##fileformat=VCFv4.1 ##FILTER= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##FORMAT= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants bypassFlowAlign=true kmer_len=19 min_var_count=5 short_suffix_match=5 min_indel_size=4 max_hp_length=8 min_var_freq=0.15 min_var_score=10.0 relative_strand_bias=0.8 output_mnv=0 sse_hp_size=0 sse_report_file= target_size=1.0 pref_kmer_max=3 pref_kmer_min=0 pref_delta_max=2 pref_delta_min=0 suff_kmer_max=3 suff_kmer_min=0 suff_delta_max=2 suff_delta_min=0 motif_min_ppv=0.2 generate_flow_position=0 analyze_missmatches=0 sse_rate=0.07 input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL reference_sequence=/results/referenceLibrary/tmap-f3/hg19/hg19.fasta rodBind=[] nonDeterministicRandomSeed=false downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 combined_sample_name= num_cpu_threads=null num_io_threads=null num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false variant=(RodBinding name=variant source=/results/analysis/output/Home/Auto_user_UMB-35-RYIA_EXOME_RUN_116_212/plugin_out/variantCaller_out.288/IonXpress_015/small_variants.sorted.vcf) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filter_mismatching_base_and_quals=false" ##basecallerVersion="4.2-18/6b3fd1b" ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##fileDate=20141128 ##fileUTCtime=2014-11-28T01:37:48 ##parametersDetails="somatic_low_stringency_proton, $Rev$, TS version: 4.2" ##parametersName="Generic - Proton - Somatic - Low Stringency" ##phasing=none ##reference=/results/referenceLibrary/tmap-f3/hg19/hg19.fasta ##reference=file:///results/referenceLibrary/tmap-f3/hg19/hg19.fasta ##source="tvc 4.2-18 (6b3fd1b) - Torrent Variant Caller" ##tmapVersion="4.2.18 (6b3fd1b) (201408050144)" ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##deamination_metric=0.195500467106 ##SnpSiftVersion="SnpSift 4.0e (build 2014-09-13), by Pablo Cingolani" ##SnpSiftCmd="SnpSift filter '( QUAL >= 30 )'" ##FILTER== 30 )"> #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT R4N chr1 13273 . G C 387.22 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00279134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7843;QD=23.8289;RBI=0.0076064;REFB=-0.00080159;REVB=-0.00707572;RO=27;SAF=13;SAR=25;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222402;STB=0.622341;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.000549382;OID=.;OPOS=13273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:25:13:17:10:25:13:17:10 chr1 13417 . C CGAGA 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0201679;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=287.611;QD=13.2053;RBI=0.0239831;REFB=-0.0376859;REVB=-0.0129785;RO=9;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.503774;STB=0.713468;STBP=0.202;TYPE=ins;VARB=0.0273992;OID=.;OPOS=13418;OREF=-;OALT=GAGA;OMAPALT=CGAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:6:15:6:12:6:1:5:3:3:36:9:1:5:6:3 chr1 762273 . G A 395.66 PASS AF=0.935484;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0513418;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0407;QD=51.0527;RBI=0.0581277;REFB=-0.123073;REVB=0.0272553;RO=2;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115798;STB=0.562455;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0123611;OID=.;OPOS=762273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:31:2:2:29:29:0.935484:7:22:0:2:7:22:0:2 chr1 808922 . G A 2315.6 PASS AF=0.993197;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00563017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.443;QD=63.0096;RBI=0.00977307;REFB=0.0673631;REVB=0.00798837;RO=1;SAF=63;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0056957;STB=0.502994;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=1.22153e-05;OID=.;OPOS=808922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:147:147:1:1:146:146:0.993197:83:63:0:1:83:63:0:1 chr1 808928 . C T 542.22 PASS AF=0.412587;AO=59;DP=143;FAO=59;FDP=143;FR=.,HEALED;FRO=84;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=0.0138864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2689;QD=15.1671;RBI=0.102883;REFB=-0.0237303;REVB=-0.101942;RO=64;SAF=27;SAR=32;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545497;STB=0.524327;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0157525;OID=.;OPOS=808928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:64:84:59:59:0.412587:32:27:33:31:32:27:35:49 chr1 856242 . G A 88.12 PASS AF=0.197531;AO=16;DP=81;FAO=16;FDP=81;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=0.0239671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.088;QD=4.35139;RBI=0.0456886;REFB=-0.0197947;REVB=-0.0388977;RO=64;SAF=15;SAR=1;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.676897;STB=0.932456;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.221712;OID=.;OPOS=856242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:81:81:64:65:16:16:0.197531:1:15:26:38:1:15:27:38 chr1 879317 . C T 529.75 PASS AF=0.504587;AO=53;DP=107;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0108592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.574;QD=19.4404;RBI=0.0143874;REFB=-0.0195254;REVB=0.0094379;RO=54;SAF=23;SAR=30;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247395;STB=0.51463;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.018156;OID=.;OPOS=879317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:54:54:53:55:0.504587:30:23:22:32:31:24:22:32 chr1 881627 . G A 156.35 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0274948;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.3708;QD=24.0531;RBI=0.0489111;REFB=-0.0398812;REVB=0.0404516;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432421;STB=0.524241;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.02906;OID=.;OPOS=881627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:9:7:5:5:9:7:5:5 chr1 887801 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.228;QD=62.6711;RBI=0.0159569;REFB=0;REVB=-0.0066252;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84694e-05;OID=.;OPOS=887801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr1 888639 . T C 600.88 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.136481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5897;QD=58.6225;RBI=0.136652;REFB=0.0899406;REVB=-0.00683368;RO=1;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267872;STB=0.514279;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.0204888;OID=.;OPOS=888639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:17:23:0:1:17:23:0:1 chr1 888659 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.176;QD=58.142;RBI=0.0350508;REFB=0;REVB=-0.0330339;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000300135;OID=.;OPOS=888659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0 chr1 894573 . G A 351.82 PASS AF=0.417582;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.00881061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.332;QD=15.4646;RBI=0.0141465;REFB=-0.0302327;REVB=0.0110679;RO=51;SAF=16;SAR=22;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510809;STB=0.514891;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0384647;OID=.;OPOS=894573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:53:38:38:0.417582:22:16:19:32:22:16:21:32 chr1 897325 . G C 741.63 PASS AF=0.96;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0465174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.846;QD=59.3307;RBI=0.0692591;REFB=0.0201343;REVB=0.0513124;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520825;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.00136604;OID=.;OPOS=897325;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:49:50:0:2:48:48:0.96:24:24:0:0:25:23:2:0 chr1 897564 . T C 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.144675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2366;QD=46.8453;RBI=0.175243;REFB=0;REVB=-0.0988905;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00989645;OID=.;OPOS=897564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr1 900953 . C T 241.05 PASS AF=0.490909;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0100536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.491;QD=17.5307;RBI=0.0108225;REFB=-0.0281881;REVB=0.0040066;RO=26;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342964;STB=0.508765;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0289037;OID=.;OPOS=900953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:28:26:27:0.490909:13:13:14:12:13:14:15:13 chr1 900972 . T G 951.43 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2363;QD=58.5498;RBI=0.0682055;REFB=0;REVB=-0.06737;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000782076;OID=.;OPOS=900972;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0 chr1 901023 . T C 980.63 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.034252;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8951;QD=57.6843;RBI=0.0342794;REFB=-0.116963;REVB=-0.00137151;RO=1;SAF=36;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129467;STB=0.506847;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00173935;OID=.;OPOS=901023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:31:36:1:0:31:36:1:0 chr1 909238 . G C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.289;QD=60.2305;RBI=0.019678;REFB=0;REVB=0.00851305;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.4027e-05;OID=.;OPOS=909238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr1 909309 . T C 501.25 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.675;QD=58.9706;RBI=0.0386844;REFB=0;REVB=0.0340831;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15627e-05;OID=.;OPOS=909309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:12:21:0:0:12:22:0:0 chr1 909363 . A C 618.46 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315041;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.744;QD=61.8463;RBI=0.0318428;REFB=0;REVB=0.00463177;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147402;OID=.;OPOS=909363;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:12:28:0:0:12:28:0:0 chr1 909768 . A G 2456.83 PASS AF=1;AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00277296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.036;QD=61.4208;RBI=0.0278446;REFB=0;REVB=-0.0277061;RO=0;SAF=56;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66393e-05;OID=.;OPOS=909768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:160:0:0:160:160:1:104:56:0:0:104:56:0:0 chr1 911595 . A G 1483.73 PASS AF=1;AO=93;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0850852;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6518;QD=62.4729;RBI=0.0893288;REFB=0;REVB=-0.0272054;RO=0;SAF=38;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122087;OID=.;OPOS=911595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:95:0:0:93:95:1:55:38:0:0:55:40:0:0 chr1 914333 . C G 538.52 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.993;QD=59.8357;RBI=0.041552;REFB=0;REVB=0.016667;RO=0;SAF=4;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6015e-05;OID=.;OPOS=914333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:32:4:0:0:32:4:0:0 chr1 914852 . G C 257.47 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.033538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1269;QD=23.4059;RBI=0.0411668;REFB=0.00137269;REVB=0.0238727;RO=19;SAF=18;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103677;STB=0.531225;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.000200045;OID=.;OPOS=914852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:20:24:24:0.545455:6:18:16:3:6:18:16:4 chr1 914876 . T C 906.55 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0001191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.63;QD=56.6592;RBI=0.0212857;REFB=-0.101581;REVB=0.0212853;RO=1;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219527;STB=0.511624;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000181255;OID=.;OPOS=914876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:21:42:0:1:21:42:0:1 chr1 914940 . T C 228.45 PASS AF=0.290598;AO=31;DP=112;FAO=34;FDP=117;FR=.;FRO=83;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=-0.0527975;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1673;QD=7.81024;RBI=0.0528372;REFB=-0.0293226;REVB=-0.00204704;RO=81;SAF=5;SAR=26;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.446803;STB=0.700644;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0538581;OID=.;OPOS=914940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:117:81:83:31:34:0.290598:26:5:39:42:26:8:41:42 chr1 915227 . A G 375.67 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00098181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.538;QD=55.655;RBI=0.0825446;REFB=0;REVB=0.0825388;RO=0;SAF=21;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000645009;OID=.;OPOS=915227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:5:21:0:0:6:21:0:0 chr1 915264 . G A 238.56 PASS AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0278468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.415;QD=27.2641;RBI=0.0688937;REFB=-0.0313022;REVB=0.063015;RO=13;SAF=16;SAR=6;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106472;STB=0.558571;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0212265;OID=.;OPOS=915264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:6:16:11:2:6:16:11:2 chr1 916549 . A G 972.46 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6292;QD=58.9371;RBI=0.0558974;REFB=0;REVB=-0.011367;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230589;OID=.;OPOS=916549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:40:26:0:0:40:26:0:0 chr1 948921 . T C 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6238;QD=60.2295;RBI=0.0228929;REFB=0;REVB=-0.0138851;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000323235;OID=.;OPOS=948921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr1 949654 . A G 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.911;QD=58.7815;RBI=0.0421575;REFB=0;REVB=0.0419745;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151803;OID=.;OPOS=949654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0 chr1 981931 . A G 666.68 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182143;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9599;QD=62.0168;RBI=0.0200558;REFB=0;REVB=-0.0083948;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125551;OID=.;OPOS=981931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr1 982994 . T C 740.12 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325494;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.7102;QD=56.9326;RBI=0.0600591;REFB=0;REVB=-0.0504741;RO=0;SAF=9;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000828706;OID=.;OPOS=982994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:43:9:0:0:43:9:0:0 chr1 984302 . T C 1060.45 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.589;QD=59.7439;RBI=0.0847612;REFB=0;REVB=0.0344383;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100387;OID=.;OPOS=984302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:33:37:0:0:33:38:0:0 chr1 986443 . C T 198.56 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.48;QD=46.721;RBI=0.0358318;REFB=0;REVB=0.0267766;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016132;OID=.;OPOS=986443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:8:8:0:0:8:9:0:0 chr1 987200 . C T 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.687;QD=60.0308;RBI=0.0381495;REFB=0;REVB=0.0279799;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132841;OID=.;OPOS=987200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:29:43:0:0:29:43:0:0 chr1 990280 . C T 1167.24 PASS AF=0.987013;AO=74;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380191;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5539;QD=60.6358;RBI=0.0484535;REFB=0;REVB=0.0300382;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0104254;OID=.;OPOS=990280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:0:74:76:0.987013:39:35:0:0:41:35:0:0 chr1 990806 . G A 582.43 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0392545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.118;QD=58.2429;RBI=0.0534084;REFB=-0.037116;REVB=0.0362152;RO=1;SAF=32;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623305;STB=0.533316;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000529235;OID=.;OPOS=990806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:7:32:0:1:7:32:0:1 chr1 990816 . G A 191.31 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.00216096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.076;QD=15.6167;RBI=0.0252961;REFB=-0.0294358;REVB=0.0252037;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186296;STB=0.606216;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0506133;OID=.;OPOS=990816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:9:11:21:8:9:11:21:8 chr1 1007203 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0926764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.194;QD=33.4285;RBI=0.0932799;REFB=0;REVB=0.0105935;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152061;OID=.;OPOS=1007203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr1 1021346 . A G 237.67 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0302413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.441;QD=18.6406;RBI=0.0302996;REFB=-0.0259391;REVB=0.00187899;RO=26;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128942;STB=0.507241;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.028316;OID=.;OPOS=1021346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:17:8:8:18:17:8:8:18 chr1 1026707 . C A 691.91 PASS AF=0.928571;AO=52;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00281092;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.724;QD=49.4221;RBI=0.0116461;REFB=-0.0658742;REVB=0.0113018;RO=3;SAF=22;SAR=30;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254814;STB=0.523734;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.000854032;OID=.;OPOS=1026707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:56:56:3:4:52:52:0.928571:30:22:2:1:30:22:3:1 chr1 1147422 . C T 289.15 PASS AF=1;AO=18;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.478;QD=52.573;RBI=0.0738994;REFB=0;REVB=0.0631413;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247024;OID=.;OPOS=1147422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:18:22:1:3:15:0:0:6:16:0:0 chr1 1156131 . T A,C 470.8 PASS AF=0.0909091,0.909091;AO=3,30;DP=33;FAO=3,30;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=1,17;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154834,0.0118595;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=134.368,117.632;QD=57.0663;RBI=0.0171832,0.018998;REFB=0,0;REVB=0.00745167,-0.0148417;RO=0;SAF=1,17;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.63861e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0730781,-0.00838218;OID=.,.;OPOS=1156131,1156131;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:33:33:0:0:3,30:3,30:0.0909091,0.909091:2,13:1,17:0:0:2,13:1,17:0:0 chr1 1158631 . A G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.093;QD=63.8718;RBI=0.028189;REFB=0;REVB=-0.0151917;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65392e-05;OID=.;OPOS=1158631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr1 1220954 . G A 942.02 PASS AF=0.502703;AO=93;DP=186;FAO=93;FDP=185;FR=.;FRO=92;FSAF=57;FSAR=36;FSRF=52;FSRR=40;FWDB=0.0147451;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5155;QD=20.368;RBI=0.0602881;REFB=-0.0131063;REVB=0.0584571;RO=89;SAF=57;SAR=36;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473753;STB=0.524704;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00968897;OID=.;OPOS=1220954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:89:92:93:93:0.502703:36:57:50:39:36:57:52:40 chr1 1223385 . G C 230.65 PASS AF=0.315217;AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.015665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.812;QD=10.0284;RBI=0.0167226;REFB=-0.0050929;REVB=-0.00585253;RO=63;SAF=18;SAR=11;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309664;STB=0.680114;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0137741;OID=.;OPOS=1223385;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:63:63:29:29:0.315217:11:18:22:41:11:18:22:41 chr1 1226292 . G A 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0222161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.73;QD=19.6682;RBI=0.0417673;REFB=0.00137845;REVB=0.0353688;RO=19;SAF=15;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325255;STB=0.686059;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00087294;OID=.;OPOS=1226292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:4:15:9:10:4:15:9:10 chr1 1226346 . TCC TC,TCG 85.37 PASS AF=0.285714,0.5;AO=4,6;DP=14;FAO=4,7;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=1,4;FSAR=3,3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.030019,-0.00247699;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=8.27945,165.992;QD=24.3903;RBI=0.190499,0.0779421;REFB=-0.163461,-0.0704483;REVB=-0.188119,-0.0779027;RO=3;SAF=1,3;SAR=3,3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.5,0;SSSB=-0.490704,-0.28674;STB=0.798623,0.636015;STBP=0.147,0.271;TYPE=del,snp;VARB=0.0736554,0.047491;OID=.,.;OPOS=1226347,1226348;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TC,TCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.285714,0.5:4,6:14:4,7:14:3:1,4:3,3:3:0:25:3:1,3:3,3:3:0 chr1 1242468 . G A 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0110994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.556;QD=22.3411;RBI=0.0213988;REFB=-0.0141184;REVB=0.0182952;RO=13;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863657;STB=0.562432;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00622441;OID=.;OPOS=1242468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:13:14:18:18:0.5625:9:9:5:8:9:9:5:9 chr1 1242707 . A G 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.057697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3968;QD=11.9196;RBI=0.0577907;REFB=-0.00528059;REVB=0.00328895;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163877;STB=0.5997;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0134952;OID=.;OPOS=1242707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:4:5:5:2:4:5 chr1 1246004 . A G 719.48 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000534786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.59;QD=54.3003;RBI=0.0187642;REFB=0;REVB=0.0187566;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144186;OID=.;OPOS=1246004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:53:0:0:49:53:1:19:30:0:0:22:31:0:0 chr1 1247494 . T C 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0339431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.406;QD=18.7452;RBI=0.0539027;REFB=-0.0262369;REVB=-0.0418732;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31972;STB=0.691659;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0128219;OID=.;OPOS=1247494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:6:1:2:2:6:1:2:2 chr1 1249187 . G A 637.64 PASS AF=0.485075;AO=63;DP=132;FAO=65;FDP=134;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=-0.0099487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.852;QD=19.0341;RBI=0.0396501;REFB=-0.0003017;REVB=0.0383817;RO=66;SAF=26;SAR=37;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325868;STB=0.512496;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00035237;OID=.;OPOS=1249187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:66:69:63:65:0.485075:37:26:25:41:39:26:26:43 chr1 1254436 . A G 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0084722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.081;QD=61.2131;RBI=0.0140328;REFB=0;REVB=0.0111867;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51771e-05;OID=.;OPOS=1254436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:45:34:0:0:45:34:0:0 chr1 1254443 . G A,C 1047.02 PASS AF=0.934211,0.0394737;AO=70,4;DP=77;FAO=71,3;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=36,0;FSAR=35,3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0134302,0.0366229;FXX=0.0129853;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=157.777,9.14069;QD=55.1062;RBI=0.0265857,0.106048;REFB=-0.172454,-0.0225539;REVB=0.022944,-0.0995236;RO=0;SAF=36,0;SAR=34,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.513885,0.5;STBP=0.244,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0015476,0.138154;OID=.,.;OPOS=1254443,1254443;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:77:76:0:2:70,4:71,3:0.934211,0.0394737:34,4:36,0:0:0:35,3:36,0:0:2 chr1 1254841 . C G 185.41 PASS AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.4105;QD=46.3514;RBI=0.0564519;REFB=0;REVB=0.043853;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0202436;OID=.;OPOS=1254841;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:8:5:0:0:11:5:0:0 chr1 1262966 . C T 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.073;QD=49.5986;RBI=0.160403;REFB=0;REVB=0.01429;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00371625;OID=.;OPOS=1262966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr1 1263144 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.622;QD=58.5878;RBI=0.0503808;REFB=0;REVB=0.0428698;RO=0;SAF=5;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139082;OID=.;OPOS=1263144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:28:5:0:0:28:5:0:0 chr1 1269554 . T C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.619;QD=62.9829;RBI=0.0602179;REFB=0;REVB=0.0581852;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216563;OID=.;OPOS=1269554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr1 1273116 . A G 2834.4 PASS AF=1;AO=175;DP=178;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370085;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5124;QD=62.6386;RBI=0.0524965;REFB=0;REVB=-0.0372324;RO=0;SAF=80;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56058e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.9351e-05;OID=.;OPOS=1273116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:181:0:0:175:181:1:95:80:0:0:99:82:0:0 chr1 1277533 . T C 832.08 PASS AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0342468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.4341;QD=52.8303;RBI=0.034299;REFB=-0.113822;REVB=-0.00189187;RO=3;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398368;STB=0.52112;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00272715;OID=.;OPOS=1277533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:63:63:3:3:60:60:0.952381:34:26:0:3:34:26:0:3 chr1 1310074 . C G 693.12 PASS AF=1;AO=33;DP=46;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768956;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.642;QD=63.0105;RBI=0.0903985;REFB=0;REVB=0.0475283;RO=1;SAF=23;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198849;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130513;OID=.;OPOS=1310074;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:44:1:0:33:44:1:10:23:1:0:17:27:0:0 chr1 1361544 . G A 323.99 PASS AF=0.555556;AO=27;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.016425;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=182;QD=23.9994;RBI=0.0268618;REFB=-0.0497173;REVB=-0.021255;RO=14;SAF=11;SAR=16;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147011;STB=0.54388;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0252452;OID=.;OPOS=1361544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:14:17:27:30:0.555556:16:11:9:5:16:14:10:7 chr1 1361633 . G A 268.84 PASS AF=1;AO=21;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744085;FXX=0.0416493;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.501;QD=46.755;RBI=0.0808087;REFB=-0.177902;REVB=0.0315186;RO=1;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708105;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00406781;OID=.;OPOS=1361633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:24:23:1:0:21:23:1:15:6:1:0:15:8:0:0 chr1 1361641 . C T 306.27 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389747;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=163.043;QD=53.2641;RBI=0.0403084;REFB=0;REVB=0.010283;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5042e-05;OID=.;OPOS=1361641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr1 1376214 . C G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.979;QD=47.822;RBI=0.0643042;REFB=0;REVB=0.0613535;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484256;OID=.;OPOS=1376214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0 chr1 1376567 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.556;QD=59.8389;RBI=0.0579772;REFB=0;REVB=0.0338123;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151073;OID=.;OPOS=1376567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr1 1378173 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.441;QD=55.6557;RBI=0.0705111;REFB=0;REVB=0.00206647;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210667;OID=.;OPOS=1378173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:20:7:0:0:20:7:0:0 chr1 1396238 . G T 708.49 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2704;QD=62.9768;RBI=0.0902846;REFB=0;REVB=0.0818629;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137324;OID=.;OPOS=1396238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:30:15:0:0:30:15:0:0 chr1 1418004 . T C 803.4 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000909677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.315;QD=55.407;RBI=0.0577264;REFB=-0.0447636;REVB=-0.0577192;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017147;STB=0.509088;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.000167626;OID=.;OPOS=1418004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:27:30:0:1:27:30:0:1 chr1 1421531 . C A 345.6 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0149499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.287;QD=51.2001;RBI=0.0327858;REFB=-0.00670306;REVB=0.0291789;RO=1;SAF=15;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029965;STB=0.516117;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00280709;OID=.;OPOS=1421531;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:11:15:1:0:11:15:1:0 chr1 1421991 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.982;QD=43.4861;RBI=0.0437919;REFB=0;REVB=-0.000474389;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255088;OID=.;OPOS=1421991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0 chr1 1423267 . A G 470.22 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425131;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0823;QD=58.7771;RBI=0.0425157;REFB=0;REVB=0.000468162;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00066087;OID=.;OPOS=1423267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0 chr1 1425700 . T C 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1172;QD=56.9373;RBI=0.0295841;REFB=0;REVB=0.017964;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.74361e-05;OID=.;OPOS=1425700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr1 1426003 . G A 153.13 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0226725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7236;QD=15.7051;RBI=0.0308621;REFB=-0.0278352;REVB=-0.0209386;RO=22;SAF=14;SAR=3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298379;STB=0.674465;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0352552;OID=.;OPOS=1426003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:3:14:13:9:3:14:13:9 chr1 1451380 . T C 391.3 PASS AF=0.935484;AO=28;DP=30;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0107797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7535;QD=50.4906;RBI=0.0162164;REFB=0.00886142;REVB=-0.0121149;RO=2;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191453;STB=0.50823;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00613018;OID=.;OPOS=1451380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:31:2:2:28:29:0.935484:18:10:1:1:18:11:1:1 chr1 1458255 . T G 538.51 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0450605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4399;QD=59.8343;RBI=0.0621896;REFB=0;REVB=-0.0428613;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00152336;OID=.;OPOS=1458255;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0 chr1 1458954 . C T 676.52 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403312;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.276;QD=62.9321;RBI=0.0403728;REFB=0;REVB=-0.00183227;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266547;OID=.;OPOS=1458954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr1 1479333 . A G 636.93 PASS AF=1;AO=33;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2622;QD=62.1394;RBI=0.0756518;REFB=0;REVB=0.0739957;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107314;OID=.;OPOS=1479333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:33:41:1:13:20:0:0:21:20:0:0 chr1 1510801 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.173;QD=52.6131;RBI=0.0371755;REFB=0;REVB=0.0153415;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000815782;OID=.;OPOS=1510801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0 chr1 1511104 . G C 357.92 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000649193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9562;QD=55.0649;RBI=0.0164572;REFB=0;REVB=0.0164444;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438703;OID=.;OPOS=1511104;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr1 1551927 . T C 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00873296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.876;QD=17.1565;RBI=0.0231613;REFB=-0.0212295;REVB=-0.0214518;RO=20;SAF=14;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172385;STB=0.59987;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0281795;OID=.;OPOS=1551927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:3:14:14:6:3:14:14:6 chr1 1558792 . T C 49.6 PASS AF=0.32;AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0204093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.554;QD=7.9365;RBI=0.0337801;REFB=-0.0164463;REVB=-0.0269176;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177312;STB=0.559852;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0480274;OID=.;OPOS=1558792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:24:25:17:17:7:8:0.32:4:3:10:7:4:4:10:7 chr1 1562080 . C T 903.37 PASS AF=0.471503;AO=91;DP=193;FAO=91;FDP=193;FR=.;FRO=102;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=0.00866417;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1936;QD=18.7227;RBI=0.00868161;REFB=0.0100534;REVB=0.000550063;RO=101;SAF=40;SAR=51;SRF=51;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626373;STB=0.532157;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.0103224;OID=.;OPOS=1562080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:101:102:91:91:0.471503:51:40:51:50:51:40:51:51 chr1 1588670 . G A 208.36 PASS AF=0.25;AO=31;DP=125;FAO=31;FDP=124;FR=.;FRO=93;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=54;FSRR=39;FWDB=-0.0174474;FXX=0.0236202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.946;QD=6.72114;RBI=0.0299962;REFB=-0.0120366;REVB=-0.0244;RO=84;SAF=15;SAR=16;SRF=50;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136058;STB=0.572271;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0216431;OID=.;OPOS=1588670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:84:93:31:31:0.25:16:15:50:34:16:15:54:39 chr1 1588717 . G A 266.35 PASS AF=0.256757;AO=37;DP=148;FAO=38;FDP=148;FR=.;FRO=110;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=66;FSRR=44;FWDB=-0.00168226;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.972;QD=7.19856;RBI=0.00758204;REFB=-0.000539274;REVB=0.00739306;RO=110;SAF=17;SAR=20;SRF=66;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173865;STB=0.611951;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.001848;OID=.;OPOS=1588717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:110:110:37:38:0.256757:20:17:66:44:21:17:66:44 chr1 1588737 . C T 178.46 PASS AF=0.208633;AO=29;DP=139;FAO=29;FDP=139;FR=.;FRO=110;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=65;FSRR=45;FWDB=0.0151558;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.087;QD=5.1356;RBI=0.0155883;REFB=-0.00505348;REVB=0.00364666;RO=110;SAF=13;SAR=16;SRF=65;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179885;STB=0.61139;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00567445;OID=.;OPOS=1588737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:110:110:29:29:0.208633:16:13:65:45:16:13:65:45 chr1 1588743 . A T 132.36 PASS AF=0.179104;AO=24;DP=134;FAO=24;FDP=134;FR=.;FRO=110;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=64;FSRR=46;FWDB=0.000223948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.398;QD=3.95102;RBI=0.0220905;REFB=-0.00494839;REVB=-0.0220893;RO=110;SAF=9;SAR=15;SRF=64;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259628;STB=0.665924;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0380864;OID=.;OPOS=1588743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:110:110:24:24:0.179104:15:9:64:46:15:9:64:46 chr1 1588744 . AGCG A 118.17 PASS AF=0.170543;AO=22;DP=134;FAO=22;FDP=129;FR=.;FRO=107;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=45;FWDB=-0.00462089;FXX=0.0300729;HRUN=1;LEN=3;MLLD=312.987;QD=3.66435;RBI=0.00510649;REFB=-0.000999277;REVB=0.00217339;RO=104;SAF=8;SAR=14;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267317;STB=0.674777;STBP=0.08;TYPE=del;VARB=0.00726046;OID=.;OPOS=1588745;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.170543:22:134:22:129:107:8:14:62:45:99:104:8:14:60:44 chr1 1599888 . A G 69.17 PASS AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00469265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0874;QD=6.148;RBI=0.0356397;REFB=0.00542412;REVB=0.0353294;RO=35;SAF=1;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.578126;STB=0.87723;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.022542;OID=.;OPOS=1599888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:9:1:19:16:9:1:19:16 chr1 1604499 . G A 316.16 PASS AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00825207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.135;QD=31.6162;RBI=0.0192729;REFB=0.0259457;REVB=-0.0174169;RO=12;SAF=14;SAR=13;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150481;STB=0.568216;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.0140775;OID=.;OPOS=1604499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:12:13:27:27:0.675:13:14:3:9:13:14:4:9 chr1 1635004 . T C 1830.27 PASS AF=0.98374;AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00795846;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=240.141;QD=59.5209;RBI=0.008217;REFB=-0.168163;REVB=-0.00204497;RO=1;SAF=75;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629233;STB=0.506578;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000348191;OID=.;OPOS=1635004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:123:123:1:2:121:121:0.98374:46:75:1:0:46:75:2:0 chr1 1635749 . C A 639.39 PASS AF=0.88;AO=44;DP=50;FAO=44;FDP=50;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00362187;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=149.969;QD=51.1509;RBI=0.0347731;REFB=-0.0547112;REVB=0.034584;RO=5;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119859;STB=0.574965;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.000571914;OID=.;OPOS=1635749;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:50:50:5:6:44:44:0.88:17:27:0:5:17:27:0:6 chr1 1636044 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.243;QD=59.0187;RBI=0.0299515;REFB=0;REVB=0.0254347;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144788;OID=.;OPOS=1636044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr1 1636274 . C T 888.62 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135714;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.405;QD=56.4204;RBI=0.0423766;REFB=-0.0896124;REVB=0.0401446;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000217238;OID=.;OPOS=1636274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:26:36:0:0:26:36:1:0 chr1 1647814 . T C 584.38 PASS AF=0.359375;AO=69;DP=192;FAO=69;FDP=192;FR=.;FRO=123;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=50;FSRR=73;FWDB=0.0232788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.898;QD=12.1745;RBI=0.0233316;REFB=-0.0013818;REVB=0.00156931;RO=123;SAF=27;SAR=42;SRF=50;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178683;STB=0.510172;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00256511;OID=.;OPOS=1647814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:123:123:69:69:0.359375:42:27:50:73:42:27:50:73 chr1 1647871 . T C 638.16 PASS AF=0.380208;AO=73;DP=192;FAO=73;FDP=192;FR=.;FRO=119;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=57;FSRR=62;FWDB=0.00736241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6925;QD=13.2949;RBI=0.0120325;REFB=-0.0135389;REVB=0.00951715;RO=117;SAF=28;SAR=45;SRF=56;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106364;STB=0.560751;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0226297;OID=.;OPOS=1647871;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:117:119:73:73:0.380208:45:28:56:61:45:28:57:62 chr1 1647893 . C CTTTCTT 285.82 PASS AF=0.270968;AO=34;DP=166;FAO=42;FDP=155;FR=.;FRO=113;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=59;FWDB=-0.00868657;FXX=0.0251557;HRUN=3;LEN=6;MLLD=185.698;QD=7.37595;RBI=0.0367713;REFB=-0.0108593;REVB=-0.0357305;RO=116;SAF=10;SAR=24;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228665;STB=0.62935;STBP=0.056;TYPE=ins;VARB=0.0264181;OID=.;OPOS=1647894;OREF=-;OALT=TTTCTT;OMAPALT=CTTTCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.270968:34:166:42:155:113:13:29:54:59:99:116:10:24:54:62 chr1 1650787 . T C 151.54 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00242638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.329;QD=12.897;RBI=0.0204975;REFB=-0.00987768;REVB=-0.0203534;RO=29;SAF=13;SAR=4;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298113;STB=0.687785;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0223056;OID=.;OPOS=1650787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:30:17:17:0.361702:4:13:15:14:4:13:15:15 chr1 1650797 . A G 155.95 PASS AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0109856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.618;QD=10.9435;RBI=0.0183227;REFB=0.00136031;REVB=-0.0146641;RO=35;SAF=14;SAR=6;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245386;STB=0.645606;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.000698083;OID=.;OPOS=1650797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:37:20:20:0.350877:6:14:17:18:6:14:18:19 chr1 1650801 . T C 131.3 PASS AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00408813;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.872;QD=8.90153;RBI=0.00655021;REFB=-0.00971329;REVB=-0.00511786;RO=41;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411165;STB=0.74675;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0157183;OID=.;OPOS=1650801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:4:14:18:23:4:14:18:23 chr1 1650807 . T C 312.58 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00774329;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6867;QD=19.2356;RBI=0.032156;REFB=-0.014538;REVB=-0.0312097;RO=27;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935779;STB=0.538798;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0130426;OID=.;OPOS=1650807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:27:32:33:33:0.507692:16:17:17:10:16:17:19:13 chr1 1650832 . A G 247.71 PASS AF=0.344828;AO=29;DP=87;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.00442804;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.36;QD=11.389;RBI=0.00767199;REFB=-0.00312957;REVB=0.00626513;RO=53;SAF=17;SAR=12;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210227;STB=0.627649;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00537953;OID=.;OPOS=1650832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:53:57:29:30:0.344828:12:17:21:32:13:17:21:36 chr1 1650845 . G A 621.71 PASS AF=0.571429;AO=54;DP=95;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0578533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.79;QD=25.3761;RBI=0.0580232;REFB=-0.00498618;REVB=-0.00443615;RO=35;SAF=19;SAR=35;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184293;STB=0.547139;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00122022;OID=.;OPOS=1650845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:35:42:54:56:0.571429:35:19:21:14:34:22:21:21 chr1 1654058 . C T 82.06 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.174;QD=32.822;RBI=0.0318801;REFB=-0.00414169;REVB=0.0247792;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.000407745;OID=.;OPOS=1654058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:6:3:0:1:6:3:0:1 chr1 1654064 . A T 82.05 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00413877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.906;QD=32.8209;RBI=0.0206675;REFB=-0.0270848;REVB=0.0202488;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00857724;OID=.;OPOS=1654064;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:6:3:0:1:6:3:0:1 chr1 1654065 . AGCG A 82.06 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00123245;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=283.55;QD=32.822;RBI=0.014817;REFB=-0.0125598;REVB=0.0147657;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=del;VARB=0.00296548;OID=.;OPOS=1654066;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.9:9:10:9:10:1:3:6:0:1:6:1:3:6:0:1 chr1 1683565 . G A 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.185;QD=54.5173;RBI=0.0147243;REFB=0;REVB=0.0112507;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167693;OID=.;OPOS=1683565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0 chr1 1686040 . G T 597.99 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8131;QD=59.7988;RBI=0.0278106;REFB=0;REVB=-0.00918312;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015749;OID=.;OPOS=1686040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:15:23:0:0:16:24:0:0 chr1 1823922 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.907;QD=53.2772;RBI=0.0340223;REFB=0;REVB=0.0254524;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335888;OID=.;OPOS=1823922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0 chr1 1847979 . T C 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0103503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5913;QD=16.8836;RBI=0.0225099;REFB=0.00613042;REVB=0.0199892;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112983;STB=0.506485;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.00328029;OID=.;OPOS=1847979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:6:9:10:7:6:9:10:7 chr1 1849530 . T C 440.7 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00410826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.235;QD=19.5868;RBI=0.0135978;REFB=-0.0171452;REVB=0.0129624;RO=43;SAF=19;SAR=25;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301145;STB=0.524018;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0200581;OID=.;OPOS=1849530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:46:44:44:0.488889:25:19:20:23:25:19:22:24 chr1 1849744 . G A 69.12 PASS AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0738493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.714;QD=15.3597;RBI=0.0779608;REFB=-0.013928;REVB=0.0249831;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162764;STB=0.555432;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0251949;OID=.;OPOS=1849744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:17:18:9:9:8:9:0.5:3:5:4:5:4:5:4:5 chr1 1854109 . A G 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00105012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.472;QD=22.3967;RBI=0.041862;REFB=0.000406076;REVB=-0.0418488;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200566;STB=0.600581;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.000553249;OID=.;OPOS=1854109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:23:25:25:0.520833:11:14:7:15:11:14:8:15 chr1 1854546 . C T 148.08 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0649809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5162;QD=17.9493;RBI=0.0691523;REFB=-0.00943064;REVB=-0.0236543;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079858;STB=0.545399;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0109534;OID=.;OPOS=1854546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:5:12:10:6:5:12 chr1 1854934 . AT A 52.11 PASS AF=0.267857;AO=17;DP=57;FAO=15;FDP=56;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0591676;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.1948;QD=3.72204;RBI=0.105513;REFB=-0.0364467;REVB=-0.0873618;RO=37;SAF=16;SAR=1;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.429712;SSSB=0.641779;STB=0.877262;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.08134;OID=.;OPOS=1854935;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.267857:17:57:15:56:41:14:1:23:18:52:37:16:1:19:18 chr1 1855319 . C T 308.18 PASS AF=0.56;AO=27;DP=49;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0678844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9881;QD=24.654;RBI=0.0754828;REFB=0.00996865;REVB=0.0330055;RO=22;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149647;STB=0.515748;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=-0.00385028;OID=.;OPOS=1855319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:22:22:27:28:0.56:14:13:11:11:15:13:11:11 chr1 1859131 . C T 469.07 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00309646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.104;QD=20.3945;RBI=0.00811405;REFB=-0.0202153;REVB=-0.00749999;RO=46;SAF=24;SAR=22;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393851;STB=0.521812;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0162492;OID=.;OPOS=1859131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:22:24:26:20:22:24:26:20 chr1 1859176 . T C 201.82 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0698004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4853;QD=14.4159;RBI=0.0698641;REFB=0.029519;REVB=0.00298411;RO=32;SAF=19;SAR=5;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279362;STB=0.661024;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0623169;OID=.;OPOS=1859176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:5:19:18:14:5:19:18:14 chr1 1873514 . A G 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0800872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9517;QD=18.7117;RBI=0.0855216;REFB=-0.00915718;REVB=-0.0299995;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788358;STB=0.544841;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00617014;OID=.;OPOS=1873514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:7:11:10:9:7:11:10:9 chr1 1873525 . T C 158.67 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0435111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1063;QD=17.1535;RBI=0.0457505;REFB=0.0115947;REVB=-0.0141384;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00883899;STB=0.506571;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=-0.0204928;OID=.;OPOS=1873525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:19:20:17:17:0.459459:7:10:11:8:7:10:12:8 chr1 1878477 . G A 260.9 PASS AF=0.40678;AO=23;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00488206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1158;QD=17.688;RBI=0.016198;REFB=-0.0533649;REVB=0.0154448;RO=17;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128491;STB=0.519983;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0189196;OID=.;OPOS=1878477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:17:22:23:24:0.40678:12:11:11:6:13:11:11:11 chr1 1886888 . C T 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0344644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.067;QD=13.2053;RBI=0.0344767;REFB=-0.0905289;REVB=-0.000918627;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119263;STB=0.587932;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0400627;OID=.;OPOS=1886888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:4:6:6:6:0.5:4:2:2:2:4:2:3:3 chr1 1896440 . G A 391.89 PASS AF=0.603175;AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0428281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3312;QD=24.8817;RBI=0.0468173;REFB=-0.0407662;REVB=0.0189106;RO=25;SAF=17;SAR=21;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238135;STB=0.513051;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0310828;OID=.;OPOS=1896440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:25:25:38:38:0.603175:21:17:12:13:21:17:12:13 chr1 1900106 . T C,TCTC 447.49 PASS AF=0.0283019,0.443396;AO=4,46;DP=106;FAO=3,47;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=1,23;FSAR=2,24;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00702315,0.00464825;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=61.6104,230.987;QD=16.8864;RBI=0.0449055,0.0167747;REFB=-0.00468214,-0.0208445;REVB=-0.0443529,-0.0161178;RO=56;SAF=2,22;SAR=2,24;SRF=28;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0213597;STB=0.658031,0.505783;STBP=0.683,0.894;TYPE=snp,ins;VARB=0.0748653,0.0254028;OID=.,.;OPOS=1900106,1900107;OREF=T,-;OALT=C,CTC;OMAPALT=C,TCTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:106:106:56:56:4,46:3,47:0.0283019,0.443396:2,24:2,22:28:28:2,24:1,23:28:28 chr1 1900186 . T C 303.06 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00124772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.755;QD=14.6054;RBI=0.0104165;REFB=-0.00583606;REVB=-0.0103415;RO=49;SAF=15;SAR=19;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721056;STB=0.540901;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0125319;OID=.;OPOS=1900186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:49:49:34:34:0.409639:19:15:25:24:19:15:25:24 chr1 1900232 . T C 193.09 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0112216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.774;QD=13.7918;RBI=0.0134851;REFB=-0.0260871;REVB=0.00747819;RO=32;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968991;STB=0.54813;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0187468;OID=.;OPOS=1900232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:15:8:14:18:15:8:14:19 chr1 1905565 . C T 400.61 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=37;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0264853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.042;QD=23.9171;RBI=0.0276155;REFB=-0.0252531;REVB=0.00781944;RO=28;SAF=2;SAR=37;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426332;STB=0.74148;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0118777;OID=.;OPOS=1905565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:37:2:7:21:37:2:7:21 chr1 1916890 . C T 380.9 PASS AF=0.5;AO=38;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00181557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.272;QD=19.5334;RBI=0.0129732;REFB=-0.00196508;REVB=0.0128456;RO=37;SAF=20;SAR=18;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126791;STB=0.512916;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0018777;OID=.;OPOS=1916890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:37:39:38:39:0.5:18:20:20:17:18:21:22:17 chr1 1957037 . T C 91.11 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0600114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.755;QD=8.28249;RBI=0.0600701;REFB=-0.0107;REVB=-0.00265362;RO=32;SAF=5;SAR=7;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135193;STB=0.583194;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0208248;OID=.;OPOS=1957037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:7:5:17:15:7:5:17:15 chr1 1960674 . C T 295.07 PASS AF=0.492308;AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0264672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.085;QD=18.158;RBI=0.037026;REFB=0.0113076;REVB=0.0258923;RO=33;SAF=13;SAR=18;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142965;STB=0.586775;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00892289;OID=.;OPOS=1960674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:33:33:31:32:0.492308:18:13:9:24:18:14:9:24 chr1 1961466 . C T 246.69 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00322159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.968;QD=15.9154;RBI=0.00341134;REFB=-0.041768;REVB=0.00112186;RO=34;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148193;STB=0.583465;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0370841;OID=.;OPOS=1961466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:13:15:13:21:13:15:13:21 chr1 1987993 . T C 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.921;QD=56.1905;RBI=0.040321;REFB=0;REVB=0.00874593;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308863;OID=.;OPOS=1987993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chr1 2005740 . T C 322.64 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600317;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.59;QD=53.7739;RBI=0.0273762;REFB=0;REVB=0.0267099;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125544;OID=.;OPOS=2005740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr1 2117558 . C T 406.66 PASS AF=0.451613;AO=41;DP=92;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0280579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.232;QD=17.491;RBI=0.0303661;REFB=-0.0352995;REVB=0.0116125;RO=50;SAF=23;SAR=18;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390824;STB=0.533526;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0248746;OID=.;OPOS=2117558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:50:51:41:42:0.451613:18:23:30:20:19:23:31:20 chr1 2125133 . C G 251.97 PASS AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.02085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.709;QD=27.2396;RBI=0.026407;REFB=-0.0364901;REVB=0.0162051;RO=14;SAF=16;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957741;STB=0.553144;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0205328;OID=.;OPOS=2125133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:7:16:8:6:7:16:8:6 chr1 2125172 . G A 179.07 PASS AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0977895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9365;QD=31.143;RBI=0.102532;REFB=-0.0903571;REVB=0.0308215;RO=6;SAF=13;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617029;STB=0.534205;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0388544;OID=.;OPOS=2125172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:23:23:6:6:17:17:0.73913:4:13:4:2:4:13:4:2 chr1 2144788 . A G 229.69 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0165881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.616;QD=22.4088;RBI=0.0176737;REFB=-0.00329871;REVB=0.00609869;RO=19;SAF=14;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181402;STB=0.601716;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00341982;OID=.;OPOS=2144788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:8:14:8:11:8:14:8:11 chr1 2144982 . G T 1008.09 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.075;QD=59.2991;RBI=0.0761755;REFB=0;REVB=0.0719259;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324844;OID=.;OPOS=2144982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:42:26:0:0:42:26:0:0 chr1 2145524 . G A 102.63 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0161483;FXX=0.0384468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.432;QD=16.4208;RBI=0.0162447;REFB=-0.00674092;REVB=0.00176733;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40287;STB=0.737256;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00474372;OID=.;OPOS=2145524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:10:2:7:6:10:2:7:6 chr1 2337194 . C T 135.1 PASS AF=0.25;AO=20;DP=80;FAO=20;FDP=80;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.0109536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.319;QD=6.75482;RBI=0.0149308;REFB=-0.0178019;REVB=0.0101463;RO=43;SAF=6;SAR=14;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302763;STB=0.749766;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0430413;OID=.;OPOS=2337194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:60:20:20:0.25:14:6:24:19:14:6:39:21 chr1 2340200 . T C 131.92 PASS AF=0.416667;AO=14;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0175474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9382;QD=14.6582;RBI=0.0822424;REFB=-0.0182211;REVB=-0.0803486;RO=21;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775117;STB=0.517218;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0287924;OID=.;OPOS=2340200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:14:15:0.416667:9:5:9:12:9:6:9:12 chr1 2399119 . A G 1554.81 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.178;QD=63.4617;RBI=0.0205543;REFB=0;REVB=0.0199402;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5135e-05;OID=.;OPOS=2399119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:98:0:0:95:98:1:46:49:0:0:47:51:0:0 chr1 2418625 . C T 296.43 PASS AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0153945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6058;QD=28.9198;RBI=0.0507105;REFB=0.00355215;REVB=0.0483173;RO=15;SAF=10;SAR=16;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107564;STB=0.505924;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.000519632;OID=.;OPOS=2418625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:16:10:6:9:16:10:6:9 chr1 2430617 . C T 381.42 PASS AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0144725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.303;QD=22.4365;RBI=0.0202223;REFB=-0.0160064;REVB=-0.014124;RO=30;SAF=16;SAR=22;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117038;STB=0.564507;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0118176;OID=.;OPOS=2430617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:30:38:38:0.558824:22:16:17:13:22:16:17:13 chr1 2433900 . C T 124.92 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00425364;FXX=0.0322477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=143.223;QD=16.6557;RBI=0.0152262;REFB=-0.0149325;REVB=-0.0146199;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901033;STB=0.533286;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0226051;OID=.;OPOS=2433900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:15:16:14:14:0.466667:7:7:9:6:7:7:9:7 chr1 2441358 . T C 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00243377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.085;QD=13.4417;RBI=0.00620007;REFB=-0.037049;REVB=0.00570243;RO=12;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510055;STB=0.812949;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0259977;OID=.;OPOS=2441358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:8:2:9:3:8:2:10:3 chr1 2452569 . T C 1446.97 PASS AF=0.980392;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0176872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2988;QD=56.7438;RBI=0.028843;REFB=-0.0519144;REVB=-0.0227833;RO=2;SAF=50;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185951;STB=0.509802;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00066832;OID=.;OPOS=2452569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:102:102:2:2:100:100:0.980392:50:50:2:0:50:50:2:0 chr1 2488153 . A G 1063.94 PASS AF=0.41637;AO=117;DP=282;FAO=117;FDP=281;FR=.;FRO=164;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=79;FSRR=85;FWDB=-0.0184733;FXX=0.00354597;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.89;QD=15.145;RBI=0.0197085;REFB=-0.0100892;REVB=-0.00686755;RO=163;SAF=58;SAR=59;SRF=79;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115471;STB=0.508182;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0125592;OID=.;OPOS=2488153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:281:163:164:117:117:0.41637:59:58:79:84:59:58:79:85 chr1 2490898 . C A 89.53 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.00589033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.253;QD=15.571;RBI=0.0283559;REFB=-0.0289645;REVB=0.0277373;RO=12;SAF=10;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168205;STB=0.59979;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0321613;OID=.;OPOS=2490898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:1:10:10:2:1:10:10:2 chr1 2490942 . C A 159.18 PASS AF=0.566667;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.071207;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.3345;QD=21.2242;RBI=0.111932;REFB=-0.0797579;REVB=0.0863614;RO=14;SAF=12;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174999;STB=0.545399;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0649702;OID=.;OPOS=2490942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:14:13:16:17:0.566667:4:12:8:6:5:12:8:5 chr1 2491205 . C T 433.47 PASS AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0342622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.519;QD=20.6412;RBI=0.0342646;REFB=-0.0180383;REVB=0.000406681;RO=41;SAF=21;SAR=22;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149822;STB=0.582744;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0124515;OID=.;OPOS=2491205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:22:21:27:14:22:21:27:14 chr1 2526746 . A G 89.0 PASS AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0127233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.165;QD=27.3835;RBI=0.0235916;REFB=-0.0452019;REVB=-0.0198665;RO=3;SAF=8;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244374;STB=0.639689;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0184376;OID=.;OPOS=2526746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:2:8:1:2:2:8:1:2 chr1 2535613 . C A 246.27 PASS AF=0.560976;AO=22;DP=40;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0136599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.686;QD=24.0266;RBI=0.0586277;REFB=-0.0293141;REVB=0.0570142;RO=17;SAF=6;SAR=16;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176194;STB=0.594912;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0252844;OID=.;OPOS=2535613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:17:18:22:23:0.560976:16:6:8:9:17:6:8:10 chr1 2541269 . A G 171.82 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00224671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4874;QD=11.0853;RBI=0.0448363;REFB=-0.0124136;REVB=-0.0447799;RO=39;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139678;STB=0.591397;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0138141;OID=.;OPOS=2541269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:40:22:22:0.354839:15:7:17:22:15:7:18:22 chr1 2560882 . G A 133.45 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0180801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.28;QD=15.7005;RBI=0.0364808;REFB=-0.0152591;REVB=0.0316853;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072901;STB=0.542112;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0124978;OID=.;OPOS=2560882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:9:6:9:10:9:6:9:10 chr1 2560903 . T G 142.55 PASS AF=0.421053;AO=14;DP=36;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.000753411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.369;QD=15.0057;RBI=0.00155359;REFB=-0.0198668;REVB=0.00135868;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23878;STB=0.57423;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0246847;OID=.;OPOS=2560903;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:38:22:22:14:16:0.421053:10:4:11:11:10:6:11:11 chr1 2573199 . A G 837.08 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00208246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.295;QD=55.8051;RBI=0.012669;REFB=-0.0325096;REVB=0.0124967;RO=1;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125832;STB=0.506664;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000811161;OID=.;OPOS=2573199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:37:22:0:1:37:22:0:1 chr1 2704103 . C CG 37.94 PASS AF=0.275;AO=10;DP=41;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0150062;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=59.3369;QD=3.79427;RBI=0.0240326;REFB=-0.00762002;REVB=0.0187718;RO=31;SAF=1;SAR=9;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490205;STB=0.842621;STBP=0.026;TYPE=ins;VARB=0.125309;OID=.;OPOS=2704104;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.275:10:41:11:40:29:1:10:13:16:37:31:1:9:13:18 chr1 2938697 . T G 160.03 PASS AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0167127;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.291;QD=10.0018;RBI=0.0260147;REFB=-0.0161977;REVB=-0.0199361;RO=43;SAF=7;SAR=14;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104602;STB=0.561737;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0349967;OID=.;OPOS=2938697;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:14:7:18:25:14:7:18:25 chr1 2939409 . G T 196.62 PASS AF=0.488372;AO=19;DP=41;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0100368;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.003;QD=18.2906;RBI=0.0333319;REFB=-0.0139693;REVB=0.0317848;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18428;STB=0.590075;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.024352;OID=.;OPOS=2939409;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:22:22:19:21:0.488372:6:13:11:11:7:14:11:11 chr1 2980793 . T C 479.49 PASS AF=0.427419;AO=53;DP=123;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.0364449;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.261;QD=15.4674;RBI=0.0373462;REFB=0.000426348;REVB=-0.00815509;RO=70;SAF=23;SAR=30;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963573;STB=0.550103;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.00095366;OID=.;OPOS=2980793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:70:71:53:53:0.427419:30:23:37:33:30:23:37:34 chr1 2980834 . G A 325.78 PASS AF=0.409091;AO=35;DP=87;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00373678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.57;QD=14.8082;RBI=0.0125606;REFB=-0.00865864;REVB=0.0119919;RO=51;SAF=11;SAR=24;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194848;STB=0.603116;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0123185;OID=.;OPOS=2980834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:51:52:35:36:0.409091:24:11:25:26:24:12:26:26 chr1 2984087 . C A 299.24 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0661137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.815;QD=21.3743;RBI=0.067748;REFB=-0.0404265;REVB=-0.0147909;RO=25;SAF=15;SAR=16;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100442;STB=0.55552;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0453445;OID=.;OPOS=2984087;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:16:15:9:16:16:15:9:16 chr1 2985885 . C G 472.19 PASS AF=0.921053;AO=31;DP=34;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0859364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9348;QD=49.7047;RBI=0.105703;REFB=-0.0980204;REVB=-0.0615469;RO=3;SAF=6;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184803;STB=0.565179;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0312551;OID=.;OPOS=2985885;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:34:38:3:3:31:35:0.921053:25:6:3:0:25:10:3:0 chr1 3301721 . C T 207.32 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0163115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.671;QD=24.3901;RBI=0.0309744;REFB=-0.010677;REVB=0.0263315;RO=14;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214461;STB=0.620128;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0100486;OID=.;OPOS=3301721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:14:6:8:6:14:6:8:6 chr1 3312914 . T G 164.17 PASS AF=0.382979;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.00294763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.878;QD=13.9722;RBI=0.00503206;REFB=-0.00784796;REVB=0.00407837;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489516;STB=0.507928;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0125509;OID=.;OPOS=3312914;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:28:29:17:18:0.382979:11:6:10:18:12:6:10:19 chr1 3328358 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.864;QD=50.4124;RBI=0.0615925;REFB=0;REVB=0.00518453;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000668816;OID=.;OPOS=3328358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr1 3331193 . G A 492.98 PASS AF=0.464912;AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.00470532;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0568;QD=17.2976;RBI=0.0353297;REFB=-0.00961646;REVB=0.0350149;RO=58;SAF=32;SAR=21;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179079;STB=0.595313;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0142558;OID=.;OPOS=3331193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:58:61:53:53:0.464912:21:32:24:34:21:32:26:35 chr1 3353890 . A G 1301.99 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5587;QD=61.9996;RBI=0.0567966;REFB=0;REVB=-0.0122914;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018557;OID=.;OPOS=3353890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:42:41:0:0:43:41:0:0 chr1 3353949 . A G 1515.09 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161369;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.139;QD=63.7931;RBI=0.0162785;REFB=0;REVB=-0.00214274;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229076;OID=.;OPOS=3353949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:44:51:0:0:44:51:0:0 chr1 3354595 . T C 1341.4 PASS AF=0.869565;AO=100;DP=115;FAO=100;FDP=115;FR=.;FRO=15;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.00808517;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.1766;QD=46.6574;RBI=0.00880598;REFB=-0.175558;REVB=0.00348933;RO=2;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185951;STB=0.539123;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00575672;OID=.;OPOS=3354595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:115:115:2:15:100:100:0.869565:50:50:0:2:50:50:3:12 chr1 3354615 . T C 1417.49 PASS AF=0.961165;AO=99;DP=103;FAO=99;FDP=103;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00714291;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.214;QD=55.0483;RBI=0.00783555;REFB=-0.151675;REVB=0.00322097;RO=3;SAF=49;SAR=50;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957414;STB=0.500196;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.000389303;OID=.;OPOS=3354615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:103:103:3:4:99:99:0.961165:50:49:2:1:50:49:2:2 chr1 3380057 . G A 592.67 PASS AF=0.42;AO=63;DP=150;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.0107614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7438;QD=15.8045;RBI=0.0148041;REFB=-0.000830945;REVB=-0.0101663;RO=87;SAF=26;SAR=37;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616941;STB=0.534602;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00154864;OID=.;OPOS=3380057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:87:87:63:63:0.42:37:26:41:46:37:26:41:46 chr1 3383898 . A G 1208.79 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.855;QD=61.2048;RBI=0.0183597;REFB=0;REVB=0.0062807;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11168e-05;OID=.;OPOS=3383898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:40:37:0:0:41:38:0:0 chr1 3389727 . C T 161.42 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=0.00600718;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.206;QD=11.9571;RBI=0.0254525;REFB=-0.00215285;REVB=0.0247335;RO=34;SAF=8;SAR=12;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381565;STB=0.718116;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00323598;OID=.;OPOS=3389727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:34:34:20:20:0.37037:12:8:26:8:12:8:26:8 chr1 3394456 . T C 989.98 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00714179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.489;QD=59.1031;RBI=0.0100032;REFB=0;REVB=-0.00700417;RO=0;SAF=43;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.86788e-05;OID=.;OPOS=3394456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:24:43:0:0:24:43:0:0 chr1 3395039 . G A 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0122067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.905;QD=13.6198;RBI=0.0146368;REFB=-0.00667433;REVB=0.00807667;RO=38;SAF=6;SAR=20;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262445;STB=0.651432;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0108297;OID=.;OPOS=3395039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:20:6:17:21:20:6:17:21 chr1 3414105 . C T 229.14 PASS AF=0.464286;AO=25;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0178624;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.544;QD=16.3668;RBI=0.0190689;REFB=-0.00611458;REVB=-0.00667504;RO=29;SAF=14;SAR=11;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19832;STB=0.606664;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0128567;OID=.;OPOS=3414105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:30:25:26:0.464286:11:14:22:7:12:14:22:8 chr1 3416449 . C A 192.86 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0382032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.14;QD=23.3768;RBI=0.0392168;REFB=-0.0155652;REVB=0.00885853;RO=14;SAF=15;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268771;STB=0.651997;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0448823;OID=.;OPOS=3416449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:4:15:7:7:4:15:7:7 chr1 3428160 . T G 389.93 PASS AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0296598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.045;QD=21.6629;RBI=0.0433295;REFB=-0.00629812;REVB=-0.0315871;RO=33;SAF=24;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085828;STB=0.547437;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00641612;OID=.;OPOS=3428160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:15:24:17:16:15:24:17:16 chr1 3428608 . G A 329.21 PASS AF=0.389474;AO=21;DP=95;FAO=37;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.0376676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.261;QD=13.8615;RBI=0.0707665;REFB=-0.0292221;REVB=0.0599087;RO=41;SAF=16;SAR=5;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113236;STB=0.566536;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0453833;OID=.;OPOS=3428608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:41:58:21:37:0.389474:5:16:28:13:20:17:33:25 chr1 3496479 . T C 217.63 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00967871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.663;QD=22.9085;RBI=0.0131992;REFB=-0.0033329;REVB=0.00897455;RO=16;SAF=12;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558936;STB=0.545411;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00306225;OID=.;OPOS=3496479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:16:17:21:21:0.552632:9:12:8:8:9:12:8:9 chr1 3511934 . A G 205.51 PASS AF=0.442308;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0091906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.649;QD=15.8083;RBI=0.0471156;REFB=-0.0260488;REVB=-0.0462105;RO=29;SAF=17;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259387;STB=0.655722;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0302383;OID=.;OPOS=3511934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:29:29:22:23:0.442308:5:17:16:13:5:18:16:13 chr1 3545612 . A G 286.11 PASS AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0168148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.488;QD=20.4367;RBI=0.0267355;REFB=-0.0124495;REVB=0.0207858;RO=26;SAF=13;SAR=17;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00873579;STB=0.504851;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00509586;OID=.;OPOS=3545612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:17:13:11:15:17:13:11:15 chr1 3548136 . T C 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.798;QD=59.8557;RBI=0.0352276;REFB=0;REVB=-0.000806154;RO=0;SAF=48;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.62695e-05;OID=.;OPOS=3548136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:23:48:0:0:23:48:0:0 chr1 3551792 . G A 208.76 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00499375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1632;QD=15.4637;RBI=0.00862736;REFB=0.00240032;REVB=-0.00703518;RO=30;SAF=8;SAR=16;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138559;STB=0.57888;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.00287153;OID=.;OPOS=3551792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:16:8:14:16:16:8:14:16 chr1 3607520 . G A 1060.34 PASS AF=0.447154;AO=110;DP=248;FAO=110;FDP=246;FR=.;FRO=136;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=71;FWDB=-0.0160214;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.473;QD=17.2414;RBI=0.0200477;REFB=-0.0134942;REVB=0.0120511;RO=136;SAF=65;SAR=45;SRF=65;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113717;STB=0.563095;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0156307;OID=.;OPOS=3607520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:246:136:136:110:110:0.447154:45:65:65:71:45:65:65:71 chr1 3638674 . C T 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.95;QD=57.1774;RBI=0.050791;REFB=0;REVB=0.029696;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179178;OID=.;OPOS=3638674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0 chr1 3703710 . G A 382.9 PASS AF=0.506494;AO=37;DP=75;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0441913;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2473;QD=19.8906;RBI=0.0634324;REFB=-0.0327841;REVB=0.0455061;RO=37;SAF=23;SAR=14;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195484;STB=0.610526;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0333832;OID=.;OPOS=3703710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:37:38:37:39:0.506494:14:23:15:22:14:25:16:22 chr1 3743319 . G A 723.08 PASS AF=0.981132;AO=42;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0841566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.042;QD=54.5723;RBI=0.0951214;REFB=-0.0351625;REVB=0.0443368;RO=1;SAF=11;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407606;STB=0.512816;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00109878;OID=.;OPOS=3743319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:42:52:0.981132:31:11:1:0:33:19:1:0 chr1 3745924 . G A 1877.35 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00125389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2048;QD=61.5524;RBI=0.0109124;REFB=0;REVB=-0.0108402;RO=0;SAF=55;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.22505e-05;OID=.;OPOS=3745924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:121:122:1:66:55:0:0:66:56:0:0 chr1 4772716 . C T 445.27 PASS AF=0.470588;AO=47;DP=103;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.000766583;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.758;QD=17.4614;RBI=0.0186168;REFB=0.0106226;REVB=0.018601;RO=53;SAF=28;SAR=19;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136953;STB=0.564118;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.0103183;OID=.;OPOS=4772716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:53:54:47:48:0.470588:19:28:24:29:20:28:25:29 chr1 4842981 . G A 310.86 PASS AF=0.338983;AO=39;DP=119;FAO=40;FDP=118;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00593953;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.059;QD=10.5376;RBI=0.0267287;REFB=-0.0108939;REVB=0.0260604;RO=78;SAF=21;SAR=18;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088486;STB=0.56669;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0253169;OID=.;OPOS=4842981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:78:78:39:40:0.338983:18:21:36:42:18:22:35:43 chr1 5935162 . A T 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0442599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.695;QD=16.4541;RBI=0.0472171;REFB=-0.0503673;REVB=0.0164475;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443891;STB=0.768234;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0373246;OID=.;OPOS=5935162;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:1:5:1:3:1:5:1:3 chr1 5937168 . G A 2025.78 PASS AF=0.992424;AO=130;DP=133;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0452601;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3504;QD=61.3873;RBI=0.0546569;REFB=-0.0318968;REVB=0.0306415;RO=2;SAF=84;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459467;STB=0.505376;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000565511;OID=.;OPOS=5937168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:132:2:1:130:131:0.992424:46:84:1:1:46:85:0:1 chr1 5948677 . G A 871.29 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0290359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.22;QD=56.2119;RBI=0.0324986;REFB=0.111177;REVB=-0.0145972;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000866266;OID=.;OPOS=5948677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:31:30:0:1:31:30:0:1 chr1 6162054 . T C 200.17 PASS AF=0.947368;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0252004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.9407;QD=42.1406;RBI=0.0255431;REFB=-0.171008;REVB=-0.00416974;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538535;STB=0.526287;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0242558;OID=.;OPOS=6162054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:19:1:1:17:18:0.947368:9:8:1:0:9:9:1:0 chr1 6162355 . A T 468.29 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501793;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.409;QD=58.536;RBI=0.0502244;REFB=0;REVB=-0.00212805;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296946;OID=.;OPOS=6162355;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:33:32:1:20:13:0:0:20:12:0:0 chr1 6162407 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.03;QD=55.0975;RBI=0.0519841;REFB=0;REVB=0.0281548;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022463;OID=.;OPOS=6162407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr1 6163065 . G A 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.2;QD=60.8832;RBI=0.0130612;REFB=0;REVB=0.0125726;RO=0;SAF=29;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92564e-05;OID=.;OPOS=6163065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:48:29:0:0:48:29:0:0 chr1 6165419 . C T 650.83 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.879;QD=61.9841;RBI=0.0209279;REFB=0;REVB=0.0195418;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.39158e-05;OID=.;OPOS=6165419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chr1 6184092 . A G 767.4 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.857;QD=63.9504;RBI=0.0154886;REFB=0;REVB=-0.0102832;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00515e-06;OID=.;OPOS=6184092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:15:31:0:0:16:32:0:0 chr1 6190315 . C T 1806.63 PASS AF=0.991667;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0234427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.664;QD=60.2209;RBI=0.0360498;REFB=-0.0609653;REVB=0.0273866;RO=1;SAF=61;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772339;STB=0.504064;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000408494;OID=.;OPOS=6190315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:120:1:1:119:119:0.991667:58:61:1:0:58:61:1:0 chr1 6196869 . A G 885.0 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0769025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9712;QD=58.0331;RBI=0.0770252;REFB=0;REVB=0.00434587;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000632253;OID=.;OPOS=6196869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0 chr1 6202245 . G A 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.292;QD=64.021;RBI=0.0163846;REFB=0;REVB=0.0139581;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58225e-05;OID=.;OPOS=6202245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:42:56:0:0:42:56:0:0 chr1 6209363 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8101;QD=52.6131;RBI=0.0115487;REFB=0;REVB=-0.00984881;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000477244;OID=.;OPOS=6209363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0 chr1 6211183 . G A 1190.29 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6716;QD=61.0405;RBI=0.0682859;REFB=0;REVB=0.0319069;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000544844;OID=.;OPOS=6211183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0 chr1 6313938 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.918;QD=59.4355;RBI=0.0286296;REFB=0;REVB=0.0256366;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.18062e-05;OID=.;OPOS=6313938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr1 6314822 . T C 1008.47 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00914283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7128;QD=59.322;RBI=0.0342873;REFB=0;REVB=0.0330459;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215732;OID=.;OPOS=6314822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0 chr1 6473294 . A G 445.07 PASS AF=0.617647;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0432625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6572;QD=26.1808;RBI=0.07004;REFB=-0.0272232;REVB=-0.0550814;RO=26;SAF=9;SAR=33;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219674;STB=0.620905;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0228516;OID=.;OPOS=6473294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:26:26:42:42:0.617647:33:9:12:14:33:9:12:14 chr1 6501044 . C G 278.87 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00394633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.344;QD=21.8719;RBI=0.00768526;REFB=-0.00960125;REVB=-0.00659466;RO=23;SAF=20;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137814;STB=0.576866;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00798096;OID=.;OPOS=6501044;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:8:20:13:10:8:20:13:10 chr1 6592630 . A G 153.44 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.038098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.073;QD=13.9488;RBI=0.0385421;REFB=-0.0141976;REVB=0.00583409;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288417;STB=0.667352;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0159506;OID=.;OPOS=6592630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:11:6:17:10:11:6:17:10 chr1 6614535 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.779;QD=43.4861;RBI=0.162321;REFB=0;REVB=0.162317;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00436748;OID=.;OPOS=6614535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0 chr1 6635231 . A G 246.54 PASS AF=0.952381;AO=21;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0241642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3919;QD=46.9598;RBI=0.0333063;REFB=0.0577966;REVB=-0.0229217;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521717;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.00422165;OID=.;OPOS=6635231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:0:1:21:20:0.952381:9:12:0:0:9:11:1:0 chr1 6635306 . G A 281.23 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0494782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.858;QD=14.4223;RBI=0.0502305;REFB=-0.0105807;REVB=-0.00866071;RO=46;SAF=17;SAR=15;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550159;STB=0.53123;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0163319;OID=.;OPOS=6635306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:15:17:22:24:15:17:22:24 chr1 6646959 . GCCTGCCTTC G 64.72 PASS AF=0.259259;AO=13;DP=48;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.026089;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=9;MLLD=270.681;QD=4.79378;RBI=0.0363927;REFB=-0.00502527;REVB=0.0253731;RO=27;SAF=6;SAR=7;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146659;STB=0.642292;STBP=0.237;TYPE=del;VARB=0.011548;OID=.;OPOS=6646960;OREF=CCTGCCTTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.259259:13:48:14:54:40:6:8:25:15:64:27:6:7:16:11 chr1 6659505 . G A 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0146737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.43;QD=20.7548;RBI=0.016925;REFB=-0.0138203;REVB=-0.00843429;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350619;STB=0.695425;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0114587;OID=.;OPOS=6659505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:7:8:1:11:7:8:1:11 chr1 6693097 . A G 184.91 PASS AF=0.527778;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0542503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.238;QD=20.5453;RBI=0.0554742;REFB=-0.00163626;REVB=-0.0115884;RO=17;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172046;STB=0.605229;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0021805;OID=.;OPOS=6693097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:18:19:0.527778:7:11:7:10:7:12:7:10 chr1 6695244 . A G 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0774414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7233;QD=17.84;RBI=0.0851629;REFB=-0.00459444;REVB=-0.0354338;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130632;STB=0.574366;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.000455607;OID=.;OPOS=6695244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:4:10:8:6:4:10 chr1 6704635 . A G 172.12 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00197069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3173;QD=18.1181;RBI=0.00594126;REFB=-0.0125778;REVB=-0.00560491;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277998;STB=0.65698;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0133528;OID=.;OPOS=6704635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:5:15:8:10:5:15 chr1 6711146 . T C 185.24 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0289063;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.967;QD=13.4719;RBI=0.0459729;REFB=-0.0201567;REVB=0.0357482;RO=32;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322703;STB=0.527248;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0249885;OID=.;OPOS=6711146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:33:22:22:0.4:11:11:17:15:11:11:18:15 chr1 7723534 . G A 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0109272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.747;QD=18.4897;RBI=0.0174398;REFB=-0.0277386;REVB=-0.013592;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137578;STB=0.507805;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0293601;OID=.;OPOS=7723534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:15:11:9:13:15:11 chr1 7797503 . C G 221.93 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0030529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.922;QD=18.4942;RBI=0.0114793;REFB=-0.012405;REVB=0.0110659;RO=24;SAF=6;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11149;STB=0.593796;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0198437;OID=.;OPOS=7797503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:24:26:22:22:0.458333:16:6:9:15:16:6:11:15 chr1 7811014 . G A 334.5 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0121537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.604;QD=17.1536;RBI=0.0139753;REFB=-0.0159034;REVB=0.00689903;RO=42;SAF=21;SAR=15;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810411;STB=0.545429;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0200108;OID=.;OPOS=7811014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:15:21:21:21:15:21:21:21 chr1 7870048 . T C 118.65 PASS AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0137105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.066;QD=7.78034;RBI=0.023775;REFB=-0.0144156;REVB=-0.0194235;RO=44;SAF=7;SAR=10;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00329213;STB=0.50199;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0336406;OID=.;OPOS=7870048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:44:44:17:17:0.278689:10:7:18:26:10:7:18:26 chr1 7887248 . G A 820.18 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0369422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.55;QD=55.6055;RBI=0.0399;REFB=-0.111808;REVB=0.0150761;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00307727;OID=.;OPOS=7887248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:28:30:0:1:28:30:0:1 chr1 7887493 . T C 1102.06 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255979;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.868;QD=60.3866;RBI=0.0527484;REFB=0;REVB=0.0461209;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219727;OID=.;OPOS=7887493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0 chr1 7887605 . G A 211.19 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0173866;FXX=0.0681663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.414;QD=20.6037;RBI=0.0235843;REFB=-0.0160999;REVB=0.0159351;RO=20;SAF=15;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407199;STB=0.72129;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0150394;OID=.;OPOS=7887605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:21:20:20:0.487805:5:15:6:14:5:15:7:14 chr1 7889941 . C T 428.5 PASS AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0088622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.046;QD=22.2595;RBI=0.061187;REFB=-0.0111491;REVB=0.0605418;RO=34;SAF=14;SAR=28;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28099;STB=0.649051;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0142279;OID=.;OPOS=7889941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:35:42:42:0.545455:28:14:23:11:28:14:23:12 chr1 7890024 . T G 33.03 PASS AF=0.146341;AO=5;DP=40;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0105982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.295;QD=3.22275;RBI=0.0234208;REFB=-0.0211576;REVB=-0.0208857;RO=34;SAF=2;SAR=3;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960011;STB=0.633732;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0934421;OID=.;OPOS=7890024;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:40:41:34:35:5:6:0.146341:3:2:11:23:3:3:12:23 chr1 7890026 . A G 33.37 PASS AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0819897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.509;QD=3.33687;RBI=0.121965;REFB=0.00614331;REVB=-0.0902954;RO=34;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177605;STB=0.62461;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.0337082;OID=.;OPOS=7890026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:40:40:34:34:6:6:0.15:3:3:12:22:3:3:12:22 chr1 7890053 . G A 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0366021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.55;QD=11.369;RBI=0.0425294;REFB=-0.0248921;REVB=0.0216571;RO=19;SAF=1;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538458;STB=0.832592;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0646372;OID=.;OPOS=7890053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:10:1:9:10:10:1:9:10 chr1 7890055 . T A 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.039954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.285;QD=10.2402;RBI=0.0417986;REFB=0.00234625;REVB=-0.01228;RO=19;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520284;STB=0.824905;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0116993;OID=.;OPOS=7890055;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:9:1:9:10:9:1:9:10 chr1 7906476 . G T 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00890714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0478;QD=57.675;RBI=0.0607495;REFB=0;REVB=-0.060093;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000992378;OID=.;OPOS=7906476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr1 7909737 . C T 532.11 PASS AF=0.590361;AO=49;DP=83;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0295476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2353;QD=25.6436;RBI=0.0359363;REFB=-0.0140838;REVB=-0.0204538;RO=33;SAF=26;SAR=23;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560352;STB=0.53593;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00795928;OID=.;OPOS=7909737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:33:34:49:49:0.590361:23:26:20:13:23:26:21:13 chr1 7913430 . G A 308.45 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00706803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.966;QD=18.4149;RBI=0.0296978;REFB=0.00324148;REVB=-0.0288445;RO=34;SAF=13;SAR=20;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716279;STB=0.540013;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.00292457;OID=.;OPOS=7913430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:20:13:16:18:20:13:16:18 chr1 7990367 . G A 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0353173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9044;QD=18.251;RBI=0.0407909;REFB=-0.0274162;REVB=0.0204105;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231787;STB=0.631413;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0287653;OID=.;OPOS=7990367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:4:11:7:8:4:11 chr1 8031054 . G A 389.29 PASS AF=0.455556;AO=40;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.00831308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.229;QD=17.3017;RBI=0.0304985;REFB=-0.0424199;REVB=0.0293437;RO=50;SAF=19;SAR=21;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949426;STB=0.541647;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0470779;OID=.;OPOS=8031054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:49:40:41:0.455556:21:19:19:31:22:19:19:30 chr1 8042970 . G T 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0247055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.164;QD=12.1823;RBI=0.0324756;REFB=-0.00423382;REVB=-0.0210785;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245627;STB=0.646754;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00958585;OID=.;OPOS=8042970;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:7:3:8:7:7:3:8:7 chr1 8073430 . AAT A,ATT 35.11 PASS AF=0.121212,0;AO=12,8;DP=80;FAO=8,0;FDP=66;FR=.;FRO=58;FSAF=5,0;FSAR=3,0;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0847486,0.0500161;FXX=0.0149231;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=24.3585,18.9246;QD=2.12808;RBI=0.0855337,0.0563268;REFB=-0.0263255,0.00545428;REVB=-0.0115622,0.0259056;RO=55;SAF=7,8;SAR=5,0;SRF=23;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.203142,0.689137;STB=0.679717,0.5;STBP=0.308,1;TYPE=del,snp;VARB=0.121004,0;OID=.,.;OPOS=8073431,8073431;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.121212,0:12,8:80:8,0:66:58:5,0:3,0:24:34:35:55:7,8:5,0:23:32 chr1 8390495 . A G 79.74 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275794;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.034;QD=39.8689;RBI=0.0365788;REFB=0;REVB=0.0240289;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112828;OID=.;OPOS=8390495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr1 8390888 . G A 382.91 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-4.88189e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.971;QD=17.4052;RBI=0.00506523;REFB=-0.0214548;REVB=0.00506523;RO=48;SAF=14;SAR=26;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481821;STB=0.527013;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0321411;OID=.;OPOS=8390888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:26:14:19:29:26:14:19:29 chr1 8412935 . C T 608.73 PASS AF=0.496;AO=59;DP=122;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=45;FWDB=0.01119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.077;QD=19.4793;RBI=0.0117778;REFB=-0.00725562;REVB=-0.00367423;RO=57;SAF=23;SAR=36;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158221;STB=0.57071;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00650326;OID=.;OPOS=8412935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:125:57:63:59:62:0.496:36:23:13:44:36:26:18:45 chr1 8412989 . A G 1491.8 PASS AF=0.980769;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0147248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.534;QD=57.377;RBI=0.0152353;REFB=0.050166;REVB=0.00391087;RO=2;SAF=36;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141599;STB=0.507461;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-1.02161e-05;OID=.;OPOS=8412989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:104:104:2:2:102:102:0.980769:66:36:0:2:66:36:0:2 chr1 8418644 . C A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0118087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.505;QD=14.7986;RBI=0.016321;REFB=-0.0321085;REVB=-0.0112664;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288616;STB=0.666389;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0287603;OID=.;OPOS=8418644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:3:10:5:6:3:10 chr1 8418650 . T C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.00933926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.343;QD=12.0517;RBI=0.0291339;REFB=-0.0136353;REVB=-0.0275964;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316785;STB=0.685902;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0345974;OID=.;OPOS=8418650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:3:10:4:5:3:10 chr1 8928125 . G T 747.7 PASS AF=0.982143;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.702;QD=53.4071;RBI=0.0279766;REFB=-0.142804;REVB=0.00960647;RO=2;SAF=27;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033633;STB=0.508769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000906229;OID=.;OPOS=8928125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:56:56:2:1:54:55:0.982143:27:27:2:0:27:28:1:0 chr1 9011586 . T G 849.1 PASS AF=0.983607;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00538833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.72;QD=55.6787;RBI=0.0436039;REFB=0.00683586;REVB=0.0432696;RO=1;SAF=29;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159891;STB=0.508472;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.000897492;OID=.;OPOS=9011586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:59:61:1:1:58:60:0.983607:29:29:1:0:31:29:1:0 chr1 9011722 . G T 505.4 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102245;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.17;QD=59.4587;RBI=0.0131256;REFB=0;REVB=0.00823044;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78004e-05;OID=.;OPOS=9011722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr1 9017204 . A G 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0231733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.228;QD=20.7548;RBI=0.0234344;REFB=-0.00169287;REVB=0.00348809;RO=12;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435512;STB=0.74389;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00220061;OID=.;OPOS=9017204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:10:5:11:1:10:5:11:1 chr1 9030964 . C T 285.98 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0147024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.004;QD=21.9987;RBI=0.0266962;REFB=-0.0123865;REVB=0.0222829;RO=23;SAF=17;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171933;STB=0.50953;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0125993;OID=.;OPOS=9030964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:12:17:13:10:12:17:13:10 chr1 9034421 . G A 106.86 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0331;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=277.04;QD=12.2129;RBI=0.0349478;REFB=-0.0185081;REVB=-0.0112134;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348754;STB=0.504418;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.028399;OID=.;OPOS=9034421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:6:7:12:9:6:7:12:10 chr1 9039704 . G A 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0160017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3128;QD=10.0337;RBI=0.0179786;REFB=-0.0105977;REVB=0.00819604;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478981;STB=0.798799;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0275805;OID=.;OPOS=9039704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:5:2:4:1:5:2 chr1 9307033 . G A 157.8 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0236442;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.925;QD=15.7798;RBI=0.024758;REFB=-0.0143619;REVB=0.00734243;RO=23;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194915;STB=0.612114;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0299603;OID=.;OPOS=9307033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:7:10:9:14:7:10:9:14 chr1 9307138 . T C 56.39 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0417844;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.825;QD=9.80783;RBI=0.0419036;REFB=-0.0076607;REVB=-0.00315861;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169958;STB=0.604132;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0156993;OID=.;OPOS=9307138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:24:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:8:7:5:3:8:7 chr1 9427842 . A G 674.31 PASS AF=0.651685;AO=57;DP=88;FAO=58;FDP=89;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0306244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.732;QD=30.3061;RBI=0.0309931;REFB=-0.00582562;REVB=0.00476643;RO=31;SAF=23;SAR=34;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535911;STB=0.524932;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00295366;OID=.;OPOS=9427842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:31:31:57:58:0.651685:34:23:15:16:34:24:15:16 chr1 9427869 . G A 585.94 PASS AF=0.634146;AO=52;DP=81;FAO=52;FDP=82;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0443692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.091;QD=28.5823;RBI=0.0450059;REFB=-0.0133796;REVB=-0.00754341;RO=29;SAF=19;SAR=33;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104463;STB=0.551602;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00571887;OID=.;OPOS=9427869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:29:30:52:52:0.634146:33:19:15:14:33:19:15:15 chr1 9670834 . C T 452.13 PASS AF=0.442478;AO=50;DP=113;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.0458421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1997;QD=16.0046;RBI=0.0491114;REFB=-0.0224431;REVB=-0.0176189;RO=62;SAF=22;SAR=28;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116473;STB=0.511457;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0307991;OID=.;OPOS=9670834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:62:63:50:50:0.442478:28:22:28:34:28:22:29:34 chr1 9784423 . C T 265.03 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00941861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.449;QD=15.5899;RBI=0.0129789;REFB=-0.0122774;REVB=-0.00892977;RO=38;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590043;STB=0.533311;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0162758;OID=.;OPOS=9784423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:14:16:18:20:14:16:18:20 chr1 9804693 . C T 78.62 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0309741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.941;QD=14.9748;RBI=0.0314254;REFB=-0.0159399;REVB=-0.00530681;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185184;STB=0.589287;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0169112;OID=.;OPOS=9804693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:11:10:10:0.47619:7:3:5:5:7:3:5:6 chr1 9811541 . A G 521.4 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.000821733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.346;QD=23.4337;RBI=0.0463791;REFB=0.000948825;REVB=-0.0463718;RO=40;SAF=25;SAR=24;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121095;STB=0.506652;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=-0.001137;OID=.;OPOS=9811541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:40:40:49:49:0.550562:24:25:21:19:24:25:21:19 chr1 9888202 . C T 465.12 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.568;QD=58.14;RBI=0.0639973;REFB=0;REVB=0.0419253;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.44646e-05;OID=.;OPOS=9888202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0 chr1 10318652 . C G 420.32 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0483412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.153;QD=16.4832;RBI=0.0486545;REFB=-0.0158912;REVB=0.00551288;RO=55;SAF=24;SAR=22;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123429;STB=0.502134;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0349588;OID=.;OPOS=10318652;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:56:46:46:0.45098:22:24:28:27:22:24:29:27 chr1 10339209 . CAT C 701.29 PASS AF=0.634409;AO=58;DP=95;FAO=59;FDP=93;FR=.;FRO=34;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.000903281;FXX=0.0605999;HRUN=1;LEN=2;MLLD=280.904;QD=30.1631;RBI=0.0124631;REFB=-0.0226504;REVB=0.0124303;RO=29;SAF=33;SAR=25;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536858;STB=0.539072;STBP=0.314;TYPE=del;VARB=0.0125564;OID=.;OPOS=10339210;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.634409:58:95:59:93:34:34:25:16:18:99:29:33:25:14:15 chr1 10366692 . C G 310.7 PASS AF=0.453333;AO=32;DP=73;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00485223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.13;QD=16.5705;RBI=0.0252025;REFB=-0.0230167;REVB=0.024731;RO=39;SAF=20;SAR=12;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210172;STB=0.607414;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.019229;OID=.;OPOS=10366692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:39:41:32:34:0.453333:12:20:16:23:14:20:16:25 chr1 10435324 . C A 322.85 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00644803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.199;QD=21.8882;RBI=0.0121141;REFB=-0.00447585;REVB=0.0102554;RO=26;SAF=14;SAR=19;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00095115;STB=0.500525;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00446139;OID=.;OPOS=10435324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:19:14:11:15:19:14:11:15 chr1 10460485 . T C 140.56 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00458286;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.39;QD=12.4938;RBI=0.0203834;REFB=-0.0127031;REVB=0.0198615;RO=28;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965433;STB=0.548225;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0356329;OID=.;OPOS=10460485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:28:29:16:16:0.355556:5:11:17:11:5:11:18:11 chr1 10473196 . C T 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=0.0144676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.363;QD=16.0426;RBI=0.0654306;REFB=0.00178901;REVB=-0.063811;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335504;STB=0.689481;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00421318;OID=.;OPOS=10473196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:10:9:21:5:10:9:21:5 chr1 10511543 . C CT 201.98 PASS AF=1;AO=3;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953693;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=186.743;QD=31.0742;RBI=0.10662;REFB=0;REVB=-0.0476699;RO=24;SAF=2;SAR=1;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13701;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00415637;OID=.;OPOS=10511544;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:27:26:26:0:14:12:0:0:3:24:2:1:13:11 chr1 10511544 . C T 319.16 PASS AF=0.962963;AO=24;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.021954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.06;QD=47.2827;RBI=0.0352892;REFB=-0.0462078;REVB=0.0276288;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040273;STB=0.521722;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000963331;OID=.;OPOS=10511544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:27:27:1:1:24:26:0.962963:11:13:0:1:11:15:0:1 chr1 10511589 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00377141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.706;QD=56.1911;RBI=0.0456841;REFB=0;REVB=0.0455282;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017833;OID=.;OPOS=10511589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr1 10689924 . C T 287.09 PASS AF=0.657895;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00104982;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.259;QD=30.2194;RBI=0.0117916;REFB=-0.0565718;REVB=0.0117448;RO=13;SAF=8;SAR=17;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969454;STB=0.553444;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.039379;OID=.;OPOS=10689924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:13:13:25:25:0.657895:17:8:6:7:17:8:6:7 chr1 10708142 . A G 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.00640902;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9499;QD=12.7387;RBI=0.0677996;REFB=0.0139232;REVB=-0.067496;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214881;STB=0.624738;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.0228159;OID=.;OPOS=10708142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:6:2:1:9:6:2:1:9 chr1 10709441 . C T 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0321191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.262;QD=12.8611;RBI=0.0370275;REFB=-0.0297749;REVB=0.0184228;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206125;STB=0.624625;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0334729;OID=.;OPOS=10709441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:4:4:5:2:4:4 chr1 10713765 . T C 64.35 PASS AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0838862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1031;QD=23.3998;RBI=0.162599;REFB=-0.0314249;REVB=-0.139289;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288883;STB=0.631225;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00562051;OID=.;OPOS=10713765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:11:11:2:3:8:8:0.727273:2:6:0:2:2:6:1:2 chr1 10725498 . G A 92.48 PASS AF=0.387097;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00894659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.164;QD=11.9323;RBI=0.0261206;REFB=-0.0168651;REVB=0.0245407;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115455;STB=0.530676;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.047598;OID=.;OPOS=10725498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:31:31:20:19:11:12:0.387097:6:5:7:13:7:5:7:12 chr1 11008497 . G C 574.77 PASS AF=0.484615;AO=51;DP=118;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=0.0906814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.135;QD=17.6853;RBI=0.0923871;REFB=-0.0385114;REVB=0.0176705;RO=67;SAF=14;SAR=37;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133854;STB=0.504726;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0384938;OID=.;OPOS=11008497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:130:67:67:51:63:0.484615:37:14:26:41:38:25:26:41 chr1 11008695 . T C 405.88 PASS AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0233411;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.704;QD=24.9771;RBI=0.0236715;REFB=-0.0261227;REVB=-0.00394113;RO=25;SAF=13;SAR=26;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278498;STB=0.659711;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0148828;OID=.;OPOS=11008695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:25:26:39:39:0.6:26:13:18:7:26:13:19:7 chr1 11014118 . C T 275.09 PASS AF=0.442857;AO=30;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0525391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1351;QD=15.7195;RBI=0.0527604;REFB=-0.0136933;REVB=0.0048277;RO=39;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542976;STB=0.519913;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0173935;OID=.;OPOS=11014118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:39:30:31:0.442857:17:13:19:20:17:14:19:20 chr1 11015165 . A G 479.89 PASS AF=0.464286;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0028425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.921;QD=17.139;RBI=0.00285377;REFB=-0.012128;REVB=-0.000253376;RO=60;SAF=36;SAR=16;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228877;STB=0.627856;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0183603;OID=.;OPOS=11015165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:60:60:52:52:0.464286:16:36:28:32:16:36:28:32 chr1 11087524 . G A 291.51 PASS AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0475171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.638;QD=33.3151;RBI=0.0484128;REFB=0.00719583;REVB=0.00926918;RO=10;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114515;STB=0.562593;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.00216897;OID=.;OPOS=11087524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:35:35:10:10:25:25:0.714286:13:12:7:3:13:12:7:3 chr1 11090916 . C A 425.32 PASS AF=0.767442;AO=31;DP=41;FAO=33;FDP=43;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0300637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.112;QD=39.5649;RBI=0.0415137;REFB=-0.0449921;REVB=-0.028628;RO=10;SAF=15;SAR=16;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377832;STB=0.526744;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0121722;OID=.;OPOS=11090916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:41:43:10:10:31:33:0.767442:16:15:4:6:16:17:4:6 chr1 11137661 . A G 149.25 PASS AF=0.592593;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00847705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.777;QD=22.1116;RBI=0.0263256;REFB=-0.0330177;REVB=-0.0249234;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285642;STB=0.530768;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0238925;OID=.;OPOS=11137661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:27:11:11:15:16:0.592593:9:6:4:7:9:7:4:7 chr1 11141187 . C G 47.67 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0746326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5377;QD=11.917;RBI=0.0862073;REFB=-0.0097187;REVB=0.0431472;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206013;STB=0.622323;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0222727;OID=.;OPOS=11141187;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:7:2:3:4:7:2 chr1 11150682 . C T 194.85 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0713027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1902;QD=17.3201;RBI=0.0720182;REFB=-0.00898367;REVB=0.0101262;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171522;STB=0.597162;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0167649;OID=.;OPOS=11150682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:18:7:9:11:18:7 chr1 11159823 . T C 347.46 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00522448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.022;QD=17.1584;RBI=0.0118251;REFB=-0.0106948;REVB=0.0106083;RO=43;SAF=24;SAR=13;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244737;STB=0.642923;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00967498;OID=.;OPOS=11159823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:44:37:37:0.45679:13:24:17:26:13:24:17:27 chr1 11166713 . T C 239.76 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.039525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1877;QD=14.3141;RBI=0.0511071;REFB=-0.00562217;REVB=-0.0323992;RO=39;SAF=16;SAR=12;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867336;STB=0.549321;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00614282;OID=.;OPOS=11166713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:12:16:19:20:12:16:19:20 chr1 11167146 . G A 787.51 PASS AF=0.560606;AO=74;DP=132;FAO=74;FDP=132;FR=.;FRO=58;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0182119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4654;QD=23.8639;RBI=0.01894;REFB=-0.0157373;REVB=0.00520098;RO=58;SAF=34;SAR=40;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115495;STB=0.563019;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.015138;OID=.;OPOS=11167146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:58:58:74:74:0.560606:40:34:35:23:40:34:35:23 chr1 11171226 . C T 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00373573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.7855;QD=11.4394;RBI=0.0366379;REFB=-0.0226609;REVB=-0.0364469;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244315;STB=0.646728;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00936522;OID=.;OPOS=11171226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:6:8:3:6:6:8 chr1 11181327 . C T 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.000834452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.08;QD=21.0647;RBI=0.0183816;REFB=0.00209807;REVB=-0.0183626;RO=23;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106374;STB=0.576855;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.00190252;OID=.;OPOS=11181327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:24:24:24:0.5:18:6:8:15:18:6:9:15 chr1 11190646 . G A 885.25 PASS AF=0.6875;AO=77;DP=112;FAO=77;FDP=112;FR=.;FRO=35;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0432873;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0865;QD=31.6162;RBI=0.0602299;REFB=-0.0424163;REVB=0.041879;RO=35;SAF=40;SAR=37;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857938;STB=0.546158;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0132442;OID=.;OPOS=11190646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:35:35:77:77:0.6875:37:40:13:22:37:40:13:22 chr1 11212458 . A G 210.71 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=2.53289e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.398;QD=19.1557;RBI=0.00162148;REFB=-0.0105785;REVB=0.00162128;RO=23;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771839;STB=0.543583;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0145512;OID=.;OPOS=11212458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:9:12:15:8:9:12:15:8 chr1 11255008 . T C 232.91 PASS AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00338652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.948;QD=17.5777;RBI=0.0215055;REFB=-0.0114913;REVB=0.0212372;RO=27;SAF=18;SAR=7;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184409;STB=0.506844;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0188927;OID=.;OPOS=11255008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:27:27:25:26:0.490566:7:18:19:8:8:18:19:8 chr1 11288758 . G A 157.74 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0101198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.71;QD=11.2669;RBI=0.0212684;REFB=0.00937022;REVB=-0.0187065;RO=36;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246454;STB=0.514374;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.0163079;OID=.;OPOS=11288758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:9:11:19:17:9:11:19:17 chr1 11301714 . A G 524.43 PASS AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.021845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.135;QD=21.4052;RBI=0.0310002;REFB=-0.00975515;REVB=-0.0219957;RO=48;SAF=17;SAR=33;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185571;STB=0.602762;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00684868;OID=.;OPOS=11301714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:33:17:26:22:33:17:26:22 chr1 11561593 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.468;QD=33.4285;RBI=0.0214545;REFB=0;REVB=0.00645868;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011196;OID=.;OPOS=11561593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr1 11579470 . G A 1283.28 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00778779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.463;QD=61.845;RBI=0.0380846;REFB=0;REVB=0.0372798;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.4198e-05;OID=.;OPOS=11579470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:48:35:0:0:48:35:0:0 chr1 11710561 . T G 287.96 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0164502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.552;QD=25.0399;RBI=0.0235972;REFB=-0.0446359;REVB=0.016918;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276951;STB=0.653728;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.019621;OID=.;OPOS=11710561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:9:17:6:14:9:17:6:14 chr1 11771988 . A G 164.4 PASS AF=0.395349;AO=14;DP=42;FAO=17;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0213159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=75.7341;QD=15.2933;RBI=0.0410885;REFB=-0.088041;REVB=-0.0351269;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151154;STB=0.542324;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0580685;OID=.;OPOS=11771988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:18:25:14:17:0.395349:9:5:4:14:9:8:10:15 chr1 11810674 . G A 322.87 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0299227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.352;QD=19.276;RBI=0.0535593;REFB=-0.0217638;REVB=0.0444211;RO=31;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17234;STB=0.609692;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0269971;OID=.;OPOS=11810674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:33:34:34:0.507463:14:20:12:19:14:20:12:21 chr1 11810691 . C T 362.62 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00807368;FXX=0.0270234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.7365;QD=20.1456;RBI=0.0155999;REFB=-0.0202682;REVB=-0.0133482;RO=34;SAF=18;SAR=19;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647479;STB=0.528202;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0185148;OID=.;OPOS=11810691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:34:35:37:37:0.513889:19:18:14:20:19:18:15:20 chr1 11810765 . T A 1455.56 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284884;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.013;QD=63.2851;RBI=0.0299601;REFB=0;REVB=-0.00927462;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2549e-05;OID=.;OPOS=11810765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0 chr1 11810844 . A G 293.61 PASS AF=0.525424;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0120379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.106;QD=19.9055;RBI=0.0176312;REFB=-0.0146918;REVB=0.0128821;RO=27;SAF=14;SAR=16;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147809;STB=0.577509;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0117159;OID=.;OPOS=11810844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:27:28:30:31:0.525424:16:14:8:19:16:15:9:19 chr1 11826630 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324506;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=320.496;QD=53.9112;RBI=0.0325237;REFB=0;REVB=0.00217914;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40872e-05;OID=.;OPOS=11826630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0 chr1 11827304 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00741521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.624;QD=35.5752;RBI=0.0271628;REFB=0;REVB=0.0261311;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172636;OID=.;OPOS=11827304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr1 11828238 . G A 175.91 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.899;QD=46.9092;RBI=0.0328441;REFB=0;REVB=-0.00220621;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141158;OID=.;OPOS=11828238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:7:7:0:0:7:8:0:0 chr1 11828319 . G A 369.73 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0342866;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.363;QD=52.818;RBI=0.0482016;REFB=-0.172707;REVB=0.0338796;RO=1;SAF=16;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281787;STB=0.51514;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00185534;OID=.;OPOS=11828319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:29:28:1:1:27:27:0.964286:11:16:1:0:11:16:1:0 chr1 11831615 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.657;QD=56.9569;RBI=0.022331;REFB=0;REVB=0.0220879;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116742;OID=.;OPOS=11831615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0 chr1 11832311 . G C 785.73 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9339;QD=64.1415;RBI=0.0873043;REFB=0;REVB=0.0770552;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000998029;OID=.;OPOS=11832311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0 chr1 11836628 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.63;QD=61.3363;RBI=0.0439609;REFB=0;REVB=0.0396128;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014442;OID=.;OPOS=11836628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr1 11836682 . C T 375.64 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0005;QD=55.6499;RBI=0.0414228;REFB=0;REVB=0.0223955;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049226;OID=.;OPOS=11836682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0 chr1 11838848 . G T 1047.68 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317859;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.547;QD=59.8673;RBI=0.0474085;REFB=0;REVB=0.0351742;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243223;OID=.;OPOS=11838848;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:28:41:0:0:29:41:0:0 chr1 11839966 . G A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0851116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.692;QD=62.3505;RBI=0.0889845;REFB=0;REVB=0.0259663;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000493302;OID=.;OPOS=11839966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr1 11839998 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00264431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.748;QD=62.0215;RBI=0.0509895;REFB=0;REVB=0.0509209;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130226;OID=.;OPOS=11839998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr1 11844330 . C T 1492.49 PASS AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.763;QD=58.529;RBI=0.016629;REFB=0.00255333;REVB=0.00344737;RO=0;SAF=43;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-1.89071e-05;OID=.;OPOS=11844330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:102:0:1:101:101:0.990196:58:43:0:0:58:43:0:1 chr1 11849447 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.762;QD=62.3504;RBI=0.0216576;REFB=0;REVB=0.0126806;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15385e-05;OID=.;OPOS=11849447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0 chr1 11854457 . G A 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.4;QD=57.2374;RBI=0.0572291;REFB=0;REVB=-0.05715;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122565;OID=.;OPOS=11854457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0 chr1 11856378 . G A 608.24 PASS AF=0.6625;AO=53;DP=80;FAO=53;FDP=80;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0159803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.64;QD=30.4118;RBI=0.0161508;REFB=-0.0124848;REVB=-0.00234057;RO=26;SAF=24;SAR=29;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00533719;STB=0.502856;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00898573;OID=.;OPOS=11856378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:26:27:53:53:0.6625:29:24:12:14:29:24:12:15 chr1 11880460 . C A 327.91 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.044317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.246;QD=20.4947;RBI=0.0463172;REFB=-0.00577541;REVB=-0.0134641;RO=30;SAF=15;SAR=19;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214142;STB=0.617752;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0129547;OID=.;OPOS=11880460;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:19:15:6:24:19:15:6:24 chr1 11884554 . GA G,GG 388.68 PASS AF=0.0357143,0.964286;AO=3,25;DP=28;FAO=1,27;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=1,18;FSAR=0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569056,-0.00273758;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=250.488,268.663;QD=55.5253;RBI=0.0392981,0.0340859;REFB=0,0;REVB=0.0388839,0.0339758;RO=0;SAF=2,17;SAR=1,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.033857,0.00249555;OID=.,.;OPOS=11884555,11884555;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0357143,0.964286:3,25:28:1,27:28:0:1,18:0,9:0:0:4:0:2,17:1,8:0:0 chr1 11968216 . G A 163.75 PASS AF=0.367347;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0441047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.65;QD=13.3676;RBI=0.0442312;REFB=-0.0128253;REVB=0.00334244;RO=30;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121217;STB=0.581518;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0189242;OID=.;OPOS=11968216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:30:31:18:18:0.367347:11:7:15:15:11:7:16:15 chr1 11968235 . T C 148.63 PASS AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0118137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.668;QD=10.8096;RBI=0.0123932;REFB=-0.000924602;REVB=0.00374542;RO=34;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225486;STB=0.533945;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00491915;OID=.;OPOS=11968235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:36:19:19:0.345455:11:8:15:19:11:8:17:19 chr1 11968273 . A G 131.33 PASS AF=0.305085;AO=18;DP=57;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0277992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9924;QD=8.90395;RBI=0.0577374;REFB=0.000876229;REVB=0.0506044;RO=39;SAF=8;SAR=10;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494724;STB=0.530269;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=-0.00125606;OID=.;OPOS=11968273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:39:41:18:18:0.305085:10:8:19:20:10:8:20:21 chr1 11969917 . A G 137.96 PASS AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0501434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.693;QD=29.044;RBI=0.0625503;REFB=-0.0321232;REVB=0.0373921;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471926;STB=0.526278;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0173848;OID=.;OPOS=11969917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:7:7:3:2:7:7:3:2 chr1 12009956 . G A 834.38 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8175;QD=57.5437;RBI=0.0674432;REFB=0;REVB=0.0653269;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000555967;OID=.;OPOS=12009956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:34:24:0:0:34:24:0:0 chr1 12010469 . G T 389.22 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=0.0114727;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.309;QD=16.0502;RBI=0.0127885;REFB=-0.003153;REVB=0.00565007;RO=56;SAF=21;SAR=20;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177042;STB=0.599352;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00323604;OID=.;OPOS=12010469;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:56:56:41:41:0.42268:20:21:19:37:20:21:19:37 chr1 12024235 . C T 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0040961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3495;QD=19.6471;RBI=0.00410291;REFB=-0.00461777;REVB=-0.000236232;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335209;STB=0.519196;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00288215;OID=.;OPOS=12024235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:5:6:4:4:5:6:4:4 chr1 12081851 . TG T 40.49 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.133853;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.2834;QD=6.74888;RBI=0.165181;REFB=-0.0378491;REVB=-0.0967886;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.34058;SSSB=0.0795555;STB=0.779333;STBP=0.065;TYPE=del;VARB=0.0209899;OID=.;OPOS=12081852;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:7:24:8:24:16:6:2:5:11:40:14:3:4:5:9 chr1 12082290 . C T 440.91 PASS AF=0.714286;AO=34;DP=48;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0511099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.688;QD=35.9925;RBI=0.0549566;REFB=-0.0203349;REVB=-0.0201993;RO=14;SAF=18;SAR=16;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179103;STB=0.591835;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.011325;OID=.;OPOS=12082290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:14:14:34:35:0.714286:16:18:12:2:16:19:12:2 chr1 12164437 . C T 290.99 PASS AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0131437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.607;QD=14.3697;RBI=0.0181413;REFB=-0.0244266;REVB=0.012504;RO=47;SAF=17;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173874;STB=0.515733;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0357067;OID=.;OPOS=12164437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:48:33:33:0.407407:16:17:25:22:16:17:26:22 chr1 12175729 . C T 696.44 PASS AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.030201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.916;QD=56.8519;RBI=0.0336275;REFB=-0.105584;REVB=0.0147889;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.512929;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00117925;OID=.;OPOS=12175729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:49:49:0:3:46:46:0.938776:21:25:0:0:21:25:1:2 chr1 12186058 . A G 91.46 PASS AF=0.27907;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00270837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.112;QD=8.50799;RBI=0.0248853;REFB=-0.019996;REVB=-0.0247375;RO=31;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182844;STB=0.61271;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0489975;OID=.;OPOS=12186058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:43:43:31:31:12:12:0.27907:8:4:15:16:8:4:15:16 chr1 12198297 . T C 994.58 PASS AF=0.435685;AO=105;DP=245;FAO=105;FDP=241;FR=.;FRO=136;FSAF=30;FSAR=75;FSRF=48;FSRR=88;FWDB=-0.0178612;FXX=0.0163259;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.997;QD=16.5075;RBI=0.0357929;REFB=-0.0462362;REVB=-0.0310179;RO=135;SAF=30;SAR=75;SRF=47;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744211;STB=0.544684;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0565192;OID=.;OPOS=12198297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:241:135:136:105:105:0.435685:75:30:47:88:75:30:48:88 chr1 12198362 . C A 1086.99 PASS AF=0.529703;AO=107;DP=201;FAO=107;FDP=202;FR=.;FRO=95;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=35;FSRR=60;FWDB=0.0402624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5022;QD=21.5245;RBI=0.0407572;REFB=-0.0121336;REVB=0.00633192;RO=93;SAF=45;SAR=62;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580352;STB=0.525354;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0108638;OID=.;OPOS=12198362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:93:95:107:107:0.529703:62:45:33:60:62:45:35:60 chr1 12251808 . T G 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0050525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.98;QD=14.3343;RBI=0.00803529;REFB=-0.0185402;REVB=0.00624805;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322491;STB=0.689242;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0245303;OID=.;OPOS=12251808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:7:3:6:3:7:3 chr1 12401868 . A C 1048.66 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.864;QD=58.259;RBI=0.080811;REFB=0;REVB=0.0459386;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209529;OID=.;OPOS=12401868;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:62:72:0:0:62:72:1:32:30:0:0:32:40:0:0 chr1 12638964 . T C 213.5 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0434753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.186;QD=16.1132;RBI=0.0600568;REFB=-0.00064008;REVB=-0.0414333;RO=29;SAF=8;SAR=16;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025233;STB=0.514274;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.000950315;OID=.;OPOS=12638964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:16:8:9:20:16:8:9:20 chr1 12639168 . A G 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00225898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.78;QD=12.0157;RBI=0.0220388;REFB=-0.00258311;REVB=0.0219227;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439131;STB=0.761136;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0054477;OID=.;OPOS=12639168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:6:1:4:2:6:1 chr1 12776344 . A T 671.78 PASS AF=0.592593;AO=64;DP=108;FAO=64;FDP=108;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.00771928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.394;QD=24.8809;RBI=0.0319763;REFB=-0.0271791;REVB=0.0310306;RO=43;SAF=33;SAR=31;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100628;STB=0.549375;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0212567;OID=.;OPOS=12776344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:43:44:64:64:0.592593:31:33:28:15:31:33:28:16 chr1 12779560 . T C 1359.28 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.408;QD=62.4956;RBI=0.0349941;REFB=0;REVB=0.0348953;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.86824e-05;OID=.;OPOS=12779560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:42:44:0:0:42:45:0:0 chr1 12779618 . T C 1753.34 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.451;QD=60.4602;RBI=0.0416914;REFB=0;REVB=0.0124116;RO=0;SAF=55;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.39825e-05;OID=.;OPOS=12779618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:108:116:0:0:108:116:1:53:55:0:0:53:63:0:0 chr1 12785493 . TG T,TT 621.64 PASS AF=0.658537,0.341463;AO=20,20;DP=40;FAO=27,14;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16,8;FSAR=11,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0047283,-0.00457459;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.291,182.686;QD=60.6475;RBI=0.015933,0.0126308;REFB=0,0;REVB=0.0152152,0.0117732;RO=0;SAF=11,12;SAR=9,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.0487e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0191311,0.0216503;OID=.,.;OPOS=12785494,12785494;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.658537,0.341463:20,20:40:27,14:41:0:16,8:11,6:0:0:41:0:11,12:9,8:0:0 chr1 12799736 . C T 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.741;QD=62.1617;RBI=0.0428193;REFB=0;REVB=-0.00611075;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103507;OID=.;OPOS=12799736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0 chr1 12820870 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.229;QD=58.5878;RBI=0.0439419;REFB=0;REVB=0.0330688;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152935;OID=.;OPOS=12820870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:18:14:0:0:18:15:0:0 chr1 12835868 . T C 1770.85 PASS AF=1;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176155;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.705;QD=61.0636;RBI=0.0397971;REFB=0;REVB=0.0356862;RO=0;SAF=54;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52607e-05;OID=.;OPOS=12835868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:116:0:0:116:116:1:62:54:0:0:62:54:0:0 chr1 12837634 . T A 2403.23 PASS AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4256;QD=61.2288;RBI=0.0616878;REFB=0;REVB=-0.0544045;RO=0;SAF=70;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000324143;OID=.;OPOS=12837634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:87:70:0:0:87:70:0:0 chr1 12853403 . A C 48.56 PASS AF=0.173913;AO=7;DP=45;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.032349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6555;QD=4.22296;RBI=0.057977;REFB=-0.0110827;REVB=0.0481132;RO=38;SAF=4;SAR=3;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117188;STB=0.624688;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.100013;OID=.;OPOS=12853403;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:45:46:38:38:7:8:0.173913:3:4:18:20:3:5:18:20 chr1 12854428 . C T 188.88 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.00593748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.421;QD=11.1105;RBI=0.0213285;REFB=0.00485419;REVB=0.0204854;RO=44;SAF=15;SAR=9;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066055;STB=0.538429;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.0104706;OID=.;OPOS=12854428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:9:15:25:19:9:15:25:19 chr1 12854530 . C G 516.17 PASS AF=0.676471;AO=46;DP=69;FAO=46;FDP=68;FR=.;FRO=22;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=22;FWDB=-0.0149976;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.092;QD=30.363;RBI=0.0474673;REFB=-0.0147372;REVB=0.0450357;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.719907;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0067866;OID=.;OPOS=12854530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:0:22:46:46:0.676471:14:32:0:0:14:32:0:22 chr1 12854544 . T C 114.89 PASS AF=0.225;AO=18;DP=80;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0310812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.956;QD=5.74423;RBI=0.031082;REFB=-0.0114367;REVB=0.00021147;RO=62;SAF=8;SAR=10;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492536;STB=0.530692;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0583452;OID=.;OPOS=12854544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:62:62:18:18:0.225:10:8:30:32:10:8:30:32 chr1 12855835 . C G 183.09 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3055;QD=45.7729;RBI=0.161983;REFB=0;REVB=0.0908666;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01477;OID=.;OPOS=12855835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:14:16:1:9:5:0:0:11:5:0:0 chr1 12855845 . G C 191.25 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.075998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.1;QD=47.8123;RBI=0.0787902;REFB=0;REVB=0.0207895;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000468248;OID=.;OPOS=12855845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr1 12887549 . T C 1409.5 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2398;QD=62.6444;RBI=0.0378738;REFB=0;REVB=-0.015437;RO=0;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000329646;OID=.;OPOS=12887549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:39:50:0:0:39:51:0:0 chr1 12888601 . G GC 158.23 PASS AF=0.95;AO=13;DP=22;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.294458;FXX=0.0475964;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8811;QD=31.6468;RBI=0.297658;REFB=-0.0599391;REVB=-0.0435299;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203205;STB=0.529381;STBP=0.288;TYPE=ins;VARB=0.0277032;OID=.;OPOS=12888602;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.95:13:22:19:20:1:11:8:0:1:5:9:5:8:6:3 chr1 12907282 . G C 35.2 PASS AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0929812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8403;QD=5.21552;RBI=0.094115;REFB=-0.023171;REVB=0.0145647;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197729;STB=0.629227;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0167445;OID=.;OPOS=12907282;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:14:7:3:3:14:7 chr1 12907284 . TG CC 35.21 PASS AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00663807;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=258.876;QD=5.21556;RBI=0.0101263;REFB=-0.0120951;REVB=0.00764704;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197729;STB=0.629227;STBP=0.545;TYPE=mnp;VARB=0.059048;OID=.;OPOS=12907284;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:14:7:3:3:14:7 chr1 12907379 . T C 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00977192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.793;QD=16.8738;RBI=0.0196718;REFB=-0.00216747;REVB=-0.0170731;RO=26;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760636;STB=0.543435;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00329145;OID=.;OPOS=12907379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:10:10:15:11:10:10:15:11 chr1 12907777 . T C 65.36 PASS AF=0.112676;AO=16;DP=143;FAO=16;FDP=142;FR=.;FRO=126;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=80;FWDB=0.000528072;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9677;QD=1.84116;RBI=0.057283;REFB=0.00450649;REVB=0.0572805;RO=126;SAF=11;SAR=5;SRF=45;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387397;STB=0.766096;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.0304898;OID=.;OPOS=12907777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:143:142:126:126:16:16:0.112676:5:11:45:81:5:11:46:80 chr1 12907781 . T C 93.64 PASS AF=0.136054;AO=21;DP=147;FAO=20;FDP=147;FR=.;FRO=127;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=82;FWDB=-0.000349144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.14;QD=2.54815;RBI=0.0394738;REFB=-0.00144965;REVB=-0.0394722;RO=126;SAF=12;SAR=9;SRF=45;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267915;STB=0.702941;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00835309;OID=.;OPOS=12907781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:147:147:126:127:21:20:0.136054:9:12:45:81:8:12:45:82 chr1 12907798 . A C 163.37 PASS AF=0.186667;AO=28;DP=149;FAO=28;FDP=150;FR=.;FRO=122;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=82;FWDB=-0.0257666;FXX=0.00662208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.675;QD=4.35664;RBI=0.0259163;REFB=-0.00408725;REVB=-0.00278133;RO=120;SAF=19;SAR=9;SRF=40;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420702;STB=0.764876;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0168407;OID=.;OPOS=12907798;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:120:122:28:28:0.186667:9:19:40:80:9:19:40:82 chr1 12907802 . CC TT 164.03 PASS AF=0.189189;AO=28;DP=148;FAO=28;FDP=148;FR=.;FRO=120;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=78;FWDB=-0.0237718;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=213.168;QD=4.43335;RBI=0.0240468;REFB=-0.00399566;REVB=-0.00362613;RO=119;SAF=19;SAR=9;SRF=41;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408362;STB=0.750518;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.0200044;OID=.;OPOS=12907802;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:119:120:28:28:0.189189:9:19:41:78:9:19:42:78 chr1 12907837 . C T 297.81 PASS AF=0.27451;AO=42;DP=153;FAO=42;FDP=153;FR=.;FRO=111;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=45;FSRR=66;FWDB=-0.00365018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.898;QD=7.78592;RBI=0.0200541;REFB=-0.00599658;REVB=-0.0197191;RO=111;SAF=25;SAR=17;SRF=45;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229559;STB=0.635465;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0159264;OID=.;OPOS=12907837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:111:111:42:42:0.27451:17:25:45:66:17:25:45:66 chr1 12907885 . T C 828.45 PASS AF=0.535948;AO=82;DP=153;FAO=82;FDP=153;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.0123695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.127;QD=21.6589;RBI=0.0125424;REFB=-0.00446117;REVB=-0.00207489;RO=70;SAF=42;SAR=40;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583215;STB=0.535023;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00368334;OID=.;OPOS=12907885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:70:71:82:82:0.535948:40:42:31:39:40:42:31:40 chr1 12918963 . G T 388.06 PASS AF=0.420561;AO=44;DP=108;FAO=45;FDP=107;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0231605;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.99;QD=14.5071;RBI=0.0239067;REFB=-0.0201488;REVB=-0.00592633;RO=61;SAF=23;SAR=21;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116089;STB=0.565728;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0265376;OID=.;OPOS=12918963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:61:62:44:45:0.420561:21:23:25:36:21:24:26:36 chr1 12919064 . T G 376.96 PASS AF=0.493671;AO=38;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0411386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.07;QD=19.0865;RBI=0.0418486;REFB=-0.0216102;REVB=0.00767585;RO=40;SAF=18;SAR=20;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210362;STB=0.609509;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0168179;OID=.;OPOS=12919064;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:38:39:0.493671:20:18:10:30:21:18:10:30 chr1 12919079 . C G 290.29 PASS AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.00409423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.005;QD=16.588;RBI=0.00571214;REFB=-0.00740106;REVB=0.00398319;RO=38;SAF=17;SAR=14;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32525;STB=0.685016;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00501152;OID=.;OPOS=12919079;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:38:38:31:32:0.457143:14:17:8:30:14:18:8:30 chr1 12919928 . A G 370.37 PASS AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0175901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.078;QD=14.8149;RBI=0.0384114;REFB=0.00662985;REVB=-0.0341471;RO=59;SAF=21;SAR=19;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124014;STB=0.564709;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.0125145;OID=.;OPOS=12919928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:59:60:40:40:0.4:19:21:24:35:19:21:25:35 chr1 12919934 . A G 346.06 PASS AF=0.395833;AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.0215027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0606;QD=14.419;RBI=0.0258706;REFB=0.00600355;REVB=0.0143847;RO=58;SAF=21;SAR=17;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128849;STB=0.573106;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00884131;OID=.;OPOS=12919934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:58:58:38:38:0.395833:17:21:25:33:17:21:25:33 chr1 12919963 . T G 346.88 PASS AF=0.4;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.01522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1933;QD=14.6055;RBI=0.0174868;REFB=-0.00693444;REVB=0.00861031;RO=56;SAF=20;SAR=18;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464215;STB=0.521053;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00882175;OID=.;OPOS=12919963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:56:57:38:38:0.4:18:20:27:29:18:20:28:29 chr1 12920067 . C G 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00571863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.868;QD=13.4591;RBI=0.0205722;REFB=-0.00720051;REVB=-0.0197614;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100129;STB=0.558211;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0104555;OID=.;OPOS=12920067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:9:17:9:7:9:17 chr1 12921110 . A G 205.15 PASS AF=0.42;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00982455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.473;QD=16.4122;RBI=0.0112969;REFB=-0.0035454;REVB=-0.00557652;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177121;STB=0.610066;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.014519;OID=.;OPOS=12921110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:28:29:21:21:0.42:9:12:11:17:9:12:11:18 chr1 12921127 . A G 205.33 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00111986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.597;QD=14.6667;RBI=0.0204363;REFB=-0.000795077;REVB=0.0204056;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850273;STB=0.548299;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000754922;OID=.;OPOS=12921127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:13:11:12:20:13:11:12:20 chr1 12921132 . A G 215.36 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.000223048;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.497;QD=14.8522;RBI=0.00207998;REFB=-0.0149676;REVB=-0.00206799;RO=35;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112036;STB=0.549198;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.015487;OID=.;OPOS=12921132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:58:35:33:25:25:0.431034:13:12:13:22:13:12:13:20 chr1 12921332 . TG CA 249.19 PASS AF=0.575;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0154228;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.226;QD=24.9191;RBI=0.0154869;REFB=-0.0408287;REVB=0.00140856;RO=17;SAF=14;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624999;STB=0.534801;STBP=0.611;TYPE=mnp;VARB=0.0279481;OID=.;OPOS=12921332;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:17:17:23:23:0.575:9:14:9:8:9:14:9:8 chr1 13001312 . C G 229.25 PASS AF=0.677419;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0413488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.735;QD=29.5805;RBI=0.0414152;REFB=0.00459053;REVB=-0.00234404;RO=10;SAF=7;SAR=14;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163882;STB=0.589665;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.00224265;OID=.;OPOS=13001312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:10:10:21:21:0.677419:14:7:1:9:14:7:1:9 chr1 13052789 . G A 274.47 PASS AF=0.273381;AO=38;DP=139;FAO=38;FDP=139;FR=.;FRO=101;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=-0.0261528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2779;QD=7.89839;RBI=0.0269946;REFB=-0.0264263;REVB=-0.00668845;RO=96;SAF=22;SAR=16;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1088;STB=0.582408;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0300019;OID=.;OPOS=13052789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:96:101:38:38:0.273381:16:22:47:49:16:22:47:54 chr1 13052871 . C T 399.44 PASS AF=0.284211;AO=53;DP=189;FAO=54;FDP=190;FR=.;FRO=136;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=61;FSRR=75;FWDB=-0.00445802;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.658;QD=8.40928;RBI=0.0118352;REFB=-0.00875296;REVB=-0.0109634;RO=136;SAF=24;SAR=29;SRF=61;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00530711;STB=0.502957;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0215257;OID=.;OPOS=13052871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:136:136:53:54:0.284211:29:24:61:75:30:24:61:75 chr1 13052907 . T C 1700.21 PASS AF=0.719577;AO=136;DP=192;FAO=136;FDP=189;FR=.;FRO=53;FSAF=59;FSAR=77;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0154563;FXX=0.0156242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.116;QD=35.9832;RBI=0.0154749;REFB=-0.0323946;REVB=-0.000758234;RO=55;SAF=59;SAR=77;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212482;STB=0.505416;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0144471;OID=.;OPOS=13052907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:189:55:53:136:136:0.719577:77:59:26:29:77:59:24:29 chr1 13183225 . T C 33.05 PASS AF=0.107692;AO=7;DP=65;FAO=7;FDP=65;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0251415;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.51;QD=2.03399;RBI=0.0259163;REFB=-0.00553097;REVB=-0.0062898;RO=58;SAF=4;SAR=3;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142276;STB=0.608391;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0301885;OID=.;OPOS=13183225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:65:65:58:58:7:7:0.107692:3:4:26:32:3:4:26:32 chr1 13183237 . CT TC 45.9 PASS AF=0.145455;AO=8;DP=55;FAO=8;FDP=55;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0486133;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=53.1165;QD=3.33804;RBI=0.0491012;REFB=-0.0153469;REVB=-0.00690479;RO=45;SAF=4;SAR=4;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149989;STB=0.581619;STBP=0.716;TYPE=mnp;VARB=0.0797489;OID=.;OPOS=13183237;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:55:55:45:47:8:8:0.145455:4:4:17:28:4:4:19:28 chr1 13183243 . T C 47.8 PASS AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0310342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.986;QD=3.67723;RBI=0.0355252;REFB=-0.00930893;REVB=0.0172892;RO=44;SAF=4;SAR=4;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111007;STB=0.576736;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0438642;OID=.;OPOS=13183243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:52:52:44:44:8:8:0.153846:4:4:18:26:4:4:18:26 chr1 13183248 . TC AA 49.06 PASS AF=0.163265;AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0383556;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.334;QD=4.00458;RBI=0.0396808;REFB=-0.0086079;REVB=0.0101692;RO=41;SAF=4;SAR=4;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104252;STB=0.571254;STBP=0.683;TYPE=mnp;VARB=0.0366288;OID=.;OPOS=13183248;OREF=TC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:49:49:41:41:8:8:0.163265:4:4:17:24:4:4:17:24 chr1 13183439 . T C 1742.59 PASS AF=0.72;AO=144;DP=201;FAO=144;FDP=200;FR=.;FRO=56;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.00570945;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.136;QD=34.8518;RBI=0.00871082;REFB=-0.00253886;REVB=0.0065788;RO=56;SAF=66;SAR=78;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441575;STB=0.523586;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00113205;OID=.;OPOS=13183439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:56:56:144:144:0.72:78:66:21:35:78:66:21:35 chr1 13183511 . T C 315.48 PASS AF=0.237624;AO=48;DP=202;FAO=48;FDP=202;FR=.;FRO=154;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=72;FSRR=82;FWDB=0.00891849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.244;QD=6.2472;RBI=0.0268394;REFB=-0.00685833;REVB=-0.0253143;RO=153;SAF=18;SAR=30;SRF=72;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123426;STB=0.572488;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0216636;OID=.;OPOS=13183511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:153:154:48:48:0.237624:30:18:72:81:30:18:72:82 chr1 13183528 . A C 233.18 PASS AF=0.203125;AO=39;DP=189;FAO=39;FDP=192;FR=.;FRO=153;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=69;FSRR=84;FWDB=-0.0293683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.421;QD=4.85798;RBI=0.0326277;REFB=-0.00501258;REVB=-0.014215;RO=150;SAF=16;SAR=23;SRF=68;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056122;STB=0.533116;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0237469;OID=.;OPOS=13183528;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:192:150:153:39:39:0.203125:23:16:68:82:23:16:69:84 chr1 13183532 . CC TT 198.09 PASS AF=0.190217;AO=35;DP=184;FAO=35;FDP=184;FR=.;FRO=149;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=65;FSRR=84;FWDB=-0.0297586;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=202.846;QD=4.30629;RBI=0.0309215;REFB=-0.00399146;REVB=-0.00840034;RO=148;SAF=15;SAR=20;SRF=65;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138616;STB=0.506326;STBP=0.947;TYPE=mnp;VARB=0.0189318;OID=.;OPOS=13183532;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:148:149:35:35:0.190217:20:15:65:83:20:15:65:84 chr1 13183567 . C T 51.34 PASS AF=0.0972222;AO=14;DP=144;FAO=14;FDP=144;FR=.;FRO=130;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=78;FWDB=-0.036827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.335;QD=1.42616;RBI=0.0430808;REFB=-0.00730245;REVB=-0.0223546;RO=130;SAF=7;SAR=7;SRF=52;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119677;STB=0.590153;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0609414;OID=.;OPOS=13183567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:144:144:130:130:14:14:0.0972222:7:7:52:78:7:7:52:78 chr1 13183573 . G T 43.68 PASS AF=0.0923077;AO=12;DP=131;FAO=12;FDP=130;FR=.;FRO=118;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=70;FWDB=0.00830164;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.991;QD=1.3441;RBI=0.0114979;REFB=-0.00140608;REVB=-0.00795511;RO=118;SAF=6;SAR=6;SRF=48;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109584;STB=0.584479;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0092347;OID=.;OPOS=13183573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:131:130:118:118:12:12:0.0923077:6:6:48:70:6:6:48:70 chr1 13219048 . T G 130.68 PASS AF=1;AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5784;QD=43.5595;RBI=0.0182815;REFB=0;REVB=0.015044;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142024;OID=.;OPOS=13219048;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:10:12:1:5:5:0:0:7:5:0:0 chr1 13448283 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.731;QD=46.848;RBI=0.0381938;REFB=0;REVB=0.0368545;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002934;OID=.;OPOS=13448283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr1 13448351 . T C 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1321;QD=40.7598;RBI=0.0272531;REFB=0;REVB=-0.0162177;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277822;OID=.;OPOS=13448351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr1 13695787 . C G 339.81 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109247;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.408;QD=54.3694;RBI=0.0172206;REFB=0;REVB=0.0133116;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245726;OID=.;OPOS=13695787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr1 13695816 . G A 559.01 PASS AF=1;AO=33;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.959;QD=60.4334;RBI=0.0450042;REFB=0;REVB=0.0252801;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450609;OID=.;OPOS=13695816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:33:37:1:17:16:0:0:21:16:0:0 chr1 13802325 . T C 1491.7 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.8;QD=63.4766;RBI=0.0677726;REFB=0;REVB=0.00165673;RO=0;SAF=58;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103968;OID=.;OPOS=13802325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:36:58:0:0:36:58:0:0 chr1 13802437 . G A 411.05 PASS AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.000695792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.727;QD=23.8289;RBI=0.00244809;REFB=-0.0141533;REVB=0.00234713;RO=29;SAF=24;SAR=16;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109652;STB=0.506021;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0122284;OID=.;OPOS=13802437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:16:24:17:12:16:24:17:12 chr1 13910417 . C T 440.17 PASS AF=0.640625;AO=42;DP=65;FAO=41;FDP=64;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.00616972;FXX=0.0153822;HRUN=7;LEN=1;MLLD=210.308;QD=27.5105;RBI=0.00759191;REFB=-0.00533699;REVB=-0.00442399;RO=23;SAF=8;SAR=34;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277725;STB=0.512539;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0027615;OID=.;OPOS=13910417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:23:23:42:41:0.640625:34:8:5:18:33:8:5:18 chr1 13940864 . C G 1804.16 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00850668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.077;QD=61.1578;RBI=0.0119844;REFB=0;REVB=0.0084417;RO=0;SAF=48;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26157e-08;OID=.;OPOS=13940864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:70:48:0:0:70:48:0:0 chr1 13944236 . C CTT,T 584.52 PASS AF=0.974359,0.025641;AO=34,3;DP=40;FAO=38,1;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27,1;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00477274,-0.00438948;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=46.328,182.576;QD=59.9504;RBI=0.0447759,0.00447896;REFB=0,0;REVB=0.0445209,-0.000890846;RO=2;SAF=23,3;SAR=11,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0389367,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00495386,-0.0390624;OID=.,.;OPOS=13944237,13944236;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:40:39:2:0:34,3:38,1:0.974359,0.025641:11,0:23,3:2:0:11,0:27,1:0:0 chr1 14106394 . A ACTC 254.09 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00797673;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=3;MLLD=214.89;QD=17.5237;RBI=0.00864509;REFB=-0.0299839;REVB=-0.00333307;RO=32;SAF=16;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068273;STB=0.554416;STBP=0.455;TYPE=ins;VARB=0.0262809;OID=.;OPOS=14106395;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=ACTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.482759:28:60:28:58:30:16:12:14:16:99:32:16:12:16:16 chr1 14143003 . A G 1081.12 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.663;QD=60.0621;RBI=0.0191424;REFB=0;REVB=0.00208188;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45094e-05;OID=.;OPOS=14143003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:34:36:0:0:34:38:0:0 chr1 14149622 . T C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.597;QD=58.2395;RBI=0.0429713;REFB=0;REVB=0.0299477;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127249;OID=.;OPOS=14149622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0 chr1 14150709 . C T 2197.76 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571722;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.758;QD=63.245;RBI=0.0323366;REFB=0;REVB=0.0318272;RO=0;SAF=69;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56374e-05;OID=.;OPOS=14150709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:70:69:0:0:70:69:0:0 chr1 14150714 . G A 1902.8 PASS AF=0.955556;AO=128;DP=135;FAO=129;FDP=135;FR=.;FRO=6;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0515053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2909;QD=56.3794;RBI=0.109619;REFB=-0.143329;REVB=0.0967653;RO=4;SAF=66;SAR=62;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296703;STB=0.522724;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0146764;OID=.;OPOS=14150714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:135:135:4:6:128:129:0.955556:62:66:0:4:63:66:0:6 chr1 14150740 . G T 1943.07 PASS AF=1;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00547826;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.32;QD=61.1991;RBI=0.0183004;REFB=-0.112697;REVB=0.0174612;RO=0;SAF=60;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000660578;OID=.;OPOS=14150740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:128:127:0:0:126:127:1:66:60:0:0:67:60:0:0 chr1 14150992 . T C 1525.92 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00879438;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.742;QD=59.8399;RBI=0.0415976;REFB=0;REVB=0.0406573;RO=0;SAF=59;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94694e-05;OID=.;OPOS=14150992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:102:102:1:43:59:0:0:43:59:0:0 chr1 14450771 . G A 1024.73 PASS AF=0.972603;AO=69;DP=71;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0185676;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=171.483;QD=56.1497;RBI=0.018703;REFB=-0.0946671;REVB=0.0022463;RO=2;SAF=38;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242294;STB=0.512192;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00143937;OID=.;OPOS=14450771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:71:73:2:2:69:71:0.972603:31:38:2:0:31:40:2:0 chr1 15438990 . G A 1280.05 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0055433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.053;QD=61.689;RBI=0.0678204;REFB=0;REVB=0.0675934;RO=0;SAF=37;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274536;OID=.;OPOS=15438990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:46:37:0:0:46:37:0:0 chr1 15490865 . T A 511.52 PASS AF=0.482143;AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.0239891;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.257;QD=18.2684;RBI=0.0239916;REFB=-0.019412;REVB=-0.000350176;RO=58;SAF=31;SAR=23;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858941;STB=0.547649;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0192342;OID=.;OPOS=15490865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:58:58:54:54:0.482143:23:31:28:30:23:31:28:30 chr1 15497727 . T C 775.72 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.59;QD=63.324;RBI=0.0515328;REFB=0;REVB=0.000823699;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242715;OID=.;OPOS=15497727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:27:19:0:0:29:20:0:0 chr1 15541607 . T C 130.27 PASS AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0394365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.35;QD=9.30479;RBI=0.0504099;REFB=-0.0163294;REVB=-0.0313993;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173028;STB=0.593895;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0367108;OID=.;OPOS=15541607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:37:38:18:18:0.321429:7:11:17:20:7:11:18:20 chr1 15599021 . C T 178.7 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0209384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.143;QD=22.3381;RBI=0.0211619;REFB=0.0152109;REVB=0.00306755;RO=14;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0108222;OID=.;OPOS=15599021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:9:9:7:7:9:9:7:7 chr1 15599025 . G A 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0295156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.756;QD=15.9166;RBI=0.0406108;REFB=0.0125372;REVB=0.0278938;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664503;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.0118291;OID=.;OPOS=15599025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:7:6:8:7:7:6:8:7 chr1 15623214 . A G 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.00481914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.711;QD=13.0148;RBI=0.00592169;REFB=-0.00465575;REVB=0.00344126;RO=32;SAF=7;SAR=13;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348881;STB=0.700552;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00585021;OID=.;OPOS=15623214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:13:7:22:10:13:7:22:10 chr1 15627776 . G A 171.27 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0920581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8864;QD=12.4557;RBI=0.092601;REFB=-0.000735683;REVB=-0.0100127;RO=31;SAF=6;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314893;STB=0.706608;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00156101;OID=.;OPOS=15627776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:34:21:21:0.381818:15:6:18:13:15:6:21:13 chr1 15708540 . A G 210.72 PASS AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00301523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.56;QD=19.1559;RBI=0.0087033;REFB=-0.0163449;REVB=0.0081643;RO=23;SAF=7;SAR=13;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355672;STB=0.705693;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.016141;OID=.;OPOS=15708540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:23:23:20:21:0.477273:13:7:17:6:14:7:17:6 chr1 15710411 . G C 236.27 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0639714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.579;QD=17.5011;RBI=0.0768844;REFB=-0.0328724;REVB=-0.0426481;RO=28;SAF=21;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278403;STB=0.658535;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0206998;OID=.;OPOS=15710411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:5:21:16:12:5:21:16:12 chr1 15714831 . C CCATT,T 114.09 PASS AF=0.181818,0.818182;AO=2,10;DP=12;FAO=2,9;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=2,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391377,-0.0452527;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=4,1;MLLD=240.162,49.8441;QD=41.4874;RBI=0.0532443,0.0688953;REFB=0,0;REVB=-0.0360998,0.0519496;RO=0;SAF=0,5;SAR=2,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0184347,0.0338499;OID=.,.;OPOS=15714832,15714831;OREF=-,C;OALT=CATT,T;OMAPALT=CCATT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:12:11:0:0:2,10:2,9:0.181818,0.818182:2,5:0,5:0:0:2,5:0,4:0:0 chr1 15714842 . G C 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0610673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7414;QD=8.69078;RBI=0.0702641;REFB=-0.00527307;REVB=-0.0347539;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677072;STB=0.559852;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00302005;OID=.;OPOS=15714842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:16:17:8:8:0.32:4:4:9:7:4:4:10:7 chr1 15723811 . T A 417.39 PASS AF=0.525;AO=34;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.000271661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.623;QD=20.8696;RBI=0.0412755;REFB=-0.0165928;REVB=-0.0412746;RO=35;SAF=12;SAR=22;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251542;STB=0.584476;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0182022;OID=.;OPOS=15723811;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:35:38:34:42:0.525:22:12:22:13:23:19:24:14 chr1 15754484 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.136;QD=58.0611;RBI=0.0329633;REFB=0;REVB=0.0274396;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25769e-05;OID=.;OPOS=15754484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0 chr1 15788269 . A C 742.15 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9455;QD=56.0116;RBI=0.0189771;REFB=0;REVB=0.0155871;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167431;OID=.;OPOS=15788269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:34:18:0:0:35:18:0:0 chr1 15808198 . C T 1607.13 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.698;QD=64.285;RBI=0.0548645;REFB=0;REVB=-0.0303992;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90021e-05;OID=.;OPOS=15808198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:51:49:0:0:51:49:0:0 chr1 15808767 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.828;QD=59.4356;RBI=0.0577166;REFB=0;REVB=0.0542926;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203134;OID=.;OPOS=15808767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr1 15808872 . G A 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.079;QD=58.7815;RBI=0.0247708;REFB=0;REVB=0.0223916;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67651e-05;OID=.;OPOS=15808872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0 chr1 15809876 . G A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.844;QD=57.6804;RBI=0.0454942;REFB=0;REVB=0.0192237;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.05883e-05;OID=.;OPOS=15809876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0 chr1 15812432 . A G 937.58 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.287;QD=58.5987;RBI=0.0179413;REFB=0;REVB=-0.0129322;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.68286e-05;OID=.;OPOS=15812432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0 chr1 15832543 . T C 1030.05 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0464985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4222;QD=58.0311;RBI=0.0480767;REFB=0.0232864;REVB=0.0122172;RO=1;SAF=28;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165852;STB=0.508769;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.000362029;OID=.;OPOS=15832543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:42:28:1:0:42:28:1:0 chr1 15844615 . A G 1526.99 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1665;QD=58.7306;RBI=0.0414845;REFB=0;REVB=0.0322105;RO=0;SAF=34;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000968729;OID=.;OPOS=15844615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:104:0:0:102:104:1:68:34:0:0:68:36:0:0 chr1 15850613 . G A 230.36 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0149885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.981;QD=46.0724;RBI=0.0229853;REFB=-0.113785;REVB=0.0174261;RO=1;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101694;STB=0.555494;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00281503;OID=.;OPOS=15850613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:4:15:0:1:4:15:0:1 chr1 15909850 . C G 234.98 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0123157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.8901;QD=15.4082;RBI=0.013995;REFB=-0.000935915;REVB=0.00664711;RO=34;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341533;STB=0.519336;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00133924;OID=.;OPOS=15909850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:11:16:19:15:11:16:19:15 chr1 15953261 . A G 277.39 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.000477901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.652;QD=18.4926;RBI=0.0127046;REFB=0.00831164;REVB=0.0126956;RO=30;SAF=14;SAR=16;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00678348;OID=.;OPOS=15953261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:16:14:14:16:16:14:14:16 chr1 16069071 . C T 654.29 PASS AF=0.460526;AO=70;DP=151;FAO=70;FDP=152;FR=.;FRO=82;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.0024164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4111;QD=17.2181;RBI=0.0068081;REFB=-0.0365094;REVB=-0.00636485;RO=81;SAF=26;SAR=44;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122083;STB=0.571519;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0427103;OID=.;OPOS=16069071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:81:82:70:70:0.460526:44:26:40:41:44:26:41:41 chr1 16096934 . C T 31.5 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00867529;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.4786;QD=14.0002;RBI=0.0847743;REFB=0.0731061;REVB=0.0843292;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.665923;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.0467533;OID=.;OPOS=16096934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:2:2:4:1:2:2 chr1 16341649 . C T 734.24 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.013272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=338.298;QD=61.1863;RBI=0.0498345;REFB=-0.0233575;REVB=0.0480347;RO=1;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303164;STB=0.516122;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000126069;OID=.;OPOS=16341649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:15:32:0:1:15:32:0:1 chr1 16341733 . T C 754.91 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.746;QD=56.9743;RBI=0.0176267;REFB=0;REVB=-0.000156784;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1561e-05;OID=.;OPOS=16341733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:23:29:0:0:24:29:0:0 chr1 16342237 . A G 674.95 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00188463;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.051;QD=62.7857;RBI=0.0101455;REFB=0;REVB=0.00996894;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261127;OID=.;OPOS=16342237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:27:15:0:0:27:16:0:0 chr1 16344360 . A G 2663.36 PASS AF=1;AO=168;DP=168;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.51;QD=61.9385;RBI=0.0548686;REFB=0;REVB=0.0479269;RO=0;SAF=76;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02044e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85516e-05;OID=.;OPOS=16344360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:168:172:0:0:168:172:1:92:76:0:0:92:80:0:0 chr1 16344402 . G A 2517.0 PASS AF=0.988024;AO=162;DP=165;FAO=165;FDP=167;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=96;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0779984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8757;QD=60.2874;RBI=0.0804701;REFB=-0.130024;REVB=0.0197912;RO=3;SAF=66;SAR=96;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211332;STB=0.507142;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00153454;OID=.;OPOS=16344402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:165:167:3:2:162:165:0.988024:96:66:3:0:96:69:2:0 chr1 16344494 . G A 821.53 PASS AF=0.984127;AO=58;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0384971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4764;QD=52.1608;RBI=0.180623;REFB=-0.243306;REVB=0.176472;RO=3;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434874;STB=0.50704;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0207623;OID=.;OPOS=16344494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:62:63:3:1:58:62:0.984127:31:27:0:3:35:27:0:1 chr1 16344625 . C G 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.976;QD=59.6789;RBI=0.0273485;REFB=0;REVB=0.0254308;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13867e-05;OID=.;OPOS=16344625;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0 chr1 16344664 . G A,C 1093.3 PASS AF=0.945946,0.0540541;AO=70,4;DP=74;FAO=70,4;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0;FSAR=34,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646252,-0.00627373;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.094,128.657;QD=59.0976;RBI=0.0827713,0.0417409;REFB=0,0;REVB=0.0517173,0.0412667;RO=0;SAF=36,0;SAR=34,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00710387,0.118659;OID=.,.;OPOS=16344664,16344664;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:74:74:0:0:70,4:70,4:0.945946,0.0540541:34,4:36,0:0:0:34,4:36,0:0:0 chr1 16351275 . A G 723.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.045;QD=56.7186;RBI=0.015268;REFB=0;REVB=-0.0129798;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.94902e-05;OID=.;OPOS=16351275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:25:26:0:0 chr1 16356501 . G A 750.76 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0794406;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1316;QD=63.8942;RBI=0.0906293;REFB=0;REVB=0.0436218;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118016;OID=.;OPOS=16356501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0 chr1 16358932 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.334;QD=63.872;RBI=0.036722;REFB=0;REVB=0.0211309;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.90492e-06;OID=.;OPOS=16358932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:33:15:0:0:33:15:0:0 chr1 16361916 . G A 69.33 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0112436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.722;QD=30.8116;RBI=0.0112739;REFB=-0.123274;REVB=-0.000825114;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.545344;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00380318;OID=.;OPOS=16361916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:0:1:8:8:0.888889:5:3:0:0:5:3:0:1 chr1 16371067 . G T 207.47 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0173384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.461;QD=15.0886;RBI=0.0193987;REFB=-0.0222838;REVB=0.00870001;RO=31;SAF=4;SAR=20;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360593;STB=0.708462;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.023099;OID=.;OPOS=16371067;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:20:4:14:17:20:4:14:17 chr1 16373124 . A G 1012.31 PASS AF=1;AO=58;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0919626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.607;QD=59.5477;RBI=0.0965586;REFB=0;REVB=0.0294353;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219497;OID=.;OPOS=16373124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:58:68:1:34:24:0:0:35:33:0:0 chr1 16374533 . G C 880.42 PASS AF=0.890411;AO=65;DP=73;FAO=65;FDP=73;FR=.;FRO=8;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0138565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.408;QD=48.2424;RBI=0.0189875;REFB=-0.0572339;REVB=-0.0129816;RO=8;SAF=20;SAR=45;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15636;STB=0.583307;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000522713;OID=.;OPOS=16374533;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:73:73:8:8:65:65:0.890411:45:20:8:0:45:20:8:0 chr1 16374994 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918326;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.726;QD=55.6561;RBI=0.0116858;REFB=0;REVB=0.00722674;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31087e-05;OID=.;OPOS=16374994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0 chr1 16375063 . CA GC 382.44 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107056;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=135.703;QD=52.7498;RBI=0.174411;REFB=0;REVB=0.137689;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00156742;OID=.;OPOS=16375063;OREF=CA;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr1 16376190 . G GT 320.72 PASS AF=1;AO=4;DP=37;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.292385;FXX=0.216158;HRUN=0;LEN=1;MLLD=20.1194;QD=44.2371;RBI=0.293567;REFB=0;REVB=-0.0263151;RO=33;SAF=0;SAR=4;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.749776;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0184304;OID=.;OPOS=16376191;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:4:37:29:29:0:27:2:0:0:6:33:0:4:27:6 chr1 16376191 . C G,T 535.02 PASS AF=0.0810811,0.918919;AO=4,33;DP=37;FAO=3,34;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=3,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149474,0.00762224;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.416,59.8809;QD=57.8405;RBI=0.015684,0.0399196;REFB=0,0;REVB=0.00475011,0.0391852;RO=0;SAF=0,27;SAR=4,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.86929e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.231741,-0.00631747;OID=.,.;OPOS=16376191,16376191;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:37:37:0:0:4,33:3,34:0.0810811,0.918919:4,6:0,27:0:0:3,7:0,27:0:0 chr1 16376319 . T C 1256.61 PASS AF=0.988095;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0084038;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6829;QD=59.8386;RBI=0.0146969;REFB=-0.0599132;REVB=0.0120572;RO=1;SAF=33;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141336;STB=0.507461;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000829885;OID=.;OPOS=16376319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:82:83:0.988095:49:33:1:0:50:33:1:0 chr1 16380196 . T C 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.702;QD=57.3852;RBI=0.009676;REFB=0;REVB=0.00958162;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.32465e-05;OID=.;OPOS=16380196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0 chr1 16380243 . A G 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00380646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.119;QD=57.5451;RBI=0.0593462;REFB=0;REVB=-0.059224;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011826;OID=.;OPOS=16380243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0 chr1 16380252 . C T 791.9 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790126;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.792;QD=56.5641;RBI=0.0939224;REFB=0;REVB=-0.0507782;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364943;OID=.;OPOS=16380252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr1 16383682 . G C 450.37 PASS AF=0.478723;AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0240138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4327;QD=19.1645;RBI=0.0486752;REFB=-0.0288834;REVB=0.0423393;RO=48;SAF=20;SAR=25;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166458;STB=0.597147;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0342012;OID=.;OPOS=16383682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:49:45:45:0.478723:25:20:30:18:25:20:31:18 chr1 16383742 . C G 668.37 PASS AF=0.470199;AO=68;DP=147;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.0174083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8072;QD=17.7053;RBI=0.0375948;REFB=-0.0231908;REVB=-0.0333215;RO=78;SAF=37;SAR=31;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549527;STB=0.531906;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0261124;OID=.;OPOS=16383742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:151:78:80:68:71:0.470199:31:37:38:40:33:38:38:42 chr1 16385175 . G A 471.9 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0134166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.112;QD=55.5179;RBI=0.013589;REFB=-0.0788429;REVB=0.00215769;RO=1;SAF=26;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621254;STB=0.533312;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000460771;OID=.;OPOS=16385175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:7:26:0:1:7:26:0:1 chr1 16385184 . G A 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0126009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.407;QD=16.7279;RBI=0.0142201;REFB=-0.00646676;REVB=0.00659008;RO=18;SAF=12;SAR=4;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350097;STB=0.509422;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00660539;OID=.;OPOS=16385184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:4:12:14:4:4:12:14:5 chr1 16386008 . T C 330.9 PASS AF=0.961538;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0103187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.5916;QD=50.9077;RBI=0.132234;REFB=-0.175603;REVB=0.131831;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514274;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0197172;OID=.;OPOS=16386008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:25:26:0:1:24:25:0.961538:16:8:0:0:17:8:0:1 chr1 16386416 . G A 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.938;QD=46.8443;RBI=0.0512463;REFB=0;REVB=0.00845509;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100226;OID=.;OPOS=16386416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr1 16386447 . G C 82.8 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0513366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.5376;QD=33.118;RBI=0.0951829;REFB=-0.106004;REVB=0.080152;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0258528;OID=.;OPOS=16386447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0 chr1 16388646 . T C 1098.71 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.074;QD=60.2033;RBI=0.0350119;REFB=0;REVB=0.0349915;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.78296e-05;OID=.;OPOS=16388646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0 chr1 16464673 . G A 109.0 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=23;FAO=9;FDP=21;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0571577;FXX=0.0869187;HRUN=6;LEN=1;MLLD=24.3925;QD=20.7622;RBI=0.0884579;REFB=-0.0874446;REVB=0.0675114;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280783;STB=0.639683;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00897397;OID=.;OPOS=16464673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:21:6:8:6:9:0.428571:3:3:1:5:3:6:3:5 chr1 16533022 . C T 101.88 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5555;QD=40.752;RBI=0.103577;REFB=0;REVB=0.103553;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00602766;OID=.;OPOS=16533022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0 chr1 16578146 . A G 201.51 PASS AF=0.606061;AO=19;DP=32;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0208663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.674;QD=24.4255;RBI=0.0210259;REFB=-0.0128592;REVB=0.00258642;RO=13;SAF=4;SAR=15;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168011;STB=0.599891;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00992744;OID=.;OPOS=16578146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:13:13:19:20:0.606061:15:4:5:8:16:4:5:8 chr1 16641899 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.326;QD=61.684;RBI=0.0243897;REFB=0;REVB=0.000540162;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.56988e-05;OID=.;OPOS=16641899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0 chr1 16723084 . G A 1120.09 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473342;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.898;QD=60.5454;RBI=0.049743;REFB=0;REVB=-0.0152918;RO=0;SAF=27;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44866e-05;OID=.;OPOS=16723084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:47:27:0:0:47:27:0:0 chr1 16840730 . C T 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00526975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.992;QD=22.6322;RBI=0.00550203;REFB=-0.00500518;REVB=-0.0015818;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684983;STB=0.50387;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00264324;OID=.;OPOS=16840730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:8:5:3:5:8:5:3:5 chr1 16858909 . G C 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00858297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.513;QD=61.2128;RBI=0.0136173;REFB=0;REVB=-0.0105718;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.1766e-05;OID=.;OPOS=16858909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:34:45:0:0:34:45:0:0 chr1 16860633 . G A 62.04 PASS AF=0.0962567;AO=18;DP=187;FAO=18;FDP=187;FR=.;FRO=169;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=74;FSRR=95;FWDB=0.0386727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8662;QD=1.32698;RBI=0.0677608;REFB=-0.00879745;REVB=-0.0556413;RO=169;SAF=11;SAR=7;SRF=74;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204178;STB=0.6533;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0764085;OID=.;OPOS=16860633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:187:187:169:169:18:18:0.0962567:7:11:74:95:7:11:74:95 chr1 16860652 . A C 214.97 PASS AF=0.187192;AO=37;DP=203;FAO=38;FDP=203;FR=.;FRO=165;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=70;FSRR=95;FWDB=0.0223414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.004;QD=4.23582;RBI=0.0226489;REFB=-0.00293954;REVB=0.00371928;RO=164;SAF=28;SAR=9;SRF=70;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420068;STB=0.749871;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0123826;OID=.;OPOS=16860652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:164:165:37:38:0.187192:9:28:70:94:10:28:70:95 chr1 16860695 . G T 37.21 PASS AF=0.0714286;AO=14;DP=196;FAO=14;FDP=196;FR=.;FRO=182;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=92;FSRR=90;FWDB=-0.0108647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8392;QD=0.759316;RBI=0.0191037;REFB=-0.00116753;REVB=0.0157134;RO=182;SAF=9;SAR=5;SRF=92;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151355;STB=0.628492;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0206618;OID=.;OPOS=16860695;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:196:196:182:182:14:14:0.0714286:5:9:92:90:5:9:92:90 chr1 16861772 . A G 71.51 PASS AF=0.14433;AO=13;DP=97;FAO=14;FDP=97;FR=.;FRO=83;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=58;FSRR=25;FWDB=-0.0111985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.666;QD=2.94889;RBI=0.0303936;REFB=0.00177466;REVB=-0.0282553;RO=83;SAF=7;SAR=6;SRF=58;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209893;STB=0.669888;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0130263;OID=.;OPOS=16861772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:97:97:83:83:13:14:0.14433:6:7:58:25:7:7:58:25 chr1 16861804 . G A 78.12 PASS AF=0.175;AO=14;DP=80;FAO=14;FDP=80;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=-0.0470733;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.629;QD=3.90621;RBI=0.0479211;REFB=-0.0179758;REVB=0.00897406;RO=66;SAF=7;SAR=7;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212609;STB=0.637318;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0717117;OID=.;OPOS=16861804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:80:80:66:66:14:14:0.175:7:7:44:22:7:7:44:22 chr1 16862282 . G A 215.32 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0273596;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.813;QD=12.8548;RBI=0.0366601;REFB=-0.0155086;REVB=-0.0244012;RO=41;SAF=9;SAR=17;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231847;STB=0.633191;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0260903;OID=.;OPOS=16862282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:41:41:26:26:0.38806:17:9:23:18:17:9:23:18 chr1 16862375 . C G 31.34 PASS AF=0.0709677;AO=11;DP=155;FAO=11;FDP=155;FR=.;FRO=144;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=54;FSRR=90;FWDB=0.00748617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.077;QD=0.808864;RBI=0.0132641;REFB=-0.000416944;REVB=0.0109496;RO=144;SAF=9;SAR=2;SRF=54;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455253;STB=0.867349;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00500492;OID=.;OPOS=16862375;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:155:155:144:144:11:11:0.0709677:2:9:54:90:2:9:54:90 chr1 16862394 . G A 77.05 PASS AF=0.113514;AO=20;DP=183;FAO=21;FDP=185;FR=.;FRO=164;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=74;FSRR=90;FWDB=-0.00656462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3725;QD=1.66598;RBI=0.0608151;REFB=-0.00472916;REVB=0.0604597;RO=163;SAF=9;SAR=11;SRF=73;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00265351;STB=0.520357;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0462404;OID=.;OPOS=16862394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:183:185:163:164:20:21:0.113514:11:9:73:90:12:9:74:90 chr1 16862454 . T G 1122.5 PASS AF=0.521127;AO=111;DP=214;FAO=111;FDP=213;FR=.;FRO=102;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=44;FWDB=-0.00789602;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.2;QD=21.0797;RBI=0.0279347;REFB=-0.00796625;REVB=0.0267956;RO=98;SAF=55;SAR=56;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563863;STB=0.534995;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0235487;OID=.;OPOS=16862454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:98:102:111:111:0.521127:56:55:55:43:56:55:58:44 chr1 16862461 . T A 1549.49 PASS AF=0.627273;AO=134;DP=227;FAO=138;FDP=220;FR=.;FRO=82;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=0.00279675;FXX=0.0434764;HRUN=6;LEN=1;MLLD=222.571;QD=28.1725;RBI=0.0137471;REFB=-0.0229265;REVB=-0.0134597;RO=63;SAF=68;SAR=66;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381688;STB=0.522724;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00715555;OID=.;OPOS=16862461;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:220:63:82:134:138:0.627273:66:68:36:27:69:69:46:36 chr1 16862472 . G C 53.25 PASS AF=0.0763359;AO=20;DP=262;FAO=20;FDP=262;FR=.;FRO=242;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=120;FSRR=122;FWDB=-0.00900883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.569;QD=0.812914;RBI=0.0104063;REFB=-0.0009622;REVB=-0.00520876;RO=241;SAF=10;SAR=10;SRF=119;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0070338;STB=0.503813;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00914979;OID=.;OPOS=16862472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:262:262:241:242:20:20:0.0763359:10:10:119:122:10:10:120:122 chr1 16862502 . A G 2565.37 PASS AF=0.652695;AO=218;DP=334;FAO=218;FDP=334;FR=.;FRO=116;FSAF=127;FSAR=91;FSRF=64;FSRR=52;FWDB=-0.000109309;FXX=0.00298499;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.965;QD=30.723;RBI=0.0143185;REFB=0.0029194;REVB=-0.014318;RO=115;SAF=127;SAR=91;SRF=64;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171776;STB=0.510972;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.000904794;OID=.;OPOS=16862502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:334:115:116:218:218:0.652695:91:127:64:51:91:127:64:52 chr1 16862566 . G A 84.14 PASS AF=0.0828877;AO=31;DP=374;FAO=31;FDP=374;FR=.;FRO=343;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=184;FSRR=159;FWDB=-0.0122323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.462;QD=0.89993;RBI=0.057471;REFB=-0.00504409;REVB=-0.0561542;RO=343;SAF=18;SAR=13;SRF=184;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520294;STB=0.541043;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0583537;OID=.;OPOS=16862566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:374:374:343:343:31:31:0.0828877:13:18:184:159:13:18:184:159 chr1 16863304 . T C 58.27 PASS AF=0.104895;AO=15;DP=144;FAO=15;FDP=143;FR=.;FRO=128;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=77;FWDB=-0.00355107;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.483;QD=1.6298;RBI=0.00475506;REFB=-0.00176646;REVB=-0.00316235;RO=129;SAF=3;SAR=12;SRF=52;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275309;STB=0.707891;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.011528;OID=.;OPOS=16863304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:144:143:129:128:15:15:0.104895:12:3:52:77:12:3:51:77 chr1 16863308 . G T 64.67 PASS AF=0.111111;AO=16;DP=143;FAO=16;FDP=144;FR=.;FRO=128;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=51;FSRR=77;FWDB=-0.00762047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.439;QD=1.79626;RBI=0.0282244;REFB=-0.000979993;REVB=0.0271761;RO=127;SAF=3;SAR=13;SRF=50;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289548;STB=0.721914;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0099589;OID=.;OPOS=16863308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:143:144:127:128:16:16:0.111111:13:3:50:77:13:3:51:77 chr1 16863314 . A G 63.58 PASS AF=0.108108;AO=16;DP=148;FAO=16;FDP=148;FR=.;FRO=132;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=54;FSRR=78;FWDB=0.0054659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.295;QD=1.71849;RBI=0.0063724;REFB=-0.000387447;REVB=-0.00327588;RO=132;SAF=3;SAR=13;SRF=54;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30335;STB=0.730451;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00512979;OID=.;OPOS=16863314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:148:148:132:132:16:16:0.108108:13:3:54:78:13:3:54:78 chr1 16863328 . T G 118.23 PASS AF=0.155405;AO=23;DP=148;FAO=23;FDP=148;FR=.;FRO=125;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=52;FSRR=73;FWDB=-0.038013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.54;QD=3.19531;RBI=0.0381285;REFB=-0.00473823;REVB=-0.00296546;RO=124;SAF=4;SAR=19;SRF=52;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359366;STB=0.742781;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0277952;OID=.;OPOS=16863328;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:124:125:23:23:0.155405:19:4:52:72:19:4:52:73 chr1 16863352 . C T 145.07 PASS AF=0.175676;AO=26;DP=148;FAO=26;FDP=148;FR=.;FRO=122;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=72;FWDB=-0.00174985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8111;QD=3.92089;RBI=0.0149073;REFB=-0.00325923;REVB=-0.0148042;RO=122;SAF=4;SAR=22;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390111;STB=0.759363;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00699213;OID=.;OPOS=16863352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:122:122:26:26:0.175676:22:4:50:72:22:4:50:72 chr1 16874206 . A C 411.08 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0525717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2751;QD=56.7012;RBI=0.0572378;REFB=0;REVB=-0.0226359;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00186892;OID=.;OPOS=16874206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr1 16874245 . A C 112.66 PASS AF=0.5;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0574296;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=32.5809;QD=16.0947;RBI=0.132993;REFB=-0.0265259;REVB=-0.119954;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362916;STB=0.674756;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0261287;OID=.;OPOS=16874245;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:28:12:14:13:14:0.5:8:5:10:2:9:5:10:4 chr1 16890598 . T A 792.54 PASS AF=0.373016;AO=94;DP=251;FAO=94;FDP=252;FR=.;FRO=158;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=73;FSRR=85;FWDB=-0.0206876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.17;QD=12.5799;RBI=0.0207723;REFB=-0.0046136;REVB=0.00187487;RO=155;SAF=34;SAR=60;SRF=72;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117954;STB=0.565625;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00648346;OID=.;OPOS=16890598;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:155:158:94:94:0.373016:60:34:72:83:60:34:73:85 chr1 16890599 . A G 114.18 PASS AF=0.116;AO=29;DP=248;FAO=29;FDP=250;FR=.;FRO=221;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=95;FSRR=126;FWDB=-0.0138432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.168;QD=1.82682;RBI=0.0200127;REFB=-0.00194486;REVB=-0.0144525;RO=218;SAF=12;SAR=17;SRF=94;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222132;STB=0.514558;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0383034;OID=.;OPOS=16890599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:250:218:221:29:29:0.116:17:12:94:124:17:12:95:126 chr1 16890639 . C T 573.36 PASS AF=0.39759;AO=66;DP=167;FAO=66;FDP=166;FR=.;FRO=100;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=57;FWDB=-0.0147224;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.644;QD=13.8158;RBI=0.019677;REFB=-0.012471;REVB=-0.0130551;RO=98;SAF=29;SAR=37;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000666652;STB=0.50575;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.017958;OID=.;OPOS=16890639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:98:100:66:66:0.39759:37:29:43:55:37:29:43:57 chr1 16890644 . C T 166.35 PASS AF=0.186335;AO=30;DP=161;FAO=30;FDP=161;FR=.;FRO=131;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=61;FSRR=70;FWDB=-0.00276476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.685;QD=4.13292;RBI=0.00900572;REFB=-0.00856402;REVB=-0.00857083;RO=130;SAF=9;SAR=21;SRF=61;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226254;STB=0.642104;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0463203;OID=.;OPOS=16890644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:130:131:30:30:0.186335:21:9:61:69:21:9:61:70 chr1 16890671 . TG CA 419.9 PASS AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00707056;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.298;QD=19.9952;RBI=0.00719246;REFB=-0.0115491;REVB=0.00131861;RO=42;SAF=18;SAR=24;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218115;STB=0.512105;STBP=0.829;TYPE=mnp;VARB=0.0105108;OID=.;OPOS=16890671;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:24:18:19:23:24:18:19:23 chr1 16893841 . C T 32.52 PASS AF=0.0666667;AO=13;DP=195;FAO=13;FDP=195;FR=.;FRO=182;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=92;FSRR=90;FWDB=-0.0208462;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.308;QD=0.666998;RBI=0.0208852;REFB=0.0004128;REVB=-0.00127603;RO=182;SAF=5;SAR=8;SRF=91;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123708;STB=0.612781;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=-0.0075334;OID=.;OPOS=16893841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:195:195:182:182:13:13:0.0666667:8:5:91:91:8:5:92:90 chr1 16901668 . T C 412.61 PASS AF=0.711538;AO=37;DP=52;FAO=37;FDP=52;FR=.;FRO=15;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00872988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8475;QD=31.7394;RBI=0.0270886;REFB=0.0150216;REVB=-0.0256433;RO=15;SAF=23;SAR=14;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642865;STB=0.534813;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.00689546;OID=.;OPOS=16901668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:15:15:37:37:0.711538:14:23:11:4:14:23:11:4 chr1 16901714 . G A 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0107041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.445;QD=14.6521;RBI=0.0111941;REFB=0.00206541;REVB=-0.00327582;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392076;STB=0.739831;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.000408139;OID=.;OPOS=16901714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:3:2:5:1:3:2 chr1 16903882 . T C 47.67 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0175743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.092;QD=11.9185;RBI=0.0177085;REFB=0.0211452;REVB=-0.00217634;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525367;STB=0.531821;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.017325;OID=.;OPOS=16903882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:3:6:5:2:3:6 chr1 16907303 . C T 269.12 PASS AF=0.117552;AO=73;DP=621;FAO=73;FDP=621;FR=.;FRO=548;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=265;FSRR=283;FWDB=-0.020502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.748;QD=1.73346;RBI=0.0251413;REFB=0.00177569;REVB=-0.0145517;RO=546;SAF=37;SAR=36;SRF=264;SRR=282;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029469;STB=0.520524;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=-0.0127365;OID=.;OPOS=16907303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:621:621:546:548:73:73:0.117552:36:37:264:282:36:37:265:283 chr1 16907328 . G T 3127.71 PASS AF=0.616253;AO=273;DP=443;FAO=273;FDP=443;FR=.;FRO=170;FSAF=138;FSAR=135;FSRF=67;FSRR=103;FWDB=0.00605663;FXX=0.0022522;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.824;QD=28.2412;RBI=0.00654841;REFB=-0.00457226;REVB=-0.00248976;RO=167;SAF=138;SAR=135;SRF=64;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861989;STB=0.542702;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00283156;OID=.;OPOS=16907328;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:443:443:167:170:273:273:0.616253:135:138:64:103:135:138:67:103 chr1 16909052 . C T 2073.09 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.375;QD=62.3485;RBI=0.0287597;REFB=0;REVB=0.0151027;RO=0;SAF=72;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21615e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32502e-05;OID=.;OPOS=16909052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:133:0:0:128:133:1:56:72:0:0:56:77:0:0 chr1 16909100 . G C 106.86 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.000325671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.979;QD=12.2129;RBI=0.0261293;REFB=0.000778712;REVB=0.0261273;RO=22;SAF=4;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346153;STB=0.704037;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.00109256;OID=.;OPOS=16909100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:9:4:14:8:9:4:14:8 chr1 16913584 . A C 57.08 PASS AF=0.102041;AO=15;DP=147;FAO=15;FDP=147;FR=.;FRO=132;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=60;FSRR=72;FWDB=-0.000734854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8823;QD=1.55311;RBI=0.0270195;REFB=0.00204735;REVB=0.0270095;RO=131;SAF=5;SAR=10;SRF=60;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153845;STB=0.613053;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=-0.0241322;OID=.;OPOS=16913584;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:147:147:131:132:15:15:0.102041:10:5:60:71:10:5:60:72 chr1 16913612 . G A 55.25 PASS AF=0.0941176;AO=16;DP=170;FAO=16;FDP=170;FR=.;FRO=154;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=70;FSRR=84;FWDB=0.0275947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9148;QD=1.30011;RBI=0.029586;REFB=-0.000969483;REVB=0.0106707;RO=150;SAF=5;SAR=11;SRF=67;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165643;STB=0.634442;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00622033;OID=.;OPOS=16913612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:170:170:150:154:16:16:0.0941176:11:5:67:83:11:5:70:84 chr1 16913633 . G T 41.27 PASS AF=0.081761;AO=13;DP=159;FAO=13;FDP=159;FR=.;FRO=146;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=67;FSRR=79;FWDB=-0.0121311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.112;QD=1.03821;RBI=0.0133238;REFB=-0.00161795;REVB=-0.00550983;RO=146;SAF=3;SAR=10;SRF=67;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271066;STB=0.723526;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0108391;OID=.;OPOS=16913633;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:159:159:146:146:13:13:0.081761:10:3:67:79:10:3:67:79 chr1 16915357 . C T 165.83 PASS AF=0.355932;AO=20;DP=58;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00555982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.8;QD=11.2424;RBI=0.00558143;REFB=-0.0131161;REVB=0.000490648;RO=38;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884138;STB=0.535681;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0180788;OID=.;OPOS=16915357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:38:38:20:21:0.355932:10:10:22:16:10:11:22:16 chr1 16918424 . G C 484.52 PASS AF=0.16753;AO=97;DP=580;FAO=97;FDP=579;FR=.;FRO=482;FSAF=65;FSAR=32;FSRF=204;FSRR=278;FWDB=-0.00149665;FXX=0.00172411;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.67;QD=3.34731;RBI=0.00888318;REFB=-0.00385085;REVB=-0.00875619;RO=479;SAF=65;SAR=32;SRF=203;SRR=276;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314948;STB=0.700634;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0177787;OID=.;OPOS=16918424;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:580:579:479:482:97:97:0.16753:32:65:203:276:32:65:204:278 chr1 16918498 . G A 135.75 PASS AF=0.125475;AO=33;DP=263;FAO=33;FDP=263;FR=.;FRO=230;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=117;FSRR=113;FWDB=-0.0338661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.613;QD=2.06464;RBI=0.0341616;REFB=-0.00317533;REVB=0.00448389;RO=230;SAF=13;SAR=20;SRF=117;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144956;STB=0.600539;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0196683;OID=.;OPOS=16918498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:230:230:33:33:0.125475:20:13:117:113:20:13:117:113 chr1 16918502 . A G 750.23 PASS AF=0.366255;AO=81;DP=234;FAO=89;FDP=243;FR=.;FRO=154;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=82;FSRR=72;FWDB=0.0170477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.565;QD=12.3494;RBI=0.0245475;REFB=-0.00955047;REVB=0.0176623;RO=153;SAF=35;SAR=46;SRF=82;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118975;STB=0.588906;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0186059;OID=.;OPOS=16918502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:243:153:154:81:89:0.366255:46:35:82:71:54:35:82:72 chr1 17004785 . A C 199.77 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0265051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5538;QD=19.9769;RBI=0.0292168;REFB=-0.0506658;REVB=0.0122924;RO=19;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117349;STB=0.583246;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0300956;OID=.;OPOS=17004785;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:6:14:11:8:6:14:11:9 chr1 17017717 . C T 260.57 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0118551;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.97;QD=11.9801;RBI=0.0169781;REFB=0.000173192;REVB=-0.0121537;RO=57;SAF=13;SAR=18;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220537;STB=0.506075;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.000311563;OID=.;OPOS=17017717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:57:56:31:31:0.356322:18:13:25:32:18:13:24:32 chr1 17017734 . C T 192.99 PASS AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00691757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.119;QD=10.0255;RBI=0.00726228;REFB=-0.0184471;REVB=0.00221085;RO=52;SAF=14;SAR=11;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135089;STB=0.579048;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0277842;OID=.;OPOS=17017734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:52:52:25:25:0.324675:11:14:23:29:11:14:23:29 chr1 17022952 . C A 736.73 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0414448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9196;QD=54.5729;RBI=0.0758061;REFB=-0.100058;REVB=0.0634735;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177765;STB=0.50943;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00157144;OID=.;OPOS=17022952;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:27:26:1:0:27:26:1:0 chr1 17023110 . G A 365.81 PASS AF=0.37931;AO=44;DP=116;FAO=44;FDP=116;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.00697754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3338;QD=12.614;RBI=0.00725609;REFB=0.00400389;REVB=0.00199119;RO=72;SAF=25;SAR=19;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164267;STB=0.593343;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00600764;OID=.;OPOS=17023110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:72:72:44:44:0.37931:19:25:30:42:19:25:30:42 chr1 17023143 . C T 592.09 PASS AF=0.55102;AO=53;DP=97;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00534509;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.672;QD=24.1668;RBI=0.00710997;REFB=-0.0240654;REVB=-0.00468846;RO=44;SAF=31;SAR=22;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163711;STB=0.592558;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0215728;OID=.;OPOS=17023143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:44:44:53:54:0.55102:22:31:17:27:22:32:17:27 chr1 17023182 . C G 413.01 PASS AF=0.588235;AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0115254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9491;QD=24.2948;RBI=0.0126914;REFB=-0.0449551;REVB=0.00531385;RO=27;SAF=29;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17319;STB=0.60512;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0290408;OID=.;OPOS=17023182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:27:28:40:40:0.588235:11:29:14:13:11:29:14:14 chr1 17023376 . C T 858.13 PASS AF=0.470588;AO=87;DP=186;FAO=88;FDP=187;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.0314694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.209;QD=18.3557;RBI=0.0447003;REFB=-0.0211527;REVB=0.0317458;RO=93;SAF=44;SAR=43;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101031;STB=0.551365;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0284576;OID=.;OPOS=17023376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:93:99:87:88:0.470588:43:44:37:56:43:45:41:58 chr1 17023403 . G A 468.91 PASS AF=0.355828;AO=55;DP=164;FAO=58;FDP=163;FR=.;FRO=105;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=71;FWDB=-0.0246089;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6805;QD=11.5069;RBI=0.0246693;REFB=-0.00517141;REVB=0.00172498;RO=101;SAF=24;SAR=31;SRF=32;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141164;STB=0.560977;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0178693;OID=.;OPOS=17023403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:101:105:55:58:0.355828:31:24:32:69:34:24:34:71 chr1 17026087 . G A 142.6 PASS AF=0.4;AO=14;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00149014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.976;QD=14.2603;RBI=0.0729992;REFB=-0.00366839;REVB=0.0729839;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116789;STB=0.549938;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00698007;OID=.;OPOS=17026087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:24:14:16:0.4:6:8:13:6:8:8:14:10 chr1 17029462 . A G 392.69 PASS AF=0.302198;AO=53;DP=178;FAO=55;FDP=182;FR=.;FRO=127;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=58;FSRR=69;FWDB=-0.0660577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3551;QD=8.6305;RBI=0.104473;REFB=-0.0281764;REVB=-0.0809383;RO=122;SAF=37;SAR=16;SRF=58;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274707;STB=0.653017;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0569408;OID=.;OPOS=17029462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:182:122:127:53:55:0.302198:16:37:58:64:18:37:58:69 chr1 17030504 . T A 768.95 PASS AF=0.281579;AO=107;DP=381;FAO=107;FDP=380;FR=.;FRO=273;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=135;FSRR=138;FWDB=-0.00393875;FXX=0.0026246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2866;QD=8.09418;RBI=0.00726054;REFB=-0.0202443;REVB=0.00609932;RO=272;SAF=55;SAR=52;SRF=134;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262465;STB=0.514016;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0189843;OID=.;OPOS=17030504;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:380:272:273:107:107:0.281579:52:55:134:138:52:55:135:138 chr1 17030515 . G A 699.48 PASS AF=0.27248;AO=100;DP=370;FAO=100;FDP=367;FR=.;FRO=267;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=135;FSRR=132;FWDB=-0.00547801;FXX=0.00810789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.391;QD=7.62371;RBI=0.0116135;REFB=-0.00773972;REVB=-0.0102404;RO=269;SAF=48;SAR=52;SRF=135;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271091;STB=0.518636;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0265971;OID=.;OPOS=17030515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:367:269:267:100:100:0.27248:52:48:135:134:52:48:135:132 chr1 17030518 . CT TG 639.19 PASS AF=0.256757;AO=94;DP=373;FAO=95;FDP=370;FR=.;FRO=275;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=136;FSRR=139;FWDB=-0.0540074;FXX=0.00804268;HRUN=1;LEN=2;MLLD=92.7602;QD=6.91015;RBI=0.0658842;REFB=-0.00551863;REVB=-0.0377349;RO=271;SAF=49;SAR=45;SRF=135;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289767;STB=0.515786;STBP=0.725;TYPE=mnp;VARB=0.0134032;OID=.;OPOS=17030518;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:373:370:271:275:94:95:0.256757:45:49:135:136:46:49:136:139 chr1 17030590 . G A 613.14 PASS AF=0.282392;AO=85;DP=301;FAO=85;FDP=301;FR=.;FRO=216;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=101;FSRR=115;FWDB=0.00343878;FXX=0.00331115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9348;QD=8.14799;RBI=0.00763505;REFB=-0.00904861;REVB=0.0068168;RO=214;SAF=38;SAR=47;SRF=100;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249561;STB=0.514852;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0206816;OID=.;OPOS=17030590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:214:216:85:85:0.282392:47:38:100:114:47:38:101:115 chr1 17033805 . C T 431.96 PASS AF=0.278539;AO=61;DP=220;FAO=61;FDP=219;FR=.;FRO=158;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=82;FSRR=76;FWDB=0.00185215;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.995;QD=7.88973;RBI=0.0156164;REFB=-0.0157239;REVB=-0.0155062;RO=156;SAF=39;SAR=22;SRF=81;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151009;STB=0.589421;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0356923;OID=.;OPOS=17033805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:156:158:61:61:0.278539:22:39:81:75:22:39:82:76 chr1 17033854 . C T 1037.24 PASS AF=0.56;AO=98;DP=175;FAO=98;FDP=175;FR=.;FRO=77;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.047425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.666;QD=23.7084;RBI=0.0475651;REFB=-0.0169191;REVB=-0.00364746;RO=75;SAF=58;SAR=40;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163577;STB=0.583511;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0104034;OID=.;OPOS=17033854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:75:77:98:98:0.56:40:58:29:46:40:58:31:46 chr1 17033900 . C T 104.43 PASS AF=0.174312;AO=19;DP=109;FAO=19;FDP=109;FR=.;FRO=90;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=0.00731023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.055;QD=3.83222;RBI=0.0173148;REFB=-0.00443536;REVB=-0.0156959;RO=89;SAF=7;SAR=12;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175153;STB=0.618551;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0191694;OID=.;OPOS=17033900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:89:90:19:19:0.174312:12:7:45:44:12:7:46:44 chr1 17034455 . CGCGCGCGT C 238.47 PASS AF=0.307692;AO=32;DP=106;FAO=32;FDP=104;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.00412619;FXX=0.0458673;HRUN=1;LEN=8;MLLD=292.745;QD=9.17192;RBI=0.0109548;REFB=-0.00769872;REVB=0.0101481;RO=71;SAF=26;SAR=6;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469822;STB=0.774429;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.0136913;OID=.;OPOS=17034456;OREF=GCGCGCGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.307692:32:106:32:104:72:26:6:32:40:99:71:26:6:31:40 chr1 17046456 . T C 904.14 PASS AF=0.564935;AO=87;DP=153;FAO=87;FDP=154;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.00241514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.239;QD=23.484;RBI=0.0707099;REFB=-0.00764809;REVB=-0.0706686;RO=65;SAF=41;SAR=46;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124836;STB=0.573788;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00973246;OID=.;OPOS=17046456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:65:67:87:87:0.564935:46:41:41:24:46:41:43:24 chr1 17052116 . CG GC 117.27 PASS AF=0.0761194;AO=51;DP=676;FAO=51;FDP=670;FR=.;FRO=619;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=349;FSRR=270;FWDB=-0.000576744;FXX=0.0103396;HRUN=1;LEN=2;MLLD=240.519;QD=0.700101;RBI=0.0403165;REFB=-0.00147647;REVB=-0.0403124;RO=609;SAF=23;SAR=28;SRF=346;SRR=263;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134504;STB=0.603087;STBP=0.124;TYPE=mnp;VARB=0.0222491;OID=.;OPOS=17052116;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:676:670:609:619:51:51:0.0761194:28:23:346:263:28:23:349:270 chr1 17052136 . GTTTTTT GTTTTT,GTTTTTG,TGTTTTT 130.47 PASS AF=0.0791367,0.0521583,0.0161871;AO=99,30,51;DP=620;FAO=44,29,9;FDP=556;FR=.;FRO=474;FSAF=7,0,0;FSAR=37,29,9;FSRF=298;FSRR=176;FWDB=-0.000600626,-0.0388875,-0.00492937;FXX=0.114648;HRUN=6,6,2;LEN=1,1,2;MLLD=11.6541,26.941,232.684;QD=0.938665;RBI=0.0584611,0.0597257,0.058797;REFB=-0.0908921,-0.0473689,-0.00322168;REVB=-0.058458,-0.0453312,-0.05859;RO=375;SAF=23,0,0;SAR=76,30,51;SRF=275;SRR=100;SSEN=0,0,0;SSEP=0.454545,0,0;SSSB=-0.587748,-0.708443,-0.780883;STB=0.883147,0.999719,0.99915;STBP=0,0,0;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.0339585,0.106339,0.0800748;OID=.,.,.;OPOS=17052137,17052142,17052136;OREF=T,T,GT;OALT=-,G,TG;OMAPALT=GTTTTT,GTTTTTG,TGTTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:620:556:375:474:99,30,51:44,29,9:0.0791367,0.0521583,0.0161871:76,30,51:23,0,0:275:100:37,29,9:7,0,0:298:176 chr1 17053766 . G A 925.25 PASS AF=0.517045;AO=91;DP=178;FAO=91;FDP=176;FR=.;FRO=85;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=0.00176046;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.48;QD=21.0284;RBI=0.00232252;REFB=-0.0218655;REVB=-0.00151488;RO=84;SAF=44;SAR=47;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118422;STB=0.56174;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0229636;OID=.;OPOS=17053766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:84:85:91:91:0.517045:47:44:52:32:47:44:52:33 chr1 17053770 . G T 46.95 PASS AF=0.0842697;AO=15;DP=183;FAO=15;FDP=178;FR=.;FRO=163;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=86;FSRR=77;FWDB=-0.0571277;FXX=0.0273209;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2975;QD=1.05506;RBI=0.057133;REFB=-0.00131671;REVB=0.000783426;RO=165;SAF=10;SAR=5;SRF=86;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1693;STB=0.630592;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00751544;OID=.;OPOS=17053770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:183:178:165:163:15:15:0.0842697:5:10:86:79:5:10:86:77 chr1 17053782 . C A,G 1715.05 PASS AF=0.381215,0.39779;AO=69,72;DP=182;FAO=69,72;FDP=181;FR=.;FRO=40;FSAF=37,40;FSAR=32,32;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.015063,-0.0339134;FXX=0.0054942;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=126.521,72.6406;QD=37.9017;RBI=0.0172291,0.0628032;REFB=-0.0068884,-0.00268684;REVB=-0.0083635,-0.0528594;RO=40;SAF=37,40;SAR=32,32;SRF=17;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.075295,0.0863468;STB=0.54078,0.546707;STBP=0.281,0.189;TYPE=snp,snp;VARB=0.0144024,-0.00448522;OID=.,.;OPOS=17053782,17053782;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:182:181:40:40:69,72:69,72:0.381215,0.39779:32,32:37,40:17:23:32,32:37,40:17:23 chr1 17053809 . C T 491.31 PASS AF=0.319588;AO=62;DP=194;FAO=62;FDP=194;FR=.;FRO=132;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=59;FSRR=73;FWDB=-0.0176405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.728;QD=10.13;RBI=0.0343749;REFB=-0.0202154;REVB=-0.0295034;RO=132;SAF=31;SAR=31;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625008;STB=0.536071;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0386183;OID=.;OPOS=17053809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:132:132:62:62:0.319588:31:31:59:73:31:31:59:73 chr1 17053826 . C T 333.25 PASS AF=0.292994;AO=46;DP=157;FAO=46;FDP=157;FR=.;FRO=111;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=72;FWDB=-0.00610152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.499;QD=8.49035;RBI=0.0191009;REFB=-0.0118367;REVB=-0.0181001;RO=111;SAF=20;SAR=26;SRF=39;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104417;STB=0.560936;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0187557;OID=.;OPOS=17053826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:111:111:46:46:0.292994:26:20:39:72:26:20:39:72 chr1 17053829 . G C 55.1 PASS AF=0.0974026;AO=15;DP=154;FAO=15;FDP=154;FR=.;FRO=139;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=83;FWDB=0.000373643;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.406;QD=1.43129;RBI=0.0214803;REFB=-0.00301169;REVB=-0.021477;RO=139;SAF=2;SAR=13;SRF=56;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371878;STB=0.796587;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0246321;OID=.;OPOS=17053829;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:154:154:139:139:15:15:0.0974026:13:2:56:83:13:2:56:83 chr1 17053834 . A AC 153.04 PASS AF=0.256757;AO=38;DP=150;FAO=38;FDP=148;FR=.;FRO=110;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=68;FWDB=-0.0104992;FXX=0.0133324;HRUN=0;LEN=1;MLLD=312.799;QD=4.13616;RBI=0.0110269;REFB=-0.00204056;REVB=-0.00337053;RO=111;SAF=11;SAR=27;SRF=43;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136502;STB=0.577905;STBP=0.284;TYPE=ins;VARB=0.00508156;OID=.;OPOS=17053835;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.256757:38:150:38:148:110:11:27:42:68:99:111:11:27:43:68 chr1 17053856 . T G 160.8 PASS AF=0.203008;AO=27;DP=133;FAO=27;FDP=133;FR=.;FRO=106;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=67;FWDB=-0.0277097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.402;QD=4.836;RBI=0.0337275;REFB=-0.00338104;REVB=0.0192279;RO=106;SAF=9;SAR=18;SRF=39;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482943;STB=0.530364;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0421743;OID=.;OPOS=17053856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:106:106:27:27:0.203008:18:9:39:67:18:9:39:67 chr1 17053861 . C T 537.03 PASS AF=0.442748;AO=55;DP=128;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.00991773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.999;QD=16.3979;RBI=0.023531;REFB=-0.00127021;REVB=0.0213389;RO=73;SAF=19;SAR=36;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057049;STB=0.542751;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00199162;OID=.;OPOS=17053861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:73:73:55:58:0.442748:36:19:29:44:39:19:29:44 chr1 17084152 . C T 84.04 PASS AF=0.108374;AO=22;DP=203;FAO=22;FDP=203;FR=.;FRO=181;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=100;FSRR=81;FWDB=0.00363304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.958;QD=1.65596;RBI=0.0289536;REFB=-0.00159651;REVB=-0.0287248;RO=181;SAF=11;SAR=11;SRF=100;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644311;STB=0.546756;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0165483;OID=.;OPOS=17084152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:203:203:181:181:22:22:0.108374:11:11:100:81:11:11:100:81 chr1 17084510 . G A 573.33 PASS AF=0.35;AO=70;DP=200;FAO=70;FDP=200;FR=.;FRO=130;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=70;FSRR=60;FWDB=0.058145;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1028;QD=11.4666;RBI=0.0690423;REFB=-0.00435147;REVB=0.037229;RO=130;SAF=34;SAR=36;SRF=71;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687628;STB=0.534237;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00815087;OID=.;OPOS=17084510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:130:130:70:70:0.35:36:34:71:59:36:34:70:60 chr1 17084536 . TGGAACA T 164.46 PASS AF=0.286822;AO=35;DP=132;FAO=37;FDP=129;FR=.;FRO=92;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=-0.00142344;FXX=0.015266;HRUN=2;LEN=6;MLLD=321.421;QD=5.09956;RBI=0.00974238;REFB=-0.00723893;REVB=-0.00963783;RO=92;SAF=16;SAR=19;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0.20438;SSSB=-0.0655482;STB=0.536668;STBP=0.591;TYPE=del;VARB=0.0173397;OID=.;OPOS=17084537;OREF=GGAACA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.286822:35:132:37:129:92:17:20:47:45:99:92:16:19:47:45 chr1 17084755 . T C 74.68 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.066014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.938;QD=10.6681;RBI=0.0670086;REFB=-0.0195919;REVB=-0.0115024;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359331;STB=0.521695;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0232233;OID=.;OPOS=17084755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:8:2:4:14:8:2:4:14 chr1 17084968 . G C 250.7 PASS AF=0.289256;AO=32;DP=118;FAO=35;FDP=121;FR=.;FRO=86;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.00745056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.852;QD=8.28757;RBI=0.0113222;REFB=-0.0126699;REVB=-0.00852536;RO=86;SAF=10;SAR=22;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182846;STB=0.560474;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0301362;OID=.;OPOS=17084968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:121:86:86:32:35:0.289256:22:10:39:47:22:13:39:47 chr1 17085006 . C T 40.09 PASS AF=0.0797546;AO=13;DP=163;FAO=13;FDP=163;FR=.;FRO=150;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=74;FSRR=76;FWDB=-0.00704358;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=313.021;QD=0.983753;RBI=0.00899906;REFB=-0.00274911;REVB=-0.005601;RO=150;SAF=6;SAR=7;SRF=74;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358749;STB=0.529256;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0301583;OID=.;OPOS=17085006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:163:163:150:150:13:13:0.0797546:7:6:74:76:7:6:74:76 chr1 17085046 . C G 31.08 PASS AF=0.0757576;AO=10;DP=132;FAO=10;FDP=132;FR=.;FRO=122;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=61;FWDB=-0.00426326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.514;QD=0.941834;RBI=0.0054638;REFB=-0.00392721;REVB=-0.00341726;RO=122;SAF=6;SAR=4;SRF=61;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110138;STB=0.59252;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0443498;OID=.;OPOS=17085046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:132:132:122:122:10:10:0.0757576:4:6:61:61:4:6:61:61 chr1 17085412 . C T 123.12 PASS AF=0.116788;AO=32;DP=274;FAO=32;FDP=274;FR=.;FRO=242;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=100;FSRR=142;FWDB=0.014536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.774;QD=1.79731;RBI=0.0200618;REFB=-0.00684161;REVB=-0.0138268;RO=240;SAF=14;SAR=18;SRF=100;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266215;STB=0.521888;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0516163;OID=.;OPOS=17085412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:274:240:242:32:32:0.116788:18:14:100:140:18:14:100:142 chr1 17085427 . T C 117.15 PASS AF=0.109589;AO=32;DP=291;FAO=32;FDP=292;FR=.;FRO=260;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=109;FSRR=151;FWDB=-0.00213046;FXX=0.00341285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.635;QD=1.60484;RBI=0.00743723;REFB=-0.00177582;REVB=0.00712555;RO=259;SAF=15;SAR=17;SRF=108;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649391;STB=0.544484;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0222362;OID=.;OPOS=17085427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:292:259:260:32:32:0.109589:17:15:108:151:17:15:109:151 chr1 17085502 . T C 1679.12 PASS AF=0.845161;AO=126;DP=151;FAO=131;FDP=155;FR=.;FRO=24;FSAF=65;FSAR=66;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0217065;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.178;QD=43.3322;RBI=0.0281113;REFB=-0.041793;REVB=0.0178627;RO=23;SAF=62;SAR=64;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420467;STB=0.518767;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00719502;OID=.;OPOS=17085502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:155:23:24:126:131:0.845161:64:62:8:15:66:65:9:15 chr1 17085834 . G T 619.52 PASS AF=0.921569;AO=47;DP=52;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0314839;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.833;QD=48.5897;RBI=0.0466241;REFB=-0.132485;REVB=0.0343884;RO=4;SAF=25;SAR=22;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00471253;STB=0.502512;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00220192;OID=.;OPOS=17085834;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:52:51:4:4:47:47:0.921569:22:25:2:2:22:25:2:2 chr1 17086941 . C T 94.27 PASS AF=0.137931;AO=20;DP=144;FAO=20;FDP=145;FR=.;FRO=125;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=58;FSRR=67;FWDB=-0.00344228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.682;QD=2.60059;RBI=0.0362896;REFB=-0.00198273;REVB=-0.036126;RO=121;SAF=10;SAR=10;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469413;STB=0.531004;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.015032;OID=.;OPOS=17086941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:144:145:121:125:20:20:0.137931:10:10:56:65:10:10:58:67 chr1 17087262 . C T 112.81 PASS AF=0.183486;AO=20;DP=109;FAO=20;FDP=109;FR=.;FRO=89;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=63;FWDB=0.0983311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1054;QD=4.13989;RBI=0.115148;REFB=0.00980208;REVB=0.0599172;RO=89;SAF=2;SAR=18;SRF=26;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377479;STB=0.756436;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0421374;OID=.;OPOS=17087262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:89:89:20:20:0.183486:18:2:26:63:18:2:26:63 chr1 17087305 . G C 39.47 PASS AF=0.0839161;AO=12;DP=143;FAO=12;FDP=143;FR=.;FRO=131;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=93;FWDB=-0.0369706;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.252;QD=1.10403;RBI=0.0527406;REFB=-0.00526406;REVB=-0.0376131;RO=131;SAF=6;SAR=6;SRF=38;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253122;STB=0.692035;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0749417;OID=.;OPOS=17087305;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:143:143:131:131:12:12:0.0839161:6:6:38:93:6:6:38:93 chr1 17087365 . C G 1072.67 PASS AF=0.738095;AO=82;DP=115;FAO=93;FDP=126;FR=.;FRO=33;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0324518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.972;QD=34.053;RBI=0.0428902;REFB=-0.0477993;REVB=0.0280438;RO=33;SAF=39;SAR=43;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373493;STB=0.533534;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0200355;OID=.;OPOS=17087365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:126:33:33:82:93:0.738095:43:39:18:15:54:39:18:15 chr1 17087465 . G A 399.93 PASS AF=0.309942;AO=53;DP=172;FAO=53;FDP=171;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=53;FSRR=65;FWDB=-0.0131078;FXX=0.00581362;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.23;QD=9.35515;RBI=0.014314;REFB=-0.0199581;REVB=-0.00575119;RO=118;SAF=30;SAR=23;SRF=53;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138372;STB=0.580317;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.040029;OID=.;OPOS=17087465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:118:118:53:53:0.309942:23:30:53:65:23:30:53:65 chr1 17087541 . GGTGCT G 103.07 PASS AF=0.202532;AO=32;DP=169;FAO=32;FDP=158;FR=.;FRO=126;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=83;FWDB=0.00114932;FXX=0.030673;HRUN=2;LEN=5;MLLD=259.796;QD=2.60946;RBI=0.0171571;REFB=-0.000490507;REVB=-0.0171185;RO=130;SAF=16;SAR=16;SRF=45;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199113;STB=0.626508;STBP=0.147;TYPE=del;VARB=0.00204412;OID=.;OPOS=17087542;OREF=GTGCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.202532:32:169:32:158:126:16:16:43:83:99:130:16:16:45:85 chr1 17087582 . G A 341.6 PASS AF=0.303448;AO=44;DP=145;FAO=44;FDP=145;FR=.;FRO=101;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=66;FWDB=0.0355418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.794;QD=9.42335;RBI=0.0361391;REFB=-0.00425928;REVB=0.00654346;RO=101;SAF=19;SAR=25;SRF=35;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105835;STB=0.561519;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0139974;OID=.;OPOS=17087582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:101:101:44:44:0.303448:25:19:35:66:25:19:35:66 chr1 17090944 . G A 63.56 PASS AF=0.134021;AO=13;DP=97;FAO=13;FDP=97;FR=.;FRO=84;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=-0.0595178;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.8409;QD=2.62123;RBI=0.0664012;REFB=-9.89772e-05;REVB=0.0294406;RO=84;SAF=9;SAR=4;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320047;STB=0.721891;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.000787072;OID=.;OPOS=17090944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:97:97:84:84:13:13:0.134021:4:9:36:48:4:9:36:48 chr1 17186680 . T G 54.83 PASS AF=0.0958084;AO=16;DP=167;FAO=16;FDP=167;FR=.;FRO=151;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=78;FSRR=73;FWDB=0.00680152;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=41.8988;QD=1.31335;RBI=0.0271961;REFB=-0.00456988;REVB=0.0263319;RO=149;SAF=5;SAR=11;SRF=78;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250353;STB=0.68469;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0487107;OID=.;OPOS=17186680;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:167:167:149:151:16:16:0.0958084:11:5:78:71:11:5:78:73 chr1 17186685 . T C 335.91 PASS AF=0.269663;AO=48;DP=178;FAO=48;FDP=178;FR=.;FRO=130;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=64;FSRR=66;FWDB=0.0242645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9903;QD=7.54844;RBI=0.0370714;REFB=-0.0102287;REVB=0.0280272;RO=130;SAF=26;SAR=22;SRF=64;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608599;STB=0.536067;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0276997;OID=.;OPOS=17186685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:130:130:48:48:0.269663:22:26:64:66:22:26:64:66 chr1 17186719 . T G 442.4 PASS AF=0.295567;AO=59;DP=202;FAO=60;FDP=203;FR=.;FRO=143;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=69;FSRR=74;FWDB=0.00361999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8738;QD=8.71726;RBI=0.0451701;REFB=-0.00256086;REVB=0.0450248;RO=143;SAF=31;SAR=28;SRF=69;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051922;STB=0.524036;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00691395;OID=.;OPOS=17186719;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:143:143:59:60:0.295567:28:31:69:74:29:31:69:74 chr1 17186742 . C T 602.59 PASS AF=0.357488;AO=74;DP=208;FAO=74;FDP=207;FR=.;FRO=133;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=60;FSRR=73;FWDB=-0.00767831;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.894;QD=11.6442;RBI=0.0121744;REFB=-0.0027309;REVB=-0.00944775;RO=132;SAF=36;SAR=38;SRF=58;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053211;STB=0.522757;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00516462;OID=.;OPOS=17186742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:132:133:74:74:0.357488:38:36:58:74:38:36:60:73 chr1 17197563 . G T 309.21 PASS AF=0.294964;AO=41;DP=139;FAO=41;FDP=139;FR=.;FRO=98;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=-0.0220444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4279;QD=8.89811;RBI=0.0379951;REFB=-0.00965168;REVB=-0.0309463;RO=98;SAF=26;SAR=15;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103775;STB=0.561052;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0226146;OID=.;OPOS=17197563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:98:98:41:41:0.294964:15:26:54:44:15:26:54:44 chr1 17197571 . G A 227.4 PASS AF=0.237762;AO=34;DP=143;FAO=34;FDP=143;FR=.;FRO=109;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=49;FWDB=-0.0143524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.057;QD=6.3608;RBI=0.0308693;REFB=-0.00569252;REVB=-0.0273299;RO=108;SAF=23;SAR=11;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160204;STB=0.60177;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0328576;OID=.;OPOS=17197571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:108:109:34:34:0.237762:11:23:60:48:11:23:60:49 chr1 17197595 . A C 317.87 PASS AF=0.28125;AO=45;DP=160;FAO=45;FDP=160;FR=.;FRO=115;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=-0.00144845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.846;QD=7.94683;RBI=0.0483138;REFB=-0.00349393;REVB=-0.048292;RO=115;SAF=29;SAR=16;SRF=62;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133188;STB=0.57879;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0104352;OID=.;OPOS=17197595;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:115:115:45:45:0.28125:16:29:62:53:16:29:62:53 chr1 17197609 . T C 345.57 PASS AF=0.289157;AO=48;DP=166;FAO=48;FDP=166;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=64;FSRR=54;FWDB=0.00205513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.509;QD=8.32704;RBI=0.0111222;REFB=-0.00256222;REVB=0.0109307;RO=116;SAF=30;SAR=18;SRF=62;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112394;STB=0.560722;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00714802;OID=.;OPOS=17197609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:116:118:48:48:0.289157:18:30:62:54:18:30:64:54 chr1 17197615 . C A 343.92 PASS AF=0.292683;AO=47;DP=163;FAO=48;FDP=164;FR=.;FRO=116;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=63;FSRR=53;FWDB=0.0246066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.193;QD=8.38816;RBI=0.0283452;REFB=-0.00610773;REVB=0.0140701;RO=116;SAF=30;SAR=17;SRF=63;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119637;STB=0.559912;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0100892;OID=.;OPOS=17197615;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:116:116:47:48:0.292683:17:30:63:53:18:30:63:53 chr1 17197619 . A G 348.25 PASS AF=0.294479;AO=48;DP=163;FAO=48;FDP=163;FR=.;FRO=115;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=0.00311698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.856;QD=8.54609;RBI=0.00761509;REFB=-0.0144992;REVB=-0.00694795;RO=115;SAF=30;SAR=18;SRF=62;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106629;STB=0.562573;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0242079;OID=.;OPOS=17197619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:115:115:48:48:0.294479:18:30:62:53:18:30:62:53 chr1 17199074 . T C 416.65 PASS AF=0.65;AO=39;DP=60;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0274555;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.484;QD=27.7766;RBI=0.0277763;REFB=-0.00736429;REVB=0.0042096;RO=21;SAF=26;SAR=13;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012185;OID=.;OPOS=17199074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:21:21:39:39:0.65:13:26:14:7:13:26:14:7 chr1 17199076 . T A 429.41 PASS AF=0.655738;AO=39;DP=60;FAO=40;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00850568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.103;QD=28.1578;RBI=0.0324876;REFB=-0.0344839;REVB=0.0313544;RO=19;SAF=26;SAR=13;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235488;STB=0.506326;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0253114;OID=.;OPOS=17199076;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:19:21:39:40:0.655738:13:26:12:7:14:26:14:7 chr1 17199142 . C T 68.21 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.0151976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.236;QD=5.568;RBI=0.0544407;REFB=-0.0111191;REVB=-0.0522764;RO=39;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.531707;STB=0.82745;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0534193;OID=.;OPOS=17199142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:39:39:10:10:0.204082:3:7:9:30:3:7:9:30 chr1 17200227 . C A 59.89 PASS AF=0.0747664;AO=24;DP=321;FAO=24;FDP=321;FR=.;FRO=297;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=144;FSRR=153;FWDB=-0.0155899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.0771;QD=0.746338;RBI=0.021526;REFB=2.02722e-05;REVB=-0.0148433;RO=296;SAF=14;SAR=10;SRF=144;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109096;STB=0.59081;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.000610311;OID=.;OPOS=17200227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:321:321:296:297:24:24:0.0747664:10:14:144:152:10:14:144:153 chr1 17200270 . T G 2650.27 PASS AF=0.524691;AO=255;DP=487;FAO=255;FDP=486;FR=.;FRO=231;FSAF=118;FSAR=137;FSRF=116;FSRR=115;FWDB=0.00638742;FXX=0.00205335;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5791;QD=21.8129;RBI=0.0535533;REFB=-0.0356466;REVB=0.053171;RO=231;SAF=118;SAR=137;SRF=116;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344743;STB=0.518787;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0305819;OID=.;OPOS=17200270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:487:486:231:231:255:255:0.524691:137:118:116:115:137:118:116:115 chr1 17200289 . C T 2971.52 PASS AF=0.532588;AO=264;DP=511;FAO=286;FDP=537;FR=.;FRO=251;FSAF=134;FSAR=152;FSRF=123;FSRR=128;FWDB=-0.0411599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2758;QD=22.1342;RBI=0.120302;REFB=-0.0554883;REVB=0.113042;RO=247;SAF=134;SAR=130;SRF=119;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228513;STB=0.51008;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0486086;OID=.;OPOS=17200289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:511:537:247:251:264:286:0.532588:130:134:119:128:152:134:123:128 chr1 17216233 . C A 346.99 PASS AF=0.4;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0263913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.249;QD=14.61;RBI=0.0285412;REFB=-0.0152315;REVB=-0.0108671;RO=57;SAF=17;SAR=21;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282448;STB=0.516012;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0194688;OID=.;OPOS=17216233;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:57:57:38:38:0.4:21:17:24:33:21:17:24:33 chr1 17250836 . A G 92.23 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.032106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.636;QD=18.4453;RBI=0.041293;REFB=-0.0222804;REVB=-0.0259677;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153845;STB=0.588621;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0152816;OID=.;OPOS=17250836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:4:7:4:5:4:7:4:5 chr1 17264920 . C T 134.56 PASS AF=0.246914;AO=20;DP=81;FAO=20;FDP=81;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0316733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9387;QD=6.6449;RBI=0.0316742;REFB=-0.0248691;REVB=-0.000235963;RO=60;SAF=11;SAR=9;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102075;STB=0.568198;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0310454;OID=.;OPOS=17264920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:60:61:20:20:0.246914:9:11:28:32:9:11:28:33 chr1 17264939 . T C 129.03 PASS AF=0.256757;AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.00759472;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.111;QD=6.97435;RBI=0.0395449;REFB=-0.0116711;REVB=-0.0388087;RO=55;SAF=11;SAR=8;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172684;STB=0.604968;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0283936;OID=.;OPOS=17264939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:55:55:19:19:0.256757:8:11:24:31:8:11:24:31 chr1 17267302 . A G 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00404016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.266;QD=12.8607;RBI=0.00491572;REFB=-0.0140514;REVB=-0.00280025;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639024;STB=0.538351;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.013162;OID=.;OPOS=17267302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:4:4:3:4:4:4 chr1 17273396 . A G 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0382702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.876;QD=8.24618;RBI=0.0395316;REFB=-0.000520381;REVB=0.00990649;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420002;STB=0.52624;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.000633328;OID=.;OPOS=17273396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:8:7:3:4:8:7 chr1 17273444 . G A 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00273809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.285;QD=7.76204;RBI=0.0171478;REFB=-0.0219603;REVB=0.0169278;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414775;STB=0.526228;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0466572;OID=.;OPOS=17273444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:7:6:3:3:7:6 chr1 17295679 . T C 411.59 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.766;QD=56.7716;RBI=0.0416702;REFB=0;REVB=0.0377039;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156176;OID=.;OPOS=17295679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:12:17:0:0 chr1 17301780 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.714;QD=55.6561;RBI=0.0316852;REFB=0;REVB=-0.0249259;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60238e-05;OID=.;OPOS=17301780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0 chr1 17312743 . C T 385.21 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.881;QD=55.0297;RBI=0.036304;REFB=0;REVB=0.00490753;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000918624;OID=.;OPOS=17312743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:21:6:0:0:22:6:0:0 chr1 17313343 . G A 453.75 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0799149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1158;QD=54.9996;RBI=0.0926695;REFB=-0.00669118;REVB=0.0469176;RO=1;SAF=21;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217181;STB=0.511621;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.000326798;OID=.;OPOS=17313343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:11:21:1:0:11:21:1:0 chr1 17313654 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.936;QD=43.4861;RBI=0.0562374;REFB=0;REVB=0.038832;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803106;OID=.;OPOS=17313654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0 chr1 17314942 . G A 910.63 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0046958;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5527;QD=56.9141;RBI=0.0293177;REFB=-0.107904;REVB=0.0289392;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00248339;OID=.;OPOS=17314942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:64:0:1:63:63:0.984375:32:31:0:0:32:31:0:1 chr1 17319011 . G A 374.32 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434236;FXX=0.0357015;HRUN=5;LEN=1;MLLD=232.083;QD=55.4547;RBI=0.0489009;REFB=0;REVB=0.0224876;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287636;OID=.;OPOS=17319011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0 chr1 17380497 . G T 1569.46 PASS AF=0.981818;AO=106;DP=111;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0483215;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.468;QD=57.0713;RBI=0.0483575;REFB=-0.0994318;REVB=0.00186498;RO=1;SAF=41;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00724621;STB=0.50193;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00103576;OID=.;OPOS=17380497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:111:110:1:2:106:108:0.981818:65:41:0:1:65:43:1:1 chr1 17394613 . T C 746.69 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.353;QD=56.354;RBI=0.0522078;REFB=0;REVB=0.0492928;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460986;OID=.;OPOS=17394613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:29:24:0:0 chr1 17394623 . C T 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.014;QD=57.7114;RBI=0.0542015;REFB=0;REVB=-0.00238343;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019337;OID=.;OPOS=17394623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr1 17395480 . G A 853.04 PASS AF=0.953125;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00825644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.982;QD=53.315;RBI=0.0657481;REFB=-0.151289;REVB=0.0652276;RO=1;SAF=32;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145233;STB=0.508976;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00247366;OID=.;OPOS=17395480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:64:64:1:3:61:61:0.953125:29:32:1:0:29:32:1:2 chr1 17395521 . G A 1172.2 PASS AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.242;QD=58.6099;RBI=0.108023;REFB=-0.11574;REVB=0.10608;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000997702;OID=.;OPOS=17395521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:80:0:0:78:80:1:39:39:0:0:41:39:0:0 chr1 17396703 . T C 536.84 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.356;QD=59.6488;RBI=0.0207199;REFB=0;REVB=0.00379643;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77834e-05;OID=.;OPOS=17396703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:22:13:0:0:22:14:0:0 chr1 17402255 . C T 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.923;QD=54.5174;RBI=0.0587044;REFB=0;REVB=0.0198209;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354556;OID=.;OPOS=17402255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr1 17405809 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.886;QD=61.684;RBI=0.0399712;REFB=0;REVB=0.0376075;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111253;OID=.;OPOS=17405809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr1 17609448 . G T 1339.72 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.181;QD=62.3127;RBI=0.0387794;REFB=0;REVB=0.0248371;RO=0;SAF=37;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267809;OID=.;OPOS=17609448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:49:37:0:0:49:37:0:0 chr1 17657534 . G A 360.12 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0279284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.506;QD=22.8645;RBI=0.0280733;REFB=0.00319599;REVB=-0.00284785;RO=27;SAF=16;SAR=20;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588241;STB=0.532356;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.00298269;OID=.;OPOS=17657534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:20:16:10:17:20:16:10:17 chr1 17657616 . T C 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0208175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.924;QD=17.9407;RBI=0.024394;REFB=-0.0165309;REVB=0.0127162;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117542;STB=0.566939;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.013722;OID=.;OPOS=17657616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:11:8:12:10:11:8:12:10 chr1 17661128 . A C 223.17 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3002;QD=49.5941;RBI=0.142219;REFB=0;REVB=0.125309;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00704333;OID=.;OPOS=17661128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr1 17662639 . T C 64.07 PASS AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0130876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0139;QD=9.49159;RBI=0.0131535;REFB=0.0100936;REVB=-0.00131518;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353661;STB=0.713832;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.0408238;OID=.;OPOS=17662639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:3:6:6:12:3:6:6:12 chr1 17662662 . T C 519.79 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3413;QD=59.4049;RBI=0.0590263;REFB=0;REVB=-0.0132474;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000854337;OID=.;OPOS=17662662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr1 17674537 . C A 360.25 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00956165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5786;QD=32.0218;RBI=0.0102947;REFB=-0.0292345;REVB=0.00381523;RO=15;SAF=21;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751276;STB=0.540957;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0157319;OID=.;OPOS=17674537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:9:21:12:3:9:21:12:3 chr1 17707601 . T C 852.68 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.151;QD=57.8087;RBI=0.081182;REFB=0;REVB=0.0653517;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276352;OID=.;OPOS=17707601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:36:21:0:0:38:21:0:0 chr1 17718671 . AG A 794.67 PASS AF=1;AO=66;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.7423;QD=45.4096;RBI=0.18715;REFB=0;REVB=0.156043;RO=2;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0.445205;SSEP=0;SSSB=0.024218;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00486411;OID=.;OPOS=17718672;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:66:70:70:70:0:29:41:0:0:14:2:28:38:0:2 chr1 17733267 . ATGT A 1293.35 PASS AF=1;AO=80;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000665625;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=3;MLLD=195.698;QD=61.5882;RBI=0.00462783;REFB=0;REVB=0.00457971;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.64227e-06;OID=.;OPOS=17733268;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:80:84:84:84:0:35:49:0:0:7:0:33:47:0:0 chr1 17733996 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6107;QD=55.6559;RBI=0.0481008;REFB=0;REVB=0.0430144;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013952;OID=.;OPOS=17733996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0 chr1 17991052 . T C 181.39 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145335;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.169;QD=48.3707;RBI=0.0510806;REFB=0;REVB=-0.0489695;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000681506;OID=.;OPOS=17991052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr1 18021406 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0649411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.487;QD=33.4285;RBI=0.0789463;REFB=0;REVB=0.0448906;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105174;OID=.;OPOS=18021406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr1 18023365 . C T 519.99 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.364;QD=59.4273;RBI=0.0540833;REFB=0;REVB=0.0415226;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196463;OID=.;OPOS=18023365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0 chr1 18023509 . T C 769.43 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00768787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.346;QD=56.9949;RBI=0.0087499;REFB=0;REVB=0.00417821;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.01684e-05;OID=.;OPOS=18023509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:35:19:0:0:35:19:0:0 chr1 18023690 . A G 563.96 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.288;QD=59.3646;RBI=0.0369129;REFB=0;REVB=0.00155516;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180778;OID=.;OPOS=18023690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:19:19:0:0 chr1 18149510 . G T 147.46 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0107552;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.203;QD=16.3845;RBI=0.0173397;REFB=-0.023052;REVB=-0.0136012;RO=20;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249699;STB=0.642687;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0206546;OID=.;OPOS=18149510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:20:20:16:16:0.444444:7:9:6:14:7:9:6:14 chr1 18149566 . C A 253.61 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0292746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.263;QD=17.4901;RBI=0.029507;REFB=-0.00991818;REVB=0.00369548;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588617;STB=0.532972;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00861446;OID=.;OPOS=18149566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:16:12:11:19:16:12:11:19 chr1 18807897 . C G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137175;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.785;QD=48.7373;RBI=0.0191182;REFB=0;REVB=0.0133168;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106957;OID=.;OPOS=18807897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr1 18807938 . C A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.694;QD=44.6898;RBI=0.010962;REFB=0;REVB=0.00247788;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66662e-05;OID=.;OPOS=18807938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr1 18808292 . C A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.862;QD=57.202;RBI=0.0492018;REFB=0;REVB=0.0339975;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306573;OID=.;OPOS=18808292;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr1 18808465 . T A 1434.43 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.819;QD=63.0519;RBI=0.0420542;REFB=0;REVB=0.0395362;RO=0;SAF=60;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9511e-05;OID=.;OPOS=18808465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:31:60:0:0:31:60:0:0 chr1 18808526 . A C 1434.42 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.134;QD=63.0515;RBI=0.0280285;REFB=0;REVB=-0.0192623;RO=1;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129832;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28303e-07;OID=.;OPOS=18808526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:1:0:90:91:1:36:54:0:1:37:54:0:0 chr1 18808711 . G C 421.91 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00465104;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.175;QD=54.4403;RBI=0.0129457;REFB=0.105381;REVB=0.0120813;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512812;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=5.60744e-05;OID=.;OPOS=18808711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:31:0:1:30:30:0.967742:11:19:0:0:11:19:1:0 chr1 18809896 . A T 582.44 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00241501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.12;QD=58.2439;RBI=0.00361467;REFB=-0.136917;REVB=0.00268953;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000661806;OID=.;OPOS=18809896;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:15:24:0:0:15:24:1:0 chr1 18810344 . G T 668.97 PASS AF=0.978261;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0411606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.151;QD=58.1717;RBI=0.0560145;REFB=-0.154241;REVB=0.0379924;RO=1;SAF=19;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240734;STB=0.5102;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00163443;OID=.;OPOS=18810344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:45:46:1:1:43:45:0.978261:24:19:1:0:24:21:0:1 chr1 18810484 . G A 873.43 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.111;QD=56.3503;RBI=0.252804;REFB=0;REVB=0.119264;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54721e-05;OID=.;OPOS=18810484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:34:25:0:0:35:27:0:0 chr1 18810486 . A C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.71;QD=58.2396;RBI=0.0194755;REFB=0;REVB=-0.00449685;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.83536e-05;OID=.;OPOS=18810486;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0 chr1 18811668 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.265;QD=33.4285;RBI=0.0658857;REFB=0;REVB=0.0641332;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000763888;OID=.;OPOS=18811668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr1 19018405 . G A 515.36 PASS AF=0.526882;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0203553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3671;QD=22.1659;RBI=0.039056;REFB=-0.000956042;REVB=0.0333322;RO=43;SAF=28;SAR=21;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110235;STB=0.566127;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00101854;OID=.;OPOS=19018405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:43:44:49:49:0.526882:21:28:19:24:21:28:19:25 chr1 19018432 . A C 361.07 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00495157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.941;QD=20.3419;RBI=0.0183911;REFB=-0.0165977;REVB=-0.017712;RO=34;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842007;STB=0.546682;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0175315;OID=.;OPOS=19018432;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:16:21:16:18:16:21:16:18 chr1 19027239 . A G 335.19 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.103584;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2417;QD=28.5269;RBI=0.103799;REFB=-0.0428729;REVB=0.00668757;RO=16;SAF=5;SAR=24;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561836;STB=0.524122;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0284718;OID=.;OPOS=19027239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:18:29:29:0.617021:24:5:2:14:23:6:3:15 chr1 19181082 . A C 38.14 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0189347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.109;QD=10.1714;RBI=0.0243918;REFB=-0.0113653;REVB=0.0153765;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.59968;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0159763;OID=.;OPOS=19181082;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:3:3:6:3:3:3:6:3 chr1 19181393 . T C 317.56 PASS AF=0.507463;AO=33;DP=66;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.019106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.867;QD=18.9585;RBI=0.0326426;REFB=-0.0349409;REVB=0.0264669;RO=33;SAF=22;SAR=11;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298878;STB=0.653756;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0185009;OID=.;OPOS=19181393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:33:33:33:34:0.507463:11:22:11:22:12:22:11:22 chr1 19184077 . A G 373.25 PASS AF=0.75;AO=30;DP=40;FAO=30;FDP=40;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0254226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.959;QD=37.3245;RBI=0.0268206;REFB=0.0164944;REVB=-0.00854608;RO=10;SAF=21;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152824;STB=0.583275;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.00837127;OID=.;OPOS=19184077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:40:40:10:10:30:30:0.75:9:21:4:6:9:21:4:6 chr1 19186129 . G C 1460.04 PASS AF=0.959596;AO=95;DP=99;FAO=95;FDP=99;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0248189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.178;QD=58.9914;RBI=0.0315771;REFB=-0.0555016;REVB=-0.0195227;RO=1;SAF=32;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145863;STB=0.529405;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000698406;OID=.;OPOS=19186129;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:99:99:1:4:95:95:0.959596:63:32:1:0:63:32:4:0 chr1 19201956 . A G 796.51 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.143;QD=63.7209;RBI=0.0239985;REFB=0;REVB=0.0119529;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000780527;OID=.;OPOS=19201956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:30:19:0:0:30:20:0:0 chr1 19202896 . G A 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.142;QD=59.1432;RBI=0.0411576;REFB=0;REVB=0.00278792;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3354e-05;OID=.;OPOS=19202896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr1 19202917 . T C 755.61 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096154;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.77;QD=57.0268;RBI=0.0103577;REFB=0;REVB=0.00385039;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97135e-05;OID=.;OPOS=19202917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0 chr1 19202926 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.752;QD=62.6705;RBI=0.0300879;REFB=0;REVB=-0.00958305;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.24831e-05;OID=.;OPOS=19202926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr1 19203997 . C G 909.79 PASS AF=0.585714;AO=82;DP=141;FAO=82;FDP=140;FR=.;FRO=58;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.013258;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.757;QD=25.994;RBI=0.0145894;REFB=-0.0286017;REVB=0.00608918;RO=59;SAF=55;SAR=27;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934308;STB=0.546207;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0164186;OID=.;OPOS=19203997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:59:58:82:82:0.585714:27:55:33:26:27:55:33:25 chr1 19235138 . C T 373.9 PASS AF=0.52;AO=35;DP=72;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0704982;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.99;QD=19.9415;RBI=0.0704982;REFB=-0.0269504;REVB=-3.78471e-05;RO=35;SAF=14;SAR=21;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204164;STB=0.596561;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0248082;OID=.;OPOS=19235138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:75:35:36:35:39:0.52:21:14:22:13:22:17:23:13 chr1 19408294 . G GC 50.98 PASS AF=0.3125;AO=9;DP=33;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0305388;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.3391;QD=6.37294;RBI=0.0305416;REFB=-0.0221992;REVB=0.00041141;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312079;STB=0.725171;STBP=0.105;TYPE=ins;VARB=0.0316551;OID=.;OPOS=19408295;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3125:9:33:10:32:22:3:7:14:8:50:23:3:6:14:9 chr1 19411129 . A G 317.11 PASS AF=0.465753;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.00405637;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8569;QD=17.3758;RBI=0.033744;REFB=-0.00651882;REVB=-0.0334994;RO=38;SAF=19;SAR=15;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961259;STB=0.559204;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0085106;OID=.;OPOS=19411129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:73:38:39:34:34:0.465753:15:19:25:13:15:19:26:13 chr1 19413261 . T A 425.05 PASS AF=0.577465;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00436714;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.773;QD=23.9466;RBI=0.0106456;REFB=-0.0178276;REVB=0.00970858;RO=30;SAF=11;SAR=30;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228137;STB=0.625901;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.017902;OID=.;OPOS=19413261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:30:30:41:41:0.577465:30:11:16:14:30:11:16:14 chr1 19415304 . C T 374.85 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0366921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.236;QD=21.1185;RBI=0.0536687;REFB=-0.0374462;REVB=0.0391665;RO=32;SAF=18;SAR=20;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124785;STB=0.561268;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0348941;OID=.;OPOS=19415304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:33:38:38:0.535211:20:18:20:12:20:18:20:13 chr1 19422060 . G A 277.86 PASS AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00251806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.78;QD=13.7213;RBI=0.00578054;REFB=-0.0170042;REVB=0.00520327;RO=49;SAF=17;SAR=15;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000679258;STB=0.500387;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0230722;OID=.;OPOS=19422060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:49:32:32:0.395062:15:17:26:23:15:17:26:23 chr1 19433449 . A G 324.49 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0333468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.057;QD=19.6661;RBI=0.0334844;REFB=0.0060741;REVB=-0.00303333;RO=32;SAF=16;SAR=18;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052904;STB=0.529394;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.0038819;OID=.;OPOS=19433449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:18:16:17:15:18:16:17:15 chr1 19447843 . C G 223.86 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0839084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.718;QD=19.4664;RBI=0.0977519;REFB=-0.0529974;REVB=-0.050148;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180797;STB=0.50199;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0529918;OID=.;OPOS=19447843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:10:12:13:10:10:12:13:11 chr1 19471388 . A G 288.83 PASS AF=0.444444;AO=31;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0528563;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2991;QD=16.0462;RBI=0.0528737;REFB=0.0138441;REVB=-0.00135584;RO=40;SAF=5;SAR=26;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456022;STB=0.73371;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00790129;OID=.;OPOS=19471388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:31:32:0.444444:26:5:22:18:26:6:22:18 chr1 19493520 . T G 340.95 PASS AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0369905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.279;QD=20.9815;RBI=0.037035;REFB=0.00638118;REVB=0.00181345;RO=30;SAF=15;SAR=20;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115343;STB=0.56384;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.00570379;OID=.;OPOS=19493520;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:20:15:17:13:20:15:17:13 chr1 19510394 . A G 349.28 PASS AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00306509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.232;QD=25.4019;RBI=0.00632012;REFB=0.00150079;REVB=-0.00552713;RO=21;SAF=15;SAR=19;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123574;STB=0.56773;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.00150739;OID=.;OPOS=19510394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:21:21:34:34:0.618182:19:15:13:8:19:15:13:8 chr1 19565344 . C G 317.14 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0311941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.851;QD=25.8886;RBI=0.037111;REFB=-0.0481523;REVB=0.0201035;RO=19;SAF=20;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194787;STB=0.592036;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0390211;OID=.;OPOS=19565344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:19:21:28:28:0.571429:8:20:9:10:8:20:11:10 chr1 19595137 . C T 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.025;QD=62.3496;RBI=0.0414878;REFB=0;REVB=0.0411193;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192199;OID=.;OPOS=19595137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr1 19596124 . C T 1396.44 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3888;QD=62.7613;RBI=0.044396;REFB=0;REVB=-0.0379747;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.97244e-05;OID=.;OPOS=19596124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:44:45:0:0:44:45:0:0 chr1 19596156 . G T 1283.21 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4942;QD=61.8416;RBI=0.0487142;REFB=0;REVB=0.024352;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404301;OID=.;OPOS=19596156;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0 chr1 19597420 . G T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0294752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.785;QD=11.9536;RBI=0.0402977;REFB=-0.017238;REVB=0.0274794;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763832;STB=0.507025;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0169051;OID=.;OPOS=19597420;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:10:11:8:8:0.421053:5:3:3:7:5:3:4:7 chr1 19609254 . T C 891.04 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00185393;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.991;QD=58.4288;RBI=0.114827;REFB=0;REVB=0.114812;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151954;OID=.;OPOS=19609254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0 chr1 19611241 . T C 563.76 PASS AF=0.974359;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0724926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2981;QD=57.822;RBI=0.0964905;REFB=0.0500639;REVB=-0.0636808;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.00162616;OID=.;OPOS=19611241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:37:38:0.974359:19:18:0:1:19:19:0:1 chr1 19612477 . C T 393.7 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9206;QD=56.2434;RBI=0.0435629;REFB=0;REVB=0.0289236;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00080742;OID=.;OPOS=19612477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:10:18:0:0 chr1 19638384 . C T 226.0 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00579296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.786;QD=20.5457;RBI=0.0177153;REFB=-0.0128741;REVB=-0.0167414;RO=22;SAF=4;SAR=18;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643273;STB=0.536389;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.01186;OID=.;OPOS=19638384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:18:4:5:17:18:4:5:17 chr1 19750917 . G A 999.06 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0448563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.416;QD=56.2851;RBI=0.0500217;REFB=-0.133077;REVB=0.0221378;RO=2;SAF=34;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000385837;STB=0.500204;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00089723;OID=.;OPOS=19750917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:71:2:2:69:69:0.971831:35:34:1:1:35:34:1:1 chr1 19951918 . G A 182.4 PASS AF=0.365079;AO=22;DP=62;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00660078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.089;QD=11.581;RBI=0.0128305;REFB=-0.0054673;REVB=-0.0110023;RO=39;SAF=17;SAR=5;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437133;STB=0.754105;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0216612;OID=.;OPOS=19951918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:39:40:22:23:0.365079:5:17:15:24:5:18:16:24 chr1 19953118 . G T 766.44 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9108;QD=63.8703;RBI=0.00788427;REFB=0;REVB=0.00193309;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124607;OID=.;OPOS=19953118;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0 chr1 20020993 . A G 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0253413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.441;QD=19.6923;RBI=0.0258039;REFB=-0.0195349;REVB=0.00486419;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860871;STB=0.548156;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0254896;OID=.;OPOS=20020993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:12:14:11:14:12:14:11:14 chr1 20097941 . G T 144.18 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00151888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.14;QD=24.0303;RBI=0.0170458;REFB=-0.0405448;REVB=0.016978;RO=9;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166737;STB=0.593102;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0307322;OID=.;OPOS=20097941;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:7:8:7:2:7:8:7:2 chr1 20141528 . C T 790.93 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00677563;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.961;QD=64.5657;RBI=0.0364268;REFB=0;REVB=0.0357911;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411178;OID=.;OPOS=20141528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0 chr1 20141605 . G C 109.9 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0141828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.0549;QD=14.6533;RBI=0.0487478;REFB=-0.00375684;REVB=-0.046639;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122807;STB=0.57132;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00139962;OID=.;OPOS=20141605;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:7:6:10:7:7:6:10:7 chr1 20246876 . C T 1305.5 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159676;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.704;QD=62.1669;RBI=0.0405205;REFB=0;REVB=0.0372417;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.19528e-05;OID=.;OPOS=20246876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0 chr1 20411332 . C T 605.04 PASS AF=0.437086;AO=66;DP=151;FAO=66;FDP=151;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=0.00291201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.514;QD=16.0276;RBI=0.0101372;REFB=-0.0170473;REVB=-0.00970989;RO=84;SAF=30;SAR=36;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751741;STB=0.544662;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0221876;OID=.;OPOS=20411332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:84:85:66:66:0.437086:36:30:32:52:36:30:32:53 chr1 20442054 . T C 331.29 PASS AF=0.381443;AO=37;DP=97;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.00225448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.174;QD=13.6614;RBI=0.00569875;REFB=-0.0128428;REVB=0.00523384;RO=60;SAF=16;SAR=21;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556961;STB=0.531778;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0205387;OID=.;OPOS=20442054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:60:60:37:37:0.381443:21:16:29:31:21:16:29:31 chr1 20518226 . G A 1250.0 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00408089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.711;QD=60.2408;RBI=0.0119827;REFB=0.00497165;REVB=0.0112664;RO=1;SAF=39;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119881;STB=0.506328;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-5.82196e-05;OID=.;OPOS=20518226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:43:39:1:0:43:39:1:0 chr1 20656824 . A G 342.48 PASS AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0259585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.81;QD=16.1165;RBI=0.0316822;REFB=-0.0164898;REVB=-0.0181637;RO=48;SAF=23;SAR=14;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145549;STB=0.582045;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0355664;OID=.;OPOS=20656824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:0.435294:14:23:23:25:14:23:23:25 chr1 20662938 . A G 201.54 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00799157;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.342;QD=13.8996;RBI=0.0209806;REFB=-0.0138049;REVB=0.019399;RO=34;SAF=6;SAR=18;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945441;STB=0.5543;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0157118;OID=.;OPOS=20662938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:18:6:11:23:18:6:11:23 chr1 20671961 . G A 198.03 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00243042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.976;QD=13.2021;RBI=0.00260648;REFB=-0.00716171;REVB=-0.000941719;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437018;STB=0.525049;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0140765;OID=.;OPOS=20671961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:13:11:18:18:13:11:18:18 chr1 20972048 . G A,C 618.69 PASS AF=0.95122,0.0487805;AO=39,2;DP=41;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19,1;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394991,-0.0155807;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=80.8279,141.934;QD=60.3597;RBI=0.0398425,0.0171001;REFB=0,0;REVB=0.00521968,-0.00704663;RO=0;SAF=19,1;SAR=20,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.3303e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00215271,0.114274;OID=.,.;OPOS=20972048,20972048;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:41:41:0:0:39,2:39,2:0.95122,0.0487805:20,1:19,1:0:0:20,1:19,1:0:0 chr1 20972111 . G A 224.01 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.013582;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.726;QD=14.9342;RBI=0.038597;REFB=-0.0100443;REVB=-0.0361283;RO=34;SAF=13;SAR=13;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587296;STB=0.533308;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0195889;OID=.;OPOS=20972111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:34:34:26:26:0.433333:13:13:15:19:13:13:15:19 chr1 20977000 . A C 237.59 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0016744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.318;QD=18.6347;RBI=0.0111021;REFB=-0.0068605;REVB=0.0109751;RO=26;SAF=20;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292783;STB=0.666518;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0085821;OID=.;OPOS=20977000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:5:20:14:12:5:20:14:12 chr1 20987873 . G C 990.63 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.959;QD=59.1422;RBI=0.0567913;REFB=0;REVB=0.0162758;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296445;OID=.;OPOS=20987873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:29:38:0:0:29:38:0:0 chr1 20992819 . G C 296.12 PASS AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.000169682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6648;QD=28.8899;RBI=0.085876;REFB=0.018631;REVB=0.0858759;RO=15;SAF=18;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324497;STB=0.517844;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=-0.00900848;OID=.;OPOS=20992819;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:8:18:11:4:8:18:11:4 chr1 20998445 . GT GG,G,TG 940.27 PASS AF=0,0.828829,0.144144;AO=23,17,16;DP=112;FAO=0,92,16;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=0,48,0;FSAR=0,44,16;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.460502,0.937757,0.118344;FXX=0.0176975;HRUN=5,5,2;LEN=1,1,2;MLLD=13.32,12.2962,170.056;QD=33.8835;RBI=0.479007,0.938301,0.119048;REFB=0.197509,0.084907,-0.0430214;REVB=-0.131855,0.0319496,-0.0129246;RO=50;SAF=0,1,0;SAR=23,16,16;SRF=45;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.879069,-0.823713,-0.868577;STB=0.5,0.51648,0.5;STBP=1,0.085,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0,0.0463999,0.0920332;OID=.,.,.;OPOS=20998446,20998446,20998445;OREF=T,T,GT;OALT=G,-,TG;OMAPALT=GG,G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:81:112:111:50:3:23,17,16:0,92,16:0,0.828829,0.144144:23,16,16:0,1,0:45:5:0,44,16:0,48,0:0:3 chr1 21011346 . A G 483.3 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.408;QD=58.5823;RBI=0.0153377;REFB=0;REVB=0.0142411;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.93237e-05;OID=.;OPOS=21011346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr1 21011622 . C A,CGACA 343.8 PASS AF=0.0789474,0.710526;AO=3,25;DP=38;FAO=3,27;FDP=38;FR=.;FRO=8;FSAF=3,12;FSAR=0,15;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0164245,0.010676;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,4;MLLD=115.473,213.574;QD=36.1899;RBI=0.0170442,0.0113202;REFB=0.00590558,-0.0300039;REVB=0.00455453,0.00376416;RO=9;SAF=3,10;SAR=0,15;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.670564,-0.0223027;STB=0.99637,0.516117;STBP=0.075,0.756;TYPE=snp,ins;VARB=0.0415464,0.00879284;OID=.,.;OPOS=21011622,21011623;OREF=C,-;OALT=A,GACA;OMAPALT=A,CGACA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:55:38:38:9:8:3,25:3,27:0.0789474,0.710526:0,15:3,10:4:5:0,15:3,12:3:5 chr1 21024901 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.05;QD=52.6129;RBI=0.0205309;REFB=0;REVB=0.0202598;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108095;OID=.;OPOS=21024901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0 chr1 21031046 . C T 1533.37 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00626874;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.337;QD=63.8906;RBI=0.0270932;REFB=0;REVB=0.026358;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14303e-05;OID=.;OPOS=21031046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0 chr1 21042094 . G A 2164.01 PASS AF=1;AO=135;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320405;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.011;QD=63.1829;RBI=0.0351853;REFB=0;REVB=0.01454;RO=0;SAF=70;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62647e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06933e-05;OID=.;OPOS=21042094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:136:137:0:0:135:137:1:65:70:0:0:65:72:0:0 chr1 21044161 . A G 207.11 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.07536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7761;QD=48.7311;RBI=0.0754908;REFB=0;REVB=-0.00444115;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073967;OID=.;OPOS=21044161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0 chr1 21046205 . A G 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00322373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.809;QD=17.7318;RBI=0.00323826;REFB=-0.0268915;REVB=0.000306441;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106788;STB=0.560984;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0433942;OID=.;OPOS=21046205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:9:10:7:10:9:10 chr1 21050958 . C T 945.06 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.71;QD=58.1577;RBI=0.0666405;REFB=0;REVB=0.0613826;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257469;OID=.;OPOS=21050958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:37:27:0:0:38:27:0:0 chr1 21167404 . A G 962.21 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.013697;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=324.728;QD=57.4453;RBI=0.0144635;REFB=-0.055265;REVB=0.00464597;RO=1;SAF=38;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122726;STB=0.506492;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000846117;OID=.;OPOS=21167404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:67:1:1:66:66:0.985075:28:38:1:0:28:38:1:0 chr1 21307703 . T C 91.82 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00532183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.541;QD=8.74515;RBI=0.00978571;REFB=-0.00322717;REVB=-0.00821208;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840597;STB=0.551636;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00698109;OID=.;OPOS=21307703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:4:8:18:12:4:8:18:12 chr1 21795388 . A G 1193.81 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297983;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.003;QD=61.221;RBI=0.0350538;REFB=0;REVB=0.0184615;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.4765e-06;OID=.;OPOS=21795388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0 chr1 21808159 . G A 35.56 PASS AF=0.222222;AO=5;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=1;FWDB=-0.00690119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5922;QD=5.26855;RBI=0.0935059;REFB=-0.0190994;REVB=0.0932509;RO=20;SAF=3;SAR=2;SRF=19;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.554951;STB=0.799463;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0693046;OID=.;OPOS=21808159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:20:21:5:6:0.222222:2:3:19:1:2:4:20:1 chr1 21889635 . T C 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3016;QD=63.8707;RBI=0.0338645;REFB=0;REVB=0.0186472;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.13183e-05;OID=.;OPOS=21889635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0 chr1 21904267 . A G 636.94 PASS AF=0.57;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0089008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8845;QD=25.4777;RBI=0.0100131;REFB=-0.00218739;REVB=-0.00458673;RO=43;SAF=29;SAR=28;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112377;STB=0.561358;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00202117;OID=.;OPOS=21904267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:43:43:57:57:0.57:28:29:28:15:28:29:28:15 chr1 21935433 . G T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00239753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.21;QD=12.724;RBI=0.00510842;REFB=-0.0169779;REVB=-0.00451085;RO=35;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378247;STB=0.513263;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0239907;OID=.;OPOS=21935433;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:12:11:18:17:12:11:18:18 chr1 21940555 . C T 257.73 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0157142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5689;QD=19.8253;RBI=0.0470573;REFB=0.000371474;REVB=-0.044356;RO=25;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140432;STB=0.578136;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00102914;OID=.;OPOS=21940555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:13:14:17:8:13:14:17:8 chr1 21943820 . G A 305.93 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00959585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.262;QD=15.2966;RBI=0.0103138;REFB=-0.00481763;REVB=0.00378082;RO=46;SAF=24;SAR=10;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325972;STB=0.684574;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00816132;OID=.;OPOS=21943820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:10:24:18:28:10:24:18:28 chr1 22005665 . C T 90.38 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.288;QD=16.4326;RBI=0.012577;REFB=-0.0371237;REVB=0.012577;RO=11;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0284966;OID=.;OPOS=22005665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:11:0:0:11:11:0:0:11 chr1 22050649 . C A 52.12 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0219713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.353;QD=6.31777;RBI=0.0250612;REFB=-0.00991903;REVB=-0.0120551;RO=25;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235792;STB=0.515114;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.036127;OID=.;OPOS=22050649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:4:4:13:12:4:4:13:12 chr1 22109370 . G A 206.13 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0144656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.897;QD=16.8266;RBI=0.0145944;REFB=-0.00604544;REVB=-0.00193478;RO=28;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19613;STB=0.61279;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00549709;OID=.;OPOS=22109370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:15:6:13:15:15:6:13:15 chr1 22141030 . C T 160.48 PASS AF=0.64;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0744106;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.114;QD=25.6762;RBI=0.0756886;REFB=-0.000802521;REVB=0.01385;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357466;STB=0.519975;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00139968;OID=.;OPOS=22141030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:26:25:9:9:16:16:0.64:8:8:4:5:8:8:4:5 chr1 22149935 . T C 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00706969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.298;QD=19.577;RBI=0.00709328;REFB=-0.0179186;REVB=0.000578008;RO=31;SAF=23;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226758;STB=0.62656;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0163769;OID=.;OPOS=22149935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:10:23:14:17:10:23:14:17 chr1 22191454 . G A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.59;QD=57.6802;RBI=0.0888041;REFB=0;REVB=0.0723721;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701904;OID=.;OPOS=22191454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr1 22206649 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00726527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.5659;QD=55.0978;RBI=0.00726531;REFB=0;REVB=-2.62143e-05;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101418;OID=.;OPOS=22206649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0 chr1 22206942 . G A 1016.96 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0278193;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.488;QD=58.1118;RBI=0.0398586;REFB=-0.018968;REVB=0.0285446;RO=1;SAF=25;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185316;STB=0.509801;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000142135;OID=.;OPOS=22206942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:70:1:1:69:69:0.985714:44:25:1:0:44:25:1:0 chr1 22207235 . T C 520.02 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.445;QD=59.4304;RBI=0.062951;REFB=0;REVB=-0.0581897;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073027;OID=.;OPOS=22207235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:9:26:0:0:9:26:0:0 chr1 22214127 . A G 1587.77 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.865;QD=64.1523;RBI=0.0574868;REFB=0;REVB=-0.0375875;RO=0;SAF=32;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.76003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6528e-05;OID=.;OPOS=22214127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:67:32:0:0:67:32:0:0 chr1 22217108 . G A 1008.67 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0490518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0323;QD=57.6385;RBI=0.061455;REFB=-0.150427;REVB=0.0370221;RO=1;SAF=20;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00955148;STB=0.505049;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0028519;OID=.;OPOS=22217108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:49:20:0:1:49:20:0:1 chr1 22307340 . C T 101.89 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00805036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9751;QD=40.7581;RBI=0.0140871;REFB=0;REVB=0.0115602;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203737;OID=.;OPOS=22307340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr1 22307358 . C G 160.25 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8265;QD=45.7862;RBI=0.0644837;REFB=0;REVB=0.0515647;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0004056;OID=.;OPOS=22307358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr1 22307538 . C T 715.36 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.031602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.969;QD=60.8819;RBI=0.031784;REFB=-0.125041;REVB=0.00339731;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184352;STB=0.5098;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000475274;OID=.;OPOS=22307538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:25:21:0:1:25:21:0:1 chr1 22310262 . G C 836.65 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0457593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2409;QD=55.7767;RBI=0.049842;REFB=0.0474485;REVB=-0.0197564;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159925;STB=0.508472;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.0112015;OID=.;OPOS=22310262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:29:30:0:1:29:30:0:1 chr1 22310725 . G C 968.71 PASS AF=0.985507;AO=63;DP=64;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0108591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7505;QD=56.1568;RBI=0.0742284;REFB=-0.014085;REVB=0.0734298;RO=1;SAF=34;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136873;STB=0.506847;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00122053;OID=.;OPOS=22310725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:69:1:1:63:68:0.985507:29:34:1:0:32:36:1:0 chr1 22310824 . T C 1032.12 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00228931;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.848;QD=59.8328;RBI=0.00900759;REFB=0;REVB=0.00871181;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184887;OID=.;OPOS=22310824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr1 22313161 . T C 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00700623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.334;QD=59.839;RBI=0.0202603;REFB=0;REVB=0.0190104;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31121e-05;OID=.;OPOS=22313161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0 chr1 22314015 . GA G,GG 742.09 PASS AF=0.979592,0;AO=41,5;DP=47;FAO=48,0;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=19,0;FSAR=29,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.02565,-0.0342919;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=239.31,229.943;QD=60.5788;RBI=0.0426037,0.0437803;REFB=-0.0640508,-0.0365406;REVB=0.0340169,0.0272173;RO=1;SAF=15,4;SAR=26,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0302497,-0.0951258;STB=0.512815,0.5;STBP=0.334,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000492695,-0.000156742;OID=.,.;OPOS=22314016,22314016;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.979592,0:41,5:47:48,0:49:1:19,0:29,0:1:0:5:1:15,4:26,1:1:0 chr1 22314240 . A T 167.47 PASS AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00517595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.164;QD=41.8675;RBI=0.0119068;REFB=-0.00595606;REVB=0.010723;RO=1;SAF=3;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129286;STB=0.571326;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.000453319;OID=.;OPOS=22314240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:12:3:1:0:12:3:1:0 chr1 22315738 . C T 134.07 PASS AF=0.923077;AO=15;DP=16;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0299551;FXX=0.187383;HRUN=7;LEN=1;MLLD=281.04;QD=41.2534;RBI=0.0421023;REFB=0.0351652;REVB=0.0295854;RO=1;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826301;STB=0.545378;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-7.81372e-05;OID=.;OPOS=22315738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:16:13:1:1:15:12:0.923077:5:10:0:1:5:7:0:1 chr1 22324705 . T C 483.25 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.649;QD=58.5751;RBI=0.0660193;REFB=0;REVB=0.0612259;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000310643;OID=.;OPOS=22324705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr1 22329041 . GC G 119.24 PASS AF=0.607143;AO=15;DP=27;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.17205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.099;QD=17.0343;RBI=0.192983;REFB=0.103779;REVB=-0.0874143;RO=9;SAF=12;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215071;STB=0.608554;STBP=0.222;TYPE=del;VARB=-0.0582343;OID=.;OPOS=22329042;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.607143:15:27:17:28:11:14:3:7:4:64:9:12:3:5:4 chr1 22329062 . CC GT 302.86 PASS AF=0.666667;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00184608;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=2;MLLD=244.971;QD=31.0624;RBI=0.0162062;REFB=-0.0184211;REVB=-0.0161007;RO=13;SAF=20;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121361;STB=0.566956;STBP=0.317;TYPE=mnp;VARB=0.00792346;OID=.;OPOS=22329062;OREF=CC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:13:13:26:26:0.666667:6:20:8:5:6:20:8:5 chr1 22332008 . T C 36.58 PASS AF=0.111111;AO=8;DP=72;FAO=8;FDP=72;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.0180206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.275;QD=2.03238;RBI=0.0259589;REFB=-0.00192566;REVB=0.0186849;RO=64;SAF=5;SAR=3;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324572;STB=0.734776;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00830678;OID=.;OPOS=22332008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:72:72:64:64:8:8:0.111111:3:5:22:42:3:5:22:42 chr1 22336277 . C G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9746;QD=59.8387;RBI=0.0546483;REFB=0;REVB=-0.0264287;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00137908;OID=.;OPOS=22336277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0 chr1 22336305 . C T 499.7 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00882117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.458;QD=54.0216;RBI=0.0282725;REFB=-0.104031;REVB=0.0268611;RO=2;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424896;STB=0.522714;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00450692;OID=.;OPOS=22336305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:21:14:0:2:21:14:0:2 chr1 22336308 . G A 463.42 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0105126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.675;QD=52.962;RBI=0.0415964;REFB=-0.0727926;REVB=0.0402461;RO=2;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466723;STB=0.524985;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00465235;OID=.;OPOS=22336308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:2:2:33:33:0.942857:19:14:0:2:19:14:0:2 chr1 22835677 . A G 2318.91 PASS AF=0.993197;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122115;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.53;QD=63.0997;RBI=0.0364227;REFB=-0.0143776;REVB=0.0343147;RO=1;SAF=62;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562843;STB=0.502958;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=4.72904e-05;OID=.;OPOS=22835677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:148:147:1:1:146:146:0.993197:84:62:0:1:84:62:0:1 chr1 22846709 . G A 1154.25 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.096;QD=60.7498;RBI=0.0313479;REFB=0;REVB=0.0269635;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27446e-05;OID=.;OPOS=22846709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:43:32:0:0:43:33:0:0 chr1 22965438 . AG GC,GG 667.59 PASS AF=0,0.385;AO=8,68;DP=200;FAO=0,77;FDP=200;FR=.;FRO=123;FSAF=0,35;FSAR=0,42;FSRF=57;FSRR=66;FWDB=-0.0144511,-0.00820387;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=185.522,198.038;QD=13.3518;RBI=0.0146296,0.00839256;REFB=-0.0170222,-0.0187604;REVB=0.00227841,-0.00176964;RO=120;SAF=8,26;SAR=0,42;SRF=54;SRR=66;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.554562,-0.0785353;STB=0.5,0.505493;STBP=1,0.912;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0299859;OID=.,.;OPOS=22965438,22965438;OREF=AG,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:200:200:120:123:8,68:0,77:0,0.385:0,42:8,26:54:66:0,42:0,35:57:66 chr1 22970642 . C T 835.47 PASS AF=0.532051;AO=83;DP=157;FAO=83;FDP=156;FR=.;FRO=73;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.0123677;FXX=0.00636902;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.0645;QD=21.4224;RBI=0.0124014;REFB=-0.0353162;REVB=0.000914374;RO=71;SAF=47;SAR=36;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859322;STB=0.547264;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0190774;OID=.;OPOS=22970642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:71:73:83:83:0.532051:36:47:33:38:36:47:34:39 chr1 23101688 . T G 1610.15 PASS AF=0.990826;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0277918;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3987;QD=59.0881;RBI=0.0506933;REFB=-0.0623045;REVB=0.0423961;RO=1;SAF=50;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939812;STB=0.50495;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000639583;OID=.;OPOS=23101688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:108:109:1:1:107:108:0.990826:57:50:1:0:58:50:1:0 chr1 23208925 . G A 292.67 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.00968711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.245;QD=17.2161;RBI=0.0185429;REFB=-0.0234135;REVB=0.0158114;RO=35;SAF=21;SAR=11;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928201;STB=0.556928;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0174487;OID=.;OPOS=23208925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:35:36:32:32:0.470588:11:21:26:9:11:21:27:9 chr1 23219493 . T C 660.92 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.792;QD=61.4811;RBI=0.0412658;REFB=0;REVB=0.0254532;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248321;OID=.;OPOS=23219493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:22:20:0:0:22:21:0:0 chr1 23241601 . C T 138.46 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0252759;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.572;QD=17.8653;RBI=0.0252773;REFB=-0.016747;REVB=-0.000261678;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174999;STB=0.584302;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0215458;OID=.;OPOS=23241601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:16:15:15:0.483871:6:9:6:9:6:9:7:9 chr1 23280424 . G T 283.75 PASS AF=0.545455;AO=28;DP=53;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0121268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.42;QD=20.6363;RBI=0.0361228;REFB=-0.0106765;REVB=0.0340265;RO=24;SAF=19;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158484;STB=0.572097;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00915079;OID=.;OPOS=23280424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:24:25:28:30:0.545455:9:19:12:12:11:19:12:13 chr1 23413027 . T C 257.15 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00155223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.779;QD=16.0718;RBI=0.0186199;REFB=-0.00800996;REVB=-0.0185551;RO=35;SAF=12;SAR=17;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098423;STB=0.555517;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00924172;OID=.;OPOS=23413027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:17:12:18:17:17:12:18:17 chr1 23418153 . C T 544.8 PASS AF=0.536842;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.00999793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0729;QD=22.9391;RBI=0.0362442;REFB=0.00579965;REVB=-0.034838;RO=44;SAF=28;SAR=23;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060563;STB=0.53332;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.00519029;OID=.;OPOS=23418153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:44:44:51:51:0.536842:23:28:21:23:23:28:21:23 chr1 23419261 . G A 156.42 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0487091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6447;QD=24.065;RBI=0.0512059;REFB=-0.0432136;REVB=0.0157945;RO=10;SAF=10;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222788;STB=0.624844;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0320114;OID=.;OPOS=23419261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:6:10:3:7:6:10:3:7 chr1 23419374 . G T 286.68 PASS AF=0.383721;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00388724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.087;QD=13.3339;RBI=0.00672354;REFB=0.0255722;REVB=0.00548593;RO=53;SAF=17;SAR=16;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265122;STB=0.515142;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.0430061;OID=.;OPOS=23419374;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:53:33:33:0.383721:16:17:26:27:16:17:26:27 chr1 23419383 . C T 323.14 PASS AF=0.391304;AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.00287748;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.765;QD=14.0497;RBI=0.0169602;REFB=0.00154182;REVB=-0.0167143;RO=53;SAF=21;SAR=15;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137187;STB=0.562009;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.00247775;OID=.;OPOS=23419383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:53:56:36:36:0.391304:15:21:24:29:15:21:27:29 chr1 23419855 . T C 158.64 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00190732;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5267;QD=16.2705;RBI=0.00574014;REFB=-0.0239915;REVB=0.005414;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158032;STB=0.50908;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0189738;OID=.;OPOS=23419855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:10:12:9:8:10:12 chr1 23519633 . A G 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.013378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.41;QD=16.6157;RBI=0.0159902;REFB=0.00685239;REVB=-0.00875879;RO=21;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198035;STB=0.613365;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00672779;OID=.;OPOS=23519633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:10:7:13:8:10:7:13:8 chr1 23687827 . T C 238.15 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00796074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.244;QD=13.8057;RBI=0.0278313;REFB=-0.00762627;REVB=-0.0266685;RO=40;SAF=15;SAR=13;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111111;STB=0.50052;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0120534;OID=.;OPOS=23687827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:41:28:28:0.405797:13:15:21:19:13:15:22:19 chr1 23688933 . A G 204.52 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00517467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.183;QD=22.7243;RBI=0.00697951;REFB=-0.0246945;REVB=-0.00468363;RO=16;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235061;STB=0.631022;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0124002;OID=.;OPOS=23688933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:11:9:12:4:11:9:12:4 chr1 23689083 . G A 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0036451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5783;QD=15.9164;RBI=0.030643;REFB=0.0191335;REVB=0.0304254;RO=15;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122387;STB=0.571312;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.0175977;OID=.;OPOS=23689083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:10:3:5:10:10:3:5:10 chr1 23696152 . G A 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.191;QD=57.2009;RBI=0.0481976;REFB=0;REVB=0.0116819;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222572;OID=.;OPOS=23696152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr1 23697617 . T C 129.4 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0453274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4946;QD=12.9403;RBI=0.0755356;REFB=0.0088181;REVB=0.060424;RO=24;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304406;STB=0.688278;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.00925387;OID=.;OPOS=23697617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:25:15:15:0.375:10:5:15:9:10:5:16:9 chr1 23698120 . C G 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00996184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.963;QD=19.6972;RBI=0.0103743;REFB=-0.0170773;REVB=-0.00289624;RO=22;SAF=7;SAR=14;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633716;STB=0.535681;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0120625;OID=.;OPOS=23698120;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:14:7:6:16:14:7:6:16 chr1 23710805 . A G 594.51 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0601883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.924;QD=60.9757;RBI=0.0622082;REFB=0;REVB=0.0157234;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00036832;OID=.;OPOS=23710805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr1 23751140 . G T 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.13442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.054;QD=30.7895;RBI=0.145967;REFB=-0.0603826;REVB=0.0569004;RO=1;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679981;STB=0.538369;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0115218;OID=.;OPOS=23751140;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:6:2:0:1:6:2:0:1 chr1 23833611 . G T 374.84 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00544374;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=213.998;QD=20.8243;RBI=0.00607438;REFB=-0.00585455;REVB=-0.00269514;RO=33;SAF=18;SAR=20;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675277;STB=0.543424;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00506173;OID=.;OPOS=23833611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:34:38:38:0.527778:20:18:13:20:20:18:13:21 chr1 23835794 . A G 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0205803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.216;QD=14.6578;RBI=0.0205841;REFB=0.013128;REVB=-0.000398311;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723649;STB=0.56561;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0121802;OID=.;OPOS=23835794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:9:4:6:10:9:4:7:10 chr1 23836364 . A G 56.27 PASS AF=0.4;AO=7;DP=19;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0297981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3175;QD=11.2546;RBI=0.0487618;REFB=0.0437021;REVB=0.0385977;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240999;STB=0.670319;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0271938;OID=.;OPOS=23836364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:20:12:12:7:8:0.4:4:3:8:4:5:3:8:4 chr1 23847464 . C A 311.69 PASS AF=0.613636;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00277555;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.716;QD=28.3352;RBI=0.0235766;REFB=-0.00825107;REVB=0.0234127;RO=17;SAF=16;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086828;STB=0.547909;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00333514;OID=.;OPOS=23847464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:17:17:27:27:0.613636:11:16:8:9:11:16:8:9 chr1 23885498 . T C 1558.33 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0120444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.579;QD=58.8049;RBI=0.0180146;REFB=-0.0864649;REVB=0.0133963;RO=0;SAF=46;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=2.32773e-06;OID=.;OPOS=23885498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:106:106:0:1:105:105:0.990566:59:46:0:0:59:46:0:1 chr1 23965704 . A C 979.62 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151206;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.844;QD=59.3711;RBI=0.0199428;REFB=0;REVB=-0.0130032;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167764;OID=.;OPOS=23965704;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:33:31:0:0:34:32:0:0 chr1 23966894 . T TAAG 329.79 PASS AF=0.961538;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0133491;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=186.49;QD=50.7372;RBI=0.0149745;REFB=0.0997126;REVB=-0.00678497;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487199;STB=0.526294;STBP=0.276;TYPE=ins;VARB=-0.00285602;OID=.;OPOS=23966895;OREF=-;OALT=AAG;OMAPALT=TAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.961538:24:26:25:26:1:9:16:1:0:5:1:9:15:1:0 chr1 24018277 . C G 1015.3 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00790069;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5536;QD=58.0172;RBI=0.0229653;REFB=-0.07058;REVB=0.0215635;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00120079;OID=.;OPOS=24018277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:70:0:1:69:69:0.985714:41:28:0:0:41:28:0:1 chr1 24077451 . C T 188.48 PASS AF=0.527778;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.022122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.692;QD=20.9424;RBI=0.0262627;REFB=-0.023623;REVB=0.0141544;RO=15;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118771;STB=0.551568;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0308635;OID=.;OPOS=24077451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:15:17:18:19:0.527778:11:7:8:7:11:8:9:8 chr1 24121601 . C T 179.4 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0234653;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=232.355;QD=22.4248;RBI=0.0234707;REFB=-0.0164373;REVB=-0.000504144;RO=13;SAF=11;SAR=7;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225464;STB=0.610988;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00809051;OID=.;OPOS=24121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:13:14:18:18:0.5625:7:11:4:9:7:11:5:9 chr1 24201094 . G C 191.65 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0557363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0932;QD=14.742;RBI=0.0935231;REFB=-0.0060369;REVB=0.0751001;RO=30;SAF=16;SAR=6;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280921;STB=0.6615;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00887981;OID=.;OPOS=24201094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:6:16:14:16:6:16:14:16 chr1 24201109 . C T 189.11 PASS AF=0.431373;AO=20;DP=49;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00109907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.793;QD=14.8323;RBI=0.00535082;REFB=-0.00808452;REVB=-0.00523673;RO=26;SAF=13;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262169;STB=0.655594;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0233109;OID=.;OPOS=24201109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:26:29:20:22:0.431373:7:13:10:16:7:15:12:17 chr1 24201162 . G A 199.76 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0132722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.458;QD=19.9758;RBI=0.0289157;REFB=-0.0277525;REVB=-0.0256898;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884614;STB=0.54995;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0235753;OID=.;OPOS=24201162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:11:9:11:9:11:9:11:9 chr1 24201262 . A G 116.82 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00636647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1859;QD=11.981;RBI=0.0135685;REFB=-0.0239597;REVB=0.0119821;RO=25;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184235;STB=0.608543;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0242434;OID=.;OPOS=24201262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:6:8:10:15:6:8:10:15 chr1 24201357 . A G 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00208064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.969;QD=12.3289;RBI=0.0073997;REFB=-0.000489061;REVB=-0.00710116;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195548;STB=0.615182;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.000747934;OID=.;OPOS=24201357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:5:6:6:11:5:6:6:11 chr1 24201448 . C T 124.16 PASS AF=0.722222;AO=12;DP=17;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0543248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4552;QD=27.5916;RBI=0.0678635;REFB=-0.0321821;REVB=0.0406727;RO=5;SAF=9;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312758;STB=0.64263;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0111082;OID=.;OPOS=24201448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:18:5:5:12:13:0.722222:3:9:1:4:4:9:1:4 chr1 24201643 . G A 245.64 PASS AF=0.560976;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.000320432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.271;QD=23.9648;RBI=0.000339039;REFB=-0.0214998;REVB=-0.000110774;RO=17;SAF=16;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229338;STB=0.618075;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0155965;OID=.;OPOS=24201643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:18:23:23:0.560976:7:16:7:10:7:16:8:10 chr1 24288432 . C T 1169.78 PASS AF=0.975309;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0308219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7944;QD=57.7668;RBI=0.0334843;REFB=0.0558761;REVB=-0.0130848;RO=2;SAF=30;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305085;STB=0.516125;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00151125;OID=.;OPOS=24288432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:80:81:2:2:78:79:0.975309:48:30:2:0:49:30:2:0 chr1 24392600 . G A 786.35 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802523;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.25;QD=57.1887;RBI=0.0293784;REFB=0;REVB=0.028261;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191324;OID=.;OPOS=24392600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0 chr1 24392671 . T C 483.33 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0926;QD=58.5853;RBI=0.0589196;REFB=0;REVB=0.0564463;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000735795;OID=.;OPOS=24392671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr1 24393563 . C T 1989.57 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.263;QD=62.1741;RBI=0.045134;REFB=0;REVB=0.02919;RO=0;SAF=64;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.32184e-05;OID=.;OPOS=24393563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:64:64:0:0:64:64:0:0 chr1 24394811 . A G 393.64 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.544;QD=56.2337;RBI=0.0603299;REFB=0;REVB=0.0160733;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427129;OID=.;OPOS=24394811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:13:15:0:0 chr1 24409165 . C T 2220.16 PASS AF=1;AO=106;DP=136;FAO=141;FDP=141;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.186134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0152;QD=62.9832;RBI=0.186611;REFB=0;REVB=-0.0133357;RO=0;SAF=29;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00309448;OID=.;OPOS=24409165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:136:141:0:0:106:141:1:77:29:0:0:77:64:0:0 chr1 24416059 . T C,G 734.49 PASS AF=0.918367,0.0816327;AO=39,7;DP=46;FAO=45,4;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=17,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171637,-0.0385126;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.0849,29.3258;QD=59.9582;RBI=0.0302373,0.0396345;REFB=0,0;REVB=0.0248938,-0.00936315;RO=0;SAF=26,0;SAR=13,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00310475,0.14618;OID=.,.;OPOS=24416059,24416059;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:22:46:49:0:0:39,7:45,4:0.918367,0.0816327:13,7:26,0:0:0:17,4:28,0:0:0 chr1 24416133 . C T 296.96 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.000535068;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.261;QD=17.9973;RBI=0.0162316;REFB=-0.015741;REVB=-0.0162227;RO=34;SAF=19;SAR=13;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245306;STB=0.636788;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0229103;OID=.;OPOS=24416133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:34:34:32:32:0.484848:13:19:11:23:13:19:11:23 chr1 24419496 . A G 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0673758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.087;QD=17.6169;RBI=0.067509;REFB=-0.0188028;REVB=-0.00423857;RO=27;SAF=11;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217963;STB=0.512305;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0151132;OID=.;OPOS=24419496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:13:11:13:14:13:11:13:14 chr1 24421950 . C G 212.81 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00331404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7031;QD=20.2679;RBI=0.0104942;REFB=0.0224341;REVB=-0.00995721;RO=21;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129307;STB=0.573015;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-0.022668;OID=.;OPOS=24421950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:8:13:10:11:8:13:10:11 chr1 24447468 . G C 1253.13 PASS AF=0.954545;AO=84;DP=88;FAO=84;FDP=88;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0582013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2767;QD=56.9603;RBI=0.076885;REFB=-0.132786;REVB=0.0502385;RO=4;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429976;STB=0.522722;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0074133;OID=.;OPOS=24447468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:88:88:4:4:84:84:0.954545:42:42:0:4:42:42:0:4 chr1 24460797 . T G 294.36 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0328494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0556;QD=17.8399;RBI=0.0516125;REFB=-0.000388922;REVB=-0.0398091;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112005;STB=0.562461;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=-0.000848381;OID=.;OPOS=24460797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:34:32:32:0.484848:14:18:14:18:14:18:15:19 chr1 24465113 . C T 503.76 PASS AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.020004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.9;QD=22.3891;RBI=0.0205568;REFB=-0.0193165;REVB=0.00473521;RO=41;SAF=26;SAR=22;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427953;STB=0.508376;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0170008;OID=.;OPOS=24465113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:41:42:48:48:0.533333:22:26:22:19:22:26:22:20 chr1 24480905 . C T 273.33 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0264074;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.479;QD=23.7676;RBI=0.0273803;REFB=-0.00659522;REVB=-0.00723405;RO=21;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251022;STB=0.639888;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0108576;OID=.;OPOS=24480905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:21:21:25:25:0.543478:16:9:14:7:16:9:14:7 chr1 24658063 . C G 452.09 PASS AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0396928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.27;QD=22.0533;RBI=0.039827;REFB=-0.0216993;REVB=-0.0032658;RO=38;SAF=29;SAR=15;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11866;STB=0.565572;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0226237;OID=.;OPOS=24658063;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:15:29:20:18:15:29:20:18 chr1 24680915 . C T 229.82 PASS AF=0.481481;AO=25;DP=55;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.00826384;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2963;QD=17.0238;RBI=0.0380433;REFB=-0.0231551;REVB=0.037135;RO=30;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060709;STB=0.536056;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0353262;OID=.;OPOS=24680915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:30:28:25:26:0.481481:17:8:8:22:18:8:7:21 chr1 24690764 . T A 409.19 PASS AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0141979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.901;QD=17.9863;RBI=0.0194914;REFB=-0.0127815;REVB=0.0133542;RO=45;SAF=23;SAR=19;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283734;STB=0.501848;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0134917;OID=.;OPOS=24690764;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:49:42:42:0.461538:19:23:26:19:19:23:27:22 chr1 24706113 . G A 428.44 PASS AF=0.378788;AO=50;DP=132;FAO=50;FDP=132;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.0344926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6924;QD=12.9829;RBI=0.0597687;REFB=-0.0139611;REVB=-0.0488114;RO=82;SAF=33;SAR=17;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181456;STB=0.603362;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0210505;OID=.;OPOS=24706113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:82:82:50:50:0.378788:17:33:41:41:17:33:41:41 chr1 24706269 . A G 411.17 PASS AF=0.461538;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00394025;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.718;QD=18.0732;RBI=0.0164325;REFB=-0.0166795;REVB=-0.0159531;RO=48;SAF=26;SAR=16;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17511;STB=0.592744;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0157639;OID=.;OPOS=24706269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:48:49:42:42:0.461538:16:26:21:27:16:26:22:27 chr1 24706292 . T C 277.6 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0076595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.323;QD=16.0925;RBI=0.00907985;REFB=-0.0061627;REVB=-0.00487603;RO=38;SAF=16;SAR=15;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118418;STB=0.566593;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00809009;OID=.;OPOS=24706292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:15:16:15:23:15:16:15:23 chr1 24718075 . T C 532.62 PASS AF=0.543478;AO=49;DP=91;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0194659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9815;QD=23.1576;RBI=0.0234504;REFB=0.00334232;REVB=0.0130768;RO=42;SAF=25;SAR=24;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915862;STB=0.554326;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.00268778;OID=.;OPOS=24718075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:42:42:49:50:0.543478:24:25:26:16:25:25:26:16 chr1 24785393 . C T 204.03 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0258837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0025;QD=10.4632;RBI=0.0325067;REFB=-0.0229452;REVB=0.019665;RO=52;SAF=14;SAR=12;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0266753;OID=.;OPOS=24785393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:52:52:26:26:0.333333:12:14:28:24:12:14:28:24 chr1 24859617 . G A 290.73 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0227418;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2819;QD=25.2804;RBI=0.0450393;REFB=-0.0191927;REVB=0.0388761;RO=18;SAF=13;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535822;STB=0.518505;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.044486;OID=.;OPOS=24859617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:18:19:27:27:0.586957:14:13:10:8:14:13:10:9 chr1 24859665 . G A 373.61 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.000127083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=314.067;QD=23.3504;RBI=0.00726971;REFB=-0.011993;REVB=-0.0072686;RO=27;SAF=14;SAR=23;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653924;STB=0.503595;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00956665;OID=.;OPOS=24859665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:23:14:10:17:23:14:10:17 chr1 24861704 . G A 230.88 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0339481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.087;QD=23.0884;RBI=0.0348523;REFB=-0.00896669;REVB=0.00788726;RO=18;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248172;STB=0.63827;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00148814;OID=.;OPOS=24861704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:9:13:5:13:9:13:5:13 chr1 25167528 . G A 100.27 PASS AF=0.26;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00225502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.359;QD=8.02154;RBI=0.0155435;REFB=-0.0160933;REVB=-0.0153791;RO=36;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428811;STB=0.533284;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0408789;OID=.;OPOS=25167528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:36:37:13:13:0.26:9:4:10:26:9:4:10:27 chr1 25291010 . A T 1025.57 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000706415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0916;QD=59.4534;RBI=0.0316295;REFB=0;REVB=0.0316216;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114444;OID=.;OPOS=25291010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0 chr1 25634143 . T C 223.15 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0382204;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.694;QD=24.1238;RBI=0.0388868;REFB=-0.0168744;REVB=0.00716844;RO=18;SAF=2;SAR=19;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036497;STB=0.535176;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0145324;OID=.;OPOS=25634143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:37:18:16:21:21:0.567568:19:2:2:16:19:2:2:14 chr1 25889632 . T C 51.44 PASS AF=0.636364;AO=5;DP=9;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0635174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.85;QD=18.7037;RBI=0.0657051;REFB=-0.0302975;REVB=0.0168136;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744193;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.015724;OID=.;OPOS=25889632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:11:4:4:5:7:0.636364:3:2:2:2:3:4:2:2 chr1 25890189 . A G 118.05 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0197171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.701;QD=12.7622;RBI=0.0494087;REFB=-0.0107407;REVB=-0.0453041;RO=23;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276642;STB=0.664857;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0177122;OID=.;OPOS=25890189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:3:11:13:10:3:11:13:10 chr1 26131654 . G A 283.18 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.0183403;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.824;QD=14.7107;RBI=0.0462784;REFB=-0.0025029;REVB=0.0424891;RO=45;SAF=22;SAR=10;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246823;STB=0.51401;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00367953;OID=.;OPOS=26131654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:45:45:32:32:0.415584:10:22:30:15:10:22:30:15 chr1 26138262 . T C 229.16 PASS AF=0.509804;AO=22;DP=47;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0128849;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7457;QD=17.9732;RBI=0.0140675;REFB=-0.0415005;REVB=0.00564563;RO=25;SAF=3;SAR=19;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45981;STB=0.611561;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.103971;OID=.;OPOS=26138262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:51:25:25:22:26:0.509804:19:3:13:12:18:8:13:12 chr1 26140573 . C A 263.94 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0363151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8579;QD=15.3007;RBI=0.0368141;REFB=0.0167591;REVB=0.00604069;RO=39;SAF=24;SAR=6;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339505;STB=0.694301;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.024278;OID=.;OPOS=26140573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:6:24:20:19:6:24:20:19 chr1 26142081 . G A 401.45 PASS AF=0.482353;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0369474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2302;QD=18.8918;RBI=0.0415993;REFB=-0.00804076;REVB=-0.0191151;RO=43;SAF=24;SAR=17;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183458;STB=0.515144;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00596825;OID=.;OPOS=26142081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:43:44:41:41:0.482353:17:24:26:17:17:24:27:17 chr1 26142253 . G T 135.77 PASS AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0281058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.22;QD=27.154;RBI=0.0281063;REFB=-0.0128048;REVB=-0.000166615;RO=6;SAF=5;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810806;STB=0.545388;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.00934096;OID=.;OPOS=26142253;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:9:5:3:3:9:5:3:3 chr1 26142855 . A G 214.62 PASS AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0480032;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.95;QD=20.4404;RBI=0.0480584;REFB=-0.0230442;REVB=-0.00230299;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210139;STB=0.61787;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0257122;OID=.;OPOS=26142855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:21:21:21:21:0.5:11:10:15:6:11:10:15:6 chr1 26146884 . C G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.416;QD=35.5759;RBI=0.0631978;REFB=0;REVB=-0.0338714;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000664823;OID=.;OPOS=26146884;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr1 26158962 . A G 182.91 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0257393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.825;QD=43.0373;RBI=0.0757484;REFB=-0.120873;REVB=0.0712412;RO=1;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043542;STB=0.52378;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00366981;OID=.;OPOS=26158962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:17:17:1:1:16:16:0.941176:10:6:0:1:10:6:0:1 chr1 26212261 . G A 164.18 PASS AF=0.372549;AO=20;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00319963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8154;QD=12.8768;RBI=0.0389263;REFB=-0.0186359;REVB=0.0387946;RO=31;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334559;STB=0.739641;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0333714;OID=.;OPOS=26212261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:32:20:19:0.372549:5:15:14:17:4:15:14:18 chr1 26290745 . G C 393.62 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.467;QD=56.2315;RBI=0.0304858;REFB=0;REVB=0.0239561;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119207;OID=.;OPOS=26290745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:12:16:0:0 chr1 26357656 . C A 1089.06 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222928;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.219;QD=60.5033;RBI=0.02062;REFB=0;REVB=0.0204991;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60356e-05;OID=.;OPOS=26357656;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0 chr1 26378002 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.726;QD=55.0981;RBI=0.0266994;REFB=0;REVB=0.00682423;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010743;OID=.;OPOS=26378002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr1 26449335 . CAA C 124.57 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0158856;FXX=0.0454442;HRUN=2;LEN=2;MLLD=170.503;QD=11.8633;RBI=0.0168427;REFB=-0.0144924;REVB=-0.00559696;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876044;STB=0.549948;STBP=0.548;TYPE=del;VARB=0.0150739;OID=.;OPOS=26449336;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.452381:19:43:19:42:23:10:9:10:13:99:23:10:9:10:13 chr1 26487940 . A G 596.29 PASS AF=1;AO=35;DP=42;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.431;QD=61.1576;RBI=0.105948;REFB=0;REVB=0.00508383;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042128;OID=.;OPOS=26487940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:39:0:0:35:39:1:28:7:0:0:26:13:0:0 chr1 26487941 . C G 41.83 PASS AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0100144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=82.8894;QD=4.29007;RBI=0.011985;REFB=-0.0248337;REVB=0.00658435;RO=32;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.670056;STB=0.922209;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00938917;OID=.;OPOS=26487941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:1:6:7:25:1:6:7:25 chr1 26510925 . TC CT,T 39.65 PASS AF=0.0454545,0.5;AO=2,8;DP=23;FAO=1,11;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=0,1;FSAR=1,10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0346818,0.0525836;FXX=0.0434594;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=79.1199,8.43316;QD=7.20925;RBI=0.192566,0.1113;REFB=-0.0126415,-0.0764714;REVB=-0.189417,-0.0980951;RO=9;SAF=0,0;SAR=2,8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,1;SSSB=-0.602534,-0.788558;STB=0.989266,0.799313;STBP=0.5,0.037;TYPE=mnp,del;VARB=0.141923,0.0154756;OID=.,.;OPOS=26510925,26510926;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:37:23:22:9:10:2,8:1,11:0.0454545,0.5:2,8:0,0:5:4:1,10:0,1:5:5 chr1 26582091 . G A 721.54 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.629;QD=62.7421;RBI=0.0211388;REFB=0;REVB=0.0173826;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124926;OID=.;OPOS=26582091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:24:21:0:0:24:22:0:0 chr1 26608782 . C T 279.61 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0149239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6055;QD=48.6273;RBI=0.0149239;REFB=-0.123784;REVB=0;RO=1;SAF=22;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00106319;OID=.;OPOS=26608782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:0:22:1:0:0:22:1:0 chr1 26608811 . TCCAGGACAGGGACTGGG TCCGGGACAGGGACTGGA 273.43 PASS AF=1;AO=12;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00377918;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=15;MLLD=453.968;QD=52.082;RBI=0.00377918;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00254569;OID=.;OPOS=26608814;OREF=AGGACAGGGACTGGG;OALT=GGGACAGGGACTGGA;OMAPALT=TCCGGGACAGGGACTGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:12:22:21:21:0:21:0:0:0:4:0:12:0:0:0 chr1 26608843 . C A 113.21 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.0103494;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5117;QD=16.1726;RBI=0.0103494;REFB=-0.0246491;REVB=0;RO=15;SAF=13;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00750497;OID=.;OPOS=26608843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:0:13:15:0:0:13:15:0 chr1 26608852 . G A 220.44 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.00705048;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.682;QD=24.493;RBI=0.0712494;REFB=-0.0336521;REVB=0.0708997;RO=15;SAF=19;SAR=2;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260519;STB=0.641407;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0166426;OID=.;OPOS=26608852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:2:19:15:0:2:19:15:0 chr1 26609259 . C T 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0819325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0211;QD=51.915;RBI=0.0900344;REFB=0;REVB=-0.0373264;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114301;OID=.;OPOS=26609259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr1 26610891 . A C 747.26 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.368;QD=63.5964;RBI=0.0501624;REFB=0;REVB=-0.00689272;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169756;OID=.;OPOS=26610891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:24:22:0:0:24:23:0:0 chr1 26611903 . C A 166.0 PASS AF=0.409091;AO=17;DP=43;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0259525;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.449;QD=15.0911;RBI=0.0267058;REFB=-0.0182153;REVB=-0.00629822;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674181;STB=0.512806;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0300255;OID=.;OPOS=26611903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:23:26:17:18:0.409091:10:7:11:12:10:8:11:15 chr1 26627478 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.551;QD=45.8067;RBI=0.0471363;REFB=0;REVB=0.0249607;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567814;OID=.;OPOS=26627478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr1 26629342 . G A 172.13 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.000916251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.237;QD=18.1185;RBI=0.00362681;REFB=-0.00418401;REVB=0.00350916;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194659;STB=0.609567;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00588894;OID=.;OPOS=26629342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:11:7:4:16:11:7:4:16 chr1 26646726 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.78;QD=56.938;RBI=0.0502397;REFB=0;REVB=0.0330175;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338064;OID=.;OPOS=26646726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr1 26646730 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.884;QD=56.9382;RBI=0.0403451;REFB=0;REVB=0.0378025;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.3345e-05;OID=.;OPOS=26646730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr1 26648550 . G GC 416.18 PASS AF=1;AO=5;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465997;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=201.818;QD=48.9619;RBI=0.0683144;REFB=0;REVB=-0.0499531;RO=30;SAF=5;SAR=0;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.636787;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000968075;OID=.;OPOS=26648551;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:5:35:34:34:0:21:13:0:0:4:30:5:0:16:14 chr1 26648551 . G C 471.64 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139361;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.845;QD=55.4869;RBI=0.0187419;REFB=-0.0248175;REVB=0.0125316;RO=1;SAF=20;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227903;STB=0.512188;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=9.96627e-05;OID=.;OPOS=26648551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:13:20:1:0:13:20:1:0 chr1 26670392 . C G 410.03 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0172486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2353;QD=20.761;RBI=0.021282;REFB=-0.00535025;REVB=-0.0124663;RO=35;SAF=16;SAR=25;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175938;STB=0.603664;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00571685;OID=.;OPOS=26670392;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:35:38:41:41:0.518987:25:16:21:14:25:16:23:15 chr1 26670444 . G T 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.365;QD=59.6779;RBI=0.0284876;REFB=0;REVB=0.0184048;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93466e-05;OID=.;OPOS=26670444;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0 chr1 26670609 . C T 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.12372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.728;QD=48.6254;RBI=0.126468;REFB=-0.0515913;REVB=0.0262209;RO=1;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280287;STB=0.515138;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00242907;OID=.;OPOS=26670609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:16:6:0:1:16:6:0:1 chr1 26691174 . C A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.509;QD=60.2305;RBI=0.0765292;REFB=0;REVB=0.0616642;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052484;OID=.;OPOS=26691174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr1 26700795 . T C 769.89 PASS AF=1;AO=45;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.793;QD=57.0291;RBI=0.0539075;REFB=0;REVB=0.0339524;RO=0;SAF=12;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568985;OID=.;OPOS=26700795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:45:54:1:33:12:0:0:34:20:0:0 chr1 26755919 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571481;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=333.348;QD=52.6132;RBI=0.0065333;REFB=0;REVB=0.00316622;RO=0;SAF=19;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53073e-05;OID=.;OPOS=26755919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:3:19:0:0:3:19:0:0 chr1 26786627 . G A 253.62 PASS AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0670554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.832;QD=28.1796;RBI=0.0670631;REFB=-0.012899;REVB=0.00101638;RO=13;SAF=8;SAR=15;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870604;STB=0.547905;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.010057;OID=.;OPOS=26786627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:15:8:3:10:15:8:3:10 chr1 26796101 . AAG A 48.7 PASS AF=0.202532;AO=16;DP=88;FAO=16;FDP=79;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0665359;FXX=0.0365809;HRUN=6;LEN=2;MLLD=30.2242;QD=2.46558;RBI=0.0665366;REFB=-0.0486661;REVB=0.000292013;RO=66;SAF=9;SAR=7;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0.455399;SSSB=-0.0961888;STB=0.546285;STBP=0.699;TYPE=del;VARB=0.155094;OID=.;OPOS=26796102;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.202532:16:88:16:79:63:9:7:39:24:48:66:9:7:42:24 chr1 26879376 . T C 81.12 PASS AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=-0.00355197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4122;QD=9.01348;RBI=0.00407002;REFB=-0.00908238;REVB=0.00198712;RO=22;SAF=1;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225932;STB=0.666296;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0526286;OID=.;OPOS=26879376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:36:36:22:25:11:11:0.305556:10:1:4:18:10:1:5:20 chr1 26879920 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.987;QD=52.613;RBI=0.0149352;REFB=0;REVB=0.0139287;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80231e-05;OID=.;OPOS=26879920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0 chr1 26883511 . A C 205.39 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0118758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.021;QD=12.8369;RBI=0.0148945;REFB=-0.00910008;REVB=-0.00898948;RO=39;SAF=14;SAR=11;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504196;STB=0.528944;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0108518;OID=.;OPOS=26883511;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:11:14:20:19:11:14:20:19 chr1 26887592 . T C 87.83 PASS AF=0.392857;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0135809;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.313;QD=12.5474;RBI=0.0240646;REFB=0.00147021;REVB=0.0198662;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349124;STB=0.675404;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.00147593;OID=.;OPOS=26887592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:28:28:17:17:10:11:0.392857:5:5:14:3:5:6:14:3 chr1 26900735 . C G 272.56 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0135123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7597;QD=17.3053;RBI=0.0295489;REFB=-0.031161;REVB=0.0262784;RO=32;SAF=11;SAR=19;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210804;STB=0.610858;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0323509;OID=.;OPOS=26900735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:33:30:30:0.47619:19:11:19:13:19:11:19:14 chr1 26901319 . G A 200.55 PASS AF=0.487805;AO=18;DP=39;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.0678541;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8021;QD=19.566;RBI=0.0803499;REFB=-0.0629513;REVB=0.043034;RO=19;SAF=10;SAR=8;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398914;STB=0.682768;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.026542;OID=.;OPOS=26901319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:19:21:18:20:0.487805:8:10:2:17:10:10:3:18 chr1 27210721 . TG CA,CG 477.68 PASS AF=0.235294,0.764706;AO=6,26;DP=33;FAO=8,26;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=2,5;FSAR=6,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00809429,0.00501257;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=240.08,255.132;QD=56.1978;RBI=0.0252555,0.0221938;REFB=0,0;REVB=0.0239233,0.0216204;RO=0;SAF=1,5;SAR=5,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00786868,-0.000148835;OID=.,.;OPOS=27210721,27210721;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:50:33:34:0:0:6,26:8,26:0.235294,0.764706:5,21:1,5:0:0:6,21:2,5:0:0 chr1 27276637 . G A 327.93 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0178417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.306;QD=20.4955;RBI=0.0215941;REFB=-0.048009;REVB=-0.0121648;RO=29;SAF=15;SAR=19;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597739;STB=0.503729;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0361028;OID=.;OPOS=27276637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:30:34:34:0.53125:19:15:13:16:19:15:13:17 chr1 27426796 . T C 766.4 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7793;QD=63.8665;RBI=0.0511722;REFB=0;REVB=-0.0422906;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000933694;OID=.;OPOS=27426796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr1 27427041 . T C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0492;QD=48.7357;RBI=0.0349611;REFB=0;REVB=-0.0344389;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153457;OID=.;OPOS=27427041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0 chr1 27688633 . G A 283.75 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.00688762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.254;QD=23.1633;RBI=0.0090823;REFB=-0.0115093;REVB=-0.00592021;RO=23;SAF=21;SAR=5;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331023;STB=0.518504;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0118106;OID=.;OPOS=27688633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:5:21:18:5:5:21:18:5 chr1 27875824 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00533615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0684;QD=35.5758;RBI=0.0403953;REFB=0;REVB=0.0400413;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00366805;OID=.;OPOS=27875824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr1 27876482 . C A 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0734448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.587;QD=57.5449;RBI=0.0742281;REFB=0;REVB=0.0107555;RO=0;SAF=11;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240017;OID=.;OPOS=27876482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:47:11:0:0:47:11:0:0 chr1 27877019 . G A 102.47 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0227524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.496;QD=17.8204;RBI=0.0271031;REFB=0.0128847;REVB=-0.0147277;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107737;STB=0.56194;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.0226625;OID=.;OPOS=27877019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:5:6:5:7:5:6 chr1 28020307 . G C 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00786791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.425;QD=19.3428;RBI=0.0091587;REFB=-0.0291359;REVB=0.00468806;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242273;STB=0.637045;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00806208;OID=.;OPOS=28020307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:11:7:12:6:11:7:12:6 chr1 28060574 . A G 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0479961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.898;QD=15.2625;RBI=0.0500026;REFB=-0.00545649;REVB=0.0140226;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835315;STB=0.548314;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00613049;OID=.;OPOS=28060574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:6:7:10:6:6:7:10:6 chr1 28209305 . A G 153.42 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00846876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.529;QD=13.9468;RBI=0.0176295;REFB=-0.019381;REVB=-0.0154622;RO=27;SAF=11;SAR=6;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252606;STB=0.646886;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0313208;OID=.;OPOS=28209305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:6:11:11:16:6:11:11:16 chr1 28209362 . T C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0291603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.371;QD=12.4823;RBI=0.0301543;REFB=-0.0101137;REVB=-0.00767845;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136949;STB=0.580514;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0140328;OID=.;OPOS=28209362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:6:6:7:12:6:6:7:12 chr1 28209366 . A G 97.11 PASS AF=0.4;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.134582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9309;QD=12.9485;RBI=0.173179;REFB=-0.0250292;REVB=-0.108989;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953953;STB=0.59984;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0232856;OID=.;OPOS=28209366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:28:30:15:18:12:12:0.4:6:6:6:9:6:6:6:12 chr1 28268835 . A C 714.38 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0533369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6493;QD=60.7986;RBI=0.106341;REFB=0.00161509;REVB=-0.0919976;RO=1;SAF=17;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268486;STB=0.514279;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.00262569;OID=.;OPOS=28268835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:29:17:1:0:29:17:1:0 chr1 28282206 . C T 439.48 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0117799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.539;QD=21.9739;RBI=0.049655;REFB=-0.00634903;REVB=-0.0482374;RO=37;SAF=18;SAR=25;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804999;STB=0.544417;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00584466;OID=.;OPOS=28282206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:0.5375:25:18:19:18:25:18:19:18 chr1 28422847 . C T 673.87 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0815524;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6701;QD=62.6853;RBI=0.0959411;REFB=0;REVB=0.0505361;RO=0;SAF=8;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54187e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205827;OID=.;OPOS=28422847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:35:8:0:0:35:8:0:0 chr1 28638859 . A T 1492.45 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0170025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.594;QD=58.5273;RBI=0.0220214;REFB=-0.101236;REVB=0.013995;RO=0;SAF=40;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506172;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000208016;OID=.;OPOS=28638859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:102:0:1:100:101:0.990196:60:40:0:0:61:40:1:0 chr1 29138975 . G T 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00691848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.935;QD=39.2068;RBI=0.0825457;REFB=0;REVB=0.0822552;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357559;OID=.;OPOS=29138975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr1 29189483 . C T 259.83 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0293187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7884;QD=18.8971;RBI=0.0939483;REFB=-0.0191542;REVB=-0.0892564;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175853;STB=0.562868;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0184521;OID=.;OPOS=29189483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:23:27:28:28:0.509091:11:17:9:14:11:17:13:14 chr1 29189597 . C T 820.18 PASS AF=0.983051;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00745902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.948;QD=55.6053;RBI=0.0148721;REFB=-0.108829;REVB=0.0128663;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.509801;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000730299;OID=.;OPOS=29189597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:59:0:1:57:58:0.983051:24:33:0:0:25:33:0:1 chr1 29213667 . G A 272.74 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0439202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3946;QD=24.2435;RBI=0.0597546;REFB=-0.0148695;REVB=0.0405171;RO=20;SAF=10;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50618e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0291966;OID=.;OPOS=29213667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:15:10:8:12:15:10:8:12 chr1 29446811 . A G 154.06 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.124917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0795;QD=14.3315;RBI=0.124971;REFB=-0.0145198;REVB=0.00367126;RO=25;SAF=3;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410676;STB=0.752835;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0254915;OID=.;OPOS=29446811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:14:3:13:12:14:3:14:12 chr1 29475648 . T G 230.29 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00646933;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.274;QD=46.0588;RBI=0.0128425;REFB=-0.136063;REVB=0.011094;RO=1;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340907;STB=0.518499;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00140935;OID=.;OPOS=29475648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:13:6:0:1:13:6:0:1 chr1 29522674 . C T 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00125548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.173;QD=16.5356;RBI=0.0375792;REFB=-0.000375237;REVB=-0.0375582;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149345;STB=0.585274;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=4.96783e-05;OID=.;OPOS=29522674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:9:9:8:15:9:9:8:15 chr1 29529699 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.004;QD=58.5877;RBI=0.0570262;REFB=0;REVB=0.00768926;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665746;OID=.;OPOS=29529699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr1 29542637 . A G 964.59 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0201932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5766;QD=55.9184;RBI=0.0388434;REFB=-0.0270232;REVB=-0.033182;RO=2;SAF=37;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248583;STB=0.513154;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00323717;OID=.;OPOS=29542637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:30:37:2:0:30:37:2:0 chr1 31188089 . C T 347.66 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0174218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.699;QD=19.8664;RBI=0.0210907;REFB=-0.0206099;REVB=-0.0118869;RO=34;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126733;STB=0.570262;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0183209;OID=.;OPOS=31188089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:19:17:21:13:19:17:21:13 chr1 31188901 . A G 370.14 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.00151393;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.594;QD=14.1004;RBI=0.00453423;REFB=-0.00533935;REVB=-0.00427402;RO=64;SAF=22;SAR=21;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111262;STB=0.554352;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00751446;OID=.;OPOS=31188901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:105:64:62:43:43:0.409524:21:22:26:38:21:22:26:36 chr1 31215364 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00066246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.105;QD=58.5878;RBI=0.00472406;REFB=0;REVB=0.00467739;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57259e-05;OID=.;OPOS=31215364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr1 31346057 . A G 277.29 PASS AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00422767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.044;QD=26.4087;RBI=0.0526388;REFB=-0.00471161;REVB=-0.0524687;RO=17;SAF=16;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085196;STB=0.547245;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00266055;OID=.;OPOS=31346057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:9:16:9:8:9:16:9:8 chr1 31347320 . G A 220.69 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00682667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.785;QD=12.0927;RBI=0.0172997;REFB=-0.0290127;REVB=0.0158958;RO=45;SAF=20;SAR=7;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250102;STB=0.639889;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0489566;OID=.;OPOS=31347320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:45:46:27:27:0.369863:7:20:24:21:7:20:25:21 chr1 31349675 . G A 36.37 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0156565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.914;QD=6.92816;RBI=0.0157401;REFB=-0.0152261;REVB=0.00162025;RO=15;SAF=3;SAR=3;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433819;STB=0.76127;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0392734;OID=.;OPOS=31349675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:3:3:13:2:3:3:13:2 chr1 31426815 . A G 201.99 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0227384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.048;QD=12.0589;RBI=0.0232102;REFB=-0.00741205;REVB=0.00465607;RO=41;SAF=10;SAR=15;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173585;STB=0.607057;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0164574;OID=.;OPOS=31426815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:41:42:25:25:0.373134:15:10:23:18:15:10:24:18 chr1 31445932 . C G 1483.09 PASS AF=1;AO=98;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928306;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1871;QD=59.3235;RBI=0.03329;REFB=0;REVB=0.0319695;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.51413e-05;OID=.;OPOS=31445932;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:100:0:0:98:100:1:45:53:0:0:47:53:0:0 chr1 31732892 . G A 375.11 PASS AF=0.649123;AO=32;DP=55;FAO=37;FDP=57;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0666744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.345;QD=26.3232;RBI=0.0670468;REFB=-0.0599729;REVB=0.00705712;RO=15;SAF=16;SAR=16;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975462;STB=0.583369;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0224635;OID=.;OPOS=31732892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:15:20:32:37:0.649123:16:16:10:5:18:19:15:5 chr1 31733926 . A G 851.16 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.351;QD=57.7059;RBI=0.0180195;REFB=0;REVB=-0.017972;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.23457e-05;OID=.;OPOS=31733926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0 chr1 31769560 . C G 452.78 PASS AF=0.454545;AO=47;DP=109;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=-0.00237161;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.941;QD=16.4648;RBI=0.0148727;REFB=-0.0150924;REVB=0.0146823;RO=62;SAF=28;SAR=19;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240891;STB=0.621729;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0136026;OID=.;OPOS=31769560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:62:60:47:50:0.454545:19:28:22:40:22:28:20:40 chr1 31837174 . C G 660.08 PASS AF=0.426901;AO=73;DP=171;FAO=73;FDP=171;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=0.0134596;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.106;QD=15.4404;RBI=0.022381;REFB=-0.00347914;REVB=0.0178815;RO=98;SAF=33;SAR=40;SRF=56;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122013;STB=0.568127;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00432703;OID=.;OPOS=31837174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:98:98:73:73:0.426901:40:33:56:42:40:33:56:42 chr1 31883295 . T C 1212.42 PASS AF=0.987654;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00454539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9144;QD=59.8727;RBI=0.0208047;REFB=-0.0281037;REVB=0.0203021;RO=1;SAF=29;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956315;STB=0.504853;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0046122;OID=.;OPOS=31883295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:81:1:1:78:80:0.987654:49:29:0:1:51:29:0:1 chr1 31897643 . G A 1210.11 PASS AF=0.566502;AO=115;DP=203;FAO=115;FDP=203;FR=.;FRO=88;FSAF=50;FSAR=65;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=-0.00833912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.301;QD=23.8446;RBI=0.0262101;REFB=-0.0235749;REVB=0.0248481;RO=87;SAF=50;SAR=65;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292815;STB=0.518644;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0174777;OID=.;OPOS=31897643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:87:88:115:115:0.566502:65:50:41:46:65:50:42:46 chr1 31907457 . A G 923.88 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242579;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0564;QD=58.6589;RBI=0.0242891;REFB=0;REVB=-0.00122976;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405568;OID=.;OPOS=31907457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr1 32127953 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00728326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.016;QD=63.8715;RBI=0.00808126;REFB=0;REVB=0.00350155;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93381e-05;OID=.;OPOS=32127953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:34:14:0:0:34:14:0:0 chr1 32148571 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.866;QD=54.5176;RBI=0.0419228;REFB=0;REVB=0.0221096;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265066;OID=.;OPOS=32148571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr1 32158374 . T C 197.39 PASS AF=0.454545;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00546668;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.411;QD=17.9443;RBI=0.0607259;REFB=-0.0136807;REVB=-0.0604794;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00439952;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0193689;OID=.;OPOS=32158374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:23:24:19:20:0.454545:10:9:11:12:10:10:12:12 chr1 32162678 . C CG 40.97 PASS AF=0.28;AO=15;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0137987;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=43.4261;QD=3.27746;RBI=0.0171077;REFB=-0.00496831;REVB=-0.0101129;RO=35;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883719;STB=0.519971;STBP=0.858;TYPE=ins;VARB=0.0980126;OID=.;OPOS=32162679;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.28:15:50:14:50:36:7:7:17:19:40:35:8:7:16:19 chr1 32164206 . T G 321.13 PASS AF=0.515152;AO=33;DP=65;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.040285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4638;QD=19.4623;RBI=0.080783;REFB=-0.00535114;REVB=-0.0700215;RO=32;SAF=18;SAR=15;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403398;STB=0.514277;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0012365;OID=.;OPOS=32164206;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:32:32:33:34:0.515152:15:18:16:16:16:18:16:16 chr1 32165495 . G T 343.95 PASS AF=0.390476;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.0985276;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7766;QD=13.1028;RBI=0.0993543;REFB=-0.012227;REVB=0.0127904;RO=65;SAF=14;SAR=27;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032852;STB=0.522392;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0262147;OID=.;OPOS=32165495;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:65:64:41:41:0.390476:27:14:24:41:27:14:24:40 chr1 32193647 . T C 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0177998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.567;QD=16.0426;RBI=0.0197346;REFB=-0.0301723;REVB=0.00852185;RO=25;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00627176;STB=0.507035;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0302419;OID=.;OPOS=32193647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:26:19:19:0.422222:10:9:12:13:10:9:12:14 chr1 32196647 . C G 179.31 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.109411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2507;QD=23.1372;RBI=0.109851;REFB=0.0392986;REVB=-0.00981731;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992905;STB=0.539524;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.00341955;OID=.;OPOS=32196647;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:12:13:18:18:0.580645:10:8:7:5:10:8:7:6 chr1 32208507 . TG T 67.41 PASS AF=0.575;AO=19;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0388909;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.78985;QD=6.74099;RBI=0.0739965;REFB=-0.107617;REVB=0.0629522;RO=18;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018818;STB=0.50239;STBP=0.977;TYPE=del;VARB=0.119408;OID=.;OPOS=32208508;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.575:19:40:23:40:17:8:15:6:11:53:18:7:12:7:11 chr1 32230280 . C T 225.2 PASS AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0012811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.14;QD=15.268;RBI=0.0203554;REFB=-0.0112407;REVB=-0.020315;RO=33;SAF=20;SAR=6;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197253;STB=0.612809;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0138309;OID=.;OPOS=32230280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:6:20:20:13:6:20:20:13 chr1 32256590 . G A 436.56 PASS AF=0.478261;AO=43;DP=91;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.00287093;FXX=0.0107515;HRUN=6;LEN=1;MLLD=61.6132;QD=18.981;RBI=0.0302158;REFB=0.00248682;REVB=0.0300791;RO=46;SAF=23;SAR=20;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232398;STB=0.61983;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00341417;OID=.;OPOS=32256590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:46:48:43:44:0.478261:20:23:13:33:20:24:15:33 chr1 32280369 . G A 361.87 PASS AF=0.625;AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.000727714;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.598;QD=25.8479;RBI=0.0142779;REFB=-0.0295939;REVB=0.0142594;RO=20;SAF=18;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0094992;STB=0.514278;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0192517;OID=.;OPOS=32280369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:20:21:35:35:0.625:17:18:10:10:17:18:10:11 chr1 32280610 . T C 396.59 PASS AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0399964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.119;QD=15.1081;RBI=0.0578401;REFB=-0.0182693;REVB=-0.0417823;RO=59;SAF=24;SAR=21;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593595;STB=0.528577;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0224329;OID=.;OPOS=32280610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:59:60:45:45:0.428571:21:24:28:31:21:24:29:31 chr1 32373843 . T G 39.22 PASS AF=0.214286;AO=2;DP=24;FAO=6;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=1;FWDB=-0.0702904;FXX=0;HRUN=16;LEN=1;MLLD=181.612;QD=5.60292;RBI=0.0901137;REFB=-0.0237471;REVB=0.0563891;RO=3;SAF=0;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.74993;STB=0.945194;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0280637;OID=.;OPOS=32373843;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:24:28:3:21:2:6:0.214286:2:0:3:0:5:1:20:1 chr1 32672932 . G A 167.79 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.02397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6056;QD=15.6085;RBI=0.0859435;REFB=-0.00241168;REVB=0.0825332;RO=25;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183322;STB=0.606289;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00701992;OID=.;OPOS=32672932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:13:5:11:14:13:5:11:14 chr1 33065947 . G C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00620407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.476;QD=57.6806;RBI=0.0068535;REFB=0;REVB=0.00291203;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37745e-05;OID=.;OPOS=33065947;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr1 33133968 . T C 545.25 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00860557;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.632;QD=57.3946;RBI=0.00871543;REFB=-0.128787;REVB=0.00137943;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0004979;OID=.;OPOS=33133968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:20:17:0:1:20:17:0:1 chr1 33160878 . C T 447.35 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.664;QD=55.9182;RBI=0.0425052;REFB=0;REVB=0.0410041;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116073;OID=.;OPOS=33160878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:15:17:0:0 chr1 33161212 . T C 640.66 PASS AF=0.976744;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00253778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.445;QD=59.596;RBI=0.0149929;REFB=-0.14396;REVB=0.0147765;RO=1;SAF=25;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184012;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00202206;OID=.;OPOS=33161212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:42:43:1:1:41:42:0.976744:16:25:1:0:17:25:1:0 chr1 33235626 . G A 354.45 PASS AF=0.647059;AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-8.63753e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.255;QD=27.8004;RBI=0.033263;REFB=-0.0309781;REVB=0.0332628;RO=17;SAF=25;SAR=8;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606062;STB=0.516683;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0169664;OID=.;OPOS=33235626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:17:18:33:33:0.647059:8:25:13:4:8:25:13:5 chr1 33237661 . C T 280.23 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00339874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.396;QD=16.7301;RBI=0.00834749;REFB=2.83251e-05;REVB=-0.00762425;RO=36;SAF=21;SAR=10;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703017;STB=0.539588;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-8.91875e-05;OID=.;OPOS=33237661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:10:21:22:14:10:21:22:14 chr1 33299673 . TAAAC GTAAC,TAAC,TAACA,TAATA,TAATC 317.88 PASS AF=0,0.698113,0.0943396,0,0;AO=2,19,2,2,2;DP=53;FAO=0,37,5,0,0;FDP=53;FR=.;FRO=11;FSAF=0,28,0,0,0;FSAR=0,9,5,0,0;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0167957,0.14299,0.0638542,-0.0344305,-0.027754;FXX=0;HRUN=1,3,3,3,3;LEN=2,1,2,2,1;MLLD=51.2221,14.2382,16.4378,139.747,142.068;QD=23.9907;RBI=0.0356691,0.196008,0.121026,0.0599597,0.0297689;REFB=-0.0468141,-0.141218,-0.0820844,0.0239216,0.011353;REVB=0.0314673,0.134063,0.10281,-0.0490888,-0.0107658;RO=21;SAF=2,16,0,0,0;SAR=0,3,2,2,2;SRF=14;SRR=7;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0.442452,0.242105,-0.585199,-0.585199,-0.585199;STB=0.5,0.585725,0.997252,0.5,0.5;STBP=1,0.049,0.03,1,1;TYPE=mnp,del,mnp,mnp,snp;VARB=0,0.117622,-0.00354475,0.137425,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=33299673,33299674,33299676,33299676,33299676;OREF=TA,A,AC,AC,A;OALT=GT,-,CA,TA,T;OMAPALT=GTAAC,TAAC,TAACA,TAATA,TAATC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:52:53:53:21:11:2,19,2,2,2:0,37,5,0,0:0,0.698113,0.0943396,0,0:0,3,2,2,2:2,16,0,0,0:14:7:0,9,5,0,0:0,28,0,0,0:5:6 chr1 33324245 . T C 198.99 PASS AF=0.4;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0183447;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.722;QD=13.2658;RBI=0.0247245;REFB=0.00488277;REVB=-0.0165763;RO=36;SAF=17;SAR=7;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232876;STB=0.634211;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-0.00636114;OID=.;OPOS=33324245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:36:36:24:24:0.4:7:17:18:18:7:17:18:18 chr1 33327889 . T C 451.65 PASS AF=0.535714;AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.00209834;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=88.0292;QD=21.5072;RBI=0.029531;REFB=-0.0299425;REVB=0.0294564;RO=39;SAF=20;SAR=24;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15773;STB=0.590511;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0122759;OID=.;OPOS=33327889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:39:44:45:0.535714:24:20:25:14:25:20:25:14 chr1 33328165 . G A 2015.73 PASS AF=0.964029;AO=133;DP=139;FAO=134;FDP=139;FR=.;FRO=5;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0129794;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.463;QD=58.0065;RBI=0.0131282;REFB=-0.165858;REVB=0.00197139;RO=4;SAF=64;SAR=69;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287788;STB=0.518516;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.000592121;OID=.;OPOS=33328165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:139:139:4:5:133:134:0.964029:69:64:4:0:69:65:5:0 chr1 33409693 . G A 210.71 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=-0.0517936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.627;QD=19.155;RBI=0.0646338;REFB=-0.0104603;REVB=-0.0386646;RO=23;SAF=5;SAR=16;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492201;STB=0.777754;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0269032;OID=.;OPOS=33409693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:16:5:18:5:16:5:18:5 chr1 33475721 . G C 74.62 PASS AF=0.20339;AO=12;DP=59;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0312949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1198;QD=5.0592;RBI=0.0315358;REFB=-0.0181869;REVB=0.00389104;RO=47;SAF=5;SAR=7;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379194;STB=0.524455;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0662603;OID=.;OPOS=33475721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:59:59:47:47:12:12:0.20339:7:5:21:26:7:5:21:26 chr1 33475750 . A G 111.29 PASS AF=0.246377;AO=16;DP=68;FAO=17;FDP=69;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.00463331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.918;QD=6.45138;RBI=0.00464603;REFB=-0.0109893;REVB=0.000343438;RO=52;SAF=6;SAR=10;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373341;STB=0.540935;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0173526;OID=.;OPOS=33475750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:52:52:16:17:0.246377:10:6:21:31:11:6:21:31 chr1 33475767 . G A 131.24 PASS AF=0.271429;AO=19;DP=70;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0159622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.251;QD=7.49928;RBI=0.0207498;REFB=-0.0019162;REVB=0.0132575;RO=51;SAF=6;SAR=13;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101047;STB=0.561395;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00545178;OID=.;OPOS=33475767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:51:51:19:19:0.271429:13:6:20:31:13:6:20:31 chr1 33631069 . C A 1479.83 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0172046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.803;QD=58.607;RBI=0.0229121;REFB=-0.00560941;REVB=0.0151315;RO=1;SAF=47;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00998653;STB=0.505262;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=4.50043e-05;OID=.;OPOS=33631069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:1:1:100:100:0.990099:53:47:1:0:53:47:1:0 chr1 33789588 . T C 149.03 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0154922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.773;QD=17.0322;RBI=0.0294402;REFB=-0.0322429;REVB=0.0250343;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14083;STB=0.599886;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0388598;OID=.;OPOS=33789588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:35:17:19:16:16:0.457143:6:10:13:4:6:10:15:4 chr1 33789670 . G A 250.55 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=0.0194464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.548;QD=20.0439;RBI=0.0333669;REFB=-0.00699582;REVB=0.0271143;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283249;STB=0.663674;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0118702;OID=.;OPOS=33789670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:11:13:21:4:11:13:22:4 chr1 33790496 . G A 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.015831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.921;QD=19.0005;RBI=0.0158544;REFB=-0.00611356;REVB=0.000860267;RO=17;SAF=13;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292682;STB=0.667771;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0128542;OID=.;OPOS=33790496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:4:13:8:9:4:13:8:9 chr1 33820134 . C T 92.14 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.057882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.155;QD=18.4274;RBI=0.0659889;REFB=-0.0216849;REVB=-0.0316894;RO=9;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350646;STB=0.695379;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0333458;OID=.;OPOS=33820134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:7:4:0:9:7:4:0:9 chr1 33832865 . A G 327.64 PASS AF=0.270833;AO=26;DP=96;FAO=26;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=43;FWDB=0.000822339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.914;QD=13.6517;RBI=0.0190601;REFB=-0.0156573;REVB=-0.0190424;RO=56;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234553;STB=0.666553;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0157777;OID=.;OPOS=33832865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:56:58:26:26:0.270833:14:12:15:41:13:13:15:43 chr1 33957152 . T G 783.24 PASS AF=1;AO=38;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.621;QD=63.9378;RBI=0.11327;REFB=0;REVB=0.11018;RO=0;SAF=31;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00356031;OID=.;OPOS=33957152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:38:49:1:7:31:0:0:18:31:0:0 chr1 33960062 . A G 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0239093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.654;QD=14.2705;RBI=0.0247327;REFB=-0.00347998;REVB=-0.00632873;RO=33;SAF=15;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114744;STB=0.565555;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00416906;OID=.;OPOS=33960062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:9:15:17:16:9:15:17:16 chr1 33961722 . C T 120.28 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.004128;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.4969;QD=14.1506;RBI=0.0421337;REFB=0.000206164;REVB=0.041931;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317097;STB=0.694856;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00127149;OID=.;OPOS=33961722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:19:20:14:14:0.411765:9:5:13:6:9:5:14:6 chr1 34071525 . C T 255.43 PASS AF=0.522727;AO=17;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00636404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.413;QD=23.2206;RBI=0.0244274;REFB=-0.000816378;REVB=0.0235838;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176965;STB=0.597476;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0126058;OID=.;OPOS=34071525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:17:23:0.522727:10:7:12:8:14:9:12:8 chr1 34090679 . T C 598.69 PASS AF=0.45;AO=62;DP=138;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=54;FSRR=23;FWDB=-0.0125268;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.149;QD=17.1055;RBI=0.0127358;REFB=-0.0333982;REVB=-0.00229763;RO=72;SAF=42;SAR=20;SRF=50;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189891;STB=0.512005;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0303954;OID=.;OPOS=34090679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:72:77:62:63:0.45:20:42:50:22:20:43:54:23 chr1 34190962 . G A 826.17 PASS AF=0.5;AO=84;DP=168;FAO=84;FDP=168;FR=.;FRO=84;FSAF=57;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.00177752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.144;QD=19.6707;RBI=0.0237671;REFB=-0.0149939;REVB=0.0237005;RO=84;SAF=57;SAR=27;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106603;STB=0.558809;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0138973;OID=.;OPOS=34190962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:84:84:84:84:0.5:27:57:48:36:27:57:48:36 chr1 34270498 . G A 1560.03 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00911261;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.503;QD=64.3309;RBI=0.0126131;REFB=0;REVB=-0.00872074;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305739;OID=.;OPOS=34270498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:97:0:0:97:97:1:44:53:0:0:44:53:0:0 chr1 34285342 . G A 364.62 PASS AF=0.416667;AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0740882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6472;QD=15.1925;RBI=0.084699;REFB=0.0129749;REVB=0.0410469;RO=56;SAF=21;SAR=18;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015862;STB=0.502104;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-0.0228917;OID=.;OPOS=34285342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:56:56:39:40:0.416667:18:21:31:25:18:22:31:25 chr1 34285381 . C T 487.69 PASS AF=0.52809;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0197972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.538;QD=21.9185;RBI=0.0291498;REFB=-0.000946357;REVB=0.0213958;RO=42;SAF=24;SAR=23;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725818;STB=0.539993;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.000867504;OID=.;OPOS=34285381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:42:42:47:47:0.52809:23:24:25:17:23:24:25:17 chr1 34329897 . T C 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.159;QD=57.1062;RBI=0.0258921;REFB=0;REVB=0.00882273;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21654e-05;OID=.;OPOS=34329897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0 chr1 34330067 . A C 888.63 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0155918;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.9;QD=56.4208;RBI=0.0276556;REFB=-0.0316439;REVB=0.0228413;RO=1;SAF=30;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154778;STB=0.508194;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000238058;OID=.;OPOS=34330067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:63:1:1:62:62:0.984127:32:30:1:0:32:30:1:0 chr1 34578613 . A G 381.64 PASS AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0164237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.521;QD=22.4492;RBI=0.0219158;REFB=-0.0265718;REVB=0.0145108;RO=28;SAF=8;SAR=30;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443885;STB=0.555525;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00949295;OID=.;OPOS=34578613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:30:38:38:0.558824:30:8:7:21:30:8:9:21 chr1 34663208 . C G 134.17 PASS AF=0.315789;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.0121637;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.303;QD=9.41534;RBI=0.025563;REFB=-0.010013;REVB=-0.0224836;RO=39;SAF=11;SAR=7;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135246;STB=0.559936;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0198137;OID=.;OPOS=34663208;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:39:39:18:18:0.315789:7:11:28:11:7:11:27:12 chr1 35184033 . C T 693.01 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752174;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.694;QD=63.0008;RBI=0.0361112;REFB=0;REVB=0.0353192;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94624e-05;OID=.;OPOS=35184033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr1 35223913 . A C 43.02 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00743427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.409;QD=5.37736;RBI=0.0169444;REFB=-0.00816236;REVB=-0.0152264;RO=25;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190123;STB=0.622323;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0384825;OID=.;OPOS=35223913;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:25:25:7:7:0.21875:4:3:7:18:4:3:7:18 chr1 35251229 . G A 146.89 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0120888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0758;QD=17.2808;RBI=0.0149289;REFB=-0.016598;REVB=0.00875971;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281531;STB=0.661448;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0267916;OID=.;OPOS=35251229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:5:11:7:11:5:11:7:11 chr1 35259946 . G A 251.52 PASS AF=0.309091;AO=34;DP=110;FAO=34;FDP=110;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=-0.00824837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.724;QD=9.14623;RBI=0.0184194;REFB=-0.0127488;REVB=-0.0164693;RO=76;SAF=13;SAR=21;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476384;STB=0.527916;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0260503;OID=.;OPOS=35259946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:76:76:34:34:0.309091:21:13:32:44:21:13:32:44 chr1 35259961 . A G 253.48 PASS AF=0.320388;AO=33;DP=103;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.0395193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.681;QD=9.84386;RBI=0.0399959;REFB=0.000123874;REVB=0.00615593;RO=70;SAF=13;SAR=20;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587337;STB=0.534284;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.00149956;OID=.;OPOS=35259961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:70:70:33:33:0.320388:20:13:31:39:20:13:31:39 chr1 35260769 . C T 111.8 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00944017;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=293.834;QD=15.4212;RBI=0.0121585;REFB=0.000604907;REVB=0.00766236;RO=16;SAF=1;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483391;STB=0.791866;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.000414378;OID=.;OPOS=35260769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:12:1:6:10:12:1:6:10 chr1 35260929 . G A 335.52 PASS AF=0.386139;AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.00048073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.18;QD=13.2881;RBI=0.00286851;REFB=-0.00934857;REVB=0.00282794;RO=62;SAF=16;SAR=23;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132192;STB=0.575255;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0137476;OID=.;OPOS=35260929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:62:62:39:39:0.386139:23:16:33:29:23:16:33:29 chr1 35261166 . G A 339.94 PASS AF=0.630435;AO=28;DP=46;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0235473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8554;QD=29.5597;RBI=0.0262112;REFB=-0.0216151;REVB=0.0115131;RO=17;SAF=11;SAR=17;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095855;STB=0.543349;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0158824;OID=.;OPOS=35261166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:17:17:28:29:0.630435:17:11:9:8:17:12:9:8 chr1 35370688 . G A 659.49 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.152;QD=61.3483;RBI=0.0275865;REFB=0;REVB=0.0234778;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101844;OID=.;OPOS=35370688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:43:0:0:40:43:1:26:14:0:0:29:14:0:0 chr1 35442168 . A C 652.15 PASS AF=0.463087;AO=67;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=-0.0064019;FXX=0.0132442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.442;QD=17.5074;RBI=0.0267575;REFB=-0.0236451;REVB=-0.0259804;RO=80;SAF=29;SAR=38;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090601;STB=0.556628;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0338223;OID=.;OPOS=35442168;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:80:80:67:69:0.463087:38:29:42:38:40:29:42:38 chr1 35578630 . C T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00334429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.6;QD=20.7383;RBI=0.00701968;REFB=-0.0199376;REVB=0.00617184;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247442;STB=0.639842;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0220503;OID=.;OPOS=35578630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:12:6:10:6:12:6:10:6 chr1 35757843 . A T 740.41 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00461788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2414;QD=56.9545;RBI=0.0756141;REFB=0;REVB=0.075473;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000946481;OID=.;OPOS=35757843;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr1 35824720 . G A 310.4 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0379773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5203;QD=21.4072;RBI=0.0474687;REFB=0.0128272;REVB=-0.0284781;RO=26;SAF=11;SAR=21;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253544;STB=0.640434;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0151854;OID=.;OPOS=35824720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:21:11:17:9:21:11:17:9 chr1 35900615 . A G 1216.12 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0615149;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.145;QD=60.0555;RBI=0.0700281;REFB=0.0278691;REVB=0.0334641;RO=1;SAF=35;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133348;STB=0.507041;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000126696;OID=.;OPOS=35900615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:81:1:1:80:80:0.987654:45:35:1:0:45:35:1:0 chr1 35919979 . A G 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00235209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.091;QD=20.2683;RBI=0.00863848;REFB=-0.0145143;REVB=-0.0083121;RO=21;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920197;STB=0.551677;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0128803;OID=.;OPOS=35919979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:8:13:15:6:8:13:15:6 chr1 35921764 . G C 892.53 PASS AF=0.570423;AO=83;DP=145;FAO=81;FDP=142;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.00122349;FXX=0.0206882;HRUN=6;LEN=1;MLLD=281.936;QD=25.1417;RBI=0.0173242;REFB=-0.0175526;REVB=-0.017281;RO=60;SAF=40;SAR=43;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246817;STB=0.504365;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0121767;OID=.;OPOS=35921764;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:142:60:61:83:81:0.570423:43:40:27:33:43:38:28:33 chr1 36031342 . T A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.02;QD=51.9163;RBI=0.00600363;REFB=0;REVB=0.00137754;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.49578e-05;OID=.;OPOS=36031342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:20:1:0:0:20:1:0:0 chr1 36225948 . T C 376.41 PASS AF=0.425532;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=0.0268811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6123;QD=16.0176;RBI=0.0450545;REFB=0.00380226;REVB=0.0361568;RO=54;SAF=25;SAR=15;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459717;STB=0.525849;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.0056237;OID=.;OPOS=36225948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:54:40:40:0.425532:15:25:36:18:15:25:36:18 chr1 36316571 . A C 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00989066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.948;QD=12.9138;RBI=0.0131932;REFB=-0.0106574;REVB=0.00873135;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290639;STB=0.52457;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0126493;OID=.;OPOS=36316571;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:12:12:17:19:12:12:17:20 chr1 36320134 . T TGTA 45.33 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00930051;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=3;MLLD=289.767;QD=6.97387;RBI=0.0208866;REFB=0.00096485;REVB=-0.0187017;RO=21;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468866;STB=0.772481;STBP=0.124;TYPE=ins;VARB=-0.00300716;OID=.;OPOS=36320135;OREF=-;OALT=GTA;OMAPALT=TGTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.269231:7:28:7:26:19:5:2:6:13:45:21:5:2:6:15 chr1 36359669 . A G 267.53 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00401706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.486;QD=21.8389;RBI=0.0255993;REFB=-0.0154962;REVB=-0.0252822;RO=24;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904086;STB=0.550733;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0143267;OID=.;OPOS=36359669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:9:16:13:11:9:16:13:11 chr1 36550658 . C T 154.94 PASS AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0285529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.883;QD=32.6182;RBI=0.0306216;REFB=-0.0283135;REVB=-0.0110642;RO=4;SAF=9;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392188;STB=0.52171;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0145379;OID=.;OPOS=36550658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:19:19:4:4:15:15:0.789474:6:9:2:2:6:9:2:2 chr1 36553673 . A G 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.633;QD=57.1035;RBI=0.0511525;REFB=0;REVB=0.0138647;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216079;OID=.;OPOS=36553673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr1 36642420 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.632;QD=58.1418;RBI=0.0289852;REFB=0;REVB=0.0114064;RO=0;SAF=3;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126001;OID=.;OPOS=36642420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:29:3:0:0:29:3:0:0 chr1 36752433 . C T 211.19 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235073;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.123;QD=49.6915;RBI=0.0665926;REFB=0;REVB=0.0665511;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319625;OID=.;OPOS=36752433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr1 36773405 . T G 1894.72 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.865;QD=61.6171;RBI=0.079066;REFB=0;REVB=0.0705757;RO=0;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30693e-05;OID=.;OPOS=36773405;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:60:63:0:0:60:63:0:0 chr1 36788100 . G C 204.46 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0699084;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3793;QD=22.7177;RBI=0.0903167;REFB=-0.0102221;REVB=0.0571832;RO=15;SAF=7;SAR=13;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014105;STB=0.512109;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00842279;OID=.;OPOS=36788100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:15:16:20:20:0.555556:13:7:5:10:13:7:6:10 chr1 36793789 . TTGG T,TTG 31.14 PASS AF=0.222222,0;AO=4,3;DP=26;FAO=6,0;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0394258,-0.067477;FXX=0;HRUN=2,6;LEN=3,1;MLLD=40.8061,11.7575;QD=4.61391;RBI=0.0499479,0.101496;REFB=-0.00603156,-0.00103388;REVB=0.0306659,0.0758172;RO=17;SAF=1,2;SAR=3,1;SRF=11;SRR=6;SSEN=0,0.764706;SSEP=0,0.482759;SSSB=-0.431019,0.0237149;STB=0.842259,0.5;STBP=0.094,1;TYPE=del,del;VARB=0.0156545,0.0754213;OID=.,.;OPOS=36793790,36793791;OREF=TGG,G;OALT=-,-;OMAPALT=T,TTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.222222,0:4,3:26:6,0:27:21:1,0:5,0:13:8:28:17:1,2:3,1:11:6 chr1 36794192 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7156;QD=42.1825;RBI=0.0393551;REFB=0;REVB=0.0246584;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175861;OID=.;OPOS=36794192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0 chr1 36807481 . C T 157.74 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0162208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.569;QD=11.267;RBI=0.0162492;REFB=-0.0177578;REVB=0.000961205;RO=36;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552514;STB=0.532226;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0362818;OID=.;OPOS=36807481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:11:9:18:18:11:9:18:18 chr1 36888462 . A G 163.75 PASS AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.055189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1758;QD=13.3675;RBI=0.0633784;REFB=0.0273198;REVB=0.031161;RO=30;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156203;STB=0.601254;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.0349915;OID=.;OPOS=36888462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:31:18:18:0.367347:11:7:16:14:11:7:17:14 chr1 36889005 . G A 442.74 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0257549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.966;QD=22.7045;RBI=0.0258667;REFB=-0.00287433;REVB=-0.00240174;RO=35;SAF=25;SAR=18;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789142;STB=0.543458;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.00238412;OID=.;OPOS=36889005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:18:25:17:18:18:25:17:18 chr1 36893968 . A G 131.43 PASS AF=0.405405;AO=14;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00704399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.252;QD=14.2085;RBI=0.0487247;REFB=-0.00245524;REVB=0.0482129;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749621;STB=0.560358;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00424605;OID=.;OPOS=36893968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:22:22:14:15:0.405405:8:6:11:11:9:6:11:11 chr1 36926853 . G A 154.99 PASS AF=0.789474;AO=14;DP=18;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.042;QD=32.6301;RBI=0.0502437;REFB=-0.0707917;REVB=0.0502437;RO=4;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0287147;OID=.;OPOS=36926853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:18:19:4:4:14:15:0.789474:14:0:0:4:15:0:0:4 chr1 36927733 . G A 710.75 PASS AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00753486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1545;QD=54.6728;RBI=0.0765159;REFB=-0.0958749;REVB=0.076144;RO=1;SAF=32;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014486;STB=0.50746;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00361098;OID=.;OPOS=36927733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:51:52:1:1:50:51:0.980769:18:32:1:0:18:33:1:0 chr1 38005912 . GTTTTTTG GTTTTTG,GTTTTTTT,TGTTTTTG 90.77 PASS AF=0.454545,0,0.0227273;AO=19,2,3;DP=47;FAO=20,0,1;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=5,0,0;FSAR=15,0,1;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.134159,-0.0878406,0.0093104;FXX=0;HRUN=6,4,1;LEN=1,1,2;MLLD=11.5918,31.7473,59.1292;QD=8.25205;RBI=0.142998,0.143295,0.0896655;REFB=-0.128583,0.0961393,-0.0112404;REVB=-0.0494967,0.113215,-0.0891808;RO=20;SAF=4,2,0;SAR=15,0,3;SRF=17;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0.338983,0,0;SSSB=-0.556483,0.396346,-0.760436;STB=0.758365,0.5,0.994215;STBP=0.005,1,0.132;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.162473,0,0.046494;OID=.,.,.;OPOS=38005913,38005919,38005912;OREF=T,G,GT;OALT=-,T,TG;OMAPALT=GTTTTTG,GTTTTTTT,TGTTTTTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:47:44:20:23:19,2,3:20,0,1:0.454545,0,0.0227273:15,0,3:4,2,0:17:3:15,0,1:5,0,0:17:6 chr1 38006359 . A G 714.94 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149598;FXX=0.0217344;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.515;QD=63.5502;RBI=0.0212191;REFB=0;REVB=-0.0150484;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00317681;OID=.;OPOS=38006359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr1 38023316 . C T 759.56 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.49;QD=63.2966;RBI=0.0444321;REFB=0;REVB=-0.0170145;RO=0;SAF=9;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83101e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201611;OID=.;OPOS=38023316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:46:48:1:37:9:0:0:37:11:0:0 chr1 38077420 . A C 62.26 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3777;QD=35.5759;RBI=0.00496641;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000388661;OID=.;OPOS=38077420;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:0:6:0:0:0:7:0:0 chr1 38148765 . A G 1873.2 PASS AF=1;AO=120;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0592952;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6216;QD=61.4165;RBI=0.059884;REFB=0;REVB=0.00837737;RO=1;SAF=59;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079833;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178562;OID=.;OPOS=38148765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:122:1:0:120:122:1:61:59:1:0:62:60:0:0 chr1 38173983 . TTTC T,TT 500.45 PASS AF=1,0;AO=30,9;DP=40;FAO=43,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00469195,-0.00237362;FXX=0.0227221;HRUN=4,4;LEN=3,2;MLLD=226.681,219.056;QD=46.5538;RBI=0.0319015,0.0369058;REFB=0,0;REVB=-0.0315546,-0.0368294;RO=0;SAF=18,0;SAR=12,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-9.46393e-05,0;OID=.,.;OPOS=38173984,38173985;OREF=TTC,TC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:30,9:40:43,0:43:0:20,0:23,0:0:0:9:0:18,0:12,9:0:0 chr1 38185169 . G A 1503.55 PASS AF=0.98;AO=94;DP=96;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0565314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.076;QD=60.1421;RBI=0.0688611;REFB=-0.158609;REVB=0.0393198;RO=1;SAF=45;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104202;STB=0.509998;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00194599;OID=.;OPOS=38185169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:100:1:2:94:98:0.98:49:45:1:0:49:49:2:0 chr1 38197170 . C T 541.78 PASS AF=0.478992;AO=57;DP=119;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00519775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.076;QD=18.2112;RBI=0.0052975;REFB=-0.0113464;REVB=0.00102318;RO=60;SAF=26;SAR=31;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102149;STB=0.55632;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0108035;OID=.;OPOS=38197170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:60:62:57:57:0.478992:31:26:34:26:31:26:35:27 chr1 38203661 . T TG 190.68 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.1597;QD=47.6709;RBI=0.0518914;REFB=0;REVB=-0.0284294;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0011673;OID=.;OPOS=38203662;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:16:16:16:16:0:9:7:0:0:4:0:9:7:0:0 chr1 38227086 . A T 384.06 PASS AF=0.72093;AO=31;DP=43;FAO=31;FDP=43;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=-0.0456376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1208;QD=35.726;RBI=0.0478442;REFB=0.00582474;REVB=-0.0143625;RO=12;SAF=1;SAR=30;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155103;STB=0.583287;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.00384383;OID=.;OPOS=38227086;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:43:43:12:12:31:31:0.72093:30:1:0:12:30:1:0:12 chr1 38227268 . G T 82.3 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0220531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.077;QD=19.3645;RBI=0.0225517;REFB=-0.0116992;REVB=0.00471622;RO=7;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317856;STB=0.685302;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0216938;OID=.;OPOS=38227268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:2:8:3:4:2:8:3:4 chr1 38279666 . CTTTTTTTTTTTTTTTT CTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTTTA 106.66 PASS AF=0,0.684211,0.263158;AO=3,5,3;DP=20;FAO=0,13,5;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=0,12,5;FSAR=0,1,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.106205,-0.15784,-0.0757891;FXX=0.173837;HRUN=16,16,16;LEN=3,2,1;MLLD=7.00722,5.34167,19.2002;QD=22.4549;RBI=0.116253,0.168676,0.080982;REFB=0.0255088,0.0346405,0.0415257;REVB=0.0472785,0.0594813,0.0285323;RO=2;SAF=3,4,3;SAR=0,1,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.171367,0;STB=0.5,0.51997,0.5;STBP=1,0.663,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.114669,0.13876,-0.200166;OID=.,.,.;OPOS=38279667,38279667,38279682;OREF=TTT,TT,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=CTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.684211,0.263158:3,5,3:20:0,13,5:19:1:0,12,5:0,1,0:1:0:34:2:3,4,3:0,1,0:2:0 chr1 38423853 . G C 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.061;QD=62.008;RBI=0.0254524;REFB=0;REVB=-0.00322123;RO=0;SAF=30;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62501e-05;OID=.;OPOS=38423853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:54:30:0:0:54:30:0:0 chr1 38442547 . G A 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.226;QD=55.0976;RBI=0.0379968;REFB=0;REVB=0.0231219;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000931489;OID=.;OPOS=38442547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:4:22:0:0:4:22:0:0 chr1 38449910 . T C 264.36 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0134226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.205;QD=20.734;RBI=0.0736163;REFB=-0.00589625;REVB=-0.0723823;RO=24;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795018;STB=0.544346;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00311191;OID=.;OPOS=38449910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:11:16:12:12:11:16:12:12 chr1 38450367 . A G 494.39 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645479;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6227;QD=58.1637;RBI=0.0646658;REFB=0;REVB=0.00390355;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00363625;OID=.;OPOS=38450367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:17:16:0:0:18:16:0:0 chr1 38462905 . C G 62.24 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00551966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5629;QD=35.563;RBI=0.0689094;REFB=0;REVB=0.068688;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00591026;OID=.;OPOS=38462905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0 chr1 38463504 . C T 719.9 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6456;QD=56.463;RBI=0.00952141;REFB=0;REVB=0.0088316;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75687e-05;OID=.;OPOS=38463504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr1 38463725 . G C 398.84 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.000567764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.933;QD=18.3377;RBI=0.0132914;REFB=-0.00198241;REVB=-0.0132793;RO=45;SAF=22;SAR=19;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390114;STB=0.515247;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0021102;OID=.;OPOS=38463725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:45:46:41:41:0.471264:19:22:26:19:19:22:26:20 chr1 38862336 . T A 651.06 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.435;QD=62.0061;RBI=0.12595;REFB=0;REVB=-0.113309;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00266063;OID=.;OPOS=38862336;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr1 39329700 . G T 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0265671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.579;QD=16.4169;RBI=0.0265691;REFB=-0.0318219;REVB=0.000326287;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00841846;STB=0.504847;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.020925;OID=.;OPOS=39329700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:6:8:9:7:6:8:9:7 chr1 39339449 . C T 385.35 PASS AF=0.465116;AO=39;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.016283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.301;QD=17.9233;RBI=0.0501394;REFB=-0.0185968;REVB=-0.0474218;RO=46;SAF=18;SAR=21;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260817;STB=0.521601;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0187017;OID=.;OPOS=39339449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:46:39:40:0.465116:21:18:20:26:21:19:20:26 chr1 39340282 . C T 463.84 PASS AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0760268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.622;QD=19.3266;RBI=0.0760368;REFB=-0.0115783;REVB=0.00123581;RO=50;SAF=21;SAR=25;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096737;STB=0.553774;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0106307;OID=.;OPOS=39340282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:25:21:28:22:25:21:28:22 chr1 39340607 . A G 315.55 PASS AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0280611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.598;QD=25.2439;RBI=0.0282786;REFB=0.00227155;REVB=-0.0035004;RO=22;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115114;STB=0.564015;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.00134379;OID=.;OPOS=39340607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:19:9:10:12:19:9:10:12 chr1 39352083 . T G 255.29 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0314599;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.142;QD=17.915;RBI=0.041264;REFB=-0.0107177;REVB=-0.026702;RO=26;SAF=20;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991601;STB=0.574657;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0144824;OID=.;OPOS=39352083;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:29:28:28:0.491228:8:20:16:10:8:20:17:12 chr1 39352271 . G T 130.64 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00267419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.639;QD=22.7197;RBI=0.0391795;REFB=-0.0105448;REVB=-0.0390882;RO=9;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164121;STB=0.592461;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00527533;OID=.;OPOS=39352271;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:6:8:3:6:6:8:3:6 chr1 39748921 . G A 301.5 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0298341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2009;QD=16.7499;RBI=0.0324591;REFB=0.00574936;REVB=0.0127875;RO=39;SAF=14;SAR=19;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365568;STB=0.520535;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.00590186;OID=.;OPOS=39748921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:19:14:18:21:19:14:18:21 chr1 39797055 . A G 337.59 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.036972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.757;QD=20.1547;RBI=0.0404146;REFB=-0.00806347;REVB=0.016322;RO=32;SAF=9;SAR=26;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123247;STB=0.568709;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0105652;OID=.;OPOS=39797055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:26:9:12:20:26:9:12:20 chr1 39801815 . A C 75.14 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.000607996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.3051;QD=11.1324;RBI=0.0487089;REFB=-0.0369855;REVB=0.0487051;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431396;STB=0.758388;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0651692;OID=.;OPOS=39801815;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:9:1:6:10:9:1:6:11 chr1 39806610 . C T 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00908677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.143;QD=16.9414;RBI=0.00940324;REFB=-0.0125603;REVB=-0.00241898;RO=24;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972961;STB=0.555498;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.014688;OID=.;OPOS=39806610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:9:10:15:9:9:10:15:9 chr1 39812822 . C A 251.55 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00344379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3139;QD=23.3996;RBI=0.00509808;REFB=-0.00533253;REVB=-0.00375909;RO=19;SAF=6;SAR=18;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207455;STB=0.616334;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0111156;OID=.;OPOS=39812822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:18:6:9:10:18:6:9:10 chr1 39835817 . A G 294.51 PASS AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0736048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.606;QD=28.0481;RBI=0.0737063;REFB=0.000705047;REVB=0.00386739;RO=16;SAF=7;SAR=19;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136606;STB=0.575696;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000242313;OID=.;OPOS=39835817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:19:7:7:9:19:7:7:9 chr1 39881040 . G C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.000335339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.262;QD=12.0517;RBI=0.00486807;REFB=-0.0209144;REVB=-0.0048565;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13422;STB=0.580461;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0249714;OID=.;OPOS=39881040;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:6:3:6:7:6:3:6:7 chr1 39881468 . T A 1069.85 PASS AF=0.502326;AO=107;DP=215;FAO=108;FDP=215;FR=.;FRO=107;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=48;FSRR=59;FWDB=-0.000112852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.377;QD=19.9042;RBI=0.0022946;REFB=-0.0146365;REVB=0.00229182;RO=107;SAF=49;SAR=58;SRF=48;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00857531;STB=0.507195;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0136141;OID=.;OPOS=39881468;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:107:107:107:108:0.502326:58:49:48:59:58:50:48:59 chr1 39908506 . G A 448.97 PASS AF=0.573333;AO=41;DP=74;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00251823;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=356.566;QD=23.9451;RBI=0.00754574;REFB=-0.0178309;REVB=0.00711314;RO=32;SAF=15;SAR=26;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603264;STB=0.529398;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.012684;OID=.;OPOS=39908506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:32:32:41:43:0.573333:26:15:14:18:27:16:14:18 chr1 39914363 . G C 559.68 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0228722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.666;QD=19.1345;RBI=0.0248318;REFB=-0.0247929;REVB=0.00966856;RO=59;SAF=21;SAR=37;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435077;STB=0.524071;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0184115;OID=.;OPOS=39914363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:59:59:58:58:0.495726:37:21:24:35:37:21:24:35 chr1 40098328 . T C 467.27 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0656833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.756;QD=54.9734;RBI=0.0656833;REFB=-0.0666598;REVB=-8.85264e-05;RO=1;SAF=1;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305424;STB=0.666534;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00143628;OID=.;OPOS=40098328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:32:1:1:0:32:1:1:0 chr1 40129066 . G A 346.14 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00285944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.0938;QD=19.5007;RBI=0.0116496;REFB=0.0100281;REVB=-0.0112932;RO=35;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112946;STB=0.562709;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.0136399;OID=.;OPOS=40129066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:19:17:21:14:19:17:21:14 chr1 40145297 . C T 189.56 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0550621;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.581;QD=11.1508;RBI=0.0589621;REFB=-0.0260972;REVB=-0.0210879;RO=43;SAF=10;SAR=14;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105749;STB=0.55441;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0231988;OID=.;OPOS=40145297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:43:44:24:24:0.352941:14:10:22:21:14:10:22:22 chr1 40147817 . C A 257.59 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.00839585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1987;QD=19.8142;RBI=0.0141019;REFB=-0.002649;REVB=-0.0113302;RO=25;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198962;STB=0.610951;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00235463;OID=.;OPOS=40147817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:11:16:9:16:11:16:9:16 chr1 40149642 . G T 1881.18 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201011;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.07;QD=61.678;RBI=0.0509873;REFB=0;REVB=0.0468577;RO=0;SAF=67;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75939e-05;OID=.;OPOS=40149642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:55:67:0:0:55:67:0:0 chr1 40150156 . G A 343.74 PASS AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00564323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7843;QD=16.3684;RBI=0.0193945;REFB=-0.0205934;REVB=0.0185554;RO=41;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909668;STB=0.522232;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0232749;OID=.;OPOS=40150156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:47:37:37:0.440476:19:18:16:25:19:18:21:26 chr1 40229368 . A G 66.97 PASS AF=0.173913;AO=12;DP=69;FAO=12;FDP=69;FR=.;FRO=57;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0262184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7465;QD=3.88248;RBI=0.0269414;REFB=-0.00174831;REVB=0.00619943;RO=57;SAF=2;SAR=10;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.579141;STB=0.872814;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00722063;OID=.;OPOS=40229368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:69:69:57:57:12:12:0.173913:10:2:38:19:10:2:38:19 chr1 40230336 . C G 35.56 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0107953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.896;QD=5.68938;RBI=0.0126565;REFB=-0.00426788;REVB=0.00660661;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167553;STB=0.610731;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.012498;OID=.;OPOS=40230336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:2:4:10:9:2:4:10:9 chr1 40349131 . G A 280.75 PASS AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00662583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.446;QD=28.0749;RBI=0.0246068;REFB=-0.0390893;REVB=0.023698;RO=15;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167394;STB=0.592517;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0152248;OID=.;OPOS=40349131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:16:9:9:6:16:9:9:6 chr1 40363054 . G C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0339;QD=59.4356;RBI=0.0795721;REFB=0;REVB=0.0427429;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200592;OID=.;OPOS=40363054;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0 chr1 40432307 . T C 188.69 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0281349;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.94;QD=19.8624;RBI=0.0327845;REFB=-0.00476773;REVB=0.0168301;RO=20;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113833;STB=0.578431;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00385444;OID=.;OPOS=40432307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:20:19:19:19:0.5:10:9:12:8:10:9:12:7 chr1 40533266 . T G 306.31 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.381;QD=53.2712;RBI=0.0498642;REFB=0;REVB=0.029536;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100023;OID=.;OPOS=40533266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0 chr1 40533286 . AT A,AG 181.54 PASS AF=0.25,0.75;AO=4,11;DP=16;FAO=4,12;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=4,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=22.1045,36.0083;QD=45.3858;RBI=0.0676788,0.0720774;REFB=0,0;REVB=0.0676788,0.0720774;RO=0;SAF=0,0;SAR=4,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0504915,-0.0468878;OID=.,.;OPOS=40533287,40533287;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.25,0.75:4,11:16:4,12:16:0:0,0:4,12:0:0:20:0:0,0:4,11:0:0 chr1 40533315 . T G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.558;QD=46.8475;RBI=0.01743;REFB=0;REVB=0.01743;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242296;OID=.;OPOS=40533315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:15:0:0:0:15:0:0:0 chr1 40533320 . T G 175.64 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.808;QD=46.8364;RBI=0.0702798;REFB=0;REVB=0.0702798;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102293;OID=.;OPOS=40533320;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:15:0:0:0:15:0:0:0 chr1 40533326 . T G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.024;QD=46.8479;RBI=0.00846825;REFB=0;REVB=0.00846825;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359628;OID=.;OPOS=40533326;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:15:0:0:0:15:0:0:0 chr1 40533347 . T G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.615;QD=47.8223;RBI=0.0452058;REFB=0;REVB=0.0370379;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44248e-05;OID=.;OPOS=40533347;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:15:1:0:0:15:1:0:0 chr1 40557033 . A G 96.58 PASS AF=0.276596;AO=12;DP=46;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00863815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.678;QD=8.21959;RBI=0.0086556;REFB=-0.00543281;REVB=0.000549379;RO=32;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368851;STB=0.514829;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0135694;OID=.;OPOS=40557033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:47:32:34:12:13:0.276596:6:6:15:17:7:6:15:19 chr1 40559686 . G A 624.87 PASS AF=0.48855;AO=63;DP=130;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=13;FSRR=54;FWDB=-0.00998125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7036;QD=19.0799;RBI=0.0264875;REFB=-0.00560666;REVB=-0.0245349;RO=67;SAF=20;SAR=43;SRF=13;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141187;STB=0.582143;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00651413;OID=.;OPOS=40559686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:67:67:63:64:0.48855:43:20:13:54:43:21:13:54 chr1 40737589 . T C 379.53 PASS AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0143383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5383;QD=22.0015;RBI=0.0634569;REFB=-0.0193954;REVB=0.0618158;RO=31;SAF=25;SAR=13;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177761;STB=0.509799;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.01195;OID=.;OPOS=40737589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:13:25:21:10:13:25:21:10 chr1 40773123 . G C 307.25 PASS AF=0.43038;AO=33;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0151079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.341;QD=15.5571;RBI=0.0158619;REFB=-0.0124853;REVB=-0.00483248;RO=45;SAF=21;SAR=12;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176376;STB=0.58725;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0117101;OID=.;OPOS=40773123;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:33:34:0.43038:12:21:21:24:13:21:21:24 chr1 40776752 . C A 132.15 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00119231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.402;QD=24.0277;RBI=0.0497691;REFB=-0.0745287;REVB=0.0497549;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775029;STB=0.543418;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0423477;OID=.;OPOS=40776752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:5:9:6:2:5:9:6:2 chr1 40777800 . T G 179.43 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.066425;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4071;QD=21.7485;RBI=0.0927179;REFB=0.029847;REVB=-0.0646865;RO=15;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018107;STB=0.510193;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=-0.0307349;OID=.;OPOS=40777800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:8:10:8:7:8:10:8:7 chr1 40881041 . C G 2007.6 PASS AF=0.977612;AO=131;DP=136;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0404427;FXX=0.0147048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.023;QD=59.9283;RBI=0.0854646;REFB=-0.121699;REVB=0.07529;RO=5;SAF=66;SAR=65;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212047;STB=0.503816;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0151672;OID=.;OPOS=40881041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:136:134:5:3:131:131:0.977612:65:66:1:4:65:66:1:2 chr1 40980731 . G T 129.47 PASS AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.000454619;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.84;QD=32.3683;RBI=0.0181761;REFB=-0.0626118;REVB=0.0181704;RO=3;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436406;STB=0.524235;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0174899;OID=.;OPOS=40980731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:7:6:1:2:7:6:1:2 chr1 41013015 . C T 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0255521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.372;QD=9.44487;RBI=0.0255676;REFB=-0.0120546;REVB=0.000889158;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726992;STB=0.545299;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0126866;OID=.;OPOS=41013015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:4:6:4:2:4:6 chr1 41087734 . C T 165.85 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000187995;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.388;QD=47.3851;RBI=0.00718035;REFB=0;REVB=0.00717789;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16696e-05;OID=.;OPOS=41087734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0 chr1 41285087 . T C 1109.82 PASS AF=0.550265;AO=103;DP=188;FAO=104;FDP=189;FR=.;FRO=85;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=0.00979154;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.385;QD=23.4883;RBI=0.0106283;REFB=-0.0286182;REVB=0.00413364;RO=83;SAF=51;SAR=52;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384928;STB=0.523805;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0189813;OID=.;OPOS=41285087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:83:85:103:104:0.550265:52:51:45:38:52:52:47:38 chr1 41296828 . T G 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00849303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.21;QD=58.061;RBI=0.0526387;REFB=0;REVB=0.051949;RO=0;SAF=47;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92147e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127744;OID=.;OPOS=41296828;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:14:47:0:0:14:47:0:0 chr1 41483510 . TGAG T 473.48 PASS AF=0.592105;AO=42;DP=75;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00364679;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.06;QD=24.9199;RBI=0.0169928;REFB=-0.0328065;REVB=0.0165968;RO=30;SAF=23;SAR=19;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403422;STB=0.523799;STBP=0.634;TYPE=del;VARB=0.0226209;OID=.;OPOS=41483511;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.592105:42:75:45:76:31:25:20:19:12:99:30:23:19:18:12 chr1 41976017 . C G,T 524.26 PASS AF=0.0555556,0.944444;AO=2,34;DP=36;FAO=2,34;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191121,-0.0303217;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=142.004,113.414;QD=58.2511;RBI=0.0469592,0.0511093;REFB=0,0;REVB=-0.042894,0.041143;RO=0;SAF=0,20;SAR=2,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.48532e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.190037,-0.000494547;OID=.,.;OPOS=41976017,41976017;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:36:36:0:0:2,34:2,34:0.0555556,0.944444:2,14:0,20:0:0:2,14:0,20:0:0 chr1 41978566 . T G 2031.57 PASS AF=1;AO=120;DP=123;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0936209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.5262;QD=60.1948;RBI=0.111109;REFB=0;REVB=0.0598369;RO=0;SAF=48;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000720556;OID=.;OPOS=41978566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:123:135:0:0:120:135:1:72:48:0:0:76:59:0:0 chr1 41978825 . C G 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.989;QD=58.4197;RBI=0.0402382;REFB=0;REVB=0.035015;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.9325e-05;OID=.;OPOS=41978825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:38:25:0:0:38:25:0:0 chr1 42048745 . T C 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.496;QD=64.4142;RBI=0.0539723;REFB=0;REVB=0.000421329;RO=0;SAF=15;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385558;OID=.;OPOS=42048745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:35:15:0:0:35:15:0:0 chr1 42049032 . G A 3151.25 PASS AF=1;AO=205;DP=207;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270269;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.733;QD=61.4878;RBI=0.0415142;REFB=-0.0637899;REVB=0.0315115;RO=0;SAF=105;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03237e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174537;OID=.;OPOS=42049032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:207:205:0:0:205:205:1:100:105:0:0:100:105:0:0 chr1 42049140 . C G 1955.1 PASS AF=0.992188;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0536256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.843;QD=61.0968;RBI=0.0566986;REFB=-0.141296;REVB=0.0184129;RO=1;SAF=78;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605349;STB=0.503184;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00016286;OID=.;OPOS=42049140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:128:1:1:126:127:0.992188:48:78:1:0:49:78:1:0 chr1 42050366 . C T 163.71 PASS AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.00367906;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.716;QD=9.22315;RBI=0.0599166;REFB=-0.00649897;REVB=-0.0598035;RO=49;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10234;STB=0.560164;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0202625;OID=.;OPOS=42050366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:49:49:22:22:0.309859:13:9:16:33:13:9:16:33 chr1 42619139 . A G 316.57 PASS AF=0.372549;AO=38;DP=102;FAO=38;FDP=102;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.027474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.017;QD=12.4144;RBI=0.0274748;REFB=-0.0172251;REVB=0.000203182;RO=59;SAF=18;SAR=20;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733702;STB=0.526302;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0276534;OID=.;OPOS=42619139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:59:64:38:38:0.372549:20:18:32:27:20:18:33:31 chr1 42619152 . C A 684.11 PASS AF=0.615385;AO=64;DP=104;FAO=64;FDP=104;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0236269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.122;QD=26.3118;RBI=0.053285;REFB=-0.0264919;REVB=0.0477605;RO=40;SAF=33;SAR=31;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464351;STB=0.525217;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00427977;OID=.;OPOS=42619152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:40:40:64:64:0.615385:31:33:18:22:31:33:18:22 chr1 42693597 . A G 498.05 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.010086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.464;QD=19.7247;RBI=0.0178537;REFB=0.00458085;REVB=-0.0147319;RO=50;SAF=29;SAR=22;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846137;STB=0.546675;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.00479717;OID=.;OPOS=42693597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:50:50:51:51:0.50495:22:29:33:17:22:29:33:17 chr1 42898843 . A G 338.07 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0106596;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.362;QD=28.7722;RBI=0.0113083;REFB=-0.00837979;REVB=0.003775;RO=18;SAF=22;SAR=7;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134209;STB=0.57323;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00436222;OID=.;OPOS=42898843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:7:22:16:2:7:22:16:2 chr1 42915727 . C G 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0172364;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.728;QD=18.6371;RBI=0.0173286;REFB=-0.0161257;REVB=-0.00178533;RO=16;SAF=4;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698884;STB=0.539948;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0151063;OID=.;OPOS=42915727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:12:4:5:11:12:4:5:11 chr1 42925688 . T G 411.44 PASS AF=0.452632;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0222448;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1067;QD=17.3238;RBI=0.0222453;REFB=-0.0202431;REVB=-0.000140053;RO=48;SAF=26;SAR=17;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139919;STB=0.558414;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0273512;OID=.;OPOS=42925688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:48:52:43:43:0.452632:17:26:22:26:17:26:26:26 chr1 43034740 . T C 435.84 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6046;QD=54.4805;RBI=0.0602477;REFB=-0.0301141;REVB=0.0571213;RO=1;SAF=11;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405228;STB=0.521725;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0023415;OID=.;OPOS=43034740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:20:11:1:0:20:11:1:0 chr1 43042703 . C T 506.6 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301752;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.609;QD=59.5995;RBI=0.0533732;REFB=0;REVB=-0.0440245;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000546728;OID=.;OPOS=43042703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr1 43047057 . A G 658.93 PASS AF=0.93617;AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0321234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.182;QD=56.079;RBI=0.0413638;REFB=-0.0824252;REVB=0.0260586;RO=3;SAF=24;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025533;STB=0.513613;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00153444;OID=.;OPOS=43047057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:47:47:3:3:44:44:0.93617:20:24:1:2:20:24:1:2 chr1 43108188 . G A 68.67 PASS AF=0.212766;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0111884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.23;QD=5.84466;RBI=0.0144122;REFB=-0.00122356;REVB=-0.00908469;RO=37;SAF=6;SAR=4;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202203;STB=0.629996;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00923297;OID=.;OPOS=43108188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:47:47:37:37:10:10:0.212766:4:6:16:21:4:6:16:21 chr1 43119661 . C A 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0292118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.694;QD=15.626;RBI=0.0293375;REFB=-0.0125799;REVB=-0.00271255;RO=23;SAF=5;SAR=12;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39344;STB=0.725965;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0125617;OID=.;OPOS=43119661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:12:5:16:7:12:5:16:7 chr1 43119855 . A C 371.69 PASS AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0101868;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.543;QD=20.0915;RBI=0.0170749;REFB=-0.0112392;REVB=0.0137033;RO=36;SAF=24;SAR=14;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237134;STB=0.63151;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0112108;OID=.;OPOS=43119855;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:14:24:13:23:14:24:13:23 chr1 43131653 . G A 471.8 PASS AF=0.511111;AO=44;DP=88;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0108193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.966;QD=20.9689;RBI=0.0160514;REFB=-0.0190897;REVB=-0.011857;RO=44;SAF=19;SAR=25;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202776;STB=0.61886;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00935002;OID=.;OPOS=43131653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:44:44:44:46:0.511111:25:19:29:15:27:19:29:15 chr1 43201534 . G A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00087715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.088;QD=14.7986;RBI=0.0305386;REFB=-0.0254733;REVB=0.030526;RO=13;SAF=3;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121367;STB=0.571292;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0201095;OID=.;OPOS=43201534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:8:3:5:8:8:3:5:8 chr1 43201614 . C T 229.98 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0195139;FXX=0.0555401;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.015;QD=27.056;RBI=0.0396002;REFB=-0.0317561;REVB=0.0344585;RO=11;SAF=3;SAR=18;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144364;STB=0.562435;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.025049;OID=.;OPOS=43201614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:34:11:13:21:21:0.617647:18:3:3:8:18:3:3:10 chr1 43212111 . C T 96.72 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00194401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.278;QD=12.4804;RBI=0.0102399;REFB=-0.00908263;REVB=0.0100537;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447868;STB=0.759617;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0210243;OID=.;OPOS=43212111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:15:4:8:4:15:4 chr1 43212430 . GA G,GC,GG 2137.79 PASS AF=0.0352113,0.0211268,0.943662;AO=35,6,99;DP=140;FAO=5,3,134;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=4,3,90;FSAR=1,0,44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521229,0.117804,0.0400403;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=31.4822,16.4995,38.7705;QD=60.2193;RBI=0.059881,0.124666,0.0634264;REFB=0,0,0;REVB=0.0294777,0.0407897,0.0491903;RO=0;SAF=20,4,73;SAR=15,2,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.023696,0.0176992,0.00901781;OID=.,.,.;OPOS=43212431,43212431,43212431;OREF=A,A,A;OALT=-,C,G;OMAPALT=G,GC,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.0352113,0.0211268,0.943662:35,6,99:140:5,3,134:142:0:4,3,90:1,0,44:0:0:13:0:20,4,73:15,2,26:0:0 chr1 43212926 . G A 376.6 PASS AF=0.673913;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00822283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.719;QD=32.7474;RBI=0.0164483;REFB=-0.00670608;REVB=0.0142454;RO=14;SAF=7;SAR=24;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149531;STB=0.59993;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00571357;OID=.;OPOS=43212926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:14:15:31:31:0.673913:24:7:6:8:24:7:7:8 chr1 43215571 . A G 1400.63 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000500866;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.64;QD=62.9498;RBI=0.0342172;REFB=0;REVB=0.0342135;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029363;OID=.;OPOS=43215571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0 chr1 43223489 . C T 115.59 PASS AF=0.306122;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0946514;FXX=0.109071;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.981;QD=9.43585;RBI=0.094652;REFB=-0.00866138;REVB=-0.000350767;RO=23;SAF=1;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.546132;STB=0.905527;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00820837;OID=.;OPOS=43223489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:49:23:34:15:15:0.306122:14:1:9:14:14:1:19:15 chr1 43232504 . C A 99.64 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0452607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.187;QD=26.5702;RBI=0.0472278;REFB=-0.0511614;REVB=-0.0134881;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138896;STB=0.578172;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0372829;OID=.;OPOS=43232504;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:5:6:1:3:5:6:1:3 chr1 43296118 . G A 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0380645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.876;QD=11.1308;RBI=0.0388521;REFB=-0.00989442;REVB=0.0077833;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092771;STB=0.555446;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0201806;OID=.;OPOS=43296118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:5:5:10:7:5:5:10:7 chr1 43305753 . G A 407.74 PASS AF=0.433962;AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.00579461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.929;QD=15.3865;RBI=0.0101263;REFB=-0.000339781;REVB=0.00830452;RO=59;SAF=26;SAR=20;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15794;STB=0.592794;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.000439513;OID=.;OPOS=43305753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:59:60:46:46:0.433962:20:26:24:35:20:26:24:36 chr1 43309842 . G C 689.37 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.452;QD=62.6703;RBI=0.024047;REFB=0;REVB=-0.00309738;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010305;OID=.;OPOS=43309842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:24:19:0:0:25:19:0:0 chr1 43394612 . T C 286.39 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.035186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.187;QD=15.6923;RBI=0.0367187;REFB=-0.0130924;REVB=-0.010498;RO=41;SAF=11;SAR=21;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173843;STB=0.598334;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.016563;OID=.;OPOS=43394612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:21:11:21:20:21:11:21:20 chr1 43408966 . G A 344.72 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00439108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.532;QD=19.1509;RBI=0.00536553;REFB=-0.021264;REVB=-0.00308339;RO=36;SAF=25;SAR=11;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259923;STB=0.645078;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0190106;OID=.;OPOS=43408966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:11:25:15:21:11:25:15:21 chr1 43457170 . T C 289.49 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.373;QD=52.6346;RBI=0.0453295;REFB=0;REVB=0.0444457;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237367;OID=.;OPOS=43457170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:11:11:0:0 chr1 43675467 . G A 804.82 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00381068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3685;QD=64.3857;RBI=0.0973199;REFB=0;REVB=0.0972453;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111184;OID=.;OPOS=43675467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0 chr1 43675778 . A T 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.258;QD=14.0438;RBI=0.00471045;REFB=-0.000211725;REVB=-0.00471045;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002033;OID=.;OPOS=43675778;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:5:0:0:4:5:0:0:4 chr1 43771016 . TA T 229.36 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265226;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.8026;QD=43.687;RBI=0.0397176;REFB=0;REVB=-0.0295642;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.45841e-05;OID=.;OPOS=43771017;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:21:22:21:21:0:10:11:0:0:4:0:10:11:0:0 chr1 43779564 . T C 1453.45 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.609;QD=63.1933;RBI=0.0408718;REFB=0;REVB=0.0396305;RO=0;SAF=26;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70595e-05;OID=.;OPOS=43779564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:66:26:0:0:66:26:0:0 chr1 43898053 . T G 277.59 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.125751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.807;QD=20.5623;RBI=0.125991;REFB=0.0108471;REVB=0.00777109;RO=25;SAF=11;SAR=18;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171578;STB=0.50953;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=-0.00783176;OID=.;OPOS=43898053;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:18:11:9:16:18:11:9:16 chr1 43917601 . C T 236.73 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00884174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7;QD=26.303;RBI=0.035641;REFB=0.0238202;REVB=0.0345269;RO=14;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150546;STB=0.58326;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.0144686;OID=.;OPOS=43917601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:11:11:10:4:11:11:10:4 chr1 44044624 . C T 214.04 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0222419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.692;QD=14.7615;RBI=0.0313974;REFB=-0.0131873;REVB=0.0221607;RO=33;SAF=10;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251026;STB=0.514274;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0230112;OID=.;OPOS=44044624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:15:10:14:19:15:10:14:19 chr1 44058265 . C A 1000.24 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00944818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.387;QD=56.3516;RBI=0.0541944;REFB=0.0384936;REVB=0.0533645;RO=1;SAF=29;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160211;STB=0.516662;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00086284;OID=.;OPOS=44058265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:71:1:2:69:69:0.971831:40:29:1:0:40:29:2:0 chr1 44071221 . G A 273.65 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0147079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.471;QD=17.6546;RBI=0.0251416;REFB=-0.00671165;REVB=0.0203907;RO=32;SAF=16;SAR=14;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174719;STB=0.597313;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0097563;OID=.;OPOS=44071221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:14:16:23:9:14:16:23:9 chr1 44072018 . C T 485.18 PASS AF=0.449153;AO=53;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.0355736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6725;QD=16.4467;RBI=0.0639897;REFB=-0.0157788;REVB=-0.0531902;RO=63;SAF=24;SAR=29;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692596;STB=0.530306;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0208373;OID=.;OPOS=44072018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:63:65:53:53:0.449153:29:24:33:30:29:24:33:32 chr1 44072066 . C T 425.42 PASS AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0359656;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.032;QD=18.9077;RBI=0.0359988;REFB=-0.0121212;REVB=-0.00154633;RO=47;SAF=19;SAR=24;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155541;STB=0.508657;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0138705;OID=.;OPOS=44072066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:43:43:0.477778:24:19:20:27:24:19:20:27 chr1 44083507 . T C 241.2 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0119149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.568;QD=14.6184;RBI=0.0147124;REFB=-0.0157956;REVB=0.00863068;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463095;STB=0.526297;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0190257;OID=.;OPOS=44083507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:16:12:18:20:16:12:18:20 chr1 44083519 . G A 266.53 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0699002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8615;QD=15.9122;RBI=0.0760063;REFB=-0.0157015;REVB=0.0298484;RO=37;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00709063;STB=0.503997;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0187862;OID=.;OPOS=44083519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:16:14:17:20:16:14:17:20 chr1 44084739 . C T 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0175679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.918;QD=22.1442;RBI=0.0295058;REFB=-0.0200828;REVB=0.0237057;RO=13;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314285;STB=0.677206;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0171604;OID=.;OPOS=44084739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:12:5:9:4:12:5:9:4 chr1 44086831 . C T 172.12 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00346833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.453;QD=18.1183;RBI=0.110799;REFB=-0.0127638;REVB=-0.110745;RO=20;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138956;STB=0.578862;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0179601;OID=.;OPOS=44086831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:9:9:13:7:9:9:13:7 chr1 44137257 . C A 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.487;QD=57.2375;RBI=0.0159159;REFB=0;REVB=0.014741;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17092e-05;OID=.;OPOS=44137257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0 chr1 44137465 . T G,TG 49.59 PASS AF=0,0.204545;AO=4,5;DP=44;FAO=0,9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=0,8;FSAR=0,1;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0208508,0.0692077;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=124.243,21.0146;QD=4.50832;RBI=0.0297753,0.142003;REFB=-0.00139742,-0.0115306;REVB=0.0212558,0.123996;RO=34;SAF=4,4;SAR=0,1;SRF=18;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.578595,0.330589;STB=0.5,0.846191;STBP=1,0.044;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0817357;OID=.,.;OPOS=44137465,44137466;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:50:44:44:34:35:4,5:0,9:0,0.204545:0,1:4,4:18:16:0,1:0,8:18:17 chr1 44395786 . C T 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.48;QD=64.1525;RBI=0.0424713;REFB=0;REVB=0.0196173;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022756;OID=.;OPOS=44395786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chr1 44401384 . A G 766.86 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.14;QD=63.9052;RBI=0.0594456;REFB=0;REVB=0.0332233;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362774;OID=.;OPOS=44401384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:29:18:0:0:30:18:0:0 chr1 44415415 . C T 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00256153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.302;QD=57.7115;RBI=0.0147057;REFB=0;REVB=0.0144809;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.36075e-05;OID=.;OPOS=44415415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0 chr1 44457305 . G A 1243.14 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009067;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.692;QD=61.3896;RBI=0.0607552;REFB=0;REVB=0.0600748;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240612;OID=.;OPOS=44457305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:82:81:0:0:81:81:1:36:45:0:0:36:45:0:0 chr1 44595113 . G C 990.59 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.254;QD=59.1396;RBI=0.0527557;REFB=0;REVB=0.0285347;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247796;OID=.;OPOS=44595113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr1 44595410 . A G 198.41 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00151714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.386;QD=44.0919;RBI=0.0249269;REFB=0.0750807;REVB=-0.0248807;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521714;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-0.00165453;OID=.;OPOS=44595410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:6:11:0:0:6:11:1:0 chr1 44595426 . G A 482.63 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.153;QD=58.5008;RBI=0.0194871;REFB=0;REVB=0.0128258;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168125;OID=.;OPOS=44595426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:21:11:0:0:22:11:0:0 chr1 44788397 . CA C,CT 452.11 PASS AF=0.125,0.875;AO=5,27;DP=32;FAO=4,28;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=4,15;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363088,0.0341059;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=131.17,152.734;QD=56.5131;RBI=0.0400616,0.0342789;REFB=0,0;REVB=0.0169294,0.0034392;RO=0;SAF=5,14;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.39874e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0601381,0.00919168;OID=.,.;OPOS=44788398,44788398;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=C,CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.125,0.875:5,27:32:4,28:32:0:4,15:0,13:0:0:16:0:5,14:0,13:0:0 chr1 45270156 . C T 390.96 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.00749854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.05;QD=16.6367;RBI=0.00908935;REFB=-0.0125126;REVB=0.00513694;RO=53;SAF=21;SAR=20;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17305;STB=0.596853;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0166596;OID=.;OPOS=45270156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:20:21:18:35:20:21:18:35 chr1 45285664 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2695;QD=53.9111;RBI=0.0315445;REFB=0;REVB=-0.0193941;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000663467;OID=.;OPOS=45285664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0 chr1 45504720 . G C 400.21 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00225606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8206;QD=53.3608;RBI=0.0133747;REFB=0.0790731;REVB=-0.0131831;RO=1;SAF=3;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175878;STB=0.509427;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=-0.0031568;OID=.;OPOS=45504720;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:26:3:0:1:26:3:0:1 chr1 45793371 . TGGGC TGG,TGGC 1213.03 PASS AF=0,0.978417;AO=38,80;DP=137;FAO=0,136;FDP=139;FR=.;FRO=3;FSAF=0,94;FSAR=0,42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0412902,-0.127827;FXX=0.0141834;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=128.316,15.1253;QD=34.9074;RBI=0.0550636,0.160346;REFB=0.0355923,-0.0712169;REVB=0.0364297,0.0968047;RO=9;SAF=26,61;SAR=12,19;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.336364,0.336364;SSSB=0.136189,0.105983;STB=0.5,0.507852;STBP=1,0.287;TYPE=del,del;VARB=0,0.024465;OID=.,.;OPOS=45793374,45793372;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGG,TGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,0.978417:38,80:137:0,136:139:3:0,94:0,42:3:0:10:9:26,61:12,19:3:6 chr1 45797505 . C G 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.205;QD=57.1062;RBI=0.0219194;REFB=0;REVB=-0.0102846;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.33092e-05;OID=.;OPOS=45797505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr1 45805566 . G C 501.36 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.835;QD=58.9834;RBI=0.0428666;REFB=0;REVB=0.0194575;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.80164e-05;OID=.;OPOS=45805566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:26:6:0:0:27:7:0:0 chr1 45810091 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.28;QD=56.7062;RBI=0.0405342;REFB=0;REVB=-0.00955273;RO=0;SAF=6;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100559;OID=.;OPOS=45810091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:23:6:0:0:23:6:0:0 chr1 46094027 . A G 885.25 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5414;QD=58.0493;RBI=0.0709889;REFB=0;REVB=-0.06044;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171162;OID=.;OPOS=46094027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0 chr1 46095272 . T C 613.29 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.8759;QD=61.3291;RBI=0.0101973;REFB=0;REVB=-0.00123046;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125194;OID=.;OPOS=46095272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chr1 46195375 . T C 695.88 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.641;QD=60.5112;RBI=0.0222415;REFB=-0.114141;REVB=-0.00643141;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.50943;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000589635;OID=.;OPOS=46195375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:19:26:0:0:19:26:1:0 chr1 46379518 . A G 1411.14 PASS AF=0.978495;AO=90;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0329876;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.126;QD=60.6942;RBI=0.0471441;REFB=-0.0816773;REVB=-0.0336806;RO=2;SAF=41;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225564;STB=0.511625;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00312545;OID=.;OPOS=46379518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:93:93:2:2:90:91:0.978495:49:41:2:0:49:42:2:0 chr1 46476587 . T G 689.14 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2586;QD=62.6491;RBI=0.0417016;REFB=0;REVB=0.0182469;RO=0;SAF=3;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614026;OID=.;OPOS=46476587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:41:3:0:0:41:3:0:0 chr1 46496839 . G A 245.21 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.00181546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.963;QD=15.5688;RBI=0.0330607;REFB=-0.00954222;REVB=-0.0330109;RO=34;SAF=14;SAR=14;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172122;STB=0.603104;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00967202;OID=.;OPOS=46496839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:14:14:11:23:14:14:11:24 chr1 46655158 . T C 958.09 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171649;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.811;QD=58.9591;RBI=0.029393;REFB=0;REVB=0.0238603;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2773e-06;OID=.;OPOS=46655158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0 chr1 46810530 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0900246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3111;QD=55.0984;RBI=0.0900346;REFB=0;REVB=-0.00134295;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00223045;OID=.;OPOS=46810530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr1 46827249 . C T 259.98 PASS AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00342256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.902;QD=31.513;RBI=0.0681635;REFB=-0.0498899;REVB=-0.0680775;RO=10;SAF=15;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293734;STB=0.516115;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00658866;OID=.;OPOS=46827249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:10:10:23:23:0.69697:8:15:7:3:8:15:7:3 chr1 46871986 . T C 1086.14 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669684;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0063;QD=59.5146;RBI=0.0766318;REFB=0;REVB=0.0372515;RO=1;SAF=20;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230558;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132615;OID=.;OPOS=46871986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:1:0:72:73:1:52:20:1:0:52:21:0:0 chr1 46972694 . C T 1214.24 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175705;FXX=0.048187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.104;QD=61.4806;RBI=0.0246671;REFB=0;REVB=0.0173131;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.04159e-05;OID=.;OPOS=46972694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:31:48:0:0:31:48:0:0 chr1 47059934 . T C 1163.5 PASS AF=0.975;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00625595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.71;QD=58.1748;RBI=0.0289503;REFB=-0.0116774;REVB=0.0282663;RO=2;SAF=26;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350194;STB=0.518514;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0001288;OID=.;OPOS=47059934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:80:80:2:2:78:78:0.975:52:26:2:0:52:26:2:0 chr1 47078637 . T C 1434.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.128;QD=63.0519;RBI=0.0612161;REFB=0;REVB=0.0142602;RO=0;SAF=48;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174518;OID=.;OPOS=47078637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:42:48:0:0:42:49:0:0 chr1 47080665 . C T 148.14 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00174191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.044;QD=17.9561;RBI=0.0256428;REFB=-0.0151133;REVB=0.0255836;RO=17;SAF=5;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154133;STB=0.588363;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0175762;OID=.;OPOS=47080665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:11:5:8:9:11:5:8:9 chr1 47080679 . G A 465.12 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4517;QD=58.1405;RBI=0.0293708;REFB=0;REVB=-0.0261277;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000654041;OID=.;OPOS=47080679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chr1 47080741 . C T 97.79 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.000201568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.91;QD=13.4879;RBI=0.0156511;REFB=-0.0181966;REVB=-0.0156498;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293607;STB=0.517213;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0291842;OID=.;OPOS=47080741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:8:9:6:6:8:9 chr1 47101015 . C A 393.06 PASS AF=0.420561;AO=44;DP=107;FAO=45;FDP=107;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0165358;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.45;QD=14.6938;RBI=0.0165401;REFB=-0.00565437;REVB=-0.000380975;RO=62;SAF=18;SAR=26;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620491;STB=0.526793;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00868033;OID=.;OPOS=47101015;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:62:62:44:45:0.420561:26:18:29:33:26:19:29:33 chr1 47131319 . A T 435.07 PASS AF=0.45283;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=0.00723013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.224;QD=16.4178;RBI=0.0156772;REFB=-0.00741788;REVB=-0.0139104;RO=58;SAF=24;SAR=24;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101458;STB=0.55658;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0100479;OID=.;OPOS=47131319;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:58:58:48:48:0.45283:24:24:23:35:24:24:23:35 chr1 47138819 . T G 160.25 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.2299;QD=45.786;RBI=0.114069;REFB=0;REVB=0.0416083;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00398334;OID=.;OPOS=47138819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr1 47139103 . C T 293.26 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00621166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.299;QD=23.001;RBI=0.0137627;REFB=0.00128062;REVB=0.0122811;RO=21;SAF=17;SAR=12;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225574;STB=0.61438;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00054647;OID=.;OPOS=47139103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:21:22:29:29:0.568627:12:17:6:15:12:17:7:15 chr1 47395973 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4657;QD=56.938;RBI=0.0286041;REFB=0;REVB=0.0285836;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248402;OID=.;OPOS=47395973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr1 47571902 . C T 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.167;QD=59.8382;RBI=0.0231466;REFB=0;REVB=0.0151434;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59923e-05;OID=.;OPOS=47571902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr1 47571905 . C T 385.28 PASS AF=0.90625;AO=31;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0200783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3316;QD=48.1598;RBI=0.0545765;REFB=-0.0371925;REVB=0.0507489;RO=1;SAF=17;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266551;STB=0.545424;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0038015;OID=.;OPOS=47571905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:32:32:1:3:31:29:0.90625:14:17:1:0:14:15:3:0 chr1 47607281 . C T 479.38 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0248714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.844;QD=19.9741;RBI=0.0271328;REFB=0.0119739;REVB=-0.0108446;RO=49;SAF=19;SAR=28;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230882;STB=0.512815;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00721107;OID=.;OPOS=47607281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:28:19:21:28:28:19:21:28 chr1 47607785 . G A 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0068404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.562;QD=25.6502;RBI=0.00692642;REFB=-0.00665188;REVB=-0.00108822;RO=18;SAF=22;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422704;STB=0.739263;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0109776;OID=.;OPOS=47607785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:3:22:9:9:3:22:9:9 chr1 47607851 . A T 669.6 PASS AF=0.960784;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0374781;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.201;QD=52.5172;RBI=0.0381531;REFB=-0.0540901;REVB=-0.00714494;RO=2;SAF=35;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261364;STB=0.513883;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.000662977;OID=.;OPOS=47607851;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:51:2:2:49:49:0.960784:14:35:2:0:14:35:2:0 chr1 47608983 . G T 272.68 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0264968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8197;QD=24.2379;RBI=0.0541425;REFB=0.0133414;REVB=-0.0472157;RO=20;SAF=6;SAR=19;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281267;STB=0.657705;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0128854;OID=.;OPOS=47608983;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:19:6:11:9:19:6:11:9 chr1 47609489 . T C 1395.11 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.09;QD=62.7015;RBI=0.0377129;REFB=0;REVB=-0.0194677;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07624e-05;OID=.;OPOS=47609489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:55:33:0:0:55:34:0:0 chr1 47610293 . C T 256.07 PASS AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00602703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2309;QD=13.4773;RBI=0.0222515;REFB=-0.00520663;REVB=0.0214197;RO=46;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161894;STB=0.592274;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0159517;OID=.;OPOS=47610293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:46:46:30:30:0.394737:13:17:19:27:13:17:19:27 chr1 47610590 . A C 214.77 PASS AF=0.3375;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.0200988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.106;QD=10.7383;RBI=0.020648;REFB=-0.00782629;REVB=-0.00473025;RO=53;SAF=15;SAR=12;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179811;STB=0.60432;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0183679;OID=.;OPOS=47610590;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:53:53:27:27:0.3375:12:15:21:32:12:15:21:32 chr1 47611598 . T C 880.44 PASS AF=0.537037;AO=87;DP=160;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.000616161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1267;QD=21.7394;RBI=0.00436864;REFB=-0.0238455;REVB=-0.00432497;RO=73;SAF=47;SAR=40;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00502543;STB=0.503;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0183411;OID=.;OPOS=47611598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:162:73:75:87:87:0.537037:40:47:39:34:40:47:41:34 chr1 47685455 . T C 356.51 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140749;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.215;QD=54.847;RBI=0.0208705;REFB=0;REVB=-0.0154103;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.11018e-06;OID=.;OPOS=47685455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:12:14:0:0 chr1 47717189 . A G 199.37 PASS AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00585955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.497;QD=27.4989;RBI=0.0266648;REFB=-0.0121914;REVB=0.026013;RO=10;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12517;STB=0.569645;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00495426;OID=.;OPOS=47717189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:6:13:5:5:6:13:5:5 chr1 47746678 . G C 513.79 PASS AF=0.564706;AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00447128;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.288;QD=24.1783;RBI=0.0167378;REFB=-0.0233341;REVB=-0.0161295;RO=36;SAF=27;SAR=21;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00551069;STB=0.509683;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0114131;OID=.;OPOS=47746678;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:36:37:48:48:0.564706:21:27:20:16:21:27:20:17 chr1 47767914 . G A 254.4 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0194123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.907;QD=15.4183;RBI=0.0540426;REFB=-0.00835948;REVB=0.0504358;RO=37;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178403;STB=0.600762;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00679805;OID=.;OPOS=47767914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:12:17:15:22:12:17:15:22 chr1 47799639 . G C 156.15 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.102946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.2524;QD=16.8812;RBI=0.123045;REFB=-0.0440544;REVB=-0.0673961;RO=18;SAF=5;SAR=12;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423723;STB=0.738192;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0467032;OID=.;OPOS=47799639;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:37:18:20:17:17:0.459459:12:5:14:4:12:5:15:5 chr1 47842431 . G A 922.06 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0311004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2959;QD=56.7422;RBI=0.0402515;REFB=-0.0312215;REVB=0.0255528;RO=1;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136873;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00598108;OID=.;OPOS=47842431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:34:29:0:1:35:29:0:1 chr1 47842666 . A T 809.46 PASS AF=1;AO=41;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=22.6628;QD=51.3944;RBI=0.198589;REFB=0;REVB=0.0360268;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0118386;OID=.;OPOS=47842666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:41:63:1:31:10:0:0:42:21:0:0 chr1 47883019 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.677;QD=47.8224;RBI=0.0394462;REFB=0;REVB=0.0394462;RO=0;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143335;OID=.;OPOS=47883019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:16:0:0:0:16:0:0:0 chr1 47883024 . A G 200.03 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.4562e-07;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4512;QD=50.0074;RBI=0.0500166;REFB=0;REVB=0.0500166;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049715;OID=.;OPOS=47883024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:17:16:0:0:15:16:1:15:0:0:0:16:0:0:0 chr1 47906338 . G A 2475.28 PASS AF=1;AO=160;DP=160;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.692;QD=61.4976;RBI=0.0268034;REFB=0;REVB=0.0145483;RO=0;SAF=69;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.72236e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93568e-05;OID=.;OPOS=47906338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:160:161:0:0:160:161:1:91:69:0:0:91:70:0:0 chr1 48241061 . G A 48.84 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0199258;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.573;QD=13.9542;RBI=0.0446835;REFB=-0.0123113;REVB=0.0399948;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119504;STB=0.571224;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00363881;OID=.;OPOS=48241061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:4:3:4:3:4:3 chr1 48694594 . G A 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.00515517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.812;QD=13.6198;RBI=0.00545355;REFB=-0.00341582;REVB=-0.00177918;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773426;STB=0.544008;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00582226;OID=.;OPOS=48694594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:10:16:26:12:10:16:26:12 chr1 48697226 . T C 681.71 PASS AF=0.59633;AO=63;DP=107;FAO=65;FDP=109;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0105607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.502;QD=25.0167;RBI=0.0133906;REFB=-0.0338744;REVB=-0.00823275;RO=44;SAF=31;SAR=32;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916625;STB=0.54282;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.021437;OID=.;OPOS=48697226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:44:44:63:65:0.59633:32:31:27:17:32:33:27:17 chr1 48697733 . T G 1518.25 PASS AF=0.990476;AO=103;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00640422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.819;QD=57.8382;RBI=0.0146657;REFB=-0.0503413;REVB=0.0131935;RO=2;SAF=48;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00123345;STB=0.505154;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-7.2257e-05;OID=.;OPOS=48697733;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:2:1:103:104:0.990476:55:48:1:1:56:48:1:0 chr1 48697781 . C T 436.49 PASS AF=0.53012;AO=39;DP=79;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.031612;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.899;QD=21.0357;RBI=0.0316122;REFB=-0.0269044;REVB=0.000127906;RO=39;SAF=16;SAR=23;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481859;STB=0.535195;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0230348;OID=.;OPOS=48697781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:83:39:39:39:44:0.53012:23:16:14:25:25:19:14:25 chr1 48713100 . C A 684.88 PASS AF=0.466216;AO=69;DP=148;FAO=69;FDP=148;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.00736318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.304;QD=18.5102;RBI=0.0119839;REFB=-0.0272696;REVB=-0.00945498;RO=79;SAF=36;SAR=33;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513487;STB=0.528471;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0274467;OID=.;OPOS=48713100;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:79:79:69:69:0.466216:33:36:37:42:33:36:37:42 chr1 48713394 . C T 274.55 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0199193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.729;QD=19.9671;RBI=0.0202564;REFB=-0.0125506;REVB=0.00368024;RO=26;SAF=20;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106383;STB=0.559398;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.010119;OID=.;OPOS=48713394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:9:20:15:11:9:20:15:11 chr1 48764419 . C T 455.75 PASS AF=0.605634;AO=43;DP=71;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00254645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.266;QD=25.6762;RBI=0.00509891;REFB=-0.0156519;REVB=0.00441752;RO=28;SAF=10;SAR=33;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849715;STB=0.546621;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0127679;OID=.;OPOS=48764419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:28:28:43:43:0.605634:33:10:9:19:33:10:9:19 chr1 48869529 . G C 501.37 PASS AF=0.486239;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.029903;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7416;QD=18.399;RBI=0.0314127;REFB=-0.0108078;REVB=-0.00962119;RO=53;SAF=26;SAR=27;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683921;STB=0.531888;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0185875;OID=.;OPOS=48869529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:53:56:53:53:0.486239:27:26:22:31:27:26:24:32 chr1 49113319 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.312;QD=60.9785;RBI=0.0240237;REFB=0;REVB=0.0105345;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48929e-05;OID=.;OPOS=49113319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0 chr1 49224584 . G T 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0057652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.677;QD=11.1979;RBI=0.0264557;REFB=-0.0150318;REVB=-0.0258199;RO=22;SAF=10;SAR=2;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379651;STB=0.731268;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0279921;OID=.;OPOS=49224584;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:2:10:12:10:2:10:12:10 chr1 49511424 . A G 436.4 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0391682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.144;QD=21.2876;RBI=0.0398997;REFB=-0.0030355;REVB=0.0076051;RO=38;SAF=18;SAR=25;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179975;STB=0.593177;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00362762;OID=.;OPOS=49511424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:39:43:43:0.52439:25:18:24:14:25:18:24:15 chr1 50661411 . C T 960.94 PASS AF=0.945205;AO=68;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0520427;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=127.043;QD=52.6543;RBI=0.0539407;REFB=-0.0107028;REVB=0.0141829;RO=4;SAF=20;SAR=48;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560657;STB=0.512531;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0001602;OID=.;OPOS=50661411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:73:73:4:4:68:69:0.945205:48:20:3:1:48:21:2:2 chr1 50666515 . C T 2005.26 PASS AF=0.970588;AO=131;DP=135;FAO=132;FDP=136;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0232169;FXX=0.0144917;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.4894;QD=58.9783;RBI=0.0645612;REFB=-0.20185;REVB=0.0602422;RO=4;SAF=56;SAR=75;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102188;STB=0.505253;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00528786;OID=.;OPOS=50666515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:135:136:4:4:131:132:0.970588:75:56:1:3:76:56:1:3 chr1 51702476 . T A 176.09 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0451849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6273;QD=20.7162;RBI=0.0481292;REFB=-0.0324024;REVB=0.0165757;RO=15;SAF=4;SAR=14;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500673;STB=0.518497;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0383367;OID=.;OPOS=51702476;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:14:4:4:11:14:4:4:12 chr1 51873951 . G A 1362.58 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785456;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.339;QD=62.6473;RBI=0.00874512;REFB=0;REVB=-0.00384487;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.38988e-05;OID=.;OPOS=51873951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:86:87:1:37:49:0:0:37:50:0:0 chr1 52266242 . G A 692.97 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322344;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.48;QD=62.997;RBI=0.0344867;REFB=0;REVB=-0.0122586;RO=0;SAF=10;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30365e-05;OID=.;OPOS=52266242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:34:10:0:0:34:10:0:0 chr1 52290984 . T G 1042.3 PASS AF=0.986301;AO=67;DP=67;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0709008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8068;QD=57.1121;RBI=0.0713646;REFB=0.00910799;REVB=0.00812311;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.506492;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000621556;OID=.;OPOS=52290984;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:73:0:1:67:72:0.986301:34:33:0:0:34:38:1:0 chr1 52306063 . ATCTTCTTCTTCT ATCTTCTTCT,ATCTTCTTCTTCC 223.91 PASS AF=0.85,0.1;AO=16,2;DP=20;FAO=17,2;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=13,0;FSAR=4,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0436675,0.0370605;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=197.214,51.0324;QD=44.781;RBI=0.0538556,0.0858178;REFB=0.103408,-0.00627252;REVB=0.031521,-0.0774029;RO=1;SAF=12,0;SAR=4,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.036598,-0.697199;STB=0.518497,0.993266;STBP=0.643,0.232;TYPE=del,snp;VARB=0.000943851,-0.0478722;OID=.,.;OPOS=52306064,52306075;OREF=TCT,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATCTTCTTCT,ATCTTCTTCTTCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.85,0.1:16,2:20:17,2:20:1:13,0:4,2:1:0:10:1:12,0:4,2:1:0 chr1 52439128 . G GT 2011.35 PASS AF=1;AO=125;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304017;FXX=0.0151504;HRUN=0;LEN=1;MLLD=207.858;QD=61.8878;RBI=0.0366316;REFB=0;REVB=0.0204355;RO=2;SAF=78;SAR=47;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00394884;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000353235;OID=.;OPOS=52439129;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:125:129:130:130:0:82:48:0:0:11:2:78:47:1:1 chr1 52991638 . C T 691.25 PASS AF=1;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573916;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.013;QD=62.8412;RBI=0.0582314;REFB=0;REVB=-0.00985383;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00082244;OID=.;OPOS=52991638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:20:24:0:0 chr1 53072454 . T C 786.91 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0132184;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.906;QD=55.2214;RBI=0.0146525;REFB=-0.0566674;REVB=0.0063223;RO=1;SAF=37;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012575;STB=0.506664;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-1.01814e-05;OID=.;OPOS=53072454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:19:37:1:0:19:37:1:0 chr1 53250650 . G A 899.14 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1804;QD=57.0879;RBI=0.0752116;REFB=0;REVB=0.0421187;RO=1;SAF=28;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165629;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179094;OID=.;OPOS=53250650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:1:0:62:63:1:34:28:1:0:34:29:0:0 chr1 53320274 . G T 335.06 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0271416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.255;QD=16.9652;RBI=0.0271525;REFB=-0.00826287;REVB=0.000772361;RO=42;SAF=13;SAR=23;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138069;STB=0.584556;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00866541;OID=.;OPOS=53320274;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:23:13:21:21:23:13:22:21 chr1 53333392 . C T 332.91 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0181629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.522;QD=19.0235;RBI=0.018221;REFB=-0.0125419;REVB=0.00145434;RO=35;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102983;STB=0.557344;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0121723;OID=.;OPOS=53333392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:15:20:16:19:15:20:16:19 chr1 53380922 . T G 183.1 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.00398558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.085;QD=25.2545;RBI=0.023697;REFB=-0.00979467;REVB=0.0233595;RO=11;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280798;STB=0.655016;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00487844;OID=.;OPOS=53380922;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:11:11:18:18:0.62069:9:9:10:1:9:9:10:1 chr1 53535478 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.959;QD=58.5877;RBI=0.0540278;REFB=0;REVB=0.0486315;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463168;OID=.;OPOS=53535478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr1 53537266 . G A 1153.55 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4082;QD=60.7133;RBI=0.0614308;REFB=0;REVB=0.029252;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441211;OID=.;OPOS=53537266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:47:29:0:0:47:29:0:0 chr1 53544439 . G A 378.79 PASS AF=0.673077;AO=26;DP=52;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.019706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.468;QD=29.138;RBI=0.0274541;REFB=-0.0741983;REVB=0.0191155;RO=14;SAF=13;SAR=13;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909643;STB=0.573004;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0446306;OID=.;OPOS=53544439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:14:17:26:35:0.673077:13:13:5:9:13:22:7:10 chr1 53544513 . C T 373.15 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0231994;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.475;QD=22.9627;RBI=0.085552;REFB=0.00261863;REVB=0.0823464;RO=28;SAF=23;SAR=14;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177449;STB=0.509764;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.000546976;OID=.;OPOS=53544513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:28:28:37:37:0.569231:14:23:18:10:14:23:18:10 chr1 53544597 . T C 226.92 PASS AF=0.397059;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0276894;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.866;QD=13.3482;RBI=0.0280592;REFB=-0.0172415;REVB=0.00454025;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456055;STB=0.534495;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0304036;OID=.;OPOS=53544597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:40:41:27:27:0.397059:11:16:22:18:11:16:22:19 chr1 53547800 . A G 148.13 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0335059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.879;QD=17.9554;RBI=0.036152;REFB=-0.036916;REVB=-0.0135766;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938147;STB=0.553129;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00643722;OID=.;OPOS=53547800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:4:12:14:3:4:12:14:3 chr1 53553702 . A G 801.3 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.203;QD=57.2355;RBI=0.0241125;REFB=0;REVB=0.0214478;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18574e-05;OID=.;OPOS=53553702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0 chr1 53553754 . T C 335.52 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.018186;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.252;QD=22.001;RBI=0.0310705;REFB=-0.029413;REVB=0.0251922;RO=27;SAF=24;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196173;STB=0.608812;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0231237;OID=.;OPOS=53553754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:27:27:34:34:0.557377:10:24:13:14:10:24:13:14 chr1 53558270 . A G 707.88 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.198;QD=62.9225;RBI=0.057345;REFB=0;REVB=0.0555883;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000616064;OID=.;OPOS=53558270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr1 53676448 . G A 102.68 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0472197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.519;QD=9.33441;RBI=0.0656616;REFB=-0.00305758;REVB=-0.0456261;RO=31;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260658;STB=0.657299;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0127378;OID=.;OPOS=53676448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:5:8:12:19:5:8:12:19 chr1 53679878 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7739;QD=59.4354;RBI=0.0500024;REFB=0;REVB=-0.0488067;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000722369;OID=.;OPOS=53679878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr1 53684525 . C G 445.31 PASS AF=1;AO=17;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.28;QD=57.4596;RBI=0.0989804;REFB=0;REVB=0.0632989;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062422;OID=.;OPOS=53684525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:17:31:1:8:9:0:0:12:19:0:0 chr1 53716416 . G A 1526.17 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00916599;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.937;QD=59.8498;RBI=0.0635092;REFB=0;REVB=0.0628442;RO=0;SAF=64;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26365e-06;OID=.;OPOS=53716416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:102:102:1:38:64:0:0:38:64:0:0 chr1 53732315 . G T 1307.12 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257932;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.091;QD=62.2437;RBI=0.0305864;REFB=0;REVB=0.0164391;RO=0;SAF=28;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.167e-05;OID=.;OPOS=53732315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:55:28:0:0:55:29:0:0 chr1 53792651 . A C 376.14 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0355321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.724;QD=21.191;RBI=0.038014;REFB=-0.0204658;REVB=-0.0135106;RO=33;SAF=16;SAR=22;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234746;STB=0.51297;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0102898;OID=.;OPOS=53792651;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:22:16:13:20:22:16:13:20 chr1 53995515 . G A 430.34 PASS AF=0.534247;AO=36;DP=75;FAO=39;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.075465;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.5903;QD=23.58;RBI=0.20853;REFB=0.00580944;REVB=0.194396;RO=16;SAF=21;SAR=15;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137152;STB=0.520537;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0131041;OID=.;OPOS=53995515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:73:16:29:36:39:0.534247:15:21:13:3:18:21:17:12 chr1 54060248 . T C 234.97 PASS AF=0.303922;AO=31;DP=102;FAO=31;FDP=102;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=-0.00249836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.519;QD=9.21459;RBI=0.00261891;REFB=-0.00737739;REVB=0.00078545;RO=71;SAF=14;SAR=17;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08635;STB=0.550581;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0159526;OID=.;OPOS=54060248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:71:71:31:31:0.303922:17:14:27:44:17:14:27:44 chr1 54354658 . T G 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00596934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6312;QD=9.75962;RBI=0.0102403;REFB=-0.036231;REVB=-0.00832048;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125019;STB=0.50767;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0543138;OID=.;OPOS=54354658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:3:4:7:5:3:4:7:5 chr1 54562444 . A G 1246.06 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.699;QD=61.5341;RBI=0.0286918;REFB=0;REVB=0.00280563;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77018e-05;OID=.;OPOS=54562444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0 chr1 54564485 . G A 754.61 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.207;QD=54.8809;RBI=0.0147544;REFB=0.00558197;REVB=-0.00520468;RO=1;SAF=20;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229779;STB=0.512191;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-7.11765e-06;OID=.;OPOS=54564485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:34:20:1:0:34:20:1:0 chr1 54571318 . C T 218.2 PASS AF=0.863636;AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0421058;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.397;QD=39.672;RBI=0.0421096;REFB=-0.0185437;REVB=0.000564101;RO=1;SAF=8;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540538;STB=0.542668;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00727526;OID=.;OPOS=54571318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:23:22:1:3:19:19:0.863636:11:8:1:0:12:7:2:1 chr1 54605319 . G GC 266.95 PASS AF=0.756757;AO=22;DP=38;FAO=28;FDP=37;FR=.;FRO=9;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00769006;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.957;QD=28.8589;RBI=0.0758135;REFB=-0.0119594;REVB=-0.0754225;RO=16;SAF=19;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287118;STB=0.554419;STBP=0.309;TYPE=ins;VARB=0.0047759;OID=.;OPOS=54605320;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.756757:22:38:28:37:9:20:8:8:1:43:16:19:3:10:6 chr1 54606804 . C T 565.34 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.037;QD=57.983;RBI=0.0421393;REFB=-0.169892;REVB=0.0376336;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.509429;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0011982;OID=.;OPOS=54606804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:39:39:0:1:38:38:0.974359:12:26:0:0:12:26:1:0 chr1 54607051 . A G 393.28 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.394;QD=56.1823;RBI=0.018598;REFB=0;REVB=0.0157322;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11972e-05;OID=.;OPOS=54607051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0 chr1 54637167 . T C,G 584.82 PASS AF=0.902439,0.0731707;AO=37,3;DP=40;FAO=37,3;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=21,0;FSAR=16,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0328213,-0.105734;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=108.193,9.73076;QD=57.0554;RBI=0.0417627,0.159708;REFB=-0.0113346,0.0209113;REVB=-0.0258241,-0.119695;RO=0;SAF=21,0;SAR=16,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.7558e-08,0;STB=0.515143,0.5;STBP=0.284,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0019656,0.143053;OID=.,.;OPOS=54637167,54637167;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:40:41:0:1:37,3:37,3:0.902439,0.0731707:16,3:21,0:0:0:16,3:21,0:0:1 chr1 54637417 . G A 1227.13 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.007;QD=61.3563;RBI=0.033353;REFB=0;REVB=0.0297639;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14389e-05;OID=.;OPOS=54637417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:41:39:0:0:41:39:0:0 chr1 54637696 . AA AG,GG 1219.87 PASS AF=0.950617,0.0493827;AO=74,4;DP=82;FAO=77,4;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37,0;FSAR=40,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229838,0.0135259;FXX=0.0121936;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=153.472,84.0637;QD=60.2405;RBI=0.0460752,0.0276065;REFB=0,0;REVB=0.0399333,0.024066;RO=0;SAF=35,0;SAR=39,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.80413e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000266085,0.0260412;OID=.,.;OPOS=54637697,54637696;OREF=A,AA;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:82:81:0:0:74,4:77,4:0.950617,0.0493827:39,4:35,0:0:0:40,4:37,0:0:0 chr1 54637915 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4853;QD=42.1825;RBI=0.0574397;REFB=0;REVB=-0.0420242;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00345608;OID=.;OPOS=54637915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0 chr1 54683856 . C G 1584.06 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7144;QD=63.3622;RBI=0.0633586;REFB=0;REVB=0.031529;RO=0;SAF=61;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185008;OID=.;OPOS=54683856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:100:0:0:98:100:1:37:61:0:0:39:61:0:0 chr1 54683925 . G A 1120.28 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000202978;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.8;QD=60.5558;RBI=0.0599473;REFB=0;REVB=0.059947;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239742;OID=.;OPOS=54683925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:37:37:0:0:37:37:0:0 chr1 54686374 . T C 856.06 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6395;QD=57.0704;RBI=0.0456618;REFB=0;REVB=-0.0182985;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.19086e-05;OID=.;OPOS=54686374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:30:29:0:0:30:30:0:0 chr1 54686464 . C T 754.3 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5574;QD=56.9282;RBI=0.0650003;REFB=0;REVB=-0.0282017;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382162;OID=.;OPOS=54686464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0 chr1 54690867 . G A 716.49 PASS AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0106685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.65;QD=51.1776;RBI=0.0115425;REFB=-0.0130694;REVB=-0.00440618;RO=3;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532425;STB=0.528291;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=5.78834e-05;OID=.;OPOS=54690867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:56:56:3:3:53:53:0.946429:25:28:0:3:25:28:0:3 chr1 54704563 . G A 30.97 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0046027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4841;QD=12.388;RBI=0.0260393;REFB=-0.0434001;REVB=-0.0256293;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.088135;OID=.;OPOS=54704563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:1:4:4:1:1:4 chr1 54704567 . A G 141.89 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0239;QD=43.6574;RBI=0.0387262;REFB=0;REVB=-0.0295556;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00589706;OID=.;OPOS=54704567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:7:5:0:0:8:5:0:0 chr1 54704629 . C T 582.44 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-7.67217e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.164;QD=58.2444;RBI=0.0321052;REFB=-0.174482;REVB=-0.0321051;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.510633;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000890799;OID=.;OPOS=54704629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:23:16:0:0:23:16:0:1 chr1 55060251 . C T 432.15 PASS AF=0.453608;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.000123121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.33;QD=17.8205;RBI=0.00170817;REFB=-0.0277696;REVB=-0.00170373;RO=53;SAF=20;SAR=24;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390386;STB=0.521812;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0264227;OID=.;OPOS=55060251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:44:44:0.453608:24:20:22:31:24:20:22:31 chr1 55064980 . G A 528.38 PASS AF=0.556818;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00170725;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8777;QD=24.0175;RBI=0.00748418;REFB=-0.0267484;REVB=0.00728685;RO=39;SAF=24;SAR=25;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039265;STB=0.521549;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0200822;OID=.;OPOS=55064980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:88:39:39:49:49:0.556818:25:24:21:18:25:24:21:18 chr1 55075062 . C T 177.42 PASS AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0149509;FXX=0.0270197;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.671;QD=19.7138;RBI=0.0320737;REFB=-0.0260986;REVB=-0.0283759;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648528;STB=0.528814;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0203178;OID=.;OPOS=55075062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:15:18:18:18:0.5:7:11:8:7:7:11:10:8 chr1 55075122 . C G 308.98 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0318828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.253;QD=15.8452;RBI=0.0319041;REFB=0.00157323;REVB=-0.00116668;RO=44;SAF=21;SAR=13;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142783;STB=0.580597;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.00708712;OID=.;OPOS=55075122;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:13:21:21:23:13:21:21:23 chr1 55080524 . G A 238.75 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.0226897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.735;QD=14.0439;RBI=0.0230839;REFB=0.000791995;REVB=-0.00424796;RO=40;SAF=6;SAR=22;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872528;STB=0.549962;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00181526;OID=.;OPOS=55080524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:22:6:11:29:22:6:11:29 chr1 55118566 . C G 933.53 PASS AF=1;AO=55;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.461;QD=58.3458;RBI=0.0566724;REFB=0;REVB=0.0419732;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498074;OID=.;OPOS=55118566;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:55:64:1:28:27:0:0:32:32:0:0 chr1 55119144 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.318;QD=59.8391;RBI=0.0568384;REFB=0;REVB=0.0553223;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264279;OID=.;OPOS=55119144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0 chr1 55119289 . G C 474.77 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000316839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1533;QD=57.5475;RBI=0.0453003;REFB=0;REVB=0.0452992;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00377299;OID=.;OPOS=55119289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:13:19:0:0:13:20:0:0 chr1 55119545 . GA CG,G,GG 956.72 PASS AF=0,0.107692,0.892308;AO=4,6,49;DP=59;FAO=0,7,58;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7,20;FSAR=0,0,38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0875124,0.104803,0.112788;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=97.8298,177.472,194.833;QD=58.8752;RBI=0.0877105,0.104809,0.11293;REFB=0,0,0;REVB=0.00589212,-0.00119554,0.0056578;RO=0;SAF=4,5,11;SAR=0,1,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,-0.00115023,0.00494789;OID=.,.,.;OPOS=55119545,55119546,55119546;OREF=GA,A,A;OALT=CG,-,G;OMAPALT=CG,G,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:14:59:65:0:0:4,6,49:0,7,58:0,0.107692,0.892308:0,1,38:4,5,11:0:0:0,0,38:0,7,20:0:0 chr1 55139741 . A G 1343.85 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00580572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.969;QD=61.0842;RBI=0.0291028;REFB=-0.0876076;REVB=0.0285178;RO=1;SAF=38;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123057;STB=0.506492;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00017015;OID=.;OPOS=55139741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:49:38:1:0:49:38:1:0 chr1 55167773 . T A,C 2253.71 PASS AF=0.972222,0.0277778;AO=138,6;DP=144;FAO=140,4;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=75,1;FSAR=65,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135952,-0.0180113;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=57.5357,16.7903;QD=62.6031;RBI=0.0754919,0.0601998;REFB=0,0;REVB=0.0742576,-0.0574423;RO=0;SAF=74,2;SAR=64,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0013505,0.15711;OID=.,.;OPOS=55167773,55167773;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:144:144:0:0:138,6:140,4:0.972222,0.0277778:64,4:74,2:0:0:65,3:75,1:0:0 chr1 55182300 . T A 1587.75 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0058;QD=64.1516;RBI=0.0209125;REFB=0;REVB=0.00700647;RO=0;SAF=61;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5137e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011705;OID=.;OPOS=55182300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:38:61:0:0:38:61:0:0 chr1 55224799 . G A 315.47 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0301058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.4709;QD=22.5338;RBI=0.0303485;REFB=-0.021962;REVB=0.00383019;RO=24;SAF=20;SAR=12;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226334;STB=0.624922;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0136256;OID=.;OPOS=55224799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:12:20:8:16:12:20:8:16 chr1 55251689 . T C 1472.56 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.967;QD=63.3359;RBI=0.0589689;REFB=0;REVB=0.0563016;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56623e-05;OID=.;OPOS=55251689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:46:47:0:0:46:47:0:0 chr1 55273580 . G T 723.84 PASS AF=0.964286;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00313084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.421;QD=51.7026;RBI=0.0093624;REFB=-0.0288871;REVB=-0.0088234;RO=2;SAF=37;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553097;STB=0.529401;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.000239078;OID=.;OPOS=55273580;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:56:56:2:2:53:54:0.964286:16:37:0:2:16:38:0:2 chr1 55277599 . T C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.9265;QD=60.61;RBI=0.123183;REFB=0;REVB=-0.117059;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00196078;OID=.;OPOS=55277599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr1 55319902 . A G 710.28 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0263633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.108;QD=54.6366;RBI=0.0264279;REFB=-0.0995318;REVB=0.00184673;RO=1;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154392;STB=0.508194;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000534012;OID=.;OPOS=55319902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:30:21:0:1:30:21:0:1 chr1 55352309 . C T 98.97 PASS AF=0.375;AO=13;DP=34;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0152554;FXX=0.0588062;HRUN=5;LEN=1;MLLD=165.392;QD=12.3713;RBI=0.0321639;REFB=-0.0291116;REVB=-0.0283158;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414547;STB=0.510735;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.027791;OID=.;OPOS=55352309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:34:32:19:20:13:12:0.375:7:6:8:11:7:5:8:12 chr1 55446697 . G A 356.19 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0276731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.199;QD=21.9191;RBI=0.027771;REFB=-0.0370889;REVB=-0.00232873;RO=29;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210481;STB=0.511621;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0297666;OID=.;OPOS=55446697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:14:22:17:12:14:22:17:12 chr1 55457710 . G A 439.36 PASS AF=0.591549;AO=42;DP=71;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00568513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.979;QD=24.7527;RBI=0.00597888;REFB=-0.0173066;REVB=0.00185105;RO=29;SAF=16;SAR=26;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786933;STB=0.543155;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0116867;OID=.;OPOS=55457710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:29:29:42:42:0.591549:26:16:14:15:26:16:14:15 chr1 55464986 . G A 259.14 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0322791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.769;QD=24.1062;RBI=0.0407916;REFB=0.00767043;REVB=0.0249402;RO=18;SAF=9;SAR=15;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819634;STB=0.554097;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.00403606;OID=.;OPOS=55464986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:19:24:24:0.55814:15:9:5:13:15:9:5:14 chr1 55518467 . A G 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0128385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.541;QD=10.2396;RBI=0.0490325;REFB=-0.00452548;REVB=-0.0473218;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413721;STB=0.551075;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0066045;OID=.;OPOS=55518467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:29:18:19:10:10:0.344828:3:7:12:6:3:7:12:7 chr1 55523033 . A G 2501.1 PASS AF=0.982143;AO=165;DP=168;FAO=165;FDP=168;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0140687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6863;QD=59.5501;RBI=0.0570846;REFB=0.00184344;REVB=-0.0553238;RO=2;SAF=86;SAR=79;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109372;STB=0.50857;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.000449293;OID=.;OPOS=55523033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:168:168:2:3:165:165:0.982143:79:86:2:0:79:86:3:0 chr1 55524197 . A G 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.37;QD=61.2126;RBI=0.0220392;REFB=0;REVB=-0.0206279;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17427e-05;OID=.;OPOS=55524197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0 chr1 55524237 . G A 1385.12 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010209;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.444;QD=62.9598;RBI=0.0312402;REFB=0;REVB=0.029525;RO=0;SAF=53;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37291e-05;OID=.;OPOS=55524237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:35:53:0:0:35:53:0:0 chr1 55529187 . G A 1558.89 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307814;FXX=0.00934492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.232;QD=58.8259;RBI=0.0401728;REFB=-0.0946286;REVB=0.025814;RO=0;SAF=51;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000129825;OID=.;OPOS=55529187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:106:0:1:105:105:0.990566:54:51:0:0:54:51:1:0 chr1 55541174 . A G 729.0 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.557;QD=57.1768;RBI=0.0214858;REFB=0;REVB=0.0131648;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118546;OID=.;OPOS=55541174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr1 55638075 . G A 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.392;QD=59.8558;RBI=0.0372219;REFB=0;REVB=-0.0257428;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54775e-06;OID=.;OPOS=55638075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0 chr1 55839117 . G T 433.31 PASS AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0199113;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.294;QD=20.1539;RBI=0.0199318;REFB=-0.0169305;REVB=-0.00090357;RO=43;SAF=26;SAR=17;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148024;STB=0.582157;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0157522;OID=.;OPOS=55839117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:17:26:19:24:17:26:19:24 chr1 55842312 . G C 408.3 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.000160454;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.515;QD=20.4151;RBI=0.0549342;REFB=0.00885705;REVB=0.054934;RO=39;SAF=28;SAR=13;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417706;STB=0.523172;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00850473;OID=.;OPOS=55842312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:13:28:25:14:13:28:25:14 chr1 55864258 . C T 1095.95 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.528;QD=60.0523;RBI=0.0131169;REFB=0;REVB=-0.00302152;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.73833e-05;OID=.;OPOS=55864258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0 chr1 56714810 . A G 370.61 PASS AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0306929;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5526;QD=14.8245;RBI=0.0561703;REFB=-0.00111585;REVB=0.047043;RO=58;SAF=20;SAR=20;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541256;STB=0.51999;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00150786;OID=.;OPOS=56714810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:60:40:40:0.4:20:20:26:32:20:20:28:32 chr1 56961756 . A G 400.49 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0445592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.7559;QD=21.3595;RBI=0.046441;REFB=-0.0139022;REVB=0.0130862;RO=35;SAF=23;SAR=17;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519648;STB=0.528721;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0117553;OID=.;OPOS=56961756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:17:23:18:17:17:23:18:17 chr1 57180867 . A G 807.68 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0366142;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.921;QD=55.7018;RBI=0.0397321;REFB=-0.0440841;REVB=0.0154286;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.507934;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000332984;OID=.;OPOS=57180867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:58:0:1:56:57:0.982759:26:30:0:0:26:31:1:0 chr1 57221558 . A G 276.2 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0016773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.888;QD=15.3443;RBI=0.00779725;REFB=-0.00381733;REVB=-0.00761471;RO=40;SAF=7;SAR=22;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294823;STB=0.668794;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00283665;OID=.;OPOS=57221558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:29:29:0.402778:22:7:20:20:22:7:20:20 chr1 57422484 . C T 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.076;QD=64.0213;RBI=0.0261077;REFB=0;REVB=0.0217477;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.19734e-05;OID=.;OPOS=57422484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:42:56:0:0:42:56:0:0 chr1 58939634 . G A 1038.52 PASS AF=0.649635;AO=89;DP=136;FAO=89;FDP=137;FR=.;FRO=48;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=15;FWDB=0.00475803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.441;QD=30.3218;RBI=0.0117883;REFB=-0.0162289;REVB=0.0107854;RO=47;SAF=46;SAR=43;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105741;STB=0.560086;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00825408;OID=.;OPOS=58939634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:47:48:89:89:0.649635:43:46:32:15:43:46:33:15 chr1 59002221 . T C 295.57 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0028984;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.831;QD=15.1573;RBI=0.003327;REFB=0.00690447;REVB=0.00163347;RO=45;SAF=15;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102764;STB=0.558104;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=-0.0117586;OID=.;OPOS=59002221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:45:45:33:33:0.423077:18:15:25:20:18:15:25:20 chr1 59002282 . A C 177.09 PASS AF=0.338235;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00858001;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.125;QD=10.4168;RBI=0.0105812;REFB=-0.00189211;REVB=-0.00619233;RO=44;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00339498;STB=0.508467;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00444519;OID=.;OPOS=59002282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:45:23:23:0.338235:13:10:19:25:13:10:19:26 chr1 59004617 . G A 180.65 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.0471835;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.259;QD=10.9484;RBI=0.0473828;REFB=0.0250381;REVB=-0.00434156;RO=40;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215159;STB=0.605975;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.0631735;OID=.;OPOS=59004617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:40:43:23:23:0.348485:13:10:10:30:13:10:12:31 chr1 59042181 . G T 169.32 PASS AF=0.461538;AO=16;DP=37;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0796682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3889;QD=17.3661;RBI=0.0800489;REFB=-0.0313347;REVB=0.00779813;RO=20;SAF=11;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938807;STB=0.52827;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0300104;OID=.;OPOS=59042181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:39:20:21:16:18:0.461538:5:11:12:8:6:12:13:8 chr1 59142713 . T C 1341.59 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0219942;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.377;QD=60.9816;RBI=0.0232956;REFB=-0.0765478;REVB=0.00767718;RO=1;SAF=34;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137314;STB=0.507245;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=8.91693e-05;OID=.;OPOS=59142713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:53:34:1:0:53:34:1:0 chr1 59147926 . T C 1472.5 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.956;QD=63.3335;RBI=0.093227;REFB=0;REVB=0.0930354;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335898;OID=.;OPOS=59147926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:46:47:0:0:46:47:0:0 chr1 59248813 . G C 357.55 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00874778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4269;QD=49.3177;RBI=0.0205254;REFB=-0.146387;REVB=0.0185679;RO=2;SAF=11;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772824;STB=0.541636;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00400123;OID=.;OPOS=59248813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:16:11:2:0:16:11:2:0 chr1 59249031 . T G 2919.68 PASS AF=1;AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.703;QD=63.1282;RBI=0.0498786;REFB=0;REVB=0.0353271;RO=0;SAF=106;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38401e-05;OID=.;OPOS=59249031;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:184:185:0:0:184:185:1:78:106:0:0:79:106:0:0 chr1 59249347 . G C 3555.01 PASS AF=1;AO=226;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275991;FXX=0.00438577;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.36;QD=62.6433;RBI=0.0276035;REFB=-0.0967783;REVB=-0.000492254;RO=1;SAF=105;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451664;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08724e-05;OID=.;OPOS=59249347;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:227:227:1:0:226:227:1:121:105:1:0:122:105:0:0 chr1 59364918 . G A 191.08 PASS AF=0.403509;AO=22;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0317693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.644;QD=13.4091;RBI=0.0319399;REFB=-0.00758603;REVB=-0.00329694;RO=34;SAF=11;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062041;STB=0.522186;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0176316;OID=.;OPOS=59364918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:22:23:0.403509:11:11:19:15:11:12:19:15 chr1 59787350 . T G 383.46 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.00717462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.364;QD=17.4301;RBI=0.0249438;REFB=-0.00304994;REVB=-0.0238897;RO=48;SAF=26;SAR=14;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131756;STB=0.573948;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00324197;OID=.;OPOS=59787350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:14:26:25:23:14:26:25:23 chr1 59844471 . G A 666.19 PASS AF=0.550847;AO=65;DP=118;FAO=65;FDP=118;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00440654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.213;QD=22.5826;RBI=0.00470446;REFB=-0.00259436;REVB=-0.00164754;RO=53;SAF=21;SAR=44;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099715;STB=0.55471;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00227393;OID=.;OPOS=59844471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:53:53:65:65:0.550847:44:21:23:30:44:21:23:30 chr1 60505783 . G C 151.54 PASS AF=0.361702;AO=16;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.010687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1424;QD=12.8973;RBI=0.0242561;REFB=-0.0131536;REVB=-0.0217749;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00468114;STB=0.514122;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0251865;OID=.;OPOS=60505783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:30:30:16:17:0.361702:7:9:17:13:7:10:17:13 chr1 60506744 . G A 620.87 PASS AF=0.570093;AO=61;DP=106;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00124473;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2874;QD=23.2101;RBI=0.0404363;REFB=-0.0416677;REVB=-0.0404172;RO=45;SAF=24;SAR=37;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127957;STB=0.565657;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0306487;OID=.;OPOS=60506744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:45:46:61:61:0.570093:37:24:25:20:37:24:25:21 chr1 61869783 . G A 1283.29 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6577;QD=61.8451;RBI=0.043773;REFB=0;REVB=0.0197392;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015521;OID=.;OPOS=61869783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr1 61869820 . C T 420.46 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.00175611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.967;QD=16.4886;RBI=0.0262658;REFB=-0.0149238;REVB=0.026207;RO=56;SAF=21;SAR=25;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16432;STB=0.591677;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0135961;OID=.;OPOS=61869820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:25:21:35:21:25:21:35:21 chr1 62232031 . C T 2105.47 PASS AF=0.992647;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0400693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.151;QD=61.9256;RBI=0.0453527;REFB=-0.0765733;REVB=0.0212443;RO=0;SAF=49;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99536e-08;STB=0.50505;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000130122;OID=.;OPOS=62232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:135:136:0:1:135:135:0.992647:86:49:0:0:86:49:1:0 chr1 62253483 . G A 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00860055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.188;QD=17.247;RBI=0.017404;REFB=-0.00228084;REVB=0.0151304;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259962;STB=0.646929;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00332308;OID=.;OPOS=62253483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:11:10:20:7:11:10:20:7 chr1 62261168 . A G 638.55 PASS AF=0.485075;AO=65;DP=134;FAO=65;FDP=134;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=0.0367952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1791;QD=19.0611;RBI=0.0375376;REFB=-0.00175698;REVB=0.00742884;RO=69;SAF=32;SAR=33;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813254;STB=0.54494;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00201163;OID=.;OPOS=62261168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:69:69:65:65:0.485075:33:32:40:29:33:32:40:29 chr1 62318192 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.809;QD=53.911;RBI=0.014157;REFB=0;REVB=-0.003485;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022619;OID=.;OPOS=62318192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chr1 62330080 . T G 770.63 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0247638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.95;QD=55.0447;RBI=0.0379199;REFB=-0.0474515;REVB=0.0287171;RO=1;SAF=31;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149647;STB=0.507934;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000832901;OID=.;OPOS=62330080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:24:31:1:0:24:31:1:0 chr1 62380270 . C T 145.23 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.397;QD=44.6862;RBI=0.115887;REFB=0;REVB=0.0132072;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166888;OID=.;OPOS=62380270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:11:2:0:0:11:2:0:0 chr1 62380298 . G A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.962;QD=42.1826;RBI=0.0137677;REFB=0;REVB=-0.0136462;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.49919e-05;OID=.;OPOS=62380298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0 chr1 62456014 . G A 163.85 PASS AF=0.314286;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0196443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.301;QD=9.36277;RBI=0.0327103;REFB=-0.010064;REVB=-0.0261547;RO=47;SAF=12;SAR=10;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339492;STB=0.5118;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0266628;OID=.;OPOS=62456014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:47:48:22:22:0.314286:10:12:27:20:10:12:27:21 chr1 62516683 . G C 251.48 PASS AF=0.316327;AO=31;DP=98;FAO=31;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0103116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.741;QD=10.2645;RBI=0.0182725;REFB=-0.0107936;REVB=-0.0150849;RO=66;SAF=18;SAR=13;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146661;STB=0.590493;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.025099;OID=.;OPOS=62516683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:66:67:31:31:0.316327:13:18:30:36:13:18:30:37 chr1 62579823 . G A 1712.68 PASS AF=0.991453;AO=108;DP=110;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0197434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.846;QD=58.5531;RBI=0.10214;REFB=-0.0618974;REVB=0.100214;RO=1;SAF=41;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703255;STB=0.503401;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00442002;OID=.;OPOS=62579823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:117:1:1:108:116:0.991453:67:41:0:1:73:43:0:1 chr1 62579907 . C T 1413.57 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.801;QD=62.8253;RBI=0.0351239;REFB=0;REVB=0.0281643;RO=0;SAF=25;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23861e-05;OID=.;OPOS=62579907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:64:25:0:0:65:25:0:0 chr1 62603421 . C T 1995.07 PASS AF=1;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132779;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.896;QD=62.3459;RBI=0.0139418;REFB=0;REVB=-0.00425095;RO=0;SAF=51;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13367e-05;OID=.;OPOS=62603421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:128:0:0:128:128:1:77:51:0:0:77:51:0:0 chr1 62603544 . C T 1157.4 PASS AF=0.987179;AO=78;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0468576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3267;QD=59.354;RBI=0.0469027;REFB=-0.0581318;REVB=0.00205781;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.507245;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00739975;OID=.;OPOS=62603544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:0:1:78:77:0.987179:43:35:0:0:43:34:1:0 chr1 62644118 . A G 952.52 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6468;QD=58.6166;RBI=0.0344985;REFB=0;REVB=0.0320858;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190757;OID=.;OPOS=62644118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:30:34:0:0:31:34:0:0 chr1 62672546 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101135;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=347.953;QD=51.9167;RBI=0.0033576;REFB=0;REVB=0.00320167;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.2875e-06;OID=.;OPOS=62672546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr1 62713224 . C G 2395.62 PASS AF=0.981481;AO=158;DP=161;FAO=159;FDP=162;FR=.;FRO=3;FSAF=80;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0113359;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.387;QD=59.1511;RBI=0.0133895;REFB=-0.0375719;REVB=0.00712571;RO=3;SAF=80;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613182;STB=0.503144;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00046546;OID=.;OPOS=62713224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:161:162:3:3:158:159:0.981481:78:80:1:2:79:80:1:2 chr1 62728784 . A G 992.96 PASS AF=1;AO=66;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145989;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0066;QD=59.2812;RBI=0.049249;REFB=0;REVB=-0.0470355;RO=0;SAF=24;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15721e-05;OID=.;OPOS=62728784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:67:0:0:66:67:1:42:24:0:0:42:25:0:0 chr1 62728838 . T C 1540.59 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000696997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.981;QD=59.8288;RBI=0.028455;REFB=0;REVB=0.0284465;RO=0;SAF=44;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95972e-05;OID=.;OPOS=62728838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:59:44:0:0:59:44:0:0 chr1 62728861 . T C 1528.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673815;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.211;QD=59.3684;RBI=0.0191519;REFB=0;REVB=-0.0179275;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868437;OID=.;OPOS=62728861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:103:0:0:102:103:1:54:48:0:0:55:48:0:0 chr1 62728918 . G A 1556.76 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191312;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.979;QD=62.8995;RBI=0.0352231;REFB=-0.0100201;REVB=0.0295747;RO=1;SAF=47;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00998494;STB=0.505262;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=6.60784e-05;OID=.;OPOS=62728918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:51:47:1:0:51:47:1:0 chr1 62732421 . T C 773.3 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0288946;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.214;QD=55.2357;RBI=0.0314607;REFB=-0.138253;REVB=0.0124449;RO=1;SAF=40;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303841;STB=0.516123;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0017577;OID=.;OPOS=62732421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:56:1:1:55:55:0.982143:15:40:0:1:15:40:0:1 chr1 62738904 . T C 1850.43 PASS AF=1;AO=119;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00315768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.567;QD=61.1711;RBI=0.0613652;REFB=0;REVB=0.0612839;RO=0;SAF=71;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.16314e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80224e-05;OID=.;OPOS=62738904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:119:121:1:48:71:0:0:49:72:0:0 chr1 62740446 . T C 867.97 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00942139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9241;QD=57.8649;RBI=0.06113;REFB=0;REVB=0.0603996;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358353;OID=.;OPOS=62740446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0 chr1 62740449 . T C 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00489445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8016;QD=57.7121;RBI=0.0120558;REFB=0;REVB=0.0110175;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133687;OID=.;OPOS=62740449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr1 63069711 . T C 518.16 PASS AF=0.478261;AO=54;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.00458855;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.507;QD=18.0228;RBI=0.00460664;REFB=-0.0208569;REVB=-0.000407781;RO=60;SAF=24;SAR=30;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115599;STB=0.567884;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0265012;OID=.;OPOS=63069711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:60:60:54:55:0.478261:30:24:34:26:31:24:34:26 chr1 63881552 . C T 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00340978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.191;QD=57.2014;RBI=0.00395666;REFB=0;REVB=0.00200714;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66871e-06;OID=.;OPOS=63881552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:8:22:0:0:8:22:0:0 chr1 63991267 . T C 467.72 PASS AF=0.5;AO=45;DP=91;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0014563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8307;QD=20.3358;RBI=0.0110347;REFB=-0.0140466;REVB=-0.0109382;RO=46;SAF=27;SAR=18;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132036;STB=0.565686;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0186499;OID=.;OPOS=63991267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:46:46:45:46:0.5:18:27:21:25:19:27:21:25 chr1 64015217 . G A 148.08 PASS AF=0.31746;AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0235974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.223;QD=9.40167;RBI=0.0320003;REFB=-0.00992549;REVB=-0.0216144;RO=43;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23318;STB=0.637366;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0211363;OID=.;OPOS=64015217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:43:20:20:0.31746:8:12:17:26:8:12:17:26 chr1 64097432 . C T 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.54;QD=59.6793;RBI=0.0407764;REFB=0;REVB=-0.0130282;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69896e-05;OID=.;OPOS=64097432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:31:39:0:0:31:39:0:0 chr1 64114301 . T C 324.8 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.0088616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.55;QD=17.0948;RBI=0.009794;REFB=-0.00851526;REVB=-0.00417066;RO=41;SAF=13;SAR=22;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378844;STB=0.710585;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0115652;OID=.;OPOS=64114301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:22:13:32:9:22:13:32:9 chr1 64121441 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.10792e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.267;QD=50.4134;RBI=0.00717118;REFB=0;REVB=0.00717083;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.3171e-05;OID=.;OPOS=64121441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr1 64121569 . A C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.699;QD=63.8714;RBI=0.0798246;REFB=0;REVB=0.0172602;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377471;OID=.;OPOS=64121569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0 chr1 64121684 . G A 373.41 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.434;QD=55.3198;RBI=0.04328;REFB=0;REVB=0.0425204;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487836;OID=.;OPOS=64121684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr1 64515379 . C T 873.63 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221138;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.725;QD=58.2418;RBI=0.0472924;REFB=0;REVB=0.0418038;RO=0;SAF=45;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734932;OID=.;OPOS=64515379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:15:45:0:0:15:45:0:0 chr1 64608329 . G T 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.007;QD=60.6103;RBI=0.0420904;REFB=0;REVB=0.00932269;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146192;OID=.;OPOS=64608329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:28:10:0:0:28:10:0:0 chr1 65016349 . A T 689.9 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6332;QD=62.7181;RBI=0.0582015;REFB=0;REVB=0.0383182;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000913676;OID=.;OPOS=65016349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:21:23:0:0 chr1 65113568 . T C 3124.13 PASS AF=1;AO=195;DP=197;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238399;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.229;QD=64.0848;RBI=0.0619182;REFB=0;REVB=0.0618722;RO=0;SAF=98;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.53674e-06;OID=.;OPOS=65113568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:197:195:0:0:195:195:1:97:98:0:0:97:98:0:0 chr1 65147002 . C T 380.7 PASS AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=-0.0108853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.003;QD=16.9199;RBI=0.0157894;REFB=-0.00557304;REVB=-0.0114374;RO=50;SAF=17;SAR=23;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129928;STB=0.572555;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00543153;OID=.;OPOS=65147002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:50:40:40:0.444444:23:17:15:35:23:17:15:35 chr1 65158724 . C T 1036.09 PASS AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00192346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.101;QD=56.7721;RBI=0.00886052;REFB=-0.0150822;REVB=0.00864922;RO=2;SAF=32;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028636;STB=0.515147;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000259139;OID=.;OPOS=65158724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:39:32:2:0:39:32:2:0 chr1 65311262 . G A 543.07 PASS AF=0.401274;AO=63;DP=158;FAO=63;FDP=157;FR=.;FRO=94;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.00917887;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.909;QD=13.8362;RBI=0.00972775;REFB=-0.0104034;REVB=-0.0032214;RO=94;SAF=31;SAR=32;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310531;STB=0.51748;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.01642;OID=.;OPOS=65311262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:94:94:63:63:0.401274:32:31:49:45:32:31:49:45 chr1 65591719 . GC G 52.39 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0313254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.4535;QD=9.97819;RBI=0.230082;REFB=-0.01286;REVB=-0.227939;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.374101;SSSB=-0.118061;STB=0.571254;STBP=0.628;TYPE=del;VARB=-0.017637;OID=.;OPOS=65591720;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.380952:8:21:8:21:13:4:4:8:5:52:13:4:4:8:5 chr1 65614154 . T A 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369571;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.579;QD=57.7117;RBI=0.0399761;REFB=0;REVB=0.0152402;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333976;OID=.;OPOS=65614154;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr1 65690461 . G A 1558.65 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121794;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.704;QD=59.9479;RBI=0.0149347;REFB=0;REVB=-0.00864332;RO=0;SAF=58;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.17031e-06;OID=.;OPOS=65690461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:46:58:0:0:46:58:0:0 chr1 65858151 . C T 1899.06 PASS AF=0.992;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0132225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.42;QD=60.7699;RBI=0.0135144;REFB=-0.0185484;REVB=-0.00279363;RO=1;SAF=78;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010216;STB=0.505376;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-2.35872e-05;OID=.;OPOS=65858151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:125:125:1:1:124:124:0.992:46:78:0:1:46:78:0:1 chr1 65860660 . T C 1840.8 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00421562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2725;QD=61.3599;RBI=0.0047653;REFB=0;REVB=-0.00222185;RO=0;SAF=57;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27725e-06;OID=.;OPOS=65860660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:63:57:0:0:63:57:0:0 chr1 65860687 . A C 1694.84 PASS AF=0.966387;AO=115;DP=119;FAO=115;FDP=119;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00637812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2261;QD=56.9695;RBI=0.0183283;REFB=-0.0240504;REVB=-0.0171827;RO=4;SAF=44;SAR=71;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412284;STB=0.521735;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00804632;OID=.;OPOS=65860687;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:119:119:4:4:115:115:0.966387:71:44:4:0:71:44:4:0 chr1 65867519 . G A 977.22 PASS AF=0.985507;AO=62;DP=64;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0345209;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.699;QD=56.6504;RBI=0.0380081;REFB=-0.0624064;REVB=0.0159035;RO=1;SAF=8;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554087;STB=0.523802;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00188635;OID=.;OPOS=65867519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:69:1:1:62:68:0.985507:54:8:1:0:58:10:1:0 chr1 65879252 . A G 635.86 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206218;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4929;QD=62.0348;RBI=0.0286616;REFB=0;REVB=0.0199056;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471122;OID=.;OPOS=65879252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr1 65886398 . T C 1014.95 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0165875;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.759;QD=57.9972;RBI=0.0438214;REFB=-0.0757539;REVB=0.0405607;RO=1;SAF=49;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00955148;STB=0.505049;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00179133;OID=.;OPOS=65886398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:20:49:1:0:20:49:1:0 chr1 65886448 . T C 1733.51 PASS AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00235108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.241;QD=59.7763;RBI=0.0418602;REFB=0.0575649;REVB=-0.0417941;RO=0;SAF=81;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503067;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-8.39774e-05;OID=.;OPOS=65886448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:116:116:0:1:115:115:0.991379:34:81:0:0:34:81:1:0 chr1 66036441 . A G 116.86 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00258919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6184;QD=20.3234;RBI=0.0297088;REFB=-0.0235672;REVB=-0.0295957;RO=10;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180782;STB=0.602495;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.015341;OID=.;OPOS=66036441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:23:23:10:10:13:13:0.565217:7:6:7:3:7:6:7:3 chr1 66058513 . A G 1172.01 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.656;QD=60.8834;RBI=0.0187922;REFB=0;REVB=-0.00741205;RO=0;SAF=25;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.91719e-06;OID=.;OPOS=66058513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:51:25:0:0:51:26:0:0 chr1 66102257 . G A 757.13 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275501;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.305;QD=57.1415;RBI=0.00608244;REFB=0;REVB=-0.00542273;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000748822;OID=.;OPOS=66102257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0 chr1 66226961 . T C 192.9 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.00513981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.972;QD=23.3816;RBI=0.0265779;REFB=-0.000101781;REVB=0.0260762;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196148;STB=0.608592;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.000114186;OID=.;OPOS=66226961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:7:12:12:2:7:12:12:2 chr1 67094171 . G A 363.23 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0626906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8527;QD=18.1615;RBI=0.0893146;REFB=0.00126751;REVB=-0.063616;RO=42;SAF=22;SAR=16;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750546;STB=0.541922;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.00134732;OID=.;OPOS=67094171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:16:22:21:21:16:22:21:21 chr1 67109335 . A G 322.12 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00358125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8969;QD=21.8385;RBI=0.0465685;REFB=0.0230688;REVB=0.0464306;RO=25;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217645;STB=0.628405;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0164682;OID=.;OPOS=67109335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:26:33:33:0.559322:21:12:16:9:21:12:17:9 chr1 67266756 . T A 876.38 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616117;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.625;QD=58.4251;RBI=0.0616158;REFB=0;REVB=0.000712016;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330159;OID=.;OPOS=67266756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0 chr1 67288045 . C T 1085.49 PASS AF=0.831579;AO=79;DP=95;FAO=79;FDP=95;FR=.;FRO=16;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.00636517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.344;QD=45.705;RBI=0.00655164;REFB=-0.0764905;REVB=-0.00155195;RO=8;SAF=41;SAR=38;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083887;STB=0.570951;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00129838;OID=.;OPOS=67288045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:95:95:8:16:79:79:0.831579:38:41:8:0:38:41:15:1 chr1 67313249 . G A 463.71 PASS AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.00802159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.054;QD=19.3214;RBI=0.025268;REFB=-0.0133445;REVB=-0.0239609;RO=50;SAF=19;SAR=27;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670725;STB=0.50373;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0199183;OID=.;OPOS=67313249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:27:19:21:29:27:19:21:29 chr1 67390425 . CTT CCT,CT,TCC,TTC 337.65 PASS AF=0.0869565,0.630435,0.217391,0.0217391;AO=3,14,10,2;DP=47;FAO=4,29,10,1;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=1,26,0,0;FSAR=3,3,10,1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.193808,0.0739834,-0.0226249,-0.0266933;FXX=0.115362;HRUN=7,7,4,4;LEN=1,1,3,3;MLLD=6.81997,9.89843,177.248,164.088;QD=29.3607;RBI=0.198739,0.0740189,0.0551396,0.04825;REFB=-0.140303,-0.0971925,-0.0118143,-0.0105943;REVB=0.0439971,-0.00229146,0.0502841,0.0401937;RO=8;SAF=0,13,0,0;SAR=3,1,10,2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.773286,0.114475,-0.839099,-0.742825;STB=0.599463,0.562115,0.99813,0.986712;STBP=0.614,0.133,0.072,0.516;TYPE=snp,del,mnp,mnp;VARB=0.0111944,0.103273,0.0311309,0.0303651;OID=.,.,.,.;OPOS=67390426,67390426,67390425,67390425;OREF=T,T,CTT,CTT;OALT=C,-,TCC,TTC;OMAPALT=CCT,CT,TCC,TTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:84:47:46:8:2:3,14,10,2:4,29,10,1:0.0869565,0.630435,0.217391,0.0217391:3,1,10,2:0,13,0,0:7:1:3,3,10,1:1,26,0,0:1:1 chr1 67442275 . C T 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00707949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.013;QD=57.545;RBI=0.00773564;REFB=0;REVB=-0.00311782;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06781e-05;OID=.;OPOS=67442275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr1 67452322 . G A 643.29 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.463;QD=61.2654;RBI=0.0397491;REFB=0;REVB=-0.00894217;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26877e-05;OID=.;OPOS=67452322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:22:20:0:0 chr1 67558739 . C T 670.23 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6204;QD=62.347;RBI=0.0367251;REFB=0;REVB=-0.0277606;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00060759;OID=.;OPOS=67558739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0 chr1 67558756 . C T 274.16 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.03978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8606;QD=24.9238;RBI=0.0406202;REFB=-0.0431278;REVB=-0.00821857;RO=19;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708107;STB=0.503934;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0267975;OID=.;OPOS=67558756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:9:16:12:7:9:16:12:7 chr1 67558763 . A G 286.5 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0116332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.23;QD=24.3827;RBI=0.0202353;REFB=-0.0185877;REVB=-0.016557;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00332099;STB=0.516981;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.00731437;OID=.;OPOS=67558763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:21:26:26:0.553191:9:17:13:7:9:17:13:8 chr1 67560956 . C T 2200.69 PASS AF=0.992908;AO=139;DP=140;FAO=140;FDP=141;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0853216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.116;QD=62.4309;RBI=0.0854743;REFB=-0.102651;REVB=-0.00510639;RO=0;SAF=68;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36214e-08;STB=0.503649;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=7.56938e-05;OID=.;OPOS=67560956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:140:141:0:1:139:140:0.992908:71:68:0:0:72:68:1:0 chr1 67561090 . T C 465.8 PASS AF=0.455357;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.00610607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.989;QD=16.6356;RBI=0.0125981;REFB=-0.0083229;REVB=0.0110195;RO=61;SAF=27;SAR=24;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760484;STB=0.542356;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.007732;OID=.;OPOS=67561090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:61:61:51:51:0.455357:24:27:37:24:24:27:37:24 chr1 67568351 . C T 407.0 PASS AF=0.56338;AO=39;DP=70;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.000953729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.916;QD=22.9297;RBI=0.00561327;REFB=-0.0150586;REVB=0.00553165;RO=31;SAF=24;SAR=15;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329732;STB=0.67205;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0144414;OID=.;OPOS=67568351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:31:31:39:40:0.56338:15:24:6:25:16:24:6:25 chr1 67579386 . A G 411.1 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6984;QD=56.7038;RBI=0.0628815;REFB=0;REVB=0.0107172;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016188;OID=.;OPOS=67579386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0 chr1 67579395 . C T 167.43 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0288335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.973;QD=23.0939;RBI=0.0319179;REFB=0.000518116;REVB=-0.0136888;RO=12;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360619;STB=0.700176;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.000543264;OID=.;OPOS=67579395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:10:7:11:1:10:7:11:1 chr1 67633812 . G T 209.7 PASS AF=0.466667;AO=20;DP=44;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00503375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.677;QD=18.6404;RBI=0.0126666;REFB=-0.0106803;REVB=0.0116234;RO=24;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250896;STB=0.529384;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00966643;OID=.;OPOS=67633812;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:24:24:20:21:0.466667:8:12:15:9:9:12:15:9 chr1 67685387 . T C 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00117552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.317;QD=62.6703;RBI=0.0202749;REFB=0;REVB=0.0202408;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16189e-05;OID=.;OPOS=67685387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr1 67733321 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.787;QD=59.0184;RBI=0.00699759;REFB=0;REVB=-0.00395206;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81332e-06;OID=.;OPOS=67733321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0 chr1 67733346 . G A 594.5 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.793;QD=60.9744;RBI=0.013235;REFB=0;REVB=-0.0095197;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05491e-06;OID=.;OPOS=67733346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0 chr1 67795319 . T C 1679.32 PASS AF=0.99115;AO=113;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0129318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.141;QD=59.4451;RBI=0.0273607;REFB=0.0149658;REVB=0.0241118;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.503759;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=2.20045e-05;OID=.;OPOS=67795319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:113:0:1:113:112:0.99115:46:67:0:0:46:66:1:0 chr1 67852335 . G A 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.736;QD=63.2839;RBI=0.032174;REFB=0;REVB=0.0304943;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.29868e-05;OID=.;OPOS=67852335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0 chr1 67861520 . C A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.036;QD=43.4849;RBI=0.0106915;REFB=0;REVB=-0.00113281;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.88546e-05;OID=.;OPOS=67861520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr1 68006815 . T C 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00976023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.832;QD=55.6544;RBI=0.0242527;REFB=0;REVB=0.0222021;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104272;OID=.;OPOS=68006815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr1 68462247 . A G,T 527.22 PASS AF=0.944444,0.0555556;AO=34,2;DP=36;FAO=34,2;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10,1;FSAR=24,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224876,0.0470358;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.983,62.4801;QD=58.5798;RBI=0.0275336,0.0522244;REFB=0,0;REVB=0.0274416,0.0226941;RO=0;SAF=10,1;SAR=24,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000543229,0.0975444;OID=.,.;OPOS=68462247,68462247;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:36:36:0:0:34,2:34,2:0.944444,0.0555556:24,1:10,1:0:0:24,1:10,1:0:0 chr1 68591253 . C T 851.76 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.769;QD=57.7462;RBI=0.0189577;REFB=0;REVB=-0.0150939;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.05311e-05;OID=.;OPOS=68591253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:33:25:0:0:33:26:0:0 chr1 68624878 . C T 1589.6 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9962;QD=59.9848;RBI=0.0142288;REFB=0;REVB=0.00982974;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.48433e-06;OID=.;OPOS=68624878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:49:57:0:0:49:57:0:0 chr1 68903942 . C T 602.33 PASS AF=0.48062;AO=62;DP=129;FAO=62;FDP=129;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.0104404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6907;QD=18.6768;RBI=0.0157849;REFB=0.0197326;REVB=-0.011839;RO=66;SAF=26;SAR=36;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024427;STB=0.508751;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.0116108;OID=.;OPOS=68903942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:66:67:62:62:0.48062:36:26:26:40:36:26:27:40 chr1 68940883 . T TTA 1043.0 PASS AF=0.44358;AO=107;DP=272;FAO=114;FDP=257;FR=.;FRO=143;FSAF=76;FSAR=38;FSRF=70;FSRR=73;FWDB=-0.000438138;FXX=0.011538;HRUN=3;LEN=2;MLLD=228.076;QD=16.2335;RBI=0.0197281;REFB=-0.0085276;REVB=-0.0197233;RO=157;SAF=73;SAR=34;SRF=78;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207111;STB=0.603242;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.0103532;OID=.;OPOS=68940884;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.44358:107:272:114:257:143:76:38:70:73:99:157:73:34:78:79 chr1 68940982 . T C 1339.59 PASS AF=0.50566;AO=133;DP=263;FAO=134;FDP=265;FR=.;FRO=131;FSAF=80;FSAR=54;FSRF=57;FSRR=74;FWDB=0.0140675;FXX=0.00749036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.233;QD=20.2203;RBI=0.0140857;REFB=-0.0164268;REVB=0.000714932;RO=129;SAF=79;SAR=54;SRF=56;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144452;STB=0.580553;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0121053;OID=.;OPOS=68940982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:265:129:131:133:134:0.50566:54:79:56:73:54:80:57:74 chr1 68948280 . A C 165.7 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0121468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.242;QD=11.4272;RBI=0.0174594;REFB=0.00319511;REVB=0.0125414;RO=36;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861574;STB=0.558047;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00544063;OID=.;OPOS=68948280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:37:21:21:0.362069:10:11:16:20:10:11:16:21 chr1 68960349 . T C 209.34 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00928407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.236;QD=13.7269;RBI=0.0127356;REFB=-0.00619865;REVB=-0.00871796;RO=36;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779118;STB=0.544467;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00833214;OID=.;OPOS=68960349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:13:12:20:16:13:12:20:16 chr1 70034372 . G A 534.14 PASS AF=0.789474;AO=45;DP=57;FAO=45;FDP=57;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0479641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.547;QD=37.4836;RBI=0.0481265;REFB=-0.0473893;REVB=-0.00395046;RO=12;SAF=17;SAR=28;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05403;STB=0.529003;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00432648;OID=.;OPOS=70034372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:57:57:12:12:45:45:0.789474:28:17:3:9:28:17:3:9 chr1 70225923 . G A 609.45 PASS AF=0.5;AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0105471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.039;QD=19.6597;RBI=0.0217135;REFB=-0.00446517;REVB=0.0189799;RO=61;SAF=27;SAR=35;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214431;STB=0.508181;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00447624;OID=.;OPOS=70225923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:61:62:62:62:0.5:35:27:28:33:35:27:28:34 chr1 70345344 . A G 359.14 PASS AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00441736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2895;QD=19.9522;RBI=0.0180132;REFB=-0.00708533;REVB=-0.0174632;RO=35;SAF=15;SAR=21;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366412;STB=0.525815;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0081829;OID=.;OPOS=70345344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:21:15:16:19:22:15:16:19 chr1 70611347 . A G 782.8 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000308167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.21;QD=56.9308;RBI=0.0637935;REFB=0;REVB=0.0637927;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233819;OID=.;OPOS=70611347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:25:26:0:0:29:26:0:0 chr1 70831841 . C T 241.22 PASS AF=0.424242;AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.010629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.809;QD=14.6194;RBI=0.0174499;REFB=-0.00646332;REVB=-0.0138392;RO=38;SAF=9;SAR=18;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204813;STB=0.599927;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0171269;OID=.;OPOS=70831841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:38:38:27:28:0.424242:18:9:20:18:18:10:20:18 chr1 71331498 . A G 624.65 PASS AF=0.954545;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0313049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.047;QD=56.7862;RBI=0.0451637;REFB=-0.100301;REVB=0.032554;RO=2;SAF=37;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231396;STB=0.583289;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00288027;OID=.;OPOS=71331498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:44:2:2:40:42:0.954545:3:37:0:2:5:37:0:2 chr1 71419499 . C T 902.7 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00907675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.66;QD=58.2388;RBI=0.0127805;REFB=0;REVB=-0.00899741;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49581e-07;OID=.;OPOS=71419499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr1 72058552 . G A 451.99 PASS AF=0.466667;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=0.0187318;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4061;QD=17.2188;RBI=0.082598;REFB=-0.00732048;REVB=-0.0804459;RO=56;SAF=27;SAR=22;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161683;STB=0.57961;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0103877;OID=.;OPOS=72058552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:56:56:49:49:0.466667:22:27:40:16:22:27:39:17 chr1 74507450 . G C 428.28 PASS AF=0.408333;AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.00958201;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5853;QD=14.276;RBI=0.0388326;REFB=-0.0257963;REVB=0.0376318;RO=71;SAF=24;SAR=25;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262667;STB=0.514805;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0396871;OID=.;OPOS=74507450;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:71:71:49:49:0.408333:25:24:33:38:25:24:33:38 chr1 74575182 . C T 1443.19 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.309;QD=62.7474;RBI=0.0361831;REFB=0;REVB=-0.0023636;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16756e-05;OID=.;OPOS=74575182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:92:0:0:89:92:1:47:42:0:0:49:43:0:0 chr1 74665493 . G A 281.66 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.012162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.078;QD=17.0703;RBI=0.0121902;REFB=-0.0151949;REVB=-0.000827802;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556799;STB=0.53123;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.010674;OID=.;OPOS=74665493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:16:15:19:16:16:15:19:16 chr1 74670172 . A G 579.74 PASS AF=0.517544;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.024507;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.012;QD=20.3418;RBI=0.0246249;REFB=-0.0137047;REVB=-0.00240706;RO=54;SAF=30;SAR=29;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555631;STB=0.534748;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00737975;OID=.;OPOS=74670172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:55:59:59:0.517544:29:30:24:30:29:30:24:31 chr1 74671519 . A G 277.6 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0123854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.166;QD=16.0925;RBI=0.0143288;REFB=-0.00542754;REVB=0.00720533;RO=38;SAF=20;SAR=11;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689314;STB=0.538897;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00558705;OID=.;OPOS=74671519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:11:20:22:16:11:20:22:16 chr1 74941210 . C T 412.83 PASS AF=0.442308;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.0170271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.153;QD=15.8779;RBI=0.0285238;REFB=-0.0176613;REVB=-0.0228842;RO=57;SAF=21;SAR=25;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070875;STB=0.543699;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0153775;OID=.;OPOS=74941210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:58:46:46:0.442308:25:21:22:35:25:21:22:36 chr1 74941293 . G A 183.49 PASS AF=0.431818;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0312348;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.89;QD=16.681;RBI=0.0312377;REFB=0.00140976;REVB=0.000422658;RO=25;SAF=4;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219851;STB=0.591447;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=-0.00185566;OID=.;OPOS=74941293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:18:19:0.431818:14:4:10:15:14:5:10:15 chr1 74946445 . G C 557.09 PASS AF=0.518182;AO=57;DP=110;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0327124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5061;QD=20.2579;RBI=0.0332134;REFB=0.000460369;REVB=0.0057468;RO=52;SAF=27;SAR=30;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044103;STB=0.519224;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=2.43595e-05;OID=.;OPOS=74946445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:52:53:57:57:0.518182:30:27:22:30:30:27:23:30 chr1 75036812 . C T 1556.51 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.795;QD=59.8658;RBI=0.0348677;REFB=0;REVB=0.0297422;RO=0;SAF=42;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.52695e-05;OID=.;OPOS=75036812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:62:42:0:0:62:42:0:0 chr1 75037857 . CCCT C 97.44 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0416055;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=282.773;QD=9.27978;RBI=0.0437676;REFB=-0.0188337;REVB=-0.0135863;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17293;STB=0.558211;STBP=0.559;TYPE=del;VARB=0.0319748;OID=.;OPOS=75037858;OREF=CCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.380952:16:40:16:42:26:7:9:9:17:97:19:7:9:5:14 chr1 75055419 . T C 446.66 PASS AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.00635136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.253;QD=16.6977;RBI=0.0151746;REFB=-0.0061686;REVB=0.0137815;RO=57;SAF=20;SAR=29;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579611;STB=0.526096;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0085763;OID=.;OPOS=75055419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:58:49:49:0.457944:29:20:20:37:29:20:21:37 chr1 75175886 . T C 286.07 PASS AF=0.535714;AO=29;DP=55;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0151666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.383;QD=20.4338;RBI=0.0158125;REFB=-0.00788786;REVB=0.00447342;RO=25;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118646;STB=0.504851;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00752674;OID=.;OPOS=75175886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:25:26:29:30:0.535714:12:17:15:10:13:17:15:11 chr1 75190452 . C T 118.64 PASS AF=0.278689;AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0215521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.722;QD=7.77992;RBI=0.0652275;REFB=-0.000359416;REVB=-0.061564;RO=42;SAF=5;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22792;STB=0.624846;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00050491;OID=.;OPOS=75190452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:42:44:17:17:0.278689:12:5:20:22:12:5:20:24 chr1 75214441 . A G 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0409001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.311;QD=19.3436;RBI=0.0422678;REFB=-0.0109495;REVB=0.0106654;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28794;STB=0.662476;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0119867;OID=.;OPOS=75214441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:7:11:5:13:7:11:5:13 chr1 75622616 . C T 830.4 PASS AF=0.566176;AO=77;DP=136;FAO=77;FDP=136;FR=.;FRO=59;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.00126148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.924;QD=24.4234;RBI=0.006305;REFB=-0.00636575;REVB=0.00617752;RO=57;SAF=42;SAR=35;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834264;STB=0.552723;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00361834;OID=.;OPOS=75622616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:57:59:77:77:0.566176:35:42:25:32:35:42:25:34 chr1 75672376 . A G 2988.16 PASS AF=1;AO=188;DP=189;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544328;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.829;QD=63.5779;RBI=0.0544335;REFB=0;REVB=-0.000270621;RO=0;SAF=88;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.80658e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.74436e-05;OID=.;OPOS=75672376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:189:188:0:0:188:188:1:100:88:0:0:100:88:0:0 chr1 75681511 . T C 1544.23 PASS AF=0.990476;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0495253;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.709;QD=58.8276;RBI=0.0598674;REFB=0.0837469;REVB=0.0336356;RO=1;SAF=48;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978349;STB=0.505154;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00176829;OID=.;OPOS=75681511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:105:1:1:104:104:0.990476:56:48:1:0:56:48:1:0 chr1 75708664 . TAAAAAT TAAAA,TAAAAT,TAAAATT 233.84 PASS AF=0.485294,0,0;AO=22,8,5;DP=77;FAO=33,0,0;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=18,0,0;FSAR=15,0,0;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.0659061,0.0612277,-0.00333565;FXX=0.0422476;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=21.8454,11.2714,17.4028;QD=13.7552;RBI=0.0659094,0.06419,0.019582;REFB=-0.126302,-0.14703,-0.0282933;REVB=-0.000664786,-0.019275,-0.0192958;RO=31;SAF=11,4,5;SAR=11,4,0;SRF=7;SRR=24;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.283647,0.346103,0.75581;STB=0.673534,0.5,0.5;STBP=0.015,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.12836,0,0;OID=.,.,.;OPOS=75708669,75708665,75708669;OREF=AT,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=TAAAA,TAAAAT,TAAAATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.485294,0,0:22,8,5:77:33,0,0:68:35:18,0,0:15,0,0:7:28:99:31:11,4,5:11,4,0:7:24 chr1 75716925 . C T 1792.88 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.095046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.575;QD=60.7757;RBI=0.0954495;REFB=0;REVB=0.00876656;RO=0;SAF=60;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211672;OID=.;OPOS=75716925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:58:60:0:0:58:60:0:0 chr1 76143505 . T C 61.17 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.675;QD=34.9533;RBI=0.0464061;REFB=0;REVB=2.28884e-05;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119143;OID=.;OPOS=76143505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:4:2:0:0:4:3:0:0 chr1 76257892 . A T 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00406382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.264;QD=60.7161;RBI=0.0225726;REFB=0;REVB=-0.0222038;RO=0;SAF=44;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56794e-05;OID=.;OPOS=76257892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:32:44:0:0:32:44:0:0 chr1 76344705 . T C 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.588;QD=64.1537;RBI=0.0358971;REFB=0;REVB=0.0255125;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.88915e-05;OID=.;OPOS=76344705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0 chr1 76344711 . A T 785.83 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.574;QD=64.1497;RBI=0.0138478;REFB=0;REVB=0.0014792;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17188e-05;OID=.;OPOS=76344711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0 chr1 76397972 . C T 130.44 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.764;QD=43.4785;RBI=0.059908;REFB=0;REVB=-0.0256482;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228415;OID=.;OPOS=76397972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr1 77093180 . C A 789.69 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.043204;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2086;QD=55.4165;RBI=0.0467532;REFB=-0.0834044;REVB=-0.0178682;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000946908;OID=.;OPOS=77093180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:57:0:1:56:56:0.982456:33:23:0:0:33:23:1:0 chr1 77555481 . C T 866.13 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.197;QD=55.8794;RBI=0.0700416;REFB=0;REVB=0.00706034;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055941;OID=.;OPOS=77555481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:62:0:0:56:62:1:24:32:0:0:25:37:0:0 chr1 77558057 . G C 465.13 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9993;QD=58.1409;RBI=0.0194996;REFB=0;REVB=0.0185225;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242938;OID=.;OPOS=77558057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:17:14:0:0:18:14:0:0 chr1 77634948 . G A 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.66;QD=62.614;RBI=0.0167063;REFB=0;REVB=0.00968277;RO=0;SAF=55;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16281e-05;OID=.;OPOS=77634948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:33:55:0:0:33:55:0:0 chr1 77763542 . G A 1316.71 PASS AF=1;AO=83;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251392;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.191;QD=61.9628;RBI=0.0265597;REFB=0;REVB=0.0085696;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100138;OID=.;OPOS=77763542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:83:85:1:36:47:0:0:37:48:0:0 chr1 78024284 . T C 756.22 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216603;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.49;QD=57.0734;RBI=0.0217093;REFB=0;REVB=-0.0014574;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71057e-05;OID=.;OPOS=78024284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0 chr1 78024345 . C CTAT 1052.06 PASS AF=0.892857;AO=73;DP=86;FAO=75;FDP=84;FR=.;FRO=9;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00376658;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=3;MLLD=267.97;QD=50.098;RBI=0.0163329;REFB=-0.013408;REVB=0.0158926;RO=10;SAF=35;SAR=38;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273453;STB=0.521457;STBP=0.254;TYPE=ins;VARB=0.00167973;OID=.;OPOS=78024346;OREF=-;OALT=TAT;OMAPALT=CTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.892857:73:86:75:84:9:35:40:6:3:38:10:35:38:6:4 chr1 78111153 . A G 218.03 PASS AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00102954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.669;QD=11.475;RBI=0.0251052;REFB=-0.0096156;REVB=-0.0250841;RO=49;SAF=14;SAR=13;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00926837;STB=0.505362;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0170302;OID=.;OPOS=78111153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:13:14:25:24:13:14:25:24 chr1 78201745 . G T 278.83 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.035812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4234;QD=13.9416;RBI=0.0416087;REFB=-0.00752187;REVB=-0.0211844;RO=48;SAF=20;SAR=12;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113074;STB=0.564475;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0109343;OID=.;OPOS=78201745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:12:20:25:23:12:20:25:23 chr1 78420930 . T C 520.96 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.00315952;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.1;QD=18.1204;RBI=0.0253109;REFB=-0.00849777;REVB=0.0251129;RO=58;SAF=24;SAR=31;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911759;STB=0.550743;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0110416;OID=.;OPOS=78420930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:58:60:55:55:0.478261:31:24:31:27:31:24:32:28 chr1 78560583 . G A 512.64 PASS AF=0.486486;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0355917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.553;QD=18.4734;RBI=0.0391689;REFB=-0.0228698;REVB=0.0163532;RO=56;SAF=24;SAR=30;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349262;STB=0.515146;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0222362;OID=.;OPOS=78560583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:56:57:54:54:0.486486:30:24:27:29:30:24:27:30 chr1 78585086 . T C 184.57 PASS AF=0.358209;AO=23;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00725629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.73;QD=11.0193;RBI=0.0153099;REFB=-0.0128322;REVB=0.0134811;RO=43;SAF=13;SAR=10;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603589;STB=0.54656;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0120627;OID=.;OPOS=78585086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:43:43:23:24:0.358209:10:13:22:21:10:14:22:21 chr1 79093818 . A G 129.47 PASS AF=0.290323;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.000529081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.844;QD=8.35259;RBI=0.00316677;REFB=-0.00501284;REVB=0.00312226;RO=43;SAF=11;SAR=7;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918131;STB=0.56403;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00785459;OID=.;OPOS=79093818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:43:44:18:18:0.290323:7:11:23:20:7:11:23:21 chr1 79094081 . T A 388.13 PASS AF=0.637931;AO=37;DP=58;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00303315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.434;QD=26.7675;RBI=0.00849798;REFB=-0.0232878;REVB=-0.00793824;RO=21;SAF=17;SAR=20;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526408;STB=0.528731;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0104882;OID=.;OPOS=79094081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:21:21:37:37:0.637931:20:17:8:13:20:17:8:13 chr1 79095526 . G A 420.24 PASS AF=0.35461;AO=50;DP=141;FAO=50;FDP=141;FR=.;FRO=91;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.00695693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.389;QD=11.9217;RBI=0.0119922;REFB=-0.0222389;REVB=-0.00976801;RO=88;SAF=26;SAR=24;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022352;STB=0.516452;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0360151;OID=.;OPOS=79095526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:88:91:50:50:0.35461:24:26:44:44:24:26:45:46 chr1 79102726 . C T 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0127163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.644;QD=17.8403;RBI=0.0203333;REFB=-0.0174074;REVB=0.0158663;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130632;STB=0.574366;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0186111;OID=.;OPOS=79102726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:6:8:10:4:6:8:10:4 chr1 79392756 . C A 556.25 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.324;QD=60.1351;RBI=0.0133859;REFB=0;REVB=0.013117;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30276e-05;OID=.;OPOS=79392756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:25:11:0:0:26:11:0:0 chr1 82421596 . C T 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0353934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.667;QD=56.9478;RBI=0.0403785;REFB=-0.0522557;REVB=0.0194354;RO=1;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374036;STB=0.519989;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00172712;OID=.;OPOS=82421596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:12:24:0:1:12:24:0:1 chr1 82457662 . G A 1089.3 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0363032;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.781;QD=58.8813;RBI=0.0395909;REFB=-0.0395748;REVB=-0.015796;RO=1;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145519;STB=0.50769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0010021;OID=.;OPOS=82457662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:32:41:0:1:32:41:0:1 chr1 84335412 . C T 283.13 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.000728633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.333;QD=17.4231;RBI=0.00597464;REFB=-0.00741473;REVB=0.00593004;RO=33;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969001;STB=0.563632;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00797113;OID=.;OPOS=84335412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:34:31:31:0.476923:20:11:15:18:20:11:16:18 chr1 84640691 . T G 233.7 PASS AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.000855078;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.473;QD=24.5996;RBI=0.0119308;REFB=-0.0158822;REVB=0.0119001;RO=16;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116966;STB=0.565158;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0116204;OID=.;OPOS=84640691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:13:9:9:7:13:9:9:7 chr1 84810815 . A G 238.22 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0711914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.063;QD=20.2738;RBI=0.0721394;REFB=-0.0243763;REVB=-0.0116562;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943123;STB=0.553027;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0280667;OID=.;OPOS=84810815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:9:15:12:11:9:15 chr1 84853957 . A T 1343.69 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0323099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4455;QD=61.0768;RBI=0.0691105;REFB=-0.0449541;REVB=0.0610929;RO=1;SAF=54;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014141;STB=0.507461;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00526032;OID=.;OPOS=84853957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:87:87:0.988636:33:54:0:1:33:54:0:1 chr1 84944989 . A G 272.3 PASS AF=0.47619;AO=28;DP=61;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0235102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.788;QD=17.2889;RBI=0.0280089;REFB=-0.0128796;REVB=-0.0152239;RO=33;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983069;STB=0.568135;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00882507;OID=.;OPOS=84944989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:33:33:28:30:0.47619:18:10:15:18:20:10:15:18 chr1 85009894 . A G 337.75 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00460558;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=217.5;QD=15.0113;RBI=0.00561633;REFB=0.00225577;REVB=0.00321432;RO=53;SAF=20;SAR=17;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466832;STB=0.526397;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.00316007;OID=.;OPOS=85009894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:53:53:37:37:0.411111:17:20:31:22:17:20:31:22 chr1 85016177 . A G 535.81 PASS AF=0.42029;AO=58;DP=138;FAO=58;FDP=138;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=0.00158773;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.278;QD=15.5307;RBI=0.00835943;REFB=-0.00718954;REVB=-0.00820726;RO=80;SAF=29;SAR=29;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387513;STB=0.521732;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00996696;OID=.;OPOS=85016177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:80:80:58:58:0.42029:29:29:37:43:29:29:37:43 chr1 85031630 . G A 1517.15 PASS AF=0.572614;AO=138;DP=242;FAO=138;FDP=241;FR=.;FRO=103;FSAF=78;FSAR=60;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.00569593;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.553;QD=25.181;RBI=0.0108003;REFB=-0.0189098;REVB=0.00917623;RO=104;SAF=78;SAR=60;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10513;STB=0.554985;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.010839;OID=.;OPOS=85031630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:104:103:138:138:0.572614:60:78:45:59:60:78:45:58 chr1 85039893 . G A 453.09 PASS AF=0.414634;AO=49;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.01299;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.853;QD=14.7348;RBI=0.0133806;REFB=-0.015107;REVB=0.00320966;RO=73;SAF=20;SAR=29;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134285;STB=0.572372;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0228802;OID=.;OPOS=85039893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:73:72:49:51:0.414634:29:20:39:34:31:20:37:35 chr1 85039955 . G A 145.15 PASS AF=0.352941;AO=16;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00941999;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.669;QD=11.3841;RBI=0.0122455;REFB=-0.0301449;REVB=0.00782404;RO=33;SAF=7;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12204;STB=0.545801;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.043476;OID=.;OPOS=85039955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:33:33:16:18:0.352941:9:7:18:15:10:8:17:16 chr1 85113203 . T C 589.91 PASS AF=0.512821;AO=60;DP=117;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.0322511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2127;QD=20.1677;RBI=0.0338351;REFB=-0.0124742;REVB=-0.0102313;RO=57;SAF=32;SAR=28;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527583;STB=0.529067;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0107032;OID=.;OPOS=85113203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:57:57:60:60:0.512821:28:32:27:30:28:32:27:30 chr1 85113229 . A G 519.04 PASS AF=0.5;AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0198477;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2561;QD=19.2237;RBI=0.0198852;REFB=-0.000677021;REVB=0.00122025;RO=53;SAF=29;SAR=25;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586087;STB=0.537023;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.000938131;OID=.;OPOS=85113229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:54:54:54:0.5:25:29:25:28:25:29:25:29 chr1 85121255 . A G 657.6 PASS AF=0.421965;AO=72;DP=173;FAO=73;FDP=173;FR=.;FRO=100;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=0.0381583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.267;QD=15.2046;RBI=0.0382709;REFB=-0.00523743;REVB=-0.00293249;RO=100;SAF=44;SAR=28;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198423;STB=0.61367;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00891508;OID=.;OPOS=85121255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:100:100:72:73:0.421965:28:44:42:58:28:45:42:58 chr1 85422244 . G A 534.9 PASS AF=0.459677;AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=-0.00431764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.098;QD=17.255;RBI=0.00712113;REFB=-0.00151521;REVB=-0.0056629;RO=67;SAF=29;SAR=28;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160669;STB=0.589134;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00206793;OID=.;OPOS=85422244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:67:57:57:0.459677:28:29:23:44:28:29:23:44 chr1 85488030 . G A 708.07 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8966;QD=62.9398;RBI=0.0435646;REFB=0;REVB=-0.0110205;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258154;OID=.;OPOS=85488030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0 chr1 85537706 . T C 466.3 PASS AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0427138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.798;QD=19.8427;RBI=0.0429815;REFB=-0.00955059;REVB=0.00478961;RO=48;SAF=21;SAR=25;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783032;STB=0.543459;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00933079;OID=.;OPOS=85537706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:25:21:26:22:25:21:26:22 chr1 85559452 . A G 106.8 PASS AF=0.253968;AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00683397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6199;QD=6.78086;RBI=0.0177849;REFB=-0.0114628;REVB=0.0164195;RO=47;SAF=7;SAR=9;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632864;STB=0.538873;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0330013;OID=.;OPOS=85559452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:47:47:16:16:0.253968:9:7:23:24:9:7:23:24 chr1 85589842 . A G 641.85 PASS AF=0.520325;AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.00633706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.401;QD=20.8731;RBI=0.013686;REFB=-0.0188384;REVB=0.0121305;RO=58;SAF=32;SAR=32;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447447;STB=0.520319;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0137318;OID=.;OPOS=85589842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:58:59:64:64:0.520325:32:32:32:26:32:32:32:27 chr1 85594392 . T C 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00660957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.415;QD=14.0977;RBI=0.0291677;REFB=-0.00176632;REVB=0.028409;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254806;STB=0.649248;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00345553;OID=.;OPOS=85594392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:9:4:10:8:9:4:10:8 chr1 85594466 . G A 242.95 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0036363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.674;QD=22.6002;RBI=0.0720179;REFB=-0.00807008;REVB=-0.071926;RO=20;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107565;STB=0.56003;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00364163;OID=.;OPOS=85594466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:12:11:7:13:12:11:7:13 chr1 85598679 . TA TAA,T 52.02 PASS AF=0.457143,0;AO=14,6;DP=36;FAO=16,0;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5,0;FSAR=11,0;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.097057,-0.0767605;FXX=0.0277701;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=8.49237,9.88141;QD=5.94485;RBI=0.132568,0.114556;REFB=0.0789105,-0.0695913;REVB=0.0903004,-0.0850342;RO=13;SAF=5,1;SAR=9,5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0.44;SSSB=-0.0926398,-0.375164;STB=0.565133,0.5;STBP=0.522,1;TYPE=ins,del;VARB=0.0115352,0.103944;OID=.,.;OPOS=85598680,85598680;OREF=-,A;OALT=A,-;OMAPALT=TAA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.457143,0:14,6:36:16,0:35:19:5,0:11,0:8:11:49:13:5,1:9,5:6:7 chr1 85599563 . A C 208.89 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0482736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.163;QD=25.3201;RBI=0.048469;REFB=-0.0403085;REVB=-0.00434762;RO=13;SAF=6;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00645519;STB=0.503594;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0140222;OID=.;OPOS=85599563;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:14:6:4:9:14:6:4:9 chr1 85624549 . C T 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.099;QD=57.5445;RBI=0.0194887;REFB=0;REVB=0.0157585;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46669e-05;OID=.;OPOS=85624549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:38:20:0:0:38:20:0:0 chr1 85624864 . G A 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.265;QD=60.8835;RBI=0.00903133;REFB=0;REVB=0.00446223;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4924e-05;OID=.;OPOS=85624864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr1 85648620 . C T 1452.59 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270397;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.533;QD=63.156;RBI=0.0271554;REFB=0;REVB=0.00250353;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.12977e-05;OID=.;OPOS=85648620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:46:45:0:0:47:45:0:0 chr1 85655916 . G A 270.59 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0544972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5453;QD=14.4317;RBI=0.0545277;REFB=-0.010214;REVB=-0.00182335;RO=43;SAF=13;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047675;STB=0.521039;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0103203;OID=.;OPOS=85655916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:44:31:31:0.413333:18:13:20:23:18:13:20:24 chr1 85666156 . T G 265.82 PASS AF=0.392405;AO=29;DP=77;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0231649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.288;QD=13.4591;RBI=0.0238022;REFB=-0.00356689;REVB=0.00547085;RO=48;SAF=7;SAR=22;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329631;STB=0.648642;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0113458;OID=.;OPOS=85666156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:48:48:29:31:0.392405:22:7:25:23:22:9:25:23 chr1 85724328 . C T 452.06 PASS AF=0.53012;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.057864;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1261;QD=21.7861;RBI=0.0670397;REFB=-0.0177061;REVB=-0.0338538;RO=39;SAF=20;SAR=24;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497542;STB=0.52746;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0150854;OID=.;OPOS=85724328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:39:39:44:44:0.53012:24:20:20:19:24:20:20:19 chr1 85729987 . A G 360.53 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.00257677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.609;QD=17.5869;RBI=0.0180096;REFB=-0.00898977;REVB=0.0178243;RO=43;SAF=17;SAR=21;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234765;STB=0.635493;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00889538;OID=.;OPOS=85729987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:44:38:38:0.463415:21:17:30:13:21:17:31:13 chr1 85733374 . C T 201.15 PASS AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0337588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4141;QD=9.81224;RBI=0.0339372;REFB=0.00298154;REVB=-0.00347539;RO=55;SAF=11;SAR=15;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162018;STB=0.588717;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=-0.00908739;OID=.;OPOS=85733374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:55:56:26:26:0.317073:15:11:31:24:15:11:31:25 chr1 86202016 . C T 1456.7 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027544;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.35;QD=63.335;RBI=0.0165656;REFB=0;REVB=0.016335;RO=0;SAF=40;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0217e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7222e-05;OID=.;OPOS=86202016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:52:40:0:0:52:40:0:0 chr1 86202102 . C A 346.48 PASS AF=0.44186;AO=37;DP=85;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.00233207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.212;QD=16.1155;RBI=0.0179357;REFB=-0.033401;REVB=-0.0177834;RO=47;SAF=20;SAR=17;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134939;STB=0.586832;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0314605;OID=.;OPOS=86202102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:47:48:37:38:0.44186:17:20:19:28:17:21:19:29 chr1 86249206 . T C 365.95 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00737985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.747;QD=21.5262;RBI=0.00756208;REFB=-0.0108992;REVB=-0.00165014;RO=30;SAF=8;SAR=29;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25005;STB=0.649376;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00800912;OID=.;OPOS=86249206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:31:37:37:0.544118:29:8:14:16:29:8:15:16 chr1 86375654 . C G 410.33 PASS AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00278788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.599;QD=18.2368;RBI=0.00558831;REFB=-0.00842261;REVB=-0.00484324;RO=48;SAF=22;SAR=20;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371287;STB=0.520713;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0105768;OID=.;OPOS=86375654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:20:22:27:21:20:22:27:21 chr1 86487981 . G A 1429.5 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.809;QD=62.8351;RBI=0.042484;REFB=0;REVB=0.0191236;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72716e-05;OID=.;OPOS=86487981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:49:41:0:0:50:41:0:0 chr1 86487992 . A AACAG 881.05 PASS AF=0.846154;AO=65;DP=82;FAO=66;FDP=78;FR=.;FRO=12;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.004698;FXX=0.0249969;HRUN=2;LEN=4;MLLD=253.004;QD=45.1819;RBI=0.013136;REFB=-0.0502386;REVB=0.0122672;RO=17;SAF=30;SAR=35;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264035;STB=0.5327;STBP=0.19;TYPE=ins;VARB=0.0073746;OID=.;OPOS=86487993;OREF=-;OALT=ACAG;OMAPALT=AACAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.846154:65:82:66:78:12:30:36:8:4:62:17:30:35:9:8 chr1 86488232 . G A 344.26 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0194034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0669;QD=21.8576;RBI=0.0217086;REFB=0.00535088;REVB=0.00973513;RO=28;SAF=23;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162072;STB=0.589691;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.00605275;OID=.;OPOS=86488232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:28:28:35:35:0.555556:12:23:13:15:12:23:13:15 chr1 86512536 . C T 89.7 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0266587;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.181;QD=13.7999;RBI=0.038983;REFB=-0.0383922;REVB=-0.0284426;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141797;STB=0.583184;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0299278;OID=.;OPOS=86512536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:26:26:15:15:11:11:0.423077:5:6:6:9:5:6:6:9 chr1 86557967 . G A 352.47 PASS AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.019489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.26;QD=21.0431;RBI=0.0205765;REFB=0.00733371;REVB=-0.00660085;RO=31;SAF=17;SAR=19;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036733;STB=0.520321;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.00354031;OID=.;OPOS=86557967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:19:17:16:15:19:17:16:15 chr1 86590915 . G A 619.94 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0170375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.87;QD=59.0423;RBI=0.0180327;REFB=-0.0267798;REVB=0.00590777;RO=1;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218198;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000134097;OID=.;OPOS=86590915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:21:20:0:1:21:20:0:1 chr1 86591837 . G A 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00789251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.825;QD=57.6751;RBI=0.0445748;REFB=0;REVB=0.0438705;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336956;OID=.;OPOS=86591837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr1 86818572 . T C 972.86 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.186;QD=58.961;RBI=0.0425191;REFB=0;REVB=0.0294712;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.4096e-05;OID=.;OPOS=86818572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:34:32:0:0:34:32:0:0 chr1 86820267 . C T 2140.52 PASS AF=1;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.323;QD=62.9565;RBI=0.0218236;REFB=0;REVB=-0.0214771;RO=0;SAF=67;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.01588e-05;OID=.;OPOS=86820267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:135:136:1:68:67:0:0:68:68:0:0 chr1 86834369 . T C 264.29 PASS AF=0.373494;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.036532;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.036;QD=12.7368;RBI=0.0379935;REFB=-0.0238209;REVB=0.0104366;RO=49;SAF=14;SAR=17;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106288;STB=0.566185;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0305166;OID=.;OPOS=86834369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:49:52:31:31:0.373494:17:14:27:22:17:14:29:23 chr1 86838158 . C T 6035.71 PASS AF=1;AO=378;DP=378;FAO=380;FDP=380;FR=.;FRO=0;FSAF=228;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00479345;FXX=0.0026246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.881;QD=63.5338;RBI=0.0111009;REFB=0;REVB=-0.0100126;RO=0;SAF=226;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9551e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.05662e-07;OID=.;OPOS=86838158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:378:380:0:0:378:380:1:152:226:0:0:152:228:0:0 chr1 86847955 . G A 587.04 PASS AF=0.411043;AO=67;DP=163;FAO=67;FDP=163;FR=.;FRO=96;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.00284073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.899;QD=14.4059;RBI=0.00745227;REFB=-0.0135209;REVB=-0.0068896;RO=96;SAF=34;SAR=33;SRF=59;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112838;STB=0.563204;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0220931;OID=.;OPOS=86847955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:96:96:67:67:0.411043:33:34:59:37:33:34:59:37 chr1 86848019 . C T 912.59 PASS AF=0.571429;AO=87;DP=154;FAO=88;FDP=154;FR=.;FRO=66;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0206418;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6005;QD=23.7037;RBI=0.0217346;REFB=-0.00223629;REVB=0.0068049;RO=66;SAF=51;SAR=36;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128954;STB=0.571922;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00308245;OID=.;OPOS=86848019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:66:66:87:88:0.571429:36:51:28:38:36:52:28:38 chr1 86939130 . C T 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.893;QD=59.5018;RBI=0.0215093;REFB=0;REVB=0.0121367;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98655e-05;OID=.;OPOS=86939130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0 chr1 86952324 . A G 1810.93 PASS AF=0.96063;AO=122;DP=127;FAO=122;FDP=127;FR=.;FRO=5;FSAF=62;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0159374;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.0216;QD=57.0371;RBI=0.0307594;REFB=-0.13594;REVB=0.0263086;RO=0;SAF=62;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64881e-08;STB=0.50426;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00341116;OID=.;OPOS=86952324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:127:127:0:5:122:122:0.96063:60:62:0:0:60:62:2:3 chr1 86959173 . T C 3459.52 PASS AF=1;AO=221;DP=221;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.151;QD=62.6157;RBI=0.0140019;REFB=0;REVB=-0.0129786;RO=0;SAF=101;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49617e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.20995e-06;OID=.;OPOS=86959173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:221:221:0:0:221:221:1:120:101:0:0:120:101:0:0 chr1 86965419 . T C 346.28 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0111606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.535;QD=16.8916;RBI=0.0122569;REFB=-0.0198459;REVB=-0.00506666;RO=44;SAF=24;SAR=13;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171312;STB=0.602795;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0172788;OID=.;OPOS=86965419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:45:37:37:0.45122:13:24:21:23:13:24:21:24 chr1 87045895 . ATCCTACACCTAC A 50.0 PASS AO=38;DP=73;LEN=12;RO=35;SAF=25;SAR=19;SRF=14;SRR=15;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=87045896;OREF=TCCTACACCTAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:73:35:38:19:25:14:15 chr1 87045896 . TCCTACA T,TCCTACT 787.15 PASS AF=0.857143,0.142857;AO=42,13;DP=58;FAO=48,8;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29,3;FSAR=19,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00828049,-0.00968346;FXX=0.0175408;HRUN=2,1;LEN=6,1;MLLD=235.112,156.952;QD=56.2252;RBI=0.0250541,0.0146897;REFB=0,0;REVB=0.0236462,0.0110461;RO=0;SAF=25,7;SAR=17,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-2.98888e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00347283,0.00749461;OID=.,.;OPOS=87045897,87045902;OREF=CCTACA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCCTACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.857143,0.142857:42,13:58:48,8:56:0:29,3:19,5:0:0:55:0:25,7:17,6:0:0 chr1 87045929 . T TACTCCT 50.0 PASS AO=37;DP=73;LEN=6;RO=36;SAF=25;SAR=19;SRF=14;SRR=15;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=87045929;OREF=-;OALT=TACTCC;OMAPALT=TACTCCT GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:73:36:37:19:25:14:15 chr1 87599697 . G A 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.439;QD=59.1425;RBI=0.0237927;REFB=0;REVB=-0.00504996;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108422;OID=.;OPOS=87599697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0 chr1 89225976 . T C 1231.13 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0118303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0513;QD=60.055;RBI=0.0501299;REFB=0.00992811;REVB=0.048714;RO=1;SAF=27;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00868924;STB=0.504586;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=-0.000709273;OID=.;OPOS=89225976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:54:27:0:1:54:27:0:1 chr1 89271574 . T C 405.52 PASS AF=0.555556;AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0127985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.981;QD=22.5289;RBI=0.0137919;REFB=-0.0353459;REVB=0.00513951;RO=32;SAF=19;SAR=21;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453732;STB=0.524988;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0202784;OID=.;OPOS=89271574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:0.555556:21:19:17:15:21:19:17:15 chr1 89301123 . C T 1227.3 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00822828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9065;QD=61.3652;RBI=0.0696989;REFB=0;REVB=-0.0692115;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000362269;OID=.;OPOS=89301123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:47:33:0:0:47:33:0:0 chr1 89322982 . G A 575.75 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.8;QD=60.6054;RBI=0.0321965;REFB=0;REVB=0.0106295;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.67637e-05;OID=.;OPOS=89322982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr1 89426902 . G A 503.76 PASS AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.027131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.77;QD=22.3893;RBI=0.0357483;REFB=-0.033344;REVB=-0.0232778;RO=42;SAF=19;SAR=29;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149993;STB=0.582676;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0218296;OID=.;OPOS=89426902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:42:48:48:0.533333:29:19:24:18:29:19:24:18 chr1 89449390 . T C 70.62 PASS AF=0.0985222;AO=20;DP=203;FAO=20;FDP=203;FR=.;FRO=183;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=96;FSRR=87;FWDB=0.0257498;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.0462;QD=1.39156;RBI=0.025898;REFB=0.00143546;REVB=-0.00276714;RO=183;SAF=11;SAR=9;SRF=96;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306353;STB=0.523008;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.0182516;OID=.;OPOS=89449390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:203:203:183:183:20:20:0.0985222:9:11:96:87:9:11:96:87 chr1 89449399 . T C 71.52 PASS AF=0.1;AO=20;DP=200;FAO=20;FDP=200;FR=.;FRO=180;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=98;FSRR=82;FWDB=-0.0213693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.726;QD=1.4303;RBI=0.0218024;REFB=-0.00249805;REVB=-0.00432395;RO=179;SAF=11;SAR=9;SRF=98;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00305754;STB=0.50504;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0161224;OID=.;OPOS=89449399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:200:200:179:180:20:20:0.1:9:11:98:81:9:11:98:82 chr1 89449434 . T C 75.43 PASS AF=0.116129;AO=18;DP=154;FAO=18;FDP=155;FR=.;FRO=137;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=85;FSRR=52;FWDB=0.00521242;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.004;QD=1.94655;RBI=0.0132037;REFB=-0.00118107;REVB=0.0121313;RO=136;SAF=9;SAR=9;SRF=84;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146796;STB=0.606339;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0118834;OID=.;OPOS=89449434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:154:155:136:137:18:18:0.116129:9:9:84:52:9:9:85:52 chr1 89449483 . C G 57.36 PASS AF=0.110294;AO=14;DP=136;FAO=15;FDP=136;FR=.;FRO=121;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=75;FSRR=46;FWDB=0.0104632;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.61;QD=1.68704;RBI=0.012614;REFB=-0.00248133;REVB=-0.00704516;RO=119;SAF=8;SAR=6;SRF=74;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630889;STB=0.518494;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0261748;OID=.;OPOS=89449483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:136:136:119:121:14:15:0.110294:6:8:74:45:6:9:75:46 chr1 89477490 . A G 44.51 PASS AF=0.096;AO=12;DP=125;FAO=12;FDP=125;FR=.;FRO=113;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=61;FSRR=52;FWDB=-0.0155904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.8;QD=1.42445;RBI=0.0221927;REFB=-0.00543987;REVB=-0.0157942;RO=113;SAF=9;SAR=3;SRF=61;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257877;STB=0.701775;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0363946;OID=.;OPOS=89477490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:125:125:113:113:12:12:0.096:3:9:61:52:3:9:61:52 chr1 89478868 . G A 455.19 PASS AF=0.35625;AO=56;DP=161;FAO=57;FDP=160;FR=.;FRO=103;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=-0.00378729;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.312;QD=11.3798;RBI=0.00713225;REFB=-0.00206255;REVB=0.00604362;RO=105;SAF=32;SAR=24;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16186;STB=0.591056;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00344525;OID=.;OPOS=89478868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:105:103:56:57:0.35625:24:32:45:60:24:33:45:58 chr1 89479063 . G A 1587.81 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.178;QD=64.154;RBI=0.0117312;REFB=0;REVB=0.0107724;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22553e-05;OID=.;OPOS=89479063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:98:99:1:52:46:0:0:52:47:0:0 chr1 89479074 . C T 1278.26 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177998;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.566;QD=60.8696;RBI=0.0202974;REFB=0;REVB=0.00975468;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00280483;OID=.;OPOS=89479074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:84:0:0:80:84:1:43:37:0:0:45:39:0:0 chr1 89479758 . T C 1016.41 PASS AF=0.946667;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.012176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.808;QD=54.2087;RBI=0.025179;REFB=-0.0213195;REVB=0.0220392;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.527019;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00108854;OID=.;OPOS=89479758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:72:75:0:4:70:71:0.946667:34:36:0:0:35:36:0:4 chr1 89486037 . C T 731.45 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0902173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.671;QD=62.2514;RBI=0.0913787;REFB=0;REVB=0.0145226;RO=1;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191868;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157909;OID=.;OPOS=89486037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:1:0:46:47:1:24:22:0:1:25:22:0:0 chr1 89518623 . C T 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.951;QD=57.3858;RBI=0.0203304;REFB=0;REVB=-0.0054644;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.28001e-05;OID=.;OPOS=89518623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0 chr1 89521766 . C T 892.1 PASS AF=0.550336;AO=82;DP=149;FAO=82;FDP=149;FR=.;FRO=67;FSAF=56;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00553549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.263;QD=23.9491;RBI=0.0161388;REFB=0.000675121;REVB=0.0151597;RO=67;SAF=56;SAR=26;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130757;STB=0.571615;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.000427094;OID=.;OPOS=89521766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:67:67:82:82:0.550336:26:56:36:31:26:56:36:31 chr1 89522646 . G C 1595.0 PASS AF=0.956522;AO=110;DP=115;FAO=110;FDP=115;FR=.;FRO=5;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0229037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.321;QD=55.4782;RBI=0.029107;REFB=-0.105342;REVB=0.017962;RO=4;SAF=56;SAR=54;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172421;STB=0.513434;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.000605975;OID=.;OPOS=89522646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:115:115:4:5:110:110:0.956522:54:56:1:3:54:56:1:4 chr1 89579941 . T C 1560.86 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01451;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.659;QD=60.0329;RBI=0.024167;REFB=0;REVB=-0.0193262;RO=0;SAF=33;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280677;OID=.;OPOS=89579941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:71:33:0:0:71:33:0:0 chr1 89582690 . G C 2562.57 PASS AF=1;AO=165;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0010921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.244;QD=61.7487;RBI=0.0250397;REFB=0;REVB=0.0250159;RO=0;SAF=73;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02831e-06;OID=.;OPOS=89582690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:166:166:0:0:165:166:1:92:73:0:0:92:74:0:0 chr1 89599037 . A G 54.24 PASS AF=0.0924855;AO=10;DP=173;FAO=16;FDP=173;FR=.,HEALED;FRO=157;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=75;FSRR=82;FWDB=-0.0723209;FXX=0.0057468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.229;QD=1.25412;RBI=0.0740527;REFB=-0.00424472;REVB=-0.0159212;RO=128;SAF=4;SAR=6;SRF=52;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704385;STB=0.576579;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.045607;OID=.;OPOS=89599037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:173:173:128:157:10:16:0.0924855:6:4:52:76:7:9:75:82 chr1 89599070 . T C 36.03 PASS AF=0.0820896;AO=11;DP=134;FAO=11;FDP=134;FR=.;FRO=123;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=65;FSRR=58;FWDB=-0.014474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.185;QD=1.07539;RBI=0.0191228;REFB=-0.0011433;REVB=-0.0124974;RO=123;SAF=7;SAR=4;SRF=65;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123504;STB=0.600922;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0379024;OID=.;OPOS=89599070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:134:134:123:123:11:11:0.0820896:4:7:65:58:4:7:65:58 chr1 89637578 . G A 1572.13 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.391;QD=59.8908;RBI=0.0245529;REFB=0;REVB=0.0203684;RO=0;SAF=53;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87661e-05;OID=.;OPOS=89637578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:52:53:0:0:52:53:0:0 chr1 89652071 . TC CT 998.99 PASS AF=0.988372;AO=82;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.154278;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=178.93;QD=46.4647;RBI=0.161215;REFB=-0.117188;REVB=0.0467834;RO=1;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101845;STB=0.505153;STBP=0.516;TYPE=mnp;VARB=0.000104996;OID=.;OPOS=89652071;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:86:86:1:1:82:85:0.988372:46:36:0:1:48:37:0:1 chr1 89652078 . A T 1415.42 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.363;QD=62.9077;RBI=0.0168872;REFB=0;REVB=-0.0139644;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.60279e-06;OID=.;OPOS=89652078;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:50:40:0:0:50:40:0:0 chr1 89652087 . CC TG 1313.81 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179903;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=110.565;QD=61.8265;RBI=0.0230219;REFB=0;REVB=-0.0143651;RO=0;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000101393;OID=.;OPOS=89652087;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:50:34:0:0:50:35:0:0 chr1 89652090 . T G 1287.33 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0303336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.1056;QD=60.5803;RBI=0.0625229;REFB=-0.118097;REVB=0.0546716;RO=1;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956961;STB=0.505049;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00185513;OID=.;OPOS=89652090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:49:35:0:1:49:35:0:1 chr1 89652094 . G A 1256.09 PASS AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0211373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.21;QD=59.1102;RBI=0.0252676;REFB=0.0108015;REVB=0.0138445;RO=2;SAF=33;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278364;STB=0.514702;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.000254884;OID=.;OPOS=89652094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:50:33:2:0:50:33:2:0 chr1 89652097 . C T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.863;QD=62.1623;RBI=0.0228613;REFB=0;REVB=0.0183649;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65522e-05;OID=.;OPOS=89652097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:48:37:0:0:48:37:0:0 chr1 89652102 . A T 1352.5 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00387984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.355;QD=62.1839;RBI=0.0223908;REFB=0;REVB=0.0220521;RO=0;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21938e-05;OID=.;OPOS=89652102;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:87:0:0:82:87:1:48:34:0:0:49:38:0:0 chr1 89732237 . G A 206.95 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00841999;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.084;QD=17.246;RBI=0.0118087;REFB=-0.00176327;REVB=-0.00827941;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052726;STB=0.530092;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00259062;OID=.;OPOS=89732237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:12:9:13:14:12:9:13:14 chr1 89844035 . T C 487.38 PASS AF=0.413534;AO=54;DP=133;FAO=55;FDP=133;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.00259889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.807;QD=14.6579;RBI=0.0158194;REFB=-0.00072733;REVB=-0.0156045;RO=79;SAF=28;SAR=26;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000494845;STB=0.509709;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.000884434;OID=.;OPOS=89844035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:79:78:54:55:0.413534:26:28:41:38:27:28:41:37 chr1 89847372 . G T 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.888;QD=63.2847;RBI=0.0539276;REFB=0;REVB=0.00662048;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103019;OID=.;OPOS=89847372;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr1 89847411 . C T 474.79 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0132;QD=57.5498;RBI=0.0706266;REFB=0;REVB=0.0495823;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000949817;OID=.;OPOS=89847411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:20:11:0:0:21:12:0:0 chr1 89847444 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9797;QD=57.6805;RBI=0.0352126;REFB=0;REVB=0.0276099;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793519;OID=.;OPOS=89847444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr1 89849268 . T C 426.79 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00666755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6074;QD=21.8867;RBI=0.0668896;REFB=0.000288257;REVB=0.0665565;RO=36;SAF=22;SAR=20;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16847;STB=0.59255;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.000759166;OID=.;OPOS=89849268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:20:22:26:10:20:22:26:10 chr1 89849742 . A T 239.54 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.283;QD=50.4294;RBI=0.0542529;REFB=0;REVB=0.0498807;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453635;OID=.;OPOS=89849742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:7:11:0:0:8:11:0:0 chr1 90049040 . A G 476.53 PASS AF=0.424;AO=54;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=0.00287991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.02;QD=15.249;RBI=0.0148276;REFB=-0.0108344;REVB=0.0145452;RO=71;SAF=43;SAR=11;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330805;STB=0.682235;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0139931;OID=.;OPOS=90049040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:71:72:54:53:0.424:11:43:37:34:11:42:38:34 chr1 90171835 . C T 1410.48 PASS AF=1;AO=88;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129483;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0408;QD=62.6882;RBI=0.0400334;REFB=0;REVB=-0.0378816;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00312941;OID=.;OPOS=90171835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:88:90:1:38:50:0:0:38:52:0:0 chr1 90178743 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.839;QD=58.5865;RBI=0.0838367;REFB=0;REVB=-0.052864;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226427;OID=.;OPOS=90178743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:18:14:0:0:18:15:0:0 chr1 90486412 . T G 2140.67 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.457;QD=62.9607;RBI=0.0193029;REFB=0;REVB=0.0139803;RO=0;SAF=76;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71761e-05;OID=.;OPOS=90486412;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:60:76:0:0:60:76:0:0 chr1 90493026 . G A 306.3 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9749;QD=53.2698;RBI=0.0676329;REFB=0;REVB=-0.0301063;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832541;OID=.;OPOS=90493026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:19:4:0:0:19:4:0:0 chr1 91403912 . G A 239.94 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00137903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.707;QD=14.3245;RBI=0.00754389;REFB=-0.0120388;REVB=0.00741677;RO=39;SAF=17;SAR=11;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185706;STB=0.51056;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0164203;OID=.;OPOS=91403912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:11:17:23:16:11:17:23:16 chr1 91405204 . CTTTTTTT CTTTTTTA,CTTTTTT,TCTTTTTT 36.7 PASS AF=0.0185185,0.222222,0.0185185;AO=3,17,3;DP=56;FAO=1,12,1;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=1,7,0;FSAR=0,5,1;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0222207,0.165174,0.018885;FXX=0.0357079;HRUN=7,7,1;LEN=1,1,2;MLLD=139.626,6.73328,20.4623;QD=2.71837;RBI=0.0489768,0.266367,0.147298;REFB=-0.0183925,-0.141545,-0.0843572;REVB=-0.0436459,-0.208972,-0.146083;RO=26;SAF=3,4,0;SAR=0,13,3;SRF=20;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.474336,-0.528825,-0.697524;STB=0.988543,0.506568,0.991358;STBP=0.485,0.965,0.267;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.06516,0.165277,0.172301;OID=.,.,.;OPOS=91405211,91405205,91405204;OREF=T,T,CT;OALT=A,-,TC;OMAPALT=CTTTTTTA,CTTTTTT,TCTTTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:30:56:54:26:40:3,17,3:1,12,1:0.0185185,0.222222,0.0185185:0,13,3:3,4,0:20:6:0,5,1:1,7,0:23:17 chr1 91728053 . G A 1421.27 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0136445;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.431;QD=61.7943;RBI=0.0269803;REFB=-0.00627885;REVB=0.0232758;RO=1;SAF=43;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108962;STB=0.505746;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=3.78926e-05;OID=.;OPOS=91728053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:92:1:1:91:91:0.98913:48:43:1:0:48:43:1:0 chr1 91781413 . T G 2350.86 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.257;QD=63.9688;RBI=0.0551696;REFB=0;REVB=0.0145286;RO=0;SAF=52;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108052;OID=.;OPOS=91781413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:95:52:0:0:95:52:0:0 chr1 91851253 . T C 601.19 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00180467;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=307.102;QD=58.6523;RBI=0.0168077;REFB=-0.0892774;REVB=0.0167106;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-4.309e-06;OID=.;OPOS=91851253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:20:20:0:0:20:20:0:1 chr1 91853111 . A C 3940.87 PASS AF=0.97026;AO=262;DP=269;FAO=261;FDP=269;FR=.;FRO=8;FSAF=173;FSAR=88;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0448632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.67;QD=58.6002;RBI=0.0481815;REFB=0.0500825;REVB=0.0175712;RO=3;SAF=174;SAR=88;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.15788e-05;STB=0.50709;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.00628395;OID=.;OPOS=91853111;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:269:269:3:8:262:261:0.97026:88:174:2:1:88:173:7:1 chr1 91859795 . T C 1558.18 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048722;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7384;QD=59.9301;RBI=0.0490714;REFB=0;REVB=0.00584575;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280411;OID=.;OPOS=91859795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:103:104:1:53:50:0:0:54:50:0:0 chr1 91870410 . G C 1105.9 PASS AF=0.518868;AO=110;DP=212;FAO=110;FDP=212;FR=.;FRO=102;FSAF=64;FSAR=46;FSRF=59;FSRR=43;FWDB=-0.0617775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.299;QD=20.866;RBI=0.0632246;REFB=-0.0276305;REVB=0.0134496;RO=101;SAF=64;SAR=46;SRF=59;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00210388;STB=0.501673;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0215691;OID=.;OPOS=91870410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:101:102:110:110:0.518868:46:64:59:42:46:64:59:43 chr1 91980447 . A G 1740.32 PASS AF=0.97561;AO=114;DP=117;FAO=120;FDP=123;FR=.;FRO=3;FSAF=76;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.000690052;FXX=0.00806387;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.154;QD=56.5957;RBI=0.00415925;REFB=-0.138446;REVB=0.00410161;RO=3;SAF=76;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183732;STB=0.509676;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.000905183;OID=.;OPOS=91980447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:117:123:3:3:114:120:0.97561:38:76:3:0:44:76:3:0 chr1 92107937 . C T 1510.73 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2348;QD=63.6097;RBI=0.0380033;REFB=0;REVB=0.0336967;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.94094e-05;OID=.;OPOS=92107937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:44:51:0:0:44:51:0:0 chr1 92108119 . A G 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.755;QD=63.8707;RBI=0.0780763;REFB=0;REVB=0.0298816;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000530946;OID=.;OPOS=92108119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:33:15:0:0:33:15:0:0 chr1 92108899 . C T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00987225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.674;QD=63.8719;RBI=0.0100819;REFB=0;REVB=0.00204552;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.9262e-05;OID=.;OPOS=92108899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr1 92174260 . A G 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.137;QD=60.2045;RBI=0.023949;REFB=0;REVB=8.38533e-05;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95942e-05;OID=.;OPOS=92174260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:41:32:0:0:41:32:0:0 chr1 92185657 . C T 276.31 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00522998;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=352.461;QD=15.5667;RBI=0.00845863;REFB=0.00337987;REVB=-0.00664799;RO=39;SAF=13;SAR=18;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118087;STB=0.573723;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.00459421;OID=.;OPOS=92185657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:39:40:31:31:0.43662:18:13:21:18:18:13:22:18 chr1 92200382 . T C 597.05 PASS AF=0.431507;AO=63;DP=146;FAO=63;FDP=146;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=-0.00707244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.764;QD=16.3576;RBI=0.0193543;REFB=-0.0102773;REVB=-0.0180158;RO=83;SAF=26;SAR=37;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144195;STB=0.58062;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0171129;OID=.;OPOS=92200382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:83:83:63:63:0.431507:37:26:46:37:37:26:46:37 chr1 92262874 . T C 1289.45 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305558;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.527;QD=62.1423;RBI=0.0350374;REFB=0;REVB=0.0171455;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.95506e-05;OID=.;OPOS=92262874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:83:0:0:84:83:1:44:40:0:0:44:39:0:0 chr1 92295565 . C T 317.17 PASS AF=0.892857;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0244592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.03;QD=45.3093;RBI=0.0272942;REFB=-0.0324267;REVB=0.0121127;RO=3;SAF=10;SAR=15;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12047;STB=0.565165;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000811008;OID=.;OPOS=92295565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:28:28:3:3:25:25:0.892857:15:10:3:0:15:10:3:0 chr1 92327045 . G A 772.66 PASS AF=0.98;AO=50;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00260543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2603;QD=61.813;RBI=0.0146573;REFB=0.01574;REVB=-0.0144239;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50943;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000721452;OID=.;OPOS=92327045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:0:1:50:49:0.98:27:23:0:0:26:23:0:1 chr1 92442695 . A C 1193.27 PASS AF=0.9875;AO=58;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348086;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=156.131;QD=59.6634;RBI=0.0358946;REFB=-0.0569763;REVB=0.00876281;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.507934;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000185742;OID=.;OPOS=92442695;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:80:0:1:58:79:0.9875:27:31:0:0:48:31:1:0 chr1 92646021 . G A 446.18 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.637;QD=57.5722;RBI=0.0496055;REFB=0;REVB=-0.0171793;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80029e-05;OID=.;OPOS=92646021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:14:15:0:0:14:17:0:0 chr1 92647223 . A G 327.57 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332158;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.758;QD=54.5946;RBI=0.0143309;REFB=0;REVB=-0.0139406;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.75999e-05;OID=.;OPOS=92647223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chr1 92647532 . C A 573.7 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.63737e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.398;QD=60.389;RBI=0.00854857;REFB=0;REVB=0.00854844;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22719e-05;OID=.;OPOS=92647532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr1 92889408 . C T 539.77 PASS AF=0.974359;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0390474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.171;QD=55.3613;RBI=0.0522894;REFB=-0.0823592;REVB=-0.0347776;RO=2;SAF=14;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623005;STB=0.51612;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00302242;OID=.;OPOS=92889408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:39:39:2:1:37:38:0.974359:23:14:2:0:23:15:1:0 chr1 92946479 . G A 239.23 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5778;QD=50.3631;RBI=0.0663984;REFB=0;REVB=0.0486273;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032698;OID=.;OPOS=92946479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0 chr1 92974595 . G A 1635.7 PASS AF=0.982301;AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0117671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.933;QD=57.9011;RBI=0.0186943;REFB=-0.0464914;REVB=0.0145263;RO=1;SAF=59;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921748;STB=0.50056;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000272742;OID=.;OPOS=92974595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:112:113:1:2:110:111:0.982301:51:59:0:1:52:59:1:1 chr1 92979124 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.882;QD=37.4885;RBI=0.0309403;REFB=0;REVB=0.00899795;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000917678;OID=.;OPOS=92979124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr1 92979354 . A G 698.99 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00633067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.357;QD=54.8229;RBI=0.00731291;REFB=0.0943713;REVB=0.00366078;RO=1;SAF=11;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408723;STB=0.52173;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.00094711;OID=.;OPOS=92979354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:39:11:1:0:39:11:1:0 chr1 93089823 . T C 1116.81 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9346;QD=60.3683;RBI=0.0696939;REFB=0;REVB=0.0498219;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000932514;OID=.;OPOS=93089823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:42:32:0:0:42:32:0:0 chr1 93160902 . T C 581.64 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460982;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.989;QD=61.2256;RBI=0.0708489;REFB=0;REVB=0.0538009;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000671557;OID=.;OPOS=93160902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr1 93306317 . G A 1472.18 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00216161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2422;QD=63.3194;RBI=0.0790323;REFB=0;REVB=0.0790028;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247723;OID=.;OPOS=93306317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:93:0:0:91:93:1:39:52:0:0:41:52:0:0 chr1 93307908 . T A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.818;QD=64.4152;RBI=0.0201752;REFB=0;REVB=-0.0193481;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.84986e-05;OID=.;OPOS=93307908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0 chr1 93311708 . G A 1589.78 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.353;QD=59.9916;RBI=0.0306807;REFB=0;REVB=-0.0301868;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010045;OID=.;OPOS=93311708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:55:51:0:0:55:51:0:0 chr1 93440474 . T C 289.33 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.654;QD=52.6046;RBI=0.0538086;REFB=0;REVB=0.0113434;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235525;OID=.;OPOS=93440474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:12:10:0:0 chr1 93580581 . G C 1511.64 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00228763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.86;QD=63.648;RBI=0.0670835;REFB=0;REVB=0.0670444;RO=0;SAF=59;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105633;OID=.;OPOS=93580581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:95:0:0:92:95:1:33:59:0:0:36:59:0:0 chr1 93581024 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.703;QD=52.6131;RBI=0.0344771;REFB=0;REVB=0.00888968;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026688;OID=.;OPOS=93581024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0 chr1 93603177 . T C 35.65 PASS AF=0.108108;AO=8;DP=74;FAO=8;FDP=74;FR=.;FRO=66;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.00998085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.938;QD=1.92714;RBI=0.0669075;REFB=-0.00598704;REVB=0.0661588;RO=66;SAF=4;SAR=4;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177704;STB=0.51348;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.078507;OID=.;OPOS=93603177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:74:74:66:66:8:8:0.108108:4:4:34:32:4:4:34:32 chr1 93603183 . C CAT,T 990.59 PASS AF=0.838235,0.161765;AO=57,11;DP=73;FAO=57,11;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31,5;FSAR=26,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180446,-0.0300215;FXX=0.0684838;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=133.622,41.5635;QD=58.2697;RBI=0.0188921,0.102105;REFB=0,0;REVB=-0.005595,-0.0975918;RO=5;SAF=31,5;SAR=26,6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0219394,0.0304345;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00836271,-0.00699833;OID=.,.;OPOS=93603184,93603183;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:60:73:68:5:0:57,11:57,11:0.838235,0.161765:26,6:31,5:2:3:26,6:31,5:0:0 chr1 93617546 . T C 826.27 PASS AF=1;AO=58;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6031;QD=54.1819;RBI=0.0796215;REFB=-0.0458572;REVB=0.0697752;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00406256;OID=.;OPOS=93617546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:61:61:0:0:58:61:1:21:37:0:0:24:37:0:0 chr1 93620393 . G A 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.010262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.042;QD=48.626;RBI=0.0102765;REFB=-0.0365258;REVB=0.000545713;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521719;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00233229;OID=.;OPOS=93620393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:0:1:22:22:0.956522:11:11:0:0:11:11:0:1 chr1 93646207 . T C 57.07 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0236367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.57;QD=28.5371;RBI=0.0244095;REFB=-0.00122885;REVB=-0.00609327;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173072;STB=0.599698;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.000578424;OID=.;OPOS=93646207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:5:2:1:0:5:2:1:0 chr1 93672723 . A C 1181.38 PASS AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0061296;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=97.1253;QD=58.3398;RBI=0.0334232;REFB=-0.137129;REVB=0.0328563;RO=2;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236559;STB=0.512497;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000413341;OID=.;OPOS=93672723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:81:81:2:2:79:79:0.975309:39:40:0:2:39:40:0:2 chr1 93851295 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.782;QD=59.3225;RBI=0.0473345;REFB=0;REVB=0.00723804;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152963;OID=.;OPOS=93851295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:37:31:0:0:37:31:0:0 chr1 93995245 . GAAAA GAAA,GAAAG,GAGAAA 509.53 PASS AF=0.859375,0.046875,0.09375;AO=22,4,7;DP=70;FAO=55,3,6;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0,0;FSAR=25,3,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.899113,0.530843,0.0962261;FXX=0.085702;HRUN=4,4,0;LEN=1,1,1;MLLD=10.8515,8.83939,154.261;QD=31.8453;RBI=0.9011,0.533333,0.177653;REFB=-0.00729352,-0.0195409,0.0357445;REVB=0.0598005,0.0514789,-0.149336;RO=29;SAF=2,0,0;SAR=20,4,7;SRF=27;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.763569,-0.828103,-0.852456;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,ins;VARB=0.0306347,0.0593084,0.21592;OID=.,.,.;OPOS=93995246,93995249,93995247;OREF=A,A,-;OALT=-,G,G;OMAPALT=GAAA,GAAAG,GAGAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.859375,0.046875,0.09375:22,4,7:70:55,3,6:64:0:30,0,0:25,3,6:0:0:30:29:2,0,0:20,4,7:27:2 chr1 94341267 . A G 302.11 PASS AF=0.5;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.00216769;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.726;QD=18.8819;RBI=0.0031445;REFB=-0.0224646;REVB=0.00227794;RO=31;SAF=14;SAR=18;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10488;STB=0.564477;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0186854;OID=.;OPOS=94341267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:31:32:32:32:0.5:18:14:10:21:18:14:10:22 chr1 94342564 . C A 345.38 PASS AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0012565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.494;QD=23.0253;RBI=0.00512132;REFB=-0.0256184;REVB=0.00496479;RO=25;SAF=15;SAR=20;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394798;STB=0.521727;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0165364;OID=.;OPOS=94342564;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:20:15:12:13:20:15:12:13 chr1 94343023 . A G 487.72 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0114976;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.628;QD=21.2052;RBI=0.0125702;REFB=-0.00389471;REVB=-0.00508088;RO=45;SAF=18;SAR=29;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173898;STB=0.59622;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00332457;OID=.;OPOS=94343023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:47:47:0.51087:29:18:26:19:29:18:26:19 chr1 94343233 . T C 237.25 PASS AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0266832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.232;QD=11.4336;RBI=0.0343253;REFB=-0.0110019;REVB=-0.0215925;RO=54;SAF=13;SAR=16;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00435449;STB=0.502519;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0194668;OID=.;OPOS=94343233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:54:54:29:29:0.349398:16:13:24:30:16:13:24:30 chr1 94344716 . C T 231.54 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=5.70299e-05;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.167;QD=22.589;RBI=0.004299;REFB=-0.0256045;REVB=0.00429862;RO=19;SAF=9;SAR=13;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350656;STB=0.519613;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0228852;OID=.;OPOS=94344716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:19:19:22:22:0.536585:13:9:7:12:13:9:7:12 chr1 94471075 . A G 1153.58 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0715;QD=60.7147;RBI=0.0202603;REFB=0;REVB=0.000791347;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163814;OID=.;OPOS=94471075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0 chr1 94473845 . T C 96.72 PASS AF=0.387097;AO=11;DP=29;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.024617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.24;QD=12.4805;RBI=0.0427308;REFB=-0.0351031;REVB=0.0349274;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191819;STB=0.599845;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0338649;OID=.;OPOS=94473845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:29:31:18:19:11:12:0.387097:6:5:5:13:7:5:5:14 chr1 94473864 . C T 65.28 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.000542769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.614;QD=10.8798;RBI=0.0231332;REFB=-0.0288363;REVB=-0.0231268;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119127;STB=0.571275;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0272016;OID=.;OPOS=94473864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:5:4:5:10:5:4:5:10 chr1 94474328 . T C 210.29 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=0.00466359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.1;QD=15.5772;RBI=0.00481379;REFB=-0.00600676;REVB=-0.00119314;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235297;STB=0.631483;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00710759;OID=.;OPOS=94474328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:15:9:5:25:15:9:5:25 chr1 94476203 . CT C 638.5 PASS AF=0.472222;AO=66;DP=146;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.0338541;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1634;QD=17.7361;RBI=0.0339387;REFB=-0.0174969;REVB=-0.00239423;RO=77;SAF=32;SAR=34;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587063;STB=0.543217;STBP=0.33;TYPE=del;VARB=0.0194905;OID=.;OPOS=94476204;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.472222:66:146:68:144:76:32:36:42:34:99:77:32:34:42:35 chr1 94476388 . C G 244.83 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=0.00166795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.576;QD=13.0579;RBI=0.0195437;REFB=-0.0169798;REVB=-0.0194724;RO=46;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218368;STB=0.623876;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.025148;OID=.;OPOS=94476388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:15:14:13:33:15:14:13:33 chr1 94578548 . T C 663.86 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107309;FXX=0.09802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.398;QD=57.7266;RBI=0.113312;REFB=0;REVB=0.0363924;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124472;OID=.;OPOS=94578548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:31:15:0:0:31:15:0:0 chr1 94639337 . A G 323.85 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.156;QD=53.975;RBI=0.0365783;REFB=0;REVB=0.00107015;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64514e-05;OID=.;OPOS=94639337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:10:13:0:0:10:14:0:0 chr1 94639447 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.931;QD=46.8479;RBI=0.0112796;REFB=0;REVB=-0.00404429;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189639;OID=.;OPOS=94639447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr1 94930345 . G A 1476.29 PASS AF=1;AO=88;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022264;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.5111;QD=59.0517;RBI=0.0654377;REFB=0;REVB=0.0615338;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112138;OID=.;OPOS=94930345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:100:0:0:88:100:1:55:33:0:0:63:37:0:0 chr1 95001600 . A C 1065.93 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318065;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.926;QD=60.0523;RBI=0.0424653;REFB=0;REVB=0.0281362;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83878e-05;OID=.;OPOS=95001600;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:29:42:0:0:29:42:0:0 chr1 95294089 . T C 478.21 PASS AF=0.460177;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0127141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.845;QD=16.9277;RBI=0.0129336;REFB=-0.0173487;REVB=0.002373;RO=61;SAF=25;SAR=27;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107003;STB=0.50596;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0141278;OID=.;OPOS=95294089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:61:61:52:52:0.460177:27:25:30:31:27:25:30:31 chr1 95305553 . G A 329.55 PASS AF=0.377358;AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0114104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.244;QD=12.4356;RBI=0.0240857;REFB=-0.00247838;REVB=-0.0212113;RO=66;SAF=20;SAR=20;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330852;STB=0.518858;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00364539;OID=.;OPOS=95305553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:66:66:40:40:0.377358:20:20:35:31:20:20:35:31 chr1 95330372 . G A 1695.27 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.282;QD=60.5453;RBI=0.0185472;REFB=0;REVB=0.0113566;RO=0;SAF=49;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.55782e-06;OID=.;OPOS=95330372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:63:49:0:0:63:49:0:0 chr1 95709821 . T C 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8627;QD=64.4153;RBI=0.0844237;REFB=0;REVB=0.0421568;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144155;OID=.;OPOS=95709821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr1 95709939 . T G 524.37 PASS AF=0.509259;AO=54;DP=106;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0242603;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.427;QD=19.4212;RBI=0.0242696;REFB=-0.0231886;REVB=-0.000673272;RO=52;SAF=29;SAR=25;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500583;STB=0.518025;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0227659;OID=.;OPOS=95709939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:52:53:54:55:0.509259:25:29:25:27:26:29:26:27 chr1 97770920 . C T 285.02 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0438504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8515;QD=23.7519;RBI=0.0497361;REFB=-0.0362301;REVB=0.0234696;RO=20;SAF=7;SAR=19;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300848;STB=0.527756;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0230557;OID=.;OPOS=97770920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:22:26:26:0.541667:19:7:6:14:19:7:7:15 chr1 98348885 . G A 2015.68 PASS AF=0.984962;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0101371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.695;QD=60.6219;RBI=0.0356863;REFB=-0.0837167;REVB=0.0342163;RO=2;SAF=75;SAR=56;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166689;STB=0.508771;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.000460213;OID=.;OPOS=98348885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:133:2:2:131:131:0.984962:56:75:0:2:56:75:0:2 chr1 99127392 . T C 526.76 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0482806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.582;QD=56.9473;RBI=0.0494176;REFB=0.0473333;REVB=0.0105392;RO=1;SAF=29;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158718;STB=0.50847;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00223263;OID=.;OPOS=99127392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:7:29:1:0:7:29:1:0 chr1 99156634 . T A 499.08 PASS AF=0.388889;AO=56;DP=143;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=56;FSRR=32;FWDB=0.0190554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.995;QD=13.8634;RBI=0.0199681;REFB=1.24056e-05;REVB=-0.00596778;RO=87;SAF=38;SAR=18;SRF=55;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558052;STB=0.528943;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=2.74469e-05;OID=.;OPOS=99156634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:87:88:56:56:0.388889:18:38:55:32:18:38:56:32 chr1 99225627 . G A 655.34 PASS AF=0.478571;AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.0188552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.712;QD=18.7241;RBI=0.0217223;REFB=-0.00582233;REVB=-0.0107862;RO=72;SAF=34;SAR=33;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459822;STB=0.521733;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00869371;OID=.;OPOS=99225627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:72:73:67:67:0.478571:33:34:33:39:33:34:34:39 chr1 99753631 . G A 656.22 PASS AF=0.417143;AO=73;DP=176;FAO=73;FDP=175;FR=.;FRO=102;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=0.000868389;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.114;QD=14.9992;RBI=0.00532485;REFB=-0.00509689;REVB=0.00525356;RO=102;SAF=37;SAR=36;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479227;STB=0.526827;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0075298;OID=.;OPOS=99753631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:102:102:73:73:0.417143:36:37:47:55:36:37:47:55 chr1 99762420 . G A 377.22 PASS AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.0457054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2281;QD=16.4008;RBI=0.0465661;REFB=-0.0140529;REVB=0.00891186;RO=51;SAF=25;SAR=15;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987103;STB=0.561766;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0205261;OID=.;OPOS=99762420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:52:40:40:0.434783:15:25:27:24:15:25:27:25 chr1 100336361 . C T 1509.79 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.069;QD=59.7937;RBI=0.0138538;REFB=0;REVB=-0.0021746;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62048e-06;OID=.;OPOS=100336361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:101:0:0:99:101:1:60:39:0:0:61:40:0:0 chr1 100340787 . G A 231.05 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.016419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9927;QD=16.5036;RBI=0.0669056;REFB=-0.0228193;REVB=-0.0648597;RO=30;SAF=12;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162108;STB=0.591212;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0302469;OID=.;OPOS=100340787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:14:12:19:11:14:12:19:11 chr1 100547994 . T C 1047.97 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00896698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.495;QD=58.2204;RBI=0.038723;REFB=-0.044855;REVB=0.0376704;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000141205;OID=.;OPOS=100547994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:0:1:70:71:0.986111:33:37:0:0:34:37:0:1 chr1 100575933 . G A 1792.15 PASS AF=0.983471;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0150686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1297;QD=59.2447;RBI=0.017146;REFB=-0.0253352;REVB=0.00818057;RO=2;SAF=63;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148386;STB=0.507811;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00167547;OID=.;OPOS=100575933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:121:121:2:2:119:119:0.983471:56:63:2:0:56:63:2:0 chr1 100598866 . GC AT 1253.52 PASS AF=1;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00755313;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=2;MLLD=247.44;QD=61.902;RBI=0.0222685;REFB=0;REVB=0.0209484;RO=0;SAF=29;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45212e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000128525;OID=.;OPOS=100598866;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:81:0:0:81:81:1:52:29:0:0:52:29:0:0 chr1 100672060 . T C 1822.52 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.32;QD=61.2613;RBI=0.0337977;REFB=0;REVB=0.0227393;RO=0;SAF=51;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21823e-05;OID=.;OPOS=100672060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:68:51:0:0:68:51:0:0 chr1 101005855 . T C 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.338;QD=62.1623;RBI=0.0141286;REFB=0;REVB=0.0118786;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45767e-05;OID=.;OPOS=101005855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:43:42:0:0:43:42:0:0 chr1 101006577 . A G 885.95 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.105034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5517;QD=56.2507;RBI=0.10518;REFB=-0.131331;REVB=0.00552927;RO=1;SAF=33;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140928;STB=0.50746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00310506;OID=.;OPOS=101006577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:29:33:1:0:29:33:1:0 chr1 101007055 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0422054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.301;QD=57.8844;RBI=0.0425437;REFB=0;REVB=0.00535487;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158957;OID=.;OPOS=101007055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0 chr1 101203827 . G A 350.72 PASS AF=0.44186;AO=37;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00574735;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.49;QD=16.3124;RBI=0.0113748;REFB=-0.0110679;REVB=0.00981606;RO=48;SAF=12;SAR=25;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185499;STB=0.59214;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0122762;OID=.;OPOS=101203827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:37:38:0.44186:25:12:24:24:25:13:24:24 chr1 103352451 . A G 1606.66 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4927;QD=64.2664;RBI=0.0412419;REFB=0;REVB=-0.0370069;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.15983e-05;OID=.;OPOS=103352451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:56:43:0:0:56:44:0:0 chr1 103354138 . A G 2330.83 PASS AF=1;AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00428165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.455;QD=63.8584;RBI=0.00428562;REFB=0;REVB=-0.000184424;RO=0;SAF=74;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95582e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61869e-06;OID=.;OPOS=103354138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:146:146:0:0:146:146:1:72:74:0:0:72:74:0:0 chr1 103354428 . A G 1472.53 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.631;QD=63.3348;RBI=0.0223683;REFB=0;REVB=0.0196967;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60685e-05;OID=.;OPOS=103354428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:51:42:0:0:51:42:0:0 chr1 103379918 . G A 1453.09 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0776475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7213;QD=63.1778;RBI=0.0779671;REFB=0;REVB=0.00705257;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000492172;OID=.;OPOS=103379918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:41:51:0:0:41:51:0:0 chr1 103444679 . T G 1521.02 PASS AF=0.981308;AO=103;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0241816;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.544;QD=56.8606;RBI=0.0286564;REFB=-0.202573;REVB=0.0153766;RO=3;SAF=53;SAR=50;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276165;STB=0.509614;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0014572;OID=.;OPOS=103444679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:107:107:3:2:103:105:0.981308:50:53:0:3:51:54:0:2 chr1 103471456 . CCAT C 1527.65 PASS AF=0.678571;AO=195;DP=366;FAO=190;FDP=280;FR=.;FRO=90;FSAF=13;FSAR=177;FSRF=18;FSRR=72;FWDB=-0.03834;FXX=0.401701;HRUN=2;LEN=3;MLLD=215.489;QD=21.8235;RBI=0.0384848;REFB=-0.0307573;REVB=-0.00333468;RO=4;SAF=87;SAR=108;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213878;STB=0.628938;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0181427;OID=.;OPOS=103471457;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.678571:195:366:190:280:90:13:177:18:72:99:4:87:108:4:0 chr1 107979396 . A C 3306.41 PASS AF=0.986239;AO=215;DP=218;FAO=215;FDP=218;FR=.;FRO=3;FSAF=100;FSAR=115;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00569378;FXX=0.0090905;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.976;QD=60.6681;RBI=0.0298186;REFB=-0.0721515;REVB=0.0292699;RO=2;SAF=100;SAR=115;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000615532;STB=0.501823;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=1.71415e-05;OID=.;OPOS=107979396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:218:218:2:3:215:215:0.986239:115:100:1:1:115:100:1:2 chr1 108023589 . A C 298.67 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0116241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.197;QD=23.8932;RBI=0.0207614;REFB=-0.0324;REVB=0.0172022;RO=20;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00431581;STB=0.535688;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0276101;OID=.;OPOS=108023589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:23:27:27:0.54:15:12:9:11:15:12:12:11 chr1 108113526 . C G 190.09 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.065;QD=47.5216;RBI=0.0665867;REFB=0;REVB=0.0177117;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174925;OID=.;OPOS=108113526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0 chr1 108113856 . G A 337.74 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.0313343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.483;QD=15.0105;RBI=0.0474284;REFB=-0.0200936;REVB=-0.0356037;RO=52;SAF=17;SAR=20;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101242;STB=0.562504;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0171041;OID=.;OPOS=108113856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:52:53:37:37:0.411111:20:17:29:23:20:17:30:23 chr1 108113865 . G A 313.15 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0105805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.069;QD=14.3976;RBI=0.0276786;REFB=-0.0142644;REVB=-0.0255765;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157524;STB=0.508941;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0156213;OID=.;OPOS=108113865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:16:19:29:23:16:19:29:23 chr1 108115145 . T C 1481.44 PASS AF=1;AO=82;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.05896;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.674;QD=63.0401;RBI=0.11388;REFB=0;REVB=0.0974286;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123223;OID=.;OPOS=108115145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:82:94:1:44:38:0:0:55:39:0:0 chr1 108307727 . T A 2276.94 PASS AF=1;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00731087;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.558;QD=63.6907;RBI=0.0197536;REFB=0;REVB=0.0183509;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042156;OID=.;OPOS=108307727;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:143:0:0:143:143:1:69:74:0:0:69:74:0:0 chr1 108313258 . C T 675.35 PASS AF=0.927273;AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00368534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2239;QD=49.1162;RBI=0.0186474;REFB=-0.124469;REVB=0.0182796;RO=3;SAF=20;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00645388;STB=0.51089;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00962686;OID=.;OPOS=108313258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:55:55:3:4:51:51:0.927273:31:20:1:2:31:20:1:3 chr1 108771721 . T C 38.09 PASS AF=0.0672269;AO=16;DP=240;FAO=16;FDP=238;FR=.;FRO=222;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=99;FSRR=123;FWDB=-0.0399706;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.669;QD=0.640196;RBI=0.0408135;REFB=-0.0019808;REVB=-0.00825197;RO=220;SAF=3;SAR=13;SRF=98;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297479;STB=0.764351;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0217453;OID=.;OPOS=108771721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:240:238:220:222:16:16:0.0672269:13:3:98:122:13:3:99:123 chr1 109010230 . G A 243.12 PASS AF=0.31068;AO=32;DP=102;FAO=32;FDP=103;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0106073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.631;QD=9.44166;RBI=0.0284115;REFB=-0.00866888;REVB=-0.0263572;RO=70;SAF=13;SAR=19;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176431;STB=0.598364;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0343399;OID=.;OPOS=109010230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:70:71:32:32:0.31068:19:13:39:31:19:13:39:32 chr1 109265029 . G T 477.29 PASS AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.00410342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.687;QD=18.011;RBI=0.0211367;REFB=-0.00672017;REVB=0.0207346;RO=55;SAF=27;SAR=24;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838207;STB=0.546455;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0101406;OID=.;OPOS=109265029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:55:55:51:51:0.481132:24:27:34:21:24:27:34:21 chr1 109268573 . T C 491.52 PASS AF=0.485981;AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0113285;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.608;QD=18.3745;RBI=0.0163474;REFB=0.00111338;REVB=0.0117857;RO=55;SAF=25;SAR=27;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026259;STB=0.523886;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=-0.000381185;OID=.;OPOS=109268573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:55:55:52:52:0.485981:27:25:28:27:27:25:29:26 chr1 109351501 . A G 600.98 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229874;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.262;QD=61.6385;RBI=0.0348189;REFB=0;REVB=0.0261521;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100008;OID=.;OPOS=109351501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr1 109363232 . T C 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00448862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.869;QD=56.9482;RBI=0.0467764;REFB=0.0391698;REVB=0.0465605;RO=1;SAF=17;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267359;STB=0.514278;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.000193971;OID=.;OPOS=109363232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:19:17:1:0:19:17:1:0 chr1 109395105 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.798;QD=56.9383;RBI=0.0492092;REFB=0;REVB=0.0230286;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181422;OID=.;OPOS=109395105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr1 109656946 . T C 520.06 PASS AF=0.482456;AO=54;DP=112;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=-0.00814354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.891;QD=18.2478;RBI=0.00939517;REFB=-0.0224657;REVB=-0.0046853;RO=57;SAF=28;SAR=26;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187296;STB=0.596674;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0201594;OID=.;OPOS=109656946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:57:59:54:55:0.482456:26:28:18:39:26:29:20:39 chr1 109704618 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.103;QD=43.4861;RBI=0.0195036;REFB=0;REVB=-0.00749557;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155642;OID=.;OPOS=109704618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr1 109735298 . T C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.475;QD=57.5445;RBI=0.011122;REFB=0;REVB=0.0064894;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07782e-05;OID=.;OPOS=109735298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:36:22:0:0:36:22:0:0 chr1 109735416 . A C 686.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.367;QD=62.3953;RBI=0.053082;REFB=0;REVB=0.0194131;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89529e-05;OID=.;OPOS=109735416;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:44:0:0:40:44:1:26:14:0:0:28:16:0:0 chr1 109737063 . C T 582.68 PASS AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00220668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.464;QD=58.2683;RBI=0.0527302;REFB=-0.172209;REVB=0.052684;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302093;STB=0.515144;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00169336;OID=.;OPOS=109737063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:39:40:1:1:38:39:0.975:23:15:1:0:23:16:1:0 chr1 109737090 . G A 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.057546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.755;QD=63.2847;RBI=0.0582872;REFB=0;REVB=0.00926594;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221265;OID=.;OPOS=109737090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0 chr1 109737132 . T C 747.04 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00932342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.921;QD=63.5781;RBI=0.0189492;REFB=0;REVB=0.0164968;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82209e-05;OID=.;OPOS=109737132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:30:17:0:0:30:17:0:0 chr1 109737172 . C T 591.15 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.8;QD=60.631;RBI=0.0204741;REFB=0;REVB=0.0146521;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.96899e-05;OID=.;OPOS=109737172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:20:18:0:0:20:19:0:0 chr1 109742485 . G A 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.426;QD=63.5829;RBI=0.0406862;REFB=0;REVB=0.0254442;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142675;OID=.;OPOS=109742485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0 chr1 109745618 . T C 1347.3 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4711;QD=61.9446;RBI=0.0194487;REFB=0;REVB=-0.00962206;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94005e-05;OID=.;OPOS=109745618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:53:33:0:0:53:34:0:0 chr1 109771063 . T C 903.08 PASS AF=0.984375;AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0120407;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.015;QD=56.4423;RBI=0.0928406;REFB=-0.111514;REVB=0.0920565;RO=1;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125907;STB=0.506491;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00058607;OID=.;OPOS=109771063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:64:1:1:62:63:0.984375:37:25:0:1:38:25:0:1 chr1 109794252 . T C 1208.85 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.134;QD=61.2075;RBI=0.0222351;REFB=0;REVB=0.0196173;RO=0;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16649e-05;OID=.;OPOS=109794252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:48:31:0:0:48:31:0:0 chr1 109795608 . T C 114.57 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8001;QD=41.6634;RBI=0.0490484;REFB=0;REVB=0.00557167;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00241956;OID=.;OPOS=109795608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0 chr1 109807173 . C T 846.56 PASS AF=0.541096;AO=80;DP=146;FAO=79;FDP=146;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.04702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.403;QD=23.1933;RBI=0.0791972;REFB=-0.016954;REVB=0.0637285;RO=66;SAF=35;SAR=45;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142914;STB=0.502194;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0152622;OID=.;OPOS=109807173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:66:67:80:79:0.541096:45:35:30:36:44:35:30:37 chr1 109815866 . C T 2670.4 PASS AF=0.983425;AO=174;DP=177;FAO=178;FDP=181;FR=.;FRO=3;FSAF=98;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.021921;FXX=0.0054942;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.686;QD=59.0143;RBI=0.0397808;REFB=-0.153137;REVB=0.0331962;RO=3;SAF=98;SAR=76;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00752754;STB=0.503635;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000426781;OID=.;OPOS=109815866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:177:181:3:3:174:178:0.983425:76:98:1:2:80:98:1:2 chr1 109816176 . A C 272.55 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.726;QD=51.9149;RBI=0.0524838;REFB=0;REVB=0.0044898;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202678;OID=.;OPOS=109816176;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:18:2:0:0:19:2:0:0 chr1 109816268 . TG T 91.88 PASS AF=0.8;AO=10;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.153743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.5667;QD=24.5011;RBI=0.216998;REFB=-0.030754;REVB=0.153138;RO=4;SAF=0;SAR=10;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.823065;STB=0.799358;STBP=0.006;TYPE=del;VARB=0.0456523;OID=.;OPOS=109816269;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.8:10:15:12:15:3:1:11:3:0:15:4:0:10:3:1 chr1 109818263 . G A 2737.23 PASS AF=1;AO=175;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00902228;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.503;QD=62.5652;RBI=0.00902262;REFB=0;REVB=-7.83001e-05;RO=0;SAF=91;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.12769e-07;OID=.;OPOS=109818263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:175:0:0:175:175:1:84:91:0:0:84:91:0:0 chr1 109824250 . G A 402.54 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.0353374;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5236;QD=18.5076;RBI=0.0356662;REFB=0.00264488;REVB=0.00483197;RO=46;SAF=25;SAR=16;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650144;STB=0.536189;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.00467638;OID=.;OPOS=109824250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:46:46:41:41:0.471264:16:25:31:15:16:25:31:15 chr1 109825360 . C T 487.09 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00317095;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.72;QD=59.0414;RBI=0.0328589;REFB=0;REVB=0.0327055;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118864;OID=.;OPOS=109825360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0 chr1 109836842 . C G 347.68 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.020659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.167;QD=51.5086;RBI=0.0542355;REFB=-0.0107863;REVB=-0.0501468;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519985;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-4.15077e-05;OID=.;OPOS=109836842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:0:1:26:26:0.962963:12:14:0:0:12:14:0:1 chr1 109838918 . C T 1339.7 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8748;QD=62.3115;RBI=0.0089541;REFB=0;REVB=0.00406485;RO=0;SAF=63;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02109e-05;OID=.;OPOS=109838918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:23:63:0:0:23:63:0:0 chr1 109839433 . A G 1676.04 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00245117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.825;QD=60.3978;RBI=0.013025;REFB=0;REVB=0.0127923;RO=0;SAF=42;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20861e-05;OID=.;OPOS=109839433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:69:42:0:0:69:42:0:0 chr1 109856306 . G A 2208.1 PASS AF=1;AO=139;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127903;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8453;QD=63.0887;RBI=0.0312312;REFB=0;REVB=0.028492;RO=0;SAF=70;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.01178e-05;OID=.;OPOS=109856306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:139:140:1:69:70:0:0:70:70:0:0 chr1 109856384 . CAA C 831.19 PASS AF=1;AO=57;DP=68;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10106;FXX=0.0135117;HRUN=6;LEN=2;MLLD=26.5808;QD=45.5445;RBI=0.101892;REFB=0;REVB=-0.0129944;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00112024;OID=.;OPOS=109856385;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:57:68:73:73:0:31:42:0:0:15:0:22:35:0:0 chr1 109856444 . A G 229.41 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0258293;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.6562;QD=14.1173;RBI=0.0902387;REFB=0.00374374;REVB=0.0864631;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108175;STB=0.561359;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.00285837;OID=.;OPOS=109856444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:15:12:13:25:15:12:13:25 chr1 109884775 . T G 1608.19 PASS AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000365782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1341;QD=59.0162;RBI=0.0510308;REFB=-0.00611202;REVB=0.0510295;RO=0;SAF=58;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61453e-08;STB=0.504273;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000358786;OID=.;OPOS=109884775;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:0:1:108:108:0.990826:50:58:0:0:50:58:1:0 chr1 109897103 . A G 1589.73 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00458391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.5884;QD=59.9898;RBI=0.0356244;REFB=0;REVB=0.0353282;RO=0;SAF=64;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.79622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114471;OID=.;OPOS=109897103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:42:64:0:0:42:64:0:0 chr1 110136458 . A G 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.937;QD=61.6953;RBI=0.0265593;REFB=0;REVB=0.0221235;RO=0;SAF=49;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83268e-05;OID=.;OPOS=110136458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:33:49:0:0:33:49:0:0 chr1 110148974 . C T 1568.28 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000273259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.548;QD=64.0113;RBI=0.00641116;REFB=0;REVB=-0.00640533;RO=0;SAF=34;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35237e-06;OID=.;OPOS=110148974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:64:34:0:0:64:34:0:0 chr1 110170896 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4918;QD=59.3225;RBI=0.0428287;REFB=0;REVB=0.0223293;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.53475e-05;OID=.;OPOS=110170896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:40:28:0:0 chr1 110201699 . T C 1572.74 PASS AF=0.990654;AO=105;DP=106;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0871263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1708;QD=58.7942;RBI=0.0930952;REFB=-0.0964276;REVB=-0.0327982;RO=1;SAF=50;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0093969;STB=0.50495;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00032381;OID=.;OPOS=110201699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:107:1:1:105:106:0.990654:55:50:1:0:56:50:1:0 chr1 110201809 . G T 1629.83 PASS AF=1;AO=107;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.175;QD=59.8104;RBI=0.0207997;REFB=0;REVB=-0.00576887;RO=0;SAF=51;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157623;OID=.;OPOS=110201809;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:107:109:1:56:51:0:0:57:52:0:0 chr1 110201812 . A G 1578.61 PASS AF=0.990654;AO=106;DP=109;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0471816;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.705;QD=59.0134;RBI=0.0684429;REFB=-0.0933598;REVB=0.0495815;RO=1;SAF=50;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939754;STB=0.50495;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000457124;OID=.;OPOS=110201812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:107:1:1:106:106:0.990654:56:50:1:0:56:50:1:0 chr1 110210780 . C G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.222;QD=47.8223;RBI=0.0218633;REFB=0;REVB=-0.00114691;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017844;OID=.;OPOS=110210780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr1 110233147 . C T 1358.34 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.28;QD=62.4523;RBI=0.0502395;REFB=0;REVB=-0.0487281;RO=0;SAF=27;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.39086e-05;OID=.;OPOS=110233147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:86:87:1:59:27:0:0:60:27:0:0 chr1 110279701 . C T 273.47 PASS AF=0.52;AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00982137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.604;QD=21.8777;RBI=0.0494878;REFB=-0.0429522;REVB=-0.0485034;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538525;STB=0.538432;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0333752;OID=.;OPOS=110279701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:24:24:25:26:0.52:12:13:11:13:12:14:11:13 chr1 110282972 . G T 413.44 PASS AF=0.580645;AO=33;DP=65;FAO=36;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0665769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.522;QD=26.6733;RBI=0.0674879;REFB=-0.017003;REVB=-0.0110514;RO=25;SAF=7;SAR=26;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376162;STB=0.630725;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00970809;OID=.;OPOS=110282972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:62:25:22:33:36:0.580645:26:7:16:9:26:10:13:9 chr1 110295772 . T C 155.75 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00410512;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.044;QD=11.9806;RBI=0.00979627;REFB=-0.0201041;REVB=0.00889466;RO=33;SAF=11;SAR=8;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702086;STB=0.560018;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0268159;OID=.;OPOS=110295772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:33:33:19:19:0.365385:8:11:17:16:8:11:16:17 chr1 110300441 . G A 376.24 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0113285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.388;QD=21.1963;RBI=0.0128038;REFB=-0.00682424;REVB=0.00596687;RO=32;SAF=26;SAR=12;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00315381;STB=0.509365;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00608763;OID=.;OPOS=110300441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:33:38:38:0.535211:12:26:22:10:12:26:22:11 chr1 110300504 . A G 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1748;QD=62.1624;RBI=0.0244875;REFB=0;REVB=-0.0184021;RO=0;SAF=51;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145641;OID=.;OPOS=110300504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:34:51:0:0:34:51:0:0 chr1 110466338 . C A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.112;QD=50.4135;RBI=0.00804049;REFB=0;REVB=-0.00121961;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4171e-05;OID=.;OPOS=110466338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0 chr1 110466709 . T C 3951.86 PASS AF=1;AO=247;DP=248;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257215;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4428;QD=63.7397;RBI=0.0257316;REFB=-0.0243887;REVB=0.000719088;RO=1;SAF=113;SAR=134;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00354399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322647;OID=.;OPOS=110466709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:248:248:1:0:247:248:1:134:113:0:1:134:114:0:0 chr1 110467745 . A G 1553.35 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-3.76802e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.661;QD=62.7618;RBI=0.0212396;REFB=-0.118256;REVB=-0.0212396;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-8.14176e-05;OID=.;OPOS=110467745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:0:1:98:98:0.989899:47:51:0:0:47:51:1:0 chr1 110656067 . A C 147.22 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.058337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9883;QD=17.3199;RBI=0.0630075;REFB=0.0220332;REVB=0.0238063;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079858;STB=0.52378;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=-0.0280298;OID=.;OPOS=110656067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:17:18:16:16:0.470588:10:6:5:12:10:6:6:12 chr1 110709719 . TG CA 957.78 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209038;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=123.679;QD=58.0471;RBI=0.0564514;REFB=0;REVB=0.0524385;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00094672;OID=.;OPOS=110709719;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:64:66:1:40:24:0:0:42:24:0:0 chr1 110738296 . G A 646.65 PASS AF=0.464789;AO=66;DP=142;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.0109138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.76;QD=18.2154;RBI=0.0109967;REFB=-0.0276749;REVB=-0.0013474;RO=75;SAF=34;SAR=32;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847312;STB=0.543234;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.028781;OID=.;OPOS=110738296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:75:76:66:66:0.464789:32:34:32:43:32:34:33:43 chr1 110742085 . T C 396.35 PASS AF=0.376;AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=125;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=-0.00393918;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=343.982;QD=12.683;RBI=0.00398217;REFB=0.0016553;REVB=-0.000583579;RO=78;SAF=23;SAR=24;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959388;STB=0.554513;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-0.00244221;OID=.;OPOS=110742085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:78:78:47:47:0.376:24:23:45:33:24:23:45:33 chr1 110765630 . C G 220.77 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=0.00372482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.842;QD=12.0969;RBI=0.0329176;REFB=-0.00588202;REVB=0.0327062;RO=46;SAF=9;SAR=18;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383221;STB=0.719145;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0177441;OID=.;OPOS=110765630;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:18:9:32:14:18:9:32:14 chr1 110883569 . A T 258.85 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0246693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6644;QD=24.0792;RBI=0.0279681;REFB=0.0166902;REVB=0.0131773;RO=18;SAF=8;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927516;STB=0.56661;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.0134448;OID=.;OPOS=110883569;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:19:24:24:0.55814:16:8:8:10:16:8:9:10 chr1 110884839 . AAG AA,A 630.63 PASS AF=1,0;AO=41,9;DP=56;FAO=56,0;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.215492,0.0872671;FXX=0.0175408;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=19.7348,6.55238;QD=45.0451;RBI=0.293674,0.117146;REFB=0,0;REVB=0.199519,-0.0781519;RO=4;SAF=21,0;SAR=20,9;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.285418,0;SSSB=0.0435723,-0.787382;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0101446,0;OID=.,.;OPOS=110884841,110884840;OREF=G,AG;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:41,9:56:56,0:56:0:23,0:33,0:0:0:12:4:21,0:20,9:1:3 chr1 110924353 . G A 223.87 PASS AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0115165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.515;QD=19.4665;RBI=0.0628659;REFB=-0.0104965;REVB=0.061802;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018054;STB=0.519982;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0129904;OID=.;OPOS=110924353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:22:24:21:22:0.478261:9:12:13:9:10:12:14:10 chr1 110998854 . G A 378.38 PASS AF=0.534247;AO=37;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00972097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.298;QD=20.7329;RBI=0.045634;REFB=-0.0101186;REVB=0.0445866;RO=34;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109342;STB=0.54524;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0137308;OID=.;OPOS=110998854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:37:39:0.534247:21:16:19:15:21:18:19:15 chr1 111060729 . G A 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.022815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.625;QD=17.6171;RBI=0.0265477;REFB=-0.032688;REVB=0.0135741;RO=27;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266285;STB=0.515038;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0314366;OID=.;OPOS=111060729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:14:10:12:15:14:10:12:15 chr1 111144661 . A G 508.2 PASS AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.00859104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.707;QD=20.7431;RBI=0.0305803;REFB=-0.00592792;REVB=-0.0293487;RO=48;SAF=27;SAR=22;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483347;STB=0.531118;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00728939;OID=.;OPOS=111144661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:49:49:49:0.5:22:27:29:19:22:27:30:19 chr1 111441829 . C T 453.2 PASS AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0328294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0489;QD=19.7043;RBI=0.083461;REFB=0.0271122;REVB=-0.0767331;RO=47;SAF=16;SAR=29;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048052;STB=0.526713;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.0316259;OID=.;OPOS=111441829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:29:16:19:28:29:16:19:28 chr1 111726869 . G A 1064.86 PASS AF=1;AO=65;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.334;QD=59.9918;RBI=0.079947;REFB=0;REVB=0.074854;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386474;OID=.;OPOS=111726869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:65:71:1:32:33:0:0:36:35:0:0 chr1 111773568 . G C 695.84 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00561094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5021;QD=60.5077;RBI=0.0324239;REFB=-0.0569998;REVB=0.0319348;RO=1;SAF=17;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268394;STB=0.514279;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00204261;OID=.;OPOS=111773568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:28:17:1:0:28:17:1:0 chr1 111783982 . C A 879.18 PASS AF=0.543624;AO=81;DP=149;FAO=81;FDP=149;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=-0.00612488;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.22;QD=23.602;RBI=0.0440153;REFB=-0.0155671;REVB=-0.043587;RO=65;SAF=39;SAR=42;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104809;STB=0.558986;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.012331;OID=.;OPOS=111783982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:65:68:81:81:0.543624:42:39:23:42:42:39:24:44 chr1 111783996 . A G 2310.85 PASS AF=0.987179;AO=152;DP=156;FAO=154;FDP=156;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0126109;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.425;QD=59.2524;RBI=0.0240601;REFB=-0.0573523;REVB=0.0204904;RO=1;SAF=66;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00549943;STB=0.505617;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=4.92601e-05;OID=.;OPOS=111783996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:156:156:1:2:152:154:0.987179:86:66:0:1:88:66:0:2 chr1 111833488 . C CCT 1967.92 PASS AF=0.984733;AO=123;DP=131;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0217837;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=292.503;QD=60.0892;RBI=0.0271391;REFB=-0.0534645;REVB=0.0161865;RO=2;SAF=50;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186211;STB=0.509089;STBP=0.147;TYPE=ins;VARB=0.000243977;OID=.;OPOS=111833489;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.984733:123:131:129:131:2:54:75:2:0:4:2:50:73:2:0 chr1 111833517 . G A 2178.41 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.361;QD=63.1423;RBI=0.0502792;REFB=0;REVB=0.0477405;RO=0;SAF=55;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59235e-05;OID=.;OPOS=111833517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:138:0:0:137:138:1:82:55:0:0:83:55:0:0 chr1 111858051 . G C 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00476934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.539;QD=15.1566;RBI=0.00768134;REFB=-0.00686717;REVB=-0.00602132;RO=32;SAF=14;SAR=11;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211437;STB=0.619547;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00711702;OID=.;OPOS=111858051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:11:14:11:21:11:14:11:21 chr1 111957097 . C G 1130.21 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.743;QD=60.2781;RBI=0.0581625;REFB=0;REVB=0.0515685;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474348;OID=.;OPOS=111957097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:33:41:0:0:34:41:0:0 chr1 111957245 . G A 398.06 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.00580481;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.9584;QD=18.0936;RBI=0.0507284;REFB=-0.035097;REVB=-0.0503952;RO=47;SAF=19;SAR=22;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077918;STB=0.543445;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0289979;OID=.;OPOS=111957245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:0.465909:22:19:18:29:22:19:18:29 chr1 111957311 . G C 766.21 PASS AF=1;AO=41;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488116;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.028;QD=63.8507;RBI=0.0195113;REFB=0;REVB=0.0188909;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47839e-05;OID=.;OPOS=111957311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:41:48:1:16:25:0:0:21:27:0:0 chr1 111957517 . T C 208.85 PASS AF=0.48;AO=19;DP=45;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0112986;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.613;QD=16.708;RBI=0.0195803;REFB=-0.0256532;REVB=-0.0159916;RO=26;SAF=13;SAR=6;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055622;STB=0.514274;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0318926;OID=.;OPOS=111957517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:50:26:26:19:24:0.48:6:13:19:7:7:17:19:7 chr1 111957688 . T C 408.35 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0117454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.584;QD=20.4174;RBI=0.0184704;REFB=-0.0349944;REVB=0.0142549;RO=39;SAF=18;SAR=23;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176331;STB=0.597536;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0227661;OID=.;OPOS=111957688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:23:18:25:14:23:18:25:14 chr1 111957693 . A G 1230.88 PASS AF=1;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772349;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.086;QD=61.5438;RBI=0.0136128;REFB=0;REVB=-0.0112096;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.47412e-05;OID=.;OPOS=111957693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:79:80:1:36:43:0:0:36:44:0:0 chr1 111968121 . C T 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.212;QD=57.2372;RBI=0.0251451;REFB=0;REVB=-0.00938649;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05371e-05;OID=.;OPOS=111968121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr1 111969294 . A G 911.76 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0212113;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=300.61;QD=55.2583;RBI=0.0235843;REFB=-0.0478921;REVB=-0.0103101;RO=2;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269723;STB=0.514281;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.000590501;OID=.;OPOS=111969294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:34:30:0:2:34:30:0:2 chr1 111969719 . A G 722.99 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.825;QD=56.7047;RBI=0.0586975;REFB=0;REVB=0.0501369;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91032e-05;OID=.;OPOS=111969719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:22:28:0:0:22:29:0:0 chr1 111991845 . C A 2102.74 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00560961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.433;QD=62.7683;RBI=0.0299484;REFB=0;REVB=0.0294183;RO=0;SAF=65;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0832e-05;OID=.;OPOS=111991845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:69:65:0:0:69:65:0:0 chr1 111992095 . C T 2115.1 PASS AF=0.954248;AO=145;DP=153;FAO=146;FDP=153;FR=.;FRO=7;FSAF=58;FSAR=88;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0285261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8414;QD=55.2969;RBI=0.0328581;REFB=-0.0298073;REVB=-0.0163068;RO=8;SAF=56;SAR=89;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377219;STB=0.50829;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00322406;OID=.;OPOS=111992095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:153:153:8:7:145:146:0.954248:89:56:6:2:88:58:4:3 chr1 111992516 . C T 435.25 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.000563599;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0042;QD=18.5211;RBI=0.00376468;REFB=-0.0161555;REVB=-0.00372225;RO=51;SAF=13;SAR=31;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165219;STB=0.585812;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.018205;OID=.;OPOS=111992516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:51:50:44:44:0.468085:31:13:23:28:31:13:22:28 chr1 112029193 . A G 632.23 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0797;QD=61.6812;RBI=0.0402651;REFB=0;REVB=0.0158889;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461244;OID=.;OPOS=112029193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr1 112042632 . A G 1026.38 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0973;QD=59.5003;RBI=0.0335259;REFB=0;REVB=0.0301376;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451533;OID=.;OPOS=112042632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0 chr1 112269872 . G A 595.18 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.248;QD=61.0442;RBI=0.0652737;REFB=0;REVB=0.0539011;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261078;OID=.;OPOS=112269872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:21:16:0:0:22:17:0:0 chr1 112533649 . C G 192.78 PASS AF=0.423077;AO=21;DP=51;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00543257;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.7156;QD=14.8293;RBI=0.0342153;REFB=0.0256115;REVB=-0.0337813;RO=30;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205561;STB=0.522367;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.032675;OID=.;OPOS=112533649;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:30:30:21:22:0.423077:13:8:12:18:14:8:12:18 chr1 112533728 . G A 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00179782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.037;QD=12.6374;RBI=0.00968999;REFB=-0.0337435;REVB=-0.00952176;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164083;STB=0.596268;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0467949;OID=.;OPOS=112533728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:6:7:8:13:6:7:8:13 chr1 112539061 . A G 398.71 PASS AF=0.526316;AO=39;DP=75;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.000262827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9189;QD=20.9846;RBI=0.0409642;REFB=-0.0155437;REVB=0.0409633;RO=36;SAF=28;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25509;STB=0.629146;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00909371;OID=.;OPOS=112539061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:36:36:39:40:0.526316:11:28:16:20:12:28:16:20 chr1 112999227 . G A 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3144;QD=56.9367;RBI=0.106363;REFB=0;REVB=-0.0971376;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00180116;OID=.;OPOS=112999227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0 chr1 113000565 . A G 885.35 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.374;QD=58.0558;RBI=0.0329503;REFB=0;REVB=0.0151418;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.95092e-05;OID=.;OPOS=113000565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr1 113000946 . GGTCA G 390.85 PASS AF=0.883721;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=43;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0299228;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=329.5;QD=36.3583;RBI=0.0324135;REFB=-0.0321191;REVB=0.0124602;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521186;STBP=0.453;TYPE=del;VARB=0.00418815;OID=.;OPOS=113000947;OREF=GTCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.883721:38:38:38:43:5:16:22:3:2:14:0:16:22:0:0 chr1 113063125 . A G 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158452;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.837;QD=59.6795;RBI=0.0222085;REFB=0;REVB=0.015561;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45259e-05;OID=.;OPOS=113063125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0 chr1 113083439 . C T 355.1 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.461;QD=54.6303;RBI=0.0304857;REFB=0;REVB=0.0069654;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108605;OID=.;OPOS=113083439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:14:10:0:0:14:12:0:0 chr1 113236681 . C T 1398.81 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000448428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.794;QD=61.4862;RBI=0.0146693;REFB=-0.065182;REVB=0.0146624;RO=1;SAF=55;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133487;STB=0.507041;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000178024;OID=.;OPOS=113236681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:35:55:0:1:35:55:0:1 chr1 113237171 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.864;QD=57.2024;RBI=0.0123331;REFB=0;REVB=0.0122377;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11907e-05;OID=.;OPOS=113237171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr1 113239382 . G A 1035.72 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.357;QD=58.3504;RBI=0.0513652;REFB=-0.0703886;REVB=0.0262123;RO=1;SAF=37;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126076;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000673435;OID=.;OPOS=113239382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:71:71:1:0:70:71:1:33:37:1:0:33:38:0:0 chr1 113241052 . T C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.509;QD=59.6795;RBI=0.0197205;REFB=0;REVB=0.00986828;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08942e-05;OID=.;OPOS=113241052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0 chr1 113243048 . C T 1571.63 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0647069;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8575;QD=64.148;RBI=0.077076;REFB=0;REVB=0.0418774;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000429297;OID=.;OPOS=113243048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:55:42:0:0:56:42:0:0 chr1 113255389 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000139176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.737;QD=57.0007;RBI=0.0014449;REFB=0;REVB=0.00143819;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26899e-06;OID=.;OPOS=113255389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr1 113456546 . A T 595.97 PASS AF=0.428571;AO=62;DP=146;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=-0.0164204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.544;QD=16.2167;RBI=0.0347807;REFB=-0.0188964;REVB=-0.0306605;RO=84;SAF=29;SAR=33;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209605;STB=0.515928;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0254813;OID=.;OPOS=113456546;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:84:84:62:63:0.428571:33:29:41:43:34:29:41:43 chr1 113657092 . A C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.531;QD=48.7373;RBI=0.0230841;REFB=0;REVB=0.0160385;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201946;OID=.;OPOS=113657092;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr1 114301335 . C T 2677.65 PASS AF=1;AO=172;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.387;QD=62.271;RBI=0.0454335;REFB=0;REVB=0.014588;RO=0;SAF=112;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41603e-05;OID=.;OPOS=114301335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:172:172:0:0:172:172:1:60:112:0:0:60:112:0:0 chr1 114377568 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.94;QD=55.0987;RBI=0.0628813;REFB=0;REVB=0.0234181;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425349;OID=.;OPOS=114377568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr1 114424601 . C T 438.07 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.012979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5143;QD=54.7592;RBI=0.0435215;REFB=-0.13888;REVB=0.0415412;RO=1;SAF=22;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207404;STB=0.511104;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00923086;OID=.;OPOS=114424601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:32:32:1:1:31:31:0.96875:9:22:1:0:9:22:1:0 chr1 114448389 . C T 2102.23 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.851;QD=62.7531;RBI=0.0196666;REFB=0;REVB=0.0149349;RO=0;SAF=69;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47458e-05;OID=.;OPOS=114448389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:65:69:0:0:65:69:0:0 chr1 114449662 . T C 1642.99 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026172;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.384;QD=60.2931;RBI=0.0279998;REFB=0;REVB=0.00995063;RO=0;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60582e-06;OID=.;OPOS=114449662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:56:53:0:0:56:53:0:0 chr1 114455784 . T G,TG 71.48 PASS AF=0,0.223684;AO=3,10;DP=78;FAO=0,17;FDP=76;FR=.;FRO=59;FSAF=0,13;FSAR=0,4;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=-0.0248051,-0.122712;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=171.471,18.6625;QD=3.76211;RBI=0.0268979,0.123026;REFB=-0.00219415,-0.0428141;REVB=-0.0104021,0.00878456;RO=64;SAF=3,7;SAR=0,3;SRF=25;SRR=39;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.482471,0.365662;STB=0.5,0.800255;STBP=1,0.006;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.130679;OID=.,.;OPOS=114455784,114455785;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:72:78:76:64:59:3,10:0,17:0,0.223684:0,3:3,7:25:39:0,4:0,13:21:38 chr1 114515717 . G A 56.86 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.00549394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.336;QD=11.9697;RBI=0.0116445;REFB=-0.00189616;REVB=-0.010267;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409453;STB=0.736382;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0020171;OID=.;OPOS=114515717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:1:10:4:4:1:10 chr1 114632115 . TAAAAAAA AAAAAATA,AAAAATAA,AAAATAAA,TAAAAAA,TAAAAAAC 327.83 PASS AF=0.0337079,0.146067,0,0.606742,0.0449438;AO=4,5,4,15,5;DP=71;FAO=3,13,0,54,4;FDP=89;FR=.;FRO=15;FSAF=3,13,0,26,1;FSAR=0,0,0,28,3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.125104,-0.120706,-0.0955437,-0.0404932,0.0489631;FXX=0.0111099;HRUN=6,6,6,7,7;LEN=7,6,5,1,1;MLLD=147.358,147.606,145.471,7.06489,14.246;QD=14.7338;RBI=0.126776,0.122892,0.0989178,0.125092,0.051245;REFB=0.00756735,0.010145,0.0126856,-0.0615818,-0.0236997;REVB=-0.0205209,-0.0230724,-0.0256152,-0.118357,-0.0151218;RO=21;SAF=4,5,4,0,2;SAR=0,0,0,15,3;SRF=11;SRR=10;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0.63611,0.675191,0.63611,-0.81675,-0.143796;STB=0.996678,0.998955,0.5,0.517754,0.635634;STBP=0.082,0,1,0.609,0.535;TYPE=mnp,mnp,mnp,del,snp;VARB=0.0946266,0.0843962,0,0.0718465,0.0914714;OID=.,.,.,.,.;OPOS=114632115,114632115,114632115,114632116,114632122;OREF=TAAAAAA,TAAAAA,TAAAA,A,A;OALT=AAAAAAT,AAAAAT,AAAAT,-,C;OMAPALT=AAAAAATA,AAAAATAA,AAAATAAA,TAAAAAA,TAAAAAAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/4:61:71:89:21:15:4,5,4,15,5:3,13,0,54,4:0.0337079,0.146067,0,0.606742,0.0449438:0,0,0,15,3:4,5,4,0,2:11:10:0,0,0,28,3:3,13,0,26,1:6:9 chr1 114632124 . CT TA 42.3 PASS AF=0.112245;AO=11;DP=98;FAO=11;FDP=98;FR=.;FRO=87;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=43;FSRR=44;FWDB=-0.0871552;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=43.8081;QD=1.72634;RBI=0.0894476;REFB=-0.0174751;REVB=-0.0201208;RO=82;SAF=8;SAR=3;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318082;STB=0.710386;STBP=0.173;TYPE=mnp;VARB=0.146134;OID=.;OPOS=114632124;OREF=CT;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:98:98:82:87:11:11:0.112245:3:8:38:44:3:8:43:44 chr1 114948281 . A G 362.46 PASS AF=0.536232;AO=36;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0077768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.693;QD=21.0122;RBI=0.00786219;REFB=-0.00995055;REVB=0.00115558;RO=32;SAF=18;SAR=18;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796797;STB=0.549622;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0102076;OID=.;OPOS=114948281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:36:37:0.536232:18:18:13:19:18:19:13:19 chr1 115119392 . T C 165.19 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0073311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.206;QD=16.1159;RBI=0.0109333;REFB=-0.00615458;REVB=-0.00811124;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242514;STB=0.638151;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00691083;OID=.;OPOS=115119392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:8:10:7:16:8:10:7:16 chr1 115537933 . A G 263.62 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0241718;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2113;QD=19.5272;RBI=0.045761;REFB=-0.0313367;REVB=0.0388561;RO=27;SAF=21;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325655;STB=0.673337;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0434683;OID=.;OPOS=115537933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:27:26:28:28:0.518519:7:21:11:16:7:21:11:15 chr1 115576023 . A G 1361.19 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121264;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2817;QD=62.5835;RBI=0.0130969;REFB=0;REVB=-0.00494777;RO=0;SAF=55;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92665e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.64362e-05;OID=.;OPOS=115576023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:32:55:0:0:32:55:0:0 chr1 115590998 . T C 1170.02 PASS AF=0.504348;AO=116;DP=230;FAO=116;FDP=230;FR=.;FRO=114;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=61;FSRR=53;FWDB=0.0311509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7658;QD=20.3481;RBI=0.0315244;REFB=-0.0131063;REVB=0.00483845;RO=114;SAF=65;SAR=51;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230811;STB=0.512663;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0118225;OID=.;OPOS=115590998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:114:114:116:116:0.504348:51:65:61:53:51:65:61:53 chr1 115591058 . T C 1407.57 PASS AF=0.486395;AO=135;DP=285;FAO=143;FDP=294;FR=.;FRO=151;FSAF=69;FSAR=74;FSRF=76;FSRR=75;FWDB=-0.00965759;FXX=0.00675653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.319;QD=19.1506;RBI=0.0264675;REFB=-0.00547984;REVB=0.0246426;RO=150;SAF=66;SAR=69;SRF=76;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169819;STB=0.510683;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00580563;OID=.;OPOS=115591058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:294:150:151:135:143:0.486395:69:66:76:74:74:69:76:75 chr1 115604798 . C T 255.65 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00391759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.11;QD=17.9402;RBI=0.00960786;REFB=-0.0131171;REVB=-0.00877288;RO=29;SAF=7;SAR=21;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107253;STB=0.560394;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0146649;OID=.;OPOS=115604798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:21:7:10:19:21:7:10:19 chr1 116149152 . G A 2015.64 PASS AF=0.984962;AO=130;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0240424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.598;QD=60.6208;RBI=0.0328463;REFB=-0.0878962;REVB=0.0223796;RO=1;SAF=66;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736821;STB=0.507575;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.000256116;OID=.;OPOS=116149152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:133:1:2:130:131:0.984962:64:66:0:1:65:66:0:2 chr1 116164595 . G A 481.75 PASS AF=0.468468;AO=51;DP=110;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0092461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.948;QD=17.3605;RBI=0.0102719;REFB=0.000365601;REVB=0.00447453;RO=58;SAF=17;SAR=34;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199741;STB=0.610643;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.000452948;OID=.;OPOS=116164595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:58:59:51:52:0.468468:34:17:31:27:35:17:31:28 chr1 116206423 . G A 759.23 PASS AF=0.619469;AO=70;DP=113;FAO=70;FDP=113;FR=.;FRO=43;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0280065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9367;QD=26.8753;RBI=0.028847;REFB=-0.0369928;REVB=-0.00691255;RO=41;SAF=37;SAR=33;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221957;STB=0.5113;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0222627;OID=.;OPOS=116206423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:41:43:70:70:0.619469:33:37:23:18:33:37:24:19 chr1 116234313 . A G 565.7 PASS AF=0.54902;AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0313325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.948;QD=22.1844;RBI=0.0326013;REFB=-0.00380985;REVB=-0.00900684;RO=46;SAF=22;SAR=34;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173149;STB=0.509499;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00321765;OID=.;OPOS=116234313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:46:46:56:56:0.54902:34:22:19:27:34:22:19:27 chr1 116234505 . A G 189.8 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0178398;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.369;QD=11.0029;RBI=0.0179196;REFB=-0.0399034;REVB=-0.00168897;RO=45;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187978;STB=0.608609;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0639052;OID=.;OPOS=116234505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:12:12:15:30:12:12:15:30 chr1 116239633 . T G 467.8 PASS AF=0.398496;AO=52;DP=131;FAO=53;FDP=133;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=0.0107958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3938;QD=14.0691;RBI=0.0289121;REFB=-0.0102408;REVB=0.0268209;RO=79;SAF=23;SAR=29;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405295;STB=0.520898;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0169609;OID=.;OPOS=116239633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:79:80:52:53:0.398496:29:23:32:47:30:23:32:48 chr1 116260532 . A T 371.0 PASS AF=0.415842;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00601728;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.492;QD=14.693;RBI=0.0124438;REFB=-0.00251099;REVB=0.0108922;RO=57;SAF=9;SAR=33;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293706;STB=0.660293;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00334747;OID=.;OPOS=116260532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:57:59:42:42:0.415842:33:9:26:31:33:9:26:33 chr1 116310967 . T C 440.34 PASS AF=0.461538;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.00823283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.752;QD=16.9361;RBI=0.00824912;REFB=-0.0141731;REVB=0.000518224;RO=56;SAF=33;SAR=15;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290206;STB=0.662093;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0115172;OID=.;OPOS=116310967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:56:48:48:0.461538:15:33:22:34:15:33:22:34 chr1 116382318 . A G 1472.48 PASS AF=1;AO=72;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4724;QD=63.3324;RBI=0.0232053;REFB=0;REVB=-0.0178297;RO=0;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.98353e-05;OID=.;OPOS=116382318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:72:93:1:45:27:0:0:46:47:0:0 chr1 116382511 . A T 1080.54 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6554;QD=60.03;RBI=0.0172938;REFB=0;REVB=0.00284329;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119597;OID=.;OPOS=116382511;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:35:37:0:0:35:37:0:0 chr1 116382778 . T C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6043;QD=58.2395;RBI=0.0710934;REFB=0;REVB=0.0379696;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00083897;OID=.;OPOS=116382778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr1 116383300 . T C 194.02 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0670047;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.507;QD=43.1152;RBI=0.0805603;REFB=-0.172671;REVB=-0.0447251;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.529377;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00261397;OID=.;OPOS=116383300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:18:18:0:1:17:17:0.944444:9:8:0:0:9:8:1:0 chr1 116383333 . C A 122.1 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0117431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.424;QD=25.7052;RBI=0.0196425;REFB=-0.0277636;REVB=-0.0157456;RO=6;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207161;STB=0.615828;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.010916;OID=.;OPOS=116383333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:7:6:5:1:7:6:5:1 chr1 116384090 . G A 1515.04 PASS AF=1;AO=72;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.52;QD=60.0016;RBI=0.0685264;REFB=0;REVB=0.0142154;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00238737;OID=.;OPOS=116384090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:72:101:1:44:28:0:0:46:55:0:0 chr1 116384580 . C T 361.36 PASS AF=0.366667;AO=44;DP=120;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=0.0104507;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2634;QD=12.0452;RBI=0.0154831;REFB=-0.0136776;REVB=0.0114241;RO=76;SAF=19;SAR=25;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057356;STB=0.532696;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0234099;OID=.;OPOS=116384580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:76:76:44:44:0.366667:25:19:29:47:25:19:29:47 chr1 116384773 . A G 215.48 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00635259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.017;QD=13.0593;RBI=0.0373468;REFB=-0.00110635;REVB=0.0368026;RO=40;SAF=18;SAR=8;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080274;STB=0.546138;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00124038;OID=.;OPOS=116384773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:8:18:25:15:8:18:25:15 chr1 116385122 . T C 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0525461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.313;QD=7.83729;RBI=0.060849;REFB=-0.0045506;REVB=-0.030684;RO=16;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.546603;STB=0.845135;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00623227;OID=.;OPOS=116385122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:1:6:6:10:1:6:6:10 chr1 116385171 . C T 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0107316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.833;QD=14.0442;RBI=0.0158246;REFB=-0.00625795;REVB=0.0116297;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165639;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0347826;OID=.;OPOS=116385171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:3:4:5:5:0.555556:3:2:2:1:3:2:2:2 chr1 116385288 . C T 78.58 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0221409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0104;QD=14.9672;RBI=0.0470573;REFB=-0.0361196;REVB=0.0415231;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13532;STB=0.578169;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0535082;OID=.;OPOS=116385288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:2:9:7:3:2:9 chr1 116385309 . C A 113.1 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0318494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4901;QD=17.3998;RBI=0.0325876;REFB=0.0225745;REVB=0.00689723;RO=13;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817639;STB=0.546694;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=-0.0142819;OID=.;OPOS=116385309;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:9:4:3:10:9:4:3:10 chr1 116385467 . A G 119.53 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0147266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.476;QD=13.6604;RBI=0.0337436;REFB=-0.00444319;REVB=-0.0303604;RO=20;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822685;STB=0.52937;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0067584;OID=.;OPOS=116385467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:21:14:14:0.4:8:6:7:13:8:6:8:13 chr1 116386105 . G A 455.09 PASS AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0265968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9494;QD=18.0234;RBI=0.0470105;REFB=-0.00917107;REVB=-0.0387633;RO=53;SAF=19;SAR=29;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018903;STB=0.510515;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00685063;OID=.;OPOS=116386105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:53:53:48:48:0.475248:29:19:22:31:29:19:22:31 chr1 116386139 . G A 1877.57 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7508;QD=61.0591;RBI=0.047213;REFB=0;REVB=0.0335599;RO=0;SAF=55;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002427;OID=.;OPOS=116386139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:123:0:0:117:123:1:62:55:0:0:67:56:0:0 chr1 116386243 . C T 780.88 PASS AF=0.419048;AO=87;DP=210;FAO=88;FDP=210;FR=.;FRO=122;FSAF=36;FSAR=52;FSRF=54;FSRR=68;FWDB=-0.00611564;FXX=0.00943352;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.604;QD=14.874;RBI=0.0204583;REFB=0.000770985;REVB=-0.0195228;RO=122;SAF=35;SAR=52;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520065;STB=0.519995;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00812854;OID=.;OPOS=116386243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:122:122:87:88:0.419048:52:35:55:67:52:36:54:68 chr1 116386244 . C T 1318.97 PASS AF=0.582938;AO=123;DP=211;FAO=123;FDP=211;FR=.;FRO=88;FSAF=55;FSAR=68;FSRF=35;FSRR=53;FWDB=-0.00467451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.867;QD=25.0041;RBI=0.00648272;REFB=-0.0174999;REVB=0.00449161;RO=88;SAF=55;SAR=68;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386293;STB=0.520936;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00254547;OID=.;OPOS=116386244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:88:88:123:123:0.582938:68:55:35:53:68:55:35:53 chr1 116569530 . G C 2408.94 PASS AF=1;AO=149;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000985942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4256;QD=64.2384;RBI=0.0187701;REFB=0;REVB=0.0187441;RO=0;SAF=72;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80287e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94676e-05;OID=.;OPOS=116569530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:149:150:1:77:72:0:0:78:72:0:0 chr1 116610388 . A G 1026.35 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0022686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7166;QD=59.4986;RBI=0.0123701;REFB=0;REVB=0.0121603;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73516e-05;OID=.;OPOS=116610388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0 chr1 116931628 . C A 409.74 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0024388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0905;QD=20.7464;RBI=0.0299808;REFB=-0.00248014;REVB=-0.0298814;RO=37;SAF=19;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502576;STB=0.533359;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0012761;OID=.;OPOS=116931628;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:37:38:41:41:0.518987:22:19:15:22:22:19:15:23 chr1 116947051 . G A 1036.32 PASS AF=0.457627;AO=107;DP=235;FAO=108;FDP=236;FR=.;FRO=128;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=73;FWDB=0.0199239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2173;QD=17.5648;RBI=0.0206793;REFB=-0.0121705;REVB=-0.00553819;RO=128;SAF=49;SAR=58;SRF=55;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280747;STB=0.513168;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0127018;OID=.;OPOS=116947051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:236:128:128:107:108:0.457627:58:49:55:73:59:49:55:73 chr1 116952787 . C T 497.31 PASS AF=0.354651;AO=61;DP=172;FAO=61;FDP=172;FR=.;FRO=111;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=48;FSRR=63;FWDB=-0.0846741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2385;QD=11.5653;RBI=0.0857016;REFB=-0.00342275;REVB=-0.0132311;RO=111;SAF=28;SAR=33;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303611;STB=0.517315;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00623224;OID=.;OPOS=116952787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:111:111:61:61:0.354651:33:28:48:63:33:28:48:63 chr1 116995178 . C T 342.73 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0170158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.041;QD=21.4209;RBI=0.054058;REFB=-0.0109335;REVB=-0.0513102;RO=29;SAF=17;SAR=18;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258313;STB=0.514278;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.00510849;OID=.;OPOS=116995178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:18:17:15:14:18:17:15:14 chr1 116995182 . A T 327.53 PASS AF=0.523077;AO=35;DP=66;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00531817;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6051;QD=20.1558;RBI=0.0165646;REFB=-0.00648228;REVB=0.0156877;RO=31;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257704;STB=0.521726;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00822361;OID=.;OPOS=116995182;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:31:31:35:34:0.523077:18:17:16:15:18:16:16:15 chr1 117122288 . G C 115.11 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0108294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0949;QD=10.7079;RBI=0.0110087;REFB=-0.0175188;REVB=0.00197859;RO=29;SAF=2;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.608154;STB=0.862236;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0458523;OID=.;OPOS=117122288;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:12:2:20:9:12:2:20:9 chr1 117142641 . G A 51.59 PASS AF=0.111111;AO=12;DP=108;FAO=12;FDP=108;FR=.;FRO=96;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=0.0011297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.303;QD=1.91069;RBI=0.0203708;REFB=-0.00108611;REVB=-0.0203394;RO=96;SAF=6;SAR=6;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113876;STB=0.583198;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.010272;OID=.;OPOS=117142641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:108:108:96:96:12:12:0.111111:6:6:39:57:6:6:39:57 chr1 117142700 . C A 193.74 PASS AF=0.204969;AO=33;DP=161;FAO=33;FDP=161;FR=.;FRO=128;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=53;FSRR=75;FWDB=-0.00982804;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.757;QD=4.81352;RBI=0.018489;REFB=-0.00727601;REVB=0.0156605;RO=128;SAF=19;SAR=14;SRF=53;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204088;STB=0.626454;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0306978;OID=.;OPOS=117142700;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:128:128:33:33:0.204969:14:19:53:75:14:19:53:75 chr1 117142736 . A G 248.87 PASS AF=0.236364;AO=39;DP=165;FAO=39;FDP=165;FR=.;FRO=126;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=52;FSRR=74;FWDB=-0.000502779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.601;QD=6.03311;RBI=0.0144486;REFB=-0.00397742;REVB=-0.0144398;RO=125;SAF=22;SAR=17;SRF=51;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194474;STB=0.614053;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00939974;OID=.;OPOS=117142736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:125:126:39:39:0.236364:17:22:51:74:17:22:52:74 chr1 117142855 . C T 485.27 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0552374;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2029;QD=20.4325;RBI=0.0553411;REFB=-0.0275323;REVB=-0.0033872;RO=35;SAF=29;SAR=18;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357053;STB=0.621932;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0488359;OID=.;OPOS=117142855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:35:48:47:47:0.494737:18:29:5:30:18:29:18:30 chr1 117142868 . CA TG 418.32 PASS AF=0.464286;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.000794353;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=2;MLLD=163.128;QD=19.9202;RBI=0.00420965;REFB=-0.0179738;REVB=0.00413403;RO=39;SAF=27;SAR=12;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325842;STB=0.681459;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.0320862;OID=.;OPOS=117142868;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:41:39:39:0.464286:12:27:13:26:12:27:14:27 chr1 117150928 . C T 229.96 PASS AF=0.363636;AO=26;DP=75;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0392242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.907;QD=11.946;RBI=0.0400819;REFB=-0.0280136;REVB=-0.00824736;RO=48;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286342;STB=0.683418;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0485072;OID=.;OPOS=117150928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:48:49:26:28:0.363636:10:16:17:31:10:18:17:32 chr1 117150933 . G A 219.85 PASS AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0292519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.058;QD=11.8839;RBI=0.0325571;REFB=-0.0221419;REVB=-0.014293;RO=46;SAF=17;SAR=10;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323533;STB=0.678548;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0173236;OID=.;OPOS=117150933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:46:47:27:27:0.364865:10:17:15:31:10:17:16:31 chr1 117156459 . C T 214.32 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0398332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7482;QD=12.7952;RBI=0.0501136;REFB=0.00388238;REVB=0.0304088;RO=41;SAF=18;SAR=8;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125734;STB=0.572461;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00605447;OID=.;OPOS=117156459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:8:18:24:17:8:18:24:17 chr1 117156490 . T C 180.65 PASS AF=0.307692;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0172082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9862;QD=9.26425;RBI=0.0606097;REFB=-0.00404591;REVB=-0.0581155;RO=53;SAF=17;SAR=7;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18159;STB=0.615553;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0200747;OID=.;OPOS=117156490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:53:54:24:24:0.307692:7:17:30:23:7:17:30:24 chr1 117156584 . TG CA 32.4 PASS AF=0.0963855;AO=7;DP=83;FAO=8;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=75;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.0194669;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=180.621;QD=1.56145;RBI=0.0709652;REFB=-0.00650209;REVB=-0.0682429;RO=50;SAF=3;SAR=4;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272752;STB=0.584401;STBP=0.662;TYPE=mnp;VARB=0.0777937;OID=.;OPOS=117156584;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:83:83:50:75:7:8:0.0963855:4:3:33:17:5:3:35:40 chr1 117487710 . AT GA 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-7.14026e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=226.744;QD=7.83719;RBI=0.002462;REFB=-0.00956921;REVB=-0.00246097;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342331;STB=0.731059;STBP=0.193;TYPE=mnp;VARB=0.0140003;OID=.;OPOS=117487710;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:15:16:7:7:0.304348:2:5:6:9:2:5:6:10 chr1 117503940 . G A 551.14 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0114851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.069;QD=20.7977;RBI=0.0115009;REFB=-0.00135134;REVB=0.000602135;RO=49;SAF=34;SAR=22;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10177;STB=0.561188;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00111042;OID=.;OPOS=117503940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:49:50:56:56:0.528302:22:34:24:25:22:34:24:26 chr1 117529458 . G A 517.21 PASS AF=0.5;AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0123444;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.445;QD=19.1559;RBI=0.0142757;REFB=-0.0153028;REVB=-0.00717008;RO=54;SAF=33;SAR=21;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175315;STB=0.509695;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.019034;OID=.;OPOS=117529458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:54:54:0.5:21:33:32:22:21:33:32:22 chr1 117529499 . C T 561.7 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.000924862;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.639;QD=19.2034;RBI=0.0167194;REFB=-0.0144768;REVB=-0.0166938;RO=59;SAF=37;SAR=21;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059683;STB=0.541899;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0125564;OID=.;OPOS=117529499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:59:59:58:58:0.495726:21:37:34:25:21:37:33:26 chr1 117530273 . A G 399.56 PASS AF=0.655172;AO=36;DP=57;FAO=38;FDP=58;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00121967;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.598;QD=27.5561;RBI=0.0307912;REFB=0.0168432;REVB=-0.030767;RO=21;SAF=17;SAR=19;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347706;STB=0.5355;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=-0.00571068;OID=.;OPOS=117530273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:21:20:36:38:0.655172:19:17:11:10:21:17:11:9 chr1 117559726 . A G 225.2 PASS AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00557138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.249;QD=15.2681;RBI=0.010985;REFB=-0.00217787;REVB=-0.00946727;RO=33;SAF=17;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143136;STB=0.581331;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00219577;OID=.;OPOS=117559726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:9:17:17:16:9:17:17:16 chr1 117560818 . A G 331.43 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00706574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9138;QD=18.6723;RBI=0.0156915;REFB=-0.0136395;REVB=0.0140107;RO=35;SAF=20;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263067;STB=0.520649;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0113038;OID=.;OPOS=117560818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:36:35:35:0.492958:15:20:21:14:15:20:22:14 chr1 117602960 . C A 1299.49 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7494;QD=61.8804;RBI=0.065506;REFB=0;REVB=0.0327243;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000613352;OID=.;OPOS=117602960;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:36:47:0:0:37:47:0:0 chr1 117617705 . A G 575.75 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000146871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0812;QD=60.6057;RBI=0.0301004;REFB=0;REVB=0.0301001;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492503;OID=.;OPOS=117617705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr1 117618067 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.666;QD=57.2021;RBI=0.0191357;REFB=0;REVB=0.00118774;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012091;OID=.;OPOS=117618067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0 chr1 117654858 . G A 257.69 PASS AF=0.434783;AO=28;DP=68;FAO=30;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00385256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.915;QD=14.9387;RBI=0.0905975;REFB=0.0146101;REVB=0.0905155;RO=32;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296056;STB=0.565175;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=-0.0089516;OID=.;OPOS=117654858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:32:39:28:30:0.434783:14:14:15:17:15:15:15:24 chr1 117656088 . A G 226.42 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0144154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.01;QD=17.0881;RBI=0.0158461;REFB=-0.0185036;REVB=-0.00657974;RO=28;SAF=10;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953341;STB=0.553803;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0221064;OID=.;OPOS=117656088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:15:10:14:14:15:10:14:14 chr1 117715026 . C T 181.29 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00191332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.611;QD=16.4805;RBI=0.0168122;REFB=-0.0128182;REVB=-0.0167029;RO=25;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173553;STB=0.599891;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0137932;OID=.;OPOS=117715026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:13:6:12:13:13:6:12:13 chr1 117715817 . C A 379.62 PASS AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0171088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.187;QD=16.6864;RBI=0.0171268;REFB=-0.00735818;REVB=-0.000784707;RO=51;SAF=17;SAR=23;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461339;STB=0.525921;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.012246;OID=.;OPOS=117715817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:23:17:24:27:23:17:24:27 chr1 117785931 . G A 580.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130443;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.745;QD=61.1368;RBI=0.0131455;REFB=0;REVB=0.00162774;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454814;OID=.;OPOS=117785931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr1 117785979 . T C 670.03 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000951365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2664;QD=62.3286;RBI=0.020703;REFB=0;REVB=-0.0206811;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000218938;OID=.;OPOS=117785979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr1 118065841 . A G 796.3 PASS AF=0.517007;AO=76;DP=147;FAO=76;FDP=147;FR=.;FRO=71;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.0062081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.518;QD=21.6679;RBI=0.0202302;REFB=-0.0190197;REVB=-0.0192541;RO=69;SAF=43;SAR=33;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150707;STB=0.582406;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0184663;OID=.;OPOS=118065841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:69:71:76:76:0.517007:33:43:27:42:33:43:28:43 chr1 118166853 . C A 109.02 PASS AF=0.341463;AO=13;DP=39;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0121953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.31;QD=10.6365;RBI=0.0121986;REFB=-0.00491964;REVB=0.000281493;RO=26;SAF=2;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449471;STB=0.792915;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00701837;OID=.;OPOS=118166853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:26:27:13:14:0.341463:11:2:13:13:12:2:14:13 chr1 118166877 . C T 143.34 PASS AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0148159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.102;QD=9.88536;RBI=0.02763;REFB=-0.00418977;REVB=-0.0233217;RO=39;SAF=4;SAR=15;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447296;STB=0.765306;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0141152;OID=.;OPOS=118166877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:15:4:23:16:15:4:23:16 chr1 118167199 . A G 405.47 PASS AF=0.5;AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00229526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.666;QD=19.779;RBI=0.0362508;REFB=-0.0084647;REVB=0.036178;RO=41;SAF=13;SAR=27;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222849;STB=0.613203;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00921744;OID=.;OPOS=118167199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:41:41:40:41:0.5:27:13:23:18:27:14:23:18 chr1 118167653 . C T 216.62 PASS AF=0.461538;AO=22;DP=49;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0212324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.749;QD=16.6631;RBI=0.0241937;REFB=-0.0112066;REVB=-0.0115983;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435255;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0140762;OID=.;OPOS=118167653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:52:26:28:22:24:0.461538:12:10:13:13:12:12:14:14 chr1 118530796 . C T 390.4 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00216776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.518;QD=19.0438;RBI=0.012068;REFB=-0.00214164;REVB=-0.0118717;RO=42;SAF=23;SAR=17;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113196;STB=0.563004;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00214278;OID=.;OPOS=118530796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:17:23:19:23:17:23:19:23 chr1 118537074 . A G 447.79 PASS AF=0.36;AO=51;DP=148;FAO=54;FDP=150;FR=.;FRO=96;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=59;FWDB=-0.00270326;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.942;QD=11.941;RBI=0.00296468;REFB=-0.0111557;REVB=-0.00121725;RO=92;SAF=18;SAR=33;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593184;STB=0.510265;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.019673;OID=.;OPOS=118537074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:92:96:51:54:0.36:33:18:37:55:34:20:37:59 chr1 118624123 . C T 359.9 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0338752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.108;QD=17.5563;RBI=0.0345796;REFB=-0.00522001;REVB=-0.0069439;RO=44;SAF=25;SAR=13;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694399;STB=0.538922;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00737242;OID=.;OPOS=118624123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:0.463415:13:25:26:18:13:25:26:18 chr1 118629599 . G A 245.28 PASS AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00209622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.492;QD=13.2582;RBI=0.0159724;REFB=-0.0151011;REVB=-0.0158343;RO=45;SAF=9;SAR=20;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154582;STB=0.588769;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0276519;OID=.;OPOS=118629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:20:9:20:25:20:9:20:25 chr1 118644430 . A G 524.17 PASS AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00513895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.508;QD=21.3947;RBI=0.0359304;REFB=-0.0023951;REVB=-0.035561;RO=48;SAF=24;SAR=26;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177389;STB=0.5098;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0016986;OID=.;OPOS=118644430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:26:24:24:24:26:24:24:24 chr1 118657952 . C T 780.86 PASS AF=0.503145;AO=80;DP=159;FAO=80;FDP=159;FR=.;FRO=79;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0214624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.491;QD=19.6441;RBI=0.0225206;REFB=-0.0107885;REVB=-0.0068222;RO=79;SAF=23;SAR=57;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181485;STB=0.60029;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00905127;OID=.;OPOS=118657952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:79:79:80:80:0.503145:57:23:37:42:57:23:37:42 chr1 118693217 . T C 261.28 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.000866427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.149;QD=17.133;RBI=0.0186081;REFB=-0.0220448;REVB=0.0185879;RO=32;SAF=16;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101874;STB=0.505717;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0243752;OID=.;OPOS=118693217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:13:16:18:14:13:16:18:14 chr1 118807059 . T C 1535.05 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163089;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.728;QD=63.9606;RBI=0.0212543;REFB=0;REVB=0.0136295;RO=0;SAF=52;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.72787e-05;OID=.;OPOS=118807059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:44:52:0:0:44:52:0:0 chr1 119874055 . A C 557.98 PASS AF=0.491525;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.00229686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.288;QD=18.9146;RBI=0.00423768;REFB=-0.00589964;REVB=0.00356123;RO=60;SAF=27;SAR=31;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077565;STB=0.542892;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00696816;OID=.;OPOS=119874055;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:60:60:58:58:0.491525:31:27:33:27:31:27:33:27 chr1 120057158 . C T 1377.52 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.558;QD=62.6146;RBI=0.0270008;REFB=0;REVB=-0.0240628;RO=0;SAF=30;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.85931e-05;OID=.;OPOS=120057158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:58:30:0:0:58:30:0:0 chr1 120057246 . C A 538.04 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159969;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.6257;QD=59.7819;RBI=0.0704577;REFB=0;REVB=-0.0704395;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00129701;OID=.;OPOS=120057246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr1 120164738 . C T 1742.87 PASS AF=0.983333;AO=117;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0302425;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.5381;QD=58.0957;RBI=0.0779034;REFB=-0.099964;REVB=0.0717937;RO=3;SAF=43;SAR=74;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188626;STB=0.506578;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00310593;OID=.;OPOS=120164738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:120:120:3:2:117:118:0.983333:74:43:0:3:75:43:0:2 chr1 120165826 . C T 87.27 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.255795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.179;QD=38.7879;RBI=0.272873;REFB=0;REVB=0.0950209;RO=1;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0070279;OID=.;OPOS=120165826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:1:0:8:9:1:6:2:1:0:6:3:0:0 chr1 120166681 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0012366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.768;QD=51.9167;RBI=0.0234729;REFB=0;REVB=0.0234403;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156269;OID=.;OPOS=120166681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0 chr1 120267544 . C T 333.12 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.0155329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5027;QD=16.4503;RBI=0.0443755;REFB=-0.0286121;REVB=-0.0415682;RO=45;SAF=7;SAR=29;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161719;STB=0.591781;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.033441;OID=.;OPOS=120267544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:29:7:14:31:29:7:14:31 chr1 120267597 . GC G 90.9 PASS AF=0.363636;AO=17;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.244869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.5134;QD=8.26362;RBI=0.257935;REFB=0.00471657;REVB=-0.081053;RO=26;SAF=4;SAR=13;SRF=8;SRR=18;SSEN=0.298411;SSEP=0;SSSB=-0.0976985;STB=0.618883;STBP=0.303;TYPE=del;VARB=-0.0359711;OID=.;OPOS=120267598;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636:17:44:16:44:28:3:13:9:19:90:26:4:13:8:18 chr1 120285546 . G A 507.62 PASS AF=0.387097;AO=60;DP=155;FAO=60;FDP=155;FR=.;FRO=95;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=-0.015966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.361;QD=13.0998;RBI=0.0242019;REFB=-0.00823234;REVB=-0.0181884;RO=94;SAF=32;SAR=28;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215845;STB=0.515146;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0125744;OID=.;OPOS=120285546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:94:95:60:60:0.387097:28:32:52:42:28:32:53:42 chr1 120291724 . G A 277.59 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.00102676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.296;QD=20.5623;RBI=0.0259738;REFB=-0.00339663;REVB=0.0259535;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205139;STB=0.613328;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00171677;OID=.;OPOS=120291724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:15:14:6:19:15:14:6:19 chr1 120378678 . C T 1785.77 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7293;QD=61.0518;RBI=0.0359847;REFB=0;REVB=0.00599729;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000178434;OID=.;OPOS=120378678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:65:52:0:0:65:52:0:0 chr1 120384205 . A G 1553.84 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277452;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7994;QD=64.0759;RBI=0.0409306;REFB=0;REVB=-0.0300918;RO=0;SAF=63;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.76468e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57904e-05;OID=.;OPOS=120384205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:34:63:0:0:34:63:0:0 chr1 120387120 . G A 1913.93 PASS AF=0.976744;AO=125;DP=129;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=83;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.100213;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4126;QD=59.3467;RBI=0.102185;REFB=-0.0740262;REVB=0.019981;RO=3;SAF=42;SAR=83;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163955;STB=0.508369;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00359375;OID=.;OPOS=120387120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:129:129:3:3:125:126:0.976744:83:42:2:1:83:43:2:1 chr1 120539331 . C T 721.4 PASS AF=0.455621;AO=77;DP=169;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=38;FWDB=-0.0147325;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.135;QD=17.0746;RBI=0.0147445;REFB=-0.0144402;REVB=-0.000593475;RO=91;SAF=49;SAR=28;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055855;STB=0.528597;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0157768;OID=.;OPOS=120539331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:91:92:77:77:0.455621:28:49:53:38:28:49:54:38 chr1 120611554 . TT CG 68.92 PASS AF=0.217391;AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0101939;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=293.257;QD=5.99321;RBI=0.0211008;REFB=-0.00382058;REVB=-0.018475;RO=36;SAF=2;SAR=8;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415675;STB=0.770076;STBP=0.081;TYPE=mnp;VARB=0.0179079;OID=.;OPOS=120611554;OREF=TT;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:46:46:36:36:10:10:0.217391:8:2:19:17:8:2:19:17 chr1 121116688 . A G 1073.32 PASS AF=0.831683;AO=83;DP=101;FAO=84;FDP=101;FR=.;FRO=17;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0322729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.596;QD=42.5078;RBI=0.0520863;REFB=-0.0595276;REVB=0.0408833;RO=16;SAF=55;SAR=28;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127319;STB=0.512287;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0124072;OID=.;OPOS=121116688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:101:101:16:17:83:84:0.831683:28:55:10:6:29:55:10:7 chr1 121116733 . A G 67.75 PASS AF=0.128205;AO=15;DP=117;FAO=15;FDP=117;FR=.;FRO=102;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=63;FSRR=39;FWDB=0.00839428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.15;QD=2.31632;RBI=0.00882617;REFB=0.000984916;REVB=-0.00272715;RO=101;SAF=10;SAR=5;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706436;STB=0.54652;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.00667377;OID=.;OPOS=121116733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:117:117:101:102:15:15:0.128205:5:10:62:39:5:10:63:39 chr1 142667306 . C T 185.16 PASS AF=0.642857;AO=17;DP=27;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.108502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.971;QD=26.4514;RBI=0.109335;REFB=-0.0379726;REVB=-0.0134681;RO=9;SAF=4;SAR=13;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161904;STB=0.551827;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00956463;OID=.;OPOS=142667306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:27:28:9:10:17:18:0.642857:13:4:4:5:13:5:4:6 chr1 143879823 . T G 37.61 PASS AF=0.0734463;AO=13;DP=177;FAO=13;FDP=177;FR=.;FRO=164;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=99;FSRR=65;FWDB=-0.0150948;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.815;QD=0.850037;RBI=0.0212165;REFB=-0.000648245;REVB=-0.0149093;RO=157;SAF=7;SAR=6;SRF=93;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613256;STB=0.56125;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0246816;OID=.;OPOS=143879823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:177:177:157:164:13:13:0.0734463:6:7:93:64:6:7:99:65 chr1 143879873 . G A 55.58 PASS AF=0.0941176;AO=15;DP=170;FAO=16;FDP=170;FR=.;FRO=154;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=85;FSRR=69;FWDB=-0.0135498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.032;QD=1.30783;RBI=0.0141227;REFB=0.000865323;REVB=-0.00398168;RO=153;SAF=6;SAR=9;SRF=84;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172335;STB=0.602494;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.00641348;OID=.;OPOS=143879873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:170:170:153:154:15:16:0.0941176:9:6:84:69:9:7:85:69 chr1 143879895 . G A 56.28 PASS AF=0.1;AO=15;DP=150;FAO=15;FDP=150;FR=.;FRO=135;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=73;FSRR=62;FWDB=-0.0126364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8752;QD=1.50076;RBI=0.0306984;REFB=-0.00399656;REVB=-0.027977;RO=134;SAF=6;SAR=9;SRF=73;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171749;STB=0.625165;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0661536;OID=.;OPOS=143879895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:150:150:134:135:15:15:0.1:9:6:73:61:9:6:73:62 chr1 144014051 . G A 285.78 PASS AF=0.280576;AO=39;DP=139;FAO=39;FDP=139;FR=.;FRO=100;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=0.0510227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.838;QD=8.22373;RBI=0.0510421;REFB=-0.000920514;REVB=0.00140756;RO=100;SAF=22;SAR=17;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197651;STB=0.61639;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00410562;OID=.;OPOS=144014051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:100:100:39:39:0.280576:17:22:40:60:17:22:40:60 chr1 144014068 . T C 766.21 PASS AF=0.646465;AO=64;DP=100;FAO=64;FDP=99;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00118385;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.835;QD=30.9578;RBI=0.0192029;REFB=-0.0154506;REVB=0.0191664;RO=35;SAF=29;SAR=35;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264572;STB=0.501432;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00706541;OID=.;OPOS=144014068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:35:35:64:64:0.646465:35:29:16:19:35:29:16:19 chr1 144534038 . A G 187.65 PASS AF=0.171429;AO=36;DP=210;FAO=36;FDP=210;FR=.;FRO=174;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=108;FSRR=66;FWDB=-0.0289415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.555;QD=3.57432;RBI=0.0355465;REFB=-0.00763545;REVB=-0.0206383;RO=174;SAF=25;SAR=11;SRF=108;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105026;STB=0.568143;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0499422;OID=.;OPOS=144534038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:174:174:36:36:0.171429:11:25:108:66:11:25:108:66 chr1 144534045 . T C 1732.98 PASS AF=0.647826;AO=148;DP=230;FAO=149;FDP=230;FR=.;FRO=81;FSAF=105;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.00512766;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.309;QD=30.1388;RBI=0.0139213;REFB=-0.0346056;REVB=0.0129425;RO=81;SAF=104;SAR=44;SRF=44;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118672;STB=0.564695;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0132324;OID=.;OPOS=144534045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:81:81:148:149:0.647826:44:104:44:37:44:105:44:37 chr1 144534076 . G A 414.42 PASS AF=0.212766;AO=68;DP=334;FAO=70;FDP=329;FR=.;FRO=259;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=156;FSRR=103;FWDB=-0.000286909;FXX=0.0149696;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.068;QD=5.03856;RBI=0.00394166;REFB=-0.00385727;REVB=-0.0039312;RO=254;SAF=41;SAR=27;SRF=156;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151464;STB=0.513524;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0118983;OID=.;OPOS=144534076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:329:254:259:68:70:0.212766:27:41:156:98:29:41:156:103 chr1 144534082 . TC CT,TT 4453.48 PASS AF=0.22191,0.702247;AO=79,233;DP=363;FAO=79,250;FDP=356;FR=.;FRO=27;FSAF=56,138;FSAR=23,112;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0036968,-0.00171646;FXX=0.0192832;HRUN=4,2;LEN=2,1;MLLD=222.312,50.7527;QD=50.0391;RBI=0.0263552,0.0125541;REFB=0.0122247,0.0057193;REVB=-0.0260947,-0.0124363;RO=29;SAF=56,136;SAR=23,97;SRF=14;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.12886,0.0217097;STB=0.55597,0.503297;STBP=0.076,0.766;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00674948,0.00229802;OID=.,.;OPOS=144534082,144534083;OREF=TC,C;OALT=CT,T;OMAPALT=CT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:363:356:29:27:79,233:79,250:0.22191,0.702247:23,97:56,136:14:15:23,112:56,138:14:13 chr1 144534084 . C G 32.73 PASS AF=0.064;AO=16;DP=373;FAO=24;FDP=375;FR=.;FRO=351;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=202;FSRR=149;FWDB=-0.00896193;FXX=0.0131575;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.647;QD=0.349087;RBI=0.0256003;REFB=-0.000414156;REVB=-0.0239804;RO=349;SAF=7;SAR=9;SRF=198;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118957;STB=0.60835;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.131321;OID=.;OPOS=144534084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:373:375:349:351:16:24:0.064:9:7:198:151:13:11:202:149 chr1 144534092 . G A 3448.08 PASS AF=0.684964;AO=287;DP=420;FAO=287;FDP=419;FR=.;FRO=132;FSAF=169;FSAR=118;FSRF=64;FSRR=68;FWDB=0.00585282;FXX=0.00475048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.356;QD=32.9173;RBI=0.00661676;REFB=-0.0165257;REVB=-0.00308641;RO=105;SAF=169;SAR=118;SRF=56;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286734;STB=0.533428;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0168443;OID=.;OPOS=144534092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:420:419:105:132:287:287:0.684964:118:169:56:49:118:169:64:68 chr1 144534096 . T C 3600.74 PASS AF=0.674058;AO=304;DP=452;FAO=304;FDP=451;FR=.;FRO=147;FSAF=175;FSAR=129;FSRF=69;FSRR=78;FWDB=-0.00848753;FXX=0.00221234;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.406;QD=31.9356;RBI=0.00940567;REFB=-0.0136392;REVB=-0.00405319;RO=140;SAF=175;SAR=129;SRF=66;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622658;STB=0.535071;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00999556;OID=.;OPOS=144534096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:451:140:147:304:304:0.674058:129:175:66:74:129:175:69:78 chr1 144534186 . TCG T 683.12 PASS AF=0.209964;AO=106;DP=571;FAO=118;FDP=562;FR=.;FRO=444;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=190;FSRR=254;FWDB=-0.00748883;FXX=0.0157615;HRUN=1;LEN=2;MLLD=198.011;QD=4.86203;RBI=0.0182295;REFB=-0.00500565;REVB=-0.0166203;RO=414;SAF=51;SAR=55;SRF=183;SRR=231;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508415;STB=0.537083;STBP=0.374;TYPE=del;VARB=0.0213007;OID=.;OPOS=144534187;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.209964:106:571:118:562:444:56:62:190:254:99:414:51:55:183:231 chr1 144534195 . C T 136.76 PASS AF=0.0884477;AO=48;DP=553;FAO=49;FDP=554;FR=.;FRO=505;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=220;FSRR=285;FWDB=-0.00487677;FXX=0.00180177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.778;QD=0.987439;RBI=0.00999003;REFB=-0.000647285;REVB=-0.00871883;RO=498;SAF=19;SAR=29;SRF=221;SRR=277;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582556;STB=0.506566;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.00730302;OID=.;OPOS=144534195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:553:554:498:505:48:49:0.0884477:29:19:221:277:28:21:220:285 chr1 144617251 . A G 388.95 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00908003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.021;QD=18.7447;RBI=0.038362;REFB=-0.0146729;REVB=-0.0372719;RO=42;SAF=23;SAR=17;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00335948;STB=0.503391;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0190034;OID=.;OPOS=144617251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:43:40:40:0.481928:17:23:24:18:17:23:25:18 chr1 144618123 . C T 109.26 PASS AF=0.176991;AO=20;DP=113;FAO=20;FDP=113;FR=.;FRO=93;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=54;FWDB=-0.00277948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.187;QD=3.86776;RBI=0.0164755;REFB=-0.00882061;REVB=-0.0162394;RO=92;SAF=6;SAR=14;SRF=38;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155287;STB=0.606825;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0520098;OID=.;OPOS=144618123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:92:93:20:20:0.176991:14:6:38:54:14:6:39:54 chr1 144618144 . A G 1087.18 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.113;QD=57.9827;RBI=0.0348404;REFB=-0.0955624;REVB=0.0176962;RO=0;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000790321;OID=.;OPOS=144618144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:74:75:0:0:72:75:1:43:29:0:0:46:29:0:0 chr1 144618157 . T A 94.06 PASS AF=0.25;AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0745647;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.524;QD=7.2354;RBI=0.0760582;REFB=-0.00804585;REVB=0.0149984;RO=38;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472702;STB=0.543555;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0238315;OID=.;OPOS=144618157;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:52:52:38:39:13:13:0.25:9:4:13:25:9:4:14:25 chr1 144619346 . G A 186.74 PASS AF=0.256881;AO=26;DP=109;FAO=28;FDP=109;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=-0.00859302;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.462;QD=6.8527;RBI=0.0146425;REFB=-0.0091635;REVB=-0.0118559;RO=74;SAF=13;SAR=13;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331754;STB=0.541255;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0256909;OID=.;OPOS=144619346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:74:81:26:28:0.256881:13:13:35:39:14:14:36:45 chr1 144619354 . C T 295.52 PASS AF=0.309524;AO=39;DP=126;FAO=39;FDP=126;FR=.;FRO=87;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0161287;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.306;QD=9.38153;RBI=0.0285;REFB=-0.027888;REVB=-0.0234971;RO=83;SAF=17;SAR=22;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401557;STB=0.508666;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0286562;OID=.;OPOS=144619354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:83:87:39:39:0.309524:22:17:39:44:22:17:39:48 chr1 144811823 . A C 34.57 PASS AF=0.193548;AO=5;DP=30;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0295879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0683;QD=4.46087;RBI=0.0923416;REFB=0.0244972;REVB=0.087473;RO=25;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309732;STB=0.758529;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.0772694;OID=.;OPOS=144811823;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:30:31:25:25:5:6:0.193548:1:4:14:11:1:5:14:11 chr1 144811827 . G A 34.57 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00226542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5268;QD=4.4612;RBI=0.0437371;REFB=-0.00771382;REVB=-0.0436784;RO=25;SAF=5;SAR=1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368667;STB=0.758529;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0053959;OID=.;OPOS=144811827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:1:5:14:11:1:5:14:11 chr1 144811836 . G A 648.03 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.024304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.61;QD=57.603;RBI=0.0699445;REFB=-0.0488905;REVB=0.0655862;RO=2;SAF=27;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113745;STB=0.506061;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00616032;OID=.;OPOS=144811836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:16:27:1:1:16:27:1:1 chr1 144811924 . T G 2043.61 PASS AF=0.992424;AO=131;DP=136;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0152922;FXX=0.0294096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3965;QD=61.9276;RBI=0.0304285;REFB=0.0152175;REVB=0.0263067;RO=0;SAF=73;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.00012691;OID=.;OPOS=144811924;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:132:0:1:131:131:0.992424:58:73:0:0:58:73:0:1 chr1 144811926 . C T 53.05 PASS AF=0.101449;AO=14;DP=139;FAO=14;FDP=138;FR=.;FRO=124;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=67;FSRR=57;FWDB=-0.00446128;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.428;QD=1.53774;RBI=0.0263708;REFB=0.00014501;REVB=-0.0259907;RO=122;SAF=11;SAR=3;SRF=66;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310207;STB=0.737894;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.00086879;OID=.;OPOS=144811926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:139:138:122:124:14:14:0.101449:3:11:66:56:3:11:67:57 chr1 144828752 . G T 244.29 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00359208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8894;QD=13.0286;RBI=0.0686575;REFB=-0.00545364;REVB=0.0685635;RO=46;SAF=16;SAR=13;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147717;STB=0.584417;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.011899;OID=.;OPOS=144828752;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:13:16:19:27:13:16:19:27 chr1 144852390 . C T 68.23 PASS AF=0.179104;AO=12;DP=67;FAO=12;FDP=67;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00196831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.571;QD=4.07337;RBI=0.00668073;REFB=-0.00143011;REVB=-0.0063842;RO=55;SAF=9;SAR=3;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312641;STB=0.708299;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00517723;OID=.;OPOS=144852390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:67:67:55:55:12:12:0.179104:3:9:28:27:3:9:28:27 chr1 144852476 . TG CA,CG 182.98 PASS AF=0.111111,0.269841;AO=7,17;DP=63;FAO=7,17;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=3,6;FSAR=4,11;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0167131,-0.00656935;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=162.244,126.471;QD=11.618;RBI=0.0217566,0.00796326;REFB=-0.00302371,-0.00494387;REVB=-0.0139291,-0.00450078;RO=39;SAF=3,6;SAR=4,11;SRF=16;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0225867,-0.070977;STB=0.515878,0.54255;STBP=0.939,0.68;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.002985,0.0118096;OID=.,.;OPOS=144852476,144852476;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:63:63:39:39:7,17:7,17:0.111111,0.269841:4,11:3,6:16:23:4,11:3,6:16:23 chr1 144852518 . C T 41.41 PASS AF=0.152174;AO=7;DP=45;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0177002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.479;QD=3.60073;RBI=0.0430147;REFB=0.000413878;REVB=-0.0392041;RO=38;SAF=3;SAR=4;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419892;STB=0.538354;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.00134298;OID=.;OPOS=144852518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:45:46:38:39:7:7:0.152174:4:3:15:23:4:3:15:24 chr1 144852522 . C T 40.65 PASS AF=0.148936;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=47;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.00950607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.986;QD=3.45934;RBI=0.0143669;REFB=-0.00765022;REVB=-0.0107723;RO=40;SAF=3;SAR=4;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669256;STB=0.547038;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0354039;OID=.;OPOS=144852522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:47:47:40:40:7:7:0.148936:4:3:15:25:4:3:15:25 chr1 144854180 . T C 575.45 PASS AF=0.246459;AO=87;DP=353;FAO=87;FDP=353;FR=.;FRO=266;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=125;FSRR=141;FWDB=-0.0162363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.887;QD=6.52068;RBI=0.0164575;REFB=-0.00974703;REVB=0.00268975;RO=265;SAF=44;SAR=43;SRF=124;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477165;STB=0.526974;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0339548;OID=.;OPOS=144854180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:353:265:266:87:87:0.246459:43:44:124:141:43:44:125:141 chr1 144854528 . A G 129.96 PASS AF=0.158537;AO=26;DP=164;FAO=26;FDP=164;FR=.;FRO=138;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=57;FSRR=81;FWDB=-0.00826311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.189;QD=3.16962;RBI=0.0156885;REFB=-0.00257065;REVB=0.0133361;RO=138;SAF=14;SAR=12;SRF=57;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159569;STB=0.604379;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.013741;OID=.;OPOS=144854528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:138:138:26:26:0.158537:12:14:57:81:12:14:57:81 chr1 144854537 . T C 166.4 PASS AF=0.178161;AO=31;DP=174;FAO=31;FDP=174;FR=.;FRO=143;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=58;FSRR=85;FWDB=-0.00846887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.007;QD=3.82535;RBI=0.0129783;REFB=-0.00697689;REVB=-0.00983434;RO=143;SAF=15;SAR=16;SRF=58;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101385;STB=0.564626;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0373499;OID=.;OPOS=144854537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:143:143:31:31:0.178161:16:15:58:85:16:15:58:85 chr1 144854581 . T C 348.59 PASS AF=0.221344;AO=56;DP=253;FAO=56;FDP=253;FR=.;FRO=197;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=90;FSRR=107;FWDB=0.0434633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8276;QD=5.51136;RBI=0.0499104;REFB=-0.00785048;REVB=-0.0245355;RO=197;SAF=21;SAR=35;SRF=90;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107472;STB=0.565725;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0350477;OID=.;OPOS=144854581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:197:197:56:56:0.221344:35:21:90:107:35:21:90:107 chr1 144854594 . G T 363.27 PASS AF=0.227451;AO=58;DP=256;FAO=58;FDP=255;FR=.;FRO=197;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=86;FSRR=111;FWDB=-0.0311862;FXX=0.0039061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.696;QD=5.69841;RBI=0.0485733;REFB=-0.0204241;REVB=-0.0372396;RO=197;SAF=24;SAR=34;SRF=86;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296376;STB=0.517999;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0621783;OID=.;OPOS=144854594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:255:197:197:58:58:0.227451:34:24:86:111:34:24:86:111 chr1 144854597 . TC CC,CT 669.15 PASS AF=0.436893,0;AO=55,82;DP=251;FAO=90,0;FDP=206;FR=.;FRO=116;FSAF=42,0;FSAR=48,0;FSRF=53;FSRR=63;FWDB=-0.012045,-0.0427883;FXX=0.195305;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=117.757,136.385;QD=12.9932;RBI=0.0141707,0.0534272;REFB=-0.0466371,-0.0180524;REVB=-0.00746509,-0.0319942;RO=112;SAF=24,32;SAR=31,50;SRF=49;SRR=63;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00134352,-0.0506102;STB=0.505529,0.5;STBP=0.896,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0682256,0.0806446;OID=.,.;OPOS=144854597,144854597;OREF=T,TC;OALT=C,CT;OMAPALT=CC,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:206:112:116:55,82:90,0:0.436893,0:31,50:24,32:49:63:48,0:42,0:53:63 chr1 144855812 . T C 37.46 PASS AF=0.114286;AO=8;DP=71;FAO=8;FDP=70;FR=.;FRO=62;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0216647;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.253;QD=2.14077;RBI=0.022744;REFB=0.00438114;REVB=-0.00692314;RO=62;SAF=1;SAR=7;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488579;STB=0.867674;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0106415;OID=.;OPOS=144855812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:71:70:62:62:8:8:0.114286:7:1:33:29:7:1:33:29 chr1 144865850 . G T 942.33 PASS AF=0.372014;AO=109;DP=293;FAO=109;FDP=293;FR=.;FRO=184;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=74;FSRR=110;FWDB=-0.00811892;FXX=0.00340124;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.639;QD=12.8645;RBI=0.00841076;REFB=-0.00740168;REVB=0.00219635;RO=183;SAF=50;SAR=59;SRF=74;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611496;STB=0.535957;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0129429;OID=.;OPOS=144865850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:183:184:109:109:0.372014:59:50:74:109:59:50:74:110 chr1 144866643 . G A 538.27 PASS AF=0.5;AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.0118969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.707;QD=19.2238;RBI=0.0183105;REFB=-0.0180226;REVB=0.013919;RO=56;SAF=23;SAR=33;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114097;STB=0.563081;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0114781;OID=.;OPOS=144866643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:56:56:56:56:0.5:33:23:30:26:33:23:30:26 chr1 144866662 . T C 516.0 PASS AF=0.478261;AO=54;DP=113;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0219876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.288;QD=17.9479;RBI=0.0268806;REFB=-0.0177766;REVB=-0.0154633;RO=59;SAF=21;SAR=33;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146238;STB=0.578918;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0238971;OID=.;OPOS=144866662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:59:60:54:55:0.478261:33:21:32:27:33:22:33:27 chr1 144868170 . C T 407.31 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00131057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.275;QD=22.9468;RBI=0.0139099;REFB=-0.0107811;REVB=0.013848;RO=31;SAF=10;SAR=30;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162109;STB=0.589696;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00943521;OID=.;OPOS=144868170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:31:31:40:40:0.56338:30:10:13:18:30:10:13:18 chr1 144871738 . C A 170.95 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0163823;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.418;QD=8.88045;RBI=0.0166209;REFB=-0.0163003;REVB=-0.00280583;RO=54;SAF=7;SAR=16;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281091;STB=0.66729;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0481377;OID=.;OPOS=144871738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:54:54:23:23:0.298701:16:7:29:25:16:7:29:25 chr1 144871755 . A T 144.16 PASS AF=0.294118;AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0118232;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.332;QD=8.47986;RBI=0.0263592;REFB=-0.00812984;REVB=-0.0235589;RO=48;SAF=1;SAR=19;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.702522;STB=0.929575;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0462521;OID=.;OPOS=144871755;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:48:48:20:20:0.294118:19:1:27:21:19:1:27:21 chr1 144871782 . A G 159.84 PASS AF=0.33871;AO=20;DP=61;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0248632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.82;QD=10.3121;RBI=0.0254122;REFB=-0.0233964;REVB=-0.0052535;RO=37;SAF=0;SAR=20;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.823573;STB=0.934779;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0392524;OID=.;OPOS=144871782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:37:41:20:21:0.33871:20:0:21:16:20:1:25:16 chr1 144871837 . C A 114.25 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0109523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.411;QD=10.1551;RBI=0.0293787;REFB=-0.00405362;REVB=-0.0272608;RO=31;SAF=3;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202136;STB=0.623289;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0384462;OID=.;OPOS=144871837;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:11:3:11:20:11:3:11:20 chr1 144873887 . C T 1026.71 PASS AF=0.435484;AO=108;DP=249;FAO=108;FDP=248;FR=.;FRO=140;FSAF=69;FSAR=39;FSRF=102;FSRR=38;FWDB=0.0116165;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2065;QD=16.5598;RBI=0.0352202;REFB=-0.0226961;REVB=0.0332494;RO=139;SAF=69;SAR=39;SRF=101;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996221;STB=0.556575;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0214547;OID=.;OPOS=144873887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:248:139:140:108:108:0.435484:39:69:101:38:39:69:102:38 chr1 144873894 . G A 400.33 PASS AF=0.24031;AO=62;DP=258;FAO=62;FDP=258;FR=.;FRO=196;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=135;FSRR=61;FWDB=0.013404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.43;QD=6.20663;RBI=0.031431;REFB=-0.00106066;REVB=-0.0284296;RO=191;SAF=41;SAR=21;SRF=134;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581533;STB=0.523654;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.00343462;OID=.;OPOS=144873894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:191:196:62:62:0.24031:21:41:134:57:21:41:135:61 chr1 144874760 . T C 612.59 PASS AF=0.504065;AO=61;DP=122;FAO=62;FDP=123;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.00986386;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.36;QD=19.9217;RBI=0.0117155;REFB=-0.0129278;REVB=0.00632121;RO=60;SAF=29;SAR=32;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379979;STB=0.520722;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0114905;OID=.;OPOS=144874760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:60:61:61:62:0.504065:32:29:26:34:33:29:26:35 chr1 144874815 . T C 183.4 PASS AF=0.226562;AO=29;DP=127;FAO=29;FDP=128;FR=.;FRO=99;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=-0.0154914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.997;QD=5.73123;RBI=0.0172127;REFB=-0.00806478;REVB=-0.00750301;RO=98;SAF=13;SAR=16;SRF=47;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395902;STB=0.520593;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0256661;OID=.;OPOS=144874815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:98:99:29:29:0.226562:16:13:47:51:16:13:47:52 chr1 144875979 . G C 138.15 PASS AF=0.176056;AO=25;DP=142;FAO=25;FDP=142;FR=.;FRO=117;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=59;FSRR=58;FWDB=-0.0031442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.422;QD=3.89165;RBI=0.0263481;REFB=-8.56093e-06;REVB=-0.0261599;RO=117;SAF=15;SAR=10;SRF=59;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123061;STB=0.579481;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.000343994;OID=.;OPOS=144875979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:117:117:25:25:0.176056:10:15:59:58:10:15:59:58 chr1 144877176 . C T 420.7 PASS AF=0.316092;AO=55;DP=174;FAO=55;FDP=174;FR=.;FRO=119;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=0.00551427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.371;QD=9.67114;RBI=0.0380057;REFB=-0.00366808;REVB=-0.0376036;RO=119;SAF=30;SAR=25;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00908373;STB=0.505261;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00833428;OID=.;OPOS=144877176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:119:119:55:55:0.316092:25:30:64:55:25:30:64:55 chr1 144879264 . A G 2164.74 PASS AF=0.76652;AO=159;DP=217;FAO=174;FDP=227;FR=.;FRO=53;FSAF=73;FSAR=101;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0151644;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.951;QD=38.1451;RBI=0.0383717;REFB=-0.035852;REVB=0.035248;RO=53;SAF=67;SAR=92;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864334;STB=0.543535;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0119919;OID=.;OPOS=144879264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:227:53:53:159:174:0.76652:92:67:32:21:101:73:32:21 chr1 144879375 . T C 794.41 PASS AF=0.50625;AO=81;DP=160;FAO=81;FDP=160;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=60;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=-0.0831108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.848;QD=19.8601;RBI=0.0844101;REFB=-0.0042624;REVB=0.0147531;RO=79;SAF=21;SAR=60;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155488;STB=0.585937;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00358155;OID=.;OPOS=144879375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:79:79:81:81:0.50625:60:21:32:47:60:21:32:47 chr1 144882581 . A G 869.42 PASS AF=0.463542;AO=89;DP=192;FAO=89;FDP=192;FR=.;FRO=103;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=-0.0134761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1428;QD=18.113;RBI=0.020915;REFB=-0.00650272;REVB=-0.0159947;RO=103;SAF=41;SAR=48;SRF=46;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137389;STB=0.507604;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00699241;OID=.;OPOS=144882581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:103:103:89:89:0.463542:48:41:46:57:48:41:46:57 chr1 144882823 . C T 683.27 PASS AF=0.49635;AO=67;DP=136;FAO=68;FDP=137;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=-0.0011537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.395;QD=19.9496;RBI=0.00754759;REFB=-0.0125683;REVB=-0.00745889;RO=69;SAF=30;SAR=37;SRF=19;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163935;STB=0.593112;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0121286;OID=.;OPOS=144882823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:69:69:67:68:0.49635:37:30:19:50:37:31:19:50 chr1 144886197 . A T 629.53 PASS AF=0.445161;AO=69;DP=155;FAO=69;FDP=155;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=52;FSRR=34;FWDB=-0.0176886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.759;QD=16.246;RBI=0.0208264;REFB=-0.0139927;REVB=0.0109932;RO=86;SAF=30;SAR=39;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168132;STB=0.593514;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0139401;OID=.;OPOS=144886197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:86:86:69:69:0.445161:39:30:52:34:39:30:52:34 chr1 144892089 . G T 322.4 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0168208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0577;QD=16.5335;RBI=0.0228064;REFB=0.0155188;REVB=-0.015401;RO=43;SAF=20;SAR=15;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149384;STB=0.583894;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.0186211;OID=.;OPOS=144892089;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:15:20:18:25:15:20:18:25 chr1 144892149 . G A 288.88 PASS AF=0.402439;AO=32;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0370457;FXX=0.0465062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.244;QD=14.0916;RBI=0.0431019;REFB=-0.0127251;REVB=-0.0220314;RO=44;SAF=16;SAR=16;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232249;STB=0.52731;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0296379;OID=.;OPOS=144892149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:49:32:33:0.402439:16:16:21:23:16:17:23:26 chr1 144909956 . G A 56.49 PASS AF=0.126316;AO=12;DP=95;FAO=12;FDP=95;FR=.;FRO=83;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=53;FWDB=-0.0797226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4296;QD=2.37832;RBI=0.0840732;REFB=-0.00494922;REVB=-0.0266946;RO=83;SAF=4;SAR=8;SRF=30;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378402;STB=0.527086;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0164098;OID=.;OPOS=144909956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:95:95:83:83:12:12:0.126316:8:4:30:53:8:4:30:53 chr1 144912153 . A G 2929.24 PASS AF=1;AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333839;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.711;QD=63.335;RBI=0.0307295;REFB=0;REVB=0.0305477;RO=0;SAF=94;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90271e-05;OID=.;OPOS=144912153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:184:185:0:0:184:185:1:90:94:0:0:90:95:0:0 chr1 144912161 . G A 304.29 PASS AF=0.235897;AO=46;DP=195;FAO=46;FDP=195;FR=.;FRO=149;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=72;FSRR=77;FWDB=0.00535319;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=281.272;QD=6.24178;RBI=0.0401475;REFB=-0.00349349;REVB=-0.039789;RO=149;SAF=26;SAR=20;SRF=72;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103575;STB=0.562668;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0108127;OID=.;OPOS=144912161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:149:149:46:46:0.235897:20:26:72:77:20:26:72:77 chr1 144912233 . C T 781.81 PASS AF=0.458101;AO=82;DP=180;FAO=82;FDP=179;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=-0.00972537;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.561;QD=17.4705;RBI=0.0113559;REFB=0.00103265;REVB=0.00586296;RO=96;SAF=34;SAR=48;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294627;STB=0.512825;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.00152381;OID=.;OPOS=144912233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:96:97:82:82:0.458101:48:34:37:59:48:34:38:59 chr1 144915561 . G A 986.37 PASS AF=0.418251;AO=110;DP=263;FAO=110;FDP=263;FR=.;FRO=153;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=82;FSRR=71;FWDB=-0.018145;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.361;QD=15.0018;RBI=0.0239862;REFB=-0.012015;REVB=-0.0156874;RO=153;SAF=48;SAR=62;SRF=82;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103946;STB=0.558007;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0200534;OID=.;OPOS=144915561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:153:153:110:110:0.418251:62:48:82:71:62:48:82:71 chr1 144915624 . G A 644.67 PASS AF=0.227778;AO=41;DP=181;FAO=41;FDP=180;FR=.,HEALED;FRO=103;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=49;FWDB=-0.00467972;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.297;QD=14.326;RBI=0.0108566;REFB=-0.0155636;REVB=-0.0097962;RO=103;SAF=14;SAR=27;SRF=54;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225178;STB=0.633038;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0243863;OID=.;OPOS=144915624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:103:103:41:41:0.227778:27:14:54:49:27:14:54:49 chr1 144916676 . C T 227.08 PASS AF=0.166667;AO=45;DP=270;FAO=45;FDP=270;FR=.;FRO=225;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=117;FSRR=108;FWDB=-0.0539257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.165;QD=3.36415;RBI=0.0625784;REFB=-0.00832749;REVB=-0.0317502;RO=225;SAF=22;SAR=23;SRF=117;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401525;STB=0.525897;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0402473;OID=.;OPOS=144916676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:225:225:45:45:0.166667:23:22:117:108:23:22:117:108 chr1 144916748 . C G 838.78 PASS AF=0.525;AO=83;DP=159;FAO=84;FDP=160;FR=.;FRO=76;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.0330391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9412;QD=20.9694;RBI=0.0330543;REFB=-0.0310809;REVB=0.00100146;RO=76;SAF=36;SAR=47;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236787;STB=0.509636;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0249766;OID=.;OPOS=144916748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:76:76:83:84:0.525:47:36:35:41:47:37:35:41 chr1 144917546 . A G 728.48 PASS AF=0.472393;AO=77;DP=163;FAO=77;FDP=163;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=0.00950964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6756;QD=17.8767;RBI=0.0328407;REFB=0.006274;REVB=-0.0314337;RO=86;SAF=31;SAR=46;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498513;STB=0.527602;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.0074681;OID=.;OPOS=144917546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:86:86:77:77:0.472393:46:31:39:47:46:31:39:47 chr1 144917827 . CA C 110.71 PASS AF=0.231343;AO=31;DP=134;FAO=31;FDP=134;FR=.;FRO=103;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=47;FWDB=-0.0276192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.9756;QD=3.30479;RBI=0.030303;REFB=-0.00185437;REVB=-0.0124679;RO=103;SAF=22;SAR=9;SRF=56;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222292;STB=0.636929;STBP=0.101;TYPE=del;VARB=0.00593627;OID=.;OPOS=144917828;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.231343:31:134:31:134:103:22:9:56:47:99:103:22:9:56:47 chr1 144917841 . T C 830.32 PASS AF=0.506024;AO=84;DP=166;FAO=84;FDP=166;FR=.;FRO=82;FSAF=53;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=0.0176365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.357;QD=20.0076;RBI=0.0240124;REFB=-0.0227959;REVB=0.0162957;RO=82;SAF=53;SAR=31;SRF=49;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318924;STB=0.517542;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0198213;OID=.;OPOS=144917841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:82:82:84:84:0.506024:31:53:49:33:31:53:49:33 chr1 144918957 . T A 417.41 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=-0.00376737;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.598;QD=17.037;RBI=0.00401541;REFB=-0.00595157;REVB=0.00138941;RO=54;SAF=21;SAR=22;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192827;STB=0.6011;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00672063;OID=.;OPOS=144918957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:54:55:43:43:0.438776:22:21:16:38:22:21:17:38 chr1 144921924 . G A 454.91 PASS AF=0.2607;AO=66;DP=256;FAO=67;FDP=257;FR=.;FRO=190;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=110;FSRR=80;FWDB=-0.0144894;FXX=0.00387582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8731;QD=7.08024;RBI=0.0216832;REFB=-0.00615315;REVB=0.0161313;RO=188;SAF=33;SAR=33;SRF=109;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996921;STB=0.552928;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0209513;OID=.;OPOS=144921924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:257:188:190:66:67:0.2607:33:33:109:79:33:34:110:80 chr1 144922523 . C T 306.93 PASS AF=0.258427;AO=46;DP=178;FAO=46;FDP=178;FR=.;FRO=132;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=66;FSRR=66;FWDB=-0.0127081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.169;QD=6.89737;RBI=0.0226354;REFB=-0.00524317;REVB=-0.0187314;RO=131;SAF=23;SAR=23;SRF=66;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473704;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117307;OID=.;OPOS=144922523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:131:132:46:46:0.258427:23:23:66:65:23:23:66:66 chr1 144922583 . G A 846.9 PASS AF=0.494253;AO=84;DP=172;FAO=86;FDP=174;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=0.0338868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5815;QD=19.469;RBI=0.0339207;REFB=-0.0210089;REVB=0.00151454;RO=88;SAF=31;SAR=53;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156726;STB=0.577481;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0201842;OID=.;OPOS=144922583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:174:88:88:84:86:0.494253:53:31:47:41:53:33:47:41 chr1 144923728 . GT G 216.08 PASS AF=0.231317;AO=65;DP=284;FAO=65;FDP=281;FR=.;FRO=216;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=118;FSRR=98;FWDB=0.0474255;FXX=0.0140346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.4874;QD=3.07581;RBI=0.0717236;REFB=-0.000757395;REVB=-0.0538061;RO=212;SAF=33;SAR=32;SRF=117;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562028;STB=0.529699;STBP=0.575;TYPE=del;VARB=0.00691679;OID=.;OPOS=144923729;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.231317:65:284:65:281:216:33:32:118:98:99:212:33:32:117:95 chr1 144923823 . TAGGAAGAAACGGCA T 1355.87 PASS AF=1;AO=88;DP=171;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216971;FXX=0.295976;HRUN=1;LEN=14;MLLD=359.355;QD=61.6305;RBI=0.0244246;REFB=0;REVB=0.0112161;RO=51;SAF=40;SAR=48;SRF=45;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286091;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=1.57703e-05;OID=.;OPOS=144923824;OREF=AGGAAGAAACGGCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:88:171:88:88:0:40:48:0:0:7:51:40:48:45:6 chr1 144930596 . C A 589.74 PASS AF=0.416149;AO=66;DP=160;FAO=67;FDP=161;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=40;FWDB=-0.0165967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.707;QD=14.6519;RBI=0.0195969;REFB=-0.018444;REVB=-0.0104207;RO=71;SAF=41;SAR=25;SRF=54;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144878;STB=0.522791;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.023349;OID=.;OPOS=144930596;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:71:94:66:67:0.416149:25:41:54:17:26:41:54:40 chr1 144930940 . T C 538.77 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0516908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6082;QD=21.7684;RBI=0.0569957;REFB=-0.00185977;REVB=-0.0240119;RO=48;SAF=28;SAR=23;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249223;STB=0.513756;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.000738321;OID=.;OPOS=144930940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:23:28:25:23:23:28:25:23 chr1 144931330 . C T 451.17 PASS AF=0.414634;AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=17;FWDB=-0.00349743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.623;QD=14.6722;RBI=0.017389;REFB=-0.009216;REVB=0.0170337;RO=72;SAF=27;SAR=24;SRF=55;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251375;STB=0.63995;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.015732;OID=.;OPOS=144931330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:72:72:51:51:0.414634:24:27:55:17:24:27:55:17 chr1 144931392 . G A 601.47 PASS AF=0.443662;AO=63;DP=142;FAO=63;FDP=142;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=26;FWDB=-0.00809447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.058;QD=16.9428;RBI=0.0183841;REFB=-0.00130163;REVB=-0.0165062;RO=79;SAF=34;SAR=29;SRF=53;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133729;STB=0.5743;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.000786332;OID=.;OPOS=144931392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:79:79:63:63:0.443662:29:34:53:26:29:34:53:26 chr1 144944655 . T G 134.06 PASS AF=0.243902;AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=82;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00867528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.621;QD=6.53941;RBI=0.0123025;REFB=0.00121408;REVB=0.008723;RO=61;SAF=7;SAR=13;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254317;STB=0.660857;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00514451;OID=.;OPOS=144944655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:61:62:20:20:0.243902:13:7:34:27:13:7:35:27 chr1 144952207 . C T 75.06 PASS AF=0.16092;AO=14;DP=87;FAO=14;FDP=87;FR=.;FRO=73;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=50;FSRR=23;FWDB=0.0404189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.9904;QD=3.45099;RBI=0.0890114;REFB=-0.00868081;REVB=-0.0793054;RO=72;SAF=12;SAR=2;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302033;STB=0.707199;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.041389;OID=.;OPOS=144952207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:87:87:72:73:14:14:0.16092:2:12:49:23:2:12:50:23 chr1 144952220 . C T 143.14 PASS AF=0.25;AO=21;DP=84;FAO=21;FDP=84;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=43;FSRR=20;FWDB=-0.0127639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.777;QD=6.81637;RBI=0.0190898;REFB=-0.0052018;REVB=-0.0141951;RO=62;SAF=18;SAR=3;SRF=42;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313527;STB=0.693251;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0154054;OID=.;OPOS=144952220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:62:63:21:21:0.25:3:18:42:20:3:18:43:20 chr1 144994658 . C A 483.65 PASS AF=0.395683;AO=55;DP=140;FAO=55;FDP=139;FR=.;FRO=84;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=0.0113102;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.78;QD=13.918;RBI=0.0177036;REFB=-0.0149742;REVB=0.0136197;RO=84;SAF=30;SAR=25;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00233567;STB=0.501319;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0228133;OID=.;OPOS=144994658;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:84:84:55:55:0.395683:25:30:46:38:25:30:46:38 chr1 145014103 . G C 492.79 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.0138145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.371;QD=20.1137;RBI=0.0367377;REFB=-0.0278883;REVB=0.0340414;RO=50;SAF=29;SAR=19;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544302;STB=0.530141;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0247362;OID=.;OPOS=145014103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:50:50:48:48:0.489796:19:29:33:17:19:29:33:17 chr1 145014210 . G A 135.57 PASS AF=0.28169;AO=19;DP=68;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0516895;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.8426;QD=7.63794;RBI=0.0685995;REFB=-0.0103885;REVB=0.0451009;RO=49;SAF=9;SAR=10;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192964;STB=0.521106;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.013106;OID=.;OPOS=145014210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:49:51:19:20:0.28169:10:9:24:25:10:10:24:27 chr1 145014263 . C T 353.36 PASS AF=0.469136;AO=35;DP=78;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=0.0201241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8534;QD=17.4496;RBI=0.0245364;REFB=-0.0321864;REVB=0.0140376;RO=43;SAF=15;SAR=20;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154247;STB=0.566004;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0346804;OID=.;OPOS=145014263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:43:43:35:38:0.469136:20:15:12:31:23:15:12:31 chr1 145018023 . G T 421.61 PASS AF=0.531646;AO=40;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.000986996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3219;QD=21.3475;RBI=0.0784726;REFB=-0.0413988;REVB=0.0784664;RO=37;SAF=21;SAR=19;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998483;STB=0.504829;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.039576;OID=.;OPOS=145018023;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:37:37:40:42:0.531646:19:21:19:18:20:22:19:18 chr1 145021150 . T C 57.6 PASS AF=0.0855856;AO=19;DP=222;FAO=19;FDP=222;FR=.;FRO=203;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=92;FSRR=111;FWDB=0.00209578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.828;QD=1.03792;RBI=0.0194178;REFB=-0.00406086;REVB=-0.0193043;RO=198;SAF=8;SAR=11;SRF=88;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02778;STB=0.529834;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0529508;OID=.;OPOS=145021150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:222:222:198:203:19:19:0.0855856:11:8:88:110:11:8:92:111 chr1 145021183 . C A 57.4 PASS AF=0.0869565;AO=17;DP=206;FAO=18;FDP=207;FR=.;FRO=189;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=86;FSRR=103;FWDB=-0.0348774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.747;QD=1.10918;RBI=0.0372915;REFB=-0.00321511;REVB=-0.0131992;RO=189;SAF=7;SAR=10;SRF=86;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503633;STB=0.56171;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0313471;OID=.;OPOS=145021183;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:206:207:189:189:17:18:0.0869565:10:7:86:103:11:7:86:103 chr1 145038952 . C T 524.63 PASS AF=0.398693;AO=60;DP=151;FAO=61;FDP=153;FR=.;FRO=92;FSAF=16;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=0.000904948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.839;QD=13.7159;RBI=0.00603521;REFB=-0.00690082;REVB=0.00596697;RO=91;SAF=16;SAR=44;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121962;STB=0.569891;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0115905;OID=.;OPOS=145038952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:91:92:60:61:0.398693:44:16:33:58:45:16:33:59 chr1 145038954 . G T 37.1 PASS AF=0.0784314;AO=12;DP=148;FAO=12;FDP=153;FR=.;FRO=141;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=94;FWDB=-0.0320534;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.6254;QD=0.970047;RBI=0.0543603;REFB=-0.00196649;REVB=0.0439047;RO=136;SAF=2;SAR=10;SRF=43;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216216;STB=0.701621;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0246224;OID=.;OPOS=145038954;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:148:153:136:141:12:12:0.0784314:10:2:43:93:10:2:47:94 chr1 145039562 . C T 260.28 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.025474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.743;QD=11.9671;RBI=0.0256468;REFB=-0.0270188;REVB=-0.00297193;RO=56;SAF=16;SAR=15;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578038;STB=0.533312;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.039154;OID=.;OPOS=145039562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:56:56:31:31:0.356322:15:16:26:30:15:16:26:30 chr1 145075683 . C T 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0130312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.518;QD=19.3436;RBI=0.0152581;REFB=-0.0477147;REVB=0.00793708;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980718;STB=0.555495;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0442393;OID=.;OPOS=145075683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:7:11:9:9:7:11 chr1 145075854 . G C 88.78 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0305993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.313;QD=14.7964;RBI=0.0321051;REFB=-0.016132;REVB=-0.00971711;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822389;STB=0.512173;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0122204;OID=.;OPOS=145075854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:13:11:11:0.458333:7:4:5:6:7:4:5:8 chr1 145103928 . G A 259.83 PASS AF=0.206422;AO=44;DP=217;FAO=45;FDP=218;FR=.;FRO=173;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=79;FSRR=94;FWDB=-0.0261012;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.193;QD=4.7675;RBI=0.0314669;REFB=-0.00585646;REVB=-0.0175755;RO=171;SAF=19;SAR=25;SRF=78;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03158;STB=0.527742;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0191496;OID=.;OPOS=145103928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:171:173:44:45:0.206422:25:19:78:93:26:19:79:94 chr1 145103947 . T C 709.41 PASS AF=0.382488;AO=83;DP=219;FAO=83;FDP=217;FR=.;FRO=134;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=66;FSRR=68;FWDB=-0.0231562;FXX=0.0180987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.274;QD=13.0768;RBI=0.0279788;REFB=-0.0104439;REVB=0.0157035;RO=132;SAF=35;SAR=48;SRF=66;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860366;STB=0.544219;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0179777;OID=.;OPOS=145103947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:217:132:134:83:83:0.382488:48:35:66:66:48:35:66:68 chr1 145109549 . G T 379.83 PASS AF=0.156556;AO=80;DP=511;FAO=80;FDP=511;FR=.;FRO=431;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=214;FSRR=217;FWDB=-0.0106196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.345;QD=2.97326;RBI=0.0114922;REFB=0.00153434;REVB=0.00439276;RO=430;SAF=36;SAR=44;SRF=213;SRR=217;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589347;STB=0.539312;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.010126;OID=.;OPOS=145109549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:511:511:430:431:80:80:0.156556:44:36:213:217:44:36:214:217 chr1 145109583 . C A 1958.92 PASS AF=0.402154;AO=220;DP=554;FAO=224;FDP=557;FR=.;FRO=333;FSAF=113;FSAR=111;FSRF=148;FSRR=185;FWDB=-0.00987068;FXX=0.00179208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8192;QD=14.0676;RBI=0.051431;REFB=-0.00417283;REVB=0.050475;RO=331;SAF=112;SAR=108;SRF=148;SRR=183;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665718;STB=0.535859;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00751858;OID=.;OPOS=145109583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:554:557:331:333:220:224:0.402154:108:112:148:183:111:113:148:185 chr1 145109661 . G A 459.3 PASS AF=0.191686;AO=81;DP=431;FAO=83;FDP=433;FR=.;FRO=350;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=151;FSRR=199;FWDB=-0.0160206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.404;QD=4.24293;RBI=0.0160731;REFB=-0.00358632;REVB=0.00129831;RO=349;SAF=35;SAR=46;SRF=150;SRR=199;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304035;STB=0.50805;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0165094;OID=.;OPOS=145109661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:431:433:349:350:81:83:0.191686:46:35:150:199:48:35:151:199 chr1 145112414 . T C 143.25 PASS AF=0.16568;AO=28;DP=169;FAO=28;FDP=169;FR=.;FRO=141;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=78;FSRR=63;FWDB=0.0298701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.783;QD=3.39044;RBI=0.0307856;REFB=-0.00790493;REVB=-0.0074518;RO=141;SAF=14;SAR=14;SRF=78;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068214;STB=0.544347;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0268286;OID=.;OPOS=145112414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:141:141:28:28:0.16568:14:14:78:63:14:14:78:63 chr1 145112420 . C T 338.04 PASS AF=0.284024;AO=46;DP=168;FAO=48;FDP=169;FR=.;FRO=121;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=68;FSRR=53;FWDB=0.0300635;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5207;QD=8.00091;RBI=0.0316381;REFB=-0.0129994;REVB=0.00985673;RO=121;SAF=22;SAR=24;SRF=68;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102376;STB=0.54436;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0402033;OID=.;OPOS=145112420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:121:121:46:48:0.284024:24:22:68:53:24:24:68:53 chr1 145112428 . C T 159.1 PASS AF=0.174419;AO=28;DP=170;FAO=30;FDP=172;FR=.;FRO=142;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=79;FSRR=63;FWDB=-0.0262433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.746;QD=3.70002;RBI=0.0307042;REFB=7.65998e-05;REVB=-0.0159386;RO=142;SAF=13;SAR=15;SRF=79;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117481;STB=0.600548;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00155325;OID=.;OPOS=145112428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:172:142:142:28:30:0.174419:15:13:79:63:17:13:79:63 chr1 145112485 . C T 178.97 PASS AF=0.211679;AO=29;DP=138;FAO=29;FDP=137;FR=.;FRO=108;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.00198172;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3178;QD=5.22534;RBI=0.00199934;REFB=-7.94203e-05;REVB=0.000264867;RO=108;SAF=12;SAR=17;SRF=55;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121485;STB=0.575491;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.000333886;OID=.;OPOS=145112485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:108:108:29:29:0.211679:17:12:55:53:17:12:55:53 chr1 145115810 . A G 1575.52 PASS AF=0.473373;AO=159;DP=339;FAO=160;FDP=338;FR=.;FRO=178;FSAF=81;FSAR=79;FSRF=91;FSRR=87;FWDB=0.00751532;FXX=0.00294977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.479;QD=18.6452;RBI=0.00915048;REFB=-0.0116484;REVB=0.00522027;RO=177;SAF=80;SAR=79;SRF=91;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105059;STB=0.502626;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0121202;OID=.;OPOS=145115810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:338:177:178:159:160:0.473373:79:80:91:86:79:81:91:87 chr1 145115820 . T C 531.32 PASS AF=0.250784;AO=79;DP=319;FAO=80;FDP=319;FR=.;FRO=239;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=114;FSRR=125;FWDB=-0.0156315;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.463;QD=6.66228;RBI=0.0208238;REFB=0.00120694;REVB=0.0137582;RO=239;SAF=38;SAR=41;SRF=114;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00507877;STB=0.507882;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.00810681;OID=.;OPOS=145115820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:319:239:239:79:80:0.250784:41:38:114:125:41:39:114:125 chr1 145115883 . G T 176.68 PASS AF=0.172775;AO=33;DP=191;FAO=33;FDP=191;FR=.;FRO=158;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=78;FSRR=80;FWDB=-0.0614153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.773;QD=3.70004;RBI=0.0624137;REFB=-0.00290246;REVB=-0.0111188;RO=158;SAF=9;SAR=24;SRF=78;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29357;STB=0.690357;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00929961;OID=.;OPOS=145115883;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:158:158:33:33:0.172775:24:9:78:80:24:9:78:80 chr1 145116147 . T TA 138.74 PASS AF=0.231214;AO=39;DP=175;FAO=40;FDP=173;FR=.;FRO=133;FSAF=35;FSAR=5;FSRF=85;FSRR=48;FWDB=0.0360223;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.9256;QD=3.20792;RBI=0.0526339;REFB=-0.00738853;REVB=-0.038376;RO=132;SAF=34;SAR=5;SRF=86;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38455;STB=0.755448;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.0237269;OID=.;OPOS=145116148;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.231214:39:175:40:173:133:35:5:85:48:99:132:34:5:86:46 chr1 145116311 . GT TG,TT 311.31 PASS AF=0,0.618182;AO=2,26;DP=46;FAO=0,34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=0,26;FSAR=0,8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0320895,0.0197573;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=11.5787,197.51;QD=22.641;RBI=0.234511,0.0231772;REFB=-0.0122886,-0.0129042;REVB=-0.232305,0.0121175;RO=16;SAF=1,18;SAR=1,8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.062606,0.100354;STB=0.5,0.592435;STBP=1,0.1;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0183017;OID=.,.;OPOS=145116311,145116311;OREF=GT,G;OALT=TG,T;OMAPALT=TG,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:46:55:16:21:2,26:0,34:0,0.618182:1,8:1,18:9:7:0,8:0,26:12:9 chr1 145116319 . G T 56.88 PASS AF=0.243243;AO=7;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0110455;FXX=0.0975372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.448;QD=6.14937;RBI=0.0338815;REFB=-0.0115523;REVB=0.0320305;RO=30;SAF=2;SAR=5;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467781;STB=0.596072;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.022691;OID=.;OPOS=145116319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:37:37:30:28:7:9:0.243243:5:2:21:9:4:5:19:9 chr1 145116326 . TG T,TT 453.79 PASS AF=0.658537,0.195122;AO=5,21;DP=34;FAO=27,8;FDP=41;FR=.;FRO=6;FSAF=16,3;FSAR=11,5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0143612,0.0138873;FXX=0.0681663;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.121,180.399;QD=44.2718;RBI=0.0235656,0.0194118;REFB=0.0143373,0.00964001;REVB=0.0186841,0.0135633;RO=2;SAF=3,10;SAR=2,11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0491618,-0.0038199;STB=0.514008,0.624687;STBP=0.78,0.368;TYPE=del,snp;VARB=-0.00446517,0.0144663;OID=.,.;OPOS=145116327,145116327;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.658537,0.195122:5,21:34:27,8:41:6:16,3:11,5:4:2:31:2:3,10:2,11:1:1 chr1 145273302 . A G 379.7 PASS AF=0.326389;AO=47;DP=142;FAO=47;FDP=144;FR=.;FRO=97;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=96;FWDB=0.0325543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.643;QD=10.5472;RBI=0.045729;REFB=-0.00876261;REVB=-0.0321147;RO=94;SAF=8;SAR=39;SRF=1;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461161;STB=0.754657;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.010755;OID=.;OPOS=145273302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:94:97:47:47:0.326389:39:8:1:93:39:8:1:96 chr1 145273345 . T C 583.34 PASS AF=0.331839;AO=74;DP=223;FAO=74;FDP=223;FR=.;FRO=149;FSAF=10;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=148;FWDB=0.00513345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.352;QD=10.4635;RBI=0.0199221;REFB=0.00432649;REVB=0.0192493;RO=149;SAF=10;SAR=64;SRF=1;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.463784;STB=0.750671;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.00545233;OID=.;OPOS=145273345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:149:149:74:74:0.331839:64:10:1:148:64:10:1:148 chr1 145277398 . A G 40.68 PASS AF=0.0807453;AO=13;DP=161;FAO=13;FDP=161;FR=.;FRO=148;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=72;FSRR=76;FWDB=-0.00143668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.2;QD=1.01057;RBI=0.00149923;REFB=-0.000350645;REVB=0.000428507;RO=148;SAF=10;SAR=3;SRF=72;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321765;STB=0.762141;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00331323;OID=.;OPOS=145277398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:161:161:148:148:13:13:0.0807453:3:10:72:76:3:10:72:76 chr1 145277402 . A G 40.96 PASS AF=0.08125;AO=13;DP=153;FAO=13;FDP=160;FR=.;FRO=147;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=70;FSRR=77;FWDB=-0.0532584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.812;QD=1.02399;RBI=0.059109;REFB=-0.0039029;REVB=-0.0256402;RO=139;SAF=10;SAR=3;SRF=64;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351219;STB=0.768817;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0422358;OID=.;OPOS=145277402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:153:160:139:147:13:13:0.08125:3:10:64:75:3:10:70:77 chr1 145277411 . G A 69.79 PASS AF=0.112583;AO=17;DP=151;FAO=17;FDP=151;FR=.;FRO=134;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=63;FSRR=71;FWDB=-0.0132103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.048;QD=1.84863;RBI=0.0138631;REFB=-0.00125352;REVB=-0.00420408;RO=132;SAF=14;SAR=3;SRF=61;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44405;STB=0.817302;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0137707;OID=.;OPOS=145277411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:151:151:132:134:17:17:0.112583:3:14:61:71:3:14:63:71 chr1 145277430 . T C 73.6 PASS AF=0.123188;AO=17;DP=138;FAO=17;FDP=138;FR=.;FRO=121;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=-0.013599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.426;QD=2.13336;RBI=0.0179597;REFB=-0.000341675;REVB=0.0117311;RO=121;SAF=14;SAR=3;SRF=59;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427478;STB=0.805651;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00471844;OID=.;OPOS=145277430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:138:138:121:121:17:17:0.123188:3:14:59:62:3:14:59:62 chr1 145277457 . A G 87.02 PASS AF=0.132867;AO=19;DP=142;FAO=19;FDP=143;FR=.;FRO=124;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=58;FSRR=66;FWDB=-0.0141382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.801;QD=2.43406;RBI=0.065593;REFB=-0.00246019;REVB=-0.0640511;RO=123;SAF=16;SAR=3;SRF=58;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474446;STB=0.832221;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.018501;OID=.;OPOS=145277457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:142:143:123:124:19:19:0.132867:3:16:58:65:3:16:58:66 chr1 145277469 . G A 90.6 PASS AF=0.135714;AO=19;DP=144;FAO=19;FDP=140;FR=.,HEALED;FRO=121;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=54;FSRR=67;FWDB=-0.0565017;FXX=0.0277759;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.306;QD=2.58861;RBI=0.0659936;REFB=-0.0154268;REVB=-0.0340987;RO=93;SAF=16;SAR=3;SRF=30;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606305;STB=0.841746;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0584082;OID=.;OPOS=145277469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:144:140:93:121:19:19:0.135714:3:16:30:63:3:16:54:67 chr1 145277481 . A G 70.36 PASS AF=0.114094;AO=17;DP=149;FAO=17;FDP=149;FR=.;FRO=132;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=60;FSRR=72;FWDB=-0.00749849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.808;QD=1.88875;RBI=0.0478315;REFB=-0.00157098;REVB=-0.0472401;RO=131;SAF=16;SAR=1;SRF=60;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.602522;STB=0.938382;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0281027;OID=.;OPOS=145277481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:149:149:131:132:17:17:0.114094:1:16:60:71:1:16:60:72 chr1 145281408 . C T 362.48 PASS AF=0.232365;AO=56;DP=241;FAO=56;FDP=241;FR=.;FRO=185;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=93;FSRR=92;FWDB=-0.0157699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.881;QD=6.01627;RBI=0.0165905;REFB=-0.00970808;REVB=-0.00515314;RO=185;SAF=27;SAR=29;SRF=93;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260843;STB=0.515779;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0302804;OID=.;OPOS=145281408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:185:185:56:56:0.232365:29:27:93:92:29:27:93:92 chr1 145281543 . C T 89.08 PASS AF=0.11828;AO=22;DP=186;FAO=22;FDP=186;FR=.;FRO=164;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=70;FSRR=94;FWDB=-0.0194618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.594;QD=1.91579;RBI=0.036673;REFB=-0.00348233;REVB=-0.031083;RO=164;SAF=10;SAR=12;SRF=70;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348975;STB=0.52473;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.024945;OID=.;OPOS=145281543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:186:186:164:164:22:22:0.11828:12:10:70:94:12:10:70:94 chr1 145281613 . C A 214.39 PASS AF=0.222973;AO=33;DP=148;FAO=33;FDP=148;FR=.;FRO=115;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=0.0062461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.125;QD=5.79434;RBI=0.0173647;REFB=-0.00275104;REVB=0.0162025;RO=115;SAF=11;SAR=22;SRF=48;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11343;STB=0.570005;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00582728;OID=.;OPOS=145281613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:115:115:33:33:0.222973:22:11:48:67:22:11:48:67 chr1 145281633 . C A 246.27 PASS AF=0.241611;AO=36;DP=149;FAO=36;FDP=149;FR=.;FRO=113;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=-0.0246314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.334;QD=6.61138;RBI=0.0269283;REFB=-0.0110933;REVB=-0.0108823;RO=113;SAF=13;SAR=23;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949628;STB=0.557652;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0299484;OID=.;OPOS=145281633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:113:113:36:36:0.241611:23:13:49:64:23:13:49:64 chr1 145281656 . A T 225.04 PASS AF=0.22973;AO=34;DP=148;FAO=34;FDP=148;FR=.;FRO=114;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=-0.0462048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4595;QD=6.08202;RBI=0.0522548;REFB=-0.0176477;REVB=-0.0244066;RO=114;SAF=10;SAR=24;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185127;STB=0.61398;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0491488;OID=.;OPOS=145281656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:114:114:34:34:0.22973:24:10:49:65:24:10:49:65 chr1 145290409 . G A 100.02 PASS AF=0.121212;AO=24;DP=197;FAO=24;FDP=198;FR=.;FRO=174;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=87;FSRR=87;FWDB=-0.0102302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.383;QD=2.02061;RBI=0.0103457;REFB=0.000137759;REVB=0.00154197;RO=168;SAF=10;SAR=14;SRF=81;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825534;STB=0.573418;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.00089864;OID=.;OPOS=145290409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:168:174:24:24:0.121212:14:10:81:87:14:10:87:87 chr1 145290498 . T G 51.1 PASS AF=0.0965517;AO=14;DP=145;FAO=14;FDP=145;FR=.;FRO=131;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=66;FSRR=65;FWDB=0.0293964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.672;QD=1.40952;RBI=0.0307557;REFB=-0.00308457;REVB=0.00904229;RO=131;SAF=6;SAR=8;SRF=66;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889753;STB=0.56795;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.032361;OID=.;OPOS=145290498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:145:145:131:131:14:14:0.0965517:8:6:66:65:8:6:66:65 chr1 145293425 . C A 384.57 PASS AF=0.240664;AO=58;DP=242;FAO=58;FDP=241;FR=.;FRO=183;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=92;FSRR=91;FWDB=0.00159173;FXX=0.00413206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.505;QD=6.38293;RBI=0.00456407;REFB=-0.00129199;REVB=-0.00427751;RO=180;SAF=29;SAR=29;SRF=89;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699901;STB=0.502074;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00588044;OID=.;OPOS=145293425;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:180:183:58:58:0.240664:29:29:89:91:29:29:92:91 chr1 145293469 . G C 527.24 PASS AF=0.184906;AO=98;DP=530;FAO=98;FDP=530;FR=.;FRO=432;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=197;FSRR=235;FWDB=-0.00568519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.849;QD=3.97913;RBI=0.0245875;REFB=-0.00273332;REVB=-0.0239212;RO=432;SAF=58;SAR=40;SRF=197;SRR=235;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17561;STB=0.60992;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.01604;OID=.;OPOS=145293469;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:530:530:432:432:98:98:0.184906:40:58:197:235:40:58:197:235 chr1 145293490 . G C 504.98 PASS AF=0.169779;AO=100;DP=589;FAO=100;FDP=589;FR=.;FRO=489;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=223;FSRR=266;FWDB=-0.0243192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8407;QD=3.42942;RBI=0.0319009;REFB=-0.00350591;REVB=-0.0206457;RO=486;SAF=59;SAR=41;SRF=221;SRR=265;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175008;STB=0.610357;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0192453;OID=.;OPOS=145293490;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:589:589:486:489:100:100:0.169779:41:59:221:265:41:59:223:266 chr1 145293498 . G C 510.34 PASS AF=0.171821;AO=99;DP=587;FAO=100;FDP=582;FR=.;FRO=482;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=217;FSRR=265;FWDB=0.00263916;FXX=0.00851774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.756;QD=3.5075;RBI=0.0223191;REFB=-0.0067825;REVB=0.0221625;RO=473;SAF=57;SAR=42;SRF=213;SRR=260;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162258;STB=0.606533;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0223457;OID=.;OPOS=145293498;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:587:582:473:482:99:100:0.171821:42:57:213:260:42:58:217:265 chr1 145293510 . C G 536.76 PASS AF=0.176672;AO=103;DP=583;FAO=103;FDP=583;FR=.;FRO=480;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=218;FSRR=262;FWDB=-0.00373235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4054;QD=3.68274;RBI=0.0109284;REFB=-0.0131566;REVB=0.0102713;RO=478;SAF=60;SAR=43;SRF=216;SRR=262;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168999;STB=0.604859;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.061414;OID=.;OPOS=145293510;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:583:583:478:480:103:103:0.176672:43:60:216:262:43:60:218:262 chr1 145293515 . A G 1099.5 PASS AF=0.276106;AO=155;DP=565;FAO=156;FDP=565;FR=.;FRO=409;FSAF=74;FSAR=82;FSRF=192;FSRR=217;FWDB=0.00115664;FXX=0.00176675;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.23;QD=7.78408;RBI=0.0107931;REFB=-0.0109791;REVB=-0.010731;RO=404;SAF=74;SAR=81;SRF=191;SRR=213;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00575865;STB=0.503573;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0286882;OID=.;OPOS=145293515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:565:565:404:409:155:156:0.276106:81:74:191:213:82:74:192:217 chr1 145293566 . G A 840.58 PASS AF=0.26226;AO=123;DP=469;FAO=123;FDP=469;FR=.;FRO=346;FSAF=39;FSAR=84;FSRF=181;FSRR=165;FWDB=-0.0134416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.906;QD=7.16916;RBI=0.0135857;REFB=-0.00115425;REVB=0.00197402;RO=346;SAF=39;SAR=84;SRF=181;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262834;STB=0.655503;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00476351;OID=.;OPOS=145293566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:469:469:346:346:123:123:0.26226:84:39:181:165:84:39:181:165 chr1 145296372 . A G 511.28 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196592;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.704;QD=60.1504;RBI=0.0206994;REFB=0;REVB=0.00647943;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327754;OID=.;OPOS=145296372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr1 145296478 . G T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2676;QD=37.4883;RBI=0.0438843;REFB=0;REVB=-0.0351736;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000517342;OID=.;OPOS=145296478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0 chr1 145311083 . A C 2717.37 PASS AF=0.628647;AO=220;DP=362;FAO=237;FDP=377;FR=.;FRO=140;FSAF=147;FSAR=90;FSRF=99;FSRR=41;FWDB=0.00951268;FXX=0.00527691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.236;QD=28.8315;RBI=0.039877;REFB=-0.0262694;REVB=0.0387257;RO=138;SAF=146;SAR=74;SRF=100;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049802;STB=0.534818;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0138169;OID=.;OPOS=145311083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:377:138:140:220:237:0.628647:74:146:100:38:90:147:99:41 chr1 145311110 . G C 571.07 PASS AF=0.236702;AO=89;DP=376;FAO=89;FDP=376;FR=.;FRO=287;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=192;FSRR=95;FWDB=0.00507322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.377;QD=6.07517;RBI=0.0128453;REFB=-0.00932822;REVB=0.011801;RO=287;SAF=53;SAR=36;SRF=192;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997283;STB=0.559525;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.018964;OID=.;OPOS=145311110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:376:287:287:89:89:0.236702:36:53:192:95:36:53:192:95 chr1 145311828 . C G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.292;QD=58.5864;RBI=0.0188519;REFB=0;REVB=-0.00300915;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145318;OID=.;OPOS=145311828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chr1 145368461 . A C 645.1 PASS AF=0.461538;AO=66;DP=142;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=0.00341999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.328;QD=18.0448;RBI=0.0194705;REFB=-0.0117096;REVB=-0.0191678;RO=76;SAF=34;SAR=32;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061738;STB=0.530378;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0155851;OID=.;OPOS=145368461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:76:77:66:66:0.461538:32:34:44:32:32:34:44:33 chr1 145368518 . C T 36.29 PASS AF=0.0696517;AO=14;DP=199;FAO=14;FDP=201;FR=.;FRO=187;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=101;FSRR=86;FWDB=-0.035681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.37;QD=0.722247;RBI=0.0567143;REFB=-0.00355525;REVB=-0.0440837;RO=183;SAF=10;SAR=4;SRF=99;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195789;STB=0.669392;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0279242;OID=.;OPOS=145368518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:199:201:183:187:14:14:0.0696517:4:10:99:84:4:10:101:86 chr1 145379324 . C A 61.63 PASS AF=0.236842;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0517488;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.333;QD=6.48711;RBI=0.0528024;REFB=-0.00213243;REVB=-0.0104952;RO=29;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00462376;STB=0.502952;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00713481;OID=.;OPOS=145379324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:39:38:29:29:9:9:0.236842:5:4:13:16:5:4:13:16 chr1 145379352 . T A 34.88 PASS AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0181485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.007;QD=4.81112;RBI=0.0265636;REFB=-0.000829607;REVB=0.0193973;RO=23;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3641;STB=0.752478;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0132269;OID=.;OPOS=145379352;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:5:1:10:13:5:1:10:13 chr1 145379371 . TCACCATTA T 50.0 PASS AO=62;DP=291;LEN=8;RO=229;SAF=25;SAR=43;SRF=120;SRR=103;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=145379372;OREF=CACCATTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:291:229:62:43:25:120:103 chr1 145395530 . G A 394.05 PASS AF=0.44086;AO=40;DP=95;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0248822;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.469;QD=16.9482;RBI=0.0364107;REFB=-0.0162786;REVB=-0.0265822;RO=52;SAF=17;SAR=23;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15225;STB=0.590532;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0266617;OID=.;OPOS=145395530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:52:52:40:41:0.44086:23:17:30:22:24:17:30:22 chr1 145397942 . A T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.719;QD=58.5878;RBI=0.0040565;REFB=0;REVB=-0.00380511;RO=0;SAF=4;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.63402e-06;OID=.;OPOS=145397942;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:29:4:0:0:29:4:0:0 chr1 145397947 . A G 501.52 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3826;QD=59.0024;RBI=0.0351941;REFB=0;REVB=0.0278247;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000703638;OID=.;OPOS=145397947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:30:4:0:0:30:4:0:0 chr1 145399229 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.406;QD=61.6837;RBI=0.0361989;REFB=0;REVB=0.0295527;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150987;OID=.;OPOS=145399229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr1 145442254 . G C 958.51 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0917;QD=58.0916;RBI=0.0758334;REFB=0;REVB=0.0242665;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416071;OID=.;OPOS=145442254;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:66:0:0:60:66:1:36:24:0:0:37:29:0:0 chr1 145532549 . T C 801.17 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158456;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.125;QD=57.2264;RBI=0.0167595;REFB=0;REVB=0.00545871;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46538e-05;OID=.;OPOS=145532549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:33:22:0:0:33:23:0:0 chr1 145561594 . C T 75.6 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0111248;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.746;QD=11.6304;RBI=0.0195579;REFB=-0.0164559;REVB=-0.0160857;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32826;STB=0.689353;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0200282;OID=.;OPOS=145561594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:4:6:14:2:4:6:14:2 chr1 145562293 . G C 103.33 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0504317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0296;QD=18.7867;RBI=0.0576565;REFB=-0.0663053;REVB=0.027945;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013628;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0331257;OID=.;OPOS=145562293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:5:7:6:4:5:7:6:4 chr1 145562881 . T C 586.55 PASS AF=0.54;AO=54;DP=99;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0358186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4565;QD=23.462;RBI=0.0358261;REFB=-0.0128073;REVB=0.000730623;RO=45;SAF=20;SAR=34;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02608;STB=0.520809;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.012774;OID=.;OPOS=145562881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:45:46:54:54:0.54:34:20:18:27:34:20:19:27 chr1 145586309 . C T 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00885608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.104;QD=64.1538;RBI=0.0296416;REFB=0;REVB=0.0282877;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27894e-05;OID=.;OPOS=145586309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0 chr1 145586403 . G T 1804.17 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=353.201;QD=61.1582;RBI=0.019266;REFB=0;REVB=0.0188743;RO=0;SAF=58;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.0496e-05;OID=.;OPOS=145586403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:60:58:0:0:60:58:0:0 chr1 145588905 . G A 88.49 PASS AF=0.44;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0403891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3516;QD=14.1589;RBI=0.0929348;REFB=-0.0260307;REVB=-0.0836994;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276263;STB=0.678877;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0300053;OID=.;OPOS=145588905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:25:14:14:10:11:0.44:2:8:8:6:2:9:8:6 chr1 146057292 . T C 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.013109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.79;QD=17.7326;RBI=0.0139445;REFB=-0.00347752;REVB=-0.00475427;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342104;STB=0.69211;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00480209;OID=.;OPOS=146057292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:9:8:16:3:9:8:16:3 chr1 146215223 . G C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9694;QD=33.4285;RBI=0.0249773;REFB=0;REVB=-0.0249773;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00256989;OID=.;OPOS=146215223;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr1 146215232 . A C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=375.818;QD=33.4285;RBI=0.00640491;REFB=0;REVB=0.00640491;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17328e-05;OID=.;OPOS=146215232;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr1 146215276 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6688;QD=33.4284;RBI=3.99825e-05;REFB=0;REVB=3.99825e-05;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95865e-06;OID=.;OPOS=146215276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr1 146246193 . G A 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.037689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.018;QD=18.7117;RBI=0.0379834;REFB=0.0021839;REVB=0.00471945;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313633;STB=0.675504;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00308015;OID=.;OPOS=146246193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:3:16:9:9:3:16 chr1 146395447 . A G 236.81 PASS AF=0.329545;AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.000108052;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.371;QD=10.7643;RBI=0.0066808;REFB=-0.010659;REVB=0.00667993;RO=59;SAF=14;SAR=15;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107391;STB=0.562457;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0215332;OID=.;OPOS=146395447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:59:59:29:29:0.329545:15:14:34:25:15:14:34:25 chr1 146494510 . TG CA 91.16 PASS AF=0.255319;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00608794;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=2;MLLD=207.796;QD=7.75846;RBI=0.0139493;REFB=-0.0118478;REVB=0.0125507;RO=35;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188167;STB=0.617446;STBP=0.373;TYPE=mnp;VARB=0.0418935;OID=.;OPOS=146494510;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:48:47:35:35:12:12:0.255319:8:4:17:18:8:4:17:18 chr1 146495752 . C T 93.05 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0207289;FXX=0.0434688;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.396;QD=8.45891;RBI=0.0207321;REFB=-0.00400757;REVB=-0.00036511;RO=30;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.659892;STB=0.877834;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0125485;OID=.;OPOS=146495752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:46:44:30:32:12:12:0.272727:2:10:6:24:2:10:8:24 chr1 146496389 . C T 449.09 PASS AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0159627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.147;QD=21.3852;RBI=0.0258264;REFB=-0.00473819;REVB=-0.0203025;RO=40;SAF=20;SAR=24;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608371;STB=0.533607;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00397602;OID=.;OPOS=146496389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:24:20:21:19:24:20:21:19 chr1 146672906 . C T 1577.45 PASS AF=1;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899453;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.518;QD=60.0932;RBI=0.0115043;REFB=0;REVB=-0.00717273;RO=0;SAF=40;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02925e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35755e-07;OID=.;OPOS=146672906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:105:0:0:105:105:1:65:40:0:0:65:40:0:0 chr1 146714392 . G C 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00167533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.832;QD=15.1969;RBI=0.014033;REFB=-0.0089723;REVB=0.0139327;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892394;STB=0.551811;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00983697;OID=.;OPOS=146714392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:5:9:10:8:5:9:10:8 chr1 146728162 . T A,TA 448.79 PASS AF=0,1;AO=2,30;DP=32;FAO=0,32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00653933,-0.0257266;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=295.428,28.1938;QD=56.0992;RBI=0.0200116,0.191945;REFB=0,0;REVB=-0.018913,-0.190214;RO=0;SAF=1,15;SAR=1,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.00902085;OID=.,.;OPOS=146728162,146728163;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:4:32:32:0:0:2,30:0,32:0,1:1,15:1,15:0:0:0,16:0,16:0:0 chr1 146751782 . A C 1787.69 PASS AF=0.991597;AO=116;DP=117;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00439137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.424;QD=60.0903;RBI=0.0439937;REFB=-0.0896047;REVB=0.0437739;RO=1;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00922077;STB=0.504672;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000166854;OID=.;OPOS=146751782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:117:119:1:1:116:118:0.991597:51:65:0:1:53:65:0:1 chr1 146767149 . G T 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.716;QD=64.154;RBI=0.0150599;REFB=0;REVB=0.0080066;RO=0;SAF=56;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53694e-05;OID=.;OPOS=146767149;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:43:56:0:0:43:56:0:0 chr1 147119273 . G A 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00543979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.594;QD=60.2294;RBI=0.00890981;REFB=0;REVB=0.00705645;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1532e-05;OID=.;OPOS=147119273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:13:24:0:0:13:24:0:0 chr1 147121977 . C T 2111.17 PASS AF=1;AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433515;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.182;QD=63.0201;RBI=0.0197506;REFB=0;REVB=0.0192689;RO=0;SAF=71;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000663552;OID=.;OPOS=147121977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:134:0:0:134:134:1:63:71:0:0:63:71:0:0 chr1 147124310 . T G 1549.76 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4963;QD=63.9074;RBI=0.0386721;REFB=0;REVB=0.0368726;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107054;OID=.;OPOS=147124310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:43:53:0:0:44:53:0:0 chr1 147229299 . G A 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00644308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0738;QD=30.7901;RBI=0.0189936;REFB=0.0225007;REVB=-0.0178674;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.571246;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.0251111;OID=.;OPOS=147229299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:0:1:3:5:0:1 chr1 147735828 . C T 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0826686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.702;QD=63.2843;RBI=0.0847788;REFB=0;REVB=-0.0187976;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0014004;OID=.;OPOS=147735828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr1 147781062 . A G 267.47 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0359629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.709;QD=13.7165;RBI=0.0359676;REFB=-0.00773624;REVB=-0.000581819;RO=47;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162955;STB=0.592535;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0158756;OID=.;OPOS=147781062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:15:16:17:30:15:16:17:30 chr1 147806874 . G C 329.56 PASS AF=0.377358;AO=40;DP=107;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.0130998;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.25;QD=12.4362;RBI=0.0283892;REFB=-0.0148474;REVB=-0.0251862;RO=66;SAF=24;SAR=16;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110704;STB=0.563186;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0230428;OID=.;OPOS=147806874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:66:66:40:40:0.377358:16:24:33:33:16:24:33:33 chr1 147806880 . T C 1587.18 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2365;QD=64.1283;RBI=0.0177122;REFB=0;REVB=0.0138495;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82035e-05;OID=.;OPOS=147806880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:45:54:0:0:45:54:0:0 chr1 147825732 . C G 120.09 PASS AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0221401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.265;QD=9.4188;RBI=0.0265529;REFB=-0.0170491;REVB=0.0146585;RO=36;SAF=5;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20058;STB=0.621456;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0392043;OID=.;OPOS=147825732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:10:5:18:18:10:5:18:18 chr1 147825763 . G A 68.92 PASS AF=0.217391;AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00870348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.454;QD=5.99325;RBI=0.00870644;REFB=-0.00590936;REVB=-0.000227146;RO=34;SAF=3;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147123;STB=0.599791;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00915683;OID=.;OPOS=147825763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:46:46:34:36:10:10:0.217391:7:3:14:20:7:3:15:21 chr1 147825765 . G A 69.17 PASS AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0546782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0815;QD=6.14805;RBI=0.0549496;REFB=0.00268925;REVB=-0.00545483;RO=35;SAF=3;SAR=7;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167697;STB=0.608469;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.00546283;OID=.;OPOS=147825765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:7:3:15:20:7:3:15:20 chr1 148009349 . A G 64.62 PASS AF=0.180328;AO=11;DP=61;FAO=11;FDP=61;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.00645213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.255;QD=4.23758;RBI=0.0266721;REFB=-0.0044133;REVB=0.0258799;RO=50;SAF=9;SAR=2;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296625;STB=0.702188;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0306211;OID=.;OPOS=148009349;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:61:61:50:50:11:11:0.180328:2:9:31:19:2:9:31:19 chr1 148009367 . A G 33.71 PASS AF=0.1;AO=8;DP=80;FAO=8;FDP=80;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.00250294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.021;QD=1.68561;RBI=0.0279639;REFB=-0.00194774;REVB=-0.0278517;RO=72;SAF=7;SAR=1;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419417;STB=0.837099;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0146987;OID=.;OPOS=148009367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:80:80:72:72:8:8:0.1:1:7:39:33:1:7:39:33 chr1 148009510 . G A 92.38 PASS AF=0.13245;AO=20;DP=151;FAO=20;FDP=151;FR=.;FRO=131;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=74;FSRR=57;FWDB=-0.0325196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.317;QD=2.44714;RBI=0.0368034;REFB=-9.14851e-05;REVB=-0.0172328;RO=131;SAF=12;SAR=8;SRF=74;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451724;STB=0.531304;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0005966;OID=.;OPOS=148009510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:151:151:131:131:20:20:0.13245:8:12:74:57:8:12:74:57 chr1 148342488 . T C 39.03 PASS AF=0.0744681;AO=14;DP=190;FAO=14;FDP=188;FR=.;FRO=174;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=109;FSRR=65;FWDB=0.00638092;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.264;QD=0.83046;RBI=0.0216433;REFB=-0.0041234;REVB=-0.0206813;RO=173;SAF=10;SAR=4;SRF=109;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103951;STB=0.59163;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0361602;OID=.;OPOS=148342488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:190:188:173:174:14:14:0.0744681:4:10:109:64:4:10:109:65 chr1 149155848 . C T 486.74 PASS AF=0.495146;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0297181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6801;QD=18.9026;RBI=0.0387113;REFB=-0.0197904;REVB=-0.0248073;RO=50;SAF=27;SAR=24;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275358;STB=0.514346;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0141291;OID=.;OPOS=149155848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:50:52:51:51:0.495146:24:27:28:22:24:27:29:23 chr1 149211947 . C G 60.26 PASS AF=0.118644;AO=14;DP=117;FAO=14;FDP=118;FR=.;FRO=104;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=0.0333918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.881;QD=2.04288;RBI=0.0466932;REFB=0.00471735;REVB=-0.0326381;RO=103;SAF=1;SAR=13;SRF=56;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587329;STB=0.923318;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0356115;OID=.;OPOS=149211947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:117:118:103:104:14:14:0.118644:13:1:56:47:13:1:56:48 chr1 149211962 . T C 96.28 PASS AF=0.143885;AO=20;DP=139;FAO=20;FDP=139;FR=.;FRO=119;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=62;FSRR=57;FWDB=-0.00998457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.801;QD=2.77058;RBI=0.0100035;REFB=-0.0120602;REVB=0.000615116;RO=119;SAF=7;SAR=13;SRF=62;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216169;STB=0.646573;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.025244;OID=.;OPOS=149211962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:139:139:119:119:20:20:0.143885:13:7:62:57:13:7:62:57 chr1 149211967 . G A 136.68 PASS AF=0.168919;AO=25;DP=150;FAO=25;FDP=148;FR=.;FRO=123;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=61;FSRR=62;FWDB=-0.0155036;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.607;QD=3.6941;RBI=0.0156782;REFB=-0.00647945;REVB=-0.00233318;RO=124;SAF=11;SAR=14;SRF=63;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869611;STB=0.5466;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0144357;OID=.;OPOS=149211967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:148:124:123:25:25:0.168919:14:11:63:61:14:11:61:62 chr1 149211975 . C A 187.64 PASS AF=0.202532;AO=32;DP=158;FAO=32;FDP=158;FR=.;FRO=126;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=63;FSRR=63;FWDB=0.0147003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7478;QD=4.75033;RBI=0.0148181;REFB=-0.00294378;REVB=-0.00186516;RO=126;SAF=15;SAR=17;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399011;STB=0.524925;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0112312;OID=.;OPOS=149211975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:126:126:32:32:0.202532:17:15:63:63:17:15:63:63 chr1 149211992 . G A 209.14 PASS AF=0.197802;AO=36;DP=184;FAO=36;FDP=182;FR=.;FRO=146;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=74;FSRR=72;FWDB=-0.0231986;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.408;QD=4.59643;RBI=0.0240041;REFB=-0.00166058;REVB=-0.00616636;RO=144;SAF=16;SAR=20;SRF=72;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712589;STB=0.550094;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00757456;OID=.;OPOS=149211992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:182:144:146:36:36:0.197802:20:16:72:72:20:16:74:72 chr1 149211998 . T G 234.46 PASS AF=0.206349;AO=39;DP=189;FAO=39;FDP=189;FR=.;FRO=150;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=72;FSRR=78;FWDB=-0.0306415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.154;QD=4.96219;RBI=0.0329134;REFB=-0.00226126;REVB=0.0120162;RO=147;SAF=19;SAR=20;SRF=69;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227582;STB=0.505701;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0106139;OID=.;OPOS=149211998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:147:150:39:39:0.206349:20:19:69:78:20:19:72:78 chr1 149215180 . T C 374.62 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00350552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.478;QD=20.8122;RBI=0.00434373;REFB=-0.0307942;REVB=-0.00256501;RO=34;SAF=23;SAR=15;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151381;STB=0.50838;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0260745;OID=.;OPOS=149215180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:15:23:20:14:15:23:20:14 chr1 149224130 . G A 165.39 PASS AF=0.188312;AO=29;DP=155;FAO=29;FDP=154;FR=.;FRO=125;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=63;FSRR=62;FWDB=-0.013239;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0831;QD=4.29571;RBI=0.0526617;REFB=-0.00672332;REVB=0.0509704;RO=115;SAF=15;SAR=14;SRF=56;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385653;STB=0.510745;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0476244;OID=.;OPOS=149224130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:115:125:29:29:0.188312:14:15:56:59:14:15:63:62 chr1 149286406 . T C 59.17 PASS AF=0.114754;AO=12;DP=119;FAO=14;FDP=122;FR=.;FRO=108;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=76;FWDB=-0.105056;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.0854;QD=1.93991;RBI=0.108253;REFB=-0.0117547;REVB=-0.0261148;RO=107;SAF=1;SAR=11;SRF=31;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362925;STB=0.827576;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.086524;OID=.;OPOS=149286406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:119:122:107:108:12:14:0.114754:11:1:31:76:13:1:32:76 chr1 149286469 . C G 135.34 PASS AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=39;FWDB=-0.0388779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.93;QD=8.32853;RBI=0.0403341;REFB=-0.00730937;REVB=0.0107401;RO=46;SAF=3;SAR=16;SRF=7;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128665;STB=0.507684;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.020752;OID=.;OPOS=149286469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:46:46:19:19:0.292308:16:3:7:39:16:3:7:39 chr1 149287392 . T G 495.22 PASS AF=0.318408;AO=64;DP=201;FAO=64;FDP=201;FR=.;FRO=137;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=69;FSRR=68;FWDB=-0.0208905;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.769;QD=9.85517;RBI=0.0311133;REFB=-0.0122959;REVB=-0.0230569;RO=137;SAF=31;SAR=33;SRF=69;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022741;STB=0.513135;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0204202;OID=.;OPOS=149287392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:137:137:64:64:0.318408:33:31:69:68:33:31:69:68 chr1 149294658 . G A 976.52 PASS AF=0.586667;AO=75;DP=137;FAO=88;FDP=150;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.0499793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.919;QD=26.0406;RBI=0.0505252;REFB=-0.019975;REVB=0.0074069;RO=61;SAF=29;SAR=46;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220108;STB=0.582963;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0126418;OID=.;OPOS=149294658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:150:61:62:75:88:0.586667:46:29:40:21:49:39:40:22 chr1 149294693 . G C 907.46 PASS AF=0.572414;AO=81;DP=145;FAO=83;FDP=145;FR=.;FRO=62;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.0178125;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.628;QD=25.0335;RBI=0.017945;REFB=-0.0143043;REVB=-0.00217694;RO=59;SAF=33;SAR=48;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170108;STB=0.595019;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00921858;OID=.;OPOS=149294693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:59:62:81:83:0.572414:48:33:37:22:48:35:40:22 chr1 149294742 . C T 139.75 PASS AF=0.213592;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=103;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.00142754;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.962;QD=5.42723;RBI=0.0072057;REFB=-0.0051705;REVB=-0.00706287;RO=81;SAF=12;SAR=10;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157335;STB=0.597815;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0205617;OID=.;OPOS=149294742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:81:81:22:22:0.213592:10:12:34:47:10:12:34:47 chr1 149294744 . C T 140.04 PASS AF=0.213592;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=103;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=0.0245345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.456;QD=5.43838;RBI=0.0246097;REFB=-0.00367113;REVB=-0.00192214;RO=80;SAF=12;SAR=10;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166191;STB=0.607235;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0224874;OID=.;OPOS=149294744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:80:81:22:22:0.213592:10:12:33:47:10:12:33:48 chr1 149298554 . C A 226.14 PASS AF=0.564103;AO=21;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0438087;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9885;QD=23.1943;RBI=0.0439651;REFB=-0.0248825;REVB=-0.00370511;RO=17;SAF=7;SAR=14;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357767;STB=0.533304;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00361309;OID=.;OPOS=149298554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:17:17:21:22:0.564103:14:7:5:12:14:8:5:12 chr1 149298562 . GC AT 153.67 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.00671716;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=2;MLLD=231.032;QD=13.0786;RBI=0.0228766;REFB=0.00286891;REVB=-0.0218682;RO=30;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340865;STB=0.696905;STBP=0.06;TYPE=mnp;VARB=-0.00363502;OID=.;OPOS=149298562;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:30:30:17:17:0.361702:7:10:8:22:7:10:8:22 chr1 149298603 . G A 219.8 PASS AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=0.0125732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.441;QD=12.9295;RBI=0.0140664;REFB=-0.0301928;REVB=0.00630715;RO=41;SAF=16;SAR=11;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356376;STB=0.701326;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0311053;OID=.;OPOS=149298603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:41:41:27:27:0.397059:11:16:10:31:11:16:10:31 chr1 149334339 . G C 1370.0 PASS AF=0.327068;AO=174;DP=532;FAO=174;FDP=532;FR=.;FRO=358;FSAF=58;FSAR=116;FSRF=123;FSRR=235;FWDB=0.000813769;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.427;QD=10.3008;RBI=0.00405646;REFB=-0.00578676;REVB=-0.003974;RO=353;SAF=58;SAR=116;SRF=122;SRR=231;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160838;STB=0.507713;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0110599;OID=.;OPOS=149334339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:532:532:353:358:174:174:0.327068:116:58:122:231:116:58:123:235 chr1 149664423 . A G 401.75 PASS AF=0.347826;AO=48;DP=138;FAO=48;FDP=138;FR=.;FRO=90;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=36;FWDB=0.0502953;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.608;QD=11.6448;RBI=0.0503037;REFB=-0.00519404;REVB=-0.000917709;RO=86;SAF=22;SAR=26;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16317;STB=0.591579;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00671545;OID=.;OPOS=149664423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:86:90:48:48:0.347826:26:22:52:34:26:22:54:36 chr1 149676401 . A G 241.52 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0331099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.606;QD=12.3857;RBI=0.0337775;REFB=-0.00847732;REVB=-0.00668217;RO=49;SAF=14;SAR=15;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967173;STB=0.555518;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00868862;OID=.;OPOS=149676401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:15:14:28:21:15:14:28:21 chr1 149680227 . A G 998.62 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107157;FXX=0.0289813;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.288;QD=59.6189;RBI=0.010891;REFB=0;REVB=-0.00194599;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049799;OID=.;OPOS=149680227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0 chr1 149680293 . A C 33.96 PASS AF=0.111111;AO=7;DP=63;FAO=7;FDP=63;FR=.;FRO=56;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0258854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5392;QD=2.15614;RBI=0.0363608;REFB=0.00724222;REVB=-0.0255353;RO=55;SAF=2;SAR=5;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263692;STB=0.707166;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.0683142;OID=.;OPOS=149680293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:63:63:55:56:7:7:0.111111:5:2:28:27:5:2:29:27 chr1 149684085 . T C 90.31 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0155531;FXX=0.0689417;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8255;QD=13.3795;RBI=0.0508274;REFB=0.00436148;REVB=-0.0483893;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277675;STB=0.691913;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.0324437;OID=.;OPOS=149684085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:28:27:15:16:11:11:0.407407:9:2:6:9:9:2:7:9 chr1 149684119 . TA T 815.92 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.764;QD=57.2577;RBI=0.00479221;REFB=0;REVB=-0.00405859;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-1.20116e-06;OID=.;OPOS=149684120;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:57:57:57:57:0:26:31:0:0:5:0:26:31:0:0 chr1 149684166 . G A 135.97 PASS AF=0.294118;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00514456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0579;QD=7.99843;RBI=0.0271657;REFB=-0.00909475;REVB=-0.0266741;RO=47;SAF=5;SAR=15;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347509;STB=0.702912;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0305791;OID=.;OPOS=149684166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:47:48:20:20:0.294118:15:5:25:22:15:5:25:23 chr1 149684169 . G A 132.78 PASS AF=0.279412;AO=19;DP=68;FAO=19;FDP=68;FR=.;FRO=49;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0423706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.916;QD=7.8107;RBI=0.0460423;REFB=-0.0116896;REVB=-0.0180174;RO=49;SAF=5;SAR=14;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310548;STB=0.688317;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0254773;OID=.;OPOS=149684169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:49:49:19:19:0.279412:14:5:25:24:14:5:25:24 chr1 149684171 . A T 154.35 PASS AF=0.308824;AO=19;DP=66;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00507094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.603;QD=9.07919;RBI=0.0134714;REFB=-0.0189978;REVB=-0.0124805;RO=47;SAF=5;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331261;STB=0.716201;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0260405;OID=.;OPOS=149684171;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:47:47:19:21:0.308824:14:5:25:22:16:5:25:22 chr1 149711815 . G A 47.53 PASS AF=0.106195;AO=12;DP=113;FAO=12;FDP=113;FR=.;FRO=101;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=56;FSRR=45;FWDB=-0.00240635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.796;QD=1.68243;RBI=0.013446;REFB=-0.00175571;REVB=-0.0132289;RO=92;SAF=4;SAR=8;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264328;STB=0.693327;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0338008;OID=.;OPOS=149711815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:113:113:92:101:12:12:0.106195:8:4:51:41:8:4:56:45 chr1 149711845 . C A 35.62 PASS AF=0.0877193;AO=10;DP=113;FAO=10;FDP=114;FR=.;FRO=104;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=-0.0487474;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7906;QD=1.24993;RBI=0.0588089;REFB=-0.00422291;REVB=0.0328964;RO=103;SAF=4;SAR=6;SRF=51;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109141;STB=0.582872;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0530441;OID=.;OPOS=149711845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:113:114:103:104:10:10:0.0877193:6:4:51:52:6:4:51:53 chr1 149895842 . G T 116.3 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00953808;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.655;QD=25.8449;RBI=0.00989571;REFB=0.0134833;REVB=0.00263633;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776539;STB=0.543407;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.00417398;OID=.;OPOS=149895842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:18:18:4:4:12:12:0.666667:5:7:3:1:5:7:3:1 chr1 149908108 . A G 1005.15 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0841;QD=58.2698;RBI=0.00817638;REFB=0;REVB=0.00358432;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142337;OID=.;OPOS=149908108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:69:0:0:66:69:1:35:31:0:0:38:31:0:0 chr1 149914680 . AGGG AAGG,AGG,AGGA 86.77 PASS AF=0.222222,0,0.777778;AO=2,2,4;DP=9;FAO=2,0,7;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,6;FSAR=1,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602141,0.0745822,0.107459;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,1,1;MLLD=14.1978,26.0177,30.3012;QD=38.5641;RBI=0.122036,0.115048,0.108053;REFB=0,0,0;REVB=0.106147,-0.0875984,0.0113152;RO=0;SAF=1,2,3;SAR=1,0,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0.460204,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=-0.0110034,0,0.0385135;OID=.,.,.;OPOS=149914681,149914681,149914683;OREF=G,G,G;OALT=A,-,A;OMAPALT=AAGG,AGG,AGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.222222,0,0.777778:2,2,4:9:2,0,7:9:0:1,0,6:1,0,1:0:0:9:0:1,2,3:1,0,1:0:0 chr1 150123132 . C G 309.46 PASS AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.00396804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6736;QD=11.9023;RBI=0.0508782;REFB=-0.0100467;REVB=-0.0507232;RO=66;SAF=26;SAR=12;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306674;STB=0.675748;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0208444;OID=.;OPOS=150123132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:66:66:38:38:0.365385:12:26:27:39:12:26:27:39 chr1 150199039 . CTCCTCTTCCTCT CTCATCCTCCTCT,CTCCTCT,CTCCTCTTCCTCC 107.96 PASS AF=0.0416667,0.333333,0.166667;AO=2,6,4;DP=27;FAO=1,8,4;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=0,3,3;FSAR=1,5,1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0675072,0.000475839,-0.0141831;FXX=0.0768935;HRUN=2,2,2;LEN=4,6,1;MLLD=128.745,106.357,51.0106;QD=17.993;RBI=0.068382,0.0156473,0.0359242;REFB=-0.00331305,-0.0197266,-0.0357203;REVB=0.0109028,0.0156401,-0.0330058;RO=10;SAF=0,2,3;SAR=2,4,1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.57573,-0.173695,0.282644;STB=0.986937,0.507025,0.772874;STBP=0.531,0.98,0.26;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0228291,0.0368329,0.032007;OID=.,.,.;OPOS=150199042,150199040,150199051;OREF=CTCT,TCCTCT,T;OALT=ATCC,-,C;OMAPALT=CTCATCCTCCTCT,CTCCTCT,CTCCTCTTCCTCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0416667,0.333333,0.166667:2,6,4:27:1,8,4:24:11:0,3,3:1,5,1:4:7:30:10:0,2,3:2,4,1:5:5 chr1 150278741 . G GTC 325.94 PASS AF=0.896552;AO=22;DP=30;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0208301;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=2;MLLD=248.65;QD=44.9571;RBI=0.0333566;REFB=-0.0608697;REVB=0.0260533;RO=3;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368142;STB=0.52126;STBP=0.481;TYPE=ins;VARB=0.00491051;OID=.;OPOS=150278742;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=GTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.896552:22:30:26:29:3:14:12:1:2:14:3:11:11:1:2 chr1 150526044 . G C 205.14 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.000525066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3516;QD=15.7796;RBI=0.0240516;REFB=0.0266028;REVB=-0.0240458;RO=29;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812293;STB=0.546178;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.0351968;OID=.;OPOS=150526044;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:13:10:15:14:13:10:15:14 chr1 150526406 . C T 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0564079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6057;QD=22.144;RBI=0.0606268;REFB=-0.0145153;REVB=-0.0222208;RO=13;SAF=15;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339079;STB=0.695086;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0133915;OID=.;OPOS=150526406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:2:15:8:5:2:15:8:5 chr1 150531008 . T C 575.77 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.193;QD=60.6077;RBI=0.04257;REFB=0;REVB=0.0359503;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251813;OID=.;OPOS=150531008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr1 150531050 . G A 608.74 PASS AF=1;AO=29;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905803;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.096;QD=59.389;RBI=0.0873399;REFB=-0.126716;REVB=0.0868689;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019875;OID=.;OPOS=150531050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:42:41:0:0:29:41:1:13:16:0:0:20:21:0:0 chr1 150531170 . C T 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.387;QD=60.9771;RBI=0.0308245;REFB=0;REVB=-0.00396457;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114618;OID=.;OPOS=150531170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr1 150547747 . G A 71.11 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0141425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5317;QD=14.9704;RBI=0.0189265;REFB=-0.000973159;REVB=-0.0125778;RO=8;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44639;STB=0.754021;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00981361;OID=.;OPOS=150547747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:8:9:9:9:0.473684:1:8:4:4:1:8:5:4 chr1 150597890 . G A 242.39 PASS AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0174277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.696;QD=29.3805;RBI=0.0267855;REFB=-0.0210477;REVB=-0.0203405;RO=11;SAF=13;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282188;STB=0.515567;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00949689;OID=.;OPOS=150597890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:9:13:6:5:9:13:6:5 chr1 150679033 . G A 277.41 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0152396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2265;QD=18.4939;RBI=0.0258836;REFB=-0.0183796;REVB=-0.0209216;RO=30;SAF=17;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601557;STB=0.53361;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0162088;OID=.;OPOS=150679033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:13:17:15:15:13:17:15:15 chr1 150727539 . G A 220.93 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00175357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1983;QD=18.0353;RBI=0.0440144;REFB=-0.0178187;REVB=-0.0439794;RO=27;SAF=14;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118527;STB=0.567505;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00937454;OID=.;OPOS=150727539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:8:14:14:13:8:14:14:13 chr1 150771703 . T C 1008.47 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.935;QD=59.3219;RBI=0.0466431;REFB=0;REVB=-0.0161473;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51155e-05;OID=.;OPOS=150771703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0 chr1 150779755 . C T 2249.13 PASS AF=0.979592;AO=143;DP=147;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0275676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.647;QD=61.2009;RBI=0.0538496;REFB=-0.0228956;REVB=-0.0462581;RO=4;SAF=71;SAR=72;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131078;STB=0.503401;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00340207;OID=.;OPOS=150779755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:147:147:4:3:143:144:0.979592:72:71:3:1:72:72:2:1 chr1 150782797 . C T 130.02 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0467845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.104;QD=13.3348;RBI=0.0564959;REFB=0.0108803;REVB=0.0316701;RO=24;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106613;STB=0.562416;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.0174175;OID=.;OPOS=150782797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:9:6:12:12:9:6:12:12 chr1 150808889 . C G 281.36 PASS AF=0.517241;AO=28;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0284643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.205;QD=19.4043;RBI=0.0332689;REFB=0.000803778;REVB=0.0172221;RO=28;SAF=10;SAR=18;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100635;STB=0.531893;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.000764278;OID=.;OPOS=150808889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:28:30:0.517241:18:10:13:15:18:12:13:15 chr1 150937771 . T A 1876.72 PASS AF=1;AO=76;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=87;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383723;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=24.1387;QD=55.6066;RBI=0.230888;REFB=-0.0121306;REVB=0.227677;RO=1;SAF=57;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0082312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0175467;OID=.;OPOS=150937771;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:135:135:1:0:76:135:1:19:57:1:0:48:87:0:0 chr1 150940357 . GC TT 119.85 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0338231;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=2;MLLD=126.817;QD=21.7901;RBI=0.0354847;REFB=0.00620154;REVB=0.0107316;RO=9;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265052;STB=0.654253;STBP=0.301;TYPE=mnp;VARB=-0.00540888;OID=.;OPOS=150940357;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:23:22:9:9:13:13:0.590909:12:1:2:7:12:1:2:7 chr1 150960350 . A C 273.92 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.00303373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.715;QD=17.672;RBI=0.0098334;REFB=-0.0370452;REVB=0.00935373;RO=32;SAF=17;SAR=13;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14647;STB=0.581604;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0261608;OID=.;OPOS=150960350;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:13:17:23:9:13:17:23:9 chr1 150969567 . A G 594.44 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.924;QD=60.9678;RBI=0.0357548;REFB=0;REVB=0.00713784;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201223;OID=.;OPOS=150969567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:29:10:0:0:29:10:0:0 chr1 150969992 . T C 145.08 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.975;QD=44.6386;RBI=0.0376612;REFB=0;REVB=0.0348067;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031929;OID=.;OPOS=150969992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:6:6:0:0:7:6:0:0 chr1 150970577 . G T 495.98 PASS AF=1;AO=28;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.5182;QD=58.351;RBI=0.147404;REFB=0;REVB=0.0988789;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00445425;OID=.;OPOS=150970577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:28:34:1:12:16:0:0:14:20:0:0 chr1 150975108 . T C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3995;QD=53.9087;RBI=0.0458568;REFB=0;REVB=-0.010219;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312376;OID=.;OPOS=150975108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr1 151006539 . C A 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00368502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.415;QD=49.5981;RBI=0.0979051;REFB=0;REVB=0.0978358;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00331858;OID=.;OPOS=151006539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr1 151019180 . A G 958.97 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0150652;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0525;QD=55.5922;RBI=0.0328955;REFB=-0.201475;REVB=0.0292431;RO=2;SAF=33;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277783;STB=0.514701;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00764015;OID=.;OPOS=151019180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:69:69:2:2:67:67:0.971014:34:33:2:0:34:33:2:0 chr1 151040435 . G A 753.17 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.289;QD=56.8431;RBI=0.0249987;REFB=0;REVB=-0.000420966;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337782;OID=.;OPOS=151040435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:21:30:0:0:21:32:0:0 chr1 151104950 . G A 243.38 PASS AF=0.954545;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00891565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.916;QD=44.2516;RBI=0.055381;REFB=0.140718;REVB=0.0546586;RO=2;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708106;STB=0.518501;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.0014928;OID=.;OPOS=151104950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:22:22:2:1:20:21:0.954545:12:8:0:2:13:8:0:1 chr1 151105824 . C G 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0861259;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.1702;QD=23.221;RBI=0.145367;REFB=0.00507728;REVB=-0.117107;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.0225334;OID=.;OPOS=151105824;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0 chr1 151108137 . T G 833.54 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3106;QD=57.4852;RBI=0.0463837;REFB=0;REVB=-0.0155413;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000667636;OID=.;OPOS=151108137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:33:24:0:0:33:25:0:0 chr1 151209063 . C T 127.2 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.003918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.779;QD=11.5634;RBI=0.107811;REFB=0.00263298;REVB=-0.10774;RO=29;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561997;STB=0.533289;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.0063798;OID=.;OPOS=151209063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:8:7:15:14:8:7:15:14 chr1 151239051 . T C 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0131553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.569;QD=13.4591;RBI=0.0141353;REFB=-0.0160139;REVB=-0.00517135;RO=26;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226376;STB=0.631421;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.024424;OID=.;OPOS=151239051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:7:9:9:17:7:9:9:17 chr1 151254041 . T C 224.51 PASS AF=0.488889;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00393543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.287;QD=19.9566;RBI=0.0204201;REFB=-0.00457295;REVB=0.0200373;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161075;STB=0.578444;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00889926;OID=.;OPOS=151254041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:21:22:0.488889:11:10:7:16:12:10:7:16 chr1 151288172 . G A 274.29 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0297795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.647;QD=24.9358;RBI=0.0544172;REFB=-0.0271724;REVB=0.0455458;RO=19;SAF=6;SAR=19;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125987;STB=0.570379;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0145981;OID=.;OPOS=151288172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:19:6:7:12:19:6:7:12 chr1 151288391 . A G 785.79 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00639537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.548;QD=64.1464;RBI=0.0398795;REFB=0;REVB=0.0393634;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202376;OID=.;OPOS=151288391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr1 151316161 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.194;QD=44.6898;RBI=0.0188608;REFB=0;REVB=0.0140708;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138991;OID=.;OPOS=151316161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0 chr1 151372138 . G A 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0106897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.95;QD=14.6657;RBI=0.0107448;REFB=-0.00761702;REVB=0.00108646;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199743;STB=0.615237;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00850873;OID=.;OPOS=151372138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:8:7:14:7:8:7:14:7 chr1 151376067 . A G 241.03 PASS AF=0.522727;AO=18;DP=45;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.000553317;FXX=0.0222173;HRUN=6;LEN=1;MLLD=66.1722;QD=21.9117;RBI=0.00307769;REFB=-0.00200636;REVB=0.00302754;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146424;STB=0.564796;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00193189;OID=.;OPOS=151376067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:16:21:18:23:0.522727:11:7:9:7:15:8:10:11 chr1 151376075 . T C 292.31 PASS AF=0.574468;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0495366;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7225;QD=24.8772;RBI=0.0499469;REFB=-0.00529829;REVB=-0.00638894;RO=22;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133033;STB=0.596941;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00182804;OID=.;OPOS=151376075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:22:20:26:27:0.574468:17:9:11:11:18:9:11:9 chr1 151377407 . A C 404.24 PASS AF=0.43299;AO=41;DP=95;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=0.00349109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.082;QD=16.6698;RBI=0.012696;REFB=-0.0195813;REVB=-0.0122065;RO=54;SAF=21;SAR=20;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180671;STB=0.597893;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0309915;OID=.;OPOS=151377407;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:54:55:41:42:0.43299:20:21:18:36:21:21:18:37 chr1 151497202 . G A 260.44 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0747689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.981;QD=14.4691;RBI=0.080231;REFB=-0.029992;REVB=0.0290967;RO=42;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734204;STB=0.541639;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0509279;OID=.;OPOS=151497202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:15:15:18:24:15:15:18:24 chr1 151666826 . CTTTTTTTTTTT CTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTC,TCTTTTTTTTTT 262.29 PASS AF=0,0.905882,0.0823529,0;AO=10,33,5,3;DP=85;FAO=0,77,7,0;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=0,49,3,0;FSAR=0,28,4,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0817688,0.186247,0.114668,0.0136717;FXX=0.0116266;HRUN=11,11,11,1;LEN=2,1,1,2;MLLD=6.92136,4.98459,16.9129,19.0211;QD=12.3431;RBI=0.0823807,0.1863,0.118145,0.0463984;REFB=-0.0164121,-0.0324175,-0.00468058,-0.00455837;REVB=-0.0100226,-0.00442255,-0.0284523,-0.0443384;RO=30;SAF=4,22,1,2;SAR=6,11,4,1;SRF=21;SRR=9;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.347606,-0.0325729,-0.536326,-0.0400916;STB=0.5,0.505049,0.571224,0.5;STBP=1,0.534,0.543,1;TYPE=del,del,snp,mnp;VARB=0,0.0873796,-0.171808,-0.0128299;OID=.,.,.,.;OPOS=151666827,151666827,151666837,151666826;OREF=TT,T,T,CT;OALT=-,-,C,TC;OMAPALT=CTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTC,TCTTTTTTTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:16:85:85:30:1:10,33,5,3:0,77,7,0:0,0.905882,0.0823529,0:6,11,4,1:4,22,1,2:21:9:0,28,4,0:0,49,3,0:1:0 chr1 151670590 . CAG CA,C 194.81 PASS AF=0,0.418182;AO=6,18;DP=56;FAO=0,23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=0,12;FSAR=0,11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0529829,-0.000839684;FXX=0.017854;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=10.1027,243.947;QD=14.168;RBI=0.138985,0.0203798;REFB=-0.0578128,-0.0211496;REVB=0.12849,0.0203625;RO=24;SAF=6,10;SAR=0,8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0.672727,0;SSEP=0.648649,0;SSSB=0.688518,0.0139466;STB=0.5,0.542094;STBP=1,0.627;TYPE=del,del;VARB=0.101567,0.0225587;OID=.,.;OPOS=151670592,151670591;OREF=G,AG;OALT=-,-;OMAPALT=CA,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.418182:6,18:56:0,23:55:32:0,12:0,11:19:13:99:24:6,10:0,8:13:11 chr1 151675414 . A G 256.18 PASS AF=0.913043;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0646011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3469;QD=44.5523;RBI=0.0722335;REFB=-0.0229551;REVB=-0.0323168;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439301;STB=0.545411;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00706248;OID=.;OPOS=151675414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:23:1:2:21:21:0.913043:10:11:0:1:10:11:0:2 chr1 151686983 . T A 859.15 PASS AF=0.890411;AO=59;DP=68;FAO=65;FDP=73;FR=.;FRO=8;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0134489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2399;QD=47.0765;RBI=0.0511056;REFB=-0.05516;REVB=-0.0493043;RO=8;SAF=22;SAR=37;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14428;STB=0.568944;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0511975;OID=.;OPOS=151686983;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:68:73:8:8:59:65:0.890411:37:22:8:0:40:25:8:0 chr1 151735545 . A G 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0028222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.466;QD=13.0909;RBI=0.022575;REFB=-0.00140033;REVB=-0.0223979;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17156;STB=0.600783;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0011367;OID=.;OPOS=151735545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:11:9:8:5:11:9 chr1 151740666 . T C 871.85 PASS AF=0.983871;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0677566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2646;QD=56.2483;RBI=0.0677569;REFB=-0.0233701;REVB=0.000196456;RO=1;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149779;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00348933;OID=.;OPOS=151740666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:62:1:1:59:61:0.983871:31:28:0:1:31:30:0:1 chr1 151746235 . C T 392.05 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.00065565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6386;QD=16.8622;RBI=0.002378;REFB=0.00342455;REVB=-0.00228583;RO=52;SAF=26;SAR=15;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402321;STB=0.522602;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.00437923;OID=.;OPOS=151746235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:15:26:31:21:15:26:31:21 chr1 151773851 . T A 69.02 PASS AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.00333706;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1157;QD=8.36631;RBI=0.0302542;REFB=-0.0479824;REVB=-0.0300696;RO=22;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150529;STB=0.583157;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0588012;OID=.;OPOS=151773851;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:33:33:22:24:9:9:0.272727:5:4:7:15:5:4:8:16 chr1 151789702 . TG T 153.94 PASS AF=0.55;AO=20;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0142125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8938;QD=15.394;RBI=0.227088;REFB=-0.0506624;REVB=-0.226643;RO=17;SAF=0;SAR=20;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.87196;STB=0.890706;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0246555;OID=.;OPOS=151789703;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.55:20:39:22:40:18:2:20:16:2:77:17:0:20:15:2 chr1 151814234 . A G 526.76 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0185398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.176;QD=56.9473;RBI=0.0375508;REFB=0.0432235;REVB=0.0326548;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000624347;OID=.;OPOS=151814234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:18:18:0:0:18:18:1:0 chr1 151820298 . G C 903.2 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1344;QD=58.2707;RBI=0.0395052;REFB=0;REVB=0.0324721;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568004;OID=.;OPOS=151820298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:23:38:0:0:23:39:0:0 chr1 151820324 . T C 817.1 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.717;QD=57.3407;RBI=0.0973472;REFB=0;REVB=0.0923258;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368151;OID=.;OPOS=151820324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:21:34:0:0:23:34:0:0 chr1 151825991 . G T 842.09 PASS AF=0.911765;AO=62;DP=68;FAO=62;FDP=68;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.000702538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.175;QD=49.5347;RBI=0.0467598;REFB=-0.0202968;REVB=0.0467546;RO=2;SAF=24;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700305;STB=0.540713;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00044747;OID=.;OPOS=151825991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:68:68:2:6:62:62:0.911765:38:24:1:1:38:24:5:1 chr1 151845569 . A G 859.69 PASS AF=0.968254;AO=42;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0192219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.486;QD=54.5834;RBI=0.0610922;REFB=-0.0718543;REVB=0.0579895;RO=0;SAF=42;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524992;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0046446;OID=.;OPOS=151845569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:63:63:0:2:42:61:0.968254:0:42:0:0:19:42:0:2 chr1 151845650 . G C 613.29 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6934;QD=61.3291;RBI=0.0783584;REFB=0;REVB=0.037406;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118479;OID=.;OPOS=151845650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chr1 151862661 . G A 152.4 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0504054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1831;QD=40.6396;RBI=0.0505454;REFB=-0.144969;REVB=0.00375882;RO=1;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698108;STB=0.538406;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0114745;OID=.;OPOS=151862661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:8:6:1:0:8:6:1:0 chr1 151867560 . G A,T 581.62 PASS AF=0.948718,0.0512821;AO=37,2;DP=39;FAO=37,2;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10,2;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119307,-0.0339575;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=147.46,27.1442;QD=59.6531;RBI=0.0122696,0.0376174;REFB=0,0;REVB=-0.00286355,-0.0161851;RO=0;SAF=10,2;SAR=27,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.67388e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000968201,0.15067;OID=.,.;OPOS=151867560,151867560;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:39:39:0:0:37,2:37,2:0.948718,0.0512821:27,0:10,2:0:0:27,0:10,2:0:0 chr1 152079989 . T G 301.79 PASS AF=0.35;AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=100;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00526154;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.238;QD=12.0714;RBI=0.0106793;REFB=-0.00850437;REVB=-0.00929326;RO=65;SAF=14;SAR=21;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122752;STB=0.570809;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0141483;OID=.;OPOS=152079989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:65:65:35:35:0.35:21:14:33:32:21:14:33:32 chr1 152080754 . C G 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00442083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.752;QD=22.3408;RBI=0.0532348;REFB=0.00423203;REVB=0.0530509;RO=14;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556163;STB=0.531215;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=-0.00627102;OID=.;OPOS=152080754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:9:9:8:6:9:9:8:6 chr1 152081921 . G C 374.6 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00344059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.452;QD=20.8112;RBI=0.00477515;REFB=-0.0405245;REVB=-0.00331125;RO=34;SAF=21;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00534391;STB=0.502957;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.036661;OID=.;OPOS=152081921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:17:21:19:15:17:21:19:15 chr1 152085505 . A C 975.4 PASS AF=0.985294;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.136;QD=57.3766;RBI=0.101416;REFB=-0.178171;REVB=0.0994064;RO=1;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178244;STB=0.509088;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00432467;OID=.;OPOS=152085505;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:68:1:1:66:67:0.985294:26:40:0:1:27:40:0:1 chr1 152129087 . T C 296.56 PASS AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0134083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.847;QD=13.1806;RBI=0.0177124;REFB=-0.0520934;REVB=-0.0115736;RO=56;SAF=12;SAR=22;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145853;STB=0.583623;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0755501;OID=.;OPOS=152129087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:56:56:34:34:0.377778:22:12:27:29:22:12:27:29 chr1 152129094 . A G 249.06 PASS AF=0.357143;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0641674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.569;QD=11.8599;RBI=0.0670805;REFB=-0.0367816;REVB=0.0195537;RO=53;SAF=9;SAR=21;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203895;STB=0.613323;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0437568;OID=.;OPOS=152129094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:53:54:30:30:0.357143:21:9:25:28:21:9:25:29 chr1 152129098 . ACCA ACTG 81.79 PASS AF=0.125;AO=8;DP=81;FAO=10;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0738918;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=2;MLLD=170.483;QD=4.08934;RBI=0.0989789;REFB=-0.0295686;REVB=-0.0658545;RO=42;SAF=1;SAR=7;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.507069;STB=0.857736;STBP=0.025;TYPE=mnp;VARB=0.11594;OID=.;OPOS=152129100;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=ACTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.125:8:81:10:80:62:1:9:28:34:48:42:1:7:22:20 chr1 152129115 . T C 33.16 PASS AF=0.0865385;AO=8;DP=103;FAO=9;FDP=104;FR=.;FRO=95;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=68;FWDB=-0.0278423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4753;QD=1.27556;RBI=0.0295697;REFB=-0.0139686;REVB=-0.00995862;RO=94;SAF=3;SAR=5;SRF=26;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12539;STB=0.552128;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.157343;OID=.;OPOS=152129115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:103:104:94:95:8:9:0.0865385:5:3:26:68:6:3:27:68 chr1 152185750 . G A 1080.45 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6383;QD=60.025;RBI=0.0586743;REFB=0;REVB=0.000418012;RO=0;SAF=52;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346173;OID=.;OPOS=152185750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:20:52:0:0:20:52:0:0 chr1 152187628 . A G 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0443251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.469;QD=24.3274;RBI=0.0446353;REFB=-0.0995561;REVB=-0.00525264;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955799;STB=0.55539;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0229029;OID=.;OPOS=152187628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:1:1:5:2:1:1 chr1 152188413 . C T 439.45 PASS AF=0.441441;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=0.0083975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.768;QD=15.8359;RBI=0.0103052;REFB=-0.0149737;REVB=0.00597322;RO=62;SAF=20;SAR=29;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187383;STB=0.604787;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0146567;OID=.;OPOS=152188413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:62:62:49:49:0.441441:29:20:37:25:29:20:37:25 chr1 152190835 . G A 432.83 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181695;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5925;QD=57.7106;RBI=0.0823776;REFB=0;REVB=0.0803489;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178986;OID=.;OPOS=152190835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr1 152190945 . C T 2178.7 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.982;QD=63.1509;RBI=0.0399283;REFB=0;REVB=0.0296519;RO=0;SAF=61;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48328e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92182e-05;OID=.;OPOS=152190945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:77:61:0:0:77:61:0:0 chr1 152192555 . T C 784.63 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142388;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.428;QD=64.051;RBI=0.0580611;REFB=0;REVB=0.0562881;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000401239;OID=.;OPOS=152192555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:30:18:0:0:31:18:0:0 chr1 152192687 . T C 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.146;QD=62.7621;RBI=0.0360322;REFB=0;REVB=0.0342614;RO=0;SAF=41;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42715e-05;OID=.;OPOS=152192687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:48:41:0:0:48:41:0:0 chr1 152192978 . T C 1989.68 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.41;QD=62.1775;RBI=0.024054;REFB=0;REVB=-0.0131826;RO=0;SAF=78;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21785e-06;OID=.;OPOS=152192978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:50:78:0:0:50:78:0:0 chr1 152193052 . A G 1624.41 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4159;QD=60.1633;RBI=0.0168281;REFB=0;REVB=-0.0152879;RO=0;SAF=68;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.51753e-05;OID=.;OPOS=152193052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:40:68:0:0:40:68:0:0 chr1 152193547 . G A 1549.04 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.253;QD=63.8779;RBI=0.0197118;REFB=0;REVB=0.0162613;RO=0;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.61046e-05;OID=.;OPOS=152193547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:50:47:0:0:50:47:0:0 chr1 152276149 . C T 2254.14 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011382;FXX=0.0472941;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.268;QD=63.9472;RBI=0.0492712;REFB=0;REVB=0.0479385;RO=0;SAF=70;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.23847e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504879;OID=.;OPOS=152276149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:142:141:0:0:141:141:1:71:70:0:0:71:70:0:0 chr1 152276659 . TG CC 303.01 PASS AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00855122;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=235.022;QD=32.7574;RBI=0.0129371;REFB=-0.0143463;REVB=0.00970806;RO=11;SAF=14;SAR=12;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537579;STB=0.529389;STBP=0.609;TYPE=mnp;VARB=0.00611461;OID=.;OPOS=152276659;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:11:11:26:26:0.702703:12:14:7:4:12:14:7:4 chr1 152276671 . C T 582.59 PASS AF=0.813559;AO=48;DP=59;FAO=48;FDP=59;FR=.;FRO=11;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00423571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.008;QD=39.4976;RBI=0.00530738;REFB=-0.0176673;REVB=-0.00319798;RO=11;SAF=29;SAR=19;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117341;STB=0.506289;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00844423;OID=.;OPOS=152276671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:59:59:11:11:48:48:0.813559:19:29:7:4:19:29:7:4 chr1 152276699 . A G 36.62 PASS AF=0.0952381;AO=10;DP=105;FAO=10;FDP=105;FR=.;FRO=95;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=-0.025862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2473;QD=1.3952;RBI=0.0423595;REFB=-0.0105948;REVB=-0.0335483;RO=93;SAF=7;SAR=3;SRF=53;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160004;STB=0.617824;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.13387;OID=.;OPOS=152276699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:105:105:93:95:10:10:0.0952381:3:7:53:40:3:7:55:40 chr1 152276772 . C A 2612.71 PASS AF=0.982759;AO=171;DP=174;FAO=171;FDP=174;FR=.;FRO=3;FSAF=92;FSAR=79;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.01963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.52;QD=60.0623;RBI=0.0589657;REFB=0.0903043;REVB=0.0556023;RO=3;SAF=92;SAR=79;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00424699;STB=0.502232;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.000164552;OID=.;OPOS=152276772;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:174:174:3:3:171:171:0.982759:79:92:2:1:79:92:2:1 chr1 152276871 . A G 1788.19 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488895;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.703;QD=61.1348;RBI=0.0506605;REFB=0;REVB=-0.0132781;RO=0;SAF=66;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108915;OID=.;OPOS=152276871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:51:66:0:0:51:66:0:0 chr1 152276889 . A G 1617.03 PASS AF=1;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000803102;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.612;QD=59.8899;RBI=0.00171567;REFB=0;REVB=-0.0015161;RO=0;SAF=60;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129427;OID=.;OPOS=152276889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:107:108:1:47:60:0:0:47:61:0:0 chr1 152277055 . C G 815.45 PASS AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0409927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.771;QD=52.6097;RBI=0.0454575;REFB=-0.0249968;REVB=0.0196466;RO=3;SAF=28;SAR=31;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175426;STB=0.509307;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00194036;OID=.;OPOS=152277055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:62:62:3:3:59:59:0.951613:31:28:2:1:31:28:2:1 chr1 152277168 . A G 2457.62 PASS AF=1;AO=158;DP=158;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.12;QD=61.4405;RBI=0.0636077;REFB=0;REVB=0.0571605;RO=0;SAF=84;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.61369e-05;OID=.;OPOS=152277168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:158:160:0:0:158:160:1:74:84:0:0:75:85:0:0 chr1 152277345 . C T 1476.22 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0745359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0742;QD=62.1567;RBI=0.0918416;REFB=-0.0524633;REVB=0.0536589;RO=1;SAF=46;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101963;STB=0.505375;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0028468;OID=.;OPOS=152277345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:48:46:1:0:48:46:1:0 chr1 152277396 . T C 1400.24 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0320752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5998;QD=61.549;RBI=0.0322891;REFB=-0.0842927;REVB=0.00371035;RO=1;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099782;STB=0.505262;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0015053;OID=.;OPOS=152277396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:47:43:0:1:47:43:0:1 chr1 152277717 . C A 1201.5 PASS AF=1;AO=68;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.96;QD=60.8357;RBI=0.0661597;REFB=0;REVB=0.0333196;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027921;OID=.;OPOS=152277717;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:68:79:1:35:33:0:0:35:44:0:0 chr1 152278555 . T C 78.03 PASS AF=0.175;AO=14;DP=80;FAO=14;FDP=80;FR=.;FRO=66;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0662078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1758;QD=3.90169;RBI=0.0668231;REFB=-0.0113629;REVB=-0.00904749;RO=66;SAF=9;SAR=5;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144444;STB=0.595449;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0455039;OID=.;OPOS=152278555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:80:80:66:66:14:14:0.175:5:9:35:31:5:9:35:31 chr1 152278560 . T G 251.58 PASS AF=0.37037;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.00391211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.979;QD=12.4238;RBI=0.0242912;REFB=-0.0187948;REVB=-0.0239741;RO=51;SAF=16;SAR=14;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389722;STB=0.522373;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0233312;OID=.;OPOS=152278560;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:51:51:30:30:0.37037:14:16:29:22:14:16:29:22 chr1 152278689 . C A 3817.86 PASS AF=1;AO=231;DP=234;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477248;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.625;QD=60.3613;RBI=0.0677355;REFB=-0.0665077;REVB=0.0480671;RO=2;SAF=114;SAR=117;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00807575;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182211;OID=.;OPOS=152278689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:234:253:2:0:231:253:1:117:114:0:2:125:128:0:0 chr1 152278814 . C T 117.0 PASS AF=0.120833;AO=29;DP=240;FAO=29;FDP=240;FR=.;FRO=211;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=118;FSRR=93;FWDB=-0.0584437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.542;QD=1.95007;RBI=0.0584609;REFB=-0.00496811;REVB=-0.00141838;RO=209;SAF=16;SAR=13;SRF=116;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00418368;STB=0.506685;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0359996;OID=.;OPOS=152278814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:209:211:29:29:0.120833:13:16:116:93:13:16:118:93 chr1 152278856 . T G 431.4 PASS AF=0.337423;AO=55;DP=162;FAO=55;FDP=163;FR=.;FRO=108;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=62;FSRR=46;FWDB=-0.00543786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.501;QD=10.5866;RBI=0.00563716;REFB=-0.0216952;REVB=0.00148569;RO=105;SAF=30;SAR=25;SRF=59;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190228;STB=0.51918;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0407028;OID=.;OPOS=152278856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:105:108:55:55:0.337423:25:30:59:46:25:30:62:46 chr1 152278966 . C A 92.13 PASS AF=0.214286;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0213664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.291;QD=5.26468;RBI=0.0269548;REFB=0.00560994;REVB=-0.0164328;RO=55;SAF=9;SAR=6;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916685;STB=0.558061;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.0162034;OID=.;OPOS=152278966;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:70:70:55:55:15:15:0.214286:6:9:29:26:6:9:29:26 chr1 152279019 . G A 288.15 PASS AF=0.316667;AO=37;DP=118;FAO=38;FDP=120;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=-0.00729975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.229;QD=9.60511;RBI=0.00759112;REFB=-0.00544176;REVB=0.00208299;RO=79;SAF=17;SAR=20;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696275;STB=0.526302;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0181076;OID=.;OPOS=152279019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:79:82:37:38:0.316667:20:17:41:38:20:18:42:40 chr1 152279729 . C T 2984.31 PASS AF=0.97549;AO=199;DP=204;FAO=199;FDP=204;FR=.;FRO=5;FSAF=107;FSAR=92;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0520914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.962;QD=58.5159;RBI=0.052109;REFB=-0.144325;REVB=-0.00135273;RO=2;SAF=107;SAR=92;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000718343;STB=0.501536;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00154921;OID=.;OPOS=152279729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:204:204:2:5:199:199:0.97549:92:107:1:1:92:107:3:2 chr1 152279841 . G C 1524.46 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2641;QD=59.2023;RBI=0.0856363;REFB=0;REVB=0.0832966;RO=0;SAF=75;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515129;OID=.;OPOS=152279841;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:103:0:0:101:103:1:26:75:0:0:28:75:0:0 chr1 152279920 . A G 1607.1 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.01;QD=64.2839;RBI=0.044974;REFB=0;REVB=-0.00548718;RO=0;SAF=35;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49932e-05;OID=.;OPOS=152279920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:65:35:0:0:65:35:0:0 chr1 152280032 . T C 3611.57 PASS AF=1;AO=230;DP=231;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299004;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.292;QD=62.8099;RBI=0.0632167;REFB=-0.0795538;REVB=0.0556984;RO=1;SAF=122;SAR=108;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439207;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192243;OID=.;OPOS=152280032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:231:230:1:0:230:230:1:108:122:0:1:108:122:0:0 chr1 152280170 . C G 1716.27 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489307;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2436;QD=60.7529;RBI=0.0497936;REFB=0;REVB=-0.00922957;RO=0;SAF=41;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000412478;OID=.;OPOS=152280170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:72:41:0:0:72:41:0:0 chr1 152280372 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000932153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.328;QD=33.4285;RBI=0.000932153;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.60854e-05;OID=.;OPOS=152280372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr1 152280471 . C G 86.64 PASS AF=0.185185;AO=15;DP=82;FAO=15;FDP=81;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.035875;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6188;QD=4.27856;RBI=0.0359104;REFB=0.00923232;REVB=0.00159552;RO=66;SAF=11;SAR=4;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285863;STB=0.68724;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.0506331;OID=.;OPOS=152280471;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:82:81:66:66:15:15:0.185185:4:11:34:32:4:11:34:32 chr1 152280685 . C A 49.23 PASS AF=0.0772532;AO=18;DP=232;FAO=18;FDP=233;FR=.;FRO=215;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=123;FSRR=92;FWDB=-0.0121539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5794;QD=0.845192;RBI=0.0281748;REFB=0.00216191;REVB=-0.0254186;RO=214;SAF=3;SAR=15;SRF=122;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443182;STB=0.854446;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0503955;OID=.;OPOS=152280685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:232:233:214:215:18:18:0.0772532:15:3:122:92:15:3:123:92 chr1 152280687 . CA TG 59.76 PASS AF=0.0851064;AO=20;DP=236;FAO=20;FDP=235;FR=.;FRO=215;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=122;FSRR=93;FWDB=-0.0177817;FXX=0.00423711;HRUN=3;LEN=2;MLLD=208.326;QD=1.01727;RBI=0.0275279;REFB=-0.00054636;REVB=-0.0210142;RO=213;SAF=5;SAR=15;SRF=121;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361764;STB=0.778875;STBP=0.009;TYPE=mnp;VARB=0.014971;OID=.;OPOS=152280687;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:236:235:213:215:20:20:0.0851064:15:5:121:92:15:5:122:93 chr1 152280691 . A T 65.31 PASS AF=0.0889831;AO=21;DP=235;FAO=21;FDP=236;FR=.;FRO=215;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=122;FSRR=93;FWDB=-0.069093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.569;QD=1.10687;RBI=0.0733733;REFB=-0.000438312;REVB=-0.0246941;RO=211;SAF=6;SAR=15;SRF=120;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327023;STB=0.747438;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00443575;OID=.;OPOS=152280691;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:235:236:211:215:21:21:0.0889831:15:6:120:91:15:6:122:93 chr1 152280736 . T C 270.1 PASS AF=0.206278;AO=46;DP=223;FAO=46;FDP=223;FR=.;FRO=177;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=97;FSRR=80;FWDB=-0.0123593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.371;QD=4.84485;RBI=0.019074;REFB=-0.00775519;REVB=-0.0145281;RO=177;SAF=18;SAR=28;SRF=97;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199862;STB=0.623494;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0280213;OID=.;OPOS=152280736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:177:177:46:46:0.206278:28:18:97:80:28:18:97:80 chr1 152280759 . A G 393.64 PASS AF=0.274112;AO=54;DP=198;FAO=54;FDP=197;FR=.;FRO=143;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=75;FSRR=68;FWDB=-0.00635383;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.568;QD=7.99276;RBI=0.0196657;REFB=-0.00789627;REVB=-0.0186109;RO=142;SAF=19;SAR=35;SRF=74;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210617;STB=0.626977;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0171417;OID=.;OPOS=152280759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:142:143:54:54:0.274112:35:19:74:68:35:19:75:68 chr1 152280782 . A G 2275.5 PASS AF=0.993377;AO=148;DP=150;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187311;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2154;QD=60.2782;RBI=0.0300358;REFB=-0.0851666;REVB=-0.0234797;RO=1;SAF=61;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773302;STB=0.503999;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000816226;OID=.;OPOS=152280782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:150:151:1:1:148:150:0.993377:87:61:1:0:88:62:1:0 chr1 152280788 . T G 519.58 PASS AF=0.430769;AO=53;DP=134;FAO=56;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=73;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.0339919;FXX=0.0298485;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.816;QD=15.9872;RBI=0.0349515;REFB=-0.0199426;REVB=-0.00813393;RO=57;SAF=21;SAR=32;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906818;STB=0.568837;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0222657;OID=.;OPOS=152280788;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:130:57:73:53:56:0.430769:32:21:28:29:35:21:36:37 chr1 152280864 . A G 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.657;QD=60.3767;RBI=0.025509;REFB=0;REVB=0.00406299;RO=0;SAF=20;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.808e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13196e-05;OID=.;OPOS=152280864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:54:20:0:0:54:20:0:0 chr1 152280900 . T G 635.38 PASS AF=0.586538;AO=61;DP=104;FAO=61;FDP=104;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0088826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.481;QD=24.4376;RBI=0.0259661;REFB=0.000210773;REVB=-0.0243995;RO=43;SAF=13;SAR=48;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293792;STB=0.661504;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000819973;OID=.;OPOS=152280900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:43:43:61:61:0.586538:48:13:23:20:48:13:23:20 chr1 152281007 . AA GG 2055.31 PASS AF=0.605863;AO=184;DP=304;FAO=186;FDP=307;FR=.;FRO=121;FSAF=92;FSAR=94;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=-0.0103295;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=105.738;QD=26.7793;RBI=0.0166556;REFB=-0.0218583;REVB=-0.0130656;RO=118;SAF=92;SAR=92;SRF=59;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502767;STBP=0.889;TYPE=mnp;VARB=0.0127926;OID=.;OPOS=152281007;OREF=AA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:307:118:121:184:186:0.605863:92:92:59:59:94:92:59:62 chr1 152281039 . G A 1958.81 PASS AF=0.559633;AO=183;DP=327;FAO=183;FDP=327;FR=.;FRO=144;FSAF=93;FSAR=90;FSRF=69;FSRR=75;FWDB=0.0023117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.781;QD=23.961;RBI=0.0464423;REFB=-0.025866;REVB=0.0463847;RO=144;SAF=93;SAR=90;SRF=69;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235462;STB=0.512781;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0178519;OID=.;OPOS=152281039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:327:144:144:183:183:0.559633:90:93:69:75:90:93:69:75 chr1 152281228 . C G 673.46 PASS AF=0.425287;AO=74;DP=175;FAO=74;FDP=174;FR=.;FRO=100;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=0.0691504;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8449;QD=15.4819;RBI=0.0693805;REFB=-0.0351214;REVB=-0.00564541;RO=96;SAF=39;SAR=35;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00428951;STB=0.513257;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0404182;OID=.;OPOS=152281228;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:96:100:74:74:0.425287:35:39:51:45:35:39:55:45 chr1 152281290 . A G 217.5 PASS AF=0.288462;AO=30;DP=104;FAO=30;FDP=104;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.00440475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.133;QD=8.36521;RBI=0.0172156;REFB=-0.0147325;REVB=-0.0166425;RO=73;SAF=17;SAR=13;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104605;STB=0.55716;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0316654;OID=.;OPOS=152281290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:73:74:30:30:0.288462:13:17:35:38:13:17:36:38 chr1 152281304 . A C 211.07 PASS AF=0.317647;AO=27;DP=85;FAO=27;FDP=85;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0112193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.26;QD=9.93258;RBI=0.0115511;REFB=-0.0226955;REVB=-0.00274871;RO=57;SAF=17;SAR=10;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182662;STB=0.601694;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0495306;OID=.;OPOS=152281304;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:57:58:27:27:0.317647:10:17:27:30:10:17:28:30 chr1 152281479 . G T 4181.31 PASS AF=1;AO=266;DP=266;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00818501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5681;QD=62.4076;RBI=0.038452;REFB=0;REVB=0.0375708;RO=0;SAF=153;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50383e-05;OID=.;OPOS=152281479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:266:268:0:0:266:268:1:113:153:0:0:113:155:0:0 chr1 152281523 . A C 861.22 PASS AF=0.347267;AO=104;DP=308;FAO=108;FDP=311;FR=.;FRO=203;FSAF=65;FSAR=43;FSRF=112;FSRR=91;FWDB=0.0123936;FXX=0.00320503;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9557;QD=11.0768;RBI=0.0127257;REFB=-0.0111237;REVB=0.00288836;RO=204;SAF=63;SAR=41;SRF=113;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619092;STB=0.533662;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0259295;OID=.;OPOS=152281523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:311:204:203:104:108:0.347267:41:63:113:91:43:65:112:91 chr1 152281534 . A T 750.33 PASS AF=0.318182;AO=98;DP=308;FAO=98;FDP=308;FR=.;FRO=210;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=116;FSRR=94;FWDB=-0.00218059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.442;QD=9.74456;RBI=0.00370676;REFB=0.00228934;REVB=-0.00299752;RO=209;SAF=59;SAR=39;SRF=116;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571967;STB=0.534821;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.00781363;OID=.;OPOS=152281534;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:308:209:210:98:98:0.318182:39:59:116:93:39:59:116:94 chr1 152281635 . C A 57.82 PASS AF=0.0823045;AO=20;DP=243;FAO=20;FDP=243;FR=.;FRO=223;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=130;FSRR=93;FWDB=-0.0403051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.893;QD=0.951799;RBI=0.0408474;REFB=-0.00941098;REVB=-0.00663401;RO=223;SAF=14;SAR=6;SRF=130;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143318;STB=0.615879;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.100691;OID=.;OPOS=152281635;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:243:243:223:223:20:20:0.0823045:6:14:130:93:6:14:130:93 chr1 152281644 . TGA CTC 510.43 PASS AF=0.330049;AO=58;DP=214;FAO=67;FDP=203;FR=.;FRO=136;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=83;FSRR=53;FWDB=0.0243568;FXX=0.0513995;HRUN=1;LEN=3;MLLD=162.655;QD=10.0577;RBI=0.0325381;REFB=-0.00846014;REVB=-0.0215749;RO=134;SAF=28;SAR=30;SRF=82;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15463;STB=0.559307;STBP=0.255;TYPE=mnp;VARB=0.0206841;OID=.;OPOS=152281644;OREF=TGA;OALT=CTC;OMAPALT=CTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:203:134:136:58:67:0.330049:30:28:82:52:32:35:83:53 chr1 152281690 . C T 2728.77 PASS AF=0.967568;AO=179;DP=185;FAO=179;FDP=185;FR=.;FRO=6;FSAF=99;FSAR=80;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0198119;FXX=0.00537606;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.247;QD=59.0004;RBI=0.0201905;REFB=0.00446269;REVB=0.00389183;RO=6;SAF=99;SAR=80;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00709278;STB=0.503729;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-5.65483e-05;OID=.;OPOS=152281690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:185:185:6:6:179:179:0.967568:80:99:4:2:80:99:4:2 chr1 152281948 . G A 2255.06 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.651;QD=63.5229;RBI=0.0387373;REFB=0;REVB=0.0337228;RO=0;SAF=57;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79467e-05;OID=.;OPOS=152281948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:142:0:0:141:142:1:84:57:0:0:85:57:0:0 chr1 152282267 . G A 1071.22 PASS AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0230502;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.938;QD=57.9037;RBI=0.0361704;REFB=0.0427696;REVB=0.0278745;RO=1;SAF=36;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129566;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=2.26623e-05;OID=.;OPOS=152282267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:74:74:1:1:72:73:0.986486:36:36:1:0:36:37:0:1 chr1 152282311 . C T 785.84 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0092304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2021;QD=64.1503;RBI=0.01212;REFB=0;REVB=-0.00785463;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106549;OID=.;OPOS=152282311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0 chr1 152282917 . G T 1697.33 PASS AF=0.991228;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0335098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.07;QD=59.5554;RBI=0.0338904;REFB=-0.0223928;REVB=0.00506507;RO=1;SAF=52;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0090437;STB=0.504761;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=9.44995e-05;OID=.;OPOS=152282917;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:114:1:1:113:113:0.991228:61:52:1:0:61:52:1:0 chr1 152283236 . T C 619.89 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0118768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.542;QD=59.0371;RBI=0.0539167;REFB=0.0651055;REVB=0.0525923;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.512189;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.000878839;OID=.;OPOS=152283236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:42:0:1:41:41:0.97619:21:20:0:0:21:20:1:0 chr1 152283283 . C G,T 734.95 PASS AF=0.0638298,0.93617;AO=3,44;DP=47;FAO=3,44;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=1,30;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100935,0.0113743;FXX=0.020829;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.727,95.6808;QD=62.5492;RBI=0.0240274,0.0469222;REFB=0,0;REVB=-0.0218045,-0.0455227;RO=0;SAF=1,30;SAR=2,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0280563,0.000462936;OID=.,.;OPOS=152283283,152283283;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:47:47:0:0:3,44:3,44:0.0638298,0.93617:2,14:1,30:0:0:2,14:1,30:0:0 chr1 152283862 . G C 1483.82 PASS AF=0.979381;AO=93;DP=95;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00379499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.995;QD=61.1885;RBI=0.043285;REFB=-0.0340351;REVB=0.0431183;RO=2;SAF=33;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00631286;STB=0.503462;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.000687879;OID=.;OPOS=152283862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:97:2:2:93:95:0.979381:60:33:1:1:62:33:1:1 chr1 152283975 . A G 2371.14 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.241;QD=64.0849;RBI=0.0722564;REFB=0;REVB=0.0642728;RO=0;SAF=81;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94291e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43103e-05;OID=.;OPOS=152283975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:147:148:0:0:147:148:1:66:81:0:0:66:82:0:0 chr1 152284854 . A G 3196.05 PASS AF=1;AO=203;DP=206;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109995;FXX=0.0189564;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.883;QD=61.7595;RBI=0.0231483;REFB=-0.0506578;REVB=0.020368;RO=1;SAF=107;SAR=96;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493588;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48239e-05;OID=.;OPOS=152284854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:206:207:1:0:203:207:1:96:107:0:1:96:111:0:0 chr1 152285099 . C T 1118.13 PASS AF=0.986842;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00968987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.521;QD=58.8488;RBI=0.0222423;REFB=0.0697392;REVB=0.0200206;RO=1;SAF=25;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975393;STB=0.505153;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000652935;OID=.;OPOS=152285099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:76:1:1:73:75:0.986842:48:25:0:1:48:27:0:1 chr1 152285930 . G A 3003.17 PASS AF=0.994764;AO=190;DP=192;FAO=190;FDP=191;FR=.;FRO=1;FSAF=125;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00184786;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.719;QD=62.8936;RBI=0.0124709;REFB=0.123036;REVB=-0.0123332;RO=1;SAF=125;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00379465;STB=0.501992;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.000267591;OID=.;OPOS=152285930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:192:191:1:1:190:190:0.994764:65:125:1:0:65:125:1:0 chr1 152286002 . T C 1818.49 PASS AF=1;AO=118;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401077;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8756;QD=61.1257;RBI=0.0722683;REFB=0;REVB=0.0601172;RO=0;SAF=87;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137319;OID=.;OPOS=152286002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:119:0:0:118:119:1:31:87:0:0:32:87:0:0 chr1 152286032 . C T 2197.76 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.572;QD=63.245;RBI=0.0334408;REFB=0;REVB=-0.011266;RO=0;SAF=75;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.38759e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25762e-05;OID=.;OPOS=152286032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:64:75:0:0:64:75:0:0 chr1 152286367 . C A 1138.99 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0225927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.298;QD=59.1683;RBI=0.0237042;REFB=-0.105878;REVB=0.00717335;RO=1;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137144;STB=0.507244;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=4.93994e-05;OID=.;OPOS=152286367;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:34:42:0:1:34:42:0:1 chr1 152287084 . T A 459.7 PASS AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0455158;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3377;QD=23.8804;RBI=0.0654703;REFB=-0.0358619;REVB=0.0470603;RO=33;SAF=11;SAR=33;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164025;STB=0.576141;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0273235;OID=.;OPOS=152287084;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:33:11:14:19:32:12:14:19 chr1 152287809 . G A 445.9 PASS AF=0.431034;AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0160822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3748;QD=15.3758;RBI=0.0324662;REFB=-0.00423245;REVB=0.0282032;RO=66;SAF=25;SAR=25;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107763;STB=0.560321;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00800112;OID=.;OPOS=152287809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:66:66:50:50:0.431034:25:25:40:26:25:25:40:26 chr1 152323132 . G T 784.66 PASS AF=0.513699;AO=74;DP=147;FAO=75;FDP=146;FR=.;FRO=71;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.00602491;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.172;QD=21.4975;RBI=0.014942;REFB=-0.0112482;REVB=-0.0136734;RO=71;SAF=43;SAR=31;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918585;STB=0.546296;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00862165;OID=.;OPOS=152323132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:71:71:74:75:0.513699:31:43:34:37:32:43:34:37 chr1 152325732 . G A 550.24 PASS AF=0.523364;AO=55;DP=107;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.00907394;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.045;QD=20.5697;RBI=0.00909058;REFB=-0.0102834;REVB=-0.000549813;RO=52;SAF=26;SAR=29;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142048;STB=0.577279;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00667322;OID=.;OPOS=152325732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:52:51:55:56:0.523364:29:26:33:19:30:26:32:19 chr1 152326843 . C T 589.69 PASS AF=0.541284;AO=59;DP=108;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0355262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.684;QD=21.6401;RBI=0.0497653;REFB=-0.00480042;REVB=-0.0348493;RO=49;SAF=30;SAR=29;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521597;STB=0.523653;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00406775;OID=.;OPOS=152326843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:49:50:59:59:0.541284:29:30:28:21:29:30:28:22 chr1 152327469 . C T 91.83 PASS AF=0.179775;AO=16;DP=89;FAO=16;FDP=89;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.0100469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.898;QD=4.12736;RBI=0.0298867;REFB=-0.0109017;REVB=-0.0281474;RO=72;SAF=7;SAR=9;SRF=22;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176532;STB=0.604563;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0453057;OID=.;OPOS=152327469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:89:89:72:73:16:16:0.179775:9:7:22:50:9:7:23:50 chr1 152327502 . A G 45.18 PASS AF=0.114943;AO=9;DP=87;FAO=10;FDP=87;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=0.0126022;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.017;QD=2.07731;RBI=0.0261768;REFB=-0.00227556;REVB=-0.0229436;RO=78;SAF=6;SAR=3;SRF=27;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363981;STB=0.783857;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0240102;OID=.;OPOS=152327502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:87:87:78:77:9:10:0.114943:3:6:27:51:3:7:27:50 chr1 152328411 . A G 67.48 PASS AF=0.189655;AO=11;DP=58;FAO=11;FDP=58;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00934172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.493;QD=4.65376;RBI=0.0197541;REFB=-0.00774996;REVB=-0.0174057;RO=47;SAF=5;SAR=6;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199653;STB=0.629405;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0301268;OID=.;OPOS=152328411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:58:58:47:47:11:11:0.189655:6:5:29:18:6:5:29:18 chr1 152329435 . C T 371.87 PASS AF=0.569231;AO=36;DP=64;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.012482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.243;QD=22.8842;RBI=0.0134701;REFB=-0.00280128;REVB=-0.00506407;RO=28;SAF=14;SAR=22;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14669;STB=0.572108;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0022535;OID=.;OPOS=152329435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:28:28:36:37:0.569231:22:14:16:12:22:15:16:12 chr1 152331240 . G A 385.38 PASS AF=0.418367;AO=40;DP=97;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.00101016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.04;QD=15.7298;RBI=0.0161971;REFB=-0.0248602;REVB=-0.0161656;RO=57;SAF=18;SAR=22;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678624;STB=0.531553;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0308288;OID=.;OPOS=152331240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:57:57:40:41:0.418367:22:18:22:35:23:18:22:35 chr1 152382120 . C T 417.81 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0601925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8235;QD=53.911;RBI=0.0602355;REFB=-0.15973;REVB=0.00227438;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266361;STB=0.514276;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0379578;OID=.;OPOS=152382120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:13:17:1:0:13:17:1:0 chr1 152484129 . G A 297.41 PASS AF=0.336134;AO=38;DP=119;FAO=40;FDP=119;FR=.;FRO=79;FSAF=2;FSAR=38;FSRF=16;FSRR=63;FWDB=-0.0486045;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.885;QD=9.99692;RBI=0.0492799;REFB=-0.0067502;REVB=0.00813066;RO=78;SAF=0;SAR=38;SRF=15;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.781912;STB=0.771821;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.025629;OID=.;OPOS=152484129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:78:79:38:40:0.336134:38:0:15:63:38:2:16:63 chr1 152487979 . C T 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0275169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.851;QD=16.8984;RBI=0.0293965;REFB=-0.0188804;REVB=-0.010343;RO=8;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18104;STB=0.648318;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0220296;OID=.;OPOS=152487979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:8:9:10:10:0.526316:2:8:5:3:2:8:5:4 chr1 152488063 . C T 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0228302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6637;QD=19.5766;RBI=0.0251591;REFB=-0.0082676;REVB=0.0105718;RO=31;SAF=21;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137209;STB=0.576423;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00878804;OID=.;OPOS=152488063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:12:21:15:16:12:21:15:16 chr1 152488146 . G A 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00109099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.72;QD=17.4543;RBI=0.0342259;REFB=-0.0174592;REVB=0.0342085;RO=29;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195421;STB=0.609643;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0142035;OID=.;OPOS=152488146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:16:11:18:11:16:11:18:11 chr1 152488428 . T C 487.6 PASS AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0398059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6493;QD=21.6709;RBI=0.0556633;REFB=0.0129826;REVB=0.0389087;RO=43;SAF=19;SAR=28;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743065;STB=0.541045;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.00667322;OID=.;OPOS=152488428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:28:19:21:22:28:19:21:22 chr1 152552285 . C A 122.15 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.0127946;FXX=0.0277701;HRUN=5;LEN=1;MLLD=101.963;QD=13.9595;RBI=0.0470451;REFB=0.00909197;REVB=0.0452719;RO=21;SAF=10;SAR=4;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128834;STB=0.57437;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.00958732;OID=.;OPOS=152552285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:4:10:17:4:4:10:17:4 chr1 152659412 . A AC 34.59 PASS AF=0.183099;AO=11;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=42;FWDB=-0.0586121;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=67.8489;QD=1.94874;RBI=0.0588918;REFB=-0.00205487;REVB=-0.00573271;RO=57;SAF=1;SAR=10;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371475;STB=0.790115;STBP=0.077;TYPE=ins;VARB=0.0554656;OID=.;OPOS=152659413;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.183099:11:71:13:71:58:1:12:16:42:34:57:1:10:16:41 chr1 152659471 . T G 243.37 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0133873;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.443;QD=17.3834;RBI=0.0298194;REFB=-0.0205622;REVB=0.0266455;RO=27;SAF=7;SAR=20;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441726;STB=0.511065;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0226287;OID=.;OPOS=152659471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:27:29:27:27:0.482143:20:7:6:21:20:7:8:21 chr1 152671913 . C G 174.06 PASS AF=0.68;AO=16;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0595639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1675;QD=27.849;RBI=0.060146;REFB=0.00677247;REVB=-0.00834761;RO=8;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152268;STB=0.568639;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.00298832;OID=.;OPOS=152671913;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:8:8:16:17:0.68:10:6:5:3:10:7:5:3 chr1 152692512 . G A 126.68 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.00949358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3691;QD=11.2607;RBI=0.0404891;REFB=-0.00217949;REVB=0.0393603;RO=30;SAF=8;SAR=7;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31537;STB=0.68272;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00659552;OID=.;OPOS=152692512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:7:8:24:6:7:8:24:6 chr1 152732174 . T C 267.02 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00445083;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.677;QD=15.7072;RBI=0.0258597;REFB=-0.00986879;REVB=-0.0254738;RO=37;SAF=19;SAR=11;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677732;STB=0.532136;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0132167;OID=.;OPOS=152732174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:38:30:30:0.441176:11:19:21:16:11:19:22:16 chr1 152732436 . G C 421.73 PASS AF=0.625;AO=40;DP=64;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0155327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.395;QD=26.3583;RBI=0.0171071;REFB=-0.039613;REVB=0.0071686;RO=24;SAF=13;SAR=27;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100048;STB=0.554766;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0301825;OID=.;OPOS=152732436;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:24:24:40:40:0.625:27:13:11:13:27:13:11:13 chr1 152732567 . G A 450.45 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0192253;FXX=0.0487745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.938;QD=23.1001;RBI=0.0257674;REFB=-0.0136144;REVB=0.0171564;RO=34;SAF=19;SAR=24;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245748;STB=0.50605;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0199961;OID=.;OPOS=152732567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:78:34:35:43:43:0.551282:24:19:14:20:24:19:15:20 chr1 152733301 . T A 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.00693017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.038;QD=9.19977;RBI=0.0357787;REFB=0.00128144;REVB=-0.0351011;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191487;STB=0.6151;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=-0.00433697;OID=.;OPOS=152733301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:11:2:2:5:11:2 chr1 152734390 . C T 355.21 PASS AF=0.463415;AO=36;DP=80;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0218338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.384;QD=17.3271;RBI=0.0220738;REFB=-0.0211253;REVB=-0.00324631;RO=44;SAF=17;SAR=19;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272333;STB=0.528372;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0248082;OID=.;OPOS=152734390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:44:44:36:38:0.463415:19:17:22:22:21:17:22:22 chr1 152759950 . A G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0223227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.669;QD=15.2589;RBI=0.0344957;REFB=-0.0323081;REVB=-0.0262992;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364235;STB=0.521675;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0232177;OID=.;OPOS=152759950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:6:1:1:5:6:1:1:5 chr1 152760352 . T A 348.66 PASS AF=0.323529;AO=44;DP=137;FAO=44;FDP=136;FR=.;FRO=92;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.032418;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.479;QD=10.2547;RBI=0.0410527;REFB=-0.0213234;REVB=0.0251872;RO=92;SAF=19;SAR=25;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673992;STB=0.539066;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0410431;OID=.;OPOS=152760352;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:92:92:44:44:0.323529:25:19:45:47:25:19:45:47 chr1 152760558 . G T 56.95 PASS AF=0.117117;AO=13;DP=111;FAO=13;FDP=111;FR=.;FRO=98;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=59;FWDB=-0.0105717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.416;QD=2.05228;RBI=0.0172626;REFB=-0.0022414;REVB=-0.0136469;RO=97;SAF=3;SAR=10;SRF=38;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221616;STB=0.669574;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0287621;OID=.;OPOS=152760558;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:111:111:97:98:13:13:0.117117:10:3:38:59:10:3:39:59 chr1 152760628 . T C 140.32 PASS AF=0.277778;AO=20;DP=72;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.00502029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=332.963;QD=7.79575;RBI=0.0219329;REFB=-0.00826736;REVB=-0.0213506;RO=52;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802562;STB=0.548111;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0195892;OID=.;OPOS=152760628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:52:52:20:20:0.277778:11:9:20:32:11:9:20:32 chr1 152760642 . C T 138.93 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.00652356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.872;QD=7.50965;RBI=0.0162601;REFB=-0.0113747;REVB=-0.0148941;RO=54;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987272;STB=0.559334;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0160461;OID=.;OPOS=152760642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:11:9:20:34:11:9:20:34 chr1 152760644 . C T 138.93 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.000740054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.609;QD=7.50966;RBI=0.0133776;REFB=-0.00725992;REVB=-0.0133572;RO=54;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987272;STB=0.559334;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0178392;OID=.;OPOS=152760644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:11:9:20:34:11:9:20:34 chr1 152760647 . C A 138.93 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.0110497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.081;QD=7.50963;RBI=0.0211251;REFB=0.0150416;REVB=0.0180048;RO=54;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987272;STB=0.559334;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00685998;OID=.;OPOS=152760647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:11:9:20:34:11:9:20:34 chr1 152760651 . C T 129.75 PASS AF=0.263889;AO=19;DP=72;FAO=19;FDP=72;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0162953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.999;QD=7.20806;RBI=0.0200334;REFB=-0.00432036;REVB=0.0116533;RO=53;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142229;STB=0.585712;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00527696;OID=.;OPOS=152760651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:53:53:19:19:0.263889:10:9:19:34:10:9:19:34 chr1 152770521 . G A 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0284352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.614;QD=11.0921;RBI=0.0429506;REFB=-0.00519654;REVB=-0.0321899;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429493;STB=0.7681;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.000423455;OID=.;OPOS=152770521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:2:4:1:4:2:4 chr1 152770589 . A G 194.01 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0273364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.713;QD=16.8703;RBI=0.029343;REFB=-0.0162116;REVB=-0.0106646;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011497;STB=0.506572;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0219687;OID=.;OPOS=152770589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:11:9:12:14:11:9:12:14 chr1 152771207 . C A 159.44 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.154979;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1321;QD=16.7829;RBI=0.155232;REFB=-0.000597041;REVB=-0.00886322;RO=22;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158032;STB=0.503102;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00728266;OID=.;OPOS=152771207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:22:21:17:17:0.447368:8:9:12:10:8:9:11:10 chr1 152771293 . A G 272.3 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.0214477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.378;QD=17.289;RBI=0.040023;REFB=-0.0248825;REVB=0.0337911;RO=32;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202599;STB=0.618973;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0196;OID=.;OPOS=152771293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:33:30:30:0.47619:15:15:23:9:15:15:24:9 chr1 152771360 . A T 402.79 PASS AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0087841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3539;QD=19.1802;RBI=0.0137872;REFB=-0.0141296;REVB=-0.0106266;RO=42;SAF=21;SAR=20;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977272;STB=0.559412;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0146941;OID=.;OPOS=152771360;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:43:41:41:0.488095:20:21:26:16:20:21:27:16 chr1 152777908 . C T 91.78 PASS AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0144603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1135;QD=30.5927;RBI=0.0144603;REFB=-0.0374682;REVB=0;RO=2;SAF=10;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0155689;OID=.;OPOS=152777908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:12:12:2:2:10:10:0.833333:0:10:2:0:0:10:2:0 chr1 152882610 . A G 241.62 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0110616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.865;QD=21.9655;RBI=0.0221898;REFB=-0.0214652;REVB=-0.0192361;RO=20;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174216;STB=0.608601;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0267842;OID=.;OPOS=152882610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:9:14:8:12:9:14:8:13 chr1 152883608 . G A 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0294807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.68;QD=16.1985;RBI=0.0344501;REFB=-0.0473204;REVB=0.0178241;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0191621;OID=.;OPOS=152883608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:1:2:2:3:1:2 chr1 152884111 . G A 382.66 PASS AF=0.425743;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0570047;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9952;QD=15.1547;RBI=0.0650846;REFB=-0.00492567;REVB=-0.0314081;RO=56;SAF=20;SAR=23;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736388;STB=0.529726;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00632548;OID=.;OPOS=152884111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:56:58:43:43:0.425743:23:20:22:34:23:20:24:34 chr1 152884246 . GA TG 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0482323;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=224.039;QD=13.5055;RBI=0.0526116;REFB=-0.0219311;REVB=-0.0210151;RO=17;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125735;STB=0.574337;STBP=0.539;TYPE=mnp;VARB=0.0222035;OID=.;OPOS=152884246;OREF=GA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:9:3:6:11:9:3:6:11 chr1 152944594 . C T 718.58 PASS AF=0.674157;AO=60;DP=89;FAO=60;FDP=89;FR=.;FRO=29;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0221199;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2356;QD=32.2959;RBI=0.0548652;REFB=-0.0148285;REVB=0.0502086;RO=29;SAF=34;SAR=26;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113114;STB=0.56112;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00467714;OID=.;OPOS=152944594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:29:29:60:60:0.674157:26:34:11:18:26:34:11:18 chr1 152957887 . G A 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.000570555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.112;QD=8.69114;RBI=0.00546929;REFB=-0.0101303;REVB=-0.00543945;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09343;STB=0.571265;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0153832;OID=.;OPOS=152957887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:11:17:8:8:0.32:6:2:2:9:6:2:3:14 chr1 152958238 . A G 441.03 PASS AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0201738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9956;QD=17.4664;RBI=0.0349767;REFB=-0.0456978;REVB=-0.0285725;RO=54;SAF=18;SAR=29;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128404;STB=0.507153;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0545935;OID=.;OPOS=152958238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:47:47:0.465347:29:18:20:34:29:18:20:34 chr1 152958267 . T C 418.18 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0311946;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8543;QD=19.6788;RBI=0.0458686;REFB=-0.000598758;REVB=-0.0336278;RO=44;SAF=15;SAR=27;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163546;STB=0.517552;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.000208241;OID=.;OPOS=152958267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:44:43:42:42:0.494118:27:15:15:29:27:15:14:29 chr1 152975495 . G A 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.000361426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.405;QD=16.728;RBI=0.00135459;REFB=-0.011604;REVB=0.00130549;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513688;STB=0.514268;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0100942;OID=.;OPOS=152975495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:8:8:10:8:8:8:10:9 chr1 152975715 . C T 72.97 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0132455;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4831;QD=18.242;RBI=0.022143;REFB=-0.018413;REVB=-0.0177445;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787225;STB=0.507027;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0293848;OID=.;OPOS=152975715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:17:16:6:7:9:9:0.5625:5:4:2:4:5:4:3:4 chr1 152975739 . T A 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0689569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.327;QD=16.199;RBI=0.0806717;REFB=-0.0193904;REVB=0.0418672;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0214022;OID=.;OPOS=152975739;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1 chr1 152975829 . A G 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.00705211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8148;QD=9.44481;RBI=0.0159781;REFB=-0.0175684;REVB=0.0143376;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444295;STB=0.768453;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.020687;OID=.;OPOS=152975829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:2:8:2:4:2:8 chr1 152975941 . C G 193.19 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00406201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.001;QD=16.4413;RBI=0.0208719;REFB=-0.00869654;REVB=-0.0204728;RO=27;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0056272;STB=0.503223;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0343755;OID=.;OPOS=152975941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:11:9:12:15:11:9:12:15 chr1 152976108 . C T 195.36 PASS AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00538815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.622;QD=12.6038;RBI=0.00575354;REFB=-0.00909904;REVB=0.00201767;RO=38;SAF=15;SAR=9;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801619;STB=0.546179;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0085719;OID=.;OPOS=152976108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:9:15:21:17:9:15:21:17 chr1 152976114 . G C 182.28 PASS AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.017337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9001;QD=11.5732;RBI=0.0938913;REFB=-0.0223455;REVB=-0.0922768;RO=40;SAF=15;SAR=8;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899201;STB=0.552236;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0158862;OID=.;OPOS=152976114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:8:15:23:17:8:15:23:17 chr1 152976306 . T G 108.75 PASS AF=0.262295;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.011203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.003;QD=7.13128;RBI=0.0331778;REFB=-0.014147;REVB=0.0312292;RO=45;SAF=10;SAR=6;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113478;STB=0.569532;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0299562;OID=.;OPOS=152976306;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:45:45:16:16:0.262295:6:10:24:21:6:10:24:21 chr1 153004848 . T C 45.03 PASS AF=0.304348;AO=8;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00312534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8895;QD=7.83089;RBI=0.0744174;REFB=-0.0117989;REVB=-0.0743518;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303091;STB=0.633776;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0182237;OID=.;OPOS=153004848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:15:16:8:7:0.304348:5:3:10:5:4:3:10:6 chr1 153004983 . C T 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.103951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.617;QD=9.76062;RBI=0.105273;REFB=-0.021115;REVB=0.0166298;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443355;STB=0.749596;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.042992;OID=.;OPOS=153004983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:6:1:0:12:6:1:0:12 chr1 153005156 . C T 180.6 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0224566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1085;QD=20.0671;RBI=0.0551189;REFB=-0.0309337;REVB=0.0503369;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422077;STB=0.523784;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0383436;OID=.;OPOS=153005156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:8:9:11:8:8:9 chr1 153066072 . T C 262.98 PASS AF=0.318182;AO=35;DP=110;FAO=35;FDP=110;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=0.0207396;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=234.174;QD=9.56305;RBI=0.0207629;REFB=-0.00141371;REVB=-0.000983273;RO=75;SAF=29;SAR=6;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35347;STB=0.709989;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00450027;OID=.;OPOS=153066072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:75:75:35:35:0.318182:6:29:44:31:6:29:44:31 chr1 153085029 . G T 1349.66 PASS AF=0.617801;AO=118;DP=191;FAO=118;FDP=191;FR=.;FRO=73;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=0.00156443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.817;QD=28.2652;RBI=0.0134588;REFB=-0.0279243;REVB=-0.0133675;RO=73;SAF=49;SAR=69;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17098;STB=0.592338;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0171289;OID=.;OPOS=153085029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:73:73:118:118:0.617801:69:49:48:25:69:49:48:25 chr1 153113139 . G A 257.44 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0900868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5395;QD=18.3882;RBI=0.120155;REFB=-0.046989;REVB=0.0795088;RO=28;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659301;STB=0.536816;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0493333;OID=.;OPOS=153113139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:16:12:10:18:16:12:10:18 chr1 153277423 . C T 1197.01 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8895;QD=59.8503;RBI=0.0256925;REFB=-0.104371;REVB=0.016078;RO=1;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116883;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205289;OID=.;OPOS=153277423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:80:1:0:79:80:1:40:39:0:1:41:39:0:0 chr1 153314153 . C A 1175.86 PASS AF=0.987342;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0169661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.992;QD=59.5373;RBI=0.0250828;REFB=-0.0111026;REVB=0.0184742;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111359;STB=0.505881;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000148957;OID=.;OPOS=153314153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:77:78:0.987342:42:35:0:1:42:36:0:1 chr1 153315579 . A G 1287.13 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.273;QD=61.2918;RBI=0.00334665;REFB=0;REVB=0.0030943;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332918;OID=.;OPOS=153315579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:38:45:0:0:39:45:0:0 chr1 153320334 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704924;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=343.287;QD=60.9786;RBI=0.00704973;REFB=0;REVB=8.31544e-05;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8246e-06;OID=.;OPOS=153320334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr1 153320372 . T G 473.05 PASS AF=1;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240757;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.481;QD=59.1309;RBI=0.0252642;REFB=0;REVB=-0.00765796;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72054e-05;OID=.;OPOS=153320372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0 chr1 153410822 . C A 308.92 PASS AF=0.492537;AO=32;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.020249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.397;QD=18.4429;RBI=0.0224791;REFB=-0.0150059;REVB=-0.00976153;RO=34;SAF=13;SAR=19;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033082;STB=0.508767;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0160727;OID=.;OPOS=153410822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:34:34:32:33:0.492537:19:13:15:19:19:14:15:19 chr1 153412392 . T G 226.57 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00653656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.651;QD=17.0996;RBI=0.00728927;REFB=-0.012037;REVB=0.00322596;RO=28;SAF=15;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422594;STB=0.523791;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00891482;OID=.;OPOS=153412392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:10:15:18:10:10:15:18:10 chr1 153431406 . C G 1337.52 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313893;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.73;QD=62.2102;RBI=0.0558775;REFB=0;REVB=-0.0462278;RO=0;SAF=38;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.74561e-05;OID=.;OPOS=153431406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:48:38:0:0:48:38:0:0 chr1 153588279 . G A 845.01 PASS AF=1;AO=48;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.38;QD=57.2889;RBI=0.103724;REFB=0;REVB=0.103688;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00446109;OID=.;OPOS=153588279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:48:59:1:26:22:0:0:36:23:0:0 chr1 153604027 . ACCT AC,ACT,ACTT 511.5 PASS AF=0.0263158,0,0.973684;AO=4,4,30;DP=39;FAO=1,0,37;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,17;FSAR=0,0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.247721,0.00998012,0.259366;FXX=0.0256345;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=10.5866,18.9794,32.2176;QD=53.8422;RBI=0.248301,0.0854738,0.279442;REFB=0,0,0;REVB=-0.0169645,0.0848891,0.104005;RO=0;SAF=4,4,11;SAR=0,0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0746518,-0.0279554,0.00937545;OID=.,.,.;OPOS=153604029,153604028,153604029;OREF=CT,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=AC,ACT,ACTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.0263158,0,0.973684:4,4,30:39:1,0,37:38:0:1,0,17:0,0,20:0:0:4:0:4,4,11:0,0,19:0:0 chr1 153676713 . C A 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00350639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.536;QD=59.3225;RBI=0.024997;REFB=0;REVB=0.0247498;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19195e-05;OID=.;OPOS=153676713;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0 chr1 153743234 . T C 266.57 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0486249;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.16;QD=20.1188;RBI=0.0487507;REFB=-0.0269563;REVB=-0.00349917;RO=25;SAF=10;SAR=18;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729641;STB=0.540512;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0208717;OID=.;OPOS=153743234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:25:25:28:28:0.528302:18:10:7:18:18:10:7:18 chr1 153907278 . CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT CCTGCTGCTGCTGCTGCTGT,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC 145.58 PASS AF=0.428571,0.285714;AO=8,6;DP=23;FAO=9,6;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=2,3;FSAR=7,3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0396918,-0.0570203;FXX=0.0454339;HRUN=1,1;LEN=9,10;MLLD=242.839,209.286;QD=27.7295;RBI=0.0437277,0.0633454;REFB=-0.0715481,-0.0906822;REVB=0.0183486,-0.0275922;RO=5;SAF=1,3;SAR=7,3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.428999,-0.0757641;STB=0.699519,0.583063;STBP=0.112,0.692;TYPE=del,mnp;VARB=0.0393108,0.10363;OID=.,.;OPOS=153907279,153907297;OREF=CTGCTGCTG,CTGCTGCTGT;OALT=-,TTGCTGCTGC;OMAPALT=CCTGCTGCTGCTGCTGCTGT,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571,0.285714:8,6:23:9,6:21:6:2,3:7,3:4:2:49:5:1,3:7,3:3:2 chr1 153909069 . G C 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.056063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1927;QD=16.4169;RBI=0.0624443;REFB=-0.0263611;REVB=0.0274995;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174377;STB=0.599863;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0246484;OID=.;OPOS=153909069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:7:7:11:5:7:7:11:5 chr1 153913699 . T G 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0312754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.147;QD=14.6983;RBI=0.0360754;REFB=-0.0261878;REVB=-0.01798;RO=23;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303677;STB=0.676153;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0176805;OID=.;OPOS=153913699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:5:11:9:14:5:11:9:14 chr1 153913770 . A G 867.97 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4317;QD=57.8646;RBI=0.0349115;REFB=0;REVB=0.0154911;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000517995;OID=.;OPOS=153913770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:21:37:0:0:23:37:0:0 chr1 153926078 . T C 132.71 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00770612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.946;QD=15.1666;RBI=0.00994263;REFB=-0.0130544;REVB=0.00628263;RO=19;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14369;STB=0.599863;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0133493;OID=.;OPOS=153926078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:10:5:9:10:10:5:10:10 chr1 153932212 . G C 405.43 PASS AF=0.609375;AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00739667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.828;QD=25.3392;RBI=0.027147;REFB=-0.0224555;REVB=-0.0261199;RO=25;SAF=21;SAR=18;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015478;STB=0.50847;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0174074;OID=.;OPOS=153932212;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:25:25:39:39:0.609375:18:21:14:11:18:21:14:11 chr1 153941514 . C T 88.8 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00556696;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.591;QD=14.7996;RBI=0.0246768;REFB=0.00360145;REVB=0.0240406;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140286;STB=0.581059;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00424368;OID=.;OPOS=153941514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:7:4:3:10:7:4:3:10 chr1 153994647 . C T 218.06 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.00466152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.354;QD=15.5754;RBI=0.00643674;REFB=-0.000995207;REVB=-0.00443867;RO=31;SAF=17;SAR=8;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338122;STB=0.51912;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.00170541;OID=.;OPOS=153994647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:8:17:22:9:8:17:22:9 chr1 154089438 . T C 306.59 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0239524;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0076;QD=15.1403;RBI=0.0386418;REFB=0.0160172;REVB=0.0303227;RO=46;SAF=22;SAR=12;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260115;STB=0.641316;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0135911;OID=.;OPOS=154089438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:47:34:34:0.419753:12:22:18:28:12:22:19:28 chr1 154108387 . G A 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0610455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.649;QD=58.0601;RBI=0.0610508;REFB=0;REVB=-0.000803284;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108599;OID=.;OPOS=154108387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0 chr1 154144681 . A T 162.34 PASS AF=0.485714;AO=18;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00515443;FXX=0.0277701;HRUN=11;LEN=1;MLLD=242.558;QD=18.5532;RBI=0.00515665;REFB=0.00178475;REVB=-0.000151153;RO=15;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134807;STB=0.571347;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.000992657;OID=.;OPOS=154144681;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:15:18:18:17:0.485714:9:9:10:5:8:9:12:6 chr1 154310048 . C G 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.089;QD=61.6947;RBI=0.0393924;REFB=0;REVB=-0.0128479;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56242e-05;OID=.;OPOS=154310048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:35:47:0:0:35:47:0:0 chr1 154317153 . C T 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.085;QD=57.3855;RBI=0.0526027;REFB=0;REVB=0.0303519;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192413;OID=.;OPOS=154317153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr1 154426970 . A C 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0142339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.406;QD=17.7318;RBI=0.0143103;REFB=-0.0242328;REVB=-0.00147756;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998626;STB=0.556937;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0350768;OID=.;OPOS=154426970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:8:9:8:11:8:9:8:11 chr1 154437896 . T C 1025.64 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000694012;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.706;QD=58.608;RBI=0.0142176;REFB=0;REVB=0.0142007;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102263;OID=.;OPOS=154437896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:70:0:0:65:70:1:27:38:0:0:32:38:0:0 chr1 154438880 . T C 1083.63 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492301;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4638;QD=60.2017;RBI=0.0629769;REFB=0;REVB=0.0392745;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483917;OID=.;OPOS=154438880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:39:33:0:0:39:33:0:0 chr1 154474131 . C G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.506;QD=59.0187;RBI=0.0270501;REFB=0;REVB=0.00437239;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21355e-05;OID=.;OPOS=154474131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr1 154516571 . T C 549.02 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.263;QD=59.3531;RBI=0.00762306;REFB=0;REVB=0.00293132;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106774;OID=.;OPOS=154516571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:23:13:0:0:24:13:0:0 chr1 154556663 . G A 304.1 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0552132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.456;QD=19.941;RBI=0.0568375;REFB=-0.0207732;REVB=0.0134912;RO=29;SAF=20;SAR=12;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350163;STB=0.519468;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.02122;OID=.;OPOS=154556663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:12:20:17:12:12:20:17:12 chr1 154561925 . C T 136.59 PASS AF=0.326531;AO=15;DP=48;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0178731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.883;QD=11.1505;RBI=0.0196715;REFB=0.00380243;REVB=-0.00821702;RO=33;SAF=8;SAR=7;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491391;STB=0.50908;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00920661;OID=.;OPOS=154561925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:33:33:15:16:0.326531:7:8:19:14:7:9:19:14 chr1 154573967 . T C 234.95 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0154022;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.284;QD=18.7958;RBI=0.0157671;REFB=-0.00864579;REVB=-0.00337242;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168273;STB=0.604042;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00861916;OID=.;OPOS=154573967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:27:23:23:0.46:13:10:16:10:13:10:17:10 chr1 154574820 . T C 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.096;QD=56.9569;RBI=0.00985652;REFB=0;REVB=-0.00370232;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.15647e-05;OID=.;OPOS=154574820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0 chr1 154575040 . C T 575.51 PASS AF=0.824561;AO=45;DP=55;FAO=47;FDP=57;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0178675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.288;QD=40.3865;RBI=0.0354956;REFB=-0.222838;REVB=0.0306707;RO=6;SAF=11;SAR=34;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199485;STB=0.638827;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0162454;OID=.;OPOS=154575040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:55:57:6:10:45:47:0.824561:34:11:6:0:34:13:10:0 chr1 154600372 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.452;QD=39.2068;RBI=0.122917;REFB=0;REVB=-0.00268492;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100107;OID=.;OPOS=154600372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr1 154686000 . G A 178.21 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00378843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6625;QD=14.851;RBI=0.0423206;REFB=-0.0080449;REVB=-0.0421507;RO=29;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267272;STB=0.515423;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0110289;OID=.;OPOS=154686000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:12:7:10:19:12:7:10:19 chr1 154744807 . C G 218.22 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0352861;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.013;QD=15.5873;RBI=0.0421059;REFB=-0.0452418;REVB=-0.0229738;RO=31;SAF=7;SAR=18;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501346;STB=0.528474;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0434771;OID=.;OPOS=154744807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:18:7:10:21:18:7:10:21 chr1 154744852 . A G 357.86 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.478;QD=55.0556;RBI=0.0170227;REFB=0;REVB=-0.000753917;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101681;OID=.;OPOS=154744852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:19:6:0:0:20:6:0:0 chr1 154917314 . G A 1471.63 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00595848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.342;QD=63.296;RBI=0.0059586;REFB=0;REVB=3.86691e-05;RO=0;SAF=34;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.20828e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69117e-05;OID=.;OPOS=154917314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:59:34:0:0:59:34:0:0 chr1 154919080 . C T 601.11 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0152562;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=112.997;QD=58.6444;RBI=0.0334072;REFB=-0.0263412;REVB=0.0297201;RO=1;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177001;STB=0.509429;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000364597;OID=.;OPOS=154919080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:26:14:0:1:26:14:0:1 chr1 154942529 . G A 191.63 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00079818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.696;QD=15.643;RBI=0.00158886;REFB=-0.00709172;REVB=0.00137382;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139375;STB=0.580042;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00671049;OID=.;OPOS=154942529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:11:9:17:12:11:9:17:12 chr1 154987526 . C T 71.24 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0256331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.6977;QD=17.8105;RBI=0.0377512;REFB=0.00672593;REVB=0.0277147;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20145;STB=0.571275;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.00323709;OID=.;OPOS=154987526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:15:16:6:7:9:9:0.5625:5:4:1:5:5:4:2:5 chr1 154988957 . A G 44.53 PASS AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0452873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.783;QD=7.12509;RBI=0.0456209;REFB=0.00571271;REVB=0.00550661;RO=18;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234837;STB=0.654033;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.0142855;OID=.;OPOS=154988957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:6:1:5:13:6:1:5:13 chr1 155006091 . A G 135.7 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0438906;FXX=0.0377287;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.297;QD=10.643;RBI=0.0440185;REFB=-0.0177092;REVB=0.00335422;RO=34;SAF=9;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033353;STB=0.519698;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0207188;OID=.;OPOS=155006091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:51:34:34:17:17:0.333333:8:9:19:15:8:9:19:15 chr1 155006999 . C T 153.98 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0440211;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.215;QD=13.6869;RBI=0.0696071;REFB=0.0100855;REVB=0.0539192;RO=29;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364265;STB=0.512181;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=-0.0130028;OID=.;OPOS=155006999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:29:28:17:17:0.377778:7:10:18:11:7:10:17:11 chr1 155015918 . C G 237.06 PASS AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0271261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.9914;QD=13.546;RBI=0.0387897;REFB=0.00435633;REVB=-0.0277274;RO=42;SAF=17;SAR=11;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139102;STB=0.579488;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.0148271;OID=.;OPOS=155015918;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:42:42:28:28:0.4:11:17:20:22:11:17:20:22 chr1 155019710 . A C 383.47 PASS AF=0.52;AO=38;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0174743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.529;QD=20.4515;RBI=0.0196225;REFB=-0.0195759;REVB=-0.00892688;RO=36;SAF=17;SAR=21;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021974;STB=0.505152;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0165337;OID=.;OPOS=155019710;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:36:36:38:39:0.52:21:17:17:19:21:18:17:19 chr1 155026854 . G C 362.23 PASS AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00293701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.872;QD=23.3695;RBI=0.00507896;REFB=0.00229406;REVB=0.00414365;RO=26;SAF=13;SAR=23;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110607;STB=0.560941;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00208324;OID=.;OPOS=155026854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:26:26:36:36:0.580645:23:13:13:13:23:13:13:13 chr1 155026942 . A C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.68;QD=55.6555;RBI=0.0171032;REFB=0;REVB=-0.0132556;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.40775e-05;OID=.;OPOS=155026942;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0 chr1 155033317 . T C 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00687501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.319;QD=25.2766;RBI=0.0194815;REFB=0.0106744;REVB=-0.0182281;RO=11;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126582;STB=0.510193;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.00663872;OID=.;OPOS=155033317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:11:12:19:19:0.612903:10:9:5:6:10:9:6:6 chr1 155059851 . A G 630.24 PASS AF=0.955556;AO=42;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0432287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.713;QD=56.021;RBI=0.0549209;REFB=-0.174216;REVB=0.0338759;RO=3;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598141;STB=0.520824;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00184322;OID=.;OPOS=155059851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:45:45:3:2:42:43:0.955556:22:20:0:3:23:20:0:2 chr1 155106697 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00348681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.125;QD=55.6559;RBI=0.00731275;REFB=0;REVB=0.00642794;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51837e-05;OID=.;OPOS=155106697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr1 155149718 . G A 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.781;QD=55.6554;RBI=0.0165379;REFB=0;REVB=0.00527617;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.11624e-05;OID=.;OPOS=155149718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr1 155162067 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.119;QD=45.8068;RBI=0.096782;REFB=0;REVB=0.0962135;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000729481;OID=.;OPOS=155162067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr1 155178782 . A T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0142;QD=60.2303;RBI=0.0488798;REFB=0;REVB=0.0102756;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637661;OID=.;OPOS=155178782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:25:12:0:0:25:12:0:0 chr1 155186729 . T C 2167.21 PASS AF=0.97931;AO=131;DP=135;FAO=142;FDP=145;FR=.;FRO=3;FSAF=77;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0032446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8167;QD=59.7851;RBI=0.0283422;REFB=-0.0375404;REVB=0.0281559;RO=3;SAF=72;SAR=59;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00928149;STB=0.502593;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00565535;OID=.;OPOS=155186729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:135:145:3:3:131:142:0.97931:59:72:1:2:65:77:2:1 chr1 155186742 . G A 2150.41 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.53;QD=62.7857;RBI=0.114198;REFB=0;REVB=0.113926;RO=0;SAF=74;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151257;OID=.;OPOS=155186742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:136:137:0:0:136:137:1:62:74:0:0:63:74:0:0 chr1 155217436 . GGA ATT 442.73 PASS AF=1;AO=28;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581158;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=3;MLLD=154.219;QD=57.1269;RBI=0.104181;REFB=0;REVB=0.0864647;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00134298;OID=.;OPOS=155217436;OREF=GGA;OALT=ATT;OMAPALT=ATT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:28:31:1:18:10:0:0:20:11:0:0 chr1 155230131 . C T 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164663;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=234.751;QD=58.1421;RBI=0.0231087;REFB=0;REVB=0.0162133;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13278e-05;OID=.;OPOS=155230131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0 chr1 155247518 . G A 148.27 PASS AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0471181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6943;QD=18.5334;RBI=0.121797;REFB=0.00613805;REVB=0.112313;RO=16;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348757;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000507533;OID=.;OPOS=155247518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:16:16:15:16:0.5:6:9:9:7:7:9:9:7 chr1 155258752 . G A 708.4 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.348;QD=62.9686;RBI=0.0346781;REFB=0;REVB=0.0319011;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104601;OID=.;OPOS=155258752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0 chr1 155258756 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.224;QD=62.3508;RBI=0.0292101;REFB=0;REVB=0.0240256;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203106;OID=.;OPOS=155258756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr1 155260383 . G T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.344;QD=56.7065;RBI=0.0291745;REFB=0;REVB=0.0113112;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143011;OID=.;OPOS=155260383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr1 155294274 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.525;QD=51.916;RBI=0.0403308;REFB=0;REVB=0.036763;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229906;OID=.;OPOS=155294274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:15:6:0:0:15:6:0:0 chr1 155408558 . C T 184.08 PASS AF=0.527778;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0205287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.927;QD=20.4529;RBI=0.0205768;REFB=-0.0113164;REVB=0.00140607;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226446;STB=0.523784;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0122417;OID=.;OPOS=155408558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:17:17:18:19:0.527778:10:8:8:9:11:8:8:9 chr1 155408635 . T C 731.04 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642563;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9614;QD=63.5683;RBI=0.100163;REFB=0;REVB=0.0768355;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202349;OID=.;OPOS=155408635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:47:46:1:22:25:0:0:21:25:0:0 chr1 155533274 . A T 220.93 PASS AF=0.44898;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00890776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.636;QD=18.0354;RBI=0.0278393;REFB=-0.0185229;REVB=-0.0263757;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897061;STB=0.550974;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0169881;OID=.;OPOS=155533274;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:27:21:22:0.44898:10:11:16:10:11:11:16:11 chr1 155581311 . T C 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00153107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.381;QD=12.73;RBI=0.00268315;REFB=-0.0111082;REVB=-0.00220344;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311955;STB=0.551606;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0257056;OID=.;OPOS=155581311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:6:3:4:7:6:3:5:7 chr1 155658085 . T C 130.95 PASS AF=0.313725;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00204683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.13;QD=10.2709;RBI=0.0216356;REFB=-0.0087015;REVB=-0.0215386;RO=34;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716344;STB=0.533292;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.021139;OID=.;OPOS=155658085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:34:35:16:16:0.313725:9:7:17:17:9:7:17:18 chr1 155735012 . T C 232.25 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0193489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.623;QD=23.8206;RBI=0.0297272;REFB=-0.00919727;REVB=0.0225683;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689408;STB=0.538427;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00364281;OID=.;OPOS=155735012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:11:11:10:7:11:11:10:7 chr1 155755097 . G A 594.44 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.445;QD=60.9678;RBI=0.0127301;REFB=0;REVB=0.00279381;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.61883e-05;OID=.;OPOS=155755097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:26:13:0:0:26:13:0:0 chr1 155837865 . G C 632.16 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1432;QD=61.6743;RBI=0.064053;REFB=0;REVB=0.0266359;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128143;OID=.;OPOS=155837865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0 chr1 155838267 . T C 327.6 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114297;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.545;QD=54.6;RBI=0.0368033;REFB=0;REVB=0.0349834;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.85384e-05;OID=.;OPOS=155838267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr1 155880573 . C G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.534;QD=62.9825;RBI=0.0374501;REFB=0;REVB=0.0329727;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79074e-05;OID=.;OPOS=155880573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0 chr1 155904177 . T C 1283.39 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00437525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.403;QD=61.8502;RBI=0.00465557;REFB=0;REVB=0.00159108;RO=0;SAF=31;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.58492e-06;OID=.;OPOS=155904177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:52:31:0:0:52:31:0:0 chr1 155912486 . T C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4007;QD=53.2763;RBI=0.0540242;REFB=0;REVB=-0.0497956;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000818696;OID=.;OPOS=155912486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0 chr1 156011444 . T C 114.59 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.048365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.282;QD=10.4177;RBI=0.0518877;REFB=-0.0180057;REVB=-0.0187925;RO=29;SAF=7;SAR=7;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176232;STB=0.613482;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0715911;OID=.;OPOS=156011444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:29:30:14:14:0.318182:7:7:19:10:7:7:20:10 chr1 156096376 . G A 574.5 PASS AF=0.465116;AO=57;DP=128;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=22;FWDB=-0.011754;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.28;QD=17.814;RBI=0.0476768;REFB=-0.010185;REVB=0.0462052;RO=70;SAF=27;SAR=30;SRF=48;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208447;STB=0.62181;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0232131;OID=.;OPOS=156096376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:70:69:57:60:0.465116:30:27:48:22:33:27:47:22 chr1 156096417 . T G 603.72 PASS AF=0.484375;AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.00600424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.453;QD=18.8662;RBI=0.0124991;REFB=-0.0205989;REVB=0.0109625;RO=64;SAF=29;SAR=33;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726509;STB=0.540017;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0175007;OID=.;OPOS=156096417;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:64:66:62:62:0.484375:33:29:35:29:33:29:36:30 chr1 156099669 . T G 374.25 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=46;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00226092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.258;QD=31.1876;RBI=0.0190443;REFB=-0.0191824;REVB=-0.0189097;RO=16;SAF=16;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186201;STB=0.52082;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.010258;OID=.;OPOS=156099669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:16:16:30:32:0.666667:14:16:9:7:16:16:9:7 chr1 156105028 . T C 94.36 PASS AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0116732;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0998;QD=9.67748;RBI=0.0311037;REFB=0.00475955;REVB=0.0288301;RO=26;SAF=1;SAR=11;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336415;STB=0.705986;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.0111212;OID=.;OPOS=156105028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:39:39:26:27:12:12:0.307692:11:1:6:20:11:1:6:21 chr1 156106185 . T C 182.91 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00753012;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.586;QD=16.628;RBI=0.0446438;REFB=-0.0519855;REVB=-0.0440042;RO=25;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214454;STB=0.622515;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.073003;OID=.;OPOS=156106185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:25:25:19:19:0.431818:8:11:9:16:8:11:9:16 chr1 156202173 . A G 411.1 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.7448;QD=56.7034;RBI=0.0396773;REFB=0;REVB=0.0359405;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361712;OID=.;OPOS=156202173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr1 156206121 . G A 284.65 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0141233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.428;QD=17.7905;RBI=0.027017;REFB=-0.00454232;REVB=-0.0230316;RO=33;SAF=17;SAR=14;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586805;STB=0.53284;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0042879;OID=.;OPOS=156206121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:14:17:16:17:14:17:16:17 chr1 156206205 . C T 318.37 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0023075;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.711;QD=20.5402;RBI=0.0262777;REFB=-0.0201668;REVB=0.0261762;RO=29;SAF=19;SAR=14;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163007;STB=0.589877;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0220103;OID=.;OPOS=156206205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:29:29:33:33:0.532258:14:19:22:7:14:19:22:7 chr1 156215899 . G A 594.73 PASS AF=0.455882;AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=26;FWDB=-0.00282376;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.931;QD=17.4922;RBI=0.0323962;REFB=-0.0111722;REVB=0.0322729;RO=74;SAF=30;SAR=32;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160799;STB=0.589207;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0170788;OID=.;OPOS=156215899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:74:74:62:62:0.455882:32:30:48:26:32:30:48:26 chr1 156220056 . T C 132.7 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0372973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.819;QD=15.1657;RBI=0.112915;REFB=-0.0290777;REVB=-0.106577;RO=20;SAF=13;SAR=2;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.53045;STB=0.812031;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0156748;OID=.;OPOS=156220056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:2:13:8:12:2:13:8:12 chr1 156233189 . C T 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0328366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.965;QD=15.7844;RBI=0.0382009;REFB=-0.0408594;REVB=0.0195208;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163226;STB=0.509421;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0407038;OID=.;OPOS=156233189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:6:8:10:7:6:8:10:7 chr1 156263940 . T C 358.85 PASS AF=0.614035;AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0143061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5982;QD=25.1827;RBI=0.0143307;REFB=-0.00780605;REVB=-0.000839555;RO=22;SAF=19;SAR=16;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622347;STB=0.534117;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0110182;OID=.;OPOS=156263940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:22:22:35:35:0.614035:16:19:10:12:16:19:10:12 chr1 156264000 . G A 269.11 PASS AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0312441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.351;QD=29.0927;RBI=0.0313581;REFB=-0.0341793;REVB=0.00267056;RO=13;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122736;STB=0.567512;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0158103;OID=.;OPOS=156264000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:12:12:4:9:12:12:4:9 chr1 156280969 . G A 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0148202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7142;QD=7.83709;RBI=0.0209565;REFB=0.0233356;REVB=0.0148167;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147359;STB=0.59233;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.0161932;OID=.;OPOS=156280969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:4:3:9:7:4:3:9:7 chr1 156280971 . G A 46.61 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00257972;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0672;QD=8.47397;RBI=0.0537753;REFB=0.0191274;REVB=0.0537134;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147359;STB=0.571224;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.0312927;OID=.;OPOS=156280971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:23:22:16:15:7:7:0.318182:4:3:9:7:4:3:8:7 chr1 156347131 . G A 310.39 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0379688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.235;QD=21.4059;RBI=0.045606;REFB=-0.0337197;REVB=0.0252642;RO=26;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820652;STB=0.545426;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0127471;OID=.;OPOS=156347131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:14:18:12:14:14:18:12:14 chr1 156347834 . T A 601.19 PASS AF=0.434483;AO=63;DP=147;FAO=63;FDP=145;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0343658;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7483;QD=16.5845;RBI=0.0798116;REFB=-0.0248634;REVB=0.072034;RO=82;SAF=31;SAR=32;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032708;STB=0.51827;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0327903;OID=.;OPOS=156347834;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:145:82:82:63:63:0.434483:32:31:43:39:32:31:43:39 chr1 156351699 . G A 774.44 PASS AF=0.490798;AO=80;DP=163;FAO=80;FDP=163;FR=.;FRO=83;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=0.00453265;FXX=0.00609719;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.819;QD=19.0047;RBI=0.019472;REFB=-0.0342903;REVB=0.0189371;RO=81;SAF=39;SAR=41;SRF=49;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107119;STB=0.558364;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.034658;OID=.;OPOS=156351699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:81:83:80:80:0.490798:41:39:49:32:41:39:50:33 chr1 156354293 . A G 466.94 PASS AF=0.49;AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0047238;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.628;QD=18.6775;RBI=0.00751696;REFB=-0.00962568;REVB=0.00584726;RO=48;SAF=24;SAR=25;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463712;STB=0.5102;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00828818;OID=.;OPOS=156354293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:48:51:49:49:0.49:25:24:26:22:25:24:26:25 chr1 156354367 . A G 1120.27 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0923908;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5049;QD=60.5553;RBI=0.0924914;REFB=0;REVB=-0.00431226;RO=0;SAF=24;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000727638;OID=.;OPOS=156354367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:50:24:0:0:50:24:0:0 chr1 156450719 . G A 255.25 PASS AF=0.916667;AO=21;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0390155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.086;QD=42.5408;RBI=0.0566035;REFB=-0.157933;REVB=0.0410092;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535682;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00249211;OID=.;OPOS=156450719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:24:24:0:2:21:22:0.916667:8:13:0:0:9:13:2:0 chr1 156496297 . T C 246.2 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00501737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0437;QD=13.4903;RBI=0.0231636;REFB=-0.00162211;REVB=-0.0226137;RO=44;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439093;STB=0.525079;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00197234;OID=.;OPOS=156496297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:44:44:29:29:0.39726:17:12:20:24:17:12:20:24 chr1 156526387 . C G 1512.88 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000177566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6522;QD=59.9161;RBI=0.0470979;REFB=0;REVB=-0.0470975;RO=0;SAF=44;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.17359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000299175;OID=.;OPOS=156526387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:57:44:0:0:57:44:0:0 chr1 156526444 . T C 1249.91 PASS AF=0.987952;AO=78;DP=78;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.55;QD=60.2366;RBI=0.0364709;REFB=0.0202674;REVB=0.032945;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.506665;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.000198248;OID=.;OPOS=156526444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:83:0:1:78:82:0.987952:43:35:0:0:45:37:1:0 chr1 156532977 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3667;QD=56.706;RBI=0.0536926;REFB=0;REVB=-0.0409967;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00168402;OID=.;OPOS=156532977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr1 156536221 . G C 673.86 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770511;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.633;QD=62.6845;RBI=0.0217341;REFB=0;REVB=-0.0203225;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.59665e-05;OID=.;OPOS=156536221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0 chr1 156536251 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00252512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.432;QD=58.061;RBI=0.0258778;REFB=0;REVB=0.0257543;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36258e-05;OID=.;OPOS=156536251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0 chr1 156556321 . G A 507.22 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844717;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.4551;QD=57.9684;RBI=0.0192628;REFB=0;REVB=-0.0173119;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138194;OID=.;OPOS=156556321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:12:22:0:0:12:23:0:0 chr1 156561651 . G C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00148942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.039;QD=43.4862;RBI=0.153328;REFB=0;REVB=0.153321;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100557;OID=.;OPOS=156561651;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0 chr1 156563275 . G C 241.64 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.012336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.707;QD=21.9676;RBI=0.0255798;REFB=-0.0205914;REVB=-0.0224087;RO=20;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290823;STB=0.672367;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0137225;OID=.;OPOS=156563275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:15:8:14:6:15:8:15:6 chr1 156563375 . G A 380.53 PASS AF=0.965517;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.015418;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.789;QD=52.4865;RBI=0.0382913;REFB=-0.0385626;REVB=0.0350501;RO=1;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545937;STB=0.526297;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000222504;OID=.;OPOS=156563375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:29:29:1:1:27:28:0.965517:8:19:0:1:9:19:0:1 chr1 156563726 . A C 2123.94 PASS AF=1;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016147;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8685;QD=62.9316;RBI=0.0215082;REFB=0;REVB=-0.0142082;RO=0;SAF=53;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84364e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105806;OID=.;OPOS=156563726;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:135:0:0:135:135:1:82:53:0:0:82:53:0:0 chr1 156563813 . G A 1098.03 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.995;QD=60.166;RBI=0.0727033;REFB=0;REVB=0.0149956;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107331;OID=.;OPOS=156563813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:73:0:0:66:73:1:41:25:0:0:41:32:0:0 chr1 156563852 . C T 861.67 PASS AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.006309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.259;QD=54.7094;RBI=0.00702007;REFB=-0.165049;REVB=0.00307863;RO=1;SAF=23;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200789;STB=0.504145;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00174908;OID=.;OPOS=156563852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:63:63:1:2:61:61:0.968254:38:23:1:0:38:23:1:1 chr1 156564922 . C T 490.18 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0407433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.461;QD=56.0204;RBI=0.0407433;REFB=-0.110013;REVB=2.98384e-05;RO=1;SAF=8;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548779;STB=0.529394;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.000560426;OID=.;OPOS=156564922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:26:8:1:0:26:8:1:0 chr1 156565049 . A AAC 336.49 PASS AF=1;AO=23;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00842007;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=290.489;QD=53.839;RBI=0.031922;REFB=0;REVB=0.0307915;RO=2;SAF=9;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167852;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000164425;OID=.;OPOS=156565050;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:26:25:25:0:11:14:0:0:4:2:9:14:1:1 chr1 156595447 . G A 923.74 PASS AF=0.929577;AO=66;DP=72;FAO=66;FDP=71;FR=.;FRO=5;FSAF=57;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0107084;FXX=0.013887;HRUN=6;LEN=1;MLLD=238.449;QD=52.0419;RBI=0.0112313;REFB=-0.0120332;REVB=-0.00338696;RO=5;SAF=57;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700493;STB=0.537263;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=7.91379e-05;OID=.;OPOS=156595447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:72:71:5:5:66:66:0.929577:9:57:3:2:9:57:3:2 chr1 156622252 . G A 227.18 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.109722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2222;QD=28.3971;RBI=0.113578;REFB=-0.0395513;REVB=0.0293465;RO=11;SAF=7;SAR=14;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110782;STB=0.560921;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0255084;OID=.;OPOS=156622252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:14:7:2:9:14:7:2:9 chr1 156627996 . T C 434.44 PASS AF=0.463158;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.0157302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.899;QD=18.2924;RBI=0.0164033;REFB=-0.0253124;REVB=-0.0046505;RO=50;SAF=17;SAR=27;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472518;STB=0.519075;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0340105;OID=.;OPOS=156627996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:51:44:44:0.463158:27:17:17:33:27:17:18:33 chr1 156639636 . G A 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0115945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.106;QD=15.1962;RBI=0.0142742;REFB=-0.0162371;REVB=0.00832589;RO=26;SAF=4;SAR=14;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116022;STB=0.567488;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0286757;OID=.;OPOS=156639636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:14:4:8:18:14:4:8:18 chr1 156639753 . G A 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00521148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.044;QD=19.1804;RBI=0.0105684;REFB=-0.012405;REVB=-0.00919409;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017866;STB=0.510188;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.009383;OID=.;OPOS=156639753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:4:7:8:5:4:7 chr1 156640156 . G A 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0141131;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.144;QD=14.6525;RBI=0.0223042;REFB=-0.041879;REVB=0.0172713;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392076;STB=0.739831;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0220935;OID=.;OPOS=156640156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:3:2:5:1:3:2 chr1 156640308 . C T 195.76 PASS AF=0.425532;AO=19;DP=48;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00673181;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.299;QD=16.6608;RBI=0.0287077;REFB=-0.0297537;REVB=0.0279073;RO=22;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847374;STB=0.568896;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0198053;OID=.;OPOS=156640308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:22:27:19:20:0.425532:7:12:12:10:8:12:13:14 chr1 156640503 . C T 514.18 PASS AF=0.430769;AO=54;DP=129;FAO=56;FDP=130;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0934832;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2705;QD=15.821;RBI=0.101827;REFB=-0.0023372;REVB=0.0403683;RO=75;SAF=21;SAR=33;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110404;STB=0.551513;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00397061;OID=.;OPOS=156640503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:75:74:54:56:0.430769:33:21:37:38:33:23:37:37 chr1 156641537 . C T 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00942301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.146;QD=23.8999;RBI=0.0110442;REFB=-0.0180227;REVB=-0.0057603;RO=23;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515799;STB=0.528661;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0126902;OID=.;OPOS=156641537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:11:16:15:8:11:16:15:8 chr1 156705593 . G C 1044.31 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.349;QD=59.6751;RBI=0.0172695;REFB=0;REVB=0.0105688;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98923e-05;OID=.;OPOS=156705593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:45:25:0:0:45:25:0:0 chr1 156713512 . C T 668.84 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0747041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3092;QD=58.1595;RBI=0.0924908;REFB=-0.133509;REVB=0.0545331;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.520824;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00783738;OID=.;OPOS=156713512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:46:46:0:2:44:44:0.956522:23:21:0:0:23:21:0:2 chr1 156737969 . C T 219.7 PASS AF=0.488889;AO=20;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0610367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.4252;QD=19.5291;RBI=0.112564;REFB=-0.0427445;REVB=0.0945794;RO=24;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250896;STB=0.555506;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0538813;OID=.;OPOS=156737969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:24:23:20:22:0.488889:8:12:15:9:10:12:15:8 chr1 156752048 . C G 613.67 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2255;QD=61.3674;RBI=0.0170475;REFB=0;REVB=0.001886;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235024;OID=.;OPOS=156752048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:18:21:0:0:19:21:0:0 chr1 156760887 . C A 211.7 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.00969476;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.729;QD=14.1133;RBI=0.0368579;REFB=-0.0202211;REVB=-0.0355601;RO=34;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129934;STB=0.580583;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.030342;OID=.;OPOS=156760887;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:34:35:25:25:0.416667:13:12:12:22:13:12:12:23 chr1 156784982 . T C 749.06 PASS AF=1;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410984;FXX=0.0535619;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.035;QD=56.5326;RBI=0.0411107;REFB=0;REVB=-0.00100498;RO=0;SAF=13;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353417;OID=.;OPOS=156784982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:52:53:1:39:13:0:0:39:14:0:0 chr1 156785617 . G A 565.49 PASS AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0542679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.325;QD=53.8562;RBI=0.0609126;REFB=-0.0664087;REVB=0.0276648;RO=3;SAF=16;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351465;STB=0.518787;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.000721518;OID=.;OPOS=156785617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:42:42:3:3:39:39:0.928571:23:16:2:1:23:16:2:1 chr1 156846233 . G A 129.18 PASS AF=0.3125;AO=16;DP=50;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00227187;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.122;QD=10.7646;RBI=0.0123978;REFB=-0.0147043;REVB=-0.0121878;RO=33;SAF=6;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160934;STB=0.579725;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0262856;OID=.;OPOS=156846233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:48:33:33:16:15:0.3125:10:6:17:16:9:6:17:16 chr1 156873727 . G A 432.14 PASS AF=0.387597;AO=50;DP=130;FAO=50;FDP=129;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=0.0170562;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1504;QD=13.3997;RBI=0.0408862;REFB=-0.0381069;REVB=0.0371587;RO=79;SAF=31;SAR=19;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056791;STB=0.532219;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0232652;OID=.;OPOS=156873727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:79:79:50:50:0.387597:19:31:45:34:19:31:45:34 chr1 156877457 . T C 739.02 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0336803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5896;QD=54.7424;RBI=0.0403717;REFB=0.14837;REVB=-0.0222602;RO=1;SAF=28;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165303;STB=0.508769;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00844233;OID=.;OPOS=156877457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:25:28:1:0:25:28:1:0 chr1 156878531 . T C 245.32 PASS AF=0.638889;AO=22;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0115705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4972;QD=27.2582;RBI=0.0462356;REFB=-0.00750286;REVB=-0.0447644;RO=13;SAF=9;SAR=13;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138969;STB=0.581835;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.00735065;OID=.;OPOS=156878531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:22:23:0.638889:13:9:8:5:14:9:8:5 chr1 156878737 . T C 128.72 PASS AF=0.428571;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0169809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.908;QD=14.7109;RBI=0.0299874;REFB=-0.00604919;REVB=-0.0247162;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300736;STB=0.673227;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00940544;OID=.;OPOS=156878737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:19:20:14:15:0.428571:4:10:8:11:4:11:9:11 chr1 156879580 . C T 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0172905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.089;QD=20.5627;RBI=0.0185403;REFB=-0.00986562;REVB=0.00669194;RO=24;SAF=6;SAR=23;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141456;STB=0.595783;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.010087;OID=.;OPOS=156879580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:25:29:29:0.537037:23:6:8:16:23:6:9:16 chr1 156882996 . G C 192.29 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.051089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.164;QD=16.0243;RBI=0.0866454;REFB=-0.0108536;REVB=-0.069981;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25078;STB=0.644587;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0242329;OID=.;OPOS=156882996;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:14:6:15:13:14:6:15:13 chr1 156883215 . C A 461.0 PASS AF=0.479167;AO=42;DP=93;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0735054;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0444;QD=19.2084;RBI=0.0864676;REFB=-0.0363318;REVB=0.0455369;RO=51;SAF=25;SAR=17;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012848;STB=0.515574;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0389108;OID=.;OPOS=156883215;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:51:50:42:46:0.479167:17:25:31:20:18:28:29:21 chr1 156883493 . G A 339.18 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0033705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.387;QD=17.8517;RBI=0.0108475;REFB=-0.0198241;REVB=0.0103106;RO=40;SAF=17;SAR=19;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021012;STB=0.511741;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.02117;OID=.;OPOS=156883493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:19:17:18:22:19:17:18:22 chr1 156883546 . A G 414.61 PASS AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00301505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.768;QD=21.8213;RBI=0.0170252;REFB=-0.00635527;REVB=-0.0167561;RO=35;SAF=23;SAR=18;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086889;STB=0.547948;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00402531;OID=.;OPOS=156883546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:35:41:41:0.539474:18:23:16:19:18:23:16:19 chr1 156884584 . C T 217.36 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00581368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.105;QD=22.8804;RBI=0.0200739;REFB=-0.0122851;REVB=0.0192136;RO=17;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994097;STB=0.555504;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00828331;OID=.;OPOS=156884584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:11:10:6:11:11:10:6:11 chr1 156890672 . T C 699.09 PASS AF=0.370536;AO=82;DP=224;FAO=83;FDP=224;FR=.;FRO=141;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=74;FSRR=67;FWDB=-7.58849e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.053;QD=12.4837;RBI=0.0697354;REFB=-0.004384;REVB=-0.0697353;RO=141;SAF=41;SAR=41;SRF=74;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276936;STB=0.511835;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00669274;OID=.;OPOS=156890672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:141:141:82:83:0.370536:41:41:74:67:41:42:74:67 chr1 156902222 . G A 400.28 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0058221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.069;QD=21.3483;RBI=0.00605617;REFB=-0.0221187;REVB=0.00166743;RO=35;SAF=15;SAR=25;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144908;STB=0.580164;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0123331;OID=.;OPOS=156902222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:25:15:19:16:25:15:19:16 chr1 156902259 . G A 1111.12 PASS AF=0.9625;AO=76;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0421842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.107;QD=55.5558;RBI=0.0423246;REFB=-0.0113868;REVB=0.00344438;RO=2;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201293;STB=0.51546;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=8.67729e-05;OID=.;OPOS=156902259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:80:80:2:3:76:77:0.9625:46:30:0:2:47:30:0:3 chr1 156902281 . T G 360.07 PASS AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0235706;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.802;QD=17.1464;RBI=0.0290214;REFB=-0.00222603;REVB=0.0169312;RO=46;SAF=12;SAR=26;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148603;STB=0.583628;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00503733;OID=.;OPOS=156902281;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:26:12:21:25:26:12:21:25 chr1 156904644 . A G 164.54 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0235254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.575;QD=9.53848;RBI=0.0246306;REFB=-0.00697729;REVB=-0.00729519;RO=46;SAF=11;SAR=11;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100156;STB=0.550679;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0287012;OID=.;OPOS=156904644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:46:47:22:22:0.318841:11:11:27:19:11:11:27:20 chr1 156904818 . G A 340.74 PASS AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00758705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2095;QD=15.6663;RBI=0.0462565;REFB=0.0103619;REVB=0.0456301;RO=48;SAF=25;SAR=12;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144011;STB=0.571965;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.0131399;OID=.;OPOS=156904818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:50:37:37:0.425287:12:25:26:22:12:25:28:22 chr1 156907081 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.985;QD=63.8717;RBI=0.0402761;REFB=0;REVB=0.0384334;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.35889e-05;OID=.;OPOS=156907081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0 chr1 156907115 . T C 305.66 PASS AF=0.571429;AO=27;DP=51;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0486246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0463;QD=21.8329;RBI=0.0772458;REFB=-0.0339324;REVB=0.0600214;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598413;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0272433;OID=.;OPOS=156907115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:56:24:24:27:32:0.571429:15:12:9:15:20:12:9:15 chr1 156909695 . G A 357.25 PASS AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00640829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.085;QD=16.8119;RBI=0.0192493;REFB=-0.0163161;REVB=-0.0181513;RO=47;SAF=21;SAR=17;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833533;STB=0.546783;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0187643;OID=.;OPOS=156909695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:38:38:0.447059:17:21:22:25:17:21:22:25 chr1 156939067 . G A 408.27 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00892055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9722;QD=20.4136;RBI=0.0253723;REFB=-0.0206324;REVB=-0.0237524;RO=39;SAF=26;SAR=15;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415259;STB=0.523026;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0180607;OID=.;OPOS=156939067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:15:26:23:16:15:26:23:16 chr1 157062739 . C G 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0197324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.657;QD=15.3789;RBI=0.0317114;REFB=-0.0219888;REVB=0.0248243;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316258;STB=0.692034;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0162139;OID=.;OPOS=157062739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:14:12:12:0.461538:6:6:11:2:6:6:12:2 chr1 157095470 . A G 302.25 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.000979014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.556;QD=14.3928;RBI=0.0491879;REFB=-0.0113315;REVB=-0.0491782;RO=47;SAF=11;SAR=23;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090805;STB=0.537361;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0178583;OID=.;OPOS=157095470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:47:50:34:34:0.404762:23:11:19:28:23:11:19:31 chr1 157488487 . C T 378.52 PASS AF=0.434783;AO=39;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00185394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.965;QD=16.4574;RBI=0.0194595;REFB=-0.0126152;REVB=-0.019371;RO=52;SAF=19;SAR=20;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714503;STB=0.532592;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0170819;OID=.;OPOS=157488487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:39:40:0.434783:20:19:29:23:20:20:29:23 chr1 157489535 . G A 319.84 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00976542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.675;QD=18.5414;RBI=0.0211274;REFB=-0.00963664;REVB=0.0187351;RO=34;SAF=14;SAR=20;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053856;STB=0.538172;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0104351;OID=.;OPOS=157489535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:35:34:34:0.492754:20:14:16:18:20:14:17:18 chr1 157494106 . C T 225.96 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00916201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.533;QD=20.5415;RBI=0.0355189;REFB=-0.0278512;REVB=0.0343169;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181635;STB=0.612603;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.029384;OID=.;OPOS=157494106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:22:22:22:0.5:9:13:8:13:9:13:8:14 chr1 157504143 . G A 176.15 PASS AF=0.285714;AO=24;DP=81;FAO=24;FDP=84;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0331041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.332;QD=8.38789;RBI=0.0608922;REFB=-0.0168209;REVB=-0.0511075;RO=57;SAF=11;SAR=13;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142304;STB=0.565163;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.049852;OID=.;OPOS=157504143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:57:60:24:24:0.285714:13:11:33:24:13:11:33:27 chr1 157504422 . C T 169.2 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0301831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.994;QD=13.015;RBI=0.0310424;REFB=-0.0107664;REVB=-0.00725347;RO=32;SAF=11;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134426;STB=0.507774;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0223503;OID=.;OPOS=157504422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:9:11:18:14:9:11:18:14 chr1 157504433 . C G 192.65 PASS AF=0.410714;AO=22;DP=55;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00418595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.337;QD=13.7609;RBI=0.0122474;REFB=-0.0163783;REVB=-0.0115098;RO=32;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470768;STB=0.529755;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0433763;OID=.;OPOS=157504433;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:32:33:22:23:0.410714:10:12:16:16:10:13:17:16 chr1 157508882 . C T 230.77 PASS AF=0.48;AO=22;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0182441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4731;QD=18.4613;RBI=0.0202389;REFB=-0.0322828;REVB=0.00876162;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107117;STB=0.521721;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0321814;OID=.;OPOS=157508882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:26:22:24:0.48:13:9:14:13:13:11:13:13 chr1 157509025 . C T 1268.66 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00449957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.503;QD=60.4125;RBI=0.0104531;REFB=-0.09649;REVB=-0.00943508;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.505493;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-9.41434e-05;OID=.;OPOS=157509025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:45:38:0:0:45:38:0:1 chr1 157514091 . C T 425.35 PASS AF=0.531646;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0211939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.233;QD=21.5365;RBI=0.057021;REFB=-0.015618;REVB=-0.0529359;RO=36;SAF=21;SAR=21;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930241;STB=0.556935;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0125988;OID=.;OPOS=157514091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:36:37:42:42:0.531646:21:21:14:22:21:21:14:23 chr1 157514097 . A G 508.53 PASS AF=0.551724;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00784589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.361;QD=23.3805;RBI=0.0113021;REFB=-0.0180551;REVB=0.00813515;RO=39;SAF=23;SAR=25;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354192;STB=0.519454;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0140504;OID=.;OPOS=157514097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:39:39:48:48:0.551724:25:23:17:22:25:23:17:22 chr1 157517127 . C T 230.22 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.000195069;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.927;QD=16.1554;RBI=0.0045551;REFB=-0.00523663;REVB=-0.00455092;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525914;STB=0.529707;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00589707;OID=.;OPOS=157517127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:12:14:15:16:12:14:15:16 chr1 157557701 . G A 95.92 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0374756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.617;QD=11.6264;RBI=0.0538159;REFB=-0.0174515;REVB=-0.0386229;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164807;STB=0.597828;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0273753;OID=.;OPOS=157557701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:7:5:12:9:7:5:12:9 chr1 157567751 . A G 593.73 PASS AF=1;AO=31;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00283858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7594;QD=60.8954;RBI=0.130788;REFB=0;REVB=0.130757;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00222682;OID=.;OPOS=157567751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:31:39:1:9:22:0:0:17:22:0:0 chr1 157668390 . T C 158.11 PASS AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00179461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5419;QD=9.88172;RBI=0.00771465;REFB=-0.0117975;REVB=0.00750301;RO=42;SAF=10;SAR=11;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161715;STB=0.585719;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0271605;OID=.;OPOS=157668390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:43:21:21:0.328125:11:10:26:16:11:10:26:17 chr1 157670290 . C G 379.36 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.000271039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4408;QD=19.2081;RBI=0.0444078;REFB=-0.0122761;REVB=-0.044407;RO=39;SAF=20;SAR=19;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116019;STB=0.569717;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0200324;OID=.;OPOS=157670290;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:40:39:39:0.493671:19:20:25:14:19:20:26:14 chr1 157771880 . C T 446.27 PASS AF=0.714286;AO=34;DP=48;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0369807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.797;QD=36.4299;RBI=0.039056;REFB=-0.0429355;REVB=0.0125618;RO=14;SAF=14;SAR=20;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19925;STB=0.609694;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00900517;OID=.;OPOS=157771880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:14:14:34:35:0.714286:20:14:11:3:21:14:11:3 chr1 157802979 . C T 972.87 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.743;QD=58.9617;RBI=0.0327968;REFB=0;REVB=0.0303165;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161798;OID=.;OPOS=157802979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:39:27:0:0:39:27:0:0 chr1 158066834 . A G 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0776185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1914;QD=60.6098;RBI=0.0785187;REFB=0;REVB=0.0118554;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141647;OID=.;OPOS=158066834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0 chr1 158224904 . C T 363.25 PASS AF=0.475;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0117645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8255;QD=18.1627;RBI=0.0399327;REFB=0.0164653;REVB=-0.0381604;RO=41;SAF=23;SAR=15;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192728;STB=0.505492;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00979661;OID=.;OPOS=158224904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:41:42:38:38:0.475:15:23:24:17:15:23:25:17 chr1 158225019 . C G 464.19 PASS AF=0.522727;AO=44;DP=86;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0376666;FXX=0.0112347;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.1364;QD=21.0995;RBI=0.0389783;REFB=-0.0292092;REVB=-0.0100268;RO=41;SAF=20;SAR=24;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787243;STB=0.5467;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0174755;OID=.;OPOS=158225019;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:41:42:44:46:0.522727:24:20:15:26:24:22:16:26 chr1 158324425 . A G 264.02 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0131767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.188;QD=15.3052;RBI=0.0150595;REFB=-0.0104983;REVB=0.00729133;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569126;STB=0.532142;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0120021;OID=.;OPOS=158324425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:16:14:16:23:16:14:16:23 chr1 158435927 . C A 233.47 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0209415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.641;QD=16.9796;RBI=0.0496723;REFB=-0.0433243;REVB=0.0450422;RO=29;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111123;STB=0.562264;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0356869;OID=.;OPOS=158435927;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:16:10:8:21:16:10:8:21 chr1 158436299 . T C 231.29 PASS AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=45;FSRR=17;FWDB=-0.00732666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.161;QD=10.1665;RBI=0.101641;REFB=-0.00706188;REVB=0.101377;RO=62;SAF=17;SAR=12;SRF=45;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175221;STB=0.60139;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0168806;OID=.;OPOS=158436299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:12:17:45:17:12:17:45:17 chr1 158450142 . C T 361.06 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00236864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.405;QD=20.3415;RBI=0.00240229;REFB=-0.024398;REVB=-0.000400656;RO=34;SAF=24;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826153;STB=0.545872;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0220972;OID=.;OPOS=158450142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:13:24:19:15:13:24:19:15 chr1 158450314 . A G 97.02 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00580818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7406;QD=12.9358;RBI=0.0110011;REFB=0.0109949;REVB=-0.00934286;RO=18;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282827;STB=0.666389;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.0171942;OID=.;OPOS=158450314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:4:8:7:11:4:8:7:11 chr1 158450382 . C T 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00206392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.186;QD=13.9118;RBI=0.0164409;REFB=-0.00589861;REVB=-0.0163108;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240398;STB=0.645029;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00983077;OID=.;OPOS=158450382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:9:12:10:20:9:12:10:21 chr1 158517142 . C T 520.35 PASS AF=0.538462;AO=48;DP=92;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.00864321;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.528;QD=22.8724;RBI=0.0111342;REFB=-0.020625;REVB=-0.0070189;RO=41;SAF=29;SAR=19;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137734;STB=0.56287;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0168965;OID=.;OPOS=158517142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:41:42:48:49:0.538462:19:29:31:10:19:30:31:11 chr1 158517353 . G A 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0248829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.799;QD=16.2711;RBI=0.0283797;REFB=-0.00989461;REVB=-0.0136473;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840217;STB=0.548323;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.014504;OID=.;OPOS=158517353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:7:8:8:10:7:8:8:10 chr1 158533140 . A G 210.18 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00665424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3484;QD=14.2494;RBI=0.134315;REFB=0.0155392;REVB=-0.13415;RO=33;SAF=17;SAR=8;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113774;STB=0.575784;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.0229688;OID=.;OPOS=158533140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:33:34:25:25:0.423729:8:17:19:14:8:17:19:15 chr1 158533224 . A G 272.11 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0126265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8682;QD=17.2765;RBI=0.0370088;REFB=-0.0104096;REVB=0.0347882;RO=33;SAF=18;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191823;STB=0.607523;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0170051;OID=.;OPOS=158533224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:12:18:13:20:12:18:13:20 chr1 158549264 . G A 303.49 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00344706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.02;QD=22.072;RBI=0.0100949;REFB=-0.0147917;REVB=-0.00948818;RO=24;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531914;STB=0.529393;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0102696;OID=.;OPOS=158549264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:15:16:14:10:15:16:14:10 chr1 158549420 . C T 416.09 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.00244115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.457;QD=16.9832;RBI=0.046478;REFB=-0.00431707;REVB=-0.0464138;RO=48;SAF=26;SAR=17;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19716;STB=0.642959;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.010975;OID=.;OPOS=158549420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:55:43:43:0.438776:17:26:19:29:17:26:19:36 chr1 158549492 . C T 422.71 PASS AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.00430491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.132;QD=14.9631;RBI=0.00463653;REFB=-0.0108887;REVB=0.00172196;RO=65;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404042;STB=0.522664;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0159386;OID=.;OPOS=158549492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:30:18:22:43:30:18:22:43 chr1 158549511 . A G 414.39 PASS AF=0.431193;AO=46;DP=108;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.0204851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.933;QD=15.207;RBI=0.0204852;REFB=-0.00760628;REVB=3.60606e-05;RO=61;SAF=16;SAR=30;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413061;STB=0.534669;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0107102;OID=.;OPOS=158549511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:61:62:46:47:0.431193:30:16:19:42:30:17:19:43 chr1 158577109 . A C 335.43 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0158807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.969;QD=16.9839;RBI=0.020902;REFB=-0.01645;REVB=-0.0135903;RO=43;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00253891;STB=0.501424;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0167384;OID=.;OPOS=158577109;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:20:16:19:24:20:16:19:24 chr1 158582646 . T C 545.43 PASS AF=0.483051;AO=58;DP=118;FAO=57;FDP=118;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0172293;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.667;QD=18.4892;RBI=0.018452;REFB=-0.016759;REVB=-0.00660513;RO=60;SAF=28;SAR=30;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046458;STB=0.534747;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0165341;OID=.;OPOS=158582646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:60:61:58:57:0.483051:30:28:32:28:30:27:33:28 chr1 158584091 . A G 162.08 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00870186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.363;QD=12.0057;RBI=0.009723;REFB=-0.00178023;REVB=-0.00433754;RO=34;SAF=13;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136228;STB=0.579376;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00787979;OID=.;OPOS=158584091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:7:13:18:16:7:13:18:16 chr1 158587390 . C T 256.32 PASS AF=0.394737;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0175717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.137;QD=13.4906;RBI=0.0527879;REFB=-0.0105427;REVB=-0.0497775;RO=44;SAF=14;SAR=16;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105691;STB=0.546379;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0161717;OID=.;OPOS=158587390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:44:46:30:30:0.394737:16:14:25:19:16:14:25:21 chr1 158607935 . T G 395.62 PASS AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0917277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3102;QD=20.0316;RBI=0.0924779;REFB=0.0170975;REVB=-0.0117552;RO=39;SAF=14;SAR=26;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576793;STB=0.532044;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.0144976;OID=.;OPOS=158607935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:26:14:16:23:26:14:16:23 chr1 158612236 . A G 2121.46 PASS AF=0.557143;AO=195;DP=350;FAO=195;FDP=350;FR=.;FRO=155;FSAF=93;FSAR=102;FSRF=83;FSRR=72;FWDB=-0.00748595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.082;QD=24.2453;RBI=0.0220821;REFB=-0.0160601;REVB=0.0207745;RO=155;SAF=93;SAR=102;SRF=83;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047758;STB=0.525925;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0134747;OID=.;OPOS=158612236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:350:350:155:155:195:195:0.557143:102:93:83:72:102:93:83:72 chr1 158619728 . A C 2217.23 PASS AF=1;AO=92;DP=143;FAO=139;FDP=139;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222742;FXX=0.0279701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.902;QD=63.8051;RBI=0.0425594;REFB=0;REVB=0.0362652;RO=0;SAF=40;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0217e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162367;OID=.;OPOS=158619728;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:139:0:0:92:139:1:52:40:0:0:96:43:0:0 chr1 158626378 . C T 343.22 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0273372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.506;QD=18.8067;RBI=0.0406009;REFB=-0.00912406;REVB=-0.0300185;RO=37;SAF=18;SAR=18;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160299;STB=0.588993;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00864265;OID=.;OPOS=158626378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:18:18:12:25:18:18:12:25 chr1 158631171 . A C 502.48 PASS AF=0.433071;AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=41;FWDB=0.00297548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.499;QD=15.826;RBI=0.00995155;REFB=-0.0140876;REVB=-0.00949631;RO=72;SAF=30;SAR=25;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115993;STB=0.564884;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0213903;OID=.;OPOS=158631171;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:0.433071:25:30:31:41:25:30:31:41 chr1 158647495 . A T 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00316502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.98;QD=60.2045;RBI=0.00570777;REFB=0;REVB=-0.00474988;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.41586e-05;OID=.;OPOS=158647495;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:30:43:0:0:30:43:0:0 chr1 158655036 . G A 1544.13 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.879;QD=62.389;RBI=0.0787173;REFB=0;REVB=-0.0212057;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000691818;OID=.;OPOS=158655036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:99:0:0:88:99:1:53:35:0:0:53:46:0:0 chr1 158656281 . T C 1530.78 PASS AF=1;AO=95;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125326;FXX=0.0204061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.785;QD=63.7825;RBI=0.0213213;REFB=0;REVB=0.0172491;RO=0;SAF=59;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126278;OID=.;OPOS=158656281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:96:0:0:95:96:1:36:59:0:0:37:59:0:0 chr1 158736215 . G A 301.31 PASS AF=0.471429;AO=31;DP=67;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0393945;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4426;QD=17.2174;RBI=0.0572635;REFB=-0.024043;REVB=-0.0415594;RO=36;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170108;STB=0.613791;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0337476;OID=.;OPOS=158736215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:36:37:31:33:0.471429:11:20:17:19:11:22:17:20 chr1 158813819 . A G 976.0 PASS AF=0.985294;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0171811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.921;QD=57.4116;RBI=0.0178202;REFB=-0.0643951;REVB=0.00472952;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506327;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=1.19094e-05;OID=.;OPOS=158813819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:68:0:1:65:67:0.985294:25:40:0:0:28:39:1:0 chr1 158986477 . G C 163.57 PASS AF=0.35;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.12497;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.759;QD=10.9048;RBI=0.125245;REFB=-0.00883129;REVB=-0.00828506;RO=38;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732009;STB=0.555501;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00894669;OID=.;OPOS=158986477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:38:39:21:21:0.35:15:6:13:25:15:6:14:25 chr1 158990247 . A G 420.61 PASS AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0120116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.241;QD=17.8981;RBI=0.0153102;REFB=-0.0146971;REVB=0.00949337;RO=50;SAF=13;SAR=30;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126226;STB=0.566635;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0166;OID=.;OPOS=158990247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:51:43:43:0.457447:30:13:21:29:30:13:21:30 chr1 159002377 . C A 211.53 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0141299;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2638;QD=14.102;RBI=0.0175527;REFB=-0.0235506;REVB=-0.0104136;RO=35;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245361;STB=0.639888;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0344099;OID=.;OPOS=159002377;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:35:35:25:25:0.416667:9:16:14:21:9:16:14:21 chr1 159002389 . T A 246.69 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00220985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.215;QD=15.9155;RBI=0.00221322;REFB=-0.00757398;REVB=-0.000122028;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244004;STB=0.637403;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00801909;OID=.;OPOS=159002389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:11:17:12:22:11:17:12:22 chr1 159169641 . T C 770.25 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0431335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.472;QD=55.0178;RBI=0.0436572;REFB=0.11456;REVB=0.00674165;RO=1;SAF=29;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159783;STB=0.508471;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00227856;OID=.;OPOS=159169641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:26:29:1:0:26:29:1:0 chr1 159175354 . G A 465.8 PASS AF=0.455357;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=47;FWDB=0.0118371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.602;QD=16.6356;RBI=0.0188002;REFB=-0.00780486;REVB=-0.0146058;RO=61;SAF=24;SAR=27;SRF=14;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242055;STB=0.633785;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00825004;OID=.;OPOS=159175354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:61:61:51:51:0.455357:27:24:14:47:27:24:14:47 chr1 159273943 . G A 404.06 PASS AF=0.425926;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0254852;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.135;QD=14.9653;RBI=0.0438057;REFB=-0.0244566;REVB=-0.0356293;RO=61;SAF=20;SAR=26;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258683;STB=0.528041;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0280919;OID=.;OPOS=159273943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:61:62:46:46:0.425926:26:20:25:36:26:20:24:38 chr1 159283494 . T C 286.24 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0134246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8501;QD=18.1737;RBI=0.0377968;REFB=0.00667691;REVB=-0.0353325;RO=31;SAF=20;SAR=11;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511104;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.0128347;OID=.;OPOS=159283494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:32:31:31:0.492063:11:20:20:11:11:20:20:12 chr1 159283746 . T C 973.97 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201154;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.221;QD=59.0286;RBI=0.0376218;REFB=0;REVB=0.0317926;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91763e-05;OID=.;OPOS=159283746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:21:44:0:0:23:43:0:0 chr1 159409734 . G T 859.63 PASS AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0446351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2551;QD=54.5796;RBI=0.0446767;REFB=0.0414318;REVB=0.00192715;RO=2;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285886;STB=0.515147;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.0108124;OID=.;OPOS=159409734;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:63:63:2:2:61:61:0.968254:32:29:0:2:32:29:0:2 chr1 159409757 . T C 302.25 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00540239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.582;QD=19.4997;RBI=0.0208765;REFB=-0.0115625;REVB=0.0201654;RO=30;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836259;STB=0.54653;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00829613;OID=.;OPOS=159409757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:18:14:16:14:18:14:16:14 chr1 159558258 . A G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.715;QD=57.8846;RBI=0.0213361;REFB=0;REVB=0.00605895;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.95178e-05;OID=.;OPOS=159558258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:20:40:0:0:20:40:0:0 chr1 159778983 . T C 724.81 PASS AF=0.529851;AO=63;DP=126;FAO=71;FDP=134;FR=.;FRO=63;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00308315;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.647;QD=21.636;RBI=0.00426722;REFB=-0.0189808;REVB=0.00295015;RO=61;SAF=41;SAR=22;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582858;STB=0.501209;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0152073;OID=.;OPOS=159778983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:134:61:63:63:71:0.529851:22:41:36:25:28:43:38:25 chr1 159785370 . T C 444.04 PASS AF=0.505747;AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0120356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9449;QD=20.4154;RBI=0.0136931;REFB=-0.00334405;REVB=-0.00653031;RO=43;SAF=22;SAR=22;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103714;STB=0.505745;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.00306694;OID=.;OPOS=159785370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:43:44:44:0.505747:22:22:22:21:22:22:22:21 chr1 159785425 . A G 212.3 PASS AF=0.376812;AO=25;DP=68;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0195079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.321;QD=12.3074;RBI=0.0199418;REFB=-0.0060952;REVB=0.00413745;RO=41;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142283;STB=0.566158;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0122655;OID=.;OPOS=159785425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:41:43:25:26:0.376812:9:16:21:20:10:16:22:21 chr1 159824967 . G C 1080.48 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.387;QD=60.0268;RBI=0.0548762;REFB=0;REVB=0.0332667;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304526;OID=.;OPOS=159824967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:44:27:0:0:45:27:0:0 chr1 159850401 . C G 195.41 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.000398516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.992;QD=10.5624;RBI=0.0334123;REFB=-0.0102811;REVB=-0.0334099;RO=49;SAF=16;SAR=9;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218245;STB=0.627348;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0216018;OID=.;OPOS=159850401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:49:49:25:25:0.337838:9:16:22:27:9:16:22:27 chr1 159897559 . G T 991.07 PASS AF=0.52459;AO=96;DP=183;FAO=96;FDP=183;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=0.0150879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.353;QD=21.6627;RBI=0.0157125;REFB=-0.027143;REVB=-0.00438612;RO=85;SAF=41;SAR=55;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118393;STB=0.570226;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0207862;OID=.;OPOS=159897559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:85:87:96:96:0.52459:55:41:48:37:55:41:50:37 chr1 159898100 . A G 501.63 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.531;QD=59.0158;RBI=0.0612852;REFB=0;REVB=-0.0562329;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000311693;OID=.;OPOS=159898100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr1 159912899 . C T 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0628537;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.303;QD=14.0438;RBI=0.0735094;REFB=-0.0341758;REVB=-0.0381188;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251123;STB=0.651584;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0253039;OID=.;OPOS=159912899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:2:3:1:3:2:3:1:3 chr1 159923111 . T G 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.739;QD=56.9364;RBI=0.0314084;REFB=0;REVB=0.0163021;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268912;OID=.;OPOS=159923111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0 chr1 159997713 . G T 427.31 PASS AF=0.408333;AO=49;DP=120;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=-0.0364499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5493;QD=14.2438;RBI=0.0384689;REFB=-0.0120881;REVB=-0.0122989;RO=70;SAF=15;SAR=34;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140549;STB=0.576239;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00966755;OID=.;OPOS=159997713;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:70:71:49:49:0.408333:34:15:30:40:34:15:30:41 chr1 160062340 . G A 293.46 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00368074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.98;QD=14.8587;RBI=0.0108818;REFB=-0.0160472;REVB=-0.0102403;RO=46;SAF=18;SAR=15;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691186;STB=0.539147;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.025378;OID=.;OPOS=160062340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:15:18:22:24:15:18:22:24 chr1 160124875 . G A 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00934268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.01;QD=12.6379;RBI=0.0265634;REFB=0.0135867;REVB=0.0248662;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380893;STB=0.720725;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.0161703;OID=.;OPOS=160124875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:8:5:16:5:8:5:16:5 chr1 160134205 . C T 356.57 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.00270281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.821;QD=19.2739;RBI=0.0315192;REFB=0.0111773;REVB=-0.0314031;RO=37;SAF=19;SAR=18;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121272;STB=0.567335;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.0104694;OID=.;OPOS=160134205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:18:19:14:23:18:19:14:23 chr1 160136350 . G A 366.87 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.000352553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2334;QD=16.676;RBI=0.0323678;REFB=-0.0343773;REVB=0.0323659;RO=49;SAF=12;SAR=27;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251366;STB=0.641607;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0252142;OID=.;OPOS=160136350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:27:12:27:22:27:12:27:22 chr1 160141056 . CGGGA CGGA,CGGAC 30.52 PASS AF=0.148148,0;AO=18,3;DP=79;FAO=12,0;FDP=81;FR=.;FRO=69;FSAF=11,0;FSAR=1,0;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.192053,-0.0706136;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=15.7911,53.2417;QD=1.50714;RBI=0.200785,0.0729058;REFB=-0.101318,-0.0218341;REVB=0.0585688,-0.0181375;RO=54;SAF=17,3;SAR=1,0;SRF=21;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.708304,0.51227;STB=0.897238,0.5;STBP=0.004,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.036752,0.0253045;OID=.,.;OPOS=160141057,160141059;OREF=G,GA;OALT=-,AC;OMAPALT=CGGA,CGGAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.148148,0:18,3:79:12,0:81:69:11,0:1,0:34:35:29:54:17,3:1,0:21:33 chr1 160141196 . C T 1257.0 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318179;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4451;QD=61.317;RBI=0.0357473;REFB=0;REVB=-0.0162939;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263457;OID=.;OPOS=160141196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:44:38:0:0:44:38:0:0 chr1 160141525 . A G 123.12 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0315151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4356;QD=16.4164;RBI=0.031601;REFB=0.0208103;REVB=-0.00232849;RO=16;SAF=11;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047337;STB=0.527357;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=-0.0186078;OID=.;OPOS=160141525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:3:11:12:4:3:11:12:4 chr1 160341142 . T C 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.010002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.885;QD=11.9197;RBI=0.0104935;REFB=-0.00710641;REVB=0.00317367;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206013;STB=0.622323;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0116314;OID=.;OPOS=160341142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:4:3:2:7:4:3:2:7 chr1 160342015 . T G 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0140907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.642;QD=16.2364;RBI=0.0181723;REFB=-0.0383309;REVB=0.0114753;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063531;STB=0.536635;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0295665;OID=.;OPOS=160342015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:36:30:30:0.454545:17:13:17:17:17:13:18:18 chr1 160393905 . A G 425.13 PASS AF=0.585714;AO=41;DP=70;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00268449;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.575;QD=24.2933;RBI=0.00353871;REFB=-0.0128598;REVB=-0.00230564;RO=29;SAF=19;SAR=22;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011505;STB=0.506308;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.00921952;OID=.;OPOS=160393905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:29:29:41:41:0.585714:22:19:13:16:22:19:13:16 chr1 160585554 . C G 769.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.787;QD=57.0001;RBI=0.0564145;REFB=0;REVB=0.0549497;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123517;OID=.;OPOS=160585554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr1 160650913 . A G 526.84 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1159;QD=58.5375;RBI=0.0913914;REFB=0;REVB=0.0858575;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000910599;OID=.;OPOS=160650913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:17:19:0:0 chr1 160719843 . A C 281.41 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0111713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.255;QD=19.4078;RBI=0.0126073;REFB=-0.00658285;REVB=-0.00584349;RO=28;SAF=18;SAR=12;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883627;STB=0.549263;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00534478;OID=.;OPOS=160719843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:12:18:14:14:12:18:14:14 chr1 160793442 . A G 254.74 PASS AF=0.422535;AO=29;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0107436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.927;QD=14.3515;RBI=0.0192503;REFB=0.00807108;REVB=-0.0159733;RO=41;SAF=9;SAR=20;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16978;STB=0.579945;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0121673;OID=.;OPOS=160793442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:29:30:0.422535:20:9:19:22:20:10:19:22 chr1 160793560 . A G 350.85 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0305433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.933;QD=20.6381;RBI=0.0306407;REFB=-0.00503778;REVB=0.00244056;RO=32;SAF=18;SAR=18;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132979;STB=0.573489;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00347354;OID=.;OPOS=160793560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:18:18:21:11:18:18:21:11 chr1 160793962 . G C 219.73 PASS AF=0.311111;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.012857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.141;QD=9.76588;RBI=0.0161134;REFB=-0.000682374;REVB=-0.00971293;RO=62;SAF=13;SAR=15;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00407171;STB=0.502391;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00154546;OID=.;OPOS=160793962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:62:62:28:28:0.311111:15:13:29:33:15:13:29:33 chr1 160851826 . A T 710.0 PASS AF=0.61;AO=61;DP=100;FAO=61;FDP=100;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0416175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.908;QD=28.4002;RBI=0.0595198;REFB=-0.0451747;REVB=-0.042551;RO=39;SAF=29;SAR=32;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121566;STB=0.565973;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0276329;OID=.;OPOS=160851826;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:39:39:61:61:0.61:32:29:12:27:32:29:12:27 chr1 160851894 . G A 534.05 PASS AF=0.648649;AO=48;DP=74;FAO=48;FDP=74;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.0142615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.811;QD=28.8677;RBI=0.0226734;REFB=-0.0320671;REVB=-0.0176265;RO=25;SAF=25;SAR=23;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201489;STB=0.614479;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.014349;OID=.;OPOS=160851894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:25:26:48:48:0.648649:23:25:5:20:23:25:5:21 chr1 160920966 . C T 495.58 PASS AF=0.605263;AO=46;DP=76;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0566634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.161;QD=26.0834;RBI=0.0568363;REFB=-0.00696745;REVB=0.00443072;RO=30;SAF=15;SAR=31;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592894;STB=0.532428;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00411418;OID=.;OPOS=160920966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:30:30:46:46:0.605263:31:15:12:18:31:15:12:18 chr1 160971146 . A G 365.05 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0145714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.434;QD=52.1496;RBI=0.0180228;REFB=-0.09446;REVB=-0.0106064;RO=1;SAF=10;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442286;STB=0.523792;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00193579;OID=.;OPOS=160971146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:17:10:1:0:17:10:1:0 chr1 160990875 . TC CA 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0505927;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=118.774;QD=57.6807;RBI=0.0678398;REFB=0;REVB=0.0451954;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000952575;OID=.;OPOS=160990875;OREF=TC;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr1 160990878 . C T 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01288;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.79;QD=57.6807;RBI=0.0226053;REFB=0;REVB=0.018577;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167327;OID=.;OPOS=160990878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr1 161049662 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.299;QD=40.7629;RBI=0.0756817;REFB=0;REVB=-0.071716;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00569758;OID=.;OPOS=161049662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr1 161068836 . A C 297.71 PASS AF=0.353659;AO=24;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.000540213;FXX=0.0465062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.336;QD=14.5225;RBI=0.00733841;REFB=-0.0322006;REVB=0.00731849;RO=47;SAF=18;SAR=6;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250857;STB=0.583441;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.044215;OID=.;OPOS=161068836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:46:24:29:0.353659:6:18:26:21:9:20:26:20 chr1 161141432 . C G 234.72 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00515154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5372;QD=18.7773;RBI=0.0138337;REFB=-0.000491974;REVB=-0.0128388;RO=26;SAF=6;SAR=17;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176959;STB=0.593343;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.000177392;OID=.;OPOS=161141432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:27:23:23:0.46:17:6:11:15:17:6:11:16 chr1 161160456 . ATTTTC ATTTC,ATTTCT,ATTTTCAC 88.62 PASS AF=0.166667,0,0.416667;AO=3,2,7;DP=27;FAO=4,0,10;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=1,0,3;FSAR=3,0,7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0464113,0.0163024,-0.0273838;FXX=0.11107;HRUN=4,4,1;LEN=1,2,2;MLLD=8.61243,63.1424,87.3598;QD=14.7707;RBI=0.0488052,0.0319584,0.0787552;REFB=-0.241256,-0.0584219,-0.0992442;REVB=-0.0150976,-0.0274877,0.0738411;RO=9;SAF=1,0,3;SAR=2,2,4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.319444,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.341307,-0.64528,-0.218747;STB=0.748751,0.5,0.655927;STBP=0.333,1,0.201;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0.227779,0.0715532,0.11713;OID=.,.,.;OPOS=161160457,161160460,161160461;OREF=T,TC,-;OALT=-,CT,CA;OMAPALT=ATTTC,ATTTCT,ATTTTCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:0.166667,0,0.416667:3,2,7:27:4,0,10:24:10:1,0,3:3,0,7:6:4:70:9:1,0,3:2,2,4:6:3 chr1 161163037 . T C 721.03 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.367;QD=54.4171;RBI=0.219178;REFB=0;REVB=0.216945;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516086;OID=.;OPOS=161163037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:53:0:0:42:53:1:13:29:0:0:22:31:0:0 chr1 161168004 . C T 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.077;QD=59.3225;RBI=0.0495207;REFB=0;REVB=0.0406171;RO=0;SAF=48;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188015;OID=.;OPOS=161168004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:20:48:0:0:20:48:0:0 chr1 161200586 . T G 661.33 PASS AF=0.548387;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0126996;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6169;QD=28.4444;RBI=0.0260984;REFB=-0.0420809;REVB=0.0228001;RO=23;SAF=20;SAR=31;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270103;STB=0.626214;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0240634;OID=.;OPOS=161200586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:23:26:51:51:0.548387:31:20:20:3:31:20:20:6 chr1 161202605 . G A 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.457;QD=48.6254;RBI=0.0235667;REFB=-0.0418531;REVB=0.000265986;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00040078;OID=.;OPOS=161202605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:8:14:0:1:8:14:0:1 chr1 161369555 . A G 256.42 PASS AF=0.533333;AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0124067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9657;QD=22.7929;RBI=0.0152311;REFB=-0.0196409;REVB=-0.00883512;RO=21;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742616;STB=0.548345;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0403585;OID=.;OPOS=161369555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:21:21:23:24:0.533333:16:7:8:13:17:7:8:13 chr1 161390656 . G A 1530.03 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1176;QD=63.7512;RBI=0.0395879;REFB=0;REVB=0.0352046;RO=0;SAF=61;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116301;OID=.;OPOS=161390656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:35:61:0:0:35:61:0:0 chr1 161391870 . G GA,GAA 90.47 PASS AF=0.944444,0;AO=11,3;DP=19;FAO=17,0;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11,0;FSAR=6,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.115638,-0.0605977;FXX=0.0526039;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.90511,10.2261;QD=20.1038;RBI=0.191011,0.107994;REFB=-0.0456442,-0.0396471;REVB=0.15203,0.0893902;RO=3;SAF=6,3;SAR=5,0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0468493,0.664835;STB=0.521714,0.5;STBP=0.626,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0200439,-0.00721486;OID=.,.;OPOS=161391871,161391871;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.944444,0:11,3:19:17,0:18:1:11,0:6,0:1:0:7:3:6,3:5,0:2:1 chr1 161410044 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.808;QD=37.4885;RBI=0.0680556;REFB=0;REVB=-0.00221489;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000741404;OID=.;OPOS=161410044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr1 161479745 . A G 1922.2 PASS AF=1;AO=123;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440837;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.749;QD=60.5416;RBI=0.056974;REFB=0;REVB=0.0360924;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230832;OID=.;OPOS=161479745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:127:127:0:0:123:127:1:59:64:0:0:63:64:0:0 chr1 161483723 . G A 30.58 PASS AF=0.0879121;AO=8;DP=91;FAO=8;FDP=91;FR=.;FRO=83;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=54;FWDB=-0.000800241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.157;QD=1.34396;RBI=0.0187915;REFB=-0.00317006;REVB=-0.0187745;RO=82;SAF=2;SAR=6;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135135;STB=0.607556;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0405622;OID=.;OPOS=161483723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:91:91:82:83:8:8:0.0879121:6:2:29:53:6:2:29:54 chr1 161493715 . A C 72.7 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0578581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.559;QD=8.81167;RBI=0.05822;REFB=-0.0149417;REVB=-0.00648155;RO=23;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462616;STB=0.795729;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0305305;OID=.;OPOS=161493715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:9:1:9:14:9:1:9:14 chr1 161495477 . A T 615.2 PASS AF=0.732394;AO=52;DP=71;FAO=52;FDP=71;FR=.;FRO=19;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00110143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0854;QD=34.6592;RBI=0.00276971;REFB=-0.00206425;REVB=0.00254129;RO=19;SAF=28;SAR=24;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322757;STB=0.517385;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00231148;OID=.;OPOS=161495477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:19:19:52:52:0.732394:24:28:9:10:24:28:9:10 chr1 161495885 . T C 336.39 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460848;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.99;QD=53.8223;RBI=0.046085;REFB=0;REVB=-0.00012763;RO=1;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544279;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0012156;OID=.;OPOS=161495885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:1:0:24:25:1:8:16:0:1:9:16:0:0 chr1 161496530 . C G 1311.28 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000277261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.397;QD=61.7071;RBI=0.0111518;REFB=0;REVB=0.0111483;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14407e-06;OID=.;OPOS=161496530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:85:0:0:79:85:1:34:45:0:0:39:46:0:0 chr1 161501904 . A T 1720.25 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.022;QD=60.3597;RBI=0.00340164;REFB=0;REVB=0.000150438;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89735e-07;OID=.;OPOS=161501904;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:114:0:0:111:114:1:53:58:0:0:55:59:0:0 chr1 161518214 . T C 97.54 PASS AF=0.16129;AO=20;DP=124;FAO=20;FDP=124;FR=.;FRO=104;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=-0.0353031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4118;QD=3.14632;RBI=0.0558587;REFB=-0.0105075;REVB=0.0432884;RO=102;SAF=12;SAR=8;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247356;STB=0.660224;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0620591;OID=.;OPOS=161518214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:124:124:102:104:20:20:0.16129:8:12:41:61:8:12:42:62 chr1 161518336 . C T 283.87 PASS AF=0.15978;AO=58;DP=363;FAO=58;FDP=363;FR=.;FRO=305;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=164;FSRR=141;FWDB=-0.00325657;FXX=0.00274718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.773;QD=3.12803;RBI=0.031002;REFB=-0.00526153;REVB=-0.0308304;RO=305;SAF=34;SAR=24;SRF=164;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636497;STB=0.541387;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0338485;OID=.;OPOS=161518336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:363:305:305:58:58:0.15978:24:34:164:141:24:34:164:141 chr1 161559571 . C T 104.35 PASS AF=0.238806;AO=17;DP=69;FAO=16;FDP=67;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00349894;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0005;QD=6.22986;RBI=0.00351063;REFB=-0.00394802;REVB=-0.000286353;RO=51;SAF=7;SAR=10;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143569;STB=0.569745;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0184783;OID=.;OPOS=161559571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:51:51:17:16:0.238806:10:7:27:24:9:7:27:24 chr1 161561151 . G A 651.16 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.12;QD=62.0155;RBI=0.0378377;REFB=0;REVB=0.00601283;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242707;OID=.;OPOS=161561151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr1 161561156 . A T 91.83 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0345735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.676;QD=8.74529;RBI=0.0382416;REFB=-0.00549664;REVB=-0.0163428;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341542;STB=0.70736;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0155542;OID=.;OPOS=161561156;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:4:8:11:19:4:8:11:19 chr1 161565408 . T C 221.53 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0446212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9446;QD=18.4608;RBI=0.046891;REFB=-0.00503418;REVB=-0.0144123;RO=26;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144194;STB=0.581128;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00850584;OID=.;OPOS=161565408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:14:8:6:20:14:8:6:20 chr1 161565479 . G A 990.8 PASS AF=0.985507;AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0158548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.289;QD=57.4377;RBI=0.0160317;REFB=0.00425194;REVB=-0.00237469;RO=1;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011667;STB=0.506171;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000237998;OID=.;OPOS=161565479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:69:1:1:66:68:0.985507:40:26:0:1:40:28:0:1 chr1 161565604 . G A 150.32 PASS AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0606237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.821;QD=9.85686;RBI=0.0613561;REFB=-0.012397;REVB=-0.00945197;RO=41;SAF=10;SAR=10;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139079;STB=0.508189;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0236674;OID=.;OPOS=161565604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:10:10:21:20:10:10:21:20 chr1 161565705 . A G 340.25 PASS AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0337742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.571;QD=48.6076;RBI=0.094896;REFB=-0.0182142;REVB=0.0886823;RO=2;SAF=11;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772126;STB=0.541634;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00197442;OID=.;OPOS=161565705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:15:11:2:0:15:11:2:0 chr1 161565761 . AT A 306.09 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.9687;QD=45.3468;RBI=0.0370789;REFB=0;REVB=0.00715837;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.347639;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00134746;OID=.;OPOS=161565762;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:27:27:27:0:11:16:0:0:6:0:11:16:0:0 chr1 161574654 . G A 674.64 PASS AF=0.536585;AO=65;DP=122;FAO=66;FDP=123;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0049018;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.325;QD=21.9396;RBI=0.0141131;REFB=-0.0105858;REVB=0.0132345;RO=56;SAF=27;SAR=38;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874992;STB=0.539599;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00885697;OID=.;OPOS=161574654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:56:57:65:66:0.536585:38:27:29:27:38:28:29:28 chr1 161582570 . GG AC 269.11 PASS AF=0.256757;AO=38;DP=148;FAO=38;FDP=148;FR=.;FRO=110;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=57;FSRR=53;FWDB=9.77879e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=287.956;QD=7.2732;RBI=0.00735179;REFB=-0.00950134;REVB=-0.00735114;RO=110;SAF=25;SAR=13;SRF=57;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178718;STB=0.607453;STBP=0.139;TYPE=mnp;VARB=0.0260145;OID=.;OPOS=161582570;OREF=GG;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:110:110:38:38:0.256757:13:25:57:53:13:25:57:53 chr1 161591542 . G A 301.24 PASS AF=0.553571;AO=29;DP=55;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00983627;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.585;QD=21.517;RBI=0.0503443;REFB=-0.0338242;REVB=0.0493741;RO=26;SAF=11;SAR=18;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301568;STB=0.517143;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0145431;OID=.;OPOS=161591542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:26:25:29:31:0.553571:18:11:9:17:20:11:8:17 chr1 161591548 . C T 289.43 PASS AF=0.545455;AO=28;DP=53;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0124528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.79;QD=21.0493;RBI=0.0416015;REFB=-0.0155513;REVB=0.0396939;RO=24;SAF=9;SAR=19;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112618;STB=0.523102;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0063478;OID=.;OPOS=161591548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:24:25:28:30:0.545455:19:9:8:16:19:11:8:17 chr1 161599693 . T C 583.12 PASS AF=0.87234;AO=41;DP=47;FAO=41;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00826506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5482;QD=49.6274;RBI=0.0535074;REFB=-0.0736629;REVB=0.0528652;RO=6;SAF=15;SAR=26;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155359;STB=0.583292;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0173164;OID=.;OPOS=161599693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:47:47:6:6:41:41:0.87234:26:15:6:0:26:15:6:0 chr1 161600995 . C T 689.46 PASS AF=0.619048;AO=63;DP=103;FAO=65;FDP=105;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0495275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.506;QD=26.2651;RBI=0.049821;REFB=-0.032859;REVB=-0.00539997;RO=40;SAF=21;SAR=42;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524917;STB=0.532712;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0176024;OID=.;OPOS=161600995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:40:40:63:65:0.619048:42:21:16:24:44:21:16:24 chr1 161680258 . G A 1685.54 PASS AF=0.99115;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206379;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.765;QD=59.6652;RBI=0.0243973;REFB=-0.131201;REVB=0.0130119;RO=1;SAF=64;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736135;STB=0.503875;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-3.86771e-05;OID=.;OPOS=161680258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:113:1:1:112:112:0.99115:48:64:1:0:48:64:1:0 chr1 161683136 . G A 859.3 PASS AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0625652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.336;QD=54.5585;RBI=0.0630836;REFB=-0.0882862;REVB=0.00807021;RO=1;SAF=36;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129329;STB=0.502954;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000961517;OID=.;OPOS=161683136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:63:63:1:2:61:61:0.968254:25:36:1:0:25:36:1:1 chr1 161695639 . G T 101.89 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.957;QD=40.7575;RBI=0.0662964;REFB=0;REVB=0.0425612;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00237553;OID=.;OPOS=161695639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr1 161696088 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00701012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.741;QD=37.4885;RBI=0.0595181;REFB=0;REVB=0.0591038;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384122;OID=.;OPOS=161696088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr1 161696782 . G C 239.01 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8444;QD=50.3174;RBI=0.130993;REFB=0;REVB=-0.033492;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003191;OID=.;OPOS=161696782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0 chr1 161721707 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6703;QD=59.4354;RBI=0.0249729;REFB=0;REVB=0.0210432;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.57579e-05;OID=.;OPOS=161721707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0 chr1 161751741 . A G 1370.83 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424246;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.831;QD=62.3104;RBI=0.0525067;REFB=0;REVB=0.0309371;RO=0;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74831e-05;OID=.;OPOS=161751741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:87:88:1:54:33:0:0:55:33:0:0 chr1 161823011 . T A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.771;QD=60.6103;RBI=0.0607163;REFB=0;REVB=0.0575304;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125025;OID=.;OPOS=161823011;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0 chr1 161928327 . A G 1540.19 PASS AF=0.990476;AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.528;QD=58.674;RBI=0.0297516;REFB=-0.0393131;REVB=-0.0190412;RO=0;SAF=43;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00034602;OID=.;OPOS=161928327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:105:0:1:103:104:0.990476:60:43:0:0:60:44:1:0 chr1 161967681 . A G 1089.48 PASS AF=1;AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00950071;FXX=0.0526247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9413;QD=60.5269;RBI=0.0138557;REFB=0;REVB=-0.0100855;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00565647;OID=.;OPOS=161967681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:72:0:0:71:72:1:24:47:0:0:25:47:0:0 chr1 161993121 . C CG 35.4 PASS AF=0.107527;AO=21;DP=94;FAO=10;FDP=93;FR=.;FRO=83;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=58;FSRR=25;FWDB=-0.103849;FXX=0.0106372;HRUN=0;LEN=1;MLLD=26.6546;QD=1.52272;RBI=0.124993;REFB=-0.00277552;REVB=-0.0695605;RO=70;SAF=9;SAR=12;SRF=50;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349633;STB=0.939152;STBP=0.022;TYPE=ins;VARB=-0.0559449;OID=.;OPOS=161993122;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.107527:21:94:10:93:83:1:9:58:25:35:70:9:12:50:20 chr1 161993192 . T C 190.98 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00660565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.922;QD=13.402;RBI=0.00664978;REFB=-0.0239196;REVB=-0.000764781;RO=34;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290285;STB=0.665538;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0337273;OID=.;OPOS=161993192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:9:14:11:23:9:14:11:23 chr1 162343913 . G A 283.86 PASS AF=0.370787;AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00680593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.926;QD=12.7576;RBI=0.00778845;REFB=-0.013889;REVB=0.00378673;RO=56;SAF=20;SAR=13;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191692;STB=0.510994;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0115983;OID=.;OPOS=162343913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:56:33:33:0.370787:13:20:33:23:13:20:33:23 chr1 162344102 . C T 729.62 PASS AF=0.632653;AO=62;DP=98;FAO=62;FDP=98;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=5;FWDB=0.00440942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.13;QD=29.7804;RBI=0.0192552;REFB=-0.0239819;REVB=0.0187436;RO=36;SAF=31;SAR=31;SRF=31;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245891;STB=0.632613;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0142594;OID=.;OPOS=162344102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:36:36:62:62:0.632653:31:31:31:5:31:31:31:5 chr1 162345091 . G A 2402.59 PASS AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.057;QD=61.2126;RBI=0.0837379;REFB=0;REVB=0.0704433;RO=0;SAF=87;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259367;OID=.;OPOS=162345091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:70:87:0:0:70:87:0:0 chr1 162367103 . G T 115.34 PASS AF=0.278689;AO=15;DP=59;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.00180577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.669;QD=7.56326;RBI=0.012037;REFB=-0.00537512;REVB=-0.0119008;RO=43;SAF=6;SAR=9;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518436;STB=0.528122;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0175816;OID=.;OPOS=162367103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:43:44:15:17:0.278689:9:6:19:24:9:8:19:25 chr1 162467014 . C G 1145.15 PASS AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00691592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.262;QD=57.9824;RBI=0.0214865;REFB=-0.109265;REVB=0.0203431;RO=2;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248932;STB=0.513155;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0018614;OID=.;OPOS=162467014;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:37:40:0:2:37:40:0:2 chr1 162493009 . C T 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.435;QD=61.6826;RBI=0.0143822;REFB=0;REVB=0.00607997;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14538e-05;OID=.;OPOS=162493009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr1 162737116 . C G 1339.67 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2058;QD=62.3104;RBI=0.0420565;REFB=0;REVB=-0.0266145;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35152e-05;OID=.;OPOS=162737116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:50:36:0:0:50:36:0:0 chr1 162740327 . T C 1785.36 PASS AF=1;AO=118;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000313575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5359;QD=59.02;RBI=0.062609;REFB=0;REVB=0.0626082;RO=0;SAF=59;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266874;OID=.;OPOS=162740327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:121:0:0:118:121:1:59:59:0:0:62:59:0:0 chr1 162765475 . G C 263.02 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00228512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.746;QD=47.8218;RBI=0.00403567;REFB=-0.0791437;REVB=-0.00332639;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.521719;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0010111;OID=.;OPOS=162765475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:10:11:0:0:10:11:1:0 chr1 162782145 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=332.25;QD=62.022;RBI=0.0221618;REFB=0;REVB=0.0168078;RO=0;SAF=33;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27702e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13278e-05;OID=.;OPOS=162782145;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:9:33:0:0:9:33:0:0 chr1 163479278 . G A 511.07 PASS AF=0.454545;AO=55;DP=122;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=-0.00461293;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.607;QD=16.895;RBI=0.0056532;REFB=-0.00542144;REVB=0.00326796;RO=66;SAF=25;SAR=30;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176584;STB=0.598179;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00368798;OID=.;OPOS=163479278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:66:66:55:55:0.454545:30:25:42:24:30:25:42:24 chr1 163479330 . C T 755.18 PASS AF=0.545455;AO=71;DP=132;FAO=72;FDP=132;FR=.;FRO=60;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.00196784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.715;QD=22.8842;RBI=0.00611866;REFB=-0.00612872;REVB=0.00579358;RO=60;SAF=47;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157198;STB=0.58821;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00320358;OID=.;OPOS=163479330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:60:60:71:72:0.545455:24:47:29:31:24:48:29:31 chr1 163893042 . G A 838.06 PASS AF=0.583333;AO=77;DP=133;FAO=77;FDP=132;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0112311;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.664;QD=25.3959;RBI=0.0173378;REFB=-0.00847716;REVB=-0.0132085;RO=52;SAF=31;SAR=46;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157357;STB=0.514538;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0049004;OID=.;OPOS=163893042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:52:55:77:77:0.583333:46:31:22:30:46:31:24:31 chr1 164529120 . G A 60.31 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.03865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.643;QD=17.2319;RBI=0.0395397;REFB=0.0311007;REVB=-0.00834067;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771948;STB=0.545336;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.0146532;OID=.;OPOS=164529120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:2:4:6:2:2:4 chr1 164608825 . G A 1485.57 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258919;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.589;QD=63.2157;RBI=0.0289108;REFB=0;REVB=0.0128624;RO=0;SAF=33;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00228018;OID=.;OPOS=164608825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:92:94:1:59:33:0:0:60:34:0:0 chr1 165172696 . G A 292.18 PASS AF=0.54;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0107015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.092;QD=23.3742;RBI=0.0107701;REFB=-0.00950211;REVB=-0.0012138;RO=21;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451556;STB=0.512967;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00867664;OID=.;OPOS=165172696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:21:23:26:27:0.54:15:11:9:12:16:11:10:13 chr1 165173216 . A G 1139.21 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00334414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5047;QD=59.1795;RBI=0.0252022;REFB=-0.152418;REVB=0.0249794;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.000573653;OID=.;OPOS=165173216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:25:51:0:0:25:51:1:0 chr1 165218792 . G A 1135.13 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00240686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8152;QD=60.5405;RBI=0.0170897;REFB=0;REVB=0.0169193;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165552;OID=.;OPOS=165218792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:45:30:0:0:45:30:0:0 chr1 165377552 . G A 444.9 PASS AF=0.454545;AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=-0.019904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6664;QD=17.9758;RBI=0.0262741;REFB=0.014943;REVB=-0.017151;RO=54;SAF=31;SAR=14;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345753;STB=0.693117;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.018551;OID=.;OPOS=165377552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:54:54:45:45:0.454545:14:31:18:36:14:31:18:36 chr1 165533005 . C A 214.17 PASS AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0157996;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.933;QD=20.3967;RBI=0.0219643;REFB=-0.0127457;REVB=-0.0152579;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453469;STB=0.525523;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0161215;OID=.;OPOS=165533005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:21:21:21:21:0.5:13:8:7:14:13:8:7:14 chr1 165601466 . G A 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00690202;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.092;QD=60.5473;RBI=0.00696519;REFB=0;REVB=-0.000935928;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22691e-06;OID=.;OPOS=165601466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0 chr1 165624799 . G T 112.03 PASS AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0263918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5101;QD=8.96231;RBI=0.0281243;REFB=-0.0226831;REVB=-0.00971831;RO=34;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138105;STB=0.599863;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0370836;OID=.;OPOS=165624799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:36:14:14:0.28:7:7:13:21:7:7:13:23 chr1 165630698 . A G 617.0 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534919;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9657;QD=61.6997;RBI=0.055674;REFB=0;REVB=0.0154341;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241385;OID=.;OPOS=165630698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr1 165652273 . A G 769.4 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7743;QD=56.9926;RBI=0.0980477;REFB=0;REVB=-0.0872039;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000534686;OID=.;OPOS=165652273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0 chr1 165737704 . C G 545.24 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0129437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=324.258;QD=57.3932;RBI=0.020843;REFB=-0.0532896;REVB=0.0163368;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.511622;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000233161;OID=.;OPOS=165737704;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:16:21:0:0:16:21:1:0 chr1 166591271 . T C 755.44 PASS AF=0.478788;AO=79;DP=165;FAO=79;FDP=165;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=50;FWDB=-0.0459469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5947;QD=18.3138;RBI=0.0484028;REFB=0.00157084;REVB=0.0152222;RO=86;SAF=30;SAR=49;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384686;STB=0.521271;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00130697;OID=.;OPOS=166591271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:86:86:79:79:0.478788:49:30:36:50:49:30:36:50 chr1 166818566 . A G 200.52 PASS AF=0.433962;AO=22;DP=52;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0164161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.733;QD=15.1338;RBI=0.0169122;REFB=-0.0145348;REVB=-0.00406623;RO=30;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238453;STB=0.617545;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0169555;OID=.;OPOS=166818566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:30:30:22:23:0.433962:8:14:12:18:9:14:12:18 chr1 166825797 . A ACAGATCCAG 110.8 PASS AF=0.239437;AO=17;DP=73;FAO=17;FDP=71;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0123917;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=9;MLLD=309.715;QD=6.24229;RBI=0.017493;REFB=-0.00690217;REVB=-0.012347;RO=55;SAF=9;SAR=8;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198723;STB=0.519977;STBP=0.867;TYPE=ins;VARB=0.021768;OID=.;OPOS=166825798;OREF=-;OALT=CAGATCCAG;OMAPALT=ACAGATCCAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.239437:17:73:17:71:54:9:8:30:24:99:55:9:8:30:25 chr1 166826655 . C T 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0254481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.329;QD=14.1389;RBI=0.03283;REFB=-0.00336589;REVB=0.0207413;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822685;STB=0.547759;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00864084;OID=.;OPOS=166826655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:6:8:13:7:6:8:13:7 chr1 166826773 . C T 122.13 PASS AF=0.301887;AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0296782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.555;QD=9.21744;RBI=0.0337192;REFB=-0.0110331;REVB=-0.016006;RO=37;SAF=5;SAR=11;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380308;STB=0.72638;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0179122;OID=.;OPOS=166826773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:37:37:16:16:0.301887:11:5:24:13:11:5:24:13 chr1 167042762 . C T 1572.78 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427482;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.34;QD=64.1951;RBI=0.00448299;REFB=0;REVB=-0.00135022;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.49056e-05;OID=.;OPOS=167042762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:52:46:0:0:52:46:0:0 chr1 167059462 . G C 583.21 PASS AF=0.576087;AO=53;DP=92;FAO=53;FDP=92;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00902083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5254;QD=25.3569;RBI=0.0441809;REFB=0.00802086;REVB=-0.0432502;RO=39;SAF=23;SAR=30;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01875;STB=0.510251;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.00743545;OID=.;OPOS=167059462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:39:39:53:53:0.576087:30:23:16:23:30:23:16:23 chr1 167095163 . G C 731.64 PASS AF=0.464286;AO=75;DP=164;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=0.00924212;FXX=0.00591681;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5137;QD=17.4199;RBI=0.0294388;REFB=-0.0206843;REVB=0.0279504;RO=89;SAF=35;SAR=40;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928038;STB=0.563017;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0152475;OID=.;OPOS=167095163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:89:90:75:78:0.464286:40:35:50:39:43:35:51:39 chr1 167096931 . A C 105.62 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.054701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.9286;QD=11.418;RBI=0.0696064;REFB=-0.0258249;REVB=0.0430448;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177174;STB=0.604781;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0428626;OID=.;OPOS=167096931;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:9:15:6:7:9:15 chr1 167408565 . G T 305.1 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0183346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.049;QD=15.0667;RBI=0.0235552;REFB=-0.00426219;REVB=0.0147881;RO=47;SAF=15;SAR=19;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931384;STB=0.552696;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00496816;OID=.;OPOS=167408565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:19:15:25:22:19:15:25:22 chr1 167510996 . G A 754.4 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.418;QD=56.9358;RBI=0.0211244;REFB=0;REVB=0.0210889;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121203;OID=.;OPOS=167510996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0 chr1 167511035 . C G 169.17 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0325294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5876;QD=13.0131;RBI=0.0389115;REFB=-0.001855;REVB=-0.0213529;RO=32;SAF=15;SAR=5;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291345;STB=0.670031;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00543371;OID=.;OPOS=167511035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:5:15:16:16:5:15:16:16 chr1 167683950 . C T 466.09 PASS AF=0.542169;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.00892227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1064;QD=22.4623;RBI=0.0356224;REFB=0.0112104;REVB=-0.034487;RO=38;SAF=30;SAR=15;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416989;STB=0.522926;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.00824282;OID=.;OPOS=167683950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:38:38:45:45:0.542169:15:30:27:11:15:30:27:11 chr1 167815030 . A G 607.03 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7547;QD=60.7033;RBI=0.0292645;REFB=0;REVB=0.00883221;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036346;OID=.;OPOS=167815030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:29:10:0:0:30:10:0:0 chr1 167817639 . A G 861.61 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167698;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.694;QD=58.414;RBI=0.0221844;REFB=0;REVB=-0.0145231;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020069;OID=.;OPOS=167817639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0 chr1 167825485 . T C 333.43 PASS AF=0.341463;AO=42;DP=123;FAO=42;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=48;FSRR=33;FWDB=-0.0238753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.408;QD=10.8434;RBI=0.0238825;REFB=-0.0134912;REVB=0.000588383;RO=80;SAF=22;SAR=20;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731056;STB=0.545575;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0297901;OID=.;OPOS=167825485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:80:81:42:42:0.341463:20:22:47:33:20:22:48:33 chr1 167825606 . A G 345.1 PASS AF=0.391753;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0091839;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.2559;QD=14.2307;RBI=0.0334552;REFB=-0.00547211;REVB=-0.03217;RO=57;SAF=14;SAR=24;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115206;STB=0.556531;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0103812;OID=.;OPOS=167825606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:57:59:38:38:0.391753:24:14:27:30:24:14:27:32 chr1 167906239 . A C,G 1027.43 PASS AF=0.971429,0.0285714;AO=66,3;DP=70;FAO=68,2;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=39,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321535,-0.0829485;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=165.759,32.0511;QD=58.7105;RBI=0.0286069,0.0830427;REFB=0,0;REVB=0.0284257,-0.00395526;RO=0;SAF=27,2;SAR=39,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.91393e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000496335,0.107637;OID=.,.;OPOS=167906239,167906239;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:70:70:0:0:66,3:68,2:0.971429,0.0285714:39,1:27,2:0:0:39,2:29,0:0:0 chr1 168013850 . T C 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00761011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.009;QD=14.9203;RBI=0.00782874;REFB=-0.0101819;REVB=0.00183723;RO=37;SAF=16;SAR=12;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112608;STB=0.563831;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00954596;OID=.;OPOS=168013850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:12:16:17:20:12:16:17:20 chr1 168195368 . C T 729.45 PASS AF=0.632653;AO=62;DP=98;FAO=62;FDP=98;FR=.;FRO=36;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00567055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0247;QD=29.7733;RBI=0.0085424;REFB=-0.0488391;REVB=0.00638885;RO=36;SAF=36;SAR=26;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00186964;STB=0.501014;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0261112;OID=.;OPOS=168195368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:36:36:62:62:0.632653:26:36:21:15:26:36:21:15 chr1 168510314 . G T 1264.18 PASS AF=0.615385;AO=112;DP=183;FAO=112;FDP=182;FR=.;FRO=70;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=0.0122895;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6968;QD=27.7842;RBI=0.0222769;REFB=-0.013654;REVB=-0.0185804;RO=70;SAF=60;SAR=52;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358669;STB=0.519379;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0125069;OID=.;OPOS=168510314;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:70:70:112:112:0.615385:52:60:41:29:52:60:41:29 chr1 168511284 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.779;QD=55.0981;RBI=0.0613086;REFB=0;REVB=0.0499317;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000513294;OID=.;OPOS=168511284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr1 168513129 . C T 1240.56 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.819;QD=61.2623;RBI=0.0520587;REFB=0;REVB=0.0504874;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.68173e-05;OID=.;OPOS=168513129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:34:45:0:0:34:47:0:0 chr1 169101935 . C T 441.05 PASS AF=0.594595;AO=41;DP=71;FAO=44;FDP=74;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00612095;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8058;QD=23.8405;RBI=0.00676496;REFB=-0.0652233;REVB=0.00288073;RO=29;SAF=8;SAR=33;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159408;STB=0.559294;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0390671;OID=.;OPOS=169101935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:74:29:30:41:44:0.594595:33:8:10:19:33:11:11:19 chr1 169256524 . T C 347.45 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00665321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.838;QD=17.1582;RBI=0.010053;REFB=-0.0133841;REVB=-0.00753643;RO=44;SAF=22;SAR=15;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13656;STB=0.576571;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0152547;OID=.;OPOS=169256524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:44:44:37:37:0.45679:15:22:20:24:15:22:20:24 chr1 169272451 . A T 1491.56 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0610363;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.589;QD=63.4708;RBI=0.062592;REFB=0;REVB=0.0138682;RO=0;SAF=36;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.02416e-05;OID=.;OPOS=169272451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:58:36:0:0:58:36:0:0 chr1 169272453 . G A 1453.48 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.284;QD=63.1948;RBI=0.0312446;REFB=0;REVB=0.00166843;RO=0;SAF=36;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141692;OID=.;OPOS=169272453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:56:36:0:0:56:36:0:0 chr1 169391154 . A G 556.58 PASS AF=0.513514;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0108575;FXX=0.00892777;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.91;QD=20.0568;RBI=0.0124034;REFB=-0.00514715;REVB=-0.0059967;RO=54;SAF=32;SAR=25;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545792;STB=0.530095;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.00521669;OID=.;OPOS=169391154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:54:54:57:57:0.513514:25:32:27:27:25:32:27:27 chr1 169433273 . C T 178.8 PASS AF=0.343284;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.00120696;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.97;QD=10.6748;RBI=0.0274285;REFB=-0.00359709;REVB=-0.027402;RO=43;SAF=18;SAR=5;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157365;STB=0.604943;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00521498;OID=.;OPOS=169433273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:43:44:23:23:0.343284:5:18:29:14:5:18:29:15 chr1 169435027 . C T 801.27 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0818;QD=57.2336;RBI=0.0314937;REFB=0;REVB=0.000461112;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283383;OID=.;OPOS=169435027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0 chr1 169498975 . T C 245.03 PASS AF=0.337079;AO=30;DP=89;FAO=30;FDP=89;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0140362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.501;QD=11.0124;RBI=0.0395586;REFB=-0.0255402;REVB=0.0369847;RO=59;SAF=15;SAR=15;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029017;STB=0.516843;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0432302;OID=.;OPOS=169498975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:59:59:30:30:0.337079:15:15:28:31:15:15:28:31 chr1 169500210 . T C 325.17 PASS AF=0.376147;AO=34;DP=101;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0397919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5851;QD=11.9328;RBI=0.0506572;REFB=-0.045342;REVB=0.0313489;RO=66;SAF=15;SAR=19;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154227;STB=0.541125;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0771019;OID=.;OPOS=169500210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:109:66:68:34:41:0.376147:19:15:30:36:19:22:32:36 chr1 169510118 . G A 313.25 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0217444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.993;QD=19.5784;RBI=0.0220508;REFB=-0.00485856;REVB=-0.00366326;RO=28;SAF=27;SAR=6;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130234;STB=0.557485;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00387143;OID=.;OPOS=169510118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:31:33:33:0.515625:6:27:20:8:6:27:23:8 chr1 169510380 . G A 100.71 PASS AF=0.302326;AO=11;DP=40;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00902509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.3;QD=9.36815;RBI=0.0778651;REFB=-0.0121383;REVB=0.0773403;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279152;STB=0.618199;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0226625;OID=.;OPOS=169510380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:43:28:30:11:13:0.302326:4:7:11:17:6:7:11:19 chr1 169510475 . G T 136.35 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0137387;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.925;QD=10.9076;RBI=0.0295028;REFB=-0.0246336;REVB=-0.0261087;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671896;STB=0.53995;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0331016;OID=.;OPOS=169510475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:8:8:15:19:8:8:15:19 chr1 169510524 . A G 56.02 PASS AF=0.388889;AO=5;DP=20;FAO=7;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0126881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.215;QD=12.449;RBI=0.0128093;REFB=-0.0251424;REVB=0.0017579;RO=11;SAF=4;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221046;STB=0.650814;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0508895;OID=.;OPOS=169510524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:20:18:11:10:5:7:0.388889:1:4:10:1:2:5:9:1 chr1 169511555 . T C 350.49 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0570522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7551;QD=20.6168;RBI=0.0571797;REFB=-0.0529982;REVB=0.00381733;RO=31;SAF=23;SAR=13;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107325;STB=0.553234;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0513974;OID=.;OPOS=169511555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:32:36:36:0.529412:13:23:16:15:13:23:17:15 chr1 169511734 . T C 285.08 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0203688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.853;QD=23.7567;RBI=0.027465;REFB=-0.0248954;REVB=0.0184239;RO=22;SAF=8;SAR=18;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208113;STB=0.616345;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0204872;OID=.;OPOS=169511734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:18:8:12:10:18:8:12:10 chr1 169511755 . T C 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00400228;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.59;QD=25.6506;RBI=0.00407486;REFB=-0.00586424;REVB=0.00076568;RO=18;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152177;STB=0.584546;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00350045;OID=.;OPOS=169511755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:16:9:10:8:16:9:10:8 chr1 169512027 . T C 419.15 PASS AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0239592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.984;QD=20.1997;RBI=0.0248152;REFB=-0.0288967;REVB=0.00646129;RO=41;SAF=17;SAR=25;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535584;STB=0.529709;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0280692;OID=.;OPOS=169512027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:41:42:42:0.506024:25:17:19:22:25:17:19:22 chr1 169512093 . A G 279.34 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00605606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.67;QD=18.9385;RBI=0.0184866;REFB=-0.00870722;REVB=0.0174665;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156839;STB=0.581076;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00388896;OID=.;OPOS=169512093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:29:30:30:0.508475:9:21:15:13:9:21:16:13 chr1 169512120 . G A 339.18 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00478648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.866;QD=17.8517;RBI=0.00825101;REFB=-0.0105544;REVB=-0.00672078;RO=40;SAF=23;SAR=13;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637663;STB=0.535694;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00918878;OID=.;OPOS=169512120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:13:23:23:17:13:23:23:17 chr1 169519049 . T C 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.229;QD=59.1426;RBI=0.0179705;REFB=0;REVB=0.01493;RO=0;SAF=43;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.82553e-05;OID=.;OPOS=169519049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:24:43:0:0:24:43:0:0 chr1 169519112 . C T 346.06 PASS AF=0.395833;AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00324078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.321;QD=14.4192;RBI=0.00371218;REFB=-0.00239112;REVB=0.00181041;RO=58;SAF=24;SAR=14;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125466;STB=0.57139;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0037861;OID=.;OPOS=169519112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:58:58:38:38:0.395833:14:24:30:28:14:24:30:28 chr1 169521849 . T C 765.48 PASS AF=0.532847;AO=73;DP=137;FAO=73;FDP=137;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.046557;FXX=0.00724585;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2097;QD=22.3499;RBI=0.0478304;REFB=0.00893827;REVB=0.0109633;RO=64;SAF=38;SAR=35;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308315;STB=0.516899;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=-0.00551855;OID=.;OPOS=169521849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:64:64:73:73:0.532847:35:38:31:33:35:38:31:33 chr1 169529826 . C A 600.25 PASS AF=0.435065;AO=67;DP=154;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=-0.0481294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.967;QD=15.5908;RBI=0.0516968;REFB=-0.0142729;REVB=-0.018871;RO=87;SAF=37;SAR=30;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116547;STB=0.56503;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0248975;OID=.;OPOS=169529826;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:87:87:67:67:0.435065:30:37:38:49:30:37:38:49 chr1 169529973 . C T 447.98 PASS AF=0.35;AO=56;DP=161;FAO=56;FDP=160;FR=.;FRO=104;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=-0.00979745;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.751;QD=11.1994;RBI=0.0123272;REFB=-0.0204278;REVB=0.00748122;RO=104;SAF=18;SAR=38;SRF=42;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102417;STB=0.558802;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0323238;OID=.;OPOS=169529973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:104:104:56:56:0.35:38:18:42:62:38:18:42:62 chr1 169562904 . C T 173.25 PASS AF=0.388889;AO=22;DP=55;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0383391;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.574;QD=12.8335;RBI=0.0389055;REFB=0.00464933;REVB=-0.00661431;RO=33;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516114;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.00388546;OID=.;OPOS=169562904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:33:33:22:21:0.388889:12:10:15:18:12:9:15:18 chr1 169566313 . C T 1526.14 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.179;QD=59.8485;RBI=0.018852;REFB=0;REVB=0.00571745;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60419e-05;OID=.;OPOS=169566313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:102:0:0:101:102:1:51:50:0:0:52:50:0:0 chr1 169580885 . C T 287.65 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0145328;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6126;QD=17.9783;RBI=0.0275156;REFB=-0.0184309;REVB=0.0233647;RO=33;SAF=21;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240536;STB=0.634947;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0103039;OID=.;OPOS=169580885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:10:21:14:19:10:21:14:19 chr1 169702705 . G A 165.73 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0296366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.035;QD=14.4114;RBI=0.0484622;REFB=-0.0182669;REVB=-0.038344;RO=27;SAF=7;SAR=11;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020074;STB=0.525097;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0306051;OID=.;OPOS=169702705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:11:7:11:16:11:7:12:16 chr1 169761800 . A G 570.58 PASS AF=0.571429;AO=45;DP=91;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.0018417;FXX=0.0108684;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.236;QD=25.0804;RBI=0.00295071;REFB=-0.00971952;REVB=0.0023054;RO=28;SAF=19;SAR=26;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736069;STB=0.528373;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00719702;OID=.;OPOS=169761800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:28:39:45:52:0.571429:26:19:9:19:30:22:14:25 chr1 169768033 . T C 266.16 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0150221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2646;QD=21.2931;RBI=0.0424899;REFB=-0.0152149;REVB=0.0397458;RO=25;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11658;STB=0.56562;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0184905;OID=.;OPOS=169768033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:8:17:14:11:8:17:14:11 chr1 169768080 . C A 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0109457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.806;QD=17.9529;RBI=0.0109963;REFB=-0.0120682;REVB=-0.0010541;RO=28;SAF=19;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998522;STB=0.556197;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0117374;OID=.;OPOS=169768080;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:8:19:17:11:8:19:17:11 chr1 169821135 . C T 252.78 PASS AF=0.5;AO=23;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00433557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.493;QD=21.0648;RBI=0.00433653;REFB=-0.0157639;REVB=9.09131e-05;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174666;STB=0.605175;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00797495;OID=.;OPOS=169821135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:24:24:23:24:0.5:14:9:14:10:15:9:14:10 chr1 169823718 . T C 337.73 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0330104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.4621;QD=15.0101;RBI=0.03441;REFB=-0.00105676;REVB=0.00971416;RO=51;SAF=15;SAR=22;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884037;STB=0.55098;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.000554898;OID=.;OPOS=169823718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:51:53:37:37:0.411111:22:15:25:26:22:15:26:27 chr1 169927228 . T TG 903.88 PASS AF=1;AO=75;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0846628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.0606;QD=46.3529;RBI=0.105953;REFB=0;REVB=0.0637049;RO=3;SAF=61;SAR=14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911923;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00250233;OID=.;OPOS=169927229;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:75:78:78:78:0:62:16:0:0:17:3:61:14:0:3 chr1 169951997 . C T 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199759;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=337.605;QD=59.5017;RBI=0.019982;REFB=0;REVB=-0.000494871;RO=0;SAF=20;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60911e-05;OID=.;OPOS=169951997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:49:20:0:0:49:20:0:0 chr1 170135798 . A C 400.23 PASS AF=0.435644;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0197612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.426;QD=15.8506;RBI=0.0231854;REFB=-0.00309472;REVB=0.0121268;RO=56;SAF=28;SAR=16;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684597;STB=0.544571;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00489542;OID=.;OPOS=170135798;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:56:57:44:44:0.435644:16:28:32:24:16:28:32:25 chr1 170501385 . A C 582.06 PASS AF=1;AO=34;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.518;QD=59.6979;RBI=0.0611546;REFB=0;REVB=0.0448248;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524017;OID=.;OPOS=170501385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:39:0:0:34:39:1:20:14:0:0:24:15:0:0 chr1 170521376 . G A 1523.27 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.64;QD=59.7361;RBI=0.0142981;REFB=0;REVB=0.00776466;RO=0;SAF=38;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88802e-05;OID=.;OPOS=170521376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:64:38:0:0:64:38:0:0 chr1 171076966 . G A 728.63 PASS AF=0.507042;AO=57;DP=130;FAO=72;FDP=142;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=0.0310098;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=364.085;QD=20.5247;RBI=0.0313593;REFB=-0.00956719;REVB=0.00466893;RO=70;SAF=25;SAR=32;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427194;STB=0.534965;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00955755;OID=.;OPOS=171076966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:142:70:70:57:72:0.507042:32:25:31:39:35:37:31:39 chr1 171112490 . C T 242.74 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0016708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.291;QD=18.6721;RBI=0.0434151;REFB=-0.0253894;REVB=-0.0433829;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137164;STB=0.576864;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0176117;OID=.;OPOS=171112490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:15:11:15:11:15:11:15:11 chr1 171168545 . T C 297.44 PASS AF=0.382022;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.000781367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.378;QD=13.368;RBI=0.0359972;REFB=-0.022488;REVB=-0.0359887;RO=55;SAF=20;SAR=14;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163969;STB=0.593613;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0248881;OID=.;OPOS=171168545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:0.382022:14:20:24:31:14:20:24:31 chr1 171168584 . CA CG,TG 1071.78 PASS AF=0.378378,0.621622;AO=28,45;DP=73;FAO=28,46;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=15,19;FSAR=13,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142397,0.010639;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=175.68,322.967;QD=57.934;RBI=0.0289065,0.0125541;REFB=0,0;REVB=0.0251559,0.00666449;RO=0;SAF=15,19;SAR=13,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.15971e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00840496,-0.000418637;OID=.,.;OPOS=171168585,171168584;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:73:74:0:0:28,45:28,46:0.378378,0.621622:13,26:15,19:0:0:13,27:15,19:0:0 chr1 171174531 . A G 787.38 PASS AF=0.523179;AO=79;DP=151;FAO=79;FDP=151;FR=.;FRO=72;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.000123037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.812;QD=20.8576;RBI=0.00598273;REFB=-0.0139569;REVB=0.00598147;RO=72;SAF=39;SAR=40;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103438;STB=0.556661;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0118741;OID=.;OPOS=171174531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:72:72:79:79:0.523179:40:39:27:45:40:39:27:45 chr1 171178152 . A G 603.78 PASS AF=0.567308;AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00339866;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.181;QD=23.2225;RBI=0.0129221;REFB=-0.0109994;REVB=0.0124672;RO=45;SAF=28;SAR=31;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00627599;STB=0.503431;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00750044;OID=.;OPOS=171178152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:45:45:59:59:0.567308:31:28:21:24:31:28:21:24 chr1 171223134 . G A 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0244664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.478;QD=15.6456;RBI=0.0263775;REFB=-0.0240032;REVB=-0.00985743;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203877;STB=0.511617;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0331347;OID=.;OPOS=171223134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:8:14:19:10:8:14:19:10 chr1 171303565 . C T 197.7 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0277022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.122;QD=18.8285;RBI=0.0294458;REFB=-0.0103285;REVB=-0.00998218;RO=22;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168539;STB=0.595146;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0163796;OID=.;OPOS=171303565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:10:10:7:15:10:10:7:15 chr1 171461787 . G A 101.07 PASS AF=0.444444;AO=13;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00296797;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8956;QD=14.9736;RBI=0.0188882;REFB=-0.0148518;REVB=-0.0186535;RO=15;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170123;STB=0.588073;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0333031;OID=.;OPOS=171461787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:15:15:13:12:0.444444:11:2:4:11:10:2:4:11 chr1 171482616 . A C 223.99 PASS AF=0.333333;AO=28;DP=84;FAO=28;FDP=84;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0143623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.666;QD=10.6662;RBI=0.0167199;REFB=0.000502682;REVB=-0.00856044;RO=56;SAF=18;SAR=10;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106957;STB=0.562454;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.00132062;OID=.;OPOS=171482616;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:56:56:28:28:0.333333:10:18:31:25:10:18:31:25 chr1 171486912 . G A 509.25 PASS AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0219198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.612;QD=20.9998;RBI=0.0223507;REFB=-0.00428187;REVB=0.00436755;RO=48;SAF=23;SAR=26;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00993177;STB=0.505492;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00492057;OID=.;OPOS=171486912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:26:23:22:26:26:23:22:26 chr1 171509327 . G A 116.2 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.023587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.997;QD=20.2082;RBI=0.0657837;REFB=-0.0712127;REVB=-0.0614097;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156207;STB=0.588109;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0526951;OID=.;OPOS=171509327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:8:5:2:8:8:5:2:8 chr1 171511039 . C G 181.52 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0213461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5342;QD=24.2022;RBI=0.0244163;REFB=0.00647878;REVB=0.0118532;RO=12;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119374;STB=0.566594;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00475485;OID=.;OPOS=171511039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:9:9:8:4:9:9:8:4 chr1 171514731 . C G 152.58 PASS AF=0.358491;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00329245;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.55;QD=11.5153;RBI=0.00349642;REFB=-0.00422415;REVB=0.00117674;RO=31;SAF=7;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258699;STB=0.622625;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0113857;OID=.;OPOS=171514731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:53:31:34:19:19:0.358491:12:7:19:12:12:7:19:15 chr1 171526570 . G A 229.25 PASS AF=0.677419;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0497137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.439;QD=29.5812;RBI=0.0640411;REFB=-0.0557867;REVB=-0.0403708;RO=9;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157894;STB=0.603616;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.019496;OID=.;OPOS=171526570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:31:9:10:21:21:0.677419:13:8:6:3:13:8:7:3 chr1 171556165 . G C 331.45 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00656787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.884;QD=18.6733;RBI=0.00838837;REFB=-0.0170374;REVB=-0.00521803;RO=36;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012284;STB=0.506845;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0143938;OID=.;OPOS=171556165;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:17:18:19:17:17:18:19:17 chr1 171558516 . C T 159.79 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0157148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.274;QD=11.6207;RBI=0.0166547;REFB=-0.0145075;REVB=0.00551574;RO=35;SAF=6;SAR=14;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356743;STB=0.707375;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0309283;OID=.;OPOS=171558516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:14:6:22:13:14:6:22:13 chr1 171751236 . T C 292.21 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0172063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8913;QD=14.6104;RBI=0.0182203;REFB=-0.00630174;REVB=0.00599351;RO=46;SAF=19;SAR=14;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166386;STB=0.587871;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0146282;OID=.;OPOS=171751236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:47:33:33:0.4125:14:19:19:27:14:19:20:27 chr1 171755182 . G A 105.32 PASS AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0479222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.748;QD=11.0866;RBI=0.0484836;REFB=0.0009829;REVB=-0.00735672;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239501;STB=0.514264;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=-0.00106202;OID=.;OPOS=171755182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:6:7:14:11:6:7:14:11 chr1 171763549 . C T 586.11 PASS AF=0.469231;AO=61;DP=130;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=0.000756315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.111;QD=18.0342;RBI=0.0236718;REFB=0.00477905;REVB=-0.0236597;RO=67;SAF=33;SAR=28;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739283;STB=0.54097;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.00666581;OID=.;OPOS=171763549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:67:69:61:61:0.469231:28:33:31:36:28:33:32:37 chr1 171810960 . A G 138.32 PASS AF=0.306452;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0433948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.619;QD=8.92366;RBI=0.0488665;REFB=-0.0116102;REVB=-0.0224682;RO=42;SAF=7;SAR=12;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234437;STB=0.646312;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0309398;OID=.;OPOS=171810960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:42:43:19:19:0.306452:12:7:24:18:12:7:25:18 chr1 171956803 . C T 152.9 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0138133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.524;QD=11.9922;RBI=0.0191784;REFB=0.0032602;REVB=0.0133043;RO=33;SAF=12;SAR=6;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141457;STB=0.583238;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.00829738;OID=.;OPOS=171956803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:6:12:18:15:6:12:18:15 chr1 172356437 . A G 854.1 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0373092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.715;QD=56.0063;RBI=0.0377187;REFB=-0.0618251;REVB=0.00554304;RO=1;SAF=39;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011949;STB=0.506327;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00064197;OID=.;OPOS=172356437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:21:39:1:0:21:39:1:0 chr1 172378884 . G GT 130.68 PASS AF=0.358333;AO=41;DP=123;FAO=43;FDP=120;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.0352459;FXX=0.00826378;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.936;QD=4.35583;RBI=0.153007;REFB=-0.0192077;REVB=0.148892;RO=79;SAF=30;SAR=11;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178419;STB=0.545278;STBP=0.513;TYPE=ins;VARB=0.00665271;OID=.;OPOS=172378885;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.358333:41:123:43:120:77:29:14:47:30:99:79:30:11:47:32 chr1 172410967 . G A 316.45 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0562039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.778;QD=15.4364;RBI=0.070412;REFB=-0.0180474;REVB=0.0424143;RO=45;SAF=19;SAR=16;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956769;STB=0.518534;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.026156;OID=.;OPOS=172410967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:47:35:35:0.426829:16:19:24:21:16:19:24:23 chr1 172411496 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.542;QD=40.7629;RBI=0.0399239;REFB=0;REVB=-0.0370666;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017562;OID=.;OPOS=172411496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr1 172411768 . T C 195.4 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.134876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.637;QD=14.2111;RBI=0.136758;REFB=-0.0120385;REVB=0.0226114;RO=31;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221369;STB=0.617221;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0112876;OID=.;OPOS=172411768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:31:32:23:23:0.418182:9:14:12:19:9:14:13:19 chr1 172412845 . C A 216.68 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0307587;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=172.888;QD=13.3343;RBI=0.0314233;REFB=-0.00905394;REVB=-0.00642885;RO=39;SAF=11;SAR=15;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679611;STB=0.538892;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0112354;OID=.;OPOS=172412845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:15:11:19:20:15:11:19:20 chr1 172412995 . T C 182.1 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0336371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4302;QD=16.9399;RBI=0.0480757;REFB=0.00769761;REVB=-0.0343485;RO=24;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106659;STB=0.560912;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0126671;OID=.;OPOS=172412995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:9:10:10:14:9:10:10:14 chr1 172422209 . C T 722.26 PASS AF=0.530303;AO=70;DP=132;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0200263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1254;QD=21.8868;RBI=0.0248828;REFB=-0.00100935;REVB=0.0147682;RO=62;SAF=37;SAR=33;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00316695;STB=0.501737;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00100763;OID=.;OPOS=172422209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:62:62:70:70:0.530303:33:37:33:29:33:37:33:29 chr1 172434812 . C T 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0150866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.318;QD=16.1724;RBI=0.0160096;REFB=-0.00281144;REVB=-0.00535747;RO=20;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194256;STB=0.610979;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00221575;OID=.;OPOS=172434812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:8:8:14:6:8:8:14:6 chr1 172437592 . G A 1488.64 PASS AF=1;AO=98;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417903;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.005;QD=58.9559;RBI=0.0439397;REFB=0;REVB=-0.0135745;RO=0;SAF=59;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9126e-05;OID=.;OPOS=172437592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:98:101:1:39:59:0:0:39:62:0:0 chr1 172501643 . T C 223.12 PASS AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0197381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.068;QD=16.5274;RBI=0.0197455;REFB=-0.011304;REVB=-0.000538351;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166028;STB=0.593447;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00962752;OID=.;OPOS=172501643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:13:12:19:10:13:12:19:10 chr1 172502340 . T C 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0236959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.243;QD=16.4544;RBI=0.0331139;REFB=-0.00934192;REVB=-0.0231308;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28888;STB=0.666218;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00778935;OID=.;OPOS=172502340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:4:0:2:4:4:0 chr1 172502479 . T C 593.17 PASS AF=0.455882;AO=62;DP=136;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.0126724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.149;QD=17.4462;RBI=0.0774748;REFB=0.0118401;REVB=-0.0764314;RO=73;SAF=24;SAR=38;SRF=44;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209387;STB=0.612867;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0166775;OID=.;OPOS=172502479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:73:74:62:62:0.455882:38:24:44:29:38:24:44:30 chr1 172547465 . A G 824.52 PASS AF=0.497041;AO=84;DP=169;FAO=84;FDP=169;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=0.015397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.572;QD=19.5152;RBI=0.0162709;REFB=-0.0102324;REVB=0.00526066;RO=83;SAF=36;SAR=48;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378607;STB=0.51546;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0115291;OID=.;OPOS=172547465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:83:85:84:84:0.497041:48:36:39:44:48:36:39:46 chr1 173457017 . C T 1804.17 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00472662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.883;QD=61.1582;RBI=0.0172875;REFB=0;REVB=0.0166287;RO=0;SAF=64;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69066e-05;OID=.;OPOS=173457017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:54:64:0:0:54:64:0:0 chr1 173474429 . T C 332.91 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0254519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8877;QD=19.0232;RBI=0.0283528;REFB=-0.00375686;REVB=-0.0124933;RO=35;SAF=12;SAR=23;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557178;STB=0.531065;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.00447601;OID=.;OPOS=173474429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:23:12:14:21:23:12:14:21 chr1 173516871 . G C 211.94 PASS AF=0.423729;AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0041134;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.87;QD=14.3686;RBI=0.0132696;REFB=-0.0140345;REVB=0.012616;RO=34;SAF=7;SAR=17;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312169;STB=0.657331;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0223325;OID=.;OPOS=173516871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:34:34:24:25:0.423729:17:7:20:14:17:8:20:14 chr1 173516903 . A G 221.51 PASS AF=0.42623;AO=25;DP=60;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00521298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8666;QD=14.5255;RBI=0.011775;REFB=-0.0168356;REVB=0.0105582;RO=35;SAF=7;SAR=18;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310285;STB=0.656127;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0177331;OID=.;OPOS=173516903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:35:35:25:26:0.42623:18:7:20:15:18:8:20:15 chr1 173823004 . T C 198.97 PASS AF=0.357143;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0384105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1297;QD=11.37;RBI=0.0385933;REFB=0.00960301;REVB=-0.0037525;RO=45;SAF=12;SAR=13;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00986733;STB=0.505716;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.0248738;OID=.;OPOS=173823004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:45:45:25:25:0.357143:13:12:22:23:13:12:22:23 chr1 173878832 . T C 805.11 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0347;QD=64.4088;RBI=0.0287663;REFB=0;REVB=-0.0238937;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000523215;OID=.;OPOS=173878832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0 chr1 173878862 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.305;QD=60.9786;RBI=0.0411912;REFB=0;REVB=0.0253416;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154997;OID=.;OPOS=173878862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr1 173903737 . G A 200.86 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0267095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5168;QD=20.6007;RBI=0.0457435;REFB=0.0354351;REVB=-0.0371358;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253371;STB=0.514271;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=-0.0360128;OID=.;OPOS=173903737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:11:9:8:11:11:9:8:11 chr1 174959108 . G A 447.97 PASS AF=0.573333;AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00707906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.89;QD=23.8918;RBI=0.0113388;REFB=-0.0246516;REVB=0.00885753;RO=32;SAF=13;SAR=30;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117744;STB=0.564822;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.016744;OID=.;OPOS=174959108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:32:32:43:43:0.573333:30:13:14:18:30:13:14:18 chr1 175046789 . A G 525.49 PASS AF=0.695652;AO=46;DP=67;FAO=48;FDP=69;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00511902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.815;QD=30.4633;RBI=0.017694;REFB=-0.0380095;REVB=0.0169373;RO=15;SAF=20;SAR=26;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474415;STB=0.526497;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00695463;OID=.;OPOS=175046789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:15:21:46:48:0.695652:26:20:5:10:27:21:11:10 chr1 175049379 . G A 289.36 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0489074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8053;QD=25.721;RBI=0.0489135;REFB=-0.00762422;REVB=0.000772899;RO=19;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031099;STB=0.517228;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0064633;OID=.;OPOS=175049379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:12:14:11:8:12:14:11:8 chr1 175054548 . C T 243.19 PASS AF=0.482143;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00607838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.225;QD=17.3708;RBI=0.0268593;REFB=0.00780087;REVB=0.0261624;RO=29;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183615;STB=0.609643;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0128228;OID=.;OPOS=175054548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:29:26:27:0.482143:15:11:18:11:16:11:18:11 chr1 175087884 . CA TG 571.57 PASS AF=0.535354;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.00650912;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=142.292;QD=23.0935;RBI=0.0112916;REFB=-0.020957;REVB=-0.00922671;RO=46;SAF=21;SAR=32;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107946;STB=0.559418;STBP=0.226;TYPE=mnp;VARB=0.0179079;OID=.;OPOS=175087884;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:46:46:53:53:0.535354:32:21:24:22:32:21:24:22 chr1 175092674 . C T 267.52 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=33;FSRR=3;FWDB=0.00904344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=308.834;QD=16.2135;RBI=0.0158017;REFB=-0.0131622;REVB=-0.012958;RO=33;SAF=28;SAR=2;SRF=31;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233034;STB=0.534327;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0150854;OID=.;OPOS=175092674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:36:30:30:0.454545:2:28:31:2:2:28:33:3 chr1 175113578 . T C 1883.91 PASS AF=0.991935;AO=122;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0194315;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.339;QD=60.7714;RBI=0.0391347;REFB=-0.137326;REVB=0.0339697;RO=1;SAF=50;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00940637;STB=0.50495;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000727601;OID=.;OPOS=175113578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:124:1:1:122:123:0.991935:72:50:1:0:73:50:1:0 chr1 175129924 . C CCTT 288.03 PASS AF=0.537037;AO=25;DP=143;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=3;FWDB=-0.0135891;FXX=0.228539;HRUN=2;LEN=3;MLLD=94.929;QD=21.3355;RBI=0.0694321;REFB=-0.136947;REVB=-0.0680893;RO=106;SAF=23;SAR=2;SRF=59;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.564387;STB=0.519986;STBP=0.858;TYPE=ins;VARB=0.0947267;OID=.;OPOS=175129925;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.537037:25:143:29:54:25:26:3:22:3:99:106:23:2:59:47 chr1 175129955 . G C 107.18 PASS AF=0.175439;AO=20;DP=114;FAO=20;FDP=114;FR=.;FRO=94;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=-0.0885499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.002;QD=3.76053;RBI=0.110923;REFB=-0.00986715;REVB=-0.0668046;RO=94;SAF=19;SAR=1;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.650638;STB=0.934251;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.108755;OID=.;OPOS=175129955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:94:94:20:20:0.175439:1:19:46:48:1:19:46:48 chr1 175299301 . T C 585.95 PASS AF=0.975;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0319668;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5096;QD=58.5954;RBI=0.0425505;REFB=0.00691959;REVB=-0.0280833;RO=1;SAF=23;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199479;STB=0.510633;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00267555;OID=.;OPOS=175299301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:40:1:1:39:39:0.975:16:23:1:0:16:23:1:0 chr1 175324651 . A G 997.27 PASS AF=1;AO=66;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713531;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.779;QD=59.5385;RBI=0.00780407;REFB=0;REVB=0.00316081;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123793;OID=.;OPOS=175324651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:67:0:0:66:67:1:26:40:0:0:26:41:0:0 chr1 175335234 . C T 635.74 PASS AF=0.422619;AO=71;DP=168;FAO=71;FDP=168;FR=.;FRO=97;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=40;FSRR=57;FWDB=-0.017993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.513;QD=15.1366;RBI=0.0194272;REFB=-0.0113235;REVB=0.007326;RO=96;SAF=25;SAR=46;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596815;STB=0.537276;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0138996;OID=.;OPOS=175335234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:96:97:71:71:0.422619:46:25:39:57:46:25:40:57 chr1 175348723 . C T 817.02 PASS AF=0.482759;AO=84;DP=174;FAO=84;FDP=174;FR=.;FRO=90;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=38;FWDB=0.0312683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.2999;QD=18.7822;RBI=0.0332277;REFB=0.0248844;REVB=-0.0112416;RO=90;SAF=44;SAR=40;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050853;STB=0.528046;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.026448;OID=.;OPOS=175348723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:90:90:84:84:0.482759:40:44:52:38:40:44:52:38 chr1 175355391 . A G 671.66 PASS AF=0.48227;AO=67;DP=141;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.0445582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7585;QD=19.0542;RBI=0.0682182;REFB=0.0124899;REVB=0.0516554;RO=71;SAF=27;SAR=40;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188209;STB=0.50749;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.0153905;OID=.;OPOS=175355391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:71:73:67:68:0.48227:40:27:30:41:41:27:30:43 chr1 175375469 . C A 767.43 PASS AF=0.513158;AO=77;DP=151;FAO=78;FDP=152;FR=.;FRO=74;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.000812218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.728;QD=20.1955;RBI=0.0086287;REFB=-0.00681655;REVB=-0.00859039;RO=74;SAF=41;SAR=36;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0889899;STB=0.545275;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0060325;OID=.;OPOS=175375469;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:74:74:77:78:0.513158:36:41:32:42:37:41:32:42 chr1 175375683 . T C 496.04 PASS AF=0.477477;AO=53;DP=111;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0138436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.31;QD=17.8753;RBI=0.0161096;REFB=-0.0106918;REVB=0.0082384;RO=58;SAF=34;SAR=19;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384247;STB=0.52135;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.013638;OID=.;OPOS=175375683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:58:53:53:0.477477:19:34:35:23:19:34:35:23 chr1 175375802 . T C 268.56 PASS AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0140183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.105;QD=13.9514;RBI=0.019496;REFB=-0.00840733;REVB=0.0135493;RO=46;SAF=19;SAR=12;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439733;STB=0.524984;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0153767;OID=.;OPOS=175375802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:12:19:30:16:12:19:30:16 chr1 176102974 . T C 394.51 PASS AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0241007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.235;QD=19.9751;RBI=0.0244502;REFB=-0.00300978;REVB=-0.00411894;RO=38;SAF=21;SAR=19;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476748;STB=0.532129;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00760717;OID=.;OPOS=176102974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:38:39:40:40:0.506329:19:21:22:16:19:21:23:16 chr1 176103053 . TAC T 193.21 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.00151967;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=2;MLLD=291.823;QD=15.1534;RBI=0.011023;REFB=-0.00549372;REVB=-0.0109177;RO=30;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212034;STB=0.631465;STBP=0.113;TYPE=del;VARB=0.0073197;OID=.;OPOS=176103054;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.431373:22:53:22:51:29:12:10:9:20:99:30:12:10:10:20 chr1 176118219 . G A 269.93 PASS AF=0.537037;AO=24;DP=49;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0281095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.172;QD=19.9949;RBI=0.0332471;REFB=-0.0273964;REVB=-0.0177547;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111393;STB=0.586147;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0223957;OID=.;OPOS=176118219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:54:24:25:24:29:0.537037:12:12:9:15:12:17:10:15 chr1 176863836 . G C 182.09 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0431189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9143;QD=16.9389;RBI=0.0431193;REFB=0.00377233;REVB=0.000192927;RO=23;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34537;STB=0.708634;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00513235;OID=.;OPOS=176863836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:5:14:9:14:5:14:9:15 chr1 176863867 . T C 199.71 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0632438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4371;QD=19.9708;RBI=0.0648035;REFB=-0.0279406;REVB=0.014132;RO=19;SAF=14;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294619;STB=0.656089;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0407949;OID=.;OPOS=176863867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:6:14:7:12:6:14:8:12 chr1 176903373 . G A 587.36 PASS AF=0.472868;AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=0.00453044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.471;QD=18.2128;RBI=0.00787229;REFB=-0.0166425;REVB=0.00643802;RO=67;SAF=29;SAR=32;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114492;STB=0.559251;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0187448;OID=.;OPOS=176903373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:67:68:61:61:0.472868:32:29:40:27:32:29:40:28 chr1 176992553 . A G 1552.61 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00195444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0341;QD=62.7316;RBI=0.0324666;REFB=-0.0835536;REVB=0.0324077;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000604911;OID=.;OPOS=176992553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:0:1:98:98:0.989899:42:56:0:0:42:56:0:1 chr1 177001896 . C G 446.68 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.662;QD=57.6367;RBI=0.0448794;REFB=0;REVB=0.0240854;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22515e-05;OID=.;OPOS=177001896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:20:9:0:0:21:10:0:0 chr1 177247854 . C G 198.2 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.023267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.216;QD=13.2133;RBI=0.0233123;REFB=-0.00602463;REVB=-0.00145262;RO=35;SAF=7;SAR=17;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299352;STB=0.665075;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0135865;OID=.;OPOS=177247854;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:36:24:24:0.4:17:7:20:15:17:7:20:16 chr1 177901713 . T C 480.93 PASS AF=0.547619;AO=45;DP=82;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00588337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8097;QD=22.9013;RBI=0.0130446;REFB=0.00715937;REVB=-0.0116424;RO=36;SAF=32;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232807;STB=0.633122;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00390642;OID=.;OPOS=177901713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:36:38:45:46:0.547619:13:32:16:20:13:33:17:21 chr1 177902753 . G C 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.027787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.595;QD=19.6972;RBI=0.0305999;REFB=-0.020406;REVB=-0.0128154;RO=22;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193394;STB=0.608296;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0236637;OID=.;OPOS=177902753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:12:9:5:17:12:9:5:17 chr1 177915474 . A C 405.15 PASS AF=0.58209;AO=36;DP=68;FAO=39;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=-0.0398605;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=100.759;QD=24.1881;RBI=0.0414883;REFB=-0.0233226;REVB=0.0115073;RO=21;SAF=27;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716665;STB=0.503523;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0204842;OID=.;OPOS=177915474;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:21:28:36:39:0.58209:9:27:14:7:10:29:21:7 chr1 177915498 . G A 363.24 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.00338265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.396;QD=18.1618;RBI=0.00730702;REFB=-0.0111323;REVB=0.0064769;RO=42;SAF=27;SAR=11;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00430516;STB=0.502403;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0119352;OID=.;OPOS=177915498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:11:27:30:12:11:27:30:12 chr1 177929940 . G A 623.87 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.194;QD=60.8657;RBI=0.0663234;REFB=0;REVB=0.0604848;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000622319;OID=.;OPOS=177929940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:24:16:0:0:25:16:0:0 chr1 177929987 . T C 885.41 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8388;QD=58.0598;RBI=0.0373372;REFB=0;REVB=0.0359244;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274381;OID=.;OPOS=177929987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:40:21:0:0:40:21:0:0 chr1 178426850 . A G 696.3 PASS AF=0.466667;AO=70;DP=150;FAO=70;FDP=150;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0230445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4521;QD=18.5679;RBI=0.0340919;REFB=-0.0264915;REVB=0.0251239;RO=80;SAF=31;SAR=39;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174446;STB=0.509668;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0228379;OID=.;OPOS=178426850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:80:80:70:70:0.466667:39:31:34:46:39:31:34:46 chr1 178492423 . T C 648.4 PASS AF=0.567568;AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00622013;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.127;QD=23.3657;RBI=0.00649784;REFB=-0.0238461;REVB=0.00187936;RO=48;SAF=27;SAR=36;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239445;STB=0.513085;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0166818;OID=.;OPOS=178492423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:48:48:63:63:0.567568:36:27:22:26:36:27:22:26 chr1 178514165 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00110903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.364;QD=47.822;RBI=0.0163264;REFB=0;REVB=0.0162887;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133541;OID=.;OPOS=178514165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr1 178514560 . A AT 434.83 PASS AF=1;AO=40;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014588;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.6772;QD=39.5296;RBI=0.0195405;REFB=-0.019948;REVB=-0.0130009;RO=3;SAF=20;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217618;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00144815;OID=.;OPOS=178514561;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:40:44:44:44:0:22:22:0:0:7:3:20:20:2:1 chr1 178820159 . C A 324.9 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0435895;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3831;QD=16.878;RBI=0.118318;REFB=-0.0173504;REVB=-0.109996;RO=42;SAF=23;SAR=12;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364463;STB=0.520422;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0183667;OID=.;OPOS=178820159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:12:23:29:13:12:23:29:13 chr1 179051300 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0972276;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=194.773;QD=35.5759;RBI=0.0991667;REFB=0;REVB=0.0195148;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120161;OID=.;OPOS=179051300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr1 179064539 . CT C,TT 57.28 PASS AF=0.282353,0;AO=23,3;DP=83;FAO=24,0;FDP=85;FR=.;FRO=61;FSAF=7,0;FSAR=17,0;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.112415,0.011941;FXX=0.0116266;HRUN=8,1;LEN=1,1;MLLD=8.01102,211.481;QD=2.69547;RBI=0.119754,0.0135459;REFB=-0.0772177,-0.00103916;REVB=0.0412778,-0.00639574;RO=51;SAF=7,2;SAR=16,1;SRF=28;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.290824,0.109239;STB=0.672948,0.5;STBP=0.051,1;TYPE=del,snp;VARB=0.129526,0;OID=.,.;OPOS=179064540,179064539;OREF=T,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:83:85:51:61:23,3:24,0:0.282353,0:16,1:7,2:28:23:17,0:7,0:32:29 chr1 179065125 . C T 184.8 PASS AF=0.475;AO=18;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00986244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7297;QD=18.4797;RBI=0.0272317;REFB=0.00977651;REVB=0.025383;RO=22;SAF=16;SAR=2;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221014;STB=0.643064;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00886194;OID=.;OPOS=179065125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:21:18:19:0.475:2:16:17:5:2:17:16:5 chr1 179068851 . A G 142.35 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0188639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2183;QD=14.9846;RBI=0.0639286;REFB=0.0144433;REVB=-0.0610821;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363461;STB=0.709421;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.0195973;OID=.;OPOS=179068851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:15:7:11:5:15:7 chr1 179072728 . T C 262.77 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00409057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.075;QD=15.0156;RBI=0.00419556;REFB=-0.000481857;REVB=0.000932754;RO=40;SAF=13;SAR=17;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170688;STB=0.509665;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.000694373;OID=.;OPOS=179072728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:17:13:18:22:17:13:18:22 chr1 179084080 . T G 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.000519252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.363;QD=16.2716;RBI=0.0527965;REFB=0.00438045;REVB=0.0527939;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577205;STB=0.533288;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=-0.00300455;OID=.;OPOS=179084080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:10:5:7:11:10:5:7:11 chr1 179086450 . G A 36.02 PASS AF=0.0869565;AO=4;DP=46;FAO=4;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00228527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.966;QD=3.13256;RBI=0.00505947;REFB=-0.00926611;REVB=0.00451395;RO=38;SAF=3;SAR=1;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24961;STB=0.702641;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0531326;OID=.;OPOS=179086450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:46:46:38:39:4:4:0.0869565:1:3:20:18:1:3:21:18 chr1 179310262 . C T 172.98 PASS AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0200109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8995;QD=11.3431;RBI=0.0211821;REFB=0.00516823;REVB=0.00694595;RO=39;SAF=12;SAR=10;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494359;STB=0.528675;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=-0.00525336;OID=.;OPOS=179310262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:39:39:22:22:0.360656:10:12:23:16:10:12:23:16 chr1 179347832 . T C 278.92 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0184844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.311;QD=13.9457;RBI=0.0210581;REFB=-0.000646189;REVB=-0.010088;RO=48;SAF=13;SAR=19;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561403;STB=0.53198;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00124466;OID=.;OPOS=179347832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:19:13:22:26:19:13:22:26 chr1 179504043 . C G 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.114755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.294;QD=17.8273;RBI=0.11509;REFB=0.00750845;REVB=0.00877559;RO=11;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125863;STB=0.571321;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=-0.00385806;OID=.;OPOS=179504043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:10:2:1:10:10:2:1:10 chr1 179504130 . G A 311.5 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0137946;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.983;QD=21.4825;RBI=0.0157542;REFB=-0.00375816;REVB=-0.00760939;RO=25;SAF=19;SAR=13;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916485;STB=0.560006;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00281493;OID=.;OPOS=179504130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:26:32:32:0.551724:13:19:12:13:13:19:12:14 chr1 179520151 . C T 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.359;QD=58.2396;RBI=0.0164305;REFB=0;REVB=0.00485012;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.42798e-05;OID=.;OPOS=179520151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr1 179520506 . G A 92.27 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.038731;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.634;QD=14.763;RBI=0.0539416;REFB=0.00125203;REVB=0.0375447;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317416;STB=0.68154;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0104091;OID=.;OPOS=179520506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:12:2:5:6:12:2 chr1 179562740 . G C 564.69 PASS AF=0.508772;AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00885095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=351.052;QD=19.8136;RBI=0.00912946;REFB=-0.00502991;REVB=-0.00223781;RO=56;SAF=23;SAR=35;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141243;STB=0.577955;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00483343;OID=.;OPOS=179562740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:56:56:58:58:0.508772:35:23:31:25:35:23:31:25 chr1 179604864 . C T 1495.64 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00760028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.365;QD=62.3182;RBI=0.0393152;REFB=-0.106412;REVB=0.0385736;RO=1;SAF=57;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824724;STB=0.504347;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=4.43676e-05;OID=.;OPOS=179604864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:38:57:1:0:38:57:1:0 chr1 179609589 . G T 429.84 PASS AF=0.44;AO=42;DP=98;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=0.00644236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.17;QD=17.1935;RBI=0.0129086;REFB=-0.0150658;REVB=-0.0111861;RO=56;SAF=18;SAR=24;SRF=17;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132973;STB=0.586555;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.017794;OID=.;OPOS=179609589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:56:56:42:44:0.44:24:18:17:39:24:20:17:39 chr1 179852074 . T C 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.459;QD=64.1536;RBI=0.0421006;REFB=0;REVB=-0.00529269;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019191;OID=.;OPOS=179852074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:34:15:0:0:34:15:0:0 chr1 179858444 . G A 1603.19 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.259;QD=59.9325;RBI=0.0215467;REFB=0;REVB=-0.010785;RO=0;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5115e-05;OID=.;OPOS=179858444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:58:48:0:0:59:48:0:0 chr1 179876988 . C G 2288.57 PASS AF=0.993421;AO=151;DP=154;FAO=151;FDP=152;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00209205;FXX=0.0129862;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.122;QD=60.2254;RBI=0.0109404;REFB=-0.0454768;REVB=0.0107385;RO=1;SAF=77;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0061376;STB=0.503225;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-4.90476e-06;OID=.;OPOS=179876988;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:154:152:1:1:151:151:0.993421:74:77:1:0:74:77:1:0 chr1 179887125 . G A 825.52 PASS AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0204207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.0684;QD=54.1322;RBI=0.0226642;REFB=-0.078123;REVB=-0.00983166;RO=2;SAF=37;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248227;STB=0.513153;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00125218;OID=.;OPOS=179887125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:61:61:2:2:59:59:0.967213:22:37:2:0:22:37:2:0 chr1 179989584 . G C 54.67 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.05915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5365;QD=9.11094;RBI=0.0592373;REFB=-0.0044248;REVB=0.00321429;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266321;STB=0.662868;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0082241;OID=.;OPOS=179989584;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:5:3:10:6:5:3:10:6 chr1 179989742 . G C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0134595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.861;QD=9.44482;RBI=0.0554964;REFB=0.00559482;REVB=-0.0538395;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383856;STB=0.523731;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0258849;OID=.;OPOS=179989742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:7:3:2:4:7:3 chr1 180010911 . A G 314.8 PASS AF=0.411765;AO=34;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00241982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.469;QD=14.8142;RBI=0.0285069;REFB=-0.010647;REVB=0.028404;RO=50;SAF=13;SAR=21;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627826;STB=0.542229;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0151682;OID=.;OPOS=180010911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:50:34:35:0.411765:21:13:22:28:22:13:22:28 chr1 180145088 . A G 1664.3 PASS AF=0.991071;AO=112;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140214;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8828;QD=59.4394;RBI=0.014032;REFB=0.0354633;REVB=0.000545055;RO=1;SAF=52;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784784;STB=0.504201;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.000370223;OID=.;OPOS=180145088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:112:1:1:112:111:0.991071:60:52:0:1:59:52:0:1 chr1 180165699 . A C 323.08 PASS AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00246385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.879;QD=25.3394;RBI=0.00818865;REFB=-0.0115393;REVB=-0.00780919;RO=20;SAF=12;SAR=19;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00966453;STB=0.505316;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00714979;OID=.;OPOS=180165699;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:19:12:8:12:19:12:8:12 chr1 180167414 . C G 338.5 PASS AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0328775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5964;QD=15.2135;RBI=0.0742128;REFB=-0.0311603;REVB=-0.0665328;RO=52;SAF=27;SAR=10;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330744;STB=0.687793;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0386258;OID=.;OPOS=180167414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:10:27:22:30:10:27:22:30 chr1 180199727 . T C 221.66 PASS AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0374397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.685;QD=12.3142;RBI=0.0376506;REFB=-0.0118795;REVB=0.00397893;RO=45;SAF=10;SAR=17;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591946;STB=0.534102;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0236904;OID=.;OPOS=180199727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:17:10:19:26:17:10:19:26 chr1 180243524 . A G 247.33 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.00430717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.641;QD=13.7406;RBI=0.0188677;REFB=-0.0275948;REVB=-0.0183695;RO=43;SAF=20;SAR=9;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991109;STB=0.556705;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0350506;OID=.;OPOS=180243524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:9:20:26:17:9:20:26:17 chr1 180854067 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0033305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.112;QD=56.9379;RBI=0.0227704;REFB=0;REVB=0.0225255;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27766e-05;OID=.;OPOS=180854067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr1 180885430 . T C 1205.48 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.137;QD=61.037;RBI=0.00862389;REFB=0;REVB=-0.00313193;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72465e-05;OID=.;OPOS=180885430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0 chr1 180886063 . G A 207.58 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0113477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4999;QD=15.0967;RBI=0.0705126;REFB=-0.0168687;REVB=0.0695935;RO=31;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204622;STB=0.616341;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0426014;OID=.;OPOS=180886063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:9:15:13:18:9:15:13:18 chr1 180897569 . C T 378.86 PASS AF=0.673077;AO=35;DP=52;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0115692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.34;QD=29.1432;RBI=0.0223752;REFB=-0.015405;REVB=0.0191521;RO=16;SAF=14;SAR=21;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531857;STB=0.51612;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00654034;OID=.;OPOS=180897569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:16:17:35:35:0.673077:21:14:5:11:21:14:6:11 chr1 180905352 . C T 35.21 PASS AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00871025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.574;QD=5.21561;RBI=0.0135237;REFB=0.0130145;REVB=-0.0103452;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648388;STB=0.542719;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.0130762;OID=.;OPOS=180905352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:2:4:15:6:2:4:15:6 chr1 180905448 . G T 125.61 PASS AF=0.375;AO=14;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.00193879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.389;QD=12.5609;RBI=0.00814944;REFB=-0.00151411;REVB=0.00791545;RO=25;SAF=10;SAR=4;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12221;STB=0.555984;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00248673;OID=.;OPOS=180905448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:25:25:14:15:0.375:4:10:20:5:4:11:20:5 chr1 180913597 . A G 549.92 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.534;QD=59.4512;RBI=0.107032;REFB=0;REVB=-0.0928533;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000699768;OID=.;OPOS=180913597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:19:15:0:0:20:17:0:0 chr1 181019202 . C T 334.25 PASS AF=0.384615;AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0020543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.489;QD=12.8559;RBI=0.0142129;REFB=-0.00626664;REVB=0.0140636;RO=64;SAF=19;SAR=21;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607608;STB=0.534565;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0110247;OID=.;OPOS=181019202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:64:64:40:40:0.384615:21:19:34:30:21:19:34:30 chr1 181019253 . T C 386.54 PASS AF=0.377049;AO=45;DP=122;FAO=46;FDP=122;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.00717922;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.654;QD=12.6734;RBI=0.0119361;REFB=0.00263514;REVB=0.00953564;RO=75;SAF=25;SAR=20;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00986079;STB=0.502512;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.00370995;OID=.;OPOS=181019253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:75:76:45:46:0.377049:20:25:41:34:21:25:41:35 chr1 181024404 . G A 416.66 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.048491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.082;QD=19.6077;RBI=0.0484984;REFB=-0.0198389;REVB=0.000846701;RO=42;SAF=26;SAR=16;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886837;STB=0.544165;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.022651;OID=.;OPOS=181024404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:43:42:42:0.494118:16:26:22:20:16:26:23:20 chr1 181752923 . AAGCTT A 50.0 PASS AO=94;DP=125;LEN=5;RO=31;SAF=44;SAR=52;SRF=14;SRR=15;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=181752924;OREF=AGCTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:125:31:94:52:44:14:15 chr1 181768186 . T C 223.5 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.015522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1724;QD=14.8998;RBI=0.0425273;REFB=0.026617;REVB=-0.0395934;RO=34;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19252;STB=0.609054;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.0357022;OID=.;OPOS=181768186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:11:15:13:21:11:15:13:21 chr1 182356399 . A G 477.38 PASS AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0254689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.642;QD=18.0144;RBI=0.0354228;REFB=-0.0235467;REVB=0.0246192;RO=54;SAF=22;SAR=29;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983115;STB=0.559324;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0246552;OID=.;OPOS=182356399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:54:55:51:51:0.481132:29:22:29:25:29:22:30:25 chr1 182369078 . G A 128.86 PASS AF=0.314815;AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.00084107;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.124;QD=9.54497;RBI=0.000887663;REFB=-0.00627787;REVB=0.000283807;RO=37;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235177;STB=0.638557;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0125503;OID=.;OPOS=182369078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:37:37:17:17:0.314815:8:9:12:25:8:9:12:25 chr1 182369233 . A G 195.79 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00433311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.4099;QD=17.7987;RBI=0.0433606;REFB=-0.0163351;REVB=0.0431435;RO=24;SAF=6;SAR=14;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350974;STB=0.6998;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0248779;OID=.;OPOS=182369233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:14:6:16:8:14:6:16:8 chr1 182443014 . G C 39.4 PASS AF=0.461538;AO=4;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.112844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4433;QD=12.1227;RBI=0.120874;REFB=-0.0296359;REVB=0.0433224;RO=7;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198753;STB=0.688929;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0551974;OID=.;OPOS=182443014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:4:6:0.461538:1:3:4:3:1:5:4:3 chr1 182443462 . T C 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7107;QD=62.6696;RBI=0.0380865;REFB=0;REVB=0.0379632;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000528108;OID=.;OPOS=182443462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr1 182551337 . A C 657.47 PASS AF=0.528455;AO=65;DP=123;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00325575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.208;QD=21.3812;RBI=0.0182154;REFB=-0.0204277;REVB=-0.017922;RO=58;SAF=36;SAR=29;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316672;STB=0.517393;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0173324;OID=.;OPOS=182551337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:58:58:65:65:0.528455:29:36:30:28:29:36:30:28 chr1 182554557 . C T 926.42 PASS AF=0.542169;AO=90;DP=168;FAO=90;FDP=166;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.0375259;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.644;QD=22.3234;RBI=0.0375411;REFB=-0.00500821;REVB=0.00106692;RO=77;SAF=46;SAR=44;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399851;STB=0.519031;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00554747;OID=.;OPOS=182554557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:166:77:76:90:90:0.542169:44:46:43:34:44:46:42:34 chr1 182568204 . G C 1472.58 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.172;QD=63.3367;RBI=0.0206861;REFB=0;REVB=0.012041;RO=0;SAF=38;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17314e-05;OID=.;OPOS=182568204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:55:38:0:0:55:38:0:0 chr1 182569626 . T C 851.22 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5527;QD=57.71;RBI=0.0519049;REFB=0;REVB=0.0414906;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76681e-05;OID=.;OPOS=182569626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0 chr1 182778367 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00152126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.445;QD=57.2026;RBI=0.00384046;REFB=0;REVB=0.00352631;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23679e-05;OID=.;OPOS=182778367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr1 182850727 . T C 1635.44 PASS AF=0.991071;AO=106;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0333351;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7924;QD=58.4087;RBI=0.0618617;REFB=0.00688233;REVB=0.0521118;RO=1;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811295;STB=0.504761;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000646164;OID=.;OPOS=182850727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:1:1:106:111:0.991071:58:48:0:1:59:52:1:0 chr1 182993025 . C T 502.97 PASS AF=0.391608;AO=56;DP=146;FAO=56;FDP=143;FR=.;FRO=87;FSAF=42;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=51;FWDB=0.0708036;FXX=0.0205465;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8836;QD=14.0691;RBI=0.0903589;REFB=0.0142509;REVB=-0.0561389;RO=88;SAF=42;SAR=14;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402842;STB=0.714206;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0193553;OID=.;OPOS=182993025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:143:88:87:56:56:0.391608:14:42:34:54:14:42:36:51 chr1 183072590 . T C 369.91 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.00642423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8155;QD=14.0916;RBI=0.0375344;REFB=-0.0169644;REVB=-0.0369805;RO=62;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163823;STB=0.592191;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0247815;OID=.;OPOS=183072590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:62:43:43:0.409524:21:22:22:40:21:22:22:40 chr1 183085755 . A G 609.69 PASS AF=0.466667;AO=63;DP=135;FAO=63;FDP=135;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.0319035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.988;QD=18.065;RBI=0.0321686;REFB=0.00839865;REVB=0.00412112;RO=72;SAF=32;SAR=31;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876351;STB=0.548599;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.0072302;OID=.;OPOS=183085755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:72:72:63:63:0.466667:31:32:30:42:31:32:30:42 chr1 183086534 . C T 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00597619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.196;QD=13.6197;RBI=0.0154525;REFB=0.00704608;REVB=-0.0142501;RO=38;SAF=17;SAR=9;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165767;STB=0.594925;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00955548;OID=.;OPOS=183086534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:9:17:19:19:9:17:19:19 chr1 183086757 . A C 484.81 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00237883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.491;QD=21.0788;RBI=0.0139269;REFB=-0.00879466;REVB=-0.0137223;RO=44;SAF=27;SAR=20;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147508;STB=0.501656;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.008393;OID=.;OPOS=183086757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:44:45:47:47:0.51087:20:27:26:18:20:27:26:19 chr1 183093875 . T C 518.31 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.0224317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.656;QD=18.0283;RBI=0.0440135;REFB=-0.00219202;REVB=0.0378683;RO=60;SAF=23;SAR=32;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621896;STB=0.53452;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00160697;OID=.;OPOS=183093875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:60:60:55:55:0.478261:32:23:29:31:32:23:29:31 chr1 183094547 . T C 413.97 PASS AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=0.00865284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.813;QD=16.3947;RBI=0.0106588;REFB=-0.00958254;REVB=-0.00622394;RO=55;SAF=30;SAR=15;SRF=40;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689655;STB=0.541967;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0120701;OID=.;OPOS=183094547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:55:56:45:45:0.445545:15:30:40:15:15:30:41:15 chr1 183105534 . T C 110.7 PASS AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.032149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.974;QD=26.048;RBI=0.0444805;REFB=-0.102268;REVB=0.0307402;RO=5;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147448;STB=0.58319;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0252391;OID=.;OPOS=183105534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:8:4:3:2:8:4:3:2 chr1 183105705 . G A 277.34 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0168232;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.318;QD=15.8481;RBI=0.0211206;REFB=-0.00707613;REVB=-0.0127694;RO=39;SAF=16;SAR=15;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228564;STB=0.62783;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00847462;OID=.;OPOS=183105705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:39:39:31:31:0.442857:15:16:29:10:15:16:29:10 chr1 183112041 . G C 353.36 PASS AF=0.457831;AO=36;DP=81;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0107966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8136;QD=17.0295;RBI=0.0157754;REFB=-0.0184164;REVB=-0.011502;RO=45;SAF=20;SAR=16;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022298;STB=0.50065;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0251313;OID=.;OPOS=183112041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:45:45:36:38:0.457831:16:20:26:19:16:22:26:19 chr1 183112412 . A G 421.06 PASS AF=0.5;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0312215;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.47;QD=20.0504;RBI=0.0391126;REFB=-0.0120148;REVB=0.0235587;RO=42;SAF=17;SAR=25;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12977;STB=0.572048;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0149576;OID=.;OPOS=183112412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:84:42:42:42:42:0.5:25:17:23:19:25:17:23:19 chr1 183112505 . T C 320.16 PASS AF=0.357143;AO=40;DP=112;FAO=40;FDP=112;FR=.;FRO=72;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.0341127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.914;QD=11.4342;RBI=0.0341129;REFB=-0.00482158;REVB=0.000116424;RO=72;SAF=17;SAR=23;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130707;STB=0.574962;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00838641;OID=.;OPOS=183112505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:72:72:40:40:0.357143:23:17:39:33:23:17:39:33 chr1 183112566 . T C 360.63 PASS AF=0.397959;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=0.0141723;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.495;QD=14.7194;RBI=0.0156966;REFB=-0.00145376;REVB=-0.00674748;RO=61;SAF=22;SAR=17;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232692;STB=0.633028;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00232935;OID=.;OPOS=183112566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:61:59:39:39:0.397959:17:22:21:40:17:22:20:39 chr1 183112764 . A G 150.95 PASS AF=0.351852;AO=18;DP=53;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0121112;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.104;QD=11.1812;RBI=0.0235342;REFB=-0.0097098;REVB=0.0201786;RO=33;SAF=7;SAR=11;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23705;STB=0.648494;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0123123;OID=.;OPOS=183112764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:33:35:18:19:0.351852:11:7:20:13:12:7:21:14 chr1 183114634 . G A 276.31 PASS AF=0.333333;AO=33;DP=99;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=51;FWDB=0.00175512;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.944;QD=11.1639;RBI=0.0494523;REFB=-0.0157043;REVB=-0.0494212;RO=66;SAF=15;SAR=18;SRF=15;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275441;STB=0.657059;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.018661;OID=.;OPOS=183114634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:66:66:33:33:0.333333:18:15:15:51:18:15:15:51 chr1 183486859 . G A 2307.84 PASS AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.54;QD=61.1349;RBI=0.0138918;REFB=0;REVB=0.0122699;RO=0;SAF=71;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29396e-05;OID=.;OPOS=183486859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:80:71:0:0:80:71:0:0 chr1 183542387 . T C 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9639;QD=61.0488;RBI=0.054178;REFB=0;REVB=-0.0165655;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00060646;OID=.;OPOS=183542387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:46:32:0:0:46:32:0:0 chr1 183885657 . ACCCC ACCC,ACCCT 684.12 PASS AF=0.930233,0.0697674;AO=31,7;DP=86;FAO=80,6;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=35,6;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103436,-0.0259116;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.602,194.746;QD=31.8193;RBI=0.863783,0.102238;REFB=0.0163049,0.000839601;REVB=0.857568,0.0988996;RO=40;SAF=25,7;SAR=6,0;SRF=7;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0.650794,0;SSSB=0.598266,0.800295;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.017592,0.127094;OID=.,.;OPOS=183885658,183885661;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=ACCC,ACCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.930233,0.0697674:31,7:86:80,6:86:0:35,6:45,0:0:0:19:40:25,7:6,0:7:33 chr1 183909717 . G A 519.99 PASS AF=0.544444;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0150899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.498;QD=23.1107;RBI=0.0200527;REFB=-0.0136996;REVB=0.0132062;RO=40;SAF=19;SAR=30;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134933;STB=0.580077;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0110435;OID=.;OPOS=183909717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:40:41:49:49:0.544444:30:19:22:18:30:19:23:18 chr1 184020945 . G A 486.03 PASS AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=0.0138255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.87;QD=24.0012;RBI=0.109152;REFB=-0.0436078;REVB=0.108273;RO=35;SAF=34;SAR=12;SRF=29;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964033;STB=0.55261;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0345961;OID=.;OPOS=184020945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:12:34:29:6:12:34:29:6 chr1 184023529 . A C 870.78 PASS AF=0.49162;AO=88;DP=179;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=21;FSRR=70;FWDB=-0.0125766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.101;QD=19.4587;RBI=0.0192905;REFB=0.0059391;REVB=0.0146272;RO=91;SAF=37;SAR=51;SRF=21;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186675;STB=0.60213;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0031344;OID=.;OPOS=184023529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:91:91:88:88:0.49162:51:37:21:70:51:37:21:70 chr1 184660205 . T A 270.27 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00152421;FXX=0.0172384;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.014;QD=18.9666;RBI=0.0015243;REFB=-0.00779985;REVB=1.65786e-05;RO=27;SAF=10;SAR=19;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920479;STB=0.54424;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00608804;OID=.;OPOS=184660205;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:27:28:29:29:0.508772:19:10:12:15:19:10:12:16 chr1 184662181 . C T 391.63 PASS AF=0.612903;AO=36;DP=60;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0160147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.776;QD=25.2663;RBI=0.0314938;REFB=-0.0193392;REVB=0.027118;RO=24;SAF=21;SAR=15;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617059;STB=0.520502;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0152467;OID=.;OPOS=184662181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:24:24:36:38:0.612903:15:21:12:12:17:21:12:12 chr1 184663537 . A C 405.51 PASS AF=0.555556;AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.020367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.733;QD=22.5283;RBI=0.0203721;REFB=-0.023462;REVB=0.000457155;RO=32;SAF=26;SAR=14;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225297;STB=0.624231;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0206602;OID=.;OPOS=184663537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:0.555556:14:26:12:20:14:26:12:20 chr1 184663581 . T C 156.43 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0278541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.279;QD=24.0668;RBI=0.0285132;REFB=0.00994352;REVB=-0.00609517;RO=10;SAF=13;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405834;STB=0.730018;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00593662;OID=.;OPOS=184663581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:3:13:3:7:3:13:3:7 chr1 184675814 . G A 468.12 PASS AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00924812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.766;QD=22.8351;RBI=0.0157324;REFB=-0.00532542;REVB=-0.0127272;RO=37;SAF=29;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901095;STB=0.549662;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00485679;OID=.;OPOS=184675814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:16:29:20:17:16:29:20:17 chr1 184677464 . G A 278.89 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0553781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.39;QD=13.9446;RBI=0.0620958;REFB=-0.019526;REVB=-0.0280918;RO=48;SAF=13;SAR=19;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143283;STB=0.581581;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0245747;OID=.;OPOS=184677464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:19:13:26:22:19:13:26:22 chr1 184706212 . GT G 238.31 PASS AF=0.433333;AO=37;DP=91;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0678102;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.4974;QD=10.5916;RBI=0.135479;REFB=-0.0107124;REVB=-0.117287;RO=50;SAF=23;SAR=14;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166708;STB=0.609699;STBP=0.079;TYPE=del;VARB=0.00547581;OID=.;OPOS=184706213;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.433333:37:91:39:90:51:25:14:23:28:99:50:23:14:23:27 chr1 184765072 . A G 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.018768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.747;QD=8.2462;RBI=0.0190595;REFB=-0.00767553;REVB=0.00332047;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342331;STB=0.713674;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0159229;OID=.;OPOS=184765072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:5:2:9:6:5:2:9:6 chr1 184868431 . C T 143.64 PASS AF=0.64;AO=14;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6429;QD=22.9826;RBI=0.144338;REFB=-0.260082;REVB=0.144338;RO=10;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0978368;OID=.;OPOS=184868431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:24:25:10:9:14:16:0.64:14:0:0:10:16:0:0:9 chr1 185069561 . A G 586.68 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.266;QD=60.1725;RBI=0.0346296;REFB=0;REVB=0.00704961;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331821;OID=.;OPOS=185069561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:18:19:0:0:18:21:0:0 chr1 185069843 . T A 243.8 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.00366474;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=285.442;QD=15.2376;RBI=0.0142104;REFB=0.00347175;REVB=-0.0137297;RO=34;SAF=12;SAR=16;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168;STB=0.605564;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.00361333;OID=.;OPOS=185069843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:36:28:28:0.4375:16:12:9:25:16:12:9:27 chr1 185119563 . C T 386.08 PASS AF=0.465116;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.00131688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.541;QD=17.9572;RBI=0.00135373;REFB=-0.0078845;REVB=0.000313683;RO=46;SAF=15;SAR=24;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235911;STB=0.622059;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00987022;OID=.;OPOS=185119563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:46:46:39:40:0.465116:24:15:29:17:24:16:29:17 chr1 185135745 . A G 214.81 PASS AF=0.538462;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00612218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.721;QD=22.032;RBI=0.00654936;REFB=-0.0296483;REVB=-0.00232658;RO=16;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173878;STB=0.606777;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0272393;OID=.;OPOS=185135745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:39:16:18:20:21:0.538462:7:13:7:9:8:13:7:11 chr1 185137452 . C CCTAAATGATAGA 123.26 PASS AF=0.293103;AO=14;DP=63;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.00337349;FXX=0.0937354;HRUN=2;LEN=12;MLLD=369.286;QD=8.5004;RBI=0.00467489;REFB=0.000135191;REVB=0.00323639;RO=46;SAF=10;SAR=4;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274636;STB=0.508918;STBP=0.977;TYPE=ins;VARB=-0.000296587;OID=.;OPOS=185137453;OREF=-;OALT=CTAAATGATAGA;OMAPALT=CCTAAATGATAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.293103:14:63:17:58:41:11:6:27:14:99:46:10:4:32:14 chr1 185137461 . A T 884.75 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.445;QD=57.0809;RBI=0.0550828;REFB=0;REVB=0.0360381;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46705e-05;OID=.;OPOS=185137461;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:22:40:0:0:22:40:0:0 chr1 185137463 . TT AA,TTAA 848.38 PASS AF=0.377049,0.622951;AO=22,26;DP=62;FAO=23,38;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=15,24;FSAR=8,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412082,-0.0117889;FXX=0.0161264;HRUN=3,1;LEN=2,2;MLLD=29.2083,29.7191;QD=55.6315;RBI=0.085764,0.0486363;REFB=0,0;REVB=0.0752154,-0.0471859;RO=5;SAF=14,19;SAR=8,7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0843894,0.117272;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0807763,-0.0322671;OID=.,.;OPOS=185137463,185137465;OREF=TT,-;OALT=AA,AA;OMAPALT=AA,TTAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:62:61:5:0:22,26:23,38:0.377049,0.622951:8,7:14,19:2:3:8,14:15,24:0:0 chr1 185143721 . A G 332.53 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00553817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.436;QD=26.6026;RBI=0.00985401;REFB=0.000667529;REVB=-0.00815047;RO=21;SAF=16;SAR=13;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151582;STB=0.508374;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.000112363;OID=.;OPOS=185143721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:13:16:12:9:13:16:12:9 chr1 185266050 . A T 463.38 PASS AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.0201349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.352;QD=21.8061;RBI=0.0299503;REFB=-0.0148835;REVB=-0.0221721;RO=40;SAF=15;SAR=30;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572625;STB=0.531518;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0135376;OID=.;OPOS=185266050;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:30:15:11:29:30:15:11:29 chr1 185704106 . AAT A,AAA 114.83 PASS AF=0.350877,0;AO=10,7;DP=61;FAO=20,0;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=18,0;FSAR=2,0;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0821562,-0.00659467;FXX=0.0499917;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=23.2676,18.8546;QD=8.05849;RBI=0.124765,0.0948121;REFB=-0.026805,0.0211547;REVB=-0.0938964,-0.0945825;RO=39;SAF=9,7;SAR=1,0;SRF=18;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.573208,0.690545;STB=0.817796,0.5;STBP=0.004,1;TYPE=del,snp;VARB=0.046245,0;OID=.,.;OPOS=185704107,185704108;OREF=AT,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.350877,0:10,7:61:20,0:57:37:18,0:2,0:20:17:99:39:9,7:1,0:18:21 chr1 185984517 . T C 306.93 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0082312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.842;QD=18.0547;RBI=0.00836167;REFB=-0.00295297;REVB=0.00147136;RO=33;SAF=11;SAR=22;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521726;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00396548;OID=.;OPOS=185984517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:35:33:33:0.485294:22:11:11:22:22:11:13:22 chr1 186026474 . T C 684.86 PASS AF=0.531746;AO=67;DP=127;FAO=67;FDP=126;FR=.;FRO=59;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.00987788;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.344;QD=21.7417;RBI=0.0207969;REFB=-0.0079671;REVB=0.0183013;RO=59;SAF=42;SAR=25;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217502;STB=0.619374;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00543225;OID=.;OPOS=186026474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:59:59:67:67:0.531746:25:42:22:37:25:42:22:37 chr1 186031041 . C T 217.59 PASS AF=0.4;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0629245;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.477;QD=13.3902;RBI=0.063158;REFB=-0.00958647;REVB=-0.00542587;RO=39;SAF=9;SAR=17;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23144;STB=0.63255;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0113462;OID=.;OPOS=186031041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:39:39:26:26:0.4:17:9:22:17:17:9:22:17 chr1 186050417 . A G 735.66 PASS AF=0.458824;AO=79;DP=172;FAO=78;FDP=170;FR=.;FRO=92;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=-0.00356858;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.343;QD=17.3096;RBI=0.0162999;REFB=0.00797006;REVB=-0.0159045;RO=93;SAF=36;SAR=43;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00654839;STB=0.504263;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.00968935;OID=.;OPOS=186050417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:170:93:92:79:78:0.458824:43:36:43:50:43:35:42:50 chr1 186052064 . C A 99.5 PASS AF=0.121212;AO=37;DP=261;FAO=32;FDP=264;FR=.;FRO=232;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=127;FSRR=105;FWDB=-0.0755998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1905;QD=1.50763;RBI=0.110689;REFB=-0.0100589;REVB=-0.0808496;RO=200;SAF=9;SAR=28;SRF=121;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448873;STB=0.730699;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.138852;OID=.;OPOS=186052064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:264:200:232:37:32:0.121212:28:9:121:79:23:9:127:105 chr1 186052065 . CA C,CC 848.73 PASS AF=0.582996,0.174089;AO=128,32;DP=238;FAO=144,43;FDP=247;FR=.;FRO=60;FSAF=79,9;FSAR=65,34;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.147533,0.0269824;FXX=0.0119995;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=8.03279,20.0834;QD=13.7446;RBI=0.148426,0.104802;REFB=-0.154977,-0.0953823;REVB=0.0162559,0.101269;RO=57;SAF=69,5;SAR=59,27;SRF=29;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0174903,-0.46026;STB=0.504532,0.714031;STBP=0.867,0;TYPE=del,snp;VARB=0.122401,0.0578319;OID=.,.;OPOS=186052066,186052066;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.582996,0.174089:128,32:238:144,43:247:60:79,9:65,34:32:28:99:57:69,5:59,27:29:28 chr1 186101539 . A G 390.39 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00979844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.786;QD=19.0434;RBI=0.0148494;REFB=-0.01344;REVB=0.0111577;RO=42;SAF=20;SAR=20;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131724;STB=0.573135;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0190323;OID=.;OPOS=186101539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:20:20:27:15:20:20:27:15 chr1 186277088 . G C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5779;QD=37.4875;RBI=0.0303925;REFB=0;REVB=0.00269385;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0020558;OID=.;OPOS=186277088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr1 186326757 . TA T 139.09 PASS AF=0.55102;AO=23;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.134744;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.5266;QD=11.354;RBI=0.135068;REFB=-0.00445275;REVB=-0.00935738;RO=21;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742616;STB=0.518445;STBP=0.802;TYPE=del;VARB=0.0118305;OID=.;OPOS=186326758;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.55102:23:49:27:49:22:10:17:9:13:96:21:7:16:8:13 chr1 186643541 . C T 845.29 PASS AF=0.465241;AO=87;DP=187;FAO=87;FDP=187;FR=.;FRO=100;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=57;FSRR=43;FWDB=0.00470882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.948;QD=18.081;RBI=0.0190562;REFB=-0.00624342;REVB=-0.0184653;RO=100;SAF=42;SAR=45;SRF=57;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841532;STB=0.546548;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00644884;OID=.;OPOS=186643541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:100:100:87:87:0.465241:45:42:57:43:45:42:57:43 chr1 186648197 . C G 346.65 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.000894358;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7946;QD=19.5298;RBI=0.0734169;REFB=-0.0074143;REVB=0.0734115;RO=35;SAF=13;SAR=23;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23797;STB=0.632291;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00589937;OID=.;OPOS=186648197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:35:35:36:36:0.507042:23:13:22:13:23:13:22:13 chr1 186839879 . AAG A 360.65 PASS AF=0.4;AO=61;DP=165;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=52;FSRR=41;FWDB=-0.00603208;FXX=0.071852;HRUN=2;LEN=2;MLLD=247.59;QD=9.30708;RBI=0.0184759;REFB=-0.0209522;REVB=-0.0174635;RO=89;SAF=23;SAR=38;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196006;STB=0.603645;STBP=0.043;TYPE=del;VARB=0.0340994;OID=.;OPOS=186839880;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:61:165:62:155:93:24:38:52:41:99:89:23:38:50:39 chr1 186946912 . G A 1959.55 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7028;QD=61.7182;RBI=0.0732909;REFB=0;REVB=-0.0488263;RO=0;SAF=53;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85747e-05;OID=.;OPOS=186946912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:127:0:0:126:127:1:73:53:0:0:74:53:0:0 chr1 187610537 . AC AG,GG 836.72 PASS AF=0.533333,0.466667;AO=32,28;DP=60;FAO=32,28;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=17,19;FSAR=15,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00561335,0.00312291;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=287.243,262.065;QD=55.7815;RBI=0.00972996,0.00545546;REFB=0,0;REVB=0.00794748,0.00447319;RO=0;SAF=17,19;SAR=15,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.62669e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00350353,-0.00485995;OID=.,.;OPOS=187610538,187610537;OREF=C,AC;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:60:60:0:0:32,28:32,28:0.533333,0.466667:15,9:17,19:0:0:15,9:17,19:0:0 chr1 187610777 . C G 430.2 PASS AF=0.730769;AO=38;DP=52;FAO=38;FDP=52;FR=.;FRO=14;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0379651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.655;QD=33.0926;RBI=0.0496004;REFB=-0.0204065;REVB=0.0319194;RO=14;SAF=25;SAR=13;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121131;STB=0.565697;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00650584;OID=.;OPOS=187610777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:14:14:38:38:0.730769:13:25:6:8:13:25:6:8 chr1 187610852 . A C 556.53 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.538;QD=60.1655;RBI=0.0420551;REFB=0;REVB=0.0071455;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112728;OID=.;OPOS=187610852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr1 192780268 . T C 152.27 PASS AF=0.414634;AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00527135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.548;QD=14.8551;RBI=0.0502772;REFB=-0.0137573;REVB=0.0500001;RO=24;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131994;STB=0.552263;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.02087;OID=.;OPOS=192780268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:24:24:16:17:0.414634:6:10:12:12:7:10:12:12 chr1 192781172 . C G 1208.93 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.283;QD=61.2114;RBI=0.0182572;REFB=0;REVB=0.0127367;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72668e-05;OID=.;OPOS=192781172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0 chr1 192844886 . G A 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.913;QD=58.1421;RBI=0.0307441;REFB=0;REVB=0.0161258;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022043;OID=.;OPOS=192844886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0 chr1 193701055 . G C 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.367;QD=61.6947;RBI=0.0191232;REFB=0;REVB=-0.0109242;RO=0;SAF=35;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20793e-05;OID=.;OPOS=193701055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:47:35:0:0:47:35:0:0 chr1 193701480 . G A 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000234263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.438;QD=60.7158;RBI=0.00791927;REFB=0;REVB=0.00791581;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75445e-05;OID=.;OPOS=193701480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0 chr1 193701489 . C T 1181.96 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00832201;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2239;QD=59.8463;RBI=0.0197842;REFB=-0.0490765;REVB=0.0179487;RO=1;SAF=34;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137178;STB=0.507245;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-2.42969e-05;OID=.;OPOS=193701489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:44:34:1:0:44:34:1:0 chr1 194457292 . T C 1510.84 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00148373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.742;QD=63.6144;RBI=0.0222663;REFB=0;REVB=0.0222168;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29823e-05;OID=.;OPOS=194457292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:45:50:0:0:45:50:0:0 chr1 196227526 . A G 1749.43 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00567074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.697;QD=60.8497;RBI=0.0136787;REFB=0;REVB=-0.0124478;RO=0;SAF=56;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.03065e-06;OID=.;OPOS=196227526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:59:56:0:0:59:56:0:0 chr1 196654324 . A C 549.28 PASS AF=0.467742;AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0310944;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3942;QD=17.7186;RBI=0.046864;REFB=-0.00593554;REVB=-0.0350624;RO=66;SAF=30;SAR=28;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0889491;STB=0.549373;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00594386;OID=.;OPOS=196654324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:66:66:58:58:0.467742:28:30:28:38:28:30:28:38 chr1 196659237 . C T 773.86 PASS AF=0.622807;AO=71;DP=114;FAO=71;FDP=114;FR=.;FRO=43;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.00969017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.181;QD=27.1529;RBI=0.0183386;REFB=-0.0125932;REVB=0.0155694;RO=43;SAF=37;SAR=34;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135591;STB=0.573411;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00495138;OID=.;OPOS=196659237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:43:43:71:71:0.622807:34:37:14:29:34:37:14:29 chr1 196695661 . G T 264.82 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0129025;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.387;QD=12.9178;RBI=0.0134926;REFB=-0.0046685;REVB=-0.00394677;RO=50;SAF=20;SAR=11;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968015;STB=0.550426;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00825137;OID=.;OPOS=196695661;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:51:31:31:0.378049:11:20:28:22:11:20:29:22 chr1 196706049 . G A 517.47 PASS AF=0.394737;AO=60;DP=152;FAO=60;FDP=152;FR=.;FRO=92;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=66;FWDB=-0.0204575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6269;QD=13.6176;RBI=0.0445063;REFB=0.00925312;REVB=-0.039526;RO=90;SAF=21;SAR=39;SRF=26;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735163;STB=0.546048;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.0144328;OID=.;OPOS=196706049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:90:92:60:60:0.394737:39:21:26:64:39:21:26:66 chr1 196706645 . A G 295.02 PASS AF=0.534483;AO=29;DP=57;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.032429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8083;QD=20.3459;RBI=0.0329467;REFB=-0.0169566;REVB=-0.00581774;RO=27;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585542;STB=0.526299;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0117973;OID=.;OPOS=196706645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:27:27:29:31:0.534483:10:19:16:11:11:20:16:11 chr1 196712586 . C T 106.5 PASS AF=0.125;AO=25;DP=207;FAO=25;FDP=200;FR=.;FRO=175;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=67;FSRR=108;FWDB=0.0278142;FXX=0.0338148;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1286;QD=2.13008;RBI=0.028164;REFB=0.00173194;REVB=-0.0044249;RO=180;SAF=14;SAR=11;SRF=66;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240397;STB=0.651431;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.0108507;OID=.;OPOS=196712586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:200:180:175:25:25:0.125:11:14:66:114:11:14:67:108 chr1 196749097 . C T 784.36 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.792;QD=57.0444;RBI=0.0269633;REFB=0;REVB=0.00701168;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137809;OID=.;OPOS=196749097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0 chr1 196757392 . C T 544.74 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00295921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.307;QD=57.3412;RBI=0.0227985;REFB=-0.0727331;REVB=-0.0226056;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000271259;OID=.;OPOS=196757392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:37:38:0:1:37:37:0.973684:19:18:0:0:19:18:1:0 chr1 196757912 . T C 754.18 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00805129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.96;QD=56.9191;RBI=0.0348759;REFB=0;REVB=0.0339338;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249552;OID=.;OPOS=196757912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:35:17:0:0:36:17:0:0 chr1 196799746 . C G 688.62 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6604;QD=62.6019;RBI=0.0335191;REFB=0;REVB=0.0211276;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00053935;OID=.;OPOS=196799746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr1 196801042 . G T 1525.75 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00236459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=321.595;QD=59.8332;RBI=0.0141377;REFB=0;REVB=0.0139386;RO=0;SAF=53;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.68392e-06;OID=.;OPOS=196801042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:49:53:0:0:49:53:0:0 chr1 196874356 . G T 3944.53 PASS AF=1;AO=245;DP=247;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00711768;FXX=0.0040321;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.675;QD=63.879;RBI=0.0301794;REFB=0;REVB=0.029328;RO=0;SAF=129;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.66907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.62742e-05;OID=.;OPOS=196874356;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:247:247:0:0:245:247:1:116:129:0:0:118:129:0:0 chr1 196920060 . AAATT A 495.61 PASS AF=0.522727;AO=69;DP=132;FAO=69;FDP=132;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.00528106;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=287.556;QD=15.0186;RBI=0.00649018;REFB=-0.0131291;REVB=0.00377264;RO=59;SAF=40;SAR=29;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464438;STB=0.534749;STBP=0.413;TYPE=del;VARB=0.0134222;OID=.;OPOS=196920061;OREF=AATT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.522727:69:132:69:132:63:40:29:32:31:99:59:40:29:31:28 chr1 196963213 . G A 323.73 PASS AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0570871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8611;QD=28.7759;RBI=0.0591635;REFB=0.0107568;REVB=-0.0155365;RO=17;SAF=10;SAR=18;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823999;STB=0.545421;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=-0.00908584;OID=.;OPOS=196963213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:18:10:8:9:18:10:8:9 chr1 197019858 . A C 596.64 PASS AF=0.574468;AO=54;DP=94;FAO=54;FDP=94;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0144554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.191;QD=25.3889;RBI=0.0163594;REFB=-0.0192261;REVB=0.00765973;RO=40;SAF=28;SAR=26;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338504;STB=0.518512;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.011934;OID=.;OPOS=197019858;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:40:40:54:54:0.574468:26:28:19:21:26:28:19:21 chr1 197026169 . T C 528.74 PASS AF=0.44186;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.00316105;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.266;QD=16.3949;RBI=0.0166297;REFB=-0.00913941;REVB=-0.0163265;RO=72;SAF=22;SAR=35;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606159;STB=0.533886;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0123484;OID=.;OPOS=197026169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:72:72:57:57:0.44186:35:22:32:40:35:22:32:40 chr1 197026225 . T G 756.26 PASS AF=0.545455;AO=72;DP=132;FAO=72;FDP=132;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.0184844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.774;QD=22.9171;RBI=0.0227471;REFB=-0.0154665;REVB=0.0132574;RO=59;SAF=30;SAR=42;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905293;STB=0.553556;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00890944;OID=.;OPOS=197026225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:59:60:72:72:0.545455:42:30:31:28:42:30:32:28 chr1 197030201 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.922;QD=58.142;RBI=0.0181104;REFB=0;REVB=0.0148922;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67745e-05;OID=.;OPOS=197030201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0 chr1 197031021 . C T 648.85 PASS AF=0.471429;AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0078102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.158;QD=18.5386;RBI=0.0103191;REFB=0.000721735;REVB=0.00674423;RO=74;SAF=32;SAR=34;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144518;STB=0.50801;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=-0.000794747;OID=.;OPOS=197031021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:74:74:66:66:0.471429:34:32:37:37:34:32:37:37 chr1 197070215 . A G 1094.05 PASS AF=0.519048;AO=109;DP=210;FAO=109;FDP=210;FR=.;FRO=101;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=0.0665223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6921;QD=20.8391;RBI=0.0781329;REFB=-0.00890419;REVB=0.0409821;RO=101;SAF=51;SAR=58;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127712;STB=0.569851;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0088698;OID=.;OPOS=197070215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:101:101:109:109:0.519048:58:51:62:39:58:51:62:39 chr1 197070442 . G T 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0117542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.821;QD=23.8996;RBI=0.0160526;REFB=0.00767765;REVB=-0.0109328;RO=23;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957823;STB=0.553344;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=-0.00993818;OID=.;OPOS=197070442;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:11:16:11:12:11:16:11:12 chr1 197070594 . A G 366.16 PASS AF=0.481013;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0122834;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.071;QD=18.5395;RBI=0.0127939;REFB=-0.0126528;REVB=0.00357819;RO=40;SAF=17;SAR=21;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117174;STB=0.571296;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0144288;OID=.;OPOS=197070594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:40:41:38:38:0.481013:21:17:23:17:21:17:24:17 chr1 197070697 . T C 334.49 PASS AF=0.617021;AO=28;DP=48;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0901104;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9359;QD=28.4673;RBI=0.0933806;REFB=-0.0433049;REVB=0.0244958;RO=20;SAF=15;SAR=13;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269778;STB=0.541148;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.031436;OID=.;OPOS=197070697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:20:18:28:29:0.617021:13:15:10:10:13:16:8:10 chr1 197070707 . G A 312.09 PASS AF=0.642857;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0024821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.852;QD=29.7224;RBI=0.00874418;REFB=-0.0235363;REVB=0.0083845;RO=15;SAF=14;SAR=13;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336686;STB=0.518505;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0175591;OID=.;OPOS=197070707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:15:15:27:27:0.642857:13:14:7:8:13:14:7:8 chr1 197070815 . T C 586.76 PASS AF=0.97619;AO=39;DP=41;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0252597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.224;QD=55.8817;RBI=0.0949651;REFB=-0.14793;REVB=0.0915441;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253303;STB=0.512814;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00246871;OID=.;OPOS=197070815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:42:1:1:39:41:0.97619:21:18:1:0:22:19:1:0 chr1 197070901 . A G 851.19 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2259;QD=57.7077;RBI=0.032574;REFB=0;REVB=0.0234894;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356791;OID=.;OPOS=197070901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0 chr1 197072420 . T C 352.46 PASS AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.000190604;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.442;QD=18.3095;RBI=0.00881939;REFB=-0.0147227;REVB=0.00881733;RO=37;SAF=23;SAR=14;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124537;STB=0.590535;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0126994;OID=.;OPOS=197072420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:40:37:37:0.480519:14:23:18:19:14:23:18:22 chr1 197072560 . A G 766.71 PASS AF=0.606838;AO=71;DP=117;FAO=71;FDP=117;FR=.;FRO=46;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0222313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.609;QD=26.2122;RBI=0.0223127;REFB=-0.011738;REVB=0.00190403;RO=46;SAF=39;SAR=32;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358859;STB=0.519491;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00827762;OID=.;OPOS=197072560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:46:46:71:71:0.606838:32:39:23:23:32:39:23:23 chr1 197072802 . G A 278.89 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00228091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.859;QD=16.4055;RBI=0.0158538;REFB=-2.40389e-05;REVB=-0.0156889;RO=36;SAF=16;SAR=15;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645122;STB=0.54283;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-3.59784e-05;OID=.;OPOS=197072802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:37:31:31:0.455882:15:16:21:15:15:16:22:15 chr1 197073196 . G A 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0519491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9297;QD=21.0154;RBI=0.0519535;REFB=-0.0110351;REVB=-0.000680306;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234285;STB=0.645397;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00383776;OID=.;OPOS=197073196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:7:9:3:9:7:9:3:10 chr1 197073932 . T C 263.96 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.0027103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.5628;QD=15.3023;RBI=0.00693405;REFB=0.00205909;REVB=-0.00638243;RO=39;SAF=10;SAR=20;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328912;STB=0.685592;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00185696;OID=.;OPOS=197073932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:20:10:26:13:20:10:26:13 chr1 197091537 . A T 804.39 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.828;QD=64.351;RBI=0.0666215;REFB=0;REVB=-0.00260682;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245888;OID=.;OPOS=197091537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0 chr1 197112375 . G T 280.93 PASS AF=0.469697;AO=30;DP=65;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00716926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.481;QD=17.0259;RBI=0.017512;REFB=-0.00378027;REVB=0.0159772;RO=34;SAF=9;SAR=21;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118576;STB=0.582726;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00417662;OID=.;OPOS=197112375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:34:35:30:31:0.469697:21:9:14:20:22:9:15:20 chr1 197112477 . C T 273.94 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00259623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.91;QD=14.0484;RBI=0.0820022;REFB=-0.00363233;REVB=-0.0819611;RO=46;SAF=16;SAR=16;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00613787;OID=.;OPOS=197112477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:16:16:23:23:16:16:23:23 chr1 197112533 . G A 257.88 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0078353;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.491;QD=16.1175;RBI=0.0142394;REFB=-0.015059;REVB=-0.0118899;RO=35;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286888;STB=0.501617;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0214977;OID=.;OPOS=197112533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:35:35:29:29:0.453125:15:14:17:18:15:14:17:18 chr1 197112538 . T G 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0156848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.131;QD=16.923;RBI=0.0183085;REFB=-5.62141e-05;REVB=0.00944396;RO=33;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042443;STB=0.531229;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.000161955;OID=.;OPOS=197112538;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:34:30:30:0.46875:15:15:15:18:15:15:15:19 chr1 197124448 . A C 68.2 PASS AF=0.375;AO=11;DP=26;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00764065;FXX=0.0768935;HRUN=11;LEN=1;MLLD=247.089;QD=11.3672;RBI=0.0077463;REFB=-0.00214228;REVB=-0.00127499;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17847;STB=0.571275;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0026387;OID=.;OPOS=197124448;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:26:24:14:15:11:9:0.375:5:6:5:9:5:4:5:10 chr1 197127041 . CA C 236.41 PASS AF=1;AO=29;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0492726;FXX=0.0789266;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.4529;QD=27.0185;RBI=0.188556;REFB=-0.018401;REVB=0.182004;RO=4;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929272;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00884776;OID=.;OPOS=197127042;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:29:38:35:35:0:12:23:0:0:4:4:11:18:0:4 chr1 197168625 . C A 360.51 PASS AF=0.506849;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.000989707;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.396;QD=19.7538;RBI=0.00605433;REFB=-0.0093634;REVB=0.00597289;RO=36;SAF=17;SAR=20;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165487;STB=0.591481;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0115283;OID=.;OPOS=197168625;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:36:36:37:37:0.506849:20:17:10:26:20:17:10:26 chr1 197383079 . A G 876.91 PASS AF=0.502857;AO=88;DP=175;FAO=88;FDP=175;FR=.;FRO=87;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.0334593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7835;QD=20.0436;RBI=0.0420533;REFB=-0.00193396;REVB=-0.0254746;RO=87;SAF=44;SAR=44;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259833;STB=0.514282;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00127779;OID=.;OPOS=197383079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:87:87:88:88:0.502857:44:44:46:41:44:44:46:41 chr1 197390368 . A G 1472.5 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.727;QD=63.3334;RBI=0.037429;REFB=0;REVB=-0.02792;RO=0;SAF=59;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.55999e-06;OID=.;OPOS=197390368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:33:59:0:0:34:59:0:0 chr1 197396761 . G A 201.98 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00756009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8035;QD=12.0585;RBI=0.00762013;REFB=0.00140027;REVB=-0.000954622;RO=41;SAF=11;SAR=14;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181533;STB=0.596374;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.00297004;OID=.;OPOS=197396761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:41:42:25:25:0.373134:14:11:25:16:14:11:25:17 chr1 197643277 . T A 499.39 PASS AF=0.490909;AO=52;DP=108;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0460815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.578;QD=18.1597;RBI=0.0461571;REFB=0.00277488;REVB=0.00264163;RO=55;SAF=26;SAR=26;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02528;STB=0.500337;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.00413775;OID=.;OPOS=197643277;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:110:55:56:52:54:0.490909:26:26:26:29:28:26:27:29 chr1 197684139 . T A 42.56 PASS AF=0.875;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.135456;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=15.8352;QD=21.2791;RBI=0.238006;REFB=-0.139904;REVB=0.1957;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538356;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0802916;OID=.;OPOS=197684139;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:7:8:1:1:6:7:0.875:0:6:1:0:1:6:1:0 chr1 197742171 . C T 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.566;QD=57.6804;RBI=0.0173138;REFB=0;REVB=-0.00961839;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131914;OID=.;OPOS=197742171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0 chr1 197896728 . T C 322.38 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00234487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.237;QD=16.5322;RBI=0.0794117;REFB=-0.00451745;REVB=0.0793771;RO=43;SAF=23;SAR=12;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126695;STB=0.571387;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00534668;OID=.;OPOS=197896728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:12:23:23:20:12:23:23:20 chr1 198201732 . A C 212.4 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00497068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.518;QD=14.3999;RBI=0.0095847;REFB=-0.00787869;REVB=-0.00819505;RO=34;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00776967;STB=0.504421;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00873127;OID=.;OPOS=198201732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:16:9:12:22:16:9:12:22 chr1 199977636 . C A 1092.71 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.026;QD=59.8745;RBI=0.0448482;REFB=0;REVB=0.0283239;RO=0;SAF=49;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73791e-05;OID=.;OPOS=199977636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:22:49:0:0:23:50:0:0 chr1 199977724 . G T 817.51 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0660266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9068;QD=57.3693;RBI=0.0660419;REFB=0;REVB=0.00142361;RO=0;SAF=39;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000619446;OID=.;OPOS=199977724;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:57:0:0:55:57:1:16:39:0:0:18:39:0:0 chr1 200143281 . C T 231.65 PASS AF=0.421875;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00298789;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.043;QD=14.4779;RBI=0.00567621;REFB=0.00379929;REVB=0.00482617;RO=37;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184869;STB=0.604244;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=-0.00354683;OID=.;OPOS=200143281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:37:37:27:27:0.421875:15:12:10:27:15:12:10:27 chr1 200146493 . GAAT GAA,GAT,GATT 52.24 PASS AF=0,0.444444,0;AO=6,11,2;DP=36;FAO=0,16,0;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=0,13,0;FSAR=0,3,0;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.137065,-0.152641,-0.00775674;FXX=0;HRUN=10,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=6.50578,11.7392,12.6841;QD=5.80397;RBI=0.24632,0.164986,0.150128;REFB=-0.0506246,-0.0598455,-0.0132153;REVB=0.204663,-0.0626188,-0.149928;RO=11;SAF=3,11,0;SAR=3,0,2;SRF=2;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.340216,0.840717,-0.473103;STB=0.5,0.812109,0.5;STBP=1,0.003,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.111302,0.039227,-0.0251667;OID=.,.,.;OPOS=200146496,200146494,200146495;OREF=T,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=GAA,GAT,GATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.444444,0:6,11,2:36:0,16,0:36:20:0,13,0:0,3,0:5:15:47:11:3,11,0:3,0,2:2:9 chr1 200182834 . A G 454.86 PASS AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=0.000310617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.116;QD=15.2894;RBI=0.00843295;REFB=-0.0150069;REVB=0.00842723;RO=67;SAF=25;SAR=26;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930134;STB=0.54753;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0132525;OID=.;OPOS=200182834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:67:68:51:51:0.428571:26:25:39:28:26:25:39:29 chr1 200183398 . C A 400.53 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.000925269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.576;QD=21.3616;RBI=0.0159037;REFB=-0.00440485;REVB=-0.0158768;RO=35;SAF=16;SAR=24;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768391;STB=0.542352;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00348758;OID=.;OPOS=200183398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:24:16:11:24:24:16:11:24 chr1 200311868 . C G 244.35 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0045348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.284;QD=17.4535;RBI=0.014514;REFB=-0.0134414;REVB=-0.0137874;RO=29;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673308;STB=0.53782;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0164368;OID=.;OPOS=200311868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:12:15:14:15:12:15:14:15 chr1 200375822 . GTTTTTTTTTTTT GTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTG 109.42 PASS AF=0.666667,0.25;AO=6,5;DP=28;FAO=16,6;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13,2;FSAR=3,4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0301644,0.15134;FXX=0.142806;HRUN=12,12;LEN=1,1;MLLD=5.72626,12.7843;QD=18.2359;RBI=0.147523,0.196392;REFB=-0.181375,-0.164608;REVB=-0.144406,-0.125164;RO=5;SAF=4,2;SAR=2,3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.120202,-0.317065;STB=0.553121,0.545299;STBP=0.316,0.788;TYPE=del,snp;VARB=0.105106,0.0144037;OID=.,.;OPOS=200375823,200375834;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=GTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.666667,0.25:6,5:28:16,6:24:2:13,2:3,4:1:1:39:5:4,2:2,3:4:1 chr1 200534248 . C T 244.07 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00673632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.218;QD=18.7743;RBI=0.00759457;REFB=-0.0186697;REVB=-0.00350706;RO=26;SAF=16;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105531;STB=0.559224;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0179943;OID=.;OPOS=200534248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:10:16:13:13:10:16:13:13 chr1 200558363 . T C 597.91 PASS AF=0.533981;AO=55;DP=110;FAO=55;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00657974;FXX=0.0636306;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.925;QD=23.2197;RBI=0.0166958;REFB=-0.027621;REVB=-0.0153446;RO=37;SAF=26;SAR=29;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109479;STB=0.532397;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0171249;OID=.;OPOS=200558363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:103:37:42:55:55:0.533981:29:26:23:14:29:26:23:19 chr1 200618238 . T C 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.381;QD=57.0007;RBI=0.0470177;REFB=0;REVB=0.0198007;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100764;OID=.;OPOS=200618238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0 chr1 200635550 . T C 868.21 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00928083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.067;QD=57.8805;RBI=0.0670747;REFB=0;REVB=0.0664296;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03261e-05;OID=.;OPOS=200635550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0 chr1 200635560 . T C 904.42 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.496;QD=56.5261;RBI=0.01086;REFB=-0.124859;REVB=0.00715479;RO=1;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185094;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000730516;OID=.;OPOS=200635560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:63:64:1:0:62:64:1:25:37:0:1:26:38:0:0 chr1 200776641 . C T 397.53 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0037969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.818;QD=20.6507;RBI=0.00628782;REFB=-0.0223222;REVB=-0.00501201;RO=35;SAF=16;SAR=24;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122145;STB=0.581111;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0202348;OID=.;OPOS=200776641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:35:37:40:40:0.519481:24:16:19:16:24:16:21:16 chr1 200867492 . C G 393.47 PASS AF=0.482353;AO=35;DP=84;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00241533;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.2945;QD=18.516;RBI=0.0247343;REFB=-0.0510825;REVB=0.0246161;RO=29;SAF=8;SAR=27;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219538;STB=0.593303;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.053275;OID=.;OPOS=200867492;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:29:44:35:41:0.482353:27:8:13:16:29:12:20:24 chr1 200880978 . C T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0989849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.792;QD=40.7629;RBI=0.101574;REFB=0;REVB=0.0227857;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00356191;OID=.;OPOS=200880978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0 chr1 200940180 . G A 1254.24 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00683545;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.974;QD=61.1825;RBI=0.0102913;REFB=0;REVB=0.0076933;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855547;OID=.;OPOS=200940180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:36:45:0:0:37:45:0:0 chr1 201047075 . A G 276.2 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0148502;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.574;QD=24.0176;RBI=0.0237951;REFB=-0.0021391;REVB=0.0185924;RO=20;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240149;STB=0.523541;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00290858;OID=.;OPOS=201047075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:20:21:25:25:0.543478:12:13:11:9:12:13:12:9 chr1 201047135 . G A 278.9 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00625328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.588;QD=16.406;RBI=0.0271005;REFB=-0.0228979;REVB=-0.0263692;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136439;STB=0.574622;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.037463;OID=.;OPOS=201047135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:37:31:31:0.455882:16:15:22:13:16:15:23:14 chr1 201060865 . G A 134.97 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0132077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8188;QD=11.2477;RBI=0.0202651;REFB=-0.0127967;REVB=-0.0153698;RO=32;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186267;STB=0.610967;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0368223;OID=.;OPOS=201060865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:5:11:17:15:5:11:17:15 chr1 201112981 . A G 616.67 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172396;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9839;QD=61.6671;RBI=0.0568569;REFB=0;REVB=0.0541803;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109566;OID=.;OPOS=201112981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr1 201115822 . A G 484.37 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0412006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1415;QD=21.0595;RBI=0.0768692;REFB=-9.36051e-05;REVB=-0.0648951;RO=45;SAF=30;SAR=17;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00589757;STB=0.50326;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.00131443;OID=.;OPOS=201115822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:47:47:0.51087:17:30:29:16:17:30:29:16 chr1 201122947 . T G 888.45 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0264774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9212;QD=56.4096;RBI=0.0408065;REFB=-0.114362;REVB=-0.0310502;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00188098;OID=.;OPOS=201122947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:30:32:0:0:30:32:1:0 chr1 201166383 . G A 1026.37 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1738;QD=59.4998;RBI=0.0125306;REFB=0;REVB=-0.00792704;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170954;OID=.;OPOS=201166383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:26:43:0:0:26:43:0:0 chr1 201166435 . T C 787.71 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286601;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.34;QD=57.2878;RBI=0.0293747;REFB=0;REVB=-0.00643945;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200801;OID=.;OPOS=201166435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0 chr1 201168499 . G A 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0196362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.338;QD=16.8737;RBI=0.0230774;REFB=-0.0114772;REVB=-0.0121238;RO=24;SAF=4;SAR=16;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301528;STB=0.700809;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0167763;OID=.;OPOS=201168499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:26:20:20:0.434783:16:4:11:13:16:4:13:13 chr1 201168803 . G T 242.92 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0437213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1919;QD=22.5975;RBI=0.0448732;REFB=-0.00775006;REVB=0.0101019;RO=20;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295472;STB=0.516515;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00557463;OID=.;OPOS=201168803;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:13:10:8:12:13:10:8:12 chr1 201175227 . C A 1659.38 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0598087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2741;QD=60.3412;RBI=0.0727974;REFB=0;REVB=0.0415016;RO=0;SAF=48;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52354e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109391;OID=.;OPOS=201175227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:62:48:0:0:62:48:0:0 chr1 201175274 . A G 636.33 PASS AF=0.429412;AO=59;DP=156;FAO=73;FDP=170;FR=.;FRO=97;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.00625552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.3;QD=14.9725;RBI=0.0138585;REFB=-0.0321968;REVB=0.0123664;RO=97;SAF=15;SAR=44;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257292;STB=0.582406;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0466623;OID=.;OPOS=201175274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:170:97:97:59:73:0.429412:44:15:45:52:49:24:45:52 chr1 201175715 . G T 1208.93 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.549;QD=61.2118;RBI=0.0444213;REFB=0;REVB=0.0417282;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.73973e-05;OID=.;OPOS=201175715;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:47:32:0:0:47:32:0:0 chr1 201176018 . A G 483.12 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.458;QD=58.5599;RBI=0.00543071;REFB=0;REVB=-0.00149481;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.55046e-05;OID=.;OPOS=201176018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0 chr1 201178758 . G C 44.23 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0128322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.5;QD=6.80491;RBI=0.0237812;REFB=-0.0163484;REVB=0.020022;RO=18;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413192;STB=0.7597;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0813695;OID=.;OPOS=201178758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:18:19:7:7:0.269231:1:6:10:8:1:6:11:8 chr1 201181223 . A G 698.99 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0445241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.235;QD=54.8225;RBI=0.044528;REFB=-0.0563359;REVB=0.000590342;RO=1;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254311;STB=0.513508;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00142716;OID=.;OPOS=201181223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:18:32:0:1:18:32:0:1 chr1 201181994 . A G 162.13 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=0.00584531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.309;QD=12.0094;RBI=0.0187704;REFB=-0.00766023;REVB=-0.0178371;RO=33;SAF=16;SAR=4;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312453;STB=0.523786;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0164027;OID=.;OPOS=201181994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:34:20:20:0.37037:4:16:27:6:4:16:28:6 chr1 201187764 . T C 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.136;QD=58.6005;RBI=0.0209859;REFB=0;REVB=0.007928;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57095e-05;OID=.;OPOS=201187764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr1 201195119 . C T 1607.54 PASS AF=0.990826;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.046305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.316;QD=58.9924;RBI=0.0650563;REFB=-0.0814832;REVB=0.0456964;RO=1;SAF=55;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00855182;STB=0.504424;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00105007;OID=.;OPOS=201195119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:1:1:107:108:0.990826:52:55:1:0:52:56:1:0 chr1 201197471 . T C 126.68 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.025481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.979;QD=11.2607;RBI=0.0259209;REFB=-0.0100956;REVB=-0.00475523;RO=30;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10198;STB=0.559925;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00918594;OID=.;OPOS=201197471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:11:4:6:24:11:4:6:24 chr1 201285759 . A G 1792.59 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0254996;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.735;QD=60.2551;RBI=0.0302415;REFB=0.00716309;REVB=0.0162579;RO=1;SAF=56;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840614;STB=0.504424;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=4.60005e-05;OID=.;OPOS=201285759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:119:1:1:118:118:0.991597:62:56:1:0:62:56:1:0 chr1 201286771 . C T 427.61 PASS AF=0.408333;AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.0231629;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.931;QD=14.2538;RBI=0.036054;REFB=-0.0159797;REVB=-0.0276293;RO=71;SAF=27;SAR=22;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14875;STB=0.58375;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0276028;OID=.;OPOS=201286771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:71:71:49:49:0.408333:22:27:29:42:22:27:29:42 chr1 201288955 . G A 324.74 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.051322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9286;QD=14.761;RBI=0.0707304;REFB=-0.0344847;REVB=0.0486707;RO=51;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160029;STB=0.595187;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0514527;OID=.;OPOS=201288955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:51:52:36:36:0.409091:17:19:19:32:17:19:19:33 chr1 201299263 . A G 1840.9 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.518;QD=61.3635;RBI=0.0111991;REFB=0;REVB=-0.000374058;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.23293e-05;OID=.;OPOS=201299263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:56:64:0:0:56:64:0:0 chr1 201331554 . T G 246.73 PASS AF=0.490909;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.023949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5825;QD=17.9441;RBI=0.0452359;REFB=-0.0123829;REVB=-0.0383762;RO=27;SAF=10;SAR=16;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904817;STB=0.549892;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0185797;OID=.;OPOS=201331554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:28:26:27:0.490909:16:10:13:14:17:10:13:15 chr1 201334382 . G A 181.24 PASS AF=0.311688;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0283248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5044;QD=9.41525;RBI=0.0437687;REFB=-0.00631544;REVB=-0.0333677;RO=53;SAF=7;SAR=17;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18159;STB=0.607772;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0142052;OID=.;OPOS=201334382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:53:53:24:24:0.311688:17:7:23:30:17:7:23:30 chr1 201341175 . CAGAAG C 252.1 PASS AF=0.402778;AO=27;DP=76;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.00760336;FXX=0.0526247;HRUN=1;LEN=5;MLLD=220.857;QD=14.0057;RBI=0.051239;REFB=-0.0228071;REVB=0.0506718;RO=39;SAF=18;SAR=9;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295078;STB=0.517807;STBP=0.828;TYPE=del;VARB=0.0341748;OID=.;OPOS=201341176;OREF=AGAAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.402778:27:76:29:72:43:19:10:27:16:99:39:18:9:25:14 chr1 201351421 . T A 207.88 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0398124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.6;QD=13.4118;RBI=0.0501485;REFB=-0.0114547;REVB=0.0304933;RO=37;SAF=15;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635555;STB=0.536394;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0129952;OID=.;OPOS=201351421;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:10:15:20:17:10:15:20:17 chr1 201383643 . A C 456.72 PASS AF=0.916667;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0137172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.635;QD=50.7469;RBI=0.0562647;REFB=-0.0329861;REVB=0.054567;RO=3;SAF=24;SAR=9;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117878;STB=0.506325;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00846943;OID=.;OPOS=201383643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:36:36:3:3:33:33:0.916667:9:24:2:1:9:24:2:1 chr1 201598659 . C CG 63.97 PASS AF=0.214286;AO=17;DP=84;FAO=18;FDP=84;FR=.;FRO=66;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.00318069;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=20.4551;QD=3.04627;RBI=0.0271883;REFB=-0.0290587;REVB=0.0270016;RO=66;SAF=1;SAR=16;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.705972;STB=0.946405;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.0737945;OID=.;OPOS=201598660;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.214286:17:84:18:84:66:1:17:42:24:63:66:1:16:42:24 chr1 201755636 . C A 186.0 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.01154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5149;QD=10.4789;RBI=0.0154187;REFB=-0.012415;REVB=-0.0102257;RO=46;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216718;STB=0.63111;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0395404;OID=.;OPOS=201755636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:46:47:24:24:0.338028:11:13:16:30:11:13:16:31 chr1 201860626 . A G 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0486083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.967;QD=11.1978;RBI=0.0487052;REFB=-0.0158769;REVB=0.00307041;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234139;STB=0.642587;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0191983;OID=.;OPOS=201860626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:10:2:7:15:10:2:7:15 chr1 201865763 . A G 142.04 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.121814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0954;QD=16.7101;RBI=0.123352;REFB=0.00233491;REVB=-0.0194132;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218222;STB=0.624844;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.000790833;OID=.;OPOS=201865763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:6:10:7:11:6:10:7:11 chr1 201869257 . G A 162.2 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0229349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.074;QD=12.0147;RBI=0.0307758;REFB=-0.00362358;REVB=0.0205217;RO=34;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160039;STB=0.592503;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0060719;OID=.;OPOS=201869257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:10:10:22:12:10:10:22:12 chr1 201938995 . C T 972.32 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.925;QD=58.9284;RBI=0.0491541;REFB=0;REVB=0.0126943;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143851;OID=.;OPOS=201938995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:66:0:0:63:66:1:36:27:0:0:36:30:0:0 chr1 201952574 . T C 820.18 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00062804;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=317.093;QD=55.6056;RBI=0.00414789;REFB=0.00130573;REVB=-0.00410007;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-3.77592e-06;OID=.;OPOS=201952574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:28:30:0:1:28:30:0:1 chr1 201952598 . G A 334.42 PASS AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00684059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.88;QD=19.3866;RBI=0.00694732;REFB=0.00488732;REVB=0.00121311;RO=34;SAF=20;SAR=15;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113751;STB=0.506325;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=-0.00323272;OID=.;OPOS=201952598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:34:35:35:0.507246:15:20:19:15:15:20:19:15 chr1 201969082 . G A 389.1 PASS AF=0.481928;AO=39;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0376439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.283;QD=18.7517;RBI=0.0376588;REFB=-0.00669329;REVB=-0.00105931;RO=43;SAF=12;SAR=27;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687341;STB=0.527259;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00643231;OID=.;OPOS=201969082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:39:40:0.481928:27:12:16:27:27:13:16:27 chr1 201970562 . T C 1877.88 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00050361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.756;QD=61.5697;RBI=0.00965575;REFB=0;REVB=-0.00964261;RO=0;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19367e-05;OID=.;OPOS=201970562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:69:53:0:0:69:53:0:0 chr1 201973565 . G A 471.85 PASS AF=0.511111;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00390117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.204;QD=20.9711;RBI=0.0040906;REFB=-0.0209466;REVB=0.00123042;RO=44;SAF=28;SAR=18;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164254;STB=0.509087;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0177556;OID=.;OPOS=201973565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:44:46:46:0.511111:18:28:26:18:18:28:26:18 chr1 201981862 . T C 482.64 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.999;QD=58.5019;RBI=0.00926808;REFB=0;REVB=0.00892913;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47329e-05;OID=.;OPOS=201981862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:23:9:0:0:23:10:0:0 chr1 202092360 . G A 74.12 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.031881;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3912;QD=19.7643;RBI=0.0345994;REFB=0.0151213;REVB=0.0134431;RO=6;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409156;STB=0.743518;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0329857;OID=.;OPOS=202092360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:15:15:6:6:9:9:0.6:8:1:3:3:8:1:3:3 chr1 202092415 . A G 191.58 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.54;QD=47.8947;RBI=0.0388421;REFB=0;REVB=0.0387899;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161138;OID=.;OPOS=202092415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:9:7:0:0 chr1 202092580 . T C 195.54 PASS AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0345272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.161;QD=12.6153;RBI=0.0346665;REFB=-0.0128724;REVB=0.00310502;RO=38;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016436;STB=0.509452;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0243191;OID=.;OPOS=202092580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:13:11:18:20:13:11:18:20 chr1 202129826 . T C 633.59 PASS AF=0.450331;AO=68;DP=151;FAO=68;FDP=151;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.00691687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.235;QD=16.7838;RBI=0.0228318;REFB=-0.0287298;REVB=-0.0217588;RO=82;SAF=37;SAR=31;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793286;STB=0.547387;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0346666;OID=.;OPOS=202129826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:82:83:68:68:0.450331:31:37:38:44:31:37:38:45 chr1 202155543 . A C 1956.4 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0839543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.332;QD=61.6188;RBI=0.0988249;REFB=0;REVB=0.0521346;RO=0;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131623;OID=.;OPOS=202155543;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:117:127:0:0:117:127:1:59:58:0:0:62:65:0:0 chr1 202156628 . A C 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.566;QD=57.0007;RBI=0.0127941;REFB=0;REVB=0.00975336;RO=0;SAF=15;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65391e-05;OID=.;OPOS=202156628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:39:15:0:0:39:15:0:0 chr1 202200799 . G A 289.26 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0721089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.769;QD=52.593;RBI=0.0730296;REFB=0;REVB=0.0115601;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000268075;OID=.;OPOS=202200799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:17:5:0:0:17:5:0:0 chr1 202276494 . C T 1481.26 PASS AF=0.971429;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0421247;FXX=0.00943307;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.928;QD=56.4288;RBI=0.0617742;REFB=-0.128249;REVB=0.0451836;RO=2;SAF=53;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189694;STB=0.514849;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000468818;OID=.;OPOS=202276494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:105:105:2:3:102:102:0.971429:49:53:0:2:49:53:0:3 chr1 202287206 . T C 1000.62 PASS AF=1;AO=56;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145666;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.392;QD=58.8602;RBI=0.0279185;REFB=0;REVB=0.0238171;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7951e-05;OID=.;OPOS=202287206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:56:68:1:28:28:0:0:35:33:0:0 chr1 202287537 . G A 316.66 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.971;QD=52.7761;RBI=0.14214;REFB=0;REVB=0.141125;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00639766;OID=.;OPOS=202287537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:14:9:0:0:15:9:0:0 chr1 202287813 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.628;QD=33.4283;RBI=0.0567905;REFB=0;REVB=0.0485502;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537527;OID=.;OPOS=202287813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr1 202304868 . T C 457.87 PASS AF=0.614286;AO=41;DP=68;FAO=43;FDP=70;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00402145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.686;QD=26.1639;RBI=0.0329628;REFB=-0.0155156;REVB=0.0327165;RO=27;SAF=18;SAR=23;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031117;STB=0.506335;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00770178;OID=.;OPOS=202304868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:27:27:41:43:0.614286:23:18:13:14:23:20:13:14 chr1 202531741 . C T 640.46 PASS AF=0.477941;AO=62;DP=133;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=-0.0135688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.496;QD=18.8369;RBI=0.0179673;REFB=-0.0092133;REVB=0.0117775;RO=71;SAF=33;SAR=29;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118603;STB=0.551724;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00993296;OID=.;OPOS=202531741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:71:71:62:65:0.477941:29:33:29:42:32:33:29:42 chr1 202705455 . G C 455.53 PASS AF=0.428571;AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.0807045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.6858;QD=15.312;RBI=0.0856118;REFB=-0.0188801;REVB=0.0285683;RO=67;SAF=19;SAR=32;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167142;STB=0.505971;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0284867;OID=.;OPOS=202705455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:67:68:51:51:0.428571:32:19:26:41:32:19:26:42 chr1 202715284 . G A 281.26 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00209736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.04;QD=21.227;RBI=0.0142653;REFB=0.00282403;REVB=-0.0141103;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480101;STB=0.52664;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=-0.00263093;OID=.;OPOS=202715284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:14:15:11:13:14:15:11:13 chr1 202718202 . G A 267.02 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0460096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7404;QD=20.1524;RBI=0.0474317;REFB=-0.0183396;REVB=-0.0115276;RO=25;SAF=22;SAR=6;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305624;STB=0.671891;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0177729;OID=.;OPOS=202718202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:6:22:12:13:6:22:12:13 chr1 202733238 . C T 180.08 PASS AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0259482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.659;QD=11.0821;RBI=0.033837;REFB=-0.0097119;REVB=-0.0217172;RO=42;SAF=7;SAR=16;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203268;STB=0.618804;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0245705;OID=.;OPOS=202733238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:16:7:20:22:16:7:20:22 chr1 202795262 . G A 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0254301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.76;QD=18.251;RBI=0.109641;REFB=-0.0220799;REVB=0.106651;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393468;STB=0.721258;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0426705;OID=.;OPOS=202795262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:9:6:13:2:9:6:13:2 chr1 202861342 . A G 198.36 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0309915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.006;QD=13.224;RBI=0.0314226;REFB=-0.00156193;REVB=0.00518715;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581527;STB=0.533306;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00261935;OID=.;OPOS=202861342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:12:12:16:20:12:12:16:20 chr1 202884063 . C T 116.67 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.025142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.589;QD=11.6672;RBI=0.0297959;REFB=-0.00204552;REVB=-0.0159898;RO=23;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692392;STB=0.549925;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.00397173;OID=.;OPOS=202884063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:26:14:14:0.35:11:3:6:17:11:3:7:19 chr1 202888947 . T C 228.92 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=0.00810936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.129;QD=16.0645;RBI=0.0103485;REFB=-0.014804;REVB=0.00642882;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134896;STB=0.575609;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0192814;OID=.;OPOS=202888947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:9:17:24:7:9:17:24:7 chr1 203003870 . G A 244.15 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00739868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0349;QD=17.4396;RBI=0.0579275;REFB=-0.017493;REVB=0.0574531;RO=27;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345038;STB=0.503417;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0204275;OID=.;OPOS=203003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:29:27:27:0.482143:11:16:17:10:11:16:17:12 chr1 203008174 . G C 833.41 PASS AF=1;AO=48;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.31;QD=57.4766;RBI=0.0246474;REFB=0;REVB=0.0213367;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293458;OID=.;OPOS=203008174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:48:58:1:23:25:0:0:31:27:0:0 chr1 203008286 . C G 1152.65 PASS AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.119714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.6;QD=56.9208;RBI=0.122979;REFB=-0.0540077;REVB=0.0281498;RO=3;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333785;STB=0.517643;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00228937;OID=.;OPOS=203008286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:3:3:78:78:0.962963:41:37:0:3:41:37:0:3 chr1 203040816 . G C 342.91 PASS AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0031351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.379;QD=16.1372;RBI=0.00653646;REFB=-0.0213738;REVB=-0.00573555;RO=47;SAF=22;SAR=15;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147597;STB=0.588862;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0249248;OID=.;OPOS=203040816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:48:37:37:0.435294:15:22:21:26:15:22:21:27 chr1 203053768 . T C 1907.39 PASS AF=0.992;AO=123;DP=126;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00181822;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.946;QD=61.0365;RBI=0.0226428;REFB=-0.0985011;REVB=0.0225697;RO=0;SAF=80;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00118995;OID=.;OPOS=203053768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:126:125:0:1:123:124:0.992:43:80:0:0:44:80:0:1 chr1 203148633 . A G 340.6 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.65;QD=54.4961;RBI=0.0449911;REFB=0;REVB=0.0389307;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870808;OID=.;OPOS=203148633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0 chr1 203194186 . C T 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0207455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.079;QD=16.8738;RBI=0.03504;REFB=-0.0115146;REVB=0.0282387;RO=24;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280439;STB=0.661995;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0116994;OID=.;OPOS=203194186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:26:20:20:0.434783:6:14:10:14:6:14:11:15 chr1 203309966 . G C 1506.96 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0914911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6757;QD=59.6815;RBI=0.105303;REFB=0;REVB=-0.0521345;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221814;OID=.;OPOS=203309966;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:101:0:0:98:101:1:50:48:0:0:50:51:0:0 chr1 203317162 . C T 114.49 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=32;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0081241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.993;QD=13.0846;RBI=0.0222545;REFB=-0.0230211;REVB=-0.0207187;RO=20;SAF=11;SAR=1;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411187;STB=0.777283;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0359969;OID=.;OPOS=203317162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:35:20:20:12:15:0.428571:1:11:14:6:1:14:14:6 chr1 203472112 . T C 269.52 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00444385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=351.307;QD=18.9137;RBI=0.00933278;REFB=0.00288663;REVB=-0.00820688;RO=28;SAF=11;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109228;STB=0.561054;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00206516;OID=.;OPOS=203472112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:18:11:14:14:18:11:14:14 chr1 203652444 . A G 770.59 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0124572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.763;QD=55.0422;RBI=0.022469;REFB=0.0325815;REVB=-0.0186996;RO=1;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159783;STB=0.508471;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000101143;OID=.;OPOS=203652444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:29:26:0:1:29:26:0:1 chr1 203667409 . T C 1419.2 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0246452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7349;QD=61.7042;RBI=0.0264537;REFB=-0.019367;REVB=-0.00961327;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.505617;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000248908;OID=.;OPOS=203667409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:92:0:1:91:91:0.98913:47:44:0:0:47:44:1:0 chr1 203712996 . T C 338.74 PASS AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.0601929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8637;QD=15.2242;RBI=0.0606966;REFB=-0.00946994;REVB=0.00780334;RO=52;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457549;STB=0.525853;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.012946;OID=.;OPOS=203712996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:19:18:23:29:19:18:23:29 chr1 203713133 . G A 307.18 PASS AF=0.515625;AO=32;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00916591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.951;QD=19.1988;RBI=0.0183554;REFB=-0.00820243;REVB=-0.015903;RO=32;SAF=11;SAR=21;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146802;STB=0.593348;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00662821;OID=.;OPOS=203713133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:31:32:33:0.515625:21:11:16:16:22:11:16:15 chr1 203766964 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.43;QD=57.2026;RBI=0.0337435;REFB=0;REVB=0.0131565;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132416;OID=.;OPOS=203766964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr1 203769661 . A T 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.059863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.0332;QD=18.8862;RBI=0.0602325;REFB=0.0508129;REVB=-0.00666143;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258785;STB=0.651766;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.0374527;OID=.;OPOS=203769661;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:6:2:3:2:6:2:3:2 chr1 203787700 . T C 755.79 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309571;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.039;QD=57.0408;RBI=0.0323788;REFB=0;REVB=-0.00948901;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6876e-05;OID=.;OPOS=203787700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0 chr1 203818866 . A G 95.76 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0250948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.996;QD=11.9705;RBI=0.0395686;REFB=0.000373867;REVB=0.030593;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105621;STB=0.562397;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.000549301;OID=.;OPOS=203818866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:32:32:20:20:12:12:0.375:6:6:8:12:6:6:8:12 chr1 204110334 . A G 851.14 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5758;QD=57.7044;RBI=0.0890176;REFB=0;REVB=0.028011;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128874;OID=.;OPOS=204110334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0 chr1 204116628 . G C 168.9 PASS AF=0.392157;AO=18;DP=50;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0189568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.757;QD=13.2468;RBI=0.0293274;REFB=-0.0151541;REVB=-0.0223771;RO=31;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778116;STB=0.571357;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0187462;OID=.;OPOS=204116628;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:31:18:20:0.392157:8:10:15:16:8:12:15:16 chr1 204188349 . G A 354.3 PASS AF=0.62963;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00119464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.205;QD=26.2441;RBI=0.00691658;REFB=-0.0176121;REVB=0.00681263;RO=17;SAF=14;SAR=20;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179054;STB=0.570134;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00954308;OID=.;OPOS=204188349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:17:20:34:34:0.62963:20:14:12:5:20:14:12:8 chr1 204230581 . G A 601.43 PASS AF=0.540541;AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00283696;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.953;QD=21.673;RBI=0.0122618;REFB=-0.0218657;REVB=0.0119291;RO=51;SAF=29;SAR=31;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104041;STB=0.557034;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0162138;OID=.;OPOS=204230581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:60:60:0.540541:31:29:31:20:31:29:31:20 chr1 204237416 . C T 528.79 PASS AF=0.474576;AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00601421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.772;QD=17.9251;RBI=0.00792823;REFB=-0.0258819;REVB=-0.00516586;RO=60;SAF=27;SAR=29;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770547;STB=0.541627;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0247234;OID=.;OPOS=204237416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:60:62:56:56:0.474576:29:27:24:36:29:27:25:37 chr1 204242838 . A C 449.29 PASS AF=0.435897;AO=41;DP=110;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.00466421;FXX=0.0249979;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.801;QD=15.3604;RBI=0.0157409;REFB=-0.0145464;REVB=0.015034;RO=69;SAF=27;SAR=14;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157065;STB=0.527758;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0202001;OID=.;OPOS=204242838;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:117:69:66:41:51:0.435897:14:27:36:33:23:28:33:33 chr1 204379617 . T C 1577.79 PASS AF=1;AO=104;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.08;QD=59.5392;RBI=0.00661957;REFB=0;REVB=0.00643725;RO=0;SAF=47;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44686e-06;OID=.;OPOS=204379617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:104:106:1:57:47:0:0:57:49:0:0 chr1 204403659 . A G 223.1 PASS AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00852253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3714;QD=16.5262;RBI=0.0109175;REFB=0.000982683;REVB=0.00682344;RO=27;SAF=10;SAR=15;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768025;STB=0.526696;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.000673688;OID=.;OPOS=204403659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:29:25:25:0.462963:15:10:13:14:15:10:13:16 chr1 204418364 . G A 454.82 PASS AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0120906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.288;QD=19.9922;RBI=0.0160781;REFB=-0.0269167;REVB=0.0105982;RO=45;SAF=13;SAR=32;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256263;STB=0.64858;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0222635;OID=.;OPOS=204418364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:46:45:45:0.494505:32:13:25:20:32:13:26:20 chr1 204425028 . G A 465.34 PASS AF=0.594595;AO=42;DP=72;FAO=44;FDP=74;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00081953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.266;QD=25.1533;RBI=0.0570592;REFB=-0.0389935;REVB=0.0570534;RO=24;SAF=27;SAR=15;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173911;STB=0.519888;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0220596;OID=.;OPOS=204425028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:24:30:42:44:0.594595:15:27:16:8:17:27:17:13 chr1 204428997 . CG CC,TC 183.0 PASS AF=0.413043,0;AO=19,2;DP=46;FAO=19,0;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9,0;FSAR=10,0;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0097546,-0.000688384;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=136.478,118.42;QD=15.9131;RBI=0.0494441,0.0322502;REFB=-0.0177811,-0.0156621;REVB=-0.0484723,0.0322428;RO=23;SAF=9,0;SAR=10,2;SRF=13;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0876044,-0.522115;STB=0.526288,0.5;STBP=0.802,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0190513,0.0976545;OID=.,.;OPOS=204428998,204428997;OREF=G,CG;OALT=C,TC;OMAPALT=CC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:27:19,2:19,0:0.413043,0:10,2:9,0:13:10:10,0:9,0:14:13 chr1 204436066 . G A 266.21 PASS AF=0.484375;AO=28;DP=61;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=3;FWDB=0.0287453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3118;QD=16.6382;RBI=0.0503243;REFB=-0.0276367;REVB=0.0413067;RO=32;SAF=11;SAR=17;SRF=30;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48915;STB=0.751276;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0207091;OID=.;OPOS=204436066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:64:32:33:28:31:0.484375:17:11:30:2:19:12:30:3 chr1 204438334 . C T 72.88 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=5.86496e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.503;QD=19.4359;RBI=0.0157595;REFB=-0.0228506;REVB=0.0157594;RO=5;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289354;STB=0.636055;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00463147;OID=.;OPOS=204438334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:15:15:5:6:9:9:0.6:3:6:1:4:3:6:2:4 chr1 204438643 . G T 118.56 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0224813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.163;QD=13.1738;RBI=0.0233062;REFB=-0.0100603;REVB=0.00614557;RO=21;SAF=3;SAR=11;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159853;STB=0.584975;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.027623;OID=.;OPOS=204438643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:21:22:14:14:0.388889:11:3:7:14:11:3:7:15 chr1 204501383 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00198424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.699;QD=16.3859;RBI=0.00917382;REFB=-0.0103748;REVB=-0.00895666;RO=8;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315978;STB=0.518476;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00982213;OID=.;OPOS=204501383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:2:7:6:2:2:7:6:2 chr1 204531567 . C T 157.81 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00992725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.914;QD=16.6119;RBI=0.010343;REFB=-0.00286455;REVB=-0.002903;RO=21;SAF=11;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124079;STB=0.571343;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00397694;OID=.;OPOS=204531567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:6:11:11:10:6:11:11:10 chr1 204531623 . C T 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.018776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.903;QD=23.5284;RBI=0.0234266;REFB=0.000942573;REVB=0.0140096;RO=15;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114633;STB=0.564039;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=-0.000255052;OID=.;OPOS=204531623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:11:9:9:6:11:9:9:6 chr1 204587240 . G A 469.07 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00590659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.71;QD=20.3944;RBI=0.0202081;REFB=-0.0176562;REVB=0.0193256;RO=46;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392289;STB=0.52173;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0179594;OID=.;OPOS=204587240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:23:23:21:25:23:23:21:25 chr1 204590044 . G A 1520.24 PASS AF=1;AO=100;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.635;QD=59.0386;RBI=0.030431;REFB=0;REVB=0.027214;RO=1;SAF=54;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870439;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97593e-05;OID=.;OPOS=204590044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:103:1:0:100:103:1:46:54:1:0:47:56:0:0 chr1 204591237 . A G 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00494294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.71;QD=57.7124;RBI=0.0332248;REFB=0;REVB=0.032855;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73909e-05;OID=.;OPOS=204591237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0 chr1 204966690 . G A 1027.05 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.768;QD=59.5393;RBI=0.0289217;REFB=0;REVB=0.0272548;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141241;OID=.;OPOS=204966690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:40:28:0:0:41:28:0:0 chr1 204970302 . T C 1575.8 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.776;QD=63.6687;RBI=0.0483988;REFB=0;REVB=0.0167451;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13363e-05;OID=.;OPOS=204970302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:99:0:0:88:99:1:45:43:0:0:51:48:0:0 chr1 204978533 . A G 831.84 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.533;QD=57.3682;RBI=0.0163851;REFB=0;REVB=0.011197;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85569e-05;OID=.;OPOS=204978533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:37:19:0:0:37:21:0:0 chr1 204991328 . CCT CC,C 33.12 PASS AF=0.393939,0;AO=7,4;DP=37;FAO=13,0;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8,0;FSAR=5,0;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.212855,-0.243141;FXX=0;HRUN=7,4;LEN=1,2;MLLD=9.80449,20.2595;QD=4.01439;RBI=0.258534,0.248085;REFB=-0.0687255,0.0171371;REVB=0.14674,0.04928;RO=23;SAF=3,4;SAR=4,0;SRF=9;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.045161,0.67482;STB=0.629432,0.5;STBP=0.245,1;TYPE=del,del;VARB=0.0800653,0;OID=.,.;OPOS=204991330,204991329;OREF=T,CT;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.393939,0:7,4:37:13,0:33:20:8,0:5,0:8:12:33:23:3,4:4,0:9:14 chr1 205027390 . C T 601.08 PASS AF=0.638554;AO=53;DP=83;FAO=53;FDP=83;FR=.;FRO=30;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0117982;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.955;QD=28.9677;RBI=0.0282169;REFB=-0.0138413;REVB=0.025632;RO=30;SAF=28;SAR=25;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410367;STB=0.522285;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00561513;OID=.;OPOS=205027390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:30:30:53:53:0.638554:25:28:14:16:25:28:14:16 chr1 205027737 . G A 2278.05 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.568;QD=60.3457;RBI=0.0346807;REFB=0;REVB=0.023521;RO=0;SAF=67;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358715;OID=.;OPOS=205027737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:136:151:0:0:136:151:1:69:67:0:0:77:74:0:0 chr1 205031116 . C T 2588.63 PASS AF=0.988304;AO=169;DP=171;FAO=169;FDP=171;FR=.;FRO=2;FSAF=118;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0418351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3686;QD=60.5529;RBI=0.0555014;REFB=-0.0443626;REVB=0.0364723;RO=2;SAF=118;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00522348;STB=0.502744;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0027719;OID=.;OPOS=205031116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:171:171:2:2:169:169:0.988304:51:118:1:1:51:118:1:1 chr1 205041158 . C T 2841.48 PASS AF=1;AO=180;DP=180;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375641;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.267;QD=62.7952;RBI=0.0541392;REFB=0;REVB=0.038987;RO=0;SAF=95;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41762e-05;OID=.;OPOS=205041158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:180:181:0:0:180:181:1:85:95:0:0:85:96:0:0 chr1 205052939 . G A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000910627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.334;QD=62.3508;RBI=0.00468683;REFB=0;REVB=0.00459752;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61227e-06;OID=.;OPOS=205052939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0 chr1 205053070 . C T 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00494704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.335;QD=17.2469;RBI=0.00760416;REFB=-0.00638009;REVB=-0.00577495;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127841;STB=0.559944;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00908008;OID=.;OPOS=205053070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:27:21:21:0.4375:11:10:9:17:11:10:10:17 chr1 205053075 . C T 231.03 PASS AF=0.480769;AO=24;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0513694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2798;QD=17.7719;RBI=0.0552923;REFB=-0.00365398;REVB=-0.0204554;RO=27;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868684;STB=0.558236;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00481124;OID=.;OPOS=205053075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:27:27:24:25:0.480769:12:12:11:16:12:13:11:16 chr1 205053219 . C T 1049.25 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0249719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.161;QD=58.2918;RBI=0.0324064;REFB=-0.0878283;REVB=0.0206538;RO=1;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155009;STB=0.508194;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000571845;OID=.;OPOS=205053219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:30:41:0:1:30:41:0:1 chr1 205056844 . T A,TA,TTA 187.18 PASS AF=0,0,0.941176;AO=2,3,13;DP=19;FAO=0,0,16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0,8;FSAR=0,0,8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0313213,-0.0226313,-0.00713253;FXX=0.0555247;HRUN=5,1,5;LEN=1,1,2;MLLD=270.144,291.05,307.24;QD=44.0432;RBI=0.0343712,0.0259369,0.0129019;REFB=0.0493631,0.0263627,0.00701891;REVB=0.0141547,0.0126708,0.0107511;RO=1;SAF=1,3,5;SAR=1,0,8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.25849,0.727144,0.0533084;STB=0.5,0.5,0.529375;STBP=1,1,0.508;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0,0,-0.000288885;OID=.,.,.;OPOS=205056844,205056845,205056845;OREF=T,-,-;OALT=A,A,TA;OMAPALT=A,TA,TTA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:6:19:17:1:1:2,3,13:0,0,16:0,0,0.941176:1,0,8:1,3,5:0:1:0,0,8:0,0,8:0:1 chr1 205113595 . AG CA 194.89 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00941889;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=184.588;QD=17.3239;RBI=0.00990591;REFB=-0.0212295;REVB=0.00306783;RO=24;SAF=16;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173553;STB=0.592492;STBP=0.37;TYPE=mnp;VARB=0.0346163;OID=.;OPOS=205113595;OREF=AG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:4:16:16:8:4:16:17:8 chr1 205113702 . A C 388.31 PASS AF=0.637931;AO=37;DP=58;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0259414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.056;QD=26.7803;RBI=0.0259558;REFB=-0.00700213;REVB=0.000865398;RO=21;SAF=29;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313908;STB=0.672826;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00871214;OID=.;OPOS=205113702;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:21:21:37:37:0.637931:8:29:8:13:8:29:8:13 chr1 205130413 . A G 728.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.109;QD=57.1698;RBI=0.0174258;REFB=0;REVB=-0.00982929;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36969e-05;OID=.;OPOS=205130413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr1 205132866 . A G 587.66 PASS AF=0.689189;AO=50;DP=73;FAO=51;FDP=74;FR=.;FRO=23;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00792511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.837;QD=31.7652;RBI=0.00956878;REFB=-0.0360991;REVB=-0.00536229;RO=23;SAF=29;SAR=21;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700228;STB=0.540672;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.013357;OID=.;OPOS=205132866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:23:23:50:51:0.689189:21:29:16:7:22:29:16:7 chr1 205180544 . C A 224.44 PASS AF=0.461538;AO=25;DP=59;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.037426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2014;QD=13.8115;RBI=0.0442232;REFB=-0.0113272;REVB=-0.0235581;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031249;STB=0.52565;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0124006;OID=.;OPOS=205180544;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:65:34:35:25:30:0.461538:11:14:18:16:16:14:18:17 chr1 205225457 . G A 237.01 PASS AF=0.469388;AO=22;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00292424;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.324;QD=19.3475;RBI=0.00916001;REFB=-0.0349359;REVB=0.0086807;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124296;STB=0.555112;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0321431;OID=.;OPOS=205225457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:22:23:0.469388:9:13:12:14:10:13:12:14 chr1 205238275 . A G 150.12 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0216917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.295;QD=19.3697;RBI=0.0219136;REFB=-0.00844522;REVB=-0.00311042;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354502;STB=0.700947;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00953445;OID=.;OPOS=205238275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:11:5:11:4:11:5:11:4 chr1 205240251 . C T 132.71 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0149176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.344;QD=15.1663;RBI=0.0184364;REFB=-0.0305681;REVB=-0.0108335;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317485;STB=0.666455;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0345594;OID=.;OPOS=205240251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:9:6:14:5:9:6:14:6 chr1 205275421 . A G 820.19 PASS AF=0.983051;AO=59;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.92;QD=55.6058;RBI=0.0343328;REFB=-0.144467;REVB=-0.0324854;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.509801;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00104808;OID=.;OPOS=205275421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:0:1:59:58:0.983051:26:33:0:0:25:33:0:1 chr1 205277781 . C T 215.54 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0727193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7072;QD=13.0628;RBI=0.0847692;REFB=-0.00396955;REVB=-0.0435628;RO=39;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147556;STB=0.591577;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00826388;OID=.;OPOS=205277781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:39:40:26:26:0.393939:11:15:17:22:11:15:17:23 chr1 205492756 . A G 172.08 PASS AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0041179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.108;QD=19.1204;RBI=0.0166793;REFB=-0.00311051;REVB=-0.016163;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138146;STB=0.588134;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00285355;OID=.;OPOS=205492756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:18:18:17:18:0.5:11:6:9:9:12:6:9:9 chr1 205501843 . A G 244.09 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=26;FWDB=0.00548454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1765;QD=17.4348;RBI=0.0270455;REFB=-0.00465733;REVB=-0.0264835;RO=27;SAF=10;SAR=17;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271849;STB=0.660424;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00364565;OID=.;OPOS=205501843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:29:27:27:0.482143:17:10:3:24:17:10:3:26 chr1 205570406 . T A 1619.87 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0882;QD=59.9952;RBI=0.042786;REFB=0;REVB=-0.0107109;RO=0;SAF=55;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130006;OID=.;OPOS=205570406;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:108:0:0:106:108:1:51:55:0:0:51:57:0:0 chr1 205588637 . C T 255.25 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9791;QD=51.05;RBI=0.0177805;REFB=0;REVB=0.0114773;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286114;OID=.;OPOS=205588637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:7:12:0:0:7:13:0:0 chr1 205589574 . C T 435.95 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0260623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9476;QD=54.4935;RBI=0.0298798;REFB=-0.0736228;REVB=0.0146138;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000885026;OID=.;OPOS=205589574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:19:12:0:0:19:12:0:1 chr1 205626995 . C G 508.35 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0321536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8355;QD=56.4828;RBI=0.0335799;REFB=0.0241246;REVB=0.00968289;RO=1;SAF=16;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283378;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00133104;OID=.;OPOS=205626995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:19:16:1:0:19:16:1:0 chr1 205627101 . AC AA,A 522.74 PASS AF=0.015625,0.984375;AO=3,51;DP=64;FAO=1,63;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233909,0.0951051;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=13.2932,11.1109;QD=32.6711;RBI=0.073521,0.133673;REFB=-0.0926628,-0.0502647;REVB=-0.0697009,-0.0939341;RO=4;SAF=0,26;SAR=3,25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.729277,-0.0328532;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0483542,-0.00439743;OID=.,.;OPOS=205627102,205627102;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.015625,0.984375:3,51:64:1,63:64:0:0,32:1,31:0:0:5:4:0,26:3,25:3:1 chr1 205738110 . C T 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0153714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2927;QD=21.0154;RBI=0.0229941;REFB=0.00318474;REVB=-0.0171012;RO=13;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715741;STB=0.540489;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.00414121;OID=.;OPOS=205738110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:10:6:6:7:10:6:6:7 chr1 205738166 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.114;QD=58.1421;RBI=0.0272943;REFB=0;REVB=0.0198126;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.4487e-05;OID=.;OPOS=205738166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:22:10:0:0:22:10:0:0 chr1 205779231 . G A 263.54 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00867107;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.638;QD=19.5215;RBI=0.0131628;REFB=-0.0109926;REVB=0.00990314;RO=26;SAF=10;SAR=18;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161216;STB=0.590098;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00925327;OID=.;OPOS=205779231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:26:26:28:28:0.518519:18:10:14:12:18:10:14:12 chr1 205814485 . G A 320.2 PASS AF=0.492754;AO=27;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0121528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.238;QD=18.562;RBI=0.0519789;REFB=-0.0313465;REVB=-0.0505382;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018431;STB=0.579615;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0481166;OID=.;OPOS=205814485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:23:35:27:34:0.492754:17:10:9:14:18:16:22:13 chr1 205814497 . T C 1079.82 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00358464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.298;QD=59.9897;RBI=0.0258058;REFB=0;REVB=0.0255556;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79743e-05;OID=.;OPOS=205814497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0 chr1 205817018 . T C 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00915803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.903;QD=15.9168;RBI=0.0410942;REFB=-0.0130363;REVB=-0.0400607;RO=15;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122387;STB=0.571312;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0204366;OID=.;OPOS=205817018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:10:3:5:10:10:3:5:10 chr1 205819039 . C T 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0110219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.843;QD=18.175;RBI=0.011892;REFB=-0.0179077;REVB=0.00446492;RO=31;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256658;STB=0.633352;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0316652;OID=.;OPOS=205819039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:32:31:31:0.492063:17:14:23:8:17:14:23:9 chr1 205819104 . G A 340.91 PASS AF=0.48;AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.00711695;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.684;QD=18.1818;RBI=0.00973035;REFB=-0.025481;REVB=0.00663542;RO=39;SAF=17;SAR=18;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121943;STB=0.57402;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0171402;OID=.;OPOS=205819104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:35:36:0.48:18:17:24:15:19:17:24:15 chr1 206317568 . G A 200.86 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0159437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.413;QD=20.6011;RBI=0.0405897;REFB=-0.0273259;REVB=0.0373272;RO=19;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155872;STB=0.5877;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0227805;OID=.;OPOS=206317568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:9:11:7:12:9:11:7:12 chr1 206516261 . C T 414.05 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00461153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4044;QD=19.0366;RBI=0.0054924;REFB=0.000633856;REVB=0.00298334;RO=44;SAF=19;SAR=23;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191325;STB=0.515782;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.00144317;OID=.;OPOS=206516261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:45:42:42:0.482759:23:19:19:25:23:19:19:26 chr1 206566195 . C T 150.33 PASS AF=0.217391;AO=24;DP=113;FAO=25;FDP=115;FR=.;FRO=90;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=62;FWDB=0.0294904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8709;QD=5.22878;RBI=0.0304172;REFB=-0.00490072;REVB=0.00745106;RO=88;SAF=6;SAR=18;SRF=27;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893615;STB=0.570612;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0196753;OID=.;OPOS=206566195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:88:90:24:25:0.217391:18:6:27:61:19:6:28:62 chr1 206566904 . T C 551.36 PASS AF=0.405405;AO=60;DP=148;FAO=60;FDP=148;FR=.;FRO=88;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=-0.0217115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.576;QD=14.9016;RBI=0.0217197;REFB=-0.0104861;REVB=-0.000598628;RO=87;SAF=25;SAR=35;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339722;STB=0.516124;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.017758;OID=.;OPOS=206566904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:87:88:60:60:0.405405:35:25:39:48:35:25:39:49 chr1 206603535 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.938;QD=56.9382;RBI=0.0273301;REFB=0;REVB=-0.0105135;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.49566e-05;OID=.;OPOS=206603535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr1 206634771 . A G 165.05 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0332965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.96;QD=14.0469;RBI=0.0355702;REFB=-0.0123174;REVB=0.0125131;RO=29;SAF=6;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367499;STB=0.712103;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0161428;OID=.;OPOS=206634771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:12:6:20:9:12:6:20:9 chr1 206635570 . C T 1216.21 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00103381;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.939;QD=60.0596;RBI=0.00376923;REFB=-0.119956;REVB=-0.00362469;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264401;OID=.;OPOS=206635570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:81:81:0:0:80:81:1:37:43:0:0:37:44:0:0 chr1 206647742 . A G 1343.25 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0115291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3153;QD=61.0568;RBI=0.0766292;REFB=-0.033423;REVB=-0.0757569;RO=1;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108921;STB=0.505746;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00026874;OID=.;OPOS=206647742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:87:87:0.988636:43:44:0:1:43:44:0:1 chr1 206647787 . T C 1587.78 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.463;QD=64.1527;RBI=0.0496427;REFB=0;REVB=0.0468366;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39172e-05;OID=.;OPOS=206647787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:49:50:0:0:49:50:0:0 chr1 206651107 . G A 1202.06 PASS AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0320366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.276;QD=58.6373;RBI=0.0585879;REFB=-0.144466;REVB=0.049053;RO=2;SAF=40;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230823;STB=0.512192;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.000450381;OID=.;OPOS=206651107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:82:82:2:2:80:80:0.97561:40:40:2:0:40:40:2:0 chr1 206665052 . C T 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1813;QD=59.0175;RBI=0.00380057;REFB=0;REVB=0.000646162;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.75187e-05;OID=.;OPOS=206665052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr1 206665837 . G A 1194.68 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126357;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.7538;QD=61.2657;RBI=0.0177052;REFB=0;REVB=0.0124021;RO=0;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128991;OID=.;OPOS=206665837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:48:30:0:0:48:30:0:0 chr1 206757857 . C A 445.15 PASS AF=0.5;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00517227;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0968;QD=20.2339;RBI=0.0112838;REFB=-0.000122452;REVB=-0.0100286;RO=42;SAF=21;SAR=23;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103814;STB=0.556617;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.000260768;OID=.;OPOS=206757857;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:42:44:44:44:0.5:23:21:25:17:23:21:26:18 chr1 206758077 . T A 50.14 PASS AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.141;QD=33.4285;RBI=0.0860662;REFB=0;REVB=0.0860662;RO=0;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235287;OID=.;OPOS=206758077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:1:5:0:0:0:6:0:0:0 chr1 206762256 . G A 53.69 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.694;QD=7.95467;RBI=0.0258669;REFB=-0.00300261;REVB=-0.0076816;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210201;STB=0.629327;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0052848;OID=.;OPOS=206762256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:13:6:4:4:13:6 chr1 206773659 . A G 1506.23 PASS AF=1;AO=87;DP=90;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.764;QD=59.0679;RBI=0.115726;REFB=0;REVB=0.10723;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125288;OID=.;OPOS=206773659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:102:0:0:87:102:1:43:44:0:0:54:48:0:0 chr1 207015957 . T C 497.15 PASS AF=0.443548;AO=52;DP=122;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.029761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2338;QD=16.037;RBI=0.0312354;REFB=0.00777569;REVB=0.00948337;RO=69;SAF=20;SAR=32;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226749;STB=0.625721;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00773425;OID=.;OPOS=207015957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:124:69:69:52:55:0.443548:32:20:42:27:34:21:42:27 chr1 207107097 . G A 33.82 PASS AF=0.127273;AO=7;DP=55;FAO=7;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0510792;FXX=0.017854;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.9995;QD=2.45947;RBI=0.0516749;REFB=-0.0379019;REVB=0.00782366;RO=40;SAF=5;SAR=2;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235426;STB=0.690932;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.204031;OID=.;OPOS=207107097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:55:55:40:48:7:7:0.127273:2:5:21:19:2:5:24:24 chr1 207109116 . C T 34.76 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0241627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.652;QD=23.1705;RBI=0.0320368;REFB=-0.133681;REVB=0.0210361;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0478557;OID=.;OPOS=207109116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1 chr1 207110936 . T C 242.14 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0264631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.294;QD=16.9923;RBI=0.029122;REFB=-0.000554665;REVB=-0.0121572;RO=30;SAF=18;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310118;STB=0.67429;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.000634079;OID=.;OPOS=207110936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:9:18:10:20:9:18:10:20 chr1 207132345 . A G 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.00196141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.36;QD=22.1438;RBI=0.0459673;REFB=-0.0235301;REVB=-0.0459254;RO=13;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148936;STB=0.583241;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0110149;OID=.;OPOS=207132345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:10:7:3:10:10:7:3:10 chr1 207140440 . C T 359.58 PASS AF=0.457831;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.00342053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.38;QD=17.329;RBI=0.00930065;REFB=-0.00426436;REVB=-0.00864882;RO=45;SAF=8;SAR=30;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20814;STB=0.617725;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00516373;OID=.;OPOS=207140440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:45:38:38:0.457831:30:8:17:28:30:8:17:28 chr1 207143422 . A G 141.32 PASS AF=0.380952;AO=15;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0211121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.924;QD=13.4589;RBI=0.0249155;REFB=-0.00586044;REVB=0.0132311;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118413;STB=0.54756;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00428278;OID=.;OPOS=207143422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:15:16:0.380952:8:7:15:11:8:8:15:11 chr1 207195779 . A G 306.21 PASS AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0512392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1381;QD=47.1096;RBI=0.0596488;REFB=-0.00672711;REVB=0.0305373;RO=2;SAF=14;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121653;STB=0.506573;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000102159;OID=.;OPOS=207195779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:10:14:1:1:10:14:1:1 chr1 207263829 . A G 868.27 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.98;QD=57.8849;RBI=0.0169096;REFB=0;REVB=0.00943718;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37181e-05;OID=.;OPOS=207263829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:28:31:0:0:29:31:0:0 chr1 207297680 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00723141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.523;QD=59.0186;RBI=0.0124907;REFB=0;REVB=-0.0101846;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.35025e-06;OID=.;OPOS=207297680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0 chr1 207304900 . T C 629.41 PASS AF=0.520661;AO=62;DP=120;FAO=63;FDP=121;FR=.;FRO=58;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0118872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.727;QD=20.8068;RBI=0.0162506;REFB=-0.00351294;REVB=0.0110805;RO=58;SAF=39;SAR=23;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00782755;STB=0.500834;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.00557426;OID=.;OPOS=207304900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:58:58:62:63:0.520661:23:39:36:22:24:39:36:22 chr1 207653395 . C A 1062.41 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.15;QD=59.8541;RBI=0.039567;REFB=0;REVB=0.0141091;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.88027e-05;OID=.;OPOS=207653395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0 chr1 207679307 . A G 3830.61 PASS AF=1;AO=240;DP=243;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201166;FXX=0.0123452;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.78;QD=63.8434;RBI=0.0285779;REFB=0;REVB=0.0202983;RO=0;SAF=127;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91009e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.24879e-07;OID=.;OPOS=207679307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:243:240:0:0:240:240:1:113:127:0:0:113:127:0:0 chr1 207753621 . A G 2011.19 PASS AF=0.992366;AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0223891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.91;QD=61.4105;RBI=0.0479335;REFB=-0.0424277;REVB=0.0423833;RO=0;SAF=75;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503311;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000129314;OID=.;OPOS=207753621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:131:131:0:1:130:130:0.992366:55:75:0:0:55:75:1:0 chr1 207782916 . A T 1034.07 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.325;QD=59.0899;RBI=0.0189104;REFB=0;REVB=0.00624103;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010424;OID=.;OPOS=207782916;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:70:0:0:67:70:1:37:30:0:0:40:30:0:0 chr1 207782931 . A G 851.22 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9539;QD=57.7096;RBI=0.0543497;REFB=0;REVB=0.0148708;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000464399;OID=.;OPOS=207782931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr1 207790088 . C G 2937.06 PASS AF=0.970443;AO=197;DP=203;FAO=197;FDP=203;FR=.;FRO=6;FSAF=68;FSAR=129;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0427239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.977;QD=57.8731;RBI=0.0428396;REFB=-0.0467677;REVB=0.00314643;RO=3;SAF=68;SAR=129;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205429;STB=0.521125;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000196071;OID=.;OPOS=207790088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:203:203:3:6:197:197:0.970443:129:68:3:0:129:68:6:0 chr1 207795320 . A G 2561.93 PASS AF=0.988166;AO=167;DP=172;FAO=167;FDP=169;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00207553;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6091;QD=60.6374;RBI=0.0480128;REFB=-0.144389;REVB=0.0479679;RO=2;SAF=90;SAR=77;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000881897;STB=0.500463;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00112099;OID=.;OPOS=207795320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:172:169:2:2:167:167:0.988166:77:90:1:1:77:90:1:1 chr1 207851611 . A G 1117.61 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.834;QD=60.4111;RBI=0.0323815;REFB=0;REVB=0.014399;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87041e-05;OID=.;OPOS=207851611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:33:39:0:0:34:40:0:0 chr1 207857254 . A G 589.42 PASS AF=0.397661;AO=68;DP=171;FAO=68;FDP=171;FR=.;FRO=103;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=54;FWDB=0.0253756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3196;QD=13.7876;RBI=0.0256788;REFB=-0.0138245;REVB=0.00393475;RO=101;SAF=31;SAR=37;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206902;STB=0.512019;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0262148;OID=.;OPOS=207857254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:101:103:68:68:0.397661:37:31:48:53:37:31:49:54 chr1 207875116 . GAGA G 158.0 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.00103658;FXX=0.081616;HRUN=1;LEN=3;MLLD=329.483;QD=14.0444;RBI=0.00971675;REFB=-0.00584738;REVB=0.0096613;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198929;STB=0.662933;STBP=0.116;TYPE=del;VARB=0.00717925;OID=.;OPOS=207875117;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.377778:17:41:17:45:28:8:9:6:22:99:22:8:9:6:16 chr1 207881557 . A G 2329.69 PASS AF=1;AO=151;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000124581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.824;QD=60.9069;RBI=0.0175125;REFB=0;REVB=0.017512;RO=0;SAF=71;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116821;OID=.;OPOS=207881557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:153:153:0:0:151:153:1:80:71:0:0:82:71:0:0 chr1 207884105 . C A,G 1441.89 PASS AF=0.956989,0.0430108;AO=89,4;DP=93;FAO=89,4;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=37,4;FSAR=52,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0787537,0.034091;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=55.1317,5.26487;QD=62.0169;RBI=0.0790403,0.0731209;REFB=0,0;REVB=0.00672556,-0.0646875;RO=0;SAF=37,4;SAR=52,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00194761,0.132607;OID=.,.;OPOS=207884105,207884105;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:93:93:0:0:89,4:89,4:0.956989,0.0430108:52,0:37,4:0:0:52,0:37,4:0:0 chr1 207884107 . G A 1472.54 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.439;QD=63.3353;RBI=0.0183898;REFB=0;REVB=0.012298;RO=0;SAF=41;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63979e-06;OID=.;OPOS=207884107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:52:41:0:0:52:41:0:0 chr1 207885881 . C T 1662.77 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00282436;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.071;QD=59.3845;RBI=0.0291126;REFB=-0.138865;REVB=-0.0289752;RO=0;SAF=55;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000205233;OID=.;OPOS=207885881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:113:112:0:1:111:111:0.991071:56:55:0:0:56:55:1:0 chr1 207886150 . C T 2988.6 PASS AF=1;AO=189;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302564;FXX=0.0104707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.949;QD=63.2507;RBI=0.0308284;REFB=-0.075556;REVB=0.00591115;RO=0;SAF=89;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014984;OID=.;OPOS=207886150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:191:189:0:0:189:189:1:100:89:0:0:100:89:0:0 chr1 207888739 . G T 2282.89 PASS AF=0.987097;AO=151;DP=155;FAO=153;FDP=155;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00270562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.95;QD=58.9133;RBI=0.00420988;REFB=0.0298127;REVB=-0.00322532;RO=2;SAF=80;SAR=71;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132087;STB=0.506756;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.000462562;OID=.;OPOS=207888739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:155:155:2:2:151:153:0.987097:71:80:0:2:73:80:0:2 chr1 207941191 . G T 778.31 PASS AF=1;AO=40;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.953;QD=63.5351;RBI=0.0394486;REFB=0;REVB=0.0103199;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183438;OID=.;OPOS=207941191;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:40:49:1:27:13:0:0:27:22:0:0 chr1 207958976 . C G 325.62 PASS AF=0.366972;AO=40;DP=111;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.00676713;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.214;QD=11.9494;RBI=0.011156;REFB=-0.00686633;REVB=-0.00886912;RO=70;SAF=18;SAR=22;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565621;STB=0.537796;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0112209;OID=.;OPOS=207958976;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:109:70:69:40:40:0.366972:22:18:28:42:22:18:27:42 chr1 208063067 . G A 114.01 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.136674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5103;QD=18.2412;RBI=0.136887;REFB=0.0100087;REVB=-0.00764594;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281085;STB=0.516104;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.0156877;OID=.;OPOS=208063067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:5:7:8:5:5:7 chr1 208390155 . C T 218.89 PASS AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.0170698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.433;QD=11.674;RBI=0.0219607;REFB=-0.00669133;REVB=-0.0138164;RO=48;SAF=12;SAR=15;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227107;STB=0.629543;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0122125;OID=.;OPOS=208390155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:48:48:27:27:0.36:15:12:12:36:15:12:12:36 chr1 208390162 . T C 214.6 PASS AF=0.36;AO=25;DP=73;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=0.0234011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.816;QD=11.4452;RBI=0.0240985;REFB=-0.0154738;REVB=-0.00575521;RO=46;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169767;STB=0.615306;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0257948;OID=.;OPOS=208390162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:46:48:25:27:0.36:15:10:12:34:15:12:13:35 chr1 208391098 . T C 320.14 PASS AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0453614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.951;QD=16.0072;RBI=0.0482696;REFB=8.33285e-05;REVB=-0.0165013;RO=44;SAF=19;SAR=16;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253165;STB=0.519844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.000441458;OID=.;OPOS=208391098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:45:35:35:0.4375:16:19:25:19:16:19:26:19 chr1 209782343 . A G 393.65 PASS AF=0.410714;AO=36;DP=117;FAO=46;FDP=112;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0136505;FXX=0.0427314;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.311;QD=14.0589;RBI=0.0147303;REFB=-0.00461886;REVB=0.00553576;RO=52;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215896;STB=0.630378;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0119909;OID=.;OPOS=209782343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:112:52:66:36:46:0.410714:16:20:18:34:17:29:27:39 chr1 209799253 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00217592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.106;QD=57.2025;RBI=0.0134513;REFB=0;REVB=-0.0132742;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147973;OID=.;OPOS=209799253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:11:18:0:0:11:19:0:0 chr1 209800230 . C T 1680.22 PASS AF=0.907692;AO=118;DP=130;FAO=118;FDP=130;FR=.;FRO=12;FSAF=73;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00663689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6313;QD=51.6989;RBI=0.040569;REFB=-0.0671419;REVB=0.0400224;RO=12;SAF=73;SAR=45;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966012;STB=0.551083;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00167873;OID=.;OPOS=209800230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:130:130:12:12:118:118:0.907692:45:73:1:11:45:73:1:11 chr1 209801519 . C T 618.55 PASS AF=0.976744;AO=40;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0245433;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.109;QD=57.5393;RBI=0.0355516;REFB=-0.0544099;REVB=0.0257205;RO=2;SAF=11;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248513;STB=0.508193;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00111049;OID=.;OPOS=209801519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:44:43:2:1:40:42:0.976744:29:11:1:1:30:12:0:1 chr1 209823354 . G A 241.89 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.0106376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.589;QD=12.5655;RBI=0.0125315;REFB=-0.0159341;REVB=-0.00662416;RO=47;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202779;STB=0.620176;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0272446;OID=.;OPOS=209823354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:47:48:29:29:0.376623:15:14:14:33:15:14:14:34 chr1 209849399 . AG A 155.43 PASS AF=0.36;AO=19;DP=55;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00151848;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.372;QD=12.4343;RBI=0.00155218;REFB=-0.0223443;REVB=-0.000321688;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779767;STB=0.519978;STBP=0.836;TYPE=del;VARB=0.047978;OID=.;OPOS=209849400;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.36:19:55:18:50:32:9:9:17:15:99:33:10:9:15:18 chr1 209849406 . T G 167.3 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00748713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.099;QD=11.7401;RBI=0.0170735;REFB=-0.0397018;REVB=-0.0153443;RO=34;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00600169;STB=0.50251;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0440453;OID=.;OPOS=209849406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:34:36:21:21:0.368421:11:10:16:18:11:10:17:19 chr1 209933540 . A G 206.49 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0157965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.937;QD=13.1104;RBI=0.0185722;REFB=-0.0169039;REVB=0.00976728;RO=38;SAF=11;SAR=14;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1183;STB=0.567753;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0298403;OID=.;OPOS=209933540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:14:11:21:17:14:11:21:17 chr1 209936466 . A G 152.86 PASS AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00948471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.763;QD=10.3634;RBI=0.0160394;REFB=-0.020915;REVB=-0.0129346;RO=39;SAF=8;SAR=12;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184243;STB=0.608;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0241697;OID=.;OPOS=209936466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:12:8:22:17:12:8:22:17 chr1 209936673 . C G 286.46 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0237108;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.164;QD=15.4844;RBI=0.025105;REFB=0.00118882;REVB=0.00824989;RO=42;SAF=16;SAR=16;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119807;STB=0.567526;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.00110795;OID=.;OPOS=209936673;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:32:32:0.432432:16:16:26:16:16:16:26:16 chr1 209936914 . C T 226.72 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0128162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7329;QD=13.5352;RBI=0.0411241;REFB=-0.0247003;REVB=-0.0390761;RO=40;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022998;STB=0.513117;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0335233;OID=.;OPOS=209936914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:17:10:14:26:17:10:14:26 chr1 210337043 . A G 512.29 PASS AF=0.923077;AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.155263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.151;QD=52.5422;RBI=0.163335;REFB=-0.135519;REVB=0.0507143;RO=2;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622689;STB=0.54836;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.005271;OID=.;OPOS=210337043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:39:39:2:3:36:36:0.923077:14:22:0:2:14:22:0:3 chr1 210407031 . G T 705.35 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.528;QD=62.6977;RBI=0.0960786;REFB=0;REVB=0.0785962;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497773;OID=.;OPOS=210407031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:28:16:0:0:29:16:0:0 chr1 210547505 . C G 351.52 PASS AF=0.388889;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=-0.00346574;FXX=0.00917347;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.478;QD=13.0191;RBI=0.0102148;REFB=-0.010199;REVB=0.00960889;RO=66;SAF=18;SAR=24;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189283;STB=0.60728;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0150425;OID=.;OPOS=210547505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:66:66:42:42:0.388889:24:18:40:26:24:18:40:26 chr1 210547517 . C T 406.57 PASS AF=0.408696;AO=45;DP=113;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.0026685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.071;QD=14.1415;RBI=0.0434415;REFB=0.00302249;REVB=0.0433595;RO=68;SAF=20;SAR=25;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167297;STB=0.603917;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.0107959;OID=.;OPOS=210547517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:68:68:45:47:0.408696:25:20:41:27:27:20:41:27 chr1 210577873 . G C 558.42 PASS AF=0.586207;AO=51;DP=87;FAO=51;FDP=87;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0268868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.07;QD=25.6743;RBI=0.0375849;REFB=-0.0194799;REVB=-0.0262626;RO=35;SAF=19;SAR=32;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440528;STB=0.531297;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00964219;OID=.;OPOS=210577873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:35:36:51:51:0.586207:32:19:15:20:32:19:16:20 chr1 210577884 . G A 500.27 PASS AF=0.573171;AO=46;DP=81;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0163828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.016;QD=24.4032;RBI=0.0164496;REFB=-0.0194398;REVB=0.00148065;RO=34;SAF=18;SAR=28;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165746;STB=0.510725;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0165896;OID=.;OPOS=210577884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:34:35:46:47:0.573171:28:18:14:20:28:19:15:20 chr1 210857457 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.012;QD=53.9108;RBI=0.0509204;REFB=0;REVB=-0.00779676;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286358;OID=.;OPOS=210857457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chr1 211447625 . G A 1524.03 PASS AF=0.979798;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00626615;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1915;QD=61.5768;RBI=0.00790408;REFB=-0.00565579;REVB=-0.00481766;RO=2;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160722;STB=0.508473;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=6.13188e-05;OID=.;OPOS=211447625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:100:99:2:2:97:97:0.979798:58:39:0:2:58:39:0:2 chr1 211836789 . T C 132.11 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0246973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.933;QD=24.0205;RBI=0.0284591;REFB=-0.0132773;REVB=-0.0141409;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177266;STB=0.599854;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00674298;OID=.;OPOS=211836789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:5:9:3:5:5:9:3:5 chr1 211846876 . A G 1230.84 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102193;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.809;QD=61.542;RBI=0.0270489;REFB=0;REVB=0.0250442;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92476e-05;OID=.;OPOS=211846876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0 chr1 211922603 . G A 536.19 PASS AF=0.5;AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00522663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.938;QD=19.1497;RBI=0.0194826;REFB=-0.0156798;REVB=-0.0187685;RO=55;SAF=23;SAR=33;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023649;STB=0.518318;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0181259;OID=.;OPOS=211922603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:55:56:56:56:0.5:33:23:24:31:33:23:25:31 chr1 212154489 . G A 328.67 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00975186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.76;QD=18.0094;RBI=0.00980819;REFB=-0.0112978;REVB=-0.00104968;RO=38;SAF=19;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040048;STB=0.522375;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0122054;OID=.;OPOS=212154489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:16:19:19:19:16:19:19:19 chr1 212273639 . C T 1031.91 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262645;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.549;QD=59.8209;RBI=0.0273049;REFB=0;REVB=-0.00746568;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.96216e-05;OID=.;OPOS=212273639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:29:40:0:0:29:40:0:0 chr1 212274413 . A C 739.88 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0355013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.229;QD=54.8061;RBI=0.0364348;REFB=-0.183646;REVB=0.00819441;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165303;STB=0.508769;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000775906;OID=.;OPOS=212274413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:28:25:0:1:28:25:0:1 chr1 212515613 . C T 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0230949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.303;QD=19.9925;RBI=0.0246835;REFB=0.00467262;REVB=-0.00871192;RO=23;SAF=13;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239256;STB=0.513501;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.00360663;OID=.;OPOS=212515613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:9:13:13:10:9:13:13:10 chr1 212526288 . C T 1419.63 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216793;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.509;QD=63.0947;RBI=0.0216924;REFB=0;REVB=-0.000752394;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10917e-05;OID=.;OPOS=212526288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:46:44:0:0:46:44:0:0 chr1 212534377 . T A 385.31 PASS AF=0.666667;AO=36;DP=54;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0151189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.544;QD=28.5412;RBI=0.0188514;REFB=-0.0274916;REVB=0.0112602;RO=18;SAF=18;SAR=18;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339706;STB=0.518508;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.017088;OID=.;OPOS=212534377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:18:18:36:36:0.666667:18:18:10:8:18:18:10:8 chr1 212534448 . T C 181.76 PASS AF=0.359375;AO=22;DP=63;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0165879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.666;QD=11.3599;RBI=0.0247379;REFB=-3.6284e-05;REVB=0.0183523;RO=40;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742444;STB=0.518553;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.000486333;OID=.;OPOS=212534448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:40:41:22:23:0.359375:9:13:21:19:10:13:22:19 chr1 212560327 . A G 469.16 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0588699;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.7173;QD=58.6451;RBI=0.108793;REFB=0;REVB=-0.0914892;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00593775;OID=.;OPOS=212560327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chr1 212619339 . T C 450.86 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209633;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.209;QD=58.1759;RBI=0.0398157;REFB=0;REVB=0.0338501;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257054;OID=.;OPOS=212619339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr1 212788567 . C T 294.14 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0229938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1631;QD=17.5607;RBI=0.0255017;REFB=-0.00601259;REVB=0.0110282;RO=33;SAF=22;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828744;STB=0.551115;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.011353;OID=.;OPOS=212788567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:35:32:32:0.477612:10:22:20:13:10:22:21:14 chr1 212798601 . C A 270.04 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00012221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.706;QD=22.9823;RBI=0.00239836;REFB=-0.0105913;REVB=-0.00239524;RO=22;SAF=5;SAR=20;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18551;STB=0.60456;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00796452;OID=.;OPOS=212798601;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:20:5:8:14:20:5:8:14 chr1 212799870 . A G 1079.14 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9832;QD=59.9524;RBI=0.0569449;REFB=0;REVB=-0.0516253;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000240357;OID=.;OPOS=212799870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:41:30:0:0:42:30:0:0 chr1 212799949 . C T 349.9 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00751884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.82;QD=17.7164;RBI=0.00766498;REFB=-0.0199862;REVB=-0.00148958;RO=42;SAF=15;SAR=22;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913391;STB=0.55112;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.017734;OID=.;OPOS=212799949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:22:15:21:21:22:15:21:21 chr1 212900487 . A G 187.68 PASS AF=0.389831;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00200416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.916;QD=12.7239;RBI=0.0046982;REFB=-0.0186621;REVB=-0.00424928;RO=36;SAF=10;SAR=12;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489413;STB=0.513263;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0298322;OID=.;OPOS=212900487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:36:36:22:23:0.389831:12:10:18:18:12:11:18:18 chr1 213009469 . A G 166.61 PASS AF=0.761905;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00455598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.494;QD=31.7355;RBI=0.0392407;REFB=-0.0249252;REVB=0.0389754;RO=5;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184814;STB=0.60228;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00532785;OID=.;OPOS=213009469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:21:21:5:5:16:16:0.761905:10:6:4:1:10:6:4:1 chr1 213031948 . G C 42.94 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0099997;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=29.2831;QD=6.36191;RBI=0.0686601;REFB=-0.0216562;REVB=-0.067928;RO=18;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194397;STB=0.631788;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0525767;OID=.;OPOS=213031948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:27:27:18:20:7:7:0.259259:5:2:8:10:5:2:9:11 chr1 213068404 . T C 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00601183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.177;QD=8.69803;RBI=0.0837649;REFB=-0.00442794;REVB=0.0835489;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439136;STB=0.76852;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00448788;OID=.;OPOS=213068404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:2:5:4:10:2:5:4:10 chr1 213068595 . C T 110.66 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00767175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.949;QD=15.2635;RBI=0.0166279;REFB=0.0124744;REVB=0.0147523;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185962;STB=0.58366;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.0183279;OID=.;OPOS=213068595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:7:6:4:11:7:6:5:11 chr1 214492286 . G A 367.27 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0947401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3969;QD=16.5064;RBI=0.0966437;REFB=-0.0104909;REVB=0.0190874;RO=50;SAF=18;SAR=21;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216958;STB=0.512189;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0107404;OID=.;OPOS=214492286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:50:50:39:39:0.438202:21:18:22:28:21:18:22:28 chr1 214542819 . T C 294.51 PASS AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.006369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5165;QD=28.0481;RBI=0.00706505;REFB=0.00926792;REVB=0.00305791;RO=16;SAF=16;SAR=10;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00702362;STB=0.503873;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.0034823;OID=.;OPOS=214542819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:10:16:10:6:10:16:10:6 chr1 214564340 . T C 141.87 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00844457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.581;QD=11.1268;RBI=0.0107665;REFB=-0.00700911;REVB=0.00667891;RO=33;SAF=11;SAR=6;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492153;STB=0.521172;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0136991;OID=.;OPOS=214564340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:34:17:17:0.333333:6:11:20:13:6:11:21:13 chr1 214826196 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00586443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.795;QD=52.6129;RBI=0.0186938;REFB=0;REVB=0.0177501;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.03123e-05;OID=.;OPOS=214826196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr1 214830617 . A G 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00789837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.489;QD=60.2291;RBI=0.00802746;REFB=0;REVB=0.00143382;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.55944e-05;OID=.;OPOS=214830617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:10:27:0:0:10:27:0:0 chr1 214837110 . C G 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0079394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.489;QD=56.956;RBI=0.00943136;REFB=0;REVB=0.00509082;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60139e-05;OID=.;OPOS=214837110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr1 215256779 . GAC CGA,GA,GCA 278.5 PASS AF=0.027027,0.72973,0;AO=7,33,3;DP=74;FAO=2,54,0;FDP=74;FR=.;FRO=18;FSAF=0,11,0;FSAR=2,43,0;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0550587,0.246178,0.0680447;FXX=0;HRUN=1,7,1;LEN=3,1,2;MLLD=28.0422,9.06779,123.004;QD=15.054;RBI=0.0888198,0.248021,0.0917042;REFB=-0.0263286,-0.100058,0.0062786;REVB=-0.0696958,-0.0301854,-0.0614783;RO=20;SAF=1,3,0;SAR=6,30,3;SRF=6;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.265835,-0.306707,-0.528374;STB=0.992081,0.507073,0.5;STBP=0.386,0.872,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0.112623,0.0812885,0;OID=.,.,.;OPOS=215256779,215256781,215256780;OREF=GAC,C,AC;OALT=CGA,-,CA;OMAPALT=CGA,GA,GCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:52:74:74:20:18:7,33,3:2,54,0:0.027027,0.72973,0:6,30,3:1,3,0:6:14:2,43,0:0,11,0:4:14 chr1 215741053 . T G 41.32 PASS AF=0.6;AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00672572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.316;QD=16.5267;RBI=0.0630378;REFB=-0.0362215;REVB=-0.062678;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.599679;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0398808;OID=.;OPOS=215741053;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:2:4:5:6:0.6:3:2:1:1:3:3:1:3 chr1 215793834 . G A 397.6 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00331823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.109;QD=18.0726;RBI=0.0157797;REFB=0.00117687;REVB=0.0154269;RO=47;SAF=30;SAR=11;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254389;STB=0.642914;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00122965;OID=.;OPOS=215793834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:0.465909:11:30:23:24:11:30:23:24 chr1 215848062 . C T 548.09 PASS AF=0.542553;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0396028;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6828;QD=23.3231;RBI=0.0439631;REFB=-0.0197975;REVB=-0.0190885;RO=43;SAF=28;SAR=23;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118583;STB=0.506518;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0245135;OID=.;OPOS=215848062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:43:43:51:51:0.542553:23:28:23:20:23:28:23:20 chr1 215848641 . T C 589.76 PASS AF=0.55102;AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0358123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.044;QD=24.0716;RBI=0.037314;REFB=0.00254937;REVB=-0.0104793;RO=43;SAF=34;SAR=20;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173644;STB=0.590699;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.00435705;OID=.;OPOS=215848641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:43:44:54:54:0.55102:20:34:18:25:20:34:19:25 chr1 215960167 . T G 443.86 PASS AF=0.354839;AO=55;DP=155;FAO=55;FDP=155;FR=.;FRO=100;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=-0.0114933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.697;QD=11.4545;RBI=0.0120189;REFB=-0.012419;REVB=-0.00351535;RO=100;SAF=22;SAR=33;SRF=60;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22361;STB=0.627505;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0212896;OID=.;OPOS=215960167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:100:100:55:55:0.354839:33:22:60:40:33:22:60:40 chr1 216172380 . A G 269.24 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00387371;FXX=0.0769132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.97;QD=14.9578;RBI=0.0193173;REFB=-0.00300235;REVB=-0.0189249;RO=39;SAF=12;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16439;STB=0.613185;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00337359;OID=.;OPOS=216172380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:39:42:30:30:0.416667:18:12:22:17:18:12:25:17 chr1 216348764 . C T 2901.03 PASS AF=0.994624;AO=185;DP=186;FAO=185;FDP=186;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=105;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0436549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3645;QD=62.3878;RBI=0.062214;REFB=0.0388662;REVB=-0.0443263;RO=1;SAF=80;SAR=105;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591449;STB=0.503105;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.000519884;OID=.;OPOS=216348764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:186:186:1:1:185:185:0.994624:105:80:1:0:105:80:1:0 chr1 216592003 . T C 2066.66 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.135;QD=62.1551;RBI=0.0207637;REFB=0;REVB=0.0180623;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124631;OID=.;OPOS=216592003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:133:0:0:130:133:1:70:60:0:0:72:61:0:0 chr1 216595306 . C T 1679.63 PASS AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00796476;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.348;QD=60.5273;RBI=0.0100009;REFB=0;REVB=-0.00604825;RO=0;SAF=47;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.6268e-05;OID=.;OPOS=216595306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:110:111:1:63:47:0:0:64:47:0:0 chr1 217947738 . G A 1416.14 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.445;QD=62.9398;RBI=0.0319079;REFB=0;REVB=0.0291322;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64299e-05;OID=.;OPOS=217947738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:90:0:0:86:90:1:41:45:0:0:45:45:0:0 chr1 218578685 . T TTTGTTG 82.06 PASS AF=0.222222;AO=11;DP=57;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0784674;FXX=0;HRUN=3;LEN=6;MLLD=225.623;QD=6.07862;RBI=0.0793741;REFB=-0.0159745;REVB=0.0119633;RO=45;SAF=1;SAR=10;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.541667;STB=0.882483;STBP=0.009;TYPE=ins;VARB=0.0504506;OID=.;OPOS=218578686;OREF=-;OALT=TTGTTG;OMAPALT=TTTGTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.222222:11:57:12:54:42:1:11:21:21:82:45:1:10:21:24 chr1 218683528 . A G 362.43 PASS AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00524485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7824;QD=15.7581;RBI=0.0321293;REFB=-0.0126247;REVB=0.0316983;RO=53;SAF=11;SAR=28;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26799;STB=0.651859;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.018692;OID=.;OPOS=218683528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:53:39:39:0.423913:28:11:28:25:28:11:28:25 chr1 219383866 . G GC 619.26 PASS AF=1;AO=13;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0891688;FXX=0.0232504;HRUN=0;LEN=1;MLLD=137.506;QD=58.9771;RBI=0.167595;REFB=0;REVB=0.141904;RO=28;SAF=0;SAR=13;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.807036;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00162431;OID=.;OPOS=219383867;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:13:43:42:42:0:17:25:0:0:4:28:0:13:17:11 chr1 219383905 . A G 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.925;QD=64.1538;RBI=0.0160507;REFB=0;REVB=0.0125148;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74059e-05;OID=.;OPOS=219383905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0 chr1 220136115 . A G,T 1256.69 PASS AF=0.975904,0.0240964;AO=79,3;DP=83;FAO=81,2;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31,2;FSAR=50,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421708,-0.0149717;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=64.6803,162.247;QD=60.5635;RBI=0.0639189,0.0235723;REFB=0,0;REVB=0.0480338,-0.0182072;RO=0;SAF=31,2;SAR=48,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00518341,0.0810209;OID=.,.;OPOS=220136115,220136115;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:83:83:0:0:79,3:81,2:0.975904,0.0240964:48,1:31,2:0:0:50,0:31,2:0:0 chr1 220197625 . G T 1135.22 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.35;QD=60.5451;RBI=0.0820385;REFB=0;REVB=0.0760654;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285855;OID=.;OPOS=220197625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0 chr1 220239448 . T C 159.98 PASS AF=0.293333;AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0159029;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=118.501;QD=8.53223;RBI=0.0161931;REFB=-0.0125582;REVB=-0.00305165;RO=51;SAF=14;SAR=8;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106855;STB=0.565596;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0321292;OID=.;OPOS=220239448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:51:53:22:22:0.293333:8:14:28:23:8:14:29:24 chr1 220366647 . G C 185.23 PASS AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.000204207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.793;QD=10.2904;RBI=0.00220304;REFB=-0.00108242;REVB=-0.00219356;RO=48;SAF=8;SAR=16;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196515;STB=0.615286;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00207614;OID=.;OPOS=220366647;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:48:48:24:24:0.333333:16:8:24:24:16:8:24:24 chr1 220578893 . AACACACACACACACACACACACACACAC AACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACAC 451.9 PASS AF=0.59375,0.40625,0;AO=7,4,8;DP=31;FAO=19,13,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11,6,0;FSAR=8,7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00511465,0.0166351,-0.013425;FXX=0.0856898;HRUN=1,1,1;LEN=5,3,4;MLLD=113.364,71.7148,109.768;QD=56.487;RBI=0.0711268,0.17755,0.013439;REFB=0,0,0;REVB=0.0709427,0.176769,-0.000615136;RO=0;SAF=7,4,3;SAR=0,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-4.46938e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0240051,0.0499209,0.0322743;OID=.,.,.;OPOS=220578917,220578919,220578894;OREF=CACAC,CAC,ACAC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.59375,0.40625,0:7,4,8:31:19,13,0:32:0:11,6,0:8,7,0:0:0:99:0:7,4,3:0,0,5:0:0 chr1 220603310 . TGTGA AGAGA,T,TGAGA,TGTGT 215.07 PASS AF=0,0.222222,0.666667,0.111111;AO=2,3,7,9;DP=24;FAO=0,4,12,2;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,12,0;FSAR=0,3,0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.173004,-0.0867794,-0.0703568,0.0197388;FXX=0.142789;HRUN=1,1,1,1;LEN=3,4,1,1;MLLD=53.3596,37.8712,53.8592,64.189;QD=47.7942;RBI=0.210339,0.0909624,0.178789,0.230221;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.119634,0.0272672,-0.164364,0.229373;RO=2;SAF=2,1,7,1;SAR=0,2,0,8;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,-0.39997,0,-0.429214;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,snp,snp;VARB=0,0.093589,0.00529056,0.0888387;OID=.,.,.,.;OPOS=220603310,220603311,220603312,220603314;OREF=TGT,GTGA,T,A;OALT=AGA,-,A,T;OMAPALT=AGAGA,T,TGAGA,TGTGT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:28:24:18:2:0:2,3,7,9:0,4,12,2:0,0.222222,0.666667,0.111111:0,2,0,8:2,1,7,1:2:0:0,3,0,2:0,1,12,0:0:0 chr1 220603324 . A G 94.82 PASS AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0187274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5248;QD=14.0469;RBI=0.0418645;REFB=-0.0384439;REVB=0.0374423;RO=15;SAF=3;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272488;STB=0.615187;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0260363;OID=.;OPOS=220603324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:26:27:15:15:11:12:0.444444:8:3:8:7:8:4:8:7 chr1 220607685 . G A 982.27 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00589821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.841;QD=56.13;RBI=0.0139939;REFB=-0.0577187;REVB=0.0126901;RO=2;SAF=35;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000794477;STB=0.50042;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000592637;OID=.;OPOS=220607685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:70:70:2:2:68:68:0.971429:33:35:1:1:33:35:1:1 chr1 220789355 . ATTTTTTT AAATTTTT,ATTTTT,ATTTTTAA,ATTTTTT,ATTTTTTA 508.0 PASS AF=0,0.415584,0.12987,0.233766,0.220779;AO=3,11,11,9,15;DP=74;FAO=0,32,10,18,17;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11,2,3,7;FSAR=0,21,8,15,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235732,-0.0417277,-0.0217573,-0.0788726,-0.0602646;FXX=0;HRUN=7,7,7,7,7;LEN=2,2,2,1,1;MLLD=16.6295,11.5511,12.8626,6.72917,7.38468;QD=26.3895;RBI=0.0676894,0.0760136,0.0714258,0.14761,0.151506;REFB=-0.0172211,-0.0183518,-0.183174,-0.0154559,-0.231863;REVB=-0.063452,-0.0635363,-0.0680313,-0.124771,-0.139004;RO=0;SAF=0,7,2,1,8;SAR=3,4,9,8,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp,del,snp;VARB=0,-0.0335479,0.0864209,0.0389619,0.0630504;OID=.,.,.,.,.;OPOS=220789356,220789356,220789361,220789356,220789362;OREF=TT,TT,TT,T,T;OALT=AA,-,AA,-,A;OMAPALT=AAATTTTT,ATTTTT,ATTTTTAA,ATTTTTT,ATTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/5:0,0.415584,0.12987,0.233766,0.220779:3,11,11,9,15:74:0,32,10,18,17:77:0:0,11,2,3,7:0,21,8,15,10:0:0:46:0:0,7,2,1,8:3,4,9,8,7:0:0 chr1 220970028 . A G 1455.32 PASS AF=1;AO=92;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237093;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1186;QD=61.9287;RBI=0.0370963;REFB=-0.0268917;REVB=0.0285308;RO=1;SAF=41;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114219;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139691;OID=.;OPOS=220970028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:96:94:1:0:92:94:1:51:41:1:0:51:43:0:0 chr1 221053545 . T C 186.4 PASS AF=0.642857;AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0401759;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.46;QD=26.6284;RBI=0.040653;REFB=-0.015919;REVB=0.00620958;RO=11;SAF=1;SAR=16;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273886;STB=0.571341;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00909546;OID=.;OPOS=221053545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:28:28:11:10:17:18:0.642857:16:1:2:9:16:2:2:8 chr1 221509332 . G A 387.46 PASS AF=0.427083;AO=39;DP=94;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00410427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.395;QD=16.1441;RBI=0.0128905;REFB=-0.0194316;REVB=0.0122197;RO=55;SAF=15;SAR=24;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112636;STB=0.574096;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0204564;OID=.;OPOS=221509332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:55:55:39:41:0.427083:24:15:27:28:26:15:27:28 chr1 221912361 . T C 1475.92 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155729;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.341;QD=63.4803;RBI=0.01741;REFB=0;REVB=0.00778435;RO=0;SAF=53;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55386e-05;OID=.;OPOS=221912361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:94:93:1:41:53:0:0:41:52:0:0 chr1 221912808 . T C 257.73 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0137522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.115;QD=19.8256;RBI=0.0229372;REFB=-0.00948141;REVB=-0.0183574;RO=25;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389473;STB=0.521723;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00804238;OID=.;OPOS=221912808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:12:15:15:10:12:15:15:10 chr1 222649341 . A C 240.01 PASS AF=1;AO=17;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7692;QD=50.529;RBI=0.222014;REFB=0;REVB=0.221874;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00726725;OID=.;OPOS=222649341;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:17:19:1:7:10:0:0:9:10:0:0 chr1 222696021 . C T 195.26 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0165504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1865;QD=14.2006;RBI=0.021194;REFB=-0.0191991;REVB=0.013239;RO=32;SAF=12;SAR=11;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117241;STB=0.566872;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0259392;OID=.;OPOS=222696021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:11:12:13:19:11:12:13:19 chr1 222713503 . C G 271.69 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00828292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.785;QD=14.6859;RBI=0.00848477;REFB=-0.0341203;REVB=0.00183975;RO=43;SAF=18;SAR=13;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715794;STB=0.54061;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.038613;OID=.;OPOS=222713503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:13:18:22:21:13:18:22:21 chr1 222713631 . G C 376.24 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0135107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6909;QD=21.1963;RBI=0.0155047;REFB=-0.0278278;REVB=-0.00760636;RO=33;SAF=13;SAR=25;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152523;STB=0.584522;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0248216;OID=.;OPOS=222713631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:25:13:17:16:25:13:17:16 chr1 222721288 . C T 71.06 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0339281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.269;QD=18.9486;RBI=0.0377878;REFB=-0.0322715;REVB=-0.0166375;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137772;STB=0.578784;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0170211;OID=.;OPOS=222721288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:5:1:3:6:5:1 chr1 222798106 . G A 1051.36 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00203077;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.088;QD=58.4086;RBI=0.0163484;REFB=-0.113429;REVB=0.0162218;RO=1;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106271;STB=0.505616;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000394872;OID=.;OPOS=222798106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:72:1:1:71:71:0.986111:44:27:0:1:44:27:0:1 chr1 222802006 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.158;QD=56.9382;RBI=0.0829909;REFB=0;REVB=0.0610098;RO=0;SAF=13;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469419;OID=.;OPOS=222802006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:40:13:0:0:40:13:0:0 chr1 222802376 . A G 216.29 PASS AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.000749474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.011;QD=29.8325;RBI=0.00568669;REFB=-0.00964679;REVB=0.00563709;RO=9;SAF=11;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182625;STB=0.600584;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00536059;OID=.;OPOS=222802376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:9:11:2:7:9:11:2:7 chr1 222802803 . T G 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0173531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.847;QD=22.3411;RBI=0.0189996;REFB=-0.00328188;REVB=0.00773645;RO=14;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193404;STB=0.609247;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00177539;OID=.;OPOS=222802803;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:13:5:7:7:13:5:7:7 chr1 222802926 . C T 380.49 PASS AF=0.965517;AO=16;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.057408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.824;QD=52.482;RBI=0.057827;REFB=0.0365812;REVB=0.00694818;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.514276;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.000612748;OID=.;OPOS=222802926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:16:28:0.965517:7:9:1:0:11:17:1:0 chr1 222803204 . A G 226.87 PASS AF=0.471698;AO=24;DP=52;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00900953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.075;QD=17.122;RBI=0.0123037;REFB=-0.0195933;REVB=-0.00837913;RO=28;SAF=17;SAR=7;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246887;STB=0.645881;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0250729;OID=.;OPOS=222803204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:28:28:24:25:0.471698:7:17:13:15:7:18:13:15 chr1 222823529 . A C 256.09 PASS AF=0.491228;AO=27;DP=64;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0353152;FXX=0.123058;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2639;QD=17.9714;RBI=0.0709307;REFB=-0.0335782;REVB=0.0615142;RO=26;SAF=7;SAR=20;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33177;STB=0.676953;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0373112;OID=.;OPOS=222823529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:57:26:29:27:28:0.491228:20:7:16:10:20:8:18:11 chr1 222825403 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0735556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3091;QD=57.2025;RBI=0.0735852;REFB=0;REVB=0.0020868;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100504;OID=.;OPOS=222825403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr1 222833601 . T C 1478.92 PASS AF=0.990099;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0100955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.521;QD=58.5713;RBI=0.0262405;REFB=-0.0420061;REVB=0.0242207;RO=1;SAF=41;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114286;STB=0.506023;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000163132;OID=.;OPOS=222833601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:101:1:1:99:100:0.990099:58:41:1:0:59:41:1:0 chr1 222838216 . C T 522.51 PASS AF=1;AO=27;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438129;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.608;QD=59.7149;RBI=0.0649798;REFB=0;REVB=0.0479876;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832041;OID=.;OPOS=222838216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:35:0:0:27:35:1:16:11:0:0:16:19:0:0 chr1 222886119 . A G 1058.68 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3356;QD=58.8153;RBI=0.0609437;REFB=0;REVB=-0.0584352;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000923005;OID=.;OPOS=222886119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:40:30:0:0:40:32:0:0 chr1 222919895 . T G 868.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.169;QD=57.8842;RBI=0.0440048;REFB=0;REVB=0.00978729;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140726;OID=.;OPOS=222919895;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:31:28:0:0:31:29:0:0 chr1 222923351 . A G 1287.19 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0292634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2407;QD=60.5738;RBI=0.0360119;REFB=0.0258633;REVB=0.0209883;RO=1;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997231;STB=0.505262;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.00396055;OID=.;OPOS=222923351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:47:37:0:1:47:37:0:1 chr1 223116240 . G A 668.01 PASS AF=0.555556;AO=64;DP=116;FAO=65;FDP=117;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0109913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.844;QD=22.8379;RBI=0.0149187;REFB=-0.0193337;REVB=0.0100875;RO=52;SAF=34;SAR=30;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376495;STB=0.517236;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0117275;OID=.;OPOS=223116240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:52:52:64:65:0.555556:30:34:30:22:30:35:30:22 chr1 223176849 . AT AA,A 48.34 PASS AF=0.075,0.3;AO=3,10;DP=40;FAO=3,12;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=0,8;FSAR=3,4;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0960202,-0.184768;FXX=0.0243843;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=15.9992,7.72862;QD=4.83381;RBI=0.120544,0.190954;REFB=-0.068123,-0.124647;REVB=0.0728764,0.0482074;RO=19;SAF=0,4;SAR=3,6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.590079,-0.0813642;STB=0.995976,0.654286;STBP=0.123,0.186;TYPE=snp,del;VARB=0.0305119,0.00962659;OID=.,.;OPOS=223176850,223176850;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.075,0.3:3,10:40:3,12:40:25:0,8:3,4:11:14:31:19:0,4:3,6:9:10 chr1 223178561 . A C 678.43 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.984;QD=61.6754;RBI=0.037914;REFB=0;REVB=0.0356962;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184992;OID=.;OPOS=223178561;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:44:0:0:40:44:1:15:25:0:0:19:25:0:0 chr1 223283910 . A G 724.08 PASS AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.012073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.369;QD=59.1087;RBI=0.0148108;REFB=0.0228876;REVB=-0.00857928;RO=2;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494209;STB=0.526304;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00110943;OID=.;OPOS=223283910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:49:49:2:2:47:47:0.959184:18:29:0:2:18:29:0:2 chr1 223394228 . T C 152.12 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0107749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8264;QD=13.2274;RBI=0.0117786;REFB=-0.00535573;REVB=-0.00475775;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363426;STB=0.714019;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00907871;OID=.;OPOS=223394228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:13:4:16:13:13:4:16:13 chr1 223396838 . G T 296.72 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.0083884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1728;QD=15.617;RBI=0.0163481;REFB=-0.0197759;REVB=0.0140319;RO=42;SAF=20;SAR=13;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089984;STB=0.555523;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0175231;OID=.;OPOS=223396838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:43:33:33:0.434211:13:20:29:13:13:20:30:13 chr1 223536702 . TTGC T 232.92 PASS AF=0.366972;AO=65;DP=145;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=2;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=52;FWDB=-0.0271563;FXX=0.355009;HRUN=2;LEN=3;MLLD=210.181;QD=8.54753;RBI=0.0332401;REFB=-0.0263777;REVB=-0.0191687;RO=63;SAF=28;SAR=37;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165025;STB=0.800234;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.0380934;OID=.;OPOS=223536703;OREF=TGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.366972:65:145:40:109:69:2:38:17:52:99:63:28:37:26:37 chr1 223715248 . GT G 210.15 PASS AF=0.435294;AO=33;DP=86;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0761334;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.1991;QD=9.88919;RBI=0.0775023;REFB=-0.0176203;REVB=-0.0145024;RO=49;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155838;STB=0.536362;STBP=0.584;TYPE=del;VARB=0.0239108;OID=.;OPOS=223715249;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.435294:33:86:37:85:48:17:20:19:29:99:49:13:20:20:29 chr1 223717484 . G A 372.2 PASS AF=0.645833;AO=31;DP=48;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.012302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0397;QD=31.0169;RBI=0.0291697;REFB=-0.0118812;REVB=0.0264487;RO=17;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169481;STB=0.592884;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00610686;OID=.;OPOS=223717484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:17:17:31:31:0.645833:19:12:11:6:19:12:11:6 chr1 223718651 . G A 396.6 PASS AF=0.460674;AO=32;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0233627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.796;QD=17.8246;RBI=0.0236527;REFB=-0.0103659;REVB=0.00369233;RO=40;SAF=10;SAR=22;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959308;STB=0.533096;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0155521;OID=.;OPOS=223718651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:40:48:32:41:0.460674:22:10:16:24:23:18:24:24 chr1 223718670 . G A 363.51 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0024934;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.186;QD=17.7321;RBI=0.0084726;REFB=-0.00555935;REVB=-0.0080974;RO=44;SAF=17;SAR=21;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00695167;STB=0.503889;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00639263;OID=.;OPOS=223718670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:0.463415:21:17:20:24:21:17:20:24 chr1 223722780 . G A 354.29 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0069131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.951;QD=21.4723;RBI=0.0319547;REFB=-0.0169087;REVB=-0.031198;RO=30;SAF=20;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00926141;STB=0.505117;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0146582;OID=.;OPOS=223722780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:16:20:17:13:16:20:17:13 chr1 223813586 . G T 179.7 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.000626841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.9;QD=15.626;RBI=0.0104799;REFB=-0.00370881;REVB=-0.0104612;RO=27;SAF=5;SAR=14;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109537;STB=0.562439;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00613048;OID=.;OPOS=223813586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:14:5:5:22:14:5:5:22 chr1 223877789 . T C 1377.3 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0818073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0002;QD=62.6046;RBI=0.0860539;REFB=0;REVB=0.0266989;RO=0;SAF=28;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437326;OID=.;OPOS=223877789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:60:28:0:0:60:28:0:0 chr1 223900408 . C G 1062.35 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000232949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7823;QD=59.8509;RBI=0.038957;REFB=0;REVB=0.0389563;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177829;OID=.;OPOS=223900408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:29:41:0:0:30:41:0:0 chr1 223900544 . A G 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.00684922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.888;QD=19.6924;RBI=0.00684942;REFB=-0.0114055;REVB=5.29687e-05;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288922;STB=0.660676;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00784381;OID=.;OPOS=223900544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:11:15:6:19:11:15:6:19 chr1 223905532 . G A 70.5 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.017741;FXX=0.11534;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.148;QD=12.2608;RBI=0.039018;REFB=-0.0156755;REVB=-0.0347514;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196246;STB=0.554337;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0525206;OID=.;OPOS=223905532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:24:23:12:14:9:9:0.391304:4:5:9:3:4:5:9:5 chr1 223933094 . C T 486.35 PASS AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00693191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.638;QD=21.378;RBI=0.00693839;REFB=-0.000871864;REVB=-0.000299765;RO=44;SAF=24;SAR=23;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010585;STB=0.505847;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00083466;OID=.;OPOS=223933094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:23:24:23:21:23:24:23:21 chr1 223934720 . G A 1208.68 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00109916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.918;QD=61.199;RBI=0.0193965;REFB=0;REVB=-0.0193653;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.77468e-05;OID=.;OPOS=223934720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0 chr1 223954080 . A C 306.13 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0493453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5608;QD=15.6987;RBI=0.049582;REFB=-0.00984721;REVB=0.00483919;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851494;STB=0.547917;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0163828;OID=.;OPOS=223954080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:18:16:17:27:18:16:17:27 chr1 223984272 . C T 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00878854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.321;QD=10.2403;RBI=0.0700659;REFB=-0.0124008;REVB=-0.0695126;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13765;STB=0.583166;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0178978;OID=.;OPOS=223984272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:6:4:10:9:6:4:10:9 chr1 224301869 . G A 142.61 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0477522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3168;QD=14.2607;RBI=0.0561517;REFB=-0.0167225;REVB=0.0295422;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295006;STB=0.670525;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0345089;OID=.;OPOS=224301869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:10:6:16:8:10:6:16:8 chr1 224346959 . G A 330.64 PASS AF=0.589286;AO=25;DP=54;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0029012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.371;QD=23.6172;RBI=0.0049622;REFB=-0.0103344;REVB=0.00402573;RO=20;SAF=18;SAR=7;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195884;STB=0.537526;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00481632;OID=.;OPOS=224346959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:20:23:25:33:0.589286:7:18:14:6:9:24:15:8 chr1 224492746 . C T 598.21 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235217;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3718;QD=61.3544;RBI=0.0391946;REFB=0;REVB=-0.031352;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.58856e-05;OID=.;OPOS=224492746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr1 224495852 . C T 1617.17 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8532;QD=59.8953;RBI=0.084352;REFB=0;REVB=-0.0748004;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000201535;OID=.;OPOS=224495852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:55:52:0:0:56:52:0:0 chr1 224505570 . T A,TAA 350.53 PASS AF=0.0769231,0.923077;AO=3,22;DP=27;FAO=2,24;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=1,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132558,-0.0748402;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=222.272,42.21;QD=53.9273;RBI=0.0138425,0.0759264;REFB=0,0;REVB=-0.00398722,0.0127967;RO=1;SAF=1,13;SAR=2,9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.266641,-0.0342405;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0377365,-0.00105934;OID=.,.;OPOS=224505570,224505571;OREF=T,-;OALT=A,AA;OMAPALT=A,TAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:27:26:1:0:3,22:2,24:0.0769231,0.923077:2,9:1,13:1:0:1,11:1,13:0:0 chr1 224517842 . C T 340.89 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0282;QD=54.5431;RBI=0.0605555;REFB=0;REVB=-0.0408283;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85803e-05;OID=.;OPOS=224517842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:6:18:0:0:6:19:0:0 chr1 224575373 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00739193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.947;QD=63.8715;RBI=0.0440771;REFB=0;REVB=0.0434529;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142706;OID=.;OPOS=224575373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr1 225230608 . C T 322.82 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.011172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1867;QD=19.2729;RBI=0.0405541;REFB=-0.0226009;REVB=-0.0389849;RO=33;SAF=24;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101055;STB=0.556417;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0188267;OID=.;OPOS=225230608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:10:24:20:13:10:24:20:13 chr1 225266966 . C G 342.47 PASS AF=0.564516;AO=33;DP=60;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.000456453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9541;QD=22.0951;RBI=0.0143398;REFB=0.00399852;REVB=-0.0143325;RO=27;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220302;STB=0.510652;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=-0.00284111;OID=.;OPOS=225266966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:27:27:33:35:0.564516:15:18:14:13:16:19:14:13 chr1 225268343 . A G 53.66 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.027096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4883;QD=7.95012;RBI=0.0683964;REFB=0.00755323;REVB=-0.0628003;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273982;STB=0.673008;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.0206188;OID=.;OPOS=225268343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:6:2:9:10:6:2:9:10 chr1 225268346 . G A 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0495412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.424;QD=7.46491;RBI=0.0503647;REFB=-0.0150264;REVB=0.00907019;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281128;STB=0.678486;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0342386;OID=.;OPOS=225268346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:9:8:5:2:9:8 chr1 225270409 . A T 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0322143;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=139.141;QD=19.6684;RBI=0.0458093;REFB=-0.00759073;REVB=0.0325689;RO=19;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143117;STB=0.58111;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00864988;OID=.;OPOS=225270409;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:7:12:9:10:7:12:9:10 chr1 225273248 . G T 371.87 PASS AF=0.578125;AO=33;DP=61;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.00421244;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.843;QD=23.2419;RBI=0.0197975;REFB=-0.0292353;REVB=-0.0193441;RO=28;SAF=15;SAR=18;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112731;STB=0.580603;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0156353;OID=.;OPOS=225273248;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:64:28:27:33:37:0.578125:18:15:9:19:19:18:8:19 chr1 225288534 . A C 157.03 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00729799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.827;QD=16.1053;RBI=0.0165472;REFB=-0.00692113;REVB=0.0148508;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117594;STB=0.567489;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00775794;OID=.;OPOS=225288534;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:13:9:9:8:13:9 chr1 225373072 . C T 469.07 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0153076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.39;QD=20.3945;RBI=0.0153121;REFB=-0.00957368;REVB=0.000374044;RO=45;SAF=21;SAR=25;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290371;STB=0.510927;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0127164;OID=.;OPOS=225373072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:46:46:46:0.5:25:21:22:23:25:21:22:24 chr1 225463772 . A G 183.07 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0300782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4764;QD=13.314;RBI=0.0307134;REFB=0.00847027;REVB=-0.00621445;RO=32;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194828;STB=0.61808;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.0119157;OID=.;OPOS=225463772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:33:22:22:0.4:11:11:10:22:11:11:10:23 chr1 225506294 . A G 298.32 PASS AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0277964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8637;QD=13.5598;RBI=0.0426378;REFB=0.00447047;REVB=0.0323317;RO=54;SAF=17;SAR=17;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199119;STB=0.511357;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=-0.00514508;OID=.;OPOS=225506294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:54:34:34:0.386364:17:17:26:28:17:17:26:28 chr1 225528183 . C A 286.88 PASS AF=0.414634;AO=31;DP=79;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00679417;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.157;QD=13.9941;RBI=0.00682584;REFB=-0.0110558;REVB=-0.000656754;RO=48;SAF=11;SAR=20;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202174;STB=0.576324;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0157317;OID=.;OPOS=225528183;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:82:48:48:31:34:0.414634:20:11:26:22:20:14:26:22 chr1 225533684 . A G 355.51 PASS AF=0.396226;AO=41;DP=104;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=7.73053e-06;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.839;QD=13.4155;RBI=0.0555904;REFB=-0.00819637;REVB=0.0555904;RO=62;SAF=30;SAR=11;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109648;STB=0.541381;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00978737;OID=.;OPOS=225533684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:62:64:41:42:0.396226:11:30:40:22:12:30:42:22 chr1 225533731 . T A 518.42 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=9;FWDB=0.00310701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.488;QD=22.7875;RBI=0.00726274;REFB=-0.0133419;REVB=-0.00656459;RO=40;SAF=33;SAR=16;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983407;STB=0.56138;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0112111;OID=.;OPOS=225533731;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:40:42:49:49:0.538462:16:33:31:9:16:33:33:9 chr1 225534219 . T C 368.57 PASS AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.00179713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.213;QD=19.3984;RBI=0.0112546;REFB=-0.0147389;REVB=-0.0111102;RO=38;SAF=25;SAR=13;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283945;STB=0.657812;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0116617;OID=.;OPOS=225534219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:13:25:13:25:13:25:13:25 chr1 225534348 . G A 224.87 PASS AF=0.470588;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0130278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.86;QD=17.6372;RBI=0.0160513;REFB=-0.036798;REVB=0.00937665;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13982;STB=0.588164;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0409665;OID=.;OPOS=225534348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:27:27:23:24:0.470588:12:11:9:18:12:12:9:18 chr1 225541899 . C T 643.45 PASS AF=0.52459;AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.0024837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.448;QD=21.0968;RBI=0.0164487;REFB=-0.0218812;REVB=-0.0162601;RO=58;SAF=37;SAR=27;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127515;STB=0.570086;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0168482;OID=.;OPOS=225541899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:58:58:64:64:0.52459:27:37:25:33:27:37:25:33 chr1 225565015 . T C 198.01 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0702977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9128;QD=11.1556;RBI=0.0706195;REFB=-0.00562361;REVB=-0.00673381;RO=46;SAF=10;SAR=15;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343761;STB=0.697153;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0183749;OID=.;OPOS=225565015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:46:46:25:25:0.352113:15:10:33:13:15:10:33:13 chr1 225565073 . C T 168.03 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00962347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.492;QD=11.7917;RBI=0.0100265;REFB=-0.000457383;REVB=-0.00281427;RO=36;SAF=9;SAR=12;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167286;STB=0.596923;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00095605;OID=.;OPOS=225565073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:12:9:21:15:12:9:21:15 chr1 225569241 . T G 488.91 PASS AF=0.452991;AO=51;DP=119;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.000554222;FXX=0.0249979;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.705;QD=16.715;RBI=0.00549481;REFB=-0.00853217;REVB=0.00546679;RO=63;SAF=32;SAR=19;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902916;STB=0.55182;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00971939;OID=.;OPOS=225569241;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:117:63:64:51:53:0.452991:19:32:34:29:20:33:34:30 chr1 225601647 . C T 576.23 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.779;QD=60.6561;RBI=0.0608293;REFB=0;REVB=0.0561545;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000513178;OID=.;OPOS=225601647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:20:17:0:0:21:17:0:0 chr1 225607144 . C T 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.045;QD=59.6793;RBI=0.0195507;REFB=0;REVB=0.0125693;RO=0;SAF=22;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31724e-05;OID=.;OPOS=225607144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:48:22:0:0:48:22:0:0 chr1 225609884 . A G 2335.71 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00424815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.917;QD=63.5567;RBI=0.00443602;REFB=0;REVB=0.0012773;RO=0;SAF=81;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.25873e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01747e-05;OID=.;OPOS=225609884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:147:0:0:144:147:1:63:81:0:0:66:81:0:0 chr1 225611661 . C T 1473.29 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.942;QD=63.3671;RBI=0.0508887;REFB=0;REVB=0.0188889;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101714;OID=.;OPOS=225611661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:0:0:91:93:1:52:39:0:0:53:40:0:0 chr1 225682560 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0265;QD=52.6124;RBI=0.0183622;REFB=0;REVB=-0.0177956;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000385794;OID=.;OPOS=225682560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:11:11:0:0 chr1 226016558 . G C 641.9 PASS AF=0.924528;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=53;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00318271;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.946;QD=48.4454;RBI=0.0306178;REFB=-0.171317;REVB=0.0304519;RO=3;SAF=22;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599513;STB=0.54165;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00241817;OID=.;OPOS=226016558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:52:53:3:4:49:49:0.924528:27:22:3:0:27:22:4:0 chr1 226019633 . T C 754.42 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.705;QD=56.9371;RBI=0.0323872;REFB=0;REVB=0.0168756;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249558;OID=.;OPOS=226019633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:22:30:0:0:22:31:0:0 chr1 226027630 . A G 341.49 PASS AF=0.392157;AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0118522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1595;QD=13.3919;RBI=0.0356844;REFB=-0.0042293;REVB=-0.0336587;RO=62;SAF=18;SAR=22;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088012;STB=0.549975;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0079086;OID=.;OPOS=226027630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:62:62:40:40:0.392157:22:18:33:29:22:18:33:29 chr1 226054333 . G A 834.39 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1583;QD=57.5441;RBI=0.0498825;REFB=0;REVB=0.0488643;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035469;OID=.;OPOS=226054333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0 chr1 226055595 . G A 593.22 PASS AF=1;AO=37;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0732615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.803;QD=59.3221;RBI=0.0775774;REFB=0;REVB=0.0255147;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263051;OID=.;OPOS=226055595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:37:40:1:21:16:0:0:24:16:0:0 chr1 226474132 . G A 335.13 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0233417;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.359;QD=14.2609;RBI=0.0252797;REFB=-0.00664751;REVB=-0.00970705;RO=57;SAF=15;SAR=22;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129871;STB=0.573873;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0104539;OID=.;OPOS=226474132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:57:57:37:37:0.393617:22:15:30:27:22:15:30:27 chr1 226570840 . T C 635.38 PASS AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0108571;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=196.517;QD=49.8338;RBI=0.0140675;REFB=-0.176117;REVB=0.00894528;RO=3;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625489;STB=0.533319;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.000500554;OID=.;OPOS=226570840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:51:51:3:3:46:46:0.901961:21:25:0:3:21:25:0:3 chr1 226573364 . A G 109.27 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0104243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.285;QD=14.0991;RBI=0.0141732;REFB=-0.0265715;REVB=0.00960281;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061658;STB=0.536026;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0270521;OID=.;OPOS=226573364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:8:10:8:5:8:10 chr1 226589833 . T C 82.32 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0196898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.776;QD=19.3688;RBI=0.0220888;REFB=0.00023805;REVB=0.0100113;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211612;STB=0.512171;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.000190262;OID=.;OPOS=226589833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:6:4:3:4:6:4:3:4 chr1 226613233 . T C 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.319;QD=57.1774;RBI=0.0246391;REFB=0;REVB=0.00842605;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1131e-05;OID=.;OPOS=226613233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0 chr1 226613287 . A G 96.81 PASS AF=0.4;AO=10;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0640646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4143;QD=12.9074;RBI=0.143726;REFB=0.0364925;REVB=-0.128658;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245627;STB=0.615195;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.0692912;OID=.;OPOS=226613287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:30:30:15:18:10:12:0.4:3:7:7:8:5:7:7:11 chr1 226633767 . C T 767.99 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.175863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.844;QD=62.6928;RBI=0.176019;REFB=0;REVB=0.00742463;RO=1;SAF=18;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025416;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170997;OID=.;OPOS=226633767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:1:0:48:49:1:30:18:1:0:30:19:0:0 chr1 226819535 . C G 31.75 PASS AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0887471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5668;QD=2.70244;RBI=0.0949582;REFB=-0.0205981;REVB=-0.0337789;RO=40;SAF=4;SAR=2;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414646;STB=0.778435;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.149986;OID=.;OPOS=226819535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:47:47:40:41:6:6:0.12766:2:4:12:28:2:4:13:28 chr1 226819833 . A G 124.79 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00295944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2226;QD=17.8268;RBI=0.0216968;REFB=-0.0193137;REVB=0.021494;RO=12;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277455;STB=0.634404;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0292889;OID=.;OPOS=226819833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:12:14:14:14:0.5:11:3:6:6:11:3:6:8 chr1 226923264 . G A 372.06 PASS AF=0.654545;AO=25;DP=56;FAO=36;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0560044;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9235;QD=27.0589;RBI=0.158991;REFB=-0.0794116;REVB=0.148801;RO=18;SAF=16;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675575;STB=0.536811;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0575826;OID=.;OPOS=226923264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:18:19:25:36:0.654545:9:16:10:8:19:17:11:8 chr1 226923505 . G T 512.03 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0194293;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.502;QD=56.8922;RBI=0.0306111;REFB=0.0818057;REVB=0.0236547;RO=1;SAF=16;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283378;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000384772;OID=.;OPOS=226923505;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:36:1:1:35:35:0.972222:19:16:1:0:19:16:1:0 chr1 226923938 . A C 854.12 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00467802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.688;QD=56.0076;RBI=0.00767364;REFB=0.00222135;REVB=-0.00608283;RO=1;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011949;STB=0.506327;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-6.94777e-05;OID=.;OPOS=226923938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:39:21:0:1:39:21:0:1 chr1 226924642 . C T 135.74 PASS AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0213287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0818;QD=27.1488;RBI=0.118581;REFB=-0.00826999;REVB=0.116647;RO=6;SAF=2;SAR=12;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385962;STB=0.71963;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0163883;OID=.;OPOS=226924642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:12:2:4:2:12:2:4:2 chr1 227069677 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.781;QD=55.0987;RBI=0.0344055;REFB=0;REVB=0.0166932;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.08158e-05;OID=.;OPOS=227069677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr1 227069737 . C T 91.23 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.025459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.448;QD=17.3773;RBI=0.0261691;REFB=-0.0364667;REVB=-0.00605492;RO=10;SAF=9;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400039;STB=0.734219;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0321784;OID=.;OPOS=227069737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:2:9:4:6:2:9:4:6 chr1 227071525 . C T 404.59 PASS AF=0.655172;AO=38;DP=58;FAO=38;FDP=58;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00255842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0989;QD=27.9029;RBI=0.00347811;REFB=-0.0206168;REVB=0.00235621;RO=20;SAF=15;SAR=23;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131621;STB=0.571785;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0104335;OID=.;OPOS=227071525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:20:20:38:38:0.655172:23:15:12:8:23:15:12:8 chr1 227172290 . C T 258.61 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00463321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7964;QD=16.4198;RBI=0.00574397;REFB=0.00451859;REVB=-0.00339508;RO=34;SAF=10;SAR=19;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236396;STB=0.63324;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00326743;OID=.;OPOS=227172290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:19:10:20:14:19:10:20:14 chr1 227174210 . T C 499.58 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=-0.00416694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.911;QD=16.9348;RBI=0.023207;REFB=-0.00330889;REVB=0.0228298;RO=62;SAF=31;SAR=23;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0871006;STB=0.546177;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0043338;OID=.;OPOS=227174210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:64:54:54:0.457627:23:31:41:21:23:31:42:22 chr1 227177731 . A T 405.05 PASS AF=0.444444;AO=46;DP=101;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0131618;FXX=0.0198;HRUN=5;LEN=1;MLLD=280.161;QD=16.3655;RBI=0.0131815;REFB=-0.011667;REVB=0.000719406;RO=55;SAF=23;SAR=23;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265835;STB=0.50253;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0167781;OID=.;OPOS=227177731;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:55:55:46:44:0.444444:23:23:26:29:23:21:26:29 chr1 227178127 . A G 84.26 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00325521;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.889;QD=9.62922;RBI=0.0582092;REFB=-0.0113108;REVB=0.0581181;RO=24;SAF=9;SAR=2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32379;STB=0.700886;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.020671;OID=.;OPOS=227178127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:36:35:24:24:11:11:0.314286:2:9:14:10:2:9:14:10 chr1 227178948 . G A 753.15 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00915165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.033;QD=61.4812;RBI=0.0339329;REFB=0.0029059;REVB=-0.0326755;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209034;STB=0.511106;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.00136476;OID=.;OPOS=227178948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:26:22:1:0:26:22:1:0 chr1 227178962 . T C 138.91 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0221861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7567;QD=12.0794;RBI=0.0258024;REFB=-0.00037223;REVB=0.0131736;RO=30;SAF=3;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451335;STB=0.768871;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.000974217;OID=.;OPOS=227178962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:13:3:17:13:13:3:17:13 chr1 227182033 . G A 764.12 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00173865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.752;QD=56.6016;RBI=0.0669515;REFB=0;REVB=0.0669289;RO=0;SAF=41;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18464e-05;OID=.;OPOS=227182033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:11:41:0:0:13:41:0:0 chr1 227182575 . A G 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.775;QD=57.7122;RBI=0.0392939;REFB=0;REVB=0.00648009;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209531;OID=.;OPOS=227182575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chr1 227216662 . T C 267.38 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00537489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4683;QD=13.7116;RBI=0.012233;REFB=-0.00287783;REVB=0.0109889;RO=47;SAF=11;SAR=20;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191003;STB=0.609065;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00569651;OID=.;OPOS=227216662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:20:11:25:22:20:11:25:22 chr1 227216775 . C T 369.64 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00697884;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.797;QD=21.7433;RBI=0.00700157;REFB=-0.000105024;REVB=0.000563728;RO=31;SAF=14;SAR=23;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630472;STB=0.534865;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.000196689;OID=.;OPOS=227216775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:23:14:14:17:23:14:14:17 chr1 227221123 . G A 212.31 PASS AF=0.525;AO=20;DP=39;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0070501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.442;QD=21.2313;RBI=0.00806;REFB=-0.0131963;REVB=0.00390637;RO=18;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884096;STB=0.546173;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0142401;OID=.;OPOS=227221123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:18:19:20:21:0.525:15:5:6:12:15:6:7:12 chr1 227681475 . T C 1082.65 PASS AF=0.550505;AO=101;DP=190;FAO=109;FDP=198;FR=.;FRO=89;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=0.0263188;FXX=0.0388331;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.389;QD=21.8717;RBI=0.0684792;REFB=-0.0296301;REVB=0.0632197;RO=83;SAF=49;SAR=52;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526401;STB=0.523845;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.030499;OID=.;OPOS=227681475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:198:83:89:101:109:0.550505:52:49:35:48:53:56:41:48 chr1 227954677 . C T 182.21 PASS AF=0.383333;AO=22;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00650915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.677;QD=12.1473;RBI=0.0491668;REFB=-0.0168225;REVB=0.0487341;RO=35;SAF=15;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217514;STB=0.605288;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0278124;OID=.;OPOS=227954677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:37:22:23:0.383333:7:15:17:18:8:15:18:19 chr1 227954689 . C T 219.21 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0230734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.775;QD=13.9183;RBI=0.0244568;REFB=-0.0170902;REVB=0.00810891;RO=37;SAF=18;SAR=8;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24942;STB=0.642744;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0295754;OID=.;OPOS=227954689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:8:18:17:20:8:18:17:20 chr1 228033197 . A G 268.21 PASS AF=0.54;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0238755;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.948;QD=21.4565;RBI=0.0245309;REFB=-0.0258159;REVB=0.00563276;RO=22;SAF=14;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587174;STB=0.521529;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.023182;OID=.;OPOS=228033197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:22:23:27:27:0.54:13:14:13:9:13:14:13:10 chr1 228294567 . C T 322.89 PASS AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.000206046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.482;QD=14.1929;RBI=0.013524;REFB=-0.0107942;REVB=-0.0135225;RO=55;SAF=21;SAR=15;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605277;STB=0.534431;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0152784;OID=.;OPOS=228294567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:15:21:29:26:15:21:29:26 chr1 228335328 . C T 167.32 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0327555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.911;QD=11.7417;RBI=0.0327569;REFB=-0.0268602;REVB=0.000299092;RO=34;SAF=12;SAR=9;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838926;STB=0.525749;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.049502;OID=.;OPOS=228335328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:36:21:21:0.368421:9:12:22:12:9:12:22:14 chr1 228347352 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.597;QD=53.2772;RBI=0.0475589;REFB=0;REVB=-0.0427165;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330727;OID=.;OPOS=228347352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0 chr1 228352160 . T C 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.729;QD=51.915;RBI=0.0244416;REFB=0;REVB=0.0160453;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300221;OID=.;OPOS=228352160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr1 228399482 . C G 885.25 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.064;QD=58.0495;RBI=0.0101338;REFB=0;REVB=-0.0023101;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78332e-05;OID=.;OPOS=228399482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0 chr1 228399505 . CG C 34.04 PASS AF=0.22807;AO=15;DP=58;FAO=13;FDP=57;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.0165172;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.4881;QD=2.38903;RBI=0.1164;REFB=-0.0550853;REVB=-0.115222;RO=41;SAF=5;SAR=10;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426412;STB=0.830851;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=0.123525;OID=.;OPOS=228399506;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.22807:15:58:13:57:44:3:10:31:13:34:41:5:10:29:12 chr1 228399766 . T C 289.61 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.304;QD=52.6566;RBI=0.0136974;REFB=0;REVB=0.0135414;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.9728e-05;OID=.;OPOS=228399766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:14:7:0:0:15:7:0:0 chr1 228402047 . A G 1677.28 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4055;QD=60.4426;RBI=0.0448744;REFB=0;REVB=-0.0365345;RO=0;SAF=71;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.46616e-05;OID=.;OPOS=228402047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:40:71:0:0:40:71:0:0 chr1 228402121 . A G 1451.17 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394221;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.356;QD=63.0944;RBI=0.041442;REFB=0;REVB=0.0127804;RO=0;SAF=61;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.36587e-05;OID=.;OPOS=228402121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:30:61:0:0:30:62:0:0 chr1 228444565 . T A 517.83 PASS AF=1;AO=32;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182155;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.993;QD=59.1801;RBI=0.04261;REFB=0;REVB=0.0385202;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00258856;OID=.;OPOS=228444565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:32:35:1:15:17:0:0:18:17:0:0 chr1 228461068 . G T 349.28 PASS AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00138212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.269;QD=25.4019;RBI=0.0310931;REFB=-0.0648031;REVB=0.0310623;RO=19;SAF=15;SAR=19;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561371;STB=0.513506;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0266645;OID=.;OPOS=228461068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:19:21:34:34:0.618182:19:15:10:9:19:15:10:11 chr1 228461129 . A G 218.06 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0162891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3819;QD=15.5757;RBI=0.0303794;REFB=-0.0209993;REVB=-0.0256432;RO=31;SAF=8;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106232;STB=0.56039;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0221138;OID=.;OPOS=228461129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:17:8:13:18:17:8:13:18 chr1 228464248 . T G 203.52 PASS AF=0.403226;AO=22;DP=59;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00552496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.76;QD=13.1302;RBI=0.0189135;REFB=-0.02285;REVB=0.0180885;RO=37;SAF=7;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192045;STB=0.605392;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0362572;OID=.;OPOS=228464248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:62:37:37:22:25:0.403226:15:7:18:19:17:8:18:19 chr1 228464276 . T C 169.51 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.01578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.768;QD=10.5941;RBI=0.0259414;REFB=-0.0198632;REVB=-0.02059;RO=42;SAF=8;SAR=14;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208157;STB=0.621665;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0310387;OID=.;OPOS=228464276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:14:8:23:19:14:8:23:19 chr1 228467711 . G A 490.97 PASS AF=0.398551;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=138;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=49;FSRR=34;FWDB=-0.0278162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.077;QD=14.2309;RBI=0.0425984;REFB=-0.0410737;REVB=-0.0322627;RO=81;SAF=30;SAR=25;SRF=47;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372373;STB=0.52736;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0639433;OID=.;OPOS=228467711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:81:83:55:55:0.398551:25:30:47:34:25:30:49:34 chr1 228468244 . G A 402.15 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0326784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.823;QD=21.7376;RBI=0.0340439;REFB=-0.00624189;REVB=-0.0095451;RO=33;SAF=24;SAR=16;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020595;STB=0.519543;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00464039;OID=.;OPOS=228468244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:34:40:40:0.540541:16:24:19:14:16:24:19:15 chr1 228469870 . C T 308.5 PASS AF=0.425;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0229692;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.925;QD=15.4248;RBI=0.0244484;REFB=-0.0323282;REVB=0.00837482;RO=45;SAF=17;SAR=17;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03363;STB=0.512493;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0345963;OID=.;OPOS=228469870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:45:46:34:34:0.425:17:17:24:21:17:17:24:22 chr1 228469903 . AG TT 208.1 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00424209;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.219;QD=13.4258;RBI=0.00907361;REFB=-0.0116579;REVB=0.00802092;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762365;STB=0.536394;STBP=0.682;TYPE=mnp;VARB=0.0177691;OID=.;OPOS=228469903;OREF=AG;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:37:25:25:0.403226:10:15:19:17:10:15:20:17 chr1 228476366 . GA TT 149.25 PASS AF=0.551724;AO=14;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0564472;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=143.651;QD=20.5861;RBI=0.0589102;REFB=-0.0258411;REVB=0.0168562;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22989;STB=0.575126;STBP=0.42;TYPE=mnp;VARB=0.0329828;OID=.;OPOS=228476366;OREF=GA;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:13:13:14:16:0.551724:4:10:6:7:6:10:6:7 chr1 228476414 . G A 239.38 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0224316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.42;QD=20.816;RBI=0.0237804;REFB=-0.0395298;REVB=0.00789513;RO=23;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0236526;OID=.;OPOS=228476414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:11:12:12:11:11:12:12:11 chr1 228480282 . A G 409.37 PASS AF=0.518987;AO=40;DP=77;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0288707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.944;QD=20.7278;RBI=0.0302874;REFB=-0.0186975;REVB=-0.0091546;RO=37;SAF=17;SAR=23;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192427;STB=0.603631;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0123847;OID=.;OPOS=228480282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:37:38:40:41:0.518987:23:17:24:13:24:17:24:14 chr1 228480346 . C G 615.62 PASS AF=0.508197;AO=62;DP=122;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.011573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.348;QD=20.1841;RBI=0.0116134;REFB=-0.0320519;REVB=-0.00096781;RO=58;SAF=42;SAR=20;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166082;STB=0.601314;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0201457;OID=.;OPOS=228480346;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:58:60:62:62:0.508197:20:42:29:29:20:42:29:31 chr1 228494696 . G A 423.33 PASS AF=0.577465;AO=40;DP=69;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0091276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.858;QD=23.8497;RBI=0.0273416;REFB=-0.0410572;REVB=0.0257731;RO=29;SAF=24;SAR=16;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649671;STB=0.53667;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0346995;OID=.;OPOS=228494696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:29:30:40:41:0.577465:16:24:15:14:17:24:15:15 chr1 228503677 . A G 178.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00377273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.632;QD=14.8513;RBI=0.04582;REFB=-0.0229283;REVB=-0.0456644;RO=29;SAF=9;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454997;STB=0.526288;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0358921;OID=.;OPOS=228503677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:10:9:15:14:10:9:15:14 chr1 228504472 . T C 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0165993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6419;QD=11.3692;RBI=0.0492212;REFB=-0.0209214;REVB=-0.0463377;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18633;STB=0.610583;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0289683;OID=.;OPOS=228504472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:7:12:5:6:7:12 chr1 228505204 . G A 275.81 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0430932;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7947;QD=17.5116;RBI=0.116972;REFB=-0.0149384;REVB=0.108745;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129604;STB=0.572584;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0168806;OID=.;OPOS=228505204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:63:33:33:30:30:0.47619:14:16:13:20:14:16:13:20 chr1 228505668 . C G 218.06 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00582326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.051;QD=15.5756;RBI=0.0268667;REFB=-0.0167964;REVB=-0.0262281;RO=31;SAF=15;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835894;STB=0.547407;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.014805;OID=.;OPOS=228505668;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:10:15:16:15:10:15:16:15 chr1 228505699 . T C 80.88 PASS AF=0.255814;AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0393437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3127;QD=7.52325;RBI=0.0432503;REFB=-0.0312603;REVB=-0.0179628;RO=32;SAF=1;SAR=10;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382483;STB=0.751298;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0830186;OID=.;OPOS=228505699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:43:43:32:32:11:11:0.255814:10:1:9:23:10:1:9:23 chr1 228505727 . C T 150.38 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0206038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.072;QD=12.276;RBI=0.0273973;REFB=-0.0184733;REVB=-0.0180582;RO=32;SAF=2;SAR=15;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260737;STB=0.657674;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.031162;OID=.;OPOS=228505727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:15:2:8:24:15:2:8:24 chr1 228505750 . C T 165.53 PASS AF=0.362069;AO=20;DP=57;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0593319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1853;QD=11.4158;RBI=0.0602076;REFB=-0.0198617;REVB=0.0102314;RO=37;SAF=3;SAR=17;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171103;STB=0.610051;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0495805;OID=.;OPOS=228505750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:37:37:20:21:0.362069:17:3:9:28:18:3:9:28 chr1 228509427 . A G 361.34 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0224752;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6263;QD=20.0743;RBI=0.0420455;REFB=-0.0434734;REVB=-0.0355344;RO=35;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097033;STB=0.553852;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0379113;OID=.;OPOS=228509427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:35:35:37:37:0.513889:16:21:16:19:16:21:16:19 chr1 228526665 . T C 2605.76 PASS AF=0.994118;AO=169;DP=170;FAO=169;FDP=170;FR=.;FRO=1;FSAF=92;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.067548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.605;QD=61.3121;RBI=0.0675548;REFB=-0.115326;REVB=-0.000960168;RO=0;SAF=92;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98145e-08;STB=0.503225;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000149129;OID=.;OPOS=228526665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:170:170:0:1:169:169:0.994118:77:92:0:0:77:92:0:1 chr1 228528563 . C G 801.07 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.212;QD=57.2191;RBI=0.0433137;REFB=0;REVB=0.0138633;RO=0;SAF=39;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119138;OID=.;OPOS=228528563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:17:39:0:0:17:39:0:0 chr1 228548197 . G A 332.75 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298801;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.605;QD=55.4589;RBI=0.0376306;REFB=0;REVB=0.0228743;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155388;OID=.;OPOS=228548197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr1 228548419 . GCCC GCC,GCCCG 34.27 PASS AF=0,0.127451;AO=47,16;DP=106;FAO=0,13;FDP=102;FR=.;FRO=89;FSAF=0,1;FSAR=0,12;FSRF=50;FSRR=39;FWDB=-0.764312,-0.0754562;FXX=0.0377323;HRUN=3,0;LEN=1,1;MLLD=20.7531,117.626;QD=1.34403;RBI=0.76938,0.0947304;REFB=-0.0110577,-0.000826433;REVB=-0.0881615,-0.0572731;RO=36;SAF=45,0;SAR=2,16;SRF=3;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0.588004,0;SSSB=0.796674,-0.728605;STB=0.5,0.922427;STBP=1,0;TYPE=del,ins;VARB=0.0627548,0.159187;OID=.,.;OPOS=228548420,228548423;OREF=C,-;OALT=-,G;OMAPALT=GCC,GCCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.127451:47,16:106:0,13:102:89:0,1:0,12:50:39:34:36:45,0:2,16:3:33 chr1 228550426 . C T 2552.4 PASS AF=0.988166;AO=167;DP=169;FAO=167;FDP=169;FR=.;FRO=2;FSAF=74;FSAR=93;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0108056;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=87.4344;QD=60.4119;RBI=0.0609838;REFB=-0.0811424;REVB=0.0600188;RO=2;SAF=74;SAR=93;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126867;STB=0.506666;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.000257655;OID=.;OPOS=228550426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:169:169:2:2:167:167:0.988166:93:74:2:0:93:74:2:0 chr1 228558891 . CCG CC,C 321.76 PASS AF=1,0;AO=20,6;DP=33;FAO=33,0;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.248604,-0.0817148;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=16.7911,6.55676;QD=39.0013;RBI=0.257793,0.0837454;REFB=0,0;REVB=0.0682154,-0.0183298;RO=6;SAF=5,6;SAR=15,0;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.384615,0.416667;SSSB=-0.129507,0.759974;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0135397,0;OID=.,.;OPOS=228558893,228558892;OREF=G,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:20,6:33:33,0:33:0:15,0:18,0:0:0:6:6:5,6:15,0:3:3 chr1 228559994 . C T 1246.08 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.579;QD=61.5349;RBI=0.0459092;REFB=0;REVB=-0.00448981;RO=0;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156301;OID=.;OPOS=228559994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:42:39:0:0:42:39:0:0 chr1 228560139 . A G 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.513;QD=53.9107;RBI=0.0583289;REFB=0;REVB=-0.0480573;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117093;OID=.;OPOS=228560139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0 chr1 228560700 . T C 2708.45 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00665789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5168;QD=62.2631;RBI=0.055983;REFB=0;REVB=-0.0555857;RO=0;SAF=81;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145279;OID=.;OPOS=228560700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:174:0:0:173:174:1:92:81:0:0:93:81:0:0 chr1 228564884 . G A 400.88 PASS AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00788488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.718;QD=24.296;RBI=0.0180922;REFB=-0.0378401;REVB=0.0162836;RO=26;SAF=18;SAR=21;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508192;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0282558;OID=.;OPOS=228564884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:26:27:39:39:0.590909:21:18:12:14:21:18:13:14 chr1 228602660 . G C 597.08 PASS AF=0.5;AO=61;DP=122;FAO=61;FDP=122;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0147414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7851;QD=19.5762;RBI=0.0250596;REFB=-0.0313263;REVB=-0.0202652;RO=61;SAF=24;SAR=37;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154904;STB=0.508553;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0277538;OID=.;OPOS=228602660;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:61:61:61:61:0.5:37:24:25:36:37:24:25:36 chr1 228612838 . G T 285.09 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00506463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.602;QD=23.7579;RBI=0.0130993;REFB=-0.000937456;REVB=-0.0120806;RO=22;SAF=13;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112334;STB=0.562453;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00103769;OID=.;OPOS=228612838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:13:13:8:14:13:13:8:14 chr1 228699477 . T C 180.71 PASS AF=0.413043;AO=20;DP=47;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00878707;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0507;QD=15.714;RBI=0.0256476;REFB=-0.0231915;REVB=-0.0240954;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194604;STB=0.517223;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.055401;OID=.;OPOS=228699477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:25:27:20:19:0.413043:10:10:13:12:9:10:15:12 chr1 228743499 . C A 1549.42 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718162;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8884;QD=59.0255;RBI=0.0723259;REFB=0;REVB=-0.00857127;RO=1;SAF=54;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870632;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431355;OID=.;OPOS=228743499;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:104:105:1:0:103:105:1:49:54:1:0:49:56:0:0 chr1 229386237 . T A 142.1 PASS AF=0.484848;AO=15;DP=34;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0230089;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.053;QD=17.2243;RBI=0.031117;REFB=-0.0206288;REVB=0.0209489;RO=17;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21177;STB=0.631402;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0190669;OID=.;OPOS=229386237;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:17:17:15:16:0.484848:4:11:9:8:4:12:9:8 chr1 229622162 . A G 236.21 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.106954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7079;QD=17.497;RBI=0.109916;REFB=-0.00142169;REVB=-0.0253476;RO=28;SAF=13;SAR=13;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988874;STB=0.555513;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00365162;OID=.;OPOS=229622162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:13:13:17:11:13:13:17:11 chr1 229623338 . T C 290.8 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0117249;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5241;QD=19.0689;RBI=0.0227088;REFB=-0.00436675;REVB=-0.0194478;RO=31;SAF=27;SAR=4;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410861;STB=0.738418;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00689099;OID=.;OPOS=229623338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:31:30:31:31:0.508197:4:27:17:14:4:27:16:14 chr1 229631734 . T C 219.17 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0208507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1769;QD=13.9157;RBI=0.0210404;REFB=-0.0156195;REVB=0.00281848;RO=37;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066033;STB=0.537672;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.023004;OID=.;OPOS=229631734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:11:15:19:18:11:15:19:18 chr1 229635521 . A G 433.68 PASS AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00420199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2337;QD=23.442;RBI=0.0132836;REFB=-0.0112277;REVB=0.0126015;RO=32;SAF=19;SAR=23;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118308;STB=0.506499;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.01052;OID=.;OPOS=229635521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:23:19:14:18:23:19:14:18 chr1 229652698 . G T 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00388381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.607;QD=18.2512;RBI=0.0119603;REFB=-0.0181605;REVB=0.0113121;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174999;STB=0.599867;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0125785;OID=.;OPOS=229652698;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:6:9:6:9:6:9:6:9 chr1 229663064 . GAGGAA G 215.7 PASS AF=1;AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00954092;FXX=0.105208;HRUN=1;LEN=5;MLLD=237.351;QD=50.7534;RBI=0.0209258;REFB=0;REVB=0.0186242;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000226705;OID=.;OPOS=229663065;OREF=AGGAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:17:19:17:17:0:2:15:0:0:4:0:2:15:0:0 chr1 229683264 . G A 300.43 PASS AF=0.464789;AO=32;DP=73;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00263248;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.927;QD=16.9254;RBI=0.00287829;REFB=-0.0106598;REVB=-0.00116389;RO=38;SAF=18;SAR=14;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016172;STB=0.518124;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0072754;OID=.;OPOS=229683264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:38:38:32:33:0.464789:14:18:22:16:15:18:22:16 chr1 229737680 . C T 305.04 PASS AF=0.485294;AO=32;DP=67;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0151831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.923;QD=17.9436;RBI=0.0235598;REFB=-0.0169114;REVB=0.0180149;RO=35;SAF=15;SAR=17;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647249;STB=0.543802;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0136541;OID=.;OPOS=229737680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:35:35:32:33:0.485294:17:15:14:21:17:16:14:21 chr1 229738170 . T G 433.3 PASS AF=0.458333;AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00341059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.201;QD=18.054;RBI=0.0151545;REFB=-0.00653417;REVB=0.0147658;RO=52;SAF=24;SAR=20;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119777;STB=0.506689;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0105686;OID=.;OPOS=229738170;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:52:52:44:44:0.458333:20:24:29:23:20:24:29:23 chr1 229738236 . G A 957.89 PASS AF=0.897436;AO=69;DP=77;FAO=70;FDP=78;FR=.;FRO=8;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00967138;FXX=0.0126566;HRUN=6;LEN=1;MLLD=115.949;QD=49.1227;RBI=0.0265515;REFB=-0.11542;REVB=0.0247275;RO=7;SAF=30;SAR=39;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519251;STB=0.518792;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00108331;OID=.;OPOS=229738236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:77:78:7:8:69:70:0.897436:39:30:1:6:40:30:2:6 chr1 229750036 . C T 323.82 PASS AF=0.378641;AO=39;DP=103;FAO=39;FDP=103;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.00286183;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.488;QD=12.5755;RBI=0.0144237;REFB=-0.00871074;REVB=-0.014137;RO=64;SAF=26;SAR=13;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188882;STB=0.608051;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0119013;OID=.;OPOS=229750036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:64:64:39:39:0.378641:13:26:32:32:13:26:32:32 chr1 229772693 . T G 88.79 PASS AF=0.458333;AO=9;DP=22;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00445307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.173;QD=14.7976;RBI=0.00459036;REFB=-0.037029;REVB=0.00111426;RO=13;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198262;STB=0.649179;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0442419;OID=.;OPOS=229772693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:22:24:13:13:9:11:0.458333:7:2:5:8:9:2:5:8 chr1 229772932 . A G 310.09 PASS AF=0.388889;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00838039;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=315.283;QD=13.7819;RBI=0.0126595;REFB=-0.0115555;REVB=-0.00948847;RO=55;SAF=11;SAR=24;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160291;STB=0.509139;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0164218;OID=.;OPOS=229772932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:55:35:35:0.388889:24:11:18:37:24:11:18:37 chr1 229773441 . C T 377.09 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0426362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7954;QD=13.9662;RBI=0.0428827;REFB=0.00416042;REVB=-0.00459155;RO=64;SAF=19;SAR=25;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274558;STB=0.515497;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.0147177;OID=.;OPOS=229773441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:25:19:26:38:25:19:26:38 chr1 229790048 . A G 2409.0 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7514;QD=64.2399;RBI=0.0651459;REFB=0;REVB=-0.0651106;RO=0;SAF=68;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279051;OID=.;OPOS=229790048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:82:68:0:0:82:68:0:0 chr1 230384937 . T C 1264.71 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.403;QD=61.6934;RBI=0.0165806;REFB=0;REVB=0.00586552;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01655e-05;OID=.;OPOS=230384937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:49:33:0:0:49:33:0:0 chr1 230417557 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000233594;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.825;QD=56.7066;RBI=0.0288907;REFB=0;REVB=0.0288897;RO=0;SAF=25;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10829e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106377;OID=.;OPOS=230417557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:4:25:0:0:4:25:0:0 chr1 230417560 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6932;QD=56.7063;RBI=0.049456;REFB=0;REVB=0.031484;RO=0;SAF=25;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10829e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001181;OID=.;OPOS=230417560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:4:25:0:0:4:25:0:0 chr1 230461079 . G A 389.08 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0270363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.572;QD=18.751;RBI=0.02724;REFB=-0.00445855;REVB=0.0033251;RO=43;SAF=27;SAR=13;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072259;STB=0.54034;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00405984;OID=.;OPOS=230461079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:13:27:26:17:13:27:26:17 chr1 230814431 . A G 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00921198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.521;QD=51.1821;RBI=0.042269;REFB=0;REVB=0.041253;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176459;OID=.;OPOS=230814431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr1 230841687 . T C 1114.53 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.846;QD=60.2451;RBI=0.0434855;REFB=0;REVB=-0.0433556;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022434;OID=.;OPOS=230841687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:43:31:0:0:43:31:0:0 chr1 230845794 . A G 257.08 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0198021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.847;QD=16.0673;RBI=0.0213331;REFB=-0.019987;REVB=-0.00793577;RO=35;SAF=16;SAR=13;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086808;STB=0.504893;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0172632;OID=.;OPOS=230845794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:13:16:19:16:13:16:19:16 chr1 230895279 . C T 283.91 PASS AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00744213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.588;QD=15.1419;RBI=0.029342;REFB=-0.0196226;REVB=0.0283825;RO=43;SAF=10;SAR=22;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680368;STB=0.538582;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0222126;OID=.;OPOS=230895279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:22:10:16:27:22:10:16:27 chr1 230898397 . A G 284.93 PASS AF=0.375;AO=33;DP=88;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.001775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.229;QD=12.9513;RBI=0.0209897;REFB=-0.0130678;REVB=0.0209145;RO=54;SAF=13;SAR=20;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289643;STB=0.658952;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0136868;OID=.;OPOS=230898397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:55:33:33:0.375:20:13:36:18:20:13:36:19 chr1 230898494 . C T 267.02 PASS AF=0.340426;AO=32;DP=94;FAO=32;FDP=94;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=0.0373584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9773;QD=11.3623;RBI=0.0373591;REFB=-0.00524709;REVB=-0.000240849;RO=61;SAF=10;SAR=22;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395701;STB=0.73132;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00865387;OID=.;OPOS=230898494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:61:62:32:32:0.340426:22:10:41:20:22:10:42:20 chr1 230903350 . T C 220.35 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00401071;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.532;QD=15.4632;RBI=0.00480517;REFB=0.0014431;REVB=-0.00264649;RO=29;SAF=20;SAR=5;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40885;STB=0.729958;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.000976591;OID=.;OPOS=230903350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:57:29:32:25:25:0.438596:5:20:12:17:5:20:14:18 chr1 230974609 . C T 257.54 PASS AF=0.340659;AO=29;DP=89;FAO=31;FDP=91;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00730413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.074;QD=11.3205;RBI=0.00784012;REFB=0.000179988;REVB=-0.00284906;RO=60;SAF=21;SAR=8;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201762;STB=0.631573;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.000369053;OID=.;OPOS=230974609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:60:60:29:31:0.340659:8:21:34:26:8:23:34:26 chr1 231057247 . A T 1482.68 PASS AF=0.990099;AO=86;DP=92;FAO=100;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4976;QD=58.7198;RBI=0.086003;REFB=0;REVB=0.0343977;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000900732;OID=.;OPOS=231057247;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:101:0:0:86:100:0.990099:46:40:0:0:57:43:0:0 chr1 231480431 . TTA T,TTT 65.87 PASS AF=0.17,0;AO=16,8;DP=112;FAO=17,0;FDP=100;FR=.;FRO=83;FSAF=5,0;FSAR=12,0;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=-0.0379,0.111587;FXX=0.0291234;HRUN=6,7;LEN=2,1;MLLD=23.6078,19.6048;QD=2.63465;RBI=0.16098,0.118531;REFB=-0.0180854,-0.000975214;REVB=-0.156455,-0.039975;RO=72;SAF=5,0;SAR=11,8;SRF=44;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0.368071,0;SSSB=-0.364834,-0.666665;STB=0.767923,0.5;STBP=0.023,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0908365,0;OID=.,.;OPOS=231480432,231480433;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.17,0:16,8:112:17,0:100:83:5,0:12,0:53:30:66:72:5,0:11,8:44:28 chr1 231488524 . C T 1293.36 PASS AF=0.977011;AO=86;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.024785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9333;QD=59.465;RBI=0.047967;REFB=0.00802096;REVB=0.0410675;RO=1;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01373;STB=0.502392;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=-0.00178538;OID=.;OPOS=231488524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:87:87:1:2:86:85:0.977011:34:52:0:1:34:51:1:1 chr1 232534957 . T C 440.56 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00413921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.452;QD=19.5805;RBI=0.00437311;REFB=-0.0463962;REVB=-0.00141104;RO=45;SAF=13;SAR=31;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862377;STB=0.556108;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0412336;OID=.;OPOS=232534957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:45:46:44:44:0.488889:31:13:17:28:31:13:18:28 chr1 232539219 . C T 456.18 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00360277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.973;QD=20.2748;RBI=0.00507219;REFB=-0.0160091;REVB=0.00357031;RO=45;SAF=26;SAR=19;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407641;STB=0.522603;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0172255;OID=.;OPOS=232539219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:45:45:45:45:0.5:19:26:24:21:19:26:24:21 chr1 232564162 . T C 271.04 PASS AF=0.54902;AO=27;DP=49;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0103637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7073;QD=21.2581;RBI=0.0280895;REFB=-0.0276411;REVB=-0.0261078;RO=22;SAF=18;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179339;STB=0.596471;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0575544;OID=.;OPOS=232564162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:22:23:27:28:0.54902:9:18:10:12:10:18:10:13 chr1 232574921 . T C 237.61 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0518293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1357;QD=13.7744;RBI=0.0566398;REFB=0.000225221;REVB=0.0228427;RO=40;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516604;STB=0.521724;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=-0.000856747;OID=.;OPOS=232574921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:14:14:22:18:14:14:22:19 chr1 232650750 . A G 444.74 PASS AF=0.449541;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=0.0117852;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.709;QD=16.3208;RBI=0.0185832;REFB=-0.015742;REVB=-0.0143682;RO=59;SAF=27;SAR=22;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189188;STB=0.600405;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0190572;OID=.;OPOS=232650750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:59:60:49:49:0.449541:22:27:21:38:22:27:22:38 chr1 232650867 . C T 413.03 PASS AF=0.552632;AO=36;DP=71;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0151936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.417;QD=21.7381;RBI=0.0272562;REFB=-0.0356649;REVB=-0.0226286;RO=32;SAF=22;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123176;STB=0.592547;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0252038;OID=.;OPOS=232650867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:76:32:34:36:42:0.552632:14:22:15:17:14:28:16:18 chr1 232941153 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.779;QD=33.4285;RBI=0.0604238;REFB=0;REVB=0.0292386;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309278;OID=.;OPOS=232941153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr1 232941390 . C G 212.77 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00507505;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.7017;QD=20.2641;RBI=0.0164573;REFB=-0.0276282;REVB=-0.0156552;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105504;STB=0.547899;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0275481;OID=.;OPOS=232941390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:21:21:21:0.5:12:9:11:9:12:9:11:10 chr1 232944569 . C T 382.72 PASS AF=0.616667;AO=37;DP=60;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00395326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.4;QD=25.5145;RBI=0.00539797;REFB=-0.0135956;REVB=-0.00367557;RO=23;SAF=22;SAR=15;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746298;STB=0.540775;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00814915;OID=.;OPOS=232944569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:23:23:37:37:0.616667:15:22:16:7:15:22:16:7 chr1 232944926 . A T 243.91 PASS AF=0.589744;AO=22;DP=38;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.03984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.464;QD=25.0164;RBI=0.0455347;REFB=-0.00430718;REVB=0.0220494;RO=16;SAF=6;SAR=16;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371029;STB=0.503934;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.00294134;OID=.;OPOS=232944926;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:16:16:22:23:0.589744:16:6:5:11:16:7:5:11 chr1 232967889 . T C 850.94 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.337;QD=56.7294;RBI=0.029064;REFB=0;REVB=0.0173177;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154654;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41738e-07;OID=.;OPOS=232967889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:1:0:58:60:1:28:30:1:0:28:32:0:0 chr1 233086483 . GC G,GG 200.22 PASS AF=0.84375,0.0625;AO=20,3;DP=28;FAO=27,2;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=14,1;FSAR=13,1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.172392,-0.111949;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.0392,8.47396;QD=25.0277;RBI=0.174681,0.172414;REFB=0.0226383,-0.0296295;REVB=-0.0281828,0.131125;RO=3;SAF=11,2;SAR=9,1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0520434,0.255936;STB=0.518505,0.599037;STBP=0.608,0.764;TYPE=del,snp;VARB=0.00178101,0.0955761;OID=.,.;OPOS=233086484,233086484;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.84375,0.0625:20,3:28:27,2:32:3:14,1:13,1:1:2:10:3:11,2:9,1:1:2 chr1 233388242 . A G 394.05 PASS AF=0.4;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0159353;FXX=0.00861995;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.0598;QD=13.7062;RBI=0.018999;REFB=-0.00537258;REVB=-0.0103455;RO=63;SAF=23;SAR=23;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244586;STB=0.539114;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00926014;OID=.;OPOS=233388242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:115:63:69:46:46:0.4:23:23:30:33:23:23:30:39 chr1 233398713 . C T 354.43 PASS AF=0.422222;AO=32;DP=87;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=0.0273937;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.529;QD=15.7526;RBI=0.027557;REFB=-0.0142385;REVB=0.00299563;RO=55;SAF=14;SAR=18;SRF=15;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191014;STB=0.608487;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0218462;OID=.;OPOS=233398713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:55:52:32:38:0.422222:18:14:15:40:20:18:15:37 chr1 233515413 . G A 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0058809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.056;QD=14.0965;RBI=0.00591646;REFB=-0.0170083;REVB=0.000647649;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299689;STB=0.676588;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0219266;OID=.;OPOS=233515413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:3:8:6:8:3:8:6:8 chr1 233518983 . G GT 182.07 PASS AF=0.265537;AO=44;DP=185;FAO=47;FDP=177;FR=.;FRO=130;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=-0.00835172;FXX=0.027471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.4514;QD=4.11455;RBI=0.0187352;REFB=-0.00956749;REVB=-0.0167707;RO=135;SAF=18;SAR=26;SRF=69;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128422;STB=0.550375;STBP=0.425;TYPE=ins;VARB=0.0240296;OID=.;OPOS=233518984;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.265537:44:185:47:177:130:21:26:67:63:99:135:18:26:69:66 chr1 233518998 . C T 368.18 PASS AF=0.281768;AO=51;DP=180;FAO=51;FDP=181;FR=.;FRO=130;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=70;FSRR=60;FWDB=-0.00450217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.563;QD=8.13651;RBI=0.0689481;REFB=-0.0141358;REVB=-0.0688009;RO=129;SAF=21;SAR=30;SRF=70;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159182;STB=0.590874;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0309462;OID=.;OPOS=233518998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:129:130:51:51:0.281768:30:21:70:59:30:21:70:60 chr1 233520845 . T C 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00637345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.521;QD=17.6896;RBI=0.0243727;REFB=0.00344169;REVB=0.0235246;RO=26;SAF=15;SAR=6;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422151;STB=0.739424;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00150162;OID=.;OPOS=233520845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:6:15:7:19:6:15:7:19 chr1 233759918 . T C 266.58 PASS AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0105004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.173;QD=13.4975;RBI=0.0123067;REFB=0.000513725;REVB=0.00641855;RO=48;SAF=14;SAR=17;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377253;STB=0.521509;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=-0.000757709;OID=.;OPOS=233759918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:17:14:20:28:17:14:20:28 chr1 233767008 . T A 189.87 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.000397991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.534;QD=11.3354;RBI=0.00706705;REFB=-0.0100217;REVB=-0.00705584;RO=42;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108572;STB=0.550979;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0151796;OID=.;OPOS=233767008;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:42:43:24:24:0.358209:15:9:12:30:15:9:13:30 chr1 233767023 . A G 179.03 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.066089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2826;QD=10.8502;RBI=0.0677482;REFB=-0.00461328;REVB=-0.0149014;RO=43;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07227;STB=0.54197;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00601439;OID=.;OPOS=233767023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:43:43:23:23:0.348485:13:10:16:27:13:10:16:27 chr1 233767059 . T C 126.79 PASS AF=0.285714;AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0119663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.782;QD=8.04983;RBI=0.0137975;REFB=-0.00668746;REVB=0.0068686;RO=45;SAF=7;SAR=11;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679603;STB=0.540938;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.027575;OID=.;OPOS=233767059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:45:45:18:18:0.285714:11:7:20:25:11:7:20:25 chr1 233785786 . A C 1659.59 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.913;QD=60.3486;RBI=0.0133177;REFB=0;REVB=0.0128051;RO=0;SAF=52;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53715e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87744e-05;OID=.;OPOS=233785786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:110:0:0:109:110:1:57:52:0:0:57:53:0:0 chr1 234442257 . A T 797.83 PASS AF=0.606557;AO=74;DP=122;FAO=74;FDP=122;FR=.;FRO=48;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.000272121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.722;QD=26.1582;RBI=0.0154786;REFB=0.00214204;REVB=0.0154762;RO=48;SAF=45;SAR=29;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140604;STB=0.576384;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.000688807;OID=.;OPOS=234442257;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:48:48:74:74:0.606557:29:45:20:28:29:45:20:28 chr1 234509259 . G C 655.26 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493129;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.253;QD=62.4058;RBI=0.0551794;REFB=0;REVB=0.024759;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.26772e-05;OID=.;OPOS=234509259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0 chr1 234529552 . C T 1102.5 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0279043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.103;QD=58.8002;RBI=0.0325774;REFB=-0.0124862;REVB=0.0168118;RO=1;SAF=37;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126148;STB=0.506665;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=7.50319e-05;OID=.;OPOS=234529552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:37:37:1:0:37:37:1:0 chr1 234529570 . G A 884.21 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386058;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4058;QD=57.9812;RBI=0.043891;REFB=0;REVB=-0.0208809;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218804;OID=.;OPOS=234529570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:28:31:0:0:28:33:0:0 chr1 234546245 . C T 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.509;QD=63.2865;RBI=0.0192367;REFB=0;REVB=-0.00226182;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.89999e-05;OID=.;OPOS=234546245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0 chr1 234561541 . TA AT,T 101.14 PASS AF=0.0444444,0.622222;AO=3,22;DP=46;FAO=2,28;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=0,11;FSAR=2,17;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0054653,0.099459;FXX=0.0217344;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=59.9511,6.88546;QD=8.99007;RBI=0.0943186,0.0998577;REFB=-0.0540317,-0.177369;REVB=-0.0941602,-0.00891458;RO=16;SAF=0,8;SAR=3,14;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.594791,-0.0591331;STB=0.994165,0.526659;STBP=0.184,0.618;TYPE=mnp,del;VARB=0.0328168,0.19916;OID=.,.;OPOS=234561541,234561542;OREF=TA,A;OALT=AT,-;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:37:46:45:16:15:3,22:2,28:0.0444444,0.622222:3,14:0,8:7:9:2,17:0,11:7:8 chr1 234569192 . T C 235.54 PASS AF=0.394366;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0315832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.242;QD=13.2696;RBI=0.0342879;REFB=-0.0138603;REVB=-0.0133478;RO=42;SAF=12;SAR=16;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246325;STB=0.63232;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0215898;OID=.;OPOS=234569192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:42:43:28:28:0.394366:16:12:28:14:16:12:28:15 chr1 234582651 . T C 356.9 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.0140836;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.791;QD=16.4093;RBI=0.0150653;REFB=-0.0216239;REVB=0.00534947;RO=48;SAF=21;SAR=17;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235545;STB=0.636295;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.019966;OID=.;OPOS=234582651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:17:21:15:33:17:21:15:34 chr1 234584231 . C T 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0567559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.482;QD=11.1978;RBI=0.0583147;REFB=-0.017751;REVB=0.013393;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493258;STB=0.797341;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0272841;OID=.;OPOS=234584231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:10:2:13:9:10:2:13:9 chr1 234603322 . A T 214.37 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00577021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.082;QD=12.7982;RBI=0.00916216;REFB=-2.89694e-05;REVB=-0.00711687;RO=40;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275861;STB=0.65;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=7.50476e-06;OID=.;OPOS=234603322;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:10:16:14:26:10:16:15:26 chr1 234606998 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.882;QD=39.2068;RBI=0.0598414;REFB=0;REVB=-0.0143102;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000773412;OID=.;OPOS=234606998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr1 235040004 . G A 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.65;QD=60.9779;RBI=0.0397426;REFB=0;REVB=0.0340839;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100172;OID=.;OPOS=235040004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr1 235040045 . A G 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6153;QD=58.419;RBI=0.0260474;REFB=0;REVB=-0.0117375;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105057;OID=.;OPOS=235040045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0 chr1 235652513 . T C 926.19 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4982;QD=57.8868;RBI=0.060636;REFB=0;REVB=0.029099;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000916181;OID=.;OPOS=235652513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:34:28:0:0:36:28:0:0 chr1 235705001 . G T 954.89 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3552;QD=58.7625;RBI=0.0190657;REFB=0;REVB=-0.0174831;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261953;OID=.;OPOS=235705001;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0 chr1 235715523 . A G 1116.61 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4094;QD=60.3575;RBI=0.0165411;REFB=0;REVB=0.011385;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.15768e-05;OID=.;OPOS=235715523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0 chr1 236139141 . A T 73.11 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=13;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0429953;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=24.421;QD=19.4963;RBI=0.0680152;REFB=-0.0559514;REVB=0.0527017;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276405;STB=0.670882;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0354165;OID=.;OPOS=236139141;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:13:15:5:5:8:10:0.666667:5:3:4:1:7:3:4:1 chr1 236141174 . T C 464.21 PASS AF=0.451327;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0148723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.88;QD=16.4321;RBI=0.0235018;REFB=-0.015288;REVB=-0.0181975;RO=61;SAF=32;SAR=19;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550996;STB=0.536233;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0189558;OID=.;OPOS=236141174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:61:62:51:51:0.451327:19:32:35:26:19:32:35:27 chr1 236175327 . C A 233.67 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0170373;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.876;QD=16.9945;RBI=0.0188173;REFB=0.00475954;REVB=0.0079889;RO=29;SAF=4;SAR=22;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397486;STB=0.727738;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00362123;OID=.;OPOS=236175327;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:29:29:26:26:0.472727:22:4:14:15:22:4:14:15 chr1 236175339 . T C 230.79 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0314553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.313;QD=17.7534;RBI=0.0322506;REFB=-0.00498257;REVB=-0.00711783;RO=27;SAF=4;SAR=21;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381126;STB=0.718109;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00350332;OID=.;OPOS=236175339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:21:4:13:14:21:4:13:14 chr1 236208773 . C T 197.44 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0069251;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.547;QD=17.9492;RBI=0.0221493;REFB=0.000963566;REVB=-0.0210389;RO=25;SAF=17;SAR=3;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473355;STB=0.763743;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00106488;OID=.;OPOS=236208773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:25:24:20:20:0.454545:3:17:11:14:3:17:11:13 chr1 236381825 . G C 1080.23 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7841;QD=60.0128;RBI=0.0408513;REFB=0;REVB=0.0405726;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249276;OID=.;OPOS=236381825;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0 chr1 236389999 . C T 140.14 PASS AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0620118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.738;QD=10.3804;RBI=0.063427;REFB=-0.00492905;REVB=-0.0133236;RO=36;SAF=5;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207086;STB=0.623143;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00595909;OID=.;OPOS=236389999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:36:36:18:18:0.333333:13:5:16:20:13:5:16:20 chr1 236415347 . T C 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0119554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.592;QD=8.69141;RBI=0.0122113;REFB=-0.00814065;REVB=-0.002487;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323108;STB=0.51995;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0063351;OID=.;OPOS=236415347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:8:9:4:4:8:9 chr1 236557771 . G A 923.53 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0109667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.008;QD=56.8325;RBI=0.0316689;REFB=-0.0668489;REVB=0.0297095;RO=1;SAF=20;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230263;STB=0.512191;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.000246977;OID=.;OPOS=236557771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:44:20:1:0:44:20:1:0 chr1 236719135 . T C 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.889;QD=56.9369;RBI=0.0426522;REFB=0;REVB=-0.0223265;RO=0;SAF=40;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000371335;OID=.;OPOS=236719135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:13:40:0:0:13:40:0:0 chr1 236721731 . T C 1513.78 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1774;QD=59.364;RBI=0.0814358;REFB=0;REVB=0.062799;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000652739;OID=.;OPOS=236721731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:56:45:0:0:57:45:0:0 chr1 236755837 . C T 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00779224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.24;QD=9.13238;RBI=0.0136361;REFB=-0.00682002;REVB=-0.0111903;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106085;STB=0.50648;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0271967;OID=.;OPOS=236755837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:6:4:9:13:6:4:9:13 chr1 236758887 . T C 303.48 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0177177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.111;QD=22.0716;RBI=0.0404677;REFB=-0.0232503;REVB=0.0363829;RO=24;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119617;STB=0.565996;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.018887;OID=.;OPOS=236758887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:16:15:8:16:16:15:8:16 chr1 236767330 . A G 451.49 PASS AF=0.46875;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00399988;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.545;QD=18.812;RBI=0.0163802;REFB=-0.0285765;REVB=-0.0158843;RO=52;SAF=23;SAR=22;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476006;STB=0.521508;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0309089;OID=.;OPOS=236767330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:52:51:45:45:0.46875:22:23:24:28:22:23:24:27 chr1 236882303 . T C 1153.07 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.918;QD=60.6877;RBI=0.0415309;REFB=0;REVB=0.0317853;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104168;OID=.;OPOS=236882303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:44:31:0:0:44:32:0:0 chr1 236883421 . C T 972.33 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00189046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.917;QD=58.929;RBI=0.00935414;REFB=0;REVB=-0.00916112;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77433e-05;OID=.;OPOS=236883421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0 chr1 236925844 . G A 3282.54 PASS AF=0.990698;AO=213;DP=215;FAO=213;FDP=215;FR=.;FRO=2;FSAF=92;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0187136;FXX=0.00921617;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.547;QD=61.0704;RBI=0.0192684;REFB=-0.0954966;REVB=-0.00459035;RO=1;SAF=92;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00392122;STB=0.504098;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=2.35137e-05;OID=.;OPOS=236925844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:215:215:1:2:213:213:0.990698:121:92:0:1:121:92:0:2 chr1 237433625 . C T 2969.97 PASS AF=1;AO=188;DP=191;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026187;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.892;QD=63.1908;RBI=0.0286623;REFB=0.0233763;REVB=-0.011652;RO=1;SAF=90;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483427;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02484e-06;OID=.;OPOS=237433625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:191:188:1:0:188:188:1:98:90:0:1:98:90:0:0 chr1 237617757 . C T 1460.54 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205111;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.336;QD=62.1508;RBI=0.0226017;REFB=-0.0435548;REVB=0.00949369;RO=1;SAF=39;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869954;STB=0.504586;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000780832;OID=.;OPOS=237617757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:94:1:1:93:93:0.989362:54:39:0:1:54:39:0:1 chr1 237664108 . G T 729.41 PASS AF=0.461538;AO=75;DP=166;FAO=78;FDP=169;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.0173963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.206;QD=17.2641;RBI=0.0196349;REFB=-0.017115;REVB=0.00910483;RO=90;SAF=28;SAR=47;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084106;STB=0.535499;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0174204;OID=.;OPOS=237664108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:169:90:91:75:78:0.461538:47:28:41:49:47:31:42:49 chr1 237711797 . A G 1494.93 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311341;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3796;QD=63.614;RBI=0.0477251;REFB=0;REVB=0.0361711;RO=0;SAF=62;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438522;OID=.;OPOS=237711797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:32:62:0:0:32:62:0:0 chr1 237766753 . A G 192.84 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0193552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.873;QD=14.8341;RBI=0.0284029;REFB=-0.0128112;REVB=0.0207871;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101053;STB=0.557641;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0156242;OID=.;OPOS=237766753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:11:11:18:12:11:11:18:12 chr1 237801770 . T C 1610.31 PASS AF=0.981982;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0260381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0686;QD=58.0291;RBI=0.0335442;REFB=-0.171873;REVB=0.0211479;RO=0;SAF=43;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69419e-08;STB=0.501988;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00164462;OID=.;OPOS=237801770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:111:111:0:2:109:109:0.981982:66:43:0:0:66:43:1:1 chr1 237863718 . T G 901.93 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0404483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.226;QD=58.1887;RBI=0.0405172;REFB=0;REVB=-0.0023602;RO=0;SAF=20;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110897;OID=.;OPOS=237863718;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:42:20:0:0:42:20:0:0 chr1 237881770 . C T 2569.28 PASS AF=1;AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00892282;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.578;QD=61.9103;RBI=0.0318253;REFB=0;REVB=-0.0305488;RO=0;SAF=69;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.64595e-05;OID=.;OPOS=237881770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:166:166:0:0:166:166:1:97:69:0:0:97:69:0:0 chr1 237890437 . C T 2206.23 PASS AF=1;AO=138;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852868;FXX=0.0141834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.701;QD=63.4887;RBI=0.0227868;REFB=0;REVB=0.0211305;RO=0;SAF=63;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.92479e-05;OID=.;OPOS=237890437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:139:0:0:138:139:1:75:63:0:0:76:63:0:0 chr1 237905573 . T C 68.52 PASS AF=0.261538;AO=13;DP=61;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=15;FWDB=0.000725158;FXX=0.0151492;HRUN=15;LEN=1;MLLD=121.993;QD=4.21689;RBI=0.0363134;REFB=-0.0010053;REVB=-0.0363062;RO=45;SAF=3;SAR=10;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.565509;STB=0.852408;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0973894;OID=.;OPOS=237905573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:61:65:45:48:13:17:0.261538:10:3:33:12:14:3:33:15 chr1 237997087 . A G 314.83 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0288183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.041;QD=19.9893;RBI=0.0331237;REFB=-0.0105307;REVB=0.0163304;RO=30;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149722;STB=0.583282;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00398125;OID=.;OPOS=237997087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:21:12:16:14:21:12:16:14 chr1 238107035 . C G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=333.304;QD=57.8849;RBI=0.00440871;REFB=0;REVB=0.00393897;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83029e-06;OID=.;OPOS=238107035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0 chr1 238109693 . GTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT GTATATATATATATATA,GTATATATATATATATAT 88.47 PASS AF=0,1;AO=2,7;DP=9;FAO=0,9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475143,0.0503569;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=27,26;MLLD=932.558,956.541;QD=39.3178;RBI=0.0773974,0.0831958;REFB=0,0;REVB=0.0610963,0.0662248;RO=0;SAF=2,3;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.00061961;OID=.,.;OPOS=238109710,238109694;OREF=TATATATATATATATATATATATATAT,TATATATATATATATATATATATATA;OALT=-,-;OMAPALT=GTATATATATATATATA,GTATATATATATATATAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:2,7:9:0,9:9:0:0,5:0,4:0:0:4:0:2,3:0,4:0:0 chr1 238114860 . G A 955.76 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.789;QD=58.8159;RBI=0.00745084;REFB=0;REVB=0.00669414;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52319e-05;OID=.;OPOS=238114860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:25:39:0:0:26:39:0:0 chr1 238114934 . G A 1320.94 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.204;QD=62.162;RBI=0.0142776;REFB=0;REVB=0.0101162;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69294e-08;OID=.;OPOS=238114934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:39:45:0:0:39:46:0:0 chr1 238114936 . A G 1244.12 PASS AF=0.965116;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.011622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.79;QD=57.8662;RBI=0.0314628;REFB=0.0204353;REVB=0.0292376;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.507782;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-7.42757e-05;OID=.;OPOS=238114936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:82:86:0:3:82:83:0.965116:38:44:0:0:37:46:1:2 chr1 240073226 . C T 461.36 PASS AF=0.469388;AO=46;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00543347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.109;QD=18.8309;RBI=0.0144675;REFB=-0.00425341;REVB=0.0134084;RO=52;SAF=17;SAR=29;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12807;STB=0.571462;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00504878;OID=.;OPOS=240073226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:52:52:46:46:0.469388:29:17:26:26:29:17:26:26 chr1 240073619 . G A 41.79 PASS AF=0.184211;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=38;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0646382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1206;QD=4.39881;RBI=0.189178;REFB=-0.0425117;REVB=-0.177793;RO=31;SAF=1;SAR=6;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44954;STB=0.812576;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.159145;OID=.;OPOS=240073619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:38:31:31:7:7:0.184211:6:1:15:16:6:1:15:16 chr1 240074981 . A G 90.66 PASS AF=0.375;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.014518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.266;QD=11.3329;RBI=0.0264738;REFB=-0.0146934;REVB=0.022138;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301978;STB=0.693562;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0192599;OID=.;OPOS=240074981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:31:32:20:20:11:12:0.375:7:4:13:7:8:4:13:7 chr1 240076544 . C A 517.22 PASS AF=0.482456;AO=51;DP=109;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00311857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.561;QD=18.148;RBI=0.0174551;REFB=-0.0205746;REVB=-0.0171742;RO=56;SAF=21;SAR=30;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150612;STB=0.545438;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0209098;OID=.;OPOS=240076544;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:114:56:59:51:55:0.482456:30:21:32:24:30:25:32:27 chr1 240076975 . G A 270.53 PASS AF=0.54902;AO=27;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0246984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8977;QD=21.2182;RBI=0.0637534;REFB=-0.021688;REVB=0.0587749;RO=23;SAF=19;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165851;STB=0.597411;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0191115;OID=.;OPOS=240076975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:27:28:0.54902:8:19:12:11:8:20:12:11 chr1 240077023 . A G 125.23 PASS AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00283196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.171;QD=10.4362;RBI=0.0148117;REFB=-0.00135048;REVB=-0.0145385;RO=33;SAF=12;SAR=3;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396452;STB=0.740394;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00236453;OID=.;OPOS=240077023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:3:12:16:17:3:12:16:17 chr1 240370314 . G A 206.04 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0387221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9898;QD=16.8193;RBI=0.0408641;REFB=-0.0250032;REVB=0.0130565;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142763;STB=0.589309;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0310219;OID=.;OPOS=240370314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:28:21:21:0.428571:11:10:9:18:11:10:9:19 chr1 240458107 . CT C 40.58 PASS AF=0.370968;AO=20;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.22302;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.2355;QD=2.61805;RBI=0.264533;REFB=-0.0922604;REVB=0.142267;RO=30;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206671;STB=0.526737;STBP=0.767;TYPE=del;VARB=0.0860891;OID=.;OPOS=240458108;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.370968:20:62:23:62:39:11:12:17:22:40:30:12:8:12:18 chr1 240492414 . T C 221.98 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0027073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9752;QD=14.5558;RBI=0.00599314;REFB=-0.0167448;REVB=0.0053468;RO=35;SAF=12;SAR=14;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244776;STB=0.513913;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.020952;OID=.;OPOS=240492414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:14:12:17:18:14:12:17:18 chr1 240492734 . G A 815.54 PASS AF=0.531034;AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=46;FWDB=-0.0096827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.463;QD=22.4976;RBI=0.00975233;REFB=-0.00795166;REVB=-0.00116328;RO=68;SAF=42;SAR=35;SRF=22;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188281;STB=0.602952;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0125903;OID=.;OPOS=240492734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:68:68:77:77:0.531034:35:42:22:46:35:42:22:46 chr1 240497265 . A C 599.49 PASS AF=0.414634;AO=68;DP=164;FAO=68;FDP=164;FR=.;FRO=96;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=61;FWDB=0.0220081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.733;QD=14.6216;RBI=0.0233824;REFB=0.00410444;REVB=-0.00789807;RO=94;SAF=29;SAR=39;SRF=35;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579422;STB=0.537424;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.00516635;OID=.;OPOS=240497265;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:94:96:68:68:0.414634:39:29:35:59:39:29:35:61 chr1 241712134 . C T 939.91 PASS AF=0.477157;AO=94;DP=197;FAO=94;FDP=197;FR=.;FRO=103;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=0.00869233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.315;QD=19.0844;RBI=0.0108548;REFB=-0.00560048;REVB=-0.00650149;RO=102;SAF=50;SAR=44;SRF=50;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393975;STB=0.519252;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0061562;OID=.;OPOS=241712134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:102:103:94:94:0.477157:44:50:50:52:44:50:51:52 chr1 241907817 . T C 909.92 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00887786;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.135;QD=56.8699;RBI=0.0201659;REFB=-0.112248;REVB=0.0181065;RO=1;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129378;STB=0.506847;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-7.34622e-05;OID=.;OPOS=241907817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:64:1:1:63:63:0.984375:36:27:0:1:36:27:0:1 chr1 242020652 . C T 448.48 PASS AF=0.46875;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.0058481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.463;QD=18.6868;RBI=0.00704637;REFB=-0.0289945;REVB=0.00393078;RO=50;SAF=21;SAR=24;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828884;STB=0.55054;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.026547;OID=.;OPOS=242020652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:51:45:45:0.46875:24:21:19:31:24:21:19:32 chr1 242030151 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.217;QD=59.8383;RBI=0.0546105;REFB=0;REVB=0.0300249;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692391;OID=.;OPOS=242030151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr1 242042545 . A G 917.25 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00436555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.389;QD=58.2383;RBI=0.00676683;REFB=0;REVB=0.00517029;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39781e-05;OID=.;OPOS=242042545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0 chr1 242045275 . C T 2456.73 PASS AF=1;AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00851823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.368;QD=61.4182;RBI=0.0187537;REFB=0;REVB=-0.0167075;RO=0;SAF=88;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33094e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.0375e-06;OID=.;OPOS=242045275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:160:0:0:160:160:1:72:88:0:0:72:88:0:0 chr1 242048674 . C T 483.32 PASS AF=0.472727;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0211443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.005;QD=17.5755;RBI=0.0265378;REFB=0.00274356;REVB=-0.0160367;RO=57;SAF=21;SAR=31;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132899;STB=0.578491;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.00239122;OID=.;OPOS=242048674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:57:58:52:52:0.472727:31:21:31:26:31:21:32:26 chr1 242053030 . AT A 136.28 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0409351;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.7158;QD=8.79238;RBI=0.0418951;REFB=0.012809;REVB=0.00891726;RO=33;SAF=12;SAR=14;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529505;STB=0.538432;STBP=0.63;TYPE=del;VARB=-0.00809866;OID=.;OPOS=242053031;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.419355:26:62:26:62:36:12:14:19:17:99:33:12:14:17:16 chr1 242053042 . A G 288.07 PASS AF=0.535714;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0221917;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.874;QD=20.5765;RBI=0.0247676;REFB=-0.0208654;REVB=0.0109984;RO=26;SAF=17;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10676;STB=0.54901;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0250772;OID=.;OPOS=242053042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:26:26:29:30:0.535714:12:17:12:14:13:17:12:14 chr1 242222754 . A G 1591.78 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00525501;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.921;QD=64.3145;RBI=0.020253;REFB=0;REVB=0.0195594;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23648e-05;OID=.;OPOS=242222754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0 chr1 242687390 . G A 165.18 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0261675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.689;QD=12.4668;RBI=0.0466374;REFB=-0.00543077;REVB=0.0386046;RO=32;SAF=14;SAR=6;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904921;STB=0.565889;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0098727;OID=.;OPOS=242687390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:33:20:20:0.377358:6:14:20:12:6:14:20:13 chr1 243328887 . G T 84.47 PASS AF=0.205882;AO=14;DP=68;FAO=14;FDP=68;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.011053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.741;QD=4.96868;RBI=0.0110531;REFB=-0.00344302;REVB=-5.31141e-05;RO=52;SAF=9;SAR=5;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109801;STB=0.572263;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0179784;OID=.;OPOS=243328887;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:68:68:52:54:14:14:0.205882:5:9:29:23:5:9:30:24 chr1 243329049 . G A 209.7 PASS AF=0.269565;AO=30;DP=115;FAO=31;FDP=115;FR=.;FRO=84;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.00806657;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.492;QD=7.29375;RBI=0.00851482;REFB=-0.00699852;REVB=0.00272627;RO=83;SAF=22;SAR=8;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240271;STB=0.628103;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0232449;OID=.;OPOS=243329049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:83:84:30:31:0.269565:8:22:46:37:9:22:46:38 chr1 243329075 . T C 105.63 PASS AF=0.169492;AO=20;DP=117;FAO=20;FDP=118;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=51;FSRR=47;FWDB=0.0103037;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8335;QD=3.58064;RBI=0.0538943;REFB=0.00324901;REVB=-0.0529002;RO=97;SAF=16;SAR=4;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374873;STB=0.752498;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.0185436;OID=.;OPOS=243329075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:97:98:20:20:0.169492:4:16:51:46:4:16:51:47 chr1 243579112 . G A 767.49 PASS AF=0.98;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0438114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6404;QD=61.3989;RBI=0.0698515;REFB=-0.098244;REVB=0.054404;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200022;STB=0.50943;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0356113;OID=.;OPOS=243579112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:50:1:1:46:49:0.98:23:23:1:0:23:26:1:0 chr1 243666566 . AC AA,A 33.74 PASS AF=0.0126582,0.139241;AO=3,10;DP=78;FAO=1,11;FDP=79;FR=.;FRO=67;FSAF=0,1;FSAR=1,10;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0613962,0.101813;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=38.661,16.4013;QD=1.70843;RBI=0.0737608,0.110676;REFB=0.0051567,-0.00255812;REVB=0.0408799,0.0433969;RO=61;SAF=0,2;SAR=3,8;SRF=19;SRR=42;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.364917,-0.175579;STB=0.986809,0.806319;STBP=0.518,0.067;TYPE=snp,del;VARB=0.0170737,0.016607;OID=.,.;OPOS=243666567,243666567;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0126582,0.139241:3,10:78:1,11:79:67:0,1:1,10:22:45:28:61:0,2:3,8:19:42 chr1 244219563 . A G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.707;QD=57.1775;RBI=0.0191931;REFB=0;REVB=0.0153123;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75481e-05;OID=.;OPOS=244219563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0 chr1 244653781 . ATTTTTT ATTTTT,ATTTTTA 72.95 PASS AF=0.254545,0.0545455;AO=15,3;DP=55;FAO=14,3;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=5,2;FSAR=9,1;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.118767,-0.112124;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=10.6283,20.7933;QD=5.30523;RBI=0.240452,0.15059;REFB=-0.0100786,-0.005558;REVB=0.209073,0.100526;RO=27;SAF=6,2;SAR=9,1;SRF=9;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0773426,0.342387;STB=0.512031,0.774558;STBP=0.967,0.461;TYPE=del,snp;VARB=-0.0256431,-0.0112019;OID=.,.;OPOS=244653782,244653787;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.254545,0.0545455:15,3:55:14,3:55:38:5,2:9,1:13:25:56:27:6,2:9,1:9:18 chr1 244773784 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.83;QD=60.2305;RBI=0.0426675;REFB=0;REVB=0.0202639;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016647;OID=.;OPOS=244773784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr1 244773803 . T C 573.22 PASS AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0337834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.201;QD=55.9242;RBI=0.0345605;REFB=-0.110345;REVB=0.00728769;RO=2;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623593;STB=0.533316;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00153018;OID=.;OPOS=244773803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:14:25:0:2:14:25:0:2 chr1 245133489 . T G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=348.4;QD=33.4285;RBI=0.0421237;REFB=0;REVB=0.0421237;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192045;OID=.;OPOS=245133489;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr1 245133623 . T TCCTCC 109.12 PASS AF=0.916667;AO=10;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000307643;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=287.556;QD=36.374;RBI=0.00469581;REFB=0.0294457;REVB=0.00468572;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126911;STB=0.571292;STBP=0.289;TYPE=ins;VARB=-0.001623;OID=.;OPOS=245133624;OREF=-;OALT=CCTCC;OMAPALT=TCCTCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.916667:10:12:11:12:1:8:3:0:1:6:1:7:3:0:1 chr1 245133662 . G C 306.31 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9352;QD=53.2719;RBI=0.0459094;REFB=0;REVB=0.0457723;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141987;OID=.;OPOS=245133662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr1 245703990 . G T 581.87 PASS AF=0.416107;AO=60;DP=148;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=0.00874087;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.966;QD=15.6206;RBI=0.00882929;REFB=-0.00864447;REVB=0.00124641;RO=88;SAF=25;SAR=35;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124552;STB=0.570785;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0108428;OID=.;OPOS=245703990;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:88:87:60:62:0.416107:35:25:47:41:36:26:47:40 chr1 245704130 . G C 273.42 PASS AF=0.372093;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0184097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.069;QD=12.7172;RBI=0.020273;REFB=-0.00943303;REVB=0.00848984;RO=53;SAF=9;SAR=23;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516314;STB=0.525467;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.014712;OID=.;OPOS=245704130;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:54:32:32:0.372093:23:9:17:36:23:9:17:37 chr1 245850806 . G A 152.14 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.034496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3214;QD=13.2294;RBI=0.0699907;REFB=0.0064673;REVB=0.0608993;RO=29;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513012;STB=0.52988;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00709919;OID=.;OPOS=245850806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:11:6:9:20:11:6:9:20 chr1 245861571 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00738082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.575;QD=59.8386;RBI=0.01727;REFB=0;REVB=0.0156134;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51418e-05;OID=.;OPOS=245861571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr1 246670481 . C G 3449.34 PASS AF=1;AO=221;DP=222;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634104;FXX=0.0133923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1606;QD=62.4315;RBI=0.0665143;REFB=0.046542;REVB=0.0200815;RO=0;SAF=105;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47666e-05;OID=.;OPOS=246670481;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:222:221:0:0:221:221:1:116:105:0:0:116:105:0:0 chr1 246714587 . G A 244.1 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00283773;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.014;QD=18.7769;RBI=0.0086302;REFB=-0.00950605;REVB=-0.00815031;RO=26;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343872;STB=0.519273;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00826606;OID=.;OPOS=246714587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:12:14:13:13:12:14:13:13 chr1 246720798 . G A 769.49 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9085;QD=56.9991;RBI=0.0216548;REFB=0;REVB=-0.00766392;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000284111;OID=.;OPOS=246720798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:29:24:0:0:30:24:0:0 chr1 246755124 . T C 501.63 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.054214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8202;QD=59.0154;RBI=0.0555327;REFB=0;REVB=0.01203;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000505372;OID=.;OPOS=246755124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr1 246829616 . T C 1917.24 PASS AF=0.984496;AO=126;DP=130;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0104895;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.045;QD=59.4492;RBI=0.0115908;REFB=-0.189816;REVB=0.00493117;RO=0;SAF=67;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31893e-08;STB=0.500428;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000836602;OID=.;OPOS=246829616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:130:129:0:2:126:127:0.984496:59:67:0:0:60:67:1:1 chr1 246939513 . G A 1020.49 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.841;QD=56.6938;RBI=0.118074;REFB=-0.123025;REVB=0.117291;RO=1;SAF=34;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137031;STB=0.507244;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00366001;OID=.;OPOS=246939513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:72:72:1:1:70:71:0.986111:36:34:1:0:37:34:1:0 chr1 246942159 . G A 906.69 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480545;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.947;QD=58.4958;RBI=0.013675;REFB=0;REVB=-0.0128028;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.44768e-05;OID=.;OPOS=246942159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr1 247006051 . G C 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0242546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9136;QD=19.1804;RBI=0.024278;REFB=-0.0131062;REVB=-0.00106516;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201895;STB=0.615207;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0126173;OID=.;OPOS=247006051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:7:4:8:5:7:4 chr1 247007232 . TA T 39.74 PASS AF=0.482759;AO=11;DP=32;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.04215;FXX=0.121175;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.22536;QD=5.48071;RBI=0.125692;REFB=0.0368495;REVB=-0.118414;RO=13;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716338;STB=0.511095;STBP=0.935;TYPE=del;VARB=-0.0857323;OID=.;OPOS=247007233;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.482759:11:32:14:29:15:3:11:3:12:38:13:2:9:3:10 chr1 247048834 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00151912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.986;QD=61.6837;RBI=0.0111682;REFB=0;REVB=0.0110644;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.48121e-05;OID=.;OPOS=247048834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr1 247150740 . T C 808.52 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0557876;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3606;QD=53.9015;RBI=0.100737;REFB=-0.125179;REVB=0.0838787;RO=2;SAF=26;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00328432;STB=0.501742;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00656586;OID=.;OPOS=247150740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:60:2:2:58:58:0.966667:32:26:1:1:32:26:1:1 chr1 247162658 . C T 784.07 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.231;QD=64.0058;RBI=0.0733993;REFB=0;REVB=0.0176687;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199641;OID=.;OPOS=247162658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:24:21:0:0:25:24:0:0 chr1 247419509 . T C 594.5 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000657983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.44;QD=60.9741;RBI=0.0257266;REFB=0;REVB=0.0257181;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109209;OID=.;OPOS=247419509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr1 247419664 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.312;QD=52.6132;RBI=0.0192953;REFB=0;REVB=0.00315386;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103828;OID=.;OPOS=247419664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr1 247587408 . C T 224.75 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=77;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0119107;FXX=0.0519413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.787;QD=12.3148;RBI=0.012034;REFB=-0.0118167;REVB=0.00171805;RO=43;SAF=22;SAR=5;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178329;STB=0.624011;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0214379;OID=.;OPOS=247587408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:73:43:46:27:27:0.369863:5:22:30:13:5:22:31:15 chr1 247587477 . G A 378.21 PASS AF=0.481481;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00438321;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.511;QD=18.6771;RBI=0.0181991;REFB=-0.0133236;REVB=0.0176634;RO=41;SAF=28;SAR=11;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314148;STB=0.670568;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0126004;OID=.;OPOS=247587477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:41:42:39:39:0.481481:11:28:16:25:11:28:17:25 chr1 247587531 . A G 851.58 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.259;QD=57.7344;RBI=0.0738158;REFB=0;REVB=0.0186032;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154221;OID=.;OPOS=247587531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:37:21:0:0:37:22:0:0 chr1 247588053 . C T 180.91 PASS AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.018766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.656;QD=12.9222;RBI=0.0195163;REFB=-0.00520481;REVB=0.00535937;RO=34;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029352;STB=0.516877;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00922253;OID=.;OPOS=247588053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:9:13:21:13:9:13:21:13 chr1 247614693 . C T 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.12;QD=58.1408;RBI=0.0378624;REFB=0;REVB=0.00387919;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322091;OID=.;OPOS=247614693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr1 247614896 . A C 145.23 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00297792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.6;QD=44.6872;RBI=0.00610135;REFB=0;REVB=0.00532527;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.58711e-05;OID=.;OPOS=247614896;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr1 247654993 . T C 1381.0 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0621485;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2645;QD=62.7727;RBI=0.065091;REFB=0;REVB=-0.0193495;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000600769;OID=.;OPOS=247654993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0 chr1 247655275 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.501;QD=56.9383;RBI=0.0264778;REFB=0;REVB=-0.0140687;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50483e-05;OID=.;OPOS=247655275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr1 247690320 . C T 1896.41 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7878;QD=61.6719;RBI=0.0341938;REFB=0;REVB=-0.0267759;RO=0;SAF=62;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.55703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.69198e-05;OID=.;OPOS=247690320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:61:62:0:0:61:62:0:0 chr1 247695405 . T A 181.18 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00983683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.232;QD=11.3237;RBI=0.0256841;REFB=-0.0111855;REVB=-0.0237257;RO=41;SAF=12;SAR=11;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117886;STB=0.568277;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0176194;OID=.;OPOS=247695405;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:41:41:23:23:0.359375:11:12:17:24:11:12:17:24 chr1 247695612 . G A 1008.13 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.055;QD=59.3017;RBI=0.0173538;REFB=0;REVB=0.0023508;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21396e-05;OID=.;OPOS=247695612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0 chr1 247695756 . T A,C 402.51 PASS AF=0.0344828,0.965517;AO=2,27;DP=29;FAO=1,28;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620367,0.0272645;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=17.9961,112.536;QD=55.519;RBI=0.0621586,0.040449;REFB=0,0;REVB=-0.00389001,0.0298792;RO=0;SAF=2,7;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.41836e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.120559,0.000234676;OID=.,.;OPOS=247695756,247695756;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:29:29:0:0:2,27:1,28:0.0344828,0.965517:0,20:2,7:0:0:0,20:1,8:0:0 chr1 247752019 . G C 885.32 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.117;QD=58.0537;RBI=0.0325459;REFB=0;REVB=0.0176166;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300927;OID=.;OPOS=247752019;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr1 247752161 . T C 147.55 PASS AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0205773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.383;QD=36.8875;RBI=0.025045;REFB=-0.000394919;REVB=-0.0142768;RO=2;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180146;STB=0.59985;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.000120702;OID=.;OPOS=247752161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:4:10:0:2:4:10:0:2 chr1 247752367 . A G 2190.99 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000605409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.049;QD=63.0501;RBI=0.0123802;REFB=0;REVB=0.0123654;RO=0;SAF=59;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97276e-06;OID=.;OPOS=247752367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:139:0:0:137:139:1:78:59:0:0:80:59:0:0 chr1 247769752 . A G 1191.19 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0944714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.73;QD=61.0866;RBI=0.0949856;REFB=0;REVB=-0.0098695;RO=0;SAF=31;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234078;OID=.;OPOS=247769752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:46:31:0:0:46:32:0:0 chr1 247835950 . T C 537.62 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4772;QD=59.7353;RBI=0.0392891;REFB=0;REVB=0.0365397;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000582183;OID=.;OPOS=247835950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0 chr1 247886928 . C G 253.47 PASS AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=-0.00190256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.178;QD=12.8338;RBI=0.00201528;REFB=-0.0166865;REVB=-0.000664544;RO=49;SAF=14;SAR=16;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222305;STB=0.626586;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0282819;OID=.;OPOS=247886928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:49:49:30:30:0.379747:16:14:33:16:16:14:33:16 chr1 247921100 . T G 425.98 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.875;QD=56.797;RBI=0.026452;REFB=0;REVB=0.0159613;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114151;OID=.;OPOS=247921100;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:12:17:0:0:13:17:0:0 chr1 247921352 . C T 676.78 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00792651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.133;QD=60.1586;RBI=0.0130179;REFB=-0.0343484;REVB=0.0103265;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516122;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000454221;OID=.;OPOS=247921352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:29:15:0:0:29:15:1:0 chr1 247921717 . C A 1400.99 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=365.342;QD=62.2664;RBI=0.0282589;REFB=0;REVB=0.00859777;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06088e-05;OID=.;OPOS=247921717;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:90:0:0:84:90:1:51:33:0:0:55:35:0:0 chr1 247921789 . A AGT 181.97 PASS AF=0.708333;AO=12;DP=50;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0592958;FXX=0.172354;HRUN=1;LEN=2;MLLD=71.5071;QD=30.3277;RBI=0.292601;REFB=-0.215321;REVB=0.28653;RO=34;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135648;STB=0.660812;STBP=0.032;TYPE=ins;VARB=0.109361;OID=.;OPOS=247921790;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.708333:12:50:17:24:7:4:13:5:2:49:34:4:8:15:19 chr1 247921888 . C T 465.12 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1829;QD=58.1395;RBI=0.0470596;REFB=0;REVB=-0.0465628;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000566424;OID=.;OPOS=247921888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr1 247978319 . A G 1788.37 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0203384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.959;QD=60.1134;RBI=0.0330877;REFB=-0.0647439;REVB=0.0260988;RO=0;SAF=59;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000114977;OID=.;OPOS=247978319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:119:0:1:118:118:0.991597:59:59:0:0:59:59:0:1 chr1 247978541 . AAGG A 386.65 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00411618;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=3;MLLD=288.182;QD=48.3314;RBI=0.0213984;REFB=0;REVB=0.0209988;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.57417e-05;OID=.;OPOS=247978542;OREF=AGG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:32:33:32:32:0:17:15:0:0:7:0:17:15:0:0 chr1 248004614 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.301;QD=53.9111;RBI=0.044063;REFB=0;REVB=-0.0259341;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.29601e-05;OID=.;OPOS=248004614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr1 248004687 . C G 266.3 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.089;QD=50.7236;RBI=0.060228;REFB=0;REVB=0.0283048;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000894483;OID=.;OPOS=248004687;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:14:6:0:0:15:6:0:0 chr1 248004775 . C T 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.656;QD=51.1822;RBI=0.0628871;REFB=0;REVB=0.0313563;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010034;OID=.;OPOS=248004775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr1 248004848 . G C 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3223;QD=51.1828;RBI=0.092354;REFB=0;REVB=0.068991;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00400395;OID=.;OPOS=248004848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0 chr1 248004877 . C T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.686;QD=49.5992;RBI=0.0383333;REFB=0;REVB=0.0341744;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358635;OID=.;OPOS=248004877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr1 248004884 . T C 237.47 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.894;QD=49.9933;RBI=0.0622995;REFB=0;REVB=0.0435039;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000643751;OID=.;OPOS=248004884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:12:7:0:0 chr1 248005213 . G C 336.4 PASS AF=0.903226;AO=23;DP=29;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0114426;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.863;QD=43.4065;RBI=0.0230898;REFB=-0.164479;REVB=0.0200551;RO=4;SAF=12;SAR=11;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131699;STB=0.548353;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00196592;OID=.;OPOS=248005213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:29:31:4:3:23:28:0.903226:11:12:4:0:14:14:3:0 chr1 248020556 . G C 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0275048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.27;QD=13.2054;RBI=0.041673;REFB=-0.0417197;REVB=0.0313069;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513504;STB=0.799197;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00682592;OID=.;OPOS=248020556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:4:2:6:0:4:2:6:0 chr1 248023966 . C T 176.16 PASS AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=-0.0221977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4596;QD=10.2123;RBI=0.0294041;REFB=-0.00842083;REVB=-0.0192838;RO=46;SAF=13;SAR=10;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267963;STB=0.655469;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0115386;OID=.;OPOS=248023966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:46:46:23:23:0.333333:10:13:15:31:10:13:15:31 chr1 248028219 . G A 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00559479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=344.063;QD=16.3859;RBI=0.0148175;REFB=-0.00206085;REVB=0.0137206;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417055;STB=0.74025;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00153032;OID=.;OPOS=248028219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:1:7:3:6:1:7 chr1 248039713 . A G 238.56 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0516586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.962;QD=14.0327;RBI=0.0571462;REFB=-0.00495962;REVB=-0.0244352;RO=40;SAF=19;SAR=9;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42418;STB=0.739362;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0164366;OID=.;OPOS=248039713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:9:19:10:30:9:19:10:30 chr1 248059423 . C T 564.18 PASS AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0211371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.207;QD=26.8655;RBI=0.024065;REFB=-0.0087223;REVB=0.0115043;RO=33;SAF=26;SAR=25;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179768;STB=0.5098;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00472971;OID=.;OPOS=248059423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:25:26:16:17:25:26:16:17 chr1 248059456 . G A 646.57 PASS AF=0.533333;AO=64;DP=120;FAO=64;FDP=120;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.00579404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.326;QD=21.5524;RBI=0.0258604;REFB=-0.00375308;REVB=0.0252029;RO=56;SAF=36;SAR=28;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383371;STB=0.521046;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00356968;OID=.;OPOS=248059456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:56:56:64:64:0.533333:28:36:29:27:28:36:29:27 chr1 248059476 . A C 771.35 PASS AF=0.521127;AO=74;DP=142;FAO=74;FDP=142;FR=.;FRO=68;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0272124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.368;QD=21.7282;RBI=0.0326742;REFB=-0.0214262;REVB=-0.0180855;RO=68;SAF=43;SAR=31;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587905;STB=0.532293;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0192605;OID=.;OPOS=248059476;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:68:68:74:74:0.521127:31:43:35:33:31:43:35:33 chr1 248059703 . T A 362.57 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00706158;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.091;QD=22.6608;RBI=0.0110569;REFB=-0.0206445;REVB=-0.00850823;RO=30;SAF=9;SAR=27;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17974;STB=0.576878;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0324091;OID=.;OPOS=248059703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:64:30:28:36:36:0.5625:27:9:13:17:27:9:11:17 chr1 248059712 . T C 344.8 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0200617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.341;QD=21.892;RBI=0.0234707;REFB=-0.0239353;REVB=0.0121821;RO=27;SAF=9;SAR=26;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204872;STB=0.607798;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0186095;OID=.;OPOS=248059712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:28:35:35:0.555556:26:9:13:14:26:9:13:15 chr1 248059856 . T C 587.89 PASS AF=0.557692;AO=58;DP=104;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0538274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7488;QD=22.6112;RBI=0.0538275;REFB=-0.00842126;REVB=-7.77926e-05;RO=46;SAF=24;SAR=34;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882799;STB=0.54837;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0055897;OID=.;OPOS=248059856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:46:46:58:58:0.557692:34:24:24:22:34:24:24:22 chr1 248060029 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.922;QD=53.2767;RBI=0.0321719;REFB=0;REVB=0.00994811;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188796;OID=.;OPOS=248060029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr1 248060037 . G A 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0471129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.79;QD=6.57236;RBI=0.0488083;REFB=0.000658558;REVB=-0.0127523;RO=16;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28974;STB=0.681292;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.00685104;OID=.;OPOS=248060037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:3:3:4:12:3:3:4:12 chr1 248060246 . TA T 46.68 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0840629;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.4704;QD=10.374;RBI=0.0840648;REFB=0.0379733;REVB=-0.000559356;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15636;STB=0.535622;STBP=0.828;TYPE=del;VARB=-0.0388293;OID=.;OPOS=248060247;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.444444:8:18:8:18:10:6:2:7:3:46:8:6:2:7:1 chr1 248060279 . C T 64.48 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00357264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2794;QD=9.91998;RBI=0.0353198;REFB=-0.0205711;REVB=-0.0351386;RO=17;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154634;STB=0.594378;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0339831;OID=.;OPOS=248060279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:3:6:9:8:3:6:9:8 chr1 248060380 . C G 239.32 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0472294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3959;QD=20.8104;RBI=0.055642;REFB=-0.0324161;REVB=0.0294179;RO=23;SAF=15;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419051;STB=0.523593;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0318655;OID=.;OPOS=248060380;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:8:15:14:9:8:15:14:9 chr1 248084434 . G A 483.97 PASS AF=0.445378;AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=119;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0302443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.317;QD=16.2678;RBI=0.0302668;REFB=-0.0108157;REVB=-0.00116762;RO=66;SAF=26;SAR=27;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995431;STB=0.555535;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0131536;OID=.;OPOS=248084434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:66:66:53:53:0.445378:27:26:39:27:27:26:39:27 chr1 248084464 . T C 1495.87 PASS AF=0.990291;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0121255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.417;QD=58.0922;RBI=0.0124877;REFB=0.0281425;REVB=-0.00298583;RO=1;SAF=58;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811007;STB=0.504201;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000263343;OID=.;OPOS=248084464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:103:1:1:101:102:0.990291:43:58:1:0:43:59:1:0 chr1 248084511 . T C 57.99 PASS AF=0.18;AO=9;DP=50;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=-0.0503668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.076;QD=4.63905;RBI=0.0506324;REFB=-0.00690634;REVB=-0.00517952;RO=41;SAF=6;SAR=3;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21639;STB=0.639083;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0281258;OID=.;OPOS=248084511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:50:50:41:41:9:9:0.18:3:6:33:8:3:6:33:8 chr1 248085108 . C T 189.27 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0188996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6296;QD=13.0527;RBI=0.0266592;REFB=-0.00212826;REVB=0.0188021;RO=35;SAF=7;SAR=16;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173624;STB=0.600235;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00492004;OID=.;OPOS=248085108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:16:7:16:19:16:7:16:19 chr1 248085124 . G A 377.92 PASS AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00827815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.649;QD=24.382;RBI=0.00872231;REFB=-0.0017148;REVB=-0.0027479;RO=25;SAF=17;SAR=20;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10428;STB=0.5571;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00145414;OID=.;OPOS=248085124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:20:17:8:17:20:17:8:17 chr1 248085149 . C G 368.98 PASS AF=0.557143;AO=37;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0251057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3236;QD=21.0843;RBI=0.0847472;REFB=-0.0549665;REVB=0.0809431;RO=31;SAF=20;SAR=17;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152314;STB=0.619435;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0386292;OID=.;OPOS=248085149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:37:39:0.557143:17:20:11:20:17:22:9:22 chr1 248112627 . T C 730.58 PASS AF=0.453488;AO=78;DP=172;FAO=78;FDP=172;FR=.;FRO=94;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=0.0022874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.253;QD=16.9901;RBI=0.00356759;REFB=-0.0107225;REVB=0.00273779;RO=94;SAF=41;SAR=37;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119083;STB=0.566046;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0139857;OID=.;OPOS=248112627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:94:94:78:78:0.453488:37:41:38:56:37:41:38:56 chr1 248112745 . G T 760.65 PASS AF=0.72093;AO=62;DP=86;FAO=62;FDP=86;FR=.;FRO=24;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0110041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.532;QD=35.3789;RBI=0.0197325;REFB=-0.0292334;REVB=-0.0163794;RO=24;SAF=35;SAR=27;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320568;STB=0.517236;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00901301;OID=.;OPOS=248112745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:24:24:62:62:0.72093:27:35:15:9:27:35:15:9 chr1 248112754 . T C 142.35 PASS AF=0.2625;AO=21;DP=78;FAO=21;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00554046;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=147.884;QD=7.11727;RBI=0.00592977;REFB=-0.00171442;REVB=0.00211316;RO=56;SAF=12;SAR=9;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669677;STB=0.542396;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00593768;OID=.;OPOS=248112754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:56:59:21:21:0.2625:9:12:35:21:9:12:37:22 chr1 248112762 . TG CA 606.23 PASS AF=0.75;AO=51;DP=68;FAO=51;FDP=68;FR=.;FRO=17;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0067132;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=281.69;QD=35.6606;RBI=0.0196812;REFB=0.0112922;REVB=-0.0185008;RO=17;SAF=32;SAR=19;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193719;STB=0.510425;STBP=0.807;TYPE=mnp;VARB=-0.00146512;OID=.;OPOS=248112762;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:17:17:51:51:0.75:19:32:10:7:19:32:10:7 chr1 248112771 . C T 627.2 PASS AF=0.809524;AO=48;DP=61;FAO=51;FDP=63;FR=.;FRO=12;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00287338;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.961;QD=39.8225;RBI=0.0462054;REFB=-0.020964;REVB=0.046116;RO=13;SAF=31;SAR=17;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202873;STB=0.508018;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.00494045;OID=.;OPOS=248112771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:61:63:13:12:48:51:0.809524:17:31:9:4:19:32:8:4 chr1 248112794 . G C 47.32 PASS AF=0.140625;AO=9;DP=64;FAO=9;FDP=64;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.0219748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.623;QD=2.95732;RBI=0.022659;REFB=-0.0057871;REVB=-0.00552606;RO=55;SAF=5;SAR=4;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786557;STB=0.555041;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0718748;OID=.;OPOS=248112794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:64:64:55:55:9:9:0.140625:4:5:34:21:4:5:34:21 chr1 248112809 . A G 748.72 PASS AF=0.948276;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00994088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.38;QD=51.636;RBI=0.0146248;REFB=-0.00549398;REVB=-0.0107268;RO=3;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627024;STB=0.533321;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.000450687;OID=.;OPOS=248112809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:58:58:3:3:55:55:0.948276:21:34:0:3:21:34:0:3 chr1 248112836 . A G 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.872;QD=63.2862;RBI=0.0511262;REFB=0;REVB=0.0378146;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477879;OID=.;OPOS=248112836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:16:30:0:0:16:30:0:0 chr1 248113026 . T A 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.941;QD=62.6711;RBI=0.0328188;REFB=0;REVB=0.0170125;RO=0;SAF=11;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33029e-05;OID=.;OPOS=248113026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:33:11:0:0:33:11:0:0 chr1 248113040 . A G 695.78 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0119694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6596;QD=60.5026;RBI=0.0126513;REFB=-0.0020526;REVB=-0.0040973;RO=1;SAF=12;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140319;STB=0.507459;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=-8.07319e-05;OID=.;OPOS=248113040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:33:12:0:1:33:12:0:1 chr1 248128929 . G A 109.28 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00941319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.885;QD=14.1008;RBI=0.0281651;REFB=-0.0185417;REVB=-0.0265456;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383131;STB=0.522354;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0399347;OID=.;OPOS=248128929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:9:9:6:7:9:9 chr1 248129240 . G A 222.06 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0299532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5513;QD=14.5613;RBI=0.0379459;REFB=-0.00568609;REVB=0.0232958;RO=33;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826887;STB=0.546564;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00748505;OID=.;OPOS=248129240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:35:26:26:0.42623:12:14:15:18:12:14:16:19 chr1 248202344 . G C 281.96 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=44;FWDB=-0.0460943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.832;QD=14.6472;RBI=0.0474763;REFB=-0.0212422;REVB=-0.0113716;RO=44;SAF=4;SAR=28;SRF=1;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310469;STB=0.672821;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0217214;OID=.;OPOS=248202344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:45:32:32:0.415584:28:4:1:43:28:4:1:44 chr1 248224099 . T C 430.66 PASS AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=0.00742074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.125;QD=20.0306;RBI=0.0345922;REFB=-0.029325;REVB=0.0337869;RO=43;SAF=15;SAR=28;SRF=10;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120628;STB=0.566534;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0207129;OID=.;OPOS=248224099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:28:15:10:33:28:15:10:33 chr1 248224216 . C T 288.77 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0608689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5067;QD=16.2689;RBI=0.0810661;REFB=0.01207;REVB=-0.0535415;RO=39;SAF=11;SAR=21;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311457;STB=0.674957;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0233199;OID=.;OPOS=248224216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:21:11:26:13:21:11:26:13 chr1 248224294 . C T 203.42 PASS AF=0.278351;AO=27;DP=97;FAO=27;FDP=97;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=20;FWDB=0.010875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.571;QD=8.38832;RBI=0.0137958;REFB=-0.00689407;REVB=-0.00848873;RO=70;SAF=10;SAR=17;SRF=50;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39903;STB=0.733659;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00769154;OID=.;OPOS=248224294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:70:70:27:27:0.278351:17:10:50:20:17:10:50:20 chr1 248224398 . A G 105.5 PASS AF=0.178218;AO=18;DP=101;FAO=18;FDP=101;FR=.;FRO=83;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=-0.0111486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.638;QD=4.17815;RBI=0.0122693;REFB=-0.00904894;REVB=0.00512287;RO=82;SAF=7;SAR=11;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302883;STB=0.696735;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0436037;OID=.;OPOS=248224398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:82:83:18:18:0.178218:11:7:52:30:11:7:53:30 chr1 248224754 . T C 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00676939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4769;QD=16.4168;RBI=0.0275321;REFB=0.00428107;REVB=-0.0266869;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457514;STB=0.526279;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.00625258;OID=.;OPOS=248224754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:9:5:5:11:9:5:5:11 chr1 248264018 . C T 480.04 PASS AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0528331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.521;QD=17.2986;RBI=0.0552604;REFB=-0.0267348;REVB=-0.016198;RO=59;SAF=29;SAR=23;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063527;STB=0.53534;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0305152;OID=.;OPOS=248264018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:0.468468:23:29:29:30:23:29:29:30 chr1 248285441 . G T 493.87 PASS AF=0.546512;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0230363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.032;QD=22.9707;RBI=0.0232006;REFB=-0.0124359;REVB=0.00275636;RO=39;SAF=28;SAR=19;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269077;STB=0.514805;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0109552;OID=.;OPOS=248285441;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:39:39:47:47:0.546512:19:28:22:17:19:28:22:17 chr1 248285487 . A G 548.03 PASS AF=0.548387;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00577352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.157;QD=23.5711;RBI=0.00690469;REFB=-0.0216396;REVB=-0.00378699;RO=41;SAF=31;SAR=20;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039505;STB=0.517114;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0162621;OID=.;OPOS=248285487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:41:42:51:51:0.548387:20:31:23:18:20:31:24:18 chr1 248366792 . T C 353.9 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0171447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2793;QD=16.0864;RBI=0.0206366;REFB=-0.00270919;REVB=0.011486;RO=49;SAF=26;SAR=12;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244008;STB=0.632887;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00531043;OID=.;OPOS=248366792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:50:38:38:0.431818:12:26:22:27:12:26:23:27 chr1 248402758 . C T 471.6 PASS AF=0.51087;AO=43;DP=88;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00316609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.447;QD=20.5041;RBI=0.021835;REFB=-0.0137112;REVB=0.0216043;RO=37;SAF=15;SAR=28;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23192;STB=0.59622;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0181498;OID=.;OPOS=248402758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:92:37:45:43:47:0.51087:28:15:23:14:29:18:26:19 chr1 248436611 . G A 670.06 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.034;QD=62.3307;RBI=0.0733495;REFB=0;REVB=0.0667052;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246072;OID=.;OPOS=248436611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:22:19:0:0:24:19:0:0 chr1 248436616 . A G 657.75 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00616085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.026;QD=59.7959;RBI=0.0513346;REFB=-0.0644088;REVB=0.0509635;RO=1;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191664;STB=0.510199;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.00232097;OID=.;OPOS=248436616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:24:19:0:1:24:19:0:1 chr1 248436805 . T G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0045606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.056;QD=47.8224;RBI=0.018826;REFB=0;REVB=0.0182653;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28161e-05;OID=.;OPOS=248436805;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr1 248436925 . A G 60.68 PASS AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0106413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.708;QD=6.38738;RBI=0.0333448;REFB=-0.0049109;REVB=-0.0316012;RO=29;SAF=2;SAR=7;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299971;STB=0.694895;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0231726;OID=.;OPOS=248436925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:7:2:13:16:7:2:13:16 chr1 248436972 . A G 408.35 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0118506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.207;QD=20.4177;RBI=0.0143376;REFB=-0.00949397;REVB=0.00807021;RO=39;SAF=15;SAR=26;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653465;STB=0.503619;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00843478;OID=.;OPOS=248436972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:26:15:14:25:26:15:14:25 chr1 248457979 . C A 1223.3 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00683414;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.249;QD=58.9543;RBI=0.0249777;REFB=-0.123722;REVB=0.0240246;RO=2;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185631;STB=0.509802;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000595068;OID=.;OPOS=248457979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:83:2:2:81:81:0.975904:50:31:0:2:50:31:0:2 chr1 248457993 . C G 454.93 PASS AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0156584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1926;QD=19.9968;RBI=0.0578111;REFB=0.00228323;REVB=0.0556501;RO=46;SAF=18;SAR=27;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290848;STB=0.516122;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-0.00132397;OID=.;OPOS=248457993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:27:18:17:29:27:18:17:29 chr1 248458676 . T C 920.11 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00667897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.828;QD=58.4194;RBI=0.0451852;REFB=0;REVB=0.0446889;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132847;OID=.;OPOS=248458676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:34:28:0:0:34:29:0:0 chr1 248458689 . A G 1012.11 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00606584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.667;QD=57.8346;RBI=0.00606693;REFB=-0.0195875;REVB=-0.0001152;RO=1;SAF=30;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154963;STB=0.508194;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=5.70465e-06;OID=.;OPOS=248458689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:39:30:1:0:39:30:1:0 chr1 248458717 . C G 1491.66 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1254;QD=63.4747;RBI=0.0237116;REFB=0;REVB=-0.0180049;RO=0;SAF=40;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.01549e-05;OID=.;OPOS=248458717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:54:40:0:0:54:40:0:0 chr1 248458736 . A G 479.98 PASS AF=0.464286;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00804492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.948;QD=17.1422;RBI=0.00815495;REFB=-0.0103465;REVB=0.00133504;RO=59;SAF=18;SAR=34;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145394;STB=0.586173;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0122066;OID=.;OPOS=248458736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:59:60:52:52:0.464286:34:18:29:30:34:18:30:30 chr1 248458760 . C A 509.02 PASS AF=0.447154;AO=55;DP=123;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0170735;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.287;QD=16.5534;RBI=0.0213059;REFB=-0.000574562;REVB=-0.0127451;RO=68;SAF=19;SAR=36;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145055;STB=0.581156;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.000849638;OID=.;OPOS=248458760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:68:68:55:55:0.447154:36:19:33:35:36:19:33:35 chr1 248458875 . CT C 274.92 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00953181;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.706;QD=17.4551;RBI=0.0176042;REFB=-0.0129852;REVB=0.0148004;RO=33;SAF=11;SAR=19;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197473;STB=0.610858;STBP=0.123;TYPE=del;VARB=0.0166577;OID=.;OPOS=248458876;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.47619:30:64:30:63:33:11:19:19:14:99:33:11:19:19:14 chr1 248487016 . C T 297.27 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00988998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.637;QD=18.2936;RBI=0.010192;REFB=-0.0276215;REVB=0.00246284;RO=31;SAF=16;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157145;STB=0.584564;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0234137;OID=.;OPOS=248487016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:31:33:32:32:0.492308:16:16:10:21:16:16:11:22 chr1 248487300 . C T 754.82 PASS AF=0.350943;AO=92;DP=266;FAO=93;FDP=265;FR=.;FRO=172;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=82;FSRR=90;FWDB=-0.00963274;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.694;QD=11.3935;RBI=0.0096355;REFB=-0.00381465;REVB=-0.000230753;RO=172;SAF=47;SAR=45;SRF=82;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390132;STB=0.518575;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00781114;OID=.;OPOS=248487300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:265:172:172:92:93:0.350943:45:47:82:90:46:47:82:90 chr1 248487338 . C A 4604.43 PASS AF=1;AO=291;DP=291;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00533467;FXX=0.00343631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.731;QD=63.5094;RBI=0.022479;REFB=-0.0895823;REVB=0.0218368;RO=0;SAF=146;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0004318;OID=.;OPOS=248487338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:291:290:0:0:291:290:1:145:146:0:0:144:146:0:0 chr1 248487638 . A G 2950.91 PASS AF=0.994681;AO=186;DP=187;FAO=187;FDP=188;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00459578;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.042;QD=62.7854;RBI=0.0227387;REFB=-0.00127829;REVB=0.0222695;RO=1;SAF=73;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419531;STB=0.502183;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=2.52941e-05;OID=.;OPOS=248487638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:187:188:1:1:186:187:0.994681:113:73:0:1:114:73:0:1 chr1 248487768 . A G 1257.91 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259952;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.0744;QD=61.3612;RBI=0.0573199;REFB=0;REVB=-0.0510864;RO=0;SAF=57;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000574548;OID=.;OPOS=248487768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:24:57:0:0:24:58:0:0 chr1 248512094 . C T 536.33 PASS AF=0.42963;AO=57;DP=134;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0180168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.472;QD=15.8912;RBI=0.0270299;REFB=-0.0163411;REVB=-0.0201497;RO=76;SAF=33;SAR=24;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409734;STB=0.523752;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0136039;OID=.;OPOS=248512094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:76:77:57:58:0.42963:24:33:41:35:24:34:42:35 chr1 248512498 . A G 245.21 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00385981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.801;QD=15.5688;RBI=0.00438403;REFB=-0.00864238;REVB=0.00207885;RO=33;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777995;STB=0.55928;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0100241;OID=.;OPOS=248512498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:35:28:28:0.444444:13:15:15:18:13:15:15:20 chr1 248512637 . C T 419.96 PASS AF=0.417391;AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.0288287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.381;QD=14.6073;RBI=0.0308031;REFB=-0.0187539;REVB=-0.0108508;RO=67;SAF=14;SAR=34;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253263;STB=0.643181;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.027463;OID=.;OPOS=248512637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:67:67:48:48:0.417391:34:14:35:32:34:14:35:32 chr1 248512749 . G A 380.71 PASS AF=0.430108;AO=39;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0114692;FXX=0.0210504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.5;QD=16.3746;RBI=0.0116739;REFB=-0.0145598;REVB=-0.00217662;RO=51;SAF=10;SAR=29;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280667;STB=0.6455;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0300409;OID=.;OPOS=248512749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:53:39:40:0.430108:29:10:26:25:29:11:27:26 chr1 248512767 . G T 509.72 PASS AF=0.505155;AO=48;DP=96;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0116943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.746;QD=21.0192;RBI=0.0128447;REFB=-0.0275537;REVB=0.00531312;RO=47;SAF=19;SAR=29;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123426;STB=0.577385;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.026932;OID=.;OPOS=248512767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:47:48:48:49:0.505155:29:19:25:22:30:19:26:22 chr1 248525146 . C T 31.34 PASS AF=0.0810811;AO=9;DP=111;FAO=9;FDP=111;FR=.;FRO=102;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=47;FWDB=-0.00656812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2587;QD=1.1294;RBI=0.0638989;REFB=-0.000991707;REVB=-0.0635604;RO=102;SAF=4;SAR=5;SRF=55;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105217;STB=0.586291;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0306983;OID=.;OPOS=248525146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:111:111:102:102:9:9:0.0810811:5:4:55:47:5:4:55:47 chr1 248525330 . A G 109.21 PASS AF=0.176991;AO=20;DP=112;FAO=20;FDP=113;FR=.;FRO=93;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.0417025;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.254;QD=3.86572;RBI=0.044447;REFB=-0.0159093;REVB=-0.0153767;RO=90;SAF=14;SAR=6;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297532;STB=0.703501;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0654626;OID=.;OPOS=248525330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:90:93:20:20:0.176991:6:14:42:48:6:14:42:51 chr1 248525613 . T C 340.58 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=-0.0186572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5812;QD=18.1642;RBI=0.039885;REFB=-0.0373749;REVB=0.0352523;RO=39;SAF=21;SAR=15;SRF=31;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212528;STB=0.617518;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0387939;OID=.;OPOS=248525613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:15:21:31:8:15:21:31:8 chr1 248525638 . CA C 422.87 PASS AF=0.585714;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.000199985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.94;QD=24.1641;RBI=0.0270322;REFB=-0.0425552;REVB=0.0270315;RO=29;SAF=32;SAR=9;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18777;STB=0.603719;STBP=0.077;TYPE=del;VARB=0.0250965;OID=.;OPOS=248525639;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.585714:41:71:41:70:29:32:9:17:12:99:29:32:9:17:12 chr1 248525647 . C A 199.94 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=11;FWDB=-0.00664497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.883;QD=11.5907;RBI=0.0364386;REFB=-0.0114249;REVB=-0.0358276;RO=44;SAF=13;SAR=12;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260321;STB=0.648542;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0631173;OID=.;OPOS=248525647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:12:13:33:11:12:13:33:11 chr1 248525650 . C T 198.97 PASS AF=0.357143;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=11;FWDB=-0.00291246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.715;QD=11.3698;RBI=0.0066745;REFB=-0.0224126;REVB=-0.00600554;RO=43;SAF=13;SAR=12;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251672;STB=0.653424;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0377342;OID=.;OPOS=248525650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:43:45:25:25:0.357143:12:13:32:11:12:13:34:11 chr1 248525657 . G A 141.29 PASS AF=0.311475;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0201979;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.234;QD=9.26515;RBI=0.0268871;REFB=-0.00955211;REVB=-0.0177472;RO=38;SAF=10;SAR=9;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245984;STB=0.648366;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0220897;OID=.;OPOS=248525657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:61:38:42:19:19:0.311475:9:10:28:10:9:10:31:11 chr1 248525780 . C T 672.1 PASS AF=0.5;AO=67;DP=134;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.00135406;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.899;QD=20.0627;RBI=0.00812019;REFB=-0.0273219;REVB=0.0080065;RO=67;SAF=31;SAR=36;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271486;STB=0.514971;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.025305;OID=.;OPOS=248525780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:67:67:67:67:0.5:36:31:33:34:36:31:33:34 chr1 248550970 . A G 318.73 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.0100208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9045;QD=15.7398;RBI=0.0175077;REFB=-0.01445;REVB=0.0143563;RO=45;SAF=15;SAR=20;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234375;STB=0.624931;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0382666;OID=.;OPOS=248550970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:45:46:35:35:0.432099:20:15:30:15:20:15:30:16 chr1 248550976 . T G 1270.92 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223918;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.664;QD=61.9963;RBI=0.0365597;REFB=0;REVB=0.0289001;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132802;OID=.;OPOS=248550976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:35:47:0:0:35:47:0:0 chr1 248551203 . T C 119.38 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0923943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9799;QD=13.6428;RBI=0.101354;REFB=-0.00166717;REVB=-0.0416647;RO=21;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146058;STB=0.585244;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00397212;OID=.;OPOS=248551203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:6:8:9:12:6:8:9:12 chr1 248551560 . C T 391.56 PASS AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0290993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8849;QD=19.3364;RBI=0.029808;REFB=-0.0152112;REVB=0.00646095;RO=39;SAF=11;SAR=29;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254886;STB=0.644368;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.012945;OID=.;OPOS=248551560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:41:40:40:0.493827:29:11:21:18:29:11:22:19 chr1 248551636 . T G 344.45 PASS AF=0.390476;AO=41;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0177507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.267;QD=13.1219;RBI=0.0217825;REFB=-0.0178691;REVB=-0.012625;RO=64;SAF=12;SAR=29;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171434;STB=0.597888;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0242909;OID=.;OPOS=248551636;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:64:64:41:41:0.390476:29:12:28:36:29:12:28:36 chr1 248569369 . A G 384.14 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.00597674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.326;QD=17.6616;RBI=0.0129475;REFB=-0.0113758;REVB=0.0114855;RO=47;SAF=15;SAR=25;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512315;STB=0.528686;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0113602;OID=.;OPOS=248569369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:25:15:20:27:25:15:20:27 chr1 248616730 . CTCTA C 36.63 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0271;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=4;MLLD=276.189;QD=5.86014;RBI=0.0298496;REFB=-0.0190026;REVB=-0.0125135;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388794;STB=0.74925;STBP=0.18;TYPE=del;VARB=0.0543961;OID=.;OPOS=248616731;OREF=TCTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.24:6:25:6:25:19:2:4:13:6:36:19:2:4:13:6 chr1 248637138 . T C 181.54 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00126708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.327;QD=24.2059;RBI=0.0065201;REFB=0.00503116;REVB=0.0063958;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992905;STB=0.555494;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.00170856;OID=.;OPOS=248637138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:10:8:7:5:10:8:7:5 chr1 248685253 . T C 1134.41 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.128;QD=60.5017;RBI=0.0273876;REFB=0;REVB=0.0272427;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0563e-05;OID=.;OPOS=248685253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:42:32:0:0:43:32:0:0 chr1 248722671 . T A 133.08 PASS AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00323124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.163;QD=35.4875;RBI=0.0231319;REFB=-0.00522654;REVB=-0.0229051;RO=2;SAF=10;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860742;STB=0.547868;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000827832;OID=.;OPOS=248722671;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:3:10:1:1:3:10:1:1 chr1 248722739 . G C 138.42 PASS AF=0.517241;AO=14;DP=28;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0281219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2706;QD=19.0929;RBI=0.0341124;REFB=-0.0175018;REVB=0.0193085;RO=14;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069643;STB=0.526281;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0174776;OID=.;OPOS=248722739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:14:14:14:15:0.517241:5:9:10:4:5:10:10:4 chr1 248722752 . A G 123.74 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.080426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6682;QD=17.0677;RBI=0.0804714;REFB=-0.0494139;REVB=0.0027048;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732887;STB=0.529369;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0550411;OID=.;OPOS=248722752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:14:15:14:14:0.482759:4:10:9:5:4:10:10:5 chr1 248722756 . T A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0203657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.129;QD=14.6575;RBI=0.0226432;REFB=-0.0177886;REVB=-0.00989715;RO=17;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503595;STB=0.529366;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0240155;OID=.;OPOS=248722756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:4:9:11:6:4:9:11:6 chr1 248722767 . T C 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00224394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.648;QD=15.7844;RBI=0.0187805;REFB=-0.00205792;REVB=-0.0186459;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135697;STB=0.578829;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00603379;OID=.;OPOS=248722767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:4:10:10:7:4:10:10:7 chr1 248722777 . T A 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00500395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.782;QD=15.7843;RBI=0.0265709;REFB=0.00504694;REVB=-0.0260954;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135697;STB=0.578829;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.0130406;OID=.;OPOS=248722777;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:4:10:10:7:4:10:10:7 chr1 248722788 . G T 121.57 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0182647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6485;QD=15.1965;RBI=0.0560297;REFB=-0.047984;REVB=-0.0529691;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17127;STB=0.59985;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.053978;OID=.;OPOS=248722788;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:10:8:4:10:10:8 chr1 248789504 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.399;QD=56.9383;RBI=0.00964056;REFB=0;REVB=0.00630625;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82362e-05;OID=.;OPOS=248789504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr1 248790075 . A G 345.3 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254886;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.428;QD=55.2474;RBI=0.0282442;REFB=0;REVB=0.0121682;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367621;OID=.;OPOS=248790075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr1 248801592 . C T 417.97 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00211534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.303;QD=53.9321;RBI=0.039572;REFB=-0.0540711;REVB=0.0395154;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345091;STB=0.518506;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000592763;OID=.;OPOS=248801592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:13:17:0:1:13:17:0:1 chr1 248801602 . T TCA 312.18 PASS AF=0.862069;AO=25;DP=29;FAO=25;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.021276;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=320.248;QD=43.0591;RBI=0.0677058;REFB=-0.0518212;REVB=0.0642761;RO=4;SAF=11;SAR=14;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142004;STB=0.576862;STBP=0.067;TYPE=ins;VARB=0.00251529;OID=.;OPOS=248801603;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.862069:25:29:25:29:4:11:14:4:0:19:4:11:14:4:0 chr1 248801610 . GC AT 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224209;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=181.5;QD=54.5177;RBI=0.0671948;REFB=0;REVB=0.0633439;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000758655;OID=.;OPOS=248801610;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr1 248801633 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=351.003;QD=53.9112;RBI=0.0430729;REFB=0;REVB=0.00609934;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137873;OID=.;OPOS=248801633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr1 248801944 . TCAGCACG T,TCAGCAGG 191.09 PASS AF=0.8125,0.1875;AO=13,3;DP=17;FAO=13,3;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7,3;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162168,0.028441;FXX=0.0587889;HRUN=1,1;LEN=7,1;MLLD=251.044,69.2655;QD=47.7723;RBI=0.0456024,0.0288043;REFB=0,0;REVB=0.0426215,0.00456018;RO=0;SAF=7,3;SAR=6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0129187,0.0427907;OID=.,.;OPOS=248801945,248801950;OREF=CAGCACG,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TCAGCAGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.8125,0.1875:13,3:17:13,3:16:0:7,3:6,0:0:0:15:0:7,3:6,0:0:0 chr1 248814052 . T A 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0017138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.43;QD=21.9722;RBI=0.0266477;REFB=-0.0267232;REVB=0.0265925;RO=21;SAF=8;SAR=15;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107249;STB=0.55977;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0291514;OID=.;OPOS=248814052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:15:8:5:16:15:8:5:16 chr1 248814080 . A C 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00681459;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.051;QD=64.4154;RBI=0.00924298;REFB=0;REVB=-0.00624451;RO=0;SAF=15;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72783e-05;OID=.;OPOS=248814080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:35:15:0:0:35:15:0:0 chr1 248814126 . G A 738.77 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265688;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.692;QD=56.8284;RBI=0.0266734;REFB=0;REVB=0.00236018;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.51784e-05;OID=.;OPOS=248814126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:35:16:0:0:36:16:0:0 chr1 248845097 . C T 223.43 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.996;QD=49.6519;RBI=0.0336332;REFB=0;REVB=0.0269029;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344154;OID=.;OPOS=248845097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0 chr1 248845411 . G A 1400.4 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0301533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.805;QD=61.5562;RBI=0.0357642;REFB=-0.0858229;REVB=0.0192316;RO=1;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101926;STB=0.505375;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00117887;OID=.;OPOS=248845411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:46:44:0:1:46:44:0:1 chr1 248845458 . C T 1368.3 PASS AF=1;AO=86;DP=90;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00152393;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8945;QD=62.9103;RBI=0.0535112;REFB=0;REVB=0.0534895;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000768866;OID=.;OPOS=248845458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:87:0:0:86:87:1:46:40:0:0:47:40:0:0 chr1 248845471 . T C 1227.48 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00351645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.682;QD=61.3738;RBI=0.0230416;REFB=0;REVB=0.0227717;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66231e-05;OID=.;OPOS=248845471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0 chr1 248845499 . A G 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0564349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.657;QD=59.5015;RBI=0.0821372;REFB=0;REVB=0.0596794;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000579618;OID=.;OPOS=248845499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0 chr1 249105163 . T C 602.89 PASS AF=0.484375;AO=62;DP=127;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0337331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4252;QD=18.8403;RBI=0.0379681;REFB=-0.0327518;REVB=-0.0174257;RO=64;SAF=33;SAR=29;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101173;STB=0.55551;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0199836;OID=.;OPOS=249105163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:64:66:62:62:0.484375:29:33:27:37:29:33:28:38 chr1 249141782 . A T 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0813957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.609;QD=19.3691;RBI=0.0822523;REFB=-0.0266081;REVB=-0.0118397;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193237;STB=0.609428;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0315266;OID=.;OPOS=249141782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:7:9:5:10:7:9:5:10 chr1 249143522 . C A 96.58 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0168353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.576;QD=12.462;RBI=0.0215498;REFB=-0.0149259;REVB=0.0134524;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27225;STB=0.659433;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0245539;OID=.;OPOS=249143522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:7:5:13:6:7:5:13:6 chr1 249168107 . G C 152.14 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0275616;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9347;QD=12.4192;RBI=0.057044;REFB=0.0119112;REVB=0.0499437;RO=32;SAF=8;SAR=9;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170531;STB=0.599886;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.0165443;OID=.;OPOS=249168107;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:9:8:20:12:9:8:20:12 chr1 249168436 . G A 330.9 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.0178048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.657;QD=15.947;RBI=0.0217577;REFB=-0.0157053;REVB=-0.0125056;RO=47;SAF=29;SAR=7;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147463;STB=0.583842;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0189917;OID=.;OPOS=249168436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:7:29:33:14:7:29:33:14 chr1 249168516 . A G 841.52 PASS AF=0.984127;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0432536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8726;QD=53.4299;RBI=0.0503911;REFB=-0.0418058;REVB=-0.0258531;RO=2;SAF=31;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294689;STB=0.507244;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00675752;OID=.;OPOS=249168516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:63:2:1:59:62:0.984127:28:31:2:0:28:34:1:0 chr1 249208772 . C T 368.06 PASS AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.015075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.801;QD=29.4446;RBI=0.0154554;REFB=-0.038229;REVB=0.00340754;RO=19;SAF=20;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160262;STB=0.588177;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0264822;OID=.;OPOS=249208772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:11:20:8:11:11:20:8:11 chr1 249211096 . G A 138.96 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00317026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.271;QD=12.0834;RBI=0.0193425;REFB=-0.0106978;REVB=-0.0190809;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214002;STB=0.625516;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0173537;OID=.;OPOS=249211096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:7:9:11:19:7:9:11:19 chr1 249211619 . G A 134.69 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0341948;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=149.502;QD=16.3263;RBI=0.0344172;REFB=-0.0201628;REVB=-0.00390641;RO=18;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128581;STB=0.573675;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0295284;OID=.;OPOS=249211619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:8:7:6:12:8:7:6:12 chr2 224919 . A G 304.91 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.00754979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.532;QD=26.5139;RBI=0.010863;REFB=-0.0159556;REVB=-0.00781059;RO=18;SAF=12;SAR=15;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210347;STB=0.623032;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0150829;OID=.;OPOS=224919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:18:19:27:27:0.586957:15:12:3:15:15:12:3:16 chr2 234221 . CAAAA CAAA,CAAAT 35.11 PASS AF=0.191489,0.0212766;AO=16,2;DP=47;FAO=9,1;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=3,1;FSAR=6,0;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.179241,-0.0804787;FXX=0.020829;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=11.9931,71.6349;QD=2.9879;RBI=0.196235,0.0883623;REFB=-0.129088,-0.0177767;REVB=-0.0798794,-0.0364838;RO=28;SAF=8,2;SAR=8,0;SRF=9;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.194986,0.559993;STB=0.584422,0.991196;STBP=0.681,0.285;TYPE=del,snp;VARB=0.0790578,0.170979;OID=.,.;OPOS=234222,234225;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=CAAA,CAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.191489,0.0212766:16,2:47:9,1:47:37:3,1:6,0:16:21:35:28:8,2:8,0:9:19 chr2 242793 . G C 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0530633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1654;QD=11.4394;RBI=0.0530638;REFB=0.000824718;REVB=0.000220967;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145537;STB=0.586031;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00166288;OID=.;OPOS=242793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:6:3:3:11:6:3:3:11 chr2 242800 . T C 144.18 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0148361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.294;QD=24.0303;RBI=0.0291515;REFB=-0.0201937;REVB=0.0250939;RO=9;SAF=3;SAR=12;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126109;STB=0.571326;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0129325;OID=.;OPOS=242800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:12:3:3:6:12:3:3:6 chr2 243504 . C T 140.69 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0104819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.983;QD=13.0873;RBI=0.0162092;REFB=-0.00373777;REVB=-0.012364;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475257;STB=0.527824;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00842441;OID=.;OPOS=243504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:7:9:14:13:7:9:14:13 chr2 264019 . C A 225.32 PASS AF=0.488889;AO=21;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.103177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.168;QD=20.0286;RBI=0.10318;REFB=-0.0102577;REVB=0.000843209;RO=23;SAF=7;SAR=14;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181521;STB=0.610175;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00788827;OID=.;OPOS=264019;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:23:23:21:22:0.488889:14:7:12:11:15:7:12:11 chr2 269352 . G A 410.48 PASS AF=0.439252;AO=46;DP=108;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.0134234;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.837;QD=15.3449;RBI=0.0135775;REFB=-0.00114824;REVB=0.00204024;RO=61;SAF=23;SAR=23;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249598;STB=0.524632;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00161981;OID=.;OPOS=269352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:61:60:46:47:0.439252:23:23:29:32:23:24:28:32 chr2 272203 . C T 1095.53 PASS AF=0.544974;AO=103;DP=189;FAO=103;FDP=189;FR=.;FRO=86;FSAF=40;FSAR=63;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.00281198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7239;QD=23.1859;RBI=0.0238187;REFB=-0.0218145;REVB=-0.0236521;RO=86;SAF=40;SAR=63;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662235;STB=0.536163;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0161778;OID=.;OPOS=272203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:86:86:103:103:0.544974:63:40:40:46:63:40:40:46 chr2 277003 . A G 416.67 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0311329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.906;QD=19.6081;RBI=0.0323457;REFB=-0.0194694;REVB=-0.00877411;RO=43;SAF=25;SAR=17;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987593;STB=0.554897;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0219663;OID=.;OPOS=277003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:17:25:21:22:17:25:21:22 chr2 676177 . C G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.399;QD=57.8848;RBI=0.0473854;REFB=0;REVB=0.0260988;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152484;OID=.;OPOS=676177;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0 chr2 1079320 . C T 558.12 PASS AF=0.518182;AO=57;DP=111;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0044886;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8518;QD=20.2952;RBI=0.00550034;REFB=-0.00633253;REVB=-0.00317903;RO=53;SAF=24;SAR=33;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00534894;STB=0.502946;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0047005;OID=.;OPOS=1079320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:53:53:57:57:0.518182:33:24:22:31:33:24:22:31 chr2 1099075 . TTA CTT,TCT,TTC 656.43 PASS AF=0,0.036036,0.459459;AO=5,10,23;DP=125;FAO=0,4,51;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=0,3,39;FSAR=0,1,12;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.010137,-0.00751832,-0.00561515;FXX=0.132802;HRUN=11,11,1;LEN=3,2,1;MLLD=105.566,96.3862,97.579;QD=23.6553;RBI=0.0363026,0.0947034,0.0258554;REFB=-0.0206827,-0.0172332,-0.0138358;REVB=-0.0348586,-0.0944045,0.0252383;RO=16;SAF=2,5,20;SAR=3,5,3;SRF=14;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.534695,-0.400015,-0.00891508;STB=0.5,0.538278,0.50987;STBP=1,0.91,0.87;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=-0.195212,0.078104,0.00982451;OID=.,.,.;OPOS=1099075,1099076,1099077;OREF=TTA,TA,A;OALT=CTT,CT,C;OMAPALT=CTT,TCT,TTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:99:125:111:16:41:5,10,23:0,4,51:0,0.036036,0.459459:3,5,3:2,5,20:14:2:0,1,12:0,3,39:32:9 chr2 1133367 . G A 560.87 PASS AF=0.543689;AO=55;DP=102;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.0211731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.839;QD=21.7814;RBI=0.0231947;REFB=-0.00447131;REVB=-0.00947083;RO=44;SAF=29;SAR=26;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108056;STB=0.547352;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00427143;OID=.;OPOS=1133367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:44:47:55:56:0.543689:26:29:29:15:26:30:30:17 chr2 1168781 . C A 291.35 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00555033;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.111;QD=16.6486;RBI=0.018586;REFB=-0.0115019;REVB=0.0177379;RO=37;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427779;STB=0.53123;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0116016;OID=.;OPOS=1168781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:38:32:32:0.457143:17:15:19:18:17:15:20:18 chr2 1204796 . C T 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0114998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1263;QD=16.0642;RBI=0.0640578;REFB=-0.0151613;REVB=0.0630171;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981343;STB=0.555512;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0325756;OID=.;OPOS=1204796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:10:16:16:15:10:16:16:15 chr2 1271230 . A G 1576.78 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000403409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.792;QD=63.7085;RBI=0.016984;REFB=0;REVB=0.0169792;RO=0;SAF=45;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000702242;OID=.;OPOS=1271230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:99:0:0:97:99:1:52:45:0:0:52:47:0:0 chr2 1320143 . C T 643.27 PASS AF=0.547826;AO=63;DP=115;FAO=63;FDP=115;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0394154;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7617;QD=22.3745;RBI=0.0456504;REFB=-0.0156103;REVB=-0.0230301;RO=49;SAF=27;SAR=36;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822308;STB=0.558585;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0129259;OID=.;OPOS=1320143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:49:52:63:63:0.547826:36:27:26:23:36:27:29:23 chr2 1418192 . C G 614.83 PASS AF=0.480916;AO=63;DP=131;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0370481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0032;QD=18.7734;RBI=0.0376501;REFB=-0.00800919;REVB=0.00670591;RO=68;SAF=39;SAR=24;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114566;STB=0.563507;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00876574;OID=.;OPOS=1418192;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:68:68:63:63:0.480916:24:39:34:34:24:39:34:34 chr2 1460004 . G T 519.53 PASS AF=0.520833;AO=49;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.00195523;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.7576;QD=21.6472;RBI=0.0341253;REFB=-0.0336297;REVB=-0.0340693;RO=47;SAF=17;SAR=32;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259546;STB=0.630291;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0236422;OID=.;OPOS=1460004;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:47:46:49:50:0.520833:32:17:30:17:32:18:29:17 chr2 1497803 . C T 209.33 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0135102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.939;QD=13.7268;RBI=0.0153883;REFB=-0.015338;REVB=-0.00736719;RO=35;SAF=11;SAR=14;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191011;STB=0.615692;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0248811;OID=.;OPOS=1497803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:14:11:22:13:14:11:23:13 chr2 1499899 . C T 486.53 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00223202;FXX=0.0107515;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.855;QD=21.1533;RBI=0.00745371;REFB=-0.00743858;REVB=-0.00711167;RO=42;SAF=26;SAR=21;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863327;STB=0.531585;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00717587;OID=.;OPOS=1499899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:42:45:47:47:0.51087:21:26:19:23:21:26:22:23 chr2 1499927 . A C 551.34 PASS AF=0.56044;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0248695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.62;QD=24.2349;RBI=0.0267999;REFB=-0.00773594;REVB=0.00998709;RO=40;SAF=28;SAR=23;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594997;STB=0.532629;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00581628;OID=.;OPOS=1499927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:40:40:51:51:0.56044:23:28:19:21:23:28:19:21 chr2 1520676 . T C 381.48 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00306926;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8756;QD=19.0742;RBI=0.00688969;REFB=-0.0338599;REVB=-0.00616826;RO=41;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000575833;STB=0.500321;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0213593;OID=.;OPOS=1520676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:41:41:39:39:0.4875:20:19:20:21:20:19:20:21 chr2 1546327 . C G 302.03 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0436029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7366;QD=14.3823;RBI=0.0489035;REFB=-0.00792595;REVB=0.0221436;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165305;STB=0.593696;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0114903;OID=.;OPOS=1546327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:50:34:34:0.404762:19:15:30:20:19:15:30:20 chr2 1647171 . T C 1305.61 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105227;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.851;QD=62.1717;RBI=0.0105246;REFB=0;REVB=0.000203606;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13592e-05;OID=.;OPOS=1647171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0 chr2 1652822 . T G 1572.94 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.443;QD=59.9217;RBI=0.00528662;REFB=0;REVB=0.00434705;RO=0;SAF=66;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34076e-06;OID=.;OPOS=1652822;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:39:66:0:0:39:66:0:0 chr2 1664654 . A G 1859.33 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.319;QD=61.4656;RBI=0.0565648;REFB=0;REVB=0.0551011;RO=0;SAF=69;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101857;OID=.;OPOS=1664654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:52:69:0:0:52:69:0:0 chr2 1842968 . T C 444.44 PASS AF=0.544304;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00893774;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.278;QD=22.5032;RBI=0.014771;REFB=-0.0158519;REVB=-0.0117601;RO=36;SAF=12;SAR=31;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807201;STB=0.544603;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0176483;OID=.;OPOS=1842968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:36:36:43:43:0.544304:31:12:13:23:31:12:13:23 chr2 1926437 . G T 786.5 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0138748;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.931;QD=55.1932;RBI=0.0244531;REFB=0.0632778;REVB=0.0201357;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154585;STB=0.508194;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=4.33357e-05;OID=.;OPOS=1926437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:30:26:0:1:30:26:0:1 chr2 1946914 . A G 236.11 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0247335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.613;QD=19.2746;RBI=0.0249038;REFB=-0.0302149;REVB=-0.00290708;RO=26;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00172967;STB=0.500978;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0278493;OID=.;OPOS=1946914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:15:8:9:17:15:8:9:17 chr2 1946968 . C T 481.31 PASS AF=0.438017;AO=53;DP=121;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0217583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.124;QD=15.911;RBI=0.0221021;REFB=-0.0325393;REVB=-0.00388303;RO=68;SAF=20;SAR=33;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111617;STB=0.562536;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.043418;OID=.;OPOS=1946968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:68:68:53:53:0.438017:33:20:33:35:33:20:33:35 chr2 3212704 . C A 54.0 PASS AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0113608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.767;QD=8.30755;RBI=0.0191195;REFB=-0.00833322;REVB=0.0153781;RO=18;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163863;STB=0.510178;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0229006;OID=.;OPOS=3212704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:5:3:7:11:5:3:7:11 chr2 3392075 . T C 189.06 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0130382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.472;QD=21.007;RBI=0.0299726;REFB=-0.0240378;REVB=-0.0269881;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496376;STB=0.507878;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0266004;OID=.;OPOS=3392075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:17:19:19:0.527778:12:7:5:11:12:7:6:11 chr2 3392295 . A G 127.01 PASS AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0038653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.612;QD=19.5397;RBI=0.0257782;REFB=-0.0299531;REVB=0.0254867;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239512;STB=0.615228;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0171299;OID=.;OPOS=3392295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:26:12:12:13:14:0.538462:6:7:3:9:7:7:3:9 chr2 3392513 . TT CA 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0051077;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=181.408;QD=17.3782;RBI=0.00735104;REFB=0.0049324;REVB=-0.0052867;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373453;STB=0.708051;STBP=0.129;TYPE=mnp;VARB=-0.00315555;OID=.;OPOS=3392513;OREF=TT;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:0:10:7:4:0:10 chr2 3425514 . G C 277.93 PASS AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.0528234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.923;QD=13.7251;RBI=0.0548161;REFB=0.00188456;REVB=-0.0146456;RO=48;SAF=20;SAR=12;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177613;STB=0.595551;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00488376;OID=.;OPOS=3425514;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:48:49:32:32:0.395062:12:20:22:26:12:20:23:26 chr2 3425729 . C T 262.42 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.028706;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5277;QD=16.9302;RBI=0.0289693;REFB=-0.0178993;REVB=0.00389712;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424109;STB=0.531229;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0407926;OID=.;OPOS=3425729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:33:29:29:0.467742:14:15:18:14:14:15:19:14 chr2 3469463 . G C 315.84 PASS AF=0.416667;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.010151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.532;QD=15.0401;RBI=0.010835;REFB=-0.0115224;REVB=-0.00378877;RO=49;SAF=22;SAR=13;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207222;STB=0.617318;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0213379;OID=.;OPOS=3469463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:49:49:35:35:0.416667:13:22:21:28:13:22:21:28 chr2 3470115 . T C 309.71 PASS AF=0.5;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0181912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3389;QD=18.7704;RBI=0.0182655;REFB=-0.023665;REVB=-0.00164574;RO=31;SAF=25;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27148;STB=0.640934;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.015027;OID=.;OPOS=3470115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:31:33:33:33:0.5:8:25:15:16:8:25:17:16 chr2 3470124 . G A 284.72 PASS AF=0.484375;AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0267541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.0618;QD=17.795;RBI=0.0336979;REFB=-0.0434205;REVB=-0.0204881;RO=32;SAF=22;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266234;STB=0.648151;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0319753;OID=.;OPOS=3470124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:32:33:30:31:0.484375:8:22:15:17:8:23:16:17 chr2 3483205 . C T 103.26 PASS AF=0.444444;AO=10;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0282709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.311;QD=15.2984;RBI=0.0292541;REFB=-0.00622431;REVB=0.00752036;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376093;STB=0.687169;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00766226;OID=.;OPOS=3483205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:11:14:10:12:0.444444:3:7:3:8:3:9:6:8 chr2 3488502 . A G 1542.52 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251623;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.719;QD=59.9038;RBI=0.0442348;REFB=0;REVB=0.036381;RO=0;SAF=63;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152272;OID=.;OPOS=3488502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:103:0:0:101:103:1:38:63:0:0:38:65:0:0 chr2 3504687 . A G 317.01 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.000365718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.805;QD=17.8595;RBI=0.00234407;REFB=0.00531588;REVB=0.00231536;RO=36;SAF=12;SAR=22;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115373;STB=0.572873;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.00515922;OID=.;OPOS=3504687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:37:34:34:0.478873:22:12:17:19:22:12:18:19 chr2 3518643 . T C 183.54 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0063646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.143;QD=11.8412;RBI=0.0327243;REFB=-0.0176672;REVB=-0.0320994;RO=37;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197804;STB=0.612093;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0293988;OID=.;OPOS=3518643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:37:39:23:23:0.370968:10:13:14:23:10:13:15:24 chr2 3597974 . T C 70.5 PASS AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00264371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.834;QD=7.04988;RBI=0.00407522;REFB=-0.0056956;REVB=-0.00310132;RO=30;SAF=7;SAR=3;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385129;STB=0.739927;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.014109;OID=.;OPOS=3597974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:3:7:11:19:3:7:11:19 chr2 3605468 . A G 742.88 PASS AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.14857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2837;QD=59.4304;RBI=0.148791;REFB=-0.177199;REVB=0.00810358;RO=1;SAF=26;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177516;STB=0.518511;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00294913;OID=.;OPOS=3605468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:50:1:2:48:48:0.96:22:26:1:0:22:26:2:0 chr2 3652616 . G C 781.08 PASS AF=0.44385;AO=81;DP=185;FAO=83;FDP=187;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=54;FSRR=50;FWDB=0.0411885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.589;QD=16.7075;RBI=0.0411909;REFB=-0.0332911;REVB=0.000437435;RO=104;SAF=42;SAR=39;SRF=54;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000719871;STB=0.507345;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0406789;OID=.;OPOS=3652616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:187:104:104:81:83:0.44385:39:42:54:50:41:42:54:50 chr2 3653844 . T C 214.37 PASS AF=0.446429;AO=20;DP=52;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0201064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.636;QD=15.3119;RBI=0.0266607;REFB=-0.0442067;REVB=0.0175078;RO=30;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364741;STB=0.56973;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0517994;OID=.;OPOS=3653844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:56:30:31:20:25:0.446429:12:8:11:19:13:12:11:20 chr2 3673648 . G A 103.02 PASS AF=0.309524;AO=11;DP=40;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=0.0147995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.003;QD=9.81132;RBI=0.0189171;REFB=-0.00230113;REVB=-0.0117826;RO=29;SAF=5;SAR=6;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397312;STB=0.722136;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00878997;OID=.;OPOS=3673648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:29:29:11:13:0.309524:6:5:23:6:7:6:23:6 chr2 3721641 . T A 34.48 PASS AF=0.105263;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=57;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0501619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.475;QD=2.41967;RBI=0.0523538;REFB=-0.0248621;REVB=-0.01499;RO=26;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366226;STB=0.732614;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.058316;OID=.;OPOS=3721641;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:33:57:26:51:6:6:0.105263:4:2:17:9:4:2:31:20 chr2 3721729 . A G 503.8 PASS AF=0.527473;AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0489278;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0368;QD=22.1451;RBI=0.0534681;REFB=-0.00560406;REVB=0.0215618;RO=43;SAF=15;SAR=33;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295761;STB=0.663325;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00600328;OID=.;OPOS=3721729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:43:43:48:48:0.527473:33:15:28:15:33:15:28:15 chr2 3749151 . GGAA G 333.78 PASS AF=0.480769;AO=56;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.00819437;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=244.219;QD=12.8376;RBI=0.00873107;REFB=-0.0136482;REVB=-0.00301393;RO=43;SAF=28;SAR=28;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138665;STB=0.537368;STBP=0.467;TYPE=del;VARB=0.0149966;OID=.;OPOS=3749152;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.480769:56:104:50:104:54:27:23:33:21:99:43:28:28:29:14 chr2 3800383 . C T 374.98 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00953033;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0733;QD=14.5624;RBI=0.0530865;REFB=-0.00941291;REVB=-0.0522241;RO=60;SAF=19;SAR=24;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258818;STB=0.514592;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0132155;OID=.;OPOS=3800383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:60:60:43:43:0.417476:24:19:28:32:24:19:28:32 chr2 5835512 . TGGGGC TGGG,TGGGC,TGGGG 195.71 PASS AF=0.925926,0,0;AO=7,6,4;DP=29;FAO=25,0,0;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=13,0,0;FSAR=12,0,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.190413,0.429954,-0.063115;FXX=0.0689417;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=14.7645,7.62531,8.05755;QD=28.9937;RBI=0.259816,0.502383,0.654414;REFB=-0.165484,-0.199034,-0.0596687;REVB=0.176769,-0.259861,0.651363;RO=3;SAF=5,0,4;SAR=2,6,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.445161,0.445161,0.435897;SSEP=0,0,0.466667;SSSB=-0.202067,-0.804025,0;STB=0.535686,0.5,0.5;STBP=0.25,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0484466,0.159754,0;OID=.,.,.;OPOS=5835516,5835513,5835517;OREF=GC,G,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGGG,TGGGC,TGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.925926,0,0:7,6,4:29:25,0,0:27:2:13,0,0:12,0,0:2:0:5:3:5,0,4:2,6,0:3:0 chr2 5835697 . GTTTTTTTTTTTTTTTTTT GTTTTTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTTTTTTTG 118.02 PASS AF=0.466667,0.533333;AO=4,4;DP=18;FAO=7,8;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7,8;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101469,-0.0537351;FXX=0.249875;HRUN=19,19;LEN=3,1;MLLD=6.74507,98.7694;QD=31.473;RBI=0.101469,0.0537351;REFB=0.236046,0.0589327;REVB=-2.80434e-06,-2.25647e-05;RO=0;SAF=4,4;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0783272,-0.0513316;OID=.,.;OPOS=5835698,5835715;OREF=TTT,T;OALT=-,G;OMAPALT=GTTTTTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTTTTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.466667,0.533333:4,4:18:7,8:15:0:7,8:0,0:0:0:51:0:4,4:0,0:0:0 chr2 5838030 . G A 285.24 PASS AF=0.565217;AO=23;DP=43;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0433736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.119;QD=24.8036;RBI=0.0434935;REFB=-0.014526;REVB=-0.00322745;RO=20;SAF=16;SAR=7;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367358;STB=0.673136;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0211805;OID=.;OPOS=5838030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:46:20:20:23:26:0.565217:7:16:5:15:9:17:5:15 chr2 5839686 . A G 233.49 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00841046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.78;QD=15.0638;RBI=0.017199;REFB=-0.00437087;REVB=0.0150023;RO=35;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413667;STB=0.523448;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00745599;OID=.;OPOS=5839686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:12:15:18:17:12:15:18:17 chr2 5839811 . T C 213.94 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0493612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.572;QD=20.8719;RBI=0.0509363;REFB=0.00559963;REVB=0.012569;RO=20;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143615;STB=0.591159;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00459605;OID=.;OPOS=5839811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:20:21:0.512195:12:8:5:15:12:9:5:15 chr2 5840461 . A G 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0512597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.261;QD=19.1805;RBI=0.051388;REFB=0.00265167;REVB=-0.00362879;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129697;STB=0.574349;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.000944472;OID=.;OPOS=5840461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:9:4:5:6:9:4:5:6 chr2 6990020 . C T 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00105717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.504;QD=63.1954;RBI=0.0113945;REFB=0;REVB=0.0113453;RO=0;SAF=48;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26933e-05;OID=.;OPOS=6990020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:44:48:0:0:44:48:0:0 chr2 7137067 . A G 542.59 PASS AF=0.409722;AO=59;DP=145;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=-0.00537671;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.379;QD=15.0719;RBI=0.0176099;REFB=-0.0109699;REVB=0.016769;RO=85;SAF=31;SAR=28;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00419781;STB=0.50236;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.013515;OID=.;OPOS=7137067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:85:85:59:59:0.409722:28:31:45:40:28:31:45:40 chr2 7154632 . T C 1659.62 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.114;QD=60.3497;RBI=0.0239608;REFB=0;REVB=0.0182056;RO=0;SAF=40;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03964e-05;OID=.;OPOS=7154632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:70:40:0:0:70:40:0:0 chr2 7208422 . T C 254.19 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.00528934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.489;QD=15.4055;RBI=0.0164287;REFB=-0.0200822;REVB=0.015554;RO=36;SAF=9;SAR=20;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260062;STB=0.509085;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0305889;OID=.;OPOS=7208422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:37:29:29:0.439394:20:9:12:24:20:9:12:25 chr2 8871342 . C A 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00553929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.787;QD=16.8738;RBI=0.00830046;REFB=-0.0120903;REVB=0.00618173;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19953;STB=0.613623;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0117164;OID=.;OPOS=8871342;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:11:9:17:9:11:9:17:9 chr2 9491017 . C T 2056.97 PASS AF=0.992481;AO=132;DP=135;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0251072;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1085;QD=61.8637;RBI=0.0289715;REFB=-0.139065;REVB=0.0144561;RO=0;SAF=94;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000991144;OID=.;OPOS=9491017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:135:133:0:1:132:132:0.992481:38:94:0:0:38:94:0:1 chr2 9983686 . G T 249.69 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=0.0190408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8776;QD=18.4953;RBI=0.0222764;REFB=0.00276716;REVB=0.0115622;RO=27;SAF=6;SAR=21;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102461;STB=0.556923;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.00173951;OID=.;OPOS=9983686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:21:6:4:23:21:6:4:23 chr2 9983716 . A C 670.13 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.669;QD=62.3379;RBI=0.0355264;REFB=0;REVB=0.0349025;RO=0;SAF=7;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.87566e-05;OID=.;OPOS=9983716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:35:7:0:0:36:7:0:0 chr2 10045014 . C A,T 1656.5 PASS AF=0.226891,0.764706;AO=23,87;DP=110;FAO=27,91;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=18,47;FSAR=9,44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00580634,-4.23079e-05;FXX=0.0245881;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=119.841,75.9354;QD=55.6807;RBI=0.00715859,0.0194571;REFB=-0.115974,-0.0917876;REVB=0.00418709,0.0194571;RO=0;SAF=18,46;SAR=5,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.513504,0.505262;STBP=0.63,0.509;TYPE=snp,snp;VARB=0.030971,-0.000703297;OID=.,.;OPOS=10045014,10045014;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:110:119:0:1:23,87:27,91:0.226891,0.764706:5,41:18,46:0:0:9,44:18,47:1:0 chr2 10045015 . A T 45.25 PASS AF=0.097561;AO=12;DP=123;FAO=12;FDP=123;FR=.;FRO=111;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=64;FSRR=47;FWDB=-0.0101215;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=111.772;QD=1.47145;RBI=0.0157605;REFB=-0.00159298;REVB=0.0120809;RO=111;SAF=5;SAR=7;SRF=64;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186667;STB=0.641207;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00573775;OID=.;OPOS=10045015;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:123:123:111:111:12:12:0.097561:7:5:64:47:7:5:64:47 chr2 10045024 . G A 1935.77 PASS AF=1;AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250741;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.571;QD=61.9446;RBI=0.0463726;REFB=0;REVB=0.0390091;RO=0;SAF=68;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017027;OID=.;OPOS=10045024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:124:125:1:56:68:0:0:56:69:0:0 chr2 10050947 . T C 567.21 PASS AF=0.469697;AO=52;DP=123;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0317254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.955;QD=17.1881;RBI=0.0333856;REFB=-0.0143831;REVB=-0.0103968;RO=66;SAF=21;SAR=31;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210716;STB=0.514197;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0194529;OID=.;OPOS=10050947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:132:66:70:52:62:0.469697:31:21:28:38:32:30:32:38 chr2 10050960 . A G 572.06 PASS AF=0.465116;AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0396535;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=70.4271;QD=17.7384;RBI=0.0412725;REFB=-0.00130516;REVB=0.0114464;RO=66;SAF=33;SAR=27;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901686;STB=0.561464;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0011289;OID=.;OPOS=10050960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:66:69:60:60:0.465116:27:33:30:36:27:33:30:39 chr2 10053412 . C T 373.36 PASS AF=0.412371;AO=40;DP=97;FAO=40;FDP=97;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0374586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3155;QD=15.3961;RBI=0.0512177;REFB=0.011142;REVB=0.0349301;RO=57;SAF=25;SAR=15;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875892;STB=0.549573;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.0161957;OID=.;OPOS=10053412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:57:57:40:40:0.412371:15:25:31:26:15:25:31:26 chr2 10059770 . G T 323.28 PASS AF=0.651163;AO=26;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00188046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6751;QD=30.0724;RBI=0.0503626;REFB=-0.0288756;REVB=0.0503275;RO=15;SAF=20;SAR=6;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240347;STB=0.616349;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0216972;OID=.;OPOS=10059770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:15:15:26:28:0.651163:6:20:7:8:7:21:7:8 chr2 10059844 . C T 73.44 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0704367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.776;QD=9.47554;RBI=0.0713696;REFB=-0.0194404;REVB=0.0115017;RO=21;SAF=3;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257359;STB=0.657393;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0235079;OID=.;OPOS=10059844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:7:3:11:10:7:3:11:10 chr2 10094992 . A G 318.8 PASS AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0227639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.704;QD=26.567;RBI=0.0410799;REFB=-0.0295139;REVB=-0.0341959;RO=19;SAF=11;SAR=17;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018837;STB=0.503113;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.031319;OID=.;OPOS=10094992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:19:20:28:28:0.583333:17:11:7:12:17:11:8:12 chr2 10188649 . A T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.47;QD=60.2307;RBI=0.0251803;REFB=0;REVB=0.0216939;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010097;OID=.;OPOS=10188649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0 chr2 10262920 . T G 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.0197619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.843;QD=16.1065;RBI=0.0296601;REFB=-0.0260739;REVB=0.0221175;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14311;STB=0.581308;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0323044;OID=.;OPOS=10262920;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:5:12:18:4:5:12:18:4 chr2 10563236 . G A 52.89 PASS AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0406669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.4203;QD=21.1575;RBI=0.0493378;REFB=-0.00984498;REVB=0.027936;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122639;STB=0.571224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00172903;OID=.;OPOS=10563236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:4:3:2:1:4:3:2:1 chr2 10580967 . G A 265.41 PASS AF=0.33;AO=33;DP=96;FAO=33;FDP=100;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.0219464;FXX=0.00990001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.135;QD=10.6162;RBI=0.0241379;REFB=-0.00392451;REVB=-0.0100496;RO=63;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103817;STB=0.576164;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00898515;OID=.;OPOS=10580967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:100:63:67:33:33:0.33:18:15:23:40:18:15:23:44 chr2 10712278 . C T 1515.13 PASS AF=1;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125833;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5773;QD=58.84;RBI=0.0767976;REFB=-0.0214885;REVB=0.0757597;RO=1;SAF=73;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016077;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661253;OID=.;OPOS=10712278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:104:103:1:0:102:103:1:29:73:0:1:30:73:0:0 chr2 10784491 . A G 369.1 PASS AF=0.610169;AO=35;DP=58;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0293362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1166;QD=25.0236;RBI=0.0524831;REFB=0.00600114;REVB=0.0435186;RO=23;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260161;STB=0.50847;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=-0.00336082;OID=.;OPOS=10784491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:23:23:35:36:0.610169:17:18:11:12:18:18:11:12 chr2 10808776 . C CAA 1523.71 PASS AF=1;AO=94;DP=99;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047069;FXX=0.0404;HRUN=0;LEN=2;MLLD=198.813;QD=64.1561;RBI=0.0514944;REFB=0;REVB=0.020885;RO=1;SAF=44;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938906;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.97966e-05;OID=.;OPOS=10808777;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:94:99:95:95:0:45:50:0:0:8:1:44:50:0:1 chr2 10824666 . GC G 285.92 PASS AF=0.557692;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0272684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.043;QD=21.9941;RBI=0.0282582;REFB=-0.0368657;REVB=-0.00741338;RO=22;SAF=8;SAR=20;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151441;STB=0.581479;STBP=0.225;TYPE=del;VARB=0.0135444;OID=.;OPOS=10824667;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.557692:28:52:29:52:23:8:21:10:13:99:22:8:20:10:12 chr2 10908893 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0682;QD=54.5176;RBI=0.0723453;REFB=0;REVB=-0.0681775;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120144;OID=.;OPOS=10908893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0 chr2 10928906 . T C 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00362006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.324;QD=15.3789;RBI=0.0107963;REFB=-0.00176627;REVB=0.0101713;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319896;STB=0.687169;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00664931;OID=.;OPOS=10928906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:9:3:8:6:9:3:8:6 chr2 10930903 . T C 394.41 PASS AF=0.660714;AO=37;DP=56;FAO=37;FDP=56;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00618706;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.056;QD=28.1722;RBI=0.00901188;REFB=-0.0290313;REVB=-0.00655242;RO=19;SAF=16;SAR=21;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260414;STB=0.514194;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0141501;OID=.;OPOS=10930903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:19:19:37:37:0.660714:21:16:9:10:21:16:9:10 chr2 10933249 . C T 360.16 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0360911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.415;QD=32.014;RBI=0.0365456;REFB=-0.0190927;REVB=0.00574544;RO=15;SAF=11;SAR=19;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642544;STB=0.535187;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0100972;OID=.;OPOS=10933249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:19:11:7:8:19:11:7:8 chr2 10942687 . C T 460.72 PASS AF=0.535714;AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00868551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9512;QD=21.9392;RBI=0.0843549;REFB=0.00688226;REVB=-0.0839066;RO=39;SAF=27;SAR=17;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216219;STB=0.622168;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00551681;OID=.;OPOS=10942687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:39:44:45:0.535714:17:27:14:25:17:28:14:25 chr2 11053020 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00448215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.081;QD=53.2771;RBI=0.00624869;REFB=0;REVB=0.0043539;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129731;OID=.;OPOS=11053020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr2 11053740 . C T 598.12 PASS AF=0.508333;AO=60;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0050913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1196;QD=19.9374;RBI=0.0249732;REFB=-0.0169509;REVB=-0.0244487;RO=59;SAF=36;SAR=24;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686714;STB=0.532504;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.017293;OID=.;OPOS=11053740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:59:60:61:0.508333:24:36:31:28:25:36:31:28 chr2 11264830 . G A 1573.41 PASS AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0416999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4902;QD=58.8191;RBI=0.0533335;REFB=0.0500179;REVB=0.0332502;RO=1;SAF=43;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109089;STB=0.505746;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.000112244;OID=.;OPOS=11264830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:63:43:1:0:63:43:1:0 chr2 11323276 . T C 690.94 PASS AF=0.482517;AO=69;DP=143;FAO=69;FDP=143;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=-0.00521885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.035;QD=19.327;RBI=0.0119264;REFB=-0.0267801;REVB=0.0107239;RO=74;SAF=34;SAR=35;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132927;STB=0.573323;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0339444;OID=.;OPOS=11323276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:74:74:69:69:0.482517:35:34:26:48:35:34:26:48 chr2 11359120 . G T 45.99 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0608712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.01;QD=9.19818;RBI=0.0608962;REFB=-0.017382;REVB=-0.00174513;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476186;STB=0.529329;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0258802;OID=.;OPOS=11359120;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:5:8:4:3:5:8 chr2 11374200 . C G 549.59 PASS AF=0.433824;AO=59;DP=136;FAO=59;FDP=136;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.00317855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5404;QD=16.1645;RBI=0.00528638;REFB=0.00294096;REVB=-0.00422406;RO=77;SAF=22;SAR=37;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726764;STB=0.540696;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.00361897;OID=.;OPOS=11374200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:77:77:59:59:0.433824:37:22:34:43:37:22:34:43 chr2 11702661 . A C 1426.38 PASS AF=0.943925;AO=99;DP=104;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0354216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.3787;QD=53.3226;RBI=0.0354585;REFB=0.0348015;REVB=-0.00161896;RO=5;SAF=41;SAR=58;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00132714;STB=0.504848;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.00160266;OID=.;OPOS=11702661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:104:107:5:6:99:101:0.943925:58:41:2:3:59:42:3:3 chr2 11738091 . T C 727.48 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262439;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.867;QD=57.057;RBI=0.0542644;REFB=0;REVB=0.0474962;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279957;OID=.;OPOS=11738091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0 chr2 11751118 . G A 55.03 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0300573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2351;QD=9.56966;RBI=0.0348569;REFB=0.0202729;REVB=-0.0176511;RO=14;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354271;STB=0.753085;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.0298667;OID=.;OPOS=11751118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:14:15:8:8:0.347826:7:1:5:9:7:1:6:9 chr2 11752635 . T C 1822.18 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9452;QD=61.2496;RBI=0.0322019;REFB=0;REVB=0.00612158;RO=0;SAF=50;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222752;OID=.;OPOS=11752635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:68:50:0:0:68:51:0:0 chr2 11817812 . G C 2383.92 PASS AF=0.993711;AO=157;DP=159;FAO=158;FDP=159;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0163342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1344;QD=59.9727;RBI=0.0240269;REFB=-0.0455161;REVB=0.0176207;RO=2;SAF=75;SAR=82;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114613;STB=0.502994;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000109681;OID=.;OPOS=11817812;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:159:159:2:1:157:158:0.993711:82:75:0:2:83:75:0:1 chr2 11965541 . A G 281.2 PASS AF=0.352941;AO=35;DP=104;FAO=36;FDP=102;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=-0.00419005;FXX=0.0192289;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.311;QD=11.0274;RBI=0.014084;REFB=-0.00397098;REVB=-0.0134463;RO=61;SAF=13;SAR=22;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728602;STB=0.527827;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00530792;OID=.;OPOS=11965541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:102:61:66:35:36:0.352941:22:13:19:42:22:14:23:43 chr2 12551577 . C CATT 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0263343;FXX=0;HRUN=0;LEN=3;MLLD=194.931;QD=14.0975;RBI=0.0362158;REFB=0.00674761;REVB=-0.0248613;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180198;STB=0.586817;STBP=0.437;TYPE=ins;VARB=-0.00564951;OID=.;OPOS=12551578;OREF=-;OALT=ATT;OMAPALT=CATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.419355:13:32:13:31:18:4:9:8:10:99:19:4:9:9:10 chr2 14777095 . AT AA,TA 35.78 PASS AF=0.461538,0;AO=3,2;DP=13;FAO=6,0;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0120689,-0.0147595;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=49.7012,43.3538;QD=11.0093;RBI=0.208394,0.0337563;REFB=-0.195071,-0.183442;REVB=0.208044,0.0303586;RO=7;SAF=0,1;SAR=3,1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.649962,0.0720733;STB=0.756614,0.5;STBP=0.15,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0227554,0;OID=.,.;OPOS=14777096,14777095;OREF=T,AT;OALT=A,TA;OMAPALT=AA,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:13:13:7:7:3,2:6,0:0.461538,0:3,1:0,1:3:4:5,0:1,0:4:3 chr2 15533779 . G A 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0156777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.586;QD=21.7468;RBI=0.0204446;REFB=0.0141267;REVB=-0.0131221;RO=20;SAF=6;SAR=16;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214818;STB=0.621242;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00499872;OID=.;OPOS=15533779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:16:6:10:10:16:6:10:10 chr2 15542337 . C G 365.98 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0219309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3437;QD=21.528;RBI=0.0258792;REFB=-0.008414;REVB=0.0137393;RO=31;SAF=15;SAR=22;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171166;STB=0.594543;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00719724;OID=.;OPOS=15542337;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:22:15:19:12:22:15:19:12 chr2 15555762 . C G 289.66 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0277804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7593;QD=18.9941;RBI=0.0282528;REFB=-0.00918859;REVB=-0.00514536;RO=29;SAF=13;SAR=18;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144804;STB=0.588551;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00940202;OID=.;OPOS=15555762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:30:31:31:0.508197:18:13:17:12:18:13:18:12 chr2 15555832 . A G 242.96 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0792532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.159;QD=22.601;RBI=0.0810315;REFB=-0.00557566;REVB=0.0168829;RO=19;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111486;STB=0.574883;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00501453;OID=.;OPOS=15555832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:20:23:23:0.534884:14:9:10:9:14:9:11:9 chr2 15601441 . C T 764.08 PASS AF=0.503401;AO=74;DP=148;FAO=74;FDP=147;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=0.00887115;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.052;QD=20.7914;RBI=0.0114996;REFB=-0.0154746;REVB=0.00731736;RO=73;SAF=28;SAR=46;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180042;STB=0.509916;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0187481;OID=.;OPOS=15601441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:73:73:74:74:0.503401:46:28:29:44:46:28:29:44 chr2 15613460 . T C 266.55 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.00557741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3331;QD=15.9133;RBI=0.00711311;REFB=-0.00214027;REVB=-0.00441462;RO=37;SAF=15;SAR=15;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119295;STB=0.56712;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0027075;OID=.;OPOS=15613460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:15:15:14:23:15:15:14:23 chr2 15614404 . T C 311.93 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00350709;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.799;QD=16.4175;RBI=0.00368115;REFB=-0.024386;REVB=0.00111858;RO=43;SAF=15;SAR=19;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930196;STB=0.54578;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0338806;OID=.;OPOS=15614404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:43:42:34:34:0.447368:19:15:23:20:19:15:22:20 chr2 15618339 . G A 154.19 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0356178;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.102;QD=13.7057;RBI=0.0436004;REFB=-0.0230497;REVB=-0.0251469;RO=28;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314864;STB=0.68162;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0468527;OID=.;OPOS=15618339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:7:10:8:20:7:10:8:20 chr2 15698746 . G C 1019.51 PASS AF=0.481651;AO=105;DP=219;FAO=105;FDP=218;FR=.;FRO=113;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=62;FSRR=51;FWDB=0.0104285;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.677;QD=18.7066;RBI=0.0104507;REFB=0.00725621;REVB=0.000681302;RO=113;SAF=46;SAR=59;SRF=62;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104116;STB=0.557372;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00665915;OID=.;OPOS=15698746;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:113:113:105:105:0.481651:59:46:62:51:59:46:62:51 chr2 15743344 . T C 860.6 PASS AF=0.537975;AO=85;DP=158;FAO=85;FDP=158;FR=.;FRO=73;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=0.00842476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7553;QD=21.7874;RBI=0.0533577;REFB=5.39173e-05;REVB=0.0526884;RO=73;SAF=45;SAR=40;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741793;STB=0.540531;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000274947;OID=.;OPOS=15743344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:73:73:85:85:0.537975:40:45:45:28:40:45:45:28 chr2 15747393 . C T 347.23 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0268183;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.662;QD=19.5625;RBI=0.0274558;REFB=0.00429447;REVB=-0.00588225;RO=35;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621969;STB=0.534587;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.00465859;OID=.;OPOS=15747393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:35:35:36:36:0.507042:21:15:17:18:21:15:17:18 chr2 15771096 . G T 124.16 PASS AF=0.451613;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0327661;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.603;QD=16.0201;RBI=0.0330386;REFB=-0.00612245;REVB=0.00423452;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148003;STB=0.531973;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00725612;OID=.;OPOS=15771096;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:17:13:14:0.451613:9:4:8:10:9:5:7:10 chr2 15840623 . A G 402.09 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0142822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.882;QD=16.5811;RBI=0.0160786;REFB=-0.00489965;REVB=0.00738508;RO=54;SAF=15;SAR=27;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166236;STB=0.588998;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00725499;OID=.;OPOS=15840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:55:42:42:0.43299:27:15:28:26:27:15:28:27 chr2 16090820 . T C 486.04 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0431277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1678;QD=55.5477;RBI=0.0467636;REFB=-0.0570578;REVB=-0.0180786;RO=1;SAF=19;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239715;STB=0.512813;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00166616;OID=.;OPOS=16090820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:15:19:1:0:15:19:1:0 chr2 16380485 . A G 145.43 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.02443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8219;QD=16.1588;RBI=0.0244523;REFB=-0.0223543;REVB=-0.00104528;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355468;STB=0.705613;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0325363;OID=.;OPOS=16380485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:12:4:12:8:12:4:12:8 chr2 16380541 . C T 107.36 PASS AF=0.433333;AO=10;DP=27;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0336839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9598;QD=14.3142;RBI=0.0715527;REFB=-0.0346072;REVB=0.0631283;RO=16;SAF=2;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352803;STB=0.689341;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0218898;OID=.;OPOS=16380541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:30:16:17:10:13:0.433333:8:2:8:8:10:3:9:8 chr2 17696573 . C T 1305.11 PASS AF=0.529661;AO=123;DP=232;FAO=125;FDP=236;FR=.;FRO=111;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=66;FSRR=45;FWDB=-0.0052466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.484;QD=22.1206;RBI=0.0116893;REFB=-0.010072;REVB=-0.0104457;RO=109;SAF=69;SAR=54;SRF=64;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229366;STB=0.512787;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00896463;OID=.;OPOS=17696573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:236:109:111:123:125:0.529661:54:69:64:45:54:71:66:45 chr2 17698678 . A G 815.89 PASS AF=0.454545;AO=85;DP=187;FAO=85;FDP=187;FR=.;FRO=102;FSAF=29;FSAR=56;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=0.0169761;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.719;QD=17.4522;RBI=0.017194;REFB=-0.010319;REVB=-0.00272908;RO=102;SAF=29;SAR=56;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114904;STB=0.563894;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00694423;OID=.;OPOS=17698678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:102:102:85:85:0.454545:56:29:46:56:56:29:46:56 chr2 17942775 . T A 937.56 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0564507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1885;QD=58.5978;RBI=0.0585408;REFB=0;REVB=0.0155029;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000347036;OID=.;OPOS=17942775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:40:24:0:0:40:24:0:0 chr2 17954027 . G A 1491.59 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2945;QD=63.472;RBI=0.0932695;REFB=0;REVB=-0.0878238;RO=0;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00070337;OID=.;OPOS=17954027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:46:48:0:0:46:48:0:0 chr2 17954421 . C G 1591.24 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147784;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.588;QD=64.2924;RBI=0.0643229;REFB=0;REVB=0.0643059;RO=0;SAF=49;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.24581e-05;OID=.;OPOS=17954421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:50:49:0:0:50:49:0:0 chr2 17962450 . A G 1098.6 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.709;QD=60.1975;RBI=0.0440806;REFB=0;REVB=-0.0120173;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000515011;OID=.;OPOS=17962450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:44:29:0:0:44:29:0:0 chr2 17962518 . C T 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000920252;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.179;QD=57.7121;RBI=0.0346397;REFB=0;REVB=-0.0346274;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.28084e-05;OID=.;OPOS=17962518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr2 17962993 . CAAGTT C 46.98 PASS AF=0.243902;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0013233;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=322.093;QD=4.58326;RBI=0.0129132;REFB=0.000694252;REVB=-0.0128452;RO=30;SAF=1;SAR=9;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.526533;STB=0.83771;STBP=0.033;TYPE=del;VARB=-0.00186124;OID=.;OPOS=17962994;OREF=AAGTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.243902:10:41:10:41:31:1:9:14:17:46:30:1:9:14:16 chr2 18112473 . G A 1873.27 PASS AF=0.991935;AO=119;DP=120;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1089;QD=60.4282;RBI=0.089755;REFB=-0.0686984;REVB=0.088059;RO=1;SAF=52;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703708;STB=0.503496;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00124153;OID=.;OPOS=18112473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:120:124:1:1:119:123:0.991935:67:52:0:1:71:52:0:1 chr2 18113508 . G A 315.14 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0244981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.197;QD=16.371;RBI=0.0245827;REFB=-0.0117008;REVB=-0.00203759;RO=42;SAF=19;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878;STB=0.549268;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0188437;OID=.;OPOS=18113508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:16:19:19:23:16:19:19:23 chr2 18113623 . A G 616.9 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159434;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.731;QD=61.6899;RBI=0.0507482;REFB=0;REVB=0.0481787;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000600437;OID=.;OPOS=18113623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0 chr2 18113789 . G A 346.27 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0109726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.167;QD=16.8914;RBI=0.0110189;REFB=-0.00978384;REVB=-0.00100921;RO=44;SAF=15;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930799;STB=0.558791;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0124221;OID=.;OPOS=18113789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:45:37:37:0.45122:22:15:22:22:22:15:23:22 chr2 19551762 . GTTC G 279.99 PASS AF=0.367347;AO=43;DP=148;FAO=54;FDP=147;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=58;FWDB=-0.00644549;FXX=0.0199987;HRUN=2;LEN=3;MLLD=288.385;QD=7.61881;RBI=0.0186987;REFB=-0.00576353;REVB=0.0175527;RO=79;SAF=22;SAR=21;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120152;STB=0.589441;STBP=0.111;TYPE=del;VARB=0.00878388;OID=.;OPOS=19551763;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.367347:43:148:54:147:93:28:26:35:58:99:79:22:21:32:47 chr2 20101487 . G A 1731.28 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.887;QD=60.7465;RBI=0.0665928;REFB=0;REVB=0.0549694;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144551;OID=.;OPOS=20101487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:59:55:0:0:59:55:0:0 chr2 20135283 . T C 1642.87 PASS AF=0.990991;AO=108;DP=109;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00777021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1533;QD=59.2024;RBI=0.0299359;REFB=-0.0135477;REVB=-0.0289099;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50505;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00076738;OID=.;OPOS=20135283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:111:0:1:108:110:0.990991:61:47:0:0:61:49:1:0 chr2 20205680 . C T 922.19 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0629385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3499;QD=56.7502;RBI=0.073697;REFB=-0.111856;REVB=0.0383404;RO=1;SAF=35;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133044;STB=0.50704;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00314043;OID=.;OPOS=20205680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:29:35:1:0:29:35:1:0 chr2 20205848 . G A 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000684742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.208;QD=62.0206;RBI=0.00406022;REFB=0;REVB=-0.00400206;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35453e-05;OID=.;OPOS=20205848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr2 20403794 . A T 975.78 PASS AF=1;AO=39;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00197656;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.46;QD=59.1381;RBI=0.0143501;REFB=0;REVB=0.0142133;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.91877e-05;OID=.;OPOS=20403794;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:39:66:1:9:30:0:0:35:31:0:0 chr2 20648211 . G T 150.67 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619904;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.04;QD=46.3591;RBI=0.0771411;REFB=0;REVB=0.0459123;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00270872;OID=.;OPOS=20648211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr2 20680665 . C A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00354968;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=299.04;QD=53.2772;RBI=0.0538799;REFB=0;REVB=0.0537628;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180879;OID=.;OPOS=20680665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0 chr2 20680693 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4153;QD=53.2757;RBI=0.0233898;REFB=0;REVB=0.0229701;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000787234;OID=.;OPOS=20680693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0 chr2 20818454 . T A 661.07 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147181;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.114;QD=60.0974;RBI=0.0198339;REFB=-0.0705227;REVB=0.0132951;RO=1;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284424;STB=0.515144;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.000530328;OID=.;OPOS=20818454;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:44:1:1:43:43:0.977273:16:27:0:1:16:27:0:1 chr2 20818458 . G A 727.7 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.345;QD=63.2781;RBI=0.016284;REFB=0;REVB=0.010287;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.67894e-05;OID=.;OPOS=20818458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0 chr2 20823724 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.19;QD=57.2025;RBI=0.0563476;REFB=0;REVB=0.0559734;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237656;OID=.;OPOS=20823724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:24:6:0:0:24:6:0:0 chr2 20838318 . G A 1487.7 PASS AF=0.97;AO=90;DP=93;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0254965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.225;QD=59.5079;RBI=0.0265873;REFB=0.01694;REVB=0.00753734;RO=2;SAF=49;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225564;STB=0.517643;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.000833839;OID=.;OPOS=20838318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:93:100:2:3:90:97:0.97:41:49:0:2:41:56:0:3 chr2 21225281 . C T 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00790117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.858;QD=19.5771;RBI=0.0113869;REFB=-0.0214587;REVB=-0.00819957;RO=31;SAF=14;SAR=19;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807322;STB=0.544906;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0123846;OID=.;OPOS=21225281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:19:14:16:15:19:14:16:15 chr2 21230263 . C T 374.33 PASS AF=0.416667;AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.016362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7135;QD=15.5972;RBI=0.0252424;REFB=0.00186189;REVB=-0.0192215;RO=55;SAF=17;SAR=23;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026381;STB=0.519283;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=-0.00251484;OID=.;OPOS=21230263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:55:56:40:40:0.416667:23:17:22:33:23:17:22:34 chr2 21231524 . G A 423.21 PASS AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0216766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.452;QD=23.8429;RBI=0.0231468;REFB=-0.0179569;REVB=0.00811789;RO=30;SAF=17;SAR=24;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667606;STB=0.53667;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0131789;OID=.;OPOS=21231524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:0.577465:24:17:15:15:24:17:15:15 chr2 21232803 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.989;QD=54.5176;RBI=0.0531366;REFB=0;REVB=-0.0120259;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269878;OID=.;OPOS=21232803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr2 21235475 . T C 2281.15 PASS AF=1;AO=142;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319077;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.726;QD=63.8085;RBI=0.058306;REFB=0;REVB=0.0488005;RO=0;SAF=65;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2093e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57399e-05;OID=.;OPOS=21235475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:143:0:0:142:143:1:77:65:0:0:78:65:0:0 chr2 21237786 . T G 426.09 PASS AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0422148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.111;QD=16.388;RBI=0.0450137;REFB=-0.00425917;REVB=0.0156251;RO=57;SAF=24;SAR=23;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844898;STB=0.54715;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00557783;OID=.;OPOS=21237786;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:57:47:47:0.451923:23:24:34:23:23:24:34:23 chr2 21250914 . G A 1043.47 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.772;QD=59.6268;RBI=0.0364998;REFB=0;REVB=-0.000174822;RO=0;SAF=20;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08505e-05;OID=.;OPOS=21250914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:49:20:0:0:49:21:0:0 chr2 21360583 . A G 619.97 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0117077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.093;QD=59.0443;RBI=0.0120498;REFB=-0.106313;REVB=0.00285099;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510633;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00120949;OID=.;OPOS=21360583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:23:18:0:0:23:18:0:1 chr2 23865260 . T C 2773.35 PASS AF=0.994413;AO=177;DP=179;FAO=178;FDP=179;FR=.;FRO=1;FSAF=108;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.238;QD=61.9744;RBI=0.028766;REFB=-0.0177326;REVB=0.0209669;RO=1;SAF=108;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00438763;STB=0.502304;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=9.11082e-05;OID=.;OPOS=23865260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:179:179:1:1:177:178:0.994413:69:108:1:0:70:108:1:0 chr2 23865908 . G C 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0214773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.891;QD=8.24531;RBI=0.0221842;REFB=-0.00492618;REVB=0.00555586;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123921;STB=0.576071;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.00846812;OID=.;OPOS=23865908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:12:3:2:5:12:3 chr2 23919375 . C T 369.67 PASS AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0250072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.825;QD=22.404;RBI=0.0250989;REFB=0.00329724;REVB=-0.00214398;RO=29;SAF=18;SAR=19;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134204;STB=0.573838;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00208123;OID=.;OPOS=23919375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:19:18:19:10:19:18:19:10 chr2 23926659 . T C 229.58 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0386827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7949;QD=22.3977;RBI=0.0516981;REFB=-0.0198123;REVB=-0.0342979;RO=19;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196895;STB=0.609661;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0195483;OID=.;OPOS=23926659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:11:11:5:14:11:11:5:14 chr2 23973799 . T C 1200.44 PASS AF=0.97561;AO=79;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0249757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1495;QD=58.5582;RBI=0.039355;REFB=-0.0663997;REVB=0.0304142;RO=1;SAF=35;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133333;STB=0.501548;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00207589;OID=.;OPOS=23973799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:82:82:1:2:79:80:0.97561:44:35:1:0:45:35:1:1 chr2 24055058 . G C 635.9 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225112;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.151;QD=62.0389;RBI=0.0487341;REFB=0;REVB=-0.0432233;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186133;OID=.;OPOS=24055058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0 chr2 24108652 . T C 817.61 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.078;QD=57.376;RBI=0.0350738;REFB=0;REVB=0.000369552;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105426;OID=.;OPOS=24108652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0 chr2 24369674 . C T 635.9 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000504643;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.597;QD=62.0386;RBI=0.00849479;REFB=0;REVB=0.00847978;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192832;OID=.;OPOS=24369674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr2 24384424 . T C 575.46 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0957201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7369;QD=60.5743;RBI=0.0975313;REFB=0;REVB=0.0187088;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00198683;OID=.;OPOS=24384424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0 chr2 24387178 . G GC 431.31 PASS AF=1;AO=35;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0798022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.6163;QD=45.4011;RBI=0.0988389;REFB=0;REVB=0.0583159;RO=3;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075665;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00441067;OID=.;OPOS=24387179;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:35:39:38:38:0:19:19:0:0:8:3:18:17:0:3 chr2 24390517 . G A 1529.02 PASS AF=0.972222;AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0174787;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.328;QD=56.6303;RBI=0.0217284;REFB=-0.0926332;REVB=0.0129082;RO=1;SAF=52;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903911;STB=0.514016;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.000332325;OID=.;OPOS=24390517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:108:108:1:3:105:105:0.972222:53:52:1:0:53:52:3:0 chr2 24402127 . C CAA 373.05 PASS AF=1;AO=26;DP=32;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212984;FXX=0.187441;HRUN=0;LEN=2;MLLD=157.181;QD=57.393;RBI=0.0255556;REFB=0;REVB=0.0141233;RO=4;SAF=8;SAR=18;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168067;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.41758e-05;OID=.;OPOS=24402128;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:26:32:26:26:0:8:18:0:0:3:4:8:18:1:3 chr2 24587571 . A G 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.692;QD=60.0306;RBI=0.0450963;REFB=0;REVB=-0.0192751;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32787e-05;OID=.;OPOS=24587571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:44:28:0:0:44:28:0:0 chr2 24899185 . C G 228.22 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0285554;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8846;QD=27.6627;RBI=0.0286879;REFB=-0.0271906;REVB=0.0027536;RO=10;SAF=14;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164194;STB=0.595651;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0149318;OID=.;OPOS=24899185;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:33:33:10:12:21:21:0.636364:7:14:4:6:7:14:5:7 chr2 24899204 . A G 257.75 PASS AF=0.676471;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0122639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.347;QD=30.3234;RBI=0.0224922;REFB=0.0116475;REVB=-0.0188546;RO=10;SAF=14;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117255;STB=0.58024;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.00688689;OID=.;OPOS=24899204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:34:10:11:23:23:0.676471:9:14:4:6:9:14:4:7 chr2 24905927 . G C 805.04 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.44;QD=64.4032;RBI=0.0675187;REFB=0;REVB=0.00284009;RO=0;SAF=14;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003146;OID=.;OPOS=24905927;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:36:14:0:0:36:14:0:0 chr2 24933897 . C T 313.83 PASS AF=0.406977;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0238562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.671;QD=14.5969;RBI=0.0248774;REFB=-0.0202243;REVB=-0.0070543;RO=51;SAF=20;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00298696;STB=0.501694;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0287741;OID=.;OPOS=24933897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:51:51:35:35:0.406977:15:20:29:22:15:20:29:22 chr2 24974945 . T G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.733;QD=63.582;RBI=0.0184964;REFB=0;REVB=-0.00297489;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81902e-05;OID=.;OPOS=24974945;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr2 24991350 . A G 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.02727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4121;QD=12.6375;RBI=0.0313003;REFB=0.00531871;REVB=-0.0153642;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00405815;STB=0.502389;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0110008;OID=.;OPOS=24991350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:5:8:13:8:5:8:13:8 chr2 25022598 . A G 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00295864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.197;QD=11.1977;RBI=0.00302138;REFB=0.00319342;REVB=-0.000612511;RO=22;SAF=1;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515296;STB=0.820219;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00435617;OID=.;OPOS=25022598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:11:1:9:13:11:1:9:13 chr2 25046090 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.873;QD=49.5992;RBI=0.0628724;REFB=0;REVB=0.0518126;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446589;OID=.;OPOS=25046090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr2 25047408 . A G 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.00499611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.309;QD=13.5055;RBI=0.0154467;REFB=-0.00800671;REVB=-0.0146164;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207284;STB=0.6205;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0125468;OID=.;OPOS=25047408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:5:12:6:6:5:12 chr2 25050977 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.913;QD=60.9786;RBI=0.0334062;REFB=0;REVB=0.024879;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133994;OID=.;OPOS=25050977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr2 25064193 . G A 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.092;QD=63.1954;RBI=0.0544461;REFB=0;REVB=0.0433342;RO=0;SAF=33;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140666;OID=.;OPOS=25064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:59:33:0:0:59:33:0:0 chr2 25141538 . A G 263.29 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0174389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6864;QD=21.9409;RBI=0.0408069;REFB=-0.014165;REVB=-0.0368929;RO=23;SAF=9;SAR=16;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250195;STB=0.639888;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.012137;OID=.;OPOS=25141538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:16:9:15:8:16:9:15:8 chr2 25194741 . G A 1854.11 PASS AF=0.983871;AO=121;DP=125;FAO=122;FDP=124;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0212901;FXX=0.0158718;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.727;QD=59.8099;RBI=0.0513587;REFB=-0.0854249;REVB=0.0467381;RO=2;SAF=59;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150755;STB=0.507935;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.000419125;OID=.;OPOS=25194741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:125:124:2:2:121:122:0.983871:62:59:0:2:62:60:0:2 chr2 25314186 . T C 346.8 PASS AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0192445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.067;QD=22.3742;RBI=0.0774301;REFB=-0.021695;REVB=-0.0750005;RO=27;SAF=19;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106654;STB=0.55879;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0157282;OID=.;OPOS=25314186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:16:19:11:16:16:19:11:16 chr2 25359422 . G A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.825;QD=57.6799;RBI=0.0542208;REFB=0;REVB=0.0395182;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61796e-05;OID=.;OPOS=25359422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0 chr2 25377176 . T C 538.41 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.424;QD=59.8233;RBI=0.0571999;REFB=0;REVB=0.0500004;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266683;OID=.;OPOS=25377176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr2 25469502 . C T 1238.01 PASS AF=0.472325;AO=128;DP=271;FAO=128;FDP=271;FR=.;FRO=143;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=64;FSRR=79;FWDB=-0.0180028;FXX=0.00367634;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.411;QD=18.2732;RBI=0.0189326;REFB=-0.0228529;REVB=0.00586028;RO=138;SAF=58;SAR=70;SRF=63;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00322872;STB=0.502968;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.025459;OID=.;OPOS=25469502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:138:143:128:128:0.472325:70:58:63:75:70:58:64:79 chr2 25536827 . G A 269.09 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00238422;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.766;QD=16.5596;RBI=0.00467041;REFB=-0.0173693;REVB=0.004016;RO=34;SAF=8;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188677;STB=0.61674;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0173197;OID=.;OPOS=25536827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:35:30:30:0.461538:22:8:15:19:22:8:16:19 chr2 26149968 . C T 718.0 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.284;QD=62.4351;RBI=0.0462817;REFB=0;REVB=0.0443924;RO=1;SAF=25;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184224;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262648;OID=.;OPOS=26149968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:1:0:44:46:1:19:25:1:0:19:27:0:0 chr2 26321526 . T C 254.41 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.00592478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.81;QD=15.4185;RBI=0.00599513;REFB=-0.00258054;REVB=0.000915763;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362829;STB=0.520534;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00516081;OID=.;OPOS=26321526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:19:10:14:23:19:10:14:23 chr2 26399214 . G A 509.41 PASS AF=0.385135;AO=57;DP=148;FAO=57;FDP=148;FR=.;FRO=91;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.00311847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.446;QD=13.7677;RBI=0.00543875;REFB=-0.00786538;REVB=0.00445591;RO=90;SAF=32;SAR=25;SRF=40;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126292;STB=0.574643;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0210256;OID=.;OPOS=26399214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:90:91:57:57:0.385135:25:32:40:50:25:32:40:51 chr2 26455127 . G A 37.15 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0220167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.713;QD=8.25455;RBI=0.0313628;REFB=-0.0173371;REVB=0.0223359;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137104;STB=0.587912;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0290863;OID=.;OPOS=26455127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:9:3:1:5:9:3 chr2 26477125 . G GACT 164.2 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0089136;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=314.05;QD=11.1322;RBI=0.00897753;REFB=-0.00499402;REVB=-0.00106949;RO=37;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879913;STB=0.539963;STBP=0.687;TYPE=ins;VARB=0.008193;OID=.;OPOS=26477126;OREF=-;OALT=ACT;OMAPALT=GACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.355932:21:58:21:59:38:9:12:14:24:99:37:9:12:13:24 chr2 26502875 . T C 84.41 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0222807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.88;QD=8.44071;RBI=0.0222811;REFB=-0.00795663;REVB=0.000138413;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310764;STB=0.688216;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0137403;OID=.;OPOS=26502875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:40:40:28:28:12:12:0.3:8:4:17:11:8:4:17:11 chr2 26505858 . A G 332.27 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0269249;FXX=0.137915;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3918;QD=17.7212;RBI=0.0317782;REFB=0.00456733;REVB=0.016879;RO=32;SAF=22;SAR=12;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187422;STB=0.615931;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00307114;OID=.;OPOS=26505858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:75:32:41:34:34:0.453333:12:22:14:18:12:22:18:23 chr2 26505859 . T G 31.75 PASS AF=0.091954;AO=8;DP=84;FAO=8;FDP=87;FR=.;FRO=79;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=-0.0242936;FXX=0.0113623;HRUN=7;LEN=1;MLLD=117.374;QD=1.45957;RBI=0.0266106;REFB=-0.00530077;REVB=-0.0108604;RO=76;SAF=4;SAR=4;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150878;STB=0.517198;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0161888;OID=.;OPOS=26505859;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:84:87:76:79:8:8:0.091954:4:4:39:37:4:4:41:38 chr2 26507076 . A T 313.77 PASS AF=0.406977;AO=34;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.00635634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.815;QD=14.594;RBI=0.00955666;REFB=-0.00549035;REVB=-0.0071363;RO=51;SAF=19;SAR=15;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174491;STB=0.605204;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00531019;OID=.;OPOS=26507076;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:51:51:34:35:0.406977:15:19:20:31:15:20:20:31 chr2 26512957 . G C 107.86 PASS AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00410046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.739;QD=7.98952;RBI=0.0290512;REFB=-0.0138265;REVB=-0.0287604;RO=39;SAF=10;SAR=5;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129075;STB=0.578839;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0364216;OID=.;OPOS=26512957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:39:39:15:15:0.277778:5:10:22:17:5:10:22:17 chr2 26534801 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.116;QD=53.2759;RBI=0.0297906;REFB=0;REVB=0.015884;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249683;OID=.;OPOS=26534801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr2 26536694 . C T 959.31 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0105866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.497;QD=57.2721;RBI=0.0116507;REFB=-0.170872;REVB=0.00486452;RO=1;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149975;STB=0.507934;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00114652;OID=.;OPOS=26536694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:31:35:0:1:31:35:0:1 chr2 26606154 . T C 220.38 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00284167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.505;QD=16.0275;RBI=0.022784;REFB=-0.0107604;REVB=-0.0226061;RO=29;SAF=10;SAR=15;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164096;STB=0.598352;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00666584;OID=.;OPOS=26606154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:29:30:25:25:0.454545:15:10:7:22:15:10:7:23 chr2 26607992 . T C 921.35 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0505414;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6817;QD=56.6987;RBI=0.0506236;REFB=0.139598;REVB=0.0028838;RO=1;SAF=25;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185161;STB=0.509801;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00372176;OID=.;OPOS=26607992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:39:25:1:0:39:25:1:0 chr2 26613056 . C T 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00194133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.321;QD=60.2045;RBI=0.0594261;REFB=0;REVB=-0.0593944;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000211508;OID=.;OPOS=26613056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0 chr2 26613329 . A G 280.85 PASS AF=0.339623;AO=36;DP=106;FAO=36;FDP=106;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.0320662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9351;QD=10.5982;RBI=0.0404432;REFB=0.00153792;REVB=0.0246457;RO=69;SAF=18;SAR=18;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742756;STB=0.547144;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00385089;OID=.;OPOS=26613329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:69:70:36:36:0.339623:18:18:30:39:18:18:30:40 chr2 26614583 . T TA,TAA 502.2 PASS AF=1,0;AO=53,10;DP=80;FAO=71,0;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39,0;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0719543,-0.0326466;FXX=0.0273935;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=9.97852,8.8471;QD=28.2929;RBI=0.183867,0.093339;REFB=-0.00666843,-0.0112208;REVB=-0.169202,-0.0874435;RO=14;SAF=28,5;SAR=25,5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0168754,-0.0703453;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00584649,0;OID=.,.;OPOS=26614584,26614584;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:53,10:80:71,0:71:0:39,0:32,0:0:0:9:14:28,5:25,5:8:6 chr2 26647277 . T G 206.07 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0218291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.563;QD=16.8221;RBI=0.0248789;REFB=-0.0155175;REVB=-0.0119353;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119288;STB=0.506816;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0269877;OID=.;OPOS=26647277;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:10:11:15:13:10:11:15:13 chr2 26667130 . A G 333.71 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00489281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.887;QD=21.8824;RBI=0.0129063;REFB=0.00178554;REVB=0.0119429;RO=27;SAF=21;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211185;STB=0.511668;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.00118165;OID=.;OPOS=26667130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:13:21:16:11:13:21:16:11 chr2 26667615 . T C 971.94 PASS AF=0.932432;AO=69;DP=74;FAO=69;FDP=74;FR=.;FRO=5;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0181751;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.8882;QD=52.5371;RBI=0.0330946;REFB=-0.14671;REVB=0.0276572;RO=3;SAF=42;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226165;STB=0.514702;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00554149;OID=.;OPOS=26667615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:74:74:3:5:69:69:0.932432:27:42:1:2:27:42:2:3 chr2 26676322 . A G 770.6 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00160385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2413;QD=55.0425;RBI=0.00190871;REFB=-0.021195;REVB=0.0010348;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00469446;OID=.;OPOS=26676322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:31:24:0:0:31:24:0:1 chr2 26676395 . G T 225.95 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0122911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.524;QD=20.5413;RBI=0.0157777;REFB=-0.0177353;REVB=0.00989263;RO=22;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161331;STB=0.590826;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0170608;OID=.;OPOS=26676395;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:13:9:13:9:13:9:13:9 chr2 26693967 . C T 215.11 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0410551;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.523;QD=21.5109;RBI=0.0435802;REFB=-0.0138246;REVB=0.0146188;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866726;STB=0.548647;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00996299;OID=.;OPOS=26693967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:11:10:11:8:11:10:11:8 chr2 26699126 . C G 1540.58 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.943;QD=59.8282;RBI=0.0847886;REFB=0;REVB=0.0847099;RO=0;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022919;OID=.;OPOS=26699126;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:52:51:0:0:52:51:0:0 chr2 26699855 . G C 868.21 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.232;QD=57.881;RBI=0.0340917;REFB=0;REVB=-0.031833;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7092e-05;OID=.;OPOS=26699855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0 chr2 26700700 . G A 1525.75 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.067;QD=59.8332;RBI=0.0182277;REFB=0;REVB=0.0176611;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77524e-05;OID=.;OPOS=26700700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:46:56:0:0:46:56:0:0 chr2 26739423 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.424;QD=57.3857;RBI=0.0311745;REFB=0;REVB=-0.00435527;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10144e-05;OID=.;OPOS=26739423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:38:19:0:0:38:19:0:0 chr2 26798893 . A T 591.73 PASS AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.023988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.377;QD=56.3554;RBI=0.0321435;REFB=-0.126884;REVB=0.0213958;RO=2;SAF=19;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046837;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00186955;OID=.;OPOS=26798893;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:21:19:2:0:21:19:2:0 chr2 26799031 . G A 300.39 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9457;QD=52.2412;RBI=0.0533232;REFB=0;REVB=-0.0272997;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102237;OID=.;OPOS=26799031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:12:10:0:0:12:11:0:0 chr2 26804218 . G A 2247.48 PASS AF=0.993506;AO=145;DP=148;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0333269;FXX=0.0191071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.643;QD=58.3762;RBI=0.0395484;REFB=-0.0285929;REVB=0.021293;RO=1;SAF=76;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621656;STB=0.503225;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00426291;OID=.;OPOS=26804218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:148:154:1:1:145:153:0.993506:69:76:1:0:76:77:1:0 chr2 26804247 . T C 2325.78 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0269626;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5423;QD=62.4371;RBI=0.0269652;REFB=-0.0540965;REVB=-0.000371432;RO=2;SAF=67;SAR=81;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139837;STB=0.503649;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0011354;OID=.;OPOS=26804247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:150:149:2:1:148:148:0.993289:81:67:2:0:80:68:1:0 chr2 26951449 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013027;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.485;QD=56.1908;RBI=0.0226721;REFB=0;REVB=0.0185559;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112865;OID=.;OPOS=26951449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:4:24:0:0:4:24:0:0 chr2 26951643 . GC CG 107.47 PASS AF=0.272727;AO=16;DP=56;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.11434;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=104.715;QD=7.81633;RBI=0.117516;REFB=-0.00499698;REVB=-0.0271357;RO=37;SAF=1;SAR=15;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599851;STB=0.861702;STBP=0.012;TYPE=mnp;VARB=0.081695;OID=.;OPOS=26951643;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:37:40:16:15:0.272727:15:1:16:21:14:1:16:24 chr2 27001307 . GCCCCT GCCCCC,GCCCT 91.46 PASS AF=0.130435,0.608696;AO=3,12;DP=22;FAO=3,14;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=0,2;FSAR=3,12;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0791709,-0.154046;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=73.785,11.3179;QD=15.906;RBI=0.0808673,0.155923;REFB=0.0541931,-0.225167;REVB=-0.0164766,0.0241181;RO=6;SAF=0,1;SAR=3,11;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0.248649;SSSB=-0.711122,-0.529426;STB=0.996299,0.71963;STBP=0.05,0.017;TYPE=snp,del;VARB=0.13385,0.197625;OID=.,.;OPOS=27001312,27001308;OREF=T,C;OALT=C,-;OMAPALT=GCCCCC,GCCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.130435,0.608696:3,12:22:3,14:23:6:0,2:3,12:4:2:29:6:0,1:3,11:4:2 chr2 27169842 . C A 728.15 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.769;QD=54.9544;RBI=0.160246;REFB=-0.0506902;REVB=0.00571416;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000971098;OID=.;OPOS=27169842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:51:53:0:0:50:53:1:27:23:0:0:27:26:0:0 chr2 27246285 . C T 1073.71 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0333858;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.214;QD=58.8334;RBI=0.033984;REFB=0.0583781;REVB=-0.00634812;RO=1;SAF=40;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116777;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000135457;OID=.;OPOS=27246285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:75:73:1:1:72:72:0.986301:32:40:1:0:32:40:1:0 chr2 27261329 . A G 700.33 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00796411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.776;QD=62.2511;RBI=0.00822067;REFB=0;REVB=-0.00203772;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32448e-05;OID=.;OPOS=27261329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:45:0:0:42:45:1:26:16:0:0:26:19:0:0 chr2 27290525 . A G 1583.99 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.615;QD=59.7731;RBI=0.0438362;REFB=0;REVB=0.018102;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203261;OID=.;OPOS=27290525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:49:57:0:0:49:57:0:0 chr2 27303755 . A G 557.12 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.893;QD=60.2296;RBI=0.0640993;REFB=0;REVB=0.0307791;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151099;OID=.;OPOS=27303755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:24:12:0:0:24:13:0:0 chr2 27306050 . G A 213.93 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0396431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0136;QD=20.8712;RBI=0.15281;REFB=0.01781;REVB=0.147578;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1535;STB=0.565157;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.0116177;OID=.;OPOS=27306050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:20:20:21:0.512195:9:11:15:6:9:12:14:6 chr2 27324036 . G A 659.21 PASS AF=0.942308;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0140565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.242;QD=50.7086;RBI=0.0616321;REFB=-0.16313;REVB=0.0600078;RO=2;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049451;STB=0.538446;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000699945;OID=.;OPOS=27324036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:52:52:2:3:49:49:0.942308:18:31:0:2:18:31:0:3 chr2 27324724 . G C 447.0 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.814;QD=57.6779;RBI=0.0220428;REFB=0;REVB=-0.016491;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.22637e-06;OID=.;OPOS=27324724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0 chr2 27324751 . G T 393.31 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5261;QD=56.1864;RBI=0.0225021;REFB=0;REVB=0.0170762;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.06611e-05;OID=.;OPOS=27324751;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0 chr2 27351948 . T G 689.37 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.151;QD=62.6703;RBI=0.0486108;REFB=0;REVB=0.0373333;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396029;OID=.;OPOS=27351948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:20:24:0:0 chr2 27424636 . G A 1291.86 PASS AF=0.945652;AO=85;DP=92;FAO=87;FDP=92;FR=.;FRO=5;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.130622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2847;QD=56.1678;RBI=0.156885;REFB=-0.157616;REVB=0.0868958;RO=5;SAF=46;SAR=39;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359703;STB=0.50766;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0214295;OID=.;OPOS=27424636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:92:92:5:5:85:87:0.945652:39:46:1:4:40:47:2:3 chr2 27428295 . A G 1127.33 PASS AF=0.987179;AO=74;DP=76;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0476447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5372;QD=57.8118;RBI=0.057003;REFB=-0.0968299;REVB=0.0312943;RO=2;SAF=36;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000672969;STB=0.506665;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00148047;OID=.;OPOS=27428295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:76:78:2:1:74:77:0.987179:38:36:1:1:40:37:1:0 chr2 27435250 . A G 1040.74 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00780277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.448;QD=59.4707;RBI=0.0231919;REFB=0;REVB=-0.0218399;RO=0;SAF=54;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.38693e-05;OID=.;OPOS=27435250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:16:54:0:0:16:54:0:0 chr2 27440784 . C CT 540.35 PASS AF=1;AO=15;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539489;FXX=0.019996;HRUN=0;LEN=1;MLLD=113.795;QD=44.1105;RBI=0.00540468;REFB=0;REVB=0.000325145;RO=35;SAF=1;SAR=14;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.706742;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00381872;OID=.;OPOS=27440785;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:15:50:49:49:0:23:26:0:0:3:35:1:14:23:12 chr2 27440785 . C T 400.59 PASS AF=0.66;AO=32;DP=50;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.0262684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.953;QD=32.0475;RBI=0.0468096;REFB=-0.266074;REVB=0.0387441;RO=15;SAF=23;SAR=9;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384581;STB=0.713476;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0177251;OID=.;OPOS=27440785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:50:50:15:17:32:33:0.66:9:23:1:14:10:23:1:16 chr2 27801403 . C G 150.32 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0156355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1784;QD=12.2709;RBI=0.0308628;REFB=-0.0246429;REVB=-0.0266091;RO=31;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166308;STB=0.583847;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0434475;OID=.;OPOS=27801403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:31:32:17:17:0.346939:9:8:10:21:9:8:11:21 chr2 27801418 . C A 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.00347734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.589;QD=13.9483;RBI=0.0122775;REFB=-0.00105715;REVB=-0.0117747;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147442;STB=0.585269;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00144267;OID=.;OPOS=27801418;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:9:8:9:18:9:8:9:18 chr2 27801493 . T C 165.04 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0418649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.874;QD=14.0461;RBI=0.0470683;REFB=-0.00529264;REVB=0.0215117;RO=29;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128473;STB=0.574387;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0109915;OID=.;OPOS=27801493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:9:9:11:18:9:9:11:18 chr2 27801759 . A G 142.69 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0190115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.057;QD=22.8305;RBI=0.0200659;REFB=0.0281367;REVB=0.00641885;RO=10;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126338;STB=0.57133;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=-0.0120814;OID=.;OPOS=27801759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:10:5:5:5:10:5:5:5 chr2 27838058 . C A 403.82 PASS AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.00898922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.585;QD=22.127;RBI=0.017093;REFB=-0.0321143;REVB=-0.0145384;RO=33;SAF=16;SAR=24;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577296;STB=0.531776;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0252786;OID=.;OPOS=27838058;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:33:40:40:0.547945:24:16:11:22:24:16:11:22 chr2 27851918 . G A 194.9 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.124728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.958;QD=17.3244;RBI=0.138102;REFB=0.00679494;REVB=0.0592891;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145177;STB=0.5827;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=-0.0024685;OID=.;OPOS=27851918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:11:9:15:10:11:9:15:10 chr2 27873415 . G A 364.1 PASS AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0233766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.397;QD=15.8305;RBI=0.0249334;REFB=0.00383385;REVB=-0.00867243;RO=53;SAF=18;SAR=21;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00895564;STB=0.505048;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=-0.00593349;OID=.;OPOS=27873415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:53:39:39:0.423913:21:18:24:29:21:18:24:29 chr2 27887034 . C A 615.26 PASS AF=0.512397;AO=63;DP=121;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.00189304;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=271.913;QD=20.339;RBI=0.00950797;REFB=-0.000910414;REVB=0.00931761;RO=57;SAF=23;SAR=40;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187938;STB=0.593609;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00067053;OID=.;OPOS=27887034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:57:59:63:62:0.512397:40:23:33:24:39:23:33:26 chr2 28635740 . T C 420.84 PASS AF=0.512195;AO=41;DP=82;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0216967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4962;QD=20.5289;RBI=0.0221842;REFB=-0.00477062;REVB=0.00462544;RO=41;SAF=17;SAR=24;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225153;STB=0.501778;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.00444299;OID=.;OPOS=28635740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:40:41:42:0.512195:24:17:18:23:24:18:17:23 chr2 28816578 . G A 106.05 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0154985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.5;QD=12.12;RBI=0.0512354;REFB=-0.0221729;REVB=-0.048835;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232535;STB=0.636165;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0407798;OID=.;OPOS=28816578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:7:6:15:7:7:6:15:7 chr2 28824793 . C G 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0515327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.848;QD=10.0347;RBI=0.0799828;REFB=0.017384;REVB=0.0611688;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.0575835;OID=.;OPOS=28824793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:4:3:2:3:4:3 chr2 29001691 . A G 297.85 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0010342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4866;QD=15.8854;RBI=0.0196646;REFB=-0.0204294;REVB=0.0196374;RO=42;SAF=24;SAR=9;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312259;STB=0.676811;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0330036;OID=.;OPOS=29001691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:9:24:18:24:9:24:18:24 chr2 29023749 . A G 464.69 PASS AF=0.56962;AO=44;DP=77;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0219906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9552;QD=23.5284;RBI=0.0289363;REFB=-0.00668247;REVB=-0.0188075;RO=33;SAF=14;SAR=30;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188452;STB=0.601165;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0086039;OID=.;OPOS=29023749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:33:34:44:45:0.56962:30:14:18:15:31:14:18:16 chr2 29092679 . T C 205.35 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.00993053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.655;QD=14.6677;RBI=0.0111478;REFB=-0.0147242;REVB=-0.00506542;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194894;STB=0.599924;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0113122;OID=.;OPOS=29092679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:30:32:24:24:0.428571:15:9:6:24:15:9:7:25 chr2 29092850 . G T 195.2 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0276238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.285;QD=14.196;RBI=0.0276445;REFB=-0.0210374;REVB=0.00106926;RO=32;SAF=8;SAR=15;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191489;STB=0.609659;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0273808;OID=.;OPOS=29092850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:15:8:17:15:15:8:17:15 chr2 29129418 . A G 348.52 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0336202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8639;QD=17.4262;RBI=0.0336441;REFB=-0.0149249;REVB=-0.00126803;RO=43;SAF=10;SAR=27;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231986;STB=0.630671;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0166924;OID=.;OPOS=29129418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:27:10:21:22:27:10:21:22 chr2 29135468 . C G 1134.79 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00742351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.256;QD=60.5223;RBI=0.015545;REFB=0;REVB=0.0136579;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44048e-06;OID=.;OPOS=29135468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:75:0:0:72:75:1:38:34:0:0:40:35:0:0 chr2 29152456 . A G 237.67 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0362053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3394;QD=18.6411;RBI=0.0430887;REFB=0.0215797;REVB=0.0233627;RO=26;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260738;STB=0.64604;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.0242057;OID=.;OPOS=29152456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:15:10:18:8:15:10:18:8 chr2 29170623 . G T 323.58 PASS AF=0.278788;AO=44;DP=163;FAO=46;FDP=165;FR=.;FRO=119;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=-0.0010604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.633;QD=7.8443;RBI=0.00840742;REFB=-0.00984563;REVB=0.00834028;RO=113;SAF=17;SAR=27;SRF=67;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248652;STB=0.60733;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.032947;OID=.;OPOS=29170623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:113:119:44:46:0.278788:27:17:67:46:27:19:67:52 chr2 29222070 . G A 308.69 PASS AF=0.675;AO=26;DP=39;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0258886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.263;QD=30.8691;RBI=0.0277447;REFB=-0.0414849;REVB=-0.00997733;RO=13;SAF=16;SAR=10;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500008;STB=0.522072;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0220911;OID=.;OPOS=29222070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:13:13:26:27:0.675:10:16:9:4:10:17:9:4 chr2 29226498 . G A 410.98 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7402;QD=56.6866;RBI=0.131948;REFB=0;REVB=-0.00938787;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192357;OID=.;OPOS=29226498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:24:5:0:0:24:5:0:0 chr2 29226512 . A G 358.07 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.564;QD=55.0872;RBI=0.0247816;REFB=0;REVB=0.01304;RO=0;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34264e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110857;OID=.;OPOS=29226512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:23:2:0:0:23:3:0:0 chr2 29246044 . T C 1070.16 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.979;QD=59.4535;RBI=0.0564573;REFB=0;REVB=0.0221299;RO=0;SAF=26;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.73733e-05;OID=.;OPOS=29246044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:45:26:0:0:45:27:0:0 chr2 29268375 . A C 786.48 PASS AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0121037;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.5103;QD=52.4318;RBI=0.0279867;REFB=-0.183279;REVB=0.025234;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503648;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00169342;OID=.;OPOS=29268375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:60:60:0:3:57:57:0.95:34:23:0:0:34:23:1:2 chr2 29274704 . C T 1080.4 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00921322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.673;QD=60.0223;RBI=0.0383768;REFB=0;REVB=0.0372545;RO=0;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187637;OID=.;OPOS=29274704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:43:29:0:0:43:29:0:0 chr2 29274720 . A G 1030.19 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383631;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6394;QD=59.7212;RBI=0.0388233;REFB=0;REVB=0.00596033;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000961335;OID=.;OPOS=29274720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0 chr2 29286509 . T C 1482.34 PASS AF=0.979381;AO=94;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0348906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2182;QD=61.1274;RBI=0.043901;REFB=-0.0625936;REVB=0.0266448;RO=2;SAF=25;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364228;STB=0.519227;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00155343;OID=.;OPOS=29286509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:97:97:2:2:94:95:0.979381:69:25:2:0:70:25:2:0 chr2 29287926 . C CGCT 472.06 PASS AF=0.918919;AO=32;DP=39;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0326812;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=245.166;QD=51.0332;RBI=0.0621085;REFB=-0.137206;REVB=0.0528148;RO=7;SAF=10;SAR=22;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145795;STB=0.527381;STBP=0.299;TYPE=ins;VARB=0.00780536;OID=.;OPOS=29287927;OREF=-;OALT=GCT;OMAPALT=CGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.918919:32:39:34:37:3:12:22:2:1:13:7:10:22:5:2 chr2 29293976 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0147671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.908;QD=11.0198;RBI=0.0147671;REFB=-0.00917542;REVB=0;RO=8;SAF=6;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0195374;OID=.;OPOS=29293976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:0:6:8:0:0:6:8:0 chr2 29294629 . C T 502.24 PASS AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00456889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.303;QD=22.0763;RBI=0.0195427;REFB=-0.0107236;REVB=-0.0190011;RO=43;SAF=29;SAR=19;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202917;STB=0.511191;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0091916;OID=.;OPOS=29294629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:19:29:25:18:19:29:25:18 chr2 29294754 . G C 316.82 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00480278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.642;QD=20.4399;RBI=0.00796692;REFB=0.00285854;REVB=-0.00635649;RO=29;SAF=20;SAR=13;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752734;STB=0.541642;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.0027855;OID=.;OPOS=29294754;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:13:20:20:9:13:20:20:9 chr2 29295016 . A G 952.13 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.068;QD=58.5928;RBI=0.0300101;REFB=0;REVB=-0.000243777;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118425;OID=.;OPOS=29295016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0 chr2 29295389 . G A 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0479643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.944;QD=17.8403;RBI=0.0554068;REFB=0.00286563;REVB=0.0277368;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364675;STB=0.705622;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.00713526;OID=.;OPOS=29295389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:12:2:8:6:12:2 chr2 29295676 . G A 979.67 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0882871;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3414;QD=59.374;RBI=0.0943425;REFB=0;REVB=-0.033255;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791618;OID=.;OPOS=29295676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0 chr2 29295866 . T C 123.11 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0142769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7284;QD=16.4143;RBI=0.0955618;REFB=-0.000473932;REVB=-0.0944893;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112138;STB=0.564268;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.00289773;OID=.;OPOS=29295866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:6:8:11:5:6:8:11:5 chr2 29296870 . C T 130.12 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0171348;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0215;QD=12.1042;RBI=0.0333239;REFB=0.0165573;REVB=-0.0285811;RO=30;SAF=9;SAR=6;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039362;STB=0.504848;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=-0.0304653;OID=.;OPOS=29296870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:43:30:28:15:15:0.348837:6:9:19:11:6:9:17:11 chr2 29297068 . C T 232.25 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00214273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.479;QD=23.8208;RBI=0.00282154;REFB=0.00038667;REVB=-0.0018357;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161305;STB=0.589665;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=-0.000390587;OID=.;OPOS=29297068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:11:11:5:12:11:11:5:12 chr2 29352870 . G A 182.58 PASS AF=0.389831;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0412395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.357;QD=12.378;RBI=0.0433424;REFB=-0.0146461;REVB=0.0133367;RO=36;SAF=12;SAR=10;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190939;STB=0.52308;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.026004;OID=.;OPOS=29352870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:36:36:22:23:0.389831:10:12:19:17:10:13:19:17 chr2 29356669 . A G 1443.14 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.575;QD=62.0704;RBI=0.0259812;REFB=-0.0733042;REVB=-0.00913402;RO=0;SAF=27;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239869;OID=.;OPOS=29356669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:93:93:0:0:91:93:1:64:27:0:0:65:28:0:0 chr2 29366627 . C T 143.0 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0440044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.3;QD=10.7923;RBI=0.0553399;REFB=-0.00701329;REVB=0.0335577;RO=35;SAF=6;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238809;STB=0.640866;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0151115;OID=.;OPOS=29366627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:12:6:19:16:12:6:19:16 chr2 29416572 . T C 1115.82 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.003;QD=60.3148;RBI=0.0370908;REFB=0;REVB=0.0324841;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221192;OID=.;OPOS=29416572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:47:26:0:0:48:26:0:0 chr2 29444095 . C T 427.15 PASS AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00311075;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.391;QD=24.0649;RBI=0.00726633;REFB=-0.0515197;REVB=0.0065668;RO=29;SAF=11;SAR=30;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100894;STB=0.550433;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00800304;OID=.;OPOS=29444095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:29:30:41:41:0.577465:30:11:11:18:30:11:11:19 chr2 29449819 . C T 267.93 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0111409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.04;QD=16.2382;RBI=0.0162908;REFB=-0.017908;REVB=-0.0118857;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456153;STB=0.533311;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0271259;OID=.;OPOS=29449819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:36:30:30:0.454545:16:14:18:17:16:14:19:17 chr2 29543663 . T C 1885.42 PASS AF=0.984127;AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0121944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.167;QD=59.8548;RBI=0.0402922;REFB=-0.0034946;REVB=-0.0384026;RO=2;SAF=82;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00568707;STB=0.502852;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=6.18524e-06;OID=.;OPOS=29543663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:125:126:2:2:123:124:0.984127:41:82:1:1:42:82:1:1 chr2 29903931 . T A 945.5 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5644;QD=57.3028;RBI=0.133113;REFB=-0.0659523;REVB=0.129099;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00334208;OID=.;OPOS=29903931;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:66:66:0:0:65:66:1:38:27:0:0:39:27:0:0 chr2 29940529 . A T 646.78 PASS AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0249064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.594;QD=50.7275;RBI=0.025141;REFB=-0.125817;REVB=-0.00342596;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.534869;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00119045;OID=.;OPOS=29940529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:51:51:1:3:48:48:0.941176:28:20:1:0:28:20:3:0 chr2 30143039 . C A 433.48 PASS AF=0.591549;AO=39;DP=68;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.000315419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.167;QD=24.4214;RBI=0.037115;REFB=-0.0248995;REVB=0.0371137;RO=26;SAF=13;SAR=26;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185881;STB=0.633479;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.016317;OID=.;OPOS=30143039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:26:29:39:42:0.591549:26:13:15:11:29:13:18:11 chr2 30864768 . T C 49.35 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.000939719;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=193.331;QD=14.0993;RBI=0.00875391;REFB=-0.0205297;REVB=0.00870333;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125462;STB=0.574264;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00852837;OID=.;OPOS=30864768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:14:14:7:7:7:7:0.5:3:4:5:2:3:4:5:2 chr2 30864789 . G A 118.25 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0408115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3586;QD=12.7836;RBI=0.0416872;REFB=-0.00770922;REVB=-0.00849982;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229769;STB=0.513494;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00758779;OID=.;OPOS=30864789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:7:7:11:12:7:7:11:12 chr2 30976058 . C T 610.63 PASS AF=0.535088;AO=61;DP=114;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0225793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7197;QD=21.4258;RBI=0.0281015;REFB=0.00329674;REVB=-0.0167292;RO=53;SAF=26;SAR=35;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760052;STB=0.541653;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00294539;OID=.;OPOS=30976058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:53:53:61:61:0.535088:35:26:18:35:35:26:18:35 chr2 30980940 . C T 300.34 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0202035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.012;QD=24.5174;RBI=0.0293707;REFB=-0.028635;REVB=-0.021318;RO=21;SAF=12;SAR=15;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129123;STB=0.579383;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0184245;OID=.;OPOS=30980940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:21:22:27:27:0.55102:15:12:6:15:15:12:6:16 chr2 31399988 . C T 1339.73 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.447;QD=62.3128;RBI=0.0336648;REFB=0;REVB=0.0207038;RO=0;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203278;OID=.;OPOS=31399988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:51:35:0:0:51:35:0:0 chr2 31410653 . C T 183.72 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0833602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6168;QD=11.8531;RBI=0.083361;REFB=-2.81031e-05;REVB=0.000358755;RO=39;SAF=6;SAR=17;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633949;STB=0.536809;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.00362166;OID=.;OPOS=31410653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:17:6:12:27:17:6:12:27 chr2 31411155 . G C 158.26 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0875043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.926;QD=26.3767;RBI=0.0875044;REFB=-0.0448911;REVB=0.00015254;RO=8;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377081;STB=0.521026;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0181279;OID=.;OPOS=31411155;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:9:7:4:4:9:7:4:4 chr2 31411184 . C A 62.28 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0107454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.975;QD=10.3804;RBI=0.0267493;REFB=-0.00416171;REVB=-0.0244961;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139608;STB=0.587971;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0126383;OID=.;OPOS=31411184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:24:24:15:15:7:7:0.291667:5:2:6:9:5:2:6:9 chr2 31411242 . C A 82.07 PASS AF=0.407407;AO=9;DP=25;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0252885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.774;QD=12.1592;RBI=0.0279687;REFB=-0.0298933;REVB=0.0119472;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145075;STB=0.533274;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0454445;OID=.;OPOS=31411242;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:25:27:16:16:9:11:0.407407:5:4:5:11:7:4:5:11 chr2 31414223 . G A 142.69 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00887344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.064;QD=22.8311;RBI=0.0153246;REFB=-0.00293043;REVB=-0.0124943;RO=9;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215071;STB=0.652834;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00225182;OID=.;OPOS=31414223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:9:10:15:15:0.6:12:3:4:5:12:3:5:5 chr2 31414807 . C G 1062.4 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5461;QD=59.8538;RBI=0.0283769;REFB=0;REVB=0.00743256;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179657;OID=.;OPOS=31414807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:29:42:0:0:29:42:0:0 chr2 31414851 . T C 323.84 PASS AF=0.428571;AO=34;DP=83;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=0.0204227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.439;QD=15.421;RBI=0.0210511;REFB=-0.0198396;REVB=0.00510502;RO=47;SAF=18;SAR=16;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273474;STB=0.641438;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0232191;OID=.;OPOS=31414851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:47:48:34:36:0.428571:16:18:37:10:17:19:37:11 chr2 31423443 . G A 637.71 PASS AF=0.39779;AO=72;DP=182;FAO=72;FDP=181;FR=.;FRO=109;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=-0.0111676;FXX=0.0054942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.805;QD=14.093;RBI=0.0158603;REFB=-0.0196827;REVB=-0.011262;RO=108;SAF=30;SAR=42;SRF=49;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403028;STB=0.525814;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0291281;OID=.;OPOS=31423443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:108:109:72:72:0.39779:42:30:49:59:42:30:50:59 chr2 31451224 . G C 462.46 PASS AF=0.447368;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.0397376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1182;QD=16.2265;RBI=0.041952;REFB=0.0152804;REVB=-0.0134498;RO=59;SAF=28;SAR=23;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265842;STB=0.521443;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=-0.0208986;OID=.;OPOS=31451224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:59:63:51:51:0.447368:23:28:34:25:23:28:37:26 chr2 31490716 . C G 372.57 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0703024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.304;QD=20.4149;RBI=0.0744389;REFB=-0.000676859;REVB=-0.024469;RO=35;SAF=17;SAR=21;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179981;STB=0.59952;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00156197;OID=.;OPOS=31490716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:21:17:23:12:21:17:23:12 chr2 31571786 . A G 212.33 PASS AF=0.376812;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0778956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.163;QD=12.3091;RBI=0.0779028;REFB=0.0053481;REVB=-0.00105604;RO=42;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243939;STB=0.630674;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0127481;OID=.;OPOS=31571786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:42:43:26:26:0.376812:12:14:13:29:12:14:14:29 chr2 31751174 . CG TA 33.93 PASS AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0314816;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.103;QD=3.31015;RBI=0.0334576;REFB=-0.00540792;REVB=-0.011328;RO=35;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432535;STB=0.793321;STBP=0.17;TYPE=mnp;VARB=0.0228776;OID=.;OPOS=31751174;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:35:35:6:6:0.146341:2:4:10:25:2:4:10:25 chr2 31751178 . A T 50.13 PASS AF=0.173913;AO=8;DP=47;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.00195909;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1559;QD=4.35938;RBI=0.0386211;REFB=0.00901429;REVB=-0.0385714;RO=37;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536732;STB=0.835845;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.052961;OID=.;OPOS=31751178;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:47:46:37:38:8:8:0.173913:2:6:10:27:2:6:11:27 chr2 31805706 . G C 173.89 PASS AF=0.387755;AO=18;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0396372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3531;QD=14.1951;RBI=0.044842;REFB=-0.0558151;REVB=0.020969;RO=25;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941938;STB=0.507684;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0768475;OID=.;OPOS=31805706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:30:18:19:0.387755:7:11:13:12:8:11:17:13 chr2 31805880 . A AG 308.65 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.8732;QD=45.7258;RBI=0.170755;REFB=0;REVB=0.037048;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344248;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0101296;OID=.;OPOS=31805881;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:28:27:27:0:13:14:0:0:6:1:13:14:1:0 chr2 32342508 . A T 1364.59 PASS AF=0.458599;AO=145;DP=314;FAO=144;FDP=314;FR=.;FRO=170;FSAF=60;FSAR=84;FSRF=86;FSRR=84;FWDB=-0.0539742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2393;QD=17.3833;RBI=0.0576383;REFB=-0.00641626;REVB=0.0202229;RO=169;SAF=61;SAR=84;SRF=85;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810609;STB=0.548865;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00705418;OID=.;OPOS=32342508;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:314:169:170:145:144:0.458599:84:61:85:84:84:60:86:84 chr2 32475109 . G A 352.45 PASS AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00946781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.461;QD=18.3091;RBI=0.0149579;REFB=-0.0198006;REVB=-0.0115801;RO=40;SAF=19;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105497;STB=0.558792;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0217183;OID=.;OPOS=32475109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:18:19:16:24:18:19:16:24 chr2 32476390 . T G 120.09 PASS AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0354441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.457;QD=9.41879;RBI=0.0405366;REFB=-0.0193164;REVB=-0.0196706;RO=36;SAF=2;SAR=13;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398344;STB=0.747809;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0344767;OID=.;OPOS=32476390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:13:2:14:22:13:2:14:22 chr2 32481794 . TT AA 131.96 PASS AF=0.362069;AO=2;DP=40;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0066764;FXX=0.194417;HRUN=3;LEN=2;MLLD=72.2117;QD=9.10095;RBI=0.0299186;REFB=-0.0357674;REVB=0.0291642;RO=37;SAF=1;SAR=1;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112443;STB=0.843163;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.170758;OID=.;OPOS=32481794;OREF=TT;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:58:37:37:2:21:0.362069:1:1:19:18:19:2:19:18 chr2 32667182 . G C 1330.39 PASS AF=1;AO=85;DP=88;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215316;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.309;QD=61.8785;RBI=0.0337008;REFB=0;REVB=0.0259255;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.49908e-05;OID=.;OPOS=32667182;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:86:0:0:85:86:1:48:37:0:0:48:38:0:0 chr2 32690189 . A G 464.06 PASS AF=0.419355;AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=124;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.00884181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.029;QD=14.9698;RBI=0.0107145;REFB=-0.0119354;REVB=0.00605177;RO=72;SAF=32;SAR=20;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931475;STB=0.552409;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0233011;OID=.;OPOS=32690189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:72:72:52:52:0.419355:20:32:38:34:20:32:38:34 chr2 32702474 . A G 193.12 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=0.00650736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.241;QD=13.7945;RBI=0.0196739;REFB=-0.0116551;REVB=0.0185665;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19542;STB=0.616347;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.014315;OID=.;OPOS=32702474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:32:33:23:23:0.410714:9:14:25:7:9:14:26:7 chr2 32843292 . TTTA T,TTT,TTTT 345.27 PASS AF=0.958333,0,0.0416667;AO=9,5,9;DP=31;FAO=23,0,1;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0,0;FSAR=13,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.099857,-0.104133,-0.104198;FXX=0.199933;HRUN=4,1,1;LEN=3,1,1;MLLD=145.396,141.786,139.947;QD=57.5456;RBI=0.173939,0.161034,0.150897;REFB=0,0,0;REVB=0.142419,0.122835,0.109145;RO=1;SAF=0,5,6;SAR=9,0,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.767767,0.126211;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00360647,-0.233887,-0.1224;OID=.,.,.;OPOS=32843293,32843295,32843295;OREF=TTA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TTT,TTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.958333,0,0.0416667:9,5,9:31:23,0,1:24:0:10,0,0:13,0,1:0:0:7:1:0,5,6:9,0,3:0:1 chr2 32855615 . A G 582.44 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00717886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6714;QD=58.2438;RBI=0.0368218;REFB=-0.111704;REVB=0.0361152;RO=1;SAF=13;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346908;STB=0.518509;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00308409;OID=.;OPOS=32855615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:26:13:1:0:26:13:1:0 chr2 32983480 . G A 904.28 PASS AF=0.564935;AO=54;DP=154;FAO=87;FDP=154;FR=.;FRO=67;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=0.0245564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.672;QD=23.4877;RBI=0.0405013;REFB=-0.0177913;REVB=0.0322077;RO=62;SAF=22;SAR=32;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416382;STB=0.588844;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0114928;OID=.;OPOS=32983480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:62:67:54:87:0.564935:32:22:25:37:32:55:29:38 chr2 32983526 . C T 616.27 PASS AF=0.450704;AO=64;DP=142;FAO=64;FDP=142;FR=.;FRO=78;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=30;FWDB=-0.000146726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7211;QD=17.3596;RBI=0.0258056;REFB=-0.0144787;REVB=-0.0258052;RO=77;SAF=20;SAR=44;SRF=48;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308826;STB=0.668998;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0144209;OID=.;OPOS=32983526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:77:78:64:64:0.450704:44:20:48:29:44:20:48:30 chr2 33412077 . G A 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0462376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.289;QD=12.6376;RBI=0.0464519;REFB=-0.0079997;REVB=-0.00445731;RO=21;SAF=1;SAR=12;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46509;STB=0.786309;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0246398;OID=.;OPOS=33412077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:12:1:7:14:12:1:7:14 chr2 33447202 . C T 163.57 PASS AF=0.439024;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00339896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.346;QD=15.9577;RBI=0.00518219;REFB=-0.000809278;REVB=0.0039118;RO=23;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152993;STB=0.599344;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00127528;OID=.;OPOS=33447202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:17:18:0.439024:7:10:10:13:7:11:10:13 chr2 33557974 . A G 353.54 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.00252452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.053;QD=16.0699;RBI=0.00847981;REFB=-0.0205123;REVB=-0.0080953;RO=49;SAF=27;SAR=11;SRF=35;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00458487;STB=0.507222;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0292468;OID=.;OPOS=33557974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:49:50:38:38:0.431818:11:27:35:14:11:27:35:15 chr2 33585796 . T C 1853.16 PASS AF=1;AO=119;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017468;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6063;QD=60.7594;RBI=0.0303624;REFB=0;REVB=0.0248344;RO=0;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00693424;OID=.;OPOS=33585796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:122:0:0:119:122:1:60:59:0:0:63:59:0:0 chr2 33774761 . T C 337.28 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00427879;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.266;QD=14.6643;RBI=0.0313928;REFB=-0.00157093;REVB=-0.0310998;RO=54;SAF=15;SAR=22;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419698;STB=0.530104;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00175609;OID=.;OPOS=33774761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:55:37:37:0.402174:22:15:24:30:22:15:25:30 chr2 33952413 . T C 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.185;QD=64.4145;RBI=0.0281208;REFB=0;REVB=-0.0175471;RO=0;SAF=15;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00024051;OID=.;OPOS=33952413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:35:15:0:0:35:15:0:0 chr2 33952456 . C G 436.32 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0192181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.131;QD=54.5403;RBI=0.0243918;REFB=-0.156599;REVB=0.0150208;RO=1;SAF=12;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372894;STB=0.519987;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000775227;OID=.;OPOS=33952456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:19:12:1:0:19:12:1:0 chr2 36756288 . T C 2086.96 PASS AF=1;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156481;FXX=0.00746213;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.587;QD=62.7658;RBI=0.0217989;REFB=0;REVB=0.0151766;RO=0;SAF=81;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.20098e-09;OID=.;OPOS=36756288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:133:0:0:133:133:1:52:81:0:0:52:81:0:0 chr2 36776555 . G T 834.39 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.847;QD=57.5443;RBI=0.0380067;REFB=0;REVB=-0.0135632;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.84359e-05;OID=.;OPOS=36776555;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0 chr2 36781401 . T C 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8594;QD=62.0074;RBI=0.030621;REFB=0;REVB=0.0283208;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286269;OID=.;OPOS=36781401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:41:43:0:0:41:43:0:0 chr2 36782886 . G A 1106.72 PASS AF=0.974026;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0191494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.716;QD=57.4919;RBI=0.0391525;REFB=-0.0581834;REVB=0.03415;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501222;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00322783;OID=.;OPOS=36782886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:77:0:2:73:75:0.974026:39:34:0:0:41:34:1:1 chr2 36808732 . T G 690.3 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744172;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=137.824;QD=62.7548;RBI=0.0747119;REFB=0;REVB=-0.00663047;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111232;OID=.;OPOS=36808732;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr2 37028486 . T C 483.4 PASS AF=0.505376;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=0.00319107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.191;QD=20.7914;RBI=0.00365727;REFB=-0.0217287;REVB=-0.00178681;RO=46;SAF=23;SAR=24;SRF=10;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246384;STB=0.635306;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0205466;OID=.;OPOS=37028486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:46:47:47:0.505376:24:23:10:36:24:23:10:36 chr2 37035934 . A G 706.71 PASS AF=0.652174;AO=60;DP=92;FAO=60;FDP=92;FR=.;FRO=32;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0532002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3036;QD=30.7267;RBI=0.0586978;REFB=-0.0225378;REVB=-0.0248026;RO=32;SAF=36;SAR=24;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184637;STB=0.599967;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0157455;OID=.;OPOS=37035934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:32:32:60:60:0.652174:24:36:10:22:24:36:10:22 chr2 37035945 . C A 746.97 PASS AF=0.681319;AO=62;DP=91;FAO=62;FDP=91;FR=.;FRO=29;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.00601954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.843;QD=32.8336;RBI=0.0153853;REFB=-0.0107499;REVB=0.0141589;RO=29;SAF=37;SAR=25;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227938;STB=0.6229;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00971186;OID=.;OPOS=37035945;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:29:29:62:62:0.681319:25:37:6:23:25:37:6:23 chr2 37041439 . C T 327.24 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0307118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.267;QD=17.6885;RBI=0.0311523;REFB=0.0144855;REVB=-0.00522022;RO=39;SAF=14;SAR=21;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107897;STB=0.560405;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.0116461;OID=.;OPOS=37041439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:21:14:20:19:21:14:20:19 chr2 37094945 . A G 326.78 PASS AF=0.925926;AO=20;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=5.63167e-05;FXX=0.0357015;HRUN=6;LEN=1;MLLD=109.493;QD=48.4115;RBI=0.0636607;REFB=-0.137878;REVB=0.0636607;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.531225;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00729423;OID=.;OPOS=37094945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:27:27:0:2:20:25:0.925926:6:14:0:0:10:15:2:0 chr2 37227797 . C G 114.9 PASS AF=0.225;AO=18;DP=80;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.00327954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2374;QD=5.74518;RBI=0.0798526;REFB=0.00491522;REVB=-0.0797853;RO=61;SAF=10;SAR=8;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219473;STB=0.640179;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.019879;OID=.;OPOS=37227797;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:61:62:18:18:0.225:8:10:23:38:8:10:23:39 chr2 37230728 . T C 302.21 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00586484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.791;QD=19.4976;RBI=0.0557029;REFB=-0.0307586;REVB=0.0553933;RO=30;SAF=17;SAR=15;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309879;STB=0.517231;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0327047;OID=.;OPOS=37230728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:15:17:17:13:15:17:17:13 chr2 37241050 . G A 581.7 PASS AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.000502797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.352;QD=20.591;RBI=0.00312457;REFB=-0.00869376;REVB=-0.00308385;RO=54;SAF=28;SAR=31;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107664;STB=0.559133;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00616455;OID=.;OPOS=37241050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:54:54:59:59:0.522124:31:28:19:35:31:28:19:35 chr2 37306343 . G A 2634.22 PASS AF=0.988506;AO=171;DP=172;FAO=172;FDP=174;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0112818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.272;QD=60.5567;RBI=0.0124898;REFB=-0.010771;REVB=0.00535863;RO=0;SAF=85;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.77944e-08;STB=0.505813;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-3.44932e-06;OID=.;OPOS=37306343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:172:174:0:2:171:172:0.988506:86:85:0:0:87:85:2:0 chr2 37317869 . C T 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00712319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.671;QD=61.0487;RBI=0.0334327;REFB=0;REVB=-0.032665;RO=0;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09717e-05;OID=.;OPOS=37317869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:45:33:0:0:45:33:0:0 chr2 37365640 . G A 305.7 PASS AF=0.684211;AO=26;DP=39;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.012774;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.381;QD=32.1788;RBI=0.030213;REFB=-0.0213632;REVB=0.0273797;RO=12;SAF=10;SAR=16;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838261;STB=0.545817;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0146329;OID=.;OPOS=37365640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:39:38:12:12:26:26:0.684211:16:10:3:9:16:10:3:9 chr2 37406644 . A G 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.802;QD=62.6138;RBI=0.0428885;REFB=0;REVB=0.00980116;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66934e-05;OID=.;OPOS=37406644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr2 37406680 . C A,G 1284.17 PASS AF=0.0777778,0.922222;AO=5,74;DP=80;FAO=7,83;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=5,40;FSAR=2,43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00914044,0.010562;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=163.72,205.14;QD=57.0741;RBI=0.0255023,0.0358467;REFB=0,0;REVB=0.023808,0.0342554;RO=0;SAF=4,37;SAR=1,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0200482,-0.00135349;OID=.,.;OPOS=37406680,37406680;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:20:80:90:0:0:5,74:7,83:0.0777778,0.922222:1,37:4,37:0:0:2,43:5,40:0:0 chr2 37406681 . A G 41.55 PASS AF=0.111111;AO=7;DP=86;FAO=10;FDP=90;FR=.;FRO=80;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.012553;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=50.7069;QD=1.84648;RBI=0.0271306;REFB=-0.00908606;REVB=-0.0240519;RO=79;SAF=3;SAR=4;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990525;STB=0.5998;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.178558;OID=.;OPOS=37406681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:86:90:79:80:7:10:0.111111:4:3:41:38:6:4:41:39 chr2 37456032 . C T 207.09 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.651;QD=48.7282;RBI=0.0655411;REFB=0;REVB=0.0164523;RO=0;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000611237;OID=.;OPOS=37456032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:16:1:0:0:16:1:0:0 chr2 37458668 . G A 587.18 PASS AF=0.564356;AO=57;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0084693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.453;QD=23.2546;RBI=0.00928983;REFB=-0.0114446;REVB=0.00381731;RO=35;SAF=29;SAR=28;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0038589;STB=0.543357;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0142749;OID=.;OPOS=37458668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:35:44:57:57:0.564356:28:29:18:17:28:29:18:26 chr2 37477794 . C A 487.03 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194853;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.769;QD=59.0338;RBI=0.0371706;REFB=0;REVB=-0.031654;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246837;OID=.;OPOS=37477794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr2 37494591 . A G 205.36 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00960307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.223;QD=14.6688;RBI=0.0104902;REFB=-0.00212132;REVB=0.0042219;RO=32;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073137;STB=0.541632;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00313049;OID=.;OPOS=37494591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:11:13:15:17:11:13:15:17 chr2 37505105 . T G 667.16 PASS AF=0.453333;AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0184837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4063;QD=17.7909;RBI=0.0219346;REFB=-0.0267436;REVB=-0.0118103;RO=81;SAF=24;SAR=44;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167216;STB=0.596732;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0269055;OID=.;OPOS=37505105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:81:82:68:68:0.453333:44:24:42:39:44:24:43:39 chr2 37506939 . A G 352.3 PASS AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0191376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.743;QD=15.8335;RBI=0.0196468;REFB=0.000131913;REVB=0.00444425;RO=51;SAF=19;SAR=19;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697896;STB=0.539305;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.000216032;OID=.;OPOS=37506939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:51:51:38:38:0.426966:19:19:22:29:19:19:22:29 chr2 37579937 . C T 1249.96 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0254378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2944;QD=60.2391;RBI=0.0404221;REFB=-0.114143;REVB=0.0314144;RO=1;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145681;STB=0.50769;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00329603;OID=.;OPOS=37579937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:32:50:0:1:32:50:0:1 chr2 37579971 . C T 1597.15 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2377;QD=59.7065;RBI=0.0222598;REFB=0;REVB=0.0220408;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100757;OID=.;OPOS=37579971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:45:62:0:0:45:62:0:0 chr2 37599963 . A C 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00941008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.02;QD=15.6452;RBI=0.0194354;REFB=-0.00848588;REVB=-0.0170055;RO=28;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114534;STB=0.574401;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0121698;OID=.;OPOS=37599963;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:29:22:22:0.431373:10:12:12:16:10:12:12:17 chr2 37872508 . G A 574.12 PASS AF=0.48;AO=58;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0581125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.331;QD=18.3717;RBI=0.0594531;REFB=0.00105485;REVB=-0.0125542;RO=65;SAF=26;SAR=32;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11487;STB=0.570568;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00112505;OID=.;OPOS=37872508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:65:58:60:0.48:32:26:37:28:34:26:37:28 chr2 38179134 . G A 1175.87 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0184488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.526;QD=59.5378;RBI=0.0221516;REFB=0.0756085;REVB=-0.0122612;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116869;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00070648;OID=.;OPOS=38179134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:38:40:1:0:38:40:1:0 chr2 38298150 . A G 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.867;QD=57.3858;RBI=0.0329699;REFB=0;REVB=-0.000945217;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43645e-05;OID=.;OPOS=38298150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0 chr2 38298203 . C G 693.34 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00217093;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7516;QD=63.0313;RBI=0.0159102;REFB=0;REVB=0.0157614;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177575;OID=.;OPOS=38298203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr2 38536626 . T G 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0106334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.024;QD=16.9315;RBI=0.0294771;REFB=-0.00980385;REVB=0.0274924;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107737;STB=0.542183;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00727816;OID=.;OPOS=38536626;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:7:5:6:5:7:5:6:6 chr2 38604351 . A G 117.21 PASS AF=0.290909;AO=17;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0735127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.112;QD=8.52467;RBI=0.132509;REFB=-0.0118831;REVB=-0.110247;RO=38;SAF=7;SAR=10;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192007;STB=0.589054;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0475767;OID=.;OPOS=38604351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:38:39:17:16:0.290909:10:7:22:16:9:7:22:17 chr2 39008949 . G A 227.01 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0142195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.389;QD=13.5529;RBI=0.0157473;REFB=-0.00896528;REVB=-0.00676635;RO=40;SAF=10;SAR=17;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11304;STB=0.564671;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0137428;OID=.;OPOS=39008949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:17:10:19:21:17:10:19:21 chr2 39025555 . G A 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.738;QD=57.1033;RBI=0.0155246;REFB=0;REVB=0.0101826;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2001e-06;OID=.;OPOS=39025555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:35:20:0:0:35:20:0:0 chr2 39040972 . A G 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00866612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.344;QD=9.44475;RBI=0.0150425;REFB=-0.0129162;REVB=-0.0122953;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357304;STB=0.719306;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0347401;OID=.;OPOS=39040972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:3:7:2:4:3:7 chr2 39050141 . A C 411.1 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.962;QD=56.7035;RBI=0.0522617;REFB=0;REVB=0.0456257;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289604;OID=.;OPOS=39050141;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:6:22:0:0:7:22:0:0 chr2 39082344 . T C 1075.8 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196542;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.479;QD=59.7667;RBI=0.00342399;REFB=0;REVB=-0.00280372;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148899;OID=.;OPOS=39082344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:73:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0 chr2 39185298 . G A 84.8 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0158932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.974;QD=10.9414;RBI=0.0305945;REFB=-0.021725;REVB=-0.0261425;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359763;STB=0.502953;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.041616;OID=.;OPOS=39185298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:19:20:11:11:0.354839:6:5:8:11:6:5:9:11 chr2 39209426 . A G 220.16 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.152;QD=48.9239;RBI=0.0339185;REFB=0;REVB=0.0233507;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010755;OID=.;OPOS=39209426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:12:5:0:0:13:5:0:0 chr2 39212637 . T C 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00722092;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.213;QD=45.8026;RBI=0.00747931;REFB=0;REVB=0.00194892;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92612e-05;OID=.;OPOS=39212637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr2 39477170 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.252;QD=57.68;RBI=0.0455326;REFB=0;REVB=0.0394816;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141703;OID=.;OPOS=39477170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr2 39507417 . T A 500.3 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0193437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.373;QD=54.0866;RBI=0.0558813;REFB=-0.195343;REVB=0.0524265;RO=2;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549407;STB=0.529395;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00710214;OID=.;OPOS=39507417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:37:37:2:2:35:35:0.945946:16:19:0:2:16:19:0:2 chr2 39583446 . A G 1044.33 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00303725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1904;QD=59.6758;RBI=0.0373527;REFB=0;REVB=0.037229;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238262;OID=.;OPOS=39583446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0 chr2 40006368 . C A 30.97 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.123028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6502;QD=12.3893;RBI=0.13758;REFB=-0.0255578;REVB=0.0615806;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317065;STB=0.691596;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0418651;OID=.;OPOS=40006368;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:1:4:2:3:1:4 chr2 40403104 . A G 264.79 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00621983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.492;QD=20.7679;RBI=0.0203331;REFB=-0.0016991;REVB=0.0193584;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185879;STB=0.603373;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00195891;OID=.;OPOS=40403104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:15:12:16:8:15:12:16:8 chr2 42510018 . A G 1460.52 PASS AF=0.971429;AO=99;DP=102;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0406381;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7086;QD=55.6388;RBI=0.0938114;REFB=0.0367119;REVB=-0.0845525;RO=3;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260909;STB=0.513759;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.00173645;OID=.;OPOS=42510018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:102:105:3:3:99:102:0.971429:53:46:0:3:53:49:0:3 chr2 42515388 . A G 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.386;QD=62.0075;RBI=0.00118017;REFB=0;REVB=2.00331e-05;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51783e-06;OID=.;OPOS=42515388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0 chr2 42515437 . A G 291.41 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0164159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1199;QD=16.8935;RBI=0.0504351;REFB=0.00411988;REVB=0.0476887;RO=37;SAF=16;SAR=16;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904257;STB=0.550693;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.00412752;OID=.;OPOS=42515437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:16:16:15:22:16:16:15:22 chr2 42560975 . A G 785.84 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5096;QD=64.1503;RBI=0.0542503;REFB=0;REVB=0.0171551;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000585346;OID=.;OPOS=42560975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:31:18:0:0:31:18:0:0 chr2 42577803 . T C,TAAATACACAC 222.0 PASS AF=0.0666667,0.666667;AO=2,18;DP=30;FAO=2,20;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=2,9;FSAR=0,11;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00943794,-0.0210684;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,10;MLLD=118.238,302.203;QD=29.6001;RBI=0.0348997,0.021976;REFB=0.00309116,-0.0218746;REVB=0.0335993,-0.00625053;RO=9;SAF=2,7;SAR=0,11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.64528,0.0354044;STB=0.996007,0.558337;STBP=0.102,0.386;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0714869,0.0106911;OID=.,.;OPOS=42577803,42577804;OREF=T,-;OALT=C,AAATACACAC;OMAPALT=C,TAAATACACAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:56:30:30:9:8:2,18:2,20:0.0666667,0.666667:0,11:2,7:3:6:0,11:2,9:2:6 chr2 42577806 . T A 62.37 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0533277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7742;QD=7.7967;RBI=0.057369;REFB=-0.0128608;REVB=-0.0211507;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123874;STB=0.5776;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0244213;OID=.;OPOS=42577806;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:6:3:10:13:6:3:10:13 chr2 42588195 . T C 484.66 PASS AF=0.51087;AO=46;DP=91;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.0405318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5422;QD=21.0723;RBI=0.150819;REFB=0.000661422;REVB=-0.145271;RO=44;SAF=25;SAR=21;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145968;STB=0.579416;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00209704;OID=.;OPOS=42588195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:44:45:46:47:0.51087:21:25:31:13:21:26:32:13 chr2 42990101 . G C 441.37 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00949782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.777;QD=22.6343;RBI=0.0104886;REFB=-0.0150532;REVB=0.00444994;RO=35;SAF=27;SAR=16;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188015;STB=0.603577;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0155175;OID=.;OPOS=42990101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:16:27:14:21:16:27:14:21 chr2 42990173 . C T 375.39 PASS AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0341338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5337;QD=15.806;RBI=0.0404433;REFB=-0.00766545;REVB=0.0216919;RO=54;SAF=17;SAR=23;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114539;STB=0.569812;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0114173;OID=.;OPOS=42990173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:54:55:40:40:0.421053:23:17:29:25:23:17:30:25 chr2 42990336 . T G 310.16 PASS AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00130984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.464;QD=28.8521;RBI=0.00161118;REFB=-0.0346303;REVB=0.000938202;RO=16;SAF=9;SAR=18;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120707;STB=0.566616;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0193614;OID=.;OPOS=42990336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:18:9:8:8:18:9:8:8 chr2 42990522 . C T 476.08 PASS AF=0.528736;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0595062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.064;QD=21.8886;RBI=0.0595672;REFB=-0.0397928;REVB=-0.00269528;RO=39;SAF=29;SAR=17;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165383;STB=0.580858;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0391936;OID=.;OPOS=42990522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:39:41:46:46:0.528736:17:29:17:22:17:29:19:22 chr2 43015704 . T A 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00750757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.956;QD=20.5628;RBI=0.0101946;REFB=-0.0199505;REVB=0.00689678;RO=25;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18727;STB=0.60399;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0104118;OID=.;OPOS=43015704;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:17:12:16:9:17:12:16:9 chr2 43015719 . T C 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0211156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.838;QD=20.563;RBI=0.0213316;REFB=0.000154199;REVB=0.00302817;RO=25;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18727;STB=0.60399;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.000163685;OID=.;OPOS=43015719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:17:12:16:9:17:12:16:9 chr2 43015757 . G A 266.18 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.000967062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.226;QD=21.2944;RBI=0.0261726;REFB=-0.0115782;REVB=-0.0261547;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271992;STB=0.644034;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0180124;OID=.;OPOS=43015757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:25:25:25:0.5:17:8:15:9:17:8:15:10 chr2 43797619 . C T 502.48 PASS AF=0.433071;AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.0119966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.736;QD=15.8261;RBI=0.0120276;REFB=-0.00559711;REVB=-0.000862397;RO=72;SAF=32;SAR=23;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271767;STB=0.515217;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00709717;OID=.;OPOS=43797619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:0.433071:23:32:40:32:23:32:40:32 chr2 43801712 . A G 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0440753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5973;QD=17.6173;RBI=0.0469129;REFB=-0.00773148;REVB=0.0160682;RO=27;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231197;STB=0.630119;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0104117;OID=.;OPOS=43801712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:14:10:18:9:14:10:18:9 chr2 43804229 . T C 162.96 PASS AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0419556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9476;QD=13.0366;RBI=0.117267;REFB=-0.0307875;REVB=-0.109504;RO=31;SAF=6;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237241;STB=0.629989;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.057924;OID=.;OPOS=43804229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:32:18:18:0.36:12:6:17:14:12:6:17:15 chr2 43902511 . G C 194.51 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.121993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.183;QD=17.29;RBI=0.122057;REFB=0.0055133;REVB=-0.00394052;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323679;STB=0.528189;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.0132288;OID=.;OPOS=43902511;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:11:9:10:14:11:9:10:15 chr2 43903066 . A G 323.08 PASS AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0185481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.601;QD=25.3397;RBI=0.031108;REFB=-0.0112016;REVB=0.0249735;RO=20;SAF=10;SAR=21;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099584;STB=0.554901;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00657161;OID=.;OPOS=43903066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:21:10:9:11:21:10:9:11 chr2 43903354 . T C 618.07 PASS AF=0.457143;AO=64;DP=140;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.00179632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.524;QD=17.6592;RBI=0.00952785;REFB=-0.00564695;REVB=-0.00935699;RO=76;SAF=27;SAR=37;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14049;STB=0.578101;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00737503;OID=.;OPOS=43903354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:76:76:64:64:0.457143:37:27:43:33:37:27:43:33 chr2 43926943 . T A 417.18 PASS AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.0114073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.38;QD=17.2033;RBI=0.0175734;REFB=-0.00484892;REVB=-0.0133678;RO=53;SAF=20;SAR=23;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209488;STB=0.620979;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00458176;OID=.;OPOS=43926943;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:54:43:43:0.443299:23:20:36:17:23:20:37:17 chr2 43927459 . C G 280.38 PASS AF=0.469697;AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00329768;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.725;QD=16.9926;RBI=0.0147971;REFB=-0.00826157;REVB=0.0144249;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975156;STB=0.575174;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0102395;OID=.;OPOS=43927459;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:66:33:35:30:31:0.469697:14:16:21:12:15:16:23:12 chr2 43931176 . T C 219.21 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.036561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.036;QD=13.9182;RBI=0.0444269;REFB=-0.00858942;REVB=0.0252397;RO=37;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984521;STB=0.505614;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0171172;OID=.;OPOS=43931176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:11:15:21:16:11:15:21:16 chr2 44066174 . T G 1292.9 PASS AF=1;AO=69;DP=72;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0745172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.699;QD=60.1347;RBI=0.0822703;REFB=0;REVB=0.0348651;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00386874;OID=.;OPOS=44066174;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:72:86:0:0:69:86:1:25:44:0:0:34:52:0:0 chr2 44071743 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.296;QD=56.9568;RBI=0.0191262;REFB=0;REVB=0.0062081;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.24248e-05;OID=.;OPOS=44071743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:22:29:0:0:22:30:0:0 chr2 44101538 . C T 1510.99 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.772;QD=58.6792;RBI=0.0282308;REFB=0;REVB=0.0179866;RO=0;SAF=41;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54969e-05;OID=.;OPOS=44101538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:103:0:0:93:103:1:52:41:0:0:53:50:0:0 chr2 44104925 . T C 1007.68 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0737338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.889;QD=59.2751;RBI=0.0812491;REFB=0;REVB=0.0341283;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423004;OID=.;OPOS=44104925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:68:0:0:65:68:1:38:27:0:0:38:30:0:0 chr2 44173344 . T C 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00490001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.324;QD=13.4591;RBI=0.0264107;REFB=-0.00491374;REVB=-0.0259522;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209509;STB=0.631421;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0121484;OID=.;OPOS=44173344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:9:7:16:9:9:7:17:9 chr2 44200790 . A C 244.5 PASS AF=0.333333;AO=30;DP=89;FAO=30;FDP=90;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.000835469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.679;QD=10.8666;RBI=0.0231674;REFB=-0.00279112;REVB=-0.0231523;RO=59;SAF=21;SAR=9;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212382;STB=0.619534;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00474973;OID=.;OPOS=44200790;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:59:60:30:30:0.333333:9:21:31:28:9:21:32:28 chr2 44201376 . T C 540.2 PASS AF=0.620253;AO=49;DP=79;FAO=49;FDP=79;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00168895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.764;QD=27.3517;RBI=0.00677669;REFB=-0.0154076;REVB=0.00656285;RO=29;SAF=21;SAR=28;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375429;STB=0.5147;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00917764;OID=.;OPOS=44201376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:29:30:49:49:0.620253:28:21:14:15:28:21:14:16 chr2 44381958 . G A 99.97 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0347607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9005;QD=15.3801;RBI=0.047361;REFB=-0.002981;REVB=-0.0321677;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376592;STB=0.719621;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00187159;OID=.;OPOS=44381958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:3:9:5:9:3:9:5:9 chr2 44993594 . G A 538.9 PASS AF=0.534653;AO=54;DP=101;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00581856;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.227;QD=21.3425;RBI=0.00662943;REFB=-0.0054942;REVB=0.00317706;RO=47;SAF=19;SAR=35;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122194;STB=0.567323;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00538153;OID=.;OPOS=44993594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:47:54:54:0.534653:35:19:23:24:35:19:23:24 chr2 45148830 . G A 63.35 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.021998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.062;QD=8.73785;RBI=0.0251079;REFB=-0.00950047;REVB=-0.0121035;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628668;STB=0.503867;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0196845;OID=.;OPOS=45148830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:4:5:11:9:4:5:11:9 chr2 45149003 . C T 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.83;QD=57.1063;RBI=0.0242294;REFB=0;REVB=0.0152677;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.73906e-06;OID=.;OPOS=45149003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr2 45149373 . G T 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0405891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8322;QD=13.2052;RBI=0.0419727;REFB=-0.0626553;REVB=0.0106877;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168138;STB=0.599699;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0252384;OID=.;OPOS=45149373;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:4:2:1:5:4:2:1:5 chr2 45171842 . A G 846.43 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.006;QD=57.3849;RBI=0.0537478;REFB=0;REVB=0.0526617;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137347;OID=.;OPOS=45171842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:21:37:0:0:22:37:0:0 chr2 46313481 . C T 352.58 PASS AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0132224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.473;QD=21.0496;RBI=0.0162406;REFB=-0.014815;REVB=0.00942993;RO=31;SAF=21;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841381;STB=0.546573;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00997622;OID=.;OPOS=46313481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:15:21:15:16:15:21:15:16 chr2 46414169 . G A 371.5 PASS AF=0.520548;AO=37;DP=72;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0153921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0085;QD=20.3564;RBI=0.0249021;REFB=-0.0277494;REVB=0.0195754;RO=34;SAF=12;SAR=25;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109868;STB=0.559776;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0258166;OID=.;OPOS=46414169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:34:35:37:38:0.520548:25:12:15:19:26:12:15:20 chr2 46414434 . CA AA,AG 202.1 PASS AF=0.47619,0;AO=19,2;DP=44;FAO=20,0;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=7,0;FSAR=13,0;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0231954,0.0199148;FXX=0.0454442;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=310.063,289.968;QD=19.2477;RBI=0.0354458,0.0273321;REFB=-0.012966,-0.00934449;REVB=0.0268026,0.0187202;RO=22;SAF=7,0;SAR=12,2;SRF=13;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.210695,-0.539914;STB=0.62789,0.5;STBP=0.135,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0156082,0;OID=.,.;OPOS=46414434,46414434;OREF=C,CA;OALT=A,AG;OMAPALT=AA,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:42:22:22:19,2:20,0:0.47619,0:12,2:7,0:13:9:13,0:7,0:13:9 chr2 46608785 . T C 620.09 PASS AF=0.457143;AO=64;DP=141;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.0222089;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3659;QD=17.717;RBI=0.0239305;REFB=0.0133491;REVB=-0.00891251;RO=74;SAF=34;SAR=30;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484946;STB=0.518862;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.0195736;OID=.;OPOS=46608785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:74:76:64:64:0.457143:30:34:43:31:30:34:43:33 chr2 46707851 . G A 203.21 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0599787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.939;QD=30.1051;RBI=0.0613395;REFB=-0.112782;REVB=0.0128484;RO=8;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18366;STB=0.59991;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0242569;OID=.;OPOS=46707851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:16:3:0:8:16:3:0:8 chr2 46707886 . G A 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.25;QD=18.767;RBI=0.0333741;REFB=-0.0313585;REVB=0.0333741;RO=3;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263816;OID=.;OPOS=46707886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:6:0:0:3:6:0:0:3 chr2 46987300 . T G 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0222962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6511;QD=19.0005;RBI=0.0503212;REFB=-0.0118144;REVB=-0.0451122;RO=17;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166843;STB=0.593992;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0108277;OID=.;OPOS=46987300;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:7:10:13:4:7:10:13:4 chr2 47045309 . C T 575.63 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.046;QD=60.5928;RBI=0.0622599;REFB=0;REVB=0.0209355;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150999;OID=.;OPOS=47045309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr2 47201797 . A T 947.23 PASS AF=0.819048;AO=77;DP=98;FAO=86;FDP=105;FR=.;FRO=19;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0941774;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=24.9918;QD=36.085;RBI=0.0984092;REFB=-0.0410688;REVB=-0.0285481;RO=21;SAF=32;SAR=45;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158024;STB=0.558022;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0481758;OID=.;OPOS=47201797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:98:105:21:19:77:86:0.819048:45:32:17:4:50:36:14:5 chr2 47251469 . G C 902.61 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00203527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.126;QD=58.233;RBI=0.0131251;REFB=0;REVB=0.0129663;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012093;OID=.;OPOS=47251469;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0 chr2 47274443 . G T 579.43 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353203;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.955;QD=60.9924;RBI=0.038412;REFB=0;REVB=-0.0150982;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000502979;OID=.;OPOS=47274443;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr2 47278901 . G A 521.13 PASS AF=0.422222;AO=57;DP=135;FAO=57;FDP=135;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=0.00833482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.842;QD=15.4409;RBI=0.00928335;REFB=-0.0210769;REVB=-0.00408796;RO=78;SAF=27;SAR=30;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00069689;STB=0.500391;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0259389;OID=.;OPOS=47278901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:78:78:57:57:0.422222:30:27:37:41:30:27:37:41 chr2 47301029 . A G 804.4 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220526;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.104;QD=57.4568;RBI=0.0221158;REFB=0;REVB=-0.00167125;RO=0;SAF=40;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152742;OID=.;OPOS=47301029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:15:40:0:0:15:41:0:0 chr2 47301624 . T C,TTGGGGCCTC 720.15 PASS AF=0.0447761,0.80597;AO=9,45;DP=70;FAO=3,54;FDP=67;FR=.;FRO=10;FSAF=2,28;FSAR=1,26;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.000488404,-0.00859479;FXX=0.0147037;HRUN=3,3;LEN=1,9;MLLD=157.776,217.738;QD=42.9941;RBI=0.00378352,0.0142521;REFB=-0.014182,-0.0418473;REVB=0.00375186,0.0113689;RO=13;SAF=2,27;SAR=7,18;SRF=8;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.406226,-0.00668434;STB=0.624277,0.54417;STBP=0.789,0.094;TYPE=snp,ins;VARB=0.0106121,0.00414871;OID=.,.;OPOS=47301624,47301625;OREF=T,-;OALT=C,TGGGGCCTC;OMAPALT=C,TTGGGGCCTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:48:70:67:13:10:9,45:3,54:0.0447761,0.80597:7,18:2,27:8:5:1,26:2,28:8:2 chr2 47601106 . T C 235.07 PASS AF=0.46;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00755554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6927;QD=18.8056;RBI=0.0138004;REFB=-0.00961491;REVB=-0.0115484;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116405;STB=0.561472;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0130786;OID=.;OPOS=47601106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:26:27:22:23:0.46:12:10:15:11:12:11:16:11 chr2 47739551 . A G 405.19 PASS AF=0.43;AO=42;DP=100;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0192989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.274;QD=16.2076;RBI=0.0197373;REFB=-0.0124128;REVB=0.00413721;RO=56;SAF=20;SAR=22;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140901;STB=0.578666;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0158683;OID=.;OPOS=47739551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:56:57:42:43:0.43:22:20:19:37:22:21:20:37 chr2 47905390 . C A 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00552005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.99;QD=17.9407;RBI=0.00583436;REFB=-0.0179991;REVB=-0.00188915;RO=22;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018094;STB=0.510298;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.015393;OID=.;OPOS=47905390;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:10:9:10:12:10:9:10:12 chr2 48602252 . C T 538.93 PASS AF=0.471074;AO=57;DP=121;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00437394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.212;QD=17.8159;RBI=0.0107255;REFB=-0.0228849;REVB=-0.00979308;RO=64;SAF=23;SAR=34;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934467;STB=0.55193;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0245813;OID=.;OPOS=48602252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:64:64:57:57:0.471074:34:23:32:32:34:23:32:32 chr2 48756682 . C G 2403.78 PASS AF=1;AO=153;DP=156;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064628;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5513;QD=60.4724;RBI=0.128476;REFB=-0.0900992;REVB=0.111037;RO=1;SAF=56;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487928;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205488;OID=.;OPOS=48756682;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:156:159:1:0:153:159:1:97:56:0:1:103:56:0:0 chr2 48807796 . A C 91.23 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00346449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.161;QD=17.3779;RBI=0.0559803;REFB=-0.0198133;REVB=0.055873;RO=10;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791542;STB=0.545376;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0171484;OID=.;OPOS=48807796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:3:8:8:2:3:8:8:2 chr2 48807976 . T C 223.37 PASS AF=0.511111;AO=20;DP=41;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0201926;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.3974;QD=19.8552;RBI=0.025159;REFB=-0.0354348;REVB=0.0150078;RO=21;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304087;STB=0.512809;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0288742;OID=.;OPOS=48807976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:45:21:22:20:23:0.511111:13:7:8:13:13:10:9:13 chr2 48808152 . G C 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0137607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.083;QD=14.3341;RBI=0.0668759;REFB=-0.00895062;REVB=-0.0654449;RO=10;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394404;STB=0.740083;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00659911;OID=.;OPOS=48808152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:1:8:6:4:1:8:6:4 chr2 48808594 . C T 170.51 PASS AF=0.302632;AO=23;DP=76;FAO=23;FDP=76;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00667619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.406;QD=8.97396;RBI=0.0214616;REFB=-0.00744302;REVB=-0.0203968;RO=53;SAF=13;SAR=10;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110044;STB=0.565161;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0170692;OID=.;OPOS=48808594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:53:53:23:23:0.302632:10:13:25:28:10:13:25:28 chr2 48808882 . T A 263.52 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00628141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.657;QD=17.5676;RBI=0.0132996;REFB=-0.0150776;REVB=-0.0117228;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254873;STB=0.514276;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.022595;OID=.;OPOS=48808882;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:12:17:19:12:12:17:19:12 chr2 48808898 . C T 261.8 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00199987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.381;QD=17.1669;RBI=0.0130944;REFB=-0.00914112;REVB=0.0129408;RO=32;SAF=17;SAR=12;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376532;STB=0.521112;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00937836;OID=.;OPOS=48808898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:12:17:20:12:12:17:20:12 chr2 48809593 . G T 294.52 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.00804496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.154;QD=15.1035;RBI=0.0108834;REFB=-0.0207301;REVB=-0.00732981;RO=45;SAF=15;SAR=18;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236365;STB=0.632951;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0222545;OID=.;OPOS=48809593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:18:15:31:14:18:15:31:14 chr2 48822381 . G A 99.64 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0259138;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.525;QD=12.8562;RBI=0.0262041;REFB=-0.00459336;REVB=0.00388977;RO=20;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597874;STB=0.509788;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00773509;OID=.;OPOS=48822381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:31:20:19:12:12:0.387097:10:2:4:16:10:2:3:16 chr2 48825650 . C G 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0502009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2169;QD=14.6566;RBI=0.0539812;REFB=-0.00691251;REVB=0.0198454;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660375;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0197824;OID=.;OPOS=48825650;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:8:9:6:7:8:9 chr2 48873978 . A G 515.44 PASS AF=0.578313;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00337413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.2;QD=24.8403;RBI=0.0035199;REFB=0.0195541;REVB=-0.00100245;RO=35;SAF=27;SAR=21;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748886;STB=0.540941;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.0187364;OID=.;OPOS=48873978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:35:35:48:48:0.578313:21:27:23:12:21:27:23:12 chr2 48898798 . T A 2248.91 PASS AF=0.979592;AO=146;DP=147;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=92;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0162307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3032;QD=61.1948;RBI=0.0619276;REFB=-0.0251897;REVB=-0.0597628;RO=1;SAF=54;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514176;STB=0.506731;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000222369;OID=.;OPOS=48898798;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:147:147:1:3:146:144:0.979592:92:54:0:1:92:52:2:1 chr2 48915871 . A G 1377.4 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1894;QD=62.6092;RBI=0.0755096;REFB=0;REVB=0.0532764;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0007011;OID=.;OPOS=48915871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr2 48921375 . T C 1107.11 PASS AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0212106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.755;QD=57.5122;RBI=0.039843;REFB=-0.161016;REVB=0.033728;RO=2;SAF=44;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210203;STB=0.511108;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000686295;OID=.;OPOS=48921375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:31:44:2:0:31:44:2:0 chr2 50201110 . A G 1237.5 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2908;QD=61.1113;RBI=0.0606075;REFB=0;REVB=0.0502502;RO=0;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534576;OID=.;OPOS=50201110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:46:34:0:0:46:35:0:0 chr2 50724620 . C T 678.85 PASS AF=0.540984;AO=65;DP=124;FAO=66;FDP=122;FR=.;FRO=56;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.00398588;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=345.395;QD=22.2575;RBI=0.0156517;REFB=-0.0183924;REVB=0.0151356;RO=59;SAF=39;SAR=26;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246005;STB=0.50052;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.014733;OID=.;OPOS=50724620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:122:59:56:65:66:0.540984:26:39:37:22:26:40:34:22 chr2 50755733 . A AT,ATC 40.26 PASS AF=0.179487,0;AO=16,12;DP=119;FAO=21,0;FDP=117;FR=.;FRO=96;FSAF=2,0;FSAR=19,0;FSRF=52;FSRR=44;FWDB=-0.0110814,-0.00811516;FXX=0.0168053;HRUN=0,0;LEN=1,2;MLLD=113.594,126.497;QD=1.37636;RBI=0.0314295,0.0116687;REFB=-0.0032949,-0.00414057;REVB=-0.0294111,-0.00838471;RO=87;SAF=1,0;SAR=15,12;SRF=52;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.660638,-0.704089;STB=0.890231,0.5;STBP=0.001,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.17718,0;OID=.,.;OPOS=50755734,50755734;OREF=-,-;OALT=T,TC;OMAPALT=AT,ATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.179487,0:16,12:119:21,0:117:96:2,0:19,0:52:44:41:87:1,0:15,12:52:35 chr2 51125707 . C G 488.44 PASS AF=0.434109;AO=39;DP=111;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=-0.023443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7552;QD=15.1455;RBI=0.0502344;REFB=-0.0382805;REVB=0.0444288;RO=71;SAF=32;SAR=7;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277426;STB=0.524076;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0465039;OID=.;OPOS=51125707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:129:71:73:39:56:0.434109:7:32:45:26:23:33:46:27 chr2 52929680 . T C 2983.23 PASS AF=0.45858;AO=310;DP=677;FAO=310;FDP=676;FR=.;FRO=366;FSAF=172;FSAR=138;FSRF=152;FSRR=214;FWDB=8.69229e-05;FXX=0.00147708;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.518;QD=17.6523;RBI=0.0436713;REFB=-0.00493803;REVB=0.0436712;RO=364;SAF=172;SAR=138;SRF=151;SRR=213;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136744;STB=0.575202;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00464967;OID=.;OPOS=52929680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:677:676:364:366:310:310:0.45858:138:172:151:213:138:172:152:214 chr2 53992593 . A T 727.12 PASS AF=0.507143;AO=71;DP=140;FAO=71;FDP=140;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=-0.0375879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.037;QD=20.7748;RBI=0.0380981;REFB=-0.0308384;REVB=-0.0062139;RO=68;SAF=36;SAR=35;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098626;STB=0.550167;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0239301;OID=.;OPOS=53992593;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:68:69:71:71:0.507143:35:36:42:26:35:36:42:27 chr2 54035508 . G C 377.07 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0198923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.331;QD=13.9656;RBI=0.0494495;REFB=0.00339545;REVB=-0.0452719;RO=64;SAF=19;SAR=25;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606571;STB=0.503426;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.00604402;OID=.;OPOS=54035508;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:25:19:28:36:25:19:28:36 chr2 54081923 . T G 364.38 PASS AF=0.419355;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00210659;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.35;QD=15.6723;RBI=0.0122728;REFB=-0.00451628;REVB=-0.0120906;RO=52;SAF=19;SAR=20;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848912;STB=0.546437;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00566128;OID=.;OPOS=54081923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:52:54:39:39:0.419355:20:19:21:31:20:19:22:32 chr2 54115904 . A G 458.78 PASS AF=0.564103;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00145851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.97;QD=23.527;RBI=0.0256564;REFB=-0.0112228;REVB=-0.0256149;RO=34;SAF=32;SAR=12;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211428;STB=0.511623;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00877897;OID=.;OPOS=54115904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:44:44:0.564103:12:32:24:10:12:32:24:10 chr2 54120025 . A T 517.93 PASS AF=0.444444;AO=55;DP=125;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=0.00945461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.089;QD=16.4423;RBI=0.0145723;REFB=-0.0165787;REVB=-0.0110888;RO=70;SAF=32;SAR=23;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20866;STB=0.609827;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0159451;OID=.;OPOS=54120025;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:70:70:55:56:0.444444:23:32:26:44:24:32:26:44 chr2 54120820 . G A 766.33 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0381456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7115;QD=63.8607;RBI=0.0448529;REFB=0;REVB=-0.0235944;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000517066;OID=.;OPOS=54120820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0 chr2 54125495 . T C 172.22 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00246469;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.124;QD=12.5251;RBI=0.012949;REFB=-0.000797889;REVB=-0.0127123;RO=29;SAF=9;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192667;STB=0.597846;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00209521;OID=.;OPOS=54125495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:29:34:21:21:0.381818:12:9:18:11:12:9:20:14 chr2 54127041 . C T 1825.0 PASS AF=0.991736;AO=119;DP=121;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0302641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2675;QD=60.3305;RBI=0.0423392;REFB=0.0283258;REVB=-0.0296091;RO=0;SAF=61;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93668e-08;STB=0.504201;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.00333659;OID=.;OPOS=54127041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:121:0:1:119:120:0.991736:58:61:0:0:59:61:0:1 chr2 54150237 . A G 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.000599792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.806;QD=12.9138;RBI=0.00558924;REFB=-0.0138946;REVB=-0.00555696;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186589;STB=0.606958;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0202478;OID=.;OPOS=54150237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:14:10:22:15:14:10:22:15 chr2 54362645 . T C 162.69 PASS AF=0.514286;AO=11;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.135236;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=23.922;QD=18.593;RBI=0.196407;REFB=0.0188009;REVB=-0.142433;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320029;STB=0.519977;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.0123701;OID=.;OPOS=54362645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:10:16:11:18:0.514286:7:4:4:6:13:5:5:11 chr2 54482964 . C T 72.02 PASS AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00285426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.587;QD=8.23068;RBI=0.00338255;REFB=-0.00363405;REVB=0.00181516;RO=25;SAF=6;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488185;STB=0.530061;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00873662;OID=.;OPOS=54482964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:25:25:10:10:0.285714:4:6:16:9:4:6:16:9 chr2 54557360 . A G 373.63 PASS AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.041636;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.402;QD=15.2503;RBI=0.0443916;REFB=-0.0312734;REVB=0.0153967;RO=58;SAF=11;SAR=29;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288485;STB=0.664036;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0311629;OID=.;OPOS=54557360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:58:58:40:40:0.408163:29:11:31:27:29:11:31:27 chr2 54587596 . C T 101.26 PASS AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0223056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7826;QD=9.64355;RBI=0.0239827;REFB=0.00377134;REVB=0.00881079;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377811;STB=0.509211;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.0111246;OID=.;OPOS=54587596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:29:13:13:0.309524:7:6:12:16:7:6:13:16 chr2 54756652 . C T 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00424915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.229;QD=19.1804;RBI=0.0175023;REFB=0.00147154;REVB=-0.0169787;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201895;STB=0.615207;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.00302586;OID=.;OPOS=54756652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:7:4:8:5:7:4 chr2 54756740 . C T 227.12 PASS AF=0.8;AO=20;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.02177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.855;QD=36.3396;RBI=0.0399973;REFB=-0.0224817;REVB=0.0335537;RO=5;SAF=11;SAR=9;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933246;STB=0.55097;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0142807;OID=.;OPOS=54756740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:25:25:5:5:20:20:0.8:9:11:4:1:9:11:4:1 chr2 54858511 . C T 207.31 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0200391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.848;QD=24.3898;RBI=0.020319;REFB=-0.00850871;REVB=-0.00336082;RO=14;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168909;STB=0.594415;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00709991;OID=.;OPOS=54858511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:13:7:8:6:13:7:8:6 chr2 54858664 . C T 237.66 PASS AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0120564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.288;QD=18.6403;RBI=0.0530461;REFB=-0.024852;REVB=0.0516578;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142266;STB=0.588075;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.027526;OID=.;OPOS=54858664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:12:12:17:9:13:12:17:9 chr2 54872522 . G A 586.52 PASS AF=0.469231;AO=61;DP=130;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=0.00332251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.904;QD=18.0467;RBI=0.0114651;REFB=-0.0166488;REVB=0.0109731;RO=68;SAF=28;SAR=33;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669303;STB=0.533322;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0195371;OID=.;OPOS=54872522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:68:69:61:61:0.469231:33:28:36:32:33:28:36:33 chr2 54886347 . G A 629.84 PASS AF=0.594059;AO=60;DP=101;FAO=60;FDP=101;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-9.6018e-05;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.457;QD=24.944;RBI=0.0170518;REFB=-0.00410197;REVB=0.0170515;RO=38;SAF=31;SAR=29;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101297;STB=0.557858;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00261157;OID=.;OPOS=54886347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:38:41:60:60:0.594059:29:31:25:13:29:31:27:14 chr2 55040426 . A G 1414.8 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000964001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.022;QD=62.88;RBI=0.059365;REFB=0;REVB=0.0593571;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251448;OID=.;OPOS=55040426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:46:44:0:0:46:44:0:0 chr2 55155551 . C T 369.67 PASS AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0290422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.152;QD=22.404;RBI=0.0298892;REFB=-0.0370433;REVB=-0.00706497;RO=29;SAF=14;SAR=23;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141069;STB=0.577847;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.02578;OID=.;OPOS=55155551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:23:14:16:13:23:14:16:13 chr2 55186394 . A C 351.13 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0113922;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.31;QD=20.0643;RBI=0.0167084;REFB=0.00419522;REVB=0.0122225;RO=33;SAF=13;SAR=23;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848521;STB=0.541153;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.00356134;OID=.;OPOS=55186394;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:33:34:36:36:0.514286:23:13:15:18:23:13:15:19 chr2 55407754 . C T 710.02 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0456785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.664;QD=54.6168;RBI=0.0726766;REFB=-0.126337;REVB=0.0565275;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.513508;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00151952;OID=.;OPOS=55407754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:52:0:1:51:51:0.980769:33:18:0:0:33:18:1:0 chr2 55449412 . C A 269.92 PASS AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00504016;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.635;QD=14.0219;RBI=0.00505862;REFB=-0.0100914;REVB=0.00043182;RO=46;SAF=21;SAR=10;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217197;STB=0.624043;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0157546;OID=.;OPOS=55449412;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:10:21:22:24:10:21:22:24 chr2 55449464 . T C 972.88 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.378;QD=58.9626;RBI=0.0298256;REFB=0;REVB=0.0284715;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.79804e-05;OID=.;OPOS=55449464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:28:37:0:0:28:38:0:0 chr2 55516723 . C T 1066.86 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136482;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.705;QD=60.1048;RBI=0.0193178;REFB=0;REVB=-0.0192695;RO=0;SAF=20;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000982574;OID=.;OPOS=55516723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:51:20:0:0:51:20:0:0 chr2 55517287 . G A 350.39 PASS AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00414981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.726;QD=28.0315;RBI=0.017587;REFB=-0.0380935;REVB=0.0170904;RO=20;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0207821;OID=.;OPOS=55517287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:15:15:10:10:15:15:10:10 chr2 55522422 . A G 2293.03 PASS AF=1;AO=143;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.198;QD=63.6953;RBI=0.032872;REFB=0;REVB=0.0321517;RO=0;SAF=66;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14598e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06e-05;OID=.;OPOS=55522422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:143:144:1:77:66:0:0:78:66:0:0 chr2 55762957 . C T 825.52 PASS AF=0.399142;AO=93;DP=233;FAO=93;FDP=233;FR=.;FRO=140;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=62;FSRR=78;FWDB=-0.00267783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.16;QD=14.172;RBI=0.0531845;REFB=-0.0076677;REVB=-0.0531171;RO=140;SAF=47;SAR=46;SRF=62;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669085;STB=0.537531;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0131828;OID=.;OPOS=55762957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:140:140:93:93:0.399142:46:47:62:78:46:47:62:78 chr2 55771161 . A G 1661.69 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7772;QD=59.8806;RBI=0.0399646;REFB=0;REVB=0.00501883;RO=0;SAF=59;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60802e-05;OID=.;OPOS=55771161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:111:0:0:108:111:1:49:59:0:0:51:60:0:0 chr2 55805440 . T C 836.66 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117539;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.49;QD=57.7004;RBI=0.117603;REFB=0;REVB=-0.00387862;RO=0;SAF=14;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109095;OID=.;OPOS=55805440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:44:14:0:0:44:14:0:0 chr2 55883317 . G T 333.71 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0110247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.949;QD=21.8825;RBI=0.0117184;REFB=-0.0141331;REVB=0.00397222;RO=27;SAF=19;SAR=15;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236728;STB=0.630258;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0104006;OID=.;OPOS=55883317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:15:19:7:20:15:19:7:20 chr2 55912120 . T C 79.37 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0456501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.32;QD=15.8747;RBI=0.110903;REFB=-0.0271975;REVB=0.101072;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873356;STB=0.550917;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.027184;OID=.;OPOS=55912120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:5:5:4:6:5:5 chr2 56093521 . A G 489.6 PASS AF=0.575;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0548691;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.959;QD=24.4799;RBI=0.0554581;REFB=-0.0367598;REVB=-0.00806118;RO=34;SAF=24;SAR=22;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168679;STB=0.509245;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0203451;OID=.;OPOS=56093521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:34:34:46:46:0.575:22:24:17:17:22:24:17:17 chr2 56411817 . C T 95.33 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00891017;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.416;QD=34.6655;RBI=0.0386473;REFB=-0.0508167;REVB=0.0376062;RO=1;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990155;STB=0.555443;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00881535;OID=.;OPOS=56411817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:4:6:0:1:4:6:0:1 chr2 56411909 . G A 93.8 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.015527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4111;QD=10.141;RBI=0.0749426;REFB=0.0033201;REVB=0.0733164;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932106;STB=0.570018;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.00361237;OID=.;OPOS=56411909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:36:37:24:25:12:12:0.324324:5:7:12:12:5:7:12:13 chr2 58316814 . A G 990.6 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.999;QD=59.1404;RBI=0.0178874;REFB=0;REVB=0.0143191;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00398e-05;OID=.;OPOS=58316814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0 chr2 60614572 . G A 370.3 PASS AF=0.731707;AO=30;DP=41;FAO=30;FDP=41;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0152493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.149;QD=36.1271;RBI=0.0158209;REFB=-0.00765147;REVB=0.00421399;RO=10;SAF=13;SAR=17;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156494;STB=0.519122;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00200726;OID=.;OPOS=60614572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:41:10:11:30:30:0.731707:17:13:4:6:17:13:4:7 chr2 60614577 . A G 361.99 PASS AF=0.74359;AO=29;DP=41;FAO=29;FDP=39;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00696981;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.468;QD=37.1272;RBI=0.008845;REFB=-0.00907541;REVB=0.00544571;RO=12;SAF=13;SAR=16;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06281;STB=0.565174;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00479553;OID=.;OPOS=60614577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:41:39:12:10:29:29:0.74359:16:13:4:8:16:13:2:8 chr2 60687959 . A G 1062.41 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00204495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.678;QD=59.8541;RBI=0.0080262;REFB=0;REVB=0.00776132;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12828e-05;OID=.;OPOS=60687959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0 chr2 60689441 . T C 470.96 PASS AF=0.436975;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.00920973;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.173;QD=15.8304;RBI=0.0142428;REFB=-0.0122572;REVB=0.0108646;RO=67;SAF=32;SAR=20;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140839;STB=0.578917;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0144979;OID=.;OPOS=60689441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:67:67:52:52:0.436975:20:32:32:35:20:32:32:35 chr2 60867976 . C T 785.56 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.038;QD=64.1271;RBI=0.047274;REFB=0;REVB=0.0385221;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793516;OID=.;OPOS=60867976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0 chr2 61304271 . A G 112.22 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00974379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.9818;QD=16.6254;RBI=0.0269277;REFB=0.00725551;REVB=0.025103;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508418;STB=0.529366;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.00518363;OID=.;OPOS=61304271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:5:9:9:4:5:9 chr2 61315632 . ATTTTTG ATTTTG,ATTTTGT 315.36 PASS AF=0.802632,0;AO=39,8;DP=76;FAO=61,0;FDP=76;FR=.;FRO=15;FSAF=25,0;FSAR=36,0;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00820003,-0.0231482;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=9.07777,10.6573;QD=16.5977;RBI=0.253585,0.0236801;REFB=0.0192459,0.0728098;REVB=0.253452,0.00499034;RO=23;SAF=23,0;SAR=16,8;SRF=5;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.24903,-0.685324;STB=0.529508,0.5;STBP=0.298,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0903272,0;OID=.,.;OPOS=61315633,61315637;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=ATTTTG,ATTTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.802632,0:39,8:76:61,0:76:15:25,0:36,0:4:11:29:23:23,0:16,8:5:18 chr2 61389995 . TAA T 67.92 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0471707;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=41.0512;QD=10.0626;RBI=0.0480685;REFB=-0.0334903;REVB=-0.0092468;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129419;STB=0.575628;STBP=0.583;TYPE=del;VARB=0.0497963;OID=.;OPOS=61389996;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407407:11:27:11:27:16:7:4:12:4:67:16:7:4:12:4 chr2 61450454 . A G 1163.44 PASS AF=0.975;AO=76;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0142582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.675;QD=58.1721;RBI=0.0194766;REFB=-0.0458874;REVB=0.0132681;RO=1;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119796;STB=0.500642;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00388137;OID=.;OPOS=61450454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:80:80:1:2:76:78:0.975:39:37:0:1:41:37:1:1 chr2 61522123 . T C 1152.51 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8431;QD=60.6584;RBI=0.0559971;REFB=0;REVB=0.0149977;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000645748;OID=.;OPOS=61522123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:37:37:0:0:39:37:0:0 chr2 61575308 . A G 920.08 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.458;QD=58.4176;RBI=0.0281147;REFB=0;REVB=0.00381348;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010264;OID=.;OPOS=61575308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0 chr2 61577435 . T C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.469;QD=63.583;RBI=0.0416035;REFB=0;REVB=0.0362874;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18108e-05;OID=.;OPOS=61577435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr2 62066927 . A G 1229.6 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259095;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3126;QD=61.4799;RBI=0.0355087;REFB=0;REVB=0.024281;RO=0;SAF=53;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8145e-05;OID=.;OPOS=62066927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:27:53:0:0:27:53:0:0 chr2 62081012 . A C 905.8 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261963;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.811;QD=58.4385;RBI=0.0291504;REFB=0;REVB=0.0127865;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.83616e-05;OID=.;OPOS=62081012;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:38:24:0:0:38:24:0:0 chr2 62450631 . A G 326.2 PASS AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0506552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0724;QD=20.0737;RBI=0.0911164;REFB=-0.0048385;REVB=0.075738;RO=31;SAF=17;SAR=17;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152821;STB=0.584567;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00620045;OID=.;OPOS=62450631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:17:17:10:21:17:17:10:21 chr2 62450743 . T C 736.75 PASS AF=0.496552;AO=72;DP=146;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=0.000903759;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.043;QD=20.3241;RBI=0.0464805;REFB=-0.000611929;REVB=0.0464717;RO=72;SAF=37;SAR=35;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138371;STB=0.572254;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.000578935;OID=.;OPOS=62450743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:72:73:72:72:0.496552:35:37:26:46:35:37:27:46 chr2 62451422 . A G 124.25 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.00290992;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.093;QD=16.0328;RBI=0.0252036;REFB=-0.0247006;REVB=0.025035;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00971003;STB=0.50561;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0251353;OID=.;OPOS=62451422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:31:17:17:14:14:0.451613:10:4:5:12:10:4:5:12 chr2 62729674 . T C 1087.69 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00113349;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.685;QD=60.4273;RBI=0.0649751;REFB=0;REVB=0.0649652;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131286;OID=.;OPOS=62729674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:32:40:0:0:32:40:0:0 chr2 62738931 . G C 1033.72 PASS AF=0.985915;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00340342;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.594;QD=58.2377;RBI=0.020014;REFB=-0.104674;REVB=-0.0197225;RO=1;SAF=40;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116725;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000598703;OID=.;OPOS=62738931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:69:70:0.985915:29:40:1:0:30:40:1:0 chr2 63849491 . T C 1785.81 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00152657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.739;QD=61.0534;RBI=0.0352582;REFB=0;REVB=0.0352252;RO=0;SAF=65;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07798e-05;OID=.;OPOS=63849491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:52:65:0:0:52:65:0:0 chr2 64069732 . G A 406.29 PASS AF=1;AO=25;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.7782;QD=56.0402;RBI=0.0518988;REFB=0;REVB=0.0331615;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133544;OID=.;OPOS=64069732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:25:29:1:16:9:0:0:20:9:0:0 chr2 64321823 . A G 57.64 PASS AF=0.191489;AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0177314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6812;QD=4.90515;RBI=0.0792657;REFB=-0.0161773;REVB=-0.077257;RO=37;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313607;STB=0.707362;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0886532;OID=.;OPOS=64321823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:47:47:37:38:9:9:0.191489:4:5:11:26:4:5:11:27 chr2 64327544 . G T 310.65 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00133573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.853;QD=16.3499;RBI=0.0352638;REFB=-0.00152468;REVB=-0.0352385;RO=42;SAF=22;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126627;STB=0.571386;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00152304;OID=.;OPOS=64327544;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:12:22:22:20:12:22:22:20 chr2 64327592 . T C 384.1 PASS AF=0.47619;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.000752043;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0084;QD=18.2903;RBI=0.0526724;REFB=3.15203e-05;REVB=0.052667;RO=42;SAF=23;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128527;STB=0.576884;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00178518;OID=.;OPOS=64327592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:42:44:39:40:0.47619:16:23:19:23:16:24:20:24 chr2 64779509 . G A 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.00735322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.631;QD=13.0148;RBI=0.00968392;REFB=-0.00330791;REVB=0.00630147;RO=32;SAF=6;SAR=14;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156846;STB=0.509082;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0051604;OID=.;OPOS=64779509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:14:6:10:22:14:6:10:22 chr2 64796817 . A C 378.04 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0135975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4661;QD=18.9021;RBI=0.0289768;REFB=-0.0108462;REVB=0.0255884;RO=41;SAF=24;SAR=15;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12;STB=0.566894;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0123782;OID=.;OPOS=64796817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:15:24:20:21:15:24:20:21 chr2 65044680 . C T 1179.05 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.656;QD=60.4639;RBI=0.0224912;REFB=0;REVB=0.0126776;RO=0;SAF=26;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165471;OID=.;OPOS=65044680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:51:26:0:0:52:26:0:0 chr2 65217089 . G C 270.04 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00422064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.656;QD=22.9824;RBI=0.0137643;REFB=-0.00922551;REVB=0.0131012;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233566;STB=0.63015;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00823614;OID=.;OPOS=65217089;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:15:10:15:7:15:10:15:7 chr2 65311555 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.216;QD=55.098;RBI=0.0223197;REFB=0;REVB=-0.00263534;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.79518e-05;OID=.;OPOS=65311555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr2 65495887 . G A 923.9 PASS AF=0.535714;AO=90;DP=170;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.00892768;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.189;QD=21.9977;RBI=0.0244142;REFB=-0.0125611;REVB=0.0227233;RO=78;SAF=50;SAR=40;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047459;STB=0.52596;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0111348;OID=.;OPOS=65495887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:168:78:78:90:90:0.535714:40:50:39:39:40:50:39:39 chr2 65496018 . C G 1541.01 PASS AF=1;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222843;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.776;QD=59.8451;RBI=0.00261618;REFB=0;REVB=-0.00137059;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526535;OID=.;OPOS=65496018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:103:0:0:102:103:1:57:45:0:0:58:45:0:0 chr2 65496144 . A G 1396.13 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.033;QD=62.7475;RBI=0.0349382;REFB=0;REVB=0.0220219;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270645;OID=.;OPOS=65496144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:44:45:0:0:44:45:0:0 chr2 65496187 . G A 1080.51 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5229;QD=60.0286;RBI=0.0382606;REFB=0;REVB=0.0197429;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35563e-05;OID=.;OPOS=65496187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:32:40:0:0:32:40:0:0 chr2 65497571 . C A 718.1 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.942;QD=62.4437;RBI=0.0514224;REFB=0;REVB=0.00176888;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139587;OID=.;OPOS=65497571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:20:25:0:0:21:25:0:0 chr2 65540905 . C G 1130.38 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.287;QD=60.287;RBI=0.0218325;REFB=0;REVB=-0.00807339;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92731e-06;OID=.;OPOS=65540905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:35:38:0:0:35:40:0:0 chr2 65561392 . C T 445.9 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.813;QD=57.5353;RBI=0.0529383;REFB=0;REVB=0.0287698;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172494;OID=.;OPOS=65561392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:22:8:0:0:23:8:0:0 chr2 67630980 . G A 141.93 PASS AF=0.322034;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0361327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8925;QD=9.62214;RBI=0.0437611;REFB=-0.0139729;REVB=-0.0246874;RO=40;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625928;STB=0.537031;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0192317;OID=.;OPOS=67630980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:40:40:19:19:0.322034:11:8:19:21:11:8:19:21 chr2 67631831 . G A 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0206323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.25;QD=21.1723;RBI=0.0385589;REFB=0.00808098;REVB=0.0325745;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124999;STB=0.571306;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.00361511;OID=.;OPOS=67631831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:8:4:4:4:8:4:4:4 chr2 67632125 . C T 348.62 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0296336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4978;QD=17.4311;RBI=0.0304047;REFB=0.0197368;REVB=-0.00680406;RO=43;SAF=19;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464228;STB=0.525982;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=-0.022655;OID=.;OPOS=67632125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:18:19:20:23:18:19:20:23 chr2 68270068 . A G 550.44 PASS AF=0.513514;AO=56;DP=111;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0165495;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.239;QD=19.8357;RBI=0.0184694;REFB=0.00437961;REVB=0.00819956;RO=49;SAF=41;SAR=15;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246905;STB=0.647684;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00146105;OID=.;OPOS=68270068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:49:54:56:57:0.513514:15:41:23:26:15:42:25:29 chr2 68385097 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.354;QD=53.9109;RBI=0.027427;REFB=0;REVB=-0.00217536;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242471;OID=.;OPOS=68385097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:20:4:0:0:20:4:0:0 chr2 68388823 . A G 1549.25 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00190171;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.0789;QD=63.8866;RBI=0.00858765;REFB=0;REVB=-0.00837444;RO=0;SAF=40;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.07489e-05;OID=.;OPOS=68388823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:57:40:0:0:57:40:0:0 chr2 68407926 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.542;QD=55.6561;RBI=0.0198463;REFB=0;REVB=-0.000232051;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019947;OID=.;OPOS=68407926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr2 68415767 . G A 1552.57 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019119;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.951;QD=64.0236;RBI=0.0193861;REFB=0;REVB=-0.00320737;RO=0;SAF=37;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.7108e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.0966e-05;OID=.;OPOS=68415767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:60:37:0:0:60:37:0:0 chr2 68511584 . A G 62.87 PASS AF=0.346154;AO=8;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0157955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.637;QD=9.6723;RBI=0.0246388;REFB=-0.0145258;REVB=0.0189095;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136257;STB=0.608434;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0473579;OID=.;OPOS=68511584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:25:26:17:17:8:9:0.346154:6:2:6:11:7:2:6:11 chr2 68607947 . G T 755.97 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00892244;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.367;QD=57.0541;RBI=0.0132319;REFB=0;REVB=0.00977102;RO=0;SAF=15;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.46935e-05;OID=.;OPOS=68607947;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:38:15:0:0:38:15:0:0 chr2 68622914 . G A 795.59 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.416;QD=63.6469;RBI=0.0260169;REFB=0;REVB=0.0175894;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254097;OID=.;OPOS=68622914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:32:17:0:0:33:17:0:0 chr2 68873071 . A G 493.03 PASS AF=0.439024;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=123;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0057219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.284;QD=16.0335;RBI=0.0103362;REFB=-0.00443411;REVB=0.0086079;RO=69;SAF=32;SAR=22;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430653;STB=0.524095;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00573804;OID=.;OPOS=68873071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:69:69:54:54:0.439024:22:32:38:31:22:32:38:31 chr2 68882468 . T C 314.68 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0222689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.767;QD=16.3469;RBI=0.0260583;REFB=-0.0241382;REVB=-0.0135326;RO=35;SAF=19;SAR=15;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408235;STB=0.571717;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0307954;OID=.;OPOS=68882468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:35:42:34:34:0.441558:15:19:18:17:15:19:18:24 chr2 68882661 . A G 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0154735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.039;QD=18.4834;RBI=0.0250427;REFB=0.0106027;REVB=-0.0196903;RO=21;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14704;STB=0.583694;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00738703;OID=.;OPOS=68882661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:12:7:11:10:12:7:11:10 chr2 69002760 . C T 191.92 PASS AF=0.512821;AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00356048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.809;QD=19.6837;RBI=0.0168237;REFB=-0.0159242;REVB=-0.0164426;RO=19;SAF=14;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210822;STB=0.593123;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0126652;OID=.;OPOS=69002760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:19:19:19:20:0.512821:5:14:10:9:6:14:10:9 chr2 69049941 . T C 324.41 PASS AF=0.58;AO=27;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0235737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.33;QD=25.9525;RBI=0.0248677;REFB=-0.019864;REVB=0.0079172;RO=20;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908287;STB=0.542907;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0224245;OID=.;OPOS=69049941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:21:27:29:0.58:13:14:8:12:15:14:8:13 chr2 69093312 . A G 219.85 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0133866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.881;QD=17.5878;RBI=0.0168185;REFB=-0.00650022;REVB=-0.0101814;RO=28;SAF=7;SAR=15;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319104;STB=0.681653;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00836971;OID=.;OPOS=69093312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:15:7:18:10:15:7:18:10 chr2 69173570 . C T 401.66 PASS AF=0.394958;AO=47;DP=119;FAO=47;FDP=119;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0299707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.715;QD=13.5012;RBI=0.0314634;REFB=-0.0143066;REVB=-0.00957609;RO=72;SAF=24;SAR=23;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100344;STB=0.556721;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0198699;OID=.;OPOS=69173570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:72:72:47:47:0.394958:23:24:30:42:23:24:30:42 chr2 69204629 . T C 418.89 PASS AF=0.382812;AO=49;DP=128;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=0.0160009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.867;QD=13.0902;RBI=0.0164991;REFB=-0.00337112;REVB=0.00402404;RO=79;SAF=32;SAR=17;SRF=39;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178818;STB=0.601739;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00466294;OID=.;OPOS=69204629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:79:79:49:49:0.382812:17:32:39:40:17:32:39:40 chr2 69204671 . A T 534.91 PASS AF=0.406667;AO=61;DP=152;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.0180125;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.979;QD=14.2642;RBI=0.0204192;REFB=-0.0259279;REVB=-0.00961731;RO=91;SAF=36;SAR=25;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125837;STB=0.577176;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0425086;OID=.;OPOS=69204671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:150:91:89:61:61:0.406667:25:36:43:48:25:36:41:48 chr2 69300243 . G A 573.12 PASS AF=0.540816;AO=49;DP=96;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00525154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.654;QD=23.3925;RBI=0.0143329;REFB=-0.00581608;REVB=0.0133361;RO=45;SAF=20;SAR=29;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713649;STB=0.53447;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00586031;OID=.;OPOS=69300243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:45:45:49:53:0.540816:29:20:22:23:31:22:22:23 chr2 69362161 . C T 1187.68 PASS AF=0.489627;AO=118;DP=241;FAO=118;FDP=241;FR=.;FRO=123;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=0.00397708;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.208;QD=19.7125;RBI=0.0127296;REFB=-0.0175218;REVB=-0.0120924;RO=120;SAF=58;SAR=60;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154275;STB=0.514693;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0179932;OID=.;OPOS=69362161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:120:123:118:118:0.489627:60:58:61:59:60:58:64:59 chr2 69693006 . C T 179.19 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0305108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.678;QD=22.3989;RBI=0.0358683;REFB=-0.0681372;REVB=0.018858;RO=9;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077407;STB=0.5999;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0304306;OID=.;OPOS=69693006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:9:14:18:18:0.5625:6:12:7:2:6:12:12:2 chr2 69698158 . G A 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00938915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.246;QD=13.9482;RBI=0.0187239;REFB=-0.0217052;REVB=-0.0161996;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205747;STB=0.618914;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0189786;OID=.;OPOS=69698158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:9:8:18:9:9:8:18:9 chr2 69702628 . C T 457.05 PASS AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.011429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.89;QD=23.1417;RBI=0.0155459;REFB=0.00353477;REVB=0.0105383;RO=35;SAF=17;SAR=27;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105659;STB=0.558154;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.00383425;OID=.;OPOS=69702628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:27:17:18:17:27:17:18:17 chr2 69741753 . CTGTTGTTGT CTGTTGT,CTGTTGTTGC 173.92 PASS AF=0.363636,0.0681818;AO=16,3;DP=47;FAO=16,3;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10,1;FSAR=6,2;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0144927,0.0100468;FXX=0.0222173;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=116.326,118.611;QD=15.8104;RBI=0.0474274,0.0747696;REFB=-0.0259176,-0.0241868;REVB=-0.0451589,-0.0740915;RO=26;SAF=10,1;SAR=6,2;SRF=17;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0329583,-0.330599;STB=0.536379,0.781034;STBP=0.743,0.457;TYPE=del,snp;VARB=0.0354186,0.0676103;OID=.,.;OPOS=69741754,69741762;OREF=TGT,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTGTTGT,CTGTTGTTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636,0.0681818:16,3:47:16,3:44:25:10,1:6,2:17:8:99:26:10,1:6,2:17:9 chr2 69741854 . T G 955.2 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.216;QD=58.7816;RBI=0.0309411;REFB=0;REVB=0.0254654;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78357e-05;OID=.;OPOS=69741854;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:35:29:0:0:36:29:0:0 chr2 70015181 . C T 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.23;QD=62.9828;RBI=0.0144239;REFB=0;REVB=0.0140036;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41377e-05;OID=.;OPOS=70015181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:30:15:0:0:30:15:0:0 chr2 70162534 . T G 1116.03 PASS AF=0.962025;AO=79;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0471703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5458;QD=56.5076;RBI=0.0717989;REFB=0.016133;REVB=0.0541299;RO=0;SAF=24;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514015;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000183683;OID=.;OPOS=70162534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:79:79:0:3:79:76:0.962025:55:24:0:0:52:24:0:3 chr2 70476198 . G A 1024.21 PASS AF=0.432;AO=107;DP=249;FAO=108;FDP=250;FR=.;FRO=142;FSAF=26;FSAR=82;FSRF=41;FSRR=101;FWDB=-0.00113819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.612;QD=16.3873;RBI=0.00694794;REFB=0.0010626;REVB=0.00685408;RO=141;SAF=26;SAR=81;SRF=40;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545803;STB=0.535889;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00131797;OID=.;OPOS=70476198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:141:142:107:108:0.432:81:26:40:101:82:26:41:101 chr2 70485320 . C T 467.17 PASS AF=0.433333;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=120;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0350027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6164;QD=15.5724;RBI=0.104344;REFB=-0.0221068;REVB=0.0982983;RO=68;SAF=33;SAR=19;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125539;STB=0.570451;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0314819;OID=.;OPOS=70485320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:68:68:52:52:0.433333:19:33:35:33:19:33:35:33 chr2 70528601 . T C 132.71 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00795508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.35;QD=15.1663;RBI=0.0117382;REFB=-0.0261342;REVB=0.0086314;RO=20;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165407;STB=0.509566;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0283882;OID=.;OPOS=70528601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:7:8:11:9:7:8:11:9 chr2 70677994 . G A 225.2 PASS AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.013979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.439;QD=15.2681;RBI=0.0139843;REFB=-0.0168009;REVB=0.000386062;RO=33;SAF=17;SAR=9;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172553;STB=0.598028;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0260862;OID=.;OPOS=70677994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:9:17:16:17:9:17:16:17 chr2 71012604 . G A 2166.78 PASS AF=1;AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466073;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9032;QD=63.2636;RBI=0.0507057;REFB=0;REVB=-0.0199707;RO=0;SAF=64;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016096;OID=.;OPOS=71012604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:137:0:0:137:137:1:73:64:0:0:73:64:0:0 chr2 71012734 . C G 543.95 PASS AF=0.973684;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0253593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.546;QD=57.258;RBI=0.0309252;REFB=-0.00319162;REVB=-0.0176995;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.001303;OID=.;OPOS=71012734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:38:0:1:36:37:0.973684:17:19:0:0:17:20:1:0 chr2 71058230 . T A 469.88 PASS AF=0.436975;AO=51;DP=118;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0116162;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.959;QD=15.7943;RBI=0.0157727;REFB=-0.00973884;REVB=-0.0106697;RO=66;SAF=29;SAR=22;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999554;STB=0.564544;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0148233;OID=.;OPOS=71058230;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:66:67:51:52:0.436975:22:29:31:35:22:30:31:36 chr2 71058306 . T C 409.13 PASS AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.0167838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.857;QD=17.9838;RBI=0.0210102;REFB=-0.00649658;REVB=-0.0126386;RO=49;SAF=25;SAR=17;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217594;STB=0.621383;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0131193;OID=.;OPOS=71058306;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:49:49:42:42:0.461538:17:25:18:31:17:25:18:31 chr2 71058835 . A G 536.43 PASS AF=0.555556;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0148367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.442;QD=23.8415;RBI=0.0692396;REFB=0.000795247;REVB=-0.0676314;RO=40;SAF=28;SAR=22;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109288;STB=0.559976;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.000231422;OID=.;OPOS=71058835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:40:40:50:50:0.555556:22:28:17:23:22:28:17:23 chr2 71058906 . G T 561.56 PASS AF=0.547368;AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0245686;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.081;QD=23.6446;RBI=0.0534699;REFB=-0.00258271;REVB=-0.0474912;RO=42;SAF=29;SAR=23;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105109;STB=0.552473;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00169856;OID=.;OPOS=71058906;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:42:43:52:52:0.547368:23:29:18:24:23:29:19:24 chr2 71060037 . A G 178.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0147799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4798;QD=14.8516;RBI=0.016548;REFB=-0.0370895;REVB=0.00744261;RO=29;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997143;STB=0.557463;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0394032;OID=.;OPOS=71060037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:9:10:18:11:9:10:18:11 chr2 71061001 . T A 489.19 PASS AF=0.52809;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00334258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.71;QD=21.9862;RBI=0.0137974;REFB=-0.0402804;REVB=-0.0133864;RO=41;SAF=24;SAR=23;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426253;STB=0.517465;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0445522;OID=.;OPOS=71061001;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:41:42:47:47:0.52809:23:24:23:18:23:24:23:19 chr2 71061051 . C T 276.15 PASS AF=0.516667;AO=24;DP=54;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0123982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.137;QD=18.4098;RBI=0.0165664;REFB=-0.011731;REVB=0.0109878;RO=24;SAF=16;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228217;STB=0.61396;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00727987;OID=.;OPOS=71061051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:60:24:29:24:31:0.516667:8:16:10:14:11:20:12:17 chr2 71061108 . G A 199.75 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00566735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1721;QD=19.9746;RBI=0.00852722;REFB=0.0243242;REVB=-0.00637139;RO=20;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183706;STB=0.602996;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.0257717;OID=.;OPOS=71061108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:9:11:15:5:9:11:15:5 chr2 71062833 . G GC 734.01 PASS AF=1;AO=60;DP=67;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773269;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.4095;QD=45.8759;RBI=0.103045;REFB=0;REVB=0.0681087;RO=5;SAF=22;SAR=38;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959279;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00278388;OID=.;OPOS=71062834;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:60:67:64:64:0:24:40:0:0:14:5:22:38:5:0 chr2 71160076 . T G 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.00124714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.031;QD=14.7423;RBI=0.00704746;REFB=-0.00889982;REVB=-0.00693623;RO=25;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848166;STB=0.54884;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.013013;OID=.;OPOS=71160076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:11:6:7:18:11:6:7:18 chr2 71163086 . T C 166.03 PASS AF=0.514286;AO=16;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0228036;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0767;QD=18.9745;RBI=0.0239178;REFB=-0.0549732;REVB=0.00721519;RO=16;SAF=12;SAR=4;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509793;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0934617;OID=.;OPOS=71163086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:16:17:16:18:0.514286:4:12:12:4:5:13:12:5 chr2 71170807 . C T 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0409928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.73;QD=11.0924;RBI=0.0432329;REFB=0.0155866;REVB=0.0137357;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370384;STB=0.713717;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.0217877;OID=.;OPOS=71170807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:0:6:4:1:0:6 chr2 71221822 . A G 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.0555311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.748;QD=13.4558;RBI=0.0555506;REFB=-0.0309694;REVB=0.00147381;RO=15;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780997;STB=0.545377;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.051339;OID=.;OPOS=71221822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:10:1:1:14:10:1:1:14 chr2 71273543 . C T 988.01 PASS AF=0.492386;AO=97;DP=197;FAO=97;FDP=197;FR=.;FRO=100;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=0.011586;FXX=0.00505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.9;QD=20.0611;RBI=0.0125847;REFB=-0.0229664;REVB=0.00491322;RO=96;SAF=49;SAR=48;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329511;STB=0.522908;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0253637;OID=.;OPOS=71273543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:96:100:97:97:0.492386:48:49:45:51:48:49:46:54 chr2 71305456 . C T 726.47 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.62;QD=63.1712;RBI=0.0162759;REFB=0;REVB=0.0154345;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17103e-05;OID=.;OPOS=71305456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:26:19:0:0:27:19:0:0 chr2 71360282 . G A 190.26 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00200617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6352;QD=21.7442;RBI=0.0477511;REFB=-0.00911679;REVB=-0.0477089;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809189;STB=0.545407;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0141239;OID=.;OPOS=71360282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:10:9:6:10:10:9:6:10 chr2 71365805 . A G 344.12 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0292273;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7291;QD=18.1113;RBI=0.0293116;REFB=0.0113241;REVB=-0.00222098;RO=40;SAF=9;SAR=27;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116626;STB=0.565535;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.0150282;OID=.;OPOS=71365805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:76:40:40:36:36:0.473684:27:9:14:26:27:9:14:26 chr2 71366957 . C A 65.31 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0156663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.283;QD=10.8847;RBI=0.0264814;REFB=-0.0135252;REVB=-0.0213501;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232278;STB=0.513987;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.018882;OID=.;OPOS=71366957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:5:4:7:8:5:4:7:8 chr2 71415479 . T C 313.31 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0374578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.919;QD=50.1295;RBI=0.0723132;REFB=-0.0802137;REVB=-0.0618555;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280951;STB=0.515139;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00200899;OID=.;OPOS=71415479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:16:8:0:1:16:8:0:1 chr2 71417065 . G T 819.23 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018262;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.996;QD=56.4983;RBI=0.0228894;REFB=0;REVB=-0.0137995;RO=0;SAF=37;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116314;OID=.;OPOS=71417065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:58:0:0:56:58:1:19:37:0:0:19:39:0:0 chr2 71417134 . C T 107.16 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0179303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6657;QD=22.5595;RBI=0.0247883;REFB=0.0540047;REVB=-0.0171162;RO=7;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463935;STB=0.526272;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.0320034;OID=.;OPOS=71417134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:6:6:4:3:6:6:4:3 chr2 71615534 . C T 157.12 PASS AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0144769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.195;QD=9.66873;RBI=0.0282139;REFB=-0.00439375;REVB=0.0242166;RO=43;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948139;STB=0.561587;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00887926;OID=.;OPOS=71615534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:44:21:21:0.323077:12:9:15:28:12:9:15:29 chr2 71615571 . C T 814.67 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0451;QD=56.1844;RBI=0.0355013;REFB=0;REVB=-0.00751122;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166147;OID=.;OPOS=71615571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:58:0:0:56:58:1:36:20:0:0:37:21:0:0 chr2 71620563 . A G 315.85 PASS AF=0.416667;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00448034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.586;QD=15.0403;RBI=0.00448097;REFB=-0.00688188;REVB=7.54159e-05;RO=49;SAF=13;SAR=22;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266365;STB=0.650453;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00809653;OID=.;OPOS=71620563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:49:49:35:35:0.416667:22:13:31:18:22:13:31:18 chr2 71631109 . A G 322.44 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0125911;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.251;QD=19.5419;RBI=0.013302;REFB=-0.00788232;REVB=-0.00429062;RO=32;SAF=23;SAR=11;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341425;STB=0.689484;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.01559;OID=.;OPOS=71631109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:11:23:9:23:11:23:9:23 chr2 71635324 . A G 446.05 PASS AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0162664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.803;QD=20.7466;RBI=0.020808;REFB=-0.0192288;REVB=-0.0129761;RO=42;SAF=20;SAR=24;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821044;STB=0.545434;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0205768;OID=.;OPOS=71635324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:42:42:44:44:0.511628:24:20:23:19:24:20:23:19 chr2 71654175 . G A 2626.77 PASS AF=0.994152;AO=169;DP=172;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=87;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00845989;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.938;QD=61.445;RBI=0.0200203;REFB=0.00742176;REVB=0.0181451;RO=0;SAF=86;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91779e-08;STB=0.502857;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=2.38507e-05;OID=.;OPOS=71654175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:172:171:0:1:169:170:0.994152:83:86:0:0:83:87:1:0 chr2 71654450 . A G 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0200888;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=313.884;QD=21.7444;RBI=0.0218196;REFB=0.00631814;REVB=0.0085167;RO=11;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187356;STB=0.604195;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.0046996;OID=.;OPOS=71654450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:11:4:1:10:11:4:1:10 chr2 71658541 . C T 253.17 PASS AF=0.323232;AO=32;DP=99;FAO=32;FDP=99;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0601604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5444;QD=10.229;RBI=0.0626931;REFB=-0.0243283;REVB=-0.0176394;RO=67;SAF=12;SAR=20;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139323;STB=0.581344;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0501727;OID=.;OPOS=71658541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:67:67:32:32:0.323232:20:12:33:34:20:12:33:34 chr2 71755476 . G A 479.94 PASS AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.000869184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.611;QD=18.2833;RBI=0.00472082;REFB=-0.0213532;REVB=-0.00464011;RO=53;SAF=29;SAR=22;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200399;STB=0.516477;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0239075;OID=.;OPOS=71755476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:53:54:51:51:0.485714:22:29:29:24:22:29:29:25 chr2 71795152 . A T 1049.08 PASS AF=0.467532;AO=108;DP=232;FAO=108;FDP=231;FR=.;FRO=123;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=50;FSRR=73;FWDB=-0.00684193;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1867;QD=18.1658;RBI=0.0247277;REFB=-0.0219499;REVB=-0.0237623;RO=122;SAF=51;SAR=57;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603819;STB=0.535232;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0302909;OID=.;OPOS=71795152;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:122:123:108:108:0.467532:57:51:50:72:57:51:50:73 chr2 71838597 . C A 400.34 PASS AF=0.424242;AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0294427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.202;QD=16.1754;RBI=0.0309937;REFB=-0.0159119;REVB=0.00968189;RO=57;SAF=14;SAR=28;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186967;STB=0.605582;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0306403;OID=.;OPOS=71838597;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:57:57:42:42:0.424242:28:14:29:28:28:14:29:28 chr2 72692272 . A AAG 955.88 PASS AF=1;AO=62;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699992;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=2;MLLD=245.525;QD=58.8234;RBI=0.0275625;REFB=0;REVB=0.0266588;RO=4;SAF=27;SAR=35;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748468;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=2.73748e-05;OID=.;OPOS=72692273;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=AAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:62:67:65:65:0:28:37:0:0:5:4:27:35:2:2 chr2 73137102 . AG GA 44.64 PASS AF=0.35;AO=5;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0895829;FXX=0;HRUN=16;LEN=2;MLLD=28.6278;QD=8.92758;RBI=0.0941646;REFB=-0.122356;REVB=0.0290151;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347085;STB=0.50767;STBP=0.993;TYPE=mnp;VARB=-0.0159474;OID=.;OPOS=73137102;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:20:20:10:12:5:7:0.35:4:1:5:5:4:3:5:7 chr2 73339708 . G A 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295727;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.856;QD=58.0605;RBI=0.0307031;REFB=0;REVB=0.00825432;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37057e-05;OID=.;OPOS=73339708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0 chr2 73485858 . T G 327.9 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0255504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5945;QD=20.4936;RBI=0.0436717;REFB=-0.0382687;REVB=0.0354174;RO=29;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158074;STB=0.57808;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.036236;OID=.;OPOS=73485858;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:30:34:34:0.53125:17:17:20:9:17:17:20:10 chr2 73675227 . T TCTC 2183.66 PASS AF=1;AO=137;DP=161;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120326;FXX=0.0460496;HRUN=1;LEN=3;MLLD=304.711;QD=60.2388;RBI=0.0191798;REFB=0;REVB=0.0149359;RO=17;SAF=39;SAR=98;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173601;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=2.92638e-05;OID=.;OPOS=73675228;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:137:161:145:145:0:47:98:0:0:12:17:39:98:6:11 chr2 73675669 . T G 182.82 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6728;QD=43.0154;RBI=0.0405866;REFB=-0.0456663;REVB=0.0277699;RO=1;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053738;STB=0.529375;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00504934;OID=.;OPOS=73675669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:8:8:0:1:8:8:0:1 chr2 73675844 . C T 591.41 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.608;QD=60.6577;RBI=0.013808;REFB=0;REVB=0.00903905;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.16889e-06;OID=.;OPOS=73675844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:19:19:0:0:19:20:0:0 chr2 73828538 . G A 308.42 PASS AF=0.96;AO=23;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.161998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7187;QD=49.3472;RBI=0.162262;REFB=-0.115173;REVB=0.00924722;RO=2;SAF=7;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115122;STB=0.529387;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0103045;OID=.;OPOS=73828538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:2:1:23:24:0.96:16:7:2:0:16:8:1:0 chr2 73927931 . A G 1252.02 PASS AF=0.987952;AO=79;DP=82;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0508834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.78;QD=60.3382;RBI=0.0576639;REFB=-0.143625;REVB=0.0271295;RO=1;SAF=28;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166052;STB=0.508195;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000427239;OID=.;OPOS=73927931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:82:83:1:1:79:82:0.987952:51:28:1:0:52:30:1:0 chr2 73928098 . C G 768.86 PASS AF=0.95;AO=56;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0194119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.901;QD=51.257;RBI=0.0371939;REFB=-0.144101;REVB=0.0317264;RO=3;SAF=30;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194452;STB=0.510585;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00115053;OID=.;OPOS=73928098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:60:60:3:3:56:57:0.95:26:30:1:2:26:31:1:2 chr2 73928366 . G C 476.25 PASS AF=1;AO=27;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.8796;QD=57.7278;RBI=0.108462;REFB=0;REVB=0.0329894;RO=0;SAF=4;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00432311;OID=.;OPOS=73928366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:27:33:1:23:4:0:0:27:6:0:0 chr2 73957124 . A G 708.41 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000446961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.828;QD=62.9696;RBI=0.0166129;REFB=0;REVB=-0.0166069;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.5706e-05;OID=.;OPOS=73957124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr2 74007136 . T C 788.98 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.206;QD=56.3554;RBI=0.0268331;REFB=0;REVB=0.0152599;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172527;OID=.;OPOS=74007136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:23:32:0:0:23:33:0:0 chr2 74135797 . T C 785.12 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.728;QD=57.1;RBI=0.00252186;REFB=0;REVB=0.00212111;RO=0;SAF=16;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13064e-05;OID=.;OPOS=74135797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:38:16:0:0:39:16:0:0 chr2 74135898 . A G 1003.73 PASS AF=0.985714;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.165;QD=57.3562;RBI=0.0208014;REFB=-0.175543;REVB=-0.0152175;RO=1;SAF=27;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171824;STB=0.509088;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000285675;OID=.;OPOS=74135898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:68:69:0.985714:41:27:1:0:42:27:1:0 chr2 74185876 . A T 715.01 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.32;QD=60.8521;RBI=0.0285864;REFB=0.0495701;REVB=-0.00518612;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.000336095;OID=.;OPOS=74185876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:22:24:0:0:22:24:0:1 chr2 74274540 . C G 104.98 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.161667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.6096;QD=18.2573;RBI=0.164228;REFB=-0.0164423;REVB=0.0288916;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325459;STB=0.68503;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0417934;OID=.;OPOS=74274540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:2:9:5:7:2:9 chr2 74329725 . A AT,ATT 88.88 PASS AF=0.568182,0;AO=17,5;DP=46;FAO=25,0;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9,0;FSAR=16,0;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0402979,0.020639;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.25536,11.4227;QD=8.08016;RBI=0.221533,0.119821;REFB=-0.0429192,-0.0249704;REVB=-0.217837,-0.118031;RO=22;SAF=9,0;SAR=8,5;SRF=7;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.206074,-0.627713;STB=0.528132,0.5;STBP=0.72,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.0325043,0.00221066;OID=.,.;OPOS=74329726,74329726;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=AT,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.568182,0:17,5:46:25,0:44:19:9,0:16,0:8:11:51:22:9,0:8,5:7:15 chr2 74334462 . G A 861.44 PASS AF=0.544218;AO=80;DP=146;FAO=80;FDP=147;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00134875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.683;QD=23.4406;RBI=0.0126888;REFB=-0.00944807;REVB=-0.0126169;RO=65;SAF=31;SAR=49;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126293;STB=0.569651;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00921596;OID=.;OPOS=74334462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:65:67:80:80:0.544218:49:31:35:30:49:31:36:31 chr2 74362090 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.441;QD=44.6898;RBI=0.045791;REFB=0;REVB=-0.0418047;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000726609;OID=.;OPOS=74362090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr2 74362459 . T TAGC 303.87 PASS AF=0.888889;AO=24;DP=31;FAO=24;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00342604;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=3;MLLD=335.972;QD=45.0181;RBI=0.0240907;REFB=-0.0173516;REVB=0.0238458;RO=6;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122583;STB=0.55551;STBP=0.113;TYPE=ins;VARB=0.00153178;OID=.;OPOS=74362460;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.888889:24:31:24:27:3:12:12:3:0:14:6:12:12:5:1 chr2 74445635 . A G 451.06 PASS AF=0.473684;AO=46;DP=96;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0151571;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.238;QD=18.9921;RBI=0.0162695;REFB=-0.0129349;REVB=-0.00591276;RO=50;SAF=24;SAR=22;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203726;STB=0.517573;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0176109;OID=.;OPOS=74445635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:50:50:46:45:0.473684:22:24:25:25:21:24:25:25 chr2 74451993 . CT CC,C 206.75 PASS AF=0.173913,0.586957;AO=8,19;DP=44;FAO=8,27;FDP=46;FR=.;FRO=11;FSAF=3,18;FSAR=5,9;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.149458,0.158156;FXX=0.0212721;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=13.932,9.17871;QD=17.9786;RBI=0.186753,0.207905;REFB=-0.141146,-0.107185;REVB=0.111977,0.134949;RO=16;SAF=3,12;SAR=5,7;SRF=13;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.452226,-0.167198;STB=0.740214,0.550984;STBP=0.136,0.347;TYPE=snp,del;VARB=-0.0720594,0.143355;OID=.,.;OPOS=74451994,74451994;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.173913,0.586957:8,19:44:8,27:46:11:3,18:5,9:9:2:28:16:3,12:5,7:13:3 chr2 74460685 . C T 330.62 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00222212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4589;QD=23.6158;RBI=0.01305;REFB=-0.0303742;REVB=0.0128594;RO=23;SAF=9;SAR=24;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105173;STB=0.558103;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0174948;OID=.;OPOS=74460685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:24:9:9:14:24:9:9:14 chr2 74489318 . G A 295.47 PASS AF=0.409639;AO=33;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0688645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.474;QD=14.2397;RBI=0.0707207;REFB=-0.0116744;REVB=0.0160965;RO=50;SAF=19;SAR=14;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16402;STB=0.605572;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0310712;OID=.;OPOS=74489318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:50:49:33:34:0.409639:14:19:21:29:14:20:20:29 chr2 74594988 . G A 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0285721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.707;QD=14.6497;RBI=0.0344953;REFB=-0.022646;REVB=-0.0193277;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761006;STB=0.504418;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0335842;OID=.;OPOS=74594988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:6:8:11:8:6:8:11:8 chr2 74641624 . G C 955.14 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.2804;QD=58.7778;RBI=0.0401376;REFB=0;REVB=-0.0190293;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000495703;OID=.;OPOS=74641624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0 chr2 74641670 . G A 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0020944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.553;QD=14.6498;RBI=0.0264781;REFB=-0.0180106;REVB=-0.0263952;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078252;STB=0.54539;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0189733;OID=.;OPOS=74641670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:7:7:8:11:7:7:8:11 chr2 74682512 . C T 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.012;QD=57.1772;RBI=0.0279521;REFB=0;REVB=0.00204667;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90982e-05;OID=.;OPOS=74682512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0 chr2 74687409 . AC A 34.91 PASS AF=0.4;AO=11;DP=34;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.120885;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.91592;QD=3.98928;RBI=0.157902;REFB=-0.124388;REVB=0.101588;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255529;STB=0.581287;STBP=0.489;TYPE=del;VARB=0.110739;OID=.;OPOS=74687410;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:11:34:14:35:21:5:9:5:16:34:18:5:6:4:14 chr2 74687549 . CTCA CCA,CCAC,CCCA 716.71 PASS AF=1,0,0;AO=15,8,14;DP=49;FAO=51,0,0;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0,0;FSAR=27,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700788,0.0158259,0.0628877;FXX=0.0555453;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=168.559,149.847,164.457;QD=56.2126;RBI=0.0716887,0.0215632,0.0644111;REFB=0,0,0;REVB=0.015107,0.0146462,0.0139261;RO=1;SAF=2,8,5;SAR=13,0,9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.180145,0,-0.0824047;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.00102126,0.00565562,-0.0326404;OID=.,.,.;OPOS=74687550,74687550,74687550;OREF=T,TCA,T;OALT=-,CAC,C;OMAPALT=CCA,CCAC,CCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0,0:15,8,14:49:51,0,0:51:0:24,0,0:27,0,0:0:0:4:1:2,8,5:13,0,9:1:0 chr2 74690039 . G A 2348.29 PASS AF=0.888298;AO=164;DP=190;FAO=167;FDP=188;FR=.;FRO=21;FSAF=77;FSAR=90;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0320816;FXX=0.0105258;HRUN=7;LEN=1;MLLD=243.778;QD=49.9636;RBI=0.0322408;REFB=-0.0179738;REVB=0.00320054;RO=8;SAF=74;SAR=90;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265815;STB=0.533627;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000271931;OID=.;OPOS=74690039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:190:188:8:21:164:167:0.888298:90:74:6:2:90:77:16:5 chr2 74690378 . C T 775.01 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00361228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.886;QD=63.2663;RBI=0.0144066;REFB=0;REVB=0.0139464;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10098e-05;OID=.;OPOS=74690378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:46:49:1:23:23:0:0:25:24:0:0 chr2 74699778 . C A 531.93 PASS AF=1;AO=34;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.902;QD=59.1034;RBI=0.0504512;REFB=0;REVB=-0.00476891;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010099;OID=.;OPOS=74699778;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:1:0:34:36:1:18:16:1:0:19:17:0:0 chr2 74710491 . C T 447.02 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.956;QD=57.68;RBI=0.0389065;REFB=0;REVB=0.0365984;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101316;OID=.;OPOS=74710491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:16:15:0:0 chr2 74719530 . CCG CC,C 50.81 PASS AF=0,0.5;AO=3,3;DP=16;FAO=0,8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=0,5;FSAR=0,3;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0187893,-0.0778529;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.672,23.5733;QD=12.7034;RBI=0.0266655,0.260913;REFB=-0.139754,-0.107165;REVB=-0.0189212,0.249027;RO=8;SAF=1,2;SAR=2,1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.667828,-0.563404;STB=0.5,0.721819;STBP=1,0.169;TYPE=del,del;VARB=0.0710186,0.111943;OID=.,.;OPOS=74719532,74719531;OREF=G,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.5:3,3:16:0,8:16:8:0,5:0,3:8:0:43:8:1,2:2,1:8:0 chr2 74725144 . T C 710.87 PASS AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00643472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.244;QD=60.4993;RBI=0.0519335;REFB=-0.121174;REVB=0.0515333;RO=1;SAF=29;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159327;STB=0.508193;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0117724;OID=.;OPOS=74725144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:45:46:0.978723:16:29:1:0:16:30:1:0 chr2 74725178 . G A 739.39 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0591567;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.4226;QD=54.7697;RBI=0.080233;REFB=-0.171358;REVB=0.0542016;RO=1;SAF=28;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165303;STB=0.508769;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00564552;OID=.;OPOS=74725178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:25:28:1:0:25:28:1:0 chr2 74746322 . A T 958.67 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0211066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.796;QD=57.2341;RBI=0.0249483;REFB=0.0018493;REVB=-0.0133014;RO=1;SAF=23;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200972;STB=0.510635;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=1.56122e-05;OID=.;OPOS=74746322;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:43:23:1:0:43:23:1:0 chr2 74756176 . G C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600865;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=316.544;QD=57.2026;RBI=0.0166836;REFB=0;REVB=0.0155641;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91834e-05;OID=.;OPOS=74756176;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr2 74758666 . G A 559.56 PASS AF=0.457364;AO=59;DP=130;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.00286559;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2747;QD=17.3507;RBI=0.00475538;REFB=-0.00704964;REVB=-0.003795;RO=69;SAF=40;SAR=19;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18944;STB=0.610056;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0120007;OID=.;OPOS=74758666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:69:70:59:59:0.457364:19:40:34:35:19:40:34:36 chr2 74761685 . T C,TC 53.4 PASS AF=0,0.184211;AO=3,16;DP=78;FAO=0,14;FDP=76;FR=.;FRO=62;FSAF=0,8;FSAR=0,6;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.151499,-0.0817822;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=41.6902,28.1677;QD=2.81027;RBI=0.180797,0.0893155;REFB=-0.000878733,-0.0294174;REVB=-0.098668,-0.0359017;RO=59;SAF=0,9;SAR=3,7;SRF=37;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.506735,-0.0832222;STB=0.5,0.507681;STBP=1,0.962;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.121487;OID=.,.;OPOS=74761685,74761686;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:53:78:76:59:62:3,16:0,14:0,0.184211:3,7:0,9:37:22:0,6:0,8:36:26 chr2 74763258 . C G 478.74 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00143436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.285;QD=25.197;RBI=0.0142032;REFB=-0.00153919;REVB=-0.0141306;RO=31;SAF=23;SAR=22;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923191;STB=0.550474;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000921805;OID=.;OPOS=74763258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:31:31:45:45:0.592105:22:23:12:19:22:23:12:19 chr2 74900588 . G T 209.4 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.00223664;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=178.517;QD=13.7312;RBI=0.00270943;REFB=0.00188289;REVB=-0.0015292;RO=31;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758707;STB=0.573278;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.00276788;OID=.;OPOS=74900588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:36:25:25:0.409836:16:9:9:22:16:9:9:27 chr2 75099477 . A T 717.92 PASS AF=0.552;AO=69;DP=125;FAO=69;FDP=125;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=0.00625034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.113;QD=22.9734;RBI=0.0200832;REFB=-0.0240897;REVB=0.0190858;RO=56;SAF=36;SAR=33;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999862;STB=0.554606;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.020608;OID=.;OPOS=75099477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:56:56:69:69:0.552:33:36:36:20:33:36:36:20 chr2 75101454 . T C 347.93 PASS AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00167724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.675;QD=14.8056;RBI=0.0317511;REFB=-0.0082893;REVB=0.0317068;RO=56;SAF=11;SAR=27;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322882;STB=0.683445;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.01589;OID=.;OPOS=75101454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:56:38:38:0.404255:27:11:33:23:27:11:33:23 chr2 75113657 . C T 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=2;FWDB=0.00993457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.997;QD=12.395;RBI=0.0579693;REFB=-0.0118165;REVB=-0.0571117;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=22;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318612;STB=0.680656;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0151195;OID=.;OPOS=75113657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:4:10:22:2:4:10:22:2 chr2 75113789 . C G 980.0 PASS AF=0.985507;AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0085322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.9085;QD=56.8114;RBI=0.0120563;REFB=0.102503;REVB=0.00851799;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.000198163;OID=.;OPOS=75113789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:69:0:1:66:68:0.985507:28:38:0:0:28:40:1:0 chr2 75115108 . A G 1480.22 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.353;QD=58.6227;RBI=0.0120784;REFB=-0.0574211;REVB=-0.00364948;RO=1;SAF=45;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104252;STB=0.505493;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=7.71566e-06;OID=.;OPOS=75115108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:1:1:100:100:0.990099:55:45:1:0:55:45:1:0 chr2 75118737 . C T 761.87 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6016;QD=62.1935;RBI=0.026314;REFB=0;REVB=0.0151169;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165072;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199548;OID=.;OPOS=75118737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:49:49:1:0:48:49:1:28:20:0:1:29:20:0:0 chr2 75124037 . C T 418.31 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.00748978;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6189;QD=19.4561;RBI=0.0317205;REFB=-0.000882096;REVB=-0.0308236;RO=44;SAF=19;SAR=23;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832542;STB=0.546202;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00169101;OID=.;OPOS=75124037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:44:44:42:42:0.488372:23:19:16:28:23:19:16:28 chr2 75185856 . G T 202.64 PASS AF=0.44;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0160288;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.2;QD=16.2116;RBI=0.0160438;REFB=-0.015124;REVB=-0.000694856;RO=28;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079776;STB=0.545413;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0157384;OID=.;OPOS=75185856;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:28:28:22:22:0.44:12:10:15:13:12:10:15:13 chr2 75744918 . T C 736.59 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.009;QD=62.6883;RBI=0.0204583;REFB=0;REVB=0.0200969;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417062;OID=.;OPOS=75744918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:25:19:0:0:27:20:0:0 chr2 75915035 . C T 476.62 PASS AF=0.424;AO=52;DP=124;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.00491069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.895;QD=15.2518;RBI=0.00614804;REFB=-0.0091594;REVB=-0.00369913;RO=72;SAF=29;SAR=23;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116809;STB=0.569937;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0148858;OID=.;OPOS=75915035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:72:72:52:53:0.424:23:29:32:40:23:30:32:40 chr2 75923413 . T C 239.33 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0046678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.36;QD=20.8109;RBI=0.0112739;REFB=-0.00638591;REVB=0.0102622;RO=23;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778015;STB=0.543689;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.00594031;OID=.;OPOS=75923413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:12:11:9:14:12:11:9:14 chr2 76672457 . G T 225.33 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0215529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.734;QD=27.3133;RBI=0.0353321;REFB=-0.0522162;REVB=0.027997;RO=12;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474479;STB=0.526291;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0295808;OID=.;OPOS=76672457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:12:9:6:6:12:9:6:6 chr2 79109771 . A G 164.05 PASS AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0140501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.456;QD=29.827;RBI=0.0493496;REFB=-0.0549191;REVB=0.0473072;RO=6;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102299;STB=0.556888;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00678269;OID=.;OPOS=79109771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:11:5:3:3:11:5:3:3 chr2 79254261 . T C 569.52 PASS AF=0.39759;AO=66;DP=166;FAO=66;FDP=166;FR=.;FRO=100;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=47;FWDB=-0.0376317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1109;QD=13.7234;RBI=0.0469778;REFB=-0.0042037;REVB=-0.0281206;RO=100;SAF=37;SAR=29;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330541;STB=0.518622;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00728316;OID=.;OPOS=79254261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:100:100:66:66:0.39759:29:37:53:47:29:37:53:47 chr2 79312414 . G A 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0183265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.289;QD=18.9665;RBI=0.0192529;REFB=-0.0026863;REVB=0.00590043;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449535;STB=0.525401;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00417457;OID=.;OPOS=79312414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:8:17:14:8:8:17 chr2 79350347 . A G 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3385;QD=54.5146;RBI=0.0411965;REFB=0;REVB=0.0313855;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127168;OID=.;OPOS=79350347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr2 79385786 . TG CA 210.39 PASS AF=0.219355;AO=34;DP=156;FAO=34;FDP=155;FR=.;FRO=121;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=64;FSRR=57;FWDB=-0.0133975;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=2;MLLD=164.558;QD=5.4295;RBI=0.0135612;REFB=-0.00577601;REVB=0.00210076;RO=120;SAF=20;SAR=14;SRF=64;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705974;STB=0.546968;STBP=0.539;TYPE=mnp;VARB=0.0233468;OID=.;OPOS=79385786;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:120:121:34:34:0.219355:14:20:64:56:14:20:64:57 chr2 79385823 . T G 134.53 PASS AF=0.183824;AO=21;DP=133;FAO=25;FDP=136;FR=.;FRO=111;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=0.00302782;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.965;QD=3.95675;RBI=0.0147331;REFB=-0.0142235;REVB=-0.0144186;RO=110;SAF=12;SAR=9;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795243;STB=0.60532;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0589089;OID=.;OPOS=79385823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:110:111:21:25:0.183824:9:12:56:54:9:16:57:54 chr2 79385857 . G T 50.62 PASS AF=0.109091;AO=12;DP=110;FAO=12;FDP=110;FR=.;FRO=98;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=0.00129583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.197;QD=1.84067;RBI=0.0165807;REFB=-0.00441118;REVB=-0.01653;RO=98;SAF=7;SAR=5;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394227;STB=0.529272;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0344218;OID=.;OPOS=79385857;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:110:110:98:98:12:12:0.109091:5:7:54:44:5:7:54:44 chr2 79385866 . C G 41.29 PASS AF=0.10101;AO=10;DP=100;FAO=10;FDP=99;FR=.;FRO=89;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.0420266;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.223;QD=1.66815;RBI=0.0449569;REFB=-0.00198728;REVB=-0.0159652;RO=90;SAF=7;SAR=3;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201294;STB=0.660048;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0698886;OID=.;OPOS=79385866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:100:99:90:89:10:10:0.10101:3:7:48:42:3:7:47:42 chr2 79864080 . G C 253.23 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0248412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.5733;QD=19.1119;RBI=0.0402072;REFB=-0.0363107;REVB=0.0316154;RO=25;SAF=8;SAR=19;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138323;STB=0.589992;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0448094;OID=.;OPOS=79864080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:25:26:27:27:0.509434:19:8:11:14:19:8:12:14 chr2 80101321 . T G 746.98 PASS AF=0.517986;AO=72;DP=141;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=57;FSAR=15;FSRF=49;FSRR=18;FWDB=-0.0265415;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9011;QD=21.4959;RBI=0.0666295;REFB=-0.00501428;REVB=-0.061115;RO=66;SAF=57;SAR=15;SRF=49;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621933;STB=0.541907;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00374476;OID=.;OPOS=80101321;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:139:66:67:72:72:0.517986:15:57:49:17:15:57:49:18 chr2 80801346 . T C 387.56 PASS AF=0.47619;AO=41;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0483921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9015;QD=18.4551;RBI=0.0620806;REFB=0.0232967;REVB=-0.0388871;RO=43;SAF=12;SAR=29;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175184;STB=0.618604;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.0283946;OID=.;OPOS=80801346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:44:41:40:0.47619:29:12:20:23:29:11:21:23 chr2 80875725 . TC CT,TCT,TT 140.47 PASS AF=0,0.457143,0.142857;AO=2,11,5;DP=38;FAO=0,16,5;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=0,7,0;FSAR=0,9,5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0854239,-0.0377758,0.014249;FXX=0.0789266;HRUN=9,5,1;LEN=2,1,1;MLLD=39.0666,13.553,188.548;QD=16.0534;RBI=0.0858508,0.038536,0.014554;REFB=-0.00724919,-0.0395822,-0.000388658;REVB=-0.00855139,0.00761628,-0.00296395;RO=15;SAF=0,6,0;SAR=2,5,5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.528044,0.0771943,-0.697662;STB=0.5,0.504232,0.997267;STBP=1,0.997,0.038;TYPE=mnp,ins,snp;VARB=0.0416693,-0.00778856,0.00229606;OID=.,.,.;OPOS=80875725,80875727,80875726;OREF=TC,-,C;OALT=CT,T,T;OMAPALT=CT,TCT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:78:38:35:15:14:2,11,5:0,16,5:0,0.457143,0.142857:2,5,5:0,6,0:7:8:0,9,5:0,7,0:6:8 chr2 83042810 . GGAAC G 124.53 PASS AF=0.308642;AO=24;DP=81;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00340178;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=4;MLLD=334.841;QD=6.14938;RBI=0.0034019;REFB=-0.000655556;REVB=2.94635e-05;RO=50;SAF=6;SAR=18;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246441;STB=0.650246;STBP=0.091;TYPE=del;VARB=0.00172156;OID=.;OPOS=83042811;OREF=GAAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.308642:24:81:25:81:56:7:18:27:29:99:50:6:18:22:28 chr2 84756049 . G A 2048.86 PASS AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0051572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.113;QD=61.6199;RBI=0.0175722;REFB=-0.0828673;REVB=0.0167983;RO=1;SAF=75;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826558;STB=0.504347;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00131449;OID=.;OPOS=84756049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:133:1:1:132:132:0.992481:57:75:0:1:57:75:0:1 chr2 84771480 . G A 1362.56 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0252667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.105;QD=61.2389;RBI=0.0286624;REFB=-0.000287458;REVB=-0.0135326;RO=1;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108931;STB=0.505746;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.000168748;OID=.;OPOS=84771480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:43:45:0:1:43:45:0:1 chr2 84771567 . C T 923.44 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00864521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.811;QD=56.827;RBI=0.0118546;REFB=-0.0317685;REVB=0.0081112;RO=1;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171708;STB=0.509088;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000474832;OID=.;OPOS=84771567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:27:37:0:1:27:37:0:1 chr2 84800605 . C A 894.31 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0362584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.688;QD=55.0345;RBI=0.0372143;REFB=-0.0029115;REVB=0.00838049;RO=2;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349417;STB=0.518513;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.000161794;OID=.;OPOS=84800605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:26:37:0:2:26:37:0:2 chr2 84897517 . A G 347.66 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00822783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.847;QD=51.5044;RBI=0.0233273;REFB=-0.0282026;REVB=0.0218281;RO=1;SAF=14;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320266;STB=0.517228;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00029967;OID=.;OPOS=84897517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:12:14:1:0:12:14:1:0 chr2 85282879 . A G 272.31 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0389876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.601;QD=17.2892;RBI=0.0400252;REFB=0.00267002;REVB=0.00905449;RO=32;SAF=19;SAR=11;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824084;STB=0.501709;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=-0.00283363;OID=.;OPOS=85282879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:33:30:30:0.47619:11:19:20:12:11:19:21:12 chr2 85283329 . CTT C 95.1 PASS AF=0.416667;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.000426137;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=278.007;QD=10.5668;RBI=0.00196562;REFB=-0.00725954;REVB=0.00191887;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733535;STB=0.560805;STBP=0.549;TYPE=del;VARB=0.0113659;OID=.;OPOS=85283330;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.416667:14:35:15:36:21:8:7:9:12:95:21:7:7:9:12 chr2 85283395 . C T 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0065971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8213;QD=16.931;RBI=0.00898421;REFB=0.00535473;REVB=0.00609872;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722214;STB=0.541598;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.00347105;OID=.;OPOS=85283395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:5:7:6:6:5:7 chr2 85536213 . T TC 33.08 PASS AF=0.285714;AO=5;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0261209;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.518;QD=6.30056;RBI=0.0295366;REFB=-0.0131958;REVB=0.0137879;RO=14;SAF=1;SAR=4;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.591575;STB=0.889351;STBP=0.059;TYPE=ins;VARB=0.0913478;OID=.;OPOS=85536214;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:5:21:6:21:15:1:5:12:3:33:14:1:4:11:3 chr2 85546615 . C T 812.27 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00877338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.916;QD=57.0014;RBI=0.0117115;REFB=0;REVB=0.00775802;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.42529e-05;OID=.;OPOS=85546615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:21:34:0:0:21:36:0:0 chr2 85549527 . T C 272.53 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.899;QD=51.9106;RBI=0.0614578;REFB=0;REVB=0.0553886;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062574;OID=.;OPOS=85549527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr2 85549547 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183874;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.195;QD=56.7066;RBI=0.0215593;REFB=0;REVB=0.0112565;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25692e-05;OID=.;OPOS=85549547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr2 85553784 . C T 921.36 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3975;QD=58.4992;RBI=0.216195;REFB=0;REVB=0.206295;RO=0;SAF=46;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00296481;OID=.;OPOS=85553784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:63:0:0:59:63:1:13:46:0:0:17:46:0:0 chr2 85554080 . G A 198.42 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212306;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.427;QD=44.0923;RBI=0.0320184;REFB=-0.0317651;REVB=0.0239674;RO=1;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000486647;OID=.;OPOS=85554080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:8:9:1:0:8:9:1:0 chr2 85570849 . C T 122.67 PASS AF=0.264706;AO=18;DP=69;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0155208;FXX=0.0144907;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.867;QD=7.21613;RBI=0.0166681;REFB=-0.0271631;REVB=0.00607693;RO=50;SAF=5;SAR=13;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303019;STB=0.685161;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0475513;OID=.;OPOS=85570849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:50:50:18:18:0.264706:13:5:26:24:13:5:26:24 chr2 85570857 . G A 129.6 PASS AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00338351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.273;QD=7.73705;RBI=0.00500471;REFB=-0.00377782;REVB=-0.00368768;RO=48;SAF=6;SAR=13;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179682;STB=0.608577;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0139322;OID=.;OPOS=85570857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:13:6:22:26:13:6:22:26 chr2 85573033 . G A 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4414;QD=58.061;RBI=0.0329949;REFB=0;REVB=0.0113834;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415878;OID=.;OPOS=85573033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0 chr2 85573049 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156961;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=350.879;QD=57.3859;RBI=0.0165672;REFB=0;REVB=-0.00530125;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33126e-06;OID=.;OPOS=85573049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:28:29:0:0:28:29:0:0 chr2 85769711 . C G 485.77 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0119129;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.183;QD=20.0318;RBI=0.0150857;REFB=-0.0137246;REVB=-0.00925533;RO=46;SAF=25;SAR=22;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067321;STB=0.526766;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0170291;OID=.;OPOS=85769711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:46:50:47:47:0.484536:22:25:21:25:22:25:24:26 chr2 85771669 . C G 43.58 PASS AF=0.0990991;AO=11;DP=111;FAO=11;FDP=111;FR=.;FRO=100;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=-0.00560292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.144;QD=1.57031;RBI=0.00954634;REFB=-0.00534015;REVB=-0.00772916;RO=100;SAF=3;SAR=8;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260673;STB=0.701142;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.044223;OID=.;OPOS=85771669;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:111:111:100:100:11:11:0.0990991:8:3:49:51:8:3:49:51 chr2 85771763 . G A 35.93 PASS AF=0.0957447;AO=9;DP=94;FAO=9;FDP=94;FR=.;FRO=85;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.0100081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.229;QD=1.52886;RBI=0.0173636;REFB=0.000468806;REVB=0.0141891;RO=83;SAF=2;SAR=7;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35734;STB=0.769728;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00371513;OID=.;OPOS=85771763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:94:94:83:85:9:9:0.0957447:7:2:44:39:7:2:44:41 chr2 85780131 . G A 437.92 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0128791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.501;QD=21.6259;RBI=0.020809;REFB=-0.0184824;REVB=0.0163445;RO=38;SAF=19;SAR=24;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942305;STB=0.552017;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0144116;OID=.;OPOS=85780131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:24:19:21:17:24:19:21:17 chr2 85780536 . C T 289.04 PASS AF=0.666667;AO=24;DP=37;FAO=26;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.220502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0466;QD=29.6451;RBI=0.220534;REFB=0.0841685;REVB=0.00376127;RO=6;SAF=6;SAR=18;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398481;STB=0.675529;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.0121718;OID=.;OPOS=85780536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:39:6:13:24:26:0.666667:18:6:2:4:20:6:9:4 chr2 85781318 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00975112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.575;QD=51.9167;RBI=0.0455314;REFB=0;REVB=0.0444749;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256562;OID=.;OPOS=85781318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr2 85806266 . C T 331.62 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0268102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.854;QD=26.5295;RBI=0.0268358;REFB=-0.0119679;REVB=0.00117152;RO=21;SAF=5;SAR=24;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228388;STB=0.627668;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00596594;OID=.;OPOS=85806266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:24:5:8:13:24:5:8:13 chr2 85808737 . A G 376.7 PASS AF=0.481481;AO=40;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0147398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.7775;QD=18.6025;RBI=0.0331017;REFB=0.00451445;REVB=-0.0296389;RO=40;SAF=25;SAR=15;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203658;STB=0.597651;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00569528;OID=.;OPOS=85808737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:40:42:40:39:0.481481:15:25:16:24:15:24:18:24 chr2 85808982 . T C 503.95 PASS AF=0.469565;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.0404586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3106;QD=17.5286;RBI=0.0408585;REFB=-0.0160026;REVB=0.00570204;RO=61;SAF=28;SAR=26;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214862;STB=0.511939;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0198691;OID=.;OPOS=85808982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:61:61:54:54:0.469565:26:28:33:28:26:28:33:28 chr2 85824084 . G C 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0270597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.239;QD=18.2898;RBI=0.0300268;REFB=-0.0446091;REVB=-0.0130147;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179268;STB=0.599938;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0356713;OID=.;OPOS=85824084;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:14:18:12:21:14:18:12:21 chr2 85824251 . T C 282.67 PASS AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00748196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.96;QD=28.9922;RBI=0.0147906;REFB=-0.039589;REVB=0.0127586;RO=14;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192918;STB=0.51063;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0158288;OID=.;OPOS=85824251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:15:10:6:8:15:10:6:8 chr2 85846329 . G A 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0629775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8321;QD=14.1389;RBI=0.0683911;REFB=0.0176146;REVB=-0.0266679;RO=20;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291325;STB=0.669184;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0225104;OID=.;OPOS=85846329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:9:5:13:7:9:5:13:7 chr2 85852667 . G A 114.27 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0126405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9075;QD=10.1573;RBI=0.0309315;REFB=-0.0023426;REVB=-0.0282308;RO=31;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420572;STB=0.747463;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00157155;OID=.;OPOS=85852667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:5:9:8:23:5:9:8:23 chr2 85894308 . G T 333.26 PASS AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0244234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.229;QD=27.2051;RBI=0.0340826;REFB=-0.0312378;REVB=-0.0237723;RO=20;SAF=11;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922776;STB=0.550985;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0254785;OID=.;OPOS=85894308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:20:20:29:29:0.591837:18:11:10:10:18:11:10:10 chr2 85895338 . T G 312.25 PASS AF=0.367347;AO=34;DP=96;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=-0.0315605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.903;QD=12.7448;RBI=0.0318532;REFB=-0.0118754;REVB=0.00430786;RO=62;SAF=9;SAR=25;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579991;STB=0.522148;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0224458;OID=.;OPOS=85895338;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:62:62:34:36:0.367347:25:9:19:43:26:10:19:43 chr2 85924729 . C T 665.19 PASS AF=0.546218;AO=65;DP=120;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.00912515;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.54;QD=22.3594;RBI=0.0104112;REFB=-0.0260368;REVB=-0.00501247;RO=54;SAF=30;SAR=35;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765397;STB=0.541872;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0152703;OID=.;OPOS=85924729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:54:54:65:65:0.546218:35:30:20:34:35:30:20:34 chr2 85925529 . A G 237.25 PASS AF=0.349398;AO=28;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=0.0239724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.065;QD=11.4337;RBI=0.0525475;REFB=-0.0318288;REVB=-0.0467607;RO=45;SAF=16;SAR=12;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813884;STB=0.580933;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0635833;OID=.;OPOS=85925529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:54:28:29:0.349398:12:16:29:16:12:17:38:16 chr2 85925756 . C G 277.47 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0397373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0583;QD=20.5534;RBI=0.0397374;REFB=-0.00353872;REVB=-5.20071e-05;RO=25;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408433;STB=0.522682;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00318527;OID=.;OPOS=85925756;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:13:16:15:10:13:16:15:10 chr2 85925848 . C G 274.85 PASS AF=0.376471;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0250055;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.545;QD=12.934;RBI=0.0251906;REFB=-0.0103551;REVB=-0.00304802;RO=54;SAF=19;SAR=13;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18299;STB=0.599351;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.019283;OID=.;OPOS=85925848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:54:53:32:32:0.376471:13:19:23:31:13:19:23:30 chr2 86259443 . C T 338.07 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00836737;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.252;QD=28.7722;RBI=0.0110907;REFB=-0.0117181;REVB=0.00727949;RO=18;SAF=22;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213985;STB=0.618541;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00575638;OID=.;OPOS=86259443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:7:22:9:9:7:22:9:9 chr2 86272758 . G A 146.07 PASS AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00583555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.02;QD=8.98884;RBI=0.0133813;REFB=0.00270375;REVB=-0.0120419;RO=45;SAF=9;SAR=11;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148114;STB=0.5877;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=-0.00765497;OID=.;OPOS=86272758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:45:45:20:20:0.307692:11:9:26:19:11:9:26:19 chr2 86315741 . C T 317.81 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0234917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.027;QD=16.5096;RBI=0.0263173;REFB=-0.00711332;REVB=-0.0118635;RO=41;SAF=11;SAR=24;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201432;STB=0.620618;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00695249;OID=.;OPOS=86315741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:42:35:35:0.454545:24:11:21:20:24:11:22:20 chr2 86317037 . G C 434.92 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0015914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.777;QD=20.9598;RBI=0.00292944;REFB=-0.00142711;REVB=-0.00245948;RO=40;SAF=17;SAR=26;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417568;STB=0.523066;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00132634;OID=.;OPOS=86317037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:26:17:14:26:26:17:14:26 chr2 86344237 . A G 43.02 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.000395801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.93;QD=5.37737;RBI=0.00490687;REFB=-0.00280647;REVB=-0.00489088;RO=25;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337018;STB=0.730931;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00448639;OID=.;OPOS=86344237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:25:25:7:7:0.21875:6:1:9:16:6:1:9:16 chr2 86363074 . A G 492.27 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0265558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.123;QD=20.0928;RBI=0.0412434;REFB=-0.0258657;REVB=-0.0315564;RO=48;SAF=20;SAR=28;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132061;STB=0.573348;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0332698;OID=.;OPOS=86363074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:50:48:48:0.489796:28:20:27:21:28:20:28:22 chr2 86364653 . A G 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0164573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.482;QD=19.6924;RBI=0.0176657;REFB=-0.0184468;REVB=-0.00642146;RO=25;SAF=16;SAR=10;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155485;STB=0.587088;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0184;OID=.;OPOS=86364653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:10:16:11:14:10:16:11:14 chr2 86385728 . C T 285.02 PASS AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00128841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.507;QD=30.0024;RBI=0.0136583;REFB=-0.0192857;REVB=0.0135974;RO=12;SAF=9;SAR=16;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136776;STB=0.563824;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00820295;OID=.;OPOS=86385728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:12:13:25:25:0.657895:16:9:7:5:16:9:7:6 chr2 86400824 . G A 603.81 PASS AF=0.567308;AO=58;DP=104;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0224741;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.137;QD=23.2236;RBI=0.0248707;REFB=-0.00993833;REVB=-0.010652;RO=45;SAF=23;SAR=35;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00287339;STB=0.503042;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00912951;OID=.;OPOS=86400824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:45:45:58:59:0.567308:35:23:18:27:35:24:18:27 chr2 86406556 . C T 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0234989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.686;QD=20.2683;RBI=0.024754;REFB=-0.00922312;REVB=0.00778213;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421918;STB=0.523787;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00976632;OID=.;OPOS=86406556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:11:10:11:10:11:10:11:10 chr2 86440718 . T C 500.48 PASS AF=0.521739;AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0282845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.821;QD=21.7599;RBI=0.0283379;REFB=-0.00514105;REVB=0.00173853;RO=43;SAF=26;SAR=22;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954707;STB=0.545937;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.00510755;OID=.;OPOS=86440718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:43:44:48:48:0.521739:22:26:28:15:22:26:28:16 chr2 86441334 . C CTGTT 209.71 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00634693;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=281.064;QD=18.6411;RBI=0.00678442;REFB=-0.0167385;REVB=0.00239684;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23972;STB=0.636231;STBP=0.099;TYPE=ins;VARB=0.0171189;OID=.;OPOS=86441335;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:21:45:21:45:24:14:7:10:14:99:24:14:7:10:14 chr2 86481835 . C T 135.6 PASS AF=0.28169;AO=19;DP=70;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0106675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.123;QD=7.63914;RBI=0.0290023;REFB=-0.00374662;REVB=-0.0269692;RO=50;SAF=13;SAR=6;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31574;STB=0.656226;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0106577;OID=.;OPOS=86481835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:50:51:19:20:0.28169:6:13:21:29:7:13:22:29 chr2 86683642 . A G 377.96 PASS AF=1;AO=26;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.213632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0084;QD=53.9937;RBI=0.214141;REFB=0;REVB=0.014757;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285064;OID=.;OPOS=86683642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:26:28:1:20:6:0:0:20:8:0:0 chr2 86691250 . G A 2877.96 PASS AF=1;AO=182;DP=186;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119051;FXX=0.0161282;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.161;QD=62.9061;RBI=0.0354222;REFB=0;REVB=0.0354022;RO=0;SAF=81;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31865e-05;OID=.;OPOS=86691250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:186:183:0:0:182:183:1:101:81:0:0:102:81:0:0 chr2 86707313 . G A 301.4 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.000969984;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.204;QD=21.5284;RBI=0.00110974;REFB=0.00230267;REVB=-0.000539125;RO=26;SAF=20;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600018;STB=0.521725;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=-0.00107198;OID=.;OPOS=86707313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:26:25:31:31:0.553571:11:20:15:11:11:20:15:10 chr2 86850978 . C T 163.13 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0331126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.87;QD=20.3915;RBI=0.0497513;REFB=-0.0246312;REVB=0.0371315;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099476;STB=0.556352;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0171479;OID=.;OPOS=86850978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:7:8:11:6:7:8 chr2 86979093 . G A 2217.0 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00217396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0532;QD=63.343;RBI=0.0498813;REFB=0;REVB=0.049834;RO=0;SAF=79;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259628;OID=.;OPOS=86979093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:140:0:0:139:140:1:60:79:0:0:61:79:0:0 chr2 87015633 . T TGA 667.08 PASS AF=0.956522;AO=43;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0178574;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=279.007;QD=58.007;RBI=0.0351738;REFB=-0.0949184;REVB=0.0303036;RO=2;SAF=20;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029222;STB=0.501991;STBP=0.859;TYPE=ins;VARB=0.00553006;OID=.;OPOS=87015634;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.956522:43:46:44:46:2:20:24:1:1:9:2:20:23:1:1 chr2 87069379 . G A 527.53 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0109788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2532;QD=57.03;RBI=0.0262066;REFB=-0.123052;REVB=-0.023796;RO=1;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239982;STB=0.512813;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00459362;OID=.;OPOS=87069379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:37:37:1:1:36:36:0.972973:19:17:0:1:19:17:0:1 chr2 87069431 . C T 256.11 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8848;QD=51.2218;RBI=0.0648101;REFB=0;REVB=0.0463673;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239942;OID=.;OPOS=87069431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:8:11:0:0:9:11:0:0 chr2 87276811 . T C 161.81 PASS AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00666796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.96;QD=28.1411;RBI=0.00780726;REFB=0.00516426;REVB=-0.00406099;RO=7;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529375;STB=0.529376;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.00185327;OID=.;OPOS=87276811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:7:7:16:16:0.695652:6:10:5:2:6:10:5:2 chr2 88315954 . C A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014673;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=363.685;QD=56.1916;RBI=0.0178865;REFB=0;REVB=0.0102289;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18595e-05;OID=.;OPOS=88315954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr2 88315993 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3487;QD=56.1911;RBI=0.049378;REFB=0;REVB=0.0211469;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152655;OID=.;OPOS=88315993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr2 88387403 . C A 729.95 PASS AF=1;AO=39;DP=53;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214424;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.337;QD=57.2506;RBI=0.0535702;REFB=0;REVB=0.0490916;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000564145;OID=.;OPOS=88387403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:51:0:0:39:51:1:9:30:0:0:20:31:0:0 chr2 88405975 . G A 350.07 PASS AF=0.330827;AO=44;DP=133;FAO=44;FDP=133;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.00647991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.943;QD=10.5284;RBI=0.00850509;REFB=-0.00126887;REVB=0.00550884;RO=89;SAF=15;SAR=29;SRF=35;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656388;STB=0.538016;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.00196994;OID=.;OPOS=88405975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:89:89:44:44:0.330827:29:15:35:54:29:15:35:54 chr2 88407959 . T C 267.38 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0195655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2542;QD=13.7119;RBI=0.0307078;REFB=-0.0159912;REVB=-0.0236677;RO=43;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671557;STB=0.509522;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0276195;OID=.;OPOS=88407959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:47:31:31:0.397436:15:16:25:18:15:16:25:22 chr2 88411605 . A T 478.96 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.017522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9584;QD=19.9565;RBI=0.030468;REFB=0.0144318;REVB=0.0249254;RO=49;SAF=28;SAR=19;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172497;STB=0.595704;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.00710597;OID=.;OPOS=88411605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:19:28:20:29:19:28:20:29 chr2 88424066 . T C 279.9 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00428327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.721;QD=14.1723;RBI=0.00811123;REFB=-0.0095355;REVB=-0.00688809;RO=46;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154351;STB=0.593349;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.018214;OID=.;OPOS=88424066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:46:47:32:32:0.405063:14:18:19:27:14:18:19:28 chr2 88472791 . G A 1250.02 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0234528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=332.598;QD=60.242;RBI=0.0243201;REFB=-0.080448;REVB=-0.00643701;RO=1;SAF=44;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106419;STB=0.505617;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000127547;OID=.;OPOS=88472791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:38:44:1:0:38:44:1:0 chr2 88482258 . G A 200.86 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0156967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.195;QD=20.6009;RBI=0.0237176;REFB=-0.00894031;REVB=-0.0177803;RO=19;SAF=16;SAR=4;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140554;STB=0.507928;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00760337;OID=.;OPOS=88482258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:4:16:15:4:4:16:15:4 chr2 88874891 . C A 486.42 PASS AF=0.495146;AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=0.0136465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.802;QD=18.8902;RBI=0.013829;REFB=-0.00793953;REVB=-0.00223897;RO=52;SAF=34;SAR=17;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355165;STB=0.696128;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00578186;OID=.;OPOS=88874891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:52:52:51:51:0.495146:17:34:14:38:17:34:14:38 chr2 88879131 . T C 350.88 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0021845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.095;QD=20.6401;RBI=0.0152231;REFB=-0.0117692;REVB=0.0150656;RO=32;SAF=21;SAR=15;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124413;STB=0.568927;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00885659;OID=.;OPOS=88879131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:15:21:14:18:15:21:14:18 chr2 88895123 . T C 292.92 PASS AF=0.361702;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.000596252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.774;QD=12.4647;RBI=0.0250051;REFB=-0.00515997;REVB=0.024998;RO=60;SAF=16;SAR=18;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106409;STB=0.561062;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00800532;OID=.;OPOS=88895123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:60:60:34:34:0.361702:18:16:34:26:18:16:34:26 chr2 88895351 . T C 241.16 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00188971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.81;QD=14.616;RBI=0.0101833;REFB=0.00985694;REVB=-0.0100064;RO=38;SAF=15;SAR=13;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168609;STB=0.595427;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.017534;OID=.;OPOS=88895351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:13:15:14:24:13:15:14:24 chr2 88913273 . G C 372.45 PASS AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0119767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.524;QD=15.202;RBI=0.0173075;REFB=-0.0109936;REVB=-0.0124942;RO=58;SAF=15;SAR=25;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23789;STB=0.634451;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.014542;OID=.;OPOS=88913273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:58:58:40:40:0.408163:25:15:35:23:25:15:35:23 chr2 89156948 . C G 704.46 PASS AF=0.416216;AO=77;DP=186;FAO=77;FDP=185;FR=.;FRO=108;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=59;FWDB=0.002035;FXX=0.0159566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8183;QD=15.2316;RBI=0.0218238;REFB=-0.0134222;REVB=-0.0217287;RO=103;SAF=45;SAR=32;SRF=46;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141454;STB=0.576497;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0176893;OID=.;OPOS=89156948;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:103:108:77:77:0.416216:32:45:46:57:32:45:49:59 chr2 89197190 . C T 3795.68 PASS AF=0.98374;AO=241;DP=246;FAO=242;FDP=246;FR=.;FRO=4;FSAF=125;FSAR=117;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0134443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.126;QD=61.7183;RBI=0.0149113;REFB=0.00444719;REVB=0.00644951;RO=4;SAF=125;SAR=116;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0083671;STB=0.504337;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-3.48958e-05;OID=.;OPOS=89197190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:246:246:4:4:241:242:0.98374:116:125:1:3:117:125:1:3 chr2 89246951 . C T 1556.47 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00782224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7317;QD=59.8643;RBI=0.0256783;REFB=0;REVB=-0.0244579;RO=0;SAF=53;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102241;OID=.;OPOS=89246951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:51:53:0:0:51:53:0:0 chr2 89278489 . A C 245.28 PASS AF=0.316832;AO=32;DP=103;FAO=32;FDP=101;FR=.;FRO=69;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=-0.0354655;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.028;QD=9.7139;RBI=0.0487067;REFB=-0.0328707;REVB=-0.0333847;RO=68;SAF=19;SAR=13;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664757;STB=0.500321;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0490283;OID=.;OPOS=89278489;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:101:68:69:32:32:0.316832:13:19:40:28:13:19:41:28 chr2 89292182 . A G 262.79 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.02739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.321;QD=15.0166;RBI=0.0351463;REFB=-0.0117714;REVB=-0.022024;RO=40;SAF=15;SAR=15;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15184;STB=0.585659;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0215809;OID=.;OPOS=89292182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:15:15:14:26:15:15:14:26 chr2 89292201 . C T 251.84 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.000777926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.421;QD=14.8144;RBI=0.00584258;REFB=-0.0125782;REVB=-0.00579056;RO=36;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651105;STB=0.556537;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0104247;OID=.;OPOS=89292201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:36:39:29:29:0.426471:15:14:15:21:15:14:15:24 chr2 89292401 . T C 178.95 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0118437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.486;QD=15.2295;RBI=0.0123192;REFB=0.00499598;REVB=-0.00338962;RO=28;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100654;STB=0.557975;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.00898815;OID=.;OPOS=89292401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:9:10:12:16:9:10:12:16 chr2 89309542 . T G 321.76 PASS AF=0.375;AO=39;DP=104;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0261081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3149;QD=12.3752;RBI=0.0368937;REFB=0.00751051;REVB=-0.0260674;RO=65;SAF=19;SAR=20;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729046;STB=0.541584;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.0130892;OID=.;OPOS=89309542;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:65:65:39:39:0.375:20:19:36:29:20:19:36:29 chr2 89309554 . T A 285.28 PASS AF=0.346939;AO=32;DP=96;FAO=34;FDP=98;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.0618736;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4737;QD=11.6441;RBI=0.0745028;REFB=-0.0149022;REVB=0.041501;RO=64;SAF=18;SAR=14;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181644;STB=0.507893;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0314799;OID=.;OPOS=89309554;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:64:64:32:34:0.346939:14:18:35:29:15:19:35:29 chr2 89309735 . A G 107.37 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.018617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6794;QD=13.0147;RBI=0.0574592;REFB=-0.0336631;REVB=0.0543596;RO=20;SAF=10;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938032;STB=0.555466;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0488838;OID=.;OPOS=89309735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:3:10:14:6:3:10:14:6 chr2 89309762 . T G 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00511891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.342;QD=17.3207;RBI=0.00860906;REFB=-0.0223182;REVB=-0.0069219;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380381;STB=0.521712;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0170009;OID=.;OPOS=89309762;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:5:11:13:5:5:11:13:5 chr2 89399635 . T G 37.59 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0485632;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0272;QD=7.16022;RBI=0.0485962;REFB=-0.023473;REVB=-0.0017918;RO=15;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493865;STB=0.818575;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0449173;OID=.;OPOS=89399635;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:22:21:15:15:6:6:0.285714:5:1:9:6:5:1:9:6 chr2 90121675 . T C 398.21 PASS AF=0.966667;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0106486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.835;QD=53.0948;RBI=0.064955;REFB=-0.03775;REVB=0.0640762;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320562;STB=0.516118;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00105257;OID=.;OPOS=90121675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:30:1:1:27:29:0.966667:14:13:0:1:15:14:0:1 chr2 90121926 . G T 158.12 PASS AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0136903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5305;QD=9.88221;RBI=0.0215072;REFB=-0.00349173;REVB=0.0165872;RO=43;SAF=7;SAR=14;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25903;STB=0.652485;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0104633;OID=.;OPOS=90121926;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:14:7:24:19:14:7:24:19 chr2 90121985 . A G 126.71 PASS AF=0.2;AO=21;DP=105;FAO=21;FDP=105;FR=.;FRO=84;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.019339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.661;QD=4.82717;RBI=0.0193463;REFB=-0.00437036;REVB=0.000530468;RO=84;SAF=10;SAR=11;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120172;STB=0.575741;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0263288;OID=.;OPOS=90121985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:84:84:21:21:0.2:11:10:48:36:11:10:48:36 chr2 90139116 . G A 256.44 PASS AF=0.340659;AO=31;DP=91;FAO=31;FDP=91;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00220084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.375;QD=11.2721;RBI=0.0609431;REFB=-0.0209582;REVB=-0.0609034;RO=60;SAF=15;SAR=16;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577087;STB=0.533407;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0370374;OID=.;OPOS=90139116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:60:60:31:31:0.340659:16:15:26:34:16:15:26:34 chr2 90249290 . A C 46.97 PASS AF=0.0948905;AO=13;DP=137;FAO=13;FDP=137;FR=.;FRO=124;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=60;FSRR=64;FWDB=-0.00981445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6828;QD=1.3713;RBI=0.0130581;REFB=0.00183294;REVB=-0.00861344;RO=124;SAF=4;SAR=9;SRF=60;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210627;STB=0.663338;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.0181727;OID=.;OPOS=90249290;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:137:137:124:124:13:13:0.0948905:9:4:60:64:9:4:60:64 chr2 90249299 . C T 47.46 PASS AF=0.0962963;AO=13;DP=135;FAO=13;FDP=135;FR=.;FRO=122;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=60;FSRR=62;FWDB=-0.0517913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8605;QD=1.40636;RBI=0.0721788;REFB=-0.00533441;REVB=-0.0502736;RO=119;SAF=4;SAR=9;SRF=58;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216149;STB=0.669502;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0635772;OID=.;OPOS=90249299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:135:135:119:122:13:13:0.0962963:9:4:58:61:9:4:60:62 chr2 90259760 . A T 37.41 PASS AF=0.114286;AO=8;DP=70;FAO=8;FDP=70;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0109358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.818;QD=2.1378;RBI=0.0753313;REFB=-0.00272662;REVB=0.0745334;RO=62;SAF=5;SAR=3;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22142;STB=0.663937;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0242753;OID=.;OPOS=90259760;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:70:70:62:62:8:8:0.114286:3:5:27:35:3:5:27:35 chr2 95542363 . C G 42.44 PASS AF=0.121622;AO=9;DP=75;FAO=9;FDP=74;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.0162633;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.264;QD=2.29409;RBI=0.0422757;REFB=-0.00259545;REVB=-0.0390223;RO=64;SAF=6;SAR=3;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219887;STB=0.6542;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0147011;OID=.;OPOS=95542363;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:75:74:64:65:9:9:0.121622:3:6:31:33:3:6:32:33 chr2 95542376 . GC TT 39.3 PASS AF=0.108434;AO=9;DP=85;FAO=9;FDP=83;FR=.;FRO=74;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.0038999;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=2;MLLD=250.492;QD=1.89419;RBI=0.0251337;REFB=-0.0022769;REVB=-0.0248293;RO=71;SAF=6;SAR=3;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253987;STB=0.70269;STBP=0.231;TYPE=mnp;VARB=0.0207211;OID=.;OPOS=95542376;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:85:83:71:74:9:9:0.108434:3:6:32:39:3:6:32:42 chr2 95542415 . CA TG 34.21 PASS AF=0.0891089;AO=9;DP=101;FAO=9;FDP=101;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.00501502;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=161.541;QD=1.35496;RBI=0.00769346;REFB=-0.00122967;REVB=0.00583429;RO=92;SAF=6;SAR=3;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271401;STB=0.712924;STBP=0.189;TYPE=mnp;VARB=0.0162548;OID=.;OPOS=95542415;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:101:101:92:92:9:9:0.0891089:3:6:39:53:3:6:39:53 chr2 95542419 . G A 55.05 PASS AF=0.12;AO=9;DP=96;FAO=12;FDP=100;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.0178996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2416;QD=2.20203;RBI=0.0352605;REFB=0.00147311;REVB=-0.0303794;RO=85;SAF=6;SAR=3;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301051;STB=0.640297;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=-0.014262;OID=.;OPOS=95542419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:96:100:85:88:9:12:0.12:3:6:34:51:5:7:37:51 chr2 95542476 . C T 51.44 PASS AF=0.125;AO=11;DP=88;FAO=11;FDP=88;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=51;FWDB=0.0250857;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.029;QD=2.33825;RBI=0.0332599;REFB=-0.00210318;REVB=-0.0218388;RO=77;SAF=7;SAR=4;SRF=26;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353647;STB=0.744291;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0211327;OID=.;OPOS=95542476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:88:88:77:77:11:11:0.125:4:7:26:51:4:7:26:51 chr2 95847040 . TGCG T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100143;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=276.975;QD=55.6561;RBI=0.020437;REFB=0;REVB=0.0178153;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000129037;OID=.;OPOS=95847041;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:27:27:27:0:16:11:0:0:4:0:16:11:0:0 chr2 95848354 . G A 972.48 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0622232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7908;QD=58.9382;RBI=0.0829223;REFB=0;REVB=-0.0548123;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00118634;OID=.;OPOS=95848354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0 chr2 95947085 . A G 1525.05 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00375875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.469;QD=59.8059;RBI=0.0303715;REFB=0;REVB=0.030138;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36714e-05;OID=.;OPOS=95947085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:47:55:0:0:47:55:0:0 chr2 96195632 . T C 1631.92 PASS AF=0.973684;AO=111;DP=114;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00586827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.246;QD=57.2603;RBI=0.0120347;REFB=-0.0467636;REVB=0.010507;RO=3;SAF=69;SAR=42;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201921;STB=0.510636;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.000854892;OID=.;OPOS=96195632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:114:114:3:3:111:111:0.973684:42:69:3:0:42:69:3:0 chr2 96514607 . TAA ATA,TA,T,TAAT 297.11 PASS AF=0,0.872727,0,0.127273;AO=2,28,6,6;DP=56;FAO=0,48,0,7;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15,0,6;FSAR=0,33,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.15878,-0.426303,-0.2064,-0.0341524;FXX=0.017854;HRUN=1,11,11,0;LEN=2,1,2,1;MLLD=13.9681,5.93324,7.83791,202.834;QD=21.6081;RBI=0.161642,0.473602,0.231363,0.0345505;REFB=-0.058137,-0.031042,-0.0270135,0.0446212;REVB=0.0302822,0.206312,0.104537,-0.00522928;RO=10;SAF=1,9,4,5;SAR=1,19,2,1;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.493481,0.129415,0.530397,0.656508;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,del,ins;VARB=-0.116419,-0.00240713,-0.0171998,0.0137541;OID=.,.,.,.;OPOS=96514607,96514608,96514608,96514610;OREF=TA,A,AA,-;OALT=AT,-,-,T;OMAPALT=ATA,TA,T,TAAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/4:40:56:55:10:0:2,28,6,6:0,48,0,7:0,0.872727,0,0.127273:1,19,2,1:1,9,4,5:1:9:0,33,0,1:0,15,0,6:0:0 chr2 96517502 . AA CA,CG 58.86 PASS AF=0.0925926,0.037037;AO=9,4;DP=108;FAO=10,4;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=4,3;FSAR=6,1;FSRF=44;FSRR=50;FWDB=-0.0150341,-0.0414256;FXX=0.00917347;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=190.819,99.6713;QD=2.18005;RBI=0.0234752,0.0522485;REFB=-0.00223857,-0.00496851;REVB=0.0180295,0.0318406;RO=76;SAF=3,3;SAR=6,1;SRF=39;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.212228,0.215999;STB=0.562374,0.763709;STBP=0.691,0.365;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00488772,0.0553205;OID=.,.;OPOS=96517502,96517502;OREF=A,AA;OALT=C,CG;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:108:108:76:94:9,4:10,4:0.0925926,0.037037:6,1:3,3:39:37:6,1:4,3:44:50 chr2 96517518 . A G 152.78 PASS AF=0.217391;AO=24;DP=115;FAO=25;FDP=115;FR=.;FRO=90;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=0.0402031;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2545;QD=5.31416;RBI=0.0474256;REFB=-0.012999;REVB=0.0251574;RO=90;SAF=10;SAR=14;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064015;STB=0.521051;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0769953;OID=.;OPOS=96517518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:90:90:24:25:0.217391:14:10:42:48:14:11:42:48 chr2 96517882 . G A 113.35 PASS AF=0.145455;AO=23;DP=165;FAO=24;FDP=165;FR=.;FRO=141;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=76;FSRR=65;FWDB=-0.0568915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.773;QD=2.74787;RBI=0.0569613;REFB=-0.00419542;REVB=-0.00281822;RO=140;SAF=10;SAR=13;SRF=75;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127241;STB=0.568571;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0200611;OID=.;OPOS=96517882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:140:141:23:24:0.145455:13:10:75:65:13:11:76:65 chr2 96517885 . G A 178.27 PASS AF=0.196203;AO=31;DP=159;FAO=31;FDP=158;FR=.;FRO=127;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=70;FSRR=57;FWDB=-0.0152649;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.026;QD=4.51324;RBI=0.0218145;REFB=-0.00251389;REVB=-0.0155839;RO=126;SAF=15;SAR=16;SRF=69;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813653;STB=0.553937;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0152128;OID=.;OPOS=96517885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:126:127:31:31:0.196203:16:15:69:57:16:15:70:57 chr2 96521455 . A G 41.56 PASS AF=0.118421;AO=9;DP=76;FAO=9;FDP=76;FR=.;FRO=67;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=-0.00904239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.082;QD=2.18751;RBI=0.00970353;REFB=-0.0010141;REVB=0.00352045;RO=67;SAF=4;SAR=5;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110782;STB=0.581216;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0131717;OID=.;OPOS=96521455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:76:76:67:67:9:9:0.118421:5:4:36:31:5:4:36:31 chr2 96521481 . C T 47.18 PASS AF=0.107843;AO=11;DP=102;FAO=11;FDP=102;FR=.;FRO=91;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.00278438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.235;QD=1.85005;RBI=0.0317813;REFB=-0.0120518;REVB=-0.0316591;RO=89;SAF=6;SAR=5;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00738785;STB=0.506272;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.038497;OID=.;OPOS=96521481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:102:102:89:91:11:11:0.107843:5:6:48:41:5:6:49:42 chr2 96521483 . TG CA 30.55 PASS AF=0.0824742;AO=8;DP=101;FAO=8;FDP=97;FR=.;FRO=89;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=0.00745386;FXX=0.0582468;HRUN=1;LEN=2;MLLD=214.456;QD=1.25996;RBI=0.0173272;REFB=1.94269e-05;REVB=-0.015642;RO=89;SAF=4;SAR=4;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312249;STB=0.525709;STBP=0.904;TYPE=mnp;VARB=-0.0198353;OID=.;OPOS=96521483;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:101:97:89:89:8:8:0.0824742:4:4:47:42:4:4:47:42 chr2 96521486 . G A 47.22 PASS AF=0.105769;AO=12;DP=107;FAO=11;FDP=104;FR=.;FRO=93;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=50;FSRR=43;FWDB=0.00124442;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.946;QD=1.81627;RBI=0.0154246;REFB=-0.00161238;REVB=-0.0153743;RO=91;SAF=7;SAR=5;SRF=47;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815395;STB=0.507029;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0108741;OID=.;OPOS=96521486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:107:104:91:93:12:11:0.105769:5:7:47:44:5:6:50:43 chr2 96521512 . A C 185.8 PASS AF=0.208333;AO=30;DP=145;FAO=30;FDP=144;FR=.;FRO=114;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=58;FWDB=-0.045494;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6648;QD=5.16103;RBI=0.0491134;REFB=0.0077967;REVB=0.0185048;RO=112;SAF=15;SAR=15;SRF=56;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50694;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=-0.0334149;OID=.;OPOS=96521512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:112:114:30:30:0.208333:15:15:56:56:15:15:56:58 chr2 96521548 . G A 168.81 PASS AF=0.182353;AO=31;DP=171;FAO=31;FDP=170;FR=.;FRO=139;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=70;FSRR=69;FWDB=-0.000147312;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.121;QD=3.97198;RBI=0.00588357;REFB=-0.000305306;REVB=-0.00588172;RO=139;SAF=13;SAR=18;SRF=70;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108328;STB=0.569098;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00121119;OID=.;OPOS=96521548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:139:139:31:31:0.182353:18:13:70:69:18:13:70:69 chr2 96521556 . T C 155.16 PASS AF=0.167598;AO=30;DP=179;FAO=30;FDP=179;FR=.;FRO=149;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=75;FSRR=74;FWDB=0.000834381;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.216;QD=3.4673;RBI=0.0101124;REFB=-0.0048793;REVB=-0.0100779;RO=148;SAF=13;SAR=17;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856852;STB=0.558378;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0209932;OID=.;OPOS=96521556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:148:149:30:30:0.167598:17:13:74:74:17:13:75:74 chr2 96521563 . G A 90.11 PASS AF=0.115789;AO=19;DP=187;FAO=22;FDP=190;FR=.;FRO=168;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=87;FSRR=81;FWDB=-0.00411432;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.291;QD=1.89715;RBI=0.0126201;REFB=-0.00205625;REVB=-0.0119306;RO=167;SAF=7;SAR=12;SRF=87;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183731;STB=0.63624;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0444797;OID=.;OPOS=96521563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:187:190:167:168:19:22:0.115789:12:7:87:80:14:8:87:81 chr2 96521607 . GGT CAC 71.57 PASS AF=0.1;AO=19;DP=210;FAO=21;FDP=210;FR=.;FRO=189;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=106;FSRR=83;FWDB=-0.00127;FXX=0.0186907;HRUN=2;LEN=3;MLLD=239.296;QD=1.36329;RBI=0.00734656;REFB=-0.000853502;REVB=0.00723596;RO=186;SAF=8;SAR=11;SRF=105;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168597;STB=0.61734;STBP=0.304;TYPE=mnp;VARB=0.00693575;OID=.;OPOS=96521607;OREF=GGT;OALT=CAC;OMAPALT=CAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:210:210:186:189:19:21:0.1:11:8:105:81:12:9:106:83 chr2 96521640 . C T 30.93 PASS AF=0.061674;AO=12;DP=227;FAO=14;FDP=227;FR=.;FRO=213;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=122;FSRR=91;FWDB=-0.0405747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.113;QD=0.545003;RBI=0.0629202;REFB=-0.00374663;REVB=-0.04809;RO=212;SAF=5;SAR=7;SRF=122;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156342;STB=0.568186;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0476288;OID=.;OPOS=96521640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:227:227:212:213:12:14:0.061674:7:5:122:90:7:7:122:91 chr2 96523096 . T C 315.61 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.00547209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.012;QD=17.5339;RBI=0.0330158;REFB=-0.0160371;REVB=0.0325592;RO=38;SAF=23;SAR=11;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974054;STB=0.554233;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0263381;OID=.;OPOS=96523096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:11:23:29:9:11:23:29:9 chr2 96525640 . G T 37.0 PASS AF=0.1;AO=9;DP=90;FAO=9;FDP=90;FR=.;FRO=81;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=-0.0208576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.661;QD=1.64443;RBI=0.0306254;REFB=-0.00734567;REVB=-0.022425;RO=81;SAF=3;SAR=6;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769686;STB=0.559863;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0478002;OID=.;OPOS=96525640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:90:90:81:81:9:9:0.1:6:3:32:49:6:3:32:49 chr2 96525643 . T C 150.43 PASS AF=0.241758;AO=22;DP=91;FAO=22;FDP=91;FR=.;FRO=69;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.00582354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.993;QD=6.6121;RBI=0.00671122;REFB=-0.00642602;REVB=-0.00333569;RO=69;SAF=4;SAR=18;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380475;STB=0.737465;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0346097;OID=.;OPOS=96525643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:69:69:22:22:0.241758:18:4:31:38:18:4:31:38 chr2 96525652 . T C 230.63 PASS AF=0.315217;AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.00680348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.169;QD=10.0273;RBI=0.00762723;REFB=-0.00711186;REVB=-0.00344778;RO=63;SAF=6;SAR=23;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339564;STB=0.701678;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.022363;OID=.;OPOS=96525652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:63:63:29:29:0.315217:23:6:29:34:23:6:29:34 chr2 96525718 . G T 191.44 PASS AF=0.218978;AO=29;DP=137;FAO=30;FDP=137;FR=.;FRO=107;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=59;FSRR=48;FWDB=-0.00788136;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.527;QD=5.58952;RBI=0.0155509;REFB=-0.00614217;REVB=0.0134058;RO=102;SAF=6;SAR=23;SRF=57;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452654;STB=0.782938;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0213505;OID=.;OPOS=96525718;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:102:107:29:30:0.218978:23:6:57:45:24:6:59:48 chr2 96525723 . C T 167.36 PASS AF=0.202899;AO=27;DP=138;FAO=28;FDP=138;FR=.;FRO=110;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=61;FSRR=49;FWDB=0.00170015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.889;QD=4.85102;RBI=0.0275282;REFB=-0.00195083;REVB=0.0274756;RO=110;SAF=4;SAR=23;SRF=61;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.533085;STB=0.808081;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0225399;OID=.;OPOS=96525723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:110:110:27:28:0.202899:23:4:61:49:23:5:61:49 chr2 96525736 . T C 144.34 PASS AF=0.173333;AO=26;DP=150;FAO=26;FDP=150;FR=.;FRO=124;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=66;FSRR=58;FWDB=0.021218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.435;QD=3.84902;RBI=0.022687;REFB=-0.000644442;REVB=-0.00803082;RO=123;SAF=5;SAR=21;SRF=66;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450279;STB=0.790332;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0117628;OID=.;OPOS=96525736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:123:124:26:26:0.173333:21:5:66:57:21:5:66:58 chr2 96525750 . T A 93.93 PASS AF=0.13125;AO=21;DP=160;FAO=21;FDP=160;FR=.;FRO=139;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=71;FSRR=68;FWDB=-0.00938457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8627;QD=2.34834;RBI=0.0232602;REFB=-0.00636917;REVB=-0.021283;RO=139;SAF=4;SAR=17;SRF=71;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413778;STB=0.789188;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.02895;OID=.;OPOS=96525750;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:160:160:139:139:21:21:0.13125:17:4:71:68:17:4:71:68 chr2 96525755 . A T 100.97 PASS AF=0.14;AO=21;DP=152;FAO=21;FDP=150;FR=.;FRO=129;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=67;FSRR=62;FWDB=-0.0362879;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.777;QD=2.69244;RBI=0.0366847;REFB=-0.00574827;REVB=-0.00538144;RO=128;SAF=5;SAR=16;SRF=68;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3729;STB=0.746842;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0343346;OID=.;OPOS=96525755;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:150:128:129:21:21:0.14:16:5:68:60:16:5:67:62 chr2 96525768 . G A 54.49 PASS AF=0.105263;AO=14;DP=133;FAO=14;FDP=133;FR=.;FRO=119;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=55;FSRR=64;FWDB=-0.0350928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.801;QD=1.63883;RBI=0.0359993;REFB=-0.0030403;REVB=-0.00802756;RO=119;SAF=2;SAR=12;SRF=55;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414676;STB=0.817687;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00691858;OID=.;OPOS=96525768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:133:133:119:119:14:14:0.105263:12:2:55:64:12:2:55:64 chr2 96525771 . A C 37.42 PASS AF=0.0852713;AO=11;DP=126;FAO=11;FDP=129;FR=.;FRO=118;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=62;FWDB=-0.0329296;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4726;QD=1.16015;RBI=0.0359782;REFB=-0.000808782;REVB=-0.0144938;RO=114;SAF=2;SAR=9;SRF=52;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335114;STB=0.785595;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00240585;OID=.;OPOS=96525771;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:126:129:114:118:11:11:0.0852713:9:2:52:62:9:2:56:62 chr2 96548068 . C T 495.21 PASS AF=0.446281;AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0881613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.05;QD=16.3706;RBI=0.0896113;REFB=-0.00334165;REVB=-0.0160552;RO=67;SAF=23;SAR=31;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814977;STB=0.545522;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00477403;OID=.;OPOS=96548068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:67:67:54:54:0.446281:31:23:34:33:31:23:34:33 chr2 96563206 . A T 68.2 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.000957255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.764;QD=5.56701;RBI=0.00971492;REFB=-0.0131238;REVB=-0.00966764;RO=39;SAF=3;SAR=7;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265333;STB=0.673286;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0306835;OID=.;OPOS=96563206;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:39:39:10:10:0.204082:7:3:20:19:7:3:20:19 chr2 96583735 . A C 129.46 PASS AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0184993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.584;QD=9.58926;RBI=0.0227216;REFB=-0.0182603;REVB=0.0131927;RO=37;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111237;STB=0.566083;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0549951;OID=.;OPOS=96583735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:9:8:21:16:9:8:21:16 chr2 96587496 . C T 310.35 PASS AF=0.583333;AO=25;DP=46;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.018661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.152;QD=25.8622;RBI=0.0190241;REFB=-0.0238995;REVB=-0.00369886;RO=20;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759698;STB=0.541109;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0242676;OID=.;OPOS=96587496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:20:20:25:28:0.583333:16:9:9:11:18:10:9:11 chr2 96592982 . T C 41.26 PASS AF=0.081761;AO=13;DP=160;FAO=13;FDP=159;FR=.;FRO=146;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=79;FSRR=67;FWDB=-0.01154;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.992;QD=1.038;RBI=0.0171936;REFB=-0.00182902;REVB=-0.0127456;RO=146;SAF=2;SAR=11;SRF=80;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441325;STB=0.850471;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0233564;OID=.;OPOS=96592982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:160:159:146:146:13:13:0.081761:11:2:80:66:11:2:79:67 chr2 96593000 . A G 202.03 PASS AF=0.181818;AO=36;DP=200;FAO=36;FDP=198;FR=.;FRO=162;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=87;FSRR=75;FWDB=-0.0225026;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.581;QD=4.08149;RBI=0.0252582;REFB=-0.00376704;REVB=0.0114721;RO=162;SAF=8;SAR=28;SRF=87;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412169;STB=0.763341;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0574407;OID=.;OPOS=96593000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:162:162:36:36:0.181818:28:8:87:75:28:8:87:75 chr2 96593016 . C A 308.34 PASS AF=0.224215;AO=50;DP=225;FAO=50;FDP=223;FR=.;FRO=173;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=94;FSRR=79;FWDB=-0.0550695;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5073;QD=5.53073;RBI=0.068371;REFB=-0.0123151;REVB=-0.0405208;RO=169;SAF=11;SAR=39;SRF=91;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417906;STB=0.759211;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0482396;OID=.;OPOS=96593016;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:169:173:50:50:0.224215:39:11:91:78:39:11:94:79 chr2 96593025 . C T 375.81 PASS AF=0.241525;AO=57;DP=235;FAO=57;FDP=236;FR=.;FRO=179;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=98;FSRR=81;FWDB=-0.0252273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.467;QD=6.36961;RBI=0.0297436;REFB=-6.47013e-05;REVB=-0.0157564;RO=178;SAF=13;SAR=44;SRF=97;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411601;STB=0.750255;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000294419;OID=.;OPOS=96593025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:236:178:179:57:57:0.241525:44:13:97:81:44:13:98:81 chr2 96593108 . T G 260.05 PASS AF=0.210784;AO=43;DP=204;FAO=43;FDP=204;FR=.;FRO=161;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=92;FSRR=69;FWDB=0.0189392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7065;QD=5.09895;RBI=0.0393775;REFB=0.00147767;REVB=0.0345238;RO=157;SAF=10;SAR=33;SRF=90;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434701;STB=0.767318;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0053431;OID=.;OPOS=96593108;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:157:161:43:43:0.210784:33:10:90:67:33:10:92:69 chr2 96593118 . T A 195.89 PASS AF=0.185185;AO=35;DP=189;FAO=35;FDP=189;FR=.;FRO=154;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=91;FSRR=63;FWDB=0.00680696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7577;QD=4.14579;RBI=0.0178878;REFB=0.000237082;REVB=0.016542;RO=154;SAF=8;SAR=27;SRF=91;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456289;STB=0.787639;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000674604;OID=.;OPOS=96593118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:154:154:35:35:0.185185:27:8:91:63:27:8:91:63 chr2 96594966 . T G 387.66 PASS AF=0.833333;AO=30;DP=36;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00499668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.13;QD=43.0728;RBI=0.0846483;REFB=-0.0470508;REVB=0.0845007;RO=6;SAF=23;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107382;STB=0.558212;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00648893;OID=.;OPOS=96594966;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:36:36:6:6:30:30:0.833333:7:23:3:3:7:23:3:3 chr2 96595032 . A T 462.09 PASS AF=0.795455;AO=35;DP=44;FAO=35;FDP=44;FR=.;FRO=9;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.017354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.28;QD=42.0085;RBI=0.0193077;REFB=-0.0186932;REVB=0.0084633;RO=9;SAF=25;SAR=10;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162847;STB=0.588182;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00855381;OID=.;OPOS=96595032;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:44:44:9:9:35:35:0.795455:10:25:3:6:10:25:3:6 chr2 96595037 . TAATC T 111.73 PASS AF=0.418605;AO=17;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0188846;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=4;MLLD=254.251;QD=10.3931;RBI=0.0205955;REFB=-0.0318067;REVB=0.00821849;RO=24;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260364;STB=0.674487;STBP=0.074;TYPE=del;VARB=0.0343906;OID=.;OPOS=96595038;OREF=AATC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.418605:17:43:18:43:25:14:4:13:12:99:24:13:4:13:11 chr2 96601240 . G A 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.000302695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.628;QD=12.4825;RBI=0.0241878;REFB=-0.00174426;REVB=0.0241859;RO=18;SAF=1;SAR=11;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.567564;STB=0.857435;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00331258;OID=.;OPOS=96601240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:11:1:9:9:11:1:10:9 chr2 96601345 . T C 124.06 PASS AF=0.32;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00664305;FXX=0.166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.389;QD=9.92509;RBI=0.052079;REFB=-0.0127651;REVB=0.0516536;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134796;STB=0.579903;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0320471;OID=.;OPOS=96601345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:50:34:34:16:16:0.32:8:8:21:13:8:8:21:13 chr2 96601364 . C T 183.07 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0102371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.021;QD=13.3139;RBI=0.0153436;REFB=-0.00345296;REVB=-0.0114293;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105895;STB=0.567367;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00567727;OID=.;OPOS=96601364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:33:22:22:0.4:9:13:22:10:9:13:23:10 chr2 96604591 . A G 2087.39 PASS AF=0.617162;AO=187;DP=304;FAO=187;FDP=303;FR=.;FRO=116;FSAF=106;FSAR=81;FSRF=52;FSRR=64;FWDB=0.0266541;FXX=0.00328937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.942;QD=27.5563;RBI=0.0308924;REFB=-0.025621;REVB=0.0156173;RO=117;SAF=106;SAR=81;SRF=52;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878154;STB=0.54565;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0108294;OID=.;OPOS=96604591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:303:117:116:187:187:0.617162:81:106:52:65:81:106:52:64 chr2 96604606 . C A 281.62 PASS AF=0.174917;AO=53;DP=303;FAO=53;FDP=303;FR=.;FRO=250;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=132;FSRR=118;FWDB=-0.00992575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.898;QD=3.71775;RBI=0.0156288;REFB=-0.0011488;REVB=-0.0120722;RO=250;SAF=27;SAR=26;SRF=132;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240525;STB=0.515327;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00562884;OID=.;OPOS=96604606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:303:250:250:53:53:0.174917:26:27:132:118:26:27:132:118 chr2 96604632 . A T 1523.68 PASS AF=0.513889;AO=148;DP=288;FAO=148;FDP=288;FR=.;FRO=140;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=71;FSRR=69;FWDB=-0.00587353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6379;QD=21.1622;RBI=0.00899582;REFB=-0.0172212;REVB=-0.0068137;RO=140;SAF=84;SAR=64;SRF=71;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542375;STB=0.529675;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0282099;OID=.;OPOS=96604632;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:288:140:140:148:148:0.513889:64:84:71:69:64:84:71:69 chr2 96604730 . T C 83.51 PASS AF=0.226415;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.0385058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.517;QD=6.3029;RBI=0.0417047;REFB=-0.010261;REVB=-0.0160182;RO=41;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057526;STB=0.536173;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0196984;OID=.;OPOS=96604730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:41:41:12:12:0.226415:8:4:12:29:8:4:12:29 chr2 96606944 . C T 121.59 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0011174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8787;QD=15.1985;RBI=0.00255577;REFB=-0.00953094;REVB=0.00229857;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279744;STB=0.660653;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0119498;OID=.;OPOS=96606944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:6:8:5:13:6:8:5:13 chr2 96610399 . C A 108.24 PASS AF=0.161538;AO=21;DP=131;FAO=21;FDP=130;FR=.;FRO=109;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=65;FWDB=0.00281616;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=353.145;QD=3.3305;RBI=0.00950066;REFB=-0.00264129;REVB=0.00907369;RO=109;SAF=12;SAR=9;SRF=44;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210909;STB=0.637805;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0112962;OID=.;OPOS=96610399;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:109:109:21:21:0.161538:9:12:44:65:9:12:44:65 chr2 96610410 . T A 83.17 PASS AF=0.136364;AO=18;DP=131;FAO=18;FDP=132;FR=.;FRO=114;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=0.000212113;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.662;QD=2.52016;RBI=0.00621152;REFB=-0.00253859;REVB=0.00620789;RO=112;SAF=11;SAR=7;SRF=45;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258153;STB=0.680592;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00522772;OID=.;OPOS=96610410;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:131:132:112:114:18:18:0.136364:7:11:45:67:7:11:45:69 chr2 96610420 . G T 86.01 PASS AF=0.144;AO=17;DP=127;FAO=18;FDP=125;FR=.;FRO=107;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=0.017775;FXX=0.0234357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.804;QD=2.75223;RBI=0.0178276;REFB=-0.00221264;REVB=-0.00136755;RO=109;SAF=10;SAR=7;SRF=44;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227737;STB=0.629233;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0191938;OID=.;OPOS=96610420;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:127:125:109:107:17:18:0.144:7:10:44:65:8:10:43:64 chr2 96610455 . C A 32.34 PASS AF=0.09375;AO=8;DP=97;FAO=9;FDP=96;FR=.;FRO=87;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=55;FWDB=0.00402928;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.379;QD=1.34754;RBI=0.00431811;REFB=-0.00245174;REVB=-0.00155272;RO=88;SAF=5;SAR=3;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261823;STB=0.665574;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.029672;OID=.;OPOS=96610455;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:97:96:88:87:8:9:0.09375:3:5:34:54:4:5:32:55 chr2 96610899 . T C 1346.83 PASS AF=0.63587;AO=117;DP=184;FAO=117;FDP=184;FR=.;FRO=67;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.00731876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.4319;QD=29.279;RBI=0.0109589;REFB=-0.0312246;REVB=0.00815677;RO=64;SAF=57;SAR=60;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841928;STB=0.501952;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0168142;OID=.;OPOS=96610899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:64:67:117:117:0.63587:60:57:32:32:60:57:33:34 chr2 96610921 . T G 1447.87 PASS AF=0.64;AO=128;DP=201;FAO=128;FDP=200;FR=.;FRO=72;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0188404;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.989;QD=28.9574;RBI=0.0188408;REFB=-0.0141225;REVB=0.000116515;RO=72;SAF=58;SAR=70;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314974;STB=0.516968;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00939215;OID=.;OPOS=96610921;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:72:72:128:128:0.64:70:58:36:36:70:58:36:36 chr2 96616485 . C G 60.14 PASS AF=0.142857;AO=12;DP=84;FAO=12;FDP=84;FR=.;FRO=72;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.0120267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7429;QD=2.86375;RBI=0.0344635;REFB=-0.0067;REVB=0.0322969;RO=72;SAF=4;SAR=8;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240571;STB=0.666389;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0199603;OID=.;OPOS=96616485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:84:84:72:72:12:12:0.142857:8:4:38:34:8:4:38:34 chr2 96616506 . GC CA 60.95 PASS AF=0.146341;AO=12;DP=82;FAO=12;FDP=82;FR=.;FRO=70;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0287564;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=162.987;QD=2.97302;RBI=0.0366056;REFB=-0.00819429;REVB=-0.0226503;RO=69;SAF=4;SAR=8;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234297;STB=0.666389;STBP=0.228;TYPE=mnp;VARB=0.0272966;OID=.;OPOS=96616506;OREF=GC;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:82:82:69:70:12:12:0.146341:8:4:36:33:8:4:37:33 chr2 96616532 . T G 53.48 PASS AF=0.150685;AO=10;DP=74;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00387786;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.614;QD=2.93054;RBI=0.00388234;REFB=0.000765364;REVB=-0.000186488;RO=59;SAF=2;SAR=8;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375066;STB=0.710271;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.00657495;OID=.;OPOS=96616532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:74:73:59:62:10:11:0.150685:8:2:29:30:8:3:32:30 chr2 96617090 . A G 138.98 PASS AF=0.198347;AO=24;DP=121;FAO=24;FDP=121;FR=.;FRO=97;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.0127442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.33;QD=4.59426;RBI=0.0149069;REFB=-0.00393935;REVB=0.00773311;RO=97;SAF=15;SAR=9;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128487;STB=0.581326;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0288115;OID=.;OPOS=96617090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:97:97:24:24:0.198347:9:15:51:46:9:15:51:46 chr2 96617106 . A C 179.94 PASS AF=0.216418;AO=29;DP=134;FAO=29;FDP=134;FR=.;FRO=105;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=58;FSRR=47;FWDB=0.019321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.865;QD=5.37129;RBI=0.0197044;REFB=-0.0102184;REVB=-0.00386803;RO=105;SAF=17;SAR=12;SRF=58;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436603;STB=0.527044;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0470356;OID=.;OPOS=96617106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:105:105:29:29:0.216418:12:17:58:47:12:17:58:47 chr2 96617111 . G A 178.01 PASS AF=0.210145;AO=29;DP=137;FAO=29;FDP=138;FR=.;FRO=109;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=61;FSRR=48;FWDB=-0.0152319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0445;QD=5.15964;RBI=0.0159583;REFB=-0.00355747;REVB=0.00475963;RO=108;SAF=17;SAR=12;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396856;STB=0.521458;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0195398;OID=.;OPOS=96617111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:108:109:29:29:0.210145:12:17:60:48:12:17:61:48 chr2 96617113 . G A 177.59 PASS AF=0.208633;AO=29;DP=139;FAO=29;FDP=139;FR=.;FRO=110;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=62;FSRR=48;FWDB=-0.0114534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.86;QD=5.11036;RBI=0.0167076;REFB=-0.00363973;REVB=-0.012164;RO=110;SAF=17;SAR=12;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293334;STB=0.51828;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0116458;OID=.;OPOS=96617113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:110:110:29:29:0.208633:12:17:62:48:12:17:62:48 chr2 96617125 . T C 196.28 PASS AF=0.21831;AO=31;DP=142;FAO=31;FDP=142;FR=.;FRO=111;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=63;FSRR=48;FWDB=0.000529222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.612;QD=5.529;RBI=0.0362693;REFB=0.00489188;REVB=0.0362655;RO=111;SAF=17;SAR=14;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246093;STB=0.51517;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.0188329;OID=.;OPOS=96617125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:111:111:31:31:0.21831:14:17:63:48:14:17:63:48 chr2 96617132 . T C 205.36 PASS AF=0.22069;AO=32;DP=145;FAO=32;FDP=145;FR=.;FRO=113;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=63;FSRR=50;FWDB=-0.0136774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.646;QD=5.66496;RBI=0.0155106;REFB=-0.00344177;REVB=-0.00731504;RO=113;SAF=18;SAR=14;SRF=63;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00639287;STB=0.503935;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0133469;OID=.;OPOS=96617132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:113:113:32:32:0.22069:14:18:63:50:14:18:63:50 chr2 96617155 . A G 159.63 PASS AF=0.18239;AO=29;DP=159;FAO=29;FDP=159;FR=.;FRO=130;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=73;FSRR=57;FWDB=-0.00392314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.315;QD=4.01588;RBI=0.0341983;REFB=-0.00320214;REVB=0.0339725;RO=130;SAF=15;SAR=14;SRF=73;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570118;STB=0.536327;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0224004;OID=.;OPOS=96617155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:130:130:29:29:0.18239:14:15:73:57:14:15:73:57 chr2 96619688 . T G 59.81 PASS AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00379051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.568;QD=5.69635;RBI=0.00388344;REFB=-0.00663573;REVB=0.00084449;RO=33;SAF=7;SAR=2;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820281;STB=0.553831;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0353355;OID=.;OPOS=96619688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:42:33:33:9:9:0.214286:2:7:24:9:2:7:24:9 chr2 96619734 . CA TA,TG 133.74 PASS AF=0.235294,0.0980392;AO=11,5;DP=51;FAO=12,5;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=8,1;FSAR=4,4;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0250676,0.0170234;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=68.4468,100.83;QD=10.4895;RBI=0.0282037,0.017571;REFB=-0.0160033,0.0015789;REVB=0.0129253,0.00435256;RO=34;SAF=7,1;SAR=4,4;SRF=26;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.180464,-0.590495;STB=0.586075,0.898893;STBP=0.548,0.212;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0454316,0.00631685;OID=.,.;OPOS=96619734,96619734;OREF=C,CA;OALT=T,TG;OMAPALT=TA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:51:51:34:34:11,5:12,5:0.235294,0.0980392:4,4:7,1:26:8:4,4:8,1:26:8 chr2 96626292 . C T 375.65 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.287;QD=55.6513;RBI=0.0300626;REFB=0;REVB=0.0223946;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175966;OID=.;OPOS=96626292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0 chr2 96780716 . T G 255.16 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0182339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.003;QD=22.1879;RBI=0.0669325;REFB=-0.020484;REVB=-0.0644009;RO=22;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148545;STB=0.583263;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0238307;OID=.;OPOS=96780716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:15:9:12:10:15:9:12:10 chr2 96789787 . T C 162.21 PASS AF=0.305556;AO=21;DP=73;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0174037;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.64;QD=9.01151;RBI=0.019972;REFB=-0.0206843;REVB=-0.00979742;RO=45;SAF=14;SAR=7;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210922;STB=0.61824;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0377331;OID=.;OPOS=96789787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:45:50:21:22:0.305556:7:14:22:23:7:15:26:24 chr2 96795608 . T G 277.49 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0652143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4267;QD=20.5551;RBI=0.066184;REFB=-0.0232819;REVB=-0.0112877;RO=25;SAF=13;SAR=16;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125896;STB=0.569927;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0141301;OID=.;OPOS=96795608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:16:13:15:10:16:13:15:10 chr2 96795714 . G A 258.6 PASS AF=0.460317;AO=28;DP=62;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.0207843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.988;QD=16.419;RBI=0.0361464;REFB=-0.00376046;REVB=0.0295732;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135537;STB=0.58531;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.011055;OID=.;OPOS=96795714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:34:34:28:29:0.460317:11:17:25:9:12:17:25:9 chr2 96795857 . T C 564.12 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.012347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.715;QD=57.8583;RBI=0.0370565;REFB=-0.0838174;REVB=0.034939;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.511622;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000798294;OID=.;OPOS=96795857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:0:1:38:38:0.974359:21:17:0:0:21:17:0:1 chr2 96809331 . T C 1489.17 PASS AF=0.97;AO=96;DP=99;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0249226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.192;QD=59.567;RBI=0.0252875;REFB=-0.086428;REVB=-0.0042808;RO=2;SAF=65;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143678;STB=0.500474;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0123009;OID=.;OPOS=96809331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:99:100:2:3:96:97:0.97:31:65:2:0:31:66:2:1 chr2 96859034 . A G 320.49 PASS AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.011919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.989;QD=27.2759;RBI=0.0367799;REFB=-0.0225628;REVB=0.034795;RO=19;SAF=13;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709935;STB=0.539143;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0164049;OID=.;OPOS=96859034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:15:13:7:12:15:13:7:12 chr2 96861159 . C G 582.28 PASS AF=0.424658;AO=62;DP=146;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=0.0246851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.624;QD=15.953;RBI=0.0331536;REFB=0.00512285;REVB=0.0221316;RO=82;SAF=43;SAR=19;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185425;STB=0.605454;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00607938;OID=.;OPOS=96861159;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:82:84:62:62:0.424658:19:43:43:39:19:43:44:40 chr2 96874589 . CTT CCC 50.39 PASS AF=0.32;AO=6;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0756871;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=65.3573;QD=8.0621;RBI=0.103312;REFB=-0.020203;REVB=-0.0703194;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946031;STB=0.585139;STBP=0.639;TYPE=mnp;VARB=0.0413672;OID=.;OPOS=96874590;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.32:6:25:8:25:17:6:2:11:6:50:12:4:2:7:5 chr2 96917588 . T G 877.17 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00694301;FXX=0.0312451;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.75;QD=56.5915;RBI=0.00926171;REFB=0.0992653;REVB=0.00612976;RO=1;SAF=20;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230134;STB=0.512191;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000598467;OID=.;OPOS=96917588;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:62:1:1:61:61:0.983871:41:20:1:0:41:20:1:0 chr2 96919642 . C T 228.92 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0230495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.401;QD=16.0642;RBI=0.0244619;REFB=-0.0239552;REVB=0.0081916;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253021;STB=0.514275;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0297118;OID=.;OPOS=96919642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:9:17:21:10:9:17:21:10 chr2 96937296 . G C 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.011911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4731;QD=11.8143;RBI=0.0359137;REFB=0.00680662;REVB=-0.033881;RO=23;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441799;STB=0.526274;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.0125075;OID=.;OPOS=96937296;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:10:3:6:17:10:3:6:17 chr2 96944553 . G A 186.86 PASS AF=0.666667;AO=17;DP=26;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0190597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.29;QD=27.6836;RBI=0.0257336;REFB=0.0375135;REVB=-0.01729;RO=9;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158275;STB=0.593256;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.0108899;OID=.;OPOS=96944553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:26:27:9:9:17:18:0.666667:7:10:3:6:7:11:3:6 chr2 96952833 . A G 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0203678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.063;QD=11.8142;RBI=0.0589129;REFB=-0.0102456;REVB=-0.0552801;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174558;STB=0.602471;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0236883;OID=.;OPOS=96952833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:6:7:16:7:6:7:16:7 chr2 96993757 . C T 178.93 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0105896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.704;QD=15.2278;RBI=0.046353;REFB=-0.0220941;REVB=0.0451272;RO=28;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137298;STB=0.578983;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0357143;OID=.;OPOS=96993757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:9:10:11:17:9:10:11:17 chr2 96993884 . A G 267.81 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.000538236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3635;QD=16.2311;RBI=0.00145388;REFB=-0.010143;REVB=-0.00135058;RO=36;SAF=7;SAR=23;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918075;STB=0.551964;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0116658;OID=.;OPOS=96993884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:23:7:11:25:23:7:11:25 chr2 97020049 . T C 380.04 PASS AF=0.4875;AO=38;DP=79;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00321669;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.232;QD=19.0022;RBI=0.0220954;REFB=-0.011509;REVB=0.02186;RO=39;SAF=16;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138152;STB=0.527854;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0126401;OID=.;OPOS=97020049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:39:41:38:39:0.4875:22:16:17:22:23:16:19:22 chr2 97030247 . T C 389.09 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.00546639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.054;QD=18.7513;RBI=0.0447691;REFB=-0.0361284;REVB=0.0444341;RO=43;SAF=23;SAR=17;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734648;STB=0.540841;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0333585;OID=.;OPOS=97030247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:17:23:28:15:17:23:28:15 chr2 97166204 . A G 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.82;QD=57.6806;RBI=0.0151418;REFB=0;REVB=0.0059046;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.32079e-05;OID=.;OPOS=97166204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr2 97351840 . A G 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.017335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.533;QD=17.4545;RBI=0.0206069;REFB=-0.019592;REVB=-0.011142;RO=29;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00357308;STB=0.502007;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.00845842;OID=.;OPOS=97351840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:15:12:13:16:15:12:13:16 chr2 97559759 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000702539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0021;QD=63.2858;RBI=0.0369242;REFB=0;REVB=0.0369175;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360259;OID=.;OPOS=97559759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0 chr2 97808349 . T C 132.65 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0388334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.65;QD=15.1596;RBI=0.0389417;REFB=-0.027101;REVB=0.00290217;RO=20;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329428;STB=0.519058;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0577058;OID=.;OPOS=97808349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:7:8:10:10:7:8:10:10 chr2 97808394 . C G 137.56 PASS AF=0.301587;AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0177155;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.353;QD=8.73412;RBI=0.0205201;REFB=-0.00628942;REVB=0.0103555;RO=44;SAF=11;SAR=8;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144095;STB=0.508582;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0161666;OID=.;OPOS=97808394;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:44:44:19:19:0.301587:8:11:26:18:8:11:26:18 chr2 97820434 . T G 37.74 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0183653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.34;QD=25.1608;RBI=0.01843;REFB=-0.0988951;REVB=-0.0015432;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00230738;OID=.;OPOS=97820434;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1 chr2 97820478 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7441;QD=35.5757;RBI=0.0291905;REFB=0;REVB=-0.0119017;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135272;OID=.;OPOS=97820478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr2 97820489 . C G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.952;QD=33.4285;RBI=0.0589853;REFB=0;REVB=0.0534648;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218058;OID=.;OPOS=97820489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr2 97820493 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.809;QD=33.4284;RBI=0.0732927;REFB=0;REVB=0.0464883;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00313435;OID=.;OPOS=97820493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr2 97827818 . CTTTTTTTTTTTT CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA 156.24 PASS AF=0.553846,0.215385;AO=16,14;DP=66;FAO=36,14;FDP=65;FR=.;FRO=15;FSAF=22,10;FSAR=14,4;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0261826,-0.00209919;FXX=0.0579626;HRUN=12,12;LEN=1,1;MLLD=5.07032,14.2394;QD=9.61495;RBI=0.145601,0.0940903;REFB=-0.161615,-0.116377;REVB=-0.143227,-0.0940669;RO=24;SAF=12,10;SAR=4,4;SRF=18;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.83577e-08,-0.0481776;STB=0.581905,0.605131;STBP=0.107,0.432;TYPE=del,snp;VARB=0.175738,-0.0448461;OID=.,.;OPOS=97827819,97827830;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.553846,0.215385:16,14:66:36,14:65:15:22,10:14,4:13:2:43:24:12,10:4,4:18:6 chr2 97827839 . G A 283.35 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00213822;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6751;QD=14.3471;RBI=0.0297156;REFB=-0.0121857;REVB=0.0296386;RO=47;SAF=22;SAR=10;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196303;STB=0.612069;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0202258;OID=.;OPOS=97827839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:47:47:32:32:0.405063:10:22:24:23:10:22:24:23 chr2 97828982 . C T 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0142607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.281;QD=17.6438;RBI=0.0397763;REFB=-0.0103507;REVB=-0.037132;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955156;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00488166;OID=.;OPOS=97828982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:3:4:4:5:3:4 chr2 97829029 . GT AG 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0336159;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=238.954;QD=9.56944;RBI=0.0452626;REFB=0.00504319;REVB=-0.0303096;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106688;STB=0.565057;STBP=0.675;TYPE=mnp;VARB=-0.0192189;OID=.;OPOS=97829029;OREF=GT;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:4:4:6:9:4:4:6:9 chr2 97830012 . C T 63.94 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00672381;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.764;QD=19.6744;RBI=0.0466977;REFB=-0.00871224;REVB=-0.0462111;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213494;STB=0.588011;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00319693;OID=.;OPOS=97830012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:14:13:6:5:8:8:0.615385:3:5:2:4:3:5:2:3 chr2 97830053 . A G 140.4 PASS AF=0.311475;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00477888;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.965;QD=9.20679;RBI=0.0131902;REFB=-0.00871174;REVB=-0.012294;RO=40;SAF=14;SAR=5;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263851;STB=0.675131;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0334113;OID=.;OPOS=97830053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:40:42:19:19:0.311475:5:14:21:19:5:14:21:21 chr2 97833342 . G A 130.65 PASS AF=0.394737;AO=14;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0107397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.906;QD=13.7526;RBI=0.0264004;REFB=-0.0196455;REVB=-0.0241172;RO=23;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219817;STB=0.641823;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0232463;OID=.;OPOS=97833342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:14:15:0.394737:4:10:12:11:4:11:12:11 chr2 97833361 . A G 45.11 PASS AF=0.212121;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0775046;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7305;QD=5.46727;RBI=0.077538;REFB=-0.00193034;REVB=-0.00227713;RO=24;SAF=6;SAR=1;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464903;STB=0.814547;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0308904;OID=.;OPOS=97833361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:35:33:24:26:7:7:0.212121:1:6:12:12:1:6:13:13 chr2 97833466 . C T 218.65 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0202256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.855;QD=17.4924;RBI=0.0248215;REFB=-0.00746915;REVB=0.0143886;RO=28;SAF=13;SAR=9;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165649;STB=0.509425;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0122412;OID=.;OPOS=97833466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:9:13:17:11:9:13:17:11 chr2 97869848 . G A 573.58 PASS AF=0.429577;AO=61;DP=143;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.0072383;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.106;QD=16.1571;RBI=0.0171913;REFB=-0.00437066;REVB=-0.0155932;RO=75;SAF=34;SAR=27;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294925;STB=0.501052;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00586213;OID=.;OPOS=97869848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:75:81:61:61:0.429577:27:34:44:31:27:34:45:36 chr2 97884763 . T C 976.82 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.626;QD=57.46;RBI=0.093952;REFB=-0.150945;REVB=0.087236;RO=1;SAF=46;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101641;STB=0.505375;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00103377;OID=.;OPOS=97884763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:21:46:1:0:21:46:1:0 chr2 98128172 . C A 86.13 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00882037;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2269;QD=11.1139;RBI=0.023308;REFB=0.000431935;REVB=-0.0215746;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202063;STB=0.621079;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.00202945;OID=.;OPOS=98128172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:31:31:20:20:11:11:0.354839:7:4:11:9:7:4:11:9 chr2 98128194 . GGT CAC 208.57 PASS AF=0.478261;AO=19;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00281041;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=183.008;QD=18.1362;RBI=0.0270315;REFB=-0.00505615;REVB=0.026885;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668713;STB=0.504078;STBP=0.969;TYPE=mnp;VARB=0.0090251;OID=.;OPOS=98128194;OREF=GGT;OALT=CAC;OMAPALT=CAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:23:24:19:22:0.478261:7:12:13:10:9:13:14:10 chr2 98128228 . G A 59.81 PASS AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00596716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.79;QD=5.69645;RBI=0.0176299;REFB=-0.014523;REVB=-0.0165894;RO=32;SAF=6;SAR=3;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132251;STB=0.576097;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0390128;OID=.;OPOS=98128228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:42:32:33:9:9:0.214286:3:6:18:14:3:6:19:14 chr2 98128256 . C T 180.22 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0520055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.517;QD=23.2542;RBI=0.0523569;REFB=-0.0163872;REVB=0.00605504;RO=12;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596025;STB=0.548334;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00591054;OID=.;OPOS=98128256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:12:13:18:18:0.580645:9:9:7:5:9:9:8:5 chr2 98128258 . G C 168.25 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0350113;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.945;QD=22.4334;RBI=0.0363742;REFB=-0.0106676;REVB=0.00986381;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.562427;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.00972702;OID=.;OPOS=98128258;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:8:5:9:8:8:5 chr2 98128300 . A G 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00151272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2546;QD=11.2561;RBI=0.0324828;REFB=-0.0133233;REVB=0.0324476;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345943;STB=0.709978;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0253228;OID=.;OPOS=98128300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:5:7:2:6:5:7 chr2 98833449 . G C 49.98 PASS AF=1;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.922;QD=33.3232;RBI=0.0621601;REFB=0;REVB=-0.00651891;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0238902;OID=.;OPOS=98833449;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:4:6:1:2:2:0:0:2:4:0:0 chr2 98844674 . C G 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6724;QD=62.9815;RBI=0.0635049;REFB=0;REVB=0.0629242;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000514694;OID=.;OPOS=98844674;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr2 98853173 . G A 1700.24 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6932;QD=60.1855;RBI=0.0490317;REFB=0;REVB=0.0178555;RO=0;SAF=54;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114163;OID=.;OPOS=98853173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:58:54:0:0:58:55:0:0 chr2 98928494 . G A 841.75 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0257149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9034;QD=54.3064;RBI=0.0996771;REFB=0.00458874;REVB=0.096303;RO=1;SAF=47;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349148;STB=0.535702;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00150071;OID=.;OPOS=98928494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:62:62:1:2:60:60:0.967742:13:47:0:1:13:47:0:2 chr2 98994641 . G A 1974.06 PASS AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00690486;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.618;QD=62.1753;RBI=0.032236;REFB=0;REVB=0.0314878;RO=0;SAF=65;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21802e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58479e-05;OID=.;OPOS=98994641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:62:65:0:0:62:65:0:0 chr2 99013259 . C T 216.29 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00733692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7808;QD=22.184;RBI=0.0116598;REFB=-0.0471788;REVB=0.00906206;RO=18;SAF=16;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100989;STB=0.556905;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0404603;OID=.;OPOS=99013259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:5:16:12:6:5:16:12:6 chr2 99342785 . C T 258.56 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0362494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3496;QD=16.4163;RBI=0.0374282;REFB=-0.00551492;REVB=-0.00931964;RO=33;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634834;STB=0.528033;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.00905223;OID=.;OPOS=99342785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:34:29:29:0.460317:16:13:17:16:16:13:17:17 chr2 99778735 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.752;QD=60.9785;RBI=0.0146882;REFB=0;REVB=0.00132632;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67041e-05;OID=.;OPOS=99778735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0 chr2 99778985 . T C 989.95 PASS AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0172474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0252;QD=54.9971;RBI=0.0190152;REFB=0.0357147;REVB=-0.00800665;RO=3;SAF=38;SAR=31;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922706;STB=0.504885;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=-0.0050017;OID=.;OPOS=99778985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:72:72:3:3:69:69:0.958333:31:38:2:1:31:38:2:1 chr2 99804642 . T C 558.23 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189428;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.252;QD=60.3493;RBI=0.0589893;REFB=0;REVB=0.0558651;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392243;OID=.;OPOS=99804642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:37:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:18:19:0:0 chr2 99812070 . G A 993.93 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152538;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2157;QD=59.3391;RBI=0.0429417;REFB=0;REVB=-0.0401411;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000502144;OID=.;OPOS=99812070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0 chr2 99978048 . G A 258.47 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0888336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.074;QD=16.4105;RBI=0.0905215;REFB=-0.0443273;REVB=-0.0173996;RO=33;SAF=11;SAR=18;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785306;STB=0.532446;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0443105;OID=.;OPOS=99978048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:33:34:29:29:0.460317:18:11:10:23:18:11:11:23 chr2 99995804 . T C 547.87 PASS AF=0.525253;AO=51;DP=98;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0277634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.222;QD=22.1362;RBI=0.0278127;REFB=-0.0266161;REVB=0.00165419;RO=46;SAF=23;SAR=28;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713642;STB=0.537722;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0236164;OID=.;OPOS=99995804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:46:47:51:52:0.525253:28:23:17:29:28:24:18:29 chr2 100017514 . ATAAT A 543.11 PASS AF=0.547368;AO=46;DP=98;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00915728;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=4;MLLD=257.315;QD=22.8677;RBI=0.011052;REFB=-0.0170203;REVB=-0.00618805;RO=41;SAF=13;SAR=33;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173647;STB=0.557354;STBP=0.26;TYPE=del;VARB=0.0151266;OID=.;OPOS=100017515;OREF=TAAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.547368:46:98:52:95:43:18:34:20:23:99:41:13:33:19:22 chr2 100017545 . G A 339.27 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00177855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.168;QD=20.5616;RBI=0.00179516;REFB=-0.0372848;REVB=0.000243611;RO=30;SAF=13;SAR=22;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138579;STB=0.570111;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0116927;OID=.;OPOS=100017545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:30:31:35:35:0.530303:22:13:16:14:22:13:16:15 chr2 100017609 . A G 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0529818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.637;QD=12.6375;RBI=0.0533805;REFB=-0.00792582;REVB=0.00651258;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164083;STB=0.596268;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00789952;OID=.;OPOS=100017609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:13:8:7:6:13:8 chr2 100019496 . A G 197.72 PASS AF=0.5;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.000536113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.784;QD=19.7722;RBI=0.00796491;REFB=-0.0200117;REVB=-0.00794685;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308989;STB=0.64985;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0335701;OID=.;OPOS=100019496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:18:20:20:20:0.5:13:7:13:5:13:7:13:7 chr2 100055506 . A G 265.38 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0112219;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.122;QD=17.9916;RBI=0.018011;REFB=-0.00211062;REVB=-0.0140877;RO=30;SAF=22;SAR=7;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106338;STB=0.559837;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00207471;OID=.;OPOS=100055506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:7:22:20:10:7:22:20:10 chr2 100199386 . G T 574.07 PASS AF=0.46875;AO=56;DP=124;FAO=60;FDP=128;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.0254639;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.007;QD=17.9397;RBI=0.0256549;REFB=-0.0133569;REVB=0.00312396;RO=67;SAF=20;SAR=36;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479907;STB=0.501628;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0146128;OID=.;OPOS=100199386;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:128:67:68:56:60:0.46875:36:20:27:40:36:24:27:41 chr2 100218080 . G A 754.64 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0528032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.278;QD=54.8829;RBI=0.0552728;REFB=-0.108776;REVB=0.0163369;RO=1;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140687;STB=0.50746;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00292833;OID=.;OPOS=100218080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:33:21:0:1:33:21:0:1 chr2 100247478 . C T 88.09 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00255353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9753;QD=14.094;RBI=0.00308752;REFB=-0.00881487;REVB=0.00173558;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435331;STB=0.525501;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0100963;OID=.;OPOS=100247478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:7:7:5:6:7:7 chr2 100343557 . C T 1080.44 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.956;QD=60.0245;RBI=0.0293609;REFB=0;REVB=0.0292463;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13488e-05;OID=.;OPOS=100343557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0 chr2 100897573 . G A 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.933;QD=59.5017;RBI=0.0339272;REFB=0;REVB=0.000496939;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22137e-05;OID=.;OPOS=100897573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr2 100915772 . A G 696.09 PASS AF=0.938776;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0491001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2421;QD=56.8237;RBI=0.0495216;REFB=0.0229147;REVB=-0.00644742;RO=2;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268574;STB=0.505718;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.0115208;OID=.;OPOS=100915772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:49:2:3:46:46:0.938776:34:12:0:2:34:12:1:2 chr2 100916306 . A G 1202.27 PASS AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000563617;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.702;QD=58.6473;RBI=0.0141115;REFB=0.0133368;REVB=-0.0141002;RO=2;SAF=43;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00174064;STB=0.500919;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=2.71689e-05;OID=.;OPOS=100916306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:37:43:1:1:37:43:1:1 chr2 100916315 . A G 302.61 PASS AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00299323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.395;QD=17.0483;RBI=0.0472646;REFB=0.00327479;REVB=0.0471697;RO=36;SAF=17;SAR=16;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1425;STB=0.56257;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00431327;OID=.;OPOS=100916315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:38:33:33:0.464789:16:17:24:12:16:17:24:14 chr2 100917109 . C T 915.36 PASS AF=0.479167;AO=92;DP=192;FAO=92;FDP=192;FR=.;FRO=100;FSAF=70;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=48;FWDB=0.00383328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.641;QD=19.0699;RBI=0.0106723;REFB=-0.0118182;REVB=-0.00996012;RO=100;SAF=70;SAR=22;SRF=52;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262771;STB=0.646063;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.014104;OID=.;OPOS=100917109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:100:100:92:92:0.479167:22:70:52:48:22:70:52:48 chr2 101010082 . G C 399.24 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.00182229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.964;QD=15.3552;RBI=0.0177824;REFB=-0.0101742;REVB=-0.0176888;RO=59;SAF=31;SAR=14;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125154;STB=0.57052;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.014545;OID=.;OPOS=101010082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:59:45:45:0.432692:14:31:34:25:14:31:34:25 chr2 101031561 . G T 423.94 PASS AF=0.512195;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.044314;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7077;QD=20.6798;RBI=0.0465565;REFB=-0.00280444;REVB=-0.0142749;RO=40;SAF=26;SAR=16;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176892;STB=0.509799;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00234993;OID=.;OPOS=101031561;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:82:40:40:42:42:0.512195:16:26:24:16:16:26:24:16 chr2 101086966 . C T 268.5 PASS AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0340363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.6265;QD=13.9483;RBI=0.0465348;REFB=0.00241914;REVB=0.0317334;RO=46;SAF=13;SAR=18;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130453;STB=0.574259;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00199297;OID=.;OPOS=101086966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:18:13:25:21:18:13:25:21 chr2 101093702 . C T 469.11 PASS AF=0.51087;AO=43;DP=90;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0190033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6366;QD=20.396;RBI=0.0825952;REFB=-0.0199339;REVB=0.0803794;RO=45;SAF=19;SAR=24;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102805;STB=0.535358;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0201577;OID=.;OPOS=101093702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:45:45:43:47:0.51087:24:19:15:30:27:20:16:29 chr2 101096960 . C T 1606.84 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00306015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.577;QD=64.2735;RBI=0.0266035;REFB=0;REVB=0.026427;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5377e-05;OID=.;OPOS=101096960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:100:0:0:97:100:1:47:50:0:0:48:52:0:0 chr2 101186088 . C T 1532.84 PASS AF=1;AO=101;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3372;QD=59.5276;RBI=0.0321475;REFB=0;REVB=0.0320986;RO=0;SAF=38;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167232;OID=.;OPOS=101186088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:101:103:1:63:38:0:0:65:38:0:0 chr2 101437561 . G A 1578.71 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398085;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.467;QD=60.1414;RBI=0.0430458;REFB=0;REVB=0.0163776;RO=0;SAF=41;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134157;OID=.;OPOS=101437561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:105:0:0:102:105:1:61:41:0:0:64:41:0:0 chr2 101437601 . C G 1420.29 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00971303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.291;QD=61.7518;RBI=0.0214396;REFB=-0.177567;REVB=0.0191132;RO=1;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869802;STB=0.504586;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000437114;OID=.;OPOS=101437601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:54:37:0:1:54:37:0:1 chr2 101587455 . C T 528.34 PASS AF=0.470588;AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00677104;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.686;QD=17.7593;RBI=0.00677579;REFB=-0.0112185;REVB=-0.000253696;RO=63;SAF=26;SAR=30;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416662;STB=0.523143;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.012348;OID=.;OPOS=101587455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:63:63:56:56:0.470588:30:26:32:31:30:26:32:31 chr2 101591304 . A G 1549.16 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1129;QD=63.8829;RBI=0.0755738;REFB=0;REVB=0.0134508;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549813;OID=.;OPOS=101591304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:49:47:0:0:50:47:0:0 chr2 101624384 . T C 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.00705186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.249;QD=22.3964;RBI=0.00969435;REFB=-0.00799823;REVB=-0.00665219;RO=23;SAF=9;SAR=16;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139203;STB=0.577301;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00520145;OID=.;OPOS=101624384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:16:9:5:18:16:9:5:18 chr2 101656726 . T C 908.89 PASS AF=0.469388;AO=92;DP=196;FAO=92;FDP=196;FR=.;FRO=104;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=-0.0234135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9847;QD=18.5487;RBI=0.035699;REFB=-0.0190688;REVB=-0.0269486;RO=103;SAF=40;SAR=52;SRF=56;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104286;STB=0.555148;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0192577;OID=.;OPOS=101656726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:103:104:92:92:0.469388:52:40:56:47:52:40:56:48 chr2 101869588 . G T 303.78 PASS AF=0.903226;AO=15;DP=32;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.000162461;FXX=0.0605877;HRUN=6;LEN=1;MLLD=151.179;QD=39.1975;RBI=0.0812739;REFB=-0.0595848;REVB=0.0812738;RO=0;SAF=14;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501318;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00421557;OID=.;OPOS=101869588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:32:31:0:3:15:28:0.903226:1:14:0:0:9:19:2:1 chr2 101898412 . G C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.341;QD=57.3858;RBI=0.0327993;REFB=0;REVB=0.00288741;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118869;OID=.;OPOS=101898412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0 chr2 102038849 . T A 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.966;QD=63.0523;RBI=0.032543;REFB=0;REVB=0.0324275;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147411;OID=.;OPOS=102038849;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:52:39:0:0:52:39:0:0 chr2 102067083 . T C 1391.76 PASS AF=0.989247;AO=90;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.992;QD=59.8608;RBI=0.0161351;REFB=-0.0444899;REVB=0.0117928;RO=3;SAF=42;SAR=48;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00818754;STB=0.505881;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00115103;OID=.;OPOS=102067083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:93:93:3:1:90:92:0.989247:48:42:1:2:50:42:1:0 chr2 102068872 . T A 350.71 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00996133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2416;QD=20.63;RBI=0.0281131;REFB=-0.0154694;REVB=-0.0262891;RO=32;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982142;STB=0.554425;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.012611;OID=.;OPOS=102068872;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:21:15:17:15:21:15:17:15 chr2 102644698 . G A 367.28 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00180826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.387;QD=16.5069;RBI=0.00671089;REFB=-0.0112392;REVB=-0.00646268;RO=50;SAF=24;SAR=15;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161619;STB=0.509086;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0124734;OID=.;OPOS=102644698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:50:50:39:39:0.438202:15:24:30:20:15:24:30:20 chr2 102955474 . C T 98.55 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0126355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.607;QD=14.0792;RBI=0.0137001;REFB=-0.00825969;REVB=-0.00529485;RO=16;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822464;STB=0.548112;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0119774;OID=.;OPOS=102955474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:7:5:8:8:7:5:8:8 chr2 102957204 . G A 551.1 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0116366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.162;QD=20.7961;RBI=0.0230109;REFB=-0.0246572;REVB=-0.0198517;RO=50;SAF=28;SAR=28;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172001;STB=0.594307;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0167521;OID=.;OPOS=102957204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:28:28:15:35:28:28:15:35 chr2 102968007 . G A 371.53 PASS AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00710198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.208;QD=20.0827;RBI=0.015997;REFB=-0.0138206;REVB=-0.0143341;RO=36;SAF=24;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119404;STB=0.566336;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0173925;OID=.;OPOS=102968007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:14:24:18:18:14:24:18:18 chr2 102968075 . T C 344.66 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0077426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7255;QD=19.1479;RBI=0.0078729;REFB=0.00971544;REVB=-0.00142644;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249874;STB=0.513903;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00375589;OID=.;OPOS=102968075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:17:19:18:18:17:19:18:18 chr2 102968211 . CA AG 44.27 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0210099;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=2;MLLD=56.7741;QD=5.71205;RBI=0.0811523;REFB=0.0139656;REVB=0.0783854;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214284;STB=0.611357;STBP=0.581;TYPE=mnp;VARB=-0.0450202;OID=.;OPOS=102968211;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:32:31:23:24:7:7:0.225806:4:3:6:17:4:3:7:17 chr2 102968285 . T C 129.41 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.017861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.392;QD=12.941;RBI=0.0317499;REFB=-0.00673508;REVB=-0.0262495;RO=25;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359461;STB=0.709409;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0146249;OID=.;OPOS=102968285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:5:10:8:17:5:10:8:17 chr2 102968356 . C T 238.3 PASS AF=0.457627;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0410145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1502;QD=16.1557;RBI=0.0425038;REFB=-0.020624;REVB=0.0111527;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31434;STB=0.688752;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0239167;OID=.;OPOS=102968356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:31:32:26:27:0.457627:9:17:10:21:9:18:10:22 chr2 102968362 . T C 251.65 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00892114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.366;QD=17.0609;RBI=0.037908;REFB=-0.0130559;REVB=-0.0368433;RO=31;SAF=18;SAR=10;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295587;STB=0.665755;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0157053;OID=.;OPOS=102968362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:10:18:10:21:10:18:10:21 chr2 103048738 . G A 1052.78 PASS AF=0.447154;AO=109;DP=245;FAO=110;FDP=246;FR=.;FRO=136;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=57;FSRR=79;FWDB=0.000173976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.031;QD=17.1184;RBI=0.00352793;REFB=-0.0200059;REVB=-0.00352364;RO=136;SAF=57;SAR=52;SRF=57;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103618;STB=0.554612;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0206355;OID=.;OPOS=103048738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:246:136:136:109:110:0.447154:52:57:57:79:53:57:57:79 chr2 103149100 . G A 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0583713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.007;QD=17.9529;RBI=0.0592786;REFB=-0.0318217;REVB=-0.0103322;RO=28;SAF=9;SAR=18;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191183;STB=0.607513;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0268444;OID=.;OPOS=103149100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:18:9:15:13:18:9:15:13 chr2 103334969 . G A 2483.14 PASS AF=0.993865;AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=163;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0168274;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0705;QD=60.9359;RBI=0.0511747;REFB=-0.0995508;REVB=0.048329;RO=0;SAF=86;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22958e-08;STB=0.503268;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000476105;OID=.;OPOS=103334969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:164:163:0:1:162:162:0.993865:76:86:0:0:76:86:0:1 chr2 103431404 . T C 2208.93 PASS AF=0.986842;AO=147;DP=151;FAO=150;FDP=152;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.069936;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8132;QD=58.1298;RBI=0.0791911;REFB=-0.0978265;REVB=0.0371509;RO=0;SAF=62;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99978e-08;STB=0.50108;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00184666;OID=.;OPOS=103431404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:151:152:0:2:147:150:0.986842:85:62:0:0:87:63:1:1 chr2 105709023 . T C 961.56 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047162;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.086;QD=59.1727;RBI=0.0475616;REFB=0;REVB=0.00615207;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01041e-05;OID=.;OPOS=105709023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0 chr2 105883624 . TTTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA T 50.0 PASS AO=30;DP=82;LEN=28;RO=52;SAF=19;SAR=26;SRF=20;SRR=17;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=105883625;OREF=TTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:82:52:30:26:19:20:17 chr2 105915128 . G A 1156.39 PASS AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0194621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0096;QD=59.3018;RBI=0.0900254;REFB=-0.147928;REVB=0.0878966;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.505746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00284178;OID=.;OPOS=105915128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:78:0:1:76:77:0.987179:42:34:0:0:43:34:0:1 chr2 105924510 . A G 1264.62 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.456;QD=61.689;RBI=0.083976;REFB=0;REVB=-0.0836236;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000263021;OID=.;OPOS=105924510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:41:40:0:0:41:41:0:0 chr2 105953938 . G GC 1358.03 PASS AF=1;AO=86;DP=93;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178644;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=162.783;QD=61.0352;RBI=0.0355777;REFB=0;REVB=0.0307675;RO=5;SAF=43;SAR=43;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519651;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000117927;OID=.;OPOS=105953939;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:86:93:89:89:0:46:43:0:0:7:5:43:43:5:0 chr2 106510454 . TG CA,TGCA,TGCACA 245.09 PASS AF=0,0.5,0.205882;AO=2,11,7;DP=36;FAO=0,17,7;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=0,10,3;FSAR=0,7,4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00418623,0.152056,0.107499;FXX=0.0285633;HRUN=1,1,1;LEN=2,2,4;MLLD=59.353,66.719,90.4863;QD=28.8346;RBI=0.061717,0.152892,0.112452;REFB=-0.0795383,-0.106625,-0.0585128;REVB=-0.0615749,-0.0159643,-0.0330037;RO=10;SAF=2,6,3;SAR=0,5,4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.57573,0.0376028,-0.0695696;STB=0.5,0.570092,0.517192;STBP=1,0.378,0.919;TYPE=mnp,ins,ins;VARB=0,0.0830207,0.0975939;OID=.,.,.;OPOS=106510454,106510456,106510456;OREF=TG,-,-;OALT=CA,CA,CACA;OMAPALT=CA,TGCA,TGCACA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:72:36:34:10:10:2,11,7:0,17,7:0,0.5,0.205882:0,5,4:2,6,3:5:5:0,7,4:0,10,3:4:6 chr2 106710108 . C T 1260.33 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00310152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.478;QD=61.4793;RBI=0.0256676;REFB=0;REVB=0.0254796;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69111e-05;OID=.;OPOS=106710108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:78:82:0:0:78:82:1:44:34:0:0:46:36:0:0 chr2 106742139 . C T 447.0 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.253;QD=57.678;RBI=0.0439769;REFB=0;REVB=-0.0123916;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261078;OID=.;OPOS=106742139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0 chr2 107073469 . T A 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8531;QD=39.2057;RBI=0.0420939;REFB=0;REVB=0.03649;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00349315;OID=.;OPOS=107073469;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr2 107073501 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.053974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.308;QD=37.4885;RBI=0.0544372;REFB=0;REVB=0.00708646;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000953617;OID=.;OPOS=107073501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr2 107084739 . A G 1624.36 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.205;QD=60.1615;RBI=0.0374264;REFB=0;REVB=0.0297548;RO=0;SAF=50;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45756e-05;OID=.;OPOS=107084739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:58:50:0:0:58:50:0:0 chr2 107107511 . C T 152.9 PASS AF=0.352941;AO=17;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00997961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.781;QD=11.9922;RBI=0.0165915;REFB=-0.0039442;REVB=-0.0132546;RO=32;SAF=5;SAR=12;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138675;STB=0.563308;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00939368;OID=.;OPOS=107107511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:32:33:17:18:0.352941:12:5:13:19:12:6:14:19 chr2 107107567 . G C 657.7 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00407437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0985;QD=59.7906;RBI=0.0446769;REFB=-0.0489192;REVB=-0.0444907;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268199;STB=0.514279;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000843343;OID=.;OPOS=107107567;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:26:17:1:0:26:17:1:0 chr2 108608648 . A G 495.08 PASS AF=0.5;AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0310537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.016;QD=20.6284;RBI=0.0319491;REFB=-0.0101481;REVB=-0.00751101;RO=48;SAF=23;SAR=25;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377557;STB=0.520897;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.01228;OID=.;OPOS=108608648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:48:48:48:48:0.5:25:23:21:27:25:23:21:27 chr2 108863767 . A C 1788.13 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4995;QD=60.1052;RBI=0.0528478;REFB=-0.0889175;REVB=0.0190932;RO=1;SAF=50;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00940432;STB=0.50495;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00124199;OID=.;OPOS=108863767;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:119:1:1:118:118:0.991597:68:50:1:0:68:50:1:0 chr2 108875198 . G A 1501.64 PASS AF=0.979592;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00955849;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.02;QD=61.2914;RBI=0.0161319;REFB=0.0444732;REVB=0.0129951;RO=2;SAF=34;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027075;STB=0.514283;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00014207;OID=.;OPOS=108875198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:98:2:2:96:96:0.979592:62:34:2:0:62:34:2:0 chr2 108875244 . T C 1605.52 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000542368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9145;QD=64.2209;RBI=0.00889501;REFB=0;REVB=-0.00887846;RO=0;SAF=33;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73319e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.71165e-05;OID=.;OPOS=108875244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:67:33:0:0:67:33:0:0 chr2 108875471 . G T 2963.53 PASS AF=0.994709;AO=186;DP=189;FAO=188;FDP=189;FR=.;FRO=1;FSAF=95;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0309764;FXX=0.00526288;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7506;QD=62.7203;RBI=0.0310787;REFB=0.0375149;REVB=-0.00251936;RO=1;SAF=95;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520374;STB=0.502674;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00334612;OID=.;OPOS=108875471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:189:189:1:1:186:188:0.994709:91:95:0:1:93:95:0:1 chr2 108877062 . T A 1540.6 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00957251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=332.666;QD=59.8292;RBI=0.0101571;REFB=0;REVB=0.00339602;RO=0;SAF=40;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15547e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.01626e-06;OID=.;OPOS=108877062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:63:40:0:0:63:40:0:0 chr2 109099572 . C G 582.4 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.958;QD=59.7337;RBI=0.00319955;REFB=0;REVB=-0.000286572;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879812;OID=.;OPOS=109099572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:18:20:0:0:18:21:0:0 chr2 109106381 . A G 1066.15 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0090292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.549;QD=58.4194;RBI=0.0113423;REFB=-0.0415807;REVB=-0.00686442;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116777;STB=0.506171;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=2.85171e-06;OID=.;OPOS=109106381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:40:32:0:1:40:32:0:1 chr2 109389463 . G A 1227.48 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7279;QD=61.3741;RBI=0.0412398;REFB=0;REVB=-0.0036301;RO=0;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306486;OID=.;OPOS=109389463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:48:32:0:0:48:32:0:0 chr2 109429146 . T A 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9015;QD=62.0219;RBI=0.0114411;REFB=0;REVB=-0.0083003;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9646e-06;OID=.;OPOS=109429146;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr2 109510937 . G A 1283.03 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1002;QD=61.8327;RBI=0.017545;REFB=0;REVB=0.000699332;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117524;OID=.;OPOS=109510937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:50:33:0:0:50:33:0:0 chr2 109512234 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.009;QD=54.5175;RBI=0.0315003;REFB=0;REVB=-0.0306793;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113572;OID=.;OPOS=109512234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr2 109513601 . A G 1660.56 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0117214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.111;QD=59.3056;RBI=0.0341506;REFB=-0.0541044;REVB=0.032076;RO=1;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008554;STB=0.504504;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000106155;OID=.;OPOS=109513601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:55:56:0:1:55:56:0:1 chr2 109513654 . G A 1415.42 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000164802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.467;QD=62.9077;RBI=0.0504749;REFB=0;REVB=0.0504747;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91287e-05;OID=.;OPOS=109513654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0 chr2 109526969 . G A,T 1102.62 PASS AF=0.987013,0.012987;AO=72,4;DP=76;FAO=76,1;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44,0;FSAR=32,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213076,0.0064479;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=181.298,71.1182;QD=57.2788;RBI=0.034589,0.039818;REFB=0,0;REVB=0.0272468,-0.0392925;RO=0;SAF=44,0;SAR=28,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.21139e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0009037,0.0102469;OID=.,.;OPOS=109526969,109526969;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:76:77:0:0:72,4:76,1:0.987013,0.012987:28,4:44,0:0:0:32,1:44,0:0:0 chr2 109527373 . A G 834.19 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9083;QD=57.5306;RBI=0.0271768;REFB=0;REVB=0.024618;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194969;OID=.;OPOS=109527373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0 chr2 109745176 . G A 950.49 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0260481;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.268;QD=55.9113;RBI=0.0357599;REFB=-0.0839145;REVB=0.0245004;RO=2;SAF=23;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393201;STB=0.520827;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.000875191;OID=.;OPOS=109745176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:68:2:2:66:66:0.970588:43:23:2:0:43:23:2:0 chr2 110376214 . G A 549.6 PASS AF=0.522523;AO=50;DP=105;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00108034;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.422;QD=19.8055;RBI=0.00144571;REFB=-0.0194569;REVB=-0.000960695;RO=51;SAF=20;SAR=30;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154532;STB=0.546717;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0145205;OID=.;OPOS=110376214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:111:51:53:50:58:0.522523:30:20:29:22:33:25:28:25 chr2 110855123 . G T 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00712903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.495;QD=58.0611;RBI=0.0540015;REFB=0;REVB=0.0535289;RO=0;SAF=55;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8513e-05;OID=.;OPOS=110855123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:6:55:0:0:6:55:0:0 chr2 110922703 . C T 90.03 PASS AF=0.158879;AO=16;DP=106;FAO=17;FDP=107;FR=.;FRO=90;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0364067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.231;QD=3.36576;RBI=0.0449187;REFB=-0.00729918;REVB=-0.0263106;RO=89;SAF=7;SAR=9;SRF=46;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996303;STB=0.534026;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0398412;OID=.;OPOS=110922703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:106:107:89:90:16:17:0.158879:9:7:46:43:9:8:46:44 chr2 111430381 . C A 250.29 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0213696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.535;QD=14.5093;RBI=0.0298477;REFB=-0.0126797;REVB=-0.0208381;RO=40;SAF=18;SAR=11;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12606;STB=0.571671;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0185111;OID=.;OPOS=111430381;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:11:18:20:20:11:18:20:20 chr2 111691147 . G A 2243.65 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272381;FXX=0.013985;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.651;QD=63.6495;RBI=0.02749;REFB=0;REVB=0.0037126;RO=0;SAF=82;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35412e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40931e-05;OID=.;OPOS=111691147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:59:82:0:0:59:82:0:0 chr2 111881475 . AG A 71.62 PASS AF=0.342857;AO=27;DP=68;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.0894852;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.6286;QD=4.09248;RBI=0.102404;REFB=-0.0832116;REVB=-0.0497891;RO=37;SAF=5;SAR=22;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050168;STB=0.851435;STBP=0.003;TYPE=del;VARB=0.0720468;OID=.;OPOS=111881476;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.342857:27:68:24:70:46:1:23:13:33:71:37:5:22:8:29 chr2 111899881 . G A 521.6 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0126822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.358;QD=23.4428;RBI=0.0128726;REFB=0.0057483;REVB=-0.00220568;RO=39;SAF=27;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723803;STB=0.545436;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-0.00462317;OID=.;OPOS=111899881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:40:49:49:0.550562:22:27:18:21:22:27:18:22 chr2 111907691 . T C 1528.74 PASS AF=0.990476;AO=103;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000839737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.84;QD=58.2378;RBI=0.00178305;REFB=-0.0427582;REVB=0.00157293;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505154;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000410392;OID=.;OPOS=111907691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:0:1:103:104:0.990476:48:55:0:0:48:56:0:1 chr2 111908262 . G A 1491.7 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.228;QD=63.4765;RBI=0.024221;REFB=0;REVB=0.0115452;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.948e-05;OID=.;OPOS=111908262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:51:43:0:0:51:43:0:0 chr2 111925731 . CTTATGTT C 127.49 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00463659;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=7;MLLD=292.451;QD=9.62156;RBI=0.0195455;REFB=0.00179137;REVB=0.0189876;RO=30;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191041;STB=0.591897;STBP=0.33;TYPE=del;VARB=-8.73627e-05;OID=.;OPOS=111925732;OREF=TTATGTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.396226:21:59:21:53:32:8:13:17:15:99:30:8:13:17:13 chr2 112582766 . CTT C 312.1 PASS AF=0.52381;AO=43;DP=86;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0176024;FXX=0.0344788;HRUN=2;LEN=2;MLLD=293.412;QD=14.8621;RBI=0.0177693;REFB=-0.000835957;REVB=0.00243016;RO=40;SAF=26;SAR=17;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114843;STB=0.555895;STBP=0.333;TYPE=del;VARB=0.00081473;OID=.;OPOS=112582767;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.52381:43:86:44:84:40:26:18:19:21:99:40:26:17:19:21 chr2 112605302 . C T 79.43 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0121819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.122;QD=6.90655;RBI=0.0242595;REFB=-0.00096791;REVB=-0.0209792;RO=35;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214276;STB=0.632434;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00390271;OID=.;OPOS=112605302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:6:5:10:25:6:5:10:25 chr2 112641149 . G C 205.88 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0187511;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.811;QD=30.5008;RBI=0.0215406;REFB=-0.0246886;REVB=-0.0106016;RO=8;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243775;STB=0.633208;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.020008;OID=.;OPOS=112641149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:28:27:8:8:19:19:0.703704:11:8:0:8:11:8:0:8 chr2 112641256 . G A 148.65 PASS AF=0.941176;AO=7;DP=16;FAO=16;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.100993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.782;QD=34.9761;RBI=0.16152;REFB=-0.111146;REVB=0.126052;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.794046;STB=0.555483;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0462478;OID=.;OPOS=112641256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:17:1:1:7:16:0.941176:7:0:1:0:12:4:1:0 chr2 112641266 . G C 70.5 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0374969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4633;QD=17.6245;RBI=0.0962906;REFB=0.0602624;REVB=0.0886897;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411267;STB=0.732904;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0409289;OID=.;OPOS=112641266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:0:7:4:5:0:7 chr2 112641283 . A G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0365189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8105;QD=15.2589;RBI=0.0365878;REFB=-0.0229512;REVB=-0.00224472;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.434081;STB=0.749421;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0203105;OID=.;OPOS=112641283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:0:6:3:4:0:6 chr2 112704987 . T G 325.34 PASS AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00835552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0847;QD=22.4369;RBI=0.0390518;REFB=0.0101539;REVB=0.0381475;RO=25;SAF=22;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215132;STB=0.618974;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0113304;OID=.;OPOS=112704987;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:25:33:33:0.568966:11:22:10:15:11:22:10:15 chr2 112939548 . T C 44.29 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0711306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9347;QD=6.81313;RBI=0.0729765;REFB=-0.00652279;REVB=-0.0163099;RO=18;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256863;STB=0.627577;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0229851;OID=.;OPOS=112939548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:18:19:7:7:0.269231:4:3:4:14:4:3:5:14 chr2 113089267 . T C 2107.21 PASS AF=1;AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000505778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8298;QD=62.4357;RBI=0.00198706;REFB=0;REVB=-0.00192161;RO=0;SAF=53;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17008e-07;OID=.;OPOS=113089267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:135:0:0:134:135:1:81:53:0:0:81:54:0:0 chr2 113090047 . T C 1586.45 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3642;QD=64.0992;RBI=0.0525967;REFB=0;REVB=-0.00302408;RO=0;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244023;OID=.;OPOS=113090047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:97:99:1:46:51:0:0:48:51:0:0 chr2 113091685 . T G 885.18 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0874937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8727;QD=58.0446;RBI=0.0911702;REFB=0;REVB=0.0256291;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121886;OID=.;OPOS=113091685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0 chr2 113277949 . T C 257.34 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0192433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.178;QD=13.7245;RBI=0.0204554;REFB=-0.0138022;REVB=-0.00693659;RO=45;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116514;STB=0.566328;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0160775;OID=.;OPOS=113277949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:14:16:19:26:14:16:19:26 chr2 113289032 . A G 293.25 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00807775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6594;QD=23.0003;RBI=0.028424;REFB=0.0174393;REVB=-0.0272521;RO=22;SAF=8;SAR=21;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403593;STB=0.522372;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.014164;OID=.;OPOS=113289032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:21:8:7:15:21:8:7:15 chr2 113482779 . A C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5528;QD=51.916;RBI=0.033524;REFB=0;REVB=-0.0272958;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000470492;OID=.;OPOS=113482779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr2 113484319 . G A 557.14 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.962;QD=60.2308;RBI=0.0080789;REFB=0;REVB=0.0019172;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03406e-05;OID=.;OPOS=113484319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr2 113498566 . A G 1480.35 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0861232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.265;QD=58.6276;RBI=0.0896458;REFB=-0.124446;REVB=0.0248828;RO=1;SAF=44;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839647;STB=0.504424;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.000573313;OID=.;OPOS=113498566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:101:101:1:1:100:100:0.990099:56:44:0:1:56:44:0:1 chr2 113513825 . T C 1491.33 PASS AF=1;AO=97;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8621;QD=59.0624;RBI=0.0566929;REFB=0;REVB=0.0531627;RO=1;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101988;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360606;OID=.;OPOS=113513825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:1:0:97:101:1:46:51:0:1:47:54:0:0 chr2 113671378 . G T 216.68 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0353396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2998;QD=13.334;RBI=0.0355581;REFB=0.00647819;REVB=-0.00393663;RO=39;SAF=8;SAR=18;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251414;STB=0.64433;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00805666;OID=.;OPOS=113671378;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:18:8:21:18:18:8:21:18 chr2 113671410 . A G 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00210569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3773;QD=13.9118;RBI=0.0135976;REFB=0.00401183;REVB=-0.0134336;RO=31;SAF=7;SAR=14;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289709;STB=0.666508;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00326354;OID=.;OPOS=113671410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:14:7:19:12:14:7:19:12 chr2 113763575 . A G 1380.22 PASS AF=1;AO=71;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.729;QD=60.6691;RBI=0.0641382;REFB=0;REVB=0.0160867;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235633;OID=.;OPOS=113763575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:91:0:0:71:91:1:29:42:0:0:42:49:0:0 chr2 113789316 . C T 439.9 PASS AF=0.605634;AO=40;DP=70;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00894954;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.749;QD=24.7832;RBI=0.0386098;REFB=-0.0122054;REVB=-0.0375583;RO=27;SAF=22;SAR=18;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158294;STB=0.588194;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00992457;OID=.;OPOS=113789316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:27:28:40:43:0.605634:18:22:9:18:18:25:10:18 chr2 113819725 . A G 401.49 PASS AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0542724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9267;QD=18.8938;RBI=0.0543013;REFB=-0.0208479;REVB=0.00177002;RO=44;SAF=22;SAR=19;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055167;STB=0.530714;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0307706;OID=.;OPOS=113819725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:0.482353:19:22:21:23:19:22:21:23 chr2 113831945 . T C 239.32 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.000342065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.209;QD=20.8102;RBI=0.0494867;REFB=-0.00746417;REVB=0.0494855;RO=23;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155866;STB=0.587709;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00459822;OID=.;OPOS=113831945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:9:14:10:13:9:14:10:13 chr2 113832333 . C A 831.43 PASS AF=0.527027;AO=78;DP=147;FAO=78;FDP=148;FR=.;FRO=70;FSAF=52;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0117604;FXX=0.0133324;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.451;QD=22.4711;RBI=0.0117626;REFB=-0.00845096;REVB=0.000229435;RO=69;SAF=52;SAR=26;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119865;STB=0.56309;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0121605;OID=.;OPOS=113832333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:69:70:78:78:0.527027:26:52:37:32:26:52:38:32 chr2 113870663 . G A 710.76 PASS AF=0.566667;AO=68;DP=120;FAO=68;FDP=120;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.0279318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.704;QD=23.6921;RBI=0.0279789;REFB=-0.00894241;REVB=0.00162302;RO=52;SAF=34;SAR=34;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122263;STB=0.566647;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00466903;OID=.;OPOS=113870663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:52:52:68:68:0.566667:34:34:18:34:34:34:18:34 chr2 113940207 . T A 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00580294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.511;QD=21.9445;RBI=0.0325766;REFB=-0.022548;REVB=-0.0320556;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11081;STB=0.562422;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0183555;OID=.;OPOS=113940207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:9:7:7:5:9:7:7:5 chr2 113940681 . T C 183.09 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0272689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2792;QD=25.2539;RBI=0.0281269;REFB=-0.0166024;REVB=-0.00689412;RO=11;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927626;STB=0.551667;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00731197;OID=.;OPOS=113940681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:11:11:18:18:0.62069:9:9:7:4:9:9:7:4 chr2 113940839 . G C 380.81 PASS AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00390186;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=293.215;QD=19.5285;RBI=0.00679497;REFB=-0.00030312;REVB=0.005563;RO=39;SAF=26;SAR=13;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146773;STB=0.581775;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.000314581;OID=.;OPOS=113940839;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:39:39:39:0.5:13:26:20:19:13:26:20:19 chr2 113943470 . A G 123.81 PASS AF=0.5;AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00637729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9233;QD=17.6866;RBI=0.0408572;REFB=-0.0501079;REVB=-0.0403564;RO=14;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246548;STB=0.609216;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0166753;OID=.;OPOS=113943470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:28:14:14:13:14:0.5:4:9:6:8:5:9:6:8 chr2 113955074 . G A 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.401;QD=62.6141;RBI=0.0429412;REFB=0;REVB=0.0386567;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109587;OID=.;OPOS=113955074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:53:35:0:0:53:35:0:0 chr2 113956371 . G C 195.25 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162156;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.49;QD=48.8116;RBI=0.0476457;REFB=0;REVB=0.0448015;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000410835;OID=.;OPOS=113956371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr2 114220055 . T C 2757.52 PASS AF=0.988889;AO=176;DP=178;FAO=178;FDP=180;FR=.;FRO=2;FSAF=94;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0503478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.994;QD=61.2782;RBI=0.0922163;REFB=-0.0301074;REVB=0.077259;RO=2;SAF=94;SAR=82;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000732594;STB=0.500313;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000283401;OID=.;OPOS=114220055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:178:180:2:2:176:178:0.988889:82:94:1:1:84:94:1:1 chr2 114256840 . C T 409.95 PASS AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0897677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5465;QD=51.2443;RBI=0.0920132;REFB=-0.1827;REVB=0.0202038;RO=2;SAF=19;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016613;STB=0.508923;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0352354;OID=.;OPOS=114256840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:11:19:1:1:11:19:1:1 chr2 114256859 . C T 275.17 PASS AF=1;AO=11;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.286396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.1205;QD=52.414;RBI=0.287371;REFB=0;REVB=0.0236555;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0106371;OID=.;OPOS=114256859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:11:21:1:8:3:0:0:8:13:0:0 chr2 116099725 . A T 816.19 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0446701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2005;QD=57.2763;RBI=0.0679676;REFB=0;REVB=-0.0512267;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00114783;OID=.;OPOS=116099725;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:37:20:0:0:37:20:0:0 chr2 116510817 . G C 825.27 PASS AF=0.442786;AO=89;DP=201;FAO=89;FDP=201;FR=.;FRO=112;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=59;FWDB=-0.0104575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.659;QD=16.4233;RBI=0.0152752;REFB=-0.0119503;REVB=-0.0111343;RO=112;SAF=42;SAR=47;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00131119;STB=0.500729;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0164117;OID=.;OPOS=116510817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:112:112:89:89:0.442786:47:42:53:59:47:42:53:59 chr2 116525960 . G A 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.784;QD=62.9078;RBI=0.013675;REFB=0;REVB=0.0134275;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86314e-05;OID=.;OPOS=116525960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:50:40:0:0:50:40:0:0 chr2 116600388 . A G 264.77 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0397834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5582;QD=20.7662;RBI=0.0431944;REFB=-0.0292653;REVB=0.0168236;RO=24;SAF=14;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858047;STB=0.547791;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0271869;OID=.;OPOS=116600388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:13:14:10:14:13:14:10:14 chr2 118575215 . C G 72.7 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.000112001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.135;QD=8.81182;RBI=0.00635355;REFB=0.00292075;REVB=-0.00635256;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123879;STB=0.57561;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.00728818;OID=.;OPOS=118575215;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:9:14:5:5:9:14 chr2 118583940 . C T 374.93 PASS AF=0.434783;AO=39;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0177801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.759;QD=16.3013;RBI=0.0189556;REFB=-0.0167516;REVB=-0.0065714;RO=52;SAF=15;SAR=24;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195484;STB=0.59995;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0202219;OID=.;OPOS=118583940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:39:40:0.434783:24:15:30:22:24:16:30:22 chr2 118589808 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.589;QD=52.6132;RBI=0.0214693;REFB=0;REVB=-0.00550486;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137883;OID=.;OPOS=118589808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr2 118771566 . C A 4227.61 PASS AF=0.985612;AO=268;DP=272;FAO=274;FDP=278;FR=.;FRO=4;FSAF=132;FSAR=142;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0944027;FXX=0.0071426;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.3166;QD=60.829;RBI=0.118478;REFB=-0.083878;REVB=0.0715903;RO=4;SAF=129;SAR=139;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00753939;STB=0.503863;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00132446;OID=.;OPOS=118771566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:272:278:4:4:268:274:0.985612:139:129:3:1:142:132:3:1 chr2 118774082 . T C 700.8 PASS AF=1;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.538;QD=54.9643;RBI=0.0422768;REFB=0;REVB=0.0328941;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000632069;OID=.;OPOS=118774082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:49:51:1:31:18:0:0:33:18:0:0 chr2 118774178 . G C 582.39 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0847198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5708;QD=58.2388;RBI=0.0847991;REFB=-0.101876;REVB=0.00366684;RO=1;SAF=16;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028395;STB=0.515144;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00503292;OID=.;OPOS=118774178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:23:16:1:0:23:16:1:0 chr2 119591683 . C A 238.22 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.0993128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0851;QD=16.1502;RBI=0.119166;REFB=0.00489028;REVB=0.0658603;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258216;STB=0.644122;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.00172705;OID=.;OPOS=119591683;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:25:7:13:14:25:7 chr2 119915249 . T C 407.95 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00736937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.587;QD=17.7372;RBI=0.031418;REFB=-0.0289827;REVB=-0.0305415;RO=50;SAF=27;SAR=15;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143834;STB=0.580606;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0299101;OID=.;OPOS=119915249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:15:27:25:25:15:27:25:25 chr2 119927405 . G C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.48;QD=50.4135;RBI=0.0358338;REFB=0;REVB=0.0161127;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219978;OID=.;OPOS=119927405;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr2 119927411 . G T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8719;QD=50.413;RBI=0.123759;REFB=0;REVB=0.110639;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00521821;OID=.;OPOS=119927411;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr2 120021785 . T C 1339.73 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.425;QD=62.3131;RBI=0.0162762;REFB=0;REVB=-0.00673406;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.52582e-05;OID=.;OPOS=120021785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0 chr2 120060082 . T C 1135.21 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7666;QD=60.5444;RBI=0.0424664;REFB=0;REVB=0.0423729;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395778;OID=.;OPOS=120060082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:73:75:1:41:32:0:0:42:33:0:0 chr2 120078778 . T C 3471.51 PASS AF=1;AO=223;DP=225;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651683;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.793;QD=62.2692;RBI=0.0722597;REFB=-0.0783714;REVB=0.0312178;RO=1;SAF=101;SAR=122;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0038898;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104516;OID=.;OPOS=120078778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:225:223:1:0:223:223:1:122:101:0:1:122:101:0:0 chr2 120125029 . A G 340.7 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.626;QD=54.5126;RBI=0.0796425;REFB=0;REVB=0.079203;RO=0;SAF=18;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284132;OID=.;OPOS=120125029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:7:18:0:0:7:18:0:0 chr2 120125052 . AC A,AG 375.11 PASS AF=0.185185,0.814815;AO=4,23;DP=27;FAO=5,22;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=5,16;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0723434,-0.0911141;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=80.2785,87.2839;QD=55.5712;RBI=0.0723448,0.263889;REFB=0,0;REVB=-0.000439658,0.247661;RO=0;SAF=0,21;SAR=4,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.63689e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.028054,0.037872;OID=.,.;OPOS=120125053,120125053;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.185185,0.814815:4,23:27:5,22:27:0:5,16:0,6:0:0:17:0:0,21:4,2:0:0 chr2 120125058 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2812;QD=56.1914;RBI=0.0309427;REFB=0;REVB=-0.012525;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246771;OID=.;OPOS=120125058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:6:22:0:0:6:22:0:0 chr2 120194651 . A AGTGTGC 743.88 PASS AF=1;AO=50;DP=66;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222688;FXX=0.0545355;HRUN=0;LEN=6;MLLD=335.276;QD=57.2212;RBI=0.0222716;REFB=0;REVB=-0.000358249;RO=12;SAF=12;SAR=38;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187942;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.88429e-05;OID=.;OPOS=120194652;OREF=-;OALT=GTGTGC;OMAPALT=AGTGTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:50:66:52:52:0:14:38:0:0:4:12:12:38:8:4 chr2 120199140 . A G 361.9 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05264;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.88;QD=55.6762;RBI=0.054495;REFB=0;REVB=0.0140974;RO=0;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279798;OID=.;OPOS=120199140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:5:20:0:0:5:21:0:0 chr2 120303820 . A T 657.26 PASS AF=0.942308;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0230872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.885;QD=50.5582;RBI=0.0237164;REFB=-0.08148;REVB=0.00542667;RO=2;SAF=20;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044741;STB=0.53332;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00103858;OID=.;OPOS=120303820;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:51:52:2:3:48:49:0.942308:28:20:2:0:28:21:3:0 chr2 120369300 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.061;QD=58.7815;RBI=0.0288102;REFB=0;REVB=0.00518871;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.71781e-05;OID=.;OPOS=120369300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:43:22:0:0:43:22:0:0 chr2 120388412 . G A 1434.43 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8971;QD=63.052;RBI=0.0285671;REFB=0;REVB=-0.028509;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.90977e-05;OID=.;OPOS=120388412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:52:39:0:0:52:39:0:0 chr2 120438523 . A G 1171.97 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.384;QD=60.8815;RBI=0.021024;REFB=0;REVB=0.0137445;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20458e-05;OID=.;OPOS=120438523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr2 120438696 . A G 990.62 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.254;QD=59.1415;RBI=0.0540433;REFB=0;REVB=0.000588772;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178741;OID=.;OPOS=120438696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0 chr2 120439230 . C G 830.2 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5169;QD=57.2552;RBI=0.0140927;REFB=0;REVB=-0.00265282;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.58506e-05;OID=.;OPOS=120439230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:32:25:0:0:32:26:0:0 chr2 120439459 . C A 794.01 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00175578;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.908;QD=56.7149;RBI=0.0099003;REFB=0;REVB=0.00974336;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00647202;OID=.;OPOS=120439459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:54:56:1:33:21:0:0:34:22:0:0 chr2 120704166 . G T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.797;QD=57.2026;RBI=0.028793;REFB=0;REVB=0.0262347;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97989e-05;OID=.;OPOS=120704166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr2 120830815 . A G 426.48 PASS AF=1;AO=26;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.468;QD=56.8644;RBI=0.0696699;REFB=0;REVB=0.0510504;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489708;OID=.;OPOS=120830815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:26:30:1:15:11:0:0:19:11:0:0 chr2 120885310 . G A 772.68 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0309132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.006;QD=61.8144;RBI=0.0311593;REFB=-0.030076;REVB=-0.0039083;RO=1;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015953;STB=0.508471;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000970902;OID=.;OPOS=120885310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:29:20:0:1:29:20:0:1 chr2 120980428 . G C 1037.12 PASS AF=0.894118;AO=76;DP=85;FAO=76;FDP=85;FR=.;FRO=9;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0111867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9293;QD=48.8054;RBI=0.0120649;REFB=-0.022231;REVB=0.00451857;RO=7;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956348;STB=0.563363;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0360102;OID=.;OPOS=120980428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:85:85:7:9:76:76:0.894118:31:45:0:7:31:45:0:9 chr2 121106850 . C T 761.54 PASS AF=0.5625;AO=72;DP=128;FAO=72;FDP=128;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00460936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.406;QD=23.798;RBI=0.0144991;REFB=-0.00742682;REVB=-0.013747;RO=54;SAF=30;SAR=42;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518619;STB=0.521271;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00676921;OID=.;OPOS=121106850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:54:56:72:72:0.5625:42:30:26:28:42:30:26:30 chr2 121726447 . G A 655.91 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12536;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.816;QD=62.4672;RBI=0.126572;REFB=0;REVB=0.017472;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000798219;OID=.;OPOS=121726447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:31:11:0:0:31:11:0:0 chr2 121746956 . G T 553.05 PASS AF=0.566667;AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00276998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.793;QD=24.58;RBI=0.0453374;REFB=-0.0196069;REVB=0.0452527;RO=39;SAF=29;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851622;STB=0.546672;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0125946;OID=.;OPOS=121746956;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:39:51:51:0.566667:22:29:18:21:22:29:18:21 chr2 121747392 . A T 221.87 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0262956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.998;QD=18.4894;RBI=0.026414;REFB=-0.0117777;REVB=-0.00249858;RO=26;SAF=5;SAR=17;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263057;STB=0.650752;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0123911;OID=.;OPOS=121747392;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:17:5:12:14:17:5:12:14 chr2 121747406 . G A 286.11 PASS AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00608258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.007;QD=20.4363;RBI=0.0227791;REFB=-0.00628271;REVB=0.021952;RO=26;SAF=13;SAR=17;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143171;STB=0.579157;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00295299;OID=.;OPOS=121747406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:17:13:7:19:17:13:7:19 chr2 121747429 . A G 321.43 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0138968;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0244;QD=18.6334;RBI=0.0140839;REFB=-0.012259;REVB=-0.00228829;RO=35;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143237;STB=0.579664;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0114642;OID=.;OPOS=121747429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:35:35:34:34:0.492754:17:17:12:23:17:17:12:23 chr2 121749067 . G C 259.54 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.036641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.538;QD=11.933;RBI=0.0385792;REFB=0.00215244;REVB=-0.0120744;RO=55;SAF=20;SAR=11;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115842;STB=0.573595;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=-0.00345172;OID=.;OPOS=121749067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:11:20:30:25:11:20:30:26 chr2 121948235 . C G 79.34 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516783;FXX=0.110988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.294;QD=39.6721;RBI=0.0537035;REFB=0;REVB=0.0534543;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281117;OID=.;OPOS=121948235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr2 121948239 . A C 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00126404;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=107.624;QD=39.2024;RBI=0.0539208;REFB=0;REVB=0.053906;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376444;OID=.;OPOS=121948239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr2 121980405 . TC T 85.21 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00835512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.8014;QD=9.46784;RBI=0.0177551;REFB=-0.0146604;REVB=-0.0156664;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274841;STB=0.516106;STBP=0.911;TYPE=del;VARB=0.0211346;OID=.;OPOS=121980406;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.388889:14:36:14:36:22:8:6:12:10:85:22:8:6:12:10 chr2 121981950 . A G 165.19 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00631723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.619;QD=12.4668;RBI=0.0119804;REFB=-0.00751375;REVB=-0.0101795;RO=33;SAF=11;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00492397;STB=0.502854;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0070409;OID=.;OPOS=121981950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:9:11:18:15:9:11:18:15 chr2 125192068 . T C 891.97 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.158;QD=57.5465;RBI=0.0572856;REFB=0;REVB=0.0563812;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190253;OID=.;OPOS=125192068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:33:28:0:0:34:28:0:0 chr2 125746817 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.857;QD=61.6839;RBI=0.0409614;REFB=0;REVB=0.0266218;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000527662;OID=.;OPOS=125746817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr2 127453664 . A C 667.67 PASS AF=1;AO=17;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.079713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.6138;QD=62.1086;RBI=0.19045;REFB=0;REVB=0.172966;RO=0;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145256;OID=.;OPOS=127453664;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:17:43:1:3:14:0:0:28:15:0:0 chr2 127811576 . CCG C 35.04 PASS AF=0.333333;AO=4;DP=21;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.00758377;FXX=0.166574;HRUN=4;LEN=2;MLLD=32.8624;QD=9.34458;RBI=0.0512744;REFB=-0.0675202;REVB=-0.0507105;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806035;STB=0.811817;STBP=0.493;TYPE=del;VARB=0.121779;OID=.;OPOS=127811577;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:4:21:5:15:10:2:3:0:10:35:15:1:3:3:12 chr2 127818193 . C T 377.86 PASS AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0176396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4239;QD=24.3782;RBI=0.0573206;REFB=-0.019303;REVB=0.054539;RO=25;SAF=18;SAR=19;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00476896;STB=0.502616;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0239855;OID=.;OPOS=127818193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:19:18:12:13:19:18:12:13 chr2 128065066 . CTTTTT CTTTTA,CTTTT,TCTTTT 178.43 PASS AF=0.0384615,0.435897,0.025641;AO=3,32,3;DP=85;FAO=3,34,2;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=3,19,0;FSAR=0,15,2;FSRF=8;FSRR=31;FWDB=-0.030586,-0.100658,0.0508627;FXX=0.0930124;HRUN=7,7,1;LEN=1,1,2;MLLD=190.938,9.53001,17.1363;QD=9.15018;RBI=0.0313576,0.154213,0.0528861;REFB=-0.00697442,-0.094807,-0.0330092;REVB=-0.00691363,0.116831,0.0144889;RO=32;SAF=3,22,0;SAR=0,10,3;SRF=3;SRR=29;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.786401,0.497903,-0.408387;STB=0.998256,0.683249,0.992056;STBP=0,0.006,0.368;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0541653,0.074862,0.0585516;OID=.,.,.;OPOS=128065071,128065067,128065066;OREF=T,T,CT;OALT=A,-,TC;OMAPALT=CTTTTA,CTTTT,TCTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:85:78:32:39:3,32,3:3,34,2:0.0384615,0.435897,0.025641:0,10,3:3,22,0:3:29:0,15,2:3,19,0:8:31 chr2 128382994 . G A 855.72 PASS AF=0.572464;AO=79;DP=138;FAO=79;FDP=138;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-7.61648e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.797;QD=24.8034;RBI=0.0187141;REFB=-0.030358;REVB=0.0187139;RO=57;SAF=36;SAR=43;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269652;STB=0.521153;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0228931;OID=.;OPOS=128382994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:57:59:79:79:0.572464:43:36:24:33:43:36:24:35 chr2 128400608 . C T 786.75 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.055866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6287;QD=55.2107;RBI=0.105519;REFB=0.113841;REVB=-0.0895172;RO=1;SAF=27;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171432;STB=0.509088;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00278947;OID=.;OPOS=128400608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:29:27:1:0:29:27:1:0 chr2 128401091 . A G 304.68 PASS AF=0.507692;AO=32;DP=64;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0108568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.899;QD=18.7492;RBI=0.0147959;REFB=-0.0100619;REVB=-0.0100523;RO=31;SAF=19;SAR=13;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699312;STB=0.537713;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0121618;OID=.;OPOS=128401091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:31:32:32:33:0.507692:13:19:16:15:14:19:16:16 chr2 128460956 . G A 446.89 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.269;QD=57.6628;RBI=0.041782;REFB=0;REVB=0.00307662;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134918;OID=.;OPOS=128460956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0 chr2 128495645 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.032992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.794;QD=61.684;RBI=0.0333235;REFB=0;REVB=-0.00468888;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.67773e-05;OID=.;OPOS=128495645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr2 128849114 . T C 990.63 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.744;QD=59.1421;RBI=0.0728766;REFB=0;REVB=0.0292918;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111953;OID=.;OPOS=128849114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0 chr2 128870808 . T C 582.41 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.821;QD=58.241;RBI=0.0553744;REFB=-0.0236676;REVB=0.0484162;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267753;STB=0.514278;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000711682;OID=.;OPOS=128870808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:0:1:17:22:0:1 chr2 128878014 . G A 724.43 PASS AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00154652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3875;QD=54.6737;RBI=0.0167521;REFB=0.0332265;REVB=0.0166806;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507933;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.000690467;OID=.;OPOS=128878014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:53:0:1:51:52:0.981132:30:21:0:0:31:21:0:1 chr2 128934400 . T C 625.18 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00292477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.824;QD=60.993;RBI=0.0342015;REFB=0;REVB=0.0340762;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163486;OID=.;OPOS=128934400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:19:21:0:0:20:21:0:0 chr2 128939817 . G A 446.64 PASS AF=0.457944;AO=48;DP=106;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.0110401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8474;QD=16.6968;RBI=0.0404887;REFB=-0.025087;REVB=0.0389545;RO=58;SAF=24;SAR=24;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168876;STB=0.503815;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0314163;OID=.;OPOS=128939817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:58:58:48:49:0.457944:24:24:28:30:25:24:28:30 chr2 129023249 . T C 55.33 PASS AF=0.121212;AO=12;DP=99;FAO=12;FDP=99;FR=.;FRO=87;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.00763517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.291;QD=2.2357;RBI=0.0120288;REFB=-5.50712e-06;REVB=0.00929496;RO=87;SAF=11;SAR=1;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.521984;STB=0.889447;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.000893454;OID=.;OPOS=129023249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:99:99:87:87:12:12:0.121212:1:11:46:41:1:11:46:41 chr2 129023282 . G C 275.18 PASS AF=0.413333;AO=23;DP=77;FAO=31;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0546034;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1896;QD=14.676;RBI=0.057437;REFB=-0.0271483;REVB=0.0178181;RO=26;SAF=9;SAR=14;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296866;STB=0.522771;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0385083;OID=.;OPOS=129023282;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:26:44:23:31:0.413333:14:9:3:23:15:16:21:23 chr2 129075797 . A C 31.06 PASS AF=0.294118;AO=5;DP=19;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00124881;FXX=0.105208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.045;QD=7.30737;RBI=0.0148878;REFB=0.00403661;REVB=-0.0148354;RO=14;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505846;STB=0.614966;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.0104062;OID=.;OPOS=129075797;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:19:17:14:12:5:5:0.294118:2:3:9:5:2:3:9:3 chr2 129075877 . G T 113.4 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.00822803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.162;QD=9.65114;RBI=0.0082922;REFB=-0.00419762;REVB=-0.00102963;RO=32;SAF=4;SAR=10;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.528747;STB=0.800735;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00452205;OID=.;OPOS=129075877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:32:33:14:14:0.297872:10:4:25:7:10:4:25:8 chr2 130738163 . G A 178.96 PASS AF=0.487179;AO=16;DP=36;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00474918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.3;QD=18.355;RBI=0.0208788;REFB=-0.000638506;REVB=-0.0203315;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434237;STB=0.666496;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.000706769;OID=.;OPOS=130738163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:39:20:20:16:19:0.487179:12:4:14:6:12:7:14:6 chr2 130738220 . G C 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0109143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.771;QD=16.4544;RBI=0.0291766;REFB=-0.0465754;REVB=-0.0270583;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194334;STB=0.66611;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0225341;OID=.;OPOS=130738220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:3:4:6:6:0.6:2:4:1:2:2:4:1:3 chr2 130739444 . TGAAGACG T 99.19 PASS AF=0.324324;AO=11;DP=34;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0271433;FXX=0.119019;HRUN=1;LEN=7;MLLD=268.182;QD=10.7237;RBI=0.031864;REFB=-0.0142609;REVB=0.0166901;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766352;STB=0.622023;STBP=0.312;TYPE=del;VARB=0.0215409;OID=.;OPOS=130739445;OREF=GAAGACG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.324324:11:34:12:37:25:7:5:10:15:99:17:6:5:8:9 chr2 130739646 . TTAAC T 100.45 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00342617;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=306.172;QD=9.79987;RBI=0.019927;REFB=-0.0184753;REVB=-0.0196303;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865243;STB=0.550395;STBP=0.644;TYPE=del;VARB=0.0267018;OID=.;OPOS=130739647;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.390244:16:41:16:41:25:7:9:13:12:99:25:7:9:13:12 chr2 130739891 . T A 302.97 PASS AF=0.464789;AO=32;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0103475;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.191;QD=17.0685;RBI=0.0111788;REFB=-0.00755223;REVB=-0.00423007;RO=39;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123327;STB=0.566287;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00595114;OID=.;OPOS=130739891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:38:32:33:0.464789:18:14:22:17:18:15:22:16 chr2 130832531 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0735923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.886;QD=39.2068;RBI=0.0743298;REFB=0;REVB=0.0104446;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192026;OID=.;OPOS=130832531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr2 130866805 . C G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.903;QD=58.1421;RBI=0.0474584;REFB=0;REVB=-0.0388014;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104887;OID=.;OPOS=130866805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr2 130897234 . C T 192.05 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0736315;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.593;QD=21.3385;RBI=0.0736477;REFB=-0.0176261;REVB=0.00154536;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27762;STB=0.653948;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0226401;OID=.;OPOS=130897234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:2:15:11:8:2:15 chr2 130912720 . G A 62.86 PASS AF=0.123894;AO=14;DP=113;FAO=14;FDP=113;FR=.;FRO=99;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=0.0144391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.635;QD=2.22508;RBI=0.0177358;REFB=-0.00245526;REVB=-0.0102991;RO=98;SAF=10;SAR=4;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301444;STB=0.710358;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0157883;OID=.;OPOS=130912720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:113:113:98:99:14:14:0.123894:4:10:46:52:4:10:47:52 chr2 130912778 . A G 51.23 PASS AF=0.115789;AO=11;DP=92;FAO=11;FDP=95;FR=.;FRO=84;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.0840995;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.216;QD=2.15705;RBI=0.099382;REFB=-0.000330502;REVB=-0.0529534;RO=81;SAF=9;SAR=2;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393819;STB=0.794621;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00396158;OID=.;OPOS=130912778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:92:95:81:84:11:11:0.115789:2:9:41:40:2:9:42:42 chr2 130941592 . GA G 39.45 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.0378916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0372;QD=5.84462;RBI=0.0438537;REFB=-0.0917046;REVB=-0.0220766;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431837;STB=0.778358;STBP=0.135;TYPE=del;VARB=0.170107;OID=.;OPOS=130941593;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:10:27:9:27:18:4:5:1:17:39:17:4:6:1:16 chr2 130949411 . G T 88.43 PASS AF=1;AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0315;QD=39.3035;RBI=0.0874212;REFB=0;REVB=0.0874212;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00267141;OID=.;OPOS=130949411;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:7:9:1:7:0:0:0:9:0:0:0 chr2 130951548 . G A 1406.44 PASS AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0221353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.63;QD=60.4919;RBI=0.0575151;REFB=-0.206574;REVB=0.053085;RO=2;SAF=68;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394411;STB=0.520829;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00248694;OID=.;OPOS=130951548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:93:93:2:2:91:91:0.978495:23:68:0:2:23:68:0:2 chr2 130951566 . G A 1400.41 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.484;QD=61.5563;RBI=0.0730063;REFB=-0.0987479;REVB=0.072139;RO=1;SAF=67;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201575;STB=0.510636;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00101286;OID=.;OPOS=130951566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:23:67:0:1:23:67:0:1 chr2 131266530 . C A 501.63 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.508;QD=59.0157;RBI=0.10187;REFB=0;REVB=0.0186978;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000412928;OID=.;OPOS=131266530;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0 chr2 131414176 . C T 234.74 PASS AF=0.286957;AO=33;DP=115;FAO=33;FDP=115;FR=.;FRO=82;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.045599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1072;QD=8.16488;RBI=0.0995239;REFB=-0.0112475;REVB=-0.0884632;RO=81;SAF=11;SAR=22;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170583;STB=0.605995;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.025181;OID=.;OPOS=131414176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:81:82:33:33:0.286957:22:11:38:43:22:11:39:43 chr2 131487673 . A C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.778;QD=58.9627;RBI=0.0220157;REFB=0;REVB=-0.0138138;RO=0;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.33666e-05;OID=.;OPOS=131487673;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:23:43:0:0:23:43:0:0 chr2 131520178 . C G 375.04 PASS AF=0.453488;AO=38;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00492099;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.593;QD=17.4435;RBI=0.0068652;REFB=-0.00862641;REVB=0.00478694;RO=48;SAF=15;SAR=23;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649881;STB=0.520479;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.00687601;OID=.;OPOS=131520178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:47:38:39:0.453488:23:15:22:26:23:16:21:26 chr2 131520663 . T C 997.13 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00572208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.109;QD=58.6548;RBI=0.0128689;REFB=0;REVB=0.0115267;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02243e-05;OID=.;OPOS=131520663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:40:27:0:0:41:27:0:0 chr2 131672950 . A G 181.48 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516534;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.138;QD=48.3954;RBI=0.0605102;REFB=0;REVB=0.0315184;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445919;OID=.;OPOS=131672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0 chr2 131673316 . C T 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196886;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.417;QD=40.7606;RBI=0.00733191;REFB=0;REVB=0.00706261;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98476e-05;OID=.;OPOS=131673316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr2 131674285 . A G 1190.36 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.675;QD=61.0442;RBI=0.0400501;REFB=0;REVB=0.0374028;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141086;OID=.;OPOS=131674285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:41:37:0:0:41:37:0:0 chr2 131976272 . G C 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0313739;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.304;QD=23.2209;RBI=0.0562686;REFB=-0.0183698;REVB=0.0467101;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00201363;OID=.;OPOS=131976272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1 chr2 132044753 . A C 69.17 PASS AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.00616859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.449;QD=6.14842;RBI=0.0129338;REFB=-0.00773069;REVB=-0.0113681;RO=35;SAF=3;SAR=7;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52919;STB=0.823022;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0186848;OID=.;OPOS=132044753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:7:3:27:8:7:3:27:8 chr2 132044787 . G A 31.49 PASS AF=0.115385;AO=6;DP=52;FAO=6;FDP=52;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.00532922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.388;QD=2.42226;RBI=0.0181013;REFB=-0.000150229;REVB=-0.017299;RO=46;SAF=5;SAR=1;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259921;STB=0.707541;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=1.65768e-05;OID=.;OPOS=132044787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:52:52:46:46:6:6:0.115385:1:5:30:16:1:5:30:16 chr2 132137239 . C T 1607.05 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.02;QD=60.0767;RBI=0.0382444;REFB=0;REVB=0.0352024;RO=0;SAF=53;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.4914e-06;OID=.;OPOS=132137239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:54:53:0:0:54:53:0:0 chr2 132140090 . A C 2278.67 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7153;QD=62.4292;RBI=0.134115;REFB=-0.0744392;REVB=0.133648;RO=2;SAF=86;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163897;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106143;OID=.;OPOS=132140090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:145:146:2:0:143:146:1:57:86:0:2:59:87:0:0 chr2 132140200 . C A 2298.72 PASS AF=0.957055;AO=156;DP=166;FAO=156;FDP=163;FR=.;FRO=7;FSAF=72;FSAR=84;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0021597;FXX=0.0180712;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.822;QD=56.4103;RBI=0.00656267;REFB=-0.0648488;REVB=0.00619713;RO=5;SAF=72;SAR=84;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318914;STB=0.517043;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=7.62131e-07;OID=.;OPOS=132140200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:166:163:5:7:156:156:0.957055:84:72:5:0:84:72:6:1 chr2 132141767 . A G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.72;QD=57.1772;RBI=0.0453886;REFB=0;REVB=0.0292329;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67809e-05;OID=.;OPOS=132141767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0 chr2 132200256 . T C 120.07 PASS AF=0.294118;AO=14;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0195135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.936;QD=9.41688;RBI=0.0288881;REFB=-0.00828161;REVB=-0.0213013;RO=36;SAF=6;SAR=8;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404776;STB=0.714046;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0434399;OID=.;OPOS=132200256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:14:15:0.294118:8:6:28:8:8:7:28:8 chr2 132200307 . G A 177.46 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0244286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.659;QD=14.4863;RBI=0.0524137;REFB=-0.0229182;REVB=0.0463728;RO=29;SAF=10;SAR=9;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174078;STB=0.607736;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0357528;OID=.;OPOS=132200307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:29:30:19:19:0.387755:9:10:20:9:9:10:21:9 chr2 132200345 . C T 229.43 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0269551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.476;QD=14.119;RBI=0.0297067;REFB=-0.0371794;REVB=-0.0124863;RO=38;SAF=10;SAR=17;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24025;STB=0.636675;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0551713;OID=.;OPOS=132200345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:17:10:23:15:17:10:23:15 chr2 132200529 . A G 292.16 PASS AF=0.434211;AO=31;DP=75;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.07963;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5048;QD=15.3766;RBI=0.104324;REFB=-0.00485004;REVB=-0.0673987;RO=44;SAF=13;SAR=18;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035245;STB=0.516807;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00346939;OID=.;OPOS=132200529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:44:43:31:33:0.434211:18:13:17:27:19:14:17:26 chr2 132200935 . C T 60.28 PASS AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0175326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.321;QD=6.02756;RBI=0.0182436;REFB=-0.0136245;REVB=0.00504357;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258426;STB=0.666297;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0206277;OID=.;OPOS=132200935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:3:6:14:17:3:6:14:17 chr2 132201288 . A G 79.46 PASS AF=0.206349;AO=13;DP=63;FAO=13;FDP=63;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.03639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.032;QD=5.04478;RBI=0.0492138;REFB=-0.00547627;REVB=0.0331325;RO=49;SAF=7;SAR=6;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601644;STB=0.54627;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0176416;OID=.;OPOS=132201288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:63:63:49:50:13:13:0.206349:6:7:24:25:6:7:24:26 chr2 132201468 . G A 380.91 PASS AF=0.415094;AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=-0.00480244;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.7845;QD=14.3739;RBI=0.0145785;REFB=-0.00434893;REVB=-0.0137647;RO=61;SAF=24;SAR=20;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134038;STB=0.578913;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00608421;OID=.;OPOS=132201468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:61:62:44:44:0.415094:20:24:41:20:20:24:42:20 chr2 132201582 . A G 433.54 PASS AF=0.426087;AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=0.0107009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2417;QD=15.0797;RBI=0.0467393;REFB=-0.0136752;REVB=-0.0454978;RO=66;SAF=27;SAR=22;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732077;STB=0.541032;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0142225;OID=.;OPOS=132201582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:49:49:0.426087:22:27:41:25:22:27:41:25 chr2 132201663 . T C 359.58 PASS AF=0.457831;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0213931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.019;QD=17.3291;RBI=0.0238287;REFB=-0.0198441;REVB=-0.010495;RO=45;SAF=24;SAR=14;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771092;STB=0.543253;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0207074;OID=.;OPOS=132201663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:45:38:38:0.457831:14:24:25:20:14:24:25:20 chr2 132201718 . T C 281.66 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00703213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.657;QD=17.0701;RBI=0.00764826;REFB=-0.0124662;REVB=-0.00300749;RO=34;SAF=18;SAR=13;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936228;STB=0.542191;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00887541;OID=.;OPOS=132201718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:35:31:31:0.469697:13:18:23:11:13:18:23:12 chr2 132201736 . C G 228.35 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.0369004;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9785;QD=13.6326;RBI=0.0476719;REFB=-0.0181272;REVB=-0.0301824;RO=41;SAF=21;SAR=6;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161369;STB=0.562451;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0463898;OID=.;OPOS=132201736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:41:40:27:27:0.402985:6:21:27:14:6:21:28:12 chr2 132201862 . C G 463.61 PASS AF=0.451327;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.00555221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.825;QD=16.4111;RBI=0.00569427;REFB=-0.000567498;REVB=0.00126397;RO=61;SAF=32;SAR=19;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298139;STB=0.520052;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.000812828;OID=.;OPOS=132201862;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:61:62:51:51:0.451327:19:32:40:21:19:32:41:21 chr2 132201889 . C A 485.07 PASS AF=0.472727;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=0.00386014;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9326;QD=17.639;RBI=0.0168763;REFB=-0.00548426;REVB=0.0164289;RO=55;SAF=29;SAR=23;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127623;STB=0.571659;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00338165;OID=.;OPOS=132201889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:55:58:52:52:0.472727:23:29:38:17:23:29:40:18 chr2 132201930 . T C 414.05 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0540225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.06;QD=19.0368;RBI=0.0560891;REFB=-0.016408;REVB=0.0150847;RO=45;SAF=20;SAR=22;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135226;STB=0.575128;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0115295;OID=.;OPOS=132201930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:45:42:42:0.482759:22:20:28:17:22:20:28:17 chr2 132229720 . T C 50.84 PASS AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0343613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.427;QD=5.21479;RBI=0.0350218;REFB=-0.00457293;REVB=0.00676957;RO=31;SAF=4;SAR=4;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194237;STB=0.512788;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0175634;OID=.;OPOS=132229720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:4:4:15:16:4:4:15:16 chr2 132248379 . T G 319.06 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.0331675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9141;QD=15.7562;RBI=0.0627955;REFB=-0.0157694;REVB=-0.0533216;RO=45;SAF=14;SAR=21;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705961;STB=0.531232;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.021252;OID=.;OPOS=132248379;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:46:35:35:0.432099:21:14:15:30:21:14:16:30 chr2 132248584 . T C 288.79 PASS AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.023525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7073;QD=46.2056;RBI=0.0719615;REFB=-0.029813;REVB=-0.0680076;RO=2;SAF=12;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710841;STB=0.538428;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0185624;OID=.;OPOS=132248584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:11:12:2:0:11:12:2:0 chr2 132266142 . G C 483.87 PASS AF=0.37415;AO=55;DP=147;FAO=55;FDP=147;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=-0.000397265;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.088;QD=13.1665;RBI=0.00060413;REFB=-0.00481232;REVB=-0.000455141;RO=91;SAF=27;SAR=28;SRF=50;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642345;STB=0.53286;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00790691;OID=.;OPOS=132266142;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:91:92:55:55:0.37415:28:27:50:41:28:27:50:42 chr2 132274474 . G A 625.86 PASS AF=0.564815;AO=61;DP=108;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00975585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.02;QD=23.1799;RBI=0.0229756;REFB=-0.0378357;REVB=0.0208015;RO=46;SAF=23;SAR=38;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827502;STB=0.550708;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.024584;OID=.;OPOS=132274474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:46:47:61:61:0.564815:38:23:22:24:38:23:23:24 chr2 132275343 . G T 362.28 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0165533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9877;QD=18.5783;RBI=0.0534524;REFB=-0.0272591;REVB=0.0508247;RO=40;SAF=17;SAR=21;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229699;STB=0.627426;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0244296;OID=.;OPOS=132275343;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:21:17:28:12:21:17:28:12 chr2 132275366 . A G 283.03 PASS AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0021854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.8;QD=14.8962;RBI=0.0216179;REFB=-0.0328076;REVB=-0.0215071;RO=44;SAF=22;SAR=10;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371032;STB=0.709549;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0297085;OID=.;OPOS=132275366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:10:22:14:30:10:22:14:30 chr2 132275384 . T C 151.89 PASS AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0493802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0866;QD=9.79957;RBI=0.060815;REFB=-0.00283443;REVB=-0.0354973;RO=40;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269272;STB=0.648877;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00693838;OID=.;OPOS=132275384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:40:41:21:21:0.33871:8:13:15:25:8:13:16:25 chr2 132275396 . T C 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.841;QD=58.5996;RBI=0.0196515;REFB=0;REVB=-0.00298207;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52954e-05;OID=.;OPOS=132275396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr2 132275403 . C A 106.79 PASS AF=0.253968;AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0201131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.051;QD=6.78055;RBI=0.0204223;REFB=-0.0114835;REVB=-0.0035403;RO=47;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383362;STB=0.733057;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0273089;OID=.;OPOS=132275403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:47:47:16:16:0.253968:5:11:17:30:5:11:17:30 chr2 132277686 . C T 266.85 PASS AF=0.631579;AO=23;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0117318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2411;QD=28.0898;RBI=0.0228917;REFB=-0.0301532;REVB=0.0196569;RO=13;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163912;STB=0.56468;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0149511;OID=.;OPOS=132277686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:13:14:23:24:0.631579:11:12:10:3:11:13:10:4 chr2 132277962 . T C 210.72 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0797879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1269;QD=14.0482;RBI=0.0800036;REFB=0.00244601;REVB=0.00587065;RO=35;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141903;STB=0.580583;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00605486;OID=.;OPOS=132277962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:13:12:12:23:13:12:12:23 chr2 132277984 . G A 189.67 PASS AF=0.396552;AO=21;DP=56;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0625623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.224;QD=13.0807;RBI=0.0630517;REFB=-0.00854962;REVB=0.00783996;RO=35;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096208;STB=0.582382;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0156082;OID=.;OPOS=132277984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:35:35:21:23:0.396552:12:9:12:23:12:11:12:23 chr2 132287569 . G A 251.7 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0514393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.305;QD=17.0641;RBI=0.0645327;REFB=0.0176179;REVB=0.0389674;RO=31;SAF=8;SAR=20;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232776;STB=0.63148;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0170403;OID=.;OPOS=132287569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:20:8:16:15:20:8:16:15 chr2 132287824 . C T 370.74 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0206644;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.655;QD=19.2591;RBI=0.0431286;REFB=-0.0364515;REVB=0.0378558;RO=39;SAF=16;SAR=22;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107435;STB=0.559803;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0222124;OID=.;OPOS=132287824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:22:16:21:18:22:16:21:18 chr2 132909843 . T C 2351.92 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00345254;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.617;QD=63.1389;RBI=0.00456194;REFB=-0.0760793;REVB=-0.00298181;RO=1;SAF=85;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748953;STB=0.503936;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=5.34237e-07;OID=.;OPOS=132909843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:150:149:1:1:148:148:0.993289:63:85:0:1:63:85:0:1 chr2 133010786 . C T 330.6 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0273408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1624;QD=23.6146;RBI=0.0391565;REFB=0.000821494;REVB=-0.0280306;RO=23;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00205888;STB=0.501133;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=-0.00157452;OID=.;OPOS=133010786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:13:20:14:9:13:20:14:9 chr2 133011929 . C T 34.02 PASS AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0719704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.4922;QD=3.88747;RBI=0.0720156;REFB=-0.00309149;REVB=0.00255048;RO=29;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187708;STB=0.628172;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0199245;OID=.;OPOS=133011929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:35:35:29:29:6:6:0.171429:3:3:10:19:3:3:10:19 chr2 133011947 . C G 44.44 PASS AF=0.170732;AO=8;DP=46;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0132345;FXX=0.108672;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7362;QD=4.33586;RBI=0.0827693;REFB=-0.00162689;REVB=0.0817044;RO=33;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308254;STB=0.652647;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0207107;OID=.;OPOS=133011947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:46:41:33:34:8:7:0.170732:3:5:12:21:3:4:13:21 chr2 133011953 . T C 58.76 PASS AF=0.1875;AO=10;DP=48;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.014628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.4023;QD=4.89673;RBI=0.0487121;REFB=-7.86561e-06;REVB=-0.0464638;RO=37;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352041;STB=0.684527;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00144595;OID=.;OPOS=133011953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:48:48:37:39:10:9:0.1875:3:7:15:22:3:6:17:22 chr2 133011994 . T C 45.19 PASS AF=0.142857;AO=8;DP=56;FAO=8;FDP=56;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00731184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.504;QD=3.22788;RBI=0.00758788;REFB=-0.00553829;REVB=-0.00202804;RO=47;SAF=5;SAR=3;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139846;STB=0.607836;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.038667;OID=.;OPOS=133011994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:56:56:47:48:8:8:0.142857:3:5:24:23:3:5:24:24 chr2 133012005 . C T 38.45 PASS AF=0.12963;AO=7;DP=54;FAO=7;FDP=54;FR=.;FRO=47;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.018534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.342;QD=2.84815;RBI=0.0186146;REFB=-0.00316646;REVB=0.00173026;RO=46;SAF=1;SAR=6;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531426;STB=0.873363;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0290307;OID=.;OPOS=133012005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:54:54:46:47:7:7:0.12963:6:1:28:18:6:1:28:19 chr2 133012006 . G A 56.61 PASS AF=0.173077;AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00034556;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.701;QD=4.3547;RBI=0.0190104;REFB=-0.0029374;REVB=-0.0190073;RO=43;SAF=6;SAR=3;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193717;STB=0.631281;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00301367;OID=.;OPOS=133012006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:52:43:43:9:9:0.173077:3:6:22:21:3:6:22:21 chr2 133012007 . T C 32.34 PASS AF=0.12;AO=6;DP=51;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0357488;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.377;QD=2.58697;RBI=0.0414316;REFB=-0.00377728;REVB=-0.0209427;RO=44;SAF=3;SAR=3;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530354;STB=0.539868;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0422038;OID=.;OPOS=133012007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:51:50:44:44:6:6:0.12:3:3:24:20:3:3:24:20 chr2 133012011 . G C 65.24 PASS AF=0.2;AO=7;DP=47;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0335039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.343;QD=5.21905;RBI=0.0348784;REFB=-0.00666284;REVB=-0.00969489;RO=40;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115448;STB=0.560853;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.020156;OID=.;OPOS=133012011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:47:50:40:40:7:10:0.2:4:3:21:19:4:6:21:19 chr2 133012012 . C A 141.85 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00350297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.126;QD=11.1252;RBI=0.0260694;REFB=-0.0143013;REVB=0.025833;RO=34;SAF=12;SAR=5;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304666;STB=0.680634;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0405871;OID=.;OPOS=133012012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:5:12:15:19:5:12:15:19 chr2 133012022 . G A 49.06 PASS AF=0.163265;AO=8;DP=46;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0520825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.241;QD=4.00497;RBI=0.0592187;REFB=-0.0112096;REVB=-0.0281826;RO=38;SAF=1;SAR=7;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.532238;STB=0.878464;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0417228;OID=.;OPOS=133012022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:46:49:38:41:8:8:0.163265:7:1:21:17:7:1:24:17 chr2 133012034 . C G 234.31 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0582088;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.959;QD=20.8275;RBI=0.102297;REFB=-0.0599372;REVB=0.0841215;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13202;STB=0.610468;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.101725;OID=.;OPOS=133012034;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:20:20:19:19:0.422222:6:13:11:9:5:14:11:9 chr2 133012079 . G A 233.46 PASS AF=0.472727;AO=25;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00201188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.037;QD=16.9792;RBI=0.0133863;REFB=-0.0120664;REVB=0.0132342;RO=29;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106179;STB=0.56797;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0146379;OID=.;OPOS=133012079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:29:29:25:26:0.472727:11:14:13:16:11:15:13:16 chr2 133012080 . A AC 221.61 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.000821325;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.2315;QD=17.0469;RBI=0.0726414;REFB=0.0353223;REVB=0.0726368;RO=25;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310039;STB=0.501991;STBP=0.971;TYPE=ins;VARB=-0.0262795;OID=.;OPOS=133012081;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.557692:29:55:29:52:23:15:14:12:11:99:25:15:14:12:13 chr2 133012099 . G A 231.03 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0102483;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.21;QD=16.5019;RBI=0.0459655;REFB=-0.00263301;REVB=-0.0448084;RO=30;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737818;STB=0.541634;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00326804;OID=.;OPOS=133012099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:11:15:15:15:11:15:15:15 chr2 133012111 . T C 104.07 PASS AF=0.263158;AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0217665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.406;QD=7.30293;RBI=0.0224256;REFB=0.00749916;REVB=0.00539687;RO=38;SAF=7;SAR=8;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132161;STB=0.559362;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0250238;OID=.;OPOS=133012111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:38:42:15:15:0.263158:8:7:22:16:8:7:23:19 chr2 133012126 . A C 45.81 PASS AF=0.145455;AO=8;DP=56;FAO=8;FDP=55;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00739665;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.874;QD=3.33162;RBI=0.0138344;REFB=-0.00770564;REVB=-0.011691;RO=48;SAF=3;SAR=5;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200271;STB=0.633152;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0228565;OID=.;OPOS=133012126;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:56:55:48:47:8:8:0.145455:5:3:26:22:5:3:25:22 chr2 133012147 . A G 74.2 PASS AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00131968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.317;QD=5.6002;RBI=0.0038528;REFB=-0.00560896;REVB=-0.00361974;RO=42;SAF=4;SAR=7;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224876;STB=0.644789;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0145253;OID=.;OPOS=133012147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:53:53:42:42:11:11:0.207547:7:4:23:19:7:4:23:19 chr2 133012170 . CC AA 105.82 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00916621;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=181.041;QD=11.4396;RBI=0.0106786;REFB=-0.00107897;REVB=0.00547842;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872131;STB=0.551788;STBP=0.648;TYPE=mnp;VARB=0.00316887;OID=.;OPOS=133012170;OREF=CC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:13:11:7:6:13:11 chr2 133012172 . T C 43.22 PASS AF=0.2;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0129445;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.767;QD=4.93942;RBI=0.0326101;REFB=-0.00522556;REVB=-0.0299308;RO=29;SAF=2;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318366;STB=0.701895;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00738946;OID=.;OPOS=133012172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:36:35:29:28:7:7:0.2:5:2:16:13:5:2:15:13 chr2 133012182 . C T 106.64 PASS AF=0.393939;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0354805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.524;QD=12.9255;RBI=0.0376238;REFB=-0.0236064;REVB=-0.0125173;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886344;STB=0.523328;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0167217;OID=.;OPOS=133012182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:20:20:12:13:0.393939:7:5:10:10:7:6:10:10 chr2 133012267 . T C 849.24 PASS AF=0.731183;AO=65;DP=91;FAO=68;FDP=93;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=58;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0315241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.55;QD=36.5265;RBI=0.0372416;REFB=-0.0276461;REVB=0.0198285;RO=25;SAF=8;SAR=57;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384647;STB=0.680689;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00647761;OID=.;OPOS=133012267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:25:25:65:68:0.731183:57:8:15:10:58:10:15:10 chr2 133012274 . T C 806.06 PASS AF=0.714286;AO=65;DP=91;FAO=65;FDP=91;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=56;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.000146011;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.877;QD=35.4311;RBI=0.00176484;REFB=-0.0068131;REVB=-0.00175879;RO=26;SAF=9;SAR=56;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391508;STB=0.713298;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00508431;OID=.;OPOS=133012274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:26:26:65:65:0.714286:56:9:17:9:56:9:17:9 chr2 133012309 . A G 840.45 PASS AF=0.728261;AO=67;DP=92;FAO=67;FDP=92;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=56;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0198111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.298;QD=36.5415;RBI=0.0270586;REFB=-0.00226545;REVB=-0.0184306;RO=25;SAF=11;SAR=56;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329684;STB=0.678879;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00114389;OID=.;OPOS=133012309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:25:25:67:67:0.728261:56:11:16:9:56:11:16:9 chr2 133012358 . G A 43.71 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00344773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.67;QD=6.02896;RBI=0.0374453;REFB=-0.0195884;REVB=-0.0372863;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187877;STB=0.621021;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0333593;OID=.;OPOS=133012358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:3:4:9:13:3:4:9:13 chr2 133012361 . CCA CGG 33.23 PASS AF=0.137931;AO=4;DP=30;FAO=4;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.016609;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=2;MLLD=184.235;QD=4.5832;RBI=0.0167885;REFB=-0.00851161;REVB=0.00244802;RO=23;SAF=1;SAR=3;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226378;STB=0.672549;STBP=0.533;TYPE=mnp;VARB=0.0063666;OID=.;OPOS=133012362;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=CGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.137931:4:30:4:29:23:1:3:10:13:21:23:1:3:10:13 chr2 133012369 . A G 95.48 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00543261;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7806;QD=10.6092;RBI=0.0220724;REFB=0.00130735;REVB=-0.0213934;RO=24;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00341064;OID=.;OPOS=133012369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:37:36:24:24:12:12:0.333333:7:5:10:14:7:5:10:14 chr2 133012401 . G A 154.4 PASS AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0119056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.708;QD=10.6485;RBI=0.0119355;REFB=-0.0131947;REVB=-0.000844772;RO=38;SAF=10;SAR=10;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588911;STB=0.534448;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.020656;OID=.;OPOS=133012401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:38:38:20:20:0.344828:10:10:17:21:10:10:17:21 chr2 133012414 . G A 183.54 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00602587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.635;QD=11.8414;RBI=0.00789186;REFB=-0.00523636;REVB=-0.00509611;RO=39;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272502;STB=0.515746;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00953886;OID=.;OPOS=133012414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:13:10:16:23:13:10:16:23 chr2 133012439 . A AGAAC,C 223.81 PASS AF=0.228261,0.0978261;AO=21,9;DP=92;FAO=21,9;FDP=92;FR=.;FRO=62;FSAF=20,9;FSAR=1,0;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0195569,-0.00509317;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,1;MLLD=251.085,71.9029;QD=9.73089;RBI=0.0325066,0.0277668;REFB=-0.00011038,0.00772443;REVB=-0.0259655,-0.0272957;RO=62;SAF=20,9;SAR=1,0;SRF=26;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.712602,0.693572;STB=0.941015,0.998906;STBP=0,0;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0109489,-0.0411616;OID=.,.;OPOS=133012440,133012439;OREF=-,A;OALT=GAAC,C;OMAPALT=AGAAC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:62:62:21,9:21,9:0.228261,0.0978261:1,0:20,9:26:36:1,0:20,9:26:36 chr2 133012457 . C T 73.18 PASS AF=0.0888889;AO=24;DP=270;FAO=24;FDP=270;FR=.;FRO=246;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=113;FSRR=133;FWDB=0.019621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.691;QD=1.08414;RBI=0.0303651;REFB=-0.00230077;REVB=-0.0231744;RO=239;SAF=12;SAR=12;SRF=108;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572246;STB=0.537006;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0167656;OID=.;OPOS=133012457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:270:270:239:246:24:24:0.0888889:12:12:108:131:12:12:113:133 chr2 133012458 . GT AC 2747.48 PASS AF=0.783088;AO=211;DP=271;FAO=213;FDP=272;FR=.;FRO=59;FSAF=101;FSAR=112;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.00228341;FXX=0.007299;HRUN=1;LEN=2;MLLD=231.9;QD=40.4042;RBI=0.0145217;REFB=-0.0331467;REVB=0.014341;RO=59;SAF=100;SAR=111;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207414;STB=0.510984;STBP=0.493;TYPE=mnp;VARB=0.00486887;OID=.;OPOS=133012458;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:272:59:59:211:213:0.783088:111:100:25:34:112:101:25:34 chr2 133012465 . C T 62.12 PASS AF=0.0750751;AO=25;DP=332;FAO=25;FDP=333;FR=.;FRO=308;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=140;FSRR=168;FWDB=0.0207118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.525;QD=0.746176;RBI=0.0274755;REFB=-0.000981751;REVB=-0.0180533;RO=306;SAF=14;SAR=11;SRF=138;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12289;STB=0.59659;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0340879;OID=.;OPOS=133012465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:332:333:306:308:25:25:0.0750751:11:14:138:168:11:14:140:168 chr2 133012504 . A G 4454.33 PASS AF=0.83376;AO=323;DP=388;FAO=326;FDP=391;FR=.;FRO=65;FSAF=173;FSAR=153;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.00180371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.089;QD=45.5686;RBI=0.00833297;REFB=-0.0144594;REVB=-0.00813541;RO=64;SAF=171;SAR=152;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239171;STB=0.51152;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00198815;OID=.;OPOS=133012504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:391:64:65:323:326:0.83376:152:171:29:35:153:173:30:35 chr2 133012508 . TG CA,CG 5039.34 PASS AF=0.0642674,0.8509;AO=22,321;DP=380;FAO=25,331;FDP=389;FR=.;FRO=33;FSAF=14,175;FSAR=11,156;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.000803356,0.00154708;FXX=0.00765287;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=136.716,176.505;QD=51.8184;RBI=0.0135461,0.0626218;REFB=-0.00295631,-0.00734175;REVB=0.0135222,0.0626027;RO=33;SAF=14,172;SAR=8,149;SRF=13;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.251889,0.0252095;STB=0.593633,0.51224;STBP=0.235,0.143;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00728397,0.00245645;OID=.,.;OPOS=133012508,133012508;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:97:380:389:33:33:22,321:25,331:0.0642674,0.8509:8,149:14,172:13:20:11,156:14,175:13:20 chr2 133012516 . T G 4495.91 PASS AF=0.84131;AO=316;DP=376;FAO=334;FDP=397;FR=.;FRO=63;FSAF=185;FSAR=149;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.0517482;FXX=0.00749981;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.0122;QD=45.2989;RBI=0.0528751;REFB=-0.0261008;REVB=0.0108582;RO=60;SAF=185;SAR=131;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519973;STB=0.520033;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00562277;OID=.;OPOS=133012516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:397:60:63:316:334:0.84131:131:185:25:35:149:185:27:36 chr2 133012523 . A G 4654.03 PASS AF=0.85213;AO=340;DP=400;FAO=340;FDP=399;FR=.;FRO=59;FSAF=189;FSAR=151;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0267372;FXX=0.00498741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.522;QD=46.6569;RBI=0.0326295;REFB=-0.0154066;REVB=0.018703;RO=59;SAF=189;SAR=151;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373164;STB=0.5197;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00150086;OID=.;OPOS=133012523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:399:59:59:340:340:0.85213:151:189:25:34:151:189:25:34 chr2 133012542 . T C 4931.86 PASS AF=0.886889;AO=338;DP=388;FAO=345;FDP=389;FR=.;FRO=44;FSAF=193;FSAR=152;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0120148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.956;QD=50.7132;RBI=0.0162297;REFB=-0.0153129;REVB=-0.0109108;RO=43;SAF=190;SAR=148;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310969;STB=0.517176;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00138527;OID=.;OPOS=133012542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:389:43:44:338:345:0.886889:148:190:18:25:152:193:18:26 chr2 133012571 . T C 5148.86 PASS AF=0.916667;AO=351;DP=385;FAO=352;FDP=384;FR=.;FRO=32;FSAF=209;FSAR=143;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0119607;FXX=0.00259734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.635;QD=53.6339;RBI=0.0130275;REFB=0.000128125;REVB=0.00516313;RO=32;SAF=209;SAR=142;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360679;STB=0.518759;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-2.95038e-06;OID=.;OPOS=133012571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:385:384:32:32:351:352:0.916667:142:209:12:20:143:209:12:20 chr2 133012612 . T C 2743.8 PASS AF=0.919811;AO=176;DP=193;FAO=195;FDP=212;FR=.;FRO=17;FSAF=97;FSAR=98;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0398779;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.248;QD=51.7699;RBI=0.0404085;REFB=-0.0175845;REVB=-0.00652738;RO=17;SAF=85;SAR=91;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175974;STB=0.50728;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00124858;OID=.;OPOS=133012612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:193:212:17:17:176:195:0.919811:91:85:10:7:98:97:10:7 chr2 133012642 . TT CC 273.32 PASS AF=0.685714;AO=24;DP=35;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00872885;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=291.63;QD=31.2366;RBI=0.0589836;REFB=-0.0212522;REVB=0.0583341;RO=11;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100955;STB=0.555508;STBP=0.309;TYPE=mnp;VARB=0.00780136;OID=.;OPOS=133012642;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:11:11:24:24:0.685714:15:9:6:5:15:9:6:5 chr2 133012655 . A G 690.3 PASS AF=0.820896;AO=55;DP=67;FAO=55;FDP=67;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=40;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0134711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.9;QD=41.2121;RBI=0.0361332;REFB=-0.00778642;REVB=0.0335282;RO=12;SAF=15;SAR=40;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122844;STB=0.565891;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000778672;OID=.;OPOS=133012655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:67:67:12:12:55:55:0.820896:40:15:7:5:40:15:7:5 chr2 133012674 . A G 1052.0 PASS AF=0.948052;AO=73;DP=77;FAO=73;FDP=77;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0028872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.673;QD=54.6493;RBI=0.0174669;REFB=0.0655417;REVB=-0.0172266;RO=4;SAF=26;SAR=47;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153089;STB=0.508106;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.00214592;OID=.;OPOS=133012674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:77:77:4:4:73:73:0.948052:47:26:2:2:47:26:2:2 chr2 133012680 . A G 757.22 PASS AF=0.753086;AO=61;DP=81;FAO=61;FDP=81;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0172898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9852;QD=37.3935;RBI=0.0286166;REFB=-0.0111818;REVB=-0.0228029;RO=19;SAF=18;SAR=43;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165488;STB=0.58421;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00869344;OID=.;OPOS=133012680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:19:20:61:61:0.753086:43:18:12:7:43:18:12:8 chr2 133012688 . A G 757.08 PASS AF=0.753086;AO=61;DP=80;FAO=61;FDP=81;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0101166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.194;QD=37.3864;RBI=0.029488;REFB=-0.0172819;REVB=0.0276983;RO=19;SAF=18;SAR=43;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189195;STB=0.596922;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00346988;OID=.;OPOS=133012688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:19:20:61:61:0.753086:43:18:13:6:43:18:13:7 chr2 133012691 . T C 1021.0 PASS AF=0.901235;AO=73;DP=81;FAO=73;FDP=81;FR=.;FRO=8;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00838299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.017;QD=50.4196;RBI=0.00894996;REFB=0.0154256;REVB=0.00313486;RO=8;SAF=27;SAR=46;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257815;STB=0.513685;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=-0.000862453;OID=.;OPOS=133012691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:81:81:8:8:73:73:0.901235:46:27:4:4:46:27:4:4 chr2 133012712 . T C 1450.34 PASS AF=0.95;AO=95;DP=100;FAO=95;FDP=100;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0315924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4655;QD=58.0137;RBI=0.0509646;REFB=-0.00643511;REVB=0.0399913;RO=5;SAF=34;SAR=61;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247378;STB=0.513068;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00087696;OID=.;OPOS=133012712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:100:100:5:5:95:95:0.95:61:34:3:2:61:34:3:2 chr2 133012716 . A G 1244.66 PASS AF=0.91;AO=89;DP=102;FAO=91;FDP=100;FR=.;FRO=9;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00109006;FXX=0.0291234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.276;QD=49.7865;RBI=0.00150764;REFB=-0.00055942;REVB=-0.00104151;RO=9;SAF=33;SAR=56;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339994;STB=0.518584;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=5.17085e-05;OID=.;OPOS=133012716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:102:100:9:9:89:91:0.91:56:33:5:4:58:33:5:4 chr2 133012797 . C CCG 407.85 PASS AF=0.772727;AO=32;DP=83;FAO=34;FDP=44;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0369621;FXX=0.254194;HRUN=1;LEN=2;MLLD=103.895;QD=37.0772;RBI=0.0539108;REFB=-0.0336228;REVB=0.039245;RO=46;SAF=9;SAR=23;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475427;STB=0.564476;STBP=0.15;TYPE=ins;VARB=0.0285591;OID=.;OPOS=133012798;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=CCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.772727:32:83:34:44:10:9:25:5:5:71:46:9:23:35:11 chr2 133012798 . TAAACT CGTCTT,TCTTGC 454.01 PASS AF=0.097561,0.780488;AO=3,32;DP=56;FAO=4,32;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=2,9;FSAR=2,23;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0187688,0.0205971;FXX=0.267809;HRUN=1,3;LEN=5,5;MLLD=77.513,171.201;QD=44.2932;RBI=0.0242541,0.020732;REFB=0.0109894,-0.0125998;REVB=-0.015362,0.00236129;RO=5;SAF=2,9;SAR=1,23;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.247694,-0.0361781;STB=0.555281,0.519495;STBP=0.813,0.626;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0287327,0.000102851;OID=.,.;OPOS=133012798,133012799;OREF=TAAAC,AAACT;OALT=CGTCT,CTTGC;OMAPALT=CGTCTT,TCTTGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:31:56:41:5:5:3,32:4,32:0.097561,0.780488:1,23:2,9:2:3:2,23:2,9:2:3 chr2 133012807 . A G 452.69 PASS AF=0.672131;AO=41;DP=63;FAO=41;FDP=61;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0161994;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.644;QD=29.6843;RBI=0.0252057;REFB=-0.0309793;REVB=0.0193107;RO=20;SAF=11;SAR=30;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194187;STB=0.606006;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0134083;OID=.;OPOS=133012807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:20:20:41:41:0.672131:30:11:11:9:30:11:11:9 chr2 133012830 . G A 36.58 PASS AF=0.111111;AO=8;DP=72;FAO=8;FDP=72;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.0255798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.029;QD=2.03234;RBI=0.032458;REFB=-0.00156349;REVB=0.01998;RO=64;SAF=5;SAR=3;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306591;STB=0.723181;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0124759;OID=.;OPOS=133012830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:72:72:64:64:8:8:0.111111:3:5:23:41:3:5:23:41 chr2 133012832 . T C 650.28 PASS AF=0.75;AO=52;DP=72;FAO=54;FDP=72;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0220154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3146;QD=36.1265;RBI=0.0252956;REFB=0.00710156;REVB=-0.0124575;RO=17;SAF=17;SAR=35;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101202;STB=0.566301;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00214251;OID=.;OPOS=133012832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:17:18:52:54:0.75:35:17:9:8:37:17:10:8 chr2 133012839 . T C 690.47 PASS AF=0.777778;AO=55;DP=71;FAO=56;FDP=72;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00546043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.832;QD=38.3597;RBI=0.0113733;REFB=-0.00698207;REVB=0.00997673;RO=16;SAF=17;SAR=38;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090194;STB=0.544037;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00435786;OID=.;OPOS=133012839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:16:16:55:56:0.777778:38:17:8:8:38:18:8:8 chr2 133012866 . C A 38.16 PASS AF=0.104651;AO=9;DP=86;FAO=9;FDP=86;FR=.;FRO=77;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=0.0189199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.829;QD=1.77472;RBI=0.0227503;REFB=-0.00044134;REVB=-0.0126337;RO=76;SAF=4;SAR=5;SRF=28;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931112;STB=0.5622;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00425977;OID=.;OPOS=133012866;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:86:86:76:77:9:9:0.104651:5:4:28:48:5:4:29:48 chr2 133012882 . A G 42.99 PASS AF=0.116883;AO=9;DP=76;FAO=9;FDP=77;FR=.;FRO=68;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=46;FWDB=-0.0565356;FXX=0.0253133;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.2008;QD=2.23322;RBI=0.0565829;REFB=-0.0104614;REVB=0.00231314;RO=67;SAF=6;SAR=3;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373663;STB=0.777254;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0501911;OID=.;OPOS=133012882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:76:77:67:68:9:9:0.116883:3:6:23:44:3:6:22:46 chr2 133012901 . T C 443.12 PASS AF=0.891892;AO=33;DP=37;FAO=33;FDP=37;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00170823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.334;QD=47.9046;RBI=0.0275448;REFB=-0.0180728;REVB=0.0274917;RO=4;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847389;STB=0.545428;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000637826;OID=.;OPOS=133012901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:37:37:4:4:33:33:0.891892:20:13:0:4:20:13:0:4 chr2 133012903 . TG CA,CG 198.9 PASS AF=0.205882,0.382353;AO=7,13;DP=34;FAO=7,13;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=5,4;FSAR=2,9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0155393,-0.0132438;FXX=0.0285633;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=163.696,77.8996;QD=23.4003;RBI=0.0183129,0.0181381;REFB=0.00244054,0.00473105;REVB=-0.00968984,0.0123932;RO=14;SAF=5,4;SAR=2,9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.439136,0.0234553;STB=0.76852,0.513493;STBP=0.102,0.891;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00521035,-0.0191254;OID=.,.;OPOS=133012903,133012903;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:34:34:14:14:7,13:7,13:0.205882,0.382353:2,9:5,4:4:10:2,9:5,4:4:10 chr2 133012909 . T C 52.48 PASS AF=0.242424;AO=7;DP=32;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0283711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.926;QD=6.36131;RBI=0.0288451;REFB=-0.00479719;REVB=-0.00520779;RO=25;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443651;STB=0.718927;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0416436;OID=.;OPOS=133012909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:33:25:25:7:8:0.242424:2:5:8:17:3:5:8:17 chr2 133012923 . A T 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0104569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.91;QD=9.13212;RBI=0.0110538;REFB=-0.00790108;REVB=0.00358321;RO=21;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155879;STB=0.614625;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0128304;OID=.;OPOS=133012923;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:21:22:10:10:0.3125:7:3:9:12:7:3:10:12 chr2 133012930 . A G 73.83 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.015769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.618;QD=9.84392;RBI=0.0159416;REFB=-0.00372694;REVB=0.00233931;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0122025;OID=.;OPOS=133012930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:6:4:8:12:6:4:8:12 chr2 133012940 . C T 52.36 PASS AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00177767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.225;QD=6.5449;RBI=0.0114588;REFB=-0.00536842;REVB=-0.0113201;RO=24;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332289;STB=0.708474;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0215219;OID=.;OPOS=133012940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:3:5:8:16:3:5:8:16 chr2 133012945 . T C 83.9 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00977166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.479;QD=10.1699;RBI=0.00987635;REFB=-0.00210996;REVB=-0.00143423;RO=22;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104359;STB=0.563101;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00240023;OID=.;OPOS=133012945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:7:4:10:12:7:4:10:12 chr2 133012982 . GT AC 112.9 PASS AF=0.75;AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0139168;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=161.094;QD=28.226;RBI=0.0140905;REFB=0.00788583;REVB=0.00220577;RO=4;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.00227555;OID=.;OPOS=133012982;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:16:16:4:4:12:12:0.75:6:6:2:2:6:6:2:2 chr2 133012988 . C T 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00471981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.581;QD=9.44475;RBI=0.0132532;REFB=-0.00345278;REVB=-0.0123843;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535511;STB=0.832222;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0167872;OID=.;OPOS=133012988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:1:5:3:7:1:5:3:7 chr2 133012994 . A G 39.8 PASS AF=0.4;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0307577;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.375;QD=10.6127;RBI=0.0307816;REFB=-0.00952488;REVB=-0.00121247;RO=9;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.572962;STB=0.849948;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0213078;OID=.;OPOS=133012994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:16:15:9:9:6:6:0.4:5:1:7:2:5:1:7:2 chr2 133012995 . C G 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0692414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.288;QD=9.44486;RBI=0.070196;REFB=0.00584413;REVB=-0.0115373;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535511;STB=0.832222;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.0498663;OID=.;OPOS=133012995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:1:5:3:7:1:5:3:7 chr2 133013049 . G A 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00335284;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.744;QD=10.0339;RBI=0.0314159;REFB=-0.0238654;REVB=-0.0312365;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0288552;OID=.;OPOS=133013049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:3:4:3:2:3:4 chr2 133013144 . A G 285.28 PASS AF=0.641026;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0221355;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2774;QD=29.2599;RBI=0.0280432;REFB=-0.0326586;REVB=-0.0172175;RO=14;SAF=13;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105816;STB=0.558236;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0242135;OID=.;OPOS=133013144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:14:14:25:25:0.641026:12:13:5:9:12:13:5:9 chr2 133013145 . C T 42.13 PASS AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00314115;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.603;QD=4.10975;RBI=0.0170554;REFB=-0.00303403;REVB=-0.0167636;RO=32;SAF=3;SAR=4;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487352;STB=0.559271;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0409604;OID=.;OPOS=133013145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:41:41:32:34:7:7:0.170732:4:3:15:17:4:3:17:17 chr2 133013165 . G T 31.16 PASS AF=0.113208;AO=6;DP=53;FAO=6;FDP=53;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=9.25879e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.45;QD=2.35194;RBI=0.000631895;REFB=-0.0028043;REVB=0.000625075;RO=46;SAF=3;SAR=3;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759101;STB=0.565822;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0182562;OID=.;OPOS=133013165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:53:53:46:47:6:6:0.113208:3:3:26:20:3:3:27:20 chr2 133013175 . T G 536.85 PASS AF=0.830189;AO=44;DP=53;FAO=44;FDP=53;FR=.;FRO=9;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0427627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2449;QD=40.5168;RBI=0.0431344;REFB=0.0393788;REVB=-0.00565082;RO=9;SAF=23;SAR=21;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104188;STB=0.505586;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=-0.00974098;OID=.;OPOS=133013175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:53:53:9:9:44:44:0.830189:21:23:5:4:21:23:5:4 chr2 133013183 . A G 344.08 PASS AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00768448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.379;QD=25.024;RBI=0.00803736;REFB=0.00115246;REVB=-0.00235541;RO=21;SAF=18;SAR=16;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00391209;STB=0.502145;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.00104161;OID=.;OPOS=133013183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:21:21:34:34:0.618182:16:18:11:10:16:18:11:10 chr2 133013189 . A G 325.17 PASS AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0102155;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.2262;QD=22.4258;RBI=0.0173188;REFB=0.00782103;REVB=0.0139852;RO=24;SAF=17;SAR=16;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020282;STB=0.502091;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.0134581;OID=.;OPOS=133013189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:24:25:33:33:0.568966:16:17:13:11:16:17:13:12 chr2 133013201 . C G 573.31 PASS AF=0.824561;AO=45;DP=55;FAO=47;FDP=57;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00960577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.858;QD=40.2324;RBI=0.0162206;REFB=-0.00379882;REVB=0.0130704;RO=10;SAF=22;SAR=23;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376579;STB=0.501866;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.000691995;OID=.;OPOS=133013201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:55:57:10:10:45:47:0.824561:23:22:5:5:23:24:5:5 chr2 133013224 . A C,T 542.58 PASS AF=0.610169,0.186441;AO=36,11;DP=59;FAO=36,11;FDP=59;FR=.;FRO=12;FSAF=17,6;FSAR=19,5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0021303,0.00957149;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=94.4061,135.675;QD=36.7848;RBI=0.011329,0.0108514;REFB=-0.0264131,-0.0436024;REVB=0.0111269,0.00511264;RO=11;SAF=17,6;SAR=19,5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0317331,0;STB=0.527762,0.519964;STBP=0.542,0.872;TYPE=snp,snp;VARB=0.00793912,-0.0191581;OID=.,.;OPOS=133013224,133013224;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:59:59:11:12:36,11:36,11:0.610169,0.186441:19,5:17,6:6:5:19,5:17,6:7:5 chr2 133013250 . C T 69.99 PASS AF=0.171053;AO=12;DP=75;FAO=13;FDP=76;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0234332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.586;QD=3.68343;RBI=0.0237269;REFB=-0.00332568;REVB=-0.00372163;RO=63;SAF=5;SAR=7;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152248;STB=0.627571;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.083093;OID=.;OPOS=133013250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:75:76:63:63:12:13:0.171053:7:5:34:29:8:5:34:29 chr2 133013260 . TC T 51.13 PASS AF=0.219178;AO=15;DP=73;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.000359454;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.7745;QD=2.80174;RBI=0.0641816;REFB=0.00524153;REVB=0.0641806;RO=55;SAF=5;SAR=10;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0.45;SSSB=-0.221678;STB=0.605403;STBP=0.392;TYPE=del;VARB=-0.00980576;OID=.;OPOS=133013261;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.219178:15:73:16:73:57:6:10:29:28:51:55:5:10:28:27 chr2 133013266 . T G 150.39 PASS AF=0.287671;AO=21;DP=73;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00323115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.036;QD=8.24045;RBI=0.0117816;REFB=0.00179822;REVB=-0.0113298;RO=52;SAF=7;SAR=14;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225846;STB=0.635383;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00154714;OID=.;OPOS=133013266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:52:52:21:21:0.287671:14:7:27:25:14:7:27:25 chr2 133013270 . A G 120.98 PASS AF=0.257143;AO=18;DP=70;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0136901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.045;QD=6.91317;RBI=0.0209525;REFB=-0.00445043;REVB=-0.0158616;RO=51;SAF=7;SAR=11;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170871;STB=0.597335;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.00767627;OID=.;OPOS=133013270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:51:52:18:18:0.257143:11:7:27:24:11:7:27:25 chr2 133013286 . AG CA 105.78 PASS AF=0.206897;AO=12;DP=59;FAO=12;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.024836;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.756;QD=7.29514;RBI=0.0319769;REFB=0.00106702;REVB=-0.020142;RO=42;SAF=9;SAR=3;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369695;STB=0.735449;STBP=0.075;TYPE=mnp;VARB=0.00934448;OID=.;OPOS=133013286;OREF=AG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:59:58:42:42:12:12:0.206897:3:9:19:23:3:9:19:23 chr2 133013318 . A G 268.25 PASS AF=0.510204;AO=23;DP=47;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00103059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.527;QD=21.8981;RBI=0.00466013;REFB=-0.0220351;REVB=-0.00454474;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560942;STB=0.550448;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00388708;OID=.;OPOS=133013318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:49:24:24:23:25:0.510204:11:12:14:10:13:12:14:10 chr2 133013324 . C A 89.78 PASS AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.010071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.858;QD=7.48128;RBI=0.0102711;REFB=-0.00950522;REVB=0.00201761;RO=36;SAF=2;SAR=10;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.555327;STB=0.844037;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0309725;OID=.;OPOS=133013324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:10:2:23:13:10:2:23:13 chr2 133013327 . G T 90.15 PASS AF=0.244898;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0227654;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.129;QD=7.35923;RBI=0.0369112;REFB=0.00423215;REVB=-0.0290547;RO=37;SAF=2;SAR=10;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.563432;STB=0.849116;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0300284;OID=.;OPOS=133013327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:50:49:37:37:12:12:0.244898:10:2:24:13:10:2:24:13 chr2 133013332 . T C 78.18 PASS AF=0.215686;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0075756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3882;QD=6.13202;RBI=0.00857621;REFB=-0.0144496;REVB=0.00402016;RO=39;SAF=8;SAR=3;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328879;STB=0.702919;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0755483;OID=.;OPOS=133013332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:50:51:39:40:11:11:0.215686:3:8:18:21:3:8:19:21 chr2 133013343 . T C 78.59 PASS AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0216854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.457;QD=6.41543;RBI=0.0222555;REFB=0.00218937;REVB=0.00500511;RO=37;SAF=8;SAR=3;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272421;STB=0.684476;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.0190441;OID=.;OPOS=133013343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:49:49:37:38:11:11:0.22449:3:8:19:18:3:8:19:19 chr2 133013351 . G A 78.59 PASS AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0423338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.003;QD=6.41545;RBI=0.046802;REFB=0.00808898;REVB=0.0199569;RO=38;SAF=3;SAR=8;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422153;STB=0.7655;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0416566;OID=.;OPOS=133013351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:49:49:38:38:11:11:0.22449:8:3:24:14:8:3:24:14 chr2 133013378 . A G 194.14 PASS AF=0.425532;AO=14;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0177932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.574;QD=16.5221;RBI=0.0178539;REFB=-0.0397067;REVB=-0.00147135;RO=26;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119122;STB=0.510628;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0506363;OID=.;OPOS=133013378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:26:27:14:20:0.425532:9:5:12:14:10:10:13:14 chr2 133013388 . C T 69.19 PASS AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0196771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0935;QD=6.14989;RBI=0.0197004;REFB=-0.00430483;REVB=-0.000958638;RO=35;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.614326;STB=0.895122;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00381522;OID=.;OPOS=133013388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:1:9:14:21:1:9:14:21 chr2 133013418 . A G 179.23 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0198853;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.597;QD=21.0854;RBI=0.0241452;REFB=-0.00278614;REVB=-0.0136955;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949381;STB=0.553631;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00242846;OID=.;OPOS=133013418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:8:8:7:11:8:8 chr2 133013449 . G A 39.57 PASS AF=0.25;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0119662;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.175;QD=6.59576;RBI=0.018327;REFB=-0.00271012;REVB=0.0138813;RO=18;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690318;STB=0.5453;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0282988;OID=.;OPOS=133013449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:24:18:18:6:6:0.25:2:4:11:7:2:4:11:7 chr2 133013461 . C T 45.62 PASS AF=0.28;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00293125;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.108;QD=7.2994;RBI=0.00520738;REFB=-0.018776;REVB=-0.00430401;RO=18;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463469;STB=0.529329;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0506113;OID=.;OPOS=133013461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:26:25:18:18:7:7:0.28:3:4:11:7:3:4:11:7 chr2 133013475 . A G 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0185275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2273;QD=18.2488;RBI=0.0289165;REFB=0.00490281;REVB=0.0222012;RO=11;SAF=10;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354326;STB=0.723321;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.00424687;OID=.;OPOS=133013475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:3:10:4:7:3:10:4:8 chr2 133013498 . AC A 51.97 PASS AF=0.590909;AO=8;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.183196;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.3022;QD=9.44895;RBI=0.196302;REFB=-0.0974914;REVB=0.0705264;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.826087;SSSB=-0.0434779;STB=0.5624;STBP=0.538;TYPE=del;VARB=0.137192;OID=.;OPOS=133013499;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.590909:8:22:13:22:9:4:9:4:5:44:12:3:5:5:7 chr2 133013513 . A C 158.01 PASS AF=0.64;AO=10;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.016516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.438;QD=25.2821;RBI=0.0174925;REFB=-0.026423;REVB=-0.00576271;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390506;STB=0.580215;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0109625;OID=.;OPOS=133013513;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:24:25:7:9:10:16:0.64:3:7:1:6:9:7:2:7 chr2 133013541 . G A 43.72 PASS AF=0.291667;AO=6;DP=23;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0337825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.452;QD=7.28597;RBI=0.0370254;REFB=-0.0115479;REVB=0.0151533;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522784;STB=0.763456;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.053454;OID=.;OPOS=133013541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:23:24:17:17:6:7:0.291667:2:4:3:14:3:4:3:14 chr2 133013556 . C T 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0444399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5995;QD=11.4404;RBI=0.047303;REFB=-0.0114313;REVB=-0.016207;RO=14;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382401;STB=0.73781;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0055727;OID=.;OPOS=133013556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:8:1:5:9:8:1:5:9 chr2 133013567 . T C 118.65 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0346223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.6;QD=22.5993;RBI=0.0352895;REFB=0.00784047;REVB=0.00682966;RO=8;SAF=2;SAR=11;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112223;STB=0.563996;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00593869;OID=.;OPOS=133013567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:11:2:2:6:11:2:2:6 chr2 133013590 . A C,G 187.24 PASS AF=0.1875,0.8125;AO=3,13;DP=16;FAO=3,13;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2,3;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00141337,0.0100013;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=165.178,203.842;QD=46.809;RBI=0.0129822,0.0150019;REFB=0,0;REVB=0.012905,0.0111818;RO=0;SAF=2,3;SAR=1,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0130006,0.00630686;OID=.,.;OPOS=133013590,133013590;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:16:16:0:0:3,13:3,13:0.1875,0.8125:1,10:2,3:0:0:1,10:2,3:0:0 chr2 133013680 . G A 124.13 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.000390229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7528;QD=9.93051;RBI=0.032871;REFB=0.00978142;REVB=-0.0328686;RO=35;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147281;STB=0.587963;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.0157734;OID=.;OPOS=133013680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:8:7:12:23:8:7:12:23 chr2 133013687 . T C 56.78 PASS AF=0.173077;AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.00236802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.118;QD=4.36796;RBI=0.00498411;REFB=-0.00462309;REVB=-0.00438564;RO=43;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400195;STB=0.761393;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0310195;OID=.;OPOS=133013687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:52:43:43:9:9:0.173077:3:6:14:29:3:6:14:29 chr2 133013695 . CA CG,TG 108.06 PASS AF=0.134615,0.153846;AO=7,8;DP=52;FAO=7,8;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=2,5;FSAR=5,3;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0248911,0.00266108;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=154.327,159.372;QD=8.31195;RBI=0.0249388,0.0374995;REFB=-0.00131655,-0.000479423;REVB=-0.001542,-0.037405;RO=36;SAF=2,5;SAR=5,3;SRF=12;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.06671,0.343858;STB=0.538349,0.732469;STBP=0.87,0.179;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00957757,-0.0131158;OID=.,.;OPOS=133013696,133013695;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:52:52:52:36:37:7,8:7,8:0.134615,0.153846:5,3:2,5:12:24:5,3:2,5:12:25 chr2 133013704 . G A 38.42 PASS AF=0.12963;AO=7;DP=53;FAO=7;FDP=54;FR=.;FRO=47;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0313629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.537;QD=2.84582;RBI=0.0462353;REFB=-0.00667402;REVB=-0.0339716;RO=45;SAF=2;SAR=5;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148859;STB=0.594953;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0330977;OID=.;OPOS=133013704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:53:54:45:47:7:7:0.12963:5:2:18:27:5:2:18:29 chr2 133013756 . G A 40.38 PASS AF=0.142857;AO=7;DP=49;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0281439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5859;QD=3.29618;RBI=0.0643321;REFB=0.0041983;REVB=-0.0578492;RO=42;SAF=2;SAR=5;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097155;STB=0.57026;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=-0.0349233;OID=.;OPOS=133013756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:49:49:42:42:7:7:0.142857:5:2:15:27:5:2:15:27 chr2 133014552 . C T 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.000998409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.642;QD=8.81086;RBI=0.0463358;REFB=-0.0203922;REVB=-0.046325;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359862;STB=0.730829;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0121648;OID=.;OPOS=133014552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:1:5:6:5:1:5:6:5 chr2 133014602 . G C 78.63 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0248404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.111;QD=14.9781;RBI=0.0368695;REFB=-0.0336221;REVB=-0.0272454;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286528;STB=0.666349;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00953272;OID=.;OPOS=133014602;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:4:6:3:8:4:6:3:8 chr2 133014612 . A C 58.7 PASS AF=0.421053;AO=9;DP=20;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0162628;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.145;QD=12.358;RBI=0.0223568;REFB=-0.00831441;REVB=-0.0153411;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356162;STB=0.695742;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0120059;OID=.;OPOS=133014612;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:20:19:11:11:9:8:0.421053:3:6:3:8:3:5:3:8 chr2 133014651 . A AC 66.44 PASS AF=0.5;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.000727641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.598;QD=13.2873;RBI=0.0296409;REFB=-0.00423459;REVB=0.029632;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247851;STB=0.726776;STBP=0.058;TYPE=ins;VARB=0.0127843;OID=.;OPOS=133014652;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:9:23:10:20:10:8:2:4:6:65:14:7:2:8:6 chr2 133036337 . A G 42.31 PASS AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00103392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.731;QD=4.70063;RBI=0.0678668;REFB=-0.0138223;REVB=-0.0678589;RO=29;SAF=3;SAR=4;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309487;STB=0.701777;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0441357;OID=.;OPOS=133036337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:36:36:29:29:7:7:0.194444:4:3:20:9:4:3:20:9 chr2 133036343 . C T 34.27 PASS AF=0.181818;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00988798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.786;QD=4.15379;RBI=0.0726104;REFB=0.00781534;REVB=0.071934;RO=27;SAF=2;SAR=4;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380335;STB=0.75396;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.0282382;OID=.;OPOS=133036343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:33:33:27:27:6:6:0.181818:4:2:18:9:4:2:18:9 chr2 133036364 . G A 35.56 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0200427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4357;QD=5.68926;RBI=0.0250238;REFB=-0.000211323;REVB=0.0149828;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335001;STB=0.717261;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00451769;OID=.;OPOS=133036364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:12:7:4:2:12:7 chr2 133036571 . C T 53.3 PASS AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0107886;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.466;QD=6.66286;RBI=0.0225821;REFB=-0.0120377;REVB=0.0198383;RO=22;SAF=7;SAR=1;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.56164;STB=0.843892;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0211879;OID=.;OPOS=133036571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:32:32:22:24:8:8:0.25:1:7:9:13:1:7:11:13 chr2 133036619 . CC TG 86.96 PASS AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0170513;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=170.361;QD=8.69617;RBI=0.0172111;REFB=-0.00337052;REVB=0.00233962;RO=28;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467727;STB=0.805221;STBP=0.058;TYPE=mnp;VARB=0.0105069;OID=.;OPOS=133036619;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:40:40:28:28:10:10:0.25:1:9:17:11:1:9:17:11 chr2 133036630 . A G 62.57 PASS AF=0.181818;AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0162504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.018;QD=4.55043;RBI=0.0163466;REFB=-0.00374482;REVB=0.00177157;RO=45;SAF=2;SAR=8;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499999;STB=0.82697;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0199669;OID=.;OPOS=133036630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:55:55:45:45:10:10:0.181818:8:2:28:17:8:2:28:17 chr2 133036632 . G A 77.02 PASS AF=0.210526;AO=12;DP=57;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.014917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.956;QD=5.40475;RBI=0.0154009;REFB=0.00337694;REVB=-0.00382999;RO=45;SAF=4;SAR=8;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345737;STB=0.718756;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.0311577;OID=.;OPOS=133036632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:57:57:45:45:12:12:0.210526:8:4:28:17:8:4:28:17 chr2 133036650 . T G 398.67 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0112459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1138;QD=23.8013;RBI=0.020913;REFB=-0.030126;REVB=0.0176319;RO=28;SAF=21;SAR=18;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805368;STB=0.544164;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0168119;OID=.;OPOS=133036650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:18:21:18:10:18:21:18:10 chr2 133036661 . A AT 173.1 PASS AF=0.359375;AO=24;DP=66;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.00232018;FXX=0.0153822;HRUN=0;LEN=1;MLLD=84.0385;QD=10.819;RBI=0.00239654;REFB=0.00675499;REVB=-0.000600143;RO=42;SAF=9;SAR=15;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36023;STB=0.732463;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=-0.00628773;OID=.;OPOS=133036662;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.359375:24:66:23:64:41:8:15:30:11:99:42:9:15:30:12 chr2 133036666 . AC A 147.32 PASS AF=0.365079;AO=21;DP=65;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.00361184;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6399;QD=9.35358;RBI=0.0067841;REFB=0.00778654;REVB=0.00574271;RO=41;SAF=8;SAR=13;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356125;STB=0.688676;STBP=0.035;TYPE=del;VARB=-0.00146371;OID=.;OPOS=133036667;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.365079:21:65:23:63:40:9:14:28:12:99:41:8:13:29:12 chr2 133036669 . G T 156.68 PASS AF=0.318182;AO=20;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.00647659;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.322;QD=9.49554;RBI=0.019875;REFB=-0.00767738;REVB=-0.0187902;RO=45;SAF=9;SAR=11;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199021;STB=0.598763;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0252524;OID=.;OPOS=133036669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:45:45:20:21:0.318182:11:9:28:17:11:10:28:17 chr2 133036693 . T G 380.91 PASS AF=0.527027;AO=37;DP=73;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00187402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.558;QD=20.59;RBI=0.00605034;REFB=-0.0177563;REVB=0.00575279;RO=35;SAF=18;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493335;STB=0.514219;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0096121;OID=.;OPOS=133036693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:35:35:37:39:0.527027:19:18:19:16:19:20:19:16 chr2 133036695 . C A 42.36 PASS AF=0.121622;AO=11;DP=71;FAO=9;FDP=74;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.0083298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.285;QD=2.28965;RBI=0.0263606;REFB=0.00354469;REVB=-0.0250099;RO=59;SAF=10;SAR=1;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.556771;STB=0.87687;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0279654;OID=.;OPOS=133036695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:71:74:59:65:11:9:0.121622:1:10:29:30:1:8:31:34 chr2 133036697 . A G 300.63 PASS AF=0.445946;AO=38;DP=75;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0164661;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.866;QD=16.2505;RBI=0.0192556;REFB=-0.00948946;REVB=-0.00998226;RO=36;SAF=20;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0012855;STB=0.518507;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0137864;OID=.;OPOS=133036697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:36:41:38:33:0.445946:18:20:19:17:15:18:21:20 chr2 133036704 . T C 182.01 PASS AF=0.315789;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00526255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.801;QD=9.57947;RBI=0.0113144;REFB=-0.0139936;REVB=-0.010016;RO=52;SAF=10;SAR=14;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184929;STB=0.608606;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0174629;OID=.;OPOS=133036704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:52:52:24:24:0.315789:14:10:30:22:14:10:30:22 chr2 133036714 . A G 157.94 PASS AF=0.278481;AO=22;DP=80;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.0126703;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.217;QD=7.99685;RBI=0.0126758;REFB=-0.00150798;REVB=-0.000372964;RO=56;SAF=10;SAR=12;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202751;STB=0.613536;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0133321;OID=.;OPOS=133036714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:56:57:22:22:0.278481:12:10:35:21:12:10:35:22 chr2 133036716 . G T 152.05 PASS AF=0.275;AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.00476605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.088;QD=7.60246;RBI=0.0109079;REFB=-0.0117734;REVB=0.00981153;RO=54;SAF=10;SAR=12;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206778;STB=0.606647;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0361298;OID=.;OPOS=133036716;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:54:58:22:22:0.275:12:10:34:20:12:10:35:23 chr2 133036720 . T C 106.23 PASS AF=0.217949;AO=17;DP=78;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.020617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.779;QD=5.44789;RBI=0.0276757;REFB=-0.00459621;REVB=-0.018463;RO=61;SAF=14;SAR=3;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443882;STB=0.782538;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0109653;OID=.;OPOS=133036720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:61:61:17:17:0.217949:3:14:30:31:3:14:30:31 chr2 133036742 . T C 72.97 PASS AF=0.178082;AO=13;DP=73;FAO=13;FDP=73;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0158438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9351;QD=3.99842;RBI=0.0191354;REFB=-0.00941708;REVB=-0.0107302;RO=60;SAF=8;SAR=5;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00169091;STB=0.501112;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0280462;OID=.;OPOS=133036742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:73:73:60:60:13:13:0.178082:5:8:37:23:5:8:37:23 chr2 133036757 . A G 41.96 PASS AF=0.131148;AO=8;DP=60;FAO=8;FDP=61;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0424748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.467;QD=2.75125;RBI=0.0431385;REFB=-0.00112242;REVB=-0.00753796;RO=52;SAF=7;SAR=1;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399513;STB=0.808157;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00945513;OID=.;OPOS=133036757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:60:61:52:53:8:8:0.131148:1:7:31:21:1:7:31:22 chr2 133036787 . C A 102.29 PASS AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00646964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.627;QD=9.09231;RBI=0.0191734;REFB=-0.00102916;REVB=-0.0180489;RO=31;SAF=10;SAR=3;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3535;STB=0.726906;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0019513;OID=.;OPOS=133036787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:32:13:13:0.288889:3:10:15:16:3:10:15:17 chr2 133036797 . A AAGC 72.79 PASS AF=0.277778;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0027657;FXX=0.0270197;HRUN=6;LEN=3;MLLD=232.218;QD=8.08747;RBI=0.00361113;REFB=-0.00416759;REVB=0.00232189;RO=32;SAF=8;SAR=2;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.472393;STB=0.7994;STBP=0.032;TYPE=ins;VARB=0.0121202;OID=.;OPOS=133036798;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=AAGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.277778:10:42:10:36:26:8:2:10:16:72:32:8:2:13:19 chr2 133036812 . T C 50.38 PASS AF=0.216216;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0265301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.941;QD=5.44636;RBI=0.0278876;REFB=-0.00323029;REVB=-0.00859473;RO=29;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398662;STB=0.75936;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0719575;OID=.;OPOS=133036812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:37:37:29:29:8:8:0.216216:2:6:12:17:2:6:12:17 chr2 133036828 . A G 43.02 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0242741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.959;QD=5.37734;RBI=0.0260139;REFB=-0.0107293;REVB=0.00935375;RO=24;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42936;STB=0.784397;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0255692;OID=.;OPOS=133036828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:24:25:7:7:0.21875:2:5:8:16:2:5:8:17 chr2 133036840 . C T 43.53 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.00859751;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8513;QD=6.00469;RBI=0.00972044;REFB=-0.0244266;REVB=0.00453539;RO=21;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513414;STB=0.802831;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.066288;OID=.;OPOS=133036840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:21:22:7:7:0.241379:2:5:5:16:2:5:6:16 chr2 133037153 . C T 41.54 PASS AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00209294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.054;QD=11.8683;RBI=0.0281078;REFB=-0.00923367;REVB=0.0280297;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413635;STB=0.581152;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0363802;OID=.;OPOS=133037153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:13:14:7:7:6:7:0.5:1:5:3:4:2:5:4:3 chr2 133037226 . T C 138.37 PASS AF=0.535714;AO=14;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0194965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.419;QD=19.7669;RBI=0.0196348;REFB=-0.0184749;REVB=0.00232714;RO=12;SAF=10;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256667;STB=0.599863;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0101312;OID=.;OPOS=133037226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:12:13:14:15:0.535714:4:10:5:7:5:10:6:7 chr2 133037311 . C A 223.49 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00402267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.74;QD=26.293;RBI=0.0168339;REFB=0.00893558;REVB=0.0163462;RO=13;SAF=16;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293935;STB=0.664368;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00466153;OID=.;OPOS=133037311;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:5:16:5:8:5:16:5:8 chr2 133037397 . C T 200.86 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00265953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.903;QD=20.601;RBI=0.0581441;REFB=-0.00629348;REVB=0.0580832;RO=19;SAF=15;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223102;STB=0.62673;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0089809;OID=.;OPOS=133037397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:5:15:10:9:5:15:10:9 chr2 133037568 . T C 470.24 PASS AF=0.833333;AO=35;DP=42;FAO=35;FDP=42;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0276192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3158;QD=44.7848;RBI=0.0285551;REFB=-0.00312996;REVB=0.00725069;RO=7;SAF=2;SAR=33;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423124;STB=0.733155;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.000730483;OID=.;OPOS=133037568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:42:42:7:7:35:35:0.833333:33:2:4:3:33:2:4:3 chr2 133037812 . A G 489.89 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.952;QD=57.6339;RBI=0.0576536;REFB=0;REVB=-0.024329;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139247;OID=.;OPOS=133037812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:17:16:0:0:17:17:0:0 chr2 133038166 . T C 78.62 PASS AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00495456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8971;QD=6.41807;RBI=0.0997229;REFB=0.00439985;REVB=0.0995997;RO=37;SAF=9;SAR=2;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324542;STB=0.722761;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00390938;OID=.;OPOS=133038166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:49:49:37:38:11:11:0.22449:2:9:22:15:2:9:22:16 chr2 133038179 . AG CT 99.12 PASS AF=0.22807;AO=13;DP=57;FAO=13;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.012262;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.584;QD=6.95587;RBI=0.0297695;REFB=-0.00295818;REVB=-0.0271268;RO=39;SAF=9;SAR=4;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134771;STB=0.59984;STBP=0.446;TYPE=mnp;VARB=0.0165472;OID=.;OPOS=133038179;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:57:57:39:42:13:13:0.22807:4:9:23:16:4:9:24:18 chr2 133038188 . T C 100.21 PASS AF=0.25;AO=15;DP=59;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0348313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6156;QD=6.6807;RBI=0.0446536;REFB=0.00228509;REVB=-0.0279414;RO=44;SAF=11;SAR=4;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271816;STB=0.662422;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-0.00922305;OID=.;OPOS=133038188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:44:45:15:15:0.25:4:11:23:21:4:11:24:21 chr2 133038228 . C T 93.45 PASS AF=0.220588;AO=15;DP=68;FAO=15;FDP=68;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00346358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.699;QD=5.49695;RBI=0.0292691;REFB=-0.00227502;REVB=-0.0290634;RO=52;SAF=12;SAR=3;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415991;STB=0.769809;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00826642;OID=.;OPOS=133038228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:68:68:52:53:15:15:0.220588:3:12:25:27:3:12:25:28 chr2 133038234 . C T 75.86 PASS AF=0.191176;AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00728454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.127;QD=4.46208;RBI=0.0285544;REFB=-0.00682439;REVB=-0.0276095;RO=55;SAF=10;SAR=3;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378571;STB=0.747272;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0267977;OID=.;OPOS=133038234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:68:68:55:55:13:13:0.191176:3:10:26:29:3:10:26:29 chr2 133038264 . G A 70.25 PASS AF=0.1875;AO=12;DP=63;FAO=12;FDP=64;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0762011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9091;QD=4.39038;RBI=0.0777473;REFB=-0.00348862;REVB=0.0154284;RO=51;SAF=9;SAR=3;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353126;STB=0.737693;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0169107;OID=.;OPOS=133038264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:63:64:51:52:12:12:0.1875:3:9:24:27:3:9:24:28 chr2 133038275 . C T 53.05 PASS AF=0.160714;AO=9;DP=57;FAO=9;FDP=56;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00044375;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.195;QD=3.78907;RBI=0.00605398;REFB=-0.00581228;REVB=0.0060377;RO=47;SAF=7;SAR=2;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444809;STB=0.800886;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0211395;OID=.;OPOS=133038275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:57:56:47:47:9:9:0.160714:2:7:19:28:2:7:19:28 chr2 133038280 . A C 60.06 PASS AF=0.181818;AO=7;DP=52;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.034778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.78;QD=4.36814;RBI=0.0476747;REFB=-0.028703;REVB=-0.0326093;RO=45;SAF=5;SAR=2;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386479;STB=0.82697;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.050101;OID=.;OPOS=133038280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:52:55:45:45:7:10:0.181818:2:5:17:28:2:8:17:28 chr2 133038365 . G T 109.25 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0281949;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.594;QD=14.0968;RBI=0.0283583;REFB=-0.00655004;REVB=0.00303994;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932572;STB=0.554372;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00451204;OID=.;OPOS=133038365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:8:10:6:7:8:10 chr2 133038366 . C T 126.81 PASS AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00670735;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.945;QD=18.1159;RBI=0.0133114;REFB=-0.000399081;REVB=0.0114981;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111609;OID=.;OPOS=133038366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:28:14:14:14:14:0.5:6:8:8:6:6:8:8:6 chr2 133038378 . A G 114.09 PASS AF=0.52;AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0125759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.834;QD=18.2538;RBI=0.0305898;REFB=-0.0236796;REVB=-0.0278851;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190057;STB=0.562406;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.028185;OID=.;OPOS=133038378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:24:25:11:12:12:13:0.52:6:6:8:3:6:7:8:4 chr2 133038383 . GC AT 118.45 PASS AF=0.565217;AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0028178;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=2;MLLD=283.829;QD=20.6001;RBI=0.0116902;REFB=-0.0151243;REVB=0.0113456;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013628;STB=0.526986;STBP=0.797;TYPE=mnp;VARB=0.015761;OID=.;OPOS=133038383;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:24:23:10:10:12:13:0.565217:5:7:6:4:6:7:6:4 chr2 133038400 . GA G 137.55 PASS AF=0.678571;AO=17;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0631366;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.6955;QD=19.6506;RBI=0.157119;REFB=0.00537876;REVB=-0.143876;RO=8;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982288;STB=0.529153;STBP=0.711;TYPE=del;VARB=-0.00286727;OID=.;OPOS=133038401;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.678571:17:28:19:28:9:11:8:6:3:42:8:10:7:6:2 chr2 133038421 . G C 256.04 PASS AF=0.606061;AO=19;DP=32;FAO=20;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0239829;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.685;QD=31.0354;RBI=0.0271732;REFB=-0.0228548;REVB=-0.0127752;RO=7;SAF=11;SAR=8;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143169;STB=0.54995;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0203122;OID=.;OPOS=133038421;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:32:33:7:8:19:20:0.606061:8:11:2:5:9:11:3:5 chr2 133038491 . T C 174.56 PASS AF=0.275862;AO=24;DP=87;FAO=24;FDP=87;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00982488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.189;QD=8.02552;RBI=0.0108164;REFB=-0.012625;REVB=-0.00452406;RO=63;SAF=10;SAR=14;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110844;STB=0.566418;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0340006;OID=.;OPOS=133038491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:63:63:24:24:0.275862:14:10:32:31:14:10:32:31 chr2 133038501 . G A 130.46 PASS AF=0.224719;AO=20;DP=89;FAO=20;FDP=89;FR=.;FRO=69;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.00483384;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.187;QD=5.86348;RBI=0.00610363;REFB=-0.00356383;REVB=-0.00372671;RO=69;SAF=8;SAR=12;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169669;STB=0.605276;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0114514;OID=.;OPOS=133038501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:69:69:20:20:0.224719:12:8:37:32:12:8:37:32 chr2 133038515 . A G 117.65 PASS AF=0.2;AO=19;DP=95;FAO=19;FDP=95;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00304512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.823;QD=4.95363;RBI=0.0246978;REFB=0.0006831;REVB=0.0245093;RO=76;SAF=9;SAR=10;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827556;STB=0.552431;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.00440455;OID=.;OPOS=133038515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:76:76:19:19:0.2:10:9:41:35:10:9:41:35 chr2 133038530 . A G 97.55 PASS AF=0.173469;AO=17;DP=98;FAO=17;FDP=98;FR=.;FRO=81;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0180321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.097;QD=3.98159;RBI=0.0190639;REFB=-0.00575024;REVB=0.00618688;RO=80;SAF=7;SAR=10;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142704;STB=0.588132;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0252941;OID=.;OPOS=133038530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:98:98:80:81:17:17:0.173469:10:7:42:38:10:7:42:39 chr2 133038543 . A G 82.95 PASS AF=0.150943;AO=16;DP=106;FAO=16;FDP=106;FR=.;FRO=90;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.00121295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.256;QD=3.13001;RBI=0.0105219;REFB=-0.00650255;REVB=0.0104517;RO=90;SAF=7;SAR=9;SRF=46;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924611;STB=0.562422;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0247894;OID=.;OPOS=133038543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:106:106:90:90:16:16:0.150943:9:7:46:44:9:7:46:44 chr2 133038569 . T C 58.9 PASS AF=0.115702;AO=14;DP=119;FAO=14;FDP=121;FR=.;FRO=107;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=50;FSRR=57;FWDB=-0.0221872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.553;QD=1.94723;RBI=0.0322839;REFB=-0.00164912;REVB=-0.0234516;RO=105;SAF=6;SAR=8;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353205;STB=0.534557;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0170727;OID=.;OPOS=133038569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:119:121:105:107:14:14:0.115702:8:6:48:57:8:6:50:57 chr2 133038580 . C T 71.14 PASS AF=0.128;AO=16;DP=125;FAO=16;FDP=125;FR=.;FRO=109;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=51;FSRR=58;FWDB=0.00290032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.924;QD=2.27654;RBI=0.00574031;REFB=-0.00378764;REVB=0.00495372;RO=108;SAF=5;SAR=11;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193329;STB=0.640818;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0223734;OID=.;OPOS=133038580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:125:125:108:109:16:16:0.128:11:5:50:58:11:5:51:58 chr2 133038625 . G A 61.47 PASS AF=0.126214;AO=13;DP=103;FAO=13;FDP=103;FR=.;FRO=90;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0099947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.867;QD=2.38727;RBI=0.0254869;REFB=-0.00474928;REVB=-0.0234454;RO=90;SAF=4;SAR=9;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214491;STB=0.653544;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0436715;OID=.;OPOS=133038625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:103:103:90:90:13:13:0.126214:9:4:43:47:9:4:43:47 chr2 133038686 . A G 1264.17 PASS AF=0.726619;AO=101;DP=140;FAO=101;FDP=139;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=96;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00760096;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.065;QD=36.3789;RBI=0.0183241;REFB=0.00105014;REVB=0.0166732;RO=37;SAF=5;SAR=96;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549591;STB=0.800195;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00018274;OID=.;OPOS=133038686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:37:38:101:101:0.726619:96:5:19:18:96:5:19:19 chr2 133038693 . A T 1129.59 PASS AF=0.709924;AO=93;DP=131;FAO=93;FDP=131;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=91;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00946465;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=330.462;QD=34.4913;RBI=0.009465;REFB=0.00717341;REVB=8.1676e-05;RO=38;SAF=2;SAR=91;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.653458;STB=0.863461;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00195865;OID=.;OPOS=133038693;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:38:38:93:93:0.709924:91:2:14:24:91:2:14:24 chr2 133038728 . CT CG,GG 338.55 PASS AF=0.230769,0.653846;AO=6,17;DP=26;FAO=6,17;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=5,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337148,0.0285645;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=78.6154,112.983;QD=52.0846;RBI=0.033741,0.0290463;REFB=0,0;REVB=0.00133027,0.00526881;RO=0;SAF=1,8;SAR=5,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18042e-08,-4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0215635,0.00900072;OID=.,.;OPOS=133038729,133038728;OREF=T,CT;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:38:26:26:0:0:6,17:6,17:0.230769,0.653846:5,9:1,8:0:0:5,9:1,8:0:0 chr2 133038886 . A G 101.89 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1322;QD=40.7568;RBI=0.0770115;REFB=0;REVB=0.0749766;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00233407;OID=.;OPOS=133038886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr2 133039014 . A G 141.31 PASS AF=0.372093;AO=15;DP=42;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0121138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.538;QD=13.1455;RBI=0.0179851;REFB=-0.00518199;REVB=-0.0132935;RO=27;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359833;STB=0.684298;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0079136;OID=.;OPOS=133039014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:27:27:15:16:0.372093:6:9:7:20:7:9:7:20 chr2 133039048 . A G 131.61 PASS AF=0.410256;AO=15;DP=38;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0431074;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.283;QD=13.4981;RBI=0.0434636;REFB=-0.0100442;REVB=-0.00555337;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383171;STB=0.727018;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0555759;OID=.;OPOS=133039048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:23:23:15:16:0.410256:6:9:5:18:6:10:5:18 chr2 133039061 . A G 68.68 PASS AF=0.217391;AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00196368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.064;QD=5.97207;RBI=0.0356487;REFB=0.00395619;REVB=0.0355946;RO=36;SAF=3;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186802;STB=0.621242;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.0060243;OID=.;OPOS=133039061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:46:46:36:36:10:10:0.217391:7:3:16:20:7:3:16:20 chr2 133039063 . T C 68.68 PASS AF=0.212766;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00193083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.386;QD=5.8447;RBI=0.00590654;REFB=-0.00532123;REVB=-0.00558204;RO=37;SAF=3;SAR=7;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172914;STB=0.612668;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0297296;OID=.;OPOS=133039063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:47:47:37:37:10:10:0.212766:7:3:16:21:7:3:16:21 chr2 133039074 . AT GC 66.28 PASS AF=0.192308;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0129462;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.642;QD=5.09811;RBI=0.0199983;REFB=0.00129536;REVB=-0.0152423;RO=41;SAF=4;SAR=6;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108699;STB=0.581232;STBP=0.565;TYPE=mnp;VARB=-0.00382254;OID=.;OPOS=133039074;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:52:52:41:42:10:10:0.192308:6:4:20:21:6:4:21:21 chr2 133039082 . CC AT 86.73 PASS AF=0.235294;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0137213;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=2;MLLD=319.592;QD=6.80209;RBI=0.0142206;REFB=-0.00125151;REVB=0.00373498;RO=38;SAF=10;SAR=2;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.551175;STB=0.838153;STBP=0.017;TYPE=mnp;VARB=0.00495173;OID=.;OPOS=133039082;OREF=CC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:52:51:38:39:12:12:0.235294:2:10:14:24:2:10:15:24 chr2 133039087 . A G 42.94 PASS AF=0.142857;AO=6;DP=48;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0245981;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.991;QD=3.50515;RBI=0.0248273;REFB=-0.00427618;REVB=0.00336625;RO=39;SAF=1;SAR=5;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398708;STB=0.688072;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0168165;OID=.;OPOS=133039087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:48:49:39:42:6:7:0.142857:5:1:19:20:5:2:21:21 chr2 133039090 . T C 218.2 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00385175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.969;QD=17.4557;RBI=0.00386907;REFB=-0.00585803;REVB=-0.000365622;RO=28;SAF=14;SAR=8;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27188;STB=0.654537;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0141947;OID=.;OPOS=133039090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:8:14:10:18:8:14:10:18 chr2 133039101 . A G 32.11 PASS AF=0.12;AO=6;DP=50;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0129201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1678;QD=2.56852;RBI=0.0157229;REFB=-0.00340601;REVB=-0.00895987;RO=44;SAF=3;SAR=3;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.033822;OID=.;OPOS=133039101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:50:50:44:44:6:6:0.12:3:3:22:22:3:3:22:22 chr2 133039105 . T C 40.08 PASS AF=0.14;AO=7;DP=50;FAO=7;FDP=50;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0403175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1274;QD=3.20602;RBI=0.0415635;REFB=-0.00327999;REVB=0.0101007;RO=43;SAF=4;SAR=3;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993028;STB=0.571225;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0181364;OID=.;OPOS=133039105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:50:50:43:43:7:7:0.14:3:4:21:22:3:4:21:22 chr2 133039137 . A G 32.32 PASS AF=0.130435;AO=6;DP=46;FAO=6;FDP=46;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0303116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6297;QD=2.81018;RBI=0.052203;REFB=0.00155511;REVB=-0.0425013;RO=36;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319882;STB=0.685106;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00535147;OID=.;OPOS=133039137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:46:46:36:40:6:6:0.130435:2:4:14:22:2:4:18:22 chr2 133039143 . C T 125.59 PASS AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00957015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4415;QD=10.6883;RBI=0.014278;REFB=-0.00995826;REVB=0.0105959;RO=32;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734819;STB=0.543851;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0231658;OID=.;OPOS=133039143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:7:8:15:17:7:8:15:17 chr2 133039156 . TG CA,CG 278.41 PASS AF=0.22,0.32;AO=11,16;DP=50;FAO=11,16;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=4,13;FSAR=7,3;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00819394,-0.0038189;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=188.745,159.32;QD=22.2725;RBI=0.00819458,0.00924969;REFB=-0.0088235,-0.0103933;REVB=0.000102176,-0.00842454;RO=23;SAF=4,13;SAR=7,3;SRF=9;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.032954,0.46111;STB=0.519963,0.769674;STBP=0.878,0.016;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00450102,0.00783464;OID=.,.;OPOS=133039156,133039156;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:50:50:23:23:11,16:11,16:0.22,0.32:7,3:4,13:9:14:7,3:4,13:9:14 chr2 133039164 . C T 79.16 PASS AF=0.234043;AO=11;DP=47;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.000214652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.686;QD=6.73673;RBI=0.0128573;REFB=-0.0180531;REVB=0.0128555;RO=36;SAF=4;SAR=7;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293304;STB=0.683889;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0472641;OID=.;OPOS=133039164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:47:47:36:36:11:11:0.234043:7:4:22:14:7:4:22:14 chr2 133039166 . T C 113.83 PASS AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0384445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7973;QD=9.89843;RBI=0.09098;REFB=-0.00348528;REVB=-0.0824583;RO=32;SAF=12;SAR=2;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526245;STB=0.821419;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0047048;OID=.;OPOS=133039166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:32:32:14:14:0.304348:2:12:14:18:2:12:14:18 chr2 133039171 . C G 114.72 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00487139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.905;QD=10.4293;RBI=0.0414574;REFB=-0.00308692;REVB=0.0411702;RO=30;SAF=12;SAR=2;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526132;STB=0.819647;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00343699;OID=.;OPOS=133039171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:2:12:13:17:2:12:13:17 chr2 133039176 . A G 103.18 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00888484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.189;QD=9.59836;RBI=0.0229083;REFB=0.00028188;REVB=0.0211152;RO=29;SAF=12;SAR=1;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.631017;STB=0.895577;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.000387259;OID=.;OPOS=133039176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:30:13:13:0.302326:1:12:13:16:1:12:13:17 chr2 133039199 . AC TG 88.24 PASS AF=0.27907;AO=11;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0420448;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=2;MLLD=187.075;QD=8.20876;RBI=0.0440551;REFB=-0.000931508;REVB=-0.0131562;RO=30;SAF=10;SAR=1;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.591472;STB=0.877205;STBP=0.009;TYPE=mnp;VARB=0.0129978;OID=.;OPOS=133039199;OREF=AC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:43:43:30:31:11:12:0.27907:1:10:14:16:1:11:15:16 chr2 133039221 . C T 92.2 PASS AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.01668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9747;QD=8.99473;RBI=0.0401379;REFB=0.0223282;REVB=-0.036508;RO=29;SAF=5;SAR=7;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309642;STB=0.685989;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.0167557;OID=.;OPOS=133039221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:7:5:20:9:7:5:20:9 chr2 133174764 . C T 1458.07 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.045909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7733;QD=62.0455;RBI=0.0749939;REFB=-0.0812282;REVB=0.0592996;RO=1;SAF=46;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101954;STB=0.505375;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00160197;OID=.;OPOS=133174764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:47:46:1:0:47:46:1:0 chr2 133174999 . A G 1589.89 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.242;QD=59.9959;RBI=0.0237765;REFB=0;REVB=0.00306676;RO=0;SAF=67;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74321e-05;OID=.;OPOS=133174999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:39:67:0:0:39:67:0:0 chr2 133175152 . C T 341.84 PASS AF=0.430233;AO=33;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.0151763;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.993;QD=15.8995;RBI=0.0161669;REFB=-0.0153677;REVB=-0.00557207;RO=42;SAF=17;SAR=16;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015053;STB=0.540519;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0187879;OID=.;OPOS=133175152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:42:49:33:37:0.430233:16:17:21:21:17:20:23:26 chr2 133489601 . A G 523.45 PASS AF=0.491071;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00515253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.773;QD=18.6948;RBI=0.0102782;REFB=-0.0139945;REVB=0.00889347;RO=57;SAF=26;SAR=29;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653283;STB=0.536153;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0139952;OID=.;OPOS=133489601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:57:57:55:55:0.491071:29:26:31:26:29:26:31:26 chr2 133539566 . G A 2388.02 PASS AF=1;AO=148;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219404;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.298;QD=64.108;RBI=0.0238588;REFB=0;REVB=0.00937333;RO=0;SAF=71;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27384e-05;OID=.;OPOS=133539566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:149:0:0:148:149:1:77:71:0:0:77:72:0:0 chr2 133541107 . T A 1293.67 PASS AF=0.935484;AO=87;DP=93;FAO=87;FDP=93;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0536524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.389;QD=55.6419;RBI=0.0553815;REFB=-0.182432;REVB=0.0137307;RO=3;SAF=47;SAR=40;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00803744;STB=0.513403;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00275176;OID=.;OPOS=133541107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:93:93:3:6:87:87:0.935484:40:47:2:1:40:47:2:4 chr2 133541444 . T C 3900.65 PASS AF=1;AO=244;DP=245;FAO=244;FDP=244;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127575;FXX=0.00408147;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.513;QD=63.9451;RBI=0.00137928;REFB=0;REVB=0.000524277;RO=0;SAF=123;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.69971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19698e-05;OID=.;OPOS=133541444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:245:244:0:0:244:244:1:121:123:0:0:121:123:0:0 chr2 133541454 . A G 3705.5 PASS AF=1;AO=233;DP=234;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.535;QD=63.3419;RBI=0.0181628;REFB=0;REVB=-0.0168951;RO=0;SAF=119;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.73535e-06;OID=.;OPOS=133541454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:234:234:0:0:233:234:1:114:119:0:0:115:119:0:0 chr2 133542014 . T C 1690.43 PASS AF=1;AO=81;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9858;QD=60.3724;RBI=0.135997;REFB=0;REVB=0.117242;RO=0;SAF=64;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100913;OID=.;OPOS=133542014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:112:0:0:81:112:1:17:64:0:0:47:65:0:0 chr2 133542574 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0056583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.463;QD=52.6131;RBI=0.0394;REFB=0;REVB=0.0389916;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451788;OID=.;OPOS=133542574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr2 133554288 . A G 822.51 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109919;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0006;QD=57.7198;RBI=0.113486;REFB=0;REVB=-0.0282281;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000841983;OID=.;OPOS=133554288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0 chr2 134884697 . G C 265.26 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0223575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.869;QD=15.6033;RBI=0.0312296;REFB=-0.0217606;REVB=0.0218044;RO=38;SAF=10;SAR=20;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198086;STB=0.612168;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0271323;OID=.;OPOS=134884697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:20:10:20:18:20:10:20:18 chr2 134884700 . G A 379.63 PASS AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.016337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.464;QD=22.0073;RBI=0.0169428;REFB=0.00635635;REVB=-0.00448994;RO=31;SAF=20;SAR=18;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139062;STB=0.576592;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00637521;OID=.;OPOS=134884700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:18:20:11:20:18:20:11:20 chr2 135710322 . A G 727.44 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102277;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9049;QD=57.0543;RBI=0.104519;REFB=0;REVB=0.021533;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115856;OID=.;OPOS=135710322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr2 135711657 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.35;QD=54.5177;RBI=0.0321074;REFB=0;REVB=0.0199136;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46365e-05;OID=.;OPOS=135711657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr2 135745129 . G A 344.63 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0431514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.583;QD=19.146;RBI=0.0436856;REFB=-0.00951543;REVB=0.00681106;RO=33;SAF=16;SAR=20;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164351;STB=0.569192;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0162931;OID=.;OPOS=135745129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:36:36:36:0.5:20:16:21:12:20:16:21:15 chr2 135781035 . C T 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.687;QD=60.6099;RBI=0.0200355;REFB=0;REVB=0.0188112;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218618;OID=.;OPOS=135781035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0 chr2 135911422 . T C 871.23 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0462145;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.3017;QD=56.2083;RBI=0.0497534;REFB=-0.0823151;REVB=0.0184288;RO=1;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122616;STB=0.506491;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00154147;OID=.;OPOS=135911422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:38:23:0:1:38:23:0:1 chr2 135965376 . T C 882.92 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2689;QD=56.9627;RBI=0.0808819;REFB=0;REVB=0.0539549;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0100725;OID=.;OPOS=135965376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:59:62:1:23:36:0:0:26:36:0:0 chr2 135988127 . T A 1804.04 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.703;QD=61.1537;RBI=0.0276524;REFB=0;REVB=-0.0255708;RO=0;SAF=64;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.27306e-05;OID=.;OPOS=135988127;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:54:64:0:0:54:64:0:0 chr2 135988186 . G A 2300.2 PASS AF=0.96875;AO=154;DP=161;FAO=155;FDP=160;FR=.;FRO=5;FSAF=70;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00778322;FXX=0.00621079;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.287;QD=57.505;RBI=0.0133022;REFB=-0.0389954;REVB=0.0107875;RO=5;SAF=69;SAR=85;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271581;STB=0.514284;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.000461003;OID=.;OPOS=135988186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:161:160:5:5:154:155:0.96875:85:69:0:5:85:70:0:5 chr2 135988235 . C T 2487.54 PASS AF=1;AO=161;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704326;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.321;QD=61.4209;RBI=0.0174625;REFB=0;REVB=-0.015979;RO=0;SAF=66;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.85631e-06;OID=.;OPOS=135988235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:163:162:0:0:161:162:1:95:66:0:0:95:67:0:0 chr2 135988416 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.488;QD=56.9377;RBI=0.0234638;REFB=0;REVB=-0.015697;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67522e-06;OID=.;OPOS=135988416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr2 136407479 . A G 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.702;QD=62.008;RBI=0.0223938;REFB=0;REVB=0.00253452;RO=0;SAF=56;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97764e-05;OID=.;OPOS=136407479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:28:56:0:0:28:56:0:0 chr2 136409574 . A C 408.04 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00331415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.58;QD=56.2813;RBI=0.0157829;REFB=0;REVB=-0.015431;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270302;OID=.;OPOS=136409574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:12:16:0:0:12:17:0:0 chr2 136555659 . T C 319.93 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0533773;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.936;QD=18.5466;RBI=0.0534549;REFB=-0.017327;REVB=-0.00287905;RO=35;SAF=14;SAR=20;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145487;STB=0.581149;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0209976;OID=.;OPOS=136555659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:35:35:34:34:0.492754:20:14:20:15:20:14:20:15 chr2 136561557 . G A 1558.08 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221126;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1246;QD=59.9261;RBI=0.0136816;REFB=0;REVB=-0.0135017;RO=0;SAF=70;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.67766e-05;OID=.;OPOS=136561557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:34:70:0:0:34:70:0:0 chr2 136562472 . G A 1240.89 PASS AF=0.965116;AO=82;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00313434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.426;QD=57.7158;RBI=0.00315903;REFB=-0.0709301;REVB=-0.000394215;RO=1;SAF=37;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126271;STB=0.518983;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-1.24111e-05;OID=.;OPOS=136562472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:86:86:1:3:82:83:0.965116:45:37:1:0:45:38:3:0 chr2 136575534 . T C 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3085;QD=39.2066;RBI=0.0293331;REFB=0;REVB=0.0289278;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109067;OID=.;OPOS=136575534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr2 136873084 . G A 2027.79 PASS AF=1;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.702;QD=62.3935;RBI=0.0163848;REFB=0;REVB=0.014608;RO=0;SAF=61;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17228e-05;OID=.;OPOS=136873084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:129:130:1:68:61:0:0:68:62:0:0 chr2 137814138 . T C 556.62 PASS AF=0.41958;AO=60;DP=143;FAO=60;FDP=143;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.00308399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.227;QD=15.5697;RBI=0.00593665;REFB=-0.0138624;REVB=-0.00507275;RO=83;SAF=26;SAR=34;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137206;STB=0.576915;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0193206;OID=.;OPOS=137814138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:83:83:60:60:0.41958:34:26:47:36:34:26:47:36 chr2 138237038 . C T 931.98 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0622081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8225;QD=58.2487;RBI=0.0980078;REFB=0;REVB=-0.0757343;RO=1;SAF=33;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140954;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00139866;OID=.;OPOS=138237038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:1:0:63:64:1:30:33:1:0:30:34:0:0 chr2 138237093 . G A 200.94 PASS AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0196037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.872;QD=11.8202;RBI=0.022619;REFB=-0.00853531;REVB=-0.0112834;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160797;STB=0.59992;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0214406;OID=.;OPOS=138237093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:43:25:25:0.367647:10:15:19:23:10:15:19:24 chr2 139045852 . A G 413.02 PASS AF=0.588235;AO=39;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0200304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.87;QD=24.2953;RBI=0.0222658;REFB=-0.0227397;REVB=0.00972354;RO=28;SAF=21;SAR=18;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00210193;STB=0.504423;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0250204;OID=.;OPOS=139045852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:28:39:40:0.588235:18:21:15:13:19:21:15:13 chr2 139045855 . C T 224.79 PASS AF=0.391304;AO=26;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0140653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.241;QD=13.0315;RBI=0.0332688;REFB=-0.0147249;REVB=-0.0301493;RO=42;SAF=14;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158103;STB=0.519466;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0372281;OID=.;OPOS=139045855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:42:42:26:27:0.391304:12:14:22:20:12:15:22:20 chr2 139045929 . C T 260.48 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0116286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1422;QD=18.944;RBI=0.020101;REFB=-0.0182208;REVB=-0.0163959;RO=27;SAF=18;SAR=10;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13548;STB=0.575171;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0150656;OID=.;OPOS=139045929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:10:18:21:6:10:18:21:6 chr2 139045972 . T C 838.86 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0640757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5636;QD=55.9238;RBI=0.0654746;REFB=-0.115859;REVB=-0.0134619;RO=1;SAF=36;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129277;STB=0.506847;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00401004;OID=.;OPOS=139045972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:23:36:1:0:23:36:1:0 chr2 139045987 . C T 189.82 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0180696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.763;QD=11.3327;RBI=0.0351404;REFB=-0.00803043;REVB=-0.0301386;RO=43;SAF=15;SAR=9;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153719;STB=0.589278;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0144729;OID=.;OPOS=139045987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:9:15:21:22:9:15:21:22 chr2 139326879 . G C 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.063;QD=63.1952;RBI=0.0217198;REFB=0;REVB=-0.0177852;RO=0;SAF=53;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0723e-05;OID=.;OPOS=139326879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:39:53:0:0:39:53:0:0 chr2 139429068 . G A 440.39 PASS AF=0.461538;AO=47;DP=103;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00620216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.39;QD=16.9379;RBI=0.0117345;REFB=-0.00594754;REVB=0.00996155;RO=56;SAF=19;SAR=28;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129091;STB=0.564489;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00608122;OID=.;OPOS=139429068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:56:56:47:48:0.461538:28:19:30:26:28:20:30:26 chr2 139621308 . C T 475.31 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.011872;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5588;QD=17.6042;RBI=0.0288869;REFB=-0.00756125;REVB=-0.0263345;RO=59;SAF=33;SAR=18;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556346;STB=0.538446;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00785611;OID=.;OPOS=139621308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:108:59:57:51:51:0.472222:18:33:35:24:18:33:33:24 chr2 139621319 . A ATCT 743.58 PASS AF=0.701149;AO=61;DP=90;FAO=61;FDP=87;FR=.;FRO=26;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00470873;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=3;MLLD=202.817;QD=34.1878;RBI=0.00475247;REFB=-0.0359633;REVB=-0.000643238;RO=26;SAF=37;SAR=24;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276532;STB=0.514894;STBP=0.699;TYPE=ins;VARB=0.0116636;OID=.;OPOS=139621320;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.701149:61:90:61:87:26:37:24:17:9:99:26:37:24:17:9 chr2 139621326 . G A 1006.38 PASS AF=0.986111;AO=67;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0505131;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5222;QD=55.9098;RBI=0.052239;REFB=-0.117293;REVB=0.0133169;RO=2;SAF=39;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00461499;STB=0.506022;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00482333;OID=.;OPOS=139621326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:72:72:2:1:67:71:0.986111:28:39:1:1:30:41:1:0 chr2 141032088 . C T 2591.04 PASS AF=0.988304;AO=169;DP=171;FAO=169;FDP=171;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0107425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.371;QD=60.6091;RBI=0.0124658;REFB=-0.150164;REVB=0.0063241;RO=2;SAF=93;SAR=76;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101242;STB=0.505319;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00089575;OID=.;OPOS=141032088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:171:171:2:2:169:169:0.988304:76:93:2:0:76:93:2:0 chr2 141260668 . A G 1914.86 PASS AF=0.992063;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0456181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1138;QD=60.7892;RBI=0.0456722;REFB=-0.121441;REVB=-0.00222336;RO=0;SAF=46;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00123236;OID=.;OPOS=141260668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:126:0:1:124:125:0.992063:78:46:0:0:78:47:1:0 chr2 141571329 . T C 1263.88 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.408;QD=61.6526;RBI=0.0187316;REFB=0;REVB=0.0157988;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74382e-05;OID=.;OPOS=141571329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:40:41:0:0:41:41:0:0 chr2 141707868 . G T 745.7 PASS AF=0.496774;AO=77;DP=154;FAO=77;FDP=155;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=-0.0335915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.407;QD=19.2439;RBI=0.0355272;REFB=-0.0151674;REVB=-0.0115666;RO=77;SAF=37;SAR=40;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589001;STB=0.529128;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0150239;OID=.;OPOS=141707868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:77:78:77:77:0.496774:40:37:42:35:40:37:42:36 chr2 141709419 . T G 412.41 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.048801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3874;QD=18.746;RBI=0.0630033;REFB=-0.0262194;REVB=0.0398482;RO=46;SAF=25;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908247;STB=0.550636;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0261192;OID=.;OPOS=141709419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:17:25:23:23:17:25:23:23 chr2 141751592 . G A 1592.38 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136286;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.884;QD=60.09;RBI=0.0206872;REFB=0;REVB=0.0155635;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00965e-05;OID=.;OPOS=141751592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:54:52:0:0:54:52:0:0 chr2 141816621 . A G 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.343;QD=58.061;RBI=0.0404611;REFB=0;REVB=0.0225428;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67755e-05;OID=.;OPOS=141816621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr2 141946094 . G A 542.52 PASS AF=0.534653;AO=54;DP=101;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0258273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.767;QD=21.4859;RBI=0.0499598;REFB=-0.00424122;REVB=-0.042766;RO=47;SAF=24;SAR=30;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201975;STB=0.511107;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00461348;OID=.;OPOS=141946094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:47:54:54:0.534653:30:24:22:25:30:24:22:25 chr2 142567910 . T C 405.64 PASS AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.00578253;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.037;QD=15.9076;RBI=0.0375099;REFB=0.0075659;REVB=-0.0370615;RO=56;SAF=24;SAR=21;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103441;STB=0.562472;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.0102348;OID=.;OPOS=142567910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:57:45:45:0.441176:21:24:24:32:21:24:24:33 chr2 143849094 . G A 492.27 PASS AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00503672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8434;QD=22.633;RBI=0.00585995;REFB=-0.0136158;REVB=-0.00299508;RO=39;SAF=20;SAR=27;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872381;STB=0.511461;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.015752;OID=.;OPOS=143849094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:39:40:47:47:0.54023:27:20:17:22:27:20:18:22 chr2 144899559 . C A 1192.68 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0398048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6581;QD=59.6339;RBI=0.0575207;REFB=-0.048272;REVB=-0.0415235;RO=0;SAF=26;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77523e-08;STB=0.509432;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-1.05665e-05;OID=.;OPOS=144899559;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:0:1:79:79:0.9875:53:26:0:0:53:26:1:0 chr2 150432976 . C T 388.56 PASS AF=0.653061;AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00560582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.97;QD=31.7189;RBI=0.0148782;REFB=-0.0164825;REVB=-0.0137817;RO=17;SAF=13;SAR=19;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189301;STB=0.603493;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0100529;OID=.;OPOS=150432976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:17:17:32:32:0.653061:19:13:12:5:19:13:12:5 chr2 151219315 . C T 1171.95 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.283;QD=60.8803;RBI=0.024754;REFB=0;REVB=0.02227;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107345;OID=.;OPOS=151219315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:32:45:0:0:32:45:0:0 chr2 152117957 . T C 1559.11 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00829251;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.645;QD=63.6371;RBI=0.0129745;REFB=0;REVB=0.00997863;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298022;OID=.;OPOS=152117957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:47:49:0:0:49:49:0:0 chr2 152266473 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.876;QD=61.3362;RBI=0.0635142;REFB=0;REVB=0.0633092;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150239;OID=.;OPOS=152266473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr2 152295227 . C T 566.67 PASS AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00731866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.993;QD=20.059;RBI=0.0112488;REFB=-0.00174203;REVB=-0.00854238;RO=54;SAF=31;SAR=27;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00224661;STB=0.503523;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00160979;OID=.;OPOS=152295227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:54:55:58:58:0.513274:27:31:29:25:27:31:29:26 chr2 152311570 . G A 920.38 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.334;QD=58.4371;RBI=0.0479217;REFB=0;REVB=0.011149;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139482;OID=.;OPOS=152311570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:30:32:0:0:30:33:0:0 chr2 152320118 . G A 682.07 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.995;QD=62.0065;RBI=0.0270549;REFB=0;REVB=0.0244272;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.32121e-05;OID=.;OPOS=152320118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:21:23:0:0 chr2 152322095 . A T 160.25 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5298;QD=45.7844;RBI=0.0714724;REFB=0;REVB=0.0270526;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00409713;OID=.;OPOS=152322095;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr2 152331418 . C G 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.661;QD=57.1752;RBI=0.0478289;REFB=0;REVB=0.0123149;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309325;OID=.;OPOS=152331418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0 chr2 152346979 . T C 939.08 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106448;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.106;QD=58.6924;RBI=0.0120954;REFB=0;REVB=0.00574342;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000606353;OID=.;OPOS=152346979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:37:26:0:0:37:27:0:0 chr2 152352843 . C G 2991.83 PASS AF=1;AO=186;DP=187;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00740104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.403;QD=63.3191;RBI=0.029837;REFB=0;REVB=-0.0289045;RO=0;SAF=102;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.11532e-05;OID=.;OPOS=152352843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:187:189:0:0:186:189:1:84:102:0:0:86:103:0:0 chr2 152359900 . A G 355.26 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0259014;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.851;QD=16.1479;RBI=0.0285998;REFB=-0.0162077;REVB=0.0121272;RO=49;SAF=12;SAR=26;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185241;STB=0.599945;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0152667;OID=.;OPOS=152359900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:49:50:38:38:0.431818:26:12:24:25:26:12:24:26 chr2 152387553 . T C 3206.84 PASS AF=0.990521;AO=209;DP=212;FAO=209;FDP=211;FR=.;FRO=2;FSAF=98;FSAR=111;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0149136;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.421;QD=60.7931;RBI=0.0153189;REFB=-0.109005;REVB=0.00350058;RO=2;SAF=98;SAR=111;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00962148;STB=0.50505;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.000134962;OID=.;OPOS=152387553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:212:211:2:2:209:209:0.990521:111:98:2:0:111:98:2:0 chr2 152422076 . C G 887.98 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154498;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.745;QD=58.2279;RBI=0.0217266;REFB=0;REVB=-0.0152758;RO=0;SAF=14;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92147e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.28107e-05;OID=.;OPOS=152422076;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:47:14:0:0:47:14:0:0 chr2 152476028 . C G 1218.86 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0101196;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.823;QD=58.7402;RBI=0.0498823;REFB=-0.0217289;REVB=0.048845;RO=2;SAF=42;SAR=39;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00084581;STB=0.500447;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.000170479;OID=.;OPOS=152476028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:83:2:2:81:81:0.975904:39:42:1:1:39:42:1:1 chr2 152490219 . A G 2817.68 PASS AF=1;AO=176;DP=176;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.042;QD=62.6152;RBI=0.0129602;REFB=0;REVB=0.0122537;RO=0;SAF=86;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8456e-05;OID=.;OPOS=152490219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:180:0:0:176:180:1:90:86:0:0:91:89:0:0 chr2 152490458 . A G 2889.13 PASS AF=0.994595;AO=183;DP=184;FAO=184;FDP=185;FR=.;FRO=1;FSAF=90;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00910781;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.332;QD=62.4676;RBI=0.0247377;REFB=-0.0791828;REVB=0.023;RO=0;SAF=90;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05186e-08;STB=0.502762;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000131693;OID=.;OPOS=152490458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:184:185:0:1:183:184:0.994595:93:90:0:0:94:90:1:0 chr2 152492791 . C T 89.78 PASS AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00294177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.559;QD=7.48138;RBI=0.0380287;REFB=-0.0110562;REVB=-0.0379148;RO=36;SAF=8;SAR=4;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205141;STB=0.628353;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0325562;OID=.;OPOS=152492791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:4:8:18:18:4:8:18:18 chr2 152496526 . A G 516.45 PASS AF=0.5;AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0647761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7682;QD=19.1276;RBI=0.0647924;REFB=-0.0215121;REVB=0.00145338;RO=54;SAF=29;SAR=25;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168627;STB=0.50932;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0186268;OID=.;OPOS=152496526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:54:54:0.5:25:29:30:24:25:29:30:24 chr2 152499355 . T C 441.13 PASS AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.000794569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.945;QD=17.4705;RBI=0.00149197;REFB=0.00373689;REVB=0.00126279;RO=54;SAF=31;SAR=16;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228734;STB=0.627691;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.00376807;OID=.;OPOS=152499355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:47:47:0.465347:16:31:23:31:16:31:23:31 chr2 152500449 . C G 909.78 PASS AF=0.471795;AO=92;DP=195;FAO=92;FDP=195;FR=.;FRO=103;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=43;FWDB=0.016589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6529;QD=18.6622;RBI=0.0224621;REFB=-0.00476379;REVB=-0.0151444;RO=103;SAF=52;SAR=40;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168739;STB=0.50932;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00578419;OID=.;OPOS=152500449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:103:103:92:92:0.471795:40:52:60:43:40:52:60:43 chr2 152521096 . C T 176.02 PASS AF=0.328571;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0609719;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3956;QD=10.0584;RBI=0.0616382;REFB=0.0216191;REVB=-0.00903865;RO=46;SAF=14;SAR=9;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313572;STB=0.661683;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.0458683;OID=.;OPOS=152521096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:46:47:23:23:0.328571:9:14:15:31:9:14:17:30 chr2 152521983 . A G 559.15 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00663754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.938;QD=23.0579;RBI=0.00727211;REFB=-0.0152341;REVB=0.00297096;RO=44;SAF=19;SAR=33;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172705;STB=0.590448;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0172368;OID=.;OPOS=152521983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:44:45:52:52:0.536082:33:19:25:19:33:19:25:20 chr2 152527572 . C T 804.76 PASS AF=0.482558;AO=83;DP=172;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.0262109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.71;QD=18.7154;RBI=0.0262346;REFB=-0.0122204;REVB=-0.00111392;RO=89;SAF=41;SAR=42;SRF=37;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734783;STB=0.540523;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0134204;OID=.;OPOS=152527572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:89:89:83:83:0.482558:42:41:37:52:42:41:37:52 chr2 152527608 . C T 728.92 PASS AF=0.472393;AO=77;DP=162;FAO=77;FDP=163;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.0252337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.326;QD=17.8875;RBI=0.0341178;REFB=-0.00852023;REVB=-0.0229627;RO=85;SAF=28;SAR=49;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139381;STB=0.574547;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0127555;OID=.;OPOS=152527608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:85:86:77:77:0.472393:49:28:43:42:49:28:43:43 chr2 152531077 . A G 1377.52 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.295;QD=62.6146;RBI=0.00859727;REFB=0;REVB=0.00798202;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78666e-06;OID=.;OPOS=152531077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0 chr2 152534545 . T C 931.41 PASS AF=0.40458;AO=106;DP=262;FAO=106;FDP=262;FR=.;FRO=156;FSAF=38;FSAR=68;FSRF=66;FSRR=90;FWDB=-0.00124286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.236;QD=14.22;RBI=0.0115993;REFB=9.78227e-05;REVB=0.0115325;RO=155;SAF=38;SAR=68;SRF=66;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756236;STB=0.54083;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.000171047;OID=.;OPOS=152534545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:155:156:106:106:0.40458:68:38:66:89:68:38:66:90 chr2 152536498 . T A 3219.52 PASS AF=1;AO=208;DP=208;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00967104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.572;QD=61.9139;RBI=0.0483768;REFB=0;REVB=0.0474003;RO=0;SAF=96;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121755;OID=.;OPOS=152536498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:208:208:0:0:208:208:1:112:96:0:0:112:96:0:0 chr2 152573981 . A G 779.89 PASS AF=0.519737;AO=78;DP=151;FAO=79;FDP=152;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.00541364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.711;QD=20.5233;RBI=0.00656463;REFB=-0.00801544;REVB=0.00371306;RO=73;SAF=32;SAR=46;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497359;STB=0.524584;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00699836;OID=.;OPOS=152573981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:73:73:78:79:0.519737:46:32:26:47:47:32:26:47 chr2 152586193 . T C 181.16 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=35;FWDB=0.00212946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.333;QD=11.3227;RBI=0.0126941;REFB=-0.0114815;REVB=0.0125142;RO=41;SAF=4;SAR=19;SRF=6;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554781;STB=0.531993;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0226228;OID=.;OPOS=152586193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:41:41:23:23:0.359375:19:4:6:35:19:4:6:35 chr2 152988610 . C CT 626.85 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.1186;QD=47.3092;RBI=0.0771899;REFB=0;REVB=-0.0693559;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018468;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00254272;OID=.;OPOS=152988611;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:52:53:53:53:0:26:27:0:0:11:1:25:27:1:0 chr2 153378459 . T C 1433.71 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.669;QD=63.02;RBI=0.0476665;REFB=0;REVB=-0.00372009;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71126e-05;OID=.;OPOS=153378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:48:43:0:0:48:43:0:0 chr2 153399310 . C T 321.24 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0069675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.961;QD=16.2652;RBI=0.00836332;REFB=-0.00879483;REVB=-0.00462592;RO=44;SAF=16;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00259002;STB=0.501457;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.012263;OID=.;OPOS=153399310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:19:16:20:24:19:16:20:24 chr2 153405594 . G A 994.23 PASS AF=0.985507;AO=69;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00633645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.276;QD=57.6363;RBI=0.0105862;REFB=0.0241372;REVB=0.00848033;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.50704;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.000518756;OID=.;OPOS=153405594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:0:1:69:68:0.985507:33:36:0:0:33:35:1:0 chr2 153476066 . G GCCA 150.83 PASS AF=1;AO=5;DP=30;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607094;FXX=0.0666222;HRUN=5;LEN=3;MLLD=234.364;QD=43.0948;RBI=0.0711466;REFB=0;REVB=0.0370973;RO=23;SAF=1;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305545;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000601534;OID=.;OPOS=153476067;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=GCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:5:30:14:14:0:2:12:0:0:4:23:1:4:10:13 chr2 153511027 . T C 1647.09 PASS AF=0.982301;AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0267314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.519;QD=58.3042;RBI=0.0752479;REFB=-0.065497;REVB=0.0703397;RO=2;SAF=46;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201897;STB=0.510636;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00209924;OID=.;OPOS=153511027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:112:113:2:2:110:111:0.982301:64:46:2:0:65:46:2:0 chr2 153577013 . G A 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.469;QD=61.6952;RBI=0.0200239;REFB=0;REVB=-0.0139258;RO=0;SAF=52;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.29759e-07;OID=.;OPOS=153577013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:30:52:0:0:30:52:0:0 chr2 155265623 . G A 870.92 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125836;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.617;QD=58.0613;RBI=0.0140589;REFB=0;REVB=0.00626953;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518176;OID=.;OPOS=155265623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:27:32:0:0:27:33:0:0 chr2 155307336 . G C 2280.85 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155698;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.723;QD=63.7999;RBI=0.0161362;REFB=0;REVB=-0.00423768;RO=0;SAF=79;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.78133e-06;OID=.;OPOS=155307336;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:143:0:0:143:143:1:64:79:0:0:64:79:0:0 chr2 156120552 . A G 1553.64 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00944763;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.391;QD=64.0677;RBI=0.015146;REFB=0;REVB=0.0118382;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77855e-05;OID=.;OPOS=156120552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:45:52:0:0:45:52:0:0 chr2 156168039 . T G 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.816;QD=56.9374;RBI=0.0554736;REFB=0;REVB=0.0147975;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027397;OID=.;OPOS=156168039;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0 chr2 157189011 . G C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.815;QD=60.9781;RBI=0.0465944;REFB=0;REVB=0.00117462;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000363712;OID=.;OPOS=157189011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0 chr2 157257361 . G A 1567.08 PASS AF=0.990654;AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0305007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.248;QD=58.5826;RBI=0.0725652;REFB=-0.0934107;REVB=-0.0658439;RO=0;SAF=37;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503703;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000214591;OID=.;OPOS=157257361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:107:0:1:104:106:0.990654:67:37:0:0:67:39:0:1 chr2 157406249 . G A 1329.74 PASS AF=0.956522;AO=88;DP=92;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0354683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.73;QD=57.8148;RBI=0.0394712;REFB=-0.148425;REVB=0.0173198;RO=4;SAF=39;SAR=49;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161377;STB=0.508524;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00273454;OID=.;OPOS=157406249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:92:92:4:4:88:88:0.956522:49:39:1:3:49:39:1:3 chr2 158114824 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0120262;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=339.609;QD=16.3857;RBI=0.0173024;REFB=-0.00713898;REVB=-0.0124397;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.583142;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00485292;OID=.;OPOS=158114824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:4:4:3:6:4:4 chr2 158155446 . ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCG ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA 838.43 PASS AF=0.762712,0.237288;AO=39,10;DP=63;FAO=45,14;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=17,7;FSAR=28,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246789,0.0524002;FXX=0.0781128;HRUN=2,2;LEN=8,1;MLLD=225.703,274.342;QD=56.8428;RBI=0.0247243,0.0534561;REFB=0,0;REVB=-0.00149757,-0.0105721;RO=0;SAF=16,3;SAR=23,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.43889e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00134533,0.00957504;OID=.,.;OPOS=158155447,158155472;OREF=CGGAAGAC,G;OALT=-,A;OMAPALT=ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.762712,0.237288:39,10:63:45,14:59:0:17,7:28,7:0:0:93:0:16,3:23,7:0:0 chr2 158155480 . A G 47.51 PASS AF=0.133333;AO=9;DP=75;FAO=10;FDP=75;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=-0.00151411;FXX=0.0624922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.353;QD=2.53398;RBI=0.0320601;REFB=-0.00883;REVB=-0.0320243;RO=64;SAF=3;SAR=6;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00707734;STB=0.571293;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0387413;OID=.;OPOS=158155480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:75:75:64:65:9:10:0.133333:6:3:21:43:6:4:21:44 chr2 158155576 . G A 696.17 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00466287;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=235.962;QD=60.5362;RBI=0.00572517;REFB=-0.124501;REVB=-0.00332193;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.515145;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000261696;OID=.;OPOS=158155576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:29:16:0:0:29:16:1:0 chr2 158157361 . C T 3083.01 PASS AF=1;AO=200;DP=202;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747427;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.982;QD=61.6603;RBI=0.0147567;REFB=0;REVB=0.0127238;RO=0;SAF=108;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124303;OID=.;OPOS=158157361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:202:200:0:0:200:200:1:92:108:0:0:92:108:0:0 chr2 158165142 . A G 736.71 PASS AF=0.496552;AO=72;DP=145;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.0149533;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.68;QD=20.323;RBI=0.0167388;REFB=0.00416802;REVB=0.00752237;RO=73;SAF=36;SAR=36;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813531;STB=0.544815;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00401364;OID=.;OPOS=158165142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:73:73:72:72:0.496552:36:36:30:43:36:36:30:43 chr2 158291188 . A C 453.86 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0232684;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=275.445;QD=55.0134;RBI=0.0256647;REFB=-0.149984;REVB=0.0108285;RO=1;SAF=15;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301077;STB=0.516119;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000490384;OID=.;OPOS=158291188;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:17:15:1:0:17:15:1:0 chr2 158386938 . C T 440.72 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=0.000364487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.117;QD=19.5874;RBI=0.0672427;REFB=-0.00467144;REVB=-0.0672417;RO=46;SAF=28;SAR=16;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105849;STB=0.558533;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00580665;OID=.;OPOS=158386938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:16:28:34:12:16:28:34:12 chr2 158626980 . C T 1472.51 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000661413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.442;QD=63.3336;RBI=0.00209008;REFB=0;REVB=0.00198267;RO=0;SAF=36;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.76215e-07;OID=.;OPOS=158626980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:93:0:0:91:93:1:55:36:0:0:56:37:0:0 chr2 158636910 . G A 590.17 PASS AF=0.508475;AO=60;DP=118;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.00688864;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.399;QD=20.0058;RBI=0.0220248;REFB=-0.00941489;REVB=0.0209198;RO=58;SAF=24;SAR=36;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059972;STB=0.53309;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00812324;OID=.;OPOS=158636910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:58:58:60:60:0.508475:36:24:27:31:36:24:27:31 chr2 159166069 . T A,C 770.9 PASS AF=0.0350877,0.947368;AO=2,54;DP=57;FAO=2,54;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=2,12;FSAR=0,42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0193502,0.00978013;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=171.482,52.6371;QD=54.0985;RBI=0.0229792,0.0527912;REFB=-0.0116951,-0.104929;REVB=-0.0123941,0.0518773;RO=1;SAF=2,12;SAR=0,42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.697199,0.0110913;STB=0.993266,0.50588;STBP=0.227,0.656;TYPE=snp,snp;VARB=0.182332,0.0027775;OID=.,.;OPOS=159166069,159166069;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:57:57:1:1:2,54:2,54:0.0350877,0.947368:0,42:2,12:0:1:0,42:2,12:0:1 chr2 159195282 . C T 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00873978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.893;QD=16.2365;RBI=0.00887843;REFB=-0.0111495;REVB=-0.00156292;RO=35;SAF=19;SAR=11;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858709;STB=0.536562;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0135155;OID=.;OPOS=159195282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:36:30:30:0.454545:11:19:25:10:11:19:25:11 chr2 159196771 . T C 361.06 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0166212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.457;QD=20.3415;RBI=0.022909;REFB=-0.00411014;REVB=0.0157657;RO=34;SAF=22;SAR=15;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158277;STB=0.587739;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00506555;OID=.;OPOS=159196771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:15:22:14:20:15:22:14:20 chr2 159537868 . A G 545.25 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.206;QD=57.3948;RBI=0.059903;REFB=-0.0986545;REVB=0.0589438;RO=1;SAF=20;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00107977;OID=.;OPOS=159537868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:17:20:1:0:17:20:1:0 chr2 160019863 . A G 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.739;QD=62.6697;RBI=0.0525449;REFB=0;REVB=-0.0299809;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000401821;OID=.;OPOS=160019863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr2 160035207 . T C 1120.95 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502955;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.998;QD=60.5919;RBI=0.051707;REFB=0;REVB=0.0119989;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47534e-05;OID=.;OPOS=160035207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0 chr2 160088607 . A G 325.78 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0103299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.96;QD=24.587;RBI=0.0231584;REFB=-0.0374564;REVB=0.0207269;RO=21;SAF=15;SAR=17;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209672;STB=0.614867;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0339283;OID=.;OPOS=160088607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:17:15:16:5:17:15:16:5 chr2 160112881 . G T 259.67 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0083478;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5508;QD=13.8492;RBI=0.0549619;REFB=-0.0202638;REVB=-0.0543243;RO=45;SAF=12;SAR=18;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242063;STB=0.513803;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0340306;OID=.;OPOS=160112881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:18:12:19:26:18:12:19:26 chr2 160114437 . G A 390.9 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0226664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6137;QD=16.6338;RBI=0.0260532;REFB=0.000314207;REVB=-0.0128454;RO=53;SAF=14;SAR=27;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193497;STB=0.608968;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0010339;OID=.;OPOS=160114437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:27:14:28:25:27:14:28:25 chr2 160136337 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.98;QD=49.5992;RBI=0.0397005;REFB=0;REVB=0.0377584;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251896;OID=.;OPOS=160136337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr2 160182302 . C T 214.1 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0514674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2108;QD=14.7658;RBI=0.0648257;REFB=-0.0358066;REVB=-0.0394142;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135335;STB=0.576862;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0333999;OID=.;OPOS=160182302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:14:19:11:14:14:19 chr2 160294779 . T C 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00108928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.966;QD=11.1978;RBI=0.00825522;REFB=-0.0106938;REVB=-0.00818304;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138903;STB=0.58319;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0309066;OID=.;OPOS=160294779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:4:8:12:10:4:8:12:10 chr2 160294842 . A G 304.07 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00230222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.291;QD=17.3756;RBI=0.0192901;REFB=-0.000716793;REVB=0.0191522;RO=37;SAF=21;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120317;STB=0.567526;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.000776445;OID=.;OPOS=160294842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:12:21:19:18:12:21:19:18 chr2 160604812 . C T 176.65 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0139162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=330.469;QD=14.132;RBI=0.0165075;REFB=-0.00682465;REVB=-0.00887901;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584315;STB=0.533863;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0103352;OID=.;OPOS=160604812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:9:10:18:13:9:10:18:13 chr2 160605268 . T C 221.09 PASS AF=0.462963;AO=21;DP=51;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=5.45435e-05;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.961;QD=16.3771;RBI=0.0154098;REFB=-0.0179921;REVB=0.0154097;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525772;STB=0.573077;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0216661;OID=.;OPOS=160605268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:30:29:21:25:0.462963:8:13:20:10:12:13:19:10 chr2 160639970 . T C 247.34 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00119034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.813;QD=13.7412;RBI=0.013684;REFB=-0.00241407;REVB=0.0136321;RO=43;SAF=16;SAR=13;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00679677;STB=0.503873;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00400393;OID=.;OPOS=160639970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:13:16:24:19:13:16:24:19 chr2 160676427 . C A 739.61 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.104;QD=56.8933;RBI=0.0283752;REFB=0;REVB=-0.00807411;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9449e-05;OID=.;OPOS=160676427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:32:19:0:0:32:20:0:0 chr2 160697258 . G A 376.63 PASS AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0158093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.372;QD=18.5988;RBI=0.0432156;REFB=-0.00979481;REVB=0.0402201;RO=42;SAF=15;SAR=24;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877965;STB=0.548994;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0108143;OID=.;OPOS=160697258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:24:15:20:22:24:15:20:22 chr2 160710153 . T G 446.13 PASS AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0119553;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.681;QD=23.1755;RBI=0.0122976;REFB=-0.00963764;REVB=0.00288163;RO=34;SAF=25;SAR=18;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796681;STB=0.543718;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00693823;OID=.;OPOS=160710153;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:34:43:43:0.558442:18:25:23:11:18:25:23:11 chr2 160710922 . T C 1183.1 PASS AF=0.483607;AO=117;DP=244;FAO=118;FDP=244;FR=.;FRO=126;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=67;FSRR=59;FWDB=0.0217486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.11;QD=19.395;RBI=0.0247642;REFB=-0.0209561;REVB=0.0118433;RO=126;SAF=64;SAR=53;SRF=67;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144752;STB=0.505521;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.023088;OID=.;OPOS=160710922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:126:126:117:118:0.483607:53:64:67:59:54:64:67:59 chr2 160711045 . G C 1713.25 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.374;QD=60.6462;RBI=0.0327154;REFB=0;REVB=0.0182371;RO=0;SAF=49;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34554e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72576e-05;OID=.;OPOS=160711045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:64:49:0:0:64:49:0:0 chr2 160737621 . C T 392.94 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00244633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.75;QD=17.0844;RBI=0.00258551;REFB=0.00474721;REVB=-0.000836854;RO=51;SAF=19;SAR=22;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265502;STB=0.514886;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00324527;OID=.;OPOS=160737621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:22:19:25:26:22:19:25:26 chr2 160737663 . T A 513.86 PASS AF=0.521277;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0150284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.308;QD=21.8665;RBI=0.0174723;REFB=-0.00874513;REVB=0.00891223;RO=45;SAF=22;SAR=27;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924496;STB=0.551;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00669262;OID=.;OPOS=160737663;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:45:45:49:49:0.521277:27:22:25:20:27:22:25:20 chr2 160738677 . G A 385.86 PASS AF=0.42268;AO=40;DP=98;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.0144027;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.175;QD=15.9116;RBI=0.0145344;REFB=-0.00823799;REVB=0.00195213;RO=58;SAF=21;SAR=19;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119562;STB=0.56534;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0115605;OID=.;OPOS=160738677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:58:56:40:41:0.42268:19:21:37:21:20:21:35:21 chr2 160761136 . A G 113.9 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00029611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.529;QD=10.3542;RBI=0.0195872;REFB=-0.0214063;REVB=-0.019585;RO=30;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202554;STB=0.621535;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0570892;OID=.;OPOS=160761136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:9:5:16:14:9:5:16:14 chr2 160833188 . A G 2275.41 PASS AF=1;AO=145;DP=147;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294226;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.196;QD=60.6776;RBI=0.0395598;REFB=0;REVB=0.0264441;RO=0;SAF=90;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46084e-05;OID=.;OPOS=160833188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:147:150:0:0:145:150:1:55:90:0:0:56:94:0:0 chr2 160901517 . A G 377.46 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=0.00507499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5428;QD=16.2349;RBI=0.0432807;REFB=0.0207568;REVB=0.0429822;RO=53;SAF=16;SAR=24;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149009;STB=0.583294;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.032043;OID=.;OPOS=160901517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:53:53:40:40:0.430108:24:16:14:39:24:16:14:39 chr2 160983060 . G C 130.64 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0210155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.231;QD=22.7198;RBI=0.0241324;REFB=-0.0255643;REVB=0.0118626;RO=8;SAF=6;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355542;STB=0.538407;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.015932;OID=.;OPOS=160983060;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:8:9:14:14:0.608696:8:6:3:5:8:6:3:6 chr2 160994348 . C T 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0365554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.598;QD=16.8985;RBI=0.0383884;REFB=-0.0288533;REVB=-0.0117205;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130908;STB=0.576311;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.014254;OID=.;OPOS=160994348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:7:3:4:5:7:3:4:5 chr2 161029218 . G A 186.9 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0272852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.73;QD=14.6586;RBI=0.0276332;REFB=-0.0112768;REVB=-0.00437188;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925042;STB=0.553022;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0125101;OID=.;OPOS=161029218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:11:10:17:13:11:10:17:13 chr2 161174693 . C T 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0291416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.762;QD=19.6971;RBI=0.0291515;REFB=0.00105726;REVB=0.000760105;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611111;STB=0.534489;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.0010853;OID=.;OPOS=161174693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:9:13:11:10:9:13 chr2 161253376 . A G 270.77 PASS AF=0.418919;AO=29;DP=72;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0141852;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.859;QD=14.6363;RBI=0.0144037;REFB=-0.0104802;REVB=-0.00249888;RO=43;SAF=17;SAR=12;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103356;STB=0.554055;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0104022;OID=.;OPOS=161253376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:43:43:29:31:0.418919:12:17:21:22:13:18:21:22 chr2 162696414 . C T 848.06 PASS AF=0.502924;AO=85;DP=165;FAO=86;FDP=171;FR=.;FRO=85;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=-0.0455348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.421;QD=19.8376;RBI=0.0559594;REFB=-0.0423595;REVB=-0.0325275;RO=78;SAF=37;SAR=48;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118915;STB=0.514424;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0396572;OID=.;OPOS=162696414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:171:78:85:85:86:0.502924:48:37:35:43:48:38:40:45 chr2 162821644 . C T 586.35 PASS AF=0.469231;AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.00195163;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.393;QD=18.0416;RBI=0.0180862;REFB=-0.010185;REVB=-0.0179806;RO=69;SAF=28;SAR=33;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115033;STB=0.563798;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0128999;OID=.;OPOS=162821644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:69:69:61:61:0.469231:33:28:40:29:33:28:40:29 chr2 162870985 . C A 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00545565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.133;QD=13.7531;RBI=0.00776075;REFB=-0.013394;REVB=0.00551953;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244146;STB=0.642664;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0175543;OID=.;OPOS=162870985;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:13:10:10:5:13:10 chr2 162876768 . G A 144.89 PASS AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0221006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.339;QD=10.168;RBI=0.0327351;REFB=-0.00761019;REVB=-0.0241485;RO=38;SAF=14;SAR=5;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202137;STB=0.620119;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00818204;OID=.;OPOS=162876768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:38:38:19:19:0.333333:5:14:22:16:5:14:22:16 chr2 163005674 . G A 177.09 PASS AF=0.372881;AO=23;DP=58;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0119087;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3754;QD=12.0063;RBI=0.0120018;REFB=-0.00523763;REVB=0.00149148;RO=35;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539318;STB=0.549251;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0270589;OID=.;OPOS=163005674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:35:37:23:22:0.372881:10:13:18:17:9:13:19:18 chr2 163078195 . T A 283.17 PASS AF=0.462687;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0275972;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.21;QD=16.9058;RBI=0.0370786;REFB=-0.028572;REVB=-0.0247632;RO=36;SAF=11;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133124;STB=0.56209;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0393483;OID=.;OPOS=163078195;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:36:36:30:31:0.462687:19:11:18:18:19:12:18:18 chr2 163080982 . A G 389.19 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0087604;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.162;QD=16.049;RBI=0.00930247;REFB=-0.0258321;REVB=0.00312912;RO=55;SAF=17;SAR=24;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00371494;STB=0.502332;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.029421;OID=.;OPOS=163080982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:55:56:41:41:0.42268:24:17:23:32:24:17:23:33 chr2 163128824 . T C 216.33 PASS AF=0.538462;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0266023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.774;QD=22.188;RBI=0.0266147;REFB=-0.0105025;REVB=-0.000812245;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199495;STB=0.618706;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00858157;OID=.;OPOS=163128824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:18:18:20:21:0.538462:9:11:14:4:10:11:14:4 chr2 163137871 . C G 569.64 PASS AF=0.376404;AO=67;DP=178;FAO=67;FDP=178;FR=.;FRO=111;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=48;FSRR=63;FWDB=-0.00624203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.392;QD=12.8009;RBI=0.00657408;REFB=-0.00773551;REVB=0.0020629;RO=111;SAF=36;SAR=31;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115071;STB=0.565111;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0144534;OID=.;OPOS=163137871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:111:111:67:67:0.376404:31:36:48:63:31:36:48:63 chr2 163137983 . T C 744.23 PASS AF=0.454023;AO=79;DP=174;FAO=79;FDP=174;FR=.;FRO=95;FSAF=25;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=50;FWDB=0.0305332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.421;QD=17.1086;RBI=0.0390353;REFB=-0.00766548;REVB=0.0243204;RO=95;SAF=25;SAR=54;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165957;STB=0.592452;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0118669;OID=.;OPOS=163137983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:95:95:79:79:0.454023:54:25:45:50:54:25:45:50 chr2 163175656 . A C 154.78 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0317731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4924;QD=14.7405;RBI=0.0413554;REFB=-0.0179129;REVB=0.0264716;RO=25;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205907;STB=0.619913;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0267784;OID=.;OPOS=163175656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:12:5:12:13:12:5:12:13 chr2 163213381 . A G 335.46 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0242567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.821;QD=16.9851;RBI=0.0247637;REFB=-0.0149984;REVB=0.00498536;RO=43;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296084;STB=0.516599;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0184893;OID=.;OPOS=163213381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:17:19:24:19:17:19:24:19 chr2 163217273 . AT A,GA 485.32 PASS AF=0.442623,0;AO=49,5;DP=123;FAO=54,0;FDP=122;FR=.;FRO=68;FSAF=26,0;FSAR=28,0;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.0155935,0.0222074;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=135.659,139.605;QD=15.9123;RBI=0.015598,0.0232208;REFB=-0.00575792,-0.00415801;REVB=0.000373297,0.00678517;RO=69;SAF=21,5;SAR=28,0;SRF=35;SRR=34;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.082263,0.525849;STB=0.510324,0.5;STBP=0.815,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00960836,0;OID=.,.;OPOS=163217274,163217273;OREF=T,AT;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:69:68:49,5:54,0:0.442623,0:28,0:21,5:35:34:28,0:26,0:34:34 chr2 163227849 . C T 220.58 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00922296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.643;QD=14.2308;RBI=0.00962825;REFB=0.0024824;REVB=-0.00276409;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222127;STB=0.512648;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00363024;OID=.;OPOS=163227849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:11:15:20:16:11:15:20:16 chr2 163256949 . G T 699.76 PASS AF=0.507353;AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=-0.00298599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.649;QD=20.5812;RBI=0.00833113;REFB=0.00631188;REVB=0.00777764;RO=67;SAF=23;SAR=46;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394286;STB=0.521733;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.00777827;OID=.;OPOS=163256949;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:67:67:69:69:0.507353:46:23:25:42:46:23:25:42 chr2 163291981 . G A 655.83 PASS AF=0.592593;AO=62;DP=103;FAO=64;FDP=108;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0458836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2635;QD=24.2901;RBI=0.050464;REFB=0.00564108;REVB=-0.0210074;RO=41;SAF=29;SAR=33;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503755;STB=0.51562;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.00220939;OID=.;OPOS=163291981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:108:41:44:62:64:0.592593:33:29:22:19:33:31:23:21 chr2 164145582 . C A 103.51 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0137181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.054;QD=18.8207;RBI=0.0198601;REFB=-0.00736008;REVB=0.0143609;RO=10;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47493;STB=0.775356;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00690181;OID=.;OPOS=164145582;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:10:2:7:3:10:2:7:3 chr2 165353712 . C T 590.46 PASS AF=0.504132;AO=61;DP=121;FAO=61;FDP=121;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0258066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4972;QD=19.5194;RBI=0.0654365;REFB=-0.0121489;REVB=-0.0601328;RO=60;SAF=24;SAR=37;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200295;STB=0.610459;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00966918;OID=.;OPOS=165353712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:60:60:61:61:0.504132:37:24:37:23:37:24:37:23 chr2 165996107 . T A 1478.29 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0999717;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.796;QD=58.5463;RBI=0.0999897;REFB=-0.0921047;REVB=0.00189671;RO=1;SAF=44;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839647;STB=0.504424;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.000461004;OID=.;OPOS=165996107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:102:101:1:1:100:100:0.990099:56:44:0:1:56:44:0:1 chr2 166170127 . T C 3250.32 PASS AF=1;AO=209;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0325;QD=61.9108;RBI=0.0465216;REFB=0;REVB=0.0350407;RO=0;SAF=103;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173774;OID=.;OPOS=166170127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:210:210:0:0:209:210:1:106:103:0:0:107:103:0:0 chr2 166248047 . G A 1877.81 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6349;QD=61.5676;RBI=0.0108136;REFB=0;REVB=0.00286455;RO=0;SAF=54;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.72266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48789e-05;OID=.;OPOS=166248047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:68:54:0:0:68:54:0:0 chr2 166535918 . C T 1733.77 PASS AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0199398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.975;QD=59.7852;RBI=0.0373501;REFB=-0.129383;REVB=0.0315822;RO=1;SAF=69;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683317;STB=0.503596;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000325403;OID=.;OPOS=166535918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:116:116:1:1:115:115:0.991379:46:69:1:0:46:69:1:0 chr2 166605010 . A T 716.72 PASS AF=1;AO=43;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0770264;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.275;QD=57.3373;RBI=0.0795259;REFB=0;REVB=0.0197812;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181869;OID=.;OPOS=166605010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:50:0:0:43:50:1:18:25:0:0:18:32:0:0 chr2 166618262 . C T 1339.73 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.743;QD=62.3132;RBI=0.0137071;REFB=0;REVB=0.00335551;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.11081e-05;OID=.;OPOS=166618262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:47:39:0:0:47:39:0:0 chr2 166767913 . C G 351.14 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0176657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.901;QD=18.007;RBI=0.02979;REFB=-0.0127572;REVB=0.0239868;RO=41;SAF=19;SAR=18;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678289;STB=0.537853;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.016124;OID=.;OPOS=166767913;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:18:19:24:17:18:19:24:17 chr2 166769021 . T C 707.41 PASS AF=0.486667;AO=73;DP=151;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.00466453;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.916;QD=18.8642;RBI=0.0112817;REFB=-0.0133597;REVB=0.0102723;RO=77;SAF=39;SAR=34;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022638;STB=0.512497;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0129315;OID=.;OPOS=166769021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:77:77:73:73:0.486667:34:39:43:34:34:39:43:34 chr2 166770120 . A G 522.49 PASS AF=0.459016;AO=56;DP=119;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0451934;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.7263;QD=17.1308;RBI=0.0453819;REFB=0.0024924;REVB=0.00413148;RO=63;SAF=25;SAR=31;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588615;STB=0.545438;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=-0.00560905;OID=.;OPOS=166770120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:122:63:66:56:56:0.459016:31:25:32:31:31:25:35:31 chr2 166773971 . G A 250.36 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0789515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4514;QD=20.0291;RBI=0.0797053;REFB=0.0180197;REVB=-0.0109357;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778135;STB=0.543882;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.0079119;OID=.;OPOS=166773971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:14:10:13:13:14:10:13:13 chr2 166781158 . G A 442.79 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0220832;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2233;QD=17.1958;RBI=0.0386264;REFB=-0.0213374;REVB=-0.0316912;RO=54;SAF=22;SAR=26;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311339;STB=0.521659;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0250932;OID=.;OPOS=166781158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:54:55:48:48:0.466019:26:22:23:31:26:22:23:32 chr2 166788336 . T C 1268.72 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00911352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.808;QD=60.4153;RBI=0.0385178;REFB=-0.0347604;REVB=0.0374241;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000137198;OID=.;OPOS=166788336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:43:40:0:0:43:40:1:0 chr2 166797646 . C T 441.0 PASS AF=0.445455;AO=49;DP=110;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.0149322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.351;QD=16.0365;RBI=0.0193548;REFB=-0.00990288;REVB=-0.012314;RO=61;SAF=23;SAR=26;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231966;STB=0.628982;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0152551;OID=.;OPOS=166797646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:61:61:49:49:0.445455:26:23:43:18:26:23:43:18 chr2 166810159 . C T 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00550964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.204;QD=12.0157;RBI=0.0165902;REFB=-0.0112758;REVB=-0.0156486;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215036;STB=0.631131;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.010321;OID=.;OPOS=166810159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:2:4:3:4:2:4:3:4 chr2 166810161 . G A 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0131437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.445;QD=10.173;RBI=0.0181584;REFB=-0.0447105;REVB=-0.0125289;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114905;STB=0.571184;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0145291;OID=.;OPOS=166810161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:5:4:2:4:5:4 chr2 166892788 . C T 1522.79 PASS AF=0.990385;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0697877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.3;QD=58.569;RBI=0.069788;REFB=-0.0696301;REVB=-0.000219622;RO=1;SAF=54;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087057;STB=0.504504;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00139507;OID=.;OPOS=166892788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:104:1:1:102:103:0.990385:48:54:1:0:48:55:1:0 chr2 166897864 . A G 2280.25 PASS AF=0.993103;AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00757601;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8105;QD=62.9034;RBI=0.028523;REFB=-0.0276194;REVB=0.0274985;RO=1;SAF=77;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704489;STB=0.503703;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000221293;OID=.;OPOS=166897864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:145:1:1:144:144:0.993103:67:77:0:1:67:77:0:1 chr2 166903445 . T C 2013.82 PASS AF=1;AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146566;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2468;QD=62.4442;RBI=0.0162932;REFB=0;REVB=-0.00711716;RO=0;SAF=72;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010625;OID=.;OPOS=166903445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:129:0:0:129:129:1:57:72:0:0:57:72:0:0 chr2 167055393 . T C 835.46 PASS AF=0.611111;AO=75;DP=126;FAO=77;FDP=126;FR=.;FRO=49;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0120344;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.122;QD=26.5227;RBI=0.0253311;REFB=-0.00537855;REVB=0.0222898;RO=51;SAF=34;SAR=41;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858454;STB=0.532459;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00429047;OID=.;OPOS=167055393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:51:49:75:77:0.611111:41:34:29:22:41:36:27:22 chr2 167094730 . G T 434.87 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00677012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.416;QD=20.9577;RBI=0.0117782;REFB=-0.005227;REVB=-0.00963805;RO=40;SAF=15;SAR=28;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201787;STB=0.611793;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00482328;OID=.;OPOS=167094730;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:28:15:23:17:28:15:23:17 chr2 167099158 . A G 1491.69 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.452;QD=63.476;RBI=0.0321919;REFB=0;REVB=0.013777;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0356e-05;OID=.;OPOS=167099158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:49:45:0:0:49:45:0:0 chr2 167144974 . A T 277.54 PASS AF=0.286765;AO=39;DP=134;FAO=39;FDP=136;FR=.;FRO=97;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=-0.0179976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7433;QD=8.163;RBI=0.0354004;REFB=-0.0320442;REVB=-0.030484;RO=94;SAF=20;SAR=19;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281947;STB=0.505467;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0746761;OID=.;OPOS=167144974;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:94:97:39:39:0.286765:19:20:46:48:19:20:49:48 chr2 167144995 . T C 461.62 PASS AF=0.378571;AO=53;DP=140;FAO=53;FDP=140;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=0.0146022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.749;QD=13.1892;RBI=0.0156507;REFB=-0.00982043;REVB=0.00563204;RO=87;SAF=28;SAR=25;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999307;STB=0.556669;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.017392;OID=.;OPOS=167144995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:87:87:53:53:0.378571:25:28:38:49:25:28:38:49 chr2 167145142 . A G 186.73 PASS AF=0.358209;AO=23;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0012802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.419;QD=11.148;RBI=0.0052368;REFB=-0.0127978;REVB=-0.00507791;RO=42;SAF=8;SAR=15;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399104;STB=0.527449;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.01706;OID=.;OPOS=167145142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:42:43:23:24:0.358209:15:8:16:26:16:8:16:27 chr2 167168093 . C T 587.36 PASS AF=0.472868;AO=61;DP=129;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.00421468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.916;QD=18.2126;RBI=0.0125012;REFB=-0.00772207;REVB=-0.0117693;RO=68;SAF=30;SAR=31;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217603;STB=0.512067;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0082535;OID=.;OPOS=167168093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:68:68:61:61:0.472868:31:30:35:33:31:30:35:33 chr2 167262088 . T G 246.32 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0174903;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.86;QD=15.6392;RBI=0.0276248;REFB=-0.00955216;REVB=0.0213826;RO=35;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291307;STB=0.664314;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0133525;OID=.;OPOS=167262088;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:10:18:12:23:10:18:12:23 chr2 167262353 . C G 636.33 PASS AF=0.538462;AO=63;DP=117;FAO=63;FDP=117;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.00414224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1871;QD=21.7548;RBI=0.0173111;REFB=-0.0231452;REVB=0.0168082;RO=53;SAF=17;SAR=46;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107109;STB=0.565491;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0229082;OID=.;OPOS=167262353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:53:54:63:63:0.538462:46:17:20:33:46:17:21:33 chr2 167266344 . G A 427.33 PASS AF=0.455446;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.00556451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.633;QD=16.9239;RBI=0.00781992;REFB=-0.000981836;REVB=-0.0054943;RO=55;SAF=15;SAR=31;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238334;STB=0.633437;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0016024;OID=.;OPOS=167266344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:55:55:46:46:0.455446:31:15:31:24:31:15:31:24 chr2 167279922 . C A 214.27 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.0350936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.723;QD=12.7923;RBI=0.0382707;REFB=-0.00848999;REVB=-0.0152672;RO=40;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127383;STB=0.561052;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0115281;OID=.;OPOS=167279922;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:16:10:11:29:16:10:12:29 chr2 167334085 . G T 561.68 PASS AF=0.408805;AO=64;DP=158;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=-0.00973917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.552;QD=14.1303;RBI=0.00981804;REFB=-0.00416721;REVB=0.00124196;RO=93;SAF=34;SAR=30;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038638;STB=0.519932;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00696411;OID=.;OPOS=167334085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:93:94:64:65:0.408805:30:34:46:47:31:34:46:48 chr2 168099738 . T C 525.38 PASS AF=0.671429;AO=47;DP=70;FAO=47;FDP=70;FR=.;FRO=23;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0576987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4206;QD=30.0215;RBI=0.0617843;REFB=0.000902947;REVB=0.0220944;RO=23;SAF=26;SAR=21;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341548;STB=0.518511;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.000358141;OID=.;OPOS=168099738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:23:23:47:47:0.671429:21:26:14:9:21:26:14:9 chr2 168100443 . C A 279.02 PASS AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.000914608;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=333.59;QD=27.2217;RBI=0.00310075;REFB=-0.0165573;REVB=-0.00296279;RO=16;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141244;STB=0.507806;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00998336;OID=.;OPOS=168100443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:13:12:8:8:13:12:8:8 chr2 168101142 . T G 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0167024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.317;QD=21.7465;RBI=0.0301124;REFB=-0.0152346;REVB=-0.0250557;RO=20;SAF=15;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165061;STB=0.592936;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0210051;OID=.;OPOS=168101142;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:7:15:10:10:7:15:10:10 chr2 168103701 . A G 113.11 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00407601;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.942;QD=15.0809;RBI=0.0144474;REFB=-0.0248147;REVB=-0.0138605;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884949;STB=0.505147;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0298564;OID=.;OPOS=168103701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:17:17:13:13:0.433333:7:6:8:9:7:6:8:9 chr2 168108357 . A G 95.97 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0527111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3148;QD=22.5815;RBI=0.0527239;REFB=0.0216089;REVB=0.00116097;RO=6;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204503;STB=0.511607;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.0160017;OID=.;OPOS=168108357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:7:4:2:4:7:4:2:4 chr2 168115325 . A G 271.32 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0123464;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.432;QD=14.4703;RBI=0.0128859;REFB=-0.00674361;REVB=-0.0036895;RO=44;SAF=10;SAR=21;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729434;STB=0.54152;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00768587;OID=.;OPOS=168115325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:21:10:17:27:21:10:17:27 chr2 168726659 . A C 644.17 PASS AF=0.438272;AO=71;DP=162;FAO=71;FDP=162;FR=.;FRO=91;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=56;FWDB=0.00305422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.808;QD=15.9055;RBI=0.011077;REFB=-0.00632318;REVB=0.0106477;RO=91;SAF=33;SAR=38;SRF=35;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818121;STB=0.545538;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00724324;OID=.;OPOS=168726659;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:91:91:71:71:0.438272:38:33:35:56:38:33:35:56 chr2 169629494 . G A 581.69 PASS AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0048949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.518;QD=20.5908;RBI=0.0101263;REFB=-0.00296673;REVB=-0.00886464;RO=53;SAF=22;SAR=37;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719613;STB=0.535882;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00278331;OID=.;OPOS=169629494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:53:54:59:59:0.522124:37:22:24:29:37:22:24:30 chr2 169668122 . G A 438.14 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00437016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.696;QD=19.0497;RBI=0.00498878;REFB=-0.00394577;REVB=0.00240616;RO=48;SAF=25;SAR=19;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838833;STB=0.546698;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00422315;OID=.;OPOS=169668122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:48:44:44:0.478261:19:25:23:25:19:25:23:25 chr2 169707428 . C T 1621.52 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5402;QD=60.0564;RBI=0.0278743;REFB=0;REVB=-0.0270325;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200999;OID=.;OPOS=169707428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0 chr2 169721377 . G A 575.77 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3836;QD=60.6075;RBI=0.0280929;REFB=0;REVB=0.0194153;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714544;OID=.;OPOS=169721377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr2 169764176 . G C 1545.7 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.969;QD=63.7402;RBI=0.00726424;REFB=0;REVB=0.00668039;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86308e-05;OID=.;OPOS=169764176;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:47:50:0:0:47:50:0:0 chr2 169764238 . CA C,GC 307.7 PASS AF=0.358491,0.132075;AO=32,11;DP=106;FAO=38,14;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=6,0;FSAR=32,14;FSRF=47;FSRR=7;FWDB=0.163772,0.00109848;FXX=0.0275204;HRUN=5,2;LEN=1,2;MLLD=11.1432,153.534;QD=11.6113;RBI=0.170455,0.0010985;REFB=-0.0902096,-0.0159416;REVB=-0.0472611,-5.99829e-06;RO=47;SAF=3,0;SAR=29,11;SRF=43;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.770889,-0.860845;STB=0.87858,0.999559;STBP=0,0;TYPE=del,mnp;VARB=0.195858,0.0674687;OID=.,.;OPOS=169764239,169764238;OREF=A,CA;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:47:54:32,11:38,14:0.358491,0.132075:29,11:3,0:43:4:32,14:6,0:47:7 chr2 169789016 . T C 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.855;QD=59.6789;RBI=0.0459413;REFB=0;REVB=0.0305672;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35659e-05;OID=.;OPOS=169789016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0 chr2 169826877 . C T 151.58 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0670062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9748;QD=12.9008;RBI=0.0715787;REFB=-0.020374;REVB=-0.0251729;RO=28;SAF=4;SAR=13;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378154;STB=0.723862;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0139428;OID=.;OPOS=169826877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:47:28:30:17:17:0.361702:13:4:16:12:13:4:17:13 chr2 169830328 . A G 463.47 PASS AF=0.535714;AO=44;DP=83;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0196324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9013;QD=22.0701;RBI=0.0230837;REFB=-0.0206908;REVB=0.0121418;RO=39;SAF=22;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03274;STB=0.512706;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0184747;OID=.;OPOS=169830328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:39:39:44:45:0.535714:22:22:18:21:23:22:18:21 chr2 169847412 . A G 352.18 PASS AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0394257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.317;QD=28.7491;RBI=0.0402361;REFB=-0.0511684;REVB=0.00803507;RO=19;SAF=15;SAR=15;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01854;STB=0.510197;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0325788;OID=.;OPOS=169847412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:19:19:30:30:0.612245:15:15:9:10:15:15:9:10 chr2 169870855 . A G 195.19 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0213312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.333;QD=14.196;RBI=0.0239245;REFB=-0.0100739;REVB=0.0108334;RO=32;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18061;STB=0.602739;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0102245;OID=.;OPOS=169870855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:11:12:11:21:11:12:11:21 chr2 169952166 . T C 429.82 PASS AF=0.456311;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=103;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=0.0124881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.93;QD=16.6919;RBI=0.0153632;REFB=-0.00903073;REVB=-0.00894853;RO=54;SAF=31;SAR=16;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341794;STB=0.689367;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0163371;OID=.;OPOS=169952166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:56:47:47:0.456311:16:31:16:38:16:31:17:39 chr2 169952233 . T C 415.22 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00158742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.997;QD=19.3126;RBI=0.00165245;REFB=0.000684561;REVB=-0.000458988;RO=44;SAF=16;SAR=26;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153698;STB=0.585544;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.000440384;OID=.;OPOS=169952233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:26:16:24:20:26:16:24:20 chr2 170053505 . C T 601.57 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0551641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.893;QD=58.6901;RBI=0.0554616;REFB=-0.110162;REVB=-0.00573686;RO=1;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267872;STB=0.514279;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00133851;OID=.;OPOS=170053505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:17:23:0:1:17:23:0:1 chr2 170070172 . C T 552.14 PASS AF=0.56044;AO=50;DP=90;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0213601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.969;QD=24.2699;RBI=0.0550686;REFB=-0.0247508;REVB=0.0507572;RO=40;SAF=23;SAR=27;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527076;STB=0.532629;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0169074;OID=.;OPOS=170070172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:40:40:50:51:0.56044:27:23:21:19:28:23:21:19 chr2 170088351 . G A 322.98 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0371551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.074;QD=21.8968;RBI=0.0400573;REFB=-0.0311398;REVB=-0.0149694;RO=24;SAF=13;SAR=20;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490811;STB=0.522245;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0213938;OID=.;OPOS=170088351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:24:26:33:33:0.559322:20:13:8:16:20:13:9:17 chr2 170092395 . A G 552.65 PASS AF=0.487805;AO=58;DP=123;FAO=60;FDP=123;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.0257294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5707;QD=17.9725;RBI=0.0404327;REFB=-0.0196387;REVB=0.0311897;RO=64;SAF=26;SAR=32;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491425;STB=0.504895;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0481968;OID=.;OPOS=170092395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:63:58:60:0.487805:32:26:32:32:32:28:30:33 chr2 170099473 . T C 168.77 PASS AF=0.338462;AO=21;DP=64;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0261295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.983;QD=10.3859;RBI=0.0564061;REFB=0.0145707;REVB=0.049989;RO=43;SAF=13;SAR=8;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393802;STB=0.541813;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.0254907;OID=.;OPOS=170099473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:43:43:21:22:0.338462:8:13:28:15:9:13:28:15 chr2 170103336 . T C 692.8 PASS AF=0.48;AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=150;FR=.;FRO=78;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.010192;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.039;QD=18.4747;RBI=0.0131268;REFB=-0.00544897;REVB=0.00827259;RO=79;SAF=41;SAR=31;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154796;STB=0.588926;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00619814;OID=.;OPOS=170103336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:79:78:72:72:0.48:31:41:32:47:31:41:31:47 chr2 170103351 . G T 721.85 PASS AF=0.477987;AO=75;DP=158;FAO=76;FDP=159;FR=.;FRO=83;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=-0.0207492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4809;QD=18.1598;RBI=0.0317315;REFB=-0.0106142;REVB=0.0240075;RO=83;SAF=42;SAR=33;SRF=33;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153384;STB=0.580433;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0109844;OID=.;OPOS=170103351;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:83:83:75:76:0.477987:33:42:33:50:34:42:33:50 chr2 170115588 . T C 380.72 PASS AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00444843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.701;QD=16.9208;RBI=0.00937696;REFB=0.00618644;REVB=-0.00825463;RO=50;SAF=16;SAR=24;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139713;STB=0.578436;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.00834818;OID=.;OPOS=170115588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:50:40:40:0.444444:24:16:27:23:24:16:27:23 chr2 170129528 . G A 1438.13 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00070582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1968;QD=61.8549;RBI=0.0435828;REFB=0.0383486;REVB=-0.0435771;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.504853;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00193419;OID=.;OPOS=170129528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:51:41:0:0:51:41:0:1 chr2 170175334 . T C 365.21 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.00532647;FXX=0.0198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.403;QD=14.7558;RBI=0.00540874;REFB=-0.00152486;REVB=0.000939773;RO=56;SAF=22;SAR=19;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919213;STB=0.549876;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0014999;OID=.;OPOS=170175334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:56:58:41:41:0.414141:19:22:35:21:19:22:36:22 chr2 170177382 . G A 266.16 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0567069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.346;QD=21.293;RBI=0.0585032;REFB=-0.0155913;REVB=-0.0143857;RO=25;SAF=7;SAR=18;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161619;STB=0.591164;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0139828;OID=.;OPOS=170177382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:18:7:11:14:18:7:11:14 chr2 170218847 . C G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.496;QD=53.2772;RBI=0.0489088;REFB=0;REVB=0.01663;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191839;OID=.;OPOS=170218847;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr2 170403030 . T C 341.76 PASS AF=0.48;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0331823;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.339;QD=18.227;RBI=0.0333327;REFB=-0.0158876;REVB=0.0031628;RO=39;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426014;STB=0.523796;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0239365;OID=.;OPOS=170403030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:39:39:36:36:0.48:21:15:18:21:21:15:18:21 chr2 170411693 . T C 508.42 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00714094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.532;QD=56.4909;RBI=0.0076695;REFB=-0.115208;REVB=-0.00279788;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.518508;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000748774;OID=.;OPOS=170411693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:0:1:35:35:0.972222:22:13:0:0:22:13:1:0 chr2 170411698 . C G 149.43 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0161423;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.657;QD=17.0775;RBI=0.0338332;REFB=-0.0155899;REVB=0.029734;RO=18;SAF=3;SAR=13;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435129;STB=0.742524;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0283258;OID=.;OPOS=170411698;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:18:19:16:16:0.457143:13:3:11:7:13:3:11:8 chr2 170417031 . T C 409.12 PASS AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0131061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.488;QD=17.9835;RBI=0.0131085;REFB=-0.0144538;REVB=0.000254687;RO=49;SAF=21;SAR=21;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688608;STB=0.538443;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0145884;OID=.;OPOS=170417031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:49:49:42:42:0.461538:21:21:28:21:21:21:28:21 chr2 170493103 . T A 296.74 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00352656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.712;QD=15.6177;RBI=0.00738042;REFB=-0.017015;REVB=0.00648336;RO=43;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732871;STB=0.541402;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.012557;OID=.;OPOS=170493103;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:20:13:20:23:20:13:20:23 chr2 170510651 . C T 220.87 PASS AF=0.448276;AO=22;DP=54;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0113974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.143;QD=15.2326;RBI=0.0189672;REFB=-0.0106426;REVB=0.015161;RO=32;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467638;STB=0.560782;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0128633;OID=.;OPOS=170510651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:58:32:32:22:26:0.448276:14:8:13:19:18:8:13:19 chr2 170550839 . A G 316.88 PASS AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0137373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.987;QD=15.2711;RBI=0.0189505;REFB=-0.00999281;REVB=-0.013054;RO=48;SAF=20;SAR=15;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124574;STB=0.507038;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0134336;OID=.;OPOS=170550839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:48:35:35:0.421687:15:20:28:20:15:20:28:20 chr2 170605981 . C T 1463.4 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0302356;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9016;QD=62.2723;RBI=0.0312773;REFB=0.0553854;REVB=0.00800487;RO=1;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104194;STB=0.505493;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.000979419;OID=.;OPOS=170605981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:94:1:1:93:93:0.989362:45:48:0:1:45:48:0:1 chr2 170672022 . G A 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00771568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.959;QD=15.1566;RBI=0.0228523;REFB=-0.0112695;REVB=-0.0215103;RO=32;SAF=15;SAR=10;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22048;STB=0.624901;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0152419;OID=.;OPOS=170672022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:10:15:12:20:10:15:12:20 chr2 170672843 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2609;QD=51.9157;RBI=0.0233044;REFB=0;REVB=-0.0172868;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.37911e-05;OID=.;OPOS=170672843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr2 170762566 . A T 484.33 PASS AF=0.51087;AO=48;DP=93;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0560454;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.791;QD=21.0576;RBI=0.0658565;REFB=-0.00922444;REVB=-0.0345831;RO=45;SAF=30;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636555;STB=0.542769;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0110938;OID=.;OPOS=170762566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:45:45:48:47:0.51087:18:30:25:20:17:30:25:20 chr2 170885930 . C A 177.51 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0495121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.602;QD=14.4903;RBI=0.053182;REFB=-0.00718396;REVB=-0.0194135;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428847;STB=0.524812;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0167459;OID=.;OPOS=170885930;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:9:10:17:13:9:10:17:13 chr2 170917648 . A G 156.92 PASS AF=0.36;AO=17;DP=49;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0609717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.51;QD=12.5533;RBI=0.0674269;REFB=-0.0167755;REVB=0.0287895;RO=30;SAF=5;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202589;STB=0.591445;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0445635;OID=.;OPOS=170917648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:30:32:17:18:0.36:12:5:14:16:12:6:15:17 chr2 170938659 . G A 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0272141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.054;QD=11.634;RBI=0.0615683;REFB=-0.0283057;REVB=-0.0552273;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644098;STB=0.538385;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0528033;OID=.;OPOS=170938659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:9:7:5:5:9:7 chr2 170976590 . A G,T 731.56 PASS AF=0.957447,0.0425532;AO=45,2;DP=47;FAO=45,2;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132868,-0.000386864;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.56,100.831;QD=62.2601;RBI=0.0310812,0.0132093;REFB=0,0;REVB=0.0280981,-0.0132037;RO=0;SAF=21,2;SAR=24,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000183928,0.114573;OID=.,.;OPOS=170976590,170976590;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:47:47:0:0:45,2:45,2:0.957447,0.0425532:24,0:21,2:0:0:24,0:21,2:0:0 chr2 171070912 . T C 509.97 PASS AF=0.458333;AO=54;DP=120;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.0210149;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.691;QD=16.9991;RBI=0.0218243;REFB=-0.0129946;REVB=0.00588823;RO=64;SAF=27;SAR=27;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152542;STB=0.574442;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0155668;OID=.;OPOS=171070912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:64:65:54:55:0.458333:27:27:22:42:28:27:23:42 chr2 171073887 . G A 280.17 PASS AF=0.290076;AO=38;DP=131;FAO=38;FDP=131;FR=.;FRO=93;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=60;FSRR=33;FWDB=-0.00460524;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.683;QD=8.55485;RBI=0.00739401;REFB=-0.000983083;REVB=-0.00578474;RO=92;SAF=19;SAR=19;SRF=59;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170959;STB=0.603002;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00188287;OID=.;OPOS=171073887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:92:93:38:38:0.290076:19:19:59:33:19:19:60:33 chr2 171260787 . G A 102.68 PASS AF=0.258621;AO=15;DP=58;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0246822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.935;QD=7.08118;RBI=0.0382433;REFB=-0.00584404;REVB=-0.0292119;RO=43;SAF=12;SAR=3;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309817;STB=0.693928;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0141616;OID=.;OPOS=171260787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:43:43:15:15:0.258621:3:12:25:18:3:12:25:18 chr2 171260820 . T C 152.87 PASS AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00664498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3995;QD=10.364;RBI=0.0365835;REFB=0.00638906;REVB=0.0359749;RO=39;SAF=16;SAR=4;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316024;STB=0.688316;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0113096;OID=.;OPOS=171260820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:4:16:22:17:4:16:22:17 chr2 171355198 . A G 552.78 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.542;QD=58.1869;RBI=0.0563639;REFB=-0.0512132;REVB=-0.000296659;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000499796;OID=.;OPOS=171355198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:38:38:0:0:37:38:1:25:12:0:0:25:13:0:0 chr2 171356274 . G A 2127.27 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.948;QD=61.66;RBI=0.0719097;REFB=0;REVB=0.066695;RO=0;SAF=52;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000600847;OID=.;OPOS=171356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:123:138:0:0:123:138:1:71:52:0:0:84:54:0:0 chr2 171570151 . C T 238.22 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0343595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2933;QD=16.1507;RBI=0.0369119;REFB=-0.0530846;REVB=-0.0134876;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738495;STB=0.550982;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0480688;OID=.;OPOS=171570151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:32:27:27:0.457627:11:16:16:15:11:16:16:16 chr2 171570488 . C G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.438;QD=37.4885;RBI=0.044057;REFB=0;REVB=0.0338889;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316559;OID=.;OPOS=171570488;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr2 171572940 . G A 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00681364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.043;QD=8.81099;RBI=0.00728193;REFB=-0.00203372;REVB=0.00256923;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308307;STB=0.691681;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0127843;OID=.;OPOS=171572940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:4:2:7:4:4:2:7:4 chr2 171649402 . C T 425.23 PASS AF=0.531646;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0189208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.752;QD=21.5308;RBI=0.0237189;REFB=-0.0275483;REVB=-0.0143036;RO=35;SAF=16;SAR=26;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653782;STB=0.52524;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0135435;OID=.;OPOS=171649402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:35:37:42:42:0.531646:26:16:16:19:26:16:16:21 chr2 171678625 . T C 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0134361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.607;QD=7.76212;RBI=0.0413315;REFB=0.00360981;REVB=-0.0390867;RO=13;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375164;STB=0.74376;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.0399999;OID=.;OPOS=171678625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:1:5:7:6:1:5:7:6 chr2 171822466 . C T 405.66 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0333104;FXX=0.0624805;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.009;QD=54.0884;RBI=0.0413576;REFB=-0.046741;REVB=0.0245126;RO=1;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190217;STB=0.510197;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.000239405;OID=.;OPOS=171822466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:32:30:1:1:29:29:0.966667:24:5:0:1:24:5:0:1 chr2 171854232 . TA T 45.75 PASS AF=0.289474;AO=10;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.0671194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.8759;QD=4.81627;RBI=0.146902;REFB=0.00713437;REVB=-0.130672;RO=25;SAF=2;SAR=8;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.622819;STB=0.884687;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=-0.0118765;OID=.;OPOS=171854233;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.289474:10:38:11:38:27:2:9:22:5:45:25:2:8:20:5 chr2 171910337 . T C 166.4 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00578372;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5632;QD=14.1616;RBI=0.0421624;REFB=0.00178232;REVB=0.0417638;RO=30;SAF=12;SAR=6;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409627;STB=0.516111;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00149873;OID=.;OPOS=171910337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:30:29:18:18:0.382979:6:12:21:9:6:12:20:9 chr2 171916495 . C A 441.12 PASS AF=0.65625;AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=64;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0715625;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7491;QD=27.5699;RBI=0.0716692;REFB=-0.0205255;REVB=-0.00390912;RO=22;SAF=23;SAR=19;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144184;STB=0.578365;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0145787;OID=.;OPOS=171916495;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:22:22:42:42:0.65625:19:23:7:15:19:23:7:15 chr2 172174150 . AA GC 411.9 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265273;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=160.206;QD=56.8135;RBI=0.0549062;REFB=0;REVB=0.0480727;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000442137;OID=.;OPOS=172174150;OREF=AA;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:27:29:1:18:9:0:0:20:9:0:0 chr2 172180771 . A G 1749.43 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.595;QD=60.8496;RBI=0.028773;REFB=0;REVB=0.027571;RO=0;SAF=65;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16468e-05;OID=.;OPOS=172180771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:50:65:0:0:50:65:0:0 chr2 172291616 . C T 189.46 PASS AF=0.301205;AO=25;DP=84;FAO=25;FDP=83;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0178372;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.904;QD=9.13073;RBI=0.0256885;REFB=-0.00168628;REVB=-0.018486;RO=59;SAF=13;SAR=12;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113912;STB=0.561911;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00385802;OID=.;OPOS=172291616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:59:58:25:25:0.301205:12:13:25:34:12:13:25:33 chr2 172329458 . G T 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0360791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.298;QD=13.0148;RBI=0.0914935;REFB=-0.0117618;REVB=-0.0840794;RO=32;SAF=10;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998132;STB=0.557635;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0130939;OID=.;OPOS=172329458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:10:10:19:13:10:10:19:13 chr2 172330393 . A G 258.35 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00864355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0994;QD=16.4031;RBI=0.0267907;REFB=0.0115845;REVB=0.025358;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13356;STB=0.575112;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.0125314;OID=.;OPOS=172330393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:16:13:20:14:16:13:20:14 chr2 172378818 . A G 77.52 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0587165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9618;QD=17.2271;RBI=0.0593981;REFB=-0.0142332;REVB=0.00897234;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240747;STB=0.642515;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0176294;OID=.;OPOS=172378818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:1:9:6:2:1:9:6:2 chr2 172379781 . G A 195.2 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.013317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.546;QD=14.1962;RBI=0.0147422;REFB=-0.00783615;REVB=-0.00632373;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152109;STB=0.593004;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0129654;OID=.;OPOS=172379781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:32:23:23:0.418182:13:10:9:22:13:10:9:23 chr2 172411273 . G A 257.65 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0435408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6424;QD=23.4226;RBI=0.0680444;REFB=-0.0212709;REVB=-0.05229;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407239;STB=0.522708;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0246627;OID=.;OPOS=172411273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:12:12:9:11:12:12:9:11 chr2 172693780 . G A 149.64 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0158233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4551;QD=11.9713;RBI=0.0173302;REFB=-0.0057311;REVB=0.0070681;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116318;STB=0.568639;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0122371;OID=.;OPOS=172693780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:10:7:17:16:10:7:17:16 chr2 172709215 . G C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0770637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.113;QD=53.911;RBI=0.077137;REFB=0;REVB=0.00336306;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016293;OID=.;OPOS=172709215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0 chr2 172725301 . A G 851.02 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7405;QD=57.6962;RBI=0.0196691;REFB=0;REVB=-0.00747157;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.31102e-05;OID=.;OPOS=172725301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:36:23:0:0:36:23:0:0 chr2 172841178 . GGAAAAA GAAAA,GGAAAAG,GGAAAA 117.06 PASS AF=0.125,0,0.75;AO=6,2,8;DP=28;FAO=3,0,18;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=2,0,10;FSAR=1,0,8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0952646,-0.0534214,0.0358581;FXX=0.11107;HRUN=3,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=15.1046,152.688,9.50747;QD=19.5104;RBI=0.0953849,0.0547023,0.204382;REFB=-0.0630288,0.00262035,-0.167404;REVB=0.00478889,-0.011768,0.201212;RO=9;SAF=1,2,6;SAR=5,0,2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0887268,0.694553,0.458547;STB=0.5,0.5,0.516111;STBP=1,1,0.798;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0686469,0,0.188667;OID=.,.,.;OPOS=172841179,172841184,172841180;OREF=GA,A,A;OALT=-,G,-;OMAPALT=GAAAA,GGAAAAG,GGAAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:0.125,0,0.75:6,2,8:28:3,0,18:24:3:2,0,10:1,0,8:2:1:13:9:1,2,6:5,0,2:2:7 chr2 172964638 . C A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00577639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.888;QD=55.0987;RBI=0.0083963;REFB=0;REVB=0.00609354;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50576e-07;OID=.;OPOS=172964638;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr2 172967128 . G GGCT 30.51 PASS AF=0.333333;AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0401389;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=3;MLLD=187.825;QD=8.1366;RBI=0.0497527;REFB=-0.0562243;REVB=-0.0293974;RO=16;SAF=4;SAR=1;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306506;STB=0.726281;STBP=0.279;TYPE=ins;VARB=0.0905743;OID=.;OPOS=172967129;OREF=-;OALT=GCT;OMAPALT=GGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:5:21:5:15:10:4:1:5:5:30:16:4:1:9:7 chr2 173352103 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.035;QD=55.6558;RBI=0.0268617;REFB=0;REVB=0.0125345;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.12263e-05;OID=.;OPOS=173352103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0 chr2 173686663 . G T 590.78 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136983;FXX=0.0952154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.721;QD=62.1872;RBI=0.014731;REFB=0;REVB=0.00541846;RO=0;SAF=33;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042927;OID=.;OPOS=173686663;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:39:38:0:0:38:38:1:5:33:0:0:5:33:0:0 chr2 173917425 . G A 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.234;QD=60.716;RBI=0.0261526;REFB=0;REVB=-0.0240181;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04665e-05;OID=.;OPOS=173917425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:44:32:0:0:44:32:0:0 chr2 174068513 . G C 1415.3 PASS AF=1;AO=88;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.391;QD=62.9023;RBI=0.015886;REFB=0;REVB=-0.00697622;RO=0;SAF=42;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12553e-05;OID=.;OPOS=174068513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:88:90:1:46:42:0:0:46:44:0:0 chr2 174091088 . T C 399.25 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.000278403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.36;QD=15.3557;RBI=0.00758947;REFB=0.0044564;REVB=0.00758436;RO=58;SAF=18;SAR=27;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143695;STB=0.503998;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=-0.00623978;OID=.;OPOS=174091088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:59:45:45:0.432692:27:18:24:34:27:18:24:35 chr2 174091200 . A G 897.44 PASS AF=0.469072;AO=91;DP=194;FAO=91;FDP=194;FR=.;FRO=103;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=0.018707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3627;QD=18.5039;RBI=0.04057;REFB=0.0222582;REVB=-0.0359996;RO=103;SAF=40;SAR=51;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723534;STB=0.540012;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.0261922;OID=.;OPOS=174091200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:103:103:91:91:0.469072:51:40:53:50:51:40:53:50 chr2 174097106 . A G 452.12 PASS AF=0.571429;AO=43;DP=76;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00488168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.36;QD=23.4865;RBI=0.00795893;REFB=-0.00489524;REVB=-0.006286;RO=32;SAF=22;SAR=21;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639965;STB=0.522811;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00361041;OID=.;OPOS=174097106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:32:33:43:44:0.571429:21:22:19:13:21:23:19:14 chr2 174103160 . T C 314.84 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0177819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1139;QD=19.9901;RBI=0.019407;REFB=-0.0147829;REVB=-0.00777399;RO=30;SAF=11;SAR=22;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092874;STB=0.551692;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0359184;OID=.;OPOS=174103160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:22:11:13:17:22:11:13:17 chr2 174232845 . T C 785.12 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5749;QD=57.0992;RBI=0.0252775;REFB=0;REVB=-0.00660516;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153526;OID=.;OPOS=174232845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr2 174939984 . G A 64.34 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00798888;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=150.344;QD=9.89892;RBI=0.0132945;REFB=-0.0125177;REVB=0.0106264;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666296;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00447161;OID=.;OPOS=174939984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:0:17:9:9:0.346154:3:6:0:0:3:6:7:10 chr2 175201299 . C G 462.16 PASS AF=0.353293;AO=55;DP=163;FAO=59;FDP=167;FR=.;FRO=108;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=52;FSRR=56;FWDB=0.0029468;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.104;QD=11.0697;RBI=0.0116186;REFB=-0.0222482;REVB=0.0112387;RO=108;SAF=33;SAR=22;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137682;STB=0.561561;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0353428;OID=.;OPOS=175201299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:167:108:108:55:59:0.353293:22:33:52:56:25:34:52:56 chr2 175424779 . T G 420.73 PASS AF=0.911765;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=34;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0130393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.901;QD=49.4974;RBI=0.013634;REFB=0.0205861;REVB=-0.00398267;RO=3;SAF=15;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030003;STB=0.516119;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.00142469;OID=.;OPOS=175424779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:34:34:3:3:31:31:0.911765:16:15:2:1:16:15:2:1 chr2 175425476 . G A 783.65 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0094401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.672;QD=56.9927;RBI=0.0216254;REFB=0;REVB=0.0194562;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32256e-05;OID=.;OPOS=175425476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:31:23:0:0:31:24:0:0 chr2 175426274 . C G 1431.36 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148156;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3895;QD=62.917;RBI=0.0342493;REFB=0;REVB=0.030879;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235141;OID=.;OPOS=175426274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:50:40:0:0:50:41:0:0 chr2 175436940 . G A 643.45 PASS AF=0.961538;AO=48;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0254058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.877;QD=49.4961;RBI=0.0616918;REFB=-0.0669215;REVB=0.0562176;RO=2;SAF=28;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324231;STB=0.517235;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0021876;OID=.;OPOS=175436940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:52:52:2:2:48:50:0.961538:20:28:2:0:22:28:2:0 chr2 176866967 . C T 99.6 PASS AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0670145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.478;QD=14.7553;RBI=0.109498;REFB=-0.0195518;REVB=0.0865962;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121912;STB=0.592443;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0241419;OID=.;OPOS=176866967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:27:15:15:11:12:0.444444:6:5:5:10:6:6:5:10 chr2 176984194 . A T 364.03 PASS AF=0.673469;AO=23;DP=42;FAO=33;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0547102;FXX=0.0754575;HRUN=5;LEN=1;MLLD=65.9677;QD=29.7165;RBI=0.100532;REFB=-0.00389835;REVB=-0.084342;RO=7;SAF=1;SAR=22;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.556072;STB=0.755889;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0544898;OID=.;OPOS=176984194;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:42:49:7:9:23:33:0.673469:22:1:4:3:31:2:5:4 chr2 177036754 . T C 46.33 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0430316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.5296;QD=9.7543;RBI=0.0759167;REFB=-0.0541043;REVB=-0.0625431;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270468;STB=0.644727;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0688144;OID=.;OPOS=177036754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:19:11:12:7:7:0.368421:2:5:5:6:2:5:6:6 chr2 177193087 . G A 4037.88 PASS AF=1;AO=259;DP=259;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6857;QD=62.3611;RBI=0.0286942;REFB=0;REVB=-0.00535158;RO=0;SAF=123;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.07379e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90198e-05;OID=.;OPOS=177193087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:259:259:0:0:259:259:1:136:123:0:0:136:123:0:0 chr2 178085137 . G A 274.52 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.000562373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.161;QD=19.9652;RBI=0.00175955;REFB=0.000590632;REVB=-0.00166726;RO=25;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181924;STB=0.521724;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.000430448;OID=.;OPOS=178085137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:25:26:29:29:0.527273:11:18:15:10:11:18:15:11 chr2 178417142 . C T 1498.4 PASS AF=1;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192524;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1425;QD=59.9359;RBI=0.0196425;REFB=0;REVB=0.00389565;RO=0;SAF=43;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06311e-05;OID=.;OPOS=178417142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:100:0:0:100:100:1:57:43:0:0:57:43:0:0 chr2 178417225 . C T 1094.05 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0767891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.346;QD=59.9481;RBI=0.0774552;REFB=0;REVB=0.0101364;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285129;OID=.;OPOS=178417225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:37:35:0:0:37:36:0:0 chr2 178481818 . G T 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.015;QD=62.7621;RBI=0.0232433;REFB=0;REVB=0.0202783;RO=0;SAF=49;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97527e-06;OID=.;OPOS=178481818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:40:49:0:0:40:49:0:0 chr2 178482094 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00270198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.707;QD=45.8068;RBI=0.00431338;REFB=0;REVB=-0.00336223;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93094e-06;OID=.;OPOS=178482094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr2 178482596 . T G 580.84 PASS AF=0.531532;AO=47;DP=111;FAO=59;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.00466751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.505;QD=20.9312;RBI=0.0172699;REFB=-0.0224566;REVB=0.0166272;RO=52;SAF=23;SAR=24;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100704;STB=0.588835;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0181699;OID=.;OPOS=178482596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:52:52:47:59:0.531532:24:23:31:21:35:24:31:21 chr2 178483621 . G A 540.83 PASS AF=0.471074;AO=57;DP=121;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0618772;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4013;QD=17.8788;RBI=0.0855047;REFB=-0.00553053;REVB=0.0590108;RO=61;SAF=30;SAR=27;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322201;STB=0.530424;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00468269;OID=.;OPOS=178483621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:61:64:57:57:0.471074:27:30:30:31:27:30:30:34 chr2 178491217 . G A 1415.41 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.164;QD=62.9072;RBI=0.0209136;REFB=0;REVB=0.0200254;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93863e-05;OID=.;OPOS=178491217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:48:42:0:0:48:42:0:0 chr2 178493301 . G T 167.44 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00183765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.281;QD=23.0947;RBI=0.00720474;REFB=-0.0165576;REVB=-0.00696645;RO=12;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113857;STB=0.564025;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0106282;OID=.;OPOS=178493301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:11:6:6:6:11:6:6:6 chr2 178494173 . G GGGA 957.21 PASS AF=0.492308;AO=92;DP=200;FAO=96;FDP=195;FR=.;FRO=99;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=35;FSRR=64;FWDB=0.0119785;FXX=0.0101518;HRUN=4;LEN=3;MLLD=305.573;QD=19.6351;RBI=0.013883;REFB=-0.01582;REVB=-0.00701801;RO=104;SAF=47;SAR=45;SRF=37;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148729;STB=0.569286;STBP=0.066;TYPE=ins;VARB=0.0175591;OID=.;OPOS=178494174;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.492308:92:200:96:195:99:47:49:35:64:99:104:47:45:37:67 chr2 178562138 . A T 564.57 PASS AF=0.55914;AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0273595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2664;QD=24.2827;RBI=0.0310066;REFB=-0.0175863;REVB=0.0145899;RO=41;SAF=28;SAR=24;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060372;STB=0.5331;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0175507;OID=.;OPOS=178562138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:41:41:52:52:0.55914:24:28:19:22:24:28:19:22 chr2 178682603 . T C 266.28 PASS AF=0.333333;AO=31;DP=94;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.013504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.063;QD=11.0952;RBI=0.0198264;REFB=-0.00741922;REVB=-0.0145164;RO=63;SAF=9;SAR=22;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211443;STB=0.600775;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0162018;OID=.;OPOS=178682603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:63:64:31:32:0.333333:22:9:29:34:22:10:29:35 chr2 178682655 . A G 294.86 PASS AF=0.369565;AO=34;DP=92;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.00284917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.336;QD=12.8198;RBI=0.00609777;REFB=0.00282601;REVB=0.0053912;RO=57;SAF=12;SAR=22;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118276;STB=0.563304;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.00416107;OID=.;OPOS=178682655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:57:58:34:34:0.369565:22:12:26:31:22:12:26:32 chr2 178936373 . T G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.846;QD=63.872;RBI=0.0304507;REFB=0;REVB=0.0239586;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38475e-05;OID=.;OPOS=178936373;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0 chr2 178936614 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.598;QD=53.2772;RBI=0.0257726;REFB=0;REVB=0.00736551;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132296;OID=.;OPOS=178936614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0 chr2 179203797 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.271;QD=64.4152;RBI=0.0372766;REFB=0;REVB=-0.0209936;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.198e-05;OID=.;OPOS=179203797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0 chr2 179358665 . A G 1495.48 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0265234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.027;QD=62.3115;RBI=0.0415027;REFB=-0.104793;REVB=0.0319216;RO=1;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839311;STB=0.504424;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00113159;OID=.;OPOS=179358665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:56:39:0:1:56:39:0:1 chr2 179367086 . A G 688.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9724;QD=62.5804;RBI=0.0755671;REFB=0;REVB=-0.0492382;RO=0;SAF=38;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00160175;OID=.;OPOS=179367086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:6:38:0:0:6:38:0:0 chr2 179395958 . T C 1135.65 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.864;QD=60.568;RBI=0.0420887;REFB=0;REVB=0.0392246;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70135e-05;OID=.;OPOS=179395958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:30:43:0:0:31:44:0:0 chr2 179396354 . G A 791.47 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0221776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6991;QD=53.6592;RBI=0.0431964;REFB=0.0869629;REVB=-0.0370686;RO=2;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304049;STB=0.516123;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.00367706;OID=.;OPOS=179396354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:30:27:0:2:30:27:0:2 chr2 179397561 . C T 2350.33 PASS AF=0.99359;AO=154;DP=156;FAO=155;FDP=156;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0248596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.11;QD=60.265;RBI=0.0363303;REFB=-0.0883903;REVB=0.0264932;RO=2;SAF=73;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000635161;STB=0.503067;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=3.49644e-05;OID=.;OPOS=179397561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:156:156:2:1:154:155:0.99359:81:73:1:1:81:74:0:1 chr2 179398823 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.588;QD=51.184;RBI=0.0427817;REFB=0;REVB=-0.0420065;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248157;OID=.;OPOS=179398823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr2 179406191 . C T 2216.83 PASS AF=1;AO=139;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.104;QD=63.338;RBI=0.0142626;REFB=0;REVB=0.012621;RO=0;SAF=76;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39859e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16056e-05;OID=.;OPOS=179406191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:139:140:1:63:76:0:0:64:76:0:0 chr2 179413110 . G A 772.26 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00102347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.193;QD=63.0418;RBI=0.00102824;REFB=0;REVB=-9.89491e-05;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.57126e-05;OID=.;OPOS=179413110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:21:27:0:0:21:28:0:0 chr2 179421694 . A G 1476.3 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0367136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1385;QD=62.1601;RBI=0.0410499;REFB=-0.12763;REVB=-0.0183631;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000978736;OID=.;OPOS=179421694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:0:1:94:94:0.989474:45:49:0:0:45:49:1:0 chr2 179427186 . A G 1767.56 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5492;QD=60.9504;RBI=0.0297295;REFB=0;REVB=0.0149851;RO=0;SAF=66;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18089e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114807;OID=.;OPOS=179427186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:50:66:0:0:50:66:0:0 chr2 179427536 . T C 1666.25 PASS AF=0.974138;AO=111;DP=114;FAO=113;FDP=116;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0176073;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.853;QD=57.4567;RBI=0.0659147;REFB=-0.20641;REVB=0.0635195;RO=2;SAF=48;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148319;STB=0.511448;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.000654784;OID=.;OPOS=179427536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:114:116:2:3:111:113:0.974138:63:48:0:2:64:49:0:3 chr2 179430997 . G A 1533.36 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169641;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.548;QD=63.8898;RBI=0.0169747;REFB=0;REVB=0.000598996;RO=0;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63234e-05;OID=.;OPOS=179430997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:54:42:0:0:54:42:0:0 chr2 179436020 . G A 1549.27 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.003;QD=63.8873;RBI=0.0283889;REFB=0;REVB=0.0268396;RO=0;SAF=49;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60483e-05;OID=.;OPOS=179436020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:48:49:0:0:48:49:0:0 chr2 179444768 . C G 2370.42 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.891;QD=64.0654;RBI=0.0191584;REFB=0;REVB=0.0117783;RO=0;SAF=78;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00515e-05;OID=.;OPOS=179444768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:70:78:0:0:70:78:0:0 chr2 179444939 . C T 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3471;QD=51.1827;RBI=0.0513385;REFB=0;REVB=-0.049343;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00113232;OID=.;OPOS=179444939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr2 179447848 . T C 2383.02 PASS AF=0.993671;AO=157;DP=158;FAO=157;FDP=158;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0408769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.876;QD=60.3295;RBI=0.0408823;REFB=-0.10232;REVB=0.000662083;RO=0;SAF=78;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503184;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.000182996;OID=.;OPOS=179447848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:158:158:0:1:157:157:0.993671:79:78:0:0:79:78:1:0 chr2 179451420 . G A 2903.57 PASS AF=1;AO=183;DP=183;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00208488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.259;QD=63.1211;RBI=0.0273109;REFB=0;REVB=-0.0272312;RO=0;SAF=88;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.38724e-05;OID=.;OPOS=179451420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:183:184:0:0:183:184:1:95:88:0:0:95:89:0:0 chr2 179454394 . A G 1135.25 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00321262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.788;QD=60.5469;RBI=0.0260596;REFB=0;REVB=0.0258608;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29684e-05;OID=.;OPOS=179454394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chr2 179455207 . T C 2612.67 PASS AF=0.982759;AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=174;FR=.;FRO=3;FSAF=105;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0285014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.108;QD=60.0613;RBI=0.0648355;REFB=-0.051762;REVB=0.0582349;RO=1;SAF=105;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451172;STB=0.505093;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000489641;OID=.;OPOS=179455207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:172:174:1:3:171:171:0.982759:66:105:1:0:66:105:1:2 chr2 179457147 . G A 695.8 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0117969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7801;QD=60.5045;RBI=0.0173712;REFB=0.0756988;REVB=-0.0127512;RO=1;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347745;STB=0.51851;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.00118033;OID=.;OPOS=179457147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:13:32:0:1:13:32:0:1 chr2 179458591 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.85;QD=56.7061;RBI=0.0128779;REFB=0;REVB=-0.00805571;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110135;OID=.;OPOS=179458591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr2 179464527 . T C 1522.23 PASS AF=0.979798;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00466924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.455;QD=61.5044;RBI=0.0238075;REFB=-0.0591672;REVB=0.0233452;RO=1;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101988;STB=0.510636;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00163648;OID=.;OPOS=179464527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:99:99:1:2:97:97:0.979798:46:51:0:1:46:51:0:2 chr2 179543217 . C T 2072.04 PASS AF=0.985294;AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0469822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0496;QD=60.9424;RBI=0.0530386;REFB=0.0607534;REVB=-0.0246122;RO=1;SAF=67;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704205;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00445207;OID=.;OPOS=179543217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:136:136:1:2:134:134:0.985294:67:67:0:1:67:67:1:1 chr2 179558366 . T C 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.129;QD=63.1952;RBI=0.0100108;REFB=0;REVB=3.25168e-05;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.02722e-06;OID=.;OPOS=179558366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:41:51:0:0:41:51:0:0 chr2 179569400 . C T 579.21 PASS AF=0.483871;AO=60;DP=124;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0426039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.899;QD=18.6843;RBI=0.0429664;REFB=0.00304773;REVB=-0.00556951;RO=63;SAF=33;SAR=27;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391466;STB=0.517851;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00451877;OID=.;OPOS=179569400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:64:60:60:0.483871:27:33:32:31:27:33:33:31 chr2 179569436 . A G 421.76 PASS AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0108977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9941;QD=18.1402;RBI=0.0116978;REFB=-0.00271308;REVB=0.00425191;RO=50;SAF=25;SAR=18;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983939;STB=0.554969;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00130214;OID=.;OPOS=179569436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:50:43:43:0.462366:18:25:24:26:18:25:24:26 chr2 179574384 . C T 570.46 PASS AF=0.39521;AO=66;DP=169;FAO=66;FDP=167;FR=.;FRO=101;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=3.78142e-05;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1237;QD=13.6636;RBI=0.0641908;REFB=0.0150014;REVB=0.0641908;RO=103;SAF=40;SAR=26;SRF=62;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00465163;STB=0.507573;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=-0.0227337;OID=.;OPOS=179574384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:167:103:101:66:66:0.39521:26:40:62:41:26:40:60:41 chr2 179578730 . G A 2640.34 PASS AF=1;AO=170;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.556;QD=62.1255;RBI=0.0188172;REFB=0;REVB=0.0159327;RO=0;SAF=97;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28405e-06;OID=.;OPOS=179578730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:170:170:0:0:170:170:1:73:97:0:0:73:97:0:0 chr2 179579093 . T C 373.6 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00586117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.626;QD=23.3501;RBI=0.00630778;REFB=-0.00787533;REVB=0.00233125;RO=27;SAF=22;SAR=15;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171936;STB=0.594543;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00199;OID=.;OPOS=179579093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:15:22:10:17:15:22:10:17 chr2 179579212 . T C 2046.07 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.563;QD=62.4754;RBI=0.0252186;REFB=0;REVB=0.0247194;RO=0;SAF=58;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.81173e-05;OID=.;OPOS=179579212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:73:58:0:0:73:58:0:0 chr2 179579822 . T A 2369.74 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2336;QD=64.0471;RBI=0.0411901;REFB=0;REVB=0.0396029;RO=0;SAF=67;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240072;OID=.;OPOS=179579822;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:81:67:0:0:81:67:0:0 chr2 179580434 . A G 699.84 PASS AF=0.5;AO=69;DP=138;FAO=69;FDP=138;FR=.;FRO=69;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=24;FWDB=0.0099401;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.085;QD=20.2851;RBI=0.0144778;REFB=-0.0134525;REVB=-0.0105262;RO=69;SAF=35;SAR=34;SRF=45;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132015;STB=0.572611;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0127874;OID=.;OPOS=179580434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:69:69:69:69:0.5:34:35:45:24:34:35:45:24 chr2 179581835 . C A 447.27 PASS AF=0.463918;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0141291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.028;QD=18.4442;RBI=0.0159951;REFB=-0.0135975;REVB=-0.00749746;RO=52;SAF=24;SAR=21;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235537;STB=0.513134;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0150451;OID=.;OPOS=179581835;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:52:52:45:45:0.463918:21:24:29:23:21:24:29:23 chr2 179582327 . C T 285.36 PASS AF=0.346154;AO=36;DP=104;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0129715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.055;QD=10.9754;RBI=0.0156786;REFB=-0.00971411;REVB=0.00880675;RO=68;SAF=18;SAR=18;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834341;STB=0.54805;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0169614;OID=.;OPOS=179582327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:68:68:36:36:0.346154:18:18:39:29:18:18:39:29 chr2 179582537 . G T 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.666;QD=58.0608;RBI=0.0180514;REFB=0;REVB=-0.0108724;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7214e-05;OID=.;OPOS=179582537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0 chr2 179583496 . T G 382.99 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00767118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=339.123;QD=17.4085;RBI=0.00779858;REFB=-0.0150567;REVB=-0.00140387;RO=48;SAF=23;SAR=17;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153728;STB=0.586027;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.019459;OID=.;OPOS=179583496;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:17:23:20:28:17:23:20:28 chr2 179585266 . C T 1097.81 PASS AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00176175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4833;QD=56.2978;RBI=0.00735574;REFB=-0.059213;REVB=0.00714165;RO=3;SAF=38;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126019;STB=0.506665;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0117597;OID=.;OPOS=179585266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:78:78:3:3:75:75:0.961538:37:38:1:2:37:38:1:2 chr2 179585393 . A G 182.82 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00257656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.258;QD=43.0172;RBI=0.0339448;REFB=-0.0981859;REVB=0.0338468;RO=1;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608641;STB=0.533291;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000677666;OID=.;OPOS=179585393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:9:7:1:0:9:7:1:0 chr2 179587130 . C G 444.74 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.0457971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.688;QD=16.4718;RBI=0.0464476;REFB=0.000538789;REVB=-0.00774654;RO=59;SAF=17;SAR=32;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277148;STB=0.515483;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.00071345;OID=.;OPOS=179587130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:32:17:22:37:32:17:22:37 chr2 179593462 . C T 1346.14 PASS AF=0.483986;AO=136;DP=282;FAO=136;FDP=281;FR=.;FRO=145;FSAF=72;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=73;FWDB=-0.00120623;FXX=0.00354597;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.18;QD=19.1621;RBI=0.0048457;REFB=-0.0106405;REVB=-0.00469316;RO=144;SAF=72;SAR=64;SRF=71;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340476;STB=0.516979;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0123169;OID=.;OPOS=179593462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:281:144:145:136:136:0.483986:64:72:71:73:64:72:72:73 chr2 179600563 . G A 2121.65 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00170345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.447;QD=62.8637;RBI=0.012833;REFB=0;REVB=-0.0127195;RO=0;SAF=58;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.23899e-06;OID=.;OPOS=179600563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:77:58:0:0:77:58:0:0 chr2 179600648 . C T 958.08 PASS AF=0.484694;AO=95;DP=197;FAO=95;FDP=196;FR=.;FRO=101;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=37;FSRR=64;FWDB=-0.003983;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5524;QD=19.5526;RBI=0.00537727;REFB=-0.00766402;REVB=-0.00361258;RO=100;SAF=44;SAR=51;SRF=37;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879372;STB=0.550528;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00983328;OID=.;OPOS=179600648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:100:101:95:95:0.484694:51:44:37:63:51:44:37:64 chr2 179604160 . T G 255.34 PASS AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0214704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8983;QD=13.2645;RBI=0.0239206;REFB=-0.011233;REVB=0.010546;RO=47;SAF=15;SAR=15;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171162;STB=0.59734;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0101939;OID=.;OPOS=179604160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:47:47:30:30:0.38961:15:15:16:31:15:15:16:31 chr2 179604742 . G A 641.81 PASS AF=0.520325;AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0146225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.149;QD=20.8719;RBI=0.0149166;REFB=-0.0173786;REVB=0.00294757;RO=59;SAF=19;SAR=45;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229147;STB=0.626494;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00407044;OID=.;OPOS=179604742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:59:59:64:64:0.520325:45:19:32:27:45:19:32:27 chr2 179605180 . C A,T 717.16 PASS AF=0.615385,0.384615;AO=32,20;DP=52;FAO=32,20;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16,11;FSAR=16,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020602,-0.0112551;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=137.231,77.7054;QD=55.166;RBI=0.0288757,0.0129944;REFB=0,0;REVB=0.0202328,-0.00649453;RO=0;SAF=16,11;SAR=16,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.0487e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00671086,0.00252618;OID=.,.;OPOS=179605180,179605180;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:52:52:0:0:32,20:32,20:0.615385,0.384615:16,9:16,11:0:0:16,9:16,11:0:0 chr2 179605705 . A G 315.17 PASS AF=0.36;AO=35;DP=100;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.00190704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.162;QD=12.6068;RBI=0.0345783;REFB=-0.00447167;REVB=0.0345256;RO=64;SAF=16;SAR=19;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152485;STB=0.594662;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.012474;OID=.;OPOS=179605705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:64:64:35:36:0.36:19:16:38:26:20:16:38:26 chr2 179606538 . G A 670.7 PASS AF=0.496296;AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00380475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=355.234;QD=19.8727;RBI=0.00663957;REFB=-0.00547011;REVB=-0.00544131;RO=68;SAF=28;SAR=39;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00577127;STB=0.503184;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00572635;OID=.;OPOS=179606538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:68:68:67:67:0.496296:39:28:28:40:39:28:28:40 chr2 179611711 . C A 231.03 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00257399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.781;QD=16.502;RBI=0.0104121;REFB=-0.00868155;REVB=-0.0100889;RO=30;SAF=18;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195135;STB=0.610531;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0151587;OID=.;OPOS=179611711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:8:18:15:15:8:18:15:15 chr2 179614952 . A G 1558.61 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012945;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.247;QD=59.9466;RBI=0.0213442;REFB=0;REVB=0.0169705;RO=0;SAF=54;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69928e-05;OID=.;OPOS=179614952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:50:54:0:0:50:54:0:0 chr2 179615887 . T C 179.69 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0347905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6049;QD=15.625;RBI=0.0459979;REFB=-0.0179008;REVB=0.0300904;RO=25;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164133;STB=0.590816;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0251818;OID=.;OPOS=179615887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:27:19:19:0.413043:9:10:9:16:9:10:10:17 chr2 179615931 . C G 1264.75 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00460551;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.148;QD=61.695;RBI=0.00944523;REFB=0;REVB=-0.00824631;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216385;OID=.;OPOS=179615931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:80:82:1:42:38:0:0:42:40:0:0 chr2 179615994 . T C 1589.82 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.235;QD=59.9934;RBI=0.0141853;REFB=0;REVB=0.0140321;RO=0;SAF=53;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24232e-05;OID=.;OPOS=179615994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:53:53:0:0:53:53:0:0 chr2 179620951 . C T 293.61 PASS AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00724375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.267;QD=19.9058;RBI=0.00992111;REFB=-0.0119728;REVB=0.00677912;RO=28;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349901;STB=0.519468;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00895922;OID=.;OPOS=179620951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:11:20:17:11:11:20:17:11 chr2 179621477 . C T 1698.81 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460314;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.023;QD=60.6719;RBI=0.0479978;REFB=0;REVB=0.0135977;RO=0;SAF=53;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78886e-05;OID=.;OPOS=179621477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:59:53:0:0:59:53:0:0 chr2 179623758 . C T 668.07 PASS AF=0.386139;AO=78;DP=202;FAO=78;FDP=202;FR=.;FRO=124;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=83;FWDB=0.00819117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.785;QD=13.2291;RBI=0.01132;REFB=-0.00466248;REVB=-0.00781322;RO=123;SAF=44;SAR=34;SRF=41;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246803;STB=0.640423;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00588242;OID=.;OPOS=179623758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:123:124:78:78:0.386139:34:44:41:82:34:44:41:83 chr2 179629363 . T C 1264.6 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.044;QD=61.6878;RBI=0.0261319;REFB=0;REVB=0.0237611;RO=0;SAF=29;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45212e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56352e-05;OID=.;OPOS=179629363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:52:29:0:0:53:29:0:0 chr2 179629461 . C T 187.39 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0150963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.554;QD=14.6975;RBI=0.0152018;REFB=-0.00622737;REVB=-0.0017881;RO=30;SAF=5;SAR=16;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198972;STB=0.615266;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0047188;OID=.;OPOS=179629461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:16:5:12:18:16:5:12:18 chr2 179631214 . T C 421.88 PASS AF=0.392;AO=49;DP=125;FAO=49;FDP=125;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=0.0183289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.7;QD=13.5002;RBI=0.0213281;REFB=-0.0123374;REVB=-0.0109059;RO=74;SAF=25;SAR=24;SRF=28;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140242;STB=0.577956;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0197481;OID=.;OPOS=179631214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:74:76:49:49:0.392:24:25:28:46:24:25:29:47 chr2 179634936 . C T 407.73 PASS AF=0.433962;AO=45;DP=105;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0145073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.573;QD=15.386;RBI=0.0155781;REFB=-0.0134387;REVB=0.00567598;RO=60;SAF=15;SAR=30;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109349;STB=0.551641;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0210646;OID=.;OPOS=179634936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:60:60:45:46:0.433962:30:15:26:34:30:16:26:34 chr2 179637861 . C G 258.36 PASS AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0135833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8995;QD=13.9656;RBI=0.0155001;REFB=0.0191632;REVB=0.00746641;RO=44;SAF=15;SAR=15;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950497;STB=0.554018;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.0134467;OID=.;OPOS=179637861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:15:15:26:18:15:15:26:18 chr2 179641975 . C T 566.68 PASS AF=0.475806;AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0121725;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3533;QD=18.28;RBI=0.0181225;REFB=-0.0205336;REVB=-0.0134259;RO=63;SAF=26;SAR=33;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185223;STB=0.511058;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0117663;OID=.;OPOS=179641975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:63:65:59:59:0.475806:33:26:29:34:33:26:30:35 chr2 179644035 . G A 1626.92 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172274;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.548;QD=60.2563;RBI=0.039858;REFB=0;REVB=0.0359427;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85291e-05;OID=.;OPOS=179644035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:108:0:0:102:108:1:54:48:0:0:60:48:0:0 chr2 179644160 . T C 278.86 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.06154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5716;QD=16.4035;RBI=0.0631947;REFB=-0.0132596;REVB=-0.0143665;RO=37;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338983;STB=0.519072;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0472536;OID=.;OPOS=179644160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:14:17:19:18:14:17:19:18 chr2 179647546 . A G 684.1 PASS AF=0.62766;AO=59;DP=94;FAO=59;FDP=94;FR=.;FRO=35;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00055535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.864;QD=29.1106;RBI=0.0258124;REFB=0.00246967;REVB=-0.0258064;RO=35;SAF=31;SAR=28;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468139;STB=0.525415;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.00214713;OID=.;OPOS=179647546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:35:35:59:59:0.62766:28:31:16:19:28:31:16:19 chr2 179659681 . C T 339.18 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0103428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.659;QD=17.8517;RBI=0.0139107;REFB=-0.0219396;REVB=-0.00930237;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021012;STB=0.511741;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0253115;OID=.;OPOS=179659681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:17:19:22:18:17:19:22:18 chr2 179659912 . G A 1320.77 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.901;QD=62.1538;RBI=0.0644943;REFB=0;REVB=0.0541422;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299555;OID=.;OPOS=179659912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0 chr2 179702268 . A G 866.85 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.395;QD=57.7897;RBI=0.0360001;REFB=0;REVB=0.0330526;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70599e-05;OID=.;OPOS=179702268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:34:24:0:0:35:25:0:0 chr2 179839833 . A G 868.25 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6012;QD=57.8832;RBI=0.0540825;REFB=0;REVB=0.0279646;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431953;OID=.;OPOS=179839833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0 chr2 179914640 . G A 469.07 PASS AF=0.5;AO=45;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0213194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9792;QD=20.3941;RBI=0.0213279;REFB=-0.00349187;REVB=-0.000602155;RO=46;SAF=22;SAR=23;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295233;STB=0.52173;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0042934;OID=.;OPOS=179914640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:45:46:0.5:23:22:21:25:23:23:21:25 chr2 180047908 . T C 1102.31 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419577;FXX=0.0266631;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5444;QD=60.4007;RBI=0.0610919;REFB=0;REVB=-0.0444047;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000605311;OID=.;OPOS=180047908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:41:32:0:0:41:32:0:0 chr2 180308028 . C T 155.51 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0582757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.0408;QD=15.1716;RBI=0.0615873;REFB=-0.000739847;REVB=0.0199235;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904212;STB=0.552263;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00385593;OID=.;OPOS=180308028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:7:10:12:12:7:10:12:12 chr2 180810180 . C T 452.02 PASS AF=0.483871;AO=43;DP=94;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0313404;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.149;QD=19.4417;RBI=0.0317567;REFB=-0.0177982;REVB=-0.00512501;RO=49;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181389;STB=0.515782;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0149578;OID=.;OPOS=180810180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:49:48:43:45:0.483871:22:21:23:26:23:22:22:26 chr2 180810202 . C T 421.27 PASS AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00926862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.098;QD=18.1192;RBI=0.0163921;REFB=-0.000141491;REVB=-0.0135202;RO=49;SAF=16;SAR=27;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766792;STB=0.538282;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=7.40752e-05;OID=.;OPOS=180810202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:49:50:43:43:0.462366:27:16:22:27:27:16:22:28 chr2 180810264 . A T 1044.18 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.805;QD=59.6675;RBI=0.0186378;REFB=0;REVB=0.0132811;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93774e-05;OID=.;OPOS=180810264;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:42:28:0:0:42:28:0:0 chr2 180835792 . T A 242.7 PASS AF=0.344828;AO=29;DP=86;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0292646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.217;QD=11.1587;RBI=0.0292679;REFB=-0.0013928;REVB=-0.000434784;RO=57;SAF=18;SAR=11;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497523;STB=0.514276;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00282206;OID=.;OPOS=180835792;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:57:57:29:30:0.344828:11:18:33:24:12:18:33:24 chr2 182347072 . T C 382.08 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0114788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7885;QD=19.8485;RBI=0.0289248;REFB=-0.0105907;REVB=-0.0265496;RO=38;SAF=25;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153506;STB=0.585355;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.015815;OID=.;OPOS=182347072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:14:25:18:20:14:25:18:20 chr2 182374534 . A G 368.32 PASS AF=0.506667;AO=37;DP=74;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.00550049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.291;QD=19.6439;RBI=0.00601568;REFB=-0.00235195;REVB=-0.00243578;RO=37;SAF=14;SAR=23;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793384;STB=0.551362;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00173524;OID=.;OPOS=182374534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:37:37:37:38:0.506667:23:14:11:26:23:15:11:26 chr2 182374660 . A T 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0117193;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.077;QD=14.7986;RBI=0.0257884;REFB=-0.02439;REVB=-0.0229717;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140078;STB=0.581253;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0180971;OID=.;OPOS=182374660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:9:4:5:6:9:4 chr2 182395345 . G A 1589.86 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000168748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.04;QD=59.9949;RBI=0.0184573;REFB=0;REVB=-0.0184565;RO=0;SAF=34;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.04084e-05;OID=.;OPOS=182395345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:72:34:0:0:72:34:0:0 chr2 182399097 . T C 437.41 PASS AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.109082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.738;QD=24.3003;RBI=0.109807;REFB=-0.00671006;REVB=0.0125958;RO=30;SAF=21;SAR=21;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152288;STB=0.583295;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00788179;OID=.;OPOS=182399097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:30:30:42:42:0.583333:21:21:9:21:21:21:9:21 chr2 182399638 . A G 2492.9 PASS AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6292;QD=61.5531;RBI=0.0241126;REFB=0;REVB=0.00290901;RO=0;SAF=82;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110462;OID=.;OPOS=182399638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:80:82:0:0:80:82:0:0 chr2 182400905 . T G 1877.87 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.128;QD=61.5696;RBI=0.055998;REFB=0;REVB=0.00828292;RO=0;SAF=50;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83711e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16298e-05;OID=.;OPOS=182400905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:72:50:0:0:72:50:0:0 chr2 182401116 . C T 330.63 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0289555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.872;QD=23.6162;RBI=0.0302477;REFB=-0.0272304;REVB=-0.00874653;RO=23;SAF=14;SAR=19;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12783;STB=0.570095;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0123753;OID=.;OPOS=182401116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:19:14:6:17:19:14:6:17 chr2 182403851 . G A 1190.41 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.763;QD=61.0464;RBI=0.0454916;REFB=0;REVB=0.0217264;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90443e-05;OID=.;OPOS=182403851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:43:35:0:0:43:35:0:0 chr2 182413259 . A G 296.44 PASS AF=0.574074;AO=29;DP=52;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.010203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.326;QD=21.9582;RBI=0.0423926;REFB=-0.00222742;REVB=0.0411464;RO=23;SAF=13;SAR=16;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262917;STB=0.651015;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00293106;OID=.;OPOS=182413259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:23:23:29:31:0.574074:16:13:18:5:18:13:18:5 chr2 182414358 . T C 281.1 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0302065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5584;QD=21.2154;RBI=0.0302197;REFB=0.0175741;REVB=-0.000892585;RO=23;SAF=20;SAR=9;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343706;STB=0.51204;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=-0.0141049;OID=.;OPOS=182414358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:24:29:29:0.54717:9:20:15:8:9:20:16:8 chr2 182468803 . T G 96.19 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00963836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.832;QD=12.0243;RBI=0.0144246;REFB=0.0011275;REVB=0.0107318;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181383;STB=0.510735;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.0026977;OID=.;OPOS=182468803;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:5:7:12:8:5:7:12:8 chr2 182521578 . G A 240.03 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00473128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.233;QD=16.5539;RBI=0.0230188;REFB=-0.0117578;REVB=0.0225273;RO=31;SAF=7;SAR=20;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208791;STB=0.618463;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0208593;OID=.;OPOS=182521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:20:7:14:17:20:7:14:17 chr2 182542837 . C A 147.37 PASS AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0157423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.427;QD=10.5263;RBI=0.0188005;REFB=-0.0145542;REVB=0.0102781;RO=36;SAF=12;SAR=7;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15;STB=0.597597;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0330139;OID=.;OPOS=182542837;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:37:19:19:0.339286:7:12:18:18:7:12:18:19 chr2 182543455 . T C 153.42 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00496911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.397;QD=12.033;RBI=0.0303456;REFB=-0.00822697;REVB=-0.029936;RO=32;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155754;STB=0.583238;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0132163;OID=.;OPOS=182543455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:32:33:18:18:0.352941:6:12:17:15:6:12:18:15 chr2 182763586 . G A 261.84 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.0065734;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.538;QD=14.5465;RBI=0.0212767;REFB=-0.00166616;REVB=-0.0202359;RO=41;SAF=19;SAR=11;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553966;STB=0.521155;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00237601;OID=.;OPOS=182763586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:41:42:30:30:0.416667:11:19:28:13:11:19:28:14 chr2 182780307 . G A 255.36 PASS AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0131098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.718;QD=13.2655;RBI=0.0131193;REFB=-0.00498979;REVB=-0.000498276;RO=47;SAF=14;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442894;STB=0.525289;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00552284;OID=.;OPOS=182780307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:47:47:30:30:0.38961:16:14:20:27:16:14:20:27 chr2 182792984 . T A 134.17 PASS AF=0.315789;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0482357;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9853;QD=9.41542;RBI=0.0681179;REFB=-0.00523495;REVB=-0.0480974;RO=39;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443059;STB=0.526287;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0109071;OID=.;OPOS=182792984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:39:39:18:18:0.315789:9:9:21:18:9:9:21:18 chr2 182925120 . T C 566.04 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.225;QD=59.5829;RBI=0.0265552;REFB=0;REVB=0.0115936;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368293;OID=.;OPOS=182925120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:15:22:0:0:16:22:0:0 chr2 182981968 . A G 639.38 PASS AF=0.592233;AO=61;DP=103;FAO=61;FDP=103;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0360526;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2886;QD=24.8301;RBI=0.0637932;REFB=-0.020985;REVB=0.0526287;RO=42;SAF=18;SAR=43;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169614;STB=0.592757;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0150707;OID=.;OPOS=182981968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:42:42:61:61:0.592233:43:18:21:21:43:18:21:21 chr2 183007502 . A G,T 684.51 PASS AF=0.942308,0.0384615;AO=48,2;DP=52;FAO=49,2;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=35,2;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0335807,-0.028369;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=46.5137,61.2002;QD=52.6549;RBI=0.0372603,0.0382145;REFB=-0.0655189,0.0198806;REVB=-0.0161453,-0.0256037;RO=2;SAF=35,2;SAR=13,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0670194,0.727176;STB=0.517234,0.993266;STBP=0.177,0.227;TYPE=snp,snp;VARB=0.00298631,0.1565;OID=.,.;OPOS=183007502,183007502;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:52:52:2:1:48,2:49,2:0.942308,0.0384615:13,0:35,2:0:2:14,0:35,2:0:1 chr2 183584755 . G A 218.3 PASS AF=0.469388;AO=19;DP=44;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0253279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1137;QD=17.8206;RBI=0.0255364;REFB=-0.039648;REVB=-0.00325637;RO=25;SAF=14;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347107;STB=0.618272;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0174288;OID=.;OPOS=183584755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:49:25:26:19:23:0.469388:5:14:10:15:9:14:10:16 chr2 183593697 . C T 697.86 PASS AF=0.511111;AO=69;DP=134;FAO=69;FDP=135;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=52;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=-0.0366617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.999;QD=20.6773;RBI=0.0456206;REFB=0.00413405;REVB=-0.0271506;RO=65;SAF=17;SAR=52;SRF=18;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354907;STB=0.526574;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.00323843;OID=.;OPOS=183593697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:65:66:69:69:0.511111:52:17:18:47:52:17:19:47 chr2 183622547 . T G 514.43 PASS AF=0.434109;AO=55;DP=129;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0240378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.151;QD=15.9513;RBI=0.0266137;REFB=-0.0146736;REVB=0.0114226;RO=72;SAF=20;SAR=35;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100217;STB=0.556572;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0160587;OID=.;OPOS=183622547;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:72:73:55:56:0.434109:35:20:33:39:36:20:33:40 chr2 183731191 . AGCCCCG AGCCC,AGCCCG,CAGCCCG 48.92 PASS AF=0,0.5,0;AO=5,3,2;DP=20;FAO=0,10,0;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=0,1,0;FSAR=0,9,0;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.150686,-0.179327,-0.0653064;FXX=0;HRUN=4,4,1;LEN=2,1,3;MLLD=22.859,14.3219,139.803;QD=9.78307;RBI=0.216135,0.180331,0.0674716;REFB=0.00494376,-0.101562,-0.0035569;REVB=-0.154945,0.0190032,-0.0169558;RO=10;SAF=0,0,1;SAR=5,3,1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.725473,-0.649379,0;STB=0.5,0.79339,0.5;STBP=1,0.041,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0,0.101569,0;OID=.,.,.;OPOS=183731196,183731193,183731191;OREF=CG,C,AGC;OALT=-,-,CAG;OMAPALT=AGCCC,AGCCCG,CAGCCCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:48:20:20:10:10:5,3,2:0,10,0:0,0.5,0:5,3,1:0,0,1:5:5:0,9,0:0,1,0:5:5 chr2 183738620 . T C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1513;QD=39.2067;RBI=0.0523037;REFB=0;REVB=0.0497209;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00437666;OID=.;OPOS=183738620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr2 183789649 . C A 286.02 PASS AF=0.714286;AO=24;DP=34;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00677633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.892;QD=32.6876;RBI=0.00689534;REFB=-0.0222968;REVB=-0.00127556;RO=10;SAF=18;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350019;STB=0.507037;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00843831;OID=.;OPOS=183789649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:35:10:10:24:25:0.714286:6:18:7:3:7:18:7:3 chr2 183799558 . G C 2510.92 PASS AF=1;AO=163;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.835;QD=61.6176;RBI=0.0688302;REFB=0;REVB=0.00667328;RO=0;SAF=82;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142098;OID=.;OPOS=183799558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:163:163:0:0:163:163:1:81:82:0:0:81:82:0:0 chr2 183948210 . A G 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0117198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9865;QD=19.6682;RBI=0.0200933;REFB=0.0113521;REVB=0.0163214;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481396;STB=0.527192;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.0156602;OID=.;OPOS=183948210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:11:8:7:12:11:8:7:12 chr2 183961650 . A C 1513.42 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.786;QD=59.9375;RBI=0.0265519;REFB=0;REVB=0.0165223;RO=0;SAF=47;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92508e-05;OID=.;OPOS=183961650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:54:47:0:0:54:47:0:0 chr2 183961668 . A G 384.86 PASS AF=0.444444;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00863281;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.157;QD=17.1047;RBI=0.0165269;REFB=0.00269063;REVB=0.014093;RO=50;SAF=17;SAR=23;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114176;STB=0.56407;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00296949;OID=.;OPOS=183961668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:50:50:40:40:0.444444:23:17:27:23:23:17:27:23 chr2 184814072 . T C 713.42 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337137;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.511;QD=63.4148;RBI=0.0338043;REFB=0;REVB=0.0024725;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318604;OID=.;OPOS=184814072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0 chr2 185469503 . C T 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.132;QD=60.7157;RBI=0.0347021;REFB=0;REVB=0.0118751;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21618e-05;OID=.;OPOS=185469503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:44:32:0:0:44:32:0:0 chr2 185800905 . A T 575.75 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.179;QD=60.6053;RBI=0.0458753;REFB=0;REVB=-0.0211059;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120617;OID=.;OPOS=185800905;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr2 185801747 . G A 746.14 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.069;QD=63.501;RBI=0.0154213;REFB=0;REVB=0.00101912;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54383e-05;OID=.;OPOS=185801747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:30:17:0:0:30:17:0:0 chr2 185801755 . A G 676.88 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0308883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.916;QD=60.1674;RBI=0.0356228;REFB=-0.130874;REVB=0.0177453;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.509087;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000666379;OID=.;OPOS=185801755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:27:17:0:0:27:17:0:1 chr2 185802211 . C CACA 109.08 PASS AF=0.916667;AO=10;DP=13;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0747066;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=239.083;QD=36.3583;RBI=0.074744;REFB=0.0202739;REVB=0.00236516;RO=3;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680236;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=ins;VARB=-0.00392163;OID=.;OPOS=185802212;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=CACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.916667:10:13:11:12:1:6:5:0:1:6:3:5:5:2:1 chr2 185802243 . C A 116.0 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.836;QD=42.1832;RBI=0.0409809;REFB=0;REVB=0.016172;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419808;OID=.;OPOS=185802243;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:4:6:0:0:4:7:0:0 chr2 185802363 . A G 1396.43 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.929;QD=62.7609;RBI=0.0547138;REFB=0;REVB=0.00824694;RO=0;SAF=49;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.39196e-05;OID=.;OPOS=185802363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:39:49:0:0:39:50:0:0 chr2 186526579 . G A 542.5 PASS AF=0.409722;AO=59;DP=145;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.00121102;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.793;QD=15.0693;RBI=0.0539637;REFB=0.00315147;REVB=-0.0539501;RO=85;SAF=32;SAR=27;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260701;STB=0.514659;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.00621656;OID=.;OPOS=186526579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:85:85:59:59:0.409722:27:32:44:41:27:32:44:41 chr2 186625770 . A G 294.51 PASS AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.00118788;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=254.238;QD=28.0488;RBI=0.00381697;REFB=0.00168941;REVB=0.00362743;RO=16;SAF=12;SAR=14;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104612;STB=0.557577;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=-0.000746824;OID=.;OPOS=186625770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:14:12:5:11:14:12:5:11 chr2 186627943 . T C 476.93 PASS AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.00476011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.61;QD=17.9972;RBI=0.0462776;REFB=-0.0251303;REVB=-0.0460321;RO=55;SAF=27;SAR=24;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838207;STB=0.546455;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0303806;OID=.;OPOS=186627943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:55:55:51:51:0.481132:24:27:34:21:24:27:34:21 chr2 186654592 . A G 402.14 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0211445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.718;QD=21.7373;RBI=0.024645;REFB=0.00398027;REVB=0.0126605;RO=34;SAF=17;SAR=23;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036552;STB=0.520157;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=-0.00216796;OID=.;OPOS=186654592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:34:40:40:0.540541:23:17:13:21:23:17:13:21 chr2 186654867 . G C 348.65 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.021499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5411;QD=17.4327;RBI=0.0330416;REFB=0.00193042;REVB=0.0250906;RO=43;SAF=20;SAR=17;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852063;STB=0.54761;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=-0.00128884;OID=.;OPOS=186654867;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:17:20:27:16:17:20:27:16 chr2 186655726 . G A 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4104;QD=57.2365;RBI=0.0246025;REFB=0;REVB=-0.009028;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.93274e-05;OID=.;OPOS=186655726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:36:20:0:0:36:20:0:0 chr2 186656657 . C T 295.69 PASS AF=0.373626;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00642074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.978;QD=12.9972;RBI=0.07229;REFB=-0.0045147;REVB=-0.0720043;RO=57;SAF=16;SAR=18;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339678;STB=0.501944;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0155593;OID=.;OPOS=186656657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:57:57:34:34:0.373626:18:16:27:30:18:16:27:30 chr2 186656956 . T C 212.28 PASS AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0145135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.045;QD=27.3905;RBI=0.0198352;REFB=-0.00442904;REVB=0.0135201;RO=11;SAF=12;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947799;STB=0.552578;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00149083;OID=.;OPOS=186656956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:8:12:5:6:8:12:5:6 chr2 186657089 . C A 627.36 PASS AF=0.481203;AO=64;DP=133;FAO=64;FDP=133;FR=.;FRO=69;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00171004;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.866;QD=18.8678;RBI=0.0140883;REFB=-0.0077308;REVB=-0.0139842;RO=69;SAF=38;SAR=26;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960561;STB=0.553205;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0075121;OID=.;OPOS=186657089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:69:69:64:64:0.481203:26:38:34:35:26:38:34:35 chr2 186658056 . G A 236.07 PASS AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0123462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.976;QD=17.8163;RBI=0.014426;REFB=-0.0147982;REVB=-0.00746196;RO=27;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658101;STB=0.547023;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0108618;OID=.;OPOS=186658056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:27:27:25:26:0.490566:14:11:10:17:14:12:10:17 chr2 186658438 . C T 239.77 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0061585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.049;QD=18.0956;RBI=0.0239062;REFB=0.00199094;REVB=-0.0230993;RO=27;SAF=18;SAR=8;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235922;STB=0.632922;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.0012275;OID=.;OPOS=186658438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:8:18:12:15:8:18:12:15 chr2 186658565 . G T 301.41 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00642715;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.219;QD=21.529;RBI=0.013077;REFB=-0.0310372;REVB=-0.0113886;RO=25;SAF=15;SAR=16;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100442;STB=0.55552;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0272267;OID=.;OPOS=186658565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:25:25:31:31:0.553571:16:15:9:16:16:15:9:16 chr2 186659359 . G T 197.79 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0123044;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.561;QD=14.6512;RBI=0.0476151;REFB=-0.00286223;REVB=-0.0459978;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15915;STB=0.590829;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00304972;OID=.;OPOS=186659359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:14:9:17:14:14:9:17:14 chr2 186661673 . A G 334.32 PASS AF=0.5;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00159656;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.999;QD=19.1042;RBI=0.00315129;REFB=-0.00849177;REVB=-0.00271691;RO=35;SAF=13;SAR=22;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106326;STB=0.559288;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00553325;OID=.;OPOS=186661673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:35:35:35:35:0.5:22:13:17:18:22:13:17:18 chr2 186664473 . T C 480.37 PASS AF=0.309645;AO=61;DP=198;FAO=61;FDP=197;FR=.;FRO=136;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=0.0123237;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.074;QD=9.7536;RBI=0.0123566;REFB=-0.00122597;REVB=0.00090177;RO=134;SAF=28;SAR=33;SRF=78;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145232;STB=0.588479;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00223102;OID=.;OPOS=186664473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:134:136:61:61:0.309645:33:28:78:56:33:28:80:56 chr2 186664963 . C A 227.67 PASS AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0356372;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.4445;QD=20.697;RBI=0.0360759;REFB=0.0111605;REVB=-0.00560884;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620553;STB=0.545414;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.0190732;OID=.;OPOS=186664963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:21:22:22:22:0.5:11:11:9:12:11:11:9:13 chr2 186665432 . G A 273.86 PASS AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.000890686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.384;QD=12.8877;RBI=0.00646361;REFB=-0.0158093;REVB=-0.00640195;RO=48;SAF=17;SAR=15;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776818;STB=0.521822;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0258796;OID=.;OPOS=186665432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:53:32:32:0.376471:15:17:29:19:15:17:30:23 chr2 186665824 . A G 250.39 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0117322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.645;QD=20.0308;RBI=0.0129805;REFB=-0.00557423;REVB=0.00555423;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709782;STB=0.539967;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00847816;OID=.;OPOS=186665824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:12:12:11:15:12:12:11:15 chr2 186667121 . T C 133.71 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00532945;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.571;QD=16.2074;RBI=0.0273711;REFB=-0.00752726;REVB=0.0268472;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769795;STB=0.544493;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00909467;OID=.;OPOS=186667121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:4:11:12:6:4:11:12:6 chr2 186668935 . A G 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0567201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.557;QD=13.9953;RBI=0.0567203;REFB=-0.00635437;REVB=0.00014422;RO=42;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151764;STB=0.586248;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00774012;OID=.;OPOS=186668935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:13:16:17:25:13:16:17:25 chr2 186670104 . A C 1694.92 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2624;QD=60.533;RBI=0.032998;REFB=0;REVB=0.0320534;RO=0;SAF=50;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49535e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243178;OID=.;OPOS=186670104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:112:0:0:110:112:1:60:50:0:0:60:52:0:0 chr2 186670780 . T A 210.84 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0187372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.945;QD=19.1671;RBI=0.0196379;REFB=-0.00517299;REVB=0.00587936;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168145;STB=0.615277;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00532963;OID=.;OPOS=186670780;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:21:23:21:21:0.477273:11:10:14:7:12:9:15:8 chr2 186670979 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.104;QD=56.1914;RBI=0.0531361;REFB=0;REVB=0.0472608;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218227;OID=.;OPOS=186670979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:21:7:0:0:21:7:0:0 chr2 186671357 . G A 470.2 PASS AF=0.440678;AO=52;DP=118;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00947713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.676;QD=15.9389;RBI=0.0249682;REFB=-0.0142206;REVB=-0.0230997;RO=66;SAF=29;SAR=23;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881399;STB=0.549295;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0105696;OID=.;OPOS=186671357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:66:66:52:52:0.440678:23:29:31:35:23:29:31:35 chr2 186671636 . C T 176.27 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00200157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.704;QD=20.7381;RBI=0.00286328;REFB=-0.0275898;REVB=0.00204746;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591057;STB=0.533297;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0176148;OID=.;OPOS=186671636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:10:6:8:10:10:6 chr2 186671912 . G A 500.26 PASS AF=0.426357;AO=55;DP=129;FAO=55;FDP=129;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.019222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.637;QD=15.512;RBI=0.0196667;REFB=-0.0134944;REVB=0.00415874;RO=74;SAF=28;SAR=27;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645647;STB=0.536174;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0222136;OID=.;OPOS=186671912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:74:74:55:55:0.426357:27:28:33:41:27:28:33:41 chr2 186697876 . A G 1138.11 PASS AF=0.9625;AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00816092;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6342;QD=56.9055;RBI=0.0206542;REFB=-0.175956;REVB=0.0189736;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51546;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00293295;OID=.;OPOS=186697876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:81:80:0:3:77:77:0.9625:30:47:0:0:30:47:3:0 chr2 187487160 . G A 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.461;QD=62.762;RBI=0.0140496;REFB=0;REVB=-0.00700807;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46952e-06;OID=.;OPOS=187487160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:46:43:0:0:46:43:0:0 chr2 187532417 . G A 1592.21 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290857;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.061;QD=60.0834;RBI=0.0509776;REFB=0;REVB=0.0418657;RO=0;SAF=73;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293048;OID=.;OPOS=187532417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:33:73:0:0:33:73:0:0 chr2 187558960 . G A 429.81 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.101;QD=55.4588;RBI=0.126306;REFB=0;REVB=0.120165;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132643;OID=.;OPOS=187558960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:12:17:0:0:13:18:0:0 chr2 187559047 . G A,GCAA 1032.31 PASS AF=0.375,0.458333;AO=42,31;DP=100;FAO=36,44;FDP=96;FR=.;FRO=16;FSAF=22,27;FSAR=14,17;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00601271,0.0161669;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=112.031,115.482;QD=43.0127;RBI=0.0274307,0.0181019;REFB=-0.0356368,-0.0398158;REVB=-0.0267636,0.00814307;RO=25;SAF=22,24;SAR=20,7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0248324,0.212892;STB=0.535378,0.531482;STBP=0.479,0.46;TYPE=snp,ins;VARB=0.0209066,0.0236795;OID=.,.;OPOS=187559047,187559048;OREF=G,-;OALT=A,CAA;OMAPALT=A,GCAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:100:96:25:16:42,31:36,44:0.375,0.458333:20,7:22,24:14:11:14,17:22,27:8:8 chr2 187559065 . G A 32.07 PASS AF=0.078125;AO=12;DP=128;FAO=10;FDP=128;FR=.;FRO=118;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=70;FSRR=48;FWDB=-0.0242992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.336;QD=1.00231;RBI=0.0245817;REFB=-0.00269514;REVB=-0.00371599;RO=115;SAF=5;SAR=7;SRF=68;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20253;STB=0.755443;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0465282;OID=.;OPOS=187559065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:128:128:115:118:12:10:0.078125:7:5:68:47:7:3:70:48 chr2 188250301 . T A 2274.29 PASS AF=0.993103;AO=142;DP=143;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0015291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.608;QD=62.739;RBI=0.00846917;REFB=-0.0156868;REVB=0.00832998;RO=0;SAF=55;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40284e-08;STB=0.504504;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000183355;OID=.;OPOS=188250301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:143:145:0:1:142:144:0.993103:87:55:0:0:89:55:1:0 chr2 188343497 . T C 499.63 PASS AF=0.482143;AO=53;DP=112;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0067795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.672;QD=17.8439;RBI=0.0143352;REFB=-0.00507453;REVB=0.0126308;RO=59;SAF=20;SAR=33;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220697;STB=0.61107;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00730745;OID=.;OPOS=188343497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:59:58:53:54:0.482143:33:20:36:23:33:21:35:23 chr2 189460553 . T C 2105.56 PASS AF=0.992647;AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.574;QD=61.9282;RBI=0.0215568;REFB=-0.00344664;REVB=0.00209885;RO=1;SAF=70;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674262;STB=0.503546;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=4.16733e-05;OID=.;OPOS=189460553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:135:136:1:1:134:135:0.992647:64:70:1:0:65:70:1:0 chr2 189863389 . C T 370.64 PASS AF=0.453488;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.000359664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.627;QD=17.2391;RBI=0.00838934;REFB=-0.0106982;REVB=0.00838163;RO=46;SAF=25;SAR=14;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775083;STB=0.538636;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00967054;OID=.;OPOS=189863389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:47:39:39:0.453488:14:25:26:20:14:25:27:20 chr2 189864080 . G A 630.34 PASS AF=0.454545;AO=65;DP=143;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.0220653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.72;QD=17.6318;RBI=0.0243468;REFB=-0.00559698;REVB=0.0102905;RO=74;SAF=26;SAR=39;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847244;STB=0.555538;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00569488;OID=.;OPOS=189864080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:74:78:65:65:0.454545:39:26:36:38:39:26:39:39 chr2 189866199 . T A 3470.55 PASS AF=1;AO=222;DP=226;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104239;FXX=0.0176983;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.979;QD=62.5324;RBI=0.0362576;REFB=0.0358714;REVB=0.0347269;RO=1;SAF=127;SAR=95;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373724;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180684;OID=.;OPOS=189866199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:226:222:1:0:222:222:1:95:127:1:0:95:127:0:0 chr2 189875421 . T G 1138.01 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122669;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.041;QD=60.6939;RBI=0.0375083;REFB=0;REVB=0.0354456;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69445e-05;OID=.;OPOS=189875421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:39:36:0:0:39:36:0:0 chr2 189904203 . A G 573.18 PASS AF=0.47619;AO=59;DP=126;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.00246933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.957;QD=18.1962;RBI=0.00969239;REFB=-0.00939683;REVB=0.00937256;RO=66;SAF=26;SAR=33;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133543;STB=0.511274;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00765128;OID=.;OPOS=189904203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:66:66:59:60:0.47619:33:26:30:36:34:26:30:36 chr2 189904233 . T G 570.27 PASS AF=0.522523;AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.00934456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.813;QD=20.5501;RBI=0.0155902;REFB=-0.0314269;REVB=0.0124794;RO=53;SAF=23;SAR=35;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00029477;STB=0.500162;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0254447;OID=.;OPOS=189904233;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:53:53:58:58:0.522523:35:23:21:32:35:23:21:32 chr2 189907937 . A G 416.66 PASS AF=0.494118;AO=41;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00495317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2406;QD=19.6076;RBI=0.0153612;REFB=-0.0202324;REVB=-0.0145408;RO=43;SAF=28;SAR=13;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102991;STB=0.561494;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.027923;OID=.;OPOS=189907937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:43:41:42:0.494118:13:28:25:18:13:29:25:18 chr2 189932831 . T C 1841.06 PASS AF=0.991803;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.023011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.24;QD=60.3628;RBI=0.0230308;REFB=-0.0222778;REVB=0.000955127;RO=1;SAF=69;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683504;STB=0.503596;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=1.48701e-05;OID=.;OPOS=189932831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:122:1:1:120:121:0.991803:51:69:1:0:52:69:1:0 chr2 189948696 . G A 241.16 PASS AF=0.424242;AO=29;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0066531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.621;QD=14.6155;RBI=0.00688661;REFB=-0.0252324;REVB=-0.00177812;RO=37;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083942;STB=0.565686;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0291276;OID=.;OPOS=189948696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:38:29:28:0.424242:14:15:16:21:13:15:16:22 chr2 189953508 . C T 227.1 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0513005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7588;QD=28.387;RBI=0.0542139;REFB=-0.00145268;REVB=0.0175331;RO=11;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127881;STB=0.570505;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00283481;OID=.;OPOS=189953508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:10:11:8:3:10:11:8:3 chr2 189964891 . A G 249.87 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0612953;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.2474;QD=16.6579;RBI=0.0614893;REFB=0.00898668;REVB=0.0048807;RO=32;SAF=10;SAR=18;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197975;STB=0.61157;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.0117886;OID=.;OPOS=189964891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:18:10:18:14:18:10:18:14 chr2 189974958 . G T 575.78 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0857718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7771;QD=60.6081;RBI=0.0899393;REFB=0;REVB=0.0270606;RO=0;SAF=29;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000959331;OID=.;OPOS=189974958;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:9:29:0:0:9:29:0:0 chr2 189997837 . CG C,CA 812.7 PASS AF=0.152542,0.847458;AO=10,49;DP=59;FAO=9,50;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=3,47;FSAR=6,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283622,-0.022836;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=30.4459,42.9044;QD=55.0982;RBI=0.0635007,0.087446;REFB=0,0;REVB=0.0568148,0.0844116;RO=0;SAF=2,48;SAR=8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.33141e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0209254,0.00781032;OID=.,.;OPOS=189997838,189997838;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.152542,0.847458:10,49:59:9,50:59:0:3,47:6,3:0:0:30:0:2,48:8,1:0:0 chr2 190323530 . A G 289.46 PASS AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0191788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.834;QD=13.9498;RBI=0.0193476;REFB=0.00869422;REVB=0.0025505;RO=50;SAF=22;SAR=11;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302216;STB=0.671896;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0179962;OID=.;OPOS=190323530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:50:50:33:33:0.39759:11:22:19:31:11:22:19:31 chr2 190331262 . T C 303.06 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0127637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.701;QD=14.6054;RBI=0.013046;REFB=-0.0158217;REVB=-0.0026991;RO=48;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733315;STB=0.547356;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0220667;OID=.;OPOS=190331262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:49:34:34:0.409639:18:16:26:22:18:16:27:22 chr2 190430177 . A G 561.83 PASS AF=0.434783;AO=60;DP=138;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=0.0156313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8263;QD=16.2848;RBI=0.0683799;REFB=0.0232112;REVB=0.0665693;RO=78;SAF=28;SAR=32;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136792;STB=0.576344;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.0297061;OID=.;OPOS=190430177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:78:78:60:60:0.434783:32:28:47:31:32:28:47:31 chr2 190531426 . G A 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.93;QD=60.2046;RBI=0.00479497;REFB=0;REVB=-0.0040847;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.83926e-06;OID=.;OPOS=190531426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0 chr2 190595258 . G T 1606.99 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0455;QD=64.2794;RBI=0.0613096;REFB=0;REVB=0.037385;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.33134e-05;OID=.;OPOS=190595258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:46:54:0:0:46:54:0:0 chr2 190602513 . T C 933.42 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00674607;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.1285;QD=56.5709;RBI=0.0286259;REFB=0.070339;REVB=0.0278196;RO=1;SAF=29;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160106;STB=0.508472;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00751203;OID=.;OPOS=190602513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:36:29:1:0:36:29:1:0 chr2 190617643 . A G,T 1153.7 PASS AF=0.884615,0.115385;AO=67,11;DP=78;FAO=69,9;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37,0;FSAR=32,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342253,-0.0554643;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.431,29.3785;QD=59.1639;RBI=0.0370613,0.0613187;REFB=0,0;REVB=0.0369029,-0.0261476;RO=0;SAF=35,2;SAR=32,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.62221e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000535497,0.1635;OID=.,.;OPOS=190617643,190617643;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:36:78:78:0:0:67,11:69,9:0.884615,0.115385:32,9:35,2:0:0:32,9:37,0:0:0 chr2 190618249 . T A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00592295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.044;QD=60.6102;RBI=0.00741093;REFB=0;REVB=0.00445426;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.1894e-06;OID=.;OPOS=190618249;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr2 190636411 . C G 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.132;QD=60.0307;RBI=0.0423259;REFB=0;REVB=0.0259827;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66733e-05;OID=.;OPOS=190636411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0 chr2 190788844 . T TC 495.41 PASS AF=1;AO=17;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208886;FXX=0.0285633;HRUN=0;LEN=1;MLLD=67.7821;QD=58.2829;RBI=0.112043;REFB=0;REVB=0.110079;RO=14;SAF=15;SAR=2;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633951;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00192393;OID=.;OPOS=190788845;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:17:35:34:34:0:19:15:0:0:4:14:15:2:2:12 chr2 190788845 . G C 123.39 PASS AF=0.405405;AO=13;DP=35;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0246719;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=61.3148;QD=13.339;RBI=0.0993464;REFB=-0.0294943;REVB=0.0962341;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.643742;STB=0.872304;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0232403;OID=.;OPOS=190788845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:37:21:22:13:15:0.405405:11:2:17:4:13:2:17:5 chr2 190815211 . G A 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0278246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.46;QD=54.7462;RBI=0.0283694;REFB=-0.0347351;REVB=-0.00553313;RO=1;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136578;STB=0.507244;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000696494;OID=.;OPOS=190815211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:34:19:0:1:34:19:0:1 chr2 191066769 . C T 588.68 PASS AF=1;AO=34;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0506;QD=60.3774;RBI=0.0679284;REFB=0;REVB=0.0645093;RO=0;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406043;OID=.;OPOS=191066769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:34:39:1:27:7:0:0:32:7:0:0 chr2 191161622 . T C 1496.04 PASS AF=1;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610255;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.161;QD=59.8415;RBI=0.0616077;REFB=0;REVB=0.00844977;RO=0;SAF=61;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39894e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179668;OID=.;OPOS=191161622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:100:0:0:100:100:1:39:61:0:0:39:61:0:0 chr2 191231458 . G A 1840.85 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1067;QD=61.3615;RBI=0.022683;REFB=0;REVB=-0.00330874;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106488;OID=.;OPOS=191231458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:56:64:0:0:56:64:0:0 chr2 191235901 . A C 1277.3 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0159;QD=59.4092;RBI=0.129054;REFB=0;REVB=0.128303;RO=0;SAF=51;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51863e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00677891;OID=.;OPOS=191235901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:86:0:0:80:86:1:29:51:0:0:35:51:0:0 chr2 191301368 . A G 175.44 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.182337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.024;QD=46.7837;RBI=0.182578;REFB=0;REVB=0.0093788;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326874;OID=.;OPOS=191301368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr2 191354491 . T C 326.04 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00748448;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.603;QD=17.1601;RBI=0.0119109;REFB=-0.00326618;REVB=-0.00926565;RO=41;SAF=15;SAR=20;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340101;STB=0.519073;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00567625;OID=.;OPOS=191354491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:41:41:35:35:0.460526:20:15:19:22:20:15:19:22 chr2 191379268 . G A 102.69 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0255373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.787;QD=9.33509;RBI=0.028764;REFB=0.00428459;REVB=-0.0132367;RO=31;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140939;STB=0.586069;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.017765;OID=.;OPOS=191379268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:9:4:13:18:9:4:13:18 chr2 191402654 . A G 42.65 PASS AF=0.205882;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0345987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.66;QD=5.01757;RBI=0.0670424;REFB=-0.0052629;REVB=-0.0574249;RO=25;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136405;STB=0.578732;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0230542;OID=.;OPOS=191402654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:34:34:25:27:7:7:0.205882:4:3:8:17:4:3:9:18 chr2 191402680 . A G 168.29 PASS AF=0.338462;AO=21;DP=64;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00560297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.487;QD=10.3563;RBI=0.0160245;REFB=-0.00876525;REVB=0.015013;RO=43;SAF=10;SAR=11;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119834;STB=0.583259;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0202946;OID=.;OPOS=191402680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:43:43:21:22:0.338462:11:10:25:18:12:10:25:18 chr2 191402685 . A C 250.47 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0018633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3935;QD=14.7337;RBI=0.0172384;REFB=0.0110394;REVB=-0.0171374;RO=38;SAF=20;SAR=9;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276053;STB=0.663785;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0153693;OID=.;OPOS=191402685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:39:29:29:0.426471:9:20:16:22:9:20:16:23 chr2 191402698 . A C 293.33 PASS AF=0.458333;AO=26;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00226257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1391;QD=16.2959;RBI=0.0218639;REFB=0.0460829;REVB=0.0217466;RO=34;SAF=17;SAR=9;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188192;STB=0.655638;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0512707;OID=.;OPOS=191402698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:39:26:33:0.458333:9:17:16:18:9:24:18:21 chr2 191402702 . T C 315.64 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0175471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6257;QD=17.5355;RBI=0.0339069;REFB=0.00112865;REVB=-0.0290134;RO=37;SAF=25;SAR=9;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255764;STB=0.651884;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00301382;OID=.;OPOS=191402702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:38:34:34:0.472222:9:25:18:19:9:25:18:20 chr2 191402710 . T C 333.45 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00509469;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.854;QD=16.6726;RBI=0.00988944;REFB=-0.0167119;REVB=-0.00847616;RO=44;SAF=27;SAR=9;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314869;STB=0.677977;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.026242;OID=.;OPOS=191402710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:9:27:20:24:9:27:20:24 chr2 191402712 . TA CG 335.46 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00378883;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=136.902;QD=16.9851;RBI=0.00944395;REFB=-0.00757896;REVB=0.00865061;RO=43;SAF=27;SAR=9;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303199;STB=0.671227;STBP=0.01;TYPE=mnp;VARB=0.0103105;OID=.;OPOS=191402712;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:9:27:20:23:9:27:20:23 chr2 191402748 . A T 330.02 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0145574;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.948;QD=15.5304;RBI=0.0156157;REFB=-0.0105072;REVB=-0.00565066;RO=48;SAF=26;SAR=10;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224022;STB=0.62257;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0170599;OID=.;OPOS=191402748;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:48:49:36:36:0.423529:10:26:25:23:10:26:26:23 chr2 191402761 . G A 288.86 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0405419;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.982;QD=16.048;RBI=0.0423907;REFB=0.00925842;REVB=-0.0123827;RO=40;SAF=25;SAR=7;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272277;STB=0.65503;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00953898;OID=.;OPOS=191402761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:40:40:32:32:0.444444:7:25:22:18:7:25:22:18 chr2 191402775 . T C 254.41 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0313715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.6;QD=15.4185;RBI=0.031664;REFB=-0.0101056;REVB=-0.00429362;RO=37;SAF=25;SAR=4;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39997;STB=0.730806;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0022438;OID=.;OPOS=191402775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:4:25:21:16:4:25:21:16 chr2 191402778 . T C 233.09 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0123432;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.071;QD=14.7995;RBI=0.0147025;REFB=0.00895835;REVB=0.00798805;RO=36;SAF=26;SAR=1;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.683899;STB=0.905325;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00515821;OID=.;OPOS=191402778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:1:26:20:16:1:26:20:16 chr2 192160839 . A T 526.49 PASS AF=0.431818;AO=57;DP=132;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=0.0430994;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.431;QD=15.9542;RBI=0.0467962;REFB=3.78544e-05;REVB=-0.0182298;RO=75;SAF=25;SAR=32;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962393;STB=0.553714;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=1.32372e-05;OID=.;OPOS=192160839;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:75:75:57:57:0.431818:32:25:26:49:32:25:26:49 chr2 192160875 . C T 528.73 PASS AF=0.44186;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=0.0211288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.337;QD=16.3946;RBI=0.0214937;REFB=-0.00675504;REVB=-0.00394385;RO=72;SAF=24;SAR=33;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768471;STB=0.542818;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00959588;OID=.;OPOS=192160875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:72:72:57:57:0.44186:33:24:25:47:33:24:25:47 chr2 192214966 . T C 412.87 PASS AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0171755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9446;QD=21.448;RBI=0.0289953;REFB=0.0237559;REVB=0.0233608;RO=34;SAF=23;SAR=18;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746513;STB=0.554542;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.0201942;OID=.;OPOS=192214966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:36:41:41:0.532468:18:23:16:18:18:23:16:20 chr2 192250726 . G A 892.41 PASS AF=0.969697;AO=61;DP=64;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0452591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.525;QD=54.0852;RBI=0.0508562;REFB=-0.0179003;REVB=0.023194;RO=2;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325244;STB=0.516124;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00156165;OID=.;OPOS=192250726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:64:66:2:2:61:64:0.969697:28:33:0:2:30:34:0:2 chr2 192279327 . T C 1609.58 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156159;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=320.212;QD=60.1711;RBI=0.0318029;REFB=0;REVB=0.027705;RO=0;SAF=55;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99468e-05;OID=.;OPOS=192279327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:51:55:0:0:51:56:0:0 chr2 192699639 . A AG 1839.2 PASS AF=1;AO=148;DP=159;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658227;FXX=0.0256394;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.6109;QD=48.4001;RBI=0.0697558;REFB=0;REVB=-0.0230922;RO=10;SAF=79;SAR=69;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00407448;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000214739;OID=.;OPOS=192699640;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:148:159:152:152:0:81:71:0:0:33:10:79:69:5:5 chr2 192701393 . A G 1880.31 PASS AF=0.991935;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0415193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.647;QD=60.655;RBI=0.0447798;REFB=-0.0990427;REVB=0.0167742;RO=1;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748166;STB=0.503936;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000348913;OID=.;OPOS=192701393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:124:1:1:123:123:0.991935:63:60:0:1:63:60:0:1 chr2 195523141 . G T 804.37 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.075386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0947;QD=55.4736;RBI=0.0851712;REFB=-0.130753;REVB=0.0396371;RO=1;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229942;STB=0.512191;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00275196;OID=.;OPOS=195523141;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:20:37:0:1:20:37:0:1 chr2 196601214 . AATAT A 93.86 PASS AF=0.394737;AO=13;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.000424492;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=297.115;QD=9.87995;RBI=0.0111923;REFB=-0.0300109;REVB=0.0111843;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748266;STB=0.548322;STBP=0.659;TYPE=del;VARB=0.0463322;OID=.;OPOS=196601215;OREF=ATAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.394737:13:37:15:38:23:6:9:11:12:93:22:6:7:10:12 chr2 196602089 . TATCA TATCAATCA,T 504.22 PASS AF=0.564103,0.410256;AO=17,14;DP=38;FAO=22,16;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=11,6;FSAR=11,10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212451,0.0352785;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=4,4;MLLD=87.191,226.302;QD=51.7149;RBI=0.0228332,0.0355002;REFB=-0.0525208,-0.0555508;REVB=0.00836642,0.00396135;RO=0;SAF=7,6;SAR=10,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.521719,0.538413;STBP=0.515,0.294;TYPE=ins,del;VARB=0.0250154,0.01431;OID=.,.;OPOS=196602090,196602090;OREF=-,ATCA;OALT=ATCA,-;OMAPALT=TATCAATCA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.564103,0.410256:17,14:38:22,16:39:1:11,6:11,10:1:0:99:0:7,6:10,8:0:0 chr2 196602132 . GTGAT G 341.63 PASS AF=0.604167;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00472575;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=4;MLLD=287.77;QD=28.4688;RBI=0.0216941;REFB=-0.0317696;REVB=0.0211731;RO=17;SAF=20;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185874;STB=0.613416;STBP=0.063;TYPE=del;VARB=0.0179638;OID=.;OPOS=196602133;OREF=TGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.604167:28:50:29:48:19:20:9:8:11:99:17:20:8:8:9 chr2 196673533 . A G 756.82 PASS AF=1;AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4505;QD=54.0588;RBI=0.146736;REFB=-0.094906;REVB=0.146727;RO=2;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303841;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00743497;OID=.;OPOS=196673533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:56:56:2:0:54:56:1:30:24:0:2:32:24:0:0 chr2 196791276 . T G 421.28 PASS AF=0.569444;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00475146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.276;QD=23.4043;RBI=0.0142626;REFB=0.00491912;REVB=0.0134479;RO=31;SAF=20;SAR=21;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104644;STB=0.557416;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00803179;OID=.;OPOS=196791276;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:31:31:41:41:0.569444:21:20:11:20:21:20:11:20 chr2 196799394 . A G 426.92 PASS AF=0.538462;AO=41;DP=77;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.013161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.675;QD=21.8935;RBI=0.0149656;REFB=-0.0194272;REVB=0.00712438;RO=36;SAF=14;SAR=27;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232594;STB=0.631515;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0183984;OID=.;OPOS=196799394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:36:36:41:42:0.538462:27:14:22:14:28:14:22:14 chr2 196851911 . G A 199.08 PASS AF=0.4;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0286734;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.766;QD=13.2718;RBI=0.0286891;REFB=0.000728415;REVB=0.000948456;RO=35;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028483;STB=0.508373;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.00132009;OID=.;OPOS=196851911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:35:36:24:24:0.4:13:11:17:18:13:11:17:19 chr2 196866420 . C T 663.5 PASS AF=0.45283;AO=72;DP=159;FAO=72;FDP=159;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=-0.0116799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=311.671;QD=16.6919;RBI=0.0203008;REFB=-0.0119785;REVB=-0.0166043;RO=86;SAF=28;SAR=44;SRF=49;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178131;STB=0.602077;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0138627;OID=.;OPOS=196866420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:86:87:72:72:0.45283:44:28:49:37:44:28:50:37 chr2 196915991 . A G 1790.3 PASS AF=0.9;AO=124;DP=137;FAO=126;FDP=140;FR=.;FRO=14;FSAF=53;FSAR=73;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00118949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2751;QD=51.1515;RBI=0.0163906;REFB=0.00431464;REVB=-0.0163474;RO=13;SAF=53;SAR=71;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203039;STB=0.515391;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.00800798;OID=.;OPOS=196915991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:137:140:13:14:124:126:0.9:71:53:7:6:73:53:8:6 chr2 197004439 . A G 2351.14 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.301;QD=63.9766;RBI=0.0243741;REFB=0;REVB=0.00323209;RO=0;SAF=80;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65164e-05;OID=.;OPOS=197004439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:67:80:0:0:67:80:0:0 chr2 197021276 . T C 629.15 PASS AF=0.589474;AO=56;DP=95;FAO=56;FDP=95;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0230929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.23;QD=26.4904;RBI=0.0236396;REFB=-0.0148729;REVB=-0.00505456;RO=39;SAF=33;SAR=23;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586919;STB=0.532042;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0117978;OID=.;OPOS=197021276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:39:39:56:56:0.589474:23:33:20:19:23:33:20:19 chr2 197021372 . T A 871.55 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000593183;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.04;QD=56.2289;RBI=0.0151117;REFB=-0.114495;REVB=0.0151001;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.508472;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000165692;OID=.;OPOS=197021372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:32:29:1:0:32:29:1:0 chr2 197065221 . A G 1607.05 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00299869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.451;QD=60.0766;RBI=0.0505078;REFB=0;REVB=0.0504187;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03805e-05;OID=.;OPOS=197065221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:45:62:0:0:45:62:0:0 chr2 197065415 . T C 173.49 PASS AF=0.269663;AO=24;DP=89;FAO=24;FDP=89;FR=.;FRO=65;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=0.0367578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6626;QD=7.79717;RBI=0.0571818;REFB=0.00830855;REVB=0.043802;RO=65;SAF=9;SAR=15;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28651;STB=0.671095;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.0198176;OID=.;OPOS=197065415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:65:65:24:24:0.269663:15:9:40:25:15:9:40:25 chr2 197118729 . C T 1043.77 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00180539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.488;QD=59.6437;RBI=0.0473826;REFB=0;REVB=0.0473482;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129428;OID=.;OPOS=197118729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:31:38:0:0:32:38:0:0 chr2 197154234 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.566;QD=62.3505;RBI=0.0160968;REFB=0;REVB=0.0155102;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40871e-05;OID=.;OPOS=197154234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr2 197184321 . C T 1030.38 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262199;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.713;QD=58.0498;RBI=0.0264947;REFB=-0.103588;REVB=-0.00380624;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000170551;OID=.;OPOS=197184321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:71:0:1:70:70:0.985915:36:34:0:0:36:34:1:0 chr2 197504545 . C G 1028.71 PASS AF=1;AO=57;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.686;QD=59.6352;RBI=0.145046;REFB=0;REVB=0.140543;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249908;OID=.;OPOS=197504545;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:57:69:1:29:28:0:0:39:30:0:0 chr2 197890001 . C T 231.16 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00695403;FXX=0.0555453;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.127;QD=18.1299;RBI=0.0201378;REFB=0.0102147;REVB=-0.018899;RO=23;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678905;STB=0.554411;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.0132671;OID=.;OPOS=197890001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:51:23:26:25:25:0.490196:16:9:10:13:16:9:12:14 chr2 198001319 . A G 972.58 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.117;QD=58.9441;RBI=0.106868;REFB=0;REVB=0.00245273;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540948;OID=.;OPOS=198001319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr2 198257795 . T C 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0109302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.695;QD=16.1723;RBI=0.0214394;REFB=0.00857967;REVB=0.018444;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313311;STB=0.681577;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.0133315;OID=.;OPOS=198257795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:12:4:11:9:12:4:11:9 chr2 198265526 . A G 187.95 PASS AF=0.324324;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0208569;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.652;QD=10.1595;RBI=0.0220453;REFB=-0.014474;REVB=-0.00714024;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116901;STB=0.513502;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0422533;OID=.;OPOS=198265526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:74:49:50:24:24:0.324324:12:12:25:24:12:12:26:24 chr2 198283305 . T C 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0106303;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.822;QD=16.9316;RBI=0.011017;REFB=0.00794961;REVB=0.00289351;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152196;STB=0.588084;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.00582198;OID=.;OPOS=198283305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:6:6:8:4:6:6 chr2 198327314 . G A 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0360861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.665;QD=22.3411;RBI=0.0361008;REFB=-0.0116786;REVB=-0.00102873;RO=14;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125302;STB=0.507034;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00696885;OID=.;OPOS=198327314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:10:8:6:8:10:8:6:8 chr2 198362018 . T C 177.21 PASS AF=0.513514;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0347455;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.157;QD=19.1583;RBI=0.0348076;REFB=-0.00664054;REVB=-0.00207924;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10071;STB=0.544333;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0063261;OID=.;OPOS=198362018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:18:19:0.513514:10:8:6:12:11:8:6:12 chr2 198363504 . A G 211.68 PASS AF=0.416667;AO=24;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00646234;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.251;QD=14.1119;RBI=0.0117156;REFB=-0.0115725;REVB=0.0097721;RO=36;SAF=9;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756676;STB=0.559392;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0186343;OID=.;OPOS=198363504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:36:35:24:25:0.416667:15:9:16:20:16:9:16:19 chr2 198508951 . G A 531.05 PASS AF=0.448819;AO=57;DP=126;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.00418476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7976;QD=16.7261;RBI=0.0469086;REFB=-0.00211393;REVB=0.0467215;RO=69;SAF=20;SAR=37;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254388;STB=0.638237;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00393453;OID=.;OPOS=198508951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:69:70:57:57:0.448819:37:20:42:27:37:20:42:28 chr2 198572076 . A ATTC 221.29 PASS AF=0.947368;AO=17;DP=21;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00312215;FXX=0.0951928;HRUN=2;LEN=3;MLLD=113.702;QD=46.5875;RBI=0.0284571;REFB=-0.0797825;REVB=0.0282853;RO=1;SAF=11;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398535;STB=0.521715;STBP=0.522;TYPE=ins;VARB=0.00843984;OID=.;OPOS=198572077;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=ATTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.947368:17:21:18:19:1:11:7:1:0:6:1:11:6:1:0 chr2 198572461 . C T 356.49 PASS AF=0.413462;AO=39;DP=100;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.00693961;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.893;QD=13.7113;RBI=0.00789315;REFB=-0.0214086;REVB=0.00376079;RO=60;SAF=30;SAR=9;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288378;STB=0.583852;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0294016;OID=.;OPOS=198572461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:104:60:61:39:43:0.413462:9:30:32:28:14:29:33:28 chr2 198950029 . A G 114.93 PASS AF=0.304348;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0226283;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4688;QD=9.99419;RBI=0.0233655;REFB=-0.0227318;REVB=0.00582323;RO=31;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167402;STB=0.586836;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0351904;OID=.;OPOS=198950029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:31:32:14:14:0.304348:7:7:11:20:7:7:12:20 chr2 200136583 . T A 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.599;QD=57.5452;RBI=0.0280865;REFB=0;REVB=-0.0192737;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76438e-06;OID=.;OPOS=200136583;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0 chr2 200790050 . A G 139.64 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0266932;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.651;QD=11.8844;RBI=0.026845;REFB=-0.00473898;REVB=0.00285094;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131019;STB=0.578418;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00976985;OID=.;OPOS=200790050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:28:31:16:16:0.340426:9:7:9:19:9:7:10:21 chr2 200790216 . C T 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0253656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.861;QD=14.7942;RBI=0.0324014;REFB=-0.0191693;REVB=-0.0201602;RO=27;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078716;STB=0.545405;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0150891;OID=.;OPOS=200790216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:10:8:10:17:10:8:10:17 chr2 200792881 . C T 1525.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.441;QD=59.833;RBI=0.0184748;REFB=0;REVB=-0.0154784;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.59437e-06;OID=.;OPOS=200792881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:57:45:0:0:57:45:0:0 chr2 201173767 . T G 358.02 PASS AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00879399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.744;QD=19.6173;RBI=0.0108467;REFB=-0.0224362;REVB=0.00634949;RO=36;SAF=19;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126726;STB=0.507038;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0215533;OID=.;OPOS=201173767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:18:19:19:17:18:19:19:17 chr2 201253956 . A G 379.65 PASS AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.022189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.256;QD=22.0084;RBI=0.0231713;REFB=-0.0272205;REVB=-0.00667514;RO=31;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0083118;STB=0.504585;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0207252;OID=.;OPOS=201253956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:18:20:16:15:18:20:16:15 chr2 201344434 . A G 176.96 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0814706;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.235;QD=20.2236;RBI=0.0821571;REFB=-0.0102307;REVB=0.010598;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51427;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0159116;OID=.;OPOS=201344434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:16:17:18:18:0.514286:9:9:8:8:9:9:8:9 chr2 201344491 . G A 128.83 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0246173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6095;QD=12.5689;RBI=0.0248954;REFB=-0.0167347;REVB=-0.00371078;RO=26;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225901;STB=0.633152;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0281003;OID=.;OPOS=201344491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:10:5:14:12:10:5:14:12 chr2 201344732 . C T 368.31 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0595867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.948;QD=16.7413;RBI=0.0625719;REFB=-0.0111244;REVB=-0.0190962;RO=49;SAF=18;SAR=21;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949051;STB=0.553165;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0160842;OID=.;OPOS=201344732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:21:18:18:31:21:18:18:31 chr2 201354935 . C G 480.98 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0249695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.159;QD=20.2519;RBI=0.0250577;REFB=-0.0308882;REVB=0.00210087;RO=48;SAF=25;SAR=22;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670001;STB=0.537137;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0376379;OID=.;OPOS=201354935;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:48:48:47:47:0.494737:22:25:22:26:22:25:22:26 chr2 201437328 . C A 207.6 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0430339;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3796;QD=15.0984;RBI=0.0491681;REFB=-0.0181809;REVB=-0.0237819;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073137;STB=0.550639;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0400769;OID=.;OPOS=201437328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:32:31:24:24:0.436364:13:11:17:15:13:11:17:14 chr2 201437334 . T C 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.54;QD=64.1539;RBI=0.0308469;REFB=0;REVB=0.0220506;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.307e-05;OID=.;OPOS=201437334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr2 201468732 . C G 101.16 PASS AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00270831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.401;QD=8.42979;RBI=0.0257041;REFB=-0.00310454;REVB=0.025561;RO=31;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800431;STB=0.554371;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0210994;OID=.;OPOS=201468732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:35:13:13:0.270833:8:5:14:17:8:5:16:19 chr2 201468785 . C G 90.76 PASS AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0206689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.9;QD=8.06766;RBI=0.0489047;REFB=-0.000439831;REVB=-0.0443223;RO=33;SAF=4;SAR=8;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253115;STB=0.656453;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00106628;OID=.;OPOS=201468785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:8:4:18:15:8:4:18:15 chr2 202245244 . A G 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0245335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.423;QD=18.1751;RBI=0.0283051;REFB=-0.000980662;REVB=-0.0141168;RO=32;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239822;STB=0.633352;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.000999281;OID=.;OPOS=202245244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:17:14:23:9:17:14:23:9 chr2 202252539 . G A 596.87 PASS AF=0.623529;AO=53;DP=85;FAO=53;FDP=85;FR=.;FRO=32;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0576615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6791;QD=28.0877;RBI=0.0754675;REFB=-0.00662952;REVB=0.0486877;RO=32;SAF=33;SAR=20;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660302;STB=0.535949;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00502642;OID=.;OPOS=202252539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:32:32:53:53:0.623529:20:33:17:15:20:33:17:15 chr2 202260049 . G A 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00989151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.785;QD=62.982;RBI=0.0176304;REFB=0;REVB=0.0145941;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16487e-05;OID=.;OPOS=202260049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0 chr2 202264156 . C T 554.18 PASS AF=0.44697;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=-0.00749016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.558;QD=16.7934;RBI=0.0132612;REFB=-0.00825661;REVB=-0.0109434;RO=73;SAF=34;SAR=25;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559951;STB=0.531239;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00842485;OID=.;OPOS=202264156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:73:59:59:0.44697:25:34:38:35:25:34:38:35 chr2 202337730 . A G 429.31 PASS AF=0.494253;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.00897934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.099;QD=19.7384;RBI=0.0129701;REFB=-0.0148176;REVB=0.00935925;RO=44;SAF=23;SAR=20;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17552;STB=0.5972;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0199903;OID=.;OPOS=202337730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:44:43:43:0.494253:20:23:15:29:20:23:15:29 chr2 202342402 . G T 342.68 PASS AF=0.368421;AO=42;DP=114;FAO=42;FDP=114;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.00310218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.803;QD=12.0238;RBI=0.0031421;REFB=-0.00898299;REVB=0.000499316;RO=72;SAF=20;SAR=22;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439753;STB=0.502511;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0163809;OID=.;OPOS=202342402;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:72:72:42:42:0.368421:22:20:34:38:22:20:34:38 chr2 202357949 . A C 272.51 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8092;QD=51.9073;RBI=0.0582962;REFB=0;REVB=0.0504955;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239299;OID=.;OPOS=202357949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr2 202410300 . A T 510.26 PASS AF=0.61039;AO=47;DP=77;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00925865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.63;QD=26.5071;RBI=0.01996;REFB=0.00491985;REVB=0.0176827;RO=30;SAF=36;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298656;STB=0.664047;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00170948;OID=.;OPOS=202410300;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:30:30:47:47:0.61039:11:36:12:18:11:36:12:18 chr2 202469361 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.93;QD=57.2022;RBI=0.0389629;REFB=0;REVB=0.00576435;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012341;OID=.;OPOS=202469361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0 chr2 202507353 . G C 250.17 PASS AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=0.00983419;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.883;QD=13.167;RBI=0.0126596;REFB=-0.0177832;REVB=0.00797211;RO=47;SAF=5;SAR=24;SRF=11;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106106;STB=0.561358;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0230461;OID=.;OPOS=202507353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:47:47:29:29:0.381579:24:5:11:36:24:5:11:36 chr2 202512449 . C T 330.04 PASS AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00816768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.845;QD=18.3355;RBI=0.0186569;REFB=0.00554246;REVB=0.0167741;RO=37;SAF=17;SAR=18;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100084;STB=0.555788;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.00677312;OID=.;OPOS=202512449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:18:17:22:15:18:17:22:15 chr2 202557702 . C T 689.35 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00217168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4705;QD=62.6683;RBI=0.0194016;REFB=0;REVB=0.0192796;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227809;OID=.;OPOS=202557702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0 chr2 202575821 . G A 306.3 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8916;QD=53.2688;RBI=0.0285732;REFB=0;REVB=-0.00761538;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380425;OID=.;OPOS=202575821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0 chr2 202625615 . C T 1374.83 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00672031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.619;QD=62.4925;RBI=0.0215138;REFB=0;REVB=-0.0204372;RO=0;SAF=55;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92665e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50587e-07;OID=.;OPOS=202625615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:32:55:0:0:32:56:0:0 chr2 202633582 . A G 598.64 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00904406;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.205;QD=61.3991;RBI=0.0091057;REFB=0;REVB=0.00105771;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.55024e-05;OID=.;OPOS=202633582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr2 202741256 . A T 1511.11 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285478;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.777;QD=59.8461;RBI=0.0370523;REFB=0;REVB=-0.0236199;RO=0;SAF=41;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64937e-05;OID=.;OPOS=202741256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:60:41:0:0:60:41:0:0 chr2 202741269 . G A 1530.04 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.254;QD=63.7516;RBI=0.0506349;REFB=0;REVB=0.035988;RO=0;SAF=37;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130413;OID=.;OPOS=202741269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:59:37:0:0:59:37:0:0 chr2 202964380 . G A 308.61 PASS AF=0.507692;AO=32;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0116931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.42;QD=18.9915;RBI=0.0130085;REFB=-0.0126967;REVB=-0.00570032;RO=32;SAF=19;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168007;STB=0.59863;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0144722;OID=.;OPOS=202964380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:32:33:0.507692:13:19:13:19:13:20:13:19 chr2 203155936 . A C 322.7 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0619001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.569;QD=21.8777;RBI=0.0803308;REFB=-0.0107963;REVB=0.0511996;RO=26;SAF=17;SAR=16;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120847;STB=0.506676;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0102339;OID=.;OPOS=203155936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:16:17:13:13:16:17:13:13 chr2 203421199 . G A 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0197091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.323;QD=12.0157;RBI=0.0219566;REFB=0.00153544;REVB=0.00967707;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484388;STB=0.529316;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=-0.000441689;OID=.;OPOS=203421199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:2:5:4:2:2:5 chr2 203640713 . T C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00902938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.684;QD=9.44485;RBI=0.0265335;REFB=-0.0160161;REVB=0.0249499;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203317;STB=0.624609;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0265623;OID=.;OPOS=203640713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:7:3:3:3:7:3 chr2 204062061 . A G 651.31 PASS AF=0.478261;AO=66;DP=138;FAO=66;FDP=138;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0033752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.023;QD=18.8786;RBI=0.0102497;REFB=-0.0010902;REVB=-0.00967806;RO=72;SAF=27;SAR=39;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086967;STB=0.548178;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000742061;OID=.;OPOS=204062061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:72:72:66:66:0.478261:39:27:36:36:39:27:36:36 chr2 204090887 . C G 314.99 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00646877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.034;QD=19.999;RBI=0.0186082;REFB=-0.00117443;REVB=0.0174476;RO=30;SAF=14;SAR=19;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122345;STB=0.567943;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00152503;OID=.;OPOS=204090887;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:19:14:17:13:19:14:17:13 chr2 204116690 . C T 331.65 PASS AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.00164045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.169;QD=21.3968;RBI=0.0713286;REFB=0.00448189;REVB=-0.0713098;RO=28;SAF=23;SAR=11;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358054;STB=0.519769;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=-0.00215132;OID=.;OPOS=204116690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:28:34:34:0.548387:11:23:20:8:11:23:20:8 chr2 204206977 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.878;QD=59.4356;RBI=0.034425;REFB=0;REVB=-0.0203602;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2461e-05;OID=.;OPOS=204206977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr2 204298736 . C T 510.6 PASS AF=0.395833;AO=56;DP=141;FAO=57;FDP=144;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=0.011805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.068;QD=14.1833;RBI=0.0189304;REFB=-0.0199715;REVB=-0.0147986;RO=84;SAF=23;SAR=33;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453257;STB=0.516773;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0344617;OID=.;OPOS=204298736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:144:84:87:56:57:0.395833:33:23:38:46:33:24:39:48 chr2 204298783 . A C 283.08 PASS AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0677263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7357;QD=28.3083;RBI=0.0850959;REFB=-0.0773656;REVB=0.0515215;RO=14;SAF=15;SAR=10;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203729;STB=0.623664;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0507998;OID=.;OPOS=204298783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:14:15:25:25:0.625:10:15:4:10:10:15:4:11 chr2 204298787 . A C 178.22 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0720467;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0546;QD=20.9676;RBI=0.0844597;REFB=-0.0463383;REVB=-0.0440763;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342335;STB=0.691625;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0467324;OID=.;OPOS=204298787;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:3:13:7:11:3:13 chr2 204298791 . A C 151.24 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0628412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9261;QD=20.1655;RBI=0.0690938;REFB=-0.0214333;REVB=0.0287217;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329074;STB=0.685263;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0158122;OID=.;OPOS=204298791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:6:10:3:11:6:10:3:11 chr2 204298795 . A C 84.44 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.027881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5347;QD=10.8959;RBI=0.0333196;REFB=-0.0451626;REVB=0.0182441;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150282;STB=0.590194;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0794832;OID=.;OPOS=204298795;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:4:7:10:10:4:7:10:10 chr2 204298802 . T G 188.85 PASS AF=0.465116;AO=19;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0129328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9441;QD=17.5677;RBI=0.0250142;REFB=-0.0496659;REVB=0.0214116;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133281;STB=0.554403;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0321173;OID=.;OPOS=204298802;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:23:19:20:0.465116:8:11:17:7:8:12:16:7 chr2 204299256 . C T 341.85 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0121917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.393;QD=18.4781;RBI=0.0189015;REFB=-0.00399983;REVB=-0.0144439;RO=38;SAF=15;SAR=21;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101774;STB=0.556786;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00420956;OID=.;OPOS=204299256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:21:15:20:18:21:15:20:18 chr2 204304214 . G A 718.19 PASS AF=0.634615;AO=66;DP=104;FAO=66;FDP=104;FR=.;FRO=38;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00602411;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=255.992;QD=27.6227;RBI=0.00736249;REFB=-0.0182245;REVB=-0.00423277;RO=37;SAF=39;SAR=27;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14166;STB=0.581554;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00912465;OID=.;OPOS=204304214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:37:38:66:66:0.634615:27:39:14:23:27:39:14:24 chr2 204322298 . T C 209.36 PASS AF=0.458333;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0281036;FXX=0.020404;HRUN=6;LEN=1;MLLD=50.9985;QD=17.4465;RBI=0.0443793;REFB=-0.00669755;REVB=-0.0343469;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168346;STB=0.503813;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00179692;OID=.;OPOS=204322298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:48:24:26:21:22:0.458333:10:11:13:11:10:12:14:12 chr2 204732714 . A G 734.25 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00235753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.89;QD=61.1874;RBI=0.00903869;REFB=-0.0560875;REVB=0.00872582;RO=1;SAF=14;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032403;STB=0.517234;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=9.89784e-05;OID=.;OPOS=204732714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:48:48:1:1:47:47:0.979167:33:14:1:0:33:14:1:0 chr2 204824283 . T G 300.48 PASS AF=0.404762;AO=33;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00456026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1776;QD=14.3087;RBI=0.0355891;REFB=0.0168301;REVB=0.0352957;RO=50;SAF=15;SAR=18;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903207;STB=0.541234;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.0191811;OID=.;OPOS=204824283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:50:33:34:0.404762:18:15:27:23:18:16:27:23 chr2 205829991 . C T 231.52 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.00533251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.128;QD=12.3475;RBI=0.00813834;REFB=-0.0139356;REVB=0.00614791;RO=47;SAF=19;SAR=9;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00285006;STB=0.501638;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0225752;OID=.;OPOS=205829991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:9:19:32:15:9:19:32:15 chr2 205912403 . T C 566.37 PASS AF=0.537736;AO=57;DP=106;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0170823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.547;QD=21.3726;RBI=0.0181197;REFB=-0.00637936;REVB=0.00604317;RO=49;SAF=26;SAR=31;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968619;STB=0.553187;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00445028;OID=.;OPOS=205912403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:49:49:57:57:0.537736:31:26:28:21:31:26:28:21 chr2 205969220 . G A 1020.3 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.908;QD=59.1478;RBI=0.0315103;REFB=0;REVB=0.0041957;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03716e-05;OID=.;OPOS=205969220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:69:0:0:66:69:1:32:34:0:0:33:36:0:0 chr2 205986321 . A G 244.09 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0238967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8558;QD=18.7764;RBI=0.0303075;REFB=0.0174671;REVB=0.0186411;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144759;STB=0.580686;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.0172839;OID=.;OPOS=205986321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:19:7:11:15:19:7 chr2 205990353 . C T 840.18 PASS AF=0.557143;AO=78;DP=140;FAO=78;FDP=140;FR=.;FRO=62;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.0113786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.276;QD=24.0052;RBI=0.0113786;REFB=-0.0153531;REVB=-3.87445e-06;RO=61;SAF=43;SAR=35;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00836111;STB=0.501295;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0122685;OID=.;OPOS=205990353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:61:62:78:78:0.557143:35:43:33:28:35:43:34:28 chr2 206218963 . G A 387.08 PASS AF=0.373984;AO=46;DP=126;FAO=46;FDP=123;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.00615576;FXX=0.0238076;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.37;QD=12.588;RBI=0.00625701;REFB=-0.00659426;REVB=0.00112104;RO=77;SAF=14;SAR=32;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120101;STB=0.568689;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0106801;OID=.;OPOS=206218963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:123:77:77:46:46:0.373984:32:14:31:46:32:14:31:46 chr2 206219012 . TA CC 339.02 PASS AF=0.355932;AO=42;DP=119;FAO=42;FDP=118;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=-0.0131373;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=2;MLLD=136.923;QD=11.4923;RBI=0.0132392;REFB=-0.00728915;REVB=-0.00163994;RO=76;SAF=9;SAR=33;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184936;STB=0.6072;STBP=0.135;TYPE=mnp;VARB=0.0134082;OID=.;OPOS=206219012;OREF=TA;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:76:76:42:42:0.355932:33:9:26:50:33:9:26:50 chr2 206364737 . T C 1586.24 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.693;QD=59.8581;RBI=0.0104319;REFB=0;REVB=0.0102718;RO=0;SAF=38;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11471e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46526e-05;OID=.;OPOS=206364737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:67:38:0:0:68:38:0:0 chr2 206581033 . G A 1849.08 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5531;QD=61.1265;RBI=0.0385275;REFB=0;REVB=-0.0300903;RO=0;SAF=55;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216943;OID=.;OPOS=206581033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:65:55:0:0:65:56:0:0 chr2 206592695 . T C 1006.93 PASS AF=0.495192;AO=103;DP=209;FAO=103;FDP=208;FR=.;FRO=105;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=46;FSRR=59;FWDB=-0.00396005;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.027;QD=19.364;RBI=0.00627573;REFB=-0.0112102;REVB=0.00486855;RO=105;SAF=47;SAR=56;SRF=46;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168816;STB=0.509279;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0111944;OID=.;OPOS=206592695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:105:105:103:103:0.495192:56:47:46:59:56:47:46:59 chr2 206608039 . T C 817.67 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3771;QD=57.3803;RBI=0.0118051;REFB=0;REVB=-0.0007912;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19216e-05;OID=.;OPOS=206608039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr2 206863874 . C T 118.32 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.131002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5546;QD=12.7912;RBI=0.132301;REFB=-0.0276659;REVB=-0.0184899;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20862;STB=0.621458;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0367833;OID=.;OPOS=206863874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:7:7:7:16:7:7:7:16 chr2 206874339 . G A 417.96 PASS AF=0.379845;AO=49;DP=128;FAO=49;FDP=129;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=0.017689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.419;QD=12.9601;RBI=0.0250988;REFB=0.00213126;REVB=0.0178058;RO=79;SAF=32;SAR=17;SRF=54;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371028;STB=0.515145;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.00476116;OID=.;OPOS=206874339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:79:80:49:49:0.379845:17:32:54:25:17:32:54:26 chr2 206911228 . G A 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00788356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.585;QD=16.4166;RBI=0.0119429;REFB=-0.00136155;REVB=-0.00897122;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510947;STB=0.52937;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00265397;OID=.;OPOS=206911228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:6:10:8:6:6:10 chr2 206921451 . G A 234.95 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00556006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=343.295;QD=18.7957;RBI=0.00574107;REFB=-0.00449123;REVB=-0.00143022;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038358;STB=0.52172;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00626258;OID=.;OPOS=206921451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:12:11:14:13:12:11:14:13 chr2 207006676 . T C 275.73 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0132701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4804;QD=25.6489;RBI=0.0138643;REFB=-0.00465874;REVB=0.00401542;RO=18;SAF=16;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192904;STB=0.607123;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00398103;OID=.;OPOS=207006676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:9:16:7:11:9:16:7:11 chr2 207008763 . C A 269.75 PASS AF=0.538462;AO=27;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00463812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.744;QD=20.7498;RBI=0.0272547;REFB=-0.0114917;REVB=0.0268572;RO=25;SAF=10;SAR=17;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981079;STB=0.531227;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00946951;OID=.;OPOS=207008763;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:24:27:28:0.538462:17:10:12:13:17:11:11:13 chr2 207041053 . T C 234.99 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0227523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8299;QD=15.4093;RBI=0.0295724;REFB=-0.0156116;REVB=-0.0188908;RO=34;SAF=16;SAR=11;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177537;STB=0.60041;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0249295;OID=.;OPOS=207041053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:11:16:14:20:11:16:14:20 chr2 207086148 . T C 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00272338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.363;QD=57.2373;RBI=0.0315629;REFB=0;REVB=0.0314451;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123157;OID=.;OPOS=207086148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr2 207172770 . A G 283.53 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.014713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.909;QD=19.8966;RBI=0.0313433;REFB=-0.0116288;REVB=0.0276755;RO=26;SAF=15;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128787;STB=0.578896;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0119191;OID=.;OPOS=207172770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:27:30:30:0.526316:15:15:9:17:15:15:9:18 chr2 207459467 . C T 1202.76 PASS AF=0.428094;AO=128;DP=299;FAO=128;FDP=299;FR=.;FRO=171;FSAF=57;FSAR=71;FSRF=84;FSRR=87;FWDB=-0.00795704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.283;QD=16.0905;RBI=0.00917523;REFB=-0.0142015;REVB=0.00456842;RO=170;SAF=57;SAR=71;SRF=83;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443098;STB=0.52642;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0197572;OID=.;OPOS=207459467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:170:171:128:128:0.428094:71:57:83:87:71:57:84:87 chr2 207472683 . C CTA 739.07 PASS AF=0.438889;AO=78;DP=185;FAO=79;FDP=180;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=51;FSRR=50;FWDB=-0.00664648;FXX=0.0322563;HRUN=1;LEN=2;MLLD=268.053;QD=16.4237;RBI=0.0151379;REFB=-0.0174849;REVB=0.0136007;RO=102;SAF=33;SAR=45;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789229;STB=0.549475;STBP=0.265;TYPE=ins;VARB=0.0238381;OID=.;OPOS=207472684;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.438889:78:185:79:180:101:33:46:51:50:99:102:33:45:51:51 chr2 207621759 . A G 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1567;QD=62.6143;RBI=0.0124557;REFB=0;REVB=0.0122191;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82544e-05;OID=.;OPOS=207621759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0 chr2 207647981 . C T 120.5 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.017135;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.293;QD=24.1;RBI=0.0530894;REFB=-0.0339336;REVB=0.0502482;RO=7;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351849;STB=0.701766;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0271835;OID=.;OPOS=207647981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:20:20:7:7:13:13:0.65:11:2:4:3:11:2:4:3 chr2 207653653 . G A 341.38 PASS AF=0.392157;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.011967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.086;QD=13.3874;RBI=0.0377943;REFB=-0.0116524;REVB=-0.0358497;RO=61;SAF=24;SAR=16;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133793;STB=0.580987;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0204845;OID=.;OPOS=207653653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:61:62:40:40:0.392157:16:24:29:32:16:24:29:33 chr2 207820276 . G A 446.74 PASS AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.0848093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.786;QD=16.7007;RBI=0.0848604;REFB=-0.00055913;REVB=-0.00294622;RO=57;SAF=25;SAR=24;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136683;STB=0.580037;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.000668633;OID=.;OPOS=207820276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:58:49:49:0.457944:24:25:21:36:24:25:21:37 chr2 207824384 . T G 306.0 PASS AF=0.472222;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0262266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.062;QD=17;RBI=0.0355413;REFB=-0.0215085;REVB=0.0239864;RO=36;SAF=15;SAR=18;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094047;STB=0.558789;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0314063;OID=.;OPOS=207824384;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:36:38:33:34:0.472222:18:15:20:16:19:15:21:17 chr2 207825656 . A T 343.37 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0484975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2187;QD=18.8149;RBI=0.0507107;REFB=0.0139823;REVB=0.0148175;RO=36;SAF=13;SAR=23;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129496;STB=0.566285;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.00951368;OID=.;OPOS=207825656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:23:13:18:18:23:13:18:19 chr2 207945785 . ATG ATA,A 40.66 PASS AF=0.103448,0.137931;AO=3,4;DP=32;FAO=3,4;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2,2;FSAR=1,2;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0076489,-0.120283;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=61.1839,92.0161;QD=5.60822;RBI=0.0515238,0.140155;REFB=-0.0426118,-0.0722108;REVB=-0.0509528,-0.0719397;RO=24;SAF=2,2;SAR=1,2;SRF=16;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.194311;STB=0.529213,0.61484;STBP=0.953,0.675;TYPE=snp,del;VARB=0.0159812,0.209751;OID=.,.;OPOS=207945787,207945786;OREF=G,TG;OALT=A,-;OMAPALT=ATA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.103448,0.137931:3,4:32:3,4:29:22:2,2:1,2:14:8:21:24:2,2:1,2:16:8 chr2 207988613 . C T 2138.06 PASS AF=0.978723;AO=138;DP=142;FAO=138;FDP=141;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0280234;FXX=0.013985;HRUN=5;LEN=1;MLLD=116.629;QD=60.6542;RBI=0.0326802;REFB=-0.170179;REVB=0.0168131;RO=1;SAF=69;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684062;STB=0.510637;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.000614466;OID=.;OPOS=207988613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:142:141:1:3:138:138:0.978723:69:69:0:1:69:69:0:3 chr2 207998800 . C T 530.28 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281503;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.029;QD=60.6035;RBI=0.0659732;REFB=0;REVB=0.0596659;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000648929;OID=.;OPOS=207998800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr2 208477852 . G A 1249.33 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162832;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.368;QD=61.6955;RBI=0.0187787;REFB=0;REVB=0.00935397;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74672e-05;OID=.;OPOS=208477852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:32:49:0:0:32:49:0:0 chr2 208477956 . C T 1264.37 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.307;QD=61.6765;RBI=0.0154714;REFB=0;REVB=0.0110089;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.31927e-06;OID=.;OPOS=208477956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:82:0:0:80:82:1:49:31:0:0:51:31:0:0 chr2 208478055 . A G 1468.99 PASS AF=0.979167;AO=94;DP=98;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0440048;FXX=0.0204061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7494;QD=61.208;RBI=0.0448057;REFB=0.00164034;REVB=-0.00843335;RO=1;SAF=44;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938906;STB=0.500667;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.000402262;OID=.;OPOS=208478055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:96:1:2:94:94:0.979167:50:44:0:1:50:44:1:1 chr2 208633627 . C T 884.26 PASS AF=0.478723;AO=89;DP=187;FAO=90;FDP=188;FR=.;FRO=98;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=52;FWDB=-0.00967853;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.953;QD=18.814;RBI=0.015518;REFB=-0.0197124;REVB=0.0121299;RO=97;SAF=42;SAR=47;SRF=46;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00219493;STB=0.501424;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0203656;OID=.;OPOS=208633627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:188:97:98:89:90:0.478723:47:42:46:51:48:42:46:52 chr2 208811097 . C T 392.33 PASS AF=0.431373;AO=42;DP=100;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0106029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7518;QD=15.3857;RBI=0.0433219;REFB=-0.035393;REVB=0.0420044;RO=57;SAF=25;SAR=17;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579734;STB=0.540845;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0168799;OID=.;OPOS=208811097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:102:57:58:42:44:0.431373:17:25:37:20:19:25:37:21 chr2 208938866 . G T 711.57 PASS AF=1;AO=43;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152103;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.778;QD=63.2503;RBI=0.0565521;REFB=0;REVB=0.0544682;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00726973;OID=.;OPOS=208938866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:43:45:1:21:22:0:0:23:22:0:0 chr2 208986637 . T C 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0189446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.002;QD=25.3681;RBI=0.019039;REFB=-0.0392532;REVB=0.00189399;RO=14;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0277254;OID=.;OPOS=208986637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:12:9:6:8:12:9:6:8 chr2 208989037 . A G 335.62 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0454178;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.826;QD=16.7812;RBI=0.0519779;REFB=-0.00978856;REVB=-0.025277;RO=43;SAF=12;SAR=24;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224171;STB=0.632404;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00987668;OID=.;OPOS=208989037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:44:36:36:0.45:24:12:24:19:24:12:25:19 chr2 209007559 . T G 406.76 PASS AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0311845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7033;QD=17.495;RBI=0.0313008;REFB=0.00613967;REVB=-0.00269636;RO=50;SAF=18;SAR=24;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893351;STB=0.555529;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.00670825;OID=.;OPOS=209007559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:51:42:42:0.451613:24:18:26:24:24:18:27:24 chr2 209030050 . T A 128.26 PASS AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.013395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1042;QD=12.2148;RBI=0.0380621;REFB=-0.020285;REVB=0.0356272;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136651;STB=0.580336;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0304057;OID=.;OPOS=209030050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:7:8:11:16:7:8:11:16 chr2 209033173 . A G 136.26 PASS AF=0.296875;AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0261132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.467;QD=8.51652;RBI=0.0386428;REFB=-0.00484688;REVB=-0.0284845;RO=45;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00141059;STB=0.500842;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0147627;OID=.;OPOS=209033173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:45:45:19:19:0.296875:11:8:19:26:11:8:19:26 chr2 209036712 . T C 512.71 PASS AF=0.514851;AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.000328421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=348.845;QD=20.3053;RBI=0.00507755;REFB=0.00225233;REVB=-0.00506692;RO=49;SAF=32;SAR=20;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11309;STB=0.562476;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.00190515;OID=.;OPOS=209036712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:49:49:52:52:0.514851:20:32:24:25:20:32:24:25 chr2 209036778 . A G 1713.58 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.946;QD=60.6578;RBI=0.0758922;REFB=0;REVB=0.0586192;RO=1;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008554;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188174;OID=.;OPOS=209036778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:113:1:0:111:113:1:55:56:0:1:56:57:0:0 chr2 209184980 . G A 948.87 PASS AF=0.985294;AO=64;DP=65;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00623533;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1968;QD=55.8157;RBI=0.0536559;REFB=-0.0391436;REVB=0.0532923;RO=0;SAF=23;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000671643;OID=.;OPOS=209184980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:68:0:1:64:67:0.985294:41:23:0:0:44:23:0:1 chr2 209184999 . C T 1021.78 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.04859;FXX=0.0136968;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.149;QD=56.7656;RBI=0.0489809;REFB=-0.0245615;REVB=-0.00617606;RO=1;SAF=24;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01929;STB=0.504827;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-2.19265e-05;OID=.;OPOS=209184999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:72:1:2:70:70:0.972222:46:24:1:0:46:24:1:1 chr2 209190330 . T C 1336.79 PASS AF=0.947368;AO=89;DP=95;FAO=90;FDP=95;FR=.;FRO=5;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0808199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3771;QD=56.2859;RBI=0.0974201;REFB=-0.082614;REVB=0.054395;RO=5;SAF=51;SAR=38;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234285;STB=0.512028;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00940132;OID=.;OPOS=209190330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:95:95:5:5:89:90:0.947368:38:51:4:1:38:52:4:1 chr2 209190519 . A T 519.75 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.233;QD=59.3996;RBI=0.0189788;REFB=0;REVB=0.0188483;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46352e-05;OID=.;OPOS=209190519;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr2 209190528 . C G 485.51 PASS AF=1;AO=29;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5029;QD=58.8491;RBI=0.0211362;REFB=0;REVB=-0.0206889;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235143;OID=.;OPOS=209190528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:29:33:1:18:11:0:0:18:15:0:0 chr2 209191082 . C A 160.05 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3669;QD=45.7291;RBI=0.0182705;REFB=0;REVB=-0.0147824;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123879;OID=.;OPOS=209191082;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr2 209191099 . T C 130.38 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.421;QD=43.4585;RBI=0.0738109;REFB=0;REVB=0.0299273;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00077932;OID=.;OPOS=209191099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0 chr2 209209827 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.796;QD=57.2026;RBI=0.0340382;REFB=0;REVB=0.0111928;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.43823e-05;OID=.;OPOS=209209827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr2 209212707 . G A 2029.05 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305624;FXX=0.0151504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.632;QD=62.4322;RBI=0.0328775;REFB=0;REVB=0.0121191;RO=0;SAF=58;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192526;OID=.;OPOS=209212707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:72:58:0:0:72:58:0:0 chr2 209214770 . A G 1321.0 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.01119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.772;QD=60.0453;RBI=0.0574821;REFB=0.0144261;REVB=0.0563824;RO=2;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197323;STB=0.505153;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=7.1147e-05;OID=.;OPOS=209214770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:2:1:86:87:0.988636:47:39:0:2:48:39:0:1 chr2 209215586 . A G 1171.78 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7703;QD=60.8715;RBI=0.0356332;REFB=0;REVB=0.0278316;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69996e-05;OID=.;OPOS=209215586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0 chr2 209220157 . G T 3578.87 PASS AF=1;AO=227;DP=229;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200344;FXX=0.00873324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.358;QD=63.0638;RBI=0.0200351;REFB=0;REVB=-0.000168799;RO=0;SAF=85;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12308e-05;OID=.;OPOS=209220157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:229:227:0:0:227:227:1:142:85:0:0:142:85:0:0 chr2 209220238 . G C 3638.96 PASS AF=0.987395;AO=229;DP=234;FAO=235;FDP=238;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=160;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0883352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3233;QD=61.159;RBI=0.0967959;REFB=-0.101228;REVB=0.0395769;RO=4;SAF=72;SAR=157;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00701941;STB=0.500206;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00163585;OID=.;OPOS=209220238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:234:238:4:3:229:235:0.987395:157:72:2:2:160:75:1:2 chr2 209224874 . CA C 734.13 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0079181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.177;QD=45.8833;RBI=0.0151024;REFB=0;REVB=0.0128603;RO=1;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113779;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00119844;OID=.;OPOS=209224875;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:62:64:64:64:0:22:42:0:0:13:1:21:41:0:1 chr2 209358027 . C T 353.97 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.00590156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.29;QD=16.0895;RBI=0.0062545;REFB=-0.00821209;REVB=0.00207132;RO=50;SAF=17;SAR=21;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133249;STB=0.574961;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0130506;OID=.;OPOS=209358027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:21:17:29:21:21:17:29:21 chr2 209785278 . A G 5335.74 PASS AF=1;AO=327;DP=327;FAO=336;FDP=336;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=192;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.138;QD=63.5208;RBI=0.0164254;REFB=0;REVB=0.00962934;RO=0;SAF=142;SAR=185;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.44462e-07;OID=.;OPOS=209785278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:327:336:0:0:327:336:1:185:142:0:0:192:144:0:0 chr2 210517915 . T C 417.2 PASS AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00105744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.888;QD=17.204;RBI=0.00991612;REFB=-0.00997426;REVB=-0.00985958;RO=54;SAF=30;SAR=13;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971223;STB=0.554623;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0104431;OID=.;OPOS=210517915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:0.443299:13:30:33:21:13:30:33:21 chr2 210586685 . T C 2385.57 PASS AF=1;AO=155;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.396;QD=61.1686;RBI=0.0164137;REFB=0;REVB=0.00846135;RO=0;SAF=94;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04263e-05;OID=.;OPOS=210586685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:155:156:0:0:155:156:1:61:94:0:0:61:95:0:0 chr2 211060050 . T G 849.93 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0984654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.499;QD=56.6618;RBI=0.0986383;REFB=0;REVB=-0.00583726;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171544;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374974;OID=.;OPOS=211060050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:1:0:59:60:1:32:27:1:0:32:28:0:0 chr2 211074909 . T C 695.77 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00429379;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=291.029;QD=52.5112;RBI=0.0129748;REFB=-0.050105;REVB=0.0122437;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000696368;STB=0.50037;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0016105;OID=.;OPOS=211074909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:25:26:1:1:25:26:1:1 chr2 211098113 . C T 1509.08 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.742;QD=59.7655;RBI=0.0142546;REFB=0;REVB=0.000871728;RO=0;SAF=36;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50811e-05;OID=.;OPOS=211098113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:101:0:0:96:101:1:60:36:0:0:60:41:0:0 chr2 211296239 . G A 333.69 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0161851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.077;QD=24.2686;RBI=0.0223842;REFB=-0.0186299;REVB=-0.0154626;RO=22;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232145;STB=0.512753;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0145274;OID=.;OPOS=211296239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:13:20:14:8:13:20:14:8 chr2 211342502 . G A 352.95 PASS AF=0.480519;AO=35;DP=75;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0157334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.035;QD=18.3349;RBI=0.0157405;REFB=-0.0116549;REVB=-0.000471297;RO=40;SAF=22;SAR=13;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480687;STB=0.515143;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00994006;OID=.;OPOS=211342502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:40:40:35:37:0.480519:13:22:27:13:13:24:27:13 chr2 211421452 . A ATCT,T 1495.44 PASS AF=0.935185,0.0462963;AO=97,5;DP=108;FAO=101,5;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=49,2;FSAR=52,3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00493209,0.00359129;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=258.778,99.2576;QD=55.3868;RBI=0.0123103,0.0491139;REFB=0.0225519,-0.0448006;REVB=0.0112791,0.0489824;RO=6;SAF=46,2;SAR=51,3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0212496,-0.231237;STB=0.500289,0.529293;STBP=0.871,0.911;TYPE=ins,snp;VARB=0.000104509,0.0128111;OID=.,.;OPOS=211421453,211421452;OREF=-,A;OALT=TCT,T;OMAPALT=ATCT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:108:108:6:2:97,5:101,5:0.935185,0.0462963:51,3:46,2:4:2:52,3:49,2:1:1 chr2 211456637 . A G 3277.69 PASS AF=1;AO=211;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230837;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4928;QD=62.1364;RBI=0.0274994;REFB=0;REVB=0.0149453;RO=0;SAF=115;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123123;OID=.;OPOS=211456637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:212:211:0:0:211:211:1:96:115:0:0:96:115:0:0 chr2 211456639 . C T 3156.36 PASS AF=0.981132;AO=208;DP=212;FAO=208;FDP=212;FR=.;FRO=4;FSAF=113;FSAR=95;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0160365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.035;QD=59.554;RBI=0.0191346;REFB=-0.0383922;REVB=-0.0104385;RO=3;SAF=113;SAR=95;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124768;STB=0.508695;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000606875;OID=.;OPOS=211456639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:212:212:3:4:208:208:0.981132:95:113:3:0:95:113:4:0 chr2 211481257 . C G 1222.47 PASS AF=0.987805;AO=78;DP=79;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0262367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4243;QD=59.6325;RBI=0.0572407;REFB=-0.0822552;REVB=0.0508737;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.506492;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0080135;OID=.;OPOS=211481257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:82:0:1:78:81:0.987805:36:42:0:0:38:43:0:1 chr2 212241725 . C T 246.34 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0213802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.448;QD=13.4979;RBI=0.023642;REFB=-0.0166965;REVB=0.0100911;RO=42;SAF=6;SAR=23;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202817;STB=0.638013;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0199919;OID=.;OPOS=212241725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:42:44:29:29:0.39726:23:6:15:27:23:6:17:27 chr2 212242745 . G C 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206874;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.473;QD=57.5452;RBI=0.0540535;REFB=0;REVB=0.0499381;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023713;OID=.;OPOS=212242745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0 chr2 212244403 . G A 538.82 PASS AF=0.471074;AO=57;DP=121;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.000634976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.853;QD=17.8122;RBI=0.00615349;REFB=-0.0161503;REVB=-0.00612064;RO=64;SAF=30;SAR=27;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548019;STB=0.530424;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0204853;OID=.;OPOS=212244403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:64:64:57:57:0.471074:27:30:30:34:27:30:30:34 chr2 212640299 . G T 431.16 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0243401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1847;QD=17.4205;RBI=0.0304198;REFB=0.0177598;REVB=-0.0182462;RO=55;SAF=26;SAR=18;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00934089;STB=0.505231;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.0213652;OID=.;OPOS=212640299;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:18:26:33:22:18:26:33:22 chr2 212642775 . T C 433.98 PASS AF=0.666667;AO=40;DP=60;FAO=40;FDP=60;FR=.;FRO=20;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00673323;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.39;QD=28.9319;RBI=0.00688635;REFB=-0.00247272;REVB=-0.00144412;RO=20;SAF=26;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128727;STB=0.57014;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00128014;OID=.;OPOS=212642775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:20:20:40:40:0.666667:14:26:9:11:14:26:9:11 chr2 212642845 . G C 371.47 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00398068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7974;QD=22.8599;RBI=0.0297473;REFB=0.00216557;REVB=0.0294797;RO=28;SAF=21;SAR=16;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108916;STB=0.559967;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00100217;OID=.;OPOS=212642845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:16:21:12:16:16:21:12:16 chr2 213866714 . G A 2293.34 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00142638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.341;QD=63.7038;RBI=0.0039054;REFB=0;REVB=0.0036356;RO=0;SAF=62;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.2896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52633e-06;OID=.;OPOS=213866714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:82:62:0:0:82:62:0:0 chr2 213886454 . A T 1000.23 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=4.99821e-05;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.656;QD=56.3512;RBI=0.0359128;REFB=0.0500903;REVB=0.0359127;RO=1;SAF=21;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219749;STB=0.506473;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.000550095;OID=.;OPOS=213886454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:71:71:1:2:69:69:0.971831:48:21:1:0:48:21:1:1 chr2 214012405 . AA AC,CA 1074.68 PASS AF=0.232143,0.589286;AO=8,55;DP=109;FAO=26,66;FDP=112;FR=.;FRO=20;FSAF=20,41;FSAR=6,25;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0174335,0.0202997;FXX=0.00884877;HRUN=9,9;LEN=1,1;MLLD=150.653,119.437;QD=38.3814;RBI=0.03268,0.0312263;REFB=-0.0303556,-0.0826312;REVB=-0.0276415,-0.0237277;RO=0;SAF=8,32;SAR=0,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.49259e-08;STB=0.540508,0.519646;STBP=0.6,0.507;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0108562,0.014166;OID=.,.;OPOS=214012406,214012405;OREF=A,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:109:112:0:20:8,55:26,66:0.232143,0.589286:0,23:8,32:0:0:6,25:20,41:14:6 chr2 214727221 . A C 1543.06 PASS AF=0.923729;AO=109;DP=119;FAO=109;FDP=118;FR=.;FRO=9;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0187605;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9405;QD=52.3072;RBI=0.0364674;REFB=0.00674351;REVB=-0.0312716;RO=8;SAF=54;SAR=55;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653067;STB=0.538455;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00583314;OID=.;OPOS=214727221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:119:118:8:9:109:109:0.923729:55:54:8:0:55:54:9:0 chr2 214794697 . G C 375.9 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.0248157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3547;QD=14.5982;RBI=0.0526033;REFB=0.0232187;REVB=0.046382;RO=60;SAF=17;SAR=26;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10999;STB=0.562068;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.0318909;OID=.;OPOS=214794697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:26:17:30:30:26:17:30:30 chr2 215102929 . T A 557.14 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00371826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=380.816;QD=60.2308;RBI=0.00645247;REFB=0;REVB=0.00527342;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4184e-05;OID=.;OPOS=215102929;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0 chr2 215632256 . A G 1785.8 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8001;QD=61.053;RBI=0.0170966;REFB=0;REVB=0.0109793;RO=0;SAF=65;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34793e-05;OID=.;OPOS=215632256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:52:65:0:0:52:65:0:0 chr2 215818620 . GA G 39.09 PASS AF=0.306122;AO=14;DP=51;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.170872;FXX=0.039208;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.41281;QD=3.19092;RBI=0.223868;REFB=-0.0969722;REVB=-0.144637;RO=28;SAF=9;SAR=5;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442444;STB=0.534438;STBP=0.806;TYPE=del;VARB=0.124115;OID=.;OPOS=215818621;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.306122:14:51:15:49:34:9:6:22:12:39:28:9:5:19:9 chr2 215876166 . A T 697.4 PASS AF=0.885246;AO=54;DP=61;FAO=54;FDP=61;FR=.;FRO=7;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0198987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.745;QD=45.7314;RBI=0.0687226;REFB=-0.00617344;REVB=-0.0657788;RO=7;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123857;STB=0.566013;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00102241;OID=.;OPOS=215876166;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:61:61:7:7:54:54:0.885246:23:31:0:7:23:31:0:7 chr2 215901774 . C T 1190.42 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.457;QD=61.0471;RBI=0.0387115;REFB=0;REVB=0.03582;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246587;OID=.;OPOS=215901774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr2 215940242 . T C 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00176936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=352.831;QD=61.6953;RBI=0.0192691;REFB=0;REVB=0.0191876;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47987e-05;OID=.;OPOS=215940242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0 chr2 216235089 . C T 1587.76 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.298;QD=64.152;RBI=0.0196207;REFB=0;REVB=-0.0123222;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46169e-06;OID=.;OPOS=216235089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:63:36:0:0:63:36:0:0 chr2 216242917 . T A 958.36 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221357;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8628;QD=58.9761;RBI=0.111476;REFB=0;REVB=0.109256;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00083327;OID=.;OPOS=216242917;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0 chr2 216249587 . C T 1437.85 PASS AF=0.979167;AO=84;DP=87;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0243618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.76;QD=59.9103;RBI=0.15458;REFB=-0.207991;REVB=0.152648;RO=1;SAF=69;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305258;STB=0.519996;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0029018;OID=.;OPOS=216249587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:87:96:1:2:84:94:0.979167:15:69:0:1:24:70:0:2 chr2 216272900 . T G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.509;QD=62.6711;RBI=0.0434091;REFB=0;REVB=0.029057;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115;OID=.;OPOS=216272900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr2 216272907 . A T 599.68 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322264;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.541;QD=61.5057;RBI=0.0359282;REFB=0;REVB=0.0158837;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106771;OID=.;OPOS=216272907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:39:39:0:0:38:39:1:23:15:0:0:24:15:0:0 chr2 216300482 . T A 955.2 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1223;QD=58.7813;RBI=0.0498221;REFB=0;REVB=0.0475117;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183501;OID=.;OPOS=216300482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:42:22:0:0:43:22:0:0 chr2 216878008 . C G 724.92 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0601248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7148;QD=54.7106;RBI=0.0683782;REFB=-0.0365729;REVB=0.0325667;RO=1;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018468;STB=0.5098;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.000681005;OID=.;OPOS=216878008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:53:53:1:1:52:52:0.981132:25:27:0:1:25:27:0:1 chr2 216967346 . CTTTTTTTTTTTTTT CTTCTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTA 191.63 PASS AF=0.0833333,0.722222,0.194444;AO=3,11,2;DP=38;FAO=3,26,7;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=2,11,4;FSAR=1,15,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327673,-0.24247,-0.227378;FXX=0.162753;HRUN=14,14,14;LEN=1,2,1;MLLD=156.126,6.4614,12.3692;QD=21.292;RBI=0.0620965,0.247018,0.238244;REFB=-0.0155272,-0.0637461,-0.0735807;REVB=-0.0527473,-0.047185,-0.07113;RO=2;SAF=2,1,0;SAR=1,10,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.111102,-0.253844,-0.639851;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=-0.00702131,0.0845916,-0.0490604;OID=.,.,.;OPOS=216967349,216967347,216967360;OREF=T,TT,T;OALT=C,-,A;OMAPALT=CTTCTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0.0833333,0.722222,0.194444:3,11,2:38:3,26,7:36:0:2,11,4:1,15,3:0:0:28:2:2,1,0:1,10,2:1:1 chr2 217012901 . A G 676.81 PASS AF=0.927273;AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0115116;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.034;QD=49.2222;RBI=0.0129511;REFB=-0.0839356;REVB=0.00593407;RO=4;SAF=25;SAR=26;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695893;STB=0.537023;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000788668;OID=.;OPOS=217012901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:55:55:4:4:51:51:0.927273:26:25:4:0:26:25:4:0 chr2 217148417 . C A 185.82 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0390704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.556;QD=19.0583;RBI=0.0403452;REFB=-0.00916918;REVB=-0.0100618;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252995;STB=0.643282;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0079709;OID=.;OPOS=217148417;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:7:12:7:13:7:12:7:13 chr2 217364539 . C T 2293.8 PASS AF=1;AO=150;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3407;QD=60.3632;RBI=0.0182345;REFB=0;REVB=-0.00561285;RO=1;SAF=69;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0058363;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7862e-05;OID=.;OPOS=217364539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:152:152:1:0:150:152:1:81:69:0:1:82:70:0:0 chr2 217541582 . T C 1555.22 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241496;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.212;QD=64.1328;RBI=0.0138239;REFB=0;REVB=-0.0136113;RO=0;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152949;OID=.;OPOS=217541582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:50:47:0:0:50:47:0:0 chr2 218604247 . A C,G 704.79 PASS AF=0.913043,0.0869565;AO=41,4;DP=46;FAO=42,4;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0;FSAR=21,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685492,0.00694239;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=127.045,11.9204;QD=61.2858;RBI=0.0702083,0.020584;REFB=0,0;REVB=0.0151727,-0.0193779;RO=0;SAF=20,0;SAR=21,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.02085e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00371587,0.110115;OID=.,.;OPOS=218604247,218604247;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:46:46:0:0:41,4:42,4:0.913043,0.0869565:21,4:20,0:0:0:21,4:21,0:0:0 chr2 218664633 . T G 1767.59 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.527;QD=60.9514;RBI=0.0448112;REFB=0;REVB=0.0414197;RO=0;SAF=51;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39423e-05;OID=.;OPOS=218664633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:65:51:0:0:65:51:0:0 chr2 218674697 . C T 266.53 PASS AF=0.6;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0163844;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.809;QD=26.6527;RBI=0.0205121;REFB=-0.0101408;REVB=0.012341;RO=16;SAF=8;SAR=16;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124552;STB=0.568574;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00859031;OID=.;OPOS=218674697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:16:16:24:24:0.6:16:8:3:13:16:8:3:13 chr2 218682474 . A G 517.26 PASS AF=0.532609;AO=36;DP=93;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0129645;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.574;QD=22.4897;RBI=0.0129833;REFB=-0.0294409;REVB=-0.000697793;RO=39;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340063;STB=0.581258;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0255096;OID=.;OPOS=218682474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:39:43:36:49:0.532609:17:19:22:17:29:20:25:18 chr2 218682771 . A G 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.013917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.844;QD=9.13216;RBI=0.0361461;REFB=0.000520292;REVB=0.0333596;RO=22;SAF=8;SAR=2;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232628;STB=0.644839;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.000646029;OID=.;OPOS=218682771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:2:8:14:8:2:8:14:8 chr2 218683154 . A G 289.38 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.315;QD=52.6137;RBI=0.0699416;REFB=0;REVB=0.0667385;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870044;OID=.;OPOS=218683154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:3:18:0:0:3:19:0:0 chr2 218683257 . A G 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00973575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.005;QD=16.6158;RBI=0.011131;REFB=-0.0129091;REVB=-0.00539573;RO=21;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291976;STB=0.516759;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0130767;OID=.;OPOS=218683257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:6:11:13:8:6:11:13:8 chr2 218683368 . C T 277.58 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00406812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.923;QD=16.0915;RBI=0.0130793;REFB=-0.0188469;REVB=-0.0124306;RO=34;SAF=22;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212446;STB=0.639185;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.036005;OID=.;OPOS=218683368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:38:31:31:0.449275:9:22:17:17:9:22:18:20 chr2 218694551 . A G 1414.9 PASS AF=0.505415;AO=139;DP=276;FAO=140;FDP=277;FR=.;FRO=137;FSAF=41;FSAR=99;FSRF=58;FSRR=79;FWDB=0.0342763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.04;QD=20.4317;RBI=0.034676;REFB=-0.00774166;REVB=-0.0052499;RO=134;SAF=40;SAR=99;SRF=56;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132961;STB=0.57318;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00953261;OID=.;OPOS=218694551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:277:134:137:139:140:0.505415:99:40:56:78:99:41:58:79 chr2 218712918 . C T 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0284409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2614;QD=8.81267;RBI=0.0421379;REFB=0.00389797;REVB=-0.0310921;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359862;STB=0.730829;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0148351;OID=.;OPOS=218712918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:5:6:5:1:5:6 chr2 218745685 . G A 749.63 PASS AF=0.5;AO=73;DP=146;FAO=73;FDP=146;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=0.0111444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.379;QD=20.5379;RBI=0.0111485;REFB=-0.0044312;REVB=-0.000305729;RO=73;SAF=36;SAR=37;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372789;STB=0.520535;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00386576;OID=.;OPOS=218745685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:73:73:73:0.5:37:36:39:34:37:36:39:34 chr2 218770085 . C T 123.66 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0714464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6842;QD=17.057;RBI=0.0722695;REFB=-0.0159241;REVB=0.0108763;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901033;STB=0.551651;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0177776;OID=.;OPOS=218770085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:7:7:6:9:7:7:6:9 chr2 218940418 . C T 785.8 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8896;QD=64.1468;RBI=0.0335182;REFB=0;REVB=0.0106867;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026986;OID=.;OPOS=218940418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chr2 219000310 . C T 594.51 PASS AF=0.556604;AO=55;DP=101;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00998391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.791;QD=22.4342;RBI=0.0155284;REFB=-0.0414477;REVB=0.0118934;RO=46;SAF=32;SAR=23;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507072;STB=0.521774;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0325871;OID=.;OPOS=219000310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:106:46:47:55:59:0.556604:23:32:24:22:26:33:24:23 chr2 219000734 . T C 229.69 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0225991;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3391;QD=28.711;RBI=0.0550337;REFB=0.0379336;REVB=-0.0501795;RO=11;SAF=10;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01349;STB=0.507456;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0209146;OID=.;OPOS=219000734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:33:32:11:11:21:21:0.65625:11:10:5:6:11:10:5:6 chr2 219029108 . C G 489.58 PASS AF=0.46087;AO=53;DP=115;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.00538506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.55;QD=17.0287;RBI=0.0164614;REFB=-0.0265829;REVB=-0.0155557;RO=61;SAF=25;SAR=28;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439995;STB=0.519623;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0266541;OID=.;OPOS=219029108;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:61:62:53:53:0.46087:28:25:26:35:28:25:27:35 chr2 219029955 . T C 32.75 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.101125;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.634;QD=11.9092;RBI=0.103141;REFB=-0.00235247;REVB=0.0202956;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892949;STB=0.555331;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00426912;OID=.;OPOS=219029955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:12:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:3:3:2:3:3:3 chr2 219110555 . A G 173.1 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0112387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2944;QD=18.714;RBI=0.0220327;REFB=-0.00575122;REVB=0.0189508;RO=19;SAF=17;SAR=1;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449851;STB=0.766513;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00427117;OID=.;OPOS=219110555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:1:17:14:5:1:17:14:5 chr2 219110625 . G A 253.26 PASS AF=0.533333;AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=-0.00412338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.827;QD=22.5117;RBI=0.0641691;REFB=-0.00695188;REVB=0.0640365;RO=21;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377891;STB=0.705753;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.010134;OID=.;OPOS=219110625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:21:21:23:24:0.533333:8:15:21:0:9:15:21:0 chr2 219128506 . C T 3467.34 PASS AF=0.986784;AO=224;DP=227;FAO=224;FDP=227;FR=.;FRO=3;FSAF=112;FSAR=112;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0044202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.415;QD=61.0986;RBI=0.00892812;REFB=-0.0364605;REVB=0.00775713;RO=3;SAF=112;SAR=112;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00419663;STB=0.502202;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=6.8649e-05;OID=.;OPOS=219128506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:227:227:3:3:224:224:0.986784:112:112:2:1:112:112:2:1 chr2 219140288 . G C 289.1 PASS AF=0.34;AO=34;DP=95;FAO=34;FDP=100;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=-0.0460878;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.604;QD=11.5641;RBI=0.0625144;REFB=-0.0100861;REVB=-0.0422371;RO=61;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23638;STB=0.645656;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00190775;OID=.;OPOS=219140288;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:100:61:66:34:34:0.34:15:19:21:40:15:19:22:44 chr2 219143229 . G A 242.52 PASS AF=0.5;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00460459;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.373;QD=21.0887;RBI=0.0625355;REFB=0.00390653;REVB=-0.0623658;RO=22;SAF=15;SAR=8;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288956;STB=0.652042;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00217311;OID=.;OPOS=219143229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:22:23:23:23:0.5:8:15:7:15:8:15:8:15 chr2 219144089 . G A 184.84 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0111736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.634;QD=18.4841;RBI=0.011394;REFB=-0.0208811;REVB=0.00223015;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181591;STB=0.603026;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0204957;OID=.;OPOS=219144089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:8:11:8:13:8:11:8:13 chr2 219144815 . T C 1008.68 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.52;QD=59.3342;RBI=0.032367;REFB=0;REVB=0.0247903;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105004;OID=.;OPOS=219144815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:35:32:0:0:35:33:0:0 chr2 219146663 . C T 57.92 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0771494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2623;QD=13.6292;RBI=0.0771707;REFB=-0.00887623;REVB=0.00181229;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347252;STB=0.703751;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0069979;OID=.;OPOS=219146663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:7:2:5:3:7:2 chr2 219146803 . G A 31.8 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.132767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.24;QD=14.1334;RBI=0.133373;REFB=-0.0345093;REVB=0.0127009;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268008;STB=0.665923;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0575736;OID=.;OPOS=219146803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:0.555556:1:4:2:2:1:4:2:2 chr2 219231807 . C T 428.76 PASS AF=1;AO=24;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.294;QD=57.168;RBI=0.0254392;REFB=0;REVB=-0.00477965;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44719e-05;OID=.;OPOS=219231807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:24:30:1:16:8:0:0:18:12:0:0 chr2 219254622 . A G 810.23 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.478;QD=56.8583;RBI=0.0369283;REFB=0;REVB=0.0282335;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393472;OID=.;OPOS=219254622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:57:0:0:56:57:1:30:26:0:0:31:26:0:0 chr2 219265094 . T C 467.41 PASS AF=1;AO=27;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.23517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3431;QD=58.4258;RBI=0.235897;REFB=0;REVB=0.018503;RO=0;SAF=4;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00451955;OID=.;OPOS=219265094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:27:32:1:23:4:0:0:23:9:0:0 chr2 219267781 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9762;QD=48.737;RBI=0.0355981;REFB=0;REVB=0.0067224;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111745;OID=.;OPOS=219267781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0 chr2 219319657 . A G 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.888;QD=58.4197;RBI=0.0197138;REFB=0;REVB=-0.00937771;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.54455e-05;OID=.;OPOS=219319657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0 chr2 219492924 . T C 753.09 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0436;QD=56.8369;RBI=0.0282922;REFB=0;REVB=0.0243274;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70213e-05;OID=.;OPOS=219492924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr2 219508988 . T C 770.02 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.131;QD=57.0385;RBI=0.036861;REFB=0;REVB=0.0213412;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103431;OID=.;OPOS=219508988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:25:28:0:0:25:29:0:0 chr2 219509618 . C A 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3448;QD=57.2351;RBI=0.0160104;REFB=0;REVB=0.000686096;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012384;OID=.;OPOS=219509618;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr2 219557313 . G A 339.39 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00377785;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.612;QD=17.1843;RBI=0.0335673;REFB=-0.0402269;REVB=0.033354;RO=42;SAF=25;SAR=11;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243841;STB=0.631894;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0331786;OID=.;OPOS=219557313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:79:42:43:36:36:0.455696:11:25:19:23:11:25:20:23 chr2 219754840 . C T 545.09 PASS AF=0.533981;AO=55;DP=103;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00356577;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.092;QD=21.1686;RBI=0.0194196;REFB=-0.0103093;REVB=0.0190894;RO=46;SAF=26;SAR=29;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134934;STB=0.516489;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0072188;OID=.;OPOS=219754840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:46:48:55:55:0.533981:29:26:21:25:29:26:21:27 chr2 219846749 . G A 280.36 PASS AF=0.347368;AO=33;DP=95;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00279797;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.081;QD=11.8045;RBI=0.0132518;REFB=-0.0142225;REVB=0.012953;RO=62;SAF=21;SAR=12;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261457;STB=0.650763;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0256866;OID=.;OPOS=219846749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:62:62:33:33:0.347368:12:21:25:37:12:21:25:37 chr2 219896028 . C G 53.13 PASS AF=0.0851064;AO=9;DP=99;FAO=8;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.0886364;FXX=0.0309246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.1423;QD=2.26078;RBI=0.0929188;REFB=-0.00444522;REVB=-0.0278836;RO=74;SAF=2;SAR=7;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37449;STB=0.781939;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.128824;OID=.;OPOS=219896028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:99:94:74:80:9:8:0.0851064:7:2:40:34:6:2:46:34 chr2 219900320 . T G 325.58 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.00606489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.894;QD=14.7992;RBI=0.0333992;REFB=-0.0164668;REVB=0.0328439;RO=51;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631067;STB=0.529209;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0382533;OID=.;OPOS=219900320;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:51:52:36:36:0.409091:19:17:21:30:19:17:22:30 chr2 219920037 . A G 2580.62 PASS AF=1;AO=159;DP=159;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.914;QD=60.3654;RBI=0.0489285;REFB=0;REVB=0.0283029;RO=0;SAF=62;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60218e-05;OID=.;OPOS=219920037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:159:171:0:0:159:171:1:97:62:0:0:104:67:0:0 chr2 219940484 . C T 815.45 PASS AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0106777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.412;QD=52.6095;RBI=0.0107289;REFB=0.0087541;REVB=-0.00104692;RO=3;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349219;STB=0.518512;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.00131263;OID=.;OPOS=219940484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:62:62:3:3:59:59:0.951613:39:20:0:3:39:20:0:3 chr2 219967380 . T C 428.98 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9289;QD=57.1967;RBI=0.0417354;REFB=0;REVB=-0.0129849;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120362;OID=.;OPOS=219967380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr2 220037393 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.707;QD=46.848;RBI=0.0536096;REFB=0;REVB=0.031304;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449806;OID=.;OPOS=220037393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr2 220045454 . G A 2353.52 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6197;QD=63.1817;RBI=0.0325881;REFB=0.0304024;REVB=0.0301539;RO=1;SAF=61;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773302;STB=0.504064;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-3.35804e-05;OID=.;OPOS=220045454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:149:149:1:1:148:148:0.993289:87:61:1:0:87:61:1:0 chr2 220072766 . G T 670.46 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0823216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0192;QD=62.3682;RBI=0.0829966;REFB=0;REVB=-0.0105634;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118856;OID=.;OPOS=220072766;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:24:18:0:0:24:19:0:0 chr2 220083279 . C T 746.91 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242438;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.744;QD=63.5667;RBI=0.0317039;REFB=0;REVB=0.0204297;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177752;OID=.;OPOS=220083279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0 chr2 220084902 . G A 747.09 PASS AF=0.982143;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239341;FXX=0.0175408;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.276;QD=53.3638;RBI=0.0464891;REFB=-0.16187;REVB=0.0398546;RO=2;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303841;STB=0.507934;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00060747;OID=.;OPOS=220084902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:56:56:2:1:54:55:0.982143:30:24:0:2:31:24:0:1 chr2 220085845 . A G 376.1 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3327;QD=55.7177;RBI=0.0914954;REFB=0;REVB=-0.0839584;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000818792;OID=.;OPOS=220085845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:10:16:0:0:10:17:0:0 chr2 220113242 . T G 4011.1 PASS AF=0.988593;AO=260;DP=265;FAO=260;FDP=263;FR=.;FRO=3;FSAF=138;FSAR=122;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00494177;FXX=0.00754688;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.335;QD=61.0053;RBI=0.017057;REFB=0.0180144;REVB=0.0163254;RO=0;SAF=138;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505376;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.000229717;OID=.;OPOS=220113242;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:265:263:0:3:260:260:0.988593:122:138:0:0:122:138:3:0 chr2 220118531 . G C 463.36 PASS AF=0.942857;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0632494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.767;QD=52.9558;RBI=0.0632936;REFB=-0.0990986;REVB=0.00236392;RO=2;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103249;STB=0.549969;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00170398;OID=.;OPOS=220118531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:34:35:2:2:32:33:0.942857:8:24:0:2:9:24:0:2 chr2 220136155 . T C 1415.26 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.546;QD=62.9006;RBI=0.00317401;REFB=0;REVB=-0.00228186;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46606e-05;OID=.;OPOS=220136155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:39:51:0:0:39:51:0:0 chr2 220136351 . G A 616.68 PASS AF=0.57;AO=43;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0921077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6549;QD=24.6671;RBI=0.0921123;REFB=-0.0126182;REVB=-0.000928659;RO=43;SAF=14;SAR=29;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13522;STB=0.503695;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0134753;OID=.;OPOS=220136351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:43:43:43:57:0.57:29:14:20:23:30:27:20:23 chr2 220136371 . T C 1348.66 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324426;FXX=0.0227247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.974;QD=62.7282;RBI=0.036106;REFB=0;REVB=0.0158468;RO=0;SAF=37;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.8874e-05;OID=.;OPOS=220136371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:49:37:0:0:49:37:0:0 chr2 220250147 . A G 689.34 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.811;QD=62.6672;RBI=0.0222623;REFB=0;REVB=-0.0139687;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12645e-05;OID=.;OPOS=220250147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0 chr2 220283259 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1441;QD=51.1837;RBI=0.0884357;REFB=0;REVB=-0.0787304;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0039502;OID=.;OPOS=220283259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr2 220283277 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00406816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.9;QD=53.9111;RBI=0.0141062;REFB=0;REVB=0.0135069;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152245;OID=.;OPOS=220283277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr2 220315970 . G A 931.94 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.281;QD=57.3501;RBI=0.0491056;REFB=0;REVB=0.00464904;RO=1;SAF=21;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219567;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000902734;OID=.;OPOS=220315970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:1:0:64:65:1:43:21:1:0:43:22:0:0 chr2 220330804 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00312852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.223;QD=51.183;RBI=0.0191011;REFB=0;REVB=0.0188431;RO=0;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.98133e-05;OID=.;OPOS=220330804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:17:3:0:0:17:3:0:0 chr2 220333950 . T C 923.24 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108842;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.197;QD=58.6186;RBI=0.0192505;REFB=0;REVB=0.0158782;RO=0;SAF=20;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39434e-05;OID=.;OPOS=220333950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:43:20:0:0:43:20:0:0 chr2 220362899 . C G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5117;QD=56.7056;RBI=0.160255;REFB=0;REVB=-0.0169989;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00278802;OID=.;OPOS=220362899;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr2 220379560 . C G 981.36 PASS AF=0.957746;AO=71;DP=74;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00338103;FXX=0.0405351;HRUN=6;LEN=1;MLLD=204.689;QD=55.2878;RBI=0.00633612;REFB=-0.0314888;REVB=-0.00535864;RO=3;SAF=32;SAR=39;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00908596;STB=0.504026;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.000246468;OID=.;OPOS=220379560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:74:71:3:3:71:68:0.957746:39:32:1:2:39:29:1:2 chr2 220402671 . G T 73.81 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.00131629;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.505;QD=9.84122;RBI=0.0971422;REFB=-0.00721181;REVB=-0.0971333;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186615;STB=0.555452;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0116032;OID=.;OPOS=220402671;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:29:30:19:20:10:10:0.333333:2:8:17:2:2:8:17:3 chr2 220402680 . T C 73.44 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=-0.0209708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6666;QD=9.4756;RBI=0.0313101;REFB=0.00860844;REVB=-0.0232497;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320824;STB=0.565098;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=-0.0521906;OID=.;OPOS=220402680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:19:21:10:10:0.322581:2:8:18:1:2:8:18:3 chr2 220403469 . G A 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.00402892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.861;QD=10.9363;RBI=0.0179677;REFB=-0.00922922;REVB=-0.0175102;RO=34;SAF=11;SAR=5;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522695;STB=0.53121;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0203686;OID=.;OPOS=220403469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:5:11:22:12:5:11:22:12 chr2 220404381 . A G 465.09 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.446;QD=58.1359;RBI=0.0479572;REFB=0;REVB=0.00998127;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441316;OID=.;OPOS=220404381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0 chr2 220404648 . C T 429.52 PASS AF=0.415254;AO=48;DP=117;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.0160262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9007;QD=14.56;RBI=0.0283699;REFB=-0.0145897;REVB=-0.0234097;RO=64;SAF=34;SAR=14;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272841;STB=0.678317;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0316365;OID=.;OPOS=220404648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:64:69:48:49:0.415254:14:34:29:35:14:35:29:40 chr2 220404726 . G A 347.53 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.014354;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.37;QD=16.9528;RBI=0.0227309;REFB=-0.0237215;REVB=0.0176255;RO=45;SAF=19;SAR=18;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197783;STB=0.610435;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0230695;OID=.;OPOS=220404726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:45:45:37:37:0.45122:18:19:14:31:18:19:14:31 chr2 220405230 . G A 531.57 PASS AF=0.482759;AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0185663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.553;QD=18.3299;RBI=0.0245635;REFB=-0.0196241;REVB=0.0160828;RO=60;SAF=28;SAR=28;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622337;STB=0.53447;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0175244;OID=.;OPOS=220405230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:60:60:56:56:0.482759:28:28:34:26:28:28:34:26 chr2 220405321 . T C 1729.06 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247808;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.512;QD=60.6686;RBI=0.0260105;REFB=0;REVB=-0.00790305;RO=0;SAF=45;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42864e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63286e-05;OID=.;OPOS=220405321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:113:114:1:68:45:0:0:68:46:0:0 chr2 220406722 . T C 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0160852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.164;QD=10.39;RBI=0.0164103;REFB=-0.0164825;REVB=-0.0032502;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116701;STB=0.571224;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0199519;OID=.;OPOS=220406722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:6:5:4:3:6:5 chr2 220412256 . T C 786.89 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0491848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2099;QD=55.22;RBI=0.0618679;REFB=-0.00459487;REVB=-0.0375298;RO=0;SAF=39;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87981e-08;STB=0.514281;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00093414;OID=.;OPOS=220412256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:17:39:0:0:17:39:0:1 chr2 220412778 . A AG 35.69 PASS AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0797711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.1604;QD=2.69389;RBI=0.0923947;REFB=-0.032147;REVB=0.0466193;RO=42;SAF=3;SAR=8;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198016;STB=0.512797;STBP=0.952;TYPE=ins;VARB=0.123533;OID=.;OPOS=220412779;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.207547:11:53:11:53:42:3:8:12:30:35:42:3:8:12:30 chr2 220414016 . C T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152343;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.255;QD=54.5177;RBI=0.0486611;REFB=0;REVB=0.046215;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222884;OID=.;OPOS=220414016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr2 220415595 . GGA G 202.52 PASS AF=0.69697;AO=22;DP=31;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0168607;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=2;MLLD=244.859;QD=24.5475;RBI=0.0341715;REFB=-0.0260981;REVB=0.0297222;RO=5;SAF=12;SAR=10;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880239;STB=0.605975;STBP=0.113;TYPE=del;VARB=0.00915787;OID=.;OPOS=220415596;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.69697:22:31:23:33:10:13:10:9:1:52:5:12:10:4:1 chr2 220417266 . C T 106.3 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0695091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0001;QD=11.8116;RBI=0.0717958;REFB=0.0242352;REVB=0.0179757;RO=23;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149372;STB=0.588607;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=-0.037037;OID=.;OPOS=220417266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:8:5:12:11:8:5:12:11 chr2 220419236 . T C 2360.6 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.237;QD=63.8;RBI=0.0521902;REFB=0;REVB=0.043181;RO=0;SAF=75;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13135e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126439;OID=.;OPOS=220419236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:148:0:0:143:148:1:68:75:0:0:73:75:0:0 chr2 220419339 . T C 2385.95 PASS AF=1;AO=156;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.138;QD=61.1782;RBI=0.0288059;REFB=0;REVB=-0.0264467;RO=0;SAF=75;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.7294e-05;OID=.;OPOS=220419339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:156:156:0:0:156:156:1:81:75:0:0:81:75:0:0 chr2 220420785 . G A 886.83 PASS AF=0.632;AO=79;DP=125;FAO=79;FDP=125;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0183818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.093;QD=28.3786;RBI=0.0620611;REFB=-0.0169651;REVB=0.0592764;RO=46;SAF=23;SAR=56;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143636;STB=0.577961;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0138787;OID=.;OPOS=220420785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:46:46:79:79:0.632:56:23:22:24:56:23:22:24 chr2 220420956 . A G 239.44 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00491155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.849;QD=50.4074;RBI=0.082616;REFB=0;REVB=0.0824699;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000698731;OID=.;OPOS=220420956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr2 220421417 . C G 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0136376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.687;QD=19.6924;RBI=0.023089;REFB=-0.0130729;REVB=-0.0186311;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505672;STB=0.528309;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0118048;OID=.;OPOS=220421417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:11:15:13:12:11:15:13:12 chr2 220422774 . A G 554.14 PASS AF=0.424658;AO=54;DP=139;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=0.00731633;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.044;QD=15.1818;RBI=0.0147381;REFB=-0.0221471;REVB=0.0127938;RO=78;SAF=25;SAR=29;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971921;STB=0.543494;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0304089;OID=.;OPOS=220422774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:146:78:84:54:62:0.424658:29:25:29:49:33:29:33:51 chr2 220427347 . G T 138.82 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0192639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3526;QD=12.0715;RBI=0.0308957;REFB=-0.0105486;REVB=-0.0241546;RO=30;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036845;STB=0.521712;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0175538;OID=.;OPOS=220427347;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:8:8:16:14:8:8:16:14 chr2 220427395 . G A 83.48 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00729444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.369;QD=9.82157;RBI=0.0230141;REFB=-0.0093682;REVB=-0.0218275;RO=23;SAF=8;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20057;STB=0.622518;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0193372;OID=.;OPOS=220427395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:3:8:13:10:3:8:13:10 chr2 220430203 . C T 1269.2 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.011377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8719;QD=60.4381;RBI=0.0815465;REFB=-0.142113;REVB=0.080749;RO=1;SAF=54;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01605;STB=0.508473;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00201976;OID=.;OPOS=220430203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:84:84:1:1:83:83:0.988095:29:54:0:1:29:54:0:1 chr2 220435034 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.993;QD=49.5992;RBI=0.0174245;REFB=0;REVB=0.016519;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16252e-05;OID=.;OPOS=220435034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr2 220435375 . G A 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.014862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2718;QD=17.2292;RBI=0.0560294;REFB=-0.00221083;REVB=0.0540224;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00756586;OID=.;OPOS=220435375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:4:2:4:4:4:2 chr2 220439678 . C T 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0202464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.581;QD=13.2123;RBI=0.0346252;REFB=-0.00995992;REVB=0.0280889;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334653;STB=0.702033;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0200502;OID=.;OPOS=220439678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:22:14:14:0.388889:8:6:16:5:8:6:17:5 chr2 220462640 . G T 1767.62 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=333.95;QD=60.9523;RBI=0.024412;REFB=0;REVB=0.00895415;RO=0;SAF=51;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46315e-05;OID=.;OPOS=220462640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:65:51:0:0:65:51:0:0 chr2 220466199 . G T 961.65 PASS AF=1;AO=53;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=50;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436757;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.318;QD=58.2819;RBI=0.0459072;REFB=0;REVB=-0.0141389;RO=0;SAF=41;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445606;OID=.;OPOS=220466199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:53:66:1:12:41:0:0:16:50:0:0 chr2 220466200 . C T 75.24 PASS AF=0.188406;AO=11;DP=67;FAO=13;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=-0.0204478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.7977;QD=4.36182;RBI=0.0223154;REFB=-0.017053;REVB=-0.00893664;RO=56;SAF=9;SAR=2;SRF=41;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151131;STB=0.540476;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0114461;OID=.;OPOS=220466200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:67:69:56:56:11:13:0.188406:2:9:41:15:3:10:41:15 chr2 220471116 . C G 946.98 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0220564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.033;QD=55.7047;RBI=0.0225735;REFB=-0.0509629;REVB=-0.00480403;RO=1;SAF=31;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149975;STB=0.51562;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000279298;OID=.;OPOS=220471116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:68:1:2:66:66:0.970588:35:31:1:0:35:31:2:0 chr2 220473355 . G A 587.28 PASS AF=0.536364;AO=59;DP=110;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=0.0288487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.744;QD=21.3557;RBI=0.0292633;REFB=-0.0186077;REVB=-0.0049083;RO=51;SAF=26;SAR=33;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172931;STB=0.594835;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0168598;OID=.;OPOS=220473355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:51:51:59:59:0.536364:33:26:33:18:33:26:33:18 chr2 220476443 . C T 1085.28 PASS AF=0.986486;AO=68;DP=69;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0524335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.271;QD=58.6638;RBI=0.0548225;REFB=-0.0424029;REVB=0.0160074;RO=1;SAF=40;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116708;STB=0.505493;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000578195;OID=.;OPOS=220476443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:69:74:1:1:68:73:0.986486:28:40:1:0:28:45:1:0 chr2 220476747 . C A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0131617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4196;QD=14.7983;RBI=0.0577864;REFB=0.00205149;REVB=-0.0562676;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452513;STB=0.526269;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00418839;OID=.;OPOS=220476747;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:2:9:11:2:2:9:11:2 chr2 220479312 . T C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.647;QD=62.9829;RBI=0.0310424;REFB=0;REVB=0.0188203;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67925e-05;OID=.;OPOS=220479312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0 chr2 220494117 . CA C,CC 620.1 PASS AF=0.317073,0.682927;AO=14,26;DP=41;FAO=13,28;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=9,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606255,0.0642385;FXX=0.0465008;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=234.468,237.649;QD=60.4972;RBI=0.0606814,0.064313;REFB=0,0;REVB=0.00260377,0.00309425;RO=0;SAF=3,8;SAR=11,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.28381e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00396879,0.00590953;OID=.,.;OPOS=220494118,220494118;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.317073,0.682927:14,26:41:13,28:41:0:4,8:9,20:0:0:26:0:3,8:11,18:0:0 chr2 220500423 . A G 1877.73 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4175;QD=61.5651;RBI=0.0410845;REFB=0;REVB=0.00776881;RO=0;SAF=61;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156761;OID=.;OPOS=220500423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:61:61:0:0:61:61:0:0 chr2 220500426 . A G 1828.79 PASS AF=0.98374;AO=119;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00261621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.315;QD=59.4728;RBI=0.0506936;REFB=-0.0507424;REVB=-0.0506261;RO=2;SAF=58;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016095;STB=0.508195;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.000189669;OID=.;OPOS=220500426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:123:123:2:2:119:121:0.98374:61:58:2:0:61:60:2:0 chr2 220502367 . A C 169.13 PASS AF=0.375;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0354592;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.671;QD=12.0803;RBI=0.0361577;REFB=-0.00539587;REVB=0.00707279;RO=29;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1708;STB=0.5479;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00959527;OID=.;OPOS=220502367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:29:35:21:21:0.375:11:10:9:20:11:10:14:21 chr2 220505265 . T C 292.43 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0291715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.918;QD=14.6213;RBI=0.0318786;REFB=-0.0289411;REVB=-0.0128557;RO=47;SAF=11;SAR=22;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212121;STB=0.620615;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0350221;OID=.;OPOS=220505265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:22:11:25:22:22:11:25:22 chr2 220771223 . C T 1955.8 PASS AF=0.977273;AO=129;DP=132;FAO=129;FDP=132;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0156141;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.701;QD=59.2666;RBI=0.0248693;REFB=-0.010244;REVB=0.0193567;RO=0;SAF=53;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505991;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00194645;OID=.;OPOS=220771223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:132:132:0:3:129:129:0.977273:76:53:0:0:76:53:2:1 chr2 220771290 . G A 1914.99 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00332706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.316;QD=61.7738;RBI=0.00827117;REFB=0;REVB=0.00757251;RO=0;SAF=52;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8317e-06;OID=.;OPOS=220771290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:72:52:0:0:72:52:0:0 chr2 222322598 . C T 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0105998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.862;QD=13.5518;RBI=0.0111296;REFB=-0.00411012;REVB=-0.00339299;RO=35;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427501;STB=0.524475;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00702126;OID=.;OPOS=222322598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:14:10:16:19:14:10:16:19 chr2 223161889 . A G 1135.08 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0033348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4099;QD=60.5376;RBI=0.0191348;REFB=0;REVB=-0.018842;RO=0;SAF=21;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.24686e-05;OID=.;OPOS=223161889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:54:21:0:0:54:21:0:0 chr2 223423362 . A G 784.65 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.54;QD=57.0652;RBI=0.0680228;REFB=0;REVB=0.0438439;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000597105;OID=.;OPOS=223423362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0 chr2 223423491 . C G 764.24 PASS AF=0.49375;AO=79;DP=160;FAO=79;FDP=160;FR=.;FRO=81;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.0155366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.398;QD=19.106;RBI=0.0201686;REFB=-0.00430615;REVB=-0.0128603;RO=80;SAF=38;SAR=41;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0059318;STB=0.506492;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00535643;OID=.;OPOS=223423491;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:80:81:79:79:0.49375:41:38:39:41:41:38:40:41 chr2 223436607 . C T 1283.2 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.454;QD=61.8409;RBI=0.0208205;REFB=0;REVB=-0.0125382;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52957e-05;OID=.;OPOS=223436607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0 chr2 223520797 . T G 1034.64 PASS AF=0.512821;AO=94;DP=189;FAO=100;FDP=195;FR=.;FRO=95;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=0.00103809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.681;QD=21.2234;RBI=0.0277435;REFB=-0.0140672;REVB=0.0277241;RO=95;SAF=48;SAR=46;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721867;STB=0.523668;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.014753;OID=.;OPOS=223520797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:195:95:95:94:100:0.512821:46:48:41:54:52:48:41:54 chr2 223536541 . G A 654.56 PASS AF=0.449664;AO=67;DP=150;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=0.00182688;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.833;QD=17.572;RBI=0.0320683;REFB=-0.0114277;REVB=0.0320162;RO=82;SAF=31;SAR=36;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168454;STB=0.593536;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0109831;OID=.;OPOS=223536541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:82:82:67:67:0.449664:36:31:52:30:36:31:52:30 chr2 223559089 . T C 360.09 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0343116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.4648;QD=22.8626;RBI=0.0496012;REFB=0.0124772;REVB=0.035819;RO=26;SAF=24;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746814;STB=0.534864;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0129116;OID=.;OPOS=223559089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:27:36:36:0.571429:12:24:15:11:12:24:16:11 chr2 223785740 . A G 195.19 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0268966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.29;QD=14.1959;RBI=0.0270714;REFB=-0.00712105;REVB=0.00307098;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389248;STB=0.509991;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00943291;OID=.;OPOS=223785740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:32:23:23:0.418182:14:9:11:20:14:9:12:20 chr2 223807380 . C A 2118.46 PASS AF=0.992754;AO=136;DP=139;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00284139;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.245;QD=61.4047;RBI=0.00550274;REFB=0.00451145;REVB=0.00471239;RO=1;SAF=78;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605607;STB=0.503144;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=2.54823e-05;OID=.;OPOS=223807380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:139:138:1:1:136:137:0.992754:58:78:1:0:58:79:1:0 chr2 223917629 . C T 487.15 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514357;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9328;QD=59.0487;RBI=0.0675067;REFB=0;REVB=0.043721;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163398;OID=.;OPOS=223917629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0 chr2 223917812 . T C 1272.26 PASS AF=1;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266169;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.179;QD=62.0612;RBI=0.0413643;REFB=0;REVB=0.031663;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14737e-05;OID=.;OPOS=223917812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:81:82:1:32:49:0:0:33:49:0:0 chr2 223917983 . T G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.841;QD=61.684;RBI=0.0216813;REFB=0;REVB=-0.021625;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7006e-05;OID=.;OPOS=223917983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr2 223918080 . C G 519.98 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0665;QD=59.4265;RBI=0.0527747;REFB=0;REVB=0.0248264;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124099;OID=.;OPOS=223918080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0 chr2 223918363 . T C 708.54 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.8565;QD=62.9809;RBI=0.00939512;REFB=0;REVB=0.00541025;RO=0;SAF=10;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67971e-05;OID=.;OPOS=223918363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:34:10:0:0:34:11:0:0 chr2 224620181 . G C,T 600.96 PASS AF=0.05,0.95;AO=2,38;DP=40;FAO=2,38;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=2,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0092092,-0.00899225;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=121.067,155.258;QD=60.0959;RBI=0.025589,0.0306107;REFB=0,0;REVB=-0.0238744,-0.0292601;RO=0;SAF=0,12;SAR=2,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.05056e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0522535,0.000522588;OID=.,.;OPOS=224620181,224620181;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:40:40:0:0:2,38:2,38:0.05,0.95:2,26:0,12:0:0:2,26:0,12:0:0 chr2 224622860 . TA T 59.39 PASS AF=0.583333;AO=10;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.100462;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=8.11481;QD=9.8977;RBI=0.110471;REFB=-0.0271028;REVB=-0.0459483;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22118;STB=0.59985;STBP=0.288;TYPE=del;VARB=0.0348902;OID=.;OPOS=224622861;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:10:24:14:24:10:10:4:5:5:25:9:7:3:4:5 chr2 224856650 . G A 521.73 PASS AF=0.486726;AO=55;DP=113;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.000663967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.335;QD=18.4683;RBI=0.00249244;REFB=-0.00719516;REVB=-0.00240237;RO=58;SAF=23;SAR=32;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446652;STB=0.524753;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00909022;OID=.;OPOS=224856650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:58:58:55:55:0.486726:32:23:27:31:32:23:27:31 chr2 225630233 . C T 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.205;QD=57.177;RBI=0.0597715;REFB=0;REVB=-0.0402573;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000900278;OID=.;OPOS=225630233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0 chr2 225658104 . G A 273.92 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0266733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.444;QD=17.6721;RBI=0.0275243;REFB=-0.00338434;REVB=0.00679125;RO=29;SAF=20;SAR=10;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228684;STB=0.637269;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00513064;OID=.;OPOS=225658104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:32:30:30:0.483871:10:20:12:17:10:20:13:19 chr2 226273689 . T C 850.18 PASS AF=0.518293;AO=84;DP=163;FAO=85;FDP=164;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.00957809;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.582;QD=20.7361;RBI=0.0190456;REFB=-0.00790511;REVB=0.0164619;RO=79;SAF=34;SAR=50;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023345;STB=0.515148;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00744666;OID=.;OPOS=226273689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:79:79:84:85:0.518293:50:34:34:45:51:34:34:45 chr2 226447735 . C T 405.51 PASS AF=0.5;AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00921986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.088;QD=19.7807;RBI=0.0120745;REFB=0.00360489;REVB=-0.00779663;RO=40;SAF=16;SAR=24;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235741;STB=0.512609;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.00313165;OID=.;OPOS=226447735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:40:41:40:41:0.5:24:16:15:25:24:17:16:25 chr2 226491770 . A C 850.21 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.467;QD=57.6413;RBI=0.137541;REFB=0;REVB=0.0233916;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121085;OID=.;OPOS=226491770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:34:23:0:0:34:25:0:0 chr2 226516913 . A G 859.66 PASS AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00428597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.229;QD=54.5816;RBI=0.00441497;REFB=0.038786;REVB=-0.00105942;RO=1;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140901;STB=0.501309;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.00147751;OID=.;OPOS=226516913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:63:63:1:2:61:61:0.968254:33:28:0:1:33:28:1:1 chr2 227662189 . A G 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00550912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.88;QD=10.9361;RBI=0.0226322;REFB=-0.0139125;REVB=-0.0219515;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237924;STB=0.639839;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0326324;OID=.;OPOS=227662189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:8:8:24:10:8:8:24:10 chr2 227807202 . G T 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00047819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.552;QD=12.7388;RBI=0.0834602;REFB=-0.0286197;REVB=0.0834588;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245631;STB=0.514669;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0248262;OID=.;OPOS=227807202;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:3:5:6:4:3:5:6:4 chr2 227872182 . G A 346.73 PASS AF=0.479452;AO=29;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00352101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9828;QD=18.9986;RBI=0.0231401;REFB=-0.013378;REVB=0.0228707;RO=35;SAF=17;SAR=12;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17971;STB=0.585317;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0223263;OID=.;OPOS=227872182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:35:35:29:35:0.479452:12:17:14:21:15:20:14:21 chr2 227872995 . T C 482.58 PASS AF=0.6;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=75;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0493636;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4869;QD=25.7374;RBI=0.0504823;REFB=-0.0228255;REVB=-0.0105686;RO=30;SAF=14;SAR=31;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464243;STB=0.525412;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0274432;OID=.;OPOS=227872995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:30:30:45:45:0.6:31:14:11:19:31:14:11:19 chr2 227886773 . A G 179.12 PASS AF=0.315789;AO=23;DP=75;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0120368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.165;QD=9.42753;RBI=0.0123721;REFB=-0.00562413;REVB=0.0028606;RO=47;SAF=15;SAR=8;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143376;STB=0.579371;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00996613;OID=.;OPOS=227886773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:47:52:23:24:0.315789:8:15:25:22:8:16:29:23 chr2 227892619 . C T 174.7 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.1538;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.07;QD=11.6464;RBI=0.154108;REFB=0.045418;REVB=-0.00973427;RO=37;SAF=14;SAR=8;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467762;STB=0.533304;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.104947;OID=.;OPOS=227892619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:37:38:22:22:0.366667:8:14:25:12:8:14:26:12 chr2 227892720 . C T 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.000170729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.26;QD=14.6499;RBI=0.0199526;REFB=-0.00904087;REVB=0.0199519;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221272;STB=0.628635;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0100668;OID=.;OPOS=227892720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:11:8:9:5:11:8 chr2 227896886 . C T 915.92 PASS AF=0.435345;AO=91;DP=222;FAO=101;FDP=232;FR=.;FRO=131;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=69;FSRR=62;FWDB=-0.00334408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.403;QD=15.7917;RBI=0.00525899;REFB=-0.00207109;REVB=-0.00405884;RO=126;SAF=48;SAR=43;SRF=65;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120819;STB=0.506707;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00260771;OID=.;OPOS=227896886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:232:126:131:91:101:0.435345:43:48:65:61:49:52:69:62 chr2 227896976 . C T 755.61 PASS AF=0.462428;AO=79;DP=170;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.00176046;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.0715;QD=17.4707;RBI=0.0169301;REFB=-0.00699377;REVB=-0.0168383;RO=91;SAF=39;SAR=40;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417013;STB=0.526005;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0041198;OID=.;OPOS=227896976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:173:91:93:79:80:0.462428:40:39:41:50:40:40:42:51 chr2 228111435 . T C 1677.12 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.627;QD=60.4367;RBI=0.0400285;REFB=0;REVB=-0.0280124;RO=0;SAF=55;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.15907e-05;OID=.;OPOS=228111435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:56:55:0:0:56:55:0:0 chr2 228111600 . G T 549.66 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0633;QD=59.4222;RBI=0.0365641;REFB=0;REVB=0.0105769;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00176754;OID=.;OPOS=228111600;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr2 228113175 . A G 1098.72 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0491988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3168;QD=60.2039;RBI=0.0506152;REFB=0;REVB=-0.0118898;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000529907;OID=.;OPOS=228113175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0 chr2 228121101 . G T 459.01 PASS AF=0.432203;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.00664452;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8492;QD=15.5597;RBI=0.0330677;REFB=-0.0061649;REVB=-0.0323933;RO=67;SAF=22;SAR=29;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625037;STB=0.535042;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00720581;OID=.;OPOS=228121101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:67:67:51:51:0.432203:29:22:33:34:29:22:33:34 chr2 228128540 . C T 1364.26 PASS AF=0.422222;AO=152;DP=359;FAO=152;FDP=360;FR=.;FRO=208;FSAF=76;FSAR=76;FSRF=124;FSRR=84;FWDB=0.0113454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0028;QD=15.1585;RBI=0.0548302;REFB=-0.00868028;REVB=-0.0536435;RO=196;SAF=76;SAR=76;SRF=115;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881437;STB=0.555548;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0211585;OID=.;OPOS=228128540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:360:196:208:152:152:0.422222:76:76:115:81:76:76:124:84 chr2 228135631 . C T 407.31 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.00339716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.435;QD=22.9468;RBI=0.0100783;REFB=-0.017914;REVB=-0.00948845;RO=30;SAF=15;SAR=25;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635695;STB=0.54021;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.016155;OID=.;OPOS=228135631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:31:40:40:0.56338:25:15:9:21:25:15:9:22 chr2 228162451 . G A 444.71 PASS AF=0.42735;AO=50;DP=115;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=0.0177418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.269;QD=15.2037;RBI=0.0179987;REFB=-0.00406678;REVB=-0.00302983;RO=65;SAF=19;SAR=31;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693802;STB=0.531606;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00609888;OID=.;OPOS=228162451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:65:67:50:50:0.42735:31:19:29:36:31:19:29:38 chr2 228177479 . C T 1094.26 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.595;QD=59.9593;RBI=0.0291863;REFB=0;REVB=-0.000499379;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90061e-05;OID=.;OPOS=228177479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0 chr2 228177751 . G A 196.89 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0337104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5338;QD=12.9111;RBI=0.0359425;REFB=0.0038187;REVB=-0.012469;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300885;STB=0.507036;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=-0.00866582;OID=.;OPOS=228177751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:14:10:14:22:14:10:15:22 chr2 228177825 . C G 727.66 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.475;QD=63.275;RBI=0.060356;REFB=0;REVB=0.0595133;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327784;OID=.;OPOS=228177825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr2 228179238 . G A 912.57 PASS AF=0.394737;AO=105;DP=265;FAO=105;FDP=266;FR=.;FRO=161;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=69;FSRR=92;FWDB=-0.0358734;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3089;QD=13.7228;RBI=0.054435;REFB=-0.0203193;REVB=-0.0409423;RO=159;SAF=49;SAR=56;SRF=68;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422029;STB=0.523228;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0280495;OID=.;OPOS=228179238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:266:159:161:105:105:0.394737:56:49:68:91:56:49:69:92 chr2 228194480 . AG TT 120.09 PASS AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00656593;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=286.563;QD=9.41879;RBI=0.00893235;REFB=-0.00958943;REVB=0.00605602;RO=36;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135864;STB=0.581711;STBP=0.463;TYPE=mnp;VARB=0.0206384;OID=.;OPOS=228194480;OREF=AG;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:7:8:15:21:7:8:15:21 chr2 228228558 . A G 288.86 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0100283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.75;QD=18.9419;RBI=0.0100494;REFB=-0.0147986;REVB=-0.000650577;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436012;STB=0.524297;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0201684;OID=.;OPOS=228228558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:15:16:14:16:15:16:14:16 chr2 228230840 . C T 237.15 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0173104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4533;QD=19.7622;RBI=0.0871865;REFB=-0.0424538;REVB=-0.0854507;RO=25;SAF=7;SAR=16;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992073;STB=0.556187;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0366298;OID=.;OPOS=228230840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:16:7:10:15:16:7:10:15 chr2 228416712 . A G 213.93 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0362007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.51;QD=20.8707;RBI=0.0362494;REFB=-0.0188888;REVB=0.00187783;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13768;STB=0.576855;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0139487;OID=.;OPOS=228416712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:16:4:7:14:16:4 chr2 228476253 . C G 1492.5 PASS AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0402414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7344;QD=58.5296;RBI=0.0410486;REFB=-0.118676;REVB=-0.00810082;RO=1;SAF=53;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886767;STB=0.504672;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00109686;OID=.;OPOS=228476253;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:102:1:1:101:101:0.990196:48:53:1:0:48:53:1:0 chr2 228776996 . T C 129.42 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00826527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.705;QD=12.9423;RBI=0.0344623;REFB=-0.0107152;REVB=-0.0334565;RO=25;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17037;STB=0.599867;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0184105;OID=.;OPOS=228776996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:6:9:11:14:6:9:11:14 chr2 228882970 . T C 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.322;QD=64.413;RBI=0.0175813;REFB=0;REVB=0.017442;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26904e-05;OID=.;OPOS=228882970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0 chr2 228883721 . T C 772.77 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0154809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.231;QD=61.8218;RBI=0.0178467;REFB=-0.00672292;REVB=0.00887959;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209097;STB=0.511107;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-1.37206e-05;OID=.;OPOS=228883721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:27:22:1:0:27:22:1:0 chr2 230045542 . C G 886.35 PASS AF=0.52071;AO=88;DP=169;FAO=88;FDP=169;FR=.;FRO=81;FSAF=54;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0376652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3563;QD=20.9787;RBI=0.0454939;REFB=0.00467396;REVB=-0.0255152;RO=81;SAF=54;SAR=34;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253089;STB=0.638555;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00288725;OID=.;OPOS=230045542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:81:81:88:88:0.52071:34:54:26:55:34:54:26:55 chr2 230045545 . T C 933.98 PASS AF=0.532164;AO=91;DP=173;FAO=91;FDP=171;FR=.;FRO=80;FSAF=57;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=55;FWDB=0.0101984;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.498;QD=21.8476;RBI=0.0118418;REFB=-0.0204423;REVB=-0.00601844;RO=81;SAF=57;SAR=34;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260629;STB=0.645306;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0118756;OID=.;OPOS=230045545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:171:81:80:91:91:0.532164:34:57:26:55:34:57:25:55 chr2 230045554 . G C 968.28 PASS AF=0.553571;AO=93;DP=167;FAO=93;FDP=168;FR=.;FRO=75;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=51;FWDB=0.0109352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.107;QD=23.0542;RBI=0.0148232;REFB=-0.00721397;REVB=-0.0100075;RO=74;SAF=61;SAR=32;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280963;STB=0.650488;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00611644;OID=.;OPOS=230045554;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:74:75:93:93:0.553571:32:61:23:51:32:61:24:51 chr2 230045564 . T C 984.17 PASS AF=0.57764;AO=93;DP=162;FAO=93;FDP=161;FR=.;FRO=68;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=-0.025753;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.939;QD=24.4513;RBI=0.0339713;REFB=-0.0130604;REVB=0.0221548;RO=68;SAF=61;SAR=32;SRF=21;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271066;STB=0.647422;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0210187;OID=.;OPOS=230045564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:68:68:93:93:0.57764:32:61:21:47:32:61:21:47 chr2 230045568 . T C 985.29 PASS AF=0.58125;AO=93;DP=160;FAO=93;FDP=160;FR=.;FRO=67;FSAF=62;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=-0.0167058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.708;QD=24.6322;RBI=0.0241987;REFB=-0.00461325;REVB=-0.0175069;RO=67;SAF=62;SAR=31;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285864;STB=0.655428;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00448348;OID=.;OPOS=230045568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:67:67:93:93:0.58125:31:62:20:47:31:62:20:47 chr2 230045615 . G A 965.61 PASS AF=0.706897;AO=82;DP=116;FAO=82;FDP=116;FR=.;FRO=34;FSAF=60;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00201359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.595;QD=33.2968;RBI=0.0125365;REFB=-0.00600741;REVB=0.0123737;RO=34;SAF=60;SAR=22;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165793;STB=0.589368;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00319988;OID=.;OPOS=230045615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:34:34:82:82:0.706897:22:60:16:18:22:60:16:18 chr2 230045628 . GT G 45.64 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.149797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.5243;QD=6.08488;RBI=0.168664;REFB=-0.00217795;REVB=-0.0775132;RO=20;SAF=0;SAR=9;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.308261;SSSB=-0.805859;STB=0.888025;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=-0.0112694;OID=.;OPOS=230045629;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3:9:30:9:30:21:1:8:14:7:45:20:0:9:14:6 chr2 230092723 . G A 432.93 PASS AF=0.418803;AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.0361883;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3552;QD=14.801;RBI=0.037768;REFB=-0.0123878;REVB=0.0108088;RO=68;SAF=29;SAR=20;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257677;STB=0.644387;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0248277;OID=.;OPOS=230092723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:68:68:49:49:0.418803:20:29:23:45:20:29:23:45 chr2 230135711 . G GC 1604.03 PASS AF=1;AO=125;DP=149;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.158106;FXX=0.0349626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.9732;QD=46.4936;RBI=0.232931;REFB=0;REVB=0.171054;RO=15;SAF=40;SAR=85;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184877;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-6.13892e-05;OID=.;OPOS=230135712;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:125:149:138:138:0:46:92:0:0:30:15:40:85:6:9 chr2 230632213 . G T 611.61 PASS AF=0.525862;AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0243196;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7668;QD=21.0901;RBI=0.0280918;REFB=0.000854;REVB=0.0140608;RO=54;SAF=42;SAR=19;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141552;STB=0.574602;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.000215218;OID=.;OPOS=230632213;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:54:55:61:61:0.525862:19:42:29:25:19:42:30:25 chr2 230723777 . G C 317.25 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00664047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.928;QD=25.8982;RBI=0.0323408;REFB=-0.0263857;REVB=0.0316517;RO=21;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651959;STB=0.536057;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0192136;OID=.;OPOS=230723777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:15:13:8:13:15:13:8:13 chr2 230841074 . C T 327.75 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304046;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.818;QD=54.6251;RBI=0.049607;REFB=0;REVB=-0.0391972;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00125214;OID=.;OPOS=230841074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr2 231050715 . A G 1339.72 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1325;QD=62.3125;RBI=0.055021;REFB=0;REVB=-0.00577689;RO=0;SAF=63;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211877;OID=.;OPOS=231050715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:23:63:0:0:23:63:0:0 chr2 231072709 . C T 714.83 PASS AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0448129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7584;QD=57.1862;RBI=0.0450563;REFB=-0.0130029;REVB=-0.0046765;RO=3;SAF=18;SAR=29;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721518;STB=0.538445;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0106956;OID=.;OPOS=231072709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:50:50:3:3:47:47:0.94:29:18:3:0:29:18:3:0 chr2 231077725 . A G 512.32 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1209;QD=58.5503;RBI=0.0405367;REFB=0;REVB=0.0151675;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000967181;OID=.;OPOS=231077725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:22:12:0:0:23:12:0:0 chr2 231118041 . A C 220.58 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0263573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.146;QD=14.2308;RBI=0.0264053;REFB=-0.00985917;REVB=-0.00159273;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508173;STB=0.528945;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00986242;OID=.;OPOS=231118041;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:11:15:19:17:11:15:19:17 chr2 231149097 . T C 233.49 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0311327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.653;QD=15.0641;RBI=0.0325697;REFB=-0.0169281;REVB=-0.00956768;RO=34;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159683;STB=0.583271;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0235679;OID=.;OPOS=231149097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:35:27:27:0.435484:10:17:16:18:10:17:17:18 chr2 231149108 . G A 950.52 PASS AF=1;AO=56;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6142;QD=58.4938;RBI=0.0638158;REFB=0;REVB=0.058052;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124707;OID=.;OPOS=231149108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:56:65:1:24:32:0:0:29:36:0:0 chr2 231222655 . G T 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.014126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.22;QD=12.6377;RBI=0.0238672;REFB=-0.00528276;REVB=-0.019238;RO=20;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498891;STB=0.55094;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0089861;OID=.;OPOS=231222655;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:9:4:7:13:9:4:8:13 chr2 231222675 . T C 84.46 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=32;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00859544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.503;QD=10.2372;RBI=0.0159658;REFB=-0.0118694;REVB=0.0134545;RO=22;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812577;STB=0.571292;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0183284;OID=.;OPOS=231222675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:33:22:22:10:11:0.333333:7:3:8:14:8:3:8:14 chr2 231451851 . A G 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0613699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.61;QD=14.1699;RBI=0.062263;REFB=-0.0189674;REVB=-0.0105081;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170018;STB=0.5998;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0110671;OID=.;OPOS=231451851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:7:5:6:4:7:5 chr2 231738168 . G A 258.05 PASS AF=0.509434;AO=22;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.00789327;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=235.902;QD=19.4752;RBI=0.0127813;REFB=-0.0394657;REVB=-0.0100528;RO=18;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37466;STB=0.608621;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0158783;OID=.;OPOS=231738168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:18:26:22:27:0.509434:9:13:18:0:12:15:20:6 chr2 231738263 . C T 253.1 PASS AF=0.432836;AO=28;DP=66;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=0.0114833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9466;QD=15.1102;RBI=0.0175373;REFB=-0.011586;REVB=-0.0132549;RO=38;SAF=13;SAR=15;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300509;STB=0.657393;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.014539;OID=.;OPOS=231738263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:38:38:28:29:0.432836:15:13:29:9:15:14:29:9 chr2 231738269 . G A 223.42 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.0096543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.973;QD=14.8944;RBI=0.0310953;REFB=-0.00327827;REVB=0.0295586;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270658;STB=0.652284;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00611824;OID=.;OPOS=231738269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:14:12:25:9:14:12:25:9 chr2 231774844 . G A 407.7 PASS AF=0.433962;AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.00969971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.865;QD=15.3848;RBI=0.0113517;REFB=-0.00528541;REVB=0.00589718;RO=60;SAF=22;SAR=24;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965497;STB=0.554064;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00528985;OID=.;OPOS=231774844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:60:60:46:46:0.433962:24:22:23:37:24:22:23:37 chr2 231775094 . C A 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0578487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.3083;QD=20.8975;RBI=0.0726306;REFB=-0.0213343;REVB=-0.0439174;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749496;STB=0.543368;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.00362505;OID=.;OPOS=231775094;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:5:3:2:2:5:3:2:2 chr2 231775297 . T G 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0172265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.611;QD=15.1567;RBI=0.0177878;REFB=-0.0226842;REVB=0.00443341;RO=32;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00642615;STB=0.503647;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0229151;OID=.;OPOS=231775297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:10:15:19:13:10:15:19:13 chr2 231861044 . C T 528.45 PASS AF=0.973684;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0640561;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.778;QD=55.6261;RBI=0.07869;REFB=-0.130972;REVB=0.0457049;RO=1;SAF=24;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190966;STB=0.509429;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00105661;OID=.;OPOS=231861044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:38:1:1:35:37:0.973684:11:24:1:0:11:26:1:0 chr2 231861071 . T C 272.61 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0229507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.995;QD=24.2322;RBI=0.0253018;REFB=-0.0280983;REVB=-0.0106512;RO=20;SAF=15;SAR=10;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198771;STB=0.610531;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0480431;OID=.;OPOS=231861071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:10:15:7:13:10:15:7:13 chr2 231865144 . G C 1013.72 PASS AF=0.515789;AO=96;DP=188;FAO=98;FDP=190;FR=.;FRO=92;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.00376892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9335;QD=21.3416;RBI=0.0340191;REFB=-0.026394;REVB=-0.0338097;RO=86;SAF=50;SAR=46;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580929;STB=0.515148;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0227015;OID=.;OPOS=231865144;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:190:86:92:96:98:0.515789:46:50:39:47:47:51:45:47 chr2 232035429 . G A 298.06 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0283366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.0219;QD=20.9167;RBI=0.0297903;REFB=-0.00471157;REVB=0.00919237;RO=25;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231778;STB=0.637759;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00508406;OID=.;OPOS=232035429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:25:26:31:31:0.54386:21:10:15:10:21:10:16:10 chr2 232072912 . T C 463.11 PASS AF=0.471698;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0171562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.84;QD=17.4758;RBI=0.0223021;REFB=-0.00433411;REVB=0.0142496;RO=56;SAF=24;SAR=26;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359514;STB=0.519992;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00510682;OID=.;OPOS=232072912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:56:50:50:0.471698:26:24:29:27:26:24:29:27 chr2 232087474 . AT GA 437.14 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0913414;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=247.224;QD=48.5712;RBI=0.134339;REFB=0;REVB=0.0985077;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00637725;OID=.;OPOS=232087474;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:18:16:0:0:19:17:0:0 chr2 232196564 . C T 105.81 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0226338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.024;QD=11.4393;RBI=0.0275495;REFB=-0.00525764;REVB=-0.0157062;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381748;STB=0.725472;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0199397;OID=.;OPOS=232196564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:4:9:8:16:4:9:8:16 chr2 232196597 . G A 83.48 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0140736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.871;QD=9.82172;RBI=0.0574427;REFB=-0.00708583;REVB=-0.055692;RO=23;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358398;STB=0.713925;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0210539;OID=.;OPOS=232196597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:4:7:7:16:4:7:7:16 chr2 232225533 . CACGGGAC ACGGGGAC,CACGGGGA,CACGGGGAC 1555.76 PASS AF=0,0,1;AO=9,25,84;DP=152;FAO=0,0,126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,48;FSAR=0,0,78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14329,-0.110038,0.298841;FXX=0.0156238;HRUN=5,1,3;LEN=3,2,1;MLLD=5.59987,5.53624,17.5302;QD=49.3892;RBI=0.143382,0.110355,0.298876;REFB=0,0,0;REVB=0.0051177,-0.00836538,0.00453578;RO=1;SAF=5,16,11;SAR=4,9,73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.080744,-0.0281249,-0.0411194;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,mnp,ins;VARB=0,0.0849572,0.00116961;OID=.,.,.;OPOS=232225533,232225539,232225536;OREF=CAC,AC,-;OALT=ACG,GA,G;OMAPALT=ACGGGGAC,CACGGGGA,CACGGGGAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 3/3:8:152:126:1:0:9,25,84:0,0,126:0,0,1:4,9,73:5,16,11:1:0:0,0,78:0,0,48:0:0 chr2 232263127 . G A 308.34 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.00696075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.671;QD=15.8122;RBI=0.00833675;REFB=-0.018622;REVB=-0.00458796;RO=43;SAF=19;SAR=15;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463954;STB=0.518422;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0225664;OID=.;OPOS=232263127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:44:34:34:0.435897:15:19:26:17:15:19:26:18 chr2 232325414 . TTCA T 36.78 PASS AF=0.235294;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.0505491;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=3;MLLD=199.571;QD=4.32685;RBI=0.0510324;REFB=-0.0196406;REVB=-0.00700673;RO=22;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133332;STB=0.660683;STBP=0.4;TYPE=del;VARB=0.0624701;OID=.;OPOS=232325415;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.235294:8:35:8:34:26:5:3:21:5:36:22:5:3:16:6 chr2 232326417 . C T 258.52 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0384786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9825;QD=16.4139;RBI=0.0499559;REFB=-0.053485;REVB=0.0318589;RO=34;SAF=15;SAR=14;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125492;STB=0.570437;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0648905;OID=.;OPOS=232326417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:14:15:22:12:14:15:22:12 chr2 232378231 . T C 313.96 PASS AF=0.447368;AO=35;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0174498;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2263;QD=16.5242;RBI=0.0247741;REFB=-0.0207604;REVB=0.0175859;RO=40;SAF=15;SAR=20;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00347295;STB=0.522966;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0312021;OID=.;OPOS=232378231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:42:35:34:0.447368:20:15:17:23:20:14:19:23 chr2 232458443 . T C 446.69 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.198;QD=57.6373;RBI=0.026393;REFB=0;REVB=-0.0225334;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97188e-05;OID=.;OPOS=232458443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:10:20:0:0:11:20:0:0 chr2 232672932 . C T 218.21 PASS AF=0.385714;AO=26;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00280836;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.745;QD=12.469;RBI=0.01722;REFB=-0.0160351;REVB=-0.0169894;RO=43;SAF=12;SAR=14;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00389379;STB=0.512811;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0324502;OID=.;OPOS=232672932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:43:43:26:27:0.385714:14:12:20:23:15:12:20:23 chr2 232952286 . A G 333.12 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00651219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.85;QD=16.4506;RBI=0.00733114;REFB=-0.00694253;REVB=0.00336704;RO=45;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398522;STB=0.522376;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00887796;OID=.;OPOS=232952286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:21:15:17:28:21:15:17:28 chr2 233200849 . A G 383.68 PASS AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0301819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.509;QD=20.1937;RBI=0.0375524;REFB=-0.0172118;REVB=0.0223437;RO=37;SAF=22;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448421;STB=0.524868;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0155237;OID=.;OPOS=233200849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:17:22:19:18:17:22:19:18 chr2 233201328 . A G 125.71 PASS AF=0.307692;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0284567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.495;QD=9.67004;RBI=0.0392635;REFB=-0.00927488;REVB=-0.0270525;RO=35;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112934;STB=0.574537;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0341486;OID=.;OPOS=233201328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:35:36:16:16:0.307692:9:7:12:23:9:7:12:24 chr2 233205600 . A G 142.34 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.0494511;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.871;QD=19.6324;RBI=0.0495527;REFB=0.000498446;REVB=-0.00317061;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197765;STB=0.61098;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000833164;OID=.;OPOS=233205600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:29:14:14:15:15:0.517241:10:5:2:12:10:5:2:12 chr2 233243981 . A T 1157.26 PASS AF=0.987179;AO=78;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0034279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.45;QD=59.3469;RBI=0.0218021;REFB=-0.0274017;REVB=0.021531;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.507934;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=5.13313e-05;OID=.;OPOS=233243981;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:0:1:78:77:0.987179:46:32:0:0:46:31:1:0 chr2 233244586 . C G 279.72 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0607983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3241;QD=48.6477;RBI=0.0825229;REFB=-0.177819;REVB=-0.0557996;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517226;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0117351;OID=.;OPOS=233244586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:23:0:1:22:22:0.956522:8:14:0:0:8:14:1:0 chr2 233349588 . G A 803.46 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.019497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.329;QD=55.411;RBI=0.0208585;REFB=-0.0013092;REVB=-0.00741258;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=3.9246e-05;OID=.;OPOS=233349588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:30:27:0:0:30:27:0:1 chr2 233385321 . G A 1593.43 PASS AF=0.547101;AO=150;DP=276;FAO=151;FDP=276;FR=.;FRO=125;FSAF=76;FSAR=75;FSRF=62;FSRR=63;FWDB=0.0199157;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.752;QD=23.0931;RBI=0.0492681;REFB=-0.0431093;REVB=0.0450634;RO=124;SAF=76;SAR=74;SRF=61;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122492;STB=0.503311;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0373693;OID=.;OPOS=233385321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:124:125:150:151:0.547101:74:76:61:63:75:76:62:63 chr2 233385396 . G A 2176.37 PASS AF=0.973684;AO=146;DP=152;FAO=148;FDP=152;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=94;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0381381;FXX=0.0318451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3989;QD=57.2729;RBI=0.0709012;REFB=-0.104882;REVB=0.0597701;RO=1;SAF=53;SAR=93;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00888813;STB=0.503828;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00232956;OID=.;OPOS=233385396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:152:152:1:4:146:148:0.973684:93:53:1:0:94:54:2:2 chr2 233386583 . T C 1465.98 PASS AF=0.989474;AO=93;DP=96;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0167487;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.733;QD=61.7254;RBI=0.0444674;REFB=-0.0513234;REVB=0.0411926;RO=1;SAF=44;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106533;STB=0.505617;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000789952;OID=.;OPOS=233386583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:95:1:1:93:94:0.989474:49:44:1:0:50:44:1:0 chr2 233390937 . A G 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0124124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.878;QD=12.7823;RBI=0.0179951;REFB=-0.0109164;REVB=-0.0130291;RO=14;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33729;STB=0.6996;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0282798;OID=.;OPOS=233390937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:3:7:5:9:3:7:5:9 chr2 233406178 . G A 372.87 PASS AF=0.464286;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0196163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5624;QD=17.7555;RBI=0.0314118;REFB=-0.0228668;REVB=0.0245337;RO=45;SAF=18;SAR=21;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153046;STB=0.585411;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.025196;OID=.;OPOS=233406178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:39:39:0.464286:21:18:28:17:21:18:28:17 chr2 233408325 . C A 231.05 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00913342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.768;QD=16.5037;RBI=0.0209102;REFB=-0.0257958;REVB=0.01881;RO=30;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737818;STB=0.541634;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0282051;OID=.;OPOS=233408325;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:15:11:15:15:15:11:15:15 chr2 233438786 . G A 393.11 PASS AF=0.5;AO=39;DP=79;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00181974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.999;QD=19.6554;RBI=0.0101493;REFB=-0.0202533;REVB=-0.00998484;RO=40;SAF=20;SAR=19;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102541;STB=0.562236;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0192745;OID=.;OPOS=233438786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:40:40:39:40:0.5:19:20:16:24:19:21:16:24 chr2 233470843 . G A 242.47 PASS AF=0.5;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0129556;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1367;QD=18.6514;RBI=0.0170984;REFB=-0.00789351;REVB=-0.0111584;RO=26;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740284;STB=0.54137;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.011276;OID=.;OPOS=233470843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:26:26:26:26:0.5:16:10:8:18:16:10:8:18 chr2 233498669 . G T 346.28 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00280035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.975;QD=16.8919;RBI=0.00511695;REFB=-0.0144924;REVB=0.00428266;RO=45;SAF=21;SAR=16;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101858;STB=0.505713;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0152948;OID=.;OPOS=233498669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:16:21:26:19:16:21:26:19 chr2 233514636 . G T 167.45 PASS AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=0.0133674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.526;QD=10.1486;RBI=0.0177523;REFB=-0.0114942;REVB=-0.0116816;RO=44;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2619;STB=0.65139;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0295132;OID=.;OPOS=233514636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:11:11:12:32:11:11:12:32 chr2 233514638 . G C 167.5 PASS AF=0.333333;AO=21;DP=65;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=33;FWDB=0.0157904;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.343;QD=10.1516;RBI=0.0169015;REFB=-0.00400678;REVB=-0.00602704;RO=43;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306638;STB=0.691535;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00980135;OID=.;OPOS=233514638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:43:44:21:22:0.333333:10:11:11:32:10:12:11:33 chr2 233527574 . TGGGGGC TGGGG,TGGGGC 151.22 PASS AF=0.896552,0;AO=8,8;DP=39;FAO=26,0;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=11,0;FSAR=15,0;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.220895,0.597992;FXX=0.0937207;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=12.5778,7.26415;QD=20.8577;RBI=0.221127,0.742738;REFB=-0.0692302,-0.016726;REVB=-0.0101296,-0.440529;RO=13;SAF=5,2;SAR=3,6;SRF=11;SRR=2;SSEN=0.375,0.375;SSEP=0,0;SSSB=-0.267229,-0.558614;STB=0.509529,0.5;STBP=0.806,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0536363,0.0411686;OID=.,.;OPOS=233527579,233527575;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGG,TGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.896552,0:8,8:39:26,0:29:3:11,0:15,0:1:2:7:13:5,2:3,6:11:2 chr2 233537125 . A G 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.472;QD=61.8524;RBI=0.0336871;REFB=0;REVB=0.0306345;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98403e-05;OID=.;OPOS=233537125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:38:45:0:0:38:45:0:0 chr2 233659553 . C A 333.12 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.00631474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2332;QD=16.4505;RBI=0.010282;REFB=0.0106267;REVB=-0.00811444;RO=45;SAF=18;SAR=18;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209836;STB=0.617222;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.0115576;OID=.;OPOS=233659553;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:18:18:32:13:18:18:32:13 chr2 233708806 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0084747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.686;QD=56.7066;RBI=0.0643137;REFB=0;REVB=0.0637529;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000457514;OID=.;OPOS=233708806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr2 233712226 . CACA C,CGCA 259.3 PASS AF=0.6,0.4;AO=8,11;DP=25;FAO=12,8;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=5,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558215,0.0286117;FXX=0.19992;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=191.731,58.1757;QD=51.8607;RBI=0.0573022,0.0431394;REFB=0,0;REVB=0.0129423,0.0322859;RO=0;SAF=3,4;SAR=5,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0289863,0.035699;OID=.,.;OPOS=233712227,233712227;OREF=ACA,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.6,0.4:8,11:25:12,8:20:0:7,0:5,8:0:0:68:0:3,4:5,7:0:0 chr2 233723182 . G A 791.18 PASS AF=1;AO=44;DP=46;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.613;QD=63.2944;RBI=0.0361115;REFB=0;REVB=0.033507;RO=0;SAF=38;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249666;OID=.;OPOS=233723182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:50:0:0:44:50:1:6:38:0:0:8:42:0:0 chr2 233740177 . G A 171.65 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.061338;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.473;QD=16.7466;RBI=0.0618654;REFB=-0.0114772;REVB=-0.00806111;RO=22;SAF=12;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251204;STB=0.655563;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0344882;OID=.;OPOS=233740177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:22:23:18:18:0.439024:6:12:9:13:6:12:9:14 chr2 233740227 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.606;QD=54.5177;RBI=0.020237;REFB=0;REVB=0.0161563;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.62827e-06;OID=.;OPOS=233740227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr2 233744021 . G A 708.32 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.113;QD=62.9614;RBI=0.033986;REFB=0;REVB=-0.0324465;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121111;OID=.;OPOS=233744021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0 chr2 233757679 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.456;QD=56.9379;RBI=0.0250394;REFB=0;REVB=0.0157766;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018339;OID=.;OPOS=233757679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr2 233757697 . A G 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.43;QD=56.9367;RBI=0.0250373;REFB=0;REVB=-0.00219116;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158812;OID=.;OPOS=233757697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0 chr2 233785015 . G A 228.6 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00526873;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.082;QD=21.2647;RBI=0.0686951;REFB=-0.0105368;REVB=-0.0684928;RO=21;SAF=16;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140998;STB=0.507929;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00882569;OID=.;OPOS=233785015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:6:16:15:6:6:16:15:6 chr2 233834975 . A G 2032.79 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241013;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.039;QD=62.5474;RBI=0.0242618;REFB=0;REVB=0.00278607;RO=0;SAF=82;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3448e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144048;OID=.;OPOS=233834975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:48:82:0:0:48:82:0:0 chr2 233897503 . G A 345.9 PASS AF=0.596491;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00574239;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.415;QD=24.2734;RBI=0.0278983;REFB=-0.0752769;REVB=-0.0273009;RO=22;SAF=9;SAR=25;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159192;STB=0.581345;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0410001;OID=.;OPOS=233897503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:22:23:34:34:0.596491:25:9:10:12:25:9:10:13 chr2 234055004 . T C 766.41 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9738;QD=63.8678;RBI=0.0564781;REFB=0;REVB=0.0481529;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126361;OID=.;OPOS=234055004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0 chr2 234066969 . C A,G 964.18 PASS AF=0.0298507,0.970149;AO=3,62;DP=67;FAO=2,65;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=0,29;FSAR=2,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000596595,0.031833;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=160.042,69.4517;QD=57.563;RBI=0.0441155,0.0468316;REFB=0,0;REVB=-0.0441115,0.0343491;RO=0;SAF=0,29;SAR=3,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.107431,0.0166099;OID=.,.;OPOS=234066969,234066969;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:67:67:0:0:3,62:2,65:0.0298507,0.970149:3,33:0,29:0:0:2,36:0,29:0:0 chr2 234113057 . G A 88.55 PASS AF=0.44;AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.025932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.793;QD=14.1687;RBI=0.0324023;REFB=-0.0237889;REVB=-0.0194278;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603878;STB=0.578801;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0203747;OID=.;OPOS=234113057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:23:25:13:14:10:11:0.44:6:4:6:7:7:4:7:7 chr2 234113301 . C T 108.85 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0129374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.938;QD=24.1884;RBI=0.0665302;REFB=-0.0380585;REVB=0.0652601;RO=6;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629385;STB=0.535653;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0229826;OID=.;OPOS=234113301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:9:3:2:4:9:3:2:4 chr2 234227523 . A G 1247.11 PASS AF=1;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226565;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.743;QD=60.8347;RBI=0.00354002;REFB=0;REVB=0.00272003;RO=1;SAF=39;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119868;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00012e-05;OID=.;OPOS=234227523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:83:82:1:0:81:82:1:42:39:1:0:42:40:0:0 chr2 234394425 . C T 101.58 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00755316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.796;QD=16.9306;RBI=0.0168086;REFB=-0.00386066;REVB=0.015016;RO=12;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3641;STB=0.713877;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00634629;OID=.;OPOS=234394425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:10:2:6:6:10:2:6:6 chr2 234449316 . G A 990.53 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.383;QD=59.1363;RBI=0.055269;REFB=0;REVB=-0.0530823;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124117;OID=.;OPOS=234449316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0 chr2 234469664 . T C 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.856;QD=61.3753;RBI=0.00721358;REFB=0;REVB=-0.000999554;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09984e-05;OID=.;OPOS=234469664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:35:45:0:0:35:45:0:0 chr2 234526871 . C G 843.73 PASS AF=0.533784;AO=79;DP=148;FAO=79;FDP=148;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0143932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.478;QD=22.8034;RBI=0.0144019;REFB=-0.00280407;REVB=-0.000501117;RO=69;SAF=32;SAR=47;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260888;STB=0.514292;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00298897;OID=.;OPOS=234526871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:69:69:79:79:0.533784:47:32:30:39:47:32:30:39 chr2 234622429 . T C 820.93 PASS AF=0.441026;AO=85;DP=194;FAO=86;FDP=195;FR=.;FRO=109;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=57;FSRR=52;FWDB=-0.0165755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.703;QD=16.8396;RBI=0.0165864;REFB=-0.0136146;REVB=0.000599922;RO=108;SAF=34;SAR=51;SRF=57;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129878;STB=0.57231;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0178991;OID=.;OPOS=234622429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:108:109:85:86:0.441026:51:34:57:51:52:34:57:52 chr2 234627937 . T C 2897.82 PASS AF=0.994595;AO=184;DP=185;FAO=184;FDP=185;FR=.;FRO=1;FSAF=107;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196535;FXX=0.0159566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3721;QD=62.6555;RBI=0.0815573;REFB=0.000366903;REVB=0.0791538;RO=1;SAF=107;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00442928;STB=0.502325;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00050193;OID=.;OPOS=234627937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:185:185:1:1:184:184:0.994595:77:107:1:0:77:107:1:0 chr2 234637803 . T C 248.45 PASS AF=0.337079;AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=89;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0110853;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9826;QD=11.1663;RBI=0.0197354;REFB=-0.0213603;REVB=-0.0163279;RO=58;SAF=21;SAR=9;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275326;STB=0.66578;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0570426;OID=.;OPOS=234637803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:58:59:30:30:0.337079:9:21:27:31:9:21:27:32 chr2 234637853 . G A 425.42 PASS AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0136535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.986;QD=18.9077;RBI=0.0217014;REFB=-0.0296108;REVB=0.016868;RO=47;SAF=19;SAR=24;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564362;STB=0.531384;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0325086;OID=.;OPOS=234637853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:43:43:0.477778:24:19:18:29:24:19:18:29 chr2 234637912 . T C 339.29 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00534012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.025;QD=20.5629;RBI=0.0110261;REFB=-0.00896575;REVB=-0.00964666;RO=31;SAF=12;SAR=23;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050356;STB=0.527844;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0103292;OID=.;OPOS=234637912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:23:12:9:22:23:12:9:22 chr2 234638249 . A G 1028.61 PASS AF=0.521053;AO=99;DP=189;FAO=99;FDP=190;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=0.00528071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.18;QD=21.655;RBI=0.0124684;REFB=-0.00387222;REVB=-0.0112949;RO=90;SAF=46;SAR=53;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501272;STB=0.524859;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00349902;OID=.;OPOS=234638249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:90:91:99:99:0.521053:53:46:47:43:53:46:47:44 chr2 234688036 . C A 1030.09 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0226922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.59;QD=58.0335;RBI=0.0325808;REFB=-0.128407;REVB=-0.0233788;RO=1;SAF=40;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116744;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00152943;OID=.;OPOS=234688036;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:30:40:1:0:30:40:1:0 chr2 234702459 . T C 620.74 PASS AF=0.529915;AO=62;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0077117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.244;QD=21.222;RBI=0.00771797;REFB=-0.0204114;REVB=-0.000311044;RO=55;SAF=25;SAR=37;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013253;STB=0.507281;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0162348;OID=.;OPOS=234702459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:55:62:62:0.529915:37:25:23:32:37:25:23:32 chr2 234703136 . T C 193.79 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0775377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.521;QD=16.8515;RBI=0.0776868;REFB=-0.0410311;REVB=-0.00480994;RO=26;SAF=5;SAR=15;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309681;STB=0.678382;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0461169;OID=.;OPOS=234703136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:15:5:14:12:15:5:14:12 chr2 234704318 . A G 313.07 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00871142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5592;QD=19.5668;RBI=0.0431149;REFB=-0.00967602;REVB=-0.0422256;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290017;STB=0.516119;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00803182;OID=.;OPOS=234704318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:16:17:17:14:16:17:17:14 chr2 234704690 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.454;QD=56.1909;RBI=0.0595194;REFB=0;REVB=0.0558583;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404876;OID=.;OPOS=234704690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chr2 234708868 . G C 1526.18 PASS AF=1;AO=101;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01991;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.857;QD=59.8503;RBI=0.031375;REFB=0;REVB=0.0242483;RO=0;SAF=42;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117873;OID=.;OPOS=234708868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:101:102:1:59:42:0:0:60:42:0:0 chr2 234710831 . G C 263.51 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.00625908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.039;QD=17.5671;RBI=0.0170943;REFB=-0.0280891;REVB=-0.0159072;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295608;STB=0.664697;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0228328;OID=.;OPOS=234710831;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:12:17:8:23:12:17:8:23 chr2 234713706 . T C 464.63 PASS AF=0.37415;AO=55;DP=148;FAO=55;FDP=147;FR=.;FRO=92;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=-0.0188675;FXX=0.0328926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.81;QD=12.643;RBI=0.0206283;REFB=-0.00761213;REVB=0.0083393;RO=89;SAF=28;SAR=27;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772402;STB=0.539645;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0118323;OID=.;OPOS=234713706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:89:92:55:55:0.37415:27:28:39:50:27:28:41:51 chr2 234716426 . G A 354.9 PASS AF=0.396226;AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00806345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.203;QD=13.3924;RBI=0.00843035;REFB=-0.00433737;REVB=0.00245999;RO=64;SAF=15;SAR=27;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156824;STB=0.589093;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00710512;OID=.;OPOS=234716426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:0.396226:27:15:32:32:27:15:32:32 chr2 234725502 . T C 515.87 PASS AF=0.521277;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00140789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0842;QD=21.9519;RBI=0.001852;REFB=-0.00871291;REVB=-0.00120322;RO=45;SAF=31;SAR=18;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900863;STB=0.549775;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00848311;OID=.;OPOS=234725502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:45:45:49:49:0.521277:18:31:24:21:18:31:24:21 chr2 234727333 . C G 448.07 PASS AF=0.48913;AO=44;DP=91;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.00592422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.752;QD=19.4814;RBI=0.0104091;REFB=-0.00644867;REVB=-0.00855875;RO=47;SAF=33;SAR=11;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572127;STB=0.519991;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.00882645;OID=.;OPOS=234727333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:47:47:44:45:0.48913:11:33:33:14:12:33:33:14 chr2 234727410 . C A 566.91 PASS AF=0.537736;AO=57;DP=107;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0219176;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.723;QD=21.3926;RBI=0.0236766;REFB=-0.00588874;REVB=-0.00895568;RO=48;SAF=30;SAR=27;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565832;STB=0.526307;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0041717;OID=.;OPOS=234727410;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:48:49:57:57:0.537736:27:30:22:26:27:30:23:26 chr2 234728078 . T C 352.35 PASS AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0296752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9128;QD=18.3039;RBI=0.0354602;REFB=0.00718541;REVB=-0.0194114;RO=40;SAF=24;SAR=13;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00138022;STB=0.50077;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.00985156;OID=.;OPOS=234728078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:13:24:26:14:13:24:26:14 chr2 234732311 . G A 333.06 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0267231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.073;QD=16.4475;RBI=0.0316813;REFB=-0.0246709;REVB=0.0170171;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603356;STB=0.533908;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.019571;OID=.;OPOS=234732311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:17:19:21:24:17:19:21:24 chr2 234732317 . A G 1088.85 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00741523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.892;QD=58.0721;RBI=0.0292021;REFB=-0.0386963;REVB=0.0282449;RO=1;SAF=34;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137108;STB=0.507244;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000305208;OID=.;OPOS=234732317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:40:34:1:0:40:34:1:0 chr2 234737275 . G C 859.93 PASS AF=0.572464;AO=79;DP=138;FAO=79;FDP=138;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0383676;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.587;QD=24.9254;RBI=0.0386307;REFB=-0.0199599;REVB=-0.00450085;RO=59;SAF=44;SAR=35;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249898;STB=0.513615;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0128049;OID=.;OPOS=234737275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:59:59:79:79:0.572464:35:44:31:28:35:44:31:28 chr2 234737372 . C A 1192.97 PASS AF=0.963855;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0239894;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.834;QD=57.4926;RBI=0.0345462;REFB=-0.066374;REVB=0.0248586;RO=1;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133348;STB=0.520543;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00112591;OID=.;OPOS=234737372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:84:83:1:3:80:80:0.963855:35:45:0:1:35:45:0:3 chr2 234740136 . G A 197.13 PASS AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=12;FWDB=-0.045685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.39;QD=10.9518;RBI=0.0473577;REFB=-0.0155292;REVB=-0.0124753;RO=47;SAF=18;SAR=7;SRF=35;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350625;STB=0.520321;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0285662;OID=.;OPOS=234740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:7:18:35:12:7:18:35:12 chr2 234740157 . G A 186.09 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.000435816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.388;QD=10.4838;RBI=0.0157544;REFB=-0.00884246;REVB=0.0157484;RO=47;SAF=17;SAR=7;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209133;STB=0.512185;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0135415;OID=.;OPOS=234740157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:7:17:34:13:7:17:34:13 chr2 234749354 . G A 137.87 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0682838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5;QD=19.0171;RBI=0.0693937;REFB=0.0134738;REVB=0.0123613;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863963;STB=0.549229;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.00927498;OID=.;OPOS=234749354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:6:9:7:7:6:9:7:7 chr2 234749780 . G C 120.04 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.021218;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.405;QD=12.9768;RBI=0.0220207;REFB=-0.00400277;REVB=-0.00589148;RO=22;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377212;STB=0.736042;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00918649;OID=.;OPOS=234749780;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:23:14:14:0.378378:3:11:10:12:3:11:10:13 chr2 234750542 . G C 1496.52 PASS AF=1;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000903422;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.119;QD=59.8606;RBI=0.043932;REFB=0;REVB=0.0439227;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.86236e-05;OID=.;OPOS=234750542;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:100:0:0:100:100:1:54:46:0:0:54:46:0:0 chr2 234750831 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00135038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.098;QD=62.671;RBI=0.00868457;REFB=0;REVB=-0.00857894;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24687e-05;OID=.;OPOS=234750831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0 chr2 234761225 . C T 919.99 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00598991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.893;QD=58.4118;RBI=0.0175483;REFB=0;REVB=-0.0164943;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35149e-05;OID=.;OPOS=234761225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:38:25:0:0:38:25:0:0 chr2 234762480 . A T 1549.47 PASS AF=1;AO=102;DP=107;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150542;FXX=0.0373797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.474;QD=60.1737;RBI=0.0161234;REFB=0;REVB=0.00577347;RO=0;SAF=66;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40639e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260097;OID=.;OPOS=234762480;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:103:0:0:102:103:1:36:66:0:0:37:66:0:0 chr2 234959637 . T A 700.11 PASS AF=0.539683;AO=68;DP=126;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0217265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.573;QD=22.2256;RBI=0.0269127;REFB=-0.0133545;REVB=0.0158825;RO=58;SAF=31;SAR=37;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516682;STB=0.528316;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0154614;OID=.;OPOS=234959637;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:58:58:68:68:0.539683:37:31:30:28:37:31:30:28 chr2 234967539 . T A 457.23 PASS AF=0.55;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00086256;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.272;QD=22.8615;RBI=0.0195242;REFB=-0.0141256;REVB=-0.0195052;RO=36;SAF=18;SAR=26;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409311;STB=0.522502;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0122192;OID=.;OPOS=234967539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:36:36:44:44:0.55:26:18:13:23:26:18:13:23 chr2 235402279 . T C 228.05 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00329775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.173;QD=13.8213;RBI=0.0122124;REFB=-0.0180642;REVB=0.0117587;RO=38;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175627;STB=0.607064;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0308264;OID=.;OPOS=235402279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:39:27:27:0.409091:11:16:16:22:11:16:16:23 chr2 235950187 . T C 2008.45 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.647;QD=62.2775;RBI=0.0182945;REFB=0;REVB=0.0179615;RO=0;SAF=62;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56636e-05;OID=.;OPOS=235950187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:67:62:0:0:67:62:0:0 chr2 235951818 . TA T,TG 1722.2 PASS AF=0.118644,0.881356;AO=14,102;DP=118;FAO=14,104;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=7,58;FSAR=7,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134595,-0.00301918;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=89.6223,111.06;QD=58.3798;RBI=0.0227519,0.0141679;REFB=0,0;REVB=0.0183436,0.0138425;RO=1;SAF=7,56;SAR=7,46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.060556,-0.00839763;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00536283,-0.000220874;OID=.,.;OPOS=235951819,235951819;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.118644,0.881356:14,102:118:14,104:118:0:7,58:7,46:0:0:43:1:7,56:7,46:1:0 chr2 236761396 . C T 725.7 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.034153;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.511;QD=54.7698;RBI=0.0403486;REFB=-0.117403;REVB=-0.0214844;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.50746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000600647;OID=.;OPOS=236761396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:53:0:1:52:52:0.981132:19:33:0:0:19:33:1:0 chr2 236957822 . G A 1264.69 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9427;QD=61.6924;RBI=0.0320414;REFB=0;REVB=0.0177377;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169599;OID=.;OPOS=236957822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:34:48:0:0:34:48:0:0 chr2 237032607 . T G 388.04 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0146141;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.663;QD=18.2609;RBI=0.0528717;REFB=-0.0229967;REVB=-0.0508119;RO=43;SAF=17;SAR=23;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208046;STB=0.603447;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0388651;OID=.;OPOS=237032607;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:43:45:40:40:0.470588:23:17:28:15:23:17:28:17 chr2 237032703 . T C 562.59 PASS AF=0.614458;AO=48;DP=81;FAO=51;FDP=83;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0111535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.115;QD=27.1126;RBI=0.0118051;REFB=-0.0146582;REVB=-0.00386772;RO=31;SAF=16;SAR=32;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163178;STB=0.593183;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.013873;OID=.;OPOS=237032703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:31:32:48:51:0.614458:32:16:17:14:34:17:18:14 chr2 237061782 . A G 246.84 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0314843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4424;QD=17.9522;RBI=0.0775574;REFB=-0.0262336;REVB=0.0708794;RO=28;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146113;STB=0.508191;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0252842;OID=.;OPOS=237061782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:12:15:16:12:12:15:16:12 chr2 237119051 . T C 313.05 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.000875661;FXX=0.0555478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9989;QD=18.4148;RBI=0.000947059;REFB=-0.00963243;REVB=-0.000360747;RO=35;SAF=22;SAR=11;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27426;STB=0.653371;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00902906;OID=.;OPOS=237119051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:35:35:33:33:0.485294:11:22:13:22:11:22:13:22 chr2 237119074 . A G 375.48 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.00379856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8312;QD=18.316;RBI=0.0077182;REFB=-0.0156816;REVB=-0.00671874;RO=42;SAF=26;SAR=13;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288918;STB=0.666581;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.021044;OID=.;OPOS=237119074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:43:39:39:0.47561:13:26:15:27:13:26:15:28 chr2 237119104 . G A 437.41 PASS AF=0.45283;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=0.0146861;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.372;QD=16.5062;RBI=0.0181814;REFB=-0.00799858;REVB=-0.0107183;RO=58;SAF=29;SAR=19;SRF=19;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266457;STB=0.648359;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00657555;OID=.;OPOS=237119104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:58:58:48:48:0.45283:19:29:19:39:19:29:19:39 chr2 237119178 . T C 407.66 PASS AF=0.443299;AO=42;DP=95;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.0141858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.077;QD=16.8109;RBI=0.0141875;REFB=-0.029493;REVB=-0.000215908;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1865;STB=0.600904;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0367227;OID=.;OPOS=237119178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:53:54:42:43:0.443299:19:23:19:34:20:23:19:35 chr2 237150166 . A C 150.98 PASS AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.124715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.567;QD=11.1836;RBI=0.124868;REFB=-0.0238266;REVB=-0.00618392;RO=35;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107906;STB=0.563041;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0375835;OID=.;OPOS=237150166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:35:35:19:19:0.351852:9:10:15:20:9:10:15:20 chr2 237232855 . A T 151.51 PASS AF=0.304348;AO=19;DP=68;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.0265747;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.942;QD=8.78343;RBI=0.0272237;REFB=-0.00860849;REVB=0.00590905;RO=49;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10359;STB=0.531221;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0191396;OID=.;OPOS=237232855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:49:48:19:21:0.304348:13:6:12:37:15:6:12:36 chr2 237489297 . C T 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-8.41807e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.054;QD=23.8999;RBI=0.00194582;REFB=-0.00605266;REVB=0.001944;RO=23;SAF=8;SAR=19;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813857;STB=0.545088;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00566349;OID=.;OPOS=237489297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:19:8:5:18:19:8:5:18 chr2 237489904 . C T 206.63 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0306996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.233;QD=13.1196;RBI=0.0337588;REFB=-0.0126397;REVB=0.0140426;RO=38;SAF=13;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903866;STB=0.551683;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0145918;OID=.;OPOS=237489904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:12:13:23:15:12:13:23:15 chr2 237923852 . G A 263.57 PASS AF=0.392405;AO=28;DP=76;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00954901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.696;QD=13.3453;RBI=0.0134792;REFB=-0.0123449;REVB=0.00951337;RO=48;SAF=12;SAR=16;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146361;STB=0.60681;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0162363;OID=.;OPOS=237923852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:48:48:28:31:0.392405:16:12:27:21:19:12:27:21 chr2 238165752 . T G 652.99 PASS AF=0.577982;AO=63;DP=109;FAO=63;FDP=109;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0183433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3922;QD=23.9631;RBI=0.0378482;REFB=-0.0210839;REVB=0.033106;RO=45;SAF=22;SAR=41;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112808;STB=0.567147;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0150696;OID=.;OPOS=238165752;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:45:46:63:63:0.577982:41:22:22:23:41:22:23:23 chr2 238233483 . G A 535.25 PASS AF=0.926829;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0521159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.215;QD=52.2194;RBI=0.0600423;REFB=-0.175898;REVB=0.0298161;RO=2;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00659507;STB=0.518315;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00243579;OID=.;OPOS=238233483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:40:41:2:3:37:38:0.926829:21:16:1:1:22:16:2:1 chr2 238243285 . G A 440.7 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0114073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.469;QD=19.5869;RBI=0.0208718;REFB=-0.00904568;REVB=0.0174787;RO=46;SAF=23;SAR=21;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120317;STB=0.566671;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00428252;OID=.;OPOS=238243285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:21:23:30:16:21:23:30:16 chr2 238243292 . G A 480.71 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.000112095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.642;QD=20.2403;RBI=0.00551282;REFB=-0.0170073;REVB=-0.00551168;RO=47;SAF=30;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119917;STB=0.562034;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0182283;OID=.;OPOS=238243292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:47:48:47:47:0.494737:17:30:24:23:17:30:25:23 chr2 238243464 . C G 727.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396855;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2304;QD=57.0916;RBI=0.0629093;REFB=0;REVB=-0.0488123;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124371;OID=.;OPOS=238243464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr2 238244963 . A G 1899.62 PASS AF=1;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918113;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.767;QD=61.7764;RBI=0.009922;REFB=0;REVB=0.00376203;RO=0;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87876e-06;OID=.;OPOS=238244963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:123:0:0:123:123:1:63:60:0:0:63:60:0:0 chr2 238249606 . C T 325.98 PASS AF=0.636364;AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0175052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.57;QD=29.6345;RBI=0.0216779;REFB=-0.0263393;REVB=-0.0127866;RO=15;SAF=13;SAR=15;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00152024;STB=0.51302;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0233707;OID=.;OPOS=238249606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:16:28:28:0.636364:15:13:7:8:15:13:8:8 chr2 238249630 . C T 130.12 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0128015;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.853;QD=12.695;RBI=0.0322369;REFB=-0.0100935;REVB=-0.0295861;RO=26;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678697;STB=0.539946;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0369781;OID=.;OPOS=238249630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:26:26:15:15:0.365854:6:9:14:12:6:9:14:12 chr2 238253149 . G A 306.07 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00231996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.031;QD=20.4049;RBI=0.00621584;REFB=0.000446584;REVB=0.00576666;RO=28;SAF=12;SAR=20;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138352;STB=0.576874;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.000345975;OID=.;OPOS=238253149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:20:12:15:13:20:12:15:13 chr2 238257013 . G A 300.34 PASS AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0246759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8243;QD=14.1335;RBI=0.0272649;REFB=-0.00318185;REVB=0.0115964;RO=50;SAF=12;SAR=22;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117651;STB=0.573869;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00540478;OID=.;OPOS=238257013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:51:34:34:0.4:22:12:23:27:22:12:24:27 chr2 238258814 . C G 379.11 PASS AF=0.411215;AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.00595491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.867;QD=14.1723;RBI=0.00650367;REFB=-0.0221095;REVB=0.00261472;RO=62;SAF=22;SAR=22;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837211;STB=0.551379;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0262105;OID=.;OPOS=238258814;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:62:63:44:44:0.411215:22:22:26:36:22:22:26:37 chr2 238267717 . C T 644.63 PASS AF=0.59375;AO=57;DP=96;FAO=57;FDP=96;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0103254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.847;QD=26.8594;RBI=0.0107802;REFB=-0.013314;REVB=-0.00309811;RO=39;SAF=25;SAR=32;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150102;STB=0.58179;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0110318;OID=.;OPOS=238267717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:39:39:57:57:0.59375:32:25:25:14:32:25:25:14 chr2 238273080 . A C 391.6 PASS AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0656589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1062;QD=22.062;RBI=0.0667394;REFB=-0.00909862;REVB=0.0119604;RO=32;SAF=23;SAR=16;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19962;STB=0.60998;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0051209;OID=.;OPOS=238273080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:16:23:11:21:16:23:11:21 chr2 238427142 . T C 279.29 PASS AF=0.4;AO=29;DP=77;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00177337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.761;QD=13.9647;RBI=0.0918552;REFB=-0.00173619;REVB=0.0918381;RO=47;SAF=16;SAR=13;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901939;STB=0.512492;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00255669;OID=.;OPOS=238427142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:80:47:48:29:32:0.4:13:16:22:25:16:16:23:25 chr2 238427194 . T C 399.31 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0418855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.886;QD=15.3581;RBI=0.0461891;REFB=-0.0246276;REVB=0.0194689;RO=57;SAF=14;SAR=31;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156768;STB=0.590297;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0176101;OID=.;OPOS=238427194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:59:45:45:0.432692:31:14:26:31:31:14:27:32 chr2 238427251 . G A 246.71 PASS AF=0.344828;AO=30;DP=87;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0379676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.341;QD=11.3429;RBI=0.0380371;REFB=-0.00778602;REVB=0.00229802;RO=57;SAF=6;SAR=24;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339337;STB=0.699306;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0171304;OID=.;OPOS=238427251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:57:57:30:30:0.344828:24:6:26:31:24:6:26:31 chr2 238432187 . C A 154.34 PASS AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0549476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8286;QD=10.6438;RBI=0.0568269;REFB=0.00637548;REVB=0.0144934;RO=37;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241879;STB=0.645032;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.0162949;OID=.;OPOS=238432187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:38:20:20:0.344828:11:9:9:28:11:9:9:29 chr2 238432212 . T C 139.53 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.00298895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.666;QD=12.4026;RBI=0.0195095;REFB=-0.01143;REVB=0.0192792;RO=29;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095106;STB=0.55549;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0245263;OID=.;OPOS=238432212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:11:5:7:22:11:5:7:22 chr2 238434434 . C T 238.56 PASS AF=0.547619;AO=22;DP=40;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0994252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4176;QD=22.7195;RBI=0.101563;REFB=-0.0623065;REVB=0.0207288;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114165;STB=0.562313;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0210316;OID=.;OPOS=238434434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:18:19:22:23:0.547619:14:8:9:9:14:9:10:9 chr2 238443226 . A G 265.4 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0141317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.695;QD=17.9931;RBI=0.0141824;REFB=6.00056e-05;REVB=0.00119751;RO=30;SAF=17;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489716;STB=0.527427;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-4.48873e-05;OID=.;OPOS=238443226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:12:17:16:14:12:17:16:14 chr2 238449007 . T C 258.64 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.021936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.786;QD=16.4212;RBI=0.0242148;REFB=-0.039913;REVB=0.0102552;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105776;STB=0.559522;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0378307;OID=.;OPOS=238449007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:16:13:19:15:16:13:19:15 chr2 238449023 . T C 315.65 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0264938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.497;QD=17.5361;RBI=0.0265282;REFB=-0.0341686;REVB=-0.00135049;RO=38;SAF=19;SAR=15;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030932;STB=0.517317;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0224747;OID=.;OPOS=238449023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:15:19:20:18:15:19:20:18 chr2 238449107 . A G 234.46 PASS AF=0.337209;AO=29;DP=86;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0466984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6627;QD=10.9053;RBI=0.0502738;REFB=-0.0158369;REVB=-0.0186203;RO=56;SAF=13;SAR=16;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119135;STB=0.57457;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0372669;OID=.;OPOS=238449107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:56:57:29:29:0.337209:16:13:31:25:16:13:32:25 chr2 238461773 . G A 339.16 PASS AF=0.473684;AO=37;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0234754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2227;QD=17.8506;RBI=0.0409879;REFB=-0.0366633;REVB=-0.0335993;RO=39;SAF=18;SAR=19;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942223;STB=0.538271;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0451628;OID=.;OPOS=238461773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:40:37:36:0.473684:19:18:15:24:19:17:16:24 chr2 238462324 . A G 246.63 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.000213038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.599;QD=15.9116;RBI=0.0133873;REFB=-0.0182485;REVB=0.0133856;RO=34;SAF=11;SAR=17;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103459;STB=0.558128;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0251205;OID=.;OPOS=238462324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:17:11:10:24:17:11:10:24 chr2 238483164 . T C 129.27 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00548284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.35;QD=21.5454;RBI=0.00756073;REFB=-0.0163885;REVB=-0.00520606;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736238;STB=0.541607;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.023887;OID=.;OPOS=238483164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:7:7:4:6:7:7:4:6 chr2 238483671 . G A 132.15 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0128327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.786;QD=24.027;RBI=0.0392451;REFB=-0.00222475;REVB=0.0370877;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205435;STB=0.615223;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00191969;OID=.;OPOS=238483671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:6:8:2:6:6:8:2:6 chr2 238483729 . A G 137.05 PASS AF=0.535714;AO=14;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0115121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.576;QD=19.5787;RBI=0.0178766;REFB=-0.041213;REVB=0.0136765;RO=13;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249743;STB=0.564015;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0204503;OID=.;OPOS=238483729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:14:15:0.535714:5:9:8:5:5:10:7:6 chr2 238485251 . G A 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0196829;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.763;QD=16.923;RBI=0.0377585;REFB=-0.0112079;REVB=0.0322224;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593248;STB=0.533311;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0104427;OID=.;OPOS=238485251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:14:16:16:18:14:16:16:18 chr2 238503559 . C G 318.4 PASS AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00905077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.107;QD=18.1944;RBI=0.00919759;REFB=-0.0297397;REVB=-0.0016368;RO=35;SAF=26;SAR=8;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211616;STB=0.613891;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0273307;OID=.;OPOS=238503559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:36:34:34:0.485714:8:26:20:15:8:26:21:15 chr2 238990388 . G A 451.81 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0203611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.204;QD=19.4326;RBI=0.0412789;REFB=-0.0209129;REVB=0.0359078;RO=48;SAF=21;SAR=24;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695806;STB=0.538665;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0218633;OID=.;OPOS=238990388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:24:21:26:22:24:21:26:22 chr2 238991796 . C T 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.982;QD=62.3146;RBI=0.0145725;REFB=0;REVB=0.00993048;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50596e-06;OID=.;OPOS=238991796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:42:44:0:0:42:44:0:0 chr2 239006879 . C T 291.98 PASS AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00918026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.416;QD=21.6281;RBI=0.0297285;REFB=-0.00753532;REVB=0.0282755;RO=24;SAF=6;SAR=24;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189615;STB=0.605983;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00401286;OID=.;OPOS=239006879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:24:6:9:15:24:6:9:15 chr2 239007991 . T A 412.83 PASS AF=0.442308;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.00204082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.599;QD=15.8779;RBI=0.00978979;REFB=-0.0058162;REVB=-0.00957471;RO=58;SAF=27;SAR=19;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705242;STB=0.539523;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00460007;OID=.;OPOS=239007991;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:58:46:46:0.442308:19:27:30:28:19:27:30:28 chr2 239010719 . T C 885.34 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.544;QD=58.0548;RBI=0.0168001;REFB=0;REVB=-0.000621163;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.59642e-05;OID=.;OPOS=239010719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:31:28:0:0:32:29:0:0 chr2 239016539 . C G 1491.7 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9209;QD=63.4764;RBI=0.0170613;REFB=0;REVB=0.0062482;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.15461e-05;OID=.;OPOS=239016539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:45:49:0:0:45:49:0:0 chr2 239038912 . T C 483.61 PASS AF=0.445378;AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=119;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0636411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6295;QD=16.2558;RBI=0.0753561;REFB=0.0237064;REVB=-0.0403528;RO=64;SAF=33;SAR=20;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772639;STB=0.553052;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.0341137;OID=.;OPOS=239038912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:64:66:53:53:0.445378:20:33:35:29:20:33:35:31 chr2 239039057 . A G 850.93 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5125;QD=57.6899;RBI=0.034028;REFB=0;REVB=-0.0139473;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266332;OID=.;OPOS=239039057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr2 239039075 . G T 1271.51 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.706;QD=60.5479;RBI=0.0505338;REFB=-0.14372;REVB=0.0295306;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000994174;OID=.;OPOS=239039075;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:84:84:0:0:83:84:1:50:33:0:0:50:34:0:0 chr2 239039840 . CA C,CG 155.93 PASS AF=0.214286,0.785714;AO=5,9;DP=14;FAO=3,11;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3,7;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361062,0.0588974;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.386,119.933;QD=44.5501;RBI=0.0373549,0.0613737;REFB=0,0;REVB=0.00957778,0.0172575;RO=0;SAF=5,5;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0558845,0.00168734;OID=.,.;OPOS=239039841,239039841;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.214286,0.785714:5,9:14:3,11:14:0:3,7:0,4:0:0:13:0:5,5:0,4:0:0 chr2 239039896 . G C 1140.37 PASS AF=0.963415;AO=76;DP=79;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-4.75095e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.231;QD=55.6279;RBI=0.0286152;REFB=0.115245;REVB=-0.0286152;RO=3;SAF=35;SAR=41;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148731;STB=0.506797;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.0244189;OID=.;OPOS=239039896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:79:82:3:3:76:79:0.963415:41:35:2:1:41:38:2:1 chr2 239039970 . C T 617.59 PASS AF=0.484615;AO=63;DP=131;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=-0.000265231;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.099;QD=19.0029;RBI=0.0192408;REFB=-0.0202849;REVB=-0.019239;RO=67;SAF=34;SAR=29;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099303;STB=0.554916;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0208173;OID=.;OPOS=239039970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:67:67:63:63:0.484615:29:34:29:38:29:34:29:38 chr2 239040187 . T C 207.13 PASS AF=1;AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.561;QD=48.737;RBI=0.0387596;REFB=0;REVB=0.0363081;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344563;OID=.;OPOS=239040187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:14:17:1:7:7:0:0:7:10:0:0 chr2 239049540 . G A 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.569;QD=61.3351;RBI=0.0413749;REFB=0;REVB=0.0241136;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417481;OID=.;OPOS=239049540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0 chr2 239049928 . G A 209.54 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0175756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.572;QD=18.6257;RBI=0.0176275;REFB=-0.040417;REVB=0.00135098;RO=22;SAF=7;SAR=14;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155251;STB=0.5254;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0547113;OID=.;OPOS=239049928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:45:22:24:21:21:0.466667:14:7:7:15:14:7:7:17 chr2 239050033 . C T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.714;QD=39.2064;RBI=0.033964;REFB=0;REVB=0.0274012;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115573;OID=.;OPOS=239050033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr2 239051550 . T C 1904.07 PASS AF=1;AO=123;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.18;QD=60.9302;RBI=0.0422215;REFB=-0.045171;REVB=0.0278022;RO=1;SAF=43;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109197;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209181;OID=.;OPOS=239051550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:124:125:1:0:123:125:1:80:43:1:0:80:45:0:0 chr2 239054358 . C T 436.4 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0180946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.441;QD=21.2879;RBI=0.0205611;REFB=-0.0190393;REVB=0.00976447;RO=37;SAF=18;SAR=25;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804999;STB=0.557434;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0141178;OID=.;OPOS=239054358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:39:43:43:0.52439:25:18:19:18:25:18:21:18 chr2 239059484 . T C 1182.69 PASS AF=1;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920752;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.475;QD=61.4382;RBI=0.0146539;REFB=0;REVB=0.0113999;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000377655;OID=.;OPOS=239059484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:77:0:0:77:77:1:50:27:0:0:50:27:0:0 chr2 239075812 . C T 197.45 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00851058;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.673;QD=17.9501;RBI=0.0114966;REFB=-0.0263227;REVB=0.00772924;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160183;STB=0.590821;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0320734;OID=.;OPOS=239075812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:24:24:20:20:0.454545:10:10:16:8:10:10:16:8 chr2 239075935 . A G 236.18 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0421594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2208;QD=17.495;RBI=0.0977224;REFB=-0.0139166;REVB=-0.0881604;RO=28;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141501;STB=0.579648;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0116138;OID=.;OPOS=239075935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:16:10:15:13:16:10:15:13 chr2 239133980 . C T 278.87 PASS AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0208768;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.947;QD=13.6034;RBI=0.0208812;REFB=-0.0142068;REVB=0.000429499;RO=49;SAF=18;SAR=14;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558904;STB=0.538319;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0241852;OID=.;OPOS=239133980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:50:32:32:0.390244:14:18:25:24:14:18:25:25 chr2 239134056 . A G 289.47 PASS AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00875019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.869;QD=13.9503;RBI=0.01805;REFB=-0.0114485;REVB=0.0157873;RO=50;SAF=18;SAR=15;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482352;STB=0.527456;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0184163;OID=.;OPOS=239134056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:50:50:33:33:0.39759:15:18:25:25:15:18:25:25 chr2 239134063 . G T 205.64 PASS AF=0.333333;AO=25;DP=81;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0479063;FXX=0.0487745;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.954;QD=10.5456;RBI=0.0664275;REFB=-0.0469599;REVB=-0.0460173;RO=43;SAF=18;SAR=7;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315259;STB=0.658412;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0612095;OID=.;OPOS=239134063;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:78:43:52:25:26:0.333333:7:18:19:24:8:18:24:28 chr2 239134138 . A C 130.96 PASS AF=0.313725;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00799111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.39;QD=10.2711;RBI=0.00955986;REFB=-0.00823537;REVB=-0.0052472;RO=35;SAF=10;SAR=6;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303183;STB=0.518112;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0183038;OID=.;OPOS=239134138;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:35:35:16:16:0.313725:6:10:21:14:6:10:21:14 chr2 239139883 . G C 186.17 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00979726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9981;QD=12.6216;RBI=0.0185216;REFB=0.00420693;REVB=0.0157183;RO=36;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304485;STB=0.674742;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00861039;OID=.;OPOS=239139883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:8:15:13:23:8:15:13:23 chr2 239140728 . A G 978.6 PASS AF=0.49505;AO=101;DP=201;FAO=100;FDP=202;FR=.;FRO=102;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=-0.033951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9608;QD=19.3783;RBI=0.0474182;REFB=-0.0054876;REVB=-0.0331031;RO=100;SAF=38;SAR=63;SRF=44;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604433;STB=0.542869;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00494694;OID=.;OPOS=239140728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:100:102:101:100:0.49505:63:38:44:56:63:37:46:56 chr2 239165663 . T C 273.65 PASS AF=0.410256;AO=33;DP=77;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.147616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.988;QD=14.0335;RBI=0.147628;REFB=-0.0183457;REVB=0.00184405;RO=44;SAF=17;SAR=16;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841367;STB=0.525625;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0224746;OID=.;OPOS=239165663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:44:46:33:32:0.410256:16:17:19:25:16:16:21:25 chr2 239306268 . A C 244.68 PASS AF=0.785714;AO=21;DP=28;FAO=22;FDP=28;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0415429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.367;QD=34.9547;RBI=0.0416454;REFB=-0.0750638;REVB=-0.00291938;RO=6;SAF=12;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294417;STB=0.519982;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0235585;OID=.;OPOS=239306268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:28:6:6:21:22:0.785714:9:12:3:3:9:13:3:3 chr2 239321367 . A T 432.89 PASS AF=0.505882;AO=41;DP=83;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0126008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.929;QD=20.3712;RBI=0.0189672;REFB=0.00261572;REVB=0.0141765;RO=42;SAF=23;SAR=18;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162863;STB=0.586916;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.00315413;OID=.;OPOS=239321367;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:42:42:41:43:0.505882:18:23:16:26:19:24:16:26 chr2 239344412 . C T 223.84 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00634668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9603;QD=19.4646;RBI=0.0321159;REFB=-0.0120351;REVB=-0.0314825;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115193;STB=0.564797;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0119672;OID=.;OPOS=239344412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:9:13:17:7:9:13:17:7 chr2 239972883 . C T 160.52 PASS AF=0.485714;AO=13;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00115151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.321;QD=18.3452;RBI=0.0104602;REFB=0.00680806;REVB=0.0103966;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198112;STB=0.574236;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.0063812;OID=.;OPOS=239972883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:18:13:17:0.485714:5:8:7:10:7:10:8:10 chr2 240003870 . G A 374.27 PASS AF=0.375;AO=45;DP=119;FAO=45;FDP=120;FR=.;FRO=75;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00710086;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.846;QD=12.4757;RBI=0.0222762;REFB=-0.00287965;REVB=0.0211141;RO=74;SAF=26;SAR=19;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264268;STB=0.519795;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00560533;OID=.;OPOS=240003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:74:75:45:45:0.375:19:26:41:33:19:26:41:34 chr2 240323905 . T TG 215.48 PASS AF=0.568627;AO=28;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0174805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.5749;QD=16.9005;RBI=0.0725444;REFB=-0.027464;REVB=-0.0704069;RO=23;SAF=10;SAR=18;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103313;STB=0.570765;STBP=0.271;TYPE=ins;VARB=0.0180974;OID=.;OPOS=240323906;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.568627:28:51:29:51:22:10:19:11:11:99:23:10:18:11:12 chr2 240500413 . A G 677.64 PASS AF=0.603774;AO=64;DP=106;FAO=64;FDP=106;FR=.;FRO=42;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00456997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.259;QD=25.5713;RBI=0.0153099;REFB=-0.0242342;REVB=-0.0146119;RO=42;SAF=40;SAR=24;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590942;STB=0.532168;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0165699;OID=.;OPOS=240500413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:42:42:64:64:0.603774:24:40:23:19:24:40:23:19 chr2 240684619 . G A 424.08 PASS AF=0.398374;AO=49;DP=123;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.000994843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.524;QD=13.7913;RBI=0.0125651;REFB=-0.00562581;REVB=-0.0125257;RO=72;SAF=23;SAR=26;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119718;STB=0.558839;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0102967;OID=.;OPOS=240684619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:72:74:49:49:0.398374:26:23:42:30:26:23:42:32 chr2 240900607 . TGGGGGA TGGGGAA,TGGGGA,TGGGGG 86.86 PASS AF=0,0.345455,0;AO=2,17,6;DP=55;FAO=0,19,0;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=0,10,0;FSAR=0,9,0;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.07241,-0.11311,-0.262359;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,1,1;MLLD=17.7715,13.5324,13.8524;QD=6.31742;RBI=0.0793239,0.132984,0.26239;REFB=-0.036282,-0.0267391,0.0449429;REVB=-0.0323895,-0.0699355,-0.00400793;RO=22;SAF=0,7,6;SAR=2,10,0;SRF=7;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.431599,0.0969551,0.759254;STB=0.5,0.589262,0.5;STBP=1,0.341,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0.031988,0;OID=.,.,.;OPOS=240900612,240900608,240900613;OREF=G,G,A;OALT=A,-,-;OMAPALT=TGGGGAA,TGGGGA,TGGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.345455,0:2,17,6:55:0,19,0:55:36:0,10,0:0,9,0:14:22:89:22:0,7,6:2,10,0:7:15 chr2 240923050 . C T 557.37 PASS AF=0.393939;AO=65;DP=165;FAO=65;FDP=165;FR=.;FRO=100;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=36;FWDB=0.00905962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.474;QD=13.5121;RBI=0.00960438;REFB=-0.0108113;REVB=0.00318866;RO=100;SAF=27;SAR=38;SRF=64;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237982;STB=0.633758;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0130195;OID=.;OPOS=240923050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:100:100:65:65:0.393939:38:27:64:36:38:27:64:36 chr2 240946766 . T C 1006.57 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.8;QD=59.2102;RBI=0.0252466;REFB=0;REVB=0.00741476;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145583;OID=.;OPOS=240946766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:37:31:0:0:37:31:0:0 chr2 240961728 . T C 1070.24 PASS AF=0.987013;AO=59;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0349199;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.302;QD=55.597;RBI=0.0726617;REFB=-0.0883833;REVB=0.0637207;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.506171;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.000525962;OID=.;OPOS=240961728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:77:0:1:59:76:0.987013:19:40:0:0:36:40:1:0 chr2 240981262 . A C 337.57 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0022109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.102;QD=20.1533;RBI=0.0138635;REFB=-0.016091;REVB=0.0136861;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928441;STB=0.55146;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0212888;OID=.;OPOS=240981262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:17:18:13:19:17:18:13:19 chr2 240981375 . T A 321.23 PASS AF=0.532258;AO=32;DP=61;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0647992;FXX=0.0312451;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.632;QD=20.7243;RBI=0.0653855;REFB=-0.0422571;REVB=0.00873609;RO=29;SAF=10;SAR=22;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370883;STB=0.530846;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0381738;OID=.;OPOS=240981375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:29:29:32:33:0.532258:22:10:8:21:22:11:8:21 chr2 240984789 . C T 308.99 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.01998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.651;QD=16.0516;RBI=0.0201585;REFB=-0.0270896;REVB=-0.00267695;RO=43;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376275;STB=0.521204;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0375953;OID=.;OPOS=240984789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:21:13:18:25:21:13:18:25 chr2 240985347 . G A 146.08 PASS AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0173907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.085;QD=8.98947;RBI=0.0208879;REFB=-0.00192867;REVB=-0.0115701;RO=45;SAF=8;SAR=12;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027187;STB=0.516113;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00262883;OID=.;OPOS=240985347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:45:45:20:20:0.307692:12:8:17:28:12:8:17:28 chr2 241066280 . C T 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0709347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9354;QD=10.3789;RBI=0.0728744;REFB=-0.0240072;REVB=-0.0167018;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433491;STB=0.763038;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0231861;OID=.;OPOS=241066280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:7:2:10:6:7:2:10:6 chr2 241066325 . A C 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0176473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.999;QD=10.3793;RBI=0.0178251;REFB=0.0119463;REVB=0.00251147;RO=15;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33795;STB=0.71749;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.0222272;OID=.;OPOS=241066325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:6:3:10:5:6:3:11:5 chr2 241079723 . C T 371.45 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0106972;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.183;QD=19.8107;RBI=0.0461355;REFB=-0.0167999;REVB=-0.0448782;RO=36;SAF=20;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231038;STB=0.506326;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0149716;OID=.;OPOS=241079723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:36:37:38:38:0.506667:18:20:18:18:18:20:19:18 chr2 241390516 . C T 522.81 PASS AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00397888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.022;QD=21.1234;RBI=0.0109808;REFB=0.00423543;REVB=-0.0102346;RO=48;SAF=29;SAR=21;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00303353;STB=0.506022;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=-0.00308654;OID=.;OPOS=241390516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:49:50:50:0.505051:21:29:28:20:21:29:29:20 chr2 241492255 . G T 838.38 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00248257;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7759;QD=57.8193;RBI=0.0574073;REFB=0;REVB=-0.0573536;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.12104e-05;OID=.;OPOS=241492255;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0 chr2 241537421 . G A 919.97 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.508;QD=58.4105;RBI=0.0295111;REFB=0;REVB=0.0121964;RO=0;SAF=19;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08994e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64766e-05;OID=.;OPOS=241537421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:44:19:0:0:44:19:0:0 chr2 241538074 . A G 679.54 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.786;QD=61.7763;RBI=0.026119;REFB=0;REVB=-0.0214806;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297586;OID=.;OPOS=241538074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:25:18:0:0:26:18:0:0 chr2 241558397 . G A 1144.17 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4855;QD=60.2195;RBI=0.0237417;REFB=0;REVB=-0.00874753;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022146;OID=.;OPOS=241558397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:41:34:0:0:42:34:0:0 chr2 241570249 . A C 199.76 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.674;QD=44.3906;RBI=0.0334373;REFB=-0.00972561;REVB=-0.0178089;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.526285;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000888141;OID=.;OPOS=241570249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:18:18:0:1:17:17:0.944444:9:8:0:0:9:8:0:1 chr2 241570391 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.676;QD=60.6103;RBI=0.044609;REFB=0;REVB=0.0273745;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107036;OID=.;OPOS=241570391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr2 241622069 . G A 154.75 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.00556601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.5497;QD=14.7382;RBI=0.00652449;REFB=-0.0018021;REVB=-0.00340419;RO=25;SAF=4;SAR=13;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116369;STB=0.566595;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.004196;OID=.;OPOS=241622069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:13:4:4:21:13:4:4:21 chr2 241622187 . C T 833.17 PASS AF=0.654867;AO=74;DP=115;FAO=74;FDP=113;FR=.;FRO=39;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0202122;FXX=0.0173898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.773;QD=29.4928;RBI=0.0336879;REFB=-0.0192189;REVB=0.0269507;RO=39;SAF=37;SAR=37;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409609;STB=0.522118;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00609397;OID=.;OPOS=241622187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:113:39:39:74:74:0.654867:37:37:17:22:37:37:17:22 chr2 241622209 . T C 939.35 PASS AF=0.62406;AO=83;DP=133;FAO=83;FDP=133;FR=.;FRO=50;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0157659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5151;QD=28.2511;RBI=0.0161298;REFB=-0.0232964;REVB=-0.00340661;RO=50;SAF=43;SAR=40;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541805;STB=0.52932;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0153753;OID=.;OPOS=241622209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:50:50:83:83:0.62406:40:43:22:28:40:43:22:28 chr2 241627836 . G C 225.72 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.00846077;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.191;QD=17.0351;RBI=0.0166437;REFB=-0.0208275;REVB=-0.0143328;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184807;STB=0.60358;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0175323;OID=.;OPOS=241627836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:28:28:25:25:0.471698:12:13:20:8:12:13:20:8 chr2 241627928 . A G 176.63 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0243872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.529;QD=13.3308;RBI=0.0244964;REFB=-0.0143185;REVB=0.00231067;RO=30;SAF=11;SAR=10;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219784;STB=0.638566;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0400769;OID=.;OPOS=241627928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:32:21:21:0.396226:10:11:22:8:10:11:24:8 chr2 241664801 . C T 296.61 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0226826;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8301;QD=20.4559;RBI=0.0236886;REFB=-0.037514;REVB=-0.00683003;RO=27;SAF=19;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112633;STB=0.562601;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0499734;OID=.;OPOS=241664801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:27:27:31:31:0.534483:12:19:13:14:12:19:13:14 chr2 241667783 . C T 243.24 PASS AF=0.509804;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00916419;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.153;QD=19.0779;RBI=0.0113684;REFB=-0.0199465;REVB=-0.00672746;RO=25;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11658;STB=0.571849;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0217289;OID=.;OPOS=241667783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:25:25:26:0.509804:8:17:14:11:8:18:14:11 chr2 241696840 . ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC,CTCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC 572.05 PASS AF=0.561404,0,0.385965,0.0350877,0.0175439;AO=8,11,8,2,4;DP=56;FAO=32,0,22,2,1;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0,6,0,0;FSAR=22,0,16,2,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397694,0.0276907,0.211554,0.054304,-0.0172819;FXX=0.0338926;HRUN=2,2,5,2,1;LEN=4,3,1,1,4;MLLD=90.1024,89.0491,6.8333,37.9775,75.8319;QD=40.1439;RBI=0.124168,0.0310883,0.729728,0.0893133,0.0183993;REFB=0,0,0,0,0;REVB=0.117627,0.0141319,0.698389,0.070908,-0.00631428;RO=9;SAF=7,2,4,0,0;SAR=1,9,4,2,4;SRF=0;SRR=9;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0.366667,0,0;SSSB=0.703809,0.299996,0.465745,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp,mnp;VARB=0.0515086,0.00981959,0.0168431,0.0556995,0.108981;OID=.,.,.,.,.;OPOS=241696869,241696841,241696872,241696870,241696840;OREF=CCTC,TCC,C,C,ATCC;OALT=-,-,-,T,CTCA;OMAPALT=ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC,CTCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:99:56:57:9:0:8,11,8,2,4:32,0,22,2,1:0.561404,0,0.385965,0.0350877,0.0175439:1,9,4,2,4:7,2,4,0,0:0:9:22,0,16,2,1:10,0,6,0,0:0:0 chr2 241713646 . A G 585.38 PASS AF=0.561905;AO=38;DP=104;FAO=59;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.197326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3889;QD=22.3002;RBI=0.197358;REFB=-0.0425006;REVB=-0.0035281;RO=46;SAF=13;SAR=25;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139922;STB=0.535702;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0466074;OID=.;OPOS=241713646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:46:46:38:59:0.561905:25:13:22:24:26:33:22:24 chr2 241722445 . G A 266.5 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0165192;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.5973;QD=15.9106;RBI=0.0460961;REFB=-0.00759362;REVB=0.0430345;RO=37;SAF=9;SAR=21;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581171;STB=0.53285;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.00708304;OID=.;OPOS=241722445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:21:9:13:24:21:9:13:24 chr2 241808347 . A G 288.79 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=-0.000847678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.008;QD=21.0026;RBI=0.00377526;REFB=-0.00651251;REVB=-0.00367886;RO=25;SAF=2;SAR=28;SRF=3;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148148;STB=0.58327;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00562451;OID=.;OPOS=241808347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:28:2:3:22:28:2:3:22 chr2 241812428 . C T 376.55 PASS AF=0.417476;AO=41;DP=101;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.0246398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3827;QD=14.6234;RBI=0.0268952;REFB=-0.00228851;REVB=0.010781;RO=60;SAF=19;SAR=22;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00343126;STB=0.500907;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00313439;OID=.;OPOS=241812428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:60:60:41:43:0.417476:22:19:28:32:23:20:28:32 chr2 241812461 . G A 337.97 PASS AF=0.411111;AO=35;DP=88;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.000395372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.628;QD=15.0209;RBI=0.00820802;REFB=0.00114235;REVB=0.00819849;RO=53;SAF=19;SAR=16;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951828;STB=0.551531;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-0.000900932;OID=.;OPOS=241812461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:53:53:35:37:0.411111:16:19:24:29:17:20:24:29 chr2 241816545 . C T 353.46 PASS AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0268473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.104;QD=23.9631;RBI=0.0296141;REFB=-0.0100798;REVB=0.0124986;RO=24;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302675;STB=0.516625;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0099403;OID=.;OPOS=241816545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:19:16:10:14:19:16:10:14 chr2 241817516 . A G 578.89 PASS AF=0.451852;AO=60;DP=134;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.00625234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.38;QD=17.1522;RBI=0.029551;REFB=-0.0104716;REVB=0.028882;RO=73;SAF=32;SAR=28;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553943;STB=0.538599;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.012451;OID=.;OPOS=241817516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:73:74:60:61:0.451852:28:32:43:30:29:32:44:30 chr2 241826517 . C T 484.41 PASS AF=0.54023;AO=44;DP=85;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00990697;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.454;QD=22.2719;RBI=0.0190159;REFB=-0.0170671;REVB=0.0162313;RO=40;SAF=17;SAR=27;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100523;STB=0.55542;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0164765;OID=.;OPOS=241826517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:40:40:44:47:0.54023:27:17:20:20:29:18:20:20 chr2 241828012 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.882;QD=62.3508;RBI=0.0700002;REFB=0;REVB=0.0408795;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230583;OID=.;OPOS=241828012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr2 241828034 . A G 411.06 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.572;QD=56.6977;RBI=0.0469282;REFB=0;REVB=0.0269737;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251892;OID=.;OPOS=241828034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr2 241830969 . G A 457.36 PASS AF=0.475728;AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0171251;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.937;QD=17.7614;RBI=0.100301;REFB=-0.0226693;REVB=0.0988277;RO=52;SAF=28;SAR=21;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129758;STB=0.508471;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0318435;OID=.;OPOS=241830969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:52:54:49:49:0.475728:21:28:29:23:21:28:30:24 chr2 241831005 . C T 799.04 PASS AF=0.446809;AO=84;DP=188;FAO=84;FDP=188;FR=.;FRO=104;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=43;FWDB=0.0366945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6627;QD=17.0008;RBI=0.0438995;REFB=-0.00104617;REVB=0.0240973;RO=104;SAF=52;SAR=32;SRF=61;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339702;STB=0.518888;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00165366;OID=.;OPOS=241831005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:104:104:84:84:0.446809:32:52:61:43:32:52:61:43 chr2 241831296 . C G 108.97 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0496473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2218;QD=14.0608;RBI=0.0511235;REFB=-0.0368579;REVB=0.0121963;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275431;STB=0.659955;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0525507;OID=.;OPOS=241831296;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:6:12:5:8:6:12 chr2 241834944 . T C 588.05 PASS AF=0.564356;AO=56;DP=100;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00110915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.29;QD=23.2889;RBI=0.00763274;REFB=0.0081243;REVB=0.00755172;RO=44;SAF=33;SAR=23;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393902;STB=0.518162;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.00574614;OID=.;OPOS=241834944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:44:44:56:57:0.564356:23:33:28:16:23:34:28:16 chr2 241835379 . G A 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0364982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.87;QD=12.9747;RBI=0.0370667;REFB=-0.0316715;REVB=-0.00646659;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170731;STB=0.59984;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0610287;OID=.;OPOS=241835379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:6:12:6:6:6:12 chr2 241865156 . T C 2702.69 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128517;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.52;QD=62.1308;RBI=0.0132109;REFB=0;REVB=-0.00305978;RO=0;SAF=87;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.45787e-05;OID=.;OPOS=241865156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:174:0:0:173:174:1:86:87:0:0:88:86:0:0 chr2 241870534 . G A 232.24 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0150064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.08;QD=23.8194;RBI=0.0332686;REFB=-0.0334896;REVB=0.0296919;RO=17;SAF=16;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349385;STB=0.695469;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0509241;OID=.;OPOS=241870534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:6:16:5:12:6:16:5:12 chr2 241872597 . A G 1876.98 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.448;QD=61.5404;RBI=0.0695955;REFB=0;REVB=0.0687928;RO=0;SAF=66;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04651e-05;OID=.;OPOS=241872597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:122:0:0:121:122:1:55:66:0:0:55:67:0:0 chr2 241873180 . A G 719.36 PASS AF=0.490066;AO=74;DP=151;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0243516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.921;QD=19.0557;RBI=0.0244273;REFB=-0.0317231;REVB=0.00192133;RO=76;SAF=28;SAR=46;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102825;STB=0.553894;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0311122;OID=.;OPOS=241873180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:76:77:74:74:0.490066:46:28:37:39:46:28:37:40 chr2 241874844 . G A 141.3 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.113364;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.8916;QD=21.7389;RBI=0.140676;REFB=-0.0513637;REVB=0.0832974;RO=10;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211469;STB=0.636185;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0448999;OID=.;OPOS=241874844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:10:11:15:15:0.576923:6:9:3:7:6:9:3:8 chr2 241874893 . G A 138.1 PASS AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.000929928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.232;QD=29.0746;RBI=0.184691;REFB=-0.0256047;REVB=0.184689;RO=5;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196971;STB=0.608556;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0302043;OID=.;OPOS=241874893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:19:19:5:5:14:14:0.736842:5:9:5:0:5:9:5:0 chr2 241889798 . C T 281.15 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00477098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8773;QD=21.2186;RBI=0.00644828;REFB=-0.038065;REVB=0.00433798;RO=24;SAF=20;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167225;STB=0.593154;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0308786;OID=.;OPOS=241889798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:9:20:12:12:9:20:12:12 chr2 241898824 . A G 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00261103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.643;QD=62.0082;RBI=0.0247803;REFB=0;REVB=0.0246424;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44889e-05;OID=.;OPOS=241898824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0 chr2 241904001 . G C 1214.71 PASS AF=0.932584;AO=82;DP=88;FAO=83;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0352679;FXX=0.0430061;HRUN=7;LEN=1;MLLD=51.0849;QD=54.5939;RBI=0.038421;REFB=-0.117873;REVB=-0.0152429;RO=6;SAF=45;SAR=37;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494322;STB=0.525381;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00553213;OID=.;OPOS=241904001;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:88:89:6:6:82:83:0.932584:37:45:1:5:38:45:1:5 chr2 241922430 . T C 1358.54 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.478;QD=62.4615;RBI=0.0189416;REFB=0;REVB=0.00457777;RO=0;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.91075e-05;OID=.;OPOS=241922430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:47:40:0:0:47:40:0:0 chr2 241929228 . A G 1320.69 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.492;QD=62.1502;RBI=0.0129276;REFB=0;REVB=0.00847827;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11432e-05;OID=.;OPOS=241929228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0 chr2 242002263 . C T 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.069666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.259;QD=20.8718;RBI=0.0705389;REFB=-0.0118909;REVB=0.0110628;RO=20;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324746;STB=0.683274;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0111188;OID=.;OPOS=242002263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:15:6:13:7:15:6:13:7 chr2 242011330 . C A 1125.61 PASS AF=0.974359;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00816078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1766;QD=57.7238;RBI=0.0257655;REFB=0.0382373;REVB=0.024439;RO=2;SAF=28;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684319;STB=0.503617;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.000930989;OID=.;OPOS=242011330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:78:78:2:2:76:76:0.974359:48:28:1:1:48:28:1:1 chr2 242011531 . G A 407.06 PASS AF=0.666667;AO=38;DP=57;FAO=38;FDP=57;FR=.;FRO=19;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00490335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9868;QD=28.5652;RBI=0.142312;REFB=-0.0120007;REVB=0.142228;RO=18;SAF=31;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861262;STB=0.56677;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0071995;OID=.;OPOS=242011531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:18:19:38:38:0.666667:7:31:13:5:7:31:13:6 chr2 242021742 . G T 465.82 PASS AF=0.368421;AO=56;DP=150;FAO=56;FDP=152;FR=.;FRO=96;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=-0.0422024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0074;QD=12.2585;RBI=0.0461838;REFB=-0.0066965;REVB=-0.0187591;RO=93;SAF=31;SAR=25;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11188;STB=0.560044;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0130943;OID=.;OPOS=242021742;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:93:96:56:56:0.368421:25:31:42:51:25:31:44:52 chr2 242028762 . T C 170.19 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0175316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.312;QD=17.019;RBI=0.0237714;REFB=-0.00055741;REVB=0.0160537;RO=22;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167939;STB=0.596381;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000604459;OID=.;OPOS=242028762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:12:6:11:11:12:6:11:11 chr2 242046785 . A C 179.7 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0166719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.145;QD=15.6262;RBI=0.0167646;REFB=-0.00896292;REVB=0.00176103;RO=27;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366343;STB=0.708768;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0147475;OID=.;OPOS=242046785;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:7:12:7:20:7:12:7:20 chr2 242051777 . G A 239.65 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0152263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.549;QD=18.0872;RBI=0.0163146;REFB=-0.0306941;REVB=-0.00585862;RO=27;SAF=13;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167962;STB=0.509427;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0299553;OID=.;OPOS=242051777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:13:13:13:14:13:13:13:14 chr2 242054403 . G A 603.35 PASS AF=0.539823;AO=60;DP=113;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00505484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.958;QD=21.3576;RBI=0.00725424;REFB=-0.0163404;REVB=0.00520314;RO=52;SAF=36;SAR=24;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535134;STB=0.532363;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0151742;OID=.;OPOS=242054403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:52:60:61:0.539823:24:36:28:24:24:37:28:24 chr2 242062162 . C T 94.23 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00537657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5695;QD=10.4695;RBI=0.109155;REFB=0.00102299;REVB=0.109022;RO=23;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716318;STB=0.527732;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00208996;OID=.;OPOS=242062162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:36:23:24:12:12:0.333333:6:6:10:13:6:6:11:13 chr2 242066156 . C T 118.35 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0016721;FXX=0.0416493;HRUN=5;LEN=1;MLLD=82.3382;QD=20.5827;RBI=0.0095234;REFB=-0.0276231;REVB=-0.00937545;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303948;STB=0.673198;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0140192;OID=.;OPOS=242066156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:24:23:10:10:13:13:0.565217:9:4:7:3:9:4:7:3 chr2 242066314 . T C 95.05 PASS AF=0.413793;AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0218456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.83;QD=13.1098;RBI=0.036494;REFB=-0.00852894;REVB=-0.0292332;RO=16;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16979;STB=0.599834;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0186322;OID=.;OPOS=242066314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:28:29:16:17:11:12:0.413793:5:6:6:10:5:7:7:10 chr2 242066789 . A G 425.97 PASS AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0276035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6367;QD=18.932;RBI=0.0287281;REFB=-0.0122683;REVB=-0.00795935;RO=47;SAF=19;SAR=24;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104382;STB=0.558113;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0171908;OID=.;OPOS=242066789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:43:43:0.477778:24:19:26:21:24:19:26:21 chr2 242075362 . G A 335.85 PASS AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.00715663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8575;QD=22.3901;RBI=0.00719731;REFB=-0.00873153;REVB=0.000764138;RO=26;SAF=11;SAR=23;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142909;STB=0.507878;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0060422;OID=.;OPOS=242075362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:23:11:8:18:23:11:8:18 chr2 242082262 . T C 747.08 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.537;QD=63.5813;RBI=0.0195945;REFB=0;REVB=0.0166042;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012105;OID=.;OPOS=242082262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:13:34:0:0:13:34:0:0 chr2 242122391 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00487536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.609;QD=54.5174;RBI=0.0107081;REFB=0;REVB=0.00953387;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22249e-05;OID=.;OPOS=242122391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr2 242122820 . G A 215.67 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0530259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3992;QD=13.0711;RBI=0.0634922;REFB=-0.0112698;REVB=0.0349216;RO=40;SAF=17;SAR=9;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194052;STB=0.611423;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0166472;OID=.;OPOS=242122820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:9:17:19:21:9:17:19:21 chr2 242122844 . C T 322.43 PASS AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00885236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.264;QD=15.3536;RBI=0.00930136;REFB=-0.0162975;REVB=0.002855;RO=48;SAF=22;SAR=14;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114793;STB=0.564828;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.030573;OID=.;OPOS=242122844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:14:22:24:24:14:22:24:24 chr2 242168976 . T C 419.75 PASS AF=0.452632;AO=42;DP=93;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00664869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.911;QD=17.6735;RBI=0.00749027;REFB=-0.00660745;REVB=-0.00344952;RO=51;SAF=22;SAR=20;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247828;STB=0.501968;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00596044;OID=.;OPOS=242168976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:51:52:42:43:0.452632:20:22:28:23:20:23:28:24 chr2 242203916 . A C 1758.12 PASS AF=1;AO=114;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.56;QD=60.6248;RBI=0.0057016;REFB=0;REVB=0.00560051;RO=0;SAF=63;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.78835e-05;OID=.;OPOS=242203916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:116:0:0:114:116:1:51:63:0:0:52:64:0:0 chr2 242572846 . A G 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0196782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.901;QD=18.4827;RBI=0.0337684;REFB=-0.023384;REVB=0.0274422;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462776;STB=0.526288;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0177182;OID=.;OPOS=242572846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:10:9:11:10:10:9:11:10 chr2 242573211 . T C 186.13 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.17;QD=46.5335;RBI=0.0462153;REFB=0;REVB=0.040176;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00074044;OID=.;OPOS=242573211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:7:8:0:0:8:8:0:0 chr2 242576777 . C T 283.73 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00395608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.506;QD=19.911;RBI=0.0946794;REFB=-0.00330105;REVB=0.0945967;RO=27;SAF=25;SAR=5;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433977;STB=0.744497;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00234678;OID=.;OPOS=242576777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:5:25:11:16:5:25:11:16 chr2 242577022 . C T 93.31 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0412702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.291;QD=19.6436;RBI=0.065319;REFB=-0.0126468;REVB=0.0506295;RO=8;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104359;STB=0.559889;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0149935;OID=.;OPOS=242577022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:7:4:4:4:7:4:4:4 chr2 242607924 . A G 206.56 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00151108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9573;QD=15.0227;RBI=0.00845439;REFB=-0.0497401;REVB=0.00831826;RO=30;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26383;STB=0.641855;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0672617;OID=.;OPOS=242607924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:31:24:24:0.436364:8:16:12:18:8:16:13:18 chr2 242610738 . T C 246.32 PASS AF=0.391892;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00702935;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7669;QD=13.3144;RBI=0.0194603;REFB=-0.014929;REVB=0.0181464;RO=44;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298547;STB=0.523348;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.027583;OID=.;OPOS=242610738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:44:45:29:29:0.391892:15:14:20:24:15:14:20:25 chr2 242610773 . T A 1695.23 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.343;QD=60.5438;RBI=0.0714404;REFB=0;REVB=0.0462482;RO=0;SAF=51;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225233;OID=.;OPOS=242610773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:61:51:0:0:61:51:0:0 chr2 242611934 . T C 322.94 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0103121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.509;QD=21.8944;RBI=0.0116077;REFB=-0.0208795;REVB=-0.00532902;RO=26;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00561786;STB=0.503104;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0153843;OID=.;OPOS=242611934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:18:15:12:14:18:15:12:14 chr2 242613089 . A G 583.26 PASS AF=0.491803;AO=59;DP=123;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0638039;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.159;QD=19.1231;RBI=0.0638049;REFB=-0.011728;REVB=0.000352476;RO=62;SAF=20;SAR=39;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487589;STB=0.520456;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0101324;OID=.;OPOS=242613089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:62:62:59:60:0.491803:39:20:24:38:39:21:24:38 chr2 242613133 . T G 472.51 PASS AF=0.472222;AO=50;DP=107;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.00488164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.245;QD=17.5005;RBI=0.0115783;REFB=-0.0235457;REVB=0.0104989;RO=56;SAF=16;SAR=34;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11274;STB=0.572368;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.024598;OID=.;OPOS=242613133;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:56:57:50:51:0.472222:34:16:24:32:35:16:25:32 chr2 242674803 . G A 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0230677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.509;QD=12.8605;RBI=0.0319064;REFB=-0.0189142;REVB=0.0220432;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308464;STB=0.685728;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0164239;OID=.;OPOS=242674803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:5:3:5:2:5:3 chr2 242680430 . A G 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0332756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.488;QD=15.8821;RBI=0.0363872;REFB=-0.00337449;REVB=0.014723;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253163;STB=0.646773;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00364538;OID=.;OPOS=242680430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:3:7:4:6:3:7 chr2 242688292 . C T 288.86 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0170637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7983;QD=21.0079;RBI=0.0175467;REFB=-0.00909203;REVB=0.00408891;RO=24;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11112;STB=0.572097;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00604268;OID=.;OPOS=242688292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:25:30:30:0.545455:19:11:12:12:19:11:13:12 chr2 242688366 . C T 135.9 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0428635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9689;QD=17.5356;RBI=0.0484688;REFB=-0.0352564;REVB=-0.0226263;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839727;STB=0.547883;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0385922;OID=.;OPOS=242688366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:5:11:9:6:5:11 chr2 242690675 . G A 227.15 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00650624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.586;QD=21.1302;RBI=0.00662036;REFB=-0.00635875;REVB=0.0012239;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223253;STB=0.624891;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00337367;OID=.;OPOS=242690675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:12:10:15:6:12:10:15:6 chr2 242695151 . T A 105.51 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00042702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1917;QD=11.406;RBI=0.0042683;REFB=-0.00884609;REVB=-0.00424688;RO=24;SAF=1;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.540323;STB=0.834786;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0365474;OID=.;OPOS=242695151;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:12:1:10:14:12:1:10:14 chr2 242757411 . C T 226.43 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00349327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.694;QD=17.0891;RBI=0.00865891;REFB=-0.0104003;REVB=0.007923;RO=28;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108765;STB=0.50613;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00890966;OID=.;OPOS=242757411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:11:14:16:12:11:14:16:12 chr2 242758203 . T C 226.33 PASS AF=0.333333;AO=18;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00100398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.773;QD=12.5737;RBI=0.00576298;REFB=-0.0149662;REVB=0.00567485;RO=44;SAF=13;SAR=5;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392251;STB=0.625501;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0271921;OID=.;OPOS=242758203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:44:44:18:24:0.333333:5:13:17:27:10:14:17:27 chr2 242758326 . G A 103.22 PASS AF=0.297872;AO=13;DP=46;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0232124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.866;QD=8.78432;RBI=0.0288693;REFB=-0.00863059;REVB=-0.0171645;RO=29;SAF=6;SAR=7;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102844;STB=0.574364;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0391932;OID=.;OPOS=242758326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:29:33:13:14:0.297872:7:6:16:13:7:7:20:13 chr2 242813124 . T C 831.75 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1756;QD=57.3618;RBI=0.0870285;REFB=0;REVB=0.0855144;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000495296;OID=.;OPOS=242813124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0 chr2 242815059 . C T 492.39 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00267086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.743;QD=20.0976;RBI=0.00269574;REFB=-0.0183821;REVB=-0.000365384;RO=49;SAF=28;SAR=20;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123008;STB=0.573348;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00776089;OID=.;OPOS=242815059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:49:50:48:48:0.489796:20:28:22:27:20:28:22:28 chr3 361508 . C T 316.99 PASS AF=0.478873;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0324502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2124;QD=17.8584;RBI=0.039931;REFB=-0.00761602;REVB=-0.0232694;RO=37;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752676;STB=0.549267;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00469353;OID=.;OPOS=361508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:33:34:0.478873:17:16:15:22:17:17:15:22 chr3 391100 . A G 1435.01 PASS AF=0.98;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0234679;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.688;QD=57.4004;RBI=0.0317726;REFB=-0.16774;REVB=0.0214187;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.000297004;OID=.;OPOS=391100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:101:100:0:2:98:98:0.98:52:46:0:0:52:46:0:2 chr3 439963 . A G 1480.8 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00869292;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.368;QD=62.3493;RBI=0.028172;REFB=0.000445483;REVB=-0.0267972;RO=1;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998174;STB=0.505262;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0003313;OID=.;OPOS=439963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:95:1:1:94:94:0.989474:47:47:0:1:47:47:0:1 chr3 440028 . T C 1520.56 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125044;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.329;QD=64.0236;RBI=0.0214282;REFB=0;REVB=0.0174013;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27892e-05;OID=.;OPOS=440028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:56:38:0:0:56:39:0:0 chr3 450391 . T C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.727;QD=59.0175;RBI=0.00989365;REFB=0;REVB=-0.00808542;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89044e-05;OID=.;OPOS=450391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr3 450534 . T C 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5751;QD=61.2128;RBI=0.0537478;REFB=0;REVB=0.0467359;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000597671;OID=.;OPOS=450534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0 chr3 1107455 . T C 825.75 PASS AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0201571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.481;QD=54.1474;RBI=0.0206834;REFB=-0.0384557;REVB=0.0046362;RO=2;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285773;STB=0.515146;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0001825;OID=.;OPOS=1107455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:61:61:2:2:59:59:0.967213:32:27:0:2:32:27:0:2 chr3 1262474 . T C 2194.15 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.351;QD=63.1411;RBI=0.0543901;REFB=0;REVB=0.00148165;RO=0;SAF=72;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89366e-05;OID=.;OPOS=1262474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:139:0:0:138:139:1:66:72:0:0:67:72:0:0 chr3 1418753 . G A 2296.27 PASS AF=0.993151;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0013488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6198;QD=62.9116;RBI=0.00977823;REFB=0.0334442;REVB=-0.00968476;RO=0;SAF=69;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01877e-08;STB=0.503268;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-3.50518e-05;OID=.;OPOS=1418753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:146:0:1:145:145:0.993151:76:69:0:0:76:69:0:1 chr3 1424718 . G A 596.04 PASS AF=0.466165;AO=62;DP=133;FAO=62;FDP=133;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=-0.00036182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.732;QD=17.926;RBI=0.011503;REFB=0.00330345;REVB=-0.0114973;RO=71;SAF=34;SAR=28;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133943;STB=0.574301;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00600098;OID=.;OPOS=1424718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:71:71:62:62:0.466165:28:34:29:42:28:34:29:42 chr3 1424745 . C T 597.47 PASS AF=0.459259;AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.00326743;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.32;QD=17.7027;RBI=0.00751068;REFB=-0.00841229;REVB=-0.00676271;RO=75;SAF=36;SAR=26;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214585;STB=0.619773;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0108009;OID=.;OPOS=1424745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:135:75:73:62:62:0.459259:26:36:27:48:26:36:26:47 chr3 3067850 . A G 465.58 PASS AF=0.386861;AO=53;DP=137;FAO=53;FDP=137;FR=.;FRO=84;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=1.2987e-05;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.528;QD=13.5937;RBI=0.0118873;REFB=0.0044575;REVB=0.0118873;RO=84;SAF=16;SAR=37;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214887;STB=0.622259;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.0116763;OID=.;OPOS=3067850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:84:84:53:53:0.386861:37:16:41:43:37:16:41:43 chr3 3067853 . G A 473.43 PASS AF=0.380282;AO=54;DP=142;FAO=54;FDP=142;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0281803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.878;QD=13.3361;RBI=0.0296131;REFB=-0.00410214;REVB=0.00909955;RO=88;SAF=17;SAR=37;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200592;STB=0.614234;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0207545;OID=.;OPOS=3067853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:88:88:54:54:0.380282:37:17:43:45:37:17:43:45 chr3 3076401 . C T 309.95 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0100072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.529;QD=18.7847;RBI=0.0366657;REFB=-0.000782007;REVB=0.0352736;RO=33;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830264;STB=0.546191;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000768787;OID=.;OPOS=3076401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:18:15:12:21:18:15:12:21 chr3 3076443 . A G 176.63 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0134867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.355;QD=14.1302;RBI=0.0139376;REFB=-0.0154112;REVB=0.00351667;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148108;STB=0.585686;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0312642;OID=.;OPOS=3076443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:9:10:12:19:9:10:12:19 chr3 3081750 . A T 979.83 PASS AF=0.459821;AO=103;DP=224;FAO=103;FDP=224;FR=.;FRO=121;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=69;FWDB=0.00038911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2196;QD=17.497;RBI=0.00196472;REFB=0.00289829;REVB=-0.00192581;RO=121;SAF=56;SAR=47;SRF=52;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110915;STB=0.561343;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00277537;OID=.;OPOS=3081750;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:121:121:103:103:0.459821:47:56:52:69:47:56:52:69 chr3 3081825 . T C 3219.99 PASS AF=1;AO=208;DP=208;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00805284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.94;QD=61.9228;RBI=0.0395296;REFB=0;REVB=0.0387006;RO=0;SAF=98;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96135e-05;OID=.;OPOS=3081825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:208:208:0:0:208:208:1:110:98:0:0:110:98:0:0 chr3 3098041 . G C 568.73 PASS AF=0.571429;AO=52;DP=92;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0117231;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2328;QD=24.999;RBI=0.0405813;REFB=-0.00287235;REVB=-0.0388511;RO=39;SAF=25;SAR=27;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250961;STB=0.513737;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00226511;OID=.;OPOS=3098041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:39:39:52:52:0.571429:27:25:20:19:27:25:20:19 chr3 3115478 . T C 248.4 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00419976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.875;QD=13.9943;RBI=0.01461;REFB=-0.0130735;REVB=-0.0139934;RO=42;SAF=12;SAR=17;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115029;STB=0.565512;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0270235;OID=.;OPOS=3115478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:17:12:22:20:17:12:22:20 chr3 3170792 . C T 1305.85 PASS AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00873566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.881;QD=60.7373;RBI=0.0106178;REFB=0.0196123;REVB=0.00603533;RO=1;SAF=31;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869298;STB=0.504586;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.000932576;OID=.;OPOS=3170792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:54:31:0:1:54:31:0:1 chr3 3189279 . A G 1129.69 PASS AF=0.9625;AO=76;DP=79;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0126921;FXX=0.0123442;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.452;QD=56.4846;RBI=0.0193745;REFB=-0.172265;REVB=-0.0146383;RO=3;SAF=31;SAR=45;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436133;STB=0.522382;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.000738169;OID=.;OPOS=3189279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:79:80:3:3:76:77:0.9625:45:31:3:0:45:32:3:0 chr3 3189388 . G T 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0263161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.287;QD=7.46507;RBI=0.0269801;REFB=0.00380521;REVB=-0.00594847;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156386;STB=0.5997;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00912313;OID=.;OPOS=3189388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:7:10:5:2:7:10 chr3 3197918 . A G 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.165;QD=63.2858;RBI=0.0423099;REFB=0;REVB=0.0132475;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025258;OID=.;OPOS=3197918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr3 3886580 . A G 895.57 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.089;QD=57.779;RBI=0.0340024;REFB=0;REVB=0.0195906;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170676;OID=.;OPOS=3886580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:30:31:0:0:31:31:0:0 chr3 3886721 . C A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.522;QD=44.6896;RBI=0.0171772;REFB=0;REVB=0.00564726;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144099;OID=.;OPOS=3886721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr3 3886847 . G C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1277;QD=62.3507;RBI=0.0207236;REFB=0;REVB=0.00647736;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134575;OID=.;OPOS=3886847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0 chr3 3886919 . C T 1607.1 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.524;QD=64.2842;RBI=0.0351195;REFB=0;REVB=0.00020714;RO=0;SAF=61;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39894e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.47925e-05;OID=.;OPOS=3886919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:39:61:0:0:39:61:0:0 chr3 3889222 . G T 289.67 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000939189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.406;QD=52.6674;RBI=0.00405242;REFB=0;REVB=-0.00394208;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.81618e-05;OID=.;OPOS=3889222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:5:16:0:0:6:16:0:0 chr3 4403837 . A G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.518;QD=63.2866;RBI=0.0496126;REFB=0;REVB=0.0475408;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252828;OID=.;OPOS=4403837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0 chr3 4699936 . G C 461.27 PASS AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0240287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.559;QD=16.0441;RBI=0.0282785;REFB=-0.00185756;REVB=0.0149096;RO=64;SAF=26;SAR=25;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00579601;STB=0.50324;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00171816;OID=.;OPOS=4699936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:64:64:51:51:0.443478:25:26:33:31:25:26:33:31 chr3 4712413 . G A 163.72 PASS AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=-0.000412723;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=311.273;QD=9.22372;RBI=0.0331535;REFB=-0.00410405;REVB=0.0331509;RO=48;SAF=15;SAR=7;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956946;STB=0.560811;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00909671;OID=.;OPOS=4712413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:48:49:22:22:0.309859:7:15:36:12:7:15:37:12 chr3 4716811 . A C 441.09 PASS AF=0.544304;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00666421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.073;QD=22.3335;RBI=0.0121319;REFB=-0.0056858;REVB=0.0101376;RO=36;SAF=19;SAR=24;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446855;STB=0.524598;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00476591;OID=.;OPOS=4716811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:36:36:43:43:0.544304:24:19:14:22:24:19:14:22 chr3 4767262 . T C 654.54 PASS AF=0.58;AO=58;DP=100;FAO=58;FDP=100;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.0054222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.106;QD=26.1814;RBI=0.00845733;REFB=-0.00267969;REVB=-0.00649047;RO=42;SAF=31;SAR=27;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140796;STB=0.576655;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00123064;OID=.;OPOS=4767262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:42:42:58:58:0.58:27:31:30:12:27:31:30:12 chr3 4817057 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.787;QD=59.3221;RBI=0.0658781;REFB=0;REVB=0.0213046;RO=0;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291622;OID=.;OPOS=4817057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:44:24:0:0:44:24:0:0 chr3 4842231 . C T 2351.05 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00207814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.862;QD=63.9742;RBI=0.00665628;REFB=0;REVB=-0.00632356;RO=0;SAF=82;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72856e-05;OID=.;OPOS=4842231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:65:82:0:0:65:82:0:0 chr3 4856180 . T C 1302.15 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9958;QD=62.0071;RBI=0.0444206;REFB=0;REVB=0.0195118;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285668;OID=.;OPOS=4856180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:38:46:0:0:38:46:0:0 chr3 4856234 . G A 191.9 PASS AF=0.5;AO=16;DP=36;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00698815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.276;QD=19.1899;RBI=0.00775462;REFB=-0.00399249;REVB=-0.00336154;RO=20;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.550969;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0031267;OID=.;OPOS=4856234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:40:20:20:16:20:0.5:8:8:10:10:8:12:10:10 chr3 5241309 . C A 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00193984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.696;QD=59.1432;RBI=0.012999;REFB=0;REVB=0.0128534;RO=0;SAF=16;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24004e-05;OID=.;OPOS=5241309;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:51:16:0:0:51:16:0:0 chr3 8675539 . G A 509.44 PASS AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0193935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.839;QD=21.0076;RBI=0.0215779;REFB=-0.0203722;REVB=-0.0094603;RO=48;SAF=25;SAR=24;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195476;STB=0.60767;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0275393;OID=.;OPOS=8675539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:24:25:14:34:24:25:14:34 chr3 8676204 . A G 1190.24 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.926;QD=61.0378;RBI=0.065062;REFB=0;REVB=0.0625878;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200974;OID=.;OPOS=8676204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr3 8701430 . T C 136.37 PASS AF=0.483871;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0237061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.026;QD=17.5957;RBI=0.0237559;REFB=-0.0373391;REVB=-0.0015375;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09589;STB=0.566917;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0635201;OID=.;OPOS=8701430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:16:16:14:15:0.483871:10:4:6:10:11:4:6:10 chr3 8705555 . T C 224.59 PASS AF=0.470588;AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0187807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.703;QD=17.615;RBI=0.0189639;REFB=-0.00451119;REVB=-0.00262992;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482631;STB=0.505046;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00623688;OID=.;OPOS=8705555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:27:23:24:0.470588:13:10:10:16:14:10:11:16 chr3 8775661 . C T 258.27 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0328452;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.669;QD=19.8669;RBI=0.0338764;REFB=-0.032884;REVB=-0.0082947;RO=23;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598111;STB=0.554872;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0273792;OID=.;OPOS=8775661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:25:27:27:0.519231:11:16:12:11:11:16:12:13 chr3 8809703 . G A 557.08 PASS AF=0.522936;AO=57;DP=109;FAO=57;FDP=109;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0061441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.217;QD=20.4433;RBI=0.0172384;REFB=-0.0199861;REVB=0.0161062;RO=52;SAF=30;SAR=27;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273113;STB=0.515029;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0145817;OID=.;OPOS=8809703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:52:52:57:57:0.522936:27:30:29:23:27:30:29:23 chr3 8955389 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.93404e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.957;QD=56.938;RBI=0.00125712;REFB=0;REVB=-0.00125651;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.02419e-06;OID=.;OPOS=8955389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr3 8973271 . G T 176.65 PASS AF=1;AO=11;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0785694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.605;QD=47.1068;RBI=0.0804768;REFB=0;REVB=0.0174174;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000746115;OID=.;OPOS=8973271;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:11:15:1:9:2:0:0:9:6:0:0 chr3 8973283 . C G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6686;QD=45.8068;RBI=0.0597971;REFB=0;REVB=0.0388043;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00376781;OID=.;OPOS=8973283;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr3 9005078 . C T 2895.36 PASS AF=0.984127;AO=185;DP=188;FAO=186;FDP=189;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=111;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0188861;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.755;QD=61.2774;RBI=0.0253828;REFB=-0.101435;REVB=0.0169588;RO=3;SAF=74;SAR=111;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00842256;STB=0.504337;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=1.66162e-05;OID=.;OPOS=9005078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:188:189:3:3:185:186:0.984127:111:74:2:1:111:75:2:1 chr3 9024017 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00513001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4615;QD=51.9166;RBI=0.0138377;REFB=0;REVB=0.0128516;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115899;OID=.;OPOS=9024017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr3 9024146 . C A,T 851.93 PASS AF=0.95,0.05;AO=57,3;DP=60;FAO=57,3;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22,3;FSAR=35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0523727,-0.0433249;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=53.733,136.534;QD=56.7954;RBI=0.0525033,0.0480338;REFB=0,0;REVB=-0.00370167,-0.0207414;RO=0;SAF=22,3;SAR=35,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0053515,0.0269425;OID=.,.;OPOS=9024146,9024146;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:60:60:0:0:57,3:57,3:0.95,0.05:35,0:22,3:0:0:35,0:22,3:0:0 chr3 9091151 . C G 255.16 PASS AF=0.521739;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0142098;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.54;QD=22.1879;RBI=0.0184364;REFB=-0.00946136;REVB=-0.0117467;RO=22;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056904;STB=0.518503;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00945344;OID=.;OPOS=9091151;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:22:22:23:24:0.521739:9:14:12:10:10:14:12:10 chr3 9122948 . A G 1248.2 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.066;QD=61.6397;RBI=0.0611371;REFB=0;REVB=0.029735;RO=0;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184103;OID=.;OPOS=9122948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:78:81:0:0:78:81:1:29:49:0:0:29:52:0:0 chr3 9406836 . T C 226.13 PASS AF=0.292929;AO=29;DP=99;FAO=29;FDP=99;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.00935433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9054;QD=9.13671;RBI=0.0195439;REFB=-0.00489901;REVB=0.0171598;RO=69;SAF=10;SAR=19;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181445;STB=0.612824;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.008235;OID=.;OPOS=9406836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:69:70:29:29:0.292929:19:10:34:35:19:10:35:35 chr3 9422210 . T C 404.14 PASS AF=0.493976;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0036175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.793;QD=19.4768;RBI=0.0326301;REFB=0.000963491;REVB=-0.0324289;RO=42;SAF=18;SAR=23;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120374;STB=0.566869;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.00171379;OID=.;OPOS=9422210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:42:41:41:0.493976:23:18:24:18:23:18:24:18 chr3 9425911 . G A 191.34 PASS AF=0.403509;AO=22;DP=56;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00288122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.879;QD=13.4274;RBI=0.00479511;REFB=-0.0145668;REVB=-0.00383297;RO=34;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142326;STB=0.503873;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0219783;OID=.;OPOS=9425911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:34:34:22:23:0.403509:12:10:15:19:13:10:15:19 chr3 9438487 . G A 139.53 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0162496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.586;QD=12.4027;RBI=0.0165019;REFB=-0.00835097;REVB=-0.00287468;RO=27;SAF=13;SAR=3;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255797;STB=0.683952;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0144387;OID=.;OPOS=9438487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:29:16:16:0.355556:3:13:17:10:3:13:17:12 chr3 9540366 . C G 469.77 PASS AF=0.661538;AO=43;DP=65;FAO=43;FDP=65;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.020483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.041;QD=28.9091;RBI=0.0233486;REFB=-0.0114456;REVB=-0.0112074;RO=22;SAF=17;SAR=26;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00892695;STB=0.504852;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00995854;OID=.;OPOS=9540366;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:22:22:43:43:0.661538:26:17:9:13:26:17:9:13 chr3 9768336 . C G 1370.19 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.72;QD=61.5816;RBI=0.0418846;REFB=0;REVB=0.0336986;RO=1;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123057;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282502;OID=.;OPOS=9768336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:89:89:1:0:87:89:1:38:49:0:1:40:49:0:0 chr3 9769008 . A T 121.54 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0241639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.993;QD=15.1919;RBI=0.0970934;REFB=-0.00533357;REVB=-0.0940384;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00685683;OID=.;OPOS=9769008;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:32:16:18:14:14:0.4375:7:7:8:8:7:7:9:9 chr3 9798773 . C G 743.09 PASS AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0034539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.683;QD=59.4474;RBI=0.013507;REFB=-0.153673;REVB=0.0130579;RO=2;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408602;STB=0.52173;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00113742;OID=.;OPOS=9798773;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:22:26:0:2:22:26:0:2 chr3 9882245 . T C 32.9 PASS AF=0.214286;AO=5;DP=27;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0241645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3923;QD=4.69933;RBI=0.0259596;REFB=-0.0338913;REVB=-0.00948555;RO=22;SAF=0;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.664841;STB=0.762911;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.106917;OID=.;OPOS=9882245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:27:28:22:22:5:6:0.214286:5:0:10:12:5:1:10:12 chr3 9908749 . G C 1188.94 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0056167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9523;QD=60.9712;RBI=0.0942349;REFB=0;REVB=0.0940673;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000704783;OID=.;OPOS=9908749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:35:43:0:0:35:43:0:0 chr3 9934605 . T C 429.57 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000703679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.171;QD=57.2761;RBI=0.0468578;REFB=0;REVB=0.0468525;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151959;OID=.;OPOS=9934605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:11:18:0:0:12:18:0:0 chr3 9970031 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00421827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1865;QD=35.5756;RBI=0.00529991;REFB=0;REVB=0.00320861;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.64263e-05;OID=.;OPOS=9970031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr3 9976159 . A C,G 759.99 PASS AF=0.0816327,0.918367;AO=4,44;DP=49;FAO=4,45;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=4,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255789,0.0067645;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=19.2814,89.9354;QD=62.0396;RBI=0.0381256,0.00811324;REFB=0,0;REVB=-0.0282717,-0.00447953;RO=0;SAF=0,24;SAR=4,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.30465e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167535,-0.00215977;OID=.,.;OPOS=9976159,9976159;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:49:49:0:0:4,44:4,45:0.0816327,0.918367:4,20:0,24:0:0:4,20:0,25:0:0 chr3 9991388 . G C 1607.12 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00382681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2251;QD=64.2847;RBI=0.00555336;REFB=0;REVB=-0.00402434;RO=0;SAF=44;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.96277e-05;OID=.;OPOS=9991388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:56:44:0:0:56:44:0:0 chr3 10088266 . G T 104.21 PASS AF=0.21519;AO=15;DP=77;FAO=17;FDP=79;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.00144096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.593;QD=5.27642;RBI=0.0072874;REFB=-7.38429e-05;REVB=0.00714352;RO=62;SAF=8;SAR=7;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202809;STB=0.622837;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.000281809;OID=.;OPOS=10088266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:62:62:15:17:0.21519:7:8:23:39:8:9:23:39 chr3 10088299 . C T 137.61 PASS AF=0.263158;AO=20;DP=75;FAO=20;FDP=76;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00267224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.154;QD=7.24272;RBI=0.0154044;REFB=-0.00449199;REVB=-0.0151709;RO=55;SAF=11;SAR=9;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158691;STB=0.601463;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00962802;OID=.;OPOS=10088299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:55:56:20:20:0.263158:9:11:23:32:9:11:23:33 chr3 10088308 . T C 138.93 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.00588407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.44;QD=7.50967;RBI=0.0107149;REFB=0.00308705;REVB=0.00895473;RO=54;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193015;STB=0.615888;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.0052202;OID=.;OPOS=10088308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:9:11:21:33:9:11:21:33 chr3 10088343 . A G 122.31 PASS AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0262275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.367;QD=8.43532;RBI=0.0266398;REFB=-0.00390398;REVB=-0.00466859;RO=41;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297234;STB=0.677728;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0108468;OID=.;OPOS=10088343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:6:11:16:25:6:11:16:25 chr3 10088404 . C T 46.92 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.029032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.848;QD=7.82037;RBI=0.0401045;REFB=-0.039691;REVB=-0.0276679;RO=16;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529846;STB=0.832408;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0736277;OID=.;OPOS=10088404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:24:24:16:16:8:8:0.333333:1:7:7:9:1:7:7:9 chr3 10089723 . G A 270.85 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0713776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.856;QD=16.9281;RBI=0.0718063;REFB=0.00438816;REVB=-0.00783515;RO=32;SAF=16;SAR=14;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145149;STB=0.564273;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=-0.00452083;OID=.;OPOS=10089723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:34:30:30:0.46875:14:16:12:20:14:16:14:20 chr3 10089738 . A G 265.27 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0660705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1345;QD=17.9843;RBI=0.0669942;REFB=-0.0142241;REVB=0.0110866;RO=30;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107321;STB=0.560052;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0171264;OID=.;OPOS=10089738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:13:16:13:17:13:16:13:17 chr3 10105512 . G A 32.84 PASS AF=0.0849057;AO=9;DP=106;FAO=9;FDP=106;FR=.;FRO=97;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=57;FWDB=0.00382342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5298;QD=1.23919;RBI=0.0230954;REFB=0.000741521;REVB=0.0227767;RO=97;SAF=3;SAR=6;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939026;STB=0.577005;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=-0.00812105;OID=.;OPOS=10105512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:106:106:97:97:9:9:0.0849057:6:3:40:57:6:3:40:57 chr3 10183274 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5269;QD=45.8067;RBI=0.0300759;REFB=0;REVB=0.0147545;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175581;OID=.;OPOS=10183274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr3 10251340 . C G 449.77 PASS AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00297903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.812;QD=24.3121;RBI=0.0102871;REFB=0.0129073;REVB=0.00984627;RO=29;SAF=22;SAR=21;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106105;STB=0.542513;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.00915166;OID=.;OPOS=10251340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:29:31:43:43:0.581081:21:22:19:10:21:22:19:12 chr3 10276163 . T A 786.34 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.813;QD=64.1907;RBI=0.0161502;REFB=0;REVB=0.00629778;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69584e-05;OID=.;OPOS=10276163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:22:25:0:0:23:26:0:0 chr3 10302172 . G A 348.11 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0382688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.531;QD=51.5721;RBI=0.0402068;REFB=-0.166918;REVB=0.0123322;RO=1;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320266;STB=0.517228;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00072436;OID=.;OPOS=10302172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:14:12:0:1:14:12:0:1 chr3 10311939 . C T 1332.26 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00718385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.553;QD=60.5573;RBI=0.0112318;REFB=-0.076035;REVB=0.00863395;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=8.16457e-05;OID=.;OPOS=10311939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:88:88:0:1:86:87:0.988636:43:43:0:0:44:43:0:1 chr3 10312507 . A G 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.844;QD=62.6701;RBI=0.0962095;REFB=0;REVB=-0.0935714;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344746;OID=.;OPOS=10312507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr3 10331457 . G T 313.85 PASS AF=0.406977;AO=34;DP=85;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0668249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.181;QD=14.5975;RBI=0.0668319;REFB=-0.0131912;REVB=-0.000963122;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065686;STB=0.522172;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0199581;OID=.;OPOS=10331457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:50:51:34:35:0.406977:19:15:19:31:20:15:20:31 chr3 10379923 . C T 836.73 PASS AF=0.472527;AO=86;DP=182;FAO=86;FDP=182;FR=.;FRO=96;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=61;FSRR=35;FWDB=-0.00602461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.471;QD=18.3898;RBI=0.0175169;REFB=-0.0363968;REVB=0.0164483;RO=95;SAF=48;SAR=38;SRF=60;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714625;STB=0.541712;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.041883;OID=.;OPOS=10379923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:95:96:86:86:0.472527:38:48:60:35:38:48:61:35 chr3 10420087 . T C 801.29 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00236324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.473;QD=57.235;RBI=0.0191017;REFB=0;REVB=0.018955;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94389e-05;OID=.;OPOS=10420087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:26:29:0:0:26:30:0:0 chr3 10885920 . T C 632.54 PASS AF=0.496124;AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=18;FWDB=-0.0257462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.106;QD=19.6138;RBI=0.0295271;REFB=-0.0124796;REVB=-0.0144562;RO=64;SAF=35;SAR=29;SRF=47;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175385;STB=0.591074;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0124274;OID=.;OPOS=10885920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:64:65:64:64:0.496124:29:35:47:17:29:35:47:18 chr3 10967712 . G A 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00306535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.914;QD=22.3968;RBI=0.0155831;REFB=-0.0140144;REVB=0.0152786;RO=23;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214386;STB=0.61974;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0133345;OID=.;OPOS=10967712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:15:10:15:8:15:10:15:8 chr3 11079070 . C T 841.08 PASS AF=0.528302;AO=84;DP=159;FAO=84;FDP=159;FR=.;FRO=75;FSAF=60;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=0.013954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.73;QD=21.1593;RBI=0.0184417;REFB=-0.017654;REVB=0.0120575;RO=74;SAF=60;SAR=24;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118009;STB=0.562485;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.01859;OID=.;OPOS=11079070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:74:75:84:84:0.528302:24:60:44:30:24:60:45:30 chr3 11302884 . G A 90.3 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0190822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.208;QD=16.4185;RBI=0.0277822;REFB=-0.0199265;REVB=-0.0201921;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783488;STB=0.545372;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0221846;OID=.;OPOS=11302884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:5:6:5:6:5:6:5:6 chr3 11302933 . A G 396.8 PASS AF=0.9375;AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0384632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4822;QD=49.5994;RBI=0.073558;REFB=-0.202633;REVB=0.0627006;RO=2;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581366;STB=0.531229;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0092789;OID=.;OPOS=11302933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:31:32:2:2:29:30:0.9375:15:14:0:2:15:15:0:2 chr3 11303874 . T C 1145.08 PASS AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00722916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.137;QD=57.9785;RBI=0.0145576;REFB=0.0770105;REVB=0.0126358;RO=2;SAF=33;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278173;STB=0.514702;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=6.36086e-05;OID=.;OPOS=11303874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:44:33:2:0:44:33:2:0 chr3 11596348 . C T 108.77 PASS AF=0.262295;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0268557;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.178;QD=7.13224;RBI=0.0354941;REFB=-0.00162206;REVB=-0.0232079;RO=43;SAF=8;SAR=8;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182528;STB=0.590055;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00350956;OID=.;OPOS=11596348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:43:45:16:16:0.262295:8:8:15:28:8:8:17:28 chr3 11606490 . G A 53.69 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0391788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5193;QD=7.95433;RBI=0.0455908;REFB=-0.00497669;REVB=-0.0233141;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062059;STB=0.538369;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0370572;OID=.;OPOS=11606490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:6:2:4:15:6:2:4:15 chr3 11643465 . T C 669.81 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.1;QD=62.3077;RBI=0.0676926;REFB=0;REVB=0.0657152;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013349;OID=.;OPOS=11643465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr3 11848923 . CCACT C 118.23 PASS AF=0.416667;AO=19;DP=47;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0164453;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=292.385;QD=9.85266;RBI=0.0244365;REFB=-0.0186703;REVB=-0.0180747;RO=28;SAF=6;SAR=13;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.302174;SSSB=0.178742;STB=0.617543;STBP=0.254;TYPE=del;VARB=0.0290587;OID=.;OPOS=11848924;OREF=CACT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.416667:19:47:20:48:28:7:13:5:23:99:28:6:13:5:23 chr3 11880760 . T C 462.07 PASS AF=0.72;AO=36;DP=50;FAO=36;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0334071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.788;QD=36.9653;RBI=0.0341527;REFB=0.00121508;REVB=-0.00709735;RO=14;SAF=17;SAR=19;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172856;STB=0.593419;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.000505452;OID=.;OPOS=11880760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:14:14:36:36:0.72:19:17:2:12:19:17:2:12 chr3 11994492 . C CT 167.81 PASS AF=1;AO=3;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110784;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=256.118;QD=35.329;RBI=0.111896;REFB=0;REVB=0.0157374;RO=16;SAF=0;SAR=3;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.687676;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00121721;OID=.;OPOS=11994493;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:19:19:19:0:11:8:0:0:3:16:0:3:11:5 chr3 11994493 . C T 173.14 PASS AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0289424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.698;QD=36.4506;RBI=0.0523372;REFB=0.0162592;REVB=0.0436064;RO=3;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208877;STB=0.615235;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-1.00155e-05;OID=.;OPOS=11994493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:19:19:3:3:16:16:0.842105:5:11:0:3:5:11:0:3 chr3 12046076 . T C 101.07 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.001;QD=40.4281;RBI=0.0274735;REFB=0;REVB=0.0264753;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214471;OID=.;OPOS=12046076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:8:1:0:0:9:1:0:0 chr3 12229015 . A G 181.89 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=26;FWDB=-0.035571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7974;QD=13.9912;RBI=0.036844;REFB=-0.0170182;REVB=0.00960135;RO=30;SAF=3;SAR=18;SRF=4;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020295;STB=0.521718;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0330955;OID=.;OPOS=12229015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:18:3:4:26:18:3:5:26 chr3 12232074 . A G 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.746;QD=59.3229;RBI=0.0233524;REFB=0;REVB=-0.00611536;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.89249e-05;OID=.;OPOS=12232074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0 chr3 12552628 . A C 162.85 PASS AF=0.384615;AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=2;FWDB=0.00525248;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.778;QD=12.5268;RBI=0.010778;REFB=-0.0160038;REVB=0.0094115;RO=34;SAF=9;SAR=10;SRF=32;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.522887;STB=0.769039;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0244083;OID=.;OPOS=12552628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:34:32:19:20:0.384615:10:9:32:2:10:10:30:2 chr3 12613646 . GCCCCGA GCCCGAC 42.1 PASS AF=0.205128;AO=5;DP=44;FAO=8;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0277903;FXX=0.0714116;HRUN=4;LEN=3;MLLD=67.1787;QD=4.31822;RBI=0.0317066;REFB=-0.0313789;REVB=0.0152646;RO=26;SAF=4;SAR=1;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46703;STB=0.890803;STBP=0.024;TYPE=mnp;VARB=0.201972;OID=.;OPOS=12613650;OREF=CGA;OALT=GAC;OMAPALT=GCCCGAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.205128:5:44:8:39:29:7:1:10:19:31:26:4:1:10:16 chr3 12613866 . T C 244.11 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0260842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.635;QD=18.7775;RBI=0.0284069;REFB=-0.0022739;REVB=-0.0112504;RO=26;SAF=7;SAR=19;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158916;STB=0.589582;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00235065;OID=.;OPOS=12613866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:19:7:11:15:19:7:11:15 chr3 12838293 . G C 268.36 PASS AF=0.454545;AO=28;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0597412;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.205;QD=16.264;RBI=0.0608604;REFB=-0.034002;REVB=-0.0116184;RO=33;SAF=15;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197961;STB=0.536635;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0317796;OID=.;OPOS=12838293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:33:36:28:30:0.454545:13:15:17:16:13:17:18:18 chr3 12851445 . T C 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00435921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.707;QD=20.7383;RBI=0.0229718;REFB=-0.000937663;REVB=0.0225544;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122168;STB=0.506889;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.000780508;OID=.;OPOS=12851445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:11:7:6:10:11:7:6:10 chr3 12858028 . T C 754.69 PASS AF=0.545455;AO=72;DP=132;FAO=72;FDP=132;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00322346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.088;QD=22.8695;RBI=0.00322532;REFB=-0.0102043;REVB=-0.000109255;RO=60;SAF=32;SAR=40;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060268;STB=0.532986;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0086738;OID=.;OPOS=12858028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:60:60:72:72:0.545455:40:32:31:29:40:32:31:29 chr3 12861586 . T C 206.59 PASS AF=0.45283;AO=23;DP=52;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00997923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2209;QD=15.5913;RBI=0.0766585;REFB=-0.0358975;REVB=0.0760062;RO=29;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172952;STB=0.584837;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0637196;OID=.;OPOS=12861586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:29:29:23:24:0.45283:12:11:19:10:12:12:19:10 chr3 12861608 . G A 307.06 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00898018;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5288;QD=20.4708;RBI=0.00994329;REFB=-0.0192366;REVB=-0.00426913;RO=27;SAF=18;SAR=14;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886022;STB=0.538438;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0145053;OID=.;OPOS=12861608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:14:18:18:9:14:18:18:10 chr3 12875443 . G A 785.85 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.305;QD=64.1511;RBI=0.0436566;REFB=0;REVB=-0.00424518;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119495;OID=.;OPOS=12875443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0 chr3 12877704 . G A 62.08 PASS AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0114124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.041;QD=7.52492;RBI=0.0129786;REFB=-0.0319395;REVB=-0.00618068;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18698;STB=0.615148;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0737325;OID=.;OPOS=12877704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:5:4:7:17:5:4:7:17 chr3 13358204 . G A 985.52 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0809763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9273;QD=58.8372;RBI=0.12411;REFB=0;REVB=0.0940539;RO=0;SAF=48;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99443e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000881724;OID=.;OPOS=13358204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:18:48:0:0:18:49:0:0 chr3 13361287 . C T 1199.69 PASS AF=0.931818;AO=82;DP=88;FAO=82;FDP=88;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0126415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.367;QD=54.5312;RBI=0.0533508;REFB=-0.0685629;REVB=0.0518315;RO=4;SAF=42;SAR=40;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00107332;STB=0.512192;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00290696;OID=.;OPOS=13361287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:88:88:4:6:82:82:0.931818:40:42:2:2:40:42:2:4 chr3 13361391 . A G 1607.03 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.462;QD=60.0759;RBI=0.0305658;REFB=0;REVB=0.0247226;RO=0;SAF=50;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67725e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04397e-05;OID=.;OPOS=13361391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:57:50:0:0:57:50:0:0 chr3 13364876 . G T 1574.86 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5511;QD=59.4287;RBI=0.187307;REFB=0;REVB=0.178555;RO=1;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939493;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147014;OID=.;OPOS=13364876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:106:1:0:102:106:1:50:52:0:1:54:52:0:0 chr3 13367406 . C T 1492.27 PASS AF=0.980769;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00498384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.911;QD=57.3949;RBI=0.0337601;REFB=-0.125159;REVB=0.0333902;RO=1;SAF=43;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109059;STB=0.501545;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.000335301;OID=.;OPOS=13367406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:104:104:1:2:102:102:0.980769:59:43:1:0:59:43:1:1 chr3 13612020 . T C 155.38 PASS AF=0.268293;AO=22;DP=82;FAO=22;FDP=82;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0589001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9926;QD=7.57962;RBI=0.0671659;REFB=-0.0124172;REVB=-0.0322808;RO=59;SAF=15;SAR=7;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116533;STB=0.57824;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0355541;OID=.;OPOS=13612020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:59:60:22:22:0.268293:7:15:35:24:7:15:35:25 chr3 13612296 . C T 99.97 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00442987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9631;QD=15.38;RBI=0.018546;REFB=-0.00301108;REVB=-0.0180091;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00327351;OID=.;OPOS=13612296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:14:12:12:0.461538:6:6:7:6:6:6:7:7 chr3 13612936 . A G 226.76 PASS AF=0.409091;AO=26;DP=65;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0278523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.271;QD=13.7433;RBI=0.0288032;REFB=-0.0330187;REVB=-0.0073398;RO=39;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188773;STB=0.592524;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.037139;OID=.;OPOS=13612936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:39:39:26:27:0.409091:10:16:17:22:11:16:17:22 chr3 13670481 . A G 670.12 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9175;QD=62.3365;RBI=0.0440437;REFB=0;REVB=0.0423517;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684908;OID=.;OPOS=13670481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:26:17:0:0 chr3 13670536 . A G 420.5 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0793549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8709;QD=56.066;RBI=0.0794193;REFB=0;REVB=-0.00319873;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133614;OID=.;OPOS=13670536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:17:11:0:0:17:13:0:0 chr3 13670776 . T C 372.89 PASS AF=0.964286;AO=20;DP=30;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0272861;FXX=0.0666445;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.141;QD=53.2693;RBI=0.0346411;REFB=0.0627285;REVB=0.0213419;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.511103;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.000519829;OID=.;OPOS=13670776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:30:28:0:1:20:27:0.964286:19:1:0:0:22:5:0:1 chr3 13679203 . G A 216.58 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0116868;FXX=0.0289813;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.922;QD=12.9302;RBI=0.0132979;REFB=-0.0232737;REVB=-0.00634448;RO=39;SAF=11;SAR=15;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698438;STB=0.520694;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0270368;OID=.;OPOS=13679203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:39:41:26:26:0.38806:15:11:14:25:15:11:16:25 chr3 13679335 . C T 269.52 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0194238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.295;QD=18.9137;RBI=0.019757;REFB=-0.0212999;REVB=-0.0036134;RO=27;SAF=10;SAR=19;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218663;STB=0.630905;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0228059;OID=.;OPOS=13679335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:28:29:29:0.508772:19:10:16:11:19:10:17:11 chr3 13679688 . T A 413.61 PASS AF=0.427273;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00657904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.817;QD=15.0404;RBI=0.0129992;REFB=-0.016149;REVB=-0.0112115;RO=63;SAF=32;SAR=15;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170696;STB=0.596231;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0299582;OID=.;OPOS=13679688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:63:63:47:47:0.427273:15:32:33:30:15:32:33:30 chr3 13679695 . C A 434.65 PASS AF=0.429825;AO=48;DP=113;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.0152044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3053;QD=15.2509;RBI=0.0228448;REFB=0.0116958;REVB=0.0170503;RO=65;SAF=33;SAR=15;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180155;STB=0.591269;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.0148422;OID=.;OPOS=13679695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:65:65:48:49:0.429825:15:33:34:31:16:33:34:31 chr3 13679708 . C A 437.85 PASS AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.00428743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8685;QD=15.6375;RBI=0.0187746;REFB=0.0108722;REVB=0.0182785;RO=63;SAF=33;SAR=16;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159636;STB=0.589706;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=-0.0144407;OID=.;OPOS=13679708;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:16:33:33:30:16:33:33:30 chr3 13689455 . T G 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.0572678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1502;QD=12.143;RBI=0.0968536;REFB=-0.0079172;REVB=0.078109;RO=33;SAF=8;SAR=11;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294129;STB=0.669774;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00953855;OID=.;OPOS=13689455;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:11:8:23:10:11:8:23:10 chr3 13695587 . C T 460.16 PASS AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.00669569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.401;QD=18.5922;RBI=0.0101437;REFB=-0.0104048;REVB=0.00761992;RO=53;SAF=19;SAR=27;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167058;STB=0.50931;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0110751;OID=.;OPOS=13695587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:53:53:46:46:0.464646:27:19:21:32:27:19:21:32 chr3 13833957 . C T 724.96 PASS AF=0.507143;AO=69;DP=138;FAO=71;FDP=140;FR=.;FRO=69;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0735222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8354;QD=20.713;RBI=0.073933;REFB=-0.00244072;REVB=-0.00778382;RO=69;SAF=35;SAR=34;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394702;STB=0.514628;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.00283789;OID=.;OPOS=13833957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:69:69:69:71:0.507143:34:35:38:31:34:37:38:31 chr3 13896140 . A G 411.45 PASS AF=0.355072;AO=48;DP=138;FAO=49;FDP=138;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=55;FWDB=-0.0211076;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.752;QD=11.9261;RBI=0.0212816;REFB=-0.0145618;REVB=-0.0027165;RO=89;SAF=23;SAR=25;SRF=33;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12415;STB=0.556928;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0237851;OID=.;OPOS=13896140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:89:89:48:49:0.355072:25:23:33:56:26:23:34:55 chr3 13896284 . C T 856.94 PASS AF=0.453202;AO=92;DP=203;FAO=92;FDP=203;FR=.;FRO=111;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=0.0117386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.959;QD=16.8856;RBI=0.0208535;REFB=-0.00871738;REVB=0.0172358;RO=110;SAF=38;SAR=54;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954323;STB=0.555543;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0120406;OID=.;OPOS=13896284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:110:111:92:92:0.453202:54:38:56:54:54:38:57:54 chr3 14123156 . T C 601.15 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209828;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.225;QD=58.6486;RBI=0.0314671;REFB=0.017051;REVB=0.02345;RO=1;SAF=28;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164593;STB=0.508768;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=9.2495e-06;OID=.;OPOS=14123156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:12:28:1:0:12:28:1:0 chr3 14175262 . T C 727.6 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00244642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.71;QD=63.2691;RBI=0.0333893;REFB=0;REVB=0.0332995;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22109e-05;OID=.;OPOS=14175262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr3 14187449 . G T 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.391;QD=58.4196;RBI=0.0418914;REFB=0;REVB=0.0300962;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78311e-05;OID=.;OPOS=14187449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0 chr3 14197987 . A T 391.83 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.681;QD=55.9756;RBI=0.0502914;REFB=0;REVB=0.0228432;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138398;OID=.;OPOS=14197987;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:18:8:0:0:18:10:0:0 chr3 14220023 . G C 920.07 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5041;QD=58.4174;RBI=0.0236452;REFB=0;REVB=-0.00441235;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171498;OID=.;OPOS=14220023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0 chr3 14436184 . GT G 1038.55 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321482;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.257;QD=59.346;RBI=0.0417695;REFB=0;REVB=0.026668;RO=0;SAF=43;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000561065;OID=.;OPOS=14436185;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:67:67:70:70:0:45:25:0:0:6:0:43:24:0:0 chr3 14485484 . C A 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.000604772;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=240.98;QD=12.8607;RBI=0.0154282;REFB=-0.0204413;REVB=-0.0154163;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161108;STB=0.615099;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0256852;OID=.;OPOS=14485484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:5:2:1:6:5:2:1:7 chr3 14551444 . A G 473.38 PASS AF=0.5625;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0124299;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.162;QD=23.669;RBI=0.016944;REFB=-0.0206069;REVB=-0.011515;RO=35;SAF=23;SAR=22;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133838;STB=0.573375;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0137881;OID=.;OPOS=14551444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:35:35:45:45:0.5625:22:23:12:23:22:23:12:23 chr3 14552994 . A G 239.58 PASS AF=0.657143;AO=17;DP=29;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0205245;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.4501;QD=27.3806;RBI=0.0385236;REFB=-0.0491806;REVB=0.0326009;RO=8;SAF=11;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013827;STB=0.538428;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0201598;OID=.;OPOS=14552994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:29:35:8:12:17:23:0.657143:6:11:5:3:9:14:6:6 chr3 14555216 . T C 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.0105083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7589;QD=11.9168;RBI=0.0269482;REFB=-0.00277803;REVB=-0.024815;RO=37;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176252;STB=0.601179;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00652233;OID=.;OPOS=14555216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:12:10:11:26:12:10:11:26 chr3 14555811 . A G 99.97 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0287148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.921;QD=15.3797;RBI=0.0381416;REFB=-0.0529121;REVB=-0.0251046;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268155;STB=0.653614;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0454838;OID=.;OPOS=14555811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:3:11:6:6:3:11 chr3 14561627 . A AG 509.5 PASS AF=1;AO=44;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.6122;QD=41.592;RBI=0.236956;REFB=0;REVB=0.0293382;RO=5;SAF=25;SAR=19;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00619697;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00698289;OID=.;OPOS=14561628;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:44:49:49:49:0:28:21:0:0:10:5:25:19:3:2 chr3 14563258 . A G 133.45 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0238193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8018;QD=15.7005;RBI=0.0245706;REFB=-0.00670437;REVB=0.00602942;RO=19;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288517;STB=0.666444;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0079813;OID=.;OPOS=14563258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:10:5:12:7:10:5:12:7 chr3 14572497 . G A 191.05 PASS AF=0.403509;AO=22;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.000600621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.136;QD=13.4066;RBI=0.0288798;REFB=-0.0365562;REVB=-0.0288736;RO=34;SAF=14;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147695;STB=0.566038;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.046029;OID=.;OPOS=14572497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:22:23:0.403509:8:14:17:17:9:14:17:17 chr3 14745857 . G A 124.83 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0165678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.274;QD=17.8327;RBI=0.0238898;REFB=-0.0278308;REVB=-0.0172113;RO=14;SAF=9;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190444;STB=0.609216;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0162307;OID=.;OPOS=14745857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:5:9:6:8:5:9:6:8 chr3 14755572 . A G 486.02 PASS AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0119956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.311;QD=24.0012;RBI=0.0138532;REFB=-0.0043551;REVB=0.00692946;RO=35;SAF=26;SAR=20;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745277;STB=0.540821;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00300444;OID=.;OPOS=14755572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:20:26:23:12:20:26:23:12 chr3 14755617 . C G 305.19 PASS AF=0.532258;AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0639998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.417;QD=19.6896;RBI=0.0641778;REFB=-0.00725638;REVB=-0.00477666;RO=30;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631941;STB=0.521639;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00730636;OID=.;OPOS=14755617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:29:32:33:0.532258:14:18:19:11:14:19:18:11 chr3 14768534 . A G 281.51 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0235956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.08;QD=21.2461;RBI=0.038476;REFB=-0.033339;REVB=-0.0303917;RO=23;SAF=18;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184538;STB=0.593602;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0263337;OID=.;OPOS=14768534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:23:24:29:29:0.54717:11:18:9:14:11:18:10:14 chr3 14798976 . G A 812.01 PASS AF=0.442786;AO=87;DP=199;FAO=89;FDP=201;FR=.;FRO=112;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=39;FSRR=73;FWDB=-0.00099935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.435;QD=16.1594;RBI=0.00940293;REFB=-0.0104091;REVB=0.00934967;RO=112;SAF=37;SAR=50;SRF=39;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809463;STB=0.551558;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0150541;OID=.;OPOS=14798976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:201:112:112:87:89:0.442786:50:37:39:73:50:39:39:73 chr3 14801487 . G A 601.05 PASS AF=0.540541;AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0108552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.283;QD=21.6593;RBI=0.0162098;REFB=-0.0387383;REVB=-0.0120384;RO=51;SAF=29;SAR=31;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076697;STB=0.542042;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0306293;OID=.;OPOS=14801487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:60:60:0.540541:31:29:20:31:31:29:20:31 chr3 14861752 . GCT CGT,GCGT,GC,GGC 507.31 PASS AF=0.142857,0,0.836735,0;AO=2,6,5,3;DP=49;FAO=7,0,41,0;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=7,0,12,0;FSAR=0,0,29,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.024547,-0.0618511,0.24192,0.0651127;FXX=0;HRUN=5,0,3,1;LEN=2,1,1,2;MLLD=56.0134,42.5648,15.4483,10.9546;QD=41.4135;RBI=0.0464775,0.100751,0.835128,0.442138;REFB=-0.0866497,-0.0249582,-0.00714939,0.057533;REVB=-0.0394665,-0.0795317,0.799321,0.437317;RO=32;SAF=2,6,4,3;SAR=0,0,1,0;SRF=4;SRR=28;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.708625,0.819199,0.696907,0.759369;STB=0.5,0.5,0.51999,0.5;STBP=1,1,0.181,1;TYPE=mnp,ins,del,mnp;VARB=0.24261,0.122912,0.0586732,0.0212912;OID=.,.,.,.;OPOS=14861752,14861754,14861754,14861753;OREF=GC,-,T,CT;OALT=CG,G,-,GC;OMAPALT=CGT,GCGT,GC,GGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:19:49:49:32:1:2,6,5,3:7,0,41,0:0.142857,0,0.836735,0:0,0,1,0:2,6,4,3:4:28:0,0,29,0:7,0,12,0:1:0 chr3 14939088 . GA AT 216.44 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=0.0228986;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=2;MLLD=176.093;QD=13.1175;RBI=0.0239806;REFB=-0.0119453;REVB=-0.00712212;RO=40;SAF=17;SAR=9;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386025;STB=0.719219;STBP=0.01;TYPE=mnp;VARB=0.0113989;OID=.;OPOS=14939088;OREF=GA;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:40:40:26:26:0.393939:9:17:11:29:9:17:11:29 chr3 14939479 . G T 364.22 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0422501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4163;QD=21.1142;RBI=0.0452251;REFB=-0.0124554;REVB=0.0161319;RO=32;SAF=27;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133957;STB=0.574426;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0116151;OID=.;OPOS=14939479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:10:27:19:13:10:27:19:13 chr3 15084879 . ATA AAA,AA,AT 366.48 PASS AF=0,0.553191,0.319149;AO=19,13,12;DP=70;FAO=0,26,15;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=0,13,5;FSAR=0,13,10;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0203259,-0.018555,0.142656;FXX=0;HRUN=1,1,6;LEN=1,1,1;MLLD=188.145,189.156,9.06554;QD=31.1896;RBI=0.0855565,0.0945797,0.217749;REFB=-0.00193901,-0.00263096,0.0211931;REVB=0.083107,0.0927418,-0.164512;RO=22;SAF=18,4,2;SAR=1,9,10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.620522,-0.260252,-0.457925;STB=0.5,0.531226,0.599863;STBP=1,0.473,0.208;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0326586,-0.00225615,0.243971;OID=.,.,.;OPOS=15084880,15084880,15084881;OREF=T,T,A;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.553191,0.319149:19,13,12:70:0,26,15:47:6:0,13,5:0,13,10:4:2:81:22:18,4,2:1,9,10:12:10 chr3 15113519 . C T 294.2 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00546184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.702;QD=17.5641;RBI=0.00880705;REFB=-0.0148729;REVB=-0.00690887;RO=35;SAF=17;SAR=15;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108763;STB=0.506088;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0172289;OID=.;OPOS=15113519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:15:17:19:16:15:17:19:16 chr3 15115478 . C T 245.21 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00887133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.398;QD=15.5687;RBI=0.00985909;REFB=-0.022872;REVB=-0.00430131;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106117;STB=0.568578;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0250678;OID=.;OPOS=15115478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:11:17:17:17:11:17:17:18 chr3 15115723 . T C 611.84 PASS AF=0.578947;AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00944243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4638;QD=25.7615;RBI=0.0136459;REFB=0.000487067;REVB=0.00985146;RO=40;SAF=30;SAR=25;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425672;STB=0.523247;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.000311963;OID=.;OPOS=15115723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:40:40:55:55:0.578947:25:30:24:16:25:30:24:16 chr3 15115872 . A G 257.73 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0838294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8517;QD=19.8253;RBI=0.140685;REFB=-0.0012309;REVB=-0.112982;RO=22;SAF=20;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257436;STB=0.640914;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00346698;OID=.;OPOS=15115872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:22:25:27:27:0.519231:7:20:10:12:7:20:12:13 chr3 15117125 . G A 193.32 PASS AF=0.433962;AO=22;DP=52;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0354888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.603;QD=14.5903;RBI=0.0381934;REFB=-0.0271995;REVB=-0.0141167;RO=28;SAF=6;SAR=16;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583119;STB=0.540302;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0467615;OID=.;OPOS=15117125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:28:30:22:23:0.433962:16:6:9:19:16:7:11:19 chr3 15216429 . C T 1917.64 PASS AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00576976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6181;QD=60.8776;RBI=0.0391183;REFB=-0.063616;REVB=-0.0386904;RO=0;SAF=71;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.48324e-08;STB=0.504586;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000325856;OID=.;OPOS=15216429;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:126:126:0:1:125:125:0.992063:54:71:0:0:54:71:0:1 chr3 15216703 . A T 1069.67 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.14;QD=59.4261;RBI=0.0169428;REFB=0;REVB=0.0127967;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284532;OID=.;OPOS=15216703;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:44:27:0:0:45:27:0:0 chr3 15476011 . C G 207.7 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0409456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.5957;QD=13.3999;RBI=0.0409612;REFB=-0.0086634;REVB=-0.00112858;RO=36;SAF=8;SAR=17;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167379;STB=0.605392;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0600633;OID=.;OPOS=15476011;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:37:25:25:0.403226:17:8:17:19:17:8:18:19 chr3 15509327 . C G 606.41 PASS AF=0.550459;AO=60;DP=110;FAO=60;FDP=109;FR=.;FRO=49;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00135664;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.524;QD=22.2537;RBI=0.0013586;REFB=-0.0192816;REVB=7.29928e-05;RO=49;SAF=39;SAR=21;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155493;STB=0.508523;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.016871;OID=.;OPOS=15509327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:49:49:60:60:0.550459:21:39:31:18:21:39:31:18 chr3 15548131 . A G 253.74 PASS AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0231377;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.551;QD=28.1931;RBI=0.0233593;REFB=-0.00605841;REVB=-0.0032098;RO=13;SAF=11;SAR=12;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894256;STB=0.549355;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00316711;OID=.;OPOS=15548131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:12:11:8:5:12:11:8:5 chr3 15610070 . C T 351.16 PASS AF=0.413043;AO=39;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0150781;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.929;QD=15.2679;RBI=0.0404279;REFB=-0.0110108;REVB=-0.0375109;RO=52;SAF=17;SAR=22;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00660307;STB=0.514011;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0128015;OID=.;OPOS=15610070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:54:39:38:0.413043:22:17:23:29:22:16:24:30 chr3 15643043 . A G 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.359;QD=64.1524;RBI=0.0559833;REFB=0;REVB=0.0123095;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150741;OID=.;OPOS=15643043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr3 15737689 . G A 218.06 PASS AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00519072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.073;QD=11.477;RBI=0.0116986;REFB=0.00431064;REVB=0.0104839;RO=49;SAF=13;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00926837;STB=0.505362;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00381781;OID=.;OPOS=15737689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:14:13:24:25:14:13:24:25 chr3 15737698 . T C 172.63 PASS AF=0.319444;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0518445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8184;QD=9.59032;RBI=0.0520192;REFB=-0.0134101;REVB=-0.00426002;RO=48;SAF=12;SAR=11;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489508;STB=0.52172;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0272001;OID=.;OPOS=15737698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:48:49:23:23:0.319444:11:12:23:25:11:12:24:25 chr3 15753641 . A G 115.95 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0341125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0677;QD=11.0427;RBI=0.0406675;REFB=0.011581;REVB=0.02214;RO=26;SAF=7;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126888;STB=0.571329;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0247129;OID=.;OPOS=15753641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:28:14:14:0.333333:7:7:16:10:7:7:17:11 chr3 16261420 . C T 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0149305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.734;QD=14.2704;RBI=0.0152527;REFB=-0.0078641;REVB=0.00311838;RO=33;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305874;STB=0.674274;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00970694;OID=.;OPOS=16261420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:8:16:12:21:8:16:12:21 chr3 16305674 . C G 871.97 PASS AF=1;AO=57;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117603;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4341;QD=58.131;RBI=0.117836;REFB=0;REVB=0.00741171;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00068915;OID=.;OPOS=16305674;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:57:60:1:30:27:0:0:31:29:0:0 chr3 16312564 . C T 1320.24 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.142;QD=62.1288;RBI=0.0317967;REFB=0;REVB=0.0189748;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72461e-05;OID=.;OPOS=16312564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr3 16327855 . T G 1804.11 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.492;QD=61.1564;RBI=0.024068;REFB=0;REVB=0.00442561;RO=0;SAF=61;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76023e-05;OID=.;OPOS=16327855;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:57:61:0:0:57:61:0:0 chr3 16646745 . C G 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4074;QD=55.0953;RBI=0.0347722;REFB=0;REVB=0.0263889;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77036e-05;OID=.;OPOS=16646745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr3 17741409 . C G 885.29 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8043;QD=58.0517;RBI=0.0440533;REFB=0;REVB=0.028747;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225204;OID=.;OPOS=17741409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr3 18055231 . A C 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.046;QD=62.7621;RBI=0.0334148;REFB=0;REVB=0.0148141;RO=0;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.78155e-05;OID=.;OPOS=18055231;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:39:50:0:0:39:50:0:0 chr3 18427924 . G T 2783.27 PASS AF=0.907407;AO=194;DP=215;FAO=196;FDP=216;FR=.;FRO=20;FSAF=104;FSAR=92;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.00737093;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=216.661;QD=51.5421;RBI=0.0166652;REFB=-0.0177652;REVB=0.0149465;RO=18;SAF=102;SAR=92;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310365;STB=0.521375;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.000187871;OID=.;OPOS=18427924;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:215:216:18:20:194:196:0.907407:92:102:6:12:92:104:6:14 chr3 19930130 . A T 448.59 PASS AF=0.523256;AO=43;DP=85;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0141483;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.465;QD=20.8644;RBI=0.0189099;REFB=-0.029147;REVB=-0.0125463;RO=41;SAF=16;SAR=27;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396318;STB=0.507243;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.024968;OID=.;OPOS=19930130;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:41:41:43:45:0.523256:27:16:17:24:27:18:17:24 chr3 19959756 . G A 428.47 PASS AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00320552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.876;QD=22.2582;RBI=0.00362682;REFB=-0.00440912;REVB=-0.00169661;RO=35;SAF=14;SAR=28;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853795;STB=0.547147;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0042023;OID=.;OPOS=19959756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:35:35:42:42:0.545455:28:14:15:20:28:14:15:20 chr3 19961330 . C T 162.56 PASS AF=0.35;AO=20;DP=59;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00283553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.854;QD=10.8375;RBI=0.0148268;REFB=-0.00691156;REVB=0.0145531;RO=39;SAF=13;SAR=7;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072444;STB=0.554164;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00987578;OID=.;OPOS=19961330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:39:39:20:21:0.35:7:13:23:16:7:14:23:16 chr3 19962044 . G A 348.84 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=0.0148938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.012;QD=17.6627;RBI=0.0351779;REFB=0.0361094;REVB=-0.0318694;RO=42;SAF=20;SAR=17;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193566;STB=0.607514;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-0.0292356;OID=.;OPOS=19962044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:17:20:31:11:17:20:31:11 chr3 19975215 . C A 349.84 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0115215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.462;QD=17.7136;RBI=0.031368;REFB=-0.0201257;REVB=0.0291755;RO=41;SAF=25;SAR=12;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182468;STB=0.51962;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.017965;OID=.;OPOS=19975215;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:42:37:37:0.468354:12:25:27:14:12:25:27:15 chr3 19992432 . G T 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=359.28;QD=59.8559;RBI=0.0219614;REFB=0;REVB=0.0146854;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.02346e-06;OID=.;OPOS=19992432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0 chr3 20042834 . C T 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000678439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8413;QD=62.9815;RBI=0.0318214;REFB=0;REVB=-0.0318142;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000332959;OID=.;OPOS=20042834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr3 20053581 . C T 955.08 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2239;QD=58.7743;RBI=0.0132256;REFB=0;REVB=0.00359607;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.02032e-05;OID=.;OPOS=20053581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0 chr3 20113830 . G A 1438.1 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00977552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0024;QD=61.8536;RBI=0.0527924;REFB=0.129999;REVB=0.0518794;RO=1;SAF=45;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104184;STB=0.505493;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.00155521;OID=.;OPOS=20113830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:47:45:1:0:47:45:1:0 chr3 20141356 . C T 321.5 PASS AF=0.559322;AO=32;DP=58;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0140845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.648;QD=21.7965;RBI=0.0160732;REFB=-0.00799224;REVB=0.00774423;RO=26;SAF=15;SAR=17;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164701;STB=0.583548;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00517325;OID=.;OPOS=20141356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:26:26:32:33:0.559322:17:15:7:19:18:15:7:19 chr3 20216519 . T A 262.02 PASS AF=0.531915;AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0982894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.211;QD=22.2995;RBI=0.0982958;REFB=0.00612934;REVB=0.00112312;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509362;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00353443;OID=.;OPOS=20216519;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:24:25:0.531915:12:12:11:11:12:13:11:11 chr3 20234299 . G A 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0223974;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=307.639;QD=16.7316;RBI=0.0256766;REFB=0.00509358;REVB=0.0125557;RO=36;SAF=15;SAR=16;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111519;STB=0.506264;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00523053;OID=.;OPOS=20234299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:16:15:17:19:16:15:17:19 chr3 21462754 . A G 1677.37 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00500836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.781;QD=60.4458;RBI=0.0583699;REFB=0;REVB=0.0581547;RO=0;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106578;OID=.;OPOS=21462754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:42:69:0:0:42:69:0:0 chr3 21462787 . G A 1767.57 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.866;QD=60.9508;RBI=0.0485814;REFB=0;REVB=0.0444386;RO=0;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128244;OID=.;OPOS=21462787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:51:65:0:0:51:65:0:0 chr3 23312442 . C G 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0411791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.151;QD=13.7842;RBI=0.0416879;REFB=-0.00765531;REVB=0.00649389;RO=33;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162212;STB=0.592514;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0113002;OID=.;OPOS=23312442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:11:12:12:21:11:12:12:21 chr3 24006477 . T A 659.77 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00356122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8361;QD=59.9789;RBI=0.0347885;REFB=-0.0640279;REVB=-0.0346058;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218371;STB=0.511622;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00130394;OID=.;OPOS=24006477;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:44:44:1:1:43:43:0.977273:21:22:0:1:21:22:0:1 chr3 25393837 . T C 109.92 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00474356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.022;QD=14.6565;RBI=0.0560285;REFB=-0.0399277;REVB=-0.0558273;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957353;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0423563;OID=.;OPOS=25393837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:6:7:7:9:6:7:8:9 chr3 25393860 . A G 168.69 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.000989658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.498;QD=16.0652;RBI=0.0157298;REFB=-0.0113902;REVB=0.0156987;RO=24;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590993;STB=0.533861;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0261473;OID=.;OPOS=25393860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:11:7:8:16:11:7:8:16 chr3 25638912 . AAAT A,AA,AAAA 141.88 PASS AF=0.653846,0,0;AO=6,4,4;DP=35;FAO=17,0,0;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=14,0,0;FSAR=3,0,0;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.108181,-0.0443956,0.357705;FXX=0.103413;HRUN=8,8,7;LEN=3,2,1;MLLD=20.937,13.7247,11.0231;QD=21.8279;RBI=0.147234,0.115241,0.404752;REFB=-0.0908568,-0.131296,0.0485986;REVB=0.0998731,0.106346,-0.189396;RO=16;SAF=5,2,0;SAR=1,2,4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.467764,0.0707954,-0.648636;STB=0.674465,0.5,0.5;STBP=0.034,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0717766,-0.0083472,0;OID=.,.,.;OPOS=25638913,25638914,25638915;OREF=AAT,AT,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.653846,0,0:6,4,4:35:17,0,0:26:9:14,0,0:3,0,0:4:5:53:16:5,2,0:1,2,4:7:9 chr3 25679738 . T C 195.78 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000130691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.594;QD=17.798;RBI=0.0137614;REFB=-0.00508871;REVB=0.0137608;RO=23;SAF=13;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848779;STB=0.562436;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0109346;OID=.;OPOS=25679738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:24:20:20:0.454545:7:13:13:10:7:13:13:11 chr3 27424718 . A G 1396.65 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9799;QD=62.7707;RBI=0.0438607;REFB=0;REVB=0.0272946;RO=0;SAF=36;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57365e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369697;OID=.;OPOS=27424718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:52:36:0:0:52:37:0:0 chr3 28520417 . T A 2492.87 PASS AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00280119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.192;QD=61.5523;RBI=0.00399286;REFB=0;REVB=-0.00284539;RO=0;SAF=78;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.76497e-06;OID=.;OPOS=28520417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:84:78:0:0:84:78:0:0 chr3 28533658 . G A 90.2 PASS AF=0.458333;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0177114;FXX=0.11107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.35;QD=15.0326;RBI=0.0205673;REFB=-0.0058018;REVB=0.0104556;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644098;STB=0.581253;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00753482;OID=.;OPOS=28533658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:26:24:16:13:10:11:0.458333:5:5:7:9:6:5:4:9 chr3 29628639 . C T 440.33 PASS AF=0.461538;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0222045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3181;QD=16.9357;RBI=0.0358039;REFB=0.0170496;REVB=-0.028087;RO=56;SAF=19;SAR=29;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153421;STB=0.585586;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.0184868;OID=.;OPOS=29628639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:56:48:48:0.461538:29:19:31:25:29:19:31:25 chr3 29804487 . A T 177.46 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00287121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.443;QD=21.5108;RBI=0.0155459;REFB=-0.0164991;REVB=-0.0152784;RO=15;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268946;STB=0.515135;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0127645;OID=.;OPOS=29804487;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:9:9:8:7:9:9:8:7 chr3 30827904 . A G 158.69 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00748115;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.561;QD=17.1557;RBI=0.0303214;REFB=-0.00587233;REVB=0.029384;RO=19;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381231;STB=0.531878;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00669643;OID=.;OPOS=30827904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:20:17:17:0.459459:6:11:13:6:6:11:14:6 chr3 31705649 . C T 748.71 PASS AF=0.5;AO=77;DP=154;FAO=77;FDP=154;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.0100365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.616;QD=19.447;RBI=0.0125923;REFB=-0.0076835;REVB=0.00760487;RO=75;SAF=34;SAR=43;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257591;STB=0.519837;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00748634;OID=.;OPOS=31705649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:75:77:77:77:0.5:43:34:31:44:43:34:31:46 chr3 31712393 . C T 1435.16 PASS AF=1;AO=87;DP=90;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144303;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6066;QD=61.0706;RBI=0.0430673;REFB=0;REVB=0.0405778;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00374769;OID=.;OPOS=31712393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:94:0:0:87:94:1:37:50:0:0:44:50:0:0 chr3 31725316 . G A 927.49 PASS AF=0.526012;AO=91;DP=173;FAO=91;FDP=173;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=66;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.0227309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8089;QD=21.4448;RBI=0.034346;REFB=-0.0371296;REVB=0.0257478;RO=81;SAF=25;SAR=66;SRF=31;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109819;STB=0.56468;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0370575;OID=.;OPOS=31725316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:81:82:91:91:0.526012:66:25:31:50:66:25:32:50 chr3 31725478 . G A 554.29 PASS AF=0.443609;AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.0061104;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.157;QD=16.6705;RBI=0.00904693;REFB=-0.012649;REVB=0.00667157;RO=75;SAF=29;SAR=30;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785708;STB=0.540451;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0169375;OID=.;OPOS=31725478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:75:74:59:59:0.443609:30:29:31:44:30:29:31:43 chr3 31789582 . T C 1339.73 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0701045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2375;QD=62.3129;RBI=0.0708287;REFB=0;REVB=0.0101028;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000444577;OID=.;OPOS=31789582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0 chr3 31839242 . T C 806.16 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.679;QD=64.4931;RBI=0.0236794;REFB=0;REVB=0.0113882;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.63861e-05;OID=.;OPOS=31839242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:24:24:0:0:26:24:0:0 chr3 32031024 . C T 537.04 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.079;QD=59.6708;RBI=0.0142783;REFB=0;REVB=0.0100594;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48538e-05;OID=.;OPOS=32031024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:10:26:0:0 chr3 32031135 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000352374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.025;QD=60.9786;RBI=0.00986951;REFB=0;REVB=0.00986322;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04778e-05;OID=.;OPOS=32031135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0 chr3 32031615 . A C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00149677;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.033;QD=46.848;RBI=0.0352134;REFB=0;REVB=0.0351816;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169983;OID=.;OPOS=32031615;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0 chr3 32031622 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.517;QD=46.848;RBI=0.0181017;REFB=0;REVB=0.0180247;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.72479e-05;OID=.;OPOS=32031622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr3 32031643 . A G 255.77 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.041;QD=51.1535;RBI=0.0942045;REFB=0;REVB=0.0674383;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218278;OID=.;OPOS=32031643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr3 32031852 . G A 276.32 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0151664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8071;QD=15.7896;RBI=0.0587325;REFB=-0.0109894;REVB=-0.0567406;RO=39;SAF=10;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121318;STB=0.56866;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0174283;OID=.;OPOS=32031852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:21:10:17:22:21:10:17:22 chr3 32031962 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.705;QD=57.6806;RBI=0.0196906;REFB=0;REVB=0.0113171;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.59621e-05;OID=.;OPOS=32031962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr3 32032397 . G T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00480057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.414;QD=49.5991;RBI=0.0231142;REFB=0;REVB=-0.0226102;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000202136;OID=.;OPOS=32032397;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr3 32032743 . T G 803.92 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00324758;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.47;QD=57.4229;RBI=0.017558;REFB=0;REVB=0.017255;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28875e-05;OID=.;OPOS=32032743;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0 chr3 32208621 . T C 191.14 PASS AF=0.408163;AO=19;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0138437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.571;QD=15.6034;RBI=0.0171133;REFB=-0.000349074;REVB=0.0100606;RO=28;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237579;STB=0.606216;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.000768393;OID=.;OPOS=32208621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:28:29:19:20:0.408163:10:9:7:21:11:9:8:21 chr3 32209927 . A G 474.74 PASS AF=0.522727;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0172353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3202;QD=21.579;RBI=0.0205846;REFB=-0.0165888;REVB=0.0112548;RO=42;SAF=24;SAR=22;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224352;STB=0.512383;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0157214;OID=.;OPOS=32209927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:42:46:46:0.522727:22:24:23:19:22:24:23:19 chr3 32214179 . A T 307.42 PASS AF=0.376344;AO=35;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0376949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8859;QD=13.2222;RBI=0.0457734;REFB=-0.000399153;REVB=-0.0259672;RO=57;SAF=18;SAR=17;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598302;STB=0.508907;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.000358453;OID=.;OPOS=32214179;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:58:35:35:0.376344:17:18:29:28:17:18:29:29 chr3 32214212 . A C 249.03 PASS AF=0.357143;AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00143261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.085;QD=11.8584;RBI=0.0123127;REFB=-0.0193386;REVB=0.0122291;RO=54;SAF=15;SAR=15;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206295;STB=0.511897;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0433971;OID=.;OPOS=32214212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:54:54:30:30:0.357143:15:15:26:28:15:15:26:28 chr3 32483474 . G A 332.62 PASS AF=0.433735;AO=20;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0202138;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9016;QD=16.0299;RBI=0.0221562;REFB=-0.037442;REVB=0.00907181;RO=46;SAF=5;SAR=15;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420092;STB=0.5355;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0573817;OID=.;OPOS=32483474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:47:20:36:0.433735:15:5:28:18:16:20:29:18 chr3 32524707 . T C 275.05 PASS AF=0.447761;AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00936486;FXX=0.0563301;HRUN=7;LEN=1;MLLD=173.006;QD=16.4208;RBI=0.00939224;REFB=-0.0170718;REVB=-0.00071658;RO=21;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893216;STB=0.529628;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0207385;OID=.;OPOS=32524707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:21:37:29:30:0.447761:13:16:14:7:13:17:19:18 chr3 32815231 . A T 247.07 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.585;QD=49.4141;RBI=0.0390106;REFB=0;REVB=0.0328607;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20236e-05;OID=.;OPOS=32815231;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:20:0:0:18:20:1:15:3:0:0:16:4:0:0 chr3 32927509 . G T 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.026;QD=59.8556;RBI=0.0916397;REFB=0;REVB=0.0721111;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331243;OID=.;OPOS=32927509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0 chr3 32996423 . C T 580.25 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.090113;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6194;QD=61.079;RBI=0.0933355;REFB=0;REVB=0.0243138;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.31991e-05;OID=.;OPOS=32996423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:28:10:0:0:28:10:0:0 chr3 33038747 . C G 804.85 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.15949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9494;QD=64.3883;RBI=0.160605;REFB=0;REVB=0.0188968;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00131532;OID=.;OPOS=33038747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:29:20:0:0:30:20:0:0 chr3 33055721 . A G 1481.14 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.029;QD=63.0273;RBI=0.0347;REFB=0;REVB=0.0338587;RO=0;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394998;OID=.;OPOS=33055721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:92:94:1:43:49:0:0:44:50:0:0 chr3 33138544 . A G 1491.65 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.841;QD=63.4746;RBI=0.053713;REFB=0;REVB=0.0226277;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.17496e-05;OID=.;OPOS=33138544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:47:47:0:0:47:47:0:0 chr3 33138549 . G A 1407.8 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000288784;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2728;QD=62.5687;RBI=0.00652959;REFB=0;REVB=0.0065232;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00577769;OID=.;OPOS=33138549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:44:45:0:0:45:45:0:0 chr3 33174156 . T G 209.73 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00985509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.804;QD=18.643;RBI=0.0124121;REFB=0.00923598;REVB=0.0075457;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183126;STB=0.603676;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0063313;OID=.;OPOS=33174156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:9:12:9:15:9:12:9:15 chr3 33174168 . G A 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0117283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.947;QD=15.1604;RBI=0.0152236;REFB=0.00230693;REVB=0.00970603;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136903;STB=0.578851;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00376322;OID=.;OPOS=33174168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:8:8:8:14:8:8:8:14 chr3 33194990 . C A 227.95 PASS AF=0.448276;AO=24;DP=56;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0298775;FXX=0.0169463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=81.3281;QD=15.721;RBI=0.0302964;REFB=-0.0120061;REVB=-0.00502096;RO=23;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553909;STB=0.551685;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00834787;OID=.;OPOS=33194990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:23:32:24:26:0.448276:13:11:12:11:13:13:19:13 chr3 33195284 . G A 141.31 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.00384639;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.946;QD=11.776;RBI=0.025502;REFB=-0.00794966;REVB=-0.0252103;RO=32;SAF=10;SAR=5;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126143;STB=0.543423;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00879285;OID=.;OPOS=33195284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:32:32:15:16:0.333333:5:10:18:14:6:10:18:14 chr3 33195309 . A G 181.33 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0416448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5971;QD=14.8022;RBI=0.0541147;REFB=-0.0102044;REVB=-0.0345559;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147169;STB=0.508466;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0155;OID=.;OPOS=33195309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:8:12:17:12:8:12:17:12 chr3 33255592 . A G 293.69 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221617;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.301;QD=53.3974;RBI=0.0258882;REFB=0;REVB=-0.0133814;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302553;OID=.;OPOS=33255592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr3 33434831 . G A 443.73 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.000419096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.809;QD=17.2322;RBI=0.012473;REFB=-0.0166368;REVB=-0.0124659;RO=55;SAF=31;SAR=17;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835844;STB=0.546647;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0176794;OID=.;OPOS=33434831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:55:48:48:0.466019:17:31:31:24:17:31:31:24 chr3 33458266 . T C 295.73 PASS AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0385751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.711;QD=22.3195;RBI=0.0385763;REFB=-0.0123824;REVB=-0.000307404;RO=23;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356625;STB=0.519732;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0148863;OID=.;OPOS=33458266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:13:17:12:11:13:17:12:11 chr3 33533554 . C T 210.74 PASS AF=0.461538;AO=23;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0028509;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.631;QD=16.2108;RBI=0.0109644;REFB=-0.013352;REVB=0.0105873;RO=26;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184073;STB=0.594513;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0246919;OID=.;OPOS=33533554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:28:23:24:0.461538:15:8:14:12:16:8:14:14 chr3 33539893 . A G 156.43 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00693488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.872;QD=24.0668;RBI=0.00702506;REFB=-0.00636085;REVB=0.00112205;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262232;STB=0.514688;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00472648;OID=.;OPOS=33539893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:9:7:4:6:9:7:4:6 chr3 33879770 . G A 946.91 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0366671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.976;QD=55.7005;RBI=0.0367966;REFB=0.106543;REVB=0.00308474;RO=2;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314702;STB=0.516662;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.000580276;OID=.;OPOS=33879770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:68:2:2:66:66:0.970588:29:37:0:2:29:37:0:2 chr3 33908213 . G T 178.95 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0208549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.218;QD=15.2296;RBI=0.0217221;REFB=-0.0088488;REVB=0.00607639;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145384;STB=0.591744;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0131169;OID=.;OPOS=33908213;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:28:19:19:0.404255:9:10:18:9:9:10:19:9 chr3 33908717 . A T 820.86 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.373;QD=56.6112;RBI=0.0232342;REFB=0;REVB=0.0194922;RO=1;SAF=21;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219159;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8098e-05;OID=.;OPOS=33908717;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:58:1:0:55:58:1:34:21:1:0:36:22:0:0 chr3 35725250 . C T 4951.86 PASS AF=0.981595;AO=320;DP=327;FAO=320;FDP=326;FR=.;FRO=6;FSAF=166;FSAR=154;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00431986;FXX=0.00609737;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.951;QD=60.759;RBI=0.0117198;REFB=-0.00153296;REVB=-0.0108946;RO=6;SAF=166;SAR=154;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00651454;STB=0.503416;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-2.02109e-05;OID=.;OPOS=35725250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:327:326:6:6:320:320:0.981595:154:166:2:4:154:166:2:4 chr3 35778773 . A G 277.33 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0367553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0077;QD=20.5431;RBI=0.0377524;REFB=-0.009547;REVB=0.00861915;RO=25;SAF=13;SAR=16;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109602;STB=0.560744;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00973546;OID=.;OPOS=35778773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:16:13:8:17:16:13:8:17 chr3 35779750 . A G 481.58 PASS AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0284717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.746;QD=17.3543;RBI=0.0285464;REFB=-0.00421348;REVB=0.0020644;RO=58;SAF=29;SAR=23;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119914;STB=0.562108;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00575185;OID=.;OPOS=35779750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:59:52:52:0.468468:23:29:25:33:23:29:26:33 chr3 36779707 . G A 384.77 PASS AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0391473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7393;QD=20.7985;RBI=0.0428824;REFB=-0.0148077;REVB=0.017504;RO=35;SAF=17;SAR=22;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916977;STB=0.550739;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0182967;OID=.;OPOS=36779707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:22:17:19:16:22:17:19:16 chr3 36897812 . T C 145.5 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.847;QD=44.7688;RBI=0.148577;REFB=0;REVB=0.0495041;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139698;OID=.;OPOS=36897812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:13:0:0:11:13:1:7:4:0:0:8:5:0:0 chr3 36940741 . G T 726.77 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169713;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.091;QD=57.0017;RBI=0.0348965;REFB=0;REVB=-0.0304916;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.50513e-05;OID=.;OPOS=36940741;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0 chr3 37034029 . G A 668.33 PASS AF=0.623656;AO=58;DP=93;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.00343248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.749;QD=28.7454;RBI=0.00431916;REFB=-0.00996724;REVB=0.00262168;RO=34;SAF=30;SAR=28;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129405;STB=0.574602;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00646366;OID=.;OPOS=37034029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:34:35:58:58:0.623656:28:30:24:10:28:30:25:10 chr3 37163039 . G A 1194.89 PASS AF=1;AO=70;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.076;QD=60.5006;RBI=0.0448166;REFB=0;REVB=-0.015759;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146735;OID=.;OPOS=37163039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:79:0:0:70:79:1:44:26:0:0:48:31:0:0 chr3 37535983 . TCCCCCT TGCCCCT,TGCCCTC 368.11 PASS AF=0.455882,0;AO=22,3;DP=69;FAO=31,0;FDP=68;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=24;FSAF=26,0;FSAR=5,0;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0276544,0.0234863;FXX=0.0144907;HRUN=5,5;LEN=1,6;MLLD=193.634,198.644;QD=21.6537;RBI=0.0888303,0.0565205;REFB=-0.0462253,-0.0411351;REVB=-0.0844159,-0.0514097;RO=18;SAF=17,3;SAR=5,0;SRF=10;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.214046,0.585524;STB=0.732766,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0202379,-0.00351687;OID=.,.;OPOS=37535984,37535984;OREF=C,CCCCCT;OALT=G,GCCCTC;OMAPALT=TGCCCCT,TGCCCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.455882,0:22,3:69:31,0:68:24:26,0:5,0:10:14:99:18:17,3:5,0:10:8 chr3 37574951 . G A 560.84 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0199159;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1864;QD=19.1739;RBI=0.034922;REFB=0.01025;REVB=0.0286864;RO=60;SAF=25;SAR=33;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109571;STB=0.564746;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.0131508;OID=.;OPOS=37574951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:60:59:58:58:0.495726:33:25:33:27:33:25:33:26 chr3 38009749 . C T 139.57 PASS AF=0.273973;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.00386519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8662;QD=7.64776;RBI=0.0611639;REFB=-0.0180304;REVB=-0.0610416;RO=53;SAF=11;SAR=9;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941557;STB=0.556715;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0186531;OID=.;OPOS=38009749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:53:53:20:20:0.273973:9:11:25:28:9:11:25:28 chr3 38025750 . CA C 571.54 PASS AF=0.542056;AO=57;DP=109;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0168019;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.955;QD=21.366;RBI=0.0249526;REFB=-0.027209;REVB=-0.0184479;RO=48;SAF=27;SAR=30;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100537;STB=0.554957;STBP=0.213;TYPE=del;VARB=0.0230917;OID=.;OPOS=38025751;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.542056:57:109:58:107:49:27:31:17:32:99:48:27:30:17:31 chr3 38038982 . T C 239.64 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.118249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1613;QD=18.086;RBI=0.124385;REFB=0.0213274;REVB=-0.0385855;RO=27;SAF=15;SAR=11;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345955;STB=0.692174;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0257914;OID=.;OPOS=38038982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:11:15:5:22:11:15:5:22 chr3 38043904 . T C 334.53 PASS AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0193239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.182;QD=27.3089;RBI=0.0262228;REFB=-0.023101;REVB=-0.0177263;RO=19;SAF=18;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083217;STB=0.512773;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00819604;OID=.;OPOS=38043904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:19:20:29:29:0.591837:11:18:12:7:11:18:13:7 chr3 38047680 . G A 142.81 PASS AF=0.309091;AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00307044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0071;QD=10.3859;RBI=0.0520372;REFB=-0.0139415;REVB=-0.0519465;RO=36;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276457;STB=0.664927;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0157243;OID=.;OPOS=38047680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:36:36:17:17:0.309091:12:5:19:17:12:5:19:17 chr3 38047954 . G C 407.96 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0112715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.387;QD=17.7375;RBI=0.0155413;REFB=-0.0011513;REVB=0.0106998;RO=50;SAF=16;SAR=26;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795657;STB=0.544554;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00132673;OID=.;OPOS=38047954;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:26:16:23:27:26:16:23:27 chr3 38049029 . TG T 68.54 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0237717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.0314;QD=7.83257;RBI=0.117887;REFB=-0.0268461;REVB=0.115465;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479278;STB=0.516104;STBP=0.913;TYPE=del;VARB=0.0644891;OID=.;OPOS=38049030;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.371429:13:35:13:35:22:8:5:13:9:68:21:8:5:12:9 chr3 38051941 . T C 365.9 PASS AF=0.428571;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0714879;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5527;QD=16.0835;RBI=0.0728344;REFB=-0.0184721;REVB=0.0139402;RO=52;SAF=17;SAR=22;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104154;STB=0.558661;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0157342;OID=.;OPOS=38051941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:52:52:39:39:0.428571:22:17:28:24:22:17:28:24 chr3 38080952 . T G 220.97 PASS AF=0.419355;AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0127795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.638;QD=14.2562;RBI=0.0535731;REFB=-0.0211157;REVB=0.0520266;RO=36;SAF=11;SAR=14;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175336;STB=0.586142;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0332643;OID=.;OPOS=38080952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:36:36:25:26:0.419355:14:11:22:14:14:12:22:14 chr3 38081031 . A T 248.68 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.00114745;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9604;QD=13.8155;RBI=0.00842995;REFB=-0.0115536;REVB=0.00835149;RO=42;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224333;STB=0.619373;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0110961;OID=.;OPOS=38081031;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:42:43:29:29:0.402778:16:13:28:14:16:13:28:15 chr3 38087142 . G A 512.4 PASS AF=0.515789;AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0153829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.948;QD=21.5745;RBI=0.0156636;REFB=0.000957037;REVB=-0.00295236;RO=46;SAF=28;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632536;STB=0.53494;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00073645;OID=.;OPOS=38087142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:46:49:49:0.515789:21:28:23:23:21:28:23:23 chr3 38125705 . G A 456.35 PASS AF=0.471698;AO=49;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0385133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4196;QD=17.2206;RBI=0.0617798;REFB=-0.049611;REVB=-0.048306;RO=54;SAF=26;SAR=23;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114357;STB=0.508317;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0458229;OID=.;OPOS=38125705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:54:56:49:50:0.471698:23:26:28:26:24:26:30:26 chr3 38151731 . T C 207.21 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0715267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.5593;QD=15.0697;RBI=0.0719618;REFB=-0.0224219;REVB=-0.0079019;RO=30;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114795;STB=0.574406;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.021394;OID=.;OPOS=38151731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:30:31:24:24:0.436364:14:10:16:14:14:10:17:14 chr3 38170810 . C G 210.24 PASS AF=0.366197;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0498267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.318;QD=11.8446;RBI=0.0498363;REFB=-0.0131203;REVB=0.000974791;RO=45;SAF=14;SAR=12;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301057;STB=0.517378;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0333799;OID=.;OPOS=38170810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:45:45:26:26:0.366197:12:14:23:22:12:14:23:22 chr3 38350479 . T C 2274.24 PASS AF=1;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.15;QD=63.6151;RBI=0.0255906;REFB=0;REVB=0.0224472;RO=0;SAF=72;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12165e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73277e-05;OID=.;OPOS=38350479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:143:0:0:143:143:1:71:72:0:0:71:72:0:0 chr3 38350519 . G A 2205.8 PASS AF=0.979592;AO=138;DP=144;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.151371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.391;QD=60.0218;RBI=0.152804;REFB=-0.148346;REVB=0.0208727;RO=2;SAF=67;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000393918;STB=0.503401;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.000669005;OID=.;OPOS=38350519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:144:147:2:3:138:144:0.979592:71:67:1:1:72:72:1:2 chr3 38350543 . A G 2159.67 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.846;QD=63.056;RBI=0.0362778;REFB=0;REVB=-0.0184009;RO=0;SAF=71;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49328e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.4958e-05;OID=.;OPOS=38350543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:66:71:0:0:66:71:0:0 chr3 38357961 . C G 252.75 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0156826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.666;QD=19.0753;RBI=0.0772697;REFB=-0.00523571;REVB=0.0756615;RO=26;SAF=8;SAR=19;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288751;STB=0.516117;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00372879;OID=.;OPOS=38357961;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:19:8:7:19:19:8:7:19 chr3 38401839 . T C 1034.28 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197295;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.136;QD=59.9584;RBI=0.0348751;REFB=0;REVB=0.0287579;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285163;OID=.;OPOS=38401839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0 chr3 38406773 . G T 500.91 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0834495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.091;QD=58.9302;RBI=0.0933917;REFB=0;REVB=0.0419307;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470512;OID=.;OPOS=38406773;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:15:18:0:0:15:19:0:0 chr3 38408361 . G A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.912;QD=58.4197;RBI=0.0199817;REFB=0;REVB=0.0124318;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.8048e-06;OID=.;OPOS=38408361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0 chr3 38442490 . G A 181.05 PASS AF=0.392857;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=27;FWDB=-0.0309315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.938;QD=12.9321;RBI=0.0328271;REFB=-0.00101378;REVB=-0.0109936;RO=33;SAF=12;SAR=10;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375042;STB=0.700157;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.000819906;OID=.;OPOS=38442490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:33:34:22:22:0.392857:10:12:6:27:10:12:7:27 chr3 38519424 . A G 342.15 PASS AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0212998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.204;QD=12.9113;RBI=0.0264566;REFB=-0.0133676;REVB=-0.015693;RO=65;SAF=18;SAR=23;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245522;STB=0.51396;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0186323;OID=.;OPOS=38519424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:65:65:41:41:0.386792:23:18:30:35:23:18:30:35 chr3 38524742 . C T 805.53 PASS AF=0.456522;AO=84;DP=185;FAO=84;FDP=184;FR=.;FRO=100;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=52;FSRR=48;FWDB=0.00283695;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.166;QD=17.5115;RBI=0.0263688;REFB=-0.0147361;REVB=-0.0262157;RO=98;SAF=46;SAR=38;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266043;STB=0.515101;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0167177;OID=.;OPOS=38524742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:98:100:84:84:0.456522:38:46:51:47:38:46:52:48 chr3 38525567 . T C 603.75 PASS AF=0.484375;AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.00707249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9221;QD=18.8673;RBI=0.0214872;REFB=0.0055703;REVB=-0.0202899;RO=65;SAF=42;SAR=20;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12405;STB=0.573746;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00948272;OID=.;OPOS=38525567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:65:66:62:62:0.484375:20:42:36:29:20:42:36:30 chr3 38529818 . C T 167.76 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0520513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.563;QD=13.9798;RBI=0.0526897;REFB=-0.0153461;REVB=-0.00817708;RO=29;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566555;STB=0.533292;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0328195;OID=.;OPOS=38529818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:16:16:0.333333:8:8:16:13:8:8:16:13 chr3 38529825 . C T 151.54 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00122367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.652;QD=12.8974;RBI=0.0161427;REFB=-0.00539237;REVB=-0.0160962;RO=30;SAF=8;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104339;STB=0.561026;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00767761;OID=.;OPOS=38529825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:9:8:17:13:9:8:17:13 chr3 38532511 . G A 514.79 PASS AF=0.440945;AO=56;DP=127;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0238327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.586;QD=16.2137;RBI=0.0240311;REFB=-0.0156736;REVB=-0.00308208;RO=71;SAF=19;SAR=37;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228978;STB=0.628155;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0139641;OID=.;OPOS=38532511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:71:71:56:56:0.440945:37:19:40:31:37:19:40:31 chr3 38589666 . T TCCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC 156.55 PASS AF=0.0277778,0.444444;AO=5,12;DP=38;FAO=1,16;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=0,9;FSAR=1,7;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.00460557,-0.00455731;FXX=0.0270197;HRUN=3,3;LEN=24,25;MLLD=440.33,440.832;QD=17.3944;RBI=0.00504611,0.00530803;REFB=-0.0179023,-0.0201943;REVB=0.00206202,0.00272141;RO=20;SAF=1,8;SAR=4,4;SRF=15;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.579149,-0.103661;STB=0.994048,0.598397;STBP=0.154,0.334;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00339265,0.0269026;OID=.,.;OPOS=38589667,38589667;OREF=-,-;OALT=CCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC;OMAPALT=TCCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0277778,0.444444:5,12:38:1,16:36:19:0,9:1,7:14:5:99:20:1,8:4,4:15:5 chr3 38590358 . C CT 70.36 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0548239;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.9759;QD=10.825;RBI=0.0554795;REFB=0.0164427;REVB=-0.00850354;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119577;STB=0.531857;STBP=0.792;TYPE=ins;VARB=-0.028122;OID=.;OPOS=38590359;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.423077:11:28:11:26:15:6:5:9:6:70:15:6:5:8:7 chr3 38592406 . A G 558.69 PASS AF=0.425532;AO=59;DP=141;FAO=60;FDP=141;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.0475908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6138;QD=15.8494;RBI=0.0483368;REFB=-0.0125131;REVB=-0.00845958;RO=81;SAF=31;SAR=28;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707178;STB=0.534345;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0140211;OID=.;OPOS=38592406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:81:81:59:60:0.425532:28:31:37:44:29:31:37:44 chr3 38622467 . T C 1339.65 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00680648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6647;QD=62.3095;RBI=0.0275582;REFB=0;REVB=0.0267044;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237941;OID=.;OPOS=38622467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:34:52:0:0:34:52:0:0 chr3 38674712 . T C 1004.76 PASS AF=0.50495;AO=101;DP=202;FAO=102;FDP=202;FR=.;FRO=100;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=-0.0152056;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.872;QD=19.8961;RBI=0.019151;REFB=-0.0229242;REVB=0.0116426;RO=98;SAF=48;SAR=53;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104346;STB=0.563793;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0178306;OID=.;OPOS=38674712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:98:100:101:102:0.50495:53:48:58:40:54:48:60:40 chr3 38739574 . T C 1975.22 PASS AF=0.992248;AO=126;DP=128;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.010778;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4797;QD=61.2472;RBI=0.0763418;REFB=-0.0388132;REVB=0.0755771;RO=1;SAF=64;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760253;STB=0.503875;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000651595;OID=.;OPOS=38739574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:129:1:1:126:128:0.992248:62:64:0:1:64:64:0:1 chr3 38739845 . A G 1008.42 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.388;QD=59.3188;RBI=0.0464545;REFB=0;REVB=0.02111;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277541;OID=.;OPOS=38739845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0 chr3 38763863 . G C 902.54 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.874;QD=58.2281;RBI=0.0296801;REFB=0;REVB=0.0202392;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.25363e-05;OID=.;OPOS=38763863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:30:32:0:0:30:32:0:0 chr3 38764998 . A G 819.25 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0775676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.267;QD=57.4913;RBI=0.0779994;REFB=0;REVB=0.00819536;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289792;OID=.;OPOS=38764998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:52:57:0:0:52:57:1:22:30:0:0:22:35:0:0 chr3 38766675 . A G 1030.1 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371234;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.587;QD=59.7161;RBI=0.038614;REFB=0;REVB=0.0106251;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.4919e-05;OID=.;OPOS=38766675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0 chr3 38768247 . G A 1090.46 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00761894;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.181;QD=57.3925;RBI=0.0342857;REFB=-0.13659;REVB=0.0334284;RO=1;SAF=52;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901237;STB=0.509431;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.000582702;OID=.;OPOS=38768247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:76:1:2:74:74:0.973684:22:52:1:0:22:52:2:0 chr3 38768300 . T C 1324.92 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00014086;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.855;QD=62.3492;RBI=0.00644111;REFB=0;REVB=0.00643957;RO=0;SAF=52;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327165;OID=.;OPOS=38768300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:33:52:0:0:33:52:0:0 chr3 38793989 . G A 239.45 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00107988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.123;QD=50.4099;RBI=0.0132764;REFB=0;REVB=-0.0132324;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.36976e-05;OID=.;OPOS=38793989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr3 38798171 . C T 1434.0 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.609;QD=63.033;RBI=0.0669498;REFB=0;REVB=0.0547215;RO=0;SAF=49;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127432;OID=.;OPOS=38798171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:91:0:0:89:91:1:40:49:0:0:40:51:0:0 chr3 38802251 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4663;QD=57.0007;RBI=0.0424525;REFB=0;REVB=-0.0399671;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000311669;OID=.;OPOS=38802251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0 chr3 38908817 . TC CT 47.85 PASS AF=0.166667;AO=10;DP=60;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.00372848;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=34.4319;QD=3.19006;RBI=0.0643742;REFB=-0.0210807;REVB=0.0642662;RO=46;SAF=9;SAR=1;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.65383;STB=0.910615;STBP=0.008;TYPE=mnp;VARB=0.12124;OID=.;OPOS=38908817;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:60:60:46:50:10:10:0.166667:1:9:15:31:1:9:19:31 chr3 38945560 . A G 521.2 PASS AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00396431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.738;QD=20.848;RBI=0.0216201;REFB=-0.0141145;REVB=-0.0212535;RO=50;SAF=29;SAR=21;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126823;STB=0.570197;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.012581;OID=.;OPOS=38945560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:50:50:50:0.5:21:29:22:28:21:29:22:28 chr3 39118707 . A G 180.85 PASS AF=0.403846;AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0306317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.847;QD=13.9117;RBI=0.0318091;REFB=0.00518288;REVB=-0.00857412;RO=31;SAF=5;SAR=15;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545492;STB=0.541022;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.00951087;OID=.;OPOS=39118707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:31:31:20:21:0.403846:15:5:9:22:16:5:9:22 chr3 39138082 . C T 144.74 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0680294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3113;QD=15.6474;RBI=0.068102;REFB=-0.0055805;REVB=0.00314349;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0174239;OID=.;OPOS=39138082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:11:10:8:8:11:10 chr3 39139776 . G A 385.84 PASS AF=0.513158;AO=38;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.00763228;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.032;QD=20.3074;RBI=0.0301199;REFB=-0.019106;REVB=0.0291369;RO=37;SAF=23;SAR=15;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407494;STB=0.517233;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0176889;OID=.;OPOS=39139776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:37:37:38:39:0.513158:15:23:24:13:15:24:24:13 chr3 39148598 . G A 426.7 PASS AF=0.477778;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.0100846;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.579;QD=18.9642;RBI=0.0116867;REFB=-0.0390212;REVB=0.00590583;RO=48;SAF=34;SAR=9;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133641;STB=0.578684;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.068373;OID=.;OPOS=39148598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:48:47:43:43:0.477778:9:34:33:15:9:34:32:15 chr3 39180099 . T C 1498.51 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110577;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8986;QD=59.9404;RBI=0.0111333;REFB=0;REVB=-0.00129517;RO=0;SAF=61;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39894e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.58458e-05;OID=.;OPOS=39180099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:39:61:0:0:39:61:0:0 chr3 39180219 . C T 476.98 PASS AF=0.584416;AO=45;DP=77;FAO=45;FDP=77;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00287566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.552;QD=24.7783;RBI=0.00458125;REFB=-0.019636;REVB=0.00356629;RO=31;SAF=23;SAR=22;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027815;STB=0.508373;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0139828;OID=.;OPOS=39180219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:31:32:45:45:0.584416:22:23:17:14:22:23:17:15 chr3 39180263 . G A 754.29 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6015;QD=56.9275;RBI=0.0506357;REFB=0;REVB=0.0103475;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000737079;OID=.;OPOS=39180263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr3 39183672 . C T 259.31 PASS AF=0.571429;AO=23;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00654914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.451;QD=24.6964;RBI=0.0117497;REFB=-0.00869835;REVB=0.00975523;RO=18;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00199679;STB=0.512285;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00960682;OID=.;OPOS=39183672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:23:24:0.571429:9:14:11:7:10:14:11:7 chr3 39184959 . C T 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.074;QD=57.1774;RBI=0.0112198;REFB=0;REVB=-0.00345304;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93361e-05;OID=.;OPOS=39184959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0 chr3 39185077 . G A 84.25 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00178575;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.344;QD=9.62903;RBI=0.0315338;REFB=-0.0188364;REVB=0.0314832;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243405;STB=0.644926;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0361665;OID=.;OPOS=39185077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:36:35:24:24:11:11:0.314286:5:6:18:6:5:6:18:6 chr3 39185248 . A G 464.99 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000368919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6393;QD=58.1235;RBI=0.0466846;REFB=0;REVB=-0.0466831;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0005875;OID=.;OPOS=39185248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0 chr3 39186728 . C T 623.68 PASS AF=0.571429;AO=56;DP=98;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0107351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.042;QD=25.4561;RBI=0.0151516;REFB=-0.0402267;REVB=-0.0106925;RO=42;SAF=30;SAR=26;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838344;STB=0.545835;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0397718;OID=.;OPOS=39186728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:42:42:56:56:0.571429:26:30:18:24:26:30:18:24 chr3 39225947 . G A 604.43 PASS AF=0.453237;AO=62;DP=138;FAO=63;FDP=139;FR=.;FRO=76;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-0.0145131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.862;QD=17.3938;RBI=0.0220948;REFB=-0.015279;REVB=0.0166599;RO=76;SAF=17;SAR=45;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192916;STB=0.610582;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0166979;OID=.;OPOS=39225947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:76:76:62:63:0.453237:45:17:34:42:46:17:34:42 chr3 39229900 . T C 1440.94 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.132;QD=61.9757;RBI=0.0516227;REFB=-0.1129;REVB=0.0387829;RO=1;SAF=44;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106514;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000719357;OID=.;OPOS=39229900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:92:93:1:0:91:93:1:47:44:1:0:47:46:0:0 chr3 39323163 . A C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.229;QD=59.6792;RBI=0.0326561;REFB=0;REVB=0.0284152;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39924e-05;OID=.;OPOS=39323163;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0 chr3 39431081 . G A 689.31 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.831;QD=62.6649;RBI=0.0225733;REFB=0;REVB=0.0186468;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06249e-05;OID=.;OPOS=39431081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr3 39433037 . A G 747.34 PASS AF=0.506579;AO=76;DP=151;FAO=77;FDP=152;FR=.;FRO=75;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.0127247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.965;QD=19.6669;RBI=0.0130238;REFB=-0.0399578;REVB=0.00277481;RO=74;SAF=42;SAR=34;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474437;STB=0.525804;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0314277;OID=.;OPOS=39433037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:74:75:76:77:0.506579:34:42:37:37:35:42:37:38 chr3 40231383 . C T 514.4 PASS AF=0.495413;AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0340002;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=178.092;QD=18.8772;RBI=0.034001;REFB=-0.0155486;REVB=-0.000230775;RO=51;SAF=37;SAR=17;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183363;STB=0.604755;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0186384;OID=.;OPOS=40231383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:51:55:54:54:0.495413:17:37:25:26:17:37:27:28 chr3 40231883 . C T 572.7 PASS AF=0.535088;AO=55;DP=109;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0553772;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0448;QD=20.0947;RBI=0.0619984;REFB=-0.0288179;REVB=0.0278778;RO=54;SAF=31;SAR=24;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107004;STB=0.533322;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0258993;OID=.;OPOS=40231883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:114:54:53:55:61:0.535088:24:31:24:30:29:32:24:29 chr3 40275461 . C T 311.54 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.00788086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.566;QD=19.1719;RBI=0.0153361;REFB=-0.00767349;REVB=0.0131563;RO=32;SAF=19;SAR=14;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256007;STB=0.641926;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00898767;OID=.;OPOS=40275461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:14:19:9:23:14:19:9:23 chr3 40286017 . T C 2272.75 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0791738;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2924;QD=62.6966;RBI=0.0812837;REFB=0;REVB=0.0183996;RO=0;SAF=70;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112502;OID=.;OPOS=40286017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:145:0:0:140:145:1:70:70:0:0:72:73:0:0 chr3 40301474 . AAGC AAGA,A 332.91 PASS AF=0,0.521739;AO=7,32;DP=75;FAO=0,36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=0,13;FSAR=0,23;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0674617,0.0147839;FXX=0.14813;HRUN=1,2;LEN=1,3;MLLD=86.6395,189.949;QD=19.2993;RBI=0.0675341,0.0193233;REFB=-0.0113077,-0.00698498;REVB=0.00312506,-0.0124429;RO=23;SAF=2,11;SAR=5,21;SRF=11;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.237416,-0.108538;STB=0.5,0.576398;STBP=1,0.222;TYPE=snp,del;VARB=0,0.0044913;OID=.,.;OPOS=40301477,40301475;OREF=C,AGC;OALT=A,-;OMAPALT=AAGA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.521739:7,32:75:0,36:69:33:0,13:0,23:17:16:99:23:2,11:5,21:11:12 chr3 40351484 . C T 257.3 PASS AF=0.5;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0839911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9086;QD=18.3783;RBI=0.0870813;REFB=-0.0210945;REVB=-0.0229921;RO=27;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176048;STB=0.607066;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0486476;OID=.;OPOS=40351484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:27:28:28:28:0.5:11:17:11:16:11:17:11:17 chr3 40435890 . A G 94.35 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0976472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1832;QD=20.9661;RBI=0.0999335;REFB=-0.0698175;REVB=0.0212539;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117729;STB=0.566892;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.056493;OID=.;OPOS=40435890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:5:2:5:6:5:2 chr3 40457487 . T A 656.38 PASS AF=0.585859;AO=58;DP=99;FAO=58;FDP=99;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0108607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.277;QD=26.5204;RBI=0.0110925;REFB=-0.0198781;REVB=0.00225614;RO=41;SAF=38;SAR=20;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133864;STB=0.57319;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0122849;OID=.;OPOS=40457487;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:41:41:58:58:0.585859:20:38:20:21:20:38:20:21 chr3 40498845 . C T 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7303;QD=60.6094;RBI=0.0524714;REFB=0;REVB=0.0358703;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000748788;OID=.;OPOS=40498845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0 chr3 40499182 . C T 1098.57 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0296;QD=60.1955;RBI=0.113317;REFB=0;REVB=0.0772949;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000809117;OID=.;OPOS=40499182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0 chr3 40519429 . T C 609.36 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0590955;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=54.1;QD=56.6849;RBI=0.0646179;REFB=-0.0593888;REVB=-0.0261379;RO=1;SAF=15;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302497;STB=0.531235;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0022634;OID=.;OPOS=40519429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:43:1:2:41:41:0.953488:26:15:1:0:26:15:2:0 chr3 40557443 . C A 221.96 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0164576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7806;QD=25.3673;RBI=0.0357551;REFB=-0.00834319;REVB=-0.0317423;RO=14;SAF=15;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272203;STB=0.652023;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.005372;OID=.;OPOS=40557443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:6:15:5:9:6:15:5:9 chr3 40558150 . G C 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00421858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.603;QD=23.5278;RBI=0.0428374;REFB=-0.0191755;REVB=-0.0426292;RO=14;SAF=5;SAR=15;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343833;STB=0.509424;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0153199;OID=.;OPOS=40558150;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:15:5:4:10:15:5:4:11 chr3 40559078 . G C 335.99 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0129751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.065;QD=19.7641;RBI=0.0160314;REFB=-0.0138331;REVB=0.00941552;RO=33;SAF=21;SAR=14;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230539;STB=0.627835;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0168408;OID=.;OPOS=40559078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:14:21:11:22:14:21:11:22 chr3 40573744 . A G 669.87 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6748;QD=62.3132;RBI=0.019761;REFB=0;REVB=-0.00171051;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169121;OID=.;OPOS=40573744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr3 40574734 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6555;QD=37.4885;RBI=0.0603549;REFB=0;REVB=0.0445765;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149779;OID=.;OPOS=40574734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr3 41841716 . A C 1157.02 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949679;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6844;QD=60.8956;RBI=0.0213777;REFB=0;REVB=0.0191525;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127481;OID=.;OPOS=41841716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:72:76:1:39:33:0:0:42:34:0:0 chr3 41910571 . T C 784.89 PASS AF=1;AO=46;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3803;QD=57.083;RBI=0.0727556;REFB=0;REVB=-0.0025722;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372535;OID=.;OPOS=41910571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:46:55:1:36:10:0:0:36:19:0:0 chr3 41925398 . C T 1607.02 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.191;QD=60.0756;RBI=0.0373434;REFB=0;REVB=0.0354524;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72588e-05;OID=.;OPOS=41925398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:45:62:0:0:45:62:0:0 chr3 41925423 . T C 1521.94 PASS AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0156767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.56;QD=57.4317;RBI=0.0275781;REFB=-0.0225894;REVB=0.022689;RO=1;SAF=58;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102041;STB=0.501103;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00023016;OID=.;OPOS=41925423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:106:106:1:2:104:104:0.981132:46:58:0:1:46:58:1:1 chr3 41937000 . C T 1080.56 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.788;QD=60.0309;RBI=0.0198416;REFB=0;REVB=0.00332351;RO=0;SAF=46;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64681e-05;OID=.;OPOS=41937000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:25:46:0:0:25:47:0:0 chr3 41939990 . GTTT GTT,GTTA 695.15 PASS AF=0.0212766,0.978723;AO=13,27;DP=47;FAO=1,46;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111764,0.174847;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=26.8944,30.3708;QD=59.162;RBI=0.125236,0.175946;REFB=0,0;REVB=0.0565056,0.0196279;RO=1;SAF=5,15;SAR=8,12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0821523,-0.0299926;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0173047,0.00744936;OID=.,.;OPOS=41939991,41939993;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=GTT,GTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0212766,0.978723:13,27:47:1,46:47:0:0,24:1,22:0:0:11:1:5,15:8,12:1:0 chr3 41957466 . T G 623.53 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0264273;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.049;QD=59.384;RBI=0.116984;REFB=-0.0635992;REVB=0.11396;RO=1;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302497;STB=0.516121;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000743005;OID=.;OPOS=41957466;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:15:26:0:1:15:26:0:1 chr3 41960006 . T C 351.77 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00627102;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.638;QD=52.1135;RBI=0.0636781;REFB=-0.126391;REVB=0.0633686;RO=1;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441872;STB=0.523791;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00256945;OID=.;OPOS=41960006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:27:1:1:26:26:0.962963:10:16:0:1:10:16:0:1 chr3 41996136 . T C 871.32 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0272983;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.74;QD=56.2143;RBI=0.0364817;REFB=-0.0568632;REVB=0.0242015;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014984;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000177226;OID=.;OPOS=41996136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:30:31:1:0:30:31:1:0 chr3 42236415 . A G 446.94 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6557;QD=57.6701;RBI=0.0411525;REFB=0;REVB=-0.022446;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00119587;OID=.;OPOS=42236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:24:7:0:0:24:7:0:0 chr3 42244321 . G A 1556.49 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140852;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.897;QD=59.865;RBI=0.0395588;REFB=0;REVB=0.0369663;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43874e-05;OID=.;OPOS=42244321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:52:52:0:0:52:52:0:0 chr3 42304784 . A G 207.66 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00731208;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2257;QD=13.185;RBI=0.0564779;REFB=0.0144049;REVB=-0.0560026;RO=38;SAF=9;SAR=16;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282509;STB=0.661527;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.0291627;OID=.;OPOS=42304784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:38:38:25:25:0.396825:16:9:24:14:16:9:24:14 chr3 42438754 . T C 191.32 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.000443392;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2224;QD=13.4258;RBI=0.0216907;REFB=-0.021142;REVB=-0.0216861;RO=34;SAF=10;SAR=13;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2771;STB=0.657609;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.048658;OID=.;OPOS=42438754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:34:34:23:23:0.403509:13:10:24:10:13:10:24:10 chr3 42448471 . G A 463.0 PASS AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.0302077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.418;QD=16.1044;RBI=0.0302116;REFB=-0.0132138;REVB=-0.000485779;RO=64;SAF=39;SAR=12;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312721;STB=0.676226;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0141369;OID=.;OPOS=42448471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:64:64:51:51:0.443478:12:39:31:33:12:39:31:33 chr3 42568929 . T C 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0979687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.979;QD=16.8985;RBI=0.098368;REFB=0.00721511;REVB=0.00885399;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339319;STB=0.699557;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00396173;OID=.;OPOS=42568929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:8:2:5:4:8:2:5:4 chr3 42728144 . A C,G 810.25 PASS AF=0.0175439,0.982456;AO=2,55;DP=57;FAO=1,56;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445653,-0.0246291;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=15.2698,132.051;QD=56.8593;RBI=0.0589009,0.0246298;REFB=0,0;REVB=-0.0385129,-0.000184233;RO=0;SAF=0,25;SAR=2,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0536094,-0.000571368;OID=.,.;OPOS=42728144,42728144;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:57:57:0:0:2,55:1,56:0.0175439,0.982456:2,30:0,25:0:0:1,31:0,25:0:0 chr3 42733468 . T C 851.23 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0681982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.504;QD=57.7107;RBI=0.0706409;REFB=0;REVB=0.0184159;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270855;OID=.;OPOS=42733468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0 chr3 42735150 . T C 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0164919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.507;QD=20.8983;RBI=0.0184409;REFB=-0.0281772;REVB=0.00825143;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171168;STB=0.599732;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.010817;OID=.;OPOS=42735150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:6:2:2:2:6:2:2:2 chr3 42735274 . A G 111.41 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00403078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.583;QD=15.9163;RBI=0.0315112;REFB=-0.0137048;REVB=-0.0312524;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219892;STB=0.627703;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0215183;OID=.;OPOS=42735274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:4:9:7:8:4:9:7:8 chr3 42751187 . C T 653.16 PASS AF=0.449664;AO=67;DP=149;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00547888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.281;QD=17.5345;RBI=0.0169646;REFB=-0.00745072;REVB=-0.0160555;RO=81;SAF=36;SAR=31;SRF=43;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637674;STB=0.507142;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.00748063;OID=.;OPOS=42751187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:81:82:67:67:0.449664:31:36:43:38:31:36:43:39 chr3 42784452 . G A 376.11 PASS AF=0.421053;AO=38;DP=92;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0571763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1084;QD=15.8363;RBI=0.0691241;REFB=-0.0212835;REVB=0.038846;RO=53;SAF=16;SAR=22;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130187;STB=0.555177;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0315693;OID=.;OPOS=42784452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:53:55:38:40:0.421053:22:16:29:24:22:18:30:25 chr3 42787469 . A G 257.87 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0602754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3627;QD=18.419;RBI=0.0740409;REFB=-0.0197741;REVB=-0.0429992;RO=28;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158808;STB=0.588769;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0140118;OID=.;OPOS=42787469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:12:16:11:17:12:16:11:17 chr3 42788823 . C A 185.05 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00966794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6044;QD=12.3369;RBI=0.0111146;REFB=-0.0419143;REVB=0.0054831;RO=35;SAF=9;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711603;STB=0.559947;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0403744;OID=.;OPOS=42788823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:35:37:23:23:0.383333:14:9:16:19:14:9:18:19 chr3 42917047 . A G 2145.34 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00424583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.962;QD=62.1837;RBI=0.02248;REFB=0;REVB=0.0220754;RO=0;SAF=76;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03607e-05;OID=.;OPOS=42917047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:133:138:0:0:133:138:1:57:76:0:0:59:79:0:0 chr3 42954792 . C T 313.08 PASS AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.00100486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.626;QD=16.9233;RBI=0.00576432;REFB=-0.0106343;REVB=-0.00567606;RO=38;SAF=18;SAR=16;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148413;STB=0.593496;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0148396;OID=.;OPOS=42954792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:40:34:34:0.459459:16:18:26:12:16:18:28:12 chr3 42956273 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.769;QD=56.1912;RBI=0.0782963;REFB=0;REVB=0.0749599;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000985207;OID=.;OPOS=42956273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr3 42956519 . C A 187.93 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00466673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=327.144;QD=20.3167;RBI=0.00467044;REFB=-0.0152352;REVB=-0.00018622;RO=18;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165474;STB=0.593125;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.014622;OID=.;OPOS=42956519;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:9:10:6:12:9:10:6:12 chr3 43074430 . A G 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0262756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.627;QD=13.7531;RBI=0.027174;REFB=-0.0110653;REVB=-0.00692942;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113207;STB=0.519974;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0204531;OID=.;OPOS=43074430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:23:15:15:0.394737:10:5:5:16:10:5:7:16 chr3 43074871 . A G 2784.53 PASS AF=1;AO=172;DP=176;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142055;FXX=0.0216205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.869;QD=61.5367;RBI=0.0440483;REFB=0;REVB=0.0416948;RO=0;SAF=101;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000995345;OID=.;OPOS=43074871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:181:0:0:172:181:1:71:101:0:0:80:101:0:0 chr3 43095101 . A G 175.62 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00189384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.258;QD=13.7739;RBI=0.0114079;REFB=-0.00334802;REVB=0.0112496;RO=31;SAF=6;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2393;STB=0.63886;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0043442;OID=.;OPOS=43095101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:14:6:16:15:14:6:16:15 chr3 43095245 . A G 340.53 PASS AF=0.546875;AO=34;DP=63;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00582092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.532;QD=21.2834;RBI=0.0121788;REFB=-0.0262867;REVB=0.0106977;RO=29;SAF=16;SAR=18;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076586;STB=0.54836;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0134367;OID=.;OPOS=43095245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:29:29:34:35:0.546875:18:16:11:18:18:17:11:18 chr3 43097765 . G A 690.73 PASS AF=0.606061;AO=59;DP=97;FAO=60;FDP=99;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.084986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1276;QD=27.9085;RBI=0.106805;REFB=-0.0489932;REVB=0.0646897;RO=38;SAF=29;SAR=30;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318173;STB=0.515146;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0328373;OID=.;OPOS=43097765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:38:39:59:60:0.606061:30:29:17:21:30:30:18:21 chr3 43121559 . C T 803.35 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00233167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.944;QD=55.4037;RBI=0.0116944;REFB=-0.124665;REVB=0.0114596;RO=1;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136707;STB=0.507244;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000902878;OID=.;OPOS=43121559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:34:23:0:1:34:23:0:1 chr3 43122425 . C T 862.12 PASS AF=0.544218;AO=80;DP=147;FAO=80;FDP=147;FR=.;FRO=67;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.010785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.546;QD=23.459;RBI=0.0452815;REFB=-0.0301381;REVB=0.0439784;RO=66;SAF=37;SAR=43;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185581;STB=0.513736;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0227744;OID=.;OPOS=43122425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:66:67:80:80:0.544218:43:37:32:34:43:37:33:34 chr3 43122966 . G A 258.52 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0478412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3844;QD=16.4136;RBI=0.0479375;REFB=-0.00752767;REVB=-0.00303745;RO=33;SAF=13;SAR=16;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176609;STB=0.605989;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0118818;OID=.;OPOS=43122966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:34:29:29:0.460317:16:13:21:12:16:13:22:12 chr3 43390387 . C CT 714.89 PASS AF=1;AO=60;DP=77;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00495452;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.9604;QD=39.1719;RBI=0.125345;REFB=0;REVB=-0.125247;RO=9;SAF=40;SAR=20;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309576;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00167268;OID=.;OPOS=43390388;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:60:77:73:73:0:47:26:0:0:13:9:40:20:7:2 chr3 43414318 . A G 2255.1 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.831;QD=63.5238;RBI=0.0299675;REFB=0;REVB=0.00974221;RO=0;SAF=69;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12121e-05;OID=.;OPOS=43414318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:73:69:0:0:73:69:0:0 chr3 43602803 . C T 942.24 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00466868;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.7992;QD=57.1055;RBI=0.00517692;REFB=-0.155095;REVB=0.00223695;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00194373;OID=.;OPOS=43602803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:33:32:0:0:33:32:1:0 chr3 43607136 . T C 320.35 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787779;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.322;QD=51.2564;RBI=0.0193936;REFB=-0.0848446;REVB=0.0177215;RO=1;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343222;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000839537;OID=.;OPOS=43607136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:25:1:0:24:25:1:13:11:0:1:14:11:0:0 chr3 44283808 . C A 205.1 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00190442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.172;QD=16.4079;RBI=0.00193702;REFB=-0.0268807;REVB=0.000353911;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14578;STB=0.583256;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0393688;OID=.;OPOS=44283808;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:11:18:10:11:11:18 chr3 44284584 . G A 389.92 PASS AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.00636936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.266;QD=21.6622;RBI=0.00989889;REFB=0.00268324;REVB=0.00757755;RO=32;SAF=12;SAR=27;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256552;STB=0.519074;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=-0.00229593;OID=.;OPOS=44284584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:33:39:39:0.541667:27:12:9:23:27:12:9:24 chr3 44489264 . G A 223.93 PASS AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0438052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2523;QD=11.4835;RBI=0.0510803;REFB=0.00122087;REVB=-0.0262737;RO=49;SAF=12;SAR=16;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230812;STB=0.505614;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.00485364;OID=.;OPOS=44489264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:50:28:28:0.358974:16:12:20:29:16:12:21:29 chr3 44540791 . TTC T,TTT 1014.27 PASS AF=0.890244,0;AO=65,3;DP=77;FAO=73,0;FDP=82;FR=.;FRO=9;FSAF=33,0;FSAR=40,0;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.000865253,0.00155297;FXX=0.0574647;HRUN=5,1;LEN=2,1;MLLD=282.015,262.325;QD=49.4764;RBI=0.00318093,0.00157573;REFB=-0.014037,-0.00933565;REVB=-0.00306098,0.00026685;RO=0;SAF=28,0;SAR=37,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.99207e-08,0;STB=0.523659,0.5;STBP=0.266,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00109669,0;OID=.,.;OPOS=44540792,44540793;OREF=TC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.890244,0:65,3:77:73,0:82:9:33,0:40,0:6:3:37:0:28,0:37,3:0:0 chr3 44612050 . C T 95.98 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0197851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.079;QD=10.6649;RBI=0.0313021;REFB=-0.0132619;REVB=-0.0242563;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503109;STB=0.527732;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0392974;OID=.;OPOS=44612050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:36:22:24:11:12:0.333333:6:5:11:11:6:6:13:11 chr3 44637647 . A G 152.87 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00374717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.721;QD=11.9902;RBI=0.00922826;REFB=-0.0093148;REVB=0.00843324;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405415;STB=0.523783;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0118521;OID=.;OPOS=44637647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:7:11:19:14:7:11:19:14 chr3 44638599 . T A 310.58 PASS AF=0.584906;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0114852;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.877;QD=23.4403;RBI=0.0297864;REFB=0.0120808;REVB=0.0274831;RO=22;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909561;STB=0.55009;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.00474872;OID=.;OPOS=44638599;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:53:22:22:31:31:0.584906:16:15:8:14:16:15:8:14 chr3 44639043 . C T 263.7 PASS AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.036627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7927;QD=26.3704;RBI=0.0943605;REFB=0.00745469;REVB=-0.0869619;RO=16;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00797829;OID=.;OPOS=44639043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:12:12:8:8:12:12:8:8 chr3 44692564 . C G 347.21 PASS AF=0.395833;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0604255;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0673;QD=14.4672;RBI=0.0604811;REFB=-0.0188855;REVB=0.00259229;RO=58;SAF=17;SAR=21;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562027;STB=0.531921;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0292483;OID=.;OPOS=44692564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:58:58:38:38:0.395833:21:17:29:29:21:17:29:29 chr3 44763037 . A C 97.56 PASS AF=0.375;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0188557;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.694;QD=12.1955;RBI=0.0192939;REFB=-0.0190583;REVB=0.00408862;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158921;STB=0.593599;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0558742;OID=.;OPOS=44763037;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:33:32:20:20:12:12:0.375:6:6:13:7:6:6:13:7 chr3 44775962 . A G 249.73 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0037374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.133;QD=18.4984;RBI=0.0117245;REFB=-0.0107474;REVB=0.0111129;RO=27;SAF=8;SAR=19;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305899;STB=0.671722;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00783056;OID=.;OPOS=44775962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:19:8:17:10:19:8:17:10 chr3 44777795 . CT TC 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0126125;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=235.417;QD=17.1565;RBI=0.02587;REFB=-0.00422185;REVB=-0.0225872;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121753;STB=0.569539;STBP=0.462;TYPE=mnp;VARB=0.00632874;OID=.;OPOS=44777795;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:12:8:9:8:12:8 chr3 44869026 . A T 2079.47 PASS AF=0.971631;AO=136;DP=141;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=92;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0436145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.1901;QD=58.992;RBI=0.0542698;REFB=-0.23373;REVB=0.0322953;RO=2;SAF=45;SAR=91;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525068;STB=0.505494;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00761478;OID=.;OPOS=44869026;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:141:141:2:4:136:137:0.971631:91:45:1:1:92:45:2:2 chr3 44884647 . C A 314.83 PASS AF=0.411765;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.00519708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.006;QD=14.8156;RBI=0.0198606;REFB=-0.0260167;REVB=-0.0191685;RO=50;SAF=10;SAR=25;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112739;STB=0.564164;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0375767;OID=.;OPOS=44884647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:50:35:35:0.411765:25:10:19:31:25:10:19:31 chr3 44929287 . G C 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00243365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6339;QD=64.1524;RBI=0.0317265;REFB=0;REVB=0.031633;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272203;OID=.;OPOS=44929287;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chr3 44943069 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.854;QD=62.022;RBI=0.0114155;REFB=0;REVB=0.00294428;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04078e-05;OID=.;OPOS=44943069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0 chr3 44943389 . G A 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00660107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.687;QD=57.3852;RBI=0.0423048;REFB=0;REVB=0.0417866;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122536;OID=.;OPOS=44943389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:38:19:0:0:38:19:0:0 chr3 44948479 . C T 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00946903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.252;QD=58.2396;RBI=0.0290993;REFB=0;REVB=0.0275156;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92827e-05;OID=.;OPOS=44948479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr3 44948590 . G A 1358.59 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.308;QD=62.4641;RBI=0.00892178;REFB=0;REVB=0.00262503;RO=0;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57384e-05;OID=.;OPOS=44948590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:57:30:0:0:57:30:0:0 chr3 44968319 . CT C,TC 295.59 PASS AF=0.796296,0.0925926;AO=23,5;DP=50;FAO=43,5;FDP=54;FR=.;FRO=6;FSAF=33,0;FSAR=10,5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.10921,-0.0181977;FXX=0.0357079;HRUN=5,2;LEN=1,2;MLLD=11.1294,178.842;QD=21.8959;RBI=0.140143,0.0416412;REFB=-0.203843,-0.0192147;REVB=0.0878251,-0.0374544;RO=19;SAF=21,0;SAR=2,5;SRF=14;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.30984,-0.763434;STB=0.543705,0.997085;STBP=0.155,0.06;TYPE=del,mnp;VARB=0.0918802,0.111754;OID=.,.;OPOS=44968320,44968319;OREF=T,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:27:50:54:19:6:23,5:43,5:0.796296,0.0925926:2,5:21,0:14:5:10,5:33,0:3:3 chr3 45052775 . G C 2273.21 PASS AF=0.993377;AO=150;DP=151;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00934747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.235;QD=60.2175;RBI=0.0291711;REFB=-0.0772238;REVB=0.0276329;RO=1;SAF=61;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773355;STB=0.504065;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=3.99782e-05;OID=.;OPOS=45052775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:151:151:1:1:150:150:0.993377:89:61:1:0:89:61:1:0 chr3 45077123 . G A 666.94 PASS AF=0.956522;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0349422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.458;QD=57.995;RBI=0.0363885;REFB=-0.0252532;REVB=0.0101572;RO=2;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044666;STB=0.523799;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000198562;OID=.;OPOS=45077123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:46:2:2:43:44:0.956522:20:23:0:2:20:24:0:2 chr3 45127515 . T C 801.13 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0043766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5758;QD=57.2237;RBI=0.0800713;REFB=0;REVB=0.0799516;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000869605;OID=.;OPOS=45127515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0 chr3 45134822 . T C 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.484;QD=60.8833;RBI=0.0507276;REFB=0;REVB=-0.0495558;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.81986e-05;OID=.;OPOS=45134822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0 chr3 45187785 . C G 35.56 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00178982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1651;QD=5.68934;RBI=0.0432644;REFB=0.0109588;REVB=-0.0432274;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235388;STB=0.659768;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.0648247;OID=.;OPOS=45187785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:5:1:6:13:5:1:6:13 chr3 45297004 . T C 514.83 PASS AF=0.514563;AO=52;DP=102;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00987819;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.937;QD=19.9935;RBI=0.0197971;REFB=-0.00980111;REVB=0.0171565;RO=49;SAF=24;SAR=28;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963989;STB=0.551957;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00980065;OID=.;OPOS=45297004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:49:50:52:53:0.514563:28:24:28:21:29:24:28:22 chr3 45527218 . T C 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00881481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.952;QD=61.8524;RBI=0.0116504;REFB=0;REVB=0.00761778;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.08443e-05;OID=.;OPOS=45527218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:48:35:0:0:48:35:0:0 chr3 45533224 . G A 1208.96 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.588;QD=61.2131;RBI=0.00718709;REFB=0;REVB=0.00540644;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53554e-06;OID=.;OPOS=45533224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:38:40:0:0:38:41:0:0 chr3 45559519 . T C 1445.8 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107582;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.726;QD=62.8609;RBI=0.0212429;REFB=0;REVB=0.0183173;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282699;OID=.;OPOS=45559519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:92:0:0:91:92:1:45:46:0:0:45:47:0:0 chr3 45565554 . A G 2424.57 PASS AF=0.99375;AO=160;DP=161;FAO=159;FDP=160;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0829196;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.546;QD=60.6143;RBI=0.0858327;REFB=0.116795;REVB=-0.0221721;RO=1;SAF=71;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531645;STB=0.502824;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.0014926;OID=.;OPOS=45565554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:161:160:1:1:160:159:0.99375:89:71:0:1:88:71:0:1 chr3 45637253 . C T 756.32 PASS AF=0.933333;AO=56;DP=60;FAO=56;FDP=60;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00964487;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.689;QD=50.4216;RBI=0.0261376;REFB=-0.0422655;REVB=0.024293;RO=4;SAF=24;SAR=32;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723404;STB=0.538448;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.000243429;OID=.;OPOS=45637253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:60:60:4:4:56:56:0.933333:32:24:4:0:32:24:4:0 chr3 45637439 . T C 3537.84 PASS AF=0.995556;AO=188;DP=221;FAO=224;FDP=225;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=120;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.837;QD=62.8949;RBI=0.0854517;REFB=0;REVB=0.0651223;RO=0;SAF=119;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000648014;OID=.;OPOS=45637439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:221:225:0:0:188:224:0.995556:69:119:0:0:104:120:0:0 chr3 45817418 . A G 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.396;QD=59.3229;RBI=0.0328077;REFB=0;REVB=0.0031416;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014494;OID=.;OPOS=45817418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0 chr3 45837886 . G C 164.05 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0250846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0833;QD=12.8663;RBI=0.034479;REFB=0.0116836;REVB=0.023655;RO=32;SAF=3;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464434;STB=0.774495;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0188001;OID=.;OPOS=45837886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:16:3:17:15:16:3:17:15 chr3 45959515 . A T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.598;QD=60.9783;RBI=0.0476693;REFB=0;REVB=0.0112353;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414027;OID=.;OPOS=45959515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr3 45996761 . G A 774.26 PASS AF=0.490798;AO=79;DP=162;FAO=80;FDP=163;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=-0.0192849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.154;QD=19.0002;RBI=0.0195849;REFB=-0.0118264;REVB=-0.00341512;RO=83;SAF=31;SAR=48;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853005;STB=0.549506;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0118622;OID=.;OPOS=45996761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:83:83:79:80:0.490798:48:31:40:43:49:31:40:43 chr3 46009491 . C T 442.91 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0198499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.632;QD=22.7134;RBI=0.0290285;REFB=-0.011536;REVB=-0.021181;RO=34;SAF=17;SAR=26;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622014;STB=0.528637;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0112782;OID=.;OPOS=46009491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:35:43:43:0.551282:26:17:16:18:26:17:16:19 chr3 46010077 . C T 1231.4 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.172;QD=60.0683;RBI=0.0348075;REFB=0.0424161;REVB=0.0184739;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.504949;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-6.88947e-05;OID=.;OPOS=46010077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:50:31:0:0:50:31:0:1 chr3 46021218 . G T 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.453;QD=58.6006;RBI=0.0215744;REFB=0;REVB=0.006399;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66914e-05;OID=.;OPOS=46021218;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr3 46399208 . G A 729.23 PASS AF=0.514493;AO=70;DP=138;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=50;FWDB=0.00105897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.362;QD=21.1369;RBI=0.0186079;REFB=-0.0108196;REVB=-0.0185777;RO=67;SAF=38;SAR=32;SRF=17;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253947;STB=0.634699;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00868804;OID=.;OPOS=46399208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:67:67:70:71:0.514493:32:38:17:50:33:38:17:50 chr3 46399798 . T C 281.25 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.015318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.783;QD=21.2267;RBI=0.0153865;REFB=-0.0095113;REVB=0.00144987;RO=24;SAF=6;SAR=23;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220654;STB=0.623635;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00689105;OID=.;OPOS=46399798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:23:6:10:14:23:6:10:14 chr3 46416470 . G T 254.56 PASS AF=0.453125;AO=28;DP=63;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0870875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2729;QD=15.9098;RBI=0.140192;REFB=0.00982938;REVB=0.109862;RO=34;SAF=11;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134327;STB=0.60579;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00537562;OID=.;OPOS=46416470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:34:35:28:29:0.453125:17:11:18:16:18:11:20:15 chr3 46417312 . G T 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0276492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.362;QD=20.1601;RBI=0.0349455;REFB=-0.027405;REVB=-0.0213708;RO=11;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810739;STB=0.508917;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0266702;OID=.;OPOS=46417312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:11:14:16:16:0.533333:6:10:8:3:6:10:9:5 chr3 46449978 . A C 295.33 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.00886644;FXX=0.0243873;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.477;QD=14.7665;RBI=0.00897774;REFB=-0.00505226;REVB=0.0014093;RO=46;SAF=19;SAR=14;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011062;STB=0.513505;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00680173;OID=.;OPOS=46449978;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:47:33:33:0.4125:14:19:26:20:14:19:26:21 chr3 46450070 . T A 147.0 PASS AF=0.3125;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0134483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.868;QD=9.18762;RBI=0.0172222;REFB=-0.0217888;REVB=0.0107587;RO=44;SAF=13;SAR=7;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152807;STB=0.590816;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0432722;OID=.;OPOS=46450070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:44:44:20:20:0.3125:7:13:23:21:7:13:23:21 chr3 46480801 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.309;QD=59.4356;RBI=0.0305408;REFB=0;REVB=0.030233;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123678;OID=.;OPOS=46480801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0 chr3 46484964 . G A 205.17 PASS AF=0.469388;AO=22;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.00443657;FXX=0.0925755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.505;QD=16.7482;RBI=0.0049793;REFB=-0.0151581;REVB=-0.00226059;RO=25;SAF=4;SAR=18;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549344;STB=0.789225;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0257138;OID=.;OPOS=46484964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:26:22:23:0.469388:18:4:19:6:18:5:20:6 chr3 46501213 . T C 386.95 PASS AF=0.425743;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.014143;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.848;QD=15.3247;RBI=0.0141886;REFB=-0.00703045;REVB=0.00113623;RO=58;SAF=21;SAR=22;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118667;STB=0.506676;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0097773;OID=.;OPOS=46501213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:58:58:43:43:0.425743:22:21:29:29:22:21:29:29 chr3 46501268 . C T 422.95 PASS AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00791305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.536;QD=18.389;RBI=0.00860028;REFB=-0.0264646;REVB=-0.00336873;RO=48;SAF=20;SAR=23;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263174;STB=0.508643;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0269398;OID=.;OPOS=46501268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:49:43:43:0.467391:23:20:21:27:23:20:22:27 chr3 46501284 . C CCTT 1230.52 PASS AF=1;AO=78;DP=90;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241498;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=3;MLLD=279.681;QD=61.5259;RBI=0.0482259;REFB=0;REVB=0.0481653;RO=10;SAF=37;SAR=41;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375082;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.80553e-05;OID=.;OPOS=46501285;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:78:90:80:80:0:38:42:0:0:7:10:37:41:3:7 chr3 46580591 . G T 260.51 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0418237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.512;QD=14.4728;RBI=0.0524841;REFB=0.000482193;REVB=-0.0317074;RO=42;SAF=6;SAR=24;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493958;STB=0.781415;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00260362;OID=.;OPOS=46580591;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:24:6:28:14:24:6:28:14 chr3 46620614 . T C 804.5 PASS AF=0.482558;AO=83;DP=172;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=0.00111601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9189;QD=18.7092;RBI=0.0452653;REFB=-0.0117529;REVB=0.0452515;RO=89;SAF=37;SAR=46;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0034653;STB=0.501913;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0157382;OID=.;OPOS=46620614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:89:89:83:83:0.482558:46:37:40:49:46:37:40:49 chr3 46654132 . G A 1824.75 PASS AF=0.991736;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0082738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.641;QD=60.3225;RBI=0.0308729;REFB=0.00327907;REVB=0.0297436;RO=0;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504132;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=3.83723e-05;OID=.;OPOS=46654132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:121:0:1:119:120:0.991736:60:59:0:0:60:60:1:0 chr3 46658737 . AT GC,GT 1281.35 PASS AF=0.0357143,0.964286;AO=3,80;DP=85;FAO=3,81;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=0,39;FSAR=3,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214041,0.0370554;FXX=0.0117633;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=56.1677,67.7411;QD=61.0167;RBI=0.0533913,0.0917365;REFB=0,0;REVB=0.0489132,0.0839196;RO=0;SAF=0,39;SAR=3,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0219562,-0.000416923;OID=.,.;OPOS=46658737,46658737;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:85:84:0:0:3,80:3,81:0.0357143,0.964286:3,41:0,39:0:0:3,42:0,39:0:0 chr3 46713457 . C G 483.91 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.08494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5188;QD=19.1648;RBI=0.0851453;REFB=0.0474229;REVB=0.00590987;RO=51;SAF=29;SAR=21;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153115;STB=0.584782;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.0255777;OID=.;OPOS=46713457;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:51:50:50:0.49505:21:29:21:30:21:29:21:30 chr3 46722692 . G T 443.14 PASS AF=0.7;AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0369534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6414;QD=35.4514;RBI=0.0370402;REFB=0.00455183;REVB=-0.00253464;RO=15;SAF=19;SAR=16;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042166;STB=0.522923;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.0025711;OID=.;OPOS=46722692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:15:15:35:35:0.7:16:19:7:8:16:19:7:8 chr3 46729757 . C G 328.55 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0346419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4512;QD=15.4612;RBI=0.0410419;REFB=-0.0248831;REVB=0.0220085;RO=47;SAF=15;SAR=21;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158259;STB=0.57756;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0358064;OID=.;OPOS=46729757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:49:36:36:0.423529:21:15:27:20:21:15:27:22 chr3 46755937 . C T 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.026428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.327;QD=10.1407;RBI=0.0277583;REFB=-0.0114374;REVB=-0.00849016;RO=28;SAF=4;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227554;STB=0.637576;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0237023;OID=.;OPOS=46755937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:9:4:14:14:9:4:14:14 chr3 46775322 . A G 305.58 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0357637;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.637;QD=14.5513;RBI=0.0441772;REFB=-0.0225657;REVB=-0.0259341;RO=53;SAF=15;SAR=19;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126049;STB=0.50071;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0298175;OID=.;OPOS=46775322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:84:53:50:34:34:0.404762:19:15:24:29:19:15:22:28 chr3 46775383 . A G 176.72 PASS AF=0.403846;AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00632773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2509;QD=13.594;RBI=0.066938;REFB=-0.0113977;REVB=-0.0666382;RO=31;SAF=5;SAR=15;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134455;STB=0.548339;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0175509;OID=.;OPOS=46775383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:31:31:20:21:0.403846:15:5:11:20:15:6:11:20 chr3 46775569 . C T 547.16 PASS AF=0.595238;AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00453839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.378;QD=26.055;RBI=0.00469317;REFB=-0.0206903;REVB=0.00119535;RO=34;SAF=26;SAR=24;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366118;STB=0.519992;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0196726;OID=.;OPOS=46775569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:34:34:50:50:0.595238:24:26:16:18:24:26:16:18 chr3 46775608 . A G 589.64 PASS AF=0.55102;AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0134488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.012;QD=24.067;RBI=0.0185655;REFB=-0.0367687;REVB=0.0127987;RO=44;SAF=28;SAR=26;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893758;STB=0.549002;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0259184;OID=.;OPOS=46775608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:44:44:54:54:0.55102:26:28:18:26:26:28:18:26 chr3 46777881 . C G 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=-0.000448836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9467;QD=13.7528;RBI=0.0222452;REFB=0.00834986;REVB=-0.0222407;RO=23;SAF=6;SAR=9;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383171;STB=0.71974;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.0167582;OID=.;OPOS=46777881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:9:6:18:5:9:6:18:5 chr3 46777885 . T C 118.19 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0535388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.188;QD=12.4412;RBI=0.0572325;REFB=-0.00224087;REVB=0.0202275;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365795;STB=0.695401;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.000983883;OID=.;OPOS=46777885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:23:24:14:14:0.368421:8:6:18:5:8:6:18:6 chr3 46933960 . C G 222.53 PASS AF=0.468085;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0378866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.39;QD=18.9387;RBI=0.0443075;REFB=-0.0317013;REVB=-0.022973;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194062;STB=0.618217;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.01786;OID=.;OPOS=46933960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:25:25:21:22:0.468085:10:11:8:17:10:12:8:17 chr3 46944274 . T C 429.0 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5498;QD=57.2005;RBI=0.0522257;REFB=0;REVB=-0.0322355;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172316;OID=.;OPOS=46944274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0 chr3 46944368 . T C 226.2 PASS AF=0.405797;AO=26;DP=67;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00151943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.908;QD=13.1133;RBI=0.00264821;REFB=-0.0114569;REVB=0.00216895;RO=41;SAF=7;SAR=19;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254056;STB=0.604752;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0251188;OID=.;OPOS=46944368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:41:41:26:28:0.405797:19:7:20:21:19:9:20:21 chr3 46965111 . C T 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0282724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.17;QD=15.2931;RBI=0.0333747;REFB=-0.0249667;REVB=-0.0177354;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371297;STB=0.559863;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0249476;OID=.;OPOS=46965111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:3:6:5:3:3:6:5:4 chr3 47018214 . T C 994.33 PASS AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0319722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.615;QD=57.6424;RBI=0.0319951;REFB=-0.135567;REVB=0.00120855;RO=1;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108646;STB=0.505745;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000355796;OID=.;OPOS=47018214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:43:24:0:1:43:25:0:1 chr3 47033993 . AGGGGGA AGGGGA,AGGGGAG,GAGGGGA 1475.16 PASS AF=0.947977,0,0.0462428;AO=57,9,20;DP=173;FAO=164,0,8;FDP=173;FR=.;FRO=1;FSAF=106,0,0;FSAR=58,0,8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.648825,0.0985005,0.228452;FXX=0.0170445;HRUN=5,5,1;LEN=1,2,2;MLLD=11.5211,99.0495,9.41135;QD=34.1077;RBI=0.661479,0.098519,0.228591;REFB=-0.0441154,0.0208306,0.00486204;REVB=0.128762,-0.00190909,0.00798589;RO=75;SAF=29,9,1;SAR=28,0,19;SRF=63;SRR=12;SSEN=0.315789,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.344023,0.531529,-0.810958;STB=0.504273,0.5,0.5;STBP=0.266,1,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.0479432,0,-0.125123;OID=.,.,.;OPOS=47033994,47033998,47033993;OREF=G,GA,AG;OALT=-,AG,GA;OMAPALT=AGGGGA,AGGGGAG,GAGGGGA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:13:173:173:75:1:57,9,20:164,0,8:0.947977,0,0.0462428:28,0,19:29,9,1:63:12:58,0,8:106,0,0:0:1 chr3 47043538 . C T 1236.67 PASS AF=0.97619;AO=81;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0599381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3718;QD=58.889;RBI=0.0676908;REFB=0.0367375;REVB=0.0314558;RO=2;SAF=38;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00141309;STB=0.500875;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.00390801;OID=.;OPOS=47043538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:81:82:0.97619:43:38:1:1:44:38:1:1 chr3 47045739 . C G 427.45 PASS AF=0.888889;AO=32;DP=36;FAO=32;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0551158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.779;QD=47.4942;RBI=0.0775525;REFB=-0.142945;REVB=0.0545585;RO=1;SAF=7;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620845;STB=0.611036;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00480316;OID=.;OPOS=47045739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:36:36:1:4:32:32:0.888889:25:7:1:0:25:7:4:0 chr3 47045846 . C T 61.22 PASS AF=0.473684;AO=7;DP=17;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.080355;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=51.9212;QD=12.888;RBI=0.0852435;REFB=-0.025663;REVB=0.0284523;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125396;STB=0.523757;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.014398;OID=.;OPOS=47045846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:17:19:10:10:7:9:0.473684:5:2:4:6:5:4:4:6 chr3 47125385 . G A 726.87 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011845;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.612;QD=57.0096;RBI=0.0129725;REFB=0;REVB=0.0129183;RO=0;SAF=39;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6033e-05;OID=.;OPOS=47125385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:12:39:0:0:12:39:0:0 chr3 47161214 . T C 233.44 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.735;QD=46.6869;RBI=0.0200763;REFB=-0.0930126;REVB=-0.0177547;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000833656;OID=.;OPOS=47161214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:20:20:0:0:19:20:1:6:13:0:0:7:13:0:0 chr3 47162661 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.285;QD=51.1846;RBI=0.0193487;REFB=0;REVB=0.0160124;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122388;OID=.;OPOS=47162661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr3 47282303 . G A 975.97 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163418;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.303;QD=59.15;RBI=0.0164046;REFB=0;REVB=-0.0014351;RO=0;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81058e-05;OID=.;OPOS=47282303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:23:43:0:0:23:43:0:0 chr3 47322496 . C T 747.05 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0206;QD=63.5785;RBI=0.0805574;REFB=0;REVB=0.061312;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00154438;OID=.;OPOS=47322496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:35:12:0:0:35:12:0:0 chr3 47385585 . C A 631.33 PASS AF=1;AO=36;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287643;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.8413;QD=61.5932;RBI=0.0698618;REFB=0;REVB=0.0636654;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218043;OID=.;OPOS=47385585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:36:41:1:15:21:0:0:19:22:0:0 chr3 47386059 . TG CC 613.95 PASS AF=1;AO=4;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156226;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=64.5999;QD=58.4713;RBI=0.20842;REFB=0;REVB=0.137958;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00487658;OID=.;OPOS=47386059;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:4:42:1:2:2:0:0:18:24:0:0 chr3 47449058 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.408;QD=42.1826;RBI=0.0792478;REFB=0;REVB=0.0535642;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000654349;OID=.;OPOS=47449058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr3 47452086 . C CA 93.77 PASS AF=1;AO=2;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.192777;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=80.2292;QD=37.508;RBI=0.192967;REFB=0;REVB=0.00854517;RO=8;SAF=2;SAR=0;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.742825;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00246075;OID=.;OPOS=47452087;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:10:10:10:0:3:7:0:0:4:8:2:0:1:7 chr3 47452087 . G A,C 100.28 PASS AF=0.8,0.2;AO=8,2;DP=10;FAO=8,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1,2;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0547079,0.0128073;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=97.7016,15.7362;QD=40.1137;RBI=0.0551078,0.11766;REFB=0,0;REVB=-0.00662705,-0.116961;RO=0;SAF=1,2;SAR=7,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000549009,0.0607508;OID=.,.;OPOS=47452087,47452087;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:10:10:0:0:8,2:8,2:0.8,0.2:7,0:1,2:0:0:7,0:1,2:0:0 chr3 47452786 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.562;QD=53.2771;RBI=0.0265527;REFB=0;REVB=0.0197885;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02029e-06;OID=.;OPOS=47452786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr3 47454399 . G A 169.77 PASS AF=1;AO=12;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.1351;QD=45.2718;RBI=0.0621716;REFB=0;REVB=0.0621716;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0026883;OID=.;OPOS=47454399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:12:15:1:12:0:0:0:15:0:0:0 chr3 47459679 . C T 133.53 PASS AF=0.4;AO=15;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0355776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.71;QD=13.3526;RBI=0.0585428;REFB=-0.0058589;REVB=0.0464918;RO=25;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291666;STB=0.634807;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00565036;OID=.;OPOS=47459679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:24:15:16:0.4:6:9:8:17:7:9:8:16 chr3 47462200 . T C 542.64 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000280441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.073;QD=58.6639;RBI=0.0554561;REFB=0;REVB=0.0554554;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233901;OID=.;OPOS=47462200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr3 47539751 . T C 854.1 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00986497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.924;QD=56.0066;RBI=0.0250782;REFB=-0.0249264;REVB=0.0230564;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.506664;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000465971;OID=.;OPOS=47539751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:23:37:0:0:23:37:1:0 chr3 47618953 . C A 171.26 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0186008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.123;QD=12.4555;RBI=0.0196368;REFB=-0.00871489;REVB=0.00629418;RO=33;SAF=7;SAR=14;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317345;STB=0.674533;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0130687;OID=.;OPOS=47618953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:34:21:21:0.381818:14:7:21:12:14:7:21:13 chr3 47645933 . A T 590.66 PASS AF=0.602273;AO=53;DP=88;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.014489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2393;QD=26.8479;RBI=0.0507696;REFB=-0.00954835;REVB=-0.0486582;RO=35;SAF=30;SAR=23;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14154;STB=0.577141;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00567991;OID=.;OPOS=47645933;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:35:35:53:53:0.602273:23:30:13:22:23:30:13:22 chr3 48419897 . C T 957.77 PASS AF=0.985075;AO=64;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0243021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9705;QD=57.1804;RBI=0.0262046;REFB=-0.0831472;REVB=0.0098025;RO=1;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125954;STB=0.506327;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000729331;OID=.;OPOS=48419897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:67:1:1:64:66:0.985075:37:27:0:1:39:27:0:1 chr3 48465113 . G C 223.61 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0316689;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=218.546;QD=26.3068;RBI=0.0362434;REFB=-0.0495194;REVB=0.0176257;RO=13;SAF=5;SAR=16;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00698059;STB=0.503872;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0239317;OID=.;OPOS=48465113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:16:5:3:10:16:5:3:10 chr3 48476431 . C G 1510.82 PASS AF=0.990476;AO=102;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.014448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.678;QD=57.5551;RBI=0.015101;REFB=-0.06565;REVB=0.00439266;RO=3;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251741;STB=0.504347;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.000298347;OID=.;OPOS=48476431;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:105:105:3:1:102:104:0.990476:55:47:0:3:57:47:0:1 chr3 48510883 . A AG 33.97 PASS AF=0.218182;AO=15;DP=55;FAO=12;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0353431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.475;QD=2.4707;RBI=0.122495;REFB=-0.0664071;REVB=-0.117286;RO=40;SAF=13;SAR=2;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36023;STB=0.817932;STBP=0.041;TYPE=ins;VARB=0.135575;OID=.;OPOS=48510884;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.218182:15:55:12:55:43:11:1:28:15:33:40:13:2:26:14 chr3 48616675 . G A 144.1 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0167061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8651;QD=24.0161;RBI=0.0285343;REFB=-0.0409391;REVB=0.0231324;RO=8;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207478;STB=0.533289;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0610819;OID=.;OPOS=48616675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:8:9:15:15:0.625:7:8:4:4:7:8:4:5 chr3 48625266 . T C 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.050447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.06;QD=11.8139;RBI=0.0529048;REFB=-0.00351308;REVB=0.0159383;RO=22;SAF=10;SAR=3;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525392;STB=0.526274;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00539638;OID=.;OPOS=48625266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:23:13:13:0.361111:3:10:17:5:3:10:17:6 chr3 48628014 . G A 197.56 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0204718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.502;QD=26.3416;RBI=0.0212932;REFB=-0.0235604;REVB=0.0058572;RO=11;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16279;STB=0.59081;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0145333;OID=.;OPOS=48628014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:13:6:6:5:13:6:6:5 chr3 48727112 . G A 769.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.724;QD=57.0003;RBI=0.0234426;REFB=0;REVB=0.0146358;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131153;OID=.;OPOS=48727112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0 chr3 48995487 . C T 164.49 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226129;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.549;QD=46.9976;RBI=0.0398663;REFB=0;REVB=0.0328326;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42937e-05;OID=.;OPOS=48995487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr3 49053219 . A G 1036.26 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664534;FXX=0.0675584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.108;QD=60.0729;RBI=0.00751747;REFB=0;REVB=-0.00351451;RO=0;SAF=19;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106557;OID=.;OPOS=49053219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:49:19:0:0:49:20:0:0 chr3 49054692 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.709;QD=57.2025;RBI=0.0325696;REFB=0;REVB=0.0142709;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.11668e-05;OID=.;OPOS=49054692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr3 49200627 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.618;QD=35.5756;RBI=0.128324;REFB=0;REVB=0.120565;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00690447;OID=.;OPOS=49200627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr3 49200692 . T A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.736;QD=47.8223;RBI=0.156835;REFB=0;REVB=0.156193;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00401026;OID=.;OPOS=49200692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr3 49273996 . C T 115.58 PASS AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0247528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.569;QD=30.82;RBI=0.0452379;REFB=-0.0591501;REVB=0.0378651;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521702;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0154004;OID=.;OPOS=49273996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:0:3:12:12:0.8:3:9:0:0:3:9:2:1 chr3 49298139 . G A 487.39 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0437075;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4636;QD=55.7015;RBI=0.0439682;REFB=-0.167479;REVB=-0.00478047;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00415561;OID=.;OPOS=49298139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:36:35:0:1:34:34:0.971429:16:18:0:0:16:18:1:0 chr3 49298205 . T C 447.01 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0719068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.395;QD=57.6791;RBI=0.0811659;REFB=0;REVB=0.0376473;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012101;OID=.;OPOS=49298205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr3 49548008 . C G 730.58 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00489713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5828;QD=54.1171;RBI=0.0243368;REFB=-0.109479;REVB=0.023839;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.508194;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00169869;OID=.;OPOS=49548008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:23:30:0:0:23:30:1:0 chr3 49570882 . T C 1549.08 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2537;QD=63.8794;RBI=0.0303626;REFB=0;REVB=0.0113731;RO=0;SAF=38;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66457e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125708;OID=.;OPOS=49570882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:59:38:0:0:59:38:0:0 chr3 49690199 . G A 1786.95 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506194;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.022;QD=61.0925;RBI=0.0546827;REFB=0;REVB=0.0206852;RO=0;SAF=50;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89668e-05;OID=.;OPOS=49690199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:67:50:0:0:67:50:0:0 chr3 49701298 . G A 1438.37 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0250011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4473;QD=61.8653;RBI=0.0259633;REFB=-0.00120191;REVB=-0.00700254;RO=1;SAF=48;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977435;STB=0.505153;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=5.63294e-05;OID=.;OPOS=49701298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:44:48:1:0:44:48:1:0 chr3 49708769 . T C 1419.55 PASS AF=0.970297;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0343287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2793;QD=56.2198;RBI=0.0343308;REFB=-0.0285573;REVB=0.000380876;RO=2;SAF=45;SAR=53;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0015582;STB=0.506197;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00807935;OID=.;OPOS=49708769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:101:101:2:3:98:98:0.970297:53:45:1:1:53:45:2:1 chr3 49723784 . C A 69.25 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00587466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.672;QD=30.7761;RBI=0.0222562;REFB=-0.0358192;REVB=0.0214669;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080241;STB=0.545344;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00331378;OID=.;OPOS=49723784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:5:3:0:1:5:3:0:1 chr3 49724808 . T C 1330.92 PASS AF=0.977528;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00621576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.2473;QD=59.8167;RBI=0.0262998;REFB=-0.028371;REVB=-0.0255547;RO=2;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236761;STB=0.512497;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.000321861;OID=.;OPOS=49724808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:89:89:2:2:87:87:0.977528:39:48:0:2:39:48:0:2 chr3 49726028 . T C 43.83 PASS AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0158082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.145;QD=6.26144;RBI=0.0319484;REFB=-0.00716225;REVB=-0.0277633;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218582;STB=0.639616;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0304389;OID=.;OPOS=49726028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:4:3:13:8:4:3:13:8 chr3 49726070 . G A 34.88 PASS AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00922741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.044;QD=4.81089;RBI=0.0248562;REFB=-0.0109752;REVB=-0.02308;RO=23;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270373;STB=0.68122;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0532076;OID=.;OPOS=49726070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:4:2:13:10:4:2:13:10 chr3 49739507 . G C 364.81 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0224566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1798;QD=52.1164;RBI=0.030707;REFB=0.0179797;REVB=-0.0209433;RO=1;SAF=10;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442286;STB=0.523792;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00622434;OID=.;OPOS=49739507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:17:10:1:0:17:10:1:0 chr3 49760039 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.801;QD=62.0217;RBI=0.0403816;REFB=0;REVB=0.01554;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248927;OID=.;OPOS=49760039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr3 49928691 . T C 134.63 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900134;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.548;QD=44.8764;RBI=0.0339294;REFB=0;REVB=0.0327136;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492752;OID=.;OPOS=49928691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr3 50114515 . C T 417.93 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.559;QD=53.9263;RBI=0.0376132;REFB=0.0116873;REVB=-0.0264474;RO=1;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547301;STB=0.529392;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.000128012;OID=.;OPOS=50114515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:8:22:0:1:8:22:0:1 chr3 50129399 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00625985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.408;QD=59.4349;RBI=0.0817835;REFB=0;REVB=-0.0815435;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018249;OID=.;OPOS=50129399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr3 50144951 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0690958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.4555;QD=52.6127;RBI=0.069107;REFB=0;REVB=0.00124267;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00196835;OID=.;OPOS=50144951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr3 50153356 . T C 751.79 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.683;QD=56.7385;RBI=0.0734134;REFB=0;REVB=0.0693949;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105022;OID=.;OPOS=50153356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:29:22:0:0:30:23:0:0 chr3 50197092 . C T 675.09 PASS AF=0.98;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00580169;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.894;QD=54.0071;RBI=0.0541131;REFB=-0.0452044;REVB=0.0538012;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00480628;OID=.;OPOS=50197092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:50:0:1:48:49:0.98:27:21:0:0:27:22:1:0 chr3 50222926 . T A 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.927;QD=62.022;RBI=0.032086;REFB=0;REVB=0.0281038;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58071e-05;OID=.;OPOS=50222926;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr3 50251833 . A AG 396.06 PASS AF=1;AO=35;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.4863;QD=41.6905;RBI=0.108755;REFB=0;REVB=0.00385006;RO=1;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301623;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00514317;OID=.;OPOS=50251834;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:35:38:38:38:0:20:18:0:0:7:1:20:15:0:1 chr3 50311899 . AC A,AT 696.55 PASS AF=0.212766,0.787234;AO=7,37;DP=46;FAO=10,37;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=8,24;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000349827,0.00069418;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=298.445,317.672;QD=59.2807;RBI=0.0347574,0.0301055;REFB=0,0;REVB=0.0347556,0.0300975;RO=0;SAF=6,24;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0254355,0.00647349;OID=.,.;OPOS=50311900,50311900;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.212766,0.787234:7,37:46:10,37:47:0:8,24:2,13:0:0:48:0:6,24:1,13:0:0 chr3 50311902 . G T 53.12 PASS AF=0.1875;AO=8;DP=47;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0467297;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.7243;QD=4.42686;RBI=0.0509495;REFB=-0.0431122;REVB=0.0203023;RO=39;SAF=7;SAR=1;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370767;STB=0.636033;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.18824;OID=.;OPOS=50311902;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:47:48:39:39:8:9:0.1875:1:7:25:14:2:7:25:14 chr3 50326020 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.776;QD=56.1915;RBI=0.0252876;REFB=0;REVB=0.000241612;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152237;OID=.;OPOS=50326020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr3 50327429 . A G 219.58 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0031732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.7958;QD=48.7953;RBI=0.00390991;REFB=0;REVB=0.00228434;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00353297;OID=.;OPOS=50327429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:8:9:0:0:9:9:0:0 chr3 50329826 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.505;QD=45.8068;RBI=0.0686328;REFB=0;REVB=0.0580784;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000849427;OID=.;OPOS=50329826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr3 50334231 . T A 345.49 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116111;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5173;QD=55.2789;RBI=0.0278156;REFB=0;REVB=0.0252763;RO=0;SAF=23;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34264e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000417945;OID=.;OPOS=50334231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:2:23:0:0:2:23:0:0 chr3 50336661 . T C 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00330053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.464;QD=60.977;RBI=0.00510262;REFB=0;REVB=0.00389143;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20487e-06;OID=.;OPOS=50336661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0 chr3 50355730 . T G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.172;QD=58.5876;RBI=0.0353356;REFB=0;REVB=0.022715;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.62454e-05;OID=.;OPOS=50355730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr3 50357869 . A C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.558;QD=61.336;RBI=0.0320158;REFB=0;REVB=0.0024911;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168585;OID=.;OPOS=50357869;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr3 50367867 . A C 404.23 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.862;QD=55.7554;RBI=0.0417897;REFB=0;REVB=0.0138612;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145659;OID=.;OPOS=50367867;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:11:18:0:0 chr3 50401841 . G A 659.05 PASS AF=0.925926;AO=49;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.159652;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.3232;QD=48.8189;RBI=0.170776;REFB=-0.132071;REVB=0.060628;RO=2;SAF=15;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167043;STB=0.527767;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.014016;OID=.;OPOS=50401841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:54:54:2:4:49:50:0.925926:34:15:1:1:34:16:0:4 chr3 50457227 . G A 184.88 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0111474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.57;QD=12.1234;RBI=0.0528077;REFB=-0.00795691;REVB=0.0516178;RO=38;SAF=15;SAR=8;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276407;STB=0.659436;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00804773;OID=.;OPOS=50457227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:8:15:15:23:8:15:15:23 chr3 50597092 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00773588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.833;QD=56.9566;RBI=0.0711663;REFB=0;REVB=0.0707446;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276254;OID=.;OPOS=50597092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr3 50609624 . T G 384.91 PASS AF=0.567164;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0351051;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1024;QD=22.9796;RBI=0.0382181;REFB=0.0186146;REVB=-0.015108;RO=28;SAF=17;SAR=21;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186745;STB=0.591857;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00996838;OID=.;OPOS=50609624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:28:29:38:38:0.567164:21:17:6:22:21:17:7:22 chr3 50645158 . A G 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0139854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1233;QD=13.4585;RBI=0.0336836;REFB=-0.0231406;REVB=-0.030643;RO=26;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852039;STB=0.549936;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0304179;OID=.;OPOS=50645158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:5:11:16:10:5:11:16:10 chr3 50645413 . G A 316.96 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.000940676;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.294;QD=17.6089;RBI=0.0150171;REFB=-0.0133563;REVB=0.0149876;RO=38;SAF=15;SAR=19;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202162;STB=0.612838;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0151368;OID=.;OPOS=50645413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:38:38:34:34:0.472222:19:15:25:13:19:15:25:13 chr3 50647888 . T G 510.58 PASS AF=0.486486;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00602533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.915;QD=18.3991;RBI=0.00912408;REFB=-0.0164226;REVB=-0.00685158;RO=57;SAF=26;SAR=28;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903912;STB=0.505008;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0163762;OID=.;OPOS=50647888;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:57:57:54:54:0.486486:28:26:28:29:28:26:28:29 chr3 51273773 . T C 1472.54 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515712;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.484;QD=63.3349;RBI=0.0516885;REFB=0;REVB=-0.00347906;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00967e-05;OID=.;OPOS=51273773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:50:43:0:0:50:43:0:0 chr3 51430657 . A C 236.14 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0328455;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.636;QD=17.4922;RBI=0.0329069;REFB=-0.00684313;REVB=-0.00200919;RO=29;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052192;STB=0.519985;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00638237;OID=.;OPOS=51430657;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:29:28:26:26:0.481481:14:12:15:14:14:12:14:14 chr3 51431236 . TG T 32.84 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0100425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.4145;QD=6.25474;RBI=0.10304;REFB=-0.0352705;REVB=0.102549;RO=14;SAF=0;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.381757;SSSB=-0.765948;STB=0.844052;STBP=0.047;TYPE=del;VARB=0.100322;OID=.;OPOS=51431237;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:6:21:7:21:14:1:6:9:5:32:14:0:6:9:5 chr3 51431981 . C CTTAT,T 203.34 PASS AF=0.392157,0.0588235;AO=17,3;DP=52;FAO=20,3;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=13,3;FSAR=7,0;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0215149,-0.0275401;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=4,1;MLLD=200.521,135.158;QD=15.9479;RBI=0.0216435,0.0696155;REFB=-0.0104335,0.00221736;REVB=-0.00235639,0.0639364;RO=30;SAF=11,3;SAR=6,0;SRF=14;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.19973,0.560482;STB=0.610998,0.996576;STBP=0.216,0.091;TYPE=ins,snp;VARB=0.0180388,-0.0284912;OID=.,.;OPOS=51431982,51431981;OREF=-,C;OALT=TTAT,T;OMAPALT=CTTAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:30:28:17,3:20,3:0.392157,0.0588235:6,0:11,3:14:16:7,0:13,3:13:15 chr3 51432847 . C T 487.71 PASS AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0184191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.597;QD=21.6759;RBI=0.0192725;REFB=-0.0148162;REVB=0.00567157;RO=43;SAF=14;SAR=33;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13911;STB=0.577072;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0156839;OID=.;OPOS=51432847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:33:14:19:24:33:14:19:24 chr3 51432895 . T C 740.42 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.253;QD=56.9557;RBI=0.0294949;REFB=0;REVB=0.0207068;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021821;OID=.;OPOS=51432895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chr3 51433034 . G A 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00948293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.693;QD=13.9482;RBI=0.0356298;REFB=-0.0158297;REVB=-0.0343447;RO=27;SAF=15;SAR=2;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.521409;STB=0.810383;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0128673;OID=.;OPOS=51433034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:2:15:13:14:2:15:13:14 chr3 51433932 . AACTT A 81.62 PASS AF=0.48;AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0217375;FXX=0;HRUN=4;LEN=4;MLLD=267.138;QD=13.0594;RBI=0.0326139;REFB=-0.000909384;REVB=-0.0243136;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160306;STB=0.563652;STBP=0.557;TYPE=del;VARB=0.000859957;OID=.;OPOS=51433933;OREF=ACTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.48:11:23:12:25:13:7:5:6:7:81:11:7:4:5:6 chr3 51433995 . TTA T 312.49 PASS AF=0.616667;AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.000512007;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=65.2248;QD=20.8323;RBI=0.0500574;REFB=0.0365621;REVB=-0.0500548;RO=24;SAF=25;SAR=12;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280017;STB=0.645676;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=-0.0251195;OID=.;OPOS=51433996;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.616667:37:61:37:60:23:25:12:7:16:99:24:25:12:7:17 chr3 51434215 . A C 171.58 PASS AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0191268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.659;QD=18.5493;RBI=0.0221815;REFB=-0.0169866;REVB=0.0112331;RO=19;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116975;STB=0.544841;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0162696;OID=.;OPOS=51434215;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:19:19:17:18:0.486486:11:6:9:10:11:7:9:10 chr3 51728573 . G A 337.17 PASS AF=0.611111;AO=32;DP=53;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0165448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.506;QD=24.9755;RBI=0.0257154;REFB=-0.0101008;REVB=-0.0196863;RO=21;SAF=18;SAR=14;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966717;STB=0.557527;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00676308;OID=.;OPOS=51728573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:21:21:32:33:0.611111:14:18:9:12:14:19:9:12 chr3 51737965 . G A 287.45 PASS AF=0.31405;AO=37;DP=121;FAO=38;FDP=121;FR=.;FRO=83;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.00691327;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.004;QD=9.5025;RBI=0.00992967;REFB=-0.0107243;REVB=-0.00712776;RO=83;SAF=21;SAR=16;SRF=38;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129565;STB=0.564825;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.029372;OID=.;OPOS=51737965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:83:83:37:38:0.31405:16:21:38:45:17:21:38:45 chr3 51911118 . C T 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0505107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.478;QD=26.0262;RBI=0.0513126;REFB=0.0452864;REVB=0.00903628;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123249;STB=0.571194;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00504204;OID=.;OPOS=51911118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:0:1:3:3:0:1 chr3 51978220 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00511906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.06;QD=57.6794;RBI=0.00915505;REFB=0;REVB=-0.00759013;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.94699e-06;OID=.;OPOS=51978220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0 chr3 51990930 . G C 278.85 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0788266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.884;QD=21.8708;RBI=0.081474;REFB=0.0205054;REVB=0.0206005;RO=23;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113897;STB=0.506325;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=-0.0125836;OID=.;OPOS=51990930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:15:13:11:12:15:13:11:12 chr3 52237970 . C T 131.29 PASS AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0075333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.412;QD=8.90106;RBI=0.0309211;REFB=-0.00121003;REVB=0.0299894;RO=41;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312401;STB=0.518643;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00765621;OID=.;OPOS=52237970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:11:7:17:24:11:7:17:24 chr3 52256697 . C T 198.71 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0400743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.742;QD=19.3862;RBI=0.0496668;REFB=-0.0387013;REVB=0.0293402;RO=21;SAF=4;SAR=16;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41821;STB=0.738872;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.015681;OID=.;OPOS=52256697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:16:4:13:8:16:4:13:8 chr3 52325759 . A G 376.98 PASS AF=0.425532;AO=39;DP=93;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00239735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.455;QD=16.0418;RBI=0.0122836;REFB=-0.00780983;REVB=-0.0120474;RO=54;SAF=15;SAR=24;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249325;STB=0.644665;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0123576;OID=.;OPOS=52325759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:54:54:39:40:0.425532:24:15:34:20:25:15:34:20 chr3 52366261 . C T 162.96 PASS AF=0.33871;AO=20;DP=63;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0340259;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2905;QD=10.5137;RBI=0.0516663;REFB=-0.00400219;REVB=0.0388798;RO=41;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126652;STB=0.524668;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0145497;OID=.;OPOS=52366261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:41:41:20:21:0.33871:11:9:18:23:11:10:18:23 chr3 52387181 . G A 229.8 PASS AF=0.29703;AO=30;DP=101;FAO=30;FDP=101;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.00729623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.269;QD=9.10084;RBI=0.0456271;REFB=-0.0130359;REVB=0.0450399;RO=70;SAF=11;SAR=19;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210257;STB=0.619348;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0229482;OID=.;OPOS=52387181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:70:71:30:30:0.29703:19:11:38:32:19:11:38:33 chr3 52430698 . A G 728.83 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.877;QD=57.1629;RBI=0.0245379;REFB=0;REVB=0.0168166;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.32108e-05;OID=.;OPOS=52430698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0 chr3 52432938 . G C 196.87 PASS AF=0.571429;AO=19;DP=34;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0229864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5624;QD=22.4997;RBI=0.024561;REFB=-0.0294053;REVB=0.00865256;RO=14;SAF=7;SAR=12;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209385;STB=0.609859;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0139899;OID=.;OPOS=52432938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:14:15:19:20:0.571429:12:7:9:5:13:7:9:6 chr3 52453893 . C T 866.55 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.439;QD=57.7697;RBI=0.0678125;REFB=0;REVB=0.0626291;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012904;OID=.;OPOS=52453893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:26:32:0:0:27:33:0:0 chr3 52477080 . T C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.175;QD=60.6094;RBI=0.017077;REFB=0;REVB=-0.00429461;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65328e-05;OID=.;OPOS=52477080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr3 52492707 . T C 1227.47 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.784;QD=61.3736;RBI=0.0260695;REFB=0;REVB=0.00484579;RO=0;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50105e-05;OID=.;OPOS=52492707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:40:40:0:0:40:40:0:0 chr3 52510592 . G A 746.93 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.592;QD=63.5682;RBI=0.0312186;REFB=0;REVB=0.0285083;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6242e-05;OID=.;OPOS=52510592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr3 52523404 . G GT 525.01 PASS AF=0.977778;AO=9;DP=52;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.115832;FXX=0.062487;HRUN=0;LEN=1;MLLD=27.178;QD=46.6676;RBI=0.127675;REFB=-0.0753584;REVB=-0.0537007;RO=41;SAF=8;SAR=1;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19581;STB=0.506664;STBP=0.642;TYPE=ins;VARB=0.0275969;OID=.;OPOS=52523405;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.977778:9:52:44:45:1:37:7:1:0:5:41:8:1:33:8 chr3 52523405 . C T 451.42 PASS AF=0.765957;AO=34;DP=47;FAO=36;FDP=47;FR=.;FRO=11;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.101794;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.7271;QD=38.419;RBI=0.102232;REFB=-0.117281;REVB=-0.00945988;RO=11;SAF=26;SAR=8;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162554;STB=0.582049;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0299205;OID=.;OPOS=52523405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:47:47:11:11:34:36:0.765957:8:26:11:0:8:28:11:0 chr3 52526372 . G T 89.5 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.000443215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.8394;QD=15.5644;RBI=0.0362473;REFB=-0.0376215;REVB=-0.0362446;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293955;STB=0.671941;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0328526;OID=.;OPOS=52526372;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:3:8:5:7:3:8:5:7 chr3 52540773 . T C 309.16 PASS AF=0.351351;AO=39;DP=111;FAO=39;FDP=111;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=49;FSRR=23;FWDB=-0.017742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.752;QD=11.1409;RBI=0.0185391;REFB=-0.00347533;REVB=-0.00537766;RO=72;SAF=21;SAR=18;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164607;STB=0.594014;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00543905;OID=.;OPOS=52540773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:72:72:39:39:0.351351:18:21:49:23:18:21:49:23 chr3 52544470 . A G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00995562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.747;QD=63.5823;RBI=0.0195209;REFB=0;REVB=-0.0167914;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.98352e-05;OID=.;OPOS=52544470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr3 52554304 . G C 789.37 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00398692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.743;QD=52.6245;RBI=0.00399219;REFB=-0.0328855;REVB=-0.000204918;RO=1;SAF=26;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177973;STB=0.518512;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00110836;OID=.;OPOS=52554304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:60:1:2:58:58:0.966667:32:26:1:0:32:26:2:0 chr3 52555957 . T C 135.55 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0224111;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4392;QD=15.9464;RBI=0.0447469;REFB=-0.00652486;REVB=-0.0387301;RO=19;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271683;STB=0.657897;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0134542;OID=.;OPOS=52555957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:19:19:15:15:0.441176:4:11:9:10:4:11:9:10 chr3 52556890 . A G 357.45 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0222953;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6511;QD=21.9968;RBI=0.0721317;REFB=-0.0352132;REVB=-0.0685996;RO=29;SAF=22;SAR=14;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214486;STB=0.618333;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0161543;OID=.;OPOS=52556890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:29:29:36:36:0.553846:14:22:10:19:14:22:10:19 chr3 52557038 . C T 281.38 PASS AF=0.517241;AO=29;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0208624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8855;QD=19.4053;RBI=0.0282918;REFB=-0.027376;REVB=-0.0191099;RO=28;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151739;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01959;OID=.;OPOS=52557038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:29:30:0.517241:15:14:14:14:15:15:14:14 chr3 52558008 . T C 366.92 PASS AF=0.631579;AO=35;DP=56;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0174608;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.44;QD=25.7488;RBI=0.0261501;REFB=-0.0384613;REVB=0.0194666;RO=19;SAF=20;SAR=15;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196666;STB=0.608636;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.013061;OID=.;OPOS=52558008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:19:21:35:36:0.631579:15:20:5:14:15:21:6:15 chr3 52558133 . T C 415.36 PASS AF=0.434343;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.0159612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.367;QD=16.7821;RBI=0.0162432;REFB=-0.0143601;REVB=0.00301349;RO=55;SAF=25;SAR=18;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366512;STB=0.526303;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0172866;OID=.;OPOS=52558133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:55:56:43:43:0.434343:18:25:30:25:18:25:30:26 chr3 52558904 . A T 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0325605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.364;QD=14.9787;RBI=0.0333424;REFB=-0.0044259;REVB=0.00717821;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376093;STB=0.719196;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00280632;OID=.;OPOS=52558904;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:8:3:7:3:8:3 chr3 52584787 . T C 270.75 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0950782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2125;QD=16.9219;RBI=0.0965865;REFB=5.30503e-05;REVB=-0.0170026;RO=31;SAF=11;SAR=19;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506673;STB=0.55757;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00173392;OID=.;OPOS=52584787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:34:30:30:0.46875:19:11:13:18:19:11:16:18 chr3 52610651 . T A 211.04 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00373167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.903;QD=18.7591;RBI=0.0319049;REFB=-0.0152956;REVB=0.0316859;RO=22;SAF=6;SAR=15;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211772;STB=0.646113;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0322757;OID=.;OPOS=52610651;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:22:24:21:21:0.466667:15:6:11:11:15:6:13:11 chr3 52643307 . A G 227.99 PASS AF=0.440678;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0048323;FXX=0.0327815;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.534;QD=15.4567;RBI=0.0227896;REFB=-0.00283899;REVB=-0.0222714;RO=33;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189216;STB=0.607247;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00220638;OID=.;OPOS=52643307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:33:33:26:26:0.440678:10:16:14:19:10:16:14:19 chr3 52643685 . T C 220.94 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0303081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.37;QD=18.0357;RBI=0.0379158;REFB=-0.0142044;REVB=0.0227822;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313398;STB=0.67669;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0208208;OID=.;OPOS=52643685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:13:9:20:7:13:9:20:7 chr3 52676065 . C T 68.93 PASS AF=0.263158;AO=8;DP=35;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0170798;FXX=0.0952154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.582;QD=7.25624;RBI=0.0172686;REFB=-0.0219169;REVB=-0.00254679;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103271;STB=0.649195;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0272262;OID=.;OPOS=52676065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:35:38:14:28:8:10:0.263158:3:5:10:4:4:6:11:17 chr3 52720080 . A C 46.32 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0130384;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.852;QD=8.05483;RBI=0.0137862;REFB=-0.0158342;REVB=-0.00447863;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183097;STB=0.616089;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0408875;OID=.;OPOS=52720080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:24:23:16:16:7:7:0.304348:2:5:9:7:2:5:9:7 chr3 52721305 . G A 530.6 PASS AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.00534525;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.642;QD=22.8215;RBI=0.0148337;REFB=-0.00724412;REVB=-0.0138372;RO=43;SAF=13;SAR=37;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919073;STB=0.55075;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00595296;OID=.;OPOS=52721305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:37:13:15:28:37:13:15:28 chr3 52727257 . G A 528.93 PASS AF=0.515464;AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.00120309;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.673;QD=21.8115;RBI=0.0319694;REFB=-0.0112193;REVB=-0.0319467;RO=46;SAF=22;SAR=27;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195348;STB=0.605179;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00819945;OID=.;OPOS=52727257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:46:47:49:50:0.515464:27:22:31:15:28:22:31:16 chr3 52728804 . C T 253.17 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00515894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.676;QD=15.1145;RBI=0.00566701;REFB=-0.010783;REVB=-0.00234528;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256349;STB=0.514513;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.010986;OID=.;OPOS=52728804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:13:16:20:18:13:16:20:18 chr3 52740182 . C G 91.42 PASS AF=0.27907;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0429421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.682;QD=8.50375;RBI=0.0434779;REFB=-0.00463483;REVB=-0.00680427;RO=31;SAF=6;SAR=6;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948548;STB=0.558044;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0114525;OID=.;OPOS=52740182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:43:43:31:31:12:12:0.27907:6:6:18:13:6:6:18:13 chr3 52745087 . T C 160.5 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0187879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.985;QD=18.3431;RBI=0.0190138;REFB=0.00455284;REVB=-0.00292228;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074462;STB=0.542324;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.00393944;OID=.;OPOS=52745087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:9:8:7:11:9:8:7:11 chr3 52797634 . G C 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0381507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.493;QD=20.1601;RBI=0.0381886;REFB=-0.0126525;REVB=-0.00170074;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275361;STB=0.655547;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00631422;OID=.;OPOS=52797634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:6:10:4:10:6:10:4:10 chr3 52800284 . T C 777.32 PASS AF=0.496894;AO=79;DP=161;FAO=80;FDP=161;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.0373096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.472;QD=19.3122;RBI=0.0373152;REFB=-0.0149099;REVB=0.000645254;RO=81;SAF=37;SAR=42;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106727;STB=0.502889;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0118349;OID=.;OPOS=52800284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:81:81:79:80:0.496894:42:37:37:44:43:37:37:44 chr3 52802402 . A C 239.65 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0234989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.102;QD=18.0871;RBI=0.0287788;REFB=-0.0412459;REVB=0.0166139;RO=26;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158916;STB=0.582557;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0343143;OID=.;OPOS=52802402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:7:19:15:11:7:19:16:11 chr3 52820981 . A T 234.94 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0029474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0764;QD=18.7954;RBI=0.0109224;REFB=-0.00943968;REVB=-0.0105172;RO=26;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923585;STB=0.561472;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0168885;OID=.;OPOS=52820981;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:27:23:23:0.46:11:12:11:15:11:12:11:16 chr3 52821011 . A G 253.2 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0168851;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.19;QD=20.6696;RBI=0.0212492;REFB=-0.0314798;REVB=-0.0129005;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109043;STB=0.55174;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0308491;OID=.;OPOS=52821011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:26:25:24:24:0.489796:11:13:11:15:11:13:11:14 chr3 52821177 . A C 379.4 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0140714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.876;QD=19.2102;RBI=0.0146073;REFB=-0.0046606;REVB=0.00392043;RO=40;SAF=25;SAR=14;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221502;STB=0.623296;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00409904;OID=.;OPOS=52821177;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:14:25:16:24:14:25:16:24 chr3 52821992 . CT C,CC 129.36 PASS AF=0.297297,0.108108;AO=10,4;DP=39;FAO=11,4;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6,3;FSAR=5,1;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0180899,0.0123118;FXX=0.0512689;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=246.065,245.53;QD=13.9847;RBI=0.0252955,0.0208006;REFB=-0.0104043,-0.00821751;REVB=-0.017681,-0.0167656;RO=23;SAF=5,3;SAR=5,1;SRF=16;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.225143,0.0762926;STB=0.593059,0.571053;STBP=0.48,0.824;TYPE=del,snp;VARB=0.00630504,0.0209514;OID=.,.;OPOS=52821993,52821993;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.297297,0.108108:10,4:39:11,4:37:22:6,3:5,1:15:7:75:23:5,3:5,1:16:7 chr3 52825585 . T C 263.51 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.000313719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.866;QD=17.5676;RBI=0.0060827;REFB=-0.00935625;REVB=-0.0060746;RO=30;SAF=14;SAR=15;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227136;STB=0.632753;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0121182;OID=.;OPOS=52825585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:31:29:29:0.483333:15:14:22:8:15:14:23:8 chr3 52833805 . C A 595.19 PASS AF=0.5625;AO=55;DP=97;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0112672;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.597;QD=24.7996;RBI=0.0128637;REFB=-0.0224901;REVB=0.00620673;RO=42;SAF=23;SAR=32;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103192;STB=0.553551;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0131059;OID=.;OPOS=52833805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:42:42:55:54:0.5625:32:23:23:19:31:23:23:19 chr3 52852538 . G T 168.66 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0420768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3107;QD=16.0625;RBI=0.0843235;REFB=0.0162361;REVB=0.0730753;RO=24;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414175;STB=0.523783;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=-0.0216569;OID=.;OPOS=52852538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:9:9:13:11:9:9:13:11 chr3 52853747 . C G 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00488748;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=234.496;QD=17.3256;RBI=0.0121623;REFB=-0.0162501;REVB=0.0111371;RO=23;SAF=14;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182027;STB=0.586117;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.020887;OID=.;OPOS=52853747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:25:20:20:0.444444:6:14:12:11:6:14:14:11 chr3 52860936 . C T 241.16 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0128698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.563;QD=14.6159;RBI=0.013877;REFB=-0.0124805;REVB=-0.00519031;RO=38;SAF=6;SAR=22;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356264;STB=0.704275;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00935196;OID=.;OPOS=52860936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:22:6:20:18:22:6:20:18 chr3 52861211 . A T 320.11 PASS AF=0.710526;AO=26;DP=37;FAO=27;FDP=38;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.014074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5354;QD=33.6952;RBI=0.0163288;REFB=0.0125517;REVB=0.00827962;RO=11;SAF=8;SAR=18;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141967;STB=0.580724;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.0055433;OID=.;OPOS=52861211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:38:11:11:26:27:0.710526:18:8:6:5:19:8:6:5 chr3 52864584 . A G 236.17 PASS AF=0.560976;AO=22;DP=40;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00924195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.688;QD=23.0409;RBI=0.0122677;REFB=-0.0121259;REVB=0.00806738;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447114;STB=0.514881;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0108758;OID=.;OPOS=52864584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:18:18:22:23:0.560976:11:11:8:10:12:11:8:10 chr3 52867715 . G C 1491.69 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00369127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.186;QD=63.476;RBI=0.0193226;REFB=0;REVB=0.0189668;RO=0;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28625e-06;OID=.;OPOS=52867715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:46:48:0:0:46:48:0:0 chr3 52870618 . T A 363.24 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0255944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.921;QD=18.1619;RBI=0.0280855;REFB=-0.0174791;REVB=-0.0115637;RO=41;SAF=30;SAR=8;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238678;STB=0.643481;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0205576;OID=.;OPOS=52870618;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:42:38:38:0.475:8:30:24:17:8:30:24:18 chr3 52874288 . T C 53.4 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.000789494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.849;QD=7.62869;RBI=0.047137;REFB=-0.00233404;REVB=-0.0471304;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299924;STB=0.51882;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00879753;OID=.;OPOS=52874288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:3:5:12:8:3:5:12:8 chr3 52874296 . G A 73.83 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.000554782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.3962;QD=9.8435;RBI=0.074041;REFB=-0.00328115;REVB=0.0740389;RO=20;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122057;STB=0.574472;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0103252;OID=.;OPOS=52874296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:3:7:12:8:3:7:12:8 chr3 52874446 . C T 42.27 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0116328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.82;QD=12.0774;RBI=0.0494677;REFB=-0.0379858;REVB=0.0480805;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372539;STB=0.646649;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0560759;OID=.;OPOS=52874446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:14:14:6:8:6:6:0.428571:2:4:6:0:2:4:7:1 chr3 53125922 . T C 519.84 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00283292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.423;QD=59.4102;RBI=0.0246356;REFB=0;REVB=0.0244722;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260925;OID=.;OPOS=53125922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr3 53153964 . G A 468.9 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.00213097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.149;QD=20.3869;RBI=0.00959177;REFB=-0.011215;REVB=-0.00935206;RO=46;SAF=22;SAR=24;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393851;STB=0.521812;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0120008;OID=.;OPOS=53153964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:24:22:20:26:24:22:20:26 chr3 53215875 . A C 771.87 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361065;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.704;QD=57.1756;RBI=0.0429606;REFB=0;REVB=0.0232796;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157238;OID=.;OPOS=53215875;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:36:18:0:0:36:18:0:0 chr3 53220625 . C A 142.6 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0702165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5446;QD=14.2596;RBI=0.0771255;REFB=0.0492236;REVB=0.0319059;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552468;STB=0.532217;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.0688117;OID=.;OPOS=53220625;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:12:4:7:17:12:4:7:17 chr3 53222761 . C T 397.44 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00189491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.123;QD=20.6461;RBI=0.0217553;REFB=-0.00351734;REVB=0.0216726;RO=37;SAF=18;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392752;STB=0.521728;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00249629;OID=.;OPOS=53222761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:22:18:15:22:22:18:15:22 chr3 53223927 . C G 278.69 PASS AF=0.54902;AO=29;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0289475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1565;QD=21.8583;RBI=0.0321973;REFB=0.00808994;REVB=-0.0140966;RO=22;SAF=10;SAR=19;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29632;STB=0.686933;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.0219904;OID=.;OPOS=53223927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:23:29:28:0.54902:19:10:16:6:19:9:17:6 chr3 53224002 . T C 670.24 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0103;QD=62.3479;RBI=0.0405208;REFB=0;REVB=0.00322098;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000541835;OID=.;OPOS=53224002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr3 53264485 . A G 285.24 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00251582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.445;QD=15.4184;RBI=0.0337811;REFB=0.00230692;REVB=0.0336873;RO=41;SAF=12;SAR=20;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912575;STB=0.559403;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.00288125;OID=.;OPOS=53264485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:42:32:32:0.432432:20:12:19:22:20:12:20:22 chr3 53269046 . T C 216.3 PASS AF=0.42623;AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0030511;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.096;QD=14.1836;RBI=0.0547472;REFB=-0.0268631;REVB=-0.0546621;RO=33;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246152;STB=0.638299;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0362894;OID=.;OPOS=53269046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:35:25:26:0.42623:9:16:13:20:10:16:13:22 chr3 53321631 . A C 352.37 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00352975;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.371;QD=18.07;RBI=0.0118279;REFB=-0.0107177;REVB=0.0112889;RO=41;SAF=27;SAR=10;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292682;STB=0.664336;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0201722;OID=.;OPOS=53321631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:41:41:37:37:0.474359:10:27:18:23:10:27:18:23 chr3 53324819 . ATGGCAC A 182.05 PASS AF=0.888889;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00757488;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=6;MLLD=298.18;QD=40.4548;RBI=0.00828675;REFB=-0.0267185;REVB=0.00336027;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555487;STBP=0.232;TYPE=del;VARB=0.00546307;OID=.;OPOS=53324820;OREF=TGGCAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.888889:16:17:16:18:2:8:8:0:2:10:0:8:8:0:0 chr3 53700550 . T C 423.43 PASS AF=0.398374;AO=49;DP=123;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=46;FWDB=-0.011177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.571;QD=13.77;RBI=0.0113955;REFB=-0.0125068;REVB=-0.00222094;RO=74;SAF=25;SAR=24;SRF=28;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140242;STB=0.579055;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0168572;OID=.;OPOS=53700550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:74:74:49:49:0.398374:24:25:28:46:24:25:28:46 chr3 53766026 . T C 1101.26 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185723;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7987;QD=60.3429;RBI=0.0700727;REFB=0;REVB=0.0675667;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000687633;OID=.;OPOS=53766026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0 chr3 53769479 . C T 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0487549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0112;QD=20.0169;RBI=0.0536511;REFB=-0.0137196;REVB=0.0223919;RO=17;SAF=14;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255477;STB=0.645976;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0152653;OID=.;OPOS=53769479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:4:14:9:8:4:14:9:8 chr3 53845918 . C A 456.4 PASS AF=0.451327;AO=50;DP=112;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.00260459;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=273.318;QD=16.1559;RBI=0.00304501;REFB=-0.00532586;REVB=-0.0015774;RO=61;SAF=23;SAR=27;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000974013;STB=0.50035;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00676775;OID=.;OPOS=53845918;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:61:62:50:51:0.451327:27:23:28:33:28:23:28:34 chr3 53856653 . C T 385.33 PASS AF=0.666667;AO=36;DP=54;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0120614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.178;QD=28.5431;RBI=0.0122807;REFB=-0.0219189;REVB=-0.00231055;RO=18;SAF=11;SAR=25;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201957;STB=0.510996;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0116954;OID=.;OPOS=53856653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:18:18:36:36:0.666667:25:11:5:13:25:11:5:13 chr3 53857803 . A C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.077088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.582;QD=59.4352;RBI=0.077536;REFB=0;REVB=0.00832285;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000365056;OID=.;OPOS=53857803;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr3 53882663 . G A 666.33 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00659297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.863;QD=57.9421;RBI=0.0249448;REFB=-0.138342;REVB=-0.0240578;RO=1;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028453;STB=0.50638;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00122975;OID=.;OPOS=53882663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:46:46:1:2:44:44:0.956522:16:28:0:1:16:28:1:1 chr3 53882673 . G GT 293.64 PASS AF=1;AO=30;DP=45;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386371;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.929;QD=28.6474;RBI=0.169026;REFB=0;REVB=0.164551;RO=13;SAF=19;SAR=11;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993319;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0106007;OID=.;OPOS=53882674;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:30:45:41:41:0:24:17:0:0:5:13:19:11:6:7 chr3 53883722 . C G 812.4 PASS AF=0.52381;AO=77;DP=148;FAO=77;FDP=147;FR=.;FRO=70;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.0138903;FXX=0.0067563;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.9062;QD=22.1061;RBI=0.0297635;REFB=-0.0179165;REVB=-0.0263234;RO=67;SAF=44;SAR=33;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802867;STB=0.527552;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.017056;OID=.;OPOS=53883722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:67:70:77:77:0.52381:33:44:32:35:33:44:36:34 chr3 53886912 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.556;QD=57.0007;RBI=0.0232948;REFB=0;REVB=0.0193349;RO=0;SAF=20;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32747e-05;OID=.;OPOS=53886912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:34:20:0:0:34:20:0:0 chr3 53898807 . A C 251.17 PASS AF=0.466667;AO=26;DP=59;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00539784;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.13;QD=16.7444;RBI=0.00764179;REFB=-0.00458546;REVB=0.00540928;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179326;STB=0.585047;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00600435;OID=.;OPOS=53898807;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:33:32:26:28:0.466667:15:11:20:13:15:13:20:12 chr3 53905308 . T C 1326.17 PASS AF=0.956522;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.034566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.0042;QD=57.6597;RBI=0.0432924;REFB=-0.0489665;REVB=0.0260658;RO=3;SAF=51;SAR=37;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270585;STB=0.518864;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00114853;OID=.;OPOS=53905308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:91:92:3:4:88:88:0.956522:37:51:3:0:37:51:4:0 chr3 53906513 . G A 1523.69 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.264;QD=59.7525;RBI=0.043003;REFB=0;REVB=-0.0416664;RO=0;SAF=35;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.16463e-05;OID=.;OPOS=53906513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:102:0:0:100:102:1:65:35:0:0:65:37:0:0 chr3 53916130 . A G 790.87 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016163;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.249;QD=64.5612;RBI=0.0171378;REFB=0;REVB=-0.00569768;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48027e-05;OID=.;OPOS=53916130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0 chr3 54354510 . T C 418.66 PASS AF=0.413793;AO=46;DP=116;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.0158671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6491;QD=14.4364;RBI=0.0237889;REFB=0.00890085;REVB=0.0177242;RO=68;SAF=30;SAR=16;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560588;STB=0.513693;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=-0.0117928;OID=.;OPOS=54354510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:68:46:48:0.413793:16:30:41:27:18:30:41:27 chr3 54419977 . C T 237.7 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0159403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.52;QD=13.7795;RBI=0.0507125;REFB=-0.00138512;REVB=-0.0481421;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099968;STB=0.564269;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00273018;OID=.;OPOS=54419977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:41:28:28:0.405797:12:16:19:21:12:16:19:22 chr3 54798258 . G A 652.39 PASS AF=0.447205;AO=64;DP=155;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=0.0417124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.83;QD=16.2084;RBI=0.0417355;REFB=-0.00286105;REVB=0.00138752;RO=89;SAF=30;SAR=34;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00329042;STB=0.530864;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00303292;OID=.;OPOS=54798258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:161:89:89:64:72:0.447205:34:30:42:47:34:38:42:47 chr3 54961949 . C T 685.67 PASS AF=0.945455;AO=49;DP=53;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0808772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9694;QD=49.8668;RBI=0.0838696;REFB=0.0435193;REVB=0.0222035;RO=3;SAF=23;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148178;STB=0.508056;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.0128718;OID=.;OPOS=54961949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:53:55:3:3:49:52:0.945455:26:23:1:2:27:25:1:2 chr3 55018618 . T G 263.21 PASS AF=1;AO=2;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.217257;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=208.84;QD=52.6427;RBI=0.21949;REFB=0;REVB=0.0312334;RO=17;SAF=1;SAR=1;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478372;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422008;OID=.;OPOS=55018618;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:20:17:0:2:20:1:1:1:15:2:5:15:0:0 chr3 55018619 . T TG 187.78 PASS AF=0.85;AO=16;DP=22;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00614167;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=240.236;QD=37.5558;RBI=0.0161123;REFB=-0.0128627;REVB=-0.0148959;RO=5;SAF=14;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419574;STB=0.713979;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.00282147;OID=.;OPOS=55018620;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.85:16:22:17:20:3:15:2:0:3:15:5:14:2:1:4 chr3 55501002 . G C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.424;QD=59.1432;RBI=0.0622379;REFB=0;REVB=0.0135424;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160063;OID=.;OPOS=55501002;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0 chr3 56106226 . C T 947.1 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0293762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1064;QD=55.7119;RBI=0.0327123;REFB=-0.0137482;REVB=-0.0143923;RO=1;SAF=37;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125996;STB=0.513154;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.000172161;OID=.;OPOS=56106226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:67:68:1:2:66:66:0.970588:29:37:1:0:29:37:2:0 chr3 56219179 . GAAGCT G 423.79 PASS AF=0.595506;AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0141021;FXX=0.0631512;HRUN=2;LEN=5;MLLD=298.328;QD=19.0466;RBI=0.0146505;REFB=-0.0312254;REVB=-0.00397106;RO=35;SAF=27;SAR=26;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589347;STB=0.526261;STBP=0.55;TYPE=del;VARB=0.0203481;OID=.;OPOS=56219180;OREF=AAGCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.595506:53:94:53:89:36:27:26:16:20:99:35:27:26:15:20 chr3 56219210 . T C 1451.54 PASS AF=0.989899;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.082311;FXX=0.0198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7475;QD=58.6481;RBI=0.0962752;REFB=-0.0250109;REVB=0.0499382;RO=1;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939136;STB=0.504853;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000717763;OID=.;OPOS=56219210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:99:1:1:97:98:0.989899:50:47:0:1:51:47:0:1 chr3 56591278 . T TGGGGTAAGCA 38.86 PASS AF=0.150943;AO=6;DP=54;FAO=8;FDP=53;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00320671;FXX=0.036357;HRUN=4;LEN=10;MLLD=237.816;QD=2.93262;RBI=0.0460942;REFB=-0.00328873;REVB=-0.0459825;RO=45;SAF=6;SAR=0;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.628672;STB=0.841998;STBP=0.057;TYPE=ins;VARB=0.0178095;OID=.;OPOS=56591279;OREF=-;OALT=GGGGTAAGCA;OMAPALT=TGGGGTAAGCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.150943:6:54:8:53:45:7:1:23:22:38:45:6:0:23:22 chr3 56591298 . T A 47.11 PASS AF=0.138462;AO=9;DP=66;FAO=9;FDP=65;FR=.;FRO=56;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00733513;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.79;QD=2.89888;RBI=0.0381417;REFB=-0.00660971;REVB=-0.0374297;RO=53;SAF=4;SAR=5;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334373;STB=0.517203;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0323403;OID=.;OPOS=56591298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:66:65:53:56:9:9:0.138462:5:4:25:28:5:4:26:30 chr3 56597954 . C T 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0150413;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.811;QD=19.0179;RBI=0.0269926;REFB=-0.0047226;REVB=0.0224134;RO=14;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221099;STB=0.626763;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00374884;OID=.;OPOS=56597954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:4:11:7:7:4:11:7:7 chr3 56627048 . A G 899.96 PASS AF=0.473958;AO=91;DP=192;FAO=91;FDP=192;FR=.;FRO=101;FSAF=31;FSAR=60;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=0.010651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.061;QD=18.7491;RBI=0.0137858;REFB=-0.000913114;REVB=0.00875238;RO=101;SAF=31;SAR=60;SRF=55;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200375;STB=0.610915;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00118649;OID=.;OPOS=56627048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:101:101:91:91:0.473958:60:31:55:46:60:31:55:46 chr3 56627598 . A G 1120.77 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0544459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.469;QD=58.9877;RBI=0.0546031;REFB=-0.0307035;REVB=-0.00414007;RO=1;SAF=35;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133266;STB=0.50704;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.000397359;OID=.;OPOS=56627598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:40:35:1:0:40:35:1:0 chr3 56650012 . G C 406.93 PASS AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00643376;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3772;QD=25.0418;RBI=0.0239757;REFB=-0.0486961;REVB=-0.0230964;RO=25;SAF=26;SAR=13;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112588;STB=0.555526;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0352678;OID=.;OPOS=56650012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:25:26:39:39:0.6:13:26:13:12:13:26:14:12 chr3 56650050 . GA GACTT,TT 298.37 PASS AF=0.415584,0.0519481;AO=31,4;DP=77;FAO=32,4;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=19,4;FSAR=13,0;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.00994215,-0.00610872;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=168.046,195.537;QD=15.4997;RBI=0.0138391,0.0219091;REFB=-0.0124278,-0.00446421;REVB=0.00962672,-0.0210403;RO=42;SAF=18,4;SAR=13,0;SRF=25;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0152638,0.52364;STB=0.504869,0.996904;STBP=0.951,0.05;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0146381,0.024674;OID=.,.;OPOS=56650052,56650050;OREF=-,GA;OALT=CTT,TT;OMAPALT=GACTT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:41:31,4:32,4:0.415584,0.0519481:13,0:18,4:25:17:13,0:19,4:24:17 chr3 56650054 . T TCTC 411.33 PASS AF=0.525641;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.00353984;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=245.24;QD=21.0939;RBI=0.0366986;REFB=-0.0189006;REVB=0.0365274;RO=37;SAF=24;SAR=17;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565794;STB=0.531235;STBP=0.583;TYPE=ins;VARB=0.0232084;OID=.;OPOS=56650055;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.525641:41:78:41:78:37:24:17:24:13:99:37:24:17:24:13 chr3 56658871 . T C 336.19 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=0.0302004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.852;QD=17.2406;RBI=0.0345102;REFB=-0.0101511;REVB=0.0167;RO=42;SAF=22;SAR=14;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305404;STB=0.67027;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0129967;OID=.;OPOS=56658871;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:14:22:12:30:14:22:12:30 chr3 56667682 . G C 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0407687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3465;QD=54.7458;RBI=0.0509094;REFB=-0.102322;REVB=0.0304907;RO=1;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00316561;OID=.;OPOS=56667682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:32:21:0:1:32:21:0:1 chr3 56703746 . A C 287.89 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0284837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.14;QD=25.0334;RBI=0.0321587;REFB=0.00138482;REVB=-0.0149285;RO=20;SAF=13;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078328;STB=0.543445;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-0.000778617;OID=.;OPOS=56703746;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:13:13:8:12:13:13:8:12 chr3 56716922 . T G 337.71 PASS AF=0.9;AO=26;DP=29;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00267361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3316;QD=45.0285;RBI=0.0359273;REFB=-0.000925345;REVB=-0.0358277;RO=3;SAF=19;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919831;STB=0.542824;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.026666;OID=.;OPOS=56716922;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:29:30:3:3:26:27:0.9:7:19:1:2:8:19:1:2 chr3 56763228 . T C 81.28 PASS AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00597818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.725;QD=8.12765;RBI=0.0279235;REFB=0.00410319;REVB=-0.0272761;RO=29;SAF=8;SAR=3;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536128;STB=0.533271;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.0137954;OID=.;OPOS=56763228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:3:8:20:9:3:8:20:9 chr3 56763316 . G A 789.84 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00465953;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.895;QD=64.477;RBI=0.016348;REFB=0;REVB=-0.0156699;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.22264e-05;OID=.;OPOS=56763316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0 chr3 56763328 . T C 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3168;QD=57.1746;RBI=0.0191528;REFB=0;REVB=-0.000671292;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209148;OID=.;OPOS=56763328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr3 56763525 . A G 818.47 PASS AF=0.643478;AO=73;DP=114;FAO=74;FDP=115;FR=.;FRO=41;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00685648;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.71;QD=28.4685;RBI=0.0167741;REFB=-0.0254738;REVB=0.0153088;RO=41;SAF=40;SAR=33;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563687;STB=0.532459;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0107407;OID=.;OPOS=56763525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:41:41:73:74:0.643478:33:40:19:22:33:41:19:22 chr3 56763619 . A G 640.43 PASS AF=0.512;AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.0104141;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0025;QD=20.4937;RBI=0.0169696;REFB=0.0078863;REVB=0.0133983;RO=58;SAF=20;SAR=44;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.602545;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.00612367;OID=.;OPOS=56763619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:58:61:64:64:0.512:44:20:29:29:44:20:31:30 chr3 56766435 . C G 286.56 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.00210562;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.504;QD=15.4895;RBI=0.00759902;REFB=-0.0126493;REVB=0.00730147;RO=42;SAF=11;SAR=21;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116466;STB=0.506575;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0124355;OID=.;OPOS=56766435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:32:32:0.432432:21:11:14:28:21:11:14:28 chr3 56771251 . A C 494.76 PASS AF=0.375839;AO=56;DP=149;FAO=56;FDP=149;FR=.;FRO=93;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=45;FWDB=0.00774958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.872;QD=13.2822;RBI=0.0202819;REFB=-0.00632916;REVB=0.018743;RO=92;SAF=27;SAR=29;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314744;STB=0.5212;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0104733;OID=.;OPOS=56771251;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:92:93:56:56:0.375839:29:27:47:45:29:27:48:45 chr3 56835761 . G A 521.44 PASS AF=0.652778;AO=47;DP=72;FAO=47;FDP=72;FR=.;FRO=25;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00897932;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.066;QD=28.9686;RBI=0.0186176;REFB=-0.020433;REVB=0.0163091;RO=25;SAF=25;SAR=22;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134826;STB=0.573161;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0105015;OID=.;OPOS=56835761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:25:25:47:47:0.652778:22:25:8:17:22:25:8:17 chr3 57108551 . C A 677.39 PASS AF=0.9375;AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00214254;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.075;QD=56.4489;RBI=0.0173666;REFB=-0.0525112;REVB=0.0172339;RO=3;SAF=20;SAR=25;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262932;STB=0.514012;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000257327;OID=.;OPOS=57108551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:48:3:3:45:45:0.9375:25:20:2:1:25:20:2:1 chr3 57176503 . G A 66.23 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0108002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.1281;QD=12.615;RBI=0.0133016;REFB=-0.0270112;REVB=-0.00776454;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138405;STB=0.583135;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0348476;OID=.;OPOS=57176503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:7:2:4:8:7:2:4:8 chr3 57304725 . GTTTTG GTTTG,GTTTGT 40.86 PASS AF=0.263158,0;AO=15,3;DP=58;FAO=15,0;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=13,0;FSAR=2,0;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.176216,-0.167621;FXX=0.0172384;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=16.7421,64.868;QD=2.86704;RBI=0.194864,0.17225;REFB=-0.0732046,-0.00905947;REVB=-0.0831858,-0.0396656;RO=36;SAF=13,3;SAR=2,0;SRF=9;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.667379,0.65547;STB=0.870182,0.5;STBP=0.003,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0995354,0;OID=.,.;OPOS=57304726,57304729;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=GTTTG,GTTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.263158,0:15,3:58:15,0:57:42:13,0:2,0:15:27:41:36:13,3:2,0:9:27 chr3 57323170 . A G 519.93 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.377;QD=59.4204;RBI=0.064253;REFB=0;REVB=0.0137422;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015589;OID=.;OPOS=57323170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr3 57335876 . C T 2336.12 PASS AF=0.993548;AO=154;DP=156;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0166985;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.395;QD=60.287;RBI=0.0248883;REFB=-0.063521;REVB=0.018455;RO=1;SAF=70;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562987;STB=0.502958;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=7.37864e-05;OID=.;OPOS=57335876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:156:155:1:1:154:154:0.993548:84:70:0:1:84:70:0:1 chr3 57386148 . C G 239.16 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00170011;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1165;QD=16.2143;RBI=0.0122686;REFB=-0.0119755;REVB=0.0121502;RO=32;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676627;STB=0.53823;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0134444;OID=.;OPOS=57386148;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:32:32:27:27:0.457627:17:10:14:18:17:10:14:18 chr3 57388114 . C T 414.13 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.022782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.314;QD=19.0406;RBI=0.0369669;REFB=-0.0167848;REVB=-0.0291124;RO=44;SAF=22;SAR=20;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832939;STB=0.539629;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0163043;OID=.;OPOS=57388114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:44:45:42:42:0.482759:20:22:27:17:20:22:27:18 chr3 57394040 . T C 266.17 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0385937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.095;QD=21.2932;RBI=0.0395375;REFB=-0.00382195;REVB=-0.00858735;RO=25;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357519;STB=0.520048;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0032565;OID=.;OPOS=57394040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:12:13:14:11:12:13:14:11 chr3 57414071 . G A 518.59 PASS AF=0.313636;AO=69;DP=220;FAO=69;FDP=220;FR=.;FRO=151;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=92;FSRR=59;FWDB=-0.0917557;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8482;QD=9.42892;RBI=0.0941007;REFB=-0.0202815;REVB=-0.0208763;RO=147;SAF=30;SAR=39;SRF=92;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222565;STB=0.618049;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.038964;OID=.;OPOS=57414071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:147:151:69:69:0.313636:39:30:92:55:39:30:92:59 chr3 57414434 . A G 340.78 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.00277901;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.061;QD=20.6532;RBI=0.0135102;REFB=-0.0193129;REVB=0.0132213;RO=31;SAF=22;SAR=13;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282725;STB=0.656349;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0160752;OID=.;OPOS=57414434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:31:31:35:35:0.530303:13:22:9:22:13:22:9:22 chr3 57419497 . C T 195.68 PASS AF=0.418182;AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.039889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1406;QD=14.2312;RBI=0.0402273;REFB=0.00559245;REVB=0.00520607;RO=31;SAF=14;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159446;STB=0.592023;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00641957;OID=.;OPOS=57419497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:31:32:22:23:0.418182:8:14:15:16:8:15:16:16 chr3 57430988 . G A 303.5 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=0.0140405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.806;QD=22.0724;RBI=0.0154849;REFB=-0.00963555;REVB=-0.00653029;RO=24;SAF=10;SAR=21;SRF=1;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286662;STB=0.655656;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00581086;OID=.;OPOS=57430988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:21:10:1:23:21:10:1:23 chr3 57431985 . G A 291.52 PASS AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00438207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.86;QD=33.3163;RBI=0.00654125;REFB=-0.0274243;REVB=0.00485648;RO=10;SAF=9;SAR=16;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231308;STB=0.626626;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00471573;OID=.;OPOS=57431985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:16:9:8:2:16:9:8:2 chr3 57475351 . T G 305.56 PASS AF=0.5625;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0303635;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.046;QD=25.4631;RBI=0.0404838;REFB=-0.000164907;REVB=0.0267768;RO=23;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447282;STB=0.528281;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.000335022;OID=.;OPOS=57475351;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:48:23:21:27:27:0.5625:12:15:14:9:12:15:13:8 chr3 57479493 . C T 112.57 PASS AF=0.481481;AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0260598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1204;QD=16.6774;RBI=0.028748;REFB=-0.0176793;REVB=0.012138;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435331;STB=0.519969;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0275733;OID=.;OPOS=57479493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:27:14:14:11:13:0.481481:6:5:7:7:6:7:7:7 chr3 57494263 . G T 177.51 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0023357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.273;QD=14.4905;RBI=0.00498526;REFB=-0.0136058;REVB=-0.00440423;RO=30;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971105;STB=0.555997;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0188109;OID=.;OPOS=57494263;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:11:8:10:20:11:8:10:20 chr3 57542173 . C T 462.23 PASS AF=0.578947;AO=44;DP=76;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.00224175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3984;QD=24.328;RBI=0.0141666;REFB=-0.0163906;REVB=0.0139881;RO=31;SAF=28;SAR=16;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145446;STB=0.568335;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0232431;OID=.;OPOS=57542173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:31:32:44:44:0.578947:16:28:25:6:16:28:25:7 chr3 57563120 . GA G 74.14 PASS AF=0.461538;AO=15;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.245031;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.5014;QD=7.60418;RBI=0.299517;REFB=0.0137419;REVB=0.172251;RO=20;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219383;STB=0.57383;STBP=0.386;TYPE=del;VARB=-0.00638917;OID=.;OPOS=57563121;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.461538:15:38:18:39:21:7:11:11:10:74:20:5:10:11:9 chr3 57611237 . A G 152.12 PASS AF=0.5;AO=15;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.000689159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.387;QD=16.9026;RBI=0.0722022;REFB=-0.0118423;REVB=0.072199;RO=18;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292813;STB=0.687305;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00962948;OID=.;OPOS=57611237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:15:18:0.5:8:7:14:4:11:7:14:4 chr3 57882601 . C T 273.91 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00902104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.566;QD=17.6718;RBI=0.00930131;REFB=-0.00101398;REVB=-0.0022661;RO=32;SAF=15;SAR=15;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157926;OID=.;OPOS=57882601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:15:15:16:16:15:15:16:16 chr3 58081888 . T C 1051.84 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.519;QD=59.2586;RBI=0.0457125;REFB=0;REVB=0.039423;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98239e-05;OID=.;OPOS=58081888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:33:37:0:0:33:38:0:0 chr3 58109162 . G A 721.49 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0609916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.2864;QD=54.4519;RBI=0.0629913;REFB=-0.110263;REVB=0.0157457;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00336801;OID=.;OPOS=58109162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:24:28:0:0:24:28:0:1 chr3 58112440 . A G 708.46 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00438121;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6509;QD=62.9743;RBI=0.0350552;REFB=0;REVB=0.0347803;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135311;OID=.;OPOS=58112440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr3 58112488 . C T 294.07 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191815;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.8241;QD=51.1426;RBI=0.0210546;REFB=0;REVB=0.00868128;RO=1;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028486;OID=.;OPOS=58112488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:1:0:22:23:1:17:5:0:1:18:5:0:0 chr3 58117724 . G A 346.77 PASS AF=0.425287;AO=36;DP=86;FAO=37;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00247668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.547;QD=15.9434;RBI=0.161397;REFB=-0.00550445;REVB=0.161378;RO=36;SAF=17;SAR=19;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198517;STB=0.513506;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00931947;OID=.;OPOS=58117724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:36:49:36:37:0.425287:19:17:25:11:19:18:25:24 chr3 58118555 . G A 1324.87 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0118934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.077;QD=60.9134;RBI=0.022343;REFB=-0.114262;REVB=0.0189145;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00100481;OID=.;OPOS=58118555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:0:1:86:86:0.988506:45:41:0:0:45:41:1:0 chr3 58154327 . C T 1339.73 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.721;QD=62.3131;RBI=0.0298932;REFB=0;REVB=0.0253709;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.2917e-05;OID=.;OPOS=58154327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:38:48:0:0:38:48:0:0 chr3 58305033 . A C 253.12 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0143751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.423;QD=15.1115;RBI=0.0369494;REFB=-0.0115222;REVB=-0.0340385;RO=36;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131912;STB=0.559055;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0137279;OID=.;OPOS=58305033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:38:29:29:0.432836:13:16:15:21:13:16:17:21 chr3 58305079 . T C 382.99 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.00887967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.893;QD=17.4086;RBI=0.0177685;REFB=-0.0146003;REVB=0.0153906;RO=48;SAF=22;SAR=18;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169195;STB=0.594548;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.014557;OID=.;OPOS=58305079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:18:22:18:30:18:22:18:30 chr3 58305235 . G T 107.42 PASS AF=0.371429;AO=9;DP=31;FAO=13;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0202987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.598;QD=12.2765;RBI=0.046846;REFB=-0.0109845;REVB=0.0422198;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075443;STB=0.532206;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0131018;OID=.;OPOS=58305235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:35:17:22:9:13:0.371429:7:2:3:14:11:2:4:18 chr3 58395891 . C G 233.98 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0851145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.355;QD=18.7187;RBI=0.0857104;REFB=-0.0142235;REVB=-0.0100894;RO=27;SAF=7;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282662;STB=0.660539;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0136919;OID=.;OPOS=58395891;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:16:7:16:11:16:7:16:11 chr3 58409173 . A T 327.91 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0189652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.471;QD=20.4944;RBI=0.0398427;REFB=-0.0139576;REVB=0.0350394;RO=28;SAF=14;SAR=20;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243407;STB=0.647398;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0192472;OID=.;OPOS=58409173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:30:34:34:0.53125:20:14:20:8:20:14:22:8 chr3 58416538 . T C 1314.65 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.572;QD=61.866;RBI=0.0325329;REFB=0;REVB=0.0162982;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87744e-05;OID=.;OPOS=58416538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:85:0:0:82:85:1:38:44:0:0:39:46:0:0 chr3 58484521 . T C 657.52 PASS AF=0.421965;AO=73;DP=173;FAO=73;FDP=173;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=53;FWDB=0.041316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0299;QD=15.2027;RBI=0.0453722;REFB=-0.00665996;REVB=0.0187518;RO=100;SAF=31;SAR=42;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475254;STB=0.526596;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0100227;OID=.;OPOS=58484521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:100:100:73:73:0.421965:42:31:47:53:42:31:47:53 chr3 58512237 . A G 267.36 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.581;QD=18.4387;RBI=0.0166279;REFB=0.00278513;REVB=-0.0128933;RO=28;SAF=8;SAR=21;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154216;STB=0.580052;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00488186;OID=.;OPOS=58512237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:29:29:29:0.5:21:8:12:16:21:8:12:17 chr3 58520306 . G C 939.42 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4453;QD=57.8103;RBI=0.0442529;REFB=0;REVB=0.0202436;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104738;OID=.;OPOS=58520306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:31:32:0:0:31:34:0:0 chr3 58551247 . TG CA 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.030037;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.223;QD=21.1726;RBI=0.0339439;REFB=-0.0307458;REVB=0.0158104;RO=8;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395799;STB=0.728732;STBP=0.031;TYPE=mnp;VARB=0.0135462;OID=.;OPOS=58551247;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:10:2:5:3:10:2:5:3 chr3 58572625 . G A 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00806197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.838;QD=16.417;RBI=0.00818897;REFB=-0.0160393;REVB=0.00143659;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510947;STB=0.52937;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0347881;OID=.;OPOS=58572625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:6:8:10:6:6:8:10:6 chr3 60519224 . G A 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7132;QD=58.142;RBI=0.0702732;REFB=0;REVB=0.0669142;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00084927;OID=.;OPOS=60519224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0 chr3 62189189 . G A 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0010651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.446;QD=57.6806;RBI=0.0308128;REFB=0;REVB=0.0307944;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130389;OID=.;OPOS=62189189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr3 62229553 . C T 632.19 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6048;QD=61.6772;RBI=0.0277071;REFB=0;REVB=0.0021927;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549962;OID=.;OPOS=62229553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr3 62384314 . A G 646.19 PASS AF=1;AO=35;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112877;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.623;QD=61.5417;RBI=0.0187669;REFB=0;REVB=0.0149928;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.56531e-05;OID=.;OPOS=62384314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:35:42:1:11:24:0:0:13:29:0:0 chr3 62431415 . T C 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00787703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.573;QD=14.6657;RBI=0.00787709;REFB=-0.00350273;REVB=-3.12836e-05;RO=20;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122839;STB=0.559918;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00445455;OID=.;OPOS=62431415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:21:15:15:0.416667:10:5:9:11:10:5:9:12 chr3 62556622 . A G 705.15 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0052469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.962;QD=58.7624;RBI=0.00705774;REFB=-0.121998;REVB=0.00472036;RO=2;SAF=26;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347981;STB=0.518511;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.000491331;OID=.;OPOS=62556622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:48:48:2:2:46:46:0.958333:20:26:2:0:20:26:2:0 chr3 63816811 . C CACACT 208.9 PASS AF=0.403226;AO=24;DP=63;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00819117;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=5;MLLD=322.109;QD=13.4777;RBI=0.011784;REFB=-0.00628367;REVB=-0.00847155;RO=38;SAF=8;SAR=16;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289634;STB=0.665662;STBP=0.043;TYPE=ins;VARB=0.00893879;OID=.;OPOS=63816812;OREF=-;OALT=ACACT;OMAPALT=CACACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.403226:24:63:25:62:37:8:17:22:15:99:38:8:16:23:15 chr3 63981635 . C T 300.26 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0176092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.142;QD=24.5109;RBI=0.0190916;REFB=-0.0197212;REVB=-0.00737603;RO=20;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23162;STB=0.624911;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0115353;OID=.;OPOS=63981635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:20:22:27:27:0.55102:15:12:15:5:15:12:16:6 chr3 63982082 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.000286924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.344;QD=19.0178;RBI=0.023055;REFB=-0.0106581;REVB=-0.0230532;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317591;STB=0.67673;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0180857;OID=.;OPOS=63982082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:9:6:1:13:9:6:1:13 chr3 64009508 . T C 290.09 PASS AF=0.457143;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0353566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.628;QD=16.5764;RBI=0.0365915;REFB=-0.024413;REVB=0.00942608;RO=39;SAF=13;SAR=18;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288695;STB=0.645019;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0294612;OID=.;OPOS=64009508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:38:31:32:0.457143:18:13:28:11:18:14:27:11 chr3 64133350 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=11;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.251;QD=45.8068;RBI=0.0276948;REFB=0;REVB=0.00162586;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376769;OID=.;OPOS=64133350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:11:14:1:5:6:0:0:8:6:0:0 chr3 66354911 . G C 2052.32 PASS AF=1;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0767872;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4693;QD=62.6664;RBI=0.0978208;REFB=0;REVB=0.0606022;RO=0;SAF=57;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00024233;OID=.;OPOS=66354911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:131:0:0:131:131:1:74:57:0:0:74:57:0:0 chr3 66374361 . G C 726.83 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698656;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7691;QD=57.0063;RBI=0.0662463;REFB=0;REVB=0.0658769;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00074049;OID=.;OPOS=66374361;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:35:16:0:0:35:16:0:0 chr3 66396845 . G A 115.99 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.821;QD=42.1794;RBI=0.0346171;REFB=0;REVB=0.0274307;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000630169;OID=.;OPOS=66396845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr3 66419956 . C T 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.943;QD=57.5452;RBI=0.0186667;REFB=0;REVB=0.01579;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8803e-05;OID=.;OPOS=66419956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0 chr3 66429569 . A G 412.88 PASS AF=0.43;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.008334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.76;QD=16.5154;RBI=0.0132932;REFB=-0.0167787;REVB=-0.0103563;RO=56;SAF=24;SAR=19;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200358;STB=0.616461;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0222894;OID=.;OPOS=66429569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:56:57:43:43:0.43:19:24:20:36:19:24:20:37 chr3 66433676 . A G 1301.89 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.043645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1328;QD=61.9948;RBI=0.090788;REFB=0;REVB=-0.0796089;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105438;OID=.;OPOS=66433676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0 chr3 66434643 . T C 1903.76 PASS AF=1;AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792903;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.779;QD=61.9109;RBI=0.0357843;REFB=0;REVB=0.0348948;RO=0;SAF=59;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50652e-05;OID=.;OPOS=66434643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:123:0:0:123:123:1:64:59:0:0:64:59:0:0 chr3 67048761 . GT G,GC,GG 888.23 PASS AF=0.287879,0.712121,0;AO=12,47,4;DP=66;FAO=19,47,0;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22,0;FSAR=19,25,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573589,0.00986442,0.00187139;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=44.1657,59.5537,24.6623;QD=53.832;RBI=0.0656217,0.027739,0.023814;REFB=0,0,0;REVB=0.0318774,0.0259257,-0.0237404;RO=0;SAF=0,22,0;SAR=12,25,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.0188509,0.0103005,0.04947;OID=.,.,.;OPOS=67048762,67048762,67048762;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=G,GC,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.287879,0.712121,0:12,47,4:66:19,47,0:66:0:0,22,0:19,25,0:0:0:70:0:0,22,0:12,25,4:0:0 chr3 67411166 . A G 344.71 PASS AF=0.48;AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00689207;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.24;QD=18.3846;RBI=0.00926892;REFB=-0.00472417;REVB=-0.00619776;RO=37;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562452;STB=0.552482;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00532799;OID=.;OPOS=67411166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:39:35:36:0.48:21:14:17:20:22:14:19:20 chr3 69026586 . T C 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.025812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.805;QD=19.646;RBI=0.03543;REFB=-0.0224404;REVB=-0.0242698;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214898;STB=0.622427;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00866066;OID=.;OPOS=69026586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:5:6:2:6:5:6:2:6 chr3 69054341 . T C 404.42 PASS AF=0.66;AO=32;DP=49;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0461469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.612;QD=32.3534;RBI=0.0469615;REFB=-0.0271852;REVB=0.00870911;RO=17;SAF=10;SAR=22;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136434;STB=0.503595;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0133928;OID=.;OPOS=69054341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:17:17:32:33:0.66:22:10:5:12:23:10:5:12 chr3 69070563 . A C 185.03 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.000955358;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=220.18;QD=15.1044;RBI=0.00104378;REFB=-0.012732;REVB=0.000420444;RO=28;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06687;STB=0.529382;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0127742;OID=.;OPOS=69070563;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:28:29:20:20:0.408163:8:12:15:13:8:12:16:13 chr3 69096614 . G A 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00409746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.765;QD=61.2129;RBI=0.0287431;REFB=0;REVB=-0.0284495;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.16914e-05;OID=.;OPOS=69096614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:43:36:0:0:43:36:0:0 chr3 69157747 . G C 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.026185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.32;QD=19.6972;RBI=0.0268035;REFB=-0.0241792;REVB=0.00572491;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144454;STB=0.581422;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0132831;OID=.;OPOS=69157747;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:14:8:11:10:14:8 chr3 69230061 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.399;QD=50.4122;RBI=0.0490227;REFB=0;REVB=0.0451332;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350548;OID=.;OPOS=69230061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr3 69230801 . G A 888.73 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00707416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.66;QD=56.4276;RBI=0.0396712;REFB=-0.154597;REVB=0.0390354;RO=1;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192603;STB=0.509801;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00259877;OID=.;OPOS=69230801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:24:37:0:1:25:37:0:1 chr3 69245454 . T C 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00326666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.035;QD=57.8848;RBI=0.0352708;REFB=0;REVB=-0.0351192;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.93444e-05;OID=.;OPOS=69245454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr3 69246152 . A G 769.48 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0702597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3739;QD=56.9984;RBI=0.0702791;REFB=0;REVB=0.00164856;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000898504;OID=.;OPOS=69246152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0 chr3 69267489 . T A 642.59 PASS AF=0.523438;AO=57;DP=119;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.06709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.688;QD=20.0809;RBI=0.0680459;REFB=-0.0248735;REVB=0.0113661;RO=59;SAF=16;SAR=41;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213794;STB=0.558628;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0243141;OID=.;OPOS=69267489;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:128:59:61:57:67:0.523438:41:16:29:30:42:25:30:31 chr3 69299233 . C G 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00953492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8865;QD=13.7843;RBI=0.0410455;REFB=-0.0294567;REVB=-0.0399226;RO=33;SAF=18;SAR=5;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191304;STB=0.610674;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0378281;OID=.;OPOS=69299233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:5:18:21:12:5:18:21:12 chr3 71823582 . C T 1302.14 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00316835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.868;QD=62.0069;RBI=0.0034881;REFB=0;REVB=0.0014589;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.56223e-06;OID=.;OPOS=71823582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:51:33:0:0:51:33:0:0 chr3 72426901 . A G 5792.7 PASS AF=1;AO=368;DP=371;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=178;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880165;FXX=0.00808604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6371;QD=62.9641;RBI=0.109272;REFB=-0.0616295;REVB=0.0647573;RO=1;SAF=178;SAR=190;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00250488;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312581;OID=.;OPOS=72426901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:371:368:1:0:368:368:1:190:178:0:1:190:178:0:0 chr3 72495777 . C G 650.64 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9624;QD=61.9658;RBI=0.109919;REFB=0;REVB=0.00243166;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153573;OID=.;OPOS=72495777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0 chr3 72495945 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.208;QD=50.4134;RBI=0.0608097;REFB=0;REVB=0.0150339;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268031;OID=.;OPOS=72495945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr3 73024350 . C A 533.04 PASS AF=0.486957;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0160182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6706;QD=18.5406;RBI=0.0680361;REFB=-0.00733938;REVB=-0.0661236;RO=59;SAF=27;SAR=29;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10268;STB=0.556809;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00696978;OID=.;OPOS=73024350;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:59:56:56:0.486957:29:27:35:24:29:27:35:24 chr3 73111368 . T C 1569.91 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0335693;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.5307;QD=62.7966;RBI=0.110664;REFB=0.0814899;REVB=-0.10545;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00927433;OID=.;OPOS=73111368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:0:1:99:99:0.99:46:53:0:0:46:53:1:0 chr3 73111480 . AC ACA,CA 1177.62 PASS AF=1,0;AO=73,4;DP=84;FAO=80,0;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45,0;FSAR=35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403804,-0.0249069;FXX=0.0243873;HRUN=1,5;LEN=1,2;MLLD=26.113,12.9967;QD=58.8808;RBI=0.0805192,0.0251715;REFB=0,0;REVB=-0.0696618,0.00364007;RO=3;SAF=41,4;SAR=32,0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00796365,0.705357;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=-0.000483584,0;OID=.,.;OPOS=73111482,73111480;OREF=-,AC;OALT=A,CA;OMAPALT=ACA,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:84:80:3:0:73,4:80,0:1,0:32,0:41,4:2:1:35,0:45,0:0:0 chr3 73111809 . A G 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.547;QD=40.7602;RBI=0.0236378;REFB=0;REVB=-0.00739423;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299623;OID=.;OPOS=73111809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr3 73111973 . A G 637.21 PASS AF=0.976744;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0218499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.734;QD=59.2752;RBI=0.039424;REFB=0.0538677;REVB=0.0328152;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253417;STB=0.513507;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000417508;OID=.;OPOS=73111973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:43:1:1:40:42:0.976744:18:22:0:1:18:24:0:1 chr3 73111998 . C T 646.05 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.376;QD=61.5282;RBI=0.0187905;REFB=0;REVB=0.0157143;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286881;OID=.;OPOS=73111998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:21:19:0:0:22:20:0:0 chr3 73112378 . A G 868.21 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.568;QD=57.8808;RBI=0.0172086;REFB=0;REVB=0.00518015;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39877e-05;OID=.;OPOS=73112378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0 chr3 73114003 . T C 1030.95 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0393824;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7005;QD=58.0819;RBI=0.0406767;REFB=-0.0104202;REVB=0.0101792;RO=1;SAF=24;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01929;STB=0.510201;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00283636;OID=.;OPOS=73114003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:46:24:1:0:46:24:1:0 chr3 73290979 . G T 413.47 PASS AF=0.532468;AO=40;DP=76;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.02327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.525;QD=21.4787;RBI=0.0239567;REFB=-0.0188745;REVB=0.00569461;RO=36;SAF=17;SAR=23;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00730856;STB=0.510633;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0155823;OID=.;OPOS=73290979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:36:36:40:41:0.532468:23:17:15:21:23:18:15:21 chr3 73433494 . T C 83.57 PASS AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0170027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.965;QD=20.8932;RBI=0.0643656;REFB=-0.0488182;REVB=0.0620792;RO=6;SAF=9;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10769;STB=0.562362;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0287341;OID=.;OPOS=73433494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:1:9:5:1:1:9:5:1 chr3 73453325 . C T 347.62 PASS AF=0.45122;AO=38;DP=83;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=36;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.0122397;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.595;QD=16.9571;RBI=0.0233303;REFB=0.00191986;REVB=-0.0198618;RO=45;SAF=37;SAR=1;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.66204;STB=0.889306;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00166643;OID=.;OPOS=73453325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:45:45:38:37:0.45122:1:37:31:14:1:36:31:14 chr3 74413676 . T C 423.86 PASS AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00847129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.335;QD=26.9118;RBI=0.0436669;REFB=-0.03668;REVB=0.0428373;RO=23;SAF=19;SAR=21;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00218621;STB=0.501193;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0286756;OID=.;OPOS=74413676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:23:23:40:40:0.634921:21:19:11:12:21:19:11:12 chr3 75232044 . C T 1044.33 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171569;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=152.195;QD=59.6761;RBI=0.0171743;REFB=0;REVB=-0.000773397;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1939e-05;OID=.;OPOS=75232044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr3 75475670 . A C 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00353542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.199;QD=15.2624;RBI=0.00699193;REFB=-0.0149036;REVB=-0.00603223;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740872;STB=0.542793;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0244074;OID=.;OPOS=75475670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:8:5:5:11:8:5:5:11 chr3 75475685 . A G 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-3.93716e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.728;QD=11.4398;RBI=0.00343555;REFB=-0.0196829;REVB=-0.00343532;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19924;STB=0.618791;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0256391;OID=.;OPOS=75475685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:5:9:4:5:5:9 chr3 75679930 . A C 41.18 PASS AF=0.116883;AO=9;DP=77;FAO=9;FDP=77;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=-0.00812064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.651;QD=2.13908;RBI=0.0334981;REFB=0.000621545;REVB=-0.0324989;RO=68;SAF=5;SAR=4;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188676;STB=0.637103;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.0110945;OID=.;OPOS=75679930;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:77:77:68:68:9:9:0.116883:4:5:27:41:4:5:27:41 chr3 75679937 . G A 124.68 PASS AF=0.234568;AO=19;DP=80;FAO=19;FDP=81;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.00116519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.167;QD=6.15711;RBI=0.0438869;REFB=-0.0026114;REVB=-0.0438715;RO=58;SAF=7;SAR=12;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101564;STB=0.553538;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0148359;OID=.;OPOS=75679937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:58:62:19:19:0.234568:12:7:26:32:12:7:27:35 chr3 75679938 . T C 46.53 PASS AF=0.123457;AO=10;DP=80;FAO=10;FDP=81;FR=.;FRO=71;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.00259002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.878;QD=2.29758;RBI=0.0220044;REFB=-0.00468234;REVB=-0.0218514;RO=68;SAF=5;SAR=5;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107962;STB=0.580091;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0497162;OID=.;OPOS=75679938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:80:81:68:71:10:10:0.123457:5:5:28:40:5:5:29:42 chr3 75679958 . C T 117.34 PASS AF=0.197917;AO=19;DP=96;FAO=19;FDP=96;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.0204579;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=258.373;QD=4.88924;RBI=0.0209992;REFB=-0.00202502;REVB=0.00473707;RO=77;SAF=7;SAR=12;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454708;STB=0.528971;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00865943;OID=.;OPOS=75679958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:77:77:19:19:0.197917:12:7:31:46:12:7:31:46 chr3 75679965 . C A 62.37 PASS AF=0.128713;AO=13;DP=101;FAO=13;FDP=101;FR=.;FRO=88;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=55;FWDB=-0.0288129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.347;QD=2.47001;RBI=0.0290166;REFB=-0.00295521;REVB=-0.00343266;RO=88;SAF=6;SAR=7;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109551;STB=0.57663;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.025725;OID=.;OPOS=75679965;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:101:101:88:88:13:13:0.128713:7:6:33:55:7:6:33:55 chr3 75679973 . A G 114.72 PASS AF=0.186916;AO=20;DP=106;FAO=20;FDP=107;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=55;FWDB=-0.0247967;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.645;QD=4.28867;RBI=0.0257082;REFB=-0.00583756;REVB=-0.00678504;RO=85;SAF=7;SAR=13;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202618;STB=0.515752;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0279798;OID=.;OPOS=75679973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:85:87:20:20:0.186916:13:7:31:54:13:7:32:55 chr3 75679975 . C T 57.5 PASS AF=0.118182;AO=13;DP=110;FAO=13;FDP=110;FR=.;FRO=97;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=64;FWDB=-0.0353415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.001;QD=2.0909;RBI=0.03651;REFB=-0.00710314;REVB=0.00916266;RO=97;SAF=6;SAR=7;SRF=33;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154287;STB=0.609285;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0376687;OID=.;OPOS=75679975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:110:110:97:97:13:13:0.118182:7:6:33:64:7:6:33:64 chr3 75679988 . A G 62.85 PASS AF=0.123894;AO=14;DP=113;FAO=14;FDP=113;FR=.;FRO=99;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=66;FWDB=0.0530869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1614;QD=2.22476;RBI=0.0535418;REFB=0.00524598;REVB=-0.00696491;RO=98;SAF=6;SAR=8;SRF=32;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134039;STB=0.587184;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.0319389;OID=.;OPOS=75679988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:113:113:98:99:14:14:0.123894:8:6:32:66:8:6:33:66 chr3 75679997 . C T 63.84 PASS AF=0.123894;AO=11;DP=109;FAO=14;FDP=113;FR=.;FRO=99;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=66;FWDB=0.0101324;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7054;QD=2.26;RBI=0.0463002;REFB=-0.00270926;REVB=0.0451779;RO=98;SAF=6;SAR=5;SRF=33;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248921;STB=0.587184;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0257491;OID=.;OPOS=75679997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:109:113:98:99:11:14:0.123894:5:6:33:65:8:6:33:66 chr3 75680006 . T C 30.49 PASS AF=0.0789474;AO=9;DP=115;FAO=9;FDP=114;FR=.;FRO=105;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=71;FWDB=0.00528394;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.565;QD=1.06977;RBI=0.0160583;REFB=-0.00236469;REVB=-0.0151641;RO=105;SAF=4;SAR=5;SRF=34;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1429;STB=0.615148;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0241325;OID=.;OPOS=75680006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:115:114:105:105:9:9:0.0789474:5:4:34:71:5:4:34:71 chr3 75680010 . T C 132.47 PASS AF=0.196581;AO=23;DP=117;FAO=23;FDP=117;FR=.;FRO=94;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=63;FWDB=-0.0132377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8554;QD=4.52876;RBI=0.0197305;REFB=-0.00986168;REVB=-0.0146307;RO=94;SAF=7;SAR=16;SRF=31;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372712;STB=0.523666;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0295534;OID=.;OPOS=75680010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:94:94:23:23:0.196581:16:7:31:63:16:7:31:63 chr3 75713564 . T C 495.14 PASS AF=0.407407;AO=55;DP=135;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00415062;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.989;QD=14.6708;RBI=0.00848168;REFB=-0.00913519;REVB=-0.00739671;RO=78;SAF=32;SAR=23;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862164;STB=0.541617;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0125615;OID=.;OPOS=75713564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:78:80:55:55:0.407407:23:32:39:39:23:32:41:39 chr3 75713669 . G A 66.69 PASS AF=0.186441;AO=11;DP=59;FAO=11;FDP=59;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0622323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.749;QD=4.52123;RBI=0.0655076;REFB=-0.0135635;REVB=0.0204545;RO=47;SAF=4;SAR=7;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157683;STB=0.612293;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0488276;OID=.;OPOS=75713669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:59:59:47:48:11:11:0.186441:7:4:23:24:7:4:24:24 chr3 75714298 . A G 743.19 PASS AF=0.493243;AO=70;DP=146;FAO=73;FDP=148;FR=.;FRO=75;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=0.00498944;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.229;QD=20.0861;RBI=0.00936399;REFB=-0.00954417;REVB=0.007924;RO=75;SAF=41;SAR=29;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246586;STB=0.507934;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0131014;OID=.;OPOS=75714298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:148:75:75:70:73:0.493243:29:41:42:33:31:42:42:33 chr3 75714311 . G A 110.92 PASS AF=0.141176;AO=24;DP=170;FAO=24;FDP=170;FR=.;FRO=146;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=77;FSRR=69;FWDB=0.0103023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5317;QD=2.60997;RBI=0.01139;REFB=-0.00313773;REVB=-0.00485739;RO=138;SAF=23;SAR=1;SRF=74;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.627244;STB=0.941096;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00772959;OID=.;OPOS=75714311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:138:146:24:24:0.141176:1:23:74:64:1:23:77:69 chr3 75714337 . T G 1328.37 PASS AF=0.6;AO=117;DP=196;FAO=117;FDP=195;FR=.;FRO=78;FSAF=63;FSAR=54;FSRF=46;FSRR=32;FWDB=0.00517495;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.516;QD=27.2485;RBI=0.0123366;REFB=-0.017735;REVB=0.0111987;RO=78;SAF=63;SAR=54;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382512;STB=0.520697;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0115585;OID=.;OPOS=75714337;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:195:78:78:117:117:0.6:54:63:46:32:54:63:46:32 chr3 75714345 . G T 393.21 PASS AF=0.274112;AO=54;DP=197;FAO=54;FDP=197;FR=.;FRO=143;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=82;FSRR=61;FWDB=-0.0174074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.237;QD=7.98398;RBI=0.0319317;REFB=-0.013368;REVB=-0.0267696;RO=143;SAF=26;SAR=28;SRF=82;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112847;STB=0.56648;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0271584;OID=.;OPOS=75714345;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:143:143:54:54:0.274112:28:26:82:61:28:26:82:61 chr3 75714702 . A G 420.81 PASS AF=0.452632;AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0080214;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.724;QD=17.7184;RBI=0.0305239;REFB=0.00435635;REVB=0.029451;RO=52;SAF=25;SAR=18;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154612;STB=0.58647;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.00419986;OID=.;OPOS=75714702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:52:52:43:43:0.452632:18:25:22:30:18:25:22:30 chr3 75714809 . C T 101.17 PASS AF=0.109756;AO=24;DP=244;FAO=27;FDP=246;FR=.;FRO=219;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=109;FSRR=110;FWDB=-0.00937527;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.67;QD=1.64505;RBI=0.012966;REFB=-0.00803494;REVB=-0.00895665;RO=146;SAF=8;SAR=16;SRF=68;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172736;STB=0.682811;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0326655;OID=.;OPOS=75714809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:246:146:219:24:27:0.109756:16:8:68:78:19:8:109:110 chr3 75714819 . G A 156.02 PASS AF=0.130742;AO=36;DP=282;FAO=37;FDP=283;FR=.;FRO=246;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=128;FSRR=118;FWDB=-0.031171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.667;QD=2.20518;RBI=0.0425305;REFB=-0.00313204;REVB=-0.0289346;RO=245;SAF=14;SAR=22;SRF=127;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1638;STB=0.623216;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0320376;OID=.;OPOS=75714819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:283:245:246:36:37:0.130742:22:14:127:118:23:14:128:118 chr3 75714825 . G A 850.29 PASS AF=0.27305;AO=75;DP=282;FAO=77;FDP=282;FR=.,HEALED;FRO=173;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=82;FSRR=91;FWDB=0.0279489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6961;QD=12.0609;RBI=0.0280256;REFB=-0.0032335;REVB=-0.00207235;RO=167;SAF=47;SAR=28;SRF=79;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184861;STB=0.613824;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0257892;OID=.;OPOS=75714825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:167:173:75:77:0.27305:28:47:79:88:28:49:82:91 chr3 75714831 . G A 271.7 PASS AF=0.173203;AO=52;DP=301;FAO=53;FDP=306;FR=.;FRO=253;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=135;FSRR=118;FWDB=-0.0243588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.906;QD=3.55165;RBI=0.0283044;REFB=-0.00526307;REVB=0.0144149;RO=249;SAF=18;SAR=34;SRF=132;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238183;STB=0.660317;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0326764;OID=.;OPOS=75714831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:306:249:253:52:53:0.173203:34:18:132:117:35:18:135:118 chr3 75714835 . C T 305.41 PASS AF=0.182109;AO=57;DP=313;FAO=57;FDP=313;FR=.;FRO=256;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=137;FSRR=119;FWDB=-0.000675246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.516;QD=3.903;RBI=0.00787625;REFB=-0.006361;REVB=-0.00784726;RO=256;SAF=21;SAR=36;SRF=137;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215349;STB=0.635981;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0299765;OID=.;OPOS=75714835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:313:256:256:57:57:0.182109:36:21:137:119:36:21:137:119 chr3 75714840 . A G 1344.02 PASS AF=0.44582;AO=144;DP=323;FAO=144;FDP=323;FR=.;FRO=179;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=89;FSRR=90;FWDB=0.00258889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.755;QD=16.6442;RBI=0.0103195;REFB=0.00288594;REVB=-0.00998944;RO=178;SAF=72;SAR=72;SRF=89;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505396;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.00459776;OID=.;OPOS=75714840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:323:178:179:144:144:0.44582:72:72:89:89:71:73:89:90 chr3 75714843 . T A 556.87 PASS AF=0.250755;AO=82;DP=329;FAO=83;FDP=331;FR=.;FRO=248;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=113;FSRR=135;FWDB=-0.0338838;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2898;QD=6.72949;RBI=0.0352716;REFB=-0.00270333;REVB=0.0097966;RO=246;SAF=51;SAR=31;SRF=111;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214346;STB=0.618715;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00726826;OID=.;OPOS=75714843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:331:246:248:82:83:0.250755:31:51:111:135:32:51:113:135 chr3 75714853 . G A 573.97 PASS AF=0.244444;AO=88;DP=360;FAO=88;FDP=360;FR=.;FRO=272;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=133;FSRR=139;FWDB=-0.00810167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4644;QD=6.37741;RBI=0.0176551;REFB=-0.0175167;REVB=-0.0156865;RO=269;SAF=50;SAR=38;SRF=130;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107297;STB=0.559971;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.066915;OID=.;OPOS=75714853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:360:360:269:272:88:88:0.244444:38:50:130:139:38:50:133:139 chr3 75714898 . G A 818.12 PASS AF=0.284653;AO=113;DP=400;FAO=115;FDP=404;FR=.;FRO=289;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=156;FSRR=133;FWDB=-0.0196476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2932;QD=8.10024;RBI=0.0986028;REFB=-0.0110076;REVB=0.0966255;RO=287;SAF=57;SAR=56;SRF=154;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395399;STB=0.525364;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0301324;OID=.;OPOS=75714898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:404:287:289:113:115:0.284653:56:57:154:133:57:58:156:133 chr3 75714917 . G A 409.49 PASS AF=0.19571;AO=72;DP=378;FAO=73;FDP=373;FR=.,HEALED;FRO=300;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=155;FSRR=145;FWDB=-0.0130854;FXX=0.0132272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.991;QD=4.39132;RBI=0.0192351;REFB=-0.00402028;REVB=-0.0140982;RO=230;SAF=39;SAR=33;SRF=152;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155743;STB=0.514175;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0200139;OID=.;OPOS=75714917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:378:373:230:300:72:73:0.19571:33:39:152:78:34:39:155:145 chr3 75714929 . G A 390.97 PASS AF=0.19346;AO=70;DP=367;FAO=71;FDP=367;FR=.;FRO=296;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=151;FSRR=145;FWDB=-0.0484663;FXX=0.00271732;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.456;QD=4.26127;RBI=0.0503529;REFB=-0.0255153;REVB=-0.0136539;RO=296;SAF=37;SAR=33;SRF=151;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239011;STB=0.508872;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0408858;OID=.;OPOS=75714929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:367:296:296:70:71:0.19346:33:37:151:145:34:37:151:145 chr3 75714935 . C A 54.86 PASS AF=0.0674157;AO=24;DP=356;FAO=24;FDP=356;FR=.;FRO=332;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=169;FSRR=163;FWDB=-0.0312002;FXX=0.00558644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.278;QD=0.616391;RBI=0.0319854;REFB=-0.00255913;REVB=-0.00704349;RO=329;SAF=15;SAR=9;SRF=167;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129158;STB=0.608974;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0223065;OID=.;OPOS=75714935;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:356:356:329:332:24:24:0.0674157:9:15:167:162:9:15:169:163 chr3 75714937 . G A 62.88 PASS AF=0.0734463;AO=26;DP=357;FAO=26;FDP=354;FR=.;FRO=328;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=165;FSRR=163;FWDB=-0.027655;FXX=0.00840313;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.452;QD=0.710526;RBI=0.0350953;REFB=-0.0012238;REVB=-0.0216075;RO=327;SAF=16;SAR=10;SRF=165;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12498;STB=0.60455;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0127563;OID=.;OPOS=75714937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:357:354:327:328:26:26:0.0734463:10:16:165:162:10:16:165:163 chr3 75714950 . C A 300.43 PASS AF=0.178125;AO=57;DP=320;FAO=57;FDP=320;FR=.;FRO=263;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=129;FSRR=134;FWDB=-0.0155774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.15;QD=3.75537;RBI=0.0161546;REFB=-0.00673422;REVB=-0.00427963;RO=263;SAF=31;SAR=26;SRF=129;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069092;STB=0.543844;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0420697;OID=.;OPOS=75714950;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:320:263:263:57:57:0.178125:26:31:129:134:26:31:129:134 chr3 75714971 . C A 278.35 PASS AF=0.186813;AO=50;DP=271;FAO=51;FDP=273;FR=.;FRO=222;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=109;FSRR=113;FWDB=-0.00576228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5278;QD=4.07841;RBI=0.00963468;REFB=-0.00943698;REVB=0.00772161;RO=219;SAF=21;SAR=29;SRF=107;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891514;STB=0.548731;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0324709;OID=.;OPOS=75714971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:273:219:222:50:51:0.186813:29:21:107:112:29:22:109:113 chr3 75714976 . C T 1035.69 PASS AF=0.442688;AO=111;DP=252;FAO=112;FDP=253;FR=.;FRO=141;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=67;FSRR=74;FWDB=0.0344271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.257;QD=16.3745;RBI=0.0368639;REFB=-0.0129634;REVB=0.0131802;RO=139;SAF=54;SAR=57;SRF=65;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018925;STB=0.503887;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0130473;OID=.;OPOS=75714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:253:139:141:111:112:0.442688:57:54:65:74:58:54:67:74 chr3 75714980 . C A 208.62 PASS AF=0.17094;AO=40;DP=233;FAO=40;FDP=234;FR=.;FRO=194;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=92;FSRR=102;FWDB=0.00407279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.448;QD=3.56617;RBI=0.0277552;REFB=-0.00340115;REVB=0.0274548;RO=189;SAF=20;SAR=20;SRF=89;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037525;STB=0.521357;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00756215;OID=.;OPOS=75714980;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:234:189:194:40:40:0.17094:20:20:89:100:20:20:92:102 chr3 75715016 . T C 242.64 PASS AF=0.259259;AO=35;DP=135;FAO=35;FDP=135;FR=.;FRO=100;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=0.0176797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2355;QD=7.1894;RBI=0.0269589;REFB=-0.000922161;REVB=0.0203522;RO=100;SAF=12;SAR=23;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075858;STB=0.545594;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00341966;OID=.;OPOS=75715016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:100:100:35:35:0.259259:23:12:40:60:23:12:40:60 chr3 75715118 . G A 151.89 PASS AF=0.25;AO=22;DP=88;FAO=22;FDP=88;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0119446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.653;QD=6.90408;RBI=0.0120812;REFB=-0.00451226;REVB=0.00181125;RO=63;SAF=11;SAR=11;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875047;STB=0.53406;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0164929;OID=.;OPOS=75715118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:63:66:22:22:0.25:11:11:27:36:11:11:30:36 chr3 75715124 . C T 129.81 PASS AF=0.215054;AO=20;DP=89;FAO=20;FDP=93;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.0160487;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7652;QD=5.58305;RBI=0.016193;REFB=-0.0195453;REVB=-0.00215682;RO=69;SAF=10;SAR=10;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633641;STB=0.526855;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0566712;OID=.;OPOS=75715124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:93:69:73:20:20:0.215054:10:10:31:38:10:10:34:39 chr3 75715173 . CT TG 128.58 PASS AF=0.184;AO=23;DP=126;FAO=23;FDP=125;FR=.;FRO=102;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=-0.00963161;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=2;MLLD=240.241;QD=4.11469;RBI=0.0169164;REFB=-0.00820355;REVB=-0.0139067;RO=102;SAF=12;SAR=11;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774751;STB=0.549575;STBP=0.605;TYPE=mnp;VARB=0.0282912;OID=.;OPOS=75715173;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:102:102:23:23:0.184:11:12:47:55:11:12:47:55 chr3 75715181 . G A 147.66 PASS AF=0.204918;AO=25;DP=122;FAO=25;FDP=122;FR=.;FRO=97;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.0279457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.971;QD=4.84131;RBI=0.0281687;REFB=-0.0142609;REVB=-0.00353724;RO=97;SAF=12;SAR=13;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204479;STB=0.51281;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0452282;OID=.;OPOS=75715181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:97:97:25:25:0.204918:13:12:45:52:13:12:45:52 chr3 75779719 . T C 113.64 PASS AF=0.184211;AO=22;DP=116;FAO=21;FDP=114;FR=.;FRO=93;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=47;FWDB=-0.00948435;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.213;QD=3.98739;RBI=0.0520268;REFB=-0.00559381;REVB=0.0511551;RO=94;SAF=12;SAR=10;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712087;STB=0.562754;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0506493;OID=.;OPOS=75779719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:94:93:22:21:0.184211:10:12:46:48:9:12:46:47 chr3 75779724 . T C 733.15 PASS AF=0.589744;AO=69;DP=117;FAO=69;FDP=117;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0267416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.669;QD=25.0648;RBI=0.0398406;REFB=-0.0270576;REVB=0.0295324;RO=48;SAF=35;SAR=34;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021157;STB=0.511515;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0244301;OID=.;OPOS=75779724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:48:48:69:69:0.589744:34:35:23:25:34:35:23:25 chr3 75779727 . A G 731.66 PASS AF=0.584746;AO=68;DP=117;FAO=69;FDP=118;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.073918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.924;QD=24.8019;RBI=0.0744456;REFB=0.00525265;REVB=0.00884741;RO=49;SAF=35;SAR=33;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348111;STB=0.515713;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00170896;OID=.;OPOS=75779727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:49:49:68:69:0.584746:33:35:23:26:34:35:23:26 chr3 75779742 . G A 368.55 PASS AF=0.354331;AO=45;DP=128;FAO=45;FDP=127;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.00414953;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.827;QD=11.6078;RBI=0.0206731;REFB=-0.0047761;REVB=-0.0202524;RO=81;SAF=18;SAR=27;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792688;STB=0.541917;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0202856;OID=.;OPOS=75779742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:81:82:45:45:0.354331:27:18:38:43:27:18:38:44 chr3 75779762 . G T 422.16 PASS AF=0.359712;AO=50;DP=139;FAO=50;FDP=139;FR=.;FRO=89;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.029404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7161;QD=12.1486;RBI=0.0294634;REFB=-0.0251921;REVB=0.00187006;RO=89;SAF=22;SAR=28;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107142;STB=0.50612;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0499148;OID=.;OPOS=75779762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:89:89:50:50:0.359712:28:22:40:49:28:22:40:49 chr3 75779769 . C G 784.65 PASS AF=0.574803;AO=73;DP=126;FAO=73;FDP=127;FR=.;FRO=54;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.0100757;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.375;QD=24.7135;RBI=0.0114565;REFB=-0.0255727;REVB=0.00545276;RO=51;SAF=34;SAR=39;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101474;STB=0.540965;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0178266;OID=.;OPOS=75779769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:51:54:73:73:0.574803:39:34:17:34:39:34:20:34 chr3 75779777 . TA T 414.61 PASS AF=0.557522;AO=58;DP=117;FAO=63;FDP=113;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0225498;FXX=0.0341851;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.5321;QD=14.6764;RBI=0.0504886;REFB=-0.00704408;REVB=0.0451731;RO=49;SAF=27;SAR=31;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0.338931;SSSB=0.0829119;STB=0.544975;STBP=0.292;TYPE=del;VARB=0.0216277;OID=.;OPOS=75779778;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.557522:58:117:63:113:50:29:34:18:32:99:49:27:31:18:31 chr3 75781222 . C T 778.85 PASS AF=0.676471;AO=68;DP=101;FAO=69;FDP=102;FR=.;FRO=33;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0334167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3462;QD=30.5433;RBI=0.100162;REFB=-0.00686853;REVB=0.0944236;RO=33;SAF=31;SAR=37;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000815696;STB=0.501722;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00453852;OID=.;OPOS=75781222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:33:33:68:69:0.676471:37:31:15:18:38:31:15:18 chr3 75781243 . T C 120.48 PASS AF=0.190909;AO=21;DP=110;FAO=21;FDP=110;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.0178011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1637;QD=4.38109;RBI=0.0178012;REFB=0.00404003;REVB=5.89262e-05;RO=88;SAF=8;SAR=13;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138192;STB=0.58406;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=-0.0099411;OID=.;OPOS=75781243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:88:89:21:21:0.190909:13:8:43:45:13:8:43:46 chr3 75781257 . T G 505.09 PASS AF=0.556818;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00974116;FXX=0.207189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8087;QD=22.9585;RBI=0.0274597;REFB=0.0274714;REVB=0.0256738;RO=38;SAF=25;SAR=24;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500002;STB=0.521549;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=-0.0213807;OID=.;OPOS=75781257;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:88:38:39:49:49:0.556818:24:25:17:21:24:25:18:21 chr3 75781263 . T C 783.25 PASS AF=0.63964;AO=71;DP=112;FAO=71;FDP=111;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0191719;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.175;QD=28.2252;RBI=0.0208021;REFB=0.0332134;REVB=-0.00807251;RO=41;SAF=33;SAR=38;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000933532;STB=0.505358;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.0159513;OID=.;OPOS=75781263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:41:40:71:71:0.63964:38:33:19:22:38:33:18:22 chr3 75781272 . C A 400.08 PASS AF=0.418182;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0144037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4416;QD=14.5483;RBI=0.0611777;REFB=0.00572821;REVB=-0.0594579;RO=63;SAF=23;SAR=23;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106147;STB=0.563609;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=-0.0101679;OID=.;OPOS=75781272;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:63:64:46:46:0.418182:23:23:25:38:23:23:25:39 chr3 75786031 . A C 76.3 PASS AF=0.1;AO=22;DP=221;FAO=22;FDP=220;FR=.;FRO=198;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=110;FSRR=88;FWDB=-0.0113074;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5737;QD=1.38724;RBI=0.019654;REFB=-0.000807024;REVB=-0.0160754;RO=197;SAF=14;SAR=8;SRF=111;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910103;STB=0.575273;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00563312;OID=.;OPOS=75786031;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:221:220:197:198:22:22:0.1:8:14:111:86:8:14:110:88 chr3 75786036 . A C 83.47 PASS AF=0.105023;AO=21;DP=216;FAO=23;FDP=219;FR=.;FRO=196;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=109;FSRR=87;FWDB=-0.0122401;FXX=0.0436662;HRUN=6;LEN=1;MLLD=200.069;QD=1.52464;RBI=0.0320666;REFB=-0.00279186;REVB=-0.0296386;RO=179;SAF=14;SAR=7;SRF=96;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162732;STB=0.548305;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0290074;OID=.;OPOS=75786036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:216:219:179:196:21:23:0.105023:7:14:96:83:9:14:109:87 chr3 75786042 . G A 1221.73 PASS AF=0.4;AO=93;DP=236;FAO=94;FDP=235;FR=.,HEALED;FRO=112;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=68;FSRR=44;FWDB=-0.0021079;FXX=0.0208325;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.462;QD=20.7954;RBI=0.00237925;REFB=-0.0126504;REVB=0.00110345;RO=114;SAF=52;SAR=41;SRF=67;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028885;STB=0.53558;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0133247;OID=.;OPOS=75786042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:114:112:93:94:0.4:41:52:67:47:43:51:68:44 chr3 75786059 . CA TA,TG 1650.22 PASS AF=0.352727,0.232727;AO=97,64;DP=276;FAO=97,64;FDP=275;FR=.;FRO=114;FSAF=48,36;FSAR=49,28;FSRF=64;FSRR=50;FWDB=-0.00839527,-0.00603606;FXX=0.00362306;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=124.341,182.025;QD=24.0032;RBI=0.00944271,0.0118713;REFB=-0.0035364,-0.00513237;REVB=0.00432253,-0.0102223;RO=114;SAF=48,36;SAR=49,28;SRF=64;SRR=50;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0649367,0.00125222;STB=0.53593,0.500713;STBP=0.356,0.99;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00796189,0.0165311;OID=.,.;OPOS=75786059,75786059;OREF=C,CA;OALT=T,TG;OMAPALT=TA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:275:114:114:97,64:97,64:0.352727,0.232727:49,28:48,36:64:50:49,28:48,36:64:50 chr3 75786071 . C A 761.28 PASS AF=0.335664;AO=96;DP=308;FAO=96;FDP=286;FR=.;FRO=190;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=105;FSRR=85;FWDB=-0.00171902;FXX=0.0714263;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.648;QD=10.6473;RBI=0.0025929;REFB=-0.00598253;REVB=-0.00194116;RO=189;SAF=52;SAR=44;SRF=104;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100532;STB=0.507343;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0122867;OID=.;OPOS=75786071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:286:189:190:96:96:0.335664:44:52:104:85:44:52:105:85 chr3 75786073 . C G 72.01 PASS AF=0.0822785;AO=26;DP=316;FAO=26;FDP=316;FR=.;FRO=290;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=155;FSRR=135;FWDB=0.00798982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.004;QD=0.911483;RBI=0.00807621;REFB=0.00266494;REVB=0.0011781;RO=289;SAF=14;SAR=12;SRF=155;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00248301;STB=0.503668;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.0374005;OID=.;OPOS=75786073;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:316:316:289:290:26:26:0.0822785:12:14:155:134:12:14:155:135 chr3 75786079 . CG CA,TA 2400.82 PASS AF=0.291045,0.458955;AO=78,126;DP=320;FAO=78,123;FDP=268;FR=.;FRO=67;FSAF=43,65;FSAR=35,58;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-7.33522e-05,-0.00145112;FXX=0.162495;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=138.607,133.359;QD=35.8331;RBI=0.0155026,0.00935811;REFB=-0.00226774,0.00625532;REVB=0.0155025,-0.00924492;RO=66;SAF=43,66;SAR=35,60;SRF=36;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00493014,-0.0138752;STB=0.500447,0.508421;STBP=0.995,0.774;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00298952,-0.00139629;OID=.,.;OPOS=75786080,75786079;OREF=G,CG;OALT=A,TA;OMAPALT=CA,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:320:268:66:67:78,126:78,123:0.291045,0.458955:35,60:43,66:36:30:35,58:43,65:37:30 chr3 75786132 . T C 1040.3 PASS AF=0.355742;AO=127;DP=356;FAO=127;FDP=357;FR=.;FRO=230;FSAF=63;FSAR=64;FSRF=118;FSRR=112;FWDB=-0.00823935;FXX=0.00279322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.619;QD=11.6561;RBI=0.0137072;REFB=-0.00428467;REVB=-0.0109545;RO=226;SAF=63;SAR=64;SRF=115;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144523;STB=0.510937;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0091759;OID=.;OPOS=75786132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:357:226:230:127:127:0.355742:64:63:115:111:64:63:118:112 chr3 75786163 . C T 1250.74 PASS AF=0.444079;AO=134;DP=308;FAO=135;FDP=304;FR=.;FRO=169;FSAF=62;FSAR=73;FSRF=82;FSRR=87;FWDB=0.00515261;FXX=0.0161807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.371;QD=16.4572;RBI=0.0207439;REFB=-0.00917988;REVB=-0.0200938;RO=173;SAF=61;SAR=73;SRF=86;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426718;STB=0.514485;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0132613;OID=.;OPOS=75786163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:304:173:169:134:135:0.444079:73:61:86:87:73:62:82:87 chr3 75786175 . C A 128.95 PASS AF=0.118705;AO=33;DP=280;FAO=33;FDP=278;FR=.;FRO=245;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=114;FSRR=131;FWDB=-0.00277769;FXX=0.0141839;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.31;QD=1.85534;RBI=0.00279289;REFB=-0.00205495;REVB=0.000290929;RO=245;SAF=15;SAR=18;SRF=114;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135558;STB=0.50954;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0205751;OID=.;OPOS=75786175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:278:245:245:33:33:0.118705:18:15:114:131:18:15:114:131 chr3 75786202 . TG CA 88.16 PASS AF=0.102459;AO=25;DP=244;FAO=25;FDP=244;FR=.;FRO=219;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=101;FSRR=118;FWDB=0.00695658;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=329.167;QD=1.44521;RBI=0.0131647;REFB=-0.00240496;REVB=0.0111765;RO=215;SAF=10;SAR=15;SRF=100;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805015;STB=0.555881;STBP=0.561;TYPE=mnp;VARB=0.0167719;OID=.;OPOS=75786202;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:244:244:215:219:25:25:0.102459:15:10:100:115:15:10:101:118 chr3 75786211 . A G 1104.66 PASS AF=0.504545;AO=110;DP=220;FAO=111;FDP=220;FR=.;FRO=109;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=51;FSRR=58;FWDB=0.00647056;FXX=0.0090086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5816;QD=20.0847;RBI=0.0101217;REFB=-0.0175303;REVB=-0.00778331;RO=108;SAF=51;SAR=59;SRF=51;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00778711;STB=0.504201;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0204119;OID=.;OPOS=75786211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:108:109:110:111:0.504545:59:51:51:57:60:51:51:58 chr3 75786221 . G A 104.21 PASS AF=0.126984;AO=24;DP=197;FAO=24;FDP=189;FR=.;FRO=165;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=78;FSRR=87;FWDB=-0.0034531;FXX=0.0406071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.054;QD=2.20557;RBI=0.0201918;REFB=-0.000582451;REVB=0.0198944;RO=171;SAF=12;SAR=12;SRF=85;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00365412;STB=0.52379;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00397138;OID=.;OPOS=75786221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:189:171:165:24:24:0.126984:12:12:85:86:12:12:78:87 chr3 75786225 . G A 244.37 PASS AF=0.230337;AO=34;DP=172;FAO=41;FDP=178;FR=.;FRO=137;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=64;FSRR=73;FWDB=0.00885886;FXX=0.0165737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3207;QD=5.49153;RBI=0.0228328;REFB=-0.0238822;REVB=0.0210441;RO=134;SAF=18;SAR=16;SRF=64;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661114;STB=0.571979;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.107122;OID=.;OPOS=75786225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:178:134:137:34:41:0.230337:16:18:64:70:18:23:64:73 chr3 75786230 . C T 37.6 PASS AF=0.0755814;AO=13;DP=172;FAO=13;FDP=172;FR=.;FRO=159;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=79;FSRR=80;FWDB=-0.0185252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1533;QD=0.874443;RBI=0.0313342;REFB=0.00196096;REVB=-0.0252715;RO=159;SAF=5;SAR=8;SRF=79;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125115;STB=0.604156;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=-0.0284211;OID=.;OPOS=75786230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:172:172:159:159:13:13:0.0755814:8:5:79:80:8:5:79:80 chr3 75786243 . C T 586.7 PASS AF=0.43662;AO=62;DP=142;FAO=62;FDP=142;FR=.;FRO=80;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=0.00487607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.273;QD=16.5269;RBI=0.0349734;REFB=-0.00305907;REVB=-0.0346318;RO=80;SAF=25;SAR=37;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209558;STB=0.616907;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00983164;OID=.;OPOS=75786243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:80:80:62:62:0.43662:37:25:49:31:37:25:49:31 chr3 75786245 . T A 576.63 PASS AF=0.445255;AO=62;DP=137;FAO=61;FDP=137;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=31;FWDB=-0.000141013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.045;QD=16.8358;RBI=0.000278334;REFB=-0.00798067;REVB=-0.000239969;RO=75;SAF=25;SAR=37;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180132;STB=0.61;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.01139;OID=.;OPOS=75786245;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:75:76:62:61:0.445255:37:25:44:31:37:24:45:31 chr3 75786251 . GG AT,GT 578.72 PASS AF=0.139344,0.368852;AO=17,45;DP=123;FAO=17,45;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=9,17;FSAR=8,28;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.012529,-0.00905933;FXX=0.0239981;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=183.547,202.594;QD=18.9744;RBI=0.0126888,0.0090718;REFB=-0.00116506,-0.00471403;REVB=0.00200751,0.000475508;RO=59;SAF=9,17;SAR=8,28;SRF=37;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.123618,-0.249846;STB=0.5687,0.635501;STBP=0.554,0.023;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0171375,0.0057043;OID=.,.;OPOS=75786251,75786252;OREF=GG,G;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:123:122:59:60:17,45:17,45:0.139344,0.368852:8,28:9,17:37:22:8,28:9,17:37:23 chr3 75786256 . T A 434.95 PASS AF=0.429825;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=-0.00753871;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.16;QD=15.2616;RBI=0.00786199;REFB=-0.00414989;REVB=-0.00223128;RO=65;SAF=18;SAR=31;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27988;STB=0.656717;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00638045;OID=.;OPOS=75786256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:65:65:49:49:0.429825:31:18:42:23:31:18:42:23 chr3 75786261 . C T 72.71 PASS AF=0.137615;AO=15;DP=109;FAO=15;FDP=109;FR=.;FRO=94;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=-0.0131551;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.506;QD=2.66834;RBI=0.0145554;REFB=-0.00649734;REVB=-0.00622933;RO=93;SAF=10;SAR=5;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241291;STB=0.662359;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0319347;OID=.;OPOS=75786261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:109:109:93:94:15:15:0.137615:5:10:44:49:5:10:45:49 chr3 75786264 . G T 67.57 PASS AF=0.132075;AO=15;DP=110;FAO=14;FDP=106;FR=.;FRO=92;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.0205534;FXX=0.0363603;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.933;QD=2.54977;RBI=0.0260644;REFB=-0.00436438;REVB=-0.0160284;RO=95;SAF=9;SAR=6;SRF=46;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144141;STB=0.571327;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0243779;OID=.;OPOS=75786264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:110:106:95:92:15:14:0.132075:6:9:46:49:6:8:45:47 chr3 75786278 . A C 571.71 PASS AF=0.58427;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00695706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.739;QD=25.6946;RBI=0.00714494;REFB=-0.021818;REVB=-0.00162775;RO=37;SAF=23;SAR=29;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13589;STB=0.574229;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0140419;OID=.;OPOS=75786278;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:37:37:52:52:0.58427:29:23:23:14:29:23:23:14 chr3 75786302 . G A 238.89 PASS AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.00801068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.256;QD=11.7969;RBI=0.0260692;REFB=-0.0043877;REVB=0.0248079;RO=52;SAF=10;SAR=19;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31709;STB=0.682417;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0110675;OID=.;OPOS=75786302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:19:10:33:19:19:10:33:19 chr3 75786314 . CCTACATTCT C 219.27 PASS AF=0.464789;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00722924;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=9;MLLD=336.537;QD=12.353;RBI=0.00778194;REFB=-0.0113445;REVB=-0.00288039;RO=37;SAF=13;SAR=20;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213609;STB=0.599255;STBP=0.116;TYPE=del;VARB=0.0154617;OID=.;OPOS=75786315;OREF=CTACATTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.464789:33:74:33:71:38:13:20:22:16:99:37:13:20:23:14 chr3 75786352 . G A 32.78 PASS AF=0.0963855;AO=8;DP=83;FAO=8;FDP=83;FR=.;FRO=75;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.0471539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6743;QD=1.57956;RBI=0.0483856;REFB=0.000146122;REVB=-0.0108481;RO=74;SAF=5;SAR=3;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144571;STB=0.607631;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.000361354;OID=.;OPOS=75786352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:83:83:74:75:8:8:0.0963855:3:5:37:37:3:5:38:37 chr3 75786379 . T C 285.79 PASS AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0120089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.895;QD=13.1399;RBI=0.0189545;REFB=-0.00385787;REVB=0.0146649;RO=54;SAF=15;SAR=18;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16868;STB=0.596216;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00697096;OID=.;OPOS=75786379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:54:54:33:33:0.37931:18:15:33:21:18:15:33:21 chr3 75786385 . C G 301.7 PASS AF=0.390805;AO=35;DP=90;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0128836;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.622;QD=13.8713;RBI=0.0357594;REFB=-0.00118876;REVB=0.0333579;RO=52;SAF=17;SAR=18;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958487;STB=0.569273;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0248791;OID=.;OPOS=75786385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:87:52:53:35:34:0.390805:18:17:30:22:18:16:31:22 chr3 75786417 . T C 177.06 PASS AF=0.252525;AO=25;DP=99;FAO=25;FDP=99;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.017179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2513;QD=7.15377;RBI=0.0286784;REFB=-0.0203403;REVB=-0.0229637;RO=74;SAF=12;SAR=13;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911748;STB=0.555154;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.070176;OID=.;OPOS=75786417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:74:74:25:25:0.252525:13:12:41:33:13:12:41:33 chr3 75786438 . G A 139.72 PASS AF=0.213592;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=103;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.0114136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.486;QD=5.4261;RBI=0.0338695;REFB=-0.00457416;REVB=-0.0318885;RO=79;SAF=12;SAR=10;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966394;STB=0.559805;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0251822;OID=.;OPOS=75786438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:79:81:22:22:0.213592:10:12:37:42:10:12:38:43 chr3 75786440 . C T 717.75 PASS AF=0.634615;AO=66;DP=104;FAO=66;FDP=104;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0545322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.416;QD=27.6058;RBI=0.0602373;REFB=0.00673814;REVB=-0.0255886;RO=38;SAF=33;SAR=33;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00503799;OID=.;OPOS=75786440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:38:38:66:66:0.634615:33:33:19:19:33:33:19:19 chr3 75786450 . G A 126.56 PASS AF=0.2;AO=21;DP=105;FAO=21;FDP=105;FR=.;FRO=84;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=-0.0331288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.26;QD=4.82139;RBI=0.0371476;REFB=-0.00467848;REVB=-0.0168055;RO=83;SAF=11;SAR=10;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528622;STB=0.528531;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0381798;OID=.;OPOS=75786450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:83:84:21:21:0.2:10:11:40:43:10:11:41:43 chr3 75786453 . C T 154.5 PASS AF=0.228571;AO=24;DP=105;FAO=24;FDP=105;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=-0.0209805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.883;QD=5.88551;RBI=0.0245802;REFB=-0.0071903;REVB=-0.0128064;RO=81;SAF=12;SAR=12;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772603;STB=0.504758;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0279466;OID=.;OPOS=75786453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:81:81:24:24:0.228571:12:12:40:41:12:12:40:41 chr3 75786490 . C G 35.18 PASS AF=0.0927835;AO=10;DP=97;FAO=9;FDP=97;FR=.;FRO=88;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=-0.0266255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.422;QD=1.45091;RBI=0.0273277;REFB=-0.00499436;REVB=0.00615522;RO=87;SAF=6;SAR=4;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177451;STB=0.59071;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0492123;OID=.;OPOS=75786490;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:97:97:87:88:10:9:0.0927835:4:6:39:48:4:5:40:48 chr3 75786499 . CAT CGA,CGT,TGT 201.76 PASS AF=0.135417,0.125,0.0520833;AO=12,12,5;DP=98;FAO=13,12,5;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=9,7,2;FSAR=4,5,3;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0123618,-0.0173955,-0.0158869;FXX=0.0204061;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,2;MLLD=204.985,160.652,198.138;QD=8.40679;RBI=0.0133709,0.0215031,0.0183745;REFB=0.00104762,0.00257374,-0.00322187;REVB=0.00509585,0.0126405,-0.00923194;RO=62;SAF=8,7,2;SAR=4,5,3;SRF=28;SRR=34;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.265698,0.162831,-0.0548752;STB=0.707938,0.620057,0.537421;STBP=0.101,0.433,0.965;TYPE=mnp,snp,mnp;VARB=-0.00938503,-0.00416003,0.0269717;OID=.,.,.;OPOS=75786500,75786500,75786499;OREF=AT,A,CA;OALT=GA,G,TG;OMAPALT=CGA,CGT,TGT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:98:96:62:66:12,12,5:13,12,5:0.135417,0.125,0.0520833:4,5,3:8,7,2:28:34:4,5,3:9,7,2:29:37 chr3 75786506 . T C 59.66 PASS AF=0.122642;AO=13;DP=102;FAO=13;FDP=106;FR=.;FRO=93;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=0.00894571;FXX=0.0185168;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.968;QD=2.2515;RBI=0.00932714;REFB=0.00101332;REVB=-0.00264004;RO=87;SAF=7;SAR=6;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08266;STB=0.557076;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00460358;OID=.;OPOS=75786506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:102:106:87:93:13:13:0.122642:6:7:41:46:6:7:44:49 chr3 75786515 . GG AG,AT 319.96 PASS AF=0.330275,0.0458716;AO=35,5;DP=108;FAO=36,5;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=21,2;FSAR=15,3;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.00407968,0.00208276;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=190.635,201.797;QD=11.7415;RBI=0.0132455,0.00871518;REFB=-0.00134675,0.00331889;REVB=-0.0126015,-0.00846265;RO=67;SAF=21,2;SAR=14,3;SRF=34;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.106731,-0.110146;STB=0.554985,0.593033;STBP=0.406,0.714;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000331259,-0.00197696;OID=.,.;OPOS=75786515,75786515;OREF=G,GG;OALT=A,AT;OMAPALT=AG,AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:67:68:35,5:36,5:0.330275,0.0458716:14,3:21,2:34:33:15,3:21,2:34:34 chr3 75786518 . A C 119.52 PASS AF=0.189189;AO=21;DP=111;FAO=21;FDP=111;FR=.;FRO=90;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.00448488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0865;QD=4.30696;RBI=0.00593795;REFB=-0.00658955;REVB=-0.00389168;RO=90;SAF=13;SAR=8;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152285;STB=0.597478;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0230745;OID=.;OPOS=75786518;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:90:90:21:21:0.189189:8:13:45:45:8:13:45:45 chr3 75786521 . G A 117.01 PASS AF=0.184211;AO=21;DP=114;FAO=21;FDP=114;FR=.;FRO=93;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=0.00106832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.8;QD=4.10551;RBI=0.01982;REFB=-0.000858181;REVB=-0.0197912;RO=93;SAF=13;SAR=8;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145785;STB=0.593818;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00316029;OID=.;OPOS=75786521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:93:93:21:21:0.184211:8:13:47:46:8:13:47:46 chr3 75786533 . T G 78.04 PASS AF=0.134921;AO=17;DP=126;FAO=17;FDP=126;FR=.;FRO=109;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=52;FWDB=-0.00605256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.58;QD=2.47743;RBI=0.0234583;REFB=-0.00915468;REVB=0.022664;RO=109;SAF=9;SAR=8;SRF=57;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811248;STB=0.505611;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.034208;OID=.;OPOS=75786533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:126:126:109:109:17:17:0.134921:8:9:57:52:8:9:57:52 chr3 75786555 . C CTG 521.61 PASS AF=0.42963;AO=53;DP=140;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=-0.0020183;FXX=0.0357117;HRUN=0;LEN=2;MLLD=247.466;QD=15.4552;RBI=0.0225078;REFB=-0.0059365;REVB=0.0224172;RO=79;SAF=34;SAR=19;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148121;STB=0.546098;STBP=0.382;TYPE=ins;VARB=0.00615876;OID=.;OPOS=75786556;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.42963:53:140:58:135:77:34:24:39:38:99:79:34:19:40:39 chr3 75786572 . T C 165.17 PASS AF=0.193103;AO=28;DP=145;FAO=28;FDP=145;FR=.;FRO=117;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=0.0458381;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.535;QD=4.55637;RBI=0.0464249;REFB=-0.00198393;REVB=-0.00735798;RO=115;SAF=13;SAR=15;SRF=58;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511079;STB=0.539115;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00990942;OID=.;OPOS=75786572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:115:117:28:28:0.193103:15:13:58:57:15:13:60:57 chr3 75786597 . C T 140.44 PASS AF=0.182482;AO=25;DP=138;FAO=25;FDP=137;FR=.;FRO=112;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=54;FSRR=58;FWDB=0.00889027;FXX=0.00724585;HRUN=5;LEN=1;MLLD=178.364;QD=4.10044;RBI=0.0167694;REFB=-0.00158124;REVB=0.0142189;RO=112;SAF=10;SAR=15;SRF=54;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105973;STB=0.567992;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0113088;OID=.;OPOS=75786597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:112:112:25:25:0.182482:15:10:54:58:15:10:54:58 chr3 75786607 . C T 155.2 PASS AF=0.184932;AO=27;DP=146;FAO=27;FDP=146;FR=.;FRO=119;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=-0.0101912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.437;QD=4.25209;RBI=0.0195203;REFB=-0.0131385;REVB=-0.0166488;RO=119;SAF=10;SAR=17;SRF=58;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151766;STB=0.597035;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0146312;OID=.;OPOS=75786607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:119:119:27:27:0.184932:17:10:58:61:17:10:58:61 chr3 75786610 . T G 146.98 PASS AF=0.181818;AO=26;DP=143;FAO=26;FDP=143;FR=.;FRO=117;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=56;FSRR=61;FWDB=0.0321631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3374;QD=4.11126;RBI=0.0422018;REFB=0.00850858;REVB=0.0273227;RO=116;SAF=10;SAR=16;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127058;STB=0.578252;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.038493;OID=.;OPOS=75786610;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:116:117:26:26:0.181818:16:10:56:60:16:10:56:61 chr3 75786619 . T C 121.3 PASS AF=0.161972;AO=23;DP=142;FAO=23;FDP=142;FR=.;FRO=119;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=57;FSRR=62;FWDB=-0.0152639;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.194;QD=3.41691;RBI=0.0155038;REFB=-0.00379588;REVB=0.0027169;RO=119;SAF=10;SAR=13;SRF=57;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566593;STB=0.53729;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0128175;OID=.;OPOS=75786619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:119:119:23:23:0.161972:13:10:57:62:13:10:57:62 chr3 75786623 . G T 367.08 PASS AF=0.319444;AO=46;DP=144;FAO=46;FDP=144;FR=.;FRO=98;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=0.00805474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.127;QD=10.1967;RBI=0.0211961;REFB=-0.000868264;REVB=0.019606;RO=97;SAF=24;SAR=22;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676019;STB=0.542477;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00127704;OID=.;OPOS=75786623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:97:98:46:46:0.319444:22:24:45:52:22:24:45:53 chr3 75786670 . G A 512.94 PASS AF=0.383648;AO=61;DP=159;FAO=61;FDP=159;FR=.;FRO=98;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=-0.0128908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.273;QD=12.9041;RBI=0.0192476;REFB=-0.00995342;REVB=-0.0142932;RO=98;SAF=28;SAR=33;SRF=38;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788438;STB=0.544528;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00849489;OID=.;OPOS=75786670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:98:98:61:61:0.383648:33:28:38:60:33:28:38:60 chr3 75786681 . G A 1104.55 PASS AF=0.651316;AO=98;DP=153;FAO=99;FDP=152;FR=.;FRO=53;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.009435;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.349;QD=29.067;RBI=0.0105512;REFB=-0.0101718;REVB=-0.00472312;RO=53;SAF=39;SAR=59;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369508;STB=0.521303;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00439938;OID=.;OPOS=75786681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:53:53:98:99:0.651316:59:39:24:29:60:39:24:29 chr3 75786687 . A T 48.7 PASS AF=0.0909091;AO=14;DP=155;FAO=14;FDP=154;FR=.;FRO=140;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=61;FSRR=79;FWDB=-0.0285181;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.356;QD=1.26497;RBI=0.0286127;REFB=0.000177183;REVB=-0.00232484;RO=135;SAF=4;SAR=10;SRF=59;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187427;STB=0.645905;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00350567;OID=.;OPOS=75786687;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:155:154:135:140:14:14:0.0909091:10:4:59:76:10:4:61:79 chr3 75786737 . A T 489.05 PASS AF=0.418605;AO=53;DP=130;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.0121715;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.037;QD=15.1643;RBI=0.0134612;REFB=0.00134634;REVB=-0.00574979;RO=74;SAF=28;SAR=25;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168604;STB=0.601897;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0033302;OID=.;OPOS=75786737;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:74:75:53:54:0.418605:25:28:27:47:25:29:27:48 chr3 75786740 . CA CG,GG 655.51 PASS AF=0.330709,0.204724;AO=42,26;DP=127;FAO=42,26;FDP=127;FR=.;FRO=59;FSAF=23,6;FSAR=19,20;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00454528,0.000649608;FXX=0.00781189;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=120.706,127.746;QD=20.646;RBI=0.00853161,0.00144915;REFB=0.0020869,-0.0129543;REVB=-0.00722003,0.0012954;RO=56;SAF=23,6;SAR=19,20;SRF=23;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.138372,-0.24531;STB=0.581695,0.64504;STBP=0.177,0.116;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00701166,0.016704;OID=.,.;OPOS=75786741,75786740;OREF=A,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:56:59:42,26:42,26:0.330709,0.204724:19,20:23,6:23:33:19,20:23,6:24:35 chr3 75786748 . C T 44.51 PASS AF=0.096;AO=12;DP=124;FAO=12;FDP=125;FR=.;FRO=113;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=-0.0451683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7934;QD=1.42446;RBI=0.0470445;REFB=0.00328218;REVB=-0.0131532;RO=112;SAF=5;SAR=7;SRF=48;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143173;STB=0.515663;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.0373714;OID=.;OPOS=75786748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:124:125:112:113:12:12:0.096:7:5:48:64:7:5:49:64 chr3 75786753 . C T 93.86 PASS AF=0.152;AO=19;DP=125;FAO=19;FDP=125;FR=.;FRO=106;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=-0.00206713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.208;QD=3.00353;RBI=0.0150166;REFB=-0.00170415;REVB=-0.0148736;RO=106;SAF=7;SAR=12;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978286;STB=0.565868;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0143547;OID=.;OPOS=75786753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:125:125:106:106:19:19:0.152:12:7:47:59:12:7:47:59 chr3 75786754 . G T 165.61 PASS AF=0.217742;AO=27;DP=124;FAO=27;FDP=124;FR=.;FRO=97;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.00519616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.42;QD=5.34233;RBI=0.0166312;REFB=-0.00172262;REVB=-0.0157986;RO=97;SAF=6;SAR=21;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366662;STB=0.729549;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0159719;OID=.;OPOS=75786754;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:97:97:27:27:0.217742:21:6:48:49:21:6:48:49 chr3 75786759 . T C 705.16 PASS AF=0.552846;AO=68;DP=123;FAO=68;FDP=123;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0118369;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.479;QD=22.9321;RBI=0.0145681;REFB=-0.0126041;REVB=-0.0084922;RO=52;SAF=31;SAR=37;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573554;STB=0.517036;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0104951;OID=.;OPOS=75786759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:52:55:68:68:0.552846:37:31:20:32:37:31:23:32 chr3 75786760 . TCCCC TCCCCT,TCCC 155.92 PASS AF=0.218487,0.10084;AO=24,14;DP=117;FAO=26,12;FDP=119;FR=.;FRO=81;FSAF=6,5;FSAR=20,7;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0393601,-0.119271;FXX=0;HRUN=0,4;LEN=1,1;MLLD=148.006,19.1263;QD=5.24094;RBI=0.0393649,0.132613;REFB=0.00363179,0.0355772;REVB=0.000614824,0.0579697;RO=77;SAF=4,7;SAR=20,7;SRF=37;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.438337,0.0243668;STB=0.722896,0.577967;STBP=0.014,0.555;TYPE=ins,del;VARB=0.00259046,-0.00211031;OID=.,.;OPOS=75786765,75786761;OREF=-,C;OALT=T,-;OMAPALT=TCCCCT,TCCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.218487,0.10084:24,14:117:26,12:119:81:6,5:20,7:41:40:99:77:4,7:20,7:37:40 chr3 75786773 . T A 329.71 PASS AF=0.359649;AO=41;DP=114;FAO=41;FDP=114;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.0272602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5512;QD=11.5689;RBI=0.0297174;REFB=-0.00951014;REVB=0.0118323;RO=72;SAF=25;SAR=16;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286325;STB=0.658645;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0365597;OID=.;OPOS=75786773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:72:73:41:41:0.359649:16:25:25:47:16:25:26:47 chr3 75786784 . T C 116.14 PASS AF=0.188679;AO=20;DP=106;FAO=20;FDP=106;FR=.;FRO=86;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=41;FWDB=-0.0101858;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.984;QD=4.38247;RBI=0.0103277;REFB=-0.00855016;REVB=-0.00170613;RO=82;SAF=5;SAR=15;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342314;STB=0.727921;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0367105;OID=.;OPOS=75786784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:82:86:20:20:0.188679:15:5:42:40:15:5:45:41 chr3 75786802 . G A 308.09 PASS AF=0.364583;AO=34;DP=97;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0138959;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.329;QD=12.8371;RBI=0.0160546;REFB=-0.00708985;REVB=-0.00804076;RO=58;SAF=19;SAR=15;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102584;STB=0.553149;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0150788;OID=.;OPOS=75786802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:58:61:34:35:0.364583:15:19:27:31:16:19:28:33 chr3 75786827 . A T 620.47 PASS AF=0.559633;AO=61;DP=108;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.00365795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.277;QD=22.7696;RBI=0.0198474;REFB=-0.0195873;REVB=0.0195074;RO=47;SAF=25;SAR=36;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983896;STB=0.558715;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00781872;OID=.;OPOS=75786827;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:47:48:61:61:0.559633:36:25:25:22:36:25:26:22 chr3 75786832 . C T 752.69 PASS AF=0.633028;AO=69;DP=109;FAO=69;FDP=109;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00648475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.831;QD=27.6218;RBI=0.00662632;REFB=-0.0248599;REVB=-0.00136239;RO=40;SAF=28;SAR=41;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480942;STB=0.526064;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00969847;OID=.;OPOS=75786832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:40:40:69:69:0.633028:41:28:19:21:41:28:19:21 chr3 75786833 . G A 36.96 PASS AF=0.0900901;AO=10;DP=111;FAO=10;FDP=111;FR=.;FRO=101;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=56;FWDB=-0.0180171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.882;QD=1.33192;RBI=0.0215455;REFB=-0.00602862;REVB=-0.0118149;RO=100;SAF=3;SAR=7;SRF=45;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179311;STB=0.63971;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0372054;OID=.;OPOS=75786833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:111:111:100:101:10:10:0.0900901:7:3:45:55:7:3:45:56 chr3 75786845 . T C 808.68 PASS AF=0.666667;AO=65;DP=114;FAO=72;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0179194;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.73;QD=29.9512;RBI=0.0334691;REFB=-0.0399089;REVB=0.0282679;RO=35;SAF=23;SAR=42;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146467;STB=0.576819;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0218112;OID=.;OPOS=75786845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:108:35:36:65:72:0.666667:42:23:20:15:46:26:21:15 chr3 75786854 . A T 396.36 PASS AF=0.379032;AO=47;DP=124;FAO=47;FDP=124;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0161856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.876;QD=12.7859;RBI=0.0228912;REFB=-0.00750717;REVB=-0.0161874;RO=77;SAF=19;SAR=28;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847611;STB=0.548231;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0210733;OID=.;OPOS=75786854;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:77:77:47:47:0.379032:28:19:37:40:28:19:37:40 chr3 75786866 . G T 211.39 PASS AF=0.240602;AO=32;DP=133;FAO=32;FDP=133;FR=.;FRO=101;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=-0.0231193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.239;QD=6.35751;RBI=0.0364151;REFB=-0.0192507;REVB=-0.0281346;RO=101;SAF=11;SAR=21;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157718;STB=0.596121;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0399711;OID=.;OPOS=75786866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:101:101:32:32:0.240602:21:11:47:54:21:11:47:54 chr3 75786888 . C T 205.64 PASS AF=0.205882;AO=35;DP=170;FAO=35;FDP=170;FR=.;FRO=135;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=61;FSRR=74;FWDB=0.00780801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.045;QD=4.83851;RBI=0.0373968;REFB=-0.00264351;REVB=-0.0365726;RO=134;SAF=14;SAR=21;SRF=60;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623761;STB=0.542144;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0114867;OID=.;OPOS=75786888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:134:135:35:35:0.205882:21:14:60:74:21:14:61:74 chr3 75786892 . A C 306.64 PASS AF=0.260116;AO=45;DP=173;FAO=45;FDP=173;FR=.;FRO=128;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=64;FSRR=64;FWDB=-0.0057688;FXX=0.0057468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.828;QD=7.08988;RBI=0.0135441;REFB=-0.0039808;REVB=-0.0122541;RO=126;SAF=16;SAR=29;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182274;STB=0.609194;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0154622;OID=.;OPOS=75786892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:126:128:45:45:0.260116:29:16:63:63:29:16:64:64 chr3 75786899 . T C 436.56 PASS AF=0.267045;AO=46;DP=180;FAO=47;FDP=176;FR=.,HEALED;FRO=110;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=56;FWDB=0.141149;FXX=0.022221;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.2525;QD=9.92173;RBI=0.170172;REFB=0.00366952;REVB=-0.095055;RO=96;SAF=18;SAR=28;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116713;STB=0.577081;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00436168;OID=.;OPOS=75786899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:176:96:110:46:47:0.267045:28:18:47:49:29:18:54:56 chr3 75786910 . T C 266.7 PASS AF=0.21028;AO=45;DP=214;FAO=45;FDP=214;FR=.;FRO=169;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=78;FSRR=91;FWDB=-0.0308965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.906;QD=4.98506;RBI=0.0309719;REFB=-0.00577662;REVB=0.00216053;RO=167;SAF=19;SAR=26;SRF=76;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426644;STB=0.531493;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.029883;OID=.;OPOS=75786910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:167:169:45:45:0.21028:26:19:76:91:26:19:78:91 chr3 75786916 . C A 307.07 PASS AF=0.217391;AO=50;DP=233;FAO=50;FDP=230;FR=.;FRO=180;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=88;FSRR=92;FWDB=0.0057952;FXX=0.012875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.795;QD=5.34035;RBI=0.00903668;REFB=-0.00364221;REVB=-0.00693377;RO=182;SAF=18;SAR=32;SRF=88;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161295;STB=0.603088;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0148395;OID=.;OPOS=75786916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:230:182:180:50:50:0.217391:32:18:88:94:32:18:88:92 chr3 75786919 . A T 301.33 PASS AF=0.209205;AO=50;DP=239;FAO=50;FDP=239;FR=.;FRO=189;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=94;FSRR=95;FWDB=-0.0042018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.231;QD=5.04314;RBI=0.0130767;REFB=-0.00306049;REVB=-0.0123833;RO=181;SAF=18;SAR=32;SRF=90;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178143;STB=0.610517;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0135836;OID=.;OPOS=75786919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:181:189:50:50:0.209205:32:18:90:91:32:18:94:95 chr3 75786921 . G A 32.5 PASS AF=0.0617284;AO=15;DP=243;FAO=15;FDP=243;FR=.;FRO=228;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=107;FSRR=121;FWDB=-0.00610981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.106;QD=0.534936;RBI=0.00668216;REFB=0.000483612;REVB=-0.00270583;RO=228;SAF=6;SAR=9;SRF=107;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733375;STB=0.565855;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.00624103;OID=.;OPOS=75786921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:243:243:228:228:15:15:0.0617284:9:6:107:121:9:6:107:121 chr3 75786965 . C T 916.14 PASS AF=0.409449;AO=103;DP=255;FAO=104;FDP=254;FR=.;FRO=150;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=61;FSRR=89;FWDB=-0.0134664;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7088;QD=14.4274;RBI=0.0134879;REFB=6.99201e-05;REVB=0.000761035;RO=149;SAF=49;SAR=54;SRF=59;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849817;STB=0.543966;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00013759;OID=.;OPOS=75786965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:149:150:103:104:0.409449:54:49:59:90:54:50:61:89 chr3 75786991 . C T 883.81 PASS AF=0.401639;AO=97;DP=244;FAO=98;FDP=244;FR=.;FRO=146;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=59;FSRR=87;FWDB=-0.0468621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8458;QD=14.4887;RBI=0.0488897;REFB=-0.0108402;REVB=-0.0139339;RO=146;SAF=43;SAR=54;SRF=59;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427727;STB=0.521163;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0190075;OID=.;OPOS=75786991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:146:146:97:98:0.401639:54:43:59:87:55:43:59:87 chr3 75786993 . T A 62.31 PASS AF=0.0846774;AO=21;DP=248;FAO=21;FDP=248;FR=.;FRO=227;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=98;FSRR=129;FWDB=-0.0173813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4721;QD=1.00494;RBI=0.0366202;REFB=-0.000625547;REVB=0.0322324;RO=227;SAF=6;SAR=15;SRF=98;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179172;STB=0.643421;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0118982;OID=.;OPOS=75786993;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:248:248:227:227:21:21:0.0846774:15:6:98:129:15:6:98:129 chr3 75787015 . C T 349.56 PASS AF=0.238938;AO=54;DP=226;FAO=54;FDP=226;FR=.;FRO=172;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=79;FSRR=93;FWDB=0.00247151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.149;QD=6.18695;RBI=0.00248085;REFB=-0.000852942;REVB=0.000215045;RO=171;SAF=21;SAR=33;SRF=78;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870003;STB=0.554974;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00322805;OID=.;OPOS=75787015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:171:172:54:54:0.238938:33:21:78:93:33:21:79:93 chr3 75787032 . T C 652.94 PASS AF=0.375;AO=77;DP=208;FAO=78;FDP=208;FR=.;FRO=130;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=0.0137408;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.651;QD=12.5565;RBI=0.0205526;REFB=-0.00744648;REVB=0.0152841;RO=128;SAF=38;SAR=39;SRF=55;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705699;STB=0.535335;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0193357;OID=.;OPOS=75787032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:128:130:77:78:0.375:39:38:55:73:40:38:56:74 chr3 75787043 . G A 598.29 PASS AF=0.366492;AO=111;DP=190;FAO=70;FDP=191;FR=.;FRO=121;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=72;FWDB=0.027246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3219;QD=12.5297;RBI=0.0344317;REFB=0.000461301;REVB=-0.0210523;RO=79;SAF=50;SAR=61;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013834;STB=0.586674;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00144907;OID=.;OPOS=75787043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:79:121:111:70:0.366492:61:50:37:42:32:38:49:72 chr3 75787047 . G GACTTATA 104.88 PASS AF=0.141026;AO=22;DP=192;FAO=22;FDP=156;FR=.;FRO=134;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=67;FSRR=67;FWDB=-0.0251965;FXX=0.174594;HRUN=1;LEN=7;MLLD=298.327;QD=2.68915;RBI=0.0256617;REFB=-0.00279987;REVB=-0.00486424;RO=168;SAF=5;SAR=17;SRF=82;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334043;STB=0.744295;STBP=0.028;TYPE=ins;VARB=0.0153714;OID=.;OPOS=75787048;OREF=-;OALT=ACTTATA;OMAPALT=GACTTATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.141026:22:192:22:156:134:5:17:67:67:99:168:5:17:82:86 chr3 75787049 . C A 159.68 PASS AF=0.164021;AO=31;DP=189;FAO=31;FDP=189;FR=.;FRO=158;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=72;FSRR=86;FWDB=-0.00830599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.646;QD=3.3794;RBI=0.00982038;REFB=-0.00574905;REVB=0.00523932;RO=158;SAF=14;SAR=17;SRF=72;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00528262;STB=0.503441;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0333546;OID=.;OPOS=75787049;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:158:158:31:31:0.164021:17:14:72:86:17:14:72:86 chr3 75787057 . G A 1181.2 PASS AF=0.675325;AO=97;DP=147;FAO=104;FDP=154;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=69;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0115907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.165;QD=30.6806;RBI=0.0360444;REFB=-0.00796017;REVB=0.03413;RO=44;SAF=35;SAR=62;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440762;STB=0.515635;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00869617;OID=.;OPOS=75787057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:154:44:50:97:104:0.675325:62:35:19:25:69:35:19:31 chr3 75787081 . A T 75.76 PASS AF=0.12782;AO=17;DP=136;FAO=17;FDP=133;FR=.;FRO=116;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=51;FSRR=65;FWDB=0.00997313;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.127;QD=2.2784;RBI=0.011257;REFB=-0.00075728;REVB=-0.00522072;RO=117;SAF=6;SAR=11;SRF=51;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107045;STB=0.578853;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00497024;OID=.;OPOS=75787081;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:136:133:117:116:17:17:0.12782:11:6:51:66:11:6:51:65 chr3 75787098 . CCT C 73.47 PASS AF=0.201835;AO=20;DP=121;FAO=22;FDP=109;FR=.;FRO=87;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0164315;FXX=0.0353951;HRUN=4;LEN=2;MLLD=220.908;QD=2.69601;RBI=0.0234938;REFB=-0.00757093;REVB=-0.0167919;RO=95;SAF=10;SAR=10;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601918;STB=0.541247;STBP=0.696;TYPE=del;VARB=0.0354951;OID=.;OPOS=75787099;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.201835:20:121:22:109:87:11:11:39:48:73:95:10:10:43:52 chr3 75787127 . G T 33.44 PASS AF=0.0758621;AO=11;DP=145;FAO=11;FDP=145;FR=.;FRO=134;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=71;FSRR=63;FWDB=-0.00431488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6388;QD=0.922464;RBI=0.0703701;REFB=-0.00279201;REVB=-0.0702376;RO=134;SAF=5;SAR=6;SRF=71;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830363;STB=0.569164;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0298337;OID=.;OPOS=75787127;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:145:145:134:134:11:11:0.0758621:6:5:71:63:6:5:71:63 chr3 75787145 . T C 111.74 PASS AF=0.15493;AO=22;DP=142;FAO=22;FDP=142;FR=.;FRO=120;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=63;FSRR=57;FWDB=-0.00379447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.368;QD=3.14763;RBI=0.0105605;REFB=0.000527666;REVB=-0.00985521;RO=120;SAF=10;SAR=12;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893458;STB=0.559333;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.00419408;OID=.;OPOS=75787145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:120:120:22:22:0.15493:12:10:63:57:12:10:63:57 chr3 75787159 . C T 111.3 PASS AF=0.14966;AO=22;DP=147;FAO=22;FDP=147;FR=.;FRO=125;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=65;FSRR=60;FWDB=-0.0185934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.825;QD=3.02855;RBI=0.0193266;REFB=0.000329845;REVB=-0.00527274;RO=124;SAF=14;SAR=8;SRF=64;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1549;STB=0.600917;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.00416139;OID=.;OPOS=75787159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:124:125:22:22:0.14966:8:14:64:60:8:14:65:60 chr3 75787169 . G A 206.94 PASS AF=0.222222;AO=32;DP=146;FAO=32;FDP=144;FR=.;FRO=112;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=58;FSRR=54;FWDB=-0.00599188;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.554;QD=5.7484;RBI=0.00606117;REFB=-0.0043858;REVB=-0.000913869;RO=112;SAF=21;SAR=11;SRF=58;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179774;STB=0.610941;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0124486;OID=.;OPOS=75787169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:112:112:32:32:0.222222:11:21:58:54:11:21:58:54 chr3 75787186 . C T 204.34 PASS AF=0.217687;AO=32;DP=147;FAO=32;FDP=147;FR=.;FRO=115;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=0.00706208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4481;QD=5.56023;RBI=0.0280117;REFB=-0.00143354;REVB=-0.0271069;RO=113;SAF=19;SAR=13;SRF=61;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694873;STB=0.543536;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0075105;OID=.;OPOS=75787186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:113:115:32:32:0.217687:13:19:61:52:13:19:62:53 chr3 75787199 . A C 38.54 PASS AF=0.0816327;AO=12;DP=147;FAO=12;FDP=147;FR=.;FRO=135;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=79;FSRR=56;FWDB=-0.0370813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.108;QD=1.04871;RBI=0.0375347;REFB=-0.0028643;REVB=-0.00581666;RO=135;SAF=8;SAR=4;SRF=79;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970215;STB=0.579574;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0476809;OID=.;OPOS=75787199;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:147:147:135:135:12:12:0.0816327:4:8:79:56:4:8:79:56 chr3 75787221 . C T 40.7 PASS AF=0.0869565;AO=10;DP=138;FAO=12;FDP=138;FR=.;FRO=126;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=73;FSRR=53;FWDB=-0.0343081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.336;QD=1.17978;RBI=0.0560072;REFB=-0.000970236;REVB=-0.0442691;RO=124;SAF=7;SAR=3;SRF=72;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138333;STB=0.671695;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0267;OID=.;OPOS=75787221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:138:138:124:126:10:12:0.0869565:3:7:72:52:3:9:73:53 chr3 75787224 . C T 51.62 PASS AF=0.104839;AO=13;DP=133;FAO=13;FDP=124;FR=.;FRO=111;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=63;FSRR=48;FWDB=-0.0269424;FXX=0.0746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4288;QD=1.66526;RBI=0.0418415;REFB=-0.0200909;REVB=-0.0320128;RO=110;SAF=10;SAR=3;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265236;STB=0.69926;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0187361;OID=.;OPOS=75787224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:133:124:110:111:13:13:0.104839:3:10:62:48:3:10:63:48 chr3 75787240 . A G 39.69 PASS AF=0.0901639;AO=11;DP=122;FAO=11;FDP=122;FR=.;FRO=111;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=0.0240725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.697;QD=1.30134;RBI=0.025899;REFB=-0.00757209;REVB=0.00955374;RO=109;SAF=7;SAR=4;SRF=60;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10198;STB=0.581388;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0357013;OID=.;OPOS=75787240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:122:122:109:111:11:11:0.0901639:4:7:60:49:4:7:61:50 chr3 75787298 . T C 34.31 PASS AF=0.136364;AO=5;DP=44;FAO=6;FDP=44;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.00894877;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.048;QD=3.1191;RBI=0.0182719;REFB=-0.0261603;REVB=0.0159305;RO=36;SAF=0;SAR=5;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.562719;STB=0.651598;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0786151;OID=.;OPOS=75787298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:44:44:36:38:5:6:0.136364:5:0:11:25:5:1:11:27 chr3 75787382 . T C 80.91 PASS AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0179729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.218;QD=7.89359;RBI=0.0192497;REFB=0.000166605;REVB=0.00689374;RO=30;SAF=1;SAR=10;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.547436;STB=0.851512;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-4.40527e-05;OID=.;OPOS=75787382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:41:30:30:11:11:0.268293:10:1:14:16:10:1:14:16 chr3 75787405 . C T 117.61 PASS AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0282685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.001;QD=7.58754;RBI=0.0375561;REFB=-0.0133494;REVB=-0.0247255;RO=45;SAF=12;SAR=5;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406551;STB=0.744251;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0330714;OID=.;OPOS=75787405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:45:45:17:17:0.274194:5:12:16:29:5:12:16:29 chr3 75787416 . C T 122.78 PASS AF=0.22619;AO=19;DP=84;FAO=19;FDP=84;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.000792543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.874;QD=5.84681;RBI=0.0935592;REFB=-0.00774289;REVB=-0.0935559;RO=65;SAF=13;SAR=6;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346719;STB=0.714067;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0134411;OID=.;OPOS=75787416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:65:65:19:19:0.22619:6:13:26:39:6:13:26:39 chr3 75787424 . C G 243.89 PASS AF=0.348837;AO=29;DP=86;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.0113764;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.349;QD=11.3436;RBI=0.011494;REFB=0.00880391;REVB=0.00163984;RO=56;SAF=22;SAR=7;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453229;STB=0.742172;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.022767;OID=.;OPOS=75787424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:56:56:29:30:0.348837:7:22:20:36:8:22:20:36 chr3 75787427 . T C 185.71 PASS AF=0.284091;AO=25;DP=85;FAO=25;FDP=88;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.0058841;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.214;QD=8.44122;RBI=0.0119337;REFB=0.00489024;REVB=-0.0103822;RO=59;SAF=19;SAR=6;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423154;STB=0.767982;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00794408;OID=.;OPOS=75787427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:88:59:63:25:25:0.284091:6:19:24:35:6:19:24:39 chr3 75787458 . G A 45.23 PASS AF=0.102804;AO=11;DP=107;FAO=11;FDP=107;FR=.;FRO=96;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.0120008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.593;QD=1.69093;RBI=0.0197697;REFB=-0.00361891;REVB=-0.0157106;RO=96;SAF=7;SAR=4;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197447;STB=0.648972;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0385075;OID=.;OPOS=75787458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:107:107:96:96:11:11:0.102804:4:7:45:51:4:7:45:51 chr3 75787464 . C T 296.92 PASS AF=0.342342;AO=38;DP=111;FAO=38;FDP=111;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.0477426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6865;QD=10.6997;RBI=0.0530814;REFB=0.00746369;REVB=0.0232008;RO=72;SAF=28;SAR=10;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435939;STB=0.747063;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0174832;OID=.;OPOS=75787464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:72:73:38:38:0.342342:10:28:25:47:10:28:26:47 chr3 75787476 . C A,T 52.97 PASS AF=0.0598291,0.0598291;AO=7,7;DP=117;FAO=7,7;FDP=117;FR=.;FRO=103;FSAF=3,5;FSAR=4,2;FSRF=49;FSRR=54;FWDB=-0.00192932,-0.00112093;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=259.824,274.542;QD=1.81088;RBI=0.00854023,0.0203438;REFB=-0.0021062,-0.00237909;REVB=-0.00831945,-0.0203129;RO=102;SAF=3,5;SAR=4,2;SRF=49;SRR=53;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0534169,0.239495;STB=0.544375,0.721023;STBP=0.787,0.248;TYPE=snp,snp;VARB=0.0257238,0.0117127;OID=.,.;OPOS=75787476,75787476;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:117:117:102:103:7,7:7,7:0.0598291,0.0598291:4,2:3,5:49:53:4,2:3,5:49:54 chr3 75787486 . C T 516.27 PASS AF=0.445312;AO=54;DP=125;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=-0.00369227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.984;QD=16.1333;RBI=0.00549092;REFB=-0.00825428;REVB=0.00406416;RO=71;SAF=38;SAR=16;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332852;STB=0.670489;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0117383;OID=.;OPOS=75787486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:71:71:54:57:0.445312:16:38:27:44:18:39:27:44 chr3 75787490 . A T 55.14 PASS AF=0.10687;AO=14;DP=131;FAO=14;FDP=131;FR=.;FRO=117;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=59;FSRR=58;FWDB=-0.0168628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.455;QD=1.68367;RBI=0.0323689;REFB=-0.00260718;REVB=-0.0276296;RO=117;SAF=7;SAR=7;SRF=59;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00514561;STB=0.503811;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.00807411;OID=.;OPOS=75787490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:131:131:117:117:14:14:0.10687:7:7:59:58:7:7:59:58 chr3 75787511 . C A 65.17 PASS AF=0.105634;AO=15;DP=143;FAO=15;FDP=142;FR=.,HEALED;FRO=126;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=63;FSRR=63;FWDB=0.00535203;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.967;QD=1.83584;RBI=0.00625082;REFB=-0.000549806;REVB=-0.00322933;RO=103;SAF=8;SAR=7;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143111;STB=0.529762;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00458157;OID=.;OPOS=75787511;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:143:142:103:126:15:15:0.105634:7:8:43:60:7:8:63:63 chr3 75787516 . C G 374.35 PASS AF=0.328767;AO=45;DP=143;FAO=48;FDP=146;FR=.;FRO=98;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.00510347;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.868;QD=10.2562;RBI=0.0148783;REFB=-0.00476267;REVB=-0.0139757;RO=97;SAF=30;SAR=15;SRF=42;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275966;STB=0.645773;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0130245;OID=.;OPOS=75787516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:146:97:98:45:48:0.328767:15:30:42:55:17:31:42:56 chr3 75787519 . CT AG,CG 613.29 PASS AF=0.342466,0.116438;AO=50,17;DP=147;FAO=50,17;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=33,8;FSAR=17,9;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0116136,-0.00259592;FXX=0.00680226;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=122.715,169.063;QD=16.8025;RBI=0.0137692,0.00259689;REFB=0.0112544,0.000197497;REVB=0.00739712,-7.10156e-05;RO=76;SAF=33,8;SAR=17,9;SRF=31;SRR=45;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.27016,0.0801054;STB=0.65645,0.554393;STBP=0.012,0.651;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00835039,0.0117913;OID=.,.;OPOS=75787519,75787520;OREF=CT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:76:79:50,17:50,17:0.342466,0.116438:17,9:33,8:31:45:17,9:33,8:32:47 chr3 75787576 . A G 120.14 PASS AF=0.149701;AO=25;DP=166;FAO=25;FDP=167;FR=.;FRO=142;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=73;FSRR=69;FWDB=0.00330704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.771;QD=2.8776;RBI=0.0101422;REFB=-0.000732696;REVB=-0.00958794;RO=136;SAF=13;SAR=12;SRF=70;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675611;STB=0.505032;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00648117;OID=.;OPOS=75787576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:136:142:25:25:0.149701:12:13:70:66:12:13:73:69 chr3 75787583 . A G 129.11 PASS AF=0.157576;AO=26;DP=164;FAO=26;FDP=165;FR=.;FRO=139;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=70;FSRR=69;FWDB=-0.00848955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4961;QD=3.12993;RBI=0.0149013;REFB=-0.0138123;REVB=-0.0122465;RO=137;SAF=13;SAR=13;SRF=69;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00466047;STB=0.503028;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0556564;OID=.;OPOS=75787583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:137:139:26:26:0.157576:13:13:69:68:13:13:70:69 chr3 75787620 . T C 155.62 PASS AF=0.1875;AO=27;DP=143;FAO=27;FDP=144;FR=.;FRO=117;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=-0.0132219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8827;QD=4.32289;RBI=0.0299012;REFB=-0.00285064;REVB=0.0268191;RO=116;SAF=13;SAR=14;SRF=59;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346362;STB=0.525431;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00970539;OID=.;OPOS=75787620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:116:117:27:27:0.1875:14:13:59:57:14:13:60:57 chr3 75787637 . C T 474.07 PASS AF=0.382979;AO=52;DP=139;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=-0.00231344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.856;QD=13.4488;RBI=0.0216466;REFB=-0.0157686;REVB=-0.0215227;RO=86;SAF=30;SAR=22;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12288;STB=0.582248;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0246036;OID=.;OPOS=75787637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:141:86:87:52:54:0.382979:22:30:40:46:22:32:40:47 chr3 75787645 . GAA G 210.4 PASS AF=0.344538;AO=34;DP=123;FAO=41;FDP=119;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=45;FWDB=-0.0350956;FXX=0.0403193;HRUN=4;LEN=2;MLLD=37.9419;QD=7.07241;RBI=0.0351354;REFB=0.00621102;REVB=0.00167132;RO=69;SAF=17;SAR=17;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108897;STB=0.5897;STBP=0.17;TYPE=del;VARB=-0.0116572;OID=.;OPOS=75787646;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.344538:34:123:41:119:78:23:18:33:45:99:69:17:17:28:41 chr3 75787679 . T C 512.16 PASS AF=0.392157;AO=59;DP=152;FAO=60;FDP=153;FR=.;FRO=93;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=47;FWDB=0.0133824;FXX=0.00649309;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.444;QD=13.3898;RBI=0.0135033;REFB=0.00201811;REVB=-0.00180276;RO=93;SAF=33;SAR=26;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703076;STB=0.533759;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00321355;OID=.;OPOS=75787679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:93:93:59:60:0.392157:26:33:46:47:27:33:46:47 chr3 75787688 . T A 530.13 PASS AF=0.405405;AO=52;DP=151;FAO=60;FDP=148;FR=.;FRO=88;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0181364;FXX=0.0198662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0809;QD=14.3279;RBI=0.0566912;REFB=-0.0178514;REVB=0.0537119;RO=71;SAF=26;SAR=26;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651843;STB=0.506327;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0192546;OID=.;OPOS=75787688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:148:71:88:52:60:0.405405:26:26:31:40:28:32:46:42 chr3 75787702 . C G 1435.78 PASS AF=0.655914;AO=122;DP=186;FAO=122;FDP=186;FR=.;FRO=64;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0123774;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0158;QD=30.8771;RBI=0.0266368;REFB=-0.0337519;REVB=-0.0235864;RO=62;SAF=61;SAR=61;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.016726;OID=.;OPOS=75787702;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:62:64:122:122:0.655914:61:61:31:31:61:61:33:31 chr3 75787725 . C T 40.37 PASS AF=0.0728155;AO=15;DP=206;FAO=15;FDP=206;FR=.;FRO=191;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=94;FSRR=97;FWDB=0.00986687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.467;QD=0.783899;RBI=0.0208134;REFB=-0.000668247;REVB=-0.018326;RO=190;SAF=9;SAR=6;SRF=94;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116502;STB=0.599867;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00485519;OID=.;OPOS=75787725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:206:206:190:191:15:15:0.0728155:6:9:94:96:6:9:94:97 chr3 75787726 . G A 1109.44 PASS AF=0.537313;AO=108;DP=201;FAO=108;FDP=201;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=-0.00954567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.734;QD=22.0785;RBI=0.0103607;REFB=-0.000379495;REVB=-0.00402789;RO=93;SAF=54;SAR=54;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227773;STB=0.512435;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.000893715;OID=.;OPOS=75787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:93:93:108:108:0.537313:54:54:44:49:54:54:44:49 chr3 75787728 . C T 173.69 PASS AF=0.165;AO=32;DP=199;FAO=33;FDP=200;FR=.;FRO=167;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=82;FSRR=85;FWDB=-0.00374248;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.695;QD=3.47373;RBI=0.0407246;REFB=-0.00292417;REVB=-0.0405523;RO=166;SAF=15;SAR=17;SRF=81;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246783;STB=0.505152;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00536164;OID=.;OPOS=75787728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:200:166:167:32:33:0.165:17:15:81:85:17:16:82:85 chr3 75787732 . A C 510.25 PASS AF=0.317536;AO=67;DP=213;FAO=67;FDP=211;FR=.;FRO=144;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=76;FSRR=68;FWDB=0.00642776;FXX=0.00938923;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.83;QD=9.67306;RBI=0.021973;REFB=-0.0083838;REVB=-0.0210118;RO=144;SAF=33;SAR=34;SRF=76;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416204;STB=0.524031;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0054225;OID=.;OPOS=75787732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:211:144:144:67:67:0.317536:34:33:76:68:34:33:76:68 chr3 75787739 . A T 2279.32 PASS AF=0.789238;AO=158;DP=207;FAO=176;FDP=223;FR=.;FRO=47;FSAF=90;FSAR=86;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0033159;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.552;QD=40.8846;RBI=0.0278154;REFB=-0.0340428;REVB=0.0276171;RO=48;SAF=86;SAR=72;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264869;STB=0.517806;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00769211;OID=.;OPOS=75787739;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:223:48:47:158:176:0.789238:72:86:29:19:86:90:28:19 chr3 75787770 . C T 145.31 PASS AF=0.122867;AO=36;DP=293;FAO=36;FDP=293;FR=.;FRO=257;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=145;FSRR=112;FWDB=-0.0210009;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.87;QD=1.98373;RBI=0.0237491;REFB=-0.00457488;REVB=-0.0110898;RO=257;SAF=19;SAR=17;SRF=145;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462856;STB=0.532145;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0322061;OID=.;OPOS=75787770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:257:257:36:36:0.122867:17:19:145:112:17:19:145:112 chr3 75787794 . A G 2816.73 PASS AF=0.707692;AO=230;DP=326;FAO=230;FDP=325;FR=.;FRO=95;FSAF=121;FSAR=109;FSRF=62;FSRR=33;FWDB=0.0122987;FXX=0.00306739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.681;QD=34.6675;RBI=0.0259551;REFB=-0.0349243;REVB=0.0228563;RO=94;SAF=121;SAR=109;SRF=61;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672395;STB=0.537232;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0129058;OID=.;OPOS=75787794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:325:94:95:230:230:0.707692:109:121:61:33:109:121:62:33 chr3 75787801 . TG CA 613.61 PASS AF=0.267477;AO=87;DP=328;FAO=88;FDP=329;FR=.;FRO=241;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=139;FSRR=102;FWDB=0.00642062;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=227.809;QD=7.46034;RBI=0.009656;REFB=-0.00627009;REVB=0.00721207;RO=240;SAF=44;SAR=43;SRF=138;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863916;STB=0.548025;STBP=0.29;TYPE=mnp;VARB=0.0143951;OID=.;OPOS=75787801;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:329:240:241:87:88:0.267477:43:44:138:102:43:45:139:102 chr3 75787809 . T C 1227.18 PASS AF=0.397101;AO=137;DP=345;FAO=137;FDP=345;FR=.;FRO=208;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=119;FSRR=89;FWDB=0.00777141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.671;QD=14.2281;RBI=0.0173755;REFB=-0.0182961;REVB=-0.0155407;RO=207;SAF=71;SAR=66;SRF=118;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558934;STB=0.532592;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0289543;OID=.;OPOS=75787809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:345:207:208:137:137:0.397101:66:71:118:89:66:71:119:89 chr3 75787812 . C CT 55.41 PASS AF=0.118497;AO=41;DP=348;FAO=41;FDP=346;FR=.;FRO=305;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=164;FSRR=141;FWDB=-0.0400788;FXX=0.00574696;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.747;QD=0.64056;RBI=0.114005;REFB=0.00359483;REVB=0.106728;RO=304;SAF=26;SAR=15;SRF=163;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125722;STB=0.587272;STBP=0.237;TYPE=ins;VARB=-0.0248948;OID=.;OPOS=75787813;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.118497:41:348:41:346:305:26:15:164:141:55:304:26:15:163:141 chr3 75787829 . C G 92.66 PASS AF=0.0876712;AO=32;DP=365;FAO=32;FDP=365;FR=.;FRO=333;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=190;FSRR=143;FWDB=-0.00184825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.893;QD=1.01546;RBI=0.0181499;REFB=-0.000547589;REVB=-0.0180556;RO=333;SAF=12;SAR=20;SRF=190;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228068;STB=0.673678;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0168539;OID=.;OPOS=75787829;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:365:365:333:333:32:32:0.0876712:20:12:190:143:20:12:190:143 chr3 75787863 . AT TA 88.91 PASS AF=0.086351;AO=31;DP=360;FAO=31;FDP=359;FR=.;FRO=328;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=170;FSRR=158;FWDB=-0.0141543;FXX=0.0027777;HRUN=1;LEN=2;MLLD=230.365;QD=0.990588;RBI=0.0193406;REFB=-0.00267648;REVB=-0.0131801;RO=326;SAF=20;SAR=11;SRF=170;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147742;STB=0.617839;STBP=0.176;TYPE=mnp;VARB=0.0235004;OID=.;OPOS=75787863;OREF=AT;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:360:359:326:328:31:31:0.086351:11:20:170:156:11:20:170:158 chr3 75787869 . CA TG 2970.28 PASS AF=0.72561;AO=237;DP=330;FAO=238;FDP=328;FR=.;FRO=90;FSAF=122;FSAR=116;FSRF=52;FSRR=38;FWDB=-0.00143048;FXX=0.00906317;HRUN=1;LEN=2;MLLD=148.893;QD=36.223;RBI=0.028218;REFB=-0.0263642;REVB=-0.0281817;RO=90;SAF=121;SAR=116;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034757;STB=0.517909;STBP=0.282;TYPE=mnp;VARB=0.00720376;OID=.;OPOS=75787869;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:328:90:90:237:238:0.72561:116:121:52:38:116:122:52:38 chr3 75787876 . G T 2971.5 PASS AF=0.73913;AO=237;DP=321;FAO=238;FDP=322;FR=.;FRO=84;FSAF=125;FSAR=113;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=0.0161892;FXX=0.00309588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.67;QD=36.9131;RBI=0.0175817;REFB=-0.0350811;REVB=0.0068575;RO=84;SAF=124;SAR=113;SRF=51;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414306;STB=0.521473;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.011938;OID=.;OPOS=75787876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:322:84:84:237:238:0.73913:113:124:51:33:113:125:51:33 chr3 75787880 . A G 582.34 PASS AF=0.262346;AO=85;DP=322;FAO=85;FDP=324;FR=.;FRO=239;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=133;FSRR=106;FWDB=-0.0282766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.788;QD=7.18933;RBI=0.0406754;REFB=0.00272072;REVB=-0.0292391;RO=236;SAF=41;SAR=44;SRF=132;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956704;STB=0.554529;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.0129507;OID=.;OPOS=75787880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:324:236:239:85:85:0.262346:44:41:132:104:44:41:133:106 chr3 75787897 . T C 888.84 PASS AF=0.353896;AO=108;DP=308;FAO=109;FDP=308;FR=.;FRO=199;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=111;FSRR=88;FWDB=0.00884671;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.207;QD=11.5434;RBI=0.0300424;REFB=-0.0047404;REVB=0.0287103;RO=197;SAF=60;SAR=48;SRF=110;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00324849;STB=0.504789;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00786549;OID=.;OPOS=75787897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:308:197:199:108:109:0.353896:48:60:110:87:49:60:111:88 chr3 75787918 . C T 39.32 PASS AF=0.0645161;AO=18;DP=279;FAO=18;FDP=279;FR=.;FRO=261;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=140;FSRR=121;FWDB=-0.0278362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.634;QD=0.563739;RBI=0.029386;REFB=-0.00166509;REVB=-0.00941691;RO=260;SAF=14;SAR=4;SRF=139;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270077;STB=0.739365;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0180989;OID=.;OPOS=75787918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:279:279:260:261:18:18:0.0645161:4:14:139:121:4:14:140:121 chr3 75787926 . T C 42.11 PASS AF=0.0676692;AO=18;DP=266;FAO=18;FDP=266;FR=.;FRO=248;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=130;FSRR=118;FWDB=-0.0038679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.653;QD=0.633176;RBI=0.00429802;REFB=-0.000303443;REVB=0.00187412;RO=241;SAF=14;SAR=4;SRF=124;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295104;STB=0.747524;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0394252;OID=.;OPOS=75787926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:266:266:241:248:18:18:0.0676692:4:14:124:117:4:14:130:118 chr3 75787927 . A G 2071.04 PASS AF=0.676923;AO=171;DP=255;FAO=176;FDP=260;FR=.;FRO=84;FSAF=86;FSAR=90;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=0.00855456;FXX=0.00383127;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.28;QD=31.8622;RBI=0.0145172;REFB=-0.0120509;REVB=0.011729;RO=81;SAF=81;SAR=90;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933321;STB=0.542069;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00546703;OID=.;OPOS=75787927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:260:81:84:171:176:0.676923:90:81:51:30:90:86:52:32 chr3 75787949 . C T 1996.94 PASS AF=0.76555;AO=153;DP=207;FAO=160;FDP=209;FR=.;FRO=49;FSAF=84;FSAR=76;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0501298;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.058;QD=38.2189;RBI=0.0501365;REFB=-0.0347423;REVB=-0.000818265;RO=49;SAF=80;SAR=73;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150841;STB=0.513052;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00892768;OID=.;OPOS=75787949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:209:49:49:153:160:0.76555:73:80:24:25:76:84:23:26 chr3 75787961 . A G 988.0 PASS AF=0.518919;AO=96;DP=185;FAO=96;FDP=185;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=0.0131713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.297;QD=21.3622;RBI=0.0131979;REFB=-0.019261;REVB=-0.00083698;RO=88;SAF=45;SAR=51;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0074656;STB=0.506945;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0137939;OID=.;OPOS=75787961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:88:89:96:96:0.518919:51:45:42:46:51:45:43:46 chr3 75787962 . G C 161.63 PASS AF=0.168478;AO=31;DP=184;FAO=31;FDP=184;FR=.;FRO=153;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=72;FSRR=81;FWDB=-0.0175684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.744;QD=3.51376;RBI=0.0176925;REFB=-0.00201167;REVB=0.00209152;RO=153;SAF=15;SAR=16;SRF=72;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170766;STB=0.511057;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.020884;OID=.;OPOS=75787962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:153:153:31:31:0.168478:16:15:72:81:16:15:72:81 chr3 75787996 . C T 60.3 PASS AF=0.110294;AO=15;DP=137;FAO=15;FDP=136;FR=.;FRO=121;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=60;FSRR=61;FWDB=0.0363652;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7442;QD=1.77346;RBI=0.0436042;REFB=0.004121;REVB=0.0240603;RO=122;SAF=8;SAR=7;SRF=60;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503173;STB=0.533289;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0362162;OID=.;OPOS=75787996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:137:136:122:121:15:15:0.110294:7:8:60:62:7:8:60:61 chr3 75788010 . A C 1432.14 PASS AF=0.875;AO=105;DP=121;FAO=105;FDP=120;FR=.;FRO=15;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0202901;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.58;QD=47.738;RBI=0.0207012;REFB=-0.0263522;REVB=0.00410503;RO=16;SAF=51;SAR=54;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276673;STB=0.51908;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00358514;OID=.;OPOS=75788010;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:121:120:16:15:105:105:0.875:54:51:6:10:54:51:5:10 chr3 75788023 . C T 859.51 PASS AF=0.688073;AO=75;DP=109;FAO=75;FDP=109;FR=.;FRO=34;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0370193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2947;QD=31.5417;RBI=0.0425789;REFB=-0.0477072;REVB=-0.0210364;RO=34;SAF=36;SAR=39;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225511;STB=0.512138;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0157092;OID=.;OPOS=75788023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:34:34:75:75:0.688073:39:36:15:19:39:36:15:19 chr3 75788028 . G C 567.02 PASS AF=0.56701;AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00959517;FXX=0.0490148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.013;QD=23.3822;RBI=0.0143881;REFB=0.00140852;REVB=0.0107214;RO=42;SAF=27;SAR=28;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493849;STB=0.527017;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.00358899;OID=.;OPOS=75788028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:97:42:42:55:55:0.56701:28:27:18:24:28:27:18:24 chr3 75788068 . A C 383.1 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00436482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.578;QD=17.4135;RBI=0.0116348;REFB=-0.0270902;REVB=-0.0107851;RO=48;SAF=17;SAR=23;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00831485;STB=0.504654;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0277958;OID=.;OPOS=75788068;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:23:17:20:28:23:17:20:28 chr3 75788076 . A C 770.5 PASS AF=0.7;AO=63;DP=91;FAO=63;FDP=90;FR=.;FRO=27;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00391014;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3948;QD=34.2445;RBI=0.0126594;REFB=-0.000686902;REVB=0.0120404;RO=28;SAF=29;SAR=34;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038879;STB=0.516009;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.000437758;OID=.;OPOS=75788076;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:28:27:63:63:0.7:34:29:11:17:34:29:11:16 chr3 75788088 . C T 38.68 PASS AF=0.0934579;AO=10;DP=107;FAO=10;FDP=107;FR=.;FRO=97;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=-0.0193049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3691;QD=1.44587;RBI=0.0695629;REFB=0.00178691;REVB=-0.0668305;RO=97;SAF=4;SAR=6;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511447;STB=0.540149;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.0225736;OID=.;OPOS=75788088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:107:107:97:97:10:10:0.0934579:6:4:43:54:6:4:43:54 chr3 75788115 . G A 1038.26 PASS AF=0.6875;AO=87;DP=126;FAO=88;FDP=128;FR=.;FRO=40;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.00873044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2019;QD=32.4457;RBI=0.0239487;REFB=0.00147909;REVB=0.0223007;RO=38;SAF=46;SAR=41;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905151;STB=0.553812;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.000748677;OID=.;OPOS=75788115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:38:40:87:88:0.6875:41:46:14:24:42:46:14:26 chr3 75788130 . C A 673.46 PASS AF=0.5;AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=0.00609997;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.823;QD=20.1033;RBI=0.0106018;REFB=-0.00259317;REVB=-0.00867111;RO=67;SAF=36;SAR=31;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134697;STB=0.574192;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00328226;OID=.;OPOS=75788130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:67:67:67:67:0.5:31:36:26:41:31:36:26:41 chr3 75788152 . T C 845.58 PASS AF=0.611111;AO=77;DP=156;FAO=77;FDP=126;FR=.;FRO=49;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.00300081;FXX=0.202519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.567;QD=26.8439;RBI=0.0498241;REFB=0.00663722;REVB=0.0497336;RO=47;SAF=46;SAR=31;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13631;STB=0.582015;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00390894;OID=.;OPOS=75788152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:126:47:49:77:77:0.611111:31:46:19:28:31:46:19:30 chr3 75788199 . T C 1043.79 PASS AF=0.479821;AO=106;DP=222;FAO=107;FDP=223;FR=.;FRO=116;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=51;FSRR=65;FWDB=0.00509801;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.598;QD=18.7227;RBI=0.0322427;REFB=-0.0125021;REVB=0.0318371;RO=116;SAF=61;SAR=45;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128848;STB=0.572855;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.01367;OID=.;OPOS=75788199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:116:116:106:107:0.479821:45:61:51:65:45:62:51:65 chr3 75788226 . CA AG,GG 1730.54 PASS AF=0.479821,0.210762;AO=105,47;DP=221;FAO=107,47;FDP=223;FR=.;FRO=69;FSAF=60,24;FSAR=47,23;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=0.000224813,-0.00299351;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=239.931,219.474;QD=31.0411;RBI=0.00785202,0.00994076;REFB=-0.00935354,-0.00639791;REVB=-0.0078488,-0.00947933;RO=68;SAF=58,24;SAR=47,23;SRF=27;SRR=41;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.112592,0.118942;STB=0.560736,0.562199;STBP=0.048,0.28;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0108483,-0.0135616;OID=.,.;OPOS=75788226,75788226;OREF=CA,CA;OALT=AG,GG;OMAPALT=AG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:223:68:69:105,47:107,47:0.479821,0.210762:47,23:58,24:27:41:47,23:60,24:28:41 chr3 75788230 . C T 36.84 PASS AF=0.0678733;AO=15;DP=221;FAO=15;FDP=221;FR=.;FRO=206;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=105;FSRR=101;FWDB=-0.0366104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.635;QD=0.666749;RBI=0.0366131;REFB=0.000144903;REVB=-0.000447929;RO=205;SAF=7;SAR=8;SRF=104;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439975;STB=0.540031;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.00378773;OID=.;OPOS=75788230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:221:221:205:206:15:15:0.0678733:8:7:104:101:8:7:105:101 chr3 75788245 . C T 265.91 PASS AF=0.209302;AO=45;DP=215;FAO=45;FDP=215;FR=.;FRO=170;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=86;FSRR=84;FWDB=-0.0175314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.473;QD=4.94716;RBI=0.0182502;REFB=-0.00431606;REVB=-0.0050715;RO=170;SAF=23;SAR=22;SRF=86;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0066952;STB=0.504134;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0224789;OID=.;OPOS=75788245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:170:170:45:45:0.209302:22:23:86:84:22:23:86:84 chr3 75788258 . C A 1646.27 PASS AF=0.678392;AO=134;DP=199;FAO=135;FDP=199;FR=.;FRO=64;FSAF=75;FSAR=60;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00320669;FXX=0.00499975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.296;QD=33.0908;RBI=0.00336718;REFB=-0.00285696;REVB=-0.00102713;RO=64;SAF=75;SAR=59;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739461;STB=0.538111;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00118577;OID=.;OPOS=75788258;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:64:64:134:135:0.678392:59:75:28:36:60:75:28:36 chr3 75788281 . T C 1144.3 PASS AF=0.678571;AO=96;DP=140;FAO=95;FDP=140;FR=.;FRO=45;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00692011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.084;QD=32.6942;RBI=0.0112372;REFB=0.00645866;REVB=0.00885366;RO=42;SAF=55;SAR=41;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419397;STB=0.511455;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00619703;OID=.;OPOS=75788281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:42:45:96:95:0.678571:41:55:21:21:41:54:24:21 chr3 75788291 . AT AA,GA 997.17 PASS AF=0.221374,0.458015;AO=29,60;DP=131;FAO=29,60;FDP=131;FR=.;FRO=42;FSAF=14,36;FSAR=15,24;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0199636,0.0093305;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=102.95,211.239;QD=30.4481;RBI=0.0221692,0.0118311;REFB=0.0081742,-0.00690581;REVB=0.00963994,-0.00727437;RO=42;SAF=14,36;SAR=15,24;SRF=22;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0426204,0.0591018;STB=0.524255,0.532247;STBP=0.749,0.463;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0056284,0.00708406;OID=.,.;OPOS=75788292,75788291;OREF=T,AT;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:131:131:42:42:29,60:29,60:0.221374,0.458015:15,24:14,36:22:20:15,24:14,36:22:20 chr3 75788314 . T C 130.39 PASS AF=0.201835;AO=22;DP=109;FAO=22;FDP=109;FR=.;FRO=87;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=-0.0123063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.658;QD=4.78489;RBI=0.0158822;REFB=-0.00786927;REVB=-0.01004;RO=86;SAF=8;SAR=14;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174557;STB=0.614759;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0409244;OID=.;OPOS=75788314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:86:87:22:22:0.201835:14:8:43:43:14:8:44:43 chr3 75788316 . C T 416.91 PASS AF=0.435185;AO=46;DP=107;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.00883772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1317;QD=15.4412;RBI=0.0522752;REFB=-0.0365831;REVB=0.0515228;RO=61;SAF=26;SAR=20;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15689;STB=0.58046;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0480825;OID=.;OPOS=75788316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:61:61:46:47:0.435185:20:26:25:36:21:26:25:36 chr3 75790444 . G A 121.67 PASS AF=0.127753;AO=29;DP=222;FAO=29;FDP=227;FR=.;FRO=198;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=87;FSRR=111;FWDB=-0.00940973;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.306;QD=2.14391;RBI=0.0189613;REFB=-0.00333146;REVB=-0.0164617;RO=193;SAF=11;SAR=18;SRF=85;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794801;STB=0.554156;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0277744;OID=.;OPOS=75790444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:227:193:198:29:29:0.127753:18:11:85:108:18:11:87:111 chr3 75790446 . GG TA 75.01 PASS AF=0.0982143;AO=22;DP=225;FAO=22;FDP=224;FR=.;FRO=202;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=81;FSRR=121;FWDB=-0.0266298;FXX=0.00444425;HRUN=4;LEN=2;MLLD=282.711;QD=1.33949;RBI=0.0288516;REFB=-0.00282051;REVB=-0.0111025;RO=198;SAF=14;SAR=8;SRF=78;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286466;STB=0.703646;STBP=0.073;TYPE=mnp;VARB=0.0332943;OID=.;OPOS=75790446;OREF=GG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:225:224:198:202:22:22:0.0982143:8:14:78:120:8:14:81:121 chr3 75790466 . G T 76.53 PASS AF=0.0962343;AO=23;DP=239;FAO=23;FDP=239;FR=.;FRO=216;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=88;FSRR=128;FWDB=-0.0597938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.059;QD=1.28079;RBI=0.0598276;REFB=-6.97506e-05;REVB=0.00201169;RO=216;SAF=16;SAR=7;SRF=88;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336093;STB=0.747721;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000687031;OID=.;OPOS=75790466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:239:239:216:216:23:23:0.0962343:7:16:88:128:7:16:88:128 chr3 75790479 . C T 1669.36 PASS AF=0.604082;AO=146;DP=245;FAO=148;FDP=245;FR=.;FRO=97;FSAF=62;FSAR=86;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=-0.0181779;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.785;QD=27.2548;RBI=0.0202363;REFB=-0.0139511;REVB=-0.00889241;RO=95;SAF=61;SAR=85;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103052;STB=0.50571;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0113095;OID=.;OPOS=75790479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:95:97:146:148:0.604082:85:61:41:54:86:62:42:55 chr3 75790513 . T C 2214.58 PASS AF=0.8125;AO=169;DP=212;FAO=169;FDP=208;FR=.;FRO=39;FSAF=70;FSAR=99;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.026524;FXX=0.0234731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.241;QD=42.588;RBI=0.0281564;REFB=-0.0292145;REVB=0.0094476;RO=39;SAF=70;SAR=99;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390898;STB=0.52072;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00748812;OID=.;OPOS=75790513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:208:39:39:169:169:0.8125:99:70:12:27:99:70:12:27 chr3 75790822 . A G 118.68 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.046175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.073;QD=12.8298;RBI=0.0468923;REFB=-0.0128987;REVB=-0.00817022;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143953;STB=0.584495;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0134736;OID=.;OPOS=75790822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:8:6:13:10:8:6:13:10 chr3 75986663 . C A 1691.9 PASS AF=0.413043;AO=175;DP=448;FAO=190;FDP=460;FR=.;FRO=270;FSAF=97;FSAR=93;FSRF=147;FSRR=123;FWDB=-0.00406988;FXX=0.00647934;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.599;QD=14.7121;RBI=0.0294895;REFB=-0.0264803;REVB=0.0292073;RO=270;SAF=94;SAR=81;SRF=147;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079588;STB=0.519932;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0317577;OID=.;OPOS=75986663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:448:460:270:270:175:190:0.413043:81:94:147:123:93:97:147:123 chr3 75986686 . A G 1948.28 PASS AF=0.422535;AO=210;DP=497;FAO=210;FDP=497;FR=.;FRO=287;FSAF=108;FSAR=102;FSRF=151;FSRR=136;FWDB=0.00162871;FXX=0.00200799;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3343;QD=15.6803;RBI=0.00918779;REFB=-0.0228224;REVB=-0.00904227;RO=285;SAF=108;SAR=102;SRF=150;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012484;STB=0.506849;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0351989;OID=.;OPOS=75986686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:497:497:285:287:210:210:0.422535:102:108:150:135:102:108:151:136 chr3 75986695 . G A 312.81 PASS AF=0.140078;AO=72;DP=510;FAO=72;FDP=514;FR=.;FRO=442;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=230;FSRR=212;FWDB=-0.0162143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.735;QD=2.43431;RBI=0.0165225;REFB=-0.00387134;REVB=-0.00317626;RO=438;SAF=32;SAR=40;SRF=229;SRR=209;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100791;STB=0.565124;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0262191;OID=.;OPOS=75986695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:510:514:438:442:72:72:0.140078:40:32:229:209:40:32:230:212 chr3 75986717 . G A 248.4 PASS AF=0.123314;AO=64;DP=520;FAO=64;FDP=519;FR=.;FRO=455;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=230;FSRR=225;FWDB=0.00437268;FXX=0.00192304;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.475;QD=1.91441;RBI=0.0122807;REFB=-0.00612626;REVB=-0.0114758;RO=455;SAF=34;SAR=30;SRF=230;SRR=225;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327173;STB=0.522597;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0505196;OID=.;OPOS=75986717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:520:519:455:455:64:64:0.123314:30:34:230:225:30:34:230:225 chr3 75986719 . G C 1873.21 PASS AF=0.408203;AO=209;DP=514;FAO=209;FDP=512;FR=.;FRO=303;FSAF=101;FSAR=108;FSRF=159;FSRR=144;FWDB=-0.00193771;FXX=0.0134872;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.611;QD=14.6345;RBI=0.0238315;REFB=-0.00674588;REVB=0.0237526;RO=282;SAF=101;SAR=108;SRF=153;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061269;STB=0.524544;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00746541;OID=.;OPOS=75986719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:514:512:282:303:209:209:0.408203:108:101:153:129:108:101:159:144 chr3 78700901 . G T 638.68 PASS AF=0.477941;AO=65;DP=135;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.00311116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.688;QD=18.7846;RBI=0.0353192;REFB=-0.0240561;REVB=-0.0351819;RO=70;SAF=41;SAR=24;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099638;STB=0.552074;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0266165;OID=.;OPOS=78700901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:70:71:65:65:0.477941:24:41:37:33:24:41:38:33 chr3 78717343 . C T 224.79 PASS AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00992037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.218;QD=13.0314;RBI=0.0112176;REFB=-0.0115943;REVB=-0.00523656;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134362;STB=0.576866;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0240725;OID=.;OPOS=78717343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:12:15:18:24:12:15:18:24 chr3 80677187 . T C 909.17 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0127943;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.334;QD=56.8231;RBI=0.0128315;REFB=-0.0860563;REVB=0.000975425;RO=1;SAF=27;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171678;STB=0.509088;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000148949;OID=.;OPOS=80677187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:36:27:1:0:36:27:1:0 chr3 81558726 . C T 136.38 PASS AF=0.306452;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0159225;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0571;QD=8.79893;RBI=0.0164048;REFB=-0.0028686;REVB=0.00394848;RO=41;SAF=5;SAR=14;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197869;STB=0.589079;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0243707;OID=.;OPOS=81558726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:41:43:19:19:0.306452:14:5:17:24:14:5:16:27 chr3 81643167 . T C 1330.92 PASS AF=0.932039;AO=94;DP=102;FAO=96;FDP=103;FR=.;FRO=7;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00626972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.353;QD=51.6861;RBI=0.00642606;REFB=0.0307181;REVB=-0.00140885;RO=7;SAF=34;SAR=60;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492915;STB=0.524292;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.000366834;OID=.;OPOS=81643167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:102:103:7:7:94:96:0.932039:60:34:5:2:60:36:5:2 chr3 81698130 . T C 397.78 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0134661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.008;QD=18.0811;RBI=0.0150912;REFB=0.00100875;REVB=0.00681224;RO=45;SAF=18;SAR=23;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262327;STB=0.515687;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.000761776;OID=.;OPOS=81698130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:47:41:41:0.465909:23:18:21:24:23:18:22:25 chr3 81792730 . G A 495.96 PASS AF=0.477477;AO=53;DP=111;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.0172967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9157;QD=17.8723;RBI=0.0187752;REFB=-0.000700549;REVB=0.00730294;RO=58;SAF=25;SAR=28;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104379;STB=0.557823;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.000618021;OID=.;OPOS=81792730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:58:53:53:0.477477:28:25:21:37:28:25:21:37 chr3 81810702 . A AG 462.86 PASS AF=1;AO=38;DP=42;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.5999;QD=48.7221;RBI=0.0915849;REFB=0;REVB=0.0592089;RO=4;SAF=23;SAR=15;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074804;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00448897;OID=.;OPOS=81810703;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:38:42:38:38:0:23:15:0:0:8:4:23:15:4:0 chr3 81810725 . C T 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0288624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1739;QD=21.0137;RBI=0.0499449;REFB=-0.023481;REVB=-0.0407609;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795615;STB=0.545372;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0056167;OID=.;OPOS=81810725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:4:3:6:5:4:3 chr3 86411414 . G A 837.19 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501876;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.198;QD=57.7372;RBI=0.0501962;REFB=0;REVB=-0.000931077;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286653;OID=.;OPOS=86411414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0 chr3 86411527 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.132;QD=55.0986;RBI=0.0451196;REFB=0;REVB=-0.031087;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000657419;OID=.;OPOS=86411527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr3 86995839 . T TC 455.21 PASS AF=1;AO=38;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.3379;QD=44.4106;RBI=0.118334;REFB=0;REVB=0.106059;RO=2;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425532;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00571575;OID=.;OPOS=86995840;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:38:41:41:41:0:17:24:0:0:9:2:17:21:0:2 chr3 87295049 . T C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.573;QD=63.5828;RBI=0.0110729;REFB=0;REVB=0.00537788;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05076e-05;OID=.;OPOS=87295049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:32:15:0:0:32:15:0:0 chr3 87304561 . G A 1439.17 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00717074;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.035;QD=63.2602;RBI=0.016839;REFB=0;REVB=0.0152359;RO=0;SAF=36;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29593e-05;OID=.;OPOS=87304561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:55:36:0:0:55:36:0:0 chr3 88041023 . A C 156.74 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00483778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.315;QD=11.399;RBI=0.0326367;REFB=-0.00518584;REVB=-0.0322761;RO=35;SAF=16;SAR=4;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330882;STB=0.695436;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0064747;OID=.;OPOS=88041023;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:4:16:19:16:4:16:19:16 chr3 88041650 . G A 396.7 PASS AF=0.410714;AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=-0.00744337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.355;QD=14.1678;RBI=0.032468;REFB=-0.00951115;REVB=-0.0316032;RO=65;SAF=20;SAR=26;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170471;STB=0.599957;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0188863;OID=.;OPOS=88041650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:65:66:46:46:0.410714:26:20:39:26:26:20:40:26 chr3 88042501 . GT G 123.95 PASS AF=0.736842;AO=21;DP=38;FAO=28;FDP=38;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00429426;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.21802;QD=13.0474;RBI=0.0192069;REFB=-0.0182528;REVB=0.0187207;RO=14;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119429;STB=0.507687;STBP=0.888;TYPE=del;VARB=0.0293598;OID=.;OPOS=88042502;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.736842:21:38:28:38:10:12:16:4:6:28:14:11:10:5:9 chr3 88105360 . T C 440.3 PASS AF=0.461538;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00506663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.354;QD=16.9347;RBI=0.0304748;REFB=-0.0110371;REVB=-0.0300507;RO=55;SAF=25;SAR=23;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286865;STB=0.520825;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0116287;OID=.;OPOS=88105360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:55:56:48:48:0.461538:23:25:27:28:23:25:27:29 chr3 88190768 . C A 294.86 PASS AF=0.369565;AO=34;DP=92;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0101474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.06;QD=12.82;RBI=0.0125709;REFB=-0.00507446;REVB=-0.00741998;RO=58;SAF=15;SAR=19;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306761;STB=0.517568;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0113332;OID=.;OPOS=88190768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:58:58:34:34:0.369565:19:15:24:34:19:15:24:34 chr3 88190809 . C T 457.1 PASS AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0195284;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.33;QD=15.3646;RBI=0.0223956;REFB=-0.0100036;REVB=-0.0109637;RO=67;SAF=25;SAR=26;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00237219;STB=0.502801;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0134785;OID=.;OPOS=88190809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:67:68:51:51:0.428571:26:25:33:34:26:25:33:35 chr3 88191144 . A G 248.35 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0135402;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=107.701;QD=16.2855;RBI=0.0922011;REFB=0.00401433;REVB=0.0912015;RO=32;SAF=19;SAR=9;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804019;STB=0.530843;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=-0.00335525;OID=.;OPOS=88191144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:9:19:24:8:9:19:24:9 chr3 88192484 . T C 434.72 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0262095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2437;QD=18.4987;RBI=0.0561845;REFB=-0.0160097;REVB=0.0496967;RO=50;SAF=19;SAR=25;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122241;STB=0.568151;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0285158;OID=.;OPOS=88192484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:25:19:28:22:25:19:28:22 chr3 93593119 . T C 816.6 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00524459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.577;QD=57.3055;RBI=0.111276;REFB=0;REVB=0.111152;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442807;OID=.;OPOS=93593119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:22:33:0:0:24:33:0:0 chr3 96327750 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.243;QD=55.6559;RBI=0.041453;REFB=0;REVB=0.0331381;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481338;OID=.;OPOS=96327750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr3 97194242 . C T 669.97 PASS AF=0.528;AO=66;DP=125;FAO=66;FDP=125;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0132528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.262;QD=21.4391;RBI=0.0132593;REFB=-0.00995606;REVB=0.000416987;RO=59;SAF=28;SAR=38;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145062;STB=0.579637;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00755601;OID=.;OPOS=97194242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:59:59:66:66:0.528:38:28:35:24:38:28:35:24 chr3 97365038 . G A 767.81 PASS AF=0.5;AO=79;DP=158;FAO=79;FDP=158;FR=.;FRO=79;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.01434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.174;QD=19.4382;RBI=0.0161268;REFB=-0.0101812;REVB=0.00737822;RO=79;SAF=48;SAR=31;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128412;STB=0.570759;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00574914;OID=.;OPOS=97365038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:79:79:79:79:0.5:31:48:37:42:31:48:37:42 chr3 97365074 . A G 682.05 PASS AF=0.492754;AO=68;DP=138;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=0.0242979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0917;QD=19.7697;RBI=0.025165;REFB=-0.0198358;REVB=-0.0065489;RO=70;SAF=38;SAR=30;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674919;STB=0.537264;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0192444;OID=.;OPOS=97365074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:70:70:68:68:0.492754:30:38:34:36:30:38:34:36 chr3 97593380 . G A 243.77 PASS AF=0.32967;AO=30;DP=91;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0437535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.061;QD=10.7151;RBI=0.0458557;REFB=-0.00171583;REVB=0.013725;RO=61;SAF=13;SAR=17;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299388;STB=0.517435;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0034732;OID=.;OPOS=97593380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:61:61:30:30:0.32967:17:13:28:33:17:13:28:33 chr3 97660106 . A C 903.23 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.077904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.072;QD=58.2732;RBI=0.0779482;REFB=0;REVB=0.00262496;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115793;OID=.;OPOS=97660106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:34:27:0:0:34:28:0:0 chr3 97664725 . C T 971.09 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.944;QD=58.8539;RBI=0.0548899;REFB=0;REVB=0.00393892;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45437e-05;OID=.;OPOS=97664725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:40:26:0:0:40:26:0:0 chr3 97673268 . A C 2235.89 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000978511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.18;QD=63.4295;RBI=0.0097005;REFB=0;REVB=0.00965102;RO=0;SAF=52;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79974e-06;OID=.;OPOS=97673268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:89:52:0:0:89:52:0:0 chr3 97726747 . T A 1731.3 PASS AF=1;AO=112;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000805163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.09;QD=60.7475;RBI=0.0276441;REFB=0;REVB=0.0276324;RO=0;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34603e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93463e-05;OID=.;OPOS=97726747;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:112:114:1:55:57:0:0:55:59:0:0 chr3 97851998 . A C 498.04 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0188766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8815;QD=19.7243;RBI=0.0209685;REFB=-0.00797611;REVB=-0.00912961;RO=50;SAF=32;SAR=19;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205049;STB=0.613414;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0112168;OID=.;OPOS=97851998;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:50:50:51:51:0.50495:19:32:20:30:19:32:20:30 chr3 97852058 . A G 60.49 PASS AF=0.144578;AO=12;DP=83;FAO=12;FDP=83;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=-0.00444703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.107;QD=2.91529;RBI=0.033402;REFB=-0.0048275;REVB=0.0331047;RO=71;SAF=10;SAR=2;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.511703;STB=0.848863;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0754061;OID=.;OPOS=97852058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:83:83:71:71:12:12:0.144578:2:10:29:42:2:10:29:42 chr3 97852066 . T C 60.5 PASS AF=0.144578;AO=12;DP=83;FAO=12;FDP=83;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.0129619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.545;QD=2.91553;RBI=0.0367576;REFB=-0.00721586;REVB=-0.0343964;RO=71;SAF=10;SAR=2;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523239;STB=0.854957;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0740152;OID=.;OPOS=97852066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:83:83:71:71:12:12:0.144578:2:10:28:43:2:10:28:43 chr3 97852083 . C T 309.47 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0309491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.907;QD=16.0762;RBI=0.0377284;REFB=-0.0110671;REVB=-0.0215774;RO=43;SAF=18;SAR=16;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132391;STB=0.574425;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0101041;OID=.;OPOS=97852083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:16:18:17:26:16:18:17:26 chr3 97868419 . G A 725.47 PASS AF=0.415789;AO=79;DP=191;FAO=79;FDP=190;FR=.;FRO=111;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=65;FWDB=-0.00526902;FXX=0.00523533;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.354;QD=15.273;RBI=0.0430557;REFB=0.00334857;REVB=-0.042732;RO=111;SAF=42;SAR=37;SRF=46;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121897;STB=0.568153;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00407052;OID=.;OPOS=97868419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:111:111:79:79:0.415789:37:42:46:65:37:42:46:65 chr3 97868616 . C T 380.98 PASS AF=0.415094;AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.0193989;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.008;QD=14.3764;RBI=0.0212247;REFB=-0.013727;REVB=-0.0086123;RO=62;SAF=23;SAR=21;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604298;STB=0.534036;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0226208;OID=.;OPOS=97868616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:62:62:44:44:0.415094:21:23:36:26:21:23:36:26 chr3 97868795 . A G 295.67 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.02246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.817;QD=17.9195;RBI=0.0263229;REFB=-0.00301386;REVB=-0.0137274;RO=34;SAF=15;SAR=17;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288275;STB=0.516119;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00323076;OID=.;OPOS=97868795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:17:15:17:17:17:15:17:17 chr3 97868970 . T A 844.59 PASS AF=0.512048;AO=84;DP=165;FAO=85;FDP=166;FR=.;FRO=81;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=33;FWDB=0.0355272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.506;QD=20.3516;RBI=0.035562;REFB=-0.0256665;REVB=-0.00157131;RO=81;SAF=41;SAR=43;SRF=48;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932468;STB=0.553642;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0286092;OID=.;OPOS=97868970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:81:81:84:85:0.512048:43:41:48:33:44:41:48:33 chr3 97887865 . G A 205.1 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.0436531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.824;QD=15.7767;RBI=0.0440052;REFB=-0.00102502;REVB=-0.00555591;RO=29;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410288;STB=0.729683;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.000431104;OID=.;OPOS=97887865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:14:9:24:5:14:9:24:5 chr3 97887985 . T A 122.32 PASS AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0207486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.713;QD=8.43583;RBI=0.0345773;REFB=-0.000260946;REVB=0.0276602;RO=41;SAF=7;SAR=10;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174621;STB=0.604716;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00154642;OID=.;OPOS=97887985;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:10:7:23:18:10:7:23:18 chr3 97888042 . A T 138.96 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0239338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.649;QD=12.0838;RBI=0.0291608;REFB=-0.000574639;REVB=0.0166591;RO=30;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140886;STB=0.583228;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.000786995;OID=.;OPOS=97888042;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:10:6:15:15:10:6:15:15 chr3 97888197 . C T 424.7 PASS AF=0.684211;AO=39;DP=57;FAO=39;FDP=57;FR=.;FRO=18;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0259749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.879;QD=29.8036;RBI=0.0855167;REFB=-0.0253357;REVB=-0.0814764;RO=18;SAF=24;SAR=15;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165774;STB=0.590117;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00648604;OID=.;OPOS=97888197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:18:18:39:39:0.684211:15:24:6:12:15:24:6:12 chr3 97888337 . C T 281.6 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0046381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.465;QD=17.0664;RBI=0.00472115;REFB=-0.0423965;REVB=0.000881631;RO=35;SAF=9;SAR=22;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118171;STB=0.566585;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0282748;OID=.;OPOS=97888337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:22:9:14:21:22:9:14:21 chr3 97957349 . G A 441.66 PASS AF=0.466019;AO=44;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0197573;FXX=0.0373797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.212;QD=17.152;RBI=0.0208493;REFB=-0.00973105;REVB=-0.00665885;RO=59;SAF=19;SAR=25;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266644;STB=0.540213;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0107894;OID=.;OPOS=97957349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:59:55:44:48:0.466019:25:19:27:32:28:20:27:28 chr3 97983257 . C G 543.01 PASS AF=0.478992;AO=57;DP=120;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.00752148;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.276;QD=18.2525;RBI=0.0129867;REFB=-0.00381971;REVB=0.0105869;RO=62;SAF=29;SAR=28;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829144;STB=0.545922;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00436233;OID=.;OPOS=97983257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:62:62:57:57:0.478992:28:29:37:25:28:29:37:25 chr3 97983265 . C A 648.47 PASS AF=0.5;AO=64;DP=130;FAO=65;FDP=130;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=45;FSRR=20;FWDB=-0.00240643;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.99;QD=19.9529;RBI=0.0139548;REFB=-0.00714748;REVB=0.0137458;RO=66;SAF=36;SAR=28;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113447;STB=0.563832;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00590949;OID=.;OPOS=97983265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:66:65:64:65:0.5:28:36:45:21:28:37:45:20 chr3 97983374 . A G 692.32 PASS AF=0.465409;AO=74;DP=159;FAO=74;FDP=159;FR=.;FRO=85;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=51;FSRR=34;FWDB=0.00486386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=351.618;QD=17.4169;RBI=0.00712325;REFB=-0.00570126;REVB=-0.00520419;RO=85;SAF=51;SAR=23;SRF=51;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960402;STB=0.553383;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00648584;OID=.;OPOS=97983374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:85:85:74:74:0.465409:23:51:51:34:23:51:51:34 chr3 97983391 . C G 686.51 PASS AF=0.449102;AO=74;DP=166;FAO=75;FDP=167;FR=.;FRO=92;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=-0.01499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.403;QD=16.4434;RBI=0.0202351;REFB=0.0031481;REVB=0.0135926;RO=92;SAF=47;SAR=27;SRF=55;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395654;STB=0.516828;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00382566;OID=.;OPOS=97983391;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:92:92:74:75:0.449102:27:47:55:37:28:47:55:37 chr3 97983561 . G C 665.71 PASS AF=0.541667;AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=120;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00643368;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.377;QD=22.1902;RBI=0.00708302;REFB=-0.00634298;REVB=-0.0029626;RO=55;SAF=26;SAR=39;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108114;STB=0.559304;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00388208;OID=.;OPOS=97983561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:120:55:55:65:65:0.541667:39:26:29:26:39:26:29:26 chr3 97983711 . T C 226.98 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00800433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.618;QD=15.6537;RBI=0.0309883;REFB=-0.0137617;REVB=0.0299367;RO=32;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536108;STB=0.530363;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0204426;OID=.;OPOS=97983711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:16:10:14:18:16:10:14:18 chr3 97983942 . A G 547.01 PASS AF=0.406452;AO=63;DP=156;FAO=63;FDP=155;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=57;FSRR=35;FWDB=-0.0104363;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.202;QD=14.1165;RBI=0.0104406;REFB=-0.0196015;REVB=-0.000298621;RO=92;SAF=26;SAR=37;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216065;STB=0.621245;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0201249;OID=.;OPOS=97983942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:92:92:63:63:0.406452:37:26:57:35:37:26:57:35 chr3 98002587 . A G 431.3 PASS AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0026476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.148;QD=25.7492;RBI=0.023185;REFB=-0.00649547;REVB=0.0230334;RO=26;SAF=12;SAR=29;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163743;STB=0.589865;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00474817;OID=.;OPOS=98002587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:29:12:13:13:29:12:13:13 chr3 98073313 . A G 364.1 PASS AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00943405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.385;QD=15.8304;RBI=0.0112053;REFB=-0.000451063;REVB=-0.0060463;RO=53;SAF=23;SAR=16;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444953;STB=0.525101;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00110881;OID=.;OPOS=98073313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:53:39:39:0.423913:16:23:29:24:16:23:29:24 chr3 98109640 . G A 1728.21 PASS AF=0.97479;AO=116;DP=120;FAO=116;FDP=119;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0120275;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.999;QD=58.0912;RBI=0.0148301;REFB=-0.0414561;REVB=-0.00867597;RO=3;SAF=65;SAR=51;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110076;STB=0.505798;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=-1.56447e-05;OID=.;OPOS=98109640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:120:119:3:3:116:116:0.97479:51:65:1:2:51:65:1:2 chr3 98304467 . T C,G 563.99 PASS AF=0.947368,0.0526316;AO=36,2;DP=38;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186992,0.0350224;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=220.581,14.233;QD=59.3672;RBI=0.0174589,0.0378038;REFB=0,0;REVB=0.0173585,-0.0142323;RO=0;SAF=20,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.9376e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000845503,-0.0672196;OID=.,.;OPOS=98304467,98304467;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:38:38:0:0:36,2:36,2:0.947368,0.0526316:16,1:20,1:0:0:16,1:20,1:0:0 chr3 98307696 . T G 493.02 PASS AF=0.439024;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=123;FR=.;FRO=69;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0449593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9553;QD=16.033;RBI=0.0454944;REFB=0.00832612;REVB=-0.00695746;RO=69;SAF=33;SAR=21;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626474;STB=0.535066;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.0119922;OID=.;OPOS=98307696;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:69:69:54:54:0.439024:21:33:38:31:21:33:38:31 chr3 98540982 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.948;QD=64.4153;RBI=0.0372713;REFB=0;REVB=0.0314432;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443818;OID=.;OPOS=98540982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0 chr3 98541012 . G A 801.84 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.628;QD=57.274;RBI=0.028779;REFB=0;REVB=0.00285937;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60746e-05;OID=.;OPOS=98541012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:54:56:1:33:21:0:0:35:21:0:0 chr3 98541116 . G A 771.85 PASS AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0238178;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.9787;QD=54.165;RBI=0.0924387;REFB=-0.14813;REVB=0.0893176;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.508472;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0110662;OID=.;OPOS=98541116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:57:57:0:1:55:56:0.982456:28:27:0:0:29:27:0:1 chr3 100084432 . G A 1589.69 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0093091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.935;QD=59.9881;RBI=0.0108051;REFB=0;REVB=0.00548555;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99914e-05;OID=.;OPOS=100084432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:54:52:0:0:54:52:0:0 chr3 100084489 . G C 44.78 PASS AF=0.101852;AO=10;DP=107;FAO=11;FDP=108;FR=.;FRO=97;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=57;FSRR=40;FWDB=-0.011651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.252;QD=1.65843;RBI=0.0428763;REFB=-0.00732264;REVB=-0.041263;RO=91;SAF=0;SAR=10;SRF=57;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.679932;STB=0.919919;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.100667;OID=.;OPOS=100084489;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:107:108:91:97:10:11:0.101852:10:0:57:34:10:1:57:40 chr3 100170628 . A G 195.79 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0534038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9784;QD=17.799;RBI=0.0592959;REFB=0.00945123;REVB=0.025769;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405021;STB=0.728239;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00865709;OID=.;OPOS=100170628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:7:13:5:19:7:13:5:19 chr3 100170634 . T C 167.54 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0437584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1128;QD=14.8924;RBI=0.0460117;REFB=-0.0268576;REVB=0.0142226;RO=26;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339393;STB=0.682386;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0387169;OID=.;OPOS=100170634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:7:11:7:19:7:11:8:19 chr3 100174722 . G A 767.21 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.511;QD=63.9339;RBI=0.0560786;REFB=0;REVB=0.0544543;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175714;OID=.;OPOS=100174722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:26:22:0:0 chr3 100287764 . T C 647.48 PASS AF=0.44375;AO=71;DP=160;FAO=71;FDP=160;FR=.;FRO=89;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=44;FWDB=0.0232525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.048;QD=16.1869;RBI=0.023469;REFB=-0.00892838;REVB=-0.00318039;RO=88;SAF=33;SAR=38;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350827;STB=0.522745;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0102083;OID=.;OPOS=100287764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:88:89:71:71:0.44375:38:33:44:44:38:33:45:44 chr3 100368546 . A G 399.81 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.000545706;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.688;QD=18.5958;RBI=0.00905836;REFB=-0.0159206;REVB=-0.00904191;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680149;STB=0.537916;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0169332;OID=.;OPOS=100368546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:18:23:22:23:18:23:22:23 chr3 100468407 . C CAGTT 353.62 PASS AF=0.396226;AO=41;DP=107;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.0111635;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=4;MLLD=302.672;QD=13.3441;RBI=0.0122055;REFB=-0.0119487;REVB=0.00493447;RO=63;SAF=24;SAR=17;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731268;STB=0.543155;STBP=0.486;TYPE=ins;VARB=0.0182096;OID=.;OPOS=100468408;OREF=-;OALT=AGTT;OMAPALT=CAGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.396226:41:107:42:106:64:24:18:41:23:99:63:24:17:41:22 chr3 100539887 . C T 433.9 PASS AF=0.350649;AO=54;DP=154;FAO=54;FDP=154;FR=.;FRO=100;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=62;FWDB=-0.01597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.398;QD=11.2701;RBI=0.0202552;REFB=-0.00718279;REVB=-0.0124592;RO=100;SAF=24;SAR=30;SRF=38;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748862;STB=0.542757;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0157293;OID=.;OPOS=100539887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:100:100:54:54:0.350649:30:24:38:62:30:24:38:62 chr3 100544675 . G A 254.09 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0207997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.641;QD=21.6249;RBI=0.028222;REFB=-0.0179763;REVB=0.019075;RO=22;SAF=11;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821868;STB=0.533186;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0119299;OID=.;OPOS=100544675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:23:24:24:0.510638:13:11:8:14:13:11:9:14 chr3 100558416 . T C 1847.5 PASS AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0143817;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.964;QD=60.5737;RBI=0.0184044;REFB=-0.0810913;REVB=0.0114843;RO=0;SAF=56;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503816;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=6.83215e-05;OID=.;OPOS=100558416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:122:0:1:121:121:0.991803:65:56:0:0:65:56:0:1 chr3 100558913 . T C 381.36 PASS AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=3;FWDB=-0.00771289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.417;QD=22.4332;RBI=0.0503605;REFB=-0.00342778;REVB=-0.0497664;RO=30;SAF=29;SAR=9;SRF=27;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167922;STB=0.591507;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0028375;OID=.;OPOS=100558913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:30:38:38:0.558824:9:29:27:3:9:29:27:3 chr3 100712249 . T C 1653.28 PASS AF=0.990991;AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00387445;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.903;QD=59.5778;RBI=0.0107888;REFB=-0.0796889;REVB=0.0100691;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000272097;OID=.;OPOS=100712249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:111:0:1:110:110:0.990991:55:55:0:0:55:55:0:1 chr3 100949842 . G A 541.41 PASS AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0265011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8511;QD=24.8922;RBI=0.0270473;REFB=0.00469031;REVB=-0.005408;RO=37;SAF=26;SAR=24;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469954;STB=0.525725;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.00338981;OID=.;OPOS=100949842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:24:26:17:20:24:26:17:20 chr3 100963154 . G A 317.71 PASS AF=0.350877;AO=40;DP=114;FAO=40;FDP=114;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.012774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.138;QD=11.1476;RBI=0.0152142;REFB=-0.0111934;REVB=-0.00826423;RO=74;SAF=16;SAR=24;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687344;STB=0.539548;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0353016;OID=.;OPOS=100963154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:74:74:40:40:0.350877:24:16:34:40:24:16:34:40 chr3 101043906 . G A 294.97 PASS AF=0.325;AO=39;DP=117;FAO=39;FDP=120;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=-0.0406827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7868;QD=9.83246;RBI=0.0599959;REFB=-0.0150258;REVB=-0.0440957;RO=78;SAF=20;SAR=19;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592806;STB=0.503224;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.028734;OID=.;OPOS=101043906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:120:78:81:39:39:0.325:19:20:44:34:18:21:44:37 chr3 101044310 . TTA T,TAA 92.36 PASS AF=0.265625,0;AO=14,7;DP=84;FAO=17,0;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=10,0;FSAR=7,0;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0796817,0.00683888;FXX=0.0724533;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=22.8519,17.7198;QD=5.77249;RBI=0.118239,0.0305543;REFB=-0.0333982,0.0301339;REVB=-0.0873572,-0.0297791;RO=50;SAF=8,4;SAR=6,3;SRF=28;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0143639,0.0137358;STB=0.505697,0.5;STBP=0.987,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0958021,0;OID=.,.;OPOS=101044311,101044311;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.265625,0:14,7:84:17,0:64:47:10,0:7,0:28:19:92:50:8,4:6,3:28:22 chr3 101066717 . T A 356.16 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0291977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9256;QD=21.9173;RBI=0.0542977;REFB=-0.030212;REVB=-0.0457792;RO=29;SAF=14;SAR=22;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133708;STB=0.573871;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.027636;OID=.;OPOS=101066717;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:22:14:16:13:22:14:16:13 chr3 101080694 . T C 288.82 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00538153;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.034;QD=16.0456;RBI=0.00950911;REFB=-0.00391091;REVB=0.00783979;RO=39;SAF=14;SAR=18;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073846;STB=0.54875;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00649172;OID=.;OPOS=101080694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:40:32:32:0.444444:18:14:20:19:18:14:21:19 chr3 101085413 . G A 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00471927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.07;QD=15.7383;RBI=0.0137604;REFB=-0.00532473;REVB=-0.0129258;RO=35;SAF=17;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138253;STB=0.514276;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00659908;OID=.;OPOS=101085413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:12:17:21:14:12:17:22:14 chr3 101219889 . G C 148.7 PASS AF=0.459459;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00195998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.99;QD=16.0758;RBI=0.025411;REFB=-0.00722948;REVB=0.0253353;RO=20;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313311;STB=0.646285;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00648146;OID=.;OPOS=101219889;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:16:17:0.459459:4:12:9:11:5:12:9:11 chr3 101221069 . T C 240.47 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0190661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7677;QD=21.375;RBI=0.0854555;REFB=0.0193489;REVB=-0.0833015;RO=22;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636784;STB=0.535684;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.0214714;OID=.;OPOS=101221069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:13:10:8:14:13:10:8:14 chr3 101231921 . T C 432.15 PASS AF=0.453608;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0328789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.249;QD=17.8206;RBI=0.0329944;REFB=-0.0121663;REVB=-0.00275753;RO=53;SAF=25;SAR=19;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763226;STB=0.542689;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0134863;OID=.;OPOS=101231921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:44:44:0.453608:19:25:26:27:19:25:26:27 chr3 101283682 . G A 239.8 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00792635;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.626;QD=14.1057;RBI=0.0218855;REFB=-0.00436929;REVB=-0.0203998;RO=38;SAF=14;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05338;STB=0.529391;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00239297;OID=.;OPOS=101283682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:38:40:28:28:0.411765:14:14:17:21:14:14:18:22 chr3 101334753 . C A 435.85 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.019286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.412;QD=54.481;RBI=0.0193646;REFB=0.015108;REVB=0.00174348;RO=1;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300873;STB=0.516119;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-7.147e-05;OID=.;OPOS=101334753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:15:16:0:1:15:16:0:1 chr3 101484335 . G A 2028.9 PASS AF=0.992481;AO=130;DP=131;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00524631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.8439;QD=61.0195;RBI=0.0350537;REFB=0.0203188;REVB=-0.0346589;RO=1;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590415;STB=0.503105;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-4.32112e-06;OID=.;OPOS=101484335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:131:133:1:1:130:132:0.992481:80:50:0:1:80:52:0:1 chr3 101571550 . A G 1060.96 PASS AF=1;AO=69;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00469877;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.378;QD=59.7725;RBI=0.0428315;REFB=0;REVB=0.042573;RO=1;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58083e-05;OID=.;OPOS=101571550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:1:0:69:71:1:29:40:0:1:30:41:0:0 chr3 101574228 . A C 177.7 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00166426;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.087;QD=14.5058;RBI=0.0125196;REFB=-0.00190882;REVB=-0.0124085;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267812;STB=0.608398;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0016115;OID=.;OPOS=101574228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:26:30:19:19:0.387755:11:8:18:8:11:8:18:12 chr3 101576027 . GGT ACC,GGTACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC 145.69 PASS AF=0.0625,0.4375;AO=2,13;DP=33;FAO=2,14;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=2,3;FSAR=0,11;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0103781,-0.0192515;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=3,23;MLLD=182.624,562.915;QD=18.2113;RBI=0.0115035,0.0194057;REFB=0.00525799,-0.00587677;REVB=-0.00496239,-0.00244139;RO=17;SAF=2,3;SAR=0,10;SRF=11;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.474595,-0.41818;STB=0.993395,0.736753;STBP=0.324,0.024;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0317637,0.000101501;OID=.,.;OPOS=101576027,101576030;OREF=GGT,-;OALT=ACC,ACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC;OMAPALT=ACC,GGTACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:33:32:17:16:2,13:2,14:0.0625,0.4375:0,10:2,3:11:6:0,11:2,3:10:6 chr3 101576175 . T C 1580.16 PASS AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00759414;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9589;QD=58.5243;RBI=0.0115285;REFB=-0.0832624;REVB=-0.00867376;RO=1;SAF=57;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0082545;STB=0.504347;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.000786439;OID=.;OPOS=101576175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:108:108:1:1:107:107:0.990741:50:57:1:0:50:57:1:0 chr3 103879569 . G A 7145.37 PASS AF=1;AO=450;DP=451;FAO=455;FDP=455;FR=.;FRO=0;FSAF=180;FSAR=275;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562819;FXX=0.00219293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.645;QD=62.8164;RBI=0.056772;REFB=-0.00590682;REVB=-0.00744382;RO=1;SAF=175;SAR=275;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0017328;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70203e-05;OID=.;OPOS=103879569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:451:455:1:0:450:455:1:275:175:0:1:275:180:0:0 chr3 103879597 . AAT A,AA,AAA 3037.8 PASS AF=0.178744,0.782609,0.0338164;AO=36,55,117;DP=223;FAO=37,162,7;FDP=207;FR=.;FRO=1;FSAF=14,56,5;FSAR=23,106,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035458,0.0348361,0.0331604;FXX=0.0235838;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=186.104,188.041,184.047;QD=58.7015;RBI=0.0361746,0.045667,0.0529439;REFB=0.0315823,0.0287515,0.0237064;REVB=-0.00716449,-0.0295283,-0.0412729;RO=11;SAF=20,7,37;SAR=16,48,80;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0355803,-0.275018,-0.0587643;STB=0.517232,0.504424,0.54533;STBP=0.272,0.267,0.646;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00200546,-0.00791067,0.000258448;OID=.,.,.;OPOS=103879598,103879599,103879599;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.178744,0.782609,0.0338164:36,55,117:223:37,162,7:207:1:14,56,5:23,106,2:1:0:52:11:20,7,37:16,48,80:7:4 chr3 105260596 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.032;QD=59.1432;RBI=0.0172227;REFB=0;REVB=0.0171304;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.59444e-05;OID=.;OPOS=105260596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:65:67:1:30:35:0:0:30:37:0:0 chr3 105377515 . C T 439.49 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00519022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.46;QD=21.9743;RBI=0.00723274;REFB=-0.0110606;REVB=0.00503727;RO=36;SAF=21;SAR=22;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036382;STB=0.525905;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00581641;OID=.;OPOS=105377515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:36:37:43:43:0.5375:22:21:16:20:22:21:16:21 chr3 105389153 . A G 560.48 PASS AF=0.431655;AO=59;DP=138;FAO=60;FDP=139;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=50;FSRR=29;FWDB=0.00378711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.219;QD=16.1288;RBI=0.0101398;REFB=-0.00252676;REVB=0.00940598;RO=79;SAF=30;SAR=29;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127847;STB=0.575515;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00390429;OID=.;OPOS=105389153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:79:79:59:60:0.431655:29:30:50:29:30:30:50:29 chr3 105422844 . C T 403.68 PASS AF=0.457447;AO=41;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0130063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.598;QD=17.1776;RBI=0.0339079;REFB=0.00595268;REVB=-0.0313142;RO=52;SAF=24;SAR=17;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179915;STB=0.578989;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=-0.00938289;OID=.;OPOS=105422844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:52:51:41:43:0.457447:17:24:21:31:19:24:21:30 chr3 105438957 . T G 999.77 PASS AF=0.535912;AO=97;DP=181;FAO=97;FDP=181;FR=.;FRO=84;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.0048028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.714;QD=22.0945;RBI=0.0110418;REFB=-0.0201697;REVB=-0.00994255;RO=84;SAF=49;SAR=48;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00437658;STB=0.502392;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0273875;OID=.;OPOS=105438957;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:84:84:97:97:0.535912:48:49:42:42:48:49:42:42 chr3 105439026 . G A 1054.33 PASS AF=0.543478;AO=100;DP=184;FAO=100;FDP=184;FR=.;FRO=84;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-0.00317938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.963;QD=22.9202;RBI=0.00323773;REFB=0.00405789;REVB=-0.000611915;RO=81;SAF=55;SAR=45;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116749;STB=0.560725;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00283795;OID=.;OPOS=105439026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:81:84:100:100:0.543478:45:55:33:48:45:55:35:49 chr3 106613060 . T G 306.92 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0224025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7684;QD=18.0538;RBI=0.0586578;REFB=0.0158684;REVB=-0.0542113;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262417;STB=0.645948;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.0431377;OID=.;OPOS=106613060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:19:14:25:10:19:14:25:10 chr3 106617500 . C T 747.1 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.178;QD=63.5829;RBI=0.0363249;REFB=0;REVB=-0.00237126;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10679e-05;OID=.;OPOS=106617500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:23:23:0:0:23:24:0:0 chr3 107096547 . G A 344.66 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00630076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.335;QD=19.1479;RBI=0.0101845;REFB=-0.00447653;REVB=-0.00800156;RO=36;SAF=14;SAR=22;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126956;STB=0.570715;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00473798;OID=.;OPOS=107096547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:22:14:19:17:22:14:19:17 chr3 107646728 . G A 272.49 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00132753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.965;QD=51.9035;RBI=0.0274924;REFB=0;REVB=0.0274603;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112595;OID=.;OPOS=107646728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:13:7:0:0:13:8:0:0 chr3 107646807 . G T 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.249;QD=62.3498;RBI=0.0399691;REFB=0;REVB=0.0228026;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126106;OID=.;OPOS=107646807;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr3 107646895 . T C 675.57 PASS AF=0.896552;AO=52;DP=58;FAO=52;FDP=58;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0380437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.973;QD=46.5912;RBI=0.0623369;REFB=-0.00621912;REVB=-0.0493818;RO=5;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770091;STB=0.548369;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00359893;OID=.;OPOS=107646895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:58:58:5:6:52:52:0.896552:28:24:0:5:28:24:0:6 chr3 107765249 . T C 392.04 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0078519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.976;QD=16.862;RBI=0.0472098;REFB=-0.00138576;REVB=-0.0465523;RO=52;SAF=20;SAR=21;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646652;STB=0.53626;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0013818;OID=.;OPOS=107765249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:21:20:22:30:21:20:22:30 chr3 107765392 . G A 240.4 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0807153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9387;QD=21.3692;RBI=0.0826924;REFB=-0.0123064;REVB=0.0179739;RO=22;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137196;STB=0.576857;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0149488;OID=.;OPOS=107765392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:11:12:8:14:11:12:8:14 chr3 107884269 . A G 341.5 PASS AF=0.365217;AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=115;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=-0.017891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.456;QD=11.8781;RBI=0.0180772;REFB=-0.00506708;REVB=0.00258782;RO=73;SAF=23;SAR=19;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466781;STB=0.526657;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00818777;OID=.;OPOS=107884269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:73:73:42:42:0.365217:19:23:43:30:19:23:43:30 chr3 107937408 . C T 160.31 PASS AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0102999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.174;QD=10.3427;RBI=0.0204379;REFB=-0.0052317;REVB=-0.0176527;RO=41;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783952;STB=0.545715;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00937249;OID=.;OPOS=107937408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:13:8:13:28:13:8:13:28 chr3 108072298 . T C 1698.34 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750444;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.352;QD=60.6549;RBI=0.0152886;REFB=0;REVB=0.01332;RO=0;SAF=57;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17142e-05;OID=.;OPOS=108072298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:111:112:1:54:57:0:0:54:58:0:0 chr3 108081217 . C A 538.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.701;QD=59.7834;RBI=0.0231851;REFB=0;REVB=0.0150998;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13407e-05;OID=.;OPOS=108081217;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:15:21:0:0 chr3 108096098 . C G 1716.93 PASS AF=1;AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00120034;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.647;QD=60.7762;RBI=0.00344717;REFB=0;REVB=-0.00323144;RO=0;SAF=42;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.03664e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.49144e-05;OID=.;OPOS=108096098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:115:113:0:0:113:113:1:71:42:0:0:71:42:0:0 chr3 108403086 . T C 1600.34 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476287;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.255;QD=59.8257;RBI=0.0476714;REFB=0;REVB=-0.00201705;RO=0;SAF=57;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.91195e-05;OID=.;OPOS=108403086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:107:0:0:103:107:1:46:57:0:0:46:61:0:0 chr3 108557820 . T C 265.37 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0201567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.036;QD=17.9909;RBI=0.0223159;REFB=-0.00254543;REVB=-0.00957627;RO=29;SAF=21;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294318;STB=0.673949;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00335271;OID=.;OPOS=108557820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:29:30:29:29:0.491525:8:21:12:17:8:21:12:18 chr3 108572699 . G T 219.21 PASS AF=0.412698;AO=25;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00234477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.817;QD=13.918;RBI=0.0121229;REFB=-0.0236187;REVB=0.011894;RO=37;SAF=16;SAR=9;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504486;STB=0.503873;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0309484;OID=.;OPOS=108572699;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:25:26:0.412698:9:16:22:15:10:16:23:14 chr3 108703587 . C T 1227.45 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6385;QD=61.3725;RBI=0.0527238;REFB=0;REVB=-0.0494231;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000335336;OID=.;OPOS=108703587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:39:40:0:0:39:41:0:0 chr3 108754238 . A T 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102261;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.253;QD=60.8835;RBI=0.0104008;REFB=0;REVB=0.00189824;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.01883e-06;OID=.;OPOS=108754238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0 chr3 108867128 . A G 1529.9 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4308;QD=63.7458;RBI=0.0482211;REFB=0;REVB=-0.0351633;RO=0;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000417672;OID=.;OPOS=108867128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:55:41:0:0:55:41:0:0 chr3 109052732 . T C 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.031;QD=60.3766;RBI=0.0105158;REFB=0;REVB=-0.00299847;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92191e-06;OID=.;OPOS=109052732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:37:37:0:0:37:37:0:0 chr3 109178707 . C G 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013804;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.69;QD=57.7115;RBI=0.0211855;REFB=0;REVB=0.0160709;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9629e-05;OID=.;OPOS=109178707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr3 109178758 . C T 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.023;QD=57.6754;RBI=0.0257595;REFB=0;REVB=0.0215769;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93101e-05;OID=.;OPOS=109178758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr3 110611137 . G A 901.01 PASS AF=0.984615;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0180044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2646;QD=55.447;RBI=0.0371055;REFB=0.062077;REVB=-0.0324447;RO=1;SAF=32;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145261;STB=0.50746;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-0.0134546;OID=.;OPOS=110611137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:65:1:1:62:64:0.984615:30:32:1:0:31:33:1:0 chr3 110611201 . C T 249.83 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0216649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7861;QD=14.0751;RBI=0.0224658;REFB=-0.0308322;REVB=0.00594483;RO=42;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919567;STB=0.55229;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0354754;OID=.;OPOS=110611201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:14:15:18:24:14:15:18:24 chr3 110790879 . G A 132.13 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0150891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.063;QD=24.0239;RBI=0.0953963;REFB=0.026792;REVB=0.0941954;RO=8;SAF=13;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416959;STB=0.742401;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0122596;OID=.;OPOS=110790879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:1:13:5:3:1:13:5:3 chr3 110793050 . G A 596.67 PASS AF=0.568421;AO=54;DP=96;FAO=54;FDP=95;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00806217;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.937;QD=25.1229;RBI=0.0277726;REFB=-0.0070338;REVB=0.0265767;RO=40;SAF=34;SAR=20;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124208;STB=0.563436;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00592675;OID=.;OPOS=110793050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:40:41:54:54:0.568421:20:34:19:21:20:34:20:21 chr3 111286375 . G C 334.28 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0146826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.463;QD=16.7138;RBI=0.0242177;REFB=0.00161934;REVB=-0.0192593;RO=44;SAF=23;SAR=13;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500402;STB=0.528132;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.0025849;OID=.;OPOS=111286375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:13:23:26:18:13:23:26:18 chr3 111313457 . T C 326.72 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0347084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3044;QD=15.1962;RBI=0.0347198;REFB=-0.00639301;REVB=0.000890394;RO=50;SAF=15;SAR=21;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453977;STB=0.525677;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00411043;OID=.;OPOS=111313457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:21:15:23:27:21:15:23:27 chr3 111313854 . C T 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.964;QD=53.9064;RBI=0.0299608;REFB=0;REVB=0.0199762;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403091;OID=.;OPOS=111313854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr3 111356083 . G C 2092.65 PASS AF=0.985507;AO=111;DP=140;FAO=136;FDP=138;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=68;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0693599;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0857;QD=60.6566;RBI=0.0694246;REFB=0.0158168;REVB=0.00299686;RO=1;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008554;STB=0.503649;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00815367;OID=.;OPOS=111356083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:140:138:1:1:111:136:0.985507:55:56:0:1:68:68:0:1 chr3 111604541 . G C 781.79 PASS AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00814836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.704;QD=52.1191;RBI=0.0133484;REFB=0.0262364;REVB=-0.0105728;RO=3;SAF=22;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276872;STB=0.514701;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00083128;OID=.;OPOS=111604541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:60:60:3:3:57:57:0.95:35:22:2:1:35:22:2:1 chr3 111677526 . G A 837.67 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00988603;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.042;QD=57.77;RBI=0.0347092;REFB=0;REVB=-0.0332716;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.20393e-05;OID=.;OPOS=111677526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:30:27:0:0:30:28:0:0 chr3 111694438 . T C 1596.73 PASS AF=0.990741;AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0495338;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3932;QD=59.1381;RBI=0.0566899;REFB=0.0302673;REVB=0.0275707;RO=1;SAF=53;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088714;STB=0.504672;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-5.32061e-05;OID=.;OPOS=111694438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:108:1:1:107:107:0.990741:54:53:1:0:54:53:1:0 chr3 111719786 . A T 241.23 PASS AF=0.367089;AO=27;DP=77;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.00894147;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.023;QD=12.214;RBI=0.00916362;REFB=-0.00896015;REVB=0.00200547;RO=48;SAF=12;SAR=15;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197999;STB=0.598892;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0192794;OID=.;OPOS=111719786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:48:50:27:29:0.367089:15:12:30:18:15:14:32:18 chr3 111732608 . G A 378.95 PASS AF=0.375;AO=44;DP=118;FAO=45;FDP=120;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=-0.0479834;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.748;QD=12.6316;RBI=0.0500369;REFB=-0.0192744;REVB=-0.0141875;RO=69;SAF=24;SAR=20;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164732;STB=0.577514;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0329277;OID=.;OPOS=111732608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:69:75:44:45:0.375:20:24:27:42:22:23:29:46 chr3 111760771 . A G 366.2 PASS AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0262379;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.722;QD=16.2756;RBI=0.0311301;REFB=-0.0213058;REVB=-0.0167527;RO=51;SAF=19;SAR=20;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425007;STB=0.523906;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0291955;OID=.;OPOS=111760771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:20:19:27:24:20:19:27:24 chr3 111765834 . G A 727.37 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00591679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.151;QD=63.2499;RBI=0.0124474;REFB=0;REVB=0.0109512;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06618e-05;OID=.;OPOS=111765834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:17:29:0:0:17:29:0:0 chr3 111799845 . A T 3930.56 PASS AF=1;AO=246;DP=247;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0684496;FXX=0.00404842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.741;QD=63.9116;RBI=0.0713523;REFB=0;REVB=-0.0201445;RO=0;SAF=122;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186182;OID=.;OPOS=111799845;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:247:246:0:0:246:246:1:124:122:0:0:124:122:0:0 chr3 111828423 . G A 1761.54 PASS AF=0.975207;AO=118;DP=121;FAO=118;FDP=121;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0385282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.549;QD=58.2326;RBI=0.038588;REFB=-0.0599404;REVB=0.00214683;RO=2;SAF=49;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189882;STB=0.514849;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00105936;OID=.;OPOS=111828423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:121:121:2:3:118:118:0.975207:69:49:2:0:69:49:3:0 chr3 111918216 . A G 1318.85 PASS AF=0.978261;AO=83;DP=85;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00331699;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.722;QD=57.3414;RBI=0.0352434;REFB=-0.0294307;REVB=-0.0350869;RO=2;SAF=43;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000806099;STB=0.500484;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00524351;OID=.;OPOS=111918216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:85:92:2:2:83:90:0.978261:40:43:1:1:47:43:1:1 chr3 111921225 . G T 851.26 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00417347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.551;QD=57.7124;RBI=0.0166358;REFB=0;REVB=0.0161037;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.21344e-05;OID=.;OPOS=111921225;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:28:30:0:0:29:30:0:0 chr3 111923123 . G A 1080.51 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.003;QD=60.0286;RBI=0.0148605;REFB=0;REVB=-0.0103119;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41723e-07;OID=.;OPOS=111923123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:30:42:0:0:30:42:0:0 chr3 111981849 . C T 1038.2 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654936;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.8718;QD=58.49;RBI=0.0825641;REFB=0;REVB=0.0502735;RO=1;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113932;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00243099;OID=.;OPOS=111981849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:71:71:1:0:70:71:1:41:29:0:1:42:29:0:0 chr3 111981878 . T C 919.67 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.701;QD=58.3916;RBI=0.0396465;REFB=0;REVB=0.0221118;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108885;OID=.;OPOS=111981878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:36:26:0:0:36:27:0:0 chr3 111981924 . T C 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.386;QD=59.4343;RBI=0.00494985;REFB=0;REVB=0.000782467;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31727e-05;OID=.;OPOS=111981924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr3 111993831 . G A 277.7 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0213478;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.993;QD=20.5703;RBI=0.0260837;REFB=-0.0245679;REVB=-0.0149877;RO=26;SAF=14;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11687;STB=0.575785;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0182068;OID=.;OPOS=111993831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:26:25:29:29:0.537037:15:14:9:17:15:14:8:17 chr3 112059768 . C G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.808;QD=57.177;RBI=0.026432;REFB=0;REVB=0.0200072;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.73207e-05;OID=.;OPOS=112059768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:39:12:0:0:39:12:0:0 chr3 112066562 . G A 554.09 PASS AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.00700807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.483;QD=22.1636;RBI=0.00854102;REFB=-0.0111587;REVB=0.00488221;RO=48;SAF=17;SAR=35;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466245;STB=0.525741;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00843002;OID=.;OPOS=112066562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:48:48:52:52:0.52:35:17:18:30:35:17:18:30 chr3 112081560 . T TA,TTA 1085.29 PASS AF=0.010989,0.857143;AO=12,66;DP=116;FAO=1,78;FDP=91;FR=.;FRO=12;FSAF=0,38;FSAR=1,40;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.018907,0.0396097;FXX=0.0520779;HRUN=1,3;LEN=1,2;MLLD=158.519,172.844;QD=47.705;RBI=0.0771364,0.0839796;REFB=-0.145269,-0.146778;REVB=0.0747834,0.0740516;RO=35;SAF=5,32;SAR=7,34;SRF=19;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.150623,-0.0371519;STB=0.992387,0.523912;STBP=0.255,0.256;TYPE=ins,ins;VARB=-0.000190801,0.0207903;OID=.,.;OPOS=112081561,112081561;OREF=-,-;OALT=A,TA;OMAPALT=TA,TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.010989,0.857143:12,66:116:1,78:91:12:0,38:1,40:8:4:58:35:5,32:7,34:19:16 chr3 112185025 . G A 1377.52 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.561;QD=62.6145;RBI=0.0209712;REFB=0;REVB=0.00481059;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32287e-05;OID=.;OPOS=112185025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:43:45:0:0:43:45:0:0 chr3 112190137 . G T 1046.67 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00981444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.246;QD=58.9672;RBI=0.0506622;REFB=0;REVB=0.0497024;RO=1;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165827;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116227;OID=.;OPOS=112190137;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:1:0:69:71:1:28:41:0:1:29:42:0:0 chr3 112546473 . G A 1246.32 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00880418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.83;QD=61.5467;RBI=0.00882281;REFB=0;REVB=0.000573122;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49779e-05;OID=.;OPOS=112546473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:49:31:0:0:49:32:0:0 chr3 112642568 . C G 1936.18 PASS AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00646251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6383;QD=60.982;RBI=0.00675496;REFB=-0.0132713;REVB=0.00196607;RO=0;SAF=67;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31893e-08;STB=0.504201;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-2.39718e-05;OID=.;OPOS=112642568;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:127:127:0:1:126:126:0.992126:59:67:0:0:59:67:0:1 chr3 112647832 . A C 787.55 PASS AF=1;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341877;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.553;QD=57.2764;RBI=0.00425828;REFB=0;REVB=-0.0025387;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.16345e-05;OID=.;OPOS=112647832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:54:55:1:20:34:0:0:21:34:0:0 chr3 112647988 . C T 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00993304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.125;QD=57.3858;RBI=0.0101669;REFB=0;REVB=-0.00216814;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37028e-05;OID=.;OPOS=112647988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr3 112648125 . G T 1507.48 PASS AF=0.990291;AO=101;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000108025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.654;QD=58.5428;RBI=0.016251;REFB=-0.112774;REVB=0.0162506;RO=1;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921191;STB=0.504761;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000210559;OID=.;OPOS=112648125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:101:102:0.990291:51:50:0:1:52:50:0:1 chr3 112648127 . T G 1333.79 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.163611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.634;QD=51.7977;RBI=0.199658;REFB=-0.0388279;REVB=0.114432;RO=0;SAF=50;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00984952;OID=.;OPOS=112648127;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:103:0:1:102:102:0.990291:52:50:0:0:52:50:0:1 chr3 112648222 . T C 1859.33 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3653;QD=61.4654;RBI=0.0503852;REFB=0;REVB=0.0147069;RO=0;SAF=59;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327636;OID=.;OPOS=112648222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:62:59:0:0:62:59:0:0 chr3 112727184 . A T 295.77 PASS AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00207314;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.033;QD=22.3224;RBI=0.00315708;REFB=-0.00415699;REVB=0.00238102;RO=22;SAF=18;SAR=12;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279824;STB=0.644351;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00264584;OID=.;OPOS=112727184;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:22:23:30:30:0.566038:12:18:5:17:12:18:6:17 chr3 112935113 . G C 192.58 PASS AF=0.333333;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0692391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.115;QD=10.2708;RBI=0.0946913;REFB=-0.00838273;REVB=0.0645939;RO=50;SAF=9;SAR=16;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163594;STB=0.59576;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0216723;OID=.;OPOS=112935113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:50:50:25:25:0.333333:16:9:25:25:16:9:25:25 chr3 112935138 . C G 1065.75 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246493;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.703;QD=60.0421;RBI=0.0362965;REFB=0;REVB=-0.026643;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.8846e-06;OID=.;OPOS=112935138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:40:31:0:0:40:31:0:0 chr3 112991312 . C T 63.7 PASS AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0640337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.173;QD=9.09976;RBI=0.0641918;REFB=0.00578181;REVB=0.0045023;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220547;STB=0.513484;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.0011115;OID=.;OPOS=112991312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:6:3:6:13:6:3:6:13 chr3 112991959 . C T 468.39 PASS AF=0.367347;AO=54;DP=147;FAO=54;FDP=147;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=55;FSRR=38;FWDB=0.0205486;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.8288;QD=12.7452;RBI=0.0456169;REFB=-0.0145951;REVB=0.0407266;RO=91;SAF=28;SAR=26;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709182;STB=0.546312;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0276629;OID=.;OPOS=112991959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:91:93:54:54:0.367347:26:28:53:38:26:28:55:38 chr3 112993367 . G A 447.57 PASS AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.022618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.629;QD=21.0621;RBI=0.022857;REFB=-0.0084513;REVB=-0.00329649;RO=41;SAF=25;SAR=19;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081432;STB=0.544933;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00628214;OID=.;OPOS=112993367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:19:25:27:14:19:25:27:14 chr3 112997554 . A G 481.25 PASS AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0145116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.855;QD=53.4717;RBI=0.0433081;REFB=-0.102312;REVB=-0.0408044;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217449;STB=0.506892;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00473333;OID=.;OPOS=112997554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:1:2:34:34:0.944444:21:13:0:1:21:13:1:1 chr3 112998265 . A G 609.43 PASS AF=0.54955;AO=60;DP=110;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0492679;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.438;QD=21.9613;RBI=0.0494794;REFB=-0.0016952;REVB=-0.00456952;RO=45;SAF=18;SAR=42;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180772;STB=0.610004;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.000997704;OID=.;OPOS=112998265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:45:50:60:61:0.54955:42:18:23:22:42:19:27:23 chr3 112998268 . G A 441.26 PASS AF=0.445455;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=0.00487898;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.619;QD=16.0458;RBI=0.00555818;REFB=0.000360862;REVB=0.0026625;RO=61;SAF=26;SAR=23;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215876;STB=0.620137;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.00145496;OID=.;OPOS=112998268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:61:61:49:49:0.445455:23:26:19:42:23:26:19:42 chr3 113010466 . T C 814.32 PASS AF=0.417431;AO=91;DP=218;FAO=91;FDP=218;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=32;FSRF=54;FSRR=73;FWDB=-0.00820691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.224;QD=14.9416;RBI=0.00940323;REFB=-0.0150434;REVB=-0.00458991;RO=127;SAF=59;SAR=32;SRF=54;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234906;STB=0.631405;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0211669;OID=.;OPOS=113010466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:127:127:91:91:0.417431:32:59:54:73:32:59:54:73 chr3 113015660 . G A 900.67 PASS AF=0.569536;AO=86;DP=152;FAO=86;FDP=151;FR=.;FRO=65;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.00606343;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.529;QD=23.8588;RBI=0.00791649;REFB=-0.0257282;REVB=-0.00508976;RO=63;SAF=44;SAR=42;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589496;STB=0.531474;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0218142;OID=.;OPOS=113015660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:63:65:86:86:0.569536:42:44:37:26:42:44:38:27 chr3 113022870 . T C 1277.94 PASS AF=0.976744;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0121762;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9921;QD=59.4393;RBI=0.0365717;REFB=-0.0285472;REVB=0.0344852;RO=1;SAF=39;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119907;STB=0.512497;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000451431;OID=.;OPOS=113022870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:86:86:1:2:84:84:0.976744:45:39:1:0:45:39:2:0 chr3 113046640 . A G 165.76 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0220147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.111;QD=14.4135;RBI=0.0430141;REFB=-0.00576318;REVB=-0.0369535;RO=28;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682035;STB=0.539638;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.00631488;OID=.;OPOS=113046640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:6:12:17:11:6:12:17:11 chr3 113164109 . A G 384.61 PASS AF=0.966667;AO=24;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0470689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.6253;QD=51.2808;RBI=0.211611;REFB=-0.128364;REVB=0.20631;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343222;STB=0.518506;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0113131;OID=.;OPOS=113164109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:30:30:1:1:24:29:0.966667:11:13:1:0:16:13:1:0 chr3 113176122 . G A 1549.25 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0070977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.601;QD=63.8868;RBI=0.0122518;REFB=0;REVB=-0.00998648;RO=0;SAF=67;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.05485e-06;OID=.;OPOS=113176122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:30:67:0:0:30:67:0:0 chr3 113222036 . G A 2178.7 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836406;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.935;QD=63.1508;RBI=0.00836789;REFB=0;REVB=-0.000253196;RO=0;SAF=76;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79935e-06;OID=.;OPOS=113222036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:62:76:0:0:62:76:0:0 chr3 113286405 . C T 521.4 PASS AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00168295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.632;QD=20.8559;RBI=0.00482684;REFB=-0.00282726;REVB=-0.00452395;RO=50;SAF=24;SAR=26;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108141;STB=0.559785;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00325208;OID=.;OPOS=113286405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:50:50:50:0.5:26:24:30:20:26:24:30:20 chr3 113323793 . C T 271.87 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0172727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.954;QD=19.4193;RBI=0.0172743;REFB=-0.0168093;REVB=0.000235153;RO=27;SAF=20;SAR=9;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142815;STB=0.507954;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0315048;OID=.;OPOS=113323793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:9:20:19:8:9:20:19:8 chr3 113351719 . T C 740.42 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.303;QD=56.9551;RBI=0.0427539;REFB=0;REVB=0.00132131;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20104e-05;OID=.;OPOS=113351719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0 chr3 113373930 . A G 1320.67 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00643494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0666;QD=62.1493;RBI=0.00669083;REFB=0;REVB=0.0018327;RO=0;SAF=34;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94693e-05;OID=.;OPOS=113373930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:51:34:0:0:51:34:0:0 chr3 113376110 . TTGCTGCTGC TTGTTGCTGT 72.84 PASS AF=0.375;AO=2;DP=13;FAO=9;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.034955;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=7;MLLD=170.249;QD=12.1404;RBI=0.106173;REFB=-0.0225072;REVB=0.100254;RO=0;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.888024;STBP=0.007;TYPE=mnp;VARB=0.057738;OID=.;OPOS=113376113;OREF=CTGCTGC;OALT=TTGCTGT;OMAPALT=TTGTTGCTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:2:13:9:24:15:1:8:11:4:48:0:0:2:0:0 chr3 113377361 . AT GC,GT,TT 737.64 PASS AF=0.0416667,0.916667,0.0416667;AO=2,44,2;DP=48;FAO=2,44,2;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=2,20,2;FSAR=0,24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00413971,0.026841,-0.0356158;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=120.796,109.511,24.8521;QD=61.4696;RBI=0.00943516,0.02686,0.0356647;REFB=0,0,0;REVB=-0.00847851,0.00101061,0.00186697;RO=0;SAF=2,20,2;SAR=0,24,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-5.30465e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,snp;VARB=0.0654692,0.00201891,0.0819784;OID=.,.,.;OPOS=113377361,113377361,113377361;OREF=AT,A,A;OALT=GC,G,T;OMAPALT=GC,GT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:48:48:0:0:2,44,2:2,44,2:0.0416667,0.916667,0.0416667:0,24,0:2,20,2:0:0:0,24,0:2,20,2:0:0 chr3 113379865 . G C 689.26 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5083;QD=62.6602;RBI=0.00669475;REFB=0;REVB=0.00374234;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.7704e-05;OID=.;OPOS=113379865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0 chr3 113557787 . AGCC A 97.43 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843075;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=342.853;QD=38.9733;RBI=0.00922737;REFB=0;REVB=0.00375057;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00307383;OID=.;OPOS=113557788;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:9:10:10:0:1:9:0:0:4:0:1:8:0:0 chr3 113673125 . A G 301.78 PASS AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0433238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3671;QD=25.1483;RBI=0.0470222;REFB=-0.00746932;REVB=-0.0182794;RO=21;SAF=17;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124756;STB=0.569326;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00685431;OID=.;OPOS=113673125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:10:17:10:11:10:17:10:11 chr3 113679589 . C A 329.76 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00322604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.172;QD=20.9368;RBI=0.0208041;REFB=-0.00704122;REVB=0.0205525;RO=29;SAF=22;SAR=12;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00740054;STB=0.504096;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00709092;OID=.;OPOS=113679589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:12:22:19:10:12:22:19:10 chr3 113858350 . C T 1684.76 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.182;QD=60.1701;RBI=0.00400712;REFB=0;REVB=-0.00230247;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64851e-06;OID=.;OPOS=113858350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:53:58:0:0:53:59:0:0 chr3 113955164 . T G 750.2 PASS AF=1;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385438;FXX=0.0714158;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.722;QD=57.7079;RBI=0.0200874;REFB=0;REVB=0.0197142;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150096;OID=.;OPOS=113955164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0 chr3 113955265 . G A 1400.41 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.087;QD=61.5565;RBI=0.0198535;REFB=-0.0799566;REVB=0.00288868;RO=0;SAF=49;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000266557;OID=.;OPOS=113955265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:0:1:90:90:0.989011:41:49:0:0:41:49:1:0 chr3 113955320 . C T 1042.18 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194133;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1477;QD=59.553;RBI=0.0381571;REFB=0;REVB=0.0328495;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010891;OID=.;OPOS=113955320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:31:38:0:0:32:38:0:0 chr3 113955820 . G C 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00237421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.175;QD=61.8525;RBI=0.0027919;REFB=0;REVB=0.00146895;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31392e-06;OID=.;OPOS=113955820;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:44:39:0:0:44:39:0:0 chr3 115440074 . C CCT,CT 524.46 PASS AF=0.844444,0;AO=25,10;DP=60;FAO=38,0;FDP=45;FR=.;FRO=7;FSAF=20,0;FSAR=18,0;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0569531,0.0466047;FXX=0.0425441;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=114.591,98.3667;QD=46.6185;RBI=0.148029,0.14072;REFB=-0.189669,-0.172768;REVB=0.136634,0.132779;RO=23;SAF=19,0;SAR=6,10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.309924,-0.758561;STB=0.507039,0.5;STBP=0.841,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.0455829,0;OID=.,.;OPOS=115440075,115440075;OREF=-,-;OALT=CT,T;OMAPALT=CCT,CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.844444,0:25,10:60:38,0:45:7:20,0:18,0:4:3:38:23:19,0:6,10:10:13 chr3 116301660 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.498;QD=53.9112;RBI=0.0536771;REFB=0;REVB=0.0088792;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308141;OID=.;OPOS=116301660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr3 116683964 . G C 7296.57 PASS AF=1;AO=464;DP=469;FAO=466;FDP=466;FR=.;FRO=0;FSAF=244;FSAR=222;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010678;FXX=0.00639645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.278;QD=62.6315;RBI=0.0242911;REFB=0.0135553;REVB=0.0218183;RO=3;SAF=244;SAR=220;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0017318;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26554e-05;OID=.;OPOS=116683964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:469:466:3:0:464:466:1:220:244:2:1:222:244:0:0 chr3 118269774 . A G 612.57 PASS AF=0.539823;AO=59;DP=111;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0587245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.591;QD=21.6837;RBI=0.0587651;REFB=-0.0234629;REVB=0.00218487;RO=52;SAF=32;SAR=27;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00335663;STB=0.501168;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0231254;OID=.;OPOS=118269774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:52:52:59:61:0.539823:27:32:28:24:28:33:28:24 chr3 118621664 . C A 511.04 PASS AF=0.424242;AO=56;DP=132;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=0.00359904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.345;QD=15.4861;RBI=0.00800909;REFB=-0.0149887;REVB=-0.00715489;RO=75;SAF=19;SAR=37;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382042;STB=0.526681;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0167939;OID=.;OPOS=118621664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:75:76:56:56:0.424242:37:19:28:47:37:19:29:47 chr3 118649060 . G T 1157.64 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180461;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.824;QD=60.9283;RBI=0.0403507;REFB=0;REVB=0.0360904;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.11646e-05;OID=.;OPOS=118649060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0 chr3 118865332 . A G 185.81 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00281565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2078;QD=19.0577;RBI=0.0459967;REFB=0.0129813;REVB=0.0459104;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138931;STB=0.564449;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=-0.0249514;OID=.;OPOS=118865332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:20:19:19:0.487179:9:10:7:12:9:10:8:12 chr3 118865609 . C T 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0122109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.087;QD=12.1823;RBI=0.0272621;REFB=0.00125758;REVB=-0.0243745;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364728;STB=0.71611;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0042438;OID=.;OPOS=118865609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:5:10:3:7:5:10 chr3 118867047 . C G 650.95 PASS AF=0.942308;AO=48;DP=53;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0238892;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.153;QD=50.0732;RBI=0.0410215;REFB=-0.061222;REVB=0.0333477;RO=3;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721739;STB=0.53657;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00442251;OID=.;OPOS=118867047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:53:52:3:3:48:49:0.942308:18:30:0:3:19:30:0:3 chr3 118909159 . A G 411.06 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.424;QD=56.6984;RBI=0.104124;REFB=0;REVB=0.0898707;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245405;OID=.;OPOS=118909159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0 chr3 118948716 . G A 279.06 PASS AF=0.336449;AO=36;DP=107;FAO=36;FDP=107;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.00263039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.963;QD=10.4322;RBI=0.00529167;REFB=-0.00115884;REVB=0.0045916;RO=70;SAF=18;SAR=18;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326382;STB=0.523352;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00154784;OID=.;OPOS=118948716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:70:71:36:36:0.336449:18:18:33:37:18:18:33:38 chr3 119118104 . A G 465.64 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.849;QD=58.2045;RBI=0.0352815;REFB=0;REVB=0.0268673;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333239;OID=.;OPOS=119118104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:11:20:0:0:11:21:0:0 chr3 119128398 . G A 167.13 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=-0.0252109;FXX=0.0169463;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.871;QD=11.5263;RBI=0.0290161;REFB=-0.0251313;REVB=-0.0143648;RO=37;SAF=5;SAR=16;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338411;STB=0.519612;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0391235;OID=.;OPOS=119128398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:37:21:21:0.362069:16:5:8:29:16:5:8:29 chr3 119133183 . G A 739.0 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0365033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.231;QD=54.7405;RBI=0.039525;REFB=-0.0132282;REVB=0.015157;RO=1;SAF=31;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149574;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000500142;OID=.;OPOS=119133183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:22:31:1:0:22:31:1:0 chr3 119134886 . G A 271.1 PASS AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0825207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2639;QD=30.1226;RBI=0.125327;REFB=-0.0346022;REVB=-0.0943255;RO=12;SAF=8;SAR=16;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555234;STB=0.530586;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0124113;OID=.;OPOS=119134886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:16:8:5:7:16:8:5:7 chr3 119150836 . C T 489.66 PASS AF=0.46087;AO=53;DP=115;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=-0.0196929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.178;QD=17.0316;RBI=0.021565;REFB=-0.0206615;REVB=-0.00878855;RO=62;SAF=28;SAR=25;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986038;STB=0.554799;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0139027;OID=.;OPOS=119150836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:62:62:53:53:0.46087:25:28:39:23:25:28:39:23 chr3 119197285 . A G 1306.19 PASS AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00470545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1154;QD=60.7532;RBI=0.017215;REFB=-0.100139;REVB=0.0165595;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00068201;OID=.;OPOS=119197285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:86:86:0:1:85:85:0.988372:49:36:0:0:49:36:0:1 chr3 119222456 . G C 421.31 PASS AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.000634637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.867;QD=15.8984;RBI=0.000895173;REFB=-0.00924356;REVB=-0.000631323;RO=59;SAF=29;SAR=18;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143965;STB=0.580676;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0124467;OID=.;OPOS=119222456;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:59:47:47:0.443396:18:29:28:31:18:29:28:31 chr3 119248301 . G A 1485.0 PASS AF=0.496689;AO=150;DP=302;FAO=150;FDP=302;FR=.;FRO=152;FSAF=80;FSAR=70;FSRF=78;FSRR=74;FWDB=-0.0339272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1884;QD=19.6688;RBI=0.0460097;REFB=0.00899742;REVB=-0.0310779;RO=151;SAF=80;SAR=70;SRF=77;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214673;STB=0.510185;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0114447;OID=.;OPOS=119248301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:302:151:152:150:150:0.496689:70:80:77:74:70:80:78:74 chr3 119248321 . A G 512.24 PASS AF=0.262411;AO=67;DP=267;FAO=74;FDP=282;FR=.;FRO=208;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=86;FSRR=122;FWDB=-0.0036083;FXX=0.00704201;HRUN=9;LEN=1;MLLD=271.396;QD=7.26582;RBI=0.0104698;REFB=-0.00348086;REVB=-0.00982842;RO=88;SAF=50;SAR=17;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244348;STB=0.71146;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00567774;OID=.;OPOS=119248321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:282:88:208:67:74:0.262411:17:50:47:41:22:52:86:122 chr3 119263680 . C T 306.73 PASS AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.013307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.658;QD=22.7205;RBI=0.0361237;REFB=-0.00270663;REVB=-0.0335835;RO=23;SAF=16;SAR=15;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626526;STB=0.534584;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00389547;OID=.;OPOS=119263680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:23:23:31:31:0.574074:15:16:10:13:15:16:10:13 chr3 119301139 . C T 234.1 PASS AF=0.355263;AO=28;DP=77;FAO=27;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0455566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9302;QD=12.3213;RBI=0.0505051;REFB=-0.0191713;REVB=-0.0218027;RO=36;SAF=9;SAR=19;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410275;STB=0.68455;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0435741;OID=.;OPOS=119301139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:36:46:28:27:0.355263:19:9:27:9:18:9:29:17 chr3 119305379 . T A 461.87 PASS AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00110432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.021;QD=21.4823;RBI=0.0373079;REFB=-0.0154077;REVB=-0.0372915;RO=41;SAF=17;SAR=28;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260714;STB=0.64378;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0188465;OID=.;OPOS=119305379;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:28:17:28:13:28:17:28:13 chr3 119327653 . T C 589.95 PASS AF=0.439716;AO=62;DP=143;FAO=62;FDP=141;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.000396018;FXX=0.013985;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.68;QD=16.7362;RBI=0.0283557;REFB=0.00779825;REVB=0.028353;RO=78;SAF=36;SAR=26;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00934622;STB=0.50094;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.00985125;OID=.;OPOS=119327653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:78:79:62:62:0.439716:26:36:46:32:26:36:46:33 chr3 119331874 . C T 295.33 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0231448;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.184;QD=17.8985;RBI=0.0649135;REFB=-0.00190941;REVB=-0.0606471;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982654;STB=0.547499;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0010399;OID=.;OPOS=119331874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:34:32:32:0.484848:14:18:15:18:14:18:16:18 chr3 119331892 . C G 331.45 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0289076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.895;QD=18.6731;RBI=0.0614563;REFB=-0.0220453;REVB=-0.0542331;RO=36;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115678;STB=0.564479;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0141793;OID=.;OPOS=119331892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:15:20:16:20:15:20:16:20 chr3 119338956 . A G 1785.85 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00626349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.783;QD=61.0548;RBI=0.00875888;REFB=0;REVB=0.00612263;RO=0;SAF=55;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21903e-06;OID=.;OPOS=119338956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:62:55:0:0:62:55:0:0 chr3 119361415 . A G 410.28 PASS AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0650254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4862;QD=18.2347;RBI=0.0711078;REFB=-0.0168845;REVB=-0.0287752;RO=48;SAF=19;SAR=23;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014369;STB=0.508018;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0170949;OID=.;OPOS=119361415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:23:19:21:27:23:19:21:27 chr3 119367390 . T C 1117.63 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00877775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.472;QD=60.4122;RBI=0.0373172;REFB=0;REVB=0.0362701;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0038e-05;OID=.;OPOS=119367390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:36:37:0:0:36:38:0:0 chr3 119378872 . G A 813.08 PASS AF=0.529412;AO=81;DP=153;FAO=81;FDP=153;FR=.;FRO=72;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0226345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6124;QD=21.2569;RBI=0.0245092;REFB=-0.0162424;REVB=0.00940095;RO=72;SAF=45;SAR=36;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718099;STB=0.539349;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0138832;OID=.;OPOS=119378872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:72:72:81:81:0.529412:36:45:34:38:36:45:34:38 chr3 119379186 . C T 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.034798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2448;QD=16.7279;RBI=0.0354076;REFB=-0.00102341;REVB=0.0065424;RO=19;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664805;STB=0.503812;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.000850878;OID=.;OPOS=119379186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:10:6:7:12:10:6:7:12 chr3 119395662 . C G 965.73 PASS AF=0.589041;AO=86;DP=146;FAO=86;FDP=146;FR=.;FRO=60;FSAF=59;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.00331704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0405;QD=26.4583;RBI=0.0309855;REFB=-7.03901e-05;REVB=0.0308075;RO=58;SAF=59;SAR=27;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163048;STB=0.583227;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.000315339;OID=.;OPOS=119395662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:58:60:86:86:0.589041:27:59:28:30:27:59:30:30 chr3 119395799 . A C 390.19 PASS AF=0.431579;AO=39;DP=93;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=0.0250567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.616;QD=16.4289;RBI=0.0419863;REFB=-0.0214475;REVB=-0.0336899;RO=53;SAF=20;SAR=19;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211421;STB=0.607711;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0290421;OID=.;OPOS=119395799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:53:54:39:41:0.431579:19:20:38:15:19:22:39:15 chr3 119426307 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.35;QD=55.6557;RBI=0.0728629;REFB=0;REVB=0.0633913;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116473;OID=.;OPOS=119426307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0 chr3 119426311 . C G 75.14 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0161357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.433;QD=11.1312;RBI=0.0173539;REFB=-0.0159123;REVB=-0.00638716;RO=17;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128126;STB=0.507677;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0350931;OID=.;OPOS=119426311;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:4:6:10:7:4:6:10:7 chr3 119434527 . G C 1530.05 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.681;QD=63.7519;RBI=0.00969044;REFB=0;REVB=0.00409773;RO=0;SAF=56;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70515e-05;OID=.;OPOS=119434527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:40:56:0:0:40:56:0:0 chr3 119533910 . T C 1531.7 PASS AF=0.990566;AO=102;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0152093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.851;QD=57.7999;RBI=0.0277114;REFB=-0.0495782;REVB=0.0231646;RO=0;SAF=49;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03142e-08;STB=0.504424;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00104741;OID=.;OPOS=119533910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:0:1:102:105:0.990566:53:49:0:0:56:49:0:1 chr3 119886548 . G C 926.49 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264199;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.082;QD=58.8247;RBI=0.0516134;REFB=0;REVB=0.0443388;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155119;OID=.;OPOS=119886548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:37:25:0:0:38:25:0:0 chr3 119886776 . T A 1846.04 PASS AF=1;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105239;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.718;QD=61.0261;RBI=0.0318081;REFB=0;REVB=0.0300168;RO=0;SAF=50;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.00207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40841e-05;OID=.;OPOS=119886776;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:120:121:1:70:50:0:0:71:50:0:0 chr3 120389316 . T A 1556.39 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0119803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.714;QD=58.7315;RBI=0.015848;REFB=-0.00272672;REVB=0.0103746;RO=1;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855071;STB=0.504504;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=4.91157e-05;OID=.;OPOS=120389316;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:55:50:0:1:55:50:0:1 chr3 121137976 . C T 989.8 PASS AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00176512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.984;QD=54.9888;RBI=0.00652352;REFB=0.00157357;REVB=0.00628018;RO=3;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410516;STB=0.521733;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.000182562;OID=.;OPOS=121137976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:72:72:3:3:69:69:0.958333:33:36:0:3:33:36:0:3 chr3 121138015 . C T 1026.32 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516915;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.06;QD=58.6466;RBI=0.00609525;REFB=0;REVB=0.00322984;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185363;OID=.;OPOS=121138015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:70:0:0:69:70:1:35:34:0:0:35:35:0:0 chr3 121143384 . C CT 392.24 PASS AF=0.435065;AO=63;DP=159;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=0.0658022;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.6982;QD=10.1881;RBI=0.0658238;REFB=-0.00894223;REVB=0.00168598;RO=95;SAF=24;SAR=39;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101858;STB=0.517523;STBP=0.713;TYPE=ins;VARB=0.0125834;OID=.;OPOS=121143385;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.435065:63:159:67:154:87:28:39:39:48:99:95:24:39:45:50 chr3 121151784 . G A 377.93 PASS AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0107442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.129;QD=24.3823;RBI=0.0236655;REFB=-0.0110278;REVB=-0.021086;RO=25;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00565711;STB=0.503104;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0106563;OID=.;OPOS=121151784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:16:21:14:11:16:21:14:11 chr3 121154974 . T C 2110.23 PASS AF=0.971631;AO=136;DP=141;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0323718;FXX=0.013985;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.32;QD=59.8647;RBI=0.0323903;REFB=-0.0650211;REVB=-0.00109408;RO=4;SAF=69;SAR=67;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139685;STB=0.507194;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.000471931;OID=.;OPOS=121154974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:141:141:4:4:136:137:0.971631:67:69:1:3:68:69:1:3 chr3 121208176 . T C 937.35 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7069;QD=58.5843;RBI=0.115659;REFB=0;REVB=0.105591;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156448;OID=.;OPOS=121208176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr3 121208833 . G C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.548;QD=61.684;RBI=0.0112329;REFB=0;REVB=-0.00221424;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85418e-05;OID=.;OPOS=121208833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr3 121238749 . G A 694.78 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182509;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.234;QD=63.1618;RBI=0.0846255;REFB=0;REVB=-0.082634;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000371;OID=.;OPOS=121238749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr3 121263720 . C A 1503.09 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156704;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9127;QD=63.9612;RBI=0.0434624;REFB=0;REVB=0.0405391;RO=0;SAF=41;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481764;OID=.;OPOS=121263720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:53:41:0:0:53:41:0:0 chr3 121340536 . T C 2293.42 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2628;QD=63.7062;RBI=0.0479439;REFB=0;REVB=-0.0176414;RO=0;SAF=74;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06798e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188127;OID=.;OPOS=121340536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:70:74:0:0:70:74:0:0 chr3 121350966 . C G 330.46 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0485861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.287;QD=50.8402;RBI=0.0966488;REFB=-0.126835;REVB=0.0835486;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044143;STB=0.52379;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00362097;OID=.;OPOS=121350966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:15:10:1:0:15:10:1:0 chr3 121351315 . G A,GGGCTCAGGCTCA 299.44 PASS AF=0.230769,0.589744;AO=11,16;DP=41;FAO=9,23;FDP=39;FR=.;FRO=7;FSAF=7,12;FSAR=2,11;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0446941,0.0277567;FXX=0.0249938;HRUN=3,3;LEN=1,12;MLLD=172.391,133.011;QD=30.7115;RBI=0.0475287,0.0277671;REFB=-0.0148456,-0.0305046;REVB=0.0161684,-0.000760785;RO=12;SAF=7,6;SAR=4,10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0296512,-0.221621;STB=0.613759,0.511618;STBP=0.385,0.854;TYPE=snp,ins;VARB=0.0506116,0.0144631;OID=.,.;OPOS=121351315,121351316;OREF=G,-;OALT=A,GGCTCAGGCTCA;OMAPALT=A,GGGCTCAGGCTCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:72:41:39:12:7:11,16:9,23:0.230769,0.589744:4,10:7,6:8:4:2,11:7,12:4:3 chr3 121353254 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.082;QD=46.8479;RBI=0.0190554;REFB=0;REVB=0.0136394;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183086;OID=.;OPOS=121353254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0 chr3 121354583 . G A 936.61 PASS AF=0.956522;AO=65;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0106248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.956;QD=54.2965;RBI=0.0462048;REFB=-0.0558173;REVB=0.0449666;RO=2;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286092;STB=0.507244;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.000535569;OID=.;OPOS=121354583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:69:69:2:3:65:66:0.956522:32:33:0:2:33:33:1:2 chr3 121372875 . A G 446.88 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5738;QD=57.6616;RBI=0.0593602;REFB=0;REVB=0.0521894;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496261;OID=.;OPOS=121372875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0 chr3 121373058 . T C 575.63 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8686;QD=60.5927;RBI=0.0682063;REFB=0;REVB=0.0665133;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000894623;OID=.;OPOS=121373058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr3 121373111 . T C 417.98 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00343148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.151;QD=53.9324;RBI=0.033776;REFB=-0.0660192;REVB=0.0336013;RO=1;SAF=9;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489889;STB=0.526298;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00690603;OID=.;OPOS=121373111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:21:9:1:0:21:9:1:0 chr3 121374361 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00458408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.377;QD=64.1537;RBI=0.0297586;REFB=0;REVB=0.0294034;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320641;OID=.;OPOS=121374361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr3 121414061 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.821;QD=58.7817;RBI=0.0299906;REFB=0;REVB=0.011545;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90673e-05;OID=.;OPOS=121414061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0 chr3 121415720 . T C 1190.33 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.6;QD=61.0427;RBI=0.0187094;REFB=0;REVB=0.0172123;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31352e-05;OID=.;OPOS=121415720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:35:43:0:0:35:43:0:0 chr3 121435621 . T C 152.4 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00646368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7087;QD=40.6387;RBI=0.0181969;REFB=-0.000960823;REVB=-0.0170103;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52937;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000913177;OID=.;OPOS=121435621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:15:0:1:14:14:0.933333:6:8:0:0:6:8:1:0 chr3 121435624 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.189;QD=46.8475;RBI=0.026141;REFB=0;REVB=0.0210224;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281195;OID=.;OPOS=121435624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr3 121435897 . T C 239.87 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00931941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.983;QD=14.3206;RBI=0.0268662;REFB=-0.00394147;REVB=0.0251981;RO=39;SAF=17;SAR=11;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722787;STB=0.541134;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0065169;OID=.;OPOS=121435897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:11:17:21:18:11:17:21:18 chr3 121488995 . C G 115.54 PASS AF=0.341463;AO=13;DP=39;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0272779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1446;QD=11.2722;RBI=0.0428988;REFB=-0.00902086;REVB=-0.0331093;RO=26;SAF=11;SAR=2;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341244;STB=0.655075;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0186;OID=.;OPOS=121488995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:26:27:13:14:0.341463:2:11:16:10:3:11:16:11 chr3 121500699 . C T 295.6 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.042885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.235;QD=15.3561;RBI=0.0431893;REFB=-0.000543409;REVB=-0.00511817;RO=44;SAF=14;SAR=19;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157243;STB=0.50888;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.000609484;OID=.;OPOS=121500699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:44:33:33:0.428571:19:14:18:26:19:14:18:26 chr3 121526204 . G A 83.89 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0660539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8613;QD=10.1685;RBI=0.0673053;REFB=-0.0240521;REVB=-0.0129184;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503109;STB=0.530331;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0461989;OID=.;OPOS=121526204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:6:5:11:11:6:5:11:11 chr3 121563355 . T C 725.59 PASS AF=0.530303;AO=70;DP=134;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0533018;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.798;QD=21.9875;RBI=0.0537046;REFB=-0.00172315;REVB=-0.00656557;RO=62;SAF=45;SAR=25;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181962;STB=0.599971;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00196486;OID=.;OPOS=121563355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:132:62:62:70:70:0.530303:25:45:27:35:25:45:27:35 chr3 121641693 . G A 263.49 PASS AF=0.518519;AO=27;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0421938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.021;QD=19.5178;RBI=0.0422192;REFB=-0.0154228;REVB=0.00146245;RO=26;SAF=8;SAR=19;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227101;STB=0.632085;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0254346;OID=.;OPOS=121641693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:26:26:27:28:0.518519:19:8:14:12:20:8:14:12 chr3 121642048 . A T 290.1 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0522408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9128;QD=16.577;RBI=0.0947032;REFB=-0.00195024;REVB=-0.078991;RO=38;SAF=16;SAR=16;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508299;STB=0.528554;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=-0.000511849;OID=.;OPOS=121642048;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:16:16:21:17:16:16:21:17 chr3 121643170 . A T 218.05 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00544925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.461;QD=15.5753;RBI=0.0290642;REFB=0.00055762;REVB=-0.0285488;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100735;STB=0.537773;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=-0.000868625;OID=.;OPOS=121643170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:31:25:25:0.446429:13:12:17:12:13:12:17:14 chr3 121643804 . C T 532.9 PASS AF=0.529412;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.0891059;FXX=0.0097078;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.9651;QD=20.8981;RBI=0.0984638;REFB=0.00335512;REVB=-0.041896;RO=49;SAF=36;SAR=18;SRF=34;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267218;STB=0.52238;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.00227292;OID=.;OPOS=121643804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:49:48:54:54:0.529412:18:36:34:15:18:36:34:14 chr3 121646641 . A G 460.07 PASS AF=0.623188;AO=43;DP=69;FAO=43;FDP=69;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00447657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.42;QD=26.6706;RBI=0.00555614;REFB=-0.027683;REVB=-0.00329105;RO=26;SAF=18;SAR=25;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571039;STB=0.531171;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0215066;OID=.;OPOS=121646641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:26:26:43:43:0.623188:25:18:13:13:25:18:13:13 chr3 121647286 . C T 466.5 PASS AF=0.542169;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0181857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.942;QD=22.4819;RBI=0.0184261;REFB=0.00163205;REVB=-0.0029671;RO=38;SAF=28;SAR=17;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169505;STB=0.593436;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.00131396;OID=.;OPOS=121647286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:38:38:45:45:0.542169:17:28:16:22:17:28:16:22 chr3 121648168 . G A 255.31 PASS AF=0.521739;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0238981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.468;QD=22.2012;RBI=0.0254381;REFB=-0.0121556;REVB=-0.00871669;RO=22;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161771;STB=0.517227;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00952751;OID=.;OPOS=121648168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:22:22:23:24:0.521739:9:14:13:9:9:15:13:9 chr3 121712051 . A C 492.95 PASS AF=1;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108971;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0593;QD=57.9941;RBI=0.033052;REFB=0;REVB=0.0312039;RO=1;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373388;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00453578;OID=.;OPOS=121712051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:1:0:33:34:1:12:21:0:1:13:21:0:0 chr3 121825197 . G A 1884.35 PASS AF=1;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121466;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.384;QD=61.782;RBI=0.0127591;REFB=0;REVB=-0.0039057;RO=0;SAF=67;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93436e-07;OID=.;OPOS=121825197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:122:0:0:122:122:1:55:67:0:0:55:67:0:0 chr3 121836966 . TGA T 786.72 PASS AF=1;AO=51;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249755;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=118.518;QD=56.194;RBI=0.0252772;REFB=0;REVB=-0.00389352;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000105496;OID=.;OPOS=121836967;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:51:56:56:56:0:27:29:0:0:4:0:26:25:0:0 chr3 121838319 . G A,C 1284.83 PASS AF=0.953488,0.0348837;AO=80,4;DP=85;FAO=82,3;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=40,2;FSAR=42,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00835366,0.00449899;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=271.839,229.679;QD=59.7593;RBI=0.00846897,0.00541918;REFB=-0.0436872,-0.0303264;REVB=0.00139278,0.00302102;RO=1;SAF=39,2;SAR=41,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0119854,-0.166656;STB=0.506171,0.59939;STBP=0.339,0.681;TYPE=snp,snp;VARB=0.000341765,0.0247609;OID=.,.;OPOS=121838319,121838319;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:85:86:1:1:80,4:82,3:0.953488,0.0348837:41,2:39,2:1:0:42,1:40,2:1:0 chr3 122003045 . G C 1770.32 PASS AF=1;AO=103;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181031;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.862;QD=60.5237;RBI=0.0263394;REFB=0;REVB=0.0191321;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117546;OID=.;OPOS=122003045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:117:0:0:103:117:1:48:55:0:0:60:57:0:0 chr3 122003769 . A G 866.89 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0738175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.045;QD=55.9282;RBI=0.0775146;REFB=-0.0780121;REVB=0.0236533;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193273;OID=.;OPOS=122003769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:60:62:0:0:59:62:1:34:25:0:0:34:28:0:0 chr3 122003832 . G C 1227.48 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.794;QD=61.374;RBI=0.020983;REFB=0;REVB=-0.01442;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100969;OID=.;OPOS=122003832;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0 chr3 122140919 . T C 338.07 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.01615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.298;QD=28.7723;RBI=0.018031;REFB=-0.0105889;REVB=-0.00801843;RO=18;SAF=22;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39319;STB=0.717234;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0063145;OID=.;OPOS=122140919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:7:22:4:14:7:22:4:14 chr3 122144347 . C G 269.55 PASS AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.0181648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.916;QD=14.1866;RBI=0.0492289;REFB=-0.0113201;REVB=0.045755;RO=45;SAF=18;SAR=13;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253278;STB=0.643302;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.010825;OID=.;OPOS=122144347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:13:18:15:30:13:18:15:30 chr3 122144873 . G A 194.28 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00398992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.692;QD=19.428;RBI=0.0127873;REFB=-0.0135553;REVB=0.0121488;RO=20;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167203;STB=0.602988;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0132192;OID=.;OPOS=122144873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:12:7:11:9:13:7:11:9 chr3 122145470 . C A 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0194727;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=318.796;QD=13.9955;RBI=0.0201567;REFB=0.000859137;REVB=-0.0052067;RO=42;SAF=12;SAR=17;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187301;STB=0.606485;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.00129566;OID=.;OPOS=122145470;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:17:12:25:17:17:12:25:17 chr3 122186188 . C T 635.3 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00829146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.935;QD=60.5043;RBI=0.0371651;REFB=0;REVB=0.0362284;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481603;OID=.;OPOS=122186188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:25:16:0:0:25:17:0:0 chr3 122259606 . T C 395.07 PASS AF=0.376;AO=47;DP=125;FAO=47;FDP=125;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=0.0232986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.149;QD=12.6422;RBI=0.0267737;REFB=-0.0191195;REVB=0.013191;RO=78;SAF=27;SAR=20;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178807;STB=0.601578;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0271184;OID=.;OPOS=122259606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:78:78:47:47:0.376:20:27:32:46:20:27:32:46 chr3 122259640 . T C 319.06 PASS AF=0.371429;AO=38;DP=105;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.00121129;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.685;QD=12.1546;RBI=0.0341626;REFB=-0.0161533;REVB=0.0341411;RO=66;SAF=22;SAR=16;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251213;STB=0.648278;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00991157;OID=.;OPOS=122259640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:66:66:38:39:0.371429:16:22:23:43:16:23:23:43 chr3 122288210 . G A 97.93 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00525164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5835;QD=13.5077;RBI=0.138649;REFB=-0.0388041;REVB=-0.138549;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122388;STB=0.551639;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0479725;OID=.;OPOS=122288210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:28:29:16:17:12:12:0.413793:6:6:10:6:6:6:10:7 chr3 122290579 . C T 1228.83 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=86;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.014471;FXX=0.0348797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.151;QD=59.2207;RBI=0.0154075;REFB=0.0930597;REVB=-0.00528987;RO=2;SAF=37;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198539;STB=0.501049;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=-0.000864239;OID=.;OPOS=122290579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:86:83:2:2:81:81:0.975904:44:37:1:1:44:37:1:1 chr3 122437321 . T C 747.08 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.964;QD=63.5816;RBI=0.0475049;REFB=0;REVB=0.0297281;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000551949;OID=.;OPOS=122437321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:29:17:0:0:30:17:0:0 chr3 122630323 . T G 340.37 PASS AF=0.4625;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00572273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.293;QD=17.0182;RBI=0.00749094;REFB=-0.00517988;REVB=0.00483368;RO=43;SAF=15;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705484;STB=0.530359;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00632235;OID=.;OPOS=122630323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:36:37:0.4625:21:15:21:22:21:16:21:22 chr3 122630346 . T C 356.56 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00417151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1112;QD=19.2737;RBI=0.0115368;REFB=0.0175306;REVB=-0.0107562;RO=37;SAF=15;SAR=22;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250466;STB=0.513934;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-0.0144956;OID=.;OPOS=122630346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:22:15:16:21:22:15:16:21 chr3 122642590 . G A 327.84 PASS AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00508309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.708;QD=23.006;RBI=0.0291785;REFB=-0.0194411;REVB=-0.0287323;RO=24;SAF=13;SAR=20;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207565;STB=0.614338;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0184624;OID=.;OPOS=122642590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:20:13:16:8:20:13:16:8 chr3 122680141 . A G 803.42 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.65;QD=55.408;RBI=0.0200077;REFB=-0.102656;REVB=0.0127301;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184904;STB=0.5098;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00314968;OID=.;OPOS=122680141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:25:32:0:1:25:32:0:1 chr3 122843110 . G T 1842.14 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.956;QD=61.4045;RBI=0.0303475;REFB=0;REVB=0.0251216;RO=0;SAF=54;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63261e-05;OID=.;OPOS=122843110;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:120:0:0:117:120:1:63:54:0:0:63:57:0:0 chr3 122864436 . G A 1008.46 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.414;QD=59.3211;RBI=0.0249541;REFB=0;REVB=0.00217954;RO=0;SAF=22;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39736e-05;OID=.;OPOS=122864436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:46:22:0:0:46:22:0:0 chr3 122869147 . G C 147.68 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0207488;FXX=0.0487686;HRUN=5;LEN=1;MLLD=84.1378;QD=15.147;RBI=0.0247965;REFB=-0.0117067;REVB=0.0135777;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619456;STB=0.604675;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.068732;OID=.;OPOS=122869147;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:39:16:23:16:16:0.410256:11:5:6:10:11:5:11:12 chr3 122880191 . T C 462.15 PASS AF=0.517241;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0330308;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.297;QD=21.248;RBI=0.0330323;REFB=-0.014322;REVB=0.000308151;RO=42;SAF=26;SAR=19;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894457;STB=0.549462;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0158295;OID=.;OPOS=122880191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:42:42:45:45:0.517241:19:26:20:22:19:26:20:22 chr3 122991021 . A T 1956.35 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149175;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.344;QD=62.1064;RBI=0.0149501;REFB=0;REVB=0.000987086;RO=0;SAF=75;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.16212e-06;OID=.;OPOS=122991021;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:51:75:0:0:51:75:0:0 chr3 122991038 . C T 1933.19 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000614634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.414;QD=61.8621;RBI=0.0110107;REFB=0;REVB=0.0109935;RO=0;SAF=71;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79582e-05;OID=.;OPOS=122991038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:53:71:0:0:54:71:0:0 chr3 123213667 . TCA ATC,TC 121.02 PASS AF=0.113924,0.303797;AO=12,20;DP=82;FAO=9,24;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=0,9;FSAR=9,15;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00419203,0.232611;FXX=0.0365809;HRUN=1,6;LEN=3,1;MLLD=89.8296,8.76381;QD=6.12762;RBI=0.0898381,0.241226;REFB=-0.0052546,-0.0435622;REVB=-0.0897402,-0.0638889;RO=36;SAF=0,7;SAR=12,13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0,0.314286;SSEP=0,0;SSSB=-0.781738,-0.257004;STB=0.998789,0.611417;STBP=0,0.198;TYPE=mnp,del;VARB=0.105446,-0.0013844;OID=.,.;OPOS=123213667,123213669;OREF=TCA,A;OALT=ATC,-;OMAPALT=ATC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:82:82:79:36:46:12,20:9,24:0.113924,0.303797:12,13:0,7:21:15:9,15:0,9:25:21 chr3 123331775 . TA T,TT 55.53 PASS AF=0.222222,0.148148;AO=7,4;DP=27;FAO=6,4;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=1,1;FSAR=5,3;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0105144,-0.0680501;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=17.5054,27.2843;QD=8.22698;RBI=0.0436161,0.0835936;REFB=-8.35387e-05,-0.0109484;REVB=0.0423298,0.0485497;RO=15;SAF=1,1;SAR=6,3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.296779,-0.112906;STB=0.637776,0.545219;STBP=0.556,0.961;TYPE=del,snp;VARB=0.0339433,0.0629314;OID=.,.;OPOS=123331776,123331776;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.222222,0.148148:7,4:27:6,4:27:17:1,1:5,3:5:12:30:15:1,1:6,3:5:10 chr3 123357037 . A G 1607.13 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.93;QD=64.2851;RBI=0.0214848;REFB=0;REVB=0.0106438;RO=0;SAF=43;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.23166e-05;OID=.;OPOS=123357037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:57:43:0:0:57:43:0:0 chr3 123368013 . A G 123.12 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.096906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.127;QD=16.4164;RBI=0.0973251;REFB=-0.0181091;REVB=0.00902214;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378376;STB=0.521709;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.023947;OID=.;OPOS=123368013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:11:3:3:13:11:3:3:13 chr3 123383039 . C T 613.07 PASS AF=0.5;AO=61;DP=126;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0239331;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0167;QD=19.4624;RBI=0.023937;REFB=-0.0233926;REVB=0.000429843;RO=63;SAF=23;SAR=38;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795713;STB=0.533112;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0225731;OID=.;OPOS=123383039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:63:63:61:63:0.5:38:23:29:34:39:24:28:35 chr3 123418913 . G A 1139.46 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124206;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.818;QD=60.7713;RBI=0.0125585;REFB=0;REVB=0.00185553;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104834;OID=.;OPOS=123418913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:33:42:0:0:33:42:0:0 chr3 123419116 . GTTC G 1288.3 PASS AF=0.948276;AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=116;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0130667;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=282.55;QD=44.4241;RBI=0.0352081;REFB=-0.0365085;REVB=0.0326936;RO=0;SAF=56;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46761e-08;STB=0.516784;STBP=0.113;TYPE=del;VARB=0.000939911;OID=.;OPOS=123419117;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.948276:110:113:110:116:6:56:54:5:1:3:0:56:54:0:0 chr3 123419288 . C T 890.78 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.684;QD=57.4694;RBI=0.0422837;REFB=0;REVB=0.0150278;RO=0;SAF=19;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147484;OID=.;OPOS=123419288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:40:19:0:0:41:21:0:0 chr3 123419573 . G T 1495.21 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00451217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3757;QD=62.3003;RBI=0.0474334;REFB=0.0101456;REVB=-0.0472182;RO=0;SAF=57;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.000687395;OID=.;OPOS=123419573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:0:1:95:95:0.989583:38:57:0:0:38:57:0:1 chr3 123419733 . A G 999.98 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627484;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.929;QD=59.7;RBI=0.0746453;REFB=0;REVB=0.0404298;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837129;OID=.;OPOS=123419733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:64:67:1:39:25:0:0:41:26:0:0 chr3 123451773 . G C 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.021;QD=60.8834;RBI=0.0393065;REFB=0;REVB=0.0294365;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9179e-05;OID=.;OPOS=123451773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0 chr3 123452838 . G A 1661.69 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0262273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.986;QD=59.346;RBI=0.0300189;REFB=-0.0817986;REVB=0.0146035;RO=0;SAF=49;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503999;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=7.04067e-05;OID=.;OPOS=123452838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:0:1:111:111:0.991071:62:49:0:0:62:49:0:1 chr3 123457893 . G A 610.33 PASS AF=0.953488;AO=42;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0823491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.042;QD=56.7745;RBI=0.0904129;REFB=0.0146193;REVB=-0.0373247;RO=1;SAF=10;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446315;STB=0.549974;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00245862;OID=.;OPOS=123457893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:43:1:2:42:41:0.953488:32:10:1:0:32:9:2:0 chr3 123512627 . G T 689.16 PASS AF=0.511278;AO=68;DP=133;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.00522198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.363;QD=20.7267;RBI=0.0214787;REFB=-0.0130244;REVB=-0.0208343;RO=65;SAF=27;SAR=41;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167238;STB=0.592063;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0137462;OID=.;OPOS=123512627;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:65:65:68:68:0.511278:41:27:38:27:41:27:38:27 chr3 123634046 . G A 1677.36 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2539;QD=60.4453;RBI=0.0203235;REFB=0;REVB=-0.0127204;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134149;OID=.;OPOS=123634046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:53:57:0:0:54:57:0:0 chr3 123665859 . T C 700.09 PASS AF=0.483444;AO=72;DP=151;FAO=73;FDP=151;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0298065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.575;QD=18.5454;RBI=0.032596;REFB=-0.0317448;REVB=0.0131937;RO=78;SAF=35;SAR=37;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231428;STB=0.509274;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.029171;OID=.;OPOS=123665859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:78:78:72:73:0.483444:37:35:36:42:38:35:36:42 chr3 123665902 . T G 916.12 PASS AF=0.526012;AO=89;DP=173;FAO=91;FDP=173;FR=.;FRO=82;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=-0.0068204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4909;QD=21.182;RBI=0.0753378;REFB=0.0203966;REVB=0.0750284;RO=84;SAF=42;SAR=47;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00379823;STB=0.512497;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.017404;OID=.;OPOS=123665902;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:84:82:89:91:0.526012:47:42:40:44:49:42:40:42 chr3 123699299 . G A 356.14 PASS AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0333093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.0664;QD=16.5644;RBI=0.038828;REFB=0.00988751;REVB=0.0199524;RO=48;SAF=13;SAR=25;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579328;STB=0.532606;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.0113369;OID=.;OPOS=123699299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:25:13:19:29:25:13:19:29 chr3 124044949 . C T 913.07 PASS AF=0.594406;AO=73;DP=133;FAO=85;FDP=143;FR=.;FRO=58;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0604934;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8578;QD=25.5403;RBI=0.0637898;REFB=-0.0394444;REVB=0.0202406;RO=59;SAF=35;SAR=38;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178906;STB=0.537693;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0288286;OID=.;OPOS=124044949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:143:59:58:73:85:0.594406:38:35:27:32:39:46:26:32 chr3 124048764 . C T 327.87 PASS AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00276667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.239;QD=23.0081;RBI=0.014263;REFB=0.00859691;REVB=0.0139921;RO=24;SAF=16;SAR=17;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751156;STB=0.541376;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00646904;OID=.;OPOS=124048764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:17:16:14:10:17:16:14:10 chr3 124157806 . G A 755.31 PASS AF=0.478788;AO=79;DP=165;FAO=79;FDP=165;FR=.;FRO=86;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=-0.00893861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.735;QD=18.3106;RBI=0.0120268;REFB=0.000832929;REVB=0.00804638;RO=86;SAF=46;SAR=33;SRF=50;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000855921;STB=0.500473;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=-0.000869899;OID=.;OPOS=124157806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:86:86:79:79:0.478788:33:46:50:36:33:46:50:36 chr3 124351316 . G A 771.22 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00676741;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.369;QD=57.1277;RBI=0.0177429;REFB=0;REVB=0.0164016;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78368e-05;OID=.;OPOS=124351316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chr3 124351424 . T C 1270.13 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=89;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00441427;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.407;QD=58.3966;RBI=0.022013;REFB=0.00935169;REVB=0.0215659;RO=3;SAF=55;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465083;STB=0.524584;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.00027006;OID=.;OPOS=124351424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:89:87:3:3:84:84:0.965517:29:55:0:3:29:55:0:3 chr3 124376653 . G A 919.97 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00616179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.058;QD=58.4111;RBI=0.0148215;REFB=0;REVB=0.01348;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39008e-05;OID=.;OPOS=124376653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:35:27:0:0:36:27:0:0 chr3 124379748 . G C 1146.55 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629632;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.095;QD=61.1494;RBI=0.0105914;REFB=0;REVB=0.00851674;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557132;OID=.;OPOS=124379748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:75:0:0:77:75:1:36:41:0:0:36:39:0:0 chr3 124379817 . T C 2239.21 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380016;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3032;QD=63.5238;RBI=0.0762275;REFB=0;REVB=0.0660796;RO=0;SAF=70;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.23847e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138812;OID=.;OPOS=124379817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:141:0:0:141:141:1:71:70:0:0:71:70:0:0 chr3 124412634 . G T 619.82 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577664;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.526;QD=61.9823;RBI=0.00976717;REFB=0;REVB=0.00787579;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266323;OID=.;OPOS=124412634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chr3 124418846 . C T 295.65 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0169817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.098;QD=17.9179;RBI=0.0187407;REFB=-0.0202707;REVB=0.00792676;RO=33;SAF=9;SAR=23;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118715;STB=0.57746;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.021836;OID=.;OPOS=124418846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:34:32:32:0.484848:23:9:13:20:23:9:14:20 chr3 124451284 . T C 263.47 PASS AF=0.585366;AO=22;DP=39;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0027568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.272;QD=25.7046;RBI=0.0635031;REFB=-0.00427065;REVB=0.0634432;RO=17;SAF=16;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756476;STB=0.509083;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00255796;OID=.;OPOS=124451284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:17:17:22:24:0.585366:6:16:11:6:8:16:11:6 chr3 124646705 . A AAAG,AAG 1488.82 PASS AF=1,0;AO=72,19;DP=118;FAO=100,0;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=78,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010061,-0.0145428;FXX=0.0654144;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=249.983,230.342;QD=59.5529;RBI=0.0619752,0.0638223;REFB=0,0;REVB=0.0611532,0.0621434;RO=18;SAF=19,0;SAR=53,19;SRF=8;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0831776,-0.830735;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00159129,0.106687;OID=.,.;OPOS=124646706,124646706;OREF=-,-;OALT=AAG,AG;OMAPALT=AAAG,AAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:72,19:118:100,0:100:0:22,0:78,0:0:0:8:18:19,0:53,19:8:10 chr3 124688787 . A AT 156.89 PASS AF=1;AO=7;DP=19;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.227518;FXX=0.062461;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.9125;QD=41.8376;RBI=0.259947;REFB=0;REVB=-0.125729;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439197;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.03782;OID=.;OPOS=124688788;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:19:15:15:0:4:11:0:0:4:12:1:6:6:6 chr3 124688791 . A T 44.55 PASS AF=0.4375;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0506089;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=47.8902;QD=11.1384;RBI=0.0529778;REFB=-0.059083;REVB=-0.0156649;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129519;STB=0.54533;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.127247;OID=.;OPOS=124688791;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:15:16:9:9:6:7:0.4375:4:2:2:7:5:2:2:7 chr3 124692689 . C T 2240.94 PASS AF=1;AO=140;DP=144;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00481747;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0172;QD=63.5728;RBI=0.00984138;REFB=0;REVB=-0.00858165;RO=0;SAF=60;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109207;OID=.;OPOS=124692689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:141:0:0:140:141:1:80:60:0:0:80:61:0:0 chr3 124728626 . A G 518.68 PASS AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00187915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6129;QD=19.3898;RBI=0.00813103;REFB=0.00450871;REVB=0.0079109;RO=52;SAF=31;SAR=23;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148424;STB=0.513566;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00406628;OID=.;OPOS=124728626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:52:53:54:54:0.504673:23:31:29:23:23:31:29:24 chr3 124731485 . C G 1491.24 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179;QD=63.457;RBI=0.0324682;REFB=0;REVB=0.0147222;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5958e-05;OID=.;OPOS=124731485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:45:49:0:0:45:49:0:0 chr3 124731689 . T A 2312.64 PASS AF=1;AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00190756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.193;QD=63.7969;RBI=0.00646487;REFB=0;REVB=0.00617704;RO=0;SAF=61;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11288e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97484e-06;OID=.;OPOS=124731689;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:145:0:0:145:145:1:84:61:0:0:84:61:0:0 chr3 124733649 . T G 1981.39 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.363;QD=61.9184;RBI=0.0332257;REFB=0;REVB=0.0262644;RO=0;SAF=61;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52974e-05;OID=.;OPOS=124733649;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:128:0:0:126:128:1:65:61:0:0:67:61:0:0 chr3 124746347 . T C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.874;QD=59.6792;RBI=0.00473509;REFB=0;REVB=0.00354408;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15312e-06;OID=.;OPOS=124746347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr3 124802881 . A G 255.89 PASS AF=0.491228;AO=25;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0018837;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.989;QD=17.957;RBI=0.0136301;REFB=-0.0207482;REVB=0.0134993;RO=29;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112975;STB=0.546942;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0250543;OID=.;OPOS=124802881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:29:29:25:28:0.491228:15:10:15:14:17:11:14:15 chr3 124802888 . C T 226.98 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00734193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.451;QD=15.654;RBI=0.00769737;REFB=0.00933279;REVB=0.00231207;RO=32;SAF=9;SAR=17;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125812;STB=0.571372;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.00557321;OID=.;OPOS=124802888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:17:9:15:17:17:9:15:17 chr3 124837684 . T C 1515.41 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379954;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.495;QD=59.4277;RBI=0.0385664;REFB=0;REVB=0.00661182;RO=0;SAF=57;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.17359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264897;OID=.;OPOS=124837684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:44:57:0:0:45:57:0:0 chr3 124839470 . G A 1333.71 PASS AF=0.932692;AO=95;DP=104;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0162807;FXX=0.0280348;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.191;QD=51.2964;RBI=0.0289222;REFB=-0.0315551;REVB=0.0239047;RO=4;SAF=52;SAR=43;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350849;STB=0.5017;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=8.95785e-05;OID=.;OPOS=124839470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:104:104:4:7:95:97:0.932692:43:52:4:0:44:53:4:3 chr3 124951171 . CTTTTTTTTTTTTTTTA CTACTTTTTTTTTTTTA,CTTTATTTTTTTTTTTA,CTTTTCTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTATTC 357.0 PASS AF=0,0.0697674,0.116279,0.232558,0.348837,0.232558;AO=3,2,2,7,6,2;DP=50;FAO=0,3,5,10,15,10;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,4,8,10;FSAR=0,3,5,6,7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00735903,-0.01271,-0.0193884,-0.0357603,-0.0481829,-0.0145381;FXX=0.173044;HRUN=15,15,15,15,15,15;LEN=2,1,1,4,3,4;MLLD=90.6006,85.1561,100.319,11.6955,9.54624,98.6173;QD=33.2091;RBI=0.0601202,0.0339226,0.0353802,0.0647784,0.097559,0.0150911;REFB=-0.0118478,-0.0433994,-0.0425037,-0.0901863,-0.101254,-0.162933;REVB=-0.0596681,-0.0314515,-0.0295948,-0.0540133,-0.0848302,-0.00404789;RO=0;SAF=0,0,0,2,3,2;SAR=3,2,2,5,3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0,0;SSSB=0,0,0,-3.27427e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1,1;TYPE=mnp,snp,snp,del,del,mnp;VARB=0,0.0233192,0.0565963,0.0719828,-0.00720481,-0.0429684;OID=.,.,.,.,.,.;OPOS=124951173,124951175,124951176,124951172,124951172,124951184;OREF=TT,T,T,TTTT,TTT,TTTA;OALT=AC,A,C,-,-,ATTC;OMAPALT=CTACTTTTTTTTTTTTA,CTTTATTTTTTTTTTTA,CTTTTCTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTATTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 5/6:0,0.0697674,0.116279,0.232558,0.348837,0.232558:3,2,2,7,6,2:50:0,3,5,10,15,10:43:0:0,0,0,4,8,10:0,3,5,6,7,0:0:0:79:0:0,0,0,2,3,2:3,2,2,5,3,0:0:0 chr3 124951821 . C T 280.85 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00593404;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.143;QD=21.1961;RBI=0.00701329;REFB=-0.00952241;REVB=0.0037381;RO=24;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115754;STB=0.564159;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00822717;OID=.;OPOS=124951821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:24:24:29:29:0.54717:15:14:15:9:15:14:15:9 chr3 125235852 . A ATTTAT 758.48 PASS AF=1;AO=45;DP=52;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194822;FXX=0.039992;HRUN=3;LEN=5;MLLD=274.575;QD=63.2064;RBI=0.0211413;REFB=0;REVB=0.00820978;RO=4;SAF=15;SAR=30;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110055;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000245929;OID=.;OPOS=125235853;OREF=-;OALT=TTTAT;OMAPALT=ATTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:45:52:48:48:0:17:31:0:0:4:4:15:30:4:0 chr3 125769757 . C T 1188.18 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.344;QD=60.1611;RBI=0.0360614;REFB=0;REVB=0.00953585;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127889;OID=.;OPOS=125769757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:41:37:0:0:41:38:0:0 chr3 125775228 . T C 1093.94 PASS AF=1;AO=38;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.509;QD=60.7743;RBI=0.157801;REFB=0;REVB=0.15327;RO=0;SAF=32;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29107e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151528;OID=.;OPOS=125775228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:38:72:1:6:32:0:0:40:32:0:0 chr3 125786879 . T C 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.48;QD=57.1052;RBI=0.0205258;REFB=0;REVB=-0.00475252;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000290698;OID=.;OPOS=125786879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr3 125854311 . TC T 138.81 PASS AF=0.566265;AO=42;DP=84;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.000307192;FXX=0.0119033;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.68141;QD=6.68976;RBI=0.168147;REFB=0.0100556;REVB=0.168147;RO=29;SAF=19;SAR=23;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291224;STB=0.534629;STBP=0.505;TYPE=del;VARB=0.0795619;OID=.;OPOS=125854312;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.566265:42:84:47:83:36:22:25:14:22:79:29:19:23:12:17 chr3 126152474 . C T 370.35 PASS AF=0.453488;AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00675832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.255;QD=17.2254;RBI=0.0157668;REFB=-0.0140706;REVB=0.0142449;RO=44;SAF=18;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058104;STB=0.526868;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0133634;OID=.;OPOS=126152474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:44:47:39:39:0.453488:21:18:23:21:21:18:24:23 chr3 126169230 . C T 1298.17 PASS AF=0.988506;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.807;QD=59.6861;RBI=0.0247769;REFB=0.0152128;REVB=0.0110706;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000198677;OID=.;OPOS=126169230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:0:1:85:86:0.988506:43:42:0:0:44:42:0:1 chr3 126169472 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.135;QD=47.8224;RBI=0.0364902;REFB=0;REVB=-0.0103378;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128577;OID=.;OPOS=126169472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr3 126194076 . T C 275.61 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0395411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.062;QD=18.0729;RBI=0.0398977;REFB=-0.0306667;REVB=-0.00532211;RO=30;SAF=13;SAR=17;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119298;STB=0.57465;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0167578;OID=.;OPOS=126194076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:31:30:30:0.491803:17:13:17:13:17:13:18:13 chr3 126202257 . G A 1478.36 PASS AF=0.449857;AO=157;DP=351;FAO=157;FDP=349;FR=.;FRO=192;FSAF=80;FSAR=77;FSRF=97;FSRR=95;FWDB=-0.0220287;FXX=0.00852249;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.303;QD=16.944;RBI=0.0222241;REFB=-0.041097;REVB=0.00294109;RO=190;SAF=80;SAR=77;SRF=96;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00425097;STB=0.502391;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0441355;OID=.;OPOS=126202257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:349:190:192:157:157:0.449857:77:80:96:94:77:80:97:95 chr3 126329910 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.361;QD=57.2025;RBI=0.0455404;REFB=0;REVB=0.0339261;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424348;OID=.;OPOS=126329910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0 chr3 126708453 . T C 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0175344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.775;QD=11.8307;RBI=0.01818;REFB=-0.0122898;REVB=-0.00480211;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106346;STB=0.506318;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0125298;OID=.;OPOS=126708453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:8:10:6:5:8:10 chr3 126708459 . C T 74.61 PASS AF=0.357143;AO=9;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.000428197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.128;QD=10.659;RBI=0.0378618;REFB=-0.00183362;REVB=0.0378594;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120817;STB=0.535643;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00426398;OID=.;OPOS=126708459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:27:28:18:18:9:10:0.357143:4:5:8:10:5:5:8:10 chr3 126722304 . C T 140.76 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0387998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.655;QD=13.0937;RBI=0.0388028;REFB=-0.00263289;REVB=-0.000482082;RO=27;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329526;STB=0.519264;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0054584;OID=.;OPOS=126722304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:9:7:11:16:9:7:11:16 chr3 126741674 . G A 279.33 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0167679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.939;QD=18.9377;RBI=0.0174422;REFB=-0.0206953;REVB=0.00480272;RO=29;SAF=11;SAR=19;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543775;STB=0.530264;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.021255;OID=.;OPOS=126741674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:19:11:9:20:19:11:9:20 chr3 126746690 . A G 205.45 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0117124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.145;QD=14.6751;RBI=0.0155967;REFB=-0.012433;REVB=-0.0102993;RO=30;SAF=10;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146767;STB=0.600509;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0160471;OID=.;OPOS=126746690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:32:24:24:0.428571:14:10:17:13:14:10:19:13 chr3 126746731 . T G 51.96 PASS AF=0.222222;AO=7;DP=34;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00248648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5901;QD=5.77322;RBI=0.0730264;REFB=-0.0014636;REVB=-0.0729841;RO=25;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292628;STB=0.728477;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00113329;OID=.;OPOS=126746731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:36:25:28:7:8:0.222222:1:6:17:8:1:7:19:9 chr3 126754711 . G A 382.8 PASS AF=0.584615;AO=37;DP=64;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0446316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0416;QD=23.5571;RBI=0.0570188;REFB=-0.0250618;REVB=0.0354848;RO=27;SAF=19;SAR=18;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894405;STB=0.543208;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0159004;OID=.;OPOS=126754711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:27:27:37:38:0.584615:18:19:17:10:18:20:17:10 chr3 126916371 . T C 721.9 PASS AF=1;AO=43;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105657;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2743;QD=62.7741;RBI=0.112386;REFB=0;REVB=-0.0383057;RO=3;SAF=5;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214227;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00098149;OID=.;OPOS=126916371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:3:0:43:46:1:38:5:3:0:38:8:0:0 chr3 126916433 . T TTTC 105.19 PASS AF=0.909091;AO=8;DP=25;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0246585;FXX=0.266489;HRUN=3;LEN=3;MLLD=277.257;QD=38.2495;RBI=0.0248349;REFB=0.0599749;REVB=0.00295514;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152616;STB=0.57128;STBP=0.275;TYPE=ins;VARB=-0.00656702;OID=.;OPOS=126916434;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.909091:8:25:10:11:1:3:7:1:0:8:15:1:7:3:12 chr3 126916998 . AAT A,AAA 55.98 PASS AF=0.588235,0;AO=3,4;DP=21;FAO=10,0;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=6,0;FSAR=4,0;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0756574,0.0652497;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=18.3736,15.6841;QD=13.1729;RBI=0.280501,0.12414;REFB=-0.167995,0.0734323;REVB=0.270106,-0.105608;RO=12;SAF=1,3;SAR=2,1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.267894,0.205016;STB=0.512171,0.5;STBP=0.944,1;TYPE=del,snp;VARB=0.153282,0;OID=.,.;OPOS=126916999,126917000;OREF=AT,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.588235,0:3,4:21:10,0:17:7:6,0:4,0:4:3:43:12:1,3:2,1:7:5 chr3 127323592 . G A 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00413645;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.521;QD=18.0506;RBI=0.0343103;REFB=-0.0287776;REVB=0.0340601;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175521;STB=0.599822;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0242225;OID=.;OPOS=127323592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:7:1:3:7:7:1 chr3 127323830 . C T 126.16 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0329444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3116;QD=10.9704;RBI=0.0357544;REFB=0.00326649;REVB=0.0138939;RO=31;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963259;STB=0.557445;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.00442783;OID=.;OPOS=127323830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:6:9:16:15:6:9:16:15 chr3 127409941 . T C 318.58 PASS AF=0.485714;AO=35;DP=71;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00214957;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.873;QD=18.2046;RBI=0.0038356;REFB=-0.0175387;REVB=0.00317665;RO=36;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673139;STB=0.531714;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0147193;OID=.;OPOS=127409941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:36:36:35:34:0.485714:21:14:17:19:20:14:17:19 chr3 127410915 . C T 195.6 PASS AF=0.387097;AO=23;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0024326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.119;QD=12.6193;RBI=0.00253863;REFB=0.00131759;REVB=0.000726024;RO=38;SAF=14;SAR=9;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062367;STB=0.546179;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00137794;OID=.;OPOS=127410915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:38:23:24:0.387097:9:14:21:17:9:15:21:17 chr3 127410959 . G T 49.42 PASS AF=0.32;AO=3;DP=21;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.133609;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.4011;QD=7.90736;RBI=0.191451;REFB=-0.0852926;REVB=0.13712;RO=18;SAF=0;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.625404;STB=0.559852;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.266393;OID=.;OPOS=127410959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:25:18:17:3:8:0.32:3:0:10:8:4:4:10:7 chr3 127641968 . C A 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0215213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.44;QD=11.9197;RBI=0.0300602;REFB=-0.00740908;REVB=-0.0209868;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263271;STB=0.6599;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0143738;OID=.;OPOS=127641968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:5:4:5:2:5:4 chr3 127983495 . T C 858.8 PASS AF=1;AO=43;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.886;QD=58.2236;RBI=0.0753253;REFB=0;REVB=0.00781762;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389071;OID=.;OPOS=127983495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:43:59:1:25:18:0:0:25:34:0:0 chr3 128181537 . C T 1171.99 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.18;QD=60.8824;RBI=0.0300011;REFB=0;REVB=0.0255511;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155121;OID=.;OPOS=128181537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:35:41:0:0:36:41:0:0 chr3 128182074 . G A 851.13 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.054;QD=57.7039;RBI=0.0222145;REFB=0;REVB=0.0197278;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68538e-05;OID=.;OPOS=128182074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:37:22:0:0:37:22:0:0 chr3 128204951 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.432;QD=42.1826;RBI=0.0532356;REFB=0;REVB=0.0362883;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140513;OID=.;OPOS=128204951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0 chr3 128205860 . G C 106.03 PASS AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138828;FXX=0.0908265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0901;QD=42.4103;RBI=0.145707;REFB=0;REVB=-0.0442403;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00606383;OID=.;OPOS=128205860;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr3 128292844 . A G 246.54 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0382931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.927;QD=46.9608;RBI=0.058548;REFB=-0.124272;REVB=0.0442888;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533299;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00177686;OID=.;OPOS=128292844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:13:7:0:0:13:7:1:0 chr3 128356852 . C T 236.51 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0248265;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9475;QD=12.6138;RBI=0.0309847;REFB=-0.0230521;REVB=-0.0185391;RO=46;SAF=7;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296289;STB=0.66654;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0310321;OID=.;OPOS=128356852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:47:28:28:0.373333:21:7:23:23:21:7:23:24 chr3 128392630 . G C 185.82 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0020659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.314;QD=19.0582;RBI=0.0047712;REFB=-0.00557866;REVB=-0.00430075;RO=20;SAF=3;SAR=16;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393444;STB=0.726997;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00554793;OID=.;OPOS=128392630;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:16:3:10:10:16:3:10:10 chr3 128580574 . T C 526.92 PASS AF=0.519231;AO=54;DP=104;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0416093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.966;QD=20.2663;RBI=0.0416142;REFB=-0.0293687;REVB=0.000641704;RO=50;SAF=29;SAR=25;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119082;STB=0.565579;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0313967;OID=.;OPOS=128580574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:50:50:54:54:0.519231:25:29:20:30:25:29:20:30 chr3 128580585 . C A 583.69 PASS AF=0.517544;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00523918;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.046;QD=20.4805;RBI=0.0470865;REFB=-0.00744133;REVB=-0.0467941;RO=54;SAF=37;SAR=22;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161665;STB=0.585129;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00458917;OID=.;OPOS=128580585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:55:59:59:0.517544:22:37:24:30:22:37:25:30 chr3 128614185 . A C 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0284123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9334;QD=18.711;RBI=0.0648488;REFB=-0.00218002;REVB=-0.0582933;RO=19;SAF=5;SAR=13;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371009;STB=0.711009;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000415534;OID=.;OPOS=128614185;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:13:5:13:6:13:5:13:6 chr3 128627021 . A G 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0260754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.106;QD=12.0501;RBI=0.0284439;REFB=-0.0117673;REVB=-0.0113635;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13422;STB=0.580461;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0191144;OID=.;OPOS=128627021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:7:6:3:6:7:6 chr3 128627933 . C T 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0220615;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.014;QD=15.1966;RBI=0.0235399;REFB=-0.0249596;REVB=-0.00821088;RO=25;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212035;STB=0.610988;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.021989;OID=.;OPOS=128627933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:26:18:18:0.409091:11:7:15:10:11:7:15:11 chr3 128631481 . G A 185.92 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0087301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0543;QD=12.3947;RBI=0.0194335;REFB=-0.0197592;REVB=-0.0173622;RO=36;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304485;STB=0.667001;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0378283;OID=.;OPOS=128631481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:8:15:13:23:8:15:14:23 chr3 128890350 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00232688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.759;QD=52.6127;RBI=0.0279588;REFB=0;REVB=0.0278618;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256185;OID=.;OPOS=128890350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr3 129130197 . T C 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0164788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.842;QD=12.7823;RBI=0.0285083;REFB=-0.00395465;REVB=0.0232631;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998889;STB=0.559202;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00377542;OID=.;OPOS=129130197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:7:7:6:4:7:7 chr3 129134242 . G A 328.71 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0806894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.182;QD=18.0113;RBI=0.08218;REFB=-0.0172019;REVB=-0.0155811;RO=37;SAF=10;SAR=25;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712675;STB=0.534863;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0158483;OID=.;OPOS=129134242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:38:35:35:0.479452:25:10:13:24:25:10:13:25 chr3 129137127 . G A 184.81 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00442771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.406;QD=12.1186;RBI=0.0113917;REFB=-0.00268161;REVB=-0.010496;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146989;STB=0.58494;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0043797;OID=.;OPOS=129137127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:14:9:20:18:14:9:20:18 chr3 129140499 . T C 268.94 PASS AF=0.543478;AO=23;DP=44;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00487611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.723;QD=23.3859;RBI=0.00682;REFB=-0.0141208;REVB=0.00476822;RO=21;SAF=11;SAR=12;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15984;STB=0.602329;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0105031;OID=.;OPOS=129140499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:46:21:21:23:25:0.543478:12:11:14:7:14:11:14:7 chr3 129155451 . C T 448.82 PASS AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0191542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.639;QD=21.3723;RBI=0.0218994;REFB=-0.0123949;REVB=-0.0106161;RO=40;SAF=26;SAR=18;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141347;STB=0.507809;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0116688;OID=.;OPOS=129155451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:18:26:23:17:18:26:23:17 chr3 129210977 . G C 179.99 PASS AF=0.62069;AO=15;DP=26;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00184914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.2;QD=24.8259;RBI=0.00445005;REFB=-0.0138953;REVB=-0.00404767;RO=11;SAF=11;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296397;STB=0.647131;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00750202;OID=.;OPOS=129210977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:26:29:11:11:15:18:0.62069:4:11:4:7:5:13:4:7 chr3 129262077 . G A 118.65 PASS AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0558141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.146;QD=7.78028;RBI=0.0558145;REFB=-0.0155879;REVB=0.000221948;RO=44;SAF=9;SAR=8;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741132;STB=0.544695;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0374549;OID=.;OPOS=129262077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:44:44:17:17:0.278689:8:9:26:18:8:9:26:18 chr3 129274363 . G A 361.1 PASS AF=0.311688;AO=48;DP=154;FAO=48;FDP=154;FR=.;FRO=106;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=0.00442014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.549;QD=9.37922;RBI=0.0249081;REFB=-0.00576295;REVB=-0.0245127;RO=106;SAF=17;SAR=31;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144175;STB=0.584047;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0170474;OID=.;OPOS=129274363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:106:106:48:48:0.311688:31:17:50:56:31:17:50:56 chr3 129275206 . C T 281.51 PASS AF=0.358696;AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0862966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0425;QD=12.2397;RBI=0.0863326;REFB=0.00929249;REVB=0.00249233;RO=59;SAF=17;SAR=16;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640289;STB=0.53682;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.0148762;OID=.;OPOS=129275206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:59:59:33:33:0.358696:16:17:27:32:16:17:27:32 chr3 129279570 . T C 304.91 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00284848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.846;QD=26.5135;RBI=0.00943964;REFB=0.00657576;REVB=-0.00899961;RO=19;SAF=7;SAR=20;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144261;STB=0.580208;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00418437;OID=.;OPOS=129279570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:20:7:8:11:20:7:8:11 chr3 129279597 . C T 519.83 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00963059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3316;QD=59.4088;RBI=0.0150066;REFB=0;REVB=0.0115087;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17946e-05;OID=.;OPOS=129279597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0 chr3 129281718 . C T 423.97 PASS AF=0.472527;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0368587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.912;QD=18.6358;RBI=0.0376715;REFB=-0.0156506;REVB=0.00778326;RO=48;SAF=19;SAR=24;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553405;STB=0.53085;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0139169;OID=.;OPOS=129281718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:48:48:43:43:0.472527:24:19:24:24:24:19:24:24 chr3 129281980 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9912;QD=59.8385;RBI=0.020005;REFB=0;REVB=0.0190913;RO=0;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328593;OID=.;OPOS=129281980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:9:27:0:0:9:27:0:0 chr3 129286413 . G C 192.93 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0113571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0385;QD=13.7808;RBI=0.0355659;REFB=0.00368587;REVB=-0.0337038;RO=33;SAF=14;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159712;STB=0.591469;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00443254;OID=.;OPOS=129286413;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:9:14:15:18:9:14:15:18 chr3 129290087 . G A 191.91 PASS AF=0.425926;AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0245201;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4852;QD=14.2158;RBI=0.02551;REFB=-0.0133236;REVB=-0.00703734;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17463;STB=0.608601;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0413698;OID=.;OPOS=129290087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:31:31:22:23:0.425926:13:9:18:13:14:9:18:13 chr3 129293183 . T C 885.09 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.683;QD=58.0389;RBI=0.0246716;REFB=0;REVB=-0.0233471;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.79634e-05;OID=.;OPOS=129293183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0 chr3 129308209 . G A 197.86 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00797093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.026;QD=14.6566;RBI=0.0137292;REFB=-0.00344603;REVB=-0.0111783;RO=31;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146121;STB=0.583261;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00699763;OID=.;OPOS=129308209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:10:13:13:18:10:13:13:18 chr3 129366963 . G T 338.63 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0126477;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.7119;QD=17.3656;RBI=0.0288839;REFB=-0.0108873;REVB=0.0259676;RO=42;SAF=14;SAR=22;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109092;STB=0.56119;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0123793;OID=.;OPOS=129366963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:22:14:21:21:22:14:21:21 chr3 129367024 . T A 832.57 PASS AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0227201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.117;QD=52.8614;RBI=0.0235928;REFB=-0.0462344;REVB=-0.00635765;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.526307;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.000571959;OID=.;OPOS=129367024;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:63:63:0:3:60:60:0.952381:33:27:0:0:33:27:3:0 chr3 129538635 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.051;QD=57.6801;RBI=0.0512984;REFB=0;REVB=0.0404317;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295406;OID=.;OPOS=129538635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr3 129546729 . T C 909.57 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.788;QD=57.7506;RBI=0.0173005;REFB=0;REVB=-0.00530817;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422079;OID=.;OPOS=129546729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:35:27:0:0:36:27:0:0 chr3 129694681 . C G 262.8 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0535164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.847;QD=15.0171;RBI=0.0558424;REFB=-0.0235569;REVB=0.0159491;RO=40;SAF=11;SAR=19;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182122;STB=0.510302;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.02407;OID=.;OPOS=129694681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:19:11:14:26:19:11:14:26 chr3 129695954 . T C 619.93 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0124704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7668;QD=59.0411;RBI=0.0598986;REFB=-0.0176079;REVB=0.0585861;RO=1;SAF=29;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159086;STB=0.50847;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00409254;OID=.;OPOS=129695954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:12:29:1:0:12:29:1:0 chr3 129696041 . A G 801.48 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.702;QD=57.2487;RBI=0.030582;REFB=0;REVB=0.0184855;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8194e-05;OID=.;OPOS=129696041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:23:32:0:0:23:33:0:0 chr3 129800823 . T G 54.0 PASS AF=0.153846;AO=10;DP=65;FAO=10;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0108754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.403;QD=3.3232;RBI=0.0180828;REFB=-0.00536814;REVB=0.0144469;RO=55;SAF=5;SAR=5;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559999;STB=0.538385;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0200358;OID=.;OPOS=129800823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:65:65:55:55:10:10:0.153846:5:5:25:30:5:5:25:30 chr3 129800888 . G A 167.09 PASS AF=0.283951;AO=23;DP=81;FAO=23;FDP=81;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.00664079;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.02;QD=8.25131;RBI=0.00687399;REFB=-0.00183348;REVB=-0.00177528;RO=58;SAF=13;SAR=10;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139585;STB=0.583261;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00308807;OID=.;OPOS=129800888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:58:58:23:23:0.283951:10:13:26:32:10:13:26:32 chr3 129800895 . G A 169.09 PASS AF=0.294872;AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00189928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.713;QD=8.67115;RBI=0.00223652;REFB=-0.0025678;REVB=0.00118099;RO=55;SAF=13;SAR=10;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152006;STB=0.590177;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0147443;OID=.;OPOS=129800895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:55:55:23:23:0.294872:10:13:24:31:10:13:24:31 chr3 130098349 . G C 487.17 PASS AF=0.387324;AO=55;DP=142;FAO=55;FDP=142;FR=.;FRO=87;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=0.0142502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0275;QD=13.7232;RBI=0.01776;REFB=0.0107994;REVB=0.0105994;RO=84;SAF=23;SAR=32;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757202;STB=0.554129;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.0196093;OID=.;OPOS=130098349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:84:87:55:55:0.387324:32:23:41:43:32:23:44:43 chr3 130110550 . A G 193.22 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0014983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.99;QD=16.4438;RBI=0.0175096;REFB=-0.00383994;REVB=-0.0174454;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317387;STB=0.518183;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00598578;OID=.;OPOS=130110550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:14:13:9:11:14:13 chr3 130124826 . A G 327.96 PASS AF=0.413793;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0208958;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.833;QD=15.0787;RBI=0.0261801;REFB=-0.00583412;REVB=0.0157722;RO=50;SAF=20;SAR=16;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465789;STB=0.531233;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00738468;OID=.;OPOS=130124826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:50:51:36:36:0.413793:16:20:30:20:16:20:31:20 chr3 130128159 . ATTTTTTT ATTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTC 252.06 PASS AF=0.015873,0.857143,0;AO=8,32,4;DP=65;FAO=1,54,0;FDP=63;FR=.;FRO=8;FSAF=0,26,0;FSAR=1,28,0;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.04727,-0.0924649,0.00973418;FXX=0.0307645;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=11.2339,8.06653,13.5353;QD=16.0037;RBI=0.0950217,0.185801,0.0382841;REFB=-0.034017,-0.064149,0.00704324;REVB=0.0824298,0.161159,-0.0370259;RO=16;SAF=7,17,0;SAR=1,15,4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.529846,0.0571786,-0.648636;STB=0.993369,0.534593,0.5;STBP=0.236,0.184,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0470473,0.0534672,0;OID=.,.,.;OPOS=130128160,130128160,130128166;OREF=TT,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.015873,0.857143,0:8,32,4:65:1,54,0:63:8:0,26,0:1,28,0:6:2:19:16:7,17,0:1,15,4:7:9 chr3 130129322 . G C 252.71 PASS AF=0.5;AO=26;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0216889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6212;QD=18.0503;RBI=0.0332895;REFB=-0.0574515;REVB=0.0252544;RO=28;SAF=13;SAR=13;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988874;STB=0.553534;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0382014;OID=.;OPOS=130129322;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:28:28:26:28:0.5:13:13:17:11:14:14:17:11 chr3 130134563 . G A 285.99 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00246999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.384;QD=21.9988;RBI=0.00277579;REFB=0.00324769;REVB=0.00126655;RO=23;SAF=14;SAR=15;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143689;STB=0.579386;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.00276232;OID=.;OPOS=130134563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:15:14:7:16:15:14:7:16 chr3 130135644 . C A 595.78 PASS AF=0.4;AO=67;DP=173;FAO=68;FDP=170;FR=.;FRO=102;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=49;FWDB=-0.0103847;FXX=0.0285698;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.498;QD=14.0183;RBI=0.0106699;REFB=-0.0102182;REVB=-0.00245038;RO=96;SAF=36;SAR=31;SRF=52;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00459453;STB=0.505897;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0134353;OID=.;OPOS=130135644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:170:96:102:67:68:0.4:31:36:52:44:32:36:53:49 chr3 130162395 . A G 423.04 PASS AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0215336;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.4255;QD=23.833;RBI=0.0360806;REFB=0.0408279;REVB=-0.0289501;RO=30;SAF=21;SAR=20;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060628;STB=0.533271;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0277362;OID=.;OPOS=130162395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:0.577465:20:21:13:17:20:21:13:17 chr3 130174334 . G A 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.891;QD=62.7621;RBI=0.0180826;REFB=0;REVB=-0.00272419;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28646e-05;OID=.;OPOS=130174334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:42:47:0:0:42:47:0:0 chr3 130187817 . T C 424.15 PASS AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=0.00613051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.735;QD=15.1482;RBI=0.0197505;REFB=-0.0103613;REVB=0.018775;RO=63;SAF=26;SAR=22;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467287;STB=0.521044;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0137101;OID=.;OPOS=130187817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:64:48:48:0.428571:22:26:37:26:22:26:37:27 chr3 130190630 . G A 494.42 PASS AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0233824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.508;QD=18.835;RBI=0.0380903;REFB=-0.00533702;REVB=-0.0300688;RO=53;SAF=38;SAR=14;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978222;STB=0.554355;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00544998;OID=.;OPOS=130190630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:53:53:52:52:0.495238:14:38:34:19:14:38:34:19 chr3 130308840 . ATTTTTTTA ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA 287.27 PASS AF=0.596491,0,0;AO=18,13,3;DP=62;FAO=34,0,0;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=23,0,0;FSAR=11,0,0;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0129993,-0.0996561,-0.12797;FXX=0.0338926;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=20.1331,11.3882,11.9433;QD=20.1592;RBI=0.209823,0.289803,0.13683;REFB=-0.095666,-0.0538333,0.0394421;REVB=0.20942,0.27213,0.0484389;RO=23;SAF=9,12,3;SAR=9,1,0;SRF=12;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0212567,0.580355,0.570887;STB=0.585773,0.5,0.5;STBP=0.148,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.067588,0,0;OID=.,.,.;OPOS=130308847,130308841,130308847;OREF=TA,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.596491,0,0:18,13,3:62:34,0,0:57:23:23,0,0:11,0,0:11:12:99:23:9,12,3:9,1,0:12:11 chr3 130311398 . C T 545.84 PASS AF=0.403846;AO=63;DP=152;FAO=63;FDP=156;FR=.;FRO=93;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.00378994;FXX=0.0126574;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.189;QD=13.996;RBI=0.0075166;REFB=-0.00872783;REVB=0.00649119;RO=89;SAF=29;SAR=34;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473461;STB=0.526908;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0130313;OID=.;OPOS=130311398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:156:89:93:63:63:0.403846:34:29:45:44:34:29:47:46 chr3 130718472 . G A 255.02 PASS AF=0.351648;AO=31;DP=89;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=-0.0454881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7357;QD=11.2097;RBI=0.062593;REFB=-0.0065517;REVB=0.0429967;RO=55;SAF=19;SAR=12;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715113;STB=0.545953;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.022149;OID=.;OPOS=130718472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:55:59:31:32:0.351648:12:19:37:18:13:19:39:20 chr3 130852185 . TG CA 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278088;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=309.315;QD=62.3509;RBI=0.030391;REFB=0;REVB=0.012259;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.04035e-05;OID=.;OPOS=130852185;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr3 130947435 . A T 498.92 PASS AF=0.566265;AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00699614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.182;QD=24.0442;RBI=0.0115964;REFB=-0.0368336;REVB=-0.0092483;RO=36;SAF=25;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252823;STB=0.513869;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0229484;OID=.;OPOS=130947435;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:36:36:47:47:0.566265:22:25:18:18:22:25:18:18 chr3 130992385 . T C 401.55 PASS AF=0.424242;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00674311;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.995;QD=16.2242;RBI=0.0159111;REFB=-0.0184489;REVB=-0.0144116;RO=56;SAF=29;SAR=13;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240055;STB=0.631328;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0251604;OID=.;OPOS=130992385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:56:57:42:42:0.424242:13:29:26:30:13:29:27:30 chr3 131068497 . C T 473.13 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00163617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.667;QD=17.5233;RBI=0.0166644;REFB=0.00641515;REVB=-0.0165839;RO=57;SAF=31;SAR=20;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795091;STB=0.544248;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.00745956;OID=.;OPOS=131068497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:57:57:51:51:0.472222:20:31:30:27:20:31:30:27 chr3 131068509 . A G 525.46 PASS AF=0.490909;AO=52;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.0216145;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.72;QD=19.1075;RBI=0.0277444;REFB=-0.0309479;REVB=0.0173944;RO=34;SAF=30;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990731;STB=0.509391;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0169405;OID=.;OPOS=131068509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:34:54:52:54:0.490909:22:30:15:19:24:30:31:23 chr3 131136797 . T C 1018.13 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0421701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.382;QD=56.5627;RBI=0.0537019;REFB=-0.0252913;REVB=0.0332502;RO=1;SAF=27;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171877;STB=0.503344;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.000451355;OID=.;OPOS=131136797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:72:1:2:70:70:0.972222:43:27:1:0:43:27:1:1 chr3 131947937 . A G 1453.48 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0496829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5131;QD=63.1947;RBI=0.0528959;REFB=0;REVB=-0.0181545;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454251;OID=.;OPOS=131947937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:46:46:0:0:46:46:0:0 chr3 132068831 . C T 143.0 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0199164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.494;QD=10.7925;RBI=0.0200726;REFB=0.000625503;REVB=0.0024997;RO=35;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786777;STB=0.546384;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00140066;OID=.;OPOS=132068831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:11:7:16:19:11:7:16:19 chr3 132075554 . T C 444.66 PASS AF=0.42735;AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=-0.00251974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.918;QD=15.2021;RBI=0.0115685;REFB=-0.0020923;REVB=-0.0112908;RO=67;SAF=27;SAR=23;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154123;STB=0.586325;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00245024;OID=.;OPOS=132075554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:67:67:50:50:0.42735:23:27:26:41:23:27:26:41 chr3 132075707 . A G 65.77 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0180026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4057;QD=11.4383;RBI=0.0373992;REFB=-0.00279221;REVB=-0.0327811;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310035;STB=0.685308;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.000638823;OID=.;OPOS=132075707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:5:9:3:6:5:9 chr3 132218623 . G T 2046.06 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.679;QD=62.4752;RBI=0.0251393;REFB=0;REVB=0.024154;RO=0;SAF=60;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14404e-05;OID=.;OPOS=132218623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:71:60:0:0:71:60:0:0 chr3 132257747 . G A 420.86 PASS AF=0.388889;AO=49;DP=126;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.019419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.788;QD=13.3605;RBI=0.0319852;REFB=-0.0149493;REVB=-0.0254157;RO=77;SAF=21;SAR=28;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0257458;OID=.;OPOS=132257747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:77:77:49:49:0.388889:28:21:33:44:28:21:33:44 chr3 132360883 . C T 1674.29 PASS AF=1;AO=110;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.604;QD=59.7961;RBI=0.0211214;REFB=0;REVB=0.00208656;RO=1;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.82676e-06;OID=.;OPOS=132360883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:112:1:0:110:112:1:59:51:0:1:60:52:0:0 chr3 132394698 . GAAAAAT GAAAA,GAAAAT 78.91 PASS AF=0.277778,0;AO=31,32;DP=126;FAO=35,0;FDP=126;FR=.;FRO=91;FSAF=12,0;FSAR=23,0;FSRF=66;FSRR=25;FWDB=-0.126122,-0.411177;FXX=0.023254;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=19.751,9.90366;QD=2.50506;RBI=0.23606,0.418999;REFB=-0.0721891,-0.088004;REVB=-0.199544,-0.0805816;RO=42;SAF=8,32;SAR=23,0;SRF=31;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.473901,0.818397;STB=0.756833,0.5;STBP=0.003,1;TYPE=del,del;VARB=0.139424,0;OID=.,.;OPOS=132394703,132394699;OREF=AT,A;OALT=-,-;OMAPALT=GAAAA,GAAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.277778,0:31,32:126:35,0:126:91:12,0:23,0:66:25:76:42:8,32:23,0:31:11 chr3 132401600 . C T 234.7 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0122617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.2826;QD=15.3903;RBI=0.0211636;REFB=-0.000351176;REVB=0.0172497;RO=34;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102373;STB=0.558037;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00129823;OID=.;OPOS=132401600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:17:10:16:18:17:10:16:18 chr3 133099245 . G A 2399.02 PASS AF=1;AO=156;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.372;QD=61.1215;RBI=0.0102726;REFB=0;REVB=-0.00725728;RO=0;SAF=87;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.00982e-08;OID=.;OPOS=133099245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:156:157:1:69:87:0:0:70:87:0:0 chr3 133114893 . C T 501.47 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.864;QD=58.996;RBI=0.0225881;REFB=0;REVB=-0.0212249;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117412;OID=.;OPOS=133114893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr3 133167363 . G A 200.46 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00856362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7614;QD=20.0456;RBI=0.0417626;REFB=-0.00797553;REVB=0.0408752;RO=20;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113156;STB=0.574927;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00578702;OID=.;OPOS=133167363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:9:10:13:7:10:10:13:7 chr3 133329943 . G A 1149.51 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00514431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.408;QD=60.5003;RBI=0.0503373;REFB=0;REVB=0.0500737;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39522e-05;OID=.;OPOS=133329943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:28:46:0:0:30:46:0:0 chr3 133368362 . T G 1377.34 PASS AF=0.96;AO=96;DP=101;FAO=96;FDP=100;FR=.;FRO=4;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0166541;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.859;QD=55.0934;RBI=0.0369193;REFB=-0.100008;REVB=0.0329496;RO=2;SAF=59;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249404;STB=0.504826;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.000543571;OID=.;OPOS=133368362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:101:100:2:4:96:96:0.96:37:59:0:2:37:59:2:2 chr3 133465283 . A G 241.39 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.110468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5048;QD=13.5995;RBI=0.114754;REFB=-0.0176038;REVB=-0.0310708;RO=42;SAF=16;SAR=13;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714052;STB=0.540566;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0363883;OID=.;OPOS=133465283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:13:16:26:16:13:16:26:16 chr3 133474328 . G A 295.88 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0282763;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.149;QD=15.3705;RBI=0.0289892;REFB=0.00113434;REVB=0.00638949;RO=43;SAF=13;SAR=20;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987996;STB=0.560404;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00122032;OID=.;OPOS=133474328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:44:33:33:0.428571:20:13:13:30:20:13:13:31 chr3 133483696 . T C 319.01 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00123273;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.823;QD=15.7534;RBI=0.0130131;REFB=-0.00692407;REVB=-0.0129546;RO=46;SAF=23;SAR=12;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121143;STB=0.568499;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00944517;OID=.;OPOS=133483696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:35:35:0.432099:12:23:25:21:12:23:25:21 chr3 133485133 . A G 823.32 PASS AF=1;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570628;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9833;QD=57.7769;RBI=0.065143;REFB=0;REVB=0.0314238;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150248;OID=.;OPOS=133485133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:57:0:0:57:57:1:28:29:0:0:28:29:0:0 chr3 133494354 . C T 253.19 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.010214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.287;QD=19.1084;RBI=0.0227669;REFB=-0.0123194;REVB=-0.0203472;RO=25;SAF=6;SAR=21;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361099;STB=0.696525;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0195031;OID=.;OPOS=133494354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:25:26:27:27:0.509434:21:6:15:10:21:6:15:11 chr3 133524717 . G C 600.23 PASS AF=0.363184;AO=72;DP=201;FAO=73;FDP=201;FR=.;FRO=128;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=60;FSRR=68;FWDB=-5.05466e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.9706;QD=11.9448;RBI=0.00665537;REFB=-0.020114;REVB=-0.00665517;RO=128;SAF=50;SAR=22;SRF=60;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263255;STB=0.652687;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0261178;OID=.;OPOS=133524717;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:128:128:72:73:0.363184:22:50:60:68:22:51:60:68 chr3 133547245 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0375163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0265;QD=14.9783;RBI=0.0390954;REFB=-0.00939835;REVB=-0.0109988;RO=11;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20973;STB=0.622399;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0138767;OID=.;OPOS=133547245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:6:4:7:4:6:4:7:4 chr3 133547692 . G A 489.39 PASS AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0411142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.265;QD=18.2951;RBI=0.0413062;REFB=-0.0192799;REVB=0.0039781;RO=55;SAF=26;SAR=26;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059007;STB=0.532698;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0189224;OID=.;OPOS=133547692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:55:55:52:52:0.485981:26:26:31:24:26:26:31:24 chr3 133652712 . A G 332.77 PASS AF=0.389474;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=95;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.0263436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3825;QD=14.0113;RBI=0.0978662;REFB=-0.0030677;REVB=-0.0942539;RO=54;SAF=27;SAR=10;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144582;STB=0.611587;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00305623;OID=.;OPOS=133652712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:54:58:37:37:0.389474:10:27:33:21:10:27:33:25 chr3 133666209 . C T 433.63 PASS AF=0.465347;AO=46;DP=102;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0110262;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.281;QD=17.1733;RBI=0.0113974;REFB=-0.00613155;REVB=0.00288488;RO=55;SAF=28;SAR=18;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116924;STB=0.564175;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00738456;OID=.;OPOS=133666209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:55:54:46:47:0.465347:18:28:27:28:18:29:27:27 chr3 133670073 . T C 268.96 PASS AF=0.510204;AO=23;DP=47;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0207906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.473;QD=21.9556;RBI=0.051534;REFB=-0.0216704;REVB=0.047154;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560942;STB=0.511619;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0160324;OID=.;OPOS=133670073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:49:24:24:23:25:0.510204:12:11:10:14:14:11:10:14 chr3 133698349 . C T 990.25 PASS AF=0.933333;AO=70;DP=75;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0206061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.66;QD=52.8131;RBI=0.0309881;REFB=-0.0729677;REVB=0.0231441;RO=5;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628954;STB=0.533324;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00341901;OID=.;OPOS=133698349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:75:75:5:5:70:70:0.933333:35:35:0:5:35:35:0:5 chr3 133941320 . C T 356.14 PASS AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00118213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4955;QD=16.5646;RBI=0.00977013;REFB=0.0100387;REVB=0.00969836;RO=48;SAF=19;SAR=19;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828276;STB=0.546487;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.0103378;OID=.;OPOS=133941320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:19:19:20:28:19:19:20:28 chr3 134075522 . A G 292.42 PASS AF=0.330435;AO=38;DP=115;FAO=38;FDP=115;FR=.;FRO=77;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=-0.0124124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.678;QD=10.171;RBI=0.0233291;REFB=-0.0128147;REVB=-0.019753;RO=77;SAF=13;SAR=25;SRF=50;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346412;STB=0.699588;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0277278;OID=.;OPOS=134075522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:77:77:38:38:0.330435:25:13:50:27:25:13:50:27 chr3 134077470 . C G 657.78 PASS AF=0.458065;AO=71;DP=155;FAO=71;FDP=155;FR=.;FRO=84;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.0134513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.334;QD=16.9748;RBI=0.0191234;REFB=-0.0055334;REVB=0.0135928;RO=83;SAF=42;SAR=29;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960376;STB=0.550373;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00838655;OID=.;OPOS=134077470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:83:84:71:71:0.458065:29:42:41:42:29:42:42:42 chr3 134086356 . C G 407.16 PASS AF=0.56338;AO=38;DP=69;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0568853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8342;QD=22.9387;RBI=0.0610019;REFB=-0.00826352;REVB=0.0220293;RO=31;SAF=22;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782521;STB=0.540193;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00820933;OID=.;OPOS=134086356;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:31:31:38:40:0.56338:16:22:15:16:17:23:15:16 chr3 134201651 . T C 289.19 PASS AF=0.516667;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0651158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.206;QD=19.2794;RBI=0.0654574;REFB=-0.02367;REVB=0.00667871;RO=28;SAF=18;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119095;STB=0.564314;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0261899;OID=.;OPOS=134201651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:29:30:31:0.516667:12:18:13:15:12:19:14:15 chr3 134225969 . T C 335.77 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0431549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8325;QD=14.5987;RBI=0.045722;REFB=-0.000917827;REVB=-0.0151046;RO=55;SAF=25;SAR=12;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184708;STB=0.605155;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00137126;OID=.;OPOS=134225969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:55:55:37:37:0.402174:12:25:28:27:12:25:28:27 chr3 134278270 . C T 63.36 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00682789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.786;QD=8.73882;RBI=0.00684456;REFB=-0.005188;REVB=0.000477378;RO=19;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452536;STB=0.788843;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00701979;OID=.;OPOS=134278270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:19:20:9:9:0.310345:7:2:12:7:7:2:13:7 chr3 134280395 . T A 920.06 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.091;QD=58.4167;RBI=0.0185045;REFB=0;REVB=0.00547062;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13883e-05;OID=.;OPOS=134280395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0 chr3 134322163 . C A 844.95 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00105014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.469;QD=57.2845;RBI=0.00202492;REFB=0;REVB=-0.00173133;RO=0;SAF=18;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.91269e-06;OID=.;OPOS=134322163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:59:0:0:56:59:1:38:18:0:0:41:18:0:0 chr3 134322742 . A G 1030.0 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0117942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.067;QD=58.0281;RBI=0.0179271;REFB=0.0552199;REVB=-0.013501;RO=1;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126076;STB=0.506665;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.000820094;OID=.;OPOS=134322742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:37:33:0:1:37:33:0:1 chr3 134322916 . G A 173.69 PASS AF=0.514286;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0122811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.875;QD=19.8503;RBI=0.0124149;REFB=-0.0168674;REVB=0.00181743;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510626;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0190792;OID=.;OPOS=134322916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:17:17:17:18:0.514286:11:6:6:11:12:6:6:11 chr3 134323156 . A G 1018.1 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00815949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.6062;QD=56.5612;RBI=0.010506;REFB=0.00172603;REVB=-0.00661806;RO=2;SAF=37;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248698;STB=0.513154;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.000115206;OID=.;OPOS=134323156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:33:37:2:0:33:37:2:0 chr3 134499419 . G A 923.24 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00871363;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5012;QD=58.6185;RBI=0.0416135;REFB=0;REVB=-0.040691;RO=0;SAF=22;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000470031;OID=.;OPOS=134499419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:41:22:0:0:41:22:0:0 chr3 134670524 . C T 436.85 PASS AF=0.52439;AO=42;DP=81;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0127785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.599;QD=21.31;RBI=0.013791;REFB=-0.0157988;REVB=0.00518682;RO=36;SAF=18;SAR=24;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17479;STB=0.582026;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0184681;OID=.;OPOS=134670524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:36:39:42:43:0.52439:24:18:23:13:24:19:24:15 chr3 134898742 . C T 2894.64 PASS AF=1;AO=184;DP=186;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226894;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.003;QD=62.5869;RBI=0.0260568;REFB=-0.031057;REVB=0.0259578;RO=1;SAF=98;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00550418;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104706;OID=.;OPOS=134898742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:186:185:1:0:184:185:1:86:98:0:1:87:98:0:0 chr3 135720917 . C G 376.44 PASS AF=0.425532;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0073548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.661;QD=16.0185;RBI=0.0295143;REFB=-0.0122366;REVB=0.0285832;RO=54;SAF=21;SAR=19;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119518;STB=0.567234;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0102045;OID=.;OPOS=135720917;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:54:40:40:0.425532:19:21:22:32:19:21:22:32 chr3 136573440 . A G 834.37 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00726707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9353;QD=57.5429;RBI=0.0265699;REFB=0;REVB=0.0255567;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195083;OID=.;OPOS=136573440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0 chr3 136574501 . A G 1137.38 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0814718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5517;QD=59.0846;RBI=0.0823618;REFB=-0.173628;REVB=-0.012075;RO=1;SAF=41;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114027;STB=0.506023;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00298673;OID=.;OPOS=136574501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:35:41:1:0:35:41:1:0 chr3 136574578 . T TTAA 617.01 PASS AF=1;AO=40;DP=49;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00494242;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=3;MLLD=279.432;QD=61.7014;RBI=0.0160313;REFB=0;REVB=0.0152504;RO=9;SAF=19;SAR=21;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140789;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.42447e-05;OID=.;OPOS=136574579;OREF=-;OALT=TAA;OMAPALT=TTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:40:49:40:40:0:19:21:0:0:4:9:19:21:8:1 chr3 136649463 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00900203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.876;QD=56.9568;RBI=0.0219762;REFB=0;REVB=0.0200478;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69796e-05;OID=.;OPOS=136649463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr3 136730849 . AT A 102.11 PASS AF=0.606061;AO=15;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.12072;FXX=0.0294031;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.3203;QD=12.3767;RBI=0.241001;REFB=0.0347874;REVB=-0.208585;RO=12;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0.380435;SSEP=0;SSSB=-0.0913102;STB=0.545409;STBP=0.512;TYPE=del;VARB=-0.00100477;OID=.;OPOS=136730850;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.606061:15:34:20:33:13:10:10:8:5:50:12:7:8:7:5 chr3 137786442 . T C 439.35 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00802442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.083;QD=56.6908;RBI=0.0327479;REFB=0;REVB=0.0317496;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139398;OID=.;OPOS=137786442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:13:17:0:0:14:17:0:0 chr3 137787047 . C T 750.43 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294827;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.403;QD=63.8661;RBI=0.0311322;REFB=0;REVB=0.00999947;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38737e-05;OID=.;OPOS=137787047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0 chr3 137787192 . T C 868.11 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3486;QD=57.8741;RBI=0.0617528;REFB=0;REVB=0.0465732;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000726043;OID=.;OPOS=137787192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0 chr3 137787963 . T G 1859.38 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.354;QD=61.4671;RBI=0.0103025;REFB=0;REVB=0.00165577;RO=0;SAF=59;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76454e-06;OID=.;OPOS=137787963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:62:59:0:0:62:59:0:0 chr3 137796362 . G A 464.17 PASS AF=0.451327;AO=50;DP=111;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0213544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.236;QD=16.4307;RBI=0.0241331;REFB=-0.0142744;REVB=-0.0112426;RO=61;SAF=14;SAR=36;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243568;STB=0.644637;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0126798;OID=.;OPOS=137796362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:61:62:50:51:0.451327:36:14:31:30:37:14:32:30 chr3 137807259 . G A 1549.32 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.518;QD=63.8895;RBI=0.0348938;REFB=0;REVB=0.0328843;RO=0;SAF=52;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01513e-05;OID=.;OPOS=137807259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:44:52:0:0:45:52:0:0 chr3 137843106 . T C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.248;QD=60.6103;RBI=0.00653722;REFB=0;REVB=-0.00574935;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.9592e-05;OID=.;OPOS=137843106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chr3 137843476 . G T 836.92 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0300867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.994;QD=55.7943;RBI=0.0315168;REFB=0.0400395;REVB=0.0093863;RO=1;SAF=28;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165531;STB=0.508769;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00016134;OID=.;OPOS=137843476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:31:28:1:0:31:28:1:0 chr3 137850003 . A G 632.12 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.274;QD=61.6704;RBI=0.0355627;REFB=0;REVB=0.0241742;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.98456e-06;OID=.;OPOS=137850003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0 chr3 137880743 . G A 468.01 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101331;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.875;QD=58.5018;RBI=0.0290469;REFB=0;REVB=-0.0272221;RO=0;SAF=26;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222053;OID=.;OPOS=137880743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:6:26:0:0:6:26:0:0 chr3 137881265 . T A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.266;QD=51.1846;RBI=0.042411;REFB=0;REVB=0.00603635;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253162;OID=.;OPOS=137881265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0 chr3 138033181 . C T 278.7 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0580507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.258;QD=21.8584;RBI=0.0599436;REFB=-0.0434871;REVB=0.014945;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111191;STB=0.561753;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0346383;OID=.;OPOS=138033181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:16:12:13:10:16:12:13:10 chr3 138121692 . C G 414.4 PASS AF=0.47191;AO=41;DP=90;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.0276384;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1162;QD=18.6247;RBI=0.0318377;REFB=-0.001184;REVB=-0.0158039;RO=47;SAF=20;SAR=21;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143728;STB=0.585067;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000649307;OID=.;OPOS=138121692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:47:47:41:42:0.47191:21:20:30:17:22:20:30:17 chr3 138122781 . A G 720.76 PASS AF=0.526316;AO=70;DP=133;FAO=70;FDP=133;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.00209516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.733;QD=21.6769;RBI=0.00370233;REFB=-0.0244832;REVB=-0.00305247;RO=62;SAF=31;SAR=39;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767801;STB=0.54597;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0242465;OID=.;OPOS=138122781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:63:70:70:0.526316:39:31:33:29:39:31:34:29 chr3 138187568 . C T 3953.77 PASS AF=0.984733;AO=258;DP=262;FAO=258;FDP=262;FR=.;FRO=4;FSAF=105;FSAR=153;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00419593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.747;QD=60.3629;RBI=0.00619828;REFB=-0.165408;REVB=-0.00456211;RO=3;SAF=105;SAR=153;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00167212;STB=0.502485;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.000707793;OID=.;OPOS=138187568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:262:262:3:4:258:258:0.984733:153:105:1:2:153:105:1:3 chr3 138191232 . G A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.000547578;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.305;QD=14.6579;RBI=0.000637153;REFB=-0.0217818;REVB=-0.000325764;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660375;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0260202;OID=.;OPOS=138191232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:8:9:6:7:8:9 chr3 138191448 . A T 377.08 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.0537155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.527;QD=13.9658;RBI=0.0539045;REFB=-0.0113436;REVB=-0.00450927;RO=63;SAF=24;SAR=20;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227068;STB=0.508471;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0177562;OID=.;OPOS=138191448;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:63:64:44:44:0.407407:20:24:33:30:20:24:34:30 chr3 138218994 . T C 952.46 PASS AF=0.525424;AO=93;DP=177;FAO=93;FDP=177;FR=.;FRO=84;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=0.0166423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2096;QD=21.5246;RBI=0.0345486;REFB=-0.0342668;REVB=-0.0302761;RO=84;SAF=50;SAR=43;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073849;STB=0.540433;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0303171;OID=.;OPOS=138218994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:84:84:93:93:0.525424:43:50:38:46:43:50:38:46 chr3 138289163 . T C 164.88 PASS AF=0.377358;AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0195625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2768;QD=12.4438;RBI=0.0413079;REFB=-0.00276732;REVB=0.036382;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934425;STB=0.535474;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0104861;OID=.;OPOS=138289163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:31:33:19:20:0.377358:9:10:19:12:9:11:20:13 chr3 138289221 . C T 1377.31 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00164234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0992;QD=62.6049;RBI=0.00390833;REFB=0;REVB=0.00354651;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88004e-05;OID=.;OPOS=138289221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:39:48:0:0:39:49:0:0 chr3 138329862 . G A 1171.98 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.892;QD=60.8823;RBI=0.0271125;REFB=0;REVB=0.0233472;RO=0;SAF=48;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.89918e-05;OID=.;OPOS=138329862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:29:48:0:0:29:48:0:0 chr3 138724757 . C G 117.01 PASS AF=0.358974;AO=13;DP=38;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00946841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4652;QD=12.0007;RBI=0.0204164;REFB=-0.025595;REVB=0.0180881;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262225;STB=0.658678;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0334527;OID=.;OPOS=138724757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:24:25:13:14:0.358974:4:9:11:13:4:10:12:13 chr3 138762707 . C G 190.56 PASS AF=0.320513;AO=25;DP=78;FAO=25;FDP=78;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.0132335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.172;QD=9.77203;RBI=0.0825651;REFB=-0.00216194;REVB=-0.0814977;RO=53;SAF=17;SAR=8;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344998;STB=0.701755;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00258393;OID=.;OPOS=138762707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:53:53:25:25:0.320513:8:17:20:33:8:17:20:33 chr3 138763627 . GTGC G 1209.46 PASS AF=1;AO=65;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133778;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=310.052;QD=59.7263;RBI=0.0707851;REFB=0;REVB=0.0695094;RO=0;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.42543e-05;OID=.;OPOS=138763628;OREF=TGC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:65:77:81:81:0:52:29:0:0:7:0:45:20:0:0 chr3 139102120 . C A 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00193733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.589;QD=59.6795;RBI=0.00597064;REFB=0;REVB=0.0056476;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66404e-06;OID=.;OPOS=139102120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0 chr3 139303248 . G A 433.2 PASS AF=0.96875;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0262681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.94;QD=54.1497;RBI=0.0330577;REFB=-0.126548;REVB=0.0200699;RO=1;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251989;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000943961;OID=.;OPOS=139303248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:32:1:1:30:31:0.96875:18:12:0:1:19:12:0:1 chr3 139318241 . A T 1073.21 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.523;QD=59.6225;RBI=0.0103072;REFB=0;REVB=-0.000156348;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69863e-05;OID=.;OPOS=139318241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:72:0:0:68:72:1:33:35:0:0:35:37:0:0 chr3 139328739 . C T 289.36 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.043;QD=52.6102;RBI=0.034941;REFB=0;REVB=0.0167467;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043902;OID=.;OPOS=139328739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0 chr3 140167536 . A G 1556.39 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230227;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.146;QD=58.7316;RBI=0.0240472;REFB=-0.0495907;REVB=-0.00694423;RO=1;SAF=54;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870753;STB=0.504586;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=5.66218e-05;OID=.;OPOS=140167536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:51:54:1:0:51:54:1:0 chr3 140178485 . G A 279.88 PASS AF=0.5;AO=29;DP=61;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.000188713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.37;QD=18.0567;RBI=0.000676512;REFB=-0.00984768;REVB=-0.000649658;RO=30;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106247;STB=0.564274;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0139995;OID=.;OPOS=140178485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:31:29:31:0.5:14:15:12:18:15:16:12:19 chr3 140401693 . A G 563.76 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0666721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3935;QD=57.8215;RBI=0.0776721;REFB=0.00298135;REVB=-0.039847;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253186;STB=0.513506;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.0023425;OID=.;OPOS=140401693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:20:18:1:0:20:18:1:0 chr3 141145046 . C G 334.42 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0536084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8531;QD=16.7211;RBI=0.0555487;REFB=-0.0107593;REVB=-0.0145531;RO=44;SAF=16;SAR=20;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098901;STB=0.555525;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0125194;OID=.;OPOS=141145046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:20:16:24:20:20:16:24:20 chr3 141923506 . C T 922.17 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0624139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.25;QD=56.7489;RBI=0.0629833;REFB=-0.022548;REVB=0.00845035;RO=1;SAF=25;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185161;STB=0.509801;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=4.8056e-05;OID=.;OPOS=141923506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:39:25:1:0:39:25:1:0 chr3 141932356 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000676738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.956;QD=64.4154;RBI=0.0276011;REFB=0;REVB=-0.0275928;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.37025e-05;OID=.;OPOS=141932356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr3 142139172 . T C 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.923;QD=64.4154;RBI=0.0084026;REFB=0;REVB=-0.00482657;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.00298e-05;OID=.;OPOS=142139172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0 chr3 142168331 . C T 1767.6 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0551336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2107;QD=60.9516;RBI=0.0946168;REFB=0;REVB=0.0768936;RO=0;SAF=46;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25992e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122859;OID=.;OPOS=142168331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:70:46:0:0:70:46:0:0 chr3 142222284 . A G 1624.49 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.085;QD=60.1662;RBI=0.0418337;REFB=0;REVB=0.0263411;RO=0;SAF=48;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.16257e-05;OID=.;OPOS=142222284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:59:48:0:0:59:49:0:0 chr3 142277536 . A G 1507.23 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0873965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.502;QD=58.5333;RBI=0.0879589;REFB=-0.0385196;REVB=0.00993079;RO=1;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0087057;STB=0.504586;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000824087;OID=.;OPOS=142277536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:102:102:0.990291:54:48:0:1:54:48:0:1 chr3 142277575 . A T 1339.14 PASS AF=1;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261873;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.611;QD=62.2858;RBI=0.0264977;REFB=0;REVB=-0.00404401;RO=0;SAF=35;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.94098e-05;OID=.;OPOS=142277575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:85:86:1:50:35:0:0:51:35:0:0 chr3 142281612 . AT GC,GT 300.07 PASS AF=0.0869565,0.913043;AO=2,21;DP=23;FAO=2,21;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=2,15;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327919,0.00266412;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=131.313,237.951;QD=52.1858;RBI=0.0361452,0.00859503;REFB=0,0;REVB=0.0359961,-0.00817172;RO=0;SAF=2,15;SAR=0,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0688716,-0.00161965;OID=.,.;OPOS=142281612,142281612;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:23:23:0:0:2,21:2,21:0.0869565,0.913043:0,6:2,15:0:0:0,6:2,15:0:0 chr3 142392596 . T C,TC 411.82 PASS AF=0,0.546512;AO=4,41;DP=86;FAO=0,47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=0,30;FSAR=0,17;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00177507,0.0154679;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=200.036,20.2545;QD=19.1544;RBI=0.00440369,0.0460954;REFB=-0.00485999,0.0275223;REVB=-0.00403009,-0.0434226;RO=41;SAF=3,26;SAR=1,15;SRF=16;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.370253,0.220922;STB=0.5,0.616491;STBP=1,0.024;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.031215;OID=.,.;OPOS=142392596,142392597;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:86:86:41:39:4,41:0,47:0,0.546512:1,15:3,26:16:25:0,17:0,30:15:24 chr3 142408606 . G A 377.03 PASS AF=0.421053;AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0127817;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.049;QD=15.8748;RBI=0.0133864;REFB=0.00326431;REVB=0.003978;RO=55;SAF=21;SAR=19;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907839;STB=0.551156;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00518781;OID=.;OPOS=142408606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:55:55:40:40:0.421053:19:21:24:31:19:21:24:31 chr3 142670616 . A G 291.55 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0282213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.644;QD=19.4368;RBI=0.0284002;REFB=-0.00183948;REVB=-0.00318281;RO=28;SAF=12;SAR=19;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271364;STB=0.521725;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00178579;OID=.;OPOS=142670616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:29:31:31:0.516667:19:12:10:18:19:12:10:19 chr3 142681090 . T G 504.33 PASS AF=0.5875;AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0245114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6651;QD=25.2167;RBI=0.055348;REFB=0.00419571;REVB=-0.0496246;RO=33;SAF=26;SAR=21;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405183;STB=0.522153;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.0038375;OID=.;OPOS=142681090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:33:33:47:47:0.5875:21:26:20:13:21:26:20:13 chr3 142681642 . G A 422.54 PASS AF=0.457447;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0139051;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.527;QD=17.9805;RBI=0.0923348;REFB=-0.0117321;REVB=0.0912818;RO=48;SAF=18;SAR=25;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581972;STB=0.51793;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.014741;OID=.;OPOS=142681642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:48:51:43:43:0.457447:25:18:23:25:25:18:23:28 chr3 142730774 . T G 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1518;QD=56.9369;RBI=0.0282461;REFB=0;REVB=-0.0243625;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196516;OID=.;OPOS=142730774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0 chr3 142779294 . C T 789.25 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00889227;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.09;QD=64.4286;RBI=0.0164068;REFB=0;REVB=0.013788;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86672e-05;OID=.;OPOS=142779294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr3 143704516 . C T 729.99 PASS AF=0.458824;AO=77;DP=169;FAO=78;FDP=170;FR=.;FRO=92;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=0.0233881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.127;QD=17.1763;RBI=0.0329735;REFB=-0.0133463;REVB=-0.0232432;RO=92;SAF=36;SAR=41;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130164;STB=0.56852;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0185599;OID=.;OPOS=143704516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:92:92:77:78:0.458824:41:36:31:61:42:36:31:61 chr3 145782812 . T C 255.0 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00834652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.858;QD=22.1743;RBI=0.0271645;REFB=-0.0251509;REVB=0.0258504;RO=22;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223165;STB=0.624896;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0141786;OID=.;OPOS=145782812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:15:9:14:8:15:9:14:8 chr3 145783440 . T C 983.88 PASS AF=0.370253;AO=117;DP=316;FAO=117;FDP=316;FR=.;FRO=199;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=102;FSRR=97;FWDB=0.00650597;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.791;QD=12.4542;RBI=0.00742651;REFB=-0.00493951;REVB=0.00358127;RO=197;SAF=56;SAR=61;SRF=101;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378517;STB=0.521364;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00928448;OID=.;OPOS=145783440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:316:197:199:117:117:0.370253:61:56:101:96:61:56:102:97 chr3 145803138 . T C 117.33 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.027428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2736;QD=21.333;RBI=0.028419;REFB=0.034469;REVB=-0.00743952;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423641;STB=0.736524;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0236607;OID=.;OPOS=145803138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:8:5:9:0:8:5:9:0 chr3 145803142 . T A 79.42 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.042562;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.028;QD=15.8842;RBI=0.0434674;REFB=-0.0049795;REVB=-0.00882546;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412652;STB=0.735443;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00504896;OID=.;OPOS=145803142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:6:4:9:1:6:4:9:1 chr3 146167089 . T A 709.13 PASS AF=0.616162;AO=61;DP=99;FAO=61;FDP=99;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00514251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.958;QD=28.6519;RBI=0.0119369;REFB=-0.000803195;REVB=-0.0107724;RO=31;SAF=28;SAR=33;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657691;STB=0.504503;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.000269477;OID=.;OPOS=146167089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:31:38:61:61:0.616162:33:28:11:20:33:28:17:21 chr3 148459395 . C T 333.56 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.000728778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9289;QD=24.2589;RBI=0.0203897;REFB=0.0105732;REVB=0.0203767;RO=22;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671879;STB=0.536891;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.00688031;OID=.;OPOS=148459395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:15:18:14:8:15:18:14:8 chr3 148460467 . C A 2353.2 PASS AF=0.987421;AO=156;DP=159;FAO=157;FDP=159;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00307668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.754;QD=59.2;RBI=0.0217129;REFB=-0.0178359;REVB=0.0214938;RO=2;SAF=82;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000619123;STB=0.500281;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.000247575;OID=.;OPOS=148460467;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:159:159:2:2:156:157:0.987421:74:82:1:1:75:82:1:1 chr3 148562310 . G A 460.54 PASS AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0148427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.214;QD=23.9241;RBI=0.0183292;REFB=-0.0101656;REVB=-0.0107542;RO=33;SAF=28;SAR=16;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502929;STB=0.527626;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00788006;OID=.;OPOS=148562310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:16:28:19:14:16:28:19:14 chr3 148597612 . C T 1159.38 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204821;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.279;QD=61.0198;RBI=0.0262215;REFB=0;REVB=-0.0163722;RO=0;SAF=48;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86654e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.55342e-05;OID=.;OPOS=148597612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:28:48:0:0:28:48:0:0 chr3 148727133 . G A 185.51 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00464346;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.569;QD=17.2563;RBI=0.00583398;REFB=-0.0252681;REVB=0.00353181;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972164;STB=0.567496;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0239558;OID=.;OPOS=148727133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:23:24:19:19:0.44186:8:11:11:12:8:11:11:13 chr3 148759325 . T C 335.75 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0281209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1948;QD=19.7498;RBI=0.0292047;REFB=-0.0373869;REVB=0.00788227;RO=31;SAF=13;SAR=22;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153293;STB=0.571882;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0378387;OID=.;OPOS=148759325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:33:35:35:0.514706:22:13:17:14:22:13:17:16 chr3 148786108 . C T 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00941872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.338;QD=60.0308;RBI=0.0321769;REFB=0;REVB=-0.0307676;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.87626e-05;OID=.;OPOS=148786108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:35:37:0:0:35:37:0:0 chr3 148863151 . A G 269.93 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0189567;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.85;QD=16.6113;RBI=0.0189764;REFB=0.00343163;REVB=0.000864905;RO=35;SAF=22;SAR=8;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056365;STB=0.531785;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.00472675;OID=.;OPOS=148863151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:8:22:24:11:8:22:24:11 chr3 148916235 . T A 591.65 PASS AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00238024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2996;QD=56.3475;RBI=0.0192092;REFB=0.00501115;REVB=-0.0190612;RO=1;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199568;STB=0.503648;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.000894737;OID=.;OPOS=148916235;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:42:1:2:40:40:0.952381:23:17:0:1:23:17:1:1 chr3 149093238 . A G 951.1 PASS AF=0.985075;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.862;QD=56.782;RBI=0.024363;REFB=-0.160308;REVB=0.0219395;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.506171;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000622266;OID=.;OPOS=149093238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:67:0:1:64:66:0.985075:25:39:0:0:26:40:1:0 chr3 149459341 . A G 699.94 PASS AF=0.511111;AO=68;DP=135;FAO=69;FDP=135;FR=.;FRO=66;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=-0.00707148;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.201;QD=20.7389;RBI=0.0181349;REFB=-0.0124688;REVB=0.0166994;RO=64;SAF=40;SAR=28;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160395;STB=0.597742;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0118688;OID=.;OPOS=149459341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:64:66:68:69:0.511111:28:40:26:38:28:41:26:40 chr3 149678534 . C T 671.62 PASS AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00903656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.882;QD=52.676;RBI=0.00904531;REFB=-0.0887547;REVB=0.000397838;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507689;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00389031;OID=.;OPOS=149678534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:51:51:0:2:49:49:0.960784:16:33:0:0:16:33:1:1 chr3 150347833 . G A 445.41 PASS AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00472211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.676;QD=52.4016;RBI=0.0570077;REFB=0.0172032;REVB=-0.0568118;RO=2;SAF=10;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845856;STB=0.545425;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.00209631;OID=.;OPOS=150347833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:22:10:2:0:22:10:2:0 chr3 150658264 . G A 408.12 PASS AF=0.518987;AO=40;DP=78;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00501462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.729;QD=20.6644;RBI=0.0147261;REFB=-0.0313467;REVB=0.013846;RO=38;SAF=18;SAR=22;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672207;STB=0.53027;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.014954;OID=.;OPOS=150658264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:38:38:40:41:0.518987:22:18:20:18:22:19:20:18 chr3 151011969 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00479045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.727;QD=48.7371;RBI=0.0696755;REFB=0;REVB=-0.0695107;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00128229;OID=.;OPOS=151011969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr3 151012497 . T C 1589.75 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000105428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.671;QD=59.9906;RBI=0.0211821;REFB=0;REVB=0.0211819;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53962e-05;OID=.;OPOS=151012497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:55:51:0:0:55:51:0:0 chr3 151046308 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.634;QD=59.4352;RBI=0.0273016;REFB=0;REVB=0.0149913;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.32376e-05;OID=.;OPOS=151046308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0 chr3 151056598 . A C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.799;QD=37.4882;RBI=0.0580704;REFB=0;REVB=0.0189092;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131841;OID=.;OPOS=151056598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr3 151082923 . T C 308.32 PASS AF=0.380435;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0053507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.913;QD=13.405;RBI=0.0252912;REFB=-0.0125465;REVB=0.0247187;RO=57;SAF=21;SAR=14;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236394;STB=0.513506;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0187357;OID=.;OPOS=151082923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:57:57:35:35:0.380435:14:21:33:24:14:21:33:24 chr3 151112568 . G A 477.99 PASS AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0122681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.997;QD=22.4936;RBI=0.0298742;REFB=-0.0194391;REVB=-0.0272389;RO=38;SAF=13;SAR=33;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176439;STB=0.593001;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0167805;OID=.;OPOS=151112568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:38:39:46:46:0.541176:33:13:18:20:33:13:18:21 chr3 151143447 . G T 785.73 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00667733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.423;QD=64.1414;RBI=0.00676981;REFB=0;REVB=0.00111511;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.22721e-05;OID=.;OPOS=151143447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:31:18:0:0:31:18:0:0 chr3 151150968 . T G 447.57 PASS AF=0.5375;AO=35;DP=75;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00345732;FXX=0.0588166;HRUN=13;LEN=1;MLLD=153.253;QD=22.3786;RBI=0.0319947;REFB=-0.033687;REVB=-0.0318074;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.544417;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.000716408;OID=.;OPOS=151150968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:80:0:37:35:43:0.5375:12:23:0:0:18:25:18:19 chr3 151154666 . T C 1380.15 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123777;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.072;QD=62.7341;RBI=0.0125702;REFB=0;REVB=-0.00219139;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84973e-05;OID=.;OPOS=151154666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:43:45:0:0:43:45:0:0 chr3 151154923 . T A 422.96 PASS AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0235784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.136;QD=18.3896;RBI=0.0386232;REFB=-0.0150269;REVB=0.030591;RO=49;SAF=21;SAR=22;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768206;STB=0.542808;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0151522;OID=.;OPOS=151154923;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:49:43:43:0.467391:22:21:20:29:22:21:20:29 chr3 151155620 . G A 1047.39 PASS AF=1;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425439;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5264;QD=59.8506;RBI=0.0441144;REFB=0;REVB=0.0116662;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0035213;OID=.;OPOS=151155620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:69:70:1:30:39:0:0:31:39:0:0 chr3 151163713 . CT C 162.1 PASS AF=0.353982;AO=44;DP=120;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=16;FWDB=-0.0107287;FXX=0.0583285;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.7224;QD=5.73791;RBI=0.0619747;REFB=-0.0380799;REVB=-0.061039;RO=67;SAF=9;SAR=35;SRF=53;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.589762;STB=0.876978;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.04847;OID=.;OPOS=151163714;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.353982:44:120:40:113:73:6:34:57:16:99:67:9:35:53:14 chr3 151165678 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.648;QD=57.6807;RBI=0.0115632;REFB=0;REVB=-0.00212389;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0307e-05;OID=.;OPOS=151165678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr3 151166422 . C T 595.57 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.974;QD=61.0843;RBI=0.0341926;REFB=0;REVB=0.0246492;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116203;OID=.;OPOS=151166422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:25:12:0:0:27:12:0:0 chr3 151171439 . A C 1373.5 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0062439;FXX=0.0322546;HRUN=6;LEN=1;MLLD=184.702;QD=61.0443;RBI=0.0180421;REFB=0;REVB=0.0169272;RO=2;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459951;OID=.;OPOS=151171439;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:2:0:87:90:1:47:40:0:2:49:41:0:0 chr3 151171542 . A G 814.63 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300327;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.986;QD=57.1669;RBI=0.0370011;REFB=0;REVB=-0.021613;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165202;OID=.;OPOS=151171542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:56:57:1:32:24:0:0:33:24:0:0 chr3 151283691 . C A 1252.96 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.673;QD=60.3835;RBI=0.0326279;REFB=0;REVB=0.010372;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444679;OID=.;OPOS=151283691;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:83:0:0:80:83:1:47:33:0:0:47:36:0:0 chr3 151463421 . G T 1321.64 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.548;QD=62.1947;RBI=0.0412237;REFB=0;REVB=0.0395373;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61314e-05;OID=.;OPOS=151463421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:47:37:0:0:48:37:0:0 chr3 151545601 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.717;QD=56.9566;RBI=0.053268;REFB=0;REVB=0.000384843;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167722;OID=.;OPOS=151545601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr3 151598526 . C T 496.94 PASS AF=0.446281;AO=54;DP=122;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=46;FWDB=-0.00959772;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.373;QD=16.4279;RBI=0.0196158;REFB=-0.0144184;REVB=-0.0171074;RO=66;SAF=28;SAR=26;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211858;STB=0.612726;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0200592;OID=.;OPOS=151598526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:66:67:54:54:0.446281:26:28:20:46:26:28:21:46 chr3 152554357 . A G 2142.98 PASS AF=0.992754;AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0251396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.597;QD=62.1154;RBI=0.0252638;REFB=0.0904068;REVB=0.00250248;RO=1;SAF=54;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569375;STB=0.502994;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=3.26528e-05;OID=.;OPOS=152554357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:138:138:1:1:137:137:0.992754:83:54:0:1:83:54:0:1 chr3 152852044 . C T 182.94 PASS AF=0.513514;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00360662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.627;QD=19.7771;RBI=0.0122193;REFB=-0.00669496;REVB=-0.0116749;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28794;STB=0.668351;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0185878;OID=.;OPOS=152852044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:18:18:18:19:0.513514:11:7:13:5:12:7:13:5 chr3 152852070 . T C 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0016781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.073;QD=20.1561;RBI=0.0207287;REFB=-0.0131436;REVB=0.0206606;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208437;STB=0.616025;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0122828;OID=.;OPOS=152852070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:17:11:16:9:17:11:16:9 chr3 152852188 . T C 547.12 PASS AF=0.588235;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00108662;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.031;QD=25.747;RBI=0.00212033;REFB=0.00223594;REVB=0.00182073;RO=36;SAF=18;SAR=32;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195679;STB=0.601115;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00178343;OID=.;OPOS=152852188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:36:35:50:50:0.588235:32:18:22:14:32:18:21:14 chr3 152885599 . A T 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.263;QD=60.6103;RBI=0.0300875;REFB=0;REVB=0.0177018;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38313e-05;OID=.;OPOS=152885599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr3 153202348 . G A 283.66 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0145667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.611;QD=19.9056;RBI=0.0247632;REFB=-0.015868;REVB=0.0200256;RO=27;SAF=13;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225501;STB=0.512536;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0152424;OID=.;OPOS=153202348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:17:13:11:16:17:13:11:16 chr3 153725166 . G A 375.42 PASS AF=0.378151;AO=45;DP=119;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.0384461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.936;QD=12.6193;RBI=0.04302;REFB=-0.0160865;REVB=-0.0193034;RO=74;SAF=23;SAR=22;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174077;STB=0.509902;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0243091;OID=.;OPOS=153725166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:74:74:45:45:0.378151:22:23:39:35:22:23:39:35 chr3 153725172 . C T 368.35 PASS AF=0.357143;AO=45;DP=125;FAO=45;FDP=126;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.0207335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8332;QD=11.6936;RBI=0.0392259;REFB=-0.0012949;REVB=-0.0332985;RO=76;SAF=23;SAR=22;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00225605;STB=0.504763;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00297094;OID=.;OPOS=153725172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:76:81:45:45:0.357143:22:23:39:37:22:23:42:39 chr3 153725251 . T C 560.58 PASS AF=0.354497;AO=65;DP=185;FAO=67;FDP=189;FR=.;FRO=122;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=72;FSRR=50;FWDB=-0.0161659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9366;QD=11.8642;RBI=0.0243797;REFB=0.00156894;REVB=-0.0182492;RO=120;SAF=31;SAR=34;SRF=70;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120564;STB=0.562895;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00388315;OID=.;OPOS=153725251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:189:120:122:65:67:0.354497:34:31:70:50:34:33:72:50 chr3 153839866 . G C 2648.12 PASS AF=0.936842;AO=177;DP=190;FAO=178;FDP=190;FR=.;FRO=12;FSAF=105;FSAR=73;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0218283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.963;QD=55.7499;RBI=0.0239342;REFB=-0.0479961;REVB=0.00981703;RO=10;SAF=105;SAR=72;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011266;STB=0.50502;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0017215;OID=.;OPOS=153839866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:190:190:10:12:177:178:0.936842:72:105:7:3:73:105:8:4 chr3 153839959 . CT TC 563.56 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0218398;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=63.9605;QD=57.8013;RBI=0.0222745;REFB=-0.0598919;REVB=0.00437925;RO=1;SAF=13;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346745;STB=0.518509;STBP=0.268;TYPE=mnp;VARB=0.00693207;OID=.;OPOS=153839959;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:25:13:1:0:25:13:1:0 chr3 154018887 . G C 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.014551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.98;QD=15.6452;RBI=0.016406;REFB=-0.00217802;REVB=-0.00757811;RO=29;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122984;STB=0.570305;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00179205;OID=.;OPOS=154018887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:14:8:14:15:14:8:14:15 chr3 155093577 . G C 222.02 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00468657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.472;QD=14.5588;RBI=0.0314465;REFB=-0.00190502;REVB=0.0310953;RO=35;SAF=10;SAR=16;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141102;STB=0.508015;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00221009;OID=.;OPOS=155093577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:16:10:13:22:16:10:13:22 chr3 155241740 . A G 924.81 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.307;QD=57.8003;RBI=0.0172024;REFB=0;REVB=-0.00295257;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.65239e-06;OID=.;OPOS=155241740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:29:33:0:0:30:34:0:0 chr3 155314034 . A G,T 1510.08 PASS AF=0.971429,0.0285714;AO=99,6;DP=107;FAO=102,3;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52,0;FSAR=50,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340098,-0.0154968;FXX=0.0186898;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.138,19.8311;QD=57.5267;RBI=0.0480173,0.089752;REFB=0,0;REVB=0.0338968,-0.088404;RO=0;SAF=52,0;SAR=47,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.28099e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00019743,0.24621;OID=.,.;OPOS=155314034,155314034;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:107:105:0:0:99,6:102,3:0.971429,0.0285714:47,6:52,0:0:0:50,3:52,0:0:0 chr3 155481609 . G A 901.75 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4221;QD=58.1774;RBI=0.0183467;REFB=0;REVB=0.0110481;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.46598e-05;OID=.;OPOS=155481609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:28:33:0:0:29:33:0:0 chr3 155485302 . C T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.314;QD=50.4134;RBI=0.0287047;REFB=0;REVB=0.0103491;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031383;OID=.;OPOS=155485302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0 chr3 156177675 . A G 535.47 PASS AF=0.456;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0129555;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.681;QD=17.1352;RBI=0.0174124;REFB=-0.000621573;REVB=0.0116339;RO=68;SAF=24;SAR=33;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106454;STB=0.559301;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.000786405;OID=.;OPOS=156177675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:68:68:57:57:0.456:33:24:36:32:33:24:36:32 chr3 156234108 . A G 565.87 PASS AF=0.392857;AO=66;DP=164;FAO=66;FDP=168;FR=.;FRO=102;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=65;FWDB=-0.0874165;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.6708;QD=13.4732;RBI=0.10127;REFB=0.00165954;REVB=-0.0511267;RO=98;SAF=20;SAR=46;SRF=34;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537552;STB=0.541499;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.00406345;OID=.;OPOS=156234108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:98:102:66:66:0.392857:46:20:34:64:46:20:37:65 chr3 156266765 . A G 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00478712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.296;QD=11.8143;RBI=0.0181608;REFB=-0.0188589;REVB=-0.0175185;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194513;STB=0.615207;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0296418;OID=.;OPOS=156266765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:5:8:10:13:5:8:10:13 chr3 156544584 . C T 1936.26 PASS AF=1;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054789;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.0254;QD=61.9603;RBI=0.062355;REFB=0;REVB=0.029771;RO=0;SAF=60;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343094;OID=.;OPOS=156544584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:126:125:0:0:125:125:1:65:60:0:0:65:60:0:0 chr3 156877276 . CAA C 126.35 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0278123;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=210.89;QD=12.9591;RBI=0.0282038;REFB=-0.0197867;REVB=0.00468249;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389249;STB=0.52223;STBP=0.801;TYPE=del;VARB=0.016458;OID=.;OPOS=156877277;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.461538:18:39:18:39:21:7:11:9:12:99:21:7:11:9:12 chr3 156983414 . T C 501.87 PASS AF=0.461538;AO=54;DP=116;FAO=54;FDP=117;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.00912052;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.934;QD=17.1578;RBI=0.0106472;REFB=-0.0205995;REVB=-0.00549347;RO=62;SAF=26;SAR=28;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912689;STB=0.545785;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0189089;OID=.;OPOS=156983414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:62:63:54:54:0.461538:28:26:24:38:28:26:25:38 chr3 157081324 . A G 564.12 PASS AF=0.54902;AO=56;DP=103;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.00760922;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8692;QD=22.1222;RBI=0.00864764;REFB=-0.00413433;REVB=0.0041087;RO=47;SAF=31;SAR=25;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127143;STB=0.56571;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0035245;OID=.;OPOS=157081324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:47:46:56:56:0.54902:25:31:33:14:25:31:32:14 chr3 157099109 . A G 508.21 PASS AF=0.477876;AO=54;DP=114;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0253182;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.767;QD=17.9898;RBI=0.0254509;REFB=0.0100088;REVB=-0.00259495;RO=59;SAF=21;SAR=33;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989496;STB=0.554974;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.0126687;OID=.;OPOS=157099109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:59:59:54:54:0.477876:33:21:29:30:33:21:29:30 chr3 157131788 . A C 677.33 PASS AF=0.48227;AO=68;DP=142;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.00244865;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.333;QD=19.215;RBI=0.0173788;REFB=-0.019807;REVB=0.0172054;RO=72;SAF=30;SAR=38;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550783;STB=0.53419;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0206246;OID=.;OPOS=157131788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:72:73:68:68:0.48227:38:30:36:36:38:30:37:36 chr3 157155314 . C A 1549.53 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00851392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.978;QD=63.898;RBI=0.0157489;REFB=0;REVB=-0.0132492;RO=0;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.86357e-06;OID=.;OPOS=157155314;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:36:60:0:0:37:60:0:0 chr3 157161198 . A AT,T 631.15 PASS AF=0.857143,0.142857;AO=29,11;DP=44;FAO=36,6;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=17,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366512,0.031441;FXX=0.0232504;HRUN=0,8;LEN=1,1;MLLD=95.4714,89.9085;QD=60.1094;RBI=0.0418373,0.0400822;REFB=0,0;REVB=-0.0201753,-0.0248607;RO=2;SAF=15,3;SAR=14,8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00207078,-0.0754271;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00159001,0.0410336;OID=.,.;OPOS=157161199,157161198;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:18:44:42:2:0:29,11:36,6:0.857143,0.142857:14,8:15,3:1:1:17,6:19,0:0:0 chr3 157815088 . G A 1734.82 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024166;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.229;QD=60.871;RBI=0.0344011;REFB=0;REVB=0.0244835;RO=0;SAF=69;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138838;OID=.;OPOS=157815088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:45:69:0:0:45:69:0:0 chr3 158187189 . G A 828.05 PASS AF=0.535948;AO=81;DP=152;FAO=82;FDP=153;FR=.;FRO=71;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=19;FSRR=52;FWDB=0.0080961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.082;QD=21.6484;RBI=0.00834945;REFB=0.00572399;REVB=0.00204118;RO=71;SAF=42;SAR=39;SRF=19;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213295;STB=0.618042;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00696275;OID=.;OPOS=158187189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:71:71:81:82:0.535948:39:42:19:52:39:43:19:52 chr3 158320597 . T C 200.46 PASS AF=0.313253;AO=26;DP=83;FAO=26;FDP=83;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=0.0104785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.304;QD=9.66073;RBI=0.0208387;REFB=-0.00605979;REVB=-0.0180125;RO=56;SAF=11;SAR=15;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331016;STB=0.68474;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0141494;OID=.;OPOS=158320597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:56:57:26:26:0.313253:15:11:40:16:15:11:40:17 chr3 158320703 . C A 236.45 PASS AF=0.345238;AO=29;DP=84;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.00329793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.447;QD=11.2597;RBI=0.0206019;REFB=-0.00318928;REVB=-0.0203362;RO=55;SAF=12;SAR=17;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18848;STB=0.609046;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00506965;OID=.;OPOS=158320703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:55:55:29:29:0.345238:17:12:32:23:17:12:32:23 chr3 158362441 . T C 810.13 PASS AF=0.440415;AO=84;DP=193;FAO=85;FDP=193;FR=.;FRO=108;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=57;FWDB=-0.00613836;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.521;QD=16.7902;RBI=0.0219595;REFB=-0.00183736;REVB=-0.0210841;RO=103;SAF=43;SAR=41;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699378;STB=0.525399;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00362068;OID=.;OPOS=158362441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:103:108:84:85:0.440415:41:43:52:51:41:44:51:57 chr3 158366900 . G A 356.14 PASS AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0228285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.764;QD=16.5646;RBI=0.0228856;REFB=-0.00486041;REVB=-0.00161466;RO=48;SAF=19;SAR=19;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12439;STB=0.569731;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00345038;OID=.;OPOS=158366900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:19:19:30:18:19:19:30:18 chr3 158388780 . T C 264.01 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00333013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.433;QD=15.3051;RBI=0.0083866;REFB=0.00542652;REVB=-0.00769709;RO=39;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189104;STB=0.606865;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00712701;OID=.;OPOS=158388780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:12:18:16:23:12:18:16:23 chr3 158952312 . G A 1276.46 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435319;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.798;QD=60.784;RBI=0.0188951;REFB=0;REVB=0.0183868;RO=1;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869117;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210461;OID=.;OPOS=158952312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:84:84:1:0:83:84:1:54:29:0:1:55:29:0:0 chr3 158952315 . C A 1268.67 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00564095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.16;QD=60.4127;RBI=0.00825563;REFB=-0.0257633;REVB=0.00602787;RO=1;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869117;STB=0.504586;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=5.02508e-05;OID=.;OPOS=158952315;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:54:29:0:1:54:29:0:1 chr3 159744438 . C T 964.9 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9752;QD=58.4788;RBI=0.0690781;REFB=0;REVB=0.0308528;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000966229;OID=.;OPOS=159744438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:66:0:0:60:66:1:21:39:0:0:23:43:0:0 chr3 159744440 . C T 989.9 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.277;QD=59.0985;RBI=0.049143;REFB=0;REVB=0.0386276;RO=0;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210635;OID=.;OPOS=159744440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:23:43:0:0:23:44:0:0 chr3 160143943 . A G 386.95 PASS AF=0.425743;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00435487;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=330.429;QD=15.3247;RBI=0.00950289;REFB=1.73166e-05;REVB=-0.00844631;RO=57;SAF=26;SAR=17;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086313;STB=0.511021;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-2.54996e-05;OID=.;OPOS=160143943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:58:43:43:0.425743:17:26:34:23:17:26:34:24 chr3 160414759 . G A 2149.73 PASS AF=0.992806;AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=139;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0170195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.355;QD=61.8626;RBI=0.0304629;REFB=-0.00857474;REVB=-0.0252651;RO=1;SAF=63;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748644;STB=0.503936;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=9.07438e-05;OID=.;OPOS=160414759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:138:139:1:1:137:138:0.992806:74:63:1:0:75:63:1:0 chr3 160436316 . A G 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9127;QD=57.8841;RBI=0.0447937;REFB=0;REVB=0.0427034;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150342;OID=.;OPOS=160436316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0 chr3 160939776 . T A 141.68 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00109958;FXX=0;HRUN=30;LEN=1;MLLD=75.9721;QD=24.6402;RBI=0.0814863;REFB=-0.0104006;REVB=0.0814789;RO=7;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188936;STB=0.621152;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0277003;OID=.;OPOS=160939776;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:23:23:7:8:15:15:0.652174:7:8:6:1:7:8:7:1 chr3 160967354 . G A 1255.36 PASS AF=1;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00422018;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0531;QD=61.237;RBI=0.0358166;REFB=0;REVB=-0.0355671;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020929;OID=.;OPOS=160967354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:81:82:1:40:41:0:0:41:41:0:0 chr3 161062631 . T C 431.01 PASS AF=0.44898;AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=0.00270351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.863;QD=17.5923;RBI=0.00911955;REFB=-0.0153425;REVB=0.0087096;RO=54;SAF=23;SAR=21;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200011;STB=0.61122;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0222318;OID=.;OPOS=161062631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:54:44:44:0.44898:21:23:39:15:21:23:39:15 chr3 161062848 . G A 302.79 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00412538;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.67;QD=16.8218;RBI=0.00873619;REFB=-0.00778724;REVB=0.00770079;RO=39;SAF=14;SAR=19;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158988;STB=0.589217;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00695477;OID=.;OPOS=161062848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:19:14:23:16:19:14:23:16 chr3 164714532 . C T 1558.29 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266505;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.988;QD=59.9342;RBI=0.0108478;REFB=0;REVB=-0.0105153;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.09592e-05;OID=.;OPOS=164714532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:52:52:0:0:52:52:0:0 chr3 164730804 . T C 410.42 PASS AF=0.396694;AO=48;DP=121;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=0.0133212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9443;QD=13.5677;RBI=0.0158244;REFB=-0.00253673;REVB=0.00854151;RO=73;SAF=21;SAR=27;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590034;STB=0.53332;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00515625;OID=.;OPOS=164730804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:73:73:48:48:0.396694:27:21:28:45:27:21:28:45 chr3 164764719 . C A 1069.11 PASS AF=0.466102;AO=109;DP=235;FAO=110;FDP=236;FR=.;FRO=126;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=54;FSRR=72;FWDB=0.00286053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.625;QD=18.1205;RBI=0.00340817;REFB=-0.00909072;REVB=-0.00185284;RO=125;SAF=52;SAR=57;SRF=53;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515717;STB=0.52852;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00935555;OID=.;OPOS=164764719;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:236:125:126:109:110:0.466102:57:52:53:72:57:53:54:72 chr3 164773057 . G A 406.44 PASS AF=0.488095;AO=38;DP=85;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00098152;FXX=0.0344788;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.913;QD=19.3543;RBI=0.0111562;REFB=-0.0223532;REVB=-0.0111129;RO=23;SAF=22;SAR=16;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115839;STB=0.560156;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0205139;OID=.;OPOS=164773057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:23:43:38:41:0.488095:16:22:17:6:19:22:18:25 chr3 164783165 . T C 700.85 PASS AF=0.469799;AO=69;DP=149;FAO=70;FDP=149;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0109751;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.557;QD=18.8147;RBI=0.0117975;REFB=-0.00974966;REVB=0.0043276;RO=79;SAF=31;SAR=38;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185101;STB=0.513651;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00886557;OID=.;OPOS=164783165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:79:79:69:70:0.469799:38:31:37:42:39:31:37:42 chr3 164793758 . C A 1349.57 PASS AF=0.436747;AO=138;DP=326;FAO=145;FDP=332;FR=.;FRO=187;FSAF=71;FSAR=74;FSRF=94;FSRR=93;FWDB=-0.000427101;FXX=0.00300291;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.13;QD=16.2599;RBI=0.00431495;REFB=-0.012333;REVB=-0.00429376;RO=187;SAF=68;SAR=70;SRF=94;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102572;STB=0.507333;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0152689;OID=.;OPOS=164793758;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:332:187:187:138:145:0.436747:70:68:94:93:74:71:94:93 chr3 165951073 . C A 994.23 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000467119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.771;QD=57.6363;RBI=0.00655119;REFB=0.0241471;REVB=-0.00653451;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-3.74735e-05;OID=.;OPOS=165951073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:0:1:68:68:0.985507:35:33:0:0:35:33:0:1 chr3 166900401 . C G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8444;QD=57.6803;RBI=0.029892;REFB=0;REVB=-0.020761;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94204e-06;OID=.;OPOS=166900401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr3 166966436 . C T 4385.93 PASS AF=0.982517;AO=279;DP=285;FAO=281;FDP=286;FR=.;FRO=5;FSAF=145;FSAR=136;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0285843;FXX=0.0137926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.581;QD=61.3417;RBI=0.0286886;REFB=-0.0582254;REVB=0.00244366;RO=4;SAF=144;SAR=135;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00717698;STB=0.50203;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=3.93192e-05;OID=.;OPOS=166966436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:285:286:4:5:279:281:0.982517:135:144:1:3:136:145:2:3 chr3 167000256 . G C 332.1 PASS AF=0.961538;AO=23;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.247;QD=51.0921;RBI=0.0228166;REFB=-0.181305;REVB=0.00897782;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486633;STB=0.526294;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00128927;OID=.;OPOS=167000256;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:26:26:1:1:23:25:0.961538:9:14:0:1:9:16:0:1 chr3 167051726 . A G 1524.8 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.36;QD=60.9918;RBI=0.0160489;REFB=0;REVB=0.0010904;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00347406;OID=.;OPOS=167051726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:100:0:0:93:100:1:51:42:0:0:58:42:0:0 chr3 167077691 . T A 1008.44 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.584;QD=59.3202;RBI=0.0364574;REFB=0;REVB=0.0216409;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1842e-05;OID=.;OPOS=167077691;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:31:37:0:0 chr3 167320010 . T C 294.51 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0115545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.681;QD=15.1032;RBI=0.0230721;REFB=-0.0193888;REVB=-0.0199703;RO=45;SAF=17;SAR=16;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267715;STB=0.515142;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0282723;OID=.;OPOS=167320010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:16:17:22:23:16:17:22:23 chr3 168538993 . A G 2146.08 PASS AF=1;AO=135;DP=137;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220326;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.012;QD=63.12;RBI=0.0351369;REFB=0;REVB=0.0273709;RO=0;SAF=63;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.61757e-05;OID=.;OPOS=168538993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:137:136:0:0:135:136:1:72:63:0:0:72:64:0:0 chr3 168546914 . C T 1992.72 PASS AF=0.984848;AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00137382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.331;QD=60.3854;RBI=0.0278701;REFB=-0.0695431;REVB=0.0278362;RO=2;SAF=68;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000665869;STB=0.50035;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.000215618;OID=.;OPOS=168546914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:132:132:2:2:130:130:0.984848:62:68:1:1:62:68:1:1 chr3 169098992 . G A 103.51 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00666376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=338.426;QD=18.8207;RBI=0.0187949;REFB=-0.0228221;REVB=-0.0175739;RO=10;SAF=11;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513399;STB=0.804228;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0164963;OID=.;OPOS=169098992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:1:11:5:5:1:11:5:5 chr3 169492101 . C T 885.17 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.123;QD=58.0439;RBI=0.0225338;REFB=0;REVB=0.0212058;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104586;OID=.;OPOS=169492101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0 chr3 169514585 . A T 839.96 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00842319;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.0521;QD=55.9971;RBI=0.0581171;REFB=-0.13331;REVB=-0.0575035;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171544;STB=0.509088;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00534679;OID=.;OPOS=169514585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:1:0:32:27:1:0 chr3 169518455 . T C 707.41 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499423;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.153;QD=62.8811;RBI=0.0725393;REFB=0;REVB=0.0526091;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00457374;OID=.;OPOS=169518455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:43:45:1:19:24:0:0:20:25:0:0 chr3 169540397 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5958;QD=35.5757;RBI=0.0365985;REFB=0;REVB=0.0365985;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00344296;OID=.;OPOS=169540397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0 chr3 169558025 . C T 743.09 PASS AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0371185;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.884;QD=59.4472;RBI=0.0375807;REFB=-0.155732;REVB=0.0058759;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165072;STB=0.517234;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00188118;OID=.;OPOS=169558025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:50:1:2:48:48:0.96:28:20:0:1:28:20:0:2 chr3 169578448 . T A 287.64 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00228807;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.86;QD=15.7611;RBI=0.0252837;REFB=-0.00476867;REVB=-0.0251799;RO=41;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033538;STB=0.518931;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00551238;OID=.;OPOS=169578448;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:41:41:32:32:0.438356:19:13:18:23:19:13:18:23 chr3 169639050 . C T 458.38 PASS AF=0.517241;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0271495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8161;QD=21.0751;RBI=0.053714;REFB=-0.0258908;REVB=-0.0463475;RO=42;SAF=22;SAR=23;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11562;STB=0.563786;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0220397;OID=.;OPOS=169639050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:42:42:45:45:0.517241:23:22:15:27:23:22:15:27 chr3 169802930 . G T 1007.2 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0404521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.286;QD=59.2469;RBI=0.0405142;REFB=0;REVB=0.00224205;RO=0;SAF=24;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.08713e-05;OID=.;OPOS=169802930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:42:24:0:0:42:26:0:0 chr3 169805832 . A C 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0112535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1105;QD=10.9361;RBI=0.0339807;REFB=-0.0155807;REVB=0.0320631;RO=34;SAF=5;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254166;STB=0.651867;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0329366;OID=.;OPOS=169805832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:11:5:18:16:11:5:18:16 chr3 169894680 . G A 700.8 PASS AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00113016;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.221;QD=50.9675;RBI=0.00385412;REFB=-0.0273755;REVB=0.00368469;RO=2;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392057;STB=0.5306;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000927706;OID=.;OPOS=169894680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:55:55:2:3:52:52:0.945455:23:29:0:2:23:29:0:3 chr3 169988286 . C T 180.74 PASS AF=0.404255;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00812363;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.919;QD=15.3819;RBI=0.0109968;REFB=-0.0059683;REVB=0.00741191;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173515;STB=0.621493;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00856887;OID=.;OPOS=169988286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:28:18:19:0.404255:11:7:16:13:12:7:16:12 chr3 170078232 . C T 441.28 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266182;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.389;QD=56.9387;RBI=0.0290839;REFB=0;REVB=0.0117195;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302318;OID=.;OPOS=170078232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:19:12:0:0 chr3 170198367 . G A 185.42 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0248895;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.349;QD=13.7346;RBI=0.0249321;REFB=-0.0191954;REVB=0.00145688;RO=32;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0304659;OID=.;OPOS=170198367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:11:11:16:16:11:11:16:16 chr3 170198680 . C A 418.82 PASS AF=0.410256;AO=45;DP=116;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.0136061;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.498;QD=14.3186;RBI=0.0148212;REFB=-0.00720464;REVB=-0.00587722;RO=70;SAF=24;SAR=21;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157632;STB=0.608192;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0122916;OID=.;OPOS=170198680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:70:69:45:48:0.410256:21:24:27:43:21:27:26:43 chr3 170198898 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171587;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.497;QD=46.848;RBI=0.0232314;REFB=0;REVB=0.0156613;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135609;OID=.;OPOS=170198898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr3 170715830 . G A 724.74 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.763;QD=60.3954;RBI=0.0160289;REFB=0;REVB=0.00224985;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00305814;OID=.;OPOS=170715830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:48:0:0:43:48:1:17:26:0:0:19:29:0:0 chr3 170825905 . C G 2027.54 PASS AF=1;AO=127;DP=127;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.261;QD=62.3859;RBI=0.0428349;REFB=0;REVB=0.0266094;RO=0;SAF=63;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110169;OID=.;OPOS=170825905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:127:130:0:0:127:130:1:64:63:0:0:65:65:0:0 chr3 170843782 . C A 554.71 PASS AF=0.593023;AO=51;DP=86;FAO=51;FDP=86;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.000586089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.757;QD=25.8004;RBI=0.00271307;REFB=-0.0179192;REVB=-0.00264901;RO=35;SAF=23;SAR=28;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126343;STB=0.568803;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0176208;OID=.;OPOS=170843782;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:35:35:51:51:0.593023:28:23:10:25:28:23:10:25 chr3 170893070 . G A 250.27 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00123104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.756;QD=20.0213;RBI=0.0146666;REFB=-0.00569348;REVB=-0.0146149;RO=26;SAF=18;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224973;STB=0.627793;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00631766;OID=.;OPOS=170893070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:6:18:14:12:6:18:14:12 chr3 171065031 . G A,C 277.18 PASS AF=0.227273,0.772727;AO=3,17;DP=20;FAO=5,17;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1,2;FSAR=4,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00731503,0.12403;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=168.041,140.194;QD=50.3969;RBI=0.00753016,0.124209;REFB=0,0;REVB=0.00178706,0.00665604;RO=0;SAF=0,2;SAR=3,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.95117e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00876537,0.00194018;OID=.,.;OPOS=171065031,171065031;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:22:20:22:0:0:3,17:5,17:0.227273,0.772727:3,15:0,2:0:0:4,15:1,2:0:0 chr3 171338237 . T G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00953372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9906;QD=63.8717;RBI=0.0164604;REFB=0;REVB=0.0134184;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146593;OID=.;OPOS=171338237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr3 171395468 . A C,G 1579.84 PASS AF=0.0275229,0.963303;AO=4,102;DP=109;FAO=3,105;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=0,52;FSAR=3,53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0131622,0.0126961;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=143.736,68.4409;QD=57.9759;RBI=0.0393958,0.0219087;REFB=-0.0660474,-0.0422678;REVB=-0.037132,0.017855;RO=1;SAF=0,51;SAR=4,51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.749895,-0.00921259;STB=0.994936,0.504761;STBP=0.121,0.514;TYPE=snp,snp;VARB=0.140858,0.00179011;OID=.,.;OPOS=171395468,171395468;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:109:109:1:1:4,102:3,105:0.0275229,0.963303:4,51:0,51:1:0:3,53:0,52:1:0 chr3 171404478 . C A 1302.02 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000837976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.975;QD=62.0009;RBI=0.024092;REFB=0;REVB=0.0240774;RO=0;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34243e-05;OID=.;OPOS=171404478;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:53:31:0:0:53:31:0:0 chr3 171844787 . A T 1497.95 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363767;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.212;QD=63.0714;RBI=0.0627413;REFB=0;REVB=0.0511196;RO=0;SAF=51;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177079;OID=.;OPOS=171844787;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:95:0:0:93:95:1:42:51:0:0:43:52:0:0 chr3 171969077 . C G 215.48 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0181349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.6243;QD=13.0591;RBI=0.0181391;REFB=-0.01518;REVB=0.00039148;RO=40;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108227;STB=0.562013;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0173502;OID=.;OPOS=171969077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:11:15:19:21:11:15:19:21 chr3 172034271 . T C 460.19 PASS AF=0.464646;AO=45;DP=98;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0115494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.306;QD=18.5934;RBI=0.0122411;REFB=-0.00792897;REVB=0.00405667;RO=53;SAF=11;SAR=34;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136874;STB=0.580394;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00727682;OID=.;OPOS=172034271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:53:53:45:46:0.464646:34:11:19:34:35:11:19:34 chr3 172046861 . T C 1098.57 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0700319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.229;QD=60.1954;RBI=0.0714276;REFB=0;REVB=0.0140514;RO=0;SAF=24;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188046;OID=.;OPOS=172046861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:49:24:0:0:49:24:0:0 chr3 172115462 . TTTTT TTTAA 122.67 PASS AF=1;AO=5;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146297;FXX=0.0713776;HRUN=11;LEN=2;MLLD=18.5449;QD=37.7459;RBI=0.183426;REFB=0;REVB=0.110646;RO=3;SAF=0;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.762666;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00768054;OID=.;OPOS=172115465;OREF=TT;OALT=AA;OMAPALT=TTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:5:14:13:13:0:6:7:0:0:3:3:0:5:2:1 chr3 172118529 . T C 220.44 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0621744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.084;QD=24.4929;RBI=0.0636478;REFB=-0.00124137;REVB=-0.0136157;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107809;STB=0.559944;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.000953474;OID=.;OPOS=172118529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:5:10:11:10:5:10 chr3 172165727 . C T 347.68 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0172404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.565;QD=51.5087;RBI=0.0355793;REFB=-0.0128726;REVB=0.0311233;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343929;STB=0.518504;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00120052;OID=.;OPOS=172165727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:13:13:1:0:13:13:1:0 chr3 172165803 . A G 310.65 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.028505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.512;QD=16.3499;RBI=0.0409252;REFB=-0.0309572;REVB=-0.0293655;RO=41;SAF=21;SAR=13;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220587;STB=0.629924;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0361827;OID=.;OPOS=172165803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:42:34:34:0.447368:13:21:16:25:13:21:16:26 chr3 172166033 . G A 747.09 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5734;QD=63.5817;RBI=0.0376335;REFB=0;REVB=0.0371193;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444665;OID=.;OPOS=172166033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:19:27:0:0:19:28:0:0 chr3 172224303 . A G 138.83 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00162857;FXX=0.0243843;HRUN=7;LEN=1;MLLD=143.616;QD=13.8832;RBI=0.0221586;REFB=-0.00897231;REVB=-0.0220987;RO=18;SAF=7;SAR=7;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273127;STB=0.574908;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0121102;OID=.;OPOS=172224303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:40:18:24:14:16:0.4:7:7:14:4:8:8:15:9 chr3 172348906 . A ACCTC 474.94 PASS AF=0.784314;AO=38;DP=51;FAO=40;FDP=51;FR=.;FRO=11;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0161282;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=355.194;QD=37.25;RBI=0.0161412;REFB=-0.0124306;REVB=-0.000647095;RO=11;SAF=29;SAR=9;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06985;STB=0.523454;STBP=0.59;TYPE=ins;VARB=0.00230355;OID=.;OPOS=172348907;OREF=-;OALT=CCTC;OMAPALT=ACCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.784314:38:51:40:51:11:29:11:7:4:77:11:29:9:7:4 chr3 172428782 . T C 1264.6 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.807;QD=61.6877;RBI=0.0417623;REFB=0;REVB=0.0313963;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13083e-06;OID=.;OPOS=172428782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:82:0:0:80:82:1:50:30:0:0:52:30:0:0 chr3 172489076 . C T 1120.76 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000714177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.382;QD=58.9875;RBI=0.0301256;REFB=0.0328964;REVB=-0.0301171;RO=1;SAF=43;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108773;STB=0.505746;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.000698834;OID=.;OPOS=172489076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:32:43:1:0:32:43:1:0 chr3 172514294 . G A 823.3 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.043605;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9439;QD=55.817;RBI=0.0582149;REFB=-0.04131;REVB=0.0385692;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.000851089;OID=.;OPOS=172514294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:59:1:1:58:58:0.983051:28:30:0:1:28:30:0:1 chr3 174581888 . T C 708.14 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.712;QD=62.9453;RBI=0.0407424;REFB=0;REVB=0.014147;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118822;OID=.;OPOS=174581888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr3 174951756 . T C 1026.39 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.852;QD=59.5007;RBI=0.0254965;REFB=0;REVB=0.0179292;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25275e-05;OID=.;OPOS=174951756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0 chr3 175165079 . C T 725.84 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0198028;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.338;QD=54.7805;RBI=0.0307473;REFB=-0.125055;REVB=0.0235212;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.51219;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000711305;OID=.;OPOS=175165079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:53:53:0:1:52:52:0.981132:20:32:0:0:20:32:0:1 chr3 175189447 . G A 148.02 PASS AF=0.31746;AO=17;DP=60;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00970768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.419;QD=9.39776;RBI=0.00998646;REFB=-0.00946014;REVB=-0.00234314;RO=38;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114378;STB=0.529382;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0222805;OID=.;OPOS=175189447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:38:43:17:20:0.31746:11:6:17:21:12:8:19:24 chr3 175327309 . G A 4283.86 PASS AF=1;AO=272;DP=273;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00294549;FXX=0.00727246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.892;QD=62.7672;RBI=0.0178044;REFB=0.0389787;REVB=-0.017559;RO=0;SAF=119;SAR=153;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106012;OID=.;OPOS=175327309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:273:273:0:0:272:273:1:153:119:0:0:153:120:0:0 chr3 175345143 . C G 1394.73 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.11;QD=62.6845;RBI=0.0290441;REFB=0;REVB=0.0269416;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93412e-05;OID=.;OPOS=175345143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:45:43:0:0:45:44:0:0 chr3 175473047 . T C 1792.96 PASS AF=0.983471;AO=118;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0127866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1203;QD=59.2715;RBI=0.0239927;REFB=-0.131939;REVB=-0.0203016;RO=0;SAF=61;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03988e-08;STB=0.508473;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00179643;OID=.;OPOS=175473047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:121:121:0:2:118:119:0.983471:57:61:0:0:58:61:0:2 chr3 176765269 . T C 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.9726;QD=56.19;RBI=0.0580716;REFB=0;REVB=0.0570437;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000723222;OID=.;OPOS=176765269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr3 176838514 . C G 358.54 PASS AF=1;AO=20;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.242;QD=55.1592;RBI=0.058668;REFB=0;REVB=0.0169289;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149285;OID=.;OPOS=176838514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:20:26:1:6:14:0:0:10:16:0:0 chr3 178742690 . T C 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00352077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.459;QD=58.9626;RBI=0.0235701;REFB=0;REVB=0.0233056;RO=0;SAF=12;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99257e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7302e-05;OID=.;OPOS=178742690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:54:12:0:0:54:12:0:0 chr3 178815528 . G A 581.24 PASS AF=0.458647;AO=60;DP=132;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.0289357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9585;QD=17.4809;RBI=0.031536;REFB=-0.007945;REVB=0.0125397;RO=63;SAF=30;SAR=30;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734591;STB=0.525658;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00843298;OID=.;OPOS=178815528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:63:72:60:61:0.458647:30:30:32:31:31:30:32:40 chr3 178976777 . C T 526.21 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0284433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5672;QD=56.8873;RBI=0.028579;REFB=-0.121645;REVB=-0.00278184;RO=1;SAF=21;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021769;STB=0.511621;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00489917;OID=.;OPOS=178976777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:15:21:1:0:15:21:1:0 chr3 179096508 . C G 817.05 PASS AF=0.909091;AO=60;DP=69;FAO=60;FDP=66;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0175167;FXX=0.043472;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9561;QD=49.518;RBI=0.0316705;REFB=0.00448724;REVB=0.0263853;RO=6;SAF=33;SAR=27;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372656;STB=0.51981;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00047825;OID=.;OPOS=179096508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:69:66:6:6:60:60:0.909091:27:33:2:4:27:33:2:4 chr3 179114529 . GATTA G 330.25 PASS AF=0.83871;AO=25;DP=28;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0120035;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=4;MLLD=266.593;QD=42.613;RBI=0.0460914;REFB=-0.031847;REVB=0.0445009;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503814;STBP=0.964;TYPE=del;VARB=0.00372826;OID=.;OPOS=179114530;OREF=ATTA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.83871:25:28:26:31:5:15:11:3:2:27:0:15:10:0:0 chr3 179118998 . C T 390.96 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0258964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.738;QD=16.6367;RBI=0.0279433;REFB=-0.00317716;REVB=-0.0104978;RO=53;SAF=20;SAR=21;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149895;STB=0.583902;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00283178;OID=.;OPOS=179118998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:21:20:18:35:21:20:18:35 chr3 179137273 . A G 425.79 PASS AF=0.432432;AO=48;DP=111;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0232787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.13;QD=15.3438;RBI=0.0234039;REFB=-0.0185864;REVB=0.00241813;RO=63;SAF=21;SAR=27;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166508;STB=0.593258;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0233756;OID=.;OPOS=179137273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:63:63:48:48:0.432432:27:21:38:25:27:21:38:25 chr3 179298999 . C T 2337.69 PASS AF=1;AO=147;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00690688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.505;QD=63.1809;RBI=0.0423906;REFB=-0.0235461;REVB=-0.0418241;RO=1;SAF=67;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590816;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301747;OID=.;OPOS=179298999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:148:148:1:0:147:148:1:80:67:0:1:81:67:0:0 chr3 179439202 . C T 288.59 PASS AF=0.492063;AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00904864;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.837;QD=18.3232;RBI=0.0198226;REFB=-0.0220474;REVB=-0.0176369;RO=32;SAF=10;SAR=20;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107461;STB=0.512187;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0241589;OID=.;OPOS=179439202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:32:32:30:31:0.492063:20:10:11:21:21:10:11:21 chr3 181431659 . G A 194.31 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0325129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3865;QD=12.3368;RBI=0.0392364;REFB=0.00156797;REVB=-0.0219638;RO=39;SAF=12;SAR=12;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180016;STB=0.603092;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.00452707;OID=.;OPOS=181431659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:12:12:26:13:12:12:26:13 chr3 182631792 . C A 1825.72 PASS AF=1;AO=116;DP=117;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000789977;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.112;QD=61.3688;RBI=0.00386733;REFB=0;REVB=-0.00378579;RO=0;SAF=45;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114551;OID=.;OPOS=182631792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:119:0:0:116:119:1:71:45:0:0:71:48:0:0 chr3 182790249 . G A 1172.31 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.724;QD=60.8991;RBI=0.0142834;REFB=0;REVB=0.0126672;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25023e-05;OID=.;OPOS=182790249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:37:39:0:0:38:39:0:0 chr3 182871962 . C T 454.1 PASS AF=0.358974;AO=56;DP=156;FAO=56;FDP=156;FR=.;FRO=100;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=70;FWDB=-0.0692583;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.365;QD=11.6435;RBI=0.0694092;REFB=-0.00906229;REVB=-0.00457336;RO=98;SAF=21;SAR=35;SRF=29;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972682;STB=0.552613;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0130032;OID=.;OPOS=182871962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:98:100:56:56:0.358974:35:21:29:69:35:21:30:70 chr3 182925403 . GT G,GC 1409.38 PASS AF=0.11828,0.88172;AO=12,77;DP=93;FAO=11,82;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=11,50;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210407,0.00180191;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=84.9229,106.401;QD=60.6183;RBI=0.0310567,0.0355563;REFB=0,0;REVB=0.022843,0.0355106;RO=0;SAF=11,48;SAR=1,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.23983e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0132077,0.000445595;OID=.,.;OPOS=182925404,182925404;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.11828,0.88172:12,77:93:11,82:93:0:11,50:0,32:0:0:20:0:11,48:1,29:0:0 chr3 183006918 . A G 421.64 PASS AF=0.382812;AO=47;DP=127;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0132179;FXX=0.0153834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.734;QD=13.1764;RBI=0.0134775;REFB=-0.0228978;REVB=-0.00263255;RO=61;SAF=30;SAR=17;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277105;STB=0.589715;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0279835;OID=.;OPOS=183006918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:61:79:47:49:0.382812:17:30:22:39:19:30:37:42 chr3 183017965 . T A 176.64 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0611519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.556;QD=14.1308;RBI=0.0642757;REFB=-0.0292214;REVB=-0.0197941;RO=31;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156636;STB=0.509081;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0267362;OID=.;OPOS=183017965;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:12:7:11:20:12:7:11:20 chr3 183211906 . A G 1400.4 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.6;QD=61.5561;RBI=0.0254187;REFB=0.100686;REVB=-0.0151975;RO=1;SAF=42;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111514;STB=0.505881;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.000401642;OID=.;OPOS=183211906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:48:42:1:0:48:42:1:0 chr3 183368216 . A T 1328.67 PASS AF=0.936842;AO=89;DP=95;FAO=89;FDP=95;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0289295;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.313;QD=55.9439;RBI=0.0340931;REFB=0.0174895;REVB=0.0180394;RO=5;SAF=35;SAR=54;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00071071;STB=0.507041;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.000158975;OID=.;OPOS=183368216;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:95:95:5:6:89:89:0.936842:54:35:2:3:54:35:3:3 chr3 183368891 . C T 1153.54 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5248;QD=60.7126;RBI=0.00753595;REFB=0;REVB=0.00718192;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25251e-05;OID=.;OPOS=183368891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0 chr3 183432983 . C T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.828;QD=58.9626;RBI=0.0186078;REFB=0;REVB=-0.00516112;RO=0;SAF=23;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77001e-05;OID=.;OPOS=183432983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:43:23:0:0:43:23:0:0 chr3 183558402 . C G 521.77 PASS AF=0.486726;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.00356955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.983;QD=18.4698;RBI=0.02587;REFB=-0.00426707;REVB=0.0256225;RO=56;SAF=28;SAR=27;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569561;STB=0.539638;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00537611;OID=.;OPOS=183558402;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:56:58:55:55:0.486726:27:28:32:24:27:28:34:24 chr3 183560195 . A G 184.81 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0020706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.445;QD=12.1188;RBI=0.0108594;REFB=-0.00468192;REVB=-0.0106602;RO=38;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148919;STB=0.58554;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00717435;OID=.;OPOS=183560195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:12:11:13:25:12:11:13:25 chr3 183660585 . G A 493.99 PASS AF=0.546512;AO=46;DP=85;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0197684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9423;QD=22.9763;RBI=0.0315537;REFB=-0.00162898;REVB=0.0245937;RO=39;SAF=24;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501261;STB=0.531901;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0017108;OID=.;OPOS=183660585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:39:39:46:47:0.546512:22:24:18:21:22:25:18:21 chr3 183685534 . A G 788.25 PASS AF=1;AO=46;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3829;QD=64.3466;RBI=0.258751;REFB=0;REVB=0.253919;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315322;OID=.;OPOS=183685534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:46:49:1:16:30:0:0:19:30:0:0 chr3 183696402 . A G 1063.25 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.962;QD=59.9016;RBI=0.0579052;REFB=0;REVB=-0.00613753;RO=0;SAF=15;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73938e-05;OID=.;OPOS=183696402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:71:0:0:67:71:1:52:15:0:0:52:19:0:0 chr3 183699516 . T C 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00163003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.197;QD=7.8372;RBI=0.0231486;REFB=-0.0126547;REVB=0.0230912;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112483;STB=0.571216;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0350807;OID=.;OPOS=183699516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:2:5:10:6:2:5:10:6 chr3 183753777 . G A 78.2 PASS AF=0.625;AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00935842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7023;QD=19.5496;RBI=0.0158154;REFB=-0.0403463;REVB=-0.0127493;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152681;STB=0.5998;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0167666;OID=.;OPOS=183753777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:16:6:6:9:10:0.625:4:5:2:4:4:6:2:4 chr3 183754294 . G C 143.41 PASS AF=0.294118;AO=20;DP=68;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0343162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8668;QD=8.43596;RBI=0.0440849;REFB=0.00762453;REVB=-0.0276745;RO=48;SAF=9;SAR=11;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014951;STB=0.50892;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.0224517;OID=.;OPOS=183754294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:48:48:20:20:0.294118:11:9:21:27:11:9:21:27 chr3 183755822 . G A 599.41 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343981;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.199;QD=61.4781;RBI=0.0761937;REFB=0;REVB=0.0679872;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166587;OID=.;OPOS=183755822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr3 183756702 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.321;QD=59.4354;RBI=0.0550408;REFB=0;REVB=0.0421075;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298399;OID=.;OPOS=183756702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0 chr3 183756742 . C T 159.83 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0827013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.743;QD=26.6377;RBI=0.0865108;REFB=-0.00601942;REVB=0.0253893;RO=8;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00546602;OID=.;OPOS=183756742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:6:10:5:3:6:10:5:3 chr3 183774762 . C A 434.69 PASS AF=0.5;AO=42;DP=86;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0188545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.377;QD=19.7586;RBI=0.0233289;REFB=-0.0071966;REVB=0.0137385;RO=44;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10785;STB=0.568719;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00980659;OID=.;OPOS=183774762;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:44:44:42:44:0.5:18:24:20:24:18:26:20:24 chr3 183778010 . G C 283.12 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.000754873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.799;QD=17.4228;RBI=0.00131913;REFB=-0.0152248;REVB=0.00108179;RO=34;SAF=23;SAR=8;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761526;STB=0.542829;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0174508;OID=.;OPOS=183778010;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:8:23:23:11:8:23:23:11 chr3 183818416 . G A 39.21 PASS AF=0.269231;AO=6;DP=25;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0219187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.001;QD=6.03267;RBI=0.0220541;REFB=-0.00786639;REVB=-0.00244073;RO=19;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281994;STB=0.627577;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0245222;OID=.;OPOS=183818416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:25:26:19:19:6:7:0.269231:3:3:5:14:4:3:5:14 chr3 183900680 . G C 130.13 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0251434;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8083;QD=12.6957;RBI=0.0362438;REFB=-0.0049208;REVB=0.026104;RO=26;SAF=12;SAR=3;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366995;STB=0.718781;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0106888;OID=.;OPOS=183900680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:26:26:15:15:0.365854:3:12:13:13:3:12:13:13 chr3 183900729 . T C 36.38 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0182287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.339;QD=6.92898;RBI=0.0188231;REFB=-0.00555761;REVB=0.00469319;RO=15;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442109;STB=0.78843;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0137736;OID=.;OPOS=183900729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:1:5:7:8:1:5:7:8 chr3 183904049 . A G 182.94 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0416604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8646;QD=17.4232;RBI=0.0442744;REFB=-0.0343038;REVB=-0.0149877;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556529;STB=0.531773;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0523428;OID=.;OPOS=183904049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:11:8:11:12:11:8:11:12 chr3 183907032 . G C 622.83 PASS AF=0.411765;AO=70;DP=170;FAO=70;FDP=170;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=53;FWDB=0.00312315;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.492;QD=14.6547;RBI=0.0129243;REFB=-0.000882738;REVB=0.0125412;RO=84;SAF=35;SAR=35;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116827;STB=0.517642;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.00143702;OID=.;OPOS=183907032;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:84:100:70:70:0.411765:35:35:41:43:35:35:47:53 chr3 183951135 . C T 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.030122;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.894;QD=18.7441;RBI=0.0303613;REFB=-0.00146465;REVB=-0.00380385;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149414;STB=0.58797;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.000813595;OID=.;OPOS=183951135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:2:5:2:2:2:5:2:2 chr3 183951431 . C T 210.47 PASS AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00407184;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.606;QD=26.3088;RBI=0.00482453;REFB=-0.0414353;REVB=-0.0025877;RO=12;SAF=12;SAR=8;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233563;STB=0.629502;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0225733;OID=.;OPOS=183951431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:8:12:3:9:8:12:3:9 chr3 183952089 . GC CG,G 46.96 PASS AF=0.0222222,0.4;AO=5,17;DP=46;FAO=1,18;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=1,14;FSAR=0,4;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.109054,-0.0962072;FXX=0.0217344;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=66.9606,8.70177;QD=4.17448;RBI=0.114943,0.0985449;REFB=-0.0248924,-0.169846;REVB=-0.0363204,-0.0213374;RO=22;SAF=5,11;SAR=0,6;SRF=6;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.754038,0.356102;STB=0.993404,0.777469;STBP=0.202,0.006;TYPE=mnp,del;VARB=0.0675309,0.16653;OID=.,.;OPOS=183952089,183952090;OREF=GC,C;OALT=CG,-;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:45:46:45:22:26:5,17:1,18:0.0222222,0.4:0,6:5,11:6:16:0,4:1,14:8:18 chr3 183953972 . G A 82.71 PASS AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0096726;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2004;QD=8.4835;RBI=0.0367444;REFB=-0.00689194;REVB=0.0354485;RO=27;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117982;STB=0.518834;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0318749;OID=.;OPOS=183953972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:39:39:27:28:11:11:0.282051:5:6:15:12:5:6:16:12 chr3 183955109 . C T 251.7 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00361109;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=182.986;QD=17.0646;RBI=0.00462944;REFB=-0.0136034;REVB=-0.00289686;RO=30;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922441;STB=0.542343;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0147316;OID=.;OPOS=183955109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:31:28:28:0.474576:14:14:12:18:14:14:13:18 chr3 183975365 . C T 618.64 PASS AF=0.934783;AO=42;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0240277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.944;QD=53.7945;RBI=0.076853;REFB=-0.0456585;REVB=0.0730004;RO=3;SAF=23;SAR=19;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269296;STB=0.513178;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00403708;OID=.;OPOS=183975365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:46:46:3:3:42:43:0.934783:19:23:1:2:20:23:1:2 chr3 183976108 . T C 273.94 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00541511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.697;QD=15.2186;RBI=0.0490118;REFB=-0.0358278;REVB=-0.0487118;RO=41;SAF=22;SAR=9;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238829;STB=0.635746;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0374348;OID=.;OPOS=183976108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:9:22:20:21:9:22:20:21 chr3 184037533 . A G 528.79 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6892;QD=58.7545;RBI=0.0201174;REFB=0;REVB=0.0192561;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408265;OID=.;OPOS=184037533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:24:10:0:0:26:10:0:0 chr3 184039666 . A G 199.47 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0108901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5312;QD=15.6448;RBI=0.0131598;REFB=-0.00565802;REVB=0.00738824;RO=28;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455424;STB=0.511617;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.00231138;OID=.;OPOS=184039666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:29:22:22:0.431373:14:8:9:19:14:8:10:19 chr3 184075047 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.97;QD=60.9778;RBI=0.0197778;REFB=0;REVB=-0.0135724;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25206e-06;OID=.;OPOS=184075047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr3 184102396 . C T 1513.29 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00678955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6379;QD=59.9321;RBI=0.0086498;REFB=0;REVB=0.0053592;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82643e-05;OID=.;OPOS=184102396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:46:55:0:0:46:55:0:0 chr3 184103903 . A C 724.16 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.571;QD=54.6538;RBI=0.0232359;REFB=-0.0975649;REVB=-0.00251204;RO=0;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516123;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000567068;OID=.;OPOS=184103903;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:37:15:0:0:37:15:1:0 chr3 184289146 . G A 367.65 PASS AF=0.40566;AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.00329793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4577;QD=13.8735;RBI=0.0151344;REFB=-0.00894739;REVB=-0.0147707;RO=63;SAF=18;SAR=25;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614228;STB=0.534743;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0149898;OID=.;OPOS=184289146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:63:63:43:43:0.40566:25:18:30:33:25:18:30:33 chr3 184289152 . A G 344.35 PASS AF=0.390476;AO=40;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.00821489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.957;QD=13.1182;RBI=0.0256934;REFB=-0.0162931;REVB=-0.0243447;RO=63;SAF=16;SAR=24;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10066;STB=0.552606;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0239565;OID=.;OPOS=184289152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:63:64:40:41:0.390476:24:16:31:32:24:17:32:32 chr3 184293769 . T C 410.98 PASS AF=0.72;AO=36;DP=51;FAO=36;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00266007;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.462;QD=32.878;RBI=0.0145517;REFB=-0.0168883;REVB=-0.0143065;RO=14;SAF=21;SAR=15;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0808907;STB=0.543894;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00645024;OID=.;OPOS=184293769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:14:14:36:36:0.72:15:21:6:8:15:21:6:8 chr3 184299068 . G A 711.83 PASS AF=0.616162;AO=61;DP=99;FAO=61;FDP=99;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0402218;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.386;QD=28.7607;RBI=0.0451978;REFB=-0.0234306;REVB=0.0206166;RO=38;SAF=20;SAR=41;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240132;STB=0.630725;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.010371;OID=.;OPOS=184299068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:38:38:61:61:0.616162:41:20:25:13:41:20:25:13 chr3 184299167 . T C 346.09 PASS AF=0.644444;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0258667;FXX=0.0217344;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.7249;QD=30.7634;RBI=0.0365437;REFB=0.00803721;REVB=0.0258138;RO=16;SAF=10;SAR=19;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106929;STB=0.558782;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00568926;OID=.;OPOS=184299167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:16:16:29:29:0.644444:19:10:8:8:19:10:8:8 chr3 184300047 . T A 38.28 PASS AF=0.4375;AO=5;DP=14;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00813896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6487;QD=9.56959;RBI=0.0543356;REFB=-0.0723736;REVB=0.0537226;RO=9;SAF=0;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.718987;STB=0.730929;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.234638;OID=.;OPOS=184300047;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:16:9:9:5:7:0.4375:5:0:4:5:6:1:4:5 chr3 184428903 . T G 306.12 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0162975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.29;QD=15.3062;RBI=0.041367;REFB=-0.0126694;REVB=-0.0380213;RO=46;SAF=23;SAR=11;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052258;STB=0.529588;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0172817;OID=.;OPOS=184428903;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:11:23:29:17:11:23:29:17 chr3 184429133 . A ATCC 108.43 PASS AF=0.358974;AO=11;DP=46;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00692772;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=3;MLLD=233.095;QD=11.1205;RBI=0.0280849;REFB=-0.0275787;REVB=0.027217;RO=32;SAF=4;SAR=7;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235659;STB=0.512802;STBP=0.951;TYPE=ins;VARB=0.0512686;OID=.;OPOS=184429134;OREF=-;OALT=TCC;OMAPALT=ATCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.358974:11:46:14:39:25:7:7:13:12:99:32:4:7:18:14 chr3 184429414 . C A 55.85 PASS AF=0.666667;AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0537901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.494;QD=18.6158;RBI=0.0565206;REFB=-0.0290125;REVB=-0.0173551;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206743;STB=0.543368;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0162554;OID=.;OPOS=184429414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:12:12:5:4:7:8:0.666667:3:4:3:2:3:5:2:2 chr3 184550501 . A G 251.45 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.00670787;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6501;QD=14.1659;RBI=0.0120598;REFB=-0.0154915;REVB=-0.0100222;RO=42;SAF=17;SAR=12;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354363;STB=0.520148;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0207279;OID=.;OPOS=184550501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:42:42:29:29:0.408451:12:17:26:16:12:17:26:16 chr3 184573555 . C T 101.16 PASS AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0494718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.461;QD=8.42979;RBI=0.0499644;REFB=0.00454913;REVB=-0.00699859;RO=35;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109225;STB=0.566675;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=-0.0220917;OID=.;OPOS=184573555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:7:6:13:22:7:6:13:22 chr3 184633247 . A C 85.76 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0211928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.834;QD=11.8284;RBI=0.0215124;REFB=-0.0232466;REVB=0.00369448;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136212;STB=0.562387;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0266751;OID=.;OPOS=184633247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:5:6:7:10:5:6:8:10 chr3 184647413 . T A,C 1123.8 PASS AF=0.04,0.96;AO=3,72;DP=75;FAO=3,72;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31;FSAR=3,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597761,0.00690366;FXX=0.0259707;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=170.066,242.074;QD=59.9361;RBI=0.0230373,0.0077607;REFB=0,0;REVB=-0.0222483,-0.00354515;RO=0;SAF=0,31;SAR=3,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0315533,0.000356365;OID=.,.;OPOS=184647413,184647413;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:75:75:0:0:3,72:3,72:0.04,0.96:3,41:0,31:0:0:3,41:0,31:0:0 chr3 184700356 . A C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.029;QD=55.0987;RBI=0.0294027;REFB=0;REVB=0.0255815;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123501;OID=.;OPOS=184700356;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr3 184700426 . C T 248.61 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0143038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3996;QD=25.4979;RBI=0.0145227;REFB=-0.0393294;REVB=-0.00251212;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112942;STB=0.562448;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0265575;OID=.;OPOS=184700426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:14:9:4:12:14:9:4:12 chr3 184795895 . A G 135.87 PASS AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00238599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.649;QD=9.70524;RBI=0.00239701;REFB=-0.002638;REVB=0.000229622;RO=38;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382809;STB=0.522702;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.00562922;OID=.;OPOS=184795895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:11:7:16:22:11:7:16:22 chr3 184798067 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.63;QD=59.143;RBI=0.0372627;REFB=0;REVB=0.034713;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91326e-05;OID=.;OPOS=184798067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0 chr3 184922294 . C T 210.28 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0453055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.269;QD=15.5765;RBI=0.0453196;REFB=-0.0122971;REVB=-0.00113133;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00974821;OID=.;OPOS=184922294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:15:15:12:12:15:15 chr3 185046975 . T C 1592.99 PASS AF=0.964602;AO=109;DP=114;FAO=109;FDP=113;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0121411;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.604;QD=56.3891;RBI=0.0154821;REFB=-0.225717;REVB=0.00960679;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519996;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.000976715;OID=.;OPOS=185046975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:114:113:0:4:109:109:0.964602:48:61:0:0:48:61:0:4 chr3 185146702 . C T 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0675181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1498;QD=16.1726;RBI=0.0712586;REFB=-0.0136931;REVB=0.0227836;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158357;STB=0.507033;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0150128;OID=.;OPOS=185146702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:9:7:8:11:9:7:9:11 chr3 185866733 . T C 546.25 PASS AF=0.40411;AO=59;DP=147;FAO=59;FDP=146;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=68;FWDB=0.0166256;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.379;QD=14.9658;RBI=0.0177292;REFB=-0.0050808;REVB=-0.00615739;RO=86;SAF=25;SAR=34;SRF=19;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229943;STB=0.630213;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00777424;OID=.;OPOS=185866733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:86:87:59:59:0.40411:34:25:19:67:34:25:19:68 chr3 185867550 . G C 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0066718;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=281.573;QD=14.0975;RBI=0.0115364;REFB=-0.00437782;REVB=-0.00941143;RO=18;SAF=2;SAR=11;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239298;STB=0.513997;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00586329;OID=.;OPOS=185867550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:11:2:3:15:11:2:3:15 chr3 185867637 . C T 288.27 PASS AF=0.565217;AO=25;DP=44;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.012306;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.99;QD=25.0672;RBI=0.0123077;REFB=-0.0229932;REVB=0.000202212;RO=18;SAF=7;SAR=18;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556766;STB=0.530098;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0192587;OID=.;OPOS=185867637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:46:18:20:25:26:0.565217:18:7:4:14:18:8:5:15 chr3 185990096 . C T 880.48 PASS AF=1;AO=53;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.121;QD=57.7362;RBI=0.0393173;REFB=0;REVB=0.0368071;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247057;OID=.;OPOS=185990096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:53:61:1:29:24:0:0:36:25:0:0 chr3 186006566 . T C 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.66;QD=60.3765;RBI=0.0286682;REFB=0;REVB=-0.0211387;RO=0;SAF=54;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.808e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.29462e-05;OID=.;OPOS=186006566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:20:54:0:0:20:54:0:0 chr3 186006618 . G C 801.06 PASS AF=0.982759;AO=47;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138309;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=205.207;QD=55.2453;RBI=0.0269644;REFB=-0.0686253;REVB=-0.023147;RO=0;SAF=38;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000370197;OID=.;OPOS=186006618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:47:57:0.982759:9:38:0:0:12:45:1:0 chr3 186015283 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790031;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=283.657;QD=56.9569;RBI=0.0199266;REFB=0;REVB=-0.0182935;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86804e-05;OID=.;OPOS=186015283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:34:18:0:0:34:18:0:0 chr3 186024765 . A G 317.0 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.016195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.234;QD=17.8594;RBI=0.0267674;REFB=-0.00319979;REVB=0.0213123;RO=37;SAF=10;SAR=24;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244145;STB=0.637084;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00235773;OID=.;OPOS=186024765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:24:10:20:17:24:10:20:17 chr3 186337713 . T C 105.8 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0987499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.244;QD=11.4381;RBI=0.09875;REFB=-0.011029;REVB=-0.000160453;RO=24;SAF=4;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175995;STB=0.605213;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.051531;OID=.;OPOS=186337713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:9:4:11:13:9:4:11:13 chr3 186338382 . G C 238.75 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.00062687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.449;QD=14.044;RBI=0.000698306;REFB=0.00206078;REVB=0.000307678;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743494;STB=0.542342;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.00300522;OID=.;OPOS=186338382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:12:16:20:20:12:16:20:20 chr3 186338425 . A C 920.84 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.667;QD=58.4661;RBI=0.0561449;REFB=0;REVB=-0.00649083;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45223e-05;OID=.;OPOS=186338425;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:32:29:0:0:32:31:0:0 chr3 186370333 . G T 218.05 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00624885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7701;QD=15.5751;RBI=0.0131323;REFB=0.0107522;REVB=0.0115503;RO=31;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205188;STB=0.511619;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.0151631;OID=.;OPOS=186370333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:11:14:18:13:11:14:18:13 chr3 186390627 . C T 316.88 PASS AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00540692;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.973;QD=15.2712;RBI=0.0258277;REFB=-0.010037;REVB=0.0252554;RO=48;SAF=17;SAR=18;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359076;STB=0.520291;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.011931;OID=.;OPOS=186390627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:48:35:35:0.421687:18:17:25:23:18:17:25:23 chr3 186395113 . A G 145.81 PASS AF=0.421053;AO=15;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0495278;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.855;QD=15.3484;RBI=0.0524663;REFB=-0.000759444;REVB=0.017312;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149229;STB=0.562422;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0023679;OID=.;OPOS=186395113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:15:16:0.421053:6:9:10:12:7:9:10:12 chr3 186395180 . T C 236.03 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3407;QD=49.6906;RBI=0.132599;REFB=0;REVB=0.0502647;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00463127;OID=.;OPOS=186395180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:6:12:0:0:6:13:0:0 chr3 186395572 . A T 34.8 PASS AF=0.176471;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.00888219;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1203;QD=4.09466;RBI=0.0106017;REFB=-0.0118811;REVB=-0.00578818;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393441;STB=0.762867;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0190456;OID=.;OPOS=186395572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:35:34:28:28:6:6:0.176471:2:4:9:19:2:4:9:19 chr3 186443018 . T C 162.02 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0020721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.317;QD=12.0014;RBI=0.00451658;REFB=-0.0130179;REVB=-0.00401322;RO=34;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322557;STB=0.685541;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0288684;OID=.;OPOS=186443018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:8:12:10:24:8:12:10:24 chr3 186504148 . T C 553.91 PASS AF=0.44697;AO=58;DP=131;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.0132437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.981;QD=16.7851;RBI=0.0205314;REFB=-0.00507947;REVB=-0.015689;RO=73;SAF=29;SAR=29;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683578;STB=0.500899;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00620305;OID=.;OPOS=186504148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:73:73:58:59:0.44697:29:29:37:36:29:30:37:36 chr3 186509517 . G A 265.83 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0167632;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.892;QD=15.1903;RBI=0.0194109;REFB=-0.015774;REVB=0.00978664;RO=33;SAF=19;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114464;STB=0.52027;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.01667;OID=.;OPOS=186509517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:70:33:40:30:30:0.428571:11:19:17:16:11:19:24:16 chr3 186570892 . T G 1010.94 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108393;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.433;QD=59.4672;RBI=0.0114809;REFB=0;REVB=-0.00378423;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.70094e-05;OID=.;OPOS=186570892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:29:38:0:0:29:39:0:0 chr3 186795924 . C T 509.36 PASS AF=0.482143;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0358967;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5571;QD=18.1915;RBI=0.0370488;REFB=-0.00141729;REVB=-0.00916748;RO=50;SAF=16;SAR=38;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103063;STB=0.605756;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.001028;OID=.;OPOS=186795924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:50:58:54:54:0.482143:38:16:20:30:38:16:28:30 chr3 186937568 . A G 1399.92 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0185998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.505;QD=61.5349;RBI=0.0186106;REFB=0.0162185;REVB=-0.000634389;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-2.2471e-05;OID=.;OPOS=186937568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:0:1:90:90:0.989011:54:36:0:0:54:36:0:1 chr3 186954285 . A G 1207.94 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0214;QD=61.1617;RBI=0.118706;REFB=0;REVB=0.116992;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406454;OID=.;OPOS=186954285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:79:0:0:76:79:1:42:34:0:0:45:34:0:0 chr3 187088812 . C T 866.83 PASS AF=0.953846;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0359554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.974;QD=53.3434;RBI=0.0407149;REFB=-0.0973893;REVB=0.0191028;RO=2;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248371;STB=0.519474;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00148591;OID=.;OPOS=187088812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:65:65:2:3:62:62:0.953846:37:25:0:2:37:25:0:3 chr3 187088903 . C A 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5452;QD=59.8389;RBI=0.0540388;REFB=0;REVB=0.0494856;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486784;OID=.;OPOS=187088903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0 chr3 187088926 . G A 411.09 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.576;QD=56.702;RBI=0.100693;REFB=0;REVB=0.09868;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116804;OID=.;OPOS=187088926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr3 187089031 . C A 256.46 PASS AF=0.410959;AO=29;DP=72;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0198339;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.358;QD=14.0523;RBI=0.0259534;REFB=-0.0229828;REVB=-0.0167391;RO=43;SAF=5;SAR=24;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377016;STB=0.722374;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0397418;OID=.;OPOS=187089031;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:43:43:29:30:0.410959:24:5:20:23:25:5:20:23 chr3 187416634 . C A 1619.04 PASS AF=1;AO=109;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.169;QD=58.344;RBI=0.0363948;REFB=-0.114104;REVB=-0.0153669;RO=1;SAF=46;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102074;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00269503;OID=.;OPOS=187416634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:111:111:1:0:109:111:1:63:46:1:0:63:48:0:0 chr3 187416719 . T C 940.81 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160474;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.188;QD=58.8003;RBI=0.0171723;REFB=0;REVB=0.00611283;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3889e-05;OID=.;OPOS=187416719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:25:39:0:0:25:39:0:0 chr3 187447032 . G A 651.14 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.154;QD=62.013;RBI=0.0581606;REFB=0;REVB=0.0242557;RO=0;SAF=32;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96961e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446252;OID=.;OPOS=187447032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:10:32:0:0:10:32:0:0 chr3 187897059 . G A,C 1052.53 PASS AF=0.916667,0.0833333;AO=66,6;DP=72;FAO=66,6;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31,6;FSAR=35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308623,0.00317284;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=59.5429,183.062;QD=58.474;RBI=0.0396696,0.0131232;REFB=0,0;REVB=0.0249238,-0.0127339;RO=0;SAF=31,6;SAR=35,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.769e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00465948,0.0505128;OID=.,.;OPOS=187897059,187897059;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:24:72:72:0:0:66,6:66,6:0.916667,0.0833333:35,0:31,6:0:0:35,0:31,6:0:0 chr3 187897283 . G A 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0189841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.072;QD=11.4398;RBI=0.0479407;REFB=-0.00887995;REVB=0.0440218;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341536;STB=0.700542;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00286273;OID=.;OPOS=187897283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:3:11:4:5:3:11 chr3 187897424 . A C 277.57 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0237076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.071;QD=20.5608;RBI=0.0299494;REFB=-0.0269514;REVB=-0.0183007;RO=25;SAF=19;SAR=10;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140844;STB=0.577728;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0157578;OID=.;OPOS=187897424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:10:19:20:5:10:19:20:5 chr3 187897614 . C G 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.214;QD=53.274;RBI=0.0266249;REFB=0;REVB=0.0242191;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179579;OID=.;OPOS=187897614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0 chr3 187897954 . T A 2052.18 PASS AF=0.958333;AO=136;DP=143;FAO=138;FDP=144;FR=.;FRO=6;FSAF=68;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0535772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4909;QD=57.005;RBI=0.057831;REFB=-0.0845438;REVB=0.0217696;RO=2;SAF=67;SAR=69;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000202623;STB=0.500302;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00353517;OID=.;OPOS=187897954;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:143:144:2:6:136:138:0.958333:69:67:1:1:70:68:3:3 chr3 187898523 . T C 94.88 PASS AF=0.227273;AO=15;DP=66;FAO=15;FDP=66;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-6.96631e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.957;QD=5.75054;RBI=0.018139;REFB=0.00344438;REVB=0.0181389;RO=49;SAF=10;SAR=5;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148886;STB=0.595613;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00528614;OID=.;OPOS=187898523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:66:66:49:51:15:15:0.227273:5:10:27:22:5:10:28:23 chr3 187898593 . G A 265.08 PASS AF=0.741935;AO=23;DP=31;FAO=23;FDP=31;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0335434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.526;QD=34.2037;RBI=0.0336928;REFB=-0.019019;REVB=0.00316913;RO=8;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168739;STB=0.591991;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00174043;OID=.;OPOS=187898593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:8:8:23:23:0.741935:11:12:7:1:11:12:7:1 chr3 188464248 . G GT 1607.36 PASS AF=1;AO=129;DP=138;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0926355;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.4829;QD=47.6254;RBI=0.11843;REFB=0;REVB=-0.0737863;RO=5;SAF=84;SAR=45;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116487;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00300935;OID=.;OPOS=188464249;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:129:138:135:135:0:88:47:0:0:29:5:84:45:4:1 chr3 188590446 . A G 2138.82 PASS AF=1;AO=135;DP=137;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198039;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.753;QD=62.9064;RBI=0.0291906;REFB=0;REVB=-0.0214453;RO=0;SAF=74;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00198636;OID=.;OPOS=188590446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:137:136:0:0:135:136:1:61:74:0:0:61:75:0:0 chr3 189713205 . T C 714.52 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0398342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8677;QD=60.8102;RBI=0.0443441;REFB=0.00807783;REVB=0.0194844;RO=1;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028473;STB=0.515145;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000531682;OID=.;OPOS=189713205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:16:30:0:1:16:30:0:1 chr3 190023552 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.609;QD=51.9167;RBI=0.0122844;REFB=0;REVB=0.00572959;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97089e-05;OID=.;OPOS=190023552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr3 190024457 . A G 1511.78 PASS AF=0.980952;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00450005;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.407;QD=57.5915;RBI=0.0346446;REFB=-0.0193787;REVB=0.0343511;RO=1;SAF=43;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784321;STB=0.508195;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.000279431;OID=.;OPOS=190024457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:106:105:1:2:103:103:0.980952:60:43:0:1:60:43:0:2 chr3 190030680 . A G 1484.19 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172847;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.275;QD=59.9672;RBI=0.049656;REFB=0;REVB=0.0465505;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35302e-05;OID=.;OPOS=190030680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:55:44:0:0:55:44:0:0 chr3 190039888 . G A 203.22 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00457119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6662;QD=21.9695;RBI=0.0198391;REFB=0.00110088;REVB=-0.0193052;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810706;STB=0.54541;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0015;OID=.;OPOS=190039888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:11:9:6:11:11:9:6:11 chr3 190333162 . TG T,TT 1208.19 PASS AF=1,0;AO=76,3;DP=79;FAO=79,0;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00945162,-0.0111535;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=353.407,333.223;QD=61.1743;RBI=0.0117097,0.012192;REFB=0,0;REVB=0.00691257,0.00492389;RO=0;SAF=33,1;SAR=43,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.66218e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=3.59492e-05,0;OID=.,.;OPOS=190333163,190333163;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:76,3:79:79,0:79:0:34,0:45,0:0:0:6:0:33,1:43,2:0:0 chr3 190360102 . G A 372.86 PASS AF=0.580645;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0507152;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.938;QD=24.0552;RBI=0.0510076;REFB=-0.0169403;REVB=-0.0054541;RO=25;SAF=16;SAR=20;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126447;STB=0.558792;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0141371;OID=.;OPOS=190360102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:25:26:36:36:0.580645:20:16:7:18:20:16:8:18 chr3 190578566 . A G 814.0 PASS AF=0.527397;AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=146;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=0.00192161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.437;QD=22.3015;RBI=0.00196808;REFB=-0.0174305;REVB=-0.000425139;RO=68;SAF=34;SAR=43;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077754;STB=0.545377;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0121221;OID=.;OPOS=190578566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:68:69:77:77:0.527397:43:34:24:44:43:34:24:45 chr3 190999917 . C A 175.4 PASS AF=0.370968;AO=22;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0131494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5549;QD=11.3161;RBI=0.0176043;REFB=-0.0480349;REVB=-0.0117049;RO=39;SAF=10;SAR=12;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641835;STB=0.52172;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0268247;OID=.;OPOS=190999917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:39:39:22:23:0.370968:12:10:20:19:12:11:20:19 chr3 191047532 . A G 2357.61 PASS AF=1;AO=143;DP=144;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.622;QD=63.7191;RBI=0.0834785;REFB=0;REVB=0.0732294;RO=0;SAF=56;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.32469e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.79038e-05;OID=.;OPOS=191047532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:148:0:0:143:148:1:87:56:0:0:90:58:0:0 chr3 191074873 . C G 807.32 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.955;QD=56.6542;RBI=0.0633241;REFB=0;REVB=0.0190988;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119646;OID=.;OPOS=191074873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:26:30:0:0:26:31:0:0 chr3 191098539 . C G 1312.16 PASS AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00147674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.326;QD=59.6438;RBI=0.0128342;REFB=-0.042186;REVB=-0.0127489;RO=0;SAF=38;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512818;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00197871;OID=.;OPOS=191098539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:88:88:0:2:86:86:0.977273:48:38:0:0:48:38:2:0 chr3 191810914 . TA CG 1364.05 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189518;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=2;MLLD=176.602;QD=62.7147;RBI=0.0253903;REFB=0;REVB=0.0168966;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000125808;OID=.;OPOS=191810914;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:39:48:0:0:39:48:0:0 chr3 192516430 . C T 202.0 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00238887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.658;QD=21.263;RBI=0.0260686;REFB=-0.0266233;REVB=0.0259589;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187932;STB=0.605163;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0189888;OID=.;OPOS=192516430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:5:13:10:10:5:13 chr3 192994543 . A G 446.08 PASS AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0171803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0627;QD=18.2075;RBI=0.0455254;REFB=-0.0152792;REVB=0.0421592;RO=53;SAF=17;SAR=28;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112404;STB=0.562851;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0234399;OID=.;OPOS=192994543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:28:17:26:27:28:17:26:27 chr3 193031926 . C T 752.42 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0546022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4272;QD=61.422;RBI=0.0546083;REFB=-0.215655;REVB=-0.00081542;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00773284;OID=.;OPOS=193031926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:23:25:0:0:23:25:0:1 chr3 193036794 . G C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.915;QD=61.6838;RBI=0.0171693;REFB=0;REVB=-0.00430273;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77817e-05;OID=.;OPOS=193036794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr3 193042776 . T C 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.55;QD=56.9372;RBI=0.0188282;REFB=0;REVB=-0.00653111;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95247e-05;OID=.;OPOS=193042776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0 chr3 193080344 . C T 695.07 PASS AF=0.589286;AO=66;DP=112;FAO=66;FDP=112;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0274418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.246;QD=24.8238;RBI=0.0328679;REFB=0.00281083;REVB=-0.01809;RO=46;SAF=32;SAR=34;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125903;STB=0.56848;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00245592;OID=.;OPOS=193080344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:46:46:66:66:0.589286:34:32:30:16:34:32:30:16 chr3 193080414 . C G 271.69 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0144646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.083;QD=14.6859;RBI=0.0156204;REFB=-0.0103107;REVB=-0.00589686;RO=43;SAF=20;SAR=11;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165414;STB=0.593997;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0159531;OID=.;OPOS=193080414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:11:20:21:22:11:20:21:22 chr3 193081122 . G T 593.15 PASS AF=0.455882;AO=62;DP=136;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0377972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4936;QD=17.4455;RBI=0.0431703;REFB=-0.015627;REVB=-0.0208579;RO=74;SAF=25;SAR=37;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829933;STB=0.54621;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0185379;OID=.;OPOS=193081122;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:74:74:62:62:0.455882:37:25:36:38:37:25:36:38 chr3 193096529 . C T 1516.6 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3031;QD=63.1917;RBI=0.021692;REFB=0;REVB=0.0189081;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022942;OID=.;OPOS=193096529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0 chr3 193120359 . GA G 415.8 PASS AF=0.443299;AO=42;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0133388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.6;QD=17.1462;RBI=0.0154873;REFB=-0.0258386;REVB=0.00786981;RO=54;SAF=21;SAR=21;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111479;STB=0.55553;STBP=0.362;TYPE=del;VARB=0.0296753;OID=.;OPOS=193120360;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.443299:42:97:43:97:54:22:21:33:21:99:54:21:21:33:21 chr3 193183817 . A G 227.1 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0193868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.285;QD=15.6624;RBI=0.0196046;REFB=-0.0169237;REVB=0.00291412;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108824;STB=0.568913;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0269481;OID=.;OPOS=193183817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:31:32:26:26:0.448276:13:13:12:19:13:13:12:20 chr3 193209178 . T C 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0281636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9303;QD=15.1969;RBI=0.0368484;REFB=0.0129089;REVB=0.0237617;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253924;STB=0.514685;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.0181844;OID=.;OPOS=193209178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:9:5:6:12:9:5:6:12 chr3 193210768 . A G 646.59 PASS AF=0.6;AO=57;DP=94;FAO=57;FDP=95;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0117351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.145;QD=27.2247;RBI=0.0286454;REFB=-0.00230721;REVB=0.0261313;RO=37;SAF=28;SAR=29;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551465;STB=0.535043;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00196608;OID=.;OPOS=193210768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:37:38:57:57:0.6:29:28:21:16:29:28:22:16 chr3 193355074 . T C 1716.23 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000755974;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.038;QD=60.7516;RBI=0.0219814;REFB=0;REVB=0.0219684;RO=0;SAF=36;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44923e-05;OID=.;OPOS=193355074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:77:36:0:0:77:36:0:0 chr3 193863706 . A G 182.83 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0228662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8831;QD=43.0196;RBI=0.0231842;REFB=-0.154839;REVB=0.0038269;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.519975;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00708491;OID=.;OPOS=193863706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:0:1:16:16:0.941176:4:12:0:0:4:12:1:0 chr3 194061826 . C T 275.6 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0859355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.764;QD=18.072;RBI=0.0881596;REFB=-0.046575;REVB=0.0196776;RO=30;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508191;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0545657;OID=.;OPOS=194061826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:30:31:30:30:0.491803:15:15:15:15:15:15:15:16 chr3 194061906 . T C 333.71 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0255682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.627;QD=21.8824;RBI=0.0474954;REFB=-0.0209542;REVB=-0.040026;RO=27;SAF=18;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0087506;STB=0.504833;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0113862;OID=.;OPOS=194061906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:16:18:14:13:16:18:14:13 chr3 194062519 . C T 37.14 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0273675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8737;QD=8.25434;RBI=0.0697106;REFB=-0.0272379;REVB=-0.0641139;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.470497;STB=0.777135;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0521954;OID=.;OPOS=194062519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:1:11:3:3:1:11 chr3 194062565 . C T 30.14 PASS AF=0.25;AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0423843;FXX=0.0908678;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6213;QD=6.02883;RBI=0.0588757;REFB=-0.0393945;REVB=-0.0408647;RO=14;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236698;STB=0.66611;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.115978;OID=.;OPOS=194062565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:22:20:14:15:5:5:0.25:3:2:3:11:3:2:3:12 chr3 194063300 . T C 385.68 PASS AF=0.401786;AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0189399;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8632;QD=13.7742;RBI=0.0224309;REFB=0.00814607;REVB=0.0120178;RO=60;SAF=31;SAR=14;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187152;STB=0.632592;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0151588;OID=.;OPOS=194063300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:60:67:45:45:0.401786:14:31:31:29:14:31:32:35 chr3 194118874 . T C 631.08 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.329;QD=60.103;RBI=0.0454462;REFB=0;REVB=0.0431651;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414004;OID=.;OPOS=194118874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:25:14:0:0:27:15:0:0 chr3 194124421 . A G 301.1 PASS AF=0.4;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.00496765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.043;QD=14.1694;RBI=0.0054813;REFB=-0.00728446;REVB=-0.00231671;RO=50;SAF=16;SAR=18;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114296;STB=0.570207;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00875078;OID=.;OPOS=194124421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:50:51:34:34:0.4:18:16:29:21:18:16:30:21 chr3 194124427 . C T 543.41 PASS AF=0.581395;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00471872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.663;QD=25.2751;RBI=0.0586086;REFB=0.0140094;REVB=-0.0584184;RO=35;SAF=31;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125696;STB=0.575136;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00791464;OID=.;OPOS=194124427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:35:36:50:50:0.581395:19:31:16:19:19:31:16:20 chr3 194313832 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.372;QD=49.5991;RBI=0.0473363;REFB=0;REVB=0.000420812;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142233;OID=.;OPOS=194313832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr3 194337901 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.087;QD=63.8715;RBI=0.019854;REFB=0;REVB=-0.010908;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.05661e-05;OID=.;OPOS=194337901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:15:33:0:0:15:33:0:0 chr3 194338423 . C T 195.19 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.021179;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.335;QD=14.1953;RBI=0.0236486;REFB=-0.0232333;REVB=-0.0105216;RO=31;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380893;STB=0.512647;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0357399;OID=.;OPOS=194338423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:31:32:23:23:0.418182:12:11:16:15:12:11:16:16 chr3 194349178 . C T 457.78 PASS AF=0.475728;AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0304182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.662;QD=17.7779;RBI=0.0327395;REFB=-0.00959136;REVB=0.0121082;RO=54;SAF=24;SAR=25;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603619;STB=0.533531;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0133554;OID=.;OPOS=194349178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:54:49:49:0.475728:25:24:23:31:25:24:23:31 chr3 194353875 . G T 39.23 PASS AF=0.461538;AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.160395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9661;QD=12.0697;RBI=0.18288;REFB=0.00851291;REVB=0.0878542;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115149;STB=0.61502;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0170782;OID=.;OPOS=194353875;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:12:13:7:7:5:6:0.461538:3:2:2:5:3:3:2:5 chr3 194373832 . TG CA 2336.64 PASS AF=1;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283194;FXX=0.00680226;HRUN=2;LEN=2;MLLD=372.311;QD=64.0177;RBI=0.0302893;REFB=0;REVB=0.0107447;RO=0;SAF=67;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98198e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.51232e-05;OID=.;OPOS=194373832;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:146:0:0:146:146:1:79:67:0:0:79:67:0:0 chr3 194387300 . C T 90.29 PASS AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.032154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.89;QD=7.52411;RBI=0.0322724;REFB=-0.011977;REVB=-0.00276245;RO=36;SAF=8;SAR=4;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236386;STB=0.647638;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0383537;OID=.;OPOS=194387300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:48:48:36:36:12:12:0.25:4:8:17:19:4:8:17:19 chr3 194842877 . A G 385.18 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0257621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.098;QD=20.543;RBI=0.0266271;REFB=-0.0174193;REVB=-0.00673167;RO=36;SAF=17;SAR=22;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799828;STB=0.544307;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0164226;OID=.;OPOS=194842877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:22:17:19:17:22:17:19:17 chr3 195076877 . C G 138.27 PASS AF=0.25641;AO=20;DP=78;FAO=20;FDP=78;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00537581;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.686;QD=7.09056;RBI=0.0196642;REFB=-0.0182087;REVB=0.0189151;RO=58;SAF=10;SAR=10;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105599;STB=0.56404;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0360431;OID=.;OPOS=195076877;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:58:58:20:20:0.25641:10:10:24:34:10:10:24:34 chr3 195242526 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.867;QD=52.6132;RBI=0.0429932;REFB=0;REVB=0.00385569;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173925;OID=.;OPOS=195242526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0 chr3 195345828 . AG GA 120.29 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016374;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=2;MLLD=87.6202;QD=43.7422;RBI=0.0336431;REFB=0;REVB=0.0293896;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00230441;OID=.;OPOS=195345828;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr3 195346477 . C T 365.09 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4364;QD=54.0875;RBI=0.0661846;REFB=0;REVB=0.0163558;RO=1;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617811;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202128;OID=.;OPOS=195346477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:1:0:26:27:1:7:19:0:1:8:19:0:0 chr3 195346861 . T C 45.62 PASS AF=0.134328;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.0709293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2881;QD=2.72373;RBI=0.0714912;REFB=0.00287268;REVB=0.00894584;RO=58;SAF=1;SAR=8;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406613;STB=0.806205;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.0425759;OID=.;OPOS=195346861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:67:67:58:58:9:9:0.134328:8:1:22:36:8:1:22:36 chr3 195346906 . C T 67.44 PASS AF=0.189655;AO=11;DP=58;FAO=11;FDP=58;FR=.;FRO=47;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.017392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.408;QD=4.65086;RBI=0.0176573;REFB=-0.0136689;REVB=-0.00304884;RO=47;SAF=1;SAR=10;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525886;STB=0.858609;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0881142;OID=.;OPOS=195346906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:58:58:47:47:11:11:0.189655:10:1:21:26:10:1:21:26 chr3 195399505 . C T 50.67 PASS AF=0.152542;AO=9;DP=59;FAO=9;FDP=59;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0265814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.408;QD=3.43559;RBI=0.0314097;REFB=-0.00156143;REVB=0.016733;RO=50;SAF=5;SAR=4;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812833;STB=0.555863;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0130865;OID=.;OPOS=195399505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:59:59:50:50:9:9:0.152542:4:5:31:19:4:5:31:19 chr3 195404649 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.379;QD=44.6896;RBI=0.0208078;REFB=0;REVB=-0.00225403;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000555725;OID=.;OPOS=195404649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:6:6:0:0:7:6:0:0 chr3 195447886 . G C 1242.34 PASS AF=0.697368;AO=106;DP=152;FAO=106;FDP=152;FR=.;FRO=46;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=0.0302367;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.126;QD=32.6932;RBI=0.0394117;REFB=-0.0375725;REVB=0.0252789;RO=46;SAF=61;SAR=45;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831509;STB=0.544533;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0124147;OID=.;OPOS=195447886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:46:46:106:106:0.697368:45:61:33:13:45:61:33:13 chr3 195451880 . AG GA 174.86 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00987878;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=93.6132;QD=46.6289;RBI=0.0144978;REFB=0;REVB=0.0106111;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.10282e-05;OID=.;OPOS=195451880;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:10:5:0:0 chr3 195452770 . G A 176.21 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0147832;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.446;QD=11.9462;RBI=0.042644;REFB=-0.0155058;REVB=-0.0399997;RO=38;SAF=11;SAR=11;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574853;STB=0.542335;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0246767;OID=.;OPOS=195452770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:38:37:22:22:0.372881:11:11:21:17:11:11:21:16 chr3 195452799 . C T 259.42 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.041725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7686;QD=14.2148;RBI=0.053641;REFB=-0.00607796;REVB=0.0337102;RO=43;SAF=16;SAR=14;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258656;STB=0.514696;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00873477;OID=.;OPOS=195452799;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:0.410959:14:16:24:19:14:16:24:19 chr3 195452951 . G C 920.09 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3907;QD=58.4184;RBI=0.0383808;REFB=0;REVB=-0.02505;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000482849;OID=.;OPOS=195452951;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr3 195452987 . G A 326.01 PASS AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0312135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1721;QD=17.3872;RBI=0.0446521;REFB=-0.0543826;REVB=-0.0319299;RO=39;SAF=25;SAR=10;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534008;STB=0.5251;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0308659;OID=.;OPOS=195452987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:40:35:35:0.466667:10:25:26:13:10:25:27:13 chr3 195452991 . C T 341.5 PASS AF=0.480519;AO=36;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.011463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2566;QD=17.7401;RBI=0.0484167;REFB=-0.0116592;REVB=0.0470402;RO=40;SAF=26;SAR=10;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025698;STB=0.501677;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0197149;OID=.;OPOS=195452991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:40:36:37:0.480519:10:26:28:12:11:26:28:12 chr3 195453014 . G A 330.97 PASS AF=0.433735;AO=35;DP=81;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.00475975;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.45;QD=15.9504;RBI=0.00535377;REFB=-0.0139872;REVB=0.00245104;RO=45;SAF=24;SAR=11;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368248;STB=0.509;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.018036;OID=.;OPOS=195453014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:45:47:35:36:0.433735:11:24:31:14:11:25:32:15 chr3 195453064 . T G 1340.97 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0203226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.442;QD=60.9531;RBI=0.0583221;REFB=-0.0237236;REVB=-0.0546668;RO=1;SAF=59;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166196;STB=0.50877;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00389339;OID=.;OPOS=195453064;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:87:87:0.988636:28:59:0:1:28:59:0:1 chr3 195453243 . C T 132.66 PASS AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00858292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.043;QD=9.14892;RBI=0.0253172;REFB=-0.0208072;REVB=0.0238179;RO=40;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241569;STB=0.64324;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0206339;OID=.;OPOS=195453243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:40:40:18:18:0.310345:7:11:16:24:7:11:16:24 chr3 195453257 . G A 115.47 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0389707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9743;QD=8.88235;RBI=0.0397454;REFB=-0.0209335;REVB=-0.00780915;RO=37;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19575;STB=0.618164;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.06033;OID=.;OPOS=195453257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:37:37:15:15:0.288462:6:9:16:21:6:9:16:21 chr3 195456561 . C G 300.35 PASS AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0181808;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.944;QD=23.1039;RBI=0.0184282;REFB=0.00434364;REVB=-0.00300922;RO=22;SAF=18;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663181;STB=0.536561;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=-0.00279471;OID=.;OPOS=195456561;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:12:18:15:7:12:18:15:7 chr3 195477791 . G A 1948.2 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.266;QD=61.8476;RBI=0.0511389;REFB=0;REVB=0.0282723;RO=0;SAF=67;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.89814e-05;OID=.;OPOS=195477791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:116:126:0:0:116:126:1:49:67:0:0:54:72:0:0 chr3 195479256 . T C 760.91 PASS AF=0.982143;AO=53;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0417533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6476;QD=54.3505;RBI=0.0570705;REFB=-0.0573853;REVB=0.0389064;RO=2;SAF=20;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448028;STB=0.511624;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00255051;OID=.;OPOS=195479256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:2:1:53:55:0.982143:33:20:2:0:34:21:1:0 chr3 195489009 . C A 3059.08 PASS AF=0.994845;AO=192;DP=193;FAO=193;FDP=194;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=99;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0236168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.344;QD=63.0737;RBI=0.0457589;REFB=-0.0949447;REVB=0.0391934;RO=1;SAF=93;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509308;STB=0.502645;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000205909;OID=.;OPOS=195489009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:193:194:1:1:192:193:0.994845:99:93:1:0:99:94:1:0 chr3 195489067 . C G 3515.79 PASS AF=1;AO=224;DP=224;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9678;QD=62.782;RBI=0.088275;REFB=0;REVB=-0.0791447;RO=0;SAF=95;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45813e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000296815;OID=.;OPOS=195489067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:224:224:0:0:224:224:1:129:95:0:0:129:95:0:0 chr3 195495916 . G C 993.43 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466317;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.518;QD=59.3089;RBI=0.0477706;REFB=0;REVB=0.0103688;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62745e-05;OID=.;OPOS=195495916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:32:35:0:0:32:35:0:0 chr3 195497174 . C G 1090.07 PASS AF=0.973684;AO=73;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0419882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6271;QD=57.372;RBI=0.0423536;REFB=-0.130757;REVB=0.00555093;RO=1;SAF=29;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160305;STB=0.50298;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00284591;OID=.;OPOS=195497174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:76:1:2:73:74:0.973684:44:29:1:0:45:29:1:1 chr3 195497743 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.768;QD=57.6804;RBI=0.0318058;REFB=0;REVB=0.0312695;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119625;OID=.;OPOS=195497743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr3 195501149 . C T 857.71 PASS AF=0.939394;AO=60;DP=64;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0970616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5693;QD=51.9826;RBI=0.111157;REFB=-0.0960156;REVB=0.0541745;RO=4;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459829;STB=0.524382;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00643781;OID=.;OPOS=195501149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:64:66:4:4:60:62:0.939394:39:21:0:4:39:23:0:4 chr3 195505664 . G A 538.51 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000543565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.391;QD=59.8339;RBI=0.00340889;REFB=0;REVB=-0.00336527;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.0828e-06;OID=.;OPOS=195505664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0 chr3 195505788 . G C 166.97 PASS AF=0.9375;AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0240868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.401;QD=41.7433;RBI=0.0605136;REFB=-0.0849705;REVB=0.0555132;RO=1;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433252;STB=0.523778;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0037353;OID=.;OPOS=195505788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:1:14:15:0.9375:4:10:1:0:5:10:1:0 chr3 195512107 . T A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.485;QD=42.1825;RBI=0.0837147;REFB=0;REVB=0.0785376;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172725;OID=.;OPOS=195512107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr3 195513102 . A G 37.5 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.102673;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1881;QD=7.14331;RBI=0.15332;REFB=-0.0326487;REVB=-0.113865;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35867;STB=0.726564;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.057812;OID=.;OPOS=195513102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:22:21:15:15:6:6:0.285714:2:4:5:10:2:4:5:10 chr3 195515594 . C G 2060.36 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.955;QD=61.0477;RBI=0.0567346;REFB=0;REVB=0.0487669;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024704;OID=.;OPOS=195515594;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:124:135:0:0:124:135:1:74:50:0:0:85:50:0:0 chr3 195515617 . G C 1944.67 PASS AF=0.992754;AO=127;DP=138;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0324177;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.9962;QD=56.3672;RBI=0.204348;REFB=-0.108915;REVB=0.20176;RO=10;SAF=45;SAR=82;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545081;STB=0.502702;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0140816;OID=.;OPOS=195515617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:138:138:10:1:127:137:0.992754:82:45:0:10:92:45:0:1 chr3 195516630 . G T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.181;QD=63.872;RBI=0.0128505;REFB=0;REVB=0.00843949;RO=0;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66373e-05;OID=.;OPOS=195516630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:36:12:0:0:36:12:0:0 chr3 195516878 . T C 394.07 PASS AF=1;AO=23;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.966;QD=56.2959;RBI=0.157595;REFB=0;REVB=0.0926009;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170322;OID=.;OPOS=195516878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:23:28:1:15:8:0:0:18:10:0:0 chr3 195517258 . G A 923.72 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949007;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.277;QD=58.649;RBI=0.0171078;REFB=0;REVB=-0.0142343;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.17531e-05;OID=.;OPOS=195517258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0 chr3 195517321 . G A 520.01 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.71;QD=59.4294;RBI=0.0320444;REFB=0;REVB=-0.0192404;RO=0;SAF=32;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.86177e-05;OID=.;OPOS=195517321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:3:32:0:0:3:32:0:0 chr3 195517553 . A C 726.96 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.265;QD=63.2136;RBI=0.0380918;REFB=0;REVB=0.035489;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170379;OID=.;OPOS=195517553;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0 chr3 195518112 . T TGTCTCCTGCGTAACA 767.57 PASS AF=0.72093;AO=59;DP=90;FAO=62;FDP=86;FR=.;FRO=24;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0073114;FXX=0.0444395;HRUN=1;LEN=15;MLLD=447.664;QD=35.7011;RBI=0.0115073;REFB=-0.0171297;REVB=0.00888603;RO=24;SAF=31;SAR=28;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763711;STB=0.537838;STBP=0.259;TYPE=ins;VARB=0.0046688;OID=.;OPOS=195518113;OREF=-;OALT=GTCTCCTGCGTAACA;OMAPALT=TGTCTCCTGCGTAACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.72093:59:90:62:86:24:33:29:16:8:99:24:31:28:16:8 chr3 195518330 . C G 108.25 PASS AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978184;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5503;QD=43.3011;RBI=0.0520432;REFB=0;REVB=-0.0511156;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0162501;OID=.;OPOS=195518330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr3 195606019 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00419129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.025;QD=47.8224;RBI=0.0231875;REFB=0;REVB=0.0228056;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237631;OID=.;OPOS=195606019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr3 195615376 . A G 547.14 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.096;QD=59.1501;RBI=0.027952;REFB=0;REVB=0.00806558;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000410598;OID=.;OPOS=195615376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:23:13:0:0:23:14:0:0 chr3 195668443 . GA G 101.79 PASS AF=0.325;AO=11;DP=39;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00322625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.672;QD=10.1785;RBI=0.00333717;REFB=-0.0215773;REVB=-0.000853212;RO=27;SAF=10;SAR=1;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397232;STB=0.776422;STBP=0.071;TYPE=del;VARB=0.0426576;OID=.;OPOS=195668444;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.325:11:39:13:40:27:12:1:19:8:99:27:10:1:19:8 chr3 195668478 . A G 532.04 PASS AF=0.95;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00812882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9757;QD=53.2043;RBI=0.0185121;REFB=-0.132918;REVB=-0.0166319;RO=2;SAF=24;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374416;STB=0.519221;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00564025;OID=.;OPOS=195668478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:39:40:2:2:37:38:0.95:13:24:2:0:13:25:2:0 chr3 195701278 . C T 265.96 PASS AF=0.305085;AO=36;DP=118;FAO=36;FDP=118;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.0269732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.66;QD=9.01561;RBI=0.0272626;REFB=-0.00258128;REVB=-0.00396197;RO=82;SAF=17;SAR=19;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906344;STB=0.553022;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0160697;OID=.;OPOS=195701278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:82:82:36:36:0.305085:19:17:45:37:19:17:45:37 chr3 195701285 . G T 304.2 PASS AF=0.310078;AO=40;DP=129;FAO=40;FDP=129;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=0.0168055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.771;QD=9.43239;RBI=0.0211386;REFB=-0.00254846;REVB=-0.0128225;RO=88;SAF=19;SAR=21;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829547;STB=0.551965;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00564813;OID=.;OPOS=195701285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:88:89:40:40:0.310078:21:19:48:40:21:19:49:40 chr3 195701304 . C T 429.37 PASS AF=0.346154;AO=54;DP=156;FAO=54;FDP=156;FR=.;FRO=102;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=57;FSRR=45;FWDB=0.0227977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.954;QD=11.0094;RBI=0.0263129;REFB=-0.00302703;REVB=0.0131391;RO=102;SAF=28;SAR=26;SRF=57;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461553;STB=0.526431;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0120202;OID=.;OPOS=195701304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:102:102:54:54:0.346154:26:28:57:45:26:28:57:45 chr3 195701310 . C CAA 278.7 PASS AF=0.337423;AO=54;DP=165;FAO=55;FDP=163;FR=.;FRO=108;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.00240177;FXX=0.0180712;HRUN=1;LEN=2;MLLD=40.3124;QD=6.83933;RBI=0.00561872;REFB=0.0140426;REVB=-0.00507952;RO=108;SAF=28;SAR=26;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430476;STB=0.512655;STBP=0.811;TYPE=ins;VARB=-0.0282041;OID=.;OPOS=195701311;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.337423:54:165:55:163:108:29:26:59:49:99:108:28:26:60:48 chr3 195701331 . G A 559.63 PASS AF=0.377143;AO=66;DP=175;FAO=66;FDP=175;FR=.;FRO=109;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=62;FSRR=47;FWDB=-0.0121912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.692;QD=12.7916;RBI=0.0531601;REFB=-0.000948979;REVB=0.0517433;RO=108;SAF=37;SAR=29;SRF=62;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150216;STB=0.505189;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00244653;OID=.;OPOS=195701331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:108:109:66:66:0.377143:29:37:62:46:29:37:62:47 chr3 195701388 . GC AA 816.52 PASS AF=0.522293;AO=82;DP=157;FAO=82;FDP=157;FR=.;FRO=75;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0132567;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=207.845;QD=20.803;RBI=0.0218149;REFB=-0.00529218;REVB=0.0173249;RO=74;SAF=54;SAR=28;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120909;STB=0.563789;STBP=0.118;TYPE=mnp;VARB=0.00480017;OID=.;OPOS=195701388;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:74:75:82:82:0.522293:28:54:39:35:28:54:40:35 chr3 195710989 . G A 51.45 PASS AF=0.106195;AO=9;DP=113;FAO=12;FDP=113;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=-0.0230261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.992;QD=1.82134;RBI=0.02813;REFB=-0.00283049;REVB=0.0161586;RO=87;SAF=4;SAR=5;SRF=26;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181686;STB=0.662584;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.04494;OID=.;OPOS=195710989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:113:113:87:101:9:12:0.106195:5:4:26:61:5:7:40:61 chr3 195710993 . A G 73.99 PASS AF=0.123188;AO=17;DP=136;FAO=17;FDP=138;FR=.;FRO=121;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=54;FSRR=67;FWDB=7.37555e-05;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.76;QD=2.14457;RBI=0.0158197;REFB=0.00108649;REVB=-0.0158195;RO=119;SAF=9;SAR=8;SRF=52;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114458;STB=0.572435;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=-0.0112047;OID=.;OPOS=195710993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:136:138:119:121:17:17:0.123188:8:9:52:67:8:9:54:67 chr3 195711016 . G A 1565.0 PASS AF=0.78481;AO=124;DP=156;FAO=124;FDP=158;FR=.;FRO=34;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0125275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5436;QD=39.6203;RBI=0.0125581;REFB=-0.0186991;REVB=-0.000874776;RO=32;SAF=52;SAR=72;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439578;STB=0.530506;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00687554;OID=.;OPOS=195711016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:158:32:34:124:124:0.78481:72:52:17:15:72:52:19:15 chr3 195925458 . A C 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0312022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6076;QD=15.9167;RBI=0.0321551;REFB=-0.000407975;REVB=0.00776998;RO=15;SAF=3;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313219;STB=0.682926;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.000282244;OID=.;OPOS=195925458;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:10:3:8:7:10:3:8:7 chr3 195938177 . A G 239.23 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0486795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2846;QD=20.803;RBI=0.0490367;REFB=-0.0118994;REVB=-0.00590818;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796895;STB=0.544709;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0160716;OID=.;OPOS=195938177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:13:10:8:15:13:10:8:15 chr3 195941216 . C G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.078;QD=57.5452;RBI=0.0334917;REFB=0;REVB=0.0328152;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95959e-05;OID=.;OPOS=195941216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0 chr3 195941387 . GA AG,GAA 30.23 PASS AF=0.555556,0.222222;AO=2,2;DP=9;FAO=5,2;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3,0;FSAR=2,2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0312116,0.327072;FXX=0.0999001;HRUN=1,9;LEN=2,1;MLLD=12.7567,5.71386;QD=13.4361;RBI=0.220162,0.419405;REFB=-0.0456869,-0.0415316;REVB=-0.217938,0.262534;RO=1;SAF=1,0;SAR=1,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.25849,-0.697199;STB=0.529293,0.992443;STBP=0.911,0.326;TYPE=mnp,ins;VARB=0.010093,0.121837;OID=.,.;OPOS=195941387,195941388;OREF=GA,-;OALT=AG,A;OMAPALT=AG,GAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:9:9:1:2:2,2:5,2:0.555556,0.222222:1,2:1,0:1:0:2,2:3,0:1:1 chr3 195955762 . G A 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.975;QD=61.695;RBI=0.0233026;REFB=0;REVB=0.0117536;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27299e-05;OID=.;OPOS=195955762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:32:50:0:0:32:50:0:0 chr3 195956827 . T C 837.54 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00354002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4528;QD=55.8362;RBI=0.0056933;REFB=-0.174417;REVB=-0.00445891;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00224233;OID=.;OPOS=195956827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:30:29:0:0:30:29:1:0 chr3 196054439 . T G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00263068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.299;QD=59.0187;RBI=0.0143916;REFB=0;REVB=-0.0141491;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.72593e-05;OID=.;OPOS=196054439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr3 196294104 . C G 846.96 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000255871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.036;QD=57.4208;RBI=0.0262349;REFB=0;REVB=0.0262337;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44601e-05;OID=.;OPOS=196294104;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:28:29:0:0:29:30:0:0 chr3 196386964 . C G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.671;QD=62.9829;RBI=0.0254534;REFB=0;REVB=0.02428;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74405e-05;OID=.;OPOS=196386964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0 chr3 196435534 . T C 169.18 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0704566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.981;QD=13.0141;RBI=0.0708837;REFB=-0.00242625;REVB=-0.00776946;RO=32;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164631;STB=0.59552;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00601572;OID=.;OPOS=196435534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:13:7:16:16:13:7:16:16 chr3 196438826 . G T 113.87 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0260449;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1638;QD=16.8695;RBI=0.0373001;REFB=-0.0141254;REVB=0.0267013;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121144;STB=0.55483;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0179502;OID=.;OPOS=196438826;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:15:14:13:13:0.481481:7:6:5:10:7:6:5:9 chr3 196443803 . T C 1635.79 PASS AF=0.435208;AO=176;DP=407;FAO=178;FDP=409;FR=.;FRO=231;FSAF=68;FSAR=110;FSRF=106;FSRR=125;FWDB=0.0290348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5257;QD=15.9979;RBI=0.0480112;REFB=-0.0150932;REVB=0.0382369;RO=231;SAF=66;SAR=110;SRF=106;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891084;STB=0.544984;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0267012;OID=.;OPOS=196443803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:407:409:231:231:176:178:0.435208:110:66:106:125:110:68:106:125 chr3 196448103 . C T 241.11 PASS AF=0.5;AO=24;DP=47;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00409026;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.057;QD=20.9664;RBI=0.00411433;REFB=-0.00010174;REVB=0.000444435;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223687;STB=0.607385;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.000144428;OID=.;OPOS=196448103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:22:23:24:23:0.5:14:10:15:7:13:10:15:8 chr3 196511870 . C T 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00216332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.513;QD=14.6525;RBI=0.0192263;REFB=-0.0214661;REVB=0.0191043;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553146;STB=0.53322;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00618437;OID=.;OPOS=196511870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:2:3:4:2:2:3 chr3 196511920 . C T 31.6 PASS AF=0.555556;AO=4;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0137209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.135;QD=14.0438;RBI=0.0364655;REFB=-0.0176118;REVB=-0.0337857;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223593;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0207814;OID=.;OPOS=196511920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:4:5:0.555556:1:3:2:2:2:3:2:2 chr3 196529914 . A G 195.85 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0545884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3683;QD=25.2709;RBI=0.0545891;REFB=-0.0595055;REVB=-0.000281319;RO=12;SAF=13;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138976;STB=0.577693;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0340007;OID=.;OPOS=196529914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:6:13:6:6:6:13:6:6 chr3 196674749 . C T 138.91 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0173786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7456;QD=19.8436;RBI=0.0558807;REFB=-0.0368607;REVB=0.0531097;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183258;STB=0.603639;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0463872;OID=.;OPOS=196674749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:8:7:9:4:8:7:9:4 chr3 196674879 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6105;QD=61.336;RBI=0.0549102;REFB=0;REVB=-0.0393392;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116398;OID=.;OPOS=196674879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr3 196674916 . A C 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.103;QD=60.2289;RBI=0.0223133;REFB=0;REVB=0.00457916;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66848e-05;OID=.;OPOS=196674916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr3 196674972 . CT TC 299.23 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0050906;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=249.298;QD=52.0407;RBI=0.0194986;REFB=0;REVB=0.0188224;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000885173;OID=.;OPOS=196674972;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:17:5:0:0:17:6:0:0 chr3 196736598 . G C 734.36 PASS AF=0.44382;AO=78;DP=177;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.00132729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.563;QD=16.5025;RBI=0.0029133;REFB=-0.00841089;REVB=-0.00259338;RO=96;SAF=51;SAR=27;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128164;STB=0.564446;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00841622;OID=.;OPOS=196736598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:96:99:78:79:0.44382:27:51:51:45:28:51:53:46 chr3 196742244 . G A 387.32 PASS AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0462273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.668;QD=18.4438;RBI=0.0462293;REFB=-0.0152301;REVB=0.000436198;RO=43;SAF=25;SAR=15;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21408;STB=0.613715;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0246172;OID=.;OPOS=196742244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:44:40:40:0.47619:15:25:17:26:15:25:18:26 chr3 196742290 . T C 330.89 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.00233295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.473;QD=15.9463;RBI=0.00271799;REFB=-0.00580468;REVB=-0.00139458;RO=47;SAF=22;SAR=14;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267714;STB=0.650378;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00688239;OID=.;OPOS=196742290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:14:22:16:31:14:22:16:31 chr3 196743130 . T C 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00997612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.504;QD=13.9116;RBI=0.0338168;REFB=-0.00149572;REVB=-0.0323118;RO=31;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142457;STB=0.58201;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00237866;OID=.;OPOS=196743130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:8:13:15:16:8:13:15:16 chr3 196746629 . T C 298.87 PASS AF=0.458333;AO=32;DP=71;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0159616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2997;QD=16.6038;RBI=0.0172997;REFB=-0.014038;REVB=-0.00667156;RO=39;SAF=15;SAR=17;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322635;STB=0.510198;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0160897;OID=.;OPOS=196746629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:39:39:32:33:0.458333:17:15:17:22:18:15:17:22 chr3 196750765 . G A 402.8 PASS AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0056696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.273;QD=19.1809;RBI=0.0103074;REFB=-0.0256556;REVB=0.00860802;RO=43;SAF=15;SAR=26;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00617283;STB=0.503434;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0303208;OID=.;OPOS=196750765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:26:15:16:27:26:15:16:27 chr3 196751281 . A C 349.25 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00578807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.655;QD=20.2462;RBI=0.0112029;REFB=-0.00224441;REVB=0.00959183;RO=32;SAF=23;SAR=13;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149092;STB=0.576398;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0019361;OID=.;OPOS=196751281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:33:36:36:0.521739:13:23:15:17:13:23:16:17 chr3 196770355 . TAAGG T 1906.03 PASS AF=1;AO=151;DP=158;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361926;FXX=0.0379723;HRUN=2;LEN=4;MLLD=182.592;QD=50.1587;RBI=0.0362019;REFB=0;REVB=0.000819123;RO=0;SAF=58;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9094e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-1.83038e-06;OID=.;OPOS=196770356;OREF=AAGG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:151:158:152:152:0:58:94:0:0:33:0:58:93:0:0 chr3 196771245 . G A 727.03 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199352;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.418;QD=57.0215;RBI=0.0269922;REFB=0;REVB=-0.018198;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156623;OID=.;OPOS=196771245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr3 196846376 . A G 278.89 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0156394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.078;QD=16.4055;RBI=0.0195097;REFB=-0.00784522;REVB=-0.0116635;RO=37;SAF=11;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796175;STB=0.544875;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0107472;OID=.;OPOS=196846376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:20:11:16:21:20:11:16:21 chr3 197020780 . G A,GA 94.65 PASS AF=0.0542636,0.248062;AO=7,29;DP=144;FAO=7,32;FDP=129;FR=.;FRO=90;FSAF=5,14;FSAR=2,18;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=-0.00507739,0.0291385;FXX=0.0300729;HRUN=1,6;LEN=1,1;MLLD=234.29,8.14168;QD=2.93487;RBI=0.0353397,0.0963404;REFB=0.0025411,-0.0694731;REVB=-0.0349731,-0.0918282;RO=94;SAF=5,16;SAR=2,13;SRF=46;SRR=48;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.236871,0.0781285;STB=0.674332,0.570508;STBP=0.353,0.358;TYPE=snp,ins;VARB=0.0299127,0.0245528;OID=.,.;OPOS=197020780,197020781;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:65:144:129:94:90:7,29:7,32:0.0542636,0.248062:2,13:5,16:46:48:2,18:5,14:48:42 chr3 197495334 . G A 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00704421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0069;QD=57.1056;RBI=0.0407777;REFB=0;REVB=0.0401647;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318101;OID=.;OPOS=197495334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0 chr3 197882505 . CT C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0805068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.241;QD=35.5759;RBI=0.0805068;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000965496;OID=.;OPOS=197882506;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:7:7:7:0:7:0:0:0:4:0:7:0:0:0 chr4 53428 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.77;QD=57.1062;RBI=0.0693746;REFB=0;REVB=0.0530123;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169033;OID=.;OPOS=53428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0 chr4 60303 . G A 37.4 PASS AF=0.0639098;AO=17;DP=264;FAO=17;FDP=266;FR=.;FRO=249;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=121;FSRR=128;FWDB=-0.0440358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.943;QD=0.562384;RBI=0.058376;REFB=-0.00534572;REVB=-0.0383223;RO=246;SAF=7;SAR=10;SRF=120;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815388;STB=0.569819;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.087312;OID=.;OPOS=60303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:264:266:246:249:17:17:0.0639098:10:7:120:126:10:7:121:128 chr4 67783 . CTTT CTTC,C,CT,CTT,TCTT,TTCT 718.01 PASS AF=0.0733945,0,0.917431,0,0,0.00917431;AO=5,11,24,24,6,9;DP=100;FAO=8,0,100,0,0,1;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=3,0,44,0,0,0;FSAR=5,0,56,0,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400201,0.200188,0.304158,0.599785,0.106686,0.0902451;FXX=0.0353951;HRUN=13,13,13,13,1,1;LEN=1,3,2,1,2,3;MLLD=163.672,8.89618,7.99875,3.83702,10.2568,16.5801;QD=26.349;RBI=0.04192,0.206267,0.311764,0.61978,0.114739,0.0953677;REFB=0,0,0,0,0,0;REVB=-0.0124771,0.0497079,0.0684429,0.156154,0.0422283,0.0308356;RO=4;SAF=0,1,4,3,6,9;SAR=5,10,20,21,0,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0,0;SSSB=-0.804028,-0.575869,-0.303703,-0.36283,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del,mnp,mnp;VARB=0.0114074,-0.145622,0.0308459,0,-0.0721433,-0.301113;OID=.,.,.,.,.,.;OPOS=67786,67784,67784,67784,67783,67783;OREF=T,TTT,TT,T,CT,CTT;OALT=C,-,-,-,TC,TTC;OMAPALT=CTTC,C,CT,CTT,TCTT,TTCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:29:100:109:4:0:5,11,24,24,6,9:8,0,100,0,0,1:0.0733945,0,0.917431,0,0,0.00917431:5,10,20,21,0,0:0,1,4,3,6,9:4:0:5,0,56,0,0,1:3,0,44,0,0,0:0:0 chr4 85995 . C CA 248.54 PASS AF=1;AO=23;DP=31;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397514;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.2018;QD=39.7668;RBI=0.090055;REFB=0;REVB=-0.0808067;RO=5;SAF=10;SAR=13;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119766;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00516975;OID=.;OPOS=85996;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:31:25:25:0:11:14:0:0:5:5:10:13:4:1 chr4 86040 . G T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.191;QD=33.4284;RBI=0.10487;REFB=0;REVB=0.0105785;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00311272;OID=.;OPOS=86040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr4 86042 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.692;QD=33.4285;RBI=0.0112462;REFB=0;REVB=0.0109349;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164115;OID=.;OPOS=86042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr4 86738 . A G 472.35 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.46;QD=55.5709;RBI=0.0275515;REFB=-0.0719823;REVB=0.0226714;RO=1;SAF=18;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252499;STB=0.513505;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394299;OID=.;OPOS=86738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:15:18:1:0:15:18:1:0 chr4 87277 . G C 594.47 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.657;QD=60.9715;RBI=0.0290652;REFB=0;REVB=-0.0160753;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.35879e-05;OID=.;OPOS=87277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0 chr4 87313 . G GA 490.29 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.8375;QD=49.0295;RBI=0.0237298;REFB=0;REVB=0.0149761;RO=1;SAF=23;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199479;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-6.45507e-05;OID=.;OPOS=87314;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:40:40:40:0:24:16:0:0:8:1:23:16:1:0 chr4 527677 . T C 226.55 PASS AF=0.397059;AO=26;DP=67;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00731556;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.037;QD=13.3263;RBI=0.00753896;REFB=-0.00206631;REVB=0.00182165;RO=40;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556411;STB=0.526296;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0029119;OID=.;OPOS=527677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:40:41:26:27:0.397059:11:15:21:19:12:15:21:20 chr4 533001 . T C 217.76 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0243916;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.5335;QD=16.7511;RBI=0.0246179;REFB=0.0108916;REVB=-0.0033304;RO=27;SAF=7;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123034;STB=0.58296;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.0143303;OID=.;OPOS=533001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:17:7:11:16:17:7:12:16 chr4 648643 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.513;QD=58.5878;RBI=0.0250673;REFB=0;REVB=-0.0162397;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24977e-05;OID=.;OPOS=648643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr4 663908 . A G 324.49 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0110789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.82;QD=19.6662;RBI=0.0237059;REFB=-0.00576777;REVB=0.0209578;RO=32;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818288;STB=0.545428;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00536583;OID=.;OPOS=663908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:17:17:13:19:17:17:13:19 chr4 675855 . G A 177.59 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0864327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.211;QD=21.5264;RBI=0.0870943;REFB=-0.0280482;REVB=0.0107147;RO=13;SAF=2;SAR=16;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750421;STB=0.639816;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0177991;OID=.;OPOS=675855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:15:18:18:0.545455:16:2:2:11:16:2:4:11 chr4 677103 . G A 415.31 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.0216416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4211;QD=19.3167;RBI=0.0217922;REFB=-0.0420066;REVB=0.00255788;RO=44;SAF=14;SAR=28;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318373;STB=0.676839;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0239565;OID=.;OPOS=677103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:28:14:30:14:28:14:30:14 chr4 755129 . C T 975.56 PASS AF=0.605634;AO=86;DP=143;FAO=86;FDP=142;FR=.;FRO=56;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.00674218;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.741;QD=27.4804;RBI=0.0458522;REFB=-0.00587079;REVB=0.0453538;RO=57;SAF=41;SAR=45;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749836;STB=0.544285;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00567309;OID=.;OPOS=755129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:57:56:86:86:0.605634:45:41:33:24:45:41:33:23 chr4 762285 . A G 387.81 PASS AF=0.427184;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.00798587;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.492;QD=15.0607;RBI=0.0102782;REFB=0.00309175;REVB=-0.0064705;RO=61;SAF=19;SAR=25;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023187;STB=0.504725;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=-0.00532956;OID=.;OPOS=762285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:103:61:59:44:44:0.427184:25:19:25:36:25:19:25:34 chr4 762963 . A G 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.541;QD=40.7607;RBI=0.0235029;REFB=0;REVB=0.016552;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306915;OID=.;OPOS=762963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0 chr4 780286 . C G 328.18 PASS AF=0.492958;AO=33;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.0119424;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.299;QD=18.4891;RBI=0.0145294;REFB=-0.0377401;REVB=0.0082753;RO=35;SAF=22;SAR=11;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503619;STB=0.536415;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0330586;OID=.;OPOS=780286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:35:36:33:35:0.492958:11:22:25:10:13:22:25:11 chr4 843695 . A G 443.11 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.404;QD=57.1759;RBI=0.0197308;REFB=0;REVB=0.00217073;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111876;OID=.;OPOS=843695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0 chr4 843720 . T C 178.86 PASS AF=0.392857;AO=21;DP=55;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0326257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2654;QD=12.7754;RBI=0.0326257;REFB=-0.032116;REVB=-1.53682e-05;RO=34;SAF=12;SAR=9;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838926;STB=0.535682;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0506971;OID=.;OPOS=843720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:34:34:21:22:0.392857:9:12:22:12:9:13:22:12 chr4 858941 . T C 666.79 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5622;QD=62.0267;RBI=0.0922592;REFB=0;REVB=0.0784165;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000969449;OID=.;OPOS=858941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr4 860192 . A G 103.75 PASS AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0308243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.308;QD=6.38442;RBI=0.104998;REFB=-0.0109921;REVB=-0.100371;RO=47;SAF=10;SAR=6;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639745;STB=0.526283;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0386398;OID=.;OPOS=860192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:47:49:16:16:0.246154:6:10:27:20:6:10:29:20 chr4 946226 . T C 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0923551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.622;QD=26.0293;RBI=0.0926181;REFB=-0.135584;REVB=-0.00697389;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599655;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0186359;OID=.;OPOS=946226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:0:1:6:6:0.857143:2:4:0:0:2:4:0:1 chr4 954885 . G T 118.32 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0113312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.698;QD=12.7913;RBI=0.0227472;REFB=-0.0143866;REVB=0.0197241;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229769;STB=0.513494;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0228042;OID=.;OPOS=954885;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:7:7:11:12:7:7:11:12 chr4 961373 . G A 569.93 PASS AF=0.491667;AO=58;DP=119;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=42;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=0.0117217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.269;QD=18.9976;RBI=0.0165674;REFB=-0.0179195;REVB=-0.0117082;RO=60;SAF=41;SAR=17;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436436;STB=0.533768;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0234458;OID=.;OPOS=961373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:60:61:58:59:0.491667:17:41:40:20:17:42:40:21 chr4 982852 . G A 834.57 PASS AF=0.532051;AO=83;DP=156;FAO=83;FDP=156;FR=.;FRO=73;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.0314915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.257;QD=21.3993;RBI=0.041413;REFB=-0.0271631;REVB=0.0268946;RO=73;SAF=33;SAR=50;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118891;STB=0.506511;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0191552;OID=.;OPOS=982852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:73:73:83:83:0.532051:50:33:30:43:50:33:30:43 chr4 983060 . T C 1246.68 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00165287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.505;QD=61.5645;RBI=0.0469896;REFB=0;REVB=0.0469605;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145435;OID=.;OPOS=983060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:36:44:0:0:37:44:0:0 chr4 983809 . C T 321.79 PASS AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.029625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1626;QD=23.8363;RBI=0.0381991;REFB=-0.0554141;REVB=-0.0241149;RO=21;SAF=23;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12294;STB=0.581064;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0365406;OID=.;OPOS=983809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:21:22:32:32:0.592593:9:23:12:9:9:23:12:10 chr4 985727 . A G 1547.94 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00527309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.154;QD=63.8325;RBI=0.0443191;REFB=0;REVB=0.0440043;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85482e-05;OID=.;OPOS=985727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:50:46:0:0:51:46:0:0 chr4 1018705 . C A 111.19 PASS AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.132704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7803;QD=8.89498;RBI=0.133823;REFB=0.0176695;REVB=-0.0172678;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165217;STB=0.599863;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.0381069;OID=.;OPOS=1018705;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:7:7:13:23:7:7:13:23 chr4 1050653 . G A 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0372053;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.698;QD=9.20006;RBI=0.051604;REFB=-0.0201484;REVB=-0.0357593;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1654;STB=0.529329;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0294306;OID=.;OPOS=1050653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:20:20:11:13:7:7:0.35:3:4:8:3:3:4:8:5 chr4 1052125 . T C 272.52 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9053;QD=51.9082;RBI=0.0531565;REFB=0;REVB=0.0521617;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128877;OID=.;OPOS=1052125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr4 1052166 . A C 223.18 PASS AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.7;QD=49.5961;RBI=0.0591436;REFB=0;REVB=0.0521933;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322313;OID=.;OPOS=1052166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:9:7:0:0:10:8:0:0 chr4 1087327 . G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 44.46 PASS AF=0.233333;AO=6;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=2;FWDB=0.00404338;FXX=0.0322477;HRUN=0;LEN=21;MLLD=585.136;QD=5.92831;RBI=0.0136377;REFB=-0.0230247;REVB=-0.0130245;RO=23;SAF=4;SAR=2;SRF=21;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422596;STB=0.721793;STBP=0.471;TYPE=ins;VARB=0.0648745;OID=.;OPOS=1087328;OREF=-;OALT=CTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC;OMAPALT=GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.233333:6:30:7:30:23:5:2:21:2:44:23:4:2:21:2 chr4 1087329 . C T 34.15 PASS AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=3;FWDB=-0.00638316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.586;QD=4.01777;RBI=0.0174505;REFB=-0.0161939;REVB=-0.0162411;RO=24;SAF=4;SAR=2;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34146;STB=0.743056;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.051234;OID=.;OPOS=1087329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:34:34:24:28:6:6:0.176471:2:4:21:3:2:4:25:3 chr4 1087338 . C T 127.43 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=-0.00175491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.83;QD=11.8535;RBI=0.0161723;REFB=-0.00513424;REVB=-0.0160768;RO=28;SAF=9;SAR=6;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327103;STB=0.6873;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00767268;OID=.;OPOS=1087338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:6:9:24:4:6:9:24:4 chr4 1090625 . G A 110.65 PASS AF=0.448276;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00606294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.672;QD=15.2624;RBI=0.0184131;REFB=-0.028536;REVB=0.0173863;RO=16;SAF=10;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209717;STB=0.559344;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0352871;OID=.;OPOS=1090625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:16:16:12:13:0.448276:2:10:11:5:3:10:11:5 chr4 1164277 . C G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.206;QD=61.3361;RBI=0.0333287;REFB=0;REVB=0.0188558;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329623;OID=.;OPOS=1164277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr4 1164552 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.677;QD=56.1914;RBI=0.0425165;REFB=0;REVB=0.0136785;RO=0;SAF=26;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238416;OID=.;OPOS=1164552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:2:26:0:0:2:26:0:0 chr4 1165130 . G T 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.455;QD=56.7052;RBI=0.0677522;REFB=0;REVB=0.0595575;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879716;OID=.;OPOS=1165130;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr4 1165741 . A G 1132.99 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.034;QD=60.4264;RBI=0.0129245;REFB=0;REVB=0.0119489;RO=0;SAF=27;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2845e-05;OID=.;OPOS=1165741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:47:27:0:0:48:27:0:0 chr4 1194630 . T C 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.799;QD=61.6825;RBI=0.0514333;REFB=0;REVB=0.0256898;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.62254e-05;OID=.;OPOS=1194630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0 chr4 1215585 . T C,G 712.75 PASS AF=0.961538,0.0384615;AO=48,2;DP=51;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27,1;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267394,0.00273087;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.6937,178.449;QD=54.827;RBI=0.0964215,0.0255451;REFB=0,0;REVB=0.0926397,0.0253987;RO=0;SAF=27,1;SAR=21,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00833638,0.0822508;OID=.,.;OPOS=1215585,1215585;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:51:52:0:0:48,2:50,2:0.961538,0.0384615:21,1:27,1:0:0:23,1:27,1:0:0 chr4 1244416 . A G 1339.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00391358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.959;QD=62.3147;RBI=0.00710501;REFB=0;REVB=-0.00593001;RO=0;SAF=32;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.79022e-06;OID=.;OPOS=1244416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:54:32:0:0:54:32:0:0 chr4 1333606 . C T 417.74 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0134087;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.788;QD=17.0506;RBI=0.0200794;REFB=-0.0231385;REVB=0.0149461;RO=55;SAF=16;SAR=27;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140421;STB=0.57891;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0231216;OID=.;OPOS=1333606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:55:55:43:43:0.438776:27:16:28:27:27:16:28:27 chr4 1374695 . C A 214.36 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0159598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.354;QD=12.7978;RBI=0.0177242;REFB=-0.00527215;REVB=0.00770929;RO=40;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264382;STB=0.522371;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00772965;OID=.;OPOS=1374695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:13:13:19:21:13:13:19:22 chr4 1374774 . C T 130.26 PASS AF=0.405405;AO=12;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0234261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.254;QD=14.0818;RBI=0.0420045;REFB=-0.0175381;REVB=-0.0348654;RO=20;SAF=9;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287731;STB=0.58684;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0598355;OID=.;OPOS=1374774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:22:12:15:0.405405:3:9:10:10:6:9:10:12 chr4 1377615 . A G 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0009684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.904;QD=19.4667;RBI=0.00910328;REFB=-0.0245115;REVB=0.00905162;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254714;STB=0.630237;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0200196;OID=.;OPOS=1377615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:12:10:17:6:12:10:17:7 chr4 1619865 . T C 237.68 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00333691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.187;QD=18.6418;RBI=0.0170012;REFB=-0.00535783;REVB=-0.0166705;RO=26;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136863;STB=0.507686;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00587809;OID=.;OPOS=1619865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:16:9:9:17:16:9:9:17 chr4 1685171 . G C 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.018885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.113;QD=9.49525;RBI=0.0485624;REFB=-0.0116413;REVB=-0.04474;RO=24;SAF=8;SAR=3;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133345;STB=0.581662;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0257176;OID=.;OPOS=1685171;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:3:8:15:9:3:8:15:9 chr4 1685211 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.527;QD=59.0185;RBI=0.0284683;REFB=0;REVB=0.0240426;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133554;OID=.;OPOS=1685211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0 chr4 1701317 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.118;QD=57.3856;RBI=0.0110939;REFB=0;REVB=0.00821226;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4781e-05;OID=.;OPOS=1701317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0 chr4 1737502 . C T 638.76 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0184154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3372;QD=59.4196;RBI=0.029052;REFB=-0.0844143;REVB=0.0224698;RO=1;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347354;STB=0.51851;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00104247;OID=.;OPOS=1737502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:13:29:0:1:13:29:0:1 chr4 1739518 . CGCCATCCCTGCCATC CGCCATC,CGCCAT 544.96 PASS AF=1,0;AO=29,16;DP=49;FAO=45,0;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.80135e-05,-0.0202277;FXX=0.081616;HRUN=3,3;LEN=9,10;MLLD=287.618,268.836;QD=48.4405;RBI=0.0208316,0.0295644;REFB=0,0;REVB=0.0208316,0.0215613;RO=0;SAF=7,16;SAR=22,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.446729,0.446729;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000225874,0;OID=.,.;OPOS=1739519,1739524;OREF=GCCATCCCT,CCCTGCCATC;OALT=-,-;OMAPALT=CGCCATC,CGCCAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:29,16:49:45,0:45:0:24,0:21,0:0:0:10:0:7,16:22,0:0:0 chr4 1739592 . A G 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.744;QD=64.4127;RBI=0.0137088;REFB=0;REVB=-0.00500539;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57391e-05;OID=.;OPOS=1739592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0 chr4 1807894 . G A 370.8 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.326;QD=54.934;RBI=0.0301721;REFB=0;REVB=0.0238279;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391998;OID=.;OPOS=1807894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:15:12:0:0 chr4 1809127 . CGT C,TGC 1058.14 PASS AF=0.901408,0.0985915;AO=49,15;DP=82;FAO=64,7;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=9,6;FSAR=55,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436595,-0.0395644;FXX=0.154743;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=86.4352,67.1459;QD=59.6135;RBI=0.0549878,0.0568811;REFB=0,0;REVB=0.0334291,-0.0408671;RO=0;SAF=7,6;SAR=42,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0161948,0.0101429;OID=.,.;OPOS=1809128,1809127;OREF=GT,CGT;OALT=-,TGC;OMAPALT=C,TGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:34:82:71:0:0:49,15:64,7:0.901408,0.0985915:42,9:7,6:0:0:55,1:9,6:0:0 chr4 1815990 . G A 617.16 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042012;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.113;QD=61.7163;RBI=0.0321705;REFB=0;REVB=0.031895;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10924e-05;OID=.;OPOS=1815990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0 chr4 1816229 . C T 34.58 PASS AF=0.114286;AO=8;DP=70;FAO=8;FDP=70;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.0659084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2689;QD=1.97612;RBI=0.0660319;REFB=-0.00400343;REVB=0.00403684;RO=60;SAF=7;SAR=1;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553178;STB=0.902335;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.111168;OID=.;OPOS=1816229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:70:70:60:62:8:8:0.114286:1:7:23:37:1:7:23:39 chr4 1818594 . C T 1921.28 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.82;QD=60.5128;RBI=0.0258854;REFB=0;REVB=0.0199073;RO=1;SAF=61;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772408;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124604;OID=.;OPOS=1818594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:127:1:0:121:127:1:60:61:1:0:61:66:0:0 chr4 1944049 . G A 114.13 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0408926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8748;QD=18.2609;RBI=0.0417316;REFB=0.00197298;REVB=0.00832576;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00564475;STB=0.521706;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.00405609;OID=.;OPOS=1944049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:7:6:5:6:7:6:5:7 chr4 1954945 . A G 1730.83 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.091;QD=60.2028;RBI=0.0177939;REFB=0;REVB=-0.00663811;RO=1;SAF=43;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109137;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62667e-05;OID=.;OPOS=1954945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:115:1:0:113:115:1:70:43:1:0:71:44:0:0 chr4 1986542 . C T 259.63 PASS AF=1;AO=14;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395099;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6176;QD=51.9257;RBI=0.0397332;REFB=0;REVB=0.00420651;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122862;OID=.;OPOS=1986542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:20:0:0:14:20:1:7:7:0:0:10:10:0:0 chr4 1988119 . T C 74.92 PASS AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0285009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7791;QD=24.9742;RBI=0.0298114;REFB=-0.0050149;REVB=0.00874178;RO=3;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204298;STB=0.615147;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00166259;OID=.;OPOS=1988119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:5:4:0:3:5:4:0:3 chr4 2257020 . C CG,G 58.9 PASS AF=0.224138,0;AO=19,4;DP=64;FAO=13,0;FDP=58;FR=.;FRO=45;FSAF=1,0;FSAR=12,0;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.265149,-0.200362;FXX=0.0645057;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=66.308,111.482;QD=4.06183;RBI=0.275102,0.217531;REFB=-0.00940688,0.00880947;REVB=-0.07333,-0.0847042;RO=41;SAF=8,0;SAR=11,4;SRF=17;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00759944,-0.530924;STB=0.886769,0.5;STBP=0.005,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.147444,0;OID=.,.;OPOS=2257021,2257020;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:64:58:41:45:19,4:13,0:0.224138,0:11,4:8,0:17:24:12,0:1,0:22:23 chr4 2306053 . A G 130.72 PASS AF=0.636364;AO=12;DP=20;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00844578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.519;QD=23.7664;RBI=0.0283723;REFB=-0.0108436;REVB=0.0270861;RO=6;SAF=10;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274816;STB=0.588103;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0033375;OID=.;OPOS=2306053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:20:22:6:8:12:14:0.636364:2:10:3:3:4:10:4:4 chr4 2451694 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00615587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.013;QD=57.3858;RBI=0.030725;REFB=0;REVB=0.030102;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110526;OID=.;OPOS=2451694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr4 2460571 . C T 455.35 PASS AF=0.740741;AO=40;DP=55;FAO=40;FDP=54;FR=.;FRO=14;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0700259;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6065;QD=33.7298;RBI=0.0739794;REFB=0.0124728;REVB=0.0238604;RO=14;SAF=21;SAR=19;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568585;STB=0.530711;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.00195258;OID=.;OPOS=2460571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:14:14:40:40:0.740741:19:21:9:5:19:21:9:5 chr4 2461888 . A G 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.498;QD=59.8394;RBI=0.0591942;REFB=0;REVB=0.0590578;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317314;OID=.;OPOS=2461888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr4 2492191 . T C 252.76 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0134072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.343;QD=21.0636;RBI=0.0134345;REFB=-0.0162404;REVB=-0.000856586;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14747;STB=0.582691;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00677577;OID=.;OPOS=2492191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:9:15:11:13:9:15 chr4 2516903 . C T 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0169674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2067;QD=17.4015;RBI=0.01697;REFB=-0.0260176;REVB=-0.000295243;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334806;STB=0.658322;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0272292;OID=.;OPOS=2516903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:13:13:13:0.5:6:7:11:1:6:7:11:2 chr4 2743999 . A G 401.66 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.00649439;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.126;QD=21.422;RBI=0.0231212;REFB=-0.030341;REVB=-0.0221904;RO=35;SAF=20;SAR=20;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230589;STB=0.626607;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0194246;OID=.;OPOS=2743999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:20:20:8:27:20:20:8:27 chr4 2744087 . G A 412.35 PASS AF=0.639344;AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0546699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0509;QD=27.0395;RBI=0.0602389;REFB=-0.009191;REVB=0.0252968;RO=21;SAF=19;SAR=20;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130132;STB=0.561151;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00364952;OID=.;OPOS=2744087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:21:22:39:39:0.639344:20:19:6:15:20:19:7:15 chr4 2822467 . G T 305.87 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0265676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.728;QD=20.3911;RBI=0.0415109;REFB=-0.0306698;REVB=0.0318954;RO=28;SAF=12;SAR=20;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281114;STB=0.655642;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.011164;OID=.;OPOS=2822467;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:20:12:20:8:20:12:20:8 chr4 2826400 . T C 285.24 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0475649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9016;QD=15.4181;RBI=0.0592517;REFB=-0.00828087;REVB=-0.035332;RO=42;SAF=18;SAR=14;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831353;STB=0.546846;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0119265;OID=.;OPOS=2826400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:14:18:27:15:14:18:27:15 chr4 2828630 . G T 172.54 PASS AF=0.360656;AO=21;DP=60;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0404107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.053;QD=11.3144;RBI=0.0404918;REFB=-0.0154516;REVB=-0.00256145;RO=39;SAF=5;SAR=16;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644209;STB=0.507456;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0270236;OID=.;OPOS=2828630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:39:39:21:22:0.360656:16:5:11:28:16:6:11:28 chr4 2828771 . T G 280.52 PASS AF=0.774194;AO=23;DP=31;FAO=24;FDP=31;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0282872;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2302;QD=36.196;RBI=0.0283582;REFB=-0.0484697;REVB=-0.00200566;RO=6;SAF=5;SAR=18;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061953;STB=0.510629;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0289205;OID=.;OPOS=2828771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:31:31:6:7:23:24:0.774194:18:5:2:4:18:6:2:5 chr4 2831383 . T G 177.46 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00236778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.197;QD=21.51;RBI=0.0514044;REFB=-0.0260051;REVB=-0.0513499;RO=15;SAF=13;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226244;STB=0.628102;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0183172;OID=.;OPOS=2831383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:5:13:7:8:5:13:7:8 chr4 2906707 . G T 710.25 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.612;QD=54.6345;RBI=0.0355026;REFB=0.105753;REVB=0.0296612;RO=1;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209217;STB=0.511107;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000213881;OID=.;OPOS=2906707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:22:29:0:1:22:29:0:1 chr4 2916762 . C G 1106.32 PASS AF=1;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424057;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.901;QD=60.62;RBI=0.0459785;REFB=0;REVB=-0.0177704;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166891;OID=.;OPOS=2916762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0 chr4 2993963 . G C 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0198392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5022;QD=20.7554;RBI=0.0239755;REFB=-0.0335932;REVB=0.0134623;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713586;STB=0.540485;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0261117;OID=.;OPOS=2993963;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:5:10:7:5:5:10:7:5 chr4 3162056 . C T 885.32 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4898;QD=58.0536;RBI=0.072954;REFB=0;REVB=-0.072067;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000877633;OID=.;OPOS=3162056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0 chr4 3189379 . C T 38.16 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0325397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.887;QD=10.1747;RBI=0.0327853;REFB=-0.0225118;REVB=0.00400483;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.59968;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0126146;OID=.;OPOS=3189379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:3:3:6:3:3:3:6:3 chr4 3213832 . G A 837.92 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419202;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.999;QD=57.7875;RBI=0.0423621;REFB=0;REVB=0.00610312;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131237;OID=.;OPOS=3213832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr4 3215835 . T C 867.14 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0969325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.581;QD=57.8091;RBI=0.097558;REFB=0;REVB=0.0110304;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242637;OID=.;OPOS=3215835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:60:0:0:54:60:1:33:21:0:0:33:27:0:0 chr4 3219613 . A C 1844.12 PASS AF=1;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186887;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.057;QD=61.4705;RBI=0.0587667;REFB=0;REVB=0.0557159;RO=0;SAF=43;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.94297e-05;OID=.;OPOS=3219613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:120:0:0:120:120:1:77:43:0:0:77:43:0:0 chr4 3227419 . A G 1534.64 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.423;QD=62.6383;RBI=0.0409005;REFB=-0.140861;REVB=-0.0366584;RO=1;SAF=40;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117088;STB=0.506172;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000839871;OID=.;OPOS=3227419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:98:98:1:1:97:97:0.989796:57:40:1:0:57:40:1:0 chr4 3234980 . G A 1514.97 PASS AF=0.989691;AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00664854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.435;QD=62.4729;RBI=0.0107284;REFB=-0.102518;REVB=0.00842;RO=1;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106552;STB=0.505493;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-4.85904e-05;OID=.;OPOS=3234980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:1:1:95:96:0.989691:44:51:0:1:45:51:0:1 chr4 3257593 . C T 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0107368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.072;QD=22.9574;RBI=0.0185547;REFB=-0.0337039;REVB=0.0151327;RO=11;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123823;STB=0.569294;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0242302;OID=.;OPOS=3257593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:9:7:3:8:9:7:3:8 chr4 3263138 . G A 194.74 PASS AF=0.375;AO=23;DP=62;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0139283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.132;QD=12.1711;RBI=0.0431177;REFB=-0.0191543;REVB=0.0408061;RO=39;SAF=6;SAR=17;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157766;STB=0.611012;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.034262;OID=.;OPOS=3263138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:39:40:23:24:0.375:17:6:15:24:18:6:16:24 chr4 3318413 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.809;QD=51.9167;RBI=0.055562;REFB=0;REVB=0.0131655;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264132;OID=.;OPOS=3318413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr4 3319261 . G A 211.43 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00502087;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.548;QD=18.7936;RBI=0.00686978;REFB=-0.00749292;REVB=-0.00468878;RO=24;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178323;STB=0.600747;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0070821;OID=.;OPOS=3319261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:11:10:16:8:11:10:16:8 chr4 3319553 . C T 345.06 PASS AF=0.394231;AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0236382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7767;QD=13.2714;RBI=0.0251191;REFB=-0.0407008;REVB=-0.00849742;RO=62;SAF=23;SAR=18;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821218;STB=0.541921;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0507697;OID=.;OPOS=3319553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:63:41:41:0.394231:18:23:30:32:18:23:31:32 chr4 3417845 . G C 109.25 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0383939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.132;QD=14.0973;RBI=0.0417407;REFB=-0.0290253;REVB=-0.0163766;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904412;STB=0.552988;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0330779;OID=.;OPOS=3417845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:9:4:7:11:9:4:7:11 chr4 3427206 . C A 206.6 PASS AF=0.346667;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.0127735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=87.9466;QD=11.0186;RBI=0.0299942;REFB=-0.00523493;REVB=0.0271384;RO=48;SAF=12;SAR=14;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197868;STB=0.505151;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.010186;OID=.;OPOS=3427206;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:48:49:26:26:0.346667:14:12:23:25:14:12:23:26 chr4 3444503 . G A 290.96 PASS AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0173291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3807;QD=26.4509;RBI=0.0174025;REFB=-0.0342869;REVB=0.00159599;RO=18;SAF=18;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1125;STB=0.56245;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0148701;OID=.;OPOS=3444503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:18:18:26:26:0.590909:8:18:10:8:8:18:10:8 chr4 3445864 . T A 385.57 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00899558;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.62;QD=17.7272;RBI=0.0110416;REFB=-0.022906;REVB=-0.00640286;RO=42;SAF=23;SAR=17;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134723;STB=0.591721;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0264971;OID=.;OPOS=3445864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:87:42:47:40:40:0.45977:17:23:18:24:17:23:19:28 chr4 3446132 . C G 323.65 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.017;QD=53.9414;RBI=0.0200641;REFB=0;REVB=-0.00105499;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13297e-05;OID=.;OPOS=3446132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:14:8:0:0:14:10:0:0 chr4 3449652 . G A 269.29 PASS AF=0.43662;AO=28;DP=68;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.003684;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5618;QD=15.1711;RBI=0.0282117;REFB=-0.0203463;REVB=-0.0279701;RO=38;SAF=13;SAR=15;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894023;STB=0.533251;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0280456;OID=.;OPOS=3449652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:38:40:28:31:0.43662:15:13:21:17:15:16:23:17 chr4 3475252 . T C 3380.64 PASS AF=1;AO=217;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488906;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9319;QD=62.0301;RBI=0.054544;REFB=0;REVB=-0.0241817;RO=0;SAF=104;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60497e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213423;OID=.;OPOS=3475252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:219:218:0:0:217:218:1:113:104:0:0:113:105:0:0 chr4 3494600 . A G 152.35 PASS AF=0.551724;AO=15;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.00788842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.953;QD=21.0143;RBI=0.0301675;REFB=-0.0230434;REVB=0.0291178;RO=13;SAF=3;SAR=12;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381393;STB=0.530573;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0164062;OID=.;OPOS=3494600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:13:13:15:16:0.551724:12:3:3:10:13:3:3:10 chr4 3494826 . A C 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0173348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.081;QD=11.3693;RBI=0.0177576;REFB=-0.0105098;REVB=0.00385175;RO=19;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559997;STB=0.533274;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0228439;OID=.;OPOS=3494826;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:4:7:13:6:4:7:13:6 chr4 3494847 . G A 96.92 PASS AF=0.413793;AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0230308;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=132.22;QD=13.3686;RBI=0.023099;REFB=-0.032632;REVB=0.001774;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792561;STB=0.575637;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0483319;OID=.;OPOS=3494847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:28:29:17:17:11:12:0.413793:4:7:12:5:5:7:12:5 chr4 3494898 . C T 167.09 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0161151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.764;QD=15.1903;RBI=0.0219861;REFB=-0.012945;REVB=-0.0149564;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118338;STB=0.568107;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0153082;OID=.;OPOS=3494898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:9:9:16:10:9:9:16:10 chr4 3514695 . A G 333.95 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0276798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4099;QD=14.2106;RBI=0.0277123;REFB=0.00841142;REVB=0.00134133;RO=56;SAF=21;SAR=16;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109618;STB=0.567531;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.0204769;OID=.;OPOS=3514695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:57:37:37:0.393617:16:21:26:30:16:21:26:31 chr4 3526786 . C T 195.18 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0225448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.037;QD=14.1952;RBI=0.0230551;REFB=-0.0140677;REVB=0.00482363;RO=32;SAF=10;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098376;STB=0.556211;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0142399;OID=.;OPOS=3526786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:13:10:17:15:13:10:17:15 chr4 3589689 . C A 254.82 PASS AF=0.533333;AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0267697;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1742;QD=22.651;RBI=0.0325671;REFB=-0.0515096;REVB=0.0185472;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114911;STB=0.550519;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0569725;OID=.;OPOS=3589689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:21:21:23:24:0.533333:9:14:10:11:10:14:10:11 chr4 3589719 . CA C 177.38 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0257135;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.7529;QD=15.424;RBI=0.128486;REFB=-0.0417105;REVB=-0.125886;RO=21;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596777;STB=0.533306;STBP=0.637;TYPE=del;VARB=0.0262128;OID=.;OPOS=3589720;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.543478:25:47:25:46:21:16:9:12:9:99:21:16:9:12:9 chr4 3590683 . T G 302.08 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00769077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.152;QD=14.3846;RBI=0.00954182;REFB=-0.000227844;REVB=0.00564786;RO=49;SAF=14;SAR=20;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610727;STB=0.541286;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.000374379;OID=.;OPOS=3590683;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:49:50:34:34:0.404762:20:14:23:26:20:14:24:26 chr4 3590711 . G T 293.5 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00854889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7945;QD=14.8608;RBI=0.0212779;REFB=-0.0278517;REVB=0.0194851;RO=46;SAF=12;SAR=21;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997138;STB=0.556592;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0397688;OID=.;OPOS=3590711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:21:12:21:25:21:12:21:25 chr4 3590730 . G A 288.83 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00597192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.765;QD=16.2723;RBI=0.0115572;REFB=-0.0253666;REVB=0.00989465;RO=39;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00404736;STB=0.502278;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0192282;OID=.;OPOS=3590730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:19:13:16:23:19:13:16:23 chr4 3590817 . T C 222.15 PASS AF=0.45283;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=-0.0225108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.408;QD=16.7658;RBI=0.0281861;REFB=-0.0320519;REVB=0.0169623;RO=28;SAF=15;SAR=8;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240353;STB=0.642755;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0386405;OID=.;OPOS=3590817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:23:24:0.45283:8:15:24:4:9:15:24:4 chr4 3590823 . GACAC G,GAC 358.35 PASS AF=0.615385,0.346154;AO=15,8;DP=44;FAO=16,9;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=11,8;FSAR=5,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0275925,0.0549954;FXX=0.380862;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=103.662,56.3676;QD=55.131;RBI=0.0645665,0.091088;REFB=-0.00749517,-0.218775;REVB=0.0583736,0.0726123;RO=1;SAF=11,7;SAR=4,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0396758,-0.0589957;STB=0.521712,0.529348;STBP=0.607,0.657;TYPE=del,del;VARB=0.054835,0.0755883;OID=.,.;OPOS=3590824,3590824;OREF=ACAC,AC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.615385,0.346154:15,8:44:16,9:26:1:11,8:5,1:1:0:82:1:11,7:4,1:1:0 chr4 3590878 . C T 547.94 PASS AF=0.395062;AO=63;DP=162;FAO=64;FDP=162;FR=.;FRO=98;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=51;FSRR=47;FWDB=-0.0135617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.357;QD=13.5293;RBI=0.0606234;REFB=-0.0221657;REVB=0.059087;RO=99;SAF=32;SAR=31;SRF=51;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00780809;STB=0.512342;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0473089;OID=.;OPOS=3590878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:99:98:63:64:0.395062:31:32:51:48:32:32:51:47 chr4 3590911 . A C 839.17 PASS AF=0.420814;AO=91;DP=219;FAO=93;FDP=221;FR=.;FRO=128;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=57;FSRR=71;FWDB=0.00208256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9156;QD=15.1886;RBI=0.00949805;REFB=-0.0057111;REVB=0.00926693;RO=128;SAF=42;SAR=49;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170887;STB=0.509946;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00721519;OID=.;OPOS=3590911;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:221:128:128:91:93:0.420814:49:42:57:71:50:43:57:71 chr4 3591015 . A C 1181.52 PASS AF=0.430464;AO=130;DP=305;FAO=130;FDP=302;FR=.;FRO=172;FSAF=62;FSAR=68;FSRF=64;FSRR=108;FWDB=-0.0306216;FXX=0.00983574;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.969;QD=15.6493;RBI=0.0347529;REFB=-0.0114055;REVB=-0.0164342;RO=169;SAF=62;SAR=68;SRF=63;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106992;STB=0.560155;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0169464;OID=.;OPOS=3591015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:302:169:172:130:130:0.430464:68:62:63:106:68:62:64:108 chr4 3591049 . C T 851.9 PASS AF=0.405858;AO=94;DP=237;FAO=97;FDP=239;FR=.;FRO=142;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=59;FSRR=83;FWDB=0.0326156;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.5667;QD=14.2577;RBI=0.0681064;REFB=0.00467556;REVB=0.0597889;RO=142;SAF=42;SAR=52;SRF=59;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341049;STB=0.516796;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=-0.00552641;OID=.;OPOS=3591049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:239:142:142:94:97:0.405858:52:42:59:83:54:43:59:83 chr4 3591069 . C T 869.09 PASS AF=0.44186;AO=94;DP=215;FAO=95;FDP=215;FR=.;FRO=120;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=44;FSRR=76;FWDB=-0.019474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.074;QD=16.169;RBI=0.0326706;REFB=-0.0166919;REVB=-0.0262323;RO=117;SAF=43;SAR=51;SRF=44;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082614;STB=0.554574;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0178548;OID=.;OPOS=3591069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:117:120:94:95:0.44186:51:43:44:73:51:44:44:76 chr4 4199634 . A T 311.84 PASS AF=0.453333;AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.00780038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.214;QD=16.6317;RBI=0.011338;REFB=-0.000982549;REVB=0.00822825;RO=41;SAF=10;SAR=23;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437986;STB=0.530368;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00120193;OID=.;OPOS=4199634;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:41:41:33:34:0.453333:23:10:14:27:24:10:14:27 chr4 4204299 . T C 499.2 PASS AF=0.671642;AO=45;DP=67;FAO=45;FDP=67;FR=.;FRO=22;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0184707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.204;QD=29.8031;RBI=0.0213933;REFB=-0.0118853;REVB=-0.0107938;RO=22;SAF=26;SAR=19;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753896;STB=0.540921;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00596358;OID=.;OPOS=4204299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:22:22:45:45:0.671642:19:26:10:12:19:26:10:12 chr4 4239587 . G T 159.94 PASS AF=0.235294;AO=24;DP=103;FAO=24;FDP=102;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.019862;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3215;QD=6.27198;RBI=0.0508161;REFB=0.0013199;REVB=0.0467737;RO=78;SAF=16;SAR=8;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328948;STB=0.700475;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.0031992;OID=.;OPOS=4239587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:78:78:24:24:0.235294:8:16:31:47:8:16:31:47 chr4 4276132 . T C 817.7 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0875334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.912;QD=57.3826;RBI=0.0938362;REFB=0;REVB=0.0338103;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395715;OID=.;OPOS=4276132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr4 4304337 . C T 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.017;QD=37.4872;RBI=0.0484571;REFB=0;REVB=0.0341733;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0008805;OID=.;OPOS=4304337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr4 4304522 . A C 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00703125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.541;QD=16.5359;RBI=0.00918651;REFB=-0.0227244;REVB=-0.00591215;RO=23;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253998;STB=0.645175;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0241745;OID=.;OPOS=4304522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:11:7:15:8:11:7:15:8 chr4 4304605 . G A 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0127298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.443;QD=19.156;RBI=0.0152649;REFB=-0.0158456;REVB=-0.00842431;RO=23;SAF=15;SAR=6;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234844;STB=0.633669;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0183069;OID=.;OPOS=4304605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:6:15:11:12:6:15:11:12 chr4 4322570 . G A 222.87 PASS AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.011312;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.977;QD=16.5092;RBI=0.012571;REFB=0.00196137;REVB=0.00548353;RO=30;SAF=5;SAR=20;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246905;STB=0.647488;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00130576;OID=.;OPOS=4322570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:30:29:25:25:0.462963:20:5:12:18:20:5:12:17 chr4 4322665 . T C 219.21 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00388243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.762;QD=13.9182;RBI=0.013248;REFB=-0.00630154;REVB=0.0126663;RO=37;SAF=9;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177884;STB=0.60169;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00738471;OID=.;OPOS=4322665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:17:9:19:18:17:9:19:18 chr4 4322770 . T C 145.28 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00413649;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.581;QD=14.9;RBI=0.0391763;REFB=-0.00698207;REVB=0.0389573;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858883;STB=0.549777;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.010122;OID=.;OPOS=4322770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:9:7:12:11:9:7:12:11 chr4 4417899 . G C 407.8 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0118464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6479;QD=17.7305;RBI=0.0238091;REFB=-0.0204379;REVB=0.0206528;RO=50;SAF=22;SAR=20;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425602;STB=0.523798;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0256231;OID=.;OPOS=4417899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:20:22:24:26:20:22:24:26 chr4 4420291 . T TAA 469.73 PASS AF=0.59;AO=52;DP=99;FAO=59;FDP=100;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0234915;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=41.3274;QD=18.7891;RBI=0.0547506;REFB=0.0239309;REVB=0.0494548;RO=40;SAF=27;SAR=25;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044412;STB=0.52154;STBP=0.627;TYPE=ins;VARB=-0.0166862;OID=.;OPOS=4420292;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.59:52:99:59:100:41:30:29:23:18:99:40:27:25:23:17 chr4 4861974 . C T 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00778898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.825;QD=8.69805;RBI=0.0235242;REFB=-0.012146;REVB=-0.0221973;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795555;STB=0.549158;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0119887;OID=.;OPOS=4861974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:9:5:3:4:9:5 chr4 5333091 . G A 95.49 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.015215;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.454;QD=10.6099;RBI=0.0230758;REFB=-0.00478804;REVB=-0.0173492;RO=25;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126958;STB=0.588084;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0108385;OID=.;OPOS=5333091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:37:36:25:24:12:12:0.333333:4:8:14:11:4:8:13:11 chr4 5448429 . A G 331.45 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0192617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.348;QD=18.673;RBI=0.0319501;REFB=-0.00863182;REVB=-0.0254911;RO=36;SAF=21;SAR=14;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167131;STB=0.593167;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0137828;OID=.;OPOS=5448429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:14:21:15:21:14:21:15:21 chr4 5469810 . T C 207.32 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00863458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.067;QD=24.3901;RBI=0.0112792;REFB=-0.00538593;REVB=0.00725702;RO=14;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141557;STB=0.578869;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00281202;OID=.;OPOS=5469810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:11:9:9:5:11:9:9:5 chr4 5570221 . G A 1324.27 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017764;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.249;QD=62.3187;RBI=0.021252;REFB=0;REVB=-0.0116656;RO=0;SAF=59;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18767e-05;OID=.;OPOS=5570221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:26:59:0:0:26:59:0:0 chr4 5624670 . T C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0362817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.199;QD=9.44473;RBI=0.0362899;REFB=0.000735549;REVB=-0.000774039;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383856;STB=0.523731;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00220717;OID=.;OPOS=5624670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:7:3:2:4:7:3 chr4 5627634 . C T 416.71 PASS AF=0.494118;AO=41;DP=84;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.00827719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.983;QD=19.6099;RBI=0.00951668;REFB=-0.0284098;REVB=-0.00469631;RO=42;SAF=12;SAR=29;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363761;STB=0.685336;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0321833;OID=.;OPOS=5627634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:42:43:41:42:0.494118:29:12:29:13:29:13:29:14 chr4 5690902 . T C 267.87 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00430479;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.692;QD=19.1335;RBI=0.00595954;REFB=-0.00476908;REVB=-0.00412128;RO=27;SAF=19;SAR=10;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110428;STB=0.506152;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00285596;OID=.;OPOS=5690902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:27:27:29:29:0.517857:10:19:18:9:10:19:18:9 chr4 5743509 . C T 1108.59 PASS AF=0.974026;AO=77;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0295222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.907;QD=57.589;RBI=0.0373978;REFB=-0.0755151;REVB=0.0229571;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.515621;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.000454705;OID=.;OPOS=5743509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:77:0:2:77:75:0.974026:33:44:0:0:31:44:0:2 chr4 5743512 . T C 1135.25 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.9;QD=60.5468;RBI=0.0556185;REFB=0;REVB=0.0270874;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155806;OID=.;OPOS=5743512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0 chr4 5749904 . T C 465.05 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2571;QD=58.1318;RBI=0.0499514;REFB=0;REVB=0.0357798;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18685e-05;OID=.;OPOS=5749904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr4 5749961 . G C 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.769;QD=59.8393;RBI=0.0615324;REFB=0;REVB=0.0533573;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000916646;OID=.;OPOS=5749961;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr4 5755542 . C A 1552.08 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122505;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.084;QD=64.0034;RBI=0.0235215;REFB=0;REVB=0.0200795;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22737e-05;OID=.;OPOS=5755542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:95:97:1:48:47:0:0:49:48:0:0 chr4 5785442 . G A 1062.41 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.046;QD=59.854;RBI=0.0425878;REFB=0;REVB=0.0122539;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134843;OID=.;OPOS=5785442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0 chr4 5975538 . G A 257.97 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0212056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.298;QD=18.4265;RBI=0.0245435;REFB=-0.00493909;REVB=0.0123574;RO=28;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323845;STB=0.518122;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00725711;OID=.;OPOS=5975538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:16:12:13:15:16:12:13:15 chr4 5990110 . C A 1693.05 PASS AF=0.982759;AO=113;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.015246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.42;QD=58.3812;RBI=0.0172442;REFB=-0.132774;REVB=0.00805753;RO=3;SAF=69;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00289443;STB=0.502072;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.000328608;OID=.;OPOS=5990110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:116:116:3:2:113:114:0.982759:44:69:2:1:44:70:1:1 chr4 5990339 . G A 1042.42 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000524026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.608;QD=59.5666;RBI=0.00329004;REFB=0;REVB=-0.00324804;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16008e-06;OID=.;OPOS=5990339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:32:36:0:0:34:36:0:0 chr4 5990551 . G A 708.44 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5005;QD=62.972;RBI=0.0639381;REFB=0;REVB=-0.0586561;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000450152;OID=.;OPOS=5990551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr4 5990599 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00856536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.796;QD=59.4351;RBI=0.0331773;REFB=0;REVB=0.0320526;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338949;OID=.;OPOS=5990599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr4 5990791 . A G 1080.53 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00466414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.337;QD=60.0294;RBI=0.0273233;REFB=0;REVB=0.0269223;RO=0;SAF=48;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13033e-05;OID=.;OPOS=5990791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:24:48:0:0:24:48:0:0 chr4 5991384 . T C 632.19 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4924;QD=61.6774;RBI=0.0681632;REFB=0;REVB=-0.017218;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458748;OID=.;OPOS=5991384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0 chr4 5991476 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0748742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.943;QD=51.1845;RBI=0.0751072;REFB=0;REVB=-0.00591162;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000473807;OID=.;OPOS=5991476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr4 6293696 . C G 824.27 PASS AF=0.43128;AO=91;DP=211;FAO=91;FDP=211;FR=.;FRO=120;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=69;FSRR=51;FWDB=0.00742805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.031;QD=15.626;RBI=0.00879535;REFB=-0.0143592;REVB=-0.0047098;RO=120;SAF=33;SAR=58;SRF=69;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218566;STB=0.621859;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0170787;OID=.;OPOS=6293696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:120:120:91:91:0.43128:58:33:69:51:58:33:69:51 chr4 6302519 . G A 955.18 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4019;QD=58.7805;RBI=0.0301161;REFB=0;REVB=0.0155838;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.35274e-05;OID=.;OPOS=6302519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0 chr4 6302707 . C T 207.84 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0402632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.052;QD=17.6883;RBI=0.0407072;REFB=0.00311663;REVB=0.00599595;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799634;STB=0.555503;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.0023489;OID=.;OPOS=6302707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:11:10:14:11:11:10:15:11 chr4 6302889 . G A 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0153705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.657;QD=10.0751;RBI=0.0289955;REFB=-0.0398808;REVB=0.0245863;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118061;STB=0.590689;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0775759;OID=.;OPOS=6302889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:4:4:8:5:4:4:9:5 chr4 6303022 . C T 149.64 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.019302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.887;QD=11.9715;RBI=0.0203608;REFB=-0.00103364;REVB=0.00648023;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311475;STB=0.68162;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00122325;OID=.;OPOS=6303022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:10:7:23:10:10:7:23:10 chr4 6303955 . G A 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0189884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.685;QD=20.7383;RBI=0.0197069;REFB=-0.00390838;REVB=0.00527298;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149652;STB=0.584323;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00391459;OID=.;OPOS=6303955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:6:10:8:10:6:10 chr4 6304087 . A G 119.57 PASS AF=0.283333;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00793019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.096;QD=7.97154;RBI=0.0287016;REFB=-0.00423682;REVB=-0.0275843;RO=42;SAF=13;SAR=4;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31205;STB=0.683978;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.013629;OID=.;OPOS=6304087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:42:43:17:17:0.283333:4:13:22:20:4:13:23:20 chr4 6304242 . T C 162.01 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0606281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8463;QD=19.0603;RBI=0.0867365;REFB=-0.0198259;REVB=-0.0620278;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117167;STB=0.566847;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0138764;OID=.;OPOS=6304242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:5:12:10:7:5:12:10:7 chr4 6304285 . GC AT,GT 569.82 PASS AF=0.435897,0.564103;AO=17,22;DP=39;FAO=17,22;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12,6;FSAR=5,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162672,0.0321452;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=261.675,100.238;QD=58.4432;RBI=0.0186778,0.0328345;REFB=0,0;REVB=0.00917798,-0.00669279;RO=0;SAF=12,6;SAR=5,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.17051e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00550913,-0.00497085;OID=.,.;OPOS=6304285,6304286;OREF=GC,C;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:39:39:0:0:17,22:17,22:0.435897,0.564103:5,16:12,6:0:0:5,16:12,6:0:0 chr4 6304344 . G A 358.01 PASS AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00955224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.642;QD=19.6171;RBI=0.0234097;REFB=-0.00989727;REVB=-0.0213721;RO=36;SAF=19;SAR=18;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159667;STB=0.588449;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00624384;OID=.;OPOS=6304344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:18:19:12:24:18:19:12:24 chr4 6304448 . G A 478.21 PASS AF=0.460177;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.00444614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1046;QD=16.9279;RBI=0.0358199;REFB=-0.0166419;REVB=0.0355429;RO=61;SAF=25;SAR=27;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690881;STB=0.538447;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0239546;OID=.;OPOS=6304448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:61:61:52:52:0.460177:27:25:25:36:27:25:25:36 chr4 6304469 . A G 479.94 PASS AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00442817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.141;QD=18.2834;RBI=0.00866396;REFB=-0.0142723;REVB=-0.00744684;RO=54;SAF=24;SAR=27;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590486;STB=0.532719;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0123704;OID=.;OPOS=6304469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:54:54:51:51:0.485714:27:24:22:32:27:24:22:32 chr4 6322293 . G A 207.95 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00242629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.539;QD=13.4159;RBI=0.00493413;REFB=-0.0073779;REVB=0.00429637;RO=37;SAF=9;SAR=16;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244575;STB=0.639888;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00899135;OID=.;OPOS=6322293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:16:9:22:15:16:9:22:15 chr4 6325086 . G A 1435.22 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.425;QD=63.0868;RBI=0.0390771;REFB=0;REVB=0.0303238;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05263e-05;OID=.;OPOS=6325086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:45:45:0:0:45:46:0:0 chr4 6382919 . C T 199.66 PASS AF=0.555556;AO=18;DP=39;FAO=20;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00576092;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.039;QD=22.1841;RBI=0.00990335;REFB=-0.0101099;REVB=0.00805531;RO=17;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271527;STB=0.604294;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0119434;OID=.;OPOS=6382919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:36:17:16:18:20:0.555556:12:6:11:6:11:9:11:5 chr4 6415618 . G A 130.23 PASS AF=0.285714;AO=14;DP=64;FAO=20;FDP=70;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0153889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.733;QD=7.44154;RBI=0.0170843;REFB=-0.013001;REVB=-0.00741991;RO=47;SAF=4;SAR=10;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374462;STB=0.571359;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0515055;OID=.;OPOS=6415618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:70:47:50:14:20:0.285714:10:4:28:19:10:10:30:20 chr4 6536979 . G A 248.27 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00805208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.094;QD=16.2798;RBI=0.0197462;REFB=-0.0226164;REVB=0.0180298;RO=33;SAF=19;SAR=9;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250717;STB=0.641633;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0319918;OID=.;OPOS=6536979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:9:19:14:19:9:19:14:19 chr4 6594947 . A C 522.82 PASS AF=0.515464;AO=48;DP=94;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0853764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2593;QD=21.5595;RBI=0.103728;REFB=-0.00958514;REVB=-0.0589102;RO=46;SAF=22;SAR=26;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113487;STB=0.575155;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00737335;OID=.;OPOS=6594947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:97:46:47:48:50:0.515464:26:22:27:19:28:22:28:19 chr4 6596360 . G A 679.54 PASS AF=0.564103;AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=117;FR=.;FRO=51;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0505424;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2535;QD=23.2321;RBI=0.052177;REFB=-0.0222795;REVB=0.0129576;RO=51;SAF=37;SAR=29;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721589;STB=0.539431;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0211625;OID=.;OPOS=6596360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:51:51:66:66:0.564103:29:37:24:27:29:37:24:27 chr4 6600012 . A G 716.44 PASS AF=0.482993;AO=67;DP=142;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=57;FWDB=0.00826943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.549;QD=19.4948;RBI=0.0101999;REFB=-0.0326075;REVB=-0.00597118;RO=75;SAF=35;SAR=32;SRF=19;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255354;STB=0.651546;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0333828;OID=.;OPOS=6600012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:147:75:76:67:71:0.482993:32:35:19:56:32:39:19:57 chr4 6606864 . A G 181.95 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0506237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.45;QD=17.3287;RBI=0.051535;REFB=-0.0123847;REVB=0.00964883;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237772;STB=0.620226;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0295277;OID=.;OPOS=6606864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:9:10:6:16:9:10:7:16 chr4 6619165 . A G 323.32 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.414;QD=53.8873;RBI=0.0688559;REFB=0;REVB=-0.00225072;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576215;OID=.;OPOS=6619165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr4 6619204 . G A 147.24 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00375141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.947;QD=17.322;RBI=0.03593;REFB=0.0021872;REVB=0.0357337;RO=18;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218222;STB=0.624844;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00139798;OID=.;OPOS=6619204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:10:6:11:7:10:6:11:7 chr4 6698667 . T C 1117.71 PASS AF=1;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00130974;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.29;QD=60.4166;RBI=0.0300155;REFB=0;REVB=0.0299869;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285096;OID=.;OPOS=6698667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0 chr4 6698706 . A C 1189.76 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4665;QD=60.241;RBI=0.0230696;REFB=0;REVB=-0.00864066;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30425e-05;OID=.;OPOS=6698706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:38:40:0:0:39:40:0:0 chr4 6718775 . G T 158.25 PASS AF=0.323077;AO=22;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.00529702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.198;QD=9.73816;RBI=0.00823979;REFB=-0.00118278;REVB=-0.00631156;RO=43;SAF=10;SAR=12;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383743;STB=0.500734;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255923;OID=.;OPOS=6718775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:44:22:21:0.323077:12:10:21:22:11:10:21:23 chr4 6719092 . TAGTC T 68.45 PASS AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00132716;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=299.776;QD=5.70427;RBI=0.0129355;REFB=-0.00811721;REVB=-0.0128673;RO=37;SAF=4;SAR=6;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233672;STB=0.658232;STBP=0.285;TYPE=del;VARB=0.036944;OID=.;OPOS=6719093;OREF=AGTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.208333:10:48:10:48:38:4:6:23:15:68:37:4:6:22:15 chr4 6884329 . T C 589.5 PASS AF=0.975;AO=41;DP=42;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000848177;FXX=0.0476077;HRUN=6;LEN=1;MLLD=167.088;QD=58.95;RBI=0.0383486;REFB=0.149424;REVB=0.0383392;RO=1;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374922;STB=0.51999;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.000314429;OID=.;OPOS=6884329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:40:1:1:41:39:0.975:12:29:0:1:12:27:0:1 chr4 6956059 . T C 569.08 PASS AF=0.554455;AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.015738;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2793;QD=22.5377;RBI=0.0163596;REFB=0.00165351;REVB=0.00446656;RO=45;SAF=19;SAR=37;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217717;STB=0.619541;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.00131068;OID=.;OPOS=6956059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:45:45:56:56:0.554455:37:19:27:18:37:19:27:18 chr4 7044600 . G A 258.16 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0071918;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.123;QD=15.8865;RBI=0.0122715;REFB=-0.0491004;REVB=-0.00994323;RO=34;SAF=12;SAR=17;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090993;STB=0.546635;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0888065;OID=.;OPOS=7044600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:36:29:29:0.446154:17:12:11:23:17:12:12:24 chr4 7057106 . G C 704.46 PASS AF=0.980769;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0329532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.797;QD=54.1888;RBI=0.033056;REFB=-0.0886996;REVB=0.00260546;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508471;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000515169;OID=.;OPOS=7057106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:52:0:1:49:51:0.980769:21:28:0:0:22:29:1:0 chr4 7114091 . C T 225.35 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0109577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.501;QD=27.3146;RBI=0.0123826;REFB=-0.00968387;REVB=-0.00576706;RO=12;SAF=6;SAR=15;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213687;STB=0.618928;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00357386;OID=.;OPOS=7114091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:15:6:7:5:15:6:7:5 chr4 7325840 . G T 1558.71 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0551142;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.568;QD=58.8194;RBI=0.0557797;REFB=-0.0498212;REVB=0.00859098;RO=1;SAF=44;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106631;STB=0.505617;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000851718;OID=.;OPOS=7325840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:106:1:1:105:105:0.990566:61:44:1:0:61:44:1:0 chr4 7435194 . G A 63.66 PASS AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0242855;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.6102;QD=9.09428;RBI=0.0320086;REFB=-0.010393;REVB=-0.020851;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217768;STB=0.633843;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0264913;OID=.;OPOS=7435194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:6:3:10:9:6:3:10:9 chr4 7435379 . A G 1457.4 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0509427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.295;QD=62.017;RBI=0.0985105;REFB=0.0792641;REVB=-0.0843159;RO=1;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104194;STB=0.505493;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00216969;OID=.;OPOS=7435379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:45:48:0:1:45:48:0:1 chr4 7435805 . C A 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00962604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5415;QD=19.1794;RBI=0.0261372;REFB=0.00432973;REVB=0.0243001;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513374;STB=0.529366;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00222569;OID=.;OPOS=7435805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:9:4:4:7:9:4:4:7 chr4 7436486 . C A 420.48 PASS AF=0.339623;AO=53;DP=158;FAO=54;FDP=159;FR=.;FRO=105;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=54;FSRR=51;FWDB=0.0314417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.755;QD=10.578;RBI=0.0314525;REFB=-0.0119094;REVB=-0.00082362;RO=105;SAF=30;SAR=23;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602336;STB=0.539877;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0230595;OID=.;OPOS=7436486;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:105:105:53:54:0.339623:23:30:54:51:23:31:54:51 chr4 7461826 . C CCCA 331.95 PASS AF=0.928571;AO=21;DP=37;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0263268;FXX=0.151469;HRUN=3;LEN=3;MLLD=198.945;QD=47.4207;RBI=0.0469883;REFB=0.0205359;REVB=0.0389204;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16217;STB=0.527757;STBP=0.434;TYPE=ins;VARB=-0.00189223;OID=.;OPOS=7461827;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=CCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.928571:21:37:26:28:2:17:9:2:0:11:14:12:9:11:3 chr4 7655855 . C T 568.66 PASS AF=0.454545;AO=60;DP=132;FAO=60;FDP=132;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0146281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.0038;QD=17.232;RBI=0.0674372;REFB=-0.00357285;REVB=0.0658316;RO=72;SAF=37;SAR=23;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622156;STB=0.53467;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00513404;OID=.;OPOS=7655855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:72:72:60:60:0.454545:23:37:40:32:23:37:40:32 chr4 7714490 . T C 1066.16 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0226719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8692;QD=58.4199;RBI=0.0228168;REFB=-0.0302277;REVB=0.00256769;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145499;STB=0.50769;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000277561;OID=.;OPOS=7714490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:40:32:1:0:40:32:1:0 chr4 7716932 . T C 1079.1 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.788;QD=59.9497;RBI=0.0381716;REFB=0;REVB=0.0263848;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82093e-05;OID=.;OPOS=7716932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:33:36:0:0:35:37:0:0 chr4 7761211 . C T 923.21 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000603601;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.612;QD=58.6165;RBI=0.0150813;REFB=0;REVB=-0.0150692;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000176405;OID=.;OPOS=7761211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:37:26:0:0:37:26:0:0 chr4 7761286 . T C 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000259477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2228;QD=57.1748;RBI=0.0200268;REFB=0;REVB=0.0200251;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222224;OID=.;OPOS=7761286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr4 7765495 . G T 2058.34 PASS AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104083;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.735;QD=61.9051;RBI=0.0294512;REFB=-0.0528472;REVB=0.0275507;RO=0;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84852e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17901e-05;OID=.;OPOS=7765495;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:133:133:0:0:132:133:1:70:62:0:0:71:62:0:0 chr4 7770723 . G T 2131.88 PASS AF=0.978873;AO=137;DP=141;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0651382;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.808;QD=60.0531;RBI=0.068202;REFB=-0.0975848;REVB=0.0202121;RO=1;SAF=65;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655742;STB=0.510066;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000910191;OID=.;OPOS=7770723;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:141:142:1:3:137:139:0.978873:72:65:0:1:73:66:0:3 chr4 7774610 . C T 2391.44 PASS AF=1;AO=149;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6517;QD=63.7719;RBI=0.131525;REFB=0;REVB=0.035497;RO=0;SAF=82;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.67496e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000726697;OID=.;OPOS=7774610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:149:150:1:67:82:0:0:67:83:0:0 chr4 7783163 . G A 1171.98 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.474;QD=60.882;RBI=0.0988695;REFB=0;REVB=0.0804556;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408843;OID=.;OPOS=7783163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:47:30:0:0:47:30:0:0 chr4 7783286 . G A 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.065;QD=61.3756;RBI=0.0293717;REFB=0;REVB=0.0211095;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58217e-06;OID=.;OPOS=7783286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:49:31:0:0:49:31:0:0 chr4 7941901 . A C 740.42 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.3;QD=56.9552;RBI=0.0575182;REFB=0;REVB=0.0523843;RO=0;SAF=35;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015423;OID=.;OPOS=7941901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:17:35:0:0:17:35:0:0 chr4 8031471 . A G 534.78 PASS AF=0.549451;AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00965839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.431;QD=23.5069;RBI=0.0266045;REFB=-0.0110823;REVB=-0.0247894;RO=41;SAF=26;SAR=24;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463806;STB=0.525473;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00860637;OID=.;OPOS=8031471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:41:50:50:0.549451:24:26:19:22:24:26:19:22 chr4 8062689 . TG CA 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118495;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=227.297;QD=62.6711;RBI=0.0142579;REFB=0;REVB=-0.00792953;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.96051e-05;OID=.;OPOS=8062689;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr4 8207083 . A G 93.38 PASS AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0967539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0607;QD=9.82956;RBI=0.101678;REFB=-0.0233701;REVB=-0.0312599;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34691;STB=0.705576;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0333701;OID=.;OPOS=8207083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:7:5:19:7:7:5:19:7 chr4 8228731 . T C 2188.39 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0762927;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9838;QD=62.9753;RBI=0.0763074;REFB=0;REVB=-0.00149946;RO=0;SAF=72;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129283;OID=.;OPOS=8228731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:135:139:0:0:135:139:1:63:72:0:0:64:75:0:0 chr4 8228894 . T C 1377.48 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000900108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.717;QD=62.6129;RBI=0.0327474;REFB=0;REVB=0.032735;RO=0;SAF=57;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.07314e-05;OID=.;OPOS=8228894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:31:57:0:0:31:57:0:0 chr4 8229218 . A G 1361.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011677;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.599;QD=62.61;RBI=0.0141812;REFB=0;REVB=-0.008047;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64165e-05;OID=.;OPOS=8229218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:38:48:0:0:38:49:0:0 chr4 8229326 . T C,G 384.18 PASS AF=0.892857,0.107143;AO=24,3;DP=27;FAO=25,3;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14,3;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288056,-0.0585159;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.081,109.851;QD=54.8833;RBI=0.0444211,0.0616521;REFB=0,0;REVB=-0.0338153,-0.0194131;RO=0;SAF=13,3;SAR=11,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00398403,0.0668619;OID=.,.;OPOS=8229326,8229326;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:27:28:0:0:24,3:25,3:0.892857,0.107143:11,0:13,3:0:0:11,0:14,3:0:0 chr4 8242466 . A G 2392.24 PASS AF=1;AO=152;DP=153;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180494;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.786;QD=61.3396;RBI=0.0192782;REFB=0;REVB=-0.00677262;RO=0;SAF=69;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68244e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39775e-05;OID=.;OPOS=8242466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:153:156:0:0:152:156:1:83:69:0:0:86:70:0:0 chr4 8602884 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0852207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.328;QD=58.5876;RBI=0.0860422;REFB=0;REVB=0.0118612;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000997372;OID=.;OPOS=8602884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0 chr4 8602935 . A G 654.69 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130627;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.361;QD=62.3512;RBI=0.0315413;REFB=0;REVB=-0.0287092;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189023;OID=.;OPOS=8602935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:22:20:0:0 chr4 8605818 . C T 1701.41 PASS AF=1;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089663;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2326;QD=60.7647;RBI=0.0958593;REFB=0;REVB=0.033905;RO=0;SAF=39;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68451e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380545;OID=.;OPOS=8605818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:112:0:0:112:112:1:73:39:0:0:73:39:0:0 chr4 8613786 . C T 412.87 PASS AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0160964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.017;QD=21.4479;RBI=0.0218602;REFB=-0.0107793;REVB=0.014791;RO=36;SAF=21;SAR=20;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603634;STB=0.533317;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0132921;OID=.;OPOS=8613786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:36:41:41:0.532468:20:21:21:15:20:21:21:15 chr4 8613867 . G A 220.43 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=6.98553e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.453;QD=24.4919;RBI=0.0125943;REFB=-0.0293311;REVB=0.0125941;RO=15;SAF=5;SAR=16;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390901;STB=0.718882;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0077042;OID=.;OPOS=8613867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:16:5:11:4:16:5:11:4 chr4 8616096 . T C 483.45 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.000293903;FXX=0.0256377;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.7204;QD=25.4446;RBI=0.0983509;REFB=0.010674;REVB=-0.0983505;RO=30;SAF=23;SAR=22;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162704;STB=0.515216;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=-0.00812939;OID=.;OPOS=8616096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:30:31:45:45:0.592105:22:23:16:14:22:23:17:14 chr4 8616179 . T C 1472.55 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9685;QD=63.3356;RBI=0.0123157;REFB=0;REVB=0.00602591;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.3769e-05;OID=.;OPOS=8616179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:50:43:0:0:50:43:0:0 chr4 8621194 . A G 594.49 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.107;QD=60.973;RBI=0.0478857;REFB=0;REVB=0.00955398;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.59651e-05;OID=.;OPOS=8621194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0 chr4 8951816 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.328;QD=44.6895;RBI=0.0342071;REFB=0;REVB=0.0111144;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254761;OID=.;OPOS=8951816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr4 9388888 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=436.327;QD=33.4285;RBI=0.0723382;REFB=0;REVB=0.000897174;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533119;OID=.;OPOS=9388888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr4 9390660 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.471;QD=46.8467;RBI=0.0564334;REFB=0;REVB=0.0514583;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054797;OID=.;OPOS=9390660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0 chr4 9446325 . AG A,AA,AC 1674.16 PASS AF=0.938596,0.00877193,0.0526316;AO=91,4,6;DP=104;FAO=107,1,6;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0,0;FSAR=56,1,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129275,0.0144455,0.107622;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=287.917,272.847,56.2006;QD=58.7425;RBI=0.0221108,0.0185195,0.107695;REFB=0,0,0;REVB=0.0179378,0.0115888,-0.00398464;RO=0;SAF=38,2,0;SAR=53,2,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.000454953,-0.00519053,0.0874246;OID=.,.,.;OPOS=9446326,9446326,9446326;OREF=G,G,G;OALT=-,A,C;OMAPALT=A,AA,AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.938596,0.00877193,0.0526316:91,4,6:104:107,1,6:114:0:51,0,0:56,1,6:0:0:15:0:38,2,0:53,2,6:0:0 chr4 9557815 . TAGAAGG T 56.21 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00830614;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=6;MLLD=337.51;QD=9.36767;RBI=0.0084145;REFB=-0.00639108;REVB=0.00134607;RO=15;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365691;STB=0.741696;STBP=0.164;TYPE=del;VARB=0.0140336;OID=.;OPOS=9557816;OREF=AGAAGG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:7:25:8:24:16:1:7:6:10:56:15:1:6:6:9 chr4 9784631 . C T 1125.61 PASS AF=1;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270114;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.715;QD=59.2427;RBI=0.0270692;REFB=0;REVB=0.00176809;RO=2;SAF=35;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262641;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4711e-05;OID=.;OPOS=9784631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:2:0:74:76:1:39:35:2:0:39:37:0:0 chr4 9784642 . C A 187.98 PASS AF=0.301205;AO=25;DP=83;FAO=25;FDP=83;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0044588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.678;QD=9.05915;RBI=0.00719403;REFB=-0.00298393;REVB=0.00564563;RO=58;SAF=8;SAR=17;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276798;STB=0.66393;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00586416;OID=.;OPOS=9784642;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:58:58:25:25:0.301205:17:8:32:26:17:8:32:26 chr4 9784889 . C T 162.54 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0146065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8928;QD=19.7022;RBI=0.0203916;REFB=-0.0335143;REVB=-0.014229;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225945;STB=0.512805;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0291373;OID=.;OPOS=9784889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:10:7:7:9:10:7:7:9 chr4 9785134 . T C 200.74 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00559303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.742;QD=20.5887;RBI=0.0205486;REFB=-0.0434742;REVB=0.0197728;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354885;STB=0.537152;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0355921;OID=.;OPOS=9785134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:18:19:20:20:0.512821:13:7:7:11:13:7:8:11 chr4 9922130 . C T 1139.28 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0673657;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3409;QD=59.962;RBI=0.0773268;REFB=-0.0573172;REVB=0.0379644;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00208025;OID=.;OPOS=9922130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0 chr4 9982330 . A G 445.31 PASS AF=0.941176;AO=31;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0134322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4432;QD=52.3889;RBI=0.0359528;REFB=-0.0600299;REVB=-0.0333493;RO=1;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239259;STB=0.523795;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00202554;OID=.;OPOS=9982330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:34:34:1:2:31:32:0.941176:19:12:0:1:20:12:0:2 chr4 9987324 . G A 724.77 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0036071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4601;QD=56.8445;RBI=0.0420941;REFB=0;REVB=-0.0419392;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00044246;OID=.;OPOS=9987324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:26:24:0:0:26:25:0:0 chr4 9998493 . A G 1936.31 PASS AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181581;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.361;QD=60.9862;RBI=0.0358598;REFB=0.0432204;REVB=0.0309226;RO=1;SAF=81;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583069;STB=0.503067;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=4.93564e-05;OID=.;OPOS=9998493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:127:127:1:1:126:126:0.992126:45:81:1:0:45:81:1:0 chr4 10076658 . T C 410.96 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1403;QD=56.6847;RBI=0.0347366;REFB=0;REVB=0.0209963;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111907;OID=.;OPOS=10076658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr4 10076860 . G A 1066.33 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165386;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.946;QD=60.0751;RBI=0.0330663;REFB=0;REVB=-0.0286332;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.56984e-06;OID=.;OPOS=10076860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0 chr4 10090178 . T C 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00857617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.078;QD=63.1954;RBI=0.0167393;REFB=0;REVB=0.0143755;RO=0;SAF=58;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97764e-06;OID=.;OPOS=10090178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:34:58:0:0:34:58:0:0 chr4 10094698 . G A 432.82 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124877;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.18;QD=57.7089;RBI=0.0133802;REFB=0;REVB=0.00480486;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.79636e-05;OID=.;OPOS=10094698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:23:7:0:0:23:7:0:0 chr4 10099340 . T C 1621.49 PASS AF=0.990991;AO=108;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0323505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.003;QD=58.4322;RBI=0.042298;REFB=-0.0167803;REVB=0.02725;RO=1;SAF=61;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999205;STB=0.505154;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000198194;OID=.;OPOS=10099340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:111:111:1:1:108:110:0.990991:47:61:0:1:48:62:0:1 chr4 10117430 . C T 601.02 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0270812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.72;QD=58.6361;RBI=0.0286711;REFB=-0.0559316;REVB=-0.00941495;RO=1;SAF=20;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022873;STB=0.512189;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.000162458;OID=.;OPOS=10117430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:20:20:1:0:20:20:1:0 chr4 10441613 . AAC A 327.07 PASS AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0053157;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=206.969;QD=43.6087;RBI=0.0150673;REFB=-0.0106867;REVB=0.0140985;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.528;TYPE=del;VARB=0.000873043;OID=.;OPOS=10441614;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.966667:28:29:29:30:1:14:15:0:1:3:0:13:15:0:0 chr4 10446385 . C T 923.44 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00480637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.524;QD=56.8271;RBI=0.0132155;REFB=0.0681118;REVB=0.0123105;RO=1;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133044;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=3.54264e-05;OID=.;OPOS=10446385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:35:29:0:1:35:29:0:1 chr4 10446906 . A G 512.95 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272942;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.271;QD=58.6225;RBI=0.0395198;REFB=-0.0949479;REVB=0.0285805;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118035;OID=.;OPOS=10446906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:36:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr4 10447985 . AT AA,A 635.52 PASS AF=0,1;AO=3,40;DP=44;FAO=0,44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=0,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.145706,-0.0644126;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=9.98268,25.4561;QD=57.7748;RBI=0.145868,0.069804;REFB=0,0;REVB=0.00686306,-0.0268999;RO=0;SAF=3,12;SAR=0,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0,-0.00230412;OID=.,.;OPOS=10447986,10447986;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:3,40:44:0,44:44:0:0,16:0,28:0:0:4:0:3,12:0,28:0:0 chr4 10502937 . T G 1378.86 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00234203;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.157;QD=62.6755;RBI=0.0107611;REFB=0;REVB=0.0105032;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124125;OID=.;OPOS=10502937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0 chr4 10669522 . A C 422.68 PASS AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.0156132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.454;QD=14.962;RBI=0.0196411;REFB=-0.0222008;REVB=0.0119164;RO=65;SAF=17;SAR=31;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831815;STB=0.546824;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0285421;OID=.;OPOS=10669522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:31:17:28:37:31:17:28:37 chr4 13530604 . T C 425.85 PASS AF=0.454545;AO=44;DP=96;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.0746527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3698;QD=15.4855;RBI=0.0746533;REFB=-0.0397578;REVB=0.000301293;RO=50;SAF=22;SAR=22;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190739;STB=0.522246;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0385036;OID=.;OPOS=13530604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:110:50:60:44:50:0.454545:22:22:24:26:28:22:24:36 chr4 13545792 . G T 326.77 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126017;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.046;QD=54.4612;RBI=0.0504666;REFB=0;REVB=0.0488679;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148146;OID=.;OPOS=13545792;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr4 13548796 . T G 739.67 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8163;QD=56.8977;RBI=0.0552494;REFB=0;REVB=0.0521373;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191836;OID=.;OPOS=13548796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chr4 13606576 . A T 2283.59 PASS AF=0.946108;AO=157;DP=167;FAO=158;FDP=167;FR=.;FRO=9;FSAF=69;FSAR=89;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0176742;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7039;QD=54.6969;RBI=0.0307631;REFB=-0.0146522;REVB=-0.0251791;RO=8;SAF=68;SAR=89;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295847;STB=0.512553;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0059148;OID=.;OPOS=13606576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:167:167:8:9:157:158:0.946108:89:68:6:2:89:69:6:3 chr4 15004499 . C T 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=294.278;QD=17.2298;RBI=0.0062183;REFB=-0.00585114;REVB=0.0062183;RO=6;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00413261;OID=.;OPOS=15004499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:8:0:0:6:8:0:0:6 chr4 15095619 . G GAGGGAGGAC 98.93 PASS AF=0.165217;AO=18;DP=115;FAO=19;FDP=115;FR=.;FRO=96;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.0206822;FXX=0;HRUN=1;LEN=9;MLLD=283.31;QD=3.44118;RBI=0.0389734;REFB=-0.00741106;REVB=-0.0330329;RO=96;SAF=12;SAR=6;SRF=59;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712523;STB=0.564007;STBP=0.581;TYPE=ins;VARB=0.0239346;OID=.;OPOS=15095620;OREF=-;OALT=AGGGAGGAC;OMAPALT=GAGGGAGGAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.165217:18:115:19:115:96:13:6:59:37:98:96:12:6:59:37 chr4 15095629 . G A 103.33 PASS AF=0.172727;AO=19;DP=110;FAO=19;FDP=110;FR=.;FRO=91;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=52;FSRR=39;FWDB=-0.00762427;FXX=0.0090082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.991;QD=3.75745;RBI=0.0281824;REFB=-0.00953464;REVB=-0.0271315;RO=91;SAF=16;SAR=3;SRF=52;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397333;STB=0.766807;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0377128;OID=.;OPOS=15095629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:91:91:19:19:0.172727:3:16:52:39:3:16:52:39 chr4 15516389 . C T 979.61 PASS AF=0.476636;AO=102;DP=214;FAO=102;FDP=214;FR=.;FRO=112;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=59;FSRR=53;FWDB=-0.0389796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4206;QD=18.3104;RBI=0.046189;REFB=0.00996696;REVB=-0.0247793;RO=112;SAF=51;SAR=51;SRF=59;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254119;STB=0.514016;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0111598;OID=.;OPOS=15516389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:112:112:102:102:0.476636:51:51:59:53:51:51:59:53 chr4 15689928 . G A 221.72 PASS AF=0.511628;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00123106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.307;QD=20.625;RBI=0.0906411;REFB=-0.0243535;REVB=-0.0906327;RO=20;SAF=4;SAR=17;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286734;STB=0.645426;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0734572;OID=.;OPOS=15689928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:20:21:21:22:0.511628:17:4:9:11:17:5:10:11 chr4 15690233 . C A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.766;QD=39.2068;RBI=0.0530558;REFB=0;REVB=0.0517104;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393536;OID=.;OPOS=15690233;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr4 15709188 . C T 510.34 PASS AF=0.387755;AO=56;DP=147;FAO=57;FDP=147;FR=.;FRO=90;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=58;FWDB=0.0167952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.488;QD=13.8868;RBI=0.0168361;REFB=0.00288449;REVB=0.00117333;RO=90;SAF=24;SAR=32;SRF=32;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823904;STB=0.552265;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-0.00604856;OID=.;OPOS=15709188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:90:90:56:57:0.387755:32:24:32:58:32:25:32:58 chr4 15709252 . G A 385.83 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.0045019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.585;QD=15.589;RBI=0.0118756;REFB=-0.0131649;REVB=0.0109892;RO=55;SAF=15;SAR=26;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225351;STB=0.508453;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00967025;OID=.;OPOS=15709252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:58:41:41:0.414141:26:15:19:36:26:15:22:36 chr4 15713446 . C T 423.89 PASS AF=0.518519;AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0171012;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4382;QD=20.9327;RBI=0.0222872;REFB=-0.0157174;REVB=-0.0142922;RO=40;SAF=28;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643462;STB=0.52726;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0278693;OID=.;OPOS=15713446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:40:39:42:42:0.518519:14:28:24:16:14:28:24:15 chr4 15724487 . T G 1373.28 PASS AF=0.960396;AO=95;DP=101;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.023923;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.406;QD=54.3872;RBI=0.0323999;REFB=-0.180972;REVB=0.0218505;RO=1;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101972;STB=0.500204;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.000721843;OID=.;OPOS=15724487;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:101:101:1:4:95:97:0.960396:46:49:0:1:48:49:2:2 chr4 15733454 . A C 1540.58 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.196;QD=59.8284;RBI=0.0159207;REFB=0;REVB=-0.00307842;RO=0;SAF=56;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97864e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06447e-05;OID=.;OPOS=15733454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:47:56:0:0:47:56:0:0 chr4 15739390 . T G 727.74 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.349;QD=63.2813;RBI=0.0153582;REFB=0;REVB=-0.00259455;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13749e-05;OID=.;OPOS=15739390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr4 15835844 . A C 281.26 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00252152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.7;QD=21.2272;RBI=0.0292319;REFB=-0.00901508;REVB=0.0291229;RO=24;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131499;STB=0.572715;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00484164;OID=.;OPOS=15835844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:13:16:17:7:13:16:17:7 chr4 15937731 . T C 1577.63 PASS AF=1;AO=103;DP=105;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7246;QD=56.8514;RBI=0.0574389;REFB=-0.0497513;REVB=0.0381657;RO=2;SAF=50;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185991;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00474772;OID=.;OPOS=15937731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:105:111:2:0:103:111:1:53:50:2:0:53:58:0:0 chr4 15964485 . G A 289.41 PASS AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0121221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.618;QD=46.3056;RBI=0.0157487;REFB=-0.0262723;REVB=-0.0100537;RO=2;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978817;STB=0.505296;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00362641;OID=.;OPOS=15964485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:13:10:1:1:13:10:1:1 chr4 15964573 . A G 632.23 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.384;QD=61.6806;RBI=0.0297736;REFB=0;REVB=-0.0032534;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152425;OID=.;OPOS=15964573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr4 15992831 . C T 251.42 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0179016;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.079;QD=14.3669;RBI=0.0480324;REFB=-0.0297856;REVB=-0.0445717;RO=40;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237813;STB=0.628796;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0258105;OID=.;OPOS=15992831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:40:41:29:29:0.414286:10:19:17:23:10:19:18:23 chr4 16181283 . A G 117.62 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0393354;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.8271;QD=12.7157;RBI=0.0434885;REFB=-0.00715718;REVB=0.0185465;RO=23;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132719;STB=0.578199;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0177358;OID=.;OPOS=16181283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:9:5:11:12:9:5:11:12 chr4 17488286 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.715;QD=51.9166;RBI=0.0312654;REFB=0;REVB=0.0258276;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221569;OID=.;OPOS=17488286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr4 17488346 . G A 125.85 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0452968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.056;QD=18.6449;RBI=0.047072;REFB=-0.0065128;REVB=0.0128051;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427123;STB=0.745392;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00302099;OID=.;OPOS=17488346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:11:3:9:4:11:3:9:4 chr4 17488351 . T C 101.58 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00113912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4655;QD=16.9299;RBI=0.00542216;REFB=-0.0298845;REVB=-0.00530116;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374635;STB=0.717016;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0285136;OID=.;OPOS=17488351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:8:4:9:3:8:4 chr4 17503433 . C T 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0170785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7812;QD=15.1563;RBI=0.0385293;REFB=-0.019265;REVB=-0.0345374;RO=31;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136837;STB=0.568573;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0242372;OID=.;OPOS=17503433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:11:14:13:18:11:14:14:18 chr4 17517099 . A G 272.36 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.9875;QD=51.8784;RBI=0.0330294;REFB=0;REVB=-0.00410107;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059088;OID=.;OPOS=17517099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr4 17586703 . T C 1157.44 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196071;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.418;QD=60.9181;RBI=0.00289343;REFB=0;REVB=0.00212781;RO=0;SAF=26;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486623;OID=.;OPOS=17586703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:49:26:0:0:50:26:0:0 chr4 17627294 . A G 163.57 PASS AF=0.344262;AO=22;DP=64;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0158853;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.94;QD=10.7261;RBI=0.0160119;REFB=-0.000943454;REVB=0.00200901;RO=40;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262251;STB=0.671575;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00160269;OID=.;OPOS=17627294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:61:40:40:22:21:0.344262:9:13:14:26:8:13:14:26 chr4 17627332 . T C 670.05 PASS AF=0.918367;AO=45;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0108215;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.74;QD=54.6977;RBI=0.0210512;REFB=-0.0340093;REVB=0.0180568;RO=3;SAF=19;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107001;STB=0.514466;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000753045;OID=.;OPOS=17627332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:49:49:3:4:45:45:0.918367:26:19:1:2:26:19:1:3 chr4 17634213 . A G 784.41 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.918;QD=57.048;RBI=0.108718;REFB=0;REVB=0.10374;RO=0;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164412;OID=.;OPOS=17634213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:55:0:0:52:55:1:37:15:0:0:39:16:0:0 chr4 17643848 . G A 47.57 PASS AF=0.777778;AO=6;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0156997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.605;QD=21.1438;RBI=0.0682616;REFB=-0.202023;REVB=0.0664316;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284202;STB=0.624651;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0928623;OID=.;OPOS=17643848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:9:9:2:2:6:7:0.777778:4:2:2:0:4:3:2:0 chr4 17660082 . C T 837.0 PASS AF=0.983333;AO=57;DP=58;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0176524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0981;QD=55.7997;RBI=0.0316666;REFB=-0.00171812;REVB=0.02629;RO=1;SAF=36;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129222;STB=0.506491;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000373771;OID=.;OPOS=17660082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:60:1:1:57:59:0.983333:21:36:1:0:21:38:1:0 chr4 17694943 . A G 818.96 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8643;QD=56.4802;RBI=0.0247028;REFB=0;REVB=0.0103904;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492078;OID=.;OPOS=17694943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:58:0:0:57:58:1:33:24:0:0:34:24:0:0 chr4 17802388 . C T 125.85 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00598995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.955;QD=18.6441;RBI=0.0113918;REFB=0.00455773;REVB=0.00968984;RO=13;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21949;STB=0.624826;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.00255983;OID=.;OPOS=17802388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:8:6:9:4:8:6:9:4 chr4 17805379 . G A 637.03 PASS AF=0.57;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0169554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7566;QD=25.4813;RBI=0.0240478;REFB=0.00708594;REVB=0.0170532;RO=43;SAF=25;SAR=32;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941895;STB=0.551512;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00285777;OID=.;OPOS=17805379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:43:43:57:57:0.57:32:25:24:19:32:25:24:19 chr4 17812796 . C T 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0231067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.394;QD=14.9203;RBI=0.0397819;REFB=-0.00324236;REVB=0.0323833;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517788;STB=0.52939;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0050298;OID=.;OPOS=17812796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:18:10:15:22:18:10:15:22 chr4 17847181 . TA TAA,T 40.81 PASS AF=0,0.625;AO=2,8;DP=16;FAO=0,10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=0,6;FSAR=0,4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.12254,0.144093;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=7.12293,7.20301;QD=10.2028;RBI=0.199703,0.222914;REFB=0.0149997,0.00484837;REVB=0.157688,-0.170082;RO=5;SAF=2,4;SAR=0,4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.544828,-0.199671;STB=0.5,0.594418;STBP=1,0.401;TYPE=ins,del;VARB=0,0.081251;OID=.,.;OPOS=17847182,17847182;OREF=-,A;OALT=A,-;OMAPALT=TAA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.625:2,8:16:0,10:16:6:0,6:0,4:5:1:13:5:2,4:0,4:4:1 chr4 20492417 . G T 656.69 PASS AF=0.52381;AO=58;DP=118;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=0.00636583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.423;QD=20.8474;RBI=0.0104044;REFB=-0.0194912;REVB=0.00822972;RO=57;SAF=28;SAR=30;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103342;STB=0.556505;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0144877;OID=.;OPOS=20492417;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:126:57:60:58:66:0.52381:30:28:21:36:34:32:22:38 chr4 20520993 . T C 812.89 PASS AF=0.983333;AO=56;DP=58;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0092908;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6174;QD=54.1924;RBI=0.0557853;REFB=-0.0861264;REVB=0.0550061;RO=1;SAF=31;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149682;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000949729;OID=.;OPOS=20520993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:60:1:1:56:59:0.983333:25:31:1:0:28:31:1:0 chr4 20544184 . C T 1105.52 PASS AF=0.440741;AO=119;DP=271;FAO=119;FDP=270;FR=.;FRO=151;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=69;FSRR=82;FWDB=-0.0127048;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.756;QD=16.3781;RBI=0.0185865;REFB=-0.0104057;REVB=-0.0135664;RO=152;SAF=58;SAR=61;SRF=70;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271859;STB=0.517047;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0129044;OID=.;OPOS=20544184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:270:152:151:119:119:0.440741:61:58:70:82:61:58:69:82 chr4 20709411 . C T 95.94 PASS AF=0.578947;AO=9;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00878163;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.364;QD=20.1973;RBI=0.0786617;REFB=-0.0150496;REVB=0.07817;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195767;STB=0.611445;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0107423;OID=.;OPOS=20709411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:19:19:9:8:9:11:0.578947:3:6:4:5:4:7:3:5 chr4 20733708 . C CA 420.63 PASS AF=1;AO=40;DP=44;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340423;FXX=0.0238039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.1545;QD=41.0374;RBI=0.107517;REFB=0;REVB=-0.101985;RO=3;SAF=14;SAR=26;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904365;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00392712;OID=.;OPOS=20733709;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:40:44:41:41:0:15:26:0:0:8:3:14:26:3:0 chr4 20751278 . A G 130.18 PASS AF=0.384615;AO=14;DP=38;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.000676646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.537;QD=13.3515;RBI=0.00322033;REFB=-0.0117673;REVB=-0.00314844;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121095;STB=0.546014;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0253772;OID=.;OPOS=20751278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:24:24:14:15:0.384615:6:8:11:13:7:8:11:13 chr4 20852166 . A G 227.96 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0029199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.658;QD=11.5423;RBI=0.00331041;REFB=-0.00607234;REVB=-0.00155981;RO=49;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194582;STB=0.613178;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0140899;OID=.;OPOS=20852166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:49:51:28:28:0.35443:10:18:23:26:10:18:24:27 chr4 20852244 . A G 227.29 PASS AF=0.345679;AO=28;DP=82;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0590076;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.681;QD=11.2244;RBI=0.0598108;REFB=0.00651666;REVB=0.00976881;RO=51;SAF=16;SAR=12;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176874;STB=0.613161;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.011858;OID=.;OPOS=20852244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:51:53:28:28:0.345679:12:16:21:30:12:16:21:32 chr4 21950259 . A G 4224.91 PASS AF=1;AO=261;DP=261;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=184;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00507333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.874;QD=62.3602;RBI=0.0280971;REFB=0;REVB=0.0276353;RO=0;SAF=87;SAR=174;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.66813e-05;OID=.;OPOS=21950259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:261:271:0:0:261:271:1:174:87:0:0:184:87:0:0 chr4 22416195 . C G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3237;QD=63.8715;RBI=0.0801272;REFB=0;REVB=0.0619979;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101516;OID=.;OPOS=22416195;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0 chr4 22439914 . A C 1737.93 PASS AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00778869;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.251;QD=59.9286;RBI=0.0210755;REFB=-0.109692;REVB=0.0195835;RO=0;SAF=60;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000362307;OID=.;OPOS=22439914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:116:116:0:1:115:115:0.991379:55:60:0:0:55:60:0:1 chr4 22444692 . C T 410.8 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00625487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.7;QD=56.6619;RBI=0.0133878;REFB=0;REVB=0.0118368;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27655e-05;OID=.;OPOS=22444692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr4 22457478 . C T 1659.57 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.059;QD=60.3479;RBI=0.0140453;REFB=0;REVB=0.00796497;RO=0;SAF=54;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80357e-05;OID=.;OPOS=22457478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:56:54:0:0:56:54:0:0 chr4 22820504 . A T 894.29 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0434285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.174;QD=55.0335;RBI=0.043786;REFB=0.0261446;REVB=-0.00558433;RO=2;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349417;STB=0.518513;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.000627396;OID=.;OPOS=22820504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:26:37:0:2:26:37:0:2 chr4 23815522 . C T 1767.96 PASS AF=0.991525;AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0501208;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.728;QD=59.9309;RBI=0.0522334;REFB=-0.0895262;REVB=0.014705;RO=2;SAF=51;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182566;STB=0.504761;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000510287;OID=.;OPOS=23815522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:118:2:1:116:117:0.991525:65:51:2:0:65:52:1:0 chr4 23815662 . C T 1625.87 PASS AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0018832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.851;QD=59.1225;RBI=0.0242748;REFB=-0.0195908;REVB=0.0242017;RO=1;SAF=64;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735994;STB=0.503875;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.000102685;OID=.;OPOS=23815662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:110:1:1:109:109:0.990909:45:64:1:0:45:64:1:0 chr4 23815924 . T C 1677.35 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.329;QD=60.4449;RBI=0.0251179;REFB=0;REVB=0.0210506;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14865e-05;OID=.;OPOS=23815924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:53:58:0:0:53:58:0:0 chr4 24534687 . T C 522.72 PASS AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00391467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.19;QD=21.12;RBI=0.00806673;REFB=-0.000839698;REVB=-0.00705318;RO=48;SAF=21;SAR=29;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532764;STB=0.535041;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000419194;OID=.;OPOS=24534687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:49:50:50:0.505051:29:21:23:25:29:21:24:25 chr4 24801315 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.767;QD=51.9161;RBI=0.0803423;REFB=0;REVB=0.0473596;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136125;OID=.;OPOS=24801315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:15:6:0:0:15:6:0:0 chr4 24801949 . C T 313.34 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0754531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.388;QD=50.1336;RBI=0.117642;REFB=-0.0941371;REVB=0.0902584;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517227;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00938121;OID=.;OPOS=24801949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:10:14:0:0:10:14:1:0 chr4 24801976 . T C 657.77 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0132051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.784;QD=59.7968;RBI=0.0341391;REFB=-0.014592;REVB=0.0314818;RO=1;SAF=28;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164792;STB=0.508768;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000363674;OID=.;OPOS=24801976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:15:28:1:0:15:28:1:0 chr4 24802323 . G C 375.68 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268217;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.818;QD=55.656;RBI=0.0528274;REFB=0;REVB=0.0455118;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215832;OID=.;OPOS=24802323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:18:8:0:0:19:8:0:0 chr4 24810141 . A AG 38.57 PASS AF=0.104;AO=18;DP=127;FAO=13;FDP=125;FR=.;FRO=112;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=-0.0271901;FXX=0.00793588;HRUN=0;LEN=1;MLLD=97.2952;QD=1.23417;RBI=0.031651;REFB=-0.00143087;REVB=-0.0162014;RO=108;SAF=17;SAR=1;SRF=41;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.676296;STB=0.932091;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.0774106;OID=.;OPOS=24810142;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.104:18:127:13:125:112:12:1:46:66:38:108:17:1:41:67 chr4 25001439 . T C 547.74 PASS AF=0.495652;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0600283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5868;QD=19.0517;RBI=0.0622014;REFB=-0.00483478;REVB=-0.0162976;RO=57;SAF=38;SAR=19;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243378;STB=0.630906;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00476633;OID=.;OPOS=25001439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:58:57:57:0.495652:19:38:23:34:19:38:24:34 chr4 25005193 . G A 1589.75 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.255;QD=59.9907;RBI=0.00629455;REFB=0;REVB=0.00189285;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.40913e-06;OID=.;OPOS=25005193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:48:58:0:0:48:58:0:0 chr4 25127399 . T C 179.79 PASS AF=0.303797;AO=24;DP=79;FAO=24;FDP=79;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0260528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.095;QD=9.10336;RBI=0.0312518;REFB=-0.00245872;REVB=0.0172605;RO=55;SAF=19;SAR=5;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312736;STB=0.687718;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00384619;OID=.;OPOS=25127399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:55:55:24:24:0.303797:5:19:31:24:5:19:31:24 chr4 25363901 . T A 351.71 PASS AF=0.367521;AO=43;DP=117;FAO=43;FDP=117;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=53;FWDB=0.0332028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5877;QD=12.0243;RBI=0.0585713;REFB=-0.00845843;REVB=0.0482511;RO=73;SAF=14;SAR=29;SRF=21;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486409;STB=0.53073;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0170321;OID=.;OPOS=25363901;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:73:74:43:43:0.367521:29:14:21:52:29:14:21:53 chr4 25678199 . A G 434.51 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222848;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.48;QD=57.9342;RBI=0.0289785;REFB=0;REVB=0.0288927;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000617511;OID=.;OPOS=25678199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr4 25749303 . C A 229.58 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00677833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.687;QD=22.3981;RBI=0.0199917;REFB=-0.017499;REVB=-0.0188075;RO=19;SAF=7;SAR=15;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093987;STB=0.552776;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0143676;OID=.;OPOS=25749303;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:15:7:8:11:15:7:8:11 chr4 25760693 . A G 265.49 PASS AF=0.456522;AO=20;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.00337004;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=87.1069;QD=23.0857;RBI=0.0037805;REFB=-0.0107419;REVB=0.00171318;RO=16;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454148;STB=0.75737;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.014144;OID=.;OPOS=25760693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:16:17:20:21:0.456522:12:8:16:0:13:8:17:0 chr4 25915648 . G A 101.61 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0451669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.259;QD=16.9344;RBI=0.0490125;REFB=-0.0326926;REVB=-0.019031;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0225025;OID=.;OPOS=25915648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:6:6:6:6:6:6 chr4 25915858 . C A 237.94 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0442051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7832;QD=20.2501;RBI=0.0536987;REFB=-0.00415638;REVB=0.030487;RO=23;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771486;STB=0.553459;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0107315;OID=.;OPOS=25915858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:24:23:23:0.489362:11:12:10:13:11:12:10:14 chr4 26274274 . T A 257.3 PASS AF=0.4;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00817373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5333;QD=13.7225;RBI=0.0163964;REFB=0.00143011;REVB=-0.0142138;RO=44;SAF=5;SAR=25;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397802;STB=0.737525;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0096664;OID=.;OPOS=26274274;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:44:45:30:30:0.4:25:5:21:23:25:5:22:23 chr4 26417136 . T C 322.08 PASS AF=0.55;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0267624;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5027;QD=21.472;RBI=0.0368545;REFB=-0.0151831;REVB=0.0253383;RO=27;SAF=4;SAR=29;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212651;STB=0.619334;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0118262;OID=.;OPOS=26417136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:27:27:33:33:0.55:29:4:7:20:29:4:7:20 chr4 26483659 . G A 207.84 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0400545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4442;QD=17.6888;RBI=0.0976659;REFB=0.00259148;REVB=0.0890744;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163262;STB=0.592274;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00058148;OID=.;OPOS=26483659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:9:12:19:7:9:12:19:7 chr4 26673761 . T A 1917.51 PASS AF=0.743119;AO=162;DP=217;FAO=162;FDP=218;FR=.;FRO=56;FSAF=76;FSAR=86;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=-0.0361595;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=32.2181;QD=35.1837;RBI=0.0449221;REFB=-0.0396216;REVB=-0.026655;RO=31;SAF=76;SAR=86;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102039;STB=0.567249;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0358039;OID=.;OPOS=26673761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:31:56:162:162:0.743119:86:76:25:6:86:76:41:15 chr4 26673787 . A G 3754.75 PASS AF=0.975709;AO=241;DP=248;FAO=241;FDP=247;FR=.;FRO=6;FSAF=107;FSAR=134;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0413729;FXX=0.0040321;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.584;QD=60.8056;RBI=0.0419425;REFB=-0.142577;REVB=0.00688859;RO=2;SAF=107;SAR=134;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000889943;STB=0.509557;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00090991;OID=.;OPOS=26673787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:248:247:2:6:241:241:0.975709:134:107:1:1:134:107:5:1 chr4 27004011 . G A 1030.87 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120199;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0417;QD=59.7605;RBI=0.0382105;REFB=0;REVB=-0.0362707;RO=0;SAF=23;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02354e-06;OID=.;OPOS=27004011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:46:23:0:0:46:23:0:0 chr4 28712912 . C G 197.74 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0282142;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7258;QD=14.6472;RBI=0.0298107;REFB=0.00279711;REVB=0.0096249;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177777;STB=0.601189;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.00407783;OID=.;OPOS=28712912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:31:31:23:23:0.425926:13:10:19:12:13:10:19:12 chr4 28712968 . A G 1029.47 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285956;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6089;QD=59.6791;RBI=0.0292255;REFB=0;REVB=-0.00603487;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791027;OID=.;OPOS=28712968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0 chr4 30725696 . G A 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.883;QD=55.6536;RBI=0.0180887;REFB=0;REVB=0.0159151;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136159;OID=.;OPOS=30725696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0 chr4 30725987 . G A 1237.68 PASS AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000142034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.875;QD=58.9373;RBI=0.0245981;REFB=-0.108476;REVB=0.0245977;RO=2;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201434;STB=0.510636;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.000802166;OID=.;OPOS=30725987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:46:36:0:2:46:36:0:2 chr4 31146018 . A G 179.7 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00262207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.03;QD=15.6261;RBI=0.00297294;REFB=-0.0111218;REVB=0.00140111;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456914;STB=0.526288;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0207819;OID=.;OPOS=31146018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:9:10:13:14:9:10:13:14 chr4 31147272 . A C 610.07 PASS AF=0.613636;AO=54;DP=89;FAO=54;FDP=88;FR=.;FRO=34;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.00597854;FXX=0.0112347;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.633;QD=27.7305;RBI=0.0149224;REFB=-0.00155473;REVB=0.0136724;RO=34;SAF=29;SAR=25;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790832;STB=0.543;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0010416;OID=.;OPOS=31147272;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:34:34:54:54:0.613636:25:29:22:12:25:29:22:12 chr4 34967868 . G T 294.05 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0224042;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2116;QD=17.2971;RBI=0.0471524;REFB=-0.00978418;REVB=-0.0414898;RO=36;SAF=14;SAR=18;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111434;STB=0.562461;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0105245;OID=.;OPOS=34967868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:36:36:32:32:0.470588:18:14:20:16:18:14:20:16 chr4 34967877 . T C 356.46 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0147519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.181;QD=19.2679;RBI=0.0273124;REFB=-0.00436416;REVB=-0.0229858;RO=37;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121447;STB=0.567531;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00476677;OID=.;OPOS=34967877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:16:21:16:21:16:21:16:21 chr4 36068567 . A AT 118.9 PASS AF=0.466667;AO=5;DP=47;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.212236;FXX=0.0425441;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.4497;QD=10.569;RBI=0.212555;REFB=0.00717587;REVB=-0.0116288;RO=41;SAF=3;SAR=2;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180451;STB=0.534851;STBP=0.66;TYPE=ins;VARB=0.00231338;OID=.;OPOS=36068568;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:5:47:21:45:24:11:10:11:13:99:41:3:2:18:23 chr4 36081878 . C T 1023.35 PASS AF=1;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422407;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.868;QD=58.4771;RBI=0.0441111;REFB=0;REVB=-0.0127088;RO=1;SAF=43;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108681;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8761e-05;OID=.;OPOS=36081878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:71:70:1:0:69:70:1:26:43:1:0:26:44:0:0 chr4 36258197 . T C 4145.92 PASS AF=0.992593;AO=267;DP=271;FAO=268;FDP=270;FR=.;FRO=2;FSAF=141;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00505459;FXX=0.0036899;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.448;QD=61.421;RBI=0.0306555;REFB=-0.0573558;REVB=0.0302359;RO=3;SAF=141;SAR=126;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112145;STB=0.503906;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000230315;OID=.;OPOS=36258197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:271:270:3:2:267:268:0.992593:126:141:0:3:127:141:0:2 chr4 36292018 . T A 1012.03 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1369;QD=57.8303;RBI=0.0297349;REFB=-0.0620556;REVB=0.0220077;RO=1;SAF=27;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171851;STB=0.509088;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00250988;OID=.;OPOS=36292018;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:42:27:1:0:42:27:1:0 chr4 36310049 . C T 1581.07 PASS AF=0.972973;AO=108;DP=111;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0006269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.92;QD=56.9755;RBI=0.00873868;REFB=0.0224101;REVB=0.00871617;RO=3;SAF=36;SAR=72;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193652;STB=0.510202;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=1.06597e-05;OID=.;OPOS=36310049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:111:111:3:3:108:108:0.972973:72:36:0:3:72:36:0:3 chr4 36317965 . T C 740.05 PASS AF=0.448864;AO=79;DP=175;FAO=79;FDP=176;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=67;FWDB=0.0154444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.108;QD=16.8194;RBI=0.0164897;REFB=-0.000229185;REVB=-0.0057774;RO=96;SAF=34;SAR=45;SRF=29;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132373;STB=0.569361;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000276866;OID=.;OPOS=36317965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:96:97:79:79:0.448864:45:34:29:67:45:34:30:67 chr4 36340753 . G A 811.6 PASS AF=0.47191;AO=84;DP=178;FAO=84;FDP=178;FR=.;FRO=94;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=-0.0117039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.598;QD=18.2382;RBI=0.0250053;REFB=-0.00890946;REVB=-0.0220971;RO=94;SAF=50;SAR=34;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142579;STB=0.578872;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00825917;OID=.;OPOS=36340753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:94:94:84:84:0.47191:34:50:42:52:34:50:42:52 chr4 36345377 . G A 309.2 PASS AF=0.384615;AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.0266629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.463;QD=13.5911;RBI=0.0293759;REFB=-0.0164568;REVB=0.0123301;RO=56;SAF=17;SAR=18;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169328;STB=0.596197;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0252246;OID=.;OPOS=36345377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:56:56:35:35:0.384615:18:17:36:20:18:17:36:20 chr4 37327583 . A C 180.96 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00106943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.847;QD=13.9197;RBI=0.0166397;REFB=-0.00343421;REVB=-0.0166053;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882352;STB=0.575269;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00340192;OID=.;OPOS=37327583;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:29:31:21:21:0.403846:7:14:17:12:7:14:17:14 chr4 37612486 . T A 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.465;QD=64.1539;RBI=0.0280892;REFB=0;REVB=0.0278841;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65964e-05;OID=.;OPOS=37612486;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr4 37651063 . C T 409.26 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00748631;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0242;QD=17.7937;RBI=0.0620915;REFB=0.00837627;REVB=0.0616386;RO=51;SAF=17;SAR=25;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851532;STB=0.541735;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00571437;OID=.;OPOS=37651063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:51:50:42:42:0.456522:25:17:25:26:25:17:24:26 chr4 37836302 . T C 933.59 PASS AF=0.475728;AO=97;DP=205;FAO=98;FDP=206;FR=.;FRO=108;FSAF=31;FSAR=67;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0265984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.4612;QD=18.128;RBI=0.0369998;REFB=-0.00183638;REVB=0.0257198;RO=108;SAF=31;SAR=66;SRF=53;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174074;STB=0.598066;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00378487;OID=.;OPOS=37836302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:108:108:97:98:0.475728:66:31:53:55:67:31:53:55 chr4 37857342 . G C 449.09 PASS AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0168765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.02;QD=21.3851;RBI=0.0172586;REFB=-0.0280498;REVB=-0.00361136;RO=40;SAF=23;SAR=21;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0019628;STB=0.501084;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0233192;OID=.;OPOS=37857342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:21:23:21:19:21:23:21:19 chr4 37903756 . T C 198.85 PASS AF=0.413793;AO=21;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0380093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0214;QD=13.7141;RBI=0.0533669;REFB=0.030045;REVB=-0.037461;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207496;STB=0.592517;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0448361;OID=.;OPOS=37903756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:34:21:24:0.413793:9:12:11:19:11:13:13:21 chr4 37962133 . G A 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.00233465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.808;QD=19.9927;RBI=0.0510032;REFB=-0.0143878;REVB=0.0509498;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223548;STB=0.624896;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0193857;OID=.;OPOS=37962133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:18:5:10:12:18:5 chr4 37962186 . G C 178.89 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0286888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.771;QD=15.2248;RBI=0.0290099;REFB=0.00282073;REVB=0.00430405;RO=27;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456914;STB=0.536874;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=-0.0125394;OID=.;OPOS=37962186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:28:19:19:0.404255:10:9:14:13:10:9:15:13 chr4 38016395 . T G 115.19 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0224105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.626;QD=10.7151;RBI=0.0248541;REFB=-0.0121562;REVB=-0.010747;RO=29;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199707;STB=0.620257;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0288492;OID=.;OPOS=38016395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:10:4:13:16:10:4:13:16 chr4 38023302 . C G 206.1 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0191317;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.405;QD=16.8248;RBI=0.0191317;REFB=-0.0234162;REVB=-3.28849e-06;RO=28;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949451;STB=0.554212;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0272912;OID=.;OPOS=38023302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:11:10:16:12:11:10:16:12 chr4 38062233 . T A 218.05 PASS AF=0.433962;AO=22;DP=59;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00231077;FXX=0.116647;HRUN=5;LEN=1;MLLD=142.65;QD=16.4567;RBI=0.00514112;REFB=-0.0247995;REVB=0.00459255;RO=21;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143335;STB=0.581324;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0273926;OID=.;OPOS=38062233;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:53:21:30:22:23:0.433962:14:8:11:10:14:9:16:14 chr4 38258908 . G T 612.59 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4018;QD=61.259;RBI=0.0290609;REFB=0;REVB=0.0171471;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104865;OID=.;OPOS=38258908;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr4 38628725 . C T 115.02 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.109262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3301;QD=19.1703;RBI=0.110328;REFB=-0.0318513;REVB=0.0153047;RO=11;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129697;STB=0.574349;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0206428;OID=.;OPOS=38628725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:4:9:6:5:4:9:6:5 chr4 38702437 . A G 195.8 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0207578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.296;QD=17.8003;RBI=0.0225437;REFB=-0.00835363;REVB=-0.00879395;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188157;STB=0.607367;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0097371;OID=.;OPOS=38702437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:7:13:11:13:7:13:11:13 chr4 38774785 . A G 293.26 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0103655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.849;QD=23.0008;RBI=0.0243654;REFB=-0.0293511;REVB=0.0220505;RO=22;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10391;STB=0.557361;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0141096;OID=.;OPOS=38774785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:13:16:15:7:13:16:15:7 chr4 38774889 . T C 917.72 PASS AF=0.576389;AO=83;DP=144;FAO=83;FDP=144;FR=.;FRO=61;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=0.0242594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.014;QD=25.4923;RBI=0.0279947;REFB=-0.00393605;REVB=0.0139708;RO=61;SAF=47;SAR=36;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716996;STB=0.538969;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00231021;OID=.;OPOS=38774889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:61:61:83:83:0.576389:36:47:40:21:36:47:40:21 chr4 38775040 . A G 475.09 PASS AF=0.476636;AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0446891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4991;QD=17.7604;RBI=0.0753335;REFB=0.0110817;REVB=0.0606467;RO=55;SAF=23;SAR=28;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204717;STB=0.507019;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00801095;OID=.;OPOS=38775040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:55:56:51:51:0.476636:28:23:26:29:28:23:26:30 chr4 38776070 . C T 246.64 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.087619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6332;QD=17.9376;RBI=0.10098;REFB=0.0018045;REVB=-0.0501985;RO=28;SAF=9;SAR=18;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222222;STB=0.624905;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00846582;OID=.;OPOS=38776070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:18:9:16:12:18:9:16:12 chr4 38776107 . T G 106.21 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0343305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.919;QD=14.1617;RBI=0.0376629;REFB=-0.0226252;REVB=0.0154892;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184269;STB=0.586067;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0665288;OID=.;OPOS=38776107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:17:12:12:0.4:6:6:5:11:6:6:6:11 chr4 38776180 . C A 164.83 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0267565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6659;QD=21.2677;RBI=0.0302834;REFB=-0.0327326;REVB=-0.0141835;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455802;STB=0.525662;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0116623;OID=.;OPOS=38776180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:9:5:7:10:9:5 chr4 38776491 . T G 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0192748;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.159;QD=22.1886;RBI=0.0201666;REFB=-0.0246564;REVB=0.00593057;RO=18;SAF=12;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149696;STB=0.583862;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0224346;OID=.;OPOS=38776491;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:9:12:7:11:9:12:7:11 chr4 38798648 . C A 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.019;QD=62.9829;RBI=0.0229037;REFB=0;REVB=0.0103591;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45827e-05;OID=.;OPOS=38798648;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0 chr4 38798935 . C T 46.35 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0037238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.651;QD=9.75766;RBI=0.0117954;REFB=0.000280094;REVB=-0.0111922;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369272;STB=0.733907;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00138954;OID=.;OPOS=38798935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:1:6:7:5:1:6:7:5 chr4 38799710 . T C 220.9 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.055681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.149;QD=18.0324;RBI=0.0556815;REFB=-0.0214491;REVB=0.000245167;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391584;STB=0.522224;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0273049;OID=.;OPOS=38799710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:13:9:10:17:13:9:10:17 chr4 38830012 . G C 204.52 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00258729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.84;QD=22.7239;RBI=0.0165351;REFB=-0.00221324;REVB=0.0163314;RO=15;SAF=13;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014105;STB=0.512109;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00168158;OID=.;OPOS=38830012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:16:20:20:0.555556:7:13:10:5:7:13:10:6 chr4 38830350 . A G 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0967501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8897;QD=57.1054;RBI=0.0970186;REFB=0;REVB=-0.00721298;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113167;OID=.;OPOS=38830350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr4 38916610 . G A 545.28 PASS AF=0.588235;AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0136522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.12;QD=25.66;RBI=0.045795;REFB=-0.00180603;REVB=0.0437126;RO=35;SAF=21;SAR=29;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156816;STB=0.585687;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00171206;OID=.;OPOS=38916610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:35:35:50:50:0.588235:29:21:22:13:29:21:22:13 chr4 38945169 . A G 746.67 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.114;QD=63.5466;RBI=0.0560552;REFB=0;REVB=0.0518858;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332832;OID=.;OPOS=38945169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0 chr4 38995374 . T C 1525.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.454;QD=59.833;RBI=0.0275244;REFB=0;REVB=0.00404647;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48838e-05;OID=.;OPOS=38995374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:50:52:0:0:50:52:0:0 chr4 39064162 . A C,T 1460.34 PASS AF=0.946809,0.0531915;AO=88,5;DP=94;FAO=89,5;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=67,3;FSAR=22,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00849011,0.00128812;FXX=0.0309246;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=72.4736,180.551;QD=62.1422;RBI=0.0405911,0.0326043;REFB=0,0;REVB=0.0396932,0.0325788;RO=0;SAF=66,3;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.59293e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00226806,0.0519443;OID=.,.;OPOS=39064162,39064162;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:94:94:0:0:88,5:89,5:0.946809,0.0531915:22,2:66,3:0:0:22,2:67,3:0:0 chr4 39094738 . G A 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.721;QD=63.5826;RBI=0.019092;REFB=0;REVB=0.0173794;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52305e-05;OID=.;OPOS=39094738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr4 39116911 . T C 400.72 PASS AF=0.446809;AO=40;DP=92;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0083375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.281;QD=17.0517;RBI=0.0127742;REFB=-0.00719061;REVB=0.00967813;RO=52;SAF=18;SAR=22;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274276;STB=0.503104;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00902654;OID=.;OPOS=39116911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:52:52:40:42:0.446809:22:18:22:30:24:18:22:30 chr4 39122697 . C T 260.52 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0197384;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.564;QD=14.4734;RBI=0.0228139;REFB=0.00026886;REVB=-0.0114398;RO=42;SAF=15;SAR=15;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000521952;OID=.;OPOS=39122697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:15:15:21:21:15:15:21:21 chr4 39246087 . T C 267.33 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0125599;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.058;QD=18.4363;RBI=0.013137;REFB=-0.0130314;REVB=0.00385093;RO=29;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122937;STB=0.568673;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00762062;OID=.;OPOS=39246087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:16:13:17:12:16:13:17:12 chr4 39271653 . A G 585.13 PASS AF=0.522124;AO=58;DP=114;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0081766;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.576;QD=20.7126;RBI=0.0153393;REFB=-0.00398338;REVB=0.0129784;RO=55;SAF=39;SAR=19;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875487;STB=0.535632;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00371747;OID=.;OPOS=39271653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:55:54:58:59:0.522124:19:39:32:23:20:39:32:22 chr4 39299266 . A G 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.000899907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1821;QD=15.8817;RBI=0.052037;REFB=-0.0105388;REVB=0.0520293;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121211;STB=0.571275;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0403597;OID=.;OPOS=39299266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:8:2:3:7:8:2:3:7 chr4 39302028 . AT AC,TG 190.97 PASS AF=0.558824,0;AO=19,2;DP=34;FAO=19,0;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=12,0;FSAR=7,0;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0599891,0.00377135;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,2;MLLD=83.0235,46.4522;QD=22.4674;RBI=0.062747,0.0273564;REFB=-0.0111642,-0.00796347;REVB=-0.0183982,-0.0270952;RO=13;SAF=12,2;SAR=7,0;SRF=4;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.235442,0.637912;STB=0.603663,0.5;STBP=0.174,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0129669,0;OID=.,.;OPOS=39302029,39302028;OREF=T,AT;OALT=C,TG;OMAPALT=AC,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:15:19,2:19,0:0.558824,0:7,0:12,2:4:9:7,0:12,0:6:9 chr4 39303925 . A G 419.95 PASS AF=0.417391;AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0161345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.894;QD=14.6071;RBI=0.0162357;REFB=-0.0121305;REVB=0.00180998;RO=67;SAF=22;SAR=26;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355218;STB=0.519992;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.015536;OID=.;OPOS=39303925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:67:67:48:48:0.417391:26:22:33:34:26:22:33:34 chr4 39408989 . C G 169.16 PASS AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0138553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.096;QD=12.0831;RBI=0.0141533;REFB=-0.00798594;REVB=0.00288884;RO=35;SAF=13;SAR=8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109233;STB=0.506323;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0100317;OID=.;OPOS=39408989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:8:13:22:13:8:13:22:13 chr4 39448542 . C G 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.000964893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.565;QD=18.8866;RBI=0.00765629;REFB=0.00421175;REVB=0.00759525;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128939;STB=0.574292;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00129278;OID=.;OPOS=39448542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:3:5:4:1:3:5:4:1 chr4 39450229 . C A 96.12 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00251106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.195;QD=12.0155;RBI=0.0123856;REFB=-0.0271398;REVB=-0.0121284;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735466;STB=0.543407;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.026995;OID=.;OPOS=39450229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:7:13:7:5:7:13 chr4 39457954 . G C 206.91 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00497838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0351;QD=17.2421;RBI=0.0136688;REFB=-0.0251872;REVB=-0.01273;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891061;STB=0.550849;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0219032;OID=.;OPOS=39457954;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:13:14:9:12:13:14 chr4 39458051 . A G 199.75 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0138568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.754;QD=19.9747;RBI=0.0258979;REFB=-0.00900069;REVB=0.021879;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00613786;OID=.;OPOS=39458051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:10:10:10:10:10:10:10:10 chr4 39459724 . T C 539.88 PASS AF=0.561798;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0119449;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.199;QD=24.2643;RBI=0.0166259;REFB=0.0033508;REVB=0.0115646;RO=39;SAF=33;SAR=17;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225277;STB=0.623739;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.0017283;OID=.;OPOS=39459724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:39:39:50:50:0.561798:17:33:15:24:17:33:15:24 chr4 39460490 . C G 355.04 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.00421827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.73;QD=16.3237;RBI=0.0108912;REFB=-0.0142836;REVB=-0.0100411;RO=49;SAF=20;SAR=18;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178742;STB=0.600189;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0232436;OID=.;OPOS=39460490;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:49:38:38:0.436782:18:20:17:32:18:20:17:32 chr4 39460572 . G A 431.35 PASS AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00157541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.94;QD=25.7525;RBI=0.00374113;REFB=-0.0116015;REVB=-0.00339324;RO=26;SAF=13;SAR=28;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168557;STB=0.59243;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00759497;OID=.;OPOS=39460572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:28:13:14:12:28:13:14:12 chr4 39472842 . T A 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00153612;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.91;QD=16.9313;RBI=0.107572;REFB=0.00442037;REVB=0.107561;RO=12;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222009;STB=0.628352;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00184485;OID=.;OPOS=39472842;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:4:8:5:7:4:8:5:7 chr4 39501086 . G A 116.76 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0711427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3841;QD=11.6761;RBI=0.0967964;REFB=0.0104122;REVB=0.0656374;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229769;STB=0.549929;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.0191686;OID=.;OPOS=39501086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:26:14:14:0.35:7:7:11:12:7:7:11:15 chr4 39510264 . A G 278.86 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0684918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.37;QD=21.8716;RBI=0.0686009;REFB=0.000774439;REVB=0.00386821;RO=22;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171432;STB=0.603257;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.000454731;OID=.;OPOS=39510264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:23:28:28:0.54902:15:13:15:7:15:13:16:7 chr4 39515736 . A G 178.21 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0432817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6559;QD=14.8506;RBI=0.06275;REFB=0.00578029;REVB=0.0454341;RO=29;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343803;STB=0.696016;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00232291;OID=.;OPOS=39515736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:8:11:7:22:8:11:7:22 chr4 39515806 . TAAAAAGA T 70.96 PASS AF=0.375;AO=10;DP=33;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0181258;FXX=0.0302939;HRUN=5;LEN=7;MLLD=207.701;QD=8.87043;RBI=0.0189091;REFB=-0.00263299;REVB=0.00538593;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196547;STB=0.535652;STBP=0.863;TYPE=del;VARB=0.00559446;OID=.;OPOS=39515807;OREF=AAAAAGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:10:33:12:32:20:2:10:4:16:70:16:1:9:3:13 chr4 39921942 . A G 70.78 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0085162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.243;QD=7.25967;RBI=0.00870675;REFB=-0.00936843;REVB=0.00181161;RO=29;SAF=6;SAR=4;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695676;STB=0.543393;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0271574;OID=.;OPOS=39921942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:4:6:19:10:4:6:19:10 chr4 40079556 . C T 360.26 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0012073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.773;QD=32.0231;RBI=0.00472238;REFB=-0.0141153;REVB=0.00456545;RO=15;SAF=12;SAR=18;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829752;STB=0.545424;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00740333;OID=.;OPOS=40079556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:18:12:8:7:18:12:8:7 chr4 40121562 . G A 1283.43 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.004;QD=61.8519;RBI=0.0845162;REFB=0;REVB=-0.0823505;RO=0;SAF=59;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117666;OID=.;OPOS=40121562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:24:59:0:0:24:59:0:0 chr4 40138676 . A G 468.19 PASS AF=0.60274;AO=44;DP=73;FAO=44;FDP=73;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0623572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1489;QD=25.6544;RBI=0.0638689;REFB=-0.0110118;REVB=0.0138139;RO=29;SAF=23;SAR=21;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211327;STB=0.51155;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.00685826;OID=.;OPOS=40138676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:29:29:44:44:0.60274:21:23:16:13:21:23:16:13 chr4 40155927 . T C 231.01 PASS AF=0.480769;AO=24;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00349483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.527;QD=17.77;RBI=0.00398501;REFB=0.00322679;REVB=0.0019148;RO=27;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617012;STB=0.543272;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=-0.00267035;OID=.;OPOS=40155927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:27:27:24:25:0.480769:10:14:14:13:10:15:14:13 chr4 40337566 . C T 135.96 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0077415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.679;QD=17.5437;RBI=0.0115896;REFB=-0.0272814;REVB=-0.00862484;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414798;STB=0.523777;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0245257;OID=.;OPOS=40337566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:5:10:10:6:5:10:10:6 chr4 40337908 . T C 276.56 PASS AF=0.339806;AO=34;DP=102;FAO=35;FDP=103;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.00921852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.091;QD=10.7401;RBI=0.0101785;REFB=-0.00870735;REVB=-0.00431524;RO=68;SAF=20;SAR=14;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175151;STB=0.521355;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.024661;OID=.;OPOS=40337908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:68:68:34:35:0.339806:14:20:41:27:15:20:41:27 chr4 40356422 . A G 451.6 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602609;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.703;QD=58.2705;RBI=0.00641154;REFB=0;REVB=-0.00218954;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.763e-05;OID=.;OPOS=40356422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr4 40428010 . T C 399.44 PASS AF=0.512821;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00608489;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.858;QD=20.484;RBI=0.00706342;REFB=-0.0147916;REVB=-0.00358691;RO=36;SAF=19;SAR=21;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262697;STB=0.526404;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0182033;OID=.;OPOS=40428010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:36:38:40:40:0.512821:21:19:16:20:21:19:16:22 chr4 40438576 . A G 374.2 PASS AF=0.46988;AO=38;DP=81;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0208914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.861;QD=18.0338;RBI=0.0247142;REFB=-0.0181175;REVB=0.0132038;RO=42;SAF=16;SAR=22;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00723862;STB=0.502199;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0226918;OID=.;OPOS=40438576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:42:44:38:39:0.46988:22:16:18:24:22:17:19:25 chr4 40440215 . T C 315.18 PASS AF=0.465753;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0137283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.888;QD=17.2701;RBI=0.0141274;REFB=-0.0170643;REVB=-0.00333454;RO=38;SAF=16;SAR=18;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101864;STB=0.563366;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0197578;OID=.;OPOS=40440215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:38:39:34:34:0.465753:18:16:22:16:18:16:23:16 chr4 40778146 . C T 1102.51 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.684;QD=58.8007;RBI=0.0265915;REFB=-0.022372;REVB=0.0240946;RO=1;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137108;STB=0.507244;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=4.5648e-05;OID=.;OPOS=40778146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:34:40:0:1:34:40:0:1 chr4 40778162 . T G 1040.07 PASS AF=0.972603;AO=70;DP=74;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0328871;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.777;QD=56.9901;RBI=0.0384256;REFB=-0.0217202;REVB=0.0198738;RO=1;SAF=37;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126076;STB=0.512817;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00014426;OID=.;OPOS=40778162;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:73:1:2:70:71:0.972603:33:37:1:0:33:38:2:0 chr4 40810747 . A G 545.23 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00814231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.18;QD=57.393;RBI=0.0141993;REFB=-0.192448;REVB=0.0116328;RO=1;SAF=13;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346573;STB=0.518508;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000110185;OID=.;OPOS=40810747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:24:13:1:0:24:13:1:0 chr4 41015823 . G T 512.28 PASS AF=0.454545;AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.00677558;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.768;QD=16.9348;RBI=0.0140246;REFB=-0.01092;REVB=-0.0122793;RO=66;SAF=25;SAR=30;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300043;STB=0.516711;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0135259;OID=.;OPOS=41015823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:66:66:55:55:0.454545:30:25:28:38:30:25:28:38 chr4 41015899 . C T 485.52 PASS AF=0.489796;AO=46;DP=96;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0166719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.5;QD=19.8172;RBI=0.0191444;REFB=-0.0224468;REVB=-0.00941046;RO=49;SAF=17;SAR=29;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964606;STB=0.544048;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0247884;OID=.;OPOS=41015899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:49:50:46:48:0.489796:29:17:23:26:29:19:24:26 chr4 41016484 . T C 75.68 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0261122;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=189.536;QD=11.6424;RBI=0.0377745;REFB=-0.0141084;REVB=-0.0272958;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327049;STB=0.671317;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0108219;OID=.;OPOS=41016484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:25:26:15:16:10:10:0.384615:4:6:4:11:4:6:5:11 chr4 41259633 . C A 37.51 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00892314;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.7844;QD=7.14457;RBI=0.0408611;REFB=-0.00503434;REVB=-0.0398749;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260867;STB=0.686886;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0258421;OID=.;OPOS=41259633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:20:21:14:15:6:6:0.285714:2:4:6:8:2:4:6:9 chr4 41526503 . C T 1659.88 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.347;QD=60.3592;RBI=0.0318706;REFB=0;REVB=-0.026884;RO=0;SAF=43;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13837e-05;OID=.;OPOS=41526503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:110:0:0:108:110:1:65:43:0:0:66:44:0:0 chr4 41634859 . C T 347.44 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0292783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.203;QD=17.1576;RBI=0.0294106;REFB=-0.0202093;REVB=0.0027865;RO=43;SAF=15;SAR=22;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810293;STB=0.536823;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0287801;OID=.;OPOS=41634859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:44:37:37:0.45679:22:15:14:29:22:15:15:29 chr4 41984118 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.021;QD=58.7817;RBI=0.0193603;REFB=0;REVB=-0.00964141;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64044e-05;OID=.;OPOS=41984118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0 chr4 41985101 . A G 3991.9 PASS AF=1;AO=249;DP=249;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.415;QD=64.1269;RBI=0.0648718;REFB=0;REVB=0.036045;RO=0;SAF=117;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49369e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116697;OID=.;OPOS=41985101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:249:249:0:0:249:249:1:132:117:0:0:132:117:0:0 chr4 41985478 . A G 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.09;QD=59.5018;RBI=0.0289734;REFB=0;REVB=0.02318;RO=0;SAF=21;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27542e-05;OID=.;OPOS=41985478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:48:21:0:0:48:21:0:0 chr4 41985689 . C T 855.04 PASS AF=1;AO=46;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.182268;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7678;QD=57.9691;RBI=0.197705;REFB=0;REVB=-0.0765881;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140107;OID=.;OPOS=41985689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:46:59:1:34:12:0:0:34:25:0:0 chr4 41986857 . A G 1421.35 PASS AF=1;AO=88;DP=92;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394186;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3336;QD=63.1709;RBI=0.0460903;REFB=0;REVB=0.0459215;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101973;OID=.;OPOS=41986857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:92:90:0:0:88:90:1:53:35:0:0:55:35:0:0 chr4 41987892 . G A 734.44 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.095;QD=61.2029;RBI=0.0245564;REFB=-0.181225;REVB=0.0173357;RO=1;SAF=18;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025408;STB=0.513508;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000752681;OID=.;OPOS=41987892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:29:18:1:0:29:18:1:0 chr4 41988385 . TAC T 515.96 PASS AF=1;AO=32;DP=38;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00582693;FXX=0.105235;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.52;QD=60.7006;RBI=0.00597918;REFB=0;REVB=-0.0013407;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-9.40553e-06;OID=.;OPOS=41988386;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:32:38:34:34:0:19:15:0:0:3:0:17:15:0:0 chr4 41992677 . C G 3079.43 PASS AF=0.994949;AO=195;DP=198;FAO=197;FDP=198;FR=.;FRO=1;FSAF=105;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0953737;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1704;QD=62.2107;RBI=0.0988192;REFB=-0.172226;REVB=0.0258668;RO=2;SAF=104;SAR=91;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000647325;STB=0.502702;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00188767;OID=.;OPOS=41992677;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:198:198:2:1:195:197:0.994949:91:104:1:1:92:105:0:1 chr4 42003671 . A G 728.88 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.548;QD=57.1674;RBI=0.00149933;REFB=0;REVB=-0.00105645;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33376e-08;OID=.;OPOS=42003671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0 chr4 42020142 . A G 2008.4 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.948;QD=62.2761;RBI=0.0168389;REFB=0;REVB=0.0167746;RO=0;SAF=66;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31188e-05;OID=.;OPOS=42020142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:63:66:0:0:63:66:0:0 chr4 42022464 . C A 789.07 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560196;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.098;QD=57.3868;RBI=0.0568128;REFB=0;REVB=0.0094608;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7766e-06;OID=.;OPOS=42022464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0 chr4 42629038 . C T 352.92 PASS AF=0.392523;AO=41;DP=107;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0142001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.418;QD=13.1933;RBI=0.016144;REFB=-0.00624262;REVB=0.00768035;RO=65;SAF=20;SAR=21;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784042;STB=0.537136;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0100675;OID=.;OPOS=42629038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:65:65:41:42:0.392523:21:20:27:38:22:20:27:38 chr4 42895308 . G A 475.53 PASS AF=0.417323;AO=53;DP=128;FAO=53;FDP=127;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.00317785;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.046;QD=14.9772;RBI=0.0037638;REFB=-0.00943958;REVB=0.0020168;RO=73;SAF=34;SAR=19;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278371;STB=0.520899;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0127092;OID=.;OPOS=42895308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:73:74:53:53:0.417323:19:34:45:28:19:34:45:29 chr4 44295839 . G A 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.872;QD=58.7816;RBI=0.0254011;REFB=0;REVB=-0.0221331;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000174809;OID=.;OPOS=44295839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0 chr4 44626641 . A G 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0166818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.321;QD=16.2364;RBI=0.0166841;REFB=-0.0056431;REVB=-0.000276529;RO=36;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807533;STB=0.545424;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00856675;OID=.;OPOS=44626641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:15:15:15:21:15:15:15:21 chr4 44680718 . GCCCCGG GCC,GCCCG,GCCCGG 154.23 PASS AF=0,0.766667,0;AO=5,7,5;DP=31;FAO=0,23,0;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=0,18,0;FSAR=0,5,0;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0398473,-0.0748735,-0.321984;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=4,2,1;MLLD=29.4763,15.3437,8.88419;QD=20.5641;RBI=0.125453,0.23693,0.481837;REFB=-0.0574243,-0.105238,-0.0140817;REVB=0.118956,0.224788,0.35846;RO=8;SAF=5,5,5;SAR=0,2,0;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.711762,0.09181,0.711762;STB=0.5,0.522801,0.5;STBP=1,0.673,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.0514132,-0.0011815;OID=.,.,.;OPOS=44680721,44680722,44680719;OREF=CCGG,CG,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCC,GCCCG,GCCCGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.766667,0:5,7,5:31:0,23,0:30:7:0,18,0:0,5,0:5:2:25:8:5,5,5:0,2,0:5:3 chr4 44682465 . T C 549.36 PASS AF=0.462121;AO=63;DP=132;FAO=61;FDP=132;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=0.0339031;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8889;QD=16.6472;RBI=0.0424461;REFB=-0.038914;REVB=-0.0255392;RO=67;SAF=33;SAR=30;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265811;STB=0.537301;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0507746;OID=.;OPOS=44682465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:71:63:61:0.462121:30:33:37:30:30:31:41:30 chr4 44699484 . T G 541.85 PASS AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00764171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.993;QD=24.9125;RBI=0.00792829;REFB=-0.0126185;REVB=0.00211234;RO=37;SAF=24;SAR=26;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469954;STB=0.525725;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.015443;OID=.;OPOS=44699484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:26:24:20:17:26:24:20:17 chr4 44704757 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.328;QD=57.0007;RBI=0.023422;REFB=0;REVB=0.0156778;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68661e-05;OID=.;OPOS=44704757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0 chr4 46086060 . T C 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0331593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.122;QD=11.9165;RBI=0.042555;REFB=0.000669095;REVB=0.0266718;RO=37;SAF=10;SAR=12;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929941;STB=0.553797;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.000330024;OID=.;OPOS=46086060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:12:10:20:17:12:10:20:17 chr4 46314593 . T C 1607.97 PASS AF=0.990909;AO=107;DP=109;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00670154;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=217.205;QD=58.4716;RBI=0.00700474;REFB=-0.0164094;REVB=-0.00203856;RO=1;SAF=45;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759448;STB=0.503999;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=9.20997e-06;OID=.;OPOS=46314593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:110:1:1:107:109:0.990909:62:45:0:1:62:47:0:1 chr4 46334702 . A G 1170.44 PASS AF=0.941176;AO=80;DP=85;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00948811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7269;QD=55.0795;RBI=0.0172838;REFB=-0.0341695;REVB=0.0144467;RO=5;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497525;STB=0.526309;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00941474;OID=.;OPOS=46334702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:85:85:5:5:80:80:0.941176:45:35:0:5:45:35:0:5 chr4 47034626 . C G 1219.02 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0370743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.397;QD=58.7479;RBI=0.0701297;REFB=-0.124787;REVB=0.0595287;RO=2;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215128;STB=0.511361;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.000449654;OID=.;OPOS=47034626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:83:83:2:2:81:81:0.975904:43:38:0:2:43:38:0:2 chr4 47322190 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.536;QD=60.9781;RBI=0.0129064;REFB=0;REVB=0.00955335;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22938e-05;OID=.;OPOS=47322190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0 chr4 47408838 . C T 638.85 PASS AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0605494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8185;QD=55.552;RBI=0.108815;REFB=-0.0708089;REVB=-0.0904125;RO=2;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390966;STB=0.530598;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00933093;OID=.;OPOS=47408838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:46:46:2:3:43:43:0.934783:23:20:0:2:23:20:0:3 chr4 47408896 . G A 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0111758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.023;QD=14.6982;RBI=0.011176;REFB=-0.00423951;REVB=-6.88248e-05;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16468;STB=0.564024;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00699267;OID=.;OPOS=47408896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:23:16:16:0.410256:8:8:7:14:8:8:9:14 chr4 47428335 . C CT,T 419.89 PASS AF=0.410256,0.00641026;AO=54,7;DP=160;FAO=64,1;FDP=156;FR=.;FRO=91;FSAF=24,1;FSAR=40,0;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.14625,-0.0146797;FXX=0.0126574;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=14.5465,257.954;QD=10.7663;RBI=0.166936,0.0175884;REFB=-0.0194541,0.000791057;REVB=-0.0804898,-0.00968799;RO=91;SAF=21,1;SAR=33,6;SRF=44;SRR=47;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.106743,-0.374582;STB=0.552747,0.990817;STBP=0.299,0.285;TYPE=ins,snp;VARB=0.0112198,-0.0379898;OID=.,.;OPOS=47428336,47428335;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:156:91:91:54,7:64,1:0.410256,0.00641026:33,6:21,1:44:47:40,0:24,1:42:49 chr4 47560163 . C A 558.11 PASS AF=0.530612;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0104545;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.291;QD=22.7801;RBI=0.0172766;REFB=7.77921e-05;REVB=-0.0137545;RO=45;SAF=23;SAR=29;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207574;STB=0.51703;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.000321021;OID=.;OPOS=47560163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:45:46:52:52:0.530612:29:23:21:24:29:23:22:24 chr4 47584046 . G A 2699.42 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178014;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.531;QD=62.4144;RBI=0.0182422;REFB=0;REVB=0.00398611;RO=0;SAF=80;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49446e-05;OID=.;OPOS=47584046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:173:0:0:173:173:1:93:80:0:0:93:80:0:0 chr4 47589203 . G A 623.49 PASS AF=0.436709;AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=158;FR=.;FRO=89;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=0.00896041;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.897;QD=15.7845;RBI=0.0212838;REFB=-0.0131375;REVB=-0.0193057;RO=89;SAF=34;SAR=35;SRF=36;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893548;STB=0.549784;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0175904;OID=.;OPOS=47589203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:89:89:69:69:0.436709:35:34:36:53:35:34:36:53 chr4 47597654 . C G 217.82 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.010897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.363;QD=16.755;RBI=0.0176659;REFB=-0.0144467;REVB=-0.0139047;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032853;STB=0.535685;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0144744;OID=.;OPOS=47597654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:28:24:24:0.461538:13:11:11:15:13:11:11:17 chr4 47667064 . T C 684.68 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00218549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.277;QD=60.8605;RBI=0.0911742;REFB=0;REVB=0.091148;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000775075;OID=.;OPOS=47667064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0 chr4 47936972 . C T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00481237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.839;QD=50.4134;RBI=0.0061136;REFB=0;REVB=0.00377057;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.61663e-05;OID=.;OPOS=47936972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0 chr4 47945455 . C G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0447059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.336;QD=39.2068;RBI=0.0449588;REFB=0;REVB=-0.00476148;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00240221;OID=.;OPOS=47945455;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr4 48170669 . A G 553.84 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166102;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.696;QD=58.2993;RBI=0.0244667;REFB=-0.111982;REVB=-0.0179645;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000978773;OID=.;OPOS=48170669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:38:38:0:0:37:38:1:15:22:0:0:16:22:0:0 chr4 48172266 . G A,T 759.33 PASS AF=0.981481,0.0185185;AO=52,2;DP=54;FAO=53,1;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27,0;FSAR=26,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353402,-0.00220527;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=135.843,144.27;QD=56.2469;RBI=0.0061325,0.0245238;REFB=0,0;REVB=-0.00501181,-0.0244244;RO=0;SAF=27,0;SAR=25,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000641958,0.0468265;OID=.,.;OPOS=48172266,48172266;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:54:54:0:0:52,2:53,1:0.981481,0.0185185:25,2:27,0:0:0:26,1:27,0:0:0 chr4 48425287 . T G 166.13 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00430341;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.046;QD=22.1508;RBI=0.0194876;REFB=0.00122765;REVB=-0.0190065;RO=12;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102381;STB=0.571347;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.00118843;OID=.;OPOS=48425287;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:12:13:17:17:0.566667:8:9:8:4:8:9:9:4 chr4 48492434 . G C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3146;QD=33.4248;RBI=0.116586;REFB=0;REVB=-0.00463444;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.010096;OID=.;OPOS=48492434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr4 48582909 . G A 894.31 PASS AF=0.969231;AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00285569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.113;QD=55.0347;RBI=0.00337937;REFB=0.0916691;REVB=0.00180698;RO=1;SAF=35;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132996;STB=0.513509;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-8.75969e-06;OID=.;OPOS=48582909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:65:1:2:62:63:0.969231:27:35:1:0:27:36:2:0 chr4 48625212 . AC A,AA 853.82 PASS AF=0.612903,0.370968;AO=25,29;DP=58;FAO=38,23;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=12,6;FSAR=26,17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0538257,0.0521934;FXX=0.0605969;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=260.516,259.015;QD=55.0852;RBI=0.0539377,0.0522767;REFB=-0.169687,-0.18316;REVB=0.00347287,0.00294915;RO=1;SAF=9,7;SAR=16,22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0487725,-0.0619467;STB=0.519989,0.538427;STBP=0.26,0.166;TYPE=del,snp;VARB=-0.00862071,0.00235767;OID=.,.;OPOS=48625213,48625213;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.612903,0.370968:25,29:58:38,23:62:1:12,6:26,17:1:0:49:1:9,7:16,22:1:0 chr4 48988450 . C A 723.88 PASS AF=0.610619;AO=68;DP=112;FAO=69;FDP=113;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0219278;FXX=0.0173898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8183;QD=25.624;RBI=0.022231;REFB=-0.0518951;REVB=0.00365905;RO=43;SAF=30;SAR=38;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836817;STB=0.537541;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0380665;OID=.;OPOS=48988450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:43:44:68:69:0.610619:38:30:24:19:38:31:24:20 chr4 49063872 . C A 255.7 PASS AF=0.336957;AO=31;DP=92;FAO=31;FDP=92;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.00927624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.971;QD=11.1172;RBI=0.00944587;REFB=-0.00745561;REVB=-0.0017821;RO=59;SAF=11;SAR=20;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196527;STB=0.604248;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.015747;OID=.;OPOS=49063872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:59:61:31:31:0.336957:20:11:31:28:20:11:31:30 chr4 52714354 . A ATTTC,C 170.89 PASS AF=0.353846,0.0153846;AO=18,3;DP=65;FAO=23,1;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=17,1;FSAR=6,0;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0199624,0.00913959;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=4,1;MLLD=241.586,119.366;QD=10.5162;RBI=0.0268551,0.0171687;REFB=0.00108637,0.00535415;REVB=-0.0179639,0.0145339;RO=39;SAF=14,2;SAR=4,1;SRF=23;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.25578,0.0791773;STB=0.597354,0.987899;STBP=0.287,0.486;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00218007,-0.00863616;OID=.,.;OPOS=52714355,52714354;OREF=-,A;OALT=TTTC,C;OMAPALT=ATTTC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:41:18,3:23,1:0.353846,0.0153846:4,1:14,2:23:16:6,0:17,1:25:16 chr4 52752812 . A T 638.37 PASS AF=0.427711;AO=71;DP=166;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=0.00427848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.292;QD=15.3825;RBI=0.00556703;REFB=-0.0137399;REVB=0.00356181;RO=95;SAF=34;SAR=37;SRF=47;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162596;STB=0.509085;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0222273;OID=.;OPOS=52752812;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:95:95:71:71:0.427711:37:34:47:48:37:34:47:48 chr4 52780048 . G C 777.36 PASS AF=0.496894;AO=80;DP=161;FAO=80;FDP=161;FR=.;FRO=81;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=49;FSRR=32;FWDB=0.00566512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3936;QD=19.3133;RBI=0.0100439;REFB=-0.00651061;REVB=-0.00829381;RO=80;SAF=38;SAR=42;SRF=48;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113193;STB=0.565094;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00366549;OID=.;OPOS=52780048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:80:81:80:80:0.496894:42:38:48:32:42:38:49:32 chr4 52889602 . T A 152.17 PASS AF=0.75;AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0190195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.991;QD=30.4346;RBI=0.0328372;REFB=-0.0108457;REVB=0.0267683;RO=5;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332961;STB=0.518493;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00441063;OID=.;OPOS=52889602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:20:20:5:5:15:15:0.75:5:10:3:2:5:10:3:2 chr4 52938243 . T C 298.35 PASS AF=0.574074;AO=30;DP=52;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00166313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6226;QD=22.0997;RBI=0.0113942;REFB=-0.0246515;REVB=0.0112722;RO=19;SAF=13;SAR=17;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660177;STB=0.566624;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0256177;OID=.;OPOS=52938243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:19:23:30:31:0.574074:17:13:10:9:17:14:14:9 chr4 53361058 . G C 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00234849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6863;QD=14.6539;RBI=0.0356414;REFB=0.010893;REVB=-0.0355639;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.011417;OID=.;OPOS=53361058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:6:2:2:6:6:2 chr4 53463164 . G C 477.38 PASS AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0103313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.78;QD=18.0143;RBI=0.0311659;REFB=-0.00915674;REVB=-0.0294037;RO=55;SAF=24;SAR=27;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867974;STB=0.548154;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.011003;OID=.;OPOS=53463164;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:55:55:51:51:0.481132:27:24:31:24:27:24:31:24 chr4 53610272 . C T 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00237156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.202;QD=18.9664;RBI=0.0230607;REFB=0.00438444;REVB=-0.0229385;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113601;STB=0.564456;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.00629718;OID=.;OPOS=53610272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:12:13:14:8:12:13 chr4 53652758 . A T 526.79 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0251807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.935;QD=56.9498;RBI=0.0322596;REFB=-0.133958;REVB=-0.0201647;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514278;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000935648;OID=.;OPOS=53652758;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:19:17:0:0:19:17:1:0 chr4 53729429 . G A 764.92 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124011;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.297;QD=56.6607;RBI=0.0198903;REFB=0;REVB=0.0155511;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00466925;OID=.;OPOS=53729429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:28:24:0:0:28:26:0:0 chr4 53732943 . T A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00459765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.906;QD=61.6838;RBI=0.0159224;REFB=0;REVB=0.0152441;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79164e-05;OID=.;OPOS=53732943;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0 chr4 53822267 . CAAG C 271.54 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=11;FWDB=0.00969994;FXX=0.0227247;HRUN=2;LEN=3;MLLD=177.097;QD=12.6298;RBI=0.0191911;REFB=0.00370265;REVB=0.0165593;RO=47;SAF=23;SAR=18;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161995;STB=0.605977;STBP=0.086;TYPE=del;VARB=-0.00400112;OID=.;OPOS=53822268;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.476744:41:89:41:86:45:23:18:34:11:99:47:23:18:34:13 chr4 53822307 . A G 610.34 PASS AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.00223884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.556;QD=22.8165;RBI=0.0194393;REFB=-0.0424698;REVB=0.0193099;RO=47;SAF=43;SAR=17;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112683;STB=0.561866;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0298181;OID=.;OPOS=53822307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:47:47:60:60:0.560748:17:43:28:19:17:43:28:19 chr4 54011526 . A G 2798.87 PASS AF=0.989011;AO=180;DP=182;FAO=180;FDP=182;FR=.;FRO=2;FSAF=97;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00571258;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.438;QD=61.5137;RBI=0.00922778;REFB=0.0192819;REVB=0.00724695;RO=2;SAF=97;SAR=83;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000818494;STB=0.50043;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.000311359;OID=.;OPOS=54011526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:182:182:2:2:180:180:0.989011:83:97:1:1:83:97:1:1 chr4 54352468 . GC G 521.6 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252024;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.515;QD=44.3914;RBI=0.0315542;REFB=0;REVB=0.0189869;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.001399;OID=.;OPOS=54352469;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:47:47:47:47:0:29:18:0:0:10:0:29:18:0:0 chr4 54966667 . C T 258.03 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.000997119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.167;QD=18.4305;RBI=0.00462865;REFB=-0.0310026;REVB=-0.00451997;RO=23;SAF=8;SAR=20;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137814;STB=0.635258;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0242307;OID=.;OPOS=54966667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:28:28:28:0.5:20:8:10:13:20:8:15:13 chr4 54966830 . G A 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.296;QD=58.1417;RBI=0.019621;REFB=0;REVB=-0.00130133;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19077e-05;OID=.;OPOS=54966830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr4 55141055 . A G 1624.27 PASS AF=1;AO=93;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.431;QD=60.1582;RBI=0.0284208;REFB=0;REVB=0.0250448;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51003e-05;OID=.;OPOS=55141055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:93:108:1:47:46:0:0:56:52:0:0 chr4 55161391 . T C 2664.2 PASS AF=0.99422;AO=172;DP=174;FAO=172;FDP=173;FR=.;FRO=1;FSAF=93;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0197246;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.564;QD=61.5999;RBI=0.0409249;REFB=-0.129961;REVB=0.0358579;RO=0;SAF=93;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75077e-08;STB=0.502674;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00031215;OID=.;OPOS=55161391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:174:173:0:1:172:172:0.99422:79:93:0:0:79:93:1:0 chr4 55161517 . A G 3111.17 PASS AF=0.990291;AO=203;DP=206;FAO=204;FDP=206;FR=.;FRO=2;FSAF=97;FSAR=107;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0045388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.475;QD=60.4111;RBI=0.0106341;REFB=0.00583011;REVB=0.00961681;RO=2;SAF=97;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00971858;STB=0.505102;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-4.55538e-05;OID=.;OPOS=55161517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:206:206:2:2:203:204:0.990291:106:97:2:0:107:97:2:0 chr4 55593481 . A G 418.0 PASS AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.061567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.713;QD=19.9049;RBI=0.0616937;REFB=0.00163016;REVB=-0.00395196;RO=42;SAF=24;SAR=18;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441341;STB=0.524464;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00250595;OID=.;OPOS=55593481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:18:24:26:16:18:24:26:16 chr4 55599436 . T C 214.36 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00667939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.168;QD=12.7974;RBI=0.0589932;REFB=-0.011582;REVB=-0.0586139;RO=40;SAF=6;SAR=20;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215794;STB=0.619619;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.031869;OID=.;OPOS=55599436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:40:41:26:26:0.38806:20:6:16:24:20:6:16:25 chr4 55946081 . A G 2271.79 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.614;QD=63.5466;RBI=0.0423808;REFB=0;REVB=0.0403398;RO=0;SAF=69;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75417e-05;OID=.;OPOS=55946081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:143:0:0:141:143:1:72:69:0:0:74:69:0:0 chr4 55972974 . T A 415.46 PASS AF=0.65;AO=39;DP=60;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0101651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.337;QD=27.6971;RBI=0.0237123;REFB=-0.0154841;REVB=0.021423;RO=21;SAF=29;SAR=10;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155535;STB=0.50847;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00972212;OID=.;OPOS=55972974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:21:21:39:39:0.65:10:29:16:5:10:29:16:5 chr4 56291620 . CAA C 1135.02 PASS AF=1;AO=88;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158109;FXX=0.0891001;HRUN=2;LEN=2;MLLD=101.203;QD=49.3489;RBI=0.019529;REFB=0;REVB=-0.0114629;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000576723;OID=.;OPOS=56291621;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:88:93:92:92:0:33:59:0:0:20:0:33:55:0:0 chr4 56300685 . C T 850.53 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00495141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.178;QD=57.6629;RBI=0.00540674;REFB=0;REVB=0.00217171;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65145e-05;OID=.;OPOS=56300685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0 chr4 56301049 . G GA 901.31 PASS AF=1;AO=72;DP=84;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591137;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.0997;QD=46.8214;RBI=0.0604219;REFB=0;REVB=-0.0125047;RO=10;SAF=31;SAR=41;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715683;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00206621;OID=.;OPOS=56301050;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:72:84:77:77:0:32:45:0:0:16:10:31:41:4:6 chr4 56306111 . G A 1549.26 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.072;QD=63.8872;RBI=0.0224213;REFB=0;REVB=5.73105e-05;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23854e-05;OID=.;OPOS=56306111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0 chr4 56309992 . A G 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.408;QD=57.1056;RBI=0.0726581;REFB=0;REVB=-0.00968242;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251297;OID=.;OPOS=56309992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0 chr4 56318462 . G A 609.56 PASS AF=0.903846;AO=47;DP=52;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00509633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5672;QD=46.8895;RBI=0.0317307;REFB=0.00898294;REVB=0.0313188;RO=5;SAF=23;SAR=24;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161154;STB=0.508596;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00788017;OID=.;OPOS=56318462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:52:52:5:5:47:47:0.903846:24:23:2:3:24:23:2:3 chr4 56367796 . T G 494.1 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.981;QD=58.1298;RBI=0.0753298;REFB=0;REVB=0.0473324;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222667;OID=.;OPOS=56367796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:18:13:0:0:19:15:0:0 chr4 56756531 . T C 200.96 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00554399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.854;QD=15.1665;RBI=0.00662738;REFB=-0.0103628;REVB=0.00363129;RO=30;SAF=6;SAR=17;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22981;STB=0.631848;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.017392;OID=.;OPOS=56756531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:17:6:14:16:17:6:14:16 chr4 56771089 . G A 191.03 PASS AF=0.403509;AO=22;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.000807866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.231;QD=13.4057;RBI=0.0184617;REFB=-0.00806839;REVB=-0.018444;RO=34;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048052;STB=0.539136;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0143993;OID=.;OPOS=56771089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:22:23:0.403509:12:10:17:17:13:10:17:17 chr4 57154737 . T C 222.84 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0276847;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.73;QD=12.5544;RBI=0.0277073;REFB=-0.0121992;REVB=0.00111877;RO=44;SAF=15;SAR=12;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356664;STB=0.52049;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0278937;OID=.;OPOS=57154737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:44:44:27:27:0.380282:12:15:23:21:12:15:23:21 chr4 57176832 . T C 316.81 PASS AF=0.367925;AO=38;DP=105;FAO=39;FDP=106;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.00127787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.118;QD=11.9552;RBI=0.0427341;REFB=-0.00715709;REVB=0.042715;RO=66;SAF=20;SAR=18;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626669;STB=0.547802;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00919984;OID=.;OPOS=57176832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:66:67:38:39:0.367925:18:20:31:35:18:21:31:36 chr4 57181632 . G C 1597.82 PASS AF=1;AO=84;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.297;QD=59.7317;RBI=0.057712;REFB=0;REVB=0.0343394;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000609207;OID=.;OPOS=57181632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:84:107:1:47:37:0:0:62:45:0:0 chr4 57194329 . G T 1437.99 PASS AF=0.980198;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0514118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7268;QD=56.9503;RBI=0.0860748;REFB=0.0804735;REVB=-0.0690341;RO=2;SAF=38;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158046;STB=0.508332;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.0165949;OID=.;OPOS=57194329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:99:101:2:2:97:99:0.980198:59:38:0:2:59:40:0:2 chr4 57197335 . C CT 962.19 PASS AF=0.52381;AO=134;DP=274;FAO=143;FDP=273;FR=.;FRO=130;FSAF=70;FSAR=73;FSRF=71;FSRR=59;FWDB=-0.0414216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.4576;QD=14.098;RBI=0.0923236;REFB=-0.00129382;REVB=0.0825099;RO=137;SAF=63;SAR=71;SRF=78;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911483;STB=0.526951;STBP=0.333;TYPE=ins;VARB=0.000969652;OID=.;OPOS=57197336;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.52381:134:274:143:273:130:70:73:71:59:99:137:63:71:78:59 chr4 57204960 . A G 211.72 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0293985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.105;QD=19.6948;RBI=0.03644;REFB=0.00740924;REVB=0.0215314;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238914;STB=0.513501;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.00465994;OID=.;OPOS=57204960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:9:12:12:10:9:12:12:10 chr4 57219592 . G A 276.33 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0126237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.802;QD=15.7904;RBI=0.0194931;REFB=-0.0154447;REVB=-0.0148535;RO=39;SAF=16;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475202;STB=0.526785;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0134049;OID=.;OPOS=57219592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:15:16:22:17:15:16:22:17 chr4 57221348 . T C 138.41 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0442014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2305;QD=11.7794;RBI=0.0498967;REFB=0.0143919;REVB=0.0231499;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228698;STB=0.634303;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.0174617;OID=.;OPOS=57221348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:9:7:20:11:9:7:20:11 chr4 57248716 . G C 112.98 PASS AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00241718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.722;QD=9.41526;RBI=0.0217601;REFB=-0.00744499;REVB=0.0216254;RO=34;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170435;STB=0.603508;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.01287;OID=.;OPOS=57248716;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:34:34:14:14:0.291667:5:9:17:17:5:9:17:17 chr4 57250285 . T C 458.81 PASS AF=0.462963;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00723655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.3033;QD=16.993;RBI=0.0460958;REFB=-0.00270433;REVB=-0.0455242;RO=56;SAF=20;SAR=30;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13025;STB=0.563884;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00352998;OID=.;OPOS=57250285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:56:58:50:50:0.462963:30:20:30:26:30:20:30:28 chr4 57266959 . G A 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00572341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0681;QD=12.7239;RBI=0.0240075;REFB=-0.00344364;REVB=0.0233153;RO=35;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378247;STB=0.530165;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00839239;OID=.;OPOS=57266959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:12:11:18:17:12:11:19:17 chr4 57268328 . T C 645.77 PASS AF=0.440994;AO=71;DP=161;FAO=71;FDP=161;FR=.;FRO=90;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=-0.00143988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.421;QD=16.044;RBI=0.0193419;REFB=-0.00352326;REVB=0.0192882;RO=90;SAF=37;SAR=34;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122741;STB=0.506838;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.00510718;OID=.;OPOS=57268328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:90:90:71:71:0.440994:34:37:48:42:34:37:48:42 chr4 57270197 . T C 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.686;QD=59.8559;RBI=0.0565075;REFB=0;REVB=0.0564139;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90317e-05;OID=.;OPOS=57270197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:27:44:0:0:27:44:0:0 chr4 57356588 . A G 660.51 PASS AF=0.461039;AO=71;DP=154;FAO=71;FDP=154;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=56;FWDB=0.0170564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8776;QD=17.1561;RBI=0.0292055;REFB=-0.0102053;REVB=0.0237074;RO=83;SAF=24;SAR=47;SRF=27;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138831;STB=0.5077;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0103917;OID=.;OPOS=57356588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:83:83:71:71:0.461039:47:24:27:56:47:24:27:56 chr4 57361553 . A G 421.3 PASS AF=0.421053;AO=48;DP=114;FAO=48;FDP=114;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.00591607;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=282.266;QD=14.7825;RBI=0.0117591;REFB=-0.0106751;REVB=-0.0101625;RO=66;SAF=23;SAR=25;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411079;STB=0.523101;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0124296;OID=.;OPOS=57361553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:66:66:48:48:0.421053:25:23:29:37:25:23:29:37 chr4 57368807 . C A,T 855.21 PASS AF=0.0333333,0.966667;AO=3,57;DP=60;FAO=2,58;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=1,28;FSAR=1,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102797,-0.0153437;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.3405,170.62;QD=57.0138;RBI=0.0390194,0.0175652;REFB=0,0;REVB=-0.0376409,0.0085502;RO=0;SAF=1,28;SAR=2,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.1052,0.00162962;OID=.,.;OPOS=57368807,57368807;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:60:60:0:0:3,57:2,58:0.0333333,0.966667:2,29:1,28:0:0:1,30:1,28:0:0 chr4 57377377 . G A 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.000294901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.353;QD=12.1825;RBI=0.0183121;REFB=-0.0179472;REVB=-0.0183097;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336027;STB=0.51996;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0331554;OID=.;OPOS=57377377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:8:7:5:5:8:7 chr4 57516896 . G A 202.64 PASS AF=0.325;AO=26;DP=80;FAO=26;FDP=80;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.00217116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.837;QD=10.1322;RBI=0.0339022;REFB=-0.0117199;REVB=-0.0338326;RO=54;SAF=9;SAR=17;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182432;STB=0.607059;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0266163;OID=.;OPOS=57516896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:54:54:26:26:0.325:17:9:27:27:17:9:27:27 chr4 57660802 . T G 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8403;QD=35.5725;RBI=0.017651;REFB=0;REVB=-0.00224458;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00205591;OID=.;OPOS=57660802;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr4 57797100 . G T 134.54 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0199344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4191;QD=16.308;RBI=0.025283;REFB=-0.0155835;REVB=0.0155515;RO=17;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788801;STB=0.533288;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0132647;OID=.;OPOS=57797100;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:18:15:15:0.454545:5:10:10:7:5:10:11:7 chr4 57797253 . G A 87.23 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0202313;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.162;QD=12.0314;RBI=0.0223144;REFB=-0.0284786;REVB=-0.00941405;RO=19;SAF=10;SAR=1;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.538458;STB=0.839586;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0392539;OID=.;OPOS=57797253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:30:29:19:18:11:11:0.37931:1:10:10:9:1:10:9:9 chr4 57876955 . G A 247.01 PASS AF=0.298246;AO=34;DP=114;FAO=34;FDP=114;FR=.;FRO=80;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0266047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.394;QD=8.66715;RBI=0.0272187;REFB=-0.00696028;REVB=0.00574885;RO=79;SAF=18;SAR=16;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162384;STB=0.598715;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0200928;OID=.;OPOS=57876955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:79:80:34:34:0.298246:16:18:31:48:16:18:31:49 chr4 57881715 . G A 412.79 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.000587525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.254;QD=18.7633;RBI=0.0014949;REFB=-0.00108391;REVB=0.0013746;RO=46;SAF=27;SAR=15;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559963;STB=0.531235;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00118076;OID=.;OPOS=57881715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:15:27:27:19:15:27:27:19 chr4 57887150 . C T 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0369329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4769;QD=13.5806;RBI=0.0603494;REFB=-0.0181706;REVB=-0.0477286;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198353;STB=0.615861;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0120743;OID=.;OPOS=57887150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:11:6:15:13:11:6:15:13 chr4 57889677 . C T 219.43 PASS AF=0.36;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0190922;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.297;QD=11.703;RBI=0.0193059;REFB=-0.0121923;REVB=-0.00286471;RO=48;SAF=17;SAR=10;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235079;STB=0.635727;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0239168;OID=.;OPOS=57889677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:48:48:27:27:0.36:10:17:20:28:10:17:20:28 chr4 62598689 . C T 465.78 PASS AF=0.47619;AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=0.00663461;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.797;QD=17.7441;RBI=0.0271455;REFB=-0.0115601;REVB=-0.0263223;RO=55;SAF=27;SAR=23;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215654;STB=0.61936;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0108407;OID=.;OPOS=62598689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:55:55:50:50:0.47619:23:27:17:38:23:27:17:38 chr4 62800728 . T C 406.38 PASS AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0360962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8654;QD=20.0681;RBI=0.0415165;REFB=0.00196974;REVB=0.0205106;RO=40;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00990314;STB=0.505492;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.00168053;OID=.;OPOS=62800728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:23:18:18:22:23:18:18:22 chr4 62845388 . G C 1980.27 PASS AF=0.984733;AO=128;DP=132;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00611237;FXX=0.00757518;HRUN=5;LEN=1;MLLD=314.076;QD=60.4662;RBI=0.00841882;REFB=-0.0329263;REVB=-0.00578925;RO=2;SAF=70;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138231;STB=0.500777;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-2.42456e-05;OID=.;OPOS=62845388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:132:131:2:2:128:129:0.984733:58:70:1:1:58:71:1:1 chr4 62845490 . A G 329.83 PASS AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0110563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.634;QD=15.7059;RBI=0.0112691;REFB=-0.00544653;REVB=0.00217976;RO=48;SAF=17;SAR=19;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112192;STB=0.563206;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00716393;OID=.;OPOS=62845490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:19:17:28:20:19:17:28:20 chr4 65473384 . C G 3892.09 PASS AF=1;AO=249;DP=250;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00534719;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.025;QD=62.2735;RBI=0.0130216;REFB=0;REVB=0.0118731;RO=0;SAF=111;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01893e-06;OID=.;OPOS=65473384;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:250:250:0:0:249:250:1:138:111:0:0:139:111:0:0 chr4 66197804 . C T 1066.17 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000514915;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.146;QD=58.4202;RBI=0.0217376;REFB=0.127543;REVB=0.0217315;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145499;STB=0.50769;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=2.80668e-05;OID=.;OPOS=66197804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:40:32:1:0:40:32:1:0 chr4 68374597 . C T 1749.42 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00827487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1405;QD=60.8494;RBI=0.0366426;REFB=0;REVB=-0.035696;RO=0;SAF=62;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194403;OID=.;OPOS=68374597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:53:62:0:0:53:62:0:0 chr4 68376708 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.59;QD=57.2024;RBI=0.0322667;REFB=0;REVB=0.0145452;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290951;OID=.;OPOS=68376708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr4 68380215 . G A 1462.15 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0342;QD=61.5643;RBI=0.0802749;REFB=-0.0726671;REVB=0.0794264;RO=2;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231079;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00280062;OID=.;OPOS=68380215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:93:95:2:0:91:95:1:40:51:0:2:44:51:0:0 chr4 68384008 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.707;QD=56.9383;RBI=0.00690175;REFB=0;REVB=0.00228425;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34832e-05;OID=.;OPOS=68384008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0 chr4 68436883 . T C 500.94 PASS AF=0.453782;AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.0644661;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4876;QD=16.8383;RBI=0.0674541;REFB=-0.00829016;REVB=0.019854;RO=65;SAF=25;SAR=29;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00140325;STB=0.500782;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.00674229;OID=.;OPOS=68436883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:65:65:54:54:0.453782:29:25:30:35:29:25:30:35 chr4 68497597 . C A 146.36 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0508171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8578;QD=16.7271;RBI=0.0657369;REFB=0.00708233;REVB=-0.0417008;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16392;STB=0.594472;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=-0.00817149;OID=.;OPOS=68497597;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:11:5:9:10:11:5:9:10 chr4 68500171 . A G 645.1 PASS AF=0.528926;AO=64;DP=121;FAO=64;FDP=121;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=0.0149485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.209;QD=21.3256;RBI=0.0156313;REFB=0.00819022;REVB=0.00456958;RO=57;SAF=32;SAR=32;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143241;STB=0.578488;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00749273;OID=.;OPOS=68500171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:57:57:64:64:0.528926:32:32:38:19:32:32:38:19 chr4 68534392 . C T 384.64 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00703759;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.075;QD=17.4838;RBI=0.0140489;REFB=-0.00499413;REVB=-0.0121591;RO=48;SAF=17;SAR=23;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153728;STB=0.586027;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00644286;OID=.;OPOS=68534392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:48:48:40:40:0.454545:23:17:28:20:23:17:28:20 chr4 68567025 . T G 206.48 PASS AF=0.428571;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0230258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.699;QD=16.8551;RBI=0.0236453;REFB=-0.00987771;REVB=0.00537729;RO=28;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194119;STB=0.620578;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0134871;OID=.;OPOS=68567025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:28:28:20:21:0.428571:11:9:18:10:12:9:18:10 chr4 68780399 . A G 4205.84 PASS AF=1;AO=267;DP=269;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478137;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.015;QD=62.5403;RBI=0.0808958;REFB=0;REVB=0.0652533;RO=1;SAF=138;SAR=129;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00344249;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189233;OID=.;OPOS=68780399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:269:269:1:0:267:269:1:129:138:1:0:129:140:0:0 chr4 68784774 . T C 1950.69 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00878104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.451;QD=61.9267;RBI=0.0119728;REFB=0;REVB=-0.00813886;RO=0;SAF=59;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.37269e-05;OID=.;OPOS=68784774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:66:59:0:0:66:60:0:0 chr4 68812283 . C T 787.47 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463944;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.381;QD=57.2707;RBI=0.0504043;REFB=0;REVB=0.0197016;RO=0;SAF=10;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.71233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113539;OID=.;OPOS=68812283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:45:10:0:0:45:10:0:0 chr4 68995529 . C T 348.03 PASS AF=0.39604;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0398494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5643;QD=13.7835;RBI=0.0456869;REFB=-0.0104096;REVB=0.0223455;RO=61;SAF=23;SAR=17;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140691;STB=0.579792;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0176649;OID=.;OPOS=68995529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:61:61:40:40:0.39604:17:23:27:34:17:23:27:34 chr4 69078113 . T C 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00459703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.989;QD=59.8559;RBI=0.0154301;REFB=0;REVB=0.0147294;RO=0;SAF=48;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08531e-05;OID=.;OPOS=69078113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:23:48:0:0:23:48:0:0 chr4 69094507 . T A 920.43 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.278;QD=58.4398;RBI=0.0151334;REFB=0;REVB=0.0101397;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98119e-05;OID=.;OPOS=69094507;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:22:40:0:0:22:41:0:0 chr4 69094575 . T G 740.33 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4575;QD=56.9483;RBI=0.0537426;REFB=0;REVB=0.0392281;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621267;OID=.;OPOS=69094575;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:19:32:0:0:19:33:0:0 chr4 69095197 . T C 769.42 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00529612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.468;QD=62.8101;RBI=0.00825591;REFB=0;REVB=0.00633333;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17008e-05;OID=.;OPOS=69095197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:1:0:48:49:1:28:20:1:0:28:21:0:0 chr4 69203080 . T C 227.71 PASS AF=0.45;AO=24;DP=58;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0107792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.321;QD=15.181;RBI=0.0124767;REFB=-0.0270324;REVB=-0.00628308;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597569;STB=0.522371;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0321048;OID=.;OPOS=69203080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:30:33:24:27:0.45:15:9:13:17:15:12:16:17 chr4 69203551 . A T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.638;QD=58.7817;RBI=0.0191723;REFB=0;REVB=0.00768441;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40009e-05;OID=.;OPOS=69203551;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0 chr4 69340500 . A G 1583.48 PASS AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0167147;FXX=0.0272702;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.146;QD=59.1957;RBI=0.0171822;REFB=-0.0916197;REVB=0.00398085;RO=1;SAF=46;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102054;STB=0.505375;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000130603;OID=.;OPOS=69340500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:60:46:1:0:60:46:1:0 chr4 69536084 . A C 988.95 PASS AF=0.945946;AO=69;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0198315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.308;QD=53.4565;RBI=0.0198322;REFB=-0.0167024;REVB=0.000166186;RO=4;SAF=30;SAR=39;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194945;STB=0.510585;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0020504;OID=.;OPOS=69536084;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:74:74:4:4:69:70:0.945946:39:30:1:3:39:31:1:3 chr4 69682366 . TA T 80.56 PASS AF=0.681818;AO=11;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0715431;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.5105;QD=14.6469;RBI=0.133578;REFB=-0.103437;REVB=0.112803;RO=9;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.387097;SSSB=-0.171427;STB=0.517219;STBP=0.844;TYPE=del;VARB=0.0968262;OID=.;OPOS=69682367;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.681818:11:22:15:22:7:5:10:2:5:26:9:2:9:3:6 chr4 69687987 . C A 1135.22 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.731;QD=60.545;RBI=0.0139978;REFB=0;REVB=0.00166208;RO=0;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.36074e-06;OID=.;OPOS=69687987;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:29:46:0:0:29:46:0:0 chr4 69696568 . A G 792.31 PASS AF=0.496933;AO=80;DP=162;FAO=81;FDP=163;FR=.;FRO=82;FSAF=55;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=28;FWDB=0.0172168;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.724;QD=19.4432;RBI=0.0181585;REFB=-0.0226666;REVB=0.00577179;RO=82;SAF=54;SAR=26;SRF=54;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171075;STB=0.511713;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.019672;OID=.;OPOS=69696568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:82:82:80:81:0.496933:26:54:54:28:26:55:54:28 chr4 69795626 . C T 260.53 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0263126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1253;QD=24.8128;RBI=0.0769231;REFB=-0.0682854;REVB=-0.0722829;RO=18;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107873;STB=0.505995;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0318012;OID=.;OPOS=69795626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:11:13:10:8:11:13:10:8 chr4 69885420 . T C 106.05 PASS AF=0.301887;AO=13;DP=50;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0130875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.694;QD=8.00345;RBI=0.0154468;REFB=-0.0136818;REVB=0.00820493;RO=37;SAF=5;SAR=8;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247996;STB=0.565957;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0541209;OID=.;OPOS=69885420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:37:37:13:16:0.301887:8:5:22:15:8:8:22:15 chr4 69964271 . A G 478.78 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.000663027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.528;QD=25.1988;RBI=0.0111577;REFB=0.00722991;REVB=0.011138;RO=31;SAF=25;SAR=20;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118271;STB=0.564537;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00512311;OID=.;OPOS=69964271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:31:31:45:45:0.592105:20:25:22:9:20:25:22:9 chr4 69964337 . AT TC 531.59 PASS AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.00844725;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=213.489;QD=22.8639;RBI=0.00850725;REFB=-0.0229201;REVB=-0.00100864;RO=43;SAF=23;SAR=27;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178822;STB=0.598172;STBP=0.049;TYPE=mnp;VARB=0.015159;OID=.;OPOS=69964337;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:27:23:29:14:27:23:29:14 chr4 69972949 . C G 1029.82 PASS AF=0.544444;AO=98;DP=181;FAO=98;FDP=180;FR=.;FRO=82;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00989258;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.68;QD=22.8848;RBI=0.0106346;REFB=-0.024804;REVB=-0.00390272;RO=82;SAF=52;SAR=46;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520969;STB=0.502844;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0278157;OID=.;OPOS=69972949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:82:82:98:98:0.544444:46:52:43:39:46:52:43:39 chr4 69972952 . C T 1006.04 PASS AF=0.524324;AO=97;DP=185;FAO=97;FDP=185;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.00829012;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.995;QD=21.7522;RBI=0.018458;REFB=-0.00488088;REVB=-0.0164915;RO=87;SAF=52;SAR=45;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262857;STB=0.517207;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0151942;OID=.;OPOS=69972952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:87:88:97:97:0.524324:45:52:44:43:45:52:44:44 chr4 70079838 . T C 209.33 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00261077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.819;QD=13.7264;RBI=0.0279298;REFB=-0.00930252;REVB=0.0278075;RO=35;SAF=8;SAR=17;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366379;STB=0.700873;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0159856;OID=.;OPOS=70079838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:17:8:24:11:17:8:24:12 chr4 70079975 . A G 816.31 PASS AF=0.517442;AO=77;DP=160;FAO=89;FDP=172;FR=.;FRO=83;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=0.0156701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.445;QD=18.9839;RBI=0.0169742;REFB=-0.00558989;REVB=-0.00652473;RO=82;SAF=41;SAR=36;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644636;STB=0.561482;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00932587;OID=.;OPOS=70079975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:172:82:83:77:89:0.517442:36:41:38:44:37:52:38:45 chr4 70080139 . C T 72.63 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0104797;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.158;QD=7.44925;RBI=0.0245451;REFB=0.00292766;REVB=-0.0221954;RO=31;SAF=2;SAR=8;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431764;STB=0.755011;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0163498;OID=.;OPOS=70080139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:41:39:31:29:10:10:0.25641:8:2:17:14:8:2:15:14 chr4 70080233 . A G 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0198205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.605;QD=15.3787;RBI=0.0239246;REFB=-0.0164017;REVB=0.0133989;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454408;STB=0.526273;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0181541;OID=.;OPOS=70080233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:3:9:11:3:3:9:11:3 chr4 70146230 . G A 589.86 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9385;QD=60.4989;RBI=0.0646639;REFB=0;REVB=0.062439;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000722459;OID=.;OPOS=70146230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:21:15:0:0:24:15:0:0 chr4 70146704 . G A 1072.25 PASS AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0147199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.553;QD=57.1868;RBI=0.0182324;REFB=0.0205586;REVB=-0.0107586;RO=2;SAF=39;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023638;STB=0.512497;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.00106555;OID=.;OPOS=70146704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:34:39:2:0:34:39:2:0 chr4 70156313 . T A 435.86 PASS AF=0.96875;AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00837815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.7;QD=54.4826;RBI=0.0180858;REFB=-0.0567499;REVB=-0.0160282;RO=1;SAF=10;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443037;STB=0.521725;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000882666;OID=.;OPOS=70156313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:32:1:1:29:31:0.96875:19:10:1:0:20:11:1:0 chr4 70156392 . A G 437.49 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.433;QD=56.4502;RBI=0.059283;REFB=0;REVB=0.0248294;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256644;OID=.;OPOS=70156392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:20:9:0:0:22:9:0:0 chr4 70160277 . T G 164.5 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00287084;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.202;QD=47.0013;RBI=0.0350105;REFB=0;REVB=0.0348926;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533004;OID=.;OPOS=70160277;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr4 70160309 . C G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.77;QD=54.5176;RBI=0.0166771;REFB=0;REVB=-0.00365691;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1319e-05;OID=.;OPOS=70160309;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr4 70296603 . A G 326.55 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367038;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0294;QD=54.4251;RBI=0.101623;REFB=0;REVB=-0.0947636;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000359207;OID=.;OPOS=70296603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr4 70296618 . G C 34.57 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0131362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.875;QD=4.46115;RBI=0.0541261;REFB=-0.00543874;REVB=-0.0525078;RO=25;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177959;STB=0.621806;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0312365;OID=.;OPOS=70296618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:2:4:13:12:2:4:13:12 chr4 70296641 . A G 61.53 PASS AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0399273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.735;QD=7.03216;RBI=0.0453875;REFB=-0.000718948;REVB=-0.0215833;RO=26;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456448;STB=0.786872;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.000254153;OID=.;OPOS=70296641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:2:7:10:16:2:7:10:16 chr4 70296644 . A G 82.69 PASS AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0267316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.281;QD=9.18828;RBI=0.0267583;REFB=-0.0116881;REVB=-0.00119628;RO=23;SAF=9;SAR=2;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55681;STB=0.817603;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00557775;OID=.;OPOS=70296644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:36:23:25:11:11:0.305556:2:9:7:16:2:9:9:16 chr4 70296648 . T G 83.25 PASS AF=0.297297;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00767475;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.3;QD=9.00008;RBI=0.0288007;REFB=0.00294793;REVB=-0.0277593;RO=27;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517904;STB=0.809427;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00823026;OID=.;OPOS=70296648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:38:37:27:26:11:11:0.297297:2:9:10:17:2:9:10:16 chr4 70296653 . GCCT TGGG 72.17 PASS AF=0.27027;AO=9;DP=38;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0279637;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=4;MLLD=289.341;QD=7.80269;RBI=0.0282348;REFB=0.000803305;REVB=-0.00390309;RO=22;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540368;STB=0.839383;STBP=0.017;TYPE=mnp;VARB=-0.00340051;OID=.;OPOS=70296653;OREF=GCCT;OALT=TGGG;OMAPALT=TGGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:38:37:22:27:9:10:0.27027:2:7:6:16:2:8:8:19 chr4 70296660 . A G 92.58 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00552567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3381;QD=9.2581;RBI=0.0225382;REFB=0.0170292;REVB=0.0218504;RO=28;SAF=10;SAR=2;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.573249;STB=0.846216;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0169873;OID=.;OPOS=70296660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:2:10:9:19:2:10:9:19 chr4 70296662 . C T 106.52 PASS AF=0.325;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.000286626;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.495;QD=10.6524;RBI=0.0159501;REFB=-0.00219445;REVB=0.0159476;RO=27;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225048;STB=0.513493;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0035277;OID=.;OPOS=70296662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:27:27:13:13:0.325:7:6:13:14:7:6:13:14 chr4 70296734 . T C 50.84 PASS AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0108393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.706;QD=5.21423;RBI=0.0162919;REFB=0.000182813;REVB=0.0121629;RO=31;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244404;STB=0.659987;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=-0.000174637;OID=.;OPOS=70296734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:3:5:13:18:3:5:13:18 chr4 70355211 . T C 1025.75 PASS AF=0.959459;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00447703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.513;QD=55.4459;RBI=0.00859396;REFB=-0.175019;REVB=-0.00733568;RO=3;SAF=39;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034992;STB=0.518513;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00138026;OID=.;OPOS=70355211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:74:74:3:3:71:71:0.959459:32:39:3:0:32:39:3:0 chr4 70513139 . C T 1026.18 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186855;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.2764;QD=59.4888;RBI=0.0596305;REFB=0;REVB=-0.0566272;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273527;OID=.;OPOS=70513139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0 chr4 70802218 . T C 278.87 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00332762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.788;QD=21.8719;RBI=0.0129061;REFB=0.00343739;REVB=0.0124697;RO=23;SAF=15;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113897;STB=0.506325;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=-0.00320181;OID=.;OPOS=70802218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:13:15:12:11:13:15:12:11 chr4 70807747 . T C 193.64 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0162235;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.427;QD=16.1366;RBI=0.0205386;REFB=0.00359646;REVB=-0.0125949;RO=28;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121791;STB=0.570104;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=-0.00634747;OID=.;OPOS=70807747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:28:28:20:20:0.416667:13:7:13:15:13:7:13:15 chr4 70807771 . C T 204.79 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0559077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8307;QD=16.3828;RBI=0.0563283;REFB=-0.0301338;REVB=-0.00687022;RO=29;SAF=6;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21673;STB=0.624875;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0413379;OID=.;OPOS=70807771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:15:6:14:15:15:6:14:15 chr4 70898953 . C T 534.29 PASS AF=0.478992;AO=56;DP=118;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0165434;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.352;QD=17.9593;RBI=0.0245016;REFB=-0.0024287;REVB=-0.0180734;RO=60;SAF=29;SAR=27;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00111218;STB=0.505317;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00203966;OID=.;OPOS=70898953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:60:62:56:57:0.478992:27:29:31:29:27:30:32:30 chr4 70944452 . G A 3865.3 PASS AF=1;AO=242;DP=244;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112276;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.962;QD=63.8893;RBI=0.0115126;REFB=0;REVB=0.00254554;RO=0;SAF=117;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79982e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.43221e-06;OID=.;OPOS=70944452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:244:242:0:0:242:242:1:125:117:0:0:125:117:0:0 chr4 71114956 . G T 266.14 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0135255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.154;QD=21.2912;RBI=0.0295153;REFB=-0.0250819;REVB=-0.0262338;RO=25;SAF=10;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036776;STB=0.520644;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0226739;OID=.;OPOS=71114956;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:15:10:11:14:15:10:11:14 chr4 71201388 . C T 470.92 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0125284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8076;QD=55.4027;RBI=0.0476374;REFB=-0.104372;REVB=0.0459604;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519988;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00304447;OID=.;OPOS=71201388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:34:0:1:32:33:0.970588:11:21:0:0:12:21:0:1 chr4 71232388 . G A 1341.83 PASS AF=0.967033;AO=88;DP=92;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0206439;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.568;QD=58.9815;RBI=0.022179;REFB=-0.203911;REVB=0.00810791;RO=1;SAF=57;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824214;STB=0.512818;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.000492342;OID=.;OPOS=71232388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:92:91:1:3:88:88:0.967033:31:57:1:0:31:57:3:0 chr4 71232430 . T C 755.37 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558918;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1133;QD=57.0087;RBI=0.0582203;REFB=0;REVB=-0.0163006;RO=0;SAF=20;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186012;OID=.;OPOS=71232430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:54:53:1:34:20:0:0:34:19:0:0 chr4 71232541 . TC CT 111.81 PASS AF=0.272727;AO=8;DP=32;FAO=9;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=-0.0378176;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=110.084;QD=13.5528;RBI=0.0485783;REFB=-0.0113882;REVB=-0.0304906;RO=13;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0171943;OID=.;OPOS=71232541;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:32:33:13:15:8:9:0.272727:8:0:0:13:9:0:0:15 chr4 71275232 . C T 437.75 PASS AF=0.431034;AO=48;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.00774985;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.403;QD=15.0949;RBI=0.00883579;REFB=-0.0187054;REVB=0.00424393;RO=67;SAF=23;SAR=25;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326204;STB=0.505872;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0256215;OID=.;OPOS=71275232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:67:66:48:50:0.431034:25:23:30:37:26:24:31:35 chr4 71339723 . G A 312.06 PASS AF=0.642857;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0261305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9083;QD=29.7201;RBI=0.0425568;REFB=-0.0145147;REVB=-0.0335898;RO=15;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00498618;STB=0.50274;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00820787;OID=.;OPOS=71339723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:15:15:27:27:0.642857:11:16:9:6:11:16:9:6 chr4 71339728 . C T 374.35 PASS AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0130627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.082;QD=31.8599;RBI=0.0257969;REFB=0.00515004;REVB=0.0222452;RO=16;SAF=18;SAR=13;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115625;STB=0.506325;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=-0.00476465;OID=.;OPOS=71339728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:13:18:9:7:13:18:9:7 chr4 71346701 . C G 183.63 PASS AF=0.396552;AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00429306;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=182.839;QD=12.664;RBI=0.00504568;REFB=-0.0074939;REVB=-0.00265113;RO=32;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709926;STB=0.539258;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00818123;OID=.;OPOS=71346701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:58:32:35:22:23:0.396552:13:9:11:21:13:10:13:22 chr4 71384488 . C T 1235.06 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.732;QD=60.9906;RBI=0.0249023;REFB=0;REVB=0.0171987;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34816e-05;OID=.;OPOS=71384488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:35:44:0:0:37:44:0:0 chr4 71384537 . C T 207.68 PASS AF=0.3;AO=27;DP=90;FAO=27;FDP=90;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.000286355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.807;QD=9.23039;RBI=0.00830036;REFB=0.000472102;REVB=-0.00829542;RO=63;SAF=13;SAR=14;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143988;STB=0.584705;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00133533;OID=.;OPOS=71384537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:63:63:27:27:0.3:14:13:38:25:14:13:38:25 chr4 71398193 . A G 203.26 PASS AF=0.442308;AO=17;DP=53;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0456536;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.5336;QD=15.6352;RBI=0.0584032;REFB=0.00246938;REVB=-0.0364236;RO=20;SAF=17;SAR=0;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.819759;STB=0.67493;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00918054;OID=.;OPOS=71398193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:20:29:17:23:0.442308:0:17:11:9:6:17:13:16 chr4 71657772 . G A 1154.22 PASS AF=1;AO=73;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208538;FXX=0.0617208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.883;QD=60.7482;RBI=0.0426489;REFB=0;REVB=0.0372028;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361754;OID=.;OPOS=71657772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:73:76:1:38:35:0:0:40:36:0:0 chr4 71704965 . C T 655.04 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051476;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.96;QD=62.3847;RBI=0.102296;REFB=0;REVB=0.0884004;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100268;OID=.;OPOS=71704965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:22:20:0:0 chr4 71849697 . C T 272.77 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00158852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.826;QD=24.2461;RBI=0.00169949;REFB=-0.0103873;REVB=0.000604033;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24396;STB=0.635149;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00493616;OID=.;OPOS=71849697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:11:14:5:15:11:14:5:15 chr4 71849888 . G T 389.09 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.00597321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.956;QD=18.7515;RBI=0.00959172;REFB=-0.0264068;REVB=0.00750479;RO=43;SAF=16;SAR=24;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251495;STB=0.639742;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0271399;OID=.;OPOS=71849888;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:24:16:29:14:24:16:29:14 chr4 71888240 . C T 224.45 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.00293033;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.006;QD=14.9631;RBI=0.0090591;REFB=-0.00416931;REVB=0.00857207;RO=34;SAF=10;SAR=16;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131571;STB=0.574176;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.00576552;OID=.;OPOS=71888240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:34:34:26:26:0.433333:16:10:9:25:16:10:9:25 chr4 72425863 . C T 261.64 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00617707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.707;QD=14.7405;RBI=0.00633718;REFB=-0.0109528;REVB=0.00141549;RO=40;SAF=10;SAR=20;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248054;STB=0.634524;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0150261;OID=.;OPOS=72425863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:41:30:30:0.422535:20:10:23:17:20:10:23:18 chr4 72433642 . TG T,TT 560.29 PASS AF=0.495798,0;AO=49,13;DP=122;FAO=59,0;FDP=119;FR=.;FRO=60;FSAF=19,0;FSAR=40,0;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.016766,-0.0180472;FXX=0.0165276;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=277.696,274.963;QD=18.8331;RBI=0.0168365,0.0182467;REFB=-0.00179695,-0.00302977;REVB=0.00153899,-0.00269058;RO=56;SAF=17,3;SAR=32,10;SRF=24;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0836086,-0.273994;STB=0.5436,0.5;STBP=0.393,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00211132,0;OID=.,.;OPOS=72433643,72433643;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.495798,0:49,13:122:59,0:119:60:19,0:40,0:24:36:99:56:17,3:32,10:24:32 chr4 72434406 . G C 672.2 PASS AF=0.59596;AO=58;DP=99;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0613631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.291;QD=27.1595;RBI=0.0613879;REFB=-0.0108451;REVB=-0.00174387;RO=40;SAF=19;SAR=39;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677444;STB=0.534125;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00861472;OID=.;OPOS=72434406;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:40:40:58:59:0.59596:39:19:10:30:40:19:10:30 chr4 72436804 . G A 2280.53 PASS AF=0.993103;AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.025808;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.335;QD=62.9112;RBI=0.030402;REFB=-0.0626316;REVB=0.0160696;RO=1;SAF=69;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00629861;STB=0.503311;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=2.52981e-05;OID=.;OPOS=72436804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:145:1:1:144:144:0.993103:75:69:0:1:75:69:0:1 chr4 72618296 . T C 2598.91 PASS AF=0.994152;AO=169;DP=171;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0397993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.754;QD=60.7932;RBI=0.044188;REFB=-0.103437;REVB=0.0191988;RO=2;SAF=55;SAR=114;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00441746;STB=0.502183;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000608849;OID=.;OPOS=72618296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:171:171:2:1:169:170:0.994152:114:55:1:1:114:56:0:1 chr4 72618323 . G T 962.88 PASS AF=0.513661;AO=94;DP=184;FAO=94;FDP=183;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=62;FSRF=31;FSRR=58;FWDB=-0.0135939;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1528;QD=21.0465;RBI=0.0190472;REFB=0.00825336;REVB=0.0133417;RO=89;SAF=32;SAR=62;SRF=31;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077639;STB=0.504259;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.0104453;OID=.;OPOS=72618323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:89:89:94:94:0.513661:62:32:31:58:62:32:31:58 chr4 72649774 . G A 255.67 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0557825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6032;QD=17.9414;RBI=0.0562133;REFB=-0.0130461;REVB=-0.00694579;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156488;STB=0.508766;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0212828;OID=.;OPOS=72649774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:14:14:15:14:14:14:15:14 chr4 73414286 . C T 219.98 PASS AF=0.364865;AO=24;DP=72;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00883228;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.492;QD=11.8909;RBI=0.020797;REFB=-0.015467;REVB=0.0188283;RO=48;SAF=14;SAR=10;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721574;STB=0.505006;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.022805;OID=.;OPOS=73414286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:48:47:24:27:0.364865:10:14:25:23:13:14:24:23 chr4 73433122 . GA G 223.73 PASS AF=0.5;AO=33;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.114142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.3808;QD=12.7844;RBI=0.115666;REFB=-0.0294231;REVB=0.0187144;RO=34;SAF=20;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124973;STB=0.557344;STBP=0.368;TYPE=del;VARB=0.0306347;OID=.;OPOS=73433123;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:33:70:35:70:35:20:15:16:19:99:34:20:13:16:18 chr4 73930552 . G A 670.3 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0125894;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.851;QD=58.2873;RBI=0.0320587;REFB=-0.149216;REVB=-0.0294833;RO=2;SAF=21;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185832;STB=0.50099;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.000414563;OID=.;OPOS=73930552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:47:46:2:2:44:44:0.956522:23:21:1:1:23:21:1:1 chr4 73956736 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00858392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.731;QD=44.6883;RBI=0.104597;REFB=0;REVB=0.104244;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138157;OID=.;OPOS=73956736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr4 73991006 . T C 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00993379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.343;QD=56.9564;RBI=0.00999361;REFB=0;REVB=0.00109187;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7047e-05;OID=.;OPOS=73991006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:35:17:0:0:35:17:0:0 chr4 74285239 . C T 557.11 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.129;QD=60.2276;RBI=0.0257779;REFB=0;REVB=0.02365;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42236e-05;OID=.;OPOS=74285239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr4 74302071 . T A 1008.72 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.209;QD=59.3364;RBI=0.0104071;REFB=0;REVB=0.00607273;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30089e-05;OID=.;OPOS=74302071;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:44:23:0:0:44:24:0:0 chr4 74318330 . A G 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.141;QD=57.1045;RBI=0.049637;REFB=0;REVB=-0.000734816;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210368;OID=.;OPOS=74318330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0 chr4 74347503 . TAA TA,T 360.63 PASS AF=0.961538,0.0192308;AO=37,6;DP=53;FAO=50,1;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=23,0;FSAR=27,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0645348,0.0342845;FXX=0.0188644;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=12.5785,11.8559;QD=27.7406;RBI=0.114437,0.0593678;REFB=-0.0272055,-0.0214363;REVB=-0.0945046,-0.0484676;RO=4;SAF=19,0;SAR=18,6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0.328125,0.328125;SSEP=0,0;SSSB=0.00246183,-0.764666;STB=0.510634,0.989913;STBP=0.324,0.496;TYPE=del,del;VARB=0.0113782,-0.137762;OID=.,.;OPOS=74347504,74347504;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.961538,0.0192308:37,6:53:50,1:52:1:23,0:27,1:1:0:3:4:19,0:18,6:2:2 chr4 74447510 . A C 1392.13 PASS AF=0.960396;AO=97;DP=101;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00457599;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.322;QD=55.134;RBI=0.0122183;REFB=0.00749386;REVB=-0.0113291;RO=4;SAF=51;SAR=46;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357512;STB=0.518864;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-5.79465e-05;OID=.;OPOS=74447510;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:101:101:4:4:97:97:0.960396:46:51:4:0:46:51:4:0 chr4 74714098 . G A 602.34 PASS AF=0.419753;AO=68;DP=162;FAO=68;FDP=162;FR=.;FRO=94;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=41;FWDB=-0.0430913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.682;QD=14.8726;RBI=0.0431217;REFB=-0.0132313;REVB=0.00161953;RO=92;SAF=23;SAR=45;SRF=53;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2481;STB=0.633528;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.014183;OID=.;OPOS=74714098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:92:94:68:68:0.419753:45:23:53:39:45:23:53:41 chr4 74863997 . T C 981.93 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0765538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1944;QD=56.1101;RBI=0.0903058;REFB=-0.0736901;REVB=0.0479025;RO=2;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314803;STB=0.516662;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0156058;OID=.;OPOS=74863997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:70:70:2:2:68:68:0.971429:29:39:0:2:29:39:0:2 chr4 74904296 . G T 49.92 PASS AF=0.7;AO=6;DP=9;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00408898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.197;QD=19.9692;RBI=0.113196;REFB=-0.0118161;REVB=0.113122;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173071;STB=0.636015;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.031962;OID=.;OPOS=74904296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:10:2:3:6:7:0.7:2:4:2:0:3:4:3:0 chr4 75023609 . T C 736.4 PASS AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.130683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3304;QD=54.5484;RBI=0.140352;REFB=-0.128513;REVB=-0.0511916;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218994;STB=0.511624;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0015693;OID=.;OPOS=75023609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:52:53:0.981481:21:31:0:1:21:32:0:1 chr4 75023709 . C T 316.8 PASS AF=0.363636;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00346198;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.382;QD=12.8001;RBI=0.0176238;REFB=-0.0149211;REVB=-0.0172804;RO=61;SAF=17;SAR=19;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105854;STB=0.548361;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0276602;OID=.;OPOS=75023709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:61:63:36:36:0.363636:19:17:23:38:19:17:25:38 chr4 75046465 . C G 870.23 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392385;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5086;QD=58.0155;RBI=0.0709426;REFB=0;REVB=0.0591032;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326315;OID=.;OPOS=75046465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:30:29:0:0:31:29:0:0 chr4 75168785 . A G 1659.56 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.126;QD=60.3478;RBI=0.106026;REFB=0;REVB=0.00651135;RO=0;SAF=50;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49535e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169038;OID=.;OPOS=75168785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:60:50:0:0:60:50:0:0 chr4 75248434 . A G 1698.9 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247622;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.216;QD=60.6751;RBI=0.0249814;REFB=0;REVB=-0.00330249;RO=0;SAF=51;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36151e-05;OID=.;OPOS=75248434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:111:112:1:60:51:0:0:60:52:0:0 chr4 75254282 . G A 1533.97 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00419257;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.42;QD=63.9153;RBI=0.00752479;REFB=0;REVB=-0.00624858;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.27913e-05;OID=.;OPOS=75254282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:51:45:0:0:51:45:0:0 chr4 75719517 . A C 171.21 PASS AF=0.396226;AO=18;DP=50;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00418394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.744;QD=12.9216;RBI=0.0072303;REFB=-0.0210615;REVB=0.00589676;RO=32;SAF=5;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29104;STB=0.623256;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0423007;OID=.;OPOS=75719517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:32:32:18:21:0.396226:13:5:17:15:14:7:17:15 chr4 75937704 . C T 317.93 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0557157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.221;QD=15.5087;RBI=0.0557461;REFB=-0.00750767;REVB=-0.0018411;RO=47;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111508;STB=0.562855;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0115258;OID=.;OPOS=75937704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:17:18:19:28:17:18:19:28 chr4 75937971 . C T 196.81 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00177632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.318;QD=30.2791;RBI=0.0109338;REFB=0.0125684;REVB=0.0107886;RO=7;SAF=10;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.495778;STB=0.783797;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00362789;OID=.;OPOS=75937971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:7:7:12:12:0.461538:2:10:1:6:2:10:1:6 chr4 75938179 . G A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0475118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4079;QD=14.6574;RBI=0.0552908;REFB=0.0140207;REVB=-0.028279;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235954;STB=0.636165;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.00382698;OID=.;OPOS=75938179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:5:12:6:7:5:12 chr4 75938236 . A G 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0167762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.469;QD=16.9316;RBI=0.0199166;REFB=-0.0119564;REVB=0.0107345;RO=12;SAF=10;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294028;STB=0.672746;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0398597;OID=.;OPOS=75938236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:2:10:7:5:2:10:7:5 chr4 76407217 . A ACT,T 1505.8 PASS AF=0.918367,0.0714286;AO=89,6;DP=105;FAO=90,7;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=34,4;FSAR=56,3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018584,0.0443397;FXX=0.019998;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=260.831,81.9744;QD=61.4613;RBI=0.0224082,0.0714936;REFB=-0.0341779,-0.193985;REVB=-0.0125203,0.0560832;RO=8;SAF=33,4;SAR=56,2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0419338,0.0427406;STB=0.507245,0.5554;STBP=0.265,0.526;TYPE=ins,snp;VARB=0.00111683,-0.000982042;OID=.,.;OPOS=76407218,76407217;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:24:105:98:8:1:89,6:90,7:0.918367,0.0714286:56,2:33,4:5:3:56,3:34,4:1:0 chr4 76452357 . C T 397.1 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00932127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.516;QD=23.3589;RBI=0.0250029;REFB=0.0041392;REVB=-0.0232004;RO=28;SAF=14;SAR=25;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294134;STB=0.654372;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00358884;OID=.;OPOS=76452357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:29:39:39:0.573529:25:14:21:7:25:14:21:8 chr4 76455189 . G GA 69.73 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0970479;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.274;QD=11.6213;RBI=0.168638;REFB=-0.0619071;REVB=0.137915;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677773;STB=0.588105;STBP=0.393;TYPE=ins;VARB=0.101341;OID=.;OPOS=76455190;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.541667:13:28:13:24:11:6:7:3:8:52:13:6:7:5:8 chr4 76720885 . T C 1175.84 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00483421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.801;QD=59.5361;RBI=0.0132031;REFB=-0.011305;REVB=-0.0122863;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.505375;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-4.52759e-05;OID=.;OPOS=76720885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:0:1:78:78:0.987342:46:32:0:0:46:32:0:1 chr4 76722353 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3154;QD=50.413;RBI=0.0938384;REFB=0;REVB=-0.0841655;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154753;OID=.;OPOS=76722353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr4 76787673 . T C 891.9 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0368459;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4206;QD=56.6286;RBI=0.0902257;REFB=-0.13467;REVB=0.0823593;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145233;STB=0.50746;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00345;OID=.;OPOS=76787673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:32:29:0:1:33:29:0:1 chr4 76793228 . A G 1116.3 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.017;QD=60.3404;RBI=0.151334;REFB=0;REVB=-0.150635;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172602;OID=.;OPOS=76793228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0 chr4 76794345 . T G 1618.37 PASS AF=0.990991;AO=109;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0126382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.07;QD=58.3196;RBI=0.0126793;REFB=-0.105247;REVB=-0.0010199;RO=0;SAF=55;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00036165;OID=.;OPOS=76794345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:111:111:0:1:109:110:0.990991:54:55:0:0:54:56:1:0 chr4 76805902 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.407;QD=58.7815;RBI=0.0130251;REFB=0;REVB=-0.0117901;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.81472e-05;OID=.;OPOS=76805902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:21:44:0:0:21:44:0:0 chr4 76807218 . C G 814.38 PASS AF=0.780488;AO=64;DP=82;FAO=64;FDP=82;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=54;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0219888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7303;QD=39.7256;RBI=0.0267014;REFB=0.00249723;REVB=-0.0151479;RO=18;SAF=10;SAR=54;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190865;STB=0.602942;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00199835;OID=.;OPOS=76807218;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:18:18:64:64:0.780488:54:10:8:10:54:10:8:10 chr4 76807249 . C G 691.66 PASS AF=0.74026;AO=56;DP=76;FAO=57;FDP=77;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00760268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6908;QD=35.9302;RBI=0.0114266;REFB=-0.0145537;REVB=0.00853032;RO=19;SAF=6;SAR=50;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321999;STB=0.67275;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00906648;OID=.;OPOS=76807249;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:19:20:56:57:0.74026:50:6:9:10:51:6:9:11 chr4 76807252 . C A 676.49 PASS AF=0.76;AO=57;DP=75;FAO=57;FDP=75;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0722164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4816;QD=36.0797;RBI=0.0754521;REFB=-0.0558085;REVB=0.021859;RO=18;SAF=6;SAR=51;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295915;STB=0.661043;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0221757;OID=.;OPOS=76807252;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:18:18:57:57:0.76:51:6:8:10:51:6:8:10 chr4 76807270 . C T 681.22 PASS AF=0.7125;AO=56;DP=79;FAO=57;FDP=80;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0305642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.796;QD=34.0611;RBI=0.0325186;REFB=-0.0124282;REVB=0.0111035;RO=23;SAF=5;SAR=51;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305912;STB=0.643184;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00835159;OID=.;OPOS=76807270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:23:23:56:57:0.7125:51:5:8:15:51:6:8:15 chr4 76807288 . A G 648.05 PASS AF=0.651163;AO=56;DP=86;FAO=56;FDP=86;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=50;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0128727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.246;QD=30.1421;RBI=0.0178698;REFB=-0.0226261;REVB=0.0123944;RO=29;SAF=6;SAR=50;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373347;STB=0.702574;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00806841;OID=.;OPOS=76807288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:29:30:56:56:0.651163:50:6:13:16:50:6:13:17 chr4 76807302 . A G 653.0 PASS AF=0.626374;AO=57;DP=91;FAO=57;FDP=91;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.044007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7248;QD=28.7034;RBI=0.0670112;REFB=-0.00851472;REVB=-0.050536;RO=34;SAF=6;SAR=51;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346513;STB=0.691566;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00652437;OID=.;OPOS=76807302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:34:34:57:57:0.626374:51:6:13:21:51:6:13:21 chr4 76807304 . A G 654.68 PASS AF=0.626374;AO=57;DP=91;FAO=57;FDP=91;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0094967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.466;QD=28.777;RBI=0.0121562;REFB=-0.00801344;REVB=0.00758854;RO=34;SAF=6;SAR=51;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346513;STB=0.691566;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00183835;OID=.;OPOS=76807304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:34:34:57:57:0.626374:51:6:13:21:51:6:13:21 chr4 76807313 . C A 646.23 PASS AF=0.626374;AO=56;DP=92;FAO=57;FDP=91;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=51;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0589774;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.033;QD=28.4055;RBI=0.0591959;REFB=-0.0165903;REVB=0.00508175;RO=35;SAF=6;SAR=50;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311982;STB=0.676916;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00217689;OID=.;OPOS=76807313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:35:34:56:57:0.626374:50:6:12:23:51:6:12:22 chr4 76807325 . T A 423.81 PASS AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0126515;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.48;QD=21.1906;RBI=0.0134871;REFB=-0.0191622;REVB=-0.00467362;RO=38;SAF=6;SAR=36;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296703;STB=0.666574;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0142662;OID=.;OPOS=76807325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:38:38:42:42:0.525:36:6:14:24:36:6:14:24 chr4 76807334 . T C 241.17 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0107049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.689;QD=14.6163;RBI=0.0203739;REFB=-0.00690832;REVB=-0.0173349;RO=38;SAF=4;SAR=24;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331673;STB=0.692146;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.013568;OID=.;OPOS=76807334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:24:4:14:24:24:4:14:24 chr4 76809386 . A G 2441.58 PASS AF=1;AO=159;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192147;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5132;QD=61.4234;RBI=0.0370935;REFB=0;REVB=-0.0317289;RO=0;SAF=69;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.04659e-05;OID=.;OPOS=76809386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:159:0:0:159:159:1:90:69:0:0:90:69:0:0 chr4 76838908 . C T 59.78 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00930224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2238;QD=15.942;RBI=0.0191271;REFB=-0.0362194;REVB=-0.0167127;RO=7;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313286;STB=0.518471;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0145057;OID=.;OPOS=76838908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:15:15:7:7:8:8:0.533333:7:1:1:6:7:1:1:6 chr4 76857309 . C T 102.97 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0112209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1698;QD=9.57824;RBI=0.0143032;REFB=-0.0162716;REVB=0.00886985;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280937;STB=0.66874;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0372392;OID=.;OPOS=76857309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:5:8:11:19:5:8:11:19 chr4 76857388 . C T 137.9 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0124177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.816;QD=11.4917;RBI=0.0126026;REFB=-0.00852627;REVB=-0.00215049;RO=32;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141128;STB=0.583232;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0300657;OID=.;OPOS=76857388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:8:8:12:20:8:8:12:20 chr4 76878688 . G A 211.23 PASS AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0144211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.814;QD=12.07;RBI=0.0149693;REFB=-0.0300033;REVB=-0.00401396;RO=43;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882137;STB=0.542824;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0487024;OID=.;OPOS=76878688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:43:44:26:26:0.371429:13:13:25:18:13:13:25:19 chr4 76881233 . G T 302.83 PASS AF=0.353535;AO=35;DP=99;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.0300153;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.265;QD=12.2357;RBI=0.0319674;REFB=-0.0148403;REVB=-0.0109999;RO=60;SAF=16;SAR=19;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246768;STB=0.617029;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0324916;OID=.;OPOS=76881233;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:60:64:35:35:0.353535:19:16:41:19:19:16:41:23 chr4 76902710 . G A 262.02 PASS AF=0.520833;AO=23;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0099599;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.421;QD=21.8354;RBI=0.0134852;REFB=-0.00381248;REVB=0.00909122;RO=21;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114911;STB=0.579768;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00354538;OID=.;OPOS=76902710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:21:23:23:25:0.520833:14:9:11:10:15:10:13:10 chr4 76942943 . C G 1491.69 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.536;QD=63.476;RBI=0.0319878;REFB=0;REVB=-0.00863016;RO=0;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248012;OID=.;OPOS=76942943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:46:48:0:0:46:48:0:0 chr4 76943137 . G C 1343.84 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736732;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3901;QD=62.5044;RBI=0.0821116;REFB=0;REVB=0.0362571;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000928088;OID=.;OPOS=76943137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0 chr4 76955914 . T C 701.43 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.698;QD=62.3496;RBI=0.0345116;REFB=0;REVB=0.00980564;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81344e-05;OID=.;OPOS=76955914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:21:22:0:0:21:24:0:0 chr4 76956188 . T C 820.19 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=2.97213e-06;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.247;QD=55.606;RBI=0.0142094;REFB=-0.097219;REVB=0.0142094;RO=1;SAF=27;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171508;STB=0.509088;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=7.81681e-06;OID=.;OPOS=76956188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:31:27:1:0:31:27:1:0 chr4 77021433 . C T 295.61 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00512157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.713;QD=15.3562;RBI=0.00822105;REFB=-0.000258187;REVB=-0.0064308;RO=44;SAF=16;SAR=17;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382793;STB=0.521623;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.000328808;OID=.;OPOS=77021433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:44:33:33:0.428571:17:16:23:21:17:16:23:21 chr4 77033590 . C T 1550.36 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00317644;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.47;QD=59.6294;RBI=0.0257285;REFB=0;REVB=0.0255317;RO=0;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160187;OID=.;OPOS=77033590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:104:0:0:103:104:1:57:46:0:0:57:47:0:0 chr4 77192868 . G A 248.83 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.024039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.193;QD=16.3169;RBI=0.0289581;REFB=-0.00407135;REVB=-0.0161462;RO=33;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189961;STB=0.606485;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00423332;OID=.;OPOS=77192868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:14:14:10:23:14:14:10:23 chr4 77201487 . C T 167.91 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0105044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.029;QD=15.6193;RBI=0.041175;REFB=-0.00805267;REVB=-0.0398126;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874601;STB=0.55021;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0137935;OID=.;OPOS=77201487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:8:10:16:9:8:10:16:9 chr4 78638729 . ATAT ACAT,TACA 1072.81 PASS AF=0.972973,0.027027;AO=61,4;DP=77;FAO=72,2;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=38,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160504,0.0299378;FXX=0.0512755;HRUN=1,1;LEN=1,4;MLLD=63.9021,35.1998;QD=57.9895;RBI=0.175697,0.0600559;REFB=0,0;REVB=0.174962,0.0520619;RO=0;SAF=32,0;SAR=29,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000329721,0.154288;OID=.,.;OPOS=78638730,78638729;OREF=T,ATAT;OALT=C,TACA;OMAPALT=ACAT,TACA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:77:74:0:0:61,4:72,2:0.972973,0.027027:29,4:32,0:0:0:38,2:34,0:0:0 chr4 78669454 . A G 808.59 PASS AF=0.966667;AO=57;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0120491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.91;QD=53.9058;RBI=0.0120911;REFB=-0.060313;REVB=0.00100791;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145113;STB=0.515146;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.000239705;OID=.;OPOS=78669454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:60:1:2:57:58:0.966667:25:32:1:0:26:32:2:0 chr4 78740132 . G C 74.96 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.812;QD=37.4815;RBI=0.147662;REFB=0;REVB=0.0522926;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00639593;OID=.;OPOS=78740132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr4 78740160 . G A 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0338618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.716;QD=19.134;RBI=0.0370875;REFB=-0.044245;REVB=-0.0151281;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171367;STB=0.59965;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0146844;OID=.;OPOS=78740160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:0:2:4:1:0:2 chr4 78987157 . A G 1875.48 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.32;QD=61.4913;RBI=0.039215;REFB=0;REVB=0.0251152;RO=0;SAF=43;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8377e-05;OID=.;OPOS=78987157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:122:0:0:119:122:1:76:43:0:0:77:45:0:0 chr4 78989672 . G C 1287.37 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0587931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.77;QD=60.5823;RBI=0.07387;REFB=-0.0685325;REVB=0.044723;RO=1;SAF=42;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111448;STB=0.505881;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000733177;OID=.;OPOS=78989672;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:42:42:1:0:42:42:1:0 chr4 78989716 . T C 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.363;QD=60.2045;RBI=0.0194806;REFB=0;REVB=0.00370794;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.829e-05;OID=.;OPOS=78989716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:39:34:0:0:39:34:0:0 chr4 79186047 . G A 277.0 PASS AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0567374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9508;QD=13.5122;RBI=0.0608018;REFB=0.00810763;REVB=0.0218571;RO=49;SAF=19;SAR=13;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153917;STB=0.581878;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.0134412;OID=.;OPOS=79186047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:50:32:32:0.390244:13:19:22:27:13:19:23:27 chr4 79186171 . G A 1101.3 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00148358;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.868;QD=60.3453;RBI=0.0124147;REFB=0;REVB=0.0123257;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415583;OID=.;OPOS=79186171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:46:27:0:0:46:27:0:0 chr4 79205699 . T A 478.05 PASS AF=0.394161;AO=54;DP=137;FAO=54;FDP=137;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=0.00552006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.81;QD=13.9576;RBI=0.0162799;REFB=-0.0148043;REVB=-0.0153154;RO=83;SAF=26;SAR=28;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644129;STB=0.53636;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0245546;OID=.;OPOS=79205699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:83:83:54:54:0.394161:28:26:35:48:28:26:35:48 chr4 79238649 . T C 2294.34 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234516;FXX=0.0204068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.878;QD=63.7317;RBI=0.0292922;REFB=0;REVB=0.0175514;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0006261;OID=.;OPOS=79238649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:144:0:0:143:144:1:69:74:0:0:70:74:0:0 chr4 79240063 . A G 1476.16 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0136931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6664;QD=62.154;RBI=0.0149943;REFB=-0.0620282;REVB=0.00610977;RO=1;SAF=53;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886281;STB=0.504672;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-5.50435e-05;OID=.;OPOS=79240063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:41:53:1:0:41:53:1:0 chr4 79372930 . C T 489.31 PASS AF=0.633803;AO=45;DP=71;FAO=45;FDP=71;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00822591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.057;QD=27.5665;RBI=0.0356951;REFB=-0.00830024;REVB=-0.0347344;RO=26;SAF=27;SAR=18;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689097;STB=0.537555;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00421615;OID=.;OPOS=79372930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:26:26:45:45:0.633803:18:27:13:13:18:27:13:13 chr4 79385719 . G A 592.21 PASS AF=0.377049;AO=69;DP=183;FAO=69;FDP=183;FR=.;FRO=114;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=64;FWDB=-0.0141174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.401;QD=12.9445;RBI=0.0141556;REFB=-0.00809401;REVB=-0.00103912;RO=114;SAF=30;SAR=39;SRF=50;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00426571;STB=0.502415;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0132821;OID=.;OPOS=79385719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:114:114:69:69:0.377049:39:30:50:64:39:30:50:64 chr4 79387464 . A G 1481.24 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00397763;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.375;QD=58.088;RBI=0.00508414;REFB=-0.0406929;REVB=-0.00316653;RO=1;SAF=49;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958177;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137916;OID=.;OPOS=79387464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:99:102:1:0:98:102:1:49:49:1:0:49:53:0:0 chr4 79387586 . A G 197.66 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0756949;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.0992;QD=14.6417;RBI=0.0805986;REFB=-0.00244599;REVB=-0.0276843;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152109;STB=0.586193;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=6.82271e-05;OID=.;OPOS=79387586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:13:10:9:22:13:10:9:22 chr4 79400868 . C T 525.91 PASS AF=0.71875;AO=46;DP=64;FAO=46;FDP=64;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0103419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.675;QD=32.8695;RBI=0.0110638;REFB=-0.0366678;REVB=-0.00393095;RO=18;SAF=20;SAR=26;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541715;STB=0.529235;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00997335;OID=.;OPOS=79400868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:18:18:46:46:0.71875:26:20:6:12:26:20:6:12 chr4 79432455 . A C 544.56 PASS AF=0.453125;AO=58;DP=128;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.00041986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.663;QD=17.0174;RBI=0.0292082;REFB=-0.0197276;REVB=-0.0292052;RO=69;SAF=22;SAR=36;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996273;STB=0.552129;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0159394;OID=.;OPOS=79432455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:69:70:58:58:0.453125:36:22:33:36:36:22:33:37 chr4 79443850 . G A 464.91 PASS AF=0.535714;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.000261104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.046;QD=22.1384;RBI=0.00835333;REFB=-0.00919413;REVB=0.00834925;RO=38;SAF=23;SAR=22;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118453;STB=0.570418;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00790534;OID=.;OPOS=79443850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:38:39:45:45:0.535714:22:23:14:24:22:23:14:25 chr4 79455714 . C G 385.29 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0363983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.855;QD=17.9205;RBI=0.0451807;REFB=0.000266716;REVB=0.0267667;RO=46;SAF=22;SAR=18;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130539;STB=0.57288;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=-0.000429693;OID=.;OPOS=79455714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:18:22:19:27:18:22:19:27 chr4 79455733 . C T 428.31 PASS AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0441815;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1772;QD=19.2499;RBI=0.0513436;REFB=-0.0208701;REVB=0.0261566;RO=46;SAF=22;SAR=21;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131816;STB=0.573182;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0224715;OID=.;OPOS=79455733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:46:43:43:0.483146:21:22:17:29:21:22:17:29 chr4 79531202 . C T 263.0 PASS AF=0.511111;AO=20;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0113976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.478;QD=23.3781;RBI=0.0127693;REFB=-0.0163797;REVB=-0.00575751;RO=19;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652459;STB=0.550711;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0257687;OID=.;OPOS=79531202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:20:20:23:0.511111:8:12:10:9:8:15:11:9 chr4 79786856 . G A 366.21 PASS AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.000547336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.491;QD=16.2759;RBI=0.0127212;REFB=-0.00562342;REVB=-0.0127095;RO=51;SAF=19;SAR=20;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227785;STB=0.512814;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0151269;OID=.;OPOS=79786856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:20:19:26:25:20:19:26:25 chr4 79800080 . G A 598.63 PASS AF=0.556604;AO=59;DP=107;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00311741;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.283;QD=22.5899;RBI=0.00325341;REFB=-0.0209811;REVB=0.000930801;RO=47;SAF=23;SAR=36;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240854;STB=0.51318;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0198186;OID=.;OPOS=79800080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:47:47:59:59:0.556604:36:23:17:30:36:23:17:30 chr4 79832509 . A C 432.92 PASS AF=0.383459;AO=49;DP=132;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=0.0185736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.356;QD=13.0201;RBI=0.019583;REFB=-0.0104014;REVB=-0.00620603;RO=80;SAF=28;SAR=21;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603813;STB=0.529509;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0137617;OID=.;OPOS=79832509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:80:82:49:51:0.383459:21:28:50:30:21:30:52:30 chr4 79845007 . C A 320.51 PASS AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00201454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.372;QD=27.2773;RBI=0.00202336;REFB=-0.0105438;REVB=-0.000188723;RO=19;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721598;STB=0.539849;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00784132;OID=.;OPOS=79845007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:16:12:10:9:16:12:10:9 chr4 80329343 . T C 731.14 PASS AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0165634;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.427;QD=51.308;RBI=0.0207927;REFB=0.00403285;REVB=0.0125694;RO=3;SAF=19;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337978;STB=0.517964;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000207455;OID=.;OPOS=80329343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:57:57:3:3:54:54:0.947368:35:19:2:1:35:19:2:1 chr4 80827062 . T C 2335.39 PASS AF=0.941176;AO=160;DP=170;FAO=160;FDP=170;FR=.;FRO=10;FSAF=99;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0141174;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=320.13;QD=54.9503;RBI=0.0185169;REFB=-0.0578748;REVB=-0.0119822;RO=10;SAF=99;SAR=61;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718714;STB=0.537874;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000484951;OID=.;OPOS=80827062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:170:170:10:10:160:160:0.941176:61:99:0:10:61:99:0:10 chr4 80905990 . C G 339.48 PASS AF=1;AO=18;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.434;QD=54.317;RBI=0.0728414;REFB=0;REVB=0.0471543;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263645;OID=.;OPOS=80905990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:18:25:1:3:15:0:0:4:21:0:0 chr4 80977078 . T G 1175.25 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239253;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1108;QD=61.0522;RBI=0.040193;REFB=0;REVB=0.0322964;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272488;OID=.;OPOS=80977078;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0 chr4 81124596 . G C 2810.45 PASS AF=0.994475;AO=180;DP=181;FAO=180;FDP=181;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0146977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3184;QD=62.1094;RBI=0.052326;REFB=-0.0436557;REVB=0.0502194;RO=0;SAF=85;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502924;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00046552;OID=.;OPOS=81124596;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:181:181:0:1:180:180:0.994475:95:85:0:0:95:85:1:0 chr4 81529518 . T C 1269.45 PASS AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00731612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.748;QD=60.4501;RBI=0.0766568;REFB=0.109947;REVB=0.0763069;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111424;STB=0.505881;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000193714;OID=.;OPOS=81529518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:84:1:1:82:83:0.988095:40:42:1:0:41:42:1:0 chr4 81884722 . G A 1607.13 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.014;QD=64.2853;RBI=0.0156984;REFB=0;REVB=-0.0127532;RO=0;SAF=39;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39894e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.37346e-06;OID=.;OPOS=81884722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:61:39:0:0:61:39:0:0 chr4 81967150 . G A 237.14 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0412577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7511;QD=19.7615;RBI=0.0431208;REFB=-0.0204115;REVB=0.0125379;RO=25;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421408;STB=0.523789;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0162774;OID=.;OPOS=81967150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:10:13:13:12:10:13:13:12 chr4 81967187 . AC A,AT 786.58 PASS AF=0.02,0.98;AO=6,43;DP=50;FAO=1,49;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567868,0.0662991;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=229.175,249.098;QD=62.9262;RBI=0.0583424,0.0670302;REFB=0,0;REVB=0.0133829,0.00987271;RO=0;SAF=6,21;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0161787,0.00132425;OID=.,.;OPOS=81967188,81967188;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.02,0.98:6,43:50:1,49:50:0:1,27:0,22:0:0:4:0:6,21:0,22:0:0 chr4 81974809 . T C 287.61 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0171412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.939;QD=15.9785;RBI=0.0253422;REFB=-0.0244084;REVB=0.0186657;RO=38;SAF=10;SAR=22;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610538;STB=0.539191;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0269849;OID=.;OPOS=81974809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:40:32:32:0.444444:22:10:14:24:22:10:15:25 chr4 81975088 . G A 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00343989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.233;QD=62.6711;RBI=0.0168806;REFB=0;REVB=0.0165264;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58691e-05;OID=.;OPOS=81975088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr4 81977730 . A T 1931.9 PASS AF=0.955556;AO=129;DP=135;FAO=129;FDP=135;FR=.;FRO=6;FSAF=67;FSAR=62;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0283866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.236;QD=57.2414;RBI=0.0301274;REFB=-0.204766;REVB=0.0100927;RO=1;SAF=67;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760358;STB=0.506558;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00170559;OID=.;OPOS=81977730;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:135:135:1:6:129:129:0.955556:62:67:0:1:62:67:4:2 chr4 82025509 . G T 611.11 PASS AF=0.5;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.000712021;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.125;QD=19.7131;RBI=0.0010389;REFB=-0.00836246;REVB=0.000756531;RO=61;SAF=26;SAR=36;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110014;STB=0.556877;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00763504;OID=.;OPOS=82025509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:61:62:62:62:0.5:36:26:33:28:36:26:33:29 chr4 83274634 . C T 516.82 PASS AF=0.532609;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0547337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.217;QD=22.4704;RBI=0.0553756;REFB=0.0030247;REVB=-0.00840654;RO=43;SAF=17;SAR=32;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654952;STB=0.536127;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=-0.00351763;OID=.;OPOS=83274634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:43:43:49:49:0.532609:32:17:18:25:32:17:18:25 chr4 83551007 . G A 184.92 PASS AF=0.363636;AO=22;DP=65;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0236672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.124;QD=11.207;RBI=0.0272188;REFB=-0.0235922;REVB=-0.0134434;RO=41;SAF=16;SAR=6;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027595;STB=0.529387;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.025146;OID=.;OPOS=83551007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:41:42:22:24:0.363636:6:16:29:12:6:18:30:12 chr4 83551119 . T C 143.3 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0474092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.78;QD=14.697;RBI=0.0478386;REFB=-0.000890385;REVB=0.00639524;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215761;STB=0.624455;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00140784;OID=.;OPOS=83551119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:9:7:15:8:9:7:15:8 chr4 83582064 . G T 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0138066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.93;QD=13.9116;RBI=0.0207049;REFB=-0.0221656;REVB=0.0154295;RO=30;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155898;STB=0.516618;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0320145;OID=.;OPOS=83582064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:13:8:11:19:13:8:11:20 chr4 83778839 . T C 303.32 PASS AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00527651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.746;QD=25.8143;RBI=0.00969228;REFB=-0.00589362;REVB=0.00813011;RO=20;SAF=9;SAR=18;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143111;STB=0.507931;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00439657;OID=.;OPOS=83778839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:18:9:7:13:18:9:7:13 chr4 83788344 . A T 1377.65 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.282;QD=62.6205;RBI=0.0414886;REFB=0;REVB=0.0360866;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2538e-05;OID=.;OPOS=83788344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:34:52:0:0:34:54:0:0 chr4 83792555 . C A 357.8 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.110056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0726;QD=55.0461;RBI=0.111069;REFB=0;REVB=-0.0149688;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00327618;OID=.;OPOS=83792555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr4 83795806 . T C 157.98 PASS AF=0.328125;AO=20;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0393316;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=46.9977;QD=9.87386;RBI=0.0409396;REFB=0.031478;REVB=-0.0113609;RO=33;SAF=10;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813988;STB=0.523787;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.0650655;OID=.;OPOS=83795806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:43:20:21:0.328125:10:10:19:14:11:10:22:21 chr4 83796961 . A G 152.67 PASS AF=0.3;AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00749939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7709;QD=8.72424;RBI=0.0112645;REFB=-0.0132212;REVB=0.00840525;RO=49;SAF=14;SAR=7;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25823;STB=0.653698;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0309681;OID=.;OPOS=83796961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:49:49:21:21:0.3:7:14:22:27:7:14:22:27 chr4 83838217 . G A 1547.0 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.706;QD=59.5002;RBI=0.0203867;REFB=0;REVB=-0.00313152;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38581e-05;OID=.;OPOS=83838217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:103:104:1:58:45:0:0:59:45:0:0 chr4 83838262 . G T 575.06 PASS AF=0.445255;AO=60;DP=136;FAO=61;FDP=137;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=-0.00282592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.655;QD=16.79;RBI=0.00411398;REFB=-0.0129911;REVB=0.00298981;RO=75;SAF=32;SAR=28;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11907;STB=0.557233;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.013103;OID=.;OPOS=83838262;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:75:76:60:61:0.445255:28:32:31:44:29:32:32:44 chr4 83839799 . A G 885.41 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.266;QD=58.0597;RBI=0.0181065;REFB=0;REVB=0.00338871;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24962e-05;OID=.;OPOS=83839799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr4 83848965 . G A 443.46 PASS AF=0.45045;AO=28;DP=114;FAO=50;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=-0.0910303;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.404;QD=15.9806;RBI=0.091097;REFB=-0.0548025;REVB=0.00348627;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=35;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345759;STB=0.651187;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0457464;OID=.;OPOS=83848965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:111:40:60:28:50:0.45045:12:16:35:5:30:20:41:19 chr4 83848976 . CAGAA C 322.45 PASS AF=0.363636;AO=39;DP=115;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.000420441;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=4;MLLD=264.562;QD=11.7253;RBI=0.02711;REFB=-0.0115188;REVB=-0.0271067;RO=70;SAF=18;SAR=21;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122498;STB=0.558954;STBP=0.349;TYPE=del;VARB=0.0210636;OID=.;OPOS=83848977;OREF=AGAA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636:39:115:40:110:70:18:22:38:32:99:70:18:21:40:30 chr4 83900043 . A G 1120.76 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00119871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.429;QD=58.9874;RBI=0.00157563;REFB=-0.113725;REVB=0.0010226;RO=1;SAF=22;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210175;STB=0.511108;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00200304;OID=.;OPOS=83900043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:53:22:1:0:53:22:1:0 chr4 84191031 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.913;QD=55.0961;RBI=0.0451794;REFB=0;REVB=0.0413553;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000806969;OID=.;OPOS=84191031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr4 84230619 . T C 167.43 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0106543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3676;QD=23.0934;RBI=0.0183941;REFB=-0.0205609;REVB=0.0149943;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245494;STB=0.637293;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0154462;OID=.;OPOS=84230619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:7:10:3:9:7:10:3:9 chr4 84364751 . A G 298.77 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0121982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.44;QD=18.6728;RBI=0.0283465;REFB=-0.0107427;REVB=0.0255876;RO=32;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840805;STB=0.546846;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0139723;OID=.;OPOS=84364751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:16:16:19:13:16:16:19:13 chr4 84370091 . A G 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00697015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.658;QD=18.7108;RBI=0.010636;REFB=-0.00793025;REVB=0.00803371;RO=19;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287827;STB=0.664346;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00848083;OID=.;OPOS=84370091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:13:5:11:8:13:5:11:8 chr4 84374480 . C T 640.26 PASS AF=0.516129;AO=63;DP=123;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.0325917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6852;QD=20.6536;RBI=0.0356002;REFB=-0.00294605;REVB=0.0143232;RO=59;SAF=38;SAR=25;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378817;STB=0.528502;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00416843;OID=.;OPOS=84374480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:59:60:63:64:0.516129:25:38:38:21:26:38:39:21 chr4 84376743 . A T 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0748296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.781;QD=57.884;RBI=0.0789768;REFB=0;REVB=-0.025256;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266396;OID=.;OPOS=84376743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr4 84380955 . G T 207.9 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00358489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.405;QD=17.6939;RBI=0.00510025;REFB=-0.00578336;REVB=-0.00362783;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32719;STB=0.694264;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0107179;OID=.;OPOS=84380955;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:14:7:17:8:14:7:18:8 chr4 84382552 . A T 273.94 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00676577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.232;QD=15.2188;RBI=0.00676598;REFB=0.00202978;REVB=5.33795e-05;RO=41;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12648;STB=0.571383;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=-0.00484178;OID=.;OPOS=84382552;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:15:16:16:25:15:16:16:25 chr4 84383810 . C T 493.08 PASS AF=0.469027;AO=52;DP=112;FAO=53;FDP=113;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0060991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.73;QD=17.4542;RBI=0.030939;REFB=-0.0104661;REVB=-0.0303319;RO=59;SAF=35;SAR=17;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182591;STB=0.609911;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0123045;OID=.;OPOS=84383810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:59:60:52:53:0.469027:17:35:29:30:17:36:29:31 chr4 84557407 . G C 71.1 PASS AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0258474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.196;QD=7.48443;RBI=0.0274259;REFB=-0.011733;REVB=-0.00917021;RO=28;SAF=8;SAR=2;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27406;STB=0.674935;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0338283;OID=.;OPOS=84557407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:2:8:17:11:2:8:17:11 chr4 85762385 . T C 2159.67 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.69;QD=63.056;RBI=0.0246272;REFB=0;REVB=0.0222479;RO=0;SAF=71;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49328e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58465e-05;OID=.;OPOS=85762385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:66:71:0:0:66:71:0:0 chr4 86021741 . C T 929.63 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.866;QD=58.1018;RBI=0.0460811;REFB=0;REVB=-7.16506e-05;RO=0;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22463e-05;OID=.;OPOS=86021741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:64:0:0:60:64:1:39:21:0:0:39:25:0:0 chr4 86021765 . C T 1195.37 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0744879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7057;QD=59.7683;RBI=0.0746693;REFB=-0.144053;REVB=-0.00520135;RO=1;SAF=27;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172084;STB=0.509089;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00268993;OID=.;OPOS=86021765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:80:1:1:79:79:0.9875:52:27:1:0:52:27:1:0 chr4 86021800 . A T 660.88 PASS AF=0.604167;AO=58;DP=96;FAO=58;FDP=96;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.0477711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4346;QD=27.5365;RBI=0.0478273;REFB=-0.0103958;REVB=0.00231773;RO=38;SAF=21;SAR=37;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798759;STB=0.543377;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00734444;OID=.;OPOS=86021800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:38:38:58:58:0.604167:37:21:10:28:37:21:10:28 chr4 86021967 . C T 976.41 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00429671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.913;QD=57.4361;RBI=0.00591871;REFB=0.00852767;REVB=-0.00407055;RO=1;SAF=20;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00995023;STB=0.505262;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.000113684;OID=.;OPOS=86021967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:47:20:0:1:47:20:0:1 chr4 86021976 . T A 600.65 PASS AF=0.961538;AO=46;DP=51;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0402875;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=147.973;QD=46.2038;RBI=0.040635;REFB=-0.0848266;REVB=-0.00530289;RO=3;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447271;STB=0.51428;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.000664531;OID=.;OPOS=86021976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:51:52:3:2:46:50:0.961538:30:16:0:3:34:16:0:2 chr4 87024409 . T C 152.15 PASS AF=0.369565;AO=16;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0146173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.839;QD=13.2306;RBI=0.0398644;REFB=-0.00674547;REVB=0.0370878;RO=29;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271878;STB=0.669787;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00769559;OID=.;OPOS=87024409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:16:17:0.369565:7:9:9:20:7:10:9:20 chr4 87684031 . A G 1119.44 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161991;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.626;QD=60.5104;RBI=0.0330797;REFB=0;REVB=0.0288419;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02811e-05;OID=.;OPOS=87684031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:29:44:0:0:29:45:0:0 chr4 87690998 . A G 647.89 PASS AF=0.461538;AO=66;DP=144;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.00797652;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.789;QD=18.1229;RBI=0.0240075;REFB=-0.00659206;REVB=0.0226436;RO=77;SAF=37;SAR=29;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090442;STB=0.550229;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00753364;OID=.;OPOS=87690998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:77:77:66:66:0.461538:29:37:36:41:29:37:36:41 chr4 87706506 . T G 380.97 PASS AF=0.415094;AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0303548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9355;QD=14.3762;RBI=0.0305079;REFB=0.00676082;REVB=0.0030523;RO=62;SAF=23;SAR=21;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235892;STB=0.513299;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.0123578;OID=.;OPOS=87706506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:62:62:44:44:0.415094:21:23:31:31:21:23:31:31 chr4 87809020 . C G 318.13 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0226831;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.562;QD=20.1987;RBI=0.0231691;REFB=-0.0167132;REVB=-0.00472067;RO=29;SAF=13;SAR=20;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174464;STB=0.503016;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0152491;OID=.;OPOS=87809020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:29:30:33:33:0.52381:20:13:12:17:20:13:12:18 chr4 87809048 . T TA 57.33 PASS AF=0.352941;AO=14;DP=52;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0253326;FXX=0.0192271;HRUN=0;LEN=1;MLLD=34.9343;QD=4.49633;RBI=0.0264631;REFB=-0.0326105;REVB=-0.00765212;RO=35;SAF=1;SAR=13;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590349;STB=0.894183;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.102645;OID=.;OPOS=87809049;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.352941:14:52:18:51:33:1:17:16:17:57:35:1:13:16:19 chr4 87809387 . G T 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.696;QD=63.2862;RBI=0.0346015;REFB=0;REVB=-0.0219111;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36166e-05;OID=.;OPOS=87809387;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0 chr4 88056925 . A G,T 431.79 PASS AF=0.83871,0.16129;AO=26,5;DP=31;FAO=26,5;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16,4;FSAR=10,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00459672,0.00572116;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=217.788,131.099;QD=55.7152;RBI=0.0212229,0.0199412;REFB=0,0;REVB=-0.0207191,0.0191029;RO=0;SAF=16,4;SAR=10,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-7.71087e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0063827,0.072239;OID=.,.;OPOS=88056925,88056925;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:26:31:31:0:0:26,5:26,5:0.83871,0.16129:10,1:16,4:0:0:10,1:16,4:0:0 chr4 88057353 . G A 271.49 PASS AF=0.418919;AO=30;DP=73;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0197902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5013;QD=14.6752;RBI=0.0430751;REFB=0.00157591;REVB=-0.0382598;RO=43;SAF=10;SAR=20;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954544;STB=0.539509;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=-0.00296515;OID=.;OPOS=88057353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:43:43:30:31:0.418919:20:10:18:25:20:11:18:25 chr4 88058340 . C G 223.26 PASS AF=0.462963;AO=24;DP=53;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0288198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3029;QD=16.5377;RBI=0.0573649;REFB=-0.0263886;REVB=0.0495999;RO=28;SAF=7;SAR=17;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396595;STB=0.711236;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0308403;OID=.;OPOS=88058340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:28:29:24:25:0.462963:17:7:20:8:17:8:21:8 chr4 88059617 . G C 278.8 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.023716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3316;QD=21.867;RBI=0.0268308;REFB=-0.0331022;REVB=-0.0125478;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214277;STB=0.618702;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0361745;OID=.;OPOS=88059617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:16:12:16:7:16:12:16:7 chr4 88059662 . TGTGTG T 147.82 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00945805;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=5;MLLD=204.969;QD=15.1608;RBI=0.0317512;REFB=-0.048838;REVB=0.0303098;RO=23;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216566;STB=0.626696;STBP=0.22;TYPE=del;VARB=0.045629;OID=.;OPOS=88059663;OREF=GTGTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.410256:16:42:16:39:23:4:12:10:13:99:23:4:12:10:13 chr4 88258483 . T C 632.74 PASS AF=0.923077;AO=40;DP=52;FAO=48;FDP=52;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0562455;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=99.0511;QD=48.6725;RBI=0.0562971;REFB=-0.0482255;REVB=0.00240799;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.530291;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.000676825;OID=.;OPOS=88258483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:52:52:0:4:40:48:0.923077:30:10:0:0:31:17:0:4 chr4 88308235 . G A 626.7 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022596;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.615;QD=61.1417;RBI=0.016052;REFB=0;REVB=0.0158922;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129206;OID=.;OPOS=88308235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr4 88333461 . C A 256.5 PASS AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=259.185;QD=44.6092;RBI=0.00702569;REFB=-0.0389094;REVB=0.00702569;RO=2;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321239;OID=.;OPOS=88333461;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:21:0:0:2:21:0:0:2 chr4 88415038 . A G 175.62 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0123076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.834;QD=13.774;RBI=0.0123149;REFB=-0.0148788;REVB=-0.000423884;RO=30;SAF=10;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10423;STB=0.548971;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0218571;OID=.;OPOS=88415038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:31:20:20:0.392157:10:10:18:12:10:10:18:13 chr4 88534065 . G A 173.67 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00321446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2357;QD=11.5781;RBI=0.0111402;REFB=-0.00212336;REVB=0.0106664;RO=37;SAF=6;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304759;STB=0.670805;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00426421;OID=.;OPOS=88534065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:37:38:22:22:0.366667:16:6:20:17:16:6:20:18 chr4 88534235 . A G 316.31 PASS AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0128667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.942;QD=31.6312;RBI=0.0141718;REFB=-0.00493256;REVB=-0.00594022;RO=13;SAF=11;SAR=16;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140329;STB=0.507687;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00241523;OID=.;OPOS=88534235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:16:11:5:8:16:11:5:8 chr4 88536362 . G A 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.114127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.075;QD=7.76287;RBI=0.135728;REFB=-0.0384138;REVB=-0.073464;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302036;STB=0.696919;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.101049;OID=.;OPOS=88536362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:5:1:5:8:5:1:5:8 chr4 88536520 . T C 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0381945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.461;QD=18.7669;RBI=0.104881;REFB=-0.096652;REVB=-0.0976788;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365022;STB=0.713603;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0189837;OID=.;OPOS=88536520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:2:4:0:3:2:4:0:3 chr4 88536692 . A G 31.48 PASS AF=0.714286;AO=4;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.01044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4776;QD=17.991;RBI=0.212863;REFB=-0.0145215;REVB=0.212607;RO=3;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725463;STB=0.614874;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0403804;OID=.;OPOS=88536692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:3:2:4:5:0.714286:3:1:1:2:4:1:1:1 chr4 88732531 . T C 50.01 PASS AF=0.380952;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0190511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8416;QD=9.526;RBI=0.0259459;REFB=-0.00738545;REVB=0.0176139;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115383;STB=0.52375;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0165937;OID=.;OPOS=88732531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:21:21:13:13:7:8:0.380952:4:3:7:6:4:4:7:6 chr4 88732692 . G A 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0226486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2814;QD=17.4008;RBI=0.0519503;REFB=-0.0177536;REVB=0.0467534;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123714;STB=0.541339;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0196435;OID=.;OPOS=88732692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:13:13:13:0.5:5:8:9:3:5:8:9:4 chr4 88732746 . A G 226.02 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0148662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.756;QD=20.5468;RBI=0.018574;REFB=-0.0383085;REVB=-0.0111351;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404908;STB=0.522801;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0393843;OID=.;OPOS=88732746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:10:12:11:11:10:12:11:11 chr4 88732918 . A T 218.53 PASS AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0305984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5631;QD=11.6551;RBI=0.0404291;REFB=-0.000255492;REVB=-0.0264245;RO=48;SAF=13;SAR=14;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665616;STB=0.538433;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.000885713;OID=.;OPOS=88732918;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:48:48:27:27:0.36:14:13:26:22:14:13:26:22 chr4 88761156 . T C 325.34 PASS AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0093034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.486;QD=22.4371;RBI=0.00999364;REFB=-0.0406193;REVB=0.0036496;RO=25;SAF=8;SAR=25;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151984;STB=0.584361;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0263722;OID=.;OPOS=88761156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:25:33:33:0.568966:25:8:10:15:25:8:10:15 chr4 88767942 . T A 1062.7 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.931;QD=59.8702;RBI=0.0262603;REFB=0;REVB=0.00753487;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.59666e-05;OID=.;OPOS=88767942;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:40:30:0:0:40:31:0:0 chr4 88813503 . T C 3496.62 PASS AF=1;AO=221;DP=221;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0091067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.561;QD=62.7197;RBI=0.0238422;REFB=0;REVB=0.0220344;RO=0;SAF=97;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52291e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60509e-05;OID=.;OPOS=88813503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:221:223:0:0:221:223:1:124:97:0:0:126:97:0:0 chr4 88902692 . T C 941.88 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137437;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.585;QD=58.8678;RBI=0.0502558;REFB=0;REVB=0.04834;RO=0;SAF=21;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273582;OID=.;OPOS=88902692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:42:21:0:0:43:21:0:0 chr4 88903853 . C T 1403.22 PASS AF=1;AO=88;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275782;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.89;QD=62.3656;RBI=0.0323362;REFB=0;REVB=0.0168842;RO=0;SAF=24;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39644e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236714;OID=.;OPOS=88903853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:88:90:1:64:24:0:0:64:26:0:0 chr4 88921446 . G C 1239.2 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7526;QD=60.4489;RBI=0.024438;REFB=0;REVB=0.0119348;RO=0;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194932;OID=.;OPOS=88921446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:82:82:0:0:81:82:1:33:48:0:0:33:49:0:0 chr4 88921512 . G A 1208.96 PASS AF=1;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.931;QD=61.2132;RBI=0.00993297;REFB=0;REVB=-0.00932816;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47411e-05;OID=.;OPOS=88921512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:77:79:1:33:44:0:0:35:44:0:0 chr4 89061114 . C T 348.94 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.013443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.16;QD=22.881;RBI=0.0136791;REFB=0.00163185;REVB=0.00253014;RO=26;SAF=19;SAR=16;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332827;STB=0.518334;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00106567;OID=.;OPOS=89061114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:16:19:13:13:16:19:13:13 chr4 89182518 . T C 715.46 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215462;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.289;QD=57.2369;RBI=0.0295597;REFB=0;REVB=0.0202371;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.63634e-05;OID=.;OPOS=89182518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0 chr4 89319296 . T C 228.42 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0503316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2996;QD=21.7545;RBI=0.0699897;REFB=0.0119262;REVB=0.0486343;RO=20;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242902;STB=0.63624;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0121565;OID=.;OPOS=89319296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:8:14:7:13:8:14:7:13 chr4 89415396 . T C 1125.06 PASS AF=0.939759;AO=77;DP=83;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00674748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6642;QD=54.2196;RBI=0.00972812;REFB=-0.0287581;REVB=-0.0070077;RO=6;SAF=39;SAR=38;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000886232;STB=0.506023;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0186787;OID=.;OPOS=89415396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:83:83:6:5:77:78:0.939759:38:39:3:3:39:39:3:2 chr4 89443162 . G A 374.34 PASS AF=0.464286;AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.0784071;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.582;QD=17.8258;RBI=0.0792909;REFB=-0.000775432;REVB=-0.0118052;RO=43;SAF=18;SAR=21;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153105;STB=0.582049;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00103426;OID=.;OPOS=89443162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:43:45:39:39:0.464286:21:18:13:30:21:18:14:31 chr4 89504991 . G A 117.4 PASS AF=0.230769;AO=18;DP=79;FAO=18;FDP=78;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00523099;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.093;QD=6.02028;RBI=0.0257664;REFB=-0.0112623;REVB=-0.0252298;RO=59;SAF=11;SAR=7;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169233;STB=0.610988;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0456568;OID=.;OPOS=89504991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:59:60:18:18:0.230769:7:11:28:31:7:11:28:32 chr4 89505014 . CA AT 76.5 PASS AF=0.19403;AO=13;DP=67;FAO=13;FDP=67;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00866913;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=276.989;QD=4.56735;RBI=0.0201233;REFB=-0.00172949;REVB=-0.0181602;RO=53;SAF=9;SAR=4;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297543;STB=0.685625;STBP=0.155;TYPE=mnp;VARB=0.00716309;OID=.;OPOS=89505014;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:67:67:53:54:13:13:0.19403:4:9:24:29:4:9:25:29 chr4 89577214 . A T 1343.71 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0283567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.417;QD=61.0776;RBI=0.0289142;REFB=0.0566144;REVB=0.00565066;RO=0;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-5.16855e-05;OID=.;OPOS=89577214;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:0:1:87:87:0.988636:54:33:0:0:54:33:0:1 chr4 89607905 . A G 377.74 PASS AF=0.45977;AO=39;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0136793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6874;QD=17.3675;RBI=0.0257728;REFB=0.00458409;REVB=-0.0218429;RO=47;SAF=16;SAR=23;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605436;STB=0.502391;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=-0.00250401;OID=.;OPOS=89607905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:39:40:0.45977:23:16:19:28:24:16:19:28 chr4 89617387 . A G 473.7 PASS AF=0.382979;AO=53;DP=141;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=0.032096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.237;QD=13.4382;RBI=0.0355057;REFB=-0.00188747;REVB=0.0151822;RO=87;SAF=32;SAR=21;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458429;STB=0.518632;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00219649;OID=.;OPOS=89617387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:87:87:53:54:0.382979:21:32:49:38:22:32:49:38 chr4 89618837 . T C 330.43 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.626;QD=50.8357;RBI=0.0187402;REFB=-0.0223085;REVB=-0.00114931;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319949;STB=0.517228;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0013728;OID=.;OPOS=89618837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:11:14:1:0:11:14:1:0 chr4 89619276 . A G 1448.69 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920981;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.744;QD=62.9865;RBI=0.0256831;REFB=0;REVB=0.023975;RO=0;SAF=21;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55184e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000958969;OID=.;OPOS=89619276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:92:0:0:91:92:1:70:21:0:0:70:22:0:0 chr4 89625427 . G C 482.69 PASS AF=0.541176;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.00602938;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.569;QD=22.715;RBI=0.0268908;REFB=-0.0182901;REVB=0.0262061;RO=38;SAF=19;SAR=27;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220532;STB=0.62627;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0157682;OID=.;OPOS=89625427;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:38:39:46:46:0.541176:27:19:26:12:27:19:27:12 chr4 89647798 . AAC AAA,AA,A 420.35 PASS AF=0,0,1;AO=14,5,21;DP=41;FAO=0,0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,19;FSAR=0,0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187107,-0.0143014,-0.0102761;FXX=0;HRUN=1,1,7;LEN=1,1,2;MLLD=281.285,290.295,297.858;QD=56.0469;RBI=0.0299177,0.0280596,0.0267679;REFB=0,0,0;REVB=0.0233449,0.0241415,0.0247168;RO=0;SAF=2,4,15;SAR=12,1,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0,-0.000555855;OID=.,.,.;OPOS=89647800,89647800,89647799;OREF=C,C,AC;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/3:0,0,1:14,5,21:41:0,0,30:30:0:0,0,19:0,0,11:0:0:4:0:2,4,15:12,1,6:0:0 chr4 89653257 . G A 584.24 PASS AF=0.465649;AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.00436502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5507;QD=17.8395;RBI=0.0355781;REFB=-0.0127563;REVB=-0.0353093;RO=68;SAF=27;SAR=34;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826724;STB=0.546033;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0157914;OID=.;OPOS=89653257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:68:70:61:61:0.465649:34:27:36:32:34:27:37:33 chr4 89668859 . C T 722.47 PASS AF=0.526316;AO=70;DP=134;FAO=70;FDP=133;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.0253107;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8397;QD=21.7283;RBI=0.0389039;REFB=-0.00247616;REVB=-0.0295446;RO=63;SAF=36;SAR=34;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00822625;STB=0.504515;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00131863;OID=.;OPOS=89668859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:63:63:70:70:0.526316:34:36:33:30:34:36:33:30 chr4 89670155 . C T 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00599145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.624;QD=61.3756;RBI=0.0103349;REFB=0;REVB=0.00842096;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42316e-06;OID=.;OPOS=89670155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0 chr4 90034686 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00059892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.349;QD=58.5878;RBI=0.0232706;REFB=0;REVB=0.0232629;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.19337e-05;OID=.;OPOS=90034686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0 chr4 90168415 . A T 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.209;QD=58.4197;RBI=0.030572;REFB=0;REVB=0.0246529;RO=0;SAF=41;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56991e-05;OID=.;OPOS=90168415;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:22:41:0:0:22:41:0:0 chr4 90168566 . C A 242.12 PASS AF=0.326087;AO=29;DP=91;FAO=30;FDP=92;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0247495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6012;QD=10.527;RBI=0.0473395;REFB=-0.0249789;REVB=-0.0403545;RO=62;SAF=13;SAR=16;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072789;STB=0.531973;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0480324;OID=.;OPOS=90168566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:62:62:29:30:0.326087:16:13:24:38:17:13:24:38 chr4 90168572 . C T 1356.64 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3523;QD=61.6653;RBI=0.0446507;REFB=0;REVB=0.0154962;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181379;OID=.;OPOS=90168572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:53:33:0:0:54:34:0:0 chr4 90169925 . A G 289.72 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0085386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.553;QD=18.9977;RBI=0.0101913;REFB=-0.0167568;REVB=0.00556364;RO=30;SAF=12;SAR=19;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10208;STB=0.556966;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0199914;OID=.;OPOS=90169925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:19:12:15:15:19:12:15:15 chr4 90170118 . A G 233.48 PASS AF=0.5;AO=20;DP=46;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.012725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.0849;QD=18.678;RBI=0.0193179;REFB=-0.0247854;REVB=0.0145346;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106824;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0701682;OID=.;OPOS=90170118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:50:25:25:20:25:0.5:9:11:11:14:14:11:11:14 chr4 90857479 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00552776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.596;QD=57.3856;RBI=0.015634;REFB=0;REVB=0.0146241;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50007e-05;OID=.;OPOS=90857479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0 chr4 90874352 . A G 579.2 PASS AF=0.513043;AO=59;DP=116;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0239678;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.162;QD=20.1459;RBI=0.0275768;REFB=-0.0211213;REVB=0.013639;RO=55;SAF=30;SAR=29;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472167;STB=0.530181;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0210383;OID=.;OPOS=90874352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:55:56:59:59:0.513043:29:30:25:30:29:30:25:31 chr4 90874879 . T C 632.05 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.819;QD=61.6634;RBI=0.0244597;REFB=0;REVB=-0.00919696;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92171e-05;OID=.;OPOS=90874879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr4 91230579 . G A 178.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00801182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.841;QD=14.8515;RBI=0.0125302;REFB=-0.0108918;REVB=-0.00963408;RO=29;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813853;STB=0.546997;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0195325;OID=.;OPOS=91230579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:9:10:13:16:9:10:13:16 chr4 91291407 . C T 504.0 PASS AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00900132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.106;QD=18.8413;RBI=0.0105238;REFB=-0.015546;REVB=0.00545221;RO=54;SAF=28;SAR=25;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109898;STB=0.560764;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0155183;OID=.;OPOS=91291407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:54:54:53:53:0.495327:25:28:22:32:25:28:22:32 chr4 91584992 . A G 650.1 PASS AF=0.457516;AO=70;DP=153;FAO=70;FDP=153;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.00742754;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.021;QD=16.9959;RBI=0.0115978;REFB=-0.000659358;REVB=-0.00890733;RO=83;SAF=32;SAR=38;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230854;STB=0.512817;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.000368958;OID=.;OPOS=91584992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:83:83:70:70:0.457516:38:32:36:47:38:32:36:47 chr4 91585003 . T C 809.59 PASS AF=0.516779;AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.0741056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.742;QD=21.7339;RBI=0.0798567;REFB=-0.0350757;REVB=0.0297566;RO=72;SAF=32;SAR=45;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259986;STB=0.514282;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0129027;OID=.;OPOS=91585003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:72:72:77:77:0.516779:45:32:32:40:45:32:32:40 chr4 91585060 . A T 512.94 PASS AF=0.521277;AO=48;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00811484;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.974;QD=21.827;RBI=0.0308787;REFB=-0.0318977;REVB=0.0297933;RO=46;SAF=20;SAR=28;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634964;STB=0.53757;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0266914;OID=.;OPOS=91585060;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:45:48:49:0.521277:28:20:16:30:29:20:15:30 chr4 91760255 . C T 612.25 PASS AF=0.473684;AO=63;DP=133;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=1.08776e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.608;QD=18.4135;RBI=0.00126358;REFB=-0.0163755;REVB=0.00126353;RO=70;SAF=30;SAR=33;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018142;STB=0.510054;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.016079;OID=.;OPOS=91760255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:70:70:63:63:0.473684:33:30:32:38:33:30:32:38 chr4 92240278 . A T 2467.61 PASS AF=1;AO=82;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=73;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.9351;QD=57.3864;RBI=0.233139;REFB=0;REVB=0.206067;RO=1;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137242;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218936;OID=.;OPOS=92240278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:172:172:1:0:82:172:1:34:48:0:1:99:73:0:0 chr4 92240802 . C T 1105.49 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00178288;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7989;QD=58.9593;RBI=0.0228232;REFB=-0.186433;REVB=-0.0227534;RO=1;SAF=35;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133249;STB=0.50704;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00199342;OID=.;OPOS=92240802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:39:35:1:0:39:35:1:0 chr4 92246344 . G A 2737.67 PASS AF=1;AO=175;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404685;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.14;QD=62.5753;RBI=0.0502032;REFB=0;REVB=0.0297097;RO=0;SAF=87;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.87513e-05;OID=.;OPOS=92246344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:175:0:0:175:175:1:88:87:0:0:88:87:0:0 chr4 95210874 . A C 341.13 PASS AF=0.401961;AO=38;DP=94;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0162986;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.5145;QD=13.3776;RBI=0.0389755;REFB=-0.0204383;REVB=-0.0354041;RO=56;SAF=22;SAR=16;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175792;STB=0.575332;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0409122;OID=.;OPOS=95210874;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:102:56:61:38:41:0.401961:16:22:23:33:19:22:25:36 chr4 95496882 . C T 193.91 PASS AF=0.44;AO=18;DP=48;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0140145;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.96;QD=15.5131;RBI=0.0195461;REFB=-0.0215807;REVB=0.013625;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191516;STB=0.565158;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0277972;OID=.;OPOS=95496882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:28:28:18:22:0.44:11:7:16:12:12:10:16:12 chr4 95503902 . T C 242.46 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0227064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3449;QD=14.9206;RBI=0.0239946;REFB=-0.0231347;REVB=-0.00775637;RO=37;SAF=11;SAR=17;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131544;STB=0.507457;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0287478;OID=.;OPOS=95503902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:17:11:15:22:17:11:15:22 chr4 95531417 . A G 1557.88 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.683;QD=62.9445;RBI=0.0342422;REFB=-0.00965278;REVB=0.0118426;RO=0;SAF=52;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75225e-05;OID=.;OPOS=95531417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:98:99:0:0:98:99:1:46:52:0:0:46:53:0:0 chr4 95539267 . G A 905.1 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382987;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.29;QD=58.3938;RBI=0.0409267;REFB=0;REVB=0.0144293;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227164;OID=.;OPOS=95539267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr4 95561459 . A G 234.85 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=0.00258048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.096;QD=18.7877;RBI=0.0209814;REFB=-0.0152212;REVB=0.0208221;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214701;STB=0.620342;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0191169;OID=.;OPOS=95561459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:10:13:21:6:10:13:21:6 chr4 95578588 . G A 2216.71 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00481249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.112;QD=63.3345;RBI=0.00855563;REFB=0;REVB=0.0070738;RO=0;SAF=69;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.29942e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27064e-05;OID=.;OPOS=95578588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:71:69:0:0:71:69:0:0 chr4 95587587 . T C 526.37 PASS AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0361573;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.3951;QD=21.4845;RBI=0.0421193;REFB=0.0311207;REVB=-0.0216029;RO=48;SAF=29;SAR=21;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158685;STB=0.508768;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.027313;OID=.;OPOS=95587587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:21:29:27:21:21:29:27:21 chr4 95588075 . G A 463.56 PASS AF=0.416;AO=52;DP=125;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=-0.0412567;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.737;QD=14.834;RBI=0.0514566;REFB=-0.0209071;REVB=-0.0307517;RO=71;SAF=26;SAR=26;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796928;STB=0.543983;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0299662;OID=.;OPOS=95588075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:71:73:52:52:0.416:26:26:30:41:26:26:31:42 chr4 96075965 . C T 606.05 PASS AF=0.456522;AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.00195334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.124;QD=17.5666;RBI=0.0210051;REFB=-0.00996572;REVB=0.0209141;RO=75;SAF=38;SAR=25;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00323698;STB=0.5018;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0119042;OID=.;OPOS=96075965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:75:75:63:63:0.456522:25:38:45:30:25:38:45:30 chr4 96106322 . A G 2141.25 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00542568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.395;QD=62.978;RBI=0.0109749;REFB=0;REVB=0.00953992;RO=0;SAF=55;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78419e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71261e-05;OID=.;OPOS=96106322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:80:55:0:0:80:56:0:0 chr4 96123981 . C T 439.23 PASS AF=0.530864;AO=42;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0346834;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.056;QD=21.6906;RBI=0.0451193;REFB=-0.0345959;REVB=-0.0288585;RO=38;SAF=20;SAR=22;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656031;STB=0.530106;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0210442;OID=.;OPOS=96123981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:42:43:0.530864:22:20:21:17:22:21:21:17 chr4 96127869 . T G 1164.86 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.646;QD=60.5122;RBI=0.0330019;REFB=0;REVB=0.016811;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103732;OID=.;OPOS=96127869;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:32:42:0:0:33:44:0:0 chr4 96256616 . A G 1527.63 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0495659;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8171;QD=58.755;RBI=0.0515541;REFB=-0.0764264;REVB=-0.0141789;RO=1;SAF=57;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825224;STB=0.504347;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00114429;OID=.;OPOS=96256616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:104:1:1:103:103:0.990385:46:57:1:0:46:57:1:0 chr4 96256673 . G A 1914.94 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.295;QD=61.7722;RBI=0.0404425;REFB=0;REVB=-0.0402399;RO=0;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.06699e-05;OID=.;OPOS=96256673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:124:0:0:123:124:1:63:60:0:0:64:60:0:0 chr4 97270063 . C A 252.19 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0144302;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.327;QD=24.0182;RBI=0.0192506;REFB=-0.0214545;REVB=-0.0127418;RO=15;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652201;STB=0.510195;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0156904;OID=.;OPOS=97270063;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:15:19:23:23:0.547619:8:15:11:4:8:15:12:7 chr4 97270159 . C G 53.4 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0103931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1146;QD=7.62912;RBI=0.0208938;REFB=-0.0297325;REVB=0.0181255;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569244;STB=0.535625;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.035907;OID=.;OPOS=97270159;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:4:4:11:9:4:4:11:9 chr4 99027137 . T C 152.77 PASS AF=0.354167;AO=16;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0386754;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.232;QD=12.731;RBI=0.039468;REFB=-0.0149693;REVB=0.00786978;RO=32;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354784;STB=0.547208;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0541032;OID=.;OPOS=99027137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:31:16:17:0.354167:7:9:17:15:7:10:16:15 chr4 99027184 . T C 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0200114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.138;QD=17.7318;RBI=0.0270412;REFB=-0.00910351;REVB=0.0181871;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145576;STB=0.582688;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00795127;OID=.;OPOS=99027184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:9:8:6:13:9:8:6:13 chr4 99027218 . T C 152.3 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0597676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8089;QD=21.0074;RBI=0.0755653;REFB=-0.0249131;REVB=-0.046238;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238848;STB=0.633334;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0233536;OID=.;OPOS=99027218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:9:7:2:11:9:7:2:11 chr4 99049593 . A G 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0123814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.33;QD=20.0175;RBI=0.0127764;REFB=0.00183979;REVB=0.00315217;RO=17;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723083;STB=0.540938;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00156442;OID=.;OPOS=99049593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:7:11:9:8:7:11:9:8 chr4 99218108 . G GA 200.75 PASS AF=0.426667;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00743838;FXX=0.0131562;HRUN=0;LEN=1;MLLD=188.486;QD=10.7068;RBI=0.0277493;REFB=-0.0171107;REVB=0.0267338;RO=43;SAF=23;SAR=9;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15767;STB=0.589685;STBP=0.231;TYPE=ins;VARB=0.0258132;OID=.;OPOS=99218109;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.426667:32:76:32:75:43:23:9:25:18:99:43:23:9:25:18 chr4 99802070 . A C 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00327078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.567;QD=8.8111;RBI=0.00366055;REFB=-0.0109773;REVB=0.00164368;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.561709;STB=0.847941;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0225615;OID=.;OPOS=99802070;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:8:3:5:1:8:3 chr4 99850126 . A G 331.89 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00124763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1303;QD=26.5509;RBI=0.0353007;REFB=0.0106836;REVB=-0.0352787;RO=21;SAF=15;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00499607;STB=0.502761;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.0262844;OID=.;OPOS=99850126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:14:15:11:10:14:15:11:10 chr4 99926965 . T C 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0100793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.622;QD=14.3343;RBI=0.0119102;REFB=-0.0250237;REVB=-0.00634496;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265087;STB=0.651894;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0220125;OID=.;OPOS=99926965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:1:9:6:3:1:9 chr4 99952710 . A G 804.34 PASS AF=0.596774;AO=74;DP=125;FAO=74;FDP=124;FR=.;FRO=50;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00234786;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.342;QD=25.9464;RBI=0.00955761;REFB=0.0021185;REVB=0.00926474;RO=49;SAF=37;SAR=37;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673705;STB=0.532249;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.00152673;OID=.;OPOS=99952710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:49:50:74:74:0.596774:37:37:29:20:37:37:29:21 chr4 100045574 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00965364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.104;QD=57.6807;RBI=0.00965695;REFB=0;REVB=0.000252956;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.39484e-05;OID=.;OPOS=100045574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr4 100045616 . C T 428.97 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.993;QD=57.1965;RBI=0.025857;REFB=0;REVB=-0.0170215;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000530798;OID=.;OPOS=100045616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr4 100045647 . A G 272.53 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.24;QD=51.9113;RBI=0.0768151;REFB=0;REVB=0.0406642;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000849865;OID=.;OPOS=100045647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr4 100048414 . T C 1249.3 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110017;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.485;QD=61.6937;RBI=0.0316442;REFB=0;REVB=0.0296701;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.53863e-05;OID=.;OPOS=100048414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:34:47:0:0:34:47:0:0 chr4 100052733 . C A 839.15 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000591135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.158;QD=55.0259;RBI=0.0330797;REFB=0;REVB=0.0330744;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191548;OID=.;OPOS=100052733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:61:0:0:56:61:1:22:34:0:0:27:34:0:0 chr4 100062819 . A G 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.051;QD=59.1432;RBI=0.0441814;REFB=0;REVB=0.0252686;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105432;OID=.;OPOS=100062819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0 chr4 100064247 . G T 1442.86 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0899117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.32;QD=62.7328;RBI=0.0965017;REFB=0;REVB=-0.0350495;RO=0;SAF=41;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00090041;OID=.;OPOS=100064247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:50:41:0:0:50:42:0:0 chr4 100064305 . C G 1560.76 PASS AF=1;AO=96;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00342876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.18;QD=63.0609;RBI=0.0165934;REFB=0;REVB=0.0162353;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000409045;OID=.;OPOS=100064305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:96:99:1:50:46:0:0:51:48:0:0 chr4 100140306 . A T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00474441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.997;QD=64.1534;RBI=0.0269819;REFB=0;REVB=0.0265615;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160933;OID=.;OPOS=100140306;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0 chr4 100235053 . A G 3048.18 PASS AF=0.990099;AO=200;DP=202;FAO=200;FDP=202;FR=.;FRO=2;FSAF=106;FSAR=94;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0162662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3392;QD=60.36;RBI=0.0420697;REFB=0.0832599;REVB=-0.0387978;RO=2;SAF=106;SAR=94;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00890098;STB=0.504672;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.000832567;OID=.;OPOS=100235053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:202:202:2:2:200:200:0.990099:94:106:2:0:94:106:2:0 chr4 100266133 . T C 2875.81 PASS AF=1;AO=180;DP=181;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461327;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.884;QD=62.1797;RBI=0.0551058;REFB=0;REVB=0.0301401;RO=0;SAF=84;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24249e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194548;OID=.;OPOS=100266133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:181:185:0:0:180:185:1:96:84:0:0:96:89:0:0 chr4 100268190 . A C 2569.25 PASS AF=1;AO=166;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0863316;FXX=0.00598767;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0858;QD=61.9097;RBI=0.087638;REFB=0;REVB=0.0150754;RO=0;SAF=83;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350474;OID=.;OPOS=100268190;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:167:166:0:0:166:166:1:83:83:0:0:83:83:0:0 chr4 100510859 . T C 882.89 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00358906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.274;QD=57.8947;RBI=0.0334031;REFB=0;REVB=0.0332098;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.98472e-05;OID=.;OPOS=100510859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:29:30:0:0:31:30:0:0 chr4 100516022 . C G 1575.14 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103827;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.643;QD=60.0053;RBI=0.0116511;REFB=0;REVB=-0.00528655;RO=0;SAF=42;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45918e-05;OID=.;OPOS=100516022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:105:0:0:105:105:1:63:42:0:0:63:42:0:0 chr4 100570681 . T A 973.45 PASS AF=0.957746;AO=68;DP=72;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0255276;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1931;QD=54.8425;RBI=0.0786769;REFB=-0.0188453;REVB=0.0744204;RO=3;SAF=34;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013296;STB=0.50704;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0118066;OID=.;OPOS=100570681;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:72:71:3:3:68:68:0.957746:34:34:2:1:34:34:2:1 chr4 100574195 . A G 1552.55 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270256;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2618;QD=64.0228;RBI=0.0782823;REFB=0;REVB=-0.0734693;RO=0;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209179;OID=.;OPOS=100574195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:40:57:0:0:40:57:0:0 chr4 100574821 . C G 524.12 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0341604;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=63.7029;QD=56.6612;RBI=0.0342091;REFB=-0.00872782;REVB=-0.00182567;RO=0;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508767;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.000592361;OID=.;OPOS=100574821;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:28:8:0:0:28:8:0:1 chr4 100575711 . C T 1952.26 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.915;QD=61.9764;RBI=0.01265;REFB=0;REVB=0.00838164;RO=0;SAF=55;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.58947e-05;OID=.;OPOS=100575711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:70:55:0:0:70:56:0:0 chr4 101401161 . TAAC T 548.96 PASS AF=0.437186;AO=87;DP=196;FAO=87;FDP=199;FR=.;FRO=112;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=58;FSRR=54;FWDB=-0.0107697;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=265.748;QD=11.0344;RBI=0.012351;REFB=-0.000232203;REVB=-0.00604657;RO=102;SAF=39;SAR=48;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506165;STB=0.539254;STBP=0.338;TYPE=del;VARB=0.000283245;OID=.;OPOS=101401162;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.437186:87:196:87:199:112:39:48:58:54:99:102:39:48:51:51 chr4 102171528 . C A 521.4 PASS AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00274714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.304;QD=20.8561;RBI=0.00283674;REFB=-0.0235665;REVB=0.000707355;RO=50;SAF=23;SAR=27;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548525;STB=0.530328;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0202474;OID=.;OPOS=102171528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:50:50:50:0.5:27:23:20:30:27:23:20:30 chr4 102251501 . T C 639.21 PASS AF=0.409091;AO=72;DP=176;FAO=72;FDP=176;FR=.;FRO=104;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=0.0211042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6239;QD=14.5275;RBI=0.0416765;REFB=-0.00919117;REVB=0.035938;RO=103;SAF=46;SAR=26;SRF=50;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165158;STB=0.590293;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.016704;OID=.;OPOS=102251501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:103:104:72:72:0.409091:26:46:50:53:26:46:51:53 chr4 102751076 . G A 509.4 PASS AF=0.45082;AO=54;DP=121;FAO=55;FDP=122;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.00144638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.536;QD=16.7017;RBI=0.0283298;REFB=-0.00387653;REVB=-0.0282928;RO=66;SAF=23;SAR=31;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132739;STB=0.581788;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00377834;OID=.;OPOS=102751076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:66:67:54:55:0.45082:31:23:37:29:32:23:38:29 chr4 102751276 . C T 2318.3 PASS AF=1;AO=151;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569621;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.491;QD=61.0078;RBI=0.0159953;REFB=0;REVB=0.0149467;RO=0;SAF=86;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77232e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7464e-06;OID=.;OPOS=102751276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:152:152:0:0:151:152:1:65:86:0:0:66:86:0:0 chr4 102816467 . C G 489.0 PASS AF=0.392857;AO=55;DP=140;FAO=55;FDP=140;FR=.;FRO=85;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=30;FWDB=-0.00217738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.736;QD=13.9716;RBI=0.0304922;REFB=-0.00847923;REVB=0.0304144;RO=85;SAF=33;SAR=22;SRF=55;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533807;STB=0.53011;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0157626;OID=.;OPOS=102816467;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:85:85:55:55:0.392857:22:33:55:30:22:33:55:30 chr4 102839287 . G A 432.59 PASS AF=0.448598;AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0517747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1922;QD=16.1714;RBI=0.0571918;REFB=-0.00913468;REVB=-0.0242957;RO=59;SAF=19;SAR=29;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456997;STB=0.525563;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0102438;OID=.;OPOS=102839287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:59:59:48:48:0.448598:29:19:26:33:29:19:26:33 chr4 102965043 . T C 930.84 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224506;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.699;QD=57.2824;RBI=0.0334572;REFB=-0.125128;REVB=0.0248065;RO=1;SAF=20;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106152;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000458414;OID=.;OPOS=102965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:66:65:1:0:64:65:1:44:20:0:1:45:20:0:0 chr4 103225513 . T C 1492.17 PASS AF=0.990196;AO=99;DP=100;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0331282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8053;QD=58.5165;RBI=0.0339762;REFB=-0.00697646;REVB=0.00754347;RO=1;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104245;STB=0.505375;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000206863;OID=.;OPOS=103225513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:102:1:1:99:101:0.990196:45:54:0:1:46:55:0:1 chr4 103228734 . C T 1095.64 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.535;QD=60.035;RBI=0.0314871;REFB=0;REVB=0.0177532;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020559;OID=.;OPOS=103228734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0 chr4 103514658 . T C 923.28 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115276;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.817;QD=58.621;RBI=0.0207658;REFB=0;REVB=0.0172723;RO=0;SAF=48;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58777e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42799e-05;OID=.;OPOS=103514658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:15:48:0:0:15:48:0:0 chr4 103538359 . GTTTTTTA GTTTTTA,GTTTTTAT 32.8 PASS AF=0.196429,0.0535714;AO=13,5;DP=58;FAO=11,3;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=5,3;FSAR=6,0;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0848133,-0.0928544;FXX=0.0175408;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=10.7795,84.2661;QD=2.34281;RBI=0.0945962,0.092967;REFB=-0.153485,-0.0141581;REVB=0.0418944,-0.00457426;RO=35;SAF=7,5;SAR=6,0;SRF=11;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0.392857,0;SSSB=0.264929,0.705518;STB=0.520796,0.996904;STBP=0.904,0.035;TYPE=del,mnp;VARB=0.0985569,0.20356;OID=.,.;OPOS=103538360,103538365;OREF=T,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=GTTTTTA,GTTTTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.196429,0.0535714:13,5:58:11,3:56:42:5,3:6,0:18:24:29:35:7,5:6,0:11:24 chr4 103555992 . A G 1249.98 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0466498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8966;QD=60.2398;RBI=0.0998801;REFB=0.0145563;REVB=-0.0883167;RO=1;SAF=39;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119881;STB=0.506328;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00124257;OID=.;OPOS=103555992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:43:39:1:0:43:39:1:0 chr4 103557077 . G A 747.06 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.265;QD=63.5794;RBI=0.0110111;REFB=0;REVB=0.0108241;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93838e-05;OID=.;OPOS=103557077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr4 103644047 . T C 357.07 PASS AF=0.5;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00799339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.054;QD=19.3011;RBI=0.0256546;REFB=-0.0276437;REVB=0.0243775;RO=35;SAF=29;SAR=8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176572;STB=0.605251;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0131353;OID=.;OPOS=103644047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:35:37:37:37:0.5:8:29:22:13:8:29:23:14 chr4 103866438 . C T 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0311553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.45;QD=19.156;RBI=0.0311631;REFB=-0.0159018;REVB=-0.000697307;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181521;STB=0.603074;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0190933;OID=.;OPOS=103866438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:7:14:11:12:7:14:11:12 chr4 103866480 . G A 645.81 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.623;QD=61.5055;RBI=0.0293411;REFB=0;REVB=0.0282204;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120938;OID=.;OPOS=103866480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:20:20:0:0:21:21:0:0 chr4 103911069 . C A 715.17 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0206981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.577;QD=60.8652;RBI=0.037605;REFB=0.0241596;REVB=-0.0313962;RO=1;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028473;STB=0.515145;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000592032;OID=.;OPOS=103911069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:16:30:0:1:16:30:0:1 chr4 104012903 . GAAAAAAAAA GAAAAAAAA,GAAAAAAAAG 409.7 PASS AF=0.933333,0.0666667;AO=42,4;DP=106;FAO=98,7;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40,2;FSAR=58,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.690818,0.0183905;FXX=0.00943307;HRUN=10,10;LEN=1,1;MLLD=5.13708,210.953;QD=15.6078;RBI=0.707872,0.0184411;REFB=0.138911,0.0268225;REVB=0.154446,-0.00136574;RO=34;SAF=12,0;SAR=30,4;SRF=18;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.216584,-0.601644;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0675451,-0.0133403;OID=.,.;OPOS=104012904,104012912;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAAAAAAAA,GAAAAAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.933333,0.0666667:42,4:106:98,7:105:0:40,2:58,5:0:0:23:34:12,0:30,4:18:16 chr4 104059542 . G A 542.3 PASS AF=0.412587;AO=59;DP=143;FAO=59;FDP=143;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=54;FWDB=0.010479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.982;QD=15.1692;RBI=0.0119774;REFB=-0.00280689;REVB=-0.00580067;RO=84;SAF=34;SAR=25;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226092;STB=0.62665;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00435732;OID=.;OPOS=104059542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:84:84:59:59:0.412587:25:34:30:54:25:34:30:54 chr4 104066461 . A G 192.97 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0200111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.656;QD=13.7836;RBI=0.0207161;REFB=0.00121403;REVB=0.00535866;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100107;STB=0.557226;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00233888;OID=.;OPOS=104066461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:12:11:19:14:12:11:19:14 chr4 104082349 . C T 481.68 PASS AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0110099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.791;QD=17.3577;RBI=0.0166772;REFB=-0.00879465;REVB=-0.0125264;RO=59;SAF=25;SAR=27;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010287;STB=0.505721;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00895426;OID=.;OPOS=104082349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:0.468468:27:25:29:30:27:25:29:30 chr4 104102563 . T C 336.64 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00369844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1327;QD=17.2637;RBI=0.00369851;REFB=0.00128931;REVB=-2.22408e-05;RO=40;SAF=20;SAR=16;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912282;STB=0.548079;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=-0.00165273;OID=.;OPOS=104102563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:42:36:36:0.461538:16:20:26:14:16:20:27:15 chr4 104117191 . A G 139.23 PASS AF=0.517241;AO=11;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.01951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.222;QD=19.2038;RBI=0.0693251;REFB=-0.0219503;REVB=0.0665231;RO=15;SAF=10;SAR=1;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561535;STB=0.585249;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.020923;OID=.;OPOS=104117191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:29:15:14:11:15:0.517241:1:10:7:8:5:10:7:7 chr4 104510893 . G A 494.87 PASS AF=0.410448;AO=55;DP=134;FAO=55;FDP=134;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=0.000811723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.186;QD=14.7723;RBI=0.0229636;REFB=-0.0152413;REVB=0.0229492;RO=79;SAF=29;SAR=26;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984825;STB=0.555292;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0171316;OID=.;OPOS=104510893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:79:79:55:55:0.410448:26:29:49:30:26:29:49:30 chr4 106155185 . C G 335.97 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0440923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4516;QD=19.7629;RBI=0.0874789;REFB=-0.017881;REVB=0.0755541;RO=33;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053852;STB=0.52989;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0272519;OID=.;OPOS=106155185;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:17:18:19:14:17:18:19:14 chr4 106159644 . T A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.085;QD=59.0187;RBI=0.0186476;REFB=0;REVB=0.000453359;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02395e-05;OID=.;OPOS=106159644;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr4 106317429 . C G 252.4 PASS AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00360674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.57;QD=21.4806;RBI=0.0129865;REFB=0.000347605;REVB=0.0124756;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395617;STB=0.533186;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.000455361;OID=.;OPOS=106317429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:13:10:9:14:13:11:9:14 chr4 106328200 . A G 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0166733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.797;QD=16.3859;RBI=0.0272572;REFB=-0.00198733;REVB=-0.0215628;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144653;STB=0.58423;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00155092;OID=.;OPOS=106328200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:3:5:4:5:3:5 chr4 106474096 . T C 803.45 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00820367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.72;QD=55.4104;RBI=0.0137524;REFB=-0.0131656;REVB=-0.0110375;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-4.84329e-05;OID=.;OPOS=106474096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:30:27:0:0:30:27:0:1 chr4 106861730 . A G 1880.58 PASS AF=0.992;AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.079321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.162;QD=60.1786;RBI=0.0793767;REFB=-0.0532419;REVB=-0.00297268;RO=1;SAF=48;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00629296;STB=0.503311;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000196274;OID=.;OPOS=106861730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:125:125:1:1:123:124:0.992:75:48:0:1:75:49:0:1 chr4 106924931 . G A 1607.05 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0088449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0609;QD=64.2821;RBI=0.00942471;REFB=0;REVB=0.00325467;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45719e-05;OID=.;OPOS=106924931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:52:48:0:0:52:48:0:0 chr4 107168431 . G C 1587.32 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00669405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1169;QD=64.134;RBI=0.0453192;REFB=0;REVB=0.044822;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212446;OID=.;OPOS=107168431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:63:36:0:0:63:36:0:0 chr4 107845794 . C T 584.44 PASS AF=0.427632;AO=65;DP=152;FAO=65;FDP=152;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=51;FWDB=-0.0451994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0489;QD=15.3799;RBI=0.0471388;REFB=-0.0164135;REVB=-0.013382;RO=87;SAF=30;SAR=35;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493873;STB=0.527599;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0171677;OID=.;OPOS=107845794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:87:87:65:65:0.427632:35:30:36:51:35:30:36:51 chr4 108356274 . G A 695.8 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0245674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6486;QD=60.5046;RBI=0.033318;REFB=0.0639505;REVB=-0.0225062;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191802;STB=0.5102;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00149923;OID=.;OPOS=108356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:24:21:0:1:24:21:0:1 chr4 108575989 . G A 653.11 PASS AF=0.452229;AO=71;DP=157;FAO=71;FDP=157;FR=.;FRO=86;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=-0.0553812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.632;QD=16.6398;RBI=0.0606737;REFB=-0.0345179;REVB=-0.0247835;RO=85;SAF=36;SAR=35;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798004;STB=0.540772;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0401915;OID=.;OPOS=108575989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:85:86:71:71:0.452229:35:36:50:35:35:36:50:36 chr4 108641300 . T C 1348.99 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0251415;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.684;QD=61.3179;RBI=0.0411658;REFB=0.0802537;REVB=-0.0325965;RO=1;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104125;STB=0.505493;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.000548477;OID=.;OPOS=108641300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:86:87:0.988636:45:41:0:1:45:42:0:1 chr4 108641317 . G A 305.68 PASS AF=0.43038;AO=33;DP=78;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0599742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.677;QD=15.4773;RBI=0.060026;REFB=-0.0257421;REVB=0.0024917;RO=44;SAF=17;SAR=16;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841367;STB=0.560795;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0436946;OID=.;OPOS=108641317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:44:45:33:34:0.43038:16:17:19:25:16:18:19:26 chr4 108931039 . T C 1205.53 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0497;QD=61.0395;RBI=0.121987;REFB=0;REVB=-0.0203401;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000653046;OID=.;OPOS=108931039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:44:34:0:0:44:35:0:0 chr4 108953492 . C T 591.36 PASS AF=0.430464;AO=65;DP=150;FAO=65;FDP=151;FR=.;FRO=86;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=-0.0137039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.681;QD=15.6652;RBI=0.0143955;REFB=-0.00445131;REVB=0.00440862;RO=85;SAF=35;SAR=30;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139753;STB=0.574445;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00624425;OID=.;OPOS=108953492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:85:86:65:65:0.430464:30:35:34:51:30:35:35:51 chr4 109461985 . A G 230.72 PASS AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0162918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.602;QD=14.4201;RBI=0.0167387;REFB=-0.0116351;REVB=-0.00384216;RO=37;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500632;STB=0.528434;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0121628;OID=.;OPOS=109461985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:37:37:27:27:0.421875:14:13:16:21:14:13:16:21 chr4 109478108 . C G 295.61 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0116552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5965;QD=20.3868;RBI=0.0333228;REFB=-0.0325688;REVB=-0.031218;RO=26;SAF=10;SAR=21;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909118;STB=0.543744;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0156132;OID=.;OPOS=109478108;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:27:31:31:0.534483:21:10:11:15:21:10:11:16 chr4 109541499 . C T 619.07 PASS AF=0.516393;AO=60;DP=121;FAO=63;FDP=122;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0825426;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1901;QD=20.2975;RBI=0.0830329;REFB=-0.00684741;REVB=0.00901032;RO=61;SAF=25;SAR=35;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695524;STB=0.514701;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0130259;OID=.;OPOS=109541499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:61:59:60:63:0.516393:35:25:30:31:35:28:28:31 chr4 109541603 . T A 63.43 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.000136395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.1;QD=8.74941;RBI=0.023322;REFB=-0.00964089;REVB=-0.0233216;RO=20;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364862;STB=0.715075;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0204916;OID=.;OPOS=109541603;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:5:4:3:17:5:4:3:17 chr4 109674116 . A G 1098.72 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00195686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.211;QD=60.2038;RBI=0.0198341;REFB=0;REVB=0.0197373;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83592e-05;OID=.;OPOS=109674116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0 chr4 109683509 . A G 132.41 PASS AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0276781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.317;QD=9.99284;RBI=0.0362131;REFB=-0.00840481;REVB=0.0233519;RO=36;SAF=5;SAR=12;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121796;STB=0.572775;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0173298;OID=.;OPOS=109683509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:12:5:14:22:12:5:14:22 chr4 109735133 . T C 1148.04 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.843;QD=60.4229;RBI=0.0530974;REFB=0;REVB=0.0461275;RO=1;SAF=25;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185474;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179031;OID=.;OPOS=109735133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:1:0:75:76:1:50:25:1:0:50:26:0:0 chr4 109769899 . C T 347.43 PASS AF=0.355372;AO=43;DP=121;FAO=43;FDP=121;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.0434046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8065;QD=11.4852;RBI=0.0474801;REFB=-0.00895015;REVB=0.0192459;RO=78;SAF=19;SAR=24;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00680238;STB=0.503898;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0174447;OID=.;OPOS=109769899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:78:78:43:43:0.355372:24:19:34:44:24:19:34:44 chr4 109969337 . G T 154.79 PASS AF=0.26506;AO=22;DP=83;FAO=22;FDP=83;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=44;FSRR=17;FWDB=0.00573498;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=216.825;QD=7.45983;RBI=0.00754635;REFB=-0.004606;REVB=0.00490484;RO=61;SAF=20;SAR=2;SRF=44;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392375;STB=0.747745;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0115243;OID=.;OPOS=109969337;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:61:61:22:22:0.26506:2:20:44:17:2:20:44:17 chr4 110581363 . T A 136.6 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00154905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8863;QD=18.2138;RBI=0.00893789;REFB=-0.0240382;REVB=0.00880263;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583331;STB=0.533289;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0254138;OID=.;OPOS=110581363;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:7:8:7:8:7:8 chr4 110602636 . G A 380.1 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.031916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0797;QD=19.2455;RBI=0.0338972;REFB=-0.00810538;REVB=0.0114188;RO=39;SAF=23;SAR=16;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183782;STB=0.60794;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0149086;OID=.;OPOS=110602636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:40:39:39:0.493671:16:23:15:24:16:23:15:25 chr4 110603784 . T C 417.46 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0258268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4553;QD=17.0393;RBI=0.0580604;REFB=0.00666491;REVB=0.0519999;RO=54;SAF=10;SAR=33;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284118;STB=0.666765;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00568249;OID=.;OPOS=110603784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:54:55:43:43:0.438776:33:10:26:28:33:10:27:28 chr4 110605744 . A T 471.78 PASS AF=0.46789;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.000465548;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.418;QD=17.3129;RBI=0.00451147;REFB=-0.010215;REVB=0.00448739;RO=59;SAF=23;SAR=28;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184391;STB=0.598466;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00908861;OID=.;OPOS=110605744;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:59:58:51:51:0.46789:28:23:38:21:28:23:37:21 chr4 110605781 . A G 326.06 PASS AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00693651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.406;QD=17.3897;RBI=0.00759318;REFB=-0.000297045;REVB=-0.00308888;RO=39;SAF=15;SAR=20;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198184;STB=0.616476;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000223786;OID=.;OPOS=110605781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:40:35:35:0.466667:20:15:25:14:20:15:26:14 chr4 110661937 . G A 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.983;QD=58.1412;RBI=0.0234385;REFB=0;REVB=0.00877983;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.71251e-05;OID=.;OPOS=110661937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chr4 110678925 . T C 743.61 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1716;QD=63.286;RBI=0.0910049;REFB=0;REVB=0.0114398;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832712;OID=.;OPOS=110678925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:23:21:0:0:23:24:0:0 chr4 110681505 . C T 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0179936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.268;QD=22.144;RBI=0.0197725;REFB=-0.0174081;REVB=0.00819663;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522387;STB=0.529377;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.011086;OID=.;OPOS=110681505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:7:6:9:8:7:6 chr4 110737389 . T C 693.14 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357219;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.341;QD=63.0128;RBI=0.0382238;REFB=0;REVB=-0.0136016;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.45598e-05;OID=.;OPOS=110737389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0 chr4 110757224 . G A 463.94 PASS AF=0.375887;AO=53;DP=142;FAO=53;FDP=141;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=34;FWDB=0.00407517;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.971;QD=13.1615;RBI=0.00876236;REFB=-0.00342074;REVB=-0.00775705;RO=82;SAF=23;SAR=30;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212534;STB=0.610747;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00516456;OID=.;OPOS=110757224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:82:88:53:53:0.375887:30:23:52:30:30:23:54:34 chr4 110757287 . G A 356.63 PASS AF=0.352;AO=44;DP=124;FAO=44;FDP=125;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=50;FSRR=31;FWDB=-0.00722652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.216;QD=11.4121;RBI=0.0143731;REFB=-0.00614899;REVB=-0.0124243;RO=80;SAF=23;SAR=21;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102016;STB=0.561717;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0155407;OID=.;OPOS=110757287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:80:81:44:44:0.352:21:23:49:31:21:23:50:31 chr4 110773067 . G A 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0150107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.212;QD=14.0974;RBI=0.0194457;REFB=-0.0326934;REVB=0.0123618;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223717;STB=0.630343;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0357223;OID=.;OPOS=110773067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:11:7:8:5:11:7 chr4 110790911 . A T 527.86 PASS AF=0.417266;AO=56;DP=137;FAO=58;FDP=139;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.000222428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.013;QD=15.1903;RBI=0.00853462;REFB=-0.0156647;REVB=-0.00853172;RO=81;SAF=36;SAR=20;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13567;STB=0.572287;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0288788;OID=.;OPOS=110790911;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:81:81:56:58:0.417266:20:36:42:39:21:37:42:39 chr4 110791222 . G A 99.97 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00441214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.98;QD=15.3795;RBI=0.0106023;REFB=-0.00412668;REVB=-0.00964058;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113119;STB=0.506568;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00472023;OID=.;OPOS=110791222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:7:5:6:8:7:5:6:8 chr4 110791361 . G A 222.85 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0308383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8319;QD=18.966;RBI=0.0309312;REFB=-0.0164264;REVB=-0.00239612;RO=25;SAF=15;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30419;STB=0.672357;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0121647;OID=.;OPOS=110791361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:7:15:9:16:7:15:9:16 chr4 110791413 . C T 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00838967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.336;QD=13.0146;RBI=0.0502139;REFB=-0.00316627;REVB=-0.0495081;RO=32;SAF=15;SAR=5;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431738;STB=0.74975;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00325584;OID=.;OPOS=110791413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:5:15:11:21:5:15:11:21 chr4 110791543 . C T 367.28 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00551775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.736;QD=16.5068;RBI=0.0155253;REFB=0.00489593;REVB=0.0145117;RO=49;SAF=22;SAR=17;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153831;STB=0.580567;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.00610794;OID=.;OPOS=110791543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:50:39:39:0.438202:17:22:20:29:17:22:21:29 chr4 110901198 . G A 626.05 PASS AF=0.447368;AO=68;DP=152;FAO=68;FDP=152;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=-0.00508821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.204;QD=16.475;RBI=0.00589723;REFB=-0.0153886;REVB=-0.00298118;RO=84;SAF=32;SAR=36;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899426;STB=0.549986;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0168276;OID=.;OPOS=110901198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:84:84:68:68:0.447368:36:32:32:52:36:32:32:52 chr4 110902111 . A T 590.0 PASS AF=0.480315;AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.02808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2136;QD=18.5826;RBI=0.0343645;REFB=-0.00849067;REVB=-0.0198099;RO=65;SAF=29;SAR=32;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00141336;STB=0.504913;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00623053;OID=.;OPOS=110902111;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:65:66:61:61:0.480315:32:29:31:34:32:29:32:34 chr4 110914427 . A T 1647.54 PASS AF=1;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300729;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1245;QD=60.4601;RBI=0.0325241;REFB=0;REVB=-0.0123871;RO=0;SAF=70;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84033e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85668e-05;OID=.;OPOS=110914427;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:109:0:0:109:109:1:39:70:0:0:39:70:0:0 chr4 110971030 . G T 445.9 PASS AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0067886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.171;QD=18.2001;RBI=0.0639744;REFB=-0.0255502;REVB=-0.0636132;RO=53;SAF=27;SAR=18;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143582;STB=0.580211;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0246189;OID=.;OPOS=110971030;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:18:27:24:29:18:27:24:29 chr4 111398208 . A G 231.04 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0421271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.901;QD=16.5027;RBI=0.0470243;REFB=-0.00430126;REVB=0.0208948;RO=30;SAF=10;SAR=16;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870705;STB=0.548925;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00536628;OID=.;OPOS=111398208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:16:10:9:21:16:10:9:21 chr4 111409705 . T C 509.51 PASS AF=0.477876;AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0135999;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.223;QD=18.0356;RBI=0.0170239;REFB=-0.0208997;REVB=-0.0102399;RO=59;SAF=27;SAR=27;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239155;STB=0.513269;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0233787;OID=.;OPOS=111409705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:59:59:54:54:0.477876:27:27:31:28:27:27:31:28 chr4 112252643 . G T 255.98 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00395951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1028;QD=51.1968;RBI=0.0973159;REFB=0;REVB=0.0972353;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00204475;OID=.;OPOS=112252643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:12:7:0:0:13:7:0:0 chr4 113178894 . ATTTGT A 519.67 PASS AF=1;AO=39;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201283;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=5;MLLD=282.606;QD=47.2426;RBI=0.0699277;REFB=0;REVB=0.0669681;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000125176;OID=.;OPOS=113178895;OREF=TTTGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:42:44:44:0:26:18:0:0:9:0:25:14:0:0 chr4 113198805 . G C 1047.65 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335437;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.24;QD=59.8655;RBI=0.0351984;REFB=0;REVB=-0.0106653;RO=0;SAF=20;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110733;OID=.;OPOS=113198805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:50:20:0:0:50:20:0:0 chr4 113199075 . A G 1190.31 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0018;QD=61.0418;RBI=0.0190866;REFB=0;REVB=0.00253934;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100701;OID=.;OPOS=113199075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:27:51:0:0:27:51:0:0 chr4 113344925 . C T 245.29 PASS AF=0.5;AO=23;DP=50;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0135772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.318;QD=18.1697;RBI=0.013604;REFB=-0.0205743;REVB=-0.000854056;RO=27;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266546;STB=0.537163;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0187572;OID=.;OPOS=113344925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:54:27:27:23:27:0.5:13:10:11:16:14:13:11:16 chr4 113352397 . G A 235.44 PASS AF=0.394366;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=0.00600336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.923;QD=13.2644;RBI=0.0226307;REFB=-0.00116561;REVB=0.0218199;RO=43;SAF=11;SAR=17;SRF=11;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159348;STB=0.590301;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00160079;OID=.;OPOS=113352397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:43:43:28:28:0.394366:17:11:11:32:17:11:11:32 chr4 113352628 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.545;QD=51.1846;RBI=0.0647599;REFB=0;REVB=0.0451735;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104109;OID=.;OPOS=113352628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr4 113352899 . G A 486.33 PASS AF=0.5;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0127728;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.162;QD=19.4533;RBI=0.015001;REFB=-0.0193453;REVB=-0.00786675;RO=48;SAF=17;SAR=33;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149233;STB=0.594182;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0241906;OID=.;OPOS=113352899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:48:50:50:50:0.5:33:17:24:24:33:17:26:24 chr4 113353285 . T C 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00100995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.387;QD=57.3853;RBI=0.0243867;REFB=0;REVB=-0.0243658;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.75876e-05;OID=.;OPOS=113353285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0 chr4 113353311 . G A 121.44 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0110868;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.36;QD=9.7149;RBI=0.0234638;REFB=-0.0228798;REVB=-0.0206793;RO=34;SAF=8;SAR=7;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134148;STB=0.56748;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0569915;OID=.;OPOS=113353311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:35:15:15:0.3:7:8:22:12:7:8:22:13 chr4 113353433 . A C 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00175757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8748;QD=14.0957;RBI=0.010918;REFB=0.0170475;REVB=0.0107756;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435331;STB=0.525501;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=-0.0583138;OID=.;OPOS=113353433;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:7:7:5:6:7:7 chr4 113353449 . A G 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0159517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.763;QD=21.0155;RBI=0.0298689;REFB=-0.0224044;REVB=0.0252526;RO=13;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132778;STB=0.575126;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0155586;OID=.;OPOS=113353449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:10:6:7:6:10:6:7:6 chr4 113359703 . A G 1231.37 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0170692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.043;QD=60.067;RBI=0.0339617;REFB=-0.0142463;REVB=0.0293605;RO=1;SAF=39;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119868;STB=0.506328;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000106322;OID=.;OPOS=113359703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:42:39:1:0:42:39:1:0 chr4 113362609 . G A 188.85 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00077979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.6206;QD=11.1088;RBI=0.0507739;REFB=-0.0224302;REVB=-0.0507679;RO=44;SAF=14;SAR=10;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936169;STB=0.55441;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.039871;OID=.;OPOS=113362609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:10:14:22:22:10:14:22:22 chr4 113362622 . C G 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5645;QD=59.3228;RBI=0.0162429;REFB=0;REVB=-6.17874e-06;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124385;OID=.;OPOS=113362622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0 chr4 113436044 . T G 60.77 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.678;QD=34.7231;RBI=0.0391747;REFB=0;REVB=0.0127202;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134306;OID=.;OPOS=113436044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:3:3:0:0:4:3:0:0 chr4 113538879 . A G 284.51 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00372858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.365;QD=17.7818;RBI=0.00612813;REFB=-0.0051461;REVB=0.0048633;RO=33;SAF=10;SAR=21;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424583;STB=0.523794;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00502357;OID=.;OPOS=113538879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:21:10:12:21:21:10:12:21 chr4 113539969 . T C 344.04 PASS AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0171869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.347;QD=31.2763;RBI=0.0174537;REFB=-0.00568095;REVB=-0.00304059;RO=15;SAF=16;SAR=13;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21631;STB=0.618159;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00403932;OID=.;OPOS=113539969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:13:16:3:12:13:16:3:12 chr4 113549989 . G A 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.014953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.986;QD=12.8607;RBI=0.0261099;REFB=-0.00421623;REVB=-0.021404;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639024;STB=0.538351;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00488809;OID=.;OPOS=113549989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:4:3:4:4:4:3:4:4 chr4 113565835 . G A 69.57 PASS AF=0.232558;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0139074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.304;QD=6.47199;RBI=0.0218372;REFB=-0.005531;REVB=0.0168359;RO=30;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849332;STB=0.529354;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00919162;OID=.;OPOS=113565835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:41:43:30:33:10:10:0.232558:6:4:10:20:6:4:12:21 chr4 113568544 . G A 97.01 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00852203;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.448;QD=21.5573;RBI=0.00998333;REFB=-0.00520546;REVB=0.00520018;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270925;STB=0.653205;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00657221;OID=.;OPOS=113568544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:19:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:1:6:5:6:1:6 chr4 114081490 . A G 145.83 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00928101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.32;QD=25.3616;RBI=0.00988565;REFB=-0.0106219;REVB=0.00340426;RO=8;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636683;STB=0.535666;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00348497;OID=.;OPOS=114081490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:6:9:4:4:6:9:4:4 chr4 114341210 . T C 106.34 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0255405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.528;QD=11.8153;RBI=0.0259284;REFB=0.00290112;REVB=-0.00446839;RO=23;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100301;STB=0.559713;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.00359508;OID=.;OPOS=114341210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:9:4:9:14:9:4:9:14 chr4 114341631 . T C 87.48 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0461923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.878;QD=13.4583;RBI=0.0483876;REFB=-0.00691281;REVB=-0.0144093;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141797;STB=0.583184;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00830705;OID=.;OPOS=114341631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:6:5:9:6:6:5:9:6 chr4 114822485 . G A 332.99 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.000846149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.816;QD=19.0278;RBI=0.012628;REFB=-0.00519379;REVB=-0.0125996;RO=35;SAF=16;SAR=19;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153002;STB=0.585041;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00658796;OID=.;OPOS=114822485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:19:16:22:13:19:16:22:13 chr4 114823316 . A C 285.57 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0225492;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.2007;QD=15.6474;RBI=0.040435;REFB=0.00877156;REVB=0.0335637;RO=41;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987453;STB=0.555711;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.0106565;OID=.;OPOS=114823316;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:18:14:22:19:18:14:22:19 chr4 115544714 . A G 1437.78 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0273786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.022;QD=61.8401;RBI=0.0273788;REFB=-0.141706;REVB=-0.000100995;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.505262;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000834084;OID=.;OPOS=115544714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:45:47:0:0:45:47:1:0 chr4 115589302 . A G 1641.94 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000605959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.974;QD=60.2548;RBI=0.00681708;REFB=0;REVB=0.00679009;RO=0;SAF=62;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80978e-05;OID=.;OPOS=115589302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:47:62:0:0:47:62:0:0 chr4 117220010 . G A 634.26 PASS AF=0.5;AO=64;DP=128;FAO=64;FDP=128;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0194031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.193;QD=19.8206;RBI=0.023992;REFB=-0.00815186;REVB=-0.0141115;RO=64;SAF=28;SAR=36;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286431;STB=0.515805;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.010114;OID=.;OPOS=117220010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:64:64:64:64:0.5:36:28:30:34:36:28:30:34 chr4 119161795 . G A 1498.71 PASS AF=0.971698;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0361893;FXX=0.00934492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.134;QD=56.5552;RBI=0.0366935;REFB=-0.113582;REVB=-0.00606207;RO=1;SAF=43;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109066;STB=0.516851;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000238798;OID=.;OPOS=119161795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:106:106:1:3:103:103:0.971698:60:43:1:0:60:43:3:0 chr4 119237357 . A C 570.01 PASS AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0457997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.778;QD=22.8004;RBI=0.046126;REFB=-0.0124467;REVB=0.00547705;RO=47;SAF=27;SAR=26;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715779;STB=0.539375;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0126053;OID=.;OPOS=119237357;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:47:47:53:53:0.53:26:27:20:27:26:27:20:27 chr4 119273712 . C G 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00618222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.252;QD=12.3961;RBI=0.00618222;REFB=-0.00569151;REVB=0;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714904;OID=.;OPOS=119273712;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:0:5:5:0:0:5:5:0 chr4 119736796 . A C 1835.66 PASS AF=0.98374;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0161782;FXX=0.0159987;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.818;QD=59.6963;RBI=0.0274536;REFB=-0.06179;REVB=0.0221802;RO=0;SAF=52;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507142;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00017137;OID=.;OPOS=119736796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:125:123:0:2:121:121:0.98374:69:52:0:0:69:52:0:2 chr4 119948046 . A C 130.66 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00967018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.656;QD=13.7531;RBI=0.0100426;REFB=-0.0173689;REVB=0.0027097;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101896;STB=0.559362;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0277985;OID=.;OPOS=119948046;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:7:8:10:13:7:8:10:13 chr4 119951646 . GA G,GG 983.0 PASS AF=0.0149254,0.985075;AO=8,59;DP=67;FAO=1,66;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=1,48;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579665,0.0760261;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=25.4389,47.7555;QD=58.6867;RBI=0.0784444,0.222328;REFB=0,0;REVB=0.0528528,0.208925;RO=0;SAF=1,48;SAR=7,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00880262,0.00254706;OID=.,.;OPOS=119951647,119951647;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0149254,0.985075:8,59:67:1,66:67:0:1,48:0,18:0:0:3:0:1,48:7,11:0:0 chr4 120158685 . T G 372.75 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.348;QD=55.2227;RBI=0.0227742;REFB=0;REVB=0.0185579;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25153e-05;OID=.;OPOS=120158685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:15:12:0:0 chr4 120194799 . G A 316.61 PASS AF=0.347826;AO=40;DP=115;FAO=40;FDP=115;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0148544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.575;QD=11.0126;RBI=0.0253793;REFB=-0.0146628;REVB=-0.0205781;RO=75;SAF=18;SAR=22;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493041;STB=0.52837;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0213989;OID=.;OPOS=120194799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:75:75:40:40:0.347826:22:18:37:38:22:18:37:38 chr4 120214030 . T G 351.22 PASS AF=0.474359;AO=35;DP=76;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0403834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5288;QD=18.0112;RBI=0.0405167;REFB=0.016053;REVB=-0.00328458;RO=41;SAF=12;SAR=23;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169439;STB=0.5721;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.0169831;OID=.;OPOS=120214030;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:41:41:35:37:0.474359:23:12:21:20:23:14:21:20 chr4 120215314 . A G 580.21 PASS AF=0.5;AO=58;DP=119;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.00587831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.615;QD=19.3402;RBI=0.0354873;REFB=-0.00070594;REVB=0.034997;RO=60;SAF=24;SAR=34;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155818;STB=0.591942;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00101747;OID=.;OPOS=120215314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:60:60:58:60:0.5:34:24:35:25:36:24:35:25 chr4 120239831 . A G 80.94 PASS AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0348013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.523;QD=7.89685;RBI=0.0348039;REFB=-0.00667173;REVB=0.000429297;RO=30;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143814;STB=0.508912;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0179229;OID=.;OPOS=120239831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:41:30:30:11:11:0.268293:5:6:16:14:5:6:16:14 chr4 120239878 . G A 75.18 PASS AF=0.211538;AO=12;DP=53;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00917189;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.389;QD=5.78271;RBI=0.0281173;REFB=-0.00728704;REVB=-0.0265793;RO=41;SAF=6;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148888;STB=0.545372;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0254577;OID=.;OPOS=120239878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:53:52:41:41:12:11:0.211538:6:6:21:20:6:5:21:20 chr4 120240238 . T C 215.97 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0148147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.636;QD=15.1557;RBI=0.0259059;REFB=-0.00851172;REVB=-0.0212519;RO=32;SAF=13;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506399;STB=0.528729;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0249203;OID=.;OPOS=120240238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:12:13:15:17:12:13:15:17 chr4 120241849 . A G 237.15 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0314442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.167;QD=19.7625;RBI=0.0331413;REFB=-0.0160497;REVB=0.0104695;RO=25;SAF=9;SAR=14;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296536;STB=0.666528;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.013917;OID=.;OPOS=120241849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:14:9:18:7:14:9:18:7 chr4 120241902 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00354073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.683;QD=58.7816;RBI=0.0123292;REFB=0;REVB=0.0118098;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5035e-05;OID=.;OPOS=120241902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0 chr4 120325630 . G A 180.06 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0297185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.018;QD=23.2339;RBI=0.0315422;REFB=0.00625257;REVB=-0.0105697;RO=13;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176746;STB=0.597607;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00482567;OID=.;OPOS=120325630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:14:4:1:12:14:4:1:12 chr4 120325654 . GCCCCTG GCCCTG,GCCCTGC 210.7 PASS AF=0.638889,0;AO=20,2;DP=37;FAO=23,0;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=6,0;FSAR=17,0;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0378989,0.0214546;FXX=0.0270197;HRUN=4,4;LEN=1,3;MLLD=17.7413,15.1751;QD=23.4109;RBI=0.12896,0.0338017;REFB=-0.00455245,0.00770195;REVB=0.123265,0.02612;RO=10;SAF=5,0;SAR=15,2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0411521,-0.487131;STB=0.552588,0.5;STBP=0.5,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0153157,0;OID=.,.;OPOS=120325655,120325658;OREF=C,CTG;OALT=-,TGC;OMAPALT=GCCCTG,GCCCTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.638889,0:20,2:37:23,0:36:13:6,0:17,0:2:11:80:10:5,0:15,2:2:8 chr4 120325732 . C A 308.35 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0283434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.327;QD=15.8126;RBI=0.0300439;REFB=-0.0162045;REVB=-0.00996438;RO=44;SAF=12;SAR=22;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644729;STB=0.536236;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0224404;OID=.;OPOS=120325732;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:22:12:13:31:22:12:13:31 chr4 120330155 . C T 77.17 PASS AF=0.19697;AO=13;DP=66;FAO=13;FDP=66;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0263103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6181;QD=4.67716;RBI=0.0910169;REFB=-0.00405011;REVB=-0.0871312;RO=52;SAF=9;SAR=4;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266348;STB=0.678967;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0246792;OID=.;OPOS=120330155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:66:66:52:53:13:13:0.19697:4:9:25:27:4:9:25:28 chr4 120330272 . C G 32.73 PASS AF=0.125;AO=5;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0348489;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0202;QD=2.72724;RBI=0.0821483;REFB=-0.00415719;REVB=-0.0743901;RO=43;SAF=3;SAR=2;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998155;STB=0.647389;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0255203;OID=.;OPOS=120330272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:48:48:43:42:5:6:0.125:2:3:22:21:2:4:21:21 chr4 120330539 . G A 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0311172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9539;QD=7.46503;RBI=0.0371816;REFB=-0.01297;REVB=0.0203517;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220682;STB=0.640604;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0334614;OID=.;OPOS=120330539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:8:9:5:2:8:9 chr4 120423729 . T C 204.44 PASS AF=0.28125;AO=27;DP=96;FAO=27;FDP=96;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.00326868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.644;QD=8.51842;RBI=0.0481669;REFB=-0.0112696;REVB=0.0480558;RO=64;SAF=14;SAR=13;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591136;STB=0.549617;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0243064;OID=.;OPOS=120423729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:64:69:27:27:0.28125:13:14:30:34:13:14:31:38 chr4 120474859 . A G 417.2 PASS AF=0.435185;AO=47;DP=108;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.0293524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.144;QD=15.4518;RBI=0.0293767;REFB=-0.00314819;REVB=0.00119682;RO=61;SAF=16;SAR=31;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224819;STB=0.512614;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00529877;OID=.;OPOS=120474859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:61:61:47:47:0.435185:31:16:22:39:31:16:22:39 chr4 120528327 . G A 967.97 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00654703;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.412;QD=56.1139;RBI=0.00848866;REFB=-0.106618;REVB=0.00540312;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133112;STB=0.513885;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.000501609;OID=.;OPOS=120528327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:1:2:67:67:0.971014:35:32:0:1:35:32:0:2 chr4 120868354 . C T 176.89 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00280083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.487;QD=13.3499;RBI=0.0180775;REFB=-0.00911659;REVB=0.0178593;RO=32;SAF=7;SAR=14;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829241;STB=0.547898;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0148281;OID=.;OPOS=120868354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:14:7:13:19:14:7:13:19 chr4 121742459 . T G 767.11 PASS AF=0.496855;AO=79;DP=160;FAO=79;FDP=159;FR=.;FRO=80;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=56;FSRR=24;FWDB=-0.00700881;FXX=0.00624961;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.083;QD=19.2983;RBI=0.0089425;REFB=-0.016312;REVB=0.00555381;RO=80;SAF=43;SAR=36;SRF=56;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145885;STB=0.580059;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0157456;OID=.;OPOS=121742459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:80:80:79:79:0.496855:36:43:56:24:36:43:56:24 chr4 121957051 . C T 2991.88 PASS AF=1;AO=189;DP=190;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.928;QD=62.9868;RBI=0.0183919;REFB=0;REVB=-0.00868284;RO=0;SAF=102;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00078e-06;OID=.;OPOS=121957051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:190:190:0:0:189:190:1:87:102:0:0:88:102:0:0 chr4 121957734 . T C 1672.22 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.75;QD=60.2601;RBI=0.0241201;REFB=0;REVB=0.0220317;RO=0;SAF=56;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02021e-05;OID=.;OPOS=121957734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:54:56:0:0:55:56:0:0 chr4 121958091 . T G 615.88 PASS AF=0.954545;AO=41;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0463402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.698;QD=55.9892;RBI=0.0624661;REFB=-0.17379;REVB=0.0418879;RO=3;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164038;OID=.;OPOS=121958091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:44:44:3:2:41:42:0.954545:20:21:1:2:21:21:1:1 chr4 121958187 . A G 885.41 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000718778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.557;QD=58.0593;RBI=0.000761891;REFB=0;REVB=0.000252659;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.08889e-06;OID=.;OPOS=121958187;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr4 121958697 . G A 715.01 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.452;QD=60.8517;RBI=0.0291031;REFB=0.0106454;REVB=-0.00465435;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200022;STB=0.510634;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=7.9176e-05;OID=.;OPOS=121958697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:23:23:0:1:23:23:0:1 chr4 121966807 . C T 970.03 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.849;QD=58.7895;RBI=0.017107;REFB=0;REVB=0.00252244;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61338e-05;OID=.;OPOS=121966807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:31:33:0:0:31:35:0:0 chr4 122068316 . T G 472.02 PASS AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0141287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.331;QD=18.3307;RBI=0.016094;REFB=-0.0184967;REVB=0.00770698;RO=52;SAF=15;SAR=35;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298599;STB=0.661905;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.01541;OID=.;OPOS=122068316;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:52:53:50:50:0.485437:35:15:32:20:35:15:32:21 chr4 122078299 . CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 52.11 PASS AF=0.181818;AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=44;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00980821;FXX=0.0638162;HRUN=1;LEN=18;MLLD=313.878;QD=4.73766;RBI=0.0242665;REFB=-0.00811517;REVB=-0.022196;RO=36;SAF=3;SAR=5;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407766;STB=0.744151;STBP=0.179;TYPE=del;VARB=0.0352041;OID=.;OPOS=122078300;OREF=TCTCTGCCTGTCGTCCTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.181818:8:48:8:44:36:3:5:25:11:52:36:3:5:26:10 chr4 122079827 . G C 399.05 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00367293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.778;QD=23.8241;RBI=0.0075896;REFB=-0.00427663;REVB=-0.00664166;RO=28;SAF=29;SAR=10;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156435;STB=0.58635;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0041144;OID=.;OPOS=122079827;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:10:29:16:12:10:29:16:12 chr4 122103875 . T C 846.82 PASS AF=0.541096;AO=79;DP=146;FAO=79;FDP=146;FR=.;FRO=67;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.00263095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1539;QD=23.2004;RBI=0.00469894;REFB=-0.0153946;REVB=-0.00389335;RO=67;SAF=44;SAR=35;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543564;STB=0.529743;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0129368;OID=.;OPOS=122103875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:67:67:79:79:0.541096:35:44:33:34:35:44:33:34 chr4 122137662 . T G 710.3 PASS AF=1;AO=40;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059212;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7285;QD=56.8242;RBI=0.0679034;REFB=0;REVB=-0.0332388;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335487;OID=.;OPOS=122137662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:50:0:0:40:50:1:21:19:0:0:23:27:0:0 chr4 122250272 . C G 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0149521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.867;QD=22.1441;RBI=0.0294646;REFB=-0.00717651;REVB=-0.0253889;RO=13;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148936;STB=0.583241;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00419772;OID=.;OPOS=122250272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:10:7:3:10:10:7:3:10 chr4 122250734 . A G 588.16 PASS AF=0.476562;AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.011653;FXX=0.00775134;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.6433;QD=18.3799;RBI=0.0520462;REFB=-0.0106023;REVB=0.0507249;RO=66;SAF=22;SAR=39;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925883;STB=0.556075;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0268395;OID=.;OPOS=122250734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:66:67:61:61:0.476562:39:22:30:36:39:22:31:36 chr4 122257950 . A G 205.1 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0134995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.732;QD=16.4079;RBI=0.035675;REFB=-0.0125671;REVB=0.0330222;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554376;STB=0.531761;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0156681;OID=.;OPOS=122257950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:9:12:15:14:9:12:15:14 chr4 122301622 . A C 137.05 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00550204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.264;QD=10.9642;RBI=0.0088262;REFB=-0.00400359;REVB=0.0069014;RO=33;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226466;STB=0.624844;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00583577;OID=.;OPOS=122301622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:34:16:16:0.32:6:10:14:19:6:10:15:19 chr4 122681518 . T C 920.73 PASS AF=0.489362;AO=92;DP=188;FAO=92;FDP=188;FR=.;FRO=96;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=41;FWDB=-0.0119007;FXX=0.00529073;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.594;QD=19.5901;RBI=0.0121329;REFB=-0.00852932;REVB=-0.00236237;RO=96;SAF=41;SAR=51;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117723;STB=0.564822;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00617239;OID=.;OPOS=122681518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:96:96:92:92:0.489362:51:41:55:41:51:41:55:41 chr4 122683007 . G A 2351.95 PASS AF=1;AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.272;QD=61.0896;RBI=0.0630653;REFB=0;REVB=-0.0597305;RO=0;SAF=69;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.12319e-05;OID=.;OPOS=122683007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:154:0:0:154:154:1:85:69:0:0:85:69:0:0 chr4 122687238 . A G 540.9 PASS AF=0.439394;AO=58;DP=132;FAO=58;FDP=132;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.00355065;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.977;QD=16.3908;RBI=0.00797616;REFB=-0.0169487;REVB=-0.00714227;RO=73;SAF=33;SAR=25;SRF=32;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130228;STB=0.568942;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0288005;OID=.;OPOS=122687238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:74:58:58:0.439394:25:33:32:41:25:33:33:41 chr4 122687491 . G C 699.6 PASS AF=0.6;AO=66;DP=110;FAO=66;FDP=110;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00112976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4308;QD=25.4398;RBI=0.0440525;REFB=-0.0218731;REVB=-0.044038;RO=41;SAF=30;SAR=36;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751634;STB=0.536413;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0147081;OID=.;OPOS=122687491;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:41:44:66:66:0.6:36:30:23:18:36:30:24:20 chr4 122742217 . T C 1213.17 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0770025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.464;QD=59.9095;RBI=0.0873955;REFB=-0.132528;REVB=0.0413352;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00151114;OID=.;OPOS=122742217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:37:43:0:0:37:43:0:1 chr4 122824052 . C T 613.47 PASS AF=0.477273;AO=63;DP=132;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00876678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.577;QD=18.5899;RBI=0.0119018;REFB=-0.00828663;REVB=0.00804962;RO=69;SAF=23;SAR=40;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551779;STB=0.530602;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00998894;OID=.;OPOS=122824052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:69:69:63:63:0.477273:40:23:29:40:40:23:29:40 chr4 123008808 . C T 902.92 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00103416;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.981;QD=57.3285;RBI=0.0178564;REFB=0;REVB=-0.0178264;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130167;OID=.;OPOS=123008808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:28:33:0:0:30:33:0:0 chr4 123145751 . T A 438.53 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.023588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.017;QD=19.2762;RBI=0.025885;REFB=-0.0231099;REVB=-0.0106602;RO=44;SAF=23;SAR=21;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205545;STB=0.515782;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0234121;OID=.;OPOS=123145751;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:44:47:44:44:0.483516:21:23:24:20:21:23:26:21 chr4 123192383 . T C 489.46 PASS AF=0.485981;AO=50;DP=105;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.00577465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.361;QD=18.2975;RBI=0.0151591;REFB=0.00245351;REVB=0.0140161;RO=55;SAF=28;SAR=22;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15004;STB=0.570788;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.00181246;OID=.;OPOS=123192383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:107:55:55:50:52:0.485981:22:28:22:33:24:28:22:33 chr4 123229132 . C T 469.88 PASS AF=0.436975;AO=52;DP=119;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.0191851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.643;QD=15.7944;RBI=0.0191997;REFB=-0.00753871;REVB=-0.000748859;RO=67;SAF=16;SAR=36;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106897;STB=0.560034;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00866194;OID=.;OPOS=123229132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:67:67:52:52:0.436975:36:16:27:40:36:16:27:40 chr4 123302210 . CA C,CC 152.76 PASS AF=0.545455,0;AO=40,5;DP=90;FAO=48,0;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=25,0;FSAR=23,0;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0459507,0.0748958;FXX=0.0222198;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=7.26078,26.2061;QD=6.94358;RBI=0.150406,0.0957146;REFB=-0.130111,-0.0536686;REVB=0.143214,0.0595979;RO=40;SAF=24,0;SAR=16,5;SRF=24;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.65355;STB=0.536141,0.5;STBP=0.491,1;TYPE=del,snp;VARB=0.150081,0.0247482;OID=.,.;OPOS=123302211,123302211;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.545455,0:40,5:90:48,0:88:40:25,0:23,0:24:16:99:40:24,0:16,5:24:16 chr4 123377482 . C A 231.49 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.030416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.253;QD=12.3462;RBI=0.0311534;REFB=-0.00335169;REVB=-0.00673794;RO=46;SAF=17;SAR=11;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266153;STB=0.52063;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00656914;OID=.;OPOS=123377482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:47:28:28:0.373333:11:17:29:17:11:17:30:17 chr4 123536963 . G A 1605.57 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.43;QD=60.0214;RBI=0.0703281;REFB=0;REVB=0.0220857;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27244e-05;OID=.;OPOS=123536963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:97:107:0:0:97:107:1:47:50:0:0:53:54:0:0 chr4 123664204 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.699;QD=48.7372;RBI=0.0388379;REFB=0;REVB=-0.0205257;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.70064e-05;OID=.;OPOS=123664204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr4 123664445 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00801242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.281;QD=59.8384;RBI=0.0148506;REFB=0;REVB=0.0125036;RO=0;SAF=6;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50008e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171524;OID=.;OPOS=123664445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:30:6:0:0:30:6:0:0 chr4 123665428 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.508;QD=44.6893;RBI=0.0277579;REFB=0;REVB=-0.0026779;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000490497;OID=.;OPOS=123665428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr4 123665991 . C G 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.771;QD=59.3221;RBI=0.0300275;REFB=0;REVB=-0.00714838;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8415e-05;OID=.;OPOS=123665991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0 chr4 123814308 . C T 606.8 PASS AF=0.555556;AO=55;DP=99;FAO=55;FDP=99;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0282174;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.57;QD=24.5172;RBI=0.0282413;REFB=0.00274778;REVB=0.0011616;RO=44;SAF=27;SAR=28;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994059;STB=0.554436;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.0023548;OID=.;OPOS=123814308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:44:44:55:55:0.555556:28:27:27:17:28:27:27:17 chr4 123838758 . A G 2056.87 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.409;QD=61.399;RBI=0.0397102;REFB=0;REVB=0.0378747;RO=0;SAF=69;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.83631e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.72236e-05;OID=.;OPOS=123838758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:134:0:0:131:134:1:62:69:0:0:62:72:0:0 chr4 123949556 . G A 546.71 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00346476;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.528;QD=57.5479;RBI=0.00470971;REFB=-0.125769;REVB=0.00319012;RO=1;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176755;STB=0.509429;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.000752936;OID=.;OPOS=123949556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:38:38:1:1:37:37:0.973684:26:11:0:1:26:11:0:1 chr4 124323738 . T C 167.47 PASS AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00879042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.644;QD=41.8679;RBI=0.0102949;REFB=0.0110119;REVB=0.00535843;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.53841;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-5.30597e-05;OID=.;OPOS=124323738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:0:1:15:15:0.9375:6:9:0:0:6:9:0:1 chr4 124324242 . CCTT C 718.35 PASS AF=1;AO=55;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00933283;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=342.985;QD=49.5412;RBI=0.0450471;REFB=0;REVB=0.0440697;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=4.94517e-05;OID=.;OPOS=124324243;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:55:58:58:58:0:31:27:0:0:13:0:30:25:0:0 chr4 126237971 . C T 120.81 PASS AF=0.394737;AO=14;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0573432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2811;QD=12.7169;RBI=0.125632;REFB=0.0145993;REVB=0.111782;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00669221;STB=0.519409;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0171262;OID=.;OPOS=126237971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:23:23:14:15:0.394737:8:6:10:13:8:7:10:13 chr4 126238924 . A T 487.4 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00279174;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.573;QD=20.5222;RBI=0.00354968;REFB=-0.0229454;REVB=0.00219235;RO=46;SAF=25;SAR=22;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144381;STB=0.589114;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0220701;OID=.;OPOS=126238924;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:95:46:48:47:47:0.494737:22:25:17:29:22:25:17:31 chr4 126239986 . C T 237.68 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0232244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.156;QD=18.6418;RBI=0.0258816;REFB=-0.016839;REVB=0.0114228;RO=26;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1317;STB=0.574165;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.023566;OID=.;OPOS=126239986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:9:16:13:13:9:16:13:13 chr4 126240510 . T C 453.91 PASS AF=0.523256;AO=44;DP=85;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.00855125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.138;QD=21.1121;RBI=0.0129958;REFB=-0.0162267;REVB=0.00978605;RO=41;SAF=18;SAR=26;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174663;STB=0.589044;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0163754;OID=.;OPOS=126240510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:41:41:44:45:0.523256:26:18:25:16:26:19:25:16 chr4 126241871 . C T 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00835232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.316;QD=11.8307;RBI=0.0084744;REFB=-0.0137766;REVB=0.00143324;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219335;STB=0.629404;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0153965;OID=.;OPOS=126241871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:12:6:6:5:12:6 chr4 126329789 . T C 2181.62 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405648;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.552;QD=63.2353;RBI=0.0335861;REFB=0;REVB=0.0333403;RO=0;SAF=71;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92792e-05;OID=.;OPOS=126329789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:138:138:0:0:138:138:1:67:71:0:0:67:71:0:0 chr4 126336703 . T C 517.47 PASS AF=0.440945;AO=54;DP=125;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.00162879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.894;QD=16.2981;RBI=0.00796915;REFB=-0.00446785;REVB=0.00780092;RO=70;SAF=23;SAR=31;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268687;STB=0.501307;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00576729;OID=.;OPOS=126336703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:70:71:54:56:0.440945:31:23:28:42:33:23:29:42 chr4 126369872 . G C 1549.26 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00936044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.283;QD=63.8872;RBI=0.0125826;REFB=0;REVB=0.00840853;RO=0;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50574e-05;OID=.;OPOS=126369872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:58:39:0:0:58:39:0:0 chr4 126372742 . G A 1047.98 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00569901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.05;QD=58.221;RBI=0.0108742;REFB=-0.16622;REVB=0.00926117;RO=1;SAF=45;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178383;STB=0.509431;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00521173;OID=.;OPOS=126372742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:26:45:0:1:26:45:0:1 chr4 126373789 . G A 1528.99 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.736;QD=63.7077;RBI=0.0176392;REFB=0;REVB=0.00623723;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15768e-05;OID=.;OPOS=126373789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:55:40:0:0:55:41:0:0 chr4 126389739 . TG CT,T 1517.82 PASS AF=0.0423729,0.949153;AO=5,35;DP=113;FAO=5,112;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=0,59;FSAR=5,53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0419814,0.881085;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=203.551,20.8597;QD=51.4515;RBI=0.0602112,0.909808;REFB=0.0520851,0.00599943;REVB=-0.0431619,0.226804;RO=69;SAF=0,0;SAR=5,35;SRF=58;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.734929,-0.877185;STB=0.5,0.504672;STBP=1,0.337;TYPE=mnp,del;VARB=0.122661,0.0323606;OID=.,.;OPOS=126389739,126389740;OREF=TG,G;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:113:118:69:1:5,35:5,112:0.0423729,0.949153:5,35:0,0:58:11:5,53:0,59:0:1 chr4 126398497 . G A 243.77 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0108833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7637;QD=15.2358;RBI=0.0326764;REFB=-0.00386614;REVB=-0.0308107;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226057;STB=0.511228;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00649962;OID=.;OPOS=126398497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:36:28:28:0.4375:15:13:15:19:15:13:16:20 chr4 126412575 . A G 754.4 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00700218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3237;QD=56.9359;RBI=0.00983776;REFB=0;REVB=0.00691021;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.08189e-06;OID=.;OPOS=126412575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0 chr4 128723042 . T C 469.71 PASS AF=0.40458;AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=0.0624672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2725;QD=14.3424;RBI=0.0699861;REFB=-0.0257516;REVB=0.0315578;RO=77;SAF=25;SAR=28;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229639;STB=0.509234;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0416359;OID=.;OPOS=128723042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:77:78:53:53:0.40458:28:25:38:39:28:25:38:40 chr4 128807219 . T A 240.49 PASS AF=0.511111;AO=22;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00731945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.167;QD=21.377;RBI=0.0150661;REFB=-0.00195713;REVB=0.0131687;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404908;STB=0.510629;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00192247;OID=.;OPOS=128807219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:22:23:0.511111:10:12:11:11:11:12:11:11 chr4 128814492 . G A 252.08 PASS AF=0.375;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0199635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.377;QD=12.6039;RBI=0.0315971;REFB=-0.027115;REVB=0.0244915;RO=49;SAF=7;SAR=23;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268992;STB=0.663344;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0462517;OID=.;OPOS=128814492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:49:50:30:30:0.375:23:7:22:27:23:7:23:27 chr4 128814964 . G T 195.39 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0112666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.674;QD=10.5616;RBI=0.011273;REFB=-0.00882452;REVB=0.000381081;RO=49;SAF=12;SAR=13;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342814;STB=0.519984;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.015887;OID=.;OPOS=128814964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:49:49:25:25:0.337838:13:12:25:24:13:12:25:24 chr4 128842761 . G A 335.21 PASS AF=0.38835;AO=39;DP=102;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.00709236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.836;QD=13.0177;RBI=0.00877059;REFB=-0.0229683;REVB=0.00515962;RO=63;SAF=17;SAR=22;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11249;STB=0.570213;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0302598;OID=.;OPOS=128842761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:63:63:39:40:0.38835:22:17:34:29:23:17:34:29 chr4 128949799 . C T 61.01 PASS AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0312579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0944;QD=6.59543;RBI=0.0523739;REFB=-0.0121053;REVB=-0.0420234;RO=28;SAF=4;SAR=5;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191522;STB=0.512168;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0336512;OID=.;OPOS=128949799;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:37:37:28:28:9:9:0.243243:5:4:12:16:5:4:12:16 chr4 128949850 . A G 53.4 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00309388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.842;QD=7.62904;RBI=0.0255609;REFB=0.0061221;REVB=0.025373;RO=20;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881715;STB=0.555414;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.00902893;OID=.;OPOS=128949850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:5:3:9:11:5:3:9:11 chr4 128949929 . C A 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00174901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.222;QD=17.9407;RBI=0.0104357;REFB=-0.00287482;REVB=-0.0102881;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248086;STB=0.514124;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00342131;OID=.;OPOS=128949929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:11:11:9:10:11:11 chr4 129030059 . ATGT A 83.48 PASS AF=0.625;AO=9;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0555987;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=228.915;QD=20.8691;RBI=0.0636669;REFB=0.00238823;REVB=0.0310202;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38587;STB=0.699599;STBP=0.068;TYPE=del;VARB=-0.00116581;OID=.;OPOS=129030060;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.625:9:16:10:16:6:3:7:5:1:35:5:2:7:4:1 chr4 129143534 . A G 275.73 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0825672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.424;QD=25.6495;RBI=0.085715;REFB=-0.00973832;REVB=0.0230157;RO=18;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150997;STB=0.508373;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00987882;OID=.;OPOS=129143534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:12:13:9:9:12:13:9:9 chr4 129191716 . TA T 161.02 PASS AF=0.4;AO=38;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=-0.0141129;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.9805;QD=7.15634;RBI=0.016844;REFB=-0.00434239;REVB=-0.00919504;RO=50;SAF=18;SAR=20;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178533;STB=0.58433;STBP=0.227;TYPE=del;VARB=0.0123477;OID=.;OPOS=129191717;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:38:90:36:90:54:17:19:18:36:99:50:18:20:15:35 chr4 129208649 . C T 366.97 PASS AF=0.396396;AO=41;DP=108;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=-0.0012307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.358;QD=13.2241;RBI=0.00901265;REFB=-0.00847154;REVB=0.00892823;RO=66;SAF=14;SAR=27;SRF=22;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00983379;STB=0.501592;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0136012;OID=.;OPOS=129208649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:66:67:41:44:0.396396:27:14:22:44:29:15:23:44 chr4 129677184 . C A 268.75 PASS AF=0.430556;AO=30;DP=70;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0200902;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.111;QD=14.9303;RBI=0.0232437;REFB=-0.0254702;REVB=0.0116899;RO=39;SAF=19;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174741;STB=0.599575;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0379274;OID=.;OPOS=129677184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:39:41:30:31:0.430556:11:19:18:21:12:19:18:23 chr4 129677239 . T C 946.03 PASS AF=1;AO=49;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.63;QD=59.1272;RBI=0.11082;REFB=0;REVB=0.0203601;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472743;OID=.;OPOS=129677239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:49:64:1:34:15:0:0:34:30:0:0 chr4 129864275 . C T 225.04 PASS AF=0.391304;AO=26;DP=68;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0165807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.134;QD=13.0459;RBI=0.0191252;REFB=-0.0284275;REVB=-0.00953158;RO=42;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051181;STB=0.540163;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0445895;OID=.;OPOS=129864275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:42:42:26:27:0.391304:13:13:19:23:13:14:19:23 chr4 129867280 . T A 558.17 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00216671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.407;QD=23.0171;RBI=0.00743119;REFB=-0.0165887;REVB=0.0071083;RO=45;SAF=19;SAR=33;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702761;STB=0.538704;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0165347;OID=.;OPOS=129867280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:33:19:20:25:33:19:20:25 chr4 129913345 . G A 168.53 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0456199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3176;QD=8.75503;RBI=0.0525347;REFB=-0.0217594;REVB=-0.0260523;RO=52;SAF=12;SAR=11;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704606;STB=0.554007;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0498199;OID=.;OPOS=129913345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:52:54:23:23:0.298701:11:12:24:28:11:12:24:30 chr4 129924977 . C A 339.14 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0356516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.414;QD=17.8494;RBI=0.0519002;REFB=-0.0103763;REVB=-0.0377173;RO=40;SAF=13;SAR=23;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111876;STB=0.562656;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0100417;OID=.;OPOS=129924977;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:23:13:19:21:23:13:19:21 chr4 130030644 . C T 708.23 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.126;QD=62.9535;RBI=0.0331097;REFB=0;REVB=0.00610974;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.72609e-05;OID=.;OPOS=130030644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0 chr4 130030652 . A G 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.188;QD=63.2862;RBI=0.0683246;REFB=0;REVB=0.0392132;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291166;OID=.;OPOS=130030652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0 chr4 130032843 . A G 789.23 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113002;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.384;QD=64.4266;RBI=0.0553361;REFB=0;REVB=0.05417;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175673;OID=.;OPOS=130032843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0 chr4 132641498 . T A 1528.55 PASS AF=0.901639;AO=108;DP=120;FAO=110;FDP=122;FR=.;FRO=12;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00344641;FXX=0.0317435;HRUN=7;LEN=1;MLLD=199.871;QD=50.1163;RBI=0.0443181;REFB=-0.112096;REVB=0.0441839;RO=12;SAF=52;SAR=56;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192644;STB=0.509989;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000684762;OID=.;OPOS=132641498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:120:122:12:12:108:110:0.901639:56:52:7:5:57:53:7:5 chr4 133367588 . T C 1714.78 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00335897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.087;QD=59.6446;RBI=0.0619117;REFB=-0.135329;REVB=0.0618205;RO=0;SAF=47;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3323e-08;STB=0.503703;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00100672;OID=.;OPOS=133367588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:115:0:1:114:114:0.991304:67:47:0:0:67:47:0:1 chr4 134084291 . T C 653.92 PASS AF=0.485294;AO=66;DP=136;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0139651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.435;QD=19.2329;RBI=0.0143226;REFB=0.00283056;REVB=-0.00318009;RO=70;SAF=32;SAR=34;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106997;STB=0.559093;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00231914;OID=.;OPOS=134084291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:70:70:66:66:0.485294:34:32:42:28:34:32:42:28 chr4 134710268 . G A 394.28 PASS AF=0.450549;AO=40;DP=90;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0161105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.408;QD=17.3309;RBI=0.0186474;REFB=-0.0109921;REVB=-0.00939026;RO=48;SAF=10;SAR=30;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212621;STB=0.61557;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00623003;OID=.;OPOS=134710268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:48:50:40:41:0.450549:30:10:21:27:31:10:21:29 chr4 135121066 . T G 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00608398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.846;QD=59.5018;RBI=0.0118672;REFB=0;REVB=-0.010189;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.39628e-06;OID=.;OPOS=135121066;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:27:42:0:0:27:42:0:0 chr4 135121368 . G T 708.34 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.781;QD=62.9631;RBI=0.025781;REFB=0;REVB=0.0185666;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78334e-06;OID=.;OPOS=135121368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0 chr4 135121601 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.809;QD=55.0987;RBI=0.0381392;REFB=0;REVB=0.00271996;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235684;OID=.;OPOS=135121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr4 138449683 . A G 434.91 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0221033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.44;QD=20.9595;RBI=0.0246823;REFB=-0.0188764;REVB=0.0109847;RO=40;SAF=28;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137897;STB=0.576434;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0144214;OID=.;OPOS=138449683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:15:28:20:20:15:28:20:20 chr4 138453453 . G A 815.74 PASS AF=0.50303;AO=83;DP=165;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=56;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.000194833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.675;QD=19.7756;RBI=0.00937271;REFB=-0.0141961;REVB=0.00937069;RO=82;SAF=56;SAR=27;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189366;STB=0.604446;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0109479;OID=.;OPOS=138453453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:82:82:83:83:0.50303:27:56:39:43:27:56:39:43 chr4 139086246 . A G 250.03 PASS AF=0.414286;AO=28;DP=68;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00271471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.98;QD=14.2875;RBI=0.0056878;REFB=-0.00255301;REVB=0.00499814;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743494;STB=0.523274;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00392317;OID=.;OPOS=139086246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:40:41:28:29:0.414286:12:16:20:20:13:16:21:20 chr4 139100372 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.056;QD=57.8849;RBI=0.0204968;REFB=0;REVB=0.00912535;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.99889e-05;OID=.;OPOS=139100372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr4 139135799 . T C 2323.31 PASS AF=0.630435;AO=202;DP=328;FAO=203;FDP=322;FR=.;FRO=119;FSAF=94;FSAR=109;FSRF=45;FSRR=74;FWDB=0.0301143;FXX=0.0212759;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.599;QD=28.861;RBI=0.0302088;REFB=0.00269296;REVB=0.00238829;RO=111;SAF=93;SAR=109;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547652;STB=0.531694;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.000865662;OID=.;OPOS=139135799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:322:111:119:202:203:0.630435:109:93:42:69:109:94:45:74 chr4 139140494 . G C 499.58 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00209287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.383;QD=16.9348;RBI=0.00657221;REFB=-0.00264108;REVB=0.00623008;RO=64;SAF=27;SAR=27;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608656;STB=0.533886;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00229979;OID=.;OPOS=139140494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:64:64:54:54:0.457627:27:27:36:28:27:27:36:28 chr4 140005294 . A G 1120.27 PASS AF=0.986842;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0426376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4207;QD=58.9618;RBI=0.0782764;REFB=-0.108377;REVB=-0.0656447;RO=1;SAF=45;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010398;STB=0.505493;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00369858;OID=.;OPOS=140005294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:76:1:1:74:75:0.986842:29:45:1:0:30:45:1:0 chr4 140396931 . C A 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.112358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4412;QD=17.2294;RBI=0.115807;REFB=-0.049304;REVB=0.0280537;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260084;STB=0.655787;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0318165;OID=.;OPOS=140396931;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:7:1:2:4:7:1:2:4 chr4 140417671 . G C 868.21 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.994;QD=57.8809;RBI=0.0224189;REFB=0;REVB=-0.00386514;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0318e-05;OID=.;OPOS=140417671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:32:27:0:0:33:27:0:0 chr4 140606425 . G A 267.14 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0263254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8394;QD=21.8073;RBI=0.0324737;REFB=-0.0107414;REVB=0.0190135;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901406;STB=0.550448;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0143417;OID=.;OPOS=140606425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:12:13:10:14:12:13:10:14 chr4 140606447 . G T 300.19 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0097847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.093;QD=24.5056;RBI=0.0268316;REFB=-0.0209866;REVB=0.0249839;RO=22;SAF=15;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118036;STB=0.565562;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0184512;OID=.;OPOS=140606447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:12:15:9:13:12:15:9:13 chr4 140651584 . TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC 61.44 PASS AF=0,1;AO=3,2;DP=6;FAO=0,7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658482,0.066983;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,3;MLLD=218.062,238.631;QD=35.1083;RBI=0.0693662,0.069835;REFB=0,0;REVB=-0.0218102,-0.0197536;RO=0;SAF=3,2;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000389988;OID=.,.;OPOS=140651609,140651585;OREF=CTGC,CTG;OALT=-,-;OMAPALT=TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:3,2:6:0,7:7:0:0,6:0,1:0:0:4:0:3,2:0,0:0:0 chr4 141295264 . G A 317.21 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0276379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.469;QD=25.8948;RBI=0.0306446;REFB=-0.0343764;REVB=-0.0132378;RO=21;SAF=18;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13414;STB=0.574414;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0195876;OID=.;OPOS=141295264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:10:18:10:11:10:18:10:11 chr4 141499166 . G A 357.34 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.00702557;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.588;QD=19.0579;RBI=0.0290503;REFB=-0.0129482;REVB=0.028188;RO=38;SAF=5;SAR=32;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268825;STB=0.652182;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0103969;OID=.;OPOS=141499166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:32:5:12:26:32:5:12:26 chr4 141543997 . G A 994.73 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019972;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.983;QD=59.387;RBI=0.0290232;REFB=0;REVB=0.0210587;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392054;OID=.;OPOS=141543997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:41:25:0:0:41:26:0:0 chr4 141598126 . C T 387.27 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0176961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.774;QD=23.8319;RBI=0.0302435;REFB=-0.0245492;REVB=0.0245259;RO=27;SAF=20;SAR=18;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089713;STB=0.549247;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00884036;OID=.;OPOS=141598126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:18:20:11:16:18:20:11:16 chr4 141600320 . A G 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0140584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8447;QD=7.76196;RBI=0.0230346;REFB=-0.0156982;REVB=-0.0182471;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383322;STB=0.726748;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0365874;OID=.;OPOS=141600320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:4:2:1:12:4:2:1:12 chr4 142640637 . A G 536.5 PASS AF=0.426471;AO=54;DP=129;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.00513971;FXX=0.00729874;HRUN=8;LEN=1;MLLD=239.465;QD=15.7794;RBI=0.0123811;REFB=-0.00600206;REVB=-0.0112639;RO=47;SAF=14;SAR=40;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106029;STB=0.63153;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00807312;OID=.;OPOS=142640637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:136:47:78:54:58:0.426471:40:14:17:30:44:14:34:44 chr4 142654084 . C A 271.72 PASS AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00543704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.268;QD=12.351;RBI=0.00977063;REFB=0.00297679;REVB=-0.00811811;RO=54;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336457;STB=0.51738;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00604189;OID=.;OPOS=142654084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:56:32:32:0.363636:18:14:22:32:18:14:23:33 chr4 143067053 . C T 576.49 PASS AF=0.442029;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.0450136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.519;QD=16.7099;RBI=0.045874;REFB=-0.0119948;REVB=-0.00884325;RO=77;SAF=25;SAR=36;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199147;STB=0.610997;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0135714;OID=.;OPOS=143067053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:77:77:61:61:0.442029:36:25:47:30:36:25:47:30 chr4 143235865 . C G 701.47 PASS AF=0.472973;AO=70;DP=149;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.00786163;FXX=0.00671096;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.29;QD=18.9587;RBI=0.0141995;REFB=0.00353648;REVB=-0.0118246;RO=78;SAF=38;SAR=32;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287085;STB=0.515899;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.00380122;OID=.;OPOS=143235865;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:78:78:70:70:0.472973:32:38:40:38:32:38:40:38 chr4 143268702 . A G 1257.87 PASS AF=0.519149;AO=122;DP=235;FAO=122;FDP=235;FR=.;FRO=113;FSAF=73;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=70;FWDB=0.0352573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.701;QD=21.4105;RBI=0.0365793;REFB=-0.0123782;REVB=-0.00974529;RO=111;SAF=73;SAR=49;SRF=41;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19876;STB=0.604464;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0135897;OID=.;OPOS=143268702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:111:113:122:122:0.519149:49:73:41:70:49:73:43:70 chr4 144135718 . G A 715.5 PASS AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0372289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2672;QD=51.1071;RBI=0.0411368;REFB=-0.0429369;REVB=0.0174999;RO=3;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216946;STB=0.511529;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0102081;OID=.;OPOS=144135718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:56:56:3:3:53:53:0.946429:24:29:1:2:24:29:1:2 chr4 144442611 . T C 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0157162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.249;QD=7.46417;RBI=0.0192651;REFB=-0.0107187;REVB=0.011142;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112877;STB=0.571225;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0115422;OID=.;OPOS=144442611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:3:4:8:9:3:4:8:9 chr4 144442735 . C T 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00312234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2954;QD=15.16;RBI=0.0075024;REFB=-0.0134932;REVB=-0.0068218;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177198;OID=.;OPOS=144442735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:8:8:11:11:8:8:11:11 chr4 144467104 . T C 994.35 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.674;QD=58.4913;RBI=0.021212;REFB=0;REVB=0.0138333;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126048;OID=.;OPOS=144467104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:68:0:0:64:68:1:33:31:0:0:34:34:0:0 chr4 144617842 . G T 641.18 PASS AF=0.629213;AO=56;DP=89;FAO=56;FDP=89;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0168943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.185;QD=28.8169;RBI=0.018017;REFB=-0.0195427;REVB=-0.00626078;RO=33;SAF=17;SAR=39;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137259;STB=0.574782;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00901362;OID=.;OPOS=144617842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:33:33:56:56:0.629213:39:17:16:17:39:17:16:17 chr4 144618610 . G C 1575.16 PASS AF=0.981651;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00976732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.775;QD=57.804;RBI=0.0158447;REFB=0.00254484;REVB=-0.0124761;RO=1;SAF=58;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811295;STB=0.500953;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-4.79287e-05;OID=.;OPOS=144618610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:107:109:1:2:106:107:0.981651:48:58:1:0:48:59:1:1 chr4 144620758 . C T 125.73 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0304972;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.772;QD=18.6268;RBI=0.0926092;REFB=0.0191376;REVB=-0.0874436;RO=11;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731378;STB=0.526279;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00905141;OID=.;OPOS=144620758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:11:13:14:14:0.518519:5:9:8:3:5:9:9:4 chr4 144621779 . A G 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0710907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.598;QD=23.2187;RBI=0.0938082;REFB=-0.103115;REVB=0.0612052;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0230655;OID=.;OPOS=144621779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0 chr4 144801662 . C G 745.72 PASS AF=0.541353;AO=72;DP=168;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.00302148;FXX=0.208321;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.678;QD=22.4278;RBI=0.0370501;REFB=-0.00981753;REVB=-0.0369267;RO=61;SAF=33;SAR=39;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013267;STB=0.507263;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00913152;OID=.;OPOS=144801662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:133:61:61:72:72:0.541353:39:33:27:34:39:33:27:34 chr4 144920596 . G A 292.09 PASS AF=0.563636;AO=20;DP=54;FAO=31;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00797023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.43;QD=21.243;RBI=0.0112492;REFB=-0.00294806;REVB=-0.00793848;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683342;STB=0.571718;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00235141;OID=.;OPOS=144920596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:24:24:20:31:0.563636:7:13:14:10:18:13:14:10 chr4 145041686 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1285;QD=33.4269;RBI=0.0683013;REFB=0;REVB=-0.0573219;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00209959;OID=.;OPOS=145041686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr4 145581059 . A G 265.64 PASS AF=0.3875;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00732721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7603;QD=13.2821;RBI=0.0339402;REFB=-0.0140588;REVB=0.0331399;RO=49;SAF=16;SAR=15;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282132;STB=0.516119;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0158144;OID=.;OPOS=145581059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:49:49:31:31:0.3875:15:16:24:25:15:16:24:25 chr4 146054799 . G C 456.57 PASS AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0121325;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6852;QD=20.0688;RBI=0.0184113;REFB=-0.0174474;REVB=-0.0138484;RO=46;SAF=28;SAR=17;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094697;STB=0.552608;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0112442;OID=.;OPOS=146054799;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:17:28:24:22:17:28:24:22 chr4 146057637 . A AAC 98.8 PASS AF=0.428571;AO=11;DP=29;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00169223;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=2;MLLD=294.882;QD=14.1149;RBI=0.00567415;REFB=-0.00541981;REVB=0.00541594;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226518;STB=0.59985;STBP=0.426;TYPE=ins;VARB=0.00825341;OID=.;OPOS=146057638;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:11:29:12:28:16:8:4:13:3:98:17:7:4:14:3 chr4 146479235 . A C 118.39 PASS AF=0.225;AO=8;DP=62;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0198392;FXX=0.0697593;HRUN=15;LEN=1;MLLD=120.003;QD=5.9195;RBI=0.0297583;REFB=-0.0235007;REVB=-0.0221803;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080241;STB=0.56243;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0185918;OID=.;OPOS=146479235;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:80:1:62:8:18:0.225:5:3:0:1:11:7:29:33 chr4 146828332 . A G 340.27 PASS AF=0.617021;AO=28;DP=48;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00673735;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.02;QD=28.9587;RBI=0.0141323;REFB=-0.00560777;REVB=-0.0124229;RO=19;SAF=21;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108128;STB=0.526863;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00436769;OID=.;OPOS=146828332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:19:18:28:29:0.617021:7:21:12:7:8:21:12:6 chr4 147177207 . G GA 40.88 PASS AF=0.583333;AO=12;DP=27;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.107522;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.53793;QD=6.81391;RBI=0.127882;REFB=-0.0811863;REVB=0.0692301;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199941;STB=0.583217;STBP=0.402;TYPE=ins;VARB=0.0984468;OID=.;OPOS=147177208;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:12:27:14:24:10:7:7:7:3:35:14:6:6:10:4 chr4 147178011 . C G 546.66 PASS AF=0.410959;AO=58;DP=138;FAO=60;FDP=146;FR=.;FRO=86;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=-0.0327562;FXX=0.0135126;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.9708;QD=14.9771;RBI=0.0509351;REFB=-0.0443513;REVB=-0.0390054;RO=76;SAF=32;SAR=26;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792148;STB=0.52272;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0793093;OID=.;OPOS=147178011;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:146:76:86:58:60:0.410959:26:32:36:40:27:33:44:42 chr4 147788709 . C T 906.18 PASS AF=0.417722;AO=99;DP=237;FAO=99;FDP=237;FR=.;FRO=138;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=77;FSRR=61;FWDB=-0.00303477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.565;QD=15.2941;RBI=0.00311933;REFB=-0.00164977;REVB=0.000721379;RO=136;SAF=52;SAR=47;SRF=76;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349827;STB=0.519133;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00223589;OID=.;OPOS=147788709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:136:138:99:99:0.417722:47:52:76:60:47:52:77:61 chr4 147824864 . G A 418.04 PASS AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00970452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.412;QD=19.9067;RBI=0.0113336;REFB=0.00882921;REVB=-0.00585438;RO=42;SAF=22;SAR=20;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214699;STB=0.511913;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.00783578;OID=.;OPOS=147824864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:20:22:21:21:20:22:21:21 chr4 148461037 . T C 654.1 PASS AF=0.460526;AO=70;DP=152;FAO=70;FDP=152;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.0195884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.6221;QD=17.2132;RBI=0.0252075;REFB=-0.00118343;REVB=0.0158655;RO=82;SAF=38;SAR=32;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00580184;STB=0.50322;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00178117;OID=.;OPOS=148461037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:82:82:70:70:0.460526:32:38:45:37:32:38:45:37 chr4 148461073 . G A 488.36 PASS AF=0.425197;AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.00524978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.808;QD=15.3815;RBI=0.0064679;REFB=-0.0186293;REVB=0.00377802;RO=73;SAF=28;SAR=26;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584868;STB=0.532775;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0222318;OID=.;OPOS=148461073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:73:73:54:54:0.425197:26:28:42:31:26:28:42:31 chr4 148944467 . A G 539.65 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0050597;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.016;QD=21.8039;RBI=0.00928448;REFB=0.00643573;REVB=0.00778467;RO=47;SAF=19;SAR=32;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105233;STB=0.563909;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00614249;OID=.;OPOS=148944467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:47:48:51:51:0.515152:32:19:23:24:32:19:24:24 chr4 149000024 . C T 463.39 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.927;QD=57.9231;RBI=0.0203667;REFB=0;REVB=0.00913047;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15739e-05;OID=.;OPOS=149000024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:32:0:0:29:32:1:11:18:0:0:12:20:0:0 chr4 149002016 . AT A 186.65 PASS AF=1;AO=22;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080784;FXX=0.0312402;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.33969;QD=24.0841;RBI=0.0824948;REFB=0;REVB=0.0167134;RO=3;SAF=4;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158895;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00545435;OID=.;OPOS=149002017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:22:30:31:31:0:6:25:0:0:4:3:4:18:2:1 chr4 149356516 . A G 2028.08 PASS AF=1;AO=128;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.462;QD=62.4025;RBI=0.0316902;REFB=0;REVB=-0.018276;RO=0;SAF=63;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.17646e-06;OID=.;OPOS=149356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:128:130:1:65:63:0:0:67:63:0:0 chr4 149357475 . C T 488.78 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929808;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.528;QD=59.2464;RBI=0.0279333;REFB=0;REVB=0.0263404;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251443;OID=.;OPOS=149357475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr4 149358014 . G C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.647;QD=58.5878;RBI=0.0344275;REFB=0;REVB=0.0255728;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134965;OID=.;OPOS=149358014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:24:9:0:0:24:9:0:0 chr4 150769133 . G A 1245.67 PASS AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00232267;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=259.682;QD=57.938;RBI=0.0037426;REFB=0.023739;REVB=0.00293467;RO=2;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242725;STB=0.518983;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.000287369;OID=.;OPOS=150769133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:86:86:2:3:83:83:0.965116:38:45:0:2:38:45:0:3 chr4 151168815 . G A 764.03 PASS AF=0.540741;AO=72;DP=134;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00366974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.961;QD=22.6378;RBI=0.00370813;REFB=-0.0099717;REVB=-0.00053224;RO=61;SAF=32;SAR=40;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123364;STB=0.507259;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.010874;OID=.;OPOS=151168815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:61:62:72:73:0.540741:40:32:28:33:40:33:29:33 chr4 151177340 . CC TG 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=364.874;QD=33.4285;RBI=5.2009e-05;REFB=0;REVB=-5.2009e-05;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-2.55134e-07;OID=.;OPOS=151177340;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr4 151505322 . T A 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0775941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.81;QD=17.5596;RBI=0.0952151;REFB=-0.0158612;REVB=-0.0551821;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186942;STB=0.60702;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0298323;OID=.;OPOS=151505322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:6:12:10:11:6:12:10:11 chr4 151773593 . G C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0207894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0034;QD=9.44416;RBI=0.0207998;REFB=-0.0162486;REVB=-0.000656417;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203317;STB=0.624609;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.026601;OID=.;OPOS=151773593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:3:7:3:3:3:7 chr4 151829824 . T C 480.96 PASS AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00928115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.908;QD=22.9026;RBI=0.022101;REFB=0.00229978;REVB=0.0200578;RO=38;SAF=32;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21755;STB=0.620101;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00122576;OID=.;OPOS=151829824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:14:32:17:21:14:32:17:21 chr4 152041502 . C G 651.69 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.036;QD=62.0657;RBI=0.0580733;REFB=0;REVB=-0.050369;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119466;OID=.;OPOS=152041502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:19:23:0:0 chr4 152070633 . T A 1906.5 PASS AF=0.976562;AO=125;DP=128;FAO=125;FDP=128;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00251042;FXX=0.0303007;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.453;QD=59.5781;RBI=0.0109766;REFB=0.069392;REVB=0.0106857;RO=3;SAF=73;SAR=52;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191232;STB=0.510065;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=4.53087e-05;OID=.;OPOS=152070633;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:128:128:3:3:125:125:0.976562:52:73:3:0:52:73:3:0 chr4 152201018 . G GCAGGT,T 213.88 PASS AF=0.625,0.078125;AO=29,5;DP=64;FAO=40,5;FDP=64;FR=.;FRO=19;FSAF=27,4;FSAR=13,1;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0001817,-0.00461177;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=5,1;MLLD=91.0087,152.42;QD=13.3672;RBI=0.0374861,0.088877;REFB=-0.0790946,-0.0140335;REVB=-0.0374856,-0.0887572;RO=29;SAF=16,4;SAR=13,1;SRF=21;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.159497,0.119776;STB=0.552531,0.739702;STBP=0.277,0.246;TYPE=ins,snp;VARB=0.0653072,-0.0154217;OID=.,.;OPOS=152201019,152201018;OREF=-,G;OALT=CAGGT,T;OMAPALT=GCAGGT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:19:29,5:40,5:0.625,0.078125:13,1:16,4:21:8:13,1:27,4:10:9 chr4 152201053 . G A 313.76 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0305961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.428;QD=14.4258;RBI=0.0306591;REFB=-0.00343716;REVB=0.00196486;RO=50;SAF=13;SAR=22;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21706;STB=0.612261;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00374323;OID=.;OPOS=152201053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:52:35:35:0.402299:22:13:29:21:22:13:29:23 chr4 152212486 . C T 244.94 PASS AF=0.37037;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=12;FWDB=0.0228136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1157;QD=12.0956;RBI=0.0745026;REFB=-0.0266071;REVB=-0.0709238;RO=51;SAF=20;SAR=10;SRF=39;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127779;STB=0.57277;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0613887;OID=.;OPOS=152212486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:51:51:30:30:0.37037:10:20:39:12:10:20:39:12 chr4 152212603 . T G 1171.16 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2811;QD=60.8394;RBI=0.0520976;REFB=0;REVB=0.0380356;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31333e-05;OID=.;OPOS=152212603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr4 152583907 . CTTTTTT CTTTTTG,CTTTT,CTTTTT,CTTTTTTT 226.39 PASS AF=0.459459,0.243243,0.297297,0;AO=2,4,5,5;DP=38;FAO=17,9,11,0;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,11,0;FSAR=17,1,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185148,0.2091,0.399445,-0.399445;FXX=0.0749813;HRUN=16,16,16,16;LEN=1,2,1,1;MLLD=159.794,3.95076,2.12498,2.25467;QD=24.4745;RBI=0.101298,0.312563,0.594729,0.594729;REFB=-0.00227549,0.00184092,0.00285105,-0.00285104;REVB=0.0995917,0.23232,0.440621,-0.44062;RO=4;SAF=0,4,5,5;SAR=2,0,0,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.767801,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,ins;VARB=0.0144932,0.244266,0.157632,0.0653667;OID=.,.,.,.;OPOS=152583913,152583908,152583908,152583908;OREF=T,TT,T,-;OALT=G,-,-,T;OMAPALT=CTTTTTG,CTTTT,CTTTTT,CTTTTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.459459,0.243243,0.297297,0:2,4,5,5:38:17,9,11,0:37:0:0,8,11,0:17,1,0,0:0:0:33:4:0,4,5,5:2,0,0,0:4:0 chr4 153243476 . CAAAAAAAAAAAAA CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAT 100.13 PASS AF=0,0.611111,0,0.388889;AO=2,2,2,2;DP=18;FAO=0,11,0,7;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,7;FSAR=0,11,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.12514,-0.670022,-0.46306,-0.12645;FXX=0.09995;HRUN=18,18,18,18;LEN=1,2,3,1;MLLD=1.51321,3.25685,3.98825,167.241;QD=22.2514;RBI=1.12647,0.670672,0.463491,0.12701;REFB=0.0122252,0.0194673,0.021797,0.0281124;REVB=0.0547378,0.0295189,0.0199698,-0.0119039;RO=2;SAF=0,0,0,2;SAR=2,2,2,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0.727176;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=0.1987,0.0171191,0.00797538,-0.0404741;OID=.,.,.,.;OPOS=153243477,153243477,153243477,153243489;OREF=A,AA,AAA,A;OALT=-,-,-,T;OMAPALT=CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/4:0,0.611111,0,0.388889:2,2,2,2:18:0,11,0,7:18:0:0,0,0,7:0,11,0,0:0:0:42:2:0,0,0,2:2,2,2,0:0:2 chr4 153690842 . T C 990.63 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00260304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5803;QD=59.1419;RBI=0.0524278;REFB=0;REVB=0.0523631;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283897;OID=.;OPOS=153690842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0 chr4 153896358 . C T 803.27 PASS AF=0.40991;AO=90;DP=226;FAO=91;FDP=222;FR=.;FRO=131;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=56;FSRR=75;FWDB=0.00253461;FXX=0.0176983;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.054;QD=14.4733;RBI=0.00899896;REFB=-0.00268148;REVB=0.00863464;RO=130;SAF=45;SAR=45;SRF=54;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893642;STB=0.539581;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00364338;OID=.;OPOS=153896358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:222:130:131:90:91:0.40991:45:45:54:76:46:45:56:75 chr4 153897770 . G A 242.44 PASS AF=0.5;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00910327;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.863;QD=18.6494;RBI=0.0204201;REFB=-0.00966955;REVB=0.0182787;RO=26;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343872;STB=0.519273;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00985165;OID=.;OPOS=153897770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:26:26:26:26:0.5:14:12:13:13:14:12:13:13 chr4 153898178 . A G 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0868863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5663;QD=46.8447;RBI=0.0914374;REFB=0;REVB=-0.0284879;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00480782;OID=.;OPOS=153898178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr4 154197234 . T G 441.09 PASS AF=0.544304;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0119765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.902;QD=22.3337;RBI=0.0125529;REFB=-0.0029635;REVB=-0.00376036;RO=36;SAF=22;SAR=21;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175674;STB=0.596407;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0025243;OID=.;OPOS=154197234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:36:36:43:43:0.544304:21:22:26:10:21:22:26:10 chr4 154216710 . G A 62.69 PASS AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0526594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.52;QD=8.08854;RBI=0.0558336;REFB=-0.00117499;REVB=-0.0185574;RO=22;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584169;STB=0.867341;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00989966;OID=.;OPOS=154216710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:8:1:13:9:8:1:13:9 chr4 154388403 . A G 492.5 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0224062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.172;QD=20.1019;RBI=0.022649;REFB=-0.0355092;REVB=0.00330703;RO=49;SAF=22;SAR=26;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273873;STB=0.519751;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.021903;OID=.;OPOS=154388403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:49:50:48:48:0.489796:26:22:21:28:26:22:21:29 chr4 154478222 . C T 632.23 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00449603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8861;QD=61.681;RBI=0.0595358;REFB=0;REVB=-0.0593658;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100636;OID=.;OPOS=154478222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0 chr4 154479430 . T C 750.79 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312518;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.045;QD=63.8968;RBI=0.038335;REFB=0;REVB=-0.0222013;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262318;OID=.;OPOS=154479430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr4 154513627 . A G 387.93 PASS AF=0.39823;AO=44;DP=112;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.00425938;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.636;QD=13.7319;RBI=0.013498;REFB=-0.00975223;REVB=0.0128084;RO=67;SAF=16;SAR=28;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938106;STB=0.563427;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0164956;OID=.;OPOS=154513627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:67:68:44:45:0.39823:28:16:30:37:29:16:31:37 chr4 154513722 . C T 398.45 PASS AF=0.414414;AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.00669839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.583;QD=14.3586;RBI=0.00705233;REFB=-0.0156056;REVB=-0.00220608;RO=65;SAF=13;SAR=33;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122204;STB=0.569192;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0222428;OID=.;OPOS=154513722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:65:65:46:46:0.414414:33:13:25:40:33:13:25:40 chr4 154514965 . T C 435.51 PASS AF=0.575342;AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0179536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.735;QD=23.8634;RBI=0.02474;REFB=-0.0211774;REVB=0.0170216;RO=31;SAF=21;SAR=21;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187814;STB=0.602693;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0152337;OID=.;OPOS=154514965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:31:31:42:42:0.575342:21:21:8:23:21:21:8:23 chr4 154525458 . C T 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.013476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.107;QD=12.3948;RBI=0.0203351;REFB=-0.00576514;REVB=0.0152287;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077004;STB=0.545389;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0126936;OID=.;OPOS=154525458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:6:8:12:12:6:8:12:12 chr4 154624656 . T C 453.16 PASS AF=0.536585;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0101375;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.513;QD=22.1054;RBI=0.0116771;REFB=-0.00215753;REVB=-0.00579542;RO=38;SAF=25;SAR=19;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00923084;STB=0.505088;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00165409;OID=.;OPOS=154624656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:38:38:44:44:0.536585:19:25:22:16:19:25:22:16 chr4 154625409 . T C 316.31 PASS AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0128705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1535;QD=31.6312;RBI=0.0210843;REFB=0.00636448;REVB=0.0167002;RO=13;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130682;STB=0.571378;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00222223;OID=.;OPOS=154625409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:12:15:10:3:12:15:10:3 chr4 154631543 . A T 990.56 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.668;QD=59.1381;RBI=0.0199207;REFB=0;REVB=0.00711284;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68577e-05;OID=.;OPOS=154631543;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0 chr4 154702283 . G C 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00585048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.217;QD=11.104;RBI=0.012098;REFB=0.000308762;REVB=-0.0105893;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695696;STB=0.542251;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.00228376;OID=.;OPOS=154702283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:5:5:4:3:5:5 chr4 154709856 . A C 673.9 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196693;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.261;QD=62.6882;RBI=0.0329709;REFB=0;REVB=0.0264612;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4536e-06;OID=.;OPOS=154709856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0 chr4 155156207 . G A 244.3 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0172708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.833;QD=13.0291;RBI=0.0175342;REFB=-0.00205544;REVB=-0.00302804;RO=46;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093314;STB=0.553451;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00207024;OID=.;OPOS=155156207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:17:12:23:23:17:12:23:23 chr4 155156412 . G A 428.24 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0212821;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.473;QD=21.9609;RBI=0.0254791;REFB=-0.0127262;REVB=0.0140091;RO=36;SAF=18;SAR=24;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135213;STB=0.507459;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00961145;OID=.;OPOS=155156412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:36:36:42:42:0.538462:24:18:16:20:24:18:16:20 chr4 155241572 . G A 589.02 PASS AF=0.428571;AO=65;DP=153;FAO=66;FDP=154;FR=.;FRO=88;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=-0.00752835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.66;QD=15.2991;RBI=0.0125934;REFB=-0.01386;REVB=-0.0100955;RO=85;SAF=25;SAR=40;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412063;STB=0.529092;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0196022;OID=.;OPOS=155241572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:85:88:65:66:0.428571:40:25:36:49:40:26:39:49 chr4 155243573 . C T 1785.84 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00886931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4004;QD=61.0542;RBI=0.0255784;REFB=0;REVB=-0.0239914;RO=0;SAF=54;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.05024e-05;OID=.;OPOS=155243573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:63:54:0:0:63:54:0:0 chr4 155243604 . T C 1532.73 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0231434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1825;QD=62.5605;RBI=0.0232941;REFB=-0.0534551;REVB=-0.00264517;RO=1;SAF=47;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099842;STB=0.505262;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000661076;OID=.;OPOS=155243604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:50:47:1:0:50:47:1:0 chr4 155244401 . TTTTG T 219.29 PASS AF=0.642857;AO=26;DP=39;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00277451;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=4;MLLD=256.495;QD=20.8852;RBI=0.0321507;REFB=-0.0101567;REVB=0.0320308;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.318807;SSSB=3.50493e-08;STB=0.720291;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.00449138;OID=.;OPOS=155244402;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.642857:26:39:27:42:15:23:4:6:9:86:0:22:4:0:0 chr4 155244475 . G T 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00415613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.18;QD=59.8394;RBI=0.0071986;REFB=0;REVB=0.00587762;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52427e-06;OID=.;OPOS=155244475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:11:25:0:0:11:25:0:0 chr4 155256177 . A G 421.83 PASS AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0127565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.228;QD=18.1432;RBI=0.0154688;REFB=-0.0101059;REVB=-0.00874961;RO=50;SAF=26;SAR=17;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287283;STB=0.659763;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0214719;OID=.;OPOS=155256177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:50:43:43:0.462366:17:26:15:35:17:26:15:35 chr4 155256205 . G A 1065.76 PASS AF=0.986667;AO=71;DP=71;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0283276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.259;QD=56.8404;RBI=0.0527077;REFB=-0.19773;REVB=0.0444483;RO=0;SAF=29;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00204831;OID=.;OPOS=155256205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:75:0:1:71:74:0.986667:42:29:0:0:45:29:0:1 chr4 155287535 . T C 306.13 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0411529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.937;QD=15.3064;RBI=0.0411575;REFB=-0.00697806;REVB=0.000615631;RO=46;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885416;STB=0.549971;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00858425;OID=.;OPOS=155287535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:17:17:19:27:17:17:19:27 chr4 155295076 . A G 114.72 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0282819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2768;QD=10.429;RBI=0.0446005;REFB=-0.010392;REVB=-0.0344868;RO=30;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256909;STB=0.654941;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0328887;OID=.;OPOS=155295076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:10:4:15:15:10:4:15:15 chr4 155312411 . G A 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0201182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.355;QD=17.4546;RBI=0.0201632;REFB=-0.0328268;REVB=0.00134689;RO=28;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156348;STB=0.500662;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0205653;OID=.;OPOS=155312411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:29:27:27:0.482143:14:13:13:15:14:13:14:15 chr4 155407680 . A G 657.35 PASS AF=0.977273;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0160963;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.4859;QD=59.7586;RBI=0.0561709;REFB=-0.0121071;REVB=0.0538152;RO=1;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019159;STB=0.510199;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000498529;OID=.;OPOS=155407680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:44:1:1:42:43:0.977273:24:18:0:1:24:19:0:1 chr4 155410822 . G A 2034.33 PASS AF=0.992481;AO=131;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4011;QD=61.1828;RBI=0.0124924;REFB=-0.0230558;REVB=-0.00521861;RO=1;SAF=80;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00922767;STB=0.504761;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000145928;OID=.;OPOS=155410822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:133:1:1:131:132:0.992481:51:80:0:1:52:80:0:1 chr4 155411065 . T C 2263.75 PASS AF=1;AO=141;DP=146;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213378;FXX=0.0273954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.521;QD=63.7675;RBI=0.0226902;REFB=0;REVB=-0.00771645;RO=0;SAF=63;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4267e-05;OID=.;OPOS=155411065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:146:142:0:0:141:142:1:78:63:0:0:78:64:0:0 chr4 155411104 . A C 2389.59 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0020126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.686;QD=64.1499;RBI=0.0109633;REFB=0;REVB=-0.010777;RO=0;SAF=66;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.06567e-05;OID=.;OPOS=155411104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:149:0:0:149:149:1:83:66:0:0:83:66:0:0 chr4 155486381 . C T 124.15 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00117834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.508;QD=9.93187;RBI=0.00893724;REFB=0.00184217;REVB=-0.00885922;RO=35;SAF=5;SAR=10;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306592;STB=0.683969;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00150235;OID=.;OPOS=155486381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:10:5:21:14:10:5:21:14 chr4 155488821 . C T 409.8 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00618002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.663;QD=20.7492;RBI=0.0263387;REFB=-0.00328072;REVB=0.0256034;RO=38;SAF=24;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00573707;STB=0.503175;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00316141;OID=.;OPOS=155488821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:38:38:41:41:0.518987:17:24:22:16:17:24:22:16 chr4 155490832 . C T 479.39 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=102;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00725527;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.049;QD=18.9856;RBI=0.0110433;REFB=-0.0131315;REVB=0.00832564;RO=51;SAF=12;SAR=38;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280116;STB=0.656296;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0148989;OID=.;OPOS=155490832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:51:51:50:50:0.49505:38:12:26:25:38:12:26:25 chr4 155491759 . G A 561.92 PASS AF=0.434783;AO=60;DP=138;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=0.0554286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3814;QD=16.2875;RBI=0.0579334;REFB=0.00501297;REVB=0.016851;RO=78;SAF=36;SAR=24;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24069;STB=0.634242;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00512579;OID=.;OPOS=155491759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:78:78:60:60:0.434783:24:36:28:50:24:36:28:50 chr4 155507590 . T C 213.4 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.046196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.412;QD=14.7172;RBI=0.0476066;REFB=-0.0429351;REVB=-0.011503;RO=32;SAF=9;SAR=16;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175422;STB=0.50224;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0617696;OID=.;OPOS=155507590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:33:25:25:0.431034:16:9:11:21:16:9:12:21 chr4 155720274 . T C 594.35 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00932105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.985;QD=60.9588;RBI=0.00984194;REFB=0;REVB=0.00315941;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.6797e-05;OID=.;OPOS=155720274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr4 156135155 . T C 818.67 PASS AF=0.538462;AO=77;DP=143;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.0044389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.668;QD=22.8998;RBI=0.01423;REFB=-0.00387503;REVB=-0.01352;RO=66;SAF=40;SAR=37;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118304;STB=0.564689;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00301469;OID=.;OPOS=156135155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:66:66:77:77:0.538462:37:40:25:41:37:40:25:41 chr4 156135676 . C T 2139.12 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0099385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6754;QD=62.9153;RBI=0.0386711;REFB=0;REVB=0.0373722;RO=0;SAF=66;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136353;OID=.;OPOS=156135676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:69:66:0:0:69:67:0:0 chr4 156136027 . C T 1508.72 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00167415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.332;QD=63.5251;RBI=0.0491751;REFB=0;REVB=0.0491466;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.68733e-05;OID=.;OPOS=156136027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:38:56:0:0:39:56:0:0 chr4 156273768 . T C 730.06 PASS AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.118;QD=53.0955;RBI=0.0237774;REFB=-0.0794344;REVB=0.0212176;RO=1;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149574;STB=0.507689;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000418799;OID=.;OPOS=156273768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:55:55:1:1:53:54:0.981818:31:22:0:1:32:22:0:1 chr4 156274377 . T C 885.16 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9768;QD=58.0432;RBI=0.0368733;REFB=0;REVB=0.0219948;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.88752e-05;OID=.;OPOS=156274377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0 chr4 156276289 . C T 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4494;QD=57.1054;RBI=0.00875386;REFB=0;REVB=-0.00549903;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33268e-06;OID=.;OPOS=156276289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0 chr4 156276317 . A G 632.19 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.764;QD=61.6771;RBI=0.0120042;REFB=0;REVB=0.0119593;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51528e-05;OID=.;OPOS=156276317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0 chr4 156281371 . T C 2770.61 PASS AF=1;AO=177;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.242;QD=62.261;RBI=0.0665079;REFB=0;REVB=0.0434703;RO=1;SAF=99;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00606399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115688;OID=.;OPOS=156281371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:178:1:0:177:178:1:78:99:0:1:79:99:0:0 chr4 156289900 . C T 1983.36 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.737;QD=61.9799;RBI=0.0424161;REFB=0;REVB=0.0268128;RO=0;SAF=38;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93815e-05;OID=.;OPOS=156289900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:121:128:0:0:121:128:1:83:38:0:0:87:41:0:0 chr4 156379973 . G T 1989.35 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.853;QD=62.1672;RBI=0.052352;REFB=0;REVB=-0.0454163;RO=0;SAF=53;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.19578e-05;OID=.;OPOS=156379973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:75:53:0:0:75:53:0:0 chr4 156382738 . A C 1062.95 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.538;QD=59.8846;RBI=0.0508463;REFB=0;REVB=-0.018147;RO=1;SAF=35;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133153;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121279;OID=.;OPOS=156382738;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:1:0:69:71:1:34:35:1:0:34:37:0:0 chr4 156632391 . A G 824.09 PASS AF=0.9375;AO=60;DP=64;FAO=60;FDP=64;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00991788;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=283.052;QD=51.5058;RBI=0.0246762;REFB=-0.131777;REVB=0.0225954;RO=2;SAF=28;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032518;STB=0.533322;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.000522055;OID=.;OPOS=156632391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:64:64:2:4:60:60:0.9375:32:28:2:0:32:28:4:0 chr4 156680340 . G T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.758;QD=62.671;RBI=0.0632939;REFB=0;REVB=0.0226718;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257045;OID=.;OPOS=156680340;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr4 156706482 . G A 184.42 PASS AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0168321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8694;QD=10.1053;RBI=0.0248337;REFB=-0.0125613;REVB=-0.0182591;RO=48;SAF=13;SAR=11;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507456;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0143706;OID=.;OPOS=156706482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:48:49:24:24:0.328767:11:13:26:22:11:13:26:23 chr4 156716531 . G T 321.24 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00444029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.473;QD=16.2652;RBI=0.0113078;REFB=-0.0212434;REVB=-0.0103995;RO=44;SAF=20;SAR=15;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712871;STB=0.540123;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0291941;OID=.;OPOS=156716531;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:15:20:22:22:15:20:22:22 chr4 156787340 . G A 293.21 PASS AF=0.361702;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=0.00395167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.329;QD=12.4772;RBI=0.021924;REFB=-0.0194986;REVB=-0.0215649;RO=60;SAF=16;SAR=18;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155397;STB=0.588782;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0240368;OID=.;OPOS=156787340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:60:60:34:34:0.361702:18:16:20:40:18:16:20:40 chr4 156847230 . A G 957.84 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413466;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=37.1122;QD=58.0509;RBI=0.046563;REFB=0;REVB=-0.0214141;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000601171;OID=.;OPOS=156847230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:34:32:0:0:34:32:0:0 chr4 156847236 . AAG AAA,AA,A 630.23 PASS AF=0,0,1;AO=5,40,8;DP=53;FAO=0,0,53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,24;FSAR=0,0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129854,0.00208609,-0.129371;FXX=0;HRUN=2,2,8;LEN=1,1,2;MLLD=5.49503,11.8924,19.2304;QD=47.5644;RBI=0.153315,0.10765,0.133507;REFB=-0.0702634,-0.0646651,-0.0483098;REVB=-0.0815075,-0.10763,-0.0329732;RO=0;SAF=1,17,6;SAR=4,23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,6.4817e-08,5.58669e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0.0311743,0.00187056;OID=.,.,.;OPOS=156847238,156847238,156847237;OREF=G,G,AG;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/3:0,0,1:5,40,8:53:0,0,53:53:0:0,0,24:0,0,29:0:0:3:0:1,17,6:4,23,2:0:0 chr4 157557726 . A G 537.31 PASS AF=0.51;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.00326038;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.7056;QD=21.4926;RBI=0.0671683;REFB=-0.0106406;REVB=-0.0670891;RO=49;SAF=27;SAR=24;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107223;STB=0.55918;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0076536;OID=.;OPOS=157557726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:49:49:51:51:0.51:24:27:20:29:24:27:20:29 chr4 158065038 . T C 1448.87 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.671;QD=62.9946;RBI=0.051558;REFB=0;REVB=0.00323783;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25285e-05;OID=.;OPOS=158065038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:92:0:0:89:92:1:44:45:0:0:45:47:0:0 chr4 158238830 . T C 4722.53 PASS AF=0.987097;AO=303;DP=307;FAO=306;FDP=310;FR=.;FRO=4;FSAF=138;FSAR=168;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0286734;FXX=0.00641005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.818;QD=60.9359;RBI=0.0333179;REFB=-0.142614;REVB=0.0169681;RO=1;SAF=137;SAR=166;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00286468;STB=0.503893;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.000182126;OID=.;OPOS=158238830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:307:310:1:4:303:306:0.987097:166:137:0:1:168:138:3:1 chr4 159076826 . C T 842.0 PASS AF=0.530201;AO=78;DP=149;FAO=79;FDP=149;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.00318227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.77;QD=22.6041;RBI=0.0102966;REFB=-0.000314531;REVB=-0.00979255;RO=70;SAF=26;SAR=52;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364344;STB=0.515329;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.000258377;OID=.;OPOS=159076826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:70:70:78:79:0.530201:52:26:26:44:52:27:26:44 chr4 159092605 . A G 780.65 PASS AF=0.482143;AO=81;DP=168;FAO=81;FDP=168;FR=.;FRO=87;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.0262519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.938;QD=18.5868;RBI=0.0269351;REFB=0.000462691;REVB=-0.00602823;RO=86;SAF=34;SAR=47;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234809;STB=0.51546;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=-0.000571229;OID=.;OPOS=159092605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:86:87:81:81:0.482143:47:34:34:52:47:34:34:53 chr4 159092633 . A G 472.91 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.002418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.686;QD=17.5151;RBI=0.0320188;REFB=-0.00577004;REVB=-0.0319274;RO=57;SAF=33;SAR=18;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863037;STB=0.548069;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00692592;OID=.;OPOS=159092633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:57:57:51:51:0.472222:18:33:32:25:18:33:32:25 chr4 159601676 . C T 1116.95 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00358372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.989;QD=60.3757;RBI=0.0290873;REFB=0;REVB=0.0288657;RO=0;SAF=45;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75599e-05;OID=.;OPOS=159601676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:29:45:0:0:29:45:0:0 chr4 159826773 . T G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00368831;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.263;QD=59.0185;RBI=0.0224409;REFB=0;REVB=0.0221357;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45135e-05;OID=.;OPOS=159826773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr4 159881479 . T C 300.64 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0437122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9899;QD=21.4742;RBI=0.0531524;REFB=0.0155954;REVB=-0.0302393;RO=25;SAF=13;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082001;STB=0.545425;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=-0.0110484;OID=.;OPOS=159881479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:18:13:13:12:18:13:13:12 chr4 159894250 . C T 923.45 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00364252;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.376;QD=56.8278;RBI=0.00375135;REFB=-0.0724046;REVB=-0.000897054;RO=1;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165689;STB=0.508769;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000166032;OID=.;OPOS=159894250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:28:36:0:1:28:36:0:1 chr4 159894277 . T C 284.75 PASS AF=0.407407;AO=32;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0299006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.39;QD=14.0619;RBI=0.0310084;REFB=-0.0214793;REVB=0.00821424;RO=49;SAF=22;SAR=10;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178053;STB=0.578898;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0339336;OID=.;OPOS=159894277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:48:32:33:0.407407:10:22:26:23:11:22:26:22 chr4 159894305 . T C 1389.02 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146791;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.851;QD=62.4278;RBI=0.0363062;REFB=0;REVB=0.0332064;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486166;OID=.;OPOS=159894305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:89:0:0:84:89:1:38:46:0:0:42:47:0:0 chr4 160277276 . C T 188.15 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.100104;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.5883;QD=20.9051;RBI=0.100757;REFB=-0.0252645;REVB=0.0114525;RO=17;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915077;STB=0.551568;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0298953;OID=.;OPOS=160277276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:8:11:8:9:8:11:8:9 chr4 160428588 . G A 739.4 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0482862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.521;QD=56.8767;RBI=0.0499189;REFB=0;REVB=0.0126625;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.73183e-05;OID=.;OPOS=160428588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr4 162307060 . G T 823.34 PASS AF=0.412556;AO=92;DP=224;FAO=92;FDP=223;FR=.;FRO=131;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=79;FSRR=52;FWDB=-0.00685692;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.495;QD=14.7685;RBI=0.0127247;REFB=-0.00522761;REVB=-0.0107191;RO=131;SAF=36;SAR=56;SRF=79;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220983;STB=0.623521;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0103112;OID=.;OPOS=162307060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:223:131:131:92:92:0.412556:56:36:79:52:56:36:79:52 chr4 164048199 . G C 417.0 PASS AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.00612769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5577;QD=16.194;RBI=0.0242572;REFB=-0.0244005;REVB=-0.0234705;RO=56;SAF=21;SAR=25;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455487;STB=0.519838;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0197303;OID=.;OPOS=164048199;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:56:57:46:46:0.446602:25:21:23:33:25:21:24:33 chr4 164085425 . T C 881.27 PASS AF=0.436364;AO=95;DP=218;FAO=96;FDP=220;FR=.;FRO=124;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=72;FSRR=52;FWDB=0.0184277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.049;QD=16.023;RBI=0.0247134;REFB=-0.0332066;REVB=0.0164673;RO=123;SAF=48;SAR=47;SRF=71;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731013;STB=0.539658;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0325038;OID=.;OPOS=164085425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:220:123:124:95:96:0.436364:47:48:71:52:47:49:72:52 chr4 164272857 . T C 490.96 PASS AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.00355621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.878;QD=19.2535;RBI=0.0145067;REFB=-0.0110059;REVB=-0.0140641;RO=51;SAF=24;SAR=27;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158658;STB=0.587595;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00726643;OID=.;OPOS=164272857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:51:51:51:51:0.5:27:24:33:18:27:24:33:18 chr4 164393117 . T A 281.55 PASS AF=0.492308;AO=31;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0264044;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.418;QD=17.3263;RBI=0.0323631;REFB=-0.00973503;REVB=-0.018713;RO=33;SAF=11;SAR=20;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335162;STB=0.674052;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0154804;OID=.;OPOS=164393117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:31:32:0.492308:20:11:24:9:20:12:24:9 chr4 164415930 . C T 418.41 PASS AF=0.431193;AO=46;DP=108;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.00553112;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.448;QD=15.3543;RBI=0.010583;REFB=-0.0291559;REVB=-0.00902259;RO=62;SAF=19;SAR=27;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898784;STB=0.542749;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0337409;OID=.;OPOS=164415930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:62:62:46:47:0.431193:27:19:31:31:27:20:31:31 chr4 164433954 . T C 265.21 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.0223972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4572;QD=15.6006;RBI=0.0302869;REFB=-0.0202778;REVB=0.0203878;RO=38;SAF=15;SAR=15;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236184;STB=0.632271;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0236665;OID=.;OPOS=164433954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:15:15:28:10:15:15:28:10 chr4 164533702 . T C 445.03 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.0107916;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5068;QD=16.4827;RBI=0.0379688;REFB=0.0107948;REVB=0.0364029;RO=59;SAF=28;SAR=21;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00484059;STB=0.502702;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.0115185;OID=.;OPOS=164533702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:21:28:34:25:21:28:34:25 chr4 165878335 . A G 1062.39 PASS AF=1;AO=50;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1198;QD=59.8527;RBI=0.0459169;REFB=0;REVB=0.0281999;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.12822e-05;OID=.;OPOS=165878335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:50:71:1:24:26:0:0:43:28:0:0 chr4 165961261 . G A 347.59 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0182094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.631;QD=19.8623;RBI=0.021343;REFB=0.00570064;REVB=0.011133;RO=33;SAF=19;SAR=17;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630911;STB=0.527762;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=-0.00846894;OID=.;OPOS=165961261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:34:36:36:0.514286:17:19:15:18:17:19:16:18 chr4 166000195 . A G 584.35 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.768;QD=59.9331;RBI=0.0465028;REFB=0;REVB=0.034865;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259386;OID=.;OPOS=166000195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:14:23:0:0:16:23:0:0 chr4 166021811 . G C 207.86 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0141462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7862;QD=17.6898;RBI=0.0141863;REFB=-0.00505492;REVB=0.00106598;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134722;STB=0.576541;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00629152;OID=.;OPOS=166021811;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:10:11:10:16:10:11:10:16 chr4 166200128 . CA C,CC 63.81 PASS AF=0.3,0.2;AO=4,4;DP=18;FAO=6,4;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3,0;FSAR=3,4;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0438829,-0.0121232;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=16.6936,29.4157;QD=12.7617;RBI=0.0839311,0.118695;REFB=-0.0183054,-0.0350213;REVB=-0.0715453,0.118075;RO=10;SAF=2,0;SAR=2,4;SRF=10;SRR=0;SSEN=0.428571,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.611799,-0.836524;STB=0.811862,0.998567;STBP=0.224,0.001;TYPE=del,snp;VARB=-0.0261907,0.0218451;OID=.,.;OPOS=166200129,166200129;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3,0.2:4,4:18:6,4:20:10:3,0:3,4:10:0:34:10:2,0:2,4:10:0 chr4 166264119 . A G 672.1 PASS AF=0.5;AO=66;DP=133;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00165275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.866;QD=20.0626;RBI=0.0176755;REFB=-0.0196023;REVB=-0.0175981;RO=67;SAF=37;SAR=29;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215082;STB=0.515133;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0184064;OID=.;OPOS=166264119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:67:67:66:67:0.5:29:37:36:31:29:38:36:31 chr4 166405584 . C T 1099.47 PASS AF=0.53202;AO=108;DP=204;FAO=108;FDP=203;FR=.;FRO=95;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=43;FWDB=0.000937324;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.881;QD=21.6645;RBI=0.00246006;REFB=-0.000687013;REVB=0.00227449;RO=94;SAF=61;SAR=47;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192305;STB=0.508285;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00066909;OID=.;OPOS=166405584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:94:95:108:108:0.53202:47:61:51:43:47:61:52:43 chr4 167012381 . G A 3255.19 PASS AF=1;AO=210;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4142;QD=62.0037;RBI=0.0254972;REFB=0;REVB=-0.0109691;RO=0;SAF=105;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01273e-05;OID=.;OPOS=167012381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:210:210:0:0:210:210:1:105:105:0:0:105:105:0:0 chr4 167012480 . T C 2227.82 PASS AF=1;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.74;QD=63.2004;RBI=0.0545745;REFB=0;REVB=0.0231694;RO=0;SAF=64;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33035e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90727e-05;OID=.;OPOS=167012480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:140:141:1:76:64:0:0:76:65:0:0 chr4 167020644 . A G 2172.83 PASS AF=0.979021;AO=140;DP=143;FAO=140;FDP=143;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=78;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00716449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.973;QD=60.7785;RBI=0.00725962;REFB=-0.0363237;REVB=-0.00117143;RO=3;SAF=62;SAR=78;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224466;STB=0.511809;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00167929;OID=.;OPOS=167020644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:143:143:3:3:140:140:0.979021:78:62:3:0:78:62:3:0 chr4 167023255 . A G 1604.47 PASS AF=0.990826;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2036;QD=58.8798;RBI=0.0262518;REFB=-0.00867395;REVB=-0.0222837;RO=2;SAF=51;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182467;STB=0.504761;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-2.54175e-05;OID=.;OPOS=167023255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:2:1:107:108:0.990826:56:51:2:0:56:52:1:0 chr4 167063842 . C T 326.24 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0228863;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.929;QD=19.772;RBI=0.031722;REFB=-0.0210697;REVB=-0.0219659;RO=32;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842337;STB=0.546735;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0177465;OID=.;OPOS=167063842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:16:18:20:12:16:18:20:12 chr4 167654960 . C G 319.12 PASS AF=0.581818;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=2;FWDB=-0.0135239;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.878;QD=23.2088;RBI=0.0210162;REFB=-0.0235996;REVB=-0.0160869;RO=21;SAF=29;SAR=3;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108116;STB=0.508469;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00977332;OID=.;OPOS=167654960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:21:23:32:32:0.581818:3:29:20:1:3:29:21:2 chr4 168584259 . T A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9829;QD=52.6121;RBI=0.0131974;REFB=0;REVB=0.0127105;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213346;OID=.;OPOS=168584259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr4 169141748 . T A 49.34 PASS AF=0.0794702;AO=25;DP=301;FAO=24;FDP=302;FR=.;FRO=278;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=141;FSRR=137;FWDB=-0.0192207;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=143.391;QD=0.653503;RBI=0.0220462;REFB=-0.00121498;REVB=-0.0107982;RO=269;SAF=3;SAR=22;SRF=137;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465632;STB=0.86418;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.15923;OID=.;OPOS=169141748;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:301:302:269:278:25:24:0.0794702:22:3:137:132:21:3:141:137 chr4 169282355 . T C 1926.76 PASS AF=1;AO=125;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207978;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.753;QD=61.6563;RBI=0.0209212;REFB=0.0572937;REVB=0.00226829;RO=0;SAF=57;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.3655e-05;OID=.;OPOS=169282355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:127:125:0:0:125:125:1:68:57:0:0:68:57:0:0 chr4 169299528 . T C 616.15 PASS AF=0.480916;AO=63;DP=132;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=0.0250913;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.624;QD=18.8136;RBI=0.0258978;REFB=-0.00668219;REVB=0.00641277;RO=68;SAF=36;SAR=27;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445819;STB=0.524656;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00835561;OID=.;OPOS=169299528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:68:68:63:63:0.480916:27:36:42:26:27:36:42:26 chr4 169312753 . G A 395.42 PASS AF=0.455556;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0226841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1861;QD=17.5743;RBI=0.0361807;REFB=0.00459817;REVB=0.0281864;RO=49;SAF=14;SAR=27;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491059;STB=0.527517;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.00549286;OID=.;OPOS=169312753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:49:49:41:41:0.455556:27:14:19:30:27:14:19:30 chr4 169315760 . C A 305.09 PASS AF=0.419753;AO=33;DP=80;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0419188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.514;QD=15.066;RBI=0.0460203;REFB=-0.00982862;REVB=0.0189916;RO=47;SAF=16;SAR=17;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04871;STB=0.535538;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0131221;OID=.;OPOS=169315760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:47:47:33:34:0.419753:17:16:25:22:18:16:25:22 chr4 169317279 . C T 284.72 PASS AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0919705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3776;QD=29.9701;RBI=0.0927768;REFB=0.00617958;REVB=-0.0122054;RO=13;SAF=6;SAR=19;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169286;STB=0.59367;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.0103205;OID=.;OPOS=169317279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:13:13:25:25:0.657895:19:6:6:7:19:6:6:7 chr4 169327191 . C T 204.18 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00533675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.143;QD=10.4706;RBI=0.00611192;REFB=-0.00781399;REVB=-0.00297905;RO=52;SAF=12;SAR=14;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10949;STB=0.563802;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0193793;OID=.;OPOS=169327191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:52:52:26:26:0.333333:14:12:29:23:14:12:29:23 chr4 169336662 . T C 417.0 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018332;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5607;QD=57.5172;RBI=0.0250363;REFB=0;REVB=0.0170515;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215759;OID=.;OPOS=169336662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr4 169341435 . A G 2257.77 PASS AF=0.993056;AO=142;DP=144;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=87;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00446666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.184;QD=62.7159;RBI=0.0189196;REFB=-0.0892379;REVB=-0.0183847;RO=1;SAF=86;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00841526;STB=0.504424;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000134437;OID=.;OPOS=169341435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:144:144:1:1:142:143:0.993056:56:86:0:1:56:87:0:1 chr4 169362557 . C G 276.17 PASS AF=0.462687;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0102657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3194;QD=16.4877;RBI=0.0543956;REFB=-0.00916146;REVB=-0.0534182;RO=36;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059164;STB=0.523565;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0132513;OID=.;OPOS=169362557;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:36:36:30:31:0.462687:16:14:19:17:16:15:19:17 chr4 169369820 . T A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.003;QD=60.2306;RBI=0.0472274;REFB=0;REVB=0.0471005;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227125;OID=.;OPOS=169369820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr4 169369853 . A T 541.82 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0961657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.978;QD=58.5752;RBI=0.100511;REFB=0;REVB=0.0292348;RO=1;SAF=17;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267359;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000802891;OID=.;OPOS=169369853;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:1:0:36:37:1:19:17:1:0:19:18:0:0 chr4 169369920 . C T 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0320505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.742;QD=12.8689;RBI=0.0322021;REFB=-0.0155764;REVB=-0.0031206;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304135;STB=0.680509;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.012805;OID=.;OPOS=169369920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:3:8:7:9:3:8:7:9 chr4 169393595 . A G 1061.92 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2044;QD=59.8264;RBI=0.0677496;REFB=0;REVB=0.0301244;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000756168;OID=.;OPOS=169393595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:32:38:0:0:32:39:0:0 chr4 169432673 . C T 390.75 PASS AF=0.666667;AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-1.6723e-06;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.028;QD=32.5624;RBI=0.0249028;REFB=-0.0193405;REVB=0.0249028;RO=16;SAF=18;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114357;STB=0.562461;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0122731;OID=.;OPOS=169432673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:16:16:32:32:0.666667:14:18:6:10:14:18:6:10 chr4 169432841 . G A 472.21 PASS AF=0.481481;AO=45;DP=104;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0531266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9186;QD=17.4893;RBI=0.0676545;REFB=0.0266137;REVB=0.041889;RO=56;SAF=31;SAR=14;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298141;STB=0.61534;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0120878;OID=.;OPOS=169432841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:56:56:45:52:0.481481:14:31:22:34:20:32:22:34 chr4 169433326 . TG CA 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0159266;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=158.051;QD=20.1561;RBI=0.0204449;REFB=-0.012217;REVB=-0.0128194;RO=25;SAF=9;SAR=19;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409218;STB=0.522747;STBP=0.775;TYPE=mnp;VARB=0.00701592;OID=.;OPOS=169433326;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:19:9:7:18:19:9:7:18 chr4 169433333 . C T 268.75 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.00114154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.733;QD=22.3955;RBI=0.00121854;REFB=-0.0274629;REVB=0.000426296;RO=23;SAF=9;SAR=16;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952501;STB=0.553032;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0420768;OID=.;OPOS=169433333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:16:9:6:17:16:9:6:17 chr4 169606649 . C A 366.38 PASS AF=0.401869;AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.00710879;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.497;QD=13.6964;RBI=0.00790463;REFB=-0.0138562;REVB=0.00345664;RO=64;SAF=21;SAR=22;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122904;STB=0.506953;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0232169;OID=.;OPOS=169606649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:64:64:43:43:0.401869:22:21:32:32:22:21:32:32 chr4 169621191 . G A 398.96 PASS AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0173477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5668;QD=20.998;RBI=0.0181246;REFB=-0.00965783;REVB=-0.00524961;RO=36;SAF=19;SAR=21;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257857;STB=0.641676;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00698061;OID=.;OPOS=169621191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:21:19:28:8:21:19:28:8 chr4 169630204 . T G 322.85 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00171244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.72;QD=19.2747;RBI=0.0109836;REFB=-0.00309568;REVB=-0.0108492;RO=33;SAF=22;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391598;STB=0.521809;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00310451;OID=.;OPOS=169630204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:12:22:20:13:12:22:20:13 chr4 169806527 . A G 524.19 PASS AF=0.505051;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00267583;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4966;QD=21.1793;RBI=0.00455154;REFB=-0.0376777;REVB=0.0036819;RO=49;SAF=25;SAR=25;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456663;STB=0.525242;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0317048;OID=.;OPOS=169806527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:49:49:50:50:0.505051:25:25:22:27:25:25:22:27 chr4 169846359 . GCTCTCTCTCTC GCTCTCTCTC,GCTCTCTCTCT 713.15 PASS AF=0.941176,0.0588235;AO=42,6;DP=54;FAO=48,3;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26,3;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344264,0.029133;FXX=0.0555453;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=207.844,194.884;QD=55.9334;RBI=0.0371784,0.0291701;REFB=0,0;REVB=0.0140377,-0.00147207;RO=0;SAF=23,3;SAR=19,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.00279572,0.0827611;OID=.,.;OPOS=169846360,169846370;OREF=CT,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCTCTCTCTC,GCTCTCTCTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.941176,0.0588235:42,6:54:48,3:51:0:26,3:22,0:0:0:8:0:23,3:19,3:0:0 chr4 169928842 . G T 4449.94 PASS AF=1;AO=281;DP=281;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.594;QD=63.3443;RBI=0.0278536;REFB=0;REVB=0.00154914;RO=0;SAF=157;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36267e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.64655e-05;OID=.;OPOS=169928842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:281:281:0:0:281:281:1:124:157:0:0:124:157:0:0 chr4 170038894 . A G 334.86 PASS AF=0.397849;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=0.0262996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4186;QD=14.4027;RBI=0.0457859;REFB=-0.00994119;REVB=-0.037479;RO=54;SAF=14;SAR=23;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278016;STB=0.65631;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0112907;OID=.;OPOS=170038894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:54:56:37:37:0.397849:23:14:35:19:23:14:36:20 chr4 170581570 . G A 1397.16 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0333;QD=62.7937;RBI=0.0568783;REFB=0;REVB=-0.0109092;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170883;OID=.;OPOS=170581570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:41:47:0:0:41:48:0:0 chr4 170663235 . C T 638.82 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00488355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.196;QD=59.425;RBI=0.0165443;REFB=0.00339417;REVB=-0.0158072;RO=1;SAF=15;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302621;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000238765;OID=.;OPOS=170663235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:27:15:1:0:27:15:1:0 chr4 170678993 . T C 375.43 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.468;QD=55.6189;RBI=0.0502427;REFB=0;REVB=0.0272151;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132173;OID=.;OPOS=170678993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:18:8:0:0:18:9:0:0 chr4 170908599 . T C 170.72 PASS AF=0.473684;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.000257616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.828;QD=17.9709;RBI=0.0325366;REFB=-0.00498055;REVB=-0.0325356;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278045;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00543267;OID=.;OPOS=170908599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:20:20:17:18:0.473684:9:8:10:10:9:9:10:10 chr4 170987636 . A G 994.23 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00257712;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=347.502;QD=57.6363;RBI=0.00309552;REFB=0.0715731;REVB=0.00171486;RO=1;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122766;STB=0.506492;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000110199;OID=.;OPOS=170987636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:38:30:0:1:38:30:0:1 chr4 172735897 . C G 1495.66 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00307039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7956;QD=62.319;RBI=0.0458403;REFB=-0.0686046;REVB=-0.0457374;RO=1;SAF=63;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145863;STB=0.507691;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00195569;OID=.;OPOS=172735897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:32:63:0:1:32:63:0:1 chr4 174062875 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7118;QD=55.656;RBI=0.0204083;REFB=0;REVB=-0.0177336;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000455006;OID=.;OPOS=174062875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:21:6:0:0:21:6:0:0 chr4 174090004 . G A 1238.58 PASS AF=0.987952;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0133473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.355;QD=59.6907;RBI=0.0531529;REFB=-0.0189999;REVB=0.0514498;RO=1;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150285;STB=0.507935;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.000324348;OID=.;OPOS=174090004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:81:82:0.987952:31:50:0:1:31:51:0:1 chr4 174449862 . C T 139.53 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0726153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.892;QD=12.4024;RBI=0.0726537;REFB=-0.0033612;REVB=0.00236123;RO=27;SAF=2;SAR=14;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248816;STB=0.66642;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0033325;OID=.;OPOS=174449862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:29:16:16:0.355556:14:2:7:20:14:2:8:21 chr4 174458022 . T A 655.48 PASS AF=0.455782;AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.0216366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.548;QD=17.8362;RBI=0.021677;REFB=-0.00282712;REVB=0.00132232;RO=80;SAF=37;SAR=30;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879006;STB=0.548858;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00298264;OID=.;OPOS=174458022;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:80:80:67:67:0.455782:30:37:37:43:30:37:37:43 chr4 174537221 . T C 370.03 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0134873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2385;QD=14.0962;RBI=0.0302309;REFB=-0.00933201;REVB=0.0270555;RO=62;SAF=30;SAR=13;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219718;STB=0.624644;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0175649;OID=.;OPOS=174537221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:62:43:43:0.409524:13:30:31:31:13:30:31:31 chr4 174537356 . T A 567.07 PASS AF=0.483607;AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.00728725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.401;QD=18.5925;RBI=0.0081546;REFB=-0.018078;REVB=-0.0036597;RO=63;SAF=38;SAR=21;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720321;STB=0.539951;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0184466;OID=.;OPOS=174537356;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:63:63:59:59:0.483607:21:38:36:27:21:38:36:27 chr4 174537471 . G A 681.92 PASS AF=0.559322;AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=118;FR=.;FRO=52;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0010837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.232;QD=23.116;RBI=0.00611298;REFB=-0.0160999;REVB=-0.00601615;RO=52;SAF=45;SAR=21;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126091;STB=0.569118;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0106685;OID=.;OPOS=174537471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:52:52:66:66:0.559322:21:45:28:24:21:45:28:24 chr4 174537658 . C T 154.46 PASS AF=0.425;AO=16;DP=39;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0207444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.634;QD=15.4459;RBI=0.0250265;REFB=-0.0206435;REVB=-0.0139999;RO=23;SAF=11;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22245;STB=0.639327;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00928256;OID=.;OPOS=174537658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:23:23:16:17:0.425:5:11:11:12:5:12:11:12 chr4 175237408 . T C 341.5 PASS AF=0.365217;AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=115;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=-0.00334429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.552;QD=11.8782;RBI=0.0126451;REFB=-0.0123932;REVB=0.0121949;RO=73;SAF=22;SAR=20;SRF=44;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883934;STB=0.550435;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0216483;OID=.;OPOS=175237408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:73:73:42:42:0.365217:20:22:44:29:20:22:44:29 chr4 175443156 . C T 244.29 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.013956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.919;QD=13.029;RBI=0.0142034;REFB=-0.00137674;REVB=-0.00263934;RO=46;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302658;STB=0.672907;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00165391;OID=.;OPOS=175443156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:10:19:17:29:10:19:17:29 chr4 175598334 . T C 2536.36 PASS AF=1;AO=164;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.913;QD=61.117;RBI=0.0165694;REFB=0;REVB=0.013269;RO=1;SAF=72;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656336;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39121e-05;OID=.;OPOS=175598334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:165:166:1:0:164:166:1:92:72:1:0:93:73:0:0 chr4 175688138 . A G 1145.92 PASS AF=0.963415;AO=78;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00611622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.351;QD=55.8986;RBI=0.0222408;REFB=-0.0981872;REVB=0.0213833;RO=4;SAF=43;SAR=35;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00477586;STB=0.508271;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.000534695;OID=.;OPOS=175688138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:82:82:4:3:78:79:0.963415:35:43:2:2:35:44:1:2 chr4 175688141 . G A 1117.54 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.793;QD=55.8769;RBI=0.157291;REFB=0;REVB=0.0796421;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00661679;OID=.;OPOS=175688141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:80:0:0:78:80:1:34:44:0:0:34:46:0:0 chr4 176555585 . A C 2399.68 PASS AF=0.99375;AO=158;DP=159;FAO=159;FDP=160;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0672;QD=59.992;RBI=0.0256164;REFB=-0.0397447;REVB=0.00564219;RO=1;SAF=78;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606085;STB=0.503184;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000391286;OID=.;OPOS=176555585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:159:160:1:1:158:159:0.99375:80:78:1:0:81:78:1:0 chr4 177073026 . G A 1155.93 PASS AF=1;AO=64;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00863471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.185;QD=60.8385;RBI=0.036811;REFB=0;REVB=0.0357839;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13006e-05;OID=.;OPOS=177073026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:64:76:1:42:22:0:0:43:33:0:0 chr4 177073027 . C A 47.94 PASS AF=0.153846;AO=12;DP=78;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=-0.110127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.9367;QD=2.45871;RBI=0.144226;REFB=-0.0275148;REVB=-0.0931296;RO=66;SAF=11;SAR=1;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656953;STB=0.93372;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.237885;OID=.;OPOS=177073027;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:78:78:66:66:12:12:0.153846:1:11:23:43:1:11:23:43 chr4 177087322 . C T 804.53 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0601801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.175;QD=64.3625;RBI=0.0610198;REFB=0;REVB=-0.0100878;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394213;OID=.;OPOS=177087322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0 chr4 177098285 . G A 65.31 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.00335965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.84;QD=10.8848;RBI=0.010236;REFB=-0.0139746;REVB=0.00966893;RO=15;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168645;STB=0.5998;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0181442;OID=.;OPOS=177098285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:6:3:3:12:6:3:3:12 chr4 177113779 . T C 414.75 PASS AF=0.482759;AO=41;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-1.23167e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.943;QD=19.0691;RBI=0.00243271;REFB=-0.00516738;REVB=-0.00243268;RO=44;SAF=23;SAR=18;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358955;STB=0.531546;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00627024;OID=.;OPOS=177113779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:44:45:41:42:0.482759:18:23:23:21:18:24:23:22 chr4 177113836 . C T 906.2 PASS AF=0.553459;AO=88;DP=159;FAO=88;FDP=159;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=0.00858655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.774;QD=22.7975;RBI=0.0247357;REFB=-0.00921706;REVB=-0.0231976;RO=71;SAF=42;SAR=46;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358944;STB=0.519584;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00738576;OID=.;OPOS=177113836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:71:71:88:88:0.553459:46:42:37:34:46:42:37:34 chr4 177113956 . A G 594.99 PASS AF=0.425676;AO=63;DP=148;FAO=63;FDP=148;FR=.;FRO=85;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.0633287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.165;QD=16.0808;RBI=0.0667941;REFB=-0.00478237;REVB=-0.0212349;RO=85;SAF=28;SAR=35;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00951645;STB=0.505326;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00720774;OID=.;OPOS=177113956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:85:85:63:63:0.425676:35:28:37:48:35:28:37:48 chr4 177605081 . CTCA C 982.87 PASS AF=0.957746;AO=68;DP=73;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00778195;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=3;MLLD=294.785;QD=55.3732;RBI=0.0147038;REFB=-0.00689483;REVB=0.0124757;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506427;STBP=0.729;TYPE=del;VARB=9.01867e-05;OID=.;OPOS=177605082;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.957746:68:73:68:71:3:33:35:1:2:8:0:33:35:0:0 chr4 178102691 . C G 2262.17 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0847;QD=63.2775;RBI=0.0291526;REFB=0;REVB=0.0173182;RO=0;SAF=72;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496101;OID=.;OPOS=178102691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:143:0:0:142:143:1:70:72:0:0:71:72:0:0 chr4 178274565 . A G 1189.03 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00233734;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.2224;QD=60.2039;RBI=0.0319787;REFB=0;REVB=-0.0318931;RO=0;SAF=26;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173595;OID=.;OPOS=178274565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:51:26:0:0:51:28:0:0 chr4 178274694 . T G 1838.42 PASS AF=1;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.684;QD=60.7744;RBI=0.0355895;REFB=0;REVB=0.024319;RO=0;SAF=56;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13336e-05;OID=.;OPOS=178274694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:120:121:1:64:56:0:0:65:56:0:0 chr4 178274750 . C T 1343.19 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568357;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.759;QD=62.4738;RBI=0.00804094;REFB=0;REVB=-0.00568803;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.23493e-05;OID=.;OPOS=178274750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0 chr4 178274835 . A C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2636;QD=47.8216;RBI=0.0412395;REFB=0;REVB=0.0394585;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000785074;OID=.;OPOS=178274835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr4 178281754 . G A 1254.39 PASS AF=0.934783;AO=84;DP=91;FAO=86;FDP=92;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0178086;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.99;QD=54.5389;RBI=0.0390354;REFB=-0.144251;REVB=0.0347364;RO=6;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745662;STB=0.538453;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00320232;OID=.;OPOS=178281754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:91:92:6:6:84:86:0.934783:35:49:0:6:36:50:0:6 chr4 178359960 . G C 1008.46 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2848;QD=59.321;RBI=0.0353814;REFB=0;REVB=-0.00249949;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253779;OID=.;OPOS=178359960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0 chr4 178881982 . G T 929.32 PASS AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00855673;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.938;QD=55.4819;RBI=0.00932253;REFB=-0.0364795;REVB=0.00370028;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512191;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000117752;OID=.;OPOS=178881982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:67:67:0:2:65:65:0.970149:25:40:0:0:25:40:2:0 chr4 179037990 . C T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00447053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.74;QD=58.9625;RBI=0.00920739;REFB=0;REVB=0.00804925;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71899e-06;OID=.;OPOS=179037990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0 chr4 179327856 . G A 2055.31 PASS AF=0.992481;AO=132;DP=135;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0370227;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7573;QD=61.814;RBI=0.0382376;REFB=0.0157007;REVB=-0.00956225;RO=0;SAF=80;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.000451344;OID=.;OPOS=179327856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:135:133:0:1:132:132:0.992481:52:80:0:0:52:80:0:1 chr4 183601847 . T C 2086.57 PASS AF=0.992593;AO=133;DP=133;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.207;QD=61.8244;RBI=0.0636289;REFB=-0.0686963;REVB=0.0600698;RO=0;SAF=57;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85809e-08;STB=0.503225;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00126842;OID=.;OPOS=183601847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:135:0:1:133:134:0.992593:76:57:0:0:77:57:0:1 chr4 183652175 . T C 2961.03 PASS AF=1;AO=186;DP=187;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00360787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.114;QD=63.3375;RBI=0.0425895;REFB=0;REVB=0.0424364;RO=0;SAF=75;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36272e-05;OID=.;OPOS=183652175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:187:187:0:0:186:187:1:111:75:0:0:111:76:0:0 chr4 183674697 . C T 617.6 PASS AF=0.453901;AO=64;DP=141;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.0110251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.204;QD=17.5205;RBI=0.0178689;REFB=-0.00811876;REVB=-0.0140622;RO=77;SAF=19;SAR=45;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157222;STB=0.587844;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0111995;OID=.;OPOS=183674697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:77:77:64:64:0.453901:45:19:34:43:45:19:34:43 chr4 183720850 . C T 339.82 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.118948;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.234;QD=28.9208;RBI=0.121737;REFB=-0.0745439;REVB=0.0259123;RO=18;SAF=16;SAR=13;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113051;STB=0.562183;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0381607;OID=.;OPOS=183720850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:18:18:29:29:0.617021:13:16:7:11:13:16:7:11 chr4 183721852 . G A 329.2 PASS AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=0.0353168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.785;QD=13.7165;RBI=0.0354496;REFB=-0.00489182;REVB=0.00306636;RO=59;SAF=18;SAR=19;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133234;STB=0.575717;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00418001;OID=.;OPOS=183721852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:59:59:37:37:0.385417:19:18:36:23:19:18:36:23 chr4 184242959 . C G 182.97 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0204205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2191;QD=17.4259;RBI=0.0459124;REFB=-0.00276837;REVB=-0.0411212;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170466;STB=0.596916;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00122;OID=.;OPOS=184242959;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:10:9:15:8:10:9:15:8 chr4 184243528 . G A 86.06 PASS AF=0.392857;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00783341;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.04;QD=12.2936;RBI=0.00931726;REFB=-0.0166308;REVB=0.0050447;RO=18;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487512;STB=0.530977;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0279019;OID=.;OPOS=184243528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:18:17:10:11:0.392857:6:4:8:10:7:4:7:10 chr4 184426387 . C T 736.36 PASS AF=0.441341;AO=79;DP=179;FAO=79;FDP=179;FR=.;FRO=100;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=63;FSRR=37;FWDB=0.0074261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.94;QD=16.4551;RBI=0.00743059;REFB=-0.0385716;REVB=-0.000258122;RO=100;SAF=45;SAR=34;SRF=63;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624821;STB=0.534723;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0392198;OID=.;OPOS=184426387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:100:100:79:79:0.441341:34:45:63:37:34:45:63:37 chr4 184560790 . G A 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.611;QD=62.0214;RBI=0.0221198;REFB=0;REVB=0.00233237;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176995;OID=.;OPOS=184560790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr4 184570649 . CT C 40.01 PASS AF=0.325;AO=15;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.080102;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.3682;QD=4.00081;RBI=0.184156;REFB=-0.0490624;REVB=-0.165823;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32362;STB=0.731334;STBP=0.07;TYPE=del;VARB=0.0586843;OID=.;OPOS=184570650;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.325:15:40:13:40:27:10:3:12:15:40:23:11:4:10:13 chr4 184572218 . G A 157.11 PASS AF=0.323077;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0134357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.851;QD=9.66822;RBI=0.0141147;REFB=0.00814154;REVB=-0.00432506;RO=43;SAF=12;SAR=9;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667432;STB=0.529384;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=-0.0212301;OID=.;OPOS=184572218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:43:44:21:21:0.323077:9:12:27:16:9:12:27:17 chr4 184596309 . CT C 446.02 PASS AF=0.458678;AO=104;DP=242;FAO=111;FDP=242;FR=.;FRO=131;FSAF=70;FSAR=41;FSRF=76;FSRR=55;FWDB=-0.00116701;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.7156;QD=7.37229;RBI=0.164776;REFB=0.0117272;REVB=0.164772;RO=120;SAF=69;SAR=35;SRF=70;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841002;STB=0.528879;STBP=0.42;TYPE=del;VARB=0.0142716;OID=.;OPOS=184596310;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.458678:104:242:111:242:131:70:41:76:55:99:120:69:35:70:50 chr4 184596850 . A G 579.81 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357646;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8954;QD=61.0329;RBI=0.0366622;REFB=0;REVB=-0.00806308;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0010289;OID=.;OPOS=184596850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr4 184600601 . A G 1640.08 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.961;QD=60.1865;RBI=0.00238653;REFB=0;REVB=0.000582282;RO=0;SAF=71;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99016e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10575e-06;OID=.;OPOS=184600601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:37:71:0:0:38:71:0:0 chr4 184614874 . C T 459.04 PASS AF=0.480392;AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0212079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.029;QD=18.0017;RBI=0.0231158;REFB=-0.0063163;REVB=-0.00919592;RO=53;SAF=22;SAR=27;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567517;STB=0.531526;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0119577;OID=.;OPOS=184614874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:53:49:49:0.480392:27:22:27:26:27:22:27:26 chr4 184931818 . G A 172.13 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00817624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.125;QD=18.1185;RBI=0.0090969;REFB=-0.0185801;REVB=-0.00398782;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107618;STB=0.506128;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0241747;OID=.;OPOS=184931818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:11:7:8:12:11:7:8:12 chr4 185012398 . T C 670.66 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00245512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.574;QD=62.3866;RBI=0.0250107;REFB=0;REVB=0.0248899;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143273;OID=.;OPOS=185012398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:13:29:0:0:14:29:0:0 chr4 185310218 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147472;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.511;QD=57.2025;RBI=0.0211379;REFB=0;REVB=0.0151436;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45894e-06;OID=.;OPOS=185310218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr4 185587165 . A G 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.118;QD=60.8835;RBI=0.0364166;REFB=0;REVB=0.00759435;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72723e-05;OID=.;OPOS=185587165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr4 185655171 . C T 741.44 PASS AF=0.964286;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0261761;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.143;QD=52.9601;RBI=0.0319459;REFB=-0.0678367;REVB=0.0183126;RO=2;SAF=21;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427715;STB=0.521731;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00142086;OID=.;OPOS=185655171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:2:2:53:54:0.964286:32:21:2:0:32:22:2:0 chr4 185655190 . C G 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.067;QD=57.6807;RBI=0.0356238;REFB=0;REVB=0.0169908;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133655;OID=.;OPOS=185655190;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0 chr4 185678081 . T C 362.67 PASS AF=0.369748;AO=44;DP=118;FAO=44;FDP=119;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=0.0113556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.841;QD=12.1904;RBI=0.0122801;REFB=-0.00926413;REVB=-0.00467457;RO=73;SAF=23;SAR=21;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118959;STB=0.566008;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0119553;OID=.;OPOS=185678081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:73:75:44:44:0.369748:21:23:46:27:21:23:47:28 chr4 185678110 . A G 1624.41 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.281;QD=60.1634;RBI=0.0234233;REFB=0;REVB=0.0131041;RO=0;SAF=64;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72207e-05;OID=.;OPOS=185678110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:44:64:0:0:44:64:0:0 chr4 185678118 . C G 1526.0 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103263;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.751;QD=59.8433;RBI=0.0507158;REFB=0;REVB=0.0496534;RO=0;SAF=60;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100635;OID=.;OPOS=185678118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:102:102:1:42:60:0:0:42:60:0:0 chr4 185686032 . C T 802.26 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0041838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.467;QD=55.3282;RBI=0.088605;REFB=-0.121764;REVB=0.0885062;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017147;STB=0.509088;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00133773;OID=.;OPOS=185686032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:27:30:0:1:27:30:0:1 chr4 185735054 . G A 220.07 PASS AF=0.412698;AO=25;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0141305;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.673;QD=13.9726;RBI=0.0153718;REFB=-0.0206906;REVB=0.00605146;RO=37;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091827;STB=0.537672;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0362266;OID=.;OPOS=185735054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:25:26:0.412698:15:10:18:19:15:11:18:19 chr4 185940952 . C G 338.99 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00166746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.413;QD=17.8416;RBI=0.0116651;REFB=0.000129565;REVB=-0.0115453;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261809;STB=0.514633;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.000237116;OID=.;OPOS=185940952;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:17:19:20:20:17:19:20:20 chr4 186091487 . G A 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0226279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.012;QD=17.325;RBI=0.0339358;REFB=-0.0127216;REVB=0.0252906;RO=24;SAF=14;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037267;STB=0.538422;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.016152;OID=.;OPOS=186091487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:6:14:16:8:6:14:16:9 chr4 186097045 . C T 361.14 PASS AF=0.410526;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.00368578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.186;QD=15.206;RBI=0.00378374;REFB=-0.00106072;REVB=0.000855434;RO=53;SAF=24;SAR=15;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124818;STB=0.516121;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00119181;OID=.;OPOS=186097045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:56:39:39:0.410526:15:24:32:21:15:24:33:23 chr4 186111639 . T C 399.06 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.000670473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.768;QD=23.8244;RBI=0.0158898;REFB=-0.0191742;REVB=0.0158757;RO=28;SAF=18;SAR=21;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564873;STB=0.531019;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0215452;OID=.;OPOS=186111639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:21:18:15:13:21:18:15:13 chr4 186112111 . G A 183.86 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00664269;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.922;QD=17.9372;RBI=0.0108746;REFB=-0.00199309;REVB=0.00860993;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18428;STB=0.605364;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00317846;OID=.;OPOS=186112111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:13:6:11:11:13:6:11:11 chr4 186339584 . A G 673.22 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197815;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.858;QD=62.6247;RBI=0.0472286;REFB=0;REVB=0.0428862;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261889;OID=.;OPOS=186339584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr4 186347055 . G A 263.06 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0384685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.076;QD=47.8284;RBI=0.0412264;REFB=-0.121218;REVB=0.0148253;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518501;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00228715;OID=.;OPOS=186347055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:22:0:1:21:21:0.954545:13:8:0:0:13:8:0:1 chr4 186357523 . C G 769.43 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.237;QD=56.9945;RBI=0.0351964;REFB=0;REVB=-0.0285956;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172867;OID=.;OPOS=186357523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chr4 186361876 . A G 523.78 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325725;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.149;QD=59.8609;RBI=0.00842188;REFB=0;REVB=0.00776649;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.93176e-05;OID=.;OPOS=186361876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr4 186379371 . G A 1283.41 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9544;QD=61.851;RBI=0.00816251;REFB=0;REVB=0.00583849;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41847e-05;OID=.;OPOS=186379371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:50:33:0:0:50:33:0:0 chr4 186379899 . G C 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0139082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.023;QD=23.5283;RBI=0.0139206;REFB=-0.0171354;REVB=0.000587419;RO=15;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144798;STB=0.580568;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0146815;OID=.;OPOS=186379899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:9:11:11:4:9:11:11:4 chr4 186380243 . A C 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00295251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4933;QD=10.9358;RBI=0.00596123;REFB=-0.00121086;REVB=0.0051787;RO=33;SAF=4;SAR=12;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350309;STB=0.701863;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0026702;OID=.;OPOS=186380243;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:34:16:16:0.32:12:4:18:15:12:4:18:16 chr4 186380295 . A G 230.67 PASS AF=0.442623;AO=26;DP=60;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0102707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.44;QD=15.1258;RBI=0.0232794;REFB=-0.00629561;REVB=0.0208912;RO=34;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293531;STB=0.506078;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00756424;OID=.;OPOS=186380295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:34:34:26:27:0.442623:13:13:18:16:13:14:18:16 chr4 186380846 . A T 128.44 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00987587;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.398;QD=11.6767;RBI=0.0178984;REFB=-0.00651322;REVB=-0.0149272;RO=29;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168599;STB=0.599867;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0141426;OID=.;OPOS=186380846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:29:29:15:15:0.340909:9:6:16:13:9:6:16:13 chr4 186381165 . G A 344.01 PASS AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0287044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.603;QD=16.3815;RBI=0.0287234;REFB=-0.00524587;REVB=-0.00104484;RO=47;SAF=21;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140883;STB=0.579175;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0106365;OID=.;OPOS=186381165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:16:21:20:27:16:21:20:27 chr4 186382206 . A G 209.05 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.0108693;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.671;QD=11.4546;RBI=0.0113188;REFB=-0.0105005;REVB=0.00315828;RO=47;SAF=10;SAR=16;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363735;STB=0.708103;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0303301;OID=.;OPOS=186382206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:47:47:26:26:0.356164:16:10:34:13:16:10:34:13 chr4 186391868 . T C 1176.74 PASS AF=0.920455;AO=81;DP=88;FAO=81;FDP=88;FR=.;FRO=7;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0487029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.434;QD=53.4884;RBI=0.0523731;REFB=-0.19861;REVB=0.0192604;RO=7;SAF=38;SAR=43;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796187;STB=0.542158;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0025291;OID=.;OPOS=186391868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:88:88:7:7:81:81:0.920455:43:38:7:0:43:38:7:0 chr4 186391898 . C T 1259.56 PASS AF=0.988095;AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00879158;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.948;QD=59.9789;RBI=0.0138367;REFB=-0.100975;REVB=0.0106846;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000383135;OID=.;OPOS=186391898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:84:0:1:82:83:0.988095:45:37:0:0:45:38:1:0 chr4 186393372 . T C 296.01 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00558474;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.4908;QD=18.2158;RBI=0.0612924;REFB=0.0169122;REVB=-0.0610375;RO=33;SAF=12;SAR=20;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182541;STB=0.510198;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=-0.0187633;OID=.;OPOS=186393372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:20:12:13:20:20:12:13:20 chr4 186423637 . G A 290.11 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0133518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4858;QD=16.5777;RBI=0.0582504;REFB=-0.008862;REVB=-0.0566995;RO=37;SAF=15;SAR=17;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00891216;STB=0.502687;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00810402;OID=.;OPOS=186423637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:38:32:32:0.457143:17:15:17:20:17:15:18:20 chr4 186507298 . AAT A 229.41 PASS AF=0.916667;AO=20;DP=23;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0164378;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=2;MLLD=194.602;QD=38.2357;RBI=0.0301925;REFB=-0.0778144;REVB=0.0253256;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.541629;STBP=0.218;TYPE=del;VARB=0.00847095;OID=.;OPOS=186507299;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.916667:20:23:22:24:2:11:11:0:2:7:0:10:10:0:0 chr4 186528433 . T C 358.81 PASS AF=0.5;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0108139;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.377;QD=19.3949;RBI=0.013762;REFB=-0.00347449;REVB=-0.00851186;RO=37;SAF=22;SAR=15;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130001;STB=0.571947;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0040369;OID=.;OPOS=186528433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:37:37:37:37:0.5:15:22:27:10:15:22:27:10 chr4 187004074 . C T 287.94 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00384154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.945;QD=18.5768;RBI=0.0227356;REFB=-0.0158799;REVB=0.0224087;RO=31;SAF=24;SAR=7;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401892;STB=0.522482;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0176807;OID=.;OPOS=187004074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:7:24:23:8:7:24:23:8 chr4 187004217 . C T 337.81 PASS AF=0.607143;AO=31;DP=53;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0526535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6692;QD=24.1293;RBI=0.0580656;REFB=0.000838627;REVB=0.024479;RO=22;SAF=24;SAR=7;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135251;STB=0.532;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.00025419;OID=.;OPOS=187004217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:56:22:22:31:34:0.607143:7:24:14:8:10:24:14:8 chr4 187074833 . A G 2252.25 PASS AF=1;AO=128;DP=157;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00403768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.465;QD=56.6605;RBI=0.0401224;REFB=0;REVB=0.0399187;RO=0;SAF=87;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262637;OID=.;OPOS=187074833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:159:0:0:128:159:1:41:87:0:0:69:90:0:0 chr4 187077206 . A G 1494.99 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0180758;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.274;QD=58.6271;RBI=0.0255;REFB=-0.0629498;REVB=-0.0179865;RO=1;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870439;STB=0.504586;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000177372;OID=.;OPOS=187077206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:102:1:1:100:101:0.990196:54:46:0:1:54:47:0:1 chr4 187078785 . A G 3222.41 PASS AF=1;AO=208;DP=209;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300884;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.118;QD=61.9695;RBI=0.0456367;REFB=0;REVB=0.0343132;RO=0;SAF=124;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48268e-05;OID=.;OPOS=187078785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:209:208:0:0:208:208:1:84:124:0:0:84:124:0:0 chr4 187079047 . A G 308.0 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.00124452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7593;QD=24.1569;RBI=0.0536544;REFB=-0.0179909;REVB=-0.05364;RO=21;SAF=18;SAR=12;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232071;STB=0.627823;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0106438;OID=.;OPOS=187079047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:12:18:6:15:12:18:6:15 chr4 187079183 . G A 572.73 PASS AF=0.527273;AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0352854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.431;QD=20.8267;RBI=0.0369342;REFB=-0.0142572;REVB=0.010912;RO=52;SAF=33;SAR=25;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927491;STB=0.551022;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0133056;OID=.;OPOS=187079183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:52:52:58:58:0.527273:25:33:24:28:25:33:24:28 chr4 187088248 . C T 333.71 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00782627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.363;QD=21.8825;RBI=0.0253511;REFB=0.0142739;REVB=-0.0241128;RO=27;SAF=13;SAR=21;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107709;STB=0.559253;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-0.00762199;OID=.;OPOS=187088248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:21:13:7:20:21:13:7:20 chr4 187120211 . C A 239.66 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00403734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.741;QD=18.0872;RBI=0.00947401;REFB=0.00120462;REVB=0.00857069;RO=27;SAF=5;SAR=21;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136206;STB=0.577103;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=-0.00228106;OID=.;OPOS=187120211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:21:5:8:19:21:5:8:19 chr4 187122319 . T G 164.59 PASS AF=0.377358;AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00253392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.124;QD=12.4217;RBI=0.00411533;REFB=-0.0139832;REVB=-0.00324271;RO=33;SAF=8;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702086;STB=0.5218;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0308004;OID=.;OPOS=187122319;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:33:33:19:20:0.377358:11:8:16:17:11:9:16:17 chr4 187133576 . A C 851.16 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.876;QD=57.7054;RBI=0.0380813;REFB=0;REVB=0.0209148;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126355;OID=.;OPOS=187133576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:27:31:0:0:27:32:0:0 chr4 187158034 . G A 246.16 PASS AF=0.32967;AO=30;DP=92;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.0167267;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2588;QD=10.8203;RBI=0.0329975;REFB=0.00345727;REVB=-0.0284438;RO=58;SAF=16;SAR=14;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193472;STB=0.603706;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.00582904;OID=.;OPOS=187158034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:58:61:30:30:0.32967:14:16:21:37:14:16:23:38 chr4 187179210 . T C 648.48 PASS AF=0.977273;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0140871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2288;QD=58.9523;RBI=0.0141497;REFB=-0.0480634;REVB=0.0013291;RO=1;SAF=7;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624128;STB=0.529398;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.000731941;OID=.;OPOS=187179210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:44:1:1:42:43:0.977273:35:7:1:0:35:8:1:0 chr4 187422331 . C A 1017.64 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00425415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9011;QD=56.5353;RBI=0.00603313;REFB=-0.0311597;REVB=-0.00427794;RO=2;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230524;STB=0.512192;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00465252;OID=.;OPOS=187422331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:40:30:0:2:40:30:0:2 chr4 187454951 . T C 1080.53 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.698;QD=60.0297;RBI=0.0407193;REFB=0;REVB=0.0048972;RO=0;SAF=46;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106275;OID=.;OPOS=187454951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:26:46:0:0:26:46:0:0 chr4 187454972 . T C 432.89 PASS AF=0.722222;AO=39;DP=54;FAO=39;FDP=54;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.0303672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8875;QD=32.066;RBI=0.0307531;REFB=-0.0252487;REVB=-0.00485673;RO=15;SAF=13;SAR=26;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338031;STB=0.682834;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0384018;OID=.;OPOS=187454972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:15:15:39:39:0.722222:26:13:15:0:26:13:15:0 chr4 187510280 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.00570363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.051;QD=19.0179;RBI=0.0385887;REFB=-0.00176381;REVB=0.0381649;RO=14;SAF=3;SAR=12;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803503;STB=0.545397;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00181473;OID=.;OPOS=187510280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:12:3:2:12:12:3:2:12 chr4 187516880 . A G 1209.72 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.087;QD=61.2516;RBI=0.0420095;REFB=0;REVB=0.0401611;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50614e-05;OID=.;OPOS=187516880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:42:36:0:0:43:36:0:0 chr4 187517758 . G A 306.57 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00350804;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=285.718;QD=27.2505;RBI=0.0127282;REFB=-0.0219356;REVB=-0.0122352;RO=18;SAF=23;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268223;STB=0.650257;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0124635;OID=.;OPOS=187517758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:4:23:11:7:4:23:11:7 chr4 187519206 . C G 1674.01 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220704;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.066;QD=60.3245;RBI=0.0408517;REFB=0;REVB=0.040792;RO=0;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8281e-05;OID=.;OPOS=187519206;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:111:0:0:109:111:1:56:53:0:0:58:53:0:0 chr4 187522528 . C T 373.42 PASS AF=0.412371;AO=40;DP=97;FAO=40;FDP=97;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0269635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.87;QD=15.3987;RBI=0.0461009;REFB=-0.0208142;REVB=-0.0373934;RO=57;SAF=8;SAR=32;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303009;STB=0.673373;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0244087;OID=.;OPOS=187522528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:57:57:40:40:0.412371:32:8:25:32:32:8:25:32 chr4 187525020 . A C 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.372;QD=55.097;RBI=0.0466455;REFB=0;REVB=-0.00819107;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258671;OID=.;OPOS=187525020;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr4 187531022 . A G 546.67 PASS AF=0.548387;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0015776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.563;QD=23.5127;RBI=0.032598;REFB=-0.00437928;REVB=-0.0325598;RO=42;SAF=30;SAR=21;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342158;STB=0.518799;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00383307;OID=.;OPOS=187531022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:42:42:51:51:0.548387:21:30:23:19:21:30:23:19 chr4 187534363 . G A 1558.56 PASS AF=0.888889;AO=112;DP=127;FAO=112;FDP=126;FR=.;FRO=14;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0460351;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.403;QD=49.478;RBI=0.0460954;REFB=-0.113258;REVB=-0.00235745;RO=13;SAF=44;SAR=68;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121581;STB=0.568615;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000706193;OID=.;OPOS=187534363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:127:126:13:14:112:112:0.888889:68:44:13:0:68:44:14:0 chr4 187534375 . A G 674.49 PASS AF=0.472222;AO=68;DP=144;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.00149881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.068;QD=18.7358;RBI=0.0151032;REFB=-0.00455764;REVB=-0.0150286;RO=75;SAF=36;SAR=32;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719735;STB=0.536316;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00549286;OID=.;OPOS=187534375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:75:76:68:68:0.472222:32:36:34:41:32:36:35:41 chr4 187538330 . G A 446.06 PASS AF=0.395349;AO=51;DP=129;FAO=51;FDP=129;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.0378352;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.029;QD=13.8314;RBI=0.0383328;REFB=-0.0120239;REVB=0.00615634;RO=77;SAF=22;SAR=29;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666875;STB=0.541791;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0165929;OID=.;OPOS=187538330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:77:78:51:51:0.395349:29:22:38:39:29:22:39:39 chr4 187538942 . T G 2047.55 PASS AF=0.9125;AO=146;DP=160;FAO=146;FDP=160;FR=.;FRO=14;FSAF=75;FSAR=71;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00699708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6598;QD=51.1887;RBI=0.0674884;REFB=0.0136909;REVB=-0.0671247;RO=14;SAF=75;SAR=71;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259589;STB=0.513697;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.0059607;OID=.;OPOS=187538942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:160:160:14:14:146:146:0.9125:71:75:5:9:71:75:5:9 chr4 187539217 . G A 198.57 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.041194;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9215;QD=18.4713;RBI=0.0464538;REFB=-0.0516415;REVB=-0.0214711;RO=23;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337905;STB=0.519211;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0569186;OID=.;OPOS=187539217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:23:23:20:20:0.465116:8:12:13:10:8:12:13:10 chr4 187540635 . T G 200.74 PASS AF=0.442308;AO=20;DP=49;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0149971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.667;QD=15.4411;RBI=0.0247798;REFB=-0.0222754;REVB=0.0197263;RO=29;SAF=17;SAR=3;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42685;STB=0.715269;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0241946;OID=.;OPOS=187540635;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:52:29:29:20:23:0.442308:3:17:15:14:4:19:15:14 chr4 187540654 . T A 251.48 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00462674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.65;QD=17.0494;RBI=0.0329964;REFB=-0.0139872;REVB=-0.0326704;RO=31;SAF=21;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187235;STB=0.60598;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0181773;OID=.;OPOS=187540654;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:7:21:18:13:7:21:18:13 chr4 187540918 . G C 212.36 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00875495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.759;QD=14.3975;RBI=0.0167373;REFB=0.00332387;REVB=-0.0142649;RO=34;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122053;STB=0.569177;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.00721297;OID=.;OPOS=187540918;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:14:11:11:23:14:11:11:23 chr4 187541761 . G A 401.91 PASS AF=0.422018;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=-0.00752928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.448;QD=14.749;RBI=0.0397407;REFB=0.00142928;REVB=-0.039021;RO=63;SAF=27;SAR=19;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513903;STB=0.528862;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00292431;OID=.;OPOS=187541761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:63:63:46:46:0.422018:19:27:40:23:19:27:40:23 chr4 187542316 . T C 172.14 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.046439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.96;QD=21.5175;RBI=0.0465237;REFB=-0.0277314;REVB=-0.00280647;RO=14;SAF=2;SAR=14;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47945;STB=0.777366;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0379182;OID=.;OPOS=187542316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:16:16:0.5:14:2:8:6:14:2:8:6 chr4 187542736 . T C 448.87 PASS AF=0.462264;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00747467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.985;QD=16.9386;RBI=0.00780814;REFB=-0.0104465;REVB=0.00225749;RO=57;SAF=25;SAR=24;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521229;STB=0.529038;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.007338;OID=.;OPOS=187542736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:57:57:49:49:0.462264:24:25:26:31:24:25:26:31 chr4 187542755 . T C 586.06 PASS AF=0.531532;AO=58;DP=110;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0133797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.035;QD=21.1192;RBI=0.0263985;REFB=-0.0319755;REVB=0.0227566;RO=52;SAF=27;SAR=31;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462116;STB=0.528916;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0352078;OID=.;OPOS=187542755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:52:52:58:59:0.531532:31:27:27:25:32:27:27:25 chr4 187549428 . C T 388.83 PASS AF=0.427083;AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0207841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.018;QD=16.2011;RBI=0.0214018;REFB=-0.0175123;REVB=-0.00510471;RO=55;SAF=23;SAR=18;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346295;STB=0.519498;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0266169;OID=.;OPOS=187549428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:55:55:41:41:0.427083:18:23:29:26:18:23:29:26 chr4 187557893 . T C 3273.49 PASS AF=1;AO=210;DP=210;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5082;QD=62.0567;RBI=0.0664325;REFB=0;REVB=0.0637981;RO=0;SAF=99;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85394e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186003;OID=.;OPOS=187557893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:210:211:0:0:210:211:1:111:99:0:0:112:99:0:0 chr4 187627792 . T C 256.46 PASS AF=0.434783;AO=29;DP=68;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0162112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.503;QD=14.8673;RBI=0.0231382;REFB=-0.0278285;REVB=-0.0165097;RO=37;SAF=15;SAR=14;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00369881;STB=0.502911;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0508754;OID=.;OPOS=187627792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:37:39:29:30:0.434783:14:15:19:18:14:16:21:18 chr4 187628398 . C G 297.85 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.00257077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.45;QD=15.8854;RBI=0.00527002;REFB=-0.0240499;REVB=-0.00460046;RO=42;SAF=15;SAR=18;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501563;STB=0.528239;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0232115;OID=.;OPOS=187628398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:18:15:17:25:18:15:17:25 chr4 187629140 . G C 381.17 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0069501;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3022;QD=19.0586;RBI=0.0224092;REFB=-0.00488021;REVB=-0.0213041;RO=41;SAF=19;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444117;STB=0.524714;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00669738;OID=.;OPOS=187629140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:20:19:18:23:20:19:18:23 chr4 187630590 . G A 575.57 PASS AF=0.577778;AO=51;DP=92;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0125324;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6261;QD=25.5807;RBI=0.0178366;REFB=-0.0249079;REVB=0.0126918;RO=38;SAF=32;SAR=19;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103069;STB=0.550245;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0198754;OID=.;OPOS=187630590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:38:38:51:52:0.577778:19:32:19:19:20:32:19:19 chr4 189012728 . G C 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00175111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.322;QD=61.8526;RBI=0.00377462;REFB=0;REVB=0.00334385;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6329e-07;OID=.;OPOS=189012728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0 chr4 189012809 . C T 233.42 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00636511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.517;QD=15.0596;RBI=0.0136531;REFB=-0.0153422;REVB=-0.0120786;RO=35;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135573;STB=0.576866;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0206179;OID=.;OPOS=189012809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:11:16:16:19:11:16:16:19 chr4 189018486 . A G 217.62 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0144679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9275;QD=22.9078;RBI=0.0222468;REFB=-0.0150045;REVB=-0.0168997;RO=17;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893511;STB=0.549953;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.012155;OID=.;OPOS=189018486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:10:11:7:10:10:11:7:10 chr4 189022324 . C T 404.16 PASS AF=0.493976;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0205717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.68;QD=19.4776;RBI=0.0255065;REFB=-0.0101282;REVB=0.0150793;RO=42;SAF=18;SAR=23;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120374;STB=0.566869;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0098422;OID=.;OPOS=189022324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:42:41:41:0.493976:23:18:24:18:23:18:24:18 chr4 189026524 . C G 293.6 PASS AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0290075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3584;QD=19.9053;RBI=0.0310133;REFB=0.0160345;REVB=-0.0109724;RO=28;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047336;STB=0.526299;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0128022;OID=.;OPOS=189026524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:15:16:16:12:15:16:16:12 chr4 189042746 . T C 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00788316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.108;QD=19.6971;RBI=0.0233315;REFB=0.006493;REVB=0.0219594;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611111;STB=0.534489;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00395352;OID=.;OPOS=189042746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:9:13:11:10:9:13 chr4 190630778 . GC AT 2647.73 PASS AF=0.68652;AO=218;DP=326;FAO=219;FDP=319;FR=.;FRO=100;FSAF=115;FSAR=104;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=0.00290477;FXX=0.0303942;HRUN=1;LEN=2;MLLD=163.246;QD=33.2004;RBI=0.00409003;REFB=-0.044452;REVB=-0.00287935;RO=92;SAF=115;SAR=103;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274049;STB=0.52042;STBP=0.27;TYPE=mnp;VARB=0.022922;OID=.;OPOS=190630778;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:319:92:100:218:219:0.68652:103:115:44:48:104:115:46:54 chr4 190630786 . A G 2941.97 PASS AF=0.691011;AO=246;DP=356;FAO=246;FDP=356;FR=.;FRO=110;FSAF=126;FSAR=120;FSRF=51;FSRR=59;FWDB=0.0204734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.072;QD=33.0559;RBI=0.0220088;REFB=-0.0239123;REVB=-0.00807628;RO=110;SAF=126;SAR=120;SRF=51;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280646;STB=0.515001;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0120993;OID=.;OPOS=190630786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:356:110:110:246:246:0.691011:120:126:51:59:120:126:51:59 chr4 190814990 . T C 33.0 PASS AF=0.139535;AO=6;DP=43;FAO=6;FDP=43;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0139356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.748;QD=3.06999;RBI=0.0339582;REFB=-0.0142566;REVB=-0.030967;RO=37;SAF=2;SAR=4;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389333;STB=0.770651;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0598733;OID=.;OPOS=190814990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:43:43:37:37:6:6:0.139535:4:2:25:12:4:2:25:12 chr4 190862155 . T G 1170.51 PASS AF=0.963415;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0201612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.0176;QD=57.098;RBI=0.0263194;REFB=0.000211943;REVB=-0.0169185;RO=2;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236559;STB=0.518514;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-1.41934e-06;OID=.;OPOS=190862155;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:82:82:2:3:79:79:0.963415:39:40:0:2:39:40:0:3 chr4 190862182 . C T 1208.96 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.033;QD=61.213;RBI=0.00912547;REFB=0;REVB=-0.00526911;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.786e-06;OID=.;OPOS=190862182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:44:34:0:0:45:34:0:0 chr4 190874206 . T A 253.28 PASS AF=0.235294;AO=39;DP=170;FAO=40;FDP=170;FR=.;FRO=130;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=0.000816863;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.603;QD=5.95957;RBI=0.0459532;REFB=0.00926699;REVB=-0.0459459;RO=131;SAF=20;SAR=19;SRF=68;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00792588;STB=0.507362;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.0116982;OID=.;OPOS=190874206;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:131:130:39:40:0.235294:19:20:68:63:19:21:67:63 chr4 190874234 . C T 273.66 PASS AF=0.222798;AO=43;DP=193;FAO=43;FDP=193;FR=.;FRO=150;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=78;FSRR=72;FWDB=0.0518909;FXX=0.00515437;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.205;QD=5.67162;RBI=0.0523783;REFB=0.00413745;REVB=0.00712868;RO=150;SAF=22;SAR=21;SRF=78;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106502;STB=0.506509;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.0158184;OID=.;OPOS=190874234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:150:150:43:43:0.222798:21:22:78:72:21:22:78:72 chr4 190874255 . A T 122.01 PASS AF=0.135678;AO=24;DP=196;FAO=27;FDP=199;FR=.;FRO=172;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=83;FSRR=89;FWDB=-0.00777999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.14;QD=2.45241;RBI=0.0102681;REFB=-0.00459144;REVB=-0.00670115;RO=169;SAF=15;SAR=9;SRF=80;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18921;STB=0.659814;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0441093;OID=.;OPOS=190874255;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:199:169:172:24:27:0.135678:9:15:80:89:9:18:83:89 chr4 190874290 . T A 164.47 PASS AF=0.16;AO=32;DP=200;FAO=32;FDP=200;FR=.;FRO=168;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=78;FSRR=90;FWDB=0.0113493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.309;QD=3.2893;RBI=0.0137266;REFB=-0.00340679;REVB=0.00772086;RO=167;SAF=21;SAR=11;SRF=78;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242418;STB=0.660648;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0252206;OID=.;OPOS=190874290;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:167:168:32:32:0.16:11:21:78:89:11:21:78:90 chr4 190876192 . A C 119.43 PASS AF=0.189189;AO=21;DP=112;FAO=21;FDP=111;FR=.;FRO=90;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=0.00399181;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.599;QD=4.30372;RBI=0.00788203;REFB=-0.00463731;REVB=0.00679646;RO=90;SAF=7;SAR=14;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279829;STB=0.678403;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0189771;OID=.;OPOS=190876192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:90:90:21:21:0.189189:14:7:50:40:14:7:50:40 chr4 190876195 . C T 1096.22 PASS AF=0.778761;AO=88;DP=113;FAO=88;FDP=113;FR=.;FRO=25;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0073461;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.523;QD=38.8042;RBI=0.0073844;REFB=-0.00474957;REVB=-0.000751083;RO=23;SAF=44;SAR=44;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591414;STB=0.530966;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00104416;OID=.;OPOS=190876195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:23:25:88:88:0.778761:44:44:15:8:44:44:16:9 chr4 190876196 . G A 65.28 PASS AF=0.131579;AO=14;DP=113;FAO=15;FDP=114;FR=.;FRO=99;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=0.00641775;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.581;QD=2.29056;RBI=0.0194584;REFB=-0.000188598;REVB=-0.0183696;RO=97;SAF=9;SAR=5;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171325;STB=0.642664;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00460207;OID=.;OPOS=190876196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:113:114:97:99:14:15:0.131579:5:9:49:48:5:10:50:49 chr4 190876204 . G A 1050.36 PASS AF=0.758929;AO=82;DP=117;FAO=85;FDP=112;FR=.;FRO=27;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00641806;FXX=0.0666611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0911;QD=37.5129;RBI=0.0495001;REFB=-0.00738295;REVB=0.0490823;RO=27;SAF=42;SAR=40;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484738;STB=0.523724;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00163853;OID=.;OPOS=190876204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:112:27:27:82:85:0.758929:40:42:11:16:42:43:11:16 chr4 190876242 . G A 1820.38 PASS AF=0.826347;AO=138;DP=167;FAO=138;FDP=167;FR=.;FRO=29;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0159535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0076;QD=43.602;RBI=0.0487782;REFB=-0.0214668;REVB=-0.0460955;RO=28;SAF=72;SAR=66;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296491;STB=0.512765;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00423491;OID=.;OPOS=190876242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:28:29:138:138:0.826347:66:72:12:16:66:72:13:16 chr4 190876256 . C T 73.2 PASS AF=0.109827;AO=19;DP=173;FAO=19;FDP=173;FR=.;FRO=154;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=77;FSRR=77;FWDB=-0.0590191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.699;QD=1.69242;RBI=0.0590213;REFB=-0.000149751;REVB=-0.000507302;RO=154;SAF=12;SAR=7;SRF=77;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161675;STB=0.617901;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00131308;OID=.;OPOS=190876256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:173:173:154:154:19:19:0.109827:7:12:77:77:7:12:77:77 chr4 190876263 . A T 37.58 PASS AF=0.0755814;AO=13;DP=172;FAO=13;FDP=172;FR=.;FRO=159;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=83;FSRR=76;FWDB=-0.0130214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.487;QD=0.874024;RBI=0.0201243;REFB=-0.00133197;REVB=-0.0153437;RO=159;SAF=6;SAR=7;SRF=83;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671036;STB=0.555668;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0174239;OID=.;OPOS=190876263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:172:172:159:159:13:13:0.0755814:7:6:83:76:7:6:83:76 chr4 190876278 . G A 45.55 PASS AF=0.0838323;AO=15;DP=169;FAO=14;FDP=167;FR=.;FRO=153;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=76;FSRR=77;FWDB=-0.0179825;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.005;QD=1.09111;RBI=0.0182684;REFB=-0.00199918;REVB=-0.00321899;RO=154;SAF=10;SAR=5;SRF=76;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202227;STB=0.634373;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.021845;OID=.;OPOS=190876278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:169:167:154:153:15:14:0.0838323:5:10:76:78:5:9:76:77 chr4 190876293 . C A 51.68 PASS AF=0.0920245;AO=15;DP=163;FAO=15;FDP=163;FR=.;FRO=148;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=73;FSRR=75;FWDB=-0.0296312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6362;QD=1.2682;RBI=0.0316255;REFB=0.000148653;REVB=-0.0110527;RO=148;SAF=10;SAR=5;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204219;STB=0.658224;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-0.00334267;OID=.;OPOS=190876293;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:163:163:148:148:15:15:0.0920245:5:10:73:75:5:10:73:75 chr4 190878563 . C A 138.88 PASS AF=0.225806;AO=21;DP=93;FAO=21;FDP=93;FR=.;FRO=72;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.00666671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9698;QD=5.97322;RBI=0.0128026;REFB=-0.00492735;REVB=-0.0109299;RO=68;SAF=10;SAR=11;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993907;STB=0.579038;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.014021;OID=.;OPOS=190878563;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:68:72:21:21:0.225806:11:10:27:41:11:10:27:45 chr4 190878580 . A G 40.79 PASS AF=0.1;AO=10;DP=100;FAO=10;FDP=100;FR=.;FRO=90;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=37;FSRR=53;FWDB=-0.0107963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.767;QD=1.63165;RBI=0.0239759;REFB=-0.000767853;REVB=0.0214076;RO=90;SAF=4;SAR=6;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134921;STB=0.510353;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.011513;OID=.;OPOS=190878580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:100:100:90:90:10:10:0.1:6:4:37:53:6:4:37:53 chr4 190878597 . C T 302.97 PASS AF=0.35514;AO=38;DP=108;FAO=38;FDP=107;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.0189453;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.566;QD=11.3259;RBI=0.0534603;REFB=-0.0167767;REVB=-0.0499908;RO=68;SAF=17;SAR=21;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261469;STB=0.520049;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0250893;OID=.;OPOS=190878597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:68:69:38:38:0.35514:21:17:32:36:21:17:33:36 chr4 190878654 . C G 169.54 PASS AF=0.228814;AO=27;DP=118;FAO=27;FDP=118;FR=.;FRO=91;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.0609754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3175;QD=5.74726;RBI=0.0655047;REFB=-0.00526027;REVB=-0.0239346;RO=90;SAF=13;SAR=14;SRF=40;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046643;STB=0.532427;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0141341;OID=.;OPOS=190878654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:90:91:27:27:0.228814:14:13:40:50:14:13:40:51 chr4 190881933 . A G 44.8 PASS AF=0.233333;AO=5;DP=29;FAO=7;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0330698;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=41.7388;QD=5.97287;RBI=0.0606034;REFB=0.0228623;REVB=-0.0507855;RO=18;SAF=1;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257959;STB=0.555391;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.0895887;OID=.;OPOS=190881933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:29:30:18:23:5:7:0.233333:4:1:7:11:5:2:8:15 chr4 190881969 . G A 60.04 PASS AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0370845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.7;QD=5.85756;RBI=0.0383127;REFB=0.00292885;REVB=-0.009623;RO=32;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180279;STB=0.61876;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-0.0259684;OID=.;OPOS=190881969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:41:41:32:32:9:9:0.219512:7:2:11:21:7:2:11:21 chr4 190881992 . T C 59.39 PASS AF=0.204545;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0134636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.004;QD=5.39882;RBI=0.0146665;REFB=-0.00016289;REVB=-0.0058171;RO=35;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142035;STB=0.594544;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.000957896;OID=.;OPOS=190881992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:44:44:35:35:9:9:0.204545:7:2:11:24:7:2:11:24 chr4 190881997 . A G 58.95 PASS AF=0.195652;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0366785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.673;QD=5.12633;RBI=0.0530037;REFB=-0.00515804;REVB=-0.0382633;RO=37;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118579;STB=0.579429;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0142296;OID=.;OPOS=190881997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:46:46:37:37:9:9:0.195652:7:2:11:26:7:2:11:26 chr4 190884225 . T TTTC 343.62 PASS AF=0.896552;AO=25;DP=34;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0110387;FXX=0.147016;HRUN=4;LEN=3;MLLD=265.368;QD=47.3955;RBI=0.0121917;REFB=-0.00811372;REVB=-0.00517525;RO=9;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109769;STB=0.52126;STBP=0.471;TYPE=ins;VARB=0.000569734;OID=.;OPOS=190884226;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.896552:25:34:26:29:3:12:14:2:1:16:9:11:14:6:3 chr4 190903938 . C T 1052.57 PASS AF=1;AO=66;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.99;QD=59.2997;RBI=0.00651326;REFB=0;REVB=0.00051279;RO=0;SAF=39;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159718;OID=.;OPOS=190903938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:71:0:0:66:71:1:27:39:0:0:32:39:0:0 chr4 190903950 . A G 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0580287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.287;QD=58.7816;RBI=0.0582012;REFB=0;REVB=0.00447747;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116649;OID=.;OPOS=190903950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0 chr4 190904645 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.502;QD=50.4135;RBI=0.0450856;REFB=0;REVB=0.0428413;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621546;OID=.;OPOS=190904645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr4 190906025 . G A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.841;QD=60.6102;RBI=0.0721111;REFB=0;REVB=0.0673303;RO=0;SAF=32;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29107e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198469;OID=.;OPOS=190906025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:6:32:0:0:6:32:0:0 chr5 163259 . GA G,GC 224.28 PASS AF=0.0555556,0.944444;AO=3,15;DP=19;FAO=1,17;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1,9;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109003,0.101824;FXX=0.0526039;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=130.558,145.477;QD=49.8405;RBI=0.109664,0.102129;REFB=0,0;REVB=0.0120256,0.00788824;RO=0;SAF=3,7;SAR=0,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00742589,0.00331353;OID=.,.;OPOS=163260,163260;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0555556,0.944444:3,15:19:1,17:18:0:1,9:0,8:0:0:4:0:3,7:0,8:0:0 chr5 163266 . C G 120.99 PASS AF=0.684211;AO=12;DP=18;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0739836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.493;QD=25.4708;RBI=0.0740283;REFB=-0.0596917;REVB=0.00257206;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510973;STB=0.540921;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0344711;OID=.;OPOS=163266;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:18:19:6:6:12:13:0.684211:5:7:4:2:6:7:4:2 chr5 163622 . G A 126.67 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00307906;FXX=0.0624805;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.0022;QD=16.8886;RBI=0.0272047;REFB=-0.0243645;REVB=0.0270299;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786514;STB=0.545388;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0266218;OID=.;OPOS=163622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:30:16:16:14:14:0.466667:5:9:9:7:5:9:9:7 chr5 174106 . G A 1371.95 PASS AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0116781;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.189;QD=60.3056;RBI=0.0264972;REFB=-0.00828196;REVB=0.023785;RO=1;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00902749;STB=0.509432;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.000105882;OID=.;OPOS=174106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:91:91:1:2:89:89:0.978022:52:37:0:1:52:37:0:2 chr5 181660 . T G 614.44 PASS AF=1;AO=26;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320231;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.625;QD=61.4436;RBI=0.146394;REFB=0;REVB=0.142849;RO=0;SAF=26;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00430923;OID=.;OPOS=181660;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:26:40:1:0:26:0:0:12:28:0:0 chr5 181730 . C G 834.0 PASS AF=0.898551;AO=63;DP=69;FAO=62;FDP=69;FR=.;FRO=7;FSAF=44;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0474227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9481;QD=48.3477;RBI=0.0561116;REFB=-0.0380915;REVB=-0.0299932;RO=6;SAF=45;SAR=18;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134102;STB=0.565894;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00970578;OID=.;OPOS=181730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:6:7:63:62:0.898551:18:45:0:6:18:44:1:6 chr5 181762 . A G 920.31 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00357727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.007;QD=58.4323;RBI=0.0697136;REFB=0;REVB=0.0696218;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173178;OID=.;OPOS=181762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:22:39:0:0:23:40:0:0 chr5 231111 . T C 1510.87 PASS AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261918;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.776;QD=59.8362;RBI=0.0338584;REFB=0;REVB=0.0214565;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63551e-05;OID=.;OPOS=231111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:51:49:0:0:52:49:0:0 chr5 311478 . T C 594.48 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.915;QD=60.9724;RBI=0.0304133;REFB=0;REVB=0.0105213;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9293e-05;OID=.;OPOS=311478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr5 367990 . G A 375.96 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.00316329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.44;QD=14.6003;RBI=0.0165927;REFB=-0.0117461;REVB=-0.0162884;RO=58;SAF=27;SAR=16;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264792;STB=0.517233;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0194233;OID=.;OPOS=367990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:58:60:43:43:0.417476:16:27:35:23:16:27:36:24 chr5 601893 . C CG 40.31 PASS AF=0.166667;AO=13;DP=107;FAO=17;FDP=102;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.00753796;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.7667;QD=1.58083;RBI=0.0810604;REFB=-0.00114101;REVB=-0.0807091;RO=93;SAF=8;SAR=5;SRF=48;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122766;STB=0.877769;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=-0.0621513;OID=.;OPOS=601894;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.166667:13:107:17:102:85:15:2:37:48:40:93:8:5:48:45 chr5 640705 . A G 271.64 PASS AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00524218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7326;QD=20.8957;RBI=0.0153037;REFB=-0.0231727;REVB=0.0143779;RO=24;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345638;STB=0.519217;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0327725;OID=.;OPOS=640705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:14:14:13:11:14:14:13:11 chr5 665280 . T C 1289.79 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00304824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.176;QD=61.4184;RBI=0.00654626;REFB=0;REVB=-0.00579325;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36556e-05;OID=.;OPOS=665280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:37:46:0:0:37:47:0:0 chr5 678062 . A G 429.39 PASS AF=0.381679;AO=50;DP=131;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0380204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.663;QD=13.111;RBI=0.0384619;REFB=-0.00915537;REVB=-0.00581128;RO=80;SAF=26;SAR=24;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217099;STB=0.508554;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0111858;OID=.;OPOS=678062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:80:81:50:50:0.381679:24:26:40:40:24:26:41:40 chr5 741736 . G T 72.93 PASS AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0187119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.603;QD=20.838;RBI=0.0313809;REFB=-0.00904801;REVB=0.0251917;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397983;STB=0.726799;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00633361;OID=.;OPOS=741736;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:6:3:5:0:6:3:5:0 chr5 748594 . T C 76.78 PASS AF=0.140351;AO=16;DP=114;FAO=16;FDP=114;FR=.;FRO=98;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.023369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.024;QD=2.69392;RBI=0.0238497;REFB=-0.00429472;REVB=-0.00476455;RO=98;SAF=3;SAR=13;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417475;STB=0.78976;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0245687;OID=.;OPOS=748594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:114:114:98:98:16:16:0.140351:13:3:50:48:13:3:50:48 chr5 748621 . C G 80.33 PASS AF=0.140496;AO=17;DP=119;FAO=17;FDP=121;FR=.;FRO=104;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=57;FSRR=47;FWDB=-0.00821622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8082;QD=2.65542;RBI=0.0486807;REFB=-0.0135805;REVB=-0.0479823;RO=102;SAF=3;SAR=14;SRF=57;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477924;STB=0.820735;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0754753;OID=.;OPOS=748621;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:119:121:102:104:17:17:0.140496:14:3:57:45:14:3:57:47 chr5 766910 . C T 3441.74 PASS AF=0.75;AO=273;DP=365;FAO=273;FDP=364;FR=.;FRO=91;FSAF=126;FSAR=147;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=-4.09317e-05;FXX=0.00546433;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.01;QD=37.8213;RBI=0.0106601;REFB=-0.0145888;REVB=0.01066;RO=87;SAF=126;SAR=147;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306573;STB=0.516538;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00443355;OID=.;OPOS=766910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:364:87:91:273:273:0.75:147:126:46:41:147:126:48:43 chr5 767033 . A C 2125.17 PASS AF=0.834225;AO=147;DP=179;FAO=156;FDP=187;FR=.;FRO=31;FSAF=67;FSAR=89;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0217176;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.158;QD=45.4583;RBI=0.0354523;REFB=-0.0429896;REVB=0.0280217;RO=31;SAF=67;SAR=80;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411654;STB=0.52538;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00783854;OID=.;OPOS=767033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:187:31:31:147:156:0.834225:80:67:18:13:89:67:18:13 chr5 795933 . C G 334.23 PASS AF=0.341463;AO=42;DP=124;FAO=42;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0714287;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.1255;QD=10.8693;RBI=0.0759931;REFB=0.00432169;REVB=0.0259402;RO=81;SAF=11;SAR=31;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829068;STB=0.547993;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00454378;OID=.;OPOS=795933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:81:81:42:42:0.341463:31:11:26:55:31:11:26:55 chr5 795947 . C T 246.03 PASS AF=0.311321;AO=33;DP=107;FAO=33;FDP=106;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=0.0109307;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.06;QD=9.28403;RBI=0.0162647;REFB=-0.00536139;REVB=0.0120442;RO=72;SAF=10;SAR=23;SRF=22;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00349958;STB=0.509732;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0135007;OID=.;OPOS=795947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:72:73:33:33:0.311321:23:10:22:50:23:10:23:50 chr5 796008 . GG AA 137.94 PASS AF=0.25;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0131776;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=2;MLLD=112.967;QD=15.3271;RBI=0.0134632;REFB=-0.0307717;REVB=-0.00275855;RO=17;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32543;STB=0.717355;STBP=0.214;TYPE=mnp;VARB=0.0683799;OID=.;OPOS=796008;OREF=GG;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:35:36:17:20:9:9:0.25:8:1:5:12:8:1:6:14 chr5 796015 . A C 92.7 PASS AF=0.342857;AO=10;DP=34;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.0164761;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.656;QD=10.5941;RBI=0.0273721;REFB=-0.0244255;REVB=0.0218579;RO=22;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275029;STB=0.646761;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0446681;OID=.;OPOS=796015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:34:35:22:23:10:12:0.342857:9:1:5:17:11:1:4:19 chr5 796029 . T TGG 124.02 PASS AF=0.681818;AO=14;DP=26;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0809378;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=34.5409;QD=22.5485;RBI=0.128995;REFB=-0.102506;REVB=0.100443;RO=11;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158579;STB=0.529374;STBP=0.794;TYPE=ins;VARB=0.057287;OID=.;OPOS=796030;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=TGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.681818:14:26:15:22:7:3:12:1:6:42:11:3:11:1:10 chr5 824172 . G A 179.43 PASS AF=0.152893;AO=37;DP=242;FAO=37;FDP=242;FR=.;FRO=205;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=110;FSRR=95;FWDB=-0.00598756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.095;QD=2.9657;RBI=0.0275679;REFB=-0.00491492;REVB=-0.0269099;RO=203;SAF=21;SAR=16;SRF=109;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397391;STB=0.526527;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0318261;OID=.;OPOS=824172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:203:205:37:37:0.152893:16:21:109:94:16:21:110:95 chr5 824190 . G A 177.69 PASS AF=0.15102;AO=37;DP=245;FAO=37;FDP=245;FR=.;FRO=208;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=109;FSRR=99;FWDB=-0.00973006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.4881;QD=2.90112;RBI=0.111213;REFB=-0.00587771;REVB=0.110787;RO=207;SAF=20;SAR=17;SRF=109;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180092;STB=0.514063;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0350217;OID=.;OPOS=824190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:207:208:37:37:0.15102:17:20:109:98:17:20:109:99 chr5 825280 . C T 1636.48 PASS AF=0.519231;AO=161;DP=312;FAO=162;FDP=312;FR=.;FRO=150;FSAF=68;FSAR=94;FSRF=63;FSRR=87;FWDB=0.0333312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.25;QD=20.9805;RBI=0.0343131;REFB=-0.0118633;REVB=0.00814958;RO=150;SAF=67;SAR=94;SRF=63;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00349488;STB=0.500122;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.010113;OID=.;OPOS=825280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:312:150:150:161:162:0.519231:94:67:63:87:94:68:63:87 chr5 840342 . A G 419.31 PASS AF=0.341935;AO=53;DP=156;FAO=53;FDP=155;FR=.;FRO=102;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=0.00570109;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.234;QD=10.8208;RBI=0.0436678;REFB=-0.0154763;REVB=-0.0432941;RO=101;SAF=26;SAR=27;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743296;STB=0.53901;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0337101;OID=.;OPOS=840342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:101:102:53:53:0.341935:27:26:43:58:27:26:44:58 chr5 840506 . C T 127.34 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.010329;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.589;QD=11.0728;RBI=0.0103604;REFB=-0.00562376;REVB=0.000805072;RO=31;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946343;STB=0.556881;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0100872;OID=.;OPOS=840506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:31:31:15:15:0.326087:12:3:8:23:12:3:8:23 chr5 843723 . C A 82.19 PASS AF=0.133333;AO=18;DP=136;FAO=18;FDP=135;FR=.;FRO=117;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=0.0210005;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.725;QD=2.43522;RBI=0.0246614;REFB=-0.0233006;REVB=-0.0129292;RO=115;SAF=4;SAR=14;SRF=59;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372299;STB=0.759027;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.07738;OID=.;OPOS=843723;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:136:135:115:117:18:18:0.133333:14:4:59:56:14:4:60:57 chr5 843815 . C T 170.51 PASS AF=0.302632;AO=23;DP=76;FAO=23;FDP=76;FR=.;FRO=53;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.00851984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.034;QD=8.97411;RBI=0.0119083;REFB=-0.00594828;REVB=0.00831984;RO=53;SAF=5;SAR=18;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460486;STB=0.773278;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00751347;OID=.;OPOS=843815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:53:53:23:23:0.302632:18:5:32:21:18:5:32:21 chr5 878525 . T A 978.86 PASS AF=0.426877;AO=107;DP=254;FAO=108;FDP=253;FR=.;FRO=145;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=71;FSRR=74;FWDB=-0.0293749;FXX=0.0117183;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.451;QD=15.476;RBI=0.0293812;REFB=-0.0124354;REVB=-0.000607861;RO=147;SAF=40;SAR=67;SRF=73;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130805;STB=0.570595;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0154812;OID=.;OPOS=878525;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:253:147:145:107:108:0.426877:67:40:73:74:68:40:71:74 chr5 981277 . C G 227.03 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0357479;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.462;QD=11.4953;RBI=0.0366046;REFB=-0.0181363;REVB=0.0078729;RO=47;SAF=12;SAR=16;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512043;STB=0.550527;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.021415;OID=.;OPOS=981277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:51:28:28:0.35443:16:12:18:29:16:12:18:33 chr5 1009145 . C G 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.539;QD=30.7904;RBI=0.0177708;REFB=-0.127289;REVB=0.0177708;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.021079;OID=.;OPOS=1009145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:0:1:8:8:0.888889:8:0:0:0:8:0:0:1 chr5 1036900 . C T 146.78 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00272246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.697;QD=11.291;RBI=0.0133768;REFB=-0.0185684;REVB=-0.0130968;RO=33;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00585061;STB=0.515608;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.049995;OID=.;OPOS=1036900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:11:7:13:20:11:7:14:20 chr5 1036962 . C A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0802395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6943;QD=49.5991;RBI=0.097155;REFB=0;REVB=0.0547787;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00308121;OID=.;OPOS=1036962;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr5 1052360 . C T 1506.06 PASS AF=0.979381;AO=90;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0676518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0882;QD=62.1056;RBI=0.0722221;REFB=-0.0861767;REVB=0.0252836;RO=0;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000791468;OID=.;OPOS=1052360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:0:1:90:95:0.979381:36:54:0:0:41:54:0:1 chr5 1065399 . C T 699.0 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0106048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=336.376;QD=54.8234;RBI=0.0307603;REFB=-0.00531721;REVB=0.0288745;RO=1;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268819;STB=0.51428;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=6.07094e-05;OID=.;OPOS=1065399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:17:33:0:1:17:33:0:1 chr5 1081767 . C T 1509.26 PASS AF=0.979798;AO=96;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0693229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.69;QD=60.98;RBI=0.0708585;REFB=-0.221032;REVB=0.0146721;RO=1;SAF=48;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977764;STB=0.510202;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00253252;OID=.;OPOS=1081767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:99:99:1:2:96:97:0.979798:48:48:1:0:49:48:2:0 chr5 1216775 . A G 419.93 PASS AF=0.417391;AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0455096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.323;QD=14.6063;RBI=0.0498394;REFB=-0.0454512;REVB=-0.0203187;RO=66;SAF=27;SAR=21;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491473;STB=0.532298;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0591744;OID=.;OPOS=1216775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:67:48:48:0.417391:21:27:34:32:21:27:34:33 chr5 1216900 . G A 330.64 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0198886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.755;QD=23.6168;RBI=0.038289;REFB=-0.0187954;REVB=0.0327184;RO=23;SAF=14;SAR=19;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734704;STB=0.540457;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.020199;OID=.;OPOS=1216900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:19:14:12:11:19:14:12:11 chr5 1225613 . G A 180.6 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0123708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.285;QD=15.3706;RBI=0.0145015;REFB=-0.00805787;REVB=-0.00756697;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681024;STB=0.548482;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0117575;OID=.;OPOS=1225613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:28:19:19:0.404255:9:10:16:11:9:10:17:11 chr5 1225626 . T A 239.75 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0132783;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9537;QD=16.5342;RBI=0.0144888;REFB=-0.00297465;REVB=-0.00579748;RO=31;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158744;STB=0.589288;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00201891;OID=.;OPOS=1225626;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:31:31:27:27:0.465517:15:12:19:12:15:12:19:12 chr5 1225687 . CT TC 255.39 PASS AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.010567;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=235.984;QD=13.2669;RBI=0.0127705;REFB=-0.0103604;REVB=0.007171;RO=44;SAF=10;SAR=20;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271092;STB=0.649022;STBP=0.036;TYPE=mnp;VARB=0.0223174;OID=.;OPOS=1225687;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:47:30:30:0.38961:20:10:26:18:20:10:27:20 chr5 1225703 . A G 328.97 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.00750428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.208;QD=16.2454;RBI=0.00758131;REFB=-0.0242047;REVB=-0.001078;RO=45;SAF=11;SAR=25;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31694;STB=0.678396;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0160974;OID=.;OPOS=1225703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:25:11:28:17:25:11:28:17 chr5 1279439 . G A 301.54 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00276943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.347;QD=16.7519;RBI=0.0134471;REFB=-0.021308;REVB=0.0131588;RO=39;SAF=6;SAR=27;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360508;STB=0.705189;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0214697;OID=.;OPOS=1279439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:27:6:19:20:27:6:19:20 chr5 1294086 . C T 307.33 PASS AF=0.376344;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=0.00437173;FXX=0.0210504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.587;QD=13.2183;RBI=0.00705131;REFB=-0.0100485;REVB=0.00553253;RO=58;SAF=18;SAR=17;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12822;STB=0.573137;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0208401;OID=.;OPOS=1294086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:58:58:35:35:0.376344:17:18:23:35:17:18:23:35 chr5 1318531 . CAAAC CAAC,CAACA,CCAAC 153.81 PASS AF=0.647059,0,0;AO=10,2,5;DP=35;FAO=22,0,0;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=19,0,0;FSAR=3,0,0;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.259534,-0.225411,-0.27353;FXX=0.0285633;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=12.4192,41.2343,15.7116;QD=18.0955;RBI=0.285821,0.230876,0.287275;REFB=-0.083203,-0.0450208,-0.0310416;REVB=0.119733,0.0499378,0.0877949;RO=15;SAF=10,2,5;SAR=0,0,0;SRF=1;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.856309,0.788553,0.833325;STB=0.815631,0.5,0.5;STBP=0,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.103649,0,0;OID=.,.,.;OPOS=1318532,1318534,1318532;OREF=A,AC,A;OALT=-,CA,C;OMAPALT=CAAC,CAACA,CCAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.647059,0,0:10,2,5:35:22,0,0:34:12:19,0,0:3,0,0:1:11:48:15:10,2,5:0,0,0:1:14 chr5 1364617 . G C 1353.29 PASS AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0234381;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.462;QD=60.1464;RBI=0.0249202;REFB=-0.0231342;REVB=0.00846596;RO=2;SAF=43;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215283;STB=0.511361;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000225554;OID=.;OPOS=1364617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:90:90:2:2:88:88:0.977778:45:43:2:0:45:43:2:0 chr5 1466919 . G A 492.18 PASS AF=0.469027;AO=53;DP=113;FAO=53;FDP=113;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.0154977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.099;QD=17.4224;RBI=0.0167477;REFB=-0.00983145;REVB=0.00634879;RO=60;SAF=28;SAR=25;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529226;STB=0.529401;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0105465;OID=.;OPOS=1466919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:60:60:53:53:0.469027:25:28:35:25:25:28:35:25 chr5 1494909 . C T 324.49 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.023655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.624;QD=19.6659;RBI=0.0236636;REFB=-0.0158312;REVB=0.00063992;RO=32;SAF=14;SAR=20;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211265;STB=0.617216;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0129726;OID=.;OPOS=1494909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:20:14:21:11:20:14:21:11 chr5 1708983 . G A 152.39 PASS AF=0.346939;AO=16;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0368219;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.727;QD=12.4397;RBI=0.0381624;REFB=-0.0255041;REVB=-0.0100261;RO=32;SAF=10;SAR=6;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770094;STB=0.568451;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0429326;OID=.;OPOS=1708983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:16:17:0.346939:6:10:22:10:7:10:22:10 chr5 1814783 . T C 59.23 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0137766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.762;QD=15.794;RBI=0.0230978;REFB=0.00030575;REVB=0.0185395;RO=7;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122922;STB=0.571264;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00015335;OID=.;OPOS=1814783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:6:2:1:6:6:2:1:6 chr5 1877638 . CAA C 398.73 PASS AF=0.5;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.0230642;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=2;MLLD=181.436;QD=13.9905;RBI=0.0287262;REFB=-0.00345993;REVB=0.0171241;RO=56;SAF=25;SAR=32;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075096;STB=0.535927;STBP=0.493;TYPE=del;VARB=0.0033051;OID=.;OPOS=1877639;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:57:115:57:114:57:25:32:21:36:99:56:25:32:20:36 chr5 3610658 . T C 1281.92 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8338;QD=61.7793;RBI=0.0181493;REFB=0;REVB=0.0152369;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125405;OID=.;OPOS=3610658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr5 5146335 . C G 458.01 PASS AF=0.48;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0590937;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1574;QD=18.3202;RBI=0.063633;REFB=-0.0318244;REVB=-0.0236028;RO=50;SAF=22;SAR=26;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384379;STB=0.531706;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0293763;OID=.;OPOS=5146335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:50:52:48:48:0.48:26:22:25:25:26:22:27:25 chr5 5146377 . T C 441.86 PASS AF=0.463918;AO=43;DP=95;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.00188752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.039;QD=18.221;RBI=0.0133072;REFB=-0.0128542;REVB=-0.0131727;RO=51;SAF=21;SAR=22;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398086;STB=0.526545;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0196331;OID=.;OPOS=5146377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:51:52:43:45:0.463918:22:21:27:24:23:22:28:24 chr5 5146395 . A G 537.45 PASS AF=0.51;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00415635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198;QD=21.4981;RBI=0.00517691;REFB=-0.0260068;REVB=0.00308629;RO=48;SAF=28;SAR=23;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615179;STB=0.539081;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0221254;OID=.;OPOS=5146395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:48:49:51:51:0.51:23:28:23:25:23:28:23:26 chr5 5200281 . C T 322.9 PASS AF=0.432099;AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.00445381;FXX=0.0689576;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.669;QD=15.9456;RBI=0.0375243;REFB=-0.00651975;REVB=-0.0372591;RO=43;SAF=10;SAR=24;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181312;STB=0.536114;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00917512;OID=.;OPOS=5200281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:43:46:34:35:0.432099:24:10:12:31:24:11:12:34 chr5 5209210 . G A 246.68 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0450884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.302;QD=15.9146;RBI=0.0577719;REFB=-0.0252712;REVB=-0.0361197;RO=34;SAF=22;SAR=6;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321978;STB=0.68364;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0394902;OID=.;OPOS=5209210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:6:22:17:17:6:22:17:17 chr5 5447607 . A G 1186.06 PASS AF=0.963855;AO=79;DP=83;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0192239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.252;QD=57.1597;RBI=0.0192619;REFB=-0.0635349;REVB=-0.00120841;RO=3;SAF=47;SAR=32;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423298;STB=0.509443;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.000545223;OID=.;OPOS=5447607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:83:83:3:3:79:80:0.963855:32:47:0:3:33:47:1:2 chr5 5460569 . C T 817.73 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9124;QD=57.3847;RBI=0.014497;REFB=0;REVB=0.00686937;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158984;OID=.;OPOS=5460569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0 chr5 5460619 . G C 941.69 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017727;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.271;QD=58.8553;RBI=0.0316516;REFB=0;REVB=0.0262217;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265061;OID=.;OPOS=5460619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0 chr5 5462148 . G A 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.143;QD=59.8391;RBI=0.0308169;REFB=0;REVB=-0.00681821;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94255e-05;OID=.;OPOS=5462148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0 chr5 5462607 . A G 739.05 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.478;QD=54.7444;RBI=0.0207932;REFB=-0.0883077;REVB=-0.0153494;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00122932;OID=.;OPOS=5462607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:21:32:1:0:21:32:1:0 chr5 5462620 . G A,T 699.79 PASS AF=0.93617,0.0425532;AO=44,2;DP=47;FAO=44,2;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=28,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0185559,-0.00482873;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=204.888,29.9808;QD=59.5562;RBI=0.0197029,0.00533852;REFB=-0.120523,-0.0436307;REVB=0.00662437,0.00227664;RO=0;SAF=28,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.515145,0.665164;STBP=0.283,0.662;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000185211,0.0868562;OID=.,.;OPOS=5462620,5462620;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:47:47:0:1:44,2:44,2:0.93617,0.0425532:16,1:28,1:0:0:16,1:28,1:0:1 chr5 5489383 . G A 1498.75 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000377173;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.199;QD=59.9499;RBI=0.0111816;REFB=0;REVB=0.0111752;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24792e-06;OID=.;OPOS=5489383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:45:54:0:0:45:55:0:0 chr5 6602544 . T C 479.96 PASS AF=0.464286;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00601899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1508;QD=17.1412;RBI=0.00601919;REFB=0.00117456;REVB=4.9895e-05;RO=60;SAF=22;SAR=30;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747909;STB=0.541651;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.00137751;OID=.;OPOS=6602544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:60:60:52:52:0.464286:30:22:30:30:30:22:30:30 chr5 6604787 . C T 183.08 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0151273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.49;QD=13.3146;RBI=0.0161196;REFB=-0.00416364;REVB=0.00556843;RO=32;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141488;STB=0.567367;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0036798;OID=.;OPOS=6604787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:33:22:22:0.4:13:9:9:23:13:9:10:23 chr5 6645016 . A G 329.04 PASS AF=0.682927;AO=27;DP=40;FAO=28;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0109096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7817;QD=32.1016;RBI=0.0206092;REFB=-0.0555176;REVB=0.0174848;RO=13;SAF=13;SAR=14;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792521;STB=0.547792;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0272884;OID=.;OPOS=6645016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:13:13:27:28:0.682927:14:13:8:5:15:13:8:5 chr5 6748659 . T C 1453.45 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00579155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.081;QD=63.1933;RBI=0.0297397;REFB=0;REVB=-0.0291703;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110916;OID=.;OPOS=6748659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:53:39:0:0:53:39:0:0 chr5 7047375 . T A 2447.76 PASS AF=0.480695;AO=249;DP=519;FAO=249;FDP=518;FR=.;FRO=269;FSAF=110;FSAR=139;FSRF=135;FSRR=134;FWDB=0.0145452;FXX=0.00192675;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.801;QD=18.9016;RBI=0.0152136;REFB=-0.0119939;REVB=-0.00445991;RO=268;SAF=110;SAR=139;SRF=134;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553452;STB=0.531401;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0131036;OID=.;OPOS=7047375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:519:518:268:269:249:249:0.480695:139:110:134:134:139:110:135:134 chr5 7826680 . T C 193.15 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.00868991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.619;QD=12.072;RBI=0.00869165;REFB=-0.00413034;REVB=0.000173984;RO=37;SAF=17;SAR=7;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398466;STB=0.733314;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0104784;OID=.;OPOS=7826680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:37:40:24:24:0.375:7:17:12:25:7:17:13:27 chr5 7828404 . C T 365.07 PASS AF=0.481013;AO=37;DP=78;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.0251365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.279;QD=18.4844;RBI=0.0269478;REFB=-0.0236477;REVB=0.00971271;RO=41;SAF=19;SAR=18;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207966;STB=0.620193;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0138942;OID=.;OPOS=7828404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:41:41:37:38:0.481013:18:19:30:11:19:19:30:11 chr5 7835555 . C G 408.34 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0090866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3272;QD=20.4172;RBI=0.035557;REFB=-0.0122755;REVB=0.0343763;RO=39;SAF=20;SAR=21;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445381;STB=0.524668;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00997348;OID=.;OPOS=7835555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:21:20:21:18:21:20:21:18 chr5 7866967 . G C 1523.08 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.364;QD=58.58;RBI=0.0123665;REFB=-0.0184996;REVB=0.0013599;RO=1;SAF=62;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114319;STB=0.506023;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000356539;OID=.;OPOS=7866967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:41:62:0:1:41:62:0:1 chr5 7868030 . T C 1524.93 PASS AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0108713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.838;QD=57.5444;RBI=0.0206536;REFB=-0.0340255;REVB=0.0175609;RO=1;SAF=54;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870688;STB=0.509089;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00046151;OID=.;OPOS=7868030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:106:106:1:2:104:104:0.981132:50:54:1:0:50:54:2:0 chr5 7870973 . A G 802.9 PASS AF=0.526316;AO=80;DP=152;FAO=80;FDP=152;FR=.;FRO=72;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.0359682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6664;QD=21.1289;RBI=0.0389036;REFB=-0.0214785;REVB=-0.0148248;RO=72;SAF=42;SAR=38;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129145;STB=0.570709;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0220912;OID=.;OPOS=7870973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:72:72:80:80:0.526316:38:42:27:45:38:42:27:45 chr5 7878192 . T C 303.33 PASS AF=0.357143;AO=35;DP=98;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0456761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.26;QD=12.3808;RBI=0.0496021;REFB=-0.0160877;REVB=0.0193405;RO=63;SAF=13;SAR=22;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256706;STB=0.647349;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0219275;OID=.;OPOS=7878192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:63:63:35:35:0.357143:22:13:38:25:22:13:38:25 chr5 7885959 . A G 447.57 PASS AF=0.573333;AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0182359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1647;QD=23.8703;RBI=0.0217653;REFB=-0.0177405;REVB=0.011882;RO=32;SAF=18;SAR=25;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11251;STB=0.561769;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0182318;OID=.;OPOS=7885959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:32:32:43:43:0.573333:25:18:18:14:25:18:18:14 chr5 7897191 . C T 250.68 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0120055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.653;QD=14.5323;RBI=0.0594486;REFB=-0.022088;REVB=-0.0582237;RO=40;SAF=14;SAR=15;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685576;STB=0.538895;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0306748;OID=.;OPOS=7897191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:15:14:22:18:15:14:22:18 chr5 7897283 . G A 154.11 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.021666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.663;QD=14.3356;RBI=0.0216789;REFB=-0.00769781;REVB=0.000747692;RO=26;SAF=6;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118371;STB=0.568883;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00881745;OID=.;OPOS=7897283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:11:6:12:14:11:6:12:14 chr5 7900712 . G A 565.65 PASS AF=0.479675;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.00159311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.206;QD=18.3951;RBI=0.00998879;REFB=-0.00274976;REVB=-0.00986093;RO=64;SAF=26;SAR=33;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118312;STB=0.506557;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00390554;OID=.;OPOS=7900712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:64:59:59:0.479675:33:26:29:35:33:26:29:35 chr5 8619227 . C T 205.17 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0418492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.625;QD=15.7821;RBI=0.0456729;REFB=0.00376011;REVB=-0.0182937;RO=29;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474967;STB=0.527003;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.00225287;OID=.;OPOS=8619227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:13:10:14:15:13:10:14:15 chr5 8619258 . G A 188.53 PASS AF=0.403509;AO=19;DP=53;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0231115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.101;QD=13.2304;RBI=0.0231233;REFB=-0.00848251;REVB=-0.000738632;RO=34;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225486;STB=0.503873;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0223109;OID=.;OPOS=8619258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:57:34:34:19:23:0.403509:11:8:15:19:13:10:15:19 chr5 9041924 . T C 718.95 PASS AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00638891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.427;QD=53.2557;RBI=0.0450072;REFB=-0.0675939;REVB=0.0445514;RO=2;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261577;STB=0.506847;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00141418;OID=.;OPOS=9041924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:54:54:2:1:52:53:0.981481:35:17:0:2:36:17:0:1 chr5 9041935 . G A 738.26 PASS AF=1;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152007;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.951;QD=56.789;RBI=0.0155396;REFB=0;REVB=-0.00322727;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146411;OID=.;OPOS=9041935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:51:52:1:34:17:0:0:35:17:0:0 chr5 9053945 . C T 323.31 PASS AF=1;AO=19;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8982;QD=53.8841;RBI=0.0770278;REFB=0;REVB=-0.0336253;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00703003;OID=.;OPOS=9053945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:19:24:1:10:9:0:0:11:13:0:0 chr5 9108333 . C T 167.46 PASS AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0303851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.829;QD=10.149;RBI=0.0337528;REFB=0.000423569;REVB=0.0146969;RO=44;SAF=12;SAR=10;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259716;STB=0.515222;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=-0.000303886;OID=.;OPOS=9108333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:10:12:23:21:10:12:23:21 chr5 9122926 . C T 444.16 PASS AF=0.5;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.01885;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.256;QD=20.1889;RBI=0.0194333;REFB=-0.067816;REVB=-0.00472563;RO=39;SAF=20;SAR=24;SRF=8;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22039;STB=0.58136;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.049543;OID=.;OPOS=9122926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:88:39:44:44:44:0.5:24:20:8:31:24:20:13:31 chr5 9190404 . G A 1580.19 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.023;QD=63.846;RBI=0.0164724;REFB=0;REVB=-0.00913316;RO=0;SAF=52;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138578;OID=.;OPOS=9190404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:46:52:0:0:46:53:0:0 chr5 9238005 . G A 624.36 PASS AF=0.457143;AO=64;DP=143;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.0156522;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.233;QD=17.8388;RBI=0.0157026;REFB=-0.00596318;REVB=0.00125708;RO=76;SAF=18;SAR=46;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327591;STB=0.682687;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0108192;OID=.;OPOS=9238005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:140:76:76:64:64:0.457143:46:18:46:30:46:18:46:30 chr5 9265602 . C T 2178.69 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00726139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.009;QD=63.1504;RBI=0.0124729;REFB=0;REVB=-0.0101412;RO=0;SAF=79;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.2868e-06;OID=.;OPOS=9265602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:59:79:0:0:59:79:0:0 chr5 9280957 . C A 720.23 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.322;QD=62.629;RBI=0.0190668;REFB=0;REVB=0.0140329;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85506e-05;OID=.;OPOS=9280957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:44:46:1:19:25:0:0:21:25:0:0 chr5 9629529 . G A 182.75 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0254464;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.223;QD=16.6138;RBI=0.0273169;REFB=-0.00905037;REVB=-0.00993438;RO=25;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628676;STB=0.535943;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0118902;OID=.;OPOS=9629529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:25:25:19:19:0.431818:11:8:9:16:11:8:9:16 chr5 9629813 . C T 259.15 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0152696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.768;QD=24.1067;RBI=0.0188335;REFB=-0.00799094;REVB=-0.0110246;RO=18;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428114;STB=0.534855;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00636194;OID=.;OPOS=9629813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:19:24:24:0.55814:12:12:8:10:12:12:8:11 chr5 9630187 . T C 238.51 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0102157;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.632;QD=17.6672;RBI=0.0108023;REFB=0.00116445;REVB=0.00351147;RO=28;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136733;STB=0.576864;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.000518621;OID=.;OPOS=9630187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:11:15:12:16:11:15:12:16 chr5 10237036 . A G 728.85 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00648675;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.347;QD=57.1651;RBI=0.00675391;REFB=0;REVB=0.00188081;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.11739e-06;OID=.;OPOS=10237036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0 chr5 10239261 . G A 1189.66 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00806515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.898;QD=61.0082;RBI=0.00816949;REFB=0;REVB=-0.00130151;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75932e-05;OID=.;OPOS=10239261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:37:40:0:0:38:40:0:0 chr5 10239278 . C T 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.548;QD=61.3755;RBI=0.0148157;REFB=0;REVB=0.00634837;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.64039e-05;OID=.;OPOS=10239278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0 chr5 10250430 . G A 1342.05 PASS AF=0.941176;AO=96;DP=102;FAO=96;FDP=102;FR=.;FRO=6;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0763942;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.9747;QD=52.6295;RBI=0.128682;REFB=-0.159114;REVB=0.103552;RO=3;SAF=49;SAR=47;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101717;STB=0.500613;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0103815;OID=.;OPOS=10250430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:102:102:3:6:96:96:0.941176:47:49:1:2:47:49:3:3 chr5 10250443 . T C 1677.4 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.422;QD=60.4469;RBI=0.0091614;REFB=0;REVB=0.00682893;RO=0;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93043e-07;OID=.;OPOS=10250443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:55:56:0:0:55:56:0:0 chr5 10254817 . A G 1045.15 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.118;QD=59.723;RBI=0.0268388;REFB=0;REVB=0.0250248;RO=0;SAF=25;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92994e-05;OID=.;OPOS=10254817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:43:25:0:0:44:26:0:0 chr5 10256161 . T C 1540.24 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.323;QD=59.8153;RBI=0.0801992;REFB=0;REVB=0.00850588;RO=0;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278667;OID=.;OPOS=10256161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:61:42:0:0:61:42:0:0 chr5 10261966 . G A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4022;QD=61.3363;RBI=0.0797905;REFB=0;REVB=-0.0797109;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00128954;OID=.;OPOS=10261966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:30:10:0:0:30:10:0:0 chr5 10505585 . A G 323.0 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0133566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.197;QD=21.8981;RBI=0.0234343;REFB=-0.00815053;REVB=0.0192553;RO=26;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206532;STB=0.614056;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00592061;OID=.;OPOS=10505585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:20:13:17:9:20:13:17:9 chr5 10564846 . C T 1227.07 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.691;QD=61.3537;RBI=0.0923595;REFB=0;REVB=0.0477477;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107066;OID=.;OPOS=10564846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:46:33:0:0:47:33:0:0 chr5 10624887 . T C 396.6 PASS AF=0.460674;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=-0.0148096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.159;QD=17.8246;RBI=0.0352066;REFB=-0.00985968;REVB=-0.0319402;RO=48;SAF=28;SAR=13;SRF=37;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102536;STB=0.556994;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0106415;OID=.;OPOS=10624887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:48:48:41:41:0.460674:13:28:37:11:13:28:37:11 chr5 10638180 . T C 385.83 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.016917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.493;QD=15.5891;RBI=0.0169241;REFB=-0.00420892;REVB=-0.000492082;RO=57;SAF=20;SAR=21;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872777;STB=0.543457;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00721102;OID=.;OPOS=10638180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:57:58:41:41:0.414141:21:20:23:34:21:20:24:34 chr5 10649412 . G C 468.08 PASS AF=0.60274;AO=44;DP=73;FAO=44;FDP=73;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0451336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.801;QD=25.6482;RBI=0.047644;REFB=-0.017174;REVB=0.0152612;RO=29;SAF=18;SAR=26;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202455;STB=0.610581;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00817436;OID=.;OPOS=10649412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:29:29:44:44:0.60274:26:18:20:9:26:18:20:9 chr5 10649784 . G A 39.7 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0173615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.866;QD=13.2336;RBI=0.0562792;REFB=-0.0367363;REVB=0.0535343;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168138;STB=0.599699;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.042442;OID=.;OPOS=10649784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:5:1:2:4:5:1 chr5 10973727 . G A 1440.73 PASS AF=0.5;AO=141;DP=284;FAO=143;FDP=286;FR=.;FRO=143;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=63;FSRR=80;FWDB=0.00406527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.65;QD=20.1501;RBI=0.00745815;REFB=-0.0142651;REVB=0.0062528;RO=143;SAF=84;SAR=57;SRF=63;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143307;STB=0.577423;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0157264;OID=.;OPOS=10973727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:286:143:143:141:143:0.5:57:84:63:80:58:85:63:80 chr5 11117583 . C T 338.45 PASS AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.0631813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.6817;QD=15.2111;RBI=0.0855615;REFB=-0.0291644;REVB=0.0576966;RO=52;SAF=19;SAR=18;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105863;STB=0.559724;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0431092;OID=.;OPOS=11117583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:18:19:32:20:18:19:32:20 chr5 13701525 . T C 302.24 PASS AF=0.516129;AO=31;DP=61;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00385348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3224;QD=19.4996;RBI=0.00436752;REFB=0.0128286;REVB=0.00205571;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729317;STB=0.547254;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=-0.0156279;OID=.;OPOS=13701525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:30:31:32:0.516129:15:16:13:17:15:17:13:17 chr5 13701536 . T C 300.8 PASS AF=0.55102;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0112668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.578;QD=24.5548;RBI=0.0205151;REFB=-0.0306038;REVB=0.0171443;RO=22;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508315;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0289732;OID=.;OPOS=13701536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:22:22:26:27:0.55102:13:13:11:11:13:14:11:11 chr5 13719022 . T G 501.39 PASS AF=0.424242;AO=53;DP=129;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.0122483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.009;QD=15.1935;RBI=0.0134382;REFB=0.00972267;REVB=0.00552847;RO=75;SAF=26;SAR=27;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.002883;STB=0.510283;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=-0.0046307;OID=.;OPOS=13719022;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:132:75:76:53:56:0.424242:27:26:37:38:29:27:38:38 chr5 13719089 . G A 508.42 PASS AF=0.414815;AO=54;DP=134;FAO=56;FDP=135;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.002373;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.769;QD=15.0643;RBI=0.0109457;REFB=-0.0199744;REVB=0.0106854;RO=79;SAF=28;SAR=26;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013865;STB=0.502392;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0319061;OID=.;OPOS=13719089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:79:79:54:56:0.414815:26:28:42:37:26:30:42:37 chr5 13788886 . C A 1419.21 PASS AF=0.970297;AO=99;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0151895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3527;QD=56.2063;RBI=0.0191478;REFB=-0.00218818;REVB=0.0116583;RO=2;SAF=54;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172427;STB=0.503473;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00127186;OID=.;OPOS=13788886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:101:101:2:3:99:98:0.970297:45:54:2:0:44:54:2:1 chr5 13811775 . T C 1607.04 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.105;QD=60.0761;RBI=0.0198281;REFB=0;REVB=0.00822628;RO=0;SAF=46;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.05197e-05;OID=.;OPOS=13811775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:61:46:0:0:61:46:0:0 chr5 13829799 . G A 1773.12 PASS AF=0.991525;AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0182424;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.944;QD=60.1057;RBI=0.0183388;REFB=0.0570897;REVB=-0.00187731;RO=1;SAF=53;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887675;STB=0.504672;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000393903;OID=.;OPOS=13829799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:118:1:1:117:117:0.991525:64:53:1:0:64:53:1:0 chr5 13845045 . G A 1755.99 PASS AF=0.983193;AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=119;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0107946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.845;QD=59.0248;RBI=0.0113211;REFB=-0.0317385;REVB=0.00341237;RO=1;SAF=49;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693364;STB=0.501401;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000347366;OID=.;OPOS=13845045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:119:119:1:2:117:117:0.983193:68:49:0:1:68:49:1:1 chr5 13900345 . A G 1973.7 PASS AF=0.992248;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00952816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.925;QD=61.2001;RBI=0.034315;REFB=0.00839829;REVB=0.0329657;RO=1;SAF=61;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704024;STB=0.503703;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=4.62606e-05;OID=.;OPOS=13900345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:129:1:1:128:128:0.992248:67:61:0:1:67:61:0:1 chr5 13902220 . T C 446.96 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0972996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.111;QD=57.6726;RBI=0.0973099;REFB=0;REVB=0.00141206;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708909;OID=.;OPOS=13902220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr5 13913885 . A G 3024.3 PASS AF=0.989691;AO=192;DP=194;FAO=192;FDP=194;FR=.;FRO=2;FSAF=98;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0064311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.547;QD=62.3568;RBI=0.0127786;REFB=-0.0425026;REVB=-0.0110423;RO=1;SAF=98;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00483469;STB=0.500107;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=-4.15053e-05;OID=.;OPOS=13913885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:194:194:1:2:192:192:0.989691:94:98:1:0:94:98:1:1 chr5 13931340 . C T 993.64 PASS AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0206536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1917;QD=57.602;RBI=0.0292043;REFB=-0.0472784;REVB=-0.0206475;RO=1;SAF=26;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178273;STB=0.509088;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000564972;OID=.;OPOS=13931340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:41:26:1:0:41:27:1:0 chr5 13944512 . A C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6166;QD=57.5448;RBI=0.0135148;REFB=0;REVB=0.00552055;RO=0;SAF=39;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.0556e-05;OID=.;OPOS=13944512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:19:39:0:0:19:39:0:0 chr5 14184022 . G A 732.8 PASS AF=1;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698887;FXX=0.0727141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.582;QD=57.4747;RBI=0.00762673;REFB=0;REVB=-0.00305331;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000643921;OID=.;OPOS=14184022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:31:20:0:0 chr5 14184079 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.455;QD=64.1536;RBI=0.0229232;REFB=0;REVB=0.00531721;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110886;OID=.;OPOS=14184079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:34:15:0:0:34:15:0:0 chr5 14709412 . A AT 434.86 PASS AF=1;AO=38;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.096666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.6131;QD=43.4862;RBI=0.141535;REFB=0;REVB=0.103383;RO=2;SAF=16;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550239;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000679692;OID=.;OPOS=14709413;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:38:42:40:40:0:18:22:0:0:8:2:16:22:2:0 chr5 14741984 . T C 536.32 PASS AF=0.391304;AO=62;DP=161;FAO=63;FDP=161;FR=.;FRO=98;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=-0.00414571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.532;QD=13.3248;RBI=0.00656752;REFB=-0.00735995;REVB=0.00509367;RO=98;SAF=42;SAR=20;SRF=56;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124362;STB=0.573803;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0115609;OID=.;OPOS=14741984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:98:98:62:63:0.391304:20:42:56:42:20:43:56:42 chr5 16666180 . A G 168.82 PASS AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00435964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5837;QD=24.1164;RBI=0.0442109;REFB=-0.0201184;REVB=0.0439954;RO=11;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307576;STB=0.517221;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0151635;OID=.;OPOS=16666180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:7:10:6:5:7:10:6:5 chr5 16673975 . C G 339.21 PASS AF=0.617021;AO=28;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.020281;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.361;QD=28.8689;RBI=0.0203416;REFB=-0.0166072;REVB=0.00156892;RO=18;SAF=7;SAR=21;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121906;STB=0.551627;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0116933;OID=.;OPOS=16673975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:18:18:28:29:0.617021:21:7:7:11:21:8:7:11 chr5 16769273 . G A 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=-0.0496328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9381;QD=18.9664;RBI=0.0508837;REFB=-0.00724999;REVB=-0.0112129;RO=25;SAF=3;SAR=19;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113663;STB=0.564991;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.00517749;OID=.;OPOS=16769273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:19:3:5:20:19:3:5:20 chr5 16794780 . G A 250.38 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00849498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.024;QD=20.0307;RBI=0.0768716;REFB=-0.0052192;REVB=0.0764007;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107701;STB=0.560391;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00516738;OID=.;OPOS=16794780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:15:9:7:19:15:9:7:19 chr5 16815530 . G C 109.81 PASS AF=0.590909;AO=12;DP=21;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0220114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2863;QD=19.9653;RBI=0.0732948;REFB=-0.0149398;REVB=0.0699116;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213307;STB=0.507031;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0230335;OID=.;OPOS=16815530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:21:22:9:9:12:13:0.590909:7:5:4:5:7:6:4:5 chr5 19721490 . T C 2864.99 PASS AF=0.960976;AO=190;DP=201;FAO=197;FDP=205;FR=.;FRO=8;FSAF=70;FSAR=127;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0241659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6903;QD=55.9023;RBI=0.0276623;REFB=-0.0582305;REVB=0.0134614;RO=8;SAF=63;SAR=127;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462935;STB=0.521851;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0178179;OID=.;OPOS=19721490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:201:205:8:8:190:197:0.960976:127:63:7:1:127:70:7:1 chr5 24910721 . C G 771.14 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276203;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8562;QD=57.1218;RBI=0.0330447;REFB=0;REVB=0.0181404;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400124;OID=.;OPOS=24910721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:27:26:0:0:28:26:0:0 chr5 26013029 . G A 220.76 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0386116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.141;QD=12.0964;RBI=0.042079;REFB=-0.00154517;REVB=-0.0167269;RO=46;SAF=6;SAR=21;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437222;STB=0.75297;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00125479;OID=.;OPOS=26013029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:21:6:28:18:21:6:28:18 chr5 26013072 . T A 248.03 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00974587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.612;QD=13.9737;RBI=0.0102539;REFB=-0.00590431;REVB=0.0031875;RO=41;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285265;STB=0.67032;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0101857;OID=.;OPOS=26013072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:42:29:29:0.408451:21:8:22:19:21:8:23:19 chr5 26198575 . G T 1881.08 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234272;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7326;QD=61.6747;RBI=0.0234383;REFB=0;REVB=0.000721957;RO=0;SAF=60;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64881e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38523e-05;OID=.;OPOS=26198575;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:62:60:0:0:62:60:0:0 chr5 26198591 . C T 1937.17 PASS AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0213231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.141;QD=61.0132;RBI=0.0318635;REFB=-0.147646;REVB=0.0236772;RO=0;SAF=60;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504132;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0003844;OID=.;OPOS=26198591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:127:127:0:1:126:126:0.992126:66:60:0:0:66:60:1:0 chr5 27111712 . G A 374.93 PASS AF=0.47561;AO=40;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.00482642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8398;QD=18.2891;RBI=0.00733932;REFB=-0.0347105;REVB=-0.00552913;RO=42;SAF=20;SAR=20;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1538;STB=0.59771;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0286212;OID=.;OPOS=27111712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:43:40:39:0.47561:20:20:14:28:19:20:14:29 chr5 31302288 . C T 1659.57 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.484;QD=60.3479;RBI=0.0361266;REFB=0;REVB=0.00906051;RO=0;SAF=59;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132284;OID=.;OPOS=31302288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:51:59:0:0:51:59:0:0 chr5 31317494 . C T 1347.49 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0766712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.533;QD=61.2498;RBI=0.0773915;REFB=-0.103307;REVB=-0.0105337;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00345117;OID=.;OPOS=31317494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:88:88:0:0:87:88:1:50:37:0:0:50:38:0:0 chr5 31317529 . A G 1483.92 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00752403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.347;QD=58.193;RBI=0.0140974;REFB=-0.0288982;REVB=0.0119216;RO=1;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870439;STB=0.504504;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000146079;OID=.;OPOS=31317529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:102:1:1:100:101:0.990196:54:46:0:1:55:46:0:1 chr5 31317952 . T C 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.038;QD=61.6947;RBI=0.0443932;REFB=0;REVB=0.0411246;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148429;OID=.;OPOS=31317952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:34:48:0:0:34:48:0:0 chr5 31401447 . A G 393.76 PASS AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0117532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.989;QD=19.9373;RBI=0.0200902;REFB=0.00425156;REVB=0.0162935;RO=39;SAF=21;SAR=19;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120133;STB=0.506663;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=-0.00487761;OID=.;OPOS=31401447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:19:21:21:18:19:21:21:18 chr5 31423007 . T C 790.92 PASS AF=0.569231;AO=72;DP=128;FAO=74;FDP=130;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.0191163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.942;QD=24.336;RBI=0.0191307;REFB=-0.00517944;REVB=-0.000742629;RO=55;SAF=34;SAR=38;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000402014;STB=0.501872;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00371671;OID=.;OPOS=31423007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:130:55:56:72:74:0.569231:38:34:26:29:38:36:27:29 chr5 32074392 . G A 257.73 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00155813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.478;QD=19.8255;RBI=0.0104262;REFB=-0.00332156;REVB=0.0103091;RO=25;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10591;STB=0.559394;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00289417;OID=.;OPOS=32074392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:20:7:9:16:20:7:9:16 chr5 32087253 . A G 643.69 PASS AF=0.451613;AO=70;DP=155;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.00581051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.568;QD=16.6114;RBI=0.00756491;REFB=-0.0202833;REVB=0.00484416;RO=85;SAF=29;SAR=41;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148466;STB=0.582556;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0247655;OID=.;OPOS=32087253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:85:85:70:70:0.451613:41:29:48:37:41:29:48:37 chr5 32087374 . A G 534.74 PASS AF=0.5;AO=52;DP=113;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00195041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.028;QD=18.7626;RBI=0.00209864;REFB=-0.0175899;REVB=-0.000774724;RO=55;SAF=23;SAR=29;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573017;STB=0.535304;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0170377;OID=.;OPOS=32087374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:55:57:52:57:0.5:29:23:21:34:30:27:23:34 chr5 32087802 . A G 48.74 PASS AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0127892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.987;QD=13.9247;RBI=0.0133399;REFB=-0.0176325;REVB=-0.00379314;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280783;STB=0.574264;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0359103;OID=.;OPOS=32087802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:13:14:6:7:6:7:0.5:3:3:1:5:4:3:2:5 chr5 32229677 . G A 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0103777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.715;QD=17.3211;RBI=0.0115537;REFB=0.00278671;REVB=-0.00507853;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184693;STB=0.606161;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00541522;OID=.;OPOS=32229677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:5:11:9:9:5:11:9:9 chr5 32403346 . C T 825.34 PASS AF=0.536424;AO=81;DP=151;FAO=81;FDP=151;FR=.;FRO=70;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0395083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5563;QD=21.8634;RBI=0.056817;REFB=-0.0121475;REVB=-0.0408322;RO=70;SAF=47;SAR=34;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164268;STB=0.589872;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0124573;OID=.;OPOS=32403346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:70:70:81:81:0.536424:34:47:27:43:34:47:27:43 chr5 32789852 . T C 238.22 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0110598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.452;QD=20.2743;RBI=0.0150312;REFB=0.0116018;REVB=0.0101793;RO=24;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970598;STB=0.554683;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=-0.00828198;OID=.;OPOS=32789852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:13:10:13:11:13:10:13:11 chr5 32790616 . T C 512.76 PASS AF=0.462185;AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0226771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.432;QD=17.2356;RBI=0.0300439;REFB=-0.00984641;REVB=-0.0197076;RO=62;SAF=27;SAR=28;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866963;STB=0.513286;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0136129;OID=.;OPOS=32790616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:119:62:64:55:55:0.462185:28:27:31:31:28:27:33:31 chr5 33278013 . A G 281.23 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00463758;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.082;QD=21.2246;RBI=0.0076518;REFB=-0.0212953;REVB=-0.00608629;RO=23;SAF=18;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11669;STB=0.556412;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0193848;OID=.;OPOS=33278013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:24:29:29:0.54717:11:18:11:12:11:18:12:12 chr5 33278049 . T C 769.42 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00345888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.623;QD=56.9937;RBI=0.0145894;REFB=0;REVB=0.0141734;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37874e-05;OID=.;OPOS=33278049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0 chr5 33461355 . G A 404.69 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.010774;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.65;QD=16.6882;RBI=0.0182587;REFB=-0.0089938;REVB=-0.0147411;RO=53;SAF=27;SAR=15;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245901;STB=0.628467;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00943765;OID=.;OPOS=33461355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:53:55:42:42:0.43299:15:27:21:32:15:27:23:32 chr5 33462034 . G A 495.35 PASS AF=0.481818;AO=52;DP=109;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.000402176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.266;QD=18.0127;RBI=0.00714347;REFB=-0.00566031;REVB=-0.00713214;RO=57;SAF=26;SAR=26;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578323;STB=0.536655;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0124297;OID=.;OPOS=33462034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:57:57:52:53:0.481818:26:26:32:25:27:26:32:25 chr5 33535060 . G A 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.866;QD=55.6532;RBI=0.0311466;REFB=0;REVB=-0.0191141;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000360082;OID=.;OPOS=33535060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:21:6:0:0:21:6:0:0 chr5 33624430 . A G 618.82 PASS AF=0.521008;AO=62;DP=119;FAO=62;FDP=119;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.0255724;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.322;QD=20.8007;RBI=0.0262673;REFB=-0.0261643;REVB=0.00600217;RO=56;SAF=30;SAR=32;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945053;STB=0.555538;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0248932;OID=.;OPOS=33624430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:56:57:62:62:0.521008:32:30:21:35:32:30:21:36 chr5 33751454 . A T 263.5 PASS AF=0.518519;AO=27;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.000553382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.091;QD=19.5184;RBI=0.105347;REFB=-0.00598332;REVB=0.105346;RO=26;SAF=6;SAR=21;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37779;STB=0.71581;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0135143;OID=.;OPOS=33751454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:26:26:27:28:0.518519:21:6:16:10:22:6:16:10 chr5 33938447 . G A 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.675;QD=64.1539;RBI=0.0641437;REFB=0;REVB=0.0632152;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168942;OID=.;OPOS=33938447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0 chr5 33938975 . C A 149.63 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0203498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2876;QD=11.9705;RBI=0.0250048;REFB=0.0118939;REVB=-0.0145302;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21839;STB=0.627764;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.0226439;OID=.;OPOS=33938975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:9:8:22:11:9:8:22:11 chr5 33954511 . T C 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.917;QD=59.323;RBI=0.0615504;REFB=0;REVB=0.0600796;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.96331e-05;OID=.;OPOS=33954511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0 chr5 33963850 . G A 237.45 PASS AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00722741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.726;QD=11.4435;RBI=0.0119763;REFB=-0.00316499;REVB=0.0095497;RO=52;SAF=18;SAR=11;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072732;STB=0.544011;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00289493;OID=.;OPOS=33963850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:52:54:29:29:0.349398:11:18:29:23:11:18:30:24 chr5 33963870 . C T 570.16 PASS AF=0.58427;AO=51;DP=87;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0212221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.306;QD=25.6252;RBI=0.0238484;REFB=0.00061371;REVB=-0.0108796;RO=36;SAF=28;SAR=23;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162034;STB=0.507212;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.000381842;OID=.;OPOS=33963870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:36:37:51:52:0.58427:23:28:19:17:23:29:20:17 chr5 33989518 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.923;QD=57.8849;RBI=0.0397211;REFB=0;REVB=0.0210991;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40232e-05;OID=.;OPOS=33989518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:35:25:0:0:35:25:0:0 chr5 33994116 . A T 344.28 PASS AF=0.377193;AO=34;DP=104;FAO=43;FDP=114;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=0.00871642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.726;QD=12.08;RBI=0.0088845;REFB=-0.0130292;REVB=-0.00171995;RO=68;SAF=17;SAR=17;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169006;STB=0.505918;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0209484;OID=.;OPOS=33994116;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:114:68:71:34:43:0.377193:17:17:35:33:21:22:37:34 chr5 33998768 . C A 611.81 PASS AF=0.435374;AO=62;DP=145;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0394594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8335;QD=16.6479;RBI=0.0737748;REFB=-0.0319151;REVB=0.0623352;RO=83;SAF=35;SAR=27;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231562;STB=0.502679;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0460836;OID=.;OPOS=33998768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:83:83:62:64:0.435374:27:35:45:38:29:35:45:38 chr5 33998883 . A G 1581.66 PASS AF=0.972973;AO=107;DP=110;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0252859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6679;QD=56.9967;RBI=0.0254685;REFB=-0.0176605;REVB=-0.00304475;RO=3;SAF=50;SAR=57;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103514;STB=0.505267;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=8.8659e-05;OID=.;OPOS=33998883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:110:111:3:3:107:108:0.972973:57:50:2:1:57:51:2:1 chr5 34004707 . C T 226.01 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0292718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4659;QD=20.5461;RBI=0.054656;REFB=0.0455761;REVB=0.0461567;RO=22;SAF=15;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892695;STB=0.550412;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.0190398;OID=.;OPOS=34004707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:7:15:13:9:7:15:13:9 chr5 34008100 . C T 403.2 PASS AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.127343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8799;QD=24.8124;RBI=0.12974;REFB=-0.00421854;REVB=0.0248272;RO=26;SAF=14;SAR=25;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101984;STB=0.505586;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00522998;OID=.;OPOS=34008100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:26:26:39:39:0.6:25:14:9:17:25:14:9:17 chr5 34038537 . A G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.419;QD=58.6004;RBI=0.0311911;REFB=0;REVB=-0.0257825;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50897e-05;OID=.;OPOS=34038537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0 chr5 34757666 . G A 250.56 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0431879;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=116.218;QD=16.7038;RBI=0.0522056;REFB=-0.0195399;REVB=0.0293295;RO=32;SAF=6;SAR=22;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258358;STB=0.646943;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0363567;OID=.;OPOS=34757666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:22:6:14:18:22:6:14:18 chr5 34802384 . A G 389.9 PASS AF=0.431579;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.00723026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.289;QD=16.4169;RBI=0.00771623;REFB=-0.0021796;REVB=-0.00269509;RO=54;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110411;STB=0.561875;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00342873;OID=.;OPOS=34802384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:54:54:41:41:0.431579:23:18:18:36:23:18:18:36 chr5 34840841 . A G 318.84 PASS AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0202944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.473;QD=26.5703;RBI=0.0273676;REFB=-0.0202959;REVB=0.0183609;RO=20;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213479;STB=0.617566;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0142392;OID=.;OPOS=34840841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:15:13:15:5:15:13:15:5 chr5 34862125 . C T 409.14 PASS AF=0.461538;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0359149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.871;QD=17.9841;RBI=0.0360824;REFB=-0.0024101;REVB=0.003472;RO=48;SAF=21;SAR=21;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796661;STB=0.549427;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00286148;OID=.;OPOS=34862125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:48:49:42:42:0.461538:21:21:20:28:21:21:20:29 chr5 34880290 . T C 291.34 PASS AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0121196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.787;QD=14.3869;RBI=0.043571;REFB=-0.00483106;REVB=0.0418515;RO=48;SAF=21;SAR=12;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124872;STB=0.571052;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00693044;OID=.;OPOS=34880290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:12:21:25:23:12:21:25:23 chr5 34998877 . C A 1028.84 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00125707;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9186;QD=59.6429;RBI=0.0285148;REFB=0;REVB=0.0284871;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27841e-05;OID=.;OPOS=34998877;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0 chr5 35010138 . A G 2454.2 PASS AF=1;AO=152;DP=152;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.383;QD=60.974;RBI=0.0452006;REFB=0;REVB=-0.00158218;RO=0;SAF=74;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.80948e-05;OID=.;OPOS=35010138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:152:161:0:0:152:161:1:78:74:0:0:78:83:0:0 chr5 35033605 . G A 959.5 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.026;QD=57.2838;RBI=0.0382599;REFB=-0.157017;REVB=0.0350205;RO=1;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200972;STB=0.510635;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000699828;OID=.;OPOS=35033605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:23:43:0:1:23:43:0:1 chr5 35641582 . A C 1851.4 PASS AF=0.97619;AO=123;DP=126;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0260613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.353;QD=58.7747;RBI=0.0363989;REFB=0.0109022;REVB=0.0254104;RO=3;SAF=57;SAR=66;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243446;STB=0.512818;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.000657363;OID=.;OPOS=35641582;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:126:126:3:3:123:123:0.97619:66:57:3:0:66:57:3:0 chr5 35643615 . G A 723.49 PASS AF=0.931034;AO=54;DP=58;FAO=54;FDP=58;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00804168;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.127;QD=49.8958;RBI=0.0210571;REFB=-0.0273735;REVB=-0.0194611;RO=1;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129132;STB=0.506491;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00179319;OID=.;OPOS=35643615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:58:58:1:4:54:54:0.931034:36:18:0:1:36:18:1:3 chr5 35644621 . T C 1080.37 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7924;QD=60.0205;RBI=0.0343056;REFB=0;REVB=0.00690346;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200534;OID=.;OPOS=35644621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:31:41:0:0:31:41:0:0 chr5 35654711 . C T 3815.11 PASS AF=1;AO=239;DP=240;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.359;QD=63.5851;RBI=0.0168414;REFB=0;REVB=-0.00267208;RO=0;SAF=122;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.40947e-05;OID=.;OPOS=35654711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:240:240:0:0:239:240:1:117:122:0:0:118:122:0:0 chr5 35670303 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.51;QD=54.5177;RBI=0.0171582;REFB=0;REVB=0.0134094;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17352e-05;OID=.;OPOS=35670303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chr5 35692775 . T A 2378.0 PASS AF=0.993711;AO=132;DP=160;FAO=158;FDP=159;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=67;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422387;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.475;QD=59.8239;RBI=0.0438282;REFB=0;REVB=0.0116962;RO=0;SAF=55;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00366626;OID=.;OPOS=35692775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:160:159:0:0:132:158:0.993711:77:55:0:0:91:67:0:0 chr5 35695915 . A C 1025.57 PASS AF=0.959459;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.039001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.352;QD=55.4361;RBI=0.0542556;REFB=-0.0245291;REVB=0.0377173;RO=3;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377854;STB=0.519994;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00166104;OID=.;OPOS=35695915;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:74:74:3:3:71:71:0.959459:36:35:0:3:36:35:0:3 chr5 35709095 . C T 1545.49 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.12;QD=58.8758;RBI=0.0117743;REFB=0;REVB=0.00107146;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132545;OID=.;OPOS=35709095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:105:0:0:102:105:1:50:52:0:0:52:53:0:0 chr5 35709184 . G C 1393.43 PASS AF=0.951456;AO=98;DP=104;FAO=98;FDP=103;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0177287;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3165;QD=54.1139;RBI=0.0177891;REFB=0.00599733;REVB=-0.00146397;RO=5;SAF=33;SAR=65;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268286;STB=0.51417;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.00605689;OID=.;OPOS=35709184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:104:103:5:5:98:98:0.951456:65:33:3:2:65:33:3:2 chr5 35764696 . C T 902.67 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.644;QD=58.237;RBI=0.0237933;REFB=0;REVB=0.0130818;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.25039e-05;OID=.;OPOS=35764696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:23:38:0:0:24:38:0:0 chr5 35861068 . T C 1989.69 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.822;QD=62.1777;RBI=0.028271;REFB=0;REVB=0.0258242;RO=0;SAF=68;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23662e-05;OID=.;OPOS=35861068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:60:68:0:0:60:68:0:0 chr5 35871190 . G A 1080.55 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.67;QD=60.0307;RBI=0.0135391;REFB=0;REVB=0.00867283;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02168e-05;OID=.;OPOS=35871190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:31:40:0:0:32:40:0:0 chr5 35871273 . C T 394.5 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0263042;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0172;QD=17.1522;RBI=0.0267373;REFB=-0.0216655;REVB=0.0047932;RO=50;SAF=22;SAR=19;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829309;STB=0.550996;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0272894;OID=.;OPOS=35871273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:50:51:41:41:0.445652:19:22:31:19:19:22:32:19 chr5 35874575 . C T 624.44 PASS AF=0.43949;AO=69;DP=157;FAO=69;FDP=157;FR=.;FRO=88;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.000350937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.686;QD=15.9094;RBI=0.0728639;REFB=-0.0254301;REVB=-0.072863;RO=87;SAF=47;SAR=22;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116453;STB=0.56257;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.026407;OID=.;OPOS=35874575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:87:88:69:69:0.43949:22:47:50:37:22:47:51:37 chr5 35875593 . A T 918.17 PASS AF=0.535714;AO=77;DP=159;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=30;FWDB=0.0443739;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.08;QD=21.8611;RBI=0.0457205;REFB=-0.0266163;REVB=0.011015;RO=79;SAF=33;SAR=44;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174939;STB=0.54853;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0235266;OID=.;OPOS=35875593;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:168:79:78:77:90:0.535714:44:33:49:30:44:46:48:30 chr5 35910529 . C T 191.76 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.00477812;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.807;QD=20.7312;RBI=0.0151357;REFB=-0.0125034;REVB=0.0143617;RO=18;SAF=11;SAR=8;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345601;STB=0.692966;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.016972;OID=.;OPOS=35910529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:8:11:3:15:8:11:3:15 chr5 35962984 . A G 158.25 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.771;QD=45.2148;RBI=0.0268673;REFB=0;REVB=0.0249126;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339084;OID=.;OPOS=35962984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:14:0:0:12:14:1:8:4:0:0:9:5:0:0 chr5 35965970 . A C 210.5 PASS AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0153383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.31;QD=26.3128;RBI=0.0195016;REFB=-0.0187349;REVB=-0.0120436;RO=12;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116779;STB=0.506487;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0112216;OID=.;OPOS=35965970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:8:12:7:5:8:12:7:5 chr5 36142648 . A G 230.88 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00222603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.221;QD=23.0883;RBI=0.00406427;REFB=0.0117507;REVB=0.00340045;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217906;STB=0.512184;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=-0.00875222;OID=.;OPOS=36142648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:14:8:7:11:14:8:7:11 chr5 36143392 . C T 300.66 PASS AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.000304093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.539;QD=22.271;RBI=0.0339233;REFB=-0.0144696;REVB=0.0339219;RO=23;SAF=20;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657802;STB=0.536375;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.014684;OID=.;OPOS=36143392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:23:23:31:31:0.574074:11:20:13:10:11:20:13:10 chr5 36155318 . C CTT,CTTT 571.06 PASS AF=1,0;AO=32,13;DP=58;FAO=48,0;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324097,0.02237;FXX=0.039992;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=29.3315,20.0882;QD=47.5887;RBI=0.188889,0.128728;REFB=0,0;REVB=-0.186088,-0.126769;RO=12;SAF=10,1;SAR=22,12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.148088,-0.590669;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00511297,0.0533884;OID=.,.;OPOS=36155319,36155319;OREF=-,-;OALT=TT,TTT;OMAPALT=CTT,CTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:32,13:58:48,0:48:0:13,0:35,0:0:0:10:12:10,1:22,12:7:5 chr5 36269551 . G C 1301.6 PASS AF=1;AO=83;DP=87;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0051813;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.932;QD=61.9808;RBI=0.0130583;REFB=0;REVB=-0.0119863;RO=0;SAF=34;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000623115;OID=.;OPOS=36269551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:84:0:0:83:84:1:49:34:0:0:50:34:0:0 chr5 37036492 . C T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0127776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.321;QD=20.7382;RBI=0.042957;REFB=-0.00664975;REVB=0.0410126;RO=16;SAF=15;SAR=3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403992;STB=0.731415;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00414571;OID=.;OPOS=37036492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:3:15:7:9:3:15:7:9 chr5 37169266 . C T 108.25 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0335693;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.035;QD=12.3714;RBI=0.0337439;REFB=0.000152616;REVB=0.00342785;RO=23;SAF=1;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606611;STB=0.875713;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.000444133;OID=.;OPOS=37169266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:23:22:13:13:0.371429:12:1:12:11:12:1:12:10 chr5 37294473 . T C 266.3 PASS AF=0.336842;AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=49;FSRR=14;FWDB=0.0111223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.808;QD=11.2125;RBI=0.0129127;REFB=-0.00134103;REVB=0.00655988;RO=63;SAF=16;SAR=16;SRF=49;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323594;STB=0.684111;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00330453;OID=.;OPOS=37294473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:63:63:32:32:0.336842:16:16:49:14:16:16:49:14 chr5 37309371 . TAGA T 57.38 PASS AF=0.4;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00725133;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=3;MLLD=261.882;QD=11.4769;RBI=0.0131785;REFB=-0.0092794;REVB=0.0110041;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311223;STB=0.709978;STBP=0.13;TYPE=del;VARB=0.0114617;OID=.;OPOS=37309372;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:7:21:8:20:12:2:6:7:5:57:12:2:5:7:5 chr5 37364443 . C T 469.33 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000722705;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.886;QD=58.6668;RBI=0.0320051;REFB=0;REVB=0.0319969;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47621e-05;OID=.;OPOS=37364443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0 chr5 37700516 . C T 1570.3 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103253;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.625;QD=64.0938;RBI=0.0107398;REFB=0;REVB=-0.00295483;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279971;OID=.;OPOS=37700516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:50:48:0:0:50:48:0:0 chr5 38370537 . T C 152.09 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0159504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.364;QD=13.225;RBI=0.0160004;REFB=-0.0139981;REVB=-0.00126381;RO=29;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402461;STB=0.523532;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0140749;OID=.;OPOS=38370537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:10:7:13:16:10:7:13:16 chr5 38475507 . G A 498.07 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00666341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7838;QD=19.7256;RBI=0.0292519;REFB=0.0194605;REVB=-0.0284829;RO=50;SAF=27;SAR=24;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456056;STB=0.525195;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.0177085;OID=.;OPOS=38475507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:50:50:51:51:0.50495:24:27:29:21:24:27:29:21 chr5 38820695 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0955408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.331;QD=48.7371;RBI=0.0988414;REFB=0;REVB=0.0253292;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000738051;OID=.;OPOS=38820695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0 chr5 38822040 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0690265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0867;QD=33.4285;RBI=0.101461;REFB=0;REVB=0.0743614;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396655;OID=.;OPOS=38822040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr5 38823254 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6308;QD=60.2303;RBI=0.0336465;REFB=0;REVB=0.0242372;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604426;OID=.;OPOS=38823254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr5 38921788 . G A 930.9 PASS AF=0.417355;AO=101;DP=243;FAO=101;FDP=242;FR=.;FRO=141;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=61;FSRR=80;FWDB=0.0111318;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.402;QD=15.3868;RBI=0.0127362;REFB=-0.00659096;REVB=0.00618813;RO=141;SAF=52;SAR=49;SRF=61;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856683;STB=0.547806;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00994212;OID=.;OPOS=38921788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:141:141:101:101:0.417355:49:52:61:80:49:52:61:80 chr5 38941154 . ATTTT ATTTA,ATTT 1635.57 PASS AF=0.117978,0.882022;AO=24,30;DP=178;FAO=21,157;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=21,42;FSAR=0,115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066163,-0.00772846;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=198.022,11.4693;QD=36.7545;RBI=0.132149,0.905267;REFB=0,0;REVB=0.114393,0.905234;RO=108;SAF=24,23;SAR=0,7;SRF=5;SRR=103;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.889068,0.767154;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.136627,-0.0202836;OID=.,.;OPOS=38941158,38941155;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=ATTTA,ATTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.117978,0.882022:24,30:178:21,157:178:0:21,42:0,115:0:0:84:108:24,23:0,7:5:103 chr5 38942090 . T A,C 1241.68 PASS AF=0.0705882,0.929412;AO=5,79;DP=85;FAO=6,79;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=0,42;FSAR=6,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128082,0.000269221;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.977,193.61;QD=58.4322;RBI=0.00300242,0.0538292;REFB=-0.126863,-0.0423186;REVB=-0.00271552,0.0538285;RO=1;SAF=0,42;SAR=5,37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0126228;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.31506,-0.00141401;OID=.,.;OPOS=38942090,38942090;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:16:85:85:1:0:5,79:6,79:0.0705882,0.929412:5,37:0,42:0:1:6,37:0,42:0:0 chr5 38950776 . G A 861.66 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.357;QD=57.4442;RBI=0.0199976;REFB=0;REVB=0.00853206;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31423e-05;OID=.;OPOS=38950776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:32:27:0:0:32:28:0:0 chr5 39108309 . A G 651.14 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.861;QD=62.0128;RBI=0.0291377;REFB=0;REVB=0.0183877;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50645e-05;OID=.;OPOS=39108309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:29:12:0:0:29:13:0:0 chr5 39108322 . A G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.664;QD=63.2867;RBI=0.028101;REFB=0;REVB=-0.0076517;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44302e-05;OID=.;OPOS=39108322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0 chr5 39119723 . C A 299.31 PASS AF=0.576923;AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0123584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.481;QD=23.0235;RBI=0.0163808;REFB=-0.00260078;REVB=0.0107518;RO=22;SAF=18;SAR=11;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267732;STB=0.636275;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00182737;OID=.;OPOS=39119723;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:22:22:29:30:0.576923:11:18:6:16:12:18:6:16 chr5 39134417 . G A 248.48 PASS AF=0.348837;AO=30;DP=87;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0293608;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.305;QD=11.5571;RBI=0.0297324;REFB=-0.0136356;REVB=-0.00468641;RO=55;SAF=18;SAR=12;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143409;STB=0.577413;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0402011;OID=.;OPOS=39134417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:55:56:30:30:0.348837:12:18:26:29:12:18:27:29 chr5 40692940 . G A 497.38 PASS AF=0.546512;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00249994;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7176;QD=23.1339;RBI=0.0465608;REFB=0.00877594;REVB=-0.0464937;RO=39;SAF=22;SAR=25;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369239;STB=0.520308;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.00519756;OID=.;OPOS=40692940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:39:39:47:47:0.546512:25:22:20:19:25:22:20:19 chr5 40852451 . C G 1438.42 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0224892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9662;QD=61.8677;RBI=0.030458;REFB=-0.150243;REVB=-0.0205407;RO=1;SAF=46;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101945;STB=0.505375;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00144578;OID=.;OPOS=40852451;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:46:46:1:0:46:46:1:0 chr5 40853048 . C T 1043.76 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7448;QD=59.6432;RBI=0.0351983;REFB=0;REVB=-0.020393;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1558e-05;OID=.;OPOS=40853048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:39:29:0:0:39:31:0:0 chr5 40936541 . T C 94.23 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0234507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.877;QD=10.4695;RBI=0.0256619;REFB=-0.00596565;REVB=-0.0104211;RO=24;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993944;STB=0.559897;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00928964;OID=.;OPOS=40936541;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:8:4:10:14:8:4:10:14 chr5 40955561 . G C 416.18 PASS AF=0.371212;AO=49;DP=133;FAO=49;FDP=132;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0252099;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.866;QD=12.6117;RBI=0.0252725;REFB=-0.00735557;REVB=0.00177847;RO=83;SAF=24;SAR=25;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577882;STB=0.532887;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0122349;OID=.;OPOS=40955561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:83:83:49:49:0.371212:25:24:45:38:25:24:45:38 chr5 40964852 . A C 905.2 PASS AF=0.508475;AO=90;DP=177;FAO=90;FDP=177;FR=.;FRO=87;FSAF=34;FSAR=56;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=0.0170973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3385;QD=20.4564;RBI=0.0181607;REFB=-0.00280911;REVB=0.00612326;RO=87;SAF=34;SAR=56;SRF=40;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763435;STB=0.541973;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00289285;OID=.;OPOS=40964852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:87:87:90:90:0.508475:56:34:40:47:56:34:40:47 chr5 40972111 . C T 3348.4 PASS AF=1;AO=214;DP=216;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569046;FXX=0.0137608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.159;QD=62.2958;RBI=0.00597904;REFB=0;REVB=-0.00183511;RO=0;SAF=110;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299006;OID=.;OPOS=40972111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:216:215:0:0:214:215:1:104:110:0:0:104:111:0:0 chr5 40998196 . T C 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00509783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.266;QD=13.336;RBI=0.00687892;REFB=-0.025263;REVB=0.00461862;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350945;STB=0.520521;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0404571;OID=.;OPOS=40998196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:8:7:12:12:8:7:12:12 chr5 41000343 . G A 327.34 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0266492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.519;QD=17.6943;RBI=0.0266728;REFB=-0.00427457;REVB=0.00112315;RO=39;SAF=18;SAR=17;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957347;STB=0.553458;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00412688;OID=.;OPOS=41000343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:17:18:24:15:17:18:24:15 chr5 41005641 . A C 311.44 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0098373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9831;QD=19.1655;RBI=0.0224094;REFB=-0.0206389;REVB=0.0201347;RO=32;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125021;STB=0.569724;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0238226;OID=.;OPOS=41005641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:21:12:16:16:21:12:16:16 chr5 41008780 . A G 266.87 PASS AF=0.329897;AO=31;DP=98;FAO=32;FDP=97;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.00150989;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.316;QD=11.0048;RBI=0.0112413;REFB=-0.0162039;REVB=-0.0111395;RO=67;SAF=17;SAR=14;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168777;STB=0.577147;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0325409;OID=.;OPOS=41008780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:67:65:31:32:0.329897:14:17:27:40:15:17:27:38 chr5 41033163 . T C 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0100571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.654;QD=16.2718;RBI=0.0193602;REFB=-0.0128286;REVB=0.0165431;RO=18;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171517;STB=0.599854;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0123784;OID=.;OPOS=41033163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:12:3:6:12:12:3:6:12 chr5 41042284 . G T 1318.31 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5916;QD=62.0381;RBI=0.0508267;REFB=0;REVB=0.0430605;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121324;OID=.;OPOS=41042284;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:83:85:1:45:38:0:0:46:39:0:0 chr5 41048533 . C T 308.41 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00369312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.239;QD=15.8158;RBI=0.0122853;REFB=-0.0139868;REVB=-0.011717;RO=44;SAF=19;SAR=15;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591667;STB=0.533364;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0178183;OID=.;OPOS=41048533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:15:19:22:22:15:19:22:22 chr5 41049389 . T C 1116.92 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0515;QD=59.5691;RBI=0.0456321;REFB=0;REVB=-0.041926;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85953e-05;OID=.;OPOS=41049389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:31:43:0:0:31:44:0:0 chr5 41049397 . C T 1137.73 PASS AF=0.962963;AO=77;DP=82;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0532953;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.429;QD=56.1844;RBI=0.0567938;REFB=-0.0903416;REVB=0.0196252;RO=3;SAF=48;SAR=29;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.502008;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.000982016;OID=.;OPOS=41049397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:82:81:3:3:77:78:0.962963:29:48:1:2:30:48:2:1 chr5 41054934 . A G 465.0 PASS AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0136802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.276;QD=19.7874;RBI=0.0391538;REFB=-0.0191647;REVB=-0.0366862;RO=48;SAF=25;SAR=21;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191654;STB=0.606085;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0385479;OID=.;OPOS=41054934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:21:25:16:32:21:25:16:32 chr5 41061716 . A G 497.8 PASS AF=0.481818;AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0183696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.626;QD=18.1018;RBI=0.0187937;REFB=-0.00827365;REVB=-0.00397016;RO=57;SAF=29;SAR=24;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850152;STB=0.547152;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00978121;OID=.;OPOS=41061716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:57:57:53:53:0.481818:24:29:26:31:24:29:26:31 chr5 41158863 . G A 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.701;QD=61.8523;RBI=0.0265758;REFB=0;REVB=-0.00637133;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117942;OID=.;OPOS=41158863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr5 41199959 . G T 194.04 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0222227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.323;QD=16.8734;RBI=0.0280133;REFB=-0.0238353;REVB=-0.0170558;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137865;STB=0.578868;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0257781;OID=.;OPOS=41199959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:8:12:12:14:8:12:12:14 chr5 41310957 . C G 198.71 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0486752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7864;QD=19.3861;RBI=0.0577191;REFB=-0.0243489;REVB=0.0310197;RO=21;SAF=6;SAR=14;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125632;STB=0.570487;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0172028;OID=.;OPOS=41310957;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:14:6:4:17:14:6:4:17 chr5 41312164 . A C 411.68 PASS AF=0.360294;AO=49;DP=136;FAO=49;FDP=136;FR=.;FRO=87;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=-0.0245526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.399;QD=12.1083;RBI=0.0256848;REFB=-0.0213824;REVB=0.00754166;RO=86;SAF=27;SAR=22;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00508035;STB=0.500455;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0285691;OID=.;OPOS=41312164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:86:87:49:49:0.360294:22:27:47:39:22:27:48:39 chr5 41312206 . TA AT 45.25 PASS AF=0.181818;AO=20;DP=76;FAO=14;FDP=77;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.0437281;FXX=0.0128189;HRUN=12;LEN=2;MLLD=22.687;QD=2.3506;RBI=0.161129;REFB=-0.148319;REVB=-0.155082;RO=51;SAF=3;SAR=17;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.57555;STB=0.660324;STBP=0.19;TYPE=mnp;VARB=0.118426;OID=.;OPOS=41312206;OREF=TA;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:76:77:51:63:20:14:0.181818:17:3:32:19:9:5:35:28 chr5 41794811 . GA AG 137.0 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=47;FAO=15;FDP=45;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=26;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0512459;FXX=0.081616;HRUN=1;LEN=2;MLLD=29.6377;QD=12.1774;RBI=0.11846;REFB=-0.0200695;REVB=-0.106802;RO=21;SAF=0;SAR=7;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.813026;STB=0.935736;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=-0.115467;OID=.;OPOS=41794811;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:47:45:21:26:7:15:0.333333:7:0:17:4:14:1:20:6 chr5 42700044 . A G 846.79 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7655;QD=57.4094;RBI=0.0641429;REFB=0;REVB=0.00265903;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411132;OID=.;OPOS=42700044;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:29:28:0:0:31:28:0:0 chr5 42719239 . A C 779.85 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00288292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.511;QD=56.716;RBI=0.00288516;REFB=0;REVB=0.000113798;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34341e-05;OID=.;OPOS=42719239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:20:34:0:0:21:34:0:0 chr5 42720068 . T TA 411.68 PASS AF=0.972973;AO=34;DP=39;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0111794;FXX=0.0749813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.103;QD=44.5056;RBI=0.0119544;REFB=-0.0772225;REVB=0.00423421;RO=4;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103497;STB=0.513506;STBP=0.509;TYPE=ins;VARB=-0.000138805;OID=.;OPOS=42720069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.972973:34:39:36:37:1:18:18:0:1:3:4:18:16:0:4 chr5 43120098 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000437637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.731;QD=46.8472;RBI=0.0116295;REFB=0;REVB=-0.0116213;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190573;OID=.;OPOS=43120098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0 chr5 43175369 . G T 502.26 PASS AF=0.408759;AO=55;DP=136;FAO=56;FDP=137;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.0113443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.038;QD=14.6646;RBI=0.0114311;REFB=-0.00598105;REVB=0.00140598;RO=81;SAF=12;SAR=43;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308458;STB=0.678105;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00887662;OID=.;OPOS=43175369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:81:81:55:56:0.408759:43:12:38:43:44:12:38:43 chr5 43175597 . A G 64.44 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=26;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0319205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.454;QD=9.54627;RBI=0.0330151;REFB=-0.00638849;REVB=-0.00843098;RO=18;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351281;STB=0.736288;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0125844;OID=.;OPOS=43175597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:27:18:18:8:9:0.333333:6:2:10:8:7:2:10:8 chr5 43297144 . A G 461.28 PASS AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=0.0269703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.234;QD=16.0444;RBI=0.0270238;REFB=-0.0134635;REVB=0.00169948;RO=63;SAF=25;SAR=26;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127362;STB=0.566153;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0130646;OID=.;OPOS=43297144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:63:64:51:51:0.443478:26:25:39:24:26:25:39:25 chr5 43492978 . G A 347.8 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.326;QD=53.5082;RBI=0.059919;REFB=0;REVB=0.0543193;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407944;OID=.;OPOS=43492978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:13:11:0:0:14:12:0:0 chr5 43505993 . A G 199.76 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00439689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.286;QD=19.9758;RBI=0.00483043;REFB=-0.00158262;REVB=-0.00200011;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885636;STB=0.54995;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00241128;OID=.;OPOS=43505993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:10:10:8:12:10:10:8:12 chr5 43509348 . T A 1521.55 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00722097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2556;QD=62.7443;RBI=0.0407669;REFB=0;REVB=0.0401223;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430244;OID=.;OPOS=43509348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:97:97:0:0:96:97:1:48:48:0:0:49:48:0:0 chr5 43527135 . A C 1470.99 PASS AF=0.969388;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0101271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.914;QD=60.0405;RBI=0.036581;REFB=-0.146708;REVB=0.0351513;RO=2;SAF=56;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016633;STB=0.513041;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.000890486;OID=.;OPOS=43527135;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:98:98:2:3:95:95:0.969388:39:56:2:0:39:56:3:0 chr5 43609343 . C T 973.65 PASS AF=0.483254;AO=101;DP=208;FAO=101;FDP=209;FR=.;FRO=108;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=46;FSRR=62;FWDB=-0.00216448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.24;QD=18.6345;RBI=0.00577533;REFB=-0.0177787;REVB=0.00535438;RO=106;SAF=49;SAR=52;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565591;STB=0.53068;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0168324;OID=.;OPOS=43609343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:106:108:101:101:0.483254:52:49:45:61:52:49:46:62 chr5 43656778 . C T 868.35 PASS AF=0.486188;AO=88;DP=181;FAO=88;FDP=181;FR=.;FRO=93;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=0.0127945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8586;QD=19.19;RBI=0.0155471;REFB=-0.0164512;REVB=0.00883257;RO=92;SAF=53;SAR=35;SRF=40;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156309;STB=0.583578;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.019529;OID=.;OPOS=43656778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:92:93:88:88:0.486188:35:53:40:52:35:53:41:52 chr5 44066732 . A G 871.23 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304726;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4815;QD=58.0821;RBI=0.0305518;REFB=0;REVB=-0.0021994;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184399;OID=.;OPOS=44066732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:38:22:0:0:38:22:0:0 chr5 44809162 . G C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.192;QD=53.2772;RBI=0.0309704;REFB=0;REVB=0.0201185;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164052;OID=.;OPOS=44809162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr5 50053015 . G A 643.71 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.519;QD=61.306;RBI=0.00627898;REFB=0;REVB=-0.00430582;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20051e-06;OID=.;OPOS=50053015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:23:18:0:0:24:18:0:0 chr5 50057729 . G T 650.72 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9712;QD=61.9732;RBI=0.0330411;REFB=0;REVB=0.0233271;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.46666e-07;OID=.;OPOS=50057729;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr5 50685505 . A G 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0174745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.018;QD=10.9363;RBI=0.0535932;REFB=-0.00602622;REVB=-0.0506643;RO=34;SAF=9;SAR=7;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299921;STB=0.517835;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.015005;OID=.;OPOS=50685505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:7:9:20:14:7:9:20:14 chr5 52087584 . T TCA 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247244;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=289.59;QD=51.1846;RBI=0.0262172;REFB=0;REVB=0.00872049;RO=2;SAF=4;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18245;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000136079;OID=.;OPOS=52087585;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:22:20:20:0:4:16:0:0:4:2:4:16:2:0 chr5 52096889 . C A 2105.58 PASS AF=0.992647;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0363979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.006;QD=61.9289;RBI=0.0478345;REFB=-0.0491792;REVB=0.0310376;RO=1;SAF=68;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0070424;STB=0.503703;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=4.90738e-05;OID=.;OPOS=52096889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:136:1:1:135:135:0.992647:67:68:0:1:67:68:0:1 chr5 52193287 . C T 168.68 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00840093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4862;QD=16.0649;RBI=0.0228214;REFB=-0.000816948;REVB=-0.0212189;RO=24;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.90812e-05;OID=.;OPOS=52193287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:9:9:12:12:9:9:12:12 chr5 52248291 . T C 323.09 PASS AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00156723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.834;QD=25.3401;RBI=0.0258196;REFB=-0.0263589;REVB=0.025772;RO=20;SAF=15;SAR=16;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047103;STB=0.5259;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0146232;OID=.;OPOS=52248291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:16:15:11:9:16:15:11:9 chr5 52347369 . C T 320.52 PASS AF=0.472973;AO=34;DP=75;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0311719;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.541;QD=17.3253;RBI=0.0321061;REFB=0.00215881;REVB=-0.00768872;RO=40;SAF=16;SAR=18;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124181;STB=0.554669;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.0019183;OID=.;OPOS=52347369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:40:39:34:35:0.472973:18:16:24:16:18:17:23:16 chr5 52351413 . G A 784.65 PASS AF=0.512821;AO=78;DP=152;FAO=80;FDP=156;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0119908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.98;QD=20.1191;RBI=0.0262075;REFB=-0.0154383;REVB=0.0233036;RO=60;SAF=40;SAR=38;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563582;STB=0.519226;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0140656;OID=.;OPOS=52351413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:156:60:76:78:80:0.512821:38:40:35:25:40:40:35:41 chr5 52379277 . C T 441.29 PASS AF=0.41129;AO=50;DP=124;FAO=51;FDP=124;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0489542;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.617;QD=14.2351;RBI=0.0515984;REFB=-0.00206298;REVB=-0.0163057;RO=74;SAF=22;SAR=28;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020808;STB=0.500638;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202054;OID=.;OPOS=52379277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:74:73:50:51:0.41129:28:22:34:40:28:23:33:40 chr5 52389455 . A G 63.01 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0389692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.99;QD=8.40198;RBI=0.0394373;REFB=-0.0060067;REVB=0.00605818;RO=21;SAF=3;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365064;STB=0.722937;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00817484;OID=.;OPOS=52389455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:6:3:14:7:6:3:14:7 chr5 52389811 . T TAAAG 144.67 PASS AF=0.410256;AO=14;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0478244;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=4;MLLD=220.312;QD=14.8383;RBI=0.0499185;REFB=-0.0108078;REVB=-0.0143067;RO=23;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264141;STB=0.676153;STBP=0.093;TYPE=ins;VARB=0.0141579;OID=.;OPOS=52389812;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=TAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.410256:14:39:16:39:23:11:5:9:14:99:23:9:5:9:14 chr5 52390026 . A AATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T 111.62 PASS AF=0.22449,0.0816327;AO=10,4;DP=56;FAO=11,4;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=3,3;FSAR=8,1;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0107146,-0.00816198;FXX=0.0754575;HRUN=2,2;LEN=25,1;MLLD=828.65,437.231;QD=9.11191;RBI=0.0137018,0.0104219;REFB=-0.00536159,-0.00365153;REVB=-0.00854033,-0.00648067;RO=41;SAF=2,3;SAR=8,1;SRF=19;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.354111,0.30349;STB=0.660563,0.748754;STBP=0.247,0.379;TYPE=ins,snp;VARB=0.014782,0.0054098;OID=.,.;OPOS=52390027,52390026;OREF=-,A;OALT=ATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T;OMAPALT=AATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:56:49:41:34:10,4:11,4:0.22449,0.0816327:8,1:2,3:19:22:8,1:3,3:16:18 chr5 52778877 . GCCCCC GCCCC,GCCCCA 296.64 PASS AF=0.872727,0;AO=29,5;DP=51;FAO=48,0;FDP=55;FR=.;FRO=7;FSAF=10,0;FSAR=38,0;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.236567,0.143591;FXX=0.017854;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.7018,9.84878;QD=21.5739;RBI=0.239925,0.147267;REFB=-0.102304,-0.0940471;REVB=-0.0400025,-0.0326967;RO=14;SAF=1,4;SAR=28,1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.56134,0.481903;STB=0.514666,0.5;STBP=0.678,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0930662,0.0581195;OID=.,.;OPOS=52778878,52778882;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=GCCCC,GCCCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.872727,0:29,5:51:48,0:55:7:10,0:38,0:2:5:19:14:1,4:28,1:5:9 chr5 52856504 . G C 264.08 PASS AF=0.333333;AO=32;DP=96;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.00426673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2153;QD=11.0033;RBI=0.039504;REFB=-0.00599959;REVB=0.0392729;RO=63;SAF=11;SAR=21;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19284;STB=0.617572;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0202151;OID=.;OPOS=52856504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:63:64:32:32:0.333333:21:11:32:31:21:11:33:31 chr5 52942083 . A C 651.07 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.559;QD=62.007;RBI=0.0439663;REFB=0;REVB=0.00923982;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174845;OID=.;OPOS=52942083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr5 52942197 . A G 1153.91 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.454;QD=60.7324;RBI=0.0467491;REFB=0;REVB=0.0413607;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13683e-05;OID=.;OPOS=52942197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:76:0:0:73:76:1:44:29:0:0:47:29:0:0 chr5 52979097 . G A 109.54 PASS AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0318152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.209;QD=8.11413;RBI=0.0322873;REFB=-0.00774495;REVB=-0.00550073;RO=38;SAF=6;SAR=9;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179757;STB=0.617492;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0090717;OID=.;OPOS=52979097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:38:39:15:15:0.277778:9:6:21:17:9:6:22:17 chr5 53344135 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.882;QD=49.5992;RBI=0.0457902;REFB=0;REVB=0.0227501;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540055;OID=.;OPOS=53344135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr5 53606295 . T C 2882.77 PASS AF=1;AO=183;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9028;QD=63.0113;RBI=0.0552548;REFB=0;REVB=-0.0342231;RO=0;SAF=107;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.19971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256474;OID=.;OPOS=53606295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:183:183:0:0:183:183:1:76:107:0:0:76:107:0:0 chr5 53751901 . G A 179.02 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0423242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.075;QD=12.5626;RBI=0.0425349;REFB=-0.011484;REVB=-0.004228;RO=35;SAF=4;SAR=18;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327628;STB=0.69211;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0116854;OID=.;OPOS=53751901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:18:4:15:20:18:4:15:20 chr5 53751988 . T C 479.95 PASS AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0131569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.777;QD=18.2839;RBI=0.0134812;REFB=-0.011959;REVB=-0.00293943;RO=54;SAF=24;SAR=27;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590486;STB=0.532719;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00822584;OID=.;OPOS=53751988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:54:54:51:51:0.485714:27:24:22:32:27:24:22:32 chr5 53815495 . A C 386.06 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.007637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.674;QD=15.5984;RBI=0.0162525;REFB=-0.00619087;REVB=0.0143464;RO=57;SAF=26;SAR=15;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168819;STB=0.590864;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00948749;OID=.;OPOS=53815495;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:57:58:41:41:0.414141:15:26:27:30:15:26:28:30 chr5 53815721 . G C 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0160959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.659;QD=18.1751;RBI=0.0170012;REFB=-0.0118792;REVB=-0.00547398;RO=32;SAF=14;SAR=17;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724452;STB=0.540487;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0136219;OID=.;OPOS=53815721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:17:14:17:15:17:14:17:15 chr5 53815918 . A C 203.23 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0171759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.766;QD=21.9706;RBI=0.0263181;REFB=0.000466279;REVB=-0.0199406;RO=16;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163997;STB=0.601576;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-0.000650439;OID=.;OPOS=53815918;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:17:20:20:0.540541:9:11:12:4:9:11:13:4 chr5 53816323 . C G 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00414301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.094;QD=16.417;RBI=0.0577334;REFB=-0.00756646;REVB=-0.0575846;RO=16;SAF=13;SAR=1;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.646311;STB=0.882057;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0138855;OID=.;OPOS=53816323;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:1:13:6:10:1:13:6:10 chr5 53816341 . G A 35.04 PASS AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00532402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.869;QD=5.0056;RBI=0.0255772;REFB=-0.0117306;REVB=-0.0250169;RO=21;SAF=1;SAR=5;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.658431;STB=0.898972;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0236484;OID=.;OPOS=53816341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:28:21:22:6:6:0.214286:5:1:17:4:5:1:17:5 chr5 53816782 . T C 239.75 PASS AF=0.383562;AO=27;DP=71;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00665911;FXX=0.0519413;HRUN=6;LEN=1;MLLD=137.797;QD=13.1369;RBI=0.00680953;REFB=-0.0146827;REVB=0.00142339;RO=43;SAF=9;SAR=18;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334815;STB=0.684387;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0198931;OID=.;OPOS=53816782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:43:45:27:28:0.383562:18:9:28:15:19:9:28:17 chr5 54252345 . T C 740.34 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.739;QD=56.949;RBI=0.0556003;REFB=0;REVB=0.0258823;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225708;OID=.;OPOS=54252345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0 chr5 54253555 . A G 785.18 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0217;QD=57.1039;RBI=0.0687583;REFB=0;REVB=-0.0416825;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00114694;OID=.;OPOS=54253555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0 chr5 54253581 . A G 756.6 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964037;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.898;QD=57.102;RBI=0.0399664;REFB=0;REVB=0.0387863;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114531;OID=.;OPOS=54253581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0 chr5 54403957 . T C 868.06 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.95269e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.205;QD=57.8705;RBI=0.0220979;REFB=0;REVB=0.0220977;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25913e-05;OID=.;OPOS=54403957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr5 54404015 . C T 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.126;QD=61.0486;RBI=0.0523047;REFB=0;REVB=0.00076106;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8873e-05;OID=.;OPOS=54404015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:34:44:0:0:34:44:0:0 chr5 54410120 . A C 1178.73 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000259921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0131;QD=60.4479;RBI=0.00672708;REFB=0;REVB=0.00672206;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07985e-05;OID=.;OPOS=54410120;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:40:37:0:0:40:38:0:0 chr5 54433393 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.466;QD=51.9167;RBI=0.021072;REFB=0;REVB=0.00136362;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.72352e-05;OID=.;OPOS=54433393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr5 54439466 . G A 1235.25 PASS AF=0.97619;AO=80;DP=83;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0158509;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.38;QD=58.8213;RBI=0.0170335;REFB=-0.0772367;REVB=0.00623625;RO=2;SAF=16;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145665;STB=0.507461;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-2.18648e-05;OID=.;OPOS=54439466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:83:84:2:2:80:82:0.97619:64:16:0:2:66:16:0:2 chr5 54459961 . A G 851.13 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00927623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3768;QD=57.7037;RBI=0.0767093;REFB=0;REVB=-0.0761463;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000945163;OID=.;OPOS=54459961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chr5 54468124 . A T 2151.54 PASS AF=0.985714;AO=138;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0249772;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3503;QD=61.4725;RBI=0.0325398;REFB=-0.202006;REVB=0.0208561;RO=2;SAF=73;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128459;STB=0.506756;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00115131;OID=.;OPOS=54468124;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:140:140:2:2:138:138:0.985714:65:73:2:0:65:73:2:0 chr5 54516521 . G A 1950.0 PASS AF=1;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964308;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.032;QD=61.9047;RBI=0.0578956;REFB=0;REVB=0.0570868;RO=0;SAF=48;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.55627e-05;OID=.;OPOS=54516521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:127:126:0:0:126:126:1:78:48:0:0:78:48:0:0 chr5 54830380 . A G 804.5 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6133;QD=64.3603;RBI=0.0710646;REFB=0;REVB=0.0219914;RO=0;SAF=36;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00067448;OID=.;OPOS=54830380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:14:36:0:0:14:36:0:0 chr5 54960609 . A G 2249.3 PASS AF=0.980519;AO=151;DP=154;FAO=151;FDP=154;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=82;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0187136;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.645;QD=58.4235;RBI=0.0312202;REFB=-0.034206;REVB=0.0249901;RO=1;SAF=69;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684394;STB=0.502427;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00040261;OID=.;OPOS=54960609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:154:154:1:3:151:151:0.980519:82:69:1:0:82:69:1:2 chr5 54960673 . C G 1358.62 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.056;QD=62.4654;RBI=0.0273921;REFB=0;REVB=-0.0237544;RO=0;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89092e-05;OID=.;OPOS=54960673;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:53:34:0:0:53:34:0:0 chr5 54960687 . C T 1065.74 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287977;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.244;QD=60.0415;RBI=0.0294832;REFB=0;REVB=0.00632108;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.41303e-05;OID=.;OPOS=54960687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:44:27:0:0:44:27:0:0 chr5 54990005 . C T 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.715;QD=62.6701;RBI=0.00742635;REFB=0;REVB=0.00238708;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89033e-05;OID=.;OPOS=54990005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr5 55149407 . T C 2018.75 PASS AF=0.984962;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.039597;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.756;QD=60.7142;RBI=0.0398831;REFB=-0.127419;REVB=-0.00476834;RO=2;SAF=65;SAR=66;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143976;STB=0.507575;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000737341;OID=.;OPOS=55149407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:133:2:2:131:131:0.984962:66:65:2:0:66:65:2:0 chr5 55155402 . C T 999.44 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0864759;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.2529;QD=56.3063;RBI=0.108444;REFB=-0.204934;REVB=0.0654369;RO=2;SAF=37;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248661;STB=0.513154;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00809345;OID=.;OPOS=55155402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:71:2:2:69:69:0.971831:32:37:2:0:32:37:2:0 chr5 55206444 . G A 450.23 PASS AF=0.442478;AO=50;DP=113;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.0198775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.547;QD=15.9374;RBI=0.0208857;REFB=-0.00278311;REVB=0.00641081;RO=63;SAF=20;SAR=30;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198695;STB=0.511107;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00224272;OID=.;OPOS=55206444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:63:63:50:50:0.442478:30:20:24:39:30:20:24:39 chr5 55246001 . A G 549.87 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026643;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.7963;QD=59.4451;RBI=0.0961389;REFB=0;REVB=0.0923734;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223555;OID=.;OPOS=55246001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:23:11:0:0:24:13:0:0 chr5 55406952 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0036005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.95;QD=60.9786;RBI=0.0417503;REFB=0;REVB=0.0415948;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200991;OID=.;OPOS=55406952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr5 55407542 . C T 132.72 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0315437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0674;QD=15.1676;RBI=0.0382374;REFB=-0.0197759;REVB=-0.0216124;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100239;STB=0.558061;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0226736;OID=.;OPOS=55407542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:6:9:10:10:6:9:10:10 chr5 55422841 . T C 206.92 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.000570389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.079;QD=17.2431;RBI=0.0036002;REFB=-0.0099376;REVB=0.00355473;RO=27;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314148;STB=0.517911;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0118862;OID=.;OPOS=55422841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:10:11:15:12:10:11:15:12 chr5 56242774 . T C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.624;QD=63.5827;RBI=0.0178959;REFB=0;REVB=-0.00873598;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32858e-05;OID=.;OPOS=56242774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0 chr5 56526565 . G T 673.0 PASS AF=1;AO=37;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.845;QD=62.605;RBI=0.0385554;REFB=0;REVB=0.0338998;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454992;OID=.;OPOS=56526565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:37:43:1:17:20:0:0:20:23:0:0 chr5 56526783 . G A 769.49 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.683;QD=56.9993;RBI=0.0138011;REFB=0;REVB=0.00690054;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94758e-05;OID=.;OPOS=56526783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0 chr5 57750267 . A C 1457.32 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8832;QD=62.0135;RBI=0.0418767;REFB=-0.0552724;REVB=0.0365997;RO=1;SAF=45;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104194;STB=0.505493;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00439856;OID=.;OPOS=57750267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:48:45:1:0:48:45:1:0 chr5 57750350 . C G 1093.49 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149469;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.351;QD=59.9174;RBI=0.0180669;REFB=0;REVB=0.010149;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278918;OID=.;OPOS=57750350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:34:39:0:0:34:39:0:0 chr5 57754004 . C T 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0311093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.044;QD=14.7422;RBI=0.0315609;REFB=-0.0523149;REVB=0.00531959;RO=25;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781197;STB=0.545399;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0103368;OID=.;OPOS=57754004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:12:5:9:16:12:5:9:16 chr5 57754132 . G C 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000794122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.707;QD=63.2846;RBI=0.0117423;REFB=0;REVB=-0.0117154;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.36342e-05;OID=.;OPOS=57754132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr5 57754808 . G A 1283.27 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0818;QD=61.8444;RBI=0.0352574;REFB=0;REVB=-0.0154402;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000372262;OID=.;OPOS=57754808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:41:42:0:0:41:42:0:0 chr5 57755703 . C T 35.95 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0178574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.339;QD=6.25133;RBI=0.0523536;REFB=-0.0228009;REVB=0.049214;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161893;STB=0.605698;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.025142;OID=.;OPOS=57755703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:4:2:8:9:4:2:8:9 chr5 57792504 . G A 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0106824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2639;QD=25.6504;RBI=0.0633148;REFB=0.0116121;REVB=0.0624071;RO=18;SAF=18;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267742;STB=0.649173;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0125885;OID=.;OPOS=57792504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:7:18:7:11:7:18:7:11 chr5 57825920 . A G 54.0 PASS AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0273832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.642;QD=8.30698;RBI=0.0277353;REFB=-0.0123688;REVB=0.00440486;RO=18;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163863;STB=0.510178;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0322948;OID=.;OPOS=57825920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:5:3:7:11:5:3:7:11 chr5 58267557 . C T 1718.63 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0043767;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6784;QD=59.7783;RBI=0.00448707;REFB=-0.0999053;REVB=0.000989078;RO=0;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-6.8736e-05;OID=.;OPOS=58267557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:116:115:0:1:114:114:0.991304:52:62:0:0:52:62:0:1 chr5 59984897 . A T 994.26 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0193513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.028;QD=57.6383;RBI=0.0211553;REFB=-0.0271261;REVB=0.00854843;RO=1;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136989;STB=0.507244;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=8.17195e-05;OID=.;OPOS=59984897;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:34:34:0:1:34:34:0:1 chr5 60241142 . G A 1436.2 PASS AF=0.961905;AO=97;DP=101;FAO=101;FDP=105;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0130699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6372;QD=54.7123;RBI=0.0993425;REFB=0.0390351;REVB=0.0984789;RO=4;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371504;STB=0.518178;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.000338743;OID=.;OPOS=60241142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:101:105:4:4:97:101:0.961905:49:48:0:4:53:48:0:4 chr5 60999701 . T C 322.88 PASS AF=0.395604;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0201091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.469;QD=14.1923;RBI=0.0227615;REFB=-0.0148799;REVB=-0.0106635;RO=54;SAF=19;SAR=17;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00981691;STB=0.510724;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0269906;OID=.;OPOS=60999701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:54:55:36:36:0.395604:17:19:29:25:17:19:30:25 chr5 61645870 . A G 679.06 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.01536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.365;QD=60.3608;RBI=0.0200913;REFB=-0.149695;REVB=0.0129511;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000982241;OID=.;OPOS=61645870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:45:45:0:1:44:44:0.977778:22:22:0:0:22:22:1:0 chr5 61694379 . T C 687.55 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.155;QD=61.1157;RBI=0.0454051;REFB=0;REVB=0.0447771;RO=1;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034762;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256913;OID=.;OPOS=61694379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:1:0:44:45:1:13:31:0:1:14:31:0:0 chr5 61697859 . C T 675.17 PASS AF=0.961538;AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0210869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.368;QD=51.936;RBI=0.0357702;REFB=-0.105369;REVB=0.0288938;RO=2;SAF=23;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391497;STB=0.518511;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.000815466;OID=.;OPOS=61697859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:49:52:2:2:47:50:0.961538:24:23:2:0:24:26:2:0 chr5 61772591 . T C 696.69 PASS AF=0.833333;AO=43;DP=67;FAO=55;FDP=66;FR=.;FRO=11;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0264992;FXX=0.0149231;HRUN=6;LEN=1;MLLD=110.031;QD=42.2239;RBI=0.0307164;REFB=-0.0365415;REVB=-0.0155336;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.518388;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000652206;OID=.;OPOS=61772591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:67:66:0:11:43:55:0.833333:18:25:0:0:24:31:5:6 chr5 61847073 . G C 990.63 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00317464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.758;QD=59.1421;RBI=0.087354;REFB=0;REVB=0.0872963;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243778;OID=.;OPOS=61847073;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:29:38:0:0:29:38:0:0 chr5 63905068 . A G 666.34 PASS AF=0.413408;AO=74;DP=179;FAO=74;FDP=179;FR=.;FRO=105;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=-0.00648802;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8555;QD=14.8904;RBI=0.0162473;REFB=-0.0130258;REVB=-0.0148957;RO=104;SAF=28;SAR=46;SRF=47;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796366;STB=0.542271;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0293085;OID=.;OPOS=63905068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:104:105:74:74:0.413408:46:28:47:57:46:28:47:58 chr5 64070617 . A AAATTATGAC 50.0 PASS AO=80;DP=119;LEN=9;RO=39;SAF=52;SAR=39;SRF=16;SRR=12;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=64070618;OREF=-;OALT=AATTATGAC;OMAPALT=AAATTATGAC GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:119:39:80:39:52:16:12 chr5 64097145 . C G 1287.27 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116712;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.303;QD=62.0372;RBI=0.0301794;REFB=0;REVB=0.0278313;RO=0;SAF=25;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230693;OID=.;OPOS=64097145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:83:0:0:80:83:1:55:25:0:0:56:27:0:0 chr5 64267595 . T C 1103.77 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00420357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.071;QD=59.6632;RBI=0.0571627;REFB=0;REVB=0.057008;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41051e-05;OID=.;OPOS=64267595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:33:39:0:0:35:39:0:0 chr5 64584147 . T C 38.22 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0135834;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=97.8889;QD=10.1907;RBI=0.0141765;REFB=0.0221348;REVB=-0.00405791;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415714;STB=0.736367;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.00231172;OID=.;OPOS=64584147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:1:5:9:0:1:5:9:0 chr5 64925553 . T A 234.41 PASS AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00486879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6754;QD=13.0226;RBI=0.0146499;REFB=-0.00360705;REVB=0.0138172;RO=44;SAF=16;SAR=12;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525478;STB=0.530099;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00600444;OID=.;OPOS=64925553;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:12:16:23:21:12:16:23:21 chr5 64926315 . G A 388.13 PASS AF=0.637931;AO=37;DP=58;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0124976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.903;QD=26.7675;RBI=0.0130633;REFB=-0.01728;REVB=0.00380269;RO=21;SAF=20;SAR=17;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198682;STB=0.608238;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00712379;OID=.;OPOS=64926315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:21:21:37:37:0.637931:17:20:5:16:17:20:5:16 chr5 64926553 . G C 267.36 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0905168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5533;QD=21.825;RBI=0.0906192;REFB=-0.00742608;REVB=-0.00430684;RO=23;SAF=6;SAR=19;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117188;STB=0.582752;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0134548;OID=.;OPOS=64926553;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:19:6:8:15:19:6:9:15 chr5 65108215 . A G 386.57 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.000389442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.754;QD=18.1914;RBI=0.000518245;REFB=-0.00358535;REVB=-0.000341925;RO=45;SAF=21;SAR=19;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118157;STB=0.565872;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00473493;OID=.;OPOS=65108215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:19:21:18:27:19:21:18:27 chr5 65317181 . C T 727.06 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327299;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.874;QD=57.024;RBI=0.0036102;REFB=0;REVB=-0.00152352;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31656e-06;OID=.;OPOS=65317181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:52:51:1:21:31:0:0:21:30:0:0 chr5 66166614 . G A 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.057602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9844;QD=14.6653;RBI=0.0643826;REFB=-0.0130538;REVB=-0.0287597;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525853;STB=0.530571;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0292695;OID=.;OPOS=66166614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:5:10:13:8:5:10:13:8 chr5 66283374 . C T 1047.49 PASS AF=0.973684;AO=70;DP=71;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0105869;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.368;QD=55.1313;RBI=0.0352134;REFB=-0.0190392;REVB=0.0335842;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00232151;OID=.;OPOS=66283374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:71:76:0:2:70:74:0.973684:45:25:0:0:46:28:0:2 chr5 66459878 . G C 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0428541;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3524;QD=11.1307;RBI=0.0429111;REFB=0.00343621;REVB=-0.00221118;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194738;STB=0.592414;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.0107115;OID=.;OPOS=66459878;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:27:16:17:10:10:0.37037:5:5:11:5:5:5:11:6 chr5 66480004 . T C 785.13 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00618863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3866;QD=57.1006;RBI=0.0436002;REFB=0;REVB=0.0431588;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256591;OID=.;OPOS=66480004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0 chr5 67494070 . A T 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.974;QD=60.0304;RBI=0.0735492;REFB=0;REVB=0.0721095;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368649;OID=.;OPOS=67494070;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0 chr5 67522722 . C T 1208.35 PASS AF=1;AO=79;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288946;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.254;QD=59.6718;RBI=0.0287666;REFB=-0.119807;REVB=-0.0286211;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000555527;OID=.;OPOS=67522722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:82:81:0:0:79:81:1:38:41:0:0:39:42:0:0 chr5 67589188 . C T 288.84 PASS AF=0.444444;AO=30;DP=71;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00361714;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.762;QD=16.0467;RBI=0.00387488;REFB=-0.0102111;REVB=0.00138959;RO=40;SAF=22;SAR=8;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129334;STB=0.584689;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0168945;OID=.;OPOS=67589188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:40:40:30:32:0.444444:8:22:25:15:8:24:25:15 chr5 67596933 . C T 220.46 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0246288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.238;QD=16.0333;RBI=0.0336718;REFB=-0.0239854;REVB=-0.0229611;RO=30;SAF=18;SAR=7;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166908;STB=0.594961;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.028262;OID=.;OPOS=67596933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:7:18:17:13:7:18:17:13 chr5 68266553 . A T 196.65 PASS AF=0.465116;AO=19;DP=42;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0277334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2441;QD=18.2931;RBI=0.0290618;REFB=-0.0341236;REVB=-0.00868589;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190857;STB=0.617458;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0394582;OID=.;OPOS=68266553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:23:23:19:20:0.465116:7:12:10:13:7:13:10:13 chr5 68417643 . C T 219.21 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00538344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.747;QD=13.9183;RBI=0.0102787;REFB=-0.00332264;REVB=0.00875621;RO=37;SAF=4;SAR=22;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191827;STB=0.611015;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00364197;OID=.;OPOS=68417643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:22:4:10:27:22:4:10:27 chr5 68419054 . A T 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00583656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.456;QD=27.2219;RBI=0.0435069;REFB=-0.00855373;REVB=-0.0431137;RO=15;SAF=15;SAR=9;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823801;STB=0.545418;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00371014;OID=.;OPOS=68419054;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:9:15:11:4:9:15:11:4 chr5 68524133 . A G 212.76 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0270001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.091;QD=20.2629;RBI=0.0274442;REFB=0.00934357;REVB=-0.00491701;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849174;STB=0.547899;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.0101705;OID=.;OPOS=68524133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:9:12:10:11:9:12:10:11 chr5 68525027 . C T 193.0 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0605625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.34;QD=23.3941;RBI=0.0611236;REFB=-0.00619434;REVB=-0.0082628;RO=14;SAF=7;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920605;STB=0.505149;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00348669;OID=.;OPOS=68525027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:12:7:5:9:12:7:5:9 chr5 68531253 . C T 302.8 PASS AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0058125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.028;QD=17.0592;RBI=0.00582452;REFB=0.00303448;REVB=-0.000374039;RO=38;SAF=9;SAR=24;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352536;STB=0.698289;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00376885;OID=.;OPOS=68531253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:24:9:24:14:24:9:24:14 chr5 68546706 . A G 178.95 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.000250123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.144;QD=15.2296;RBI=0.00939614;REFB=-0.0113493;REVB=-0.00939281;RO=28;SAF=12;SAR=7;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652559;STB=0.537696;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0189518;OID=.;OPOS=68546706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:7:12:16:12:7:12:16:12 chr5 68551507 . T G 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0217317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.457;QD=18.8866;RBI=0.0217425;REFB=-0.00338434;REVB=0.000686103;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151251;STB=0.588011;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00330292;OID=.;OPOS=68551507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:3:2:5:3:3:2 chr5 68609885 . G T 72.65 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0292372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.312;QD=8.80583;RBI=0.0328065;REFB=-0.00749032;REVB=-0.0148813;RO=23;SAF=2;SAR=8;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355595;STB=0.721736;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0258814;OID=.;OPOS=68609885;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:8:2:11:12:8:2:11:12 chr5 68688608 . T C 35.68 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.256396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3175;QD=6.48738;RBI=0.257271;REFB=-0.0110155;REVB=-0.0211939;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2918e-08;STB=0.699237;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00121632;OID=.;OPOS=68688608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:22:22:12:16:6:6:0.272727:5:1:2:10:5:1:6:10 chr5 68695940 . T G 341.82 PASS AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0244697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.102;QD=15.8986;RBI=0.02515;REFB=-0.0217242;REVB=-0.00580989;RO=49;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857506;STB=0.54828;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0375508;OID=.;OPOS=68695940;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:18:19:21:28:18:19:21:28 chr5 68715310 . C T 109.24 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.00911897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.182;QD=14.096;RBI=0.00917378;REFB=-0.0122647;REVB=0.0010013;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180589;STB=0.603632;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0190929;OID=.;OPOS=68715310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:9:4:3:15:9:4:3:15 chr5 68720419 . T G 152.15 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00828518;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=269.099;QD=13.2308;RBI=0.0128102;REFB=-0.0035045;REVB=0.0097702;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22667;STB=0.633976;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00595166;OID=.;OPOS=68720419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:13:4:12:17:13:4:12:17 chr5 68775065 . C T 47.98 PASS AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.266;QD=31.987;RBI=0.0311075;REFB=0;REVB=-0.0255845;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692397;OID=.;OPOS=68775065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:1:4:1:0:0:4:2:0:0 chr5 68930746 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00536976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.231;QD=43.4862;RBI=0.00672819;REFB=0;REVB=-0.00405392;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.91353e-05;OID=.;OPOS=68930746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0 chr5 70308251 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00178885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.83;QD=56.9569;RBI=0.0173811;REFB=0;REVB=-0.0172888;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.04974e-05;OID=.;OPOS=70308251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0 chr5 70751818 . T G 1606.55 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00903949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.354;QD=64.2621;RBI=0.0162623;REFB=0;REVB=0.0135186;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20035e-05;OID=.;OPOS=70751818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:43:57:0:0:43:57:0:0 chr5 70800475 . C T 207.63 PASS AF=0.436364;AO=23;DP=54;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0452578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.964;QD=15.1003;RBI=0.0508864;REFB=-0.0183657;REVB=-0.0232628;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312271;STB=0.66064;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0136934;OID=.;OPOS=70800475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:31:31:23:24:0.436364:14:9:22:9:14:10:22:9 chr5 70800538 . G A 283.11 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0103257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.599;QD=17.4221;RBI=0.0154244;REFB=-0.00552888;REVB=-0.0114582;RO=34;SAF=20;SAR=11;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220451;STB=0.623662;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00912905;OID=.;OPOS=70800538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:11:20:14:20:11:20:14:20 chr5 70805429 . T G 137.06 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0220991;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.659;QD=17.1326;RBI=0.0232267;REFB=-0.0249756;REVB=0.00714892;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313904;STB=0.681163;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.023912;OID=.;OPOS=70805429;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:11:4:10:7:11:4:10:7 chr5 70806649 . T A 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0159456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.241;QD=17.6438;RBI=0.0187887;REFB=-0.036357;REVB=0.00993734;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092312;STB=0.553081;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0215316;OID=.;OPOS=70806649;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:1:6:7:2:1:6 chr5 70806711 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1094;QD=46.8472;RBI=0.0280843;REFB=0;REVB=0.00582834;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000896254;OID=.;OPOS=70806711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0 chr5 70806958 . G A 618.06 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0685174;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.749;QD=61.8063;RBI=0.0685289;REFB=0;REVB=0.00125991;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193474;OID=.;OPOS=70806958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0 chr5 70807016 . CT C,TC 47.22 PASS AF=0.5,0;AO=7,2;DP=19;FAO=9,0;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4,0;FSAR=5,0;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0928312,-0.0537541;FXX=0.0526039;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=14.1695,87.9256;QD=10.4926;RBI=0.142903,0.0549844;REFB=0.012433,0.00552813;REVB=-0.108644,0.0115661;RO=8;SAF=3,2;SAR=4,0;SRF=5;SRR=3;SSEN=0.471698,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.172968,0.55315;STB=0.609518,0.5;STBP=0.431,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0591766,0.0266342;OID=.,.;OPOS=70807017,70807016;OREF=T,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:19:18:8:9:7,2:9,0:0.5,0:4,0:3,2:5:3:5,0:4,0:6:3 chr5 70809169 . A G 320.81 PASS AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0249047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.27;QD=21.3876;RBI=0.0267606;REFB=-0.00610181;REVB=0.00979217;RO=27;SAF=13;SAR=20;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133159;STB=0.573725;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0104565;OID=.;OPOS=70809169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:20:13:15:12:20:13:15:12 chr5 70834926 . T C 186.79 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0153671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.079;QD=19.6617;RBI=0.0276762;REFB=-0.0207462;REVB=0.0230179;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731248;STB=0.526732;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0352845;OID=.;OPOS=70834926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:38:17:19:18:19:0.5:10:8:9:8:11:8:9:10 chr5 70837295 . A C 417.97 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.03959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4848;QD=53.9316;RBI=0.041527;REFB=-0.0461838;REVB=0.0125347;RO=1;SAF=19;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239088;STB=0.512812;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00301609;OID=.;OPOS=70837295;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:11:19:1:0:11:19:1:0 chr5 70840233 . C T 327.34 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0166061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6815;QD=17.6939;RBI=0.0808331;REFB=-0.00168791;REVB=-0.079109;RO=39;SAF=22;SAR=13;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884101;STB=0.549528;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00110329;OID=.;OPOS=70840233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:13:22:21:18:13:22:21:18 chr5 70849021 . G T 290.17 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00373321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.041;QD=16.5809;RBI=0.0204816;REFB=-0.0201866;REVB=-0.0201385;RO=38;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664649;STB=0.537385;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0243948;OID=.;OPOS=70849021;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:19:13:18:20:19:13:18:20 chr5 70858194 . C T 607.84 PASS AF=0.561224;AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00713033;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.265;QD=24.8097;RBI=0.0244152;REFB=-0.00662591;REVB=-0.0233508;RO=43;SAF=23;SAR=32;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057136;STB=0.531309;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00545482;OID=.;OPOS=70858194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:43:43:55:55:0.561224:32:23:21:22:32:23:21:22 chr5 70932002 . G A 631.77 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00736376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.4;QD=61.6356;RBI=0.0133372;REFB=0;REVB=-0.01112;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155148;OID=.;OPOS=70932002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:21:20:0:0 chr5 70945075 . A G 632.05 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.594;QD=61.663;RBI=0.0619913;REFB=0;REVB=0.0432713;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392125;OID=.;OPOS=70945075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0 chr5 71146757 . T C 643.01 PASS AF=0.934783;AO=43;DP=47;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.000870411;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5741;QD=55.9137;RBI=0.0413001;REFB=-0.0318527;REVB=-0.0412909;RO=3;SAF=33;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170758;STB=0.509112;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00177869;OID=.;OPOS=71146757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:47:46:3:3:43:43:0.934783:10:33:2:1:10:33:2:1 chr5 71146882 . T C 2239.53 PASS AF=0.928571;AO=155;DP=170;FAO=156;FDP=168;FR=.;FRO=12;FSAF=86;FSAR=70;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0143696;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.207;QD=53.322;RBI=0.0210497;REFB=0.00286112;REVB=0.0153819;RO=11;SAF=85;SAR=70;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111807;STB=0.502315;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=-0.000190958;OID=.;OPOS=71146882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:170:168:11:12:155:156:0.928571:70:85:7:4:70:86:7:5 chr5 71146889 . A G 2182.1 PASS AF=0.921687;AO=153;DP=165;FAO=153;FDP=166;FR=.;FRO=13;FSAF=87;FSAR=66;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00528228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.591;QD=52.5808;RBI=0.0166829;REFB=-0.0724081;REVB=0.0158245;RO=12;SAF=87;SAR=66;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138138;STB=0.503735;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0029405;OID=.;OPOS=71146889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:165:166:12:13:153:153:0.921687:66:87:8:4:66:87:8:5 chr5 71490962 . A G 647.93 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.011451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5668;QD=57.5936;RBI=0.0166577;REFB=-0.154785;REVB=-0.0120976;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.51851;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00479559;OID=.;OPOS=71490962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:0:2:43:43:0.955556:26:17:0:0:26:17:0:2 chr5 71495041 . T C 388.78 PASS AF=0.441558;AO=32;DP=78;FAO=34;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.0132555;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9215;QD=20.1962;RBI=0.0167351;REFB=-0.0271395;REVB=-0.0102155;RO=22;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273151;STB=0.617696;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0199726;OID=.;OPOS=71495041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:22:28:32:34:0.441558:14:18:20:2:16:18:22:6 chr5 71756102 . G A 2855.78 PASS AF=0.994595;AO=182;DP=183;FAO=184;FDP=185;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=93;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0394018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5135;QD=61.7466;RBI=0.0715354;REFB=0.0371493;REVB=0.0597061;RO=1;SAF=90;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526082;STB=0.502732;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.000257215;OID=.;OPOS=71756102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:183:185:1:1:182:184:0.994595:92:90:1:0:93:91:1:0 chr5 71756670 . C T 376.18 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.159;QD=55.7299;RBI=0.0711941;REFB=0;REVB=0.0122319;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119491;OID=.;OPOS=71756670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:14:13:0:0 chr5 72144209 . C T 457.56 PASS AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0300083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.176;QD=20.5644;RBI=0.0307501;REFB=-0.0215877;REVB=0.00671367;RO=43;SAF=14;SAR=31;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105483;STB=0.554165;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0167634;OID=.;OPOS=72144209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:43:44:45:45:0.505618:31:14:18:25:31:14:18:26 chr5 72174432 . C G 1376.49 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00837055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2129;QD=62.5676;RBI=0.0512783;REFB=0;REVB=-0.0505905;RO=0;SAF=31;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00429e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200846;OID=.;OPOS=72174432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:56:31:0:0:57:31:0:0 chr5 72184098 . C T 594.52 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.002;QD=60.9768;RBI=0.0192609;REFB=0;REVB=-0.0179675;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108385;OID=.;OPOS=72184098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0 chr5 72347223 . A G 575.25 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.028;QD=60.5528;RBI=0.0579284;REFB=0;REVB=0.0553528;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307027;OID=.;OPOS=72347223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr5 72351905 . A G 154.97 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0201684;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.801;QD=22.9582;RBI=0.0263815;REFB=-0.0111105;REVB=0.0170065;RO=11;SAF=15;SAR=1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.625243;STB=0.86272;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00289113;OID=.;OPOS=72351905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:1:15:4:7:1:15:4:7 chr5 72385914 . A G 1003.35 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0150859;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.1608;QD=56.527;RBI=0.0457137;REFB=-0.064982;REVB=0.0431528;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518513;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00105974;OID=.;OPOS=72385914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:71:0:2:69:69:0.971831:26:43:0:0:26:43:0:2 chr5 72419410 . A G 949.13 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.914;QD=58.408;RBI=0.0411461;REFB=0;REVB=-0.0306893;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25492e-06;OID=.;OPOS=72419410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0 chr5 72419456 . C G 154.7 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0466038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4899;QD=14.3903;RBI=0.05044;REFB=0.0236968;REVB=-0.0192946;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012121;STB=0.507034;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=-0.0487422;OID=.;OPOS=72419456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:10:7:11:15:10:7:11:15 chr5 72419617 . C A 563.04 PASS AF=0.55914;AO=49;DP=91;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0127047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.454;QD=24.2166;RBI=0.0140695;REFB=-0.00872127;REVB=0.00604491;RO=41;SAF=20;SAR=29;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00554001;STB=0.504927;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00756383;OID=.;OPOS=72419617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:41:41:49:52:0.55914:29:20:17:24:31:21:17:24 chr5 72742882 . T C 158.59 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0498787;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.013;QD=16.2657;RBI=0.0506476;REFB=-0.0184488;REVB=-0.00879186;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106282;STB=0.560905;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0258571;OID=.;OPOS=72742882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:8:14:9:8:8:14 chr5 72868447 . T C 125.73 PASS AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0353801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1961;QD=9.6717;RBI=0.076271;REFB=0.00583947;REVB=0.0675686;RO=36;SAF=6;SAR=10;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238998;STB=0.642681;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.0104266;OID=.;OPOS=72868447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:10:6:21:15:10:6:21:15 chr5 72874907 . A C 588.69 PASS AF=0.557692;AO=57;DP=104;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.00118092;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2897;QD=22.642;RBI=0.00629247;REFB=-0.00713711;REVB=-0.00618066;RO=46;SAF=23;SAR=34;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856246;STB=0.543356;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00654007;OID=.;OPOS=72874907;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:46:46:57:58:0.557692:34:23:14:32:35:23:14:32 chr5 73144845 . A G 1135.5 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.825;QD=60.5601;RBI=0.0446669;REFB=0;REVB=0.0418349;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151393;OID=.;OPOS=73144845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:30:44:0:0:30:45:0:0 chr5 73207372 . T A 578.16 PASS AF=0.513043;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0139701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.041;QD=20.1098;RBI=0.0207046;REFB=0.00096886;REVB=-0.0152813;RO=54;SAF=36;SAR=23;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161419;STB=0.597654;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.000672588;OID=.;OPOS=73207372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:54:56:59:59:0.513043:23:36:23:31:23:36:23:33 chr5 73218954 . C T 860.05 PASS AF=0.480874;AO=87;DP=182;FAO=88;FDP=183;FR=.;FRO=95;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=45;FWDB=0.0135335;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.375;QD=18.7988;RBI=0.0145853;REFB=-0.00954858;REVB=0.00543812;RO=89;SAF=38;SAR=49;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841858;STB=0.549302;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00889729;OID=.;OPOS=73218954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:89:95:87:88:0.480874:49:38:47:42:50:38:50:45 chr5 73471334 . G C 2083.25 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6796;QD=62.654;RBI=0.0174478;REFB=0;REVB=-0.00905005;RO=0;SAF=76;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44043e-05;OID=.;OPOS=73471334;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:57:76:0:0:57:76:0:0 chr5 73613858 . A G 610.44 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00819095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.014;QD=56.7849;RBI=0.0203466;REFB=-0.017926;REVB=0.018625;RO=2;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347354;STB=0.51851;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00170382;OID=.;OPOS=73613858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:26:15:0:2:26:15:0:2 chr5 73613972 . G C 1501.82 PASS AF=0.979592;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.022309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.245;QD=61.2988;RBI=0.0253176;REFB=-0.0458071;REVB=-0.0119704;RO=2;SAF=42;SAR=54;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220437;STB=0.511625;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.000187413;OID=.;OPOS=73613972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:98:2:2:96:96:0.979592:54:42:2:0:54:42:2:0 chr5 73930751 . C T 1152.08 PASS AF=0.962963;AO=79;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0155379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3884;QD=56.8927;RBI=0.0278359;REFB=-0.0425006;REVB=0.0230957;RO=2;SAF=39;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236559;STB=0.518982;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0063301;OID=.;OPOS=73930751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:2:3:79:78:0.962963:40:39:2:0:40:38:3:0 chr5 73931246 . T C 393.24 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145543;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.252;QD=56.1776;RBI=0.0145643;REFB=0;REVB=-0.000537265;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7946e-05;OID=.;OPOS=73931246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0 chr5 73932315 . T C 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.565;QD=60.2045;RBI=0.00802874;REFB=0;REVB=-0.0052029;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40222e-06;OID=.;OPOS=73932315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:43:30:0:0:43:30:0:0 chr5 73981270 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00244718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.811;QD=50.4134;RBI=0.0346704;REFB=0;REVB=0.034584;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010387;OID=.;OPOS=73981270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr5 73992881 . A G 508.44 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0426858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.712;QD=56.4939;RBI=0.0443631;REFB=-0.156626;REVB=0.0120833;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252795;STB=0.513506;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00102941;OID=.;OPOS=73992881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:17:18:1:0:17:18:1:0 chr5 74041654 . T C 384.29 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00744664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.671;QD=17.8738;RBI=0.0125093;REFB=-0.0114344;REVB=0.0100514;RO=45;SAF=25;SAR=15;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213882;STB=0.624937;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0139942;OID=.;OPOS=74041654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:46:40:40:0.465116:15:25:18:27:15:25:18:28 chr5 74323529 . G C 395.96 PASS AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.00381342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9803;QD=20.3054;RBI=0.00821121;REFB=-0.00727317;REVB=0.00727198;RO=38;SAF=15;SAR=25;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822313;STB=0.545433;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00473606;OID=.;OPOS=74323529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:25:15:11:27:25:15:11:27 chr5 74324548 . G A 333.03 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0111901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.487;QD=16.4461;RBI=0.0131655;REFB=0.00246216;REVB=-0.00693618;RO=45;SAF=17;SAR=19;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603356;STB=0.533908;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.00316272;OID=.;OPOS=74324548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:19:17:24:21:19:17:24:21 chr5 74400151 . A C 207.31 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.000953005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.308;QD=24.3897;RBI=0.00559673;REFB=-0.00375112;REVB=0.005515;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257122;STB=0.655023;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00738801;OID=.;OPOS=74400151;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:14:20:20:0.588235:12:8:10:3:12:8:11:3 chr5 74400400 . T C 252.9 PASS AF=0.365854;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.0173609;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.554;QD=12.3367;RBI=0.031863;REFB=-0.0247846;REVB=0.026718;RO=52;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636055;STB=0.536561;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.025265;OID=.;OPOS=74400400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:52:52:30:30:0.365854:15:15:23:29:15:15:23:29 chr5 74442410 . G A 902.24 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5215;QD=58.2087;RBI=0.0368613;REFB=0;REVB=-0.0368057;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217492;OID=.;OPOS=74442410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0 chr5 74442920 . A G 1066.07 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651939;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.393;QD=60.0601;RBI=0.00653101;REFB=0;REVB=-0.000389465;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117737;OID=.;OPOS=74442920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0 chr5 74443132 . C T 1904.78 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298868;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.395;QD=61.4444;RBI=0.0305041;REFB=0;REVB=-0.00610569;RO=0;SAF=49;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000289598;OID=.;OPOS=74443132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:124:0:0:122:124:1:73:49:0:0:74:50:0:0 chr5 74491715 . TTCA T 709.08 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213469;FXX=0.0483793;HRUN=2;LEN=3;MLLD=309.827;QD=48.0734;RBI=0.057735;REFB=0;REVB=0.0536436;RO=0;SAF=40;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.35422e-05;OID=.;OPOS=74491716;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:53:54:59:59:0:40:19:0:0:13:0:40:13:0:0 chr5 74491956 . T C 345.05 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0125958;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.157;QD=18.6513;RBI=0.0147985;REFB=-0.0126216;REVB=0.00776781;RO=38;SAF=23;SAR=13;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24894;STB=0.638812;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0169155;OID=.;OPOS=74491956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:74:38:38:36:36:0.486486:13:23:14:24:13:23:14:24 chr5 74526442 . G A 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00667482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.876;QD=20.8719;RBI=0.017159;REFB=-0.0126999;REVB=-0.0158076;RO=20;SAF=6;SAR=15;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159903;STB=0.590461;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0124052;OID=.;OPOS=74526442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:15:6:9:11:15:6:9:11 chr5 74656175 . G A 320.37 PASS AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00113391;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.344;QD=18.3069;RBI=0.00339111;REFB=-0.0093172;REVB=0.00319591;RO=36;SAF=20;SAR=14;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131224;STB=0.572913;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0126309;OID=.;OPOS=74656175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:14:20:26:10:14:20:26:10 chr5 74681773 . T C 703.39 PASS AF=0.514925;AO=69;DP=133;FAO=69;FDP=134;FR=.;FRO=65;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.0158897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1917;QD=20.9968;RBI=0.0691059;REFB=-0.0139002;REVB=0.0672543;RO=64;SAF=38;SAR=31;SRF=42;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944958;STB=0.554902;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0133756;OID=.;OPOS=74681773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:64:65:69:69:0.514925:31:38:42:22:31:38:43:22 chr5 74877266 . C T 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00738211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.091;QD=21.1726;RBI=0.0284013;REFB=-0.0224857;REVB=0.0274252;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124999;STB=0.571306;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0174862;OID=.;OPOS=74877266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:8:4:4:4:8:4:4:4 chr5 74921686 . G A 490.71 PASS AF=0.534091;AO=47;DP=88;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0327997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.564;QD=22.3048;RBI=0.0345502;REFB=-0.00922353;REVB=-0.010858;RO=41;SAF=12;SAR=35;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182832;STB=0.601329;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0130771;OID=.;OPOS=74921686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:41:47:47:0.534091:35:12:18:23:35:12:18:23 chr5 74951901 . G A 533.97 PASS AF=0.543478;AO=49;DP=91;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.0629784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5;QD=23.216;RBI=0.06344;REFB=-0.020826;REVB=-0.0076383;RO=42;SAF=20;SAR=29;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659051;STB=0.532097;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0150873;OID=.;OPOS=74951901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:42:42:49:50:0.543478:29:20:14:28:30:20:14:28 chr5 74970024 . T C 1043.63 PASS AF=0.935897;AO=73;DP=78;FAO=73;FDP=78;FR=.;FRO=5;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00112104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.961;QD=53.5194;RBI=0.0541835;REFB=-0.16407;REVB=0.0541719;RO=5;SAF=48;SAR=25;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085692;STB=0.545442;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.000420044;OID=.;OPOS=74970024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:78:78:5:5:73:73:0.935897:25:48:0:5:25:48:0:5 chr5 74998598 . G A 154.1 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0194353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.608;QD=14.3349;RBI=0.0202048;REFB=-0.0116823;REVB=0.00552294;RO=25;SAF=6;SAR=11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135825;STB=0.591957;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0100141;OID=.;OPOS=74998598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:11:6:12:13:11:6:13:13 chr5 74998606 . G A 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00276175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.032;QD=27.2218;RBI=0.0250229;REFB=-0.00113371;REVB=-0.0248701;RO=15;SAF=12;SAR=12;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695422;STB=0.53843;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.000676735;OID=.;OPOS=74998606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:12:12:6:9:12:12:6:9 chr5 75003678 . T C 2221.87 PASS AF=1;AO=138;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.92;QD=63.0318;RBI=0.041469;REFB=0;REVB=0.0401915;RO=0;SAF=55;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61292e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83197e-05;OID=.;OPOS=75003678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:141:0:0:138:141:1:83:55:0:0:86:55:0:0 chr5 75008193 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.738;QD=62.3505;RBI=0.0202217;REFB=0;REVB=-0.0147096;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.97687e-06;OID=.;OPOS=75008193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr5 75427935 . G A 330.21 PASS AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0315065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1849;QD=18.3452;RBI=0.0594561;REFB=-0.00806619;REVB=0.0504219;RO=37;SAF=12;SAR=23;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211973;STB=0.618513;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00977664;OID=.;OPOS=75427935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:23:12:21:16:23:12:21:16 chr5 75591710 . C G 362.07 PASS AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.0170672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2916;QD=15.4073;RBI=0.0171179;REFB=-0.0112061;REVB=0.00131737;RO=55;SAF=20;SAR=19;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147992;STB=0.583292;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0212565;OID=.;OPOS=75591710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:19:20:36:19:19:20:36:19 chr5 75594743 . G A 607.66 PASS AF=0.555556;AO=60;DP=108;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0091043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.813;QD=22.5057;RBI=0.0116953;REFB=0.0169211;REVB=0.00734109;RO=48;SAF=18;SAR=42;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142848;STB=0.578485;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00664007;OID=.;OPOS=75594743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:48:48:60:60:0.555556:42:18:22:26:42:18:22:26 chr5 75884734 . G A 853.39 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114463;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4829;QD=57.857;RBI=0.0422827;REFB=0;REVB=0.0407039;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322858;OID=.;OPOS=75884734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0 chr5 75923294 . T G 1463.53 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.848;QD=62.2778;RBI=0.0343418;REFB=0;REVB=-0.00203062;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313723;OID=.;OPOS=75923294;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:88:94:0:0:86:94:1:31:55:0:0:34:60:0:0 chr5 75923307 . A G 1436.33 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00452632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.851;QD=61.7776;RBI=0.00825699;REFB=0.0421395;REVB=0.00690582;RO=1;SAF=59;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141475;STB=0.507461;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=9.40149e-06;OID=.;OPOS=75923307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:33:59:0:1:33:59:0:1 chr5 75960865 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.294;QD=59.4354;RBI=0.0469135;REFB=0;REVB=0.04284;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348754;OID=.;OPOS=75960865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr5 76003246 . A AT 489.17 PASS AF=1;AO=24;DP=105;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323546;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.24149;QD=19.7645;RBI=0.290869;REFB=0.00862255;REVB=-0.289064;RO=79;SAF=8;SAR=16;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632413;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00389598;OID=.;OPOS=76003247;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:24:105:99:99:0:37:62:0:0:8:79:8:16:30:49 chr5 76003254 . A T 1306.58 PASS AF=0.97;AO=89;DP=97;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0975034;FXX=0.00990001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=30.6827;QD=52.2632;RBI=0.124776;REFB=-0.174862;REVB=0.0778599;RO=8;SAF=31;SAR=58;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673741;STB=0.520544;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0076564;OID=.;OPOS=76003254;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:97:100:8:3:89:97:0.97:58:31:6:2:62:35:3:0 chr5 76128521 . G A 271.51 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0123888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.787;QD=23.6098;RBI=0.0266929;REFB=-0.0310691;REVB=-0.0236438;RO=21;SAF=18;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180429;STB=0.601094;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0193151;OID=.;OPOS=76128521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:7:18:11:10:7:18:11:10 chr5 76171252 . A C 183.95 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0128079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.214;QD=17.1116;RBI=0.0230089;REFB=-0.0413961;REVB=-0.0191145;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772379;STB=0.598399;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0458718;OID=.;OPOS=76171252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:20:24:19:19:0.44186:7:12:11:9:7:12:11:13 chr5 76343999 . T C 265.37 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00407196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.357;QD=17.9913;RBI=0.00482503;REFB=-0.0003043;REVB=-0.00258845;RO=30;SAF=20;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242835;STB=0.636378;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.000304464;OID=.;OPOS=76343999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:9:20:13:17:9:20:13:17 chr5 76704849 . T C 1046.21 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00856528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.369;QD=58.1227;RBI=0.00982134;REFB=0.041273;REVB=0.0048057;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000417436;OID=.;OPOS=76704849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:72:0:1:70:71:0.986111:45:25:0:0:46:25:0:1 chr5 76708987 . A G 1936.59 PASS AF=0.931973;AO=135;DP=151;FAO=137;FDP=147;FR=.;FRO=10;FSAF=54;FSAR=83;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0159665;FXX=0.0264883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.392;QD=52.6963;RBI=0.0177174;REFB=-0.0114776;REVB=0.0076795;RO=8;SAF=54;SAR=81;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247401;STB=0.507513;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00338532;OID=.;OPOS=76708987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:151:147:8:10:135:137:0.931973:81:54:5:3:83:54:5:5 chr5 76722442 . C T 401.68 PASS AF=0.644068;AO=38;DP=59;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0379336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.699;QD=27.2324;RBI=0.0380164;REFB=-0.00782242;REVB=0.00250691;RO=21;SAF=19;SAR=19;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465877;STB=0.52541;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00520935;OID=.;OPOS=76722442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:21:21:38:38:0.644068:19:19:9:12:19:19:9:12 chr5 76722880 . CATAAA C 69.23 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0010342;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=5;MLLD=267.975;QD=13.8465;RBI=0.00984551;REFB=-0.0236106;REVB=0.00979104;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259257;STB=0.651856;STBP=0.258;TYPE=del;VARB=0.00759889;OID=.;OPOS=76722881;OREF=ATAAA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45:9:20:9:20:11:4:5:8:3:69:11:4:5:8:3 chr5 76926578 . T C 638.86 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000371541;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.177;QD=59.4285;RBI=0.00894623;REFB=-0.108405;REVB=-0.00893851;RO=1;SAF=28;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164729;STB=0.508768;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=-3.40735e-05;OID=.;OPOS=76926578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:14:28:1:0:14:28:1:0 chr5 77298618 . TA TC,TT 943.41 PASS AF=0.0571429,0.914286;AO=4,57;DP=70;FAO=4,64;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=4,44;FSAR=0,20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00140656,0.000962316;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.9392,86.3593;QD=53.9094;RBI=0.0530173,0.0504284;REFB=-0.0721883,-0.0186605;REVB=0.0529986,0.0504192;RO=2;SAF=4,41;SAR=0,16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0224523;STB=0.5,0.511108;STBP=1,0.421;TYPE=snp,snp;VARB=0.0364726,-0.000944575;OID=.,.;OPOS=77298619,77298619;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=TC,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0571429,0.914286:4,57:70:4,64:70:2:4,44:0,20:2:0:13:2:4,41:0,16:2:0 chr5 77412011 . A G 301.31 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0155984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.213;QD=16.7397;RBI=0.015891;REFB=-0.00497369;REVB=-0.00303531;RO=39;SAF=19;SAR=14;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614186;STB=0.534506;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0062809;OID=.;OPOS=77412011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:14:19:20:19:14:19:20:19 chr5 77425028 . A T 2968.32 PASS AF=1;AO=185;DP=187;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.542;QD=63.1558;RBI=0.0180152;REFB=0;REVB=0.00171254;RO=0;SAF=94;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91902e-05;OID=.;OPOS=77425028;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:187:188:0:0:185:188:1:91:94:0:0:91:97:0:0 chr5 77473165 . A G 156.73 PASS AF=0.390244;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0239845;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.925;QD=15.2909;RBI=0.0358404;REFB=-0.0223929;REVB=0.0266322;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241378;STB=0.538414;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0404627;OID=.;OPOS=77473165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:15:23:15:16:0.390244:8:7:3:12:8:8:10:13 chr5 77745853 . C CA 348.56 PASS AF=1;AO=28;DP=38;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0864977;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.1067;QD=42.2503;RBI=0.0949458;REFB=0;REVB=0.0391516;RO=9;SAF=22;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197167;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00474812;OID=.;OPOS=77745854;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:28:38:33:33:0:22:11:0:0:7:9:22:6:4:5 chr5 77781152 . TTACAA T 319.57 PASS AF=0.523256;AO=43;DP=89;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0176439;FXX=0.0444395;HRUN=3;LEN=5;MLLD=217.65;QD=14.8639;RBI=0.0206378;REFB=-0.0154529;REVB=0.0107056;RO=41;SAF=24;SAR=19;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104982;STB=0.555531;STBP=0.312;TYPE=del;VARB=0.0144532;OID=.;OPOS=77781153;OREF=TACAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.523256:43:89:45:86:41:25:20:18:23:99:41:24:19:18:23 chr5 77781390 . G A 140.11 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0101233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.909;QD=12.737;RBI=0.012247;REFB=0.000873935;REVB=0.00689255;RO=28;SAF=3;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282786;STB=0.66888;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.00141608;OID=.;OPOS=77781390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:13:3:11:17:13:3:11:17 chr5 77781785 . C CT 785.06 PASS AF=1;AO=67;DP=82;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301509;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.6062;QD=42.4359;RBI=0.0964449;REFB=0;REVB=0.0916108;RO=14;SAF=33;SAR=34;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207354;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00186043;OID=.;OPOS=77781786;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:67:82:74:74:0:34:40:0:0:14:14:33:34:6:8 chr5 77784433 . T C 454.67 PASS AF=0.425;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.00442766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9664;QD=15.1558;RBI=0.0303126;REFB=0.00196788;REVB=-0.0299875;RO=69;SAF=23;SAR=28;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131297;STB=0.57363;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00470236;OID=.;OPOS=77784433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:69:69:51:51:0.425:28:23:40:29:28:23:40:29 chr5 77784438 . T A 429.71 PASS AF=0.415254;AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=-0.0215817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.216;QD=14.5663;RBI=0.0241987;REFB=-0.00853557;REVB=-0.0109455;RO=69;SAF=21;SAR=28;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185569;STB=0.604275;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0122545;OID=.;OPOS=77784438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:69:49:49:0.415254:28:21:42:27:28:21:42:27 chr5 77784738 . A G 405.92 PASS AF=0.45;AO=43;DP=98;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00833798;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.308;QD=16.237;RBI=0.0238749;REFB=0.00545166;REVB=0.0223716;RO=47;SAF=25;SAR=18;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00666279;STB=0.515688;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.00125925;OID=.;OPOS=77784738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:47:55:43:45:0.45:18:25:27:20:20:25:29:26 chr5 78181477 . C T 576.35 PASS AF=0.552083;AO=53;DP=96;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.01399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.408;QD=24.0145;RBI=0.0177803;REFB=-0.0113258;REVB=-0.0109736;RO=43;SAF=25;SAR=28;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136399;STB=0.507483;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00905997;OID=.;OPOS=78181477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:43:43:53:53:0.552083:28:25:21:22:28:25:21:22 chr5 78320085 . T C 402.99 PASS AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.00909633;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.21;QD=18.9643;RBI=0.0116395;REFB=-0.0191145;REVB=0.00726188;RO=42;SAF=22;SAR=19;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319847;STB=0.504617;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0221444;OID=.;OPOS=78320085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:44:41:41:0.482353:19:22:24:18:19:22:24:20 chr5 78340257 . C G 1749.43 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.673;QD=60.8497;RBI=0.0116032;REFB=0;REVB=-0.00310745;RO=0;SAF=58;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94585e-06;OID=.;OPOS=78340257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:57:58:0:0:57:58:0:0 chr5 78340286 . A G 1642.11 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000182964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.493;QD=60.2608;RBI=0.020978;REFB=0;REVB=0.0209772;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88705e-05;OID=.;OPOS=78340286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:61:47:0:0:62:47:0:0 chr5 78351636 . A C 737.57 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0778903;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8061;QD=56.7363;RBI=0.0783584;REFB=0;REVB=0.00855224;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318605;OID=.;OPOS=78351636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:52:0:0:49:52:1:29:20:0:0:29:23:0:0 chr5 78373431 . C T 209.34 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0206262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.861;QD=13.7269;RBI=0.0221332;REFB=-0.00703685;REVB=-0.00802731;RO=36;SAF=5;SAR=20;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306208;STB=0.677262;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00842481;OID=.;OPOS=78373431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:20:5:16:20:20:5:16:20 chr5 78421959 . G A 443.27 PASS AF=0.5;AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00348011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.373;QD=20.1485;RBI=0.00787934;REFB=-0.0147039;REVB=-0.00706915;RO=44;SAF=19;SAR=24;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116901;STB=0.511537;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0174966;OID=.;OPOS=78421959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:44:44:43:44:0.5:24:19:20:24:25:19:20:24 chr5 78423621 . C T 185.59 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.00158066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.319;QD=13.7475;RBI=0.00469081;REFB=-0.00522117;REVB=0.00441648;RO=32;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951118;STB=0.55426;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.021552;OID=.;OPOS=78423621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:8:14:23:9:8:14:23:9 chr5 78573790 . A T 538.85 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0141195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.034;QD=21.7716;RBI=0.0147189;REFB=-0.00103119;REVB=-0.00415752;RO=48;SAF=29;SAR=22;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240378;STB=0.513269;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00125062;OID=.;OPOS=78573790;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:22:29:26:22:22:29:26:22 chr5 78596044 . T C 2256.46 PASS AF=0.993056;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00502561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.718;QD=62.6794;RBI=0.0143796;REFB=-0.183802;REVB=0.0134727;RO=0;SAF=66;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14598e-08;STB=0.503225;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=8.133e-06;OID=.;OPOS=78596044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:143:144:0:1:143:143:0.993056:77:66:0:0:77:66:0:1 chr5 78610174 . A G 304.12 PASS AF=0.471429;AO=32;DP=69;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00647607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7756;QD=17.3783;RBI=0.00891855;REFB=-0.00160203;REVB=-0.00613197;RO=36;SAF=20;SAR=12;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139236;STB=0.508375;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00196345;OID=.;OPOS=78610174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:36:37:32:33:0.471429:12:20:22:14:12:21:23:14 chr5 78617534 . T G 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=359.335;QD=59.3229;RBI=0.00885321;REFB=0;REVB=0.00819613;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17987e-06;OID=.;OPOS=78617534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0 chr5 79025157 . A G 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0255525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.415;QD=11.8303;RBI=0.0257915;REFB=-0.00122902;REVB=0.00350255;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201747;STB=0.620033;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00269047;OID=.;OPOS=79025157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:7:4:10:8:7:4:10:8 chr5 79028472 . C T 317.21 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00603059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.681;QD=20.465;RBI=0.0276361;REFB=0.00138319;REVB=0.0269701;RO=28;SAF=23;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517532;STB=0.540848;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00114643;OID=.;OPOS=79028472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:28:29:33:33:0.532258:10:23:18:10:10:23:18:11 chr5 79030045 . A G 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00681144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.312;QD=17.56;RBI=0.0077207;REFB=-0.00773085;REVB=-0.00363504;RO=21;SAF=6;SAR=12;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390224;STB=0.721079;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0109959;OID=.;OPOS=79030045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:12:6:16:5:12:6:16:5 chr5 79031583 . C G 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0758178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6938;QD=12.8604;RBI=0.0818724;REFB=0.00911991;REVB=-0.030899;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280299;STB=0.666221;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.0207512;OID=.;OPOS=79031583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:2:6:3:4:2:6 chr5 79033391 . G A 594.68 PASS AF=0.551402;AO=59;DP=107;FAO=59;FDP=107;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.00501525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.053;QD=22.2309;RBI=0.0110265;REFB=-0.0254138;REVB=0.00981998;RO=48;SAF=33;SAR=26;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133412;STB=0.573073;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0194447;OID=.;OPOS=79033391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:48:48:59:59:0.551402:26:33:19:29:26:33:19:29 chr5 79048562 . C T 505.43 PASS AF=0.539326;AO=47;DP=88;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00901904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.608;QD=22.7158;RBI=0.0168362;REFB=-0.0207684;REVB=0.0142167;RO=41;SAF=21;SAR=26;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00666104;STB=0.508967;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0161306;OID=.;OPOS=79048562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:41:41:47:48:0.539326:26:21:18:23:26:22:18:23 chr5 79286419 . C T 185.6 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00519112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.795;QD=13.7478;RBI=0.00531431;REFB=-0.00767941;REVB=0.00113761;RO=32;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144845;STB=0.583256;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0100294;OID=.;OPOS=79286419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:8:14:16:16:8:14:16:16 chr5 79439630 . G A 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00531617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.466;QD=14.7422;RBI=0.0152934;REFB=-0.000526586;REVB=0.0143397;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297347;STB=0.517221;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00089606;OID=.;OPOS=79439630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:7:10:14:11:7:10:14:11 chr5 79616083 . G C 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0134987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.293;QD=18.7118;RBI=0.0220074;REFB=-0.0154613;REVB=0.0173813;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0201856;OID=.;OPOS=79616083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:9:10:9:9:9:10 chr5 79617628 . A T 92.15 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0120099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.8125;QD=18.4298;RBI=0.0128505;REFB=0.0165725;REVB=0.00457144;RO=9;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.469562;STB=0.7643;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.0104451;OID=.;OPOS=79617628;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:7:4:9:0:7:4:9:0 chr5 79733079 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.169;QD=44.6897;RBI=0.0439834;REFB=0;REVB=0.00447322;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000850125;OID=.;OPOS=79733079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0 chr5 79734297 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.962;QD=45.8066;RBI=0.100972;REFB=0;REVB=0.0971082;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00233309;OID=.;OPOS=79734297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr5 79734409 . G A 306.27 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00498236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.732;QD=53.2634;RBI=0.0103703;REFB=0;REVB=-0.009095;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.81386e-05;OID=.;OPOS=79734409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr5 79735858 . A G 1510.85 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.144;QD=63.6148;RBI=0.0330571;REFB=0;REVB=0.0150882;RO=0;SAF=59;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.03192e-05;OID=.;OPOS=79735858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:36:59:0:0:36:59:0:0 chr5 79745469 . A G 1306.07 PASS AF=0.988372;AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0386747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3535;QD=60.7472;RBI=0.0503886;REFB=0.0600979;REVB=-0.0322998;RO=1;SAF=34;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137272;STB=0.504949;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.00139887;OID=.;OPOS=79745469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:86:1:1:84:85:0.988372:50:34:1:0:50:35:0:1 chr5 79815658 . T C 1383.36 PASS AF=0.988889;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00464096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.821;QD=61.4826;RBI=0.0388725;REFB=-0.0711111;REVB=0.0385944;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.504503;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000700457;OID=.;OPOS=79815658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:89:90:0:1:88:89:0.988889:55:33:0:0:55:34:0:1 chr5 79855372 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.183;QD=61.3356;RBI=0.0223437;REFB=0;REVB=-0.0114917;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40021e-05;OID=.;OPOS=79855372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0 chr5 79952348 . C T 179.76 PASS AF=0.422222;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0104631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.046;QD=15.9783;RBI=0.0317738;REFB=-0.00471396;REVB=-0.0300016;RO=26;SAF=14;SAR=4;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246564;STB=0.606926;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00712152;OID=.;OPOS=79952348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:26:26:18:19:0.422222:4:14:15:11:5:14:15:11 chr5 79966029 . G A 418.78 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=73;FAO=40;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0122666;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.474;QD=23.2653;RBI=0.056409;REFB=-0.0536193;REVB=-0.0550591;RO=21;SAF=13;SAR=22;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00696635;STB=0.513862;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0336796;OID=.;OPOS=79966029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:21:29:35:40:0.555556:22:13:8:13:22:18:14:15 chr5 80149981 . A G 538.74 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.744;QD=59.8605;RBI=0.051808;REFB=0;REVB=0.00328033;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208677;OID=.;OPOS=80149981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:10:26:0:0 chr5 80168937 . G A 206.63 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0101273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2438;QD=13.1196;RBI=0.0111943;REFB=-0.00474551;REVB=-0.00476985;RO=37;SAF=15;SAR=10;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147369;STB=0.576861;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00514282;OID=.;OPOS=80168937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:38:25:25:0.396825:10:15:17:20:10:15:18:20 chr5 80409526 . T C 446.09 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.00663994;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.887;QD=16.5219;RBI=0.00694582;REFB=-0.0123591;REVB=0.00203851;RO=59;SAF=28;SAR=21;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09522;STB=0.55317;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0135935;OID=.;OPOS=80409526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:21:28:28:31:21:28:28:31 chr5 80409729 . T C 52.92 PASS AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.81;QD=21.1692;RBI=0.00135408;REFB=0.00790692;REVB=0.00135408;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00380992;OID=.;OPOS=80409729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:7:0:0:3:7:0:0:3 chr5 80508322 . G A 279.98 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00847228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.997;QD=16.7154;RBI=0.0389965;REFB=-0.0114122;REVB=-0.0380651;RO=36;SAF=14;SAR=17;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00692295;STB=0.503889;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0110644;OID=.;OPOS=80508322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:17:14:16:20:17:14:16:20 chr5 81549216 . C T 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.685;QD=57.3851;RBI=0.0152214;REFB=0;REVB=-0.00822802;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04805e-05;OID=.;OPOS=81549216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0 chr5 81549240 . C A 619.93 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0048652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.579;QD=59.0413;RBI=0.00693734;REFB=0.053628;REVB=0.00494535;RO=1;SAF=14;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323316;STB=0.517233;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=3.17214e-05;OID=.;OPOS=81549240;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:27:14:1:0:27:14:1:0 chr5 81572184 . G C 1302.12 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3332;QD=62.0058;RBI=0.0422311;REFB=0;REVB=-0.0205456;RO=0;SAF=52;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.6718e-05;OID=.;OPOS=81572184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:32:52:0:0:32:52:0:0 chr5 82648943 . G A 976.81 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138669;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.462;QD=59.2005;RBI=0.0239559;REFB=0;REVB=0.0195345;RO=0;SAF=49;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64351e-05;OID=.;OPOS=82648943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:16:49:0:0:16:50:0:0 chr5 82648977 . T A,G 951.13 PASS AF=0.0588235,0.941176;AO=4,60;DP=65;FAO=4,64;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=3,43;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319942,0.000709027;FXX=0.0144907;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=149.968,200.047;QD=55.9489;RBI=0.0281157,0.109057;REFB=0,0;REVB=0.0279331,0.109055;RO=1;SAF=3,39;SAR=1,21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.119989,-0.011949;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0538333,-0.00139148;OID=.,.;OPOS=82648977,82648977;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:65:68:1:0:4,60:4,64:0.0588235,0.941176:1,21:3,39:1:0:1,21:3,43:0:0 chr5 82652551 . C G 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.638;QD=62.9079;RBI=0.0222453;REFB=0;REVB=0.0183265;RO=0;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84739e-05;OID=.;OPOS=82652551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:36:54:0:0:36:54:0:0 chr5 82808072 . C T 702.96 PASS AF=0.479452;AO=70;DP=146;FAO=70;FDP=146;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0139989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3382;QD=19.2592;RBI=0.0834602;REFB=3.21121e-05;REVB=0.0822778;RO=76;SAF=32;SAR=38;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651565;STB=0.53604;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.000664385;OID=.;OPOS=82808072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:76:76:70:70:0.479452:38:32:40:36:38:32:40:36 chr5 82815408 . G A 577.81 PASS AF=0.48;AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.0411981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.717;QD=18.4898;RBI=0.0429025;REFB=0.00126353;REVB=-0.0119726;RO=65;SAF=22;SAR=38;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150705;STB=0.583625;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00171434;OID=.;OPOS=82815408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:65:60:60:0.48:38:22:34:31:38:22:34:31 chr5 82875800 . C T 1910.23 PASS AF=1;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0800329;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.183;QD=61.6204;RBI=0.0811404;REFB=0;REVB=-0.0133604;RO=0;SAF=44;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012076;OID=.;OPOS=82875800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:124:0:0:124:124:1:80:44:0:0:80:44:0:0 chr5 83360520 . C T 1108.61 PASS AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000388941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.087;QD=57.59;RBI=0.0124534;REFB=-0.108134;REVB=0.0124473;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.516662;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00136126;OID=.;OPOS=83360520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:77:0:2:75:75:0.974026:46:29:0:0:46:29:2:0 chr5 85582712 . T C 616.19 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335602;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.808;QD=61.6185;RBI=0.0972143;REFB=0;REVB=0.0971564;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573588;OID=.;OPOS=85582712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0 chr5 85583507 . T G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.483;QD=47.8223;RBI=0.0228404;REFB=0;REVB=-0.000603614;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211222;OID=.;OPOS=85583507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0 chr5 85586831 . C T 827.22 PASS AF=0.455026;AO=85;DP=186;FAO=86;FDP=189;FR=.;FRO=103;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=36;FSRR=67;FWDB=0.0496792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.746;QD=17.5073;RBI=0.0506067;REFB=-0.00366647;REVB=-0.00964458;RO=100;SAF=28;SAR=57;SRF=36;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033297;STB=0.514694;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00657112;OID=.;OPOS=85586831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:189:100:103:85:86:0.455026:57:28:36:64:58:28:36:67 chr5 86513974 . A G 1584.75 PASS AF=0.932773;AO=111;DP=119;FAO=111;FDP=119;FR=.;FRO=8;FSAF=38;FSAR=73;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0420995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4609;QD=53.269;RBI=0.0510825;REFB=0.0324042;REVB=-0.0289318;RO=8;SAF=38;SAR=73;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564994;STB=0.529853;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0016644;OID=.;OPOS=86513974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:119:119:8:8:111:111:0.932773:73:38:6:2:73:38:6:2 chr5 86628436 . C G 324.77 PASS AF=0.404494;AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0111278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.667;QD=14.5963;RBI=0.0120363;REFB=0.00117751;REVB=0.00458744;RO=52;SAF=24;SAR=12;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370107;STB=0.516657;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.00230533;OID=.;OPOS=86628436;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:53:36:36:0.404494:12:24:33:19:12:24:34:19 chr5 87497977 . C T 773.89 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.955;QD=63.1749;RBI=0.0273694;REFB=0;REVB=-0.0250708;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.07249e-05;OID=.;OPOS=87497977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:20:28:0:0:20:29:0:0 chr5 87498849 . G A 2253.88 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.152;QD=63.4896;RBI=0.0286395;REFB=0;REVB=0.0079001;RO=0;SAF=51;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58937e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88279e-05;OID=.;OPOS=87498849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:142:0:0:141:142:1:90:51:0:0:90:52:0:0 chr5 87536663 . T C 554.89 PASS AF=0.479339;AO=58;DP=121;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00892238;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.596;QD=18.3435;RBI=0.0113645;REFB=-0.0123636;REVB=0.00703873;RO=63;SAF=34;SAR=24;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894925;STB=0.549636;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0131291;OID=.;OPOS=87536663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:63:63:58:58:0.479339:24:34:31:32:24:34:31:32 chr5 89769647 . G A 121.55 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0721657;FXX=0.0285633;HRUN=5;LEN=1;MLLD=64.1772;QD=14.2998;RBI=0.0722387;REFB=0.00673861;REVB=0.00324781;RO=19;SAF=2;SAR=12;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121279;STB=0.562403;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=-0.0124156;OID=.;OPOS=89769647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:19:20:14:14:0.411765:12:2:4:15:12:2:4:16 chr5 89769728 . T C 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00367818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8228;QD=39.2066;RBI=0.0674048;REFB=0;REVB=0.0673043;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00281247;OID=.;OPOS=89769728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr5 89943571 . G T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.849;QD=60.2302;RBI=0.0351327;REFB=0;REVB=-0.0160956;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.61977e-05;OID=.;OPOS=89943571;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:27:10:0:0:27:10:0:0 chr5 89977183 . A G 454.36 PASS AF=0.471154;AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00614827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.682;QD=17.4752;RBI=0.0372517;REFB=-0.0133631;REVB=-0.0367409;RO=55;SAF=26;SAR=23;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140781;STB=0.578197;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0108712;OID=.;OPOS=89977183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:55:55:49:49:0.471154:23:26:21:34:23:26:21:34 chr5 89979589 . G A 1839.6 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8121;QD=61.32;RBI=0.0176442;REFB=0;REVB=-0.0170213;RO=0;SAF=58;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.84183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.2873e-05;OID=.;OPOS=89979589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:62:58:0:0:62:58:0:0 chr5 89979698 . C T 1152.98 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0090963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5705;QD=60.6829;RBI=0.0433611;REFB=0;REVB=0.0423962;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267294;OID=.;OPOS=89979698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0 chr5 89985882 . A G 1589.86 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.481;QD=59.9949;RBI=0.0392241;REFB=0;REVB=0.00629601;RO=0;SAF=42;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67811e-05;OID=.;OPOS=89985882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:106:0:0:104:106:1:62:42:0:0:62:44:0:0 chr5 89988504 . A G 1921.49 PASS AF=1;AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017802;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.545;QD=61.9837;RBI=0.0332328;REFB=0;REVB=0.0280625;RO=0;SAF=99;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24641e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120227;OID=.;OPOS=89988504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:126:124:0:0:124:124:1:25:99:0:0:25:99:0:0 chr5 89989779 . G A 3797.67 PASS AF=1;AO=239;DP=240;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332106;FXX=0.00414921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9962;QD=63.2944;RBI=0.034171;REFB=-0.00488124;REVB=-0.0080445;RO=1;SAF=126;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419924;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46309e-05;OID=.;OPOS=89989779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:240:240:1:0:239:240:1:113:126:0:1:114:126:0:0 chr5 89990324 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1727;QD=58.5874;RBI=0.0676684;REFB=0;REVB=0.0386979;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114026;OID=.;OPOS=89990324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr5 90020923 . T G 1961.24 PASS AF=1;AO=123;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312318;FXX=0.0454511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.443;QD=62.2616;RBI=0.0459575;REFB=0;REVB=0.0337144;RO=0;SAF=66;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131271;OID=.;OPOS=90020923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:126:0:0:123:126:1:57:66:0:0:60:66:0:0 chr5 90024735 . G A 2173.1 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.276;QD=62.9883;RBI=0.0204007;REFB=0;REVB=0.0161752;RO=0;SAF=70;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89399e-06;OID=.;OPOS=90024735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:131:138:0:0:131:138:1:61:70:0:0:65:73:0:0 chr5 90052289 . G A 1318.49 PASS AF=0.977528;AO=86;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0663854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2351;QD=59.2581;RBI=0.0702672;REFB=-0.0905893;REVB=-0.0230318;RO=2;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263004;STB=0.51351;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00746304;OID=.;OPOS=90052289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:89:89:2:2:86:87:0.977528:35:51:0:2:36:51:0:2 chr5 90052372 . C T 1231.44 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0112922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.051;QD=60.0702;RBI=0.0130227;REFB=0.0352552;REVB=0.00648662;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000113708;OID=.;OPOS=90052372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:41:40:0:0:41:40:1:0 chr5 90107108 . A G 1564.27 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.808;QD=63.2028;RBI=0.0637604;REFB=0;REVB=0.0535673;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44908e-05;OID=.;OPOS=90107108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:99:0:0:90:99:1:49:41:0:0:57:42:0:0 chr5 90119324 . G A 1523.13 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00600627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.169;QD=58.5818;RBI=0.00713421;REFB=0.0247887;REVB=-0.00384988;RO=1;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771574;STB=0.504064;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-5.24999e-05;OID=.;OPOS=90119324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:61:42:0:1:61:42:0:1 chr5 90151589 . G A 1525.76 PASS AF=0.990385;AO=102;DP=105;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0598116;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.501;QD=58.6832;RBI=0.0635845;REFB=-0.0707827;REVB=-0.0215767;RO=0;SAF=51;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00118321;OID=.;OPOS=90151589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:104:0:1:102:103:0.990385:51:51:0:0:52:51:1:0 chr5 90449154 . G A 363.22 PASS AF=0.390909;AO=43;DP=110;FAO=43;FDP=110;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.021705;FXX=0.0090082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.18;QD=13.2079;RBI=0.021969;REFB=-0.00572425;REVB=-0.00339549;RO=67;SAF=18;SAR=25;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101724;STB=0.557496;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00929564;OID=.;OPOS=90449154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:67:67:43:43:0.390909:25:18:22:45:25:18:22:45 chr5 93731985 . A G 2219.97 PASS AF=0.992958;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.02703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.343;QD=62.5345;RBI=0.0281973;REFB=0.00110521;REVB=0.00802911;RO=1;SAF=68;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655814;STB=0.503448;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=1.53096e-05;OID=.;OPOS=93731985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:141:142:1:1:140:141:0.992958:72:68:0:1:72:69:0:1 chr5 93987532 . C A 805.12 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00190441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.702;QD=64.4093;RBI=0.0301099;REFB=0;REVB=-0.0300496;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011008;OID=.;OPOS=93987532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr5 94206202 . C T 686.72 PASS AF=0.503704;AO=68;DP=135;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.0269741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8221;QD=20.3472;RBI=0.0807824;REFB=-0.0260588;REVB=-0.0761458;RO=67;SAF=46;SAR=22;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201993;STB=0.611612;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0215951;OID=.;OPOS=94206202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:67:67:68:68:0.503704:22:46:31:36:22:46:31:36 chr5 94230426 . T C 491.37 PASS AF=0.505263;AO=46;DP=93;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0226249;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.988;QD=20.6892;RBI=0.0231801;REFB=-0.0171387;REVB=-0.00504303;RO=47;SAF=26;SAR=20;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183875;STB=0.618669;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0161709;OID=.;OPOS=94230426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:47:47:46:48:0.505263:20:26:17:30:20:28:16:31 chr5 94278129 . T C 44.76 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00733927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.666;QD=7.46039;RBI=0.0146717;REFB=-0.00422184;REVB=-0.0127041;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393932;STB=0.74645;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00980259;OID=.;OPOS=94278129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:11:6:5:2:11:6 chr5 94749723 . G A 327.89 PASS AF=0.353448;AO=41;DP=116;FAO=41;FDP=116;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.00549566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.648;QD=11.3064;RBI=0.00734027;REFB=-0.00923005;REVB=-0.00486592;RO=75;SAF=21;SAR=20;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512334;STB=0.529397;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0163311;OID=.;OPOS=94749723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:75:75:41:41:0.353448:20:21:35:40:20:21:35:40 chr5 94772540 . C T 916.36 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0902198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5734;QD=58.1815;RBI=0.101181;REFB=0;REVB=-0.0458043;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485238;OID=.;OPOS=94772540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:63:0:0:59:63:1:22:37:0:0:22:41:0:0 chr5 94826655 . C A 227.02 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00734992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.149;QD=13.5535;RBI=0.0304174;REFB=-0.00695121;REVB=-0.029516;RO=40;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212511;STB=0.620828;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00738349;OID=.;OPOS=94826655;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:12:15:14:26:12:15:14:26 chr5 94833109 . C T 132.79 PASS AF=0.279412;AO=18;DP=66;FAO=19;FDP=68;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0102596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.168;QD=7.8112;RBI=0.0184786;REFB=-0.00202512;REVB=0.0153688;RO=46;SAF=10;SAR=8;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921118;STB=0.549947;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00596857;OID=.;OPOS=94833109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:46:49:18:19:0.279412:8:10:22:24:8:11:25:24 chr5 94861118 . G C 591.03 PASS AF=0.484127;AO=61;DP=126;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.00412813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.946;QD=18.7627;RBI=0.00883518;REFB=-0.0100579;REVB=0.00781146;RO=65;SAF=24;SAR=37;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122745;STB=0.568003;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00727518;OID=.;OPOS=94861118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:65:65:61:61:0.484127:37:24:34:31:37:24:34:31 chr5 94939193 . A G 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00035458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.288;QD=14.2705;RBI=0.0119243;REFB=-0.000381437;REVB=-0.011919;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210912;STB=0.519924;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.000352519;OID=.;OPOS=94939193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:33:24:24:0.421053:13:11:14:18:13:11:14:19 chr5 94957676 . A T 146.42 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0987239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4059;QD=16.7333;RBI=0.0995534;REFB=-0.0100416;REVB=-0.0128247;RO=18;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109111;STB=0.576417;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00730505;OID=.;OPOS=94957676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:18:19:16:16:0.457143:7:9:8:10:7:9:8:11 chr5 94994339 . A G 249.72 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0163747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.032;QD=18.4976;RBI=0.0220466;REFB=-0.00627972;REVB=0.0147623;RO=27;SAF=18;SAR=9;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355953;STB=0.698652;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00577681;OID=.;OPOS=94994339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:9:18:7:20:9:18:7:20 chr5 95084131 . G A 1576.29 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013313;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.593;QD=60.049;RBI=0.0202016;REFB=0;REVB=-0.0151944;RO=0;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25068e-05;OID=.;OPOS=95084131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:48:57:0:0:48:57:0:0 chr5 95091194 . C T 1606.61 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00378001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.742;QD=60.0601;RBI=0.0198511;REFB=0;REVB=0.0194879;RO=0;SAF=60;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.88183e-06;OID=.;OPOS=95091194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:46:60:0:0:47:60:0:0 chr5 95091201 . A G 1648.54 PASS AF=0.957627;AO=113;DP=118;FAO=113;FDP=118;FR=.;FRO=5;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00168214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.83;QD=55.8828;RBI=0.00168463;REFB=0.0162195;REVB=-9.15735e-05;RO=5;SAF=65;SAR=48;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306919;STB=0.516185;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00335503;OID=.;OPOS=95091201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:118:118:5:5:113:113:0.957627:48:65:1:4:48:65:1:4 chr5 95194571 . T C 1525.72 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1533;QD=59.832;RBI=0.0594621;REFB=0;REVB=-0.0551945;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000440809;OID=.;OPOS=95194571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:46:56:0:0:46:56:0:0 chr5 95194593 . G T 1496.61 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300534;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.595;QD=63.6857;RBI=0.0301368;REFB=0;REVB=-0.00223985;RO=0;SAF=55;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472624;OID=.;OPOS=95194593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:39:55:0:0:39:55:0:0 chr5 95222277 . C T 140.14 PASS AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00855251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.246;QD=10.3807;RBI=0.0590885;REFB=-0.011857;REVB=-0.0584663;RO=36;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306158;STB=0.679094;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0134289;OID=.;OPOS=95222277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:36:36:18:18:0.333333:7:11:12:24:7:11:12:24 chr5 95234350 . A G 115.52 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0124134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.441;QD=8.8863;RBI=0.0315786;REFB=-0.00582152;REVB=-0.0290365;RO=36;SAF=14;SAR=1;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.711411;STB=0.932756;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.018407;OID=.;OPOS=95234350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:36:37:15:15:0.288462:1:14:12:24:1:14:12:25 chr5 95234377 . C T 150.93 PASS AF=0.291667;AO=21;DP=72;FAO=21;FDP=72;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0198839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6775;QD=8.38507;RBI=0.0488544;REFB=-0.017569;REVB=-0.044625;RO=46;SAF=16;SAR=5;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471298;STB=0.799733;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.041765;OID=.;OPOS=95234377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:46:51:21:21:0.291667:5:16:16:30:5:16:16:35 chr5 95234392 . A C 192.08 PASS AF=0.298851;AO=25;DP=83;FAO=26;FDP=87;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=0.0251742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.146;QD=8.83105;RBI=0.029309;REFB=-0.0106428;REVB=-0.0150091;RO=56;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232861;STB=0.643577;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0305018;OID=.;OPOS=95234392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:87:56:61:25:26:0.298851:12:13:18:38:13:13:18:43 chr5 95236415 . G A 193.77 PASS AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0279907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2988;QD=10.1985;RBI=0.0554375;REFB=-0.018758;REVB=-0.0478522;RO=51;SAF=12;SAR=13;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101442;STB=0.559239;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0316632;OID=.;OPOS=95236415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:51:51:25:25:0.328947:13:12:29:22:13:12:29:22 chr5 95236459 . C T 156.15 PASS AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00320687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.039;QD=9.46373;RBI=0.00508826;REFB=-0.00238637;REVB=0.00395049;RO=45;SAF=12;SAR=9;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445266;STB=0.526291;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.00480217;OID=.;OPOS=95236459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:9:12:24:21:9:12:24:21 chr5 95728898 . C G 472.93 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0317718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2594;QD=17.5158;RBI=0.0388886;REFB=-0.00873586;REVB=-0.0224247;RO=56;SAF=24;SAR=27;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144805;STB=0.575269;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0135975;OID=.;OPOS=95728898;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:57:51:51:0.472222:27:24:35:21:27:24:35:22 chr5 95728974 . G C 187.49 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0130806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.926;QD=14.705;RBI=0.0132542;REFB=-0.0180059;REVB=0.00213816;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274764;STB=0.657743;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0157317;OID=.;OPOS=95728974;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:7:14:12:18:7:14:12:18 chr5 95865526 . G A 72.03 PASS AF=0.145833;AO=14;DP=96;FAO=14;FDP=96;FR=.;FRO=82;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=53;FWDB=0.0436283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6903;QD=3.00125;RBI=0.105341;REFB=0.00852315;REVB=0.095882;RO=82;SAF=6;SAR=8;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981547;STB=0.566472;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.0371951;OID=.;OPOS=95865526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:96:96:82:82:14:14:0.145833:8:6:29:53:8:6:29:53 chr5 96079387 . C T 203.3 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0162789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7929;QD=14.2667;RBI=0.0166522;REFB=-0.0142853;REVB=-0.00350612;RO=33;SAF=5;SAR=19;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29859;STB=0.672408;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0127038;OID=.;OPOS=96079387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:19:5:15:18:19:5:15:18 chr5 96079402 . C T 169.16 PASS AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0220982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0343;QD=12.0825;RBI=0.0486161;REFB=-0.00531376;REVB=-0.0433035;RO=35;SAF=5;SAR=16;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268857;STB=0.657372;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0215806;OID=.;OPOS=96079402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:16:5:16:19:16:5:16:19 chr5 96093222 . G A 2417.06 PASS AF=0.987654;AO=156;DP=159;FAO=160;FDP=162;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000409586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8723;QD=59.6804;RBI=0.0479762;REFB=-0.131766;REVB=0.0479745;RO=2;SAF=86;SAR=70;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00124795;STB=0.500466;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00326314;OID=.;OPOS=96093222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:159:162:2:2:156:160:0.987654:70:86:1:1:74:86:1:1 chr5 96118852 . G C 1072.11 PASS AF=0.973333;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0124035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1607;QD=57.179;RBI=0.0275178;REFB=-0.0706433;REVB=0.0245638;RO=2;SAF=46;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034992;STB=0.518513;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0014235;OID=.;OPOS=96118852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:75:2:2:72:73:0.973333:26:46:0:2:26:47:0:2 chr5 96121524 . C T 1274.38 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.153;QD=61.4157;RBI=0.0321987;REFB=0;REVB=0.00581793;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110291;OID=.;OPOS=96121524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:40:42:0:0:40:43:0:0 chr5 96122260 . T A,G 1260.92 PASS AF=0.0361446,0.963855;AO=3,80;DP=83;FAO=3,80;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=3,33;FSAR=0,47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195517,0.029687;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.294,100.009;QD=60.7672;RBI=0.0207915,0.0313745;REFB=0,0;REVB=-0.00707233,0.0101508;RO=0;SAF=3,33;SAR=0,47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,6.71057e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.170522,-0.000348821;OID=.,.;OPOS=96122260,96122260;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:83:83:0:0:3,80:3,80:0.0361446,0.963855:0,47:3,33:0:0:0,47:3,33:0:0 chr5 96124330 . T C 2434.57 PASS AF=1;AO=147;DP=152;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140404;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2212;QD=61.2472;RBI=0.0426864;REFB=0;REVB=0.0403112;RO=0;SAF=76;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59344e-05;OID=.;OPOS=96124330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:152:159:0:0:147:159:1:71:76:0:0:81:78:0:0 chr5 96126308 . A G 1116.96 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.084;QD=60.3762;RBI=0.0833654;REFB=0;REVB=0.0745327;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000607648;OID=.;OPOS=96126308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0 chr5 96129512 . A G 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00507758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.556;QD=61.6953;RBI=0.0225014;REFB=0;REVB=0.0219211;RO=0;SAF=35;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38111e-05;OID=.;OPOS=96129512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:47:35:0:0:47:35:0:0 chr5 96130836 . T C 334.22 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0472601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.608;QD=16.7109;RBI=0.0478757;REFB=-0.00112869;REVB=0.00765284;RO=42;SAF=20;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099125;STB=0.543151;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00467983;OID=.;OPOS=96130836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:44:36:36:0.45:16:20:19:23:16:20:21:23 chr5 96139250 . C G 1480.38 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00464521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.333;QD=57.4903;RBI=0.0261124;REFB=0;REVB=0.0256959;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92595e-05;OID=.;OPOS=96139250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:103:0:0:92:103:1:41:51:0:0:48:55:0:0 chr5 96139464 . C T 576.48 PASS AF=0.472441;AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.00837509;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.325;QD=18.1567;RBI=0.0123107;REFB=-0.0180685;REVB=0.0090228;RO=62;SAF=33;SAR=27;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461652;STB=0.514666;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0189365;OID=.;OPOS=96139464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:62:67:60:60:0.472441:27:33:31:31:27:33:35:32 chr5 96231000 . G T 2696.34 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.431;QD=62.343;RBI=0.0118111;REFB=0;REVB=-0.00921296;RO=0;SAF=90;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.89898e-07;OID=.;OPOS=96231000;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:173:0:0:173:173:1:83:90:0:0:83:90:0:0 chr5 96232142 . T A 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.519;QD=63.0523;RBI=0.0601236;REFB=0;REVB=0.00759382;RO=0;SAF=16;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43661e-05;OID=.;OPOS=96232142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:75:16:0:0:75:16:0:0 chr5 96235896 . A G 772.68 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00855514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.479;QD=61.8144;RBI=0.0148658;REFB=-0.0270482;REVB=0.0121574;RO=1;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140498;STB=0.50746;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.000245533;OID=.;OPOS=96235896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:33:16:0:1:33:16:0:1 chr5 96237326 . G A 1491.56 PASS AF=0.980769;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0451367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4241;QD=57.3677;RBI=0.0541851;REFB=0.101891;REVB=0.0299784;RO=2;SAF=57;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206171;STB=0.510867;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.00173899;OID=.;OPOS=96237326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:104:104:2:2:102:102:0.980769:45:57:0:2:45:57:0:2 chr5 96245343 . C T 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.808;QD=61.2128;RBI=0.0314214;REFB=0;REVB=-0.0307268;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.41361e-05;OID=.;OPOS=96245343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0 chr5 96245439 . C T 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.351;QD=57.7124;RBI=0.0363029;REFB=0;REVB=0.0150036;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13374e-05;OID=.;OPOS=96245439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0 chr5 96249115 . C T 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.524;QD=62.3146;RBI=0.0192665;REFB=0;REVB=0.00562133;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13004e-05;OID=.;OPOS=96249115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0 chr5 96350710 . G A 615.66 PASS AF=0.516667;AO=62;DP=120;FAO=62;FDP=120;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.017014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.89;QD=20.5221;RBI=0.0278608;REFB=-0.0192893;REVB=-0.0220623;RO=58;SAF=22;SAR=40;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162926;STB=0.589842;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0197953;OID=.;OPOS=96350710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:58:58:62:62:0.516667:40:22:31:27:40:22:31:27 chr5 96498783 . G A 75.83 PASS AF=0.211538;AO=10;DP=51;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00403446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.63;QD=5.83282;RBI=0.0233271;REFB=-0.0104318;REVB=0.0229756;RO=41;SAF=5;SAR=5;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149507;STB=0.545372;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0242637;OID=.;OPOS=96498783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:51:52:41:41:10:11:0.211538:5:5:20:21:5:6:20:21 chr5 96503523 . C T 181.51 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00330485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.297;QD=24.2017;RBI=0.0253588;REFB=-0.0223432;REVB=-0.0251425;RO=12;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992905;STB=0.555494;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0127789;OID=.;OPOS=96503523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:8:10:5:7:8:10:5:7 chr5 96512865 . T A 299.18 PASS AF=0.386364;AO=32;DP=86;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00949066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.573;QD=13.5991;RBI=0.0169939;REFB=-0.0084227;REVB=0.0140968;RO=54;SAF=19;SAR=13;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123847;STB=0.565999;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0125608;OID=.;OPOS=96512865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:54:54:32:34:0.386364:13:19:26:28:14:20:26:28 chr5 96512871 . T A 314.16 PASS AF=0.391304;AO=35;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.00401736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.46;QD=13.6593;RBI=0.032631;REFB=0.00687307;REVB=0.0323827;RO=56;SAF=20;SAR=15;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966943;STB=0.562009;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0123076;OID=.;OPOS=96512871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:56:35:36:0.391304:15:20:27:29:15:21:27:29 chr5 96513471 . G C 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0405196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.069;QD=16.1557;RBI=0.0671664;REFB=-0.0190151;REVB=-0.0535676;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297355;STB=0.516783;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0211337;OID=.;OPOS=96513471;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:11:16:18:14:11:16:18:14 chr5 96518792 . T G 455.76 PASS AF=1;AO=27;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0766613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1432;QD=56.9697;RBI=0.139285;REFB=0;REVB=0.11629;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324839;OID=.;OPOS=96518792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:27:32:1:18:9:0:0:23:9:0:0 chr5 97014421 . T C 308.76 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.003284;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.2835;QD=16.0392;RBI=0.0231048;REFB=0.0354585;REVB=-0.0228702;RO=43;SAF=11;SAR=23;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195667;STB=0.610552;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.0438029;OID=.;OPOS=97014421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:23:11:22:21:23:11:22:21 chr5 98115828 . A G 250.09 PASS AF=0.357143;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0129158;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.693;QD=11.909;RBI=0.0151082;REFB=-0.00981927;REVB=-0.00783832;RO=54;SAF=12;SAR=18;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509059;STB=0.529392;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0201694;OID=.;OPOS=98115828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:54:54:30:30:0.357143:18:12:24:30:18:12:24:30 chr5 98131505 . A G 181.93 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0173772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.687;QD=16.9233;RBI=0.0209931;REFB=-0.00985559;REVB=0.0117789;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560016;STB=0.531986;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0168568;OID=.;OPOS=98131505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:10:14:10:9:10:14 chr5 100068875 . C T 797.74 PASS AF=0.520548;AO=76;DP=146;FAO=76;FDP=146;FR=.;FRO=70;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=-0.00283822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1725;QD=21.856;RBI=0.0161421;REFB=-0.0371283;REVB=-0.0158906;RO=70;SAF=35;SAR=41;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407976;STB=0.522382;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0361613;OID=.;OPOS=100068875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:70:70:76:76:0.520548:41:35:29:41:41:35:29:41 chr5 100145388 . A C 740.35 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5223;QD=56.9501;RBI=0.0471345;REFB=0;REVB=0.0431894;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566087;OID=.;OPOS=100145388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0 chr5 100145662 . A AACAC 142.72 PASS AF=0.384615;AO=13;DP=53;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=1;FWDB=-0.0367525;FXX=0.152141;HRUN=2;LEN=4;MLLD=162.228;QD=14.6375;RBI=0.0745541;REFB=-0.0402389;REVB=0.0648658;RO=32;SAF=6;SAR=7;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373829;STB=0.812794;STBP=0.025;TYPE=ins;VARB=0.0462686;OID=.;OPOS=100145663;OREF=-;OALT=ACAC;OMAPALT=AACAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.384615:13:53:15:39:24:6:9:23:1:99:32:6:7:25:7 chr5 100146436 . T A 39.52 PASS AF=0.105263;AO=8;DP=95;FAO=10;FDP=95;FR=.;FRO=85;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=23;FWDB=-0.00147929;FXX=0.0104156;HRUN=9;LEN=1;MLLD=206.289;QD=1.66409;RBI=0.0254851;REFB=-4.80668e-05;REVB=-0.0254421;RO=85;SAF=0;SAR=8;SRF=62;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.704312;STB=0.945945;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00196026;OID=.;OPOS=100146436;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:95:95:85:85:8:10:0.105263:8:0:62:23:9:1:62:23 chr5 100146447 . G T 1736.23 PASS AF=0.975;AO=115;DP=120;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0109671;FXX=0.0163921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.04;QD=57.8745;RBI=0.0112168;REFB=-0.202758;REVB=0.0023538;RO=3;SAF=45;SAR=70;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306041;STB=0.515461;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.000870704;OID=.;OPOS=100146447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:120:120:3:3:115:117:0.975:70:45:3:0:70:47:3:0 chr5 101638381 . G A 294.2 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0271198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.832;QD=17.5641;RBI=0.0283713;REFB=-9.28327e-06;REVB=0.00833334;RO=35;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377336;STB=0.521114;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-9.59179e-05;OID=.;OPOS=101638381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:17:15:15:20:17:15:15:20 chr5 101816104 . G A 192.52 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0535116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4857;QD=13.7512;RBI=0.0542437;REFB=-0.00651828;REVB=-0.00888169;RO=33;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224511;STB=0.627587;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0194433;OID=.;OPOS=101816104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:11:12:10:23:11:12:10:23 chr5 102345546 . A C 723.56 PASS AF=0.481013;AO=76;DP=158;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=0.000295159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.58;QD=18.318;RBI=0.0124381;REFB=-0.00228328;REVB=-0.0124346;RO=82;SAF=38;SAR=38;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011453;STB=0.506327;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.00250857;OID=.;OPOS=102345546;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:82:82:76:76:0.481013:38:38:40:42:38:38:40:42 chr5 102365186 . G A 217.78 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00224027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1016;QD=16.752;RBI=0.0415953;REFB=-0.0238986;REVB=-0.041535;RO=28;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339897;STB=0.519215;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0315435;OID=.;OPOS=102365186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:12:12:15:13:12:12:15:13 chr5 102365426 . C CAG 263.1 PASS AF=0.369048;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.000805519;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.411;QD=12.5284;RBI=0.000856932;REFB=-0.00925266;REVB=0.000292355;RO=55;SAF=15;SAR=16;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529364;STB=0.543534;STBP=0.538;TYPE=ins;VARB=0.0116731;OID=.;OPOS=102365427;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.369048:31:86:31:84:53:15:16:22:31:99:55:15:16:24:31 chr5 102433409 . G A 874.39 PASS AF=0.473404;AO=89;DP=188;FAO=89;FDP=188;FR=.;FRO=99;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.0149677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.368;QD=18.6041;RBI=0.0197712;REFB=-0.0134252;REVB=-0.0129178;RO=99;SAF=44;SAR=45;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390341;STB=0.521563;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0167945;OID=.;OPOS=102433409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:99:99:89:89:0.473404:45:44:53:46:45:44:53:46 chr5 102512570 . C A,CA 1603.52 PASS AF=0.00877193,0.991228;AO=8,100;DP=117;FAO=1,113;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=0,49;FSAR=1,64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252665,0.0178674;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=4.39185,23.371;QD=56.2638;RBI=0.120393,0.077649;REFB=0,0;REVB=-0.117712,-0.0755653;RO=7;SAF=2,42;SAR=6,58;SRF=7;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.551058,-0.0727659;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0335987,-0.000992123;OID=.,.;OPOS=102512570,102512571;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:6:117:114:7:0:8,100:1,113:0.00877193,0.991228:6,58:2,42:7:0:1,64:0,49:0:0 chr5 102520400 . A C 305.27 PASS AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0143468;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.698;QD=14.8914;RBI=0.0153362;REFB=-0.00397034;REVB=0.00541921;RO=48;SAF=21;SAR=13;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102784;STB=0.558311;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00988012;OID=.;OPOS=102520400;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:13:21:25:23:13:21:25:23 chr5 102538752 . T C 618.48 PASS AF=0.480916;AO=62;DP=128;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=20;FWDB=-0.0105506;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8897;QD=18.8849;RBI=0.0717669;REFB=-0.0113352;REVB=0.0709872;RO=64;SAF=35;SAR=27;SRF=46;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147808;STB=0.572705;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0110416;OID=.;OPOS=102538752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:64:68:62:63:0.480916:27:35:46:18:27:36:48:20 chr5 102614327 . C T 1009.97 PASS AF=0.39;AO=114;DP=300;FAO=117;FDP=300;FR=.;FRO=183;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=103;FSRR=80;FWDB=-0.0596963;FXX=0.0066223;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.453;QD=13.4663;RBI=0.0700884;REFB=-0.00521411;REVB=0.0367251;RO=184;SAF=57;SAR=57;SRF=104;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715751;STB=0.540908;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0114299;OID=.;OPOS=102614327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:300:184:183:114:117:0.39:57:57:104:80:59:58:103:80 chr5 102891695 . A G 599.13 PASS AF=0.4375;AO=63;DP=144;FAO=63;FDP=144;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=0.0247994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.232;QD=16.6423;RBI=0.0249485;REFB=-0.0115997;REVB=-0.00272327;RO=80;SAF=29;SAR=34;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997682;STB=0.558423;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0153256;OID=.;OPOS=102891695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:80:81:63:63:0.4375:34:29:29:51:34:29:29:52 chr5 105889178 . T C 662.09 PASS AF=0.532258;AO=65;DP=120;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00120389;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=273.977;QD=21.3578;RBI=0.00546886;REFB=-0.00847808;REVB=-0.0053347;RO=54;SAF=27;SAR=38;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101715;STB=0.567287;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00959441;OID=.;OPOS=105889178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:124:54:58:65:66:0.532258:38:27:29:25:39:27:32:26 chr5 108133967 . A G 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00195652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.401;QD=16.2363;RBI=0.00217584;REFB=0.000137883;REVB=-0.000951991;RO=36;SAF=9;SAR=21;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680698;STB=0.538435;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.000343436;OID=.;OPOS=108133967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:21:9:13:23:21:9:13:23 chr5 108672755 . T A 1667.09 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=114;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00430523;FXX=0.0175423;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.373;QD=59.539;RBI=0.00777433;REFB=0.0477519;REVB=-0.00647342;RO=1;SAF=40;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664054;STB=0.503496;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-4.29023e-05;OID=.;OPOS=108672755;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:112:1:1:111:111:0.991071:71:40:0:1:71:40:0:1 chr5 108672946 . C T 842.69 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.914;QD=57.1316;RBI=0.0263195;REFB=0;REVB=-0.0228202;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103053;OID=.;OPOS=108672946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:25:33:0:0:26:33:0:0 chr5 109035302 . T TAAAG,TAGAG 746.23 PASS AF=0.469388,0.530612;AO=22,26;DP=49;FAO=23,26;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=10,17;FSAR=13,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00788387,-0.00390732;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,4;MLLD=172.818,183.839;QD=60.9167;RBI=0.0336055,0.0295758;REFB=0,0;REVB=0.0326676,0.0293166;RO=0;SAF=10,17;SAR=12,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.0122485,-0.00893974;OID=.,.;OPOS=109035303,109035303;OREF=-,-;OALT=AAAG,AGAG;OMAPALT=TAAAG,TAGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.469388,0.530612:22,26:49:23,26:49:0:10,17:13,9:0:0:99:0:10,17:12,9:0:0 chr5 109035330 . G A 314.61 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00111783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.245;QD=20.2975;RBI=0.0372897;REFB=-0.0423573;REVB=0.0372729;RO=28;SAF=18;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00812778;STB=0.502957;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0497095;OID=.;OPOS=109035330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:15:18:15:13:15:18:16:13 chr5 109035496 . A G 98.54 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00395077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.674;QD=14.0775;RBI=0.00546169;REFB=0.00171204;REVB=0.00377114;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391968;STB=0.726918;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00279495;OID=.;OPOS=109035496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:4:8:4:12:4:8:4:12 chr5 109117171 . A G 2579.12 PASS AF=1;AO=165;DP=172;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116847;FXX=0.0174408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5794;QD=61.0443;RBI=0.074853;REFB=0;REVB=0.0739353;RO=0;SAF=123;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000763431;OID=.;OPOS=109117171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:172:169:0:0:165:169:1:42:123:0:0:46:123:0:0 chr5 109181682 . A T 1675.77 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.668;QD=60.3882;RBI=0.0508107;REFB=0;REVB=0.0328766;RO=0;SAF=44;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92295e-05;OID=.;OPOS=109181682;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:111:0:0:106:111:1:62:44:0:0:64:47:0:0 chr5 109190935 . TCTC T 1799.35 PASS AF=1;AO=116;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871335;FXX=0.0330551;HRUN=1;LEN=3;MLLD=188.616;QD=61.5161;RBI=0.0167086;REFB=0;REVB=-0.0142568;RO=0;SAF=60;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.33269e-06;OID=.;OPOS=109190936;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:116:117:117:117:0:60:57:0:0:10:0:60:56:0:0 chr5 110408597 . C T 956.74 PASS AF=0.47619;AO=100;DP=210;FAO=100;FDP=210;FR=.;FRO=110;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=51;FSRR=59;FWDB=0.00325548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=316.926;QD=18.2237;RBI=0.0112289;REFB=-0.00680791;REVB=0.0107466;RO=110;SAF=40;SAR=60;SRF=51;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620075;STB=0.53424;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.00778783;OID=.;OPOS=110408597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:110:110:100:100:0.47619:60:40:51:59:60:40:51:59 chr5 110439509 . A G 561.81 PASS AF=0.458015;AO=59;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.0022083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5333;QD=17.1546;RBI=0.00524139;REFB=-0.00312335;REVB=-0.00475349;RO=70;SAF=29;SAR=30;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475214;STB=0.525381;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0042322;OID=.;OPOS=110439509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:70:71:59:60:0.458015:30:29:31:39:31:29:31:40 chr5 110456704 . A T 242.13 PASS AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00215781;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.178;QD=11.9569;RBI=0.00344685;REFB=-0.00868182;REVB=-0.00268787;RO=52;SAF=15;SAR=14;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104528;STB=0.56023;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0145738;OID=.;OPOS=110456704;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:14:15:22:30:14:15:22:30 chr5 110784822 . A G 2366.96 PASS AF=1;AO=155;DP=157;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142007;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4002;QD=61.0828;RBI=0.022977;REFB=0;REVB=0.0180633;RO=0;SAF=77;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484866;OID=.;OPOS=110784822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:155:0:0:155:155:1:78:77:0:0:78:77:0:0 chr5 110819753 . G C 1189.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.665;QD=60.975;RBI=0.0282433;REFB=0;REVB=0.0255349;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68081e-05;OID=.;OPOS=110819753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:35:42:0:0:36:42:0:0 chr5 111500816 . C CTAAAA 840.98 PASS AF=0.573529;AO=76;DP=139;FAO=78;FDP=136;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=56;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0140711;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=5;MLLD=277.874;QD=24.7346;RBI=0.0148458;REFB=-0.0129524;REVB=-0.00473297;RO=60;SAF=21;SAR=55;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268148;STB=0.640485;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.00960739;OID=.;OPOS=111500817;OREF=-;OALT=TAAAA;OMAPALT=CTAAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.573529:76:139:78:136:58:22:56:34:24:99:60:21:55:35:25 chr5 111504479 . C T 2909.81 PASS AF=1;AO=184;DP=185;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0567759;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.683;QD=62.5766;RBI=0.05709;REFB=0;REVB=0.00598013;RO=0;SAF=93;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.96432e-05;OID=.;OPOS=111504479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:185:186:0:0:184:186:1:91:93:0:0:93:93:0:0 chr5 111506069 . G A 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.078;QD=60.7161;RBI=0.050434;REFB=0;REVB=0.00219893;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.91589e-05;OID=.;OPOS=111506069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:46:30:0:0:46:30:0:0 chr5 111519740 . T C 2306.19 PASS AF=0.980892;AO=153;DP=157;FAO=154;FDP=157;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0191591;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.405;QD=58.7564;RBI=0.0396426;REFB=-0.0431905;REVB=0.0347054;RO=3;SAF=86;SAR=67;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00848721;STB=0.504496;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.000911991;OID=.;OPOS=111519740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:157:157:3:3:153:154:0.980892:67:86:1:2:67:87:1:2 chr5 111530284 . A G 712.12 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619769;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7799;QD=63.2996;RBI=0.0369774;REFB=0;REVB=0.0364543;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399071;OID=.;OPOS=111530284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0 chr5 111545670 . C G 1171.35 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.676;QD=60.8495;RBI=0.00926509;REFB=0;REVB=0.00251358;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50426e-05;OID=.;OPOS=111545670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:41:35:0:0:41:36:0:0 chr5 112164561 . G A 603.04 PASS AF=0.578947;AO=52;DP=92;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00249534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9569;QD=25.3912;RBI=0.0342556;REFB=-0.0309451;REVB=0.0341645;RO=39;SAF=33;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159549;STB=0.572409;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0116877;OID=.;OPOS=112164561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:39:40:52:55:0.578947:19:33:17:22:21:34:18:22 chr5 112175770 . G A 341.01 PASS AF=0.576271;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00475925;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.254;QD=23.1192;RBI=0.0112911;REFB=-0.0134686;REVB=-0.0102391;RO=25;SAF=19;SAR=15;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032247;STB=0.517756;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0167263;OID=.;OPOS=112175770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:25:25:34:34:0.576271:15:19:15:10:15:19:15:10 chr5 112176325 . G A 171.98 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0245149;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.428;QD=15.9979;RBI=0.0566424;REFB=-0.050197;REVB=-0.0510625;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167086;STB=0.547567;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0435128;OID=.;OPOS=112176325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:24:18:18:0.418605:9:9:13:6:9:9:14:10 chr5 112176559 . T G 229.41 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0234629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.543;QD=14.1179;RBI=0.0234836;REFB=-0.0143048;REVB=0.000985764;RO=38;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14943;STB=0.58508;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0246772;OID=.;OPOS=112176559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:16:11:21:17:16:11:21:17 chr5 112176756 . T A 307.28 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0223636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7795;QD=18.0755;RBI=0.0223741;REFB=-0.00942144;REVB=-0.000686358;RO=34;SAF=9;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254389;STB=0.651066;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0110623;OID=.;OPOS=112176756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:34:35:33:33:0.485294:24:9:18:16:24:9:19:16 chr5 112177171 . G A 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0172039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.319;QD=6.57358;RBI=0.0264375;REFB=-0.00269299;REVB=0.020074;RO=16;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141582;STB=0.590616;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00987012;OID=.;OPOS=112177171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:3:3:6:10:3:3:6:10 chr5 112179909 . C A 142.58 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.000966626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.003;QD=14.2577;RBI=0.00718261;REFB=0.00243808;REVB=-0.00711727;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258604;STB=0.658351;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.011417;OID=.;OPOS=112179909;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:7:9:7:16:7:9:7:17 chr5 112180257 . C T 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0784116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4991;QD=16.8229;RBI=0.0949244;REFB=0.00543347;REVB=-0.0535001;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518377;STB=0.809829;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0140479;OID=.;OPOS=112180257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:6:1:4:1:6:1:4:1 chr5 112197082 . C T 342.88 PASS AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.0127245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.543;QD=16.1355;RBI=0.0144875;REFB=-0.0509282;REVB=-0.00692637;RO=48;SAF=17;SAR=20;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164949;STB=0.592637;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.044623;OID=.;OPOS=112197082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:0.435294:20:17:30:18:20:17:30:18 chr5 112227799 . A G 165.73 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0225161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.23;QD=14.4114;RBI=0.0225217;REFB=-0.0107053;REVB=0.000501943;RO=28;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169044;STB=0.509793;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0156056;OID=.;OPOS=112227799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:10:8:12:16:10:8:12:16 chr5 112227939 . T C 473.82 PASS AF=0.407692;AO=52;DP=131;FAO=53;FDP=130;FR=.;FRO=77;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.00320776;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.843;QD=14.579;RBI=0.0346366;REFB=-0.0176144;REVB=0.0344878;RO=79;SAF=16;SAR=36;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249079;STB=0.63631;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0434415;OID=.;OPOS=112227939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:79:77:52:53:0.407692:36:16:42:37:37:16:40:37 chr5 112228667 . GCCG ACCG,GCCA 1064.28 PASS AF=0.5875,0.4125;AO=34,16;DP=81;FAO=47,33;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=20,18;FSAR=27,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326391,0.0602613;FXX=0.0123442;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=96.996,55.1887;QD=53.2141;RBI=0.0492979,0.0603073;REFB=0,0;REVB=0.0369455,-0.00235469;RO=0;SAF=8,1;SAR=26,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0601465,0.0514825;OID=.,.;OPOS=112228667,112228670;OREF=G,G;OALT=A,A;OMAPALT=ACCG,GCCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:81:80:0:0:34,16:47,33:0.5875,0.4125:26,15:8,1:0:0:27,15:20,18:0:0 chr5 112228765 . C A 1042.99 PASS AF=0.935897;AO=73;DP=78;FAO=73;FDP=78;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0239423;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0468;QD=53.4867;RBI=0.0435272;REFB=-0.151932;REVB=0.0363509;RO=5;SAF=39;SAR=34;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016299;STB=0.508633;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00750064;OID=.;OPOS=112228765;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:78:78:5:5:73:73:0.935897:34:39:2:3:34:39:2:3 chr5 112257908 . T C 772.17 PASS AF=0.540741;AO=73;DP=136;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.00920374;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.349;QD=22.879;RBI=0.0133553;REFB=-0.0215657;REVB=0.00967753;RO=59;SAF=28;SAR=45;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146133;STB=0.584392;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0187426;OID=.;OPOS=112257908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:59:62:73:73:0.540741:45:28:33:26:45:28:35:27 chr5 112312528 . T C 102.28 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0467548;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2693;QD=15.1528;RBI=0.0566149;REFB=-0.0507426;REVB=-0.0319253;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228527;STB=0.615187;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0723213;OID=.;OPOS=112312528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:16:15:12:12:0.444444:4:8:7:9:4:8:7:8 chr5 112312676 . T C 1157.45 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.021577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.126;QD=59.3563;RBI=0.0243533;REFB=-0.020686;REVB=0.0112923;RO=1;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01088;STB=0.505746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=8.29438e-05;OID=.;OPOS=112312676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:43:34:0:1:43:34:0:1 chr5 112328377 . A G 335.08 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0225058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.947;QD=16.9661;RBI=0.0413511;REFB=-0.015553;REVB=0.0346901;RO=43;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208786;STB=0.617046;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0202749;OID=.;OPOS=112328377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:14:22:17:26:14:22:17:26 chr5 112349070 . T C 99.24 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=-0.00975114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.32;QD=14.7015;RBI=0.0256049;REFB=-0.00431674;REVB=-0.0236755;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475613;STB=0.768436;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0115033;OID=.;OPOS=112349070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:7:5:14:1:7:5:14:1 chr5 112349297 . T C 349.88 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00612859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2759;QD=20.5813;RBI=0.0487593;REFB=0.00289984;REVB=-0.0483726;RO=29;SAF=15;SAR=21;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312433;STB=0.510045;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.00422021;OID=.;OPOS=112349297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:32:36:36:0.529412:21:15:11:18:21:15:14:18 chr5 112357922 . T C 322.4 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=3.85164e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.211;QD=16.5331;RBI=0.0111094;REFB=-0.00596362;REVB=-0.0111093;RO=43;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660569;STB=0.537084;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00778751;OID=.;OPOS=112357922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:18:17:18:25:18:17:18:25 chr5 112363022 . G T 764.19 PASS AF=0.419512;AO=84;DP=204;FAO=86;FDP=205;FR=.;FRO=119;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=61;FSRR=58;FWDB=0.00337293;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.122;QD=14.9109;RBI=0.011196;REFB=-0.010104;REVB=0.0106759;RO=120;SAF=45;SAR=39;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288348;STB=0.512969;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0127591;OID=.;OPOS=112363022;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:120:119:84:86:0.419512:39:45:61:59:40:46:61:58 chr5 112384802 . G A 1324.28 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104866;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5417;QD=62.3189;RBI=0.111147;REFB=0;REVB=0.0368329;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111706;OID=.;OPOS=112384802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0 chr5 112399791 . G A 499.87 PASS AF=0.44186;AO=50;DP=123;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.00877649;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.138;QD=15.4998;RBI=0.0301694;REFB=-0.0444649;REVB=-0.0288646;RO=67;SAF=36;SAR=14;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264904;STB=0.598469;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0573802;OID=.;OPOS=112399791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:129:67:72:50:57:0.44186:14:36:32:35:21:36:33:39 chr5 112406862 . G A 481.28 PASS AF=0.547619;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.00514432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.414;QD=22.9182;RBI=0.0139307;REFB=-0.0215614;REVB=0.012946;RO=37;SAF=25;SAR=21;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176368;STB=0.59031;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0221816;OID=.;OPOS=112406862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:37:38:46:46:0.547619:21:25:12:25:21:25:13:25 chr5 112439941 . T C 1162.53 PASS AF=1;AO=75;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4143;QD=59.6171;RBI=0.0882625;REFB=-0.0380821;REVB=0.0802312;RO=1;SAF=32;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145558;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00300969;OID=.;OPOS=112439941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:77:78:1:0:75:78:1:43:32:1:0:44:34:0:0 chr5 112479004 . T C 1135.25 PASS AF=1;AO=73;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.095;QD=60.5469;RBI=0.0230679;REFB=0;REVB=0.0101848;RO=0;SAF=53;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109931;OID=.;OPOS=112479004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:73:75:1:20:53:0:0:20:55:0:0 chr5 112823998 . C T 2352.25 PASS AF=0.993333;AO=143;DP=144;FAO=149;FDP=150;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.049117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.439;QD=62.7267;RBI=0.052827;REFB=-0.133506;REVB=0.0194476;RO=1;SAF=44;SAR=99;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00477953;STB=0.502487;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.000236135;OID=.;OPOS=112823998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:144:150:1:1:143:149:0.993333:99:44:0:1:100:49:0:1 chr5 112824039 . T C 728.31 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0954925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.947;QD=57.1223;RBI=0.0987291;REFB=0;REVB=0.0250722;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793898;OID=.;OPOS=112824039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:39:12:0:0:39:12:0:0 chr5 113589389 . T A 1489.03 PASS AF=0.979381;AO=95;DP=99;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00163153;FXX=0.0202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.117;QD=61.4035;RBI=0.00361066;REFB=-0.0846942;REVB=0.00322103;RO=2;SAF=48;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193458;STB=0.510202;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00020161;OID=.;OPOS=113589389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:99:97:2:2:95:95:0.979381:47:48:2:0:47:48:2:0 chr5 113698544 . G C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.514;QD=55.6561;RBI=0.0438289;REFB=0;REVB=0.0166748;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167911;OID=.;OPOS=113698544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0 chr5 113698631 . T TGCC 325.82 PASS AF=0.83871;AO=20;DP=36;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0178606;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=3;MLLD=170.248;QD=42.0409;RBI=0.0334379;REFB=-0.0299771;REVB=0.0282682;RO=14;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219561;STB=0.60861;STBP=0.012;TYPE=ins;VARB=0.00526519;OID=.;OPOS=113698632;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=TGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.83871:20:36:26:31:5:9:17:5:0:26:14:7:13:9:5 chr5 113829121 . A G 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00871173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.565;QD=59.143;RBI=0.0268977;REFB=0;REVB=0.0254478;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03853e-05;OID=.;OPOS=113829121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0 chr5 114460539 . T C 294.03 PASS AF=0.365591;AO=34;DP=93;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.00994839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.066;QD=12.6465;RBI=0.0237051;REFB=-0.00565345;REVB=0.0215165;RO=59;SAF=23;SAR=11;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806876;STB=0.546443;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00939582;OID=.;OPOS=114460539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:59:59:34:34:0.365591:11:23:36:23:11:23:36:23 chr5 114460580 . C G 672.82 PASS AF=0.61165;AO=62;DP=102;FAO=63;FDP=103;FR=.;FRO=40;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0237886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8632;QD=26.129;RBI=0.0250319;REFB=-0.0110435;REVB=0.00779096;RO=40;SAF=35;SAR=27;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261203;STB=0.51136;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00733396;OID=.;OPOS=114460580;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:40:40:62:63:0.61165:27:35:24:16:27:36:24:16 chr5 114462355 . C T 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.109;QD=57.2377;RBI=0.018837;REFB=0;REVB=0.0180901;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01583e-05;OID=.;OPOS=114462355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0 chr5 114469724 . T C 390.01 PASS AF=0.431579;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.028368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1413;QD=16.4215;RBI=0.0307928;REFB=-0.00285226;REVB=0.0119771;RO=53;SAF=22;SAR=19;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297921;STB=0.510853;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00289915;OID=.;OPOS=114469724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:53:54:41:41:0.431579:19:22:30:23:19:22:30:24 chr5 114480364 . C T 798.91 PASS AF=0.493976;AO=82;DP=166;FAO=82;FDP=166;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=0.00585859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.292;QD=19.2508;RBI=0.0107808;REFB=0.00571715;REVB=-0.00905004;RO=84;SAF=40;SAR=42;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120373;STB=0.566221;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00731802;OID=.;OPOS=114480364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:84:84:82:82:0.493976:42:40:52:32:42:40:52:32 chr5 114858437 . G T 293.34 PASS AF=0.54;AO=23;DP=46;FAO=27;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.002854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.606;QD=23.4671;RBI=0.0520078;REFB=-0.0133186;REVB=0.0519294;RO=13;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113537;STB=0.555514;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0121041;OID=.;OPOS=114858437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:50:13:23:23:27:0.54:9:14:10:3:12:15:10:13 chr5 114860161 . G A 600.21 PASS AF=0.508333;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.0173092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7212;QD=20.0068;RBI=0.0260318;REFB=-0.0023081;REVB=-0.0194434;RO=59;SAF=36;SAR=25;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250344;STB=0.637637;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00138856;OID=.;OPOS=114860161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:59:61:61:0.508333:25:36:18:41:25:36:18:41 chr5 115249271 . G A 202.22 PASS AF=0.209877;AO=34;DP=162;FAO=34;FDP=162;FR=.;FRO=128;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=59;FSRR=69;FWDB=-0.00496381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.591;QD=4.99307;RBI=0.0120706;REFB=-0.00278106;REVB=0.0110027;RO=127;SAF=13;SAR=21;SRF=59;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107037;STB=0.56372;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0122362;OID=.;OPOS=115249271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:127:128:34:34:0.209877:21:13:59:68:21:13:59:69 chr5 115298232 . G C 991.65 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0841751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.67;QD=59.2028;RBI=0.0844765;REFB=0;REVB=0.00712917;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22576e-05;OID=.;OPOS=115298232;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:34:31:0:0:34:33:0:0 chr5 115298244 . A C 298.43 PASS AF=0.492537;AO=28;DP=62;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0210536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.402;QD=17.8164;RBI=0.0236306;REFB=-0.0277771;REVB=-0.0107308;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12803;STB=0.596717;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0292171;OID=.;OPOS=115298244;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:67:33:34:28:33:0.492537:15:13:11:22:15:18:12:22 chr5 115298378 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=21;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.005;QD=56.1915;RBI=0.0880255;REFB=0;REVB=0.029858;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036163;OID=.;OPOS=115298378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:21:28:1:10:11:0:0:16:12:0:0 chr5 115298475 . T C 223.05 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.109;QD=49.5673;RBI=0.0142359;REFB=0;REVB=-4.48977e-05;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141087;OID=.;OPOS=115298475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr5 115298518 . A G 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1377;QD=54.5147;RBI=0.0179467;REFB=0;REVB=0.01561;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306211;OID=.;OPOS=115298518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr5 115298977 . C T 1116.7 PASS AF=0.418367;AO=118;DP=292;FAO=123;FDP=294;FR=.;FRO=171;FSAF=73;FSAR=50;FSRF=87;FSRR=84;FWDB=0.0753346;FXX=0.00338972;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.114;QD=15.1931;RBI=0.0916225;REFB=-0.00906914;REVB=0.0521477;RO=172;SAF=68;SAR=50;SRF=88;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693052;STB=0.550099;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0144905;OID=.;OPOS=115298977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:294:172:171:118:123:0.418367:50:68:88:84:50:73:87:84 chr5 115336862 . T C 328.67 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0164747;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.2;QD=17.7657;RBI=0.0188031;REFB=-0.013171;REVB=-0.00906303;RO=38;SAF=20;SAR=15;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115747;STB=0.558106;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0257558;OID=.;OPOS=115336862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:39:35:35:0.472973:15:20:17:21:15:20:18:21 chr5 115341611 . G T 3191.61 PASS AF=1;AO=199;DP=199;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00236217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.449;QD=64.1531;RBI=0.00801428;REFB=0;REVB=0.00765826;RO=0;SAF=96;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12514e-06;OID=.;OPOS=115341611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:199:199:0:0:199:199:1:103:96:0:0:103:96:0:0 chr5 115341638 . G C 2756.3 PASS AF=1;AO=175;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465009;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0005;QD=62.6433;RBI=0.0050295;REFB=0;REVB=-0.00191638;RO=0;SAF=91;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75048e-06;OID=.;OPOS=115341638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:176:0:0:175:176:1:84:91:0:0:85:91:0:0 chr5 115362148 . A G 1779.23 PASS AF=0.97541;AO=119;DP=122;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.046032;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=77.2225;QD=58.3353;RBI=0.0461457;REFB=-0.159373;REVB=-0.00323697;RO=0;SAF=52;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0287e-08;STB=0.514016;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00216029;OID=.;OPOS=115362148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:122:122:0:3:119:119:0.97541:67:52:0:0:67:52:3:0 chr5 115394626 . G A 503.89 PASS AF=0.469565;AO=53;DP=116;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0231458;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.595;QD=17.5266;RBI=0.0251731;REFB=-0.0147633;REVB=0.00989741;RO=59;SAF=19;SAR=34;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115052;STB=0.557915;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0193027;OID=.;OPOS=115394626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:59:61:53:54:0.469565:34:19:28:31:34:20:29:32 chr5 115428334 . G T 424.02 PASS AF=0.364964;AO=50;DP=137;FAO=50;FDP=137;FR=.;FRO=87;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.00868577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.029;QD=12.3801;RBI=0.0111494;REFB=0.00296816;REVB=0.00699043;RO=87;SAF=35;SAR=15;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253351;STB=0.645101;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00853973;OID=.;OPOS=115428334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:87:87:50:50:0.364964:15:35:42:45:15:35:42:45 chr5 115428381 . T G 633.76 PASS AF=0.558559;AO=62;DP=111;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00224054;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.876;QD=22.8383;RBI=0.00719231;REFB=-0.0117431;REVB=0.00683442;RO=49;SAF=28;SAR=34;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11285;STB=0.561719;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00452632;OID=.;OPOS=115428381;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:49:49:62:62:0.558559:34:28:29:20:34:28:29:20 chr5 115469773 . C T 453.51 PASS AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0182414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.891;QD=19.7177;RBI=0.0231974;REFB=-0.00345945;REVB=-0.0143308;RO=47;SAF=34;SAR=11;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198422;STB=0.610962;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0050978;OID=.;OPOS=115469773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:11:34:27:20:11:34:27:20 chr5 115628215 . G A 97.13 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.012423;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.44;QD=11.7728;RBI=0.0128859;REFB=0.00676316;REVB=-0.00342285;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0130809;OID=.;OPOS=115628215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:33:33:21:21:12:12:0.363636:8:4:7:14:8:4:7:14 chr5 115811220 . T C 407.95 PASS AF=0.619048;AO=39;DP=62;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00325036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.727;QD=25.9019;RBI=0.0376772;REFB=-0.0227043;REVB=-0.0375367;RO=23;SAF=19;SAR=20;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529446;STB=0.536567;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0114438;OID=.;OPOS=115811220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:23:24:39:39:0.619048:20:19:13:10:20:19:14:10 chr5 115813726 . A G 1591.03 PASS AF=1;AO=105;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064121;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5769;QD=60.0389;RBI=0.0644792;REFB=0;REVB=0.00678786;RO=0;SAF=59;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184964;OID=.;OPOS=115813726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:106:0:0:105:106:1:46:59:0:0:47:59:0:0 chr5 118484804 . G A 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.572;QD=58.6005;RBI=0.0289935;REFB=0;REVB=-0.00450376;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57665e-05;OID=.;OPOS=118484804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr5 118503399 . TAAAAAAG TAAAAA,TAAAAAG 140.98 PASS AF=0,0.681159;AO=14,22;DP=70;FAO=0,47;FDP=69;FR=.;FRO=22;FSAF=0,18;FSAR=0,29;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0643877,-0.0717272;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=72.6302,6.87894;QD=8.17261;RBI=0.0698329,0.0931095;REFB=-0.0236645,-0.102912;REVB=-0.0270345,-0.0593682;RO=21;SAF=5,11;SAR=9,11;SRF=5;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0.302326,0.302326;SSSB=0.14059,0.229077;STB=0.5,0.553824;STBP=1,0.241;TYPE=del,del;VARB=0,0.118591;OID=.,.;OPOS=118503405,118503400;OREF=AG,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAA,TAAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.681159:14,22:70:0,47:69:22:0,18:0,29:5:17:34:21:5,11:9,11:5:16 chr5 118811533 . G A 1050.42 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.659;QD=59.1783;RBI=0.00300791;REFB=0;REVB=0.000637885;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324737;OID=.;OPOS=118811533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:30:40:0:0:30:41:0:0 chr5 118845139 . G A 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4865;QD=47.8187;RBI=0.133306;REFB=0;REVB=0.116696;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0074367;OID=.;OPOS=118845139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr5 118861713 . A G 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.755;QD=56.937;RBI=0.0333309;REFB=0;REVB=-0.0271631;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.78813e-05;OID=.;OPOS=118861713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr5 118970342 . AGG AGA,AG 1842.02 PASS AF=0.0454545,0.954545;AO=15,75;DP=197;FAO=9,189;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=0,90;FSAR=9,99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0885952,0.762116;FXX=0.0099995;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=194.806,12.1805;QD=37.2125;RBI=0.0909866,0.784239;REFB=0.0376007,0.0343151;REVB=-0.0207231,0.184959;RO=94;SAF=0,15;SAR=15,60;SRF=69;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0.358629;SSSB=-0.77991,-0.53532;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.139628,0.00289972;OID=.,.;OPOS=118970344,118970343;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AGA,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0454545,0.954545:15,75:197:9,189:198:0:0,90:9,99:0:0:13:94:0,15:15,60:69:25 chr5 120021819 . G A,C 704.63 PASS AF=0.961538,0.0384615;AO=47,3;DP=52;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30,2;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230555,0.0130839;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=154.691,20.7232;QD=54.2021;RBI=0.0263254,0.0648937;REFB=0,0;REVB=0.0127071,-0.063561;RO=0;SAF=27,3;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000593362,0.0940642;OID=.,.;OPOS=120021819,120021819;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:52:52:0:0:47,3:50,2:0.961538,0.0384615:20,0:27,3:0:0:20,0:30,2:0:0 chr5 121488635 . ATTTG ATTG,ATTGA 189.54 PASS AF=0.5,0.0263158;AO=19,2;DP=38;FAO=19,1;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8,0;FSAR=11,1;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.107127,-0.00379776;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=24.9689,27.4774;QD=19.9516;RBI=0.113608,0.0471499;REFB=-0.034563,-0.0143277;REVB=0.0378248,0.0469967;RO=17;SAF=9,0;SAR=10,2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0466785,-0.540081;STB=0.565645,0.990673;STBP=0.418,0.274;TYPE=del,mnp;VARB=0.0218067,0.0645578;OID=.,.;OPOS=121488636,121488638;OREF=T,TG;OALT=-,GA;OMAPALT=ATTG,ATTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5,0.0263158:19,2:38:19,1:38:18:8,0:11,1:10:8:99:17:9,0:10,2:9:8 chr5 121518309 . G A 993.97 PASS AF=0.424;AO=106;DP=250;FAO=106;FDP=250;FR=.;FRO=144;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=69;FSRR=75;FWDB=0.0018005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.851;QD=15.9035;RBI=0.0401319;REFB=-0.0157742;REVB=-0.0400915;RO=143;SAF=62;SAR=44;SRF=69;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106395;STB=0.561395;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0188024;OID=.;OPOS=121518309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:143:144:106:106:0.424:44:62:69:74:44:62:69:75 chr5 122165470 . TACACACACACACAC TACACAC,T 74.89 PASS AF=0.0909091,0.318182;AO=2,7;DP=11;FAO=2,7;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=1,5;FSAR=1,2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00402382,0.0133337;FXX=0.266578;HRUN=1,1;LEN=8,14;MLLD=148.425,334.351;QD=13.6164;RBI=0.00940678,0.0150746;REFB=-0.0123253,-0.00688594;REVB=0.00850272,0.00703241;RO=0;SAF=1,5;SAR=1,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.27427e-08;STB=0.599045,0.57355;STBP=0.772,0.673;TYPE=del,del;VARB=0.0548394,0.0400566;OID=.,.;OPOS=122165471,122165471;OREF=ACACACAC,ACACACACACACAC;OALT=-,-;OMAPALT=TACACAC,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0909091,0.318182:2,7:11:2,7:22:13:1,5:1,2:8:5:57:0:1,5:1,2:0:0 chr5 122435627 . G A 827.87 PASS AF=0.469945;AO=84;DP=184;FAO=86;FDP=183;FR=.;FRO=97;FSAF=27;FSAR=59;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=-0.00135628;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8379;QD=18.0955;RBI=0.00345448;REFB=-0.0242216;REVB=0.0031771;RO=97;SAF=25;SAR=59;SRF=54;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263335;STB=0.634376;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0246162;OID=.;OPOS=122435627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:97:97:84:86:0.469945:59:25:54:43:59:27:54:43 chr5 122758268 . G C 1230.08 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.172;QD=61.504;RBI=0.066915;REFB=0;REVB=0.0186427;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010833;OID=.;OPOS=122758268;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:76:80:0:0:76:80:1:38:38:0:0:38:42:0:0 chr5 122950330 . G C 749.18 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6858;QD=56.5417;RBI=0.0251987;REFB=0;REVB=-0.0143122;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000312423;OID=.;OPOS=122950330;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:28:25:0:0 chr5 122950911 . G A 619.94 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00849602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.285;QD=59.0421;RBI=0.01458;REFB=-0.0681425;REVB=0.0118488;RO=1;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284198;STB=0.515144;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000619134;OID=.;OPOS=122950911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:16:25:0:1:16:25:0:1 chr5 122990902 . A T 214.36 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.000841404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.142;QD=14.7833;RBI=0.00185846;REFB=-0.015331;REVB=-0.00165708;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117542;STB=0.566615;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0200099;OID=.;OPOS=122990902;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:13:12:12:21:13:12:12:21 chr5 123984763 . C T 520.84 PASS AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0879669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.321;QD=56.3065;RBI=0.0910304;REFB=-0.0969004;REVB=0.0234172;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252795;STB=0.512813;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00181482;OID=.;OPOS=123984763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:17:18:1:0:17:19:1:0 chr5 125696140 . G A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.765;QD=57.1775;RBI=0.023437;REFB=0;REVB=-0.00643534;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72252e-05;OID=.;OPOS=125696140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0 chr5 125828803 . A G 750.05 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0129565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.481;QD=61.2289;RBI=0.019498;REFB=-0.0979509;REVB=0.0145705;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000307438;OID=.;OPOS=125828803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:48:49:0:1:48:48:0.979592:25:23:0:0:25:23:0:1 chr5 125887715 . T G 255.48 PASS AF=0.336957;AO=31;DP=92;FAO=31;FDP=92;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0245154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5158;QD=11.108;RBI=0.0247828;REFB=0.005331;REVB=-0.00363063;RO=59;SAF=6;SAR=25;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368891;STB=0.718825;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.0148394;OID=.;OPOS=125887715;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:59:61:31:31:0.336957:25:6:28:31:25:6:29:32 chr5 126171999 . T C 207.17 PASS AF=0.293478;AO=27;DP=91;FAO=27;FDP=92;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=46;FWDB=0.029863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4877;QD=9.00733;RBI=0.0369389;REFB=0.00710384;REVB=-0.0217412;RO=64;SAF=6;SAR=21;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117232;STB=0.566291;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=-0.0197371;OID=.;OPOS=126171999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:64:65:27:27:0.293478:21:6:19:45:21:6:19:46 chr5 126674869 . G A 735.2 PASS AF=0.496552;AO=72;DP=145;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=41;FWDB=-0.00586331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1438;QD=20.2812;RBI=0.00588426;REFB=-0.0215788;REVB=0.000495987;RO=73;SAF=32;SAR=40;SRF=32;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563217;STB=0.503105;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0203994;OID=.;OPOS=126674869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:73:73:72:72:0.496552:40:32:32:41:40:32:32:41 chr5 126746277 . C T 901.07 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8996;QD=58.1333;RBI=0.0382265;REFB=0;REVB=-0.0222737;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83498e-05;OID=.;OPOS=126746277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0 chr5 126792974 . T A 351.41 PASS AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0335;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9826;QD=15.1142;RBI=0.039981;REFB=-0.00732463;REVB=-0.0218227;RO=55;SAF=16;SAR=22;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737771;STB=0.541788;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00860581;OID=.;OPOS=126792974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:22:16:27:28:22:16:27:28 chr5 126887569 . G A 234.31 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.000441906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.461;QD=14.4192;RBI=0.0263666;REFB=-0.0184134;REVB=-0.0263629;RO=36;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508553;STB=0.53417;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0260301;OID=.;OPOS=126887569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:36:37:28:28:0.430769:19:9:10:26:19:9:10:27 chr5 126890472 . C T 145.24 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0656553;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0772;QD=11.8561;RBI=0.0726199;REFB=-0.00954083;REVB=-0.0310327;RO=32;SAF=9;SAR=8;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101664;STB=0.559739;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0214164;OID=.;OPOS=126890472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:49:32:32:17:17:0.346939:8:9:14:18:8:9:14:18 chr5 126890541 . T C 127.73 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0290413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.999;QD=11.8818;RBI=0.037338;REFB=-0.0157216;REVB=-0.0234677;RO=28;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228378;STB=0.632497;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0304078;OID=.;OPOS=126890541;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:9:6:6:22:9:6:6:22 chr5 126993249 . G C 178.0 PASS AF=0.348485;AO=20;DP=63;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0122481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.198;QD=10.7876;RBI=0.0147746;REFB=-0.0111213;REVB=0.00826276;RO=42;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192697;STB=0.585035;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0133988;OID=.;OPOS=126993249;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:66:42:43:20:23:0.348485:10:10:14:28:12:11:15:28 chr5 126993263 . A T 218.06 PASS AF=0.355263;AO=26;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0175982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.323;QD=11.4769;RBI=0.0176191;REFB=-0.000961164;REVB=-0.000856522;RO=49;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155804;STB=0.600716;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00162085;OID=.;OPOS=126993263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:49:49:26:27:0.355263:14:12:16:33:14:13:16:33 chr5 126993282 . G A 362.08 PASS AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.0285039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.552;QD=15.4078;RBI=0.0330802;REFB=0.00220531;REVB=-0.0167877;RO=55;SAF=19;SAR=20;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109729;STB=0.561853;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00490615;OID=.;OPOS=126993282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:20:19:21:34:20:19:21:34 chr5 126993958 . C T 337.92 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00534054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.876;QD=17.5543;RBI=0.0110783;REFB=0.00259564;REVB=-0.009706;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00198924;STB=0.501113;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-0.00251762;OID=.;OPOS=126993958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:21:15:17:24:21:15:17:24 chr5 127594414 . A T 432.1 PASS AF=0.403226;AO=50;DP=124;FAO=50;FDP=124;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.00221723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.833;QD=13.9386;RBI=0.011214;REFB=-0.00615425;REVB=-0.0109927;RO=73;SAF=32;SAR=18;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200664;STB=0.61735;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00835842;OID=.;OPOS=127594414;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:73:74:50:50:0.403226:18:32:33:40:18:32:33:41 chr5 127597518 . G A 306.16 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0052448;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.211;QD=15.3079;RBI=0.0113746;REFB=-0.0111266;REVB=-0.0100933;RO=46;SAF=19;SAR=15;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157894;STB=0.508923;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0156509;OID=.;OPOS=127597518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:15:19:25:21:15:19:25:21 chr5 127614472 . A G 1785.81 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8283;QD=61.0534;RBI=0.0372708;REFB=0;REVB=-0.0268226;RO=0;SAF=64;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70455e-06;OID=.;OPOS=127614472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:52:64:0:0:52:65:0:0 chr5 127622491 . T C 1387.5 PASS AF=0.978261;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00204754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.457;QD=60.3259;RBI=0.0106897;REFB=-0.0856968;REVB=-0.0104918;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511902;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-4.12326e-05;OID=.;OPOS=127622491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:92:92:0:2:90:90:0.978261:49:41:0:0:49:41:2:0 chr5 127685135 . C T 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.234;QD=61.3755;RBI=0.0116536;REFB=0;REVB=-0.0105451;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.81744e-06;OID=.;OPOS=127685135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0 chr5 128430757 . T C 1599.4 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.316;QD=63.9759;RBI=0.0232694;REFB=0;REVB=0.0196354;RO=0;SAF=40;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99212e-05;OID=.;OPOS=128430757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:59:40:0:0:59:41:0:0 chr5 128863471 . A G 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.103;QD=61.0492;RBI=0.0225452;REFB=0;REVB=0.0179388;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20541e-05;OID=.;OPOS=128863471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0 chr5 129072943 . G T 783.6 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2819;QD=56.9891;RBI=0.0371563;REFB=0;REVB=0.0245217;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00687e-05;OID=.;OPOS=129072943;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:36:18:0:0:36:19:0:0 chr5 129310670 . C CA 380.83 PASS AF=1;AO=6;DP=56;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083691;FXX=0.039208;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.346;QD=31.0878;RBI=0.15244;REFB=0;REVB=-0.127412;RO=50;SAF=2;SAR=4;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171068;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000768727;OID=.;OPOS=129310671;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:56:49:49:0:23:26:0:0:8:50:2:4:24:26 chr5 129521126 . A G 651.13 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.029;QD=62.0122;RBI=0.0109229;REFB=0;REVB=-0.00180603;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96664e-06;OID=.;OPOS=129521126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr5 130539955 . A G 399.57 PASS AF=0.355556;AO=48;DP=130;FAO=48;FDP=135;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.0308028;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.8556;QD=11.839;RBI=0.0333567;REFB=-0.0137703;REVB=-0.0128005;RO=82;SAF=24;SAR=24;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269916;STB=0.518511;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0276367;OID=.;OPOS=130539955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:135:82:87:48:48:0.355556:24:24:43:39:24:24:46:41 chr5 130766662 . T C 766.24 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.872;QD=56.7583;RBI=0.0101335;REFB=0;REVB=0.00897241;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14519e-05;OID=.;OPOS=130766662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:28:25:0:0:29:25:0:0 chr5 130808198 . T C 1549.25 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.411;QD=63.8865;RBI=0.0365482;REFB=0;REVB=0.0339752;RO=0;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95229e-05;OID=.;OPOS=130808198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:40:57:0:0:40:57:0:0 chr5 130970712 . G C 519.19 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.0127254;FXX=0.0170926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1387;QD=18.0586;RBI=0.0498911;REFB=0.00778735;REVB=-0.048241;RO=60;SAF=33;SAR=22;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172644;STB=0.604129;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0116722;OID=.;OPOS=130970712;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:60:60:55:55:0.478261:22:33:25:35:22:33:24:36 chr5 130979498 . C T 291.43 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0437957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.939;QD=16.8947;RBI=0.0512386;REFB=-0.0233057;REVB=-0.0265958;RO=35;SAF=15;SAR=17;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918667;STB=0.563664;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0238346;OID=.;OPOS=130979498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:35:37:32:32:0.463768:17:15:13:22:17:15:13:24 chr5 131008194 . T C 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.682;QD=51.9142;RBI=0.0737795;REFB=0;REVB=-0.0731302;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000503158;OID=.;OPOS=131008194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr5 131066725 . C A 941.02 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00734445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.235;QD=57.0312;RBI=0.0142586;REFB=0.00717326;REVB=0.0122216;RO=1;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125975;STB=0.506665;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=5.34874e-05;OID=.;OPOS=131066725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:37:28:0:1:37:28:0:1 chr5 131322494 . C T 1507.28 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0299145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.867;QD=58.5352;RBI=0.0307317;REFB=-0.0512;REVB=0.00704012;RO=1;SAF=56;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839763;STB=0.504424;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000257343;OID=.;OPOS=131322494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:102:102:0.990291:46:56:1:0:46:56:1:0 chr5 131324250 . C CTG 1144.26 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=83;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0445012;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=278.814;QD=58.68;RBI=0.0445032;REFB=0.0142275;REVB=0.000424815;RO=5;SAF=35;SAR=42;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168625;STB=0.507461;STBP=0.29;TYPE=ins;VARB=-8.14561e-06;OID=.;OPOS=131324251;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.987179:77:83:77:78:1:33:44:1:0:3:5:35:42:3:2 chr5 131705949 . T C 461.96 PASS AF=0.871795;AO=34;DP=39;FAO=34;FDP=39;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00562423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.612;QD=47.3802;RBI=0.0362009;REFB=-0.0238897;REVB=-0.0357614;RO=5;SAF=14;SAR=20;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459015;STB=0.524677;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00991003;OID=.;OPOS=131705949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:39:39:5:5:34:34:0.871795:20:14:3:2:20:14:3:2 chr5 131721174 . A G 1413.56 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.89;QD=62.8249;RBI=0.0119241;REFB=0;REVB=0.00650582;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71986e-05;OID=.;OPOS=131721174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:44:46:0:0:44:46:0:0 chr5 131731304 . A T 417.93 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0162146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.055;QD=53.926;RBI=0.0234518;REFB=-0.0925473;REVB=0.0169432;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.51723;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000519276;OID=.;OPOS=131731304;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:16:14:0:0:16:14:1:0 chr5 131755651 . C T 612.24 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.564;QD=61.2239;RBI=0.0263999;REFB=0;REVB=0.0158616;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160649;OID=.;OPOS=131755651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:25:14:0:0:25:15:0:0 chr5 131796498 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.445;QD=59.0187;RBI=0.02477;REFB=0;REVB=-0.00397545;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98714e-05;OID=.;OPOS=131796498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0 chr5 131805735 . C T 1595.01 PASS AF=1;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225102;FXX=0.0185168;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.737;QD=60.1891;RBI=0.0225199;REFB=0;REVB=-0.000661517;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.24197e-05;OID=.;OPOS=131805735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:106:0:0:106:106:1:48:58:0:0:48:58:0:0 chr5 131819126 . C T 271.89 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0290235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.95;QD=19.4209;RBI=0.0346445;REFB=-0.00295856;REVB=0.0189178;RO=27;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358835;STB=0.519986;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00200118;OID=.;OPOS=131819126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:16:13:11:16:16:13:11:16 chr5 131822055 . T C 106.32 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0520582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.192;QD=11.8134;RBI=0.0533896;REFB=-0.0200098;REVB=0.0118486;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147988;STB=0.58673;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0502437;OID=.;OPOS=131822055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:5:8:17:6:5:8:17:6 chr5 131822072 . A G 71.81 PASS AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0308885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.6686;QD=8.20704;RBI=0.0379959;REFB=-0.00636676;REVB=0.0221266;RO=25;SAF=6;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488185;STB=0.530061;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0139335;OID=.;OPOS=131822072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:35:35:25:25:10:10:0.285714:4:6:16:9:4:6:16:9 chr5 131822133 . T C 63.1 PASS AF=0.310345;AO=7;DP=27;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00322425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.838;QD=8.70341;RBI=0.00929055;REFB=-0.0223686;REVB=-0.00871313;RO=20;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.50137;STB=0.650823;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0385146;OID=.;OPOS=131822133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:27:29:20:20:7:9:0.310345:6:1:11:9:6:3:11:9 chr5 131822224 . T C 123.23 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00606098;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.331;QD=15.4042;RBI=0.0119552;REFB=-0.014218;REVB=-0.0103049;RO=18;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152333;STB=0.624804;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.014599;OID=.;OPOS=131822224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:18:18:14:14:0.4375:11:3:6:12:11:3:7:11 chr5 131892357 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2408;QD=51.1841;RBI=0.0662138;REFB=0;REVB=0.0566376;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00280657;OID=.;OPOS=131892357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0 chr5 131995964 . A G 245.46 PASS AF=0.509804;AO=25;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00493696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.692;QD=19.2515;RBI=0.0181182;REFB=-0.00331538;REVB=0.0174326;RO=25;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381485;STB=0.50793;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00356819;OID=.;OPOS=131995964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:25:26:0.509804:16:9:10:15:16:10:10:15 chr5 131996500 . A C 190.5 PASS AF=0.352941;AO=25;DP=70;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00298999;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.22;QD=11.2058;RBI=0.0116675;REFB=0.000477193;REVB=-0.0112778;RO=44;SAF=11;SAR=14;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213931;STB=0.61371;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.00102259;OID=.;OPOS=131996500;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:44:44:25:24:0.352941:14:11:28:16:13:11:28:16 chr5 132030414 . T A 553.75 PASS AF=0.974359;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.064139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.751;QD=56.7949;RBI=0.0643217;REFB=0.0590331;REVB=0.00484522;RO=2;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549974;STB=0.514278;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.0102795;OID=.;OPOS=132030414;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:2:1:37:38:0.974359:16:21:0:2:17:21:0:1 chr5 132031972 . T C 626.81 PASS AF=0.954545;AO=41;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00445454;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.4642;QD=56.9824;RBI=0.0140985;REFB=-0.0201269;REVB=0.0133763;RO=2;SAF=11;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253828;STB=0.513806;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=8.3523e-05;OID=.;OPOS=132031972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:44:44:2:2:41:42:0.954545:30:11:1:1:31:11:1:1 chr5 132042146 . C T 2140.67 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.093;QD=62.9608;RBI=0.0142311;REFB=0;REVB=0.0140674;RO=0;SAF=54;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09915e-05;OID=.;OPOS=132042146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:82:54:0:0:82:54:0:0 chr5 132098242 . A G 1306.43 PASS AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128801;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9671;QD=62.2108;RBI=0.015209;REFB=0;REVB=0.00808811;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001067;OID=.;OPOS=132098242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:82:84:1:44:38:0:0:44:40:0:0 chr5 132099999 . A G 1587.8 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.822;QD=64.1537;RBI=0.022821;REFB=0;REVB=0.011283;RO=0;SAF=55;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.04913e-05;OID=.;OPOS=132099999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:44:55:0:0:44:55:0:0 chr5 132150948 . T G 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.333;QD=64.1539;RBI=0.0285326;REFB=0;REVB=-0.00255606;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66021e-05;OID=.;OPOS=132150948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:60:39:0:0:60:39:0:0 chr5 132918994 . G A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0141277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.981;QD=14.6576;RBI=0.019432;REFB=-0.0132517;REVB=0.013342;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142857;STB=0.583204;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0122134;OID=.;OPOS=132918994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:8:9:5:8:8:9 chr5 133186592 . G A 56.19 PASS AF=0.4;AO=7;DP=19;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0639683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6441;QD=11.2389;RBI=0.0689663;REFB=-0.0307344;REVB=-0.025776;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073775;STB=0.576728;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0350119;OID=.;OPOS=133186592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:20:12:12:7:8:0.4:4:3:6:6:5:3:6:6 chr5 133186603 . A C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.118;QD=51.9154;RBI=0.0599528;REFB=0;REVB=-0.0543394;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000358898;OID=.;OPOS=133186603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr5 133477802 . C T 1249.46 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025419;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.877;QD=61.7016;RBI=0.0327462;REFB=0;REVB=-0.0206443;RO=0;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72567e-06;OID=.;OPOS=133477802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:31:50:0:0:31:50:0:0 chr5 133481467 . G A 715.02 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0178081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.027;QD=60.8525;RBI=0.0252787;REFB=0.0677236;REVB=-0.0179412;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00164443;OID=.;OPOS=133481467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:0:1:22:24:0:1 chr5 133909475 . G A 238.69 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0217296;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5262;QD=16.1823;RBI=0.0528698;REFB=-0.0243776;REVB=0.0481979;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424094;STB=0.523912;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.014429;OID=.;OPOS=133909475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:18:14:13:14:18:14 chr5 133956668 . G A 205.39 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0153901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.169;QD=12.8369;RBI=0.0168706;REFB=-0.0011856;REVB=-0.00691097;RO=39;SAF=10;SAR=15;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147752;STB=0.584837;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00147425;OID=.;OPOS=133956668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:15:10:21:18:15:10:21:18 chr5 134235613 . A C 198.37 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0147851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.362;QD=13.2245;RBI=0.0276211;REFB=-0.0140157;REVB=0.0233308;RO=36;SAF=3;SAR=21;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370354;STB=0.71773;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0188752;OID=.;OPOS=134235613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:21:3:13:23:21:3:13:23 chr5 134262271 . C A 325.27 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.000830794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0619;QD=14.785;RBI=0.0219329;REFB=-0.0440986;REVB=-0.0219172;RO=52;SAF=18;SAR=18;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120556;STB=0.568145;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0513414;OID=.;OPOS=134262271;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:52:36:36:0.409091:18:18:20:32:18:18:20:32 chr5 134343661 . C T 232.07 PASS AF=0.428571;AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00227327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.776;QD=14.7347;RBI=0.00306234;REFB=-0.00858144;REVB=-0.00205187;RO=36;SAF=10;SAR=16;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255973;STB=0.630265;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0152486;OID=.;OPOS=134343661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:36:36:26:27:0.428571:16:10:23:13:16:11:23:13 chr5 135178124 . T C 280.92 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0139505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5704;QD=14.4062;RBI=0.0264921;REFB=0.010614;REVB=0.0225215;RO=46;SAF=19;SAR=13;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398604;STB=0.522599;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.0109867;OID=.;OPOS=135178124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:13:19:29:17:13:19:29:17 chr5 135207187 . G A 193.49 PASS AF=0.75;AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0101442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.793;QD=32.2487;RBI=0.0186125;REFB=-0.134551;REVB=0.0156051;RO=6;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100709;STB=0.555494;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0202504;OID=.;OPOS=135207187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:6:6:18:18:0.75:10:8:4:2:10:8:4:2 chr5 135207382 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.379;QD=60.2299;RBI=0.0367331;REFB=0;REVB=0.0296911;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133721;OID=.;OPOS=135207382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr5 135276201 . AGTTGT AG,AGT 977.41 PASS AF=0,1;AO=12,61;DP=79;FAO=0,78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=0,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00105656,0.00179589;FXX=0.0126566;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=225.689,239.255;QD=50.1234;RBI=0.00396747,0.0244741;REFB=0,0;REVB=0.0038242,0.0244081;RO=0;SAF=3,28;SAR=9,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,-0.000122035;OID=.,.;OPOS=135276203,135276202;OREF=TTGT,GTT;OALT=-,-;OMAPALT=AG,AGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:12,61:79:0,78:78:0:0,32:0,46:0:0:17:0:3,28:9,33:0:0 chr5 135276314 . C T 1527.85 PASS AF=1;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277229;FXX=0.0192289;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.59;QD=59.9157;RBI=0.0283166;REFB=0;REVB=0.00576789;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206517;OID=.;OPOS=135276314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:104:102:0:0:102:102:1:55:47:0:0:55:47:0:0 chr5 135276814 . G A 945.65 PASS AF=0.516484;AO=91;DP=179;FAO=94;FDP=182;FR=.;FRO=88;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=0.00987618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.513;QD=20.7835;RBI=0.0154307;REFB=-0.0174853;REVB=-0.0118561;RO=87;SAF=48;SAR=43;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398344;STB=0.520951;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.015357;OID=.;OPOS=135276814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:182:87:88:91:94:0.516484:43:48:42:45:44:50:43:45 chr5 135276847 . T C 2219.4 PASS AF=0.992958;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.115;QD=62.5183;RBI=0.0197471;REFB=0.0131501;REVB=0.0161114;RO=1;SAF=72;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00655845;STB=0.503448;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000414139;OID=.;OPOS=135276847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:142:142:1:1:141:141:0.992958:69:72:1:0:69:72:1:0 chr5 135282630 . C T 546.24 PASS AF=0.42446;AO=57;DP=139;FAO=59;FDP=139;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0100776;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.919;QD=15.7191;RBI=0.0129051;REFB=-0.00558698;REVB=0.00806129;RO=78;SAF=30;SAR=27;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10605;STB=0.557589;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00663502;OID=.;OPOS=135282630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:78:80:57:59:0.42446:27:30:33:45:28:31:34:46 chr5 135287029 . T C 417.78 PASS AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0129576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.779;QD=22.5829;RBI=0.0138379;REFB=-0.00275524;REVB=0.00485669;RO=33;SAF=15;SAR=26;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501241;STB=0.527628;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00221665;OID=.;OPOS=135287029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:26:15:14:19:26:15:14:19 chr5 135382989 . G C 424.35 PASS AF=0.531646;AO=41;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00120467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.395;QD=21.4863;RBI=0.0202406;REFB=0.000389974;REVB=-0.0202047;RO=35;SAF=15;SAR=26;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128148;STB=0.576318;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.000387241;OID=.;OPOS=135382989;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:35:37:41:42:0.531646:26:15:18:17:26:16:20:17 chr5 135399452 . T G 472.76 PASS AF=0.3625;AO=58;DP=160;FAO=58;FDP=160;FR=.;FRO=102;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=0.000918755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.671;QD=11.819;RBI=0.0180045;REFB=-0.00515615;REVB=-0.0179811;RO=102;SAF=32;SAR=26;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112479;STB=0.564036;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00922694;OID=.;OPOS=135399452;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:102:102:58:58:0.3625:26:32:46:56:26:32:46:56 chr5 135508381 . A G 1713.23 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.558;QD=60.6452;RBI=0.0286699;REFB=0;REVB=0.00544004;RO=0;SAF=51;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94754e-05;OID=.;OPOS=135508381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:62:51:0:0:62:51:0:0 chr5 135513085 . T TC 1522.71 PASS AF=0.989899;AO=93;DP=100;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0266282;FXX=0.009999;HRUN=0;LEN=1;MLLD=94.5347;QD=61.5237;RBI=0.0305496;REFB=-0.143368;REVB=-0.0149739;RO=1;SAF=45;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104194;STB=0.505154;STBP=0.291;TYPE=ins;VARB=0.000183743;OID=.;OPOS=135513086;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.989899:93:100:98:99:1:48:50:1:0:4:1:45:48:1:0 chr5 135514055 . A G 1384.95 PASS AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.012911;FXX=0.0109878;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.106;QD=61.5531;RBI=0.0159765;REFB=-0.0823455;REVB=0.00941034;RO=1;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106495;STB=0.505617;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000228375;OID=.;OPOS=135514055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:44:45:0:1:44:45:0:1 chr5 135514216 . A G 226.43 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0162427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8978;QD=17.089;RBI=0.0234978;REFB=-0.0121647;REVB=0.01698;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05214;STB=0.529388;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0116935;OID=.;OPOS=135514216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:12:13:13:15:12:13:13:15 chr5 135517740 . T G 234.14 PASS AF=0.333333;AO=29;DP=87;FAO=29;FDP=87;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.0169589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.808;QD=10.7649;RBI=0.017659;REFB=-0.00504159;REVB=-0.00492296;RO=58;SAF=10;SAR=19;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220677;STB=0.628643;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00915646;OID=.;OPOS=135517740;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:58:58:29:29:0.333333:19:10:31:27:19:10:31:27 chr5 135522878 . GT TA 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012768;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=210.415;QD=59.3229;RBI=0.0128221;REFB=0;REVB=-0.00117597;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.0236e-05;OID=.;OPOS=135522878;OREF=GT;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0 chr5 135692575 . G A 203.36 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00811879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.076;QD=14.2705;RBI=0.0415803;REFB=-0.00255051;REVB=0.04078;RO=32;SAF=13;SAR=11;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135204;STB=0.584836;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00338177;OID=.;OPOS=135692575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:33:24:24:0.421053:11:13:13:19:11:13:13:20 chr5 136313330 . A AG 123.82 PASS AF=0.353535;AO=29;DP=100;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=0.125156;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.2528;QD=5.00268;RBI=0.142064;REFB=-0.00570068;REVB=0.0672181;RO=66;SAF=19;SAR=10;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352052;STB=0.705409;STBP=0.006;TYPE=ins;VARB=-0.00418866;OID=.;OPOS=136313331;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.353535:29:100:35:99:64:23:12:21:43:99:66:19:10:23:43 chr5 136953577 . T C 59.87 PASS AF=0.4;AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0109346;FXX=0.130378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.966;QD=11.9731;RBI=0.01602;REFB=-0.00734367;REVB=-0.0117079;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.573303;STB=0.670319;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.012158;OID=.;OPOS=136953577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:21:20:8:12:6:8:0.4:4:2:8:0:5:3:8:4 chr5 136954719 . T C 255.7 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00779317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.754;QD=15.7354;RBI=0.014835;REFB=-0.0123313;REVB=0.0126232;RO=36;SAF=20;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143494;STB=0.581337;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0151809;OID=.;OPOS=136954719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:9:20:20:16:9:20:20:16 chr5 136955383 . G T 568.95 PASS AF=0.451852;AO=49;DP=126;FAO=61;FDP=135;FR=.,HEALED;FRO=74;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.0230601;FXX=0.0287749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.273;QD=16.8578;RBI=0.0245012;REFB=-0.0153103;REVB=0.00827876;RO=56;SAF=28;SAR=21;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119838;STB=0.576135;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0233555;OID=.;OPOS=136955383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:135:56:74:49:61:0.451852:21:28:25:31:32:29:25:49 chr5 136969793 . C T 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0197202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.84;QD=18.2512;RBI=0.0215705;REFB=-0.0120936;REVB=0.00874058;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238094;STB=0.636178;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.014161;OID=.;OPOS=136969793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:10:5:9:6:10:5:9:6 chr5 137028029 . T C 1174.93 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00439147;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9154;QD=61.0352;RBI=0.0690904;REFB=0;REVB=0.0689507;RO=0;SAF=51;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000491331;OID=.;OPOS=137028029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:26:51:0:0:26:51:0:0 chr5 137206560 . A C 628.75 PASS AF=0.914894;AO=42;DP=46;FAO=43;FDP=47;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0453009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.822;QD=53.5102;RBI=0.0694231;REFB=-0.0396662;REVB=-0.0526059;RO=4;SAF=26;SAR=16;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227305;STB=0.513001;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0157623;OID=.;OPOS=137206560;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:46:47:4:4:42:43:0.914894:16:26:3:1:17:26:3:1 chr5 137244517 . G A 858.73 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.531;QD=57.2485;RBI=0.0272917;REFB=0;REVB=-0.00916239;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411167;OID=.;OPOS=137244517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:29:30:0:0:29:31:0:0 chr5 137259179 . T C 2640.75 PASS AF=0.994186;AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=172;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000296461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6322;QD=61.4129;RBI=0.00129957;REFB=-0.0794342;REVB=-0.0012653;RO=0;SAF=91;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502732;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000289616;OID=.;OPOS=137259179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:172:172:0:1:171:171:0.994186:80:91:0:0:80:91:1:0 chr5 137347498 . G A 1072.23 PASS AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0101396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.702;QD=57.1854;RBI=0.0271559;REFB=-0.0118863;REVB=0.0251919;RO=2;SAF=37;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248804;STB=0.513154;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00149564;OID=.;OPOS=137347498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:36:37:2:0:36:37:2:0 chr5 137372207 . A T 764.74 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000659054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.395;QD=56.6476;RBI=0.0448117;REFB=0;REVB=0.0448069;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181103;OID=.;OPOS=137372207;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:26:27:0:0:27:27:0:0 chr5 137475787 . C T 306.93 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00758943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.585;QD=18.0548;RBI=0.0133464;REFB=-0.0197155;REVB=-0.0109785;RO=35;SAF=12;SAR=21;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632461;STB=0.535389;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0264554;OID=.;OPOS=137475787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:21:12:15:20:21:12:15:20 chr5 137476416 . T C 1320.93 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8988;QD=62.1615;RBI=0.0349873;REFB=0;REVB=-0.00493217;RO=0;SAF=49;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214413;OID=.;OPOS=137476416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:36:49:0:0:36:49:0:0 chr5 137488440 . C T 100.74 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.048827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.212;QD=16.1191;RBI=0.0506018;REFB=0.00459436;REVB=0.0132841;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173529;STB=0.59984;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.00263719;OID=.;OPOS=137488440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:9:4:6:6:9:4 chr5 137665323 . G A 250.98 PASS AF=0.509434;AO=26;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00510892;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9791;QD=18.9418;RBI=0.0450273;REFB=-0.0122403;REVB=0.0447366;RO=24;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275196;STB=0.655534;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00713153;OID=.;OPOS=137665323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:26:26:27:0.509434:17:9:16:8:17:10:18:8 chr5 137708434 . C T 1491.61 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00614711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.777;QD=63.4726;RBI=0.0206636;REFB=0;REVB=0.0197281;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8402e-05;OID=.;OPOS=137708434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:45:49:0:0:45:49:0:0 chr5 137717213 . G A 136.15 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00220273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.609;QD=10.4728;RBI=0.00408014;REFB=-0.0132242;REVB=0.00343446;RO=35;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347184;STB=0.70564;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0272655;OID=.;OPOS=137717213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:12:5:21:14:12:5:21:14 chr5 137717265 . G A 772.67 PASS AF=0.98;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.031;QD=61.8134;RBI=0.027451;REFB=-0.0266844;REVB=-0.0173198;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.511107;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.000200227;OID=.;OPOS=137717265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:50:0:1:49:49:0.98:22:27:0:0:22:27:0:1 chr5 137729020 . A G 60.91 PASS AF=0.11194;AO=15;DP=135;FAO=15;FDP=134;FR=.;FRO=119;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=-0.0254089;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.378;QD=1.81819;RBI=0.0387054;REFB=-0.0100962;REVB=-0.0291976;RO=119;SAF=2;SAR=13;SRF=58;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456097;STB=0.840032;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0843987;OID=.;OPOS=137729020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:135:134:119:119:15:15:0.11194:13:2:58:61:13:2:58:61 chr5 137754695 . T C 1532.73 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286085;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4778;QD=63.8638;RBI=0.029604;REFB=0;REVB=0.00761242;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154275;OID=.;OPOS=137754695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:95:96:1:46:49:0:0:47:49:0:0 chr5 137781792 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3807;QD=35.5758;RBI=0.0773433;REFB=0;REVB=0.0385448;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00877888;OID=.;OPOS=137781792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr5 137782578 . T C 132.74 PASS AF=0.419355;AO=9;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0256342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.901;QD=17.1275;RBI=0.0256342;REFB=-0.0217081;REVB=2.02659e-05;RO=16;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433491;STB=0.729966;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0216644;OID=.;OPOS=137782578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:16:16:9:13:0.419355:2:7:6:10:3:10:6:10 chr5 137892170 . G A 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.61;QD=59.1431;RBI=0.0129223;REFB=0;REVB=0.0119342;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18541e-05;OID=.;OPOS=137892170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0 chr5 137902339 . T C 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454171;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.807;QD=57.1774;RBI=0.00885475;REFB=0;REVB=0.00760128;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46289e-05;OID=.;OPOS=137902339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0 chr5 138632030 . G T 281.6 PASS AF=0.609756;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0248058;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.133;QD=27.4733;RBI=0.025817;REFB=-0.010004;REVB=0.00715448;RO=16;SAF=3;SAR=22;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102196;STB=0.556913;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0035007;OID=.;OPOS=138632030;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:16:16:25:25:0.609756:22:3:3:13:22:3:3:13 chr5 138665756 . G A 347.22 PASS AF=0.607143;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0227237;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.811;QD=24.8015;RBI=0.0229674;REFB=0.00393118;REVB=0.00333684;RO=21;SAF=20;SAR=14;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271697;STB=0.65565;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00384162;OID=.;OPOS=138665756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:21:22:34:34:0.607143:14:20:4:17:14:20:4:18 chr5 138705188 . C CATT 822.87 PASS AF=0.9375;AO=54;DP=64;FAO=60;FDP=64;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0135467;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.732;QD=51.4293;RBI=0.0136398;REFB=0.0301009;REVB=-0.00159084;RO=4;SAF=30;SAR=24;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00728765;STB=0.501042;STBP=0.916;TYPE=ins;VARB=-0.00094636;OID=.;OPOS=138705189;OREF=-;OALT=ATT;OMAPALT=CATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.9375:54:64:60:64:4:31:29:2:2:15:4:30:24:2:2 chr5 138713959 . A C 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00375779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.013;QD=57.2018;RBI=0.0518777;REFB=0;REVB=0.0517415;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468692;OID=.;OPOS=138713959;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr5 138720108 . C T 377.77 PASS AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.048955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7069;QD=21.587;RBI=0.145286;REFB=-0.0229326;REVB=0.13679;RO=32;SAF=29;SAR=9;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228197;STB=0.626955;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0209161;OID=.;OPOS=138720108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:9:29:17:15:9:29:17:15 chr5 138720156 . C T 412.81 PASS AF=0.442308;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.00526835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.793;QD=15.8771;RBI=0.053784;REFB=-0.0143316;REVB=0.0535253;RO=58;SAF=27;SAR=19;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169924;STB=0.509511;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0153247;OID=.;OPOS=138720156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:58:46:46:0.442308:19:27:35:23:19:27:35:23 chr5 138728483 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00174765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.554;QD=44.6896;RBI=0.0119502;REFB=0;REVB=0.0118217;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300179;OID=.;OPOS=138728483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr5 138728533 . C T 103.5 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0271612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3244;QD=18.8186;RBI=0.0509257;REFB=-0.0233683;REVB=0.0430777;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174365;STB=0.580507;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.051527;OID=.;OPOS=138728533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:9:10:12:12:0.545455:8:4:5:4:8:4:5:5 chr5 138730407 . C T 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0515001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8663;QD=18.4827;RBI=0.0559231;REFB=-0.017164;REVB=0.0217976;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955612;STB=0.554319;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0218771;OID=.;OPOS=138730407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:8:11:10:11:8:11:10:11 chr5 138732579 . C T 332.81 PASS AF=0.433735;AO=35;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0111976;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.952;QD=16.0388;RBI=0.0238558;REFB=-0.0208426;REVB=0.0210646;RO=48;SAF=17;SAR=18;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280583;STB=0.502349;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0272834;OID=.;OPOS=138732579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:47:35:36:0.433735:18:17:22:26:19:17:22:25 chr5 138773090 . A G 271.83 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0287925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2229;QD=19.4161;RBI=0.0327796;REFB=-0.0571447;REVB=-0.0156683;RO=27;SAF=13;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609373;STB=0.533969;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0385263;OID=.;OPOS=138773090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:16:13:14:13:16:13:14:13 chr5 138857919 . T C 1500.23 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000751073;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.299;QD=63.8395;RBI=0.0218141;REFB=0;REVB=0.0218012;RO=0;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256284;OID=.;OPOS=138857919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:46:48:0:0:46:48:0:0 chr5 138861146 . C G 1080.28 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.77;QD=60.0157;RBI=0.0276983;REFB=0;REVB=-0.00343159;RO=0;SAF=21;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84448e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.39217e-05;OID=.;OPOS=138861146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:51:21:0:0:51:21:0:0 chr5 139217320 . G C 500.75 PASS AF=0.521739;AO=47;DP=91;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0220969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.964;QD=21.7715;RBI=0.0224982;REFB=-0.0163904;REVB=-0.00423006;RO=44;SAF=28;SAR=19;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20195;STB=0.61447;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0118602;OID=.;OPOS=139217320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:44:44:47:48:0.521739:19:28:16:28:19:29:16:28 chr5 139496174 . TC T 256.54 PASS AF=0.391304;AO=44;DP=116;FAO=45;FDP=115;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.0200895;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.2734;QD=8.92328;RBI=0.0977458;REFB=0.0222206;REVB=-0.095659;RO=69;SAF=23;SAR=21;SRF=42;SRR=27;SSEN=0.227205;SSEP=0;SSSB=-0.0932959;STB=0.562981;STBP=0.308;TYPE=del;VARB=-0.036662;OID=.;OPOS=139496175;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.391304:44:116:45:115:70:23:22:43:27:99:69:23:21:42:27 chr5 139712548 . TAA TA,TAC 430.63 PASS AF=0.129032,0.870968;AO=4,27;DP=31;FAO=4,27;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=4,13;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727896,-0.0838078;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.2278,54.4544;QD=55.5647;RBI=0.00734647,0.0838887;REFB=0,0;REVB=0.000993642,0.00368375;RO=0;SAF=4,13;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.39874e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0223415,-0.00617034;OID=.,.;OPOS=139712549,139712550;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=TA,TAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.129032,0.870968:4,27:31:4,27:31:0:4,13:0,14:0:0:17:0:4,13:0,14:0:0 chr5 139745154 . T C 772.97 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0279341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.528;QD=61.8379;RBI=0.0300874;REFB=-0.144863;REVB=0.0111775;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000809488;OID=.;OPOS=139745154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:50:0:1:49:49:0.98:26:23:0:0:26:23:1:0 chr5 139876684 . G C 119.69 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00856946;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.095;QD=12.9396;RBI=0.010796;REFB=-0.00038124;REVB=-0.00656637;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405333;STB=0.523776;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.000438796;OID=.;OPOS=139876684;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:23:23:14:14:0.378378:6:8:14:9:6:8:14:9 chr5 139936760 . G T 298.95 PASS AF=0.96;AO=23;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1852;QD=47.8318;RBI=0.0927621;REFB=-0.0592295;REVB=0.0910439;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521721;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00729448;OID=.;OPOS=139936760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:25:25:0:1:23:24:0.96:12:11:0:0:13:11:1:0 chr5 139936980 . A G 315.19 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00660347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.78;QD=52.5313;RBI=0.00786798;REFB=0;REVB=-0.00427777;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397474;OID=.;OPOS=139936980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0 chr5 139940233 . G A 894.28 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0192375;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.777;QD=55.0324;RBI=0.0205732;REFB=-0.0288418;REVB=-0.00729204;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.503875;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.000389459;OID=.;OPOS=139940233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:65:0:2:63:63:0.969231:24:39:0:0:24:39:1:1 chr5 139940302 . G A 206.63 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0158356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.076;QD=13.1196;RBI=0.0162046;REFB=-0.00682619;REVB=0.00343841;RO=38;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344528;STB=0.519729;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00794825;OID=.;OPOS=139940302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:12:13:21:17:12:13:21:17 chr5 139941228 . A G 563.78 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0304597;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.268;QD=57.8236;RBI=0.0370579;REFB=-0.0535088;REVB=0.0211066;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253186;STB=0.513506;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00123674;OID=.;OPOS=139941228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:20:18:1:0:20:18:1:0 chr5 140048267 . T C 817.25 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.487;QD=57.3505;RBI=0.0428234;REFB=0;REVB=0.0344194;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.3532e-05;OID=.;OPOS=140048267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0 chr5 140167463 . C T 391.61 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.168;QD=54.0148;RBI=0.065051;REFB=0;REVB=0.0235642;RO=1;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032084;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151776;OID=.;OPOS=140167463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:29:29:1:0:28:29:1:14:14:0:1:15:14:0:0 chr5 140168070 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0810644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6656;QD=55.0979;RBI=0.0829953;REFB=0;REVB=-0.0177983;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00241741;OID=.;OPOS=140168070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr5 140168151 . G T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.193;QD=60.9786;RBI=0.0282253;REFB=0;REVB=0.0222545;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117509;OID=.;OPOS=140168151;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:27:12:0:0:27:12:0:0 chr5 140174622 . G A 875.04 PASS AF=0.940299;AO=63;DP=67;FAO=63;FDP=67;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.109893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.393;QD=52.2414;RBI=0.122072;REFB=-0.12649;REVB=0.0531526;RO=3;SAF=25;SAR=38;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569291;STB=0.506415;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00916211;OID=.;OPOS=140174622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:67:67:3:4:63:63:0.940299:38:25:1:2:38:25:2:2 chr5 140174865 . G C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.702;QD=59.3225;RBI=0.0224094;REFB=0;REVB=0.0058842;RO=0;SAF=25;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015778;OID=.;OPOS=140174865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:43:25:0:0:43:25:0:0 chr5 140181734 . A G 729.0 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.787;QD=57.1765;RBI=0.0321671;REFB=0;REVB=-0.00010071;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189072;OID=.;OPOS=140181734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0 chr5 140181892 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.154;QD=56.9383;RBI=0.00835126;REFB=0;REVB=-0.0044825;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92603e-06;OID=.;OPOS=140181892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0 chr5 140182101 . G T 739.08 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0424934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.502;QD=54.7466;RBI=0.0492836;REFB=-0.0778309;REVB=0.0249636;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.51219;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00116798;OID=.;OPOS=140182101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:33:20:0:0:33:20:1:0 chr5 140182777 . G T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00487049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.758;QD=14.0965;RBI=0.0242669;REFB=-0.00112806;REVB=-0.0237731;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654098;STB=0.538391;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00108748;OID=.;OPOS=140182777;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:8:6:4:7:8:6 chr5 140183058 . G A 465.09 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1283;QD=58.1361;RBI=0.030817;REFB=0;REVB=0.0120178;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433096;OID=.;OPOS=140183058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:22:10:0:0:22:10:0:0 chr5 140186937 . G T 538.52 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.82;QD=59.8354;RBI=0.0557751;REFB=0;REVB=0.0369143;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289779;OID=.;OPOS=140186937;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr5 140186979 . GG AA 79.23 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102315;FXX=0.110988;HRUN=3;LEN=2;MLLD=91.5302;QD=39.6144;RBI=0.0390613;REFB=0;REVB=-0.0376975;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000525229;OID=.;OPOS=140186979;OREF=GG;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr5 140186982 . C A 69.27 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.58;QD=30.7863;RBI=0.0757316;REFB=-0.0287359;REVB=-0.0709903;RO=1;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599732;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00867915;OID=.;OPOS=140186982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:6:2:1:0:6:2:1:0 chr5 140186984 . G A 79.23 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108382;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1387;QD=39.6144;RBI=0.124579;REFB=0;REVB=0.0614254;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01175;OID=.;OPOS=140186984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr5 140186990 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.111;QD=35.5758;RBI=0.104922;REFB=0;REVB=0.0189257;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132602;OID=.;OPOS=140186990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr5 140187048 . G C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.114;QD=60.2307;RBI=0.0379348;REFB=0;REVB=0.0344777;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69452e-05;OID=.;OPOS=140187048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:25:12:0:0:25:12:0:0 chr5 140187102 . A G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.132;QD=63.8715;RBI=0.00489532;REFB=0;REVB=0.00467286;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41441e-05;OID=.;OPOS=140187102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0 chr5 140187322 . C T 1491.14 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00880692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.961;QD=63.4527;RBI=0.0154647;REFB=0;REVB=0.012712;RO=0;SAF=51;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18509e-05;OID=.;OPOS=140187322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:42:51:0:0:43:51:0:0 chr5 140188383 . T G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0449875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.355;QD=62.9829;RBI=0.0463057;REFB=0;REVB=0.0109702;RO=0;SAF=12;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121887;OID=.;OPOS=140188383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:33:12:0:0:33:12:0:0 chr5 140188401 . A G 424.46 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.611;QD=56.5949;RBI=0.0354443;REFB=0;REVB=0.0337297;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190716;OID=.;OPOS=140188401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:19:10:0:0:20:10:0:0 chr5 140188575 . G C 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5735;QD=57.175;RBI=0.0375934;REFB=0;REVB=0.0143982;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602349;OID=.;OPOS=140188575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0 chr5 140201420 . T C 1380.53 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109241;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.394;QD=62.7511;RBI=0.0230575;REFB=0;REVB=0.0203055;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48888e-05;OID=.;OPOS=140201420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0 chr5 140203432 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989798;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.063;QD=35.5759;RBI=0.0131799;REFB=0;REVB=0.00870279;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375603;OID=.;OPOS=140203432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr5 140209467 . T G 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0581374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2473;QD=56.7043;RBI=0.0861936;REFB=0;REVB=-0.0636347;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00282361;OID=.;OPOS=140209467;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr5 140214381 . G A 702.86 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0553439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2203;QD=62.476;RBI=0.10247;REFB=0;REVB=-0.0862388;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00234448;OID=.;OPOS=140214381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:22:22:0:0:22:23:0:0 chr5 140221139 . G A 545.25 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00551707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.425;QD=57.3948;RBI=0.0137259;REFB=-0.0561312;REVB=0.0125684;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000734823;OID=.;OPOS=140221139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:18:19:1:0:18:19:1:0 chr5 140222157 . A C 817.72 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.691;QD=57.3839;RBI=0.0223622;REFB=0;REVB=0.0222076;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105098;OID=.;OPOS=140222157;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr5 140222641 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.254;QD=43.4861;RBI=0.0653663;REFB=0;REVB=-0.0131915;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000657766;OID=.;OPOS=140222641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr5 140228164 . C A 493.18 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126588;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.215;QD=58.0215;RBI=0.0834508;REFB=0;REVB=0.0824851;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000646588;OID=.;OPOS=140228164;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:12:20:0:0:14:20:0:0 chr5 140229086 . C G 1415.4 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5756;QD=62.9068;RBI=0.0428305;REFB=0;REVB=-0.0278621;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50943e-05;OID=.;OPOS=140229086;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:45:45:0:0:45:45:0:0 chr5 140229368 . G C 1084.67 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177441;FXX=0.0136968;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.246;QD=60.2597;RBI=0.0183893;REFB=0;REVB=0.00482856;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204773;OID=.;OPOS=140229368;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:39:33:0:0:39:33:0:0 chr5 140229526 . T G 1491.76 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.032364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.564;QD=63.4792;RBI=0.0498894;REFB=0;REVB=0.0379674;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20814e-06;OID=.;OPOS=140229526;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:51:42:0:0:52:42:0:0 chr5 140230370 . AA CC 1364.78 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015931;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=2;MLLD=118.592;QD=62.7484;RBI=0.0188432;REFB=0;REVB=-0.0100633;RO=0;SAF=41;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000354751;OID=.;OPOS=140230370;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:46:41:0:0:46:41:0:0 chr5 140231237 . T C 817.72 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8468;QD=57.3837;RBI=0.0854119;REFB=0;REVB=0.075321;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000951786;OID=.;OPOS=140231237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0 chr5 140232950 . G C 411.1 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0321;QD=56.7036;RBI=0.0234976;REFB=0;REVB=0.0234384;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300501;OID=.;OPOS=140232950;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0 chr5 140236771 . G A 397.44 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00377818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.915;QD=20.6461;RBI=0.00416123;REFB=-0.0286438;REVB=-0.00174391;RO=36;SAF=24;SAR=16;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134494;STB=0.581111;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0265382;OID=.;OPOS=140236771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:37:40:40:0.519481:16:24:16:20:16:24:16:21 chr5 140236950 . C G 253.2 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0135245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.596;QD=19.1095;RBI=0.0135267;REFB=0.00545147;REVB=0.000243556;RO=26;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116053;STB=0.564923;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.00521329;OID=.;OPOS=140236950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:11:16:12:14:11:16:12:14 chr5 140237109 . T G 1415.39 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6564;QD=62.9061;RBI=0.0605631;REFB=0;REVB=-0.0318602;RO=0;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000639217;OID=.;OPOS=140237109;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:53:37:0:0:53:37:0:0 chr5 140237387 . T G 397.76 PASS AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00474972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3013;QD=53.035;RBI=0.0691293;REFB=-0.0360704;REVB=0.068966;RO=1;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489106;STB=0.523793;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0111813;OID=.;OPOS=140237387;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:30:1:1:28:29:0.966667:9:19:0:1:10:19:0:1 chr5 140237548 . A G 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.866;QD=60.6097;RBI=0.0269188;REFB=0;REVB=0.0175903;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140961;OID=.;OPOS=140237548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr5 140242451 . GCCA GCA,GCAG 639.81 PASS AF=1,0;AO=40,2;DP=42;FAO=42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0813429,-0.0287207;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=29.0213,6.24375;QD=60.9347;RBI=0.0813543,0.0910082;REFB=0,0;REVB=-0.00135899,-0.0863575;RO=0;SAF=16,0;SAR=24,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0025689,0;OID=.,.;OPOS=140242452,140242453;OREF=C,CA;OALT=-,AG;OMAPALT=GCA,GCAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:40,2:42:42,0:42:0:16,0:26,0:0:0:4:0:16,0:24,2:0:0 chr5 140242479 . T A 754.02 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.406;QD=62.8346;RBI=0.0186395;REFB=0;REVB=0.0167498;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59463e-05;OID=.;OPOS=140242479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:28:20:0:0 chr5 140250252 . T C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.77;QD=60.6103;RBI=0.0348209;REFB=0;REVB=0.00517214;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135289;OID=.;OPOS=140250252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr5 140255792 . C A 188.89 PASS AF=0.515152;AO=14;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0056321;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.1264;QD=22.8959;RBI=0.0944632;REFB=-0.0593438;REVB=-0.0942952;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2785;STB=0.578634;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.0288992;OID=.;OPOS=140255792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:33:33:8:11:14:17:0.515152:5:9:8:0:8:9:8:3 chr5 140263290 . T G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.891;QD=57.5452;RBI=0.0335964;REFB=0;REVB=0.00177864;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.83186e-05;OID=.;OPOS=140263290;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0 chr5 140475980 . G A 100.52 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-3.53152e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.593;QD=16.7531;RBI=0.0150136;REFB=-0.0191913;REVB=0.0150136;RO=12;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.476506;STB=0.785101;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0204023;OID=.;OPOS=140475980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:11:1:5:7:11:1:5:7 chr5 140482483 . G A 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0163988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.59;QD=13.0914;RBI=0.0223223;REFB=-0.0153003;REVB=0.0151447;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193058;STB=0.612735;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0112854;OID=.;OPOS=140482483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:7:13:6:7:7:13 chr5 140502177 . G A 248.58 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00613724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.41;QD=25.495;RBI=0.00978289;REFB=-0.0401914;REVB=-0.00761835;RO=16;SAF=13;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09458;STB=0.552527;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0288976;OID=.;OPOS=140502177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:10:13:7:9:10:13:7:9 chr5 140517174 . T C 256.13 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.366;QD=51.225;RBI=0.104747;REFB=0;REVB=0.00572153;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313282;OID=.;OPOS=140517174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:17:2:0:0:17:3:0:0 chr5 140530529 . G A 217.81 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00349847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.188;QD=16.7545;RBI=0.0173476;REFB=-0.00197234;REVB=-0.0169912;RO=27;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868684;STB=0.557645;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0019913;OID=.;OPOS=140530529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:12:12:16:11:12:12:17:11 chr5 140531175 . T C 690.6 PASS AF=1;AO=29;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3184;QD=62.7815;RBI=0.134723;REFB=0;REVB=0.0217051;RO=0;SAF=1;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.55046e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00295673;OID=.;OPOS=140531175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:29:44:1:28:1:0:0:29:15:0:0 chr5 140531746 . C G 37.33 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0442655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.464;QD=9.33215;RBI=0.0444668;REFB=-0.0220794;REVB=-0.00422595;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41225;STB=0.768453;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0496723;OID=.;OPOS=140531746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:9:10:6:6:0.375:4:2:7:2:4:2:8:2 chr5 140532420 . C G 193.68 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0271734;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.507;QD=21.52;RBI=0.0274387;REFB=-0.00371449;REVB=-0.0038062;RO=15;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184605;STB=0.612668;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00240791;OID=.;OPOS=140532420;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:17:19:19:0.527778:14:5:7:8:14:5:8:9 chr5 140532871 . T A 183.55 PASS AF=0.396552;AO=20;DP=56;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0708752;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1655;QD=12.6589;RBI=0.11979;REFB=-0.053073;REVB=-0.0965729;RO=36;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11593;STB=0.512771;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0892245;OID=.;OPOS=140532871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:36:35:20:23:0.396552:11:9:20:16:11:12:19:16 chr5 140553581 . G C 640.87 PASS AF=0.581633;AO=57;DP=98;FAO=57;FDP=98;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0242039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.363;QD=26.1581;RBI=0.0255454;REFB=-0.0108564;REVB=0.00816918;RO=41;SAF=32;SAR=25;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000332747;STB=0.500182;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00922955;OID=.;OPOS=140553581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:41:41:57:57:0.581633:25:32:23:18:25:32:23:18 chr5 140553856 . G A 59.59 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0139221;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.396;QD=11.3505;RBI=0.0150642;REFB=-0.00604143;REVB=-0.00575393;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198042;STB=0.618767;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00966947;OID=.;OPOS=140553856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:21:21:13:13:8:8:0.380952:4:4:4:9:4:4:4:9 chr5 140554481 . G T 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0819461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.286;QD=10.0338;RBI=0.08196;REFB=0.00542099;REVB=0.00150838;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413035;STB=0.749164;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00275293;OID=.;OPOS=140554481;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:1:6:2:3:1:6 chr5 140554606 . T C 222.99 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0924214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7668;QD=14.8661;RBI=0.092492;REFB=-0.00107564;REVB=-0.0036119;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316041;STB=0.510463;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=-0.00194709;OID=.;OPOS=140554606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:33:34:26:26:0.433333:15:11:15:18:15:11:15:19 chr5 140554808 . T A 617.47 PASS AF=0.453901;AO=64;DP=141;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.000831087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.135;QD=17.5169;RBI=0.0282355;REFB=-0.010142;REVB=-0.0282232;RO=70;SAF=40;SAR=24;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134666;STB=0.566706;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0104624;OID=.;OPOS=140554808;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:70:77:64:64:0.453901:24:40:34:36:24:40:39:38 chr5 140558326 . T C 52.8 PASS AF=0.149254;AO=10;DP=67;FAO=10;FDP=67;FR=.;FRO=57;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0466224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.867;QD=3.15237;RBI=0.0477848;REFB=0.00403165;REVB=-0.0104754;RO=57;SAF=5;SAR=5;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756642;STB=0.552136;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=-0.00870773;OID=.;OPOS=140558326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:67:67:57:57:10:10:0.149254:5:5:32:25:5:5:32:25 chr5 140559596 . T G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.99;QD=51.1846;RBI=0.0327433;REFB=0;REVB=0.0294778;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253525;OID=.;OPOS=140559596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr5 140563579 . C T 85.04 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.635;QD=22.6785;RBI=0.011232;REFB=-0.00799382;REVB=0.011232;RO=5;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226263;OID=.;OPOS=140563579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:10:0:0:5:10:0:0:5 chr5 140564088 . C T 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.035674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.547;QD=12.3961;RBI=0.0643604;REFB=-0.00482363;REVB=0.053569;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0213542;OID=.;OPOS=140564088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:3:2:3:2:3:2 chr5 140564263 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0281509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.842;QD=13.5054;RBI=0.0283227;REFB=-0.0060419;REVB=-0.0031151;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361791;STB=0.710774;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0117655;OID=.;OPOS=140564263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:4:8:5:12:4:8:5:12 chr5 140567264 . G T 272.3 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0210065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.115;QD=17.289;RBI=0.0241839;REFB=-0.00443799;REVB=0.0119828;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113768;STB=0.506379;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.00575516;OID=.;OPOS=140567264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:14:16:18:15:14:16:18:15 chr5 140567445 . A G 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0190517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.382;QD=15.7382;RBI=0.0195038;REFB=0.00103187;REVB=0.00417515;RO=36;SAF=11;SAR=18;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00994387;STB=0.505614;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=-0.00147693;OID=.;OPOS=140567445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:18:11:14:22:18:11:14:22 chr5 140567608 . C T 324.34 PASS AF=0.539683;AO=33;DP=59;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.119712;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6649;QD=20.5932;RBI=0.132572;REFB=-0.0533514;REVB=-0.0569574;RO=25;SAF=9;SAR=24;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820653;STB=0.562861;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0279481;OID=.;OPOS=140567608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:63:25:29:33:34:0.539683:24:9:9:16:24:10:12:17 chr5 140568026 . T C 413.53 PASS AF=0.525641;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00678146;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.62;QD=21.2068;RBI=0.0524169;REFB=-0.0171173;REVB=0.0519763;RO=37;SAF=17;SAR=24;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108874;STB=0.560223;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0162;OID=.;OPOS=140568026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:37:37:41:41:0.525641:24:17:20:17:24:17:20:17 chr5 140568034 . C CA 895.41 PASS AF=0.986842;AO=72;DP=79;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0277526;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.8758;QD=47.127;RBI=0.162101;REFB=-0.0209562;REVB=-0.159708;RO=5;SAF=36;SAR=36;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012254;STB=0.506327;STBP=0.528;TYPE=ins;VARB=0.00102835;OID=.;OPOS=140568035;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.986842:72:79:75:76:1:36:39:0:1:11:5:36:36:2:3 chr5 140568998 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0273707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9686;QD=13.5044;RBI=0.0467221;REFB=-0.02992;REVB=0.0378656;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129894;STB=0.575637;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0431071;OID=.;OPOS=140568998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:5:12:7:5:5:12 chr5 140572668 . C T 188.69 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0224946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9674;QD=14.2404;RBI=0.0258452;REFB=-0.00703731;REVB=0.0127266;RO=31;SAF=14;SAR=8;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025645;STB=0.514692;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00936304;OID=.;OPOS=140572668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:8:14:19:12:8:14:19:12 chr5 140573439 . G C 187.38 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0435396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4338;QD=14.6965;RBI=0.0541374;REFB=0.0120624;REVB=-0.032174;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395583;STB=0.522705;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0207788;OID=.;OPOS=140573439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:9:12:16:14:9:12:16:14 chr5 140573442 . C G 192.84 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00194846;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.738;QD=15.742;RBI=0.00200503;REFB=-0.0189658;REVB=0.00047295;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338792;STB=0.519488;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0248739;OID=.;OPOS=140573442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:29:29:20:20:0.408163:9:11:15:14:9:11:15:14 chr5 140574860 . T C 170.31 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0146782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1042;QD=17.0313;RBI=0.0749896;REFB=-0.00870034;REVB=0.0735391;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140082;STB=0.580022;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0218791;OID=.;OPOS=140574860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:13:9:10:8:13:9 chr5 140575211 . G T 103.09 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00624893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.007;QD=9.58996;RBI=0.00654574;REFB=-0.0071136;REVB=-0.00194873;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328091;STB=0.519825;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0152229;OID=.;OPOS=140575211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:6:7:17:13:6:7:17:13 chr5 140580493 . T A 220.44 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00503074;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=350.556;QD=24.493;RBI=0.00650287;REFB=-0.00581893;REVB=-0.00412055;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289103;STB=0.516114;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00461623;OID=.;OPOS=140580493;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:12:9:7:8:12:9:7:8 chr5 140580931 . C G 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.035344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.733;QD=16.6157;RBI=0.0371459;REFB=-0.00016712;REVB=0.0114289;RO=21;SAF=12;SAR=5;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35868;STB=0.70564;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.000129956;OID=.;OPOS=140580931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:5:12:7:14:5:12:7:14 chr5 140581510 . G T 250.92 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0022565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.345;QD=17.0117;RBI=0.0127115;REFB=-0.00810941;REVB=0.0125096;RO=31;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112222;STB=0.563062;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0142827;OID=.;OPOS=140581510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:16:12:17:14:16:12:17:14 chr5 140591146 . G A 485.24 PASS AF=0.477064;AO=50;DP=109;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0512969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.473;QD=17.8069;RBI=0.0515865;REFB=-0.0206653;REVB=-0.00545786;RO=57;SAF=19;SAR=31;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191525;STB=0.602233;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0183719;OID=.;OPOS=140591146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:57:57:50:52:0.477064:31:19:33:24:32:20:33:24 chr5 140683265 . G A 356.13 PASS AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0027663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.064;QD=24.5606;RBI=0.00899655;REFB=-0.00739977;REVB=0.00856069;RO=23;SAF=14;SAR=21;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732561;STB=0.540124;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00469733;OID=.;OPOS=140683265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:23:23:35:35:0.603448:21:14:7:16:21:14:7:16 chr5 140710705 . G A 72.7 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0115889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.568;QD=8.81179;RBI=0.0180002;REFB=-0.00328318;REVB=-0.0137733;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246742;STB=0.515121;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00853003;OID=.;OPOS=140710705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:11:12:5:5:11:12 chr5 140720516 . C G 33.1 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0188731;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.25;QD=12.0353;RBI=0.0443888;REFB=0.027673;REVB=-0.0401767;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429211;STB=0.749312;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00976724;OID=.;OPOS=140720516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:0:6:3:2:0:6 chr5 140725828 . C T 322.99 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0478578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9609;QD=21.8978;RBI=0.0664314;REFB=0.0151169;REVB=0.0460735;RO=25;SAF=20;SAR=13;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069147;STB=0.530767;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.0101748;OID=.;OPOS=140725828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:26:33:33:0.559322:13:20:13:12:13:20:14:12 chr5 140739779 . C G 410.6 PASS AF=0.390244;AO=48;DP=123;FAO=48;FDP=123;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=-0.0134644;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=327.406;QD=13.3529;RBI=0.0241808;REFB=-0.0141385;REVB=-0.0200853;RO=75;SAF=29;SAR=19;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231681;STB=0.631014;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0204706;OID=.;OPOS=140739779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:75:75:48:48:0.390244:19:29:29:46:19:29:29:46 chr5 140750044 . T C 4574.19 PASS AF=0.983221;AO=292;DP=298;FAO=293;FDP=298;FR=.;FRO=5;FSAF=150;FSAR=143;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0417551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.31;QD=61.3986;RBI=0.048141;REFB=-0.12188;REVB=0.0239598;RO=5;SAF=149;SAR=143;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00288122;STB=0.501478;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000205061;OID=.;OPOS=140750044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:298:298:5:5:292:293:0.983221:143:149:3:2:143:150:3:2 chr5 140751128 . C G 145.45 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0392764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5468;QD=16.1606;RBI=0.0423223;REFB=-0.0370386;REVB=0.0157651;RO=20;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753757;STB=0.543423;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0715596;OID=.;OPOS=140751128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:10:6:9:11:10:6:9:11 chr5 140763029 . A G 307.85 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0325611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1162;QD=24.1455;RBI=0.0370301;REFB=-0.00843608;REVB=0.0176352;RO=20;SAF=18;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146229;STB=0.571381;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00549564;OID=.;OPOS=140763029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:20:21:30:30:0.588235:12:18:8:12:12:18:9:12 chr5 140763100 . C T 232.07 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0856346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7927;QD=23.802;RBI=0.0859596;REFB=-0.0418898;REVB=0.00746781;RO=17;SAF=18;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381917;STB=0.715689;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0446552;OID=.;OPOS=140763100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:4:18:7:10:4:18:7:10 chr5 140773388 . G T 162.8 PASS AF=0.35;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00839663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.609;QD=10.8531;RBI=0.0183012;REFB=-0.00363146;REVB=-0.0162614;RO=39;SAF=9;SAR=12;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371991;STB=0.521718;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0076758;OID=.;OPOS=140773388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:39:39:21:21:0.35:12:9:18:21:12:9:18:21 chr5 140774288 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.033;QD=57.6807;RBI=0.0331297;REFB=0;REVB=0.0218546;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231859;OID=.;OPOS=140774288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr5 140778256 . G A 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0182713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.314;QD=25.2758;RBI=0.161093;REFB=-0.0170693;REVB=-0.160053;RO=12;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157791;STB=0.58754;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0264251;OID=.;OPOS=140778256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:9:10:9:3:9:10:9:3 chr5 140783596 . C T 251.67 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0024358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.992;QD=17.0625;RBI=0.0505696;REFB=-0.0227167;REVB=-0.0505109;RO=30;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636178;STB=0.527253;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0324025;OID=.;OPOS=140783596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:31:28:28:0.474576:15:13:16:14:15:13:16:15 chr5 140784055 . T C 52.6 PASS AF=0.258065;AO=6;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0293123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.092;QD=6.78771;RBI=0.0295112;REFB=-0.00902623;REVB=-0.0034201;RO=20;SAF=0;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.713834;STB=0.683723;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0259291;OID=.;OPOS=140784055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:20:23:6:8:0.258065:6:0:10:10:6:2:11:12 chr5 140784427 . T C 51.67 PASS AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0129514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.17;QD=5.90481;RBI=0.0131435;REFB=-0.00792828;REVB=0.00223886;RO=27;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110655;STB=0.571254;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0249977;OID=.;OPOS=140784427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:4:4:11:16:4:4:11:16 chr5 140788264 . C T 338.73 PASS AF=0.564516;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00908405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.583;QD=21.8533;RBI=0.00909668;REFB=0.000635081;REVB=-0.000479141;RO=27;SAF=13;SAR=21;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141294;STB=0.582183;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00166127;OID=.;OPOS=140788264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:27:27:34:35:0.564516:21:13:15:12:22:13:15:12 chr5 140789933 . G A 399.21 PASS AF=0.42;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0153535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.413;QD=15.9685;RBI=0.0219835;REFB=-0.0144029;REVB=0.0157335;RO=58;SAF=19;SAR=23;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113376;STB=0.563686;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0128275;OID=.;OPOS=140789933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:58:42:42:0.42:23:19:20:38:23:19:20:38 chr5 140793007 . A G 651.6 PASS AF=0.651163;AO=54;DP=85;FAO=56;FDP=86;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0170749;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.008;QD=30.3069;RBI=0.0170749;REFB=-0.0176932;REVB=2.39328e-05;RO=30;SAF=22;SAR=32;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510351;STB=0.528153;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00990657;OID=.;OPOS=140793007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:30:30:54:56:0.651163:32:22:10:20:33:23:10:20 chr5 140797630 . G T 589.3 PASS AF=0.508475;AO=60;DP=118;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.034947;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.776;QD=19.9761;RBI=0.0371007;REFB=-0.00895955;REVB=0.0124566;RO=58;SAF=31;SAR=29;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122166;STB=0.567264;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00876387;OID=.;OPOS=140797630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:58:58:60:60:0.508475:29:31:22:36:29:31:22:36 chr5 140798936 . T G 237.62 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0347165;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3973;QD=25.6885;RBI=0.0354132;REFB=-0.00298001;REVB=-0.00699003;RO=15;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402817;STB=0.522368;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00134903;OID=.;OPOS=140798936;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:10:12:9:6:10:12:9:6 chr5 140801104 . T C 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00790056;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=276.605;QD=18.6371;RBI=0.0114173;REFB=-0.00362636;REVB=0.00824234;RO=16;SAF=3;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282245;STB=0.663036;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00544783;OID=.;OPOS=140801104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:13:3:7:9:13:3:7:9 chr5 140801298 . C A 470.01 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00207553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.66;QD=20.6599;RBI=0.0580359;REFB=-0.00846496;REVB=0.0579987;RO=45;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297693;STB=0.516476;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0122669;OID=.;OPOS=140801298;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:23:23:21:24:23:23:21:24 chr5 140803241 . C A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00909519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4366;QD=14.6577;RBI=0.0132601;REFB=0.00298823;REVB=0.00964922;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660375;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=-0.00378086;OID=.;OPOS=140803241;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:7:6:9:8:7:6:9:8 chr5 140807256 . A C 170.33 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0229076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0594;QD=17.0331;RBI=0.0323744;REFB=-0.0197;REVB=-0.0228767;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970462;STB=0.555494;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0148189;OID=.;OPOS=140807256;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:12:10:10:8:12:10 chr5 140812775 . CTTT CTTTC,CT,CTT 141.03 PASS AF=0.272727,0.590909,0.136364;AO=5,7,4;DP=22;FAO=6,13,3;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4,2;FSAR=6,9,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288694,0.366963,0.54784;FXX=0;HRUN=0,12,12;LEN=1,2,1;MLLD=194.211,10.3456,7.39946;QD=25.6413;RBI=0.0768416,0.387832,0.568318;REFB=0.0181281,0.0258254,0.0166129;REVB=-0.0712123,-0.125506,-0.151185;RO=0;SAF=0,0,3;SAR=5,7,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,del,del;VARB=0.0836279,0.0559326,-0.134015;OID=.,.,.;OPOS=140812779,140812776,140812776;OREF=-,TT,T;OALT=C,-,-;OMAPALT=CTTTC,CT,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.272727,0.590909,0.136364:5,7,4:22:6,13,3:22:0:0,4,2:6,9,1:0:0:36:0:0,0,3:5,7,1:0:0 chr5 140857798 . T C 327.71 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0272095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.701;QD=15.2421;RBI=0.0281638;REFB=-0.00938397;REVB=0.00726933;RO=50;SAF=17;SAR=19;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126154;STB=0.50713;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0099032;OID=.;OPOS=140857798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:19:17:23:27:19:17:23:27 chr5 140858245 . C T 495.09 PASS AF=0.5;AO=47;DP=95;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0159912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.822;QD=20.6287;RBI=0.0162692;REFB=-0.0149865;REVB=-0.00299507;RO=48;SAF=19;SAR=28;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126378;STB=0.562911;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.016736;OID=.;OPOS=140858245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:48:48:47:48:0.5:28:19:26:22:28:20:26:22 chr5 140859053 . A T 216.83 PASS AF=0.388889;AO=19;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0154571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8318;QD=12.0459;RBI=0.0219039;REFB=-0.00432193;REVB=0.0155196;RO=44;SAF=8;SAR=11;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17125;STB=0.502023;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0463402;OID=.;OPOS=140859053;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:44:44:19:28:0.388889:11:8:25:19:12:16:25:19 chr5 141021093 . T G 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00699831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.186;QD=16.9229;RBI=0.00710651;REFB=-0.0033441;REVB=-0.00123538;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401565;STB=0.522565;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00438523;OID=.;OPOS=141021093;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:12:18:19:15:12:18:19:15 chr5 141059868 . T C 213.68 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0279176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.761;QD=20.8471;RBI=0.0381839;REFB=-0.0338682;REVB=0.0260503;RO=20;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173986;STB=0.509795;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0434945;OID=.;OPOS=141059868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:13:8:8:12:13:8:8:12 chr5 141243646 . A G 2809.21 PASS AF=1;AO=178;DP=178;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.896;QD=62.7757;RBI=0.0150079;REFB=0;REVB=0.00481089;RO=0;SAF=76;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35317e-05;OID=.;OPOS=141243646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:179:0:0:178:179:1:102:76:0:0:102:77:0:0 chr5 141244732 . C CG 75.64 PASS AF=0.245283;AO=12;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0702625;FXX=0.0185151;HRUN=0;LEN=1;MLLD=32.8173;QD=5.70845;RBI=0.07093;REFB=-0.0108447;REVB=0.00970834;RO=40;SAF=1;SAR=11;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.673108;STB=0.859804;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.0831107;OID=.;OPOS=141244733;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.245283:12:53:13:53:40:2:11:26:14:75:40:1:11:26:14 chr5 141324954 . AC ACCTGCTGCTG,TG 359.64 PASS AF=0.8,0.0842105;AO=24,6;DP=91;FAO=76,8;FDP=95;FR=.;FRO=11;FSAF=63,8;FSAR=13,0;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0589663,-0.0144774;FXX=0.0206164;HRUN=2,1;LEN=9,2;MLLD=84.6894,160.481;QD=15.1429;RBI=0.0729991,0.0154258;REFB=-0.17796,0.000619573;REVB=0.0430331,-0.00532561;RO=49;SAF=13,6;SAR=11,0;SRF=49;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.597516,0;STB=0.518291,0.997586;STBP=0.534,0.309;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0192512,0.0435982;OID=.,.;OPOS=141324956,141324954;OREF=-,AC;OALT=CTGCTGCTG,TG;OMAPALT=ACCTGCTGCTG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:91:95:49:11:24,6:76,8:0.8,0.0842105:11,0:13,6:49:0:13,0:63,8:10:1 chr5 141325249 . T C 1562.95 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0276394;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.641;QD=58.9792;RBI=0.0316627;REFB=-0.0060832;REVB=0.0154464;RO=0;SAF=34;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507245;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.000129958;OID=.;OPOS=141325249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:108:106:0:1:105:105:0.990566:71:34:0:0:71:34:1:0 chr5 141334921 . C T 102.42 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0384458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.7593;QD=17.8113;RBI=0.0517494;REFB=0.0200606;REVB=0.0346399;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457974;STB=0.526272;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.0146861;OID=.;OPOS=141334921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:7:4:5:7:7:4 chr5 141335241 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.201;QD=60.6102;RBI=0.0306225;REFB=0;REVB=0.0264238;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21531e-05;OID=.;OPOS=141335241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr5 141335284 . G A 711.43 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0184877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6887;QD=52.6986;RBI=0.126533;REFB=-0.0291654;REVB=0.125175;RO=2;SAF=29;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313793;STB=0.51666;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0169808;OID=.;OPOS=141335284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:23:29:2:0:23:29:2:0 chr5 141336264 . G T 780.57 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.409;QD=63.7202;RBI=0.050444;REFB=0;REVB=0.00504568;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.3327e-05;OID=.;OPOS=141336264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:18:28:0:0:21:28:0:0 chr5 141337126 . C T 695.34 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0696688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.101;QD=60.4644;RBI=0.0760602;REFB=0.0123745;REVB=0.0305188;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.50943;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000555913;OID=.;OPOS=141337126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:26:19:0:0:26:19:0:1 chr5 141337225 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00751092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.745;QD=55.0987;RBI=0.0085725;REFB=0;REVB=-0.00413206;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.672e-05;OID=.;OPOS=141337225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0 chr5 141391532 . G A 535.94 PASS AF=0.518868;AO=55;DP=106;FAO=55;FDP=106;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0033636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0304;QD=20.2243;RBI=0.0120188;REFB=0.0114509;REVB=0.0115385;RO=51;SAF=23;SAR=32;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592208;STB=0.532585;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0101782;OID=.;OPOS=141391532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:51:51:55:55:0.518868:32:23:18:33:32:23:18:33 chr5 141531735 . C T 641.72 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.081;QD=59.6947;RBI=0.024985;REFB=-0.135831;REVB=0.0208275;RO=1;SAF=15;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302497;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215173;OID=.;OPOS=141531735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:42:43:1:0:41:43:1:26:15:1:0:26:17:0:0 chr5 141973349 . C G 549.49 PASS AF=0.536082;AO=51;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00198825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.081;QD=22.6593;RBI=0.00590808;REFB=-0.00704338;REVB=0.00556347;RO=45;SAF=20;SAR=31;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845229;STB=0.549899;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00507956;OID=.;OPOS=141973349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:45:51:52:0.536082:31:20:22:23:32:20:22:23 chr5 141973501 . T C 272.2 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00158282;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.323;QD=14.9148;RBI=0.00395607;REFB=-0.0105555;REVB=-0.00362563;RO=42;SAF=9;SAR=22;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2054;STB=0.616942;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0166137;OID=.;OPOS=141973501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:42:42:31:31:0.424658:22:9:20:22:22:9:20:22 chr5 142254679 . A G 1116.93 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.154;QD=60.3746;RBI=0.0156566;REFB=0;REVB=-0.00702392;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.54351e-05;OID=.;OPOS=142254679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:43:31:0:0:43:31:0:0 chr5 142421415 . T G 1022.99 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00388866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.309;QD=59.304;RBI=0.0163024;REFB=0;REVB=0.0158318;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70689e-05;OID=.;OPOS=142421415;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:33:34:0:0:35:34:0:0 chr5 142593652 . C T 1030.46 PASS AF=0.985915;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.304;QD=58.0539;RBI=0.0350496;REFB=-0.125588;REVB=0.0320637;RO=0;SAF=59;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504131;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.000543167;OID=.;OPOS=142593652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:71:0:1:69:70:0.985915:10:59:0:0:10:60:1:0 chr5 143059433 . T C 639.22 PASS AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0122038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9878;QD=55.5839;RBI=0.0252793;REFB=-0.0347114;REVB=0.0221384;RO=3;SAF=25;SAR=18;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309703;STB=0.516521;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0133311;OID=.;OPOS=143059433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:46:46:3:3:43:43:0.934783:18:25:1:2:18:25:1:2 chr5 143200053 . C T 191.63 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0315427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.326;QD=15.6429;RBI=0.0611524;REFB=0.00164826;REVB=-0.0523896;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741956;STB=0.542578;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=-0.00531961;OID=.;OPOS=143200053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:11:9:11:18:11:9:11:18 chr5 145199593 . ATTTTTTTAC ATTTTTTAAC,ATTTTTTAC,ATTTTTTACT 89.71 PASS AF=0,0.553191,0.0638298;AO=2,20,3;DP=57;FAO=0,26,3;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=0,5,3;FSAR=0,21,0;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0208263,0.262255,0.0338276;FXX=0.189622;HRUN=7,7,7;LEN=1,1,3;MLLD=13.1746,6.84107,34.3802;QD=7.63478;RBI=0.0539015,0.263372,0.0375558;REFB=-0.0815935,-0.16601,-0.0037563;REVB=0.0497156,0.0242286,0.0163137;RO=16;SAF=2,1,3;SAR=0,19,0;SRF=6;SRR=10;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.589174,-0.549312,0.661837;STB=0.5,0.611556,0.996836;STBP=1,0.111,0.039;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0,0.199611,-0.102728;OID=.,.,.;OPOS=145199600,145199594,145199600;OREF=T,T,TAC;OALT=A,-,ACT;OMAPALT=ATTTTTTAAC,ATTTTTTAC,ATTTTTTACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.553191,0.0638298:2,20,3:57:0,26,3:47:18:0,5,3:0,21,0:7:11:46:16:2,1,3:0,19,0:6:10 chr5 145246085 . T G 2713.49 PASS AF=1;AO=170;DP=171;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.809;QD=62.0226;RBI=0.0112658;REFB=0;REVB=-0.00179929;RO=0;SAF=90;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.86729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10391e-06;OID=.;OPOS=145246085;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:171:175:0:0:170:175:1:80:90:0:0:81:94:0:0 chr5 145393364 . C T 755.83 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106187;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.595;QD=57.0438;RBI=0.0176323;REFB=0;REVB=0.0140762;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27964e-05;OID=.;OPOS=145393364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0 chr5 145439647 . T C 1160.4 PASS AF=1;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166092;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.502;QD=61.0737;RBI=0.017077;REFB=0;REVB=-0.00396979;RO=0;SAF=23;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.59522e-05;OID=.;OPOS=145439647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:76:0:0:76:76:1:53:23:0:0:53:23:0:0 chr5 145442133 . G A 165.87 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0115912;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.328;QD=11.4392;RBI=0.0156541;REFB=-0.00766653;REVB=-0.0105212;RO=36;SAF=6;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189982;STB=0.604291;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0182896;OID=.;OPOS=145442133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:36:37:21:21:0.362069:15:6:16:20:15:6:16:21 chr5 145442203 . G C 201.98 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0410952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6816;QD=12.0587;RBI=0.0411896;REFB=0.0149108;REVB=0.00278716;RO=42;SAF=12;SAR=13;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301062;STB=0.517351;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.02437;OID=.;OPOS=145442203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:13:12:19:23:13:12:19:23 chr5 145477855 . T C 560.51 PASS AF=0.487603;AO=58;DP=120;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0101374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.594;QD=18.5294;RBI=0.0132609;REFB=-0.0232484;REVB=-0.00854901;RO=61;SAF=30;SAR=28;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690083;STB=0.537351;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0267392;OID=.;OPOS=145477855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:61:62:58:59:0.487603:28:30:27:34:29:30:27:35 chr5 145483844 . A T 180.09 PASS AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00391329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.861;QD=11.0821;RBI=0.0148685;REFB=0.000942246;REVB=-0.0143443;RO=42;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151048;STB=0.58769;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.00117612;OID=.;OPOS=145483844;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:10:13:18:24:10:13:18:24 chr5 145499996 . C T 391.96 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0135447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8191;QD=16.8586;RBI=0.0635981;REFB=0.0105443;REVB=-0.062139;RO=51;SAF=21;SAR=20;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604569;STB=0.539007;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0165313;OID=.;OPOS=145499996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:52:41:41:0.44086:20:21:23:28:20:21:23:29 chr5 145508340 . A G 545.29 PASS AF=0.487179;AO=56;DP=116;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.035607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.896;QD=18.6425;RBI=0.0377965;REFB=-0.00996656;REVB=0.0126773;RO=60;SAF=28;SAR=28;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155517;STB=0.504049;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0145151;OID=.;OPOS=145508340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:60:60:56:57:0.487179:28:28:31:29:28:29:31:29 chr5 145508636 . TA CC 231.08 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0281999;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=144.258;QD=16.5061;RBI=0.0283982;REFB=-0.00666428;REVB=-0.00335001;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451535;STB=0.533308;STBP=0.675;TYPE=mnp;VARB=0.00741555;OID=.;OPOS=145508636;OREF=TA;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:30:26:26:0.464286:12:14:17:12:12:14:18:12 chr5 145519821 . G A 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0696411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.191;QD=18.4829;RBI=0.0706299;REFB=-0.0203308;REVB=-0.0117771;RO=21;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123789;STB=0.507035;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0199925;OID=.;OPOS=145519821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:12:7:8:13:12:7:8:13 chr5 145523105 . G A 187.56 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00496901;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5507;QD=19.2366;RBI=0.00555738;REFB=0.023967;REVB=-0.00248866;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418943;STB=0.538004;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.0258025;OID=.;OPOS=145523105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:21:20:19:19:0.487179:10:9:9:12:10:9:8:12 chr5 145539996 . T G 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0104368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1629;QD=11.8305;RBI=0.0628926;REFB=-0.00625206;REVB=0.0620206;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307581;STB=0.683863;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0116097;OID=.;OPOS=145539996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:8:3:10:8:8:3:10:8 chr5 145543972 . G A 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0129196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.855;QD=17.3254;RBI=0.0343864;REFB=-0.00423468;REVB=-0.031867;RO=25;SAF=7;SAR=13;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132289;STB=0.57568;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00893826;OID=.;OPOS=145543972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:13:7:12:13:13:7:12:13 chr5 145890028 . A G 729.45 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.921;QD=57.212;RBI=0.0370076;REFB=0;REVB=0.0288134;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113002;OID=.;OPOS=145890028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:23:27:0:0:24:27:0:0 chr5 145895246 . G A 292.42 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0416659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.904;QD=14.6209;RBI=0.0463956;REFB=-0.00922524;REVB=0.0204084;RO=47;SAF=14;SAR=19;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238095;STB=0.513505;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0117825;OID=.;OPOS=145895246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:19:14:21:26:19:14:21:26 chr5 145935658 . G A 2005.32 PASS AF=0.992366;AO=128;DP=129;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0180062;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.611;QD=61.2311;RBI=0.0181798;REFB=-0.0847349;REVB=-0.00250646;RO=1;SAF=56;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655489;STB=0.503401;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000192864;OID=.;OPOS=145935658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:129:131:1:1:128:130:0.992366:72:56:0:1:73:57:0:1 chr5 146092191 . TG T 231.46 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0508108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.3501;QD=12.5114;RBI=0.0577167;REFB=0.00260545;REVB=0.0273766;RO=39;SAF=22;SAR=13;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296891;STB=0.665566;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=-0.00424552;OID=.;OPOS=146092192;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.472973:35:74:35:74:39:22:13:12:27:99:39:22:13:12:27 chr5 146092291 . C G 404.47 PASS AF=0.442105;AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00658565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.216;QD=17.0302;RBI=0.0069397;REFB=0.000947546;REVB=0.00218831;RO=53;SAF=15;SAR=27;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192683;STB=0.608243;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.000862318;OID=.;OPOS=146092291;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:53:42:42:0.442105:27:15:29:24:27:15:29:24 chr5 146460691 . T A 230.41 PASS AF=0.363636;AO=27;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0093187;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0611;QD=11.9692;RBI=0.0191937;REFB=-0.0127904;REVB=-0.0167798;RO=47;SAF=16;SAR=11;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359458;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0189333;OID=.;OPOS=146460691;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:47:49:27:28:0.363636:11:16:28:19:12:16:28:21 chr5 146619206 . G C 919.73 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.179;QD=58.3953;RBI=0.0379757;REFB=0;REVB=0.0300707;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263338;OID=.;OPOS=146619206;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:23:39:0:0:23:40:0:0 chr5 146971253 . C T 73.22 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6089;QD=36.608;RBI=0.0600273;REFB=0;REVB=-0.0580531;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119935;OID=.;OPOS=146971253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:6:1:0:0:6:2:0:0 chr5 147012291 . G A 421.26 PASS AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.00422663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1276;QD=15.8967;RBI=0.0293722;REFB=-0.00968136;REVB=-0.0290665;RO=59;SAF=19;SAR=28;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154658;STB=0.586587;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00889604;OID=.;OPOS=147012291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:59:47:47:0.443396:28:19:33:26:28:19:33:26 chr5 147024476 . C A 661.28 PASS AF=0.463576;AO=70;DP=151;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=-0.00105204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.042;QD=17.5173;RBI=0.00687951;REFB=-0.000188438;REVB=-0.00679859;RO=80;SAF=41;SAR=29;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473156;STB=0.523296;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.000218832;OID=.;OPOS=147024476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:80:81:70:70:0.463576:29:41:43:37:29:41:44:37 chr5 147024509 . C T 509.81 PASS AF=0.454545;AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.0174445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9328;QD=16.8533;RBI=0.0503518;REFB=0.0150216;REVB=-0.0472334;RO=65;SAF=32;SAR=23;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00279668;STB=0.503392;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.0494199;OID=.;OPOS=147024509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:66:55:55:0.454545:23:32:38:27:23:32:38:28 chr5 147286054 . G A 920.46 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.359;QD=58.4416;RBI=0.0483142;REFB=0;REVB=0.0446065;RO=0;SAF=20;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219614;OID=.;OPOS=147286054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:41:20:0:0:43:20:0:0 chr5 147466001 . G A 244.94 PASS AF=0.391892;AO=28;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0126292;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.148;QD=13.2401;RBI=0.0140295;REFB=-0.00930309;REVB=-0.00610979;RO=45;SAF=20;SAR=8;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211858;STB=0.628389;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0184219;OID=.;OPOS=147466001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:28:29:0.391892:8:20:24:21:8:21:24:21 chr5 147468614 . A G 562.51 PASS AF=0.547368;AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.00118645;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7276;QD=23.6844;RBI=0.00120051;REFB=-0.023702;REVB=-0.000183175;RO=44;SAF=28;SAR=24;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182311;STB=0.59547;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0297195;OID=.;OPOS=147468614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:44:43:52:52:0.547368:24:28:14:30:24:28:14:29 chr5 147475386 . A G 448.83 PASS AF=0.438596;AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=-0.00986849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.26;QD=15.7483;RBI=0.0428019;REFB=0.00150554;REVB=0.0416487;RO=64;SAF=32;SAR=18;SRF=45;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703916;STB=0.539284;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000695899;OID=.;OPOS=147475386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:64:64:50:50:0.438596:18:32:45:19:18:32:45:19 chr5 147477551 . C T 548.16 PASS AF=0.5;AO=54;DP=114;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.00598336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.551;QD=19.2336;RBI=0.009501;REFB=-0.00846291;REVB=-0.00738027;RO=57;SAF=26;SAR=28;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106338;STB=0.561156;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00872854;OID=.;OPOS=147477551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:57:57:54:57:0.5:28:26:34:23:30:27:34:23 chr5 147480027 . G A 281.2 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0263299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.054;QD=19.393;RBI=0.0494468;REFB=-0.0232192;REVB=0.0418535;RO=27;SAF=18;SAR=12;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194838;STB=0.616361;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0139365;OID=.;OPOS=147480027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:27:28:30:30:0.517241:12:18:10:17:12:18:10:18 chr5 147480080 . G A 352.55 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00446316;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.175;QD=18.0793;RBI=0.0398224;REFB=-0.00665914;REVB=-0.0395715;RO=41;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00124094;STB=0.500693;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00642662;OID=.;OPOS=147480080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:41:41:37:37:0.474359:18:19:21:20:18:19:21:20 chr5 147480112 . T C 438.07 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00320309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.928;QD=21.9035;RBI=0.00340211;REFB=-0.0063767;REVB=-0.00114654;RO=36;SAF=21;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00961681;STB=0.511622;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00457988;OID=.;OPOS=147480112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:36:37:43:43:0.5375:22:21:18:18:22:21:19:18 chr5 147480955 . A G 194.87 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.001812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.5168;QD=17.322;RBI=0.0125596;REFB=-0.00941744;REVB=0.0124282;RO=25;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30398;STB=0.672251;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0193877;OID=.;OPOS=147480955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:8:12:7:18:8:12:7:18 chr5 147481430 . A G 415.9 PASS AF=0.368421;AO=48;DP=122;FAO=49;FDP=133;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.0539272;FXX=0.0148137;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.9369;QD=12.5082;RBI=0.0630068;REFB=-0.0343838;REVB=0.0325841;RO=74;SAF=25;SAR=23;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664852;STB=0.510791;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0433033;OID=.;OPOS=147481430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:133:74:84:48:49:0.368421:23:25:39:35:23:26:46:38 chr5 147486677 . C A 505.09 PASS AF=0.486486;AO=52;DP=108;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0166277;FXX=0.0347796;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6825;QD=18.2014;RBI=0.0640092;REFB=-0.053141;REVB=-0.0618118;RO=56;SAF=27;SAR=25;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179782;STB=0.504503;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0501031;OID=.;OPOS=147486677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:56:57:52:54:0.486486:25:27:28:28:27:27:29:28 chr5 147488367 . C T 229.47 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0203932;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.236;QD=11.6188;RBI=0.0205373;REFB=-0.0100028;REVB=0.00242853;RO=50;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164146;STB=0.585958;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0298122;OID=.;OPOS=147488367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:50:51:28:28:0.35443:15:13:16:34:15:13:17:34 chr5 147492461 . T C 643.38 PASS AF=0.567568;AO=62;DP=110;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00191759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.36;QD=23.185;RBI=0.0114568;REFB=-0.0123672;REVB=0.0112951;RO=47;SAF=35;SAR=27;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765112;STB=0.533189;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00979594;OID=.;OPOS=147492461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:47:48:62:63:0.567568:27:35:22:25:28:35:23:25 chr5 147498019 . G A 508.67 PASS AF=0.376543;AO=61;DP=161;FAO=61;FDP=162;FR=.;FRO=101;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=0.000404185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.489;QD=12.5598;RBI=0.0197483;REFB=-0.00311077;REVB=-0.0197442;RO=99;SAF=27;SAR=34;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101317;STB=0.563439;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00552839;OID=.;OPOS=147498019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:99:101:61:61:0.376543:34:27:53:46:34:27:55:46 chr5 147499616 . C T 280.03 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0144786;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.952;QD=14.0017;RBI=0.0215756;REFB=-0.0188226;REVB=-0.0159961;RO=43;SAF=19;SAR=13;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609562;STB=0.506458;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00871687;OID=.;OPOS=147499616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:48:32:32:0.4:13:19:23:20:13:19:28:20 chr5 147499670 . C T 304.13 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00426204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.144;QD=17.379;RBI=0.0124896;REFB=0.00617645;REVB=-0.0117399;RO=37;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557516;STB=0.531231;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-0.00568594;OID=.;OPOS=147499670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:15:18:18:19:15:18:18:19 chr5 147505116 . G A 265.26 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0214842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.663;QD=15.6036;RBI=0.0313452;REFB=-0.0192374;REVB=-0.0228244;RO=38;SAF=12;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543063;STB=0.503065;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0231028;OID=.;OPOS=147505116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:18:12:15:23:18:12:15:23 chr5 147510866 . T C 632.76 PASS AF=0.496124;AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.00351944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.224;QD=19.6205;RBI=0.0210631;REFB=-0.0169577;REVB=0.020767;RO=65;SAF=37;SAR=27;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189221;STB=0.60434;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0131867;OID=.;OPOS=147510866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:65:65:64:64:0.496124:27:37:24:41:27:37:24:41 chr5 147516598 . T C 229.44 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0152798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.028;QD=14.1192;RBI=0.0262374;REFB=-0.00966663;REVB=-0.0213291;RO=38;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144698;STB=0.582031;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0241209;OID=.;OPOS=147516598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:14:13:13:25:14:13:13:25 chr5 147554889 . A C 945.11 PASS AF=0.423237;AO=102;DP=241;FAO=102;FDP=241;FR=.;FRO=139;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=65;FSRR=74;FWDB=0.0134927;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.247;QD=15.6864;RBI=0.0136848;REFB=-0.0181397;REVB=0.00228503;RO=139;SAF=52;SAR=50;SRF=65;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435998;STB=0.524308;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.022021;OID=.;OPOS=147554889;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:139:139:102:102:0.423237:50:52:65:74:50:52:65:74 chr5 147593497 . C A 711.29 PASS AF=0.460606;AO=76;DP=165;FAO=76;FDP=165;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=0.00113564;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.61;QD=17.2434;RBI=0.0201858;REFB=-0.00273238;REVB=-0.0201538;RO=89;SAF=42;SAR=34;SRF=46;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350261;STB=0.51943;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00304241;OID=.;OPOS=147593497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:89:89:76:76:0.460606:34:42:46:43:34:42:46:43 chr5 147703416 . C T 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00552128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.224;QD=57.2368;RBI=0.0115793;REFB=0;REVB=-0.0101782;RO=0;SAF=18;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19125e-05;OID=.;OPOS=147703416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:38:18:0:0:38:18:0:0 chr5 147805120 . T C 361.01 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.000460068;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.981;QD=20.0562;RBI=0.00673428;REFB=-0.00086168;REVB=-0.00671855;RO=36;SAF=14;SAR=23;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111091;STB=0.567864;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000756998;OID=.;OPOS=147805120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:36:35:37:37:0.513889:23:14:18:18:23:14:18:17 chr5 147822069 . A T 424.17 PASS AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0237785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.895;QD=15.149;RBI=0.0265647;REFB=-0.00528837;REVB=-0.0118434;RO=64;SAF=28;SAR=20;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0054457;STB=0.503057;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00674458;OID=.;OPOS=147822069;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:64:64:48:48:0.428571:20:28:37:27:20:28:37:27 chr5 147856333 . G A 327.74 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0201327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.722;QD=15.2438;RBI=0.0201585;REFB=-0.00347556;REVB=-0.00102138;RO=50;SAF=15;SAR=21;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01769;STB=0.509994;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00556932;OID=.;OPOS=147856333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:21:15:20:30:21:15:20:30 chr5 148042230 . G T 632.25 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.957;QD=61.6826;RBI=0.0142626;REFB=0;REVB=-0.00874944;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01671e-05;OID=.;OPOS=148042230;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:29:11:0:0:29:12:0:0 chr5 148206473 . G C 846.8 PASS AF=0.939394;AO=56;DP=68;FAO=62;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0209803;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.362;QD=51.3213;RBI=0.11496;REFB=-0.204014;REVB=0.113029;RO=5;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796799;STB=0.528562;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00284668;OID=.;OPOS=148206473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:68:66:5:4:56:62:0.939394:27:29:0:5:33:29:0:4 chr5 148206646 . G A 1549.79 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.294;QD=63.909;RBI=0.074323;REFB=0;REVB=0.0443239;RO=0;SAF=44;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123005;OID=.;OPOS=148206646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:52:44:0:0:53:44:0:0 chr5 148206917 . C A 1266.84 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=88;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00383538;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.754;QD=58.2455;RBI=0.0135357;REFB=-0.0836392;REVB=0.0129809;RO=1;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129756;STB=0.508359;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.000927372;OID=.;OPOS=148206917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:88:87:1:3:84:84:0.965517:36:48:0:1:36:48:1:2 chr5 148207447 . G C 1914.99 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.754;QD=61.774;RBI=0.0418179;REFB=0;REVB=0.0124391;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45745e-05;OID=.;OPOS=148207447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:74:50:0:0:74:50:0:0 chr5 148207633 . G A 520.02 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.264;QD=59.4305;RBI=0.0261696;REFB=0;REVB=0.00123372;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223546;OID=.;OPOS=148207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr5 148207667 . C CCG,CG 204.01 PASS AF=0.529412,0.470588;AO=9,7;DP=17;FAO=9,8;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=9,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=11,0;LEN=2,1;MLLD=313.237,312.722;QD=48.0024;RBI=0.00314049,0.00348839;REFB=0,0;REVB=-0.00314049,-0.00348839;RO=1;SAF=0,0;SAR=9,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00961036,-0.0137951;OID=.,.;OPOS=148207668,148207668;OREF=-,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CCG,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.529412,0.470588:9,7:17:9,8:17:0:0,0:9,8:0:0:25:1:0,0:9,7:0:1 chr5 148386525 . T C 221.09 PASS AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=12;FWDB=-0.0293495;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.047;QD=11.9508;RBI=0.029497;REFB=-0.021016;REVB=-0.00294546;RO=47;SAF=17;SAR=10;SRF=35;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142726;STB=0.581599;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0290885;OID=.;OPOS=148386525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:47:47:27:27:0.364865:10:17:35:12:10:17:35:12 chr5 148406973 . G A 83.57 PASS AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00755166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.569;QD=20.8932;RBI=0.0131356;REFB=-0.036249;REVB=0.0107478;RO=6;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249643;STB=0.644839;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.012434;OID=.;OPOS=148406973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:8:2:3:3:8:2:3:3 chr5 148407708 . A C 762.31 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0429;QD=63.5255;RBI=0.00894277;REFB=0;REVB=-0.00818873;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128158;OID=.;OPOS=148407708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:24:23:0:0:24:24:0:0 chr5 148407945 . C T 232.08 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00221738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.231;QD=12.3775;RBI=0.0110646;REFB=0.000683855;REVB=-0.0108402;RO=46;SAF=12;SAR=16;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778441;STB=0.551687;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00113342;OID=.;OPOS=148407945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:47:28:28:0.373333:16:12:23:23:16:12:24:23 chr5 148578636 . T C 530.55 PASS AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00264236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.126;QD=20.6038;RBI=0.00590439;REFB=-0.00224972;REVB=0.00528013;RO=47;SAF=28;SAR=26;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785575;STB=0.542698;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00243977;OID=.;OPOS=148578636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:47:49:54:54:0.524272:26:28:20:27:26:28:21:28 chr5 148610276 . C A 1079.92 PASS AF=0.488889;AO=109;DP=225;FAO=110;FDP=225;FR=.;FRO=115;FSAF=38;FSAR=72;FSRF=53;FSRR=62;FWDB=-0.00608551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.598;QD=19.1986;RBI=0.00626577;REFB=-0.0275183;REVB=-0.00149211;RO=110;SAF=37;SAR=72;SRF=49;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103853;STB=0.562682;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0297871;OID=.;OPOS=148610276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:110:115:109:110:0.488889:72:37:49:61:72:38:53:62 chr5 148627252 . G A 391.74 PASS AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=-0.0170036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.696;QD=19.345;RBI=0.029486;REFB=-0.00228492;REVB=-0.0240894;RO=41;SAF=12;SAR=28;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120511;STB=0.566532;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00188543;OID=.;OPOS=148627252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:41:41:40:40:0.493827:28:12:8:33:28:12:8:33 chr5 148720087 . T G 594.38 PASS AF=0.521739;AO=56;DP=112;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0737746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.472;QD=20.674;RBI=0.075585;REFB=-0.0275295;REVB=0.016444;RO=55;SAF=20;SAR=36;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584457;STB=0.526145;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0267537;OID=.;OPOS=148720087;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:55:55:56:60:0.521739:36:20:23:32:38:22:23:32 chr5 148989122 . C T 160.7 PASS AF=0.323944;AO=19;DP=67;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00390858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.826;QD=9.05362;RBI=0.00817477;REFB=-0.0115787;REVB=0.00717982;RO=48;SAF=5;SAR=14;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276491;STB=0.625701;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0180874;OID=.;OPOS=148989122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:71:48:48:19:23:0.323944:14:5:23:25:16:7:23:25 chr5 149001551 . A C 205.36 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0158834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.026;QD=14.6684;RBI=0.016969;REFB=-0.0192726;REVB=0.00597186;RO=31;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254187;STB=0.523861;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0207006;OID=.;OPOS=149001551;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:32:24:24:0.428571:11:13:16:15:11:13:16:16 chr5 149008403 . A G 1414.91 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.688;QD=62.8847;RBI=0.019027;REFB=0;REVB=-3.95552e-05;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.78883e-05;OID=.;OPOS=149008403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:43:46:0:0:43:47:0:0 chr5 149008467 . C A 424.21 PASS AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0193896;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.438;QD=15.1503;RBI=0.023062;REFB=-0.00670702;REVB=0.012486;RO=63;SAF=19;SAR=29;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832279;STB=0.542763;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00757616;OID=.;OPOS=149008467;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:64:48:48:0.428571:29:19:30:33:29:19:30:34 chr5 149008484 . G A 637.29 PASS AF=0.57;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.00141857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.054;QD=25.4914;RBI=0.00468593;REFB=-0.0160506;REVB=-0.00446605;RO=43;SAF=25;SAR=32;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724365;STB=0.539555;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00875279;OID=.;OPOS=149008484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:43:43:57:57:0.57:32:25:15:28:32:25:15:28 chr5 149008521 . A G 1156.84 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252725;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.138;QD=60.8864;RBI=0.0252867;REFB=0;REVB=0.000847215;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24991e-05;OID=.;OPOS=149008521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:46:30:0:0:46:30:0:0 chr5 149212430 . G A 329.89 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.000470838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.836;QD=18.8508;RBI=0.00376374;REFB=-0.0242473;REVB=0.00373418;RO=35;SAF=17;SAR=18;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772778;STB=0.542973;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0196796;OID=.;OPOS=149212430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:18:17:14:21:18:17:14:21 chr5 149212510 . C A 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0165532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.927;QD=11.2569;RBI=0.0246722;REFB=-0.0251244;REVB=0.0182951;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0366984;OID=.;OPOS=149212510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:3:9:6:2:3:9 chr5 149216256 . C T 190.22 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0857634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8858;QD=21.7392;RBI=0.0903185;REFB=-0.0271368;REVB=-0.0283207;RO=16;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386818;STB=0.521716;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0185005;OID=.;OPOS=149216256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:8:11:10:6:8:11:10:6 chr5 149216304 . C T 121.54 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0122819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.387;QD=15.1918;RBI=0.0219163;REFB=-0.0209264;REVB=0.0181515;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156724;STB=0.509078;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0270142;OID=.;OPOS=149216304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:6:8:10:8:6:8:10:8 chr5 149323772 . G A 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0243603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.468;QD=11.3693;RBI=0.0251013;REFB=-0.0100419;REVB=-0.00605392;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933329;STB=0.555457;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.013833;OID=.;OPOS=149323772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:12:7:5:6:12:7 chr5 149323905 . CT TG 234.94 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0404887;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=57.3399;QD=15.4061;RBI=0.0848579;REFB=0.00853105;REVB=-0.0745756;RO=34;SAF=6;SAR=21;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955967;STB=0.554413;STBP=0.528;TYPE=mnp;VARB=-0.0136439;OID=.;OPOS=149323905;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:21:6:10:24:21:6:10:24 chr5 149360877 . T C 1019.8 PASS AF=1;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141624;FXX=0.0422476;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3594;QD=59.9883;RBI=0.0362284;REFB=0;REVB=0.0333455;RO=0;SAF=20;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115214;OID=.;OPOS=149360877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:68:0:0:68:68:1:48:20:0:0:48:20:0:0 chr5 149374876 . CTTCT CTCT,CTTC 265.98 PASS AF=0.22,0.5;AO=10,24;DP=51;FAO=11,25;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=11,8;FSAR=0,17;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0519746,-0.090949;FXX=0.019604;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=20.9171,22.4939;QD=21.2781;RBI=0.0680951,0.0970435;REFB=-0.061534,0.0388052;REVB=-0.0439952,0.0338485;RO=14;SAF=10,8;SAR=0,16;SRF=1;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.854387,0.21434;STB=0.999127,0.610609;STBP=0,0.124;TYPE=del,del;VARB=0.0854415,0.0301619;OID=.,.;OPOS=149374877,149374880;OREF=T,T;OALT=-,-;OMAPALT=CTCT,CTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.22,0.5:10,24:51:11,25:50:14:11,8:0,17:1:13:73:14:10,8:0,16:1:13 chr5 149374932 . T C 261.89 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0090945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.733;QD=14.7543;RBI=0.00961346;REFB=-0.00110879;REVB=-0.00311589;RO=39;SAF=9;SAR=21;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201257;STB=0.61694;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.000536029;OID=.;OPOS=149374932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:39:41:30:30:0.422535:21:9:19:20:21:9:20:21 chr5 149406271 . C T 262.43 PASS AF=0.54;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00445672;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.299;QD=20.9946;RBI=0.00509858;REFB=-0.0518959;REVB=0.00247653;RO=26;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125827;STB=0.52939;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0374675;OID=.;OPOS=149406271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:50:26:23:27:27:0.54:18:9:9:17:18:9:9:14 chr5 149450132 . T C 266.16 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=-0.0622559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.806;QD=21.293;RBI=0.0625098;REFB=-0.0191439;REVB=0.00562871;RO=25;SAF=5;SAR=20;SRF=3;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121576;STB=0.567518;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.020963;OID=.;OPOS=149450132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:20:5:3:22:20:5:3:22 chr5 149493472 . C T 856.92 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241116;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.096;QD=58.096;RBI=0.00386064;REFB=0;REVB=-0.0030151;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51305e-05;OID=.;OPOS=149493472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chr5 149495050 . T C 3872.34 PASS AF=0.984;AO=246;DP=250;FAO=246;FDP=250;FR=.;FRO=4;FSAF=131;FSAR=115;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00257757;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=323.157;QD=61.9575;RBI=0.0146664;REFB=-0.0549737;REVB=0.0144382;RO=4;SAF=131;SAR=115;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00864524;STB=0.504536;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=5.05552e-05;OID=.;OPOS=149495050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:250:250:4:4:246:246:0.984:115:131:1:3:115:131:1:3 chr5 149563715 . T C 1029.65 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0961046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5381;QD=58.0085;RBI=0.120676;REFB=0.0764904;REVB=-0.0729834;RO=1;SAF=44;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106256;STB=0.505616;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.0075951;OID=.;OPOS=149563715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:26:44:1:0:26:44:1:0 chr5 149583300 . T C 365.21 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0688952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3805;QD=52.1727;RBI=0.0868052;REFB=-0.106227;REVB=-0.0528072;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488676;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00158622;OID=.;OPOS=149583300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:18:9:1:0:18:9:1:0 chr5 149583336 . T C 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00581255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.013;QD=53.9107;RBI=0.0172084;REFB=0;REVB=0.016197;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.71989e-05;OID=.;OPOS=149583336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0 chr5 149585025 . A C 759.92 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-3.0757e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.712;QD=56.2904;RBI=0.00108637;REFB=0;REVB=0.00108593;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404869;OID=.;OPOS=149585025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:23:31:0:0 chr5 149597160 . A G 817.72 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6838;QD=57.3837;RBI=0.0167843;REFB=0;REVB=0.0118626;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179365;OID=.;OPOS=149597160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:57:0:0:55:57:1:19:36:0:0:20:37:0:0 chr5 149644597 . T G 2606.3 PASS AF=1;AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385246;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.872;QD=62.0549;RBI=0.0109332;REFB=0;REVB=0.010232;RO=0;SAF=87;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99687e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.17385e-06;OID=.;OPOS=149644597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:169:168:0:0:168:168:1:81:87:0:0:81:87:0:0 chr5 149652632 . G A 557.71 PASS AF=0.487395;AO=58;DP=120;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.0037051;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.176;QD=18.7466;RBI=0.0168371;REFB=-0.00817658;REVB=0.0164244;RO=61;SAF=21;SAR=37;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154867;STB=0.585868;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00679048;OID=.;OPOS=149652632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:61:61:58:58:0.487395:37:21:32:29:37:21:32:29 chr5 149677851 . A G 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00513975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.352;QD=61.2128;RBI=0.0250055;REFB=0;REVB=0.0244715;RO=0;SAF=24;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35326e-05;OID=.;OPOS=149677851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:55:24:0:0:55:24:0:0 chr5 149825159 . G C 185.93 PASS AF=0.454545;AO=17;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0588187;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=65.4042;QD=16.9029;RBI=0.104624;REFB=-0.0203028;REVB=-0.0865243;RO=13;SAF=15;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401811;STB=0.780764;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0209063;OID=.;OPOS=149825159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:13:24:17:20:0.454545:2:15:7:6:3:17:10:14 chr5 149919739 . G C 526.84 PASS AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.00467798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.517;QD=24.504;RBI=0.0128132;REFB=-0.0162885;REVB=-0.0119287;RO=36;SAF=31;SAR=18;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170527;STB=0.599572;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0100935;OID=.;OPOS=149919739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:36:37:49:49:0.569767:18:31:15:21:18:31:15:22 chr5 149932822 . C T 623.68 PASS AF=0.571429;AO=56;DP=98;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.02016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.375;QD=25.4561;RBI=0.0366861;REFB=-0.0282749;REVB=0.0306504;RO=42;SAF=34;SAR=22;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104785;STB=0.557356;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0197201;OID=.;OPOS=149932822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:42:42:56:56:0.571429:22:34:20:22:22:34:20:22 chr5 149998128 . G A 180.88 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0229569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.195;QD=13.9142;RBI=0.0327804;REFB=-0.0145008;REVB=-0.0233994;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655719;STB=0.545412;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0265679;OID=.;OPOS=149998128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:12:9:11:19:12:9:11:20 chr5 150051958 . T C 1980.55 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.069;QD=61.8922;RBI=0.035046;REFB=0;REVB=0.0208746;RO=0;SAF=68;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33106e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29184e-05;OID=.;OPOS=150051958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:128:0:0:126:128:1:58:68:0:0:58:70:0:0 chr5 150097883 . G C 200.85 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0148192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.49;QD=20.6004;RBI=0.0153045;REFB=-0.00716345;REVB=-0.00382315;RO=19;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286187;STB=0.516113;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00894215;OID=.;OPOS=150097883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:8:12:12:7:8:12:12:7 chr5 150136032 . A G 130.67 PASS AF=0.608696;AO=13;DP=22;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0332288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4244;QD=22.725;RBI=0.116312;REFB=-0.0321873;REVB=0.111464;RO=9;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225945;STB=0.633961;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0254295;OID=.;OPOS=150136032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:22:23:9:9:13:14:0.608696:7:6:7:2:8:6:7:2 chr5 150158164 . C G 267.95 PASS AF=0.407895;AO=30;DP=75;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.0130217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.613;QD=14.1025;RBI=0.0150302;REFB=-0.0115279;REVB=0.00750616;RO=45;SAF=18;SAR=12;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745215;STB=0.553158;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0169477;OID=.;OPOS=150158164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:45:45:30:31:0.407895:12:18:30:15:13:18:30:15 chr5 150158199 . C T 257.15 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0889968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3984;QD=13.7146;RBI=0.0983453;REFB=-0.0136798;REVB=0.0418494;RO=44;SAF=16;SAR=14;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133754;STB=0.567524;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0173115;OID=.;OPOS=150158199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:45:30:30:0.4:14:16:29:15:14:16:29:16 chr5 150158226 . A C 179.74 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.076193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.703;QD=15.6298;RBI=0.0762943;REFB=-0.0190722;REVB=0.00393108;RO=25;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243098;STB=0.612131;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0292436;OID=.;OPOS=150158226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:46:25:27:19:19:0.413043:10:9:18:7:10:9:18:9 chr5 150227966 . C A 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0066476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.45;QD=17.1002;RBI=0.0172309;REFB=-0.0189334;REVB=0.0158969;RO=15;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103377;STB=0.559499;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0232664;OID=.;OPOS=150227966;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:5:9:8:7:5:9:8:7 chr5 150227998 . C T 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0101337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8484;QD=18.2488;RBI=0.0438547;REFB=0.029209;REVB=0.0426678;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205785;STB=0.616277;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=-0.0243641;OID=.;OPOS=150227998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:10:2:5:8:10:2 chr5 150257616 . A G 359.85 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0236453;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.5799;QD=31.9863;RBI=0.0577673;REFB=0.00729136;REVB=-0.0527063;RO=14;SAF=15;SAR=15;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832231;STB=0.555519;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00394054;OID=.;OPOS=150257616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:14:15:30:30:0.666667:15:15:9:5:15:15:10:5 chr5 150275787 . C T 89.55 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00286489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.684;QD=15.5741;RBI=0.0414373;REFB=-0.0215049;REVB=-0.0413381;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309957;STB=0.691998;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0355465;OID=.;OPOS=150275787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:12:11:11:0.478261:5:6:2:9:5:6:2:10 chr5 150311773 . T C 353.24 PASS AF=0.414894;AO=36;DP=91;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.0125076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3365;QD=15.0314;RBI=0.0127244;REFB=-0.00919089;REVB=0.00233859;RO=55;SAF=19;SAR=17;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116961;STB=0.543444;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0158094;OID=.;OPOS=150311773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:94:55:55:36:39:0.414894:17:19:35:20:17:22:35:20 chr5 150323428 . A G 591.84 PASS AF=0.563107;AO=58;DP=103;FAO=58;FDP=103;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0155537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.898;QD=22.9842;RBI=0.0217754;REFB=-0.0150963;REVB=0.0152398;RO=45;SAF=24;SAR=34;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610267;STB=0.533413;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0131103;OID=.;OPOS=150323428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:45:45:58:58:0.563107:34:24:22:23:34:24:22:23 chr5 150407456 . T C 3117.5 PASS AF=0.98995;AO=195;DP=198;FAO=197;FDP=199;FR=.;FRO=2;FSAF=119;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0112133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.825;QD=62.6633;RBI=0.0398456;REFB=0.010387;REVB=0.0382352;RO=2;SAF=117;SAR=78;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00807082;STB=0.504166;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-6.32809e-05;OID=.;OPOS=150407456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:198:199:2:2:195:197:0.98995:78:117:2:0:78:119:2:0 chr5 150409477 . T C 165.18 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0026667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.859;QD=12.4666;RBI=0.0151422;REFB=0.00100424;REVB=0.0149055;RO=32;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217008;STB=0.614414;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00185649;OID=.;OPOS=150409477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:33:20:20:0.377358:9:11:11:21:9:11:12:21 chr5 150410219 . C A 225.87 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00650772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.465;QD=15.577;RBI=0.00681344;REFB=-0.00491562;REVB=-0.00201806;RO=32;SAF=9;SAR=17;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125812;STB=0.571372;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00608408;OID=.;OPOS=150410219;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:17:9:15:17:17:9:15:17 chr5 150480520 . C T 526.11 PASS AF=0.491228;AO=56;DP=114;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0166776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6476;QD=18.4598;RBI=0.0168187;REFB=-0.0415771;REVB=-0.00217428;RO=57;SAF=13;SAR=43;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226529;STB=0.632302;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0440432;OID=.;OPOS=150480520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:57:58:56:56:0.491228:43:13:25:32:43:13:26:32 chr5 150489390 . A G 352.86 PASS AF=0.553846;AO=35;DP=64;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0229107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.182;QD=21.7146;RBI=0.0286756;REFB=-0.00406439;REVB=0.0172449;RO=29;SAF=18;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822353;STB=0.550697;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00424663;OID=.;OPOS=150489390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:29:29:35:36:0.553846:17:18:12:17:17:19:12:17 chr5 150518988 . G A 322.4 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0112471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.479;QD=16.5335;RBI=0.0194275;REFB=-0.00714424;REVB=-0.0158407;RO=43;SAF=19;SAR=16;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00787006;STB=0.504422;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00866494;OID=.;OPOS=150518988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:16:19:23:20:16:19:23:20 chr5 150565008 . C T 96.17 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0585774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9055;QD=12.0217;RBI=0.081491;REFB=0.0302473;REVB=0.0566523;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527134;STB=0.531198;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=-0.0417986;OID=.;OPOS=150565008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:6:6:11:9:6:6:11:9 chr5 150578574 . A G 204.72 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0120171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.851;QD=16.3772;RBI=0.0180936;REFB=-0.0103045;REVB=-0.0135265;RO=28;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264576;STB=0.529383;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00772484;OID=.;OPOS=150578574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:29:21:21:0.42:14:7:10:18:14:7:11:18 chr5 150639409 . A G 1533.31 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112053;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.598;QD=63.888;RBI=0.0112556;REFB=0;REVB=0.00106367;RO=0;SAF=36;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18687e-06;OID=.;OPOS=150639409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:60:36:0:0:60:36:0:0 chr5 150639439 . A G 1347.29 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.356;QD=61.9446;RBI=0.020903;REFB=0;REVB=0.0136627;RO=0;SAF=37;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193111;OID=.;OPOS=150639439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:86:87:1:49:37:0:0:50:37:0:0 chr5 150647012 . A G 455.99 PASS AF=0.475728;AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0344773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.227;QD=17.7085;RBI=0.0467249;REFB=-0.0207808;REVB=-0.0315362;RO=54;SAF=33;SAR=16;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836756;STB=0.546624;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0298724;OID=.;OPOS=150647012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:54:49:49:0.475728:16:33:32:22:16:33:32:22 chr5 150667016 . T C 1749.92 PASS AF=0.967213;AO=118;DP=122;FAO=118;FDP=122;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.030291;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=258.776;QD=57.3744;RBI=0.0308515;REFB=-0.0585056;REVB=0.00585449;RO=3;SAF=47;SAR=71;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131375;STB=0.503473;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.000322907;OID=.;OPOS=150667016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:122:122:3:4:118:118:0.967213:71:47:2:1:71:47:2:2 chr5 150696447 . C T 1728.59 PASS AF=0.975;AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0579954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8199;QD=57.6197;RBI=0.0872431;REFB=0.00579664;REVB=-0.0651759;RO=1;SAF=48;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979137;STB=0.506607;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.000778249;OID=.;OPOS=150696447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:119:120:1:3:117:117:0.975:69:48:1:0:69:48:2:1 chr5 150696498 . G A 1695.26 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00685853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.303;QD=60.5451;RBI=0.0280203;REFB=0;REVB=0.0271679;RO=0;SAF=54;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3955e-05;OID=.;OPOS=150696498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:112:0:0:110:112:1:56:54:0:0:58:54:0:0 chr5 150696540 . C T 1103.04 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199637;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.535;QD=60.4405;RBI=0.0211805;REFB=0;REVB=-0.00707551;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31266e-05;OID=.;OPOS=150696540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:41:32:0:0:41:32:0:0 chr5 150704975 . G A 563.05 PASS AF=0.483607;AO=58;DP=121;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0938825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8781;QD=18.4606;RBI=0.102963;REFB=-0.020196;REVB=0.0422777;RO=63;SAF=30;SAR=28;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236505;STB=0.517236;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0208364;OID=.;OPOS=150704975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:63:63:58:59:0.483607:28:30:31:32:28:31:31:32 chr5 150723806 . G A 1296.56 PASS AF=0.966292;AO=84;DP=87;FAO=86;FDP=89;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00568609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9419;QD=58.2725;RBI=0.00573681;REFB=0.0252119;REVB=0.000761162;RO=3;SAF=25;SAR=59;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284367;STB=0.513656;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.0059114;OID=.;OPOS=150723806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:87:89:3:3:84:86:0.966292:59:25:2:1:59:27:2:1 chr5 150886725 . G A 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9938;QD=57.2352;RBI=0.122795;REFB=0;REVB=-0.119156;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000958275;OID=.;OPOS=150886725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr5 150886882 . G A 3174.56 PASS AF=1;AO=198;DP=199;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124014;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.333;QD=63.8102;RBI=0.0187589;REFB=-0.0251668;REVB=0.0140748;RO=1;SAF=89;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0053214;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197442;OID=.;OPOS=150886882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:199:199:1:0:198:199:1:109:89:1:0:109:90:0:0 chr5 150891733 . A G 794.04 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.899;QD=63.5229;RBI=0.0101334;REFB=0;REVB=0.00219188;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179229;OID=.;OPOS=150891733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:21:28:0:0:22:28:0:0 chr5 150901111 . A G 1285.2 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.825;QD=61.2001;RBI=0.0274858;REFB=0;REVB=0.00452113;RO=0;SAF=54;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177111;OID=.;OPOS=150901111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:28:54:0:0:28:56:0:0 chr5 150901261 . C T 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.718;QD=58.5865;RBI=0.0399268;REFB=0;REVB=0.0205775;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263362;OID=.;OPOS=150901261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr5 150901300 . G A 464.97 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.74;QD=58.1214;RBI=0.0516745;REFB=0;REVB=0.0394895;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30569e-05;OID=.;OPOS=150901300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr5 150901612 . C CG 558.43 PASS AF=1;AO=5;DP=45;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550556;FXX=0.0681663;HRUN=0;LEN=1;MLLD=77.5357;QD=54.4808;RBI=0.090203;REFB=0;REVB=0.0714525;RO=37;SAF=5;SAR=0;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.608582;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00114085;OID=.;OPOS=150901613;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:5:45:41:41:0:25:16:0:0:3:37:5:0:20:17 chr5 150901613 . A G 552.13 PASS AF=0.909091;AO=37;DP=41;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00875134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.187;QD=50.194;RBI=0.065154;REFB=-0.040103;REVB=0.0645636;RO=4;SAF=21;SAR=16;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812383;STB=0.543457;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00179359;OID=.;OPOS=150901613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:41:44:4:4:37:40:0.909091:16:21:4:0:19:21:4:0 chr5 150914184 . A T 1441.22 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334438;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.002;QD=63.3504;RBI=0.0103462;REFB=0;REVB=-0.00979075;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.34114e-05;OID=.;OPOS=150914184;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:91:0:0:91:91:1:48:43:0:0:48:43:0:0 chr5 150923405 . A G 817.72 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6343;QD=57.3839;RBI=0.0721702;REFB=0;REVB=-0.0673634;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110993;OID=.;OPOS=150923405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0 chr5 150924769 . G A 97.27 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0409119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.85;QD=12.969;RBI=0.0458156;REFB=-0.0127993;REVB=-0.0206225;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113436;STB=0.566558;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0170626;OID=.;OPOS=150924769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:7:11:6:6:7:11 chr5 150925144 . A G 299.62 PASS AF=0.54;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0122277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.956;QD=23.9699;RBI=0.0436879;REFB=-0.0156049;REVB=0.0419418;RO=21;SAF=17;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186611;STB=0.591459;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0117449;OID=.;OPOS=150925144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:21:23:26:27:0.54:9:17:9:12:10:17:10:13 chr5 150942919 . A G 740.48 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.482;QD=56.9603;RBI=0.0191346;REFB=0;REVB=0.00591305;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69229e-05;OID=.;OPOS=150942919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:25:26:0:0:25:27:0:0 chr5 150946966 . G A 1818.33 PASS AF=0.984;AO=112;DP=114;FAO=123;FDP=125;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00366075;FXX=0.00793588;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.8603;QD=58.1866;RBI=0.0366097;REFB=0.0181523;REVB=0.0364262;RO=2;SAF=72;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130052;STB=0.506848;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.000837287;OID=.;OPOS=150946966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:114:125:2:2:112:123:0.984:40:72:2:0:51:72:2:0 chr5 150948016 . C T 222.03 PASS AF=0.42623;AO=27;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0327539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0837;QD=14.5593;RBI=0.0380032;REFB=0.00359632;REVB=0.0192725;RO=33;SAF=11;SAR=16;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136109;STB=0.513608;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00360005;OID=.;OPOS=150948016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:35:27:26:0.42623:16:11:13:20:15:11:14:21 chr5 151043103 . G C 169.16 PASS AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0476518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3607;QD=12.0831;RBI=0.0648645;REFB=-0.0266546;REVB=0.0440081;RO=34;SAF=14;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273799;STB=0.650457;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0370595;OID=.;OPOS=151043103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:34:35:21:21:0.375:7:14:14:20:7:14:15:20 chr5 151083909 . T C 456.49 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00740931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.024;QD=53.7042;RBI=0.103367;REFB=-0.158257;REVB=0.103101;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716363;STB=0.518507;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000675742;OID=.;OPOS=151083909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:2:1:32:33:0.970588:12:20:0:2:13:20:0:1 chr5 151084036 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.542;QD=59.143;RBI=0.0462338;REFB=0;REVB=0.0388996;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255858;OID=.;OPOS=151084036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0 chr5 151255217 . C T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.602;QD=58.9623;RBI=0.0235207;REFB=0;REVB=0.0232584;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97046e-05;OID=.;OPOS=151255217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0 chr5 151771817 . C T 3124.51 PASS AF=1;AO=195;DP=195;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.653;QD=63.7656;RBI=0.0336969;REFB=0;REVB=0.0308429;RO=0;SAF=95;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.62898e-05;OID=.;OPOS=151771817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:195:196:0:0:195:196:1:100:95:0:0:101:95:0:0 chr5 151784183 . G A 275.79 PASS AF=0.491803;AO=29;DP=60;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0100626;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.869;QD=18.0848;RBI=0.0108189;REFB=-0.0271186;REVB=-0.00397409;RO=31;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880828;STB=0.557485;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0349083;OID=.;OPOS=151784183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:31:31:29:30:0.491803:13:16:20:11:14:16:20:11 chr5 153413390 . C T 1402.35 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313556;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.444;QD=63.0268;RBI=0.00379925;REFB=0;REVB=0.00214536;RO=0;SAF=36;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42678e-05;OID=.;OPOS=153413390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:53:36:0:0:53:36:0:0 chr5 153429459 . T C 1971.26 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7167;QD=62.0869;RBI=0.050784;REFB=0;REVB=0.0345977;RO=0;SAF=58;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191241;OID=.;OPOS=153429459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:127:0:0:125:127:1:67:58:0:0:68:59:0:0 chr5 153432733 . T C 613.32 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.572;QD=61.3323;RBI=0.0122321;REFB=0;REVB=0.00715658;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64249e-05;OID=.;OPOS=153432733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chr5 153432970 . C T 1245.62 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1286;QD=61.5122;RBI=0.02232;REFB=0;REVB=0.0193658;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11119e-05;OID=.;OPOS=153432970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:37:44:0:0:37:44:0:0 chr5 153729217 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.295;QD=56.9569;RBI=0.0183066;REFB=0;REVB=0.000856844;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80779e-05;OID=.;OPOS=153729217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0 chr5 153783753 . C T 648.12 PASS AF=0.503876;AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0111351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.946;QD=20.0969;RBI=0.0129666;REFB=-0.021056;REVB=0.00664388;RO=63;SAF=28;SAR=37;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026791;STB=0.519104;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0212129;OID=.;OPOS=153783753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:63:64:65:65:0.503876:37:28:29:34:37:28:30:34 chr5 153788991 . G C 657.86 PASS AF=0.462069;AO=67;DP=145;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.00130013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.22;QD=18.148;RBI=0.00728636;REFB=-0.00176796;REVB=-0.00716943;RO=78;SAF=26;SAR=41;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135432;STB=0.575265;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00218581;OID=.;OPOS=153788991;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:78:78:67:67:0.462069:41:26:41:37:41:26:41:37 chr5 154171530 . G C 287.29 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0305399;FXX=0.0579626;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.482;QD=17.6792;RBI=0.0343091;REFB=-0.0145231;REVB=-0.0156343;RO=34;SAF=11;SAR=20;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113314;STB=0.563632;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0171833;OID=.;OPOS=154171530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:65:34:34:31:31:0.476923:20:11:16:18:20:11:16:18 chr5 154209024 . A G 587.04 PASS AF=0.469231;AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00972172;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.215;QD=18.0629;RBI=0.0202931;REFB=-0.0250374;REVB=-0.0178128;RO=68;SAF=37;SAR=24;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171901;STB=0.599158;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0262057;OID=.;OPOS=154209024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:68:69:61:61:0.469231:24:37:29:39:24:37:29:40 chr5 154268902 . C T 1062.28 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2622;QD=59.847;RBI=0.0854588;REFB=0;REVB=0.0836857;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414452;OID=.;OPOS=154268902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:41:30:0:0:41:30:0:0 chr5 154271948 . G A 1183.33 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6526;QD=59.9155;RBI=0.0363061;REFB=0;REVB=0.0348614;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104781;OID=.;OPOS=154271948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:35:43:0:0:36:43:0:0 chr5 154275786 . G A 264.69 PASS AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0247534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5851;QD=13.0713;RBI=0.0260281;REFB=-0.00080136;REVB=0.00804574;RO=50;SAF=12;SAR=19;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227963;STB=0.630248;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00096382;OID=.;OPOS=154275786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:50:50:31:31:0.382716:19:12:30:20:19:12:30:20 chr5 154282235 . T C 81.62 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0460992;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.6065;QD=10.2019;RBI=0.0553187;REFB=-0.0093049;REVB=-0.030578;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231162;STB=0.613842;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0126889;OID=.;OPOS=154282235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:32:32:20:21:11:11:0.34375:6:5:5:15:6:5:6:15 chr5 154291409 . C T 337.05 PASS AF=0.564516;AO=34;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0186193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.342;QD=21.7454;RBI=0.0710109;REFB=-0.00551282;REVB=0.0685264;RO=28;SAF=14;SAR=20;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141176;STB=0.519988;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.00524993;OID=.;OPOS=154291409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:27:34:35:0.564516:20:14:12:16:21:14:12:15 chr5 154300940 . A C 346.72 PASS AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0400191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.7;QD=22.3689;RBI=0.0421435;REFB=0.0278107;REVB=0.0132115;RO=27;SAF=22;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605768;STB=0.533443;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.021859;OID=.;OPOS=154300940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:13:22:15:12:13:22:15:12 chr5 154306972 . T C 431.86 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.013429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.183;QD=18.7764;RBI=0.0155585;REFB=-0.012659;REVB=0.00785679;RO=46;SAF=19;SAR=25;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432223;STB=0.524989;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0204487;OID=.;OPOS=154306972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:48:44:44:0.478261:25:19:22:24:25:19:23:25 chr5 154346259 . A G 517.28 PASS AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00776646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.522;QD=25.2332;RBI=0.0124037;REFB=-0.0114909;REVB=-0.00967131;RO=34;SAF=26;SAR=22;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120285;STB=0.565762;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00772768;OID=.;OPOS=154346259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:22:26:13:21:22:26:13:21 chr5 154395158 . G T 223.57 PASS AF=0.397059;AO=26;DP=67;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0269452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.915;QD=13.1514;RBI=0.0269669;REFB=-0.00400724;REVB=0.00108179;RO=41;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172016;STB=0.606639;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0067744;OID=.;OPOS=154395158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:41:41:26:27:0.397059:11:15:17:24:11:16:17:24 chr5 155771579 . T C 655.03 PASS AF=0.485294;AO=66;DP=136;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.00862245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.419;QD=19.2657;RBI=0.0119215;REFB=-0.0147182;REVB=0.00823258;RO=59;SAF=34;SAR=32;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639418;STB=0.506914;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0137234;OID=.;OPOS=155771579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:59:70:66:66:0.485294:32:34:26:33:32:34:37:33 chr5 156187774 . A G 350.89 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00147534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.276;QD=20.6404;RBI=0.0177159;REFB=-0.0111893;REVB=0.0176544;RO=29;SAF=24;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157035;STB=0.583286;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0108509;OID=.;OPOS=156187774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:32:36:36:0.529412:12:24:14:15:12:24:16:16 chr5 156191515 . C T 239.65 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0868392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.9431;QD=18.0872;RBI=0.0868488;REFB=0.0135041;REVB=-0.00128949;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144759;STB=0.567477;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=-0.0234658;OID=.;OPOS=156191515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:15:11:7:19:15:11:8:19 chr5 156346464 . G A 457.55 PASS AF=0.505618;AO=44;DP=88;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0647138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4799;QD=20.5641;RBI=0.073577;REFB=0.00300857;REVB=-0.0350101;RO=44;SAF=21;SAR=23;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14293;STB=0.583297;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.00481742;OID=.;OPOS=156346464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:44:44:44:45:0.505618:23:21:28:16:24:21:28:16 chr5 156376703 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0053221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.335;QD=46.848;RBI=0.00858321;REFB=0;REVB=-0.006734;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16996e-05;OID=.;OPOS=156376703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr5 156479424 . A C 2272.05 PASS AF=0.993377;AO=149;DP=153;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100823;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.923;QD=60.1868;RBI=0.0342512;REFB=-0.0114995;REVB=0.0327336;RO=1;SAF=81;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069433;STB=0.503649;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000206635;OID=.;OPOS=156479424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:153:151:1:1:149:150:0.993377:68:81:0:1:68:82:0:1 chr5 156479426 . T C 681.35 PASS AF=0.464968;AO=73;DP=158;FAO=73;FDP=157;FR=.;FRO=84;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.00814766;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.173;QD=17.3593;RBI=0.0127329;REFB=-0.0127413;REVB=-0.00978476;RO=84;SAF=38;SAR=35;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608983;STB=0.533733;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0173556;OID=.;OPOS=156479426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:84:84:73:73:0.464968:35:38:49:35:35:38:49:35 chr5 156479509 . A G 2590.55 PASS AF=1;AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130788;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.634;QD=62.049;RBI=0.0182179;REFB=0;REVB=0.0126822;RO=0;SAF=85;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02973e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70947e-05;OID=.;OPOS=156479509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:167:167:0:0:167:167:1:82:85:0:0:82:85:0:0 chr5 156479557 . GTTGGAACAGTCGTCA G,GTTGGAACAGTCGTTG,GTTGGAACAGTCGTTGTCA,GTTGGAACAGTTGTCG 1367.94 PASS AF=0.252525,0.040404,0.585859,0.121212;AO=24,8,52,11;DP=111;FAO=25,4,58,12;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0,12,1;FSAR=10,4,46,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446932,0.0250988,0.0353285,-0.00460205;FXX=0.0747594;HRUN=2,1,1,1;LEN=15,2,3,5;MLLD=138.762,218.787,253.814,83.1015;QD=55.2704;RBI=0.0462239,0.029874,0.0404499,0.0354651;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.0117972,-0.0162021,0.0197001,-0.0351653;RO=0;SAF=14,0,11,1;SAR=10,8,41,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,mnp,ins,mnp;VARB=0.00639759,0.0233101,0.0231007,0.012773;OID=.,.,.,.;OPOS=156479558,156479571,156479569,156479568;OREF=TTGGAACAGTCGTCA,CA,-,CGTCA;OALT=-,TG,GTT,TGTCG;OMAPALT=G,GTTGGAACAGTCGTTG,GTTGGAACAGTCGTTGTCA,GTTGGAACAGTTGTCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.252525,0.040404,0.585859,0.121212:24,8,52,11:111:25,4,58,12:99:0:15,0,12,1:10,4,46,11:0:0:99:0:14,0,11,1:10,8,41,10:0:0 chr5 156479596 . A ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA 50.0 PASS AO=47;DP=194;LEN=69;RO=147;SAF=17;SAR=53;SRF=81;SRR=43;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=156479596;OREF=-;OALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGA;OMAPALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:194:147:47:53:17:81:43 chr5 156482459 . G T 1153.54 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1542;QD=60.7125;RBI=0.0333564;REFB=0;REVB=-0.00798541;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000343941;OID=.;OPOS=156482459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0 chr5 156531736 . C A 786.85 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0441281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.978;QD=55.2178;RBI=0.0464217;REFB=-0.120075;REVB=0.0144113;RO=1;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200576;STB=0.510634;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00107866;OID=.;OPOS=156531736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:23:33:0:1:23:33:0:1 chr5 156589901 . C T 278.39 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0149044;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.1018;QD=21.8347;RBI=0.019049;REFB=-0.0169897;REVB=-0.0118627;RO=22;SAF=22;SAR=6;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656933;STB=0.556378;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0129355;OID=.;OPOS=156589901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:22:23:28:28:0.54902:6:22:16:6:6:22:16:7 chr5 156626907 . C T 245.23 PASS AF=0.337079;AO=30;DP=89;FAO=30;FDP=89;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=16;FWDB=-0.00902383;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.025;QD=11.0218;RBI=0.00951699;REFB=-0.0149689;REVB=-0.00302384;RO=59;SAF=16;SAR=14;SRF=43;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230801;STB=0.632385;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0269713;OID=.;OPOS=156626907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:59:59:30:30:0.337079:14:16:43:16:14:16:43:16 chr5 156644939 . G A 97.3 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0127508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.093;QD=12.9731;RBI=0.0241434;REFB=-0.0144117;REVB=-0.0205017;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120689;STB=0.571306;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0204985;OID=.;OPOS=156644939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:8:4:8:10:8:4:8:10 chr5 156715652 . G C 426.69 PASS AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0040908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.64;QD=19.1769;RBI=0.00959427;REFB=-0.0364637;REVB=0.00867844;RO=46;SAF=29;SAR=14;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191373;STB=0.606777;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0250804;OID=.;OPOS=156715652;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:46:43:43:0.483146:14:29:22:24:14:29:22:24 chr5 156721863 . T TC 847.38 PASS AF=1;AO=80;DP=94;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00625043;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4569;QD=37.6613;RBI=0.0764016;REFB=-0.0152033;REVB=0.0761455;RO=11;SAF=50;SAR=30;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192145;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000763561;OID=.;OPOS=156721864;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:80:94:90:90:0:55:35:0:0:14:11:50:30:6:5 chr5 156747669 . A G 417.74 PASS AF=0.435185;AO=47;DP=108;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.0196947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.387;QD=15.4718;RBI=0.0214686;REFB=-0.0235655;REVB=0.00854516;RO=60;SAF=22;SAR=25;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114947;STB=0.568599;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0263228;OID=.;OPOS=156747669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:60:61:47:47:0.435185:25:22:35:25:25:22:36:25 chr5 156770209 . G A 557.71 PASS AF=0.544554;AO=55;DP=101;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00550736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.786;QD=22.0875;RBI=0.0163526;REFB=-0.0125613;REVB=-0.0153973;RO=46;SAF=20;SAR=35;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624774;STB=0.534338;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0125376;OID=.;OPOS=156770209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:46:46:55:55:0.544554:35:20:20:26:35:20:20:26 chr5 156898690 . A G 1664.39 PASS AF=1;AO=95;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00210099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.858;QD=60.5231;RBI=0.0360757;REFB=0;REVB=0.0360145;RO=0;SAF=60;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103905;OID=.;OPOS=156898690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:110:0:0:95:110:1:35:60:0:0:48:62:0:0 chr5 156899869 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0099927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.613;QD=35.5759;RBI=0.0100711;REFB=0;REVB=0.00125409;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200809;OID=.;OPOS=156899869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr5 156904633 . C T 747.0 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.773;QD=55.333;RBI=0.0121467;REFB=0;REVB=-0.000432477;RO=1;SAF=21;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219051;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293231;OID=.;OPOS=156904633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:1:0:53:54:1:32:21:1:0:32:22:0:0 chr5 157078475 . C G 572.36 PASS AF=0.419355;AO=65;DP=155;FAO=65;FDP=155;FR=.;FRO=90;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=51;FWDB=0.023034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3561;QD=14.7706;RBI=0.0539302;REFB=-0.000215293;REVB=0.0487637;RO=88;SAF=39;SAR=26;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161701;STB=0.596869;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00156393;OID=.;OPOS=157078475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:88:90:65:65:0.419355:26:39:39:49:26:39:39:51 chr5 157098756 . G T 428.33 PASS AF=0.615385;AO=41;DP=68;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0233046;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.657;QD=26.3587;RBI=0.024521;REFB=-0.0248291;REVB=-0.00762722;RO=23;SAF=19;SAR=22;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385237;STB=0.517312;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.012689;OID=.;OPOS=157098756;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:65:23:25:41:40:0.615385:22:19:12:11:21:19:13:12 chr5 157102185 . A G 161.03 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.000298427;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.943;QD=16.9503;RBI=0.0137992;REFB=-0.00742669;REVB=0.013796;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872856;STB=0.549942;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0122155;OID=.;OPOS=157102185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:8:9:13:8:8:9:13:8 chr5 157106968 . C T 122.91 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00609032;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.84;QD=14.8986;RBI=0.0288323;REFB=-0.00706338;REVB=0.0281818;RO=18;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108014;STB=0.54539;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0245665;OID=.;OPOS=157106968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:7:7:11:7:7:7:11:8 chr5 157164962 . T C 582.39 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0299128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2852;QD=58.2385;RBI=0.0638236;REFB=-0.0269971;REVB=0.0563797;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.50847;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0044786;OID=.;OPOS=157164962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:29:10:0:0:29:10:0:1 chr5 157183739 . G A 1098.08 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107021;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.4355;QD=60.1688;RBI=0.0264296;REFB=0;REVB=0.0241659;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90006e-05;OID=.;OPOS=157183739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0 chr5 157183770 . C T 937.47 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7338;QD=58.5918;RBI=0.0194381;REFB=0;REVB=8.51266e-05;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102877;OID=.;OPOS=157183770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr5 157213497 . A G 2110.63 PASS AF=0.978571;AO=137;DP=141;FAO=137;FDP=140;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=51;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0637303;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.893;QD=60.3038;RBI=0.06776;REFB=-0.0362623;REVB=0.0230188;RO=3;SAF=86;SAR=51;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016293;STB=0.50857;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000286011;OID=.;OPOS=157213497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:141:140:3:3:137:137:0.978571:51:86:3:0:51:86:3:0 chr5 158204425 . A G 1589.88 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.668;QD=59.9956;RBI=0.0190063;REFB=0;REVB=0.00358826;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.43836e-05;OID=.;OPOS=158204425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:55:51:0:0:55:51:0:0 chr5 159344461 . G A 601.61 PASS AF=0.473282;AO=62;DP=132;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.00915944;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.741;QD=18.3696;RBI=0.0137325;REFB=-0.0133687;REVB=0.0102316;RO=68;SAF=32;SAR=30;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00134447;STB=0.502958;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0161789;OID=.;OPOS=159344461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:68:69:62:62:0.473282:30:32:35:33:30:32:36:33 chr5 159505208 . C A 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.372;QD=60.229;RBI=0.0306574;REFB=0;REVB=0.0104546;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177928;OID=.;OPOS=159505208;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr5 159659273 . C T 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0246083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.013;QD=20.0175;RBI=0.0346902;REFB=0.00799133;REVB=0.0244508;RO=17;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731248;STB=0.541355;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.0158243;OID=.;OPOS=159659273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:8:10:8:9:8:10:8:9 chr5 159665599 . G A 190.05 PASS AF=0.308642;AO=23;DP=79;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.00825603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.972;QD=9.38493;RBI=0.0150414;REFB=-0.0103229;REVB=0.012573;RO=56;SAF=12;SAR=11;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110661;STB=0.590125;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0172904;OID=.;OPOS=159665599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:81:56:56:23:25:0.308642:11:12:24:32:11:14:24:32 chr5 159679636 . C T 389.9 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0212709;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.589;QD=21.3641;RBI=0.0261276;REFB=0.000244222;REVB=-0.0151723;RO=34;SAF=18;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818778;STB=0.54524;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=-0.000265282;OID=.;OPOS=159679636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:34:34:39:39:0.534247:21:18:19:15:21:18:19:15 chr5 159680046 . T C 206.09 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0506407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6848;QD=16.8235;RBI=0.0506712;REFB=0.0073324;REVB=0.00175906;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196221;STB=0.601061;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00825828;OID=.;OPOS=159680046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:28:21:21:0.428571:9:12:10:17:9:12:11:17 chr5 159686503 . G A 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00569279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.098;QD=14.6498;RBI=0.00569376;REFB=-0.0123824;REVB=-0.000105013;RO=19;SAF=11;SAR=3;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681781;STB=0.539818;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0141755;OID=.;OPOS=159686503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:3:11:14:5:3:11:14:5 chr5 159696554 . A G 235.25 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00682464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7744;QD=25.4327;RBI=0.0150148;REFB=-0.0383453;REVB=-0.0133742;RO=15;SAF=13;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918485;STB=0.551075;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.012203;OID=.;OPOS=159696554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:9:13:7:8:9:13:7:8 chr5 159718987 . C T 379.79 PASS AF=0.425743;AO=42;DP=99;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.00783847;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=186.216;QD=15.0412;RBI=0.0100513;REFB=0.00433523;REVB=0.00629176;RO=57;SAF=20;SAR=22;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567089;STB=0.542916;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=-0.00526058;OID=.;OPOS=159718987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:57:58:42:43:0.425743:22:20:24:33:22:21:24:34 chr5 159775741 . G A 1544.05 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2283;QD=63.6722;RBI=0.0398139;REFB=0;REVB=-0.0248764;RO=0;SAF=64;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.25775e-05;OID=.;OPOS=159775741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:33:64:0:0:33:64:0:0 chr5 159776047 . A G 254.34 PASS AF=0.6;AO=21;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0303683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.126;QD=25.4335;RBI=0.0361481;REFB=-0.0259085;REVB=0.0196076;RO=17;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517698;STB=0.50854;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0109159;OID=.;OPOS=159776047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:17:16:21:24:0.6:11:10:7:10:14:10:7:9 chr5 159776637 . C T 279.88 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0524882;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.8126;QD=22.8469;RBI=0.0639818;REFB=-0.00137965;REVB=0.0365877;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975814;STB=0.545419;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00236526;OID=.;OPOS=159776637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:23:26:26:0.530612:10:16:11:11:10:16:12:11 chr5 159835658 . A G 550.6 PASS AF=0.402685;AO=60;DP=149;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.00103726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.499;QD=14.7813;RBI=0.00125656;REFB=-0.0305631;REVB=0.000709243;RO=89;SAF=32;SAR=28;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413587;STB=0.52329;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0400274;OID=.;OPOS=159835658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:89:89:60:60:0.402685:28:32:44:45:28:32:44:45 chr5 159901408 . C A 1235.53 PASS AF=0.857143;AO=92;DP=108;FAO=96;FDP=112;FR=.;FRO=16;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0299093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.112;QD=44.126;RBI=0.0299139;REFB=-0.0955513;REVB=-0.000525637;RO=16;SAF=48;SAR=44;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640102;STB=0.530114;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0144017;OID=.;OPOS=159901408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:108:112:16:16:92:96:0.857143:44:48:12:4:44:52:12:4 chr5 159912418 . C G 769.49 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0603349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.788;QD=56.9996;RBI=0.0615026;REFB=0;REVB=-0.0119276;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00083665;OID=.;OPOS=159912418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0 chr5 160097496 . A G 560.87 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100911;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3128;QD=60.6341;RBI=0.0246357;REFB=0;REVB=0.0224741;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63895e-05;OID=.;OPOS=160097496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0 chr5 160097632 . G A 573.16 PASS AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0369043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.878;QD=55.9177;RBI=0.0401645;REFB=-0.0153186;REVB=-0.0158511;RO=2;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323178;STB=0.517233;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00180627;OID=.;OPOS=160097632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:28:11:0:2:28:11:0:2 chr5 160716376 . CTTTTTTT CTTTTTT,CTTTTTTC 66.02 PASS AF=0.388889,0;AO=16,5;DP=55;FAO=21,0;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=12,0;FSAR=9,0;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.132825,0.0192024;FXX=0.0181785;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.47948,11.953;QD=4.89059;RBI=0.139824,0.166779;REFB=-0.0472028,-0.0365026;REVB=-0.0436863,-0.16567;RO=23;SAF=9,3;SAR=7,2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0858883,0.141867;STB=0.571361,0.5;STBP=0.417,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0199594,0.00784639;OID=.,.;OPOS=160716377,160716383;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.388889,0:16,5:55:21,0:54:33:12,0:9,0:15:18:63:23:9,3:7,2:11:12 chr5 161114522 . T C 203.07 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0118344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.729;QD=12.3073;RBI=0.01496;REFB=-0.00680252;REVB=-0.00915145;RO=41;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248832;STB=0.642746;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00911708;OID=.;OPOS=161114522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:10:15:15:26:10:15:15:26 chr5 161119071 . G T 1840.7 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5736;QD=61.3567;RBI=0.0142687;REFB=0;REVB=-0.00129199;RO=0;SAF=57;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11194e-05;OID=.;OPOS=161119071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:63:57:0:0:63:57:0:0 chr5 161119125 . C A,G 1747.24 PASS AF=0.0327869,0.942623;AO=5,113;DP=121;FAO=4,115;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=4,45;FSAR=0,70;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0237793,0.0226668;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.2201,101.894;QD=57.2865;RBI=0.0408286,0.0317504;REFB=-0.104094,-0.095973;REVB=-0.0331891,-0.0222328;RO=1;SAF=5,43;SAR=0,70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.767767,0.00673549;STB=0.995652,0.507323;STBP=0.214,0.301;TYPE=snp,snp;VARB=0.137026,0.00235948;OID=.,.;OPOS=161119125,161119125;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:121:122:1:3:5,113:4,115:0.0327869,0.942623:0,70:5,43:0:1:0,70:4,45:2:1 chr5 161128761 . C G 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0516865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6593;QD=61.6948;RBI=0.0543106;REFB=0;REVB=-0.0166779;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000498721;OID=.;OPOS=161128761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:38:44:0:0:38:44:0:0 chr5 161128914 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.681;QD=58.7817;RBI=0.00527713;REFB=0;REVB=-0.000279318;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.67098e-06;OID=.;OPOS=161128914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0 chr5 161281245 . T C 481.4 PASS AF=0.438017;AO=53;DP=121;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.00676471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.272;QD=15.9141;RBI=0.00822823;REFB=-0.00743008;REVB=0.00468428;RO=67;SAF=30;SAR=23;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118106;STB=0.570067;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00927207;OID=.;OPOS=161281245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:67:68:53:53:0.438017:23:30:30:37:23:30:30:38 chr5 161325934 . A C 754.23 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.91;QD=56.9229;RBI=0.0510525;REFB=0;REVB=0.038253;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107606;OID=.;OPOS=161325934;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:17:36:0:0:17:36:0:0 chr5 161495057 . G C 301.39 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0185438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.126;QD=19.4446;RBI=0.0265971;REFB=-0.0431707;REVB=0.0190665;RO=30;SAF=17;SAR=15;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897984;STB=0.549867;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0266553;OID=.;OPOS=161495057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:15:17:19:11:15:17:19:11 chr5 161528280 . C T 1512.51 PASS AF=1;AO=98;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.4;QD=59.9013;RBI=0.0265696;REFB=0;REVB=0.0214681;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71046e-05;OID=.;OPOS=161528280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:98:101:1:50:48:0:0:50:51:0:0 chr5 161582493 . CAT C 415.1 PASS AF=0.45;AO=41;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00684447;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.909;QD=16.6039;RBI=0.0164975;REFB=-0.0056474;REVB=0.0150107;RO=56;SAF=21;SAR=20;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241232;STB=0.508893;STBP=0.866;TYPE=del;VARB=0.00774373;OID=.;OPOS=161582494;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45:41:100:45:100:55:23:22:29:26:99:56:21:20:30:26 chr5 162210532 . A G 157.07 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0400223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.678;QD=16.1092;RBI=0.04403;REFB=-0.013362;REVB=0.0183536;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158032;STB=0.50908;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0159919;OID=.;OPOS=162210532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:10:12:9:8:10:12 chr5 162870726 . C G 355.11 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0889898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.804;QD=18.9394;RBI=0.0894186;REFB=0.0185325;REVB=-0.00874676;RO=38;SAF=20;SAR=17;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060878;STB=0.533892;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.0184025;OID=.;OPOS=162870726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:17:20:18:20:17:20:18:20 chr5 162884088 . TAAAAAAAAAAC TAAAAAAAAACA 104.68 PASS AF=0.916667;AO=4;DP=20;FAO=11;FDP=12;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=1;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.143124;FXX=0;HRUN=10;LEN=2;MLLD=26.84;QD=34.8943;RBI=0.251031;REFB=-0.0264267;REVB=-0.206233;RO=3;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490704;STB=0.666293;STBP=0.073;TYPE=mnp;VARB=-0.0026746;OID=.;OPOS=162884098;OREF=AC;OALT=CA;OMAPALT=TAAAAAAAAACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.916667:4:20:11:12:1:1:10:1:0:5:3:1:3:3:0 chr5 162890953 . G A 1116.95 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.548;QD=60.3754;RBI=0.037255;REFB=0;REVB=0.00117113;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.33772e-05;OID=.;OPOS=162890953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:37:36:0:0:38:36:0:0 chr5 162902516 . T C 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.062;QD=64.4153;RBI=0.0206525;REFB=0;REVB=0.00641214;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89407e-05;OID=.;OPOS=162902516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0 chr5 167645888 . T C 1344.0 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00879184;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1819;QD=62.5118;RBI=0.0618182;REFB=0;REVB=-0.0611898;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166877;OID=.;OPOS=167645888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:39:47:0:0:39:47:0:0 chr5 167674151 . C T 164.62 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0150221;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=120.993;QD=12.4242;RBI=0.0195272;REFB=0.00197732;REVB=-0.0124759;RO=32;SAF=11;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533249;STB=0.540602;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.00411608;OID=.;OPOS=167674151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:32:33:20:20:0.377358:9:11:16:16:9:11:16:17 chr5 167674370 . C T 367.78 PASS AF=0.544118;AO=36;DP=67;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.016399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.226;QD=21.6341;RBI=0.0513491;REFB=-0.0110926;REVB=0.0486601;RO=31;SAF=10;SAR=26;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320922;STB=0.68057;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0199322;OID=.;OPOS=167674370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:31:31:36:37:0.544118:26:10:20:11:27:10:20:11 chr5 167850748 . A G 2961.29 PASS AF=1;AO=185;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.1;QD=63.3432;RBI=0.0391588;REFB=0;REVB=0.00175479;RO=0;SAF=63;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.50217e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28377e-05;OID=.;OPOS=167850748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:185:187:0:0:185:187:1:122:63:0:0:122:65:0:0 chr5 167855129 . C T 1132.81 PASS AF=0.605882;AO=103;DP=171;FAO=103;FDP=170;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0174271;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.835;QD=26.6543;RBI=0.0238799;REFB=-0.0447941;REVB=-0.0163262;RO=66;SAF=39;SAR=64;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796393;STB=0.54661;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0263997;OID=.;OPOS=167855129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:66:67:103:103:0.605882:64:39:32:34:64:39:33:34 chr5 167868779 . A G 490.91 PASS AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0711246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.132;QD=19.2515;RBI=0.0711489;REFB=-0.0143193;REVB=0.0018582;RO=50;SAF=30;SAR=21;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108965;STB=0.510151;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0110638;OID=.;OPOS=167868779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:50:51:51:51:0.5:21:30:30:20:21:30:31:20 chr5 167868809 . C T 513.62 PASS AF=0.564706;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0782694;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.382;QD=24.1704;RBI=0.0783752;REFB=-0.000640095;REVB=0.00407155;RO=37;SAF=22;SAR=26;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865852;STB=0.547483;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000713391;OID=.;OPOS=167868809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:37:37:48:48:0.564706:26:22:21:16:26:22:21:16 chr5 167881029 . TGGA T 50.14 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0160111;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=3;MLLD=269.707;QD=13.3707;RBI=0.023792;REFB=-0.0171624;REVB=0.0175983;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.799039;STBP=0.063;TYPE=del;VARB=0.0261953;OID=.;OPOS=167881030;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:7:10:7:15:8:6:1:3:5:49:2:6:1:2:0 chr5 167913510 . G A 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.000261245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.409;QD=16.1724;RBI=0.0204345;REFB=-0.00259468;REVB=0.0204329;RO=20;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259529;STB=0.514907;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00379522;OID=.;OPOS=167913510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:10:6:7:13:10:6:7:13 chr5 167943827 . G A 362.57 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0125179;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.252;QD=20.4264;RBI=0.0165271;REFB=-0.0137395;REVB=0.010791;RO=33;SAF=19;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243978;STB=0.50647;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0101836;OID=.;OPOS=167943827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:33:34:37:37:0.521127:18:19:16:17:18:19:17:17 chr5 167957055 . G A 291.67 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=0.0157771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.92;QD=19.4444;RBI=0.0204262;REFB=-0.0149215;REVB=-0.0129736;RO=27;SAF=8;SAR=23;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837512;STB=0.557003;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0144212;OID=.;OPOS=167957055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:27:29:31:31:0.516667:23:8:5:22:23:8:5:24 chr5 168093522 . G A 107.33 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00326117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.086;QD=12.6271;RBI=0.0126489;REFB=-0.00785424;REVB=-0.0122213;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348754;STB=0.520516;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0135819;OID=.;OPOS=168093522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:6:7:12:9:6:7:12:9 chr5 168098463 . A G 563.59 PASS AF=0.974359;AO=39;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.275;QD=57.8036;RBI=0.015874;REFB=-0.104745;REVB=-0.00180116;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.513506;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=4.6452e-05;OID=.;OPOS=168098463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:0:1:39:38:0.974359:20:19:0:0:20:18:1:0 chr5 168176517 . A G 1204.65 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0500989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1463;QD=60.9947;RBI=0.083531;REFB=0;REVB=-0.0668395;RO=0;SAF=47;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000961307;OID=.;OPOS=168176517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:31:47:0:0:32:47:0:0 chr5 168180081 . C T 304.1 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.000248967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.858;QD=19.941;RBI=0.0208704;REFB=-0.0196281;REVB=0.0208689;RO=29;SAF=15;SAR=17;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120172;STB=0.506676;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0203749;OID=.;OPOS=168180081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:17:15:14:15:17:15:14:15 chr5 168212951 . A G 512.59 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.172901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5696;QD=58.5812;RBI=0.173542;REFB=0;REVB=0.0149054;RO=1;SAF=25;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182905;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146126;OID=.;OPOS=168212951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:35:1:0:30:35:1:5:25:1:0:5:30:0:0 chr5 168250350 . C G 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.083186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.386;QD=17.8276;RBI=0.0861259;REFB=-0.032678;REVB=-0.0223104;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253906;STB=0.645157;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0314759;OID=.;OPOS=168250350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:3:8:5:7:3:8 chr5 168671698 . A T 591.47 PASS AF=0.484127;AO=60;DP=126;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.0259009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.51;QD=18.7768;RBI=0.0292247;REFB=0.00241206;REVB=-0.0135362;RO=65;SAF=35;SAR=25;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199296;STB=0.604503;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00205301;OID=.;OPOS=168671698;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:65:65:60:61:0.484127:25:35:24:41:26:35:24:41 chr5 168690612 . A G 4298.15 PASS AF=1;AO=272;DP=272;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106254;FXX=0.0036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.387;QD=62.9765;RBI=0.0132656;REFB=0;REVB=-0.00794209;RO=0;SAF=143;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153511;OID=.;OPOS=168690612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:272:273:0:0:272:273:1:129:143:0:0:129:144:0:0 chr5 168690635 . C T 1218.98 PASS AF=0.497959;AO=119;DP=242;FAO=122;FDP=245;FR=.;FRO=123;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=67;FSRR=56;FWDB=0.0243516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1391;QD=19.9018;RBI=0.0287158;REFB=-0.0288606;REVB=-0.0152184;RO=120;SAF=60;SAR=59;SRF=64;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266492;STB=0.514245;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.018843;OID=.;OPOS=168690635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:245:120:123:119:122:0.497959:59:60:64:56:59:63:67:56 chr5 169021610 . C A,T 827.9 PASS AF=0.0172414,0.982759;AO=2,53;DP=55;FAO=1,57;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=1,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843243,0.0138821;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.1478,139.613;QD=57.0967;RBI=0.0436575,0.0965935;REFB=0,0;REVB=0.0428354,0.0955908;RO=0;SAF=0,25;SAR=2,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0398662,0.00153906;OID=.,.;OPOS=169021610,169021610;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:55:58:0:0:2,53:1,57:0.0172414,0.982759:2,28:0,25:0:0:1,32:0,25:0:0 chr5 169028481 . T C 1139.05 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00776682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.134;QD=59.1713;RBI=0.0405891;REFB=0.00181777;REVB=0.0398391;RO=1;SAF=39;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119796;STB=0.506327;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000137354;OID=.;OPOS=169028481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:37:39:1:0:37:39:1:0 chr5 169031150 . T C 2140.52 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00132234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.376;QD=62.9565;RBI=0.0150822;REFB=0;REVB=0.0150241;RO=0;SAF=63;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.57773e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76349e-05;OID=.;OPOS=169031150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:73:63:0:0:73:63:0:0 chr5 169129422 . A G 920.11 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020328;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.43;QD=58.4197;RBI=0.0205834;REFB=0;REVB=0.00323272;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13814e-05;OID=.;OPOS=169129422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:36:26:0:0:36:27:0:0 chr5 169310213 . A C 624.76 PASS AF=0.474074;AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=135;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.0011735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.011;QD=18.5113;RBI=0.00256888;REFB=0.000341406;REVB=0.00228517;RO=71;SAF=19;SAR=45;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265523;STB=0.647671;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000401919;OID=.;OPOS=169310213;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:71:71:64:64:0.474074:45:19:40:31:45:19:40:31 chr5 169435713 . A C 743.72 PASS AF=0.517986;AO=72;DP=139;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.00171397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.048;QD=21.402;RBI=0.0266107;REFB=-0.021886;REVB=-0.0265554;RO=67;SAF=34;SAR=38;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839456;STB=0.504612;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0198696;OID=.;OPOS=169435713;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:67:67:72:72:0.517986:38:34:31:36:38:34:31:36 chr5 169454941 . C G 283.95 PASS AF=0.365591;AO=31;DP=90;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0048866;FXX=0.0412329;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0028;QD=12.213;RBI=0.021293;REFB=0.000274093;REVB=0.0207247;RO=59;SAF=19;SAR=12;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325806;STB=0.533271;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0051652;OID=.;OPOS=169454941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:93:59:59:31:34:0.365591:12:19:36:23:15:19:36:23 chr5 169461547 . C T 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00788737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4158;QD=18.2899;RBI=0.0327342;REFB=-0.00214582;REVB=-0.0317697;RO=33;SAF=16;SAR=16;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235743;STB=0.630693;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00145514;OID=.;OPOS=169461547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:16:16:8:25:16:16:8:25 chr5 169510392 . G A 349.25 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0121704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0291;QD=20.2461;RBI=0.0124938;REFB=-0.00221551;REVB=-0.00282408;RO=32;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236277;STB=0.520537;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00183027;OID=.;OPOS=169510392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:33:36:36:0.521739:17:19:16:16:17:19:16:17 chr5 169533240 . G A 182.82 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0362412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.221;QD=43.0156;RBI=0.0436979;REFB=-0.0342614;REVB=0.0244147;RO=1;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101073;STB=0.555483;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00320524;OID=.;OPOS=169533240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:4:12:0:1:4:12:0:1 chr5 169535522 . T C 1933.59 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.913;QD=61.8749;RBI=0.0147752;REFB=0;REVB=-0.00012575;RO=0;SAF=49;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.39111e-05;OID=.;OPOS=169535522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:75:49:0:0:75:50:0:0 chr5 169661994 . G C 327.62 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286579;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.185;QD=54.6026;RBI=0.0307692;REFB=0;REVB=0.0112012;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162679;OID=.;OPOS=169661994;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr5 169685163 . C T 851.66 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.054;QD=57.7394;RBI=0.0319477;REFB=0;REVB=0.00757303;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37027e-05;OID=.;OPOS=169685163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:30:28:0:0:30:29:0:0 chr5 169693858 . G A 397.79 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0127883;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.282;QD=18.0814;RBI=0.0328908;REFB=-0.0216065;REVB=-0.0303029;RO=47;SAF=23;SAR=18;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00754571;STB=0.504214;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0255838;OID=.;OPOS=169693858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:0.465909:18:23:26:21:18:23:26:21 chr5 169715038 . AT GC,GT 789.23 PASS AF=0.0357143,0.964286;AO=2,54;DP=56;FAO=2,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=2,22;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245314,-0.0317318;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=87.0268,73.3338;QD=56.3732;RBI=0.0255435,0.0360711;REFB=0,0;REVB=0.00711908,0.0171528;RO=0;SAF=2,22;SAR=0,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.64875e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0925492,-0.000980237;OID=.,.;OPOS=169715038,169715038;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:56:56:0:0:2,54:2,54:0.0357143,0.964286:0,32:2,22:0:0:0,32:2,22:0:0 chr5 169805956 . C G 179.73 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0182163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.465;QD=23.191;RBI=0.0184046;REFB=-0.00660704;REVB=0.00262626;RO=13;SAF=3;SAR=15;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410026;STB=0.733039;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00603287;OID=.;OPOS=169805956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:15:3:8:5:15:3:8:5 chr5 169810796 . C T 253.95 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.135137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3833;QD=15.3909;RBI=0.136824;REFB=-0.00705098;REVB=0.0214177;RO=37;SAF=17;SAR=12;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280629;STB=0.657737;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0124644;OID=.;OPOS=169810796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:12:17:11:26:12:17:11:26 chr5 169910084 . G T 976.15 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0108364;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.1201;QD=57.4204;RBI=0.010904;REFB=-0.0045349;REVB=-0.00121275;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-2.47904e-05;OID=.;OPOS=169910084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:68:0:1:67:67:0.985294:37:30:0:0:37:30:1:0 chr5 170240990 . TAAAAAC ATAAAAC,TAAAAACA,TAAAACA,TAAAAC,TATAAAC 1516.7 PASS AF=0,0,0,0.942857,0.0571429;AO=20,31,18,45,16;DP=173;FAO=0,0,0,165,10;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,93,0;FSAR=0,0,0,72,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.316938,-0.55751,0.0790991,0.730828,0.0421719;FXX=0.0056815;HRUN=1,2,5,5,5;LEN=2,1,2,1,1;MLLD=6.65129,12.575,5.94401,12.3121,149.415;QD=34.6673;RBI=0.386114,0.558425,0.0840511,0.73358,0.0627761;REFB=0.0404824,-0.000350248,0.0180688,0.019982,0.012477;REVB=-0.220531,0.0319446,-0.0284238,-0.0634824,-0.0465013;RO=33;SAF=0,31,16,11,0;SAR=20,0,2,34,16;SRF=29;SRR=4;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.873153,0.816616,0.0273978,-0.483657,-0.866329;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=mnp,ins,mnp,del,snp;VARB=0,0,0,-0.0201199,0.0640465;OID=.,.,.,.,.;OPOS=170240990,170240997,170240995,170240991,170240992;OREF=TA,-,AC,A,A;OALT=AT,A,CA,-,T;OMAPALT=ATAAAAC,TAAAAACA,TAAAACA,TAAAAC,TATAAAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 4/5:22:173:175:33:0:20,31,18,45,16:0,0,0,165,10:0,0,0,0.942857,0.0571429:20,0,2,34,16:0,31,16,11,0:29:4:0,0,0,72,10:0,0,0,93,0:0:0 chr5 170294132 . G A 228.9 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00635283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.552;QD=16.063;RBI=0.0285498;REFB=-0.0128411;REVB=-0.0278341;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199529;STB=0.612949;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0330379;OID=.;OPOS=170294132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:9:17:14:17:9:17:14:17 chr5 170395512 . A T 571.83 PASS AF=0.465116;AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.013412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.372;QD=17.7312;RBI=0.0236412;REFB=-0.0322559;REVB=0.0194686;RO=68;SAF=31;SAR=29;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721382;STB=0.535988;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0468183;OID=.;OPOS=170395512;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:68:69:60:60:0.465116:29:31:30:38:29:31:31:38 chr5 170597190 . G A 203.18 PASS AF=0.571429;AO=19;DP=34;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.000918736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.179;QD=23.2201;RBI=0.0190171;REFB=-0.0129987;REVB=-0.0189949;RO=15;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133499;STB=0.558081;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00830713;OID=.;OPOS=170597190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:15:15:19:20:0.571429:12:7:8:7:12:8:8:7 chr5 170632770 . G T 240.4 PASS AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0272239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.008;QD=28.2824;RBI=0.0279003;REFB=-0.0100463;REVB=-0.00610618;RO=12;SAF=12;SAR=10;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29088;STB=0.659551;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00416782;OID=.;OPOS=170632770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:10:12:1:11:10:12:1:11 chr5 170883734 . G A 858.64 PASS AF=0.6;AO=78;DP=129;FAO=78;FDP=130;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0152959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.76;QD=26.4197;RBI=0.0162282;REFB=0.00325542;REVB=0.00542122;RO=51;SAF=32;SAR=46;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737926;STB=0.544313;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=-0.0017867;OID=.;OPOS=170883734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:51:52:78:78:0.6:46:32:26:25:46:32:27:25 chr5 171481606 . A G 237.72 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0172343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.525;QD=18.6446;RBI=0.0182851;REFB=-0.0182676;REVB=0.00610947;RO=26;SAF=18;SAR=7;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306127;STB=0.517227;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0174645;OID=.;OPOS=171481606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:7:18:18:8:7:18:18:8 chr5 171523436 . G A 136.89 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0102837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1178;QD=18.2513;RBI=0.0439027;REFB=-0.00873088;REVB=-0.0426813;RO=15;SAF=14;SAR=1;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.52083;STB=0.809367;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00799666;OID=.;OPOS=171523436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:1:14:9:6:1:14:9:6 chr5 171533629 . A G 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.026;QD=63.8709;RBI=0.0267451;REFB=0;REVB=0.0194871;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105111;OID=.;OPOS=171533629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr5 171533656 . C T 1319.46 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.462;QD=62.0922;RBI=0.0375967;REFB=0;REVB=0.0333661;RO=0;SAF=49;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33844e-05;OID=.;OPOS=171533656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:36:49:0:0:36:49:0:0 chr5 171636926 . C T 464.85 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00379511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.194;QD=58.1061;RBI=0.0368144;REFB=0;REVB=0.0366183;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10051e-05;OID=.;OPOS=171636926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:10:21:0:0:11:21:0:0 chr5 171766115 . T C 307.04 PASS AF=0.361905;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=105;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=-0.0258063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.743;QD=11.6967;RBI=0.0260806;REFB=-0.0105423;REVB=-0.00377206;RO=66;SAF=15;SAR=23;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185812;STB=0.504464;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0141401;OID=.;OPOS=171766115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:66:67:38:38:0.361905:23:15:25:41:23:15:26:41 chr5 171849471 . G A 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.665;QD=60.9785;RBI=0.0152022;REFB=0;REVB=0.00339249;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120315;OID=.;OPOS=171849471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0 chr5 172196711 . G T 500.72 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.936;QD=58.908;RBI=0.0909643;REFB=0;REVB=0.0554522;RO=0;SAF=6;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447419;OID=.;OPOS=172196711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:27:6:0:0:27:7:0:0 chr5 172294194 . G T 870.66 PASS AF=0.983871;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0383618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8475;QD=56.1715;RBI=0.0499491;REFB=-0.113227;REVB=0.0319888;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.510635;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00121495;OID=.;OPOS=172294194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:62:0:1:60:61:0.983871:23:37:0:0:23:38:0:1 chr5 172381973 . A AGGT 667.84 PASS AF=0.866667;AO=52;DP=61;FAO=52;FDP=60;FR=.;FRO=8;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.000940921;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=3;MLLD=235.889;QD=44.5223;RBI=0.0124587;REFB=-0.0378923;REVB=0.0124232;RO=8;SAF=31;SAR=21;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247994;STB=0.51324;STBP=0.629;TYPE=ins;VARB=0.00307188;OID=.;OPOS=172381974;OREF=-;OALT=GGT;OMAPALT=AGGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.866667:52:61:52:60:8:31:21:4:4:42:8:31:21:4:4 chr5 172447762 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.495;QD=59.4355;RBI=0.0329649;REFB=0;REVB=-0.030247;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000216836;OID=.;OPOS=172447762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr5 172631051 . T G 669.9 PASS AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0898429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1893;QD=62.3162;RBI=0.0899869;REFB=0;REVB=0.00508998;RO=1;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240543;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141596;OID=.;OPOS=172631051;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:1:0:41:43:1:19:22:0:1:20:23:0:0 chr5 172660526 . AT A,AA 232.33 PASS AF=0.368421,0.631579;AO=7,11;DP=18;FAO=7,12;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=7,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614112,0.0525934;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=294.049,295.024;QD=48.9123;RBI=0.0614113,0.0525944;REFB=0,0;REVB=7.3072e-05,-0.000322829;RO=0;SAF=1,0;SAR=6,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00449223,0.00294088;OID=.,.;OPOS=172660527,172660527;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.368421,0.631579:7,11:18:7,12:19:0:0,1:7,11:0:0:18:0:1,0:6,11:0:0 chr5 172662024 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.669;QD=46.8479;RBI=0.0789764;REFB=0;REVB=0.0779525;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000911627;OID=.;OPOS=172662024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr5 172681229 . G A 355.14 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0144982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.103;QD=18.9408;RBI=0.0284853;REFB=0.0111055;REVB=-0.0245196;RO=38;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597122;STB=0.533219;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.0157522;OID=.;OPOS=172681229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:19:18:16:22:19:18:16:22 chr5 172750436 . G A 211.15 PASS AF=0.366197;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00987262;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1344;QD=11.8959;RBI=0.0134298;REFB=-0.0168689;REVB=-0.00910439;RO=46;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00557715;STB=0.503266;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0252323;OID=.;OPOS=172750436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:46:45:26:26:0.366197:14:12:21:25:14:12:21:24 chr5 173383859 . G A 299.05 PASS AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0188139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5625;QD=16.1647;RBI=0.0717684;REFB=0.00450117;REVB=-0.0692585;RO=41;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987449;STB=0.555522;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00716255;OID=.;OPOS=173383859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:16:17:17:24:16:17:17:24 chr5 173534448 . G A 511.79 PASS AF=0.509615;AO=54;DP=105;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.004703;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.764;QD=19.6843;RBI=0.013429;REFB=-0.00568344;REVB=0.0125786;RO=50;SAF=25;SAR=29;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109017;STB=0.549871;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00563068;OID=.;OPOS=173534448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:50:51:54:53:0.509615:29:25:17:33:29:24:18:33 chr5 173534801 . CTT C 332.17 PASS AF=0.472222;AO=49;DP=107;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0165737;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=46.5234;QD=12.3027;RBI=0.0300334;REFB=0.0169291;REVB=-0.0250463;RO=55;SAF=20;SAR=29;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625682;STB=0.523068;STBP=0.65;TYPE=del;VARB=-0.0187109;OID=.;OPOS=173534802;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.472222:49:107:51:108:57:20:31:20:37:99:55:20:29:19:36 chr5 174156168 . T C 851.23 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.187;QD=57.7105;RBI=0.0148344;REFB=0;REVB=0.00531039;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.88918e-05;OID=.;OPOS=174156168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0 chr5 174422374 . C T 506.9 PASS AF=0.5;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.00544987;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.978;QD=19.1284;RBI=0.0087886;REFB=-0.020615;REVB=-0.00689481;RO=53;SAF=25;SAR=28;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103522;STB=0.557132;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0226568;OID=.;OPOS=174422374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:53:53:53:53:0.5:28:25:19:34:28:25:19:34 chr5 174868840 . T C 1155.44 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.94;QD=60.023;RBI=0.0173202;REFB=0;REVB=0.0113472;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61636e-05;OID=.;OPOS=174868840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr5 174869905 . C T 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00168918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.447;QD=11.257;RBI=0.012613;REFB=-0.0159498;REVB=-0.0124994;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434779;STB=0.526249;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0147432;OID=.;OPOS=174869905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:7:5:3:5:7:5 chr5 174870150 . C T 756.88 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00588605;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.023;QD=55.046;RBI=0.00589316;REFB=-0.134962;REVB=-0.000289382;RO=1;SAF=33;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140687;STB=0.50746;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000812571;OID=.;OPOS=174870150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:55:1:1:54:54:0.981818:21:33:1:0:21:33:1:0 chr5 174870196 . C T 219.23 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.038307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.779;QD=13.9192;RBI=0.0483677;REFB=-0.0163519;REVB=-0.0295297;RO=36;SAF=21;SAR=5;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.520985;STB=0.792222;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0164439;OID=.;OPOS=174870196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:37:26:26:0.412698:5:21:11:25:5:21:12:25 chr5 175307256 . T C 115.28 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0613968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6626;QD=20.049;RBI=0.125999;REFB=-0.0406716;REVB=-0.110028;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125864;STB=0.571322;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.024549;OID=.;OPOS=175307256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:6:7:7:3:6:7:7:3 chr5 175307373 . G A 428.98 PASS AF=0.494253;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0142764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9057;QD=19.7234;RBI=0.0476953;REFB=-0.00310248;REVB=0.0455085;RO=43;SAF=17;SAR=26;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50476;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00474338;OID=.;OPOS=175307373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:44:43:43:0.494253:26:17:17:26:26:17:17:27 chr5 175308022 . A G 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00976763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.087;QD=12.3285;RBI=0.0292953;REFB=-0.0319235;REVB=-0.027619;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766352;STB=0.545372;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0398646;OID=.;OPOS=175308022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:6:5:9:8:6:5:9:8 chr5 175528118 . A G 626.44 PASS AF=0.753623;AO=52;DP=70;FAO=52;FDP=69;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0274909;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.147;QD=36.3152;RBI=0.0412358;REFB=-0.00535508;REVB=-0.030735;RO=17;SAF=15;SAR=37;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126305;STB=0.568111;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00304807;OID=.;OPOS=175528118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:17:17:52:52:0.753623:37:15:9:8:37:15:9:8 chr5 175811093 . AC ACGT,GT 1012.82 PASS AF=0.946667,0.0266667;AO=65,3;DP=76;FAO=71,2;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=36,2;FSAR=35,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0419976,0.00342678;FXX=0.0384566;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=168.066,147.276;QD=54.017;RBI=0.0512003,0.0315719;REFB=0.000445983,-0.0284859;REVB=0.0292859,0.0313854;RO=0;SAF=33,3;SAR=32,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.51351,0.5;STBP=0.223,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00291224,-0.0520789;OID=.,.;OPOS=175811095,175811093;OREF=-,AC;OALT=GT,GT;OMAPALT=ACGT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:75:0:2:65,3:71,2:0.946667,0.0266667:32,0:33,3:0:0:35,0:36,2:2:0 chr5 175956271 . A C 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.033;QD=57.1773;RBI=0.0203541;REFB=0;REVB=-7.81746e-05;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57556e-05;OID=.;OPOS=175956271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr5 175998246 . T C 247.34 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.0160648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.517;QD=13.7411;RBI=0.0166325;REFB=-0.00753098;REVB=0.0043083;RO=43;SAF=13;SAR=16;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234072;STB=0.632681;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00428043;OID=.;OPOS=175998246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:16:13:29:14:16:13:29:14 chr5 176002144 . A C 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.216;QD=53.275;RBI=0.0290743;REFB=0;REVB=-0.0289054;RO=0;SAF=22;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47154e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242006;OID=.;OPOS=176002144;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:1:22:0:0:1:22:0:0 chr5 176004476 . T C 126.06 PASS AF=1;AO=9;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9298;QD=42.0197;RBI=0.194049;REFB=0;REVB=0.193563;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00887206;OID=.;OPOS=176004476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:9:12:1:1:8:0:0:3:9:0:0 chr5 176005477 . C T 244.37 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0193616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.825;QD=17.4553;RBI=0.0299942;REFB=-0.0194414;REVB=0.022908;RO=28;SAF=17;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129199;STB=0.504947;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0167665;OID=.;OPOS=176005477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:29:27:27:0.482143:10:17:18:10:10:17:18:11 chr5 176011264 . T C 80.94 PASS AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00297252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.771;QD=7.89701;RBI=0.00554187;REFB=-0.0126151;REVB=0.00467722;RO=30;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927261;STB=0.557418;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0265523;OID=.;OPOS=176011264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:41:30:30:11:11:0.268293:5:6:14:16:5:6:14:16 chr5 176017455 . C T 145.15 PASS AF=0.30303;AO=20;DP=66;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.000360188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.977;QD=8.79693;RBI=0.0138229;REFB=-0.0134017;REVB=-0.0138182;RO=46;SAF=8;SAR=12;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067735;STB=0.540332;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0231385;OID=.;OPOS=176017455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:46:46:20:20:0.30303:12:8:21:25:12:8:21:25 chr5 176017639 . C A 442.73 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00302575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.788;QD=22.7042;RBI=0.0131231;REFB=-0.023112;REVB=0.0127695;RO=35;SAF=15;SAR=28;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201152;STB=0.511077;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0184462;OID=.;OPOS=176017639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:28:15:13:22:28:15:13:22 chr5 176024880 . C T 683.65 PASS AF=0.912281;AO=52;DP=57;FAO=52;FDP=57;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.000114215;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.732;QD=47.9756;RBI=0.00988281;REFB=-0.0805489;REVB=0.00988215;RO=1;SAF=12;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037631;STB=0.586171;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00111023;OID=.;OPOS=176024880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:57:57:1:5:52:52:0.912281:40:12:1:0:40:12:5:0 chr5 176025938 . T C 507.54 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0109161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.794;QD=56.3928;RBI=0.110537;REFB=-0.0448562;REVB=-0.109996;RO=1;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444824;STB=0.523796;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-4.26017e-05;OID=.;OPOS=176025938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:10:25:0:1:10:25:0:1 chr5 176047761 . G A 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0164851;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.91;QD=19.1341;RBI=0.0180971;REFB=-0.0538449;REVB=-0.00746656;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212944;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0107352;OID=.;OPOS=176047761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:2:0:2:3:2:0 chr5 176053622 . G A 130.6 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0782594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.367;QD=22.7133;RBI=0.0830742;REFB=-0.0294619;REVB=-0.027871;RO=9;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161555;STB=0.590048;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0260641;OID=.;OPOS=176053622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:10:4:1:8:10:4:1:8 chr5 176069831 . G A 1546.57 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9079;QD=63.7762;RBI=0.0230062;REFB=0;REVB=-0.00660065;RO=0;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.81969e-05;OID=.;OPOS=176069831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:51:46:0:0:51:46:0:0 chr5 176081907 . C T 381.43 PASS AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0554464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1707;QD=22.4371;RBI=0.056413;REFB=0.024688;REVB=-0.0103983;RO=30;SAF=15;SAR=23;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593517;STB=0.53273;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=-0.0198991;OID=.;OPOS=176081907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:30:38:38:0.558824:23:15:14:16:23:15:14:16 chr5 176295808 . C T 612.45 PASS AF=0.358852;AO=75;DP=209;FAO=75;FDP=209;FR=.;FRO=134;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=79;FSRR=55;FWDB=0.0103331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.578;QD=11.7216;RBI=0.0179341;REFB=-0.0133557;REVB=-0.0146581;RO=129;SAF=42;SAR=33;SRF=74;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154676;STB=0.519308;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0271201;OID=.;OPOS=176295808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:129:134:75:75:0.358852:33:42:74:55:33:42:79:55 chr5 176314459 . G A 119.54 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00589499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.562;QD=13.6613;RBI=0.0408906;REFB=-0.0161872;REVB=0.0404635;RO=21;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174822;STB=0.602361;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0229291;OID=.;OPOS=176314459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:5:9:10:11:5:9:10:11 chr5 176314639 . G A 166.41 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00150291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.713;QD=14.7921;RBI=0.00510575;REFB=-0.0212519;REVB=-0.00487955;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229768;STB=0.621487;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0408202;OID=.;OPOS=176314639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:11:7:16:10:11:7:16:11 chr5 176334195 . C T 212.35 PASS AF=0.423729;AO=20;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0091438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.655;QD=14.3966;RBI=0.0242374;REFB=-0.00494556;REVB=-0.0224464;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870393;STB=0.517794;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0077104;OID=.;OPOS=176334195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:34:20:25:0.423729:9:11:13:15:14:11:16:18 chr5 176378574 . G T 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00798843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.263;QD=13.336;RBI=0.00916372;REFB=-0.0103687;REVB=-0.00448984;RO=24;SAF=4;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265523;STB=0.656496;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0204998;OID=.;OPOS=176378574;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:11:4:12:12:11:4:12:12 chr5 176402401 . G A 382.4 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00774483;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.511;QD=18.6538;RBI=0.052348;REFB=-0.0123468;REVB=-0.0517719;RO=41;SAF=23;SAR=16;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725995;STB=0.529397;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0134497;OID=.;OPOS=176402401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:41:43:39:39:0.47561:16:23:21:20:16:23:23:20 chr5 176492557 . G A 70.34 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00523512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.839;QD=15.6304;RBI=0.0289974;REFB=-0.0280521;REVB=0.0285209;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22915;STB=0.636033;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0735059;OID=.;OPOS=176492557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:18:18:9:9:9:9:0.5:7:2:4:5:7:2:4:5 chr5 176516631 . G A 740.22 PASS AF=0.964912;AO=54;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0198079;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=189.968;QD=51.9452;RBI=0.0287201;REFB=-0.0583871;REVB=0.0207964;RO=3;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687785;STB=0.523801;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0005163;OID=.;OPOS=176516631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:57:57:3:2:54:55:0.964912:19:35:0:3:20:35:0:2 chr5 176517136 . C T 41.37 PASS AF=0.444444;AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0841415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.766;QD=18.3864;RBI=0.0852298;REFB=-0.144468;REVB=-0.0135772;RO=3;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725463;STB=0.545217;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0785777;OID=.;OPOS=176517136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:9:9:3:3:4:4:0.444444:3:1:1:2:3:1:1:2 chr5 176517170 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.267;QD=54.5176;RBI=0.0375877;REFB=0;REVB=0.00634114;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334977;OID=.;OPOS=176517170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr5 176517292 . A G 794.13 PASS AF=0.982759;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8531;QD=54.7677;RBI=0.115571;REFB=-0.126707;REVB=-0.112413;RO=1;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129132;STB=0.506491;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0023202;OID=.;OPOS=176517292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:55:58:1:1:54:57:0.982759:36:18:0:1:38:19:0:1 chr5 176517326 . T C 805.06 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00779843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.305;QD=64.4044;RBI=0.0181647;REFB=0;REVB=0.0164055;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.88076e-05;OID=.;OPOS=176517326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr5 176517461 . T G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.341;QD=51.1846;RBI=0.0321323;REFB=0;REVB=0.0180218;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.25238e-05;OID=.;OPOS=176517461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr5 176517797 . C T 676.78 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00813744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.174;QD=60.1584;RBI=0.0109643;REFB=0.142185;REVB=0.00734834;RO=1;SAF=22;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208755;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000512787;OID=.;OPOS=176517797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:22:22:1:0:22:22:1:0 chr5 176518784 . C T 907.61 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01896;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.597;QD=58.5553;RBI=0.0201154;REFB=0;REVB=0.00671912;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.9455e-05;OID=.;OPOS=176518784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0 chr5 176636882 . C T 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00369417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.392;QD=18.2511;RBI=0.00545803;REFB=-0.0060525;REVB=-0.00401786;RO=15;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124555;STB=0.571331;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00922433;OID=.;OPOS=176636882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:5:10:8:7:5:10:8:7 chr5 176637149 . G A 155.51 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00242401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.394;QD=15.172;RBI=0.0162536;REFB=-0.00605565;REVB=-0.0160719;RO=24;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718897;STB=0.541498;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0072725;OID=.;OPOS=176637149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:9:8:13:11:9:8:13:11 chr5 176637240 . G T 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0080584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1648;QD=15.6256;RBI=0.0252284;REFB=0.00403451;REVB=0.0239068;RO=23;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130319;STB=0.575294;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=-0.00412965;OID=.;OPOS=176637240;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:11:6:11:12:11:6:11:12 chr5 176637576 . T C 135.77 PASS AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0190203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.717;QD=27.154;RBI=0.0575099;REFB=-0.000303379;REVB=0.0542735;RO=6;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115941;STB=0.564429;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.000789162;OID=.;OPOS=176637576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:5:9:5:1:5:9:5:1 chr5 176721198 . T C 214.2 PASS AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00590692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.5;QD=28.5594;RBI=0.0227522;REFB=-0.0083769;REVB=-0.021972;RO=10;SAF=10;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602408;STB=0.5333;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00251975;OID=.;OPOS=176721198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:10:10:4:6:10:10:4:6 chr5 176728400 . G A 266.57 PASS AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0499237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9663;QD=13.4973;RBI=0.0508238;REFB=0.000268317;REVB=0.00952314;RO=48;SAF=11;SAR=20;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252296;STB=0.514379;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000810967;OID=.;OPOS=176728400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:20:11:16:32:20:11:16:32 chr5 176728458 . G T 215.04 PASS AF=0.369863;AO=26;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.029904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.863;QD=11.7832;RBI=0.0347264;REFB=-0.0100609;REVB=-0.0176542;RO=46;SAF=9;SAR=17;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282398;STB=0.500544;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0308846;OID=.;OPOS=176728458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:46:46:26:27:0.369863:17:9:17:29:17:10:17:29 chr5 176733116 . A G 198.91 PASS AF=0.357143;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0177615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.337;QD=11.3664;RBI=0.0209565;REFB=-0.00917839;REVB=-0.0111223;RO=45;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11449;STB=0.566116;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0163411;OID=.;OPOS=176733116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:45:45:25:25:0.357143:13:12:17:28:13:12:17:28 chr5 176733616 . T C 171.26 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.0129553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.86;QD=12.4555;RBI=0.0147288;REFB=-0.0217357;REVB=0.00700687;RO=34;SAF=6;SAR=15;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279329;STB=0.516114;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0326802;OID=.;OPOS=176733616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:15:6:9:25:15:6:9:25 chr5 176737720 . A G 133.45 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0165836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.11;QD=15.7005;RBI=0.0185142;REFB=-0.0184892;REVB=-0.00823157;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52171;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0227813;OID=.;OPOS=176737720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:19:15:15:0.441176:5:10:12:6:5:10:12:7 chr5 176815124 . T C 586.69 PASS AF=0.531532;AO=59;DP=111;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.0260578;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.138;QD=21.1419;RBI=0.0262204;REFB=-0.0178095;REVB=-0.00291548;RO=51;SAF=28;SAR=31;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700855;STB=0.533322;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0188086;OID=.;OPOS=176815124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:52:59:59:0.531532:31:28:20:31:31:28:21:31 chr5 176831826 . C G 1377.52 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.897;QD=62.6146;RBI=0.0274963;REFB=0;REVB=0.0274282;RO=0;SAF=56;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10353e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2971e-05;OID=.;OPOS=176831826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:86:88:1:30:56:0:0:32:56:0:0 chr5 176836532 . A G 195.39 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0166137;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.888;QD=16.9907;RBI=0.0182475;REFB=0.00232438;REVB=0.00754682;RO=26;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10041;STB=0.557464;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.00331227;OID=.;OPOS=176836532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:12:8:13:13:12:8:13:13 chr5 176885178 . A G 322.98 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.179;QD=53.8305;RBI=0.035961;REFB=0;REVB=-0.0241699;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000313669;OID=.;OPOS=176885178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr5 176916516 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1391;QD=53.9112;RBI=0.0645677;REFB=0;REVB=0.0272487;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148968;OID=.;OPOS=176916516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr5 176917078 . T C 617.01 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00362902;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.941;QD=61.7011;RBI=0.0133829;REFB=0;REVB=0.0128814;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35504e-05;OID=.;OPOS=176917078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr5 176930135 . G A 885.73 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.838;QD=58.0804;RBI=0.0696903;REFB=0;REVB=0.0609195;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236694;OID=.;OPOS=176930135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:35:24:0:0:37:24:0:0 chr5 176930171 . AGAG A 221.02 PASS AF=0.369863;AO=26;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0127507;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=3;MLLD=211.226;QD=12.1109;RBI=0.0165345;REFB=-0.0331208;REVB=0.0105266;RO=44;SAF=8;SAR=18;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196863;STB=0.582461;STBP=0.295;TYPE=del;VARB=0.0496937;OID=.;OPOS=176930172;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.369863:26:73:27:73:46:9:18:21:25:99:44:8:18:21:23 chr5 176936590 . T C 715.78 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378485;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.53;QD=57.262;RBI=0.0394981;REFB=0;REVB=-0.0112956;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000205406;OID=.;OPOS=176936590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:23:26:0:0:23:27:0:0 chr5 176936650 . T C 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9331;QD=55.0974;RBI=0.02352;REFB=0;REVB=0.0108726;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208469;OID=.;OPOS=176936650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0 chr5 176951276 . A G 787.77 PASS AF=1;AO=43;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.632;QD=64.308;RBI=0.0546937;REFB=0;REVB=0.0508048;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271828;OID=.;OPOS=176951276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:43:49:1:23:20:0:0:26:23:0:0 chr5 177022652 . A G 199.28 PASS AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0345146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6415;QD=36.2328;RBI=0.171165;REFB=-0.0300118;REVB=0.167649;RO=2;SAF=16;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540534;STB=0.555499;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0492081;OID=.;OPOS=177022652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:22:22:2:4:18:18:0.818182:2:16:2:0:2:16:4:0 chr5 177031348 . T C 108.84 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.13639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6898;QD=24.1874;RBI=0.13775;REFB=-0.017096;REVB=-0.0193028;RO=6;SAF=9;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.599822;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0137721;OID=.;OPOS=177031348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:3:9:3:3:3:9:3:3 chr5 177035964 . T C 1230.88 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453336;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.425;QD=61.5439;RBI=0.0513177;REFB=0;REVB=0.0240493;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.21827e-05;OID=.;OPOS=177035964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:38:42:0:0:38:42:0:0 chr5 177158620 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.487;QD=40.7629;RBI=0.0360798;REFB=0;REVB=0.0089897;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425375;OID=.;OPOS=177158620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0 chr5 177180236 . G A 976.55 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00881059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.79;QD=57.4443;RBI=0.04225;REFB=-0.167895;REVB=-0.0413211;RO=1;SAF=54;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00867285;STB=0.504586;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.000290908;OID=.;OPOS=177180236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:13:54:1:0:13:54:1:0 chr5 177310717 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.044;QD=33.4285;RBI=0.0206925;REFB=0;REVB=-0.00115668;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00092967;OID=.;OPOS=177310717;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr5 177422823 . C T 253.52 PASS AF=0.38961;AO=29;DP=76;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00324635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.597;QD=13.1698;RBI=0.0111115;REFB=-0.0150267;REVB=0.0106267;RO=46;SAF=17;SAR=12;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093314;STB=0.555518;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0167262;OID=.;OPOS=177422823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:46:47:29:30:0.38961:12:17:23:23:12:18:24:23 chr5 177422876 . T C 1552.6 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297867;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.904;QD=64.0246;RBI=0.0298055;REFB=0;REVB=-0.0010603;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92525e-05;OID=.;OPOS=177422876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:47:50:0:0:47:50:0:0 chr5 177422908 . A G 434.23 PASS AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0248135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.344;QD=17.0286;RBI=0.0255038;REFB=-0.039281;REVB=-0.00589355;RO=53;SAF=23;SAR=24;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107077;STB=0.548286;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0349572;OID=.;OPOS=177422908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:55:47:47:0.460784:24:23:20:33:24:23:22:33 chr5 177547247 . T A,C 1013.13 PASS AF=0.0857143,0.914286;AO=6,64;DP=70;FAO=6,64;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=6,7;FSAR=0,57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268891,0.00140079;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=41.1099,248.741;QD=57.8931;RBI=0.0297165,0.00153638;REFB=0,0;REVB=0.0126509,0.000631077;RO=0;SAF=6,7;SAR=0,57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.2388e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.014981,-0.000951103;OID=.,.;OPOS=177547247,177547247;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:20:70:70:0:0:6,64:6,64:0.0857143,0.914286:0,57:6,7:0:0:0,57:6,7:0:0 chr5 177551154 . C T 43.18 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.029578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.809;QD=5.57195;RBI=0.0298936;REFB=-0.00173752;REVB=-0.00433216;RO=23;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588231;STB=0.523297;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0263275;OID=.;OPOS=177551154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:31:31:23:24:7:7:0.225806:3:4:12:11:3:4:13:11 chr5 177551169 . T C 71.38 PASS AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00168592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6457;QD=7.71694;RBI=0.0156725;REFB=-0.0174695;REVB=-0.0155816;RO=27;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181351;STB=0.613797;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0445126;OID=.;OPOS=177551169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:3:7:15:12:3:7:15:12 chr5 177551176 . T C 71.38 PASS AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0631246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.657;QD=7.71662;RBI=0.0682183;REFB=-0.000882832;REVB=-0.0258656;RO=27;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181351;STB=0.613797;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00183829;OID=.;OPOS=177551176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:3:7:15:12:3:7:15:12 chr5 177612734 . T C 1461.63 PASS AF=0.980392;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0144281;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.838;QD=57.319;RBI=0.0199308;REFB=-0.0408001;REVB=0.0137502;RO=2;SAF=48;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000744985;STB=0.500393;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000673372;OID=.;OPOS=177612734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:102:102:2:2:100:100:0.980392:52:48:1:1:52:48:1:1 chr5 177612739 . G T 559.42 PASS AF=0.543689;AO=56;DP=104;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00966737;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8081;QD=21.7248;RBI=0.0449348;REFB=0.00839034;REVB=-0.0438826;RO=48;SAF=28;SAR=28;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175003;STB=0.514558;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.00755604;OID=.;OPOS=177612739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:48:47:56:56:0.543689:28:28:23:25:28:28:22:25 chr5 177612744 . A G 1454.48 PASS AF=0.990099;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0374595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.103;QD=57.603;RBI=0.0376805;REFB=0.0576131;REVB=-0.004075;RO=2;SAF=47;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197546;STB=0.505154;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000430344;OID=.;OPOS=177612744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:2:1:99:100:0.990099:52:47:2:0:52:48:1:0 chr5 177612983 . G A 113.4 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00852275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.572;QD=9.65109;RBI=0.0100694;REFB=-0.00176956;REVB=0.00536236;RO=33;SAF=5;SAR=9;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284919;STB=0.671402;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00258797;OID=.;OPOS=177612983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:9:5:20:13:9:5:20:13 chr5 177613123 . T C 613.22 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129144;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.5351;QD=61.3223;RBI=0.0183975;REFB=0;REVB=0.0131029;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67584e-06;OID=.;OPOS=177613123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0 chr5 177613168 . C T 255.28 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.00191046;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6309;QD=17.6056;RBI=0.0643546;REFB=1.80518e-06;REVB=0.0643262;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30093;STB=0.655072;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.000909867;OID=.;OPOS=177613168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:29:30:28:28:0.482759:14:14:24:5:14:14:24:6 chr5 177613296 . C T 267.24 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0144226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.233;QD=20.1692;RBI=0.0170144;REFB=0.00824022;REVB=-0.00902661;RO=24;SAF=15;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146125;STB=0.569036;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00542239;OID=.;OPOS=177613296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:24:25:28:28:0.528302:13:15:17:7:13:15:17:8 chr5 177614001 . T C 262.09 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0110386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.493;QD=25.5695;RBI=0.0131681;REFB=-0.0101698;REVB=-0.00717978;RO=17;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041074;STB=0.522802;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00917009;OID=.;OPOS=177614001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:10:14:9:8:10:14:9:8 chr5 177669413 . T G 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.911;QD=59.6778;RBI=0.032192;REFB=0;REVB=-0.028932;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.4322e-05;OID=.;OPOS=177669413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr5 177683377 . T C 133.42 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0471967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4734;QD=15.697;RBI=0.0552608;REFB=0.00671563;REVB=0.0287441;RO=19;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790844;STB=0.545396;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.0168012;OID=.;OPOS=177683377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:5:10:14:5:5:10:14:5 chr5 177715581 . T C 153.41 PASS AF=0.292683;AO=16;DP=74;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.0216473;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.072;QD=7.48336;RBI=0.030508;REFB=-0.0302907;REVB=0.0214972;RO=58;SAF=11;SAR=5;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408613;STB=0.691026;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.077174;OID=.;OPOS=177715581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:82:58:58:16:24:0.292683:5:11:20:38:9:15:20:38 chr5 178138657 . A ATTCATTTGTAT 85.08 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0211658;FXX=0.0731529;HRUN=0;LEN=11;MLLD=289.269;QD=8.95537;RBI=0.0261166;REFB=-0.00212247;REVB=-0.0152999;RO=39;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185924;STB=0.551627;STBP=0.738;TYPE=ins;VARB=0.00578602;OID=.;OPOS=178138658;OREF=-;OALT=TTCATTTGTAT;OMAPALT=ATTCATTTGTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.289474:11:50:11:38:27:3:8:9:18:85:39:3:8:16:23 chr5 178139442 . T G 557.5 PASS AF=0.632911;AO=50;DP=79;FAO=50;FDP=79;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.020414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.603;QD=28.228;RBI=0.0218252;REFB=-0.0220941;REVB=0.00772044;RO=29;SAF=26;SAR=24;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483783;STB=0.526305;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0128933;OID=.;OPOS=178139442;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:29:29:50:50:0.632911:24:26:13:16:24:26:13:16 chr5 178140090 . C T 426.9 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.035093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.486;QD=21.8923;RBI=0.0706902;REFB=-0.0112271;REVB=-0.0613643;RO=36;SAF=24;SAR=18;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835504;STB=0.546103;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0160975;OID=.;OPOS=178140090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:18:24:17:19:18:24:17:19 chr5 178359136 . A G 89.54 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0169734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.528;QD=15.5715;RBI=0.0171132;REFB=-0.00880009;REVB=-0.00218291;RO=12;SAF=2;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275208;STB=0.662823;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00747788;OID=.;OPOS=178359136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:9:2:5:7:9:2:5:7 chr5 178391860 . G A 215.5 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0527719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.262;QD=13.0605;RBI=0.0540347;REFB=-0.00908851;REVB=-0.0116136;RO=40;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671044;STB=0.538432;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0100198;OID=.;OPOS=178391860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:12:14:19:21:12:14:19:21 chr5 178391902 . A C 279.35 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00887564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.839;QD=18.9387;RBI=0.0219601;REFB=-0.0290905;REVB=0.0200865;RO=28;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121247;STB=0.55852;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0349531;OID=.;OPOS=178391902;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:29:30:30:0.508475:16:14:17:11:16:14:17:12 chr5 178395850 . G C 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00696255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.495;QD=62.0077;RBI=0.00828161;REFB=0;REVB=0.00448419;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.50726e-06;OID=.;OPOS=178395850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:33:51:0:0:33:51:0:0 chr5 178410151 . C T 231.08 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0766633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.263;QD=17.7752;RBI=0.079847;REFB=-0.0177804;REVB=0.0223223;RO=27;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328889;STB=0.518504;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0201026;OID=.;OPOS=178410151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:13:12:12:15:13:12:12:15 chr5 178410425 . G A 224.39 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.979;QD=17.5994;RBI=0.0320048;REFB=-0.0231368;REVB=0.0222555;RO=27;SAF=10;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450608;STB=0.525403;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0245637;OID=.;OPOS=178410425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:14:10:10:17:14:10:10:17 chr5 178410538 . A C 137.82 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.118425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.566;QD=19.0098;RBI=0.120668;REFB=-0.0105512;REVB=-0.0231602;RO=14;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104493;STB=0.559915;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0068761;OID=.;OPOS=178410538;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:12:3:4:10:12:3:4:10 chr5 178412667 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.326;QD=33.4285;RBI=0.0481043;REFB=0;REVB=0.0464112;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000691254;OID=.;OPOS=178412667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr5 178413816 . T C 1140.37 PASS AF=1;AO=70;DP=72;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.021;QD=59.2399;RBI=0.0552345;REFB=0;REVB=0.0430923;RO=0;SAF=50;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353482;OID=.;OPOS=178413816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:77:0:0:70:77:1:20:50:0:0:23:54:0:0 chr5 178413947 . T C 538.73 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.673;QD=59.8586;RBI=0.0365047;REFB=0;REVB=0.0358139;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75162e-05;OID=.;OPOS=178413947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:13:22:0:0:14:22:0:0 chr5 178415937 . A G 239.45 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00808992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5095;QD=50.4105;RBI=0.0159984;REFB=0;REVB=-0.0138023;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000486582;OID=.;OPOS=178415937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:17:2:0:0:17:2:0:0 chr5 178415982 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.931;QD=62.3509;RBI=0.0103196;REFB=0;REVB=-0.000840882;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59838e-05;OID=.;OPOS=178415982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:28:15:0:0:28:15:0:0 chr5 178416063 . G A,C 971.48 PASS AF=0.955224,0.0447761;AO=64,3;DP=67;FAO=64,3;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=40,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00771449,0.00968122;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.774,12.9266;QD=57.9988;RBI=0.019733,0.0110394;REFB=0,0;REVB=0.0181625,-0.00530501;RO=0;SAF=24,0;SAR=40,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.3845e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000106643,0.152673;OID=.,.;OPOS=178416063,178416063;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:67:67:0:0:64,3:64,3:0.955224,0.0447761:40,3:24,0:0:0:40,3:24,0:0:0 chr5 178416288 . G A 1070.66 PASS AF=0.9375;AO=74;DP=82;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0186223;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.564;QD=53.5328;RBI=0.0602838;REFB=-0.220564;REVB=0.0573353;RO=6;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690537;STB=0.530113;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00356074;OID=.;OPOS=178416288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:82:80:6:5:74:75:0.9375:38:36:0:6:39:36:0:5 chr5 178419288 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6702;QD=33.4285;RBI=0.0333762;REFB=0;REVB=0.0306327;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170818;OID=.;OPOS=178419288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr5 178459283 . A G 429.88 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0307093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3773;QD=17.3689;RBI=0.0312405;REFB=-0.0123366;REVB=-0.00573638;RO=55;SAF=24;SAR=20;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548882;STB=0.530712;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00804155;OID=.;OPOS=178459283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:20:24:33:22:20:24:33:22 chr5 178459426 . A C 381.83 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00586595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.445;QD=17.1611;RBI=0.0075683;REFB=-0.00950085;REVB=0.00478224;RO=49;SAF=26;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162968;STB=0.591552;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0178799;OID=.;OPOS=178459426;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:49:40:40:0.449438:14:26:24:25:14:26:24:25 chr5 178507069 . T C 806.28 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.006567;FXX=0.0169463;HRUN=6;LEN=1;MLLD=198.134;QD=55.6051;RBI=0.012891;REFB=-0.028365;REVB=0.0110929;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.508194;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-4.505e-05;OID=.;OPOS=178507069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:58:0:1:56:57:0.982759:26:30:0:0:27:30:1:0 chr5 178507090 . G A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.007919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.552;QD=57.1773;RBI=0.0278723;REFB=0;REVB=0.0267237;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90102e-05;OID=.;OPOS=178507090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr5 178634619 . C T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.276;QD=64.1537;RBI=0.0401102;REFB=0;REVB=0.0298287;RO=0;SAF=35;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250158;OID=.;OPOS=178634619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:14:35:0:0:14:35:0:0 chr5 178634672 . C T 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0254737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.508;QD=17.9404;RBI=0.0313119;REFB=-0.0364535;REVB=-0.0182079;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23845;STB=0.634335;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0385589;OID=.;OPOS=178634672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:17:5:9:10:17:5 chr5 178949560 . AG GT 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182589;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=165.685;QD=53.9112;RBI=0.018869;REFB=0;REVB=0.00475955;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000140777;OID=.;OPOS=178949560;OREF=AG;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr5 178949781 . A G 95.33 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0232904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.17;QD=34.6648;RBI=0.0239569;REFB=-0.0255802;REVB=-0.00561179;RO=1;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811734;STB=0.545364;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00251308;OID=.;OPOS=178949781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:5:5:1:0:5:5:1:0 chr5 178951598 . G A 785.77 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7437;QD=64.1447;RBI=0.0722191;REFB=0;REVB=-0.0292926;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421893;OID=.;OPOS=178951598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0 chr5 179069468 . A G 94.71 PASS AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0825755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.859;QD=10.8235;RBI=0.0934529;REFB=-0.0156077;REVB=-0.0437577;RO=23;SAF=9;SAR=3;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130528;STB=0.578808;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0379974;OID=.;OPOS=179069468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:3:9:15:8:3:9:15:8 chr5 179071866 . A G 271.89 PASS AF=0.430556;AO=29;DP=70;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.00536786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.636;QD=15.105;RBI=0.0094474;REFB=-0.0135359;REVB=-0.00777429;RO=41;SAF=10;SAR=19;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384387;STB=0.724;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.019597;OID=.;OPOS=179071866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:41:41:29:31:0.430556:19:10:30:11:21:10:30:11 chr5 179078940 . T C 717.06 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.368;QD=54.1177;RBI=0.0382315;REFB=-0.00591119;REVB=0.020661;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.51219;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000811224;OID=.;OPOS=179078940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:53:0:1:52:52:0.981132:31:21:0:0:32:20:1:0 chr5 179079104 . G A 114.37 PASS AF=0.541667;AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0167139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1089;QD=19.0624;RBI=0.0259112;REFB=0.00276601;REVB=0.0197999;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159197;STB=0.579497;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=-0.00234838;OID=.;OPOS=179079104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:10:11:12:13:0.541667:6:6:3:7:6:7:4:7 chr5 179126090 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=9.87099e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.501;QD=16.3859;RBI=0.0051217;REFB=-0.0187238;REVB=-0.00512075;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33014;STB=0.691889;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0128832;OID=.;OPOS=179126090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:6:3:6:2:6:3:6:2 chr5 179203933 . A G 267.96 PASS AF=0.54;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00416068;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.263;QD=21.437;RBI=0.0302792;REFB=-0.0252485;REVB=-0.029992;RO=23;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332555;STB=0.518505;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0287465;OID=.;OPOS=179203933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:23:23:27:27:0.54:13:14:11:12:13:14:11:12 chr5 179260153 . C T 1049.46 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251211;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.306;QD=58.3033;RBI=0.0254647;REFB=0;REVB=0.0041693;RO=1;SAF=30;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154913;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013707;OID=.;OPOS=179260153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:72:1:0:67:72:1:37:30:1:0:41:31:0:0 chr5 179260213 . G A 993.5 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.067292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3896;QD=57.594;RBI=0.0719236;REFB=-0.120216;REVB=0.025393;RO=1;SAF=27;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171824;STB=0.509088;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0130107;OID=.;OPOS=179260213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:41:27:1:0:41:27:1:0 chr5 179264731 . T C 1548.9 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.235;QD=63.8721;RBI=0.0202277;REFB=0;REVB=0.0167204;RO=0;SAF=41;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04721e-05;OID=.;OPOS=179264731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:56:41:0:0:56:41:0:0 chr5 179267949 . T C 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.163;QD=59.5017;RBI=0.0185089;REFB=0;REVB=0.00413657;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64008e-05;OID=.;OPOS=179267949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr5 179280379 . T C 1396.44 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.722;QD=62.7613;RBI=0.024726;REFB=0;REVB=0.021806;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01307e-05;OID=.;OPOS=179280379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:44:45:0:0:44:45:0:0 chr5 179285752 . G A 385.95 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.982;QD=53.2349;RBI=0.13317;REFB=-0.0923362;REVB=0.113175;RO=1;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344547;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00448344;OID=.;OPOS=179285752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:29:29:1:0:28:29:1:13:15:0:1:14:15:0:0 chr5 179287576 . C G 234.94 PASS AF=0.46;AO=21;DP=48;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0060594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.248;QD=18.795;RBI=0.0165457;REFB=-0.00874874;REVB=0.0153962;RO=26;SAF=13;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191115;STB=0.565161;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0101531;OID=.;OPOS=179287576;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:26:27:21:23:0.46:8:13:11:15:10:13:12:15 chr5 179287585 . GC CT 198.2 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00742779;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=2;MLLD=164.543;QD=17.6176;RBI=0.0185352;REFB=-0.0289425;REVB=-0.0169818;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682441;STB=0.538936;STBP=0.661;TYPE=mnp;VARB=0.0158873;OID=.;OPOS=179287585;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:12:13:9:11:12:13 chr5 179287597 . C G 205.4 PASS AF=0.4375;AO=23;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00971592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9025;QD=17.117;RBI=0.0114647;REFB=-0.0121117;REVB=-0.00608613;RO=25;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384939;STB=0.571361;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0114351;OID=.;OPOS=179287597;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:27:23:21:0.4375:11:12:12:13:9:12:12:15 chr5 179287622 . G GTA 154.91 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.00534554;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.851;QD=14.7534;RBI=0.022608;REFB=-0.0157477;REVB=0.0219669;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213687;STB=0.633456;STBP=0.166;TYPE=ins;VARB=0.0161147;OID=.;OPOS=179287623;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.404762:17:42:17:42:25:10:7:9:16:99:24:10:7:9:15 chr5 179290845 . T G 307.7 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0110581;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.103;QD=18.6487;RBI=0.0285665;REFB=-0.0149256;REVB=-0.0263394;RO=33;SAF=24;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265086;STB=0.648554;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.018689;OID=.;OPOS=179290845;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:9:24:15:18:9:24:15:18 chr5 179542290 . TAAAAAAAAAAAA TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAT 376.58 PASS AF=0,0,0.88,0.12;AO=7,12,7,3;DP=57;FAO=0,0,44,6;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,9,6;FSAR=0,0,35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.71446,-0.31143,-0.230464,-0.0772588;FXX=0.180298;HRUN=17,17,17,17;LEN=1,2,3,1;MLLD=3.20447,6.96251,9.74333,223.129;QD=30.1266;RBI=1.17032,0.570918,0.395103,0.0880149;REFB=0,0,0,0;REVB=0.926933,0.478497,0.320925,0.0421628;RO=4;SAF=0,0,0,3;SAR=7,12,7,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0.782218;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=0,0.0386568,-0.00181036,0.129259;OID=.,.,.,.;OPOS=179542291,179542291,179542291,179542302;OREF=A,AA,AAA,A;OALT=-,-,-,T;OMAPALT=TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/4:0,0,0.88,0.12:7,12,7,3:57:0,0,44,6:50:0:0,0,9,6:0,0,35,0:0:0:30:4:0,0,0,3:7,12,7,0:0:4 chr5 179555407 . T C 1527.96 PASS AF=0.989796;AO=95;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00984169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.427;QD=62.3658;RBI=0.011567;REFB=-0.0690822;REVB=0.00607761;RO=0;SAF=60;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-2.30891e-05;OID=.;OPOS=179555407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:0:1:95:97:0.989796:35:60:0:0:36:61:1:0 chr5 179563435 . T C 143.13 PASS AF=0.327586;AO=18;DP=57;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0638656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0711;QD=9.87072;RBI=0.071914;REFB=-0.00962778;REVB=-0.0330578;RO=39;SAF=9;SAR=9;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739009;STB=0.560515;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0156721;OID=.;OPOS=179563435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:39:39:18:19:0.327586:9:9:22:17:10:9:22:17 chr5 179729519 . A G 1098.52 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0318373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6968;QD=60.193;RBI=0.0392339;REFB=0;REVB=0.0229278;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.13634e-05;OID=.;OPOS=179729519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:39:34:0:0:39:34:0:0 chr5 179740827 . T C 577.73 PASS AF=0.4125;AO=66;DP=160;FAO=66;FDP=160;FR=.;FRO=94;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=62;FWDB=0.0166593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1892;QD=14.4432;RBI=0.0199814;REFB=-0.0211657;REVB=0.0110329;RO=94;SAF=32;SAR=34;SRF=32;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152659;STB=0.585341;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0305177;OID=.;OPOS=179740827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:94:94:66:66:0.4125:34:32:32:62:34:32:32:62 chr5 179744009 . T G 365.83 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00543406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.601;QD=18.7606;RBI=0.00543949;REFB=0.00150513;REVB=0.000243142;RO=40;SAF=16;SAR=22;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164087;STB=0.59135;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00135532;OID=.;OPOS=179744009;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:22:16:24:16:22:16:24:16 chr5 179996111 . C T 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.719;QD=63.5826;RBI=0.0156599;REFB=0;REVB=0.00910582;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.14182e-05;OID=.;OPOS=179996111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0 chr5 180046344 . G C 1264.71 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.269;QD=61.6932;RBI=0.0351266;REFB=0;REVB=0.0338536;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176965;OID=.;OPOS=180046344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0 chr5 180046492 . CAGAG CA,CAG 752.36 PASS AF=0,1;AO=5,40;DP=48;FAO=0,48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,33;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204643,0.0183438;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=293.21,312.548;QD=62.6965;RBI=0.0475337,0.0417413;REFB=0,0;REVB=0.042903,0.0374945;RO=0;SAF=3,29;SAR=2,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.97233e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0499428,3.13555e-05;OID=.,.;OPOS=180046494,180046493;OREF=GAG,AG;OALT=-,-;OMAPALT=CA,CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:5,40:48:0,48:48:0:0,33:0,15:0:0:4:0:3,29:2,11:0:0 chr5 180051010 . C T 81.95 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.00108637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.22;QD=8.6268;RBI=0.00604404;REFB=-0.0143689;REVB=-0.0059456;RO=27;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287106;STB=0.671375;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0329741;OID=.;OPOS=180051010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:6:5:6:21:6:5:6:21 chr5 180120149 . T C 376.57 PASS AF=0.673913;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0131767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.189;QD=32.7452;RBI=0.0136553;REFB=-0.036517;REVB=0.00358341;RO=14;SAF=10;SAR=21;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152254;STB=0.574418;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00508346;OID=.;OPOS=180120149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:14:15:31:31:0.673913:21:10:8:6:21:10:8:7 chr5 180120192 . G T 114.27 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0137756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.351;QD=10.1573;RBI=0.0139329;REFB=-0.0121345;REVB=-0.0020878;RO=31;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129853;STB=0.577669;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0348642;OID=.;OPOS=180120192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:7:7:12:19:7:7:12:19 chr5 180166461 . C G 530.02 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224432;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.788;QD=58.8913;RBI=0.0260913;REFB=0;REVB=-0.0133063;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570225;OID=.;OPOS=180166461;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0 chr5 180218668 . A G 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.178;QD=57.712;RBI=0.0322172;REFB=0;REVB=0.0223728;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108105;OID=.;OPOS=180218668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0 chr5 180276402 . C T 1194.25 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0391147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7907;QD=59.7126;RBI=0.0392029;REFB=-0.0636627;REVB=0.00262803;RO=1;SAF=45;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104046;STB=0.505493;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00158881;OID=.;OPOS=180276402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:34:45:1:0:34:45:1:0 chr5 180278393 . C G 323.46 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.198;QD=53.9105;RBI=0.0277346;REFB=0;REVB=0.00205504;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024214;OID=.;OPOS=180278393;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:7:16:0:0:7:17:0:0 chr5 180329359 . T C 655.58 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4834;QD=60.9839;RBI=0.0775846;REFB=0;REVB=0.0716887;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00275781;OID=.;OPOS=180329359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:17:25:0:0:18:25:0:0 chr5 180336849 . C T 1540.6 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.567;QD=59.8291;RBI=0.0288323;REFB=0;REVB=-0.0235254;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.16592e-05;OID=.;OPOS=180336849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:53:50:0:0:53:50:0:0 chr5 180338368 . A G 1540.58 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.723;QD=59.8283;RBI=0.136439;REFB=0;REVB=0.0183587;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161957;OID=.;OPOS=180338368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:58:45:0:0:58:45:0:0 chr5 180374534 . G A 1977.07 PASS AF=1;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00239778;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4337;QD=62.2699;RBI=0.0325122;REFB=0;REVB=0.0324236;RO=0;SAF=68;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133664;OID=.;OPOS=180374534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:127:0:0:127:127:1:59:68:0:0:59:68:0:0 chr5 180430869 . G A 432.28 PASS AF=0.494253;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0010613;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.6688;QD=19.8747;RBI=0.00755631;REFB=-0.00873555;REVB=-0.0074814;RO=44;SAF=24;SAR=19;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945379;STB=0.552362;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00731058;OID=.;OPOS=180430869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:44:43:43:0.494253:19:24:29:15:19:24:29:15 chr5 180432416 . C T 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0219405;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.471;QD=47.8146;RBI=0.0219474;REFB=-0.0163298;REVB=0.000549068;RO=1;SAF=15;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297929;STB=0.516114;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00017815;OID=.;OPOS=180432416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:6:15:1:0:6:15:1:0 chr5 180472498 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.453;QD=59.4351;RBI=0.0742158;REFB=0;REVB=-0.0613997;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.89521e-05;OID=.;OPOS=180472498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr5 180472513 . A G 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.027;QD=61.3353;RBI=0.0558333;REFB=0;REVB=-0.0374593;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2694e-06;OID=.;OPOS=180472513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chr5 180482899 . C T 586.32 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00814511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.67;QD=60.1355;RBI=0.0265516;REFB=0;REVB=-0.0252714;RO=0;SAF=31;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128651;OID=.;OPOS=180482899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:7:31:0:0:7:32:0:0 chr5 180486247 . G T 62.09 PASS AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0222303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.79;QD=7.52631;RBI=0.0268836;REFB=-0.0018889;REVB=0.0151175;RO=24;SAF=7;SAR=2;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213607;STB=0.636033;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00304428;OID=.;OPOS=180486247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:2:7:15:9:2:7:15:9 chr5 180551462 . G A 272.44 PASS AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0388753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9756;QD=12.5261;RBI=0.0471713;REFB=0.0106586;REVB=-0.0267177;RO=54;SAF=16;SAR=16;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101513;STB=0.563179;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-0.0197973;OID=.;OPOS=180551462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:54:55:32:32:0.367816:16:16:32:22:16:16:33:22 chr5 180582604 . A G 291.51 PASS AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.028087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5639;QD=33.3155;RBI=0.0295751;REFB=-0.0403534;REVB=0.00926314;RO=10;SAF=5;SAR=20;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208942;STB=0.615283;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0124744;OID=.;OPOS=180582604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:20:5:5:5:20:5:5:5 chr5 180596597 . A G 769.84 PASS AF=0.473373;AO=80;DP=167;FAO=80;FDP=169;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=34;FWDB=-0.0602011;FXX=0.0116952;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.6524;QD=18.2211;RBI=0.0658349;REFB=0.0160111;REVB=0.0266472;RO=86;SAF=45;SAR=35;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404216;STB=0.529894;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.0169176;OID=.;OPOS=180596597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:86:89:80:80:0.473373:35:45:52:34:35:45:55:34 chr5 180600638 . T C 1212.79 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00411597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.908;QD=59.891;RBI=0.0712006;REFB=-0.122226;REVB=0.0710815;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000546022;OID=.;OPOS=180600638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:43:37:0:0:43:37:0:1 chr5 180600702 . G C 230.28 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0167789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.122;QD=14.1709;RBI=0.0167956;REFB=-0.0122903;REVB=-0.000748436;RO=32;SAF=6;SAR=21;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218183;STB=0.686125;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0162767;OID=.;OPOS=180600702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:38:27:27:0.415385:21:6:13:19:21:6:19:19 chr5 180615933 . T C 304.13 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0132576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.719;QD=17.379;RBI=0.0133249;REFB=-0.0202349;REVB=-0.0013381;RO=37;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156618;STB=0.587577;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0202619;OID=.;OPOS=180615933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:15:18:14:23:15:18:14:23 chr5 180618713 . A AC 1076.53 PASS AF=1;AO=93;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.7239;QD=43.4961;RBI=0.125736;REFB=0;REVB=-0.099098;RO=6;SAF=42;SAR=51;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248262;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000212411;OID=.;OPOS=180618714;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:93:101:99:99:0:46:53:0:0:20:6:42:51:4:2 chr5 180626927 . A G 591.21 PASS AF=0.449275;AO=62;DP=138;FAO=62;FDP=138;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=0.00452153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.412;QD=17.1366;RBI=0.00453103;REFB=-0.00857198;REVB=-0.000293258;RO=72;SAF=25;SAR=37;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199987;STB=0.617487;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0120236;OID=.;OPOS=180626927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:72:76:62:62:0.449275:37:25:44:28:37:25:47:29 chr6 203878 . C T 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0448511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.171;QD=12.1434;RBI=0.0482575;REFB=-0.0174451;REVB=0.0178093;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11387;STB=0.564449;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0161961;OID=.;OPOS=203878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:33:19:19:0.365385:10:9:18:13:10:9:19:14 chr6 203909 . A G 211.36 PASS AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.000909899;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.288;QD=16.9091;RBI=0.00165314;REFB=-0.019924;REVB=-0.0013802;RO=26;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128261;STB=0.561472;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0278861;OID=.;OPOS=203909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:26:27:23:23:0.46:12:11:16:10:12:11:16:11 chr6 204072 . G T 428.54 PASS AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0197009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.231;QD=22.262;RBI=0.0350331;REFB=-0.000858194;REVB=-0.0289688;RO=35;SAF=23;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746852;STB=0.541157;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.000532377;OID=.;OPOS=204072;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:35:35:42:42:0.545455:19:23:16:19:19:23:16:19 chr6 335175 . A T 765.71 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00165546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.849;QD=63.8093;RBI=0.0245391;REFB=0;REVB=0.0244832;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38852e-05;OID=.;OPOS=335175;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:48:0:0:45:48:1:27:18:0:0:29:19:0:0 chr6 348906 . G A 513.65 PASS AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0140014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.224;QD=24.4593;RBI=0.0182432;REFB=-0.0172153;REVB=0.011695;RO=36;SAF=13;SAR=35;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286698;STB=0.657825;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00722697;OID=.;OPOS=348906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:35:13:22:14:35:13:22:14 chr6 350829 . G A 204.04 PASS AF=0.216216;AO=32;DP=147;FAO=32;FDP=148;FR=.;FRO=116;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=72;FWDB=-0.00889152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.647;QD=5.51446;RBI=0.00985643;REFB=-0.00152899;REVB=-0.00425325;RO=115;SAF=10;SAR=22;SRF=44;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980868;STB=0.558233;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0055448;OID=.;OPOS=350829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:115:116:32:32:0.216216:22:10:44:71:22:10:44:72 chr6 350940 . T TA 359.95 PASS AF=0.478632;AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=-0.0438925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.7876;QD=12.306;RBI=0.0553529;REFB=-0.0121909;REVB=0.0337253;RO=62;SAF=24;SAR=32;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137056;STB=0.581605;STBP=0.127;TYPE=ins;VARB=0.013873;OID=.;OPOS=350941;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.478632:56:118:56:117:61:24:32:17:44:99:62:24:32:18:44 chr6 393359 . G C 335.14 PASS AF=0.467742;AO=25;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.000557513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.392;QD=21.6219;RBI=0.00990122;REFB=-0.0237199;REVB=0.00988551;RO=27;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069568;STB=0.568726;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0403278;OID=.;OPOS=393359;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:25:29:0.467742:13:12:15:12:17:12:15:12 chr6 408012 . G A 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.993;QD=58.7817;RBI=0.0405989;REFB=0;REVB=0.0127638;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143062;OID=.;OPOS=408012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0 chr6 408079 . C T 458.54 PASS AF=0.435897;AO=51;DP=117;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0175875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.228;QD=15.6765;RBI=0.0252927;REFB=-0.0173343;REVB=-0.0181769;RO=64;SAF=27;SAR=24;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603415;STB=0.525141;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.026774;OID=.;OPOS=408079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:66:51:51:0.435897:24:27:30:34:24:27:32:34 chr6 564145 . A G 74.05 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0.0536729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0717;QD=10.2139;RBI=0.0636103;REFB=-0.0102493;REVB=0.0341392;RO=19;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.516889;STB=0.787564;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0172445;OID=.;OPOS=564145;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:7:3:0:19:7:3:0:19 chr6 599209 . T C 279.89 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.00537536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.662;QD=14.1717;RBI=0.00541864;REFB=-0.0025285;REVB=0.00068354;RO=47;SAF=11;SAR=21;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446809;STB=0.525437;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00305758;OID=.;OPOS=599209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:21:11:18:29:21:11:18:29 chr6 610088 . C T 444.84 PASS AF=0.46875;AO=44;DP=97;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00628584;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8536;QD=18.5351;RBI=0.00950499;REFB=-0.00572989;REVB=0.00712973;RO=51;SAF=26;SAR=18;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980771;STB=0.546964;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00579615;OID=.;OPOS=610088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:51:51:44:45:0.46875:18:26:25:26:19:26:25:26 chr6 656143 . C A 406.16 PASS AF=0.555556;AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.028181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7861;QD=22.5641;RBI=0.0282918;REFB=-0.0133477;REVB=-0.00250118;RO=32;SAF=11;SAR=29;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630006;STB=0.50347;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0118219;OID=.;OPOS=656143;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:0.555556:29:11:9:23:29:11:9:23 chr6 656343 . T C 283.2 PASS AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0783172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.6975;QD=12.5865;RBI=0.0790405;REFB=-0.0103839;REVB=-0.0106688;RO=54;SAF=13;SAR=20;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768306;STB=0.52923;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00909225;OID=.;OPOS=656343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:57:33:33:0.366667:20:13:25:29:20:13:25:32 chr6 656555 . G T 75.6 PASS AF=0.642857;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00341722;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.509;QD=21.5989;RBI=0.00636281;REFB=0.00334471;REVB=0.00536731;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038662;STB=0.516093;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.00200496;OID=.;OPOS=656555;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:15:14:6:5:9:9:0.642857:4:5:3:3:4:5:3:2 chr6 656810 . A G 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0144212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.206;QD=18.6371;RBI=0.0305908;REFB=-0.0188566;REVB=-0.0269782;RO=15;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21392;STB=0.642666;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0187155;OID=.;OPOS=656810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:12:4:7:8:12:4:8:8 chr6 1395043 . T C 1059.54 PASS AF=0.528796;AO=101;DP=191;FAO=101;FDP=191;FR=.;FRO=90;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=-0.0144629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.496;QD=22.1893;RBI=0.018872;REFB=-0.00517618;REVB=0.0121235;RO=89;SAF=63;SAR=38;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15233;STB=0.581029;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00578959;OID=.;OPOS=1395043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:89:90:101:101:0.528796:38:63:40:49:38:63:41:49 chr6 1507626 . G A 437.11 PASS AF=0.5375;AO=41;DP=79;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00525167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.632;QD=21.8557;RBI=0.00696319;REFB=-0.0191477;REVB=-0.0045723;RO=37;SAF=15;SAR=26;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107726;STB=0.567187;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0142356;OID=.;OPOS=1507626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:37:37:41:43:0.5375:26:15:18:19:28:15:18:19 chr6 1507808 . G T 783.03 PASS AF=0.517241;AO=75;DP=145;FAO=75;FDP=145;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.00262239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.343;QD=21.6008;RBI=0.00329215;REFB=-0.00654892;REVB=0.00199031;RO=69;SAF=22;SAR=53;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203417;STB=0.616247;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00909956;OID=.;OPOS=1507808;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:69:70:75:75:0.517241:53:22:35:34:53:22:36:34 chr6 1523145 . C G 657.09 PASS AF=0.852459;AO=53;DP=61;FAO=52;FDP=61;FR=.;FRO=9;FSAF=43;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0379297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5211;QD=43.0876;RBI=0.0481601;REFB=0.0139482;REVB=-0.029677;RO=3;SAF=44;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133726;STB=0.64856;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00745067;OID=.;OPOS=1523145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:61:61:3:9:53:52:0.852459:9:44:0:3:9:43:1:8 chr6 2623820 . G A 224.88 PASS AF=0.488889;AO=21;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00340285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1801;QD=19.9894;RBI=0.0695952;REFB=-0.0269196;REVB=0.0695119;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161807;STB=0.599911;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0549818;OID=.;OPOS=2623820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:23:23:21:22:0.488889:11:10:15:8:12:10:15:8 chr6 2624053 . T A 414.02 PASS AF=0.443299;AO=42;DP=96;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00204835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.536;QD=17.0729;RBI=0.0039814;REFB=-0.0166251;REVB=-0.00341406;RO=54;SAF=18;SAR=24;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00270624;STB=0.509007;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0212844;OID=.;OPOS=2624053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:54:54:42:43:0.443299:24:18:23:31:24:19:23:31 chr6 2664375 . C A 293.29 PASS AF=0.590909;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0195225;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.02;QD=26.6626;RBI=0.0240631;REFB=-0.0276859;REVB=-0.0140678;RO=18;SAF=15;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161208;STB=0.508922;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00986481;OID=.;OPOS=2664375;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:18:18:26:26:0.590909:11:15:10:8:11:15:10:8 chr6 2667031 . A G 170.31 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00823454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.534;QD=17.0312;RBI=0.0120917;REFB=0.000147169;REVB=0.0088544;RO=21;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137043;STB=0.59988;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.000161265;OID=.;OPOS=2667031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:4:14:14:7:4:14:14:8 chr6 2667863 . ATTTTTTT AATTTTTT,ATTTTTAA,ATTTTTT,ATTTTTTA 169.17 PASS AF=0.030303,0.030303,0.606061,0.242424;AO=6,2,4,5;DP=28;FAO=1,1,20,8;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=0,1,9,6;FSAR=1,0,11,2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.115624,-0.14115,-0.45397,-0.273095;FXX=0.0294031;HRUN=7,7,7,7;LEN=1,2,1,1;MLLD=7.39168,18.8745,8.59125,8.4179;QD=20.5051;RBI=0.165808,0.151778,0.507506,0.293033;REFB=-0.0790902,-0.0426223,-0.0364848,-0.0714081;REVB=0.118841,0.0557945,0.226878,0.106243;RO=5;SAF=0,2,1,4;SAR=6,0,3,1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.731761,0.705406,0.0609289,0.487487;STB=0.985111,0.990053,0.515403,0.631225;STBP=0.528,0.474,0.761,0.277;TYPE=snp,mnp,del,snp;VARB=-0.0705945,0.117495,-0.0295117,-0.0145589;OID=.,.,.,.;OPOS=2667864,2667869,2667864,2667870;OREF=T,TT,T,T;OALT=A,AA,-,A;OMAPALT=AATTTTTT,ATTTTTAA,ATTTTTT,ATTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/4:0.030303,0.030303,0.606061,0.242424:6,2,4,5:28:1,1,20,8:33:3:0,1,9,6:1,0,11,2:1:2:21:5:0,2,1,4:6,0,3,1:1:4 chr6 2679676 . G A 413.7 PASS AF=0.525641;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0211985;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.024;QD=21.2155;RBI=0.0360775;REFB=-0.0226541;REVB=0.0291927;RO=36;SAF=19;SAR=22;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877852;STB=0.55384;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0112827;OID=.;OPOS=2679676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:37:41:41:0.525641:22:19:13:23:22:19:13:24 chr6 2749381 . C T 670.7 PASS AF=0.496296;AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.0174416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.639;QD=19.8727;RBI=0.0174624;REFB=-0.0132514;REVB=0.000851544;RO=68;SAF=34;SAR=33;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873765;STB=0.548159;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0130927;OID=.;OPOS=2749381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:68:68:67:67:0.496296:33:34:41:27:33:34:41:27 chr6 2766465 . T C 36.38 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.017935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.161;QD=6.92939;RBI=0.0228612;REFB=-0.0158703;REVB=-0.0141763;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35867;STB=0.726564;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0453372;OID=.;OPOS=2766465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:10:5:4:2:10:5 chr6 2955802 . T C 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.831;QD=60.716;RBI=0.0203941;REFB=0;REVB=-0.0081822;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3717e-05;OID=.;OPOS=2955802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:40:36:0:0:40:36:0:0 chr6 3010390 . C T 854.04 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0286842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6353;QD=56.0024;RBI=0.0287575;REFB=0.0605703;REVB=-0.00205195;RO=1;SAF=35;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132943;STB=0.50704;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00501861;OID=.;OPOS=3010390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:25:35:1:0:25:35:1:0 chr6 3015790 . A G 1771.98 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119858;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.122;QD=61.1029;RBI=0.01495;REFB=0;REVB=0.00893551;RO=0;SAF=55;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46891e-05;OID=.;OPOS=3015790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:116:0:0:117:116:1:62:55:0:0:62:54:0:0 chr6 3019927 . G C 314.84 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.000583384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.665;QD=19.9898;RBI=0.0274902;REFB=-0.0422041;REVB=-0.027484;RO=29;SAF=11;SAR=22;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108527;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0184998;OID=.;OPOS=3019927;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:30:33:33:0.52381:22:11:10:19:22:11:10:20 chr6 3077141 . T C 2017.81 PASS AF=0.950704;AO=135;DP=145;FAO=135;FDP=142;FR=.;FRO=7;FSAF=56;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0253313;FXX=0.0206882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.99;QD=56.8398;RBI=0.0505166;REFB=-0.0455273;REVB=-0.0437064;RO=6;SAF=56;SAR=79;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207266;STB=0.51387;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00106962;OID=.;OPOS=3077141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:145:142:6:7:135:135:0.950704:79:56:1:5:79:56:1:6 chr6 3154871 . A C 69.43 PASS AF=0.123077;AO=15;DP=129;FAO=16;FDP=130;FR=.;FRO=114;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=58;FWDB=-0.00460986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.928;QD=2.13645;RBI=0.0257162;REFB=-0.0039779;REVB=-0.0252996;RO=113;SAF=7;SAR=8;SRF=56;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354196;STB=0.547238;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0536834;OID=.;OPOS=3154871;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:129:130:113:114:15:16:0.123077:8:7:56:57:9:7:56:58 chr6 3225759 . C A 57.92 PASS AF=0.166667;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.00507146;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2651;QD=3.86152;RBI=0.0112326;REFB=0.00115305;REVB=-0.0100226;RO=48;SAF=8;SAR=2;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483525;STB=0.8199;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.0064923;OID=.;OPOS=3225759;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:61:60:48:50:10:10:0.166667:2:8:19:29:2:8:20:30 chr6 3255327 . G A 1438.37 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0139167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9009;QD=61.8655;RBI=0.0545795;REFB=-0.0123153;REVB=-0.0527754;RO=1;SAF=43;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108971;STB=0.505746;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=4.09394e-06;OID=.;OPOS=3255327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:49:43:1:0:49:43:1:0 chr6 3255340 . A C 1659.62 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.226;QD=60.3498;RBI=0.027458;REFB=0;REVB=-0.0179876;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47394e-06;OID=.;OPOS=3255340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:58:52:0:0:58:52:0:0 chr6 3264487 . T C 1538.5 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0982525;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.115;QD=64.104;RBI=0.103017;REFB=0;REVB=0.0309675;RO=0;SAF=39;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003878;OID=.;OPOS=3264487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:57:39:0:0:57:39:0:0 chr6 3264502 . G C 1290.88 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0396269;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.199;QD=60.7474;RBI=0.0400488;REFB=-0.0829985;REVB=-0.00579799;RO=1;SAF=38;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123019;STB=0.506492;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000375155;OID=.;OPOS=3264502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:85:1:1:84:84:0.988235:46:38:1:0:46:38:1:0 chr6 3285286 . A G 1953.36 PASS AF=0.992188;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0182618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9469;QD=61.0425;RBI=0.0325902;REFB=-0.0854723;REVB=-0.0269932;RO=1;SAF=60;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703987;STB=0.503703;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00371914;OID=.;OPOS=3285286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:128:128:1:1:127:127:0.992188:67:60:0:1:67:60:0:1 chr6 3287118 . T C 266.97 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0341188;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9905;QD=48.5394;RBI=0.0463534;REFB=-0.0503058;REVB=-0.0313774;RO=1;SAF=8;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542216;STB=0.529383;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00177722;OID=.;OPOS=3287118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:22:1:1:21:21:0.954545:13:8:1:0:13:8:1:0 chr6 3438738 . G A 941.02 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00907215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.52;QD=57.0313;RBI=0.0281968;REFB=-0.0216414;REVB=0.0266975;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000185772;OID=.;OPOS=3438738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:30:35:0:0:30:35:0:1 chr6 3439595 . G GA 380.68 PASS AF=1;AO=33;DP=37;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.099808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.3665;QD=46.1424;RBI=0.100444;REFB=0;REVB=-0.0112823;RO=4;SAF=17;SAR=16;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00349099;OID=.;OPOS=3439596;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:33:37:33:33:0:17:16:0:0:7:4:17:16:4:0 chr6 3851193 . C G 277.95 PASS AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00415828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.167;QD=13.7258;RBI=0.0163106;REFB=-0.0144134;REVB=-0.0157716;RO=49;SAF=14;SAR=18;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341882;STB=0.519489;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0220585;OID=.;OPOS=3851193;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:49:32:32:0.395062:18:14:23:26:18:14:23:26 chr6 4031998 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.462;QD=37.4885;RBI=0.055287;REFB=0;REVB=0.0186611;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121949;OID=.;OPOS=4031998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr6 4069166 . C T 266.14 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00464014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5361;QD=21.2912;RBI=0.0417259;REFB=-0.00372246;REVB=-0.0414671;RO=25;SAF=11;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106875;STB=0.559952;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00544469;OID=.;OPOS=4069166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:14:11:14:11:14:11:14:11 chr6 4069685 . C T 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00220299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.749;QD=16.043;RBI=0.0189698;REFB=-0.0217633;REVB=-0.0188414;RO=26;SAF=12;SAR=7;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973853;STB=0.556037;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0294042;OID=.;OPOS=4069685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:7:12:14:12:7:12:14:12 chr6 4074612 . A C 840.51 PASS AF=0.480447;AO=86;DP=179;FAO=86;FDP=179;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=0.00426777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.123;QD=18.7824;RBI=0.0113107;REFB=-0.0113942;REVB=-0.0104746;RO=91;SAF=44;SAR=42;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364364;STB=0.514416;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0140377;OID=.;OPOS=4074612;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:91:93:86:86:0.480447:42:44:43:48:42:44:45:48 chr6 4074634 . C A 700.46 PASS AF=0.449704;AO=75;DP=168;FAO=76;FDP=169;FR=.;FRO=93;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=50;FSRR=43;FWDB=-5.66993e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.648;QD=16.5789;RBI=0.00589205;REFB=-0.0337561;REVB=-0.00589178;RO=91;SAF=32;SAR=43;SRF=50;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121308;STB=0.564439;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.024293;OID=.;OPOS=4074634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:91:93:75:76:0.449704:43:32:50:41:44:32:50:43 chr6 4079858 . C G 532.35 PASS AF=0.482759;AO=55;DP=116;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=53;FWDB=-0.0202226;FXX=0.0169477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.304;QD=18.357;RBI=0.0207326;REFB=-0.0290656;REVB=-0.00457014;RO=57;SAF=24;SAR=31;SRF=6;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328755;STB=0.679118;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0398068;OID=.;OPOS=4079858;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:60:55:56:0.482759:31:24:6:51:31:25:7:53 chr6 4079875 . T C 491.19 PASS AF=0.40146;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=137;FR=.;FRO=82;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=60;FWDB=0.00786777;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8517;QD=14.3412;RBI=0.0382552;REFB=-0.0203716;REVB=-0.0374374;RO=82;SAF=19;SAR=36;SRF=22;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0939351;STB=0.552709;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0232906;OID=.;OPOS=4079875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:82:82:55:55:0.40146:36:19:22:60:36:19:22:60 chr6 4087934 . G C 332.39 PASS AF=0.530303;AO=33;DP=64;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0168426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.211;QD=20.1447;RBI=0.017983;REFB=0.00447755;REVB=0.00630186;RO=29;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819199;STB=0.544486;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00374878;OID=.;OPOS=4087934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:29:31:33:35:0.530303:15:18:13:16:17:18:13:18 chr6 4115758 . C T 418.34 PASS AF=0.661017;AO=39;DP=59;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0274879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.58;QD=28.3618;RBI=0.0276191;REFB=-0.0132092;REVB=0.00268859;RO=20;SAF=28;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186753;STB=0.602095;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00736741;OID=.;OPOS=4115758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:20:20:39:39:0.661017:11:28:9:11:11:28:9:11 chr6 4116262 . G A 148.14 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0809427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.089;QD=17.9558;RBI=0.0813652;REFB=-0.0186618;REVB=-0.00828181;RO=17;SAF=2;SAR=14;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431532;STB=0.752309;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00649084;OID=.;OPOS=4116262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:14:2:8:9:14:2:8:9 chr6 4122249 . C A 235.31 PASS AF=0.479167;AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0262716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.037;QD=19.6088;RBI=0.0840906;REFB=-0.00539311;REVB=-0.0798814;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615519;STB=0.544588;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0026862;OID=.;OPOS=4122249;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:25:25:22:23:0.479167:12:10:13:12:13:10:13:12 chr6 4133855 . C T 604.86 PASS AF=0.545455;AO=58;DP=110;FAO=60;FDP=110;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0213805;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.426;QD=21.9949;RBI=0.0272564;REFB=-0.0101125;REVB=-0.0169051;RO=50;SAF=23;SAR=35;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379016;STB=0.518791;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00881389;OID=.;OPOS=4133855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:50:50:58:60:0.545455:35:23:22:28:36:24:22:28 chr6 4428223 . C G 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.011406;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.416;QD=11.1041;RBI=0.0122007;REFB=-0.0103791;REVB=0.00433126;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258458;STB=0.655317;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0168789;OID=.;OPOS=4428223;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:7:3:4:3:7:3 chr6 5086558 . C A 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.936;QD=64.4142;RBI=0.0639204;REFB=0;REVB=0.0636267;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232453;OID=.;OPOS=5086558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0 chr6 5139012 . C A 214.24 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0916796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1769;QD=45.1041;RBI=0.102554;REFB=-0.00924023;REVB=-0.045958;RO=1;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611153;STB=0.533296;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00419707;OID=.;OPOS=5139012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:7:11:0:1:7:11:0:1 chr6 5260936 . A C 752.17 PASS AF=0.420792;AO=84;DP=201;FAO=85;FDP=202;FR=.;FRO=117;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=66;FWDB=-0.0147605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.097;QD=14.8944;RBI=0.0147633;REFB=-0.0303106;REVB=0.000288395;RO=117;SAF=40;SAR=44;SRF=51;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421475;STB=0.526986;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0350521;OID=.;OPOS=5260936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:117:117:84:85:0.420792:44:40:51:66:44:41:51:66 chr6 5431340 . A G 625.84 PASS AF=0.575472;AO=60;DP=106;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.00276052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.835;QD=23.6167;RBI=0.0150195;REFB=-0.00984255;REVB=0.0147637;RO=45;SAF=34;SAR=26;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21527;STB=0.612483;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00544719;OID=.;OPOS=5431340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:45:45:60:61:0.575472:26:34:13:32:27:34:13:32 chr6 6145726 . A G 2328.66 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.007;QD=60.4846;RBI=0.0238379;REFB=0;REVB=0.0113554;RO=0;SAF=79;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.85878e-05;OID=.;OPOS=6145726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:154:0:0:149:154:1:70:79:0:0:72:82:0:0 chr6 6320808 . T G 2408.79 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1727;QD=64.2345;RBI=0.0645528;REFB=0;REVB=-0.0474986;RO=0;SAF=83;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262664;OID=.;OPOS=6320808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:67:83:0:0:67:83:0:0 chr6 6321128 . T C 88.2 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.143;QD=39.202;RBI=0.016457;REFB=0;REVB=0.016457;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37164e-05;OID=.;OPOS=6321128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:9:0:0:0:9:0:0:0 chr6 6938928 . C T 463.33 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00428277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.8101;QD=52.9521;RBI=0.0170056;REFB=-0.159801;REVB=-0.0164574;RO=1;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227903;STB=0.523795;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00654597;OID=.;OPOS=6938928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:1:2:33:33:0.942857:20:13:0:1:20:13:0:2 chr6 7247248 . T C 139.08 PASS AF=0.535714;AO=14;DP=27;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0543609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.81;QD=19.8691;RBI=0.0573501;REFB=-0.0247461;REVB=0.0182736;RO=13;SAF=2;SAR=12;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303956;STB=0.683919;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0187198;OID=.;OPOS=7247248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:28:13:13:14:15:0.535714:12:2:5:8:13:2:5:8 chr6 7288544 . A C 152.45 PASS AF=0.571429;AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0321575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5008;QD=21.7789;RBI=0.110512;REFB=-0.00688665;REVB=0.10573;RO=13;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249743;STB=0.518844;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0118668;OID=.;OPOS=7288544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:27:28:13:12:14:16:0.571429:9:5:5:8:10:6:5:7 chr6 7289957 . CCA C 115.78 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00666323;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=2;MLLD=232.299;QD=10.0681;RBI=0.0261041;REFB=-0.00852806;REVB=-0.0252393;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668713;STB=0.546713;STBP=0.611;TYPE=del;VARB=0.0112474;OID=.;OPOS=7289958;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.413043:19:46:19:46:27:7:12:12:15:99:23:7:12:10:13 chr6 7295283 . T A 155.93 PASS AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0507432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0359;QD=10.9424;RBI=0.0512989;REFB=-0.0212934;REVB=-0.0075305;RO=37;SAF=3;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471401;STB=0.780477;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0140367;OID=.;OPOS=7295283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:17:3:19:18:17:3:19:18 chr6 7393452 . C T 785.85 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0202;QD=64.151;RBI=0.0256822;REFB=0;REVB=0.0227466;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.274e-05;OID=.;OPOS=7393452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr6 7563983 . T G 2359.1 PASS AF=1;AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00688077;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0754;QD=64.1931;RBI=0.00872423;REFB=0;REVB=0.0053635;RO=0;SAF=80;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.81827e-05;OID=.;OPOS=7563983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:149:147:0:0:147:147:1:67:80:0:0:67:80:0:0 chr6 7572262 . A G 221.2 PASS AF=0.440678;AO=25;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0059491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.65;QD=14.9968;RBI=0.00665193;REFB=-0.0205628;REVB=-0.00297597;RO=32;SAF=8;SAR=17;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126066;STB=0.589672;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0203637;OID=.;OPOS=7572262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:32:33:25:26:0.440678:17:8:14:18:18:8:15:18 chr6 7576527 . G A 371.97 PASS AF=0.62069;AO=36;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00734532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.649;QD=25.653;RBI=0.02142;REFB=-0.00288104;REVB=-0.0201212;RO=22;SAF=16;SAR=20;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0070757;STB=0.503874;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00170227;OID=.;OPOS=7576527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:22:22:36:36:0.62069:20:16:10:12:20:16:10:12 chr6 7577260 . C T 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0051666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1059;QD=16.1064;RBI=0.0245676;REFB=0.00433924;REVB=-0.0240182;RO=22;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608231;STB=0.534914;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.00606702;OID=.;OPOS=7577260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:8:9:13:9:8:9:13:9 chr6 7581636 . G A 256.03 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.019746;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4251;QD=19.6946;RBI=0.0387088;REFB=-0.00774817;REVB=0.0332937;RO=25;SAF=7;SAR=20;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25077;STB=0.640914;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00937411;OID=.;OPOS=7581636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:25:25:27:27:0.519231:20:7:13:12:20:7:13:12 chr6 7585967 . G C 82.32 PASS AF=0.588235;AO=8;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0181724;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.149;QD=19.3686;RBI=0.0190283;REFB=-0.0397091;REVB=0.00564276;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566609;STB=0.529353;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0280083;OID=.;OPOS=7585967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:8:10:0.588235:4:4:3:4:5:5:3:4 chr6 7601720 . C T 300.86 PASS AF=0.36;AO=36;DP=101;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0342822;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0693;QD=12.0342;RBI=0.0537785;REFB=-0.0207692;REVB=-0.041435;RO=64;SAF=16;SAR=20;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079467;STB=0.545632;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0363916;OID=.;OPOS=7601720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:64:64:36:36:0.36:20:16:33:31:20:16:33:31 chr6 7862631 . G C 1317.24 PASS AF=1;AO=71;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736426;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.794;QD=61.9877;RBI=0.0743208;REFB=0;REVB=0.0100178;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133563;OID=.;OPOS=7862631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:71:85:1:32:39:0:0:33:52:0:0 chr6 7986847 . G A 419.26 PASS AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.00657529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.21;QD=20.2051;RBI=0.00844052;REFB=-0.0195555;REVB=-0.00529226;RO=39;SAF=7;SAR=35;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187866;STB=0.628673;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0281487;OID=.;OPOS=7986847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:41:42:42:0.506024:35:7:12:27:35:7:14:27 chr6 7987560 . C T 434.13 PASS AF=0.463158;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0475696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3194;QD=18.2791;RBI=0.0702274;REFB=-0.0269932;REVB=-0.0516626;RO=51;SAF=23;SAR=21;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501155;STB=0.527964;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0376232;OID=.;OPOS=7987560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:51:51:44:44:0.463158:21:23:24:27:21:23:24:27 chr6 7988189 . T C 530.04 PASS AF=0.520833;AO=50;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.00389564;FXX=0.0204061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.792;QD=22.085;RBI=0.0415608;REFB=-0.0223641;REVB=-0.0413778;RO=44;SAF=25;SAR=25;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116053;STB=0.572888;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0284045;OID=.;OPOS=7988189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:44:46:50:50:0.520833:25:25:28:16:25:25:30:16 chr6 8015129 . T C 620.56 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450334;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.842;QD=62.0559;RBI=0.0465703;REFB=0;REVB=0.0118653;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021375;OID=.;OPOS=8015129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:28:12:0:0:28:12:0:0 chr6 8413890 . A G 217.63 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.025088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.703;QD=22.9081;RBI=0.0265864;REFB=-0.020235;REVB=0.00879942;RO=17;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517698;STB=0.52894;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0138823;OID=.;OPOS=8413890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:10:11:10:7:10:11:10:7 chr6 8428137 . A AAGT 389.47 PASS AF=0.965517;AO=24;DP=31;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00448833;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=3;MLLD=230.57;QD=53.7203;RBI=0.0333584;REFB=-0.0123867;REVB=0.033055;RO=1;SAF=14;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319609;STB=0.516118;STBP=0.501;TYPE=ins;VARB=0.000951695;OID=.;OPOS=8428138;OREF=-;OALT=AGT;OMAPALT=AAGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.965517:24:31:28:29:1:15:13:1:0:6:1:14:10:1:0 chr6 8430049 . G A 1572.99 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0523;QD=59.9235;RBI=0.0118243;REFB=0;REVB=-0.0104457;RO=0;SAF=40;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.91899e-05;OID=.;OPOS=8430049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:64:40:0:0:65:40:0:0 chr6 9900599 . T TGAG 656.25 PASS AF=0.439024;AO=72;DP=165;FAO=72;FDP=164;FR=.;FRO=92;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=0.0213053;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=3;MLLD=229.081;QD=16.006;RBI=0.022821;REFB=-0.0145123;REVB=0.00817819;RO=92;SAF=40;SAR=32;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00123035;STB=0.500686;STBP=0.998;TYPE=ins;VARB=0.0185919;OID=.;OPOS=9900600;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.439024:72:165:72:164:92:40:32:51:41:99:92:40:32:51:41 chr6 9933492 . G A 267.78 PASS AF=0.344086;AO=32;DP=93;FAO=32;FDP=93;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.0250203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.049;QD=11.5176;RBI=0.025225;REFB=-0.00482525;REVB=0.00320686;RO=61;SAF=9;SAR=23;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445861;STB=0.756134;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0187425;OID=.;OPOS=9933492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:61:61:32:32:0.344086:23:9:42:19:23:9:42:19 chr6 10401034 . CAAG C 555.07 PASS AF=0.910714;AO=46;DP=50;FAO=51;FDP=56;FR=.;FRO=5;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0276295;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=334.702;QD=39.6475;RBI=0.0306931;REFB=-0.00553585;REVB=0.013367;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.53126;STBP=0.12;TYPE=del;VARB=0.000513914;OID=.;OPOS=10401035;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.910714:46:50:51:56:5:28:23:1:4:9:0:23:23:0:0 chr6 10587038 . C G 740.06 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312056;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1038;QD=56.9278;RBI=0.0316383;REFB=0;REVB=-0.00521458;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235096;OID=.;OPOS=10587038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr6 10729020 . C T 1048.29 PASS AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0482091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5218;QD=56.6644;RBI=0.0635325;REFB=-0.104364;REVB=-0.0413795;RO=2;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02424;STB=0.512817;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00168579;OID=.;OPOS=10729020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:38:34:0:2:38:34:0:2 chr6 10753107 . T A 212.94 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0162333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.529;QD=12.526;RBI=0.0163079;REFB=-0.0141048;REVB=-0.00155736;RO=41;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865399;STB=0.543292;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.033887;OID=.;OPOS=10753107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:41:42:26:26:0.382353:16:10:19:22:16:10:19:23 chr6 10763312 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.864;QD=56.1916;RBI=0.0177955;REFB=0;REVB=0.017335;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35721e-05;OID=.;OPOS=10763312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0 chr6 10764727 . A G 1175.5 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306436;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.85;QD=61.0647;RBI=0.00318027;REFB=0;REVB=-0.000850764;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.84465e-05;OID=.;OPOS=10764727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr6 10874846 . G A 285.1 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00602913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.024;QD=23.7581;RBI=0.0235103;REFB=-0.000970614;REVB=0.0227241;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183204;STB=0.510196;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00164151;OID=.;OPOS=10874846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:10:16:14:8:10:16:14:8 chr6 10891781 . C T 773.01 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334952;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.149;QD=57.2597;RBI=0.0219347;REFB=0;REVB=-0.0216774;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283763;OID=.;OPOS=10891781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:26:27:0:0:26:28:0:0 chr6 10906256 . A G 964.33 PASS AF=0.971014;AO=68;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00729142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4459;QD=55.903;RBI=0.027008;REFB=-0.097654;REVB=-0.0260052;RO=1;SAF=41;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113897;STB=0.50341;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00280442;OID=.;OPOS=10906256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:1:2:68:67:0.971014:27:41:1:0:26:41:1:1 chr6 10955408 . C T 481.75 PASS AF=0.944444;AO=32;DP=34;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0811494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2346;QD=53.5278;RBI=0.0931583;REFB=-0.0753927;REVB=0.0457519;RO=2;SAF=18;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490904;STB=0.523796;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0159512;OID=.;OPOS=10955408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:34:36:2:2:32:34:0.944444:14:18:2:0:14:20:2:0 chr6 10981053 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.186;QD=51.1846;RBI=0.0067056;REFB=0;REVB=-0.00467887;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.33771e-07;OID=.;OPOS=10981053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr6 11079286 . G A 465.02 PASS AF=0.419355;AO=52;DP=125;FAO=52;FDP=124;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=0.00501922;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3101;QD=15.0006;RBI=0.00514746;REFB=-0.00140547;REVB=-0.00114183;RO=72;SAF=18;SAR=34;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286825;STB=0.661049;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00153538;OID=.;OPOS=11079286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:72:72:52:52:0.419355:34:18:45:27:34:18:45:27 chr6 11185257 . A T 382.52 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0456632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2776;QD=52.7613;RBI=0.0536942;REFB=-0.0244217;REVB=-0.028248;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.523792;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000533975;OID=.;OPOS=11185257;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:1:0:18:10:1:0 chr6 11185533 . G A 1825.16 PASS AF=0.991736;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.022525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.369;QD=60.3358;RBI=0.0411584;REFB=-0.0444099;REVB=0.0344476;RO=1;SAF=54;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714322;STB=0.503759;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=5.69163e-05;OID=.;OPOS=11185533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:121:1:1:120:120:0.991736:66:54:0:1:66:54:0:1 chr6 11190626 . A G 1508.45 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0116505;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.14;QD=58.5808;RBI=0.0128844;REFB=0.208406;REVB=-0.00550219;RO=1;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939493;STB=0.50495;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.000676371;OID=.;OPOS=11190626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:102:102:0.990291:50:52:0:1:50:52:0:1 chr6 11192575 . C T 1158.43 PASS AF=0.987179;AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00134445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7138;QD=59.4068;RBI=0.0121392;REFB=-0.0572906;REVB=0.0120645;RO=1;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137144;STB=0.507245;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000429677;OID=.;OPOS=11192575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:78:78:1:1:76:77:0.987179:34:42:0:1:34:43:0:1 chr6 11193860 . G A 487.61 PASS AF=0.371069;AO=60;DP=160;FAO=59;FDP=159;FR=.;FRO=100;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=0.00223104;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.565;QD=12.2669;RBI=0.0178928;REFB=-0.00464612;REVB=0.0177531;RO=100;SAF=24;SAR=36;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165591;STB=0.601122;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00809803;OID=.;OPOS=11193860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:100:100:60:59:0.371069:36:24:55:45:36:23:55:45 chr6 11213832 . T C 327.31 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0233808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.457;QD=17.6924;RBI=0.0237622;REFB=-0.0245293;REVB=0.00424024;RO=39;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349191;STB=0.519542;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0320992;OID=.;OPOS=11213832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:21:14:17:22:21:14:17:22 chr6 11576130 . T C 1651.47 PASS AF=0.973913;AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0394368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.7625;QD=57.4424;RBI=0.059522;REFB=-0.122495;REVB=0.0445825;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514016;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00205947;OID=.;OPOS=11576130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:115:115:0:3:112:112:0.973913:52:60:0:0:52:60:0:3 chr6 11576175 . T C 553.82 PASS AF=0.518182;AO=57;DP=110;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.00739658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.254;QD=20.1388;RBI=0.0619262;REFB=-0.0273468;REVB=0.0614829;RO=53;SAF=28;SAR=29;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170901;STB=0.509413;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0266701;OID=.;OPOS=11576175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:53:53:57:57:0.518182:29:28:25:28:29:28:25:28 chr6 11644302 . T C 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6524;QD=35.5706;RBI=0.0872665;REFB=0;REVB=0.0669634;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0110017;OID=.;OPOS=11644302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr6 11644518 . C T 792.32 PASS AF=0.966102;AO=55;DP=58;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0744859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8233;QD=53.7164;RBI=0.0745994;REFB=0.0281693;REVB=-0.0041146;RO=2;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409364;STB=0.521731;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.00315009;OID=.;OPOS=11644518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:58:59:2:2:55:57:0.966102:22:33:0:2:22:35:0:2 chr6 11723636 . C T 755.97 PASS AF=1;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560796;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.794;QD=64.3375;RBI=0.0606646;REFB=0;REVB=0.023136;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365962;OID=.;OPOS=11723636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr6 11770334 . TA AT,T 124.89 PASS AF=0.0454545,0.909091;AO=2,15;DP=21;FAO=1,20;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=0,6;FSAR=1,14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0566463,0.0230538;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=2,1;MLLD=5.3587,8.52595;QD=22.7068;RBI=0.0566485,0.0953263;REFB=-0.0721571,0.00604588;REVB=0.000493937,0.0924966;RO=3;SAF=1,3;SAR=1,12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.142842,-0.060143;STB=0.5,0.517224;STBP=1,0.618;TYPE=mnp,del;VARB=-0.0371767,0.0261628;OID=.,.;OPOS=11770334,11770335;OREF=TA,A;OALT=AT,-;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:5:21:22:3:1:2,15:1,20:0.0454545,0.909091:1,12:1,3:1:2:1,14:0,6:0:1 chr6 12122645 . A G 870.7 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236361;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.143;QD=58.0467;RBI=0.0237691;REFB=0;REVB=-0.00251119;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79967e-06;OID=.;OPOS=12122645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr6 12122773 . T C 118.33 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00209658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.315;QD=12.792;RBI=0.0104194;REFB=0.00234919;REVB=-0.0102063;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188687;STB=0.610532;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.00390602;OID=.;OPOS=12122773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:6:8:9:14:6:8:9:14 chr6 12124587 . C G 253.6 PASS AF=0.509434;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0553564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.778;QD=19.1393;RBI=0.0595986;REFB=-0.0147209;REVB=0.0220832;RO=26;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068626;STB=0.528731;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.012615;OID=.;OPOS=12124587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:26:26:27:0.509434:13:13:11:15:14:13:11:15 chr6 12294258 . A G 1135.25 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00936513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.07;QD=60.5464;RBI=0.0161059;REFB=0;REVB=-0.0131032;RO=0;SAF=29;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.8577e-06;OID=.;OPOS=12294258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:45:29:0:0:45:30:0:0 chr6 13053699 . G A 193.36 PASS AF=0.403509;AO=24;DP=58;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00955108;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0578;QD=13.5691;RBI=0.0154472;REFB=0.00127667;REVB=0.0121405;RO=34;SAF=4;SAR=20;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267766;STB=0.649425;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000265191;OID=.;OPOS=13053699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:34:34:24:23:0.403509:20:4:12:22:19:4:12:22 chr6 13206282 . C T 48.94 PASS AF=0.5;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0161592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.071;QD=13.9832;RBI=0.0166531;REFB=-0.0215017;REVB=0.00402569;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0135768;OID=.;OPOS=13206282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:6:7:6:7:0.5:5:1:1:5:5:2:2:5 chr6 13288648 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.765;QD=56.1916;RBI=0.0278923;REFB=0;REVB=0.0164077;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142114;OID=.;OPOS=13288648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0 chr6 13288679 . GCT G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126413;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=287.694;QD=49.5992;RBI=0.131545;REFB=0;REVB=0.0363828;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00103179;OID=.;OPOS=13288680;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:18:18:18:18:0:9:9:0:0:4:0:9:9:0:0 chr6 13295502 . T C 800.88 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.357;QD=57.2059;RBI=0.027065;REFB=0;REVB=0.0226039;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013277;OID=.;OPOS=13295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:32:23:0:0:33:23:0:0 chr6 13295515 . A C 823.66 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0477034;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.106;QD=55.8416;RBI=0.0492304;REFB=0.0757652;REVB=0.0121665;RO=1;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012925;STB=0.506847;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00111409;OID=.;OPOS=13295515;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:36:22:0:1:36:22:0:1 chr6 13295536 . C T 848.85 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304896;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.9642;QD=57.5489;RBI=0.0314821;REFB=0;REVB=0.00784244;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431244;OID=.;OPOS=13295536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr6 13361088 . A G 307.24 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00608591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.729;QD=15.5563;RBI=0.0289718;REFB=-0.0165635;REVB=-0.0283254;RO=45;SAF=14;SAR=20;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564707;STB=0.531896;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.019288;OID=.;OPOS=13361088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:20:14:21:24:20:14:21:24 chr6 13470113 . A T 736.08 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000313132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.308;QD=62.6455;RBI=0.0668997;REFB=0;REVB=0.066899;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000854033;OID=.;OPOS=13470113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:20:26:0:0:20:27:0:0 chr6 13547958 . C T 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6614;QD=57.1053;RBI=0.0467041;REFB=0;REVB=0.0420034;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000679109;OID=.;OPOS=13547958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr6 13548165 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.016;QD=53.2765;RBI=0.0145113;REFB=0;REVB=-0.00564178;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03874e-05;OID=.;OPOS=13548165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr6 13599303 . C T 489.19 PASS AF=0.52809;AO=46;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0115758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.022;QD=21.9862;RBI=0.0122227;REFB=-0.0148561;REVB=-0.0039236;RO=42;SAF=30;SAR=16;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137881;STB=0.579551;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0120228;OID=.;OPOS=13599303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:42:42:46:47:0.52809:16:30:21:21:16:31:21:21 chr6 13622132 . T TC 52.01 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0354596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.1149;QD=8.00127;RBI=0.0553409;REFB=0.0137298;REVB=0.042488;RO=18;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278625;STB=0.649122;STBP=0.361;TYPE=ins;VARB=-0.0134418;OID=.;OPOS=13622133;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.346154:9:27:9:26:17:2:7:7:10:52:18:2:7:8:10 chr6 13794147 . C T 654.85 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0708896;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2905;QD=62.3662;RBI=0.0758296;REFB=0;REVB=-0.0269219;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00192225;OID=.;OPOS=13794147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0 chr6 13978854 . G T 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00567959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.02;QD=60.0308;RBI=0.0236625;REFB=0;REVB=-0.0229708;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35407e-05;OID=.;OPOS=13978854;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:29:43:0:0:29:43:0:0 chr6 13979526 . A G 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00588185;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=332.793;QD=63.583;RBI=0.00745966;REFB=0;REVB=0.00458807;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07033e-06;OID=.;OPOS=13979526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr6 13980527 . G A 1305.52 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00616063;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.249;QD=62.1677;RBI=0.021506;REFB=0;REVB=0.0206047;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52038e-05;OID=.;OPOS=13980527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:38:46:0:0:38:46:0:0 chr6 14646772 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0537;QD=58.5875;RBI=0.0147281;REFB=0;REVB=-0.00464933;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000368298;OID=.;OPOS=14646772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr6 15147371 . T A 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0184415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.389;QD=10.1733;RBI=0.0195941;REFB=-0.00714001;REVB=-0.00662116;RO=9;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228861;STB=0.644611;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0283171;OID=.;OPOS=15147371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:5:1:3:6:5:1:3:6 chr6 15513482 . G A 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9728;QD=55.0949;RBI=0.0934318;REFB=0;REVB=0.0934259;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156302;OID=.;OPOS=15513482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0 chr6 15586009 . G T 1238.18 PASS AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.025753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.387;QD=58.961;RBI=0.0272061;REFB=-0.176542;REVB=0.00877258;RO=2;SAF=42;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220149;STB=0.511625;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00126369;OID=.;OPOS=15586009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:40:42:2:0:40:42:2:0 chr6 16145325 . A G 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00697365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.627;QD=61.3755;RBI=0.0160508;REFB=0;REVB=0.0144567;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.51495e-06;OID=.;OPOS=16145325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:44:36:0:0:44:36:0:0 chr6 16148351 . A G 761.29 PASS AF=0.5625;AO=72;DP=128;FAO=72;FDP=128;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0255516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4663;QD=23.7904;RBI=0.0262171;REFB=-0.0269669;REVB=-0.00586948;RO=55;SAF=26;SAR=46;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483061;STB=0.523206;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.023265;OID=.;OPOS=16148351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:55:56:72:72:0.5625:46:26:23:32:46:26:23:33 chr6 16279097 . T C 472.53 PASS AF=0.472727;AO=50;DP=109;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0901884;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6529;QD=17.1827;RBI=0.0949593;REFB=-0.0303862;REVB=0.0297209;RO=56;SAF=28;SAR=22;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107854;STB=0.548685;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0250214;OID=.;OPOS=16279097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:56:58:50:52:0.472727:22:28:25:31:23:29:27:31 chr6 16290761 . T A 1485.85 PASS AF=0.979381;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0220897;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.163;QD=61.272;RBI=0.0308183;REFB=-0.135899;REVB=0.0214898;RO=2;SAF=44;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00144776;STB=0.500764;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00052631;OID=.;OPOS=16290761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:97:2:2:95:95:0.979381:51:44:1:1:51:44:1:1 chr6 16306866 . G A 450.43 PASS AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0534536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.184;QD=21.9722;RBI=0.0546973;REFB=-0.0131392;REVB=-0.0115976;RO=38;SAF=23;SAR=21;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852761;STB=0.546992;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0168919;OID=.;OPOS=16306866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:21:23:16:22:21:23:16:22 chr6 16327615 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.49;QD=53.911;RBI=0.0321981;REFB=0;REVB=0.0236165;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249922;OID=.;OPOS=16327615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:4:20:0:0:4:20:0:0 chr6 16328068 . T C 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.00488923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.929;QD=15.2929;RBI=0.0493572;REFB=-0.015929;REVB=-0.0491145;RO=9;SAF=8;SAR=1;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321841;STB=0.679722;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0167567;OID=.;OPOS=16328068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:1:8:9:0:1:8:9:0 chr6 17292048 . G A 429.84 PASS AF=0.552632;AO=41;DP=77;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0106175;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.07;QD=22.6229;RBI=0.0239725;REFB=-0.0237547;REVB=0.021493;RO=34;SAF=17;SAR=24;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104367;STB=0.562471;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0166015;OID=.;OPOS=17292048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:34:34:41:42:0.552632:24:17:10:24:24:18:10:24 chr6 17543302 . A G 407.96 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00703064;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=321.265;QD=17.7373;RBI=0.0137186;REFB=0.00298326;REVB=-0.0117801;RO=50;SAF=17;SAR=25;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093989;STB=0.552606;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=-0.00343822;OID=.;OPOS=17543302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:25:17:25:25:25:17:25:25 chr6 17633061 . C T 688.6 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.099491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.506;QD=62.6002;RBI=0.0996446;REFB=0;REVB=-0.00553028;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000451999;OID=.;OPOS=17633061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0 chr6 17633078 . A G 233.68 PASS AF=0.818182;AO=2;DP=14;FAO=18;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.122053;FXX=0.119952;HRUN=17;LEN=1;MLLD=82.3371;QD=42.4875;RBI=0.130788;REFB=0.0240573;REVB=-0.0469961;RO=0;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555489;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.0164949;OID=.;OPOS=17633078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:22:0:2:2:18:0.818182:2:0:0:0:15:3:1:1 chr6 17665479 . G C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.048;QD=63.5828;RBI=0.0331594;REFB=0;REVB=0.000963722;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112604;OID=.;OPOS=17665479;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0 chr6 17764530 . C T 375.87 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.0443879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4487;QD=14.5969;RBI=0.0535199;REFB=-0.0256133;REVB=-0.0299013;RO=60;SAF=23;SAR=20;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680454;STB=0.538304;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0384863;OID=.;OPOS=17764530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:20:23:36:24:20:23:36:24 chr6 17794494 . G A 370.88 PASS AF=0.392857;AO=44;DP=112;FAO=44;FDP=112;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=0.000886337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.691;QD=13.2457;RBI=0.00380373;REFB=-0.023115;REVB=-0.00369903;RO=66;SAF=24;SAR=20;SRF=22;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222611;STB=0.623946;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0247498;OID=.;OPOS=17794494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:66:68:44:44:0.392857:20:24:22:44:20:24:23:45 chr6 17799575 . A G 376.79 PASS AF=0.465116;AO=39;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0264748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.042;QD=17.5253;RBI=0.0305497;REFB=-0.0115307;REVB=-0.0152436;RO=46;SAF=27;SAR=12;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113238;STB=0.568027;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0124748;OID=.;OPOS=17799575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:46:39:40:0.465116:12:27:27:19:12:28:27:19 chr6 17831419 . G A 193.4 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0145315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.3216;QD=13.8141;RBI=0.0145325;REFB=-0.00243303;REVB=-0.000168974;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737873;STB=0.549957;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00185651;OID=.;OPOS=17831419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:12:11:13:19:12:11:13:20 chr6 17834198 . T G 168.45 PASS AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0338171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.766;QD=10.3664;RBI=0.055059;REFB=-0.0226031;REVB=0.0434499;RO=43;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293624;STB=0.671081;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0285404;OID=.;OPOS=17834198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:8:14:16:27:8:14:16:27 chr6 17834213 . T C 156.62 PASS AF=0.318182;AO=20;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0999661;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.1764;QD=9.49226;RBI=0.109287;REFB=0.000361751;REVB=-0.0441647;RO=36;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20074;STB=0.633112;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00658984;OID=.;OPOS=17834213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:45:20:21:0.318182:8:12:15:21:8:13:19:26 chr6 18161563 . G A 542.71 PASS AF=0.581395;AO=48;DP=85;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00508105;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.097;QD=25.2424;RBI=0.0120154;REFB=-0.0148267;REVB=-0.0108882;RO=37;SAF=24;SAR=24;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321666;STB=0.519992;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0106655;OID=.;OPOS=18161563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:37:36:48:50:0.581395:24:24:17:20:24:26:17:19 chr6 18188091 . T C 376.76 PASS AF=0.481481;AO=38;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0254879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.726;QD=18.6052;RBI=0.0360246;REFB=-0.00724768;REVB=-0.0254585;RO=42;SAF=20;SAR=18;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042654;STB=0.530441;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00692277;OID=.;OPOS=18188091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:42:38:39:0.481481:18:20:24:18:19:20:24:18 chr6 18215303 . T C 2635.21 PASS AF=1;AO=168;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374707;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.32;QD=61.6424;RBI=0.0452637;REFB=0;REVB=0.0253919;RO=0;SAF=79;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16133e-05;OID=.;OPOS=18215303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:171:171:0:0:168:171:1:89:79:0:0:91:80:0:0 chr6 18273431 . G A 224.41 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.00958921;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5782;QD=19.9479;RBI=0.0265129;REFB=-0.0395657;REVB=0.0247181;RO=23;SAF=7;SAR=15;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615051;STB=0.534576;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0407195;OID=.;OPOS=18273431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:15:7:6:17:15:7:6:17 chr6 18466677 . A T 974.19 PASS AF=0.921053;AO=70;DP=76;FAO=70;FDP=76;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0280458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.891;QD=51.2732;RBI=0.0286907;REFB=-0.0498361;REVB=0.00604904;RO=5;SAF=42;SAR=28;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530312;STB=0.519332;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0283799;OID=.;OPOS=18466677;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:76:76:5:6:70:70:0.921053:28:42:5:0:28:42:5:1 chr6 18466750 . C T 512.44 PASS AF=0.490909;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.000357098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.768;QD=18.634;RBI=0.0127206;REFB=-0.0156801;REVB=0.0127156;RO=56;SAF=29;SAR=25;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153042;STB=0.508471;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0128912;OID=.;OPOS=18466750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:56:54:54:0.490909:25:29:31:25:25:29:31:25 chr6 18467328 . C G 220.93 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00633509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0275;QD=18.0354;RBI=0.0239999;REFB=0.0018892;REVB=-0.0231487;RO=26;SAF=18;SAR=4;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126102;STB=0.56565;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.00615376;OID=.;OPOS=18467328;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:27:22:22:0.44898:4:18:19:7:4:18:20:7 chr6 18836419 . G C 192.84 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00581498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.817;QD=14.8342;RBI=0.0238944;REFB=-0.000565816;REVB=0.0231761;RO=30;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112788;STB=0.564402;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.001066;OID=.;OPOS=18836419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:10:12:13:17:10:12:13:17 chr6 20282269 . T C 383.26 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00683951;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.219;QD=52.8627;RBI=0.0283219;REFB=-0.0346683;REVB=0.0274836;RO=1;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404293;STB=0.521723;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000265501;OID=.;OPOS=20282269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:29:29:1:1:28:28:0.965517:11:17:0:1:11:17:0:1 chr6 20492995 . T C 143.32 PASS AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00503587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.312;QD=9.88384;RBI=0.0107379;REFB=-0.00267421;REVB=-0.00948383;RO=39;SAF=9;SAR=10;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277988;STB=0.661741;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00681015;OID=.;OPOS=20492995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:10:9:28:11:10:9:28:11 chr6 20599628 . C T 1565.18 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.328;QD=59.6259;RBI=0.0238669;REFB=0;REVB=0.0234228;RO=0;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96936e-05;OID=.;OPOS=20599628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:105:0:0:103:105:1:55:48:0:0:56:49:0:0 chr6 21065449 . CA TG 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00865206;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=307.421;QD=13.5518;RBI=0.0121517;REFB=-0.011098;REVB=0.00853261;RO=35;SAF=5;SAR=19;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277316;STB=0.660722;STBP=0.067;TYPE=mnp;VARB=0.0185106;OID=.;OPOS=21065449;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:19:5:15:20:19:5:15:20 chr6 21201493 . G A 528.55 PASS AF=0.474576;AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.00699434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.831;QD=17.917;RBI=0.00701129;REFB=-0.000694942;REVB=0.000487309;RO=62;SAF=31;SAR=25;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509654;STB=0.528292;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.000683777;OID=.;OPOS=21201493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:62:56:56:0.474576:25:31:31:31:25:31:31:31 chr6 22085852 . C T 699.93 PASS AF=0.539683;AO=68;DP=126;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.037131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.543;QD=22.2201;RBI=0.039633;REFB=-0.0142997;REVB=0.0138586;RO=56;SAF=33;SAR=35;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106329;STB=0.564944;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0129496;OID=.;OPOS=22085852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:56:58:68:68:0.539683:35:33:20:36:35:33:20:38 chr6 22136879 . G T 378.83 PASS AF=0.454545;AO=39;DP=87;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.012329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.082;QD=17.2196;RBI=0.0199645;REFB=-0.0280719;REVB=-0.0157027;RO=47;SAF=16;SAR=23;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139899;STB=0.563822;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0354677;OID=.;OPOS=22136879;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:47:48:39:40:0.454545:23:16:26:21:23:17:26:22 chr6 24147409 . C A 435.88 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0657899;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.0065;QD=21.5249;RBI=0.0727488;REFB=0.00871728;REVB=0.0310498;RO=37;SAF=26;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783783;STB=0.537807;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00653054;OID=.;OPOS=24147409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:37:38:43:43:0.530864:17:26:19:18:17:26:20:18 chr6 24147483 . A G 424.54 PASS AF=0.483146;AO=42;DP=88;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0167905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.14;QD=19.0804;RBI=0.0184328;REFB=-0.0257321;REVB=0.00760554;RO=46;SAF=24;SAR=18;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999797;STB=0.561498;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0244215;OID=.;OPOS=24147483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:46:46:42:43:0.483146:18:24:31:15:19:24:31:15 chr6 24174955 . G C 1719.87 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.032787;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.279;QD=60.8802;RBI=0.034975;REFB=0;REVB=0.0121764;RO=0;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29304e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.88996e-05;OID=.;OPOS=24174955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:54:59:0:0:54:59:0:0 chr6 24291203 . T C 1283.41 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.02;QD=61.851;RBI=0.0310923;REFB=0;REVB=0.0225144;RO=0;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132747;OID=.;OPOS=24291203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:35:48:0:0:35:48:0:0 chr6 24358202 . G A 197.7 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0112467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.596;QD=18.8286;RBI=0.0112559;REFB=-0.010107;REVB=0.000454874;RO=22;SAF=5;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299078;STB=0.67087;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0107173;OID=.;OPOS=24358202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:15:5:12:10:15:5:12:10 chr6 24418348 . G A 512.43 PASS AF=0.490909;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0162625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.289;QD=18.6339;RBI=0.0244977;REFB=-0.0112061;REVB=-0.0183213;RO=56;SAF=21;SAR=33;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881102;STB=0.548838;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0116111;OID=.;OPOS=24418348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:56:54:54:0.490909:33:21:27:29:33:21:27:29 chr6 24437445 . G A 924.97 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0216065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.526;QD=56.9211;RBI=0.0317506;REFB=-0.068677;REVB=0.023265;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000589669;OID=.;OPOS=24437445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:30:34:0:0:30:34:1:0 chr6 24437458 . T C 212.23 PASS AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0167301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.868;QD=12.3033;RBI=0.0173618;REFB=-0.0143998;REVB=-0.00464068;RO=43;SAF=13;SAR=13;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377641;STB=0.521722;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0210511;OID=.;OPOS=24437458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:43:43:26:26:0.376812:13:13:23:20:13:13:23:20 chr6 24445829 . G A 115.72 PASS AF=0.265625;AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0253511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.696;QD=7.23237;RBI=0.0278859;REFB=-0.00461514;REVB=-0.0116165;RO=47;SAF=10;SAR=7;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170567;STB=0.510385;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0102414;OID=.;OPOS=24445829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:47:47:17:17:0.265625:7:10:27:20:7:10:27:20 chr6 24596478 . T G 981.41 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.902;QD=58.5914;RBI=0.0446408;REFB=0;REVB=0.0055227;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015517;OID=.;OPOS=24596478;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:34:32:0:0:34:33:0:0 chr6 24653273 . G C 371.53 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00448682;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.851;QD=19.3001;RBI=0.0147476;REFB=-0.016575;REVB=0.0140485;RO=39;SAF=19;SAR=19;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12858;STB=0.558411;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0133313;OID=.;OPOS=24653273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:77:39:39:38:38:0.493506:19:19:14:25:19:19:15:24 chr6 24653376 . G A 834.39 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0547905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.096;QD=57.5444;RBI=0.0549261;REFB=0;REVB=0.00385714;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172759;OID=.;OPOS=24653376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0 chr6 24698215 . G A 396.45 PASS AF=0.644068;AO=36;DP=57;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00688808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.114;QD=26.8783;RBI=0.0219464;REFB=0.00273959;REVB=-0.0208374;RO=20;SAF=13;SAR=23;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953562;STB=0.551267;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00291892;OID=.;OPOS=24698215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:20:21:36:38:0.644068:23:13:10:10:25:13:10:11 chr6 24780892 . A C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.642;QD=55.0987;RBI=0.0363733;REFB=0;REVB=0.0263647;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516721;OID=.;OPOS=24780892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr6 24804808 . G C 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7063;QD=58.0604;RBI=0.0554596;REFB=0;REVB=0.0387979;RO=0;SAF=46;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7396e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0007912;OID=.;OPOS=24804808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:15:46:0:0:15:46:0:0 chr6 24804860 . G T 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.421;QD=62.908;RBI=0.0276925;REFB=0;REVB=0.0273882;RO=0;SAF=68;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25395e-05;OID=.;OPOS=24804860;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:22:68:0:0:22:68:0:0 chr6 24818785 . A G 1069.23 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.595;QD=59.4019;RBI=0.0358167;REFB=0;REVB=-0.0195565;RO=0;SAF=20;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37583e-05;OID=.;OPOS=24818785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:51:20:0:0:52:20:0:0 chr6 24825511 . A G 959.99 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113919;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3101;QD=59.0761;RBI=0.0183384;REFB=0;REVB=0.0143709;RO=0;SAF=17;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.33797e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122573;OID=.;OPOS=24825511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:48:17:0:0:48:17:0:0 chr6 25420344 . C G 2192.32 PASS AF=0.992908;AO=139;DP=141;FAO=140;FDP=141;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.138;QD=62.1934;RBI=0.0283314;REFB=-0.0221939;REVB=-0.0245416;RO=2;SAF=60;SAR=79;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155819;STB=0.504064;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=3.13016e-05;OID=.;OPOS=25420344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:141:141:2:1:139:140:0.992908:79:60:2:0:79:61:1:0 chr6 25600968 . G A 177.36 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0392265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.365;QD=21.4977;RBI=0.0504212;REFB=-0.0503068;REVB=0.0316794;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265967;STB=0.647742;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0388684;OID=.;OPOS=25600968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:10:8:2:13:10:8:2:13 chr6 25605091 . G A 253.09 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0254473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1535;QD=15.11;RBI=0.0375907;REFB=0.000883294;REVB=-0.0276675;RO=38;SAF=9;SAR=20;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943582;STB=0.553595;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.00238909;OID=.;OPOS=25605091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:20:9:15:23:20:9:15:23 chr6 25691362 . C T 851.6 PASS AF=0.438679;AO=93;DP=213;FAO=93;FDP=212;FR=.;FRO=119;FSAF=29;FSAR=64;FSRF=45;FSRR=74;FWDB=-0.0779519;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.075;QD=16.0679;RBI=0.0813257;REFB=-0.0195991;REVB=-0.0231816;RO=119;SAF=29;SAR=64;SRF=45;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753183;STB=0.541991;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0221174;OID=.;OPOS=25691362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:119:119:93:93:0.438679:64:29:45:74:64:29:45:74 chr6 25726675 . G A 515.34 PASS AF=0.571429;AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00899348;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=330.463;QD=24.5398;RBI=0.00968818;REFB=-0.0257864;REVB=-0.00360252;RO=36;SAF=25;SAR=23;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380032;STB=0.520825;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0164432;OID=.;OPOS=25726675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:36:36:48:48:0.571429:23:25:17:19:23:25:17:19 chr6 25727265 . C T 420.98 PASS AF=0.506024;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00209095;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.921;QD=20.2882;RBI=0.0207153;REFB=-0.0188358;REVB=-0.0206095;RO=42;SAF=20;SAR=22;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215236;STB=0.506326;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0219583;OID=.;OPOS=25727265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:42:41:42:42:0.506024:22:20:19:23:22:20:19:22 chr6 25727334 . C T 518.69 PASS AF=0.504673;AO=54;DP=106;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0382365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1184;QD=19.3904;RBI=0.0409927;REFB=0.0186616;REVB=0.0147773;RO=52;SAF=25;SAR=29;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500583;STB=0.523058;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.0168307;OID=.;OPOS=25727334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:52:53:54:54:0.504673:29:25:27:25:29:25:27:26 chr6 25727517 . G A 165.66 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0535721;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.778;QD=20.7071;RBI=0.0538954;REFB=-0.0100846;REVB=0.00589511;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237515;STB=0.652008;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0180065;OID=.;OPOS=25727517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:16:15:17:17:0.53125:8:9:4:12:8:9:3:12 chr6 25769349 . T C 851.91 PASS AF=0.983607;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0730558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8876;QD=55.8632;RBI=0.0731225;REFB=0.0976725;REVB=0.00312074;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140845;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.00289525;OID=.;OPOS=25769349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:61:1:1:59:60:0.983607:26:33:1:0:27:33:1:0 chr6 25813150 . G A 851.15 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9333;QD=57.7053;RBI=0.0241103;REFB=0;REVB=0.0140012;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55837e-05;OID=.;OPOS=25813150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:27:31:0:0:27:32:0:0 chr6 25849620 . A G 1093.62 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00447841;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9569;QD=57.5587;RBI=0.0655864;REFB=-0.139269;REVB=0.0654333;RO=0;SAF=47;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09191e-08;STB=0.517852;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00427917;OID=.;OPOS=25849620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:76:0:2:74:74:0.973684:27:47:0:0:27:47:0:2 chr6 25914801 . G A 980.01 PASS AF=0.971429;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00794951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.357;QD=56.0007;RBI=0.0537704;REFB=0.0292721;REVB=-0.0531795;RO=2;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286187;STB=0.515147;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.00253039;OID=.;OPOS=25914801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:70:2:2:67:68:0.971429:32:35:0:2:32:36:0:2 chr6 25914901 . G A 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.84;QD=63.2865;RBI=0.0264983;REFB=0;REVB=-0.00474428;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158873;OID=.;OPOS=25914901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr6 25916979 . C T 1447.61 PASS AF=0.980198;AO=99;DP=104;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0039019;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.935;QD=57.3313;RBI=0.0202279;REFB=-0.0259245;REVB=0.019848;RO=0;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509257;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.000121565;OID=.;OPOS=25916979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:104:101:0:2:99:99:0.980198:53:46:0:0:53:46:0:2 chr6 25967068 . C T 618.77 PASS AF=0.443709;AO=67;DP=151;FAO=67;FDP=151;FR=.;FRO=84;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.00166572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.565;QD=16.3912;RBI=0.0119372;REFB=-0.0232656;REVB=-0.0118204;RO=83;SAF=27;SAR=40;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091973;STB=0.554869;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0327287;OID=.;OPOS=25967068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:83:84:67:67:0.443709:40:27:41:42:40:27:42:42 chr6 26027433 . G A 638.81 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0322665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.375;QD=59.4244;RBI=0.0322893;REFB=0.127978;REVB=0.00121174;RO=1;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153937;STB=0.508193;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.000701544;OID=.;OPOS=26027433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:30:12:0:1:30:12:0:1 chr6 26033506 . G A 848.82 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.375;QD=57.547;RBI=0.0268234;REFB=0;REVB=-0.0203798;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20001e-06;OID=.;OPOS=26033506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:32:25:0:0:32:27:0:0 chr6 26044369 . A G 851.2 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.915;QD=57.7087;RBI=0.0258606;REFB=0;REVB=0.025638;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58138e-05;OID=.;OPOS=26044369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr6 26045929 . T C 982.72 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0731628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0256;QD=58.6701;RBI=0.0793868;REFB=0;REVB=-0.0308133;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000839295;OID=.;OPOS=26045929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0 chr6 26056070 . TTG CTC,TTC 926.44 PASS AF=0.0153846,0.984615;AO=3,29;DP=65;FAO=1,64;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=1,35;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0580267,-0.00146571;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=3,1;MLLD=180.841,210.251;QD=57.0118;RBI=0.0679248,0.0240039;REFB=0,0;REVB=0.0353084,0.0239591;RO=0;SAF=3,0;SAR=0,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0365741,0.000419385;OID=.,.;OPOS=26056070,26056072;OREF=TTG,G;OALT=CTC,C;OMAPALT=CTC,TTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:65:65:0:0:3,29:1,64:0.0153846,0.984615:0,29:3,0:0:0:0,29:1,35:0:0 chr6 26056285 . G A 311.51 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0165959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1593;QD=16.6139;RBI=0.0890162;REFB=-0.0152185;REVB=0.0874555;RO=39;SAF=12;SAR=22;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480427;STB=0.536821;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.020576;OID=.;OPOS=26056285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:41:34:34:0.453333:22:12:12:27:22:12:12:29 chr6 26056549 . A G 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00105344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.653;QD=59.6794;RBI=0.00108597;REFB=0;REVB=0.000263816;RO=0;SAF=51;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.34984e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.23254e-07;OID=.;OPOS=26056549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:19:51:0:0:19:51:0:0 chr6 26104280 . T C 1320.9 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6053;QD=62.1602;RBI=0.0264096;REFB=0;REVB=-0.0260246;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015846;OID=.;OPOS=26104280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr6 26108282 . C G 655.16 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342557;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9155;QD=62.3965;RBI=0.074957;REFB=0;REVB=0.0666716;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169429;OID=.;OPOS=26108282;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0 chr6 26184102 . G A 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.579;QD=61.6953;RBI=0.0799246;REFB=0;REVB=0.0627542;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167768;OID=.;OPOS=26184102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0 chr6 26200083 . A G 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.337;QD=54.5152;RBI=0.0317837;REFB=0;REVB=0.00680896;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000226042;OID=.;OPOS=26200083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0 chr6 26200677 . A G 323.01 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.821;QD=53.8353;RBI=0.0566301;REFB=0;REVB=0.00914313;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025547;OID=.;OPOS=26200677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr6 26205293 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.585;QD=48.7373;RBI=0.0196174;REFB=0;REVB=0.00117277;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156077;OID=.;OPOS=26205293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0 chr6 26285560 . A G 1513.37 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.777;QD=59.9354;RBI=0.046154;REFB=0;REVB=0.0341426;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123691;OID=.;OPOS=26285560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:49:52:0:0:49:52:0:0 chr6 26285683 . T C 754.12 PASS AF=1;AO=41;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.558;QD=56.9145;RBI=0.107246;REFB=0;REVB=0.0151816;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000771622;OID=.;OPOS=26285683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:41:53:1:31:10:0:0:33:20:0:0 chr6 26286744 . C T 870.64 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000983379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8704;QD=56.1705;RBI=0.0281156;REFB=-0.0205583;REVB=-0.0280984;RO=1;SAF=39;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119514;STB=0.506327;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000147182;OID=.;OPOS=26286744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:22:39:1:0:22:39:1:0 chr6 26286748 . C G 283.13 PASS AF=0.476923;AO=32;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00266662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.634;QD=17.4231;RBI=0.00312657;REFB=-0.016457;REVB=-0.00163235;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126809;STB=0.584469;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0148104;OID=.;OPOS=26286748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:34:32:31:0.476923:14:18:23:10:14:17:24:10 chr6 26286838 . TTCTC TT,TTC,TTCCC,TTTC,TTTCC,TTTTC 701.66 PASS AF=0.0212766,0.361702,0,0.382979,0.0212766,0.212766;AO=6,10,4,7,6,10;DP=52;FAO=1,17,0,18,1,10;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,0,5,0,1;FSAR=1,14,0,13,1,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801678,0.081092,0.0788004,0.08104,0.0804136,0.0786499;FXX=0.040808;HRUN=1,1,1,1,1,1;LEN=3,2,1,1,2,1;MLLD=217.754,222.868,208.675,224.65,219.248,221.616;QD=59.7154;RBI=0.0814659,0.0819378,0.0790236,0.081765,0.0808398,0.079287;REFB=0,0,0,0,0,0;REVB=0.0144853,0.0117429,0.00593503,0.0108637,0.00829067,0.0100314;RO=0;SAF=3,0,3,0,0,3;SAR=3,10,1,7,6,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0,0;SSSB=0,0,4.86674e-08,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1,1;TYPE=del,del,snp,del,mnp,snp;VARB=-0.00411397,-0.00411592,0.0156298,0.0042486,-0.000670185,0.00406599;OID=.,.,.,.,.,.;OPOS=26286840,26286839,26286841,26286840,26286840,26286840;OREF=CTC,TC,T,C,CT,C;OALT=-,-,C,-,TC,T;OMAPALT=TT,TTC,TTCCC,TTTC,TTTCC,TTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/4:0.0212766,0.361702,0,0.382979,0.0212766,0.212766:6,10,4,7,6,10:52:1,17,0,18,1,10:47:0:0,3,0,5,0,1:1,14,0,13,1,9:0:0:28:0:3,0,3,0,0,3:3,10,1,7,6,7:0:0 chr6 26299900 . C G,T 4551.52 PASS AF=0.0792079,0.920792;AO=22,277;DP=300;FAO=24,279;FDP=303;FR=.;FRO=0;FSAF=19,165;FSAR=5,114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193439,-0.019405;FXX=0.0225799;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.895,55.4533;QD=60.086;RBI=0.0266681,0.0673825;REFB=-0.0926028,-0.0224821;REVB=-0.0183577,-0.0645278;RO=1;SAF=17,167;SAR=5,110;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0264303,-0.00284687;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.011302,-0.000144547;OID=.,.;OPOS=26299900,26299900;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:65:300:303:1:0:22,277:24,279:0.0792079,0.920792:5,110:17,167:1:0:5,114:19,165:0:0 chr6 26305787 . C CGGCCACCTCGTCACAT 457.35 PASS AF=0.754717;AO=39;DP=55;FAO=40;FDP=53;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.012692;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=16;MLLD=391.826;QD=34.5171;RBI=0.0149869;REFB=-0.014931;REVB=0.00796998;RO=13;SAF=12;SAR=27;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118751;STB=0.557246;STBP=0.181;TYPE=ins;VARB=0.0043263;OID=.;OPOS=26305788;OREF=-;OALT=GGCCACCTCGTCACAT;OMAPALT=CGGCCACCTCGTCACAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.754717:39:55:40:53:13:13:27:7:6:91:13:12:27:7:6 chr6 26305796 . C T 606.25 PASS AF=0.903846;AO=47;DP=52;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.039121;FXX=0.0370302;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9342;QD=46.6344;RBI=0.039744;REFB=-0.0478201;REVB=0.00700939;RO=3;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039712;STB=0.534232;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00841522;OID=.;OPOS=26305796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:52:52:3:5:47:47:0.903846:34:13:0:3:34:13:0:5 chr6 26305801 . C G 711.48 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0347865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.78;QD=52.7018;RBI=0.0400341;REFB=-0.0244244;REVB=0.0198149;RO=2;SAF=13;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235457;STB=0.512495;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000366831;OID=.;OPOS=26305801;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:39:13:0:2:39:13:0:2 chr6 26327814 . T C 1624.24 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.912;QD=60.1571;RBI=0.0164702;REFB=0;REVB=7.92454e-05;RO=0;SAF=69;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89526e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04865e-05;OID=.;OPOS=26327814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:39:69:0:0:39:69:0:0 chr6 26328365 . A G 2370.29 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.019;QD=64.0618;RBI=0.0562801;REFB=0;REVB=-0.0512989;RO=0;SAF=67;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.3189e-05;OID=.;OPOS=26328365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:81:67:0:0:81:67:0:0 chr6 26412690 . G A 343.21 PASS AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0109931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.233;QD=24.0849;RBI=0.0360623;REFB=0.00206979;REVB=-0.0343459;RO=23;SAF=12;SAR=22;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129633;STB=0.571386;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.0026833;OID=.;OPOS=26412690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:22:12:12:11:22:12:12:11 chr6 26466225 . A C 1933.61 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.747;QD=61.8756;RBI=0.0305173;REFB=0;REVB=-0.0304857;RO=0;SAF=50;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103105;OID=.;OPOS=26466225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:75:50:0:0:75:50:0:0 chr6 26501897 . T C 1337.19 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00365328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.836;QD=62.1948;RBI=0.00466957;REFB=0;REVB=-0.00290834;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.45404e-06;OID=.;OPOS=26501897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:42:43:0:0:42:44:0:0 chr6 26505362 . G A 651.06 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2383;QD=62.006;RBI=0.0391036;REFB=0;REVB=-0.00628913;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000642527;OID=.;OPOS=26505362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr6 26505403 . C A 447.12 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2531;QD=57.6925;RBI=0.0321752;REFB=0;REVB=0.0261788;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.71779e-05;OID=.;OPOS=26505403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:12:18:0:0:13:18:0:0 chr6 26508194 . A C 549.27 PASS AF=0.523364;AO=56;DP=107;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00703105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2166;QD=20.5333;RBI=0.0571052;REFB=-0.00384556;REVB=0.0566707;RO=51;SAF=32;SAR=24;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878312;STB=0.54837;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00411624;OID=.;OPOS=26508194;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:51:51:56:56:0.523364:24:32:24:27:24:32:24:27 chr6 26509330 . C G 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3731;QD=64.4131;RBI=0.03804;REFB=0;REVB=0.0374929;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366738;OID=.;OPOS=26509330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr6 26521435 . C G 1532.29 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.334;QD=59.5066;RBI=0.0253997;REFB=0;REVB=0.0213138;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26361e-05;OID=.;OPOS=26521435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:49:52:0:0:51:52:0:0 chr6 26521520 . T C 1525.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.995;QD=59.833;RBI=0.0301154;REFB=0;REVB=0.020087;RO=0;SAF=49;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5428e-05;OID=.;OPOS=26521520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:53:49:0:0:53:49:0:0 chr6 26538268 . T C 941.01 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0137289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.917;QD=57.0307;RBI=0.0941268;REFB=-0.0153987;REVB=0.0931202;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.508769;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00013124;OID=.;OPOS=26538268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:28:37:0:0:28:37:0:1 chr6 26545632 . G A 853.56 PASS AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00588892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2313;QD=56.9042;RBI=0.0352942;REFB=0;REVB=0.0347994;RO=2;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248175;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000917302;OID=.;OPOS=26545632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:2:0:58:60:1:37:21:0:2:39:21:0:0 chr6 26546048 . C T 715.06 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00564403;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.204;QD=60.8561;RBI=0.0241182;REFB=-0.0887055;REVB=-0.0234485;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000172576;OID=.;OPOS=26546048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:22:24:0:0:22:24:0:1 chr6 26546808 . T C 475.54 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260765;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.832;QD=55.9459;RBI=0.0306163;REFB=-0.0518113;REVB=0.0160428;RO=1;SAF=13;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345796;STB=0.518507;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00101496;OID=.;OPOS=26546808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:34:1:1:33:33:0.970588:20:13:1:0:20:13:1:0 chr6 26553815 . C G 673.86 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0799352;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5411;QD=62.6844;RBI=0.0837783;REFB=0;REVB=0.0250833;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000733204;OID=.;OPOS=26553815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr6 26555484 . A G 1568.16 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.073;QD=64.0066;RBI=0.0184226;REFB=0;REVB=0.016317;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39291e-05;OID=.;OPOS=26555484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:43:55:0:0:43:55:0:0 chr6 26556769 . G T 2045.86 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.037;QD=62.4691;RBI=0.0424743;REFB=0;REVB=0.0242083;RO=0;SAF=83;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54791e-05;OID=.;OPOS=26556769;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:48:83:0:0:48:83:0:0 chr6 26572165 . G T 904.9 PASS AF=0.985294;AO=60;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0428662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.915;QD=53.2295;RBI=0.0431723;REFB=-0.0754373;REVB=-0.00513153;RO=2;SAF=31;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00101517;STB=0.506847;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00108156;OID=.;OPOS=26572165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:67:68:2:1:60:67:0.985294:29:31:1:1:31:36:1:0 chr6 26575798 . CT C 1392.04 PASS AF=1;AO=120;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.121177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.8598;QD=42.505;RBI=0.154178;REFB=0;REVB=-0.0953249;RO=1;SAF=60;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785133;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000660797;OID=.;OPOS=26575799;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:120:131:131:131:0:69:62:0:0:24:1:60:60:1:0 chr6 26577326 . C A 1979.72 PASS AF=0.992248;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00699206;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.653;QD=61.3867;RBI=0.0633209;REFB=-0.00340013;REVB=0.0629337;RO=1;SAF=69;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683767;STB=0.503597;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000213558;OID=.;OPOS=26577326;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:129:1:1:128:128:0.992248:59:69:1:0:59:69:1:0 chr6 26577370 . C T 2828.11 PASS AF=1;AO=180;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.171;QD=62.8469;RBI=0.0585044;REFB=0;REVB=0.0499028;RO=0;SAF=91;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70835e-05;OID=.;OPOS=26577370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:180:180:0:0:180:180:1:89:91:0:0:89:91:0:0 chr6 26595168 . T C 678.02 PASS AF=0.38756;AO=76;DP=204;FAO=81;FDP=209;FR=.;FRO=128;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=71;FWDB=0.0366244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4073;QD=12.9765;RBI=0.0460078;REFB=-0.0161991;REVB=-0.0278455;RO=128;SAF=35;SAR=41;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169891;STB=0.529731;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0221011;OID=.;OPOS=26595168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:209:128:128:76:81:0.38756:41:35:57:71:41:40:57:71 chr6 26597333 . A G 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.939;QD=61.6953;RBI=0.0218585;REFB=0;REVB=0.00272837;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31358e-05;OID=.;OPOS=26597333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0 chr6 26598188 . A G 613.67 PASS AF=0.608247;AO=50;DP=93;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.023235;FXX=0.010203;HRUN=6;LEN=1;MLLD=48.4376;QD=25.3058;RBI=0.0615762;REFB=-0.107485;REVB=0.0570243;RO=25;SAF=25;SAR=25;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368941;STB=0.527632;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0487373;OID=.;OPOS=26598188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:97:25:38:50:59:0.608247:25:25:14:11:30:29:16:22 chr6 26745250 . A G 306.14 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.00975961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5362;QD=15.3068;RBI=0.0111475;REFB=-0.0213198;REVB=0.00538675;RO=45;SAF=19;SAR=15;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888313;STB=0.542144;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0196659;OID=.;OPOS=26745250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:45:46:34:34:0.425:15:19:29:16:15:19:29:17 chr6 26745254 . C G 468.12 PASS AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0105106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.254;QD=22.8351;RBI=0.0249562;REFB=-0.00440572;REVB=0.0226349;RO=37;SAF=28;SAR=17;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239208;STB=0.513167;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00442227;OID=.;OPOS=26745254;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:17:28:22:15:17:28:22:15 chr6 26745257 . G A 332.01 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0119819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.265;QD=16.1954;RBI=0.0129703;REFB=-0.0344891;REVB=-0.00496597;RO=44;SAF=21;SAR=15;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307167;STB=0.527411;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0107104;OID=.;OPOS=26745257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:46:36:36:0.439024:15:21:27:17:15:21:29:17 chr6 26745260 . A G 332.0 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00784434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.091;QD=16.195;RBI=0.00788199;REFB=-0.0122731;REVB=0.000769414;RO=46;SAF=21;SAR=15;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487802;STB=0.527411;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0194966;OID=.;OPOS=26745260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:0.439024:15:21:29:17:15:21:29:17 chr6 26745262 . T C 332.0 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0126729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.489;QD=16.1951;RBI=0.0152866;REFB=0.000972386;REVB=0.00854852;RO=45;SAF=21;SAR=15;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398522;STB=0.527411;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00257088;OID=.;OPOS=26745262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:15:21:28:17:15:21:29:17 chr6 26745286 . A G 515.39 PASS AF=0.514563;AO=52;DP=103;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.0176153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.789;QD=20.0151;RBI=0.0177555;REFB=0.000845434;REVB=-0.00222702;RO=50;SAF=20;SAR=32;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208883;STB=0.608369;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00115025;OID=.;OPOS=26745286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:50:50:52:53:0.514563:32:20:31:19:32:21:31:19 chr6 26745289 . G A 428.71 PASS AF=0.451923;AO=46;DP=105;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.00307967;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.659;QD=16.4889;RBI=0.0191914;REFB=-0.00206907;REVB=-0.0189427;RO=56;SAF=27;SAR=19;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206279;STB=0.614087;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00401089;OID=.;OPOS=26745289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:56:57:46:47:0.451923:19:27:21:35:19:28:22:35 chr6 27100503 . G A 241.67 PASS AF=0.319149;AO=30;DP=94;FAO=30;FDP=94;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0019506;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.788;QD=10.2839;RBI=0.00207506;REFB=-0.00406253;REVB=-0.000707821;RO=64;SAF=22;SAR=8;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399048;STB=0.733178;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0121304;OID=.;OPOS=27100503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:64:64:30:30:0.319149:8:22:25:39:8:22:25:39 chr6 27107610 . G A 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=-0.0113098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.789;QD=13.9955;RBI=0.0114104;REFB=-0.014123;REVB=-0.00151235;RO=42;SAF=12;SAR=17;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397477;STB=0.722602;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0123084;OID=.;OPOS=27107610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:17:12:34:8:17:12:34:8 chr6 27107865 . G A 53.9 PASS AF=0.4375;AO=5;DP=18;FAO=7;FDP=16;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00505744;FXX=0.111049;HRUN=7;LEN=1;MLLD=224.507;QD=13.4754;RBI=0.0719676;REFB=-7.27992e-06;REVB=-0.0717897;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744193;STB=0.509065;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=-0.00517737;OID=.;OPOS=27107865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:18:16:4:9:5:7:0.4375:2:3:2:2:4:3:4:5 chr6 27114425 . G A 38.71 PASS AF=0.0934579;AO=10;DP=107;FAO=10;FDP=107;FR=.;FRO=97;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=50;FSRR=47;FWDB=0.00788943;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.935;QD=1.44695;RBI=0.00966286;REFB=-0.00168184;REVB=0.00557921;RO=97;SAF=3;SAR=7;SRF=50;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249804;STB=0.695667;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0151793;OID=.;OPOS=27114425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:107:107:97:97:10:10:0.0934579:7:3:50:47:7:3:50:47 chr6 27181610 . G A 404.76 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.561;QD=55.8288;RBI=0.0709288;REFB=0;REVB=0.038133;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87861e-05;OID=.;OPOS=27181610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr6 27181619 . C T 51.89 PASS AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0248707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3835;QD=6.10503;RBI=0.0398538;REFB=-0.00132609;REVB=-0.0311412;RO=26;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32155;STB=0.703752;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0029338;OID=.;OPOS=27181619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:3:5:9:17:3:5:9:17 chr6 27181701 . T C 708.52 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0677299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3432;QD=62.9796;RBI=0.0738482;REFB=0;REVB=-0.0294318;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00149677;OID=.;OPOS=27181701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0 chr6 27203319 . C G 386.27 PASS AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0141967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.32;QD=30.9017;RBI=0.0279614;REFB=-0.0304321;REVB=0.0240893;RO=18;SAF=13;SAR=19;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206201;STB=0.612833;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0157928;OID=.;OPOS=27203319;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:19:13:13:5:19:13:13:5 chr6 27205435 . A G 212.55 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.012853;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.231;QD=15.7447;RBI=0.0129249;REFB=-0.00474034;REVB=0.00136124;RO=30;SAF=7;SAR=17;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28094;STB=0.660056;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00565479;OID=.;OPOS=27205435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:17:7:17:13:17:7:17:13 chr6 27219646 . GA G,GG 31.29 PASS AF=0.32,0;AO=6,2;DP=25;FAO=8,0;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3,0;FSAR=5,0;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.179586,-0.172141;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=12.9448,21.9757;QD=5.00717;RBI=0.184077,0.175518;REFB=-0.0614262,-0.0209785;REVB=-0.0404147,-0.0342671;RO=16;SAF=3,0;SAR=3,2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.141582,-0.589174;STB=0.679182,0.5;STBP=0.222,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0639054,0.0555536;OID=.,.;OPOS=27219647,27219647;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.32,0:6,2:25:8,0:25:17:3,0:5,0:11:6:30:16:3,0:3,2:10:6 chr6 27261700 . C G 373.62 PASS AF=0.340741;AO=46;DP=135;FAO=46;FDP=135;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.0172045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.843;QD=11.0701;RBI=0.0173892;REFB=-0.00614723;REVB=-0.00252801;RO=89;SAF=29;SAR=17;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220558;STB=0.626921;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0115597;OID=.;OPOS=27261700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:89:89:46:46:0.340741:17:29:39:50:17:29:39:50 chr6 27263252 . C T 460.81 PASS AF=0.564103;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.00182863;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.73;QD=23.6313;RBI=0.00862961;REFB=-0.0113311;REVB=-0.00843365;RO=33;SAF=20;SAR=24;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121029;STB=0.571397;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00692021;OID=.;OPOS=27263252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:33:34:44:44:0.564103:24:20:10:23:24:20:10:24 chr6 27277402 . C T 428.97 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.357;QD=57.1965;RBI=0.0224531;REFB=0;REVB=-0.0199384;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.41856e-05;OID=.;OPOS=27277402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr6 27277665 . G A 422.31 PASS AF=0.518519;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00119225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.347;QD=20.8549;RBI=0.00860532;REFB=-0.0294984;REVB=0.00852233;RO=39;SAF=20;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352095;STB=0.519471;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.032004;OID=.;OPOS=27277665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:39:42:42:0.518519:22:20:17:22:22:20:17:22 chr6 27279632 . C A 595.8 PASS AF=0.568627;AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=102;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0305105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0291;QD=23.3648;RBI=0.0427511;REFB=-0.0382734;REVB=-0.029946;RO=44;SAF=32;SAR=26;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945651;STB=0.551706;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0311131;OID=.;OPOS=27279632;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:44:44:58:58:0.568627:26:32:19:25:26:32:19:25 chr6 27302765 . T C 245.34 PASS AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.00531235;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.319;QD=13.2615;RBI=0.0075434;REFB=0.00276469;REVB=0.00535554;RO=44;SAF=21;SAR=8;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255409;STB=0.641445;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00581275;OID=.;OPOS=27302765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:44:45:29:29:0.391892:8:21:22:22:8:21:23:22 chr6 27327349 . C G 433.5 PASS AF=0.426087;AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0170447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0366;QD=15.0783;RBI=0.023856;REFB=-0.017403;REVB=-0.0166909;RO=66;SAF=22;SAR=27;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831667;STB=0.546695;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0242426;OID=.;OPOS=27327349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:49:49:0.426087:27:22:35:31:27:22:35:31 chr6 27356867 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0032392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.479;QD=57.5452;RBI=0.00419341;REFB=0;REVB=0.00266314;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09322e-06;OID=.;OPOS=27356867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:37:21:0:0:37:21:0:0 chr6 27356902 . A G 151.48 PASS AF=0.333333;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0390564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4471;QD=10.0983;RBI=0.0813043;REFB=-0.02697;REVB=-0.0713091;RO=39;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159607;STB=0.599904;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.050361;OID=.;OPOS=27356902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:39:40:20:20:0.333333:10:10:14:25:10:10:14:26 chr6 27356925 . T G 69.95 PASS AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0279238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.616;QD=6.66155;RBI=0.027969;REFB=-0.0128932;REVB=0.00158981;RO=29;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505719;STB=0.773845;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0330444;OID=.;OPOS=27356925;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:42:42:29:32:10:10:0.238095:3:7:7:22:3:7:10:22 chr6 27369873 . C T 59.16 PASS AF=0.2;AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00765522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.999;QD=5.25866;RBI=0.0124947;REFB=-0.00530351;REVB=-0.009875;RO=35;SAF=3;SAR=6;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409161;STB=0.766607;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0331732;OID=.;OPOS=27369873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:45:45:35:36:9:9:0.2:6:3:24:11:6:3:25:11 chr6 27369892 . C T 49.98 PASS AF=0.181818;AO=8;DP=44;FAO=8;FDP=44;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0066278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7126;QD=4.54345;RBI=0.014856;REFB=-0.02971;REVB=-0.0132956;RO=35;SAF=2;SAR=6;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494962;STB=0.811808;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0251753;OID=.;OPOS=27369892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:44:44:35:36:8:8:0.181818:6:2:24:11:6:2:24:12 chr6 27370046 . T G 125.44 PASS AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0147633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8008;QD=8.95986;RBI=0.042832;REFB=0.00192388;REVB=0.0402073;RO=39;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788689;STB=0.547114;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.0062784;OID=.;OPOS=27370046;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:9:8:21:18:9:8:21:18 chr6 27370473 . T C 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00571592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.438;QD=12.3954;RBI=0.0317659;REFB=0.00612861;REVB=-0.0312474;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331615;STB=0.691764;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.0105829;OID=.;OPOS=27370473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:0:5:4:1:0:5 chr6 27371011 . C T 332.71 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0157184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.611;QD=26.6168;RBI=0.0161772;REFB=-0.0291936;REVB=0.00382514;RO=21;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041288;STB=0.522806;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0233528;OID=.;OPOS=27371011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:14:15:12:9:14:15:12:9 chr6 27371193 . G A 349.94 PASS AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0363577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5572;QD=15.2149;RBI=0.0461402;REFB=-0.0129503;REVB=-0.0284083;RO=54;SAF=18;SAR=20;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111637;STB=0.506311;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0161748;OID=.;OPOS=27371193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:54:38:38:0.413043:20:18:25:29:20:18:25:29 chr6 27425185 . C A 425.35 PASS AF=0.531646;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0159036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.216;QD=21.5367;RBI=0.0176066;REFB=-0.0220492;REVB=0.00755422;RO=37;SAF=22;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773631;STB=0.542699;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0152079;OID=.;OPOS=27425185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:37:37:42:42:0.531646:20:22:16:21:20:22:16:21 chr6 27435707 . G A 109.69 PASS AF=0.266667;AO=16;DP=60;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0127734;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.273;QD=7.31249;RBI=0.0316072;REFB=-0.00303768;REVB=0.0289112;RO=43;SAF=7;SAR=9;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333903;STB=0.529375;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0102328;OID=.;OPOS=27435707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:43:44:16:16:0.266667:9:7:20:23:9:7:21:23 chr6 27471515 . A G 339.97 PASS AF=0.630435;AO=29;DP=46;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00717721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.125;QD=29.5625;RBI=0.00718306;REFB=-0.00494155;REVB=0.000289903;RO=16;SAF=18;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161562;STB=0.578812;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00179779;OID=.;OPOS=27471515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:16:17:29:29:0.630435:11:18:6:10:11:18:7:10 chr6 27473602 . C G 148.64 PASS AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.019322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.513;QD=10.8099;RBI=0.0224434;REFB=-0.00640943;REVB=-0.0114179;RO=34;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061122;STB=0.535336;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00760911;OID=.;OPOS=27473602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:36:19:19:0.345455:10:9:18:16:10:9:19:17 chr6 27487377 . C T 590.24 PASS AF=0.595506;AO=53;DP=89;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00642394;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.808;QD=26.5278;RBI=0.00776349;REFB=-0.0122174;REVB=-0.00435946;RO=35;SAF=26;SAR=27;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024398;STB=0.507422;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0124756;OID=.;OPOS=27487377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:35:36:53:53:0.595506:27:26:16:19:27:26:17:19 chr6 27515519 . AT CT,GA 437.64 PASS AF=0.935484,0.0645161;AO=29,2;DP=31;FAO=29,2;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=11,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153634,-0.0304009;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=114.737,131.935;QD=56.4694;RBI=0.0429212,0.0335459;REFB=0,0;REVB=0.0400774,0.0141813;RO=0;SAF=18,0;SAR=11,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00191611,0.0335526;OID=.,.;OPOS=27515519,27515519;OREF=A,AT;OALT=C,GA;OMAPALT=CT,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:31:31:0:0:29,2:29,2:0.935484,0.0645161:11,2:18,0:0:0:11,2:18,0:0:0 chr6 27551315 . AC AA,AG 1900.87 PASS AF=0.340909,0.477273;AO=45,50;DP=132;FAO=45,63;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12,20;FSAR=33,43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745171,0.00012302;FXX=0.0149243;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=195.802,87.431;QD=57.602;RBI=0.00796116,0.00316709;REFB=0,0;REVB=-0.00280216,0.0031647;RO=0;SAF=12,16;SAR=33,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0190177,-0.00831939;OID=.,.;OPOS=27551316,27551316;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=AA,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.340909,0.477273:45,50:132:45,63:132:0:12,20:33,43:0:0:99:0:12,16:33,34:0:0 chr6 27560587 . A G 715.02 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00845329;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=278.185;QD=60.8526;RBI=0.00846244;REFB=0.0510052;REVB=0.000393401;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-6.76814e-06;OID=.;OPOS=27560587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:0:1:22:24:0:1 chr6 27573463 . G A 938.11 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.778;QD=58.6317;RBI=0.036284;REFB=0;REVB=0.0180086;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45407e-05;OID=.;OPOS=27573463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:36:26:0:0:37:27:0:0 chr6 27694524 . G C 344.66 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0406981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1518;QD=19.1476;RBI=0.0411368;REFB=-0.0133592;REVB=-0.00599186;RO=36;SAF=22;SAR=14;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517703;STB=0.52883;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0115146;OID=.;OPOS=27694524;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:14:22:20:16:14:22:20:16 chr6 27792221 . C T 558.02 PASS AF=0.95;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0779784;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0502;QD=55.8019;RBI=0.0783701;REFB=-0.191818;REVB=0.00782581;RO=2;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334388;STB=0.517848;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0129553;OID=.;OPOS=27792221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:2:2:37:38:0.95:27:10:0:2:27:11:0:2 chr6 27792228 . T C 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00587481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.629;QD=61.6826;RBI=0.00950662;REFB=0;REVB=-0.00747411;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.71163e-06;OID=.;OPOS=27792228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0 chr6 28219496 . C T 72.02 PASS AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.012693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.684;QD=8.2305;RBI=0.0153492;REFB=-0.0223003;REVB=-0.00863057;RO=25;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162846;STB=0.599808;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.032194;OID=.;OPOS=28219496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:25:25:10:10:0.285714:5:5:9:16:5:5:9:16 chr6 28228342 . A G 761.99 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.08;QD=55.4172;RBI=0.0291071;REFB=-0.00543823;REVB=0.0139033;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7307e-05;OID=.;OPOS=28228342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:28:26:0:0:28:27:0:0 chr6 28239873 . A G 377.9 PASS AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0306762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.397;QD=21.5945;RBI=0.0307441;REFB=-0.0137451;REVB=-0.00204268;RO=32;SAF=15;SAR=23;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00994334;STB=0.505492;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0179789;OID=.;OPOS=28239873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:23:15:13:19:23:15:13:19 chr6 28239932 . T TG 397.28 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.0769;QD=48.1551;RBI=0.0444691;REFB=0;REVB=0.000120771;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00166373;OID=.;OPOS=28239933;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:33:34:33:33:0:14:19:0:0:7:1:14:19:1:0 chr6 28264681 . G A 306.94 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.012626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.282;QD=18.0551;RBI=0.0134389;REFB=-0.0149973;REVB=-0.0046031;RO=35;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271033;STB=0.515142;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0167844;OID=.;OPOS=28264681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:16:17:17:18:16:17:17:18 chr6 28269407 . G A 563.4 PASS AF=0.607143;AO=49;DP=83;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0133901;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.055;QD=26.8288;RBI=0.0134782;REFB=-0.0202902;REVB=-0.00153824;RO=34;SAF=31;SAR=18;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190373;STB=0.602265;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.013544;OID=.;OPOS=28269407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:34:33:49:51:0.607143:18:31:13:21:18:33:13:20 chr6 28269663 . A G 703.33 PASS AF=0.544;AO=68;DP=126;FAO=68;FDP=125;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00054801;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.511;QD=22.5065;RBI=0.000858653;REFB=-0.00127828;REVB=0.000661037;RO=56;SAF=34;SAR=34;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147319;STB=0.503999;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.000477221;OID=.;OPOS=28269663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:56:57:68:68:0.544:34:34:27:29:34:34:28:29 chr6 28294550 . T C 321.77 PASS AF=0.375;AO=39;DP=104;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=-0.00796745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.947;QD=12.3756;RBI=0.0104897;REFB=-0.0014394;REVB=0.00682302;RO=65;SAF=13;SAR=26;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615188;STB=0.535193;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00222635;OID=.;OPOS=28294550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:65:65:39:39:0.375:26:13:25:40:26:13:25:40 chr6 28327371 . G C 203.35 PASS AF=0.421053;AO=23;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0104292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.903;QD=14.2702;RBI=0.0238035;REFB=-0.00793324;REVB=0.0213971;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183491;STB=0.591855;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0117685;OID=.;OPOS=28327371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:23:24:0.421053:12:11:10:23:13:11:10:23 chr6 28328064 . C T 50.47 PASS AF=0.583333;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00053689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.428;QD=16.8229;RBI=0.0215334;REFB=-0.00948767;REVB=0.0215267;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290708;STB=0.666293;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0078442;OID=.;OPOS=28328064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:12:5:5:6:7:0.583333:5:1:0:5:5:2:0:5 chr6 28359170 . A G 461.87 PASS AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0233585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.121;QD=21.4825;RBI=0.0234023;REFB=-0.0083051;REVB=0.00143201;RO=41;SAF=22;SAR=23;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621654;STB=0.534316;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00673473;OID=.;OPOS=28359170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:23:22:23:18:23:22:23:18 chr6 28359186 . C T 608.34 PASS AF=0.56701;AO=55;DP=97;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0056107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6518;QD=25.0862;RBI=0.0149534;REFB=-0.00811786;REVB=-0.0138608;RO=41;SAF=29;SAR=26;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264379;STB=0.508841;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.006338;OID=.;OPOS=28359186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:41:42:55:55:0.56701:26:29:23:18:26:29:23:19 chr6 28483482 . A C 564.87 PASS AF=0.479339;AO=56;DP=121;FAO=58;FDP=121;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.0113875;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.13;QD=18.6735;RBI=0.0177476;REFB=-0.0322117;REVB=-0.0136125;RO=47;SAF=21;SAR=35;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984968;STB=0.612771;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0122998;OID=.;OPOS=28483482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:47:62:56:58:0.479339:35:21:23:24:36:22:37:25 chr6 28542424 . G A 199.45 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00613909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9052;QD=15.6434;RBI=0.0431639;REFB=-0.0359;REVB=-0.0427251;RO=29;SAF=15;SAR=7;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301614;STB=0.517226;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0304775;OID=.;OPOS=28542424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:7:15:19:10:7:15:19:10 chr6 28542520 . C T 527.46 PASS AF=0.504587;AO=52;DP=106;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.010415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.596;QD=19.3562;RBI=0.0128722;REFB=-0.0190632;REVB=0.00756453;RO=54;SAF=21;SAR=31;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189928;STB=0.586039;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0165648;OID=.;OPOS=28542520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:109:54:54:52:55:0.504587:31:21:33:21:31:24:33:21 chr6 28601934 . A T 727.12 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0750809;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.965;QD=57.0288;RBI=0.0773781;REFB=0;REVB=0.0187145;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634601;OID=.;OPOS=28601934;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0 chr6 28616066 . T A 1047.67 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117221;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.332;QD=59.8668;RBI=0.0657066;REFB=0;REVB=0.0646525;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150934;OID=.;OPOS=28616066;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:42:28:0:0:42:28:0:0 chr6 28626098 . G A 696.95 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.109;QD=61.951;RBI=0.02752;REFB=0;REVB=-0.0243286;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052323;OID=.;OPOS=28626098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:19:25:0:0:20:25:0:0 chr6 28641689 . A G 162.48 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0113362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1095;QD=19.6949;RBI=0.0141799;REFB=-0.0187257;REVB=0.0085182;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155953;STB=0.57339;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0169151;OID=.;OPOS=28641689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:16:17:17:0.515152:7:10:6:9:7:10:7:9 chr6 28663703 . G GA 80.34 PASS AF=0.421875;AO=24;DP=65;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.198131;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.5164;QD=5.02138;RBI=0.229366;REFB=-0.0807961;REVB=-0.115555;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158878;STB=0.522951;STBP=0.757;TYPE=ins;VARB=0.0959947;OID=.;OPOS=28663704;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421875:24:65:27:64:37:15:12:22:15:80:36:11:13:22:14 chr6 28663716 . A G 954.88 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.989;QD=58.7619;RBI=0.0232523;REFB=0;REVB=-0.00893411;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7441e-05;OID=.;OPOS=28663716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0 chr6 28663754 . T C 1189.26 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.081;QD=60.9877;RBI=0.0510251;REFB=0;REVB=0.032224;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362501;OID=.;OPOS=28663754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:35:42:0:0:35:43:0:0 chr6 28678357 . T A,C 564.11 PASS AF=0.0526316,0.947368;AO=2,36;DP=38;FAO=2,36;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=2,17;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044144,0.0459156;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=47.3838,100.9;QD=59.3796;RBI=0.0459205,0.0464581;REFB=0,0;REVB=-0.0126491,-0.007079;RO=0;SAF=2,17;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.144355,0.000160645;OID=.,.;OPOS=28678357,28678357;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:38:38:0:0:2,36:2,36:0.0526316,0.947368:0,19:2,17:0:0:0,19:2,17:0:0 chr6 28687469 . G A 244.28 PASS AF=0.510204;AO=21;DP=45;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0303805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1556;QD=19.9411;RBI=0.0394414;REFB=-0.00196026;REVB=0.0251526;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23972;STB=0.611205;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00866027;OID=.;OPOS=28687469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:24:24:21:25:0.510204:7:14:10:14:9:16:10:14 chr6 28687542 . T C 779.12 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00525724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.38;QD=56.6632;RBI=0.0105628;REFB=0;REVB=-0.00916154;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75082e-07;OID=.;OPOS=28687542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:27:27:0:0:27:28:0:0 chr6 28697082 . C T 377.91 PASS AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.000250933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.971;QD=21.595;RBI=0.011875;REFB=-0.00920021;REVB=0.0118724;RO=32;SAF=25;SAR=13;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188768;STB=0.604468;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00616583;OID=.;OPOS=28697082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:13:25:14:18:13:25:14:18 chr6 28697086 . C T 287.6 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0335162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0972;QD=15.978;RBI=0.0510719;REFB=-0.0161813;REVB=-0.0385357;RO=40;SAF=14;SAR=18;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183232;STB=0.603029;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0128977;OID=.;OPOS=28697086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:18:14:25:15:18:14:25:15 chr6 28703244 . T C 472.21 PASS AF=0.410853;AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=52;FSRR=24;FWDB=0.00599541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.132;QD=14.6422;RBI=0.0245661;REFB=-0.00579617;REVB=0.0238233;RO=76;SAF=28;SAR=25;SRF=52;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16623;STB=0.593086;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.011464;OID=.;OPOS=28703244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:76:76:53:53:0.410853:25:28:52:24:25:28:52:24 chr6 28703281 . T C 298.36 PASS AF=0.345455;AO=38;DP=110;FAO=38;FDP=110;FR=.;FRO=72;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=49;FSRR=23;FWDB=-0.0051027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.86;QD=10.8494;RBI=0.0136848;REFB=-0.00176966;REVB=0.0126979;RO=72;SAF=16;SAR=22;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288718;STB=0.665035;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00107995;OID=.;OPOS=28703281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:72:72:38:38:0.345455:22:16:49:23:22:16:49:23 chr6 28715604 . G C 553.88 PASS AF=0.44697;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.0431677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9348;QD=16.7843;RBI=0.043393;REFB=-0.00662662;REVB=0.00441626;RO=73;SAF=32;SAR=27;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143144;STB=0.579713;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00778487;OID=.;OPOS=28715604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:73:59:59:0.44697:27:32:29:44:27:32:29:44 chr6 28758580 . TTTG T 210.88 PASS AF=0.404494;AO=34;DP=90;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.0131574;FXX=0.0326052;HRUN=3;LEN=3;MLLD=282.836;QD=9.47782;RBI=0.0164646;REFB=-0.00237732;REVB=0.00989785;RO=46;SAF=10;SAR=24;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135733;STB=0.569303;STBP=0.343;TYPE=del;VARB=0.0029519;OID=.;OPOS=28758581;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.404494:34:90:36:89:53:10:26:20:33:99:46:10:24:19:27 chr6 28770596 . A AC 124.84 PASS AF=0.380952;AO=21;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.132071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.7406;QD=7.92662;RBI=0.158705;REFB=-0.00078472;REVB=-0.0880024;RO=40;SAF=11;SAR=10;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114787;STB=0.57137;STBP=0.394;TYPE=ins;VARB=0.00496549;OID=.;OPOS=28770597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.380952:21:63:24:63:39:12:12:24:15:99:40:11:10:25:15 chr6 28775664 . C T 548.61 PASS AF=0.523364;AO=56;DP=107;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0138287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.827;QD=20.5086;RBI=0.0143487;REFB=-0.0167725;REVB=0.00382794;RO=51;SAF=25;SAR=31;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132056;STB=0.507268;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0150739;OID=.;OPOS=28775664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:51:51:56:56:0.523364:31:25:22:29:31:25:22:29 chr6 28779933 . G A 182.03 PASS AF=0.265957;AO=25;DP=94;FAO=25;FDP=94;FR=.;FRO=69;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0306177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.396;QD=7.74582;RBI=0.0312803;REFB=-0.0106646;REVB=0.00640442;RO=69;SAF=8;SAR=17;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234705;STB=0.641675;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0295617;OID=.;OPOS=28779933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:69:69:25:25:0.265957:17:8:35:34:17:8:35:34 chr6 28785085 . C T 754.23 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7229;QD=56.9226;RBI=0.0469448;REFB=0;REVB=-0.00452517;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163894;OID=.;OPOS=28785085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr6 28791134 . G A 216.05 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0196223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.34;QD=13.094;RBI=0.0315221;REFB=-0.0172848;REVB=-0.0246701;RO=39;SAF=9;SAR=17;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206038;STB=0.625792;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.028937;OID=.;OPOS=28791134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:40:26:26:0.393939:17:9:21:18:17:9:22:18 chr6 28791150 . A C 212.18 PASS AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00926836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6842;QD=12.3;RBI=0.0316285;REFB=0.00907064;REVB=-0.0302401;RO=43;SAF=9;SAR=17;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208442;STB=0.620202;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.0200438;OID=.;OPOS=28791150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:43:43:26:26:0.376812:17:9:23:20:17:9:23:20 chr6 28806218 . G A 194.26 PASS AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0238964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1187;QD=24.2828;RBI=0.0762242;REFB=0.00601634;REVB=0.0723816;RO=13;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146285;STB=0.581234;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00189787;OID=.;OPOS=28806218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:8:11:10:3:8:11:10:3 chr6 28849157 . T C 653.01 PASS AF=0.455128;AO=71;DP=156;FAO=71;FDP=156;FR=.;FRO=85;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=-0.00285145;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.3776;QD=16.7437;RBI=0.0566484;REFB=-0.00167466;REVB=-0.0565765;RO=80;SAF=33;SAR=38;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575968;STB=0.516019;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00155664;OID=.;OPOS=28849157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:80:85:71:71:0.455128:38:33:42:38:38:33:42:43 chr6 28911802 . G A 408.27 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0354747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9803;QD=20.4135;RBI=0.0777894;REFB=-0.0183554;REVB=0.0692295;RO=39;SAF=28;SAR=13;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908906;STB=0.550483;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0187255;OID=.;OPOS=28911802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:13:28:23:16:13:28:23:16 chr6 28912076 . C T 485.58 PASS AF=0.505376;AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00516299;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.252;QD=20.8852;RBI=0.0207904;REFB=-0.0131566;REVB=0.0201392;RO=46;SAF=22;SAR=25;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285712;STB=0.515812;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0128824;OID=.;OPOS=28912076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:46:46:47:47:0.505376:25:22:23:23:25:22:23:23 chr6 28945522 . C T 547.62 PASS AF=0.542553;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0114981;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.272;QD=23.3028;RBI=0.0142818;REFB=-0.0197035;REVB=-0.00847131;RO=43;SAF=24;SAR=27;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534917;STB=0.5294;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0178591;OID=.;OPOS=28945522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:43:43:51:51:0.542553:27:24:23:20:27:24:23:20 chr6 28963248 . T G 1275.94 PASS AF=0.542222;AO=122;DP=226;FAO=122;FDP=225;FR=.;FRO=103;FSAF=69;FSAR=53;FSRF=59;FSRR=44;FWDB=0.0151491;FXX=0.00442458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.2921;QD=22.6834;RBI=0.0157663;REFB=-0.00479921;REVB=-0.00436817;RO=103;SAF=69;SAR=53;SRF=59;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00619205;STB=0.503376;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00457075;OID=.;OPOS=28963248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:225:103:103:122:122:0.542222:53:69:59:44:53:69:59:44 chr6 29012067 . C T 524.55 PASS AF=0.375;AO=63;DP=167;FAO=63;FDP=168;FR=.;FRO=105;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=61;FSRR=44;FWDB=0.0121344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7409;QD=12.4892;RBI=0.0831856;REFB=0.017085;REVB=-0.0822958;RO=103;SAF=38;SAR=25;SRF=61;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124795;STB=0.514416;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.0399048;OID=.;OPOS=29012067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:103:105:63:63:0.375:25:38:61:42:25:38:61:44 chr6 29012116 . G A 662.61 PASS AF=0.40884;AO=74;DP=181;FAO=74;FDP=181;FR=.;FRO=107;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=57;FSRR=50;FWDB=-0.0180516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.895;QD=14.6434;RBI=0.0201774;REFB=-0.0112545;REVB=-0.00901475;RO=106;SAF=35;SAR=39;SRF=56;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580687;STB=0.535273;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0211267;OID=.;OPOS=29012116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:106:107:74:74:0.40884:39:35:56:50:39:35:57:50 chr6 29068759 . C A 809.55 PASS AF=0.516779;AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0573089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6555;QD=21.7328;RBI=0.0586726;REFB=0.0140296;REVB=-0.0125761;RO=71;SAF=37;SAR=40;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477702;STB=0.529517;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.0148271;OID=.;OPOS=29068759;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:71:72:77:77:0.516779:40:37:38:33:40:37:39:33 chr6 29069016 . G A 1414.36 PASS AF=0.461059;AO=147;DP=320;FAO=148;FDP=321;FR=.;FRO=173;FSAF=67;FSAR=81;FSRF=68;FSRR=105;FWDB=0.00879024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.926;QD=17.6244;RBI=0.0181281;REFB=-0.0084414;REVB=0.0158543;RO=170;SAF=66;SAR=81;SRF=67;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542571;STB=0.532628;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0100902;OID=.;OPOS=29069016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:321:170:173:147:148:0.461059:81:66:67:103:81:67:68:105 chr6 29069264 . T C 807.18 PASS AF=0.422535;AO=90;DP=213;FAO=90;FDP=213;FR=.;FRO=123;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=70;FSRR=53;FWDB=0.00815286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.006;QD=15.1583;RBI=0.0172275;REFB=-0.0141952;REVB=0.0151762;RO=122;SAF=42;SAR=48;SRF=70;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110105;STB=0.558939;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0114118;OID=.;OPOS=29069264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:122:123:90:90:0.422535:48:42:70:52:48:42:70:53 chr6 29069299 . C T 986.96 PASS AF=0.452174;AO=104;DP=230;FAO=104;FDP=230;FR=.;FRO=126;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=62;FSRR=64;FWDB=-0.000317101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.168;QD=17.1645;RBI=0.0131632;REFB=-0.00858762;REVB=-0.0131594;RO=125;SAF=50;SAR=54;SRF=62;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150192;STB=0.506192;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0110736;OID=.;OPOS=29069299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:125:126:104:104:0.452174:54:50:62:63:54:50:62:64 chr6 29069337 . A T 1053.12 PASS AF=0.444015;AO=104;DP=248;FAO=115;FDP=259;FR=.;FRO=144;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=72;FSRR=72;FWDB=0.00743337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.439;QD=16.2644;RBI=0.0203341;REFB=-0.0175996;REVB=0.0189267;RO=138;SAF=65;SAR=39;SRF=71;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116598;STB=0.551518;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0206404;OID=.;OPOS=29069337;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:259:138:144:104:115:0.444015:39:65:71:67:47:68:72:72 chr6 29080349 . A G 1188.41 PASS AF=0.495798;AO=118;DP=238;FAO=118;FDP=238;FR=.;FRO=120;FSAF=53;FSAR=65;FSRF=63;FSRR=57;FWDB=-0.0189071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.179;QD=19.9733;RBI=0.0203551;REFB=-0.0171395;REVB=0.00753992;RO=120;SAF=53;SAR=65;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697852;STB=0.538334;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0148617;OID=.;OPOS=29080349;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:120:120:118:118:0.495798:65:53:63:57:65:53:63:57 chr6 29080450 . G A 670.69 PASS AF=0.40107;AO=75;DP=187;FAO=75;FDP=187;FR=.;FRO=112;FSAF=23;FSAR=52;FSRF=53;FSRR=59;FWDB=-0.0369335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9395;QD=14.3463;RBI=0.0406578;REFB=-0.0396038;REVB=-0.0169992;RO=112;SAF=23;SAR=52;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19045;STB=0.607503;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0455996;OID=.;OPOS=29080450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:112:112:75:75:0.40107:52:23:53:59:52:23:53:59 chr6 29141632 . T C 960.46 PASS AF=0.489796;AO=95;DP=196;FAO=96;FDP=196;FR=.;FRO=100;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.00727871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.848;QD=19.6012;RBI=0.0153534;REFB=-0.0276967;REVB=-0.0135185;RO=100;SAF=55;SAR=40;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111299;STB=0.557857;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0271025;OID=.;OPOS=29141632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:100:100:95:96:0.489796:40:55:46:54:41:55:46:54 chr6 29141743 . A G 4335.31 PASS AF=1;AO=274;DP=275;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8908;QD=63.059;RBI=0.0559239;REFB=0;REVB=0.0215266;RO=0;SAF=127;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150101;OID=.;OPOS=29141743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:275:275:0:0:274:275:1:147:127:0:0:147:128:0:0 chr6 29141772 . A G 1177.49 PASS AF=0.443262;AO=124;DP=282;FAO=125;FDP=282;FR=.;FRO=157;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=65;FSRR=92;FWDB=-0.0073831;FXX=0.00353344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.159;QD=16.702;RBI=0.0118315;REFB=-0.0195752;REVB=-0.00924523;RO=157;SAF=71;SAR=53;SRF=65;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159034;STB=0.589783;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0272106;OID=.;OPOS=29141772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:157:157:124:125:0.443262:53:71:65:92:53:72:65:92 chr6 29141849 . T C 966.22 PASS AF=0.455357;AO=102;DP=225;FAO=102;FDP=224;FR=.;FRO=122;FSAF=65;FSAR=37;FSRF=54;FSRR=68;FWDB=-0.0228534;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.158;QD=17.254;RBI=0.0250666;REFB=-0.0264694;REVB=0.0102984;RO=121;SAF=65;SAR=37;SRF=53;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198171;STB=0.607834;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0285736;OID=.;OPOS=29141849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:121:122:102:102:0.455357:37:65:53:68:37:65:54:68 chr6 29142054 . C G 998.17 PASS AF=0.497561;AO=101;DP=204;FAO=102;FDP=205;FR=.;FRO=103;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=62;FSRR=41;FWDB=0.0311999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3443;QD=19.4766;RBI=0.0322259;REFB=-0.00881353;REVB=0.00806676;RO=102;SAF=51;SAR=50;SRF=62;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942505;STB=0.55121;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00678621;OID=.;OPOS=29142054;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:102:103:101:102:0.497561:50:51:62:40:51:51:62:41 chr6 29142064 . A G 986.06 PASS AF=0.5;AO=100;DP=200;FAO=100;FDP=200;FR=.;FRO=100;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=63;FSRR=37;FWDB=0.0132651;FXX=0.0147776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.404;QD=19.7212;RBI=0.0133746;REFB=-0.0218506;REVB=0.00170822;RO=99;SAF=50;SAR=50;SRF=63;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123701;STB=0.564987;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.024326;OID=.;OPOS=29142064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:99:100:100:100:0.5:50:50:63:36:50:50:63:37 chr6 29274486 . T C 515.66 PASS AF=0.416058;AO=56;DP=137;FAO=57;FDP=137;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=0.0205866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.614;QD=15.0558;RBI=0.117339;REFB=-0.00806265;REVB=0.115519;RO=80;SAF=29;SAR=27;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205888;STB=0.516785;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0101986;OID=.;OPOS=29274486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:80:80:56:57:0.416058:27:29:43:37:28:29:43:37 chr6 29323259 . G A 769.54 PASS AF=0.982143;AO=51;DP=52;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00538437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.807;QD=54.967;RBI=0.0638034;REFB=-0.11337;REVB=0.0635758;RO=1;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209217;STB=0.509431;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00119586;OID=.;OPOS=29323259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:56:1:1:51:55:0.982143:22:29:0:1:26:29:0:1 chr6 29323905 . A C 257.55 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0285471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7393;QD=23.4133;RBI=0.0369295;REFB=-0.0104693;REVB=-0.0234276;RO=20;SAF=17;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055851;STB=0.531223;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00723509;OID=.;OPOS=29323905;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:7:17:13:7:7:17:13:7 chr6 29342236 . A G 1034.71 PASS AF=0.577381;AO=97;DP=168;FAO=97;FDP=168;FR=.;FRO=71;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=0.0221619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.532;QD=24.6361;RBI=0.0221978;REFB=-0.00675768;REVB=-0.00126234;RO=70;SAF=47;SAR=50;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121129;STB=0.568207;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00501906;OID=.;OPOS=29342236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:70:71:97:97:0.577381:50:47:23:47:50:47:23:48 chr6 29364615 . G T 1350.62 PASS AF=0.549356;AO=126;DP=231;FAO=128;FDP=233;FR=.;FRO=105;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=55;FWDB=-0.00652894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.078;QD=23.1865;RBI=0.0133038;REFB=-0.0277173;REVB=0.0115916;RO=105;SAF=65;SAR=61;SRF=50;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330971;STB=0.514245;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0238095;OID=.;OPOS=29364615;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:233:105:105:126:128:0.549356:61:65:50:55:63:65:50:55 chr6 29364643 . T C 1179.61 PASS AF=0.556122;AO=108;DP=194;FAO=109;FDP=196;FR=.;FRO=87;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=37;FSRR=50;FWDB=-0.000120996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7033;QD=24.0736;RBI=0.0669553;REFB=0.00219296;REVB=0.0669552;RO=86;SAF=51;SAR=57;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043912;STB=0.519032;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.00163461;OID=.;OPOS=29364643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:196:86:87:108:109:0.556122:57:51:36:50:58:51:37:50 chr6 29364787 . C T 2159.48 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0841779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.0529;QD=63.0505;RBI=0.0875841;REFB=0;REVB=0.024188;RO=0;SAF=59;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049577;OID=.;OPOS=29364787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:78:59:0:0:78:59:0:0 chr6 29364815 . C G 650.03 PASS AF=0.47482;AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.00256313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.043;QD=18.7059;RBI=0.00256317;REFB=-0.00280047;REVB=1.4959e-05;RO=73;SAF=28;SAR=38;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000402659;STB=0.500223;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.00303514;OID=.;OPOS=29364815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:73:73:66:66:0.47482:38:28:31:42:38:28:31:42 chr6 29364835 . T G 667.16 PASS AF=0.453333;AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=0.00544817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.821;QD=17.7908;RBI=0.0132098;REFB=0.000121524;REVB=0.0120339;RO=82;SAF=29;SAR=39;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119178;STB=0.506625;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.000143408;OID=.;OPOS=29364835;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:82:82:68:68:0.453333:39:29:34:48:39:29:34:48 chr6 29364838 . C G 672.57 PASS AF=0.464516;AO=72;DP=155;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.00657157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0231;QD=17.3566;RBI=0.0139285;REFB=-0.00493105;REVB=0.0122808;RO=83;SAF=32;SAR=40;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104846;STB=0.505812;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.00505824;OID=.;OPOS=29364838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:83:83:72:72:0.464516:40:32:36:47:40:32:36:47 chr6 29364951 . G A 852.9 PASS AF=0.524691;AO=85;DP=163;FAO=85;FDP=162;FR=.;FRO=77;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=-0.0240181;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.985;QD=21.0593;RBI=0.0278278;REFB=-0.0151944;REVB=-0.0140542;RO=76;SAF=49;SAR=36;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100528;STB=0.558268;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.015015;OID=.;OPOS=29364951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:76:77:85:85:0.524691:36:49:35:41:36:49:35:42 chr6 29365241 . T C 714.35 PASS AF=0.47651;AO=71;DP=149;FAO=71;FDP=149;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=0.00166259;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.702;QD=19.1772;RBI=0.0142278;REFB=-0.00920235;REVB=-0.0141303;RO=78;SAF=37;SAR=34;SRF=51;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126815;STB=0.569994;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0107041;OID=.;OPOS=29365241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:78:78:71:71:0.47651:34:37:51:27:34:37:51:27 chr6 29365423 . A T 636.06 PASS AF=0.568807;AO=61;DP=108;FAO=62;FDP=109;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00442188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.627;QD=23.3417;RBI=0.0136532;REFB=-0.0173845;REVB=0.0129173;RO=47;SAF=21;SAR=40;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205687;STB=0.606393;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0123571;OID=.;OPOS=29365423;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:47:47:61:62:0.568807:40:21:28:19:40:22:28:19 chr6 29385237 . T C 515.9 PASS AF=0.404255;AO=57;DP=141;FAO=57;FDP=141;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=0.0300376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6462;QD=14.6355;RBI=0.0304862;REFB=0.00647074;REVB=-0.00521105;RO=83;SAF=24;SAR=33;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000684786;STB=0.504586;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.0105929;OID=.;OPOS=29385237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:83:84:57:57:0.404255:33:24:35:48:33:24:36:48 chr6 29407970 . T C 649.02 PASS AF=0.457516;AO=70;DP=154;FAO=70;FDP=153;FR=.;FRO=83;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=-0.0218046;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.331;QD=16.9678;RBI=0.0218787;REFB=-0.0270529;REVB=0.00179864;RO=82;SAF=27;SAR=43;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137064;STB=0.579624;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0249971;OID=.;OPOS=29407970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:82:83:70:70:0.457516:43:27:43:39:43:27:44:39 chr6 29408313 . C A 684.67 PASS AF=0.615385;AO=64;DP=104;FAO=64;FDP=104;FR=.;FRO=40;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0016078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.602;QD=26.3335;RBI=0.017656;REFB=-0.0175713;REVB=0.0175827;RO=40;SAF=48;SAR=16;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150862;STB=0.582326;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0149847;OID=.;OPOS=29408313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:40:40:64:64:0.615385:16:48:23:17:16:48:23:17 chr6 29408528 . A G 467.77 PASS AF=0.410853;AO=53;DP=128;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=0.0298443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.016;QD=14.5045;RBI=0.0329248;REFB=-0.0304032;REVB=-0.0139053;RO=75;SAF=25;SAR=28;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895091;STB=0.545706;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0438924;OID=.;OPOS=29408528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:75:76:53:53:0.410853:28:25:29:46:28:25:30:46 chr6 29431698 . A G 434.39 PASS AF=0.463158;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0401519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0404;QD=18.2902;RBI=0.0429402;REFB=-0.0300442;REVB=-0.0152211;RO=50;SAF=25;SAR=19;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845503;STB=0.542149;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0246911;OID=.;OPOS=29431698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:51:44:44:0.463158:19:25:24:26:19:25:25:26 chr6 29523676 . C G 1212.8 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0515494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7085;QD=59.8915;RBI=0.0662855;REFB=-0.119501;REVB=-0.0416705;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.506492;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00115987;OID=.;OPOS=29523676;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:42:38:0:0:42:38:1:0 chr6 29555778 . A G 2386.66 PASS AF=1;AO=146;DP=146;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0061;QD=64.0714;RBI=0.0168948;REFB=0;REVB=-0.0163447;RO=0;SAF=88;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63126e-05;OID=.;OPOS=29555778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:146:149:0:0:146:149:1:58:88:0:0:60:89:0:0 chr6 29555809 . C T 2388.16 PASS AF=0.9875;AO=158;DP=160;FAO=158;FDP=160;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0769317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.167;QD=59.7039;RBI=0.0853351;REFB=-0.0519187;REVB=0.0369269;RO=2;SAF=93;SAR=65;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00217473;STB=0.501143;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00193262;OID=.;OPOS=29555809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:160:160:2:2:158:158:0.9875:65:93:1:1:65:93:1:1 chr6 29625001 . A G 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3081;QD=57.1057;RBI=0.0601596;REFB=0;REVB=-0.0523115;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262988;OID=.;OPOS=29625001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr6 29634012 . A G 1061.74 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.931;QD=59.8165;RBI=0.0156425;REFB=0;REVB=0.0103396;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20903e-05;OID=.;OPOS=29634012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:35:35:0:0:36:35:0:0 chr6 29691857 . C G 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0491395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.328;QD=15.2929;RBI=0.0538612;REFB=-0.0109359;REVB=0.0220531;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946172;STB=0.555432;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0114474;OID=.;OPOS=29691857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:5:4:5:4:5:4 chr6 29693011 . C T 650.67 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6591;QD=61.9681;RBI=0.0152087;REFB=0;REVB=-0.0117667;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49177e-05;OID=.;OPOS=29693011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr6 29695854 . G A 764.41 PASS AF=0.536765;AO=73;DP=136;FAO=73;FDP=136;FR=.;FRO=63;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.029353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1426;QD=22.4827;RBI=0.042459;REFB=0.0140816;REVB=0.0306785;RO=63;SAF=42;SAR=31;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306816;STB=0.516812;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=-0.0115761;OID=.;OPOS=29695854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:63:63:73:73:0.536765:31:42:34:29:31:42:34:29 chr6 29718220 . G A 766.45 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00940051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.404;QD=63.8709;RBI=0.0110079;REFB=0;REVB=-0.00572754;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00502e-05;OID=.;OPOS=29718220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:25:23:0:0 chr6 29855580 . GCCCTGACCCT GCCCT,GCCCTGACCCA,GCCCTGGCCCT 800.11 PASS AF=0.724138,0.189655,0.0862069;AO=41,9,5;DP=60;FAO=42,11,5;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=11,9,2;FSAR=31,2,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148657,0.0353354,-0.123339;FXX=0.0793525;HRUN=1,1,1;LEN=6,1,1;MLLD=275.219,81.1265,167.368;QD=55.1798;RBI=0.0175548,0.0354199,0.123339;REFB=0,0,0;REVB=0.00933711,-0.00244556,0.000333174;RO=0;SAF=10,8,2;SAR=31,1,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-4.09277e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0030927,0.022414,0.0151176;OID=.,.,.;OPOS=29855581,29855590,29855586;OREF=CCCTGA,T,A;OALT=-,A,G;OMAPALT=GCCCT,GCCCTGACCCA,GCCCTGGCCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.724138,0.189655,0.0862069:41,9,5:60:42,11,5:58:0:11,9,2:31,2,3:0:0:70:0:10,8,2:31,1,3:0:0 chr6 29855849 . A C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.645;QD=48.7369;RBI=0.0415302;REFB=0;REVB=0.0204294;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000828735;OID=.;OPOS=29855849;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0 chr6 29855858 . C A 182.82 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0253241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.236;QD=43.0159;RBI=0.0297223;REFB=0.0220986;REVB=0.0155598;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529375;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.000645923;OID=.;OPOS=29855858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:0:1:16:16:0.941176:8:8:0:0:8:8:1:0 chr6 29855860 . A AG 96.7 PASS AF=1;AO=2;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00416807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=6.63409;QD=22.7537;RBI=0.0109373;REFB=0;REVB=0.010112;RO=15;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554201;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00562879;OID=.;OPOS=29855861;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:17:17:17:0:9:8:0:0:3:15:2:0:7:8 chr6 29855862 . AGA GAT 195.99 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127404;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=3;MLLD=251.369;QD=48.9981;RBI=0.0294262;REFB=0;REVB=0.0265251;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000227355;OID=.;OPOS=29855862;OREF=AGA;OALT=GAT;OMAPALT=GAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:8:8:0:0 chr6 29855901 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.56;QD=56.1915;RBI=0.0180153;REFB=0;REVB=0.00665298;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11363e-05;OID=.;OPOS=29855901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr6 29856330 . G A 881.31 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0337566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.224;QD=55.956;RBI=0.0476958;REFB=-0.0362917;REVB=0.0336955;RO=1;SAF=38;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012264;STB=0.506491;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000637644;OID=.;OPOS=29856330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:24:38:1:0:24:38:1:0 chr6 29856347 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.909;QD=58.7817;RBI=0.0306296;REFB=0;REVB=0.0180404;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.88302e-05;OID=.;OPOS=29856347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0 chr6 29856427 . G A 699.25 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.1623;QD=60.8045;RBI=0.0806145;REFB=-0.0586167;REVB=0.0461028;RO=1;SAF=15;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030296;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166755;OID=.;OPOS=29856427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:46:46:1:0:45:46:1:30:15:1:0:30:16:0:0 chr6 29856550 . C G 669.83 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.491;QD=62.3093;RBI=0.0276614;REFB=0;REVB=0.0101105;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2449e-05;OID=.;OPOS=29856550;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr6 29856633 . T C 1024.19 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0844;QD=59.3736;RBI=0.0496157;REFB=0;REVB=0.0335877;RO=1;SAF=29;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016016;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.64208e-05;OID=.;OPOS=29856633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:1:0:67:69:1:38:29:1:0:39:30:0:0 chr6 29856686 . C G 1080.54 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.006;QD=60.0301;RBI=0.0303843;REFB=0;REVB=-0.010917;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85558e-05;OID=.;OPOS=29856686;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:42:30:0:0:42:30:0:0 chr6 29856693 . C T 1062.74 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.589;QD=59.8726;RBI=0.0198478;REFB=0;REVB=0.0181306;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92518e-05;OID=.;OPOS=29856693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:41:29:0:0:41:30:0:0 chr6 29856718 . G C 1102.08 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010774;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7308;QD=60.3881;RBI=0.0566736;REFB=0;REVB=0.0556401;RO=1;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122839;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285446;OID=.;OPOS=29856718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:1:0:72:73:1:38:34:0:1:39:34:0:0 chr6 29910358 . C G 733.97 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00567526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3312;QD=61.1645;RBI=0.0256336;REFB=-0.089404;REVB=0.0249975;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0030443;OID=.;OPOS=29910358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:27:20:0:0:27:20:0:1 chr6 29910378 . C T 471.96 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0276418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.954;QD=55.5246;RBI=0.0292944;REFB=-0.145125;REVB=0.00969999;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322;STB=0.517231;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000330933;OID=.;OPOS=29910378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:19:14:1:0:19:14:1:0 chr6 29910538 . C T 57.08 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0314713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.844;QD=28.5378;RBI=0.0795432;REFB=0.106738;REVB=0.0730526;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971198;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00190022;OID=.;OPOS=29910538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:1:0:3:4:1:0 chr6 29910604 . C A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.103;QD=35.5759;RBI=0.0464147;REFB=0;REVB=0.0328677;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0007361;OID=.;OPOS=29910604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr6 29910700 . G T 160.2 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.908;QD=45.7709;RBI=0.0544079;REFB=0;REVB=0.022963;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243883;OID=.;OPOS=29910700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr6 29910716 . CA GG 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023174;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=213.794;QD=45.8068;RBI=0.0462631;REFB=0;REVB=0.0400405;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.97556e-05;OID=.;OPOS=29910716;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr6 29910730 . T A 145.1 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.84;QD=44.6468;RBI=0.0293088;REFB=0;REVB=-0.0205502;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60392e-06;OID=.;OPOS=29910730;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr6 29910742 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1423;QD=44.6895;RBI=0.0895517;REFB=0;REVB=0.0814886;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00552961;OID=.;OPOS=29910742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr6 29910752 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2766;QD=44.6895;RBI=0.0494226;REFB=0;REVB=0.0271036;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002019;OID=.;OPOS=29910752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr6 29911092 . G T 123.15 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0310764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.531;QD=37.8922;RBI=0.0397995;REFB=-0.0267002;REVB=-0.0248649;RO=1;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818676;STB=0.545378;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000960649;OID=.;OPOS=29911092;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:5:7:0:1:5:7:0:1 chr6 29911114 . GG AC 207.33 PASS AF=1;AO=13;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507768;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=129.51;QD=48.7827;RBI=0.066917;REFB=0;REVB=0.0435844;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00113375;OID=.;OPOS=29911114;OREF=GG;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:13:17:1:7:6:0:0:8:9:0:0 chr6 29911119 . G T 173.17 PASS AF=0.941176;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0404413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.179;QD=40.7466;RBI=0.0646205;REFB=-0.133286;REVB=0.0504015;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533291;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0111276;OID=.;OPOS=29911119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:17:17:0:1:15:16:0.941176:6:9:0:0:7:9:0:1 chr6 29911154 . C A 465.55 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6932;QD=58.1931;RBI=0.142377;REFB=0;REVB=0.140931;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193101;OID=.;OPOS=29911154;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:15:17:0:0 chr6 29911190 . G A 527.52 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5158;QD=57.0296;RBI=0.0440623;REFB=-0.0398414;REVB=-0.0380988;RO=1;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252932;STB=0.513506;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000961883;OID=.;OPOS=29911190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:37:37:1:1:36:36:0.972973:18:18:0:1:18:18:0:1 chr6 29911198 . T C 661.98 PASS AF=0.93617;AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0219032;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.734;QD=56.3388;RBI=0.0284978;REFB=-0.017663;REVB=-0.0182311;RO=3;SAF=19;SAR=25;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120329;STB=0.506414;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.000985061;OID=.;OPOS=29911198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:47:3:3:44:44:0.93617:25:19:1:2:25:19:1:2 chr6 29911207 . G A 688.45 PASS AF=0.92;AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0176423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.881;QD=55.0759;RBI=0.133643;REFB=0.00026155;REVB=0.132473;RO=4;SAF=20;SAR=26;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283147;STB=0.515091;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000597327;OID=.;OPOS=29911207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:50:50:4:4:46:46:0.92:26:20:1:3:26:20:1:3 chr6 29911218 . G A 124.15 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00200817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.188;QD=9.93216;RBI=0.0293498;REFB=-0.0207495;REVB=0.029281;RO=34;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311538;STB=0.692071;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0426777;OID=.;OPOS=29911218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:35:15:15:0.3:6:9:11:23:6:9:11:24 chr6 29911228 . A T 279.92 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0435737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9319;QD=19.3051;RBI=0.0785263;REFB=-0.0452198;REVB=0.0653277;RO=27;SAF=10;SAR=20;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102083;STB=0.567855;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0543903;OID=.;OPOS=29911228;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:28:30:30:0.517241:20:10:12:15:20:10:13:15 chr6 29911239 . TT CA,TG 238.95 PASS AF=0.135593,0.338983;AO=8,20;DP=59;FAO=8,20;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=1,12;FSAR=7,8;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0176374,-0.0401377;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=116.343,58.734;QD=16.1998;RBI=0.0181569,0.0423241;REFB=-0.00641198,0.0209699;REVB=-0.00431259,-0.0134274;RO=30;SAF=1,12;SAR=7,8;SRF=9;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.31093,0.304677;STB=0.732632,0.663965;STBP=0.182,0.072;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0173125,-0.0201397;OID=.,.;OPOS=29911239,29911240;OREF=TT,T;OALT=CA,G;OMAPALT=CA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:59:59:30:31:8,20:8,20:0.135593,0.338983:7,8:1,12:9:21:7,8:1,12:10:21 chr6 29911256 . T G 902.53 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.139;QD=58.2278;RBI=0.0448467;REFB=0;REVB=0.0362218;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.1342e-05;OID=.;OPOS=29911256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:36:25:0:0:37:25:0:0 chr6 29911296 . G A 86.67 PASS AF=0.215385;AO=14;DP=65;FAO=14;FDP=65;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00878256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.204;QD=5.33337;RBI=0.0183157;REFB=-0.00876865;REVB=0.0160726;RO=50;SAF=4;SAR=10;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295845;STB=0.681551;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0303361;OID=.;OPOS=29911296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:65:65:50:51:14:14:0.215385:10:4:26:24:10:4:26:25 chr6 29911306 . C T 96.75 PASS AF=0.234375;AO=15;DP=65;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0144596;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.831;QD=6.04658;RBI=0.0158594;REFB=-0.00325404;REVB=-0.00651462;RO=49;SAF=5;SAR=10;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267198;STB=0.666444;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0238541;OID=.;OPOS=29911306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:65:64:49:49:15:15:0.234375:10:5:27:22:10:5:27:22 chr6 29911319 . G T 135.32 PASS AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0220886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.486;QD=8.32731;RBI=0.0242253;REFB=-0.0117624;REVB=0.00994783;RO=46;SAF=5;SAR=14;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341974;STB=0.705659;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0461254;OID=.;OPOS=29911319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:46:46:19:19:0.292308:14:5:25:21:14:5:25:21 chr6 29912108 . G C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0704;QD=45.8045;RBI=0.109324;REFB=0;REVB=0.0970005;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00523262;OID=.;OPOS=29912108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr6 29912147 . C T 289.78 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.029;QD=52.688;RBI=0.0467433;REFB=0;REVB=0.0434148;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141797;OID=.;OPOS=29912147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0 chr6 29912280 . T C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.359;QD=60.6098;RBI=0.0135441;REFB=0;REVB=-0.0014092;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8775e-05;OID=.;OPOS=29912280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr6 29912333 . C T 438.38 PASS AF=0.914286;AO=34;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0097496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5719;QD=50.1004;RBI=0.0146853;REFB=0.0119247;REVB=-0.0109819;RO=1;SAF=20;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022804;STB=0.526299;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00720797;OID=.;OPOS=29912333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:35:35:1:3:34:32:0.914286:14:20:1:0:12:20:1:2 chr6 29912368 . C T 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.811;QD=58.1418;RBI=0.0574833;REFB=0;REVB=0.0286612;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394812;OID=.;OPOS=29912368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0 chr6 29912398 . A G 323.79 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00671097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=355.609;QD=53.9656;RBI=0.0389306;REFB=0;REVB=0.0383478;RO=0;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3928e-05;OID=.;OPOS=29912398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:3:20:0:0:4:20:0:0 chr6 29912413 . TG T 207.95 PASS AF=1;AO=15;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9598;QD=41.5903;RBI=0.113585;REFB=0;REVB=-0.104932;RO=2;SAF=12;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.361702;SSEP=0;SSSB=-0.0701688;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00195867;OID=.;OPOS=29912414;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:15:20:20:20:0:17:3:0:0:4:2:12:3:2:0 chr6 29912830 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.862;QD=61.684;RBI=0.0416362;REFB=0;REVB=-0.00796013;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83693e-05;OID=.;OPOS=29912830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0 chr6 29912852 . T C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.169;QD=62.9829;RBI=0.0370537;REFB=0;REVB=0.0359827;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195275;OID=.;OPOS=29912852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0 chr6 29912856 . A T 714.84 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0479716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8424;QD=60.8378;RBI=0.0498525;REFB=-0.10046;REVB=-0.0135644;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00370636;OID=.;OPOS=29912856;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:19:27:0:0:19:27:1:0 chr6 29913042 . C T 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.281;QD=59.8559;RBI=0.0384627;REFB=0;REVB=0.0230348;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8707e-05;OID=.;OPOS=29913042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0 chr6 29913067 . T C 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8127;QD=57.2364;RBI=0.0238404;REFB=0;REVB=-0.0115359;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107609;OID=.;OPOS=29913067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0 chr6 29913074 . A G 774.61 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.353;QD=56.3356;RBI=0.0691461;REFB=0;REVB=0.0600047;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00088145;OID=.;OPOS=29913074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:18:33:0:0:22:33:0:0 chr6 29913078 . A G 739.06 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.591;QD=54.7451;RBI=0.0273571;REFB=0.0911226;REVB=-0.000974045;RO=1;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229721;STB=0.51219;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000342312;OID=.;OPOS=29913078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:20:33:0:1:20:33:0:1 chr6 29976838 . A G 1558.21 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279524;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8524;QD=59.9312;RBI=0.0366957;REFB=0;REVB=-0.0237749;RO=0;SAF=57;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96765e-05;OID=.;OPOS=29976838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:47:57:0:0:47:57:0:0 chr6 30075843 . T C 749.46 PASS AF=0.890625;AO=44;DP=63;FAO=57;FDP=64;FR=.;FRO=7;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.039877;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=132.285;QD=46.8411;RBI=0.0399262;REFB=-0.0581488;REVB=-0.00198096;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529944;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.000534748;OID=.;OPOS=30075843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:63:64:0:7:44:57:0.890625:14:30:0:0:23:34:6:1 chr6 30075864 . A G,T 984.89 PASS AF=0.942857,0.0428571;AO=64,3;DP=67;FAO=66,3;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=42,3;FSAR=24,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199634,-2.3494e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=82.4797,99.1347;QD=56.2794;RBI=0.0205288,0.00561796;REFB=-0.175234,-0.0216552;REVB=0.0047848,-0.00561792;RO=0;SAF=41,3;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.505881,0.5;STBP=0.512,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000922789,0.15107;OID=.,.;OPOS=30075864,30075864;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:67:70:0:1:64,3:66,3:0.942857,0.0428571:23,0:41,3:0:0:24,0:42,3:1:0 chr6 30075903 . C T 298.79 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.00680816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.257;QD=18.6741;RBI=0.012039;REFB=-0.0189907;REVB=0.00992907;RO=32;SAF=19;SAR=13;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214313;STB=0.618326;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0194277;OID=.;OPOS=30075903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:13:19:26:6:13:19:26:6 chr6 30114845 . T C 181.41 PASS AF=0.415094;AO=17;DP=48;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0124924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.466;QD=13.6912;RBI=0.0132619;REFB=-0.0256043;REVB=0.00445161;RO=31;SAF=12;SAR=5;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188049;STB=0.553907;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0373856;OID=.;OPOS=30114845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:53:31:31:17:22:0.415094:5:12:17:14:8:14:17:14 chr6 30114955 . C T 127.35 PASS AF=0.309091;AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0136423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.74;QD=9.26196;RBI=0.0185274;REFB=-0.0152389;REVB=-0.012536;RO=37;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142134;STB=0.592251;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0364817;OID=.;OPOS=30114955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:37:38:17:17:0.309091:8:9:15:22:8:9:15:23 chr6 30115542 . G A 165.64 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0421548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8773;QD=11.4231;RBI=0.0558813;REFB=-0.00153899;REVB=0.0366837;RO=36;SAF=12;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1738;STB=0.606124;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00250077;OID=.;OPOS=30115542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:36:37:21:21:0.362069:9:12:26:10:9:12:27:10 chr6 30121460 . C T 253.47 PASS AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0246397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=329.014;QD=12.8341;RBI=0.0352954;REFB=-0.00168348;REVB=0.0252715;RO=49;SAF=15;SAR=15;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099521;STB=0.556925;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00291953;OID=.;OPOS=30121460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:49:49:30:30:0.379747:15:15:29:20:15:15:29:20 chr6 30122154 . T C 1328.07 PASS AF=0.956522;AO=88;DP=92;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00670891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.967;QD=57.7422;RBI=0.00816938;REFB=-0.0185104;REVB=-0.00466147;RO=4;SAF=66;SAR=22;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-4.94361e-06;OID=.;OPOS=30122154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:92:92:4:4:88:88:0.956522:22:66:3:1:22:66:3:1 chr6 30131546 . A G 231.83 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0314876;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.7;QD=11.738;RBI=0.0330653;REFB=-0.017448;REVB=-0.0100918;RO=49;SAF=12;SAR=16;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222298;STB=0.614206;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0218744;OID=.;OPOS=30131546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:49:51:28:28:0.35443:16:12:31:18:16:12:31:20 chr6 30139699 . G A 439.45 PASS AF=0.441441;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.00518438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.617;QD=15.8361;RBI=0.0057972;REFB=-0.0149035;REVB=0.00259419;RO=61;SAF=19;SAR=30;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285211;STB=0.509914;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.013277;OID=.;OPOS=30139699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:62:49:49:0.441441:30:19:22:39:30:19:23:39 chr6 30140342 . T C 1066.13 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00634328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.417;QD=58.4182;RBI=0.0354315;REFB=0.081507;REVB=0.0348591;RO=1;SAF=43;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108729;STB=0.505746;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000134973;OID=.;OPOS=30140342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:29:43:1:0:29:43:1:0 chr6 30154199 . T C 224.65 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.013206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.178;QD=21.3953;RBI=0.0138757;REFB=-0.0413211;REVB=-0.00425889;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289242;STB=0.660882;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0278836;OID=.;OPOS=30154199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:10:12:4:16:10:12:4:16 chr6 30227583 . C G 51.56 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0389523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.292;QD=18.7481;RBI=0.0617737;REFB=-0.017341;REVB=-0.0479449;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31972;STB=0.691659;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0205154;OID=.;OPOS=30227583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:6:1:2:2:6:1:2:2 chr6 30228230 . A C 206.72 PASS AF=0.4375;AO=20;DP=47;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0158694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.901;QD=17.2266;RBI=0.0217208;REFB=-0.0333265;REVB=0.0148309;RO=26;SAF=14;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173827;STB=0.5999;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0382126;OID=.;OPOS=30228230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:26:27:20:21:0.4375:6:14:14:12:6:15:15:12 chr6 30228379 . A G 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00734153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.676;QD=19.523;RBI=0.0281986;REFB=-0.0120927;REVB=-0.0272262;RO=12;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675494;STB=0.538407;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0129146;OID=.;OPOS=30228379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:7:7:7:5:7:7:7:5 chr6 30228398 . CG C 45.68 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0591879;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.4236;QD=11.4202;RBI=0.0591894;REFB=-0.0291451;REVB=-0.000417445;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211205;STB=0.624687;STBP=0.419;TYPE=del;VARB=0.0406036;OID=.;OPOS=30228399;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:8:16:8:16:8:3:5:5:3:40:8:3:5:5:3 chr6 30229013 . A G 191.53 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0425002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.798;QD=22.5333;RBI=0.0443623;REFB=-0.00646674;REVB=0.0127178;RO=15;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583233;STB=0.532676;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00540552;OID=.;OPOS=30229013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:10:9:6:9:10:9:6:9 chr6 30229034 . C CT 153.25 PASS AF=0.555556;AO=18;DP=37;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0149551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.4091;QD=17.0273;RBI=0.0758454;REFB=0.0229708;REVB=0.0743564;RO=17;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126496;STB=0.555501;STBP=0.458;TYPE=ins;VARB=-0.0148452;OID=.;OPOS=30229035;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.555556:18:37:20:36:16:10:10:6:10:99:17:9:9:6:11 chr6 30229457 . C T 627.13 PASS AF=0.632184;AO=55;DP=87;FAO=55;FDP=87;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0132588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0256;QD=28.8334;RBI=0.0346073;REFB=-0.0705375;REVB=-0.0319667;RO=31;SAF=20;SAR=35;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061881;STB=0.528878;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0522335;OID=.;OPOS=30229457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:31:32:55:55:0.632184:35:20:14:17:35:20:14:18 chr6 30229463 . G A 583.53 PASS AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0101017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.368;QD=28.1217;RBI=0.010155;REFB=-0.0298742;REVB=-0.00103878;RO=31;SAF=18;SAR=34;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777616;STB=0.542356;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0216972;OID=.;OPOS=30229463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:34:18:14:17:34:18:14:17 chr6 30230085 . T C 294.82 PASS AF=0.555556;AO=23;DP=56;FAO=30;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0832023;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.206;QD=21.8383;RBI=0.0832205;REFB=-0.049687;REVB=0.00174139;RO=26;SAF=3;SAR=20;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.484945;STB=0.578893;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0417818;OID=.;OPOS=30230085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:54:26:24:23:30:0.555556:20:3:14:12:20:10:12:12 chr6 30230128 . T C 85.58 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0573539;FXX=0.09995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8686;QD=19.0182;RBI=0.0700671;REFB=-0.0044531;REVB=0.0402483;RO=8;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.534682;STB=0.817409;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00885274;OID=.;OPOS=30230128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:19:18:8:8:10:10:0.555556:9:1:5:3:9:1:5:3 chr6 30231071 . G A 357.24 PASS AF=0.447059;AO=37;DP=84;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00928699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.859;QD=16.8111;RBI=0.0112036;REFB=-0.00777618;REVB=0.00626679;RO=47;SAF=23;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922873;STB=0.557389;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0149581;OID=.;OPOS=30231071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:47:47:37:38:0.447059:14:23:25:22:14:24:25:22 chr6 30231108 . G T 368.31 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0562815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8045;QD=16.7412;RBI=0.0675569;REFB=-0.0301183;REVB=-0.0373675;RO=49;SAF=25;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154554;STB=0.58695;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0342259;OID=.;OPOS=30231108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:14:25:24:25:14:25:24:25 chr6 30297529 . T C 431.35 PASS AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0112787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.812;QD=25.752;RBI=0.0154516;REFB=-0.0258973;REVB=0.0105614;RO=26;SAF=26;SAR=15;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12684;STB=0.569452;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0167887;OID=.;OPOS=30297529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:15:26:12:14:15:26:12:14 chr6 30309508 . T C 386.87 PASS AF=0.534247;AO=37;DP=72;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0113493;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.778;QD=21.1986;RBI=0.0356164;REFB=-0.010835;REVB=0.0337598;RO=33;SAF=23;SAR=14;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127859;STB=0.576;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00591977;OID=.;OPOS=30309508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:33:34:37:39:0.534247:14:23:25:8:15:24:26:8 chr6 30313268 . G A 101.09 PASS AF=0.238095;AO=15;DP=67;FAO=15;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0292287;FXX=0.0596926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.32;QD=6.41826;RBI=0.0299211;REFB=-0.0138372;REVB=-0.0063996;RO=46;SAF=7;SAR=8;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406348;STB=0.541171;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0401384;OID=.;OPOS=30313268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:63:46:48:15:15:0.238095:8:7:23:23:8:7:25:23 chr6 30314566 . TC GA 278.29 PASS AF=0.343137;AO=35;DP=103;FAO=35;FDP=102;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.00642229;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=2;MLLD=294.272;QD=10.9133;RBI=0.0232678;REFB=-0.0163629;REVB=-0.0223639;RO=65;SAF=20;SAR=15;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140897;STB=0.571388;STBP=0.318;TYPE=mnp;VARB=0.0267072;OID=.;OPOS=30314566;OREF=TC;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:65:67:35:35:0.343137:15:20:29:36:15:20:31:36 chr6 30457729 . GAAT AGAT,GAAC 132.89 PASS AF=0,0.428571;AO=2,13;DP=35;FAO=0,15;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=0,9;FSAR=0,6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0025795,-0.00381633;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=128.695,148.286;QD=15.1869;RBI=0.186958,0.0392855;REFB=-0.0157313,-0.0279323;REVB=-0.186941,-0.0390997;RO=9;SAF=0,9;SAR=2,4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.694553,-0.0749681;STB=0.5,0.640267;STBP=1,0.189;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0705624;OID=.,.;OPOS=30457729,30457732;OREF=GA,T;OALT=AG,C;OMAPALT=AGAT,GAAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:35:35:9:20:2,13:0,15:0,0.428571:2,4:0,9:7:2:0,6:0,9:7:13 chr6 30460232 . C T 460.49 PASS AF=0.564103;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0116249;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4392;QD=23.6149;RBI=0.0126032;REFB=-0.0194818;REVB=0.00486844;RO=34;SAF=20;SAR=24;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827248;STB=0.545434;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00995814;OID=.;OPOS=30460232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:44:44:0.564103:24:20:19:15:24:20:19:15 chr6 30521137 . G A 263.53 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00732469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.125;QD=17.5683;RBI=0.0251424;REFB=-0.0126211;REVB=-0.0240518;RO=31;SAF=15;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287648;STB=0.516118;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00848017;OID=.;OPOS=30521137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:14:15:17:14:14:15:17:14 chr6 30530245 . T C 253.07 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00739723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.315;QD=15.1086;RBI=0.0170791;REFB=-0.0150635;REVB=-0.0153941;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113478;STB=0.564271;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0239809;OID=.;OPOS=30530245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:17:12:20:18:17:12:20:18 chr6 30558477 . G GA 199.75 PASS AF=0.328244;AO=42;DP=133;FAO=43;FDP=131;FR=.;FRO=88;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=0.101305;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.8024;QD=6.09927;RBI=0.115888;REFB=-0.0128994;REVB=0.0562788;RO=91;SAF=21;SAR=21;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841324;STB=0.530402;STBP=0.621;TYPE=ins;VARB=0.0336843;OID=.;OPOS=30558478;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.328244:42:133:43:131:88:21:22:39:49:99:91:21:21:39:52 chr6 30575603 . A G 252.77 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00729809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5523;QD=21.0638;RBI=0.0206635;REFB=0.00985084;REVB=0.0193318;RO=24;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184232;STB=0.603363;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0092698;OID=.;OPOS=30575603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:14:10:15:9:14:10:15:9 chr6 30652872 . G A 521.7 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00275012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.921;QD=23.4471;RBI=0.0120711;REFB=-0.0285503;REVB=0.0117536;RO=39;SAF=28;SAR=21;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170503;STB=0.598686;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0242128;OID=.;OPOS=30652872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:40:49:49:0.550562:21:28:14:25:21:28:14:26 chr6 30711804 . GC G,GG 565.18 PASS AF=0.0526316,0.947368;AO=6,32;DP=38;FAO=2,36;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=1,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181051,0.0166644;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=242.994,254.432;QD=59.4929;RBI=0.0636436,0.0497425;REFB=0,0;REVB=0.061014,0.046868;RO=0;SAF=2,12;SAR=4,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0179596,0.000963782;OID=.,.;OPOS=30711805,30711805;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0526316,0.947368:6,32:38:2,36:38:0:1,13:1,23:0:0:7:0:2,12:4,20:0:0 chr6 30782105 . T C 1510.78 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.252;QD=63.6119;RBI=0.0254209;REFB=0;REVB=-0.0179308;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.61885e-08;OID=.;OPOS=30782105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:53:42:0:0:53:42:0:0 chr6 30782218 . C CTGTT 400.94 PASS AF=0.471264;AO=39;DP=88;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0192103;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=4;MLLD=270.979;QD=18.4339;RBI=0.0208181;REFB=-0.00548522;REVB=0.00802228;RO=47;SAF=15;SAR=24;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104795;STB=0.573382;STBP=0.228;TYPE=ins;VARB=0.00595607;OID=.;OPOS=30782219;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.471264:39:88:41:87:46:15:26:23:23:99:47:15:24:23:24 chr6 30782235 . G A 1152.64 PASS AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0210966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.135;QD=56.9206;RBI=0.031996;REFB=-0.0788923;REVB=0.0240557;RO=3;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292559;STB=0.51546;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00125581;OID=.;OPOS=30782235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:3:3:78:78:0.962963:47:31:0:3:47:31:0:3 chr6 30782303 . C T 651.48 PASS AF=0.955556;AO=40;DP=43;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0161752;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.803;QD=57.9095;RBI=0.0170385;REFB=-0.0374433;REVB=0.00535482;RO=2;SAF=18;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00450343;STB=0.520824;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00289243;OID=.;OPOS=30782303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:45:2:2:40:43:0.955556:22:18:1:1:23:20:0:2 chr6 30782360 . C T 169.11 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0230594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.428;QD=16.4985;RBI=0.0240632;REFB=-0.0197106;REVB=0.00687746;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159573;STB=0.591298;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0114487;OID=.;OPOS=30782360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:10:8:14:9:10:8:14:9 chr6 30782361 . G A 244.26 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0176965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.347;QD=23.263;RBI=0.017899;REFB=-0.0176256;REVB=-0.00268497;RO=19;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153386;STB=0.585699;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0284624;OID=.;OPOS=30782361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:9:14:8:11:9:14:8:11 chr6 30782407 . A G,T 687.52 PASS AF=0.955556,0.0444444;AO=43,2;DP=45;FAO=43,2;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=23,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371279,0.0200644;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=202.813,146.68;QD=61.1132;RBI=0.044372,0.0273942;REFB=0,0;REVB=0.024298,0.0186511;RO=0;SAF=20,0;SAR=23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=5.63506e-06,0.178304;OID=.,.;OPOS=30782407,30782407;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:45:45:0:0:43,2:43,2:0.955556,0.0444444:23,2:20,0:0:0:23,2:20,0:0:0 chr6 30857072 . G C 173.73 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00294217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.033;QD=12.8691;RBI=0.0404351;REFB=-0.00435064;REVB=-0.0403279;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137033;STB=0.578874;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0133342;OID=.;OPOS=30857072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:11:10:20:13:11:10:20:13 chr6 30858857 . C T 797.13 PASS AF=0.551471;AO=75;DP=136;FAO=75;FDP=136;FR=.;FRO=61;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0185622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.12;QD=23.445;RBI=0.018872;REFB=-0.0274853;REVB=-0.00340517;RO=61;SAF=47;SAR=28;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114334;STB=0.562572;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0167723;OID=.;OPOS=30858857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:61:61:75:75:0.551471:28:47:30:31:28:47:30:31 chr6 30864829 . T C 385.46 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=-0.0100622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.186;QD=17.9283;RBI=0.0476974;REFB=-0.0139878;REVB=0.0466239;RO=46;SAF=32;SAR=8;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853109;STB=0.54792;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0151694;OID=.;OPOS=30864829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:8:32:34:12:8:32:34:12 chr6 30876238 . G A 264.78 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.000344578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.615;QD=20.7672;RBI=0.0152008;REFB=-0.0535632;REVB=0.0151969;RO=24;SAF=15;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082199;STB=0.545817;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0507895;OID=.;OPOS=30876238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:12:15:11:13:12:15:11:13 chr6 30877760 . A C 336.67 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00581725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.15;QD=17.2651;RBI=0.00864362;REFB=-0.0128744;REVB=-0.00639311;RO=41;SAF=11;SAR=25;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908404;STB=0.559965;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0146018;OID=.;OPOS=30877760;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:42:36:36:0.461538:25:11:16:25:25:11:17:25 chr6 30882203 . T C 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00374522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2177;QD=16.1988;RBI=0.00374522;REFB=0.00038259;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164748;OID=.;OPOS=30882203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:0:5:3:0:0:5:3:0 chr6 30887972 . C T 524.2 PASS AF=0.428571;AO=57;DP=133;FAO=57;FDP=133;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=-0.00551663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.896;QD=15.7654;RBI=0.0128062;REFB=-0.0273207;REVB=-0.011557;RO=76;SAF=34;SAR=23;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17873;STB=0.60007;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.039279;OID=.;OPOS=30887972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:76:76:57:57:0.428571:23:34:32:44:23:34:32:44 chr6 30888161 . T C 124.53 PASS AF=0.268657;AO=18;DP=69;FAO=18;FDP=67;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00904967;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.832;QD=7.43447;RBI=0.0132153;REFB=-0.00593485;REVB=-0.00963056;RO=45;SAF=14;SAR=4;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411096;STB=0.750576;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.015185;OID=.;OPOS=30888161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:45:49:18:18:0.268657:4:14:20:25:4:14:22:27 chr6 30889389 . T C 220.87 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0305496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8976;QD=18.0303;RBI=0.0458782;REFB=0.00952053;REVB=0.0342276;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25812;STB=0.645625;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.00527698;OID=.;OPOS=30889389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:27:22:22:0.44898:14:8:16:9:14:8:17:10 chr6 30893127 . G A 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00778125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6107;QD=18.7117;RBI=0.0106926;REFB=-0.0169502;REVB=-0.00733375;RO=19;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214181;STB=0.621171;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0121893;OID=.;OPOS=30893127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:10:8:13:6:10:8:13:6 chr6 30893728 . C T 152.92 PASS AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=0.0585617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.4289;QD=10.7312;RBI=0.0667823;REFB=-0.0256769;REVB=0.0320999;RO=37;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175539;STB=0.601135;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0483935;OID=.;OPOS=30893728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:13:7:8:29:13:7:8:29 chr6 30900427 . T G 207.62 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00253523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.691;QD=15.0998;RBI=0.0557149;REFB=-0.00497095;REVB=0.0556572;RO=31;SAF=8;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24916;STB=0.641855;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00789515;OID=.;OPOS=30900427;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:16:8:18:13:16:8:18:13 chr6 30954245 . T C 73.35 PASS AF=1;AO=6;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2933;QD=36.6765;RBI=0.113659;REFB=0;REVB=0.11228;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00704917;OID=.;OPOS=30954245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:6:8:1:3:3:0:0:4:4:0:0 chr6 30993499 . C T 508.34 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0746321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6065;QD=56.4827;RBI=0.0776959;REFB=-0.0114;REVB=0.0216032;RO=1;SAF=15;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301623;STB=0.51612;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0019793;OID=.;OPOS=30993499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:20:15:1:0:20:15:1:0 chr6 30993567 . G T 770.01 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251771;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.682;QD=64.1672;RBI=0.0372379;REFB=0;REVB=0.0274368;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48946e-05;OID=.;OPOS=30993567;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr6 30996487 . GACC G 92.45 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896153;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=3;MLLD=162.633;QD=41.0879;RBI=0.126572;REFB=0;REVB=0.0893839;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00330194;OID=.;OPOS=30996488;OREF=ACC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:9:9:9:0:4:5:0:0:4:0:4:5:0:0 chr6 31079889 . C G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.809;QD=47.8224;RBI=0.0235145;REFB=0;REVB=-0.0140957;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99627e-05;OID=.;OPOS=31079889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chr6 31079894 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00167942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.855;QD=49.5992;RBI=0.0689343;REFB=0;REVB=0.0689138;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155714;OID=.;OPOS=31079894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr6 31084163 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0836041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.306;QD=46.8469;RBI=0.0841096;REFB=0;REVB=0.00920727;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000582774;OID=.;OPOS=31084163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr6 31084288 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.874;QD=43.4862;RBI=0.0229605;REFB=0;REVB=0.00497457;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200035;OID=.;OPOS=31084288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr6 31084684 . G A 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00873577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.019;QD=23.2184;RBI=0.0388076;REFB=0.0240698;REVB=0.0378115;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.000662704;OID=.;OPOS=31084684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0 chr6 31084787 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00630553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.05;QD=55.6561;RBI=0.0126201;REFB=0;REVB=-0.010932;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.49425e-06;OID=.;OPOS=31084787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr6 31084792 . C T 394.14 PASS AF=1;AO=24;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.87;QD=56.3052;RBI=0.0437492;REFB=0;REVB=0.0437025;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341979;OID=.;OPOS=31084792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:24:28:1:15:9:0:0:19:9:0:0 chr6 31088202 . A C,G 708.62 PASS AF=0.0980392,0.901961;AO=6,43;DP=49;FAO=5,46;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=5,20;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861681,0.0795987;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=53.5977,88.9065;QD=55.5777;RBI=0.0110297,0.0813503;REFB=0,0;REVB=0.00688515,0.0167904;RO=0;SAF=6,18;SAR=0,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.65211e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.145784,0.00298291;OID=.,.;OPOS=31088202,31088202;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:16:49:51:0:0:6,43:5,46:0.0980392,0.901961:0,25:6,18:0:0:0,26:5,20:0:0 chr6 31097453 . T G 1249.87 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0547105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2264;QD=60.2345;RBI=0.0571467;REFB=-0.054585;REVB=0.0165077;RO=1;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122993;STB=0.506492;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000717449;OID=.;OPOS=31097453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:38:44:0:1:38:44:0:1 chr6 31105891 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.825;QD=43.4865;RBI=0.0154632;REFB=0;REVB=-0.00655333;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39921e-05;OID=.;OPOS=31105891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:4:7:0:0:4:8:0:0 chr6 31107733 . C T 1361.56 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.75855e-05;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.982;QD=62.6002;RBI=0.013021;REFB=0;REVB=-0.0130206;RO=0;SAF=22;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.93655e-05;OID=.;OPOS=31107733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:65:22:0:0:65:22:0:0 chr6 31111180 . T C 1020.39 PASS AF=1;AO=63;DP=67;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415138;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.297;QD=56.6883;RBI=0.0443816;REFB=0;REVB=-0.015695;RO=0;SAF=44;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08994e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00641072;OID=.;OPOS=31111180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:72:0:0:63:72:1:19:44:0:0:21:51:0:0 chr6 31113030 . A G 1047.76 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146436;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.624;QD=59.8721;RBI=0.0170602;REFB=0;REVB=0.00875313;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64007e-06;OID=.;OPOS=31113030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:43:27:0:0:43:27:0:0 chr6 31113052 . G A 939.87 PASS AF=0.956522;AO=66;DP=70;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0324199;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.726;QD=54.485;RBI=0.0384985;REFB=-0.161856;REVB=0.0207626;RO=2;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000842368;STB=0.506594;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.00634695;OID=.;OPOS=31113052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:70:69:2:3:66:66:0.956522:34:32:1:1:34:32:1:2 chr6 31113214 . C A 382.71 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0302926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.495;QD=52.7871;RBI=0.0345913;REFB=-0.0783999;REVB=0.0167009;RO=1;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238715;STB=0.512811;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00064892;OID=.;OPOS=31113214;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:19:9:0:1:19:9:0:1 chr6 31118511 . T G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.176;QD=58.1421;RBI=0.0205895;REFB=0;REVB=0.0190329;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20974e-05;OID=.;OPOS=31118511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr6 31118565 . C G 458.3 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.407;QD=57.2877;RBI=0.0119641;REFB=0;REVB=0.00314183;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010314;OID=.;OPOS=31118565;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:13:18:0:0:14:18:0:0 chr6 31122315 . G C 740.34 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0798476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0603;QD=56.949;RBI=0.110874;REFB=0;REVB=-0.0769248;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00182638;OID=.;OPOS=31122315;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chr6 31124849 . C T 1138.83 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0270058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1935;QD=59.1602;RBI=0.036789;REFB=-0.147909;REVB=0.0249823;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133285;STB=0.50704;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00979454;OID=.;OPOS=31124849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:41:35:1:0:41:35:1:0 chr6 31125158 . C T 1062.85 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.696;QD=59.8791;RBI=0.0411636;REFB=0;REVB=0.0358822;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77884e-05;OID=.;OPOS=31125158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:30:40:0:0:30:41:0:0 chr6 31129616 . A G 512.01 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153204;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.349;QD=56.8901;RBI=0.0312452;REFB=0.0248718;REVB=-0.0272314;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.511105;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00892293;OID=.;OPOS=31129616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:36:0:1:35:35:0.972222:22:13:0:0:22:13:0:1 chr6 31129642 . A C 786.44 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00913606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.732;QD=64.1991;RBI=0.0555205;REFB=0;REVB=0.0547636;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108882;OID=.;OPOS=31129642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:29:19:0:0:30:19:0:0 chr6 31132414 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0516604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.674;QD=40.7628;RBI=0.0521304;REFB=0;REVB=0.00698408;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000671341;OID=.;OPOS=31132414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0 chr6 31133943 . C A 1264.73 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00959289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.768;QD=61.6941;RBI=0.0212741;REFB=0;REVB=0.0189885;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47405e-05;OID=.;OPOS=31133943;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0 chr6 31134087 . C G 750.64 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570302;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.265;QD=63.8841;RBI=0.0574111;REFB=0;REVB=0.00660212;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460677;OID=.;OPOS=31134087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0 chr6 31134118 . C CGAG 517.87 PASS AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00786886;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=221.637;QD=54.5124;RBI=0.024983;REFB=-0.0376666;REVB=0.0237114;RO=2;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492024;STB=0.526301;STBP=0.219;TYPE=ins;VARB=0.0011931;OID=.;OPOS=31134119;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=CGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.947368:36:38:36:38:2:18:18:0:2:9:2:18:18:0:2 chr6 31138371 . G A 1416.88 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00520892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.674;QD=62.2803;RBI=0.0102893;REFB=0;REVB=-0.00887334;RO=0;SAF=39;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153554;OID=.;OPOS=31138371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:91:0:0:89:91:1:50:39:0:0:51:40:0:0 chr6 31138377 . C T 1458.55 PASS AF=1;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00956135;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.45;QD=63.4153;RBI=0.00956137;REFB=0;REVB=2.02445e-05;RO=0;SAF=42;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02014e-06;OID=.;OPOS=31138377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:92:0:0:92:92:1:50:42:0:0:50:42:0:0 chr6 31165566 . T C 1372.17 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9838;QD=62.3712;RBI=0.0419874;REFB=0;REVB=0.0390782;RO=0;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129105;OID=.;OPOS=31165566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:35:51:0:0:35:53:0:0 chr6 31165962 . G A 961.68 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.389;QD=57.4134;RBI=0.0322044;REFB=-0.113817;REVB=0.0155149;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027403;OID=.;OPOS=31165962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:67:0:0:66:67:1:30:36:0:0:30:37:0:0 chr6 31170228 . G C 1008.94 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.137;QD=59.3494;RBI=0.0467896;REFB=0;REVB=0.0201347;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197253;OID=.;OPOS=31170228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:27:40:0:0:27:41:0:0 chr6 31170528 . A G 690.17 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.526;QD=62.7426;RBI=0.031745;REFB=0;REVB=-0.00299983;RO=0;SAF=11;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95702e-05;OID=.;OPOS=31170528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:32:11:0:0:33:11:0:0 chr6 31236853 . G A 323.43 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9546;QD=53.9044;RBI=0.0197355;REFB=0;REVB=-0.0131884;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330902;OID=.;OPOS=31236853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr6 31237124 . T C 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0154;QD=57.2013;RBI=0.0323182;REFB=0;REVB=-0.0277714;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000240638;OID=.;OPOS=31237124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr6 31237162 . C G 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00884378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7092;QD=53.2744;RBI=0.0290083;REFB=0;REVB=-0.0276273;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110558;OID=.;OPOS=31237162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0 chr6 31237255 . G A 357.79 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5878;QD=55.044;RBI=0.032066;REFB=0;REVB=0.0305546;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758863;OID=.;OPOS=31237255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr6 31237323 . A G 344.64 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00985743;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7828;QD=55.1418;RBI=0.0139586;REFB=0;REVB=0.00988296;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252966;OID=.;OPOS=31237323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0 chr6 31237333 . T A 311.01 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00814038;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.786;QD=54.0878;RBI=0.00814551;REFB=0;REVB=0.000288861;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331772;OID=.;OPOS=31237333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:17:6:0:0:17:6:0:0 chr6 31237723 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.662;QD=40.7622;RBI=0.0612174;REFB=0;REVB=0.00533643;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195686;OID=.;OPOS=31237723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0 chr6 31237727 . T C 88.19 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9631;QD=39.1961;RBI=0.0328859;REFB=0;REVB=-0.0281499;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000837373;OID=.;OPOS=31237727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr6 31237767 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.845;QD=35.5758;RBI=0.00249819;REFB=0;REVB=-0.00249819;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135624;OID=.;OPOS=31237767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0 chr6 31237769 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.588;QD=33.4285;RBI=0.0282055;REFB=0;REVB=0.0282055;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0007032;OID=.;OPOS=31237769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr6 31237771 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.777;QD=33.4285;RBI=0.00252772;REFB=0;REVB=0.00252772;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112566;OID=.;OPOS=31237771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr6 31237773 . TG CC 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=129.75;QD=33.4285;RBI=0.0348133;REFB=0;REVB=-0.0348133;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.00121519;OID=.;OPOS=31237773;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr6 31237786 . A T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.224;QD=35.5759;RBI=0.0619727;REFB=0;REVB=0.0593651;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608195;OID=.;OPOS=31237786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr6 31237802 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00148665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.884;QD=35.5759;RBI=0.0186667;REFB=0;REVB=-0.0186074;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000299923;OID=.;OPOS=31237802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr6 31237833 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.946;QD=33.4283;RBI=0.0169245;REFB=0;REVB=0.0125735;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119402;OID=.;OPOS=31237833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr6 31238009 . TT CG 62.11 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0909099;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=270.485;QD=35.492;RBI=0.0952144;REFB=0;REVB=0.0283052;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000448065;OID=.;OPOS=31238009;OREF=TT;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:5:1:0:0:6:1:0:0 chr6 31238029 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8679;QD=43.4862;RBI=0.047293;REFB=0;REVB=0.0254204;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000784093;OID=.;OPOS=31238029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0 chr6 31238053 . G C 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4305;QD=46.846;RBI=0.0412566;REFB=0;REVB=0.0228383;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000461383;OID=.;OPOS=31238053;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0 chr6 31238068 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.519;QD=46.8479;RBI=0.0830537;REFB=0;REVB=0.078531;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00230522;OID=.;OPOS=31238068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0 chr6 31238135 . G A 328.38 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215529;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.55;QD=54.7293;RBI=0.0241855;REFB=0;REVB=-0.0109733;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85727e-05;OID=.;OPOS=31238135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr6 31238138 . C T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.564;QD=54.5177;RBI=0.0234026;REFB=0;REVB=-0.0194623;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.39091e-05;OID=.;OPOS=31238138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr6 31238155 . G A 344.79 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758047;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3499;QD=55.1662;RBI=0.114517;REFB=0;REVB=0.0858356;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00434607;OID=.;OPOS=31238155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr6 31238230 . G C 108.99 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0903966;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.0756;QD=36.3292;RBI=0.0904514;REFB=-0.0766747;REVB=-0.00314876;RO=1;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599362;STB=0.533274;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0140266;OID=.;OPOS=31238230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:4:7:1:0:4:7:1:0 chr6 31238234 . G A 120.17 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997656;FXX=0.0832639;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.98;QD=43.697;RBI=0.100177;REFB=0;REVB=-0.0996792;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158256;OID=.;OPOS=31238234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0 chr6 31238259 . G T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114734;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.26;QD=44.6898;RBI=0.0155354;REFB=0;REVB=0.0104742;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133162;OID=.;OPOS=31238259;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0 chr6 31238490 . T C 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.882;QD=62.981;RBI=0.0352277;REFB=0;REVB=0.0311871;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277706;OID=.;OPOS=31238490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:15:30:0:0:15:30:0:0 chr6 31238492 . C A 696.27 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.399;QD=61.8907;RBI=0.022035;REFB=0;REVB=0.0188527;RO=0;SAF=30;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144273;OID=.;OPOS=31238492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:45:0:0:40:45:1:10:30:0:0:15:30:0:0 chr6 31238851 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.869;QD=54.5166;RBI=0.0648299;REFB=0;REVB=0.0424412;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000810877;OID=.;OPOS=31238851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chr6 31238930 . A C 279.54 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0501853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.873;QD=48.6156;RBI=0.0520632;REFB=-0.029904;REVB=-0.013857;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.533302;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00169129;OID=.;OPOS=31238930;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:0:1:22:22:0.956522:15:7:0:0:15:7:1:0 chr6 31238942 . G T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.193;QD=49.5989;RBI=0.0486588;REFB=0;REVB=0.045602;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431714;OID=.;OPOS=31238942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr6 31238957 . A C 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9248;QD=49.597;RBI=0.0295806;REFB=0;REVB=-0.0239073;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133321;OID=.;OPOS=31238957;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr6 31239050 . G T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.37;QD=53.2766;RBI=0.00263955;REFB=0;REVB=0.000259954;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14112e-05;OID=.;OPOS=31239050;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr6 31239101 . G C 270.66 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.43;QD=51.5547;RBI=0.0330893;REFB=0;REVB=0.0155404;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714975;OID=.;OPOS=31239101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:12:8:0:0:12:9:0:0 chr6 31239108 . T A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.016;QD=51.9165;RBI=0.0313855;REFB=0;REVB=0.0296641;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223855;OID=.;OPOS=31239108;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr6 31239378 . T G 754.22 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0504;QD=56.9224;RBI=0.0355746;REFB=0;REVB=0.0338056;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221865;OID=.;OPOS=31239378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr6 31239430 . C T 994.22 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.071;QD=57.636;RBI=0.0146916;REFB=-0.0532614;REVB=0.00902115;RO=1;SAF=34;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136989;STB=0.507244;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00415531;OID=.;OPOS=31239430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:34:34:1:0:34:34:1:0 chr6 31239491 . C T 136.16 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0089525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.078;QD=10.4739;RBI=0.0164506;REFB=-0.0237224;REVB=-0.0138013;RO=35;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153336;STB=0.50908;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0560311;OID=.;OPOS=31239491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:9:8:16:19:9:8:16:19 chr6 31239493 . C T 139.01 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00957129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.278;QD=12.0881;RBI=0.0195851;REFB=-0.0430291;REVB=0.017087;RO=27;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179783;STB=0.565137;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0665885;OID=.;OPOS=31239493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:46:27:30:16:16:0.347826:8:8:9:18:8:8:12:18 chr6 31239497 . C T 116.31 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00381268;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.603;QD=10.3384;RBI=0.0145123;REFB=-0.0106855;REVB=-0.0140025;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156193;STB=0.603627;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0386678;OID=.;OPOS=31239497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:30:31:14:14:0.311111:6:8:13:17:6:8:13:18 chr6 31239506 . C G 114.36 PASS AF=0.351351;AO=10;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00681998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.872;QD=12.3627;RBI=0.00997985;REFB=-0.0138028;REVB=0.00728597;RO=22;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186273;STB=0.533282;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0362261;OID=.;OPOS=31239506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:38:37:22:23:10:13:0.351351:7:3:10:12:8:5:10:13 chr6 31239510 . T G 107.43 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00923501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.385;QD=12.6392;RBI=0.0121286;REFB=-0.0517516;REVB=-0.00786246;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121279;STB=0.558049;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0173497;OID=.;OPOS=31239510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:8:5:10:10:8:5:10:11 chr6 31239513 . CCT ATC 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00199249;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=212.133;QD=13.0911;RBI=0.00542563;REFB=-0.0179887;REVB=0.00504652;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121279;STB=0.571317;STBP=0.555;TYPE=mnp;VARB=0.009986;OID=.;OPOS=31239513;OREF=CCT;OALT=ATC;OMAPALT=ATC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:10:10:8:5:10:10 chr6 31239602 . G A 50.13 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.463;QD=33.4221;RBI=0.134867;REFB=0;REVB=0.0209421;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0189218;OID=.;OPOS=31239602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr6 31239722 . A C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.533;QD=39.2068;RBI=0.0634579;REFB=0;REVB=0.032345;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000802867;OID=.;OPOS=31239722;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr6 31239727 . C A 82.25 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0143111;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.577;QD=32.8996;RBI=0.0687649;REFB=-0.106231;REVB=0.0672592;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126211;STB=0.571265;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00187426;OID=.;OPOS=31239727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:3:6:0:1:3:6:0:1 chr6 31239733 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00293122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.774;QD=42.1826;RBI=0.0333289;REFB=0;REVB=0.0331998;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219322;OID=.;OPOS=31239733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr6 31239752 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.78;QD=51.184;RBI=0.118423;REFB=0;REVB=0.116647;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000678646;OID=.;OPOS=31239752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr6 31239802 . C G 599.21 PASS AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0763155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.083;QD=58.4592;RBI=0.136839;REFB=-0.021715;REVB=0.113582;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267753;STB=0.513507;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00703341;OID=.;OPOS=31239802;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:17:22:0:1:18:22:0:1 chr6 31239821 . G T 564.07 PASS AF=0.851064;AO=40;DP=47;FAO=40;FDP=47;FR=.;FRO=7;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0485669;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.865;QD=48.0063;RBI=0.0642715;REFB=-0.183627;REVB=0.0420962;RO=5;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126102;STB=0.568931;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0149573;OID=.;OPOS=31239821;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:47:47:5:7:40:40:0.851064:16:24:0:5:16:24:1:6 chr6 31239827 . C T 747.29 PASS AF=1;AO=40;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.426;QD=63.5989;RBI=0.10093;REFB=0;REVB=0.0977473;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235752;OID=.;OPOS=31239827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:47:0:0:40:47:1:15:25:0:0:22:25:0:0 chr6 31322303 . C G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8582;QD=42.1824;RBI=0.0579478;REFB=0;REVB=-0.0468359;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00438561;OID=.;OPOS=31322303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr6 31322470 . C G 393.72 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.239;QD=56.2453;RBI=0.00860831;REFB=0;REVB=0.00598335;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.06994e-07;OID=.;OPOS=31322470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:18:9:0:0:18:10:0:0 chr6 31322888 . A G 545.22 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00456644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.03;QD=57.3918;RBI=0.00665446;REFB=-0.0346921;REVB=-0.00484039;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217802;STB=0.511622;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-1.67122e-06;OID=.;OPOS=31322888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:21:16:0:1:21:16:0:1 chr6 31322911 . C T 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.448;QD=63.2863;RBI=0.0926349;REFB=0;REVB=0.0553032;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692295;OID=.;OPOS=31322911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr6 31322980 . C T 751.73 PASS AF=0.981818;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0280652;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.767;QD=54.6711;RBI=0.0386792;REFB=0.0488762;REVB=0.0266162;RO=1;SAF=27;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171308;STB=0.509088;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000194413;OID=.;OPOS=31322980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:55:1:1:53:54:0.981818:26:27:1:0:27:27:1:0 chr6 31322996 . C T 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00529696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.794;QD=57.2371;RBI=0.0240855;REFB=0;REVB=0.0234958;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87444e-05;OID=.;OPOS=31322996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0 chr6 31323233 . A G 508.43 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.377;QD=58.106;RBI=0.0435119;REFB=0;REVB=-0.0432142;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000953137;OID=.;OPOS=31323233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:16:19:0:0 chr6 31323296 . A G 357.54 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0250958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.904;QD=49.3164;RBI=0.0270247;REFB=-0.101066;REVB=-0.0100267;RO=2;SAF=14;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061895;STB=0.533309;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.000669136;OID=.;OPOS=31323296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:13:14:2:0:13:14:2:0 chr6 31323353 . G A 349.28 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3555;QD=53.736;RBI=0.146088;REFB=0;REVB=0.145649;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040273;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00238512;OID=.;OPOS=31323353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:1:0:24:26:1:11:13:0:1:13:13:0:0 chr6 31323945 . A C 175.65 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.578;QD=46.839;RBI=0.0165139;REFB=0;REVB=-0.0144215;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.33482e-05;OID=.;OPOS=31323945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr6 31323953 . C G 175.6 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.242;QD=46.8267;RBI=0.0668313;REFB=0;REVB=0.0275128;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128315;OID=.;OPOS=31323953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr6 31323958 . T G 125.26 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.61;QD=38.54;RBI=0.0391027;REFB=-0.194956;REVB=-0.0357789;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00701435;OID=.;OPOS=31323958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:13:13:1:1:12:12:0.923077:4:8:1:0:4:8:1:0 chr6 31323960 . G C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.641;QD=43.4859;RBI=0.0185738;REFB=0;REVB=0.00914119;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316975;OID=.;OPOS=31323960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 31324003 . TC AG 129.99 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100867;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=124.235;QD=43.3286;RBI=0.110012;REFB=0;REVB=0.0439146;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00366646;OID=.;OPOS=31324003;OREF=TC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:11:12:1:6:5:0:0:6:6:0:0 chr6 31324025 . G A 133.08 PASS AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0327265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9315;QD=35.487;RBI=0.0782288;REFB=0.0555195;REVB=0.0710544;RO=2;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929408;STB=0.505147;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.00353585;OID=.;OPOS=31324025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:7:6:1:1:7:6:1:1 chr6 31324086 . G C 403.12 PASS AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0949167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.985;QD=48.8633;RBI=0.097523;REFB=0.0408204;REVB=-0.0223953;RO=3;SAF=10;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00757188;OID=.;OPOS=31324086;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:33:33:3:3:30:30:0.909091:20:10:1:2:20:10:1:2 chr6 31324100 . G T 385.68 PASS AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0424306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.908;QD=48.2094;RBI=0.0448036;REFB=-0.0261369;REVB=0.0143878;RO=3;SAF=9;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00466466;STB=0.502511;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00411333;OID=.;OPOS=31324100;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:32:32:3:3:29:29:0.90625:20:9:1:2:20:9:1:2 chr6 31324144 . T G 283.82 PASS AF=0.884615;AO=23;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0242286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.218;QD=43.6643;RBI=0.0335084;REFB=-0.0302743;REVB=0.023147;RO=3;SAF=7;SAR=16;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0072556;STB=0.503934;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00354118;OID=.;OPOS=31324144;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:26:26:3:3:23:23:0.884615:16:7:1:2:16:7:1:2 chr6 31324200 . G C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.17;QD=48.7373;RBI=0.056404;REFB=0;REVB=0.0357229;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123467;OID=.;OPOS=31324200;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0 chr6 31324509 . T A 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0301021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6159;QD=23.2173;RBI=0.0340796;REFB=-0.0541163;REVB=-0.0159776;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.66592;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0108413;OID=.;OPOS=31324509;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:4:1:0:0:4:1:1:0 chr6 31324586 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.986;QD=37.4882;RBI=0.0518666;REFB=0;REVB=0.0369343;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00319154;OID=.;OPOS=31324586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr6 31324595 . C G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.314;QD=35.5759;RBI=0.00631103;REFB=0;REVB=0.00622467;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98031e-05;OID=.;OPOS=31324595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr6 31324599 . T G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.818;QD=35.5759;RBI=0.0186891;REFB=0;REVB=0.00295468;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000410531;OID=.;OPOS=31324599;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr6 31324602 . TCT ATC 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134112;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=270.699;QD=35.5759;RBI=0.0134116;REFB=0;REVB=0.000109167;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000164267;OID=.;OPOS=31324602;OREF=TCT;OALT=ATC;OMAPALT=ATC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr6 31324666 . A C 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0783258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3815;QD=39.2048;RBI=0.078728;REFB=0;REVB=0.00794797;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00548842;OID=.;OPOS=31324666;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr6 31324702 . C T 62.24 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.084;QD=35.5658;RBI=0.142428;REFB=0;REVB=0.141613;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253434;OID=.;OPOS=31324702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr6 31324705 . A C 56.15 PASS AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0098584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.054;QD=32.0861;RBI=0.0240946;REFB=0;REVB=0.0219855;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00547214;OID=.;OPOS=31324705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:3:4:0:0 chr6 31371430 . T C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.123757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.8176;QD=59.0172;RBI=0.125019;REFB=0;REVB=-0.0177199;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0027868;OID=.;OPOS=31371430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0 chr6 31378335 . G C 902.59 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0762039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0886;QD=58.2315;RBI=0.0769192;REFB=0;REVB=-0.0104661;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000684031;OID=.;OPOS=31378335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:38:24:0:0:38:24:0:0 chr6 31379115 . G A 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.736;QD=62.9829;RBI=0.0261486;REFB=0;REVB=0.0102675;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9629e-05;OID=.;OPOS=31379115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr6 31380160 . TG T 514.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.3262;QD=46.7614;RBI=0.0500539;REFB=0;REVB=-0.0302627;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000296464;OID=.;OPOS=31380161;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:44:44:44:44:0:15:29:0:0:9:0:15:29:0:0 chr6 31382911 . A G 1419.59 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109226;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8242;QD=63.0927;RBI=0.109303;REFB=0;REVB=-0.00409979;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000874488;OID=.;OPOS=31382911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0 chr6 31473546 . A G 758.8 PASS AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0285583;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.101;QD=53.2492;RBI=0.0337638;REFB=-0.0734719;REVB=0.0180115;RO=1;SAF=26;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177852;STB=0.500959;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.000586779;OID=.;OPOS=31473546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:57:57:1:2:55:55:0.964912:29:26:1:0:29:26:1:1 chr6 31477681 . A G 1171.93 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0892157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0027;QD=60.8794;RBI=0.0961378;REFB=0;REVB=-0.0358194;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430943;OID=.;OPOS=31477681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr6 31496925 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.875;QD=63.2864;RBI=0.0215732;REFB=0;REVB=0.0200813;RO=0;SAF=11;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03365e-05;OID=.;OPOS=31496925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:35:11:0:0:35:11:0:0 chr6 31497706 . C T 2670.24 PASS AF=0.994318;AO=172;DP=176;FAO=175;FDP=176;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.11192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.554;QD=60.6872;RBI=0.11192;REFB=-0.0741646;REVB=-0.000248305;RO=3;SAF=62;SAR=110;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224691;STB=0.502262;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000231958;OID=.;OPOS=31497706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:176:176:3:1:172:175:0.994318:110:62:3:0:110:65:0:1 chr6 31506624 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.07;QD=57.7124;RBI=0.0145894;REFB=0;REVB=0.000530113;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1852e-05;OID=.;OPOS=31506624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0 chr6 31506648 . G T 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0794018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0389;QD=57.106;RBI=0.0855858;REFB=0;REVB=-0.0319419;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608228;OID=.;OPOS=31506648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0 chr6 31506691 . G A 725.21 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0212219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8833;QD=54.7329;RBI=0.0244244;REFB=-0.165284;REVB=-0.0120906;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018468;STB=0.5098;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00510933;OID=.;OPOS=31506691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:53:53:1:1:52:52:0.981132:27:25:1:0:27:25:1:0 chr6 31509432 . G A 877.3 PASS AF=1;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111643;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.411;QD=56.5998;RBI=0.0131404;REFB=-0.103788;REVB=-0.0069302;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000891452;OID=.;OPOS=31509432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:63:62:1:0:61:62:1:30:31:1:0:30:32:0:0 chr6 31510105 . A G 728.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.802;QD=57.1702;RBI=0.0167643;REFB=0;REVB=-0.00420944;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86834e-05;OID=.;OPOS=31510105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr6 31525912 . C T 559.08 PASS AF=0.862745;AO=44;DP=52;FAO=44;FDP=51;FR=.;FRO=7;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0229146;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.776;QD=43.8494;RBI=0.0240394;REFB=-0.0762714;REVB=0.00726745;RO=7;SAF=22;SAR=22;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549456;STB=0.529398;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00528056;OID=.;OPOS=31525912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:52:51:7:7:44:44:0.862745:22:22:5:2:22:22:5:2 chr6 31528326 . G C 662.21 PASS AF=0.956522;AO=42;DP=44;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0251542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.69;QD=57.5838;RBI=0.0303323;REFB=-0.0756309;REVB=0.0169504;RO=2;SAF=23;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390818;STB=0.519991;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0011216;OID=.;OPOS=31528326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:44:46:2:2:42:44:0.956522:19:23:2:0:20:24:2:0 chr6 31540784 . C A 314.09 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.109704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.2556;QD=50.2536;RBI=0.119338;REFB=-0.0917759;REVB=0.0469759;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487199;STB=0.526294;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00801015;OID=.;OPOS=31540784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:25:25:1:1:24:24:0.96:15:9:1:0:15:9:1:0 chr6 31555130 . A G 991.26 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.812;QD=59.1795;RBI=0.060522;REFB=0;REVB=0.0596939;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.27966e-05;OID=.;OPOS=31555130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:25:40:0:0:27:40:0:0 chr6 31583155 . G A 471.97 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0252083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.616;QD=55.526;RBI=0.0283594;REFB=-0.139421;REVB=0.0129922;RO=1;SAF=32;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143836;STB=0.507688;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.00240763;OID=.;OPOS=31583155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:1:32:1:0:1:32:1:0 chr6 31590898 . C T 1120.76 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0347353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.036;QD=58.9873;RBI=0.0405005;REFB=-0.0637239;REVB=-0.0208266;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.506848;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00028018;OID=.;OPOS=31590898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:36:39:0:0:36:39:0:1 chr6 31592064 . C T 347.68 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0498995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.387;QD=51.5087;RBI=0.0516849;REFB=-0.0163329;REVB=0.0134674;RO=1;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226687;STB=0.512186;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.000976162;OID=.;OPOS=31592064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:20:6:0:1:20:6:0:1 chr6 31594628 . T A 902.66 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1683;QD=58.2362;RBI=0.0175896;REFB=0;REVB=-0.00738378;RO=0;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197273;OID=.;OPOS=31594628;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:19:43:0:0:19:43:0:0 chr6 31595882 . C A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.08;QD=60.6103;RBI=0.054564;REFB=0;REVB=0.0121358;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155538;OID=.;OPOS=31595882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr6 31601344 . T C 684.18 PASS AF=0.957447;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.073507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4883;QD=58.2281;RBI=0.0767452;REFB=0.0209642;REVB=0.0220578;RO=2;SAF=24;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03755;STB=0.519991;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.0382757;OID=.;OPOS=31601344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:46:47:2:2:44:45:0.957447:20:24:2:0:21:24:2:0 chr6 31604010 . C A,CA,CCA 260.39 PASS AF=0,1,0;AO=2,6,3;DP=25;FAO=0,24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,2,0;FSAR=0,22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159907,0.0166153,0.015992;FXX=0;HRUN=6,0,6;LEN=1,1,2;MLLD=129.01,139.321,132.769;QD=43.3978;RBI=0.0309648,0.0293303,0.0268624;REFB=0,0,0;REVB=0.0265163,0.0241703,0.0215834;RO=14;SAF=0,1,0;SAR=2,5,3;SRF=1;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.420526,0.235288,-0.51188;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,ins,ins;VARB=-0.0514958,-0.00392262,0.0215455;OID=.,.,.;OPOS=31604010,31604011,31604011;OREF=C,-,-;OALT=A,A,CA;OMAPALT=A,CA,CCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:3:25:24:14:0:2,6,3:0,24,0:0,1,0:2,5,3:0,1,0:1:13:0,22,0:0,2,0:0:0 chr6 31604011 . G A 128.03 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00108391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.145;QD=20.4846;RBI=0.0184128;REFB=-0.0119152;REVB=-0.0183809;RO=11;SAF=1;SAR=13;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535544;STB=0.530566;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0198804;OID=.;OPOS=31604011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:13:1:1:10:13:1:1:10 chr6 31604012 . G C 86.55 PASS AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.00652662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4572;QD=14.4253;RBI=0.01172;REFB=-0.00930055;REVB=0.00973455;RO=13;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065766;STB=0.523768;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.141524;OID=.;OPOS=31604012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:24:24:13:13:10:11:0.458333:9:1:1:12:10:1:1:12 chr6 31604044 . T G 409.15 PASS AF=0.935484;AO=25;DP=28;FAO=29;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0559339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5837;QD=52.7929;RBI=0.0804098;REFB=-0.0382686;REVB=0.0577679;RO=1;SAF=5;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840195;STB=0.545421;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00414481;OID=.;OPOS=31604044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:31:1:1:25:29:0.935484:20:5:1:0:24:5:1:0 chr6 31610686 . A G 1816.63 PASS AF=1;AO=117;DP=121;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105237;FXX=0.0247913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.968;QD=61.5807;RBI=0.016492;REFB=0;REVB=0.0126979;RO=0;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.71086e-05;OID=.;OPOS=31610686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:118:0:0:117:118:1:50:67:0:0:51:67:0:0 chr6 31627523 . C T 2714.61 PASS AF=1;AO=172;DP=174;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127018;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.9101;QD=62.4048;RBI=0.0329415;REFB=0;REVB=0.0303941;RO=0;SAF=79;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75077e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88945e-05;OID=.;OPOS=31627523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:174:174:0:0:172:174:1:93:79:0:0:95:79:0:0 chr6 31628216 . C T 1747.18 PASS AF=0.975;AO=116;DP=119;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0144139;FXX=0.00826378;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.0127;QD=58.2394;RBI=0.0384572;REFB=-0.0801881;REVB=-0.0356538;RO=3;SAF=52;SAR=64;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026607;STB=0.513759;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.000915816;OID=.;OPOS=31628216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:119:120:3:3:116:117:0.975:64:52:3:0:64:53:3:0 chr6 31630318 . C G 470.6 PASS AF=0.833333;AO=35;DP=42;FAO=35;FDP=42;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0102308;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=206.309;QD=44.8189;RBI=0.0110038;REFB=-0.108099;REVB=0.00405131;RO=5;SAF=13;SAR=22;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560155;STB=0.53503;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00115259;OID=.;OPOS=31630318;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:42:42:5:7:35:35:0.833333:22:13:3:2:22:13:4:3 chr6 31634758 . G A 1938.6 PASS AF=1;AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.475;QD=61.5428;RBI=0.0228154;REFB=0;REVB=0.0226097;RO=0;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.59154e-05;OID=.;OPOS=31634758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:126:0:0:123:126:1:63:60:0:0:66:60:0:0 chr6 31657413 . T C 1129.77 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.504;QD=60.2546;RBI=0.0710118;REFB=0;REVB=0.066972;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014357;OID=.;OPOS=31657413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:75:0:0:71:75:1:34:37:0:0:36:39:0:0 chr6 31685392 . C T 1261.69 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0829454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4244;QD=58.0087;RBI=0.0830036;REFB=-0.108854;REVB=0.00310979;RO=3;SAF=32;SAR=52;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00329743;STB=0.501742;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00279608;OID=.;OPOS=31685392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:87:87:3:3:84:84:0.965517:52:32:1:2:52:32:1:2 chr6 31868938 . C T 905.96 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00446058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.581;QD=56.6226;RBI=0.0353044;REFB=-0.0810233;REVB=-0.0350215;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017815;STB=0.509431;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.000138087;OID=.;OPOS=31868938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:37:26:1:0:37:26:1:0 chr6 31976138 . CGG CCC,C 1316.07 PASS AF=0,1;AO=4,9;DP=86;FAO=0,86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=0,37;FSAR=0,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.210333,0.0291883;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,2;MLLD=7.60658,25.1481;QD=61.2128;RBI=0.29957,0.0380451;REFB=0,0;REVB=-0.213311,-0.0244022;RO=0;SAF=1,2;SAR=3,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.0503612,0.000323962;OID=.,.;OPOS=31976139,31976139;OREF=GG,GG;OALT=CC,-;OMAPALT=CCC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:4,9:86:0,86:86:0:0,37:0,49:0:0:7:0:1,2:3,7:0:0 chr6 31977391 . C T 1377.14 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.983;QD=62.5973;RBI=0.0764599;REFB=0;REVB=0.0508652;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181579;OID=.;OPOS=31977391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:42:46:0:0:42:46:0:0 chr6 31978755 . A G 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.054;QD=57.1034;RBI=0.0301457;REFB=0;REVB=0.027014;RO=0;SAF=46;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153522;OID=.;OPOS=31978755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:9:46:0:0:9:46:0:0 chr6 32006317 . C T 205.2 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0415642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7558;QD=14.6574;RBI=0.0492452;REFB=0.00752681;REVB=0.0264104;RO=30;SAF=8;SAR=16;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372782;STB=0.506661;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=-0.0105025;OID=.;OPOS=32006317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:32:24:24:0.428571:16:8:9:21:16:8:11:21 chr6 32006337 . C A 138.84 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0572684;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5607;QD=12.0731;RBI=0.0776527;REFB=-0.00247913;REVB=0.052443;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168163;STB=0.591983;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00884803;OID=.;OPOS=32006337;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:30:16:16:0.347826:12:4:11:18:12:4:11:19 chr6 32006858 . C A 733.86 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.109511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0826;QD=61.1552;RBI=0.131154;REFB=-0.0211948;REVB=0.0721724;RO=1;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208969;STB=0.511106;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0113568;OID=.;OPOS=32006858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:22:25:0:1:22:25:0:1 chr6 32026107 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.518;QD=45.8062;RBI=0.00714588;REFB=0;REVB=-0.00371256;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50123e-05;OID=.;OPOS=32026107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr6 32029226 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00125315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.594;QD=64.4153;RBI=0.00399233;REFB=0;REVB=0.00379055;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11305e-05;OID=.;OPOS=32029226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0 chr6 32029415 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.936;QD=44.6898;RBI=0.0511559;REFB=0;REVB=-0.00552169;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00129756;OID=.;OPOS=32029415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr6 32032743 . G A 746.28 PASS AF=1;AO=43;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451083;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.868;QD=57.4058;RBI=0.0453369;REFB=0;REVB=0.0045475;RO=0;SAF=6;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233321;OID=.;OPOS=32032743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:52:0:0:43:52:1:37:6:0:0:38:14:0:0 chr6 32050067 . T C,G 1011.55 PASS AF=0.942029,0.057971;AO=65,4;DP=69;FAO=65,4;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=30,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229478,-0.00796377;FXX=0.0142837;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.799,198.973;QD=58.6404;RBI=0.0391622,0.0139578;REFB=0,0;REVB=0.0317345,0.011463;RO=0;SAF=35,0;SAR=30,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0050909,0.0069802;OID=.,.;OPOS=32050067,32050067;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:69:69:0:0:65,4:65,4:0.942029,0.057971:30,4:35,0:0:0:30,4:35,0:0:0 chr6 32119898 . T C 3894.42 PASS AF=0.962825;AO=257;DP=267;FAO=259;FDP=269;FR=.;FRO=10;FSAF=128;FSAR=131;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0162141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.144;QD=57.9096;RBI=0.0195694;REFB=-0.0300697;REVB=0.0109575;RO=10;SAF=127;SAR=130;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021807;STB=0.511365;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00307827;OID=.;OPOS=32119898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:267:269:10:10:257:259:0.962825:130:127:8:2:131:128:8:2 chr6 32122385 . GC G,GG 762.69 PASS AF=1,0;AO=15,39;DP=54;FAO=53,0;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=25,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0816275,-0.0912079;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=188.072,181.217;QD=57.5615;RBI=0.0817755,0.0962031;REFB=0,0;REVB=-0.00491719,-0.0305966;RO=0;SAF=3,25;SAR=12,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000437314,0;OID=.,.;OPOS=32122386,32122386;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:15,39:54:53,0:53:0:28,0:25,0:0:0:4:0:3,25:12,14:0:0 chr6 32151443 . C T 2083.82 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.206;QD=62.6714;RBI=0.0382224;REFB=0;REVB=0.0229899;RO=0;SAF=72;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79172e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18631e-05;OID=.;OPOS=32151443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:61:72:0:0:61:72:0:0 chr6 32151690 . TGGGGGC TGGG,TGGGC,TGGGG,TGGGGC 553.08 PASS AF=0,0,0.971429,0;AO=10,10,26,14;DP=73;FAO=0,0,68,0;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=0,0,41,0;FSAR=0,0,27,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0273911,0.0991461,-0.0367558,0.199057;FXX=0.0140825;HRUN=5,5,5,5;LEN=3,2,2,1;MLLD=15.0245,8.9229,17.8869,10.1788;QD=31.6043;RBI=0.173551,0.362265,0.0743253,0.715673;REFB=-0.0551286,-0.0620795,-0.0646144,-0.0905974;REVB=-0.171376,-0.348434,-0.0646008,-0.687433;RO=6;SAF=0,0,25,10;SAR=10,10,1,4;SRF=6;SRR=0;SSEN=0.305263,0.305263,0.305263,0.305263;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.844818,-0.844818,-0.099446,-0.209301;STB=0.5,0.5,0.511901,0.5;STBP=1,1,0.295,1;TYPE=del,del,del,del;VARB=0,0,-0.00411604,0.0179307;OID=.,.,.,.;OPOS=32151694,32151691,32151695,32151691;OREF=GGC,GG,GC,G;OALT=-,-,-,-;OMAPALT=TGGG,TGGGC,TGGGG,TGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/3:0,0,0.971429,0:10,10,26,14:73:0,0,68,0:70:2:0,0,41,0:0,0,27,0:2:0:3:6:0,0,25,10:10,10,1,4:6:0 chr6 32151994 . A T 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000574362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.303;QD=57.2377;RBI=0.0313182;REFB=0;REVB=-0.0313129;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134096;OID=.;OPOS=32151994;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr6 32156489 . G C 979.31 PASS AF=0.8875;AO=71;DP=80;FAO=71;FDP=80;FR=.;FRO=9;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00727702;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=244.655;QD=48.9657;RBI=0.00743512;REFB=-0.0237952;REVB=-0.00152512;RO=6;SAF=43;SAR=28;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414714;STB=0.531627;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00160836;OID=.;OPOS=32156489;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:80:80:6:9:71:71:0.8875:28:43:2:4:28:43:3:6 chr6 32172065 . T G 1568.36 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00841354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.142;QD=64.0146;RBI=0.010575;REFB=0;REVB=-0.00640642;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33948e-05;OID=.;OPOS=32172065;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:53:45:0:0:53:45:0:0 chr6 32184705 . G A 990.53 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4261;QD=59.136;RBI=0.047618;REFB=0;REVB=0.0269343;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.12936e-05;OID=.;OPOS=32184705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0 chr6 32190390 . T G 889.8 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0957721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4823;QD=56.4951;RBI=0.108581;REFB=-0.118384;REVB=-0.0511627;RO=1;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119536;STB=0.506327;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00139047;OID=.;OPOS=32190390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:39:23:0:1:39:23:0:1 chr6 32190406 . A G 902.56 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.692;QD=58.2299;RBI=0.0421951;REFB=0;REVB=-0.00272124;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146844;OID=.;OPOS=32190406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0 chr6 32190484 . G A 427.3 PASS AF=0.594203;AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0111496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.027;QD=24.7709;RBI=0.0127661;REFB=-0.0218984;REVB=0.00621779;RO=26;SAF=12;SAR=29;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448106;STB=0.513917;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0178892;OID=.;OPOS=32190484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:26:28:41:41:0.594203:29:12:9:17:29:12:9:19 chr6 32191658 . TAGC T 1063.75 PASS AF=1;AO=57;DP=84;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169677;FXX=0.13413;HRUN=1;LEN=3;MLLD=172.466;QD=59.9294;RBI=0.070154;REFB=0;REVB=0.0680711;RO=0;SAF=43;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000206517;OID=.;OPOS=32191659;OREF=AGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:57:84:71:71:0:50:21:0:0:6:0:43:14:0:0 chr6 32223530 . CA C,CC 742.58 PASS AF=0.0192308,0.980769;AO=19,34;DP=54;FAO=1,51;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=1,25;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13478,0.149709;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.518,200.619;QD=57.1217;RBI=0.14542,0.156766;REFB=0,0;REVB=0.0546015,0.0465046;RO=0;SAF=18,8;SAR=1,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0928504,0.00430236;OID=.,.;OPOS=32223531,32223531;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0192308,0.980769:19,34:54:1,51:52:0:1,25:0,26:0:0:3:0:18,8:1,26:0:0 chr6 32261770 . GA GG,GT 1303.98 PASS AF=0.91954,0.0804598;AO=64,7;DP=87;FAO=80,7;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40,2;FSAR=40,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266092,0.0258955;FXX=0.0113623;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=237.51,207.349;QD=59.9532;RBI=0.0429377,0.0378385;REFB=0,0;REVB=0.0336986,0.0275894;RO=0;SAF=31,2;SAR=33,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00189196,-0.0146647;OID=.,.;OPOS=32261771,32261771;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=GG,GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.91954,0.0804598:64,7:87:80,7:87:0:40,2:40,5:0:0:24:0:31,2:33,5:0:0 chr6 32261772 . T G 56.14 PASS AF=0.136364;AO=12;DP=87;FAO=12;FDP=88;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-0.00243276;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=57.4364;QD=2.55169;RBI=0.0204203;REFB=-0.00641596;REVB=0.0202749;RO=75;SAF=9;SAR=3;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378053;STB=0.758002;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.14478;OID=.;OPOS=32261772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:87:88:75:76:12:12:0.136364:3:9:33:42:3:9:34:42 chr6 32268501 . A T 1151.88 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.612;QD=60.6253;RBI=0.0184428;REFB=0;REVB=0.0130289;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14999e-05;OID=.;OPOS=32268501;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:41:34:0:0:41:35:0:0 chr6 32290927 . G T 1840.77 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7972;QD=61.3591;RBI=0.0265049;REFB=0;REVB=-0.0153676;RO=0;SAF=56;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21547e-05;OID=.;OPOS=32290927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:120:0:0:119:120:1:63:56:0:0:63:57:0:0 chr6 32291270 . CAG CAC,C 508.25 PASS AF=0.0571429,0.942857;AO=2,32;DP=37;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,11;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0059905,0.00865555;FXX=0.0540395;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=66.4258,237.627;QD=58.0862;RBI=0.0110027,0.0437989;REFB=0,0;REVB=-0.00922889,0.0429351;RO=0;SAF=2,11;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.089058,-0.000174383;OID=.,.;OPOS=32291272,32291271;OREF=G,AG;OALT=C,-;OMAPALT=CAC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0571429,0.942857:2,32:37:2,33:35:0:2,11:0,22:0:0:9:0:2,11:0,21:0:0 chr6 32291359 . T G 1008.45 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3475;QD=59.3206;RBI=0.0152404;REFB=0;REVB=0.00871341;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.72406e-05;OID=.;OPOS=32291359;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0 chr6 32298372 . A G 688.98 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.637;QD=62.6344;RBI=0.0794003;REFB=0;REVB=0.00598335;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166855;OID=.;OPOS=32298372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0 chr6 32301804 . G C 1549.22 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.259;QD=63.8853;RBI=0.0155789;REFB=0;REVB=0.0155092;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01937e-05;OID=.;OPOS=32301804;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:49:47:0:0:49:48:0:0 chr6 32303672 . T A 1148.72 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.878;QD=60.4591;RBI=0.029782;REFB=0;REVB=0.0101533;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.55478e-05;OID=.;OPOS=32303672;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:73:76:1:43:30:0:0:45:31:0:0 chr6 32307260 . T G 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.396;QD=60.3765;RBI=0.0386166;REFB=0;REVB=0.0353455;RO=0;SAF=28;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67409e-05;OID=.;OPOS=32307260;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:46:28:0:0:46:28:0:0 chr6 32307382 . G A 636.22 PASS AF=0.955556;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.062085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.742;QD=56.5528;RBI=0.0623707;REFB=-0.0317528;REVB=-0.00596297;RO=2;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00203384;STB=0.501557;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0128819;OID=.;OPOS=32307382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:44:45:2:2:42:43:0.955556:20:22:1:1:20:23:1:1 chr6 32310986 . C G 446.8 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.766;QD=57.6511;RBI=0.0315731;REFB=0;REVB=-0.0184651;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90358e-05;OID=.;OPOS=32310986;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0 chr6 32317922 . TTTTC T 783.62 PASS AF=0.821053;AO=69;DP=81;FAO=78;FDP=95;FR=.;FRO=17;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0311217;FXX=0.0206164;HRUN=4;LEN=4;MLLD=262.885;QD=32.9943;RBI=0.0317449;REFB=-0.073248;REVB=0.00625923;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.316456;SSSB=0;STB=0.534777;STBP=0.155;TYPE=del;VARB=0.0111083;OID=.;OPOS=32317923;OREF=TTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.821053:69:81:78:95:17:45:33:13:4:52:0:38:31:0:0 chr6 32333093 . A G 888.4 PASS AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.657;QD=55.5252;RBI=0.0296323;REFB=-0.127774;REVB=0.00760304;RO=1;SAF=32;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145261;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000624559;OID=.;OPOS=32333093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:62:63:0.984375:30:32:1:0:30:33:1:0 chr6 32333098 . C T 922.02 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156419;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.177;QD=58.541;RBI=0.0156678;REFB=0;REVB=0.000900132;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198134;OID=.;OPOS=32333098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0 chr6 32333955 . T C 954.54 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8506;QD=58.7407;RBI=0.0909734;REFB=0;REVB=0.0900605;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000866902;OID=.;OPOS=32333955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0 chr6 32334224 . C G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.291;QD=54.5175;RBI=0.0283791;REFB=0;REVB=0.0134361;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138937;OID=.;OPOS=32334224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr6 32336586 . A G 1945.23 PASS AF=0.992188;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0146891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.697;QD=60.7886;RBI=0.0180675;REFB=0.0171763;REVB=0.0105197;RO=1;SAF=70;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674012;STB=0.503546;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000613166;OID=.;OPOS=32336586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:128:128:1:1:126:127:0.992188:56:70:1:0:57:70:1:0 chr6 32337686 . A G 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.461;QD=57.1045;RBI=0.0388877;REFB=0;REVB=0.0178803;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171536;OID=.;OPOS=32337686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:37:18:0:0:37:18:0:0 chr6 32410987 . A G 1058.44 PASS AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00532155;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.1146;QD=57.213;RBI=0.0232793;REFB=-0.107708;REVB=0.0226629;RO=2;SAF=41;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00361604;STB=0.501912;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000560981;OID=.;OPOS=32410987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:31:41:1:1:31:41:1:1 chr6 32411035 . A C 1157.48 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.01052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.131;QD=59.3578;RBI=0.0191782;REFB=-0.119711;REVB=0.0160354;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000821665;OID=.;OPOS=32411035;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:0:1:77:77:0.987179:30:47:0:0:30:47:1:0 chr6 32411646 . T G 1496.08 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0149383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1341;QD=62.3365;RBI=0.0150013;REFB=-0.109738;REVB=-0.00137346;RO=1;SAF=51;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920763;STB=0.504853;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00076258;OID=.;OPOS=32411646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:44:51:1:0:44:51:1:0 chr6 32412480 . G A 1377.49 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.74;QD=62.613;RBI=0.0265455;REFB=0;REVB=-0.0215421;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.31286e-06;OID=.;OPOS=32412480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0 chr6 32487172 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00294793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.792;QD=33.4284;RBI=0.0228432;REFB=0;REVB=-0.0226522;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00106043;OID=.;OPOS=32487172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr6 32487214 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1077;QD=33.4277;RBI=0.0330472;REFB=0;REVB=-0.0281749;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00450799;OID=.;OPOS=32487214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr6 32487229 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.29;QD=33.4284;RBI=0.0354078;REFB=0;REVB=-0.000714419;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483935;OID=.;OPOS=32487229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr6 32487268 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0941;QD=37.4885;RBI=0.00865465;REFB=0;REVB=0.00361367;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000885448;OID=.;OPOS=32487268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr6 32487277 . T C 57.07 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00346677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.548;QD=28.5358;RBI=0.00362535;REFB=-0.0407082;REVB=-0.00106052;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124421;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0156527;OID=.;OPOS=32487277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:0:1:3:4:0:1 chr6 32489749 . G C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.78;QD=62.9829;RBI=0.0194201;REFB=0;REVB=0.0153065;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.08978e-05;OID=.;OPOS=32489749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0 chr6 32489791 . AG CT 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101219;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=222.558;QD=58.1421;RBI=0.0136965;REFB=0;REVB=0.00922725;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-4.18461e-06;OID=.;OPOS=32489791;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr6 32489794 . G A 451.0 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0505439;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.874;QD=58.1938;RBI=0.0523061;REFB=0;REVB=0.0134626;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348303;OID=.;OPOS=32489794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr6 32489825 . T A 206.09 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.78;QD=48.4924;RBI=0.0392204;REFB=0;REVB=-0.0129546;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195766;OID=.;OPOS=32489825;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:17:0:0:15:17:1:13:2:0:0:13:4:0:0 chr6 32489853 . A C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.885;QD=39.2068;RBI=0.0245803;REFB=0;REVB=0.00188527;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000773517;OID=.;OPOS=32489853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr6 32489856 . C A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4669;QD=37.4883;RBI=0.0233423;REFB=0;REVB=-0.00286295;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140038;OID=.;OPOS=32489856;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr6 32517807 . T C 232.05 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0613473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.63;QD=14.7333;RBI=0.0699358;REFB=-0.00725927;REVB=0.0335787;RO=36;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570832;STB=0.53235;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0123045;OID=.;OPOS=32517807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:15:12:14:22:15:12:14:22 chr6 32546743 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.761;QD=47.8224;RBI=0.0432242;REFB=0;REVB=-0.0187984;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272925;OID=.;OPOS=32546743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr6 32546795 . T A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0067338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.852;QD=48.7355;RBI=0.0189835;REFB=0;REVB=0.0177491;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172479;OID=.;OPOS=32546795;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr6 32546800 . A G 46.8 PASS AF=0.411765;AO=16;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00442979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.151;QD=11.012;RBI=0.0314582;REFB=-0.00182115;REVB=-0.0311447;RO=1;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043542;STB=0.765078;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.023212;OID=.;OPOS=32546800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:17:17:1:10:16:7:0.411765:10:6:0:1:6:1:5:5 chr6 32546828 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00352703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.415;QD=51.9165;RBI=0.00423691;REFB=0;REVB=0.00234765;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02035e-05;OID=.;OPOS=32546828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0 chr6 32546846 . C T 198.41 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0429296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4464;QD=44.0909;RBI=0.0430402;REFB=-0.07433;REVB=0.00308453;RO=1;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398535;STB=0.521714;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00466396;OID=.;OPOS=32546846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:11:6:0:1:11:6:0:1 chr6 32546854 . TG T 186.27 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365299;FXX=0.166574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.0954;QD=49.6709;RBI=0.0421348;REFB=0;REVB=-0.0209977;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.224771;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00442661;OID=.;OPOS=32546855;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:15:17:15:15:0:6:9:0:0:3:0:6:9:0:0 chr6 32546866 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.2206;QD=46.8475;RBI=0.0138696;REFB=0;REVB=0.00876423;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.81806e-05;OID=.;OPOS=32546866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr6 32547982 . G A 105.32 PASS AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00699618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.569;QD=11.0867;RBI=0.0227822;REFB=-0.0117583;REVB=-0.0216814;RO=25;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107536;STB=0.564215;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0184998;OID=.;OPOS=32547982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:8:5:12:13:8:5:12:13 chr6 32547988 . T C 267.21 PASS AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.000273048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.395;QD=28.1268;RBI=0.0195359;REFB=-0.0111752;REVB=-0.019534;RO=14;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953753;STB=0.552588;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00503213;OID=.;OPOS=32547988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:12:12:5:9:12:12:5:9 chr6 32547990 . TG AA,TA 551.31 PASS AF=0.368421,0.631579;AO=13,24;DP=37;FAO=14,24;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=5,12;FSAR=9,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00862365,-0.0259962;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=157.896,63.8506;QD=58.0327;RBI=0.0233551,0.0366297;REFB=0,0;REVB=0.0217047,0.0258057;RO=0;SAF=5,12;SAR=8,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.60098e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0230144,0.00583761;OID=.,.;OPOS=32547990,32547991;OREF=TG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:37:38:0:0:13,24:14,24:0.368421,0.631579:8,12:5,12:0:0:9,12:5,12:0:0 chr6 32547997 . T G 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0165186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.575;QD=13.336;RBI=0.0167059;REFB=-0.0152628;REVB=-0.00249461;RO=24;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18229;STB=0.606996;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0279486;OID=.;OPOS=32547997;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:10:5:12:12:10:5:12:12 chr6 32548026 . G C 248.6 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0270898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.75;QD=25.4972;RBI=0.0272027;REFB=-0.0231717;REVB=-0.00247617;RO=16;SAF=11;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123643;STB=0.568481;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00484885;OID=.;OPOS=32548026;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:12:11:5:11:12:11:5:11 chr6 32548066 . G T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0155849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.277;QD=20.7382;RBI=0.0155943;REFB=-0.00343074;REVB=0.000541198;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251158;STB=0.640877;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0109809;OID=.;OPOS=32548066;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:4:12:8:10:4:12 chr6 32548520 . C T 126.79 PASS AF=0.285714;AO=19;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0208272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.148;QD=8.04985;RBI=0.0229114;REFB=-0.00226544;REVB=-0.00954767;RO=44;SAF=10;SAR=9;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838872;STB=0.523783;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00862513;OID=.;OPOS=32548520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:44:45:19:18:0.285714:9:10:20:24:9:9:21:24 chr6 32548534 . C T 109.51 PASS AF=0.232877;AO=17;DP=74;FAO=17;FDP=73;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0259592;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2019;QD=6.00036;RBI=0.0428409;REFB=0.0134699;REVB=0.0340802;RO=57;SAF=8;SAR=9;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00384197;STB=0.508875;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.011399;OID=.;OPOS=32548534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:57:56:17:17:0.232877:9:8:27:30:9:8:27:29 chr6 32548554 . G C 151.62 PASS AF=0.252874;AO=22;DP=88;FAO=22;FDP=87;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0213106;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9974;QD=6.97109;RBI=0.0396286;REFB=-0.00113743;REVB=0.0334108;RO=66;SAF=10;SAR=12;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018761;STB=0.505258;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00300107;OID=.;OPOS=32548554;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:66:65:22:22:0.252874:12:10:31:35:12:10:30:35 chr6 32548556 . C T 153.21 PASS AF=0.25;AO=22;DP=84;FAO=22;FDP=88;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.00264762;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.992;QD=6.96393;RBI=0.00615393;REFB=-0.0152544;REVB=0.00555527;RO=62;SAF=10;SAR=12;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00360822;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.015517;OID=.;OPOS=32548556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:88:62:66:22:22:0.25:12:10:28:34:12:10:30:36 chr6 32548581 . A G 183.1 PASS AF=0.271739;AO=25;DP=92;FAO=25;FDP=92;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.0213998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.676;QD=7.96108;RBI=0.0214977;REFB=-0.00800815;REVB=0.00204956;RO=66;SAF=10;SAR=15;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104187;STB=0.557476;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0308461;OID=.;OPOS=32548581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:66:67:25:25:0.271739:15:10:32:34:15:10:32:35 chr6 32548632 . T A 170.52 PASS AF=0.294872;AO=23;DP=80;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.00552105;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.425;QD=8.74466;RBI=0.0281451;REFB=-0.0186364;REVB=-0.0275983;RO=53;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14303;STB=0.581484;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0343442;OID=.;OPOS=32548632;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:78:53:55:23:23:0.294872:12:11:19:34:12:11:20:35 chr6 32549401 . T C 306.32 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0686604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8982;QD=53.2733;RBI=0.0688953;REFB=0;REVB=-0.00568418;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00202153;OID=.;OPOS=32549401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr6 32549416 . C T 43.41 PASS AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0118218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.209;QD=5.78825;RBI=0.0240643;REFB=-0.00137469;REVB=-0.0209603;RO=23;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28358;STB=0.68573;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00381044;OID=.;OPOS=32549416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:30:30:23:23:7:7:0.233333:5:2:12:11:5:2:12:11 chr6 32549452 . C G 376.19 PASS AF=0.616667;AO=36;DP=62;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00939293;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.423;QD=25.0796;RBI=0.0137807;REFB=0.0261338;REVB=0.0100837;RO=23;SAF=20;SAR=16;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552439;STB=0.523926;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.00779883;OID=.;OPOS=32549452;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:60:23:23:36:37:0.616667:16:20:11:12:17:20:11:12 chr6 32549464 . T C 198.03 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.000370872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.344;QD=11.1567;RBI=0.0140706;REFB=-0.0081645;REVB=-0.0140658;RO=46;SAF=12;SAR=13;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119096;STB=0.568969;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0156001;OID=.;OPOS=32549464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:46:46:25:25:0.352113:13:12:27:19:13:12:27:19 chr6 32549475 . T C 1227.36 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.15;QD=61.3679;RBI=0.0262366;REFB=0;REVB=0.0193646;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.33215e-05;OID=.;OPOS=32549475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0 chr6 32549481 . C T 518.44 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.00955367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.199;QD=22.7884;RBI=0.0273948;REFB=-0.0286435;REVB=-0.025675;RO=42;SAF=33;SAR=16;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251489;STB=0.638652;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0208166;OID=.;OPOS=32549481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:16:33:16:26:16:33:16:26 chr6 32549497 . G A 523.86 PASS AF=0.486726;AO=54;DP=111;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.00470225;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.327;QD=18.5439;RBI=0.0315498;REFB=-0.0161743;REVB=-0.0311974;RO=56;SAF=32;SAR=22;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102832;STB=0.569867;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0156834;OID=.;OPOS=32549497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:56:58:54:55:0.486726:22:32:27:29:22:33:27:31 chr6 32549501 . A C 1773.77 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00110068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.447;QD=60.6419;RBI=0.00799225;REFB=0;REVB=0.00791609;RO=0;SAF=63;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.94359e-06;OID=.;OPOS=32549501;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:53:63:0:0:54:63:0:0 chr6 32549548 . G A 700.41 PASS AF=0.447059;AO=74;DP=168;FAO=76;FDP=170;FR=.;FRO=94;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=-0.0141004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.191;QD=16.4803;RBI=0.014189;REFB=-0.0126777;REVB=0.00158371;RO=94;SAF=33;SAR=41;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00994725;STB=0.513577;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0172368;OID=.;OPOS=32549548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:94:94:74:76:0.447059:41:33:41:53:41:35:41:53 chr6 32549557 . G C 127.16 PASS AF=0.145161;AO=27;DP=186;FAO=27;FDP=186;FR=.;FRO=159;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=74;FSRR=85;FWDB=-0.00735482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.005;QD=2.73455;RBI=0.00797367;REFB=-0.00410595;REVB=0.00307994;RO=159;SAF=12;SAR=15;SRF=74;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268857;STB=0.518059;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0281028;OID=.;OPOS=32549557;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:159:159:27:27:0.145161:15:12:74:85:15:12:74:85 chr6 32549589 . A C 937.61 PASS AF=0.497326;AO=93;DP=187;FAO=93;FDP=187;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=-0.00696514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.093;QD=20.0558;RBI=0.00707729;REFB=-0.0193567;REVB=0.00125491;RO=93;SAF=39;SAR=54;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497251;STB=0.530334;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0209212;OID=.;OPOS=32549589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:93:94:93:93:0.497326:54:39:44:49:54:39:45:49 chr6 32549596 . T C 2752.9 PASS AF=1;AO=176;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141098;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6935;QD=62.2125;RBI=0.0152626;REFB=-0.0242124;REVB=0.00581902;RO=0;SAF=77;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.22399e-05;OID=.;OPOS=32549596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:178:177:0:0:176:177:1:99:77:0:0:100:77:0:0 chr6 32549607 . T G 986.49 PASS AF=0.536723;AO=95;DP=178;FAO=95;FDP=177;FR=.;FRO=82;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=35;FSRR=47;FWDB=-0.0111856;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.481;QD=22.2935;RBI=0.0141969;REFB=-0.000228643;REVB=-0.00874273;RO=82;SAF=41;SAR=54;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00410482;STB=0.502243;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.000113634;OID=.;OPOS=32549607;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:82:82:95:95:0.536723:54:41:35:47:54:41:35:47 chr6 32549611 . T A 2624.94 PASS AF=0.988439;AO=171;DP=173;FAO=171;FDP=173;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0195232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.212;QD=60.6922;RBI=0.0195353;REFB=-0.0457464;REVB=0.000686327;RO=2;SAF=73;SAR=98;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00961371;STB=0.50505;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000537806;OID=.;OPOS=32549611;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:173:173:2:2:171:171:0.988439:98:73:0:2:98:73:0:2 chr6 32551998 . GT AG,AT 113.94 PASS AF=0.272727,0.727273;AO=3,8;DP=11;FAO=3,8;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3,3;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346085,0.0161062;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=66.8033,123.766;QD=41.4332;RBI=0.00615867,0.0164203;REFB=0,0;REVB=-0.00509429,0.00319628;RO=0;SAF=3,3;SAR=0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0422572,0.00103833;OID=.,.;OPOS=32551998,32551998;OREF=GT,G;OALT=AG,A;OMAPALT=AG,AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:11:11:0:0:3,8:3,8:0.272727,0.727273:0,5:3,3:0:0:0,5:3,3:0:0 chr6 32552029 . A T 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00862423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.837;QD=19.6463;RBI=0.0188915;REFB=-0.0330706;REVB=0.0168081;RO=8;SAF=9;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300156;STB=0.67464;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.013707;OID=.;OPOS=32552029;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:2:9:4:4:2:9:4:4 chr6 32552059 . G A,T 239.15 PASS AF=0.380952,0.571429;AO=8,12;DP=21;FAO=8,12;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=8,6;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0389197,-0.00941387;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=40.9081,48.5327;QD=45.553;RBI=0.0389923,0.0304708;REFB=-0.032871,-0.0941425;REVB=0.0023787,0.0289801;RO=1;SAF=8,6;SAR=0,6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.803989,0.069361;STB=0.997736,0.538398;STBP=0.046,0.538;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0310788,0.0251812;OID=.,.;OPOS=32552059,32552059;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:57:21:21:1:1:8,12:8,12:0.380952,0.571429:0,6:8,6:0:1:0,6:8,6:0:1 chr6 32552067 . C T 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0503933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8539;QD=12.7295;RBI=0.0523304;REFB=0.0151753;REVB=0.0141065;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368393;STB=0.713877;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0189599;OID=.;OPOS=32552067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:10:2:5:4:10:2 chr6 32552075 . A G 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00343385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.981;QD=17.3781;RBI=0.00758293;REFB=0.0067524;REVB=0.00676088;RO=10;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327076;STB=0.691913;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.00515856;OID=.;OPOS=32552075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:2:9:5:5:2:9:5:5 chr6 32557478 . CG AA 82.06 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0232297;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=198.266;QD=32.822;RBI=0.0250469;REFB=-0.00145992;REVB=0.00936633;RO=1;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080744;STB=0.545355;STBP=0.524;TYPE=mnp;VARB=0.000919392;OID=.;OPOS=32557478;OREF=CG;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:4:5:1:0:4:5:1:0 chr6 32557483 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.074097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3101;QD=44.6897;RBI=0.0769975;REFB=0;REVB=0.0209344;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00238886;OID=.;OPOS=32557483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr6 32557506 . T C 118.92 PASS AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0241371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0735;QD=33.9782;RBI=0.125808;REFB=0.00422206;REVB=-0.123471;RO=2;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11262;STB=0.562399;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00571375;OID=.;OPOS=32557506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:5:7:2:0:5:7:2:0 chr6 32605257 . C A 70.78 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0165963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.598;QD=7.25974;RBI=0.0178023;REFB=-0.00306099;REVB=0.00644074;RO=29;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.472521;STB=0.788232;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00417992;OID=.;OPOS=32605257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:3:7:8:21:3:7:8:21 chr6 32605266 . G A 70.4 PASS AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.0279054;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=132.243;QD=7.03986;RBI=0.0279161;REFB=-0.00241137;REVB=-0.000775014;RO=30;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483426;STB=0.794951;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0701295;OID=.;OPOS=32605266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:3:7:8:22:3:7:8:22 chr6 32605271 . C T 79.42 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0207587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.726;QD=6.90645;RBI=0.0209358;REFB=-0.00347588;REVB=-0.00271726;RO=35;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31169;STB=0.694321;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0116707;OID=.;OPOS=32605271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:4:7:13:22:4:7:13:22 chr6 32605274 . T C 79.14 PASS AF=0.234043;AO=11;DP=47;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0132181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.178;QD=6.73531;RBI=0.0133633;REFB=-0.00233893;REVB=-0.00196459;RO=36;SAF=7;SAR=4;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262346;STB=0.665105;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0177645;OID=.;OPOS=32605274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:47:47:36:36:11:11:0.234043:4:7:15:21:4:7:15:21 chr6 32605284 . G A 424.24 PASS AF=0.716981;AO=38;DP=53;FAO=38;FDP=53;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0165651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.599;QD=32.0182;RBI=0.0294986;REFB=-0.00307867;REVB=-0.0244083;RO=15;SAF=15;SAR=23;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389155;STB=0.521101;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00109893;OID=.;OPOS=32605284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:15:15:38:38:0.716981:23:15:7:8:23:15:7:8 chr6 32605295 . C T 455.13 PASS AF=0.706897;AO=41;DP=58;FAO=41;FDP=58;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0331055;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.5122;QD=31.3881;RBI=0.0340131;REFB=-0.0176516;REVB=0.00780489;RO=17;SAF=17;SAR=24;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00159905;STB=0.500866;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0067086;OID=.;OPOS=32605295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:17:17:41:41:0.706897:24:17:7:10:24:17:7:10 chr6 32605309 . A G 467.79 PASS AF=0.745455;AO=40;DP=54;FAO=41;FDP=55;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.000361637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3314;QD=34.0211;RBI=0.0117734;REFB=-0.0134851;REVB=0.0117678;RO=14;SAF=17;SAR=23;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691782;STB=0.53418;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00480821;OID=.;OPOS=32605309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:54:55:14:14:40:41:0.745455:23:17:4:10:24:17:4:10 chr6 32605325 . C T 51.52 PASS AF=0.155172;AO=9;DP=58;FAO=9;FDP=58;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.00180802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2899;QD=3.55313;RBI=0.0675884;REFB=-0.0141508;REVB=-0.0675642;RO=49;SAF=3;SAR=6;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455779;STB=0.531574;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0536666;OID=.;OPOS=32605325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:58:58:49:49:9:9:0.155172:6:3:18:31:6:3:18:31 chr6 32606695 . T C 1107.4 PASS AF=0.927711;AO=77;DP=83;FAO=77;FDP=83;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0410983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.775;QD=53.3685;RBI=0.0788286;REFB=0.0147452;REVB=0.0672672;RO=6;SAF=47;SAR=30;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00808916;STB=0.504284;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-9.11109e-05;OID=.;OPOS=32606695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:83:83:6:6:77:77:0.927711:30:47:4:2:30:47:4:2 chr6 32606701 . A G 1202.05 PASS AF=0.931818;AO=81;DP=88;FAO=82;FDP=88;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0492354;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.272;QD=54.6386;RBI=0.0841404;REFB=-0.0455965;REVB=0.068231;RO=6;SAF=49;SAR=32;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00842849;STB=0.504083;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.00101318;OID=.;OPOS=32606701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:88:88:6:6:81:82:0.931818:32:49:4:2:32:50:4:2 chr6 32609097 . T C 128.86 PASS AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0023538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.297;QD=8.44979;RBI=0.0257576;REFB=-0.0121826;REVB=0.0256498;RO=42;SAF=7;SAR=11;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264911;STB=0.664123;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00937997;OID=.;OPOS=32609097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:42:43:18:18:0.295082:11:7:26:16:11:7:27:16 chr6 32609105 . G A 127.8 PASS AF=0.290323;AO=18;DP=62;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0363802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8981;QD=8.24518;RBI=0.0415078;REFB=0.00192453;REVB=0.0199844;RO=44;SAF=7;SAR=11;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261302;STB=0.655972;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.00362872;OID=.;OPOS=32609105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:44:44:18:18:0.290323:11:7:27:17:11:7:27:17 chr6 32609126 . T C 112.46 PASS AF=0.25;AO=17;DP=68;FAO=17;FDP=68;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0252973;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.045;QD=6.61501;RBI=0.0252986;REFB=-0.00713349;REVB=0.000253203;RO=51;SAF=6;SAR=11;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348078;STB=0.711209;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0203055;OID=.;OPOS=32609126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:51:51:17:17:0.25:11:6:33:18:11:6:33:18 chr6 32609173 . C G 851.99 PASS AF=0.825;AO=64;DP=79;FAO=66;FDP=80;FR=.;FRO=14;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.014247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.202;QD=42.5994;RBI=0.0181708;REFB=-0.0354711;REVB=0.0112783;RO=14;SAF=44;SAR=20;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711353;STB=0.535703;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00738229;OID=.;OPOS=32609173;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:79:80:14:14:64:66:0.825:20:44:7:7:21:45:7:7 chr6 32609192 . A G 47.57 PASS AF=0.126582;AO=10;DP=80;FAO=10;FDP=79;FR=.;FRO=69;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=49;FSRR=20;FWDB=-0.0258506;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.349;QD=2.4084;RBI=0.0440357;REFB=-0.00587596;REVB=-0.0356496;RO=70;SAF=6;SAR=4;SRF=50;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154639;STB=0.604204;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0430474;OID=.;OPOS=32609192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:80:79:70:69:10:10:0.126582:4:6:50:20:4:6:49:20 chr6 32609207 . C T 35.8 PASS AF=0.108108;AO=8;DP=74;FAO=8;FDP=74;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=0.0235848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.119;QD=1.93497;RBI=0.0267768;REFB=4.59125e-05;REVB=-0.0126789;RO=66;SAF=7;SAR=1;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304531;STB=0.746831;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=5.68191e-05;OID=.;OPOS=32609207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:74:74:66:66:8:8:0.108108:1:7:45:21:1:7:45:21 chr6 32609806 . C T 81.96 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00269979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.059;QD=8.6271;RBI=0.0181445;REFB=0.000593741;REVB=-0.0179425;RO=27;SAF=10;SAR=1;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501826;STB=0.821194;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00198198;OID=.;OPOS=32609806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:1:10:16:11:1:10:16:11 chr6 32609813 . T C 61.01 PASS AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0259435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.44;QD=6.59528;RBI=0.0416142;REFB=6.5947e-05;REVB=-0.0325374;RO=28;SAF=8;SAR=1;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407415;STB=0.771193;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=-0.000876032;OID=.;OPOS=32609813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:37:37:28:28:9:9:0.243243:1:8:18:10:1:8:18:10 chr6 32609873 . G C 62.39 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0121849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.886;QD=7.79845;RBI=0.0587907;REFB=-0.00985192;REVB=0.0575141;RO=23;SAF=8;SAR=1;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474198;STB=0.806526;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0190687;OID=.;OPOS=32609873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:1:8:13:10:1:8:13:10 chr6 32609952 . T C 90.66 PASS AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0370665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.802;QD=6.71538;RBI=0.0374927;REFB=-0.0116933;REVB=-0.0056372;RO=41;SAF=9;SAR=4;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110565;STB=0.569509;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0433722;OID=.;OPOS=32609952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:4:9:25:16:4:9:25:16 chr6 32609969 . T G 129.15 PASS AF=0.260274;AO=19;DP=73;FAO=19;FDP=73;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.00665256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.62;QD=7.07642;RBI=0.0251941;REFB=0.00048644;REVB=0.0242999;RO=54;SAF=13;SAR=6;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494255;STB=0.530147;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.00108218;OID=.;OPOS=32609969;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:54:54:19:19:0.260274:6:13:35:19:6:13:35:19 chr6 32609974 . T G 139.11 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.0165276;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.683;QD=7.51934;RBI=0.0825031;REFB=-0.0150568;REVB=-0.0808307;RO=53;SAF=13;SAR=7;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138086;STB=0.501482;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0354442;OID=.;OPOS=32609974;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:53:54:20:20:0.27027:7:13:35:18:7:13:35:19 chr6 32610002 . C A 134.64 PASS AF=0.243902;AO=20;DP=83;FAO=20;FDP=82;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.00852874;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7353;QD=6.56769;RBI=0.019017;REFB=0.0118772;REVB=0.0169972;RO=62;SAF=13;SAR=7;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653569;STB=0.504007;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=-0.0177707;OID=.;OPOS=32610002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:62:62:20:20:0.243902:7:13:40:22:7:13:40:22 chr6 32610009 . C A 153.62 PASS AF=0.258824;AO=22;DP=85;FAO=22;FDP=85;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.0147124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1348;QD=7.22905;RBI=0.0147934;REFB=-0.00400802;REVB=0.0015452;RO=63;SAF=15;SAR=7;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847083;STB=0.551553;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0159694;OID=.;OPOS=32610009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:63:63:22:22:0.258824:7:15:39:24:7:15:39:24 chr6 32610044 . T C 182.51 PASS AF=0.268817;AO=25;DP=93;FAO=25;FDP=93;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.0220424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2298;QD=7.84999;RBI=0.0383126;REFB=-0.00325103;REVB=-0.0313368;RO=68;SAF=16;SAR=9;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666422;STB=0.540113;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00787048;OID=.;OPOS=32610044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:68:68:25:25:0.268817:9:16:40:28:9:16:40:28 chr6 32610047 . T C 159.32 PASS AF=0.247312;AO=23;DP=93;FAO=23;FDP=93;FR=.;FRO=70;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0207773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1541;QD=6.85247;RBI=0.0217403;REFB=-0.00296707;REVB=-0.0063988;RO=67;SAF=14;SAR=9;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339242;STB=0.506843;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00548367;OID=.;OPOS=32610047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:67:70:23:23:0.247312:9:14:39:28:9:14:42:28 chr6 32610050 . T C 151.14 PASS AF=0.23913;AO=22;DP=84;FAO=22;FDP=92;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.00895702;FXX=0.0107515;HRUN=6;LEN=1;MLLD=223.975;QD=6.5714;RBI=0.0190963;REFB=-0.000894773;REVB=-0.0168654;RO=62;SAF=15;SAR=7;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112915;STB=0.579324;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0024395;OID=.;OPOS=32610050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:92:62:70:22:22:0.23913:7:15:37:25:7:15:41:29 chr6 32610059 . T G 183.69 PASS AF=0.274725;AO=25;DP=91;FAO=25;FDP=91;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0113292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.422;QD=8.07404;RBI=0.0145836;REFB=-0.00376216;REVB=0.00918325;RO=66;SAF=16;SAR=9;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629733;STB=0.537784;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0114762;OID=.;OPOS=32610059;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:66:66:25:25:0.274725:9:16:39:27:9:16:39:27 chr6 32610109 . A C 54.77 PASS AF=0.166667;AO=9;DP=56;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00775668;FXX=0.0163908;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.0947;QD=3.65114;RBI=0.0445638;REFB=-0.0432033;REVB=-0.0438836;RO=47;SAF=4;SAR=5;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106761;STB=0.549901;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0749068;OID=.;OPOS=32610109;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:56:60:47:50:9:10:0.166667:5:4:25:22:5:5:28:22 chr6 32610436 . TG CA,CG 1363.99 PASS AF=0.472527,0.527473;AO=43,39;DP=89;FAO=43,48;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=27,37;FSAR=16,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00643115,0.0782651;FXX=0.0319115;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=230.053,106.893;QD=59.9556;RBI=0.0468341,0.0912664;REFB=0,0;REVB=0.0463905,0.0469481;RO=0;SAF=27,28;SAR=16,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0200253,0.00986371;OID=.,.;OPOS=32610436,32610436;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:89:91:0:0:43,39:43,48:0.472527,0.527473:16,11:27,28:0:0:16,11:27,37:0:0 chr6 32610461 . A G 1377.43 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.832;QD=62.6104;RBI=0.0444428;REFB=0;REVB=-0.0363921;RO=0;SAF=61;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.16754e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19221e-05;OID=.;OPOS=32610461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:27:61:0:0:27:61:0:0 chr6 32610495 . A G 196.2 PASS AF=0.342466;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.114131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0338;QD=10.7509;RBI=0.114612;REFB=0.00987837;REVB=-0.0104865;RO=46;SAF=20;SAR=5;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215384;STB=0.617543;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.0241603;OID=.;OPOS=32610495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:46:48:25:25:0.342466:5:20:30:16:5:20:32:16 chr6 32610535 . A C 161.77 PASS AF=0.36;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.00742727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.792;QD=12.9412;RBI=0.00824159;REFB=-0.00479734;REVB=-0.00357205;RO=30;SAF=14;SAR=4;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153427;STB=0.57638;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0110713;OID=.;OPOS=32610535;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:30:32:18:18:0.36:4:14:20:10:4:14:22:10 chr6 32610704 . TG CC,CG 455.48 PASS AF=0.0625,0.9375;AO=2,30;DP=32;FAO=2,30;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=2,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387975,0.0219158;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=41.3888,171.383;QD=56.9347;RBI=0.0389513,0.0228961;REFB=0,0;REVB=-0.00345863,0.00662768;RO=0;SAF=0,10;SAR=2,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00248745,0.00162648;OID=.,.;OPOS=32610704,32610704;OREF=TG,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:32:32:0:0:2,30:2,30:0.0625,0.9375:2,20:0,10:0:0:2,20:0,10:0:0 chr6 32610757 . A G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.613;QD=47.8221;RBI=0.0182118;REFB=0;REVB=-0.0131699;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31498e-05;OID=.;OPOS=32610757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr6 32610769 . A C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.167;QD=46.8481;RBI=0.0244282;REFB=0;REVB=0.00343969;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280255;OID=.;OPOS=32610769;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr6 32627988 . A G 126.5 PASS AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0395742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4828;QD=29.7651;RBI=0.0650235;REFB=-0.064586;REVB=-0.051594;RO=4;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905253;STB=0.550382;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0190827;OID=.;OPOS=32627988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:7:6:1:3:7:6:1:3 chr6 32627991 . C T 127.17 PASS AF=0.764706;AO=14;DP=18;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00178051;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7932;QD=29.9225;RBI=0.02498;REFB=-0.00552962;REVB=-0.0249165;RO=3;SAF=7;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530824;STB=0.567464;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00280258;OID=.;OPOS=32627991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:18:17:3:4:14:13:0.764706:7:7:1:2:6:7:1:3 chr6 32628001 . T C 129.62 PASS AF=0.764706;AO=7;DP=18;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.030204;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.561;QD=30.4997;RBI=0.0375797;REFB=-0.0546077;REVB=0.0223596;RO=3;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21311;STB=0.550382;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0117676;OID=.;OPOS=32628001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:18:17:3:4:7:13:0.764706:2:5:1:2:7:6:1:3 chr6 32628057 . CA TT 289.5 PASS AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0306689;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=154.18;QD=46.3204;RBI=0.0306987;REFB=-0.0364444;REVB=-0.00135377;RO=1;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237537;STB=0.524979;STBP=0.649;TYPE=mnp;VARB=0.00381004;OID=.;OPOS=32628057;OREF=CA;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:25:25:1:2:23:23:0.92:19:4:0:1:19:4:0:2 chr6 32628602 . G GC 98.46 PASS AF=0.278481;AO=21;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.143791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.7766;QD=4.98519;RBI=0.231439;REFB=0.0254932;REVB=0.181351;RO=56;SAF=6;SAR=15;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209874;STB=0.593237;STBP=0.358;TYPE=ins;VARB=-0.0489445;OID=.;OPOS=32628603;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.278481:21:79:22:79:57:7:15:25:32:98:56:6:15:25:31 chr6 32628621 . T C 177.12 PASS AF=0.289157;AO=24;DP=83;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.00569555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.283;QD=8.53611;RBI=0.0163408;REFB=-0.00382473;REVB=0.0153161;RO=59;SAF=7;SAR=17;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172961;STB=0.603683;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00637374;OID=.;OPOS=32628621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:59:59:24:24:0.289157:17:7:25:34:17:7:25:34 chr6 32629129 . T C 400.67 PASS AF=0.815789;AO=31;DP=38;FAO=31;FDP=38;FR=.;FRO=7;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0317484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.409;QD=42.1753;RBI=0.0353933;REFB=-0.0227987;REVB=0.0156437;RO=7;SAF=22;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00190714;STB=0.50103;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00374859;OID=.;OPOS=32629129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:38:7:7:31:31:0.815789:9:22:5:2:9:22:5:2 chr6 32629137 . T G 41.66 PASS AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0365713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.65;QD=4.16606;RBI=0.0389528;REFB=-0.019368;REVB=-0.0134113;RO=33;SAF=5;SAR=2;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667542;STB=0.546082;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.064123;OID=.;OPOS=32629137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:2:5:22:11:2:5:22:11 chr6 32629141 . C T 50.84 PASS AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00215869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.118;QD=5.21422;RBI=0.0195934;REFB=-0.0119412;REVB=-0.0194741;RO=31;SAF=6;SAR=2;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14907;STB=0.599734;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00779874;OID=.;OPOS=32629141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:2:6:20:11:2:6:20:11 chr6 32629146 . G A 50.84 PASS AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0373321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7897;QD=5.21416;RBI=0.0463418;REFB=0.00663953;REVB=0.0274568;RO=31;SAF=6;SAR=2;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14907;STB=0.599734;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.0196612;OID=.;OPOS=32629146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:2:6:20:11:2:6:20:11 chr6 32629155 . C A 413.63 PASS AF=0.8;AO=32;DP=40;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0075036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5055;QD=41.3627;RBI=0.0443373;REFB=-0.0206923;REVB=0.0436978;RO=8;SAF=20;SAR=12;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500407;STB=0.52701;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00636326;OID=.;OPOS=32629155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:40:40:8:8:32:32:0.8:12:20:6:2:12:20:6:2 chr6 32629161 . A G 41.82 PASS AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0174488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.283;QD=4.28889;RBI=0.0353942;REFB=0.00172958;REVB=-0.0307944;RO=32;SAF=5;SAR=2;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120488;STB=0.583084;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00713274;OID=.;OPOS=32629161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:2:5:20:12:2:5:20:12 chr6 32629170 . C G 41.27 PASS AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0148271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0433;QD=3.93073;RBI=0.037204;REFB=-0.00755574;REVB=-0.0341218;RO=35;SAF=6;SAR=1;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315123;STB=0.728205;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0305074;OID=.;OPOS=32629170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:1:6:23:12:1:6:23:12 chr6 32629193 . C T 49.74 PASS AF=0.181818;AO=8;DP=44;FAO=8;FDP=44;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0233096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1157;QD=4.52159;RBI=0.0252026;REFB=-0.00662429;REVB=0.00958299;RO=36;SAF=7;SAR=1;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281878;STB=0.699401;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0642045;OID=.;OPOS=32629193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:44:44:36:36:8:8:0.181818:1:7:26:10:1:7:26:10 chr6 32629764 . C T 142.2 PASS AF=0.652174;AO=14;DP=22;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00756116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.042;QD=24.7308;RBI=0.00757754;REFB=-0.0532939;REVB=-0.000497974;RO=8;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0808139;STB=0.532121;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0304665;OID=.;OPOS=32629764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:23:8:8:14:15:0.652174:7:7:3:5:8:7:3:5 chr6 32629802 . A G 298.74 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0214926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.31;QD=23.8988;RBI=0.0249811;REFB=-0.0046791;REVB=-0.0127327;RO=23;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13124;STB=0.573419;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00457269;OID=.;OPOS=32629802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:20:7:9:14:20:7:9:14 chr6 32629809 . C T 271.88 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0220573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.649;QD=19.42;RBI=0.0222254;REFB=-0.012765;REVB=-0.00272792;RO=26;SAF=9;SAR=20;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106383;STB=0.552449;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.013332;OID=.;OPOS=32629809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:27:29:29:0.517857:20:9:11:15:20:9:11:16 chr6 32629847 . A G 945.06 PASS AF=1;AO=57;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.6586;QD=58.1576;RBI=0.0704432;REFB=0;REVB=-0.0597619;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00096412;OID=.;OPOS=32629847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:57:65:1:32:25:0:0:40:25:0:0 chr6 32629859 . A G 981.64 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.403;QD=58.6053;RBI=0.0164509;REFB=0;REVB=0.00460568;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209992;OID=.;OPOS=32629859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:40:26:0:0:40:27:0:0 chr6 32629868 . A G 311.18 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0191578;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.479;QD=19.1498;RBI=0.0217823;REFB=0.0013474;REVB=-0.0103656;RO=32;SAF=15;SAR=18;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432639;STB=0.524065;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.00239712;OID=.;OPOS=32629868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:18:15:13:19:18:15:13:19 chr6 32629891 . C T 237.61 PASS AF=0.405797;AO=27;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00592806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.445;QD=13.7745;RBI=0.00808331;REFB=-0.00638634;REVB=-0.00549528;RO=41;SAF=10;SAR=17;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177606;STB=0.586145;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0234688;OID=.;OPOS=32629891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:41:41:27:28:0.405797:17:10:22:19:17:11:22:19 chr6 32629904 . A G 166.2 PASS AF=0.328358;AO=21;DP=66;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-4.68663e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.654;QD=9.92237;RBI=0.00552592;REFB=-0.0108724;REVB=0.00552573;RO=45;SAF=8;SAR=13;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177029;STB=0.583597;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0215942;OID=.;OPOS=32629904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:45:45:21:22:0.328358:13:8:24:21:13:9:24:21 chr6 32629931 . C G 451.05 PASS AF=0.683333;AO=41;DP=61;FAO=41;FDP=60;FR=.;FRO=19;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0163748;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5393;QD=30.07;RBI=0.0201867;REFB=-0.0444416;REVB=-0.0118055;RO=19;SAF=24;SAR=17;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127186;STB=0.569058;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0203156;OID=.;OPOS=32629931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:19:19:41:41:0.683333:17:24:7:12:17:24:7:12 chr6 32629935 . C G 142.63 PASS AF=0.322034;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.021453;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.262;QD=9.66968;RBI=0.021453;REFB=-0.00291214;REVB=4.74472e-05;RO=40;SAF=7;SAR=12;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235829;STB=0.639286;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0489121;OID=.;OPOS=32629935;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:40:40:19:19:0.322034:12:7:23:17:12:7:23:17 chr6 32629936 . C T 441.58 PASS AF=0.701754;AO=40;DP=57;FAO=40;FDP=57;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0106793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5791;QD=30.9882;RBI=0.0241945;REFB=-0.0135747;REVB=-0.02171;RO=17;SAF=23;SAR=17;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581527;STB=0.53154;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0432048;OID=.;OPOS=32629936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:17:17:40:40:0.701754:17:23:8:9:17:23:8:9 chr6 32629955 . C T 90.68 PASS AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0107291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.662;QD=6.71699;RBI=0.0107299;REFB=0.00610725;REVB=-0.000134282;RO=41;SAF=6;SAR=7;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149736;STB=0.59308;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=-0.0184642;OID=.;OPOS=32629955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:7:6:24:17:7:6:24:17 chr6 32629963 . C T 457.15 PASS AF=0.764706;AO=39;DP=51;FAO=39;FDP=51;FR=.;FRO=12;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00634269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8331;QD=35.8546;RBI=0.0279975;REFB=-0.0390058;REVB=-0.0272696;RO=12;SAF=24;SAR=15;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08934;STB=0.548262;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00746608;OID=.;OPOS=32629963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:51:51:12:12:39:39:0.764706:15:24:5:7:15:24:5:7 chr6 32630028 . G A 332.15 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1214;QD=53.1432;RBI=0.0393947;REFB=0;REVB=0.0145747;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00333608;OID=.;OPOS=32630028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:10:14:0:0:11:14:0:0 chr6 32632587 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00561627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2447;QD=39.2068;RBI=0.0249361;REFB=0;REVB=-0.0242954;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00129665;OID=.;OPOS=32632587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr6 32632598 . A T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.102;QD=39.2057;RBI=0.00912042;REFB=0;REVB=-0.00184109;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128191;OID=.;OPOS=32632598;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0 chr6 32632627 . CG TC 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.000667042;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=204.435;QD=16.3859;RBI=0.0201558;REFB=-0.0173191;REVB=0.0201448;RO=8;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315978;STB=0.518476;STBP=0.988;TYPE=mnp;VARB=0.0137902;OID=.;OPOS=32632627;OREF=CG;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:7:2:2:6:7:2:2:6 chr6 32632637 . TC GA 53.41 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00636336;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=204.113;QD=10.1734;RBI=0.0157656;REFB=-0.0120523;REVB=0.0144244;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302036;STB=0.696919;STBP=0.292;TYPE=mnp;VARB=0.0269821;OID=.;OPOS=32632637;OREF=TC;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:21:21:13:13:6:6:0.285714:5:1:5:8:5:1:5:8 chr6 32632647 . T C 89.13 PASS AF=0.458333;AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.011422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.854;QD=14.8556;RBI=0.013056;REFB=-0.0637041;REVB=0.00632443;RO=13;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227183;STB=0.649179;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0259714;OID=.;OPOS=32632647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:24:13:13:10:11:0.458333:8:2:5:8:9:2:5:8 chr6 32632650 . C T 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0199907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.628;QD=19.1804;RBI=0.0208007;REFB=-0.0265514;REVB=-0.00574833;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181889;STB=0.602692;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0355361;OID=.;OPOS=32632650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:2:9:8:5:2:9 chr6 32632687 . ATC GCT,GTC 363.64 PASS AF=0.296296,0.703704;AO=8,19;DP=27;FAO=8,19;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1,6;FSAR=7,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00352265,0.011443;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=172.411,192.773;QD=53.8726;RBI=0.0233268,0.0189894;REFB=0,0;REVB=0.0230592,0.0151544;RO=0;SAF=1,6;SAR=7,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,-3.851e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0026049,0.00678729;OID=.,.;OPOS=32632687,32632687;OREF=ATC,A;OALT=GCT,G;OMAPALT=GCT,GTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:53:27:27:0:0:8,19:8,19:0.296296,0.703704:7,13:1,6:0:0:7,13:1,6:0:0 chr6 32632694 . C G 233.86 PASS AF=0.724138;AO=20;DP=28;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0179005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5656;QD=32.2568;RBI=0.0257577;REFB=0.0246748;REVB=-0.0185211;RO=8;SAF=8;SAR=12;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826611;STB=0.538971;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.00615756;OID=.;OPOS=32632694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:29:8:8:20:21:0.724138:12:8:2:6:13:8:2:6 chr6 32632700 . T A 249.37 PASS AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0453983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.887;QD=33.2498;RBI=0.0454794;REFB=0.00444057;REVB=0.00271463;RO=8;SAF=9;SAR=13;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081429;STB=0.544546;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.00444247;OID=.;OPOS=32632700;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:13:9:2:6:13:9:2:6 chr6 32632714 . G C 428.14 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.739;QD=57.0851;RBI=0.0131223;REFB=0;REVB=0.0129348;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.82706e-05;OID=.;OPOS=32632714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:19:11:0:0 chr6 32632724 . C T 291.52 PASS AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0186386;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=312.312;QD=33.3165;RBI=0.019807;REFB=-0.022548;REVB=0.00670222;RO=10;SAF=10;SAR=15;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550855;STB=0.530097;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00988042;OID=.;OPOS=32632724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:15:10:3:7:15:10:3:7 chr6 32632744 . C T 262.65 PASS AF=0.69697;AO=24;DP=34;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0206149;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5235;QD=31.8357;RBI=0.0407151;REFB=-0.0308705;REVB=-0.0351104;RO=10;SAF=10;SAR=14;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920859;STB=0.510743;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0203245;OID=.;OPOS=32632744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:34:33:10:10:24:23:0.69697:14:10:4:6:13:10:4:6 chr6 32632745 . G A 61.8 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0103093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.894;QD=7.27016;RBI=0.0104463;REFB=-0.000561809;REVB=-0.00168617;RO=25;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530852;STB=0.53326;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00287068;OID=.;OPOS=32632745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:5:4:10:15:5:4:10:15 chr6 32632770 . A G 52.6 PASS AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00559508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8147;QD=6.7877;RBI=0.019774;REFB=0.023196;REVB=-0.0189659;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253314;STB=0.516089;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.0347837;OID=.;OPOS=32632770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:4:4:11:12:4:4:11:12 chr6 32632781 . AGA CCC,TAA 301.32 PASS AF=0.26087,0.73913;AO=6,17;DP=24;FAO=6,17;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=2,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792929,0.0176802;FXX=0.0416493;HRUN=2,2;LEN=3,2;MLLD=147.3,95.9922;QD=52.4036;RBI=0.00850803,0.0177138;REFB=0,0;REVB=-0.00308428,-0.00109196;RO=0;SAF=4,8;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=-0.00401737,-0.00175277;OID=.,.;OPOS=32632781,32632781;OREF=AGA,AG;OALT=CCC,TA;OMAPALT=CCC,TAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:36:24:23:0:0:6,17:6,17:0.26087,0.73913:2,9:4,8:0:0:2,9:4,8:0:0 chr6 32632820 . C G 85.04 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.000284874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8433;QD=22.6776;RBI=0.0302472;REFB=0.0213637;REVB=0.0302458;RO=5;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00968953;OID=.;OPOS=32632820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:4:6:3:2:4:6:3:2 chr6 32632832 . A T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4799;QD=43.4861;RBI=0.0269268;REFB=0;REVB=0.0121429;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000996117;OID=.;OPOS=32632832;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0 chr6 32634300 . G C 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0204163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9758;QD=21.0145;RBI=0.0221046;REFB=0.00862948;REVB=0.00847278;RO=13;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715741;STB=0.540489;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.00242287;OID=.;OPOS=32634300;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:10:6:6:7:10:6:6:7 chr6 32634302 . A G 332.1 PASS AF=0.964286;AO=14;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0724746;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.249;QD=47.4435;RBI=0.0900997;REFB=-0.136577;REVB=0.0535293;RO=1;SAF=5;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824047;STB=0.521723;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0263132;OID=.;OPOS=32634302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:27:28:1:1:14:27:0.964286:9:5:1:0:16:11:1:0 chr6 32634306 . A T 149.04 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00849693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0242;QD=18.6296;RBI=0.0259751;REFB=-0.00642212;REVB=-0.024546;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0108496;OID=.;OPOS=32634306;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:6:10:10:6:6:10 chr6 32634313 . C G 162.54 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0010768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.732;QD=19.7023;RBI=0.00254578;REFB=-0.0182224;REVB=0.00230684;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326819;STB=0.518497;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.017622;OID=.;OPOS=32634313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:10:7:6:10:10:7:6:10 chr6 32634331 . G A 144.77 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0621184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.709;QD=15.6507;RBI=0.0627098;REFB=0.00224876;REVB=-0.00859235;RO=21;SAF=5;SAR=11;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754966;STB=0.54367;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.000532942;OID=.;OPOS=32634331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:11:5:8:13:11:5:8:13 chr6 32634341 . A G 132.71 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0238198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.247;QD=15.1663;RBI=0.0338569;REFB=-0.0291997;REVB=-0.0240605;RO=20;SAF=4;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988718;STB=0.557524;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0358477;OID=.;OPOS=32634341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:11:4:7:13:11:4:7:13 chr6 32634350 . T C 124.35 PASS AF=0.428571;AO=13;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00948742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9245;QD=14.2109;RBI=0.017134;REFB=-0.0317534;REVB=0.0142676;RO=20;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498891;STB=0.557524;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0267454;OID=.;OPOS=32634350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:20:20:13:15:0.428571:9:4:7:13:11:4:7:13 chr6 32634369 . C A 180.0 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.018919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.87;QD=23.2263;RBI=0.0189805;REFB=0.00160258;REVB=0.00152666;RO=13;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217653;STB=0.512182;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=-0.00570138;OID=.;OPOS=32634369;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:12:6:4:9:12:6:4:9 chr6 32634373 . C T 109.14 PASS AF=0.433333;AO=10;DP=27;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00662737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.623;QD=14.5518;RBI=0.0126827;REFB=-0.0248705;REVB=0.0108134;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737803;STB=0.509077;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0301676;OID=.;OPOS=32634373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:30:17:17:10:13:0.433333:7:3:5:12:9:4:5:12 chr6 32634387 . C T 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.273;QD=57.2012;RBI=0.0313104;REFB=0;REVB=0.0109898;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036222;OID=.;OPOS=32634387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0 chr6 32636040 . T C 207.13 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.706;QD=48.7373;RBI=0.0383037;REFB=0;REVB=0.038154;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574253;OID=.;OPOS=32636040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:6:10:0:0:6:11:0:0 chr6 32636073 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.274;QD=54.5168;RBI=0.0199925;REFB=0;REVB=0.0164026;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199758;OID=.;OPOS=32636073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0 chr6 32636093 . G A 397.18 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175893;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=324.67;QD=56.7399;RBI=0.0265797;REFB=0;REVB=0.0199273;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64579e-05;OID=.;OPOS=32636093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0 chr6 32636364 . G A 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0491188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.051;QD=16.4543;RBI=0.0491728;REFB=-0.0213921;REVB=-0.00230287;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28888;STB=0.666218;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00292886;OID=.;OPOS=32636364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:4:0:2:4:4:0 chr6 32636433 . A G 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00249242;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.609;QD=10.0339;RBI=0.00462156;REFB=-0.0156678;REVB=-0.00389187;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00160124;OID=.;OPOS=32636433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:4:3:2:3:4:3 chr6 32636434 . A G 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00184462;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.186;QD=16.8229;RBI=0.0168064;REFB=0.00769072;REVB=-0.0167049;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206743;STB=0.51216;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=-0.000738238;OID=.;OPOS=32636434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:3:2:3:4:3:2 chr6 32709309 . A G 1249.58 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304094;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.698;QD=61.7074;RBI=0.0317575;REFB=0;REVB=0.00915473;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18938e-05;OID=.;OPOS=32709309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:46:35:0:0:46:35:0:0 chr6 32713030 . T C 3315.63 PASS AF=1;AO=214;DP=216;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198319;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.138;QD=61.9744;RBI=0.0205084;REFB=-0.0221508;REVB=0.0052237;RO=1;SAF=95;SAR=119;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00498856;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65187e-05;OID=.;OPOS=32713030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:216:214:1:0:214:214:1:119:95:1:0:119:95:0:0 chr6 32713771 . T C 33.02 PASS AF=0.0748299;AO=11;DP=147;FAO=11;FDP=147;FR=.;FRO=136;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=-0.071032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9814;QD=0.898478;RBI=0.0735959;REFB=0.00181328;REVB=-0.0192563;RO=136;SAF=7;SAR=4;SRF=80;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553624;STB=0.546788;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.0287574;OID=.;OPOS=32713771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:147:147:136:136:11:11:0.0748299:4:7:80:56:4:7:80:56 chr6 32724258 . C T 731.39 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233541;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.934;QD=63.5991;RBI=0.0235629;REFB=0;REVB=0.00312976;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04958e-05;OID=.;OPOS=32724258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0 chr6 32725062 . T A 742.64 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380435;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.094;QD=57.1264;RBI=0.116509;REFB=0;REVB=0.110123;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319306;OID=.;OPOS=32725062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:23:29:0:0 chr6 32725619 . TG CA 1411.46 PASS AF=0.94898;AO=92;DP=98;FAO=93;FDP=98;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0224054;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=144.146;QD=57.6108;RBI=0.0288882;REFB=-0.0204101;REVB=-0.0182353;RO=5;SAF=38;SAR=54;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00131254;STB=0.500454;STBP=0.991;TYPE=mnp;VARB=0.00207216;OID=.;OPOS=32725619;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:98:98:5:5:92:93:0.94898:54:38:2:3:55:38:2:3 chr6 32725625 . T C 1337.35 PASS AF=0.940594;AO=95;DP=101;FAO=95;FDP=101;FR=.;FRO=6;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0185148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.438;QD=52.9645;RBI=0.0254914;REFB=0.0204576;REVB=0.0175219;RO=6;SAF=39;SAR=56;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103699;STB=0.505479;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00128409;OID=.;OPOS=32725625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:101:101:6:6:95:95:0.940594:56:39:3:3:56:39:3:3 chr6 32726803 . C T 2159.67 PASS AF=0.905325;AO=153;DP=169;FAO=153;FDP=169;FR=.;FRO=16;FSAF=74;FSAR=79;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0144175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.792;QD=51.1165;RBI=0.0319689;REFB=0.0025188;REVB=0.0285333;RO=16;SAF=74;SAR=79;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645734;STB=0.534064;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-4.33613e-05;OID=.;OPOS=32726803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:169:169:16:16:153:153:0.905325:79:74:2:14:79:74:2:14 chr6 32726838 . C T 2759.43 PASS AF=0.994382;AO=177;DP=179;FAO=177;FDP=178;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0384599;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.187;QD=62.0096;RBI=0.0479257;REFB=-0.097193;REVB=0.0285956;RO=1;SAF=77;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473682;STB=0.502487;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000197721;OID=.;OPOS=32726838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:179:178:1:1:177:177:0.994382:100:77:0:1:100:77:0:1 chr6 32729459 . C T 1095.37 PASS AF=0.986667;AO=73;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0401514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.056;QD=58.42;RBI=0.041559;REFB=-0.0616858;REVB=0.0107243;RO=1;SAF=38;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122856;STB=0.506327;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000942917;OID=.;OPOS=32729459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:73:74:0.986667:35:38:1:0:35:39:1:0 chr6 32729642 . G C 1997.02 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00995754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.404;QD=61.923;RBI=0.0297055;REFB=0;REVB=0.0279869;RO=0;SAF=75;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6302e-05;OID=.;OPOS=32729642;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:129:0:0:128:129:1:53:75:0:0:53:76:0:0 chr6 32797809 . C T 288.24 PASS AF=0.444444;AO=31;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.0190939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.519;QD=16.0132;RBI=0.0212008;REFB=-0.00138102;REVB=0.00921395;RO=41;SAF=18;SAR=13;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819088;STB=0.564477;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0022291;OID=.;OPOS=32797809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:40:31:32:0.444444:13:18:27:14:14:18:27:13 chr6 32800412 . C T 1606.85 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.07;QD=60.0692;RBI=0.0680559;REFB=0;REVB=0.056481;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277967;OID=.;OPOS=32800412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:46:61:0:0:46:61:0:0 chr6 32825090 . G A 241.45 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.0472892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9442;QD=12.382;RBI=0.0491213;REFB=-0.0331625;REVB=-0.0132903;RO=48;SAF=11;SAR=18;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263252;STB=0.644443;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0587786;OID=.;OPOS=32825090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:48:49:29:29:0.371795:18:11:30:18:18:11:30:19 chr6 32826233 . A G 297.86 PASS AF=0.44;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.0160178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.19;QD=15.8856;RBI=0.016193;REFB=-0.0127397;REVB=0.00237536;RO=40;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144221;STB=0.518507;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0180253;OID=.;OPOS=32826233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:40:42:33:33:0.44:21:12:14:26:21:12:14:28 chr6 32844922 . G A 151.32 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0549219;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5476;QD=12.3524;RBI=0.0629981;REFB=-0.0221144;REVB=-0.0308602;RO=33;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185236;STB=0.598891;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0265924;OID=.;OPOS=32844922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:33:32:17:17:0.346939:11:6:17:16:11:6:16:16 chr6 32942302 . G A 251.0 PASS AF=0.474576;AO=25;DP=57;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0211436;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.875;QD=17.0172;RBI=0.0250736;REFB=-0.0151499;REVB=-0.0134771;RO=32;SAF=10;SAR=15;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00642615;STB=0.523793;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.016943;OID=.;OPOS=32942302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:32:31:25:28:0.474576:15:10:13:19:15:13:13:18 chr6 32946034 . T C 331.98 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0303766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.814;QD=16.1939;RBI=0.0323476;REFB=-0.0114276;REVB=-0.0111188;RO=46;SAF=12;SAR=24;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399457;STB=0.52251;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0181547;OID=.;OPOS=32946034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:0.439024:24:12:17:29:24:12:17:29 chr6 32948804 . C T 260.89 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0188234;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.725;QD=16.8317;RBI=0.0222811;REFB=-0.024564;REVB=-0.0119216;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445573;STB=0.52507;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.029414;OID=.;OPOS=32948804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:33:33:29:29:0.467742:11:18:19:14:11:18:19:14 chr6 32974934 . G A 684.81 PASS AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0105639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4134;QD=50.7264;RBI=0.0416649;REFB=-0.0281788;REVB=0.0403035;RO=2;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294139;STB=0.523068;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00216626;OID=.;OPOS=32974934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:54:54:2:3:51:51:0.944444:31:20:0:2:31:20:0:3 chr6 32975014 . T C 937.41 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5271;QD=58.5882;RBI=0.0522245;REFB=0;REVB=0.0424787;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450728;OID=.;OPOS=32975014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0 chr6 32975257 . C T 2342.38 PASS AF=1;AO=146;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2298;QD=63.7383;RBI=0.0422542;REFB=0;REVB=0.0356284;RO=0;SAF=67;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98198e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659248;OID=.;OPOS=32975257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:146:147:0:0:146:147:1:79:67:0:0:79:68:0:0 chr6 32975869 . G A 743.19 PASS AF=1;AO=42;DP=51;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110591;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9832;QD=63.2502;RBI=0.185919;REFB=0;REVB=0.149452;RO=0;SAF=7;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00279546;OID=.;OPOS=32975869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:47:0:0:42:47:1:35:7:0:0:33:14:0:0 chr6 33036435 . T G 286.11 PASS AF=1;AO=16;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.7664;QD=49.7585;RBI=0.0341439;REFB=0;REVB=-0.0176821;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139812;OID=.;OPOS=33036435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:16:23:1:0:16:0:0:1:22:0:0 chr6 33036505 . G C 780.78 PASS AF=1;AO=44;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.925;QD=63.7372;RBI=0.122454;REFB=0;REVB=0.121474;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000550107;OID=.;OPOS=33036505;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:44:49:1:18:26:0:0:19:30:0:0 chr6 33036853 . A C 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.001;QD=62.6135;RBI=0.0276225;REFB=0;REVB=0.00953144;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112652;OID=.;OPOS=33036853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr6 33036950 . CA CG,TG 1301.65 PASS AF=0.482759,0.517241;AO=42,45;DP=88;FAO=42,45;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=20,25;FSAR=22,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145593,0.00710148;FXX=0.0113623;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=93.1972,104.864;QD=59.846;RBI=0.0107551,0.0204193;REFB=0,0;REVB=0.0106561,0.0191447;RO=0;SAF=20,25;SAR=22,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.09779e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00907568,-0.00114193;OID=.,.;OPOS=33036951,33036950;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:88:87:0:0:42,45:42,45:0.482759,0.517241:22,20:20,25:0:0:22,20:20,25:0:0 chr6 33036959 . G A 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.586;QD=62.1619;RBI=0.0343003;REFB=0;REVB=0.00515333;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10126e-05;OID=.;OPOS=33036959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0 chr6 33036971 . C T 1084.36 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0826933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.445;QD=58.6142;RBI=0.0842724;REFB=-0.117976;REVB=-0.0162375;RO=1;SAF=36;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129584;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000878207;OID=.;OPOS=33036971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:37:36:1:0:37:36:1:0 chr6 33036977 . G A 343.31 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0123148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.659;QD=18.8117;RBI=0.0175106;REFB=-0.00764708;REVB=0.0124486;RO=36;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750665;STB=0.535149;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00792783;OID=.;OPOS=33036977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:20:16:19:17:20:16:19:18 chr6 33036999 . T C 972.11 PASS AF=0.971429;AO=66;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0364739;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0576;QD=55.5492;RBI=0.0549001;REFB=-0.0891197;REVB=0.0410327;RO=2;SAF=29;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314702;STB=0.51562;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0103718;OID=.;OPOS=33036999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:70:70:2:2:66:68:0.971429:37:29:2:0:37:31:2:0 chr6 33037061 . G C 221.3 PASS AF=0.42623;AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0383332;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4724;QD=14.5114;RBI=0.0413515;REFB=0.00442438;REVB=0.0155084;RO=36;SAF=9;SAR=16;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916214;STB=0.526295;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.010043;OID=.;OPOS=33037061;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:35:25:26:0.42623:16:9:16:20:16:10:15:20 chr6 33037080 . G A 651.33 PASS AF=0.916667;AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=48;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0378591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.01;QD=54.2773;RBI=0.0413583;REFB=-0.194463;REVB=0.0166493;RO=1;SAF=21;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218451;STB=0.501897;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.00174573;OID=.;OPOS=33037080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:48:48:1:4:44:44:0.916667:23:21:1:0:23:21:2:2 chr6 33037419 . G A 1791.47 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00662103;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.364;QD=60.2174;RBI=0.0139195;REFB=-0.0288636;REVB=-0.012244;RO=0;SAF=70;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2502e-08;STB=0.505154;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=4.43265e-05;OID=.;OPOS=33037419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:119:0:1:118:118:0.991597:48:70:0:0:48:70:0:1 chr6 33037424 . T C 1866.4 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297751;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7757;QD=61.6991;RBI=0.0836385;REFB=0;REVB=0.0835855;RO=0;SAF=71;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91843e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398174;OID=.;OPOS=33037424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:50:71:0:0:50:71:0:0 chr6 33037522 . T C 2008.43 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.013;QD=62.2768;RBI=0.0283865;REFB=0;REVB=0.0149248;RO=0;SAF=79;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82004e-05;OID=.;OPOS=33037522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:50:79:0:0:50:79:0:0 chr6 33037557 . C T 600.03 PASS AF=0.561905;AO=53;DP=99;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0238249;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.637;QD=22.8583;RBI=0.024205;REFB=-0.00946486;REVB=0.00427295;RO=45;SAF=30;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290098;STB=0.500678;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.00822656;OID=.;OPOS=33037557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:105:45:46:53:59:0.561905:23:30:27:18:23:36:28:18 chr6 33037560 . G A 614.97 PASS AF=0.566038;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=106;FR=.;FRO=46;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.04744;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.555;QD=23.2064;RBI=0.0481989;REFB=-0.0144361;REVB=-0.00851941;RO=46;SAF=38;SAR=22;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209072;STB=0.511436;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.00339192;OID=.;OPOS=33037560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:46:46:60:60:0.566038:22:38:28:18:22:38:28:18 chr6 33037579 . AT TG 1345.28 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535532;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.916;QD=62.5714;RBI=0.0547823;REFB=0;REVB=0.0115392;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000131142;OID=.;OPOS=33037579;OREF=AT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:36:50:0:0:36:50:0:0 chr6 33037611 . C T 161.52 PASS AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=-0.0151046;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.592;QD=10.5915;RBI=0.0151199;REFB=-0.0069857;REVB=-0.000679058;RO=40;SAF=12;SAR=9;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182947;STB=0.605818;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0130771;OID=.;OPOS=33037611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:40:40:21:21:0.344262:9:12:29:11:9:12:29:11 chr6 33037626 . C G 805.9 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.966;QD=64.4721;RBI=0.0175182;REFB=0;REVB=-0.00219938;RO=0;SAF=34;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68094e-05;OID=.;OPOS=33037626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:15:34:0:0:15:35:0:0 chr6 33037639 . GC AT 103.09 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=5;FWDB=-0.0415721;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=139.276;QD=9.58994;RBI=0.0417607;REFB=-0.0332665;REVB=-0.00396385;RO=30;SAF=9;SAR=4;SRF=25;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214756;STB=0.626562;STBP=0.39;TYPE=mnp;VARB=0.0292773;OID=.;OPOS=33037639;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:4:9:25:5:4:9:25:5 chr6 33048457 . C G 335.75 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0049105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.048;QD=17.2181;RBI=0.0087496;REFB=0.0064122;REVB=-0.00724172;RO=39;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016078;STB=0.50432;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=-0.0177944;OID=.;OPOS=33048457;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:42:36:36:0.461538:16:20:21:18:16:20:23:19 chr6 33048459 . TTT GCA 337.91 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0033978;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=305.967;QD=17.5537;RBI=0.00756222;REFB=-0.00472177;REVB=-0.00675589;RO=41;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00522339;STB=0.502922;STBP=0.969;TYPE=mnp;VARB=0.00652426;OID=.;OPOS=33048459;OREF=TTT;OALT=GCA;OMAPALT=GCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:16:20:23:18:16:20:23:18 chr6 33048466 . GG TT 286.41 PASS AF=0.449275;AO=28;DP=74;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0235784;FXX=0.103883;HRUN=3;LEN=2;MLLD=141.044;QD=16.6037;RBI=0.0391076;REFB=-0.0299116;REVB=-0.0312004;RO=27;SAF=15;SAR=13;SRF=24;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324865;STB=0.580954;STBP=0.267;TYPE=mnp;VARB=0.0255101;OID=.;OPOS=33048466;OREF=GG;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:69:27:38:28:31:0.449275:13:15:24:3:16:15:24:14 chr6 33048538 . T C 506.27 PASS AF=0.594937;AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0169875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.764;QD=25.6336;RBI=0.0186741;REFB=-0.0162517;REVB=-0.00775531;RO=32;SAF=26;SAR=21;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305094;STB=0.516669;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0126142;OID=.;OPOS=33048538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:32:32:47:47:0.594937:21:26:19:13:21:26:19:13 chr6 33048542 . C T 1175.56 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0215307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.842;QD=59.5221;RBI=0.0303245;REFB=0.0147642;REVB=0.0213542;RO=1;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014127;STB=0.507461;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.000397048;OID=.;OPOS=33048542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:33:45:0:1:33:45:0:1 chr6 33048599 . CT AG,AT 767.59 PASS AF=0.64,0.36;AO=32,18;DP=50;FAO=32,18;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=16,9;FSAR=16,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154668,0.040869;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=203.534,103.094;QD=61.4071;RBI=0.0299275,0.0442772;REFB=0,0;REVB=-0.0298876,-0.0170349;RO=0;SAF=16,9;SAR=16,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00795509,0.0207766;OID=.,.;OPOS=33048599,33048599;OREF=CT,C;OALT=AG,A;OMAPALT=AG,AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:50:50:0:0:32,18:32,18:0.64,0.36:16,9:16,9:0:0:16,9:16,9:0:0 chr6 33048602 . C A 146.81 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0142654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4845;QD=11.2931;RBI=0.019137;REFB=-0.0300517;REVB=-0.0127563;RO=34;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.069704;OID=.;OPOS=33048602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:9:9:17:17:9:9:17:17 chr6 33048606 . G C 154.18 PASS AF=0.358491;AO=18;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00119346;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.751;QD=11.6363;RBI=0.00723075;REFB=-0.00849805;REVB=0.00713158;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062033;STB=0.551048;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00567909;OID=.;OPOS=33048606;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:34:34:18:19:0.358491:8:10:17:17:8:11:17:17 chr6 33048628 . A C 127.18 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00244071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.466;QD=11.5616;RBI=0.00684866;REFB=-0.00457813;REVB=-0.00639898;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367416;STB=0.533289;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0131695;OID=.;OPOS=33048628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:29:15:15:0.340909:8:7:14:14:8:7:15:14 chr6 33048640 . A G 220.43 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.056862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4272;QD=24.4924;RBI=0.0985316;REFB=0.0168354;REVB=-0.0804685;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713466;STB=0.503975;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0166591;OID=.;OPOS=33048640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:7:8:11:10:7:8 chr6 33048661 . A G 69.41 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0088995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.813;QD=9.2546;RBI=0.0223853;REFB=-0.0174331;REVB=-0.0205402;RO=20;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164705;STB=0.5998;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.064722;OID=.;OPOS=33048661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:30:30:20:20:10:10:0.333333:4:6:9:11:4:6:9:11 chr6 33048663 . G A 64.59 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0155038;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1233;QD=8.90957;RBI=0.0232406;REFB=0.00336047;REVB=0.0173135;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117753;STB=0.572359;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.0116053;OID=.;OPOS=33048663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:29:29:20:20:9:9:0.310345:4:5:9:11:4:5:9:11 chr6 33052736 . G A 72.91 PASS AF=0.178082;AO=13;DP=73;FAO=13;FDP=73;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0182961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0043;QD=3.9953;RBI=0.0315177;REFB=-0.0185507;REVB=-0.0256636;RO=60;SAF=4;SAR=9;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337604;STB=0.72041;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0323969;OID=.;OPOS=33052736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:73:73:60:60:13:13:0.178082:9:4:35:25:9:4:35:25 chr6 33052743 . T C 98.4 PASS AF=0.213333;AO=16;DP=75;FAO=16;FDP=75;FR=.;FRO=59;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.0112232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.896;QD=5.24777;RBI=0.0113158;REFB=0.00311808;REVB=-0.00144466;RO=59;SAF=4;SAR=12;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404161;STB=0.75465;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.0246094;OID=.;OPOS=33052743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:75:75:59:59:16:16:0.213333:12:4:34:25:12:4:34:25 chr6 33052768 . T C 132.39 PASS AF=0.235294;AO=20;DP=85;FAO=20;FDP=85;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0605532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6781;QD=6.22997;RBI=0.062312;REFB=-0.0141421;REVB=-0.0147001;RO=65;SAF=6;SAR=14;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332521;STB=0.704714;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0436969;OID=.;OPOS=33052768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:65:65:20:20:0.235294:14:6:37:28:14:6:37:28 chr6 33052803 . G A 169.2 PASS AF=0.247423;AO=24;DP=96;FAO=24;FDP=97;FR=.;FRO=73;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.0141313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.929;QD=6.97721;RBI=0.0160615;REFB=-0.00632443;REVB=0.00763401;RO=72;SAF=8;SAR=16;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258569;STB=0.652649;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0143861;OID=.;OPOS=33052803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:72:73:24:24:0.247423:16:8:39:33:16:8:39:34 chr6 33052950 . T C 301.11 PASS AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0234402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.937;QD=14.1699;RBI=0.0288916;REFB=-0.00477954;REVB=-0.0168904;RO=51;SAF=19;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105051;STB=0.50597;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0092706;OID=.;OPOS=33052950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:15:19:29:22:15:19:29:22 chr6 33052958 . C T 326.73 PASS AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0171584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.58;QD=15.0221;RBI=0.0275705;REFB=-0.00188304;REVB=0.0215806;RO=51;SAF=21;SAR=15;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00522624;STB=0.502957;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0040521;OID=.;OPOS=33052958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:51:51:36:36:0.413793:15:21:30:21:15:21:30:21 chr6 33052986 . T C 439.41 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.00908628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.127;QD=19.3148;RBI=0.00924468;REFB=-0.00436617;REVB=-0.00170397;RO=47;SAF=21;SAR=23;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168644;STB=0.593507;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00583075;OID=.;OPOS=33052986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:23:21:31:16:23:21:31:16 chr6 33053682 . G A 262.06 PASS AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0091648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8357;QD=12.3323;RBI=0.0464958;REFB=-0.0207128;REVB=0.0455836;RO=53;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900992;STB=0.545425;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0405916;OID=.;OPOS=33053682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:53:54:31:31:0.364706:15:16:23:30:15:16:24:30 chr6 33053968 . T A 110.16 PASS AF=0.242857;AO=17;DP=70;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0461476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7778;QD=6.29471;RBI=0.0464937;REFB=-0.0126989;REVB=-0.0056622;RO=53;SAF=11;SAR=6;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150126;STB=0.592932;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0418736;OID=.;OPOS=33053968;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:53:53:17:17:0.242857:6:11:28:25:6:11:28:25 chr6 33053971 . T C 111.03 PASS AF=0.242857;AO=17;DP=70;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0030317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.897;QD=6.34477;RBI=0.057603;REFB=-0.000957345;REVB=0.0575232;RO=53;SAF=11;SAR=6;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150126;STB=0.592932;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00224893;OID=.;OPOS=33053971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:53:53:17:17:0.242857:6:11:28:25:6:11:28:25 chr6 33053982 . G C 116.26 PASS AF=0.24;AO=18;DP=75;FAO=18;FDP=75;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.00702364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.093;QD=6.20025;RBI=0.0077332;REFB=-0.00380446;REVB=-0.00323586;RO=55;SAF=11;SAR=7;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126751;STB=0.591825;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0156087;OID=.;OPOS=33053982;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:55:57:18:18:0.24:7:11:28:27:7:11:28:29 chr6 33054046 . T G 76.46 PASS AF=0.177215;AO=10;DP=75;FAO=14;FDP=79;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.0105066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.228;QD=3.8715;RBI=0.0212512;REFB=-0.0034673;REVB=-0.0184723;RO=62;SAF=9;SAR=1;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41179;STB=0.655385;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0150002;OID=.;OPOS=33054046;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:75:79:62:65:10:14:0.177215:1:9:40:22:3:11:41:24 chr6 33054057 . G A 91.42 PASS AF=0.175824;AO=16;DP=92;FAO=16;FDP=91;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0245141;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.708;QD=4.01842;RBI=0.0253534;REFB=-0.00438942;REVB=-0.00646934;RO=74;SAF=11;SAR=5;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193199;STB=0.632922;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.010514;OID=.;OPOS=33054057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:92:91:74:75:16:16:0.175824:5:11:40:34:5:11:40:35 chr6 33138677 . G A 136.04 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-6.43494e-05;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.979;QD=16.0041;RBI=0.0465907;REFB=-0.0212106;REVB=-0.0465907;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208276;STB=0.553119;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0419219;OID=.;OPOS=33138677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:14:19:15:15:0.441176:10:5:8:6:10:5:8:11 chr6 33138955 . G A 754.26 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00705218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.328;QD=56.9256;RBI=0.107816;REFB=0;REVB=0.107586;RO=0;SAF=48;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189992;OID=.;OPOS=33138955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:3:48:0:0:5:48:0:0 chr6 33139328 . C T 414.61 PASS AF=0.458333;AO=42;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=0.0417098;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7746;QD=17.2752;RBI=0.0458826;REFB=-0.0248311;REVB=-0.0191181;RO=50;SAF=19;SAR=23;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237801;STB=0.625649;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0348369;OID=.;OPOS=33139328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:50:52:42:44:0.458333:23:19:35:15:23:21:37:15 chr6 33141161 . A G 549.12 PASS AF=1;AO=30;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351543;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.182;QD=59.3647;RBI=0.0366463;REFB=0;REVB=0.01035;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223649;OID=.;OPOS=33141161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:37:0:0:30:37:1:19:11:0:0:19:18:0:0 chr6 33141475 . C T 397.36 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198165;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.702;QD=56.7663;RBI=0.121403;REFB=0;REVB=0.119775;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543517;OID=.;OPOS=33141475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr6 33141920 . G C 290.39 PASS AF=1;AO=18;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.143;QD=52.7983;RBI=0.0812487;REFB=0;REVB=0.0274587;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541596;OID=.;OPOS=33141920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:18:22:1:14:4:0:0:15:7:0:0 chr6 33144243 . T A 301.5 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0198445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.071;QD=16.75;RBI=0.0198909;REFB=-0.00903581;REVB=-0.00135672;RO=38;SAF=20;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176944;STB=0.592661;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0135836;OID=.;OPOS=33144243;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:39:33:33:0.458333:13:20:16:22:13:20:17:22 chr6 33148754 . G A 324.83 PASS AF=0.373737;AO=36;DP=97;FAO=37;FDP=99;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0351177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.055;QD=13.1243;RBI=0.0493292;REFB=-0.0264884;REVB=-0.0346427;RO=61;SAF=21;SAR=15;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136763;STB=0.562569;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0417487;OID=.;OPOS=33148754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:61:62:36:37:0.373737:15:21:28:33:16:21:29:33 chr6 33152835 . A T 57.03 PASS AF=0.363636;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.00969737;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8795;QD=10.3685;RBI=0.066414;REFB=-0.0445957;REVB=0.0657022;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.541588;STB=0.839307;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0212454;OID=.;OPOS=33152835;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:21:22:13:14:7:8:0.363636:5:2:11:2:6:2:12:2 chr6 33153528 . C T 45.32 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0115283;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3638;QD=6.9729;RBI=0.0115562;REFB=-0.00255808;REVB=-0.0008024;RO=17;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523944;STB=0.836197;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0391316;OID=.;OPOS=33153528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:25:26:17:19:7:7:0.269231:1:6:7:10:1:6:8:11 chr6 33163451 . G A 1099.26 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.453;QD=60.2332;RBI=0.0501647;REFB=0;REVB=0.0482287;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6869e-05;OID=.;OPOS=33163451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:39:32:0:0:41:32:0:0 chr6 33176958 . C T 550.88 PASS AF=0.471545;AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.0281658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8002;QD=17.9148;RBI=0.0331329;REFB=-0.0209683;REVB=-0.0174492;RO=65;SAF=23;SAR=35;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487293;STB=0.527068;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.02216;OID=.;OPOS=33176958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:65:65:58:58:0.471545:35:23:29:36:35:23:29:36 chr6 33219663 . T TC 32.85 PASS AF=0.210526;AO=10;DP=40;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0400208;FXX=0.0499875;HRUN=0;LEN=1;MLLD=76.8882;QD=3.4579;RBI=0.271136;REFB=-0.00916272;REVB=-0.268166;RO=29;SAF=1;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538036;STB=0.819405;STBP=0.082;TYPE=ins;VARB=0.0348519;OID=.;OPOS=33219664;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.210526:10:40:8:38:30:1:7:14:16:32:29:1:9:14:15 chr6 33235755 . G A 1496.94 PASS AF=1;AO=99;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389805;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.784;QD=59.8778;RBI=0.0392293;REFB=0;REVB=0.00441147;RO=0;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.26464e-05;OID=.;OPOS=33235755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:100:0:0:99:100:1:53:46:0:0:53:47:0:0 chr6 33256471 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00521144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.931;QD=45.806;RBI=0.0432431;REFB=0;REVB=0.042928;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251629;OID=.;OPOS=33256471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr6 33261238 . TC CT,T 31.47 PASS AF=0.0731707,0.097561;AO=6,13;DP=85;FAO=6,8;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=0,3;FSAR=6,5;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0339952,0.068929;FXX=0.03529;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=27.3835,8.8198;QD=1.53501;RBI=0.0483439,0.0704456;REFB=-0.0623482,-0.10931;REVB=0.0343723,-0.0145387;RO=56;SAF=0,6;SAR=6,7;SRF=31;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0.555556;SSSB=-0.623629,-0.114282;STB=0.998248,0.624688;STBP=0.006,0.519;TYPE=mnp,del;VARB=0.116801,0.14208;OID=.,.;OPOS=33261238,33261239;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:16:85:82:56:68:6,13:6,8:0.0731707,0.097561:6,7:0,6:31:25:6,5:0,3:35:33 chr6 33272855 . G C 167.5 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0196387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1564;QD=15.5812;RBI=0.0527839;REFB=-0.000519614;REVB=0.0489945;RO=25;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129868;STB=0.574388;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00324328;OID=.;OPOS=33272855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:10:8:8:17:10:8:8:17 chr6 33333446 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.357;QD=46.848;RBI=0.0270665;REFB=0;REVB=0.0227116;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305405;OID=.;OPOS=33333446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr6 33333916 . G T 306.67 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.495;QD=53.3347;RBI=0.0146;REFB=0;REVB=-0.00787603;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09444e-05;OID=.;OPOS=33333916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:11:10:0:0:11:12:0:0 chr6 33373222 . T A 476.5 PASS AF=0.417323;AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=127;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0269085;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.106;QD=15.0078;RBI=0.0486569;REFB=-0.0205604;REVB=0.0405392;RO=73;SAF=22;SAR=31;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815434;STB=0.542203;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0294714;OID=.;OPOS=33373222;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:73:74:53:53:0.417323:31:22:36:37:31:22:36:38 chr6 33382288 . G A 1067.43 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0926849;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9428;QD=59.3019;RBI=0.0927929;REFB=0;REVB=0.0044764;RO=0;SAF=20;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184013;OID=.;OPOS=33382288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:72:0:0:66:72:1:46:20:0:0:47:25:0:0 chr6 33408542 . G A 206.95 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00868502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.788;QD=17.2461;RBI=0.0535204;REFB=0.0141194;REVB=0.052811;RO=27;SAF=5;SAR=16;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028195;STB=0.516113;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=-0.00931823;OID=.;OPOS=33408542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:16:5:7:20:16:5:7:20 chr6 33422976 . T G 501.64 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9415;QD=59.0169;RBI=0.104207;REFB=0;REVB=0.100833;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173513;OID=.;OPOS=33422976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0 chr6 33541507 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.362;QD=52.6132;RBI=0.071184;REFB=0;REVB=0.0147176;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181366;OID=.;OPOS=33541507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr6 33560896 . A G 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.019;QD=40.7595;RBI=0.0372582;REFB=0;REVB=0.0367444;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000625574;OID=.;OPOS=33560896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr6 33636907 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.109;QD=45.8057;RBI=0.0669078;REFB=0;REVB=0.000717329;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141839;OID=.;OPOS=33636907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr6 33638180 . C T 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.458;QD=59.6789;RBI=0.0614201;REFB=0;REVB=0.0349759;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183329;OID=.;OPOS=33638180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0 chr6 33641379 . T C 1018.02 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215865;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.752;QD=58.1725;RBI=0.0222709;REFB=-0.139991;REVB=-0.00547845;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129508;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00165547;OID=.;OPOS=33641379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:33:36:1:0:33:36:1:0 chr6 33648228 . C T 1400.82 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0136562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=339.573;QD=61.5746;RBI=0.0354706;REFB=-0.149238;REVB=0.0327364;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.505617;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000138907;OID=.;OPOS=33648228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:0:1:90:90:0.989011:46:44:0:0:46:44:1:0 chr6 33652425 . G A 119.53 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0156461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.491;QD=13.6608;RBI=0.0294797;REFB=-0.0129774;REVB=0.0249851;RO=21;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258549;STB=0.651947;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0238833;OID=.;OPOS=33652425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:4:10:10:11:4:10:10:11 chr6 33653448 . C T 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.837;QD=63.8713;RBI=0.0351979;REFB=0;REVB=0.0348589;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45905e-05;OID=.;OPOS=33653448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0 chr6 33659472 . C G 907.64 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00155667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6784;QD=57.6276;RBI=0.00306594;REFB=0;REVB=-0.00264135;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3064e-05;OID=.;OPOS=33659472;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:63:0:0:59:63:1:26:33:0:0:29:34:0:0 chr6 33690796 . CA TG 771.47 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00176522;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=2;MLLD=189.265;QD=57.1461;RBI=0.034788;REFB=0;REVB=0.0347432;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.60399e-05;OID=.;OPOS=33690796;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr6 33739960 . A G 940.81 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1902;QD=57.0187;RBI=0.013429;REFB=-0.0500734;REVB=0.00475677;RO=1;SAF=38;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122705;STB=0.506491;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00941311;OID=.;OPOS=33739960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:27:38:1:0:27:38:1:0 chr6 33740025 . C T 340.71 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0759389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2747;QD=54.513;RBI=0.118557;REFB=0;REVB=0.0910444;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00460417;OID=.;OPOS=33740025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:24:1:0:0:24:1:0:0 chr6 33768897 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.345;QD=61.3364;RBI=0.0249145;REFB=0;REVB=0.0245892;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61661e-05;OID=.;OPOS=33768897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr6 33990447 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.989;QD=51.9166;RBI=0.0645491;REFB=0;REVB=0.0533282;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526143;OID=.;OPOS=33990447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr6 34003685 . T C 220.4 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00922262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.837;QD=16.0288;RBI=0.0188037;REFB=-0.0203445;REVB=-0.0163867;RO=30;SAF=13;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192871;STB=0.510908;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0429506;OID=.;OPOS=34003685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:12:13:15:15:12:13:15:15 chr6 34008006 . A G 188.7 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00677435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.599;QD=14.2415;RBI=0.0124485;REFB=-0.0105271;REVB=-0.0104438;RO=31;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494202;STB=0.528276;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0156243;OID=.;OPOS=34008006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:11:11:14:17:11:11:14:17 chr6 34212743 . A G 419.18 PASS AF=1;AO=16;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7456;QD=55.891;RBI=0.0269459;REFB=0;REVB=-0.0269459;RO=0;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00020998;OID=.;OPOS=34212743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:16:30:1:16:0:0:0:30:0:0:0 chr6 34213296 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.244;QD=55.6557;RBI=0.00918803;REFB=0;REVB=0.00912292;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07571e-05;OID=.;OPOS=34213296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr6 34213868 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.092;QD=40.7627;RBI=0.0492905;REFB=0;REVB=0.0150857;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522496;OID=.;OPOS=34213868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr6 34214322 . C G 696.82 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00916536;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.94;QD=52.5903;RBI=0.0107848;REFB=0.0754313;REVB=0.00568395;RO=2;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447795;STB=0.5238;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.000474478;OID=.;OPOS=34214322;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:20:31:0:2:20:31:0:2 chr6 34215228 . G A 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0267204;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.646;QD=18.7441;RBI=0.0267204;REFB=-0.0216843;REVB=0;RO=4;SAF=7;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0188107;OID=.;OPOS=34215228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:0:7:4:0:0:7:4:0 chr6 34502687 . T C 1536.21 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.647;QD=63.3487;RBI=0.0289513;REFB=0;REVB=0.0288108;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57763e-05;OID=.;OPOS=34502687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:97:0:0:94:97:1:52:42:0:0:55:42:0:0 chr6 34557374 . A G 313.33 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0223723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.437;QD=50.1332;RBI=0.0496787;REFB=-0.000970065;REVB=-0.044356;RO=1;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370602;STB=0.519983;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-9.78421e-05;OID=.;OPOS=34557374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:12:12:0:1:12:12:0:1 chr6 34725655 . G GTCA 30.22 PASS AF=0.147059;AO=4;DP=38;FAO=5;FDP=34;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0297833;FXX=0.105235;HRUN=1;LEN=3;MLLD=239.994;QD=3.55488;RBI=0.0372671;REFB=-0.00428848;REVB=-0.0224007;RO=29;SAF=1;SAR=3;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269021;STB=0.758395;STBP=0.288;TYPE=ins;VARB=0.0452381;OID=.;OPOS=34725656;OREF=-;OALT=TCA;OMAPALT=GTCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.147059:4:38:5:34:29:1:4:14:15:30:29:1:3:14:15 chr6 34725658 . G T 68.82 PASS AF=0.290323;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0600672;FXX=0.162118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.131;QD=8.87945;RBI=0.0677357;REFB=-0.0366445;REVB=-0.0313059;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269229;STB=0.68807;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0504967;OID=.;OPOS=34725658;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:36:31:21:22:9:9:0.290323:7:2:9:12:7:2:10:12 chr6 34760018 . C T 225.14 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0568393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.247;QD=27.2891;RBI=0.0857761;REFB=-0.0560927;REVB=-0.0642404;RO=11;SAF=14;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819794;STB=0.565153;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0589927;OID=.;OPOS=34760018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:11:12:21:21:0.636364:7:14:6:5:7:14:6:6 chr6 34803947 . C T 223.4 PASS AF=0.625;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.000195869;FXX=0.0302939;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.757;QD=27.9248;RBI=0.0158622;REFB=-0.0365078;REVB=0.015861;RO=7;SAF=15;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180709;STB=0.562434;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0142062;OID=.;OPOS=34803947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:33:32:7:10:20:20:0.625:5:15:3:4:5:15:6:4 chr6 34824107 . A C 365.68 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0362017;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.708;QD=21.199;RBI=0.0383914;REFB=-0.0448969;REVB=0.0127802;RO=31;SAF=11;SAR=26;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00690847;STB=0.508375;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0374765;OID=.;OPOS=34824107;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:31:32:37:37:0.536232:26:11:9:22:26:11:10:22 chr6 34824636 . A G 100.67 PASS AF=0.371429;AO=12;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00822549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.269;QD=11.5057;RBI=0.0197071;REFB=-0.00547047;REVB=0.0179084;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174446;STB=0.61951;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00892264;OID=.;OPOS=34824636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:22:22:12:13:0.371429:10:2:6:16:11:2:6:16 chr6 34831866 . G A 532.07 PASS AF=0.576471;AO=49;DP=87;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.00597739;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.145;QD=25.0384;RBI=0.00641377;REFB=-0.0195468;REVB=-0.00232535;RO=36;SAF=23;SAR=26;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150713;STB=0.582246;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0161481;OID=.;OPOS=34831866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:36:36:49:49:0.576471:26:23:10:26:26:23:10:26 chr6 34840515 . C T 135.77 PASS AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00922186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.636;QD=27.154;RBI=0.0224043;REFB=-0.0120216;REVB=0.0204184;RO=6;SAF=12;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176469;STB=0.599839;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00881616;OID=.;OPOS=34840515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:2:12:4:2:2:12:4:2 chr6 34977663 . C A 31.61 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0631926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.045;QD=15.8048;RBI=0.117967;REFB=-0.0326047;REVB=0.0996133;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361596;STB=0.713517;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0151096;OID=.;OPOS=34977663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:0:3:2:3:0:3 chr6 35027927 . T C 1661.31 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00653097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.056;QD=59.3325;RBI=0.015073;REFB=-0.118057;REVB=-0.0135846;RO=0;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41849e-08;STB=0.504761;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-7.8468e-05;OID=.;OPOS=35027927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:0:1:111:111:0.991071:52:59:0:0:52:59:0:1 chr6 35050506 . G A 745.58 PASS AF=1;AO=42;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310614;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8883;QD=56.2703;RBI=0.0341668;REFB=0;REVB=0.0142324;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000776153;OID=.;OPOS=35050506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:42:53:1:25:17:0:0:28:25:0:0 chr6 35203203 . T G 650.0 PASS AF=0.979592;AO=43;DP=51;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00776324;FXX=0.039208;HRUN=6;LEN=1;MLLD=184.35;QD=53.0613;RBI=0.00834043;REFB=0.00445282;REVB=0.00304875;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000573206;OID=.;OPOS=35203203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:51:49:0:1:43:48:0.979592:20:23:0:0:23:25:0:1 chr6 35260503 . C T 568.39 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.038;QD=59.8309;RBI=0.0539418;REFB=0;REVB=0.00855759;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367736;OID=.;OPOS=35260503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:23:14:0:0:23:15:0:0 chr6 35260530 . C T 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00048792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0933;QD=59.4345;RBI=0.0472717;REFB=0;REVB=0.0472692;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000875375;OID=.;OPOS=35260530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0 chr6 35263555 . A G 668.81 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00980378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5217;QD=62.2152;RBI=0.0182599;REFB=0;REVB=0.0154049;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36128e-05;OID=.;OPOS=35263555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr6 35285720 . A C 340.49 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4718;QD=54.4787;RBI=0.0399177;REFB=0;REVB=0.000348878;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000907866;OID=.;OPOS=35285720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr6 35391787 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.633;QD=59.4355;RBI=0.0368932;REFB=0;REVB=0.0213636;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131248;OID=.;OPOS=35391787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr6 35395010 . C T 1313.0 PASS AF=0.90566;AO=96;DP=106;FAO=96;FDP=106;FR=.;FRO=10;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0419798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.18;QD=49.5472;RBI=0.0496669;REFB=-0.172881;REVB=0.0265424;RO=8;SAF=48;SAR=48;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545548;STB=0.537728;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00194001;OID=.;OPOS=35395010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:106:106:8:10:96:96:0.90566:48:48:1:7:48:48:1:9 chr6 35395795 . G C 722.82 PASS AF=1;AO=41;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441222;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.29;QD=62.8539;RBI=0.00447872;REFB=0;REVB=0.000768896;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171317;OID=.;OPOS=35395795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:41:46:1:17:24:0:0:18:28:0:0 chr6 35423662 . A C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=362.479;QD=54.5176;RBI=0.0335773;REFB=0;REVB=0.00496979;RO=0;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34264e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97265e-05;OID=.;OPOS=35423662;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:23:2:0:0:23:2:0:0 chr6 35441516 . CAAAAAA ACAAAAA,CAAAAA,CAAAAAT 711.23 PASS AF=0,0.960938,0.0390625;AO=7,75,8;DP=129;FAO=0,123,5;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=0,52,5;FSAR=0,71,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02403,0.0211739,-0.0803859;FXX=0.022899;HRUN=1,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=11.7351,7.7604,148.875;QD=22.2259;RBI=0.0877928,0.0722935,0.0826843;REFB=0.0393088,0.0318758,-0.00372931;REVB=-0.0844401,0.0691232,-0.0193598;RO=24;SAF=1,30,8;SAR=6,45,0;SRF=11;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.430155,-0.0273426,0.750752;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.0158275,0.129866;OID=.,.,.;OPOS=35441516,35441517,35441522;OREF=CA,A,A;OALT=AC,-,T;OMAPALT=ACAAAAA,CAAAAA,CAAAAAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:11:129:128:24:0:7,75,8:0,123,5:0,0.960938,0.0390625:6,45,0:1,30,8:11:13:0,71,0:0,52,5:0:0 chr6 35477025 . C G 365.07 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.279;QD=52.1522;RBI=0.044087;REFB=-0.00901351;REVB=0.0354416;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.533308;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00158627;OID=.;OPOS=35477025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:20:7:0:0:20:7:1:0 chr6 35479574 . G C 74.61 PASS AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.598;QD=37.307;RBI=0.0566282;REFB=0;REVB=0.0525321;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394183;OID=.;OPOS=35479574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:1:5:2:0:0:6:2:0:0 chr6 35705892 . T C 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00534165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.933;QD=56.1897;RBI=0.0056385;REFB=0;REVB=0.00180541;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05227e-05;OID=.;OPOS=35705892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr6 35745655 . C T 206.06 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0479389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5021;QD=16.8209;RBI=0.0491578;REFB=0.00555303;REVB=-0.0108789;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073897;STB=0.542129;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.00710835;OID=.;OPOS=35745655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:10:18:12:9:10:18 chr6 35748931 . T C 363.07 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00536262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2797;QD=21.0477;RBI=0.0375781;REFB=-0.0190207;REVB=-0.0371935;RO=32;SAF=13;SAR=24;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495906;STB=0.527457;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0301172;OID=.;OPOS=35748931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:24:13:13:19:24:13:13:19 chr6 35755658 . A G 370.46 PASS AF=0.666667;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.000600197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.951;QD=29.0555;RBI=0.0167816;REFB=-0.00381347;REVB=-0.0167709;RO=17;SAF=16;SAR=18;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361433;STB=0.51971;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00218825;OID=.;OPOS=35755658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:17:17:34:34:0.666667:18:16:7:10:18:16:7:10 chr6 35765001 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0281576;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=117.607;QD=16.386;RBI=0.0366609;REFB=0.00305115;REVB=-0.023477;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193732;STB=0.65587;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00503489;OID=.;OPOS=35765001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:7:8:9:9:0.529412:7:2:3:4:7:2:4:4 chr6 35923246 . T C 360.75 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00637874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.284;QD=17.5975;RBI=0.0147314;REFB=0.00371319;REVB=0.0132788;RO=43;SAF=29;SAR=9;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252678;STB=0.650139;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.00643734;OID=.;OPOS=35923246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:44:38:38:0.463415:9:29:23:20:9:29:23:21 chr6 36198577 . G C 184.86 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00402893;FXX=0.0724533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.15;QD=11.5534;RBI=0.0494052;REFB=-0.0136913;REVB=-0.0492407;RO=40;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133004;STB=0.583712;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0176183;OID=.;OPOS=36198577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:64:40:41:23:23:0.359375:11:12:16:24:11:12:16:25 chr6 36260858 . C T 252.12 PASS AF=0.519231;AO=25;DP=50;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0189513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.163;QD=19.3939;RBI=0.0493247;REFB=-0.0100356;REVB=0.0455387;RO=25;SAF=10;SAR=15;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143548;STB=0.592953;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0173815;OID=.;OPOS=36260858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:25:25:25:27:0.519231:15:10:14:11:17:10:14:11 chr6 36275458 . T C 740.39 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.140253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.462;QD=56.9528;RBI=0.14606;REFB=0;REVB=-0.0407724;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00223393;OID=.;OPOS=36275458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0 chr6 36287312 . G C 211.73 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0122875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.528;QD=19.6958;RBI=0.0222272;REFB=-0.025292;REVB=0.018522;RO=22;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268452;STB=0.651275;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.04527;OID=.;OPOS=36287312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:13:8:15:7:13:8:15:7 chr6 36393816 . A G 1587.8 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00856874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.43;QD=64.1537;RBI=0.0208514;REFB=0;REVB=0.0190094;RO=0;SAF=41;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86459e-05;OID=.;OPOS=36393816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:58:41:0:0:58:41:0:0 chr6 36418781 . T TG 97.8 PASS AF=0.576923;AO=13;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0034979;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.0811;QD=15.046;RBI=0.00723761;REFB=0.0154921;REVB=0.00633622;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135944;STB=0.505148;STBP=0.957;TYPE=ins;VARB=-0.0119273;OID=.;OPOS=36418782;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.576923:13:27:15:26:11:7:8:5:6:68:13:5:8:7:6 chr6 36446975 . G C 207.3 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0174709;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1617;QD=12.956;RBI=0.0202325;REFB=-0.0178922;REVB=-0.010204;RO=38;SAF=15;SAR=10;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134041;STB=0.569564;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0247488;OID=.;OPOS=36446975;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:38:39:25:25:0.390625:10:15:18:20:10:15:19:20 chr6 36455838 . C T 75.14 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0112724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.491;QD=11.1312;RBI=0.0123452;REFB=-0.0102436;REVB=-0.0050336;RO=16;SAF=8;SAR=2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230172;STB=0.666296;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0153814;OID=.;OPOS=36455838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:2:8:10:6:2:8:10:7 chr6 36490133 . G A 173.1 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00127435;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=322.341;QD=18.7137;RBI=0.00638366;REFB=-0.00909622;REVB=0.00625517;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194029;STB=0.595134;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0088562;OID=.;OPOS=36490133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:19:18:18:0.486486:8:10:6:12:8:10:7:12 chr6 36651971 . C A 251.64 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0270094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.523;QD=20.5417;RBI=0.029881;REFB=-0.0217129;REVB=0.0127815;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200499;STB=0.612156;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0305818;OID=.;OPOS=36651971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:12:12:18:7:12:12:18:7 chr6 36653597 . C T 206.7 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00168845;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.416;QD=14.7644;RBI=0.0194258;REFB=-0.00356061;REVB=0.0193523;RO=32;SAF=8;SAR=16;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292548;STB=0.666528;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0088206;OID=.;OPOS=36653597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:32:32:24:24:0.428571:16:8:20:12:16:8:20:12 chr6 36713263 . A G 2696.17 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00133508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5249;QD=62.3392;RBI=0.00750033;REFB=0;REVB=-0.00738055;RO=0;SAF=84;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69338e-05;OID=.;OPOS=36713263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:173:0:0:173:173:1:89:84:0:0:89:84:0:0 chr6 36766292 . C G,T 922.96 PASS AF=0.046875,0.953125;AO=3,61;DP=65;FAO=3,61;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=3,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0695739,0.0577315;FXX=0.0153822;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=24.7752,115.989;QD=57.6852;RBI=0.0746684,0.0612631;REFB=0,0;REVB=-0.0271078,0.0204996;RO=0;SAF=0,32;SAR=3,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.11614,-0.000590878;OID=.,.;OPOS=36766292,36766292;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:65:64:0:0:3,61:3,61:0.046875,0.953125:3,29:0,32:0:0:3,29:0,32:0:0 chr6 36882353 . A G 263.34 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0219003;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.238;QD=15.0481;RBI=0.0634723;REFB=-0.00100709;REVB=-0.0595744;RO=41;SAF=16;SAR=14;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534726;STB=0.538436;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.000200166;OID=.;OPOS=36882353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:41:40:30:30:0.428571:14:16:24:17:14:16:24:16 chr6 36895835 . C T 358.26 PASS AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00949511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.995;QD=14.6228;RBI=0.010646;REFB=-0.0088258;REVB=0.00481454;RO=54;SAF=20;SAR=19;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131885;STB=0.502616;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0131967;OID=.;OPOS=36895835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:59:39:39:0.397959:19:20:27:27:19:20:30:29 chr6 36922684 . A C 485.57 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=0.00605794;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6247;QD=21.1115;RBI=0.0427992;REFB=0.0217257;REVB=0.0423683;RO=45;SAF=22;SAR=25;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18205;STB=0.600148;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.0191544;OID=.;OPOS=36922684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:47:47:0.51087:25:22:12:33:25:22:12:33 chr6 36931162 . A G 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00959482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.067;QD=16.4168;RBI=0.0127573;REFB=-0.0117377;REVB=-0.00840761;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09589;STB=0.555473;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0117648;OID=.;OPOS=36931162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:10:4:6:10:10:4:6:10 chr6 36976637 . G C 379.31 PASS AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0225665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.602;QD=16.6728;RBI=0.0261006;REFB=-0.015615;REVB=0.0131145;RO=51;SAF=18;SAR=22;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188139;STB=0.510562;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0247035;OID=.;OPOS=36976637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:22:18:22:29:22:18:22:29 chr6 36978834 . A G 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.000500628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.51;QD=11.4396;RBI=0.0336643;REFB=-0.0151816;REVB=-0.0336606;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167732;STB=0.576753;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0188194;OID=.;OPOS=36978834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:13:14:9:9:0.391304:4:5:5:8:4:5:6:8 chr6 36995222 . G A 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0121508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.247;QD=13.9955;RBI=0.0218241;REFB=-0.00854505;REVB=-0.0181287;RO=41;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705123;STB=0.532142;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0092351;OID=.;OPOS=36995222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:42:29:29:0.408451:15:14:17:24:15:14:18:24 chr6 37013127 . G A 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0149936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.572;QD=11.257;RBI=0.0149936;REFB=-0.00752454;REVB=9.94178e-06;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284261;STB=0.670319;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0147568;OID=.;OPOS=37013127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:5:3:8:4:5:3:8:4 chr6 37180237 . G A 747.07 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2574;QD=63.5803;RBI=0.0224438;REFB=0;REVB=0.01714;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64042e-05;OID=.;OPOS=37180237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr6 37180355 . G A 851.78 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.813;QD=57.7481;RBI=0.0378014;REFB=0;REVB=-0.00580024;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7659e-05;OID=.;OPOS=37180355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:31:26:0:0:31:28:0:0 chr6 37180523 . A G 1498.16 PASS AF=0.97;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0358631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4497;QD=59.9263;RBI=0.037035;REFB=-0.108286;REVB=-0.0092427;RO=1;SAF=45;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903379;STB=0.506108;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00310514;OID=.;OPOS=37180523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:100:100:1:3:97:97:0.97:52:45:0:1:52:45:2:1 chr6 37250112 . A G 208.15 PASS AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0335882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.548;QD=41.63;RBI=0.0430955;REFB=-0.132537;REVB=0.027001;RO=2;SAF=5;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151898;STB=0.583236;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00332569;OID=.;OPOS=37250112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:13:5:2:0:13:5:2:0 chr6 37252210 . C T 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.488;QD=60.5472;RBI=0.0258969;REFB=0;REVB=0.0254581;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31157e-05;OID=.;OPOS=37252210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0 chr6 37288036 . A G 810.09 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143656;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.18;QD=56.8483;RBI=0.0333753;REFB=0;REVB=0.0301254;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52168e-05;OID=.;OPOS=37288036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:37:18:0:0:39:18:0:0 chr6 37349033 . G A 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.781;QD=62.614;RBI=0.0121769;REFB=0;REVB=-0.00615555;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.68269e-05;OID=.;OPOS=37349033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:38:50:0:0:38:50:0:0 chr6 37450914 . T C 335.68 PASS AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00414317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.706;QD=27.9737;RBI=0.0132455;REFB=-0.00176761;REVB=0.0125808;RO=19;SAF=19;SAR=10;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232716;STB=0.512812;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00106418;OID=.;OPOS=37450914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:10:19:13:6:10:19:13:6 chr6 37603102 . TG CA,CG 540.52 PASS AF=0.447368,0.5;AO=17,19;DP=38;FAO=17,19;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9,11;FSAR=8,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554748,0.0643813;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=128.039,51.3085;QD=56.8973;RBI=0.066594,0.0730762;REFB=0,0;REVB=0.0368417,0.0345713;RO=0;SAF=9,11;SAR=8,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.126e-08,-3.41338e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.032937,0.0114289;OID=.,.;OPOS=37603102,37603102;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:38:38:0:0:17,19:17,19:0.447368,0.5:8,8:9,11:0:0:8,8:9,11:0:0 chr6 37623566 . C T 619.8 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0417984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.538;QD=59.0284;RBI=0.0435537;REFB=-0.141297;REVB=0.0122401;RO=1;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323316;STB=0.517233;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00204487;OID=.;OPOS=37623566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:14:27:0:1:14:27:0:1 chr6 37800789 . A C 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00172166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.307;QD=18.1752;RBI=0.00478644;REFB=-0.00655883;REVB=0.00446608;RO=32;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422491;STB=0.523599;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00531496;OID=.;OPOS=37800789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:16:15:14:18:16:15:14:18 chr6 38110010 . G A 863.45 PASS AF=0.451777;AO=89;DP=197;FAO=89;FDP=197;FR=.;FRO=108;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=48;FWDB=0.00183657;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.38;QD=17.5319;RBI=0.00562435;REFB=-0.0189914;REVB=0.00531605;RO=108;SAF=48;SAR=41;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161595;STB=0.508963;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0244516;OID=.;OPOS=38110010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:108:108:89:89:0.451777:41:48:60:48:41:48:60:48 chr6 38121211 . A G 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00966172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.773;QD=14.7347;RBI=0.0123698;REFB=-0.019451;REVB=-0.00772423;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13914;STB=0.578889;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.02971;OID=.;OPOS=38121211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:12:15:15:21:12:15:15:21 chr6 38650628 . T G 235.0 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0359916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.275;QD=15.4096;RBI=0.0362684;REFB=-0.00774689;REVB=-0.00447241;RO=34;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471589;STB=0.526679;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00862509;OID=.;OPOS=38650628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:13:14:16:18:13:14:16:18 chr6 38670837 . G A 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6351;QD=61.213;RBI=0.048869;REFB=0;REVB=0.0382125;RO=0;SAF=20;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553775;OID=.;OPOS=38670837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:59:20:0:0:59:20:0:0 chr6 38750888 . A G 252.57 PASS AF=0.375;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0044833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.013;QD=12.6284;RBI=0.00454555;REFB=-0.00213492;REVB=-0.000749703;RO=50;SAF=9;SAR=21;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310345;STB=0.67845;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00268403;OID=.;OPOS=38750888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:50:50:30:30:0.375:21:9:29:21:21:9:29:21 chr6 38773293 . G A 371.49 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0157739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5345;QD=22.861;RBI=0.0182864;REFB=0.00529137;REVB=-0.0092508;RO=28;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533769;STB=0.529396;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=-0.00272833;OID=.;OPOS=38773293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:16:21:14:14:16:21:14:14 chr6 38781866 . C G 476.24 PASS AF=0.528736;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0215298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1068;QD=21.8961;RBI=0.0234636;REFB=0.0150657;REVB=-0.00932786;RO=41;SAF=23;SAR=23;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729531;STB=0.540213;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.0270659;OID=.;OPOS=38781866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:41:46:46:0.528736:23:23:24:17:23:23:24:17 chr6 38800164 . G A 355.02 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0299052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8059;QD=16.3228;RBI=0.0402313;REFB=0.0125356;REVB=0.0269117;RO=48;SAF=14;SAR=24;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234091;STB=0.63684;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0139464;OID=.;OPOS=38800164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:24:14:29:19:24:14:30:19 chr6 38825329 . C T 275.98 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0250854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5856;QD=15.77;RBI=0.0479859;REFB=-0.0301831;REVB=-0.0409068;RO=38;SAF=18;SAR=13;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230029;STB=0.63521;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0213852;OID=.;OPOS=38825329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:38:39:31:31:0.442857:13:18:13:25:13:18:13:26 chr6 38841101 . G A 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0114478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.237;QD=15.1604;RBI=0.0114779;REFB=-0.0104681;REVB=0.000831216;RO=22;SAF=13;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406864;STB=0.738308;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0161914;OID=.;OPOS=38841101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:3:13:10:12:3:13:10:12 chr6 38843426 . C T 688.87 PASS AF=0.415301;AO=76;DP=183;FAO=76;FDP=183;FR=.;FRO=107;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=55;FWDB=0.00190379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5777;QD=15.0572;RBI=0.0528548;REFB=-0.00682351;REVB=-0.0528205;RO=107;SAF=31;SAR=45;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828573;STB=0.54644;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0100371;OID=.;OPOS=38843426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:107:107:76:76:0.415301:45:31:52:55:45:31:52:55 chr6 38851669 . C T 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0157298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.677;QD=13.0147;RBI=0.0252382;REFB=-0.0118396;REVB=-0.0197367;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327042;STB=0.527317;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0148099;OID=.;OPOS=38851669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:11:9:13:18:11:9:13:19 chr6 38957853 . A G 572.49 PASS AF=0.465116;AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.0296257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.661;QD=17.7516;RBI=0.0297304;REFB=-0.00781485;REVB=-0.00249299;RO=69;SAF=22;SAR=38;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690399;STB=0.538407;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00739777;OID=.;OPOS=38957853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:69:69:60:60:0.465116:38:22:30:39:38:22:30:39 chr6 39033602 . A G 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.476;QD=59.8559;RBI=0.0395008;REFB=0;REVB=0.0244999;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44669e-05;OID=.;OPOS=39033602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0 chr6 39041502 . A C 482.73 PASS AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.01547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.586;QD=18.5665;RBI=0.0166366;REFB=-0.0123519;REVB=-0.00612025;RO=52;SAF=28;SAR=23;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149028;STB=0.577398;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0280498;OID=.;OPOS=39041502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:53:51:51:0.490385:23:28:20:32:23:28:21:32 chr6 39267267 . G T 616.09 PASS AF=0.571429;AO=60;DP=105;FAO=60;FDP=105;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0037499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.592;QD=23.4702;RBI=0.0103189;REFB=-0.0103205;REVB=-0.00961339;RO=45;SAF=32;SAR=28;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349144;STB=0.519078;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00726285;OID=.;OPOS=39267267;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:45:45:60:60:0.571429:28:32:22:23:28:32:22:23 chr6 39282036 . T C 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0504225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.346;QD=12.3961;RBI=0.0595942;REFB=-0.0434213;REVB=0.0317652;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363118;STB=0.726279;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.019846;OID=.;OPOS=39282036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:3:2:4:1:3:2 chr6 39282806 . G T 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0132676;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.306;QD=16.8989;RBI=0.0154369;REFB=-0.00787518;REVB=-0.00789109;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22118;STB=0.628944;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00487489;OID=.;OPOS=39282806;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:4:5:3:7:4:5 chr6 39283083 . G A 295.67 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0159443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.145;QD=17.9193;RBI=0.0175803;REFB=-0.00412577;REVB=0.00740593;RO=34;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141225;STB=0.578998;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0058448;OID=.;OPOS=39283083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:19:13:19:15:19:13:19:15 chr6 39284050 . G T 324.7 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.017013;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.087;QD=19.3853;RBI=0.0357912;REFB=-0.00374539;REVB=0.0314891;RO=33;SAF=16;SAR=18;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146046;STB=0.581105;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00464431;OID=.;OPOS=39284050;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:33:33:34:34:0.507463:18:16:21:12:18:16:21:12 chr6 39284184 . A G 660.93 PASS AF=0.444444;AO=72;DP=162;FAO=72;FDP=162;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=34;FWDB=-0.00574957;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.99;QD=16.3193;RBI=0.00862851;REFB=-0.0239403;REVB=-0.00643379;RO=89;SAF=41;SAR=31;SRF=56;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611979;STB=0.53014;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0279479;OID=.;OPOS=39284184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:89:90:72:72:0.444444:31:41:56:33:31:41:56:34 chr6 39290200 . C T 242.68 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00124855;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.814;QD=17.0301;RBI=0.00293736;REFB=-0.0253403;REVB=0.0026588;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829605;STB=0.564155;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0381806;OID=.;OPOS=39290200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:28:30:27:27:0.473684:15:12:15:13:15:12:17:13 chr6 39325078 . A G 936.6 PASS AF=0.519774;AO=92;DP=176;FAO=92;FDP=177;FR=.;FRO=85;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=-0.00405704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.211;QD=21.1662;RBI=0.00471776;REFB=-0.0142043;REVB=0.00240783;RO=83;SAF=53;SAR=39;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614452;STB=0.5398;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0106465;OID=.;OPOS=39325078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:83:85:92:92:0.519774:39:53:42:41:39:53:42:43 chr6 39507889 . C T 389.12 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=39;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=-0.0325277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7566;QD=14.9663;RBI=0.0332544;REFB=-0.00987393;REVB=-0.00691413;RO=58;SAF=39;SAR=6;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345505;STB=0.694947;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0162451;OID=.;OPOS=39507889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:59:45:45:0.432692:6:39:37:21:6:39:38:21 chr6 39828862 . A C 384.07 PASS AF=0.513158;AO=38;DP=75;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0192043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.333;QD=20.2144;RBI=0.0201474;REFB=-0.017894;REVB=-0.00609223;RO=37;SAF=12;SAR=26;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625341;STB=0.53915;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0134678;OID=.;OPOS=39828862;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:37:37:38:39:0.513158:26:12:14:23:27:12:14:23 chr6 39851818 . G A 306.54 PASS AF=0.484848;AO=26;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00937013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.427;QD=18.578;RBI=0.0105366;REFB=-0.00613722;REVB=-0.00481882;RO=33;SAF=7;SAR=19;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205659;STB=0.542142;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00639896;OID=.;OPOS=39851818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:26:32:0.484848:19:7:15:18:20:12:15:18 chr6 39864730 . C T 146.04 PASS AF=0.457143;AO=15;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0170119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.53;QD=16.6906;RBI=0.0214429;REFB=-0.0274808;REVB=0.0130535;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17311;STB=0.61137;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.022472;OID=.;OPOS=39864730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:19:19:15:16:0.457143:9:6:11:8:10:6:11:8 chr6 39865047 . T C 197.56 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00475298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.024;QD=26.3416;RBI=0.0323813;REFB=-0.0505244;REVB=0.0320306;RO=11;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106918;STB=0.559378;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0158453;OID=.;OPOS=39865047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:10:9:7:4:10:9:7:4 chr6 39869952 . T A 197.13 PASS AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00417076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.007;QD=10.9519;RBI=0.0323302;REFB=-0.0122654;REVB=0.0320601;RO=47;SAF=18;SAR=7;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251853;STB=0.647358;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0281079;OID=.;OPOS=39869952;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:7:18:24:23:7:18:24:23 chr6 40359991 . C T 284.64 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=0.0041723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1959;QD=17.7902;RBI=0.0140587;REFB=-0.033896;REVB=0.0134253;RO=31;SAF=11;SAR=20;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36392;STB=0.713468;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0210815;OID=.;OPOS=40359991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:33:31:31:0.484375:20:11:24:7:20:11:26:7 chr6 41162518 . T C 649.45 PASS AF=0.471429;AO=65;DP=139;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=46;FWDB=0.0190299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.817;QD=18.5557;RBI=0.020142;REFB=-0.0126387;REVB=0.00660022;RO=74;SAF=36;SAR=29;SRF=28;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167172;STB=0.595465;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0154676;OID=.;OPOS=41162518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:74:74:65:66:0.471429:29:36:28:46:29:37:28:46 chr6 41166149 . A G 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0060879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.721;QD=14.6493;RBI=0.0063034;REFB=-0.0222828;REVB=0.00163409;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357417;STB=0.520803;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0278729;OID=.;OPOS=41166149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:10:4:6:13:10:4:6:13 chr6 41166151 . A G 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0115633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.299;QD=14.6497;RBI=0.0160005;REFB=-0.0250585;REVB=-0.0110592;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00948154;STB=0.520803;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0180111;OID=.;OPOS=41166151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:10:4:5:13:10:4:6:13 chr6 41166154 . GT CC 86.29 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0135822;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=263.814;QD=12.3273;RBI=0.0217773;REFB=-0.00969841;REVB=-0.0170228;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565967;STB=0.507029;STBP=0.975;TYPE=mnp;VARB=0.0117271;OID=.;OPOS=41166154;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:16:17:11:11:0.392857:7:4:5:11:7:4:6:11 chr6 41196156 . C T 912.96 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.158;QD=57.9658;RBI=0.0425295;REFB=0;REVB=0.0416645;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31332e-05;OID=.;OPOS=41196156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:26:35:0:0:27:36:0:0 chr6 41196605 . T C 792.8 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.077;QD=56.6283;RBI=0.0320243;REFB=0;REVB=0.00532258;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392487;OID=.;OPOS=41196605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:32:22:0:0:32:24:0:0 chr6 41196727 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.657;QD=60.2307;RBI=0.0467841;REFB=0;REVB=-0.00252781;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000398124;OID=.;OPOS=41196727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:25:12:0:0:25:12:0:0 chr6 41197785 . T C 877.81 PASS AF=1;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170116;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.812;QD=56.633;RBI=0.051757;REFB=-0.119206;REVB=0.0488813;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524666;OID=.;OPOS=41197785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:63:62:0:0:61:62:1:25:36:0:0:26:36:0:0 chr6 41197857 . C T 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00136031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.66;QD=57.7122;RBI=0.0532051;REFB=0;REVB=0.0531877;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156437;OID=.;OPOS=41197857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0 chr6 41250466 . T A 239.33 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0453367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.475;QD=20.8112;RBI=0.045346;REFB=-0.00597748;REVB=-0.00092173;RO=23;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126063;STB=0.570494;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00347585;OID=.;OPOS=41250466;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:9:14:17:6:9:14:17:6 chr6 41270223 . C T 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8216;QD=62.0209;RBI=0.0384919;REFB=0;REVB=-0.024035;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000827504;OID=.;OPOS=41270223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0 chr6 41303592 . T C 323.43 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0457562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9429;QD=53.9051;RBI=0.0495918;REFB=0;REVB=-0.0191236;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000769218;OID=.;OPOS=41303592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr6 41303995 . A G 239.57 PASS AF=0.465517;AO=26;DP=57;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0221284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.764;QD=16.5218;RBI=0.0224727;REFB=-0.000239571;REVB=-0.00391861;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138879;STB=0.585301;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=4.13252e-05;OID=.;OPOS=41303995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:31:31:26:27:0.465517:9:17:16:15:9:18:16:15 chr6 41309552 . T C 272.77 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00783774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.874;QD=24.2461;RBI=0.0171974;REFB=-0.0119518;REVB=-0.0153075;RO=19;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188021;STB=0.613946;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0072677;OID=.;OPOS=41309552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:20:25:25:0.555556:11:14:6:13:11:14:6:14 chr6 41318424 . T A 279.91 PASS AF=0.462687;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0039349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.401;QD=16.711;RBI=0.00940336;REFB=-0.0132757;REVB=0.00854048;RO=36;SAF=21;SAR=9;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975596;STB=0.539588;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.011833;OID=.;OPOS=41318424;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:36:36:30:31:0.462687:9:21:22:14:10:21:22:14 chr6 41318438 . A G 1106.39 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.079;QD=59.0074;RBI=0.0520838;REFB=-0.0884302;REVB=0.0256752;RO=1;SAF=46;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101746;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034189;OID=.;OPOS=41318438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:75:75:1:0:74:75:1:28:46:1:0:28:47:0:0 chr6 41533579 . C A 541.59 PASS AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00742834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.094;QD=24.9008;RBI=0.0274993;REFB=-0.0245152;REVB=0.026477;RO=37;SAF=18;SAR=32;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186115;STB=0.602028;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0150958;OID=.;OPOS=41533579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:32:18:22:15:32:18:22:15 chr6 41621618 . A G 253.98 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.628;QD=50.7961;RBI=0.00256101;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20641e-05;OID=.;OPOS=41621618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:0:19:0:0:0:20:0:0 chr6 41621625 . G A 219.29 PASS AF=0.863636;AO=19;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0205339;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.595;QD=39.8715;RBI=0.0205339;REFB=-0.0429755;REVB=0;RO=2;SAF=19;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00249539;OID=.;OPOS=41621625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:2:3:19:19:0.863636:0:19:2:0:0:19:3:0 chr6 41754573 . C CCTT 270.12 PASS AF=1;AO=20;DP=23;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425729;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=3;MLLD=267.944;QD=51.4515;RBI=0.076341;REFB=0;REVB=0.063368;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766752;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000683508;OID=.;OPOS=41754574;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:23:21:21:0:12:9:0:0:4:2:11:9:2:0 chr6 41773576 . G C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.886;QD=54.517;RBI=0.0424172;REFB=0;REVB=0.0352033;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135052;OID=.;OPOS=41773576;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0 chr6 41986208 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00651335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.922;QD=33.4285;RBI=0.0232184;REFB=0;REVB=-0.0222861;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000623764;OID=.;OPOS=41986208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr6 42044945 . G A 976.51 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.579;QD=57.4415;RBI=0.0305373;REFB=-0.128116;REVB=-0.0225715;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00082322;OID=.;OPOS=42044945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:0:1:67:67:0.985294:31:36:0:0:31:36:0:1 chr6 42072989 . G A 584.98 PASS AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0075827;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.381;QD=28.192;RBI=0.0169528;REFB=-0.0249746;REVB=0.0151624;RO=29;SAF=26;SAR=26;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340968;STB=0.506022;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0169149;OID=.;OPOS=42072989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:29:31:52:52:0.626506:26:26:13:16:26:26:15:16 chr6 42073958 . C T 245.97 PASS AF=0.491525;AO=27;DP=56;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0166196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.379;QD=16.676;RBI=0.0168339;REFB=-0.0570086;REVB=0.00267779;RO=29;SAF=10;SAR=17;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230673;STB=0.610585;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.057361;OID=.;OPOS=42073958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:59:29:30:27:29:0.491525:17:10:18:11:17:12:19:11 chr6 42074106 . A G 163.65 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00988941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.604;QD=20.4561;RBI=0.0160191;REFB=-0.00433585;REVB=-0.012602;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101757;STB=0.557553;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00397443;OID=.;OPOS=42074106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:7:10:7:8:7:10:7:8 chr6 42123317 . A C 1419.41 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00836499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.69;QD=61.7136;RBI=0.0274172;REFB=0.0387093;REVB=0.02611;RO=1;SAF=45;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104175;STB=0.505493;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.000200802;OID=.;OPOS=42123317;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:46:45:1:0:46:45:1:0 chr6 42232475 . G A 227.09 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.012136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6163;QD=15.6611;RBI=0.0174058;REFB=0.0156209;REVB=-0.0124772;RO=31;SAF=7;SAR=19;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987766;STB=0.569345;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.0268921;OID=.;OPOS=42232475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:32:26:26:0.448276:19:7:11:20:19:7:12:20 chr6 42532102 . C T 184.19 PASS AF=0.642857;AO=17;DP=27;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00273849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.976;QD=26.3132;RBI=0.0395224;REFB=-0.0288835;REVB=0.0394274;RO=9;SAF=11;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131465;STB=0.540937;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00902138;OID=.;OPOS=42532102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:27:28:9:10:17:18:0.642857:6:11:4:5:7:11:5:5 chr6 42600319 . A G 1151.46 PASS AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.000298995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.732;QD=56.8624;RBI=0.0173792;REFB=-0.135529;REVB=-0.0173766;RO=2;SAF=41;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225281;STB=0.517643;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0022532;OID=.;OPOS=42600319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:2:3:78:78:0.962963:37:41:2:0:37:41:3:0 chr6 42627430 . C T 136.63 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00961102;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.2883;QD=10.5097;RBI=0.00961607;REFB=-0.00293364;REVB=-0.000311561;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498251;STB=0.529377;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00905151;OID=.;OPOS=42627430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:33:35:17:17:0.326923:9:8:17:16:9:8:18:17 chr6 42627434 . G A 162.2 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0136531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.188;QD=12.0149;RBI=0.0138071;REFB=-0.000219434;REVB=0.00205673;RO=34;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860063;STB=0.54995;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.000242619;OID=.;OPOS=42627434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:11:9:18:16:11:9:18:16 chr6 42666061 . T C 754.39 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.533;QD=56.9351;RBI=0.0266662;REFB=0;REVB=0.00616496;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141987;OID=.;OPOS=42666061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0 chr6 42666145 . C T 1034.4 PASS AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.112592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7844;QD=56.6794;RBI=0.116534;REFB=-0.00662936;REVB=0.0300533;RO=1;SAF=29;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111269;STB=0.511625;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0293949;OID=.;OPOS=42666145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:73:1:2:71:71:0.972603:42:29:0:1:42:29:0:2 chr6 42666164 . G C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.219;QD=59.6792;RBI=0.0521801;REFB=0;REVB=0.0465727;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128932;OID=.;OPOS=42666164;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:41:29:0:0:41:29:0:0 chr6 42689755 . A G 211.86 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00384094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9007;QD=16.6165;RBI=0.0485498;REFB=-0.0164167;REVB=-0.0483977;RO=28;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899296;STB=0.550976;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0185458;OID=.;OPOS=42689755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:11:12:12:16:11:12:12:16 chr6 42713618 . A G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.484;QD=58.2396;RBI=0.0282948;REFB=0;REVB=0.0228872;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67292e-05;OID=.;OPOS=42713618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0 chr6 42932200 . G T 372.21 PASS AF=0.396396;AO=44;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.0176266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9726;QD=13.4131;RBI=0.0197988;REFB=-0.000114222;REVB=0.00901625;RO=67;SAF=20;SAR=24;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055769;STB=0.531547;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00062393;OID=.;OPOS=42932200;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:67:67:44:44:0.396396:24:20:27:40:24:20:27:40 chr6 42932202 . C T 351.26 PASS AF=0.388889;AO=41;DP=107;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0139172;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.694;QD=13.0095;RBI=0.0139173;REFB=-0.020248;REVB=-4.05631e-05;RO=66;SAF=19;SAR=22;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595452;STB=0.541241;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0260703;OID=.;OPOS=42932202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:66:66:41:42:0.388889:22:19:27:39:22:20:27:39 chr6 42942779 . A G 169.53 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00115383;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.177;QD=15.4115;RBI=0.027772;REFB=-0.0136204;REVB=0.0277481;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211975;STB=0.62176;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0177903;OID=.;OPOS=42942779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:17:9:10:8:17:9 chr6 42989057 . T C 553.27 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.059;QD=58.2387;RBI=0.0442657;REFB=0;REVB=0.0164816;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217802;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395638;OID=.;OPOS=42989057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:38:38:1:0:37:38:1:21:16:0:1:22:16:0:0 chr6 43005647 . G C 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0108678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2397;QD=23.5275;RBI=0.046341;REFB=-0.0223129;REVB=0.0450487;RO=15;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140251;STB=0.578864;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0244786;OID=.;OPOS=43005647;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:15:5:6:9:15:5:6:9 chr6 43014298 . TT CC 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790924;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=188.09;QD=47.8224;RBI=0.0148616;REFB=0;REVB=0.0125822;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.08948e-05;OID=.;OPOS=43014298;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr6 43153836 . G A 52.12 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0284732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.811;QD=6.31776;RBI=0.0288127;REFB=-0.0154851;REVB=0.00440963;RO=25;SAF=6;SAR=2;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159138;STB=0.510179;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0528285;OID=.;OPOS=43153836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:2:6:19:6:2:6:19:6 chr6 43154091 . C G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.499;QD=60.6101;RBI=0.024037;REFB=0;REVB=0.0230834;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25524e-05;OID=.;OPOS=43154091;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr6 43250710 . G C 76.12 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0114064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4681;QD=12.1796;RBI=0.0171818;REFB=-0.0180684;REVB=-0.0128495;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420733;STB=0.747625;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0151327;OID=.;OPOS=43250710;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:4:11:3:7:4:11 chr6 43250725 . GGAAGAAGAA GGAAGAA,GGAAGAAGAG 91.06 PASS AF=0.52381,0;AO=9,2;DP=22;FAO=11,0;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=10,0;FSAR=1,0;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00402519,-0.0345495;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=235.39,60.9323;QD=17.3439;RBI=0.00738537,0.0892317;REFB=-0.0323348,-0.0158527;REVB=-0.00619205,-0.0822717;RO=11;SAF=8,2;SAR=1,0;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.61306,0.663928;STB=0.859447,0.5;STBP=0,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0293907,0;OID=.,.;OPOS=43250726,43250734;OREF=GAA,A;OALT=-,G;OMAPALT=GGAAGAA,GGAAGAAGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.52381,0:9,2:22:11,0:21:10:10,0:1,0:3:7:78:11:8,2:1,0:3:8 chr6 43251118 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.000588635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.488;QD=11.9533;RBI=0.0127399;REFB=0.00651949;REVB=0.0127263;RO=11;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.646677;STB=0.885149;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.0168895;OID=.;OPOS=43251118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:7:1:9:2:7:1:9:2 chr6 43270097 . T C 755.85 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0462726;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.098;QD=57.0449;RBI=0.0489594;REFB=0;REVB=0.0159961;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000280043;OID=.;OPOS=43270097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0 chr6 43270151 . C T 298.09 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0220444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.681;QD=20.9186;RBI=0.0323076;REFB=-0.0369686;REVB=0.0236184;RO=26;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134092;STB=0.574277;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.017826;OID=.;OPOS=43270151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:14:17:10:16:14:17:10:16 chr6 43273604 . A G 323.51 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00287227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.689;QD=16.8058;RBI=0.00903004;REFB=-0.00755696;REVB=-0.00856105;RO=42;SAF=20;SAR=15;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235125;STB=0.5132;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0110176;OID=.;OPOS=43273604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:15:20:23:19:15:20:23:19 chr6 43306346 . A G 1121.47 PASS AF=0.986842;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0272741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.699;QD=59.0245;RBI=0.0331527;REFB=-0.141591;REVB=0.0188473;RO=1;SAF=39;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119765;STB=0.506327;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000515658;OID=.;OPOS=43306346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:76:1:1:74:75:0.986842:35:39:1:0:36:39:1:0 chr6 43472708 . T C 255.19 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0520749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.776;QD=22.19;RBI=0.0576301;REFB=-0.00745308;REVB=0.0246867;RO=21;SAF=7;SAR=17;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411944;STB=0.54022;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00518789;OID=.;OPOS=43472708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:22:24:24:0.521739:17:7:7:14:17:7:8:14 chr6 43496662 . A C 209.34 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00964403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.643;QD=13.727;RBI=0.012958;REFB=-0.0020465;REVB=0.00865468;RO=36;SAF=12;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206655;STB=0.511802;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00307505;OID=.;OPOS=43496662;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:13:12:18:18:13:12:18:18 chr6 43497064 . G A 280.98 PASS AF=0.75;AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00539361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.01;QD=35.1218;RBI=0.00545554;REFB=-0.0108044;REVB=0.000819696;RO=8;SAF=16;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252644;STB=0.63818;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00240289;OID=.;OPOS=43497064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:8:8:24:24:0.75:8:16:1:7:8:16:1:7 chr6 43581586 . G A 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0036509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.519;QD=19;RBI=0.0110403;REFB=0.00286552;REVB=-0.0104191;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154517;STB=0.587528;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.00627507;OID=.;OPOS=43581586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:8:9:6:11:8:9:6:11 chr6 43582091 . A T 256.63 PASS AF=0.453125;AO=27;DP=62;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0044861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.823;QD=16.0394;RBI=0.00578197;REFB=-0.00872772;REVB=-0.00364775;RO=34;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232974;STB=0.630877;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0124914;OID=.;OPOS=43582091;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:34:35:27:29:0.453125:11:16:12:22:12:17:12:23 chr6 43590408 . G A 273.9 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.000978696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.178;QD=15.878;RBI=0.0214792;REFB=-0.00575437;REVB=-0.0214569;RO=38;SAF=11;SAR=20;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136564;STB=0.507687;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.00779918;OID=.;OPOS=43590408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:20:11:13:25:20:11:13:25 chr6 43596716 . CG C,GC 143.61 PASS AF=0.789474,0.157895;AO=10,4;DP=19;FAO=15,3;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=9,0;FSAR=6,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0818512,-0.0136039;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=12.5988,162.067;QD=30.2334;RBI=0.198295,0.0578833;REFB=-0.0290616,-0.0104613;REVB=0.180613,-0.056262;RO=1;SAF=9,0;SAR=1,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.648649,0;SSSB=0.290714,0;STB=0.53841,0.5;STBP=0.332,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0700069,0.0675277;OID=.,.;OPOS=43596717,43596716;OREF=G,CG;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:19:19:1:1:10,4:15,3:0.789474,0.157895:1,4:9,0:0:1:6,3:9,0:0:1 chr6 43640099 . A G 109.23 PASS AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0275874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.246;QD=8.56683;RBI=0.03472;REFB=5.22365e-05;REVB=-0.0210812;RO=37;SAF=6;SAR=8;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371488;STB=0.522695;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-7.91754e-05;OID=.;OPOS=43640099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:8:6:17:20:8:6:17:20 chr6 43648803 . A G 262.08 PASS AF=0.364706;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.0096018;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163;QD=12.333;RBI=0.00961212;REFB=-0.00570222;REVB=0.000445382;RO=52;SAF=16;SAR=15;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130561;STB=0.584363;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00657269;OID=.;OPOS=43648803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:52:54:31:31:0.364706:15:16:33:19:15:16:35:19 chr6 43968814 . A G 651.21 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.963;QD=62.0201;RBI=0.0323674;REFB=0;REVB=0.0220064;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122423;OID=.;OPOS=43968814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr6 43970827 . G A 468.14 PASS AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00114476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6381;QD=22.8361;RBI=0.013177;REFB=-0.0170806;REVB=0.0131272;RO=37;SAF=15;SAR=30;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111287;STB=0.561375;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0138099;OID=.;OPOS=43970827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:30:15:17:20:30:15:17:20 chr6 44081718 . G A 923.51 PASS AF=1;AO=60;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6832;QD=54.3243;RBI=0.224358;REFB=0;REVB=0.223746;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223846;OID=.;OPOS=44081718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:60:68:1:23:37:0:0:31:37:0:0 chr6 44115169 . G A 354.35 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.00406452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.354;QD=21.4756;RBI=0.0172597;REFB=0.00990801;REVB=0.0167743;RO=30;SAF=14;SAR=22;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17142;STB=0.594047;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.0103476;OID=.;OPOS=44115169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:22:14:6:24:22:14:6:24 chr6 44117607 . C T 47.35 PASS AF=0.35;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.04818;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9568;QD=9.47096;RBI=0.0500386;REFB=-0.00622858;REVB=0.0135111;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65792e-08;STB=0.599758;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0411293;OID=.;OPOS=44117607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:21:20:14:13:7:7:0.35:6:1:2:12:6:1:1:12 chr6 44118379 . GGC G,GG 48.9 PASS AF=0.265306,0;AO=10,5;DP=47;FAO=13,0;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=2,0;FSAR=11,0;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.13199,-0.238611;FXX=0.019996;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=32.8368,15.4887;QD=3.9918;RBI=0.237064,0.261177;REFB=-0.0317079,-0.070163;REVB=-0.196922,-0.106198;RO=31;SAF=2,4;SAR=8,1;SRF=19;SRR=12;SSEN=0.445161,0.463768;SSEP=0,0.536585;SSSB=-0.487813,0.251625;STB=0.850861,0.5;STBP=0.005,1;TYPE=del,del;VARB=0.0705401,0;OID=.,.;OPOS=44118380,44118381;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.265306,0:10,5:47:13,0:49:36:2,0:11,0:23:13:48:31:2,4:8,1:19:12 chr6 44119676 . A G 188.91 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0163687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7037;QD=20.9901;RBI=0.0164719;REFB=-0.014065;REVB=0.00184034;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089129;STB=0.501465;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0108373;OID=.;OPOS=44119676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:17:19:19:0.527778:10:9:5:9:10:9:8:9 chr6 44137663 . A G 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2032;QD=55.6543;RBI=0.0912181;REFB=0;REVB=0.0789391;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00217587;OID=.;OPOS=44137663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr6 44218120 . A G 108.18 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203283;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=98.5828;QD=36.0594;RBI=0.1014;REFB=0.117547;REVB=-0.0993414;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690901;STB=0.538392;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00692053;OID=.;OPOS=44218120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:5:6:1:0:5:6:1:0 chr6 44222047 . G A 3387.96 PASS AF=1;AO=216;DP=218;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00898431;FXX=0.00458695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.297;QD=62.4508;RBI=0.0186225;REFB=0;REVB=0.0163119;RO=0;SAF=86;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43752e-06;OID=.;OPOS=44222047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:218:217:0:0:216:217:1:130:86:0:0:130:87:0:0 chr6 44247951 . T G 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.228;QD=61.0491;RBI=0.0237631;REFB=0;REVB=-0.004611;RO=0;SAF=46;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62093e-05;OID=.;OPOS=44247951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:32:46:0:0:32:46:0:0 chr6 44253749 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7037;QD=51.9163;RBI=0.0550977;REFB=0;REVB=-0.052414;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154085;OID=.;OPOS=44253749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr6 44253765 . A G 272.95 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1324;QD=51.9912;RBI=0.0170763;REFB=0;REVB=0.00121822;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000516445;OID=.;OPOS=44253765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:9:11:0:0:10:11:0:0 chr6 44268135 . C T 1116.96 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.887;QD=60.3765;RBI=0.049712;REFB=0;REVB=0.0094617;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146942;OID=.;OPOS=44268135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:28:46:0:0:28:46:0:0 chr6 44268371 . T C 899.63 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000269942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.907;QD=58.0407;RBI=0.0326478;REFB=0;REVB=0.0326467;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64502e-05;OID=.;OPOS=44268371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0 chr6 44275011 . T C 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00335757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.287;QD=57.0007;RBI=0.00922906;REFB=0;REVB=0.00859664;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.37541e-05;OID=.;OPOS=44275011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:32:22:0:0:32:22:0:0 chr6 44310854 . G A 1361.98 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000879568;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.52;QD=62.6198;RBI=0.0283022;REFB=0;REVB=0.0282886;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33987e-05;OID=.;OPOS=44310854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:42:45:0:0:42:45:0:0 chr6 44371714 . C T 972.86 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.081;QD=58.961;RBI=0.0469868;REFB=0;REVB=0.0045358;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120015;OID=.;OPOS=44371714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0 chr6 44403438 . A G 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.994;QD=57.6807;RBI=0.010302;REFB=0;REVB=0.00993365;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17184e-05;OID=.;OPOS=44403438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0 chr6 44413463 . T A 1292.37 PASS AF=0.897196;AO=95;DP=107;FAO=96;FDP=107;FR=.;FRO=11;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00278322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.172;QD=48.3129;RBI=0.0240589;REFB=-0.0061025;REVB=0.0238973;RO=10;SAF=47;SAR=48;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350541;STB=0.512958;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.000268181;OID=.;OPOS=44413463;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:107:107:10:11:95:96:0.897196:48:47:3:7:49:47:4:7 chr6 44413464 . G A 32.35 PASS AF=0.0810811;AO=10;DP=112;FAO=9;FDP=111;FR=.;FRO=102;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=54;FWDB=0.0495917;FXX=0.00892777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=57.2963;QD=1.16575;RBI=0.0597358;REFB=-0.0290055;REVB=0.0333021;RO=102;SAF=3;SAR=7;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200461;STB=0.629336;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0335885;OID=.;OPOS=44413464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:112:111:102:102:10:9:0.0810811:7:3:48:54:6:3:48:54 chr6 44982593 . G A 365.6 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0426854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3615;QD=21.506;RBI=0.0442296;REFB=-0.00191023;REVB=-0.0115852;RO=31;SAF=19;SAR=18;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244523;STB=0.513506;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.000513632;OID=.;OPOS=44982593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:18:19:15:16:18:19:15:16 chr6 45866361 . A T 316.82 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0350132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.015;QD=20.4402;RBI=0.0352343;REFB=-0.0112968;REVB=-0.00394132;RO=28;SAF=7;SAR=26;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159965;STB=0.583829;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00912778;OID=.;OPOS=45866361;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:26:7:10:18:26:7:10:19 chr6 46108916 . C G 1245.91 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00279162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.374;QD=61.5263;RBI=0.00842232;REFB=0;REVB=0.00794622;RO=0;SAF=46;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70159e-05;OID=.;OPOS=46108916;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:35:46:0:0:35:46:0:0 chr6 46128745 . C T 241.15 PASS AF=0.465517;AO=28;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.034794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2864;QD=16.6308;RBI=0.0642871;REFB=-0.0233364;REVB=-0.0540575;RO=30;SAF=14;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307161;STB=0.501278;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0316465;OID=.;OPOS=46128745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:31:28:27:0.465517:14:14:14:16:14:13:15:16 chr6 46190377 . A C 212.8 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.000394104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6362;QD=20.2662;RBI=0.038547;REFB=-0.00714926;REVB=0.038545;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.010793;OID=.;OPOS=46190377;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:11:10:10:11:11:10:10:11 chr6 46563817 . A T 233.38 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00827487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.418;QD=15.0568;RBI=0.00828678;REFB=0.000389581;REVB=0.000444132;RO=34;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205367;STB=0.623287;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.000490072;OID=.;OPOS=46563817;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:35:27:27:0.435484:16:11:21:13:16:11:22:13 chr6 46609905 . C T 298.81 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00802792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.11;QD=18.6756;RBI=0.0211705;REFB=-0.0254241;REVB=0.0195894;RO=32;SAF=16;SAR=16;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140362;STB=0.578077;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0232886;OID=.;OPOS=46609905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:16:16:21:11:16:16:21:11 chr6 46620252 . C G 382.98 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0602415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9356;QD=17.4079;RBI=0.0793162;REFB=0.0151868;REVB=-0.0515948;RO=48;SAF=18;SAR=22;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129346;STB=0.572362;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.0184919;OID=.;OPOS=46620252;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:22:18:28:20:22:18:28:20 chr6 46623698 . T C 1420.07 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000463048;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.309;QD=63.1144;RBI=0.0654856;REFB=0;REVB=0.0654839;RO=0;SAF=29;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34799e-05;OID=.;OPOS=46623698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:87:90:1:58:29:0:0:60:30:0:0 chr6 46657057 . A G 1383.8 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252023;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.007;QD=62.9;RBI=0.0350367;REFB=0;REVB=0.0243396;RO=1;SAF=48;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976886;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139806;OID=.;OPOS=46657057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:1:0:86:88:1:38:48:1:0:39:49:0:0 chr6 46658905 . C G 354.2 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.00290631;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.863;QD=18.1639;RBI=0.0185458;REFB=0.0114757;REVB=-0.0183166;RO=38;SAF=25;SAR=12;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304729;STB=0.686713;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0127346;OID=.;OPOS=46658905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:38:41:37:37:0.474359:12:25:13:25:12:25:13:28 chr6 46672943 . A G 2239.25 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963111;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.729;QD=63.5248;RBI=0.055856;REFB=0;REVB=0.0550194;RO=0;SAF=70;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.23847e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.314e-05;OID=.;OPOS=46672943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:141:0:0:141:141:1:71:70:0:0:71:70:0:0 chr6 46684222 . C T 711.36 PASS AF=0.5;AO=69;DP=141;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0162642;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2204;QD=20.3245;RBI=0.0716846;REFB=-0.0437709;REVB=-0.0698151;RO=69;SAF=32;SAR=37;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0431763;OID=.;OPOS=46684222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:69:70:69:70:0.5:37:32:32:37:37:33:33:37 chr6 46793175 . G A 358.89 PASS AF=0.40625;AO=38;DP=95;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=-0.00511498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.823;QD=14.9537;RBI=0.00550479;REFB=-0.0201611;REVB=-0.00203461;RO=55;SAF=29;SAR=9;SRF=41;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251456;STB=0.539936;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0192137;OID=.;OPOS=46793175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:55:57:38:39:0.40625:9:29:41:14:9:30:41:16 chr6 46801071 . G T 415.58 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.0717115;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5668;QD=16.9625;RBI=0.0717278;REFB=0.0248832;REVB=-0.00152943;RO=54;SAF=26;SAR=17;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230458;STB=0.623943;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.0311824;OID=.;OPOS=46801071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:55:43:43:0.438776:17:26:20:34:17:26:21:34 chr6 46802370 . G A 705.51 PASS AF=0.449704;AO=76;DP=168;FAO=76;FDP=169;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.0140856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.588;QD=16.6984;RBI=0.0141523;REFB=-0.00162022;REVB=-0.00137261;RO=92;SAF=44;SAR=32;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356114;STB=0.517149;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.00205166;OID=.;OPOS=46802370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:92:93:76:76:0.449704:32:44:50:42:32:44:51:42 chr6 46806809 . C T 707.33 PASS AF=0.61;AO=61;DP=100;FAO=61;FDP=100;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00204971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.413;QD=28.293;RBI=0.0122115;REFB=-0.0236693;REVB=-0.0120382;RO=39;SAF=31;SAR=30;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162097;STB=0.587938;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0173028;OID=.;OPOS=46806809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:39:39:61:61:0.61:30:31:11:28:30:31:11:28 chr6 46824448 . A G 509.77 PASS AF=0.860465;AO=37;DP=43;FAO=37;FDP=43;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00881766;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.1287;QD=47.4201;RBI=0.0508035;REFB=-0.0209364;REVB=-0.0500324;RO=5;SAF=24;SAR=13;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117941;STB=0.502761;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0144026;OID=.;OPOS=46824448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:43:43:5:6:37:37:0.860465:13:24:3:2:13:24:4:2 chr6 46826508 . G A 631.62 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.135;QD=61.6215;RBI=0.0359155;REFB=0;REVB=-0.0312753;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138559;OID=.;OPOS=46826508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:20:20:0:0:20:21:0:0 chr6 46826715 . T A 1607.12 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.212;QD=64.2848;RBI=0.0102845;REFB=0;REVB=0.00717122;RO=0;SAF=40;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58865e-05;OID=.;OPOS=46826715;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:60:40:0:0:60:40:0:0 chr6 46826844 . T C 2178.7 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.334;QD=63.1507;RBI=0.0342777;REFB=0;REVB=0.0235535;RO=0;SAF=80;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34627e-05;OID=.;OPOS=46826844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:58:80:0:0:58:80:0:0 chr6 46826910 . G A 2474.88 PASS AF=1;AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.669;QD=61.4877;RBI=0.0222822;REFB=0;REVB=0.0186713;RO=0;SAF=115;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98992e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18414e-05;OID=.;OPOS=46826910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:161:161:0:0:161:161:1:46:115:0:0:46:115:0:0 chr6 46827073 . A G 3104.59 PASS AF=0.985;AO=196;DP=199;FAO=197;FDP=200;FR=.;FRO=3;FSAF=98;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0240633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.664;QD=62.0918;RBI=0.0300181;REFB=-0.0324071;REVB=0.0179456;RO=3;SAF=98;SAR=98;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143532;STB=0.507462;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000971791;OID=.;OPOS=46827073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:199:200:3:3:196:197:0.985:98:98:0:3:99:98:0:3 chr6 46827126 . C T 1719.13 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00122777;FXX=0.00861995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.477;QD=59.7957;RBI=0.00612931;REFB=-0.00989572;REVB=0.00600509;RO=1;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855555;STB=0.504504;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=4.15413e-05;OID=.;OPOS=46827126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:116:115:1:1:114:114:0.991304:55:59:0:1:55:59:0:1 chr6 46832813 . G A 1655.07 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.333;QD=60.1843;RBI=0.0428062;REFB=0;REVB=0.0409123;RO=0;SAF=44;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40155e-05;OID=.;OPOS=46832813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:110:0:0:108:110:1:64:44:0:0:66:44:0:0 chr6 46834685 . G A 1624.37 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00562383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.545;QD=60.1618;RBI=0.0115072;REFB=0;REVB=0.0100393;RO=0;SAF=63;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07549e-05;OID=.;OPOS=46834685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:45:63:0:0:45:63:0:0 chr6 46856100 . G A,T 1520.75 PASS AF=0.938053,0.0176991;AO=105,4;DP=113;FAO=106,2;FDP=113;FR=.;FRO=5;FSAF=70,1;FSAR=36,1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00764082,-0.0110786;FXX=0.00877116;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=158.803,195.784;QD=53.832;RBI=0.0142412,0.013865;REFB=-0.0125126,0.0317009;REVB=0.0120178,-0.00833681;RO=4;SAF=69,3;SAR=36,1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0498548,0.548203;STB=0.522774,0.71253;STBP=0.045,0.717;TYPE=snp,snp;VARB=0.0005215,0.120052;OID=.,.;OPOS=46856100,46856100;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:113:113:4:5:105,4:106,2:0.938053,0.0176991:36,1:69,3:0:4:36,1:70,1:1:4 chr6 47563692 . C T 1819.53 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6411;QD=61.1607;RBI=0.0267;REFB=0;REVB=0.0246401;RO=0;SAF=43;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126141;OID=.;OPOS=47563692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:75:43:0:0:75:44:0:0 chr6 47594302 . T C 936.63 PASS AF=0.956522;AO=65;DP=68;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0231644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.553;QD=54.2976;RBI=0.0242955;REFB=-0.025338;REVB=0.00732689;RO=3;SAF=28;SAR=37;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04796;STB=0.525416;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00101858;OID=.;OPOS=47594302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:68:69:3:3:65:66:0.956522:37:28:3:0:38:28:3:0 chr6 47624239 . A G 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0259498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.407;QD=14.0965;RBI=0.0504126;REFB=-0.0141645;REVB=-0.0432208;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236675;STB=0.639731;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0152257;OID=.;OPOS=47624239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:8:3:7:7:8:3:7:7 chr6 47624299 . A G 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0201928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4076;QD=9.4951;RBI=0.0283841;REFB=-0.0196226;REVB=-0.0199476;RO=24;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110746;STB=0.567442;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0400595;OID=.;OPOS=47624299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:7:4:11:13:7:4:11:13 chr6 47626833 . C A 287.57 PASS AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.021296;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.186;QD=13.5325;RBI=0.022792;REFB=0.0216856;REVB=0.00812127;RO=51;SAF=14;SAR=19;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19381;STB=0.615424;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.00673408;OID=.;OPOS=47626833;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:51:52:33:33:0.388235:19:14:31:20:19:14:32:20 chr6 47646842 . A G 297.87 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=4.6357e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.876;QD=15.8863;RBI=0.0101696;REFB=-0.00868856;REVB=-0.0101695;RO=41;SAF=11;SAR=22;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458635;STB=0.515142;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00968729;OID=.;OPOS=47646842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:42:33:33:0.44:22:11:12:29:22:11:13:29 chr6 47649222 . T G 148.17 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0444014;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2583;QD=16.463;RBI=0.0457677;REFB=-0.0110567;REVB=0.0110996;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255214;STB=0.514687;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0104908;OID=.;OPOS=47649222;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:12:8:6:10:12:8 chr6 47649265 . T A 213.54 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00591946;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.875;QD=19.8645;RBI=0.023365;REFB=-0.0288744;REVB=-0.0226027;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126199;STB=0.558444;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0216678;OID=.;OPOS=47649265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:22:21:21:0.488372:11:10:13:8:11:10:13:9 chr6 47649573 . CA TG 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0259265;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=254.877;QD=19.0005;RBI=0.0717394;REFB=-0.00514863;REVB=0.0668906;RO=16;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192319;STB=0.57514;STBP=0.454;TYPE=mnp;VARB=0.00714669;OID=.;OPOS=47649573;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:5:12:14:2:5:12:14:3 chr6 47649694 . A G 612.42 PASS AF=0.535088;AO=61;DP=114;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0185387;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.057;QD=21.4883;RBI=0.0215671;REFB=0.0098966;REVB=-0.0110209;RO=53;SAF=34;SAR=27;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248605;STB=0.51365;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.00670952;OID=.;OPOS=47649694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:53:53:61:61:0.535088:27:34:28:25:27:34:28:25 chr6 47654742 . A T 384.67 PASS AF=0.401786;AO=45;DP=113;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.00431085;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.149;QD=13.7382;RBI=0.0114885;REFB=-0.0159992;REVB=0.010649;RO=67;SAF=21;SAR=24;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903294;STB=0.551046;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0167138;OID=.;OPOS=47654742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:67:67:45:45:0.401786:24:21:37:30:24:21:37:30 chr6 47682604 . A C 2102.6 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0524582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.045;QD=62.7642;RBI=0.0526087;REFB=0;REVB=-0.00397736;RO=0;SAF=64;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.10681e-05;OID=.;OPOS=47682604;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:70:64:0:0:70:64:0:0 chr6 47684591 . G A 656.0 PASS AF=0.503817;AO=65;DP=132;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.0178391;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.639;QD=20.0304;RBI=0.0335341;REFB=-0.00477458;REVB=-0.0283955;RO=62;SAF=37;SAR=28;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00425839;STB=0.511118;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00524459;OID=.;OPOS=47684591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:62:65:65:66:0.503817:28:37:35:27:29:37:35:30 chr6 47685097 . CCCCTTTT CCCCTTT,CCCGTTTC,CCCGTTTT,TCCCGTTT 153.58 PASS AF=0.217391,0.173913,0.152174,0.0869565;AO=9,2,3,3;DP=46;FAO=10,8,7,4;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=8,0,0,0;FSAR=2,8,7,4;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.163804,-0.009017,0.0393005,0.000610147;FXX=0;HRUN=4,4,4,4;LEN=1,5,1,5;MLLD=10.0855,58.6656,40.5511,50.1189;QD=13.3549;RBI=0.257814,0.0223016,0.0408442,0.0219493;REFB=-0.0830036,-0.0106235,-0.021824,-0.019463;REVB=-0.199089,-0.0203974,-0.011123,-0.0219408;RO=12;SAF=9,0,0,0;SAR=0,2,3,3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.833573,-0.460273,-0.549463,-0.549463;STB=0.810985,0.997999,0.997738,0.996202;STBP=0.027,0.044,0.044,0.142;TYPE=del,mnp,snp,mnp;VARB=0.122062,0.210861,0.186343,0.0284969;OID=.,.,.,.;OPOS=47685101,47685100,47685100,47685097;OREF=T,CTTTT,C,CCCCT;OALT=-,GTTTC,G,TCCCG;OMAPALT=CCCCTTT,CCCGTTTC,CCCGTTTT,TCCCGTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:46:46:12:17:9,2,3,3:10,8,7,4:0.217391,0.173913,0.152174,0.0869565:0,2,3,3:9,0,0,0:2:10:2,8,7,4:8,0,0,0:5:12 chr6 47847179 . A G 1513.25 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3596;QD=59.9309;RBI=0.0229488;REFB=0;REVB=0.0154594;RO=0;SAF=39;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.06487e-06;OID=.;OPOS=47847179;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:62:39:0:0:62:39:0:0 chr6 47847401 . A G 940.85 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0237448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.614;QD=57.0215;RBI=0.0268336;REFB=-0.0608483;REVB=0.0124991;RO=0;SAF=16;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515147;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.000204388;OID=.;OPOS=47847401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:49:16:0:0:49:16:1:0 chr6 49459978 . A G 850.39 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6155;QD=57.6537;RBI=0.0250444;REFB=0;REVB=0.0182859;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170756;OID=.;OPOS=49459978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:57:59:1:29:28:0:0:30:29:0:0 chr6 49460152 . A G 709.24 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1989;QD=61.6728;RBI=0.068736;REFB=0;REVB=0.0606891;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140568;OID=.;OPOS=49460152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr6 49485266 . C A 1803.26 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00236001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.449;QD=61.1274;RBI=0.0202087;REFB=0;REVB=0.0200705;RO=0;SAF=38;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05553e-05;OID=.;OPOS=49485266;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:118:0:0:114:118:1:76:38:0:0:80:38:0:0 chr6 49518914 . C G 1479.61 PASS AF=1;AO=98;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140232;FXX=0.0476145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8661;QD=59.1843;RBI=0.0143253;REFB=0;REVB=0.0029261;RO=0;SAF=35;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00232714;OID=.;OPOS=49518914;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:100:0:0:98:100:1:63:35:0:0:64:36:0:0 chr6 49580194 . C T 225.01 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0144186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.136;QD=27.2738;RBI=0.0145033;REFB=-0.0415203;REVB=-0.00156504;RO=12;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945353;STB=0.552276;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0215389;OID=.;OPOS=49580194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:10:11:8:4:10:11:8:4 chr6 49580247 . C T 141.41 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0300529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.201;QD=21.7556;RBI=0.0300974;REFB=-0.0238964;REVB=-0.00163676;RO=10;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726419;STB=0.562416;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0177495;OID=.;OPOS=49580247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:26:26:10:11:15:15:0.576923:9:6:5:5:9:6:6:5 chr6 49696473 . G T 223.6 PASS AF=0.325581;AO=28;DP=84;FAO=28;FDP=86;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.060083;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.411;QD=10.4001;RBI=0.0611166;REFB=-0.0118164;REVB=-0.0111923;RO=55;SAF=19;SAR=9;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334337;STB=0.678444;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0214054;OID=.;OPOS=49696473;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:55:58:28:28:0.325581:9:19:21:34:9:19:24:34 chr6 49701523 . A G 360.29 PASS AF=0.513889;AO=32;DP=67;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.00612599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.714;QD=20.0159;RBI=0.0225623;REFB=-0.019463;REVB=0.0217148;RO=35;SAF=24;SAR=8;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456595;STB=0.699453;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0178489;OID=.;OPOS=49701523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:72:35:35:32:37:0.513889:8:24:9:26:12:25:9:26 chr6 51480486 . G T 271.87 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0154009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.576;QD=19.4196;RBI=0.0177313;REFB=-0.0322911;REVB=-0.00878717;RO=26;SAF=9;SAR=20;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205663;STB=0.624911;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0232487;OID=.;OPOS=51480486;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:26:27:29:29:0.517857:20:9:14:12:20:9:15:12 chr6 51483961 . T C 411.55 PASS AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00261666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.527;QD=18.4965;RBI=0.0091901;REFB=-0.0118168;REVB=-0.00880972;RO=47;SAF=20;SAR=22;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00769458;STB=0.50429;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0107508;OID=.;OPOS=51483961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:22:20:22:25:22:20:22:25 chr6 51491884 . T C 315.64 PASS AF=0.34188;AO=40;DP=117;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.0110665;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.412;QD=10.7912;RBI=0.011513;REFB=-0.00754495;REVB=0.00317531;RO=74;SAF=15;SAR=25;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188367;STB=0.620924;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0169;OID=.;OPOS=51491884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:74:77:40:40:0.34188:25:15:40:34:25:15:43:34 chr6 51586771 . G A 769.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0016862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.815;QD=57.0001;RBI=0.0300201;REFB=0;REVB=0.0299727;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104188;OID=.;OPOS=51586771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0 chr6 51613177 . C T 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.3954;QD=53.275;RBI=0.102414;REFB=0;REVB=0.00954443;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0012038;OID=.;OPOS=51613177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:19:4:0:0:19:4:0:0 chr6 51720838 . T C 1212.84 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00326416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.311;QD=59.8934;RBI=0.00442183;REFB=0.0513039;REVB=0.00298294;RO=1;SAF=34;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137211;STB=0.507245;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=7.41614e-06;OID=.;OPOS=51720838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:46:34:1:0:46:34:1:0 chr6 51875250 . A C 764.2 PASS AF=0.964912;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0369983;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.403;QD=53.6281;RBI=0.0370134;REFB=-0.000647272;REVB=0.00105692;RO=2;SAF=18;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495292;STB=0.526306;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=5.05168e-05;OID=.;OPOS=51875250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:57:2:2:55:55:0.964912:37:18:2:0:37:18:2:0 chr6 51924774 . A G 1026.36 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0291896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.761;QD=59.4993;RBI=0.0338164;REFB=0;REVB=0.0170739;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115438;OID=.;OPOS=51924774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0 chr6 51947237 . G A 903.1 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000249037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.87;QD=58.2644;RBI=0.00503833;REFB=0;REVB=0.00503218;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76181e-06;OID=.;OPOS=51947237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:29:32:0:0:29:33:0:0 chr6 52269547 . A G 358.25 PASS AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0146545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.048;QD=14.6224;RBI=0.0221254;REFB=-0.00758704;REVB=0.0165765;RO=59;SAF=24;SAR=15;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799709;STB=0.545431;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0159317;OID=.;OPOS=52269547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:15:24:32:27:15:24:32:27 chr6 52269685 . C A 333.73 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00313849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.813;QD=24.2711;RBI=0.00365759;REFB=-0.0243833;REVB=0.00187826;RO=22;SAF=13;SAR=20;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176934;STB=0.597286;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0138557;OID=.;OPOS=52269685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:20:13:14:8:20:13:14:8 chr6 52270544 . TTTG T 385.43 PASS AF=0.579545;AO=45;DP=93;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0114557;FXX=0.0537577;HRUN=4;LEN=3;MLLD=258.986;QD=17.5195;RBI=0.0236002;REFB=-0.00484819;REVB=0.0206334;RO=38;SAF=18;SAR=27;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106678;STB=0.563611;STBP=0.192;TYPE=del;VARB=0.00308299;OID=.;OPOS=52270545;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.579545:45:93:51:88:37:20:31:20:17:99:38:18:27:20:18 chr6 52271204 . C T 205.39 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00584606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.034;QD=12.8369;RBI=0.0137437;REFB=0.000221801;REVB=-0.0124384;RO=38;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344528;STB=0.511269;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=-0.000616024;OID=.;OPOS=52271204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:39:25:25:0.390625:12:13:21:17:12:13:21:18 chr6 52271707 . G A 212.23 PASS AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0533635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3465;QD=12.3031;RBI=0.0539569;REFB=-0.00149093;REVB=0.00797985;RO=42;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768148;STB=0.550686;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00181248;OID=.;OPOS=52271707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:13:13:18:24:13:13:18:25 chr6 52272033 . C T 302.59 PASS AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0154194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7388;QD=17.0476;RBI=0.0154198;REFB=-0.00429248;REVB=-0.000109384;RO=38;SAF=15;SAR=18;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183702;STB=0.510303;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00544718;OID=.;OPOS=52272033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:18:15:18:20:18:15:18:20 chr6 52272467 . C CTTGA 166.87 PASS AF=0.615385;AO=14;DP=36;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0175276;FXX=0.161238;HRUN=2;LEN=4;MLLD=259.347;QD=25.6724;RBI=0.0193402;REFB=-0.000581542;REVB=-0.00817483;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150708;STB=0.549936;STBP=0.517;TYPE=ins;VARB=0.000918394;OID=.;OPOS=52272468;OREF=-;OALT=TTGA;OMAPALT=CTTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.615385:14:36:16:26:10:6:10:5:5:83:19:4:10:8:11 chr6 52272471 . C A 42.47 PASS AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0111594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.711;QD=4.85336;RBI=0.0115937;REFB=0.00127709;REVB=-0.00314356;RO=28;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440454;STB=0.529329;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.00793113;OID=.;OPOS=52272471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:35:35:28:28:7:7:0.2:4:3:11:17:4:3:11:17 chr6 52272574 . C T 240.14 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0378789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.449;QD=16.5616;RBI=0.0634779;REFB=-0.0183414;REVB=-0.0509375;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104332;STB=0.558818;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0224616;OID=.;OPOS=52272574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:11:16:15:16:11:16:15:16 chr6 52360283 . T A 290.43 PASS AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=7;FWDB=0.00791598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.73;QD=14.1674;RBI=0.0207818;REFB=-0.00403152;REVB=0.0192151;RO=49;SAF=24;SAR=9;SRF=42;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191811;STB=0.607305;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00534366;OID=.;OPOS=52360283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:9:24:42:7:9:24:42:7 chr6 52362844 . T A 102.78 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0363747;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=41.4141;QD=11.7463;RBI=0.0482558;REFB=-0.00427477;REVB=0.0317096;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121279;STB=0.654301;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00482734;OID=.;OPOS=52362844;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:20:22:13:13:0.371429:5:8:10:10:4:9:10:12 chr6 52374319 . T TAC 592.36 PASS AF=0.452555;AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0017907;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=165.405;QD=17.2952;RBI=0.00292031;REFB=-0.00147442;REVB=-0.00230686;RO=75;SAF=28;SAR=34;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803992;STB=0.544755;STBP=0.373;TYPE=ins;VARB=0.00187968;OID=.;OPOS=52374320;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=TAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.452555:62:137:62:137:75:28:34:40:35:99:75:28:34:40:35 chr6 52617731 . C G 456.85 PASS AF=0.458716;AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.00475472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.192;QD=16.7653;RBI=0.00544837;REFB=0.00405673;REVB=-0.00266034;RO=59;SAF=25;SAR=25;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00822558;STB=0.504585;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.00893433;OID=.;OPOS=52617731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:59:59:50:50:0.458716:25:25:29:30:25:25:29:30 chr6 52617738 . G A 618.57 PASS AF=0.554545;AO=61;DP=110;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0102316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.23;QD=22.4936;RBI=0.0121319;REFB=-0.00331827;REVB=-0.00651899;RO=49;SAF=32;SAR=29;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117221;STB=0.506418;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0024588;OID=.;OPOS=52617738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:49:49:61:61:0.554545:29:32:25:24:29:32:25:24 chr6 52658962 . T C 642.46 PASS AF=0.478261;AO=63;DP=136;FAO=66;FDP=138;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0737545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0535;QD=18.6222;RBI=0.0807763;REFB=-0.00124673;REVB=-0.0329406;RO=73;SAF=21;SAR=42;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136259;STB=0.551851;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00262803;OID=.;OPOS=52658962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:73:72:63:66:0.478261:42:21:34:39:42:24:33:39 chr6 52701143 . C T 230.86 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0176724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.283;QD=23.086;RBI=0.0293456;REFB=-0.0114911;REVB=-0.0234276;RO=18;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00820253;STB=0.504583;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0050198;OID=.;OPOS=52701143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:12:10:8:10:12:10:8:10 chr6 52843131 . G T 1201.54 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7445;QD=60.8373;RBI=0.109763;REFB=0;REVB=0.104142;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00182273;OID=.;OPOS=52843131;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:79:0:0:75:79:1:42:33:0:0:45:34:0:0 chr6 52844045 . G A 964.62 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00254195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.66;QD=55.9197;RBI=0.0360495;REFB=-0.0573261;REVB=0.0359597;RO=1;SAF=27;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171796;STB=0.517852;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000442115;OID=.;OPOS=52844045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:1:2:67:67:0.971014:40:27:1:0:40:27:2:0 chr6 52869746 . CA C 58.88 PASS AF=0.615385;AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0168409;FXX=0.0370233;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.14122;QD=9.0581;RBI=0.0220208;REFB=-0.00803776;REVB=-0.014188;RO=8;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15589;STB=0.588123;STBP=0.263;TYPE=del;VARB=0.0787767;OID=.;OPOS=52869747;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.615385:14:27:16:26:10:6:10:6:4:41:8:4:10:4:4 chr6 52963071 . A G 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.828;QD=57.6807;RBI=0.0181148;REFB=0;REVB=0.0125616;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.47571e-05;OID=.;OPOS=52963071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr6 53133897 . T C 365.03 PASS AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.000138336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.371;QD=16.0453;RBI=0.0353358;REFB=0.00268821;REVB=0.0353356;RO=51;SAF=25;SAR=14;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147713;STB=0.503969;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00370966;OID=.;OPOS=53133897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:52:39:39:0.428571:14:25:32:19:14:25:33:19 chr6 53514946 . A G 257.68 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0033924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.364;QD=23.4256;RBI=0.060391;REFB=-0.0247407;REVB=0.0602956;RO=19;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204531;STB=0.624896;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.025066;OID=.;OPOS=53514946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:20:24:24:0.545455:15:9:12:7:15:9:13:7 chr6 53516876 . T G 1302.15 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.431;QD=62.0073;RBI=0.016444;REFB=0;REVB=-0.0160095;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.17361e-05;OID=.;OPOS=53516876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:38:45:0:0:39:45:0:0 chr6 53517035 . G A 990.94 PASS AF=0.444915;AO=105;DP=236;FAO=105;FDP=236;FR=.;FRO=131;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=67;FWDB=0.0439839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.432;QD=16.7956;RBI=0.0447257;REFB=-0.0336027;REVB=0.00811194;RO=127;SAF=49;SAR=56;SRF=61;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135287;STB=0.512179;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0469606;OID=.;OPOS=53517035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:127:131:105:105:0.444915:56:49:61:66:56:49:64:67 chr6 53519062 . A G 533.56 PASS AF=0.448819;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.00646643;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8439;QD=16.805;RBI=0.0113191;REFB=0.00884333;REVB=-0.00929022;RO=72;SAF=32;SAR=25;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478684;STB=0.518285;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.011522;OID=.;OPOS=53519062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:72:70:57:57:0.448819:25:32:37:35:25:32:37:33 chr6 53519605 . C T 1970.95 PASS AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.373;QD=62.0772;RBI=0.021106;REFB=0;REVB=-0.00337494;RO=0;SAF=70;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02839e-05;OID=.;OPOS=53519605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:57:70:0:0:57:70:0:0 chr6 53519857 . G A 606.28 PASS AF=0.555556;AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=99;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0236318;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3752;QD=24.496;RBI=0.0262315;REFB=0.00116225;REVB=-0.0113854;RO=45;SAF=26;SAR=29;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678639;STB=0.532294;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00142433;OID=.;OPOS=53519857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:45:44:55:55:0.555556:29:26:25:20:29:26:24:20 chr6 53989526 . G A 817.47 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.495;QD=57.3662;RBI=0.0747796;REFB=0;REVB=0.0427321;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000502956;OID=.;OPOS=53989526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0 chr6 54025155 . T C 259.55 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00414706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.878;QD=11.9334;RBI=0.00890741;REFB=-0.0163431;REVB=-0.00788314;RO=56;SAF=21;SAR=10;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107131;STB=0.562003;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0314929;OID=.;OPOS=54025155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:56:56:31:31:0.356322:10:21:33:23:10:21:33:23 chr6 54054686 . T A 959.45 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340758;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.114;QD=59.043;RBI=0.0470537;REFB=0;REVB=0.0324483;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154579;OID=.;OPOS=54054686;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0 chr6 54079968 . G A 2370.75 PASS AF=0.993631;AO=156;DP=158;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0252659;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.829;QD=60.4012;RBI=0.0263316;REFB=-0.0753612;REVB=0.00741515;RO=1;SAF=71;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556441;STB=0.502924;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000114094;OID=.;OPOS=54079968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:158:157:1:1:156:156:0.993631:85:71:0:1:85:71:0:1 chr6 54186147 . T C 1358.52 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9191;QD=62.4607;RBI=0.0370287;REFB=0;REVB=0.027542;RO=0;SAF=25;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323718;OID=.;OPOS=54186147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:86:87:1:61:25:0:0:61:26:0:0 chr6 54191970 . T A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5099;QD=64.415;RBI=0.0495849;REFB=0;REVB=0.00497277;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000380136;OID=.;OPOS=54191970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0 chr6 54254589 . A C 370.6 PASS AF=0.389381;AO=44;DP=113;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=-0.00499957;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.905;QD=13.1186;RBI=0.0183012;REFB=-0.022486;REVB=-0.0176051;RO=66;SAF=18;SAR=26;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050423;STB=0.520527;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0262179;OID=.;OPOS=54254589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:66:69:44:44:0.389381:26:18:24:42:26:18:26:43 chr6 55142337 . A G 2511.22 PASS AF=1;AO=163;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.823;QD=61.6249;RBI=0.0312865;REFB=0;REVB=0.00708764;RO=0;SAF=67;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53749e-05;OID=.;OPOS=55142337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:163:163:0:0:163:163:1:96:67:0:0:96:67:0:0 chr6 55196587 . C T 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0303396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.358;QD=16.064;RBI=0.0308811;REFB=-0.00730167;REVB=-0.00575764;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755791;STB=0.542782;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0116871;OID=.;OPOS=55196587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:9:17:18:13:9:17:18:13 chr6 55266625 . T C 708.46 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.213;QD=62.9738;RBI=0.0309725;REFB=0;REVB=0.00159166;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191234;OID=.;OPOS=55266625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr6 55428658 . A C 225.58 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00508673;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.952;QD=23.1364;RBI=0.0202363;REFB=-0.0245955;REVB=0.0195866;RO=17;SAF=16;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593334;STB=0.556905;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0210216;OID=.;OPOS=55428658;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:39:17:18:21:21:0.538462:5:16:12:5:5:16:12:6 chr6 55639028 . G A 219.77 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00128562;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.001;QD=23.1341;RBI=0.00622005;REFB=0.0118803;REVB=0.00608574;RO=17;SAF=15;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301208;STB=0.669124;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00948161;OID=.;OPOS=55639028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:17:17:21:21:0.552632:6:15:6:11:6:15:6:11 chr6 55739553 . A G 612.48 PASS AF=0.508197;AO=61;DP=122;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0232513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=141.153;QD=20.0814;RBI=0.0276288;REFB=-0.00602434;REVB=0.0149241;RO=60;SAF=27;SAR=34;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390333;STB=0.525743;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00514258;OID=.;OPOS=55739553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:60:60:61:62:0.508197:34:27:24:36:34:28:24:36 chr6 56044578 . T C 503.38 PASS AF=0.495327;AO=51;DP=106;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00601881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.211;QD=18.818;RBI=0.00635081;REFB=-0.00829122;REVB=0.00202651;RO=54;SAF=32;SAR=19;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155667;STB=0.582252;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00898579;OID=.;OPOS=56044578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:54:54:51:53:0.495327:19:32:25:29:20:33:25:29 chr6 56351972 . G C 834.97 PASS AF=0.532051;AO=83;DP=157;FAO=83;FDP=156;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.00673065;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.534;QD=21.4095;RBI=0.0392369;REFB=-0.0124517;REVB=0.0386553;RO=73;SAF=38;SAR=45;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303065;STB=0.516595;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0152897;OID=.;OPOS=56351972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:73:73:83:83:0.532051:45:38:36:37:45:38:36:37 chr6 56380460 . GT AG,G 147.49 PASS AF=0,0.514019;AO=4,52;DP=107;FAO=0,55;FDP=107;FR=.;FRO=52;FSAF=0,29;FSAR=0,26;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.00340813,-0.0974635;FXX=0.0092584;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=28.9871,8.05928;QD=5.51366;RBI=0.0547235,0.117928;REFB=-0.0504411,-0.167809;REVB=0.0546173,0.0663921;RO=49;SAF=0,32;SAR=4,20;SRF=13;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0.314286;SSSB=-0.45236,0.301188;STB=0.5,0.605758;STBP=1,0.025;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.179539;OID=.,.;OPOS=56380460,56380461;OREF=GT,T;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:107:107:49:52:4,52:0,55:0,0.514019:4,20:0,32:13:36:0,26:0,29:16:36 chr6 56417282 . C T 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.773;QD=62.9081;RBI=0.0230516;REFB=0;REVB=-0.000856842;RO=0;SAF=53;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76915e-05;OID=.;OPOS=56417282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:37:53:0:0:37:53:0:0 chr6 56417545 . T C 683.18 PASS AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00603326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.401;QD=52.5523;RBI=0.0290014;REFB=0.0270728;REVB=0.0283669;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177622;STB=0.518511;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.000879937;OID=.;OPOS=56417545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:26:24:0:1:26:24:0:2 chr6 56810539 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.514;QD=51.1846;RBI=0.00895964;REFB=0;REVB=0.00837281;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84614e-05;OID=.;OPOS=56810539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr6 57244780 . G A 200.75 PASS AF=0.313253;AO=25;DP=82;FAO=26;FDP=83;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.0428007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.223;QD=9.67486;RBI=0.0430081;REFB=0.00186836;REVB=0.00421888;RO=57;SAF=12;SAR=13;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178137;STB=0.615299;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00342685;OID=.;OPOS=57244780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:57:57:25:26:0.313253:13:12:36:21:14:12:36:21 chr6 57246847 . C T 185.54 PASS AF=0.15261;AO=38;DP=249;FAO=38;FDP=249;FR=.;FRO=211;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=106;FSRR=105;FWDB=-0.0230128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.546;QD=2.98061;RBI=0.0276199;REFB=-0.00582716;REVB=-0.0152732;RO=209;SAF=22;SAR=16;SRF=105;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987222;STB=0.565146;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0323236;OID=.;OPOS=57246847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:209:211:38:38:0.15261:16:22:105:104:16:22:106:105 chr6 57246884 . A G 1275.02 PASS AF=0.472924;AO=131;DP=278;FAO=131;FDP=277;FR=.;FRO=146;FSAF=76;FSAR=55;FSRF=70;FSRR=76;FWDB=-0.00185558;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.016;QD=18.4119;RBI=0.0184645;REFB=-0.00719441;REVB=-0.0183711;RO=146;SAF=76;SAR=55;SRF=70;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970859;STB=0.553533;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00632392;OID=.;OPOS=57246884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:277:146:146:131:131:0.472924:55:76:70:76:55:76:70:76 chr6 57246969 . G A 709.72 PASS AF=0.370044;AO=84;DP=228;FAO=84;FDP=227;FR=.;FRO=143;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=72;FSRR=71;FWDB=-0.0133669;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.775;QD=12.506;RBI=0.0156492;REFB=-0.0072727;REVB=-0.00813773;RO=143;SAF=44;SAR=40;SRF=72;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226187;STB=0.512807;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0129011;OID=.;OPOS=57246969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:143:143:84:84:0.370044:40:44:72:71:40:44:72:71 chr6 57246982 . G T 624.08 PASS AF=0.369458;AO=75;DP=204;FAO=75;FDP=203;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=64;FSRR=64;FWDB=-0.031394;FXX=0.0145624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.232;QD=12.2972;RBI=0.0318863;REFB=-0.00599988;REVB=-0.00558121;RO=126;SAF=39;SAR=36;SRF=62;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030926;STB=0.512615;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0109336;OID=.;OPOS=57246982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:126:128:75:75:0.369458:36:39:62:64:36:39:64:64 chr6 57254927 . A G 162.38 PASS AF=0.233645;AO=25;DP=106;FAO=25;FDP=107;FR=.;FRO=82;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=0.00407235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.4;QD=6.07025;RBI=0.00830061;REFB=-0.000566436;REVB=0.00723298;RO=81;SAF=13;SAR=12;SRF=46;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601139;STB=0.531506;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.000843352;OID=.;OPOS=57254927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:81:82:25:25:0.233645:12:13:46:35:12:13:46:36 chr6 57254950 . A AT 48.17 PASS AF=0.215909;AO=16;DP=96;FAO=19;FDP=88;FR=.;FRO=69;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=-0.100104;FXX=0.0434735;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.1217;QD=2.18957;RBI=0.126066;REFB=-0.0270465;REVB=-0.0766276;RO=79;SAF=5;SAR=11;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347125;STB=0.753837;STBP=0.016;TYPE=ins;VARB=0.057997;OID=.;OPOS=57254951;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.215909:16:96:19:88:69:5:14:41:28:48:79:5:11:47:32 chr6 57254955 . G A 41.46 PASS AF=0.108108;AO=6;DP=80;FAO=8;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=65;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.00528394;FXX=0.0975491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.259;QD=2.24109;RBI=0.036958;REFB=-0.00393439;REVB=-0.0365783;RO=45;SAF=4;SAR=2;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108603;STB=0.551471;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0573356;OID=.;OPOS=57254955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:80:74:45:65:6:8:0.108108:2:4:26:19:3:5:37:28 chr6 57254986 . G A 60.33 PASS AF=0.164179;AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=67;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0155504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.017;QD=3.60169;RBI=0.0324564;REFB=-0.0149041;REVB=-0.0284886;RO=56;SAF=7;SAR=4;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127685;STB=0.586432;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0404064;OID=.;OPOS=57254986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:67:67:56:56:11:11:0.164179:4:7:30:26:4:7:30:26 chr6 57255001 . C A 43.9 PASS AF=0.137931;AO=8;DP=58;FAO=8;FDP=58;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00262974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6253;QD=3.02766;RBI=0.0673126;REFB=0.000657469;REVB=-0.0672613;RO=50;SAF=5;SAR=3;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317031;STB=0.52267;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=-0.0162085;OID=.;OPOS=57255001;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:58:58:50:50:8:8:0.137931:3:5:30:20:3:5:30:20 chr6 57372361 . C A 1137.96 PASS AF=0.594286;AO=104;DP=175;FAO=104;FDP=175;FR=.;FRO=71;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=0.0144136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7915;QD=26.0106;RBI=0.016742;REFB=-0.00523438;REVB=-0.00851713;RO=69;SAF=49;SAR=55;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159387;STB=0.514582;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00250562;OID=.;OPOS=57372361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:69:71:104:104:0.594286:55:49:34:35:55:49:36:35 chr6 57393125 . A G 753.21 PASS AF=0.541353;AO=71;DP=132;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.00835679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.307;QD=22.653;RBI=0.0330252;REFB=-0.0195476;REVB=0.0319504;RO=60;SAF=34;SAR=37;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872011;STB=0.547621;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0189071;OID=.;OPOS=57393125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:60:61:71:72:0.541353:37:34:35:25:37:35:36:25 chr6 57393160 . G A 146.39 PASS AF=0.17931;AO=24;DP=142;FAO=26;FDP=145;FR=.;FRO=119;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=0.0327325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.145;QD=4.03828;RBI=0.0365783;REFB=-0.00455737;REVB=-0.0163265;RO=118;SAF=11;SAR=13;SRF=53;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118118;STB=0.537902;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0208736;OID=.;OPOS=57393160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:145:118:119:24:26:0.17931:13:11:53:65:13:13:54:65 chr6 57398154 . T C 682.81 PASS AF=0.426136;AO=75;DP=175;FAO=75;FDP=176;FR=.;FRO=101;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=0.0312022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3705;QD=15.5183;RBI=0.0345613;REFB=-0.00824511;REVB=-0.014863;RO=100;SAF=37;SAR=38;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854812;STB=0.544519;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0109195;OID=.;OPOS=57398154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:100:101:75:75:0.426136:38:37:41:59:38:37:42:59 chr6 57398157 . A G 723.85 PASS AF=0.440678;AO=78;DP=177;FAO=78;FDP=177;FR=.;FRO=99;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.00126532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.297;QD=16.3582;RBI=0.00890119;REFB=-0.0257944;REVB=-0.0088108;RO=99;SAF=39;SAR=39;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863261;STB=0.54801;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0401872;OID=.;OPOS=57398157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:99:99:78:78:0.440678:39:39:41:58:39:39:41:58 chr6 57398163 . A G 967.08 PASS AF=0.48;AO=96;DP=200;FAO=96;FDP=200;FR=.;FRO=104;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=-0.00756331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.116;QD=19.3417;RBI=0.0119646;REFB=-0.0109615;REVB=-0.00927084;RO=104;SAF=45;SAR=51;SRF=42;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617364;STB=0.534019;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0171736;OID=.;OPOS=57398163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:104:104:96:96:0.48:51:45:42:62:51:45:42:62 chr6 57398186 . G GA 93.09 PASS AF=0.198157;AO=44;DP=222;FAO=43;FDP=217;FR=.;FRO=174;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=75;FSRR=99;FWDB=0.198018;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.2418;QD=1.7159;RBI=0.20034;REFB=0.00918579;REVB=-0.0304124;RO=169;SAF=19;SAR=25;SRF=72;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00756022;STB=0.508814;STBP=0.904;TYPE=ins;VARB=-0.0237001;OID=.;OPOS=57398187;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.198157:44:222:43:217:174:19:24:75:99:93:169:19:25:72:97 chr6 57398201 . T C 1161.68 PASS AF=0.491525;AO=116;DP=236;FAO=116;FDP=236;FR=.;FRO=120;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=48;FSRR=72;FWDB=-0.0358334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.4414;QD=19.6895;RBI=0.040244;REFB=-0.00524114;REVB=-0.0183179;RO=119;SAF=54;SAR=62;SRF=47;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657095;STB=0.533623;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0111287;OID=.;OPOS=57398201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:119:120:116:116:0.491525:62:54:47:72:62:54:48:72 chr6 57398207 . G T 272.98 PASS AF=0.199153;AO=47;DP=236;FAO=47;FDP=236;FR=.;FRO=189;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=78;FSRR=111;FWDB=-0.00158542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7241;QD=4.62673;RBI=0.03068;REFB=0.00282789;REVB=0.030639;RO=189;SAF=22;SAR=25;SRF=78;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721102;STB=0.544774;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.011012;OID=.;OPOS=57398207;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:189:189:47:47:0.199153:25:22:78:111:25:22:78:111 chr6 57398226 . T G 596.52 PASS AF=0.375;AO=68;DP=235;FAO=69;FDP=184;FR=.;FRO=115;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=46;FSRR=69;FWDB=-0.054059;FXX=0.22033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8403;QD=12.9677;RBI=0.0563852;REFB=-0.00501253;REVB=0.0160286;RO=113;SAF=30;SAR=38;SRF=45;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483544;STB=0.522237;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00977508;OID=.;OPOS=57398226;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:184:113:115:68:69:0.375:38:30:45:68:39:30:46:69 chr6 57398264 . A G 1119.1 PASS AF=0.511416;AO=111;DP=219;FAO=112;FDP=219;FR=.;FRO=107;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=-0.0112354;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.135;QD=20.4402;RBI=0.0155018;REFB=-0.0115257;REVB=-0.0106805;RO=108;SAF=44;SAR=67;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103171;STB=0.504605;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00986941;OID=.;OPOS=57398264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:108:107:111:112:0.511416:67:44:44:64:68:44:43:64 chr6 57398270 . C T 219.01 PASS AF=0.186047;AO=40;DP=215;FAO=40;FDP=215;FR=.;FRO=175;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=68;FSRR=107;FWDB=-0.0232336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.083;QD=4.07468;RBI=0.0320296;REFB=-0.00559763;REVB=-0.0220475;RO=175;SAF=15;SAR=25;SRF=68;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185022;STB=0.511708;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0216212;OID=.;OPOS=57398270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:175:175:40:40:0.186047:25:15:68:107:25:15:68:107 chr6 57467084 . A G 259.31 PASS AF=0.227778;AO=41;DP=180;FAO=41;FDP=180;FR=.;FRO=139;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=72;FSRR=67;FWDB=-0.00828176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.347;QD=5.76251;RBI=0.0112571;REFB=-0.00191032;REVB=-0.00762459;RO=137;SAF=19;SAR=22;SRF=71;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692944;STB=0.542086;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00736058;OID=.;OPOS=57467084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:137:139:41:41:0.227778:22:19:71:66:22:19:72:67 chr6 57467093 . A G 282.56 PASS AF=0.22335;AO=44;DP=198;FAO=44;FDP=197;FR=.;FRO=153;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=78;FSRR=75;FWDB=0.00142786;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.829;QD=5.73716;RBI=0.00891436;REFB=-0.00271465;REVB=0.00879926;RO=150;SAF=21;SAR=23;SRF=75;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288424;STB=0.525248;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0064739;OID=.;OPOS=57467093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:150:153:44:44:0.22335:23:21:75:75:23:21:78:75 chr6 57467100 . G C 1136.42 PASS AF=0.547264;AO=110;DP=202;FAO=110;FDP=201;FR=.;FRO=91;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=53;FSRR=38;FWDB=0.00587216;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.672;QD=22.6153;RBI=0.00690205;REFB=-0.02242;REVB=0.00362712;RO=90;SAF=47;SAR=63;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124427;STB=0.570278;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0132549;OID=.;OPOS=57467100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:90:91:110:110:0.547264:63:47:52:38:63:47:53:38 chr6 57467107 . C T 319.51 PASS AF=0.236967;AO=50;DP=211;FAO=50;FDP=211;FR=.;FRO=161;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=79;FSRR=82;FWDB=-0.00909309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.553;QD=6.05703;RBI=0.03238;REFB=-0.00290669;REVB=-0.031077;RO=161;SAF=24;SAR=26;SRF=79;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135057;STB=0.508156;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0129952;OID=.;OPOS=57467107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:161:161:50:50:0.236967:26:24:79:82:26:24:79:82 chr6 57467175 . A G 478.53 PASS AF=0.309645;AO=60;DP=197;FAO=61;FDP=197;FR=.;FRO=136;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=70;FSRR=66;FWDB=-0.0219376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.53;QD=9.71625;RBI=0.0226454;REFB=-0.00926926;REVB=-0.00561741;RO=136;SAF=22;SAR=38;SRF=70;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179394;STB=0.608306;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0197069;OID=.;OPOS=57467175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:136:136:60:61:0.309645:38:22:70:66:39:22:70:66 chr6 57499049 . T A 60.01 PASS AF=0.0550459;AO=12;DP=220;FAO=12;FDP=218;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=192;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=76;FSRR=116;FWDB=-0.0419229;FXX=0.0090905;HRUN=7;LEN=1;MLLD=24.8873;QD=1.10107;RBI=0.0431953;REFB=0.00608826;REVB=-0.0104066;RO=128;SAF=1;SAR=11;SRF=44;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38893;STB=0.868884;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0499182;OID=.;OPOS=57499049;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:220:218:128:192:12:12:0.0550459:11:1:44:84:11:1:76:116 chr6 57512476 . G A 2052.23 PASS AF=0.516883;AO=199;DP=385;FAO=199;FDP=385;FR=.;FRO=186;FSAF=110;FSAR=89;FSRF=99;FSRR=87;FWDB=-1.11404e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.144;QD=21.3218;RBI=0.00136456;REFB=-0.00742962;REVB=-0.00136452;RO=184;SAF=110;SAR=89;SRF=98;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179007;STB=0.509996;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00662559;OID=.;OPOS=57512476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:385:184:186:199:199:0.516883:89:110:98:86:89:110:99:87 chr6 57512510 . T G 2356.74 PASS AF=0.526682;AO=227;DP=430;FAO=227;FDP=431;FR=.;FRO=204;FSAF=118;FSAR=109;FSRF=107;FSRR=97;FWDB=-0.00837153;FXX=0.00919519;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.326;QD=21.8723;RBI=0.0178211;REFB=-0.0273115;REVB=0.0157324;RO=203;SAF=118;SAR=109;SRF=106;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00203408;STB=0.502222;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0182514;OID=.;OPOS=57512510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:430:431:203:204:227:227:0.526682:109:118:106:97:109:118:107:97 chr6 57512529 . C A 609.61 PASS AF=0.222222;AO=97;DP=443;FAO=98;FDP=441;FR=.;FRO=343;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=178;FSRR=165;FWDB=-0.00270187;FXX=0.00451457;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.543;QD=5.5293;RBI=0.0248189;REFB=-7.20033e-05;REVB=-0.0246714;RO=340;SAF=53;SAR=44;SRF=177;SRR=163;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332442;STB=0.525072;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.000162939;OID=.;OPOS=57512529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:443:441:340:343:97:98:0.222222:44:53:177:163:44:54:178:165 chr6 57512565 . T C 1919.95 PASS AF=0.523161;AO=172;DP=348;FAO=192;FDP=367;FR=.;FRO=175;FSAF=95;FSAR=97;FSRF=93;FSRR=82;FWDB=0.044528;FXX=0.00271732;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.257;QD=20.9258;RBI=0.0450465;REFB=-0.00181204;REVB=-0.00681497;RO=175;SAF=75;SAR=97;SRF=93;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880747;STB=0.517464;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00282607;OID=.;OPOS=57512565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:367:175:175:172:192:0.523161:97:75:93:82:97:95:93:82 chr6 57512678 . G A 516.87 PASS AF=0.69697;AO=45;DP=65;FAO=46;FDP=66;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0527615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4933;QD=31.3252;RBI=0.0541746;REFB=-0.0456063;REVB=0.0122929;RO=20;SAF=17;SAR=28;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723373;STB=0.534045;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0195793;OID=.;OPOS=57512678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:20:20:45:46:0.69697:28:17:10:10:28:18:10:10 chr6 58141869 . C T 154.82 PASS AF=0.206349;AO=26;DP=126;FAO=26;FDP=126;FR=.;FRO=100;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=38;FWDB=0.0125051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.62;QD=4.9149;RBI=0.0218527;REFB=-0.00196138;REVB=-0.017921;RO=97;SAF=15;SAR=11;SRF=62;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823756;STB=0.535371;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0085565;OID=.;OPOS=58141869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:97:100:26:26:0.206349:11:15:62:35:11:15:62:38 chr6 58141876 . C T 1267.37 PASS AF=0.785714;AO=99;DP=126;FAO=99;FDP=126;FR=.;FRO=27;FSAF=61;FSAR=38;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00875912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.452;QD=40.2339;RBI=0.0113795;REFB=0.00327492;REVB=-0.00726441;RO=27;SAF=61;SAR=38;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099892;STB=0.505324;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00114236;OID=.;OPOS=58141876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:27:27:99:99:0.785714:38:61:16:11:38:61:16:11 chr6 58141878 . A G 153.74 PASS AF=0.203125;AO=26;DP=128;FAO=26;FDP=128;FR=.;FRO=102;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=64;FSRR=38;FWDB=-0.00173138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.566;QD=4.80432;RBI=0.00556604;REFB=0.00161813;REVB=-0.00528991;RO=102;SAF=15;SAR=11;SRF=64;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668264;STB=0.541739;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.0116069;OID=.;OPOS=58141878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:102:102:26:26:0.203125:11:15:64:38:11:15:64:38 chr6 58141886 . G C 1814.8 PASS AF=0.953488;AO=123;DP=129;FAO=123;FDP=129;FR=.;FRO=6;FSAF=74;FSAR=49;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0107512;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=284.194;QD=56.2729;RBI=0.020398;REFB=0.0151463;REVB=0.0173347;RO=6;SAF=74;SAR=49;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214285;STB=0.511291;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-0.000248445;OID=.;OPOS=58141886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:129:129:6:6:123:123:0.953488:49:74:5:1:49:74:5:1 chr6 58141920 . G C 128.21 PASS AF=0.185484;AO=23;DP=124;FAO=23;FDP=124;FR=.;FRO=101;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=42;FWDB=-0.00136185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.916;QD=4.13591;RBI=0.0146507;REFB=-0.00691775;REVB=-0.0145873;RO=101;SAF=14;SAR=9;SRF=59;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324165;STB=0.52077;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0275644;OID=.;OPOS=58141920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:101:101:23:23:0.185484:9:14:59:42:9:14:59:42 chr6 58141935 . T C 38.3 PASS AF=0.0925926;AO=10;DP=108;FAO=10;FDP=108;FR=.;FRO=98;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.000335773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4408;QD=1.4187;RBI=0.046491;REFB=0.000750273;REVB=-0.0464898;RO=98;SAF=9;SAR=1;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437772;STB=0.860053;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00945128;OID=.;OPOS=58141935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:108:108:98:98:10:10:0.0925926:1:9:55:43:1:9:55:43 chr6 58196684 . G A 906.36 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.283;QD=57.5469;RBI=0.0246145;REFB=0;REVB=0.0072806;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.62179e-05;OID=.;OPOS=58196684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:27:36:0:0 chr6 62282965 . C T 1988.79 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5936;QD=62.1497;RBI=0.0800752;REFB=0;REVB=0.0449581;RO=0;SAF=50;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111106;OID=.;OPOS=62282965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:78:50:0:0:78:50:0:0 chr6 62283016 . T G 1010.92 PASS AF=0.958904;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0620084;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.28;QD=55.3929;RBI=0.0634191;REFB=-0.0607883;REVB=0.0133015;RO=3;SAF=29;SAR=41;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464281;STB=0.524583;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.000892531;OID=.;OPOS=62283016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:73:73:3:3:70:70:0.958904:41:29:3:0:41:29:3:0 chr6 62284247 . T G 2067.91 PASS AF=0.992593;AO=131;DP=132;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6999;QD=61.2715;RBI=0.0614477;REFB=-0.0943201;REVB=0.0557282;RO=1;SAF=64;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736859;STB=0.503816;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00218894;OID=.;OPOS=62284247;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:132:135:1:1:131:134:0.992593:67:64:1:0:69:65:1:0 chr6 62284487 . C T 2317.63 PASS AF=1;AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548916;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.719;QD=63.9346;RBI=0.00651008;REFB=0;REVB=0.00350004;RO=0;SAF=78;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.14042e-06;OID=.;OPOS=62284487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:145:0:0:145:145:1:67:78:0:0:67:78:0:0 chr6 62284512 . T C 1952.22 PASS AF=1;AO=125;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.497;QD=61.9754;RBI=0.0148215;REFB=0;REVB=0.00968173;RO=0;SAF=68;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74701e-06;OID=.;OPOS=62284512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:126:0:0:125:126:1:57:68:0:0:58:68:0:0 chr6 62390916 . T C 2566.24 PASS AF=1;AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00585119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.57;QD=61.837;RBI=0.016825;REFB=0;REVB=0.0157748;RO=0;SAF=84;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20256e-05;OID=.;OPOS=62390916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:166:166:0:0:166:166:1:82:84:0:0:82:84:0:0 chr6 62887099 . C T 1624.35 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0004;QD=60.1611;RBI=0.0187108;REFB=0;REVB=-0.0123929;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001227;OID=.;OPOS=62887099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:60:48:0:0:60:48:0:0 chr6 63921853 . A G 1288.47 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427355;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.759;QD=62.0951;RBI=0.043161;REFB=0;REVB=-0.00604567;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8364e-05;OID=.;OPOS=63921853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:45:38:0:0:45:38:0:0 chr6 63921873 . A T 1321.53 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.298;QD=62.1895;RBI=0.0284606;REFB=0;REVB=-0.0054153;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13394e-05;OID=.;OPOS=63921873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:44:40:0:0:44:41:0:0 chr6 63921924 . A G 911.76 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0300031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.824;QD=55.2582;RBI=0.0313985;REFB=0.0864527;REVB=-0.00925636;RO=2;SAF=32;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00165813;OID=.;OPOS=63921924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:32:32:1:1:32:32:1:1 chr6 63922023 . C T 927.58 PASS AF=0.984848;AO=63;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0717074;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.737;QD=56.2172;RBI=0.0717156;REFB=-0.129112;REVB=0.00107996;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017815;STB=0.508769;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000774275;OID=.;OPOS=63922023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:63:65:0.984848:37:26:1:0:37:28:1:0 chr6 63922916 . T C 691.71 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106797;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6069;QD=62.8831;RBI=0.110627;REFB=0;REVB=0.0288582;RO=0;SAF=3;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00286214;OID=.;OPOS=63922916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:41:3:0:0:41:3:0:0 chr6 64290633 . ATTTTT ATTTTC,ATT,ATTTT 216.96 PASS AF=0.209302,0.627907,0.162791;AO=2,6,11;DP=43;FAO=9,27,7;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20,7;FSAR=9,7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344895,0.255135,0.731035;FXX=0;HRUN=15,15,15;LEN=1,3,1;MLLD=116.331,7.82058,2.77873;QD=20.1819;RBI=0.0584307,0.315229,0.91977;REFB=-0.00582307,0.003616,0.00594147;REVB=-0.0471659,-0.185136,-0.55818;RO=4;SAF=0,3,11;SAR=2,3,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.767801,-0.344363,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0916188,0.160345,-0.123828;OID=.,.,.;OPOS=64290638,64290634,64290634;OREF=T,TTT,T;OALT=C,-,-;OMAPALT=ATTTTC,ATT,ATTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.209302,0.627907,0.162791:2,6,11:43:9,27,7:43:0:0,20,7:9,7,0:0:0:50:4:0,3,11:2,3,0:4:0 chr6 64694354 . C T 662.17 PASS AF=0.571429;AO=64;DP=112;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0172718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.677;QD=23.6491;RBI=0.0177332;REFB=-0.0171933;REVB=-0.00401916;RO=48;SAF=31;SAR=33;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204725;STB=0.511176;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0152407;OID=.;OPOS=64694354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:48:48:64:64:0.571429:33:31:22:26:33:31:22:26 chr6 65016977 . TGA T 197.66 PASS AF=0.489362;AO=17;DP=50;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.018767;FXX=0.0961354;HRUN=1;LEN=2;MLLD=85.045;QD=16.8224;RBI=0.0409748;REFB=-0.158746;REVB=-0.0364244;RO=20;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278045;STB=0.553459;STBP=0.477;TYPE=del;VARB=0.156907;OID=.;OPOS=65016978;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.489362:17:50:23:47:24:11:12:14:10:99:20:9:8:10:10 chr6 65149185 . T A 359.7 PASS AF=0.403846;AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0777561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9683;QD=13.8346;RBI=0.0780112;REFB=-0.00079038;REVB=0.00630387;RO=62;SAF=20;SAR=22;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602552;STB=0.534054;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=1.81014e-05;OID=.;OPOS=65149185;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:62:42:42:0.403846:22:20:26:36:22:20:26:36 chr6 65300143 . G C 338.08 PASS AF=0.5;AO=35;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.020362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7465;QD=18.7823;RBI=0.056981;REFB=-0.0193769;REVB=0.0532187;RO=36;SAF=18;SAR=17;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164296;STB=0.596426;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0215872;OID=.;OPOS=65300143;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:36:36:35:36:0.5:17:18:12:24:17:19:12:24 chr6 65301167 . C T 474.26 PASS AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=-0.0568687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4437;QD=18.9705;RBI=0.0656592;REFB=-0.0337352;REVB=0.032819;RO=53;SAF=27;SAR=20;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289277;STB=0.66011;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0324325;OID=.;OPOS=65301167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:53:53:47:47:0.47:20:27:14:39:20:27:14:39 chr6 65301211 . T C 483.56 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=0.0169351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.274;QD=19.1511;RBI=0.0225886;REFB=-0.00649954;REVB=0.0149482;RO=51;SAF=30;SAR=20;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273722;STB=0.651104;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00637589;OID=.;OPOS=65301211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:51:50:50:0.49505:20:30:15:36:20:30:15:36 chr6 65301217 . G A 486.4 PASS AF=0.495146;AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=0.0142895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8386;QD=18.8893;RBI=0.0209595;REFB=-0.0128174;REVB=0.0153334;RO=52;SAF=31;SAR=20;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301704;STB=0.666357;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00940733;OID=.;OPOS=65301217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:52:52:51:51:0.495146:20:31:14:38:20:31:14:38 chr6 65301408 . A G 382.34 PASS AF=0.368;AO=46;DP=125;FAO=46;FDP=125;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=-0.0165451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.327;QD=12.2348;RBI=0.0408369;REFB=-0.00716323;REVB=-0.0373352;RO=78;SAF=25;SAR=21;SRF=49;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953285;STB=0.54929;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.012983;OID=.;OPOS=65301408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:78:79:46:46:0.368:21:25:49:29:21:25:49:30 chr6 65301504 . A G 440.58 PASS AF=0.416667;AO=50;DP=120;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=0.0178728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.847;QD=14.6861;RBI=0.0213893;REFB=-0.00342952;REVB=0.0117502;RO=70;SAF=24;SAR=26;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207468;STB=0.51167;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00625155;OID=.;OPOS=65301504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:70:70:50:50:0.416667:26:24:35:35:26:24:35:35 chr6 65301679 . T C 323.27 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.00497705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.1937;QD=16.7931;RBI=0.0423835;REFB=-0.0091925;REVB=-0.0420902;RO=42;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120815;STB=0.56753;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00735949;OID=.;OPOS=65301679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:20:15:13:29:20:15:13:29 chr6 65301734 . G A 406.87 PASS AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=44;FWDB=0.00950598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.075;QD=15.9558;RBI=0.0193719;REFB=-0.0139014;REVB=-0.0168792;RO=57;SAF=20;SAR=25;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226692;STB=0.625799;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.019776;OID=.;OPOS=65301734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:57:57:45:45:0.441176:25:20:13:44:25:20:13:44 chr6 65301787 . G C 384.56 PASS AF=0.401786;AO=43;DP=110;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0255583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.766;QD=13.7341;RBI=0.0308876;REFB=0.00113419;REVB=0.0173441;RO=67;SAF=17;SAR=26;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767805;STB=0.545435;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00111378;OID=.;OPOS=65301787;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:67:67:43:45:0.401786:26:17:22:45:27:18:22:45 chr6 65301824 . T C 334.89 PASS AF=0.397849;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=0.00852795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.347;QD=14.4037;RBI=0.0100712;REFB=-0.000888514;REVB=-0.00535747;RO=56;SAF=14;SAR=23;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241052;STB=0.513674;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.001714;OID=.;OPOS=65301824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:56:56:37:37:0.397849:23:14:20:36:23:14:20:36 chr6 65301854 . G A 187.91 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0107261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.313;QD=10.8933;RBI=0.0394738;REFB=-0.0170005;REVB=-0.0379886;RO=45;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982881;STB=0.556916;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.035411;OID=.;OPOS=65301854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:14:10:15:30:14:10:15:30 chr6 65303100 . T C 468.58 PASS AF=0.433333;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=120;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=10;FSRR=58;FWDB=0.0011841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6729;QD=15.6195;RBI=0.0258954;REFB=-0.00988818;REVB=0.0258683;RO=68;SAF=9;SAR=43;SRF=10;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477551;STB=0.526641;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0144102;OID=.;OPOS=65303100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:68:68:52:52:0.433333:43:9:10:58:43:9:10:58 chr6 65622463 . A G 1321.24 PASS AF=0.978022;AO=87;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0321796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9826;QD=58.0764;RBI=0.0749932;REFB=-0.184368;REVB=0.0677381;RO=4;SAF=25;SAR=62;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00380039;STB=0.505928;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00450687;OID=.;OPOS=65622463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:91:91:4:2:87:89:0.978022:62:25:1:3:64:25:1:1 chr6 66005888 . C T 2515.89 PASS AF=0.993939;AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=165;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00422538;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.733;QD=60.9912;RBI=0.00593266;REFB=-0.0759647;REVB=-0.00416444;RO=1;SAF=78;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606185;STB=0.503184;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000117409;OID=.;OPOS=66005888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:166:165:1:1:164:164:0.993939:86:78:1:0:86:78:1:0 chr6 66005970 . G A 1208.99 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.009;QD=61.2148;RBI=0.0132577;REFB=0;REVB=-0.00951492;RO=0;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86192e-07;OID=.;OPOS=66005970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:77:79:1:45:32:0:0:45:34:0:0 chr6 66063513 . G A 695.87 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0168681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.516;QD=60.5101;RBI=0.0313951;REFB=0.050544;REVB=0.0264786;RO=1;SAF=18;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025391;STB=0.513507;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.00045183;OID=.;OPOS=66063513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:27:18:1:0:27:18:1:0 chr6 66112409 . A G 316.02 PASS AF=0.411765;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.000479133;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.811;QD=14.8715;RBI=0.0197721;REFB=-0.0137078;REVB=0.0197663;RO=49;SAF=11;SAR=24;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106763;STB=0.556021;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0199172;OID=.;OPOS=66112409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:49:50:35:35:0.411765:24:11:20:29:24:11:20:30 chr6 66204945 . G A 44.03 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0325281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.503;QD=6.52321;RBI=0.0341433;REFB=-0.00168538;REVB=-0.0103772;RO=20;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265835;STB=0.676826;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0124578;OID=.;OPOS=66204945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:6:1:6:14:6:1:6:14 chr6 68599166 . A G 578.79 PASS AF=0.448529;AO=61;DP=136;FAO=61;FDP=136;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=-0.00363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.664;QD=17.0232;RBI=0.00424315;REFB=-0.00430577;REVB=-0.00219714;RO=75;SAF=25;SAR=36;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655762;STB=0.536469;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00679806;OID=.;OPOS=68599166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:75:75:61:61:0.448529:36:25:26:49:36:25:26:49 chr6 68599169 . A T 572.1 PASS AF=0.465116;AO=59;DP=132;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=0.0108731;FXX=0.0300729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.331;QD=17.7394;RBI=0.0108806;REFB=-0.0157342;REVB=0.000404003;RO=73;SAF=25;SAR=34;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695246;STB=0.546544;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0235778;OID=.;OPOS=68599169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:129:73:69:59:60:0.465116:34:25:26:47:35:25:23:46 chr6 69666684 . A G 579.41 PASS AF=0.611765;AO=52;DP=85;FAO=52;FDP=85;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0090696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.805;QD=27.2665;RBI=0.0291235;REFB=0.00451699;REVB=-0.0276753;RO=33;SAF=19;SAR=33;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445784;STB=0.524304;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.00247553;OID=.;OPOS=69666684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:33:33:52:52:0.611765:33:19:14:19:33:19:14:19 chr6 70071173 . G A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.806;QD=57.1772;RBI=0.0263982;REFB=0;REVB=0.0260769;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183436;OID=.;OPOS=70071173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr6 70407465 . A T 1555.8 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462847;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.553;QD=63.5018;RBI=0.0528867;REFB=0;REVB=0.0255878;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118156;OID=.;OPOS=70407465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:97:98:1:45:52:0:0:46:52:0:0 chr6 70812123 . A G 215.87 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.0273479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.014;QD=15.1484;RBI=0.0278408;REFB=-0.0138406;REVB=-0.00521598;RO=32;SAF=9;SAR=16;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123435;STB=0.569568;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0213808;OID=.;OPOS=70812123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:16:9:8:24:16:9:8:24 chr6 70856535 . AC A,AT 1411.94 PASS AF=0.0107527,0.989247;AO=23,61;DP=93;FAO=1,92;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=1,44;FSAR=0,48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0050929,0.00540438;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.62,108.131;QD=60.7287;RBI=0.108486,0.14477;REFB=0,0;REVB=0.108366,0.144669;RO=0;SAF=6,35;SAR=17,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=2.9951e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00340938,0.00337896;OID=.,.;OPOS=70856536,70856536;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0107527,0.989247:23,61:93:1,92:93:0:1,44:0,48:0:0:6:0:6,35:17,26:0:0 chr6 70866609 . C T 1822.49 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.707;QD=61.2602;RBI=0.00819087;REFB=0;REVB=0.00320504;RO=0;SAF=49;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0618e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45974e-05;OID=.;OPOS=70866609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:70:49:0:0:70:49:0:0 chr6 70916888 . A C 501.93 PASS AF=0.505155;AO=47;DP=95;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.00353589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.661;QD=20.698;RBI=0.00719421;REFB=-0.0165231;REVB=-0.00626531;RO=48;SAF=19;SAR=28;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236204;STB=0.636384;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.018402;OID=.;OPOS=70916888;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:48:48:47:49:0.505155:28:19:32:16:30:19:32:16 chr6 70917559 . A AT,T 660.74 PASS AF=1,0;AO=37,2;DP=49;FAO=42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636992,0.00201485;FXX=0.142828;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=84.999,177.05;QD=62.9278;RBI=0.0676827,0.0199503;REFB=0,0;REVB=-0.0228772,-0.0198483;RO=7;SAF=16,1;SAR=21,1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0445262,0.224092;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=1.17831e-05,0;OID=.,.;OPOS=70917560,70917559;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:49:42:7:0:37,2:42,0:1,0:21,1:16,1:2:5:23,0:19,0:0:0 chr6 70944244 . T C 248.32 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=0.0364931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.337;QD=11.6856;RBI=0.0470755;REFB=-0.00241531;REVB=0.0297382;RO=54;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186797;STB=0.599936;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00122941;OID=.;OPOS=70944244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:54:55:30:30:0.352941:15:15:18:36:15:15:19:36 chr6 70944285 . C T 242.76 PASS AF=0.367089;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.00106751;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.826;QD=12.2917;RBI=0.00987396;REFB=-0.00550051;REVB=-0.00981609;RO=49;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113858;STB=0.570231;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0101407;OID=.;OPOS=70944285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:49:50:29:29:0.367089:16:13:17:32:16:13:17:33 chr6 70961833 . T C 221.75 PASS AF=0.488889;AO=19;DP=43;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.00291396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.216;QD=19.7111;RBI=0.00469166;REFB=0.0037569;REVB=0.00367702;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258183;STB=0.630091;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.00544866;OID=.;OPOS=70961833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:45:23:23:19:22:0.488889:8:11:19:4:9:13:19:4 chr6 70962039 . C T 359.9 PASS AF=0.403846;AO=41;DP=102;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0432392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0269;QD=13.8424;RBI=0.0449348;REFB=0.0156513;REVB=0.0122272;RO=60;SAF=13;SAR=28;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185226;STB=0.594548;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.0248314;OID=.;OPOS=70962039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:60:62:41:42:0.403846:28:13:29:31:28:14:30:32 chr6 70963124 . A C 346.26 PASS AF=0.401961;AO=37;DP=101;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0265248;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.101;QD=13.579;RBI=0.0272181;REFB=-0.0157943;REVB=0.00610389;RO=60;SAF=20;SAR=17;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620675;STB=0.566169;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0263918;OID=.;OPOS=70963124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:60:61:37:41:0.401961:17:20:29:31:17:24:29:32 chr6 70963156 . T G 592.85 PASS AF=0.563107;AO=55;DP=103;FAO=58;FDP=103;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0205785;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6816;QD=23.0231;RBI=0.104691;REFB=-0.00976397;REVB=0.102649;RO=45;SAF=23;SAR=32;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771775;STB=0.551163;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00845819;OID=.;OPOS=70963156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:45:45:55:58:0.563107:32:23:23:22:35:23:23:22 chr6 70981786 . A G 402.47 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.0350363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4879;QD=16.5968;RBI=0.0382178;REFB=-0.00536211;REVB=0.0152664;RO=55;SAF=11;SAR=31;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102477;STB=0.55786;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00757564;OID=.;OPOS=70981786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:31:11:19:36:31:11:19:36 chr6 70984436 . A G 2253.67 PASS AF=1;AO=140;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529751;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.627;QD=63.9338;RBI=0.0530313;REFB=0;REVB=-0.00244018;RO=0;SAF=77;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20153e-05;OID=.;OPOS=70984436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:141:0:0:140:141:1:63:77:0:0:64:77:0:0 chr6 70989703 . A G 1643.32 PASS AF=0.990991;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0130078;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.3582;QD=59.2187;RBI=0.0145065;REFB=-0.0191442;REVB=-0.00642154;RO=1;SAF=56;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840219;STB=0.504424;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00050047;OID=.;OPOS=70989703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:111:111:1:1:110:110:0.990991:54:56:1:0:54:56:1:0 chr6 71238105 . A G 192.84 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00647488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.599;QD=14.8342;RBI=0.00657376;REFB=-0.0241728;REVB=-0.00113589;RO=30;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794843;STB=0.545413;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0257802;OID=.;OPOS=71238105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:10:12:14:16:10:12:14:16 chr6 71546702 . C T 455.76 PASS AF=0.479167;AO=45;DP=97;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0349878;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9846;QD=18.9901;RBI=0.0349891;REFB=0.0137107;REVB=-0.000300769;RO=50;SAF=21;SAR=24;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444658;STB=0.530469;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=-0.0130173;OID=.;OPOS=71546702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:50:50:45:46:0.479167:24:21:21:29:24:22:21:29 chr6 71547572 . A T 324.15 PASS AF=0.290541;AO=42;DP=146;FAO=43;FDP=148;FR=.;FRO=105;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=54;FWDB=-0.0585282;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4831;QD=8.76087;RBI=0.0589657;REFB=0.00104234;REVB=0.00717013;RO=103;SAF=22;SAR=20;SRF=49;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058023;STB=0.51837;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.00534937;OID=.;OPOS=71547572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:148:103:105:42:43:0.290541:20:22:49:54:21:22:51:54 chr6 71665986 . G A 39.06 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00200995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.912;QD=12.0192;RBI=0.0765882;REFB=-0.00311907;REVB=0.0765618;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529316;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0034849;OID=.;OPOS=71665986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:2:4:4:2:2:4:5:2 chr6 72006512 . T C 221.92 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.00564542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.821;QD=18.4933;RBI=0.0331603;REFB=-0.00940948;REVB=0.0326762;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226663;STB=0.626946;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0115957;OID=.;OPOS=72006512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:21:5:9:13:21:5 chr6 72889471 . T TG 1505.61 PASS AF=1;AO=19;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161105;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=143.496;QD=48.9629;RBI=0.162381;REFB=0;REVB=0.0203122;RO=102;SAF=0;SAR=19;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.689452;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000397845;OID=.;OPOS=72889472;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:124:123:123:0:39:84:0:0:10:102:0:19:39:63 chr6 72889472 . A G 1366.9 PASS AF=0.837398;AO=103;DP=123;FAO=103;FDP=123;FR=.;FRO=20;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=-0.00609468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.689;QD=44.4519;RBI=0.0119115;REFB=-0.0215557;REVB=0.0102342;RO=20;SAF=39;SAR=64;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127593;STB=0.567555;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00773175;OID=.;OPOS=72889472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:20:20:103:103:0.837398:64:39:0:20:64:39:0:20 chr6 72892257 . A G 446.93 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00932658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9042;QD=57.6689;RBI=0.0193555;REFB=0;REVB=0.0169602;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024276;OID=.;OPOS=72892257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr6 74079024 . A G 394.27 PASS AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00144297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.04;QD=17.3305;RBI=0.0143427;REFB=-0.00722886;REVB=-0.0142699;RO=50;SAF=29;SAR=12;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274854;STB=0.654549;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00778932;OID=.;OPOS=74079024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:50:50:41:41:0.450549:12:29:22:28:12:29:22:28 chr6 74079041 . A C 1406.7 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1196;QD=62.5198;RBI=0.0834612;REFB=0;REVB=0.0753064;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000778176;OID=.;OPOS=74079041;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:88:90:1:41:47:0:0:42:48:0:0 chr6 74079414 . A T 96.3 PASS AF=0.647059;AO=10;DP=16;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00429312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.854;QD=22.6597;RBI=0.0349911;REFB=-0.0336786;REVB=0.0347268;RO=6;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123424;STB=0.580485;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0299874;OID=.;OPOS=74079414;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:17:6:6:10:11:0.647059:2:8:4:2:2:9:4:2 chr6 74155346 . G T 376.27 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0291414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.596;QD=18.8134;RBI=0.0365887;REFB=-0.0215977;REVB=-0.022125;RO=41;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000575833;STB=0.500321;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0156302;OID=.;OPOS=74155346;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:20:19:20:21:20:19:20:21 chr6 74161801 . G T 305.24 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2717;QD=53.086;RBI=0.11155;REFB=0;REVB=0.101791;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0041422;OID=.;OPOS=74161801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr6 74190448 . T C 212.62 PASS AF=0.45283;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0425126;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.098;QD=16.0465;RBI=0.0599239;REFB=0.0203206;REVB=0.0422321;RO=29;SAF=7;SAR=16;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25302;STB=0.667614;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0258266;OID=.;OPOS=74190448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:23:24:0.45283:16:7:16:13:17:7:17:12 chr6 74466377 . C T 955.18 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.971;QD=58.7805;RBI=0.036243;REFB=0;REVB=0.0188391;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156906;OID=.;OPOS=74466377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0 chr6 74493432 . A C 1041.94 PASS AF=0.497653;AO=106;DP=213;FAO=106;FDP=213;FR=.;FRO=107;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=58;FSRR=49;FWDB=0.00222067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.839;QD=19.5669;RBI=0.0291842;REFB=-0.00152238;REVB=-0.0290996;RO=107;SAF=64;SAR=42;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581265;STB=0.531963;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00143056;OID=.;OPOS=74493432;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:107:107:106:106:0.497653:42:64:58:49:42:64:58:49 chr6 74497009 . A G 335.98 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00252999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.109;QD=19.7635;RBI=0.0861159;REFB=-0.0259026;REVB=0.0860788;RO=33;SAF=17;SAR=18;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131358;STB=0.572823;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0176704;OID=.;OPOS=74497009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:18:17:21:12:18:17:21:12 chr6 74497152 . G A 91.82 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00159807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.272;QD=8.74515;RBI=0.0204897;REFB=-0.017007;REVB=-0.0204272;RO=29;SAF=3;SAR=9;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393415;STB=0.731313;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0303389;OID=.;OPOS=74497152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:29:30:12:12:0.285714:9:3:17:12:9:3:17:13 chr6 74521947 . C T 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=-0.0151608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.408;QD=19.5767;RBI=0.0385471;REFB=-0.0080817;REVB=-0.0354405;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229157;STB=0.626481;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00918701;OID=.;OPOS=74521947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:16:17:24:7:16:17:24:7 chr6 74533192 . T G 868.25 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.003;QD=57.8832;RBI=0.0294907;REFB=0;REVB=-0.0014041;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139016;OID=.;OPOS=74533192;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0 chr6 75825625 . A C 411.47 PASS AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0184378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6805;QD=18.4928;RBI=0.0297295;REFB=0.0047151;REVB=0.0233214;RO=47;SAF=21;SAR=21;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503747;STB=0.528077;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.00538105;OID=.;OPOS=75825625;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:21:21:26:21:21:21:26:21 chr6 75838071 . G T 498.32 PASS AF=0.457627;AO=53;DP=117;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.0114029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.262;QD=16.8922;RBI=0.0321683;REFB=-0.0177834;REVB=0.0300795;RO=64;SAF=30;SAR=23;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00352855;STB=0.503815;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0186987;OID=.;OPOS=75838071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:64:64:53:54:0.457627:23:30:36:28:24:30:36:28 chr6 75841722 . A T 2426.19 PASS AF=1;AO=158;DP=160;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00477271;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.084;QD=61.4224;RBI=0.0332727;REFB=0;REVB=0.0329286;RO=0;SAF=106;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82821e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79102e-05;OID=.;OPOS=75841722;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:158:0:0:158:158:1:52:106:0:0:52:106:0:0 chr6 76138146 . C CAG 299.12 PASS AF=0.44;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0228901;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=2;MLLD=301.456;QD=15.9529;RBI=0.0229358;REFB=-0.0195547;REVB=-0.00144698;RO=42;SAF=14;SAR=19;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00439658;STB=0.502478;STBP=0.972;TYPE=ins;VARB=0.0257698;OID=.;OPOS=76138147;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.44:33:76:33:75:42:14:19:18:24:99:42:14:19:18:24 chr6 76369054 . A G 1766.37 PASS AF=1;AO=114;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356034;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.406;QD=60.9094;RBI=0.0484937;REFB=0;REVB=0.0329247;RO=0;SAF=44;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40696e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019419;OID=.;OPOS=76369054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:116:0:0:114:116:1:70:44:0:0:71:45:0:0 chr6 76425594 . A C 281.26 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0135959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.232;QD=21.227;RBI=0.0140071;REFB=-0.00401444;REVB=0.0033692;RO=23;SAF=15;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100271;STB=0.545423;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00322583;OID=.;OPOS=76425594;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:24:29:29:0.54717:14:15:9:14:14:15:10:14 chr6 76625079 . T C 466.41 PASS AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0120553;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=325.421;QD=19.847;RBI=0.0124381;REFB=0.000714254;REVB=-0.00306198;RO=48;SAF=25;SAR=21;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13516;STB=0.574945;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.000913107;OID=.;OPOS=76625079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:21:25:19:29:21:25:19:29 chr6 76631823 . C T 243.56 PASS AF=0.509804;AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0164082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.131;QD=19.103;RBI=0.0164868;REFB=0.00625126;REVB=-0.0016084;RO=25;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511619;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00346661;OID=.;OPOS=76631823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:25:25:25:26:0.509804:15:10:10:15:15:11:10:15 chr6 76660551 . G C 370.66 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0197215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6129;QD=22.8098;RBI=0.0312915;REFB=-0.0356207;REVB=-0.0242944;RO=28;SAF=20;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00379816;STB=0.502091;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.021663;OID=.;OPOS=76660551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:17:20:15:13:17:20:15:13 chr6 78172260 . C G 176.77 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=2;FWDB=0.00306959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.586;QD=13.3414;RBI=0.00319605;REFB=-0.0100585;REVB=-0.000890125;RO=32;SAF=18;SAR=3;SRF=30;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20528;STB=0.615295;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0224592;OID=.;OPOS=78172260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:3:18:30:2:3:18:30:2 chr6 78172992 . G A 668.85 PASS AF=0.422857;AO=73;DP=176;FAO=74;FDP=175;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=0.00604491;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.613;QD=15.2879;RBI=0.0172725;REFB=-0.022606;REVB=0.0161802;RO=99;SAF=33;SAR=40;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857465;STB=0.545555;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0272807;OID=.;OPOS=78172992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:99:101:73:74:0.422857:40:33:53:46:41:33:53:48 chr6 79595097 . A G 206.79 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00196649;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.639;QD=16.8804;RBI=0.0123141;REFB=-0.015734;REVB=0.0121561;RO=27;SAF=16;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150617;STB=0.586124;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0314141;OID=.;OPOS=79595097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:6:16:16:11:6:16:16:11 chr6 79595167 . A ACTTAT 471.52 PASS AF=0.894737;AO=33;DP=39;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0345666;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=5;MLLD=275.564;QD=49.6331;RBI=0.0387903;REFB=-0.0580175;REVB=-0.0176022;RO=4;SAF=15;SAR=18;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10948;STB=0.555523;STBP=0.05;TYPE=ins;VARB=0.00753279;OID=.;OPOS=79595168;OREF=-;OALT=CTTAT;OMAPALT=ACTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.894737:33:39:34:38:4:16:18:4:0:19:4:15:18:4:0 chr6 79612744 . CA C 196.87 PASS AF=0.419753;AO=33;DP=82;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0325553;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.6353;QD=9.72181;RBI=0.0948104;REFB=-0.00561465;REVB=0.0890459;RO=47;SAF=18;SAR=15;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304054;STB=0.50922;STBP=0.886;TYPE=del;VARB=0.00817854;OID=.;OPOS=79612745;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.419753:33:82:34:81:47:19:15:27:20:99:47:18:15:27:20 chr6 79650639 . A G 570.33 PASS AF=0.495798;AO=58;DP=119;FAO=59;FDP=119;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.0101848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.791;QD=19.1707;RBI=0.0103621;REFB=-0.00597063;REVB=-0.00190901;RO=59;SAF=28;SAR=30;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00800321;STB=0.504272;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00810312;OID=.;OPOS=79650639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:59:60:58:59:0.495798:30:28:29:30:30:29:30:30 chr6 79656562 . A T 331.71 PASS AF=0.380952;AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=-0.00650702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.563;QD=12.6366;RBI=0.022894;REFB=-0.00808934;REVB=-0.0219498;RO=65;SAF=23;SAR=17;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188569;STB=0.607208;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00857219;OID=.;OPOS=79656562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:65:40:40:0.380952:17:23:26:39:17:23:26:39 chr6 79656570 . G A 310.81 PASS AF=0.366337;AO=37;DP=101;FAO=37;FDP=101;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.0195043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9122;QD=12.3094;RBI=0.0197349;REFB=0.0124471;REVB=-0.00300804;RO=64;SAF=22;SAR=15;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223143;STB=0.627508;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.0228445;OID=.;OPOS=79656570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:64:64:37:37:0.366337:15:22:25:39:15:22:25:39 chr6 79675701 . A G 275.6 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=0.0487863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7698;QD=13.2817;RBI=0.0578845;REFB=0.00302537;REVB=0.0311532;RO=51;SAF=12;SAR=20;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719418;STB=0.540959;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=-0.00280811;OID=.;OPOS=79675701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:20:12:16:35:20:12:16:35 chr6 79708000 . A C 1514.47 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00352128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4507;QD=62.4524;RBI=0.040632;REFB=-0.158553;REVB=-0.0404791;RO=1;SAF=58;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123156;STB=0.506492;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00327365;OID=.;OPOS=79708000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:38:58:0:1:38:58:0:1 chr6 79918309 . G A 953.25 PASS AF=1;AO=51;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.6292;QD=57.7725;RBI=0.164648;REFB=0;REVB=-0.0253604;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202029;OID=.;OPOS=79918309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:1:0:51:66:1:26:25:1:0:29:37:0:0 chr6 80196498 . T C 1362.15 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0573525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7007;QD=61.2201;RBI=0.108105;REFB=-0.0831869;REVB=0.0916375;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.504949;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00206495;OID=.;OPOS=80196498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:0:1:88:88:0.988764:50:38:0:0:50:38:0:1 chr6 80228541 . A G 3558.5 PASS AF=0.991304;AO=227;DP=230;FAO=228;FDP=230;FR=.;FRO=2;FSAF=104;FSAR=124;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0268102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.801;QD=61.8869;RBI=0.0358718;REFB=-0.0960592;REVB=0.0238328;RO=1;SAF=104;SAR=123;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00455995;STB=0.500384;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.000143899;OID=.;OPOS=80228541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:230:230:1:2:227:228:0.991304:123:104:1:0:124:104:1:1 chr6 80410956 . A G 225.54 PASS AF=0.29;AO=29;DP=100;FAO=29;FDP=100;FR=.;FRO=71;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0106131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.25;QD=9.02162;RBI=0.0116705;REFB=-0.00226049;REVB=0.00485414;RO=71;SAF=12;SAR=17;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11245;STB=0.56662;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00598288;OID=.;OPOS=80410956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:71:71:29:29:0.29:17:12:36:35:17:12:36:35 chr6 80411572 . C A 343.22 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.020631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1839;QD=18.8063;RBI=0.0474429;REFB=0.0157931;REVB=-0.0427223;RO=37;SAF=21;SAR=15;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880238;STB=0.548899;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.0151307;OID=.;OPOS=80411572;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:15:21:25:12:15:21:25:12 chr6 80513565 . G GCTCTCTGATATGCCATC 471.72 PASS AF=0.894737;AO=28;DP=39;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0224773;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=17;MLLD=515.215;QD=49.6548;RBI=0.057662;REFB=-0.0784193;REVB=0.0531007;RO=4;SAF=16;SAR=12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425055;STB=0.5263;STBP=0.357;TYPE=ins;VARB=0.00669794;OID=.;OPOS=80513566;OREF=-;OALT=CTCTCTGATATGCCATC;OMAPALT=GCTCTCTGATATGCCATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.894737:28:39:34:38:4:17:17:3:1:20:4:16:12:3:1 chr6 80513614 . G A 168.79 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0442244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4526;QD=10.5496;RBI=0.0533702;REFB=-0.024325;REVB=0.0298762;RO=42;SAF=7;SAR=15;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492338;STB=0.528819;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0531176;OID=.;OPOS=80513614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:15:7:15:27:15:7:15:27 chr6 80580038 . T G 1565.2 PASS AF=1;AO=105;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399071;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.474;QD=59.0641;RBI=0.0500314;REFB=-0.0330817;REVB=0.0301756;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82972e-05;OID=.;OPOS=80580038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:107:106:0:0:105:106:1:51:54:0:0:51:55:0:0 chr6 80626375 . T C 306.26 PASS AF=0.37234;AO=35;DP=94;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0215052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9455;QD=13.0322;RBI=0.0417736;REFB=-0.0141028;REVB=0.0358129;RO=58;SAF=17;SAR=18;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00322576;STB=0.503648;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0268549;OID=.;OPOS=80626375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:58:59:35:35:0.37234:18:17:28:30:18:17:29:30 chr6 80715838 . T G 444.18 PASS AF=0.47;AO=46;DP=99;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0110399;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.958;QD=17.7671;RBI=0.0214141;REFB=-0.0175717;REVB=0.018349;RO=53;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997368;STB=0.560484;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0144994;OID=.;OPOS=80715838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:53:53:46:47:0.47:23:23:21:32:23:24:21:32 chr6 80837253 . G T 122.87 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=31;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0190857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5964;QD=13.6523;RBI=0.0226464;REFB=-0.0155783;REVB=-0.01219;RO=21;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101142;STB=0.511612;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0225926;OID=.;OPOS=80837253;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:36:21:21:10:15:0.416667:3:7:13:8:6:9:13:8 chr6 82457147 . C G 432.63 PASS AF=0.52439;AO=42;DP=81;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0182762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.796;QD=21.104;RBI=0.0241596;REFB=-0.00908403;REVB=-0.0158009;RO=38;SAF=18;SAR=24;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768897;STB=0.529398;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00693289;OID=.;OPOS=82457147;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:38:39:42:43:0.52439:24:18:13:25:25:18:14:25 chr6 82461874 . C A 35.24 PASS AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0363601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0011;QD=5.42152;RBI=0.0440689;REFB=-0.0325832;REVB=-0.0249001;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538334;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.081924;OID=.;OPOS=82461874;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:26:26:18:20:6:6:0.230769:3:3:9:9:3:3:11:9 chr6 83075914 . G A 769.47 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.414;QD=56.9981;RBI=0.0321998;REFB=0;REVB=0.0214065;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345198;OID=.;OPOS=83075914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0 chr6 83080386 . C CTTTG 557.24 PASS AF=0.533333;AO=55;DP=106;FAO=56;FDP=105;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=-0.00977452;FXX=0.0186898;HRUN=3;LEN=4;MLLD=237.73;QD=21.228;RBI=0.0129831;REFB=-0.00492563;REVB=-0.00854511;RO=48;SAF=28;SAR=27;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134227;STB=0.580924;STBP=0.091;TYPE=ins;VARB=0.00244683;OID=.;OPOS=83080387;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.533333:55:106:56:105:49:28:28:33:16:99:48:28:27:32:16 chr6 83921044 . G T 88.11 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00416178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.963;QD=14.0972;RBI=0.0900171;REFB=0.0130364;REVB=-0.0899208;RO=12;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190272;STB=0.596848;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.0213251;OID=.;OPOS=83921044;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:12:14:11:11:0.44:5:6:9:3:5:6:10:4 chr6 84234144 . C T 145.08 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00433866;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.286;QD=15.2717;RBI=0.014618;REFB=0.00726985;REVB=-0.0139593;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121768;STB=0.507033;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.0119751;OID=.;OPOS=84234144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:22:22:16:16:0.421053:10:6:8:14:10:6:8:14 chr6 84285796 . G A,GA 45.69 PASS AF=0,0.297297;AO=4,6;DP=37;FAO=0,11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=0,9;FSAR=0,2;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0142778,-0.0526406;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=254.405,15.4808;QD=4.93935;RBI=0.014284,0.0557161;REFB=-0.0073973,-0.054981;REVB=0.000421234,-0.0182552;RO=27;SAF=3,5;SAR=1,1;SRF=12;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.340534,0.467913;STB=0.5,0.773658;STBP=1,0.038;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.176229;OID=.,.;OPOS=84285796,84285797;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:46:37:37:27:26:4,6:0,11:0,0.297297:1,1:3,5:12:15:0,2:0,9:12:14 chr6 84300997 . A G 1109.96 PASS AF=0.447368;AO=119;DP=266;FAO=119;FDP=266;FR=.;FRO=147;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=77;FSRR=70;FWDB=0.00843906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.006;QD=16.6911;RBI=0.0593358;REFB=-0.0231469;REVB=0.0587326;RO=147;SAF=56;SAR=63;SRF=77;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530658;STB=0.529407;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0308445;OID=.;OPOS=84300997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:266:147:147:119:119:0.447368:63:56:77:70:63:56:77:70 chr6 84303342 . T C,G 934.17 PASS AF=0.938462,0.0615385;AO=59,4;DP=63;FAO=61,4;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=17,2;FSAR=44,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0078641,-0.0127787;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.628,116.622;QD=57.4872;RBI=0.0361966,0.0203111;REFB=0,0;REVB=0.035332,0.0157875;RO=0;SAF=17,2;SAR=42,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00159443,0.042065;OID=.,.;OPOS=84303342,84303342;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:63:65:0:0:59,4:61,4:0.938462,0.0615385:42,2:17,2:0:0:44,2:17,2:0:0 chr6 84799185 . C T 292.28 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00101975;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.485;QD=16.7018;RBI=0.0295936;REFB=-0.0118549;REVB=-0.029576;RO=37;SAF=20;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109847;STB=0.569809;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0112298;OID=.;OPOS=84799185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:37:38:32:32:0.457143:12:20:19:18:12:20:19:19 chr6 85473758 . C T 500.04 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0288184;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.445;QD=54.058;RBI=0.040619;REFB=-0.151447;REVB=0.0286253;RO=2;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583611;STB=0.531232;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00076564;OID=.;OPOS=85473758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:37:37:2:2:35:35:0.945946:15:20:0:2:15:20:0:2 chr6 86303091 . G A 662.25 PASS AF=0.910714;AO=50;DP=55;FAO=51;FDP=56;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0901357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0484;QD=47.3034;RBI=0.0902469;REFB=-0.0875926;REVB=-0.00447768;RO=5;SAF=24;SAR=26;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885268;STB=0.545437;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0118247;OID=.;OPOS=86303091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:55:56:5:5:50:51:0.910714:26:24:5:0:26:25:5:0 chr6 87965528 . T C 519.98 PASS AF=0.544444;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00809297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.594;QD=23.1104;RBI=0.0231825;REFB=-0.0112468;REVB=-0.021724;RO=41;SAF=18;SAR=31;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02027;STB=0.51115;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.00951615;OID=.;OPOS=87965528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:41:41:49:49:0.544444:31:18:16:25:31:18:16:25 chr6 87968565 . A G 133.62 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.116849;FXX=0.0499875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.968;QD=14.0649;RBI=0.11844;REFB=-0.0037669;REVB=-0.0193502;RO=22;SAF=3;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311515;STB=0.699705;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00946025;OID=.;OPOS=87968565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:38:22:23:15:15:0.394737:12:3:10:12:12:3:11:12 chr6 87969480 . G A 257.81 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0477192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5976;QD=18.415;RBI=0.0478245;REFB=-0.00069277;REVB=-0.00317176;RO=28;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978324;STB=0.554791;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.000238607;OID=.;OPOS=87969480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:11:17:14:14:11:17:14:14 chr6 87969737 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0395616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.517;QD=11.9536;RBI=0.0396648;REFB=-0.00218551;REVB=-0.00286034;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185846;STB=0.565062;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00227717;OID=.;OPOS=87969737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:10:11:8:8:0.421053:3:5:8:2:3:5:8:3 chr6 87970301 . C G 116.21 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0230468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.908;QD=20.2096;RBI=0.0432657;REFB=-0.0229035;REVB=0.0366165;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309496;STB=0.675067;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00784743;OID=.;OPOS=87970301;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:8:5:8:2:8:5:8:2 chr6 87994015 . A G 51.89 PASS AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00756251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0741;QD=6.10509;RBI=0.0668926;REFB=0.0133949;REVB=0.0664637;RO=25;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126229;STB=0.59677;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.0360382;OID=.;OPOS=87994015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:34:25:26:8:8:0.235294:3:5:13:12:3:5:13:13 chr6 87994572 . G A 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00786563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8344;QD=14.1699;RBI=0.00845916;REFB=-0.0246592;REVB=0.00311274;RO=12;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252837;STB=0.650827;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0507344;OID=.;OPOS=87994572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:8:2:5:7:8:2:5:7 chr6 88108048 . AGAT A 105.44 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0255518;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=3;MLLD=240.771;QD=9.80819;RBI=0.0255868;REFB=-0.0181186;REVB=-0.00133745;RO=29;SAF=5;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153093;STB=0.604155;STBP=0.379;TYPE=del;VARB=0.0341926;OID=.;OPOS=88108049;OREF=GAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.302326:13:45:13:43:30:5:8:16:14:99:29:5:8:15:14 chr6 88182704 . G C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123722;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=252.328;QD=33.4285;RBI=0.0123722;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88475e-05;OID=.;OPOS=88182704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr6 88221892 . T G 387.24 PASS AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00846763;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.836;QD=20.9317;RBI=0.0150663;REFB=-0.0138035;REVB=0.0124617;RO=34;SAF=15;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124581;STB=0.576232;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0101154;OID=.;OPOS=88221892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:35:39:39:0.527027:24:15:18:16:24:15:19:16 chr6 88224164 . T C 150.12 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00210153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.8663;QD=19.3697;RBI=0.0261812;REFB=0.0197469;REVB=-0.0260967;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199204;STB=0.613586;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.0142707;OID=.;OPOS=88224164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:11:5:8:7:11:5:8:7 chr6 88231226 . T C 338.24 PASS AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0362891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.84;QD=22.9313;RBI=0.0362972;REFB=-0.0293315;REVB=-0.000765651;RO=25;SAF=21;SAR=13;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182846;STB=0.510068;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0166455;OID=.;OPOS=88231226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:25:34:34:0.576271:13:21:16:9:13:21:16:9 chr6 88315741 . TA T 284.94 PASS AF=0.50495;AO=50;DP=108;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0255598;FXX=0.0648088;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.9101;QD=11.2848;RBI=0.0677145;REFB=-0.00129535;REVB=-0.0627053;RO=47;SAF=18;SAR=32;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19179;STB=0.594429;STBP=0.06;TYPE=del;VARB=0.000980358;OID=.;OPOS=88315742;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.50495:50:108:51:101:50:19:32:28:22:99:47:18:32:27:20 chr6 88366708 . C T 1246.1 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.966;QD=61.5356;RBI=0.0438622;REFB=0;REVB=0.0382472;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229315;OID=.;OPOS=88366708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:44:37:0:0:44:37:0:0 chr6 89388023 . T C 518.39 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0242607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.728;QD=22.7863;RBI=0.0359146;REFB=-0.0325025;REVB=0.0264817;RO=42;SAF=18;SAR=31;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749075;STB=0.541276;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.029721;OID=.;OPOS=89388023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:31:18:19:23:31:18:19:23 chr6 89675684 . C A 257.69 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0650982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0601;QD=19.8223;RBI=0.0943129;REFB=-0.0198009;REVB=0.0682433;RO=25;SAF=16;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288611;STB=0.516117;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0216887;OID=.;OPOS=89675684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:11:16:14:11:11:16:14:11 chr6 89676206 . T G 217.78 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0310814;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.179;QD=16.7523;RBI=0.0561631;REFB=0.00998018;REVB=-0.0467786;RO=28;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286073;STB=0.516168;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=-0.0133656;OID=.;OPOS=89676206;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:13:11:12:16:13:11:12:16 chr6 89676343 . G C 256.53 PASS AF=0.545455;AO=16;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00718839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1755;QD=23.321;RBI=0.0197265;REFB=-0.0241139;REVB=0.0183701;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168018;STB=0.549959;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0357289;OID=.;OPOS=89676343;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:20:16:24:0.545455:10:6:3:12:13:11:7:13 chr6 89793894 . G C 309.12 PASS AF=0.441558;AO=33;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0109892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.204;QD=16.058;RBI=0.0109901;REFB=-0.00440728;REVB=-0.000141851;RO=43;SAF=8;SAR=25;SRF=9;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465583;STB=0.520595;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0064823;OID=.;OPOS=89793894;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:33:34:0.441558:25:8:9:34:26:8:9:34 chr6 89794396 . G C 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00917469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.737;QD=10.0339;RBI=0.0246991;REFB=-0.0362168;REVB=0.0229319;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090044;STB=0.555348;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0441819;OID=.;OPOS=89794396;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:1:6:4:1:1:6 chr6 89800665 . G A 100.92 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0123614;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5064;QD=14.9514;RBI=0.0553241;REFB=-0.040108;REVB=0.0539254;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159493;STB=0.592443;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0161438;OID=.;OPOS=89800665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:15:15:12:12:0.444444:6:6:5:10:6:6:5:10 chr6 89800883 . T C 73.43 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0502441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.771;QD=9.47492;RBI=0.0504775;REFB=-0.00796138;REVB=-0.00484928;RO=21;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101142;STB=0.561915;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0445102;OID=.;OPOS=89800883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:7:3:8:13:7:3:8:13 chr6 89806689 . T C 183.1 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0284816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.568;QD=25.2545;RBI=0.0326372;REFB=-0.0154198;REVB=0.0159368;RO=11;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229477;STB=0.512806;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0149187;OID=.;OPOS=89806689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:11:11:18:18:0.62069:12:6:4:7:12:6:4:7 chr6 89806992 . A C 139.44 PASS AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00587201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.903;QD=9.14342;RBI=0.0132518;REFB=-0.00454303;REVB=0.0118798;RO=42;SAF=7;SAR=12;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445405;STB=0.52648;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0114797;OID=.;OPOS=89806992;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:12:7:17:25:12:7:17:25 chr6 89856014 . C G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0185782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.392;QD=15.2589;RBI=0.025974;REFB=-0.0207973;REVB=-0.0181522;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304739;STB=0.681283;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0211985;OID=.;OPOS=89856014;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:2:5:2:4:2:5:2:4 chr6 89868128 . A G 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0155722;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=333.837;QD=25.6506;RBI=0.0163735;REFB=-0.00426917;REVB=-0.00505929;RO=18;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771509;STB=0.542822;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00348338;OID=.;OPOS=89868128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:15:10:9:9:15:10:9:9 chr6 89888744 . C T 143.28 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0321693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7332;QD=14.6958;RBI=0.0395797;REFB=-0.0127137;REVB=-0.0230584;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942034;STB=0.554389;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0281567;OID=.;OPOS=89888744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:9:7:8:15:9:7:8:15 chr6 89907873 . G A 1513.79 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372435;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.075;QD=63.7384;RBI=0.0372933;REFB=0;REVB=-0.00192543;RO=0;SAF=57;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6337e-05;OID=.;OPOS=89907873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:37:57:0:0:37:58:0:0 chr6 89913209 . C T 251.87 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00781284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.682;QD=14.8159;RBI=0.0149605;REFB=-0.00922642;REVB=-0.0127584;RO=39;SAF=21;SAR=8;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373639;STB=0.712082;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0171397;OID=.;OPOS=89913209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:8:21:14:25:8:21:14:25 chr6 89913218 . T A 229.33 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.008004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.271;QD=14.1125;RBI=0.0303298;REFB=-0.019752;REVB=-0.0292546;RO=37;SAF=21;SAR=6;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447318;STB=0.761205;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0117343;OID=.;OPOS=89913218;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:38:27:27:0.415385:6:21:13:24:6:21:13:25 chr6 89926962 . T C 261.79 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0391919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1426;QD=17.1664;RBI=0.0469703;REFB=0.0153806;REVB=0.0258883;RO=31;SAF=25;SAR=4;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450857;STB=0.752807;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0151393;OID=.;OPOS=89926962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:32:29:29:0.47541:4:25:15:16:4:25:16:16 chr6 89981413 . T C 403.21 PASS AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00770885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.766;QD=24.8129;RBI=0.043761;REFB=-0.0234295;REVB=-0.0430766;RO=26;SAF=14;SAR=25;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163736;STB=0.589863;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0270861;OID=.;OPOS=89981413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:26:26:39:39:0.6:25:14:15:11:25:14:15:11 chr6 90039670 . G C 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0115681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.896;QD=16.0426;RBI=0.0146022;REFB=-0.00789175;REVB=0.00891096;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801459;STB=0.54605;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00933056;OID=.;OPOS=90039670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:11:8:13:13:11:8:13:13 chr6 90315789 . A G 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.325;QD=63.5829;RBI=0.0415553;REFB=0;REVB=0.0206218;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397996;OID=.;OPOS=90315789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0 chr6 90327873 . G A 973.08 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00628726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7038;QD=58.9744;RBI=0.0344914;REFB=0;REVB=0.0339135;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163559;OID=.;OPOS=90327873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:34:31:0:0:35:31:0:0 chr6 90333599 . A G,T 840.51 PASS AF=0.949153,0.0508475;AO=54,7;DP=63;FAO=56,3;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=36,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324701,-0.00020999;FXX=0.063482;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.5382,66.6378;QD=56.984;RBI=0.0452789,0.0152308;REFB=0,0;REVB=0.0315575,0.0152293;RO=0;SAF=19,2;SAR=35,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.86274e-08,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0128395,0.140794;OID=.,.;OPOS=90333599,90333599;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:63:59:0:0:54,7:56,3:0.949153,0.0508475:35,5:19,2:0:0:36,2:20,1:0:0 chr6 90338863 . C T 381.84 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0252372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0947;QD=17.1613;RBI=0.118345;REFB=-0.0196389;REVB=-0.115623;RO=49;SAF=23;SAR=17;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796446;STB=0.544533;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0139643;OID=.;OPOS=90338863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:49:40:40:0.449438:17:23:32:17:17:23:32:17 chr6 90340276 . G A,C 745.83 PASS AF=0.981132,0.0188679;AO=51,2;DP=53;FAO=52,1;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=34,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248716,-0.0731397;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=149.236,9.43808;QD=56.2892;RBI=0.026577,0.0731485;REFB=0,0;REVB=0.00936715,0.00113321;RO=0;SAF=17,1;SAR=34,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000513638,0.0933844;OID=.,.;OPOS=90340276,90340276;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:53:53:0:0:51,2:52,1:0.981132,0.0188679:34,1:17,1:0:0:34,1:18,0:0:0 chr6 90362783 . A C 755.22 PASS AF=0.506579;AO=76;DP=153;FAO=77;FDP=152;FR=.;FRO=75;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=-0.00359491;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.996;QD=19.8742;RBI=0.0129314;REFB=-0.0147373;REVB=0.0124217;RO=74;SAF=44;SAR=32;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144276;STB=0.50769;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0127589;OID=.;OPOS=90362783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:74:75:76:77:0.506579:32:44:44:30:33:44:44:31 chr6 90371202 . G A 1576.48 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222045;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6616;QD=60.0565;RBI=0.022528;REFB=0;REVB=-0.00380381;RO=0;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.30644e-05;OID=.;OPOS=90371202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:48:57:0:0:48:57:0:0 chr6 90390443 . C A 492.35 PASS AF=0.921053;AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0415972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.639;QD=51.8258;RBI=0.0482939;REFB=-0.122216;REVB=0.0245352;RO=3;SAF=23;SAR=12;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057205;STB=0.530595;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00460665;OID=.;OPOS=90390443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:38:38:3:3:35:35:0.921053:12:23:3:0:12:23:3:0 chr6 90402482 . G A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.333;QD=58.4196;RBI=0.0443368;REFB=0;REVB=0.0428795;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134306;OID=.;OPOS=90402482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0 chr6 90402840 . C G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.737;QD=55.0985;RBI=0.0240159;REFB=0;REVB=-0.00749827;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127276;OID=.;OPOS=90402840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr6 90418262 . C T 1862.6 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549877;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.258;QD=61.5735;RBI=0.00952309;REFB=0;REVB=0.00777513;RO=0;SAF=74;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26466e-06;OID=.;OPOS=90418262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:47:74:0:0:47:74:0:0 chr6 90448092 . C T 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.354;QD=62.3143;RBI=0.0328065;REFB=0;REVB=0.0214817;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016169;OID=.;OPOS=90448092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0 chr6 90455084 . A G 817.64 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.958;QD=57.3784;RBI=0.0524438;REFB=0;REVB=0.0153612;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369568;OID=.;OPOS=90455084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:28:28:0:0:28:29:0:0 chr6 90459454 . G A 554.63 PASS AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0169856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.751;QD=55.4626;RBI=0.0352671;REFB=0.00866099;REVB=-0.0309072;RO=1;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208236;STB=0.521728;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.000942961;OID=.;OPOS=90459454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:22:16:0:1:22:16:0:2 chr6 90461123 . G A 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00903175;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.809;QD=15.7841;RBI=0.0278261;REFB=0.00755164;REVB=-0.0263196;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00434626;STB=0.502509;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.00335842;OID=.;OPOS=90461123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:9:5:6:11:9:5:6:11 chr6 90482397 . T C 269.56 PASS AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00097278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.784;QD=14.1874;RBI=0.00338691;REFB=-0.0127409;REVB=-0.00324421;RO=45;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00522843;STB=0.502972;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0201445;OID=.;OPOS=90482397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:15:16:23:22:15:16:23:22 chr6 90497589 . A C 299.34 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0120641;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=49.7052;QD=24.4358;RBI=0.0122713;REFB=0.0707085;REVB=0.00224583;RO=21;SAF=12;SAR=15;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510284;STB=0.53701;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.0403485;OID=.;OPOS=90497589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:22:27:27:0.55102:15:12:8:13:15:12:8:14 chr6 90565242 . A G 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0366193;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=72.1645;QD=13.5044;RBI=0.0508179;REFB=-0.00730488;REVB=0.0352346;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317828;STB=0.664545;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0422894;OID=.;OPOS=90565242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:16:17:12:12:0.413793:5:7:4:12:5:7:5:12 chr6 90577984 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.000211591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.093;QD=11.9536;RBI=0.0168859;REFB=0.00318355;REVB=0.0168846;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131886;STB=0.578755;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.00243742;OID=.;OPOS=90577984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:7:4:4:4:7:4 chr6 90637504 . A C 356.02 PASS AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00653226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.116;QD=30.2995;RBI=0.00862325;REFB=0.00619318;REVB=0.00562939;RO=17;SAF=17;SAR=13;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544216;STB=0.52982;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=-0.00544096;OID=.;OPOS=90637504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:17:17:30:30:0.638298:13:17:11:6:13:17:11:6 chr6 90638390 . G A 205.06 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0186727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100;QD=16.4049;RBI=0.0187662;REFB=-0.0129955;REVB=0.00187155;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258984;STB=0.648505;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0195929;OID=.;OPOS=90638390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:7:14:12:17:7:14:12:17 chr6 90638553 . T G 871.27 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661003;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9196;QD=58.0845;RBI=0.0781497;REFB=0;REVB=-0.0416909;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15597e-05;OID=.;OPOS=90638553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0 chr6 90642358 . G A 176.53 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00285703;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.724;QD=18.5825;RBI=0.0041566;REFB=-0.0159351;REVB=0.00301906;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195539;STB=0.506128;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0206616;OID=.;OPOS=90642358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:19:20:18:18:0.473684:7:11:12:7:7:11:12:8 chr6 90660754 . G A 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0301443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.167;QD=16.3855;RBI=0.0375352;REFB=-0.00642347;REVB=-0.0223655;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243059;STB=0.640727;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0116808;OID=.;OPOS=90660754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:2:6:4:5:2:6 chr6 93952679 . A G 450.6 PASS AF=0.53012;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0220604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.305;QD=21.7158;RBI=0.0236221;REFB=-0.00109521;REVB=0.00844637;RO=39;SAF=17;SAR=27;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00156971;STB=0.500866;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000946745;OID=.;OPOS=93952679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:39:44:44:0.53012:27:17:15:24:27:17:15:24 chr6 93967851 . C T 2531.85 PASS AF=1;AO=162;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00344466;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.022;QD=61.7524;RBI=0.0057361;REFB=0;REVB=-0.00458663;RO=0;SAF=94;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.8827e-05;OID=.;OPOS=93967851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:165:164:0:0:162:164:1:68:94:0:0:69:95:0:0 chr6 93982124 . A G 1504.98 PASS AF=1;AO=99;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.04;QD=59.019;RBI=0.0416723;REFB=0;REVB=0.026567;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323286;OID=.;OPOS=93982124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:102:0:0:99:102:1:52:47:0:0:55:47:0:0 chr6 94067981 . C T 1641.86 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.837;QD=60.2518;RBI=0.0324379;REFB=0;REVB=0.0322321;RO=0;SAF=71;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02097e-05;OID=.;OPOS=94067981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:38:71:0:0:38:71:0:0 chr6 96034869 . G A 108.02 PASS AF=0.162963;AO=22;DP=135;FAO=22;FDP=135;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=76;FSRR=37;FWDB=-0.0811143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0789;QD=3.20071;RBI=0.0960923;REFB=-0.0289937;REVB=-0.051519;RO=112;SAF=19;SAR=3;SRF=75;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334364;STB=0.727028;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0854803;OID=.;OPOS=96034869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:112:113:22:22:0.162963:3:19:75:37:3:19:76:37 chr6 96034881 . A ATATG,G 2841.53 PASS AF=0.447761,0.537313;AO=85,111;DP=221;FAO=90,108;FDP=201;FR=.;FRO=3;FSAF=58,46;FSAR=32,62;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0173045,0.0294091;FXX=0.0779781;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=125.826,85.9479;QD=56.5478;RBI=0.0222915,0.0382504;REFB=-0.105535,-0.0110279;REVB=0.0140522,0.0244581;RO=20;SAF=55,48;SAR=30,63;SRF=18;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.102417,-0.134432;STB=0.512602,0.515787;STBP=0.221,0.073;TYPE=ins,snp;VARB=0.0423101,-0.00427051;OID=.,.;OPOS=96034882,96034881;OREF=-,A;OALT=TATG,G;OMAPALT=ATATG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:221:201:20:3:85,111:90,108:0.447761,0.537313:30,63:55,48:18:2:32,62:58,46:3:0 chr6 96035175 . T C 2457.9 PASS AF=0.993827;AO=161;DP=162;FAO=161;FDP=162;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.92;QD=60.6889;RBI=0.0431045;REFB=-0.0783737;REVB=0.0388413;RO=1;SAF=80;SAR=81;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591085;STB=0.503105;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.000358057;OID=.;OPOS=96035175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:162:162:1:1:161:161:0.993827:81:80:1:0:81:80:1:0 chr6 96055915 . G C 5099.33 PASS AF=1;AO=323;DP=323;FAO=323;FDP=323;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.508;QD=63.1496;RBI=0.0747725;REFB=0;REVB=0.0640681;RO=0;SAF=142;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30798e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61089e-05;OID=.;OPOS=96055915;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:323:323:0:0:323:323:1:181:142:0:0:181:142:0:0 chr6 96386151 . G A 2577.38 PASS AF=0.988235;AO=168;DP=170;FAO=168;FDP=170;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0143282;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.348;QD=60.6442;RBI=0.0191041;REFB=-0.053087;REVB=0.0126361;RO=1;SAF=79;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598635;STB=0.500351;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.000137501;OID=.;OPOS=96386151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:170:170:1:2:168:168:0.988235:89:79:1:0:89:79:1:1 chr6 96651740 . A G 978.74 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00264811;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9991;QD=57.5731;RBI=0.0261919;REFB=-0.0372263;REVB=0.0260577;RO=1;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016016;STB=0.508472;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000676911;OID=.;OPOS=96651740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:68:1:1:67:67:0.985294:29:38:0:1:29:38:0:1 chr6 96652371 . T C 629.13 PASS AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00641871;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=235.305;QD=57.1936;RBI=0.0211677;REFB=-0.141795;REVB=0.0201711;RO=1;SAF=16;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284313;STB=0.505718;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.000445255;OID=.;OPOS=96652371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:44:44:1:2:42:42:0.954545:26:16:1:0:26:16:1:1 chr6 96652582 . G T 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.521;QD=63.871;RBI=0.0194189;REFB=0;REVB=0.00332721;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6265e-05;OID=.;OPOS=96652582;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0 chr6 96652706 . G A 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.597;QD=57.5452;RBI=0.0291169;REFB=0;REVB=0.0224412;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16523e-05;OID=.;OPOS=96652706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0 chr6 96653037 . GT G,GC 4212.59 PASS AF=0.82069,0.17931;AO=34,253;DP=293;FAO=238,52;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=128,1;FSAR=110,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300846,-0.39274;FXX=0.00343631;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=51.1997,45.972;QD=58.1047;RBI=0.0306781,0.393844;REFB=0,0;REVB=0.00600489,-0.0294703;RO=0;SAF=3,121;SAR=31,132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00256773,0.188608;OID=.,.;OPOS=96653038,96653038;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.82069,0.17931:34,253:293:238,52:290:0:128,1:110,51:0:0:99:0:3,121:31,132:0:0 chr6 96653208 . C G 1320.87 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0637;QD=62.1585;RBI=0.0234945;REFB=0;REVB=0.0193019;RO=0;SAF=39;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92867e-05;OID=.;OPOS=96653208;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:46:39:0:0:46:39:0:0 chr6 96661315 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.605;QD=44.6898;RBI=0.0388315;REFB=0;REVB=0.0387887;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498197;OID=.;OPOS=96661315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr6 96661410 . A G 710.76 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159316;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.947;QD=55.7456;RBI=0.0166262;REFB=0;REVB=-0.00475562;RO=1;SAF=26;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177622;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487029;OID=.;OPOS=96661410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:1:0:50:51:1:24:26:1:0:24:27:0:0 chr6 96730731 . G C 137.91 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0215552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.795;QD=19.0214;RBI=0.0251422;REFB=-0.00450179;REVB=-0.0129424;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381971;STB=0.52171;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00208644;OID=.;OPOS=96730731;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:9:6:5:9:9:6:5:9 chr6 96999725 . C T 900.9 PASS AF=0.447005;AO=96;DP=215;FAO=97;FDP=217;FR=.;FRO=120;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=54;FSRR=66;FWDB=0.00268591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5536;QD=16.6064;RBI=0.0236224;REFB=-0.0117472;REVB=-0.0234692;RO=106;SAF=49;SAR=47;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278297;STB=0.530478;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00824615;OID=.;OPOS=96999725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:217:106:120:96:97:0.447005:47:49:51:55:48:49:54:66 chr6 97058553 . A G 612.58 PASS AF=0.539823;AO=61;DP=113;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00222259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.564;QD=21.6841;RBI=0.00517703;REFB=-0.010448;REVB=0.00467566;RO=52;SAF=20;SAR=41;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137502;STB=0.575637;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00665015;OID=.;OPOS=97058553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:52:61:61:0.539823:41:20:25:27:41:20:25:27 chr6 97058574 . G A 448.81 PASS AF=0.438596;AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=-0.0196017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.362;QD=15.7476;RBI=0.023455;REFB=-0.0344676;REVB=-0.0128805;RO=64;SAF=26;SAR=24;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191802;STB=0.606927;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0313444;OID=.;OPOS=97058574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:64:64:50:50:0.438596:24:26:21:43:24:26:21:43 chr6 97063522 . C G 395.04 PASS AF=0.382114;AO=47;DP=123;FAO=47;FDP=123;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.0155602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6205;QD=12.8468;RBI=0.0156794;REFB=0.0196074;REVB=0.00193043;RO=76;SAF=27;SAR=20;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673676;STB=0.538284;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.0325049;OID=.;OPOS=97063522;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:76:76:47:47:0.382114:20:27:39:37:20:27:39:37 chr6 97063555 . A G 455.42 PASS AF=0.393939;AO=52;DP=132;FAO=52;FDP=132;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00585117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.494;QD=13.8005;RBI=0.0195822;REFB=-0.0092657;REVB=-0.0186876;RO=80;SAF=32;SAR=20;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112847;STB=0.563894;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0209389;OID=.;OPOS=97063555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:80:80:52:52:0.393939:20:32:41:39:20:32:41:39 chr6 97339078 . A G 638.69 PASS AF=0.512;AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0266841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.241;QD=20.438;RBI=0.0348835;REFB=-0.0212027;REVB=0.0224681;RO=61;SAF=40;SAR=24;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150178;STB=0.582796;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.022279;OID=.;OPOS=97339078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:61:61:64:64:0.512:24:40:28:33:24:40:28:33 chr6 97339088 . C T 1914.75 PASS AF=1;AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.068527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9744;QD=61.7663;RBI=0.0688669;REFB=0;REVB=-0.00683387;RO=0;SAF=66;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000407977;OID=.;OPOS=97339088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:123:124:1:57:66:0:0:58:66:0:0 chr6 99284532 . T C 1524.97 PASS AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0245873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.616;QD=57.5461;RBI=0.029856;REFB=-0.0913823;REVB=-0.0169364;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508927;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.000698207;OID=.;OPOS=99284532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:106:106:0:2:104:104:0.981132:49:55:0:0:49:55:2:0 chr6 99724713 . G A 990.64 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.013;QD=59.1428;RBI=0.014055;REFB=0;REVB=0.0116318;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93983e-05;OID=.;OPOS=99724713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:32:34:0:0:32:35:0:0 chr6 99771540 . T C 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.914;QD=57.2375;RBI=0.0175429;REFB=0;REVB=-0.005322;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.72108e-05;OID=.;OPOS=99771540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0 chr6 99817419 . T TC 693.38 PASS AF=1;AO=42;DP=47;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210523;FXX=0.0222173;HRUN=0;LEN=1;MLLD=298.688;QD=63.0347;RBI=0.0220098;REFB=0;REVB=0.00642096;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=2.27981e-05;OID=.;OPOS=99817420;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:42:47:44:44:0:19:25:0:0:4:1:17:25:0:1 chr6 99817601 . A G 689.36 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.025;QD=62.6691;RBI=0.0123741;REFB=0;REVB=-0.00626439;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.82521e-05;OID=.;OPOS=99817601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr6 99819379 . T C 556.98 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00423271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5419;QD=60.214;RBI=0.0571178;REFB=0;REVB=0.0569608;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096678;OID=.;OPOS=99819379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0 chr6 99842056 . C A 682.79 PASS AF=0.868852;AO=53;DP=61;FAO=53;FDP=61;FR=.;FRO=8;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0439116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.77;QD=44.7728;RBI=0.0440706;REFB=-0.274375;REVB=0.0037406;RO=6;SAF=32;SAR=21;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805506;STB=0.555535;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00763038;OID=.;OPOS=99842056;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:61:61:6:8:53:53:0.868852:21:32:6:0:21:32:8:0 chr6 99883694 . T C 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.256;QD=57.0007;RBI=0.0478837;REFB=0;REVB=0.0243119;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218946;OID=.;OPOS=99883694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0 chr6 99883704 . T C 740.32 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.717;QD=56.948;RBI=0.0260603;REFB=0;REVB=0.0111264;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149015;OID=.;OPOS=99883704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chr6 99893938 . T C 242.4 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.00287582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.155;QD=12.5923;RBI=0.00375094;REFB=0.00340436;REVB=-0.00240816;RO=47;SAF=16;SAR=13;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957197;STB=0.559996;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.00510251;OID=.;OPOS=99893938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:47:48:29:29:0.376623:13:16:30:17:13:16:31:17 chr6 99956560 . T C 422.32 PASS AF=0.518519;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.0106532;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.16;QD=20.8551;RBI=0.0114025;REFB=-0.00808174;REVB=0.00406509;RO=39;SAF=22;SAR=20;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171535;STB=0.594487;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00894623;OID=.;OPOS=99956560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:39:42:42:0.518519:20:22:28:11:20:22:28:11 chr6 99999793 . T A 77.95 PASS AF=0.288889;AO=7;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.189742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.9477;QD=6.92884;RBI=0.216431;REFB=-0.00609547;REVB=0.104118;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211684;STB=0.535261;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.113789;OID=.;OPOS=99999793;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:45:45:15:30:7:13:0.288889:5:2:7:8:8:5:13:17 chr6 100868721 . G A 2333.03 PASS AF=0.886486;AO=161;DP=186;FAO=164;FDP=185;FR=.;FRO=21;FSAF=85;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.00722229;FXX=0.0263144;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0302;QD=50.4439;RBI=0.0087555;REFB=-0.00512787;REVB=-0.00494948;RO=18;SAF=84;SAR=77;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675738;STB=0.542536;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00308531;OID=.;OPOS=100868721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:186:185:18:21:161:164:0.886486:77:84:3:15:79:85:3:18 chr6 100868779 . G T 2160.38 PASS AF=0.921687;AO=152;DP=166;FAO=153;FDP=166;FR=.;FRO=13;FSAF=72;FSAR=81;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0218936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6023;QD=52.0574;RBI=0.0250646;REFB=-0.0384784;REVB=-0.0122027;RO=12;SAF=72;SAR=80;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00366161;STB=0.500711;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.026173;OID=.;OPOS=100868779;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:166:166:12:13:152:153:0.921687:80:72:6:6:81:72:6:7 chr6 100964147 . G C 570.03 PASS AF=0.458015;AO=60;DP=130;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0108202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.113;QD=17.4055;RBI=0.0147348;REFB=-0.00276359;REVB=0.0100019;RO=70;SAF=35;SAR=25;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539652;STB=0.52658;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00263632;OID=.;OPOS=100964147;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:70:71:60:60:0.458015:25:35:37:33:25:35:38:33 chr6 101094554 . A G 1786.76 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0023569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.797;QD=61.0857;RBI=0.0392421;REFB=0;REVB=0.0391712;RO=0;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29304e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55373e-05;OID=.;OPOS=101094554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:113:117:0:0:113:117:1:54:59:0:0:58:59:0:0 chr6 101296389 . G A 538.81 PASS AF=0.52381;AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0186471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.535;QD=20.5262;RBI=0.0186705;REFB=-0.00675044;REVB=-0.000934578;RO=50;SAF=31;SAR=24;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207072;STB=0.511403;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.00702799;OID=.;OPOS=101296389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:50:50:55:55:0.52381:24:31:27:23:24:31:27:23 chr6 101405050 . T G 117.2 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0101672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.397;QD=12.0204;RBI=0.0134551;REFB=-0.0122548;REVB=-0.00881292;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650817;STB=0.538407;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.023711;OID=.;OPOS=101405050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:7:7:11:14:7:7:11:14 chr6 105300262 . C CAG,G 429.67 PASS AF=0.483871,0.516129;AO=12,16;DP=31;FAO=15,16;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8,4;FSAR=7,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185483,0.0123675;FXX=0.0312402;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=197.079,76.1845;QD=55.441;RBI=0.0194035,0.0243598;REFB=0,0;REVB=-0.005697,-0.0209868;RO=0;SAF=7,4;SAR=5,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.07465e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00205096,-0.00312189;OID=.,.;OPOS=105300263,105300262;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:31:31:0:0:12,16:15,16:0.483871,0.516129:5,12:7,4:0:0:7,12:8,4:0:0 chr6 105530994 . GTA G,GTG 421.99 PASS AF=0.42268,0.0412371;AO=39,4;DP=100;FAO=41,4;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=19,2;FSAR=22,2;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0125307,0.0330841;FXX=0.010203;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=273.557,62.665;QD=17.4017;RBI=0.0157884,0.0375417;REFB=-0.00376897,0.00401079;REVB=0.00960504,-0.0177432;RO=54;SAF=17,2;SAR=22,2;SRF=25;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.028175,0.0371713;STB=0.509737,0.517768;STBP=0.893,0.913;TYPE=del,snp;VARB=0.00644081,-0.00732489;OID=.,.;OPOS=105530995,105530996;OREF=TA,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.42268,0.0412371:39,4:100:41,4:97:52:19,2:22,2:25:27:99:54:17,2:22,2:25:29 chr6 106352263 . C T 44.53 PASS AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0116865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.004;QD=7.12516;RBI=0.0129832;REFB=-0.0142152;REVB=-0.0056558;RO=18;SAF=6;SAR=1;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153245;STB=0.59968;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0362228;OID=.;OPOS=106352263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:1:6:14:4:1:6:14:4 chr6 106352349 . T C 698.87 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00512147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6347;QD=54.8132;RBI=0.070224;REFB=-0.125905;REVB=0.070037;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51219;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00350685;OID=.;OPOS=106352349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:20:30:0:0:20:30:0:1 chr6 106555025 . G A 182.26 PASS AF=0.395349;AO=16;DP=44;FAO=17;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0091891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7303;QD=16.9547;RBI=0.0120348;REFB=-0.00387417;REVB=0.00777162;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790844;STB=0.583231;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0328474;OID=.;OPOS=106555025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:18:21:16:17:0.395349:11:5:7:11:12:5:9:12 chr6 106987370 . A C 514.25 PASS AF=0.395833;AO=57;DP=145;FAO=57;FDP=144;FR=.;FRO=87;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=0.0200311;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.486;QD=14.2848;RBI=0.0207713;REFB=0.00113708;REVB=0.00549592;RO=87;SAF=22;SAR=35;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166517;STB=0.594063;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.0014441;OID=.;OPOS=106987370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:87:87:57:57:0.395833:35:22:47:40:35:22:47:40 chr6 106992464 . A G 1313.56 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.582;QD=61.0958;RBI=0.0296115;REFB=0;REVB=0.0272986;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111348;OID=.;OPOS=106992464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:86:86:0:0:85:86:1:35:50:0:0:36:50:0:0 chr6 107016731 . T C 218.06 PASS AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.00522827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=324.635;QD=11.477;RBI=0.00657012;REFB=-0.00176803;REVB=0.0039789;RO=48;SAF=10;SAR=17;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00548465;STB=0.502091;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00381341;OID=.;OPOS=107016731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:48:49:27:27:0.355263:17:10:18:30:17:10:18:31 chr6 107019880 . A G 124.15 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.000238769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.518;QD=9.93186;RBI=0.0238224;REFB=-0.00310882;REVB=0.0238212;RO=35;SAF=9;SAR=6;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349378;STB=0.520981;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0280061;OID=.;OPOS=107019880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:6:9:22:13:6:9:22:13 chr6 107076783 . A T 937.39 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00140922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3026;QD=58.5867;RBI=0.0281147;REFB=0;REVB=-0.0280793;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228594;OID=.;OPOS=107076783;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0 chr6 107088231 . C T 96.7 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0333212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0558;QD=12.478;RBI=0.0375166;REFB=-0.0188168;REVB=-0.0172393;RO=19;SAF=9;SAR=3;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139821;STB=0.581273;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.02793;OID=.;OPOS=107088231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:3:9:16:3:3:9:16:3 chr6 107100483 . C T 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.00833871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.66;QD=21.0075;RBI=0.0232656;REFB=-0.00926836;REVB=-0.0217199;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242604;STB=0.635704;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0208952;OID=.;OPOS=107100483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:10:9:13:4:10:9:13:4 chr6 107113715 . G A 748.47 PASS AF=0.496599;AO=73;DP=147;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=27;FSRR=47;FWDB=-0.0304509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.141;QD=20.3664;RBI=0.0309706;REFB=-0.00451703;REVB=0.00564988;RO=73;SAF=31;SAR=42;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643636;STB=0.531079;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00518893;OID=.;OPOS=107113715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:73:74:73:73:0.496599:42:31:26:47:42:31:27:47 chr6 107351293 . G T 192.53 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0116105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9969;QD=16.3851;RBI=0.0903578;REFB=0.00130707;REVB=-0.0896087;RO=26;SAF=15;SAR=5;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159691;STB=0.60748;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.00257628;OID=.;OPOS=107351293;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:27:20:20:0.425532:5:15:16:10:5:15:16:11 chr6 107388504 . C T 2102.68 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00243462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.326;QD=62.7664;RBI=0.00893948;REFB=0;REVB=-0.00860157;RO=0;SAF=84;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.55087e-05;OID=.;OPOS=107388504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:50:84:0:0:50:84:0:0 chr6 107391396 . G A 236.85 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0206495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9027;QD=26.3168;RBI=0.0587427;REFB=-0.00385514;REVB=0.0549937;RO=14;SAF=9;SAR=13;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379631;STB=0.521034;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00423274;OID=.;OPOS=107391396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:13:9:5:9:13:9:5:9 chr6 107420516 . A C 673.88 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131656;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.019;QD=62.6863;RBI=0.015189;REFB=0;REVB=-0.00757444;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.09109e-06;OID=.;OPOS=107420516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0 chr6 107565060 . T C 803.86 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626812;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.428;QD=57.4188;RBI=0.0630213;REFB=0;REVB=0.0065384;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024762;OID=.;OPOS=107565060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0 chr6 108026146 . C T 200.97 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00505548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.787;QD=15.1674;RBI=0.00587114;REFB=-0.0093118;REVB=0.00298538;RO=29;SAF=20;SAR=3;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32599;STB=0.705076;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0121444;OID=.;OPOS=108026146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:29:30:23:23:0.433962:3:20:19:10:3:20:19:11 chr6 108026317 . G T 2317.78 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.456;QD=60.9943;RBI=0.0351451;REFB=0;REVB=0.0270715;RO=0;SAF=69;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70884e-05;OID=.;OPOS=108026317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:147:152:0:0:147:152:1:78:69:0:0:81:71:0:0 chr6 108026402 . A C 604.97 PASS AF=0.453237;AO=63;DP=140;FAO=63;FDP=139;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=-0.0129018;FXX=0.00714235;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.826;QD=17.4092;RBI=0.0129499;REFB=-0.00970268;REVB=0.00111467;RO=72;SAF=31;SAR=32;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725976;STB=0.538872;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0132453;OID=.;OPOS=108026402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:72:76:63:63:0.453237:32:31:30:42:32:31:32:44 chr6 108026455 . A G 1489.07 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286774;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.243;QD=59.5627;RBI=0.0300206;REFB=0;REVB=0.00887934;RO=0;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758865;OID=.;OPOS=108026455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:100:0:0:95:100:1:47:48:0:0:51:49:0:0 chr6 108029091 . G A 255.17 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00121407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.355;QD=22.1884;RBI=0.00975792;REFB=-0.00581057;REVB=0.0096821;RO=21;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994847;STB=0.543442;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.006324;OID=.;OPOS=108029091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:22:24:24:0.521739:12:12:8:13:12:12:9:13 chr6 108029108 . GT AC,GC 750.64 PASS AF=0.0416667,0.958333;AO=2,46;DP=48;FAO=2,46;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=2,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129991,-0.025413;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=169.283,166.914;QD=62.553;RBI=0.0241507,0.0306142;REFB=0,0;REVB=0.0203538,0.0170707;RO=0;SAF=0,21;SAR=2,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.85991e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00826192,-3.587e-05;OID=.,.;OPOS=108029108,108029109;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:48:48:0:0:2,46:2,46:0.0416667,0.958333:2,25:0,21:0:0:2,25:0,21:0:0 chr6 108233929 . G A 712.8 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100776;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.04;QD=63.3597;RBI=0.0268969;REFB=0;REVB=-0.0249376;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100227;OID=.;OPOS=108233929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr6 108277287 . C A 2686.76 PASS AF=0.988636;AO=173;DP=176;FAO=174;FDP=176;FR=.;FRO=2;FSAF=87;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0130542;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.961;QD=61.0628;RBI=0.0181544;REFB=-0.024877;REVB=-0.0126163;RO=2;SAF=86;SAR=87;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.28938e-05;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.65016e-05;OID=.;OPOS=108277287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:176:176:2:2:173:174:0.988636:87:86:1:1:87:87:1:1 chr6 108279120 . A G 624.54 PASS AF=0.474074;AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=135;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-8.69902e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9636;QD=18.5048;RBI=0.0526029;REFB=-0.0110595;REVB=-0.0526029;RO=70;SAF=42;SAR=22;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127228;STB=0.575037;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0128892;OID=.;OPOS=108279120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:70:71:64:64:0.474074:22:42:37:33:22:42:37:34 chr6 108364582 . T C 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.00653574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.354;QD=19.6924;RBI=0.0134107;REFB=-0.0186704;REVB=-0.0117103;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188455;STB=0.605301;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0227371;OID=.;OPOS=108364582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:11:15:9:16:11:15:9:16 chr6 109583186 . A G 398.96 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00317799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.329;QD=18.3429;RBI=0.0432263;REFB=0.00310754;REVB=0.0431093;RO=46;SAF=25;SAR=16;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146883;STB=0.582015;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.00328078;OID=.;OPOS=109583186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:16:25:21:25:16:25:21:25 chr6 109586062 . C T 600.26 PASS AF=0.508333;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00291023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.731;QD=20.0086;RBI=0.0124502;REFB=-0.0116481;REVB=-0.0121053;RO=59;SAF=44;SAR=17;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990346;STB=0.554783;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.011485;OID=.;OPOS=109586062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:59:61:61:0.508333:17:44:37:22:17:44:37:22 chr6 109591433 . T C 99.13 PASS AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0544318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.677;QD=14.6853;RBI=0.0609786;REFB=-0.000564149;REVB=0.0274876;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654098;STB=0.528254;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.000319574;OID=.;OPOS=109591433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:27:14:15:11:12:0.444444:7:4:6:8:7:5:7:8 chr6 109621494 . T C 245.69 PASS AF=0.226667;AO=16;DP=77;FAO=17;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00329395;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.345;QD=13.1032;RBI=0.0416489;REFB=-0.0348664;REVB=-0.0415184;RO=45;SAF=1;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64459;STB=0.834744;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.051554;OID=.;OPOS=109621494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:45:45:16:17:0.226667:15:1:23:22:15:2:23:22 chr6 109688057 . T G 361.07 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0063677;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.456;QD=20.3419;RBI=0.00636982;REFB=-0.0169963;REVB=0.000164188;RO=34;SAF=15;SAR=22;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831712;STB=0.546135;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0189041;OID=.;OPOS=109688057;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:22:15:17:17:22:15:17:17 chr6 109752451 . T C 400.33 PASS AF=0.424242;AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.00455064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.345;QD=16.175;RBI=0.00799846;REFB=-0.000248223;REVB=0.00657777;RO=56;SAF=19;SAR=23;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244738;STB=0.508018;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00029915;OID=.;OPOS=109752451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:57:42:42:0.424242:23:19:24:32:23:19:25:32 chr6 109764222 . G A 198.36 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0129013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.227;QD=13.2241;RBI=0.0147318;REFB=-0.0238583;REVB=0.00711207;RO=36;SAF=14;SAR=10;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116822;STB=0.566983;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0297887;OID=.;OPOS=109764222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:10:14:17:19:10:14:17:19 chr6 109768585 . AG AC,A 93.39 PASS AF=0.0540541,0.351351;AO=2,15;DP=38;FAO=2,13;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=0,2;FSAR=2,11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0370233,-0.108994;FXX=0.0263089;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=186.29,16.5197;QD=10.0967;RBI=0.0375279,0.114986;REFB=-0.0039266,-0.0463124;REVB=-0.00613337,-0.0366346;RO=20;SAF=0,4;SAR=2,11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0,0.408991;SSEP=0,0;SSSB=-0.45406,-0.0988718;STB=0.99381,0.715591;STBP=0.201,0.1;TYPE=snp,del;VARB=0.127987,0.0478964;OID=.,.;OPOS=109768586,109768586;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=AC,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0540541,0.351351:2,15:38:2,13:37:22:0,2:2,11:9:13:84:20:0,4:2,11:7:13 chr6 109886005 . T C 731.45 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250023;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.0199;QD=63.604;RBI=0.0250075;REFB=0;REVB=-0.000508987;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00103754;OID=.;OPOS=109886005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0 chr6 109894773 . T A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.233;QD=57.6803;RBI=0.0402268;REFB=0;REVB=0.00768284;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193295;OID=.;OPOS=109894773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0 chr6 109954252 . C T 1290.69 PASS AF=1;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00744098;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.94;QD=62.202;RBI=0.00784849;REFB=0;REVB=0.00249611;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202549;OID=.;OPOS=109954252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0 chr6 109954518 . T C 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4054;QD=58.1411;RBI=0.110055;REFB=0;REVB=0.0970995;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00309094;OID=.;OPOS=109954518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0 chr6 110106234 . A G 371.39 PASS AF=0.333333;AO=46;DP=138;FAO=46;FDP=138;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.00398832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.745;QD=10.765;RBI=0.0190701;REFB=-0.0125496;REVB=-0.0186483;RO=92;SAF=27;SAR=19;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138441;STB=0.579877;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0301431;OID=.;OPOS=110106234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:92:92:46:46:0.333333:19:27:43:49:19:27:43:49 chr6 110146303 . G A 258.61 PASS AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0578348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.008;QD=13.0942;RBI=0.0578795;REFB=-0.0413579;REVB=-0.0022742;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=4;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324367;STB=0.536883;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0558261;OID=.;OPOS=110146303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:34:48:30:30:0.379747:17:13:4:30:17:13:18:30 chr6 110301661 . A G 750.64 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00679928;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.522;QD=63.8839;RBI=0.0229;REFB=0;REVB=0.0218673;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122914;OID=.;OPOS=110301661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:32:15:0:0:32:15:0:0 chr6 110421361 . C T 769.42 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00357526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.641;QD=56.9937;RBI=0.00800624;REFB=0;REVB=-0.00716361;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90272e-05;OID=.;OPOS=110421361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0 chr6 110746526 . T C 509.84 PASS AF=0.55814;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.04142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7561;QD=23.7132;RBI=0.0419638;REFB=0.00413408;REVB=0.00673358;RO=37;SAF=24;SAR=24;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107212;STB=0.511623;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.00333972;OID=.;OPOS=110746526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:37:38:48:48:0.55814:24:24:19:18:24:24:20:18 chr6 110777962 . A G 478.02 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00659623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8927;QD=19.7123;RBI=0.00964785;REFB=-0.0136918;REVB=-0.00704065;RO=50;SAF=24;SAR=23;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654958;STB=0.536356;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0171315;OID=.;OPOS=110777962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:23:24:22:28:23:24:22:28 chr6 110778128 . T C 556.61 PASS AF=0.579545;AO=51;DP=88;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00800115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.488;QD=25.3002;RBI=0.0110395;REFB=-0.0218002;REVB=-0.00760601;RO=36;SAF=27;SAR=24;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642713;STB=0.5294;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.01337;OID=.;OPOS=110778128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:36:37:51:51:0.579545:24:27:16:20:24:27:17:20 chr6 110797704 . CG CC,GC 273.68 PASS AF=0.678571,0.178571;AO=19,4;DP=28;FAO=19,5;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=6,5;FSAR=13,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0015403,0.0234521;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=207.122,138.198;QD=39.0965;RBI=0.0175226,0.0303483;REFB=-0.0401459,-0.096104;REVB=0.0174548,0.0192619;RO=5;SAF=6,4;SAR=13,0;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.195171,0.672226;STB=0.582,0.996387;STBP=0.129,0.225;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0316814,-0.0151664;OID=.,.;OPOS=110797705,110797704;OREF=G,CG;OALT=C,GC;OMAPALT=CC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:30:28:28:5:4:19,4:19,5:0.678571,0.178571:13,0:6,4:4:1:13,0:6,5:3:1 chr6 110797707 . GGGG CACC,CCCA 358.37 PASS AF=0.851852,0.148148;AO=20,4;DP=27;FAO=23,4;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10,3;FSAR=13,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0827104,0.0744557;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=4,4;MLLD=159.82,126.546;QD=53.0918;RBI=0.0829421,0.0746605;REFB=0,0;REVB=0.00619495,0.00552598;RO=0;SAF=7,3;SAR=13,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0084487,0.00356212;OID=.,.;OPOS=110797707,110797707;OREF=GGGG,GGGG;OALT=CACC,CCCA;OMAPALT=CACC,CCCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:20:27:27:0:0:20,4:23,4:0.851852,0.148148:13,1:7,3:0:0:13,1:10,3:0:0 chr6 110797713 . C T 214.2 PASS AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0118649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.911;QD=28.5597;RBI=0.0165423;REFB=-0.0320432;REVB=0.011527;RO=8;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211544;STB=0.64985;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00868975;OID=.;OPOS=110797713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:8:10:20:20:0.666667:13:7:6:2:13:7:8:2 chr6 110964409 . G A 99.95 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0300182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.262;QD=15.3772;RBI=0.0445401;REFB=-0.00803078;REVB=-0.0329048;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245398;STB=0.514262;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00452272;OID=.;OPOS=110964409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:8:4:5:9:8:4:5:9 chr6 111280038 . C T 35.95 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0076376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.093;QD=6.25134;RBI=0.0237757;REFB=-0.0112221;REVB=-0.0225156;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276799;STB=0.685563;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0250523;OID=.;OPOS=111280038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:5:1:6:11:5:1:6:11 chr6 111283592 . C T 45.34 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0547545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2282;QD=8.24326;RBI=0.0576023;REFB=-0.0102522;REVB=-0.0178876;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885977;STB=0.538348;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0148152;OID=.;OPOS=111283592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:14:15:7:7:0.318182:2:5:9:5:2:5:10:5 chr6 111587266 . T C 349.87 PASS AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.000471024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.12;QD=15.2116;RBI=0.00122902;REFB=-0.00687318;REVB=0.00113518;RO=53;SAF=15;SAR=23;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176919;STB=0.605208;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00926716;OID=.;OPOS=111587266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:54:38:38:0.413043:23:15:30:23:23:15:31:23 chr6 111589293 . A C 147.1 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0182932;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.9801;QD=17.3061;RBI=0.0231973;REFB=0.0130262;REVB=0.0142645;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349675;STB=0.507803;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=-0.0126086;OID=.;OPOS=111589293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:17:18:16:16:0.470588:10:6:7:10:10:6:7:11 chr6 111620758 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.969;QD=55.0987;RBI=0.0361552;REFB=0;REVB=0.0147494;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.69273e-05;OID=.;OPOS=111620758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr6 111652898 . T C 381.44 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0116127;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8092;QD=17.1435;RBI=0.0132227;REFB=0.00165289;REVB=0.00632329;RO=49;SAF=18;SAR=22;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191849;STB=0.510753;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.000103599;OID=.;OPOS=111652898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:49:40:40:0.449438:22:18:23:26:22:18:23:26 chr6 111695073 . C T 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.019898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.143;QD=22.3412;RBI=0.0219427;REFB=-0.00691715;REVB=-0.00924946;RO=14;SAF=14;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362359;STB=0.70518;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00515305;OID=.;OPOS=111695073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:4:14:5:9:4:14:5:9 chr6 111695268 . C T 303.06 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.00383956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.444;QD=14.6053;RBI=0.0489088;REFB=-0.0309231;REVB=-0.0487579;RO=48;SAF=26;SAR=8;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2448;STB=0.635664;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0373269;OID=.;OPOS=111695268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:49:34:34:0.409639:8:26:27:21:8:26:28:21 chr6 111695887 . G A 92.22 PASS AF=0.55;AO=5;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0153764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4406;QD=18.4438;RBI=0.0154034;REFB=-0.0177954;REVB=0.000912659;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264433;STB=0.533271;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0250036;OID=.;OPOS=111695887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:5:11:0.55:2:3:3:6:8:3:3:6 chr6 111696257 . G A 455.01 PASS AF=0.454545;AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.0222355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7035;QD=16.5458;RBI=0.0242414;REFB=0.0122579;REVB=-0.00965537;RO=60;SAF=18;SAR=32;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157617;STB=0.588111;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.0144394;OID=.;OPOS=111696257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:60:60:50:50:0.454545:32:18:31:29:32:18:31:29 chr6 111696852 . T C 441.23 PASS AF=0.6;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0777868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4478;QD=25.2128;RBI=0.0825495;REFB=0.0205655;REVB=-0.0276339;RO=28;SAF=18;SAR=24;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155994;STB=0.585325;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.0123048;OID=.;OPOS=111696852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:28:42:42:0.6:24:18:18:10:24:18:18:10 chr6 111901453 . G T 972.02 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.481;QD=58.9105;RBI=0.0108643;REFB=0;REVB=-0.00106654;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52511e-06;OID=.;OPOS=111901453;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0 chr6 112393272 . GTTTTA GTTTA,GTTTT 57.74 PASS AF=0.428571,0;AO=8,4;DP=27;FAO=12,0;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=8,0;FSAR=4,0;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.229067,0.0640487;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,1;MLLD=14.3688,16.1641;QD=8.24846;RBI=0.2466,0.481178;REFB=-0.0939609,-0.00281245;REVB=-0.0913226,-0.476896;RO=10;SAF=7,0;SAR=1,4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.490566,0;SSSB=0.45078,-0.694591;STB=0.666389,0.5;STBP=0.138,1;TYPE=del,del;VARB=0.0950217,0;OID=.,.;OPOS=112393273,112393277;OREF=T,A;OALT=-,-;OMAPALT=GTTTA,GTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571,0:8,4:27:12,0:28:16:8,0:4,0:6:10:58:10:7,0:1,4:5:5 chr6 112457390 . C T 1810.92 PASS AF=0.983607;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00621475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.387;QD=59.3745;RBI=0.00982392;REFB=-0.0314754;REVB=-0.0076083;RO=1;SAF=50;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673805;STB=0.501404;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-4.9115e-06;OID=.;OPOS=112457390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:122:122:1:2:120:120:0.983607:70:50:0:1:70:50:1:1 chr6 112480041 . A G 810.29 PASS AF=0.550725;AO=76;DP=138;FAO=76;FDP=138;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=-0.0205789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8492;QD=23.4866;RBI=0.0233816;REFB=-0.0117374;REVB=0.0110998;RO=62;SAF=30;SAR=46;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346135;STB=0.518901;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0105481;OID=.;OPOS=112480041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:62:62:76:76:0.550725:46:30:22:40:46:30:22:40 chr6 112493872 . A G 2344.54 PASS AF=1;AO=153;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100679;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.333;QD=60.8971;RBI=0.0112589;REFB=0;REVB=-0.0050399;RO=0;SAF=74;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60783e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01182e-05;OID=.;OPOS=112493872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:154:0:0:153:154:1:79:74:0:0:80:74:0:0 chr6 112512905 . G A 169.17 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00509641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.882;QD=13.0131;RBI=0.0199487;REFB=0.00690997;REVB=0.0192867;RO=32;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533249;STB=0.530857;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.0110898;OID=.;OPOS=112512905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:11:9:16:16:11:9:16:16 chr6 112670967 . C CT 38.15 PASS AF=0.183486;AO=22;DP=114;FAO=20;FDP=109;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.0211957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.5077;QD=1.39996;RBI=0.119094;REFB=-0.0515844;REVB=-0.117192;RO=86;SAF=15;SAR=7;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221407;STB=0.732157;STBP=0.031;TYPE=ins;VARB=0.0653313;OID=.;OPOS=112670968;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.183486:22:114:20:109:89:15:5:42:47:38:86:15:7:44:42 chr6 112671933 . G A 330.97 PASS AF=0.492958;AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0127388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.838;QD=18.6459;RBI=0.0135634;REFB=-0.0189106;REVB=-0.00465688;RO=36;SAF=16;SAR=18;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781107;STB=0.53535;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.014536;OID=.;OPOS=112671933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:36:36:34:35:0.492958:18:16:20:16:18:17:20:16 chr6 112672007 . A G 255.66 PASS AF=0.491525;AO=28;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0161174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.585;QD=17.3329;RBI=0.0201938;REFB=-0.0180743;REVB=0.0121664;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066429;STB=0.544453;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0204195;OID=.;OPOS=112672007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:28:29:0.491525:16:12:15:15:17:12:15:15 chr6 114262015 . A C 235.22 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0294716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.184;QD=25.4292;RBI=0.0295766;REFB=-0.00634968;REVB=0.00248977;RO=15;SAF=9;SAR=13;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578724;STB=0.532105;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00463588;OID=.;OPOS=114262015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:13:9:5:10:13:9:5:10 chr6 114378970 . C T 220.56 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0125556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6035;QD=14.2299;RBI=0.0430998;REFB=-0.000842516;REVB=-0.0412305;RO=36;SAF=13;SAR=13;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228376;STB=0.62894;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=6.03978e-05;OID=.;OPOS=114378970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:13:13:26:10:13:13:26:10 chr6 116262976 . G A 146.35 PASS AF=0.304348;AO=20;DP=68;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=-0.00917527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.844;QD=8.48424;RBI=0.0216721;REFB=-0.00269467;REVB=-0.019634;RO=40;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335968;STB=0.631467;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00503987;OID=.;OPOS=116262976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:48:20:21:0.304348:11:9:7:33:12:9:12:36 chr6 116263094 . GAG AGA,GAA 88.15 PASS AF=0.105263,0.421053;AO=3,2;DP=18;FAO=2,8;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=2,5;FSAR=0,3;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00460703,0.00569799;FXX=0.049975;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=214.373,210.669;QD=18.5579;RBI=0.0386129,0.0564043;REFB=-0.0160219,-0.0147399;REVB=0.0383371,0.0561157;RO=6;SAF=3,1;SAR=0,1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.611271;STB=0.5,0.705493;STBP=1,0.19;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0337473,0.0227202;OID=.,.;OPOS=116263094,116263096;OREF=GAG,G;OALT=AGA,A;OMAPALT=AGA,GAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:37:18:19:6:7:3,2:2,8:0.105263,0.421053:0,1:3,1:6:0:0,3:2,5:7:0 chr6 116263181 . T C 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0232597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.648;QD=15.379;RBI=0.0252065;REFB=-0.0174623;REVB=0.0097135;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199941;STB=0.615202;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0231297;OID=.;OPOS=116263181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:4:10:6:6:4:10 chr6 116325142 . C T 1287.36 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=2.2335e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.739;QD=60.5818;RBI=0.0161592;REFB=0.025466;REVB=-0.0161591;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.505262;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000553788;OID=.;OPOS=116325142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:0:1:84:84:0.988235:47:37:0:0:47:37:0:1 chr6 116571255 . G A 851.18 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.084;QD=57.7073;RBI=0.0656125;REFB=0;REVB=-0.0608164;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000561134;OID=.;OPOS=116571255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0 chr6 116574455 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.853;QD=55.0985;RBI=0.0214442;REFB=0;REVB=-0.0191436;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110782;OID=.;OPOS=116574455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr6 116574827 . AT A,TA 68.97 PASS AF=0.358491,0;AO=20,3;DP=53;FAO=19,0;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=16,0;FSAR=3,0;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0322428,-0.0134535;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=10.0082,143.577;QD=5.20517;RBI=0.0599639,0.0333474;REFB=-0.150297,-0.0207014;REVB=0.0505577,-0.0305131;RO=27;SAF=16,3;SAR=4,0;SRF=14;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.333602,0.552625;STB=0.74847,0.5;STBP=0.024,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.184464,0.0762685;OID=.,.;OPOS=116574828,116574827;OREF=T,AT;OALT=-,TA;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:53:53:27:34:20,3:19,0:0.358491,0:4,0:16,3:14:13:3,0:16,0:18:16 chr6 116575083 . C A 1287.06 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299452;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.162;QD=62.0272;RBI=0.0352877;REFB=0;REVB=0.0186684;RO=0;SAF=49;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421671;OID=.;OPOS=116575083;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:34:49:0:0:34:49:0:0 chr6 116599665 . T C 631.65 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5196;QD=61.6248;RBI=0.0493099;REFB=0;REVB=-0.0175825;RO=0;SAF=35;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000956711;OID=.;OPOS=116599665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:6:35:0:0:6:35:0:0 chr6 116600465 . T TCAC 283.78 PASS AF=0.75;AO=23;DP=35;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0287798;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=3;MLLD=253.365;QD=35.4726;RBI=0.0317943;REFB=-0.0223223;REVB=0.0135129;RO=10;SAF=13;SAR=10;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019569;STB=0.521035;STBP=0.729;TYPE=ins;VARB=0.00717626;OID=.;OPOS=116600466;OREF=-;OALT=CAC;OMAPALT=TCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.75:23:35:24:32:8:13:11:5:3:53:10:13:10:6:4 chr6 116600774 . C G 237.59 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0964241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.477;QD=45.2556;RBI=0.098462;REFB=-0.135393;REVB=0.0199285;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.521717;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00765336;OID=.;OPOS=116600774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:21:21:1:1:20:20:0.952381:9:11:1:0:9:11:1:0 chr6 116600810 . G A 499.16 PASS AF=1;AO=34;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0783625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.6617;QD=55.4625;RBI=0.208561;REFB=0;REVB=0.19328;RO=2;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583286;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00854312;OID=.;OPOS=116600810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:36:36:2:0:34:36:1:15:19:0:2:17:19:0:0 chr6 116757557 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00052118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2496;QD=51.9154;RBI=0.0474167;REFB=0;REVB=0.0474139;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013567;OID=.;OPOS=116757557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr6 116783330 . G A 82.06 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0397637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.662;QD=32.822;RBI=0.0430812;REFB=-0.0268923;REVB=0.0165782;RO=1;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593592;STB=0.533262;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0031484;OID=.;OPOS=116783330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:7:2:0:1:7:2:0:1 chr6 116875427 . G A 2151.52 PASS AF=0.985714;AO=138;DP=141;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0440117;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.165;QD=61.472;RBI=0.0503101;REFB=0.0180301;REVB=0.0243737;RO=1;SAF=79;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798987;STB=0.501057;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.000186243;OID=.;OPOS=116875427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:141:140:1:2:138:138:0.985714:59:79:0:1:59:79:1:1 chr6 117086323 . G T 504.01 PASS AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.00896153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.409;QD=18.8413;RBI=0.0249155;REFB=-0.0130281;REVB=0.0232481;RO=54;SAF=27;SAR=26;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127121;STB=0.57019;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0128817;OID=.;OPOS=117086323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:54:54:53:53:0.495327:26:27:35:19:26:27:35:19 chr6 117121894 . G A 1181.88 PASS AF=1;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.571;QD=59.842;RBI=0.0125244;REFB=-0.0628124;REVB=0.00630493;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203676;OID=.;OPOS=117121894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:79:79:0:0:77:79:1:32:45:0:0:33:46:0:0 chr6 117243260 . T C 713.56 PASS AF=0.486301;AO=69;DP=146;FAO=71;FDP=146;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=0.000417675;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.863;QD=19.5496;RBI=0.00392217;REFB=-0.0147886;REVB=0.00389987;RO=76;SAF=35;SAR=34;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680087;STB=0.52692;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0149719;OID=.;OPOS=117243260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:76:75:69:71:0.486301:34:35:44:32:34:37:43:32 chr6 117244374 . T C 837.91 PASS AF=0.512195;AO=84;DP=167;FAO=84;FDP=164;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0350613;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.188;QD=20.4369;RBI=0.0447866;REFB=-0.0161642;REVB=0.0278667;RO=80;SAF=36;SAR=48;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529599;STB=0.529094;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0129018;OID=.;OPOS=117244374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:164:80:80:84:84:0.512195:48:36:39:41:48:36:39:41 chr6 117246719 . C T 469.04 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0123314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.673;QD=20.3931;RBI=0.0126181;REFB=-0.00181599;REVB=-0.0026744;RO=46;SAF=19;SAR=27;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137752;STB=0.576342;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00149601;OID=.;OPOS=117246719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:27:19:26:20:27:19:26:20 chr6 117248218 . T C 353.61 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0124833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.828;QD=18.6108;RBI=0.0215736;REFB=-0.0217651;REVB=0.017595;RO=39;SAF=22;SAR=15;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169649;STB=0.594543;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0308246;OID=.;OPOS=117248218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:15:22:16:23:15:22:16:23 chr6 117248606 . A G 436.37 PASS AF=0.52439;AO=42;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00177412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0466;QD=21.2864;RBI=0.0267065;REFB=0.00746971;REVB=-0.0266475;RO=39;SAF=12;SAR=30;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750685;STB=0.54531;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.013017;OID=.;OPOS=117248606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:39:39:42:43:0.52439:30:12:14:25:31:12:14:25 chr6 117252672 . C A 265.19 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.00947787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6129;QD=15.5995;RBI=0.0318888;REFB=-0.00132596;REVB=-0.0304477;RO=38;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104291;STB=0.558785;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00128456;OID=.;OPOS=117252672;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:15:15:15:23:15:15:15:23 chr6 117717348 . T C 610.37 PASS AF=0.5;AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00692479;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.036;QD=19.6894;RBI=0.0365206;REFB=-0.0118364;REVB=-0.0358581;RO=62;SAF=28;SAR=34;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586075;STB=0.532349;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0143898;OID=.;OPOS=117717348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:62:62:62:0.5:34:28:32:30:34:28:32:30 chr6 117725578 . T A 556.25 PASS AF=0.536082;AO=51;DP=96;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00520782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.194;QD=22.9381;RBI=0.0150092;REFB=-0.0115359;REVB=0.0140767;RO=45;SAF=23;SAR=28;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089008;STB=0.55258;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00975074;OID=.;OPOS=117725578;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:45:45:51:52:0.536082:28:23:25:20:29:23:25:20 chr6 117730819 . G A 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0159263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.429;QD=19.1559;RBI=0.0225147;REFB=-0.029008;REVB=-0.0159144;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092644;STB=0.552522;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0330873;OID=.;OPOS=117730819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:11:12:13:8:11:12 chr6 117842759 . CTG C 380.74 PASS AF=0.378151;AO=44;DP=121;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.0196;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.174;QD=12.7981;RBI=0.0202638;REFB=0.00815024;REVB=0.00514428;RO=73;SAF=19;SAR=25;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826172;STB=0.548791;STBP=0.451;TYPE=del;VARB=-0.0126834;OID=.;OPOS=117842760;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.378151:44:121:45:119:74:19:26:37:37:99:73:19:25:37:36 chr6 117860508 . A G 599.2 PASS AF=0.4375;AO=63;DP=144;FAO=63;FDP=144;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0656644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1829;QD=16.6444;RBI=0.0753499;REFB=0.0190346;REVB=-0.0369566;RO=80;SAF=31;SAR=32;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422224;STB=0.526807;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.0212847;OID=.;OPOS=117860508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:80:81:63:63:0.4375:32:31:36:44:32:31:36:45 chr6 117869491 . G A 173.13 PASS AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0321018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.925;QD=14.4272;RBI=0.0453223;REFB=-0.0260485;REVB=-0.0319935;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137426;STB=0.533943;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0371284;OID=.;OPOS=117869491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:28:18:18:0.375:10:8:14:10:10:8:14:14 chr6 118786486 . T C 156.15 PASS AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0257212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.957;QD=9.46369;RBI=0.026587;REFB=-0.00412274;REVB=0.00672987;RO=44;SAF=9;SAR=12;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159477;STB=0.586125;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00782344;OID=.;OPOS=118786486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:44:45:21:21:0.318182:12:9:25:19:12:9:25:20 chr6 118880493 . T C 233.83 PASS AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0105251;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.436;QD=12.6397;RBI=0.0115628;REFB=-0.00748525;REVB=0.00478755;RO=46;SAF=13;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201962;STB=0.615379;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0103506;OID=.;OPOS=118880493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:46:46:28:28:0.378378:15:13:30:16:15:13:30:16 chr6 118880640 . T G 670.09 PASS AF=0.515873;AO=65;DP=126;FAO=65;FDP=126;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=51;FSRF=13;FSRR=48;FWDB=0.0219455;FXX=0.059697;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.786;QD=21.2728;RBI=0.0357929;REFB=-0.00818146;REVB=0.0282759;RO=55;SAF=14;SAR=51;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254985;STB=0.501628;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.00643644;OID=.;OPOS=118880640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:55:61:65:65:0.515873:51:14:13:42:51:14:13:48 chr6 118881822 . C T 745.12 PASS AF=0.456647;AO=79;DP=174;FAO=79;FDP=173;FR=.;FRO=94;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=0.0135816;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.614;QD=17.2283;RBI=0.0203546;REFB=-0.00952972;REVB=-0.0151607;RO=94;SAF=33;SAR=46;SRF=33;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068034;STB=0.537679;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0150115;OID=.;OPOS=118881822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:94:94:79:79:0.456647:46:33:33:61:46:33:33:61 chr6 118886961 . G T 360.12 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0540128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.201;QD=22.8646;RBI=0.0540886;REFB=-0.0279773;REVB=-0.00286329;RO=27;SAF=18;SAR=18;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720703;STB=0.539661;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0162018;OID=.;OPOS=118886961;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:18:18:16:11:18:18:16:11 chr6 118887303 . T C 540.27 PASS AF=0.406897;AO=59;DP=145;FAO=59;FDP=145;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=0.00902597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.349;QD=14.9039;RBI=0.00991524;REFB=-0.00920672;REVB=0.00410413;RO=84;SAF=31;SAR=28;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113354;STB=0.556262;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0102741;OID=.;OPOS=118887303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:84:86:59:59:0.406897:28:31:35:49:28:31:37:49 chr6 118973953 . A G 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0031876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.688;QD=22.3968;RBI=0.0145426;REFB=-0.0172558;REVB=0.014189;RO=23;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147024;STB=0.582025;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0138968;OID=.;OPOS=118973953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:13:12:15:8:13:12:15:8 chr6 119136759 . A C 216.73 PASS AF=0.552632;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0349286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.518;QD=22.8137;RBI=0.0360731;REFB=-0.0167671;REVB=-0.00901451;RO=16;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124868;STB=0.565973;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0100599;OID=.;OPOS=119136759;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:16:17:20:21:0.552632:13:7:8:8:14:7:8:9 chr6 119149149 . C G 471.5 PASS AF=0.555556;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00994521;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.438;QD=23.2838;RBI=0.0122;REFB=-0.00839301;REVB=0.00706629;RO=36;SAF=32;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210918;STB=0.628512;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0081743;OID=.;OPOS=119149149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:36:36:45:45:0.555556:13:32:17:19:13:32:16:20 chr6 119327632 . C T 229.6 PASS AF=0.363636;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.00557439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8621;QD=11.9275;RBI=0.0410281;REFB=0.0140072;REVB=-0.0406476;RO=49;SAF=14;SAR=14;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192595;STB=0.610315;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.0255987;OID=.;OPOS=119327632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:49:49:28:28:0.363636:14:14:33:16:14:14:33:16 chr6 119510941 . C A 1674.23 PASS AF=0.974138;AO=113;DP=116;FAO=113;FDP=116;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0134131;FXX=0.0169477;HRUN=6;LEN=1;MLLD=97.3157;QD=57.732;RBI=0.0139694;REFB=-0.13438;REVB=0.00390269;RO=0;SAF=64;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34554e-08;STB=0.502642;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.000588523;OID=.;OPOS=119510941;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:116:116:0:3:113:113:0.974138:49:64:0:0:49:64:2:1 chr6 120583498 . G A 48.72 PASS AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0112141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1922;QD=3.89763;RBI=0.0132219;REFB=-0.0195277;REVB=-0.00700434;RO=42;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124879;STB=0.586515;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0268429;OID=.;OPOS=120583498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:50:50:42:42:8:8:0.16:5:3:20:22:5:3:20:22 chr6 120583501 . T G 48.72 PASS AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00830757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.65;QD=3.89778;RBI=0.0106154;REFB=-0.00206773;REVB=0.00660847;RO=42;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124879;STB=0.586515;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0119636;OID=.;OPOS=120583501;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:50:50:42:42:8:8:0.16:5:3:20:22:5:3:20:22 chr6 120583509 . A G 49.39 PASS AF=0.170213;AO=8;DP=47;FAO=8;FDP=47;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0113041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.517;QD=4.20321;RBI=0.0183382;REFB=-0.00628981;REVB=0.0144398;RO=39;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168052;STB=0.614685;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.034187;OID=.;OPOS=120583509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:47:47:39:39:8:8:0.170213:5:3:20:19:5:3:20:19 chr6 120583521 . A T 41.21 PASS AF=0.162791;AO=7;DP=43;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0129748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.162;QD=3.83347;RBI=0.0487755;REFB=-0.00111187;REVB=-0.0470182;RO=35;SAF=3;SAR=4;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103079;STB=0.559828;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0296947;OID=.;OPOS=120583521;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:43:43:35:36:7:7:0.162791:4:3:18:17:4:3:18:18 chr6 121451095 . C T 110.9 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0261292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.628;QD=13.4418;RBI=0.0398992;REFB=0.00291077;REVB=-0.0301532;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203269;STB=0.618869;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00856709;OID=.;OPOS=121451095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:10:4:9:10:10:4:9:10 chr6 121602785 . T A 307.17 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.0178845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.692;QD=15.5531;RBI=0.0252854;REFB=0.000435911;REVB=0.0178744;RO=45;SAF=19;SAR=15;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136071;STB=0.576436;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.000802325;OID=.;OPOS=121602785;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:15:19:31:14:15:19:31:14 chr6 121602795 . C T 270.61 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.00696803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.925;QD=14.4325;RBI=0.0228962;REFB=-0.000823206;REVB=-0.0218101;RO=44;SAF=16;SAR=15;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173316;STB=0.59786;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00134398;OID=.;OPOS=121602795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:15:16:30:14:15:16:30:14 chr6 121620608 . G T 723.14 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.841;QD=56.7169;RBI=0.0272089;REFB=0;REVB=-0.00514684;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.65796e-05;OID=.;OPOS=121620608;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:22:27:0:0:24:27:0:0 chr6 121625945 . A G 205.33 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00188762;FXX=0.0188644;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.696;QD=15.7946;RBI=0.0260094;REFB=-0.00460297;REVB=0.0259409;RO=29;SAF=10;SAR=13;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180829;STB=0.602561;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00858623;OID=.;OPOS=121625945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:13:10:18:11:13:10:18:11 chr6 121632008 . T A 1472.54 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2816;QD=63.3349;RBI=0.0561911;REFB=0;REVB=0.0395011;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.6488e-06;OID=.;OPOS=121632008;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0 chr6 121638666 . G A 404.27 PASS AF=0.547945;AO=39;DP=72;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0374462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.271;QD=22.1517;RBI=0.0428027;REFB=-0.0297806;REVB=-0.0207329;RO=33;SAF=25;SAR=14;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134628;STB=0.578152;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0246139;OID=.;OPOS=121638666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:33:33:39:40:0.547945:14:25:16:17:14:26:16:17 chr6 121638682 . G A 447.63 PASS AF=0.517647;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00554626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.182;QD=21.0649;RBI=0.0220684;REFB=-0.0081299;REVB=-0.0213601;RO=40;SAF=28;SAR=16;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164611;STB=0.585863;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00816877;OID=.;OPOS=121638682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:40:41:44:44:0.517647:16:28:18:22:16:28:19:22 chr6 121642790 . T C 795.37 PASS AF=0.488095;AO=82;DP=168;FAO=82;FDP=168;FR=.;FRO=86;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=0.0529203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0782;QD=18.9373;RBI=0.0594692;REFB=-0.00100882;REVB=-0.0271299;RO=86;SAF=45;SAR=37;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670031;STB=0.536953;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00127809;OID=.;OPOS=121642790;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:86:86:82:82:0.488095:37:45:41:45:37:45:41:45 chr6 121642851 . C T 724.38 PASS AF=0.463855;AO=77;DP=166;FAO=77;FDP=166;FR=.;FRO=89;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=-0.0113923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.527;QD=17.455;RBI=0.012096;REFB=-0.00642706;REVB=-0.00406554;RO=89;SAF=36;SAR=41;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101781;STB=0.556373;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00615418;OID=.;OPOS=121642851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:89:89:77:77:0.463855:41:36:51:38:41:36:51:38 chr6 121642916 . C T 664.12 PASS AF=0.610526;AO=58;DP=94;FAO=58;FDP=95;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0403406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.313;QD=27.9628;RBI=0.0405623;REFB=-0.00671778;REVB=0.00423522;RO=36;SAF=30;SAR=28;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070743;STB=0.532984;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00616045;OID=.;OPOS=121642916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:36:37:58:58:0.610526:28:30:15:21:28:30:16:21 chr6 121675600 . T C 558.26 PASS AF=0.586207;AO=51;DP=87;FAO=51;FDP=87;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0159966;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.7472;QD=25.6669;RBI=0.0518813;REFB=-0.0245419;REVB=0.0493536;RO=36;SAF=24;SAR=27;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642713;STB=0.535121;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00596096;OID=.;OPOS=121675600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:36:36:51:51:0.586207:27:24:20:16:27:24:20:16 chr6 121699975 . A G 1634.44 PASS AF=1;AO=97;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.557;QD=59.9795;RBI=0.0575392;REFB=0;REVB=0.0558551;RO=0;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188744;OID=.;OPOS=121699975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:97:109:1:40:57:0:0:51:58:0:0 chr6 121770875 . C T 343.34 PASS AF=1;AO=18;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.795;QD=54.9345;RBI=0.0792011;REFB=0;REVB=0.0766122;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354767;OID=.;OPOS=121770875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:18:25:1:7:11:0:0:14:11:0:0 chr6 123066514 . T C 322.4 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0112357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.308;QD=16.5331;RBI=0.0124716;REFB=-0.00774975;REVB=0.00541306;RO=43;SAF=16;SAR=19;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535367;STB=0.530086;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00831846;OID=.;OPOS=123066514;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:19:16:22:21:19:16:22:21 chr6 123066585 . G A 179.68 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0594442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5025;QD=15.6241;RBI=0.0642435;REFB=-0.0053752;REVB=-0.0243642;RO=27;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106561;STB=0.561138;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00459292;OID=.;OPOS=123066585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:10:9:10:17:10:9:10:17 chr6 123101646 . GA G,GG 396.15 PASS AF=1,0;AO=17,7;DP=33;FAO=29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0411741,-0.0447954;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=241.043,235.367;QD=54.6412;RBI=0.0912113,0.0885547;REFB=0,0;REVB=0.0813892,0.0763892;RO=8;SAF=4,6;SAR=13,1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0936007,0.625044;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00242709,-0.11881;OID=.,.;OPOS=123101647,123101647;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:17,7:33:29,0:29:0:12,0:17,0:0:0:4:8:4,6:13,1:1:7 chr6 123110537 . C T 393.3 PASS AF=0.59375;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0369874;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.432;QD=24.5812;RBI=0.0371332;REFB=-0.041261;REVB=-0.00328809;RO=26;SAF=17;SAR=21;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067634;STB=0.537109;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0290634;OID=.;OPOS=123110537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:26:26:38:38:0.59375:21:17:14:12:21:17:14:12 chr6 123594510 . T TA 3106.46 PASS AF=1;AO=273;DP=360;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130677;FXX=0.0031347;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.7357;QD=39.0749;RBI=0.131509;REFB=0.0123102;REVB=-0.0147761;RO=79;SAF=120;SAR=153;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033926;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00225883;OID=.;OPOS=123594511;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:273:360:318:318:0:136:182:0:0:46:79:120:153:41:38 chr6 123658825 . G T 4745.36 PASS AF=1;AO=305;DP=307;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188752;FXX=0.00651445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.237;QD=62.2343;RBI=0.0222313;REFB=0.0857367;REVB=-0.0117455;RO=1;SAF=183;SAR=122;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00389344;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1947e-05;OID=.;OPOS=123658825;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:307:305:1:0:305:305:1:122:183:0:1:122:183:0:0 chr6 123687288 . A C,T 2592.57 PASS AF=0.954802,0.0225989;AO=163,9;DP=175;FAO=169,4;FDP=177;FR=.;FRO=4;FSAF=84,1;FSAR=85,3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0336659,0.0448185;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=141.256,14.0651;QD=58.5892;RBI=0.0337168,0.0744124;REFB=-0.0238978,0.022457;REVB=-0.00185149,-0.0594013;RO=2;SAF=84,1;SAR=79,8;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0111938,-0.429214;STB=0.500068,0.64209;STBP=0.906,0.45;TYPE=snp,snp;VARB=0.00134882,0.207247;OID=.,.;OPOS=123687288,123687288;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:175:177:2:4:163,9:169,4:0.954802,0.0225989:79,8:84,1:2:0:85,3:84,1:2:2 chr6 123702499 . G A 1752.57 PASS AF=1;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0057473;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.049;QD=60.9588;RBI=0.0106168;REFB=0;REVB=0.00892669;RO=0;SAF=58;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23074e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41234e-05;OID=.;OPOS=123702499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:114:115:1:56:58:0:0:57:58:0:0 chr6 123758492 . C T 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00213614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.055;QD=56.9374;RBI=0.00776069;REFB=0;REVB=0.00746091;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90818e-05;OID=.;OPOS=123758492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr6 123833457 . G C 2722.17 PASS AF=1;AO=174;DP=176;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232023;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.689;QD=62.5785;RBI=0.0259635;REFB=0;REVB=0.0116515;RO=0;SAF=92;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84092e-05;OID=.;OPOS=123833457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:176:174:0:0:174:174:1:82:92:0:0:82:92:0:0 chr6 124603378 . A G 307.45 PASS AF=0.376344;AO=34;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.00054239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.065;QD=13.2237;RBI=0.00966755;REFB=-0.0172234;REVB=-0.00965232;RO=58;SAF=15;SAR=19;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06976;STB=0.531628;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0287223;OID=.;OPOS=124603378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:58:58:34:35:0.376344:19:15:22:36:20:15:22:36 chr6 124603390 . A G 260.8 PASS AF=0.352273;AO=31;DP=90;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0256787;FXX=0.0222198;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6045;QD=11.8547;RBI=0.0286077;REFB=-0.00843208;REVB=0.0126096;RO=57;SAF=11;SAR=20;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375836;STB=0.521725;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0154253;OID=.;OPOS=124603390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:88:57:57:31:31:0.352273:20:11:22:35:20:11:22:35 chr6 125284457 . T C 1724.78 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=118;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00554797;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.772;QD=59.9924;RBI=0.0245977;REFB=-0.0652921;REVB=0.0239638;RO=0;SAF=67;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3323e-08;STB=0.505262;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00107465;OID=.;OPOS=125284457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:118:115:0:1:114:114:0.991304:47:67:0:0:47:67:0:1 chr6 125475139 . G A 291.4 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.00701062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.703;QD=16.8929;RBI=0.011466;REFB=-0.0223308;REVB=-0.00907307;RO=37;SAF=13;SAR=19;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228818;STB=0.628161;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0193988;OID=.;OPOS=125475139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:19:13:24:13:19:13:24:13 chr6 125573194 . A G 251.66 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00816367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.113;QD=17.0614;RBI=0.0372476;REFB=-0.0156916;REVB=-0.036342;RO=30;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00688529;STB=0.503174;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0198244;OID=.;OPOS=125573194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:31:28:28:0.474576:17:11:12:18:17:11:12:19 chr6 126210395 . T G 44.29 PASS AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0274561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.411;QD=22.1436;RBI=0.0523133;REFB=-0.192343;REVB=0.0445291;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173071;STB=0.599697;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0154031;OID=.;OPOS=126210395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:0:2:4:2:0:2 chr6 126236604 . A G 33.93 PASS AF=0.0691489;AO=13;DP=191;FAO=13;FDP=188;FR=.;FRO=175;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=86;FSRR=89;FWDB=-0.0092506;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.272;QD=0.721933;RBI=0.0144598;REFB=0.00116094;REVB=0.0111136;RO=178;SAF=2;SAR=11;SRF=89;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380291;STB=0.828241;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0148484;OID=.;OPOS=126236604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:191:188:178:175:13:13:0.0691489:11:2:89:89:11:2:86:89 chr6 126250396 . TTT TAA,TTA 232.91 PASS AF=0.708333,0.208333;AO=7,6;DP=24;FAO=17,5;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=4,2;FSAR=13,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0246224,-0.0767588;FXX=0;HRUN=13,13;LEN=2,1;MLLD=24.9484,15.169;QD=38.8186;RBI=0.105816,0.269587;REFB=0.141117,0.189177;REVB=-0.102912,-0.258429;RO=1;SAF=3,2;SAR=4,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0971198,0.0962265;STB=0.518497,0.571154;STBP=0.64,0.616;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0370677,-0.0852145;OID=.,.;OPOS=126250397,126250398;OREF=TT,T;OALT=AA,A;OMAPALT=TAA,TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.708333,0.208333:7,6:24:17,5:24:1:4,2:13,3:0:1:22:1:3,2:4,4:0:1 chr6 126278230 . G C 919.86 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8404;QD=58.4041;RBI=0.0466939;REFB=0;REVB=-0.0105299;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000618915;OID=.;OPOS=126278230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0 chr6 126667455 . C T 445.64 PASS AF=0.617647;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00891719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.268;QD=26.2143;RBI=0.0260764;REFB=-0.00642315;REVB=-0.0245043;RO=26;SAF=28;SAR=14;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280662;STB=0.653392;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00306697;OID=.;OPOS=126667455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:26:26:42:42:0.617647:14:28:7:19:14:28:7:19 chr6 127609691 . C T 104.62 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0203852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.602;QD=19.9284;RBI=0.0223193;REFB=0.00135527;REVB=0.00908802;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977979;STB=0.555467;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.000653402;OID=.;OPOS=127609691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:8:4:2:7:8:4:2:7 chr6 127768472 . G A 186.19 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0234966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4662;QD=12.4123;RBI=0.0263864;REFB=0.00747012;REVB=0.0120062;RO=36;SAF=13;SAR=10;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127757;STB=0.581459;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=-0.0120735;OID=.;OPOS=127768472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:10:13:16:20:10:13:16:21 chr6 127797101 . C T 295.77 PASS AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00526451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.082;QD=22.3221;RBI=0.00715594;REFB=-0.024081;REVB=0.00484689;RO=23;SAF=8;SAR=22;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379624;STB=0.710451;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0126387;OID=.;OPOS=127797101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:22:8:17:6:22:8:17:6 chr6 127797179 . G A 234.92 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00885116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.687;QD=18.7939;RBI=0.00982323;REFB=-0.0185282;REVB=0.0042606;RO=27;SAF=16;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282662;STB=0.660539;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0252428;OID=.;OPOS=127797179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:7:16:11:16:7:16:11:16 chr6 127797374 . G A 484.82 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0172362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.148;QD=21.0792;RBI=0.0247452;REFB=-0.00460046;REVB=-0.0177549;RO=45;SAF=21;SAR=26;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115584;STB=0.563886;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00582711;OID=.;OPOS=127797374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:47:47:0.51087:26:21:26:19:26:21:26:19 chr6 128134555 . G C 120.14 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0467604;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.88;QD=12.6463;RBI=0.0474318;REFB=-0.00841269;REVB=-0.00795217;RO=23;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127032;STB=0.593081;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0229155;OID=.;OPOS=128134555;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:24:14:14:0.368421:4:10:14:9:4:10:14:10 chr6 128312033 . A G 1176.07 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0257219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.529;QD=59.5478;RBI=0.0260216;REFB=-0.0568872;REVB=0.00393767;RO=1;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101798;STB=0.505375;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000126032;OID=.;OPOS=128312033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:46:32:0:1:46:32:0:1 chr6 128403745 . A G 734.58 PASS AF=0.48125;AO=75;DP=160;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=0.00724614;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1237;QD=18.3644;RBI=0.012299;REFB=0.00298415;REVB=0.00993773;RO=84;SAF=21;SAR=54;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161149;STB=0.57375;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00523898;OID=.;OPOS=128403745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:84:83:75:77:0.48125:54:21:36:48:55:22:34:49 chr6 129381026 . C A 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00839462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.079;QD=60.7161;RBI=0.0120385;REFB=0;REVB=0.00862877;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6334e-05;OID=.;OPOS=129381026;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chr6 129511373 . T C 580.3 PASS AF=0.350254;AO=69;DP=196;FAO=69;FDP=197;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=67;FSRR=61;FWDB=0.00153288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.81;QD=11.7827;RBI=0.0305876;REFB=-0.0121987;REVB=-0.0305492;RO=126;SAF=39;SAR=30;SRF=66;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473781;STB=0.527411;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0220657;OID=.;OPOS=129511373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:126:128:69:69:0.350254:30:39:66:60:30:39:67:61 chr6 129612808 . A G 1253.34 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00214463;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.476;QD=60.402;RBI=0.0324891;REFB=-0.00176766;REVB=0.0324182;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116923;STB=0.506171;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=3.60355e-05;OID=.;OPOS=129612808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:83:1:1:82:82:0.987952:40:42:0:1:40:42:0:1 chr6 129722389 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.994;QD=62.3509;RBI=0.031941;REFB=0;REVB=0.027363;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82739e-05;OID=.;OPOS=129722389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0 chr6 129722425 . G A 722.73 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3607;QD=62.8462;RBI=0.0611608;REFB=0;REVB=0.0482064;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151664;OID=.;OPOS=129722425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:20:24:0:0:21:25:0:0 chr6 129807629 . C T 259.41 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.000633515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.318;QD=14.2143;RBI=0.0113714;REFB=-0.00287681;REVB=-0.0113537;RO=43;SAF=19;SAR=11;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153762;STB=0.587569;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00317486;OID=.;OPOS=129807629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:0.410959:11:19:21:22:11:19:21:22 chr6 129807699 . G C 264.37 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0202883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.81;QD=12.8961;RBI=0.020884;REFB=-0.00334755;REVB=-0.00495242;RO=50;SAF=19;SAR=12;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166129;STB=0.6012;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00830993;OID=.;OPOS=129807699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:51:31:31:0.378049:12:19:23:27:12:19:23:28 chr6 129807714 . G A 516.71 PASS AF=0.578313;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0203583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6803;QD=24.9016;RBI=0.0214846;REFB=-0.00752863;REVB=0.00686483;RO=33;SAF=22;SAR=26;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109777;STB=0.547623;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00657613;OID=.;OPOS=129807714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:33:35:48:48:0.578313:26:22:20:13:26:22:20:15 chr6 129813053 . A G 466.36 PASS AF=0.584416;AO=44;DP=77;FAO=45;FDP=77;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0289676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.674;QD=24.2263;RBI=0.0354976;REFB=-0.0226468;REVB=0.0205171;RO=32;SAF=21;SAR=23;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174689;STB=0.504617;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0137802;OID=.;OPOS=129813053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:32:32:44:45:0.584416:23:21:16:16:23:22:16:16 chr6 129814566 . G A 411.15 PASS AF=0.387097;AO=48;DP=123;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.00702665;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.745;QD=13.2629;RBI=0.0127728;REFB=-0.0107695;REVB=-0.0106663;RO=75;SAF=33;SAR=15;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177591;STB=0.605786;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.015061;OID=.;OPOS=129814566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:75:76:48:48:0.387097:15:33:40:35:15:33:40:36 chr6 129927014 . A G 719.28 PASS AF=0.490066;AO=73;DP=151;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=46;FSRR=31;FWDB=-0.00786308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.522;QD=19.0538;RBI=0.0214526;REFB=-0.00600841;REVB=0.0199596;RO=77;SAF=42;SAR=31;SRF=46;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210619;STB=0.515558;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.00665015;OID=.;OPOS=129927014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:77:77:73:74:0.490066:31:42:46:31:32:42:46:31 chr6 130031215 . T C 2186.91 PASS AF=1;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5392;QD=62.0399;RBI=0.104932;REFB=0;REVB=0.0961519;RO=0;SAF=65;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32058e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112116;OID=.;OPOS=130031215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:141:141:0:0:140:141:1:75:65:0:0:76:65:0:0 chr6 130152479 . T C 72.69 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00828544;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.46;QD=8.81068;RBI=0.0124601;REFB=3.85103e-05;REVB=0.00930626;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741239;STB=0.545364;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=2.92737e-05;OID=.;OPOS=130152479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:13:10:5:5:13:10 chr6 130152520 . A C 72.34 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00569598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.116;QD=8.51006;RBI=0.0392688;REFB=-0.00367495;REVB=-0.0388535;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956655;STB=0.558707;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00759275;OID=.;OPOS=130152520;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:14:10:5:5:14:10 chr6 130154686 . A G 211.74 PASS AF=0.488372;AO=19;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0447515;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=172.685;QD=19.6966;RBI=0.045732;REFB=-0.00810545;REVB=0.00941917;RO=16;SAF=3;SAR=16;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492465;STB=0.796557;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00352724;OID=.;OPOS=130154686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:16:22:19:21:0.488372:16:3:11:5:18:3:14:8 chr6 130374102 . C A 824.59 PASS AF=0.967213;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.004779;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4599;QD=54.0716;RBI=0.0730624;REFB=0.0760449;REVB=-0.072906;RO=2;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285773;STB=0.515146;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0105488;OID=.;OPOS=130374102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:61:2:2:59:59:0.967213:32:27:0:2:32:27:0:2 chr6 130381246 . T C 1513.79 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000265395;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.322;QD=63.7386;RBI=0.0239768;REFB=0;REVB=0.0239753;RO=0;SAF=51;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09171e-05;OID=.;OPOS=130381246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:94:95:1:43:51:0:0:43:52:0:0 chr6 130537005 . G A 1097.53 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.124;QD=60.1386;RBI=0.0372966;REFB=0;REVB=-0.0178313;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60918e-05;OID=.;OPOS=130537005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:35:37:0:0:36:37:0:0 chr6 130761798 . T C 502.05 PASS AF=0.377358;AO=60;DP=159;FAO=60;FDP=159;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=-0.000940259;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.552;QD=12.6301;RBI=0.0193964;REFB=-0.00664072;REVB=0.0193736;RO=99;SAF=33;SAR=27;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137456;STB=0.577835;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0105736;OID=.;OPOS=130761798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:99:99:60:60:0.377358:27:33:42:57:27:33:42:57 chr6 130761957 . A G 222.13 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00796149;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.919;QD=18.1329;RBI=0.0196887;REFB=-0.00943133;REVB=0.0180072;RO=27;SAF=13;SAR=9;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116289;STB=0.565758;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00706035;OID=.;OPOS=130761957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:9:13:19:8:9:13:19:8 chr6 130764061 . G A 378.33 PASS AF=0.328671;AO=41;DP=143;FAO=47;FDP=143;FR=.;FRO=96;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=-0.00138674;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2605;QD=10.5828;RBI=0.0191759;REFB=-0.00352994;REVB=0.0191257;RO=93;SAF=19;SAR=22;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790077;STB=0.59063;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0239053;OID=.;OPOS=130764061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:93:96:41:47:0.328671:22:19:37:56:22:25:38:58 chr6 131160876 . G T 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.88;QD=61.6953;RBI=0.0667984;REFB=0;REVB=0.0667895;RO=0;SAF=53;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85245e-05;OID=.;OPOS=131160876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:29:53:0:0:29:53:0:0 chr6 131603366 . AGT A 308.37 PASS AF=0.43038;AO=33;DP=82;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0172201;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=2;MLLD=260.363;QD=15.6136;RBI=0.0398157;REFB=-0.0270125;REVB=0.0358993;RO=46;SAF=18;SAR=15;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135539;STB=0.592093;STBP=0.174;TYPE=del;VARB=0.0362057;OID=.;OPOS=131603367;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.43038:33:82:34:79:45:18:16:31:14:99:46:18:15:31:15 chr6 131995313 . A G 2409.01 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.515;QD=64.2402;RBI=0.0225301;REFB=0;REVB=0.0165278;RO=0;SAF=84;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3174e-05;OID=.;OPOS=131995313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:66:84:0:0:66:84:0:0 chr6 132022419 . G A 277.9 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00854038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.259;QD=50.5264;RBI=0.0108954;REFB=0;REVB=0.00676554;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267003;OID=.;OPOS=132022419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:11:11:0:0 chr6 132212742 . A C 398.32 PASS AF=0.385246;AO=47;DP=122;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.00214305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.823;QD=13.0596;RBI=0.00510143;REFB=-0.00447619;REVB=-0.00462946;RO=74;SAF=25;SAR=22;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00528978;STB=0.507345;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00913324;OID=.;OPOS=132212742;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:74:75:47:47:0.385246:22:25:39:35:22:25:39:36 chr6 132212808 . C T 223.73 PASS AF=0.325581;AO=28;DP=87;FAO=28;FDP=86;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0128908;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6383;QD=10.406;RBI=0.0164733;REFB=-0.00401185;REVB=-0.0102567;RO=58;SAF=17;SAR=11;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10571;STB=0.56182;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0109267;OID=.;OPOS=132212808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:58:58:28:28:0.325581:11:17:30:28:11:17:30:28 chr6 132271952 . G C 492.44 PASS AF=0.921053;AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0269524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5508;QD=51.8354;RBI=0.0317545;REFB=-0.170848;REVB=-0.0167903;RO=3;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902223;STB=0.548359;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00738766;OID=.;OPOS=132271952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:38:38:3:3:35:35:0.921053:14:21:0:3:14:21:0:3 chr6 132271959 . T G 613.34 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0749175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.872;QD=61.3343;RBI=0.0755237;REFB=0;REVB=0.00954977;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000674096;OID=.;OPOS=132271959;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr6 132271980 . T G 588.21 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5647;QD=60.3293;RBI=0.0667128;REFB=0;REVB=0.0438315;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000479699;OID=.;OPOS=132271980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:39:0:0:35:39:1:19:16:0:0:21:18:0:0 chr6 132859609 . T A 1875.03 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.281;QD=61.4763;RBI=0.054225;REFB=0;REVB=0.0343704;RO=0;SAF=53;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.71068e-05;OID=.;OPOS=132859609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:122:0:0:118:122:1:65:53:0:0:66:56:0:0 chr6 132938842 . C T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.257;QD=49.5991;RBI=0.0166987;REFB=0;REVB=-0.0121345;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000245117;OID=.;OPOS=132938842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr6 132966348 . G A 212.94 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0539795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.901;QD=12.7131;RBI=0.0640064;REFB=-0.0138635;REVB=-0.0343954;RO=40;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175972;STB=0.608211;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0377719;OID=.;OPOS=132966348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:10:16:18:22:10:16:18:23 chr6 133035098 . G A 613.75 PASS AF=0.585106;AO=55;DP=94;FAO=55;FDP=94;FR=.;FRO=39;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.00293872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.391;QD=26.1171;RBI=0.00381741;REFB=0.000578118;REVB=0.0024365;RO=39;SAF=32;SAR=23;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877664;STB=0.547823;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000564068;OID=.;OPOS=133035098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:39:39:55:55:0.585106:23:32:27:12:23:32:27:12 chr6 133070995 . G T 2159.56 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0627673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.17;QD=63.0529;RBI=0.0649882;REFB=0;REVB=0.0168443;RO=0;SAF=62;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.59579e-05;OID=.;OPOS=133070995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:75:62:0:0:75:62:0:0 chr6 133135886 . A G 43.46 PASS AF=0.2;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.011894;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.049;QD=4.96685;RBI=0.0160856;REFB=-0.00508565;REVB=-0.0108296;RO=27;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107181;STB=0.557213;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0233388;OID=.;OPOS=133135886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:36:35:27:28:7:7:0.2:3:4:13:14:3:4:14:14 chr6 133849966 . C T 1704.21 PASS AF=0.982759;AO=113;DP=117;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00774916;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.064;QD=58.7659;RBI=0.00844783;REFB=-0.0536856;REVB=-0.00336398;RO=1;SAF=39;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637395;STB=0.503018;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.000913429;OID=.;OPOS=133849966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:117:116:1:2:113:114:0.982759:74:39:0:1:75:39:1:1 chr6 133850246 . AC A 936.5 PASS AF=1;AO=79;DP=83;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243554;FXX=0.0476134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.2183;QD=46.8252;RBI=0.0511725;REFB=0;REVB=-0.0450049;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.414462;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000932023;OID=.;OPOS=133850247;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:79:83:80:80:0:36:44:0:0:17:0:36:43:0:0 chr6 135263557 . C A 317.86 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00317217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.334;QD=15.5052;RBI=0.00441522;REFB=-0.00937693;REVB=0.00307108;RO=45;SAF=18;SAR=17;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190436;STB=0.510113;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0136788;OID=.;OPOS=135263557;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:47:35:35:0.426829:17:18:24:21:17:18:25:22 chr6 135286230 . T C 127.73 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00789079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.396;QD=11.8818;RBI=0.00789082;REFB=-0.0235697;REVB=2.36305e-05;RO=28;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263309;STB=0.501556;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0508898;OID=.;OPOS=135286230;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:7:8:15:13:7:8:15:13 chr6 135358567 . T G 218.92 PASS AF=0.567568;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0168423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.601;QD=23.6666;RBI=0.0192297;REFB=-0.0277885;REVB=0.00927992;RO=16;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173878;STB=0.579975;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0128444;OID=.;OPOS=135358567;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:16:20:21:0.567568:7:13:7:9:8:13:7:9 chr6 135358916 . G A 244.28 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.000414203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1362;QD=13.0284;RBI=0.00537031;REFB=0.00775605;REVB=-0.00535432;RO=46;SAF=17;SAR=12;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139171;STB=0.579668;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=-0.0127283;OID=.;OPOS=135358916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:12:17:21:25:12:17:21:25 chr6 135375762 . G A 118.07 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00118223;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.414;QD=11.2443;RBI=0.00337919;REFB=-0.00585113;REVB=-0.00316564;RO=28;SAF=6;SAR=8;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236241;STB=0.639808;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00890482;OID=.;OPOS=135375762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:28:28:14:14:0.333333:8:6:18:10:8:6:18:10 chr6 135523774 . A G 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00234818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.407;QD=57.2377;RBI=0.00360014;REFB=0;REVB=0.00272894;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78728e-07;OID=.;OPOS=135523774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0 chr6 136359280 . C CG 790.28 PASS AF=1;AO=79;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.150542;FXX=0.0107515;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.3601;QD=34.3602;RBI=0.155556;REFB=0.0141187;REVB=-0.0391776;RO=10;SAF=40;SAR=39;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085973;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00186394;OID=.;OPOS=136359281;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:79:93:92:92:0:42:50:0:0:13:10:40:39:1:9 chr6 136359323 . T TAGC 109.92 PASS AF=0.283019;AO=13;DP=68;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0187983;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=3;MLLD=195.018;QD=8.29609;RBI=0.018926;REFB=-0.0319048;REVB=-0.00219496;RO=54;SAF=8;SAR=5;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297835;STB=0.661558;STBP=0.147;TYPE=ins;VARB=0.0868151;OID=.;OPOS=136359324;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.283019:13:68:15:53:38:9:6:14:24:99:54:8:5:20:34 chr6 136359446 . A C 384.91 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0660216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.598;QD=53.0906;RBI=0.0669001;REFB=-0.14362;REVB=0.0108059;RO=1;SAF=15;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300185;STB=0.516118;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00245728;OID=.;OPOS=136359446;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:29:29:1:1:28:28:0.965517:13:15:1:0:13:15:1:0 chr6 136513481 . TA T 41.65 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.152955;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.027;QD=3.96652;RBI=0.153099;REFB=-0.0712229;REVB=-0.00664813;RO=22;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198983;STB=0.642653;STBP=0.198;TYPE=del;VARB=0.124657;OID=.;OPOS=136513482;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:14:42:14:42:28:5:9:16:12:41:22:5:9:12:10 chr6 136582417 . G A 32.11 PASS AF=0.12;AO=6;DP=50;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0157534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.311;QD=2.5686;RBI=0.038712;REFB=-0.00937302;REVB=-0.0353617;RO=43;SAF=3;SAR=3;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680824;STB=0.559803;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0652828;OID=.;OPOS=136582417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:50:50:43:44:6:6:0.12:3:3:24:19:3:3:25:19 chr6 136582497 . G T 199.86 PASS AF=0.212903;AO=32;DP=154;FAO=33;FDP=155;FR=.;FRO=122;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=66;FWDB=0.0159181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.342;QD=5.15766;RBI=0.0201939;REFB=-0.00446114;REVB=-0.012426;RO=120;SAF=17;SAR=15;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103085;STB=0.567716;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0209623;OID=.;OPOS=136582497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:120:122:32:33:0.212903:15:17:54:66:15:18:56:66 chr6 136597262 . T C 116.93 PASS AF=0.195876;AO=19;DP=97;FAO=19;FDP=97;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=0.00213392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.269;QD=4.82179;RBI=0.00299937;REFB=-0.00268624;REVB=-0.00210775;RO=78;SAF=8;SAR=11;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191199;STB=0.512182;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00622396;OID=.;OPOS=136597262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:78:78:19:19:0.195876:11:8:34:44:11:8:34:44 chr6 136597281 . A T 128.16 PASS AF=0.212766;AO=20;DP=94;FAO=20;FDP=94;FR=.;FRO=74;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.00384707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.382;QD=5.45374;RBI=0.0208625;REFB=-0.00131272;REVB=-0.0205048;RO=74;SAF=9;SAR=11;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514485;STB=0.503223;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0049073;OID=.;OPOS=136597281;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:74:74:20:20:0.212766:11:9:33:41:11:9:33:41 chr6 136597288 . A C 83.94 PASS AF=0.168539;AO=15;DP=92;FAO=15;FDP=89;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.0163428;FXX=0.0326052;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.512;QD=3.7728;RBI=0.0377755;REFB=-0.000363717;REVB=-0.0340574;RO=74;SAF=8;SAR=7;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143379;STB=0.594231;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00524336;OID=.;OPOS=136597288;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:92:89:74:74:15:15:0.168539:7:8:31:43:7:8:31:43 chr6 136599393 . G C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0150194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.306;QD=12.4828;RBI=0.0156003;REFB=-0.0100436;REVB=-0.00421744;RO=19;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258606;STB=0.65427;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00962119;OID=.;OPOS=136599393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:9:3:9:10:9:3:9:10 chr6 136599404 . T C 96.18 PASS AF=0.375;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0323454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.723;QD=12.0231;RBI=0.0327733;REFB=-0.0232315;REVB=-0.00527846;RO=20;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21057;STB=0.642602;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0479622;OID=.;OPOS=136599404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:32:20:20:11:12:0.375:8:3:9:11:9:3:9:11 chr6 136599822 . C G 85.62 PASS AF=0.15534;AO=15;DP=101;FAO=16;FDP=103;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.00887046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.877;QD=3.32493;RBI=0.0121295;REFB=-0.00587798;REVB=0.0082728;RO=86;SAF=7;SAR=8;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909825;STB=0.540423;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0366893;OID=.;OPOS=136599822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:101:103:86:87:15:16:0.15534:8:7:34:52:9:7:34:53 chr6 136599836 . G A 60.38 PASS AF=0.12381;AO=13;DP=105;FAO=13;FDP=105;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=54;FWDB=-0.0257608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.349;QD=2.3003;RBI=0.0345175;REFB=-0.00249422;REVB=-0.0229748;RO=91;SAF=6;SAR=7;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686793;STB=0.542961;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0140174;OID=.;OPOS=136599836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:105:105:91:92:13:13:0.12381:7:6:37:54:7:6:38:54 chr6 136599842 . G A 59.22 PASS AF=0.121495;AO=13;DP=107;FAO=13;FDP=107;FR=.;FRO=94;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=-0.0631555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5492;QD=2.21381;RBI=0.066717;REFB=-0.00688315;REVB=-0.0215068;RO=93;SAF=6;SAR=7;SRF=39;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524353;STB=0.531928;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0424859;OID=.;OPOS=136599842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:107:107:93:94:13:13:0.121495:7:6:39:54:7:6:40:54 chr6 136682172 . G A 717.3 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311562;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5966;QD=63.7597;RBI=0.0586999;REFB=0;REVB=0.049749;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819976;OID=.;OPOS=136682172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr6 137176884 . C T 147.0 PASS AF=0.269231;AO=21;DP=78;FAO=21;FDP=78;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00745349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.71;QD=7.53855;RBI=0.00781507;REFB=-0.0117531;REVB=-0.00234966;RO=57;SAF=9;SAR=12;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551715;STB=0.533301;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0316914;OID=.;OPOS=137176884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:57:57:21:21:0.269231:12:9:27:30:12:9:27:30 chr6 137325847 . C T 700.65 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3808;QD=54.9531;RBI=0.056983;REFB=0;REVB=0.0216623;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00956095;OID=.;OPOS=137325847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:51:0:0:47:51:1:27:20:0:0:27:24:0:0 chr6 138413269 . A G 1171.97 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5225;QD=60.8814;RBI=0.024843;REFB=0;REVB=0.0166864;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176648;OID=.;OPOS=138413269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0 chr6 138413333 . G C 874.12 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.022215;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.441;QD=56.3947;RBI=0.0457081;REFB=-0.105263;REVB=0.0399464;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145233;STB=0.50769;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000514334;OID=.;OPOS=138413333;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:62:1:1:61:61:0.983871:32:29:0:1:32:29:0:1 chr6 138539183 . A AG 123.22 PASS AF=0.363636;AO=22;DP=67;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0260753;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.8891;QD=7.46792;RBI=0.148717;REFB=0.0196495;REVB=0.146413;RO=40;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463687;STB=0.538429;STBP=0.655;TYPE=ins;VARB=-0.0250309;OID=.;OPOS=138539184;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636:22:67:24:66:42:14:10:22:20:99:40:13:9:22:18 chr6 138539315 . A G 529.55 PASS AF=0.394904;AO=62;DP=157;FAO=62;FDP=157;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=61;FWDB=0.011777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2249;QD=13.4918;RBI=0.0134747;REFB=-0.0110558;REVB=0.00654734;RO=95;SAF=26;SAR=36;SRF=34;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068669;STB=0.538646;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0215524;OID=.;OPOS=138539315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:95:95:62:62:0.394904:36:26:34:61:36:26:34:61 chr6 138539556 . T C 462.35 PASS AF=0.464646;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0565635;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.371;QD=18.6809;RBI=0.0627068;REFB=-0.00446155;REVB=0.0270687;RO=52;SAF=23;SAR=23;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183126;STB=0.505048;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00563496;OID=.;OPOS=138539556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:52:53:46:46:0.464646:23:23:25:27:23:23:26:27 chr6 138584685 . T G 668.31 PASS AF=0.52381;AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0225419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.295;QD=21.2161;RBI=0.0275075;REFB=-0.0124957;REVB=-0.0157646;RO=60;SAF=40;SAR=26;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354257;STB=0.519475;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0116823;OID=.;OPOS=138584685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:60:60:66:66:0.52381:26:40:34:26:26:40:34:26 chr6 138753337 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.968;QD=62.3509;RBI=0.0423765;REFB=0;REVB=0.0366695;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83921e-05;OID=.;OPOS=138753337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0 chr6 138754323 . A G 1456.9 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129655;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.043;QD=63.3433;RBI=0.013863;REFB=0;REVB=0.00490714;RO=0;SAF=48;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.61505e-05;OID=.;OPOS=138754323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:44:48:0:0:44:48:0:0 chr6 139013015 . G A 193.14 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00463556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.472;QD=12.0713;RBI=0.0243924;REFB=-0.00997534;REVB=-0.0239479;RO=40;SAF=18;SAR=6;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367161;STB=0.71293;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0181748;OID=.;OPOS=139013015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:40:40:24:24:0.375:6:18:17:23:6:18:17:23 chr6 139013227 . TC T 142.34 PASS AF=0.432836;AO=27;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0423843;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.3706;QD=8.498;RBI=0.0993116;REFB=-0.0221141;REVB=0.0898129;RO=38;SAF=11;SAR=16;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.329741;SSSB=-0.303814;STB=0.645717;STBP=0.063;TYPE=del;VARB=0.0446915;OID=.;OPOS=139013228;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.432836:27:67:29:67:38:13:16:27:11:99:38:11:16:27:11 chr6 139013263 . A C 138.42 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00806269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.428;QD=11.7807;RBI=0.0192197;REFB=-0.000882194;REVB=0.0174468;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333604;STB=0.693871;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0026897;OID=.;OPOS=139013263;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:9:7:23:8:9:7:23:8 chr6 139013283 . T TC 79.35 PASS AF=0.341463;AO=13;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0353589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.2155;QD=7.74104;RBI=0.035611;REFB=0.00820484;REVB=0.00423007;RO=28;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324398;STB=0.652854;STBP=0.193;TYPE=ins;VARB=-0.0104749;OID=.;OPOS=139013284;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.341463:13:41:14:41:27:6:8:18:9:79:28:5:8:19:9 chr6 139017815 . A G 1007.09 PASS AF=0.615385;AO=88;DP=143;FAO=88;FDP=143;FR=.;FRO=55;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0228985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.888;QD=28.1703;RBI=0.0794329;REFB=-0.0288665;REVB=-0.0760608;RO=55;SAF=52;SAR=36;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981558;STB=0.553179;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0140705;OID=.;OPOS=139017815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:55:55:88:88:0.615385:36:52:25:30:36:52:25:30 chr6 139017832 . C T 827.2 PASS AF=0.619835;AO=74;DP=121;FAO=75;FDP=121;FR=.;FRO=46;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0111045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.154;QD=27.3454;RBI=0.0166655;REFB=0.00103125;REVB=-0.0124269;RO=46;SAF=44;SAR=30;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114323;STB=0.55831;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00070761;OID=.;OPOS=139017832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:46:46:74:75:0.619835:30:44:20:26:31:44:20:26 chr6 139094638 . A G 49.01 PASS AF=0.173913;AO=8;DP=46;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0836918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.4142;QD=4.26139;RBI=0.0926943;REFB=0.000222542;REVB=0.0398485;RO=38;SAF=7;SAR=1;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354431;STB=0.753086;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.00413188;OID=.;OPOS=139094638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:46:46:38:38:8:8:0.173913:1:7:25:13:1:7:25:13 chr6 139113869 . T TTAAC 151.59 PASS AF=0.369565;AO=14;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0225995;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=245.188;QD=13.182;RBI=0.0262933;REFB=-0.0102522;REVB=-0.0134388;RO=30;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357277;STB=0.748392;STBP=0.018;TYPE=ins;VARB=0.0250924;OID=.;OPOS=139113870;OREF=-;OALT=TAAC;OMAPALT=TTAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.369565:14:46:17:46:29:13:4:11:18:99:30:10:4:12:18 chr6 139197609 . G A 185.73 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00298242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5079;QD=19.049;RBI=0.0360816;REFB=0.0264265;REVB=-0.0359581;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21056;STB=0.619439;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.0297333;OID=.;OPOS=139197609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:7:12:8:12:7:12:8:12 chr6 141004964 . G GT,T 2180.73 PASS AF=0.935065,0.0649351;AO=116,23;DP=164;FAO=144,10;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=56,9;FSAR=88,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614261,-0.0795215;FXX=0.0253149;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=32.6509,15.5471;QD=56.6424;RBI=0.0634592,0.0851841;REFB=0,0;REVB=0.0159345,0.0305397;RO=8;SAF=29,22;SAR=87,1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.114532,-0.14225;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000579065,0.0350018;OID=.,.;OPOS=141004965,141004964;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:164:154:8:0:116,23:144,10:0.935065,0.0649351:87,1:29,22:8:0:88,1:56,9:0:0 chr6 142718801 . G A 1194.32 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00876549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.881;QD=59.7162;RBI=0.0123936;REFB=0.0051124;REVB=0.00876164;RO=1;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122951;STB=0.506492;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=2.43541e-05;OID=.;OPOS=142718801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:38:41:0:1:38:41:0:1 chr6 142758631 . A G 837.2 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00306073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.024;QD=55.8131;RBI=0.0460072;REFB=-0.152309;REVB=-0.0459053;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.507244;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0014232;OID=.;OPOS=142758631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:34:25:0:0:34:25:0:1 chr6 143074700 . T C 1396.2 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.072;QD=62.7504;RBI=0.0473252;REFB=0;REVB=0.043275;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.16136e-05;OID=.;OPOS=143074700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:51:38:0:0:51:38:0:0 chr6 143090734 . T C 363.56 PASS AF=0.423913;AO=38;DP=91;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.00587361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2576;QD=15.8069;RBI=0.00825123;REFB=-0.000383798;REVB=-0.00579514;RO=53;SAF=18;SAR=20;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805586;STB=0.552546;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.000844917;OID=.;OPOS=143090734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:53:53:38:39:0.423913:20:18:21:32:20:19:21:32 chr6 143091263 . A G 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00582974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.553;QD=61.6953;RBI=0.0246045;REFB=0;REVB=0.0239039;RO=0;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56547e-05;OID=.;OPOS=143091263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:48:34:0:0:48:34:0:0 chr6 143091769 . G A 250.35 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0268579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8505;QD=20.0284;RBI=0.0356992;REFB=-0.0525022;REVB=-0.0235177;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147764;STB=0.583264;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0468411;OID=.;OPOS=143091769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:14:10:15:11:14:10:15:11 chr6 143745915 . A G 1120.64 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0367011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3721;QD=58.9809;RBI=0.0459286;REFB=-0.108643;REVB=0.0276128;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00182599;OID=.;OPOS=143745915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:44:31:0:0:44:31:1:0 chr6 143792675 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00888883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.918;QD=54.5165;RBI=0.0212201;REFB=0;REVB=-0.0192687;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146029;OID=.;OPOS=143792675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr6 143816859 . C T 804.77 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.677;QD=64.3814;RBI=0.0349625;REFB=0;REVB=0.0191399;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.8756e-05;OID=.;OPOS=143816859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr6 144151314 . T A 50.3 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0268472;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=34.0011;QD=8.74732;RBI=0.0491498;REFB=-0.0457473;REVB=-0.0411695;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43747;STB=0.737298;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0149534;OID=.;OPOS=144151314;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:21:23:11:13:10:10:0.434783:4:6:1:10:4:6:2:11 chr6 144262783 . G T 220.85 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0132291;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=219.211;QD=25.9818;RBI=0.0132548;REFB=-0.0482901;REVB=-0.000824048;RO=12;SAF=5;SAR=16;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20658;STB=0.604704;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0218073;OID=.;OPOS=144262783;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:12:13:21:21:0.617647:16:5:6:6:16:5:6:7 chr6 144508698 . G A 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00734466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.888;QD=19.5231;RBI=0.0124146;REFB=-0.0335006;REVB=-0.0100089;RO=12;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.041486;OID=.;OPOS=144508698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:7:7:6:6:7:7:6:6 chr6 144509510 . T C 356.55 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00757131;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.3175;QD=19.2731;RBI=0.0261736;REFB=0.0190793;REVB=0.0250546;RO=34;SAF=19;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877635;STB=0.553907;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.0185153;OID=.;OPOS=144509510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:37:37:37:0.5:18:19:14:20:18:19:15:22 chr6 144537771 . T C 377.92 PASS AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=6.55581e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.27;QD=16.4314;RBI=0.0123679;REFB=0.00216333;REVB=0.0123677;RO=52;SAF=6;SAR=34;SRF=15;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22123;STB=0.626244;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-0.00344638;OID=.;OPOS=144537771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:34:6:15:37:34:6:15:37 chr6 144665357 . T C 332.7 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00576575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.633;QD=26.6162;RBI=0.00835836;REFB=0.00370821;REVB=-0.00605131;RO=21;SAF=15;SAR=14;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211526;STB=0.616362;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00253839;OID=.;OPOS=144665357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:14:15:5:16:14:15:5:16 chr6 144758799 . A G 316.8 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0347411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5961;QD=20.4386;RBI=0.0394387;REFB=-0.0117902;REVB=-0.0186672;RO=29;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104844;STB=0.558246;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0109051;OID=.;OPOS=144758799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:21:12:14:15:21:12:14:15 chr6 144852201 . G A 254.37 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00658054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.8473;QD=15.4163;RBI=0.0066134;REFB=-0.0292478;REVB=-0.000658421;RO=37;SAF=13;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117926;STB=0.566621;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0249645;OID=.;OPOS=144852201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:16:13:21:16:16:13:21:16 chr6 144869785 . A G 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000276678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.158;QD=61.0491;RBI=0.0353357;REFB=0;REVB=0.0353347;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72135e-05;OID=.;OPOS=144869785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0 chr6 144878337 . G T 506.09 PASS AF=0.443548;AO=52;DP=121;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0114411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.234;QD=16.3254;RBI=0.022994;REFB=-0.0141068;REVB=0.0199455;RO=67;SAF=27;SAR=25;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101695;STB=0.569318;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0143242;OID=.;OPOS=144878337;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:67:69:52:55:0.443548:25:27:28:39:25:30:29:40 chr6 145051594 . G A 369.51 PASS AF=0.448276;AO=38;DP=86;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=33;FSRF=7;FSRR=41;FWDB=-0.043255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.644;QD=16.9888;RBI=0.0446188;REFB=0.00754807;REVB=-0.0109473;RO=45;SAF=6;SAR=32;SRF=7;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0042714;STB=0.508587;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00933088;OID=.;OPOS=145051594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:45:48:38:39:0.448276:32:6:7:38:33:6:7:41 chr6 145167978 . C G 686.07 PASS AF=0.433526;AO=74;DP=172;FAO=75;FDP=173;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=57;FWDB=0.0100023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.007;QD=15.8629;RBI=0.0153408;REFB=-0.0132759;REVB=0.0116316;RO=97;SAF=35;SAR=39;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620683;STB=0.527576;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0188239;OID=.;OPOS=145167978;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:97:98:74:75:0.433526:39:35:40:57:40:35:41:57 chr6 145172505 . A G 527.04 PASS AF=0.520833;AO=50;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.000229803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1588;QD=21.96;RBI=0.00458388;REFB=-0.0187448;REVB=0.00457812;RO=46;SAF=26;SAR=24;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550885;STB=0.530379;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0116444;OID=.;OPOS=145172505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:46:46:50:50:0.520833:24:26:21:25:24:26:21:25 chr6 145822992 . A G 286.26 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0208912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9184;QD=15.6855;RBI=0.0287073;REFB=-0.00519527;REVB=-0.0196893;RO=41;SAF=14;SAR=18;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00154049;STB=0.500869;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00712278;OID=.;OPOS=145822992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:18:14:18:23:18:14:18:23 chr6 145823642 . G A 238.35 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.000990427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.468;QD=16.1596;RBI=0.0125902;REFB=-0.00239337;REVB=0.0125512;RO=32;SAF=18;SAR=9;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763522;STB=0.543177;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00314107;OID=.;OPOS=145823642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:9:18:19:13:9:18:19:13 chr6 145946834 . T C 1076.35 PASS AF=0.454918;AO=111;DP=245;FAO=111;FDP=244;FR=.;FRO=133;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=92;FSRR=41;FWDB=0.0010628;FXX=0.00408147;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.156;QD=17.6451;RBI=0.00512702;REFB=-0.00515914;REVB=0.00501566;RO=133;SAF=69;SAR=42;SRF=92;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750344;STB=0.541429;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00664842;OID=.;OPOS=145946834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:133:133:111:111:0.454918:42:69:92:41:42:69:92:41 chr6 146112224 . C T 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00626855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.466;QD=17.3789;RBI=0.00896056;REFB=-0.0293022;REVB=0.00640289;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281505;STB=0.660746;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0190356;OID=.;OPOS=146112224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:2:8:5:6:2:8 chr6 146112348 . T C 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0609496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9858;QD=53.9102;RBI=0.0651358;REFB=0;REVB=0.0229742;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000962218;OID=.;OPOS=146112348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0 chr6 146126397 . G C 74.81 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00884182;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7689;QD=9.65321;RBI=0.0425474;REFB=-0.00998365;REVB=-0.0416185;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290067;STB=0.67467;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0338083;OID=.;OPOS=146126397;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:32:31:21:21:10:10:0.322581:6:4:14:7:6:4:14:7 chr6 146185565 . G T 95.68 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.030582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.718;QD=11.5975;RBI=0.030738;REFB=-0.0221634;REVB=-0.00309261;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254625;STB=0.515126;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0425025;OID=.;OPOS=146185565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:6:6:10:11:6:6:10:11 chr6 146207563 . A G 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0665664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.383;QD=12.7239;RBI=0.0760799;REFB=-0.0493824;REVB=0.0368384;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103988;STB=0.505983;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0639986;OID=.;OPOS=146207563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:13:10:16:20:13:10:16:20 chr6 146234644 . G A 710.06 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0555404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9141;QD=54.6201;RBI=0.0555478;REFB=-0.0454352;REVB=-0.00090979;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000652622;OID=.;OPOS=146234644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:27:24:0:0:27:24:0:1 chr6 146275983 . T G 281.05 PASS AF=0.54717;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0072896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.085;QD=21.2113;RBI=0.0183517;REFB=-0.00878046;REVB=-0.0168418;RO=23;SAF=23;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279192;STB=0.644042;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00481513;OID=.;OPOS=146275983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:23:24:28:29:0.54717:5:23:13:10:6:23:13:11 chr6 146351277 . C T 174.83 PASS AF=0.366667;AO=21;DP=61;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0191298;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.528;QD=11.6553;RBI=0.0256697;REFB=-0.0195269;REVB=0.0171168;RO=38;SAF=10;SAR=11;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843123;STB=0.561877;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0344646;OID=.;OPOS=146351277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:38:38:21:22:0.366667:11:10:21:17:12:10:21:17 chr6 146755140 . G A,C 1134.88 PASS AF=0.948052,0.0519481;AO=70,4;DP=74;FAO=73,4;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39,2;FSAR=34,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104844,-0.0197021;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=94.0906,61.8137;QD=58.9546;RBI=0.0152978,0.0292739;REFB=0,0;REVB=-0.01114,-0.0216515;RO=0;SAF=37,2;SAR=33,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00178568,0.0492306;OID=.,.;OPOS=146755140,146755140;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:74:77:0:0:70,4:73,4:0.948052,0.0519481:33,2:37,2:0:0:34,2:39,2:0:0 chr6 146755324 . T C 766.4 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.701;QD=63.8666;RBI=0.0127849;REFB=0;REVB=0.0049056;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14105e-05;OID=.;OPOS=146755324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr6 146755515 . T G 679.52 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.02;QD=61.7749;RBI=0.0478208;REFB=0;REVB=0.0286046;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.95705e-05;OID=.;OPOS=146755515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:44:0:0:40:44:1:20:20:0:0:22:22:0:0 chr6 146755842 . C A 1698.67 PASS AF=0.915385;AO=119;DP=130;FAO=119;FDP=130;FR=.;FRO=11;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.056629;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.68;QD=52.2666;RBI=0.05819;REFB=-0.143796;REVB=0.0133877;RO=6;SAF=64;SAR=55;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338858;STB=0.507078;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00107041;OID=.;OPOS=146755842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:130:130:6:11:119:119:0.915385:55:64:1:5:55:64:5:6 chr6 147062397 . C T 186.41 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0342862;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.27;QD=10.502;RBI=0.0357242;REFB=-0.0095359;REVB=-0.0100336;RO=47;SAF=9;SAR=15;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084486;STB=0.549409;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0243676;OID=.;OPOS=147062397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:15:9:21:26:15:9:21:26 chr6 147067093 . C T 1606.52 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3578;QD=60.0567;RBI=0.0157029;REFB=0;REVB=-0.0117588;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143392;OID=.;OPOS=147067093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:46:61:0:0:46:61:0:0 chr6 147136212 . A T 1749.41 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.536;QD=60.8489;RBI=0.0319438;REFB=0;REVB=0.000238932;RO=0;SAF=60;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55336e-05;OID=.;OPOS=147136212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:55:60:0:0:55:60:0:0 chr6 147136244 . A G 1397.11 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797745;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5971;QD=62.7914;RBI=0.0809608;REFB=0;REVB=0.0138088;RO=2;SAF=41;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225478;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000676057;OID=.;OPOS=147136244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:2:0:86:89:1:45:41:2:0:46:43:0:0 chr6 147830073 . C T 1555.13 PASS AF=0.463557;AO=159;DP=345;FAO=159;FDP=343;FR=.;FRO=184;FSAF=83;FSAR=76;FSRF=88;FSRR=96;FWDB=0.0146299;FXX=0.00579693;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.933;QD=18.1356;RBI=0.0158214;REFB=-0.0133809;REVB=-0.00602329;RO=184;SAF=83;SAR=76;SRF=88;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425436;STB=0.523464;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0152779;OID=.;OPOS=147830073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:343:184:184:159:159:0.463557:76:83:88:96:76:83:88:96 chr6 147886107 . C G 579.91 PASS AF=0.451852;AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0102201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1755;QD=17.1826;RBI=0.0146349;REFB=-0.0267633;REVB=-0.0104752;RO=74;SAF=32;SAR=29;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242251;STB=0.513489;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0357033;OID=.;OPOS=147886107;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:74:74:61:61:0.451852:29:32:37:37:29:32:37:37 chr6 148792557 . A G 86.89 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.033921;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.9814;QD=12.8721;RBI=0.0611802;REFB=0.0286607;REVB=-0.0509154;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487679;STB=0.528872;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.0433199;OID=.;OPOS=148792557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:8:3:5:11:8:3:5:11 chr6 149397743 . ATTTTTTTT ATTTTTTT,ATTTTTTTG 94.97 PASS AF=0.435897,0;AO=35,3;DP=79;FAO=34,0;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=14,0;FSAR=20,0;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0363974,0.062881;FXX=0.0126566;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.9246,21.7488;QD=4.87008;RBI=0.0612613,0.101384;REFB=-0.138777,-0.0739286;REVB=-0.0492765,-0.0795276;RO=32;SAF=12,2;SAR=23,1;SRF=14;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0874217,0.230887;STB=0.511621,0.5;STBP=0.859,1;TYPE=del,snp;VARB=0.124632,0.00954887;OID=.,.;OPOS=149397744,149397751;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=ATTTTTTT,ATTTTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.435897,0:35,3:79:34,0:78:44:14,0:20,0:19:25:93:32:12,2:23,1:14:18 chr6 149700491 . G A 179.01 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0157597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9615;QD=12.5623;RBI=0.0173933;REFB=-0.0101431;REVB=-0.0073591;RO=35;SAF=9;SAR=13;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259437;STB=0.648855;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0155226;OID=.;OPOS=149700491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:13:9:23:12:13:9:23:12 chr6 149721690 . G A 167.91 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.024896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.117;QD=15.6198;RBI=0.0332845;REFB=-0.00127301;REVB=-0.0220918;RO=25;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605675;STB=0.534845;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00208711;OID=.;OPOS=149721690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:9:9:14:11:9:9:14:11 chr6 149721965 . T C 216.93 PASS AF=0.525;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0191261;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.1624;QD=21.6932;RBI=0.0329148;REFB=0.00337823;REVB=0.0267876;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193081;STB=0.62253;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00187887;OID=.;OPOS=149721965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:20:19:21:21:0.525:10:11:6:14:10:11:5:14 chr6 149722040 . A G 417.77 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.084423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8093;QD=53.9061;RBI=0.0867225;REFB=-0.083301;REVB=-0.0198379;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.514276;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.003086;OID=.;OPOS=149722040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:17:13:0:0:17:13:0:1 chr6 149730846 . G A 632.83 PASS AF=0.529412;AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00366085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7935;QD=21.2715;RBI=0.0225514;REFB=-0.0197559;REVB=-0.0222522;RO=56;SAF=34;SAR=29;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110153;STB=0.56047;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.017125;OID=.;OPOS=149730846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:56:56:63:63:0.529412:29:34:23:33:29:34:23:33 chr6 149780831 . G A 160.52 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00305701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.639;QD=18.345;RBI=0.0120347;REFB=0.00116541;REVB=0.01164;RO=18;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128736;STB=0.572872;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.000942538;OID=.;OPOS=149780831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:10:7:5:13:10:7:5:13 chr6 149953981 . C T 1194.33 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.8;QD=59.7164;RBI=0.0186046;REFB=0.0422392;REVB=0.00758211;RO=1;SAF=36;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129683;STB=0.506848;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.0002442;OID=.;OPOS=149953981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:43:36:1:0:43:36:1:0 chr6 149983216 . G A 769.2 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0325296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9505;QD=61.5361;RBI=0.0338031;REFB=-0.0509497;REVB=-0.00919083;RO=1;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229468;STB=0.51219;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00184589;OID=.;OPOS=149983216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:50:1:1:49:49:0.98:20:29:0:1:20:29:0:1 chr6 150004779 . A G 1085.09 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130413;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.679;QD=60.2826;RBI=0.0158696;REFB=0;REVB=-0.00904252;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02948e-05;OID=.;OPOS=150004779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:37:35:0:0:37:35:0:0 chr6 150067675 . A G 766.4 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.279;QD=63.8668;RBI=0.0299368;REFB=0;REVB=0.00802168;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017487;OID=.;OPOS=150067675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr6 150093678 . C T 282.64 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.609;QD=51.3892;RBI=0.0305046;REFB=0;REVB=0.0119483;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51133e-05;OID=.;OPOS=150093678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:11:11:0:0 chr6 150093682 . C T 322.56 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6909;QD=53.76;RBI=0.117862;REFB=0;REVB=-0.0627341;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239501;OID=.;OPOS=150093682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0 chr6 150114745 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.067;QD=59.0185;RBI=0.0430188;REFB=0;REVB=0.0205294;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402339;OID=.;OPOS=150114745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr6 150209717 . C G 868.17 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.218;QD=57.8777;RBI=0.0205936;REFB=0;REVB=-0.0176783;RO=0;SAF=18;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41114e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196195;OID=.;OPOS=150209717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:42:18:0:0:42:18:0:0 chr6 150210681 . G A 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.868;QD=59.5016;RBI=0.0417515;REFB=0;REVB=0.00659472;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129148;OID=.;OPOS=150210681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0 chr6 150210685 . C T 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00897412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.704;QD=59.6774;RBI=0.0482549;REFB=0;REVB=0.0474131;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107995;OID=.;OPOS=150210685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0 chr6 150210723 . C T 189.88 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.0174227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.055;QD=11.3359;RBI=0.0248074;REFB=1.07014e-05;REVB=-0.0176595;RO=43;SAF=8;SAR=16;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410888;STB=0.735668;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.000212219;OID=.;OPOS=150210723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:16:8:31:12:16:8:31:12 chr6 150211100 . T C 311.99 PASS AF=0.421687;AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.046367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.834;QD=15.0354;RBI=0.0470866;REFB=-0.0114913;REVB=0.00820076;RO=48;SAF=17;SAR=17;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50826;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0139894;OID=.;OPOS=150211100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:48:48:34:35:0.421687:17:17:24:24:17:18:24:24 chr6 150211123 . A T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.635;QD=62.1623;RBI=0.0383482;REFB=0;REVB=0.0199089;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70267e-05;OID=.;OPOS=150211123;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:43:42:0:0:43:42:0:0 chr6 150212003 . C T 136.14 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0481331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3531;QD=10.4725;RBI=0.0666854;REFB=-0.004956;REVB=0.0461536;RO=32;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33466;STB=0.721347;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0129642;OID=.;OPOS=150212003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:35:17:17:0.326923:12:5:19:13:12:5:22:13 chr6 150240829 . G C 590.05 PASS AF=0.480315;AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0294939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4951;QD=18.5844;RBI=0.0470119;REFB=-0.0248291;REVB=-0.0366092;RO=66;SAF=35;SAR=26;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698954;STB=0.53873;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0318208;OID=.;OPOS=150240829;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:66:66:61:61:0.480315:26:35:33:33:26:35:33:33 chr6 150267527 . A C 934.65 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00431827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8231;QD=58.4158;RBI=0.133757;REFB=0;REVB=0.133687;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134617;OID=.;OPOS=150267527;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:62:64:1:29:33:0:0:31:33:0:0 chr6 150342232 . G A 659.95 PASS AF=0.447205;AO=72;DP=161;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=-0.0395781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.977;QD=16.3962;RBI=0.0401089;REFB=0.00271902;REVB=0.00650408;RO=88;SAF=35;SAR=37;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878145;STB=0.545253;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00365917;OID=.;OPOS=150342232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:88:89:72:72:0.447205:37:35:35:53:37:35:36:53 chr6 150346532 . T C 196.57 PASS AF=0.288462;AO=14;DP=53;FAO=15;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.00645226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.131;QD=15.1209;RBI=0.0380224;REFB=-0.0343031;REVB=-0.037471;RO=30;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230207;STB=0.604806;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0288735;OID=.;OPOS=150346532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:30:29:14:15:0.288462:7:7:9:21:8:7:9:20 chr6 150385730 . T G 475.27 PASS AF=0.42623;AO=52;DP=125;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.0110726;FXX=0.039367;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.595;QD=15.5826;RBI=0.0294327;REFB=-0.00330562;REVB=0.0272705;RO=65;SAF=31;SAR=21;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199427;STB=0.510844;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00398525;OID=.;OPOS=150385730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:122:65:70:52:52:0.42623:21:31:40:25:21:31:43:27 chr6 150390149 . G C 247.34 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.010232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.294;QD=13.7412;RBI=0.0102359;REFB=-0.0157712;REVB=0.000281473;RO=43;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454709;STB=0.525879;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0211472;OID=.;OPOS=150390149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:17:12:16:27:17:12:16:27 chr6 150665226 . G A 317.95 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.019344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.322;QD=15.5095;RBI=0.0215385;REFB=-0.027877;REVB=0.00947188;RO=46;SAF=23;SAR=12;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00553812;STB=0.501547;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.036146;OID=.;OPOS=150665226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:47:35:35:0.426829:12:23:30:16:12:23:31:16 chr6 150665264 . A T 243.8 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00812021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.898;QD=15.2374;RBI=0.00847185;REFB=-0.0107108;REVB=0.00241545;RO=36;SAF=18;SAR=10;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062951;STB=0.535688;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0154422;OID=.;OPOS=150665264;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:10:18:21:15:10:18:21:15 chr6 150665278 . A G 149.64 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00689492;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.539;QD=11.9712;RBI=0.018487;REFB=-0.00253071;REVB=-0.0171531;RO=33;SAF=11;SAR=6;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492153;STB=0.529079;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.00521433;OID=.;OPOS=150665278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:6:11:20:13:6:11:20:13 chr6 150716696 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.139;QD=57.6807;RBI=0.0198376;REFB=0;REVB=0.0195277;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00726e-05;OID=.;OPOS=150716696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr6 150722115 . G A 534.98 PASS AF=0.426471;AO=58;DP=136;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.0111548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5013;QD=15.7347;RBI=0.017324;REFB=-0.0200989;REVB=0.0132548;RO=77;SAF=32;SAR=26;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111996;STB=0.566206;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0329314;OID=.;OPOS=150722115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:77:78:58:58:0.426471:26:32:34:43:26:32:34:44 chr6 150722187 . TG CA,CG 2010.16 PASS AF=0.477612,0.522388;AO=64,68;DP=135;FAO=64,70;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=29,33;FSAR=35,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293279,0.0246714;FXX=0.00740686;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=161.418,131.431;QD=60.0047;RBI=0.0377876,0.0389513;REFB=0,0;REVB=0.0238281,0.0301417;RO=0;SAF=29,31;SAR=35,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0151126,0.00399427;OID=.,.;OPOS=150722187,150722187;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:135:134:0:0:64,68:64,70:0.477612,0.522388:35,37:29,31:0:0:35,37:29,33:0:0 chr6 151055031 . C T 650.6 PASS AF=0.612903;AO=57;DP=93;FAO=57;FDP=93;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0107145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.319;QD=27.9828;RBI=0.0192664;REFB=-0.000150595;REVB=0.0160123;RO=36;SAF=25;SAR=32;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360913;STB=0.519624;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.000151495;OID=.;OPOS=151055031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:36:36:57:57:0.612903:32:25:14:22:32:25:14:22 chr6 151055189 . C G 155.5 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00694989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0179;QD=15.1703;RBI=0.0229367;REFB=-0.00271563;REVB=-0.0218584;RO=24;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904212;STB=0.552263;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00302342;OID=.;OPOS=151055189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:10:7:12:12:10:7:12:12 chr6 151121915 . G A 406.92 PASS AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00299311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.178;QD=20.0949;RBI=0.0053883;REFB=-0.0177363;REVB=0.00448052;RO=40;SAF=22;SAR=19;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102558;STB=0.556749;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0139425;OID=.;OPOS=151121915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:19:22:26:14:19:22:26:14 chr6 151152257 . A G 1463.77 PASS AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00875054;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.382;QD=60.9904;RBI=0.0135867;REFB=-0.0894994;REVB=0.0103935;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509998;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-5.10762e-05;OID=.;OPOS=151152257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:96:96:0:2:94:94:0.979167:45:49:0:0:45:49:2:0 chr6 151152656 . T C 1327.08 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00135065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.532;QD=61.7248;RBI=0.0159566;REFB=0;REVB=0.0158994;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00562e-05;OID=.;OPOS=151152656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:46:38:0:0:48:38:0:0 chr6 151198895 . T C 287.59 PASS AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0263967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.701;QD=13.5334;RBI=0.0308399;REFB=-0.0122088;REVB=-0.0159472;RO=52;SAF=11;SAR=22;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145463;STB=0.583281;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0141925;OID=.;OPOS=151198895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:52:52:33:33:0.388235:22:11:24:28:22:11:24:28 chr6 151281426 . G A 204.46 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0534797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8848;QD=22.7177;RBI=0.0871582;REFB=-0.0237273;REVB=0.068822;RO=16;SAF=15;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122317;STB=0.568893;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0255469;OID=.;OPOS=151281426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:5:15:10:6:5:15:10:6 chr6 151336739 . C G 2069.86 PASS AF=0.985294;AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=77;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0406248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5601;QD=60.8782;RBI=0.0509862;REFB=-0.0118644;REVB=-0.0308093;RO=1;SAF=77;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826632;STB=0.508619;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000937431;OID=.;OPOS=151336739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:136:136:1:2:134:134:0.985294:57:77:0:1:57:77:0:2 chr6 151422750 . A G 362.0 PASS AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0251258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.231;QD=17.8763;RBI=0.0263079;REFB=-0.00960871;REVB=0.00779736;RO=43;SAF=12;SAR=26;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130558;STB=0.573218;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00821439;OID=.;OPOS=151422750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:26:12:19:24:26:12:19:24 chr6 151669875 . A G 605.45 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00268234;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.153;QD=59.0682;RBI=0.038522;REFB=-0.15664;REVB=-0.0384285;RO=1;SAF=15;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302369;STB=0.516121;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00104401;OID=.;OPOS=151669875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:25:15:1:0:25:15:1:0 chr6 151670057 . G A 151.97 PASS AF=0.365385;AO=18;DP=51;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=0.00440003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8321;QD=11.6901;RBI=0.00560534;REFB=0.0113272;REVB=0.00347269;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180128;STB=0.620574;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00593378;OID=.;OPOS=151670057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:33:33:18:19:0.365385:7:11:25:8:8:11:25:8 chr6 151670172 . A C 79.39 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.140021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4682;QD=15.8788;RBI=0.140035;REFB=0.00340771;REVB=0.00203027;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108107;STB=0.562382;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.012261;OID=.;OPOS=151670172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:7:3:2:8:7:3:2:8 chr6 151670897 . T C 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.417;QD=60.0307;RBI=0.0479552;REFB=0;REVB=0.041014;RO=0;SAF=26;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11269e-05;OID=.;OPOS=151670897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:46:26:0:0:46:26:0:0 chr6 151671182 . C T 526.71 PASS AF=0.53;AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00974118;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.487;QD=21.0684;RBI=0.0304685;REFB=-0.0275513;REVB=0.0288693;RO=47;SAF=31;SAR=22;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283976;STB=0.515619;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0248053;OID=.;OPOS=151671182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:47:47:53:53:0.53:22:31:29:18:22:31:29:18 chr6 151672812 . G A 164.63 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0108727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.807;QD=9.54373;RBI=0.0118019;REFB=-0.00988662;REVB=-0.00459015;RO=47;SAF=5;SAR=17;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395732;STB=0.734783;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0234564;OID=.;OPOS=151672812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:47:47:22:22:0.318841:17:5:26:21:17:5:26:21 chr6 151674071 . C T 48.74 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00568133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.779;QD=12.9964;RBI=0.0715917;REFB=-0.0215248;REVB=0.0713659;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387836;STB=0.72672;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0148508;OID=.;OPOS=151674071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:1:7:3:4:1:7 chr6 151674116 . T TGAG 162.43 PASS AF=0.882353;AO=14;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0245468;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=276.767;QD=38.2184;RBI=0.0385985;REFB=-0.0340416;REVB=0.0297876;RO=2;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347762;STB=0.512179;STBP=0.872;TYPE=ins;VARB=0.00599591;OID=.;OPOS=151674117;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.882353:14:17:15:17:2:9:6:1:1:10:2:9:5:1:1 chr6 151674326 . A C 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0139788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9761;QD=8.69139;RBI=0.0361297;REFB=-0.00596081;REVB=0.0333159;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171013;STB=0.605793;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0128932;OID=.;OPOS=151674326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:5:3:9:8:5:3:9:8 chr6 151674593 . G T 187.71 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0050864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5107;QD=12.726;RBI=0.0145596;REFB=-0.00619539;REVB=0.0136422;RO=35;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00955729;STB=0.516115;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00863525;OID=.;OPOS=151674593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:14:9:14:21:14:9:15:21 chr6 151859314 . A G 206.69 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00830313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.866;QD=16.8723;RBI=0.0194994;REFB=-0.0237834;REVB=0.0176433;RO=28;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125592;STB=0.50718;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0338395;OID=.;OPOS=151859314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:8:13:17:11:8:13:17:11 chr6 151894505 . T C 770.57 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.013135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2737;QD=55.0408;RBI=0.0571254;REFB=-0.0145716;REVB=-0.0555948;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0012181;OID=.;OPOS=151894505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:56:0:1:55:55:0.982143:21:34:0:0:21:34:1:0 chr6 151936677 . G A 313.08 PASS AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0153786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1902;QD=16.923;RBI=0.0356986;REFB=-0.0179708;REVB=-0.0322163;RO=40;SAF=11;SAR=23;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261821;STB=0.51467;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0183938;OID=.;OPOS=151936677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:23:11:12:28:23:11:12:28 chr6 151939181 . G A 387.27 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0108775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.647;QD=23.8319;RBI=0.049328;REFB=-0.0366236;REVB=-0.0481137;RO=27;SAF=18;SAR=20;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339202;STB=0.518629;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0242453;OID=.;OPOS=151939181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:20:18:14:13:20:18:14:13 chr6 152201875 . T C 1564.83 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0076495;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.897;QD=63.8705;RBI=0.021646;REFB=0;REVB=0.0202493;RO=0;SAF=38;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72687e-05;OID=.;OPOS=152201875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:98:0:0:95:98:1:57:38:0:0:57:41:0:0 chr6 152265522 . G C 2365.68 PASS AF=1;AO=128;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=80;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.984;QD=63.9373;RBI=0.0555325;REFB=0;REVB=0.0320539;RO=0;SAF=66;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109804;OID=.;OPOS=152265522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:149:148:0:0:128:148:1:62:66:0:0:68:80:0:0 chr6 152422062 . ATT ATA,AT,TAT 1179.8 PASS AF=0.0375,0.9625,0;AO=7,51,9;DP=161;FAO=6,154,0;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=0,75,0;FSAR=6,79,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0950672,0.924254,0.511523;FXX=0.0243888;HRUN=7,7,1;LEN=1,1,2;MLLD=182.362,8.94854,13.7602;QD=29.4951;RBI=0.143161,0.946354,0.577144;REFB=0,0,0;REVB=-0.107038,-0.203325,-0.26728;RO=71;SAF=0,4,0;SAR=7,47,9;SRF=67;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.850774,-0.799537,-0.861701;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.243549,-0.00755122,0;OID=.,.,.;OPOS=152422064,152422063,152422062;OREF=T,T,AT;OALT=A,-,TA;OMAPALT=ATA,AT,TAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:161:160:71:0:7,51,9:6,154,0:0.0375,0.9625,0:7,47,9:0,4,0:67:4:6,79,0:0,75,0:0:0 chr6 152422335 . C T 1236.13 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000274772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.694;QD=61.0435;RBI=0.0224956;REFB=0;REVB=0.0224939;RO=0;SAF=29;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51863e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337175;OID=.;OPOS=152422335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:51:29:0:0:52:29:0:0 chr6 152423905 . T A 526.85 PASS AF=0.466667;AO=45;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.00728563;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=238.626;QD=17.5617;RBI=0.00776181;REFB=-0.00451531;REVB=0.00267682;RO=42;SAF=15;SAR=30;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234497;STB=0.660657;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00575892;OID=.;OPOS=152423905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:42:64:45:56:0.466667:30:15:25:17:37:19:41:23 chr6 152442903 . CTT ATC,C,CT 501.76 PASS AF=0.0410959,0,0.958904;AO=6,21,59;DP=148;FAO=6,0,140;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0,86;FSAR=0,0,54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992829,0.0679635,0.17931;FXX=0.0457486;HRUN=1,11,11;LEN=3,2,1;MLLD=226.326,7.40191,4.99363;QD=13.7467;RBI=0.0206007,0.0838677,0.20492;REFB=0,0,0;REVB=-0.0180505,0.0491402,0.0991983;RO=42;SAF=6,15,38;SAR=0,6,21;SRF=29;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.580095,0.0324917,-0.0390796;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=-0.0171602,-0.104149,0.0283572;OID=.,.,.;OPOS=152442903,152442904,152442904;OREF=CTT,TT,T;OALT=ATC,-,-;OMAPALT=ATC,C,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:12:148:146:42:0:6,21,59:6,0,140:0.0410959,0,0.958904:0,6,21:6,15,38:29:13:0,0,54:6,0,86:0:0 chr6 152443756 . C T 368.37 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0472425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.571;QD=16.7443;RBI=0.0687707;REFB=-0.0263961;REVB=-0.0499755;RO=49;SAF=19;SAR=20;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632389;STB=0.535488;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0434959;OID=.;OPOS=152443756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:20:19:27:22:20:19:27:22 chr6 152446487 . C T 458.78 PASS AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0202475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3505;QD=18.351;RBI=0.0226558;REFB=-0.0208454;REVB=-0.0101649;RO=54;SAF=24;SAR=22;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328363;STB=0.518317;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0258954;OID=.;OPOS=152446487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:0.46:22:24:30:24:22:24:30:24 chr6 152489294 . T C 714.91 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0261947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6649;QD=60.8437;RBI=0.0566777;REFB=-0.0546257;REVB=0.0502614;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00191111;OID=.;OPOS=152489294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:24:22:0:0:24:22:0:1 chr6 152540278 . A C 1349.41 PASS AF=0.908257;AO=100;DP=111;FAO=99;FDP=109;FR=.;FRO=10;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00879174;FXX=0.0180164;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.696;QD=49.5196;RBI=0.00931485;REFB=-0.117483;REVB=-0.00307762;RO=9;SAF=52;SAR=48;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578486;STB=0.545445;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00109302;OID=.;OPOS=152540278;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:111:109:9:10:100:99:0.908257:48:52:8:1:49:50:10:0 chr6 152646279 . G C 559.75 PASS AF=0.428571;AO=60;DP=140;FAO=60;FDP=140;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=28;FWDB=-8.0925e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.435;QD=15.9929;RBI=0.0084235;REFB=-0.0145824;REVB=0.00842311;RO=80;SAF=31;SAR=29;SRF=52;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137362;STB=0.57664;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0196996;OID=.;OPOS=152646279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:80:80:60:60:0.428571:29:31:52:28:29:31:52:28 chr6 152647681 . A T 1660.83 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00383162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9308;QD=59.3152;RBI=0.0452374;REFB=-0.0975542;REVB=-0.0450749;RO=1;SAF=42;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683158;STB=0.503596;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000861457;OID=.;OPOS=152647681;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:69:42:0:1:69:42:0:1 chr6 152651759 . C G 154.69 PASS AF=0.36;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0241891;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.182;QD=12.3754;RBI=0.0244334;REFB=-0.0187983;REVB=0.00344702;RO=32;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284762;STB=0.666481;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0484438;OID=.;OPOS=152651759;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:32:32:18:18:0.36:6:12:13:19:6:12:13:19 chr6 152652034 . A T 1256.74 PASS AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0122525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.831;QD=59.1406;RBI=0.0140389;REFB=-0.152372;REVB=0.00685341;RO=2;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020583;STB=0.510867;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00130383;OID=.;OPOS=152652034;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:45:38:0:2:45:38:0:2 chr6 152658142 . T C 516.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153313;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.505;QD=59.0463;RBI=0.0845511;REFB=0;REVB=0.0831495;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191047;OID=.;OPOS=152658142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:16:18:0:0:17:18:0:0 chr6 152665261 . C A 480.99 PASS AF=0.464286;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=-0.0121895;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.989;QD=17.1783;RBI=0.0126256;REFB=-0.00187631;REVB=-0.00328955;RO=59;SAF=29;SAR=23;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152936;STB=0.588036;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00209703;OID=.;OPOS=152665261;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:59:60:52:52:0.464286:23:29:42:17:23:29:43:17 chr6 152675854 . A G 2950.87 PASS AF=1;AO=184;DP=187;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319915;FXX=0.0158722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.856;QD=63.4595;RBI=0.0345921;REFB=0;REVB=0.0131589;RO=0;SAF=105;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57794e-05;OID=.;OPOS=152675854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:187:186:0:0:184:186:1:79:105:0:0:80:106:0:0 chr6 152683413 . G T 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.01;QD=60.2046;RBI=0.0137402;REFB=0;REVB=0.0134557;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64131e-05;OID=.;OPOS=152683413;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:29:44:0:0:29:44:0:0 chr6 152694184 . T C 777.52 PASS AF=0.536232;AO=74;DP=138;FAO=74;FDP=138;FR=.;FRO=64;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=0.0135267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.33;QD=22.5369;RBI=0.0423411;REFB=0.00135937;REVB=0.0401223;RO=64;SAF=42;SAR=32;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00911604;STB=0.504993;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.000911326;OID=.;OPOS=152694184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:64:64:74:74:0.536232:32:42:37:27:32:42:37:27 chr6 152708310 . G A 1074.21 PASS AF=0.453061;AO=111;DP=245;FAO=111;FDP=245;FR=.;FRO=134;FSAF=60;FSAR=51;FSRF=62;FSRR=72;FWDB=-0.000152967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6658;QD=17.5382;RBI=0.00524055;REFB=-0.0150202;REVB=0.00523832;RO=134;SAF=60;SAR=51;SRF=62;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768583;STB=0.54256;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0182784;OID=.;OPOS=152708310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:134:134:111:111:0.453061:51:60:62:72:51:60:62:72 chr6 152708453 . C G 344.25 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0566702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2125;QD=21.8572;RBI=0.0635377;REFB=-0.0215364;REVB=0.028732;RO=28;SAF=13;SAR=22;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123555;STB=0.506819;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0422486;OID=.;OPOS=152708453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:28:28:35:35:0.555556:22:13:10:18:22:13:10:18 chr6 152763321 . C G 293.99 PASS AF=0.566038;AO=28;DP=51;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0440656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.054;QD=22.1877;RBI=0.0446536;REFB=-0.0397102;REVB=0.00722267;RO=23;SAF=10;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670451;STB=0.515615;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0300176;OID=.;OPOS=152763321;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:23:23:28:30:0.566038:18:10:10:13:18:12:10:13 chr6 152772264 . A G 2102.5 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7706;QD=62.7613;RBI=0.0526501;REFB=0;REVB=0.0348656;RO=0;SAF=56;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.48425e-05;OID=.;OPOS=152772264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:78:56:0:0:78:56:0:0 chr6 152776750 . G A 391.94 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0824771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3145;QD=16.8577;RBI=0.0875358;REFB=4.00073e-05;REVB=0.0293267;RO=52;SAF=22;SAR=19;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173499;STB=0.509737;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.000991069;OID=.;OPOS=152776750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:19:22:27:25:19:22:27:25 chr6 152777819 . G A 1428.58 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.442;QD=62.7948;RBI=0.032957;REFB=0;REVB=0.0184385;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312852;OID=.;OPOS=152777819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:45:45:0:0:45:46:0:0 chr6 153019099 . GAGAT G 434.34 PASS AF=0.433628;AO=48;DP=117;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0212318;FXX=0.0341851;HRUN=1;LEN=4;MLLD=288.933;QD=15.375;RBI=0.0261672;REFB=-0.00939917;REVB=0.0152949;RO=63;SAF=32;SAR=16;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230531;STB=0.645565;STBP=0.018;TYPE=del;VARB=0.0131289;OID=.;OPOS=153019100;OREF=AGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.433628:48:117:49:113:64:33:16:27:37:99:63:32:16:28:35 chr6 153296541 . G C 220.95 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0481657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9773;QD=18.0364;RBI=0.0482132;REFB=-0.0386455;REVB=-0.00214067;RO=27;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271298;STB=0.654506;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0256539;OID=.;OPOS=153296541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:7:15:11:16:7:15:11:16 chr6 153315695 . C T 567.58 PASS AF=0.451128;AO=60;DP=133;FAO=60;FDP=133;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.00699412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.542;QD=17.0702;RBI=0.00876133;REFB=-0.0197292;REVB=0.00527667;RO=73;SAF=36;SAR=24;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251479;STB=0.514014;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0197636;OID=.;OPOS=153315695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:73:73:60:60:0.451128:24:36:42:31:24:36:42:31 chr6 153315921 . G A 728.96 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.176;QD=57.1737;RBI=0.0241292;REFB=0;REVB=-0.0114257;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89388e-05;OID=.;OPOS=153315921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0 chr6 153316326 . A G 384.54 PASS AF=0.405405;AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=0.0453634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4814;QD=13.8572;RBI=0.0522991;REFB=-0.00638801;REVB=0.026026;RO=65;SAF=19;SAR=26;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00915098;STB=0.50123;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00625143;OID=.;OPOS=153316326;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:65:66:45:45:0.405405:26:19:28:37:26:19:28:38 chr6 153323594 . C T 962.0 PASS AF=0.494792;AO=95;DP=192;FAO=95;FDP=192;FR=.;FRO=97;FSAF=37;FSAR=58;FSRF=60;FSRR=37;FWDB=-0.0140345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.3904;QD=20.0416;RBI=0.0143815;REFB=-0.0158551;REVB=0.00313994;RO=97;SAF=37;SAR=58;SRF=60;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209897;STB=0.615445;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0174951;OID=.;OPOS=153323594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:97:97:95:95:0.494792:58:37:60:37:58:37:60:37 chr6 153323709 . T C 143.38 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.118773;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8817;QD=13.9882;RBI=0.119699;REFB=0.00479015;REVB=-0.0148558;RO=24;SAF=2;SAR=14;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.517944;STB=0.817066;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0195258;OID=.;OPOS=153323709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:24:25:16:16:0.390244:14:2:13:11:14:2:14:11 chr6 153365100 . A C 386.06 PASS AF=0.405405;AO=45;DP=112;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0132495;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.031;QD=13.912;RBI=0.0155234;REFB=-0.0194929;REVB=-0.00808879;RO=66;SAF=27;SAR=18;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589259;STB=0.533318;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0286186;OID=.;OPOS=153365100;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:66:66:45:45:0.405405:18:27:36:30:18:27:36:30 chr6 154414446 . A T 1036.35 PASS AF=0.504808;AO=105;DP=208;FAO=105;FDP=208;FR=.;FRO=103;FSAF=43;FSAR=62;FSRF=60;FSRR=43;FWDB=0.0121786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.001;QD=19.9298;RBI=0.0425134;REFB=-0.0131621;REVB=-0.0407317;RO=102;SAF=43;SAR=62;SRF=59;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15205;STB=0.585801;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0129408;OID=.;OPOS=154414446;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:102:103:105:105:0.504808:62:43:59:43:62:43:60:43 chr6 154428666 . C T 157.74 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0235141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.124;QD=11.2668;RBI=0.0366523;REFB=-0.0209845;REVB=-0.0281155;RO=36;SAF=11;SAR=9;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068675;STB=0.539961;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0403684;OID=.;OPOS=154428666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:9:11:22:14:9:11:22:14 chr6 154431565 . G A 263.53 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00369489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.48;QD=17.5685;RBI=0.00771346;REFB=-0.0186317;REVB=-0.00677091;RO=31;SAF=22;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196532;STB=0.611029;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0185685;OID=.;OPOS=154431565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:7:22:18:13:7:22:18:13 chr6 154727408 . T C 394.67 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.00735709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6868;QD=23.2158;RBI=0.00799172;REFB=0.00595699;REVB=-0.00312103;RO=29;SAF=29;SAR=10;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195534;STB=0.510758;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.00317524;OID=.;OPOS=154727408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:10:29:21:8:10:29:21:8 chr6 154771277 . A G 329.76 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0239886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2173;QD=20.9368;RBI=0.0241104;REFB=0.0118819;REVB=0.00241983;RO=29;SAF=15;SAR=19;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348704;STB=0.51931;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.0179601;OID=.;OPOS=154771277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:19:15:14:15:19:15:14:15 chr6 155451352 . G A 97.65 PASS AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0231879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.398;QD=24.4133;RBI=0.0272109;REFB=0.0131365;REVB=-0.0142392;RO=5;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801957;STB=0.545372;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.00585766;OID=.;OPOS=155451352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:6:5:3:2:6:5:3:2 chr6 155485554 . G A 292.31 PASS AF=0.302326;AO=39;DP=129;FAO=39;FDP=129;FR=.;FRO=90;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0124606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.831;QD=9.06389;RBI=0.0594756;REFB=-0.00528989;REVB=-0.0581557;RO=90;SAF=21;SAR=18;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722587;STB=0.542291;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0152051;OID=.;OPOS=155485554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:90:90:39:39:0.302326:18:21:43:47:18:21:43:47 chr6 155490051 . G A 394.28 PASS AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0106871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.129;QD=17.3311;RBI=0.0150794;REFB=-0.00181183;REVB=0.0106382;RO=49;SAF=24;SAR=17;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741722;STB=0.536514;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00264013;OID=.;OPOS=155490051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:49:50:41:41:0.450549:17:24:25:24:17:24:26:24 chr6 155561760 . T C 1607.91 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00671278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.278;QD=64.3164;RBI=0.0620394;REFB=0;REVB=0.0616752;RO=0;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132734;OID=.;OPOS=155561760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:100:0:0:98:100:1:57:41:0:0:59:41:0:0 chr6 155577823 . C T 650.99 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.771;QD=61.9993;RBI=0.0576437;REFB=0;REVB=0.0561034;RO=0;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000401717;OID=.;OPOS=155577823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:30:12:0:0:30:12:0:0 chr6 155578592 . A AT 477.35 PASS AF=1;AO=8;DP=77;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0676831;FXX=0.0266631;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.37447;QD=26.156;RBI=0.0700688;REFB=0;REVB=-0.018128;RO=69;SAF=3;SAR=5;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186746;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=9.50828e-05;OID=.;OPOS=155578593;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:8:77:73:73:0:39:34:0:0:9:69:3:5:37:32 chr6 155578599 . A T 1105.19 PASS AF=0.974684;AO=69;DP=72;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0138291;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.0372;QD=55.9591;RBI=0.0223268;REFB=0.00832906;REVB=0.0175283;RO=2;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304713;STB=0.513155;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.000202419;OID=.;OPOS=155578599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:72:79:2:2:69:77:0.974684:30:39:0:2:37:40:0:2 chr6 155578756 . A T 619.94 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0229817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.849;QD=59.0418;RBI=0.0275772;REFB=-0.0670942;REVB=0.0152428;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00147367;OID=.;OPOS=155578756;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:22:19:0:0:22:19:1:0 chr6 155596901 . T C 977.72 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0041197;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.586;QD=59.2556;RBI=0.0148614;REFB=0;REVB=0.014279;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59797e-05;OID=.;OPOS=155596901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0 chr6 155597147 . C T 655.26 PASS AF=0.488889;AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=135;FR=.;FRO=69;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.0139895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.482;QD=19.415;RBI=0.0227181;REFB=0.00100823;REVB=-0.0178999;RO=69;SAF=39;SAR=27;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105379;STB=0.558264;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00130527;OID=.;OPOS=155597147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:69:69:66:66:0.488889:27:39:33:36:27:39:33:36 chr6 155606325 . C T 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00967949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.212;QD=61.8526;RBI=0.0101721;REFB=0;REVB=0.00312707;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.69672e-06;OID=.;OPOS=155606325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr6 155750035 . C T 305.23 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.060862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6561;QD=17.6947;RBI=0.0650376;REFB=-0.0157409;REVB=0.0229285;RO=35;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105856;STB=0.55124;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.031606;OID=.;OPOS=155750035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:35:36:33:33:0.478261:16:17:14:21:16:17:15:21 chr6 155761246 . G T 243.53 PASS AF=0.547619;AO=21;DP=40;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00020463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.619;QD=23.193;RBI=0.039531;REFB=-0.0144287;REVB=0.0395305;RO=19;SAF=13;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355486;STB=0.514027;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0110736;OID=.;OPOS=155761246;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:19:19:21:23:0.547619:8:13:11:8:9:14:11:8 chr6 157801040 . T A 798.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.683;QD=63.8544;RBI=0.0681885;REFB=0;REVB=0.00505577;RO=0;SAF=7;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159719;OID=.;OPOS=157801040;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:43:7:0:0:43:7:0:0 chr6 157801186 . G A 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0147103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.835;QD=56.9478;RBI=0.0171006;REFB=-0.0142195;REVB=-0.00872001;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301788;STB=0.51612;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000398095;OID=.;OPOS=157801186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:21:15:1:0:21:15:1:0 chr6 157801516 . A G 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.745;QD=61.3756;RBI=0.0148246;REFB=0;REVB=0.000786716;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4191e-05;OID=.;OPOS=157801516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:38:42:0:0:38:42:0:0 chr6 158294184 . G C 274.2 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0211213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3909;QD=19.9421;RBI=0.0602574;REFB=-0.0354575;REVB=-0.0564345;RO=25;SAF=11;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120173;STB=0.55882;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.04621;OID=.;OPOS=158294184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:26:29:29:0.527273:18:11:13:12:18:11:13:13 chr6 158330765 . G A 623.2 PASS AF=0.470588;AO=63;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.00398059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9297;QD=18.3294;RBI=0.0186189;REFB=0.0113744;REVB=-0.0181884;RO=72;SAF=24;SAR=39;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182552;STB=0.604056;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.00872461;OID=.;OPOS=158330765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:72:72:63:64:0.470588:39:24:41:31:40:24:41:31 chr6 158497717 . T C 216.68 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0144128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2815;QD=13.3342;RBI=0.0208532;REFB=-0.000354467;REVB=-0.0150708;RO=38;SAF=7;SAR=19;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334879;STB=0.699228;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000583062;OID=.;OPOS=158497717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:39:26:26:0.4:19:7:22:16:19:7:23:16 chr6 158499302 . G T 601.05 PASS AF=0.561905;AO=57;DP=104;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.012637;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.114;QD=22.8971;RBI=0.0178961;REFB=-0.0248032;REVB=0.0126718;RO=46;SAF=36;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111293;STB=0.566181;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0161849;OID=.;OPOS=158499302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:46:46:57:59:0.561905:21:36:23:23:21:38:23:23 chr6 158505088 . A G 172.0 PASS AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00687243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.867;QD=9.2973;RBI=0.0104839;REFB=-0.00873758;REVB=-0.00791724;RO=51;SAF=12;SAR=11;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319589;STB=0.518852;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0206835;OID=.;OPOS=158505088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:11:12:28:23:11:12:28:23 chr6 158507981 . G A 189.37 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0710414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.362;QD=21.6424;RBI=0.0861698;REFB=-0.021756;REVB=0.0487684;RO=15;SAF=11;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191533;STB=0.592717;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0368641;OID=.;OPOS=158507981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:16:19:19:0.542857:8:11:5:10:8:11:6:10 chr6 158509750 . A G 494.56 PASS AF=0.505263;AO=46;DP=92;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0891856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5251;QD=20.8237;RBI=0.107948;REFB=-0.0310482;REVB=-0.0608176;RO=45;SAF=16;SAR=30;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143389;STB=0.507039;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0336885;OID=.;OPOS=158509750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:45:47:46:48:0.505263:30:16:15:30:30:18:17:30 chr6 158517308 . A G 59.16 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.00887781;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0222;QD=13.1463;RBI=0.0113768;REFB=0.0166001;REVB=0.00711456;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.627031;STB=0.874062;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0212919;OID=.;OPOS=158517308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:19:18:10:10:8:8:0.444444:7:1:8:2:7:1:8:2 chr6 158567889 . G A 201.17 PASS AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.00695645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.057;QD=9.81317;RBI=0.0178539;REFB=-0.00458462;REVB=-0.0164429;RO=56;SAF=9;SAR=17;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140346;STB=0.508241;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0117577;OID=.;OPOS=158567889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:56:56:26:26:0.317073:17:9:20:36:17:9:20:36 chr6 158571501 . G A 805.13 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0716;QD=64.4104;RBI=0.0424827;REFB=0;REVB=-0.0424634;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000342494;OID=.;OPOS=158571501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:25:24:0:0:25:25:0:0 chr6 158735087 . C T 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9337;QD=64.4125;RBI=0.0201092;REFB=0;REVB=-0.0138069;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05195e-05;OID=.;OPOS=158735087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0 chr6 158735090 . T C 698.99 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00169252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.266;QD=54.8231;RBI=0.017312;REFB=-0.0279605;REVB=0.017229;RO=1;SAF=29;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159576;STB=0.508471;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=3.424e-05;OID=.;OPOS=158735090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:21:29:1:0:21:29:1:0 chr6 158870081 . A G 278.78 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0107654;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6377;QD=16.1614;RBI=0.0514471;REFB=-0.00743009;REVB=-0.0503081;RO=38;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671236;STB=0.537791;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00933578;OID=.;OPOS=158870081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:38:38:31:31:0.449275:15:16:17:21:15:16:17:21 chr6 158923434 . G C 942.88 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.696;QD=58.0233;RBI=0.0133555;REFB=0;REVB=0.00418449;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44946e-05;OID=.;OPOS=158923434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:28:36:0:0:28:37:0:0 chr6 158924088 . T C 803.67 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000398364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.686;QD=55.4257;RBI=0.065278;REFB=-0.105942;REVB=0.0652768;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513509;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=7.04356e-05;OID=.;OPOS=158924088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:18:39:0:0:18:39:0:1 chr6 158927651 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.792;QD=64.4153;RBI=0.0157005;REFB=0;REVB=0.0129643;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138299;OID=.;OPOS=158927651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0 chr6 158932817 . G C 350.28 PASS AF=0.618182;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.000345577;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8619;QD=25.4751;RBI=0.0364953;REFB=-0.0245821;REVB=0.0364937;RO=21;SAF=12;SAR=22;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565042;STB=0.531016;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0333846;OID=.;OPOS=158932817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:21:21:34:34:0.618182:22:12:9:12:22:12:9:12 chr6 159065758 . C G 619.95 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0580862;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.994;QD=59.0424;RBI=0.0581415;REFB=0.0011625;REVB=-0.00253587;RO=1;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000129519;OID=.;OPOS=159065758;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:23:18:0:1:23:18:0:1 chr6 159178345 . C T 1375.13 PASS AF=0.988889;AO=86;DP=87;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0601396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3971;QD=61.117;RBI=0.0650019;REFB=-0.203203;REVB=0.0246673;RO=1;SAF=40;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116972;STB=0.505881;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00717812;OID=.;OPOS=159178345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:87:90:1:1:86:89:0.988889:46:40:1:0:47:42:1:0 chr6 159398633 . T C 551.41 PASS AF=0.504425;AO=57;DP=113;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00361215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.757;QD=19.5189;RBI=0.0162036;REFB=-0.0374933;REVB=0.0157959;RO=56;SAF=29;SAR=28;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00787371;STB=0.504346;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0342179;OID=.;OPOS=159398633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:56:56:57:57:0.504425:28:29:28:28:28:29:28:28 chr6 159398700 . C T 377.48 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0029995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.685;QD=16.2357;RBI=0.00330887;REFB=0.00166627;REVB=0.00139699;RO=53;SAF=26;SAR=14;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705407;STB=0.539772;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.00287769;OID=.;OPOS=159398700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:53:53:40:40:0.430108:14:26:31:22:14:26:31:22 chr6 159398764 . G A 387.05 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.000143145;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1477;QD=15.6382;RBI=0.0202848;REFB=-0.00869784;REVB=-0.0202843;RO=59;SAF=24;SAR=17;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975611;STB=0.509859;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0118884;OID=.;OPOS=159398764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:59:58:41:41:0.414141:17:24:34:25:17:24:33:25 chr6 159399348 . A G 149.09 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0296561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.225;QD=18.6361;RBI=0.0344096;REFB=-0.0125362;REVB=-0.0174508;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018692;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0269518;OID=.;OPOS=159399348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:4:12:11:4:4:12:12:4 chr6 159407446 . C T 453.52 PASS AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.000550052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.471;QD=19.718;RBI=0.00233048;REFB=0.00186408;REVB=-0.00226464;RO=47;SAF=21;SAR=24;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794776;STB=0.544119;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=-0.00193864;OID=.;OPOS=159407446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:24:21:26:21:24:21:26:21 chr6 159414899 . T C 392.04 PASS AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.000331366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.891;QD=19.3599;RBI=0.010647;REFB=-0.00674495;REVB=-0.0106419;RO=41;SAF=24;SAR=16;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816509;STB=0.545432;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00377603;OID=.;OPOS=159414899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:41:41:40:40:0.493827:16:24:21:20:16:24:21:20 chr6 159420574 . T C 149.5 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0301044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.695;QD=19.2906;RBI=0.0312031;REFB=-0.0309198;REVB=-0.00820724;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803505;STB=0.578216;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0363452;OID=.;OPOS=159420574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:15:16:16:0.516129:7:9:6:7:7:9:6:9 chr6 159457034 . T C 214.1 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00222383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.835;QD=14.7655;RBI=0.0129712;REFB=-0.000498409;REVB=-0.0127791;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147307;STB=0.508373;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00139539;OID=.;OPOS=159457034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:18:15:11:14:18:15 chr6 159650978 . A G 1946.62 PASS AF=1;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010479;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.079;QD=61.3108;RBI=0.0264824;REFB=-0.055779;REVB=-0.0243209;RO=1;SAF=81;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583069;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139476;OID=.;OPOS=159650978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:128:127:1:0:126:127:1:45:81:1:0:45:82:0:0 chr6 159652931 . G C 951.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0953;QD=58.5596;RBI=0.0198177;REFB=0;REVB=0.0192426;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104024;OID=.;OPOS=159652931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:33:31:0:0:33:32:0:0 chr6 159654487 . G C,T 1256.48 PASS AF=0.0481928,0.951807;AO=4,79;DP=83;FAO=4,79;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=3,39;FSAR=1,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159182,0.069428;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.535,91.1428;QD=60.5532;RBI=0.0274159,0.0753438;REFB=0,0;REVB=-0.0223213,0.0292651;RO=0;SAF=3,39;SAR=1,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,-3.33478e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.153268,0.000309868;OID=.,.;OPOS=159654487,159654487;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:83:83:0:0:4,79:4,79:0.0481928,0.951807:1,40:3,39:0:0:1,40:3,39:0:0 chr6 159654829 . G A 130.42 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0955123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5789;QD=43.4745;RBI=0.183932;REFB=0;REVB=0.157188;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00906206;OID=.;OPOS=159654829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 159654913 . C T 145.11 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.428;QD=44.6494;RBI=0.098392;REFB=0;REVB=0.09676;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221537;OID=.;OPOS=159654913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr6 159654994 . A C 517.93 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000973273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.034;QD=59.1922;RBI=0.00381052;REFB=0;REVB=0.00368413;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57803e-06;OID=.;OPOS=159654994;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0 chr6 159655084 . C G 3767.3 PASS AF=0.991701;AO=239;DP=241;FAO=239;FDP=241;FR=.;FRO=2;FSAF=138;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0026281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5717;QD=62.5279;RBI=0.00264501;REFB=-0.021612;REVB=-0.000298596;RO=2;SAF=138;SAR=101;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00125421;STB=0.500658;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.000368216;OID=.;OPOS=159655084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:241:241:2:2:239:239:0.991701:101:138:1:1:101:138:1:1 chr6 159655102 . A G 3980.7 PASS AF=1;AO=197;DP=270;FAO=264;FDP=264;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=155;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185564;FXX=0.0222214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.26;QD=60.3136;RBI=0.0554923;REFB=0;REVB=0.0522978;RO=1;SAF=114;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415965;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000835809;OID=.;OPOS=159655102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:270:264:1:0:197:264:1:83:114:1:0:109:155:0:0 chr6 159655103 . T G 209.27 PASS AF=0.190476;AO=49;DP=255;FAO=52;FDP=273;FR=.;FRO=221;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=123;FSRR=98;FWDB=0.0149585;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=30.7547;QD=3.06627;RBI=0.0152162;REFB=-0.0361012;REVB=-0.00278872;RO=206;SAF=33;SAR=16;SRF=118;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137731;STB=0.617282;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.206186;OID=.;OPOS=159655103;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:273:206:221:49:52:0.190476:16:33:118:88:16:36:123:98 chr6 159655326 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.557;QD=43.4862;RBI=0.0840899;REFB=0;REVB=0.00908974;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110877;OID=.;OPOS=159655326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0 chr6 159655383 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.791;QD=45.8068;RBI=0.0323449;REFB=0;REVB=-0.0219167;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64035e-05;OID=.;OPOS=159655383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr6 159655402 . A G 282.03 PASS AF=1;AO=17;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.413;QD=51.278;RBI=0.0391728;REFB=0;REVB=-0.0324962;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000899126;OID=.;OPOS=159655402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:17:22:1:13:4:0:0:15:7:0:0 chr6 159660804 . CC GG 46.59 PASS AF=0.35;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=202.296;QD=9.31823;RBI=0.022935;REFB=-0.00269326;REVB=-0.022935;RO=12;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.0124244;OID=.;OPOS=159660804;OREF=CC;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:20:12:13:7:7:0.35:7:0:0:12:7:0:0:13 chr6 159660879 . C A 66.53 PASS AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.26;QD=38.0149;RBI=0.0365309;REFB=0;REVB=0.0365309;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025994;OID=.;OPOS=159660879;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:7:1:0:7:7:1:7:0:0:1:7:0:0:0 chr6 159672419 . G C 1991.37 PASS AF=0.992308;AO=127;DP=128;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0621479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.673;QD=61.273;RBI=0.0621865;REFB=-0.0414816;REVB=-0.00219066;RO=1;SAF=71;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664616;STB=0.503401;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000140067;OID=.;OPOS=159672419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:130:1:1:127:129:0.992308:56:71:1:0:56:73:1:0 chr6 159672542 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.783;QD=56.9569;RBI=0.0340229;REFB=0;REVB=0.0307678;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25839e-05;OID=.;OPOS=159672542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0 chr6 160148348 . C T 553.57 PASS AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0368484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6735;QD=22.1427;RBI=0.0496693;REFB=0.0069299;REVB=0.0333051;RO=48;SAF=22;SAR=30;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621636;STB=0.534223;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00554946;OID=.;OPOS=160148348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:48:48:52:52:0.52:30:22:17:31:30:22:17:31 chr6 160174456 . T G 276.05 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00235759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.069;QD=13.3036;RBI=0.0126036;REFB=0.0057633;REVB=0.0123812;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404806;STB=0.523109;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.015503;OID=.;OPOS=160174456;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:17:15:22:29:17:15:22:29 chr6 160196343 . A G 267.53 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00287162;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=336.802;QD=21.839;RBI=0.00424286;REFB=-0.00544439;REVB=-0.0031234;RO=24;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015115;STB=0.508468;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00503412;OID=.;OPOS=160196343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:15:10:10:14:15:10:10:14 chr6 160201295 . C A 155.47 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00242086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.044;QD=15.1677;RBI=0.0747989;REFB=-0.023115;REVB=-0.0747598;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194869;STB=0.612768;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0213443;OID=.;OPOS=160201295;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:11:6:13:11:11:6:13:11 chr6 160206631 . T C 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00428885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.277;QD=18.4438;RBI=0.0087854;REFB=0.0053743;REVB=-0.0076674;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241378;STB=0.639731;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.002735;OID=.;OPOS=160206631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:3:8:4:5:3:8:4:5 chr6 160211636 . G A 560.73 PASS AF=0.344828;AO=70;DP=203;FAO=70;FDP=203;FR=.;FRO=133;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=64;FSRR=69;FWDB=0.00194145;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.578;QD=11.0489;RBI=0.0310255;REFB=-0.0153253;REVB=0.0309647;RO=132;SAF=30;SAR=40;SRF=64;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649575;STB=0.534841;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.020954;OID=.;OPOS=160211636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:132:133:70:70:0.344828:40:30:64:68:40:30:64:69 chr6 160211645 . GGTT G 332.21 PASS AF=0.343434;AO=52;DP=193;FAO=68;FDP=198;FR=.;FRO=130;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=68;FWDB=0.00394147;FXX=0.0149246;HRUN=5;LEN=3;MLLD=286.483;QD=6.7112;RBI=0.00994957;REFB=-0.000906939;REVB=0.00913557;RO=126;SAF=24;SAR=28;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465589;STB=0.533514;STBP=0.519;TYPE=del;VARB=0.00243262;OID=.;OPOS=160211646;OREF=GTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.343434:52:193:68:198:130:29:39:62:68:99:126:24:28:63:63 chr6 160224346 . T C 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0369739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.074;QD=17.7318;RBI=0.0410821;REFB=0.00145452;REVB=0.0179072;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106788;STB=0.560984;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.00145473;OID=.;OPOS=160224346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:10:7:10:9:10:7:10:9 chr6 160225012 . T G 696.3 PASS AF=0.496403;AO=69;DP=139;FAO=69;FDP=139;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=0.0429007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.428;QD=20.0375;RBI=0.0430826;REFB=-0.0246908;REVB=0.00395536;RO=70;SAF=27;SAR=42;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884339;STB=0.548829;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0176603;OID=.;OPOS=160225012;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:70:70:69:69:0.496403:42:27:34:36:42:27:34:36 chr6 160234625 . G C 1579.82 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00212187;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7524;QD=63.8312;RBI=0.0628793;REFB=0;REVB=0.0628435;RO=1;SAF=58;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012005;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414344;OID=.;OPOS=160234625;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:1:0:97:99:1:39:58:0:1:40:59:0:0 chr6 160328620 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00938531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.217;QD=56.7066;RBI=0.00983773;REFB=0;REVB=-0.00294903;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.04583e-05;OID=.;OPOS=160328620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0 chr6 160453978 . A G,T 586.05 PASS AF=0.948718,0.0512821;AO=37,2;DP=40;FAO=37,2;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023238,-0.00524504;FXX=0.0249938;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=166.535,113.759;QD=60.1075;RBI=0.0551921,0.0235611;REFB=0,0;REVB=0.0500616,0.0229699;RO=0;SAF=14,2;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.91909e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00237613,0.119969;OID=.,.;OPOS=160453978,160453978;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:40:39:0:0:37,2:37,2:0.948718,0.0512821:23,0:14,2:0:0:23,0:14,2:0:0 chr6 160464289 . G A 2301.35 PASS AF=0.986486;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0200021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.949;QD=62.1987;RBI=0.0319962;REFB=-0.105133;REVB=0.0249735;RO=1;SAF=57;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531398;STB=0.505555;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000188395;OID=.;OPOS=160464289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:148:148:1:2:146:146:0.986486:89:57:0:1:89:57:0:2 chr6 160468278 . A G 1103.02 PASS AF=0.961538;AO=73;DP=76;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00667731;FXX=0.0370325;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7414;QD=56.5651;RBI=0.0918358;REFB=-0.0850086;REVB=0.0915927;RO=2;SAF=36;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000345377;STB=0.505651;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00411282;OID=.;OPOS=160468278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:76:78:2:3:73:75:0.961538:37:36:1:1:39:36:1:2 chr6 160494409 . A G 1302.13 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.465;QD=62.0062;RBI=0.0341673;REFB=0;REVB=2.18027e-06;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0288e-05;OID=.;OPOS=160494409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0 chr6 160505199 . C G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.758;QD=58.6005;RBI=0.0426084;REFB=0;REVB=0.0102184;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159508;OID=.;OPOS=160505199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr6 160505207 . A G 888.44 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132044;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.482;QD=58.2583;RBI=0.0181419;REFB=0;REVB=0.0124408;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63349e-06;OID=.;OPOS=160505207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0 chr6 160517481 . C T 498.26 PASS AF=0.386207;AO=55;DP=144;FAO=56;FDP=145;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0156095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.143;QD=13.7452;RBI=0.0178012;REFB=-0.00655075;REVB=-0.00855729;RO=89;SAF=38;SAR=17;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177682;STB=0.604612;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0134208;OID=.;OPOS=160517481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:89:89:55:56:0.386207:17:38:48:41:17:39:48:41 chr6 160524773 . T A 184.44 PASS AF=0.53125;AO=11;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=9;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0809519;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=29.9857;QD=23.0549;RBI=0.150095;REFB=-0.00825777;REVB=0.126393;RO=6;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204503;STB=0.587057;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0168955;OID=.;OPOS=160524773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:32:32:6:9:11:17:0.53125:4:7:4:2:8:9:7:2 chr6 160526860 . G A 173.59 PASS AF=0.319444;AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0303531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.115;QD=9.64365;RBI=0.0315666;REFB=-0.0125864;REVB=-0.0086682;RO=49;SAF=13;SAR=10;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20304;STB=0.618947;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0292073;OID=.;OPOS=160526860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:49:49:23:23:0.319444:10:13:19:30:10:13:19:30 chr6 160526904 . TCAAA T,TCAAC 108.19 PASS AF=0.26087,0.0434783;AO=12,3;DP=49;FAO=12,2;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=7,0;FSAR=5,2;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.014247,-0.0574949;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=4,1;MLLD=264.27,52.2964;QD=9.40793;RBI=0.0195772,0.111994;REFB=-0.00396633,0.0174768;REVB=0.0134272,0.0961093;RO=33;SAF=7,0;SAR=5,3;SRF=11;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.290885,-0.471293;STB=0.668853,0.993311;STBP=0.207,0.307;TYPE=del,snp;VARB=0.012367,0.0559313;OID=.,.;OPOS=160526905,160526908;OREF=CAAA,A;OALT=-,C;OMAPALT=T,TCAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.26087,0.0434783:12,3:49:12,2:46:32:7,0:5,2:11:21:93:33:7,0:5,3:11:22 chr6 160543123 . T C 292.48 PASS AF=0.365385;AO=17;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0349294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2688;QD=22.498;RBI=0.0367038;REFB=-0.0361637;REVB=0.0112741;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278502;STB=0.643282;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0429493;OID=.;OPOS=160543123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:20:20:17:19:0.365385:6:11:7:13:7:12:7:13 chr6 160551204 . G C 2236.35 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0327831;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.716;QD=60.0362;RBI=0.035637;REFB=-0.103883;REVB=0.0139737;RO=1;SAF=71;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665186;STB=0.503496;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000120769;OID=.;OPOS=160551204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:150:149:1:1:148:148:0.993289:77:71:1:0:77:71:1:0 chr6 160557643 . C T 362.22 PASS AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.000608391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.747;QD=23.3688;RBI=0.0184332;REFB=-0.0269817;REVB=0.0184231;RO=26;SAF=19;SAR=17;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504782;STB=0.527762;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0296315;OID=.;OPOS=160557643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:26:26:36:36:0.580645:17:19:12:14:17:19:12:14 chr6 160560845 . A G 1171.99 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.069;QD=60.8827;RBI=0.0634602;REFB=0;REVB=0.0119602;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04792e-05;OID=.;OPOS=160560845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0 chr6 160560897 . CTGGTAAGT C 517.3 PASS AF=0.857143;AO=40;DP=45;FAO=42;FDP=49;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0172465;FXX=0.0576812;HRUN=1;LEN=8;MLLD=293.282;QD=42.2289;RBI=0.0222994;REFB=-0.0303393;REVB=-0.0141359;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.537295;STBP=0.227;TYPE=del;VARB=0.00736813;OID=.;OPOS=160560898;OREF=TGGTAAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.857143:40:45:42:49:7:14:28:4:3:43:0:12:28:0:0 chr6 160645832 . C T 259.14 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0122653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.759;QD=24.1064;RBI=0.0166893;REFB=-0.014319;REVB=0.0113179;RO=19;SAF=8;SAR=16;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758717;STB=0.542337;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0163652;OID=.;OPOS=160645832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:16:8:8:11:16:8:8:11 chr6 160670282 . A C 1290.29 PASS AF=0.410256;AO=144;DP=351;FAO=144;FDP=351;FR=.;FRO=207;FSAF=57;FSAR=87;FSRF=110;FSRR=97;FWDB=-0.00131838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.491;QD=14.7041;RBI=0.00329324;REFB=-0.0286324;REVB=-0.00301783;RO=206;SAF=57;SAR=87;SRF=110;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146977;STB=0.580754;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0357666;OID=.;OPOS=160670282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:351:206:207:144:144:0.410256:87:57:110:96:87:57:110:97 chr6 160858188 . G A 2361.48 PASS AF=0.975309;AO=157;DP=162;FAO=158;FDP=162;FR=.;FRO=4;FSAF=92;FSAR=66;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0197936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.097;QD=58.3081;RBI=0.0200169;REFB=-0.0542431;REVB=0.00298173;RO=4;SAF=92;SAR=65;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202325;STB=0.510637;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-3.88353e-05;OID=.;OPOS=160858188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:162:162:4:4:157:158:0.975309:65:92:4:0:66:92:4:0 chr6 160872151 . C T 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.166;QD=62.1619;RBI=0.0294946;REFB=0;REVB=0.00648486;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.90407e-05;OID=.;OPOS=160872151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0 chr6 160969629 . A G 295.73 PASS AF=0.373626;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.011391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.197;QD=12.9989;RBI=0.0161878;REFB=0.00445699;REVB=0.0115017;RO=57;SAF=21;SAR=13;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214522;STB=0.622752;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00626779;OID=.;OPOS=160969629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:57:57:34:34:0.373626:13:21:24:33:13:21:24:33 chr6 161026197 . G A 949.37 PASS AF=0.519553;AO=93;DP=179;FAO=93;FDP=179;FR=.;FRO=86;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=-0.00167901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.526;QD=21.215;RBI=0.00705181;REFB=-0.0133513;REVB=0.00684901;RO=86;SAF=38;SAR=55;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120499;STB=0.506602;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.013618;OID=.;OPOS=161026197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:86:86:93:93:0.519553:55:38:34:52:55:38:34:52 chr6 161085267 . C T 432.58 PASS AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00810691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.317;QD=20.5988;RBI=0.0100472;REFB=-0.00925918;REVB=-0.00593493;RO=41;SAF=17;SAR=26;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735421;STB=0.540618;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0123738;OID=.;OPOS=161085267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:26:17:13:28:26:17:13:28 chr6 161137779 . T C 248.59 PASS AF=0.589744;AO=22;DP=38;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0379869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8285;QD=25.4967;RBI=0.0814047;REFB=-0.000161108;REVB=-0.0719981;RO=16;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268045;STB=0.507036;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=-0.00294659;OID=.;OPOS=161137779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:16:16:22:23:0.589744:9:13:10:6:9:14:10:6 chr6 161139480 . C T 389.04 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0401708;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.1555;QD=18.7487;RBI=0.040579;REFB=0.00756171;REVB=0.00574093;RO=43;SAF=15;SAR=25;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00288521;STB=0.501607;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-0.00856774;OID=.;OPOS=161139480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:25:15:16:27:25:15:16:27 chr6 161173946 . T G 3695.04 PASS AF=1;AO=231;DP=233;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0086835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.893;QD=62.8942;RBI=0.0295043;REFB=0;REVB=0.0281975;RO=2;SAF=123;SAR=108;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00768516;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.23284e-05;OID=.;OPOS=161173946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:233:235:2:0:231:235:1:108:123:2:0:109:126:0:0 chr6 161469774 . G A 886.66 PASS AF=0.954545;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0197779;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5041;QD=53.7369;RBI=0.0305573;REFB=-0.134121;REVB=-0.0232934;RO=2;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362828;STB=0.51274;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0017252;OID=.;OPOS=161469774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:66:66:2:3:63:63:0.954545:25:38:0:2:25:38:1:2 chr6 161557662 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.349;QD=56.9569;RBI=0.0280464;REFB=0;REVB=0.0187127;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11506e-05;OID=.;OPOS=161557662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr6 161567601 . G A 356.1 PASS AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0412518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.008;QD=24.5586;RBI=0.0496832;REFB=-0.0244319;REVB=0.0276895;RO=22;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114507;STB=0.554424;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0215845;OID=.;OPOS=161567601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:22:23:35:35:0.603448:20:15:13:9:20:15:13:10 chr6 162137099 . CATCTT C 443.95 PASS AF=0.478723;AO=39;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00465386;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=5;MLLD=321.941;QD=18.8915;RBI=0.00647961;REFB=-0.00784797;REVB=-0.00450854;RO=48;SAF=25;SAR=14;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183487;STB=0.591697;STBP=0.096;TYPE=del;VARB=0.0095372;OID=.;OPOS=162137100;OREF=ATCTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.478723:39:94:45:94:49:28:17:22:27:99:48:25:14:22:26 chr6 162622197 . C T 351.86 PASS AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.00390599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.193;QD=15.638;RBI=0.0153583;REFB=-0.00803664;REVB=0.0148533;RO=52;SAF=15;SAR=23;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00973121;STB=0.505492;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0106881;OID=.;OPOS=162622197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:52:52:38:38:0.422222:23:15:21:31:23:15:21:31 chr6 163587146 . C G 868.92 PASS AF=0.559441;AO=80;DP=143;FAO=80;FDP=143;FR=.;FRO=63;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.0313702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.756;QD=24.3055;RBI=0.0362831;REFB=-0.0278921;REVB=0.0182312;RO=63;SAF=48;SAR=32;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501334;STB=0.527371;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0162208;OID=.;OPOS=163587146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:63:63:80:80:0.559441:32:48:34:29:32:48:34:29 chr6 163612783 . C A 315.38 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0158515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7571;QD=17.5212;RBI=0.0300935;REFB=-0.00462437;REVB=0.0255802;RO=36;SAF=9;SAR=25;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107048;STB=0.565904;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0111083;OID=.;OPOS=163612783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:38:34:34:0.472222:25:9:13:23:25:9:14:24 chr6 163736204 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.227;QD=59.4356;RBI=0.0263952;REFB=0;REVB=-0.0193291;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.84883e-06;OID=.;OPOS=163736204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr6 166307718 . T C 1859.24 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.494;QD=61.4626;RBI=0.0247527;REFB=0;REVB=0.0247023;RO=0;SAF=60;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26097e-05;OID=.;OPOS=166307718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:61:60:0:0:61:60:0:0 chr6 166308090 . AT TC 3552.79 PASS AF=1;AO=219;DP=221;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0057313;FXX=0.0173905;HRUN=1;LEN=2;MLLD=292.697;QD=62.8813;RBI=0.0689297;REFB=0;REVB=0.068691;RO=0;SAF=112;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.29414e-05;OID=.;OPOS=166308090;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:221:226:0:0:219:226:1:107:112:0:0:113:113:0:0 chr6 166308584 . C A 1263.56 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0792413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6842;QD=61.637;RBI=0.0793568;REFB=0;REVB=-0.00427968;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629109;OID=.;OPOS=166308584;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:39:43:0:0:39:43:0:0 chr6 166308611 . G C 1287.36 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=315.906;QD=60.5818;RBI=0.0317396;REFB=0.146892;REVB=0.0243586;RO=1;SAF=44;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106442;STB=0.505617;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000199228;OID=.;OPOS=166308611;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:40:44:1:0:40:44:1:0 chr6 166308682 . G GAAAT,T 998.11 PASS AF=0.731959,0.0618557;AO=67,4;DP=97;FAO=71,6;FDP=97;FR=.;FRO=20;FSAF=32,4;FSAR=39,2;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0142745,-0.0090679;FXX=0.010203;HRUN=3,2;LEN=4,1;MLLD=253.755,66.0572;QD=41.1592;RBI=0.024058,0.00938636;REFB=-0.0439775,-0.0306801;REVB=0.0193655,0.00242424;RO=21;SAF=31,2;SAR=36,2;SRF=10;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00604397,0.0271012;STB=0.510914,0.631132;STBP=0.697,0.503;TYPE=ins,snp;VARB=0.00640622,-0.0625528;OID=.,.;OPOS=166308683,166308682;OREF=-,G;OALT=AAAT,T;OMAPALT=GAAAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:21:20:67,4:71,6:0.731959,0.0618557:36,2:31,2:10:11:39,2:32,4:10:10 chr6 166308924 . G A 1217.53 PASS AF=1;AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000954594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9411;QD=59.3917;RBI=0.0372432;REFB=0;REVB=0.037231;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240162;OID=.;OPOS=166308924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:82:82:0:0:80:82:1:47:33:0:0:49:33:0:0 chr6 166309167 . G A 748.27 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.251;QD=56.4728;RBI=0.0402476;REFB=0;REVB=0.0251964;RO=0;SAF=39;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105345;OID=.;OPOS=166309167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:13:39:0:0:14:39:0:0 chr6 166309245 . A T 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.549;QD=57.6807;RBI=0.0110025;REFB=0;REVB=-0.0106159;RO=0;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.32871e-05;OID=.;OPOS=166309245;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:6:25:0:0:6:25:0:0 chr6 166309249 . G T 519.98 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026354;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.4751;QD=59.4266;RBI=0.0666205;REFB=0;REVB=-0.0665683;RO=0;SAF=30;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110768;OID=.;OPOS=166309249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:5:30:0:0:5:30:0:0 chr6 166309288 . T C 683.4 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00656974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4086;QD=62.1275;RBI=0.0302499;REFB=0;REVB=-0.0295278;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00029944;OID=.;OPOS=166309288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0 chr6 166571157 . G A 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00562331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.677;QD=62.671;RBI=0.0122859;REFB=0;REVB=0.0109234;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33429e-05;OID=.;OPOS=166571157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0 chr6 166571164 . T G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185727;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.018;QD=62.6711;RBI=0.018753;REFB=0;REVB=0.0025938;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21121e-05;OID=.;OPOS=166571164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0 chr6 166571935 . C T 221.97 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00389256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.619;QD=14.7978;RBI=0.024968;REFB=-0.0189788;REVB=-0.0246627;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00907633;STB=0.505151;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0343016;OID=.;OPOS=166571935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:14:12:16:18:14:12:16:18 chr6 166572005 . T C 170.32 PASS AF=0.45;AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00318489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.661;QD=17.0319;RBI=0.0382775;REFB=-0.0208792;REVB=-0.0381448;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216683;STB=0.633989;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0187531;OID=.;OPOS=166572005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:22:22:17:18:0.45:5:12:11:11:5:13:11:11 chr6 166579270 . C T 280.06 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.00487069;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.195;QD=16.7198;RBI=0.0384803;REFB=0.00809542;REVB=-0.0381708;RO=33;SAF=15;SAR=16;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13992;STB=0.581344;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.00661815;OID=.;OPOS=166579270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:33:36:31:31:0.462687:16:15:11:22:16:15:12:24 chr6 166721211 . G T 69.32 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0237172;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=106.877;QD=30.811;RBI=0.0241752;REFB=-0.159793;REVB=0.00468344;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00470754;OID=.;OPOS=166721211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:4:4:1:0:4:4:1:0 chr6 166721224 . C G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=355.708;QD=39.2068;RBI=0.0341996;REFB=0;REVB=0.0254957;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97901e-05;OID=.;OPOS=166721224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr6 166736362 . C T 458.35 PASS AF=0.586667;AO=43;DP=74;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0114876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.713;QD=24.4451;RBI=0.0139471;REFB=-0.00653746;REVB=0.00790937;RO=31;SAF=18;SAR=25;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248406;STB=0.50943;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00480976;OID=.;OPOS=166736362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:31:31:43:44:0.586667:25:18:12:19:26:18:12:19 chr6 166739646 . T C 164.79 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00597909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.458;QD=21.2629;RBI=0.0304444;REFB=-0.0210412;REVB=0.0298515;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013838;STB=0.507803;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0177862;OID=.;OPOS=166739646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:8:6:7:10:8:6 chr6 166739684 . G A 335.6 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.718;QD=53.6953;RBI=0.0273262;REFB=0;REVB=0.0133508;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216399;OID=.;OPOS=166739684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:12:13:0:0 chr6 166755975 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.17;QD=60.2305;RBI=0.0439598;REFB=0;REVB=0.0151809;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200921;OID=.;OPOS=166755975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:27:10:0:0:27:10:0:0 chr6 166755979 . A C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00120737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.925;QD=59.0178;RBI=0.00769385;REFB=0;REVB=0.00759853;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67418e-05;OID=.;OPOS=166755979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:26:8:0:0:26:8:0:0 chr6 166778679 . T G 205.26 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.00820814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2364;QD=14.6616;RBI=0.0197683;REFB=-0.0147997;REVB=0.0179836;RO=32;SAF=8;SAR=16;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237482;STB=0.513502;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0143697;OID=.;OPOS=166778679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:16:8:10:22:16:8:10:22 chr6 166826255 . G A 47.73 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0238991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.593;QD=11.9331;RBI=0.0245696;REFB=-0.00942803;REVB=-0.00570048;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354212;STB=0.713673;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0117426;OID=.;OPOS=166826255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:6:3:5:2:6:3 chr6 166826304 . T C 228.3 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011662;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.284;QD=50.7338;RBI=0.052348;REFB=0;REVB=-0.0510324;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00081942;OID=.;OPOS=166826304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr6 166864693 . G A 304.69 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0420427;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.591;QD=22.1593;RBI=0.0683794;REFB=-0.0328055;REVB=0.0539273;RO=23;SAF=8;SAR=23;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196952;STB=0.602688;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.025359;OID=.;OPOS=166864693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:23:24:31:31:0.563636:23:8:11:12:23:8:11:13 chr6 166873010 . C T 547.25 PASS AF=0.588235;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0419656;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5007;QD=25.753;RBI=0.0430077;REFB=-0.0124766;REVB=-0.00941007;RO=35;SAF=22;SAR=28;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991137;STB=0.554172;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00899971;OID=.;OPOS=166873010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:35:35:50:50:0.588235:28:22:20:15:28:22:20:15 chr6 166952264 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3993;QD=56.7054;RBI=0.029857;REFB=0;REVB=0.0070395;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000475678;OID=.;OPOS=166952264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr6 167271711 . T C 920.1 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00615658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.295;QD=58.4191;RBI=0.0153051;REFB=0;REVB=0.0140122;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115793;OID=.;OPOS=167271711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:31:31:0:0:32:31:0:0 chr6 167271716 . T C 279.35 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0155648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.282;QD=18.9387;RBI=0.0165122;REFB=-0.0223672;REVB=-0.00551268;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149963;STB=0.574922;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0205107;OID=.;OPOS=167271716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:29:30:30:0.508475:13:17:11:17:13:17:12:17 chr6 167343141 . G A 829.95 PASS AF=0.51875;AO=83;DP=163;FAO=83;FDP=160;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=0.0184877;FXX=0.0184038;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.384;QD=20.7488;RBI=0.0201398;REFB=-0.0284815;REVB=-0.00798845;RO=76;SAF=40;SAR=43;SRF=28;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995807;STB=0.550919;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.017484;OID=.;OPOS=167343141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:160:76:77:83:83:0.51875:43:40:28:48:43:40:29:48 chr6 167352104 . C A 754.39 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.178;QD=56.9353;RBI=0.0524224;REFB=0;REVB=0.0512274;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250426;OID=.;OPOS=167352104;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr6 167571048 . T C 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.966;QD=62.0078;RBI=0.0243952;REFB=0;REVB=-0.00754872;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28657e-05;OID=.;OPOS=167571048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:37:47:0:0:37:47:0:0 chr6 167571430 . A T 554.18 PASS AF=0.44697;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00948884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.128;QD=16.7934;RBI=0.00955998;REFB=-0.0098547;REVB=-0.00116416;RO=70;SAF=32;SAR=27;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00047554;STB=0.503105;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0116949;OID=.;OPOS=167571430;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:70:73:59:59:0.44697:27:32:38:32:27:32:40:33 chr6 167590541 . G A 102.0 PASS AF=0.16;AO=20;DP=125;FAO=20;FDP=125;FR=.;FRO=105;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=63;FSRR=42;FWDB=0.00454315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1012;QD=3.26382;RBI=0.0304021;REFB=0.00165131;REVB=-0.0300607;RO=102;SAF=11;SAR=9;SRF=61;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622883;STB=0.542745;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=-0.00493234;OID=.;OPOS=167590541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:102:105:20:20:0.16:9:11:61:41:9:11:63:42 chr6 167590574 . G C 1387.9 PASS AF=0.957895;AO=90;DP=96;FAO=91;FDP=95;FR=.;FRO=4;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00672052;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.81;QD=58.4377;RBI=0.0164091;REFB=-0.0494091;REVB=0.0149697;RO=1;SAF=52;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902834;STB=0.518178;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.005227;OID=.;OPOS=167590574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:96:95:1:4:90:91:0.957895:38:52:1:0:38:53:4:0 chr6 167591904 . G A 109.39 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00449098;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.275;QD=13.2597;RBI=0.0375514;REFB=-0.00504738;REVB=-0.0372818;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220785;STB=0.629432;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0084963;OID=.;OPOS=167591904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:5:8:8:12:5:8:8:12 chr6 167591954 . G A 578.13 PASS AF=0.407407;AO=66;DP=162;FAO=66;FDP=162;FR=.;FRO=96;FSAF=11;FSAR=55;FSRF=14;FSRR=82;FWDB=0.00477535;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.985;QD=14.2748;RBI=0.0132254;REFB=-0.027168;REVB=-0.0123332;RO=95;SAF=11;SAR=55;SRF=14;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376407;STB=0.522894;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0298519;OID=.;OPOS=167591954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:95:96:66:66:0.407407:55:11:14:81:55:11:14:82 chr6 167592524 . T C 817.64 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.873;QD=57.3781;RBI=0.0826122;REFB=0;REVB=0.0807732;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118547;OID=.;OPOS=167592524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr6 167592576 . G A 1057.86 PASS AF=0.972973;AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0445779;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4065;QD=57.1818;RBI=0.0445794;REFB=-0.0973424;REVB=0.000365827;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116777;STB=0.512192;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00314382;OID=.;OPOS=167592576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:74:1:2:72:72:0.972973:40:32:0:1:40:32:0:2 chr6 167728774 . T C 204.78 PASS AF=0.28125;AO=27;DP=97;FAO=27;FDP=96;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=7.71558e-05;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.287;QD=8.53244;RBI=0.0708166;REFB=-0.00189111;REVB=-0.0708165;RO=69;SAF=17;SAR=10;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150529;STB=0.589838;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00288017;OID=.;OPOS=167728774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:69:69:27:27:0.28125:10:17:35:34:10:17:35:34 chr6 167753691 . C T 1192.2 PASS AF=0.573684;AO=109;DP=191;FAO=109;FDP=190;FR=.;FRO=81;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.0390601;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3985;QD=25.0989;RBI=0.0413455;REFB=-0.0136709;REVB=-0.0135557;RO=80;SAF=52;SAR=57;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113808;STB=0.503388;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0114436;OID=.;OPOS=167753691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:80:81:109:109:0.573684:57:52:37:43:57:52:38:43 chr6 167754661 . A G 441.11 PASS AF=0.544304;AO=42;DP=78;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0213229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.541;QD=22.3346;RBI=0.0213989;REFB=-0.0152288;REVB=0.00180246;RO=36;SAF=14;SAR=28;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147861;STB=0.585079;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0107052;OID=.;OPOS=167754661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:36:36:42:43:0.544304:28:14:18:18:29:14:18:18 chr6 167754702 . C T 382.23 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00030845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.308;QD=19.8561;RBI=0.0180311;REFB=0.000844082;REVB=-0.0180285;RO=38;SAF=12;SAR=27;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207014;STB=0.615323;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00194419;OID=.;OPOS=167754702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:27:12:20:18:27:12:20:18 chr6 167789493 . T C 1453.08 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3572;QD=63.1776;RBI=0.0522955;REFB=0;REVB=0.043533;RO=0;SAF=33;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298842;OID=.;OPOS=167789493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:59:33:0:0:59:33:0:0 chr6 167796280 . C T 327.77 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0031546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.67;QD=15.245;RBI=0.0070308;REFB=-0.00817004;REVB=-0.00628337;RO=50;SAF=27;SAR=9;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204225;STB=0.616369;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0114389;OID=.;OPOS=167796280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:9:27:29:21:9:27:29:21 chr6 167796309 . C T 344.33 PASS AF=0.390476;AO=41;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.0141053;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.184;QD=13.1174;RBI=0.0187026;REFB=-0.0198174;REVB=0.0122812;RO=64;SAF=27;SAR=14;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126696;STB=0.572167;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.033019;OID=.;OPOS=167796309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:64:64:41:41:0.390476:14:27:35:29:14:27:35:29 chr6 167796319 . T C 302.93 PASS AF=0.361905;AO=37;DP=105;FAO=38;FDP=105;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0202338;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.981;QD=11.5402;RBI=0.0221973;REFB=-0.000843332;REVB=-0.00912758;RO=66;SAF=25;SAR=12;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154721;STB=0.571466;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00426279;OID=.;OPOS=167796319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:66:67:37:38:0.361905:12:25:36:30:13:25:37:30 chr6 168323664 . A G 714.94 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0158584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7897;QD=60.8463;RBI=0.0226002;REFB=-0.0729238;REVB=-0.0161022;RO=1;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015416;STB=0.508193;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00864004;OID=.;OPOS=168323664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:30:16:0:1:30:16:0:1 chr6 168343838 . T C 1777.28 PASS AF=0.983333;AO=117;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0321355;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.141;QD=59.2427;RBI=0.0396629;REFB=-0.0266377;REVB=0.0232478;RO=2;SAF=47;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197775;STB=0.510415;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.000832973;OID=.;OPOS=168343838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:120:120:2:2:117:118:0.983333:70:47:2:0:71:47:2:0 chr6 168349011 . C T 120.78 PASS AF=0.348837;AO=14;DP=41;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0328071;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.0196;QD=11.2349;RBI=0.0590698;REFB=-0.0397997;REVB=0.0491216;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259176;STB=0.632853;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0482214;OID=.;OPOS=168349011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:27:28:14:15:0.348837:9:5:16:11:9:6:17:11 chr6 168376866 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.603;QD=46.8477;RBI=0.0413633;REFB=0;REVB=0.00519233;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441722;OID=.;OPOS=168376866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr6 168376869 . C T 137.61 PASS AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0151462;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.507;QD=39.318;RBI=0.0168673;REFB=-0.103866;REVB=0.00742285;RO=1;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533084;STB=0.529367;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00494929;OID=.;OPOS=168376869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:8:5:0:1:8:5:0:1 chr6 168376881 . TGG GTT 76.65 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-1.42396e-06;FXX=0.181653;HRUN=2;LEN=3;MLLD=123.396;QD=34.0687;RBI=0.0113705;REFB=0.0486645;REVB=0.0113705;RO=1;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.00509221;OID=.;OPOS=168376881;OREF=TGG;OALT=GTT;OMAPALT=GTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:11:9:1:1:8:8:0.888889:8:0:0:1:8:0:0:1 chr6 168376892 . A G 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.156202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7485;QD=39.2063;RBI=0.156225;REFB=0;REVB=-0.00265259;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0101813;OID=.;OPOS=168376892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr6 168442765 . G A 305.44 PASS AF=0.478261;AO=26;DP=67;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00669924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.121;QD=17.7069;RBI=0.126569;REFB=-0.0405568;REVB=0.126391;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776654;STB=0.518976;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.05369;OID=.;OPOS=168442765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:31:36:26:33:0.478261:13:13:18:13:14:19:22:14 chr6 168457801 . A G 899.82 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000419767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.188;QD=58.0531;RBI=0.0337256;REFB=0;REVB=0.033723;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91475e-05;OID=.;OPOS=168457801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:41:19:0:0:42:20:0:0 chr6 168457966 . G A 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0153979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.863;QD=13.9479;RBI=0.0187499;REFB=-0.00245398;REVB=-0.0106988;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166926;STB=0.596706;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00560701;OID=.;OPOS=168457966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:8:9:10:17:8:9:10:17 chr6 168459789 . TGGG TTGA 495.03 PASS AF=0.575342;AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=27;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00692304;FXX=0.0135117;HRUN=7;LEN=3;MLLD=251.197;QD=27.1247;RBI=0.0170411;REFB=-0.00249165;REVB=-0.0155714;RO=12;SAF=21;SAR=21;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137713;STB=0.550701;STBP=0.311;TYPE=mnp;VARB=-0.00146524;OID=.;OPOS=168459790;OREF=GGG;OALT=TGA;OMAPALT=TTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.575342:42:73:42:73:27:21:21:17:10:99:12:21:21:10:2 chr6 168459845 . G C 1571.77 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.382;QD=59.8769;RBI=0.0705727;REFB=0;REVB=0.0617564;RO=0;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46749e-05;OID=.;OPOS=168459845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:57:48:0:0:57:48:0:0 chr6 168479562 . C T 373.07 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00303014;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.466;QD=20.4424;RBI=0.0280344;REFB=-0.0330594;REVB=0.0278702;RO=34;SAF=14;SAR=24;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127149;STB=0.51612;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.026016;OID=.;OPOS=168479562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:35:38:38:0.520548:24:14:13:21:24:14:14:21 chr6 168479568 . G A 446.39 PASS AF=0.565789;AO=42;DP=75;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0205551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1086;QD=23.4942;RBI=0.0385558;REFB=-0.031199;REVB=0.0326195;RO=33;SAF=18;SAR=24;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535149;STB=0.524703;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0167195;OID=.;OPOS=168479568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:33:33:42:43:0.565789:24:18:12:21:25:18:12:21 chr6 168479604 . G A 1791.94 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129823;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.33;QD=61.2629;RBI=0.0583832;REFB=0;REVB=0.0569216;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.4277e-05;OID=.;OPOS=168479604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:63:53:0:0:63:54:0:0 chr6 168482110 . C T 1823.32 PASS AF=1;AO=100;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.705;QD=61.288;RBI=0.0987023;REFB=0;REVB=0.0748094;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168059;OID=.;OPOS=168482110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:100:119:1:48:52:0:0:61:58:0:0 chr6 168482111 . G T 59.96 PASS AF=0.117647;AO=13;DP=118;FAO=14;FDP=119;FR=.;FRO=105;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=57;FSRR=48;FWDB=-0.00712443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6592;QD=2.0154;RBI=0.0370073;REFB=-0.0561108;REVB=0.0363151;RO=105;SAF=0;SAR=13;SRF=57;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.670554;STB=0.924534;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0635193;OID=.;OPOS=168482111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:118:119:105:105:13:14:0.117647:13:0:57:48:13:1:57:48 chr6 168694594 . C T 2105.37 PASS AF=0.992647;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0700166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5111;QD=61.9226;RBI=0.0700358;REFB=-0.0295589;REVB=0.00163852;RO=1;SAF=81;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005833;STB=0.503067;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000877741;OID=.;OPOS=168694594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:136:1:1:135:135:0.992647:54:81:1:0:54:81:1:0 chr6 168695309 . C T 1885.19 PASS AF=0.992063;AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=88;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0334701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1316;QD=59.8473;RBI=0.0339876;REFB=-0.0364475;REVB=-0.00590868;RO=1;SAF=87;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543042;STB=0.502824;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00130557;OID=.;OPOS=168695309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:126:126:1:1:124:125:0.992063:37:87:1:0:37:88:1:0 chr6 168695345 . G A 2770.94 PASS AF=1;AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00271974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4615;QD=62.6202;RBI=0.0684963;REFB=0;REVB=0.0684423;RO=0;SAF=97;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027919;OID=.;OPOS=168695345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:177:177:0:0:177:177:1:80:97:0:0:80:97:0:0 chr6 168708751 . A G 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0105207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.436;QD=11.1041;RBI=0.0219707;REFB=-0.0056949;REVB=-0.019288;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22218;STB=0.635955;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0100806;OID=.;OPOS=168708751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:5:5:5:2:5:5 chr6 168709385 . T C 459.12 PASS AF=0.505618;AO=46;DP=90;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.010482;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.201;QD=20.6348;RBI=0.0107509;REFB=-0.0135869;REVB=-0.00238951;RO=44;SAF=14;SAR=32;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104016;STB=0.580133;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.011123;OID=.;OPOS=168709385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:44:44:46:45:0.505618:32:14:18:26:32:13:19:25 chr6 169621536 . A G 572.45 PASS AF=0.548077;AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.010921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.184;QD=22.0174;RBI=0.0136906;REFB=-0.0134211;REVB=0.00825617;RO=47;SAF=36;SAR=21;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155935;STB=0.585639;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0117732;OID=.;OPOS=169621536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:47:47:57:57:0.548077:21:36:21:26:21:36:21:26 chr6 169632219 . G A 349.14 PASS AF=0.414894;AO=38;DP=96;FAO=39;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.00831779;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7214;QD=14.8571;RBI=0.0305451;REFB=-0.0264239;REVB=-0.0293907;RO=38;SAF=16;SAR=22;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323057;STB=0.589698;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0717249;OID=.;OPOS=169632219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:38:55:38:39:0.414894:22:16:30:8:23:16:31:24 chr6 169637763 . G C 350.76 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0237711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.992;QD=20.6328;RBI=0.0238402;REFB=-0.00208997;REVB=-0.00181372;RO=32;SAF=14;SAR=22;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250729;STB=0.638634;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00269064;OID=.;OPOS=169637763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:22:14:22:10:22:14:22:10 chr6 170033086 . G A 1494.96 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000293748;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.642;QD=63.6152;RBI=0.00560919;REFB=0;REVB=-0.00560149;RO=0;SAF=54;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.88138e-06;OID=.;OPOS=170033086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:40:54:0:0:40:54:0:0 chr6 170059627 . G A 768.17 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.706;QD=56.9018;RBI=0.0492805;REFB=0;REVB=0.0324752;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184107;OID=.;OPOS=170059627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:35:18:0:0:36:18:0:0 chr6 170068180 . A G 2080.14 PASS AF=1;AO=132;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051235;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.154;QD=62.5606;RBI=0.0984917;REFB=0;REVB=-0.0841165;RO=0;SAF=61;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00057567;OID=.;OPOS=170068180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:133:0:0:132:133:1:71:61:0:0:72:61:0:0 chr6 170070722 . CA C,CG 534.55 PASS AF=0.0277778,0.972222;AO=5,31;DP=36;FAO=1,35;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=1,21;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722895,0.0708937;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=127.657,149.879;QD=59.3941;RBI=0.0864023,0.0835634;REFB=0,0;REVB=0.0473242,0.0442372;RO=0;SAF=5,17;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00212891,0.00218008;OID=.,.;OPOS=170070723,170070723;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0277778,0.972222:5,31:36:1,35:36:0:1,21:0,14:0:0:3:0:5,17:0,14:0:0 chr6 170102267 . A G 255.84 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168252;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1239;QD=51.1688;RBI=0.140495;REFB=0;REVB=-0.139484;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00536145;OID=.;OPOS=170102267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr6 170103508 . G GT 374.61 PASS AF=1;AO=29;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.4555;QD=45.407;RBI=0.0386428;REFB=0;REVB=-0.0104655;RO=5;SAF=15;SAR=14;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773494;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00252703;OID=.;OPOS=170103509;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:29:34:33:33:0:18:15:0:0:7:5:15:14:4:1 chr6 170104756 . T A 159.73 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00832997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.168;QD=11.6171;RBI=0.0167914;REFB=-0.000354457;REVB=-0.0145795;RO=35;SAF=5;SAR=15;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158902;STB=0.593307;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000629302;OID=.;OPOS=170104756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:15:5:13:22:15:5:13:22 chr6 170190200 . G A 1853.53 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.59;QD=60.7715;RBI=0.0668171;REFB=0;REVB=0.0587824;RO=0;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356701;OID=.;OPOS=170190200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:122:0:0:116:122:1:51:65:0:0:54:68:0:0 chr6 170190659 . G T 369.14 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.857;QD=54.6873;RBI=0.111479;REFB=0;REVB=0.00013953;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0034972;OID=.;OPOS=170190659;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:15:12:0:0 chr6 170592906 . G A 46.35 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0177909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.166;QD=9.75817;RBI=0.0285614;REFB=-0.0293259;REVB=0.0223437;RO=12;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577328;STB=0.535609;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0469648;OID=.;OPOS=170592906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:2:5:8:4:2:5:8:4 chr6 170592945 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.552;QD=55.0987;RBI=0.0144826;REFB=0;REVB=0.0076263;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90587e-05;OID=.;OPOS=170592945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr6 170597305 . C T 911.08 PASS AF=0.969697;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0412675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0501;QD=55.2169;RBI=0.0549842;REFB=-0.132889;REVB=0.0363353;RO=1;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136873;STB=0.501432;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00298637;OID=.;OPOS=170597305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:66:1:2:63:64:0.969697:34:29:0:1:35:29:1:1 chr6 170845354 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.224;QD=60.978;RBI=0.0661675;REFB=0;REVB=0.0475413;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000906836;OID=.;OPOS=170845354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr6 170862300 . G C 2025.68 PASS AF=0.992537;AO=131;DP=134;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0237117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.516;QD=60.4681;RBI=0.0241547;REFB=0.0122511;REVB=0.00460515;RO=0;SAF=52;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000204495;OID=.;OPOS=170862300;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:134:134:0:1:131:133:0.992537:79:52:0:0:79:54:1:0 chr6 170878793 . T C 2403.39 PASS AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.72;QD=61.2328;RBI=0.0604281;REFB=0;REVB=0.0531059;RO=0;SAF=68;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155065;OID=.;OPOS=170878793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:89:68:0:0:89:68:0:0 chr6 170887693 . G C 619.63 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.046813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.788;QD=59.012;RBI=0.0476079;REFB=-0.140763;REVB=-0.00866324;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00415442;OID=.;OPOS=170887693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:19:22:0:0:19:22:1:0 chr7 228527 . TG GT,T 346.05 PASS AF=0.722222,0.222222;AO=19,9;DP=35;FAO=26,8;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=2,4;FSAR=24,4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00670634,0.0541081;FXX=0.0270197;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=48.5687,12.5275;QD=38.4501;RBI=0.0974921,0.0592274;REFB=-0.147695,0.0026402;REVB=0.0972612,0.0240873;RO=4;SAF=1,3;SAR=18,6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0.516484;SSSB=0.0920258,0.221916;STB=0.519985,0.599759;STBP=0.657,0.284;TYPE=mnp,del;VARB=0.0564583,0.110169;OID=.,.;OPOS=228527,228528;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:44:35:36:4:2:19,9:26,8:0.722222,0.222222:18,6:1,3:0:4:24,4:2,4:0:2 chr7 299850 . G T 312.43 PASS AF=0.459459;AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0064145;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.387;QD=16.888;RBI=0.00675153;REFB=-0.0251696;REVB=0.0021065;RO=41;SAF=19;SAR=14;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134516;STB=0.588183;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0262453;OID=.;OPOS=299850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:40:33:34:0.459459:14:19:18:23:14:20:17:23 chr7 299881 . A G 279.55 PASS AF=0.476923;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0606066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4345;QD=17.2028;RBI=0.080431;REFB=-0.020687;REVB=-0.0528771;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869814;STB=0.55596;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.020882;OID=.;OPOS=299881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:34:34:30:31:0.476923:14:16:15:19:14:17:15:19 chr7 470239 . A G 470.42 PASS AF=0.619718;AO=42;DP=69;FAO=44;FDP=71;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0693182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.339;QD=26.5024;RBI=0.076146;REFB=-0.0140485;REVB=-0.0315151;RO=26;SAF=16;SAR=26;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552105;STB=0.530107;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00809556;OID=.;OPOS=470239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:26:27:42:44:0.619718:26:16:8:18:26:18:9:18 chr7 470281 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.362;QD=58.5878;RBI=0.0276289;REFB=0;REVB=0.00537368;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.59311e-05;OID=.;OPOS=470281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:24:9:0:0:24:9:0:0 chr7 470316 . A G 82.32 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0833604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.217;QD=19.3687;RBI=0.0855836;REFB=-0.0055973;REVB=-0.0193802;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153826;STB=0.588064;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.00233274;OID=.;OPOS=470316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:5:5:2:5:5:5:2:5 chr7 540741 . G A 610.82 PASS AF=0.5;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.00417364;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.039;QD=19.7039;RBI=0.0191339;REFB=-0.0214528;REVB=0.0186731;RO=62;SAF=30;SAR=32;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146163;STB=0.508066;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.03175;OID=.;OPOS=540741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:62:62:62:62:0.5:32:30:31:31:32:30:31:31 chr7 552046 . A G 214.36 PASS AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00440036;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.449;QD=17.1491;RBI=0.0230575;REFB=0.00769415;REVB=-0.0226337;RO=27;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880988;STB=0.549956;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.0076184;OID=.;OPOS=552046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:27:27:23:23:0.46:9:14:14:13:9:14:14:13 chr7 590199 . A G 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00368907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.292;QD=22.144;RBI=0.00946829;REFB=-0.0208637;REVB=0.00872005;RO=13;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842929;STB=0.547271;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0249821;OID=.;OPOS=590199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:7:10:9:4:7:10:9:4 chr7 624220 . GT G,GG 3120.16 PASS AF=0.0384615,0.961538;AO=46,152;DP=210;FAO=8,200;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=2,87;FSAR=6,113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00884806,0.0100602;FXX=0.00952336;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=159.149,186.102;QD=60.003;RBI=0.027187,0.0227635;REFB=0,0;REVB=0.0257069,0.0204198;RO=0;SAF=24,58;SAR=22,94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.86819e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0441716,0.00067082;OID=.,.;OPOS=624221,624221;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0384615,0.961538:46,152:210:8,200:208:0:2,87:6,113:0:0:6:0:24,58:22,94:0:0 chr7 624222 . A G 261.64 PASS AF=0.22381;AO=42;DP=201;FAO=47;FDP=210;FR=.;FRO=163;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=62;FSRR=101;FWDB=0.00167084;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.3019;QD=4.98362;RBI=0.033672;REFB=-0.0307053;REVB=-0.0336306;RO=159;SAF=24;SAR=18;SRF=62;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229212;STB=0.678057;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.198364;OID=.;OPOS=624222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:210:159:163:42:47:0.22381:18:24:62:97:18:29:62:101 chr7 772174 . G A 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0115968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.795;QD=16.2717;RBI=0.0125974;REFB=-0.0186679;REVB=-0.00492035;RO=18;SAF=2;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449002;STB=0.76429;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0139283;OID=.;OPOS=772174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:13:2:9:9:13:2:9:9 chr7 808810 . C G 325.97 PASS AF=0.636364;AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00775664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.064;QD=29.6333;RBI=0.0169372;REFB=-0.0448283;REVB=0.0150567;RO=16;SAF=13;SAR=15;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596731;STB=0.532764;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0433124;OID=.;OPOS=808810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:16:16:28:28:0.636364:15:13:6:10:15:13:6:10 chr7 810219 . T C 680.77 PASS AF=0.489209;AO=68;DP=139;FAO=68;FDP=139;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=-0.0978051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1939;QD=19.5904;RBI=0.0978051;REFB=-0.0187533;REVB=2.01689e-05;RO=71;SAF=35;SAR=33;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851067;STB=0.546977;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0222208;OID=.;OPOS=810219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:71:71:68:68:0.489209:33:35:30:41:33:35:30:41 chr7 814788 . G A 121.57 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0228193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5662;QD=15.1963;RBI=0.0260306;REFB=0.0208947;REVB=-0.0125248;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123178;STB=0.571326;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.0225769;OID=.;OPOS=814788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:10:8:8:6:10:8 chr7 881668 . C T 253.74 PASS AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0355828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.631;QD=28.1932;RBI=0.0389088;REFB=-0.0493356;REVB=0.0157403;RO=13;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00459284;STB=0.502536;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.027041;OID=.;OPOS=881668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:9:14:8:5:9:14:8:5 chr7 882895 . C G 135.51 PASS AF=0.483871;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00389598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0584;QD=17.4857;RBI=0.0655575;REFB=-0.0274081;REVB=0.0654416;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666664;STB=0.517218;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0330881;OID=.;OPOS=882895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:14:15:0.483871:6:8:8:8:7:8:8:8 chr7 897492 . A G 287.6 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0205287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.212;QD=15.978;RBI=0.0206954;REFB=-0.0132965;REVB=-0.00262093;RO=40;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190664;STB=0.510746;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0175755;OID=.;OPOS=897492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:19:13:17:23:19:13:17:23 chr7 926827 . T C 821.05 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228566;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.686;QD=57.6175;RBI=0.0305176;REFB=0;REVB=0.0304319;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229616;OID=.;OPOS=926827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:26:30:0:0:27:30:0:0 chr7 940181 . C T 670.25 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.421;QD=62.3485;RBI=0.0286743;REFB=0;REVB=0.0270974;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.3211e-05;OID=.;OPOS=940181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr7 940258 . G GGGCAAAGGCA 86.61 PASS AF=0.392857;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0294653;FXX=0;HRUN=4;LEN=10;MLLD=331.13;QD=12.3728;RBI=0.0424801;REFB=-0.011363;REVB=-0.0305999;RO=18;SAF=8;SAR=2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309114;STB=0.680301;STBP=0.159;TYPE=ins;VARB=0.0216984;OID=.;OPOS=940259;OREF=-;OALT=GGCAAAGGCA;OMAPALT=GGGCAAAGGCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.392857:10:29:11:28:17:9:2:10:7:86:18:8:2:10:8 chr7 959692 . G A 1138.8 PASS AF=0.47541;AO=116;DP=242;FAO=116;FDP=244;FR=.;FRO=128;FSAF=70;FSAR=46;FSRF=63;FSRR=65;FWDB=-0.0133227;FXX=0.00408147;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.463;QD=18.6689;RBI=0.0140794;REFB=-0.0207284;REVB=-0.00455338;RO=124;SAF=69;SAR=47;SRF=61;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980279;STB=0.559465;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0202951;OID=.;OPOS=959692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:244:124:128:116:116:0.47541:47:69:61:63:46:70:63:65 chr7 995003 . G C 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0238869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.458;QD=13.5518;RBI=0.0323139;REFB=-0.0265709;REVB=0.0217624;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427501;STB=0.524475;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0362067;OID=.;OPOS=995003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:10:14:19:16:10:14:19:16 chr7 1023013 . C T 63.07 PASS AF=0.473684;AO=3;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0257972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1497;QD=13.277;RBI=0.206518;REFB=0.00390975;REVB=-0.2049;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167835;STB=0.578146;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.0207107;OID=.;OPOS=1023013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:18:19:6:10:3:9:0.473684:1:2:3:3:5:4:3:7 chr7 1098233 . CAGA C 126.81 PASS AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0208371;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=3;MLLD=284.325;QD=18.1159;RBI=0.0213996;REFB=-0.0101423;REVB=0.0048739;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623504;STB=0.535663;STBP=0.766;TYPE=del;VARB=0.00927876;OID=.;OPOS=1098234;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:14:29:14:28:14:7:7:8:6:99:14:7:7:8:6 chr7 1132691 . C T 55.82 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0678202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3206;QD=10.6329;RBI=0.0811359;REFB=-0.0100096;REVB=0.0445361;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392276;STB=0.52375;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0241387;OID=.;OPOS=1132691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:4:4:7:6:4:4:7:6 chr7 1133305 . C G 244.06 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0597466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7947;QD=18.7737;RBI=0.0619294;REFB=-0.0125098;REVB=-0.0162972;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137164;STB=0.576864;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0105583;OID=.;OPOS=1133305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:15:11:15:11:15:11:15:11 chr7 1481919 . C A 448.72 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0166318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.585;QD=52.791;RBI=0.0268229;REFB=-0.184553;REVB=0.021044;RO=1;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252339;STB=0.512813;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0013584;OID=.;OPOS=1481919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:34:34:1:1:32:33:0.970588:18:14:0:1:19:14:0:1 chr7 1482009 . G C 725.87 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0104295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.008;QD=54.7829;RBI=0.0106705;REFB=-0.0647594;REVB=0.00225507;RO=1;SAF=33;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140615;STB=0.50746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000294785;OID=.;OPOS=1482009;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:53:53:1:1:52:52:0.981132:19:33:1:0:19:33:1:0 chr7 1484572 . A G 159.96 PASS AF=1;AO=9;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.121369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0373;QD=45.7018;RBI=0.121941;REFB=0;REVB=-0.0118016;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00556786;OID=.;OPOS=1484572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:9:14:1:5:4:0:0:9:5:0:0 chr7 1484683 . G T 134.77 PASS AF=0.46875;AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0115929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1853;QD=16.8456;RBI=0.0794797;REFB=-0.0936251;REVB=0.0786297;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22076;STB=0.611636;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0744642;OID=.;OPOS=1484683;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:14:15:0.46875:4:10:15:2:4:11:15:2 chr7 1510845 . GC G 66.53 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.134725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.0933;QD=14.0058;RBI=0.17891;REFB=-0.0202578;REVB=-0.117721;RO=10;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.227907;SSSB=0.637019;STB=0.877174;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=-0.00853855;OID=.;OPOS=1510846;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.473684:9:19:9:19:10:8:1:2:8:66:10:8:1:2:8 chr7 1533513 . A G 941.01 PASS AF=0.930556;AO=66;DP=73;FAO=67;FDP=72;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00517511;FXX=0.0270234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.185;QD=52.2783;RBI=0.0156047;REFB=-0.016639;REVB=-0.0147216;RO=5;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724887;STB=0.537302;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000886525;OID=.;OPOS=1533513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:73:72:5:5:66:67:0.930556:30:36:0:5:31:36:0:5 chr7 1538614 . G A 584.35 PASS AF=0.97619;AO=38;DP=39;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0100269;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.337;QD=55.6525;RBI=0.0343129;REFB=-0.191156;REVB=0.0328152;RO=1;SAF=23;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199387;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00195024;OID=.;OPOS=1538614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:42:1:1:38:41:0.97619:15:23:1:0:18:23:1:0 chr7 1542697 . G A 582.59 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0169234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.255;QD=58.2585;RBI=0.0393285;REFB=-0.127051;REVB=0.0355012;RO=1;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191347;STB=0.510199;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00196769;OID=.;OPOS=1542697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:24:15:0:1:24:15:0:1 chr7 1542814 . T C 397.55 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.514;QD=54.8339;RBI=0.0331451;REFB=0;REVB=0.0292315;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375995;OID=.;OPOS=1542814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:29:0:0:26:29:1:15:11:0:0:18:11:0:0 chr7 1543981 . C A 276.85 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146559;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.843;QD=52.7324;RBI=0.0146914;REFB=0;REVB=0.00102131;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000557336;OID=.;OPOS=1543981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr7 1588391 . A G 212.03 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264412;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.132;QD=49.8893;RBI=0.0391621;REFB=0;REVB=0.0288884;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0033588;OID=.;OPOS=1588391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr7 1588549 . G A 211.18 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296569;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.992;QD=49.6886;RBI=0.0552329;REFB=0;REVB=-0.0465955;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151633;OID=.;OPOS=1588549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0 chr7 1588768 . G A 239.38 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.062;QD=50.3953;RBI=0.0192218;REFB=0;REVB=0.00914361;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368865;OID=.;OPOS=1588768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0 chr7 1594986 . GGC G,GG,GGG 236.14 PASS AF=0.896552,0,0;AO=16,4,2;DP=31;FAO=26,0,0;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=5,0,0;FSAR=21,0,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.250633,0.158089,-0.0789027;FXX=0.0333222;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=16.8548,8.89592,6.62238;QD=32.571;RBI=0.271214,0.175352,0.0818972;REFB=-0.168024,-0.182026,-0.0516945;REVB=0.103636,0.07587,-0.0219435;RO=5;SAF=3,1,1;SAR=13,3,1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.30137,0,0;SSEP=0,0.30137,0;SSSB=-0.239648,-0.320004,-0.0967026;STB=0.571925,0.5,0.5;STBP=0.092,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.037188,0.0571756,0;OID=.,.,.;OPOS=1594987,1594988,1594988;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.896552,0,0:16,4,2:31:26,0,0:29:3:5,0,0:21,0,0:2:1:10:5:3,1,1:13,3,1:3:2 chr7 1733102 . G T 162.77 PASS AF=0.35;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0435123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6285;QD=10.8514;RBI=0.0454423;REFB=0.00289355;REVB=0.0131025;RO=39;SAF=10;SAR=11;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122489;STB=0.507147;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.00617797;OID=.;OPOS=1733102;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:39:39:21:21:0.35:11:10:19:20:11:10:19:20 chr7 1785738 . G A 145.53 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.009516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.774;QD=16.1702;RBI=0.0462139;REFB=-0.0302457;REVB=-0.0452236;RO=20;SAF=13;SAR=3;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266646;STB=0.655745;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0403273;OID=.;OPOS=1785738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:3:13:12:8:3:13:12:8 chr7 1878377 . A G 171.26 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0040611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.673;QD=12.4551;RBI=0.0159765;REFB=-0.0236618;REVB=-0.0154517;RO=33;SAF=15;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31585;STB=0.675503;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0420454;OID=.;OPOS=1878377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:34:21:21:0.381818:6:15:14:19:6:15:15:19 chr7 1878453 . T A 357.67 PASS AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0343287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9307;QD=19.5982;RBI=0.0343338;REFB=-0.00983607;REVB=0.000591438;RO=36;SAF=25;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23725;STB=0.632111;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0173728;OID=.;OPOS=1878453;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:12:25:15:21:12:25:15:21 chr7 1886937 . C T 620.72 PASS AF=0.529915;AO=62;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0116194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.802;QD=21.2212;RBI=0.0255923;REFB=-0.00876822;REVB=-0.0228025;RO=55;SAF=31;SAR=31;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233347;STB=0.512816;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00867705;OID=.;OPOS=1886937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:55:62:62:0.529915:31:31:29:26:31:31:29:26 chr7 1887037 . T C 659.96 PASS AF=0.418994;AO=68;DP=180;FAO=75;FDP=179;FR=.;FRO=104;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=-0.0474276;FXX=0.0478698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.188;QD=14.7478;RBI=0.0477483;REFB=-0.0321615;REVB=-0.00552433;RO=94;SAF=36;SAR=32;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805487;STB=0.556135;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0343567;OID=.;OPOS=1887037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:94:104:68:75:0.418994:32:36:57:37:39:36:60:44 chr7 1887362 . G A 384.13 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00379031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.117;QD=17.661;RBI=0.00950966;REFB=-0.0281224;REVB=0.00872165;RO=47;SAF=18;SAR=22;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175993;STB=0.509844;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0310912;OID=.;OPOS=1887362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:22:18:22:25:22:18:22:25 chr7 1976457 . C T 446.32 PASS AF=0.505747;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0154602;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.586;QD=20.5203;RBI=0.0157707;REFB=-0.0442601;REVB=0.0031141;RO=43;SAF=25;SAR=19;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547926;STB=0.530314;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0395589;OID=.;OPOS=1976457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:43:43:44:44:0.505747:19:25:27:16:19:25:27:16 chr7 2290522 . C T 222.7 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.0295334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.15;QD=12.5467;RBI=0.0298744;REFB=-0.0112678;REVB=0.00450089;RO=44;SAF=18;SAR=9;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00915423;STB=0.505259;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0298564;OID=.;OPOS=2290522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:9:18:29:15:9:18:29:15 chr7 2297006 . A G 251.06 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0019237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.169;QD=19.6912;RBI=0.00245995;REFB=-0.0227157;REVB=-0.00153322;RO=25;SAF=13;SAR=13;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876366;STB=0.548982;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.015208;OID=.;OPOS=2297006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:13:13:10:15:13:13:10:15 chr7 2303986 . T C 182.11 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0365886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7453;QD=16.9401;RBI=0.068828;REFB=-0.00481446;REVB=0.0582972;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134659;STB=0.50251;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00594007;OID=.;OPOS=2303986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:8:11:13:10:8:11:14:10 chr7 2472429 . C A 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.019772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.83;QD=22.3411;RBI=0.0241125;REFB=-0.0556;REVB=-0.0138015;RO=14;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556163;STB=0.531215;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0317507;OID=.;OPOS=2472429;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:9:9:8:6:9:9:8:6 chr7 2472455 . A T 132.7 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00635812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5141;QD=15.166;RBI=0.0130673;REFB=-0.0307283;REVB=-0.0114161;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0375581;OID=.;OPOS=2472455;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:6:9:12:8:6:9:12:8 chr7 2552881 . A AGATG 231.09 PASS AF=0.578947;AO=20;DP=49;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0144184;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=4;MLLD=178.032;QD=24.3254;RBI=0.0257205;REFB=-0.088905;REVB=0.0212992;RO=27;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380316;STB=0.51341;STBP=0.902;TYPE=ins;VARB=0.0577603;OID=.;OPOS=2552882;OREF=-;OALT=GATG;OMAPALT=AGATG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.578947:20:49:22:38:16:5:17:4:12:99:27:5:15:6:21 chr7 2578246 . C T 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0344943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.227;QD=11.9197;RBI=0.0400588;REFB=-0.030698;REVB=0.0203678;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.590354;STB=0.856122;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0226173;OID=.;OPOS=2578246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:1:6:2:7:1:6:2:7 chr7 2611878 . T C 239.65 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0229887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9302;QD=18.0866;RBI=0.0292205;REFB=-0.0127487;REVB=0.0180377;RO=27;SAF=8;SAR=18;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269425;STB=0.51514;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0307288;OID=.;OPOS=2611878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:18:8:9:18:18:8:9:18 chr7 2613042 . G C 333.71 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0102056;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.72;QD=16.0825;RBI=0.0173645;REFB=-0.0300984;REVB=-0.0140489;RO=47;SAF=20;SAR=16;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.002404;STB=0.501354;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0340186;OID=.;OPOS=2613042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:47:47:36:36:0.433735:16:20:26:21:16:20:26:21 chr7 2701295 . C T 43.62 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0403097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.953;QD=6.01601;RBI=0.0519546;REFB=-0.00110503;REVB=0.0327781;RO=22;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259708;STB=0.6696;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00312004;OID=.;OPOS=2701295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:5:2:11:11:5:2:11:11 chr7 2748758 . G C 410.72 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372876;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.8524;QD=56.6512;RBI=0.0709788;REFB=0;REVB=-0.0603956;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000470958;OID=.;OPOS=2748758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr7 2748803 . C T 256.5 PASS AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0249131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.853;QD=44.6094;RBI=0.0721795;REFB=-0.0797838;REVB=0.0677437;RO=2;SAF=7;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114826;STB=0.562439;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00197209;OID=.;OPOS=2748803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:14:7:2:0:14:7:2:0 chr7 2946338 . G A 376.75 PASS AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0167849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.084;QD=18.605;RBI=0.0203048;REFB=-0.00691224;REVB=-0.0114261;RO=42;SAF=27;SAR=12;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770947;STB=0.543081;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00562458;OID=.;OPOS=2946338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:12:27:26:16:12:27:26:16 chr7 2946460 . GT G,GC 332.57 PASS AF=0.12,0.88;AO=3,22;DP=25;FAO=3,22;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=3,9;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118427,0.0866554;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.04,132.227;QD=53.2119;RBI=0.126091,0.0913696;REFB=0,0;REVB=-0.0432907,-0.0289698;RO=0;SAF=3,9;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.2029e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0332583,0.00523431;OID=.,.;OPOS=2946461,2946461;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.12,0.88:3,22:25:3,22:25:0:3,9:0,13:0:0:13:0:3,9:0,13:0:0 chr7 2957005 . T C 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00990907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.574;QD=14.7942;RBI=0.0110838;REFB=-0.0086515;REVB=0.00496596;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386588;STB=0.522363;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.012767;OID=.;OPOS=2957005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:8:10:14:13:8:10:14:13 chr7 4026944 . C G 222.02 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0579203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4069;QD=14.5589;RBI=0.0635081;REFB=-0.00284687;REVB=0.0260483;RO=35;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766957;STB=0.543446;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00300889;OID=.;OPOS=4026944;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:16:10:11:24:16:10:11:24 chr7 4091377 . C T 254.4 PASS AF=0.384615;AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00089473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.495;QD=13.0463;RBI=0.00739949;REFB=-0.00486318;REVB=-0.0073452;RO=47;SAF=16;SAR=14;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469766;STB=0.520534;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00726698;OID=.;OPOS=4091377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:48:30:30:0.384615:14:16:23:24:14:16:24:24 chr7 4116715 . C G 332.7 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00504976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.747;QD=26.6163;RBI=0.00579199;REFB=-0.0215217;REVB=-0.00283673;RO=21;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520443;STB=0.528732;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0156472;OID=.;OPOS=4116715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:13:16:13:8:13:16:13:8 chr7 4189075 . G C 439.88 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0423489;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.75;QD=54.9854;RBI=0.0640861;REFB=-0.172927;REVB=0.0480999;RO=1;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266551;STB=0.514277;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00606826;OID=.;OPOS=4189075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:17:14:0:1:17:14:0:1 chr7 4213877 . T C 1419.81 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103594;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.339;QD=63.1026;RBI=0.0321243;REFB=0;REVB=0.0304081;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218912;OID=.;OPOS=4213877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:43:47:0:0:43:47:0:0 chr7 4213940 . T C 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.765;QD=60.7162;RBI=0.0422226;REFB=0;REVB=0.0125438;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.84369e-05;OID=.;OPOS=4213940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:37:39:0:0:37:39:0:0 chr7 4213975 . A G 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00369381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.867;QD=57.7118;RBI=0.0312326;REFB=0;REVB=0.0310134;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.7211e-05;OID=.;OPOS=4213975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0 chr7 4714912 . C T 1190.27 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00597098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3495;QD=61.0393;RBI=0.00599362;REFB=0;REVB=-0.000520481;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.64407e-05;OID=.;OPOS=4714912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:76:78:1:29:47:0:0:29:49:0:0 chr7 4780514 . G T 1905.49 PASS AF=0.992063;AO=122;DP=124;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0632032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.128;QD=60.4917;RBI=0.0632648;REFB=-0.0862031;REVB=0.00279121;RO=0;SAF=63;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65337e-08;STB=0.504201;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000379276;OID=.;OPOS=4780514;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:126:0:1:122:125:0.992063:59:63:0:0:59:66:0:1 chr7 4802029 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.831;QD=51.9167;RBI=0.0344964;REFB=0;REVB=-0.00775804;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59948e-05;OID=.;OPOS=4802029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr7 4827287 . C T 175.18 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0138783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.63;QD=20.0204;RBI=0.0140565;REFB=-0.0135816;REVB=0.00223085;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196931;STB=0.521715;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0119874;OID=.;OPOS=4827287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:12:6:5:11:12:6:5:12 chr7 4841470 . T C 382.58 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00619544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.297;QD=52.7696;RBI=0.0118058;REFB=-0.0178434;REVB=0.0100496;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.523792;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000415216;OID=.;OPOS=4841470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:1:0:18:10:1:0 chr7 4874420 . G C 356.61 PASS AF=0.383929;AO=42;DP=110;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.00621551;FXX=0.0175423;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.731;QD=12.7359;RBI=0.00854778;REFB=-0.0128241;REVB=0.00586787;RO=68;SAF=16;SAR=26;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116138;STB=0.552227;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0170603;OID=.;OPOS=4874420;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:68:69:42:43:0.383929:26:16:33:35:26:17:33:36 chr7 4876057 . C T 151.56 PASS AF=0.53125;AO=14;DP=30;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0075981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4758;QD=18.9454;RBI=0.0936178;REFB=-0.0337013;REVB=0.093309;RO=14;SAF=11;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163346;STB=0.51011;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.073847;OID=.;OPOS=4876057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:32:14:15:14:17:0.53125:3:11:9:5:6:11:10:5 chr7 4900095 . A G 260.6 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0284239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.737;QD=24.8187;RBI=0.028886;REFB=-0.00958173;REVB=-0.0051465;RO=18;SAF=13;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117313;STB=0.565163;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00658571;OID=.;OPOS=4900095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:11:13:7:11:11:13:7:11 chr7 4900341 . G A 250.24 PASS AF=0.466667;AO=29;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00928157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.608;QD=16.6828;RBI=0.011198;REFB=-0.00699192;REVB=-0.00626477;RO=31;SAF=13;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121582;STB=0.587615;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0052964;OID=.;OPOS=4900341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:32:29:28:0.466667:16:13:18:13:16:12:19:13 chr7 4901385 . A C 127.67 PASS AF=0.517241;AO=11;DP=28;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0308188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8797;QD=17.6102;RBI=0.0546124;REFB=-0.027467;REVB=-0.0450856;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659235;STB=0.583221;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.024441;OID=.;OPOS=4901385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:13:14:11:15:0.517241:6:5:5:8:6:9:6:8 chr7 5096958 . T C 198.39 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00694221;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.178;QD=25.5981;RBI=0.0114128;REFB=-0.0110485;REVB=0.00905858;RO=12;SAF=6;SAR=13;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304703;STB=0.669922;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0202204;OID=.;OPOS=5096958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:31:31:12:12:19:19:0.612903:13:6:9:3:13:6:9:3 chr7 5104275 . G A 104.84 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0058511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.436;QD=10.7528;RBI=0.0324529;REFB=-0.0235077;REVB=-0.031921;RO=25;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114311;STB=0.578197;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0419701;OID=.;OPOS=5104275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:25:26:13:13:0.333333:7:6:9:16:7:6:9:17 chr7 5104359 . G A 87.89 PASS AF=0.3;AO=11;DP=38;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0412931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.519;QD=8.78925;RBI=0.0432276;REFB=-0.0166411;REVB=-0.0127869;RO=27;SAF=3;SAR=8;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257675;STB=0.66637;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0215967;OID=.;OPOS=5104359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:38:40:27:28:11:12:0.3:8:3:13:14:9:3:13:15 chr7 5112035 . C T 59.39 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00627221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1945;QD=15.8363;RBI=0.103506;REFB=-0.0151731;REVB=0.103316;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211985;STB=0.622369;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0212787;OID=.;OPOS=5112035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:3:5:6:1:3:5:6:1 chr7 5161512 . G T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.286;QD=42.1826;RBI=0.0440222;REFB=0;REVB=0.0433535;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549885;OID=.;OPOS=5161512;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr7 5161640 . G C 298.81 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.000381156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.72;QD=18.6756;RBI=0.00921051;REFB=-0.0107724;REVB=-0.00920262;RO=32;SAF=12;SAR=20;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170463;STB=0.595178;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.015017;OID=.;OPOS=5161640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:20:12:18:14:20:12:18:14 chr7 5166500 . A G 188.16 PASS AF=0.475;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0278746;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.142;QD=18.8164;RBI=0.0302967;REFB=-0.0303975;REVB=0.0118699;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13202;STB=0.59081;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0383011;OID=.;OPOS=5166500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:20:21:19:19:0.475:6:13:11:9:6:13:11:10 chr7 5172115 . A G 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0169454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.756;QD=11.0924;RBI=0.0187895;REFB=-0.00542398;REVB=-0.00811769;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477139;STB=0.529298;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00567849;OID=.;OPOS=5172115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:5:1:1:4:5:1 chr7 5254227 . C G 2162.24 PASS AF=1;AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.064758;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1032;QD=63.1311;RBI=0.0773487;REFB=0;REVB=0.0422993;RO=0;SAF=45;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128132;OID=.;OPOS=5254227;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:137:0:0:137:137:1:92:45:0:0:92:45:0:0 chr7 5271656 . GCTTCC G 89.72 PASS AF=0.244898;AO=14;DP=46;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0214587;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=5;MLLD=221.557;QD=7.32387;RBI=0.0310151;REFB=-0.00711248;REVB=-0.0223934;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229751;STB=0.612609;STBP=0.374;TYPE=del;VARB=0.0207561;OID=.;OPOS=5271657;OREF=CTTCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.244898:14:46:12:49:37:7:5:16:21:89:30:8:6:11:19 chr7 5347749 . G A 244.28 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0381955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.194;QD=23.265;RBI=0.042435;REFB=-0.0362859;REVB=-0.0184886;RO=18;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351596;STB=0.535683;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0370116;OID=.;OPOS=5347749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:19:23:23:0.547619:8:15:11:7:8:15:11:8 chr7 5372406 . G T 87.59 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.096;QD=38.93;RBI=0.0481676;REFB=0;REVB=0.0351942;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012423;OID=.;OPOS=5372406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:3:5:0:0:4:5:0:0 chr7 5415832 . C T 143.99 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00550317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.961;QD=15.1569;RBI=0.0234068;REFB=-0.0173663;REVB=0.0227507;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.526283;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0241204;OID=.;OPOS=5415832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:22:16:16:0.421053:8:8:10:11:8:8:10:12 chr7 5427517 . G A 357.94 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.686;QD=55.0684;RBI=0.126675;REFB=0;REVB=0.119267;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125022;OID=.;OPOS=5427517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr7 5427720 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3228;QD=39.2067;RBI=0.042376;REFB=0;REVB=0.032215;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163753;OID=.;OPOS=5427720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0 chr7 5434135 . A G 616.69 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0525974;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.4394;QD=61.6694;RBI=0.0549871;REFB=0;REVB=-0.0160342;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000434768;OID=.;OPOS=5434135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr7 5460550 . C T 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.66;QD=63.1954;RBI=0.0252838;REFB=0;REVB=0.0225053;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98533e-05;OID=.;OPOS=5460550;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:46:46:0:0:46:46:0:0 chr7 5487423 . C G 428.7 PASS AF=1;AO=18;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.7292;QD=57.1593;RBI=0.206619;REFB=0;REVB=-0.14606;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015247;OID=.;OPOS=5487423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:18:30:1:7:11:0:0:10:20:0:0 chr7 5487457 . CT AC 242.67 PASS AF=1;AO=15;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234114;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=214.4;QD=44.1213;RBI=0.0468659;REFB=0;REVB=0.0405995;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.00189688;OID=.;OPOS=5487457;OREF=CT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:15:22:1:5:10:0:0:6:16:0:0 chr7 5515624 . T G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218;QD=58.2396;RBI=0.0206091;REFB=0;REVB=-0.0149339;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.45559e-05;OID=.;OPOS=5515624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0 chr7 5518331 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.362;QD=33.4285;RBI=0.139112;REFB=0;REVB=0.048059;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.016075;OID=.;OPOS=5518331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr7 5528883 . G A 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0195537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.359;QD=22.1886;RBI=0.0212961;REFB=-0.0189627;REVB=0.00843646;RO=18;SAF=4;SAR=17;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359383;STB=0.703925;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0163093;OID=.;OPOS=5528883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:17:4:10:8:17:4:10:8 chr7 5529758 . G A 62.67 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00519419;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.872;QD=17.9054;RBI=0.0254944;REFB=-0.0329249;REVB=0.0249597;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032898;STB=0.519183;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0154358;OID=.;OPOS=5529758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:15:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:2:4:5:3:2:4 chr7 5540769 . A C 805.58 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032776;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8615;QD=57.5411;RBI=0.0425066;REFB=0;REVB=-0.0423801;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000184081;OID=.;OPOS=5540769;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0 chr7 5541657 . G A 100.74 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0365054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2653;QD=16.1186;RBI=0.0453328;REFB=-0.0397934;REVB=0.0268778;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109955;STB=0.563652;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0324226;OID=.;OPOS=5541657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:7:6:7:5:7:6 chr7 5632690 . G A 31.09 PASS AF=0.5;AO=3;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0277076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.614;QD=12.4347;RBI=0.0301788;REFB=-0.0452441;REVB=-0.0119605;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671606;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.055279;OID=.;OPOS=5632690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:3:5:0.5:1:2:3:2:2:3:3:2 chr7 5659756 . G A 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0110982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.939;QD=12.4824;RBI=0.0123395;REFB=-0.00327083;REVB=-0.00539377;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114204;STB=0.567454;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00745309;OID=.;OPOS=5659756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:7:5:10:9:7:5:10:9 chr7 5983012 . A G 330.44 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.020762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.946;QD=50.8367;RBI=0.0470578;REFB=0.00337176;REVB=0.04223;RO=1;SAF=5;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840195;STB=0.545416;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.000256975;OID=.;OPOS=5983012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:20:5:1:0:20:5:1:0 chr7 6013049 . C G 155.14 PASS AF=0.75;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.034797;FXX=0.0475964;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.966;QD=31.0288;RBI=0.0450107;REFB=-0.00562328;REVB=0.0285504;RO=5;SAF=2;SAR=13;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613491;STB=0.534198;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00274633;OID=.;OPOS=6013049;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:21:20:5:5:15:15:0.75:13:2:1:4:13:2:1:4 chr7 6026775 . T C 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.348;QD=49.5971;RBI=0.0334178;REFB=0;REVB=0.0264289;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149888;OID=.;OPOS=6026775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr7 6026942 . G T 971.15 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.69;QD=58.8572;RBI=0.0562044;REFB=0;REVB=0.0481968;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249663;OID=.;OPOS=6026942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:63:66:1:39:24:0:0:41:25:0:0 chr7 6036980 . G C 175.57 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2289;QD=46.8195;RBI=0.0683586;REFB=0;REVB=-0.0668617;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00225841;OID=.;OPOS=6036980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr7 6043386 . G A 204.52 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0129736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.734;QD=22.7238;RBI=0.0257971;REFB=-0.000607506;REVB=-0.0222975;RO=16;SAF=5;SAR=15;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32223;STB=0.681625;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.000844206;OID=.;OPOS=6043386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:15:5:10:6:15:5:10:6 chr7 6056530 . G A 222.61 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0108214;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.136;QD=18.172;RBI=0.0493148;REFB=-0.00965385;REVB=-0.0481129;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538499;STB=0.530585;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00434913;OID=.;OPOS=6056530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:27:27:22:22:0.44898:11:11:15:12:11:11:15:12 chr7 6063283 . C T 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00456627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.037;QD=20.8719;RBI=0.00643158;REFB=0.00645078;REVB=0.00452928;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19502;STB=0.610062;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00578445;OID=.;OPOS=6063283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:9:11:7:14:9:11 chr7 6066450 . T C 147.03 PASS AF=0.3125;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0273681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2763;QD=9.18915;RBI=0.0423034;REFB=0.0038957;REVB=0.0322578;RO=44;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102825;STB=0.560644;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.00593987;OID=.;OPOS=6066450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:44:44:20:20:0.3125:11:9:16:28:11:9:16:28 chr7 6066461 . T C 126.83 PASS AF=0.285714;AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0165865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.033;QD=8.05245;RBI=0.0176223;REFB=-0.0052723;REVB=0.00595267;RO=43;SAF=7;SAR=11;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803982;STB=0.525301;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00757017;OID=.;OPOS=6066461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:45:18:18:0.285714:11:7:14:29:11:7:16:29 chr7 6071060 . G A 254.76 PASS AF=0.394737;AO=28;DP=77;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00696982;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.67;QD=13.4082;RBI=0.0165853;REFB=-0.022134;REVB=-0.0150497;RO=47;SAF=12;SAR=16;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668115;STB=0.507038;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0311428;OID=.;OPOS=6071060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:47:46:28:30:0.394737:16:12:23:24:16:14:22:24 chr7 6075523 . G A 122.53 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0114376;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.35;QD=14.8526;RBI=0.0535512;REFB=-7.58925e-05;REVB=0.0523155;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120243;STB=0.570033;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.000427708;OID=.;OPOS=6075523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:9:10:9:5:9:10 chr7 6075823 . A T 137.83 PASS AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00455905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.447;QD=10.0236;RBI=0.00858367;REFB=-0.0072407;REVB=0.00727286;RO=36;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942777;STB=0.545404;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.011623;OID=.;OPOS=6075823;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:36:37:18:18:0.327273:9:9:21:15:9:9:21:16 chr7 6087389 . C A 70.79 PASS AF=0.5625;AO=7;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0194468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.2;QD=17.6984;RBI=0.0328466;REFB=-0.0394186;REVB=0.0264711;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252798;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0458534;OID=.;OPOS=6087389;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:7:9:0.5625:2:5:3:4:4:5:3:4 chr7 6087400 . C A 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0190111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.242;QD=16.3859;RBI=0.0253338;REFB=0.00223203;REVB=0.0167445;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450094;STB=0.526257;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=-0.00155224;OID=.;OPOS=6087400;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:4:4:4:5:4:4 chr7 6088420 . A G 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0189863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.566;QD=13.5045;RBI=0.0393664;REFB=0.0104266;REVB=0.0344852;RO=17;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302407;STB=0.678928;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.0106408;OID=.;OPOS=6088420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:3:9:8:9:3:9:8:9 chr7 6189780 . T C 258.55 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0331626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2328;QD=16.4157;RBI=0.0933802;REFB=0.00793357;REVB=-0.0872932;RO=34;SAF=12;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111628;STB=0.56287;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.0190971;OID=.;OPOS=6189780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:17:12:18:16:17:12:18:16 chr7 6190126 . G A 114.72 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00155978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.73;QD=10.4293;RBI=0.031536;REFB=-0.00741361;REVB=-0.0314974;RO=30;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910567;STB=0.554715;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0145657;OID=.;OPOS=6190126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:5:9:17:13:5:9:17:13 chr7 6193464 . T G 239.34 PASS AF=0.5;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0195627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.925;QD=20.8118;RBI=0.0201964;REFB=-0.0135542;REVB=-0.00501931;RO=21;SAF=8;SAR=15;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136655;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012164;OID=.;OPOS=6193464;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:21:23:23:23:0.5:15:8:7:14:15:8:8:15 chr7 6193521 . G C 88.01 PASS AF=1;AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.098684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.891;QD=39.1138;RBI=0.0994273;REFB=0;REVB=0.0121348;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00270203;OID=.;OPOS=6193521;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:7:9:1:7:0:0:0:8:1:0:0 chr7 6194274 . T C 481.72 PASS AF=1;AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204697;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.331;QD=58.3898;RBI=0.0393861;REFB=0;REVB=0.0336491;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255743;OID=.;OPOS=6194274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:31:33:1:13:18:0:0:14:19:0:0 chr7 6199072 . G C 279.37 PASS AF=0.517241;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00779234;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.522;QD=19.2666;RBI=0.00816401;REFB=-0.0282755;REVB=0.00243528;RO=28;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10815;STB=0.550425;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0274884;OID=.;OPOS=6199072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:28:28:29:30:0.517241:16:13:16:12:16:14:16:12 chr7 6202413 . T C 138.94 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0925825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9087;QD=19.8492;RBI=0.121815;REFB=0.0170194;REVB=-0.0791665;RO=13;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383534;STB=0.521711;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.0226564;OID=.;OPOS=6202413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:11:4:3:10:11:4:3:10 chr7 6204999 . A C 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0589487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.24;QD=57.2015;RBI=0.0702399;REFB=0;REVB=0.0381929;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126064;OID=.;OPOS=6204999;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr7 6252291 . G A 128.04 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00483645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.917;QD=20.4858;RBI=0.00546436;REFB=-0.0214996;REVB=0.00254322;RO=11;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105797;STB=0.559915;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0143092;OID=.;OPOS=6252291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:7:7:7:4:7:7:7:4 chr7 6370194 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4092;QD=55.6558;RBI=0.0177878;REFB=0;REVB=0.00690491;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364068;OID=.;OPOS=6370194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0 chr7 6370305 . C G,T 383.41 PASS AF=0.928571,0.0714286;AO=26,2;DP=28;FAO=26,2;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17,1;FSAR=9,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190539,-0.00240485;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=57.0739,96.706;QD=54.7724;RBI=0.0259765,0.0327225;REFB=0,0;REVB=0.0176559,0.032634;RO=0;SAF=17,1;SAR=9,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0567661,0.016603;OID=.,.;OPOS=6370305,6370305;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:28:28:0:0:26,2:26,2:0.928571,0.0714286:9,1:17,1:0:0:9,1:17,1:0:0 chr7 6370406 . C T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.017;QD=44.6897;RBI=0.0226877;REFB=0;REVB=-0.00830184;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114975;OID=.;OPOS=6370406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr7 6442433 . C T 294.43 PASS AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00365496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.932;QD=28.0408;RBI=0.0176572;REFB=0.000310052;REVB=0.0172747;RO=16;SAF=9;SAR=17;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112544;STB=0.562208;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000103493;OID=.;OPOS=6442433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:17:9:8:8:17:9:8:8 chr7 6443047 . A G 425.46 PASS AF=0.531646;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00769876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.841;QD=21.5421;RBI=0.00923854;REFB=-0.0168896;REVB=-0.00510683;RO=35;SAF=21;SAR=21;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589181;STB=0.518978;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0167584;OID=.;OPOS=6443047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:35:37:42:42:0.531646:21:21:20:15:21:21:20:17 chr7 6452461 . G A 405.49 PASS AF=0.609375;AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00372149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.187;QD=25.3429;RBI=0.0426835;REFB=-0.0281357;REVB=-0.0425209;RO=25;SAF=29;SAR=10;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575103;STB=0.531552;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0146648;OID=.;OPOS=6452461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:25:25:39:39:0.609375:10:29:17:8:10:29:17:8 chr7 6456302 . C T 244.75 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00890283;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7102;QD=15.2967;RBI=0.0427071;REFB=-0.0220775;REVB=0.0417688;RO=36;SAF=15;SAR=13;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104143;STB=0.558782;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.039787;OID=.;OPOS=6456302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:36:36:28:28:0.4375:13:15:23:13:13:15:23:13 chr7 6502367 . T C 199.51 PASS AF=0.782609;AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0604007;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6369;QD=34.6969;RBI=0.0751428;REFB=0.0159859;REVB=0.0447012;RO=5;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178192;STB=0.509793;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=-0.00211039;OID=.;OPOS=6502367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:24:23:5:5:18:18:0.782609:8:10:3:2:8:10:3:2 chr7 6505901 . T C 198.04 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0165743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.839;QD=11.1571;RBI=0.0215189;REFB=-0.004397;REVB=0.0137243;RO=45;SAF=13;SAR=12;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108211;STB=0.555012;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00895768;OID=.;OPOS=6505901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:45:46:25:25:0.352113:12:13:19:26:12:13:20:26 chr7 6537821 . G C 262.68 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=31;FWDB=0.0159746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9859;QD=15.6823;RBI=0.0159774;REFB=-0.000791802;REVB=-0.000299546;RO=37;SAF=8;SAR=22;SRF=6;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141935;STB=0.579187;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.00110366;OID=.;OPOS=6537821;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:22:8:6:31:22:8:6:31 chr7 6621277 . G A 727.31 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760555;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2782;QD=57.0441;RBI=0.00823241;REFB=0;REVB=-0.0031509;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354227;OID=.;OPOS=6621277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:35:16:0:0:35:16:0:0 chr7 6647738 . T C 307.2 PASS AF=1;AO=18;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188167;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.461;QD=53.4256;RBI=0.0190928;REFB=0;REVB=-0.00323526;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171305;OID=.;OPOS=6647738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:18:23:1:12:6:0:0:12:11:0:0 chr7 6656830 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.516;QD=59.4356;RBI=0.0193964;REFB=0;REVB=0.00840608;RO=0;SAF=27;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.88716e-05;OID=.;OPOS=6656830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:8:27:0:0:8:27:0:0 chr7 6656897 . A G 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2359;QD=56.7054;RBI=0.0604578;REFB=0;REVB=-0.0522826;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0018155;OID=.;OPOS=6656897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr7 6713936 . C T 146.1 PASS AF=0.369565;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00890167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.739;QD=12.7042;RBI=0.0346966;REFB=-0.00580635;REVB=0.0335353;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124746;STB=0.550961;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0103334;OID=.;OPOS=6713936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:29:29:16:17:0.369565:9:7:16:13:9:8:16:13 chr7 6713940 . CAG C 145.58 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00388025;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.053;QD=15.3241;RBI=0.0297082;REFB=-0.0251624;REVB=-0.0294537;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127805;STB=0.536378;STBP=0.678;TYPE=del;VARB=0.0168825;OID=.;OPOS=6713941;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421053:16:44:16:38:22:7:9:11:11:99:25:7:9:14:11 chr7 6713985 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.511;QD=57.6798;RBI=0.0570296;REFB=0;REVB=0.0239457;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487532;OID=.;OPOS=6713985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr7 6714028 . G A 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0172822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.418;QD=9.11038;RBI=0.0175747;REFB=-0.00756608;REVB=-0.00319322;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228754;STB=0.642474;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0124217;OID=.;OPOS=6714028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:7:9:6:2:7:9 chr7 6776956 . A G 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.00393933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.422;QD=20.563;RBI=0.0113415;REFB=-0.00481863;REVB=-0.0106353;RO=25;SAF=16;SAR=13;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223627;STB=0.623817;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00359066;OID=.;OPOS=6776956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:13:16:7:18:13:16:7:18 chr7 7283569 . G A 162.2 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0126172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2722;QD=12.0144;RBI=0.030687;REFB=-0.012239;REVB=-0.0279731;RO=34;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714867;STB=0.541624;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0218827;OID=.;OPOS=7283569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:13:7:14:20:13:7:14:20 chr7 7283688 . T A 364.6 PASS AF=0.487179;AO=36;DP=76;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0327725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.445;QD=18.6975;RBI=0.0370551;REFB=-0.0114319;REVB=0.0172929;RO=39;SAF=15;SAR=21;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114088;STB=0.567865;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0109926;OID=.;OPOS=7283688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:39:40:36:38:0.487179:21:15:21:18:23:15:21:19 chr7 7472161 . T G 360.83 PASS AF=0.405941;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.00368284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.578;QD=14.2902;RBI=0.00600975;REFB=0.0012121;REVB=-0.00474908;RO=59;SAF=34;SAR=7;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305475;STB=0.682541;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00150004;OID=.;OPOS=7472161;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:59:60:41:41:0.405941:7:34:36:23:7:34:36:24 chr7 7571094 . G C 1556.51 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.316;QD=59.8657;RBI=0.0322301;REFB=0;REVB=0.0292619;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67377e-05;OID=.;OPOS=7571094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:56:48:0:0:56:48:0:0 chr7 7646651 . G T 1096.74 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445159;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.806;QD=60.0953;RBI=0.0522527;REFB=0;REVB=0.0273619;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.59197e-05;OID=.;OPOS=7646651;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:72:73:1:38:34:0:0:39:34:0:0 chr7 7646687 . A G 584.33 PASS AF=0.552381;AO=56;DP=104;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00236245;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.169;QD=22.2601;RBI=0.00661139;REFB=-0.00917205;REVB=0.00617489;RO=45;SAF=23;SAR=33;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828511;STB=0.543985;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00733778;OID=.;OPOS=7646687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:45:47:56:58:0.552381:33:23:23:22:34:24:24:23 chr7 8125964 . C T 1529.27 PASS AF=0.972222;AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000340365;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.625;QD=56.6397;RBI=0.0212978;REFB=-0.113282;REVB=0.021295;RO=3;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287345;STB=0.515149;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.000384744;OID=.;OPOS=8125964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:108:108:3:3:105:105:0.972222:48:57:0:3:48:57:0:3 chr7 8132252 . T C 1433.54 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.527;QD=63.0129;RBI=0.0162166;REFB=0;REVB=0.0156094;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07305e-06;OID=.;OPOS=8132252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:39:51:0:0:39:52:0:0 chr7 8196529 . A T 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.494;QD=62.7619;RBI=0.0084496;REFB=0;REVB=-0.00140679;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36509e-06;OID=.;OPOS=8196529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0 chr7 8196566 . AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG A,AA,AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA,AAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 569.44 PASS AF=0.55814,0.0232558,0.418605,0;AO=12,6,6,2;DP=43;FAO=24,1,18,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0,7,0;FSAR=11,1,11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022204,-0.0229004,-0.0252505,-0.0237154;FXX=0.31741;HRUN=25,25,25,25;LEN=19,18,15,16;MLLD=164.837,163.863,138.965,132.371;QD=52.9715;RBI=0.0222871,0.0229869,0.0255314,0.0240159;REFB=0,0,0,0;REVB=0.00192209,0.00199275,0.00377696,0.00378732;RO=0;SAF=7,3,0,0;SAR=5,3,6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,mnp;VARB=0.00079074,0.00282419,0.00194617,-0.012367;OID=.,.,.,.;OPOS=8196567,8196568,8196571,8196570;OREF=AAAAAAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAAAAAG;OALT=-,-,GAAAGAAAGAAAGAA,GAAAGAAAGAAAGAAA;OMAPALT=A,AA,AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA,AAAAGAAAGAAAGAAAGAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.55814,0.0232558,0.418605,0:12,6,6,2:43:24,1,18,0:43:0:13,0,7,0:11,1,11,0:0:0:99:0:7,3,0,0:5,3,6,2:0:0 chr7 8792148 . T C 475.01 PASS AF=0.476636;AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=0.0445886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4715;QD=17.7575;RBI=0.0450106;REFB=-0.019512;REVB=-0.00614886;RO=55;SAF=14;SAR=37;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079634;STB=0.551733;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0143392;OID=.;OPOS=8792148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:55:56:51:51:0.476636:37:14:19:36:37:14:20:36 chr7 10979697 . G A 252.81 PASS AF=0.509434;AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.149154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8367;QD=19.0799;RBI=0.149831;REFB=-0.0265398;REVB=0.0142302;RO=24;SAF=10;SAR=16;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288315;STB=0.546748;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0212104;OID=.;OPOS=10979697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:24:26:26:27:0.509434:16:10:10:14:17:10:12:14 chr7 11521542 . T C 409.2 PASS AF=0.57971;AO=39;DP=70;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0112187;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.758;QD=23.7217;RBI=0.0197754;REFB=-0.0311777;REVB=-0.0162851;RO=24;SAF=24;SAR=15;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381225;STB=0.506021;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0192586;OID=.;OPOS=11521542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:24:29:39:40:0.57971:15:24:16:8:16:24:17:12 chr7 11581121 . T C 396.59 PASS AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.00136415;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.696;QD=15.1081;RBI=0.00845837;REFB=-0.0172356;REVB=-0.00834764;RO=60;SAF=16;SAR=29;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217345;STB=0.622263;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0238438;OID=.;OPOS=11581121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:60:60:45:45:0.428571:29:16:34:26:29:16:34:26 chr7 11581134 . T C 370.13 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0158408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.763;QD=14.1003;RBI=0.0165073;REFB=-0.00545499;REVB=-0.00464313;RO=62;SAF=15;SAR=28;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228396;STB=0.629153;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00483973;OID=.;OPOS=11581134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:62:43:43:0.409524:28:15:35:27:28:15:35:27 chr7 11675855 . C T 410.63 PASS AF=0.419643;AO=47;DP=112;FAO=47;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0653289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.258;QD=14.6655;RBI=0.0688092;REFB=-0.015364;REVB=-0.0216066;RO=65;SAF=24;SAR=23;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506037;STB=0.528462;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0155798;OID=.;OPOS=11675855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:65:65:47:47:0.419643:23:24:30:35:23:24:30:35 chr7 12269417 . C G 1084.31 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0240211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.808;QD=58.6114;RBI=0.0287711;REFB=-0.0496774;REVB=0.0158355;RO=1;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113981;STB=0.506022;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00156072;OID=.;OPOS=12269417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:41:32:0:1:41:32:0:1 chr7 12271997 . G A 428.05 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0443;QD=57.0734;RBI=0.0543138;REFB=0;REVB=0.032862;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162164;OID=.;OPOS=12271997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:11:18:0:0:12:18:0:0 chr7 12272026 . A G 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00114797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.995;QD=17.5603;RBI=0.0426762;REFB=-0.0192553;REVB=0.0426608;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113565;STB=0.565142;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0266449;OID=.;OPOS=12272026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:5:13:13:8:5:13:13:8 chr7 12370794 . T C 422.85 PASS AF=0.395161;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.0183456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2008;QD=13.6402;RBI=0.0557321;REFB=-0.00327818;REVB=0.0526261;RO=75;SAF=28;SAR=21;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223157;STB=0.6258;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00488568;OID=.;OPOS=12370794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:75:75:49:49:0.395161:21:28:27:48:21:28:27:48 chr7 12376811 . A C 356.68 PASS AF=0.380531;AO=43;DP=112;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=25;FWDB=-0.0189746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.504;QD=12.6258;RBI=0.0190112;REFB=-0.00608315;REVB=-0.00117912;RO=69;SAF=18;SAR=25;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234079;STB=0.636302;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00648996;OID=.;OPOS=12376811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:69:70:43:43:0.380531:25:18:44:25:25:18:45:25 chr7 12391268 . T TA 303.69 PASS AF=0.47;AO=43;DP=101;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0435007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.6018;QD=12.1477;RBI=0.0455698;REFB=-0.0187508;REVB=0.0135755;RO=55;SAF=14;SAR=29;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277992;STB=0.654131;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.0237243;OID=.;OPOS=12391269;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.47:43:101:47:100:53:15:32:32:21:99:55:14:29:33:22 chr7 12391319 . G T 328.53 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00254251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.391;QD=18.0016;RBI=0.00790539;REFB=-0.0153807;REVB=0.00748538;RO=38;SAF=12;SAR=23;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269944;STB=0.650857;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0155501;OID=.;OPOS=12391319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:23:12:24:14:23:12:24:14 chr7 12393966 . A G 329.88 PASS AF=0.377358;AO=39;DP=105;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0335334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7129;QD=12.4484;RBI=0.0718694;REFB=-0.00488852;REVB=0.0635666;RO=66;SAF=21;SAR=18;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00774173;STB=0.512778;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00982887;OID=.;OPOS=12393966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:66:66:39:40:0.377358:18:21:36:30:19:21:36:30 chr7 12393974 . A C 324.3 PASS AF=0.366972;AO=40;DP=109;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.00600813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.875;QD=11.9008;RBI=0.0085587;REFB=-0.00251287;REVB=-0.00609538;RO=66;SAF=21;SAR=19;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076796;STB=0.529559;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00375122;OID=.;OPOS=12393974;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:66:69:40:40:0.366972:19:21:30:36:19:21:33:36 chr7 12394053 . G T 455.94 PASS AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0116994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.176;QD=15.3257;RBI=0.0179706;REFB=-0.0068089;REVB=-0.0136405;RO=68;SAF=27;SAR=24;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748012;STB=0.541938;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00715668;OID=.;OPOS=12394053;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:68:68:51:51:0.428571:24:27:31:37:24:27:31:37 chr7 12395813 . T C 334.99 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00343192;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7014;QD=16.5426;RBI=0.0399115;REFB=-0.0151662;REVB=-0.0397637;RO=44;SAF=22;SAR=14;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262009;STB=0.51964;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0149524;OID=.;OPOS=12395813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:45:36:36:0.444444:14:22:28:16:14:22:29:16 chr7 12400783 . C T 430.21 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00211111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.114;QD=22.6426;RBI=0.0313997;REFB=-0.0217723;REVB=-0.0313287;RO=34;SAF=27;SAR=15;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259394;STB=0.642789;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00688083;OID=.;OPOS=12400783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:15:27:11:23:15:27:11:23 chr7 12400837 . G A 1223.89 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00718154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.427;QD=61.1947;RBI=0.0139736;REFB=0;REVB=0.0119869;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12841e-05;OID=.;OPOS=12400837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:79:80:1:36:43:0:0:37:43:0:0 chr7 12401021 . C T 400.25 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0355707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.862;QD=18.6165;RBI=0.0358716;REFB=-0.0200078;REVB=0.00463635;RO=45;SAF=19;SAR=22;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065619;STB=0.536568;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0222841;OID=.;OPOS=12401021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:22:19:24:21:22:19:24:21 chr7 12406989 . C G 438.87 PASS AF=0.462264;AO=43;DP=100;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0108027;FXX=0.045041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.343;QD=16.5611;RBI=0.035707;REFB=-0.0216793;REVB=0.0340336;RO=56;SAF=30;SAR=13;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159048;STB=0.528411;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0458451;OID=.;OPOS=12406989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:106:56:57:43:49:0.462264:13:30:31:25:19:30:32:25 chr7 12409263 . C A 436.76 PASS AF=0.473118;AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00296597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.388;QD=18.7853;RBI=0.0118291;REFB=-0.0137343;REVB=-0.0114512;RO=49;SAF=18;SAR=26;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058218;STB=0.532453;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0139916;OID=.;OPOS=12409263;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:49:49:44:44:0.473118:26:18:23:26:26:18:23:26 chr7 12409327 . C T 337.69 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0660541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2404;QD=15.0084;RBI=0.0666042;REFB=0.0135159;REVB=0.00854298;RO=53;SAF=15;SAR=22;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109468;STB=0.56201;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.019707;OID=.;OPOS=12409327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:53:53:37:37:0.411111:22:15:27:26:22:15:27:26 chr7 12409522 . A G 395.9 PASS AF=0.512821;AO=38;DP=76;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00391825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.639;QD=20.3027;RBI=0.00904052;REFB=-0.0109535;REVB=-0.00814729;RO=37;SAF=18;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368319;STB=0.525628;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0092333;OID=.;OPOS=12409522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:37:38:38:40:0.512821:20:18:16:21:20:20:17:21 chr7 12409535 . A G 379.41 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00734081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.412;QD=19.2107;RBI=0.0104053;REFB=-0.0152155;REVB=-0.00737454;RO=40;SAF=21;SAR=18;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102997;STB=0.557252;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0152142;OID=.;OPOS=12409535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:18:21:17:23:18:21:17:23 chr7 12410112 . G A 638.83 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00727239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.982;QD=59.4263;RBI=0.00789969;REFB=-0.0538867;REVB=0.00308504;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509429;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000213335;OID=.;OPOS=12410112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:43:0:1:42:42:0.976744:26:16:0:0:26:16:0:1 chr7 12410362 . C T 626.32 PASS AF=0.512195;AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00938401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=348.354;QD=20.3682;RBI=0.0102495;REFB=-0.0163804;REVB=-0.00412216;RO=60;SAF=31;SAR=32;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520904;STB=0.528673;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0153117;OID=.;OPOS=12410362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:60:60:63:63:0.512195:32:31:26:34:32:31:26:34 chr7 12414725 . G A 729.59 PASS AF=0.490323;AO=74;DP=153;FAO=76;FDP=155;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.0414601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2421;QD=18.8281;RBI=0.0453501;REFB=-0.00942048;REVB=-0.0183765;RO=79;SAF=37;SAR=37;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769451;STB=0.548538;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0106608;OID=.;OPOS=12414725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:79:79:74:76:0.490323:37:37:46:33:39:37:46:33 chr7 12417407 . C T 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.158;QD=64.4154;RBI=0.0158953;REFB=0;REVB=-0.0152704;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.72779e-05;OID=.;OPOS=12417407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0 chr7 12419108 . A T 785.81 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.0893;QD=64.1474;RBI=0.0167526;REFB=0;REVB=-0.00504031;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.05576e-05;OID=.;OPOS=12419108;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0 chr7 12428529 . T G 147.06 PASS AF=0.31746;AO=19;DP=62;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0136358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2973;QD=9.33693;RBI=0.0835331;REFB=-0.00955458;REVB=0.0824126;RO=43;SAF=13;SAR=6;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23557;STB=0.612893;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0206572;OID=.;OPOS=12428529;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:43:43:19:20:0.31746:6:13:21:22:7:13:21:22 chr7 12428803 . G A 440.28 PASS AF=0.475248;AO=44;DP=98;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.00455787;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.477;QD=17.4368;RBI=0.00462185;REFB=-0.00700127;REVB=0.000766346;RO=50;SAF=20;SAR=24;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156816;STB=0.554433;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00926156;OID=.;OPOS=12428803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:101:50:53:44:48:0.475248:24:20:31:19:24:24:32:21 chr7 12433347 . C T 344.65 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00216089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.772;QD=19.1473;RBI=0.0056718;REFB=0.0125913;REVB=0.00524403;RO=36;SAF=14;SAR=22;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264383;STB=0.514698;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=-0.00937578;OID=.;OPOS=12433347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:22:14:13:23:22:14:13:23 chr7 12610594 . A G 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0286579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0203;QD=20.1599;RBI=0.0507253;REFB=-0.0279846;REVB=-0.0418542;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129841;STB=0.573188;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0157738;OID=.;OPOS=12610594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:9:7:4:10:9:7:4:10 chr7 12611252 . T C 666.88 PASS AF=0.455696;AO=72;DP=159;FAO=72;FDP=158;FR=.;FRO=86;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=36;FSRR=50;FWDB=0.0214186;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.106;QD=16.883;RBI=0.0343815;REFB=-0.0135424;REVB=0.0268948;RO=86;SAF=25;SAR=47;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750283;STB=0.541749;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0164641;OID=.;OPOS=12611252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:86:86:72:72:0.455696:47:25:36:50:47:25:36:50 chr7 12620804 . C T 411.97 PASS AF=0.423423;AO=47;DP=111;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.00310998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.301;QD=14.8457;RBI=0.00506483;REFB=0.00116659;REVB=0.00399757;RO=64;SAF=27;SAR=20;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171497;STB=0.596304;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00164309;OID=.;OPOS=12620804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:64:64:47:47:0.423423:20:27:26:38:20:27:26:38 chr7 12636026 . T C 518.63 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.482;QD=59.2722;RBI=0.0426934;REFB=0;REVB=0.0163114;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000572963;OID=.;OPOS=12636026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:33:35:1:18:15:0:0:20:15:0:0 chr7 13934358 . A T 291.44 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0344893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.01;QD=16.8949;RBI=0.0387712;REFB=-0.0220861;REVB=-0.0177114;RO=37;SAF=18;SAR=14;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123998;STB=0.569577;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0309592;OID=.;OPOS=13934358;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:14:18:16:21:14:18:16:21 chr7 13935307 . C T 253.94 PASS AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=-0.00619925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.983;QD=21.6115;RBI=0.00767935;REFB=-0.0150881;REVB=0.0045323;RO=23;SAF=5;SAR=18;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194226;STB=0.618964;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0178543;OID=.;OPOS=13935307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:18:5:2:21:18:6:2:21 chr7 14025727 . C T 958.5 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.112;QD=57.2241;RBI=0.0205456;REFB=-0.0412969;REVB=-0.0108174;RO=1;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133089;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00183499;OID=.;OPOS=14025727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:35:31:0:1:35:31:0:1 chr7 14025766 . T A 1358.56 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00782231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1746;QD=62.4623;RBI=0.0628676;REFB=0;REVB=-0.0623791;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000529265;OID=.;OPOS=14025766;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0 chr7 14050371 . A G 243.8 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0163863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.751;QD=15.2377;RBI=0.0195611;REFB=-0.0136237;REVB=0.0106828;RO=35;SAF=10;SAR=18;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451147;STB=0.519217;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0137347;OID=.;OPOS=14050371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:36:28:28:0.4375:18:10:14:21:18:10:14:22 chr7 14187931 . T C 626.27 PASS AF=0.512195;AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.00194773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0598;QD=20.3665;RBI=0.00203917;REFB=0.00257441;REVB=-0.000603798;RO=60;SAF=36;SAR=27;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259463;STB=0.514281;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=-0.00188889;OID=.;OPOS=14187931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:60:60:63:63:0.512195:27:36:36:24:27:36:36:24 chr7 14758273 . C T 2181.51 PASS AF=0.992857;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=85;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0329158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6992;QD=62.3289;RBI=0.0387088;REFB=-0.0638903;REVB=-0.0203697;RO=1;SAF=54;SAR=85;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872291;STB=0.504586;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000330489;OID=.;OPOS=14758273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:140:140:1:1:139:139:0.992857:85:54:1:0:85:54:1:0 chr7 15651691 . GT CG,GC 214.82 PASS AF=0,0.385714;AO=3,25;DP=70;FAO=0,27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=0,14;FSAR=0,13;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0931357,-0.0229454;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=27.9326,106.484;QD=12.2756;RBI=0.100051,0.0230309;REFB=-0.0335413,-0.0301192;REVB=0.0365502,0.00198325;RO=36;SAF=3,13;SAR=0,12;SRF=12;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.60349,0.19233;STB=0.5,0.546956;STBP=1,0.552;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0243968;OID=.,.;OPOS=15651691,15651692;OREF=GT,T;OALT=CG,C;OMAPALT=CG,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:70:70:36:43:3,25:0,27:0,0.385714:0,12:3,13:12:24:0,13:0,14:19:24 chr7 15651770 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2693;QD=60.2302;RBI=0.0472052;REFB=0;REVB=0.0113375;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000686099;OID=.;OPOS=15651770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0 chr7 15652068 . T G 476.17 PASS AF=0.388489;AO=54;DP=139;FAO=54;FDP=139;FR=.;FRO=85;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=-0.00298328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.09;QD=13.7027;RBI=0.0209921;REFB=-0.00904525;REVB=0.020779;RO=85;SAF=34;SAR=20;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863966;STB=0.548979;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0141081;OID=.;OPOS=15652068;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:85:85:54:54:0.388489:20:34:47:38:20:34:47:38 chr7 16129172 . A G 130.33 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.719;QD=43.4439;RBI=0.127561;REFB=0;REVB=-0.0125963;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259739;OID=.;OPOS=16129172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr7 16503932 . C G 407.96 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00167644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.647;QD=17.7376;RBI=0.0131886;REFB=-0.0122199;REVB=-0.0130816;RO=50;SAF=18;SAR=24;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108558;STB=0.560719;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0142505;OID=.;OPOS=16503932;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:24:18:27:23:24:18:27:23 chr7 16823095 . G A 708.33 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.186;QD=62.9626;RBI=0.0485455;REFB=0;REVB=-0.00711683;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.05743e-05;OID=.;OPOS=16823095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:18:27:0:0 chr7 16834551 . C A 1915.26 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.683;QD=61.7827;RBI=0.0123343;REFB=0;REVB=-0.00935975;RO=0;SAF=53;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.66488e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.33317e-07;OID=.;OPOS=16834551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:124:0:0:123:124:1:70:53:0:0:71:53:0:0 chr7 16834597 . A G 1552.5 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00392608;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.505;QD=64.0205;RBI=0.00655641;REFB=0;REVB=0.00525094;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.61968e-05;OID=.;OPOS=16834597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0 chr7 16899197 . C T 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.781;QD=63.5828;RBI=0.0330066;REFB=0;REVB=0.00436498;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97737e-05;OID=.;OPOS=16899197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr7 16913394 . A G 711.46 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0281592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.034;QD=52.7006;RBI=0.0311486;REFB=0.00791625;REVB=0.0133152;RO=2;SAF=30;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030369;STB=0.516123;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.000467718;OID=.;OPOS=16913394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:22:30:2:0:22:30:2:0 chr7 17379110 . G A 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0304282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.519;QD=17.953;RBI=0.0317953;REFB=-0.00953795;REVB=-0.00922324;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829605;STB=0.546524;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00796755;OID=.;OPOS=17379110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:15:12:15:13:15:12:15:13 chr7 17831806 . C T 997.8 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.774;QD=58.6938;RBI=0.0230145;REFB=0;REVB=0.00228353;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000735032;OID=.;OPOS=17831806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:68:0:0:65:68:1:29:36:0:0:31:37:0:0 chr7 17854532 . G T 312.92 PASS AF=0.404494;AO=34;DP=82;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.00250176;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=210.444;QD=14.064;RBI=0.0190331;REFB=-0.00791131;REVB=-0.0188679;RO=47;SAF=16;SAR=18;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908403;STB=0.572994;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0168445;OID=.;OPOS=17854532;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:89:47:53:34:36:0.404494:18:16:18:29:18:18:20:33 chr7 18067082 . A G 343.42 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00147324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.901;QD=19.3474;RBI=0.0134082;REFB=-0.0136315;REVB=-0.013327;RO=35;SAF=16;SAR=20;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661692;STB=0.536721;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0139068;OID=.;OPOS=18067082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:20:16:13:22:20:16:13:22 chr7 18067479 . ACT A 775.82 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00477792;FXX=0.0526223;HRUN=1;LEN=2;MLLD=216.753;QD=57.4684;RBI=0.00547806;REFB=0;REVB=0.00267968;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.09985e-05;OID=.;OPOS=18067480;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:54:55:54:54:0:23:31:0:0:4:0:23:31:0:0 chr7 18767343 . A G 1695.27 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.268;QD=60.5455;RBI=0.0338672;REFB=0;REVB=0.0108949;RO=0;SAF=40;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64229e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83106e-05;OID=.;OPOS=18767343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:72:40:0:0:72:40:0:0 chr7 18993870 . C T 206.14 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00607498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.445;QD=16.8279;RBI=0.0110151;REFB=0.00430041;REVB=0.00918839;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138058;STB=0.589657;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.00429196;OID=.;OPOS=18993870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:28:21:21:0.428571:13:8:14:13:13:8:15:13 chr7 19155074 . T C 341.83 PASS AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0159695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.435;QD=15.8989;RBI=0.0247771;REFB=-0.0211838;REVB=-0.0189441;RO=48;SAF=16;SAR=21;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890352;STB=0.556086;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0409899;OID=.;OPOS=19155074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:49:37:37:0.430233:21:16:25:23:21:16:26:23 chr7 20178175 . C T 962.77 PASS AF=1;AO=46;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0074684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.703;QD=57.4788;RBI=0.035037;REFB=0;REVB=0.0342318;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160936;OID=.;OPOS=20178175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:46:67:1:20:26:0:0:35:32:0:0 chr7 20180717 . C G 990.62 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.41;QD=59.1414;RBI=0.0345404;REFB=0;REVB=0.018729;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133402;OID=.;OPOS=20180717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0 chr7 20198440 . G A 1970.83 PASS AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1608;QD=62.0733;RBI=0.0414728;REFB=0;REVB=0.0216642;RO=0;SAF=69;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.02916e-05;OID=.;OPOS=20198440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:58:69:0:0:58:69:0:0 chr7 20201395 . G C 521.56 PASS AF=0.5;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.00592885;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.416;QD=19.317;RBI=0.0458899;REFB=0.00186125;REVB=-0.0455053;RO=51;SAF=27;SAR=27;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09504;STB=0.555535;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.0027751;OID=.;OPOS=20201395;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:108:51:54:54:54:0.5:27:27:31:20:27:27:33:21 chr7 20418678 . C T 793.32 PASS AF=0.431373;AO=87;DP=205;FAO=88;FDP=204;FR=.;FRO=116;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=53;FWDB=-0.00460528;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.469;QD=15.5553;RBI=0.00475976;REFB=-0.0183384;REVB=-0.0012028;RO=115;SAF=45;SAR=42;SRF=62;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224029;STB=0.518068;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0225235;OID=.;OPOS=20418678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:204:115:116:87:88:0.431373:42:45:62:53:43:45:63:53 chr7 20421475 . GA AG,G 185.48 PASS AF=0.0598291,0.401709;AO=15,30;DP=118;FAO=7,47;FDP=117;FR=.;FRO=63;FSAF=0,4;FSAR=7,43;FSRF=46;FSRR=17;FWDB=-0.00497018,0.0139763;FXX=0.0168053;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=57.4689,10.5319;QD=6.34122;RBI=0.154874,0.223565;REFB=-0.0160163,-0.0957626;REVB=-0.154795,-0.223127;RO=55;SAF=1,4;SAR=14,26;SRF=45;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.78108,-0.701015;STB=0.999021,0.899399;STBP=0,0;TYPE=mnp,del;VARB=0.12017,0.0583401;OID=.,.;OPOS=20421475,20421476;OREF=GA,A;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:118:117:55:63:15,30:7,47:0.0598291,0.401709:14,26:1,4:45:10:7,43:0,4:46:17 chr7 20421490 . T C 473.95 PASS AF=0.448276;AO=51;DP=115;FAO=52;FDP=116;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.00818685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.712;QD=16.3432;RBI=0.00997468;REFB=-0.00958012;REVB=0.00569822;RO=64;SAF=21;SAR=30;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380839;STB=0.527387;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.009823;OID=.;OPOS=20421490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:64:64:51:52:0.448276:30:21:24:40:30:22:24:40 chr7 20666235 . G C 239.55 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0740104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8861;QD=18.0796;RBI=0.0753693;REFB=-0.0288287;REVB=0.0142476;RO=27;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118443;STB=0.566423;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0340025;OID=.;OPOS=20666235;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:14:12:16:11:14:12:16:11 chr7 20685484 . C A 411.22 PASS AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=-0.0593169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1865;QD=18.482;RBI=0.0747507;REFB=-0.0152839;REVB=-0.0454882;RO=47;SAF=20;SAR=22;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171537;STB=0.595195;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0151558;OID=.;OPOS=20685484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:22:20:14:33:22:20:14:33 chr7 20698270 . A G 683.52 PASS AF=0.463087;AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.0107143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.577;QD=18.3496;RBI=0.0252179;REFB=-0.0188975;REVB=0.0228286;RO=80;SAF=30;SAR=39;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756194;STB=0.541973;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0245375;OID=.;OPOS=20698270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:80:80:69:69:0.463087:39:30:41:39:39:30:41:39 chr7 20768013 . G A 228.21 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.00749302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.414;QD=13.8309;RBI=0.0206043;REFB=-0.0120404;REVB=-0.0191935;RO=39;SAF=16;SAR=11;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245929;STB=0.514008;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0157149;OID=.;OPOS=20768013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:11:16:24:15:11:16:24:15 chr7 20778646 . G A 585.69 PASS AF=0.517241;AO=52;DP=108;FAO=60;FDP=116;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0250307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.24;QD=20.1961;RBI=0.031196;REFB=-0.0241598;REVB=-0.0186187;RO=56;SAF=26;SAR=26;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167397;STB=0.608994;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0172431;OID=.;OPOS=20778646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:116:56:56:52:60:0.517241:26:26:18:38:27:33:18:38 chr7 20822196 . A AC 493.01 PASS AF=1;AO=38;DP=43;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.2038;QD=49.301;RBI=0.177529;REFB=0;REVB=0.120765;RO=5;SAF=18;SAR=20;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706924;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00858365;OID=.;OPOS=20822197;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:38:43:40:40:0:19:21:0:0:8:5:18:20:4:1 chr7 20858986 . A G 62.19 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6355;QD=35.5367;RBI=0.119547;REFB=0;REVB=-0.0631176;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0159036;OID=.;OPOS=20858986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr7 21598500 . A G 458.5 PASS AF=0.435897;AO=51;DP=117;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.00658055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.617;QD=15.6752;RBI=0.00953927;REFB=-0.00394876;REVB=0.00690608;RO=66;SAF=31;SAR=20;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955211;STB=0.55355;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00651792;OID=.;OPOS=21598500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:66:51:51:0.435897:20:31:34:32:20:31:34:32 chr7 21599233 . C T 1396.44 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00654268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.728;QD=62.7615;RBI=0.0066093;REFB=0;REVB=0.000936047;RO=0;SAF=55;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.3709e-06;OID=.;OPOS=21599233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:33:55:0:0:33:56:0:0 chr7 21628197 . A G 2368.72 PASS AF=1;AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.687;QD=61.1282;RBI=0.0354007;REFB=0;REVB=0.016299;RO=0;SAF=86;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1796e-05;OID=.;OPOS=21628197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:155:155:0:0:155:155:1:69:86:0:0:69:86:0:0 chr7 21628237 . C T 1815.24 PASS AF=0.991736;AO=119;DP=121;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0363108;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.767;QD=60.0078;RBI=0.0363813;REFB=0.023504;REVB=-0.00226399;RO=1;SAF=54;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871488;STB=0.504586;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-6.38391e-05;OID=.;OPOS=21628237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:121:1:1:119:120:0.991736:65:54:1:0:66:54:1:0 chr7 21628242 . C G 716.72 PASS AF=0.581197;AO=68;DP=117;FAO=68;FDP=117;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00842756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.684;QD=24.5034;RBI=0.00855034;REFB=-0.0202238;REVB=-0.00144381;RO=49;SAF=34;SAR=34;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548964;STB=0.529906;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.012597;OID=.;OPOS=21628242;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:49:49:68:68:0.581197:34:34:21:28:34:34:21:28 chr7 21630982 . A G 1396.38 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4166;QD=62.7586;RBI=0.0591073;REFB=0;REVB=-0.0200959;RO=0;SAF=53;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119818;OID=.;OPOS=21630982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:36:53:0:0:36:53:0:0 chr7 21640405 . A G 2159.6 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.421;QD=63.054;RBI=0.0600498;REFB=0;REVB=0.0587482;RO=0;SAF=66;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49328e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142519;OID=.;OPOS=21640405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:71:66:0:0:71:66:0:0 chr7 21641218 . G A 747.41 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5395;QD=63.6092;RBI=0.0224324;REFB=0;REVB=-0.020828;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000168745;OID=.;OPOS=21641218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:20:26:0:0:20:27:0:0 chr7 21659645 . T C 1476.43 PASS AF=0.971429;AO=101;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0053592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7211;QD=56.245;RBI=0.0245279;REFB=-0.0100255;REVB=0.0239353;RO=3;SAF=60;SAR=41;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147377;STB=0.50784;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.000745905;OID=.;OPOS=21659645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:105:105:3:3:101:102:0.971429:41:60:1:2:41:61:1:2 chr7 21737768 . G A 818.44 PASS AF=0.525641;AO=82;DP=156;FAO=82;FDP=156;FR=.;FRO=74;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.0181683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3761;QD=20.9856;RBI=0.0321417;REFB=-0.00544336;REVB=0.0265142;RO=74;SAF=46;SAR=36;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191301;STB=0.604676;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00528547;OID=.;OPOS=21737768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:74:74:82:82:0.525641:36:46:25:49:36:46:25:49 chr7 21856151 . G A 1576.44 PASS AF=0.990654;AO=107;DP=108;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0105998;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.408;QD=58.9324;RBI=0.0256611;REFB=-0.0493851;REVB=-0.0233696;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.505493;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000126406;OID=.;OPOS=21856151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:108:107:0:1:107:106:0.990654:45:62:0:0:45:61:0:1 chr7 21893993 . G T 551.34 PASS AF=0.504425;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0024244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.917;QD=19.5165;RBI=0.0106869;REFB=-0.009608;REVB=-0.0104082;RO=55;SAF=31;SAR=26;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148531;STB=0.512952;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.006996;OID=.;OPOS=21893993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:55:56:57:57:0.504425:26:31:29:26:26:31:29:27 chr7 21901566 . T C 700.53 PASS AF=0.507353;AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0279475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.65;QD=20.6038;RBI=0.029427;REFB=-0.0136425;REVB=0.0092135;RO=67;SAF=28;SAR=41;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790649;STB=0.543565;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00968429;OID=.;OPOS=21901566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:67:67:69:69:0.507353:41:28:33:34:41:28:33:34 chr7 21924014 . A G 283.02 PASS AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0201333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.167;QD=14.8956;RBI=0.0223363;REFB=0.00323132;REVB=-0.00967266;RO=44;SAF=10;SAR=22;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24696;STB=0.640321;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00403839;OID=.;OPOS=21924014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:22:10:24:20:22:10:24:20 chr7 21932044 . C T 309.48 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00258098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.191;QD=16.077;RBI=0.00968444;REFB=-0.0149309;REVB=0.00933418;RO=43;SAF=21;SAR=13;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376275;STB=0.521204;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0100984;OID=.;OPOS=21932044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:13:21:25:18:13:21:25:18 chr7 21940816 . G A 443.51 PASS AF=0.66129;AO=40;DP=61;FAO=41;FDP=62;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00872449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.919;QD=28.6134;RBI=0.0354557;REFB=-0.0301448;REVB=0.0343655;RO=21;SAF=13;SAR=27;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135432;STB=0.565768;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0178789;OID=.;OPOS=21940816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:21:21:40:41:0.66129:27:13:11:10:27:14:11:10 chr7 21941375 . CTCCAGTG C 1111.43 PASS AF=0.906977;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=86;FR=.;FRO=8;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0307717;FXX=0;HRUN=1;LEN=7;MLLD=317.925;QD=51.6944;RBI=0.0395682;REFB=-0.0185578;REVB=0.0248746;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519851;STBP=0.243;TYPE=del;VARB=0.00179238;OID=.;OPOS=21941376;OREF=TCCAGTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.906977:77:78:78:86:8:42:36:6:2:31:0:42:35:0:0 chr7 21956405 . G A 342.59 PASS AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0173345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.698;QD=24.0411;RBI=0.0225672;REFB=-0.0150764;REVB=0.0144496;RO=23;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175925;STB=0.596651;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0212971;OID=.;OPOS=21956405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:20:14:15:8:20:14:15:8 chr7 22158386 . G A 129.42 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0390946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.823;QD=12.9417;RBI=0.0394213;REFB=-0.0306703;REVB=-0.00506449;RO=25;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449217;STB=0.526281;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0388467;OID=.;OPOS=22158386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:6:9:16:9:6:9:16:9 chr7 22197507 . A G 1422.83 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0157274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1908;QD=61.197;RBI=0.0201446;REFB=0.17313;REVB=0.0125878;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00189536;OID=.;OPOS=22197507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:0:1:91:92:0.989247:46:45:0:0:46:46:0:1 chr7 22202117 . G A 196.95 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00935596;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.968;QD=10.6457;RBI=0.0163745;REFB=-0.00381621;REVB=-0.0134384;RO=49;SAF=12;SAR=13;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111297;STB=0.506488;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00641001;OID=.;OPOS=22202117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:49:49:25:25:0.337838:13:12:24:25:13:12:24:25 chr7 22478207 . G T 1846.34 PASS AF=0.991803;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0969127;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5381;QD=60.5356;RBI=0.0999382;REFB=-0.000730242;REVB=0.0244044;RO=1;SAF=59;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079833;STB=0.504201;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00030912;OID=.;OPOS=22478207;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:122:1:1:120:121:0.991803:61:59:1:0:62:59:1:0 chr7 22532260 . A G 183.24 PASS AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.0456627;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.197;QD=9.77254;RBI=0.0471841;REFB=-0.00204078;REVB=0.0118852;RO=51;SAF=17;SAR=7;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383093;STB=0.724406;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0086846;OID=.;OPOS=22532260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:51:51:24:24:0.32:7:17:19:32:7:17:19:32 chr7 22533452 . C T 62.29 PASS AF=0.171875;AO=11;DP=64;FAO=11;FDP=64;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0619746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.58;QD=3.89332;RBI=0.0620523;REFB=-0.00207241;REVB=-0.00310608;RO=53;SAF=4;SAR=7;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00690592;STB=0.504607;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0115757;OID=.;OPOS=22533452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:64:64:53:53:11:11:0.171875:7:4:19:34:7:4:19:34 chr7 22787205 . G T 1822.5 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00380016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.796;QD=61.2606;RBI=0.0235451;REFB=0;REVB=-0.0232364;RO=0;SAF=45;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15375e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63921e-05;OID=.;OPOS=22787205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:74:45:0:0:74:45:0:0 chr7 23015831 . T C 289.54 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.000986399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1831;QD=18.9861;RBI=0.0231941;REFB=-0.00888034;REVB=0.0231731;RO=30;SAF=18;SAR=13;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187421;STB=0.60434;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0141244;OID=.;OPOS=23015831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:13:18:11:19:13:18:11:19 chr7 23157582 . A G 314.38 PASS AF=0.36;AO=36;DP=100;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.0306039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1592;QD=12.575;RBI=0.0325987;REFB=-0.0076254;REVB=0.0112284;RO=64;SAF=13;SAR=23;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209043;STB=0.620157;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0168303;OID=.;OPOS=23157582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:64:64:36:36:0.36:23:13:35:29:23:13:35:29 chr7 23164526 . C G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2244;QD=57.202;RBI=0.0292934;REFB=0;REVB=0.00899794;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000231503;OID=.;OPOS=23164526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr7 23164701 . C T 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00408652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.708;QD=64.4154;RBI=0.00943613;REFB=0;REVB=0.00850535;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07648e-05;OID=.;OPOS=23164701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0 chr7 23286355 . G GT 282.02 PASS AF=0.642857;AO=31;DP=60;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.052191;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.2586;QD=20.1443;RBI=0.0663821;REFB=-0.0291089;REVB=-0.0410204;RO=28;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162105;STB=0.525934;STBP=0.637;TYPE=ins;VARB=0.0315663;OID=.;OPOS=23286356;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.642857:31:60:36:56:20:17:19:8:12:84:28:17:14:10:18 chr7 23286525 . T C 475.33 PASS AF=0.452174;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=-0.00684862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.917;QD=16.5333;RBI=0.0171751;REFB=-0.0265229;REVB=0.0157506;RO=61;SAF=23;SAR=29;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250778;STB=0.637626;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0354517;OID=.;OPOS=23286525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:61:63:52:52:0.452174:29:23:43:18:29:23:44:19 chr7 23300255 . C T 720.36 PASS AF=0.496732;AO=74;DP=151;FAO=76;FDP=153;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.00260457;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8245;QD=18.8329;RBI=0.0340415;REFB=-0.0125864;REVB=0.0339417;RO=77;SAF=27;SAR=47;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158872;STB=0.577476;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0141709;OID=.;OPOS=23300255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:77:77:74:76:0.496732:47:27:41:36:47:29:41:36 chr7 23340617 . C T 496.01 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0351095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.666;QD=19.2627;RBI=0.035563;REFB=-0.0413626;REVB=-0.00566118;RO=32;SAF=19;SAR=29;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298368;STB=0.583596;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0207896;OID=.;OPOS=23340617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:32:46:48:48:0.466019:29:19:26:6:29:19:26:20 chr7 23351346 . CATT C 125.02 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.024034;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=3;MLLD=306.797;QD=16.669;RBI=0.0341223;REFB=0.00734904;REVB=0.0242219;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298506;STB=0.517216;STBP=0.861;TYPE=del;VARB=-0.00593863;OID=.;OPOS=23351347;OREF=ATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:14:30:14:30:16:10:4:11:5:99:16:10:4:11:5 chr7 23357321 . C T 265.22 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00602057;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.841;QD=15.375;RBI=0.00651352;REFB=-0.0101093;REVB=0.00248569;RO=39;SAF=13;SAR=17;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13044;STB=0.573721;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0105178;OID=.;OPOS=23357321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:39:39:30:30:0.434783:17:13:22:17:17:13:22:17 chr7 23624887 . G A 647.06 PASS AF=0.471429;AO=64;DP=138;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0143457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.568;QD=18.4874;RBI=0.0191743;REFB=-0.0227642;REVB=-0.0127223;RO=73;SAF=33;SAR=31;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215809;STB=0.51604;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0213036;OID=.;OPOS=23624887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:73:74:64:66:0.471429:31:33:36:37:31:35:37:37 chr7 23751736 . A G 527.3 PASS AF=0.520833;AO=50;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0132344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.56;QD=21.971;RBI=0.0132587;REFB=-0.025166;REVB=0.000802732;RO=46;SAF=15;SAR=35;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903564;STB=0.549979;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0240988;OID=.;OPOS=23751736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:46:46:50:50:0.520833:35:15:18:28:35:15:18:28 chr7 23757162 . G C 605.15 PASS AF=0.484375;AO=61;DP=127;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0227107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0949;QD=18.911;RBI=0.0297867;REFB=0.0102043;REVB=0.0192736;RO=66;SAF=35;SAR=26;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413817;STB=0.526415;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=-0.0104315;OID=.;OPOS=23757162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:66:66:61:62:0.484375:26:35:35:31:26:36:35:31 chr7 23934657 . A C 131.31 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0280845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.714;QD=14.196;RBI=0.0280845;REFB=-0.00350923;REVB=-2.49703e-05;RO=22;SAF=3;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26636;STB=0.657301;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0046458;OID=.;OPOS=23934657;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:12:3:9:13:12:3:9:13 chr7 24325009 . G A 197.57 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0153169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.262;QD=18.816;RBI=0.0154932;REFB=-0.0265679;REVB=-0.00233099;RO=22;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135421;STB=0.576846;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0428526;OID=.;OPOS=24325009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:12:8:12:10:12:8:12:10 chr7 24329133 . C T 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0147808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.633;QD=19.156;RBI=0.0335667;REFB=-0.0212191;REVB=-0.0301372;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518517;STB=0.529383;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0187178;OID=.;OPOS=24329133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:10:13:13:8:10:13 chr7 24703298 . G A 1512.14 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.5;QD=59.8867;RBI=0.0617185;REFB=0;REVB=0.0549099;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17743e-05;OID=.;OPOS=24703298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:54:46:0:0:54:47:0:0 chr7 24758753 . C T 902.68 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.902;QD=58.2371;RBI=0.0379158;REFB=0;REVB=-0.0136178;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228007;OID=.;OPOS=24758753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0 chr7 24758792 . T TC 317.82 PASS AF=1;AO=6;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.179532;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=6.62718;QD=22.303;RBI=0.180552;REFB=0;REVB=-0.0191641;RO=52;SAF=6;SAR=0;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.612661;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00299042;OID=.;OPOS=24758793;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:58:57:57:0:31:26:0:0:9:52:6:0:26:26 chr7 24758795 . T C 801.26 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.058545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.759;QD=55.2595;RBI=0.0689026;REFB=0.0412016;REVB=-0.0363326;RO=1;SAF=30;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154585;STB=0.507934;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00534613;OID=.;OPOS=24758795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:26:30:1:0:26:31:1:0 chr7 24758818 . G T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.142;QD=62.6711;RBI=0.0647895;REFB=0;REVB=-0.0582431;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.48182e-05;OID=.;OPOS=24758818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr7 24854765 . G A 1207.72 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000210728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6671;QD=61.1504;RBI=0.0201312;REFB=0;REVB=-0.0201301;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.72957e-05;OID=.;OPOS=24854765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:40:38:0:0:40:39:0:0 chr7 25181912 . T C 1468.25 PASS AF=1;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149579;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.468;QD=63.8371;RBI=0.0342588;REFB=0;REVB=0.0308209;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70771e-05;OID=.;OPOS=25181912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:92:0:0:92:92:1:47:45:0:0:47:45:0:0 chr7 25267934 . T C 107.23 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0255456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1076;QD=12.6149;RBI=0.0607551;REFB=0.00208005;REVB=0.0551235;RO=21;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290777;STB=0.673286;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000278167;OID=.;OPOS=25267934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:3:10:11:10:3:10:11:10 chr7 25267963 . G C 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8904;QD=62.3494;RBI=0.0194683;REFB=0;REVB=0.00404011;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137487;OID=.;OPOS=25267963;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0 chr7 25304395 . A G 457.42 PASS AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00059341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.234;QD=18.2967;RBI=0.000829905;REFB=-0.0112139;REVB=0.000580178;RO=52;SAF=20;SAR=26;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301161;STB=0.504869;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0103905;OID=.;OPOS=25304395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:52:54:46:46:0.46:26:20:21:31:26:20:23:31 chr7 26251843 . C T 208.79 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=69;FAO=24;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.00454837;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.623;QD=12.2816;RBI=0.00814751;REFB=-0.0194301;REVB=0.00675975;RO=42;SAF=4;SAR=14;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252584;STB=0.533305;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0509286;OID=.;OPOS=26251843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:42:42:18:24:0.352941:14:4:17:25:16:8:16:26 chr7 26252932 . CTGG C 126.53 PASS AF=0.240506;AO=19;DP=84;FAO=19;FDP=79;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.0258062;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=3;MLLD=303.104;QD=6.40666;RBI=0.0327442;REFB=-0.00917803;REVB=-0.020155;RO=63;SAF=8;SAR=11;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886778;STB=0.572687;STBP=0.479;TYPE=del;VARB=0.026369;OID=.;OPOS=26252933;OREF=TGG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.240506:19:84:19:79:60:8:11:31:29:99:63:8:11:31:32 chr7 26678789 . C A 251.99 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.114807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0635;QD=17.0838;RBI=0.117435;REFB=-0.0118551;REVB=-0.0247044;RO=29;SAF=11;SAR=17;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114913;STB=0.56592;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0064087;OID=.;OPOS=26678789;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:29:31:28:28:0.474576:17:11:15:14:17:11:16:15 chr7 26678856 . A G 1055.83 PASS AF=0.986301;AO=57;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0537415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9209;QD=57.8537;RBI=0.220888;REFB=-0.0800516;REVB=0.214251;RO=1;SAF=35;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132859;STB=0.50704;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00389279;OID=.;OPOS=26678856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:73:1:1:57:72:0.986301:22:35:1:0:37:35:1:0 chr7 26685934 . T C 1897.37 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115751;FXX=0.0387567;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4137;QD=61.2055;RBI=0.15343;REFB=0;REVB=0.152993;RO=0;SAF=75;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04499e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00316417;OID=.;OPOS=26685934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:124:0:0:121:124:1:46:75:0:0:49:75:0:0 chr7 26778406 . A G 332.77 PASS AF=0.896552;AO=25;DP=28;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0012157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.253;QD=45.899;RBI=0.0308145;REFB=-0.0368955;REVB=0.0307905;RO=3;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11091;STB=0.555513;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00153557;OID=.;OPOS=26778406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:28:29:3:3:25:26:0.896552:11:14:0:3:12:14:0:3 chr7 27135314 . C T 137.08 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6811;QD=42.1789;RBI=0.0615588;REFB=0;REVB=-0.0153531;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00388238;OID=.;OPOS=27135314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:5:8:0:0 chr7 27169093 . T G 1840.91 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.953;QD=61.3635;RBI=0.0217806;REFB=0;REVB=0.00513956;RO=0;SAF=57;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39314e-05;OID=.;OPOS=27169093;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:63:57:0:0:63:57:0:0 chr7 27196069 . A C 2653.86 PASS AF=0.988506;AO=172;DP=176;FAO=172;FDP=174;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0650564;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7584;QD=61.0084;RBI=0.0735608;REFB=-0.202595;REVB=0.0343346;RO=2;SAF=69;SAR=103;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00915195;STB=0.504807;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00181848;OID=.;OPOS=27196069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:176:174:2:2:172:172:0.988506:103:69:0:2:103:69:0:2 chr7 27196113 . C T 2929.77 PASS AF=0.964467;AO=190;DP=197;FAO=190;FDP=197;FR=.;FRO=7;FSAF=78;FSAR=112;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.062966;FXX=0.0100497;HRUN=5;LEN=1;MLLD=58.748;QD=59.4878;RBI=0.0659175;REFB=-0.0709467;REVB=0.0195039;RO=7;SAF=78;SAR=112;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00873007;STB=0.504589;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00259998;OID=.;OPOS=27196113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:197:197:7:7:190:190:0.964467:112:78:2:5:112:78:2:5 chr7 27202289 . A G 545.18 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00242448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.987;QD=57.3876;RBI=0.0450758;REFB=-0.0682908;REVB=0.0450106;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000542757;OID=.;OPOS=27202289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:20:17:0:1:20:17:0:1 chr7 27210428 . A AG 352.28 PASS AF=0.478632;AO=41;DP=119;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.120821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1256;QD=12.0439;RBI=0.145641;REFB=0.00967588;REVB=0.0813234;RO=77;SAF=19;SAR=22;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00469346;STB=0.533321;STBP=0.516;TYPE=ins;VARB=-0.00622488;OID=.;OPOS=27210429;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.478632:41:119:56:117:61:24:32:30:31:99:77:19:22:36:41 chr7 27570892 . A G 540.9 PASS AF=0.409722;AO=59;DP=144;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=0.0437951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4654;QD=15.0251;RBI=0.0457259;REFB=-0.0308114;REVB=-0.0131473;RO=85;SAF=27;SAR=32;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384283;STB=0.521609;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0398758;OID=.;OPOS=27570892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:85:85:59:59:0.409722:32:27:42:43:32:27:42:43 chr7 27702390 . C A 1572.44 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.368;QD=62.8978;RBI=0.040946;REFB=-0.0438205;REVB=0.0338549;RO=1;SAF=43;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109034;STB=0.505746;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000935003;OID=.;OPOS=27702390;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:56:43:1:0:56:43:1:0 chr7 27886171 . A G 1383.54 PASS AF=0.989011;AO=84;DP=85;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0377556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.671;QD=60.8151;RBI=0.053947;REFB=-0.0849295;REVB=0.0385331;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000697999;OID=.;OPOS=27886171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:85:91:0:1:84:90:0.989011:40:44:0:0:46:44:1:0 chr7 28319007 . T A 334.26 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00586703;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.927;QD=19.1007;RBI=0.0134584;REFB=0.00239174;REVB=0.0121123;RO=35;SAF=14;SAR=21;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527621;STB=0.529395;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=-0.00209297;OID=.;OPOS=28319007;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:21:14:16:19:21:14:16:19 chr7 28319234 . A C 246.39 PASS AF=0.519231;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0221037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6223;QD=18.9534;RBI=0.0238846;REFB=-0.0262665;REVB=0.00904971;RO=23;SAF=12;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597796;STB=0.519985;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0284458;OID=.;OPOS=28319234;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:25:26:27:0.519231:14:12:9:14:14:13:11:14 chr7 28449965 . T C 61.04 PASS AF=0.375;AO=7;DP=21;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00558045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2042;QD=10.1741;RBI=0.0145676;REFB=-0.0398163;REVB=-0.0134564;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559951;STB=0.829854;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.096567;OID=.;OPOS=28449965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:21:24:14:15:7:9:0.375:5:2:12:2:7:2:12:3 chr7 28995800 . G A 74.33 PASS AF=0.6;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0608596;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.785;QD=19.8203;RBI=0.0620682;REFB=-0.045406;REVB=0.0121887;RO=6;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504538;STB=0.799198;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0394802;OID=.;OPOS=28995800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:16:15:6:6:9:9:0.6:8:1:4:2:8:1:4:2 chr7 28996557 . C T 207.89 PASS AF=0.446809;AO=19;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.033148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.694;QD=17.6924;RBI=0.0347003;REFB=-0.0496843;REVB=0.0102627;RO=19;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139431;STB=0.567502;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0411968;OID=.;OPOS=28996557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:19:26:19:21:0.446809:8:11:8:11:8:13:13:13 chr7 28996944 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.592;QD=60.9786;RBI=0.0398045;REFB=0;REVB=0.0360626;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139629;OID=.;OPOS=28996944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr7 28997141 . G C 184.84 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0138861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9415;QD=18.4841;RBI=0.0159801;REFB=-0.0182161;REVB=-0.00790817;RO=21;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00231994;STB=0.501318;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0330445;OID=.;OPOS=28997141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:9:10:11:10:9:10:11:10 chr7 28997497 . GCCA GCA,GCAG,GGCA 954.36 PASS AF=1,0,0;AO=58,4,5;DP=67;FAO=67,0,0;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0,0;FSAR=46,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0912801,-0.181368,-0.0971081;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,2,1;MLLD=25.166,4.89352,6.49413;QD=56.9767;RBI=0.0964805,0.189438,0.149492;REFB=0,0,0;REVB=-0.0312479,-0.0547,-0.113656;RO=0;SAF=17,4,0;SAR=41,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.00239764,0,0;OID=.,.,.;OPOS=28997498,28997499,28997498;OREF=C,CA,C;OALT=-,AG,G;OMAPALT=GCA,GCAG,GGCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0,0:58,4,5:67:67,0,0:67:0:21,0,0:46,0,0:0:0:5:0:17,4,0:41,0,5:0:0 chr7 29070320 . C T 361.86 PASS AF=0.625;AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0142314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.675;QD=25.847;RBI=0.0142587;REFB=-0.0279035;REVB=0.000881833;RO=21;SAF=19;SAR=16;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131184;STB=0.507183;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0107871;OID=.;OPOS=29070320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:21:21:35:35:0.625:16:19:11:10:16:19:11:10 chr7 29186217 . G A 601.12 PASS AF=0.473282;AO=62;DP=132;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.00249876;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.114;QD=18.3547;RBI=0.0178975;REFB=-0.00477212;REVB=-0.0177222;RO=67;SAF=27;SAR=35;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679468;STB=0.530425;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00535215;OID=.;OPOS=29186217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:67:69:62:62:0.473282:35:27:34:33:35:27:34:35 chr7 29186256 . A G 574.63 PASS AF=0.504274;AO=59;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.000787689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.789;QD=19.6454;RBI=0.00639707;REFB=-0.00341141;REVB=-0.00634839;RO=58;SAF=28;SAR=31;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393083;STB=0.521681;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00343805;OID=.;OPOS=29186256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:58:58:59:59:0.504274:31:28:25:33:31:28:25:33 chr7 29186576 . A G 1507.31 PASS AF=0.989691;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00433299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.574;QD=62.1572;RBI=0.0298406;REFB=0.076951;REVB=0.0295244;RO=1;SAF=45;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938984;STB=0.504949;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=5.75e-05;OID=.;OPOS=29186576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:97:1:1:95:96:0.989691:50:45:0:1:50:46:0:1 chr7 29552213 . T C 387.82 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00298876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.732;QD=15.9926;RBI=0.0250484;REFB=-0.00401327;REVB=0.0248695;RO=56;SAF=19;SAR=22;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375512;STB=0.521159;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00656585;OID=.;OPOS=29552213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:22:19:28:28:22:19:28:28 chr7 29552939 . CTTTTTA CTTTTA,CTTTTAT 649.39 PASS AF=0.924051,0.0759494;AO=9,6;DP=81;FAO=73,6;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=23,6;FSAR=50,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.271322,-0.0876318;FXX=0.0246883;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.4198,194.401;QD=32.8806;RBI=1.10366,0.142272;REFB=0,0;REVB=1.06979,0.112081;RO=51;SAF=8,6;SAR=1,0;SRF=7;SRR=44;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.759222,0.795001;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0350291,0.0657329;OID=.,.;OPOS=29552940,29552944;OREF=T,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=CTTTTA,CTTTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.924051,0.0759494:9,6:81:73,6:79:0:23,6:50,0:0:0:21:51:8,6:1,0:7:44 chr7 29605975 . C G 274.74 PASS AF=0.92;AO=22;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.040027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4604;QD=43.9581;RBI=0.0832905;REFB=-0.00628442;REVB=0.0730421;RO=2;SAF=7;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317672;STB=0.518202;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0103708;OID=.;OPOS=29605975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:25:25:2:2:22:23:0.92:15:7:1:1:16:7:1:1 chr7 29606288 . C T 135.95 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00527566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=286.529;QD=17.542;RBI=0.00879286;REFB=-0.00537454;REVB=0.00703433;RO=16;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236024;STB=0.513496;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00664154;OID=.;OPOS=29606288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:6:9:10:6:6:9:10:6 chr7 29924072 . A G 167.02 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0526691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2526;QD=15.9063;RBI=0.123266;REFB=-0.0131265;REVB=-0.111447;RO=22;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791737;STB=0.576184;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.00904149;OID=.;OPOS=29924072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:22:24:18:18:0.428571:6:12:13:9:6:12:13:11 chr7 29927688 . C T 788.77 PASS AF=0.410138;AO=89;DP=218;FAO=89;FDP=217;FR=.;FRO=128;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=79;FSRR=49;FWDB=-0.0149294;FXX=0.00458695;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.563;QD=14.5396;RBI=0.0170038;REFB=-0.0089247;REVB=-0.00813878;RO=127;SAF=48;SAR=41;SRF=78;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079789;STB=0.546542;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0125656;OID=.;OPOS=29927688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:127:128:89:89:0.410138:41:48:78:49:41:48:79:49 chr7 29952207 . C G 526.45 PASS AF=0.607595;AO=48;DP=80;FAO=48;FDP=79;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0179937;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.582;QD=26.6555;RBI=0.0180627;REFB=-0.0416609;REVB=-0.00157686;RO=31;SAF=24;SAR=24;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812226;STB=0.544285;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.030728;OID=.;OPOS=29952207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:31:31:48:48:0.607595:24:24:12:19:24:24:12:19 chr7 30113706 . A G 1107.67 PASS AF=0.442804;AO=119;DP=271;FAO=120;FDP=271;FR=.;FRO=151;FSAF=51;FSAR=69;FSRF=62;FSRR=89;FWDB=-0.0013198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.785;QD=16.3494;RBI=0.00781997;REFB=0.00313008;REVB=-0.0077078;RO=152;SAF=51;SAR=68;SRF=62;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214041;STB=0.508229;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.00415245;OID=.;OPOS=30113706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:152:151:119:120:0.442804:68:51:62:90:69:51:62:89 chr7 30177278 . C T 2334.77 PASS AF=0.993243;AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0324052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.273;QD=63.1019;RBI=0.0343934;REFB=-0.0123849;REVB=0.0115243;RO=1;SAF=69;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605862;STB=0.503184;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00120823;OID=.;OPOS=30177278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:148:148:1:1:147:147:0.993243:78:69:0:1:78:69:0:1 chr7 30491311 . C T 273.93 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0140272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.552;QD=17.6726;RBI=0.0189512;REFB=-0.0219641;REVB=-0.0127431;RO=32;SAF=12;SAR=18;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122355;STB=0.568581;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0168332;OID=.;OPOS=30491311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:18:12:17:15:18:12:17:15 chr7 30492550 . G A 190.26 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0094672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1648;QD=21.7445;RBI=0.0210944;REFB=0.00252236;REVB=-0.0188506;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214157;STB=0.512035;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.00252621;OID=.;OPOS=30492550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:10:9:8:8:10:9:8:8 chr7 30496382 . G C 257.31 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0130946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9962;QD=13.7229;RBI=0.0491776;REFB=-0.00446879;REVB=-0.0474022;RO=45;SAF=19;SAR=11;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155537;STB=0.588819;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00751077;OID=.;OPOS=30496382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:11:19:22:23:11:19:22:23 chr7 30538651 . T C 619.88 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.61;QD=59.0357;RBI=0.0218141;REFB=-0.150458;REVB=0.00701501;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509429;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00148966;OID=.;OPOS=30538651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:15:26:0:0:15:26:1:0 chr7 30693145 . CCGGGC CCG,CGGC 103.34 PASS AF=0,0.8;AO=2,5;DP=16;FAO=0,12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=0,7;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0705973,0.123273;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=15.6576,24.6759;QD=27.5564;RBI=0.250558,0.128032;REFB=0.10652,-0.0242989;REVB=-0.240407,-0.034585;RO=6;SAF=0,4;SAR=2,1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.562437,0.429493;STB=0.5,0.615195;STBP=1,0.123;TYPE=del,del;VARB=0,0.0343779;OID=.,.;OPOS=30693148,30693146;OREF=GGC,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CCG,CGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.8:2,5:16:0,12:15:3:0,7:0,5:0:3:9:6:0,4:2,1:2:4 chr7 30791847 . C T 778.88 PASS AF=0.523179;AO=67;DP=139;FAO=79;FDP=151;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=29;FWDB=0.0283521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.956;QD=20.6327;RBI=0.0291159;REFB=-0.0385895;REVB=0.00662538;RO=72;SAF=32;SAR=35;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111698;STB=0.525541;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0235315;OID=.;OPOS=30791847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:151:72:72:67:79:0.523179:35:32:43:29:36:43:43:29 chr7 30795436 . T G 391.14 PASS AF=0.649123;AO=37;DP=57;FAO=37;FDP=57;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00410497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.909;QD=27.4483;RBI=0.0044247;REFB=-0.00413731;REVB=-0.00165143;RO=19;SAF=14;SAR=23;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419032;STB=0.510633;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00254898;OID=.;OPOS=30795436;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:19:20:37:37:0.649123:23:14:6:13:23:14:7:13 chr7 30831144 . C T 346.07 PASS AF=0.4;AO=36;DP=93;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.00519292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.02;QD=14.5714;RBI=0.0312688;REFB=-0.0207724;REVB=-0.0308346;RO=56;SAF=12;SAR=24;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144069;STB=0.517726;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0341774;OID=.;OPOS=30831144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:56:57:36:38:0.4:24:12:18:38:25:13:18:39 chr7 30915262 . CA TG 358.41 PASS AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.00974699;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.639;QD=17.0671;RBI=0.0124903;REFB=-0.0103306;REVB=-0.0078105;RO=46;SAF=18;SAR=20;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10277;STB=0.557492;STBP=0.35;TYPE=mnp;VARB=0.011893;OID=.;OPOS=30915262;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:20:18:17:29:20:18:17:29 chr7 30922572 . AC A 120.2 PASS AF=0.44186;AO=17;DP=45;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0743977;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.7162;QD=11.1817;RBI=0.119368;REFB=0.0248114;REVB=0.093347;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211213;STB=0.600937;STBP=0.288;TYPE=del;VARB=-0.0155486;OID=.;OPOS=30922573;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.44186:17:45:19:43:24:8:11:6:18:99:23:7:10:5:18 chr7 31011677 . C T 313.55 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=0.024483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0252;QD=15.4839;RBI=0.0266932;REFB=-0.0106458;REVB=0.0106353;RO=46;SAF=18;SAR=17;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252942;STB=0.641207;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.019659;OID=.;OPOS=31011677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:35:35:0.432099:17:18:35:11:17:18:35:11 chr7 31592733 . C A 1283.13 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0340539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.152;QD=60.3828;RBI=0.037039;REFB=-0.101554;REVB=0.014568;RO=1;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106442;STB=0.505617;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000464093;OID=.;OPOS=31592733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:85:85:1:1:84:84:0.988235:44:40:0:1:44:40:0:1 chr7 31611758 . G T 390.73 PASS AF=0.393162;AO=46;DP=117;FAO=46;FDP=117;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0209573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.396;QD=13.3581;RBI=0.0217088;REFB=-0.00206743;REVB=-0.00566253;RO=70;SAF=23;SAR=23;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504272;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00309039;OID=.;OPOS=31611758;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:70:71:46:46:0.393162:23:23:35:35:23:23:36:35 chr7 31617733 . T C 714.58 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.032343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2953;QD=60.8151;RBI=0.0372052;REFB=-0.0812273;REVB=-0.0183891;RO=1;SAF=31;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014927;STB=0.507933;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00212255;OID=.;OPOS=31617733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:15:31:1:0:15:31:1:0 chr7 31618008 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.764;QD=45.8064;RBI=0.100942;REFB=0;REVB=0.0439719;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175131;OID=.;OPOS=31618008;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr7 31682453 . C T 1534.14 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473865;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1123;QD=63.9226;RBI=0.0497528;REFB=0;REVB=0.015161;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631658;OID=.;OPOS=31682453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:48:48:0:0:48:48:0:0 chr7 31683410 . G A 1517.45 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465221;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.794;QD=63.8927;RBI=0.0134644;REFB=0;REVB=0.0126352;RO=0;SAF=41;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82497e-05;OID=.;OPOS=31683410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:95:0:0:94:95:1:53:41:0:0:54:41:0:0 chr7 31855578 . G A 1309.53 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520032;FXX=0.0454494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.005;QD=62.3587;RBI=0.0520207;REFB=0;REVB=-0.00134682;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143052;OID=.;OPOS=31855578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:42:41:0:0:42:42:0:0 chr7 32209425 . A G 1511.12 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00122869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.719;QD=59.8465;RBI=0.02233;REFB=0;REVB=0.0222961;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43959e-05;OID=.;OPOS=32209425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:52:48:0:0:52:49:0:0 chr7 32209459 . C T 435.35 PASS AF=0.4;AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=29;FWDB=0.0007994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.961;QD=13.9312;RBI=0.00847331;REFB=-0.0043216;REVB=0.00843552;RO=75;SAF=23;SAR=27;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161852;STB=0.591205;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00783836;OID=.;OPOS=32209459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:75:75:50:50:0.4:27:23:46:29:27:23:46:29 chr7 32338337 . G A 1321.64 PASS AF=0.977528;AO=86;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0713364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5091;QD=59.3994;RBI=0.075287;REFB=-0.0618302;REVB=0.0240676;RO=1;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101887;STB=0.510636;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00425026;OID=.;OPOS=32338337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:89:89:1:2:86:87:0.977528:46:40:0:1:46:41:0:2 chr7 32529936 . G C 380.52 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0659273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.9257;QD=52.4857;RBI=0.0664195;REFB=-0.117101;REVB=0.00807043;RO=1;SAF=12;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372036;STB=0.519986;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00162077;OID=.;OPOS=32529936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:16:12:1:0:16:12:1:0 chr7 32530105 . G C 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0649462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.46;QD=54.7462;RBI=0.0688066;REFB=0.0035376;REVB=0.0227228;RO=1;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241485;STB=0.512816;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.000354032;OID=.;OPOS=32530105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:19:34:0:1:19:34:0:1 chr7 32530198 . AA TC 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209021;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=121.65;QD=58.0611;RBI=0.0209781;REFB=0;REVB=-0.00178439;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.11011e-05;OID=.;OPOS=32530198;OREF=AA;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0 chr7 32908287 . T C 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.977;QD=56.9365;RBI=0.00467476;REFB=0;REVB=0.00254427;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.87758e-06;OID=.;OPOS=32908287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0 chr7 33385852 . C T 958.78 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211745;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.36;QD=59.0016;RBI=0.0226758;REFB=0;REVB=-0.0081136;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281727;OID=.;OPOS=33385852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0 chr7 34009946 . C T 865.58 PASS AF=0.45641;AO=89;DP=195;FAO=89;FDP=195;FR=.;FRO=106;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=67;FWDB=-0.0527696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.405;QD=17.7555;RBI=0.0582228;REFB=-0.0131028;REVB=-0.0246022;RO=104;SAF=50;SAR=39;SRF=38;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189367;STB=0.604241;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0170074;OID=.;OPOS=34009946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:104:106:89:89:0.45641:39:50:38:66:39:50:39:67 chr7 34192762 . G C 2051.99 PASS AF=1;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354314;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.791;QD=62.6562;RBI=0.0588118;REFB=0;REVB=0.0469409;RO=0;SAF=72;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178944;OID=.;OPOS=34192762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:130:131:1:58:72:0:0:59:72:0:0 chr7 34685696 . A T 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00296049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2702;QD=9.11012;RBI=0.0352347;REFB=-0.0058327;REVB=-0.0351101;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00895789;OID=.;OPOS=34685696;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:4:4:8:8:4:4:8:8 chr7 34818113 . A T 1549.23 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8948;QD=63.8856;RBI=0.0358545;REFB=0;REVB=-0.0134273;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287187;OID=.;OPOS=34818113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:45:52:0:0:45:52:0:0 chr7 34851393 . C G 286.26 PASS AF=0.492063;AO=29;DP=61;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.00352676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.521;QD=18.1753;RBI=0.0576481;REFB=-0.00814976;REVB=0.0575401;RO=32;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100094;STB=0.539911;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00696738;OID=.;OPOS=34851393;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:32:32:29:31:0.492063:16:13:11:21:18:13:11:21 chr7 34889182 . A G 333.54 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0214891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.983;QD=24.2574;RBI=0.0243224;REFB=0.00372263;REVB=-0.0113928;RO=22;SAF=13;SAR=20;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208641;STB=0.61464;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.00455227;OID=.;OPOS=34889182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:20:13:15:7:20:13:15:7 chr7 34889222 . T C 323.0 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0027936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.869;QD=21.8982;RBI=0.0476251;REFB=-0.0288898;REVB=0.0475431;RO=26;SAF=10;SAR=23;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316138;STB=0.674944;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0161209;OID=.;OPOS=34889222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:23:10:18:8:23:10:18:8 chr7 34917740 . C T 462.37 PASS AF=0.412698;AO=53;DP=126;FAO=52;FDP=126;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.00420377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2924;QD=14.6785;RBI=0.0252089;REFB=-0.037293;REVB=-0.024856;RO=72;SAF=26;SAR=27;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0309983;OID=.;OPOS=34917740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:72:74:53:52:0.412698:27:26:37:35:26:26:37:37 chr7 34932074 . G C 235.84 PASS AF=0.289474;AO=33;DP=114;FAO=33;FDP=114;FR=.;FRO=81;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.00291383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.919;QD=8.27513;RBI=0.0033673;REFB=0.00147521;REVB=-0.00168769;RO=79;SAF=18;SAR=15;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138824;STB=0.501607;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=-0.00362068;OID=.;OPOS=34932074;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:79:81:33:33:0.289474:15:18:43:36:15:18:44:37 chr7 34932102 . G A 282.72 PASS AF=0.296875;AO=38;DP=130;FAO=38;FDP=128;FR=.;FRO=90;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.0175985;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.123;QD=8.8351;RBI=0.0177346;REFB=-0.00162526;REVB=0.0021931;RO=92;SAF=19;SAR=19;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523161;STB=0.539042;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00138475;OID=.;OPOS=34932102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:128:92:90:38:38:0.296875:19:19:50:42:19:19:50:40 chr7 34932113 . T A 299.97 PASS AF=0.296296;AO=40;DP=135;FAO=40;FDP=135;FR=.;FRO=95;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=0.0138368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.322;QD=8.88795;RBI=0.0151049;REFB=-0.00775019;REVB=0.00605818;RO=95;SAF=20;SAR=20;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189334;STB=0.511106;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.020102;OID=.;OPOS=34932113;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:95:95:40:40:0.296296:20:20:49:46:20:20:49:46 chr7 34968498 . A T 989.94 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0038151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.953;QD=59.1007;RBI=0.0189948;REFB=0;REVB=0.0186077;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44571e-05;OID=.;OPOS=34968498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:28:37:0:0:28:39:0:0 chr7 35293193 . A G 249.92 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00515787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.057;QD=16.6612;RBI=0.00783511;REFB=-0.0235207;REVB=-0.00589792;RO=32;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0889054;STB=0.549965;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0283905;OID=.;OPOS=35293193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:14:14:13:19:14:14:13:19 chr7 35709842 . C T 476.52 PASS AF=0.474747;AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0216182;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3131;QD=19.2535;RBI=0.0626563;REFB=-0.00853552;REVB=-0.0588087;RO=50;SAF=19;SAR=27;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638027;STB=0.529399;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0136291;OID=.;OPOS=35709842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:50:52:46:47:0.474747:27:19:24:26:27:20:25:27 chr7 35840898 . G GC 1190.73 PASS AF=0.964286;AO=76;DP=86;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0314182;FXX=0.0117633;HRUN=0;LEN=1;MLLD=140.544;QD=56.7015;RBI=0.0314584;REFB=-0.125958;REVB=-0.00158945;RO=5;SAF=37;SAR=39;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364938;STB=0.518983;STBP=0.099;TYPE=ins;VARB=0.00188533;OID=.;OPOS=35840899;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.964286:76:86:81:84:3:38:43:3:0:7:5:37:39:4:1 chr7 36124292 . G A 203.4 PASS AF=0.329114;AO=26;DP=79;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.022403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.085;QD=10.2986;RBI=0.0225607;REFB=-0.00141476;REVB=-0.00266282;RO=53;SAF=9;SAR=17;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171183;STB=0.600325;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00447952;OID=.;OPOS=36124292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:53:53:26:26:0.329114:17:9:26:27:17:9:26:27 chr7 36320821 . G A 1656.36 PASS AF=1;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210684;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.712;QD=60.2313;RBI=0.0223443;REFB=0;REVB=0.00744236;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04702e-05;OID=.;OPOS=36320821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:110:0:0:110:110:1:58:52:0:0:58:52:0:0 chr7 36338749 . T C 1677.4 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.635;QD=60.4467;RBI=0.0291566;REFB=0;REVB=0.0227814;RO=0;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21061e-06;OID=.;OPOS=36338749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:42:69:0:0:42:69:0:0 chr7 36339269 . C G 669.93 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4293;QD=62.3188;RBI=0.0621998;REFB=0;REVB=0.0416184;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142359;OID=.;OPOS=36339269;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr7 36438709 . C G 136.15 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.014781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.919;QD=10.4728;RBI=0.0149082;REFB=0.00119259;REVB=0.00194346;RO=35;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243421;STB=0.6427;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.0030639;OID=.;OPOS=36438709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:8:9:11:24:8:9:11:24 chr7 36445856 . G A 511.15 PASS AF=0.505155;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.00554511;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.397;QD=21.0785;RBI=0.00705901;REFB=-0.0102676;REVB=-0.00436823;RO=49;SAF=26;SAR=23;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371023;STB=0.52626;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00884601;OID=.;OPOS=36445856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:49:48:49:49:0.505155:23:26:28:21:23:26:28:20 chr7 36446121 . A G 459.5 PASS AF=0.40625;AO=51;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0127451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.68;QD=14.3592;RBI=0.014219;REFB=-0.00433531;REVB=0.0063042;RO=76;SAF=21;SAR=30;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667794;STB=0.530476;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00758646;OID=.;OPOS=36446121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:76:76:51:52:0.40625:30:21:36:40:30:22:36:40 chr7 36447349 . A ACTT 184.83 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0184323;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=269.894;QD=12.12;RBI=0.0187039;REFB=-0.0150883;REVB=-0.00317616;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062367;STB=0.536051;STBP=0.677;TYPE=ins;VARB=0.0234924;OID=.;OPOS=36447350;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=ACTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.377049:23:61:23:61:38:9:14:17:21:99:38:9:14:17:21 chr7 36552729 . A AT 577.18 PASS AF=0.982456;AO=48;DP=59;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.182268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.6589;QD=40.5041;RBI=0.218745;REFB=0.132567;REVB=0.120945;RO=9;SAF=30;SAR=18;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559113;STB=0.510634;STBP=0.307;TYPE=ins;VARB=-0.00537189;OID=.;OPOS=36552730;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.982456:48:59:56:57:1:33:23:0:1:7:9:30:18:4:5 chr7 36552790 . G GT,T 1107.58 PASS AF=1,0;AO=69,4;DP=81;FAO=79,0;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39,0;FSAR=40,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0912354,0.0907993;FXX=0.0124984;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=23.226,4.54747;QD=56.0801;RBI=0.110716,0.1424;REFB=0,0;REVB=-0.0627233,-0.109696;RO=3;SAF=35,1;SAR=34,3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0125488,-0.305979;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000854864,0;OID=.,.;OPOS=36552791,36552790;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:81:79:3:0:69,4:79,0:1,0:34,3:35,1:2:1:40,0:39,0:0:0 chr7 36729757 . T C 747.62 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.348;QD=56.4242;RBI=0.027306;REFB=0;REVB=0.0187935;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185614;OID=.;OPOS=36729757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr7 36763672 . C T 385.19 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.852;QD=55.0274;RBI=0.0503706;REFB=0;REVB=0.0371389;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537258;OID=.;OPOS=36763672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:14:12:0:0:15:13:0:0 chr7 37209284 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.686;QD=56.9382;RBI=0.00918683;REFB=0;REVB=-0.00824228;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.01061e-06;OID=.;OPOS=37209284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:27:25:0:0:28:25:0:0 chr7 37355590 . C CT 391.17 PASS AF=1;AO=39;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.5179;QD=38.1632;RBI=0.083622;REFB=0;REVB=-0.0708289;RO=1;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208334;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000151501;OID=.;OPOS=37355591;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:41:41:41:0:17:24:0:0:8:1:17:22:0:1 chr7 37780799 . C A 613.52 PASS AF=0.477273;AO=63;DP=132;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.0165919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.675;QD=18.5916;RBI=0.0182656;REFB=-0.00181234;REVB=0.00763803;RO=67;SAF=23;SAR=40;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109152;STB=0.561665;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0014439;OID=.;OPOS=37780799;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:69:63:63:0.477273:40:23:32:35:40:23:33:36 chr7 37907304 . T C 306.3 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.0479858;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.687;QD=15.126;RBI=0.0536811;REFB=-0.00185117;REVB=0.024063;RO=46;SAF=26;SAR=8;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451415;STB=0.76008;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00761305;OID=.;OPOS=37907304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:46:47:34:34:0.419753:8:26:15:31:8:26:15:32 chr7 37916455 . A G 472.31 PASS AF=0.49505;AO=49;DP=100;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.000285349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.544;QD=18.7053;RBI=0.0618564;REFB=0.00403742;REVB=0.0618558;RO=51;SAF=22;SAR=27;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347325;STB=0.504423;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.004287;OID=.;OPOS=37916455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:51:51:49:50:0.49505:27:22:21:30:28:22:22:29 chr7 37936530 . T C 327.74 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00988236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.619;QD=15.2436;RBI=0.00995232;REFB=-0.00127951;REVB=0.001178;RO=50;SAF=19;SAR=17;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126154;STB=0.50713;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00404527;OID=.;OPOS=37936530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:17:19:27:23:17:19:27:23 chr7 37947103 . C T 826.76 PASS AF=0.438776;AO=84;DP=195;FAO=86;FDP=196;FR=.;FRO=110;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=61;FSRR=49;FWDB=-0.000103907;FXX=0.0150746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.829;QD=16.8727;RBI=0.000990038;REFB=-0.0216045;REVB=0.00098457;RO=110;SAF=37;SAR=47;SRF=60;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106795;STB=0.556595;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0262199;OID=.;OPOS=37947103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:110:110:84:86:0.438776:47:37:60:50:47:39:61:49 chr7 37947164 . G T 583.31 PASS AF=0.403614;AO=66;DP=165;FAO=67;FDP=166;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=54;FSRR=45;FWDB=-0.0452522;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3109;QD=14.0557;RBI=0.0600984;REFB=-0.0292696;REVB=-0.0395482;RO=96;SAF=23;SAR=43;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197486;STB=0.613577;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0250135;OID=.;OPOS=37947164;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:96:99:66:67:0.403614:43:23:51:45:43:24:54:45 chr7 37951726 . G A 665.21 PASS AF=0.482014;AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0207873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.595;QD=19.1427;RBI=0.0395072;REFB=-0.0124681;REVB=-0.0335963;RO=71;SAF=38;SAR=29;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00358367;STB=0.506112;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0308457;OID=.;OPOS=37951726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:71:72:67:67:0.482014:29:38:40:31:29:38:40:32 chr7 37951735 . G A 722.55 PASS AF=0.490196;AO=75;DP=153;FAO=75;FDP=153;FR=.;FRO=78;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=-0.00635081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.485;QD=18.8902;RBI=0.010611;REFB=-0.0318363;REVB=-0.00850058;RO=78;SAF=43;SAR=32;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327387;STB=0.518067;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0329377;OID=.;OPOS=37951735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:78:78:75:75:0.490196:32:43:42:36:32:43:42:36 chr7 37953840 . C T 608.64 PASS AF=0.388889;AO=70;DP=180;FAO=70;FDP=180;FR=.;FRO=110;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=56;FWDB=-0.0166022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0876;QD=13.5254;RBI=0.0255979;REFB=-0.0124713;REVB=-0.0194839;RO=110;SAF=20;SAR=50;SRF=54;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239234;STB=0.635698;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0161526;OID=.;OPOS=37953840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:110:110:70:70:0.388889:50:20:54:56:50:20:54:56 chr7 37988589 . C G,T 1032.62 PASS AF=0.0694444,0.930556;AO=5,63;DP=68;FAO=5,67;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=1,31;FSAR=4,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287523,0.0398795;FXX=0.0270234;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.458,167.93;QD=57.3679;RBI=0.0342407,0.0456215;REFB=0,0;REVB=0.0185938,0.0221574;RO=0;SAF=1,29;SAR=4,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0233185,0.0108431;OID=.,.;OPOS=37988589,37988589;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:68:72:0:0:5,63:5,67:0.0694444,0.930556:4,34:1,29:0:0:4,36:1,31:0:0 chr7 37991129 . C A 1462.1 PASS AF=1;AO=94;DP=97;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00479735;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.947;QD=57.3372;RBI=0.029419;REFB=0;REVB=0.0290252;RO=0;SAF=59;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06074e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130921;OID=.;OPOS=37991129;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:102:0:0:94:102:1:35:59:0:0:38:64:0:0 chr7 37991186 . C T 1877.91 PASS AF=0.961832;AO=116;DP=125;FAO=126;FDP=131;FR=.;FRO=5;FSAF=65;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0439253;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2141;QD=57.3406;RBI=0.0563382;REFB=-0.0982109;REVB=0.0352783;RO=6;SAF=59;SAR=57;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474052;STB=0.519682;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00151711;OID=.;OPOS=37991186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:125:131:6:5:116:126:0.961832:57:59:0:6:61:65:0:5 chr7 38268395 . C T 216.77 PASS AF=0.446429;AO=24;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0148972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.657;QD=15.4837;RBI=0.0162905;REFB=-0.0171037;REVB=-0.00659191;RO=31;SAF=9;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111221;STB=0.547407;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0194693;OID=.;OPOS=38268395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:24:25:0.446429:15:9:15:16:15:10:15:16 chr7 38269675 . T C 330.4 PASS AF=0.377551;AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0185298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.964;QD=13.4858;RBI=0.0255946;REFB=-0.00169557;REVB=0.0176559;RO=60;SAF=13;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148607;STB=0.590677;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00366201;OID=.;OPOS=38269675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:60:61:37:37:0.377551:24:13:29:31:24:13:30:31 chr7 38284794 . C T 103.38 PASS AF=0.147887;AO=21;DP=142;FAO=21;FDP=142;FR=.;FRO=121;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=-0.0256175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3027;QD=2.91207;RBI=0.0262786;REFB=0.00349252;REVB=-0.00585753;RO=119;SAF=13;SAR=8;SRF=59;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15697;STB=0.612275;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.0321946;OID=.;OPOS=38284794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:119:121:21:21:0.147887:8:13:59:60:8:13:59:62 chr7 38284804 . T C 101.09 PASS AF=0.14094;AO=21;DP=149;FAO=21;FDP=149;FR=.;FRO=128;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=61;FSRR=67;FWDB=0.0421096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.281;QD=2.71386;RBI=0.0443713;REFB=-0.000215947;REVB=0.0139856;RO=128;SAF=13;SAR=8;SRF=61;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179612;STB=0.622092;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00232717;OID=.;OPOS=38284804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:128:128:21:21:0.14094:8:13:61:67:8:13:61:67 chr7 38284808 . A C 100.47 PASS AF=0.139073;AO=21;DP=152;FAO=21;FDP=151;FR=.;FRO=130;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=63;FSRR=67;FWDB=0.0406801;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.398;QD=2.66138;RBI=0.0640441;REFB=-0.0040144;REVB=-0.0494649;RO=125;SAF=13;SAR=8;SRF=62;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156293;STB=0.615809;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0265566;OID=.;OPOS=38284808;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:125:130:21:21:0.139073:8:13:62:63:8:13:63:67 chr7 38284834 . A G 105.66 PASS AF=0.139394;AO=23;DP=165;FAO=23;FDP=165;FR=.;FRO=142;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=66;FSRR=76;FWDB=-0.00384328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.857;QD=2.56134;RBI=0.0253119;REFB=-0.00338069;REVB=-0.0250184;RO=138;SAF=15;SAR=8;SRF=65;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229095;STB=0.660239;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.015848;OID=.;OPOS=38284834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:138:142:23:23:0.139394:8:15:65:73:8:15:66:76 chr7 38284854 . C T 108.37 PASS AF=0.142857;AO=23;DP=161;FAO=23;FDP=161;FR=.;FRO=138;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=61;FSRR=77;FWDB=-0.00775216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.974;QD=2.69238;RBI=0.0183249;REFB=-0.00512408;REVB=-0.0166044;RO=136;SAF=16;SAR=7;SRF=61;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310455;STB=0.713572;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0268693;OID=.;OPOS=38284854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:136:138:23:23:0.142857:7:16:61:75:7:16:61:77 chr7 38289121 . C T 366.51 PASS AF=0.315068;AO=46;DP=147;FAO=46;FDP=146;FR=.;FRO=100;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=-0.0389786;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2933;QD=10.0414;RBI=0.0454743;REFB=-0.0112068;REVB=-0.0234217;RO=100;SAF=28;SAR=18;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243069;STB=0.640785;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0234532;OID=.;OPOS=38289121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:100:100:46:46:0.315068:18:28:40:60:18:28:40:60 chr7 38295958 . C T 325.27 PASS AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0513185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2914;QD=22.4327;RBI=0.0557185;REFB=-0.0288272;REVB=-0.0217016;RO=25;SAF=11;SAR=22;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154196;STB=0.585313;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0201052;OID=.;OPOS=38295958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:25:33:33:0.568966:22:11:13:12:22:11:13:12 chr7 38299727 . T C 69.94 PASS AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00394907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.09;QD=6.66055;RBI=0.020963;REFB=-0.00221132;REVB=-0.0205877;RO=30;SAF=3;SAR=7;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170876;STB=0.613166;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00925383;OID=.;OPOS=38299727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:42:42:30:32:10:10:0.238095:7:3:13:17:7:3:14:18 chr7 38305043 . T C 160.72 PASS AF=0.183544;AO=29;DP=158;FAO=29;FDP=158;FR=.;FRO=129;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=71;FSRR=58;FWDB=-0.00657587;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.973;QD=4.06877;RBI=0.00950383;REFB=-0.00778156;REVB=-0.00686154;RO=129;SAF=17;SAR=12;SRF=71;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466946;STB=0.52981;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0304031;OID=.;OPOS=38305043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:129:129:29:29:0.183544:12:17:71:58:12:17:71:58 chr7 38309102 . A C 287.56 PASS AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0052864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1872;QD=13.5322;RBI=0.040735;REFB=0.0138365;REVB=0.0403905;RO=52;SAF=23;SAR=10;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243077;STB=0.639281;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.0228528;OID=.;OPOS=38309102;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:52:52:33:33:0.388235:10:23:25:27:10:23:25:27 chr7 38331416 . C T 526.7 PASS AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00972372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.597;QD=24.4976;RBI=0.0329211;REFB=-0.0159133;REVB=-0.0314523;RO=37;SAF=19;SAR=30;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058361;STB=0.532007;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0148906;OID=.;OPOS=38331416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:30:19:17:20:30:19:17:20 chr7 38356849 . C T 547.17 PASS AF=0.595238;AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0104419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.793;QD=26.0557;RBI=0.011552;REFB=-0.0105698;REVB=0.00494108;RO=34;SAF=27;SAR=23;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297476;STB=0.516246;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0124587;OID=.;OPOS=38356849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:34:34:50:50:0.595238:23:27:17:17:23:27:17:17 chr7 38388773 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.198;QD=33.4284;RBI=0.0605464;REFB=0;REVB=-0.0456422;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208297;OID=.;OPOS=38388773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr7 38467842 . A G 723.91 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0326073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9726;QD=54.635;RBI=0.0360712;REFB=-0.0391835;REVB=-0.0154239;RO=1;SAF=23;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200378;STB=0.510634;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00535102;OID=.;OPOS=38467842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:29:23:1:0:29:23:1:0 chr7 38467923 . A G 538.52 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00705033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.094;QD=59.8351;RBI=0.0299874;REFB=0;REVB=0.0291469;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149388;OID=.;OPOS=38467923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr7 38468463 . C T 1491.04 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0699143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.713;QD=63.4483;RBI=0.0728024;REFB=0;REVB=-0.0203022;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209162;OID=.;OPOS=38468463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:49:45:0:0:49:45:0:0 chr7 38468695 . C T 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.932;QD=47.8204;RBI=0.0739043;REFB=0;REVB=-0.0408447;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201188;OID=.;OPOS=38468695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr7 38469039 . C A 801.27 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.1898;QD=57.2338;RBI=0.0859977;REFB=0;REVB=0.072837;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128933;OID=.;OPOS=38469039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0 chr7 38471840 . T C 236.26 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.014884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.821;QD=17.501;RBI=0.0242663;REFB=-0.0109767;REVB=0.0191656;RO=28;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0051818;STB=0.502913;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00849906;OID=.;OPOS=38471840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:15:11:12:16:15:11:12:16 chr7 38725804 . C T 1062.38 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.02;QD=59.8524;RBI=0.00619436;REFB=0;REVB=0.00325677;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.4494e-06;OID=.;OPOS=38725804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:29:42:0:0:29:42:0:0 chr7 38780883 . C T 2238.88 PASS AF=0.993007;AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00249674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=338.624;QD=62.6261;RBI=0.00450187;REFB=0.00155437;REVB=-0.00374608;RO=1;SAF=82;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785907;STB=0.504132;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-3.10806e-07;OID=.;OPOS=38780883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:143:143:1:1:142:142:0.993007:60:82:0:1:60:82:0:1 chr7 38780924 . T C 2691.2 PASS AF=0.983146;AO=175;DP=179;FAO=175;FDP=178;FR=.;FRO=3;FSAF=95;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0207907;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.171;QD=60.4764;RBI=0.0279088;REFB=-0.0290604;REVB=0.0186185;RO=2;SAF=95;SAR=80;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000928611;STB=0.502103;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0003688;OID=.;OPOS=38780924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:179:178:2:3:175:175:0.983146:80:95:1:1:80:95:2:1 chr7 38796570 . G A 520.05 PASS AF=0.470588;AO=56;DP=119;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=-0.0653352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.066;QD=17.4805;RBI=0.0653371;REFB=-0.0114764;REVB=-0.000497395;RO=63;SAF=23;SAR=33;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329666;STB=0.518318;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0118124;OID=.;OPOS=38796570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:63:63:56:56:0.470588:33:23:28:35:33:23:28:35 chr7 39368609 . T C 555.36 PASS AF=0.450382;AO=59;DP=131;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.010377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.436;QD=16.9575;RBI=0.014834;REFB=-0.0132732;REVB=-0.0106003;RO=71;SAF=32;SAR=27;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897833;STB=0.553701;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0183807;OID=.;OPOS=39368609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:71:72:59:59:0.450382:27:32:32:39:27:32:32:40 chr7 39472708 . A G 535.7 PASS AF=0.491379;AO=51;DP=111;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00182489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.418;QD=18.4722;RBI=0.0123462;REFB=-0.0207827;REVB=0.0122106;RO=53;SAF=39;SAR=12;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304532;STB=0.607221;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0190481;OID=.;OPOS=39472708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:116:53:59:51:57:0.491379:12:39:25:28:17:40:30:29 chr7 39472846 . G A 407.2 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.105672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.8159;QD=20.6176;RBI=0.1061;REFB=-0.0238564;REVB=-0.00952158;RO=37;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410779;STB=0.529544;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00794695;OID=.;OPOS=39472846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:37:38:41:41:0.518987:23:18:18:19:23:18:19:19 chr7 39991116 . C T 403.19 PASS AF=0.425926;AO=46;DP=108;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.064437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.431;QD=14.9328;RBI=0.0668456;REFB=-0.0380222;REVB=-0.017782;RO=62;SAF=12;SAR=34;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299258;STB=0.669214;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0833168;OID=.;OPOS=39991116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:62:62:46:46:0.425926:34:12:33:29:34:12:33:29 chr7 40314165 . G A 271.88 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0337896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.494;QD=19.4203;RBI=0.0524309;REFB=0.00471559;REVB=0.0400907;RO=27;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654384;STB=0.53644;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=-0.00227441;OID=.;OPOS=40314165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:14:15:16:11:14:15:16:11 chr7 40314243 . A G 239.95 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0102456;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.223;QD=20.4214;RBI=0.0149481;REFB=-0.00398284;REVB=-0.0108846;RO=24;SAF=17;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242144;STB=0.637373;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0042827;OID=.;OPOS=40314243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:24:24:23:23:0.489362:6:17:12:12:6:17:12:12 chr7 40899966 . CG C,CC 908.4 PASS AF=0.0634921,0.936508;AO=11,49;DP=61;FAO=4,59;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=4,46;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060786,0.0624113;FXX=0.0156226;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=215.733,224.829;QD=57.6762;RBI=0.0673616,0.0682173;REFB=0,0;REVB=0.0290285,0.0275396;RO=0;SAF=7,40;SAR=4,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.55353e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0506815,0.0016449;OID=.,.;OPOS=40899967,40899967;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0634921,0.936508:11,49:61:4,59:63:0:4,46:0,13:0:0:7:0:7,40:4,9:0:0 chr7 42003679 . T A 35.34 PASS AF=0.148148;AO=5;DP=27;FAO=4;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.147444;FXX=0;HRUN=17;LEN=1;MLLD=29.7448;QD=5.23623;RBI=0.148063;REFB=-0.00435076;REVB=-0.0135256;RO=18;SAF=4;SAR=1;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41671;STB=0.716268;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0426985;OID=.;OPOS=42003679;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:27:27:18:20:5:4:0.148148:1:4:8:10:1:3:10:10 chr7 42950640 . C T 981.9 PASS AF=1;AO=66;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134084;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.721;QD=58.621;RBI=0.0136324;REFB=0;REVB=-0.00246111;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275224;OID=.;OPOS=42950640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:67:0:0:66:67:1:38:28:0:0:38:29:0:0 chr7 42970733 . C T 1174.94 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348545;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8084;QD=61.0358;RBI=0.0401756;REFB=0;REVB=0.0199811;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110442;OID=.;OPOS=42970733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr7 42976789 . A G 2272.21 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.098;QD=63.5584;RBI=0.057511;REFB=0;REVB=0.0525935;RO=0;SAF=76;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102456;OID=.;OPOS=42976789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:143:0:0:142:143:1:66:76:0:0:66:77:0:0 chr7 42977091 . G A 761.42 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000906401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.165;QD=62.1563;RBI=0.0166341;REFB=0;REVB=0.0166093;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00390673;OID=.;OPOS=42977091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:46:49:1:28:18:0:0:29:20:0:0 chr7 43506059 . A G 246.21 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00606427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9799;QD=13.4911;RBI=0.0372534;REFB=0.00886;REVB=-0.0367565;RO=43;SAF=8;SAR=21;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287621;STB=0.659459;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.021182;OID=.;OPOS=43506059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:44:29:29:0.39726:21:8:23:20:21:8:23:21 chr7 43506158 . T C 222.03 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0222258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.25;QD=14.5596;RBI=0.0249226;REFB=-0.0110257;REVB=0.0112761;RO=35;SAF=4;SAR=22;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340048;STB=0.697007;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0234639;OID=.;OPOS=43506158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:22:4:14:21:22:4:14:21 chr7 43519337 . T C 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.237;QD=56.1903;RBI=0.0300484;REFB=0;REVB=0.0177057;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.81942e-05;OID=.;OPOS=43519337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr7 43664280 . A G 1624.36 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.403;QD=60.1617;RBI=0.016824;REFB=0;REVB=0.0119083;RO=0;SAF=61;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34571e-05;OID=.;OPOS=43664280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:47:61:0:0:47:61:0:0 chr7 43664625 . G T 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.073;QD=58.1415;RBI=0.0266138;REFB=0;REVB=0.00735202;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177812;OID=.;OPOS=43664625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:9:23:0:0:9:23:0:0 chr7 43664785 . C T 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.822;QD=64.4122;RBI=0.0431434;REFB=0;REVB=-0.0312398;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.30052e-06;OID=.;OPOS=43664785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr7 43810764 . G A 928.64 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.566;QD=58.0398;RBI=0.0263044;REFB=0;REVB=-0.0171889;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245223;OID=.;OPOS=43810764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:36:27:0:0:36:28:0:0 chr7 43846603 . A G 1137.36 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.424;QD=59.8609;RBI=0.00756492;REFB=0;REVB=0.00730556;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016494;OID=.;OPOS=43846603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:74:76:1:44:30:0:0:46:30:0:0 chr7 43916128 . C CCT 377.16 PASS AF=0.464286;AO=42;DP=94;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00672707;FXX=0.0344788;HRUN=3;LEN=2;MLLD=298.641;QD=17.9598;RBI=0.00677826;REFB=-0.0158265;REVB=0.000831428;RO=52;SAF=23;SAR=19;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660987;STB=0.536567;STBP=0.53;TYPE=ins;VARB=0.0171081;OID=.;OPOS=43916129;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.464286:42:94:39:84:45:20:19:20:25:99:52:23:19:25:27 chr7 43916138 . C G 452.39 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0393119;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.399;QD=19.4575;RBI=0.0397628;REFB=-0.00317106;REVB=-0.00597162;RO=48;SAF=25;SAR=20;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109478;STB=0.560832;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00298695;OID=.;OPOS=43916138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:48:48:45:45:0.483871:20:25:21:27:20:25:21:27 chr7 43916727 . T G 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.00565445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8578;QD=17.8274;RBI=0.00573911;REFB=0.0103155;REVB=0.000982161;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211399;STB=0.619973;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0139755;OID=.;OPOS=43916727;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:7:5:2:9:7:5:2:9 chr7 43917013 . G A 638.63 PASS AF=0.477941;AO=65;DP=136;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.0370686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.462;QD=18.7831;RBI=0.0374627;REFB=-0.00695967;REVB=0.00541981;RO=70;SAF=39;SAR=26;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174219;STB=0.592892;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0094858;OID=.;OPOS=43917013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:70:71:65:65:0.477941:26:39:29:41:26:39:30:41 chr7 43917274 . A G 159.43 PASS AF=0.372549;AO=14;DP=53;FAO=19;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.063132;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4784;QD=12.5041;RBI=0.0789007;REFB=-0.0116268;REVB=-0.0473251;RO=19;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168911;STB=0.622522;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0291251;OID=.;OPOS=43917274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:51:19:32:14:19:0.372549:5:9:15:4:9:10:23:9 chr7 43982482 . A C 1804.17 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.138;QD=61.1582;RBI=0.0262826;REFB=0;REVB=0.026181;RO=0;SAF=51;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.14594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77964e-05;OID=.;OPOS=43982482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:67:51:0:0:67:51:0:0 chr7 44027348 . A G 1493.18 PASS AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0443701;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7393;QD=58.5562;RBI=0.0529993;REFB=0.0131852;REVB=-0.0289866;RO=1;SAF=60;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114303;STB=0.506023;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.000538642;OID=.;OPOS=44027348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:102:1:1:101:101:0.990196:41:60:0:1:41:60:0:1 chr7 44047066 . T C 575.77 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00628057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.373;QD=60.6076;RBI=0.00735328;REFB=0;REVB=0.00382428;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.61503e-05;OID=.;OPOS=44047066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:24:13:0:0:24:14:0:0 chr7 44147485 . C A 255.07 PASS AF=1;AO=19;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150603;FXX=0.0908678;HRUN=5;LEN=1;MLLD=127.119;QD=51.0146;RBI=0.0156599;REFB=0;REVB=0.00429166;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0087936;OID=.;OPOS=44147485;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:20:0:0:19:20:1:12:7:0:0:13:7:0:0 chr7 44148553 . A G 1380.82 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624814;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.813;QD=62.7646;RBI=0.062514;REFB=0;REVB=-0.00201784;RO=0;SAF=32;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.82247e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.37762e-05;OID=.;OPOS=44148553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:56:32:0:0:56:32:0:0 chr7 44180079 . A AG 339.11 PASS AF=1;AO=33;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0505664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.6451;QD=33.9109;RBI=0.0687035;REFB=0;REVB=-0.0465104;RO=8;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14315;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00173604;OID=.;OPOS=44180080;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:33:41:40:40:0:11:29:0:0:7:8:11:22:0:8 chr7 44258953 . T G 101.73 PASS AF=0.220779;AO=16;DP=77;FAO=17;FDP=77;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=59;FSRR=1;FWDB=0.000898051;FXX=0;HRUN=20;LEN=1;MLLD=120.766;QD=5.28483;RBI=0.0370615;REFB=-0.00788896;REVB=-0.0370506;RO=61;SAF=11;SAR=5;SRF=60;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.616649;STB=0.831209;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00910884;OID=.;OPOS=44258953;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:61:60:16:17:0.220779:5:11:60:1:5:12:59:1 chr7 44259706 . G A 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00145527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.892;QD=19.5231;RBI=0.00590885;REFB=-0.00739364;REVB=-0.00572684;RO=12;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416551;STB=0.523775;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00852182;OID=.;OPOS=44259706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:11:3:3:9:11:3:3:9 chr7 44259871 . C T 187.91 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0220968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.456;QD=20.3145;RBI=0.0268268;REFB=-0.0112472;REVB=-0.0152122;RO=18;SAF=15;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.460057;STB=0.760907;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0177516;OID=.;OPOS=44259871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:4:15:5:13:4:15:5:13 chr7 44282868 . A G 273.33 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0544303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.644;QD=17.6342;RBI=0.0545046;REFB=-0.0303765;REVB=0.0028447;RO=32;SAF=13;SAR=17;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552241;STB=0.530885;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0193666;OID=.;OPOS=44282868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:17:13:12:20:17:13:12:20 chr7 44282877 . A G 275.62 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0115209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.667;QD=18.0731;RBI=0.0170924;REFB=-0.0227469;REVB=-0.0126261;RO=30;SAF=13;SAR=17;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305206;STB=0.52406;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0224092;OID=.;OPOS=44282877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:31:30:30:0.491803:17:13:12:18:17:13:12:19 chr7 44282928 . G A 219.6 PASS AF=0.44898;AO=19;DP=46;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00207559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.232;QD=17.9264;RBI=0.0953702;REFB=-0.0126087;REVB=0.0953476;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413986;STB=0.567505;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0159326;OID=.;OPOS=44282928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:26:27:19:22:0.44898:11:8:12:14:14:8:13:14 chr7 44284564 . A G 706.82 PASS AF=0.452381;AO=76;DP=168;FAO=76;FDP=168;FR=.;FRO=92;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=55;FWDB=0.00251382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.761;QD=16.8292;RBI=0.00785386;REFB=-0.00771756;REVB=0.00744069;RO=92;SAF=30;SAR=46;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00765488;STB=0.504253;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00974173;OID=.;OPOS=44284564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:92:92:76:76:0.452381:46:30:37:55:46:30:37:55 chr7 44442296 . A C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.317;QD=60.6101;RBI=0.0240905;REFB=0;REVB=0.0165219;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162195;OID=.;OPOS=44442296;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr7 44606098 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0697623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.435;QD=35.5757;RBI=0.0711664;REFB=0;REVB=0.0140669;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166969;OID=.;OPOS=44606098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr7 44608718 . C T 239.69 PASS AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0705749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6448;QD=43.5806;RBI=0.0858873;REFB=-0.179032;REVB=0.048947;RO=2;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173342;STB=0.509424;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0175027;OID=.;OPOS=44608718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:2:2:20:20:0.909091:12:8:1:1:12:8:1:1 chr7 44620836 . C A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.336;QD=50.4135;RBI=0.0542845;REFB=0;REVB=0.0048244;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033618;OID=.;OPOS=44620836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr7 44747499 . G A 272.77 PASS AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00639656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.75;QD=45.4614;RBI=0.00640542;REFB=-0.060665;REVB=0.000336789;RO=2;SAF=13;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659543;STB=0.535682;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0198073;OID=.;OPOS=44747499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:9:13:2:0:9:13:2:0 chr7 44748451 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.991;QD=43.4862;RBI=0.00534883;REFB=0;REVB=0.00404293;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17262e-06;OID=.;OPOS=44748451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr7 44798954 . G GC 31.12 PASS AF=0.421053;AO=3;DP=20;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.101584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=10.9395;QD=6.5523;RBI=0.131342;REFB=-0.111207;REVB=0.083254;RO=16;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210722;STB=0.567382;STBP=0.796;TYPE=ins;VARB=0.115581;OID=.;OPOS=44798955;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421053:3:20:8:19:11:1:7:2:9:31:16:1:2:3:13 chr7 44836314 . A G 344.17 PASS AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0142924;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5562;QD=16.1963;RBI=0.0222818;REFB=-0.0172663;REVB=0.017094;RO=48;SAF=21;SAR=16;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263404;STB=0.514831;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0240851;OID=.;OPOS=44836314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:0.435294:16:21:26:22:16:21:26:22 chr7 44919200 . G A 55.48 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00799274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1243;QD=10.5681;RBI=0.0262544;REFB=0.00122895;REVB=0.0250082;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752617;STB=0.545344;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=-0.000136786;OID=.;OPOS=44919200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:4:9:5:3:4:9 chr7 44924627 . A C 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0682753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4548;QD=13.9588;RBI=0.0725615;REFB=-0.000208215;REVB=0.0245693;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252798;STB=0.65172;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00455462;OID=.;OPOS=44924627;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:5:2:4:3:5:2:4:3 chr7 45004063 . T C 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.968;QD=56.9567;RBI=0.0279181;REFB=0;REVB=0.0251237;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40609e-05;OID=.;OPOS=45004063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr7 45009325 . G A 223.12 PASS AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00616462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.703;QD=16.5271;RBI=0.0328793;REFB=-0.0203863;REVB=0.0322962;RO=29;SAF=17;SAR=8;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318538;STB=0.679856;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0186544;OID=.;OPOS=45009325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:8:17:10:19:8:17:10:19 chr7 45009341 . A G 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.942;QD=58.0605;RBI=0.0127655;REFB=0;REVB=-0.00591387;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139741;OID=.;OPOS=45009341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0 chr7 45009723 . G A 246.06 PASS AF=1;AO=17;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.549;QD=49.2121;RBI=0.0597308;REFB=0;REVB=-0.0295634;RO=1;SAF=12;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366754;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374391;OID=.;OPOS=45009723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:1:0:17:20:1:5:12:1:0:5:15:0:0 chr7 45011343 . T A 276.85 PASS AF=0.339806;AO=35;DP=104;FAO=35;FDP=103;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=0.00546452;FXX=0.0373797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.05;QD=10.7515;RBI=0.00601497;REFB=-0.00417632;REVB=0.00251375;RO=64;SAF=25;SAR=10;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187977;STB=0.593694;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00790596;OID=.;OPOS=45011343;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:64:68:35:35:0.339806:10:25:36:28:10:25:40:28 chr7 45023503 . T A 203.22 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0122021;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.671;QD=15.6324;RBI=0.0183781;REFB=0.00327112;REVB=-0.0137427;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114669;STB=0.565161;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.00477517;OID=.;OPOS=45023503;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:29:29:23:23:0.442308:10:13:13:16:10:13:13:16 chr7 45113170 . G A 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0284666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.248;QD=12.73;RBI=0.0495086;REFB=0.00879904;REVB=0.0405061;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00802798;OID=.;OPOS=45113170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:6:6:5:4:6:6 chr7 45122464 . A C 204.51 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00684626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.434;QD=22.7238;RBI=0.0226761;REFB=-0.00793969;REVB=0.0216179;RO=16;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199272;STB=0.611005;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00311965;OID=.;OPOS=45122464;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:10:10:12:4:10:10:12:4 chr7 45122723 . G A 240.3 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0101612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1262;QD=21.3599;RBI=0.0500827;REFB=-0.0246475;REVB=0.0490411;RO=22;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591953;STB=0.533304;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0316326;OID=.;OPOS=45122723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:16:7:8:14:16:7:8:14 chr7 45123090 . G A 108.86 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0277687;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.624;QD=24.1899;RBI=0.0462231;REFB=-0.00185984;REVB=0.0369524;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334867;STB=0.687213;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.000693287;OID=.;OPOS=45123090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:6:0:7:5:6:0 chr7 45124008 . T C 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00506978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.9505;QD=11.1972;RBI=0.0472367;REFB=0.00914807;REVB=0.0469639;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911075;STB=0.554364;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.011045;OID=.;OPOS=45124008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:7:5:11:11:7:5:11:11 chr7 45124286 . A G 124.69 PASS AF=0.306122;AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.000941464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.854;QD=10.1786;RBI=0.0527049;REFB=-0.0151225;REVB=-0.0526965;RO=34;SAF=8;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00454737;STB=0.502729;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0320034;OID=.;OPOS=45124286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:34:34:15:15:0.306122:7:8:18:16:7:8:18:16 chr7 45124465 . A T 75.14 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00399843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.31;QD=11.1312;RBI=0.00549253;REFB=-0.0161164;REVB=0.00376569;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101015;STB=0.592414;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.021722;OID=.;OPOS=45124465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:15:17:10:10:0.37037:5:5:9:6:5:5:11:6 chr7 45148667 . G A 277.77 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00656524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.261;QD=20.5758;RBI=0.0200766;REFB=-0.0169158;REVB=-0.0189728;RO=24;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261428;STB=0.522682;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0141292;OID=.;OPOS=45148667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:24:25:29:29:0.537037:16:13:10:14:16:13:10:15 chr7 45148773 . C A 198.87 PASS AF=0.444444;AO=18;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.00714;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.812;QD=17.6771;RBI=0.029692;REFB=-0.0195708;REVB=-0.0288207;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162152;STB=0.57136;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0207424;OID=.;OPOS=45148773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:18:25:18:20:0.444444:11:7:4:14:12:8:7:18 chr7 45703971 . G A 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.624;QD=62.3144;RBI=0.0450917;REFB=0;REVB=0.0421122;RO=0;SAF=34;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113201;OID=.;OPOS=45703971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:52:34:0:0:52:34:0:0 chr7 45765234 . G T 536.2 PASS AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0013329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0338;QD=54.995;RBI=0.0246011;REFB=-0.143573;REVB=-0.024565;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.523797;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0114493;OID=.;OPOS=45765234;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:39:39:1:2:37:37:0.948718:20:17:0:1:20:17:0:2 chr7 46732428 . A G 1482.84 PASS AF=0.979381;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000588733;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.966;QD=61.1481;RBI=0.00286789;REFB=-0.13734;REVB=0.00280681;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500544;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000439303;OID=.;OPOS=46732428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:97:97:0:2:95:95:0.979381:45:50:0:0:45:50:1:1 chr7 47323456 . A G 575.96 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.181;QD=60.6272;RBI=0.0192313;REFB=0;REVB=0.0124308;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240155;OID=.;OPOS=47323456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:28:9:0:0:29:9:0:0 chr7 47481602 . G A 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.538;QD=58.1419;RBI=0.0211063;REFB=0;REVB=0.00303801;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119641;OID=.;OPOS=47481602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0 chr7 47851623 . C T 310.01 PASS AF=0.542373;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0161681;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.078;QD=21.0176;RBI=0.0316757;REFB=0.0153281;REVB=-0.0272386;RO=26;SAF=11;SAR=21;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105544;STB=0.564065;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.005933;OID=.;OPOS=47851623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:26:27:32:32:0.542373:21:11:6:20:21:11:6:21 chr7 47852837 . C T 828.6 PASS AF=0.580153;AO=76;DP=133;FAO=76;FDP=131;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00284156;FXX=0.0223864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.932;QD=25.3007;RBI=0.0029409;REFB=-0.00419173;REVB=0.0007579;RO=55;SAF=28;SAR=48;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259506;STB=0.506023;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00288872;OID=.;OPOS=47852837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:131:55:55:76:76:0.580153:48:28:22:33:48:28:21:34 chr7 47854956 . C T 1154.99 PASS AF=0.481928;AO=117;DP=251;FAO=120;FDP=249;FR=.;FRO=129;FSAF=70;FSAR=50;FSRF=63;FSRR=66;FWDB=0.0129053;FXX=0.0158097;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.888;QD=18.554;RBI=0.0293154;REFB=-0.0346897;REVB=0.0263219;RO=114;SAF=70;SAR=47;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583758;STB=0.549755;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0281005;OID=.;OPOS=47854956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:249:114:129:117:120:0.481928:47:70:61:53:50:70:63:66 chr7 47872845 . A G 1374.58 PASS AF=0.988889;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0256261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9291;QD=61.0925;RBI=0.0456377;REFB=-0.0826414;REVB=0.0377638;RO=1;SAF=47;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997626;STB=0.505262;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.000793944;OID=.;OPOS=47872845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:90:1:1:88:89:0.988889:41:47:1:0:42:47:1:0 chr7 47879049 . G A 1114.57 PASS AF=0.530303;AO=104;DP=198;FAO=105;FDP=198;FR=.;FRO=93;FSAF=68;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=-0.00205304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.906;QD=22.5166;RBI=0.00314975;REFB=-0.00797985;REVB=0.00238872;RO=90;SAF=67;SAR=37;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137386;STB=0.580247;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00834543;OID=.;OPOS=47879049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:90:93:104:105:0.530303:37:67:44:46:37:68:45:48 chr7 47913579 . T C 1116.91 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.663;QD=60.3734;RBI=0.0251232;REFB=0;REVB=0.019733;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.12887e-06;OID=.;OPOS=47913579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0 chr7 47925331 . C G 1177.92 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.839;QD=60.4062;RBI=0.0560789;REFB=0;REVB=0.0210733;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19824e-05;OID=.;OPOS=47925331;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:78:0:0:75:78:1:43:32:0:0:44:34:0:0 chr7 47968927 . C A 728.28 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.348;QD=63.3284;RBI=0.0418083;REFB=0;REVB=0.0304342;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131651;OID=.;OPOS=47968927;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:15:30:0:0:16:30:0:0 chr7 47971575 . A G 1098.72 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.25;QD=60.2039;RBI=0.034684;REFB=0;REVB=-0.00213046;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43674e-05;OID=.;OPOS=47971575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0 chr7 48004962 . C T 593.17 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.433;QD=60.8376;RBI=0.0145658;REFB=0;REVB=-0.00352375;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.19426e-05;OID=.;OPOS=48004962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0 chr7 48086077 . C T 756.09 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000639202;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.322;QD=57.0632;RBI=0.00624643;REFB=0;REVB=0.00621364;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.64269e-05;OID=.;OPOS=48086077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0 chr7 48086161 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.893;QD=59.0184;RBI=0.0325687;REFB=0;REVB=0.031979;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190771;OID=.;OPOS=48086161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0 chr7 48089542 . T C 1225.03 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.85;QD=61.2513;RBI=0.0622893;REFB=0;REVB=0.0098473;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173777;OID=.;OPOS=48089542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:75:80:0:0:75:80:1:39:36:0:0:39:41:0:0 chr7 48089571 . C A 1016.29 PASS AF=0.946667;AO=51;DP=74;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0396497;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=186.294;QD=54.2019;RBI=0.0401172;REFB=-0.0889255;REVB=-0.00610657;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517791;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.000877349;OID=.;OPOS=48089571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:74:75:0:4:51:71:0.946667:39:12:0:0:41:30:3:1 chr7 48092486 . T C 447.0 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.591;QD=57.6774;RBI=0.0498778;REFB=0;REVB=0.0216348;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021865;OID=.;OPOS=48092486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr7 48285485 . C T 1886.68 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.276;QD=61.3556;RBI=0.0112938;REFB=0;REVB=-0.00505537;RO=0;SAF=70;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84362e-05;OID=.;OPOS=48285485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:52:70:0:0:53:70:0:0 chr7 48312674 . G A 1542.85 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020896;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.686;QD=59.9164;RBI=0.0246002;REFB=0;REVB=-0.0129818;RO=0;SAF=48;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00346635;OID=.;OPOS=48312674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:53:48:0:0:54:49:0:0 chr7 48315796 . C A 832.64 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.722;QD=57.4237;RBI=0.0275046;REFB=0;REVB=0.0263518;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191737;OID=.;OPOS=48315796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0 chr7 48318811 . C T 654.84 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126751;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.626;QD=62.3659;RBI=0.0139406;REFB=0;REVB=0.00580365;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.05202e-05;OID=.;OPOS=48318811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr7 48321010 . G A 408.79 PASS AF=0.5;AO=32;DP=85;FAO=42;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0148825;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.22;QD=19.4662;RBI=0.0428872;REFB=-0.0325432;REVB=0.0402222;RO=42;SAF=21;SAR=11;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186657;STB=0.535778;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0405908;OID=.;OPOS=48321010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:42:42:32:42:0.5:11:21:20:22:19:23:20:22 chr7 48336844 . C T 1610.01 PASS AF=1;AO=106;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0763552;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3769;QD=60.1871;RBI=0.0788135;REFB=0;REVB=0.0195307;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.06709e-06;OID=.;OPOS=48336844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:107:0:0:106:107:1:50:56:0:0:50:57:0:0 chr7 48443570 . G A 407.9 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0072125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4221;QD=20.6531;RBI=0.00741006;REFB=0.00169029;REVB=-0.00169965;RO=37;SAF=17;SAR=24;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626802;STB=0.541672;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.00101043;OID=.;OPOS=48443570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:37:38:41:41:0.518987:24:17:18:19:24:17:19:19 chr7 48450157 . T C 831.34 PASS AF=0.509091;AO=84;DP=165;FAO=84;FDP=165;FR=.;FRO=81;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.0043973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.947;QD=20.1538;RBI=0.00891342;REFB=-0.021548;REVB=-0.00775324;RO=81;SAF=40;SAR=44;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473624;STB=0.502602;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0175966;OID=.;OPOS=48450157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:81:81:84:84:0.509091:44:40:39:42:44:40:39:42 chr7 48545976 . A G 1788.97 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00238428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.399;QD=60.6432;RBI=0.016647;REFB=0;REVB=0.0164753;RO=0;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87092e-05;OID=.;OPOS=48545976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:117:118:1:50:67:0:0:51:67:0:0 chr7 48964322 . G T 1643.42 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00350879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.279;QD=59.7606;RBI=0.0112577;REFB=0;REVB=0.0106969;RO=0;SAF=69;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89526e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113427;OID=.;OPOS=48964322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:110:0:0:108:110:1:39:69:0:0:41:69:0:0 chr7 48964751 . G A 651.23 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00113929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.158;QD=62.022;RBI=0.0115756;REFB=0;REVB=-0.0115194;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.71096e-05;OID=.;OPOS=48964751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:19:23:0:0 chr7 48965000 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.61;QD=57.1062;RBI=0.027882;REFB=0;REVB=0.0155816;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.03046e-05;OID=.;OPOS=48965000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0 chr7 50173777 . A G 306.04 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00846676;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=171.89;QD=20.4024;RBI=0.0233316;REFB=0.00421138;REVB=0.0217412;RO=28;SAF=17;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376856;STB=0.502091;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=-0.0031985;OID=.;OPOS=50173777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:15:17:15:13:15:17:15:13 chr7 50175681 . C T 637.47 PASS AF=0.474453;AO=64;DP=134;FAO=65;FDP=137;FR=.;FRO=72;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.00373632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.153;QD=18.6123;RBI=0.00395668;REFB=-0.00605365;REVB=-0.00130202;RO=70;SAF=40;SAR=24;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943146;STB=0.554896;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0096484;OID=.;OPOS=50175681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:137:70:72:64:65:0.474453:24:40:37:33:25:40:37:35 chr7 50180972 . C T 339.48 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0142083;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.793;QD=14.4461;RBI=0.0157601;REFB=-0.0112651;REVB=-0.00681951;RO=51;SAF=18;SAR=19;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104241;STB=0.577036;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0142325;OID=.;OPOS=50180972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:51:57:37:37:0.393617:19:18:30:21:19:18:35:22 chr7 50436033 . A G 391.74 PASS AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0309287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.293;QD=19.345;RBI=0.0309645;REFB=-0.0155914;REVB=0.00148729;RO=40;SAF=19;SAR=21;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505879;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0143683;OID=.;OPOS=50436033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:41:40:40:0.493827:21:19:19:21:21:19:19:22 chr7 50611735 . T C 1576.71 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00165756;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7395;QD=60.0652;RBI=0.0060523;REFB=0;REVB=-0.0058209;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496875;OID=.;OPOS=50611735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:105:0:0:105:105:1:55:50:0:0:55:50:0:0 chr7 50660438 . T C 1245.15 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.573;QD=61.4889;RBI=0.0183141;REFB=0;REVB=0.0107258;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60477e-05;OID=.;OPOS=50660438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:35:45:0:0:35:46:0:0 chr7 50673029 . T C 819.05 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510681;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.963;QD=57.4771;RBI=0.0250607;REFB=0;REVB=0.0245348;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51283e-05;OID=.;OPOS=50673029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:56:57:1:36:20:0:0:37:20:0:0 chr7 51096036 . G C 170.28 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0207105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6968;QD=17.0276;RBI=0.0212483;REFB=-0.017364;REVB=-0.00475023;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225419;STB=0.628278;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0129208;OID=.;OPOS=51096036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:15:7:10:8:15:7 chr7 51096974 . C T 960.65 PASS AF=0.516484;AO=94;DP=182;FAO=94;FDP=182;FR=.;FRO=88;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=0.011199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.769;QD=21.1132;RBI=0.0117824;REFB=-0.0204227;REVB=-0.00366171;RO=88;SAF=54;SAR=40;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260439;STB=0.514283;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0210778;OID=.;OPOS=51096974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:88:88:94:94:0.516484:40:54:48:40:40:54:48:40 chr7 51097063 . T G 1844.15 PASS AF=1;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166759;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.063;QD=61.4715;RBI=0.0307512;REFB=0;REVB=0.025837;RO=0;SAF=61;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62368e-05;OID=.;OPOS=51097063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:120:0:0:120:120:1:59:61:0:0:59:61:0:0 chr7 51098567 . GTCT G 666.65 PASS AF=0.464516;AO=68;DP=158;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=0.00270873;FXX=0.0189861;HRUN=1;LEN=3;MLLD=260.006;QD=17.2038;RBI=0.00531324;REFB=-0.00829663;REVB=0.00457092;RO=81;SAF=29;SAR=39;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019124;STB=0.52554;STBP=0.56;TYPE=del;VARB=0.00968352;OID=.;OPOS=51098568;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.464516:68:158:72:155:83:32:40:33:50:99:81:29:39:33:48 chr7 51287470 . A G 708.52 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2543;QD=62.9798;RBI=0.0197547;REFB=0;REVB=-0.00999128;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228008;OID=.;OPOS=51287470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr7 53103371 . G T 1017.27 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8392;QD=58.1299;RBI=0.101321;REFB=-0.0692637;REVB=0.09382;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00284144;OID=.;OPOS=53103371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:70:70:0:0:69:70:1:39:30:0:0:40:30:0:0 chr7 53103382 . G T 1242.06 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.301;QD=61.3361;RBI=0.0713105;REFB=0;REVB=0.062287;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170466;OID=.;OPOS=53103382;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:49:31:0:0:50:31:0:0 chr7 53103673 . C A 659.41 PASS AF=0.943396;AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00227172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.219;QD=49.7666;RBI=0.0272769;REFB=-0.139567;REVB=0.0271821;RO=2;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03761;STB=0.50943;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00111592;OID=.;OPOS=53103673;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:53:53:2:3:49:50:0.943396:24:25:0:2:25:25:2:1 chr7 53104078 . G A 1415.4 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.559;QD=62.9065;RBI=0.0286098;REFB=0;REVB=0.0206448;RO=0;SAF=28;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66511e-05;OID=.;OPOS=53104078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:62:28:0:0:62:28:0:0 chr7 53557963 . A G 1411.03 PASS AF=0.989011;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0250056;FXX=0.0319115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.464;QD=62.0233;RBI=0.0254797;REFB=-0.156161;REVB=0.00489214;RO=1;SAF=45;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104156;STB=0.505375;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000426886;OID=.;OPOS=53557963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:91:1:1:89:90:0.989011:44:45:1:0:44:46:1:0 chr7 53558015 . G T 1523.19 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.063;QD=58.5842;RBI=0.0487035;REFB=-0.0812672;REVB=0.0474132;RO=1;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854954;STB=0.504504;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00018887;OID=.;OPOS=53558015;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:55:48:0:1:55:48:0:1 chr7 54614698 . C CG 451.51 PASS AF=1;AO=41;DP=59;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.154785;FXX=0.0555453;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.0707;QD=35.4124;RBI=0.177645;REFB=-0.0230586;REVB=0.0871737;RO=17;SAF=18;SAR=23;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00761223;OID=.;OPOS=54614699;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:41:59:51:51:0:24:27:0:0:6:17:18:23:7:10 chr7 55229255 . G A 775.0 PASS AF=0.558824;AO=72;DP=132;FAO=76;FDP=136;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.037476;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6869;QD=22.7942;RBI=0.0444921;REFB=-0.0162424;REVB=0.0239811;RO=59;SAF=28;SAR=44;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728278;STB=0.51304;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0205314;OID=.;OPOS=55229255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:136:59:60:72:76:0.558824:44:28:28:31:44:32:27:33 chr7 55238874 . T A 374.62 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00106314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.211;QD=20.8124;RBI=0.0443043;REFB=-0.000613484;REVB=0.0442915;RO=34;SAF=25;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906781;STB=0.550287;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.000735239;OID=.;OPOS=55238874;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:13:25:19:15:13:25:19:15 chr7 55266417 . T C 1587.79 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.037;QD=64.153;RBI=0.0199425;REFB=0;REVB=0.0139189;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.57182e-07;OID=.;OPOS=55266417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:55:44:0:0:55:44:0:0 chr7 55268916 . C T 364.55 PASS AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00127128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.062;QD=18.4583;RBI=0.0087183;REFB=-0.011576;REVB=0.00862512;RO=41;SAF=12;SAR=26;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215757;STB=0.620721;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.012177;OID=.;OPOS=55268916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:41:38:38:0.481013:26:12:22:19:26:12:22:19 chr7 55459563 . A G 168.69 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0225786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.459;QD=16.0655;RBI=0.0228796;REFB=-0.0203762;REVB=0.00369903;RO=24;SAF=7;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193225;STB=0.610988;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0381914;OID=.;OPOS=55459563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:11:7:14:10:11:7:14:10 chr7 55499058 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00104308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.397;QD=61.3363;RBI=0.0297174;REFB=0;REVB=0.0296991;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150938;OID=.;OPOS=55499058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:30:10:0:0:30:10:0:0 chr7 55540707 . G A 114.12 PASS AF=0.52;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0611279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.761;QD=18.2588;RBI=0.0688668;REFB=-0.0256017;REVB=-0.0317179;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672983;STB=0.51849;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0188101;OID=.;OPOS=55540707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:24:25:11:12:13:13:0.52:6:7:5:6:6:7:6:6 chr7 55750390 . A G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.401;QD=57.8849;RBI=0.0175373;REFB=0;REVB=-0.0158881;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85411e-05;OID=.;OPOS=55750390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0 chr7 56007576 . C T 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00916941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.106;QD=15.1603;RBI=0.0602613;REFB=-0.00694394;REVB=-0.0595596;RO=22;SAF=11;SAR=5;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476336;STB=0.771041;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00618855;OID=.;OPOS=56007576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:5:11:4:18:5:11:4:18 chr7 56047572 . C T 220.92 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0422406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1954;QD=18.0343;RBI=0.0669793;REFB=0.021856;REVB=-0.0519803;RO=27;SAF=15;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238047;STB=0.635711;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.0270647;OID=.;OPOS=56047572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:7:15:12:15:7:15:12:15 chr7 56087374 . C T 59.36 PASS AF=0.204545;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0223756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.637;QD=5.39642;RBI=0.0269418;REFB=-0.00733605;REVB=-0.0150065;RO=35;SAF=1;SAR=8;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.514319;STB=0.846191;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00391959;OID=.;OPOS=56087374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:44:44:35:35:9:9:0.204545:8:1:17:18:8:1:17:18 chr7 56087379 . T C 58.6 PASS AF=0.1875;AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0223336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.064;QD=4.88329;RBI=0.0226043;REFB=0.00132247;REVB=-0.00348728;RO=37;SAF=1;SAR=8;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471656;STB=0.82674;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00302201;OID=.;OPOS=56087379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:47:48:37:39:9:9:0.1875:8:1:16:21:8:1:17:22 chr7 56087399 . G A 49.39 PASS AF=0.170213;AO=8;DP=47;FAO=8;FDP=47;FR=.;FRO=39;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00471933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.13;QD=4.20302;RBI=0.0238574;REFB=0.002226;REVB=0.023386;RO=38;SAF=1;SAR=7;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405481;STB=0.782382;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.0202486;OID=.;OPOS=56087399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:47:47:38:39:8:8:0.170213:7:1:15:23:7:1:15:24 chr7 56087409 . G A 49.22 PASS AF=0.166667;AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00770964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4967;QD=4.10149;RBI=0.0348557;REFB=-0.00035273;REVB=0.0339924;RO=40;SAF=1;SAR=7;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408552;STB=0.792476;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00572094;OID=.;OPOS=56087409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:48:48:40:40:8:8:0.166667:7:1:16:24:7:1:16:24 chr7 56088780 . G A 60.33 PASS AF=0.164179;AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=67;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.0159071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.698;QD=3.60182;RBI=0.0375615;REFB=0.00050965;REVB=-0.0340269;RO=55;SAF=3;SAR=8;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430815;STB=0.787405;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0058862;OID=.;OPOS=56088780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:67:67:55:56:11:11:0.164179:8:3:35:20:8:3:36:20 chr7 56088786 . A T 74.05 PASS AF=0.183099;AO=13;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=-0.00401436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.835;QD=4.17184;RBI=0.0283717;REFB=-0.00212418;REVB=-0.0280863;RO=58;SAF=5;SAR=8;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348893;STB=0.722487;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.016052;OID=.;OPOS=56088786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:71:71:58:58:13:13:0.183099:8:5:39:19:8:5:39:19 chr7 56088789 . G A 72.88 PASS AF=0.180556;AO=13;DP=72;FAO=13;FDP=72;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=0.0138393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.342;QD=4.04909;RBI=0.0487951;REFB=-0.00160673;REVB=-0.0467914;RO=58;SAF=5;SAR=8;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348893;STB=0.726963;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0154927;OID=.;OPOS=56088789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:72:72:58:59:13:13:0.180556:8:5:39:19:8:5:40:19 chr7 56088811 . T C 97.78 PASS AF=0.210526;AO=16;DP=76;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00494297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0949;QD=5.14634;RBI=0.0197745;REFB=-0.00355605;REVB=0.0191468;RO=60;SAF=5;SAR=11;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386381;STB=0.741097;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0168354;OID=.;OPOS=56088811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:76:76:60:60:16:16:0.210526:11:5:38:22:11:5:38:22 chr7 56088825 . T A 97.84 PASS AF=0.210526;AO=16;DP=76;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.00290798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.911;QD=5.14962;RBI=0.0478479;REFB=-0.00326694;REVB=0.0477594;RO=60;SAF=5;SAR=11;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386381;STB=0.741097;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.01417;OID=.;OPOS=56088825;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:76:76:60:60:16:16:0.210526:11:5:38:22:11:5:38:22 chr7 56088902 . C T 61.45 PASS AF=0.178571;AO=10;DP=56;FAO=10;FDP=56;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0411515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.801;QD=4.38935;RBI=0.0457123;REFB=-0.00287196;REVB=0.0199039;RO=46;SAF=1;SAR=9;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.667155;STB=0.9274;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00731013;OID=.;OPOS=56088902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:56:56:46:46:10:10:0.178571:9:1:32:14:9:1:32:14 chr7 56088907 . GC CT 71.83 PASS AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0340941;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=267.512;QD=7.9807;RBI=0.0358356;REFB=-0.000227986;REVB=-0.0110356;RO=21;SAF=1;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559005;STB=0.888722;STBP=0.007;TYPE=mnp;VARB=0.00029762;OID=.;OPOS=56088907;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:36:36:21:26:10:10:0.277778:9:1:11:10:9:1:16:10 chr7 56122076 . A T 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00644867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.13;QD=9.49525;RBI=0.0125856;REFB=-0.0108056;REVB=-0.0108079;RO=24;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110746;STB=0.567442;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0264159;OID=.;OPOS=56122076;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:4:7:13:11:4:7:13:11 chr7 56126360 . T C 286.75 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0649281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.802;QD=24.4041;RBI=0.0670453;REFB=-0.0657862;REVB=0.0167154;RO=20;SAF=16;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126735;STB=0.520532;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0467159;OID=.;OPOS=56126360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:21:26:26:0.553191:10:16:12:8:10:16:12:9 chr7 56130952 . TA T,TT 45.16 PASS AF=0.3,0.15;AO=4,3;DP=18;FAO=6,3;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5,0;FSAR=1,3;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.126739,0.190135;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.961,11.5435;QD=9.03281;RBI=0.144523,0.22876;REFB=-0.00838543,-0.115777;REVB=-0.0694571,-0.127199;RO=8;SAF=2,0;SAR=2,3;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.567148,-0.819744;STB=0.517182,0.997619;STBP=0.996,0.005;TYPE=del,snp;VARB=-0.00389287,0.0481009;OID=.,.;OPOS=56130953,56130953;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3,0.15:4,3:18:6,3:20:11:5,0:1,3:9:2:25:8:2,0:2,3:8:0 chr7 56136260 . C A 1420.57 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000988418;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.599;QD=63.1364;RBI=0.0484586;REFB=0;REVB=0.0484485;RO=0;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14522e-05;OID=.;OPOS=56136260;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:88:90:1:40:48:0:0:42:48:0:0 chr7 56174115 . A C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.342;QD=57.6805;RBI=0.0688368;REFB=0;REVB=-0.0570046;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160251;OID=.;OPOS=56174115;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0 chr7 56872154 . A T 61.0 PASS AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.00803199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.508;QD=6.59507;RBI=0.015604;REFB=-0.0185175;REVB=0.013378;RO=26;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531841;STB=0.508753;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0678355;OID=.;OPOS=56872154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:37:37:26:28:9:9:0.243243:7:2:5:21:7:2:6:22 chr7 56879552 . T C 509.82 PASS AF=0.454545;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.0190313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.26;QD=16.8534;RBI=0.0286675;REFB=-0.00953352;REVB=-0.0214391;RO=64;SAF=25;SAR=30;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133917;STB=0.565844;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0145436;OID=.;OPOS=56879552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:64:66:55:55:0.454545:30:25:38:26:30:25:38:28 chr7 56879668 . C T 44.75 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00543469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8528;QD=7.45777;RBI=0.0286871;REFB=-0.00365604;REVB=-0.0281676;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725222;STB=0.54533;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.043014;OID=.;OPOS=56879668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:4:13:5:2:4:13 chr7 57187595 . A C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.042;QD=53.2756;RBI=0.0461151;REFB=0;REVB=0.00628407;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610401;OID=.;OPOS=57187595;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0 chr7 57238635 . G A 1065.47 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010979;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5498;QD=60.0265;RBI=0.0174815;REFB=0;REVB=-0.0136038;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00081014;OID=.;OPOS=57238635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:71:71:0:0:70:71:1:38:32:0:0:38:33:0:0 chr7 57242225 . T C 1140.4 PASS AF=0.898876;AO=79;DP=89;FAO=80;FDP=89;FR=.;FRO=9;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0114973;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=207.296;QD=51.2541;RBI=0.0302451;REFB=-0.0268645;REVB=0.0279746;RO=9;SAF=30;SAR=49;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797347;STB=0.540797;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.000179171;OID=.;OPOS=57242225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:89:89:9:9:79:80:0.898876:49:30:7:2:49:31:7:2 chr7 57257162 . A C 1685.84 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478648;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.041;QD=59.6757;RBI=0.0478832;REFB=0;REVB=0.00132476;RO=0;SAF=61;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122006;OID=.;OPOS=57257162;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:113:0:0:111:113:1:50:61:0:0:51:62:0:0 chr7 57260032 . GA G 781.02 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.685;QD=63.7566;RBI=0.0436705;REFB=0;REVB=0.0178427;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.18842e-05;OID=.;OPOS=57260033;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:49:49:49:49:0:28:21:0:0:4:0:28:21:0:0 chr7 57529392 . A C 51.42 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0493384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.597;QD=18.6974;RBI=0.0828715;REFB=-0.0771954;REVB=-0.0665838;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295447;STB=0.516083;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0495386;OID=.;OPOS=57529392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:11:3:4:7:7:0.636364:5:2:1:2:5:2:1:3 chr7 63225682 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.851;QD=43.4862;RBI=0.0885295;REFB=0;REVB=0.0759745;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00088868;OID=.;OPOS=63225682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0 chr7 63225725 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.475;QD=46.848;RBI=0.0905505;REFB=0;REVB=0.0588785;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000625566;OID=.;OPOS=63225725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:2:13:0:0:2:13:0:0 chr7 63225803 . T A,G 319.27 PASS AF=0.958333,0.0416667;AO=22,2;DP=24;FAO=23,1;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4,0;FSAR=19,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00164649,-0.00711536;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=232.195,161.196;QD=53.2118;RBI=0.030263,0.0095385;REFB=0,0;REVB=0.0302182,-0.00635252;RO=0;SAF=4,0;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00157777,0.0528063;OID=.,.;OPOS=63225803,63225803;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:24:24:0:0:22,2:23,1:0.958333,0.0416667:18,2:4,0:0:0:19,1:4,0:0:0 chr7 63225821 . A T 351.64 PASS AF=0.962963;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00954329;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0704;QD=52.0942;RBI=0.0102028;REFB=-0.230228;REVB=0.00360884;RO=1;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226465;STB=0.511619;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00553863;OID=.;OPOS=63225821;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:25:26:0.962963:20:5:0:1:21:5:0:1 chr7 63225842 . A T 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5442;QD=57.6801;RBI=0.0274887;REFB=0;REVB=0.0271875;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353611;OID=.;OPOS=63225842;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:24:7:0:0:24:7:0:0 chr7 63225873 . C T 396.84 PASS AF=0.935484;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.041813;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.704;QD=51.2057;RBI=0.0472175;REFB=-0.0382575;REVB=0.0219355;RO=2;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404935;STB=0.521724;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00354479;OID=.;OPOS=63225873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:31:2:2:29:29:0.935484:22:7:0:2:22:7:0:2 chr7 63225986 . T C 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0726724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.825;QD=35.5715;RBI=0.0742967;REFB=0;REVB=0.0154509;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00113942;OID=.;OPOS=63225986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr7 63529956 . G A 317.25 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0210938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.447;QD=25.898;RBI=0.0244954;REFB=-0.0282216;REVB=-0.0124528;RO=20;SAF=8;SAR=20;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100073;STB=0.570417;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.023372;OID=.;OPOS=63529956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:20:21:28:28:0.571429:20:8:8:12:20:8:9:12 chr7 63537849 . G A 321.28 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0032536;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.82;QD=18.6251;RBI=0.0114439;REFB=-0.0029429;REVB=0.0109717;RO=35;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919407;STB=0.551152;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00262547;OID=.;OPOS=63537849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:35:35:34:34:0.492754:15:19:23:12:15:19:23:12 chr7 63565953 . A C 126.19 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0029334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.922;QD=10.973;RBI=0.00503701;REFB=-0.0110309;REVB=-0.0040947;RO=31;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202775;STB=0.62053;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0134262;OID=.;OPOS=63565953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:6:9:13:18:6:9:13:18 chr7 63566387 . A ATGT 321.2 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00801738;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=3;MLLD=219.446;QD=18.6204;RBI=0.00821842;REFB=-0.0124234;REVB=-0.00180667;RO=35;SAF=20;SAR=14;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170737;STB=0.595182;STBP=0.131;TYPE=ins;VARB=0.00877631;OID=.;OPOS=63566388;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=ATGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.492754:34:70:34:69:35:20:14:14:21:99:35:20:14:14:21 chr7 63568887 . A ATAACT,T 226.33 PASS AF=0.337662,0.025974;AO=25,4;DP=79;FAO=26,2;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=13,2;FSAR=13,0;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.028315,0.0102616;FXX=0.0493766;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=149.805,261.06;QD=11.7576;RBI=0.0351703,0.0114014;REFB=-0.0219915,-0.0101454;REVB=-0.0208617,-0.004969;RO=50;SAF=13,3;SAR=12,1;SRF=26;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.240361;STB=0.506662,0.994755;STBP=0.944,0.191;TYPE=ins,snp;VARB=0.0217308,0.0421028;OID=.,.;OPOS=63568888,63568887;OREF=-,A;OALT=TAACT,T;OMAPALT=ATAACT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:77:50:49:25,4:26,2:0.337662,0.025974:12,1:13,3:26:24:13,0:13,2:25:24 chr7 63570733 . T C 270.6 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00512615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.412;QD=14.4322;RBI=0.00821076;REFB=-0.00619417;REVB=0.00641398;RO=44;SAF=10;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21516;STB=0.62256;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0140155;OID=.;OPOS=63570733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:21:10:23:21:21:10:23:21 chr7 63572047 . A G 224.47 PASS AF=0.385714;AO=25;DP=68;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0079844;FXX=0.0540468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.196;QD=12.8266;RBI=0.0444103;REFB=-0.027412;REVB=0.0436867;RO=43;SAF=24;SAR=1;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.698592;STB=0.866717;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0363332;OID=.;OPOS=63572047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:43:43:25:27:0.385714:1:24:22:21:2:25:21:22 chr7 63679733 . A G 484.86 PASS AF=0.552941;AO=44;DP=83;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00515598;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.998;QD=22.817;RBI=0.0218765;REFB=-0.0161486;REVB=0.0212602;RO=38;SAF=21;SAR=23;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697956;STB=0.52116;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0163186;OID=.;OPOS=63679733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:38:38:44:47:0.552941:23:21:15:23:25:22:16:22 chr7 63680133 . T A 83.09 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0216561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.428;QD=9.49567;RBI=0.0216657;REFB=-0.0186488;REVB=0.000643308;RO=24;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15701;STB=0.595568;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0276964;OID=.;OPOS=63680133;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:4:7:12:12:4:7:12:12 chr7 63796744 . T C 597.64 PASS AF=0.466165;AO=61;DP=132;FAO=62;FDP=133;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.0453959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.8;QD=17.9742;RBI=0.0533698;REFB=0.0169456;REVB=0.0280632;RO=71;SAF=20;SAR=41;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141685;STB=0.581781;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.0184848;OID=.;OPOS=63796744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:71:71:61:62:0.466165:41:20:33:38:42:20:33:38 chr7 63808867 . C A 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.126775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.457;QD=21.9442;RBI=0.126951;REFB=-0.00259211;REVB=-0.00668115;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815107;STB=0.545815;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.000355195;OID=.;OPOS=63808867;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:9:7:4:8:9:7:4:8 chr7 63981563 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0129;QD=60.9774;RBI=0.0167694;REFB=0;REVB=0.00661535;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258862;OID=.;OPOS=63981563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr7 64152353 . A G 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00434904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.687;QD=10.6346;RBI=0.0304332;REFB=-0.0121313;REVB=0.0301208;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16722;STB=0.599771;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0261455;OID=.;OPOS=64152353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:3:10:5:3:3:10 chr7 64169019 . G A 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0845612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.084;QD=56.9558;RBI=0.088124;REFB=0;REVB=0.024804;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371038;OID=.;OPOS=64169019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:34:18:0:0:34:18:0:0 chr7 64254901 . T C 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0647;QD=53.9099;RBI=0.0651362;REFB=0;REVB=0.0642833;RO=0;SAF=21;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86584e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156676;OID=.;OPOS=64254901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:3:21:0:0:3:21:0:0 chr7 64291333 . T A 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.821;QD=61.8526;RBI=0.0117481;REFB=0;REVB=-0.00761669;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12199e-06;OID=.;OPOS=64291333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0 chr7 64291987 . G A 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0057152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6501;QD=15.2622;RBI=0.0599543;REFB=0.0186992;REVB=-0.0596813;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141401;STB=0.581278;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.0277169;OID=.;OPOS=64291987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:8:5:4:12:8:5:4:12 chr7 64291991 . T A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192679;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=301.167;QD=56.7066;RBI=0.0209204;REFB=0;REVB=0.00814926;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.21422e-05;OID=.;OPOS=64291991;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr7 64389089 . A C 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0736302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5499;QD=15.7842;RBI=0.0737658;REFB=-0.0320222;REVB=0.00447116;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163226;STB=0.509421;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0346883;OID=.;OPOS=64389089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:8:6:7:10:8:6:7:10 chr7 64438667 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00868191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.961;QD=56.7066;RBI=0.010722;REFB=0;REVB=0.00629174;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36374e-05;OID=.;OPOS=64438667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr7 64439613 . T G 107.4 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0287833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.5504;QD=12.6356;RBI=0.0471302;REFB=0.0138583;REVB=0.0373199;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114735;STB=0.567464;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=-0.0137674;OID=.;OPOS=64439613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:12:9:7:6:12:9 chr7 64439701 . C T 309.48 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00161621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.123;QD=16.0768;RBI=0.0114649;REFB=-0.0135594;REVB=0.0113505;RO=43;SAF=18;SAR=16;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866279;STB=0.548752;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0163145;OID=.;OPOS=64439701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:16:18:19:24:16:18:19:24 chr7 64451656 . G A 496.44 PASS AF=0.505263;AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0289405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4367;QD=20.9028;RBI=0.0296817;REFB=-0.00586603;REVB=0.00659183;RO=46;SAF=29;SAR=19;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158587;STB=0.515256;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00442718;OID=.;OPOS=64451656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:47:48:48:0.505263:19:29:27:19:19:29:27:20 chr7 64451699 . T C 1665.44 PASS AF=0.991071;AO=108;DP=111;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0296587;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.937;QD=59.48;RBI=0.0296731;REFB=-0.115625;REVB=-0.000923841;RO=1;SAF=58;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939877;STB=0.504853;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.000187723;OID=.;OPOS=64451699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:111:112:1:1:108:111:0.991071:50:58:0:1:51:60:0:1 chr7 64451963 . T C 1120.8 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00964537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.264;QD=58.9893;RBI=0.0558637;REFB=-0.0689601;REVB=0.0550247;RO=1;SAF=43;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108773;STB=0.505746;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000647932;OID=.;OPOS=64451963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:32:43:1:0:32:43:1:0 chr7 64452830 . C T 598.0 PASS AF=0.428571;AO=63;DP=147;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=60;FSRR=24;FWDB=-0.00874262;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.729;QD=16.2721;RBI=0.0187113;REFB=-0.0115875;REVB=-0.0165433;RO=83;SAF=40;SAR=23;SRF=59;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857076;STB=0.550224;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0197024;OID=.;OPOS=64452830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:83:84:63:63:0.428571:23:40:59:24:23:40:60:24 chr7 64453136 . G A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.278;QD=57.6804;RBI=0.0172352;REFB=0;REVB=0.0156345;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82649e-05;OID=.;OPOS=64453136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr7 64453615 . T C 761.43 PASS AF=1;AO=52;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3778;QD=56.4021;RBI=0.0478623;REFB=0;REVB=0.0389503;RO=1;SAF=28;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016526;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649238;OID=.;OPOS=64453615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:1:0:52:54:1:24:28:1:0:25:29:0:0 chr7 64453634 . G A 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.009422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.132;QD=16.1155;RBI=0.0108017;REFB=-0.0107815;REVB=0.00528228;RO=29;SAF=18;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373772;STB=0.712687;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0114231;OID=.;OPOS=64453634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:6:18:11:18:6:18:11:18 chr7 64483597 . T C 283.12 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0154249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1535;QD=17.4226;RBI=0.0497631;REFB=-0.0162746;REVB=0.0473122;RO=34;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675715;STB=0.537824;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0187492;OID=.;OPOS=64483597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:16:15:14:20:16:15:14:20 chr7 64863392 . C T 130.66 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0112344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.912;QD=13.7532;RBI=0.0262876;REFB=-0.0322627;REVB=-0.0237661;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149229;STB=0.574368;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0389911;OID=.;OPOS=64863392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:9:6:12:10:9:6:12:11 chr7 64864607 . G A 376.77 PASS AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00269488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.957;QD=18.6057;RBI=0.00817424;REFB=-0.0139114;REVB=-0.00771725;RO=42;SAF=18;SAR=21;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00857393;STB=0.504778;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0153401;OID=.;OPOS=64864607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:21:18:19:23:21:18:19:23 chr7 64864800 . A G 206.09 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0214485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0187;QD=16.824;RBI=0.0798357;REFB=-0.013297;REVB=0.0769006;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107314;STB=0.561345;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0255789;OID=.;OPOS=64864800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:15:13:12:9:15:13 chr7 64864912 . A C 183.6 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0243512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.971;QD=17.9123;RBI=0.0263029;REFB=0.00244661;REVB=-0.009943;RO=22;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675074;STB=0.538421;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00310189;OID=.;OPOS=64864912;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:10:9:12:10:10:9:12:10 chr7 64865118 . A G 164.4 PASS AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0101448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.707;QD=13.6999;RBI=0.0107766;REFB=-0.00982065;REVB=0.00363563;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123201;STB=0.571352;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0144784;OID=.;OPOS=64865118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:20:10:8:10:20:10 chr7 64865280 . G A 494.03 PASS AF=0.404412;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=136;FR=.;FRO=81;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=-0.00795988;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.281;QD=14.5303;RBI=0.008168;REFB=0.00211438;REVB=-0.00183206;RO=81;SAF=30;SAR=25;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119388;STB=0.567219;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=-0.0030549;OID=.;OPOS=64865280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:81:81:55:55:0.404412:25:30:35:46:25:30:35:46 chr7 65159983 . A G 89.44 PASS AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0140349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.402;QD=7.30119;RBI=0.0233543;REFB=-0.0082831;REVB=-0.0186667;RO=35;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085684;STB=0.571312;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0303189;OID=.;OPOS=65159983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:49:49:35:37:12:12:0.244898:6:6:15:20:6:6:15:22 chr7 65279676 . A T 277.84 PASS AF=0.285714;AO=38;DP=133;FAO=38;FDP=133;FR=.;FRO=95;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=60;FSRR=35;FWDB=-0.00923503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.674;QD=8.35603;RBI=0.0659848;REFB=-0.0141773;REVB=-0.0653354;RO=95;SAF=25;SAR=13;SRF=60;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348504;STB=0.520596;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0390773;OID=.;OPOS=65279676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:95:95:38:38:0.285714:13:25:60:35:13:25:60:35 chr7 65279756 . TATTTTTTT TATTTTTT,TATTTTTTTA,TTTTTTTT,TTTTTTTTT 184.18 PASS AF=0.285714,0.0793651,0.0793651,0.111111;AO=13,9,12,9;DP=83;FAO=18,5,5,7;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=15,5,3,3;FSAR=3,0,2,4;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0596601,0.0747566,0.00338921,0.00341547;FXX=0.17103;HRUN=7,6,1,1;LEN=1,1,1,1;MLLD=10.1472,11.3647,265.588,267.482;QD=11.694;RBI=0.0856629,0.309372,0.00343671,0.00404986;REFB=-0.136189,-0.066444,-0.00334681,-0.00260114;REVB=0.0614719,0.300204,-0.000569436,-0.00217622;RO=22;SAF=9,9,8,4;SAR=4,0,4,5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.0446525,0.718161,-0.0765938,-0.319852;STB=0.686037,0.997342,0.506304,0.639616;STBP=0.092,0.051,0.995,0.479;TYPE=del,ins,del,snp;VARB=0.135109,0.157087,0.00997517,0.041974;OID=.,.,.,.;OPOS=65279758,65279765,65279757,65279757;OREF=T,-,A,A;OALT=-,A,-,T;OMAPALT=TATTTTTT,TATTTTTTTA,TTTTTTTT,TTTTTTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714,0.0793651,0.0793651,0.111111:13,9,12,9:83:18,5,5,7:63:28:15,5,3,3:3,0,2,4:17:11:85:22:9,9,8,4:4,0,4,5:16:6 chr7 65425894 . A G 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0133806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4849;QD=12.3945;RBI=0.0558029;REFB=0.00184921;REVB=-0.054175;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323337;STB=0.519057;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.00653541;OID=.;OPOS=65425894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:8:6:11:13:8:6:11:13 chr7 65842543 . C CAT 81.96 PASS AF=0.282051;AO=10;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0145923;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=230.03;QD=8.40618;RBI=0.0269512;REFB=-0.00963385;REVB=0.0226591;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16387;STB=0.548929;STBP=0.708;TYPE=ins;VARB=0.0251041;OID=.;OPOS=65842544;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.282051:10:39:11:39:28:7:4:16:12:81:28:7:3:16:12 chr7 65842545 . T C 81.59 PASS AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0227634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1552;QD=8.36808;RBI=0.0247682;REFB=-0.0133284;REVB=0.00976167;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792527;STB=0.548929;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0562969;OID=.;OPOS=65842545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:4:7:16:12:4:7:16:12 chr7 65860213 . T TAGAG 352.55 PASS AF=0.583333;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.000751724;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=4;MLLD=341.332;QD=23.503;RBI=0.013168;REFB=-0.00829265;REVB=-0.0131466;RO=25;SAF=22;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546624;STB=0.530103;STBP=0.581;TYPE=ins;VARB=0.00570561;OID=.;OPOS=65860214;OREF=-;OALT=AGAG;OMAPALT=TAGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:35:61:35:60:25:22:13:14:11:99:25:22:13:14:11 chr7 65860264 . CCATAT C 145.62 PASS AF=0.5;AO=23;DP=45;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0121279;FXX=0.10636;HRUN=2;LEN=5;MLLD=260.891;QD=13.8684;RBI=0.012867;REFB=-0.026398;REVB=0.00429813;RO=20;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02356;STB=0.524115;STBP=0.778;TYPE=del;VARB=0.0192077;OID=.;OPOS=65860265;OREF=CATAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:23:45:21:42:21:9:12:10:11:99:20:11:12:9:11 chr7 66015630 . C G 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0156614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.152;QD=17.3782;RBI=0.0158863;REFB=-0.0342903;REVB=-0.00266338;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578471;STB=0.533274;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0291111;OID=.;OPOS=66015630;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:4:7:7:3:4:7:7:3 chr7 66105163 . C G 222.72 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=33;FWDB=-0.0286807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.392;QD=12.5475;RBI=0.0308059;REFB=0.000323572;REVB=0.0112436;RO=44;SAF=3;SAR=24;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276077;STB=0.662578;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000716519;OID=.;OPOS=66105163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:24:3:11:33:24:3:11:33 chr7 66147057 . T C 1008.46 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.523;QD=59.3215;RBI=0.0121021;REFB=0;REVB=0.0120095;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6178e-05;OID=.;OPOS=66147057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:37:31:0:0:37:31:0:0 chr7 66147101 . G A 362.51 PASS AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00017518;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=212.43;QD=27.885;RBI=0.0132496;REFB=-0.0249288;REVB=0.0132484;RO=17;SAF=10;SAR=24;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122216;STB=0.559549;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0121685;OID=.;OPOS=66147101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:18:34:34:0.653846:24:10:8:9:24:10:8:10 chr7 66147110 . C A 359.5 PASS AF=0.783784;AO=26;DP=33;FAO=29;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0136878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.12;QD=38.8644;RBI=0.0330608;REFB=-0.0178989;REVB=0.0300942;RO=7;SAF=7;SAR=19;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252967;STB=0.614979;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00954247;OID=.;OPOS=66147110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:33:37:7:8:26:29:0.783784:19:7:6:1:21:8:6:2 chr7 66147149 . A G 208.4 PASS AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0360467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.343;QD=41.6799;RBI=0.0367951;REFB=-0.0712166;REVB=0.00738326;RO=1;SAF=9;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483018;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0105923;OID=.;OPOS=66147149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:20:20:1:2:18:18:0.9:9:9:1:0:9:9:1:1 chr7 66147178 . C T 66.5 PASS AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.075469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4967;QD=26.6015;RBI=0.125643;REFB=-0.0486846;REVB=0.100452;RO=2;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14689;STB=0.583138;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0180646;OID=.;OPOS=66147178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:3:5:2:0:3:5:2:0 chr7 66147656 . G C 155.98 PASS AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00224467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.217;QD=10.9456;RBI=0.0102259;REFB=-0.00693171;REVB=-0.00997646;RO=36;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372801;STB=0.511534;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0115096;OID=.;OPOS=66147656;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:36:37:20:20:0.350877:9:11:21:15:9:11:21:16 chr7 66147746 . C G 236.22 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00899689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.7914;QD=17.4978;RBI=0.0207593;REFB=-0.0261644;REVB=0.0187085;RO=28;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108981;STB=0.561356;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0113678;OID=.;OPOS=66147746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:10:16:14:14:10:16:14:14 chr7 68527448 . C G 543.41 PASS AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0213503;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.539;QD=24.9844;RBI=0.0307473;REFB=-0.0162836;REVB=-0.022126;RO=37;SAF=20;SAR=30;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089935;STB=0.549276;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.010717;OID=.;OPOS=68527448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:30:20:19:18:30:20:19:18 chr7 68527587 . A G 84.44 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00153507;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.266;QD=10.2353;RBI=0.0789047;REFB=-0.0112131;REVB=-0.0788897;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969096;STB=0.563101;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.027489;OID=.;OPOS=68527587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:33:20:22:11:11:0.333333:7:4:9:11:7:4:10:12 chr7 68796377 . G A 2103.9 PASS AF=0.971631;AO=137;DP=141;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0118894;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.18;QD=59.6851;RBI=0.0120718;REFB=-0.0968244;REVB=-0.00209039;RO=3;SAF=79;SAR=58;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00375667;STB=0.502225;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.00028674;OID=.;OPOS=68796377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:141:141:3:4:137:137:0.971631:58:79:2:1:58:79:2:2 chr7 70228020 . G T 327.62 PASS AF=0.615385;AO=31;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0283047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.846;QD=25.2016;RBI=0.0398869;REFB=-0.025853;REVB=-0.0281036;RO=20;SAF=17;SAR=14;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00116052;STB=0.504875;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0250372;OID=.;OPOS=70228020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:20:20:31:32:0.615385:14:17:11:9:14:18:11:9 chr7 70257628 . TAAAAAAAAT TAAAAAAAT,TAAAAAAATA 44.73 PASS AF=0.301887,0.0377358;AO=18,2;DP=53;FAO=16,2;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7,2;FSAR=9,0;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.045834,-0.0452524;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=7.09173,121.167;QD=3.3758;RBI=0.0517626,0.0476477;REFB=-0.0187593,-0.00245819;REVB=-0.0240543,-0.0149172;RO=25;SAF=7,2;SAR=11,0;SRF=11;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0534255,0.509229;STB=0.513631,0.995174;STBP=0.912,0.108;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0667865,0.0146406;OID=.,.;OPOS=70257629,70257636;OREF=A,AT;OALT=-,TA;OMAPALT=TAAAAAAAT,TAAAAAAATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.301887,0.0377358:18,2:53:16,2:53:35:7,2:9,0:16:19:39:25:7,2:11,0:11:14 chr7 70597522 . C A 2128.63 PASS AF=1;AO=135;DP=137;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206755;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7021;QD=63.0704;RBI=0.0811772;REFB=0;REVB=0.0785001;RO=0;SAF=55;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78419e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188885;OID=.;OPOS=70597522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:137:135:0:0:135:135:1:80:55:0:0:80:55:0:0 chr7 70597884 . G A 382.62 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0404325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.41;QD=52.7753;RBI=0.0872326;REFB=-0.0139075;REVB=0.0772965;RO=1;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054642;STB=0.52939;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.000619181;OID=.;OPOS=70597884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:8:20:0:1:8:20:0:1 chr7 70885993 . C T 358.1 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0309336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.236;QD=22.3813;RBI=0.0337571;REFB=-0.031598;REVB=-0.0135149;RO=28;SAF=22;SAR=14;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174231;STB=0.5961;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0216983;OID=.;OPOS=70885993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:14:22:11:17:14:22:11:17 chr7 71150706 . A T 255.86 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.528;QD=51.1728;RBI=0.0547747;REFB=0;REVB=0.0116968;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000938914;OID=.;OPOS=71150706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0 chr7 71248676 . C T 935.89 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0615803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2032;QD=55.8738;RBI=0.0616251;REFB=-0.142917;REVB=0.0023485;RO=2;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325479;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00471684;OID=.;OPOS=71248676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:67:2:0:65:67:1:28:37:0:2:30:37:0:0 chr7 71252189 . A AG 384.4 PASS AF=1;AO=31;DP=39;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.8062;QD=45.2233;RBI=0.23088;REFB=0;REVB=-0.193886;RO=7;SAF=10;SAR=21;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406334;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00241612;OID=.;OPOS=71252190;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:31:39:34:34:0:11:23:0:0:7:7:10:21:3:4 chr7 72093957 . A G 562.09 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9212;QD=59.1674;RBI=0.0404872;REFB=0;REVB=0.0256564;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248806;OID=.;OPOS=72093957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:16:21:0:0:16:22:0:0 chr7 72178756 . C A 393.12 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.022868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.597;QD=17.0923;RBI=0.0249108;REFB=-0.0305553;REVB=-0.00987951;RO=51;SAF=15;SAR=26;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20256;STB=0.613678;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0299053;OID=.;OPOS=72178756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:26:15:29:22:26:15:29:22 chr7 72193864 . T C 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00236743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.956;QD=60.3766;RBI=0.0236502;REFB=0;REVB=0.0235314;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.35821e-05;OID=.;OPOS=72193864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0 chr7 72193868 . G A 1106.56 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.698;QD=59.814;RBI=0.0385454;REFB=0;REVB=0.0163152;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153023;OID=.;OPOS=72193868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:33:40:0:0:33:41:0:0 chr7 72209527 . CA C 270.98 PASS AF=0.425926;AO=44;DP=110;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0377872;FXX=0.0181802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.3427;QD=10.0361;RBI=0.0545659;REFB=-0.00519932;REVB=-0.0393645;RO=61;SAF=22;SAR=22;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591871;STB=0.527766;STBP=0.653;TYPE=del;VARB=0.00554285;OID=.;OPOS=72209528;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.425926:44:110:46:108:62:23:23:28:34:99:61:22:22:27:34 chr7 72286028 . C T 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00326751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.639;QD=12.1824;RBI=0.0123532;REFB=0.00674988;REVB=0.0119132;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364728;STB=0.71611;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00437546;OID=.;OPOS=72286028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:7:3:10:5:7:3:10:5 chr7 72312214 . A G 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0129978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.747;QD=16.4265;RBI=0.0220668;REFB=-0.0340536;REVB=-0.0178325;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235046;STB=0.636115;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0252115;OID=.;OPOS=72312214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:4:7:4:7:4:7:4:7 chr7 72413443 . G A 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0145747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8684;QD=24.3281;RBI=0.203519;REFB=-0.00118159;REVB=0.202997;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223089;STB=0.631145;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0123523;OID=.;OPOS=72413443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:1:6:1:1:1:6:1:1 chr7 72418992 . C T 217.9 PASS AF=0.461538;AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0944959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9352;QD=16.7618;RBI=0.0954009;REFB=0.0120522;REVB=0.0131095;RO=28;SAF=11;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555195;STB=0.519215;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=-0.0107644;OID=.;OPOS=72418992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:28:28:23:24:0.461538:12:11:15:13:12:12:15:13 chr7 72717933 . C T 60.04 PASS AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0270145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5286;QD=5.85725;RBI=0.0271091;REFB=-0.0126727;REVB=-0.00226274;RO=31;SAF=5;SAR=4;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476099;STB=0.543382;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0484758;OID=.;OPOS=72717933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:41:41:31:32:9:9:0.219512:4:5:16:15:4:5:16:16 chr7 72738749 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.081;QD=50.4133;RBI=0.0741848;REFB=0;REVB=-0.0223373;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000582799;OID=.;OPOS=72738749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:4:15:0:0:4:15:0:0 chr7 72738762 . CA TG 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201943;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=143.787;QD=50.4135;RBI=0.0378425;REFB=0;REVB=0.0320038;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000678868;OID=.;OPOS=72738762;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0 chr7 72951204 . G A 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0207924;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.08;QD=17.1002;RBI=0.0231677;REFB=-0.0286335;REVB=-0.0102186;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299972;STB=0.517217;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0330216;OID=.;OPOS=72951204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:7:7:7:8:7:7:7:8 chr7 73020301 . T C 1528.11 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.647;QD=63.6711;RBI=0.00814512;REFB=0;REVB=0.00719238;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315828;OID=.;OPOS=73020301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:52:43:0:0:53:43:0:0 chr7 73097948 . G C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8599;QD=53.9083;RBI=0.0476527;REFB=0;REVB=0.0390468;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325799;OID=.;OPOS=73097948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0 chr7 73151644 . A G 65.0 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0272853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.882;QD=10.8333;RBI=0.0295537;REFB=0.0137264;REVB=-0.0113549;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33795;STB=0.702267;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.0299822;OID=.;OPOS=73151644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:5:10:3:6:5:10 chr7 73246461 . A G 182.59 PASS AF=0.32;AO=23;DP=74;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.0142966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.414;QD=9.73819;RBI=0.0155056;REFB=-0.0133656;REVB=0.00600256;RO=51;SAF=14;SAR=9;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725982;STB=0.530661;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0305774;OID=.;OPOS=73246461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:51:51:23:24:0.32:9:14:34:17:9:15:34:17 chr7 73246496 . C T 295.69 PASS AF=0.373626;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=0.00372403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.205;QD=12.9973;RBI=0.00374679;REFB=-0.00336386;REVB=-0.00041237;RO=57;SAF=19;SAR=15;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101858;STB=0.558106;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00327827;OID=.;OPOS=73246496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:57:57:34:34:0.373626:15:19:37:20:15:19:37:20 chr7 73246555 . C G 261.2 PASS AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0187291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.652;QD=12.2917;RBI=0.0225848;REFB=-0.0238934;REVB=-0.0126212;RO=54;SAF=18;SAR=13;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562155;STB=0.532263;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0435435;OID=.;OPOS=73246555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:13:18:34:20:13:18:34:20 chr7 73249165 . T A 148.04 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0203095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.695;QD=17.9444;RBI=0.020707;REFB=-0.0100609;REVB=-0.00403776;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292813;STB=0.666465;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0133423;OID=.;OPOS=73249165;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:6:10:5:12:6:10:5:12 chr7 73249299 . G C 100.73 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00350914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.178;QD=16.1163;RBI=0.0105546;REFB=-0.0163898;REVB=-0.00995416;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506435;STB=0.529362;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0257093;OID=.;OPOS=73249299;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:8:4:5:8:8:4:5:8 chr7 73254812 . T C 120.12 PASS AF=0.444444;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.090445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4037;QD=17.7962;RBI=0.090818;REFB=-0.0277882;REVB=0.00822359;RO=10;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599807;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0494115;OID=.;OPOS=73254812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:10:13:11:12:0.444444:11:0:0:10:11:1:2:11 chr7 73275565 . T A 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0450098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.473;QD=8.69803;RBI=0.0451939;REFB=0.0154647;REVB=0.00407495;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376308;STB=0.726721;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.028136;OID=.;OPOS=73275565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:3:11:3:4:3:11 chr7 73535310 . GC CG 43.88 PASS AF=0.121951;AO=5;DP=42;FAO=5;FDP=41;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=29;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=3;FWDB=-0.124844;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=2;MLLD=37.9159;QD=4.28072;RBI=0.160111;REFB=-0.0582027;REVB=-0.100247;RO=21;SAF=2;SAR=3;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596946;STB=0.874227;STBP=0.411;TYPE=mnp;VARB=0.054861;OID=.;OPOS=73535310;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:42:41:21:29:5:5:0.121951:3:2:19:2:3:2:26:3 chr7 73814749 . G C 1486.5 PASS AF=0.981308;AO=97;DP=100;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0626465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.5631;QD=55.5702;RBI=0.0628156;REFB=-0.161953;REVB=-0.00460539;RO=3;SAF=51;SAR=46;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00803627;STB=0.501175;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0129684;OID=.;OPOS=73814749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:100:107:3:2:97:105:0.981308:46:51:2:1:46:59:1:1 chr7 73944185 . T C 223.6 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00193828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.88;QD=26.3057;RBI=0.00644984;REFB=0.0174127;REVB=0.00615171;RO=12;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701954;STB=0.523787;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.00823515;OID=.;OPOS=73944185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:12:13:21:21:0.617647:11:10:7:5:11:10:7:6 chr7 73969541 . A G 118.25 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0469066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.916;QD=12.7835;RBI=0.046908;REFB=-0.0189285;REVB=-0.000367049;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20862;STB=0.621458;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0589688;OID=.;OPOS=73969541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:7:7:7:16:7:7:7:16 chr7 74193668 . G A 93.4 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00726322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.667;QD=19.6622;RBI=0.0238698;REFB=-0.040051;REVB=-0.0227379;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172885;STB=0.615197;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0303905;OID=.;OPOS=74193668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:18:19:7:8:11:11:0.578947:7:4:1:6:7:4:1:7 chr7 75051375 . T C 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0575066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3032;QD=16.8226;RBI=0.0674525;REFB=0.00647703;REVB=0.0352538;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477379;STB=0.777056;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.00698392;OID=.;OPOS=75051375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:5:0:5:2:5:0 chr7 75441111 . G T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00542006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.657;QD=37.4885;RBI=0.014111;REFB=0;REVB=0.0130286;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.0001e-05;OID=.;OPOS=75441111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr7 75442730 . T G 818.13 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3996;QD=57.4127;RBI=0.0450452;REFB=0;REVB=-0.00914209;RO=0;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164422;OID=.;OPOS=75442730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:39:16:0:0:40:17:0:0 chr7 75513062 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.572;QD=60.9784;RBI=0.0403608;REFB=0;REVB=0.0083041;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308368;OID=.;OPOS=75513062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr7 75597545 . C T 728.94 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8173;QD=57.1718;RBI=0.0726565;REFB=0;REVB=0.0617216;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013211;OID=.;OPOS=75597545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0 chr7 75609677 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.912;QD=45.8068;RBI=0.0407037;REFB=0;REVB=-0.00611134;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324965;OID=.;OPOS=75609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr7 75614953 . T C 808.46 PASS AF=1;AO=53;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207895;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5111;QD=57.7471;RBI=0.103654;REFB=0;REVB=0.101548;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351601;OID=.;OPOS=75614953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:53:56:1:22:31:0:0:25:31:0:0 chr7 75621827 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000738676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.175;QD=57.2021;RBI=0.0300876;REFB=0;REVB=0.0300785;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218442;OID=.;OPOS=75621827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr7 75629778 . T C 868.72 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.303;QD=57.9149;RBI=0.0517515;REFB=0;REVB=0.04214;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.7894e-05;OID=.;OPOS=75629778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:24:33:0:0:25:35:0:0 chr7 75630274 . T C 554.42 PASS AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0146349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2848;QD=55.4422;RBI=0.0255491;REFB=-0.0876801;REVB=0.0209422;RO=2;SAF=19;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0333009;OID=.;OPOS=75630274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:19:19:1:1:19:19:1:1 chr7 75659815 . T C 1494.27 PASS AF=0.990196;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164384;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.593;QD=58.5988;RBI=0.0251314;REFB=0.0061819;REVB=0.0190096;RO=1;SAF=44;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825107;STB=0.504347;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=6.04749e-06;OID=.;OPOS=75659815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:104:102:1:1:101:101:0.990196:57:44:0:1:57:44:0:1 chr7 75716765 . C T 60.33 PASS AF=0.164179;AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=67;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.000877677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.124;QD=3.60187;RBI=0.0334931;REFB=0.000804049;REVB=0.0334816;RO=56;SAF=3;SAR=8;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249656;STB=0.670196;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00353114;OID=.;OPOS=75716765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:67:67:56:56:11:11:0.164179:8:3:26:30:8:3:26:30 chr7 75716781 . G A 61.61 PASS AF=0.169231;AO=11;DP=65;FAO=11;FDP=65;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0257788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.215;QD=3.79127;RBI=0.0297309;REFB=-0.00419528;REVB=-0.0148114;RO=54;SAF=3;SAR=8;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227347;STB=0.65425;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.031006;OID=.;OPOS=75716781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:65:65:54:54:11:11:0.169231:8:3:24:30:8:3:24:30 chr7 75716789 . C A 47.32 PASS AF=0.140625;AO=9;DP=64;FAO=9;FDP=64;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00258172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.227;QD=2.95737;RBI=0.0150894;REFB=-0.000160014;REVB=-0.0148669;RO=55;SAF=3;SAR=6;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131137;STB=0.593193;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00115732;OID=.;OPOS=75716789;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:64:64:55:55:9:9:0.140625:6:3:24:31:6:3:24:31 chr7 75716799 . A G 38.3 PASS AF=0.117647;AO=8;DP=68;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0383086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.963;QD=2.25285;RBI=0.0620363;REFB=-0.0145334;REVB=-0.0487951;RO=60;SAF=2;SAR=6;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251576;STB=0.689974;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0458447;OID=.;OPOS=75716799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:68:68:60:60:8:8:0.117647:6:2:27:33:6:2:27:33 chr7 76019590 . C T 365.19 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0305475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.851;QD=52.1705;RBI=0.0379944;REFB=-0.146149;REVB=0.0225926;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320562;STB=0.517229;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00243174;OID=.;OPOS=76019590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:14:13:0:1:14:13:0:1 chr7 76029760 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.043;QD=53.2772;RBI=0.0743354;REFB=0;REVB=0.0417183;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032757;OID=.;OPOS=76029760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr7 76069811 . T C 1035.82 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.832;QD=59.1895;RBI=0.0295678;REFB=0;REVB=0.0290127;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00479e-05;OID=.;OPOS=76069811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr7 76112060 . C T 175.89 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.008;QD=46.9038;RBI=0.0512426;REFB=0;REVB=0.0332723;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532332;OID=.;OPOS=76112060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:5:9:0:0:5:10:0:0 chr7 76131645 . A G 1080.51 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.449;QD=60.0283;RBI=0.0158601;REFB=0;REVB=-0.0120388;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77074e-06;OID=.;OPOS=76131645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0 chr7 76144455 . A C 375.6 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.05536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.332;QD=55.6445;RBI=0.055375;REFB=0;REVB=0.00128748;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330575;OID=.;OPOS=76144455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:22:5:0:0:22:5:0:0 chr7 76144560 . T C,G 171.75 PASS AF=0.866667,0.133333;AO=13,2;DP=15;FAO=13,2;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3,2;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0814691,0.0124159;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=91.3348,54.0755;QD=45.799;RBI=0.0855368,0.0185798;REFB=0,0;REVB=0.0260642,0.0138223;RO=0;SAF=3,2;SAR=10,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000895354,0.0700561;OID=.,.;OPOS=76144560,76144560;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:15:15:0:0:13,2:13,2:0.866667,0.133333:10,0:3,2:0:0:10,0:3,2:0:0 chr7 76239503 . G GC 199.31 PASS AF=1;AO=19;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.0121;QD=36.2386;RBI=0.0452716;REFB=0;REVB=-0.0277402;RO=1;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612242;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00230925;OID=.;OPOS=76239504;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:22:22:22:0:13:9:0:0:4:1:12:7:0:1 chr7 76240785 . CA C,CG 757.32 PASS AF=0.981481,0.0185185;AO=50,3;DP=53;FAO=53,1;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27,1;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163838,-0.0352272;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.313,110.847;QD=56.0975;RBI=0.0220627,0.0396328;REFB=0,0;REVB=0.0147761,0.0181605;RO=0;SAF=24,3;SAR=26,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.10374e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000143089,-0.014032;OID=.,.;OPOS=76240786,76240786;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.981481,0.0185185:50,3:53:53,1:54:0:27,1:26,0:0:0:3:0:24,3:26,0:0:0 chr7 76240888 . A G 942.58 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.492;QD=58.0047;RBI=0.0471981;REFB=0;REVB=0.0203524;RO=0;SAF=45;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279264;OID=.;OPOS=76240888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:19:45:0:0:19:46:0:0 chr7 76241068 . C T 867.59 PASS AF=0.953846;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00708572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3519;QD=53.3904;RBI=0.0350516;REFB=-0.115689;REVB=-0.0343279;RO=1;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016002;STB=0.524582;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00528143;OID=.;OPOS=76241068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:65:65:1:3:62:62:0.953846:29:33:0:1:29:33:0:3 chr7 76885769 . A G 490.5 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0419345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.163;QD=56.057;RBI=0.0466746;REFB=-0.175108;REVB=0.0204944;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521726;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00266203;OID=.;OPOS=76885769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:35:35:0:1:34:34:0.971429:23:11:0:0:23:11:1:0 chr7 77035392 . T C 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00015758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.775;QD=59.8393;RBI=0.0428568;REFB=0;REVB=0.0428566;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255263;OID=.;OPOS=77035392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0 chr7 77053084 . T C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0857478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9816;QD=53.2772;RBI=0.130263;REFB=0;REVB=0.0980599;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340649;OID=.;OPOS=77053084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr7 77247821 . G A 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8004;QD=60.5471;RBI=0.0258729;REFB=0;REVB=-0.0252411;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106083;OID=.;OPOS=77247821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:37:38:0:0:37:38:0:0 chr7 77256713 . A G 352.71 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0381777;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.972;QD=52.253;RBI=0.0383233;REFB=0.00995632;REVB=0.00333817;RO=1;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265471;STB=0.514275;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-5.59126e-05;OID=.;OPOS=77256713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:28:27:1:1:26:26:0.962963:17:9:0:1:17:9:0:1 chr7 77552127 . G A 837.2 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00471859;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.564;QD=57.7376;RBI=0.00719833;REFB=0;REVB=0.00543607;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12133e-05;OID=.;OPOS=77552127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr7 77648671 . G C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0824216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.863;QD=37.4885;RBI=0.0869856;REFB=0;REVB=0.0278061;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213293;OID=.;OPOS=77648671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr7 77756580 . T C 1358.55 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.103;QD=62.4622;RBI=0.0307577;REFB=0;REVB=0.0301558;RO=0;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61643e-05;OID=.;OPOS=77756580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:40:47:0:0:40:47:0:0 chr7 77756724 . C T 1276.45 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.163;QD=60.7834;RBI=0.0302508;REFB=0;REVB=0.0102801;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101883;OID=.;OPOS=77756724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:84:84:0:0:83:84:1:42:41:0:0:43:41:0:0 chr7 78119109 . C T 1580.23 PASS AF=0.932773;AO=111;DP=119;FAO=111;FDP=119;FR=.;FRO=8;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.000883263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0044;QD=53.1171;RBI=0.0108526;REFB=0.000767833;REVB=0.0108166;RO=8;SAF=56;SAR=55;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164869;STB=0.508704;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.000463065;OID=.;OPOS=78119109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:119:119:8:8:111:111:0.932773:55:56:3:5:55:56:3:5 chr7 80088041 . G A 1614.67 PASS AF=0.990909;AO=108;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00196419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.495;QD=58.7154;RBI=0.0230481;REFB=-0.0312846;REVB=0.0229642;RO=1;SAF=60;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978608;STB=0.505154;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000135897;OID=.;OPOS=80088041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:110:1:1:108:109:0.990909:48:60:0:1:48:61:0:1 chr7 80374342 . A G 2206.56 PASS AF=0.973856;AO=149;DP=154;FAO=149;FDP=153;FR=.;FRO=4;FSAF=71;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00281624;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4805;QD=57.6879;RBI=0.0147091;REFB=-0.000904115;REVB=0.0144369;RO=3;SAF=71;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00538647;STB=0.505937;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-4.84129e-05;OID=.;OPOS=80374342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:154:153:3:4:149:149:0.973856:78:71:1:2:78:71:1:3 chr7 80374438 . T C 568.49 PASS AF=0.483607;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.00622202;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.951;QD=18.6389;RBI=0.006235;REFB=3.09164e-05;REVB=-0.000402162;RO=63;SAF=20;SAR=39;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193825;STB=0.607579;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-6.48717e-05;OID=.;OPOS=80374438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:63:63:59:59:0.483607:39:20:34:29:39:20:34:29 chr7 80378319 . G C 581.92 PASS AF=0.401198;AO=67;DP=167;FAO=67;FDP=167;FR=.;FRO=100;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=62;FWDB=-0.00210616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.895;QD=13.9382;RBI=0.0106632;REFB=-0.00446633;REVB=-0.0104532;RO=99;SAF=24;SAR=43;SRF=37;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177943;STB=0.514072;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0062041;OID=.;OPOS=80378319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:99:100:67:67:0.401198:43:24:37:62:43:24:38:62 chr7 80387766 . C T 343.81 PASS AF=0.371681;AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=49;FWDB=0.0138271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0382;QD=12.1703;RBI=0.0263864;REFB=0.022912;REVB=-0.0224734;RO=70;SAF=17;SAR=25;SRF=22;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105716;STB=0.563339;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.0378228;OID=.;OPOS=80387766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:70:71:42:42:0.371681:25:17:22:48:25:17:22:49 chr7 80427530 . C T 964.36 PASS AF=0.448133;AO=82;DP=245;FAO=108;FDP=241;FR=.,HEALED;FRO=133;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=51;FSRR=82;FWDB=0.0155008;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.52;QD=16.006;RBI=0.0155191;REFB=-0.0202905;REVB=0.000751698;RO=135;SAF=48;SAR=34;SRF=52;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217938;STB=0.53433;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0234226;OID=.;OPOS=80427530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:241:135:133:82:108:0.448133:34:48:52:83:60:48:51:82 chr7 80962963 . A T 821.58 PASS AF=0.3875;AO=93;DP=241;FAO=93;FDP=240;FR=.;FRO=147;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=69;FWDB=-0.00524926;FXX=0.00414921;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.605;QD=13.693;RBI=0.0196244;REFB=0.00195211;REVB=-0.0189093;RO=146;SAF=39;SAR=54;SRF=77;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117774;STB=0.568406;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00366088;OID=.;OPOS=80962963;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:146:147:93:93:0.3875:54:39:77:69:54:39:78:69 chr7 81579714 . C T 590.04 PASS AF=0.446043;AO=62;DP=139;FAO=62;FDP=139;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.000907097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.168;QD=16.9794;RBI=0.0232796;REFB=0.000998544;REVB=-0.023262;RO=77;SAF=38;SAR=24;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953318;STB=0.553205;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.00144821;OID=.;OPOS=81579714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:77:77:62:62:0.446043:24:38:40:37:24:38:40:37 chr7 82435033 . C T 538.87 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00176733;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.179;QD=21.7724;RBI=0.0153533;REFB=-0.0183412;REVB=0.0152513;RO=48;SAF=19;SAR=32;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786761;STB=0.543479;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0166411;OID=.;OPOS=82435033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:32:19:22:26:32:19:22:26 chr7 82453708 . A C 2242.48 PASS AF=0.993007;AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0102414;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.174;QD=62.7268;RBI=0.0246027;REFB=-0.0984516;REVB=0.0223698;RO=0;SAF=66;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20007e-08;STB=0.503267;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-6.09042e-05;OID=.;OPOS=82453708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:144:143:0:1:142:142:0.993007:76:66:0:0:76:66:0:1 chr7 82455895 . A G 1138.6 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00561206;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=357.474;QD=60.7251;RBI=0.00561248;REFB=0;REVB=6.87521e-05;RO=1;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114011;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67152e-06;OID=.;OPOS=82455895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:75:1:0:75:75:1:41:34:0:1:41:34:0:0 chr7 82581488 . T TTCA 660.84 PASS AF=0.9;AO=38;DP=52;FAO=45;FDP=50;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0105963;FXX=0;HRUN=5;LEN=3;MLLD=295.911;QD=52.8668;RBI=0.013345;REFB=-0.055353;REVB=0.00811221;RO=7;SAF=21;SAR=17;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476005;STB=0.506699;STBP=0.796;TYPE=ins;VARB=0.00363425;OID=.;OPOS=82581489;OREF=-;OALT=TCA;OMAPALT=TTCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.9:38:52:45:50:5:24:21:3:2:24:7:21:17:5:2 chr7 82764425 . C G 793.67 PASS AF=1;AO=50;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.631;QD=56.6908;RBI=0.0482401;REFB=0;REVB=0.0479883;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153434;OID=.;OPOS=82764425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:50:56:1:27:23:0:0:33:23:0:0 chr7 82784832 . C G 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0262403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4534;QD=19.3696;RBI=0.0401964;REFB=-0.0284582;REVB=-0.0304499;RO=15;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811631;STB=0.54616;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0169543;OID=.;OPOS=82784832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:6:10:8:7:6:10:8:7 chr7 83023587 . TAC T 1344.85 PASS AF=1;AO=77;DP=94;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443468;FXX=0.13264;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.349;QD=63.2872;RBI=0.116813;REFB=0;REVB=0.108067;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000293916;OID=.;OPOS=83023588;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:77:94:85:85:0:43:42:0:0:7:0:41:36:0:0 chr7 83029438 . C T 2406.06 PASS AF=0.987578;AO=157;DP=159;FAO=159;FDP=161;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0150666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.858;QD=59.7779;RBI=0.0164483;REFB=-0.0268078;REVB=-0.00659888;RO=1;SAF=73;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563045;STB=0.505882;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.000700776;OID=.;OPOS=83029438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:159:161:1:2:157:159:0.987578:84:73:0:1:84:75:0:2 chr7 83034754 . T A 2309.57 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.89;QD=63.7123;RBI=0.00386438;REFB=0;REVB=-0.00344654;RO=2;SAF=80;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148543;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.92566e-07;OID=.;OPOS=83034754;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:145:2:0:143:145:1:63:80:0:2:65:80:0:0 chr7 83037751 . C A 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3102;QD=64.4123;RBI=0.0487417;REFB=0;REVB=0.0458921;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265131;OID=.;OPOS=83037751;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0 chr7 83590852 . T C 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00482297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1762;QD=59.6788;RBI=0.00935797;REFB=0;REVB=-0.00801938;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57952e-05;OID=.;OPOS=83590852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0 chr7 83606518 . G A 1098.5 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.077;QD=60.192;RBI=0.026224;REFB=0;REVB=3.03563e-06;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47205e-05;OID=.;OPOS=83606518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:39:33:0:0:39:34:0:0 chr7 84628989 . T G 757.68 PASS AF=0.475904;AO=79;DP=169;FAO=79;FDP=166;FR=.;FRO=87;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=54;FSRR=33;FWDB=0.00371859;FXX=0.0177504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.681;QD=18.2572;RBI=0.00531384;REFB=-0.0151225;REVB=0.00379591;RO=86;SAF=36;SAR=43;SRF=53;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150588;STB=0.58581;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0192408;OID=.;OPOS=84628989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:166:86:87:79:79:0.475904:43:36:53:33:43:36:54:33 chr7 86577142 . AAT A,ATT 74.74 PASS AF=0.244898,0;AO=13,4;DP=61;FAO=12,0;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=7,0;FSAR=5,0;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.111095,-0.0116949;FXX=0.0925755;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=29.4854,23.8913;QD=6.10121;RBI=0.111102,0.0685281;REFB=-0.047503,0.0150892;REVB=0.00125919,0.0675228;RO=38;SAF=8,4;SAR=5,0;SRF=20;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.109263,0.564399;STB=0.553175,0.5;STBP=0.695,1;TYPE=del,snp;VARB=0.138489,0;OID=.,.;OPOS=86577143,86577143;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.244898,0:13,4:61:12,0:49:37:7,0:5,0:19:18:75:38:8,4:5,0:20:18 chr7 86800351 . A G 1307.3 PASS AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0404117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.878;QD=60.8048;RBI=0.0678842;REFB=-0.161883;REVB=0.054545;RO=1;SAF=30;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00853642;STB=0.504503;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000932374;OID=.;OPOS=86800351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:86:86:1:1:85:85:0.988372:55:30:0:1:55:30:0:1 chr7 87082292 . G A 658.05 PASS AF=0.492537;AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=134;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0110007;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8819;QD=19.6432;RBI=0.0199174;REFB=-0.00918262;REVB=-0.0166039;RO=67;SAF=34;SAR=32;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750364;STB=0.537477;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00924883;OID=.;OPOS=87082292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:67:68:66:66:0.492537:32:34:29:38:32:34:30:38 chr7 87138645 . A G 1951.89 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000570619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1108;QD=61.9648;RBI=0.00568914;REFB=0;REVB=0.00566045;RO=0;SAF=63;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33592e-05;OID=.;OPOS=87138645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:63:63:0:0:63:63:0:0 chr7 87160618 . A C 414.49 PASS AF=0.532468;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00553012;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.349;QD=21.532;RBI=0.005584;REFB=-0.0182606;REVB=0.0007739;RO=36;SAF=22;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310419;STB=0.517145;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0137232;OID=.;OPOS=87160618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:36:36:41:41:0.532468:19:22:18:18:19:22:18:18 chr7 87229501 . T C 1008.04 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1866;QD=59.2962;RBI=0.029384;REFB=0;REVB=-0.0184939;RO=0;SAF=23;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000366193;OID=.;OPOS=87229501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:45:23:0:0:45:23:0:0 chr7 87743979 . T C 692.22 PASS AF=0.485915;AO=69;DP=142;FAO=69;FDP=142;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.0351936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.987;QD=19.4993;RBI=0.0357699;REFB=-0.0206253;REVB=0.00639512;RO=72;SAF=30;SAR=39;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302465;STB=0.512496;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0207116;OID=.;OPOS=87743979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:72:73:69:69:0.485915:39:30:29:43:39:30:30:43 chr7 87813635 . C T 380.88 PASS AF=0.415094;AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.00140332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.597;QD=14.3728;RBI=0.0102791;REFB=0.000199237;REVB=0.0101829;RO=62;SAF=21;SAR=23;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435485;STB=0.524537;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.000248241;OID=.;OPOS=87813635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:62:62:44:44:0.415094:23:21:27:35:23:21:27:35 chr7 87913361 . C T 937.57 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6971;QD=58.598;RBI=0.0325279;REFB=0;REVB=-0.00479018;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272002;OID=.;OPOS=87913361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0 chr7 88956699 . A G 5600.6 PASS AF=1;AO=354;DP=356;FAO=357;FDP=357;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=192;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.49;QD=62.7518;RBI=0.0349275;REFB=0;REVB=0.0271557;RO=1;SAF=163;SAR=191;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00291824;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34025e-05;OID=.;OPOS=88956699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:356:357:1:0:354:357:1:191:163:1:0:192:165:0:0 chr7 88963039 . G A 221.11 PASS AF=0.740741;AO=20;DP=27;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0596737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.664;QD=32.7571;RBI=0.0705953;REFB=-0.0187394;REVB=-0.0377192;RO=7;SAF=11;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574354;STB=0.531567;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0044462;OID=.;OPOS=88963039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:7:7:20:20:0.740741:9:11:3:4:9:11:3:4 chr7 88964000 . C T 164.11 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.000732965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.703;QD=11.1262;RBI=0.00791625;REFB=-0.00159841;REVB=-0.00788225;RO=38;SAF=6;SAR=15;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195818;STB=0.614858;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00203829;OID=.;OPOS=88964000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:15:6:17:21:15:6:17:21 chr7 88964196 . T A 389.15 PASS AF=0.4;AO=46;DP=113;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.00997307;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.851;QD=13.5356;RBI=0.0121208;REFB=-0.0097358;REVB=-0.00688853;RO=66;SAF=15;SAR=31;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127433;STB=0.570521;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0193197;OID=.;OPOS=88964196;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:66:69:46:46:0.4:31:15:29:37:31:15:30:39 chr7 89797144 . G T 2110.08 PASS AF=1;AO=133;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.438;QD=62.521;RBI=0.032942;REFB=0;REVB=0.0200615;RO=0;SAF=96;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26865e-05;OID=.;OPOS=89797144;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:135:0:0:133:135:1:37:96:0:0:38:97:0:0 chr7 89854446 . T G 399.33 PASS AF=0.42;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=5.52431e-06;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=151.573;QD=15.973;RBI=0.014706;REFB=0.00362712;REVB=0.014706;RO=58;SAF=20;SAR=22;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646259;STB=0.536381;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=-0.00464056;OID=.;OPOS=89854446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:58:42:42:0.42:22:20:24:34:22:20:24:34 chr7 89856608 . C T 592.32 PASS AF=0.452555;AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.0309213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.69;QD=17.2941;RBI=0.0368236;REFB=-0.00279412;REVB=-0.0199963;RO=75;SAF=28;SAR=34;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673699;STB=0.537506;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00317758;OID=.;OPOS=89856608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:75:75:62:62:0.452555:34:28:39:36:34:28:39:36 chr7 89861832 . G A 364.52 PASS AF=0.520548;AO=37;DP=71;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0051524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.544;QD=19.9734;RBI=0.0357367;REFB=-0.00886517;REVB=0.0353633;RO=32;SAF=14;SAR=23;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156917;STB=0.585753;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00985619;OID=.;OPOS=89861832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:32:35:37:38:0.520548:23:14:18:14:24:14:19:16 chr7 89861890 . G T 520.04 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.3563;QD=59.4328;RBI=0.0225294;REFB=0;REVB=0.0119265;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518055;OID=.;OPOS=89861890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0 chr7 89867446 . T TCTG 520.75 PASS AF=0.531915;AO=47;DP=102;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0133279;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=3;MLLD=266.023;QD=22.1594;RBI=0.0178448;REFB=-0.0341497;REVB=0.011866;RO=54;SAF=23;SAR=24;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279582;STB=0.54119;STBP=0.422;TYPE=ins;VARB=0.033751;OID=.;OPOS=89867447;OREF=-;OALT=CTG;OMAPALT=TCTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.531915:47:102:50:94:44:24:26:25:19:99:54:23:24:28:26 chr7 89881239 . G C 385.35 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0143768;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.182;QD=17.9231;RBI=0.0224684;REFB=0.00799923;REVB=0.0172666;RO=45;SAF=22;SAR=18;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581289;STB=0.538442;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0098117;OID=.;OPOS=89881239;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:46:40:40:0.465116:18:22:22:23:18:22:22:24 chr7 89906609 . C T 417.39 PASS AF=0.410256;AO=47;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.00352861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.521;QD=14.2696;RBI=0.00461689;REFB=-0.00139674;REVB=-0.00297734;RO=68;SAF=24;SAR=23;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165253;STB=0.592883;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0023315;OID=.;OPOS=89906609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:68:69:47:48:0.410256:23:24:24:44:23:25:25:44 chr7 89912301 . G A 816.87 PASS AF=1;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00421706;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.948;QD=56.3358;RBI=0.00461906;REFB=-0.0577677;REVB=0.00188471;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532761;OID=.;OPOS=89912301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:59:58:0:0:57:58:1:30:27:0:0:31:27:0:0 chr7 89938588 . C G 1439.03 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0485751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9002;QD=61.8939;RBI=0.0489848;REFB=0.00633095;REVB=0.006322;RO=1;SAF=39;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119989;STB=0.506171;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000408539;OID=.;OPOS=89938588;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:1:1:91:92:0.989247:52:39:1:0:52:40:1:0 chr7 89938680 . C T 394.53 PASS AF=0.450549;AO=40;DP=90;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0314882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.46;QD=17.3418;RBI=0.0372319;REFB=-0.0259864;REVB=0.0198672;RO=50;SAF=14;SAR=26;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945515;STB=0.55795;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0205318;OID=.;OPOS=89938680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:50:50:40:41:0.450549:26:14:22:28:27:14:22:28 chr7 89969831 . A G 434.95 PASS AF=0.429825;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.00598202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.825;QD=15.2613;RBI=0.00606617;REFB=-0.0148104;REVB=-0.00100693;RO=65;SAF=23;SAR=26;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389573;STB=0.521855;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0214997;OID=.;OPOS=89969831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:65:65:49:49:0.429825:26:23:33:32:26:23:33:32 chr7 89969878 . A G 303.33 PASS AF=0.357143;AO=35;DP=98;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.00650739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.7982;QD=12.3808;RBI=0.0139042;REFB=0.0124193;REVB=0.0122874;RO=63;SAF=14;SAR=21;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147265;STB=0.50847;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.032129;OID=.;OPOS=89969878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:63:63:35:35:0.357143:21:14:26:37:21:14:26:37 chr7 89983808 . T G 625.31 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.16;QD=61.0056;RBI=0.034596;REFB=0;REVB=0.0282392;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04594e-05;OID=.;OPOS=89983808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:18:20:0:0:20:21:0:0 chr7 89984409 . A G 1108.67 PASS AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00212027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.775;QD=57.5934;RBI=0.0359192;REFB=-0.0790603;REVB=0.0358565;RO=2;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255586;STB=0.51351;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00236552;OID=.;OPOS=89984409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:36:39:0:2:36:39:0:2 chr7 90042857 . G T 728.05 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.287;QD=57.102;RBI=0.0269507;REFB=0;REVB=0.0162716;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246925;OID=.;OPOS=90042857;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0 chr7 90043182 . A G 1358.62 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00092063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.192;QD=62.4652;RBI=0.00805088;REFB=0;REVB=0.00799807;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63543e-05;OID=.;OPOS=90043182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:44:43:0:0:44:43:0:0 chr7 90043304 . C T 1517.22 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047787;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.653;QD=63.8829;RBI=0.0514778;REFB=0;REVB=-0.0191407;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94024e-05;OID=.;OPOS=90043304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:95:0:0:95:95:1:56:39:0:0:56:39:0:0 chr7 90043314 . C T 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00683312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.627;QD=64.0211;RBI=0.0140848;REFB=0;REVB=-0.0123162;RO=0;SAF=42;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.52016e-06;OID=.;OPOS=90043314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:56:42:0:0:56:42:0:0 chr7 90236415 . A G 1061.98 PASS AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0315926;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.34;QD=57.4045;RBI=0.0407705;REFB=-0.129657;REVB=0.0257709;RO=2;SAF=29;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00515698;STB=0.508472;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000733529;OID=.;OPOS=90236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:2:1:72:73:0.986486:43:29:1:1:44:29:1:0 chr7 90836916 . C A 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0265603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.053;QD=21.0649;RBI=0.0280753;REFB=-0.0199774;REVB=-0.00909815;RO=24;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037189;STB=0.520888;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0199986;OID=.;OPOS=90836916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:13:11:12:12:13:11:12:12 chr7 90837216 . G A 375.41 PASS AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0114846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.929;QD=15.8068;RBI=0.011498;REFB=-0.0119882;REVB=-0.000554643;RO=55;SAF=15;SAR=25;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046594;STB=0.526302;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0203665;OID=.;OPOS=90837216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:55:55:40:40:0.421053:25:15:23:32:25:15:23:32 chr7 90838866 . G A 318.4 PASS AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00785596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.003;QD=18.1942;RBI=0.0080047;REFB=-0.00924877;REVB=-0.00153591;RO=35;SAF=12;SAR=22;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460628;STB=0.535114;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00898658;OID=.;OPOS=90838866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:36:34:34:0.485714:22:12:14:21:22:12:15:21 chr7 90838869 . G C 1062.37 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3699;QD=59.8519;RBI=0.0322697;REFB=0;REVB=0.0136071;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251051;OID=.;OPOS=90838869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0 chr7 91503228 . C T 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.14507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.917;QD=53.9107;RBI=0.146706;REFB=0;REVB=-0.021845;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107224;OID=.;OPOS=91503228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr7 91632306 . C T 187.39 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0100974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.8;QD=14.6972;RBI=0.0296634;REFB=-0.0201516;REVB=-0.027892;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978491;STB=0.505613;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0278687;OID=.;OPOS=91632306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:11:10:14:16:11:10:14:16 chr7 91708898 . A G 133.45 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0381864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.058;QD=15.7005;RBI=0.0390432;REFB=-0.00827156;REVB=-0.00813426;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577034;STB=0.533289;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0109963;OID=.;OPOS=91708898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:10:9:8:7:10:9 chr7 91714911 . C T 1719.77 PASS AF=0.982906;AO=113;DP=116;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0186667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.261;QD=58.7955;RBI=0.0186695;REFB=-0.000459065;REVB=0.00032207;RO=2;SAF=61;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00132307;STB=0.500825;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=2.70198e-05;OID=.;OPOS=91714911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:116:117:2:2:113:115:0.982906:52:61:1:1:52:63:1:1 chr7 92028039 . C A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.902;QD=50.4134;RBI=0.0406351;REFB=0;REVB=0.0386923;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030595;OID=.;OPOS=92028039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr7 92029302 . G A 1624.37 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2483;QD=60.1618;RBI=0.0135572;REFB=0;REVB=0.00632493;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18025e-05;OID=.;OPOS=92029302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0 chr7 92098776 . C T 1246.1 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00675533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.165;QD=61.5356;RBI=0.0322571;REFB=0;REVB=-0.0315418;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130433;OID=.;OPOS=92098776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:38:43:0:0:38:43:0:0 chr7 92123671 . A G 188.88 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0714263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.536;QD=11.1105;RBI=0.0726353;REFB=0.00402501;REVB=-0.0131974;RO=44;SAF=7;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292121;STB=0.670337;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00759294;OID=.;OPOS=92123671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:17:7:24:20:17:7:24:20 chr7 92131289 . G T 215.43 PASS AF=0.329268;AO=27;DP=83;FAO=27;FDP=82;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.019958;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.884;QD=10.5086;RBI=0.024523;REFB=5.64545e-05;REVB=-0.0142497;RO=55;SAF=12;SAR=15;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117261;STB=0.506844;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=-0.000206604;OID=.;OPOS=92131289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:55:55:27:27:0.329268:15:12:25:30:15:12:25:30 chr7 92236829 . A G 292.19 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00507429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2422;QD=14.6095;RBI=0.0159913;REFB=-0.0102653;REVB=0.0151648;RO=47;SAF=13;SAR=20;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14427;STB=0.581879;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0168206;OID=.;OPOS=92236829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:20:13:25:22:20:13:25:22 chr7 92237396 . A T 175.8 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00172223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.088;QD=11.9187;RBI=0.00341878;REFB=-0.00836131;REVB=0.0029533;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508467;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0146213;OID=.;OPOS=92237396;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:36:37:22:22:0.372881:11:11:18:18:11:11:19:18 chr7 92241633 . G C 330.63 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0234953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.699;QD=23.6162;RBI=0.0245181;REFB=-0.0260993;REVB=0.00700767;RO=23;SAF=14;SAR=19;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105672;STB=0.55818;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0163187;OID=.;OPOS=92241633;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:19:14:13:10:19:14:13:10 chr7 92247462 . G C 431.07 PASS AF=0.468085;AO=42;DP=92;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0316557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.789;QD=18.3434;RBI=0.0328234;REFB=-0.0220357;REVB=0.00867705;RO=50;SAF=26;SAR=16;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19428;STB=0.603451;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0189598;OID=.;OPOS=92247462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:50:50:42:44:0.468085:16:26:21:29:17:27:21:29 chr7 92600509 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.436;QD=53.9112;RBI=0.0729247;REFB=0;REVB=0.0534006;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000559246;OID=.;OPOS=92600509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr7 92985305 . C G 397.08 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.00190162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.995;QD=23.3576;RBI=0.0128633;REFB=-0.0166568;REVB=0.012722;RO=29;SAF=29;SAR=10;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899541;STB=0.549199;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0142094;OID=.;OPOS=92985305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:10:29:24:5:10:29:24:5 chr7 93054827 . C CTCTT,T 993.29 PASS AF=0.848837,0;AO=62,5;DP=92;FAO=73,0;FDP=86;FR=.;FRO=13;FSAF=58,0;FSAR=15,0;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.016216,0.00984591;FXX=0.0114929;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=174.299,173.887;QD=46.1995;RBI=0.0195833,0.0168949;REFB=-0.0163175,-0.0188692;REVB=-0.0109794,-0.0137293;RO=20;SAF=51,5;SAR=11,0;SRF=18;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0631067,0.587619;STB=0.530831,0.5;STBP=0.322,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0013327,0;OID=.,.;OPOS=93054828,93054827;OREF=-,C;OALT=TCTT,T;OMAPALT=CTCTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:92:86:20:13:62,5:73,0:0.848837,0:11,0:51,5:18:2:15,0:58,0:12:1 chr7 93055344 . T G 375.46 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.0047168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0722;QD=18.3152;RBI=0.00866582;REFB=-0.00784056;REVB=-0.00726968;RO=43;SAF=23;SAR=16;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131322;STB=0.572909;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00854059;OID=.;OPOS=93055344;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:16:23:31:12:16:23:31:12 chr7 93055650 . G A 1645.36 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00632119;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5103;QD=60.3803;RBI=0.00958423;REFB=0;REVB=-0.00720417;RO=0;SAF=49;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56602e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329911;OID=.;OPOS=93055650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:60:49:0:0:60:49:0:0 chr7 93055753 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.719;QD=64.4152;RBI=0.0246339;REFB=0;REVB=0.0228156;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010638;OID=.;OPOS=93055753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0 chr7 93116299 . A G 200.39 PASS AF=0.444444;AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.000571095;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.131;QD=14.8436;RBI=0.00239443;REFB=-0.0128103;REVB=0.00232532;RO=25;SAF=5;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408918;STB=0.6766;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00940317;OID=.;OPOS=93116299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:25:30:22:24:0.444444:17:5:16:9:17:7:18:12 chr7 93515993 . T G 164.37 PASS AF=0.375;AO=17;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0167723;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=157.972;QD=13.6978;RBI=0.0176071;REFB=-2.70351e-05;REVB=0.00535704;RO=28;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107236;STB=0.52081;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=1.55372e-05;OID=.;OPOS=93515993;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:28:30:17:18:0.375:8:9:12:16:9:9:14:16 chr7 93623458 . A G 286.89 PASS AF=0.346535;AO=34;DP=100;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.00801288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.366;QD=11.362;RBI=0.0126844;REFB=-0.000539624;REVB=0.00983295;RO=65;SAF=11;SAR=23;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131077;STB=0.567008;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00121366;OID=.;OPOS=93623458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:65:66:34:35:0.346535:23:11:28:37:23:12:29:37 chr7 94027097 . T A 35.3 PASS AF=0.130435;AO=9;DP=69;FAO=9;FDP=69;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=0.0145869;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.4738;QD=2.04609;RBI=0.0389496;REFB=-0.00212549;REVB=0.036115;RO=56;SAF=8;SAR=1;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616029;STB=0.92485;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0407872;OID=.;OPOS=94027097;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:69:69:56:60:9:9:0.130435:1:8:19:37:1:8:19:41 chr7 94027699 . T C 1383.42 PASS AF=0.423398;AO=152;DP=358;FAO=152;FDP=359;FR=.;FRO=207;FSAF=85;FSAR=67;FSRF=110;FSRR=97;FWDB=0.00178204;FXX=0.0027777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.718;QD=15.4141;RBI=0.00241095;REFB=-0.0143174;REVB=-0.00162388;RO=205;SAF=85;SAR=67;SRF=108;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337523;STB=0.516199;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0166322;OID=.;OPOS=94027699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:358:359:205:207:152:152:0.423398:67:85:108:97:67:85:110:97 chr7 94030899 . T C 2405.2 PASS AF=0.43686;AO=256;DP=587;FAO=256;FDP=586;FR=.;FRO=330;FSAF=160;FSAR=96;FSRF=196;FSRR=134;FWDB=0.00157589;FXX=0.00170355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.171;QD=16.4177;RBI=0.0181517;REFB=-0.00896155;REVB=-0.0180832;RO=328;SAF=160;SAR=96;SRF=194;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359112;STB=0.518484;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0109123;OID=.;OPOS=94030899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:587:586:328:330:256:256:0.43686:96:160:194:134:96:160:196:134 chr7 94038934 . C T 1252.91 PASS AF=0.490421;AO=126;DP=260;FAO=128;FDP=261;FR=.;FRO=133;FSAF=59;FSAR=69;FSRF=75;FSRR=58;FWDB=-0.0249553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7089;QD=19.2017;RBI=0.0279413;REFB=-0.0219665;REVB=-0.0125679;RO=132;SAF=58;SAR=68;SRF=74;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931749;STB=0.552355;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0251052;OID=.;OPOS=94038934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:261:132:133:126:128:0.490421:68:58:74:58:69:59:75:58 chr7 94039032 . C T 729.25 PASS AF=0.514493;AO=71;DP=138;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.00450604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.14;QD=21.1377;RBI=0.0144336;REFB=-0.0156298;REVB=0.0137122;RO=67;SAF=40;SAR=31;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498077;STB=0.527392;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0157126;OID=.;OPOS=94039032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:67:67:71:71:0.514493:31:40:34:33:31:40:34:33 chr7 94043239 . C G 425.0 PASS AF=0.426087;AO=48;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.00888007;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=319.923;QD=14.7825;RBI=0.00933764;REFB=-0.00619251;REVB=0.00288719;RO=66;SAF=19;SAR=29;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155038;STB=0.57914;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00758558;OID=.;OPOS=94043239;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:48:49:0.426087:29:19:36:30:29:20:36:30 chr7 94047050 . G T 657.41 PASS AF=0.458065;AO=71;DP=155;FAO=71;FDP=155;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.0458835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1993;QD=16.9653;RBI=0.060435;REFB=-0.0285867;REVB=0.0393331;RO=84;SAF=34;SAR=37;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785808;STB=0.543612;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0335199;OID=.;OPOS=94047050;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:84:84:71:71:0.458065:37:34:47:37:37:34:47:37 chr7 94059899 . C T 385.22 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.00346709;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=285.111;QD=20.5448;RBI=0.00626001;REFB=-0.00556052;REVB=0.0052122;RO=35;SAF=23;SAR=16;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255621;STB=0.634096;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0041452;OID=.;OPOS=94059899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:36:39:39:0.52:16:23:10:25:16:23:11:25 chr7 94173803 . T C 914.71 PASS AF=0.526316;AO=90;DP=171;FAO=90;FDP=171;FR=.;FRO=81;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.00568288;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.775;QD=21.3966;RBI=0.00613809;REFB=-0.00748706;REVB=0.0023197;RO=81;SAF=47;SAR=43;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352419;STB=0.519299;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00620466;OID=.;OPOS=94173803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:81:81:90:90:0.526316:43:47:39:42:43:47:39:42 chr7 94174854 . T C 2636.02 PASS AF=0.988764;AO=169;DP=176;FAO=176;FDP=178;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0135381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9135;QD=59.2364;RBI=0.0868097;REFB=-0.154333;REVB=0.0857476;RO=7;SAF=72;SAR=97;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331092;STB=0.504761;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00123626;OID=.;OPOS=94174854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:176:178:7:2:169:176:0.988764:97:72:0:7:104:72:0:2 chr7 94185888 . G A 395.99 PASS AF=0.512821;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0245398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.013;QD=20.3074;RBI=0.0277207;REFB=-0.0214505;REVB=0.0128933;RO=37;SAF=19;SAR=21;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103501;STB=0.563187;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0128933;OID=.;OPOS=94185888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:37:38:40:40:0.512821:21:19:22:15:21:19:23:15 chr7 94186068 . A G 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00504388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.303;QD=17.1565;RBI=0.00861796;REFB=-0.00859055;REVB=0.00698774;RO=20;SAF=4;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238057;STB=0.63756;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00967423;OID=.;OPOS=94186068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:13:4:9:11:13:4:9:11 chr7 94273994 . A G 462.47 PASS AF=0.447368;AO=49;DP=113;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.023929;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4171;QD=16.227;RBI=0.035509;REFB=0.00416913;REVB=-0.0262354;RO=63;SAF=17;SAR=32;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243741;STB=0.630814;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00493776;OID=.;OPOS=94273994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:63:63:49:51:0.447368:32:17:37:26:33:18:37:26 chr7 94294682 . C A 491.61 PASS AF=0.40146;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=137;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=-0.0494231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3165;QD=14.3535;RBI=0.0513671;REFB=-0.00300301;REVB=0.0139977;RO=82;SAF=31;SAR=24;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207603;STB=0.616713;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00432696;OID=.;OPOS=94294682;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:82:82:55:55:0.40146:24:31:30:52:24:31:30:52 chr7 94294982 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0201373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.795;QD=16.3859;RBI=0.0234485;REFB=0.00405853;REVB=-0.0120133;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144653;STB=0.58423;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00319207;OID=.;OPOS=94294982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:3:5:4:5:3:5 chr7 94295146 . T C 761.31 PASS AF=0.528986;AO=73;DP=138;FAO=73;FDP=138;FR=.;FRO=65;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.00422386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.819;QD=22.067;RBI=0.00986904;REFB=-0.0244589;REVB=0.00891947;RO=64;SAF=49;SAR=24;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043838;STB=0.529196;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0193617;OID=.;OPOS=94295146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:64:65:73:73:0.528986:24:49:40:24:24:49:40:25 chr7 94296769 . T C 152.8 PASS AF=0.338983;AO=19;DP=58;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.015719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.545;QD=10.3594;RBI=0.0391924;REFB=-0.0156044;REVB=0.0359021;RO=39;SAF=13;SAR=6;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285903;STB=0.642106;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0255534;OID=.;OPOS=94296769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:39:39:19:20:0.338983:6:13:17:22:7:13:17:22 chr7 94296793 . C T 216.68 PASS AF=0.4;AO=25;DP=64;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0122448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.749;QD=13.334;RBI=0.0410654;REFB=-0.00869331;REVB=-0.0391973;RO=39;SAF=19;SAR=6;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388045;STB=0.699228;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0076147;OID=.;OPOS=94296793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:39:39:25:26:0.4:6:19:16:23:7:19:16:23 chr7 94297293 . GT G 132.75 PASS AF=0.489583;AO=48;DP=97;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0032265;FXX=0.039996;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.63216;QD=5.53122;RBI=0.158675;REFB=-0.0787541;REVB=-0.158642;RO=38;SAF=19;SAR=29;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127912;STB=0.55614;STBP=0.306;TYPE=del;VARB=0.0653103;OID=.;OPOS=94297294;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.489583:48:97:47:96:49:18:29:24:25:99:38:19:29:21:17 chr7 94298237 . TACAG T 516.76 PASS AF=0.564706;AO=47;DP=85;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0250955;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=4;MLLD=268.235;QD=24.3179;RBI=0.0304918;REFB=-0.0264326;REVB=-0.0173196;RO=33;SAF=25;SAR=22;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103716;STB=0.57342;STBP=0.153;TYPE=del;VARB=0.017571;OID=.;OPOS=94298238;OREF=ACAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.564706:47:85:48:85:37:25:23:13:24:99:33:25:22:13:20 chr7 94540416 . A G 362.01 PASS AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=10;FWDB=0.00648918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=313.537;QD=17.8768;RBI=0.02423;REFB=-0.00264294;REVB=0.0233449;RO=43;SAF=23;SAR=15;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168767;STB=0.593594;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00273413;OID=.;OPOS=94540416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:15:23:33:10:15:23:33:10 chr7 94898811 . G A 146.36 PASS AF=0.457143;AO=17;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00738372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.162;QD=16.7268;RBI=0.012429;REFB=-0.0136052;REVB=0.00999799;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15818;STB=0.59988;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00918544;OID=.;OPOS=94898811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:19:17:16:0.457143:9:8:5:12:8:8:6:13 chr7 94903420 . G A 340.59 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0119815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.297;QD=23.4887;RBI=0.0195984;REFB=-0.0391517;REVB=-0.0155093;RO=23;SAF=21;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105191;STB=0.550284;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0204292;OID=.;OPOS=94903420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:23:24:34:34:0.586207:13:21:11:12:13:21:12:12 chr7 94924538 . G T 335.68 PASS AF=0.386139;AO=37;DP=99;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00418154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.437;QD=13.2944;RBI=0.00585267;REFB=-0.00717497;REVB=0.00409494;RO=62;SAF=25;SAR=12;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234542;STB=0.625784;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0120598;OID=.;OPOS=94924538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:62:62:37:39:0.386139:12:25:29:33:13:26:29:33 chr7 94937446 . T C 330.63 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00165355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.282;QD=23.6162;RBI=0.00583723;REFB=-0.0221457;REVB=0.00559812;RO=23;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502677;STB=0.527671;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0166797;OID=.;OPOS=94937446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:18:15:12:11:18:15:12:11 chr7 95001555 . C T 587.85 PASS AF=0.412121;AO=65;DP=165;FAO=68;FDP=165;FR=.;FRO=97;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=53;FSRR=44;FWDB=-0.0891055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.092;QD=14.2509;RBI=0.0891221;REFB=-0.0160989;REVB=-0.00171826;RO=92;SAF=34;SAR=31;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00998026;STB=0.501347;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0199206;OID=.;OPOS=95001555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:92:97:65:68:0.412121:31:34:49:43:31:37:53:44 chr7 95024046 . A G 235.44 PASS AF=0.394366;AO=27;DP=70;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0149386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.717;QD=13.2644;RBI=0.0152035;REFB=-0.0108676;REVB=0.00282558;RO=43;SAF=7;SAR=20;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116032;STB=0.544991;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0305889;OID=.;OPOS=95024046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:43:43:27:28:0.394366:20:7:15:28:20:8:15:28 chr7 95034397 . T C 657.49 PASS AF=0.528455;AO=65;DP=123;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.01878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.589;QD=21.3817;RBI=0.0191144;REFB=0.0106017;REVB=-0.00356014;RO=58;SAF=37;SAR=28;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302643;STB=0.516623;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00966517;OID=.;OPOS=95034397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:58:58:65:65:0.528455:28:37:31:27:28:37:31:27 chr7 95213059 . G A 822.1 PASS AF=1;AO=41;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210306;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.346;QD=57.6913;RBI=0.0516531;REFB=0;REVB=0.0516102;RO=0;SAF=33;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8059e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000593331;OID=.;OPOS=95213059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:41:57:1:8:33:0:0:25:32:0:0 chr7 95213953 . A C 1510.95 PASS AF=0.981132;AO=103;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0119532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.568;QD=57.0172;RBI=0.0264678;REFB=-0.11625;REVB=0.023615;RO=2;SAF=37;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141609;STB=0.507352;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000496863;OID=.;OPOS=95213953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:106:106:2:2:103:104:0.981132:66:37:0:2:67:37:0:2 chr7 95216394 . T G 941.14 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0397429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7959;QD=57.0386;RBI=0.0397681;REFB=-0.161863;REVB=-0.00141629;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.509088;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00257896;OID=.;OPOS=95216394;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:38:27:0:0:38:27:1:0 chr7 95499234 . A G 612.21 PASS AF=0.539823;AO=61;DP=113;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.00364674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3774;QD=21.6711;RBI=0.0220414;REFB=0.00417156;REVB=-0.0217377;RO=52;SAF=30;SAR=31;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103567;STB=0.55676;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00304856;OID=.;OPOS=95499234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:52:61:61:0.539823:31:30:32:20:31:30:32:20 chr7 95668664 . C A 2394.92 PASS AF=0.964072;AO=161;DP=167;FAO=161;FDP=167;FR=.;FRO=6;FSAF=83;FSAR=78;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0268044;FXX=0.00595203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.376;QD=57.3635;RBI=0.0420221;REFB=-0.0894427;REVB=-0.0323632;RO=6;SAF=83;SAR=78;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103349;STB=0.505437;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000625987;OID=.;OPOS=95668664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:167:167:6:6:161:161:0.964072:78:83:4:2:78:83:4:2 chr7 96640130 . C T 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.000179833;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=290.707;QD=25.3678;RBI=0.0053877;REFB=-0.0210771;REVB=0.0053847;RO=14;SAF=3;SAR=18;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0122866;OID=.;OPOS=96640130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:18:3:2:12:18:3:2:12 chr7 96810485 . T C 197.5 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0108872;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.225;QD=14.6295;RBI=0.0156703;REFB=-0.00887612;REVB=0.0112706;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110308;STB=0.563084;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0102642;OID=.;OPOS=96810485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:31:31:23:23:0.425926:15:8:14:17:15:8:14:17 chr7 97488569 . A T 1268.66 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0170164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.184;QD=60.4125;RBI=0.0317741;REFB=0.0593023;REVB=0.0268335;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.000105842;OID=.;OPOS=97488569;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:41:42:0:0:41:42:0:1 chr7 97821855 . T C 139.16 PASS AF=0.326531;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0344296;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=85.6251;QD=11.3602;RBI=0.0408894;REFB=-0.0432052;REVB=0.0220577;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105114;STB=0.572472;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.017895;OID=.;OPOS=97821855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:29:33:16:16:0.326531:9:7:10:19:9:7:11:22 chr7 97823125 . G A 228.84 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00112366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.049;QD=16.0591;RBI=0.00916449;REFB=-0.0111109;REVB=-0.00909534;RO=31;SAF=11;SAR=15;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279734;STB=0.515806;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.01519;OID=.;OPOS=97823125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:15:11:14:17:15:11:14:17 chr7 97823629 . A G 282.29 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0303891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.857;QD=22.5829;RBI=0.0339545;REFB=-0.0435661;REVB=-0.0151462;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137598;STB=0.576864;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0375452;OID=.;OPOS=97823629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:15:11:14:10:15:11:14:10 chr7 97854393 . G A 170.47 PASS AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.03168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.2;QD=25.2554;RBI=0.0468664;REFB=-0.0145404;REVB=0.0345375;RO=10;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168886;STB=0.594481;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00609854;OID=.;OPOS=97854393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:10:10:17:17:0.62963:11:6:6:4:11:6:6:4 chr7 97863145 . G A 109.25 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0100329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7218;QD=14.0965;RBI=0.0340663;REFB=-0.0159375;REVB=0.0325554;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275431;STB=0.659955;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.028909;OID=.;OPOS=97863145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:6:12:5:8:6:12 chr7 97922851 . C T 521.11 PASS AF=0.6;AO=48;DP=80;FAO=48;FDP=80;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0171258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.609;QD=26.0557;RBI=0.0177392;REFB=-0.0158761;REVB=0.0046243;RO=32;SAF=24;SAR=24;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114558;STB=0.562474;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0114841;OID=.;OPOS=97922851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:32:32:48:48:0.6:24:24:11:21:24:24:11:21 chr7 97923420 . C T 416.09 PASS AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0327798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.835;QD=16.9834;RBI=0.0419714;REFB=-0.0182447;REVB=-0.0262122;RO=55;SAF=15;SAR=28;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111641;STB=0.562784;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0196416;OID=.;OPOS=97923420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:55:55:43:43:0.438776:28:15:25:30:28:15:25:30 chr7 97933601 . C T 348.84 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0329127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6337;QD=22.8749;RBI=0.0343353;REFB=-0.0531184;REVB=-0.00978083;RO=26;SAF=20;SAR=15;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259154;STB=0.514278;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0271987;OID=.;OPOS=97933601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:15:20:14:12:15:20:14:12 chr7 97944926 . TAAAAAAAAAAA CTAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAT,TAAAAAAAAAAT,TAAAAAAATAAT 292.85 PASS AF=0,0.387755,0.142857,0,0.367347;AO=2,10,6,2,12;DP=46;FAO=0,19,7,0,18;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=0,4,1,0,12;FSAR=0,15,6,0,6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.108532,-0.354633,-0.0961767,-0.07815,-0.0532726;FXX=0;HRUN=1,13,1,13,13;LEN=2,1,1,1,4;MLLD=19.0137,3.63833,140.086,143.246,149.647;QD=23.9064;RBI=0.138927,0.438828,0.0988565,0.0818067,0.0552725;REFB=-0.413095,-0.749879,-0.0293424,-0.0370177,-0.0593111;REVB=-0.0867257,-0.258467,-0.0228615,-0.024185,-0.0147336;RO=4;SAF=0,1,1,1,11;SAR=2,9,5,1,1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0,0.162992,0.248791,0.532453,0.578165;STB=0.5,0.503308,0.545316,0.5,0.605939;STBP=1,0.997,0.886,1,0.067;TYPE=mnp,del,ins,snp,mnp;VARB=0,-0.411288,0.0162561,-0.018788,0.0583905;OID=.,.,.,.,.;OPOS=97944926,97944927,97944938,97944937,97944934;OREF=TA,A,-,A,AAAA;OALT=CT,-,T,T,TAAT;OMAPALT=CTAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAT,TAAAAAAAAAAT,TAAAAAAATAAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/5:94:46:49:4:5:2,10,6,2,12:0,19,7,0,18:0,0.387755,0.142857,0,0.367347:2,9,5,1,1:0,1,1,1,11:0:4:0,15,6,0,6:0,4,1,0,12:1:4 chr7 98258736 . G A 339.78 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0293835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6406;QD=18.1214;RBI=0.0650311;REFB=-0.0315029;REVB=0.0580142;RO=39;SAF=24;SAR=12;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780373;STB=0.543665;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.026858;OID=.;OPOS=98258736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:12:24:23:16:12:24:23:16 chr7 98460824 . C A 688.73 PASS AF=0.898305;AO=53;DP=59;FAO=53;FDP=59;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0814967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.369;QD=46.6934;RBI=0.0815528;REFB=-0.0829814;REVB=0.00302365;RO=6;SAF=22;SAR=31;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492895;STB=0.526236;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0513184;OID=.;OPOS=98460824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:59:59:6:6:53:53:0.898305:31:22:1:5:31:22:1:5 chr7 98650051 . G C 380.35 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5759;QD=54.3352;RBI=0.0176229;REFB=0;REVB=0.0100243;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00197615;OID=.;OPOS=98650051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:11:17:0:0 chr7 98782750 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.862;QD=57.8847;RBI=0.052815;REFB=0;REVB=-0.0376881;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.22985e-06;OID=.;OPOS=98782750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:40:20:0:0:40:20:0:0 chr7 98790684 . A G 71.08 PASS AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0551474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4075;QD=7.48158;RBI=0.0555513;REFB=0.00372102;REVB=-0.00668722;RO=28;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24039;STB=0.649195;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.012465;OID=.;OPOS=98790684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:4:6:11:17:4:6:11:17 chr7 99202020 . G A 163.01 PASS AF=0.309859;AO=22;DP=71;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0178743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.575;QD=9.18381;RBI=0.017968;REFB=-0.00658422;REVB=-0.00183329;RO=48;SAF=9;SAR=13;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177351;STB=0.611082;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0174828;OID=.;OPOS=99202020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:48:49:22:22:0.309859:13:9:27:21:13:9:28:21 chr7 99260499 . G A 328.05 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.058045;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.532;QD=14.9114;RBI=0.0585226;REFB=-0.0133092;REVB=-0.00746184;RO=54;SAF=13;SAR=23;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520335;STB=0.514917;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0208771;OID=.;OPOS=99260499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:88:54:52:36:36:0.409091:23:13:22:32:23:13:20:32 chr7 99306685 . C G 1061.53 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7543;QD=59.8042;RBI=0.0446502;REFB=0;REVB=0.00677681;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406407;OID=.;OPOS=99306685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0 chr7 99361626 . A G 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00341311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.947;QD=13.336;RBI=0.0167477;REFB=-0.00671823;REVB=-0.0163963;RO=24;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106613;STB=0.562416;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0100326;OID=.;OPOS=99361626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:9:6:12:12:9:6:12:12 chr7 99474427 . A G 342.7 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00515408;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.49;QD=29.1659;RBI=0.0250347;REFB=-0.0246966;REVB=0.0244984;RO=17;SAF=12;SAR=17;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127126;STB=0.554663;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0140224;OID=.;OPOS=99474427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:17:18:29:29:0.617021:17:12:4:13:17:12:5:13 chr7 99500899 . T C 164.16 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0383828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.072;QD=11.1292;RBI=0.04039;REFB=-0.00631166;REVB=-0.0125743;RO=38;SAF=12;SAR=9;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384509;STB=0.522367;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0258338;OID=.;OPOS=99500899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:9:12:23:15:9:12:23:15 chr7 99500911 . A G 169.22 PASS AF=0.375;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0173759;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.969;QD=12.087;RBI=0.0199474;REFB=-0.00255987;REVB=0.00979679;RO=36;SAF=12;SAR=9;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108112;STB=0.555504;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00447368;OID=.;OPOS=99500911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:36:35:21:21:0.375:9:12:24:12:9:12:23:12 chr7 99569394 . G A 361.08 PASS AF=0.394495;AO=42;DP=108;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.00874694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.314;QD=13.2508;RBI=0.0199793;REFB=-0.0143487;REVB=-0.0179628;RO=65;SAF=25;SAR=17;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398504;STB=0.520243;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0307813;OID=.;OPOS=99569394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:65:66:42:43:0.394495:17:25:41:24:17:26:42:24 chr7 99578411 . T C 387.19 PASS AF=0.373016;AO=46;DP=125;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.00660821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.387;QD=12.2916;RBI=0.00840906;REFB=-0.0106195;REVB=-0.00520037;RO=78;SAF=14;SAR=32;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267498;STB=0.660625;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0201566;OID=.;OPOS=99578411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:78:79:46:47:0.373016:32:14:42:36:33:14:43:36 chr7 99580907 . C G 260.54 PASS AF=0.509091;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.000147206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.666;QD=18.9485;RBI=0.0258562;REFB=-0.0199073;REVB=-0.0258558;RO=27;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989762;STB=0.562698;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0117439;OID=.;OPOS=99580907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:27:27:27:28:0.509091:13:14:11:16:13:15:11:16 chr7 99669802 . A G 562.61 PASS AF=0.95122;AO=38;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0570856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.565;QD=54.889;RBI=0.0619097;REFB=0.0238237;REVB=0.0239593;RO=2;SAF=13;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667634;STB=0.535696;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000942835;OID=.;OPOS=99669802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:41:41:2:2:38:39:0.95122:25:13:2:0:26:13:2:0 chr7 99709835 . AGGGGGC AGGGG,AGGGGC,AGGGGCC,AGGGGG 342.31 PASS AF=0.590909,0,0,0;AO=28,21,6,10;DP=97;FAO=52,0,0,0;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=34,0,0,0;FSAR=18,0,0,0;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.203324,0.0755347,0.283226,-0.485742;FXX=0.0736765;HRUN=5,5,5,5;LEN=2,1,1,1;MLLD=16.2154,8.68891,10.2515,8.79158;QD=15.5595;RBI=0.254122,0.192799,0.284691,0.501289;REFB=-0.165439,-0.161429,-0.00463478,-0.163443;REVB=-0.152438,-0.177387,-0.0288511,-0.123878;RO=23;SAF=14,14,6,7;SAR=14,7,0,3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0.354167,0.354167,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.0176448,0.181521,0.709446,0.259722;STB=0.622274,0.5,0.5,0.5;STBP=0.008,1,1,1;TYPE=del,del,snp,del;VARB=0.0755109,0.118351,0,-0.0533037;OID=.,.,.,.;OPOS=99709840,99709836,99709840,99709841;OREF=GC,G,G,C;OALT=-,-,C,-;OMAPALT=AGGGG,AGGGGC,AGGGGCC,AGGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.590909,0,0,0:28,21,6,10:97:52,0,0,0:88:36:34,0,0,0:18,0,0,0:13:23:99:23:14,14,6,7:14,7,0,3:11:12 chr7 99772298 . A C 752.68 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.729;QD=56.8058;RBI=0.0556195;REFB=0;REVB=0.028834;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38283e-05;OID=.;OPOS=99772298;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:27:24:0:0:28:25:0:0 chr7 99816256 . C A 365.06 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0367236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.628;QD=52.1518;RBI=0.0805603;REFB=0.000149676;REVB=-0.0717032;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.000323249;OID=.;OPOS=99816256;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:9:18:0:0:9:18:0:1 chr7 99816272 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8516;QD=55.0972;RBI=0.0743619;REFB=0;REVB=0.0463793;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119467;OID=.;OPOS=99816272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0 chr7 99816275 . G C 348.33 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.942;QD=53.5898;RBI=0.0508441;REFB=0;REVB=0.023908;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419835;OID=.;OPOS=99816275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0 chr7 99817859 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=10;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7165;QD=51.1846;RBI=0.0562154;REFB=0;REVB=-0.041874;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0025847;OID=.;OPOS=99817859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:20:0:0:10:20:1:2:8:0:0:7:13:0:0 chr7 99821685 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.188;QD=62.6707;RBI=0.0355535;REFB=0;REVB=0.0321278;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131214;OID=.;OPOS=99821685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0 chr7 99971313 . T C 1316.67 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.6503;QD=59.8488;RBI=0.0972495;REFB=0;REVB=0.0710294;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00377187;OID=.;OPOS=99971313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:88:0:0:82:88:1:41:41:0:0:42:46:0:0 chr7 99971834 . A G 1512.12 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0126586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.462;QD=62.3553;RBI=0.0257685;REFB=-0.111824;REVB=0.0224449;RO=0;SAF=36;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00017295;OID=.;OPOS=99971834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:97:0:1:96:96:0.989691:60:36:0:0:59:37:0:1 chr7 100065678 . C G 218.63 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0842779;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.523;QD=17.1471;RBI=0.0846701;REFB=-0.0204921;REVB=-0.00814022;RO=29;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394532;STB=0.502616;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0204902;OID=.;OPOS=100065678;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:51:29:27:24:24:0.470588:15:9:12:17:15:9:10:17 chr7 100175473 . T C 144.22 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.968;QD=44.376;RBI=0.0698793;REFB=0;REVB=0.0671632;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307246;OID=.;OPOS=100175473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:11:13:1:1:10:0:0:2:11:0:0 chr7 100212754 . C T 107.63 PASS AF=0.419355;AO=10;DP=28;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0464862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.314;QD=13.8872;RBI=0.0474833;REFB=-0.00835146;REVB=0.0096797;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522173;STB=0.586076;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00584663;OID=.;OPOS=100212754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:31:17:18:10:13:0.419355:6:4:6:11:6:7:7:11 chr7 100225031 . G A 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0237539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5392;QD=10.1729;RBI=0.0583805;REFB=-0.019715;REVB=0.0533295;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0720653;OID=.;OPOS=100225031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:3:6:4:2:3:6 chr7 100278657 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.02;QD=54.5168;RBI=0.0226545;REFB=0;REVB=0.0193746;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312254;OID=.;OPOS=100278657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr7 100285476 . C T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.037372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.82;QD=20.7383;RBI=0.0401681;REFB=0.0185416;REVB=-0.0147246;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104329;STB=0.558759;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00926484;OID=.;OPOS=100285476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:6:10:9:9:6:10 chr7 100348384 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4759;QD=57.6805;RBI=0.0427569;REFB=0;REVB=-0.0360608;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188083;OID=.;OPOS=100348384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr7 100371358 . G A 657.77 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0369727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.508;QD=59.7969;RBI=0.0769652;REFB=-0.041286;REVB=0.067503;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218371;STB=0.511622;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00103962;OID=.;OPOS=100371358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:21:22:0:1:21:22:0:1 chr7 100371474 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.501;QD=57.2022;RBI=0.0430538;REFB=0;REVB=0.012016;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379811;OID=.;OPOS=100371474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr7 100371476 . T TG 271.32 PASS AF=1;AO=22;DP=30;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631082;FXX=0.039984;HRUN=0;LEN=1;MLLD=243.898;QD=45.2194;RBI=0.0672113;REFB=0;REVB=0.0231238;RO=6;SAF=9;SAR=13;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100521;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000360578;OID=.;OPOS=100371477;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:22:30:24:24:0:10:14:0:0:5:6:9:13:1:5 chr7 100373077 . C G 246.72 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00330345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7792;QD=49.3444;RBI=0.00866029;REFB=0;REVB=0.00800549;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00459417;OID=.;OPOS=100373077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:11:8:0:0:11:9:0:0 chr7 100373367 . G C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.745;QD=62.6704;RBI=0.0197117;REFB=0;REVB=-0.000796704;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0081e-05;OID=.;OPOS=100373367;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr7 100386900 . T C 700.08 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6302;QD=60.8764;RBI=0.0220307;REFB=0;REVB=-0.0102492;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397098;OID=.;OPOS=100386900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:19:25:0:0:19:27:0:0 chr7 100391644 . T C 1358.61 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00708285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.541;QD=62.4647;RBI=0.00808056;REFB=0;REVB=-0.00388956;RO=0;SAF=51;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.39763e-05;OID=.;OPOS=100391644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:36:51:0:0:36:51:0:0 chr7 100410597 . G A 127.49 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0142731;FXX=0.0951928;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.571;QD=26.84;RBI=0.0180099;REFB=-0.00714615;REVB=-0.0109833;RO=6;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729992;STB=0.540921;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.010734;OID=.;OPOS=100410597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:21:19:6:6:13:13:0.684211:6:7:4:2:6:7:4:2 chr7 100411278 . T C 341.39 PASS AF=0.529412;AO=34;DP=66;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.00470974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8803;QD=20.0819;RBI=0.00757782;REFB=-0.00735577;REVB=-0.00593647;RO=28;SAF=5;SAR=29;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265833;STB=0.636898;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.015559;OID=.;OPOS=100411278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:28:32:34:36:0.529412:29:5:10:18:31:5:10:22 chr7 100416139 . T C 191.54 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0226938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.751;QD=22.5342;RBI=0.0264932;REFB=0.00783428;REVB=-0.0136704;RO=15;SAF=10;SAR=9;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203087;STB=0.613382;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.00706276;OID=.;OPOS=100416139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:9:10:4:11:9:10:4:11 chr7 100416250 . A G 424.55 PASS AF=0.672414;AO=39;DP=58;FAO=39;FDP=58;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0171898;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.853;QD=29.2795;RBI=0.0242348;REFB=-0.0320077;REVB=0.0170832;RO=19;SAF=20;SAR=19;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398951;STB=0.52169;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0100636;OID=.;OPOS=100416250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:19:19:39:39:0.672414:19:20:11:8:19:20:11:8 chr7 100424587 . G C 176.31 PASS AF=0.372881;AO=13;DP=60;FAO=22;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.0547806;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.079;QD=11.9533;RBI=0.0554518;REFB=-0.0133349;REVB=-0.00860159;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287991;STB=0.535488;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0204972;OID=.;OPOS=100424587;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:14:37:13:22:0.372881:9:4:1:13:15:7:10:27 chr7 100458795 . T C 2103.69 PASS AF=1;AO=132;DP=132;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.363;QD=62.7967;RBI=0.0209906;REFB=0;REVB=0.0185702;RO=0;SAF=64;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05172e-05;OID=.;OPOS=100458795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:134:0:0:132:134:1:68:64:0:0:69:65:0:0 chr7 100460331 . G A 337.07 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.00695805;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.357;QD=16.6456;RBI=0.0310111;REFB=-0.000883839;REVB=0.0302205;RO=42;SAF=21;SAR=15;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258592;STB=0.659235;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.000615289;OID=.;OPOS=100460331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:81:42:45:36:36:0.444444:15:21:13:29:15:21:13:32 chr7 100463822 . G A 111.26 PASS AF=0.529412;AO=10;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0214634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.596;QD=26.1798;RBI=0.0566268;REFB=-0.0348515;REVB=-0.0524015;RO=5;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.614611;STB=0.726799;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0630568;OID=.;OPOS=100463822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:17:17:5:5:10:9:0.529412:9:1:5:0:6:3:5:0 chr7 100466441 . G A 582.3 PASS AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.00384459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.184;QD=17.5129;RBI=0.00486852;REFB=-0.0179344;REVB=0.0029869;RO=70;SAF=35;SAR=26;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192973;STB=0.606507;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0256796;OID=.;OPOS=100466441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:70:72:61:61:0.458647:26:35:26:44:26:35:27:45 chr7 100468284 . A G 1662.26 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324203;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5541;QD=60.4458;RBI=0.0538187;REFB=0;REVB=-0.0429579;RO=0;SAF=29;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000461729;OID=.;OPOS=100468284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:81:29:0:0:81:29:0:0 chr7 100482026 . T C 312.58 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0496478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5343;QD=50.0134;RBI=0.0877684;REFB=-0.0626248;REVB=-0.0723767;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040273;STB=0.521721;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00885882;OID=.;OPOS=100482026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:11:13:0:1:11:13:0:1 chr7 100486656 . T G 804.61 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.005;QD=64.3691;RBI=0.0439748;REFB=0;REVB=-0.00511611;RO=0;SAF=12;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159815;OID=.;OPOS=100486656;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:37:12:0:0:37:13:0:0 chr7 100494222 . G GC 1480.69 PASS AF=1;AO=122;DP=127;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.075544;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.3207;QD=48.1527;RBI=0.0773605;REFB=0;REVB=0.0166659;RO=5;SAF=54;SAR=68;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011896;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000661715;OID=.;OPOS=100494223;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:122:127:123:123:0:54:69:0:0:27:5:54:68:3:2 chr7 100549573 . G T 50.08 PASS AF=0.186047;AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0144522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.8;QD=4.65898;RBI=0.0152627;REFB=-0.00444968;REVB=-0.00490751;RO=35;SAF=4;SAR=4;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230423;STB=0.65082;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00767412;OID=.;OPOS=100549573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:43:43:35:35:8:8:0.186047:4:4:24:11:4:4:24:11 chr7 100549583 . G A 59.81 PASS AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0328818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.141;QD=5.69648;RBI=0.03721;REFB=-0.013042;REVB=0.0174176;RO=33;SAF=6;SAR=3;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864105;STB=0.555438;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0274879;OID=.;OPOS=100549583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:42:33:33:9:9:0.214286:3:6:24:9:3:6:24:9 chr7 100549592 . TT AA 70.3 PASS AF=0.227273;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.00617225;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=2;MLLD=223.581;QD=6.39071;RBI=0.00772616;REFB=-0.000821451;REVB=0.00464725;RO=34;SAF=6;SAR=4;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181692;STB=0.613655;STBP=0.474;TYPE=mnp;VARB=0.00517404;OID=.;OPOS=100549592;OREF=TT;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:45:44:34:34:10:10:0.227273:4:6:25:9:4:6:25:9 chr7 100549650 . A G 234.35 PASS AF=0.329545;AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=-0.0068224;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.751;QD=10.6522;RBI=0.0455072;REFB=-0.0169737;REVB=0.0449929;RO=58;SAF=15;SAR=14;SRF=45;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305817;STB=0.67821;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0162899;OID=.;OPOS=100549650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:58:59:29:29:0.329545:14:15:45:13:14:15:46:13 chr7 100549697 . A G 324.5 PASS AF=0.378641;AO=38;DP=102;FAO=39;FDP=103;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=15;FWDB=-0.0100675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.65;QD=12.602;RBI=0.0139148;REFB=-0.0208741;REVB=0.00960548;RO=63;SAF=18;SAR=20;SRF=48;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314045;STB=0.684587;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0514144;OID=.;OPOS=100549697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:63:64:38:39:0.378641:20:18:48:15:21:18:49:15 chr7 100549703 . C T 342.49 PASS AF=0.38;AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=47;FSRR=15;FWDB=-0.00130459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.851;QD=13.6996;RBI=0.013121;REFB=-0.0187094;REVB=0.013056;RO=61;SAF=15;SAR=23;SRF=46;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374933;STB=0.714328;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0431522;OID=.;OPOS=100549703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:61:62:38:38:0.38:23:15:46:15:23:15:47:15 chr7 100549787 . CA TG 195.09 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00253231;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=2;MLLD=279.969;QD=12.3868;RBI=0.00466852;REFB=-0.0015733;REVB=-0.00392205;RO=38;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616696;STB=0.544199;STBP=0.56;TYPE=mnp;VARB=0.00233407;OID=.;OPOS=100549787;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:38:39:24:24:0.380952:14:10:18:20:14:10:19:20 chr7 100549840 . C T 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00575264;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.777;QD=9.13236;RBI=0.0120183;REFB=-0.011718;REVB=-0.0105521;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987431;STB=0.559884;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.024501;OID=.;OPOS=100549840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:6:4:7:15:6:4:7:15 chr7 100549873 . G A 34.03 PASS AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00163546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.293;QD=3.88943;RBI=0.00806983;REFB=-0.0116178;REVB=0.00790237;RO=29;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593294;STB=0.541525;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0266279;OID=.;OPOS=100549873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:35:35:29:29:6:6:0.171429:4:2:11:18:4:2:11:18 chr7 100549884 . C T 42.82 PASS AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00177523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.772;QD=5.19028;RBI=0.0100806;REFB=-0.0110032;REVB=-0.00992304;RO=26;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174911;STB=0.615062;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0276106;OID=.;OPOS=100549884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:3:4:11:15:3:4:11:15 chr7 100549894 . T C 53.13 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0263199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.224;QD=7.32772;RBI=0.0293621;REFB=-0.00679885;REVB=0.0130154;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821548;STB=0.551596;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0154974;OID=.;OPOS=100549894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:9:12:4:4:9:12 chr7 100549896 . G C 52.66 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00377314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.462;QD=7.26313;RBI=0.0139832;REFB=-0.00746558;REVB=0.0134645;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821548;STB=0.551596;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0394598;OID=.;OPOS=100549896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:9:12:4:4:9:12 chr7 100549902 . C T 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0144027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.004;QD=8.69087;RBI=0.0189527;REFB=0.00668406;REVB=0.0123194;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323108;STB=0.51995;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=-0.00732253;OID=.;OPOS=100549902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:9:8:4:4:9:8 chr7 100549914 . G A 63.7 PASS AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0203558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.439;QD=9.10001;RBI=0.0262268;REFB=-0.00467919;REVB=-0.0165375;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147874;STB=0.590353;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0112149;OID=.;OPOS=100549914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:5:4:11:8:5:4:11:8 chr7 100549935 . T G 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.012855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.871;QD=11.1975;RBI=0.0132272;REFB=-0.0232518;REVB=0.00311563;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987403;STB=0.558727;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0306396;OID=.;OPOS=100549935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:13:9:6:6:13:9 chr7 100549942 . T C 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0302679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.721;QD=11.1978;RBI=0.0307245;REFB=-0.0238671;REVB=0.00527691;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987403;STB=0.558727;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0319216;OID=.;OPOS=100549942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:13:9:6:6:13:9 chr7 100549979 . C T 117.76 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0350604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.275;QD=12.3955;RBI=0.054041;REFB=-0.00833261;REVB=0.0411242;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164728;STB=0.596878;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0244147;OID=.;OPOS=100549979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:8:6:14:10:8:6:14:10 chr7 100550032 . C CCCT 119.1 PASS AF=0.4;AO=13;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.016757;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=190.622;QD=13.611;RBI=0.0263289;REFB=-0.0323132;REVB=0.020308;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195695;STB=0.585244;STBP=0.446;TYPE=ins;VARB=0.0465061;OID=.;OPOS=100550033;OREF=-;OALT=CCT;OMAPALT=CCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:13:35:14:35:21:6:8:12:9:99:21:5:8:12:9 chr7 100550079 . A C 205.15 PASS AF=0.42;AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0186449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.857;QD=16.4118;RBI=0.0208925;REFB=-0.0273508;REVB=0.00942686;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24418;STB=0.648505;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0280311;OID=.;OPOS=100550079;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:29:29:20:21:0.42:13:7:17:12:14:7:17:12 chr7 100550133 . A G 125.63 PASS AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0312727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.648;QD=10.6921;RBI=0.0366411;REFB=-0.0207334;REVB=0.0190942;RO=31;SAF=4;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230414;STB=0.650877;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0507293;OID=.;OPOS=100550133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:32:15:15:0.319149:11:4:14:17:11:4:15:17 chr7 100550138 . C T 128.76 PASS AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0333592;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.319;QD=10.9583;RBI=0.034936;REFB=-0.00943884;REVB=0.0103772;RO=31;SAF=4;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230414;STB=0.630388;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00505669;OID=.;OPOS=100550138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:32:15:15:0.319149:11:4:14:17:11:4:14:18 chr7 100550184 . C A 102.89 PASS AF=0.282609;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0251114;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8093;QD=8.94667;RBI=0.0258079;REFB=0.006934;REVB=-0.00595527;RO=33;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11183;STB=0.568664;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=-0.0182116;OID=.;OPOS=100550184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:33:33:13:13:0.282609:9:4:13:20:9:4:13:20 chr7 100550191 . C T 429.08 PASS AF=0.708333;AO=34;DP=48;FAO=34;FDP=48;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0174892;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=253.402;QD=35.7566;RBI=0.0204884;REFB=-0.00614913;REVB=0.0106724;RO=14;SAF=14;SAR=20;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708376;STB=0.538439;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00326446;OID=.;OPOS=100550191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:14:14:34:34:0.708333:20:14:4:10:20:14:4:10 chr7 100550203 . T A 79.36 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0649169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.861;QD=6.90116;RBI=0.0660531;REFB=0.00181347;REVB=-0.0121989;RO=35;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464745;STB=0.529358;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.00978875;OID=.;OPOS=100550203;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:7:4:14:21:7:4:14:21 chr7 100550205 . A C 79.42 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0461453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.906;QD=6.90631;RBI=0.0886068;REFB=0.000352397;REVB=0.0756425;RO=35;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464745;STB=0.529358;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.000688243;OID=.;OPOS=100550205;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:7:4:14:21:7:4:14:21 chr7 100551502 . A C 337.33 PASS AF=0.717949;AO=28;DP=39;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0117363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.704;QD=34.5983;RBI=0.012807;REFB=-0.042586;REVB=-0.00512636;RO=11;SAF=7;SAR=21;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748706;STB=0.540953;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0148202;OID=.;OPOS=100551502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:39:39:11:11:28:28:0.717949:21:7:4:7:21:7:4:7 chr7 100551565 . AT GC 90.1 PASS AF=0.255319;AO=12;DP=47;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00537575;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=214.609;QD=7.66792;RBI=0.0128597;REFB=-0.00755142;REVB=0.0116822;RO=35;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020626;STB=0.512799;STBP=0.943;TYPE=mnp;VARB=0.0297083;OID=.;OPOS=100551565;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:47:47:35:35:12:12:0.255319:7:5:14:21:7:5:14:21 chr7 100551578 . T G 87.15 PASS AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00471676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8772;QD=6.22511;RBI=0.012672;REFB=-0.000543353;REVB=0.0117614;RO=43;SAF=5;SAR=8;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156193;STB=0.598186;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00202793;OID=.;OPOS=100551578;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:8:5:22:21:8:5:22:21 chr7 100551626 . T C 88.2 PASS AF=0.194805;AO=15;DP=77;FAO=15;FDP=77;FR=.;FRO=62;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0253413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.38;QD=4.58165;RBI=0.0393349;REFB=0.00215607;REVB=-0.0300841;RO=61;SAF=6;SAR=9;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135834;STB=0.593625;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.0110856;OID=.;OPOS=100551626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:77:77:61:62:15:15:0.194805:9:6:31:30:9:6:32:30 chr7 100551637 . C CCAA 50.69 PASS AF=0.140845;AO=10;DP=76;FAO=10;FDP=71;FR=.;FRO=61;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00922296;FXX=0.013887;HRUN=4;LEN=3;MLLD=261.857;QD=2.85602;RBI=0.0111831;REFB=-0.00450925;REVB=-0.00632438;RO=66;SAF=3;SAR=7;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280471;STB=0.693661;STBP=0.195;TYPE=ins;VARB=0.023874;OID=.;OPOS=100551638;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=CCAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.140845:10:76:10:71:61:3:7:32:29:50:66:3:7:35:31 chr7 100551646 . A G 49.64 PASS AF=0.12987;AO=10;DP=78;FAO=10;FDP=77;FR=.;FRO=67;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0160008;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.228;QD=2.57845;RBI=0.0171218;REFB=-0.00175401;REVB=0.00609346;RO=64;SAF=3;SAR=7;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248134;STB=0.671649;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0106342;OID=.;OPOS=100551646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:78:77:64:67:10:10:0.12987:7:3:32:32:7:3:33:34 chr7 100551662 . C T 56.17 PASS AF=0.148649;AO=11;DP=74;FAO=11;FDP=74;FR=.;FRO=63;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.0152521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.898;QD=3.03597;RBI=0.022351;REFB=-0.00368306;REVB=-0.0163383;RO=63;SAF=4;SAR=7;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122375;STB=0.584653;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0760804;OID=.;OPOS=100551662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:74:74:63:63:11:11:0.148649:7:4:29:34:7:4:29:34 chr7 100551666 . A T 57.73 PASS AF=0.152778;AO=11;DP=73;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0311504;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.561;QD=3.20743;RBI=0.0391219;REFB=-0.0121976;REVB=-0.0236679;RO=61;SAF=5;SAR=6;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556769;STB=0.50381;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0414553;OID=.;OPOS=100551666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:73:72:61:61:11:11:0.152778:6:5:28:33:6:5:28:33 chr7 100551687 . T C 90.55 PASS AF=0.205479;AO=15;DP=73;FAO=15;FDP=73;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.00165955;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.574;QD=4.96165;RBI=0.00648976;REFB=-0.00350989;REVB=0.00627399;RO=56;SAF=6;SAR=9;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032712;STB=0.502853;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0240098;OID=.;OPOS=100551687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:73:73:56:58:15:15:0.205479:9:6:21:35:9:6:23:35 chr7 100551692 . C T 87.87 PASS AF=0.208333;AO=14;DP=71;FAO=15;FDP=72;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0114862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.145;QD=4.88159;RBI=0.0129305;REFB=-0.00414838;REVB=-0.00593832;RO=56;SAF=5;SAR=9;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474362;STB=0.511612;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00883608;OID=.;OPOS=100551692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:71:72:56:57:14:15:0.208333:9:5:22:34:9:6:22:35 chr7 100551719 . C T 98.4 PASS AF=0.213333;AO=16;DP=75;FAO=16;FDP=75;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.00434063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.376;QD=5.24787;RBI=0.014831;REFB=-0.00529331;REVB=0.0141816;RO=59;SAF=6;SAR=10;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00281709;STB=0.501777;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0201566;OID=.;OPOS=100551719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:75:75:59:59:16:16:0.213333:10:6:22:37:10:6:22:37 chr7 100551729 . C T 89.21 PASS AF=0.2;AO=15;DP=75;FAO=15;FDP=75;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.0242587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0908;QD=4.75808;RBI=0.0380497;REFB=-0.00162672;REVB=0.0293136;RO=57;SAF=6;SAR=9;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00454349;STB=0.513948;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.00405814;OID=.;OPOS=100551729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:75:75:57:60:15:15:0.2:9:6:23:34:9:6:23:37 chr7 100551773 . C A 78.95 PASS AF=0.179487;AO=14;DP=78;FAO=14;FDP=78;FR=.;FRO=64;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.0138691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.995;QD=4.04867;RBI=0.0209446;REFB=-0.00820763;REVB=-0.0156948;RO=63;SAF=6;SAR=8;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203752;STB=0.50561;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0338567;OID=.;OPOS=100551773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:78:78:63:64:14:14:0.179487:8:6:26:37:8:6:27:37 chr7 100551778 . G A 81.47 PASS AF=0.191781;AO=14;DP=73;FAO=14;FDP=73;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.0604236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3769;QD=4.46396;RBI=0.0610378;REFB=-0.00948357;REVB=-0.00863705;RO=59;SAF=6;SAR=8;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499852;STB=0.532213;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0510776;OID=.;OPOS=100551778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:73:73:59:59:14:14:0.191781:8:6:23:36:8:6:23:36 chr7 100551793 . G T 75.63 PASS AF=0.191176;AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0490995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8425;QD=4.44874;RBI=0.052891;REFB=-0.000282224;REVB=-0.0196645;RO=55;SAF=8;SAR=5;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220689;STB=0.642641;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00134973;OID=.;OPOS=100551793;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:68:68:55:55:13:13:0.191176:5:8:24:31:5:8:24:31 chr7 100551842 . CT TC 191.82 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0386455;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=2;MLLD=93.2301;QD=11.6255;RBI=0.0387073;REFB=-0.0587398;REVB=0.00218487;RO=41;SAF=15;SAR=9;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099678;STB=0.56635;STBP=0.402;TYPE=mnp;VARB=0.018645;OID=.;OPOS=100551842;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:41:42:24:24:0.363636:9:15:22:19:9:15:22:20 chr7 100551849 . A T 296.74 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0103025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.366;QD=15.6181;RBI=0.010974;REFB=-0.0213315;REVB=0.00377964;RO=43;SAF=16;SAR=17;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268372;STB=0.515142;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.019087;OID=.;OPOS=100551849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:17:16:22:21:17:16:22:21 chr7 100552018 . T G 462.35 PASS AF=0.578947;AO=44;DP=76;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0409108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1237;QD=24.334;RBI=0.0429906;REFB=-0.0115203;REVB=0.0132099;RO=32;SAF=20;SAR=24;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590218;STB=0.532359;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0151885;OID=.;OPOS=100552018;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:32:32:44:44:0.578947:24:20:17:15:24:20:17:15 chr7 100552020 . C T 447.89 PASS AF=0.565789;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00435655;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.468;QD=23.573;RBI=0.00874621;REFB=-0.0217409;REVB=-0.00758397;RO=33;SAF=20;SAR=23;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634763;STB=0.534867;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0190613;OID=.;OPOS=100552020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:33:33:43:43:0.565789:23:20:18:15:23:20:18:15 chr7 100552044 . T G 246.02 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.036315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1874;QD=17.8924;RBI=0.0439789;REFB=-0.0293087;REVB=0.0248065;RO=28;SAF=15;SAR=12;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477169;STB=0.526729;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0176311;OID=.;OPOS=100552044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:12:15:17:11:12:15:17:11 chr7 100552094 . G C 165.62 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.109905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7848;QD=14.4021;RBI=0.120334;REFB=0.00945712;REVB=-0.049003;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585465;STB=0.533943;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0211177;OID=.;OPOS=100552094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:8:10:14:14:8:10:14:14 chr7 100552117 . G T 193.18 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00071363;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.689;QD=13.7982;RBI=0.0089315;REFB=-0.0319652;REVB=-0.00890295;RO=33;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874586;STB=0.549957;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0385854;OID=.;OPOS=100552117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:33:33:23:23:0.410714:11:12:20:13:11:12:20:13 chr7 100552135 . T C 260.16 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0467509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5839;QD=16.7844;RBI=0.053847;REFB=0.0153409;REVB=-0.026718;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424109;STB=0.531229;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=-0.0182048;OID=.;OPOS=100552135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:33:29:29:0.467742:14:15:18:14:14:15:19:14 chr7 100552251 . T C 416.01 PASS AF=0.506024;AO=40;DP=81;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00721772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.357;QD=20.0487;RBI=0.00759156;REFB=-0.0275537;REVB=-0.00235294;RO=40;SAF=13;SAR=27;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167231;STB=0.595472;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0301064;OID=.;OPOS=100552251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:40:41:40:42:0.506024:27:13:20:20:29:13:20:21 chr7 100552311 . C T 778.77 PASS AF=0.84507;AO=60;DP=71;FAO=60;FDP=71;FR=.;FRO=11;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0413586;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.131;QD=43.8745;RBI=0.0439996;REFB=-0.0322351;REVB=0.0150143;RO=11;SAF=24;SAR=36;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388355;STB=0.520703;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00611371;OID=.;OPOS=100552311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:71:71:11:11:60:60:0.84507:36:24:3:8:36:24:3:8 chr7 100552338 . C T 281.67 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.000889706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.626;QD=17.0711;RBI=0.00626749;REFB=-0.00717699;REVB=0.00620402;RO=34;SAF=9;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157302;STB=0.59841;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.008518;OID=.;OPOS=100552338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:35:31:31:0.469697:22:9:15:19:22:9:16:19 chr7 100552358 . C G 262.87 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0298688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.6958;QD=15.0212;RBI=0.0326769;REFB=-0.0127191;REVB=0.0132527;RO=40;SAF=8;SAR=22;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281446;STB=0.660343;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0315317;OID=.;OPOS=100552358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:22:8:21:19:22:8:21:19 chr7 100552371 . C G 242.46 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00790979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.162;QD=14.9204;RBI=0.0220674;REFB=-0.0108119;REVB=-0.0206011;RO=37;SAF=9;SAR=19;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253371;STB=0.643963;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0198766;OID=.;OPOS=100552371;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:19:9:21:16:19:9:21:16 chr7 100552384 . A G 229.43 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0407812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.54;QD=14.119;RBI=0.0430159;REFB=-0.0171559;REVB=0.0136843;RO=37;SAF=10;SAR=17;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253614;STB=0.650791;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00811989;OID=.;OPOS=100552384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:38:27:27:0.415385:17:10:23:14:17:10:24:14 chr7 100552390 . T C 184.72 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00502019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5397;QD=12.113;RBI=0.0237861;REFB=-0.00466062;REVB=0.0232503;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255377;STB=0.646934;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00986531;OID=.;OPOS=100552390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:14:9:24:14:14:9:24:14 chr7 100552412 . T C 125.43 PASS AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0116637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.124;QD=8.9589;RBI=0.0173269;REFB=-0.00453972;REVB=-0.0128132;RO=39;SAF=10;SAR=7;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328836;STB=0.519628;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0167544;OID=.;OPOS=100552412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:7:10:24:15:7:10:24:15 chr7 100552435 . TC AT 124.15 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00101608;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=147.026;QD=9.93223;RBI=0.0197579;REFB=-0.00570897;REVB=0.0197317;RO=34;SAF=11;SAR=4;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796808;STB=0.540927;STBP=0.713;TYPE=mnp;VARB=0.00675373;OID=.;OPOS=100552435;OREF=TC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:35:15:15:0.3:4:11:23:11:4:11:24:11 chr7 100552440 . C T 125.72 PASS AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0102799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.715;QD=9.67054;RBI=0.0114954;REFB=-0.00945119;REVB=0.00514457;RO=36;SAF=12;SAR=4;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118211;STB=0.571334;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0231484;OID=.;OPOS=100552440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:4:12:24:12:4:12:24:12 chr7 100552535 . GT AC 270.34 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0196745;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=2;MLLD=106.915;QD=16.3841;RBI=0.0300894;REFB=-0.00871865;REVB=0.0227659;RO=36;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134812;STB=0.575708;STBP=0.285;TYPE=mnp;VARB=0.0107422;OID=.;OPOS=100552535;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:66:36:36:30:30:0.454545:15:15:23:13:15:15:23:13 chr7 100552549 . CT AC 313.88 PASS AF=0.507463;AO=32;DP=68;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0199829;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=2;MLLD=160.07;QD=18.7391;RBI=0.0200274;REFB=0.00151866;REVB=-0.00133476;RO=32;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838654;STB=0.551633;STBP=0.426;TYPE=mnp;VARB=0.000111918;OID=.;OPOS=100552549;OREF=CT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:32:33:32:34:0.507463:17:15:18:14:18:16:19:14 chr7 100552644 . C A 420.75 PASS AF=0.911765;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=34;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00750378;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.527;QD=49.4996;RBI=0.0123541;REFB=0.0124122;REVB=0.00981412;RO=2;SAF=2;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169327;STB=0.583831;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-9.95547e-05;OID=.;OPOS=100552644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:34:34:2:3:31:31:0.911765:29:2:1:1:29:2:1:2 chr7 100552659 . T C 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.0463882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.954;QD=12.8682;RBI=0.0466724;REFB=-0.00382342;REVB=0.00514342;RO=14;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12889;STB=0.555445;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0143356;OID=.;OPOS=100552659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:14:16:11:11:0.407407:10:1:2:12:10:1:2:14 chr7 100552673 . C T 97.9 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0512585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3107;QD=13.5041;RBI=0.0512897;REFB=0.00416403;REVB=0.00178815;RO=17;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957349;STB=0.55547;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.00246505;OID=.;OPOS=100552673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:10:2:2:15:10:2:2:15 chr7 100552675 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0324175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.001;QD=13.5054;RBI=0.0336362;REFB=0.00864275;REVB=0.0089721;RO=17;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957349;STB=0.55547;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.00857721;OID=.;OPOS=100552675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:10:2:2:15:10:2:2:15 chr7 100552711 . T A 52.61 PASS AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0316774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.303;QD=6.78776;RBI=0.0317394;REFB=-0.0123409;REVB=0.00198348;RO=23;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342276;STB=0.521685;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0083137;OID=.;OPOS=100552711;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:5:3:8:15:5:3:8:15 chr7 100552713 . A G 52.36 PASS AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0140775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9112;QD=6.54475;RBI=0.0617079;REFB=-0.0206427;REVB=0.0600807;RO=24;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35933e-08;STB=0.5;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0377253;OID=.;OPOS=100552713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:5:3:9:15:5:3:9:15 chr7 100552727 . G C 52.12 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0312181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.816;QD=6.31775;RBI=0.0427655;REFB=-0.000148984;REVB=-0.0292288;RO=25;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118476;STB=0.575573;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.000126797;OID=.;OPOS=100552727;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:4:4:10:15:4:4:10:15 chr7 100552738 . CA TG 42.31 PASS AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00478132;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=328.454;QD=4.70057;RBI=0.0148919;REFB=-0.00250216;REVB=0.0141035;RO=29;SAF=5;SAR=2;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245282;STB=0.666173;STBP=0.372;TYPE=mnp;VARB=0.00949237;OID=.;OPOS=100552738;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:36:36:29:29:7:7:0.194444:2:5:15:14:2:5:15:14 chr7 100552915 . A C 1607.12 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.78;QD=64.2846;RBI=0.0122075;REFB=0;REVB=-0.0120064;RO=0;SAF=45;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.04627e-05;OID=.;OPOS=100552915;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:55:45:0:0:55:45:0:0 chr7 100552978 . T C 233.05 PASS AF=0.315217;AO=29;DP=94;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.00372817;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.166;QD=10.1325;RBI=0.00719003;REFB=-0.000301296;REVB=0.00614795;RO=59;SAF=14;SAR=15;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942638;STB=0.504501;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.000827914;OID=.;OPOS=100552978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:92:59:63:29:29:0.315217:15:14:28:31:15:14:30:33 chr7 100552984 . T C 232.2 PASS AF=0.318681;AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0040771;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8377;QD=10.2066;RBI=0.0541718;REFB=-0.000623192;REVB=0.0540182;RO=62;SAF=15;SAR=14;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388338;STB=0.522712;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.00249559;OID=.;OPOS=100552984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:62:62:29:29:0.318681:14:15:30:32:14:15:30:32 chr7 100553002 . A G 192.2 PASS AF=0.316456;AO=25;DP=80;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0169772;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.407;QD=9.73184;RBI=0.03484;REFB=-0.00515945;REVB=-0.0304236;RO=54;SAF=13;SAR=12;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109164;STB=0.564026;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.01325;OID=.;OPOS=100553002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:54:54:25:25:0.316456:12:13:23:31:12:13:23:31 chr7 100607851 . C G 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00804057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.078;QD=19.4668;RBI=0.0208895;REFB=-0.00221525;REVB=0.01928;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115537;STB=0.565159;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00358785;OID=.;OPOS=100607851;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:11:11:15:9:11:11:15:9 chr7 100607871 . C T 156.23 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00610292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.794;QD=15.6228;RBI=0.00838683;REFB=-0.016234;REVB=-0.00575269;RO=23;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124324;STB=0.571347;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0173699;OID=.;OPOS=100607871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:8:9:15:8:8:9:15:8 chr7 100608370 . A C 290.12 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0375496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.004;QD=16.5781;RBI=0.037777;REFB=-0.0199426;REVB=-0.00413824;RO=38;SAF=6;SAR=26;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427298;STB=0.742691;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0133232;OID=.;OPOS=100608370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:26:6:22:16:26:6:22:16 chr7 100608375 . G A 281.42 PASS AF=0.469697;AO=30;DP=65;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0124393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.016;QD=17.0556;RBI=0.0148995;REFB=-0.0120059;REVB=-0.00820111;RO=35;SAF=6;SAR=24;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399891;STB=0.730174;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0216334;OID=.;OPOS=100608375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:35:35:30:31:0.469697:24:6:20:15:25:6:20:15 chr7 100608823 . G T 347.38 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0018907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.702;QD=19.8501;RBI=0.0167961;REFB=-0.033437;REVB=0.0166894;RO=32;SAF=12;SAR=24;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957605;STB=0.571388;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0201108;OID=.;OPOS=100608823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:32:34:36:36:0.514286:24:12:14:18:24:12:16:18 chr7 100608826 . C G 273.04 PASS AF=0.492958;AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0389212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.994;QD=15.3827;RBI=0.06114;REFB=-0.0578334;REVB=0.0471512;RO=36;SAF=12;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140987;STB=0.583707;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.110703;OID=.;OPOS=100608826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:36:36:34:35:0.492958:22:12:18:18:23:12:18:18 chr7 100608868 . A G 281.4 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00796847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.505;QD=19.4071;RBI=0.0108699;REFB=-0.0213289;REVB=0.00739314;RO=28;SAF=9;SAR=21;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218367;STB=0.622137;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0162686;OID=.;OPOS=100608868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:21:9:15:13:21:9:15:13 chr7 100608884 . G A 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00936199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8169;QD=16.1152;RBI=0.00937638;REFB=-0.0193334;REVB=0.000519279;RO=28;SAF=6;SAR=18;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298518;STB=0.680253;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0231677;OID=.;OPOS=100608884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:18:6:15:13:18:6:16:13 chr7 100610069 . C T 954.99 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.149;QD=58.7684;RBI=0.0128157;REFB=0;REVB=-0.00654949;RO=0;SAF=20;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95343e-06;OID=.;OPOS=100610069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:45:20:0:0:45:20:0:0 chr7 100612945 . C T 41.97 PASS AF=0.184211;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=38;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0120419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4845;QD=4.41756;RBI=0.0122138;REFB=-0.00832667;REVB=-0.00204189;RO=31;SAF=6;SAR=1;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330185;STB=0.733908;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.068169;OID=.;OPOS=100612945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:38:31:31:7:7:0.184211:1:6:20:11:1:6:20:11 chr7 100612952 . G A 40.91 PASS AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0456465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.037;QD=4.54605;RBI=0.050131;REFB=0.00811148;REVB=-0.0207247;RO=28;SAF=6;SAR=1;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294237;STB=0.724519;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.0174215;OID=.;OPOS=100612952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:36:36:28:29:7:7:0.194444:1:6:19:9:1:6:19:10 chr7 100615387 . C T 41.49 PASS AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0134385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2583;QD=4.04794;RBI=0.0673944;REFB=0.00703107;REVB=0.066041;RO=34;SAF=2;SAR=5;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295322;STB=0.703637;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.0227283;OID=.;OPOS=100615387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:41:41:34:34:7:7:0.170732:5:2:18:16:5:2:18:16 chr7 100624718 . G C 961.83 PASS AF=0.971429;AO=66;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00291077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3738;QD=54.9617;RBI=0.10351;REFB=-0.132181;REVB=0.103469;RO=3;SAF=33;SAR=33;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136762;STB=0.514282;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00671794;OID=.;OPOS=100624718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:70:70:3:2:66:68:0.971429:33:33:1:2:34:34:0:2 chr7 100634476 . C G 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7565;QD=55.6537;RBI=0.135811;REFB=0;REVB=0.0696738;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00466316;OID=.;OPOS=100634476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0 chr7 100634640 . T G 740.11 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.33;QD=56.9311;RBI=0.052372;REFB=0;REVB=0.0355548;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.80064e-05;OID=.;OPOS=100634640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0 chr7 100634964 . C A 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0478502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.808;QD=47.8146;RBI=0.0482345;REFB=0.0181565;REVB=0.00607647;RO=1;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708105;STB=0.538424;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.00109959;OID=.;OPOS=100634964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:15:6:1:0:15:6:1:0 chr7 100635375 . A C 323.86 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.502;QD=53.9763;RBI=0.0991844;REFB=0;REVB=0.0112186;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000436122;OID=.;OPOS=100635375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:16:7:0:0:16:8:0:0 chr7 100635591 . C A 289.7 PASS AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0194424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.848;QD=46.3514;RBI=0.0314557;REFB=-0.209329;REVB=0.0247276;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518202;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00418725;OID=.;OPOS=100635591;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:25:25:0:2:23:23:0.92:16:7:0:0:16:7:1:1 chr7 100635661 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.684;QD=57.6803;RBI=0.023584;REFB=0;REVB=0.0135357;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109785;OID=.;OPOS=100635661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr7 100635679 . C G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.658;QD=59.8393;RBI=0.0378747;REFB=0;REVB=0.0284001;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261764;OID=.;OPOS=100635679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0 chr7 100638856 . A G 728.99 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4169;QD=57.176;RBI=0.0402992;REFB=0;REVB=0.0118745;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571067;OID=.;OPOS=100638856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0 chr7 100639012 . C T 306.7 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1677;QD=53.3399;RBI=0.165241;REFB=0;REVB=0.0345314;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00332432;OID=.;OPOS=100639012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:10:12:0:0:10:13:0:0 chr7 100639040 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.289;QD=47.8224;RBI=0.0573467;REFB=0;REVB=0.0114147;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038712;OID=.;OPOS=100639040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr7 100639049 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0838792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.834;QD=44.6892;RBI=0.0838795;REFB=0;REVB=0.000232755;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126102;OID=.;OPOS=100639049;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0 chr7 100639054 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00188953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.847;QD=40.763;RBI=0.0275722;REFB=0;REVB=-0.0275074;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000318595;OID=.;OPOS=100639054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr7 100639066 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.703;QD=35.5755;RBI=0.067706;REFB=0;REVB=0.0429579;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354009;OID=.;OPOS=100639066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr7 100643351 . C A 306.19 PASS AF=0.266272;AO=44;DP=168;FAO=45;FDP=169;FR=.;FRO=124;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=70;FWDB=-0.0218173;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.49;QD=7.24715;RBI=0.0272917;REFB=-0.021664;REVB=-0.0163963;RO=121;SAF=17;SAR=27;SRF=54;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761726;STB=0.526817;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0643459;OID=.;OPOS=100643351;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:121:124:44:45:0.266272:27:17:54:67:27:18:54:70 chr7 100643477 . A C 1909.21 PASS AF=0.535503;AO=181;DP=339;FAO=181;FDP=338;FR=.;FRO=157;FSAF=97;FSAR=84;FSRF=68;FSRR=89;FWDB=0.00265704;FXX=0.00294977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.751;QD=22.5942;RBI=0.00803135;REFB=-0.0164862;REVB=-0.0075791;RO=151;SAF=97;SAR=84;SRF=62;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104504;STB=0.54766;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0128339;OID=.;OPOS=100643477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:338:151:157:181:181:0.535503:84:97:62:89:84:97:68:89 chr7 100643560 . G A 575.14 PASS AF=0.220657;AO=94;DP=426;FAO=94;FDP=426;FR=.;FRO=332;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=190;FSRR=142;FWDB=-0.0153883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.964;QD=5.4004;RBI=0.0180565;REFB=-0.0013829;REVB=-0.00944667;RO=330;SAF=50;SAR=44;SRF=189;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528443;STB=0.531715;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00528958;OID=.;OPOS=100643560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:426:426:330:332:94:94:0.220657:44:50:189:141:44:50:190:142 chr7 100647875 . C A 506.07 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191376;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.053;QD=59.5375;RBI=0.0242416;REFB=0;REVB=0.0148797;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137412;OID=.;OPOS=100647875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr7 100647920 . A C 490.09 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0458172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6745;QD=56.0103;RBI=0.0466023;REFB=-0.0594225;REVB=0.00851807;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00353853;OID=.;OPOS=100647920;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:0:1:17:17:0:1 chr7 100648029 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.926;QD=56.1915;RBI=0.050174;REFB=0;REVB=-0.0446839;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00064073;OID=.;OPOS=100648029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0 chr7 100648117 . C G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8278;QD=54.5175;RBI=0.00643443;REFB=0;REVB=-0.00389511;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38362e-05;OID=.;OPOS=100648117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:6:19:0:0:6:19:0:0 chr7 100675376 . A C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00521652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.649;QD=42.1826;RBI=0.0129343;REFB=0;REVB=0.0118357;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153355;OID=.;OPOS=100675376;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0 chr7 100675512 . G A 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1304;QD=47.8197;RBI=0.0470315;REFB=0;REVB=-0.0212372;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00242938;OID=.;OPOS=100675512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr7 100676409 . C T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.87;QD=58.5877;RBI=0.0133266;REFB=0;REVB=-0.00104487;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.41934e-05;OID=.;OPOS=100676409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr7 100677210 . C T 33.27 PASS AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0167761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.2;QD=3.24571;RBI=0.076191;REFB=-0.00674209;REVB=-0.0743212;RO=35;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119426;STB=0.58509;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0243249;OID=.;OPOS=100677210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:35:35:6:6:0.146341:3:3:14:21:3:3:14:21 chr7 100677279 . G C 127.2 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0670184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7863;QD=11.5635;RBI=0.0678669;REFB=-0.0180462;REVB=-0.010698;RO=29;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561997;STB=0.533289;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0284225;OID=.;OPOS=100677279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:8:7:15:14:8:7:15:14 chr7 100677285 . G A 131.31 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0240117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9564;QD=14.1953;RBI=0.0332007;REFB=0.00404572;REVB=0.0229287;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340922;STB=0.519829;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=-0.00580054;OID=.;OPOS=100677285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:11:11:8:7:11:11 chr7 100677333 . C G 156.23 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00433004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0873;QD=15.623;RBI=0.0627248;REFB=-0.00892195;REVB=0.0625752;RO=23;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2233;STB=0.627764;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0329201;OID=.;OPOS=100677333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:9:8:16:7:9:8:16:7 chr7 100677378 . C A 214.55 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00290831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.976;QD=20.9316;RBI=0.0192325;REFB=-0.0148851;REVB=0.0190114;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885636;STB=0.537348;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0145159;OID=.;OPOS=100677378;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:20:20:20:21:0.512195:10:10:12:8:10:11:12:8 chr7 100677405 . G A 191.03 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0511257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.958;QD=13.4059;RBI=0.0511258;REFB=-0.00795825;REVB=6.33077e-05;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690526;STB=0.530461;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0226625;OID=.;OPOS=100677405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:34:23:23:0.403509:12:11:18:15:12:11:18:16 chr7 100677409 . G A 196.47 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.042195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.058;QD=12.8831;RBI=0.0434376;REFB=-0.00980163;REVB=-0.0103155;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014609;STB=0.517132;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.033993;OID=.;OPOS=100677409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:13:11:17:19:13:11:18:19 chr7 100677415 . T C 108.96 PASS AF=0.262295;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0251545;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.171;QD=7.14462;RBI=0.0254668;REFB=-0.0070377;REVB=0.00397649;RO=46;SAF=6;SAR=10;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178767;STB=0.601531;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0165523;OID=.;OPOS=100677415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:46:45:16:16:0.262295:10:6:24:22:10:6:23:22 chr7 100677455 . G A 617.61 PASS AF=0.688312;AO=53;DP=75;FAO=53;FDP=77;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00604879;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.922;QD=32.0835;RBI=0.0117294;REFB=-0.0558883;REVB=0.0100495;RO=22;SAF=24;SAR=29;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751258;STB=0.553577;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00976852;OID=.;OPOS=100677455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:22:24:53:53:0.688312:29:24:13:9:29:24:15:9 chr7 100677457 . G T 158.58 PASS AF=0.285714;AO=22;DP=77;FAO=22;FDP=77;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0165663;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.91;QD=8.23786;RBI=0.0173264;REFB=-0.0103521;REVB=-0.00507545;RO=55;SAF=9;SAR=13;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162592;STB=0.597085;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0275515;OID=.;OPOS=100677457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:55:55:22:22:0.285714:13:9:30:25:13:9:30:25 chr7 100677502 . G A 213.54 PASS AF=0.28;AO=28;DP=100;FAO=28;FDP=100;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.00417944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.432;QD=8.54152;RBI=0.00993717;REFB=-0.00978895;REVB=0.00901552;RO=72;SAF=12;SAR=16;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103381;STB=0.56156;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.021727;OID=.;OPOS=100677502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:72:72:28:28:0.28:16:12:37:35:16:12:37:35 chr7 100677516 . A G 230.83 PASS AF=0.311828;AO=29;DP=94;FAO=29;FDP=93;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.0124399;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.689;QD=9.92811;RBI=0.0124399;REFB=-0.00946883;REVB=3.86073e-05;RO=64;SAF=17;SAR=12;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173583;STB=0.611974;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0160699;OID=.;OPOS=100677516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:64:64:29:29:0.311828:12:17:28:36:12:17:27:37 chr7 100677519 . C T 230.63 PASS AF=0.315217;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0175382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.547;QD=10.0272;RBI=0.0234214;REFB=-0.0245783;REVB=-0.0155233;RO=61;SAF=17;SAR=12;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165966;STB=0.60707;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0143618;OID=.;OPOS=100677519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:61:63:29:29:0.315217:12:17:27:34:12:17:27:36 chr7 100677523 . A C 617.51 PASS AF=0.597826;AO=55;DP=92;FAO=55;FDP=92;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00174511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.296;QD=26.848;RBI=0.0169956;REFB=-0.0203157;REVB=-0.0169058;RO=36;SAF=28;SAR=27;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469066;STB=0.519945;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0119269;OID=.;OPOS=100677523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:36:37:55:55:0.597826:27:28:16:20:27:28:17:20 chr7 100677526 . A C 607.57 PASS AF=0.593407;AO=55;DP=92;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0131164;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.02;QD=26.7065;RBI=0.0142667;REFB=-0.0141205;REVB=-0.00561214;RO=37;SAF=28;SAR=27;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056497;STB=0.534946;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0101901;OID=.;OPOS=100677526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:37:37:55:54:0.593407:27:28:16:21:26:28:16:21 chr7 100677556 . A C 316.79 PASS AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.000254163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.621;QD=12.9302;RBI=0.0184499;REFB=-0.014615;REVB=-0.0184481;RO=62;SAF=17;SAR=19;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101625;STB=0.55816;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0223414;OID=.;OPOS=100677556;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:62:62:36:36:0.367347:19:17:35:27:19:17:35:27 chr7 100677572 . A G 157.74 PASS AF=0.234694;AO=23;DP=96;FAO=23;FDP=98;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.00126801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.391;QD=6.43835;RBI=0.0102631;REFB=-0.000520795;REVB=0.0101844;RO=72;SAF=13;SAR=10;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064008;STB=0.54501;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00273963;OID=.;OPOS=100677572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:72:75:23:23:0.234694:10:13:37:35:10:13:38:37 chr7 100677586 . A G 332.15 PASS AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00936784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.486;QD=13.8394;RBI=0.0115818;REFB=-0.0321005;REVB=-0.00681034;RO=59;SAF=20;SAR=17;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346885;STB=0.519763;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0509937;OID=.;OPOS=100677586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:59:59:37:37:0.385417:17:20:30:29:17:20:30:29 chr7 100677625 . G A 216.05 PASS AF=0.279279;AO=30;DP=111;FAO=31;FDP=111;FR=.;FRO=80;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=30;FWDB=-0.0330125;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0958;QD=7.78546;RBI=0.0385255;REFB=-0.0100929;REVB=-0.0198593;RO=78;SAF=18;SAR=12;SRF=49;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360051;STB=0.533151;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0314575;OID=.;OPOS=100677625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:78:80:30:31:0.279279:12:18:49:29:13:18:50:30 chr7 100677630 . C T 890.99 PASS AF=0.672414;AO=78;DP=116;FAO=78;FDP=116;FR=.;FRO=38;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.01344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6069;QD=30.7237;RBI=0.0374082;REFB=-0.00860145;REVB=0.0349105;RO=38;SAF=54;SAR=24;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178591;STB=0.596516;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00494639;OID=.;OPOS=100677630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:38:38:78:78:0.672414:24:54:16:22:24:54:16:22 chr7 100677645 . C A 203.79 PASS AF=0.24031;AO=31;DP=128;FAO=31;FDP=129;FR=.;FRO=98;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=60;FSRR=38;FWDB=0.00820072;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.756;QD=6.3191;RBI=0.00992785;REFB=-0.00418489;REVB=-0.00559557;RO=96;SAF=14;SAR=17;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188788;STB=0.620241;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0133377;OID=.;OPOS=100677645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:96:98:31:31:0.24031:17:14:58:38:17:14:60:38 chr7 100677704 . C T 207.29 PASS AF=0.217391;AO=34;DP=161;FAO=35;FDP=161;FR=.;FRO=126;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=71;FSRR=55;FWDB=0.0617276;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8649;QD=5.15001;RBI=0.0698366;REFB=0.000918378;REVB=0.0326626;RO=121;SAF=17;SAR=17;SRF=68;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787371;STB=0.538604;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.00121204;OID=.;OPOS=100677704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:121:126:34:35:0.217391:17:17:68:53:17:18:71:55 chr7 100677714 . C T 304.64 PASS AF=0.255682;AO=45;DP=177;FAO=45;FDP=176;FR=.;FRO=131;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=75;FSRR=56;FWDB=0.006898;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.279;QD=6.92368;RBI=0.0124906;REFB=-0.00982788;REVB=-0.0104131;RO=130;SAF=23;SAR=22;SRF=75;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822027;STB=0.545803;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0237815;OID=.;OPOS=100677714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:130:131:45:45:0.255682:22:23:75:55:22:23:75:56 chr7 100677816 . G A 594.39 PASS AF=0.4;AO=67;DP=170;FAO=68;FDP=170;FR=.;FRO=102;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.00332798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2285;QD=13.9855;RBI=0.00336386;REFB=0.00636954;REVB=0.000490024;RO=103;SAF=34;SAR=33;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075813;STB=0.549882;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.014993;OID=.;OPOS=100677816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:103:102:67:68:0.4:33:34:45:58:33:35:44:58 chr7 100677944 . T C 813.63 PASS AF=0.651786;AO=73;DP=112;FAO=73;FDP=112;FR=.;FRO=39;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=-0.0336085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2483;QD=29.0583;RBI=0.0478811;REFB=-0.0282235;REVB=-0.0341038;RO=39;SAF=39;SAR=34;SRF=31;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171443;STB=0.59231;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0129445;OID=.;OPOS=100677944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:39:39:73:73:0.651786:34:39:31:8:34:39:31:8 chr7 100677974 . A G 83.71 PASS AF=0.147826;AO=17;DP=115;FAO=17;FDP=115;FR=.;FRO=98;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=0.0242894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5593;QD=2.91155;RBI=0.0263843;REFB=-0.00582277;REVB=0.0103033;RO=98;SAF=6;SAR=11;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25875;STB=0.674171;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0439127;OID=.;OPOS=100677974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:115:115:98:98:17:17:0.147826:11:6:55:43:11:6:55:43 chr7 100677988 . T A 323.75 PASS AF=0.341667;AO=41;DP=120;FAO=41;FDP=120;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0315012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8412;QD=10.7918;RBI=0.034551;REFB=-0.0268476;REVB=0.014193;RO=79;SAF=25;SAR=16;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162544;STB=0.59373;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0436952;OID=.;OPOS=100677988;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:79:79:41:41:0.341667:16:25:37:42:16:25:37:42 chr7 100677995 . A G 37.64 PASS AF=0.0859375;AO=11;DP=129;FAO=11;FDP=128;FR=.;FRO=117;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=0.00776102;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6105;QD=1.17629;RBI=0.0308908;REFB=0.000869481;REVB=0.0299;RO=118;SAF=7;SAR=4;SRF=60;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146627;STB=0.614179;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00698787;OID=.;OPOS=100677995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:129:128:118:117:11:11:0.0859375:4:7:60:58:4:7:60:57 chr7 100678013 . G A 78.04 PASS AF=0.134921;AO=17;DP=126;FAO=17;FDP=126;FR=.;FRO=109;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=-0.0156223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4699;QD=2.47744;RBI=0.0188642;REFB=-0.00215737;REVB=-0.0105736;RO=108;SAF=6;SAR=11;SRF=59;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239804;STB=0.661237;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0150092;OID=.;OPOS=100678013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:126:126:108:109:17:17:0.134921:11:6:59:49:11:6:59:50 chr7 100678075 . C T 106.32 PASS AF=0.156716;AO=21;DP=134;FAO=21;FDP=134;FR=.;FRO=113;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=66;FSRR=47;FWDB=-0.0176962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9411;QD=3.17371;RBI=0.0180144;REFB=-0.000397661;REVB=0.00337094;RO=112;SAF=10;SAR=11;SRF=65;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132162;STB=0.590312;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00212973;OID=.;OPOS=100678075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:112:113:21:21:0.156716:11:10:65:47:11:10:66:47 chr7 100678086 . T C 1920.29 PASS AF=1;AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00305821;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.86;QD=61.4494;RBI=0.0130163;REFB=0;REVB=-0.0126519;RO=1;SAF=71;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664527;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90223e-05;OID=.;OPOS=100678086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:126:125:1:0:124:125:1:53:71:1:0:53:72:0:0 chr7 100678372 . T G 192.01 PASS AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00618443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.098;QD=11.8157;RBI=0.00620831;REFB=-0.012506;REVB=-0.000544012;RO=41;SAF=14;SAR=10;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518757;STB=0.530001;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0194836;OID=.;OPOS=100678372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:10:14:22:19:10:14:22:19 chr7 100678405 . T C 101.53 PASS AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00477943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.731;QD=8.6404;RBI=0.0194102;REFB=-0.00731813;REVB=-0.0188125;RO=34;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204857;STB=0.625215;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0208627;OID=.;OPOS=100678405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:34:34:13:13:0.276596:8:5:19:15:8:5:19:15 chr7 100678407 . G A 101.52 PASS AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00635946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.888;QD=8.64024;RBI=0.0235707;REFB=-0.00597331;REVB=-0.0226966;RO=34;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204857;STB=0.625215;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.030988;OID=.;OPOS=100678407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:34:34:13:13:0.276596:8:5:19:15:8:5:19:15 chr7 100678417 . AA CC 60.76 PASS AF=0.230769;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00242257;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=301.302;QD=6.23205;RBI=0.00506151;REFB=-0.00718008;REVB=-0.0044441;RO=29;SAF=3;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297737;STB=0.677574;STBP=0.243;TYPE=mnp;VARB=0.0241284;OID=.;OPOS=100678417;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:39:39:29:30:9:9:0.230769:6:3:17:12:6:3:17:13 chr7 100678421 . T A 506.76 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218217;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.288;QD=59.6191;RBI=0.0225884;REFB=0;REVB=-0.00583539;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221289;OID=.;OPOS=100678421;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0 chr7 100678426 . C T 43.02 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00590324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.442;QD=5.37748;RBI=0.0158139;REFB=-0.00168898;REVB=0.0146707;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159419;STB=0.601483;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00192005;OID=.;OPOS=100678426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:23:25:7:7:0.21875:4:3:13:10:4:3:14:11 chr7 100678433 . AC TA 34.57 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00880896;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.079;QD=4.46118;RBI=0.0246488;REFB=-0.00592102;REVB=-0.0230209;RO=25;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710764;STB=0.548228;STBP=0.841;TYPE=mnp;VARB=0.0251967;OID=.;OPOS=100678433;OREF=AC;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:3:3:14:11:3:3:14:11 chr7 100678442 . C G 43.21 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0132579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.521;QD=5.57562;RBI=0.0136383;REFB=-0.000505805;REVB=0.00319866;RO=24;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181028;STB=0.617852;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00206669;OID=.;OPOS=100678442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:31:31:24:24:7:7:0.225806:4:3:14:10:4:3:14:10 chr7 100678527 . G T 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00676564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.55;QD=12.1823;RBI=0.00833249;REFB=-0.012443;REVB=-0.00486379;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181314;STB=0.608469;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.019869;OID=.;OPOS=100678527;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:8:7:3:7:8:7 chr7 100678560 . C A 118.92 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.052004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0449;QD=13.2129;RBI=0.0979122;REFB=-0.00476403;REVB=0.0829601;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10623;STB=0.562409;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0131618;OID=.;OPOS=100678560;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:5:9:12:10:5:9:12:10 chr7 100678568 . A T 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0113804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.688;QD=13.336;RBI=0.0163124;REFB=0.0126013;REVB=-0.0116868;RO=24;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094546;STB=0.55548;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-0.0128037;OID=.;OPOS=100678568;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:5:10:14:10:5:10:14:10 chr7 100678610 . A T 104.39 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00526086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6954;QD=10.4386;RBI=0.02282;REFB=0.00447762;REVB=-0.0222053;RO=27;SAF=9;SAR=4;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792852;STB=0.54775;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.0102647;OID=.;OPOS=100678610;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:4:9:17:10:4:9:17:10 chr7 100678616 . G A 118.0 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0360392;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4753;QD=11.8003;RBI=0.0696142;REFB=0.00191317;REVB=-0.0595594;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323715;STB=0.519203;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00858334;OID=.;OPOS=100678616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:5:9:16:10:5:9:16:10 chr7 100678622 . G A 115.67 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0270017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3173;QD=11.0157;RBI=0.0519203;REFB=-0.0119712;REVB=-0.0443466;RO=28;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427466;STB=0.52551;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0199651;OID=.;OPOS=100678622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:5:9:17:11:5:9:17:11 chr7 100678693 . T C 69.94 PASS AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.00567078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.61;QD=6.66131;RBI=0.013077;REFB=-0.00241159;REVB=0.0117834;RO=32;SAF=5;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228923;STB=0.642595;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00910101;OID=.;OPOS=100678693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:42:42:32:32:10:10:0.238095:5:5:22:10:5:5:22:10 chr7 100678740 . T C 443.06 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.738;QD=57.1688;RBI=0.0626862;REFB=0;REVB=-0.0605555;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107624;OID=.;OPOS=100678740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:8:22:0:0:9:22:0:0 chr7 100678820 . T C 501.71 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5147;QD=59.0247;RBI=0.010852;REFB=0;REVB=-0.00511862;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98709e-05;OID=.;OPOS=100678820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0 chr7 100679136 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9658;QD=44.6898;RBI=0.0455343;REFB=0;REVB=0.0275814;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131391;OID=.;OPOS=100679136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr7 100679254 . A G 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00294859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.157;QD=12.7812;RBI=0.0104517;REFB=-0.00285849;REVB=0.0100272;RO=14;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139625;STB=0.58316;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00897199;OID=.;OPOS=100679254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:3:7:8:6:3:7:8:6 chr7 100679296 . C T 199.19 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0104971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.227;QD=19.4329;RBI=0.0235372;REFB=-0.0169136;REVB=0.0210668;RO=21;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15199;STB=0.585871;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0107652;OID=.;OPOS=100679296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:11:9:13:8:11:9:13:8 chr7 100679316 . T A 209.73 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00720956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.774;QD=18.6422;RBI=0.0277378;REFB=-0.0195403;REVB=0.0267844;RO=24;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139377;STB=0.578873;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0140736;OID=.;OPOS=100679316;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:11:10:15:9:11:10:15:9 chr7 100679318 . A C 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00147905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.631;QD=17.6896;RBI=0.00859754;REFB=-0.0152962;REVB=0.00846936;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171871;STB=0.597495;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0188634;OID=.;OPOS=100679318;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:11:10:17:9:11:10:17:9 chr7 100679388 . A C 90.19 PASS AF=0.229508;AO=14;DP=58;FAO=14;FDP=61;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00719481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3647;QD=5.91382;RBI=0.0724494;REFB=-0.0128795;REVB=-0.0720913;RO=44;SAF=7;SAR=7;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111156;STB=0.540926;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0350159;OID=.;OPOS=100679388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:58:61:44:47:14:14:0.229508:7:7:26:18:7:7:26:21 chr7 100679390 . A G 88.33 PASS AF=0.222222;AO=14;DP=62;FAO=14;FDP=63;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0220919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.7866;QD=5.60816;RBI=0.0335318;REFB=-0.0175486;REVB=0.0252256;RO=47;SAF=7;SAR=7;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916556;STB=0.539626;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0348101;OID=.;OPOS=100679390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:62:63:47:49:14:14:0.222222:7:7:27:20:7:7:27:22 chr7 100679694 . C A 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0196876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4094;QD=10.0744;RBI=0.0205891;REFB=-0.025865;REVB=-0.00602566;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283525;STB=0.674535;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0288357;OID=.;OPOS=100679694;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:7:7:2:6:7:7 chr7 100679752 . T C 201.34 PASS AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0120275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.446;QD=28.7625;RBI=0.0236771;REFB=-0.0138589;REVB=0.0203947;RO=9;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138841;STB=0.507684;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0074659;OID=.;OPOS=100679752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:28:28:9:9:19:19:0.678571:11:8:4:5:11:8:4:5 chr7 100679754 . C G 201.84 PASS AF=0.678571;AO=18;DP=27;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0328318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7263;QD=28.8342;RBI=0.059229;REFB=-0.0217402;REVB=0.0492965;RO=9;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507684;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0137095;OID=.;OPOS=100679754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:27:28:9:9:18:19:0.678571:10:8:4:5:11:8:4:5 chr7 100679760 . G A 43.83 PASS AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00591764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5136;QD=6.26096;RBI=0.0530482;REFB=0.00217205;REVB=-0.0527171;RO=20;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139361;STB=0.605762;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.0107369;OID=.;OPOS=100679760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:20:21:7:7:0.25:3:4:9:11:3:4:9:12 chr7 100679809 . C T 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.048;QD=57.6754;RBI=0.0744003;REFB=0;REVB=0.0707721;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0006052;OID=.;OPOS=100679809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr7 100680370 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.8216;QD=46.8472;RBI=0.042752;REFB=0;REVB=0.0412618;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000926487;OID=.;OPOS=100680370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr7 100680939 . C A 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.23;QD=63.869;RBI=0.04703;REFB=0;REVB=0.0304076;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205945;OID=.;OPOS=100680939;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr7 100680983 . G A 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.318;QD=63.2868;RBI=0.0232687;REFB=0;REVB=-0.00792929;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69e-05;OID=.;OPOS=100680983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr7 100681172 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.283;QD=60.9775;RBI=0.0748292;REFB=0;REVB=0.0426686;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011506;OID=.;OPOS=100681172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr7 100681359 . C G 243.63 PASS AF=1;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205381;FXX=0.0908678;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5081;QD=48.7257;RBI=0.0536992;REFB=-0.0638318;REVB=0.0496164;RO=1;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399998;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00437072;OID=.;OPOS=100681359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:21:20:1:0:19:20:1:11:8:0:1:12:8:0:0 chr7 100681762 . A G 365.07 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0788901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.314;QD=52.1522;RBI=0.0840954;REFB=0.0275952;REVB=0.029127;RO=1;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281787;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.00259578;OID=.;OPOS=100681762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:16:11:0:1:16:11:0:1 chr7 100682275 . A G 145.04 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0971;QD=44.6265;RBI=0.00575765;REFB=0;REVB=-0.00147455;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319081;OID=.;OPOS=100682275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:5:8:0:0 chr7 100682831 . C G 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0235523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.84;QD=6.57359;RBI=0.0235728;REFB=-0.00136897;REVB=0.000981288;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192221;STB=0.624574;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00593355;OID=.;OPOS=100682831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:2:4:8:8:2:4:8:8 chr7 100682843 . C G 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.000485214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.889;QD=10.0752;RBI=0.0039946;REFB=-0.0210096;REVB=0.00396502;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0418921;OID=.;OPOS=100682843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:7:7:4:4:7:7 chr7 100683036 . T C 138.32 PASS AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0134867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8128;QD=8.9236;RBI=0.0340757;REFB=-0.00938159;REVB=-0.0312932;RO=43;SAF=14;SAR=5;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375648;STB=0.723899;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0203293;OID=.;OPOS=100683036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:43:43:19:19:0.306452:5:14:18:25:5:14:18:25 chr7 100683053 . A G 94.72 PASS AF=0.245614;AO=14;DP=57;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00993086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.559;QD=6.64692;RBI=0.010822;REFB=-0.0148582;REVB=-0.00430032;RO=43;SAF=11;SAR=3;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406381;STB=0.754238;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0357885;OID=.;OPOS=100683053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:57:57:43:43:14:14:0.245614:3:11:20:23:3:11:20:23 chr7 100683067 . C T 87.15 PASS AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0311473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6059;QD=6.22499;RBI=0.0317742;REFB=-0.0132029;REVB=-0.0062804;RO=43;SAF=10;SAR=3;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360413;STB=0.728494;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0490411;OID=.;OPOS=100683067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:3:10:21:22:3:10:21:22 chr7 100683087 . T G 71.01 PASS AF=0.207547;AO=9;DP=51;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00641626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2408;QD=5.35951;RBI=0.017392;REFB=-0.0110658;REVB=0.0161652;RO=42;SAF=7;SAR=2;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3785;STB=0.787769;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.055322;OID=.;OPOS=100683087;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:51:53:42:42:9:11:0.207547:2:7:20:22:2:9:20:22 chr7 100684550 . A G 557.01 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7933;QD=60.2177;RBI=0.0568268;REFB=0;REVB=0.0154084;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000999317;OID=.;OPOS=100684550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr7 100684593 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.786;QD=59.4356;RBI=0.0166905;REFB=0;REVB=-0.00274055;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43831e-05;OID=.;OPOS=100684593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr7 100692680 . T G 1843.43 PASS AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0116502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.766;QD=60.4402;RBI=0.0173257;REFB=-0.054903;REVB=-0.0128238;RO=0;SAF=58;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74998e-08;STB=0.503936;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0012372;OID=.;OPOS=100692680;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:122:0:1:121:121:0.991803:63:58:0:0:63:58:0:1 chr7 100695138 . G A 469.74 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347755;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.485;QD=58.718;RBI=0.0356786;REFB=0;REVB=0.00797684;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399243;OID=.;OPOS=100695138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr7 100731505 . C G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7362;QD=35.5756;RBI=0.0346495;REFB=0;REVB=0.0296037;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00462936;OID=.;OPOS=100731505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr7 100731829 . T C 3139.33 PASS AF=1;AO=203;DP=207;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235864;FXX=0.0192298;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.761;QD=61.5555;RBI=0.0557333;REFB=0.00247088;REVB=0.0504964;RO=1;SAF=97;SAR=106;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00447256;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188274;OID=.;OPOS=100731829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:207:204:1:0:203:204:1:106:97:0:1:106:98:0:0 chr7 100732321 . C T 816.64 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.338;QD=57.3079;RBI=0.0552024;REFB=0;REVB=-0.00330407;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07379e-05;OID=.;OPOS=100732321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:27:29:0:0:27:30:0:0 chr7 100733100 . G A 109.1 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00505066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9509;QD=36.3666;RBI=0.0773478;REFB=-0.116833;REVB=0.0771827;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994753;STB=0.555452;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00676339;OID=.;OPOS=100733100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:7:4:1:0:7:4:1:0 chr7 100802786 . A G 972.85 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=324.382;QD=58.9608;RBI=0.0066169;REFB=0;REVB=0.00139067;RO=0;SAF=52;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.018e-06;OID=.;OPOS=100802786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:14:52:0:0:14:52:0:0 chr7 100839401 . G A 95.23 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0343604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7279;QD=34.6297;RBI=0.0361163;REFB=-0.0939724;REVB=0.0111241;RO=1;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990155;STB=0.555443;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0103173;OID=.;OPOS=100839401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:4:6:0:1:4:6:0:1 chr7 100850890 . G A 563.81 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0203399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.7;QD=57.8268;RBI=0.0238834;REFB=-0.141395;REVB=0.0125183;RO=1;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240222;STB=0.512814;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00108783;OID=.;OPOS=100850890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:19:19:0:1:19:19:0:1 chr7 101006376 . C T 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.832;QD=56.7051;RBI=0.0592916;REFB=0;REVB=0.020012;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392357;OID=.;OPOS=101006376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr7 101006382 . C T 428.6 PASS AF=1;AO=27;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.236934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9582;QD=57.1471;RBI=0.257022;REFB=0;REVB=0.0996129;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00770378;OID=.;OPOS=101006382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:27:30:1:17:10:0:0:18:12:0:0 chr7 101200669 . A AG 642.34 PASS AF=1;AO=63;DP=72;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8405;QD=37.2371;RBI=0.0970344;REFB=0;REVB=-0.0864072;RO=8;SAF=35;SAR=28;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650085;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000443453;OID=.;OPOS=101200670;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:63:72:69:69:0:35:34:0:0:14:8:35:28:2:6 chr7 101200727 . G A 147.27 PASS AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0237755;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.839;QD=10.5193;RBI=0.0268265;REFB=-0.0103276;REVB=0.0124253;RO=36;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293772;STB=0.508466;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0327483;OID=.;OPOS=101200727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:37:19:19:0.339286:9:10:18:18:9:10:19:18 chr7 101892833 . C T 1190.43 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1161;QD=61.0479;RBI=0.0314082;REFB=0;REVB=0.0175367;RO=0;SAF=28;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309995;OID=.;OPOS=101892833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:50:28:0:0:50:28:0:0 chr7 101916647 . A G 238.26 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00748203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.621;QD=20.2776;RBI=0.0448317;REFB=-0.0113058;REVB=-0.0442029;RO=23;SAF=16;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206326;STB=0.628567;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00367624;OID=.;OPOS=101916647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:24:23:23:0.489362:7:16:11:12:7:16:11:13 chr7 101917521 . G A 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=0.0303131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7903;QD=19.3433;RBI=0.0476782;REFB=-0.00948105;REVB=0.0368012;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280625;STB=0.656103;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00700649;OID=.;OPOS=101917521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:11:7:2:16:11:7:2:16 chr7 101926302 . G A 247.02 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0131451;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.7;QD=19.3739;RBI=0.0726421;REFB=0.00864324;REVB=-0.0714428;RO=25;SAF=21;SAR=5;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158588;STB=0.589558;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.00575245;OID=.;OPOS=101926302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:25:26:26:0.509804:5:21:17:8:5:21:17:8 chr7 102038153 . CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 237.2 PASS AF=0.105263,0.210526,0.526316,0.157895;AO=2,5,2,10;DP=20;FAO=2,4,10,3;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,10,0;FSAR=2,4,0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429239,0.0491896,0.0826935,0.0433487;FXX=0.0951928;HRUN=1,1,1,1;LEN=3,6,5,4;MLLD=84.5841,104.073,119.496,100.478;QD=49.9366;RBI=0.0478523,0.0522659,0.0994917,0.0434871;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0211512,-0.0176666,-0.0553207,0.00346706;RO=0;SAF=0,1,2,7;SAR=2,4,0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,del;VARB=0.0363347,0.0957081,0.00152529,0.104949;OID=.,.,.,.;OPOS=102038154,102038154,102038180,102038154;OREF=TGT,TGTGTG,TGTGT,TGTG;OALT=-,-,-,-;OMAPALT=CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG,CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0.105263,0.210526,0.526316,0.157895:2,5,2,10:20:2,4,10,3:19:0:0,0,10,0:2,4,0,3:0:0:28:0:0,1,2,7:2,4,0,3:0:0 chr7 102063517 . A G 48.85 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0157295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5537;QD=13.9584;RBI=0.0250995;REFB=0.00393116;REVB=0.0195594;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135151;STB=0.581152;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=-0.00241142;OID=.;OPOS=102063517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:5:2:3:4:5:2:3:4 chr7 102063527 . G C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.368;QD=45.8068;RBI=0.0186117;REFB=0;REVB=0.0155859;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403453;OID=.;OPOS=102063527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr7 102066539 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.474;QD=44.6898;RBI=0.0369234;REFB=0;REVB=0.0231958;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463219;OID=.;OPOS=102066539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr7 102098010 . G A 164.97 PASS AF=0.472222;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00630402;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2096;QD=18.3295;RBI=0.0487238;REFB=-0.0265415;REVB=0.0483143;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265217;STB=0.526285;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.013052;OID=.;OPOS=102098010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:19:16:17:0.472222:8:8:9:8:8:9:11:8 chr7 102106201 . G A 101.31 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=46;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0618614;FXX=0.039992;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.089;QD=8.44269;RBI=0.0703093;REFB=-0.0202521;REVB=-0.0334152;RO=24;SAF=1;SAR=9;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363612;STB=0.53841;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0676996;OID=.;OPOS=102106201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:24:33:10:15:0.3125:9:1:7:17:9:6:15:18 chr7 102108532 . G A 579.98 PASS AF=0.611765;AO=52;DP=85;FAO=52;FDP=85;FR=.;FRO=33;FSAF=41;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0118856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.95;QD=27.293;RBI=0.0200904;REFB=-0.0346593;REVB=-0.0161974;RO=33;SAF=41;SAR=11;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062577;STB=0.534188;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0214817;OID=.;OPOS=102108532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:33:33:52:52:0.611765:11:41:24:9:11:41:24:9 chr7 102111936 . G A 370.13 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.00117015;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.228;QD=14.1002;RBI=0.00656313;REFB=-0.0202469;REVB=-0.00645797;RO=62;SAF=16;SAR=27;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120417;STB=0.568129;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0328603;OID=.;OPOS=102111936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:62:43:43:0.409524:27:16:30:32:27:16:30:32 chr7 102119322 . T C 53.39 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0707885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.806;QD=7.62747;RBI=0.0729901;REFB=-0.0117549;REVB=-0.0177917;RO=19;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469121;STB=0.7752;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0594535;OID=.;OPOS=102119322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:19:20:8:8:0.285714:2:6:6:13:2:6:7:13 chr7 102212939 . G C 58.35 PASS AF=0.183673;AO=9;DP=49;FAO=9;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0591084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5974;QD=4.76303;RBI=0.0789732;REFB=-0.00288237;REVB=-0.0523733;RO=39;SAF=2;SAR=7;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393127;STB=0.770035;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0147076;OID=.;OPOS=102212939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:49:49:39:40:9:9:0.183673:7:2:21:18:7:2:22:18 chr7 102389833 . G C 156.32 PASS AF=0.933333;AO=10;DP=16;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177493;FXX=0.062461;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.23;QD=41.6846;RBI=0.0475435;REFB=0.00445051;REVB=0.0441061;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526279;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.000288813;OID=.;OPOS=102389833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:15:0:1:10:14:0.933333:5:5:0:0:5:9:1:0 chr7 102462636 . T C 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.642;QD=60.8835;RBI=0.0481954;REFB=0;REVB=0.0155383;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112198;OID=.;OPOS=102462636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:47:30:0:0:47:30:0:0 chr7 102462809 . C T 131.9 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0115578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.013;QD=15.0743;RBI=0.0449323;REFB=-0.00828094;REVB=-0.0434203;RO=18;SAF=4;SAR=11;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383468;STB=0.698139;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0153682;OID=.;OPOS=102462809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:20:15:15:0.428571:11:4:12:6:11:4:12:8 chr7 102495249 . T C 198.19 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0088376;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.996;QD=12.9959;RBI=0.040927;REFB=-0.0141139;REVB=0.0399614;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419705;STB=0.524059;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0182845;OID=.;OPOS=102495249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:14:10:14:23:14:10:14:23 chr7 102574715 . A G 477.99 PASS AF=0.616438;AO=44;DP=69;FAO=45;FDP=73;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.00380456;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.357;QD=26.1914;RBI=0.0352711;REFB=-0.000398211;REVB=-0.0350653;RO=25;SAF=20;SAR=24;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278977;STB=0.620887;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0121943;OID=.;OPOS=102574715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:73:25:28:44:45:0.616438:24:20:22:3:24:21:22:6 chr7 102665620 . C G 1343.34 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00682692;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.677;QD=62.4809;RBI=0.00685057;REFB=0;REVB=0.000568804;RO=0;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173973;OID=.;OPOS=102665620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:35:51:0:0:35:51:0:0 chr7 102668001 . A C 1230.86 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177731;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.504;QD=61.5431;RBI=0.0230681;REFB=0;REVB=0.0147056;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52454e-05;OID=.;OPOS=102668001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:42:38:0:0:42:38:0:0 chr7 102696108 . A G 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00016888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.659;QD=57.1749;RBI=0.0164744;REFB=0;REVB=-0.0164735;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27284e-05;OID=.;OPOS=102696108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr7 102740683 . G A 710.6 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00264154;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.906;QD=54.6612;RBI=0.0385798;REFB=-0.0317808;REVB=-0.0384893;RO=1;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192158;STB=0.5102;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00162927;OID=.;OPOS=102740683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:27:24:1:0:27:24:1:0 chr7 102742144 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.835;QD=62.3507;RBI=0.0291772;REFB=0;REVB=-0.0170737;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222315;OID=.;OPOS=102742144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr7 102743893 . C T 708.45 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.527;QD=62.9736;RBI=0.0404993;REFB=0;REVB=0.00640266;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361098;OID=.;OPOS=102743893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr7 102952123 . G T 365.86 PASS AF=0.401869;AO=42;DP=106;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.00698619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.254;QD=13.677;RBI=0.0145441;REFB=0.00523392;REVB=0.0127563;RO=64;SAF=19;SAR=23;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498868;STB=0.521691;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.00633341;OID=.;OPOS=102952123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:64:64:42:43:0.401869:23:19:26:38:24:19:26:38 chr7 102961277 . CTTTTTTTT CTTTTTTTA,CTTTTT,CTTTTTT 322.56 PASS AF=0.472222,0.5,0.0277778;AO=2,6,5;DP=39;FAO=17,18,1;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18,1;FSAR=17,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111027,0.106078,0.15758;FXX=0.121921;HRUN=20,20,20;LEN=1,3,2;MLLD=148.279,5.75685,4.15102;QD=35.8396;RBI=0.0520734,0.209733,0.311219;REFB=0.005677,-0.00861731,-0.00748809;REVB=0.050876,-0.180929,-0.268376;RO=3;SAF=0,6,5;SAR=2,0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.74993,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0.00732556,0.107934,0.0367544;OID=.,.,.;OPOS=102961285,102961278,102961278;OREF=T,TTT,TT;OALT=A,-,-;OMAPALT=CTTTTTTTA,CTTTTT,CTTTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.472222,0.5,0.0277778:2,6,5:39:17,18,1:36:0:0,18,1:17,0,0:0:0:65:3:0,6,5:2,0,0:3:0 chr7 103007949 . A C 1302.79 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.326;QD=62.0378;RBI=0.0324127;REFB=0;REVB=0.0218602;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86397e-05;OID=.;OPOS=103007949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:41:42:0:0:42:42:0:0 chr7 103020939 . G A 236.44 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0110084;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.946;QD=15.5041;RBI=0.0280368;REFB=-0.0142203;REVB=-0.0257852;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197534;STB=0.61143;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0164964;OID=.;OPOS=103020939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:34:34:27:27:0.442623:12:15:12:22:12:15:12:22 chr7 103073964 . T C 59.59 PASS AF=0.209302;AO=9;DP=43;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00282423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.762;QD=5.54325;RBI=0.01696;REFB=-0.000190386;REVB=0.0167232;RO=34;SAF=7;SAR=2;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192416;STB=0.627895;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.000704846;OID=.;OPOS=103073964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:43:43:34:34:9:9:0.209302:2:7:22:12:2:7:22:12 chr7 103073979 . G C 90.42 PASS AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0039683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.682;QD=7.86271;RBI=0.0329281;REFB=-0.000919146;REVB=-0.0326881;RO=33;SAF=10;SAR=2;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303765;STB=0.685919;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00142269;OID=.;OPOS=103073979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:46:46:33:34:12:12:0.26087:2:10:21:12:2:10:22:12 chr7 103073993 . T C 90.43 PASS AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.013435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.256;QD=7.8631;RBI=0.0285232;REFB=-0.00260128;REVB=-0.0251609;RO=34;SAF=10;SAR=2;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356851;STB=0.726842;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00821625;OID=.;OPOS=103073993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:46:46:34:34:12:12:0.26087:2:10:20:14:2:10:20:14 chr7 103124207 . T C 918.77 PASS AF=0.602941;AO=82;DP=137;FAO=82;FDP=136;FR=.;FRO=54;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00770613;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.352;QD=27.0227;RBI=0.0193593;REFB=-0.0205892;REVB=0.0177595;RO=54;SAF=39;SAR=43;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501763;STB=0.52721;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0142097;OID=.;OPOS=103124207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:54:54:82:82:0.602941:43:39:22:32:43:39:22:32 chr7 103124785 . T C 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0126272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.604;QD=18.4896;RBI=0.0201239;REFB=-0.0083352;REVB=-0.0156692;RO=26;SAF=12;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030387;STB=0.517226;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0105193;OID=.;OPOS=103124785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:10:12:15:11:10:12:15:11 chr7 103124884 . G A 625.45 PASS AF=0.57732;AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0110353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6707;QD=25.7918;RBI=0.0290245;REFB=-0.00916459;REVB=-0.0268448;RO=41;SAF=29;SAR=27;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154821;STB=0.584434;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00637103;OID=.;OPOS=103124884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:41:41:56:56:0.57732:27:29:13:28:27:29:13:28 chr7 103151436 . T C 298.08 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0341852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.906;QD=20.9182;RBI=0.0384046;REFB=-0.00900681;REVB=-0.0175012;RO=26;SAF=10;SAR=21;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123943;STB=0.56892;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00696187;OID=.;OPOS=103151436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:21:10:12:14:21:10:12:14 chr7 103155705 . A G 271.38 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00370827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.692;QD=23.5986;RBI=0.0201154;REFB=-0.0113684;REVB=-0.0197706;RO=21;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099776;STB=0.555713;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00823139;OID=.;OPOS=103155705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:9:16:11:10:9:16:11:10 chr7 103179595 . A G 499.57 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00142093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.431;QD=16.9347;RBI=0.0340194;REFB=-0.00412614;REVB=-0.0339897;RO=64;SAF=28;SAR=26;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429638;STB=0.523921;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0054188;OID=.;OPOS=103179595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:64:64:54:54:0.457627:26:28:36:28:26:28:36:28 chr7 103292224 . T C 330.89 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0161507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.089;QD=15.9465;RBI=0.0162614;REFB=-0.00510421;REVB=-0.00189473;RO=47;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187301;STB=0.605119;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0119995;OID=.;OPOS=103292224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:17:19:16:31:17:19:16:31 chr7 104110492 . C T 240.14 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00511226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.681;QD=16.5612;RBI=0.0353523;REFB=-0.0226659;REVB=-0.0349807;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429834;STB=0.524228;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0162682;OID=.;OPOS=104110492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:11:16:17:14:11:16:17:14 chr7 104263425 . T C 417.98 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.041084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.685;QD=53.9323;RBI=0.0431591;REFB=-0.111267;REVB=0.0132216;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.515141;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00111563;OID=.;OPOS=104263425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:14:16:0:0:14:16:1:0 chr7 104717517 . C T 216.31 PASS AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0180088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7642;QD=29.8364;RBI=0.0527708;REFB=-0.0312887;REVB=-0.0496029;RO=9;SAF=12;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891533;STB=0.549246;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0121161;OID=.;OPOS=104717517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:29:29:9:9:20:20:0.689655:8:12:4:5:8:12:4:5 chr7 104785779 . T G 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.000437331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.274;QD=7.46507;RBI=0.00767095;REFB=-0.0115367;REVB=-0.00765847;RO=17;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433736;STB=0.781688;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0310998;OID=.;OPOS=104785779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:1:6:9:8:1:6:9:8 chr7 105245754 . A G 1400.32 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139976;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.201;QD=62.9359;RBI=0.0143357;REFB=0;REVB=-0.00309531;RO=0;SAF=40;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19384e-05;OID=.;OPOS=105245754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:49:40:0:0:49:40:0:0 chr7 105245877 . G A 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.793;QD=62.9829;RBI=0.0227715;REFB=0;REVB=0.0125022;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10655e-05;OID=.;OPOS=105245877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0 chr7 105245922 . TG GT 46.28 PASS AF=0.875;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0500889;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=109.827;QD=23.1395;RBI=0.0500889;REFB=-0.0699387;REVB=0;RO=2;SAF=6;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00165491;OID=.;OPOS=105245922;OREF=TG;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:8:8:2:1:6:7:0.875:0:6:2:0:0:7:1:0 chr7 105658451 . G A 210.27 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.0135663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.677;QD=15.5755;RBI=0.0136162;REFB=-0.00179547;REVB=0.00116381;RO=30;SAF=5;SAR=19;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360907;STB=0.52053;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00162733;OID=.;OPOS=105658451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:19:5:7:23:19:5:7:23 chr7 105662690 . T C 464.72 PASS AF=0.472222;AO=50;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.046744;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.805;QD=17.2119;RBI=0.0544339;REFB=-0.0124211;REVB=-0.0278935;RO=56;SAF=30;SAR=20;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248833;STB=0.514119;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0127542;OID=.;OPOS=105662690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:57:50:51:0.472222:20:30:35:21:21:30:35:22 chr7 105848638 . T C 414.14 PASS AF=0.711538;AO=37;DP=51;FAO=37;FDP=52;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0229913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.568;QD=31.857;RBI=0.028871;REFB=-0.0315228;REVB=0.0174624;RO=14;SAF=21;SAR=16;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709228;STB=0.548563;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00700389;OID=.;OPOS=105848638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:14:15:37:37:0.711538:16:21:6:8:16:21:6:9 chr7 105903904 . T C 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9302;QD=62.6135;RBI=0.0548834;REFB=0;REVB=0.0532816;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000512872;OID=.;OPOS=105903904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0 chr7 105917482 . A G 259.42 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0217393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.654;QD=14.215;RBI=0.059524;REFB=0.00397528;REVB=0.0554121;RO=42;SAF=21;SAR=9;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309385;STB=0.670306;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.00298761;OID=.;OPOS=105917482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:43:30:30:0.410959:9:21:17:25:9:21:18:25 chr7 106508978 . A G 2862.29 PASS AF=1;AO=182;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5786;QD=62.5637;RBI=0.0269051;REFB=0;REVB=0.0229368;RO=0;SAF=92;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93788e-05;OID=.;OPOS=106508978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:183:183:0:0:182:183:1:90:92:0:0:91:92:0:0 chr7 106508987 . T C 2883.75 PASS AF=1;AO=182;DP=184;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122697;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8223;QD=63.0328;RBI=0.0123923;REFB=0;REVB=0.00173871;RO=0;SAF=93;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10828e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188787;OID=.;OPOS=106508987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:184:183:0:0:182:183:1:89:93:0:0:90:93:0:0 chr7 106799997 . G A 433.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254797;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.652;QD=57.7356;RBI=0.0512587;REFB=0;REVB=0.0511953;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283666;OID=.;OPOS=106799997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:31:30:1:15:16:0:0:15:15:0:0 chr7 106826381 . C T 205.05 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=79;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0153025;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.757;QD=10.5153;RBI=0.0318646;REFB=-0.0120752;REVB=-0.0279497;RO=51;SAF=15;SAR=11;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322702;STB=0.513068;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0256134;OID=.;OPOS=106826381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:51:52:26:26:0.333333:11:15:28:23:11:15:29:23 chr7 106842683 . A ATCTT 72.64 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0125745;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=4;MLLD=193.167;QD=7.45047;RBI=0.0163383;REFB=-0.00307722;REVB=-0.0104317;RO=29;SAF=6;SAR=4;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993085;STB=0.562374;STBP=0.652;TYPE=ins;VARB=0.00867785;OID=.;OPOS=106842684;OREF=-;OALT=TCTT;OMAPALT=ATCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25641:10:39:10:39:29:6:4:15:14:72:29:6:4:15:14 chr7 106897237 . A C 653.61 PASS AF=0.547009;AO=64;DP=118;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.00781853;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9196;QD=22.3455;RBI=0.033643;REFB=0.000268303;REVB=0.0327219;RO=53;SAF=34;SAR=30;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157603;STB=0.594566;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=7.33257e-06;OID=.;OPOS=106897237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:53:53:64:64:0.547009:30:34:18:35:30:34:17:36 chr7 107002806 . A G 1384.06 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8997;QD=61.5137;RBI=0.0324392;REFB=-0.0974603;REVB=0.0241954;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148737;OID=.;OPOS=107002806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:90:90:0:0:89:90:1:46:43:0:0:47:43:0:0 chr7 107188719 . G T 358.83 PASS AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0274828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5141;QD=19.9351;RBI=0.0805378;REFB=-0.00571284;REVB=-0.0757036;RO=35;SAF=25;SAR=11;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270648;STB=0.637975;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00344128;OID=.;OPOS=107188719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:11:25:14:21:12:25:14:21 chr7 107208250 . T C 162.77 PASS AF=0.36;AO=15;DP=47;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0218343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.726;QD=13.0216;RBI=0.0229468;REFB=-0.0202078;REVB=-0.00705811;RO=32;SAF=5;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897138;STB=0.511615;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0328579;OID=.;OPOS=107208250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:50:32:32:15:18:0.36:10:5:13:19:11:7:13:19 chr7 107259721 . T C 347.91 PASS AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0112829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.521;QD=14.8046;RBI=0.0356494;REFB=-0.007438;REVB=0.0338168;RO=56;SAF=21;SAR=17;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092843;STB=0.552604;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.012006;OID=.;OPOS=107259721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:56:38:38:0.404255:17:21:26:30:17:21:26:30 chr7 107414419 . A G 1156.79 PASS AF=1;AO=76;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00736129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.921;QD=59.3227;RBI=0.0103337;REFB=0;REVB=0.00725232;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51135e-05;OID=.;OPOS=107414419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:76:78:1:29:47:0:0:31:47:0:0 chr7 107423254 . C T 204.2 PASS AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0263483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.565;QD=12.5664;RBI=0.0335197;REFB=-0.00741722;REVB=-0.0207204;RO=40;SAF=17;SAR=8;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122001;STB=0.570412;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0161052;OID=.;OPOS=107423254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:8:17:23:17:8:17:23:17 chr7 107559911 . G A 454.93 PASS AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0194404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8288;QD=18.0172;RBI=0.0199203;REFB=-0.00791415;REVB=0.00434607;RO=52;SAF=26;SAR=22;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092823;STB=0.546559;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00787585;OID=.;OPOS=107559911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:52:53:48:48:0.475248:22:26:23:29:22:26:24:29 chr7 107593989 . T C 86.87 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0274277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.754;QD=12.869;RBI=0.0282243;REFB=-0.021114;REVB=0.00665807;RO=16;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172723;STB=0.510186;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0350432;OID=.;OPOS=107593989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:5:6:9:7:5:6:9:7 chr7 107671407 . C G 419.96 PASS AF=0.410256;AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.00268021;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.003;QD=14.3575;RBI=0.00586743;REFB=-0.00890377;REVB=-0.0052195;RO=67;SAF=17;SAR=31;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133188;STB=0.57639;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0130914;OID=.;OPOS=107671407;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:67:69:48:48:0.410256:31:17:32:35:31:17:33:36 chr7 107677984 . G A 342.69 PASS AF=0.596491;AO=33;DP=56;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0158056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.817;QD=24.0481;RBI=0.0227565;REFB=-0.0305606;REVB=-0.016372;RO=22;SAF=13;SAR=20;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246637;STB=0.613289;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0120956;OID=.;OPOS=107677984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:22:23:33:34:0.596491:20:13:2:20:21:13:3:20 chr7 107818851 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.908;QD=58.7817;RBI=0.0267412;REFB=0;REVB=0.0263886;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27728e-05;OID=.;OPOS=107818851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:30:34:0:0:30:35:0:0 chr7 107824678 . A G 1641.88 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.053;QD=59.7048;RBI=0.0675684;REFB=0;REVB=0.0292676;RO=0;SAF=61;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224045;OID=.;OPOS=107824678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:110:0:0:102:110:1:41:61:0:0:42:68:0:0 chr7 107824889 . C G 489.61 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.397;QD=57.6014;RBI=0.0439504;REFB=0;REVB=0.0339276;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708686;OID=.;OPOS=107824889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:12:21:0:0:13:21:0:0 chr7 107834613 . G C 1025.98 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.921;QD=59.4773;RBI=0.0401807;REFB=0;REVB=0.0118551;RO=0;SAF=20;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.88859e-05;OID=.;OPOS=107834613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:49:20:0:0:49:20:0:0 chr7 107834734 . C T 1121.22 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206587;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.097;QD=60.6066;RBI=0.0362151;REFB=0;REVB=0.0297447;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010438;OID=.;OPOS=107834734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:37:36:0:0:38:36:0:0 chr7 107838464 . G T 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.959;QD=60.8833;RBI=0.065259;REFB=0;REVB=-0.065174;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000237781;OID=.;OPOS=107838464;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:37:40:0:0:37:40:0:0 chr7 107849908 . G A,T 1324.29 PASS AF=0.892473,0.107527;AO=80,8;DP=90;FAO=83,10;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=44,7;FSAR=39,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00184474,-0.000119041;FXX=0.0792001;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.221,158.008;QD=56.9585;RBI=0.00831006,0.00359753;REFB=0,0;REVB=0.00810272,-0.00359556;RO=0;SAF=44,5;SAR=36,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.28538e-08,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00106934,0.00851893;OID=.,.;OPOS=107849908,107849908;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:44:90:93:0:0:80,8:83,10:0.892473,0.107527:36,3:44,5:0:0:39,3:44,7:0:0 chr7 107849909 . T A 40.66 PASS AF=0.0990099;AO=9;DP=100;FAO=10;FDP=101;FR=.;FRO=91;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=-0.00607343;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=85.7266;QD=1.61034;RBI=0.00607556;REFB=-0.00374955;REVB=-0.00016091;RO=91;SAF=3;SAR=6;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255444;STB=0.727882;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0109603;OID=.;OPOS=107849909;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:100:101:91:91:9:10:0.0990099:6:3:51:40:7:3:51:40 chr7 107872816 . G A 1730.29 PASS AF=1;AO=113;DP=117;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00171613;FXX=0.0256388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.176;QD=60.7118;RBI=0.0269208;REFB=0;REVB=0.026866;RO=0;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218256;OID=.;OPOS=107872816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:117:114:0:0:113:114:1:50:63:0:0:51:63:0:0 chr7 107875170 . T C 922.2 PASS AF=0.955882;AO=65;DP=69;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0161874;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.625;QD=54.2472;RBI=0.017336;REFB=0.0088565;REVB=0.00620525;RO=2;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242139;STB=0.518982;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.000583954;OID=.;OPOS=107875170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:69:68:2:3:65:65:0.955882:38:27:0:2:38:27:0:3 chr7 111981007 . G A 341.93 PASS AF=0.365217;AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=115;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.0309958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.065;QD=11.8933;RBI=0.0313177;REFB=-0.0198326;REVB=-0.00447867;RO=73;SAF=21;SAR=21;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760232;STB=0.504346;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0402239;OID=.;OPOS=111981007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:73:73:42:42:0.365217:21:21:37:36:21:21:37:36 chr7 112722278 . A AC,C 595.84 PASS AF=0.35,0.65;AO=18,15;DP=41;FAO=14,26;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=6,13;FSAR=8,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309016,0.0310918;FXX=0.0243843;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=161.439,162.965;QD=59.5841;RBI=0.0324338,0.031659;REFB=0,0;REVB=-0.00985111,-0.00596606;RO=0;SAF=7,8;SAR=11,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00705114,-0.00293975;OID=.,.;OPOS=112722279,112722278;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:40:41:40:0:0:18,15:14,26:0.35,0.65:11,7:7,8:0:0:8,13:6,13:0:0 chr7 112723093 . T C 1395.77 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9464;QD=62.7314;RBI=0.0156347;REFB=0;REVB=-0.00270611;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00833e-05;OID=.;OPOS=112723093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:47:42:0:0:47:42:0:0 chr7 112724417 . A G 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.5438;QD=57.1035;RBI=0.047405;REFB=0;REVB=0.0274974;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000736578;OID=.;OPOS=112724417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr7 112724525 . A G 747.07 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.81;QD=63.5808;RBI=0.0214218;REFB=0;REVB=0.0145219;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77802e-05;OID=.;OPOS=112724525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr7 113518434 . C A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.01;QD=57.6802;RBI=0.0328992;REFB=0;REVB=-0.0118095;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000328833;OID=.;OPOS=113518434;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr7 113518498 . C A 817.7 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.428;QD=57.3824;RBI=0.014541;REFB=0;REVB=-0.00840633;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41012e-05;OID=.;OPOS=113518498;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:32:25:0:0:32:25:0:0 chr7 113518502 . A T 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00046497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.915;QD=58.2396;RBI=0.0103622;REFB=0;REVB=0.0103517;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17187e-05;OID=.;OPOS=113518502;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr7 113519719 . A T 1622.61 PASS AF=0.973684;AO=105;DP=108;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0142806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.036;QD=56.9337;RBI=0.0374167;REFB=0.0126689;REVB=0.0345843;RO=3;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251792;STB=0.512603;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=-3.91207e-05;OID=.;OPOS=113519719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:108:114:3:3:105:111:0.973684:55:50:0:3:58:53:0:3 chr7 113519796 . C T 885.4 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4751;QD=58.0593;RBI=0.0337623;REFB=0;REVB=-0.0068439;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000179346;OID=.;OPOS=113519796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0 chr7 114296590 . A C 1165.3 PASS AF=0.987342;AO=70;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.887;QD=59.0027;RBI=0.0856862;REFB=0;REVB=0.0284621;RO=1;SAF=26;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178357;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488365;OID=.;OPOS=114296590;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:0:70:78:0.987342:44:26:1:0:44:34:0:0 chr7 114619598 . C A 382.69 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0150899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.911;QD=52.7844;RBI=0.0163305;REFB=-0.147917;REVB=0.00624326;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000985473;OID=.;OPOS=114619598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:14:14:0:0:14:14:1:0 chr7 115578124 . G T 496.03 PASS AF=0.546512;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0137066;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.562;QD=23.0712;RBI=0.027892;REFB=-0.0100909;REVB=-0.0242918;RO=39;SAF=22;SAR=25;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580064;STB=0.531901;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00664245;OID=.;OPOS=115578124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:39:39:47:47:0.546512:25:22:21:18:25:22:21:18 chr7 115892650 . T G 1541.96 PASS AF=0.990476;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0113537;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.821;QD=58.7415;RBI=0.0144466;REFB=-0.0652742;REVB=0.00893289;RO=0;SAF=35;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33703e-08;STB=0.507041;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=4.83579e-06;OID=.;OPOS=115892650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:105:0:1:104:104:0.990476:69:35:0:0:69:35:1:0 chr7 115897392 . G C 1343.71 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.038;QD=61.0777;RBI=0.0172732;REFB=0.0100259;REVB=-0.00560702;RO=1;SAF=43;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108921;STB=0.505746;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-1.65699e-05;OID=.;OPOS=115897392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:87:87:0.988636:44:43:1:0:44:43:1:0 chr7 116165360 . A C,G 744.95 PASS AF=0.928571,0.0535714;AO=52,2;DP=56;FAO=52,3;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=36,2;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00732098,-0.0094125;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=117.949,145.811;QD=53.2106;RBI=0.0277999,0.0161335;REFB=-0.0809578,-0.160659;REVB=0.0268186,-0.0131032;RO=1;SAF=36,2;SAR=16,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0285241,0.697199;STB=0.515146,0.665547;STBP=0.202,0.558;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00501085,0.097267;OID=.,.;OPOS=116165360,116165360;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:56:56:1:1:52,2:52,3:0.928571,0.0535714:16,0:36,2:0:1:16,1:36,2:0:1 chr7 116165364 . AGCCCCT AGCCCT,AGCCCTC,GAGCCCT 59.96 PASS AF=0.326087,0,0;AO=10,2,4;DP=46;FAO=15,0,0;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=14,0,0;FSAR=1,0,0;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.016272,-0.0585696,-0.0481487;FXX=0;HRUN=4,4,1;LEN=1,2,3;MLLD=16.4875,68.2756,24;QD=5.21424;RBI=0.0162766,0.0631306,0.0546315;REFB=-0.0440903,-0.00891409,-0.0369185;REVB=-0.000386086,-0.0235603,0.0258129;RO=29;SAF=8,2,4;SAR=2,0,0;SRF=17;SRR=12;SSEN=0.345756,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.298088,0.42696,0.5792;STB=0.859035,0.5,0.5;STBP=0.005,1,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.126307,0.0704999,0;OID=.,.,.;OPOS=116165366,116165369,116165364;OREF=C,CT,AGC;OALT=-,TC,GAG;OMAPALT=AGCCCT,AGCCCTC,GAGCCCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:46:46:29:31:10,2,4:15,0,0:0.326087,0,0:2,0,0:8,2,4:17:12:1,0,0:14,0,0:18:13 chr7 116165463 . T C 476.95 PASS AF=0.897436;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0263061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8155;QD=48.918;RBI=0.0278671;REFB=0.00345905;REVB=-0.00919572;RO=3;SAF=30;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547307;STB=0.567526;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00171772;OID=.;OPOS=116165463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:39:39:3:4:35:35:0.897436:5:30:2:1:5:30:2:2 chr7 116364823 . CA C 326.72 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00418426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.209;QD=20.4202;RBI=0.0153109;REFB=-0.00811814;REVB=-0.0147281;RO=30;SAF=21;SAR=13;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130314;STB=0.572325;STBP=0.237;TYPE=del;VARB=0.0136031;OID=.;OPOS=116364824;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.53125:34:64:34:64:30:21:13:14:16:99:30:21:13:14:16 chr7 116435768 . C T 539.71 PASS AF=0.439394;AO=58;DP=132;FAO=58;FDP=132;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.00444267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.11;QD=16.3547;RBI=0.0140495;REFB=-0.00747987;REVB=-0.0133286;RO=73;SAF=22;SAR=36;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473926;STB=0.531137;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0131169;OID=.;OPOS=116435768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:74:58:58:0.439394:36:22:31:42:36:22:32:42 chr7 116436022 . G A 486.08 PASS AF=0.477064;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0061853;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.38;QD=17.8379;RBI=0.0394878;REFB=-0.0192304;REVB=0.0390004;RO=58;SAF=23;SAR=29;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875974;STB=0.553141;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0298093;OID=.;OPOS=116436022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:58:57:52:52:0.477064:29:23:31:27:29:23:31:26 chr7 116436092 . G A 795.73 PASS AF=0.488095;AO=82;DP=168;FAO=82;FDP=168;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.0211363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0981;QD=18.946;RBI=0.0235012;REFB=-0.00581231;REVB=-0.0102744;RO=86;SAF=41;SAR=41;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323802;STB=0.517853;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00694267;OID=.;OPOS=116436092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:86:86:82:82:0.488095:41:41:40:46:41:41:40:46 chr7 116436097 . G A 826.51 PASS AF=0.5;AO=84;DP=168;FAO=84;FDP=168;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.00638991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4268;QD=19.6787;RBI=0.0141491;REFB=-0.0103598;REVB=-0.012624;RO=83;SAF=40;SAR=44;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160925;STB=0.511915;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0131017;OID=.;OPOS=116436097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:83:84:84:84:0.5:44:40:41:42:44:40:42:42 chr7 116437606 . G A 642.71 PASS AF=0.455172;AO=66;DP=145;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.00339139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.484;QD=17.7298;RBI=0.00339326;REFB=-0.0100457;REVB=0.00011269;RO=79;SAF=31;SAR=35;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730134;STB=0.540585;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0104557;OID=.;OPOS=116437606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:79:79:66:66:0.455172:35:31:43:36:35:31:43:36 chr7 116528240 . C T 372.98 PASS AF=0.45977;AO=36;DP=83;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.00209466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.883;QD=17.1486;RBI=0.00299089;REFB=-0.00823247;REVB=0.0021349;RO=47;SAF=14;SAR=22;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05198;STB=0.533964;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00759298;OID=.;OPOS=116528240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:87:47:47:36:40:0.45977:22:14:16:31:24:16:16:31 chr7 116546325 . CA C 40.98 PASS AF=0.46875;AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0448394;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.26979;QD=5.12189;RBI=0.11939;REFB=-0.132214;REVB=0.11065;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861396;STB=0.529373;STBP=0.759;TYPE=del;VARB=0.161155;OID=.;OPOS=116546326;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.46875:13:32:15:32:17:8:7:10:7:40:17:8:5:9:8 chr7 116596697 . A G 1570.81 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000373615;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.713;QD=64.1149;RBI=0.00820368;REFB=0;REVB=0.00819517;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3224e-05;OID=.;OPOS=116596697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:53:45:0:0:53:45:0:0 chr7 116598724 . C T 499.31 PASS AF=0.516129;AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=93;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0155375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.479;QD=21.4756;RBI=0.018149;REFB=-0.00198036;REVB=-0.00937938;RO=44;SAF=23;SAR=25;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180658;STB=0.515457;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00200937;OID=.;OPOS=116598724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:44:45:48:48:0.516129:25:23:22:22:25:23:23:22 chr7 116598735 . A G 406.59 PASS AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0142337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1232;QD=20.0783;RBI=0.0176669;REFB=-0.0337966;REVB=0.0104652;RO=40;SAF=21;SAR=20;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114093;STB=0.506326;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0245696;OID=.;OPOS=116598735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:20:21:21:19:20:21:21:19 chr7 120380961 . ATTTG A 49.7 PASS AF=0.194444;AO=12;DP=62;FAO=14;FDP=72;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0439902;FXX=0.0769132;HRUN=3;LEN=4;MLLD=158.885;QD=2.76093;RBI=0.0450191;REFB=-0.0030678;REVB=0.00956994;RO=27;SAF=7;SAR=5;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100375;STB=0.584859;STBP=0.524;TYPE=del;VARB=0.0170553;OID=.;OPOS=120380962;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.194444:12:62:14:72:58:8:6:27:31:49:27:7:5:18:9 chr7 120428799 . C A 1540.59 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.265;QD=59.8286;RBI=0.0183586;REFB=0;REVB=0.0169549;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49237e-05;OID=.;OPOS=120428799;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:53:50:0:0:53:50:0:0 chr7 120704289 . C T 868.19 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.045;QD=57.8792;RBI=0.0194457;REFB=0;REVB=0.0147745;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0112e-05;OID=.;OPOS=120704289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0 chr7 120740103 . G T 2685.31 PASS AF=0.994253;AO=172;DP=175;FAO=173;FDP=174;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0197564;FXX=0.0169482;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.7;QD=61.7312;RBI=0.0199107;REFB=0.0130661;REVB=0.00247423;RO=1;SAF=93;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509076;STB=0.502645;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.000183831;OID=.;OPOS=120740103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:175:174:1:1:172:173:0.994253:79:93:1:0:79:94:1:0 chr7 120764477 . G C 392.96 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2253;QD=56.1372;RBI=0.102126;REFB=0;REVB=0.0302177;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00312188;OID=.;OPOS=120764477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:14:13:0:0:14:14:0:0 chr7 120765954 . T C 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00447783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.226;QD=58.5991;RBI=0.0203509;REFB=0;REVB=0.0198522;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52819e-05;OID=.;OPOS=120765954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0 chr7 120773954 . A G 417.92 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0450115;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=69.5293;QD=53.9248;RBI=0.0455722;REFB=-0.083621;REVB=0.00712625;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519987;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00151677;OID=.;OPOS=120773954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:18:12:0:0:18:12:1:0 chr7 120776097 . C G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.758;QD=59.0187;RBI=0.0171563;REFB=0;REVB=0.00594887;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87621e-05;OID=.;OPOS=120776097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr7 120901695 . G A 468.55 PASS AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.00647296;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.567;QD=18.0212;RBI=0.012234;REFB=-0.00249741;REVB=-0.0103813;RO=54;SAF=33;SAR=17;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265051;STB=0.5147;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00233919;OID=.;OPOS=120901695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:0.480769:17:33:37:17:17:33:37:17 chr7 120965464 . G GCACC 161.59 PASS AF=0.5;AO=16;DP=35;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00129574;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=184.03;QD=19.011;RBI=0.015536;REFB=-0.0317723;REVB=-0.0154818;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159503;STB=0.588131;STBP=0.318;TYPE=ins;VARB=0.0469875;OID=.;OPOS=120965465;OREF=-;OALT=CACC;OMAPALT=GCACC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:16:35:17:34:17:7:10:10:7:99:18:7:9:11:7 chr7 121616250 . G A 1249.58 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105167;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.523;QD=61.7077;RBI=0.0106811;REFB=0;REVB=0.00186706;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21389e-05;OID=.;OPOS=121616250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:41:40:0:0:41:40:0:0 chr7 121741411 . T G 364.97 PASS AF=0.697674;AO=30;DP=43;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0174332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0037;QD=33.9504;RBI=0.0292785;REFB=-0.00239568;REVB=0.0235226;RO=13;SAF=15;SAR=15;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639401;STB=0.534861;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00194392;OID=.;OPOS=121741411;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:13:13:30:30:0.697674:15:15:5:8:15:15:5:8 chr7 122078414 . T G 1054.39 PASS AF=0.543478;AO=100;DP=184;FAO=100;FDP=184;FR=.;FRO=84;FSAF=56;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.00584969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.388;QD=22.9214;RBI=0.00889293;REFB=-0.00827615;REVB=0.00669816;RO=84;SAF=56;SAR=44;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505559;STB=0.527602;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00637197;OID=.;OPOS=122078414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:84:84:100:100:0.543478:44:56:42:42:44:56:42:42 chr7 122635024 . C T 217.39 PASS AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0189006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0469;QD=11.5941;RBI=0.0632112;REFB=-0.00884771;REVB=-0.0603194;RO=48;SAF=12;SAR=15;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312853;STB=0.518059;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0100519;OID=.;OPOS=122635024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:48:48:27:27:0.36:15:12:20:28:15:12:20:28 chr7 122809234 . T C 257.96 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0186115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.774;QD=18.4256;RBI=0.0259464;REFB=-0.0108506;REVB=0.0180784;RO=28;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638389;STB=0.535689;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0120379;OID=.;OPOS=122809234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:14:14:12:16:14:14:12:16 chr7 123097468 . T C 1189.76 PASS AF=0.9875;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0331624;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6882;QD=59.488;RBI=0.0361253;REFB=-0.168354;REVB=0.014328;RO=1;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119826;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00202428;OID=.;OPOS=123097468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:78:79:0.9875:39:39:0:1:39:40:0:1 chr7 123119990 . T C 1472.57 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.638;QD=63.3366;RBI=0.0211542;REFB=0;REVB=0.0197334;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40618e-05;OID=.;OPOS=123119990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:46:46:0:0:46:47:0:0 chr7 123152019 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.502;QD=51.1832;RBI=0.0460437;REFB=0;REVB=-0.0373018;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000908337;OID=.;OPOS=123152019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr7 123152035 . T C 471.9 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00919247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.134;QD=55.5182;RBI=0.0214488;REFB=-0.00173696;REVB=0.0193791;RO=1;SAF=16;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283046;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000528599;OID=.;OPOS=123152035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:17:16:1:0:17:16:1:0 chr7 123256427 . C T 837.05 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0914355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6766;QD=55.8034;RBI=0.0943672;REFB=-0.0555991;REVB=-0.0233394;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512191;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00525328;OID=.;OPOS=123256427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:0:1:59:59:0.983333:20:39:0:0:20:39:0:1 chr7 123264804 . C T 456.42 PASS AF=0.396947;AO=52;DP=131;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=0.0229741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6903;QD=13.9366;RBI=0.0268314;REFB=0.00530802;REVB=0.0138605;RO=79;SAF=16;SAR=36;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865468;STB=0.549052;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=-0.00553833;OID=.;OPOS=123264804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:79:79:52:52:0.396947:36:16:30:49:36:16:30:49 chr7 123269118 . G C 1153.45 PASS AF=1;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.904;QD=60.7077;RBI=0.0297663;REFB=0;REVB=0.0166887;RO=2;SAF=27;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033754;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82153e-05;OID=.;OPOS=123269118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:2:0:74:76:1:47:27:2:0:47:29:0:0 chr7 123301940 . A G 379.57 PASS AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0133504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6418;QD=16.6846;RBI=0.0382801;REFB=0.00423401;REVB=0.0358766;RO=51;SAF=22;SAR=18;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986788;STB=0.555406;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=-0.00718981;OID=.;OPOS=123301940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:18:22:23:28:18:22:23:28 chr7 123321978 . C A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.4;QD=59.0187;RBI=0.0303056;REFB=0;REVB=0.0302097;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.28767e-05;OID=.;OPOS=123321978;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0 chr7 123336804 . G A 566.35 PASS AF=0.565217;AO=52;DP=92;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.00577357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.225;QD=24.6239;RBI=0.0148963;REFB=-0.00849512;REVB=-0.0137319;RO=40;SAF=26;SAR=26;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159101;STB=0.586924;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00825264;OID=.;OPOS=123336804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:40:40:52:52:0.565217:26:26:12:28:26:26:12:28 chr7 123388732 . G A 780.93 PASS AF=0.47929;AO=80;DP=167;FAO=81;FDP=169;FR=.;FRO=88;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=32;FWDB=0.00486672;FXX=0.0116952;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.896;QD=18.4836;RBI=0.00488764;REFB=-0.0121644;REVB=-0.000451719;RO=87;SAF=32;SAR=48;SRF=56;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227588;STB=0.624535;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0155407;OID=.;OPOS=123388732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:87:88:80:81:0.47929:48:32:56:31:49:32:56:32 chr7 124387092 . C G 568.82 PASS AF=0.542857;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=105;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0208209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3311;QD=21.6694;RBI=0.0696508;REFB=-0.013319;REVB=0.0664659;RO=48;SAF=20;SAR=37;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147514;STB=0.581123;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0127535;OID=.;OPOS=124387092;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:48:48:57:57:0.542857:37:20:25:23:37:20:25:23 chr7 124387374 . A G 88.19 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0937348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0503;QD=39.1972;RBI=0.0938178;REFB=0;REVB=-0.00394593;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00477433;OID=.;OPOS=124387374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr7 124486980 . T C 807.46 PASS AF=0.567164;AO=59;DP=135;FAO=76;FDP=134;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.00228429;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.263;QD=24.1032;RBI=0.0572423;REFB=-0.0411379;REVB=0.0571967;RO=38;SAF=33;SAR=26;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112253;STB=0.516322;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0412065;OID=.;OPOS=124486980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:38:58:59:76:0.567164:26:33:27:11:30:46:33:25 chr7 124540841 . A C 252.55 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0121682;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.751;QD=17.1221;RBI=0.0330563;REFB=-0.0089135;REVB=-0.0307352;RO=32;SAF=20;SAR=8;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811455;STB=0.562458;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00656027;OID=.;OPOS=124540841;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:32:31:28:28:0.474576:8:20:25:7:8:20:25:6 chr7 124540872 . C T 263.81 PASS AF=0.392405;AO=30;DP=77;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0173083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.669;QD=13.3574;RBI=0.0186804;REFB=-0.0108423;REVB=-0.00702706;RO=47;SAF=20;SAR=10;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00848644;STB=0.521605;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0435467;OID=.;OPOS=124540872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:47:48:30:31:0.392405:10:20:31:16:10:21:31:17 chr7 126542667 . A T 303.07 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0141141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.006;QD=14.6059;RBI=0.0146189;REFB=-0.00290292;REVB=-0.00380831;RO=48;SAF=15;SAR=19;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610871;STB=0.540901;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00380235;OID=.;OPOS=126542667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:48:49:34:34:0.409639:19:15:24:24:19:15:25:24 chr7 127222157 . G A 403.59 PASS AF=0.644068;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00162868;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0484;QD=27.3622;RBI=0.0175853;REFB=-0.0060063;REVB=0.0175097;RO=22;SAF=22;SAR=16;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144476;STB=0.587143;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0034343;OID=.;OPOS=127222157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:22:21:38:38:0.644068:16:22:8:14:16:22:7:14 chr7 127224286 . A G 257.15 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00573845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.796;QD=16.072;RBI=0.0144994;REFB=-0.0187045;REVB=-0.0133155;RO=35;SAF=21;SAR=8;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30213;STB=0.67111;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0165168;OID=.;OPOS=127224286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:8:21:15:20:8:21:15:20 chr7 127250907 . T C 234.61 PASS AF=0.457627;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.00562183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8029;QD=15.9056;RBI=0.054058;REFB=-0.02341;REVB=0.0537649;RO=32;SAF=17;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948309;STB=0.53823;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0275593;OID=.;OPOS=127250907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:32:32:26:27:0.457627:9:17:18:14:10:17:18:14 chr7 127251188 . T G 113.5 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00899811;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.902;QD=8.73068;RBI=0.0328892;REFB=-0.0132138;REVB=-0.0316344;RO=37;SAF=11;SAR=4;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1518;STB=0.592684;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0328579;OID=.;OPOS=127251188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:37:37:15:15:0.288462:4:11:23:14:4:11:23:14 chr7 128038555 . C G 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0401226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.546;QD=21.6129;RBI=0.0463834;REFB=-0.0244371;REVB=0.0232723;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171326;STB=0.595668;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0217751;OID=.;OPOS=128038555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:12:12:16:7:12:12:16:7 chr7 128098071 . G A 383.31 PASS AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00195839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.198;QD=22.884;RBI=0.0279189;REFB=-0.0108523;REVB=0.0278501;RO=29;SAF=21;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108978;STB=0.559968;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0166477;OID=.;OPOS=128098071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:17:21:12:17:17:21:12:17 chr7 128098198 . AT A 359.93 PASS AF=0.552239;AO=35;DP=65;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0539094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.736;QD=21.4883;RBI=0.0540359;REFB=-0.0334843;REVB=0.00369466;RO=30;SAF=26;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11175;STB=0.569645;STBP=0.254;TYPE=del;VARB=0.0236087;OID=.;OPOS=128098199;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.552239:35:65:37:67:30:28:9:19:11:99:30:26:9:19:11 chr7 128098268 . GT G 185.81 PASS AF=0.577778;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0292971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.6653;QD=16.5166;RBI=0.0559025;REFB=0.0221135;REVB=-0.0476106;RO=18;SAF=22;SAR=3;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156354;STB=0.585381;STBP=0.375;TYPE=del;VARB=-0.024507;OID=.;OPOS=128098269;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.577778:25:45:26:45:19:23:3:15:4:99:18:22:3:14:4 chr7 128133984 . G A 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.825;QD=59.8383;RBI=0.0760433;REFB=0;REVB=-0.0365218;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194967;OID=.;OPOS=128133984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:26:10:0:0:26:10:0:0 chr7 128140982 . T C 625.7 PASS AF=0.625;AO=55;DP=88;FAO=55;FDP=88;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00934028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.862;QD=28.4407;RBI=0.00980247;REFB=-0.00866259;REVB=0.00297449;RO=33;SAF=21;SAR=34;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737594;STB=0.540131;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0051174;OID=.;OPOS=128140982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:33:33:55:55:0.625:34:21:16:17:34:21:16:17 chr7 128141865 . T C 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.237;QD=59.3228;RBI=0.0359771;REFB=0;REVB=-0.0224073;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122255;OID=.;OPOS=128141865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0 chr7 128312450 . C T 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0113949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.883;QD=14.1699;RBI=0.0160977;REFB=-0.0079301;REVB=-0.0113706;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00779059;OID=.;OPOS=128312450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:5:5:6:6:5:5:6:6 chr7 128358891 . C A 380.21 PASS AF=0.421569;AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=0.00346749;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.004;QD=14.9101;RBI=0.00439754;REFB=-0.00861272;REVB=0.00270459;RO=59;SAF=17;SAR=26;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300558;STB=0.668365;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0106243;OID=.;OPOS=128358891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:59:59:43:43:0.421569:26:17:41:18:26:17:41:18 chr7 128363287 . G A 436.5 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=-3.68379e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.559;QD=21.2927;RBI=0.00551744;REFB=-0.0226326;REVB=-0.00551732;RO=38;SAF=15;SAR=28;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109015;STB=0.564174;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0172499;OID=.;OPOS=128363287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:39:43:43:0.52439:28:15:9:29:28:15:9:30 chr7 128369989 . G A 443.69 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.0155048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8451;QD=17.2306;RBI=0.0223025;REFB=-0.0234201;REVB=0.0160313;RO=55;SAF=15;SAR=33;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297866;STB=0.666184;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0162667;OID=.;OPOS=128369989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:55:48:48:0.466019:33:15:34:21:33:15:34:21 chr7 128371206 . G A 208.39 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=0.00378252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.603;QD=11.4183;RBI=0.0264726;REFB=-0.0141566;REVB=-0.026201;RO=47;SAF=12;SAR=14;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238435;STB=0.636268;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.029896;OID=.;OPOS=128371206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:14:12:12:35:14:12:12:35 chr7 128394606 . C T 378.89 PASS AF=0.425743;AO=42;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.00880021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5138;QD=15.0054;RBI=0.0724716;REFB=-0.0258983;REVB=-0.0719353;RO=57;SAF=17;SAR=25;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172096;STB=0.50284;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0356067;OID=.;OPOS=128394606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:58:42:43:0.425743:25:17:24:33:25:18:24:34 chr7 128401466 . A G 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0150114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8446;QD=11.9197;RBI=0.040831;REFB=-0.00129521;REVB=-0.0379715;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118071;STB=0.571224;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00038308;OID=.;OPOS=128401466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:4:5:3:4:4:5 chr7 128415195 . T G 619.5 PASS AF=0.576923;AO=60;DP=104;FAO=60;FDP=104;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0158972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.212;QD=23.8268;RBI=0.0325254;REFB=-0.0117278;REVB=-0.0283757;RO=43;SAF=36;SAR=24;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157391;STB=0.590703;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00787764;OID=.;OPOS=128415195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:43:44:60:60:0.576923:24:36:17:26:24:36:17:27 chr7 128451353 . C CAGAGAGCCTGGGA 678.79 PASS AF=1;AO=41;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331971;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=13;MLLD=448.117;QD=63.1432;RBI=0.0379969;REFB=0;REVB=0.0184856;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=5.69925e-05;OID=.;OPOS=128451354;OREF=-;OALT=AGAGAGCCTGGGA;OMAPALT=CAGAGAGCCTGGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:41:44:43:43:0:24:19:0:0:4:0:22:19:0:0 chr7 128455767 . C G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.896;QD=61.3363;RBI=0.0181208;REFB=0;REVB=-0.0128832;RO=0;SAF=5;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77714e-07;OID=.;OPOS=128455767;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:35:5:0:0:35:5:0:0 chr7 128487866 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.6;QD=52.6131;RBI=0.0365453;REFB=0;REVB=0.0013197;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000328984;OID=.;OPOS=128487866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr7 128499079 . G A 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.64;QD=59.0178;RBI=0.0518143;REFB=0;REVB=0.000161839;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174124;OID=.;OPOS=128499079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr7 128544133 . G T 283.58 PASS AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0435445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.099;QD=20.2554;RBI=0.0568521;REFB=-0.00508259;REVB=0.0365519;RO=26;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852822;STB=0.547413;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00652272;OID=.;OPOS=128544133;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:18:12:13:13:18:12:13:13 chr7 128550680 . GC G 214.53 PASS AF=1;AO=19;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.174325;FXX=0.0832986;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.9581;QD=39.0064;RBI=0.174413;REFB=0;REVB=0.00555576;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.323529;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00966934;OID=.;OPOS=128550681;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:23:22:22:0:13:9:0:0:4:0:10:9:0:0 chr7 128607384 . G A 747.01 PASS AF=0.473054;AO=79;DP=167;FAO=79;FDP=167;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=-0.0474753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1477;QD=17.8924;RBI=0.050618;REFB=-0.00187377;REVB=-0.0175577;RO=88;SAF=37;SAR=42;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625935;STB=0.534618;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0021275;OID=.;OPOS=128607384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:88:88:79:79:0.473054:42:37:47:41:42:37:47:41 chr7 128630227 . C T 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.698;QD=59.8558;RBI=0.0205426;REFB=0;REVB=0.0196736;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04538e-05;OID=.;OPOS=128630227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:40:31:0:0:40:31:0:0 chr7 128641226 . G C 170.61 PASS AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.000224987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9241;QD=10.8323;RBI=0.0242639;REFB=-0.0128699;REVB=-0.0242629;RO=41;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136058;STB=0.507929;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0235879;OID=.;OPOS=128641226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:11:11:20:21:11:11:20:21 chr7 128767250 . G A 335.12 PASS AF=0.397849;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0314332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.625;QD=14.4137;RBI=0.0486807;REFB=-0.00921291;REVB=0.0371721;RO=54;SAF=12;SAR=25;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746058;STB=0.545546;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00915089;OID=.;OPOS=128767250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:54:56:37:37:0.397849:25:12:21:33:25:12:22:34 chr7 128767410 . A G 332.69 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0139892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2999;QD=26.6151;RBI=0.0233154;REFB=-0.0274228;REVB=-0.0186524;RO=21;SAF=13;SAR=16;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935448;STB=0.551688;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0224636;OID=.;OPOS=128767410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:16:13:12:9:16:13:12:9 chr7 128767490 . T C 175.99 PASS AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00142328;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1554;QD=19.5548;RBI=0.0626561;REFB=-0.00621688;REVB=-0.0626399;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103383;OID=.;OPOS=128767490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:18:18:18:18:0.5:10:8:8:10:10:8:8:10 chr7 128767506 . T G 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0165611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9343;QD=17.9407;RBI=0.0190265;REFB=0.00267864;REVB=-0.00936689;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418943;STB=0.534847;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=-0.00514889;OID=.;OPOS=128767506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:22:19:19:0.463415:10:9:9:12:10:9:9:13 chr7 128804780 . C G 755.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134711;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.99;QD=57.0137;RBI=0.135603;REFB=0;REVB=0.0155304;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000922849;OID=.;OPOS=128804780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr7 128846328 . G C 1426.87 PASS AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000467291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.082;QD=60.7177;RBI=0.0420703;REFB=-0.165878;REVB=0.0420677;RO=2;SAF=55;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00409819;STB=0.502162;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.000345713;OID=.;OPOS=128846328;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:94:94:2:2:92:92:0.978723:37:55:1:1:37:55:1:1 chr7 129142694 . C G 357.77 PASS AF=0.875;AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0447022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.9015;QD=44.7212;RBI=0.0878248;REFB=-0.170097;REVB=-0.075597;RO=4;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272547;STB=0.514695;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0236567;OID=.;OPOS=129142694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:32:32:4:4:28:28:0.875:18:10:1:3:18:10:1:3 chr7 129396174 . C G 399.81 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.0087084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.656;QD=15.3775;RBI=0.043075;REFB=-0.0057235;REVB=-0.0421856;RO=57;SAF=22;SAR=23;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120796;STB=0.556341;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00794395;OID=.;OPOS=129396174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:59:45:45:0.432692:23:22:21:36:23:22:23:36 chr7 129474470 . G A 2082.59 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.004;QD=62.6342;RBI=0.0306435;REFB=0;REVB=0.004445;RO=0;SAF=65;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.76136e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53982e-05;OID=.;OPOS=129474470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:68:65:0:0:68:65:0:0 chr7 129504866 . C G 786.98 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0245927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1627;QD=55.2267;RBI=0.0283914;REFB=-0.100189;REVB=-0.014187;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00145015;OID=.;OPOS=129504866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:31:25:0:0:31:25:1:0 chr7 129813738 . T C 372.81 PASS AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0300545;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0485;QD=20.1517;RBI=0.0758435;REFB=-0.0610187;REVB=0.0696345;RO=36;SAF=14;SAR=24;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00690115;STB=0.503826;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.037919;OID=.;OPOS=129813738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:24:14:13:23:24:14:13:23 chr7 129913534 . TG GT,TT 62.41 PASS AF=0.2,0.0444444;AO=6,2;DP=45;FAO=9,2;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=4,1;FSAR=5,1;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=-0.010402,0.00754247;FXX=0;HRUN=18,1;LEN=2,1;MLLD=34.8702,187.39;QD=5.54763;RBI=0.05053,0.0175049;REFB=-0.036166,-0.00142247;REVB=0.0494477,0.0157966;RO=34;SAF=4,1;SAR=2,1;SRF=27;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.193464,-0.302322;STB=0.763097,0.775865;STBP=0.119,0.695;TYPE=mnp,snp;VARB=0.010535,0.0213576;OID=.,.;OPOS=129913534,129913535;OREF=TG,G;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:45:45:34:34:6,2:9,2:0.2,0.0444444:2,1:4,1:27:7:5,1:4,1:27:7 chr7 129916515 . T C 1308.95 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.731;QD=61.5974;RBI=0.058349;REFB=0;REVB=0.0578587;RO=0;SAF=27;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133436;OID=.;OPOS=129916515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:57:27:0:0:57:28:0:0 chr7 129962360 . A G 753.51 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0429852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.083;QD=61.5108;RBI=0.0440912;REFB=-0.0522099;REVB=0.00981366;RO=1;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159482;STB=0.508471;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000710714;OID=.;OPOS=129962360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:29:19:0:1:29:19:0:1 chr7 129962682 . A G 955.18 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.627;QD=58.7805;RBI=0.0448607;REFB=0;REVB=0.0444614;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.83109e-05;OID=.;OPOS=129962682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0 chr7 129984274 . A G 727.4 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4462;QD=63.2521;RBI=0.0812489;REFB=0;REVB=-0.028474;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000642057;OID=.;OPOS=129984274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr7 129986338 . C T 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00801392;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.484;QD=54.7462;RBI=0.0498393;REFB=0.0246882;REVB=0.0491908;RO=1;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154473;STB=0.508194;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-1.22705e-06;OID=.;OPOS=129986338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:23:30:1:0:23:30:1:0 chr7 129989878 . T C 1116.96 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.377;QD=60.3762;RBI=0.0311697;REFB=0;REVB=0.00940885;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100126;OID=.;OPOS=129989878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:35:38:0:0:36:38:0:0 chr7 130002317 . T C 296.37 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0674325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.073;QD=49.3956;RBI=0.0783515;REFB=-0.0298459;REVB=0.0398976;RO=1;SAF=17;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264628;STB=0.514273;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00540007;OID=.;OPOS=130002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:6:17:1:0:6:17:1:0 chr7 130021488 . G C 2023.03 PASS AF=0.958042;AO=137;DP=143;FAO=137;FDP=143;FR=.;FRO=6;FSAF=52;FSAR=85;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00720008;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.9017;QD=56.5882;RBI=0.0208857;REFB=-0.0757642;REVB=-0.0196054;RO=6;SAF=53;SAR=84;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023356;STB=0.520014;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00304234;OID=.;OPOS=130021488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:143:143:6:6:137:137:0.958042:84:53:4:2:85:52:5:1 chr7 130023657 . TG T 224.69 PASS AF=0.569444;AO=36;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.039965;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.1715;QD=12.4828;RBI=0.214938;REFB=-0.00852129;REVB=0.21119;RO=31;SAF=18;SAR=18;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674531;STB=0.543457;STBP=0.421;TYPE=del;VARB=0.027327;OID=.;OPOS=130023658;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.569444:36:72:41:72:31:20:21:12:19:99:31:18:18:13:18 chr7 130297115 . T C 312.09 PASS AF=0.642857;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0281009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.506;QD=29.7233;RBI=0.028574;REFB=-0.0320157;REVB=-0.00517776;RO=15;SAF=10;SAR=17;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259922;STB=0.514275;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0123861;OID=.;OPOS=130297115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:15:15:27:27:0.642857:17:10:5:10:17:10:5:10 chr7 131185995 . C A 278.87 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0130832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.981;QD=21.8719;RBI=0.0405424;REFB=-0.015047;REVB=-0.0383734;RO=23;SAF=18;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207376;STB=0.615301;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0140096;OID=.;OPOS=131185995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:10:18:9:14:10:18:9:14 chr7 131195712 . G A 1470.92 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00815132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.429;QD=63.2652;RBI=0.0976664;REFB=0;REVB=0.0973256;RO=0;SAF=61;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208909;OID=.;OPOS=131195712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:93:0:0:89:93:1:28:61:0:0:32:61:0:0 chr7 131195959 . C T 824.65 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.015393;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7028;QD=55.9085;RBI=0.038806;REFB=-0.0900377;REVB=-0.0356224;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00237088;OID=.;OPOS=131195959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:59:0:1:58:58:0.983051:36:22:0:0:36:22:1:0 chr7 131812922 . T C 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0972;QD=63.8711;RBI=0.0234795;REFB=0;REVB=-0.015234;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000308246;OID=.;OPOS=131812922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chr7 131814185 . A G 1531.59 PASS AF=1;AO=101;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.23;QD=58.9072;RBI=0.0859352;REFB=0;REVB=0.084786;RO=0;SAF=54;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161015;OID=.;OPOS=131814185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:101:104:1:47:54:0:0:48:56:0:0 chr7 131814529 . G A 647.35 PASS AF=0.955556;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00769545;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=210.233;QD=57.5425;RBI=0.0255908;REFB=0.158139;REVB=0.0244064;RO=2;SAF=22;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407766;STB=0.521729;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.000775622;OID=.;OPOS=131814529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:44:45:2:2:42:43:0.955556:20:22:2:0:21:22:2:0 chr7 131815310 . A G 1251.44 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194356;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1683;QD=61.7995;RBI=0.0213983;REFB=0;REVB=0.00895235;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202646;OID=.;OPOS=131815310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:44:37:0:0:44:37:0:0 chr7 131859678 . G T 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0159497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0004;QD=16.728;RBI=0.0360421;REFB=0.00354169;REVB=-0.0323209;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024879;STB=0.514268;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00864161;OID=.;OPOS=131859678;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:8:8:10:9:8:8:10:9 chr7 131864591 . T C 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.984;QD=61.0491;RBI=0.0193996;REFB=0;REVB=0.0183098;RO=0;SAF=26;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83324e-05;OID=.;OPOS=131864591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:52:26:0:0:52:26:0:0 chr7 131912276 . C T 461.39 PASS AF=0.412698;AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=126;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.0279553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.246;QD=14.6472;RBI=0.0402385;REFB=-0.0209902;REVB=-0.028942;RO=71;SAF=23;SAR=29;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13837;STB=0.588754;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0265681;OID=.;OPOS=131912276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:71:74:52:52:0.412698:29:23:41:30:29:23:44:30 chr7 132192295 . G A 190.87 PASS AF=0.4;AO=19;DP=49;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0196481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.646;QD=15.2699;RBI=0.0207642;REFB=-0.0142743;REVB=0.00671592;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428847;STB=0.510111;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0148685;OID=.;OPOS=132192295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:30:30:19:20:0.4:9:10:17:13:9:11:17:13 chr7 132192949 . T C 538.86 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0169131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.172;QD=21.772;RBI=0.0189817;REFB=-0.00754106;REVB=-0.00861712;RO=48;SAF=28;SAR=23;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615179;STB=0.533956;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00792719;OID=.;OPOS=132192949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:23:28:23:25:23:28:23:25 chr7 132767617 . C A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0982;QD=52.6131;RBI=0.0950317;REFB=0;REVB=-0.0914162;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00179778;OID=.;OPOS=132767617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr7 133749164 . G A 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.326;QD=57.0008;RBI=0.0315689;REFB=0;REVB=0.0293661;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96003e-05;OID=.;OPOS=133749164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:21:33:0:0:21:33:0:0 chr7 133749275 . C T 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0307813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6471;QD=13.2126;RBI=0.0308766;REFB=0.01787;REVB=0.00242461;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324718;STB=0.690778;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0642297;OID=.;OPOS=133749275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:10:4:13:9:10:4:13:9 chr7 133848257 . G T 871.8 PASS AF=0.468421;AO=89;DP=189;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.00562557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6262;QD=18.3537;RBI=0.0109819;REFB=0.0094826;REVB=0.00943165;RO=100;SAF=38;SAR=51;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166404;STB=0.506052;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00911321;OID=.;OPOS=133848257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:100:101:89:89:0.468421:51:38:41:59:51:38:42:59 chr7 133868507 . C T 2668.78 PASS AF=0.983051;AO=174;DP=177;FAO=174;FDP=177;FR=.;FRO=3;FSAF=92;FSAR=82;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00497431;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=322.42;QD=60.3114;RBI=0.0152537;REFB=0.0170135;REVB=0.0144199;RO=3;SAF=92;SAR=82;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00446501;STB=0.502346;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-6.55487e-05;OID=.;OPOS=133868507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:177:177:3:3:174:174:0.983051:82:92:2:1:82:92:2:1 chr7 133906669 . C T 133.45 PASS AF=0.441176;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0223527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.878;QD=15.7004;RBI=0.0223824;REFB=-0.0105907;REVB=-0.00115188;RO=19;SAF=2;SAR=12;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42007;STB=0.756209;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00401911;OID=.;OPOS=133906669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:14:15:0.441176:12:2:9:10:13:2:9:10 chr7 133979368 . C T 285.25 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0090346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.486;QD=15.419;RBI=0.0527265;REFB=-0.0172397;REVB=-0.0519467;RO=42;SAF=17;SAR=15;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138394;STB=0.577864;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0206984;OID=.;OPOS=133979368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:15:17:28:14:15:17:28:14 chr7 133979795 . T C 142.75 PASS AF=0.410256;AO=15;DP=38;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0552941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.719;QD=14.6408;RBI=0.0619594;REFB=-0.0286897;REVB=0.0279558;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157922;STB=0.604675;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0413232;OID=.;OPOS=133979795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:23:23:15:16:0.410256:10:5:11:12:11:5:11:12 chr7 133981227 . G A 330.43 PASS AF=0.377551;AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.0166313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.202;QD=13.4868;RBI=0.0168203;REFB=-0.0028324;REVB=-0.0025145;RO=61;SAF=19;SAR=18;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950171;STB=0.554181;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00398855;OID=.;OPOS=133981227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:61:61:37:37:0.377551:18:19:26:35:18:19:26:35 chr7 133989543 . A G 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0443008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0248;QD=12.9743;RBI=0.0479069;REFB=0.00339523;REVB=0.0182348;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566036;STB=0.533278;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.00192687;OID=.;OPOS=133989543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:8:10:6:6:8:10 chr7 134212741 . A G 299.19 PASS AF=0.445946;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.128506;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.971;QD=16.1723;RBI=0.128515;REFB=-0.0190261;REVB=0.00148072;RO=26;SAF=13;SAR=20;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556422;STB=0.605996;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0188779;OID=.;OPOS=134212741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:74:26:41:33:33:0.445946:20:13:12:14:20:13:24:17 chr7 134215403 . T C 291.6 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0115938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.961;QD=19.4397;RBI=0.0206976;REFB=-0.0157022;REVB=-0.0171457;RO=29;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610569;STB=0.533959;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0110445;OID=.;OPOS=134215403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:15:16:17:12:15:16:17:12 chr7 134221826 . A G 137.25 PASS AF=0.301587;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00426617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.892;QD=8.71397;RBI=0.0292042;REFB=-0.00937172;REVB=-0.0288909;RO=43;SAF=4;SAR=15;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359718;STB=0.711333;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0386719;OID=.;OPOS=134221826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:44:19:19:0.301587:15:4:21:22:15:4:21:23 chr7 134225788 . C T 289.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.508;QD=52.6456;RBI=0.0387114;REFB=0;REVB=0.0298417;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93334e-05;OID=.;OPOS=134225788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:6:15:0:0:7:15:0:0 chr7 134225827 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.328;QD=59.0181;RBI=0.0544082;REFB=0;REVB=-0.0449429;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157695;OID=.;OPOS=134225827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0 chr7 134261097 . C G 326.79 PASS AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0139371;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.028;QD=15.0246;RBI=0.0148508;REFB=-0.0184927;REVB=-0.00512873;RO=50;SAF=14;SAR=22;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2355;STB=0.638008;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0335857;OID=.;OPOS=134261097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:51:36:36:0.413793:22:14:31:19:22:14:32:19 chr7 134264286 . C T 129.76 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0124943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0183;QD=13.3086;RBI=0.102655;REFB=-0.0144351;REVB=-0.101892;RO=24;SAF=13;SAR=2;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318432;STB=0.691186;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0155071;OID=.;OPOS=134264286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:2:13:16:8:2:13:16:8 chr7 134576441 . T C 1120.32 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0193626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5707;QD=58.9644;RBI=0.0240657;REFB=-0.0908881;REVB=0.0142915;RO=1;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160347;STB=0.508472;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000411596;OID=.;OPOS=134576441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:29:46:0:1:29:46:0:1 chr7 134618710 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.8;QD=43.4862;RBI=0.0516615;REFB=0;REVB=0.00492026;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224348;OID=.;OPOS=134618710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr7 134653930 . T C 87.11 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.00335094;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.254;QD=12.9054;RBI=0.0276131;REFB=-0.0295934;REVB=0.027409;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146881;STB=0.586057;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0113343;OID=.;OPOS=134653930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:27:27:16:16:11:11:0.407407:6:5:5:11:6:5:5:11 chr7 134701856 . G C 2319.51 PASS AF=1;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-2.84594e-06;FXX=0.0136045;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.125;QD=63.9865;RBI=0.01567;REFB=0;REVB=-0.01567;RO=0;SAF=80;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.54995e-05;OID=.;OPOS=134701856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:146:145:0:0:145:145:1:65:80:0:0:65:80:0:0 chr7 134719551 . C G 2667.5 PASS AF=1;AO=170;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00309733;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8114;QD=62.0348;RBI=0.025571;REFB=0;REVB=0.0253827;RO=0;SAF=92;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211055;OID=.;OPOS=134719551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:171:172:0:0:170:172:1:78:92:0:0:80:92:0:0 chr7 134849280 . T A 1264.75 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00556317;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.951;QD=61.6953;RBI=0.0387553;REFB=0;REVB=0.0383539;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39662e-05;OID=.;OPOS=134849280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:43:38:0:0:44:38:0:0 chr7 134850465 . C T 1025.6 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00110679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.948;QD=59.4551;RBI=0.0344226;REFB=0;REVB=0.0344048;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104036;OID=.;OPOS=134850465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:28:41:0:0:28:41:0:0 chr7 134850469 . A G 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00765634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.283;QD=59.6777;RBI=0.0114034;REFB=0;REVB=0.00845089;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62421e-05;OID=.;OPOS=134850469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0 chr7 134871775 . C T 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.612;QD=59.8559;RBI=0.0309885;REFB=0;REVB=0.0266712;RO=0;SAF=22;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6904e-05;OID=.;OPOS=134871775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:49:22:0:0:49:22:0:0 chr7 134879830 . G A 1529.66 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00304079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0059;QD=63.7357;RBI=0.0202028;REFB=0;REVB=0.0199726;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010437;OID=.;OPOS=134879830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:94:96:1:52:42:0:0:53:43:0:0 chr7 134889141 . G A 902.65 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1698;QD=58.2353;RBI=0.018204;REFB=0;REVB=0.00952363;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209333;OID=.;OPOS=134889141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0 chr7 134925411 . G A 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0442003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3778;QD=12.4824;RBI=0.0461008;REFB=0.0139425;REVB=-0.0131001;RO=19;SAF=2;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386567;STB=0.732892;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.0308687;OID=.;OPOS=134925411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:10:2:9:10:10:2:9:10 chr7 134943159 . G A 249.51 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0243501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9407;QD=14.2579;RBI=0.036194;REFB=-0.0190605;REVB=0.0267783;RO=39;SAF=10;SAR=19;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249697;STB=0.642048;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.022168;OID=.;OPOS=134943159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:41:29:29:0.414286:19:10:23:16:19:10:24:17 chr7 135047703 . T C 175.94 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.807;QD=46.9175;RBI=0.0771976;REFB=0;REVB=0.0251309;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174775;OID=.;OPOS=135047703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:7:7:0:0:8:7:0:0 chr7 135095270 . A G 1933.91 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.745;QD=61.8853;RBI=0.055071;REFB=0;REVB=0.0231364;RO=0;SAF=54;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128068;OID=.;OPOS=135095270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:70:54:0:0:71:54:0:0 chr7 135279315 . A C 850.16 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.124;QD=56.6771;RBI=0.0375651;REFB=0;REVB=0.0193082;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520427;OID=.;OPOS=135279315;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:60:0:0:54:60:1:28:26:0:0:32:28:0:0 chr7 135304273 . G C 1383.76 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.515;QD=62.1916;RBI=0.0236067;REFB=0;REVB=-0.00165848;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99718e-05;OID=.;OPOS=135304273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:87:89:1:50:37:0:0:51:38:0:0 chr7 135387656 . G A 651.2 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9038;QD=62.0194;RBI=0.0689651;REFB=0;REVB=-0.0647239;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00163471;OID=.;OPOS=135387656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:13:29:0:0:13:29:0:0 chr7 135392876 . T C 2328.91 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.046;QD=60.8866;RBI=0.0267029;REFB=0;REVB=0.0224511;RO=0;SAF=64;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79921e-05;OID=.;OPOS=135392876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:153:0:0:150:153:1:86:64:0:0:88:65:0:0 chr7 135406176 . A G 994.21 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00919872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.826;QD=57.6354;RBI=0.0094225;REFB=-0.0495734;REVB=0.00204136;RO=0;SAF=44;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510201;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=1.20676e-05;OID=.;OPOS=135406176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:0:1:68:68:0.985507:24:44:0:0:24:44:0:1 chr7 135413626 . C T 570.47 PASS AF=0.554455;AO=55;DP=101;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=47;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00136775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.596;QD=22.5929;RBI=0.0140889;REFB=-0.014908;REVB=-0.0140224;RO=45;SAF=47;SAR=8;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311859;STB=0.65575;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00966126;OID=.;OPOS=135413626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:45:45:55:56:0.554455:8:47:27:18:9:47:27:18 chr7 135613262 . G A 417.98 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0726359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.333;QD=53.9331;RBI=0.0734276;REFB=-0.0656498;REVB=0.0107535;RO=1;SAF=1;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015813;STB=0.508469;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.000193269;OID=.;OPOS=135613262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:29:1:0:1:29:1:0:1 chr7 136701563 . G C 232.25 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00778286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.615;QD=23.8208;RBI=0.00865542;REFB=-0.00890361;REVB=-0.00378726;RO=17;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952036;STB=0.553143;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00806639;OID=.;OPOS=136701563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:9:13:8:9:9:13:8:9 chr7 136703707 . C T 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.72;QD=61.0489;RBI=0.0175535;REFB=0;REVB=-0.00945169;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71801e-05;OID=.;OPOS=136703707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0 chr7 137074760 . AT GC 1378.2 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149193;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=311.187;QD=62.6456;RBI=0.0339248;REFB=0;REVB=0.0304681;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.58182e-05;OID=.;OPOS=137074760;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:39:48:0:0:39:49:0:0 chr7 137128830 . T C 1177.2 PASS AF=0.545;AO=109;DP=200;FAO=109;FDP=200;FR=.;FRO=91;FSAF=40;FSAR=69;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=0.0156453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5816;QD=23.5439;RBI=0.0442663;REFB=-0.0222586;REVB=0.0414093;RO=91;SAF=40;SAR=69;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351786;STB=0.519199;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0195612;OID=.;OPOS=137128830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:91:91:109:109:0.545:69:40:37:54:69:40:37:54 chr7 137561008 . TCA T,TGT 507.39 PASS AF=0.944444,0.0555556;AO=31,2;DP=35;FAO=34,2;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16,2;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354409,0.0453475;FXX=0.0270197;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=213.923,60.3178;QD=56.3763;RBI=0.0405811,0.0703353;REFB=0,0;REVB=0.0197678,0.0537649;RO=0;SAF=16,2;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-7.20858e-05,0.0885081;OID=.,.;OPOS=137561009,137561009;OREF=CA,CA;OALT=-,GT;OMAPALT=T,TGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.944444,0.0555556:31,2:35:34,2:36:0:16,2:18,0:0:0:9:0:16,2:15,0:0:0 chr7 137563924 . AC AA,ACA,CA 344.28 PASS AF=0.0444444,0.888889,0.0444444;AO=6,35,11;DP=94;FAO=4,80,4;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=4,16,1;FSAR=0,64,3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0126887,0.300209,-0.0048518;FXX=0.052626;HRUN=1,7,10;LEN=1,1,2;MLLD=211.896,5.67909,21.8813;QD=15.3012;RBI=0.014824,0.359739,0.0328116;REFB=-0.0141631,-0.153152,-0.0855479;REVB=0.00766475,0.198209,0.0324509;RO=21;SAF=4,4,0;SAR=2,31,11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.22433,-0.395677,-0.781508;STB=0.995773,0.511275,0.599463;STBP=0.168,0.35,0.614;TYPE=snp,ins,mnp;VARB=0.0321524,0.128968,-0.0148637;OID=.,.,.;OPOS=137563925,137563926,137563924;OREF=C,-,AC;OALT=A,A,CA;OMAPALT=AA,ACA,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:26:94:90:21:2:6,35,11:4,80,4:0.0444444,0.888889,0.0444444:2,31,11:4,4,0:10:11:0,64,3:4,16,1:1:1 chr7 137564501 . C G 1008.44 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00668758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4921;QD=59.3201;RBI=0.0112502;REFB=0;REVB=0.00904668;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30014e-05;OID=.;OPOS=137564501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0 chr7 137600690 . C T 2794.09 PASS AF=0.994444;AO=178;DP=179;FAO=179;FDP=180;FR=.;FRO=1;FSAF=88;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0135065;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5867;QD=62.0908;RBI=0.022162;REFB=-0.0663695;REVB=0.0175707;RO=0;SAF=88;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502732;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000273037;OID=.;OPOS=137600690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:179:180:0:1:178:179:0.994444:90:88:0:0:91:88:0:1 chr7 137612913 . CTGG C 1064.02 PASS AF=0.948718;AO=73;DP=76;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0120822;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=3;MLLD=278.245;QD=54.5652;RBI=0.0164749;REFB=-0.00721057;REVB=0.0112001;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.530295;STBP=0.028;TYPE=del;VARB=-2.89041e-05;OID=.;OPOS=137612914;OREF=TGG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.948718:73:76:74:78:4:31:43:4:0:12:0:30:43:0:0 chr7 137801413 . A C 315.5 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=83;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0163184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.824;QD=15.0238;RBI=0.02313;REFB=-0.0197333;REVB=0.0163924;RO=47;SAF=22;SAR=11;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212121;STB=0.588186;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0513253;OID=.;OPOS=137801413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:47:48:33:36:0.428571:11:22:22:25:14:22:22:26 chr7 138305806 . T C 411.08 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0602057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.798;QD=56.7012;RBI=0.0622311;REFB=0;REVB=0.0157478;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00014333;OID=.;OPOS=138305806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr7 138312122 . A C 389.09 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0132888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.221;QD=18.7513;RBI=0.0152477;REFB=-0.0176172;REVB=0.00747658;RO=42;SAF=16;SAR=24;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115493;STB=0.558794;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0161783;OID=.;OPOS=138312122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:43:40:40:0.481928:24:16:22:20:24:16:22:21 chr7 138347869 . C T 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.372;QD=15.1604;RBI=0.0267447;REFB=-0.00980765;REVB=-0.0169349;RO=22;SAF=3;SAR=13;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283311;STB=0.666433;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0108404;OID=.;OPOS=138347869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:13:3:9:13:13:3:9:13 chr7 138363767 . A G 909.83 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00795276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.147;QD=57.767;RBI=0.05019;REFB=0;REVB=0.0495559;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105779;OID=.;OPOS=138363767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:63:0:0:58:63:1:37:21:0:0:41:22:0:0 chr7 138417718 . A G 230.59 PASS AF=0.315217;AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0326418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.98;QD=10.0254;RBI=0.0351399;REFB=-0.00500542;REVB=-0.0130125;RO=63;SAF=9;SAR=20;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168286;STB=0.599119;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0112736;OID=.;OPOS=138417718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:63:63:29:29:0.315217:20:9:28:35:20:9:28:35 chr7 138418910 . G A 176.13 PASS AF=0.529412;AO=17;DP=33;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0143935;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.151;QD=20.7207;RBI=0.0626719;REFB=-0.0335654;REVB=0.0609967;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235764;STB=0.526286;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0229729;OID=.;OPOS=138418910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:14:16:17:18:0.529412:9:8:7:7:8:10:8:8 chr7 138433937 . G A 508.12 PASS AF=0.594937;AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0175618;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.109;QD=25.7276;RBI=0.0197557;REFB=-0.0204295;REVB=-0.00904832;RO=33;SAF=25;SAR=22;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103716;STB=0.550758;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0135129;OID=.;OPOS=138433937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:33:32:47:47:0.594937:22:25:13:20:22:25:13:19 chr7 138486096 . G C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.651;QD=58.5877;RBI=0.0314753;REFB=0;REVB=0.0236947;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154385;OID=.;OPOS=138486096;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr7 138561175 . C G 675.72 PASS AF=0.854839;AO=53;DP=63;FAO=53;FDP=62;FR=.;FRO=9;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.00385544;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3125;QD=43.5948;RBI=0.00530957;REFB=-0.000665082;REVB=0.00365064;RO=9;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138274;STB=0.573743;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=1.19329e-05;OID=.;OPOS=138561175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:63:62:9:9:53:53:0.854839:26:27:0:9:26:27:0:9 chr7 138583840 . C A 448.48 PASS AF=0.46875;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00375066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.269;QD=18.6867;RBI=0.0040096;REFB=-0.00405685;REVB=0.00141754;RO=51;SAF=16;SAR=29;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170462;STB=0.595184;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0050841;OID=.;OPOS=138583840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:51:51:45:45:0.46875:29:16:27:24:29:16:27:24 chr7 138596064 . G A 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00946755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.216;QD=13.0148;RBI=0.0164251;REFB=-0.0121235;REVB=-0.013422;RO=31;SAF=10;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169655;STB=0.519212;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0237677;OID=.;OPOS=138596064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:10:10:16:15:10:10:17:15 chr7 138601826 . G A 414.84 PASS AF=0.4;AO=48;DP=121;FAO=48;FDP=120;FR=.;FRO=72;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=-0.00319823;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.168;QD=13.828;RBI=0.00906021;REFB=-0.00230022;REVB=0.00847695;RO=73;SAF=16;SAR=32;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221165;STB=0.50943;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0029042;OID=.;OPOS=138601826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:73:72:48:48:0.4:32:16:23:50:32:16:23:49 chr7 138602417 . G A 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0101568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.417;QD=8.81109;RBI=0.0419929;REFB=-0.00482119;REVB=0.0407461;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238861;STB=0.646611;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00966787;OID=.;OPOS=138602417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:3:3:8:3:3:3:8:3 chr7 138602523 . T C 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0066088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.936;QD=13.62;RBI=0.00912337;REFB=-0.00421681;REVB=-0.00628965;RO=33;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448534;STB=0.515613;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00592981;OID=.;OPOS=138602523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:38:26:26:0.40625:13:13:18:15:13:13:18:20 chr7 138602916 . G C 200.86 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0172464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.236;QD=20.6011;RBI=0.0199163;REFB=-0.0122644;REVB=0.00996092;RO=18;SAF=14;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272324;STB=0.666496;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00916539;OID=.;OPOS=138602916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:19:20:20:0.512821:6:14:7:11:6:14:7:12 chr7 138731687 . A G 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0349493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7357;QD=30.7896;RBI=0.09155;REFB=-0.0895464;REVB=0.0846165;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125393;STB=0.571246;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00783138;OID=.;OPOS=138731687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:5:3:1:0:5:3:1:0 chr7 138732457 . G A 1358.42 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00683277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.643;QD=61.0526;RBI=0.0278519;REFB=0;REVB=0.0270008;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000562248;OID=.;OPOS=138732457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:87:89:1:45:42:0:0:46:43:0:0 chr7 138732497 . G A 1212.17 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190535;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.775;QD=61.3755;RBI=0.0310448;REFB=0;REVB=-0.0245101;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114057;OID=.;OPOS=138732497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:46:33:0:0:46:33:0:0 chr7 138740037 . G C 1008.39 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4472;QD=59.317;RBI=0.0248932;REFB=0;REVB=-0.0129929;RO=0;SAF=23;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43669e-05;OID=.;OPOS=138740037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:45:23:0:0:45:23:0:0 chr7 138761034 . G C 365.29 PASS AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00247028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.596;QD=18.4956;RBI=0.00292185;REFB=-0.000805973;REVB=0.00156041;RO=41;SAF=21;SAR=17;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605334;STB=0.533761;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00116434;OID=.;OPOS=138761034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:41:38:38:0.481013:17:21:20:21:17:21:20:21 chr7 138764060 . G A 463.84 PASS AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0196674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.394;QD=19.3265;RBI=0.0199919;REFB=-0.000128069;REVB=-0.00358792;RO=50;SAF=17;SAR=29;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069241;STB=0.538554;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=8.2183e-05;OID=.;OPOS=138764060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:29:17:22:28:29:17:22:28 chr7 138764145 . T C 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00185903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.217;QD=13.4595;RBI=0.0188421;REFB=0.00208346;REVB=-0.0187502;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187958;STB=0.60857;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00500434;OID=.;OPOS=138764145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:7:19:9:7:7:19 chr7 138764233 . C T 70.12 PASS AF=0.416667;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00455956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.421;QD=11.6873;RBI=0.00746666;REFB=0.00145524;REVB=0.00591281;RO=14;SAF=2;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31575;STB=0.705428;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.00168918;OID=.;OPOS=138764233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:23:24:14:14:9:10:0.416667:7:2:7:7:8:2:7:7 chr7 138874416 . C G 419.29 PASS AF=0.424779;AO=46;DP=115;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=-0.00358342;FXX=0.0258598;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.498;QD=14.8422;RBI=0.0044719;REFB=0.00138758;REVB=-0.00267526;RO=64;SAF=20;SAR=26;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301383;STB=0.522025;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.00182533;OID=.;OPOS=138874416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:113:64:65:46:48:0.424779:26:20:26:38:27:21:26:39 chr7 138916599 . G A 572.61 PASS AF=0.540816;AO=53;DP=98;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.000390374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.808;QD=23.3719;RBI=0.0585402;REFB=-0.0250923;REVB=0.0585389;RO=45;SAF=37;SAR=16;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112994;STB=0.562286;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0192675;OID=.;OPOS=138916599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:45:45:53:53:0.540816:16:37:26:19:16:37:26:19 chr7 139246987 . C T 240.13 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0214519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.933;QD=16.561;RBI=0.0300583;REFB=-0.0324475;REVB=0.0210551;RO=31;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376618;STB=0.52122;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.028403;OID=.;OPOS=139246987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:12:15:16:15:12:15:16:15 chr7 139252780 . T C 177.51 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.0560514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.885;QD=14.4905;RBI=0.0561251;REFB=-0.0221955;REVB=-0.00287507;RO=30;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254811;STB=0.645027;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0309882;OID=.;OPOS=139252780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:11:8:6:24:11:8:6:24 chr7 139415775 . G C 1773.09 PASS AF=0.991525;AO=115;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00161949;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3469;QD=60.1047;RBI=0.0124408;REFB=0.0783278;REVB=0.012335;RO=1;SAF=57;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811748;STB=0.504131;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.000622612;OID=.;OPOS=139415775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:118:1:1:115:117:0.991525:58:57:0:1:60:57:0:1 chr7 139415943 . G A 510.58 PASS AF=0.486486;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.000606181;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.196;QD=18.3994;RBI=0.0102204;REFB=-0.00716117;REVB=-0.0102024;RO=57;SAF=23;SAR=31;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774403;STB=0.542928;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00746951;OID=.;OPOS=139415943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:57:57:54:54:0.486486:31:23:29:28:31:23:29:28 chr7 139653196 . A C 842.29 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0054672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1275;QD=54.3413;RBI=0.00947153;REFB=0.0425278;REVB=-0.00773431;RO=2;SAF=31;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294747;STB=0.51562;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.0017709;OID=.;OPOS=139653196;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:29:31:2:0:29:31:2:0 chr7 139724358 . G A 343.07 PASS AF=0.383838;AO=38;DP=99;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=0.00264922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2504;QD=13.8614;RBI=0.0147233;REFB=-0.0147325;REVB=0.014483;RO=61;SAF=24;SAR=14;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283349;STB=0.516121;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0310141;OID=.;OPOS=139724358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:61:61:38:38:0.383838:14:24:40:21:14:24:40:21 chr7 139724555 . C T 453.19 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0383039;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0654;QD=19.4922;RBI=0.0405289;REFB=-0.00724335;REVB=-0.013244;RO=46;SAF=26;SAR=19;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00858189;STB=0.508057;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00822735;OID=.;OPOS=139724555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:48:45:45:0.483871:19:26:27:19:19:26:27:21 chr7 139727135 . G A 261.21 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00145301;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.54;QD=16.8519;RBI=0.0240593;REFB=-0.00146799;REVB=0.0240154;RO=33;SAF=14;SAR=15;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0019799;STB=0.517229;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.00145929;OID=.;OPOS=139727135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:33:33:29:29:0.467742:15:14:16:17:15:14:17:16 chr7 139784641 . A G 1475.3 PASS AF=0.989474;AO=92;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00148756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.444;QD=62.1177;RBI=0.0133857;REFB=-0.171311;REVB=0.0133028;RO=1;SAF=36;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129856;STB=0.506848;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.000501701;OID=.;OPOS=139784641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:92:94:0.989474:56:36:1:0:58:36:1:0 chr7 139797431 . G T 162.97 PASS AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0109469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.419;QD=13.0374;RBI=0.0114148;REFB=0.00900656;REVB=0.0032345;RO=32;SAF=6;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155754;STB=0.591445;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.0100396;OID=.;OPOS=139797431;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:12:6:15:17:12:6:15:17 chr7 139801777 . T G 437.68 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0260951;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.369;QD=19.0295;RBI=0.0262351;REFB=-0.00138578;REVB=0.0027072;RO=48;SAF=29;SAR=15;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560382;STB=0.531236;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00185829;OID=.;OPOS=139801777;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:48:44:44:0.478261:15:29:29:19:15:29:29:19 chr7 140051091 . G A 753.48 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0104232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3316;QD=61.5086;RBI=0.0144496;REFB=0.0230828;REVB=0.0100074;RO=1;SAF=21;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218744;STB=0.511623;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.000454655;OID=.;OPOS=140051091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:27:21:1:0:27:21:1:0 chr7 140051772 . AGGAAAAAAG ACGAAAAGAA,AGAAAAAG,AGGAAAAAG,GAGGAAAAAG 327.5 PASS AF=0.152174,0,0.847826,0;AO=3,11,8,2;DP=47;FAO=7,0,39,0;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0,7,0;FSAR=0,0,32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513942,0.143335,0.185601,0.0141709;FXX=0.061212;HRUN=2,2,6,1;LEN=9,2,1,4;MLLD=85.9408,14.3764,9.5551,52.5685;QD=28.4783;RBI=0.0531308,0.173149,0.342741,0.0674353;REFB=-0.0737423,-0.11528,-0.15562,-0.04077;REVB=0.0134729,-0.0971376,0.288139,-0.0659295;RO=10;SAF=3,0,2,0;SAR=0,11,6,2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0.340157,0;SSEP=0,0,0.456311,0;SSSB=0.649379,-0.808008,-0.258322,-0.57573;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,del,mnp;VARB=0.0321356,0,0.10972,0;OID=.,.,.,.;OPOS=140051773,140051774,140051775,140051772;OREF=GGAAAAAAG,GA,A,AGGA;OALT=CGAAAAGAA,-,-,GAGG;OMAPALT=ACGAAAAGAA,AGAAAAAG,AGGAAAAAG,GAGGAAAAAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:34:47:46:10:0:3,11,8,2:7,0,39,0:0.152174,0,0.847826,0:0,11,6,2:3,0,2,0:5:5:0,0,32,0:7,0,7,0:0:0 chr7 140080087 . C G 1044.13 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8807;QD=59.6647;RBI=0.0573714;REFB=0;REVB=0.051452;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164351;OID=.;OPOS=140080087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0 chr7 140258000 . T C 775.29 PASS AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.024221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.876;QD=53.4681;RBI=0.0256129;REFB=-0.0471451;REVB=0.00832835;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517235;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.000415287;OID=.;OPOS=140258000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:58:58:0:2:56:56:0.965517:28:28:0:0:28:28:0:2 chr7 140301731 . G T 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00795318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.389;QD=62.9829;RBI=0.0204039;REFB=0;REVB=0.01879;RO=0;SAF=34;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14512e-05;OID=.;OPOS=140301731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:11:34:0:0:11:34:0:0 chr7 140774467 . C G 223.15 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244218;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.2277;QD=49.5896;RBI=0.027869;REFB=0;REVB=0.0134259;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394732;OID=.;OPOS=140774467;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr7 141176928 . G A 428.49 PASS AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=50;FWDB=-0.00998853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.725;QD=14.4029;RBI=0.0162601;REFB=-0.0117627;REVB=0.0128305;RO=70;SAF=23;SAR=26;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196396;STB=0.609867;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0134231;OID=.;OPOS=141176928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:70:70:49:49:0.411765:26:23:20:50:26:23:20:50 chr7 141364712 . G A 382.31 PASS AF=0.368;AO=46;DP=125;FAO=46;FDP=125;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=0.00163634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8261;QD=12.2338;RBI=0.00388231;REFB=-0.0137902;REVB=-0.00352062;RO=77;SAF=26;SAR=20;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364004;STB=0.513393;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0176463;OID=.;OPOS=141364712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:77:79:46:46:0.368:20:26:41:36:20:26:43:36 chr7 141464765 . C T 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.719;QD=60.3767;RBI=0.0222647;REFB=0;REVB=-0.00541797;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.70888e-05;OID=.;OPOS=141464765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0 chr7 141478308 . T C 805.09 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7698;QD=64.4072;RBI=0.0843085;REFB=0;REVB=0.0272249;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135373;OID=.;OPOS=141478308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0 chr7 141478574 . G C 909.91 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0193787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.027;QD=55.1459;RBI=0.0237676;REFB=-0.10812;REVB=0.0137611;RO=2;SAF=28;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325423;STB=0.517236;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0172631;OID=.;OPOS=141478574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:36:28:2:0:36:28:2:0 chr7 141478800 . G A 955.19 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.071;QD=58.7808;RBI=0.049369;REFB=0;REVB=-0.0439561;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.03379e-05;OID=.;OPOS=141478800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0 chr7 141490238 . G T 1139.4 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0121438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.633;QD=59.1897;RBI=0.0802722;REFB=-0.072584;REVB=0.0793483;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000199703;OID=.;OPOS=141490238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:35:41:0:0:35:41:0:1 chr7 141501943 . G C 773.9 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0850247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8118;QD=61.9121;RBI=0.0857071;REFB=0;REVB=0.0107936;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00971906;OID=.;OPOS=141501943;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:18:29:0:0:18:32:0:0 chr7 141504761 . A G 32.82 PASS AF=0.133333;AO=6;DP=45;FAO=6;FDP=45;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0464817;FXX=0;HRUN=17;LEN=1;MLLD=174.372;QD=2.91714;RBI=0.0478542;REFB=0.00326778;REVB=-0.0113786;RO=38;SAF=5;SAR=1;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476349;STB=0.84995;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.0228146;OID=.;OPOS=141504761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:45:45:38:39:6:6:0.133333:1:5:16:22:1:5:16:23 chr7 141537735 . T G 2293.69 PASS AF=1;AO=142;DP=144;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4125;QD=62.4133;RBI=0.0127784;REFB=-0.00854419;REVB=0.0057514;RO=1;SAF=66;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00715026;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134286;OID=.;OPOS=141537735;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:144:147:1:0:142:147:1:76:66:1:0:79:68:0:0 chr7 141537942 . T TCAA 171.56 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=75;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00248226;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=3;MLLD=318.824;QD=12.4772;RBI=0.0162727;REFB=-0.0180837;REVB=0.0160823;RO=53;SAF=5;SAR=16;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326273;STB=0.627967;STBP=0.164;TYPE=ins;VARB=0.0281164;OID=.;OPOS=141537943;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=TCAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.381818:21:75:21:55:34:5:16:14:20:99:53:5:16:26:27 chr7 141537945 . T A 30.92 PASS AF=0.1;AO=7;DP=70;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00936227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.884;QD=1.76686;RBI=0.0281034;REFB=-0.00909413;REVB=-0.0264981;RO=63;SAF=3;SAR=4;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376369;STB=0.529329;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0997362;OID=.;OPOS=141537945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:70:70:63:63:7:7:0.1:4:3:25:38:4:3:25:38 chr7 141538741 . T C 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0220618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.07;QD=14.6983;RBI=0.0354253;REFB=-0.00455364;REVB=0.027717;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200386;STB=0.615248;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00514097;OID=.;OPOS=141538741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:8:8:16:7:8:8:16:7 chr7 141672604 . T C 307.85 PASS AF=0.510638;AO=15;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=12;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.071702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8772;QD=26.2001;RBI=0.0717115;REFB=-0.0877309;REVB=0.00116724;RO=11;SAF=1;SAR=14;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675487;STB=0.618722;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0677519;OID=.;OPOS=141672604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:11:12:15:24:0.510638:14:1:1:10:14:10:1:11 chr7 141672705 . G A 173.09 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00820164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.405;QD=18.7119;RBI=0.00893057;REFB=-0.0322777;REVB=0.00353385;RO=19;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266391;STB=0.515135;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0322587;OID=.;OPOS=141672705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:8:10:10:9:8:10:10:9 chr7 141673345 . C G 177.44 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0226638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3749;QD=21.5084;RBI=0.0480279;REFB=-0.00285237;REVB=0.0423442;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125134;STB=0.570392;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00276823;OID=.;OPOS=141673345;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:10:8:9:6:10:8:9:6 chr7 141747658 . A G 972.6 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2933;QD=58.9453;RBI=0.0280676;REFB=0;REVB=-0.00386054;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194062;OID=.;OPOS=141747658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0 chr7 141755358 . T C 391.8 PASS AF=0.333333;AO=48;DP=144;FAO=48;FDP=144;FR=.;FRO=96;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.0300591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1195;QD=10.8832;RBI=0.0300595;REFB=-0.0115099;REVB=-0.000155285;RO=96;SAF=24;SAR=24;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361344;STB=0.520825;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0256494;OID=.;OPOS=141755358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:96:96:48:48:0.333333:24:24:45:51:24:24:45:51 chr7 141759676 . T C 761.97 PASS AF=0.420513;AO=82;DP=195;FAO=82;FDP=195;FR=.;FRO=113;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=59;FSRR=54;FWDB=0.0360712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.876;QD=15.6302;RBI=0.039777;REFB=-8.02357e-05;REVB=0.0167655;RO=113;SAF=43;SAR=39;SRF=59;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00235452;STB=0.501316;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.000187379;OID=.;OPOS=141759676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:113:113:82:82:0.420513:39:43:59:54:39:43:59:54 chr7 141767153 . C T 363.22 PASS AF=0.475;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00112862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.082;QD=18.1608;RBI=0.0132218;REFB=-0.0140996;REVB=0.0131736;RO=41;SAF=16;SAR=22;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174636;STB=0.59104;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0167293;OID=.;OPOS=141767153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:41:42:38:38:0.475:22:16:25:16:22:16:25:17 chr7 141780686 . C G 252.16 PASS AF=0.319588;AO=31;DP=97;FAO=31;FDP=97;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.00277157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.243;QD=10.3982;RBI=0.00550781;REFB=-0.00690924;REVB=0.00475967;RO=66;SAF=12;SAR=19;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150703;STB=0.588099;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0206065;OID=.;OPOS=141780686;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:66:66:31:31:0.319588:19:12:34:32:19:12:34:32 chr7 141784326 . G C 1220.69 PASS AF=0.465201;AO=127;DP=275;FAO=127;FDP=273;FR=.;FRO=146;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=79;FSRR=67;FWDB=-0.0292779;FXX=0.00727246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2029;QD=17.8855;RBI=0.0800526;REFB=0.0146485;REVB=0.0745065;RO=146;SAF=73;SAR=54;SRF=79;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033203;STB=0.518335;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.0173924;OID=.;OPOS=141784326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:273:146:146:127:127:0.465201:54:73:79:67:54:73:79:67 chr7 141796131 . G A 619.72 PASS AF=0.921569;AO=47;DP=52;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.02164;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.854;QD=48.6057;RBI=0.0216478;REFB=-0.0538841;REVB=0.0005816;RO=4;SAF=20;SAR=27;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484242;STB=0.525815;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00330847;OID=.;OPOS=141796131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:52:51:4:4:47:47:0.921569:27:20:3:1:27:20:3:1 chr7 141838362 . C G 418.47 PASS AF=0.401639;AO=48;DP=122;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.00783612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.111;QD=13.7202;RBI=0.0147333;REFB=-0.0123835;REVB=-0.0124766;RO=73;SAF=22;SAR=26;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00796105;STB=0.502183;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0200396;OID=.;OPOS=141838362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:73:73:48:49:0.401639:26:22:34:39:26:23:34:39 chr7 141857846 . A G 2998.84 PASS AF=1;AO=189;DP=189;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.329;QD=63.4675;RBI=0.0446518;REFB=0;REVB=0.000709932;RO=0;SAF=97;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49973e-05;OID=.;OPOS=141857846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:189:189:0:0:189:189:1:92:97:0:0:92:97:0:0 chr7 141896059 . A G 562.31 PASS AF=0.437956;AO=60;DP=137;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=0.0220298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.508;QD=16.4179;RBI=0.0282001;REFB=-0.00238749;REVB=-0.0176049;RO=77;SAF=35;SAR=25;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091302;STB=0.551028;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00289128;OID=.;OPOS=141896059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:77:77:60:60:0.437956:25:35:38:39:25:35:38:39 chr7 141898522 . T A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00724087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.562;QD=55.0978;RBI=0.0346496;REFB=0;REVB=0.0338846;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187839;OID=.;OPOS=141898522;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr7 141908052 . A ACTACATGCTT 232.09 PASS AF=0.325843;AO=28;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00978524;FXX=0;HRUN=1;LEN=10;MLLD=306.46;QD=10.4308;RBI=0.0177367;REFB=-0.0175726;REVB=-0.0147932;RO=60;SAF=12;SAR=16;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836125;STB=0.558645;STBP=0.457;TYPE=ins;VARB=0.035582;OID=.;OPOS=141908053;OREF=-;OALT=CTACATGCTT;OMAPALT=ACTACATGCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.325843:28:89:29:89:60:12:17:30:30:99:60:12:16:30:30 chr7 141920144 . G C,GC 32.25 PASS AF=0,0.25;AO=3,3;DP=26;FAO=0,7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=0,1;FSAR=0,6;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0933991,-0.00535388;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.048,16.8347;QD=4.60735;RBI=0.102348,0.0202012;REFB=0.00337995,-0.0542682;REVB=-0.0418546,-0.0194789;RO=20;SAF=0,0;SAR=3,3;SRF=6;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.528374,-0.528374;STB=0.5,0.705191;STBP=1,0.337;TYPE=snp,ins;VARB=0.104567,0.0431896;OID=.,.;OPOS=141920144,141920145;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:25:26:28:20:21:3,3:0,7:0,0.25:3,3:0,0:6:14:0,6:0,1:7:14 chr7 141957504 . A G 306.19 PASS AF=0.5;AO=31;DP=67;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00577765;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.838;QD=18.5572;RBI=0.0109185;REFB=-0.0179834;REVB=0.00926458;RO=34;SAF=19;SAR=12;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524063;STB=0.515426;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0187492;OID=.;OPOS=141957504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:34:33:31:33:0.5:12:19:19:15:14:19:18:15 chr7 142001030 . A G 1283.4 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.23;QD=61.8506;RBI=0.0620593;REFB=0;REVB=0.0569115;RO=0;SAF=37;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161728;OID=.;OPOS=142001030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:46:37:0:0:46:37:0:0 chr7 142008403 . C G 44.51 PASS AF=0.096;AO=12;DP=125;FAO=12;FDP=125;FR=.;FRO=113;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=58;FWDB=-0.0355806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9716;QD=1.42438;RBI=0.040251;REFB=0.000639583;REVB=0.0188193;RO=113;SAF=7;SAR=5;SRF=55;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113224;STB=0.587072;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.00415034;OID=.;OPOS=142008403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:125:125:113:113:12:12:0.096:5:7:55:58:5:7:55:58 chr7 142008408 . T G 38.87 PASS AF=0.0887097;AO=11;DP=123;FAO=11;FDP=124;FR=.;FRO=113;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=58;FWDB=-0.0406977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.124;QD=1.25376;RBI=0.0568905;REFB=-0.00115473;REVB=-0.039752;RO=112;SAF=6;SAR=5;SRF=54;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072782;STB=0.553344;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0271298;OID=.;OPOS=142008408;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:123:124:112:113:11:11:0.0887097:5:6:54:58:5:6:55:58 chr7 142008799 . C T 32.38 PASS AF=0.122449;AO=6;DP=49;FAO=6;FDP=49;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0088049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.284;QD=2.64356;RBI=0.009129;REFB=-0.00394592;REVB=0.00241087;RO=43;SAF=5;SAR=1;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238438;STB=0.687357;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0233309;OID=.;OPOS=142008799;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:49:49:43:43:6:6:0.122449:1:5:29:14:1:5:29:14 chr7 142008803 . C T 40.56 PASS AF=0.152174;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.0268871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6136;QD=3.52703;RBI=0.0269378;REFB=-0.0145618;REVB=-0.00165224;RO=39;SAF=6;SAR=1;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241738;STB=0.678646;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.01641;OID=.;OPOS=142008803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:46:46:39:39:7:7:0.152174:1:6:28:11:1:6:28:11 chr7 142013384 . G C 1762.54 PASS AF=0.991525;AO=117;DP=120;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0403208;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.204;QD=59.7472;RBI=0.0471475;REFB=0.000550173;REVB=0.0244362;RO=0;SAF=59;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=7.57131e-05;OID=.;OPOS=142013384;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:118:0:1:117:117:0.991525:58:59:0:0:58:59:1:0 chr7 142045613 . G T 138.86 PASS AF=0.225806;AO=21;DP=93;FAO=21;FDP=93;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0086368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.287;QD=5.97247;RBI=0.0328884;REFB=-0.00902578;REVB=-0.0317341;RO=71;SAF=15;SAR=6;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39045;STB=0.735517;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0188601;OID=.;OPOS=142045613;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:71:72:21:21:0.225806:6:15:28:43:6:15:29:43 chr7 142045678 . ACT GTC 107.02 PASS AF=0.181818;AO=18;DP=100;FAO=18;FDP=99;FR=.;FRO=81;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=-0.00950858;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=3;MLLD=263.612;QD=4.3241;RBI=0.0197193;REFB=-0.00266506;REVB=-0.0172754;RO=81;SAF=13;SAR=5;SRF=29;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439611;STB=0.778896;STBP=0.014;TYPE=mnp;VARB=0.011919;OID=.;OPOS=142045678;OREF=ACT;OALT=GTC;OMAPALT=GTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:81:81:18:18:0.181818:5:13:29:52:5:13:29:52 chr7 142045683 . A G 113.61 PASS AF=0.186275;AO=19;DP=102;FAO=19;FDP=102;FR=.;FRO=83;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=54;FWDB=0.0473467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.305;QD=4.45525;RBI=0.0477185;REFB=0.000736549;REVB=0.00594484;RO=83;SAF=14;SAR=5;SRF=29;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465691;STB=0.793187;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00655667;OID=.;OPOS=142045683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:83:83:19:19:0.186275:5:14:29:54:5:14:29:54 chr7 142045690 . A G 125.63 PASS AF=0.2;AO=20;DP=100;FAO=20;FDP=100;FR=.;FRO=80;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=0.00580671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.236;QD=5.02509;RBI=0.0202768;REFB=0.00377814;REVB=-0.0194276;RO=80;SAF=15;SAR=5;SRF=28;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480261;STB=0.798791;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00797466;OID=.;OPOS=142045690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:80:80:20:20:0.2:5:15:28:52:5:15:28:52 chr7 142045692 . AC GT 126.04 PASS AF=0.20202;AO=20;DP=99;FAO=20;FDP=99;FR=.;FRO=79;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=52;FWDB=0.00823015;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=283.576;QD=5.09231;RBI=0.0177637;REFB=0.000820269;REVB=-0.0157421;RO=78;SAF=15;SAR=5;SRF=27;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483586;STB=0.802542;STBP=0.004;TYPE=mnp;VARB=-0.00192492;OID=.;OPOS=142045692;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:78:79:20:20:0.20202:5:15:27:51:5:15:27:52 chr7 142045802 . T C 183.66 PASS AF=0.274725;AO=25;DP=91;FAO=25;FDP=91;FR=.;FRO=66;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=50;FWDB=-0.0674869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3244;QD=8.07275;RBI=0.0681809;REFB=-0.00572035;REVB=-0.00970294;RO=66;SAF=15;SAR=10;SRF=16;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417784;STB=0.743637;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0135209;OID=.;OPOS=142045802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:66:66:25:25:0.274725:10:15:16:50:10:15:16:50 chr7 142045848 . T C 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.636;QD=62.6135;RBI=0.0200592;REFB=0;REVB=0.0154335;RO=0;SAF=31;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25442e-06;OID=.;OPOS=142045848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:57:31:0:0:57:31:0:0 chr7 142045897 . C T 123.08 PASS AF=0.298246;AO=16;DP=56;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0592276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.25;QD=8.63731;RBI=0.0592449;REFB=0.00119405;REVB=-0.0014327;RO=39;SAF=5;SAR=11;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125339;STB=0.553546;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.00222051;OID=.;OPOS=142045897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:39:40:16:17:0.298246:11:5:16:23:11:6:17:23 chr7 142045899 . A G 87.15 PASS AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0252515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7391;QD=6.2248;RBI=0.0281705;REFB=0.00358127;REVB=0.0124876;RO=43;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427351;STB=0.763129;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.0241257;OID=.;OPOS=142045899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:4:9:14:29:4:9:14:29 chr7 142045912 . A G 95.54 PASS AF=0.25;AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00726707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.356;QD=7.34922;RBI=0.0399067;REFB=-0.00782389;REVB=-0.0392395;RO=39;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389291;STB=0.739029;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0252045;OID=.;OPOS=142045912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:52:52:39:39:13:13:0.25:4:9:14:25:4:9:14:25 chr7 142045924 . A G 437.86 PASS AF=0.755556;AO=34;DP=45;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0435172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6187;QD=38.9204;RBI=0.0449919;REFB=0.0165972;REVB=-0.0114248;RO=11;SAF=9;SAR=25;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274412;STB=0.649257;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00200201;OID=.;OPOS=142045924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:45:45:11:11:34:34:0.755556:25:9:9:2:25:9:9:2 chr7 142099484 . G C 75.64 PASS AF=0.157895;AO=15;DP=95;FAO=15;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=-0.190098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8768;QD=3.18482;RBI=0.194076;REFB=-0.00207922;REVB=0.039092;RO=61;SAF=5;SAR=10;SRF=18;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554051;STB=0.6028;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00391709;OID=.;OPOS=142099484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:95:95:61:80:15:15:0.157895:10:5:18:43:10:5:36:44 chr7 142099512 . T G 66.15 PASS AF=0.130841;AO=14;DP=106;FAO=14;FDP=107;FR=.;FRO=93;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=-0.0185731;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.292;QD=2.47276;RBI=0.0192558;REFB=-0.00673844;REVB=0.00508184;RO=91;SAF=5;SAR=9;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105822;STB=0.575689;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0260325;OID=.;OPOS=142099512;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:106:107:91:93:14:14:0.130841:9:5:40:51:9:5:41:52 chr7 142099533 . T C 62.41 PASS AF=0.145631;AO=15;DP=105;FAO=15;FDP=103;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=-0.0118115;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.062;QD=2.4238;RBI=0.0118431;REFB=-0.00647905;REVB=-0.00086382;RO=88;SAF=7;SAR=8;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133046;STB=0.500649;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0483079;OID=.;OPOS=142099533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:105:103:88:88:15:15:0.145631:8:7:42:46:8:7:41:47 chr7 142099537 . G T 51.95 PASS AF=0.11215;AO=12;DP=105;FAO=12;FDP=107;FR=.;FRO=95;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.0311845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.414;QD=1.94219;RBI=0.0338254;REFB=-0.00227878;REVB=0.013103;RO=92;SAF=4;SAR=8;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191303;STB=0.645324;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0083869;OID=.;OPOS=142099537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:105:107:92:95:12:12:0.11215:8:4:45:47:8:4:47:48 chr7 142099541 . T C 61.47 PASS AF=0.126214;AO=13;DP=103;FAO=13;FDP=103;FR=.;FRO=90;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0217457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.644;QD=2.38726;RBI=0.023233;REFB=-0.00273974;REVB=-0.00817911;RO=90;SAF=5;SAR=8;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11588;STB=0.582573;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0181915;OID=.;OPOS=142099541;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:103:103:90:90:13:13:0.126214:8:5:43:47:8:5:43:47 chr7 142099548 . A G 53.52 PASS AF=0.115385;AO=12;DP=104;FAO=12;FDP=104;FR=.;FRO=92;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=-0.014904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.413;QD=2.05864;RBI=0.017728;REFB=0.00195832;REVB=-0.00959967;RO=92;SAF=5;SAR=7;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114028;STB=0.583195;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.0233047;OID=.;OPOS=142099548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:104:104:92:92:12:12:0.115385:7:5:47:45:7:5:47:45 chr7 142099571 . C T 35.7 PASS AF=0.0947368;AO=9;DP=95;FAO=9;FDP=95;FR=.;FRO=86;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=35;FWDB=-0.0267824;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.885;QD=1.50297;RBI=0.0267829;REFB=-0.00152144;REVB=0.00017768;RO=85;SAF=4;SAR=5;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165756;STB=0.631903;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00797726;OID=.;OPOS=142099571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:95:95:85:86:9:9:0.0947368:5:4:50:35:5:4:51:35 chr7 142119831 . G A 208.38 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00240748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.754;QD=11.4178;RBI=0.0313603;REFB=-0.0161946;REVB=0.0312678;RO=47;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23582;STB=0.635886;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0219693;OID=.;OPOS=142119831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:11:15:17:30:11:15:17:30 chr7 142124170 . C T 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.486;QD=64.0211;RBI=0.0191378;REFB=0;REVB=0.0152629;RO=0;SAF=60;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58789e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57362e-05;OID=.;OPOS=142124170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:38:60:0:0:38:60:0:0 chr7 142124424 . T G 1372.09 PASS AF=0.960396;AO=97;DP=101;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00918792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.646;QD=54.3403;RBI=0.0183894;REFB=-0.0192179;REVB=0.0159296;RO=4;SAF=51;SAR=46;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168849;STB=0.50891;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00149041;OID=.;OPOS=142124424;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:101:101:4:4:97:97:0.960396:46:51:3:1:46:51:3:1 chr7 142124539 . C T 37.0 PASS AF=0.112676;AO=8;DP=72;FAO=8;FDP=71;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.00120371;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.325;QD=2.08471;RBI=0.0156038;REFB=-0.0149418;REVB=-0.0155573;RO=60;SAF=5;SAR=3;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300355;STB=0.730384;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0751876;OID=.;OPOS=142124539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:72:71:60:63:8:8:0.112676:3:5:22:38:3:5:22:41 chr7 142131832 . C T 52.23 PASS AF=0.147059;AO=10;DP=68;FAO=10;FDP=68;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00510443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.392;QD=3.07233;RBI=0.0118878;REFB=-0.00632929;REVB=-0.0107361;RO=58;SAF=1;SAR=9;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587079;STB=0.904382;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0239506;OID=.;OPOS=142131832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:68:68:58:58:10:10:0.147059:9:1:34:24:9:1:34:24 chr7 142131836 . C G 59.74 PASS AF=0.161765;AO=11;DP=68;FAO=11;FDP=68;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0561471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.233;QD=3.51391;RBI=0.0622569;REFB=-0.0238224;REVB=-0.0268965;RO=57;SAF=1;SAR=10;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604195;STB=0.908348;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0363216;OID=.;OPOS=142131836;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:68:68:57:57:11:11:0.161765:10:1:33:24:10:1:33:24 chr7 142131858 . C A 37.92 PASS AF=0.127273;AO=7;DP=55;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00152117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.548;QD=2.75781;RBI=0.0236793;REFB=-0.00201397;REVB=-0.0236304;RO=48;SAF=1;SAR=6;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427575;STB=0.821861;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0150835;OID=.;OPOS=142131858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:55:55:48:48:7:7:0.127273:6:1:23:25:6:1:23:25 chr7 142139348 . C T 1579.39 PASS AF=0.981651;AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00923557;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.376;QD=57.9591;RBI=0.0237034;REFB=-0.094307;REVB=0.0218302;RO=2;SAF=60;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155568;STB=0.508195;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.000927515;OID=.;OPOS=142139348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:110:109:2:2:107:107:0.981651:47:60:2:0:47:60:2:0 chr7 142139773 . C T 462.35 PASS AF=0.632353;AO=43;DP=68;FAO=43;FDP=68;FR=.;FRO=25;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00245708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.63;QD=27.1968;RBI=0.0112745;REFB=-0.0268818;REVB=0.0110035;RO=25;SAF=30;SAR=13;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161254;STB=0.588193;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0213811;OID=.;OPOS=142139773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:25:25:43:43:0.632353:13:30:12:13:13:30:12:13 chr7 142139783 . C A 976.11 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013544;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.467;QD=59.1579;RBI=0.0137082;REFB=0;REVB=0.00211509;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5358e-05;OID=.;OPOS=142139783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:26:40:0:0:26:40:0:0 chr7 142143804 . A C 2290.95 PASS AF=0.980769;AO=152;DP=156;FAO=153;FDP=156;FR=.;FRO=3;FSAF=79;FSAR=74;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0266244;FXX=0.0126574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.637;QD=58.7423;RBI=0.0266718;REFB=0.0116757;REVB=-0.00158895;RO=3;SAF=79;SAR=73;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00541762;STB=0.502894;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.000227493;OID=.;OPOS=142143804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:156:156:3:3:152:153:0.980769:73:79:2:1:74:79:2:1 chr7 142143879 . A T 59.03 PASS AF=0.087156;AO=19;DP=218;FAO=19;FDP=218;FR=.;FRO=199;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=89;FSRR=110;FWDB=-0.0161784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3961;QD=1.08303;RBI=0.0162162;REFB=-0.00506343;REVB=0.00110691;RO=197;SAF=4;SAR=15;SRF=88;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2947;STB=0.735882;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0218992;OID=.;OPOS=142143879;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:218:218:197:199:19:19:0.087156:15:4:88:109:15:4:89:110 chr7 142143906 . GT CC 140.06 PASS AF=0.147959;AO=29;DP=197;FAO=29;FDP=196;FR=.;FRO=167;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=75;FSRR=92;FWDB=0.00620238;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=2;MLLD=302.624;QD=2.85842;RBI=0.0114569;REFB=-0.00433275;REVB=0.00963276;RO=167;SAF=8;SAR=21;SRF=75;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234488;STB=0.658367;STBP=0.076;TYPE=mnp;VARB=0.020369;OID=.;OPOS=142143906;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:167:167:29:29:0.147959:21:8:75:92:21:8:75:92 chr7 142143941 . T C 227.56 PASS AF=0.208791;AO=38;DP=182;FAO=38;FDP=182;FR=.;FRO=144;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=63;FSRR=81;FWDB=-0.00768981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.899;QD=5.00122;RBI=0.011031;REFB=-0.0044461;REVB=0.0079089;RO=144;SAF=10;SAR=28;SRF=63;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242815;STB=0.652117;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0138963;OID=.;OPOS=142143941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:144:144:38:38:0.208791:28:10:63:81:28:10:63:81 chr7 142144019 . C T 55.62 PASS AF=0.107692;AO=14;DP=131;FAO=14;FDP=130;FR=.;FRO=116;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=65;FSRR=51;FWDB=-0.00930845;FXX=0.0151504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.5164;QD=1.71138;RBI=0.0168102;REFB=-0.0054607;REVB=0.0139977;RO=116;SAF=3;SAR=11;SRF=65;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410177;STB=0.800439;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0476135;OID=.;OPOS=142144019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:131:130:116:116:14:14:0.107692:11:3:65:51:11:3:65:51 chr7 142144022 . T C 132.83 PASS AF=0.211864;AO=29;DP=122;FAO=25;FDP=118;FR=.;FRO=93;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.0183187;FXX=0.0327842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.707;QD=4.50276;RBI=0.0279906;REFB=-0.0150891;REVB=0.0211636;RO=93;SAF=9;SAR=20;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299183;STB=0.747211;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0280714;OID=.;OPOS=142144022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:118:93:93:29:25:0.211864:20:9:51:42:19:6:51:42 chr7 142144059 . A C 130.84 PASS AF=0.215054;AO=19;DP=95;FAO=20;FDP=93;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00486778;FXX=0.0312467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.28;QD=5.62743;RBI=0.00885754;REFB=-0.00652539;REVB=-0.00740005;RO=75;SAF=5;SAR=14;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359809;STB=0.695268;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0216033;OID=.;OPOS=142144059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:75:73:19:20:0.215054:14:5:41:34:14:6:40:33 chr7 142144091 . GG AA 31.03 PASS AF=0.1;AO=7;DP=70;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.0284731;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=203.355;QD=1.77336;RBI=0.0309133;REFB=-0.000778224;REVB=-0.0120381;RO=63;SAF=3;SAR=4;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181014;STB=0.639617;STBP=0.496;TYPE=mnp;VARB=0.00459172;OID=.;OPOS=142144091;OREF=GG;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:70:70:63:63:7:7:0.1:4:3:37:26:4:3:37:26 chr7 142149071 . T G 646.91 PASS AF=0.421053;AO=71;DP=170;FAO=72;FDP=171;FR=.;FRO=99;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=0.00209482;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.337;QD=15.1325;RBI=0.0169418;REFB=-0.00846359;REVB=0.0168118;RO=98;SAF=42;SAR=29;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127418;STB=0.57162;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00944013;OID=.;OPOS=142149071;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:98:99:71:72:0.421053:29:42:46:52:29:43:47:52 chr7 142149160 . T G 2325.75 PASS AF=0.975;AO=155;DP=159;FAO=156;FDP=160;FR=.;FRO=4;FSAF=78;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0279787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.171;QD=58.1437;RBI=0.0296139;REFB=0.0471094;REVB=0.00970454;RO=3;SAF=77;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590259;STB=0.506249;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.000962777;OID=.;OPOS=142149160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:159:160:3:4:155:156:0.975:78:77:1:2:78:78:1:3 chr7 142149349 . A C 1062.75 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.611;QD=59.873;RBI=0.0302745;REFB=0;REVB=-0.000105926;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04888e-05;OID=.;OPOS=142149349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:30:40:0:0:30:41:0:0 chr7 142162001 . A C 3148.39 PASS AF=1;AO=204;DP=204;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657789;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.16;QD=61.432;RBI=0.00670771;REFB=-0.0853267;REVB=0.00131331;RO=0;SAF=86;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15106e-05;OID=.;OPOS=142162001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:204:205:0:0:204:205:1:118:86:0:0:119:86:0:0 chr7 142162148 . C T 2299.64 PASS AF=0.993151;AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.015615;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.839;QD=63.0038;RBI=0.0222205;REFB=-0.0274737;REVB=-0.0158089;RO=1;SAF=68;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613637;STB=0.503225;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-2.99234e-07;OID=.;OPOS=142162148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:147:146:1:1:145:145:0.993151:77:68:0:1:77:68:0:1 chr7 142162306 . A G 888.87 PASS AF=0.984375;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00579375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.115;QD=55.5546;RBI=0.00658609;REFB=0.0360529;REVB=0.00313195;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154749;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=2.48515e-06;OID=.;OPOS=142162306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:64:1:1:61:63:0.984375:30:31:0:1:32:31:0:1 chr7 142168414 . G C 68.6 PASS AF=0.192982;AO=11;DP=57;FAO=11;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00702544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.681;QD=4.8142;RBI=0.00881678;REFB=-0.00549342;REVB=0.00532718;RO=46;SAF=6;SAR=5;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029383;STB=0.519196;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0202932;OID=.;OPOS=142168414;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:57:57:46:46:11:11:0.192982:5:6:24:22:5:6:24:22 chr7 142168429 . A G 923.25 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393432;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.179;QD=58.6193;RBI=0.0432901;REFB=0;REVB=0.0180596;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103448;OID=.;OPOS=142168429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0 chr7 142168452 . C A 1175.64 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00316637;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.34;QD=61.0723;RBI=0.00363944;REFB=0;REVB=0.00179434;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138253;OID=.;OPOS=142168452;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0 chr7 142168466 . A C 73.69 PASS AF=0.153846;AO=14;DP=91;FAO=14;FDP=91;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.00689331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.295;QD=3.2393;RBI=0.006899;REFB=-0.00249707;REVB=-0.000280337;RO=77;SAF=9;SAR=5;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249027;STB=0.667462;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0145352;OID=.;OPOS=142168466;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:91:91:77:77:14:14:0.153846:5:9:34:43:5:9:34:43 chr7 142168474 . G A 70.95 PASS AF=0.14;AO=14;DP=101;FAO=14;FDP=100;FR=.;FRO=86;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.0151019;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.774;QD=2.83814;RBI=0.0430976;REFB=-0.00517367;REVB=-0.040365;RO=84;SAF=9;SAR=5;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20762;STB=0.624098;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0277973;OID=.;OPOS=142168474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:101:100:84:86:14:14:0.14:5:9:40:44:5:9:43:43 chr7 142168662 . CG TC 1510.26 PASS AF=1;AO=94;DP=98;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101679;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.353;QD=63.5901;RBI=0.0484091;REFB=0;REVB=0.0473292;RO=0;SAF=34;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.12276e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.14934e-06;OID=.;OPOS=142168662;OREF=CG;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:95:0:0:94:95:1:60:34:0:0:60:35:0:0 chr7 142168819 . G A 857.99 PASS AF=0.939394;AO=62;DP=66;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0390706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.95;QD=51.9992;RBI=0.0583017;REFB=-0.102814;REVB=0.0432733;RO=3;SAF=25;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0063283;STB=0.506077;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00552968;OID=.;OPOS=142168819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:66:66:3:4:62:62:0.939394:37:25:1:2:37:25:2:2 chr7 142168856 . C G 717.06 PASS AF=0.931034;AO=52;DP=56;FAO=54;FDP=58;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0540447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9895;QD=49.4527;RBI=0.056952;REFB=-0.00845447;REVB=0.0179638;RO=4;SAF=25;SAR=27;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310637;STB=0.514795;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00400489;OID=.;OPOS=142168856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:56:58:4:4:52:54:0.931034:27:25:1:3:29:25:1:3 chr7 142176378 . A G 803.83 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00397312;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.785;QD=57.4167;RBI=0.0317922;REFB=0;REVB=0.031543;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40196e-05;OID=.;OPOS=142176378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr7 142180704 . G T 449.16 PASS AF=0.247273;AO=68;DP=275;FAO=68;FDP=275;FR=.;FRO=207;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=99;FSRR=108;FWDB=-0.00176116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.166;QD=6.53316;RBI=0.0180209;REFB=-0.00443824;REVB=-0.0179346;RO=206;SAF=27;SAR=41;SRF=98;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100614;STB=0.562175;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0102624;OID=.;OPOS=142180704;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:206:207:68:68:0.247273:41:27:98:108:41:27:99:108 chr7 142180737 . T A 435.8 PASS AF=0.254032;AO=63;DP=249;FAO=63;FDP=248;FR=.;FRO=185;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=82;FSRR=103;FWDB=-0.00143513;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.042;QD=7.02908;RBI=0.0134322;REFB=-0.00430893;REVB=-0.0133553;RO=184;SAF=25;SAR=38;SRF=81;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558205;STB=0.535623;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0296167;OID=.;OPOS=142180737;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:248:184:185:63:63:0.254032:38:25:81:103:38:25:82:103 chr7 142180770 . T C 311.56 PASS AF=0.23445;AO=49;DP=209;FAO=49;FDP=209;FR=.;FRO=160;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=72;FSRR=88;FWDB=-0.000779926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=348.706;QD=5.96292;RBI=0.00665536;REFB=-0.0042416;REVB=-0.00660951;RO=155;SAF=24;SAR=25;SRF=71;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040063;STB=0.530504;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0138086;OID=.;OPOS=142180770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:155:160:49:49:0.23445:25:24:71:84:25:24:72:88 chr7 142231625 . C A 244.35 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0316525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0591;QD=17.4539;RBI=0.0345002;REFB=-0.0133325;REVB=0.0137251;RO=29;SAF=17;SAR=10;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604885;STB=0.533886;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0221802;OID=.;OPOS=142231625;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:10:17:20:9:10:17:20:9 chr7 142231701 . G T 262.75 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0425496;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1155;QD=14.8026;RBI=0.0435828;REFB=0.00167067;REVB=-0.00943343;RO=41;SAF=24;SAR=6;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220949;STB=0.626772;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00479534;OID=.;OPOS=142231701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:41:41:30:30:0.422535:6:24:26:15:6:24:26:15 chr7 142242511 . A G 34.06 PASS AF=0.0774648;AO=11;DP=142;FAO=11;FDP=142;FR=.;FRO=131;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=70;FSRR=61;FWDB=-0.0649789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0528;QD=0.959422;RBI=0.0653234;REFB=-0.0020966;REVB=-0.00669947;RO=130;SAF=5;SAR=6;SRF=70;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932191;STB=0.573117;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0199405;OID=.;OPOS=142242511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:142:142:130:131:11:11:0.0774648:6:5:70:60:6:5:70:61 chr7 142247134 . T C 868.24 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-2.7493e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.579;QD=57.8827;RBI=0.0809853;REFB=0;REVB=0.0809853;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150373;OID=.;OPOS=142247134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0 chr7 142247288 . T C 33.27 PASS AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00814171;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.545;QD=3.24566;RBI=0.0326445;REFB=-0.00585703;REVB=-0.0316129;RO=35;SAF=1;SAR=5;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231221;STB=0.673494;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.038761;OID=.;OPOS=142247288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:35:35:6:6:0.146341:5:1:11:24:5:1:11:24 chr7 142247567 . A G 48.69 PASS AF=0.16;AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0323339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.531;QD=3.89559;RBI=0.0478018;REFB=-0.0120548;REVB=-0.035207;RO=40;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758055;STB=0.562336;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0622292;OID=.;OPOS=142247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:49:50:40:42:8:8:0.16:6:2:12:28:6:2:13:29 chr7 142247571 . A G 48.32 PASS AF=0.156863;AO=8;DP=51;FAO=8;FDP=51;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.0166748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.184;QD=3.78999;RBI=0.0192228;REFB=-0.0157765;REVB=0.0095639;RO=43;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789506;STB=0.55541;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0732113;OID=.;OPOS=142247571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:51:51:43:43:8:8:0.156863:6:2:13:30:6:2:13:30 chr7 142250938 . T G 774.68 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.259;QD=63.2388;RBI=0.055584;REFB=0;REVB=0.0205708;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047441;OID=.;OPOS=142250938;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:21:27:0:0:21:28:0:0 chr7 142250988 . G A 766.81 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0765;QD=63.9011;RBI=0.0426922;REFB=0;REVB=0.0343462;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059735;OID=.;OPOS=142250988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:27:21:0:0 chr7 142251132 . G T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.095;QD=56.7066;RBI=0.0550173;REFB=0;REVB=0.0294776;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026771;OID=.;OPOS=142251132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr7 142326607 . C T 486.48 PASS AF=0.452991;AO=52;DP=116;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.0134993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.692;QD=16.6319;RBI=0.0154153;REFB=-0.0262192;REVB=-0.00744321;RO=64;SAF=30;SAR=22;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152803;STB=0.578562;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0328109;OID=.;OPOS=142326607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:64:64:52:53:0.452991:22:30:27:37:23:30:27:37 chr7 142326783 . A G 171.15 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00211076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.764;QD=17.5541;RBI=0.00806557;REFB=0.011408;REVB=-0.00778448;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113565;STB=0.565142;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.011953;OID=.;OPOS=142326783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:13:5:8:13:13:5:8:13 chr7 142326909 . C G 1153.58 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.959;QD=60.7146;RBI=0.0637712;REFB=0;REVB=0.0550186;RO=0;SAF=26;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122796;OID=.;OPOS=142326909;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:50:26:0:0:50:26:0:0 chr7 142334648 . A T 490.97 PASS AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00649663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.659;QD=19.2537;RBI=0.0124132;REFB=-0.00322799;REVB=-0.0105774;RO=50;SAF=29;SAR=22;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260101;STB=0.509961;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00270364;OID=.;OPOS=142334648;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:50:51:51:51:0.5:22:29:27:23:22:29:28:23 chr7 142334744 . C A 568.12 PASS AF=0.461538;AO=54;DP=125;FAO=60;FDP=130;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.0165699;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.986;QD=17.4806;RBI=0.0167249;REFB=-0.00778003;REVB=0.00227164;RO=71;SAF=31;SAR=23;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400039;STB=0.503881;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.00973279;OID=.;OPOS=142334744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:130:71:70:54:60:0.461538:23:31:38:33:27:33:38:32 chr7 142373010 . C T 332.16 PASS AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.0183711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.524;QD=13.8398;RBI=0.0618653;REFB=-0.0195519;REVB=-0.0590747;RO=58;SAF=18;SAR=19;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698966;STB=0.53429;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0341689;OID=.;OPOS=142373010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:58:59:37:37:0.385417:19:18:32:26:19:18:32:27 chr7 142374072 . C A 271.73 PASS AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.021305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.7985;QD=12.3512;RBI=0.0375731;REFB=-0.00796212;REVB=0.030949;RO=56;SAF=20;SAR=12;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160537;STB=0.592427;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0149484;OID=.;OPOS=142374072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:56:56:32:32:0.363636:12:20:27:29:12:20:27:29 chr7 142374083 . A G 283.98 PASS AF=0.37931;AO=32;DP=86;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0311147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.049;QD=13.0567;RBI=0.0332314;REFB=-0.00334852;REVB=0.0116704;RO=53;SAF=20;SAR=12;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149093;STB=0.59823;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00843259;OID=.;OPOS=142374083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:53:54:32:33:0.37931:12:20:26:27:12:21:26:28 chr7 142378633 . G A 320.49 PASS AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00167159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3797;QD=27.2753;RBI=0.0670938;REFB=-0.00610888;REVB=0.067073;RO=19;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318946;STB=0.517599;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0123516;OID=.;OPOS=142378633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:13:15:11:8:13:15:11:8 chr7 142378831 . C G 850.7 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.081;QD=57.6747;RBI=0.0986206;REFB=0;REVB=0.098319;RO=0;SAF=45;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247978;OID=.;OPOS=142378831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:14:45:0:0:14:45:0:0 chr7 142423289 . C A 479.17 PASS AF=0.489583;AO=45;DP=95;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00727042;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2435;QD=19.9655;RBI=0.021069;REFB=0.00518664;REVB=0.0197749;RO=45;SAF=25;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00306638;OID=.;OPOS=142423289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:45:49:45:47:0.489583:20:25:25:20:20:27:29:20 chr7 142423562 . C T 1573.0 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9357;QD=59.9236;RBI=0.0300412;REFB=0;REVB=0.029766;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153573;OID=.;OPOS=142423562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:55:50:0:0:55:50:0:0 chr7 142458409 . C G 36.13 PASS AF=0.0693069;AO=14;DP=200;FAO=14;FDP=202;FR=.;FRO=188;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=91;FSRR=97;FWDB=-0.00223833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.033;QD=0.715449;RBI=0.0165598;REFB=-1.9342e-05;REVB=-0.0164079;RO=185;SAF=10;SAR=4;SRF=90;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248789;STB=0.71398;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-8.35083e-06;OID=.;OPOS=142458409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:200:202:185:188:14:14:0.0693069:4:10:90:95:4:10:91:97 chr7 142458412 . C T 40.19 PASS AF=0.0724638;AO=15;DP=195;FAO=15;FDP=207;FR=.;FRO=192;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=93;FSRR=99;FWDB=-0.00590973;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=106.12;QD=0.776588;RBI=0.0129987;REFB=0.000217762;REVB=-0.0115777;RO=179;SAF=11;SAR=4;SRF=85;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289567;STB=0.731131;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.00633952;OID=.;OPOS=142458412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:195:207:179:192:15:15:0.0724638:4:11:85:94:4:11:93:99 chr7 142458414 . C T 38.46 PASS AF=0.0700935;AO=15;DP=214;FAO=15;FDP=214;FR=.;FRO=199;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=94;FSRR=105;FWDB=-0.0143192;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.943;QD=0.718871;RBI=0.016073;REFB=-0.00162446;REVB=-0.00730076;RO=198;SAF=11;SAR=4;SRF=94;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281714;STB=0.740263;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0212926;OID=.;OPOS=142458414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:214:214:198:199:15:15:0.0700935:4:11:94:104:4:11:94:105 chr7 142458437 . C T 57.66 PASS AF=0.0823045;AO=20;DP=242;FAO=20;FDP=243;FR=.;FRO=223;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=106;FSRR=117;FWDB=0.00736486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8102;QD=0.949112;RBI=0.00738642;REFB=-0.000421478;REVB=0.00056398;RO=220;SAF=14;SAR=6;SRF=104;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261566;STB=0.704956;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00659466;OID=.;OPOS=142458437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:242:243:220:223:20:20:0.0823045:6:14:104:116:6:14:106:117 chr7 142458451 . A T 120.18 PASS AF=0.118577;AO=30;DP=253;FAO=30;FDP=253;FR=.;FRO=223;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=113;FSRR=110;FWDB=-0.00249313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.147;QD=1.90007;RBI=0.00667045;REFB=0.000559546;REVB=-0.00618702;RO=222;SAF=16;SAR=14;SRF=112;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360749;STB=0.523467;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=-0.00802954;OID=.;OPOS=142458451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:222:223:30:30:0.118577:14:16:112:110:14:16:113:110 chr7 142458669 . G A 48.36 PASS AF=0.135135;AO=10;DP=74;FAO=10;FDP=74;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=-0.0111708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.051;QD=2.61384;RBI=0.0242782;REFB=-0.00544254;REVB=-0.0215556;RO=64;SAF=5;SAR=5;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236188;STB=0.661872;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0244023;OID=.;OPOS=142458669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:74:74:64:64:10:10:0.135135:5:5:20:44:5:5:20:44 chr7 142458677 . G A 49.66 PASS AF=0.135135;AO=10;DP=77;FAO=10;FDP=74;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=45;FWDB=-0.0217805;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.538;QD=2.68417;RBI=0.0218349;REFB=-0.00329662;REVB=-0.00153953;RO=67;SAF=5;SAR=5;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254503;STB=0.675368;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0154469;OID=.;OPOS=142458677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:77:74:67:64:10:10:0.135135:5:5:20:47:5:5:19:45 chr7 142458697 . T A 112.83 PASS AF=0.209302;AO=18;DP=88;FAO=18;FDP=86;FR=.;FRO=68;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=-0.0293612;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.451;QD=5.24793;RBI=0.0330086;REFB=-0.00514575;REVB=-0.0150827;RO=68;SAF=8;SAR=10;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799996;STB=0.55021;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0182565;OID=.;OPOS=142458697;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:68:68:18:18:0.209302:10:8:26:42:10:8:26:42 chr7 142458700 . G T 110.57 PASS AF=0.202247;AO=18;DP=87;FAO=18;FDP=89;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=0.00800757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.889;QD=4.96952;RBI=0.0399631;REFB=-0.00743703;REVB=-0.0391526;RO=69;SAF=8;SAR=10;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873768;STB=0.564034;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0307381;OID=.;OPOS=142458700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:69:71:18:18:0.202247:10:8:26:43:10:8:26:45 chr7 142458737 . C G 83.73 PASS AF=0.166667;AO=15;DP=89;FAO=15;FDP=90;FR=.;FRO=75;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.00181265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.203;QD=3.72114;RBI=0.0126919;REFB=0.000371013;REVB=-0.0125618;RO=74;SAF=7;SAR=8;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00910406;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0028836;OID=.;OPOS=142458737;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:89:90:74:75:15:15:0.166667:8:7:34:40:8:7:35:40 chr7 142458739 . T C 33.16 PASS AF=0.121951;AO=16;DP=90;FAO=10;FDP=82;FR=.;FRO=72;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0096884;FXX=0.108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.454;QD=1.61735;RBI=0.0125946;REFB=-0.0138568;REVB=0.00804723;RO=73;SAF=8;SAR=8;SRF=32;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077766;STB=0.74813;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0977125;OID=.;OPOS=142458739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:90:82:73:72:16:10:0.121951:8:8:32:41:8:2:33:39 chr7 142458829 . A G 142.33 PASS AF=0.206897;AO=24;DP=116;FAO=24;FDP=116;FR=.;FRO=92;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=0.00328073;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.13;QD=4.90794;RBI=0.0215766;REFB=-0.00384472;REVB=-0.0213257;RO=92;SAF=13;SAR=11;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107424;STB=0.567183;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0162982;OID=.;OPOS=142458829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:92:92:24:24:0.206897:11:13:42:50:11:13:42:50 chr7 142458837 . A T 136.41 PASS AF=0.205357;AO=22;DP=112;FAO=23;FDP=112;FR=.;FRO=89;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.000622958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.65;QD=4.87163;RBI=0.00766951;REFB=-0.0108669;REVB=0.00764417;RO=89;SAF=13;SAR=9;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150505;STB=0.608601;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0174605;OID=.;OPOS=142458837;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:89:89:22:23:0.205357:9:13:42:47:9:14:42:47 chr7 142458841 . ATC AC,ACA 151.44 PASS AF=0.173077,0.0673077;AO=16,7;DP=107;FAO=18,7;FDP=104;FR=.;FRO=79;FSAF=12,3;FSAR=6,4;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.0166768,-0.00399012;FXX=0.0280348;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=123.631,245.325;QD=5.82442;RBI=0.0170939,0.00945825;REFB=-0.00249965,0.00121975;REVB=-0.00375306,0.0085754;RO=80;SAF=11,3;SAR=5,4;SRF=39;SRR=41;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.254991,-0.064707;STB=0.633651,0.571225;STBP=0.228,0.776;TYPE=del,mnp;VARB=0.00564479,0.00363232;OID=.,.;OPOS=142458842,142458842;OREF=T,TC;OALT=-,CA;OMAPALT=AC,ACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.173077,0.0673077:16,7:107:18,7:104:79:12,3:6,4:40:39:99:80:11,3:5,4:39:41 chr7 142458967 . A T 32.62 PASS AF=0.106061;AO=7;DP=66;FAO=7;FDP=66;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0950226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4041;QD=1.97721;RBI=0.112968;REFB=6.02466e-05;REVB=-0.0610944;RO=59;SAF=6;SAR=1;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422902;STB=0.832325;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.0100242;OID=.;OPOS=142458967;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:66:66:59:59:7:7:0.106061:1:6:30:29:1:6:30:29 chr7 142458972 . T C 40.29 PASS AF=0.121212;AO=8;DP=66;FAO=8;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0694777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.4719;QD=2.44203;RBI=0.0705305;REFB=-0.0141794;REVB=-0.0121412;RO=45;SAF=6;SAR=2;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43291;STB=0.725981;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0575634;OID=.;OPOS=142458972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:66:66:45:58:8:8:0.121212:2:6:17:28:2:6:29:29 chr7 142458987 . C G 61.94 PASS AF=0.181818;AO=10;DP=57;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0100189;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.582;QD=4.50436;RBI=0.0348608;REFB=-0.0019294;REVB=-0.03339;RO=47;SAF=8;SAR=2;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418905;STB=0.793524;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0104125;OID=.;OPOS=142458987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:57:55:47:45:10:10:0.181818:2:8:22:25:2:8:20:25 chr7 142459679 . G A 47.53 PASS AF=0.0962963;AO=13;DP=135;FAO=13;FDP=135;FR=.;FRO=122;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=50;FSRR=72;FWDB=-0.0204386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.218;QD=1.40837;RBI=0.0219847;REFB=0.00314102;REVB=0.00809883;RO=122;SAF=6;SAR=7;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620447;STB=0.547273;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.0219597;OID=.;OPOS=142459679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:135:135:122:122:13:13:0.0962963:7:6:50:72:7:6:50:72 chr7 142460313 . T C 1425.58 PASS AF=0.627451;AO=128;DP=204;FAO=128;FDP=204;FR=.;FRO=76;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.00285765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.637;QD=27.9525;RBI=0.00356393;REFB=-0.0125899;REVB=0.00212965;RO=75;SAF=67;SAR=61;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00236001;STB=0.501075;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.00749057;OID=.;OPOS=142460313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:75:76:128:128:0.627451:61:67:39:36:61:67:40:36 chr7 142460335 . A G 559.17 PASS AF=0.338095;AO=71;DP=210;FAO=71;FDP=210;FR=.;FRO=139;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=71;FSRR=68;FWDB=-0.000357055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.11;QD=10.6509;RBI=0.00855618;REFB=-0.000743446;REVB=0.00854872;RO=139;SAF=36;SAR=35;SRF=71;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00433209;STB=0.502482;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00689496;OID=.;OPOS=142460335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:139:139:71:71:0.338095:35:36:71:68:35:36:71:68 chr7 142460339 . G A 86.97 PASS AF=0.109005;AO=23;DP=211;FAO=23;FDP=211;FR=.;FRO=188;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=94;FSRR=94;FWDB=-0.00363823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8714;QD=1.64871;RBI=0.0324761;REFB=0.0021181;REVB=0.0322716;RO=188;SAF=11;SAR=12;SRF=94;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266723;STB=0.519357;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=-0.0150611;OID=.;OPOS=142460339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:211:211:188:188:23:23:0.109005:12:11:94:94:12:11:94:94 chr7 142460369 . G A 278.4 PASS AF=0.218905;AO=44;DP=201;FAO=44;FDP=201;FR=.;FRO=157;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=76;FSRR=81;FWDB=0.0255591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.412;QD=5.54032;RBI=0.0264914;REFB=0.00220616;REVB=-0.00696618;RO=157;SAF=18;SAR=26;SRF=76;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965277;STB=0.559241;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=-0.00838155;OID=.;OPOS=142460369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:157:157:44:44:0.218905:26:18:76:81:26:18:76:81 chr7 142460394 . T C 111.34 PASS AF=0.134409;AO=25;DP=186;FAO=25;FDP=186;FR=.;FRO=161;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=80;FSRR=81;FWDB=0.00957158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6556;QD=2.39447;RBI=0.0349526;REFB=-0.00950932;REVB=-0.0336165;RO=161;SAF=12;SAR=13;SRF=80;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213414;STB=0.514618;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0447485;OID=.;OPOS=142460394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:161:161:25:25:0.134409:13:12:80:81:13:12:80:81 chr7 142460412 . A C 85.19 PASS AF=0.127517;AO=19;DP=149;FAO=19;FDP=149;FR=.;FRO=130;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=61;FSRR=69;FWDB=-0.0313959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.405;QD=2.28708;RBI=0.0331931;REFB=-0.00569388;REVB=-0.0107741;RO=130;SAF=8;SAR=11;SRF=61;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606736;STB=0.542485;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0275196;OID=.;OPOS=142460412;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:149:149:130:130:19:19:0.127517:11:8:61:69:11:8:61:69 chr7 142460415 . T C 86.73 PASS AF=0.131944;AO=19;DP=144;FAO=19;FDP=144;FR=.;FRO=125;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=65;FWDB=-0.0313018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.468;QD=2.40914;RBI=0.043986;REFB=0.00170509;REVB=0.0309026;RO=125;SAF=8;SAR=11;SRF=60;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742943;STB=0.551568;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.0420009;OID=.;OPOS=142460415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:144:144:125:125:19:19:0.131944:11:8:60:65:11:8:60:65 chr7 142460865 . T C 884.84 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7413;QD=58.0223;RBI=0.0454119;REFB=0;REVB=-0.0124195;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239595;OID=.;OPOS=142460865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0 chr7 142470290 . T C 1699.4 PASS AF=0.943548;AO=112;DP=123;FAO=117;FDP=124;FR=.;FRO=7;FSAF=46;FSAR=71;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0206617;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.683;QD=54.8194;RBI=0.0318999;REFB=-0.131231;REVB=0.0243043;RO=4;SAF=41;SAR=71;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440907;STB=0.527123;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00169116;OID=.;OPOS=142470290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:123:124:4:7:112:117:0.943548:71:41:4:0:71:46:6:1 chr7 142478897 . T C 1130.79 PASS AF=0.987013;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0754307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.831;QD=58.7426;RBI=0.076676;REFB=0.0381135;REVB=0.0137629;RO=1;SAF=16;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028648;STB=0.514282;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=-7.89547e-05;OID=.;OPOS=142478897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:77:1:1:75:76:0.987013:59:16:1:0:59:17:1:0 chr7 142479912 . C G 99.14 PASS AF=0.116822;AO=25;DP=215;FAO=25;FDP=214;FR=.;FRO=189;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=94;FSRR=95;FWDB=-0.00274259;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.33;QD=1.85301;RBI=0.026888;REFB=-0.00267765;REVB=-0.0267478;RO=189;SAF=11;SAR=14;SRF=94;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713701;STB=0.550727;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0493371;OID=.;OPOS=142479912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:189:189:25:25:0.116822:14:11:94:95:14:11:94:95 chr7 142479915 . T C 487.56 PASS AF=0.304147;AO=64;DP=214;FAO=66;FDP=217;FR=.;FRO=151;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=70;FSRR=81;FWDB=-0.0107181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.989;QD=8.98725;RBI=0.0244681;REFB=-0.0116444;REVB=-0.0219957;RO=149;SAF=35;SAR=29;SRF=68;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108496;STB=0.556839;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0135751;OID=.;OPOS=142479915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:217:149:151:64:66:0.304147:29:35:68:81:30:36:70:81 chr7 142479917 . C T 100.58 PASS AF=0.115044;AO=26;DP=226;FAO=26;FDP=226;FR=.;FRO=200;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=97;FSRR=103;FWDB=-0.0115194;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.793;QD=1.78014;RBI=0.0191418;REFB=-0.00165907;REVB=-0.0152876;RO=200;SAF=12;SAR=14;SRF=97;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291733;STB=0.520803;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.015203;OID=.;OPOS=142479917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:200:200:26:26:0.115044:14:12:97:103:14:12:97:103 chr7 142479940 . C T 1888.39 PASS AF=0.62782;AO=166;DP=266;FAO=167;FDP=266;FR=.;FRO=99;FSAF=80;FSAR=87;FSRF=54;FSRR=45;FWDB=-0.00660546;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.942;QD=28.3968;RBI=0.00680829;REFB=-0.0103923;REVB=-0.00164944;RO=98;SAF=80;SAR=86;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475949;STB=0.524707;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00758801;OID=.;OPOS=142479940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:266:98:99:166:167:0.62782:86:80:54:44:87:80:54:45 chr7 142479954 . C T 951.79 PASS AF=0.407692;AO=106;DP=280;FAO=106;FDP=260;FR=.;FRO=154;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=73;FSRR=81;FWDB=0.0107195;FXX=0.071426;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.586;QD=14.6429;RBI=0.0119512;REFB=-0.00271142;REVB=0.00528434;RO=153;SAF=62;SAR=44;SRF=72;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121376;STB=0.566094;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0023449;OID=.;OPOS=142479954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:260:153:154:106:106:0.407692:44:62:72:81:44:62:73:81 chr7 142480002 . C A 1071.44 PASS AF=0.425455;AO=115;DP=272;FAO=117;FDP=275;FR=.;FRO=158;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=75;FSRR=83;FWDB=0.00147977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.032;QD=15.5846;RBI=0.0117473;REFB=-0.0146013;REVB=-0.0116538;RO=156;SAF=63;SAR=52;SRF=74;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759823;STB=0.541589;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0190233;OID=.;OPOS=142480002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:275:156:158:115:117:0.425455:52:63:74:82:53:64:75:83 chr7 142480012 . C T 1547.48 PASS AF=0.552632;AO=147;DP=268;FAO=147;FDP=266;FR=.;FRO=119;FSAF=73;FSAR=74;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=0.031727;FXX=0.00746241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.948;QD=23.2704;RBI=0.0354235;REFB=-0.0323082;REVB=0.015755;RO=118;SAF=73;SAR=74;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374797;STB=0.518433;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0100722;OID=.;OPOS=142480012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:266:118:119:147:147:0.552632:74:73:64:54:74:73:64:55 chr7 142480034 . C A 1439.0 PASS AF=0.551181;AO=132;DP=247;FAO=140;FDP=254;FR=.;FRO=114;FSAF=73;FSAR=67;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=0.0280234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.226;QD=22.6614;RBI=0.0281776;REFB=-0.0175918;REVB=0.00294385;RO=111;SAF=67;SAR=65;SRF=60;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276541;STB=0.510093;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0137671;OID=.;OPOS=142480034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:254:111:114:132:140:0.551181:65:67:60:51:67:73:62:52 chr7 142480067 . C T 581.94 PASS AF=0.353846;AO=69;DP=195;FAO=69;FDP=195;FR=.;FRO=126;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=60;FSRR=66;FWDB=0.0200491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.772;QD=11.9372;RBI=0.0205623;REFB=-0.0054765;REVB=0.00456523;RO=126;SAF=31;SAR=38;SRF=60;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307012;STB=0.517505;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00472855;OID=.;OPOS=142480067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:126:126:69:69:0.353846:38:31:60:66:38:31:60:66 chr7 142481234 . T C 1485.39 PASS AF=0.979381;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0163081;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.555;QD=61.2532;RBI=0.0365269;REFB=-0.0226614;REVB=0.0326843;RO=2;SAF=48;SAR=47;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00020576;STB=0.500108;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000592249;OID=.;OPOS=142481234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:97:2:2:95:95:0.979381:47:48:1:1:47:48:1:1 chr7 142481376 . T A 190.13 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.797;QD=47.5327;RBI=0.134002;REFB=0;REVB=0.0480157;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00270302;OID=.;OPOS=142481376;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:14:16:1:9:5:0:0:11:5:0:0 chr7 142481807 . C T 1540.6 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.941;QD=59.829;RBI=0.0201724;REFB=0;REVB=-0.0088399;RO=0;SAF=63;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15547e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31701e-05;OID=.;OPOS=142481807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:40:63:0:0:40:63:0:0 chr7 142481867 . C G 1500.3 PASS AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443585;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2674;QD=59.4177;RBI=0.0455942;REFB=0;REVB=-0.0105432;RO=0;SAF=60;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406603;OID=.;OPOS=142481867;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:40:60:0:0:41:60:0:0 chr7 142494043 . CAGAAA ACTGTG 107.36 PASS AF=1;AO=9;DP=12;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642982;FXX=0.166528;HRUN=2;LEN=6;MLLD=286.68;QD=42.9451;RBI=0.00642982;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.62368e-05;OID=.;OPOS=142494043;OREF=CAGAAA;OALT=ACTGTG;OMAPALT=ACTGTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:12:10:0:0:9:10:1:0:9:0:0:0:10:0:0 chr7 142495126 . GG AT 459.63 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112052;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=194.369;QD=57.4543;RBI=0.0213785;REFB=0;REVB=0.0182067;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000212427;OID=.;OPOS=142495126;OREF=GG;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:9:23:0:0 chr7 142498735 . A C 182.99 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0152703;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.508;QD=17.4277;RBI=0.0152988;REFB=-0.00479738;REVB=0.000933602;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073141;STB=0.541624;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.00648729;OID=.;OPOS=142498735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:15:8:8:11:15:8 chr7 142498738 . C G 224.92 PASS AF=0.488889;AO=21;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00936462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.548;QD=19.9928;RBI=0.0107488;REFB=0.00206806;REVB=-0.00527649;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767254;STB=0.556453;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00195683;OID=.;OPOS=142498738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:23:23:21:22:0.488889:8:13:16:7:9:13:16:7 chr7 142498813 . G A 448.73 PASS AF=0.494505;AO=44;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00685229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5282;QD=19.7243;RBI=0.00989264;REFB=-0.0057463;REVB=0.00713516;RO=46;SAF=27;SAR=17;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166047;STB=0.595996;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00779728;OID=.;OPOS=142498813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:46:46:44:45:0.494505:17:27:20:26:17:28:20:26 chr7 142498833 . A T 473.1 PASS AF=0.472222;AO=50;DP=107;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0359531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8939;QD=17.5223;RBI=0.0373069;REFB=-0.00327977;REVB=0.00995914;RO=52;SAF=21;SAR=29;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109552;STB=0.559496;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00451648;OID=.;OPOS=142498833;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:52:57:50:51:0.472222:29:21:28:24:29:22:31:26 chr7 142498837 . C T 469.0 PASS AF=0.463636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0190855;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.292;QD=17.0546;RBI=0.0201498;REFB=-0.0203357;REVB=-0.0064622;RO=58;SAF=21;SAR=30;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134412;STB=0.570478;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0207487;OID=.;OPOS=142498837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:58:59:51:51:0.463636:30:21:32:26:30:21:32:27 chr7 142498897 . A G 491.83 PASS AF=0.435484;AO=54;DP=124;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=0.00346203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.687;QD=15.8654;RBI=0.0144903;REFB=-0.01143;REVB=-0.0140707;RO=67;SAF=24;SAR=30;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116727;STB=0.500907;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0133592;OID=.;OPOS=142498897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:70:54:54:0.435484:30:24:29:38:30:24:31:39 chr7 142499071 . T C 958.93 PASS AF=0.747475;AO=74;DP=99;FAO=74;FDP=99;FR=.;FRO=25;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0629387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.674;QD=38.7447;RBI=0.0630813;REFB=-0.0298295;REVB=0.00423821;RO=25;SAF=40;SAR=34;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473935;STB=0.52538;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0110904;OID=.;OPOS=142499071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:25:25:74:74:0.747475:34:40:16:9:34:40:16:9 chr7 142510309 . A G 397.34 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0268659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1613;QD=20.6408;RBI=0.027865;REFB=0.0263349;REVB=0.00739467;RO=37;SAF=25;SAR=15;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735598;STB=0.540616;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.0259759;OID=.;OPOS=142510309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:15:25:26:11:15:25:26:11 chr7 142510350 . G A 493.52 PASS AF=0.429688;AO=54;DP=128;FAO=55;FDP=128;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.00837757;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.957;QD=15.4226;RBI=0.0270323;REFB=-0.0100909;REVB=0.0257014;RO=72;SAF=32;SAR=22;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489238;STB=0.504237;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0113033;OID=.;OPOS=142510350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:72:73:54:55:0.429688:22:32:43:29:23:32:43:30 chr7 142510446 . G A 451.15 PASS AF=0.35443;AO=56;DP=158;FAO=56;FDP=158;FR=.;FRO=102;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=49;FWDB=0.000467357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.313;QD=11.4214;RBI=0.00112195;REFB=-0.00684218;REVB=-0.00101998;RO=100;SAF=27;SAR=29;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537246;STB=0.524167;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0134346;OID=.;OPOS=142510446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:100:102:56:56:0.35443:29:27:53:47:29:27:53:49 chr7 143017807 . G T 1572.19 PASS AF=0.981818;AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00188988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.693;QD=57.1707;RBI=0.0106112;REFB=0.00140212;REVB=0.0104415;RO=2;SAF=79;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112814;STB=0.517238;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-4.11594e-06;OID=.;OPOS=143017807;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:109:110:2:2:106:108:0.981818:27:79:1:1:28:80:0:2 chr7 143042837 . C T 803.03 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152075;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.588;QD=57.3594;RBI=0.0239497;REFB=0;REVB=0.0185019;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171812;OID=.;OPOS=143042837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:21:34:0:0:22:34:0:0 chr7 143053260 . A G 695.87 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0216342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.499;QD=60.5101;RBI=0.03182;REFB=-0.0688973;REVB=0.023334;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191802;STB=0.5102;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00011933;OID=.;OPOS=143053260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:24:21:0:1:24:21:0:1 chr7 143088823 . T C 313.67 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.944;QD=52.2789;RBI=0.0444037;REFB=0;REVB=0.0395492;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500624;OID=.;OPOS=143088823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0 chr7 143088867 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.093;QD=45.8068;RBI=0.00497487;REFB=0;REVB=-0.00479006;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.57022e-05;OID=.;OPOS=143088867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr7 143090852 . G A 621.11 PASS AF=0.56;AO=55;DP=99;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0423591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9425;QD=24.8442;RBI=0.0638876;REFB=0.00896033;REVB=0.0478261;RO=44;SAF=27;SAR=28;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737045;STB=0.50786;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=-0.00364132;OID=.;OPOS=143090852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:44:44:55:56:0.56:28:27:22:22:29:27:22:22 chr7 143093538 . G A 1746.36 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7601;QD=60.743;RBI=0.0811023;REFB=0;REVB=-0.0774033;RO=0;SAF=40;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4984e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000277088;OID=.;OPOS=143093538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:75:40:0:0:75:40:0:0 chr7 143097100 . A G 501.63 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2138;QD=59.0149;RBI=0.0254428;REFB=0;REVB=0.00199713;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000525789;OID=.;OPOS=143097100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr7 143140748 . G C 166.36 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.01424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2426;QD=14.7875;RBI=0.0147202;REFB=-0.00634824;REVB=-0.00372907;RO=27;SAF=9;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576169;STB=0.533296;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0130875;OID=.;OPOS=143140748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:9:9:15:12:9:9:15:12 chr7 143141475 . T C 728.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3559;QD=57.1702;RBI=0.033961;REFB=0;REVB=0.00165517;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362523;OID=.;OPOS=143141475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr7 143270172 . A G 820.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583829;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.323;QD=57.5958;RBI=0.0984469;REFB=0;REVB=-0.0792668;RO=0;SAF=18;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203589;OID=.;OPOS=143270172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:39:18:0:0:39:18:0:0 chr7 143453661 . T G 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00153432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.629;QD=7.76275;RBI=0.0122129;REFB=-0.0076508;REVB=-0.0121161;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316032;STB=0.519934;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0302851;OID=.;OPOS=143453661;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:4:2:4:9:4:2:4:9 chr7 143556202 . C T 99.64 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00133198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.559;QD=26.5702;RBI=0.0763633;REFB=-0.0373389;REVB=0.0763517;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215993;STB=0.512173;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00828221;OID=.;OPOS=143556202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:5:6:2:2:5:6:2:2 chr7 143632618 . C T 1874.07 PASS AF=1;AO=118;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.543;QD=61.445;RBI=0.030768;REFB=0;REVB=0.0275575;RO=0;SAF=62;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124774;OID=.;OPOS=143632618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:122:0:0:118:122:1:56:62:0:0:59:63:0:0 chr7 143633297 . A G 937.58 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.99;QD=58.5985;RBI=0.0392628;REFB=0;REVB=0.0047882;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.12439e-05;OID=.;OPOS=143633297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:42:22:0:0:42:22:0:0 chr7 143657801 . A G 2208.94 PASS AF=1;AO=137;DP=138;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.429;QD=63.1125;RBI=0.0284851;REFB=0;REVB=-0.00350941;RO=0;SAF=69;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43716e-05;OID=.;OPOS=143657801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:140:0:0:137:140:1:68:69:0:0:69:71:0:0 chr7 143701516 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0115897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.931;QD=13.5055;RBI=0.0315582;REFB=-0.009215;REVB=-0.029353;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144712;STB=0.585219;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0193039;OID=.;OPOS=143701516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:8:4:8:9:8:4:8:9 chr7 143701884 . C T 709.24 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1423;QD=54.5567;RBI=0.0341397;REFB=-0.0652554;REVB=-0.0211308;RO=1;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171217;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00597581;OID=.;OPOS=143701884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:27:24:0:1:27:24:0:1 chr7 143748364 . T C 1731.3 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.769;QD=60.7472;RBI=0.0275702;REFB=0;REVB=0.0271006;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11602e-05;OID=.;OPOS=143748364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:59:55:0:0:59:55:0:0 chr7 143771408 . G C 920.09 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.939;QD=58.4182;RBI=0.0330452;REFB=0;REVB=0.0316077;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28464e-05;OID=.;OPOS=143771408;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0 chr7 143771536 . G A 1497.55 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00592257;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.381;QD=63.7254;RBI=0.0297627;REFB=0;REVB=0.0291675;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.51165e-05;OID=.;OPOS=143771536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:56:38:0:0:56:38:0:0 chr7 143771557 . T C 610.25 PASS AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0103588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.652;QD=22.813;RBI=0.0109023;REFB=0.00411073;REVB=-0.00339951;RO=47;SAF=25;SAR=35;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045795;STB=0.525032;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=-0.00218355;OID=.;OPOS=143771557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:47:47:60:60:0.560748:35:25:17:30:35:25:17:30 chr7 143771937 . G C 1251.29 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.899;QD=61.0386;RBI=0.0149454;REFB=0;REVB=0.010052;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332021;OID=.;OPOS=143771937;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:46:35:0:0:46:36:0:0 chr7 143807515 . T G 601.08 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00166904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.817;QD=58.6415;RBI=0.0716753;REFB=-0.10993;REVB=0.0716558;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.511622;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00158163;OID=.;OPOS=143807515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:21:19:0:0:21:19:0:1 chr7 143807518 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.505;QD=61.6839;RBI=0.013354;REFB=0;REVB=0.000362346;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8763e-05;OID=.;OPOS=143807518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0 chr7 143826603 . G T 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.815;QD=57.1049;RBI=0.0190613;REFB=0;REVB=-0.0138126;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.41822e-05;OID=.;OPOS=143826603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0 chr7 143826697 . C A,G 550.6 PASS AF=0,0.87234;AO=19,22;DP=47;FAO=0,41;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=0,25;FSAR=0,16;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.283205,0.131652;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=64.089,45.5013;QD=46.8595;RBI=0.283345,0.131816;REFB=0.116363,-0.111576;REVB=0.00890069,-0.0065785;RO=6;SAF=19,6;SAR=0,16;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.303703;STB=0.5,0.553546;STBP=1,0.075;TYPE=snp,snp;VARB=0,0.114085;OID=.,.;OPOS=143826697,143826697;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:32:47:47:6:6:19,22:0,41:0,0.87234:0,16:19,6:6:0:0,16:0,25:6:0 chr7 143826729 . ACTT A 410.54 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974041;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=320.221;QD=56.6256;RBI=0.0209355;REFB=0;REVB=0.0185316;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=6.49291e-05;OID=.;OPOS=143826730;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:28:29:29:29:0:8:21:0:0:4:0:7:21:0:0 chr7 143882673 . C T 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0109443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0873;QD=16.8838;RBI=0.0343937;REFB=-0.0441336;REVB=-0.032606;RO=17;SAF=14;SAR=1;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540409;STB=0.822958;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0136904;OID=.;OPOS=143882673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:1:14:10:7:1:14:10:7 chr7 143884103 . G A 998.87 PASS AF=0.656489;AO=85;DP=130;FAO=86;FDP=131;FR=.;FRO=45;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.00858373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.095;QD=30.5;RBI=0.0107254;REFB=-0.0247956;REVB=0.00643075;RO=45;SAF=39;SAR=46;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00929629;STB=0.507141;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0110036;OID=.;OPOS=143884103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:45:45:85:86:0.656489:46:39:20:25:46:40:20:25 chr7 143884139 . G A 230.48 PASS AF=0.272727;AO=33;DP=116;FAO=33;FDP=121;FR=.;FRO=88;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=-0.00443926;FXX=0.00819605;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.719;QD=7.61917;RBI=0.0161673;REFB=-0.00154296;REVB=0.0155459;RO=82;SAF=12;SAR=21;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124341;STB=0.560402;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00530436;OID=.;OPOS=143884139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:121:82:88:33:33:0.272727:21:12:38:44:21:12:39:49 chr7 144015434 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.853;QD=59.8392;RBI=0.0551482;REFB=0;REVB=0.0388176;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000698716;OID=.;OPOS=144015434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr7 144015437 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.8947;QD=59.8393;RBI=0.042775;REFB=0;REVB=-0.027717;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000800817;OID=.;OPOS=144015437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr7 144060802 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00166472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.624;QD=43.4862;RBI=0.0246575;REFB=0;REVB=-0.0246012;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.93577e-05;OID=.;OPOS=144060802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr7 144095600 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7964;QD=51.1829;RBI=0.0570349;REFB=0;REVB=-0.0537123;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00222563;OID=.;OPOS=144095600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0 chr7 144098992 . G A 696.36 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0466815;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8612;QD=52.5557;RBI=0.0477859;REFB=-0.0953946;REVB=-0.0102142;RO=2;SAF=35;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152599;STB=0.508109;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.00394298;OID=.;OPOS=144098992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:16:35:1:1:16:35:1:1 chr7 144547012 . T C 440.16 PASS AF=0.478261;AO=43;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0139948;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.212;QD=19.1372;RBI=0.0168207;REFB=-0.00730652;REVB=0.00933175;RO=47;SAF=14;SAR=29;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221386;STB=0.608445;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00609673;OID=.;OPOS=144547012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:48:43:44:0.478261:29:14:26:21:29:15:26:22 chr7 146113454 . C T 768.69 PASS AF=0.433862;AO=82;DP=189;FAO=82;FDP=189;FR=.;FRO=107;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=66;FSRR=41;FWDB=0.0181975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.783;QD=16.2686;RBI=0.0407694;REFB=-0.0166075;REVB=-0.0364828;RO=105;SAF=54;SAR=28;SRF=66;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033165;STB=0.525819;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0177887;OID=.;OPOS=146113454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:105:107:82:82:0.433862:28:54:66:39:28:54:66:41 chr7 148113623 . ATAGTT A 327.39 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484246;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=5;MLLD=299.02;QD=54.565;RBI=0.0491639;REFB=0;REVB=-0.00849407;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=9.6657e-05;OID=.;OPOS=148113624;OREF=TAGTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:24:25:24:24:0:12:12:0:0:4:0:12:12:0:0 chr7 148131742 . G A 129.45 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.043573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.476;QD=12.9446;RBI=0.0522954;REFB=-0.00740357;REVB=0.0289172;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867922;STB=0.550952;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0182396;OID=.;OPOS=148131742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:9:6:12:13:9:6:12:13 chr7 148143136 . A G 1914.89 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4771;QD=61.7706;RBI=0.0440948;REFB=0;REVB=-0.0288578;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000323623;OID=.;OPOS=148143136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:74:50:0:0:74:50:0:0 chr7 148481488 . G A 316.86 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0124618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.312;QD=17.8515;RBI=0.0154626;REFB=-0.0151775;REVB=-0.00915409;RO=34;SAF=17;SAR=17;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105703;STB=0.549267;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0161581;OID=.;OPOS=148481488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:34:37:34:34:0.478873:17:17:21:13:17:17:22:15 chr7 148506396 . A C 165.72 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00798173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.825;QD=14.4104;RBI=0.0251873;REFB=-0.00365585;REVB=0.0238891;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118922;STB=0.577032;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00729466;OID=.;OPOS=148506396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:8:10:18:9:8:10:19:9 chr7 148801091 . G A 167.47 PASS AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00957535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.932;QD=41.8672;RBI=0.017218;REFB=0.0454836;REVB=-0.0143099;RO=1;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479918;STB=0.526281;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.00458579;OID=.;OPOS=148801091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:9:6:0:1:9:6:0:1 chr7 148801658 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00276903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.843;QD=51.1846;RBI=0.0380022;REFB=0;REVB=0.0379012;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244507;OID=.;OPOS=148801658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr7 148822810 . C T 1622.86 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.667;QD=60.1059;RBI=0.06072;REFB=0;REVB=0.0264917;RO=1;SAF=44;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106631;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105331;OID=.;OPOS=148822810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:108:1:0:105:108:1:61:44:1:0:61:47:0:0 chr7 148848358 . G A 313.34 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00624168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.708;QD=50.1347;RBI=0.0380645;REFB=-0.0777754;REVB=0.0375492;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517227;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00077398;OID=.;OPOS=148848358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:14:10:0:0:14:10:0:1 chr7 148851213 . G A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.083;QD=62.3507;RBI=0.0327774;REFB=0;REVB=0.024728;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151865;OID=.;OPOS=148851213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0 chr7 148937136 . C A 239.77 PASS AF=0.469388;AO=21;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0578613;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.943;QD=19.5726;RBI=0.0592492;REFB=0.00334904;REVB=0.0127489;RO=26;SAF=7;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205836;STB=0.579067;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.0014249;OID=.;OPOS=148937136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:26:26:21:23:0.469388:14:7:14:12:14:9:14:12 chr7 148979649 . G T 297.04 PASS AF=0.342342;AO=38;DP=111;FAO=38;FDP=111;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0124247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.62;QD=10.704;RBI=0.0173687;REFB=-0.0107613;REVB=-0.0121366;RO=73;SAF=17;SAR=21;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367942;STB=0.52123;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0203514;OID=.;OPOS=148979649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:73:73:38:38:0.342342:21:17:35:38:21:17:35:38 chr7 148991712 . A G 45.99 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.018347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.646;QD=9.19833;RBI=0.0344735;REFB=-0.0227068;REVB=-0.0291858;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115383;STB=0.571224;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0326623;OID=.;OPOS=148991712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:6:7:3:4:6:7 chr7 149112306 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.645;QD=53.2768;RBI=0.0223831;REFB=0;REVB=-0.0222451;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123148;OID=.;OPOS=149112306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr7 149191460 . G A 584.8 PASS AF=0.564356;AO=57;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=46;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0261565;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.586;QD=23.1603;RBI=0.0261612;REFB=-0.0188171;REVB=-0.000498572;RO=44;SAF=11;SAR=46;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375281;STB=0.707317;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0111553;OID=.;OPOS=149191460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:44:44:57:57:0.564356:46:11:26:18:46:11:26:18 chr7 149243619 . C T 124.16 PASS AF=0.306122;AO=14;DP=46;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0119914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7896;QD=10.1352;RBI=0.075096;REFB=-0.0219044;REVB=-0.0741324;RO=32;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188835;STB=0.563601;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0539998;OID=.;OPOS=149243619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:32:34:14:15:0.306122:8:6:19:13:8:7:19:15 chr7 149317053 . T C 775.37 PASS AF=0.493827;AO=80;DP=162;FAO=80;FDP=162;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=62;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=0.00601508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6781;QD=19.1448;RBI=0.0199711;REFB=-0.00201276;REVB=0.0190438;RO=82;SAF=18;SAR=62;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294494;STB=0.663598;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00212872;OID=.;OPOS=149317053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:82:82:80:80:0.493827:62:18:41:41:62:18:41:41 chr7 149317062 . C T 843.16 PASS AF=0.505952;AO=85;DP=168;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=63;FWDB=0.0073577;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.639;QD=20.0752;RBI=0.0229849;REFB=-0.00156309;REVB=0.0217754;RO=83;SAF=43;SAR=42;SRF=20;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238796;STB=0.63047;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000454054;OID=.;OPOS=149317062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:83:83:85:85:0.505952:42:43:20:63:42:43:20:63 chr7 149318375 . C T 272.91 PASS AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0308639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.079;QD=45.4845;RBI=0.034987;REFB=0.0098741;REVB=0.0164774;RO=2;SAF=4;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182989;STB=0.5999;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=1.92118e-05;OID=.;OPOS=149318375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:18:4:2:0:18:4:2:0 chr7 149318471 . C T 233.39 PASS AF=0.578947;AO=21;DP=37;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0263205;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8517;QD=24.5672;RBI=0.10985;REFB=0.0241227;REVB=0.10665;RO=16;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276324;STB=0.65839;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0144981;OID=.;OPOS=149318471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:16:16:21:22:0.578947:14:7:11:5:15:7:11:5 chr7 149332825 . C T 351.18 PASS AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00413542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.671;QD=23.412;RBI=0.0173332;REFB=-0.0280786;REVB=-0.0168327;RO=25;SAF=18;SAR=17;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157116;STB=0.586159;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0223042;OID=.;OPOS=149332825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:17:18:18:7:17:18:18:7 chr7 149332845 . C T 375.97 PASS AF=0.590164;AO=31;DP=64;FAO=36;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0208634;FXX=0.0468677;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.757;QD=24.6534;RBI=0.0210643;REFB=-0.0725819;REVB=-0.00290228;RO=15;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299735;STB=0.571251;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0264268;OID=.;OPOS=149332845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:61:15:21:31:36:0.590164:13:18:1:14:17:19:7:14 chr7 149335542 . C T 335.78 PASS AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.014623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4113;QD=22.3852;RBI=0.0306434;REFB=-0.00938894;REVB=-0.0269293;RO=26;SAF=9;SAR=25;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423162;STB=0.523385;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00673376;OID=.;OPOS=149335542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:25:9:8:18:25:9:8:18 chr7 149344105 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.716;QD=59.0172;RBI=0.00509018;REFB=0;REVB=0.00355266;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15371e-07;OID=.;OPOS=149344105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:26:8:0:0:26:8:0:0 chr7 149388270 . CGG CCG,GCC 120.14 PASS AF=0.313725,0;AO=14,7;DP=48;FAO=16,0;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=13,0;FSAR=3,0;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0383364,0.00422392;FXX=0.0192271;HRUN=7,1;LEN=1,3;MLLD=32.4464,48.3308;QD=9.42305;RBI=0.182825,0.236157;REFB=-0.0389237,-0.0179455;REVB=-0.17876,-0.236119;RO=21;SAF=12,0;SAR=2,7;SRF=19;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.110375,-0.841638;STB=0.719811,0.5;STBP=0.059,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0257564,0;OID=.,.;OPOS=149388271,149388270;OREF=G,CGG;OALT=C,GCC;OMAPALT=CCG,GCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:51:21:35:14,7:16,0:0.313725,0:2,7:12,0:19:2:3,0:13,0:19:16 chr7 149426305 . G GC 747.5 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00200961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.004;QD=47.46;RBI=0.117285;REFB=0;REVB=0.117268;RO=1;SAF=27;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171678;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00234639;OID=.;OPOS=149426306;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:63:64:63:63:0:27:36:0:0:14:1:27:36:1:0 chr7 149427409 . T G 1481.33 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00377131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.459;QD=58.0915;RBI=0.0814653;REFB=-0.101575;REVB=-0.0813779;RO=0;SAF=38;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000362871;OID=.;OPOS=149427409;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:100:102:0:1:100:101:0.990196:62:38:0:0:63:38:0:1 chr7 149462381 . C T 102.07 PASS AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00407113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.33;QD=29.1641;RBI=0.0775465;REFB=-0.0282376;REVB=-0.0774396;RO=3;SAF=10;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117458;STB=0.56511;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0121598;OID=.;OPOS=149462381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:1:10:3:0:1:10:3:0 chr7 149462523 . C G 469.78 PASS AF=0.661538;AO=43;DP=65;FAO=43;FDP=65;FR=.;FRO=22;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=1;FWDB=0.00477212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.915;QD=28.9092;RBI=0.0586823;REFB=-0.0192038;REVB=-0.058488;RO=22;SAF=34;SAR=9;SRF=21;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172489;STB=0.592777;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0134108;OID=.;OPOS=149462523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:22:22:43:43:0.661538:9:34:21:1:9:34:21:1 chr7 149474393 . A G 253.54 PASS AF=0.460317;AO=28;DP=58;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0104887;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.4017;QD=16.098;RBI=0.066862;REFB=-0.0213307;REVB=-0.0660342;RO=30;SAF=10;SAR=18;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095226;STB=0.534833;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0266226;OID=.;OPOS=149474393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:63:30:34:28:29:0.460317:18:10:11:19:18:11:15:19 chr7 149479335 . G C 335.28 PASS AF=0.372727;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=0.0164866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.955;QD=12.1921;RBI=0.0224933;REFB=-0.0145662;REVB=-0.0153016;RO=68;SAF=24;SAR=17;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204119;STB=0.611546;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0210266;OID=.;OPOS=149479335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:68:69:41:41:0.372727:17:24:27:41:17:24:28:41 chr7 149483237 . G A 557.8 PASS AF=0.457364;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0055845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.359;QD=17.2962;RBI=0.0059441;REFB=-0.0388864;REVB=0.00203609;RO=69;SAF=34;SAR=25;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535871;STB=0.526279;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0411862;OID=.;OPOS=149483237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:69:70:59:59:0.457364:25:34:36:33:25:34:37:33 chr7 149485059 . T C 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0276972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.726;QD=17.2277;RBI=0.0288791;REFB=-0.0312444;REVB=0.00817722;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326506;STB=0.689206;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0323895;OID=.;OPOS=149485059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:5:1:5:3:5:1 chr7 149486294 . A G 358.68 PASS AF=0.403846;AO=41;DP=103;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=-0.0182367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.814;QD=13.7954;RBI=0.054627;REFB=-0.026259;REVB=-0.0514931;RO=61;SAF=28;SAR=13;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271453;STB=0.502145;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0427768;OID=.;OPOS=149486294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:61:62:41:42:0.403846:13:28:43:18:13:29:43:19 chr7 149486382 . C G 257.26 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00528999;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.059;QD=13.7203;RBI=0.00863378;REFB=-0.0144365;REVB=-0.00682336;RO=44;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111124;STB=0.51336;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.019754;OID=.;OPOS=149486382;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:45:30:30:0.4:16:14:21:23:16:14:22:23 chr7 149486719 . C G 237.38 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.030116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.708;QD=20.2024;RBI=0.0703003;REFB=-0.0148864;REVB=-0.063523;RO=24;SAF=15;SAR=8;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101572;STB=0.556915;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00841862;OID=.;OPOS=149486719;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:8:15:18:6:8:15:18:6 chr7 149489491 . C T 305.5 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0179542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.749;QD=17.7101;RBI=0.0190599;REFB=-0.0308583;REVB=0.00639727;RO=36;SAF=11;SAR=22;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18893;STB=0.605995;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0250457;OID=.;OPOS=149489491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:22:11:19:17:22:11:19:17 chr7 149498893 . A G 216.62 PASS AF=0.341772;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0299113;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.718;QD=10.9678;RBI=0.0300035;REFB=-0.0213916;REVB=-0.00235034;RO=50;SAF=15;SAR=12;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507997;STB=0.527201;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0410983;OID=.;OPOS=149498893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:50:52:27:27:0.341772:12:15:30:20:12:15:31:21 chr7 149498903 . T C 227.12 PASS AF=0.35;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0213037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2381;QD=11.3559;RBI=0.0322045;REFB=-0.000222775;REVB=-0.0241513;RO=52;SAF=15;SAR=13;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248447;STB=0.514378;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000223386;OID=.;OPOS=149498903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:52:28:28:0.35:13:15:29:23:13:15:29:23 chr7 149498967 . C T 144.04 PASS AF=0.3125;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0493142;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4206;QD=9.00234;RBI=0.0616112;REFB=-0.00999849;REVB=-0.0369331;RO=43;SAF=10;SAR=10;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671339;STB=0.531219;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0243615;OID=.;OPOS=149498967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:43:44:20:20:0.3125:10:10:24:19:10:10:24:20 chr7 149499284 . C T 244.52 PASS AF=0.6875;AO=22;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0161145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.569;QD=30.5651;RBI=0.0373709;REFB=-0.0102659;REVB=0.0337181;RO=10;SAF=7;SAR=15;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119491;STB=0.506573;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00486262;OID=.;OPOS=149499284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:10:10:22:22:0.6875:15:7:3:7:15:7:3:7 chr7 149503843 . T G 1638.72 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3532;QD=60.1365;RBI=0.0826685;REFB=0;REVB=-0.080299;RO=0;SAF=59;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000369095;OID=.;OPOS=149503843;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:109:0:0:105:109:1:46:59:0:0:47:62:0:0 chr7 149503916 . GGATA G 1012.34 PASS AF=0.911765;AO=77;DP=86;FAO=93;FDP=102;FR=.;FRO=9;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0276671;FXX=0.0285687;HRUN=3;LEN=4;MLLD=252.048;QD=39.6996;RBI=0.0663599;REFB=-0.0744492;REVB=0.0603172;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517958;STBP=0.255;TYPE=del;VARB=0.00594845;OID=.;OPOS=149503917;OREF=GATA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.911765:77:86:93:102:9:54:39:7:2:12:0:47:30:0:0 chr7 149506211 . G GC 2796.63 PASS AF=1;AO=229;DP=243;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112063;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.2917;QD=47.6021;RBI=0.116639;REFB=0;REVB=-0.0323526;RO=11;SAF=115;SAR=114;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196305;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000470886;OID=.;OPOS=149506212;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:229:243:235:235:0:117:118:0:0:51:11:115:114:8:3 chr7 149511985 . A G 508.39 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0392288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.832;QD=56.4876;RBI=0.0435919;REFB=0.0693195;REVB=0.0190094;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032238;STB=0.517231;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000595497;OID=.;OPOS=149511985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:21:14:1:0:21:14:1:0 chr7 149513560 . T C 808.44 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00102418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.817;QD=56.7326;RBI=0.0394622;REFB=0;REVB=0.0394489;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025152;OID=.;OPOS=149513560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:33:23:0:0:34:23:0:0 chr7 149515103 . C T 747.08 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.726;QD=63.5809;RBI=0.0507916;REFB=0;REVB=0.0472794;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110567;OID=.;OPOS=149515103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr7 149515188 . TA T 169.43 PASS AF=1;AO=13;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.2159;QD=45.18;RBI=0.0408788;REFB=0;REVB=-0.0186183;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00510353;OID=.;OPOS=149515189;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:13:15:15:15:0:5:10:0:0:4:0:4:9:0:0 chr7 149515754 . A G 501.64 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.042;QD=59.0164;RBI=0.0244662;REFB=0;REVB=-0.0226341;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.84489e-05;OID=.;OPOS=149515754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr7 149515775 . C G 670.1 PASS AF=0.977778;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0299973;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.755;QD=59.5646;RBI=0.128116;REFB=-0.042916;REVB=0.124555;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218371;STB=0.511623;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0014217;OID=.;OPOS=149515775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:43:44:0.977778:21:22:0:1:21:23:0:1 chr7 149515796 . C T 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00250489;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.054;QD=57.5452;RBI=0.00292357;REFB=0;REVB=0.00150758;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.5223e-06;OID=.;OPOS=149515796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0 chr7 149516486 . A G 934.43 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.115;QD=58.402;RBI=0.0514914;REFB=0;REVB=0.0470635;RO=0;SAF=16;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40056e-05;OID=.;OPOS=149516486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:47:16:0:0:48:16:0:0 chr7 149516881 . G T 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.469;QD=60.8836;RBI=0.0628844;REFB=0;REVB=0.0300474;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9025e-05;OID=.;OPOS=149516881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr7 149518148 . A G 301.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00919196;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.4456;QD=52.4066;RBI=0.0531977;REFB=0;REVB=-0.0523975;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153189;OID=.;OPOS=149518148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0 chr7 149518532 . TC T 774.32 PASS AF=1;AO=64;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7733;QD=44.8882;RBI=0.0848972;REFB=0;REVB=0.0836542;RO=2;SAF=18;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0.227976;SSEP=0;SSSB=0.0200938;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00291139;OID=.;OPOS=149518533;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:64:69:69:69:0:19:50:0:0:13:2:18:46:0:2 chr7 149518961 . T C 3972.01 PASS AF=0.97048;AO=255;DP=265;FAO=263;FDP=271;FR=.;FRO=8;FSAF=99;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0383798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9202;QD=58.6274;RBI=0.0541231;REFB=-0.0210405;REVB=0.0381615;RO=7;SAF=96;SAR=159;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02052;STB=0.511904;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00309724;OID=.;OPOS=149518961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:265:271:7:8:255:263:0.97048:159:96:0:7:164:99:0:8 chr7 149519184 . C T 919.51 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.761;QD=58.3813;RBI=0.035238;REFB=0;REVB=0.00891765;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137604;OID=.;OPOS=149519184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0 chr7 149521183 . G A 1190.25 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3278;QD=61.0383;RBI=0.0248847;REFB=0;REVB=0.0137704;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34148e-05;OID=.;OPOS=149521183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:28:49:0:0:29:49:0:0 chr7 149521544 . C T 1000.59 PASS AF=0.892857;AO=71;DP=84;FAO=75;FDP=84;FR=.;FRO=9;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.137646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4804;QD=47.6471;RBI=0.146756;REFB=-0.219879;REVB=0.0509006;RO=9;SAF=43;SAR=28;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893054;STB=0.543678;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00980355;OID=.;OPOS=149521544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:84:84:9:9:71:75:0.892857:28:43:9:0:28:47:9:0 chr7 149522162 . G T 3219.48 PASS AF=1;AO=206;DP=208;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179558;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.425;QD=61.6168;RBI=0.0620711;REFB=-0.0702166;REVB=0.0594173;RO=1;SAF=112;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423427;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258359;OID=.;OPOS=149522162;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:208:209:1:0:206:209:1:94:112:1:0:95:114:0:0 chr7 149522366 . T G 601.16 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0432088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2885;QD=58.6499;RBI=0.044864;REFB=-0.106726;REVB=-0.0120738;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00161949;OID=.;OPOS=149522366;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:20:20:0:0:20:20:0:1 chr7 149523277 . A G 2176.14 PASS AF=1;AO=137;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00660464;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.478;QD=62.6228;RBI=0.0206969;REFB=-0.0721636;REVB=0.0196148;RO=0;SAF=60;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224278;OID=.;OPOS=149523277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:139:139:0:0:137:139:1:77:60:0:0:78:61:0:0 chr7 149528262 . C T 789.39 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0931447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.187;QD=56.3847;RBI=0.102898;REFB=0;REVB=0.0437278;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013211;OID=.;OPOS=149528262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:56:0:0:50:56:1:25:25:0:0:26:30:0:0 chr7 149530894 . G A,C 972.33 PASS AF=0.955224,0.0447761;AO=64,3;DP=68;FAO=64,3;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=47,0;FSAR=17,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000367167,-0.0491565;FXX=0.0147037;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=127.663,37.4948;QD=58.0497;RBI=0.0172692,0.0512246;REFB=0,0;REVB=0.0172653,0.014408;RO=0;SAF=47,0;SAR=17,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.23474e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0007226,0.0792011;OID=.,.;OPOS=149530894,149530894;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:68:67:0:0:64,3:64,3:0.955224,0.0447761:17,3:47,0:0:0:17,3:47,0:0:0 chr7 149556518 . C T 854.12 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0269588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.101;QD=56.0076;RBI=0.0350911;REFB=-0.0110951;REVB=0.0224634;RO=1;SAF=35;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132943;STB=0.50704;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000462416;OID=.;OPOS=149556518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:25:35:1:0:25:35:1:0 chr7 149558167 . G A 124.15 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00181865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.115;QD=9.93195;RBI=0.0395257;REFB=-0.0154766;REVB=-0.0394838;RO=35;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111293;STB=0.506693;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0409482;OID=.;OPOS=149558167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:8:7:16:19:8:7:16:19 chr7 149558409 . G C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.212;QD=53.9111;RBI=0.0420888;REFB=0;REVB=0.0297377;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243278;OID=.;OPOS=149558409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0 chr7 149559273 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.619;QD=62.6711;RBI=0.0367841;REFB=0;REVB=0.0338799;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93827e-05;OID=.;OPOS=149559273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr7 149559465 . C T 1197.79 PASS AF=1;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187199;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3464;QD=60.6478;RBI=0.0187865;REFB=0;REVB=0.00158011;RO=1;SAF=39;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119826;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305668;OID=.;OPOS=149559465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:1:0:78:79:1:39:39:1:0:39:40:0:0 chr7 149562627 . CCG C 501.06 PASS AF=1;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00558163;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=152.123;QD=50.1057;RBI=0.00630046;REFB=0;REVB=0.00292253;RO=0;SAF=31;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.402516;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000105083;OID=.;OPOS=149562628;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:41:40:40:0:32:8:0:0:9:0:31:8:0:0 chr7 149576818 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000422059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.436;QD=51.9162;RBI=0.0023165;REFB=0;REVB=-0.00227773;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.81534e-05;OID=.;OPOS=149576818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr7 149983565 . T C 345.05 PASS AF=0.385321;AO=41;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=0.00739918;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.326;QD=12.6623;RBI=0.0117108;REFB=-0.00294102;REVB=-0.00907716;RO=67;SAF=21;SAR=20;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135061;STB=0.582933;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00375212;OID=.;OPOS=149983565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:67:67:41:42:0.385321:20:21:26:41:20:22:26:41 chr7 150028958 . A G 317.11 PASS AF=0.472222;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00601526;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.371;QD=17.617;RBI=0.00820519;REFB=-0.00881904;REVB=0.00558049;RO=37;SAF=14;SAR=19;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184802;STB=0.601567;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0114496;OID=.;OPOS=150028958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:37:38:33:34:0.472222:19:14:23:14:20:14:23:15 chr7 150034378 . A G 101.89 PASS AF=0.282609;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0569082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.496;QD=8.85994;RBI=0.0569686;REFB=-0.00683511;REVB=-0.00262394;RO=31;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115958;STB=0.516753;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.027985;OID=.;OPOS=150034378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:31:33:13:13:0.282609:7:6:14:17:7:6:16:17 chr7 150035183 . C T 164.2 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.00241678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.471;QD=11.1323;RBI=0.00241887;REFB=-0.00965315;REVB=0.00010074;RO=38;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325981;STB=0.688304;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0242868;OID=.;OPOS=150035183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:8:13:12:26:8:13:12:26 chr7 150035459 . T G 84.26 PASS AF=0.423077;AO=8;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0274828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3276;QD=12.9637;RBI=0.0529293;REFB=-0.00754467;REVB=0.0452351;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19274;STB=0.55546;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0236962;OID=.;OPOS=150035459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:26:26:14:15:8:11:0.423077:5:3:3:11:8:3:3:12 chr7 150035500 . C G 86.81 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0594786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.446;QD=12.8609;RBI=0.0699278;REFB=-0.011886;REVB=-0.0367723;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291871;STB=0.505608;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0108903;OID=.;OPOS=150035500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:15:16:11:11:0.407407:9:2:3:12:9:2:3:13 chr7 150037660 . A G 128.97 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00315887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.167;QD=12.897;RBI=0.0151234;REFB=-0.0421019;REVB=0.0147898;RO=25;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718389;STB=0.542032;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0646034;OID=.;OPOS=150037660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:8:7:10:15:8:7:10:15 chr7 150068371 . T C 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0220611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.849;QD=21.613;RBI=0.0223819;REFB=-0.0234751;REVB=0.00377618;RO=22;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526104;STB=0.537542;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0257323;OID=.;OPOS=150068371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:23:24:24:0.510638:9:15:15:7:9:15:16:7 chr7 150068605 . G A 792.35 PASS AF=0.677083;AO=65;DP=97;FAO=65;FDP=96;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.103676;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.332;QD=33.0144;RBI=0.105976;REFB=-0.0311343;REVB=0.0219615;RO=30;SAF=21;SAR=44;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133215;STB=0.578522;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0120528;OID=.;OPOS=150068605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:30:31:65:65:0.677083:44:21:16:14:44:21:17:14 chr7 150068620 . C T 720.73 PASS AF=0.628571;AO=67;DP=100;FAO=66;FDP=105;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0821435;FXX=0.0186898;HRUN=5;LEN=1;MLLD=58.0455;QD=27.4564;RBI=0.0822816;REFB=-0.0668598;REVB=-0.00476577;RO=33;SAF=30;SAR=37;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599429;STB=0.536999;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0256217;OID=.;OPOS=150068620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:105:33:39:67:66:0.628571:37:30:18:15:37:29:21:18 chr7 150070630 . A G 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0291115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.02;QD=12.0154;RBI=0.0656894;REFB=-0.076573;REVB=0.0588865;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484388;STB=0.529316;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0896981;OID=.;OPOS=150070630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:2:5:4:2:2:5 chr7 150070663 . T C 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00652178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1317;QD=18.8856;RBI=0.0116252;REFB=0.00212161;REVB=0.00962354;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661115;STB=0.538366;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.00304051;OID=.;OPOS=150070663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:2:3:4:4:2:3 chr7 150070814 . G A 320.06 PASS AF=0.4375;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0188434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9924;QD=16.0032;RBI=0.0211866;REFB=-0.00262513;REVB=-0.00968482;RO=43;SAF=12;SAR=23;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558853;STB=0.548012;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00347696;OID=.;OPOS=150070814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:43:45:35:35:0.4375:23:12:17:26:23:12:19:26 chr7 150093701 . A C 950.62 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460329;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.862;QD=59.4135;RBI=0.00796747;REFB=0;REVB=0.00650311;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380625;OID=.;OPOS=150093701;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:31:33:0:0:31:33:0:0 chr7 150163837 . A G 393.47 PASS AF=0.488372;AO=41;DP=82;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0259122;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.7736;QD=18.301;RBI=0.0858997;REFB=-0.00800392;REVB=-0.0818982;RO=41;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00709375;OID=.;OPOS=150163837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:86:41:44:41:42:0.488372:23:18:18:23:23:19:21:23 chr7 150171710 . T C 229.78 PASS AF=0.29703;AO=30;DP=101;FAO=30;FDP=101;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.043754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.315;QD=9.10025;RBI=0.0438673;REFB=-0.00771321;REVB=0.00315081;RO=71;SAF=10;SAR=20;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964616;STB=0.557104;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0155895;OID=.;OPOS=150171710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:71:71:30:30:0.29703:20:10:29:42:20:10:29:42 chr7 150217089 . G A 724.13 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0255285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.5;QD=54.651;RBI=0.0493104;REFB=-0.0510485;REVB=0.0421878;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.508471;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00230337;OID=.;OPOS=150217089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:53:0:1:52:52:0.981132:29:23:0:0:29:23:0:1 chr7 150217248 . A G 1246.1 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00865403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.768;QD=61.536;RBI=0.0177531;REFB=0;REVB=0.015501;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72115e-05;OID=.;OPOS=150217248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:46:35:0:0:46:35:0:0 chr7 150218002 . C T 937.26 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.386;QD=58.5789;RBI=0.025318;REFB=0;REVB=-0.0175602;RO=0;SAF=18;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12145e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21204e-06;OID=.;OPOS=150218002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:46:18:0:0:46:18:0:0 chr7 150324825 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549709;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.954;QD=53.2763;RBI=0.0549778;REFB=0;REVB=-0.000871536;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394774;OID=.;OPOS=150324825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr7 150326191 . A G 972.88 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.864;QD=58.9626;RBI=0.0198647;REFB=0;REVB=0.0138616;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01052e-05;OID=.;OPOS=150326191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:33:32:0:0:34:32:0:0 chr7 150327024 . C T 1723.99 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033654;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2254;QD=61.0262;RBI=0.034002;REFB=0;REVB=0.00485222;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262412;OID=.;OPOS=150327024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0 chr7 150389593 . T C 248.09 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00278659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.45;QD=16.2684;RBI=0.00598983;REFB=-0.004163;REVB=0.00530217;RO=32;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976889;STB=0.563335;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0121796;OID=.;OPOS=150389593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:16:12:17:15:16:12:18:15 chr7 150389856 . A G 318.76 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0207779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.007;QD=20.9021;RBI=0.053721;REFB=-0.0270956;REVB=0.0495401;RO=28;SAF=16;SAR=17;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106434;STB=0.558847;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0261864;OID=.;OPOS=150389856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:17:16:10:18:17:16:10:18 chr7 150439500 . C T 248.26 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00113963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.602;QD=16.2791;RBI=0.00119501;REFB=-0.0187945;REVB=-0.000359564;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387593;STB=0.521826;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0233131;OID=.;OPOS=150439500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:15:13:14:19:15:13:14:19 chr7 150440043 . C T 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0307712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9961;QD=12.8689;RBI=0.0475376;REFB=0.0231688;REVB=0.0362348;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129419;STB=0.575628;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.0347783;OID=.;OPOS=150440043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:7:4:4:12:7:4:4:12 chr7 150446936 . A G 128.83 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00999024;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.545;QD=12.5691;RBI=0.0113741;REFB=-0.0115961;REVB=-0.00543738;RO=26;SAF=9;SAR=6;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106839;STB=0.56242;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0183685;OID=.;OPOS=150446936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:6:9:18:8:6:9:18:8 chr7 150447027 . T G 179.02 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0125956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.315;QD=12.5626;RBI=0.0222939;REFB=-0.0154247;REVB=-0.0183948;RO=35;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636557;STB=0.536708;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0294115;OID=.;OPOS=150447027;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:10:12:17:18:10:12:17:18 chr7 150488616 . A G 129.32 PASS AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00234994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.678;QD=9.57915;RBI=0.0253108;REFB=-0.00651337;REVB=-0.0252015;RO=37;SAF=9;SAR=8;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111237;STB=0.566083;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0228948;OID=.;OPOS=150488616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:8:9:16:21:8:9:16:21 chr7 150490376 . C T 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0530012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0016;QD=8.69138;RBI=0.0532213;REFB=-0.00237663;REVB=0.00483442;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171013;STB=0.605793;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00912228;OID=.;OPOS=150490376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:3:5:8:9:3:5:8:9 chr7 150491084 . T G 158.15 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0563424;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2915;QD=14.7116;RBI=0.0563425;REFB=-0.00945156;REVB=0.000104501;RO=26;SAF=11;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118371;STB=0.568883;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0161539;OID=.;OPOS=150491084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:26:26:17:17:0.395349:6:11:14:12:6:11:14:12 chr7 150500729 . A G 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.325;QD=57.6807;RBI=0.0347297;REFB=0;REVB=0.0109627;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234269;OID=.;OPOS=150500729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr7 150501516 . A G 1233.45 PASS AF=1;AO=75;DP=78;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053691;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.662;QD=58.7357;RBI=0.0335029;REFB=0;REVB=0.0330699;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103542;OID=.;OPOS=150501516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:78:84:0:0:75:84:1:46:29:0:0:52:32:0:0 chr7 150554887 . G A 858.28 PASS AF=0.984375;AO=59;DP=61;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0224689;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.774;QD=53.6427;RBI=0.0226215;REFB=-0.0709911;REVB=-0.00262366;RO=2;SAF=38;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024187;STB=0.506171;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00134426;OID=.;OPOS=150554887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:64:2:1:59:63:0.984375:21:38:2:0:23:40:1:0 chr7 150555915 . A G 2139.93 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.37;QD=62.9392;RBI=0.00633484;REFB=0;REVB=0.00347114;RO=0;SAF=74;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41291e-05;OID=.;OPOS=150555915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:62:74:0:0:62:74:0:0 chr7 150556002 . T C 1415.1 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0016416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.424;QD=62.8931;RBI=0.00471864;REFB=0;REVB=-0.00442388;RO=0;SAF=59;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.65347e-06;OID=.;OPOS=150556002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:31:59:0:0:31:59:0:0 chr7 150556055 . CG GC 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136005;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.147;QD=57.0007;RBI=0.0203464;REFB=0;REVB=-0.0151328;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.64798e-06;OID=.;OPOS=150556055;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0 chr7 150557622 . G A 1363.67 PASS AF=0.950495;AO=96;DP=101;FAO=96;FDP=101;FR=.;FRO=5;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0290205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.78;QD=54.0065;RBI=0.0348088;REFB=-0.129055;REVB=0.0192215;RO=5;SAF=48;SAR=48;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281217;STB=0.514848;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0014839;OID=.;OPOS=150557622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:101:101:5:5:96:96:0.950495:48:48:4:1:48:48:4:1 chr7 150557665 . C G 758.2 PASS AF=1;AO=46;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043024;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.564;QD=57.2229;RBI=0.046258;REFB=0;REVB=0.0169923;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296108;OID=.;OPOS=150557665;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:46:53:1:26:20:0:0:28:25:0:0 chr7 150648198 . A G 800.97 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8413;QD=57.2123;RBI=0.0358246;REFB=0;REVB=0.0352891;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233587;OID=.;OPOS=150648198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:28:27:0:0:29:27:0:0 chr7 150648789 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.524;QD=62.022;RBI=0.0196748;REFB=0;REVB=0.00299999;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91127e-05;OID=.;OPOS=150648789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chr7 150649531 . G A 1084.28 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217273;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.394;QD=60.2377;RBI=0.117846;REFB=0;REVB=0.115826;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059619;OID=.;OPOS=150649531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:30:39:0:0:34:38:0:0 chr7 150649603 . G A 1873.46 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.666;QD=60.9254;RBI=0.0635259;REFB=0;REVB=0.0579654;RO=0;SAF=52;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451243;OID=.;OPOS=150649603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:122:123:1:70:52:0:0:71:52:0:0 chr7 150695726 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0575312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.05;QD=62.6705;RBI=0.0590101;REFB=0;REVB=-0.0131285;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228032;OID=.;OPOS=150695726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:31:13:0:0:31:13:0:0 chr7 150696111 . T C,G 2638.55 PASS AF=0.079096,0.920904;AO=15,156;DP=171;FAO=14,163;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=0,84;FSAR=14,79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101896,0.0138885;FXX=0.00561766;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=94.0146,120.341;QD=59.6282;RBI=0.0118113,0.0310644;REFB=0,0;REVB=-0.0117672,0.0277868;RO=0;SAF=1,77;SAR=14,79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.46824e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0857803,0.000749048;OID=.,.;OPOS=150696111,150696111;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:41:171:177:0:0:15,156:14,163:0.079096,0.920904:14,79:1,77:0:0:14,79:0,84:0:0 chr7 150704250 . C G 651.01 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6684;QD=62.0006;RBI=0.0951802;REFB=0;REVB=-0.0876063;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000761506;OID=.;OPOS=150704250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0 chr7 150714154 . G C 137.25 PASS AF=0.551724;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0024588;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=25.2442;QD=18.9307;RBI=0.0678077;REFB=-0.083184;REVB=-0.0677631;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241875;STB=0.608559;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0592227;OID=.;OPOS=150714154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:26:29:11:13:15:16:0.551724:9:6:8:3:10:6:8:5 chr7 150752608 . T G 180.29 PASS AF=0.365079;AO=22;DP=60;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0623232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9347;QD=11.4467;RBI=0.0751112;REFB=-0.0245171;REVB=0.0419226;RO=37;SAF=4;SAR=18;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387425;STB=0.716489;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0553456;OID=.;OPOS=150752608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:37:40:22:23:0.365079:18:4:18:19:18:5:21:19 chr7 150761314 . G A 74.48 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0353093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.747;QD=22.9154;RBI=0.041442;REFB=-0.034532;REVB=0.0216956;RO=4;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212429;STB=0.512168;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0234935;OID=.;OPOS=150761314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:2:7:3:1:2:7:3:1 chr7 150761680 . C A 281.26 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00523953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.199;QD=19.3972;RBI=0.0330978;REFB=0.00243358;REVB=0.0326805;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304691;STB=0.670097;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00104732;OID=.;OPOS=150761680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:9:21:10:18:9:21:10:18 chr7 150765065 . T C 2999.66 PASS AF=1;AO=188;DP=188;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.348;QD=63.4849;RBI=0.0256062;REFB=0;REVB=0.0129678;RO=0;SAF=95;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5142e-05;OID=.;OPOS=150765065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:188:189:0:0:188:189:1:93:95:0:0:93:96:0:0 chr7 150768695 . G A 119.71 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0237819;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.28;QD=20.8183;RBI=0.0259998;REFB=-0.000248982;REVB=-0.0105077;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123573;STB=0.507031;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.000675008;OID=.;OPOS=150768695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:23:23:10:10:13:13:0.565217:8:5:4:6:8:5:4:6 chr7 150768786 . G A 356.1 PASS AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0010468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.387;QD=24.5587;RBI=0.00265678;REFB=-0.0247848;REVB=0.00244186;RO=21;SAF=16;SAR=19;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528414;STB=0.526406;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0128717;OID=.;OPOS=150768786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:21:23:35:35:0.603448:19:16:8:13:19:16:9:14 chr7 150773165 . C T 408.21 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0173335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.354;QD=20.4103;RBI=0.0224049;REFB=-0.03387;REVB=-0.014196;RO=39;SAF=26;SAR=15;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110998;STB=0.561596;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.049507;OID=.;OPOS=150773165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:15:26:20:19:15:26:20:19 chr7 150773287 . T C 202.81 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0948061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6275;QD=12.2915;RBI=0.0959459;REFB=-0.00355572;REVB=-0.0147457;RO=40;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127665;STB=0.578887;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00530797;OID=.;OPOS=150773287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:14:11:13:27:14:11:13:28 chr7 150773779 . TGGGGGGG TGGGGG,TGGGGGG,TGGGGGGC 190.98 PASS AF=0,0.375,0.232143;AO=6,12,8;DP=58;FAO=0,21,13;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=0,6,10;FSAR=0,15,3;FSRF=20;FSRR=2;FWDB=-0.0352269,-0.0681093,-0.0157199;FXX=0.0344768;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=13.0525,9.3119,16.3074;QD=13.6415;RBI=0.0385823,0.074393,0.0268513;REFB=-0.00430137,-0.00964762,-0.0155134;REVB=-0.0157371,-0.0299238,-0.0217687;RO=20;SAF=3,2,5;SAR=3,10,3;SRF=18;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.511808,-0.683364,-0.397004;STB=0.5,0.792438,0.642682;STBP=1,0.002,0.451;TYPE=del,del,snp;VARB=0.133164,-0.0281104,0.0731547;OID=.,.,.;OPOS=150773780,150773780,150773786;OREF=GG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=TGGGGG,TGGGGGG,TGGGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.375,0.232143:6,12,8:58:0,21,13:56:22:0,6,10:0,15,3:20:2:63:20:3,2,5:3,10,3:18:2 chr7 150773788 . C G 83.71 PASS AF=0.205882;AO=16;DP=68;FAO=14;FDP=68;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0639344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9237;QD=4.92413;RBI=0.0704246;REFB=-0.00399214;REVB=0.0295299;RO=52;SAF=15;SAR=1;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.635425;STB=0.894752;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0260474;OID=.;OPOS=150773788;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:68:68:52:54:16:14:0.205882:1:15:26:26:1:13:28:26 chr7 150773807 . A T 1093.59 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0144355;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.951;QD=57.5576;RBI=0.0209359;REFB=0.0134036;REVB=0.0151634;RO=2;SAF=42;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219938;STB=0.511625;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00043671;OID=.;OPOS=150773807;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:76:2:2:74:74:0.973684:32:42:2:0:32:42:2:0 chr7 150774308 . G A 238.56 PASS AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00219374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8076;QD=27.2634;RBI=0.0751598;REFB=-0.0172618;REVB=0.0751278;RO=13;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121731;STB=0.567505;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00580712;OID=.;OPOS=150774308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:14:8:7:6:14:8:7:6 chr7 150864240 . G C 140.05 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.142654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4672;QD=20.7485;RBI=0.147248;REFB=-0.00729741;REVB=0.0364926;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350619;STB=0.695425;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0138145;OID=.;OPOS=150864240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:7:8:1:11:7:8:1:11 chr7 150916228 . G A 207.31 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.000458166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.154;QD=24.3895;RBI=0.012965;REFB=-0.0190272;REVB=-0.0129569;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691896;STB=0.5185;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0177598;OID=.;OPOS=150916228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:14:20:20:0.588235:12:8:4:9:12:8:5:9 chr7 150921950 . A G 787.76 PASS AF=0.593496;AO=73;DP=123;FAO=73;FDP=123;FR=.;FRO=50;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0180868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.885;QD=25.6181;RBI=0.0180874;REFB=-0.0163213;REVB=-0.000145625;RO=50;SAF=39;SAR=34;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406096;STB=0.522082;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.010753;OID=.;OPOS=150921950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:50:50:73:73:0.593496:34:39:24:26:34:39:24:26 chr7 150931268 . C G 281.96 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0169906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.107;QD=14.6472;RBI=0.0427792;REFB=0.00363829;REVB=0.0392604;RO=43;SAF=10;SAR=22;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166432;STB=0.597135;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.00248904;OID=.;OPOS=150931268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:45:32:32:0.415584:22:10:20:23:22:10:21:24 chr7 150933578 . G A 487.57 PASS AF=0.522222;AO=46;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0428748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.091;QD=21.67;RBI=0.0429603;REFB=-0.0158515;REVB=-0.00270883;RO=43;SAF=30;SAR=16;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149484;STB=0.586032;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0160219;OID=.;OPOS=150933578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:43:46:47:0.522222:16:30:21:22:16:31:21:22 chr7 150934975 . C G 355.29 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0137791;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=330.908;QD=16.1495;RBI=0.0169296;REFB=-0.0135898;REVB=-0.00983617;RO=49;SAF=24;SAR=14;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206521;STB=0.519074;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0172175;OID=.;OPOS=150934975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:49:50:38:38:0.431818:14:24:30:19:14:24:30:20 chr7 150972189 . G A 1850.24 PASS AF=0.888889;AO=137;DP=154;FAO=136;FDP=153;FR=.;FRO=17;FSAF=71;FSAR=65;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.0818136;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5001;QD=48.3722;RBI=0.0819834;REFB=-0.042669;REVB=0.00527335;RO=9;SAF=71;SAR=66;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565442;STB=0.553451;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0119071;OID=.;OPOS=150972189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:154:153:9:17:137:136:0.888889:66:71:9:0:65:71:17:0 chr7 151049231 . C T 888.62 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000546356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.773;QD=56.4202;RBI=0.00149667;REFB=-0.0836973;REVB=0.00139338;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000370207;OID=.;OPOS=151049231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:31:31:0:0:31:31:0:1 chr7 151064064 . C T 449.09 PASS AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.017933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.486;QD=21.3851;RBI=0.0182986;REFB=-0.0153264;REVB=0.00363984;RO=39;SAF=20;SAR=24;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828315;STB=0.550638;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0115747;OID=.;OPOS=151064064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:40:44:44:0.52381:24:20:14:25:24:20:14:26 chr7 151074296 . A G 251.92 PASS AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0102428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.251;QD=27.235;RBI=0.0450059;REFB=0.00509074;REVB=-0.0438249;RO=14;SAF=17;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32968;STB=0.68325;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00132332;OID=.;OPOS=151074296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:6:17:4:10:6:17:4:10 chr7 151097323 . A G 872.8 PASS AF=0.431818;AO=95;DP=218;FAO=95;FDP=220;FR=.;FRO=125;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=82;FWDB=-0.0115734;FXX=0.0090086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.377;QD=15.869;RBI=0.0287631;REFB=-0.00832789;REVB=-0.0263319;RO=121;SAF=44;SAR=51;SRF=42;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119031;STB=0.568749;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0109278;OID=.;OPOS=151097323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:220:121:125:95:95:0.431818:51:44:42:79:51:44:43:82 chr7 151106066 . C T 1007.1 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00391202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.168;QD=59.2413;RBI=0.0409676;REFB=0;REVB=0.0407804;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.50629e-05;OID=.;OPOS=151106066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:33:33:0:0:35:33:0:0 chr7 151168534 . G A 888.47 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000770286;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.644;QD=58.26;RBI=0.00643666;REFB=0;REVB=0.0063904;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16887e-06;OID=.;OPOS=151168534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0 chr7 151504499 . G A 492.41 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00898683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4019;QD=20.0981;RBI=0.0096495;REFB=-0.0191552;REVB=-0.00351422;RO=50;SAF=28;SAR=20;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219714;STB=0.51219;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0177;OID=.;OPOS=151504499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:50:50:48:48:0.489796:20:28:28:22:20:28:28:22 chr7 151597368 . G A 95.97 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00903015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1419;QD=11.9966;RBI=0.00907254;REFB=-0.0666658;REVB=0.000876012;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886344;STB=0.552543;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.117271;OID=.;OPOS=151597368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:10:10:7:5:10:10 chr7 151613438 . G A 371.47 PASS AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0181;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.306;QD=25.1841;RBI=0.0278496;REFB=-0.0135044;REVB=-0.0211658;RO=23;SAF=16;SAR=20;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069607;STB=0.503815;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0107736;OID=.;OPOS=151613438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:20:16:10:13:20:16:10:13 chr7 151680175 . C T 1348.25 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137928;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.43;QD=62.7094;RBI=0.029102;REFB=0;REVB=0.0256259;RO=0;SAF=30;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10353e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037312;OID=.;OPOS=151680175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:56:30:0:0:56:30:0:0 chr7 151722338 . G A 1276.95 PASS AF=0.508197;AO=124;DP=244;FAO=124;FDP=244;FR=.;FRO=120;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=62;FSRR=58;FWDB=0.0121258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.19;QD=20.9336;RBI=0.0160374;REFB=-0.00832785;REVB=0.0104958;RO=120;SAF=66;SAR=58;SRF=62;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140354;STB=0.507691;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.00930635;OID=.;OPOS=151722338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:120:120:124:124:0.508197:58:66:62:58:58:66:62:58 chr7 151722388 . A G 1216.42 PASS AF=0.497925;AO=115;DP=237;FAO=120;FDP=241;FR=.;FRO=121;FSAF=60;FSAR=60;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=0.00357003;FXX=0.0163259;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.79;QD=20.1896;RBI=0.00972881;REFB=-0.0120605;REVB=0.00905012;RO=120;SAF=58;SAR=57;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117731;STB=0.506223;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0100102;OID=.;OPOS=151722388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:241:120:121:115:120:0.497925:57:58:59:61:60:60:59:62 chr7 151766087 . G T 279.54 PASS AF=0.318966;AO=37;DP=116;FAO=37;FDP=116;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.0300864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9817;QD=9.63941;RBI=0.0482358;REFB=-0.0100029;REVB=-0.0377029;RO=79;SAF=19;SAR=18;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141583;STB=0.582129;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0294646;OID=.;OPOS=151766087;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:79:79:37:37:0.318966:18:19:31:48:18:19:31:48 chr7 151859683 . G A 689.84 PASS AF=0.45679;AO=73;DP=160;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=0.0070263;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.33;QD=17.0331;RBI=0.096191;REFB=-0.00987277;REVB=0.095934;RO=85;SAF=43;SAR=30;SRF=53;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348044;STB=0.511865;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0122497;OID=.;OPOS=151859683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:162:85:88:73:74:0.45679:30:43:53:32:31:43:53:35 chr7 151945007 . C T 1160.16 PASS AF=0.458955;AO=123;DP=268;FAO=123;FDP=268;FR=.;FRO=145;FSAF=121;FSAR=2;FSRF=135;FSRR=10;FWDB=-0.0100058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.165;QD=17.3159;RBI=0.106152;REFB=-0.00737677;REVB=-0.105679;RO=145;SAF=121;SAR=2;SRF=135;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415544;STB=0.739251;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0084914;OID=.;OPOS=151945007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:145:145:123:123:0.458955:2:121:135:10:2:121:135:10 chr7 151945012 . GAAAAT GAAA,GAAAT 79.26 PASS AF=0.157509,0;AO=46,44;DP=276;FAO=43,0;FDP=273;FR=.;FRO=230;FSAF=33,0;FSAR=10,0;FSRF=229;FSRR=1;FWDB=-0.108764,-0.173405;FXX=0.0108692;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=22.7949,12.4884;QD=1.16125;RBI=0.109963,0.177697;REFB=-0.0435786,-0.0506391;REVB=0.016194,0.0388204;RO=169;SAF=36,44;SAR=10,0;SRF=168;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.368573,0.368573;SSSB=-0.618718,0.677915;STB=0.878257,0.5;STBP=0.157,1;TYPE=del,del;VARB=0.163286,0;OID=.,.;OPOS=151945016,151945013;OREF=AT,A;OALT=-,-;OMAPALT=GAAA,GAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.157509,0:46,44:276:43,0:273:230:33,0:10,0:229:1:77:169:36,44:10,0:168:1 chr7 151945051 . A G 89.36 PASS AF=0.0689655;AO=44;DP=635;FAO=44;FDP=638;FR=.;FRO=594;FSAF=8;FSAR=36;FSRF=309;FSRR=285;FWDB=0.0015204;FXX=0.00156492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.521;QD=0.560258;RBI=0.0454004;REFB=0.000132415;REVB=-0.045375;RO=553;SAF=8;SAR=36;SRF=291;SRR=262;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389874;STB=0.816165;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00343637;OID=.;OPOS=151945051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:635:638:553:594:44:44:0.0689655:36:8:291:262:36:8:309:285 chr7 151945071 . G GT 459.64 PASS AF=0.230519;AO=136;DP=634;FAO=142;FDP=616;FR=.;FRO=474;FSAF=66;FSAR=76;FSRF=221;FSRR=253;FWDB=0.0748894;FXX=0.0143998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.2188;QD=2.98465;RBI=0.100363;REFB=0.0103998;REVB=-0.0668161;RO=491;SAF=64;SAR=72;SRF=230;SRR=261;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00278869;STB=0.501126;STBP=0.981;TYPE=ins;VARB=-0.0349655;OID=.;OPOS=151945072;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.230519:136:634:142:616:474:66:76:221:253:99:491:64:72:230:261 chr7 151945101 . G C 125.74 PASS AF=0.0867159;AO=46;DP=541;FAO=47;FDP=542;FR=.;FRO=495;FSAF=9;FSAR=38;FSRF=242;FSRR=253;FWDB=0.00248657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.652;QD=0.927968;RBI=0.0308035;REFB=-0.00262743;REVB=0.030703;RO=494;SAF=9;SAR=37;SRF=241;SRR=253;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355611;STB=0.784443;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0260189;OID=.;OPOS=151945101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:541:542:494:495:46:47:0.0867159:37:9:241:253:38:9:242:253 chr7 151945140 . C T 767.56 PASS AF=0.297376;AO=102;DP=343;FAO=102;FDP=343;FR=.;FRO=241;FSAF=62;FSAR=40;FSRF=107;FSRR=134;FWDB=-0.0422862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9683;QD=8.95111;RBI=0.0485669;REFB=-0.0186943;REVB=-0.0238876;RO=240;SAF=62;SAR=40;SRF=107;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195519;STB=0.614748;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0458207;OID=.;OPOS=151945140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:343:240:241:102:102:0.297376:40:62:107:133:40:62:107:134 chr7 151945167 . G T 882.33 PASS AF=0.450237;AO=95;DP=212;FAO=95;FDP=211;FR=.;FRO=116;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=64;FWDB=0.00737384;FXX=0.00471676;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.334;QD=16.7266;RBI=0.009677;REFB=-0.00633852;REVB=-0.00626664;RO=116;SAF=55;SAR=40;SRF=52;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129752;STB=0.571985;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00739435;OID=.;OPOS=151945167;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:116:116:95:95:0.450237:40:55:52:64:40:55:52:64 chr7 151945204 . G A 203.07 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0323531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3918;QD=12.307;RBI=0.0602758;REFB=-0.0112554;REVB=0.0508571;RO=41;SAF=18;SAR=7;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290705;STB=0.668234;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.020959;OID=.;OPOS=151945204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:7:18:19:22:7:18:19:22 chr7 151962176 . T A 60.87 PASS AF=0.103659;AO=16;DP=163;FAO=17;FDP=164;FR=.;FRO=147;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=54;FSRR=93;FWDB=-0.00110032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.666;QD=1.48463;RBI=0.0328088;REFB=-0.00464666;REVB=-0.0327904;RO=147;SAF=7;SAR=9;SRF=54;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872538;STB=0.54165;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0393727;OID=.;OPOS=151962176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:163:164:147:147:16:17:0.103659:9:7:54:93:10:7:54:93 chr7 151970797 . A T 122.01 PASS AF=0.0955882;AO=39;DP=407;FAO=39;FDP=408;FR=.;FRO=369;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=199;FSRR=170;FWDB=0.0015886;FXX=0.00244493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.463;QD=1.1962;RBI=0.0205519;REFB=-0.00141387;REVB=-0.0204904;RO=366;SAF=25;SAR=14;SRF=196;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130323;STB=0.594573;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0201703;OID=.;OPOS=151970797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:407:408:366:369:39:39:0.0955882:14:25:196:170:14:25:199:170 chr7 151970856 . T A 3169.42 PASS AF=0.669975;AO=268;DP=402;FAO=270;FDP=403;FR=.;FRO=133;FSAF=137;FSAR=133;FSRF=69;FSRR=64;FWDB=-0.00735381;FXX=0.00493815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.284;QD=31.4583;RBI=0.00755891;REFB=-0.0174717;REVB=0.00174887;RO=132;SAF=136;SAR=132;SRF=69;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941119;STB=0.50376;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00507013;OID=.;OPOS=151970856;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:403:132:133:268:270:0.669975:132:136:69:63:133:137:69:64 chr7 151970859 . C T 100.29 PASS AF=0.0868486;AO=35;DP=404;FAO=35;FDP=403;FR=.;FRO=368;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=192;FSRR=176;FWDB=-0.00950794;FXX=0.00247519;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.705;QD=0.995388;RBI=0.0156235;REFB=-0.00234481;REVB=-0.0123973;RO=362;SAF=15;SAR=20;SRF=191;SRR=171;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117017;STB=0.584698;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0243499;OID=.;OPOS=151970859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:403:362:368:35:35:0.0868486:20:15:191:171:20:15:192:176 chr7 151970931 . G A 147.75 PASS AF=0.190141;AO=24;DP=142;FAO=27;FDP=142;FR=.;FRO=115;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=58;FSRR=57;FWDB=-0.0368987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5755;QD=4.16198;RBI=0.0453149;REFB=0.00330159;REVB=-0.0263045;RO=118;SAF=11;SAR=13;SRF=58;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424226;STB=0.578861;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0110781;OID=.;OPOS=151970931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:118:115:24:27:0.190141:13:11:58:60:16:11:58:57 chr7 152099906 . T A 845.21 PASS AF=0.701031;AO=68;DP=97;FAO=68;FDP=97;FR=.;FRO=29;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0175669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.123;QD=34.8539;RBI=0.0276686;REFB=-0.0291325;REVB=0.0213765;RO=29;SAF=36;SAR=32;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510504;STB=0.527464;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0109843;OID=.;OPOS=152099906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:29:29:68:68:0.701031:32:36:18:11:32:36:18:11 chr7 152099917 . G A 845.19 PASS AF=0.701031;AO=68;DP=97;FAO=68;FDP=97;FR=.;FRO=29;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00529478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.488;QD=34.8534;RBI=0.0112707;REFB=-0.00633579;REVB=-0.00994952;RO=29;SAF=38;SAR=30;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350059;STB=0.518833;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00314453;OID=.;OPOS=152099917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:29:29:68:68:0.701031:30:38:18:11:30:38:18:11 chr7 152099924 . T C 845.2 PASS AF=0.701031;AO=68;DP=97;FAO=68;FDP=97;FR=.;FRO=29;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0138596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.558;QD=34.8537;RBI=0.0138607;REFB=-0.00605293;REVB=-0.000177596;RO=29;SAF=37;SAR=31;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430489;STB=0.52316;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00219025;OID=.;OPOS=152099924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:29:29:68:68:0.701031:31:37:18:11:31:37:18:11 chr7 152099948 . C A 57.1 PASS AF=0.129032;AO=12;DP=93;FAO=12;FDP=93;FR=.;FRO=81;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=-0.0285369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.245;QD=2.45602;RBI=0.0319504;REFB=-0.003356;REVB=-0.0143692;RO=81;SAF=8;SAR=4;SRF=44;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156457;STB=0.611749;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0261388;OID=.;OPOS=152099948;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:93:93:81:81:12:12:0.129032:4:8:44:37:4:8:44:37 chr7 154379725 . G A 56.3 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00245085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.004;QD=11.26;RBI=0.00951019;REFB=-0.0138635;REVB=-0.00918896;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192383;STB=0.617332;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0190051;OID=.;OPOS=154379725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:5:7:6:2:5:7 chr7 154429560 . C T 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00491825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.488;QD=61.8526;RBI=0.0131639;REFB=0;REVB=0.0122106;RO=0;SAF=32;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17159e-05;OID=.;OPOS=154429560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:51:32:0:0:51:32:0:0 chr7 154461112 . A G 2316.4 PASS AF=0.993197;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=92;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0069772;FXX=0.0067563;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.5436;QD=63.0314;RBI=0.0369977;REFB=-0.108246;REVB=0.0363338;RO=0;SAF=92;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502702;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00123464;OID=.;OPOS=154461112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:148:147:0:1:146:146:0.993197:54:92:0:0:54:92:1:0 chr7 154667628 . A G 175.24 PASS AF=0.328571;AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.00399794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4445;QD=10.0134;RBI=0.00718129;REFB=-0.0124201;REVB=0.00596553;RO=47;SAF=7;SAR=16;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197945;STB=0.511618;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00623835;OID=.;OPOS=154667628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:47:47:23:23:0.328571:16:7:15:32:16:7:15:32 chr7 154672662 . C T 470.26 PASS AF=0.711864;AO=42;DP=59;FAO=42;FDP=59;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00892416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.867;QD=31.8817;RBI=0.00993306;REFB=-0.0496925;REVB=0.00436177;RO=17;SAF=13;SAR=29;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471818;STB=0.525493;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.020472;OID=.;OPOS=154672662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:17:17:42:42:0.711864:29:13:4:13:29:13:4:13 chr7 154679447 . G A 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1945;QD=64.0212;RBI=0.0166913;REFB=0;REVB=0.000678061;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.90658e-05;OID=.;OPOS=154679447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:52:46:0:0:52:46:0:0 chr7 154680972 . G A 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0145099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.601;QD=15.6454;RBI=0.0155191;REFB=-7.27435e-05;REVB=-0.00550489;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411415;STB=0.523445;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.000226157;OID=.;OPOS=154680972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:10:12:17:12:10:12:17:12 chr7 154681050 . C T 373.34 PASS AF=0.660377;AO=35;DP=53;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0153622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.089;QD=28.1767;RBI=0.0166677;REFB=-0.00772257;REVB=0.00646653;RO=18;SAF=21;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985658;STB=0.553815;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00374056;OID=.;OPOS=154681050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:18:18:35:35:0.660377:14:21:8:10:14:21:8:10 chr7 154681216 . G A 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00463868;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=341.11;QD=17.8275;RBI=0.0116125;REFB=-0.000549186;REVB=0.0106458;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321591;STB=0.518487;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.000461213;OID=.;OPOS=154681216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:6:5:5:7:6:5 chr7 154685612 . G T 135.79 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0200963;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1463;QD=15.9756;RBI=0.0270287;REFB=-0.00911662;REVB=0.0180745;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128581;STB=0.555483;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00973711;OID=.;OPOS=154685612;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:18:19:15:15:0.441176:7:8:12:6:7:8:12:7 chr7 154760369 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.92;QD=48.7372;RBI=0.064455;REFB=0;REVB=-0.0606009;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000627395;OID=.;OPOS=154760369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0 chr7 154785421 . CA C 56.31 PASS AF=0.407407;AO=21;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0918855;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.29197;QD=4.17113;RBI=0.11074;REFB=-0.0525066;REVB=0.061809;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112262;STB=0.574008;STBP=0.387;TYPE=del;VARB=0.0510879;OID=.;OPOS=154785422;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407407:21:54:22:54:32:11:11:12:20:56:25:10:11:9:16 chr7 154989054 . C T 438.14 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00650093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7563;QD=19.0496;RBI=0.0400394;REFB=0.0104802;REVB=-0.0395081;RO=48;SAF=24;SAR=20;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100995;STB=0.556188;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.0198651;OID=.;OPOS=154989054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:48:44:44:0.478261:20:24:21:27:20:24:21:27 chr7 154990003 . C T 244.1 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0124969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9583;QD=18.7768;RBI=0.0135688;REFB=0.0136301;REVB=-0.00528589;RO=26;SAF=3;SAR=23;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343325;STB=0.696786;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.0204488;OID=.;OPOS=154990003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:23:3:9:17:23:3:9:17 chr7 155100685 . G A 705.24 PASS AF=0.486111;AO=69;DP=143;FAO=70;FDP=144;FR=.;FRO=74;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.0250113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.735;QD=19.5899;RBI=0.033711;REFB=-0.0119332;REVB=-0.0226024;RO=74;SAF=45;SAR=24;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148713;STB=0.576424;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0103855;OID=.;OPOS=155100685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:74:74:69:70:0.486111:24:45:37:37:25:45:37:37 chr7 155150390 . T C 293.6 PASS AF=0.525424;AO=30;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0107782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.333;QD=19.9051;RBI=0.0241553;REFB=0.00249688;REVB=-0.0216173;RO=28;SAF=9;SAR=21;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247881;STB=0.642427;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0028861;OID=.;OPOS=155150390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:30:31:0.525424:21:9:16:12:22:9:16:12 chr7 155150472 . G A 218.44 PASS AF=0.4;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00181259;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.113;QD=13.4426;RBI=0.0159899;REFB=-0.0172643;REVB=0.0158868;RO=38;SAF=19;SAR=7;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179983;STB=0.613635;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.019251;OID=.;OPOS=155150472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:65:38:39:26:26:0.4:7:19:22:16:7:19:22:17 chr7 155150560 . A G 1035.98 PASS AF=0.972603;AO=72;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0113105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4403;QD=56.7662;RBI=0.0957211;REFB=0.00250002;REVB=-0.0950505;RO=0;SAF=46;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503939;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00132804;OID=.;OPOS=155150560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:73:0:2:72:71:0.972603:26:46:0:0:26:45:1:1 chr7 155150602 . T C 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000283311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.04;QD=57.8849;RBI=0.0331382;REFB=0;REVB=0.033137;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2095e-05;OID=.;OPOS=155150602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0 chr7 155150765 . C T 195.8 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00406435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.736;QD=17.8003;RBI=0.059939;REFB=-0.00581751;REVB=-0.059801;RO=23;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480678;STB=0.51004;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0127745;OID=.;OPOS=155150765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:24:20:20:0.454545:7:13:16:7:7:13:16:8 chr7 155151018 . G A 314.0 PASS AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0908887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8571;QD=30.6345;RBI=0.106883;REFB=-0.033655;REVB=0.0562418;RO=14;SAF=13;SAR=14;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558847;STB=0.530663;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0225676;OID=.;OPOS=155151018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:14:13:8:6:14:13:8:6 chr7 155151095 . T C 81.44 PASS AF=0.458333;AO=9;DP=22;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.00499503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.609;QD=13.5741;RBI=0.0275709;REFB=-0.0237933;REVB=0.0271147;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1059;STB=0.631371;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0394311;OID=.;OPOS=155151095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:22:24:13:13:9:11:0.458333:2:7:11:2:4:7:11:2 chr7 155151194 . G A 399.01 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0143692;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9766;QD=20.7277;RBI=0.0408811;REFB=-0.0218293;REVB=0.0382726;RO=37;SAF=8;SAR=32;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327906;STB=0.683442;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0336283;OID=.;OPOS=155151194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:37:37:40:40:0.519481:32:8:19:18:32:8:19:18 chr7 155151307 . A G 323.58 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00483852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.835;QD=16.8095;RBI=0.0200006;REFB=-0.00908887;REVB=-0.0194065;RO=42;SAF=11;SAR=24;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472493;STB=0.526567;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00897811;OID=.;OPOS=155151307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:24:11:15:27:24:11:15:27 chr7 155151367 . G T 205.38 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0109374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.055;QD=12.8362;RBI=0.0168831;REFB=-0.0026325;REVB=-0.0128613;RO=39;SAF=16;SAR=9;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192405;STB=0.610597;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0227013;OID=.;OPOS=155151367;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:9:16:18:21:9:16:18:21 chr7 155151369 . C T 205.39 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.000851313;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.198;QD=12.8369;RBI=0.0120409;REFB=-0.00900052;REVB=0.0120107;RO=39;SAF=16;SAR=9;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192405;STB=0.610597;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0100238;OID=.;OPOS=155151369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:9:16:18:21:9:16:18:21 chr7 155151433 . T C 102.73 PASS AF=0.302326;AO=12;DP=42;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0276908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.13;QD=9.55614;RBI=0.0277356;REFB=-0.0256751;REVB=0.00157517;RO=30;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591692;STB=0.503592;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.036622;OID=.;OPOS=155151433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:30:30:12:13:0.302326:7:5:14:16:7:6:14:16 chr7 155151437 . G A 71.37 PASS AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0597188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4125;QD=7.71557;RBI=0.0851429;REFB=-0.00289384;REVB=0.0606875;RO=27;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181305;STB=0.612679;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0123954;OID=.;OPOS=155151437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:4:6:12:15:4:6:12:15 chr7 155503920 . A T 1030.28 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132792;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4953;QD=59.7262;RBI=0.132978;REFB=0;REVB=-0.00703702;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126729;OID=.;OPOS=155503920;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:44:23:0:0:46:23:0:0 chr7 155755826 . A G 268.54 PASS AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0200662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.768;QD=13.9501;RBI=0.0388428;REFB=-0.0184287;REVB=-0.0332582;RO=45;SAF=17;SAR=14;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153568;STB=0.592964;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0306432;OID=.;OPOS=155755826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:46:31:31:0.402597:14:17:18:27:14:17:18:28 chr7 155757502 . T C 902.7 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.505;QD=58.239;RBI=0.0372773;REFB=0;REVB=0.0216667;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192415;OID=.;OPOS=155757502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0 chr7 156468559 . T C 168.01 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00858471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.372;QD=16.3909;RBI=0.018272;REFB=-0.0141571;REVB=0.0161297;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281921;STB=0.622506;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0243607;OID=.;OPOS=156468559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:23:18:18:0.439024:11:7:14:6:11:7:14:9 chr7 156469123 . G A 1267.91 PASS AF=0.498084;AO=126;DP=256;FAO=130;FDP=261;FR=.;FRO=131;FSAF=43;FSAR=87;FSRF=51;FSRR=80;FWDB=0.0305248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.419;QD=19.4316;RBI=0.0306602;REFB=-0.0117894;REVB=0.00287861;RO=130;SAF=40;SAR=86;SRF=50;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694709;STB=0.532451;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0082936;OID=.;OPOS=156469123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:261:130:131:126:130:0.498084:86:40:50:80:87:43:51:80 chr7 156469190 . A G 671.68 PASS AF=0.592593;AO=64;DP=108;FAO=64;FDP=108;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.00741193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.82;QD=24.8769;RBI=0.0105472;REFB=-0.02379;REVB=0.0075038;RO=43;SAF=36;SAR=28;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156925;STB=0.58062;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0163771;OID=.;OPOS=156469190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:43:44:64:64:0.592593:28:36:15:28:28:36:16:28 chr7 156518192 . G A 462.79 PASS AF=0.474227;AO=45;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.00227388;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.411;QD=19.0841;RBI=0.0124829;REFB=-0.0131594;REVB=-0.012274;RO=51;SAF=19;SAR=26;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489773;STB=0.522114;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0132741;OID=.;OPOS=156518192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:51:51:45:46:0.474227:26:19:19:32:27:19:19:32 chr7 156518195 . G A 478.08 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.012976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.048;QD=19.7147;RBI=0.0219133;REFB=-0.0206167;REVB=-0.0176583;RO=50;SAF=19;SAR=28;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234924;STB=0.513038;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.01359;OID=.;OPOS=156518195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:28:19:19:31:28:19:19:31 chr7 156554830 . T C 370.18 PASS AF=0.632653;AO=31;DP=49;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00390238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.186;QD=30.2187;RBI=0.0101864;REFB=-0.0139768;REVB=-0.00940931;RO=18;SAF=17;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697064;STB=0.538234;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00785261;OID=.;OPOS=156554830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:18:18:31:31:0.632653:14:17:8:10:14:17:8:10 chr7 156664783 . C T 298.32 PASS AF=0.65;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0402355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.687;QD=29.832;RBI=0.0410825;REFB=-0.0138555;REVB=-0.00829922;RO=14;SAF=10;SAR=16;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185558;STB=0.510196;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00933127;OID=.;OPOS=156664783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:14:14:26:26:0.65:16:10:5:9:16:10:5:9 chr7 156664907 . T A 116.82 PASS AF=0.684211;AO=12;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00217012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.745;QD=24.5938;RBI=0.0032643;REFB=-0.0131667;REVB=-0.0024385;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157135;STB=0.594902;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00281867;OID=.;OPOS=156664907;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:19:19:6:6:12:13:0.684211:7:5:1:5:7:6:1:5 chr7 156761818 . G A 234.83 PASS AF=0.411765;AO=27;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00103657;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.934;QD=13.8137;RBI=0.0163754;REFB=-0.00353201;REVB=-0.0163425;RO=36;SAF=6;SAR=21;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368187;STB=0.719457;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00540406;OID=.;OPOS=156761818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:40:27:28:0.411765:21:6:20:16:22:6:22:18 chr7 156762224 . G C 304.07 PASS AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0017963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1712;QD=14.8325;RBI=0.0203325;REFB=-0.0188688;REVB=-0.020253;RO=48;SAF=14;SAR=20;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176561;STB=0.599941;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0210444;OID=.;OPOS=156762224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:20:14:28:20:20:14:28:20 chr7 156762248 . G A 447.12 PASS AF=0.463918;AO=44;DP=97;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00305375;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.986;QD=18.4379;RBI=0.00434235;REFB=0.00085158;REVB=-0.00308717;RO=52;SAF=19;SAR=25;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851805;STB=0.540212;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.000901147;OID=.;OPOS=156762248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:52:52:44:45:0.463918:25:19:27:25:25:20:27:25 chr7 157015900 . C T 389.9 PASS AF=0.431579;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00850048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.003;QD=16.417;RBI=0.057592;REFB=-0.0133684;REVB=-0.0569612;RO=54;SAF=24;SAR=17;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308257;STB=0.517342;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0250296;OID=.;OPOS=157015900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:54:54:41:41:0.431579:17:24:30:24:17:24:30:24 chr7 157061474 . T C 242.46 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0132849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.302;QD=14.9204;RBI=0.0188461;REFB=-0.000285901;REVB=0.0133674;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107652;STB=0.561156;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.000601064;OID=.;OPOS=157061474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:18:10:17:20:18:10:17:20 chr7 157162068 . T C 430.17 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0139027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.022;QD=22.6405;RBI=0.0142075;REFB=-8.28588e-05;REVB=-0.00292719;RO=33;SAF=20;SAR=22;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907663;STB=0.55553;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000205772;OID=.;OPOS=157162068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:34:42:42:0.552632:22:20:12:21:22:20:12:22 chr7 157162103 . A G 482.58 PASS AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0264341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.372;QD=23.257;RBI=0.0264685;REFB=-0.00655349;REVB=0.00134884;RO=36;SAF=17;SAR=29;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629797;STB=0.529594;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00894398;OID=.;OPOS=157162103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:36:37:46:46:0.554217:29:17:16:20:29:17:16:21 chr7 157319423 . G C 179.11 PASS AF=0.3;AO=24;DP=80;FAO=24;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0573076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.631;QD=8.95542;RBI=0.0584252;REFB=-0.00384566;REVB=-0.011373;RO=55;SAF=16;SAR=8;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191971;STB=0.608603;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0104896;OID=.;OPOS=157319423;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:55:56:24:24:0.3:8:16:28:27:8:16:29:27 chr7 157331828 . G T 95.67 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00129472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.59;QD=11.5967;RBI=0.0178976;REFB=-0.0014137;REVB=-0.0178507;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938032;STB=0.555466;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00296949;OID=.;OPOS=157331828;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:7:5:7:14:7:5:7:14 chr7 157414097 . C T 735.81 PASS AF=0.623853;AO=68;DP=109;FAO=68;FDP=109;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00509513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.425;QD=27.0024;RBI=0.00621941;REFB=-0.0180262;REVB=-0.00356662;RO=40;SAF=30;SAR=38;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142122;STB=0.57233;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00933605;OID=.;OPOS=157414097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:40:41:68:68:0.623853:38:30:26:14:38:30:26:15 chr7 157903538 . A G 268.37 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00165119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8937;QD=22.3642;RBI=0.0285155;REFB=-0.0159949;REVB=-0.0284677;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200566;STB=0.620596;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0461462;OID=.;OPOS=157903538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:23:25:25:0.520833:11:14:7:15:11:14:7:16 chr7 157931119 . A G 598.5 PASS AF=0.469697;AO=62;DP=132;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=-0.0123983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.363;QD=18.1362;RBI=0.0218692;REFB=-0.0187189;REVB=-0.0180151;RO=69;SAF=26;SAR=36;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707582;STB=0.542204;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0193672;OID=.;OPOS=157931119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:69:70:62:62:0.469697:36:26:24:45:36:26:24:46 chr7 157931144 . C T 425.61 PASS AF=0.404959;AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=0.039999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.392;QD=14.0697;RBI=0.0432089;REFB=-0.0386752;REVB=0.0163427;RO=65;SAF=26;SAR=23;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163145;STB=0.616109;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0108456;OID=.;OPOS=157931144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:72:49:49:0.404959:23:26:24:41:23:26:24:48 chr7 157959620 . C T 323.74 PASS AF=0.72973;AO=27;DP=37;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0104646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.284;QD=34.999;RBI=0.0125887;REFB=-0.0226731;REVB=0.00699763;RO=9;SAF=16;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120119;STB=0.579418;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00955407;OID=.;OPOS=157959620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:37:9:10:27:27:0.72973:11:16:3:6:11:16:3:7 chr7 157959636 . G A 670.98 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00070264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.391;QD=62.4165;RBI=0.0856863;REFB=0;REVB=0.0856834;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285107;OID=.;OPOS=157959636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:20:22:0:0:21:22:0:0 chr7 157959879 . C T 332.8 PASS AF=0.48;AO=28;DP=76;FAO=36;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0196033;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.442;QD=17.7492;RBI=0.0197787;REFB=-0.0307404;REVB=-0.00262847;RO=38;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142247;STB=0.517232;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0538135;OID=.;OPOS=157959879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:38:39:28:36:0.48:13:15:15:23:21:15:15:24 chr7 157959895 . C T 308.26 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0255574;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7619;QD=18.133;RBI=0.0318305;REFB=-0.00846621;REVB=0.0189736;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502536;STB=0.528042;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00825343;OID=.;OPOS=157959895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:35:35:33:33:0.485294:19:14:13:22:19:14:13:22 chr7 157959911 . A G 733.84 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9052;QD=55.3841;RBI=0.0719169;REFB=0;REVB=0.0417569;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400704;OID=.;OPOS=157959911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:53:0:0:48:53:1:30:18:0:0:33:20:0:0 chr7 157985149 . C G 231.97 PASS AF=0.536585;AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00705695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5017;QD=22.6316;RBI=0.0700924;REFB=-0.036597;REVB=0.0697363;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190413;STB=0.601716;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0333201;OID=.;OPOS=157985149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:18:19:21:22:0.536585:7:14:8:10:8:14:8:11 chr7 158263331 . T C 298.96 PASS AF=0.923077;AO=21;DP=24;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0143601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5836;QD=45.9938;RBI=0.026212;REFB=0.104395;REVB=0.0219284;RO=2;SAF=10;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0038199;STB=0.503223;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.00443527;OID=.;OPOS=158263331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:24:26:2:2:21:24:0.923077:11:10:1:1:11:13:1:1 chr7 158263336 . G C 358.59 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.246;QD=55.1676;RBI=0.0407967;REFB=0;REVB=0.0355122;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73531e-05;OID=.;OPOS=158263336;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:12:14:0:0 chr7 158263344 . T A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.67;QD=55.0985;RBI=0.0258959;REFB=0;REVB=-0.00329267;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193897;OID=.;OPOS=158263344;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr7 158384305 . CTGTG C 242.95 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.000977059;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=297.115;QD=22.6;RBI=0.0112017;REFB=-0.0153726;REVB=0.011159;RO=20;SAF=6;SAR=17;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340775;STB=0.691475;STBP=0.014;TYPE=del;VARB=0.0160088;OID=.;OPOS=158384306;OREF=TGTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.534884:23:43:23:43:20:6:17:13:7:99:20:6:17:13:7 chr7 158524504 . G A 294.53 PASS AF=0.428571;AO=32;DP=76;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00458757;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.433;QD=15.3;RBI=0.00712776;REFB=-0.0044146;REVB=-0.0054552;RO=42;SAF=16;SAR=16;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239129;STB=0.53457;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0106523;OID=.;OPOS=158524504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:42:44:32:33:0.428571:16:16:20:22:16:17:20:24 chr7 158526495 . G A 298.64 PASS AF=0.322314;AO=39;DP=121;FAO=39;FDP=121;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00925359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.335;QD=9.87241;RBI=0.0412257;REFB=-0.00139761;REVB=-0.0401738;RO=82;SAF=17;SAR=22;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103323;STB=0.560003;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00365395;OID=.;OPOS=158526495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:82:82:39:39:0.322314:22:17:43:39:22:17:43:39 chr7 158526880 . G A 156.83 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.00813506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1265;QD=11.4058;RBI=0.011293;REFB=-0.0224051;REVB=-0.00783286;RO=31;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670029;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0842514;OID=.;OPOS=158526880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:35:20:20:0.363636:16:4:5:26:16:4:7:28 chr7 158528233 . A G 249.14 PASS AF=0.357143;AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0213111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2254;QD=11.8636;RBI=0.0214684;REFB=-0.0133784;REVB=-0.00259352;RO=53;SAF=8;SAR=22;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268898;STB=0.651461;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0212219;OID=.;OPOS=158528233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:53:54:30:30:0.357143:22:8:26:27:22:8:26:28 chr7 158534381 . G C 39.28 PASS AF=0.375;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0254924;FXX=0.0587889;HRUN=5;LEN=1;MLLD=203.784;QD=9.81996;RBI=0.0419482;REFB=-0.0199173;REVB=-0.0333136;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631528;STB=0.624609;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0350675;OID=.;OPOS=158534381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:17:16:7:10:6:6:0.375:3:3:4:3:3:3:7:3 chr7 158536267 . T C 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0236302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.269;QD=16.6152;RBI=0.04331;REFB=-0.0154932;REVB=-0.0362956;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407305;STB=0.523337;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0153068;OID=.;OPOS=158536267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:8:9:12:9:8:9:12:9 chr7 158536334 . G A 111.36 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0116757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.542;QD=15.9078;RBI=0.0135658;REFB=-0.0221843;REVB=0.0069072;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00477241;STB=0.502758;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0210779;OID=.;OPOS=158536334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:7:6:7:8:7:6:7:8 chr7 158536345 . A G 102.91 PASS AF=0.448276;AO=11;DP=27;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0234204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.3998;QD=14.1942;RBI=0.0836679;REFB=-0.0570501;REVB=-0.0803231;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172723;STB=0.530339;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0821779;OID=.;OPOS=158536345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:29:16:16:11:13:0.448276:6:5:7:9:8:5:7:9 chr7 158536376 . A C 66.77 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0356213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.744;QD=12.7171;RBI=0.0368274;REFB=-0.0261194;REVB=0.00934756;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163174;STB=0.531844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.02718;OID=.;OPOS=158536376;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:8:12:9:9:0.428571:5:4:2:6:5:4:6:6 chr7 158536388 . A C 68.08 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0287249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.916;QD=14.3336;RBI=0.0374662;REFB=0.00447604;REVB=-0.024054;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138165;STB=0.581216;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00771006;OID=.;OPOS=158536388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:6:4:5:4:6:4 chr7 158536408 . T C 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0102556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277;QD=16.3859;RBI=0.0261081;REFB=-0.036918;REVB=0.0240095;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144653;STB=0.58423;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.032445;OID=.;OPOS=158536408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:5:3:5:4:5:3 chr7 158536411 . T C 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0210666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.573;QD=16.3859;RBI=0.0454672;REFB=-0.0650701;REVB=0.0402922;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144653;STB=0.58423;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0163077;OID=.;OPOS=158536411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:5:3:5:4:5:3 chr7 158672476 . C G 417.96 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0258209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.01;QD=53.931;RBI=0.0339863;REFB=-0.096594;REVB=0.0220987;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510197;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00267536;OID=.;OPOS=158672476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:24:6:0:0:24:6:0:1 chr7 158672619 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.075;QD=55.0974;RBI=0.0207781;REFB=0;REVB=-0.0121148;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40738e-05;OID=.;OPOS=158672619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr7 158715219 . A G 1190.29 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.08859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.8117;QD=61.0407;RBI=0.0912217;REFB=0;REVB=0.0217536;RO=0;SAF=29;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000370208;OID=.;OPOS=158715219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:49:29:0:0:49:29:0:0 chr7 158719084 . C T 782.19 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.237;QD=56.8866;RBI=0.0166738;REFB=0;REVB=-0.000847351;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53899e-05;OID=.;OPOS=158719084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:25:28:0:0:26:29:0:0 chr7 158851234 . T G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.515;QD=53.9112;RBI=0.0325883;REFB=0;REVB=0.0323828;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73282e-05;OID=.;OPOS=158851234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr7 158896517 . G A 457.55 PASS AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0125557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6719;QD=20.5642;RBI=0.0277186;REFB=-0.0399213;REVB=-0.0247118;RO=44;SAF=29;SAR=16;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154401;STB=0.585668;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0286023;OID=.;OPOS=158896517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:44:44:45:45:0.505618:16:29:21:23:16:29:21:23 chr8 195254 . C A 521.61 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0018667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.456;QD=23.4432;RBI=0.0175365;REFB=-0.0147727;REVB=-0.0174369;RO=40;SAF=28;SAR=21;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794658;STB=0.543671;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0106039;OID=.;OPOS=195254;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:40:40:49:49:0.550562:21:28:19:21:21:28:19:21 chr8 196274 . T G 322.98 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0524726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9297;QD=21.8968;RBI=0.0548909;REFB=0.022991;REVB=-0.0161133;RO=26;SAF=13;SAR=20;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14145;STB=0.577733;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.0204001;OID=.;OPOS=196274;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:20:13:6:20:20:13:6:20 chr8 363192 . G A 304.86 PASS AF=0.358491;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=106;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0125306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.726;QD=11.5042;RBI=0.0155547;REFB=-0.0111538;REVB=-0.00921588;RO=67;SAF=22;SAR=16;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637432;STB=0.541686;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.018987;OID=.;OPOS=363192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:67:68:38:38:0.358491:16:22:35:32:16:22:35:33 chr8 577101 . A G 321.2 PASS AF=0.492754;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00135505;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.39;QD=18.6203;RBI=0.0345747;REFB=-0.000248383;REVB=-0.0345481;RO=35;SAF=18;SAR=16;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647313;STB=0.550745;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-1.76502e-05;OID=.;OPOS=577101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:35:35:34:34:0.492754:16:18:21:14:16:18:22:13 chr8 607766 . C G 728.07 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8698;QD=63.3101;RBI=0.049785;REFB=0;REVB=0.00726068;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000822071;OID=.;OPOS=607766;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:21:24:0:0:21:25:0:0 chr8 608018 . C T 339.88 PASS AF=0.818182;AO=27;DP=33;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0498034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.195;QD=41.1971;RBI=0.0541321;REFB=-0.0944574;REVB=0.0212109;RO=6;SAF=8;SAR=19;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196397;STB=0.606797;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00233928;OID=.;OPOS=608018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:33:33:6:6:27:27:0.818182:19:8:5:1:19:8:5:1 chr8 608034 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.287;QD=58.5874;RBI=0.0242944;REFB=0;REVB=0.0108262;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93234e-05;OID=.;OPOS=608034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0 chr8 609879 . AT CC 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00381268;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=142.437;QD=64.1539;RBI=0.0314314;REFB=0;REVB=0.0311993;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.49644e-05;OID=.;OPOS=609879;OREF=AT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0 chr8 618728 . A G 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.633;QD=57.2375;RBI=0.0556;REFB=0;REVB=0.0103655;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255477;OID=.;OPOS=618728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0 chr8 939075 . A AC 54.67 PASS AF=0.605263;AO=4;DP=39;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.244497;FXX=0.0256345;HRUN=0;LEN=1;MLLD=23.5902;QD=5.75495;RBI=0.244673;REFB=-0.027924;REVB=-0.00928003;RO=33;SAF=4;SAR=0;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555261;STB=0.543042;STBP=0.54;TYPE=ins;VARB=0.0536685;OID=.;OPOS=939076;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.605263:4:39:23:38:15:16:7:9:6:50:33:4:0:20:13 chr8 939076 . G C 225.63 PASS AF=0.578947;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0520893;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3817;QD=23.7503;RBI=0.0537605;REFB=-0.00813412;REVB=-0.0133001;RO=16;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357462;STB=0.527002;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0101933;OID=.;OPOS=939076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:16:16:21:22:0.578947:7:14:10:6:7:15:10:6 chr8 943504 . G C 44.06 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0130583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.767;QD=6.52709;RBI=0.0321366;REFB=-0.0126875;REVB=-0.029364;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198932;STB=0.512783;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0348647;OID=.;OPOS=943504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:5:2:6:14:5:2:6:14 chr8 1514009 . C A 295.79 PASS AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0140873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.423;QD=28.8575;RBI=0.0350041;REFB=0.0220227;REVB=-0.0320442;RO=15;SAF=7;SAR=19;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152791;STB=0.584547;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0132789;OID=.;OPOS=1514009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:19:7:7:8:19:7:7:8 chr8 1616718 . A G 182.99 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00355456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.257;QD=17.4275;RBI=0.00719534;REFB=-0.0175611;REVB=0.00625604;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122312;STB=0.569549;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0257348;OID=.;OPOS=1616718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:10:9:8:15:10:9:8:15 chr8 1649960 . G A 725.63 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0816;QD=63.0984;RBI=0.0231959;REFB=0;REVB=0.0192295;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65664e-05;OID=.;OPOS=1649960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0 chr8 1650536 . A AC,C 751.46 PASS AF=0.535714,0.446429;AO=21,30;DP=57;FAO=30,25;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=16,14;FSAR=14,11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010974,0.0145991;FXX=0.0175408;HRUN=1,9;LEN=1,1;MLLD=240.813,237.902;QD=53.6757;RBI=0.0178469,0.0206884;REFB=-0.0167481,-0.0179444;REVB=0.0140742,0.0146587;RO=2;SAF=13,13;SAR=8,17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0200927,-0.00788608;STB=0.515141,0.517228;STBP=0.53,0.505;TYPE=ins,snp;VARB=0.0103237,-0.00574326;OID=.,.;OPOS=1650537,1650536;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:71:57:56:2:1:21,30:30,25:0.535714,0.446429:8,17:13,13:1:1:14,11:16,14:1:0 chr8 1651129 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00730395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.076;QD=60.2306;RBI=0.0256856;REFB=0;REVB=-0.0246252;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163392;OID=.;OPOS=1651129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr8 1817367 . G A 643.9 PASS AF=0.492424;AO=65;DP=131;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0465058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.177;QD=19.5122;RBI=0.0471033;REFB=-0.00415395;REVB=-0.0074785;RO=66;SAF=24;SAR=41;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137052;STB=0.572438;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00373432;OID=.;OPOS=1817367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:66:67:65:65:0.492424:41:24:34:32:41:24:34:33 chr8 1873540 . C T 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00320252;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.994;QD=14.7422;RBI=0.00739491;REFB=-0.0148054;REVB=-0.00666548;RO=24;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262598;STB=0.642682;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0152045;OID=.;OPOS=1873540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:25:17:17:0.404762:5:12:11:13:5:12:12:13 chr8 1905132 . G A 351.59 PASS AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0190257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.061;QD=15.6262;RBI=0.0190998;REFB=-0.0154148;REVB=0.00168034;RO=51;SAF=22;SAR=16;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110653;STB=0.568039;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0158759;OID=.;OPOS=1905132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:52:38:38:0.422222:16:22:24:27:16:22:24:28 chr8 1906630 . G T 1552.59 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111343;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.1;QD=64.0245;RBI=0.0209918;REFB=0;REVB=0.0177956;RO=0;SAF=36;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76228e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60166e-05;OID=.;OPOS=1906630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:61:36:0:0:61:36:0:0 chr8 1953194 . T G 508.41 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.03894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.675;QD=56.49;RBI=0.0422418;REFB=-0.0613676;REVB=0.0163722;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267214;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.000541285;OID=.;OPOS=1953194;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:17:18:0:1:17:18:0:1 chr8 1953223 . C T 774.64 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.145;QD=63.2356;RBI=0.0501218;REFB=0;REVB=0.0475684;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272018;OID=.;OPOS=1953223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:49:0:0:43:49:1:17:26:0:0:23:26:0:0 chr8 1953567 . C A 1501.03 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.734;QD=58.8639;RBI=0.0486634;REFB=0;REVB=0.0216318;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348522;OID=.;OPOS=1953567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:102:0:0:96:102:1:47:49:0:0:48:54:0:0 chr8 1953642 . CAGAG CAG,CAGAA 749.88 PASS AF=0.909091,0.0909091;AO=41,5;DP=52;FAO=50,5;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0;FSAR=25,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200633,0.0113027;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=233.132,212.258;QD=54.5365;RBI=0.0556248,0.050651;REFB=0,0;REVB=0.0518805,0.0493738;RO=0;SAF=21,0;SAR=20,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.02085e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00228759,-0.0290596;OID=.,.;OPOS=1953643,1953646;OREF=AG,G;OALT=-,A;OMAPALT=CAG,CAGAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.909091,0.0909091:41,5:52:50,5:55:0:25,0:25,5:0:0:23:0:21,0:20,5:0:0 chr8 1953759 . A T 802.94 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00633329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4702;QD=55.3755;RBI=0.0285952;REFB=-0.0102402;REVB=0.0278851;RO=1;SAF=21;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021926;STB=0.511624;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0019413;OID=.;OPOS=1953759;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:36:21:1:0:36:21:1:0 chr8 1954237 . G C 1608.25 PASS AF=0.990826;AO=109;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00550942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.129;QD=59.0183;RBI=0.0214961;REFB=-0.0230673;REVB=0.0207781;RO=0;SAF=57;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53715e-08;STB=0.504424;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=2.68673e-05;OID=.;OPOS=1954237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:0:1:109:108:0.990826:52:57:0:0:52:56:1:0 chr8 1954587 . G A 469.27 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118667;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.884;QD=58.6582;RBI=0.100912;REFB=0;REVB=0.100212;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014777;OID=.;OPOS=1954587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0 chr8 2000428 . G T 802.41 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.41;QD=64.1929;RBI=0.068435;REFB=0;REVB=0.0364864;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368219;OID=.;OPOS=2000428;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:19:30:0:0:20:30:0:0 chr8 2017399 . C T 201.54 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00237397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.013;QD=13.8993;RBI=0.0109869;REFB=-0.0107189;REVB=-0.0107274;RO=34;SAF=17;SAR=7;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257364;STB=0.647738;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0179218;OID=.;OPOS=2017399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:7:17:16:18:7:17:16:18 chr8 2017415 . T C 281.96 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00170379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.704;QD=14.6473;RBI=0.0319169;REFB=-0.0300971;REVB=-0.0318714;RO=45;SAF=25;SAR=7;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340408;STB=0.694956;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0289696;OID=.;OPOS=2017415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:7:25:22:23:7:25:22:23 chr8 2033446 . G A 478.08 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00924883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.957;QD=19.7145;RBI=0.0118094;REFB=-0.0096135;REVB=-0.00734317;RO=50;SAF=27;SAR=20;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698082;STB=0.538786;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.010216;OID=.;OPOS=2033446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:20:27:25:25:20:27:25:25 chr8 2037833 . G C 267.09 PASS AF=0.340426;AO=32;DP=94;FAO=32;FDP=94;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.021303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1789;QD=11.3657;RBI=0.13545;REFB=-0.000139267;REVB=0.133765;RO=62;SAF=16;SAR=16;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183611;STB=0.510632;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00277961;OID=.;OPOS=2037833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:62:62:32:32:0.340426:16:16:32:30:16:16:32:30 chr8 2040337 . T C 2064.57 PASS AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0633951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1816;QD=62.5626;RBI=0.0708505;REFB=0;REVB=-0.0316364;RO=0;SAF=43;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000415484;OID=.;OPOS=2040337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:89:43:0:0:89:43:0:0 chr8 2041860 . T C 562.88 PASS AF=0.547368;AO=52;DP=95;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.00219537;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.413;QD=23.7004;RBI=0.0130874;REFB=-0.00352614;REVB=0.012902;RO=43;SAF=16;SAR=36;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171632;STB=0.50943;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00241452;OID=.;OPOS=2041860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:43:43:52:52:0.547368:36:16:14:29:36:16:14:29 chr8 2048811 . A C 1556.99 PASS AF=0.990566;AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.785;QD=58.7544;RBI=0.0594443;REFB=0.00262393;REVB=0.0556135;RO=1;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088696;STB=0.504586;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=9.56702e-05;OID=.;OPOS=2048811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:106:1:1:104:105:0.990566:53:51:0:1:54:51:0:1 chr8 2048831 . A G 317.93 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00279993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.963;QD=15.5087;RBI=0.0068682;REFB=-0.000852442;REVB=0.00627157;RO=47;SAF=14;SAR=21;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156148;STB=0.588185;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0011264;OID=.;OPOS=2048831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:21:14:26:21:21:14:26:21 chr8 2054171 . C T 526.91 PASS AF=0.478632;AO=50;DP=113;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0358356;FXX=0.0249979;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2853;QD=18.014;RBI=0.0361113;REFB=-0.0209632;REVB=0.00445381;RO=59;SAF=24;SAR=26;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217748;STB=0.522116;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0340089;OID=.;OPOS=2054171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:117:59:61:50:56:0.478632:26:24:27:32:27:29:29:32 chr8 2148550 . G A 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.506;QD=57.7124;RBI=0.0212561;REFB=0;REVB=0.0195075;RO=0;SAF=15;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41203e-05;OID=.;OPOS=2148550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:44:15:0:0:44:15:0:0 chr8 2148771 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000472661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.259;QD=60.2304;RBI=0.00967916;REFB=0;REVB=-0.00966761;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.11149e-05;OID=.;OPOS=2148771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0 chr8 2795430 . T G 282.67 PASS AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0727419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2664;QD=28.9913;RBI=0.0850798;REFB=0.0129161;REVB=0.0441269;RO=14;SAF=15;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192918;STB=0.51063;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00447785;OID=.;OPOS=2795430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:10:15:8:6:10:15:8:6 chr8 2795835 . T C 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00362105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.765;QD=61.6947;RBI=0.0179879;REFB=0;REVB=0.0176197;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84812e-05;OID=.;OPOS=2795835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:44:38:0:0:44:38:0:0 chr8 2820043 . G T 559.61 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=0.0326614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2847;QD=19.1321;RBI=0.0420312;REFB=0.00905175;REVB=0.0264548;RO=58;SAF=34;SAR=24;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032385;STB=0.521412;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00825893;OID=.;OPOS=2820043;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:58:59:58:58:0.495726:24:34:36:22:24:34:37:22 chr8 2820745 . G C 2301.02 PASS AF=0.993464;AO=151;DP=153;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00819757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.34;QD=60.1573;RBI=0.0366816;REFB=-0.062718;REVB=0.0357538;RO=1;SAF=80;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590892;STB=0.503105;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=6.55075e-05;OID=.;OPOS=2820745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:153:153:1:1:151:152:0.993464:71:80:1:0:72:80:1:0 chr8 2832139 . C G 1894.38 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.035;QD=61.6058;RBI=0.0616415;REFB=0;REVB=0.00470167;RO=0;SAF=47;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.88373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71562e-05;OID=.;OPOS=2832139;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:76:47:0:0:76:47:0:0 chr8 2909992 . G A 1461.65 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00597374;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.419;QD=62.198;RBI=0.0356455;REFB=0.0120059;REVB=-0.0351413;RO=1;SAF=51;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920605;STB=0.504853;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=5.1425e-05;OID=.;OPOS=2909992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:94:1:1:93:93:0.989362:42:51:1:0:42:51:1:0 chr8 2910020 . A G 1588.67 PASS AF=0.990741;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0149759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.093;QD=58.8396;RBI=0.0293456;REFB=-0.0747932;REVB=0.0252366;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.505494;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000505493;OID=.;OPOS=2910020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:107:108:0:1:107:107:0.990741:45:62:0:0:45:62:0:1 chr8 2965244 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00367196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.185;QD=62.3509;RBI=0.00991557;REFB=0;REVB=0.00921061;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35158e-05;OID=.;OPOS=2965244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr8 3224561 . T C 203.07 PASS AF=0.378788;AO=23;DP=64;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0218499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.385;QD=12.3072;RBI=0.0222501;REFB=0.00145847;REVB=-0.00420106;RO=41;SAF=13;SAR=10;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857117;STB=0.570495;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.0025988;OID=.;OPOS=3224561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:41:41:23:25:0.378788:10:13:20:21:10:15:20:21 chr8 3351147 . G A 728.99 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.453;QD=57.1754;RBI=0.0321587;REFB=0;REVB=-0.0276729;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221548;OID=.;OPOS=3351147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0 chr8 3351195 . C A 768.58 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.242;QD=56.932;RBI=0.0219992;REFB=0;REVB=-0.00467432;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11224e-05;OID=.;OPOS=3351195;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:23:30:0:0:23:31:0:0 chr8 3558050 . G A 1309.05 PASS AF=0.988372;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0449342;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.221;QD=60.8862;RBI=0.0472033;REFB=0.0846002;REVB=-0.0144594;RO=1;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123032;STB=0.506492;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.000112312;OID=.;OPOS=3558050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:86:1:1:85:85:0.988372:38:47:0:1:38:47:0:1 chr8 3807528 . C T 1607.02 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.752;QD=64.2807;RBI=0.0367454;REFB=0;REVB=0.0302671;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57359e-05;OID=.;OPOS=3807528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:50:50:0:0:50:50:0:0 chr8 5768667 . A T 263.89 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0217854;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.388;QD=17.3045;RBI=0.0219395;REFB=-0.0233489;REVB=0.00259564;RO=31;SAF=13;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00310612;STB=0.505717;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0180344;OID=.;OPOS=5768667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:31:32:29:29:0.47541:16:13:14:17:16:13:14:18 chr8 6272399 . G T 401.86 PASS AF=0.422018;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.00756295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4933;QD=14.747;RBI=0.0194221;REFB=0.0212399;REVB=0.0178891;RO=63;SAF=22;SAR=24;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304932;STB=0.517151;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=-0.0303949;OID=.;OPOS=6272399;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:63:63:46:46:0.422018:24:22:32:31:24:22:32:31 chr8 6296550 . G T 250.67 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0388042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1325;QD=14.5316;RBI=0.0437272;REFB=0.00312699;REVB=0.0201569;RO=40;SAF=9;SAR=20;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128536;STB=0.573266;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.00475497;OID=.;OPOS=6296550;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:20:9:17:23:20:9:17:23 chr8 6302183 . G C 133.47 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0346414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4702;QD=15.7023;RBI=0.0348682;REFB=-0.0140566;REVB=-0.00397042;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158751;STB=0.59132;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00793693;OID=.;OPOS=6302183;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:12:7:8:7:12:7 chr8 6302418 . A G 708.52 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.84;QD=62.98;RBI=0.09305;REFB=0;REVB=-0.0893658;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000453884;OID=.;OPOS=6302418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0 chr8 6302671 . C T 150.11 PASS AF=0.447368;AO=16;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00891262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.461;QD=15.8011;RBI=0.0104021;REFB=-0.0144821;REVB=-0.00536368;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102765;STB=0.536235;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0179421;OID=.;OPOS=6302671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:16:17:0.447368:10:6:10:11:10:7:10:11 chr8 6319260 . T C 397.79 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.010663;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.149;QD=18.0814;RBI=0.0292604;REFB=-0.0196328;REVB=-0.0272484;RO=47;SAF=18;SAR=23;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11862;STB=0.566007;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0192164;OID=.;OPOS=6319260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:0.465909:23:18:15:32:23:18:15:32 chr8 6319284 . T C 414.05 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0298514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.796;QD=19.0367;RBI=0.0321594;REFB=-0.0119096;REVB=0.0119633;RO=45;SAF=18;SAR=24;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918759;STB=0.550997;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00458835;OID=.;OPOS=6319284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:45:42:42:0.482759:24:18:15:30:24:18:15:30 chr8 6338366 . C T 420.45 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.0366067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5703;QD=16.4882;RBI=0.0433393;REFB=-0.0317663;REVB=-0.0232001;RO=56;SAF=29;SAR=17;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131421;STB=0.507343;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0377873;OID=.;OPOS=6338366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:17:29:36:20:17:29:36:20 chr8 6378784 . C A 669.27 PASS AF=0.587156;AO=64;DP=109;FAO=64;FDP=109;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00986119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.454;QD=24.5605;RBI=0.0221932;REFB=-0.0151642;REVB=-0.019882;RO=45;SAF=27;SAR=37;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344579;STB=0.518764;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0105177;OID=.;OPOS=6378784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:45:45:64:64:0.587156:37:27:17:28:37:27:17:28 chr8 6389889 . C G 412.5 PASS AF=0.393443;AO=48;DP=123;FAO=48;FDP=122;FR=.;FRO=74;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=0.00693394;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0069;QD=13.5246;RBI=0.00714158;REFB=0.00515212;REVB=0.00170958;RO=75;SAF=19;SAR=29;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120952;STB=0.572338;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00758173;OID=.;OPOS=6389889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:75:74:48:48:0.393443:29:19:38:37:29:19:38:36 chr8 6474473 . C G 367.87 PASS AF=0.40566;AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=0.00639003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.849;QD=13.8817;RBI=0.0116332;REFB=-0.0149923;REVB=0.00972101;RO=63;SAF=23;SAR=20;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127911;STB=0.572206;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0217255;OID=.;OPOS=6474473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:63:63:43:43:0.40566:20:23:26:37:20:23:26:37 chr8 6478986 . C T 187.33 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0361899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4825;QD=14.6928;RBI=0.0378128;REFB=-0.0105612;REVB=0.0109587;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144581;STB=0.583252;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0164502;OID=.;OPOS=6478986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:7:14:16:14:7:14:16:14 chr8 6479042 . C T 210.15 PASS AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0565662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.203;QD=12.0088;RBI=0.0565693;REFB=-0.0142214;REVB=-0.00059005;RO=44;SAF=14;SAR=12;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042007;STB=0.52421;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0212961;OID=.;OPOS=6479042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:44:44:26:26:0.371429:12:14:22:22:12:14:22:22 chr8 6566351 . C G 2977.86 PASS AF=0.994792;AO=187;DP=189;FAO=191;FDP=192;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0504765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.343;QD=62.0387;RBI=0.0506823;REFB=-0.0947766;REVB=0.00456328;RO=1;SAF=87;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473793;STB=0.502487;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00133851;OID=.;OPOS=6566351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:189:192:1:1:187:191:0.994792:100:87:0:1:100:91:0:1 chr8 6615663 . A G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.81;QD=58.142;RBI=0.0319052;REFB=0;REVB=0.0275781;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482897;OID=.;OPOS=6615663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr8 6673377 . CA C 687.97 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.219;QD=62.5424;RBI=0.0627354;REFB=0;REVB=0.0128948;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000357326;OID=.;OPOS=6673378;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:44:44:44:44:0:21:23:0:0:4:0:21:23:0:0 chr8 6690276 . T C 1097.14 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8534;QD=60.1171;RBI=0.0620939;REFB=0;REVB=0.0171328;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249487;OID=.;OPOS=6690276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:33:38:0:0:35:38:0:0 chr8 6735300 . T A 820.43 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.07927;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.231;QD=57.5737;RBI=0.0801239;REFB=0;REVB=0.0116664;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108261;OID=.;OPOS=6735300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr8 6793540 . C T 1062.43 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.087;QD=59.8555;RBI=0.0222955;REFB=0;REVB=-0.0128024;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.74122e-05;OID=.;OPOS=6793540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0 chr8 6793581 . A G 194.77 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0164242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0234;QD=12.9844;RBI=0.0214451;REFB=0.00422071;REVB=0.013789;RO=36;SAF=4;SAR=20;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280936;STB=0.663906;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00348755;OID=.;OPOS=6793581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:20:4:13:23:20:4:13:23 chr8 6794249 . C A 237.58 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0513475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9202;QD=13.7729;RBI=0.0641002;REFB=0.0169221;REVB=0.0383701;RO=41;SAF=14;SAR=14;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127047;STB=0.507241;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=-0.0225514;OID=.;OPOS=6794249;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:14:14:21:20:14:14:21:20 chr8 6913031 . G A 731.23 PASS AF=0.486486;AO=72;DP=148;FAO=72;FDP=148;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=-0.015641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.684;QD=19.763;RBI=0.0191318;REFB=-0.00716323;REVB=-0.0110175;RO=76;SAF=31;SAR=41;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046802;STB=0.525822;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.00672345;OID=.;OPOS=6913031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:76:76:72:72:0.486486:41:31:29:47:41:31:29:47 chr8 7154617 . T A 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.007;QD=40.7616;RBI=0.0475029;REFB=0;REVB=0.010752;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000917;OID=.;OPOS=7154617;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr8 7154641 . G C 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00251818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.271;QD=14.6525;RBI=0.00630934;REFB=-0.00119134;REVB=0.00578503;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.545304;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.00170727;OID=.;OPOS=7154641;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:2:3:3:3:2:3 chr8 7154917 . A C 794.01 PASS AF=0.461111;AO=83;DP=180;FAO=83;FDP=180;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=-0.0452826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1579;QD=17.6447;RBI=0.051106;REFB=-0.00905282;REVB=-0.0236921;RO=97;SAF=33;SAR=50;SRF=47;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864197;STB=0.547934;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00721531;OID=.;OPOS=7154917;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:97:97:83:83:0.461111:50:33:47:50:50:33:47:50 chr8 7215807 . C A 576.57 PASS AF=0.47619;AO=59;DP=122;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.00221613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.495;QD=18.3038;RBI=0.0274505;REFB=-0.00966765;REVB=-0.0273609;RO=63;SAF=29;SAR=30;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300915;STB=0.508732;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0105985;OID=.;OPOS=7215807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:63:66:59:60:0.47619:30:29:33:30:31:29:33:33 chr8 7308386 . T C 160.3 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0974307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9412;QD=45.799;RBI=0.133083;REFB=0;REVB=0.0906549;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00670875;OID=.;OPOS=7308386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr8 7308729 . G C 755.85 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436481;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.89;QD=57.0453;RBI=0.0445034;REFB=0;REVB=0.00868295;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285904;OID=.;OPOS=7308729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr8 7720995 . T C 129.47 PASS AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0215839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3624;QD=32.3677;RBI=0.0301513;REFB=-0.063872;REVB=-0.0210532;RO=3;SAF=3;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182594;STB=0.602239;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0172845;OID=.;OPOS=7720995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:10:3:2:1:10:3:2:1 chr8 8098577 . G A 308.41 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.000949211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.895;QD=15.8158;RBI=0.0117419;REFB=-0.00667626;REVB=-0.0117034;RO=44;SAF=15;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817881;STB=0.546115;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00855124;OID=.;OPOS=8098577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:19:15:23:21:19:15:23:21 chr8 8176221 . C T 167.43 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0120289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.892;QD=23.0937;RBI=0.0478574;REFB=0.00304762;REVB=-0.046321;RO=12;SAF=11;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289954;STB=0.662461;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00179155;OID=.;OPOS=8176221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:6:11:3:9:6:11:3:9 chr8 8176554 . C T 447.27 PASS AF=0.463918;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0134322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.284;QD=18.444;RBI=0.0136432;REFB=-0.0175651;REVB=-0.00238978;RO=52;SAF=30;SAR=15;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186404;STB=0.604269;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0172327;OID=.;OPOS=8176554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:52:52:45:45:0.463918:15:30:25:27:15:30:25:27 chr8 8234077 . G C 146.07 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0756526;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1079;QD=15.7913;RBI=0.129311;REFB=0.00582109;REVB=0.104871;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454969;STB=0.54049;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00649431;OID=.;OPOS=8234077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:22:21:16:16:0.432432:8:8:10:12:8:8:9:12 chr8 8234113 . G A 127.91 PASS AF=0.583333;AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00301528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.133;QD=21.318;RBI=0.113907;REFB=-0.0155028;REVB=0.113867;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123573;STB=0.519203;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0194089;OID=.;OPOS=8234113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:23:24:10:10:13:14:0.583333:8:5:4:6:9:5:4:6 chr8 8234192 . G C 101.39 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0285452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1259;QD=11.5868;RBI=0.0751651;REFB=-0.0064355;REVB=-0.0695339;RO=22;SAF=10;SAR=1;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.710093;STB=0.922367;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00982547;OID=.;OPOS=8234192;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:35:35:22:22:11:11:0.314286:1:10:5:17:1:10:5:17 chr8 8234218 . CG TA 209.73 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0173854;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=207.662;QD=18.6423;RBI=0.0187851;REFB=-0.00778711;REVB=0.00711543;RO=24;SAF=19;SAR=2;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.584929;STB=0.839392;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.00952895;OID=.;OPOS=8234218;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:2:19:10:14:2:19:10:14 chr8 8234714 . C T 64.45 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00961815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.727;QD=9.91611;RBI=0.0199889;REFB=-0.0036328;REVB=0.0175228;RO=15;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149263;STB=0.545359;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00751592;OID=.;OPOS=8234714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:15:17:9:9:0.346154:2:7:13:2:2:7:14:3 chr8 8234868 . C CGCCGCT 129.06 PASS AF=0.764706;AO=12;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00714735;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=6;MLLD=249.397;QD=30.3658;RBI=0.0277473;REFB=-0.0321866;REVB=0.0268109;RO=4;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111553;STB=0.550382;STBP=0.537;TYPE=ins;VARB=0.00551611;OID=.;OPOS=8234869;OREF=-;OALT=GCCGCT;OMAPALT=CGCCGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.764706:12:17:13:17:4:7:6:3:1:22:4:6:6:3:1 chr8 8439879 . A G 173.08 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0341424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3847;QD=18.7117;RBI=0.0594406;REFB=0.0111821;REVB=-0.0486568;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.0144192;OID=.;OPOS=8439879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:10:9:9:9:10:9 chr8 8560602 . C T 152.14 PASS AF=0.75;AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0555112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.509;QD=30.4277;RBI=0.114552;REFB=0.0257252;REVB=0.100204;RO=5;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238094;STB=0.631412;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00220011;OID=.;OPOS=8560602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:20:20:5:5:15:15:0.75:8:7:5:0:8:7:5:0 chr8 8560909 . G C 342.29 PASS AF=0.486486;AO=35;DP=73;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.0121603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.181;QD=18.5019;RBI=0.0254162;REFB=0.00621432;REVB=0.0223183;RO=38;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186404;STB=0.596223;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.00241322;OID=.;OPOS=8560909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:38:38:35:36:0.486486:19:16:10:28:20:16:10:28 chr8 8561391 . A AT 126.68 PASS AF=0.552632;AO=17;DP=41;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0597329;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.6567;QD=13.3345;RBI=0.196798;REFB=0.0705191;REVB=0.187513;RO=24;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181668;STB=0.645017;STBP=0.066;TYPE=ins;VARB=-0.0554595;OID=.;OPOS=8561392;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.552632:17:41:21:38:17:15:6:7:10:81:24:12:5:13:11 chr8 8561399 . G T 235.83 PASS AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00281736;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.748;QD=24.8242;RBI=0.0331892;REFB=-0.0362977;REVB=0.0330694;RO=16;SAF=15;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195183;STB=0.609034;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0164082;OID=.;OPOS=8561399;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:7:15:7:9:7:15:7:9 chr8 8561442 . A G 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0232862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8897;QD=19.6969;RBI=0.031382;REFB=0.0160493;REVB=0.0210376;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199077;STB=0.612793;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.0159162;OID=.;OPOS=8561442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:7:14:10:12:7:14:10:12 chr8 8561452 . A G 151.05 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0286288;FXX=0.0731529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.08;QD=15.8997;RBI=0.0671642;REFB=0.0101055;REVB=0.060757;RO=22;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31842;STB=0.685468;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00417127;OID=.;OPOS=8561452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:4:12:10:12:4:12:10:12 chr8 8561536 . TG CA 37.78 PASS AF=0.375;AO=4;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0107657;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.899;QD=9.445;RBI=0.0146287;REFB=-0.00946768;REVB=-0.00990447;RO=8;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.575744;STB=0.864277;STBP=0.052;TYPE=mnp;VARB=0.0326778;OID=.;OPOS=8561536;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:8:10:4:6:0.375:1:3:1:7:1:5:2:8 chr8 8643582 . C G 130.3 PASS AF=0.3;AO=19;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0370585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6225;QD=8.68663;RBI=0.0780676;REFB=-0.0154773;REVB=-0.0687111;RO=41;SAF=4;SAR=15;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403174;STB=0.792332;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0271312;OID=.;OPOS=8643582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:41:42:19:18:0.3:15:4:22:19:15:3:23:19 chr8 8747894 . A G 1207.1 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0479;QD=61.1191;RBI=0.0290032;REFB=0;REVB=-0.00564648;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.0645e-05;OID=.;OPOS=8747894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0 chr8 8750072 . C T 41.96 PASS AF=0.131148;AO=8;DP=61;FAO=8;FDP=61;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0261519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.863;QD=2.75119;RBI=0.0356995;REFB=-0.00364779;REVB=-0.0243009;RO=52;SAF=7;SAR=1;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.47732;STB=0.846597;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0497596;OID=.;OPOS=8750072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:61:61:52:53:8:8:0.131148:1:7:26:26:1:7:27:26 chr8 8819186 . T A 291.71 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00641644;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.63;QD=16.6689;RBI=0.0133649;REFB=-0.0087592;REVB=0.0117239;RO=38;SAF=18;SAR=14;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121878;STB=0.584188;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0094771;OID=.;OPOS=8819186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:14:18:26:12:15:17:26:12 chr8 8860620 . T C 219.6 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0196175;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.135;QD=18.3002;RBI=0.0202515;REFB=-0.0403576;REVB=-0.00502768;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978278;STB=0.585512;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0442968;OID=.;OPOS=8860620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:48:28:25:23:23:0.479167:10:13:13:15:10:13:10:15 chr8 8887542 . TAAC T 291.96 PASS AF=0.458333;AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00288088;FXX=0.0495;HRUN=2;LEN=3;MLLD=285.724;QD=12.1648;RBI=0.00679665;REFB=1.51809e-05;REVB=-0.00615589;RO=49;SAF=26;SAR=18;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386746;STB=0.552607;STBP=0.357;TYPE=del;VARB=4.44436e-06;OID=.;OPOS=8887543;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.458333:44:96:44:96:52:27:17:27:25:99:49:26:18:27:22 chr8 9145082 . T C 684.29 PASS AF=0.666667;AO=58;DP=88;FAO=58;FDP=87;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00531143;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.248;QD=31.4615;RBI=0.0307627;REFB=-0.0138329;REVB=0.0303007;RO=27;SAF=19;SAR=39;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229061;STB=0.635908;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00482047;OID=.;OPOS=9145082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:27:29:58:58:0.666667:39:19:19:8:39:19:21:8 chr8 9414049 . G A 277.34 PASS AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.015182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.169;QD=26.4135;RBI=0.0161217;REFB=-0.0282748;REVB=0.00542377;RO=17;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102416;STB=0.55646;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0178998;OID=.;OPOS=9414049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:9:16:13:4:9:16:13:4 chr8 9414159 . G C 527.45 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0433864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.207;QD=57.0211;RBI=0.0473237;REFB=-0.15501;REVB=0.0188986;RO=0;SAF=31;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507932;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.000740186;OID=.;OPOS=9414159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:37:37:0:1:36:36:0.972973:5:31:0:0:5:31:1:0 chr8 9414237 . C T 224.18 PASS AF=0.470588;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0288912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.039;QD=17.5829;RBI=0.0289388;REFB=0.0195994;REVB=0.00166034;RO=27;SAF=6;SAR=17;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491802;STB=0.519984;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.0139282;OID=.;OPOS=9414237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:27:27:23:24:0.470588:17:6:6:21:18:6:6:21 chr8 9414503 . T C 733.36 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000804345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8198;QD=61.113;RBI=0.00937946;REFB=-0.0556089;REVB=0.00934491;RO=1;SAF=17;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268575;STB=0.51428;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0015871;OID=.;OPOS=9414503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:30:17:1:0:30:17:1:0 chr8 9414924 . G C 205.4 PASS AF=1;AO=6;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.961;QD=48.329;RBI=0.0172837;REFB=0;REVB=0.0126352;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22345e-05;OID=.;OPOS=9414924;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:6:17:1:0:6:0:0:2:15:0:0 chr8 9415168 . G A 918.5 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.562;QD=58.3174;RBI=0.024855;REFB=0;REVB=0.020811;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53564e-05;OID=.;OPOS=9415168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:32:29:0:0:34:29:0:0 chr8 9415390 . G A 344.35 PASS AF=0.390476;AO=41;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0109524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.452;QD=13.1182;RBI=0.0109529;REFB=-0.00863643;REVB=0.000106969;RO=64;SAF=19;SAR=22;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225636;STB=0.512814;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0125933;OID=.;OPOS=9415390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:64:64:41:41:0.390476:22:19:31:33:22:19:31:33 chr8 9564437 . A G 511.74 PASS AF=0.52;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00160869;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.555;QD=20.4696;RBI=0.00400905;REFB=-0.0069536;REVB=-0.00367213;RO=47;SAF=23;SAR=29;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956281;STB=0.55767;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0083638;OID=.;OPOS=9564437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:47:48:52:52:0.52:29:23:26:21:29:23:27:21 chr8 9577940 . T C 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.716;QD=63.0522;RBI=0.0164766;REFB=0;REVB=-0.0163202;RO=0;SAF=50;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85699e-05;OID=.;OPOS=9577940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:41:50:0:0:41:50:0:0 chr8 9635242 . C G 178.95 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=35;FWDB=-0.000408568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8621;QD=10.8452;RBI=0.0308807;REFB=-0.0190116;REVB=0.030878;RO=43;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302358;STB=0.672142;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0280464;OID=.;OPOS=9635242;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:43:43:23:23:0.348485:13:10:8:35:13:10:8:35 chr8 9734266 . A AC 144.23 PASS AF=1;AO=2;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057502;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=220.86;QD=38.4615;RBI=0.0946025;REFB=0;REVB=-0.075121;RO=13;SAF=0;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00595747;OID=.;OPOS=9734267;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:15:15:15:0:7:8:0:0:4:13:0:2:7:6 chr8 9734267 . A C 133.08 PASS AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0166228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.327;QD=35.4875;RBI=0.0325294;REFB=0.067329;REVB=0.0279615;RO=2;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128919;STB=0.571319;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.000656582;OID=.;OPOS=9734267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:6:7:0:2:6:7:0:2 chr8 9734284 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.786;QD=47.8223;RBI=0.0214712;REFB=0;REVB=0.00191156;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132879;OID=.;OPOS=9734284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr8 10211175 . C T 341.29 PASS AF=0.420455;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.011827;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4546;QD=15.5131;RBI=0.0178816;REFB=-0.00310577;REVB=-0.0134118;RO=51;SAF=16;SAR=21;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198075;STB=0.611591;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00275783;OID=.;OPOS=10211175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:51:51:37:37:0.420455:21:16:32:19:21:16:32:19 chr8 10285825 . T G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.607;QD=46.8479;RBI=0.0606929;REFB=0;REVB=-0.0475498;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.98272e-05;OID=.;OPOS=10285825;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr8 10333811 . C T 305.82 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3447;QD=53.1853;RBI=0.0640754;REFB=0;REVB=0.0639503;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115087;OID=.;OPOS=10333811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr8 10383226 . C G 214.37 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0409342;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.625;QD=45.1307;RBI=0.041576;REFB=-0.170211;REVB=-0.00727707;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517223;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00138721;OID=.;OPOS=10383226;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:19:19:0:1:18:18:0.947368:14:4:0:0:14:4:0:1 chr8 10390452 . C T 1719.84 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200386;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.014;QD=59.8206;RBI=0.0293054;REFB=-0.0412395;REVB=-0.0213836;RO=1;SAF=53;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772123;STB=0.504064;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=2.5024e-05;OID=.;OPOS=10390452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:115:1:1:114:114:0.991304:61:53:0:1:61:53:0:1 chr8 10396054 . A C 990.58 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7725;QD=59.139;RBI=0.0428441;REFB=0;REVB=-0.0253786;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.53112e-05;OID=.;OPOS=10396054;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0 chr8 10464755 . C T 48.46 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0467419;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.754;QD=10.7685;RBI=0.0503953;REFB=-0.0196193;REVB=-0.0188383;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090156;STB=0.555391;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0348483;OID=.;OPOS=10464755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:19:18:11:11:7:7:0.388889:2:5:7:4:2:5:7:4 chr8 10464885 . T C 598.21 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268606;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.682;QD=61.3547;RBI=0.0444199;REFB=0;REVB=0.0353785;RO=1;SAF=25;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198435;OID=.;OPOS=10464885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:1:0:39:39:1:14:25:1:0:14:25:0:0 chr8 10465399 . T A 38.54 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0585891;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8496;QD=25.6966;RBI=0.0785758;REFB=-0.0114435;REVB=0.0523591;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0140652;OID=.;OPOS=10465399;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:7:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:0:1:1:4:0:1 chr8 10465771 . G T 61.85 PASS AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.505;QD=35.341;RBI=0.12174;REFB=0;REVB=0.107119;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00418512;OID=.;OPOS=10465771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0 chr8 10467160 . G A 487.68 PASS AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0310809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6756;QD=21.6747;RBI=0.034395;REFB=-0.00446734;REVB=0.0147306;RO=43;SAF=35;SAR=12;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250318;STB=0.639035;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00528616;OID=.;OPOS=10467160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:12:35:21:22:12:35:21:22 chr8 10467207 . C A 1633.68 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.944;QD=59.4064;RBI=0.101541;REFB=0;REVB=0.0920285;RO=1;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978482;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385298;OID=.;OPOS=10467207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:110:1:0:106:110:1:48:58:0:1:51:59:0:0 chr8 10467604 . C A 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0285211;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=294.085;QD=16.1984;RBI=0.0466388;REFB=0.0128967;REVB=-0.0369015;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=-0.0112514;OID=.;OPOS=10467604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1 chr8 10467627 . T C 47.69 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00951234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.278;QD=11.9233;RBI=0.0185154;REFB=-0.024643;REVB=0.0158851;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371799;STB=0.730929;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0222699;OID=.;OPOS=10467627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:1:6:5:4:1:6:5:4 chr8 10467637 . T C 78.21 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0143371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7786;QD=14.8981;RBI=0.0637452;REFB=-0.00103975;REVB=0.062112;RO=11;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279975;STB=0.666296;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00630326;OID=.;OPOS=10467637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:21:21:11:11:10:10:0.47619:2:8:6:5:2:8:6:5 chr8 10468172 . G A 169.5 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00687721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.556;QD=16.5361;RBI=0.00747636;REFB=-0.00581807;REVB=-0.00293257;RO=23;SAF=11;SAR=7;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137255;STB=0.578089;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0135874;OID=.;OPOS=10468172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:7:11:17:6:7:11:17:6 chr8 10469030 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00843549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.064;QD=11.02;RBI=0.0506677;REFB=-0.0114059;REVB=0.0499606;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374671;STB=0.726563;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00664156;OID=.;OPOS=10469030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:2:6:2:4:2:6 chr8 10469340 . G A 331.96 PASS AF=0.362832;AO=41;DP=114;FAO=41;FDP=113;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=0.0031147;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.439;QD=11.7507;RBI=0.00967699;REFB=-0.0145694;REVB=0.00916203;RO=71;SAF=20;SAR=21;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525072;STB=0.525441;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0256448;OID=.;OPOS=10469340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:71:72:41:41:0.362832:21:20:38:33:21:20:38:34 chr8 10469817 . G A 625.57 PASS AF=0.371287;AO=74;DP=202;FAO=75;FDP=202;FR=.;FRO=127;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=62;FSRR=65;FWDB=0.0075923;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.041;QD=12.3875;RBI=0.0145911;REFB=-0.0175885;REVB=0.0124602;RO=127;SAF=39;SAR=35;SRF=62;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432696;STB=0.519995;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0318014;OID=.;OPOS=10469817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:127:127:74:75:0.371287:35:39:62:65:36:39:62:65 chr8 10474042 . T G 472.89 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0245739;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.943;QD=20.5605;RBI=0.0262959;REFB=-0.0286254;REVB=0.0093592;RO=45;SAF=22;SAR=23;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200396;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0243162;OID=.;OPOS=10474042;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:45:46:45:46:0.5:23:22:23:22:23:23:23:23 chr8 10524531 . A C 581.5 PASS AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.014394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3313;QD=20.5839;RBI=0.0267101;REFB=-0.0431457;REVB=0.0224999;RO=53;SAF=38;SAR=21;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185227;STB=0.598114;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0372046;OID=.;OPOS=10524531;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:53:54:59:59:0.522124:21:38:23:30:21:38:24:30 chr8 10530218 . C T 650.87 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.331;QD=61.9872;RBI=0.047278;REFB=0;REVB=0.00795386;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200284;OID=.;OPOS=10530218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr8 10691277 . A C 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0166406;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=188.85;QD=12.8607;RBI=0.0168705;REFB=-0.0136423;REVB=0.00277584;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404365;STB=0.749165;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0207476;OID=.;OPOS=10691277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:6:1:4:4:6:1:4:4 chr8 10754511 . C T 2125.15 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020646;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4125;QD=62.9674;RBI=0.0217752;REFB=0;REVB=0.00692095;RO=0;SAF=55;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78419e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374709;OID=.;OPOS=10754511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:80:55:0:0:80:55:0:0 chr8 11179074 . A C 2335.19 PASS AF=1;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130893;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.318;QD=63.9779;RBI=0.0131754;REFB=0;REVB=0.00150392;RO=0;SAF=58;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24674e-06;OID=.;OPOS=11179074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:146:0:0:146:146:1:88:58:0:0:88:58:0:0 chr8 11184844 . T C 683.47 PASS AF=0.453988;AO=73;DP=163;FAO=74;FDP=163;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=0.0281001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.835;QD=16.7721;RBI=0.0282273;REFB=-0.014855;REVB=0.00267719;RO=89;SAF=25;SAR=48;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134908;STB=0.569217;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0177166;OID=.;OPOS=11184844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:89:89:73:74:0.453988:48:25:42:47:48:26:42:47 chr8 11184937 . G A 641.64 PASS AF=0.474453;AO=65;DP=139;FAO=65;FDP=137;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=-0.0228381;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0467;QD=18.7339;RBI=0.0255822;REFB=0.000389344;REVB=-0.011527;RO=72;SAF=31;SAR=34;SRF=28;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841304;STB=0.54655;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.000300193;OID=.;OPOS=11184937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:137:72:72:65:65:0.474453:34:31:28:44:34:31:28:44 chr8 11188743 . C T 318.81 PASS AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0227912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.479;QD=26.5675;RBI=0.0236127;REFB=-0.0204573;REVB=0.00617412;RO=20;SAF=17;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15732;STB=0.587024;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0240951;OID=.;OPOS=11188743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:11:17:8:12:11:17:8:12 chr8 11188752 . G A 315.96 PASS AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0267516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.5;QD=25.2767;RBI=0.0313755;REFB=-0.0226154;REVB=0.0163943;RO=21;SAF=18;SAR=10;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205933;STB=0.624188;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00930046;OID=.;OPOS=11188752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:22:28:28:0.56:10:18:8:13:10:18:8:14 chr8 11189316 . G C 384.43 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7477;QD=54.9184;RBI=0.178729;REFB=0;REVB=0.0649704;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545937;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00624166;OID=.;OPOS=11189316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:1:0:27:28:1:19:8:1:0:19:9:0:0 chr8 11189488 . T C 712.27 PASS AF=0.44;AO=77;DP=175;FAO=77;FDP=175;FR=.;FRO=98;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=55;FWDB=-0.0420855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.278;QD=16.2805;RBI=0.0438145;REFB=-0.0115826;REVB=-0.0121871;RO=97;SAF=39;SAR=38;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632645;STB=0.537881;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0167547;OID=.;OPOS=11189488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:97:98:77:77:0.44:38:39:43:54:38:39:43:55 chr8 11189535 . T C 230.77 PASS AF=0.300971;AO=31;DP=103;FAO=31;FDP=103;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.00587497;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.735;QD=8.96193;RBI=0.0628807;REFB=0.0107145;REVB=0.0626057;RO=72;SAF=19;SAR=12;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199691;STB=0.617424;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.0219453;OID=.;OPOS=11189535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:72:72:31:31:0.300971:12:19:32:40:12:19:32:40 chr8 11204165 . C T 171.78 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.000226799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9357;QD=11.0826;RBI=0.0106906;REFB=-0.00255895;REVB=0.0106882;RO=40;SAF=9;SAR=13;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742444;STB=0.543244;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00665182;OID=.;OPOS=11204165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:13:9:19:21:13:9:19:21 chr8 11204184 . G A 147.82 PASS AF=0.358491;AO=18;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00713402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.446;QD=11.156;RBI=0.0100957;REFB=-0.00382059;REVB=0.00714339;RO=34;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516881;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00795205;OID=.;OPOS=11204184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:34:34:18:19:0.358491:9:9:17:17:10:9:17:17 chr8 11301753 . A C 4005.16 PASS AF=1;AO=258;DP=259;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177376;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8846;QD=61.8558;RBI=0.0215389;REFB=-0.0581422;REVB=0.0122188;RO=0;SAF=166;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35466e-05;OID=.;OPOS=11301753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:259:259:0:0:258:259:1:92:166:0:0:93:166:0:0 chr8 11414237 . T C 1377.39 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0798321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9324;QD=62.6088;RBI=0.0801239;REFB=0;REVB=-0.00683202;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000659807;OID=.;OPOS=11414237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr8 11418385 . G A 902.69 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00653011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.257;QD=58.2383;RBI=0.0275709;REFB=0;REVB=0.0267864;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45955e-05;OID=.;OPOS=11418385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0 chr8 11418773 . C T 999.56 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.109793;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=54.0035;QD=56.3131;RBI=0.109819;REFB=-0.00189234;REVB=-0.00238955;RO=2;SAF=39;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00352954;STB=0.501867;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00101209;OID=.;OPOS=11418773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:71:71:2:2:69:69:0.971831:30:39:1:1:30:39:1:1 chr8 11421793 . C T 740.98 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00192283;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.375;QD=54.8874;RBI=0.0551692;REFB=-0.0934538;REVB=0.0551357;RO=1;SAF=40;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348586;STB=0.518511;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000159783;OID=.;OPOS=11421793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:54:1:1:53:53:0.981481:13:40:0:1:13:40:0:1 chr8 11619205 . C G 222.0 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00814521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.625;QD=14.5576;RBI=0.0238201;REFB=-0.00952508;REVB=-0.0223843;RO=34;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775006;STB=0.53637;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0169831;OID=.;OPOS=11619205;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:35:26:26:0.42623:11:15:17:17:11:15:18:17 chr8 11619261 . T A 1529.99 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0492;QD=63.7496;RBI=0.0950887;REFB=0;REVB=0.091761;RO=0;SAF=44;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000888685;OID=.;OPOS=11619261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:52:44:0:0:52:44:0:0 chr8 11619334 . C T 745.3 PASS AF=0.583333;AO=70;DP=120;FAO=70;FDP=120;FR=.;FRO=50;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0345185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3176;QD=24.8434;RBI=0.0398888;REFB=0.00709973;REVB=0.0199896;RO=50;SAF=36;SAR=34;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102542;STB=0.555804;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.0053776;OID=.;OPOS=11619334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:50:50:70:70:0.583333:34:36:19:31:34:36:19:31 chr8 11619635 . T A 186.64 PASS AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.00242184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.518;QD=27.6508;RBI=0.0675343;REFB=-0.000902239;REVB=-0.0674909;RO=9;SAF=16;SAR=2;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20131;STB=0.609656;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-1.30976e-05;OID=.;OPOS=11619635;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:9:9:18:18:0.666667:2:16:9:0:2:16:9:0 chr8 11619986 . C T 134.98 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00148443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.358;QD=16.873;RBI=0.0176817;REFB=-0.0121408;REVB=-0.0176193;RO=17;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264271;STB=0.652752;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0190934;OID=.;OPOS=11619986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:4:11:8:9:4:11:8:9 chr8 11620077 . GAC G 42.69 PASS AF=0.5;AO=3;DP=14;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0120602;FXX=0.142755;HRUN=1;LEN=2;MLLD=76.9099;QD=14.2309;RBI=0.0197904;REFB=-0.053503;REVB=-0.015691;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152533;STB=0.624529;STBP=0.488;TYPE=del;VARB=0.0660096;OID=.;OPOS=11620078;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:3:14:6:12:6:1:5:2:4:40:5:1:2:1:4 chr8 11620315 . T C 403.94 PASS AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0164505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.05;QD=22.1334;RBI=0.0199751;REFB=-0.0173183;REVB=-0.0113307;RO=32;SAF=20;SAR=20;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756707;STB=0.547921;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0149773;OID=.;OPOS=11620315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:32:33:40:40:0.547945:20:20:19:13:20:20:20:13 chr8 11620792 . G A 900.41 PASS AF=0.6;AO=81;DP=135;FAO=81;FDP=135;FR=.;FRO=54;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=0.0105061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.158;QD=26.6787;RBI=0.0105066;REFB=-0.00870772;REVB=9.91446e-05;RO=54;SAF=46;SAR=35;SRF=38;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103715;STB=0.556173;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00615202;OID=.;OPOS=11620792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:54:54:81:81:0.6:35:46:38:16:35:46:38:16 chr8 11621351 . C G 375.65 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.3;QD=55.6522;RBI=0.058758;REFB=0;REVB=-0.057174;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000238937;OID=.;OPOS=11621351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr8 11621450 . G A 137.89 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0867161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.909;QD=11.4908;RBI=0.0875944;REFB=-0.0179049;REVB=-0.0123732;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23012;STB=0.60513;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0218887;OID=.;OPOS=11621450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:32:16:16:0.333333:10:6:17:12:10:6:17:15 chr8 11659512 . T A 435.52 PASS AF=0.575342;AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00708112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.268;QD=23.864;RBI=0.0217475;REFB=-0.000260587;REVB=-0.0205623;RO=31;SAF=24;SAR=18;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433431;STB=0.523798;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.000201794;OID=.;OPOS=11659512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:31:31:42:42:0.575342:18:24:16:15:18:24:16:15 chr8 11659928 . A G 152.88 PASS AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0104519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.402;QD=10.3644;RBI=0.0201034;REFB=-0.0100442;REVB=-0.0171728;RO=39;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184729;STB=0.607935;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0352687;OID=.;OPOS=11659928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:9:11:15:24:9:11:15:24 chr8 11666218 . GTCCCAC CTCCCAC,G 152.28 PASS AF=0.103448,0.482759;AO=3,12;DP=24;FAO=3,14;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=0,1;FSAR=3,13;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.188067,-0.0604334;FXX=0.0937207;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=52.4593,157.204;QD=21.0046;RBI=0.194737,0.0646242;REFB=-0.00536211,-0.0439125;REVB=-0.0505301,0.0228931;RO=0;SAF=0,0;SAR=3,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.996896,0.872478;STBP=0.033,0.001;TYPE=snp,del;VARB=0.00958924,0.0264246;OID=.,.;OPOS=11666218,11666219;OREF=G,TCCCAC;OALT=C,-;OMAPALT=CTCCCAC,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:94:24:29:0:12:3,12:3,14:0.103448,0.482759:3,12:0,0:0:0:3,13:0,1:8:4 chr8 11683653 . T C 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162769;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=345.386;QD=61.2132;RBI=0.0176693;REFB=0;REVB=-0.00687497;RO=0;SAF=23;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15125e-05;OID=.;OPOS=11683653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:56:23:0:0:56:23:0:0 chr8 11689119 . G C 395.96 PASS AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0620126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1347;QD=20.3055;RBI=0.0628006;REFB=-0.000428438;REVB=-0.00991723;RO=38;SAF=17;SAR=23;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434276;STB=0.524076;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00105944;OID=.;OPOS=11689119;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:23:17:18:20:23:17:18:20 chr8 11695931 . C G 146.61 PASS AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0213321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.049;QD=10.472;RBI=0.0227331;REFB=-0.0187916;REVB=-0.00785732;RO=37;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108467;STB=0.563502;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0785971;OID=.;OPOS=11695931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:10:9:14:23:10:9:14:23 chr8 11696115 . C G 184.72 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0969386;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.786;QD=17.5926;RBI=0.0975585;REFB=-0.0235448;REVB=0.0109796;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265505;STB=0.663091;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0368171;OID=.;OPOS=11696115;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:22:23:19:19:0.452381:6:13:9:13:6:13:9:14 chr8 11701842 . A C 957.52 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200342;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.928;QD=58.9244;RBI=0.0516379;REFB=0;REVB=-0.0475931;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000734211;OID=.;OPOS=11701842;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:28:36:0:0:28:37:0:0 chr8 11702542 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.116658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.81;QD=63.8713;RBI=0.116947;REFB=0;REVB=0.00821107;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000364869;OID=.;OPOS=11702542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0 chr8 11793447 . T C 1417.82 PASS AF=0.98913;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.115304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1339;QD=61.6441;RBI=0.115391;REFB=-0.0308111;REVB=-0.00447963;RO=1;SAF=38;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123092;STB=0.506328;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000274833;OID=.;OPOS=11793447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:92:1:1:90:91:0.98913:52:38:1:0:52:39:1:0 chr8 11832079 . A G 849.6 PASS AF=0.953125;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00681987;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.245;QD=53.1;RBI=0.00957532;REFB=-0.0267104;REVB=-0.00672131;RO=2;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314423;STB=0.508976;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00015394;OID=.;OPOS=11832079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:64:64:2:3:61:61:0.953125:29:32:0:2:29:32:1:2 chr8 11872239 . C A 132.65 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0739354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3734;QD=15.1596;RBI=0.0750895;REFB=-0.00190245;REVB=0.0131147;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161375;STB=0.592478;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00278768;OID=.;OPOS=11872239;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:9:6:5:15:9:6:5:15 chr8 11872395 . A G 38.25 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.025103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.578;QD=9.56335;RBI=0.0411851;REFB=-0.020873;REVB=0.0326504;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422407;STB=0.749373;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0440359;OID=.;OPOS=11872395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:9:1:3:3:9:1 chr8 12287914 . A G 31.82 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0133899;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.545;QD=10.6076;RBI=0.0134912;REFB=-0.0208951;REVB=-0.00165032;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987559;STB=0.517172;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0306009;OID=.;OPOS=12287914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:13:12:8:7:5:5:0.416667:2:3:4:4:2:3:4:3 chr8 12516729 . T C,G 437.85 PASS AF=0.0645161,0.935484;AO=2,29;DP=31;FAO=2,29;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2,12;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456415,-0.00135957;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.86,92.5594;QD=56.4967;RBI=0.00576759,0.0307955;REFB=0,0;REVB=-0.00352614,0.0307655;RO=0;SAF=2,12;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-6.0947e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.16188,-0.000807515;OID=.,.;OPOS=12516729,12516729;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:31:31:0:0:2,29:2,29:0.0645161,0.935484:0,17:2,12:0:0:0,17:2,12:0:0 chr8 12580049 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.855;QD=56.7066;RBI=0.0364765;REFB=0;REVB=-0.00319184;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000416637;OID=.;OPOS=12580049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr8 12809667 . A T 1634.42 PASS AF=0.534483;AO=155;DP=290;FAO=155;FDP=290;FR=.;FRO=135;FSAF=75;FSAR=80;FSRF=60;FSRR=75;FWDB=0.0131405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.521;QD=22.5437;RBI=0.013644;REFB=-0.018104;REVB=0.00367265;RO=135;SAF=75;SAR=80;SRF=60;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337481;STB=0.518392;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0117741;OID=.;OPOS=12809667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:135:135:155:155:0.534483:80:75:60:75:80:75:60:75 chr8 12809700 . G A 1490.3 PASS AF=0.529197;AO=144;DP=275;FAO=145;FDP=274;FR=.;FRO=129;FSAF=70;FSAR=75;FSRF=54;FSRR=75;FWDB=-0.0173912;FXX=0.00363623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.573;QD=21.7562;RBI=0.0207339;REFB=-0.0174788;REVB=0.0112891;RO=128;SAF=70;SAR=74;SRF=54;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555474;STB=0.530299;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0140171;OID=.;OPOS=12809700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:274:128:129:144:145:0.529197:74:70:54:74:75:70:54:75 chr8 12878637 . A G 1152.79 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00407203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.215;QD=60.6732;RBI=0.0111404;REFB=0;REVB=-0.0103696;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.52219e-05;OID=.;OPOS=12878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0 chr8 12879198 . A T 298.53 PASS AF=0.5;AO=29;DP=61;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0641347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.842;QD=18.0925;RBI=0.0666031;REFB=-0.02139;REVB=0.0179642;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190859;STB=0.59044;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0282106;OID=.;OPOS=12879198;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:66:32:33:29:33:0.5:14:15:10:22:16:17:11:22 chr8 12888743 . A G 226.32 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00323573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.272;QD=17.0807;RBI=0.0052622;REFB=-0.00489542;REVB=0.00414979;RO=28;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089814;STB=0.55064;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00767074;OID=.;OPOS=12888743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:11:14:13:15:11:14:13:15 chr8 12888908 . T G 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0121446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.286;QD=20.0176;RBI=0.0212694;REFB=-0.00669797;REVB=-0.0174612;RO=17;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327536;STB=0.518498;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00503713;OID=.;OPOS=12888908;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:11:7:6:11:11:7:6:11 chr8 12943065 . T C 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0378889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.113;QD=22.5809;RBI=0.0397291;REFB=-0.0251959;REVB=-0.0119512;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162618;STB=0.592433;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0135712;OID=.;OPOS=12943065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:8:4:4:3:8:4:4:3 chr8 12957475 . C T 1288.13 PASS AF=0.977011;AO=84;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0165771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.368;QD=59.2246;RBI=0.0234627;REFB=-0.103608;REVB=0.016604;RO=2;SAF=33;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278394;STB=0.514282;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.000565787;OID=.;OPOS=12957475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:87:87:2:2:84:85:0.977011:51:33:2:0:51:34:2:0 chr8 12960281 . T C 264.14 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.00625908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.998;QD=13.5455;RBI=0.00629494;REFB=-0.0143032;REVB=0.000670953;RO=47;SAF=18;SAR=13;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872793;STB=0.549581;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0217082;OID=.;OPOS=12960281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:13:18:31:16:13:18:31:16 chr8 12990422 . A G 130.65 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.123;QD=43.5492;RBI=0.10075;REFB=0;REVB=-0.0079388;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135822;OID=.;OPOS=12990422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:11:12:1:4:7:0:0:4:8:0:0 chr8 12990518 . T A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.228;QD=37.4885;RBI=0.0632188;REFB=0;REVB=0.0631105;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00273528;OID=.;OPOS=12990518;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr8 13072177 . C T 1610.97 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0051143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.766;QD=59.6655;RBI=0.0203267;REFB=0;REVB=0.0196728;RO=0;SAF=59;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34814e-06;OID=.;OPOS=13072177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:108:0:0:106:108:1:47:59:0:0:49:59:0:0 chr8 13356802 . G A 168.44 PASS AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00523808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.308;QD=10.3652;RBI=0.00778817;REFB=-0.0106038;REVB=0.00576353;RO=43;SAF=10;SAR=12;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142614;STB=0.583259;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0393469;OID=.;OPOS=13356802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:12:10:25:18:12:10:25:18 chr8 13356818 . TT CG,CT 802.07 PASS AF=0.305085,0.677966;AO=18,40;DP=63;FAO=18,40;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=9,23;FSAR=9,17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00672864,0.00773189;FXX=0.063482;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=144.783,200.795;QD=54.3778;RBI=0.0308075,0.0154508;REFB=-0.0379824,0.0539149;REVB=0.0300637,0.013377;RO=1;SAF=9,23;SAR=9,17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0483018,-0.0199568;STB=0.526287,0.510633;STBP=0.516,0.504;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.000904116,0.00101554;OID=.,.;OPOS=13356818,13356818;OREF=TT,T;OALT=CG,C;OMAPALT=CG,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:63:59:1:1:18,40:18,40:0.305085,0.677966:9,17:9,23:1:0:9,17:9,23:1:0 chr8 13357340 . G C 390.83 PASS AF=0.358779;AO=47;DP=132;FAO=47;FDP=131;FR=.;FRO=84;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=-0.0126264;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.502;QD=11.9337;RBI=0.0138044;REFB=0.00153615;REVB=-0.00558005;RO=84;SAF=22;SAR=25;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757193;STB=0.543284;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00225161;OID=.;OPOS=13357340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:84:84:47:47:0.358779:25:22:45:39:25:22:45:39 chr8 13424583 . C T 1307.99 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.598;QD=61.5526;RBI=0.0200237;REFB=0;REVB=0.0171629;RO=1;SAF=39;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119881;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313955;OID=.;OPOS=13424583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:85:1:0:82:85:1:43:39:1:0:43:42:0:0 chr8 13424866 . G C 134.65 PASS AF=0.380952;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.025175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.517;QD=12.8242;RBI=0.0341381;REFB=-0.016437;REVB=0.023057;RO=26;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605125;STB=0.549936;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0430426;OID=.;OPOS=13424866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:26:26:15:16:0.380952:10:5:10:16:11:5:10:16 chr8 13425353 . T A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.582;QD=58.2394;RBI=0.0350508;REFB=0;REVB=0.000538834;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106183;OID=.;OPOS=13425353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0 chr8 15978063 . C T 808.61 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0303673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.109;QD=53.907;RBI=0.0309742;REFB=-0.0744151;REVB=0.00610133;RO=1;SAF=28;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165496;STB=0.500575;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00033661;OID=.;OPOS=15978063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:60:1:2:58:58:0.966667:30:28:1:0:30:28:1:1 chr8 16043667 . C T 350.18 PASS AF=0.438202;AO=37;DP=87;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0127497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.335;QD=15.7383;RBI=0.0784838;REFB=-0.00724651;REVB=-0.0774413;RO=50;SAF=17;SAR=20;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122289;STB=0.580567;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0133171;OID=.;OPOS=16043667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:50:50:37:39:0.438202:20:17:29:21:22:17:29:21 chr8 16927250 . A C 1721.16 PASS AF=1;AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694832;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.509;QD=60.926;RBI=0.0700329;REFB=0;REVB=0.00875785;RO=0;SAF=41;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43936e-05;OID=.;OPOS=16927250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:115:113:0:0:113:113:1:72:41:0:0:72:41:0:0 chr8 16979116 . A C 221.1 PASS AF=0.318182;AO=28;DP=88;FAO=28;FDP=88;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00293848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.076;QD=10.05;RBI=0.007482;REFB=-0.00395202;REVB=-0.00688082;RO=59;SAF=17;SAR=11;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116188;STB=0.562868;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00841373;OID=.;OPOS=16979116;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:59:60:28:28:0.318182:11:17:30:29:11:17:31:29 chr8 17078905 . GT G 32.55 PASS AF=0.5;AO=7;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0667331;FXX=0.0370233;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.78716;QD=5.00823;RBI=0.106435;REFB=-0.0322203;REVB=-0.0829165;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439197;STB=0.58428;STBP=0.402;TYPE=del;VARB=0.0253835;OID=.;OPOS=17078906;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:7:25:13:26:13:4:9:6:7:32:12:1:6:6:6 chr8 17079358 . A G 211.4 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00396745;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.127;QD=18.7907;RBI=0.0119656;REFB=-0.00988992;REVB=0.0112887;RO=24;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106569;STB=0.560452;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0164053;OID=.;OPOS=17079358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:12:9:13:11:12:9:13:11 chr8 17092164 . G T 1245.37 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000122869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.997;QD=61.4998;RBI=0.00172217;REFB=0;REVB=0.00171778;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28419e-05;OID=.;OPOS=17092164;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:37:44:0:0:37:44:0:0 chr8 17125768 . T C 104.39 PASS AF=0.242424;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0161397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2693;QD=6.32667;RBI=0.0188984;REFB=-0.0060733;REVB=-0.0098316;RO=49;SAF=7;SAR=9;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113509;STB=0.562422;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0309099;OID=.;OPOS=17125768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:49:50:16:16:0.242424:9:7:26:23:9:7:26:24 chr8 17142065 . C T 204.51 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00740156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.43;QD=22.7238;RBI=0.0129431;REFB=-0.0131696;REVB=0.010618;RO=16;SAF=4;SAR=16;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384765;STB=0.717709;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0117144;OID=.;OPOS=17142065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:16:4:10:6:16:4:10:6 chr8 17152857 . T G 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0601261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.734;QD=19.3427;RBI=0.0634487;REFB=-0.0148973;REVB=0.020263;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979282;STB=0.555494;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00960779;OID=.;OPOS=17152857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:10:8:10:8:10:8:10:8 chr8 17157259 . G A 295.21 PASS AF=0.369565;AO=33;DP=92;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=-0.0130112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.892;QD=12.8352;RBI=0.0217849;REFB=-0.00231611;REVB=-0.0174725;RO=58;SAF=7;SAR=26;SRF=18;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14558;STB=0.589978;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00381671;OID=.;OPOS=17157259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:58:58:33:34:0.369565:26:7:18:40:27:7:18:40 chr8 17230644 . G C 1496.31 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00645019;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.967;QD=62.3464;RBI=0.00682563;REFB=-0.138001;REVB=-0.00223256;RO=1;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998257;STB=0.505262;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.000143108;OID=.;OPOS=17230644;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:47:48:0:1:47:48:0:1 chr8 17270759 . C T 182.99 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00366162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.534;QD=17.4279;RBI=0.00662749;REFB=-0.0175079;REVB=-0.00552415;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101532;STB=0.541624;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0310146;OID=.;OPOS=17270759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:11:8:7:15:11:8:8:15 chr8 17270763 . G C 230.24 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00221702;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.987;QD=21.9276;RBI=0.0148305;REFB=-0.0421188;REVB=-0.0146639;RO=19;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182834;STB=0.568656;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0257753;OID=.;OPOS=17270763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:19:20:22:22:0.52381:15:7:10:9:15:7:9:11 chr8 17270770 . T C 185.68 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00664092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1183;QD=19.0445;RBI=0.0607654;REFB=-0.0415266;REVB=-0.0604015;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164384;STB=0.592501;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0863224;OID=.;OPOS=17270770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:11:8:5:15:11:8:5:15 chr8 17270787 . A G 588.16 PASS AF=0.975;AO=38;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0278358;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.081;QD=58.8159;RBI=0.0280211;REFB=0.0728614;REVB=-0.00321744;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176841;STB=0.509086;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.000265069;OID=.;OPOS=17270787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:38:39:0.975:26:12:0:1:27:12:0:1 chr8 17270837 . G C 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00268105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7303;QD=16.3857;RBI=0.0118071;REFB=0.0150067;REVB=0.0114987;RO=8;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315978;STB=0.518476;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.0135368;OID=.;OPOS=17270837;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:7:2:2:6:7:2:2:6 chr8 17407821 . C G 936.45 PASS AF=0.516854;AO=92;DP=179;FAO=92;FDP=178;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.0507083;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2592;QD=21.0437;RBI=0.0507247;REFB=-0.0219923;REVB=0.00129034;RO=85;SAF=41;SAR=51;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116592;STB=0.509495;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0171836;OID=.;OPOS=17407821;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:85:86:92:92:0.516854:51:41:39:46:51:41:40:46 chr8 17412140 . G C 600.97 PASS AF=0.476923;AO=62;DP=130;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.00149732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.355;QD=18.4913;RBI=0.0235386;REFB=-0.0205551;REVB=-0.023491;RO=68;SAF=27;SAR=35;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116407;STB=0.564495;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0296467;OID=.;OPOS=17412140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:68:68:62:62:0.476923:35:27:38:30:35:27:38:30 chr8 17424920 . T C 344.68 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750459;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.729;QD=55.1484;RBI=0.0211242;REFB=0;REVB=0.0197462;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1891e-05;OID=.;OPOS=17424920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr8 17425296 . C T 166.5 PASS AF=0.328358;AO=20;DP=66;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0220962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.191;QD=9.94007;RBI=0.0261028;REFB=0.0023315;REVB=-0.0138965;RO=44;SAF=10;SAR=10;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159018;STB=0.567807;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=-0.00893278;OID=.;OPOS=17425296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:44:45:20:22:0.328358:10:10:28:16:10:12:29:16 chr8 17486282 . T C 730.56 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0878841;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.818;QD=63.5266;RBI=0.08833;REFB=0;REVB=0.00886421;RO=0;SAF=8;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19647e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297258;OID=.;OPOS=17486282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:38:8:0:0:38:8:0:0 chr8 17500223 . T C 370.35 PASS AF=0.362903;AO=45;DP=124;FAO=45;FDP=124;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.0231868;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.711;QD=11.9468;RBI=0.0232451;REFB=-0.00361275;REVB=-0.00164563;RO=79;SAF=19;SAR=26;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514542;STB=0.50294;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00499303;OID=.;OPOS=17500223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:79:79:45:45:0.362903:26:19:33:46:26:19:33:46 chr8 17502900 . CTGAT C 315.42 PASS AF=0.561404;AO=29;DP=58;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0103431;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=4;MLLD=223.509;QD=22.1344;RBI=0.0269291;REFB=-0.00346131;REVB=-0.0248635;RO=24;SAF=11;SAR=18;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20118;STB=0.599937;STBP=0.108;TYPE=del;VARB=0.0028988;OID=.;OPOS=17502901;OREF=TGAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.561404:29:58:32:57:25:12:20:15:10:99:24:11:18:15:9 chr8 17503125 . C T 1917.67 PASS AF=0.962406;AO=130;DP=133;FAO=128;FDP=133;FR=.;FRO=5;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0308449;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.0739;QD=57.6741;RBI=0.0308616;REFB=-0.167376;REVB=0.0010156;RO=2;SAF=71;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00134018;STB=0.509884;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00373568;OID=.;OPOS=17503125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:133:133:2:5:130:128:0.962406:59:71:1:1:59:69:4:1 chr8 17503205 . G A 494.25 PASS AF=0.481818;AO=50;DP=106;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.000809714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.468;QD=17.9726;RBI=0.0203513;REFB=-0.00054552;REVB=-0.0203352;RO=53;SAF=27;SAR=23;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633773;STB=0.519224;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.000452232;OID=.;OPOS=17503205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:110:53:57:50:53:0.481818:23:27:25:28:25:28:28:29 chr8 17503270 . G C 835.03 PASS AF=0.967742;AO=56;DP=61;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0127053;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.859;QD=53.8727;RBI=0.0762975;REFB=-0.0679598;REVB=0.0752322;RO=2;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254762;STB=0.512191;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00568607;OID=.;OPOS=17503270;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:61:62:2:2:56:60:0.967742:36:20:0:2:40:20:0:2 chr8 17503501 . G A 865.48 PASS AF=0.443396;AO=94;DP=212;FAO=94;FDP=212;FR=.;FRO=118;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=54;FWDB=0.0104867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.124;QD=16.3297;RBI=0.0193299;REFB=-0.00494738;REVB=0.016238;RO=118;SAF=34;SAR=60;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184564;STB=0.602684;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00842339;OID=.;OPOS=17503501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:118:118:94:94:0.443396:60:34:64:54:60:34:64:54 chr8 17541999 . T C 399.45 PASS AF=0.414414;AO=45;DP=110;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.00623892;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.928;QD=14.3946;RBI=0.012337;REFB=-0.0196553;REVB=-0.0106432;RO=65;SAF=17;SAR=28;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1546;STB=0.578202;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0321433;OID=.;OPOS=17541999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:65:65:45:46:0.414414:28:17:34:31:28:18:34:31 chr8 17611886 . G A 1607.05 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00659011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.714;QD=60.0766;RBI=0.026386;REFB=0;REVB=0.0255498;RO=0;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78839e-05;OID=.;OPOS=17611886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:60:47:0:0:60:47:0:0 chr8 17612456 . C T 773.19 PASS AF=0.907692;AO=58;DP=65;FAO=59;FDP=65;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.00167952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.146;QD=47.5806;RBI=0.0447771;REFB=-0.0538778;REVB=-0.0447456;RO=6;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100677;STB=0.551707;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0237151;OID=.;OPOS=17612456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:65:65:6:6:58:59:0.907692:25:33:0:6:26:33:0:6 chr8 17612875 . A G 613.34 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.533;QD=61.3341;RBI=0.0661347;REFB=0;REVB=0.021958;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037511;OID=.;OPOS=17612875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0 chr8 17739538 . T C 483.28 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.646;QD=58.5792;RBI=0.0151334;REFB=0;REVB=0.0146217;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182037;OID=.;OPOS=17739538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr8 17743020 . G A 1131.17 PASS AF=0.987179;AO=75;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00286361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.183;QD=58.0086;RBI=0.00876579;REFB=-0.218025;REVB=0.00828486;RO=1;SAF=28;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996177;STB=0.505049;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000643598;OID=.;OPOS=17743020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:77:78:1:1:75:77:0.987179:47:28:0:1:49:28:0:1 chr8 17796381 . AAC AGT 958.24 PASS AF=1;AO=58;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00557294;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=2;MLLD=253.45;QD=58.9686;RBI=0.0515452;REFB=0;REVB=0.051243;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.04962e-05;OID=.;OPOS=17796382;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=AGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:58:66:65:65:0:33:32:0:0:5:0:31:27:0:0 chr8 17814915 . A G 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.018;QD=57.7114;RBI=0.00796503;REFB=0;REVB=0.00465002;RO=0;SAF=16;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74604e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09985e-06;OID=.;OPOS=17814915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:43:16:0:0:43:16:0:0 chr8 17817553 . G C,T 586.72 PASS AF=0.0512821,0.948718;AO=2,37;DP=39;FAO=2,37;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=2,18;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319721,0.0107666;FXX=0.0249938;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=235.027,282.212;QD=60.1767;RBI=0.0134618,0.0107723;REFB=0,0;REVB=0.0130766,0.000351004;RO=0;SAF=2,18;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.68991e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0565533,-0.00273302;OID=.,.;OPOS=17817553,17817553;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:39:39:0:0:2,37:2,37:0.0512821,0.948718:0,19:2,18:0:0:0,19:2,18:0:0 chr8 17820714 . A T 854.57 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314807;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1097;QD=57.9371;RBI=0.0940011;REFB=0;REVB=0.0885729;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132961;OID=.;OPOS=17820714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chr8 17885406 . C G 193.49 PASS AF=0.75;AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0398177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4588;QD=32.2487;RBI=0.0450577;REFB=0.0244406;REVB=-0.0210892;RO=6;SAF=6;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0102516;OID=.;OPOS=17885406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:6:6:18:18:0.75:12:6:2:4:12:6:2:4 chr8 17918934 . A G 2070.49 PASS AF=0.498795;AO=207;DP=415;FAO=207;FDP=415;FR=.;FRO=208;FSAF=93;FSAR=114;FSRF=105;FSRR=103;FWDB=0.00770039;FXX=0.00479605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9336;QD=19.9566;RBI=0.00832243;REFB=-0.0173739;REVB=0.00315701;RO=206;SAF=93;SAR=114;SRF=104;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508759;STB=0.52796;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0201967;OID=.;OPOS=17918934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:415:415:206:208:207:207:0.498795:114:93:104:102:114:93:105:103 chr8 17928811 . C T 554.13 PASS AF=0.410959;AO=60;DP=146;FAO=60;FDP=146;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=38;FWDB=0.00631185;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.383;QD=15.1816;RBI=0.0111735;REFB=-0.00248465;REVB=0.00921991;RO=85;SAF=28;SAR=32;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102046;STB=0.553716;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00437566;OID=.;OPOS=17928811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:85:86:60:60:0.410959:32:28:48:37:32:28:48:38 chr8 17930727 . G A 129.01 PASS AF=0.210526;AO=19;DP=96;FAO=20;FDP=95;FR=.;FRO=75;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.0038974;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.361;QD=5.43214;RBI=0.014514;REFB=-0.00318305;REVB=-0.0139809;RO=74;SAF=11;SAR=8;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14973;STB=0.604937;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00509726;OID=.;OPOS=17930727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:74:75:19:20:0.210526:8:11:34:40:8:12:35:40 chr8 17930734 . C A 147.39 PASS AF=0.226804;AO=22;DP=97;FAO=22;FDP=97;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.00397496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3133;QD=6.07772;RBI=0.0581966;REFB=-0.0052681;REVB=-0.0580607;RO=74;SAF=13;SAR=9;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163574;STB=0.605683;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00753181;OID=.;OPOS=17930734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:74:75:22:22:0.226804:9:13:34:40:9:13:34:41 chr8 17930772 . C T 131.93 PASS AF=0.232558;AO=20;DP=87;FAO=20;FDP=86;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0393995;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2393;QD=6.13636;RBI=0.0408142;REFB=-0.00215773;REVB=-0.0106525;RO=66;SAF=12;SAR=8;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216034;STB=0.632897;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00805003;OID=.;OPOS=17930772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:66:66:20:20:0.232558:8:12:28:38:8:12:28:38 chr8 18077007 . G C 715.8 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0547214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.686;QD=60.9191;RBI=0.055407;REFB=-0.0615745;REVB=0.00868938;RO=0;SAF=8;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19647e-08;STB=0.529399;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.000293857;OID=.;OPOS=18077007;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:47:47:0:1:46:46:0.978723:38:8:0:0:38:8:1:0 chr8 18080644 . A T 187.81 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00476803;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.159;QD=20.3041;RBI=0.00626111;REFB=-0.00346808;REVB=-0.004058;RO=18;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205733;STB=0.511616;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0031573;OID=.;OPOS=18080644;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:11:8:8:10:11:8:8:10 chr8 18080651 . A C 172.87 PASS AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00289328;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8615;QD=24.696;RBI=0.0056454;REFB=-0.00556753;REVB=-0.00484763;RO=11;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524966;STB=0.529377;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00393397;OID=.;OPOS=18080651;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:8:9:5:6:8:9:5:6 chr8 18080747 . T G 385.01 PASS AF=0.506494;AO=29;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0315301;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4767;QD=20.0005;RBI=0.211095;REFB=-0.0123348;REVB=0.208727;RO=36;SAF=23;SAR=6;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406137;STB=0.595964;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0188986;OID=.;OPOS=18080747;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:36:38:29:39:0.506494:6:23:15:21:16:23:15:23 chr8 18080923 . G A 950.46 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0564;QD=58.4897;RBI=0.0152554;REFB=0;REVB=-0.0106758;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012182;OID=.;OPOS=18080923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:26:38:0:0:27:38:0:0 chr8 18257795 . C T 81.27 PASS AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00264961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.361;QD=8.12688;RBI=0.00412999;REFB=0.00625918;REVB=0.00316803;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734822;STB=0.545372;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-0.0350668;OID=.;OPOS=18257795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:5:6:14:15:5:6:14:15 chr8 18258316 . G A 757.14 PASS AF=1;AO=41;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.539;QD=57.1429;RBI=0.0712098;REFB=0;REVB=0.0317769;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000861912;OID=.;OPOS=18258316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:41:53:1:28:13:0:0:29:24:0:0 chr8 18258370 . G A 325.33 PASS AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00565337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6472;QD=22.4365;RBI=0.0277537;REFB=-0.0254695;REVB=-0.0271718;RO=25;SAF=24;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275868;STB=0.652964;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.027279;OID=.;OPOS=18258370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:25:33:33:0.568966:9:24:10:15:9:24:10:15 chr8 18388177 . T G 286.29 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.0403718;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4704;QD=15.4753;RBI=0.0406232;REFB=-0.00109291;REVB=0.00451266;RO=41;SAF=22;SAR=10;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330179;STB=0.51361;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00200115;OID=.;OPOS=18388177;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:41:42:32:32:0.432432:10:22:27:14:10:22:28:14 chr8 18457957 . A G 885.62 PASS AF=0.957746;AO=61;DP=64;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000453585;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.0309;QD=49.8942;RBI=0.0341722;REFB=-0.0567961;REVB=0.0341692;RO=3;SAF=24;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00557215;STB=0.503424;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0102101;OID=.;OPOS=18457957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:64:71:3:3:61:68:0.957746:37:24:1:2:40:28:1:2 chr8 18620570 . T C 388.68 PASS AF=0.427083;AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.0184417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5152;QD=16.1952;RBI=0.0502104;REFB=-0.0164551;REVB=-0.046701;RO=54;SAF=13;SAR=28;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060484;STB=0.541504;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0260236;OID=.;OPOS=18620570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:54:55:41:41:0.427083:28:13:20:34:28:13:21:34 chr8 18656805 . G A 286.41 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.000729107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.798;QD=15.6937;RBI=0.0117171;REFB=-0.0162096;REVB=0.0116944;RO=41;SAF=18;SAR=14;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146493;STB=0.582572;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0159476;OID=.;OPOS=18656805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:14:18:17:24:14:18:17:24 chr8 18729459 . T C 556.6 PASS AF=0.487395;AO=58;DP=119;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.00884368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.41;QD=18.7092;RBI=0.0088532;REFB=-0.0217527;REVB=-0.00041058;RO=61;SAF=28;SAR=30;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387207;STB=0.521429;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0237139;OID=.;OPOS=18729459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:61:61:58:58:0.487395:30:28:32:29:30:28:32:29 chr8 18729496 . G A 290.07 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.000451221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.999;QD=16.5753;RBI=0.00549573;REFB=-0.0102103;REVB=-0.00547717;RO=38;SAF=10;SAR=22;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192656;STB=0.608708;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0111344;OID=.;OPOS=18729496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:22:10:19:19:22:10:19:19 chr8 18729817 . GT AG 911.53 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0248579;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.933;QD=55.244;RBI=0.0457996;REFB=-0.046638;REVB=0.0384667;RO=2;SAF=32;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286044;STB=0.515147;STBP=0.234;TYPE=mnp;VARB=0.000443203;OID=.;OPOS=18729817;OREF=GT;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:32:32:2:0:32:32:2:0 chr8 19192332 . G T 269.2 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.000721001;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.85;QD=21.9753;RBI=0.00124476;REFB=-0.0243021;REVB=0.00101468;RO=24;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195919;STB=0.609669;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0178437;OID=.;OPOS=19192332;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:24:24:25:25:0.510204:15:10:15:9:15:10:15:9 chr8 19218766 . A G 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0408247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0923;QD=19.5229;RBI=0.0428043;REFB=0.0350858;REVB=-0.0128665;RO=12;SAF=9;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250716;STB=0.642653;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.0295365;OID=.;OPOS=19218766;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:5:9:4:8:5:9:4:8 chr8 19252272 . GAAAGT G 88.95 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00782112;FXX=0.0512689;HRUN=3;LEN=5;MLLD=246.767;QD=9.61588;RBI=0.0228223;REFB=-0.0152418;REVB=-0.0214403;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132436;STB=0.50632;STBP=0.963;TYPE=del;VARB=0.0228427;OID=.;OPOS=19252273;OREF=AAAGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.378378:14:32:14:37:23:5:9:8:15:88:17:5:9:4:13 chr8 19362768 . C T 229.17 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0189622;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.401;QD=13.8893;RBI=0.0279078;REFB=-0.0153103;REVB=0.0204763;RO=40;SAF=11;SAR=16;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224825;STB=0.635664;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0288107;OID=.;OPOS=19362768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:40:39:27:27:0.409091:16:11:25:15:16:11:25:14 chr8 19819724 . C G 506.83 PASS AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00425465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.789;QD=20.4781;RBI=0.0618157;REFB=-0.0189644;REVB=-0.0616691;RO=50;SAF=21;SAR=28;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106125;STB=0.50588;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0239119;OID=.;OPOS=19819724;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:28:21:22:28:28:21:22:28 chr8 19822810 . C T 277.36 PASS AF=0.508475;AO=25;DP=54;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00285339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.28;QD=18.8037;RBI=0.00957283;REFB=-0.0161643;REVB=-0.00913768;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240738;STB=0.609319;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0214836;OID=.;OPOS=19822810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:59:26:29:25:30:0.508475:8:17:11:15:11:19:12:17 chr8 19824626 . C CTT 473.94 PASS AF=0.457317;AO=72;DP=166;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=0.00454872;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=2;MLLD=42.922;QD=11.5594;RBI=0.0343353;REFB=-0.0114359;REVB=-0.0340327;RO=88;SAF=46;SAR=26;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119624;STB=0.571703;STBP=0.108;TYPE=ins;VARB=0.0130953;OID=.;OPOS=19824627;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.457317:72:166:75:164:89:49:26:47:42:99:88:46:26:46:42 chr8 19824667 . C T 623.47 PASS AF=0.436709;AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=158;FR=.;FRO=89;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.00863897;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.624;QD=15.784;RBI=0.010611;REFB=-0.0103977;REVB=-0.00616127;RO=88;SAF=41;SAR=28;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118723;STB=0.56953;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0131889;OID=.;OPOS=19824667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:88:89:69:69:0.436709:28:41:42:46:28:41:42:47 chr8 20008206 . G A 246.62 PASS AF=0.489796;AO=20;DP=46;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0399873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.046;QD=20.1319;RBI=0.0444026;REFB=-0.0257409;REVB=0.0193031;RO=25;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671446;STB=0.50819;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0254024;OID=.;OPOS=20008206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:25:25:20:24:0.489796:14:6:9:16:15:9:9:16 chr8 20036713 . A G 684.11 PASS AF=0.564103;AO=66;DP=117;FAO=66;FDP=117;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0575597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.715;QD=23.3882;RBI=0.0591329;REFB=-0.00583456;REVB=0.0135491;RO=51;SAF=21;SAR=45;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660894;STB=0.53617;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00360185;OID=.;OPOS=20036713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:51:51:66:66:0.564103:45:21:20:31:45:21:20:31 chr8 20068163 . T G 2270.79 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655367;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.438;QD=63.5186;RBI=0.071041;REFB=0;REVB=0.0274184;RO=0;SAF=66;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107778;OID=.;OPOS=20068163;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:143:0:0:140:143:1:74:66:0:0:75:68:0:0 chr8 20147748 . G T 255.66 PASS AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0228875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.321;QD=29.2186;RBI=0.0389948;REFB=-0.0271811;REVB=0.0315715;RO=12;SAF=11;SAR=12;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907561;STB=0.549957;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0109906;OID=.;OPOS=20147748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:12:11:4:8:12:11:4:8 chr8 21455978 . GT G 458.31 PASS AF=1;AO=40;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215707;FXX=0.0454442;HRUN=6;LEN=1;MLLD=19.2488;QD=43.6482;RBI=0.287483;REFB=0;REVB=-0.286672;RO=0;SAF=35;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00996753;OID=.;OPOS=21455979;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:40:44:42:42:0:36:6:0:0:9:0:35:5:0:0 chr8 21455993 . C T 705.49 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0384518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.642;QD=58.7911;RBI=0.0386226;REFB=-0.129768;REVB=-0.00362855;RO=0;SAF=40;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571395;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.000408188;OID=.;OPOS=21455993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:48:48:0:2:46:46:0.958333:6:40:0:0:6:40:0:2 chr8 21456116 . G A 820.31 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0670989;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.149;QD=55.6142;RBI=0.0716766;REFB=-0.140879;REVB=0.0252045;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50746;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00162373;OID=.;OPOS=21456116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:59:59:0:1:58:58:0.983051:33:25:0:0:33:25:0:1 chr8 21456138 . C T 430.21 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.00916964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.016;QD=22.6424;RBI=0.011758;REFB=0.00471944;REVB=0.00735987;RO=34;SAF=24;SAR=18;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222453;STB=0.622165;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00261118;OID=.;OPOS=21456138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:18:24:10:24:18:24:10:24 chr8 21550800 . A T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.73;QD=56.7063;RBI=0.0326633;REFB=0;REVB=0.0187131;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295701;OID=.;OPOS=21550800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr8 21608105 . C G 68.87 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0510957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8539;QD=15.3041;RBI=0.0655231;REFB=0.00642257;REVB=0.0410184;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372859;STB=0.713877;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000314826;OID=.;OPOS=21608105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:1:8:4:5:1:8 chr8 21640374 . C A 100.75 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00703697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.584;QD=16.1192;RBI=0.0153504;REFB=-0.010362;REVB=0.0136425;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519967;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00867614;OID=.;OPOS=21640374;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:13:12:12:0.48:6:6:6:6:6:6:6:7 chr8 21766900 . G A 673.86 PASS AF=0.59596;AO=59;DP=99;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0125593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.996;QD=27.2265;RBI=0.0128797;REFB=-0.010065;REVB=0.00285504;RO=40;SAF=16;SAR=43;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026632;STB=0.514525;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.006259;OID=.;OPOS=21766900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:40:40:59:59:0.59596:43:16:12:28:43:16:12:28 chr8 21767275 . C G 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0054754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.225;QD=14.6519;RBI=0.00555411;REFB=-0.0185159;REVB=-0.000931752;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391876;STB=0.726669;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0209293;OID=.;OPOS=21767275;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:5:0:3:3:5:0 chr8 21833965 . C T 169.69 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0156611;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.19;QD=15.7849;RBI=0.0280764;REFB=-0.00408371;REVB=-0.0233027;RO=25;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324969;STB=0.685592;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00993476;OID=.;OPOS=21833965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:7:11:7:18:7:11:7:18 chr8 21846586 . G C 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.335;QD=58.4197;RBI=0.04354;REFB=0;REVB=0.0388921;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.58473e-05;OID=.;OPOS=21846586;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0 chr8 21862551 . A G 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.71;QD=51.1822;RBI=0.0485649;REFB=0;REVB=-2.54102e-05;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000813289;OID=.;OPOS=21862551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr8 21926975 . GC G 53.23 PASS AF=0.276316;AO=24;DP=76;FAO=21;FDP=76;FR=.;FRO=55;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=-0.00840595;FXX=0.0129853;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.0226;QD=2.80174;RBI=0.0424514;REFB=-0.0589294;REVB=-0.0416108;RO=48;SAF=2;SAR=22;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447506;STB=0.759688;STBP=0.026;TYPE=del;VARB=0.0780619;OID=.;OPOS=21926976;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.276316:24:76:21:76:55:2:19:17:38:53:48:2:22:15:33 chr8 21927460 . C G 582.46 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0117926;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.468;QD=58.246;RBI=0.0171552;REFB=-0.0240809;REVB=-0.0124594;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253303;STB=0.513507;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=9.00019e-05;OID=.;OPOS=21927460;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:21:18:1:0:21:18:1:0 chr8 21939435 . C T 1390.09 PASS AF=0.925926;AO=100;DP=108;FAO=100;FDP=108;FR=.;FRO=8;FSAF=33;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0685844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2416;QD=51.4848;RBI=0.0719641;REFB=-0.0799026;REVB=0.021795;RO=7;SAF=33;SAR=67;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470268;STB=0.528163;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0290674;OID=.;OPOS=21939435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:108:108:7:8:100:100:0.925926:67:33:0:7:67:33:0:8 chr8 21961834 . G A 1231.34 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00759818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5165;QD=60.0654;RBI=0.00862573;REFB=0.0422146;REVB=0.00408299;RO=1;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106407;STB=0.505617;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-0.00175297;OID=.;OPOS=21961834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:44:37:0:1:44:37:0:1 chr8 21965113 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0924443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2252;QD=57.6801;RBI=0.0924993;REFB=0;REVB=0.00318857;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00142923;OID=.;OPOS=21965113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0 chr8 21997738 . A T 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0167366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.427;QD=14.1385;RBI=0.0196141;REFB=-0.0100961;REVB=0.0102274;RO=20;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726024;STB=0.542312;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0109363;OID=.;OPOS=21997738;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:8:6:10:10:8:6:10:10 chr8 22021037 . C A 137.99 PASS AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0163718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.246;QD=29.0498;RBI=0.0293565;REFB=0.0054028;REVB=0.0243674;RO=5;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174113;STB=0.596878;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-0.0029515;OID=.;OPOS=22021037;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:8:6:4:1:8:6:4:1 chr8 22021517 . G A 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0291315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.103;QD=15.8391;RBI=0.0379732;REFB=-0.000451016;REVB=-0.0243581;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287934;STB=0.666295;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000311333;OID=.;OPOS=22021517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:4:4:1:6:4:4:1:6 chr8 22021883 . G A 123.72 PASS AF=0.348837;AO=12;DP=41;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0182501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.985;QD=11.5088;RBI=0.0303027;REFB=-0.0226033;REVB=0.0241907;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131088;STB=0.567812;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0446477;OID=.;OPOS=22021883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:23:28:12:15:0.348837:5:7:16:7:8:7:16:12 chr8 22021934 . G A 192.83 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.02049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9906;QD=14.8332;RBI=0.0272948;REFB=-0.0296682;REVB=0.0180324;RO=29;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272211;STB=0.664742;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0197558;OID=.;OPOS=22021934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:30:22:22:0.423077:15:7:17:12:15:7:18:12 chr8 22079355 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.004;QD=54.5177;RBI=0.0127908;REFB=0;REVB=0.0119137;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100024;OID=.;OPOS=22079355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr8 22105502 . T C 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00407092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.195;QD=19.6924;RBI=0.00536565;REFB=-0.0176596;REVB=0.00349541;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120775;STB=0.567516;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0253292;OID=.;OPOS=22105502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:12:14:10:15:12:14:10:15 chr8 22108611 . A C 346.11 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0757109;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8225;QD=19.2282;RBI=0.0770139;REFB=-0.0409567;REVB=0.0141072;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499017;STB=0.527762;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0514471;OID=.;OPOS=22108611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:17:19:17:19:17:19:17:19 chr8 22262321 . T C 1478.96 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00611093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.03;QD=62.9343;RBI=0.0399859;REFB=0;REVB=-0.0395162;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.21581e-05;OID=.;OPOS=22262321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:92:94:1:46:46:0:0:47:47:0:0 chr8 22262418 . A G 1012.1 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0322318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.855;QD=57.8344;RBI=0.0345056;REFB=-0.0902526;REVB=0.0123186;RO=1;SAF=29;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160211;STB=0.508472;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000174666;OID=.;OPOS=22262418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:40:29:1:0:40:29:1:0 chr8 22279010 . G GGGA 925.44 PASS AF=1;AO=61;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250431;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=3;MLLD=154.068;QD=57.8397;RBI=0.0322785;REFB=0;REVB=0.0203653;RO=3;SAF=32;SAR=29;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125948;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-3.08992e-05;OID=.;OPOS=22279011;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:61:65:64:64:0:34:30:0:0:5:3:32:29:2:1 chr8 22428658 . T C 289.36 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00391467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6614;QD=52.6103;RBI=0.0134781;REFB=0;REVB=0.0128971;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31634e-05;OID=.;OPOS=22428658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:14:7:0:0:15:7:0:0 chr8 22463623 . C T 831.37 PASS AF=0.462366;AO=86;DP=184;FAO=86;FDP=186;FR=.;FRO=100;FSAF=61;FSAR=25;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=0.00469972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.3572;QD=17.879;RBI=0.00702688;REFB=-0.0132575;REVB=0.00522396;RO=97;SAF=61;SAR=25;SRF=52;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183263;STB=0.601002;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.026135;OID=.;OPOS=22463623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:186:97:100:86:86:0.462366:25:61:52:45:25:61:54:46 chr8 22471824 . G A 195.08 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00840074;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.703;QD=12.3859;RBI=0.0129508;REFB=-0.0106484;REVB=0.00985653;RO=38;SAF=13;SAR=11;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444893;STB=0.533747;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0121069;OID=.;OPOS=22471824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:38:39:24:24:0.380952:11:13:19:19:11:13:19:20 chr8 22473158 . C T 246.84 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.011839;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.922;QD=17.9523;RBI=0.01468;REFB=-0.00127277;REVB=0.00867995;RO=28;SAF=10;SAR=17;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246199;STB=0.637968;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00155834;OID=.;OPOS=22473158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:17:10:18:10:17:10:18:10 chr8 22473465 . T C 364.33 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0187139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.131;QD=21.1204;RBI=0.0283363;REFB=-0.0491585;REVB=0.0212777;RO=32;SAF=17;SAR=20;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862826;STB=0.547705;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0386673;OID=.;OPOS=22473465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:20:17:18:14:20:17:18:14 chr8 22473850 . T C 378.95 PASS AF=0.688889;AO=31;DP=45;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0340108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0533;QD=33.6843;RBI=0.0442639;REFB=0.00840403;REVB=0.0283294;RO=14;SAF=18;SAR=13;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794435;STB=0.543256;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00395918;OID=.;OPOS=22473850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:14:14:31:31:0.688889:13:18:10:4:13:18:10:4 chr8 22477131 . ACAT A 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0118438;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=196.916;QD=19.156;RBI=0.0255025;REFB=-0.0113329;REVB=-0.0225854;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626175;STB=0.523787;STBP=0.799;TYPE=del;VARB=0.014643;OID=.;OPOS=22477132;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477273:21:43:21:44:23:11:10:11:12:99:22:11:10:10:12 chr8 22481449 . A G 1079.05 PASS AF=0.47561;AO=81;DP=221;FAO=117;FDP=246;FR=.;FRO=129;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=68;FSRR=61;FWDB=0.110734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.188;QD=17.5455;RBI=0.113074;REFB=-0.0532824;REVB=-0.0228883;RO=90;SAF=15;SAR=66;SRF=32;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223882;STB=0.552626;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0396312;OID=.;OPOS=22481449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:246:90:129:81:117:0.47561:66:15:32:58:67:50:68:61 chr8 22482851 . A C 517.31 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671718;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.571;QD=59.1209;RBI=0.0723753;REFB=0;REVB=0.0269468;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134552;OID=.;OPOS=22482851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:20:15:0:0 chr8 22491980 . G T 2181.09 PASS AF=0.992857;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0135306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.184;QD=62.3169;RBI=0.0172971;REFB=0.00880395;REVB=0.0107756;RO=0;SAF=65;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37847e-08;STB=0.503875;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.000179545;OID=.;OPOS=22491980;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:139:140:0:1:139:139:0.992857:74:65:0:0:75:64:1:0 chr8 22492052 . G A 1453.45 PASS AF=0.920354;AO=104;DP=113;FAO=104;FDP=113;FR=.;FRO=9;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00452437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.625;QD=51.4497;RBI=0.0047377;REFB=-0.0283879;REVB=0.00140566;RO=3;SAF=55;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0073562;STB=0.519935;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.000700748;OID=.;OPOS=22492052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:113:113:3:9:104:104:0.920354:49:55:2:1:49:55:7:2 chr8 22864622 . T C 1157.34 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0510672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5806;QD=59.3507;RBI=0.0519835;REFB=0.0215362;REVB=-0.00971721;RO=1;SAF=31;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150214;STB=0.507934;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.00316658;OID=.;OPOS=22864622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:46:31:1:0:46:31:1:0 chr8 22875909 . A G 122.4 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0011483;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.121;QD=15.7939;RBI=0.00547336;REFB=-0.00679996;REVB=-0.00535155;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393845;STB=0.726953;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.017682;OID=.;OPOS=22875909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:10:4:12:5:10:4:12:5 chr8 22886020 . A G 1084.52 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199629;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.963;QD=60.251;RBI=0.0225634;REFB=0;REVB=0.0105161;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97373e-05;OID=.;OPOS=22886020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:39:32:0:0:40:32:0:0 chr8 22926313 . G A 203.51 PASS AF=0.703704;AO=15;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0102938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.49;QD=30.1503;RBI=0.0168645;REFB=-0.0463955;REVB=0.0133584;RO=5;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179999;STB=0.560279;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0183988;OID=.;OPOS=22926313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:5:8:15:19:0.703704:9:6:4:1:13:6:4:4 chr8 22960704 . G C 513.46 PASS AF=0.571429;AO=45;DP=82;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0339965;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0889;QD=24.4504;RBI=0.0354723;REFB=-0.00839263;REVB=0.0101254;RO=37;SAF=27;SAR=18;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726098;STB=0.536275;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0180042;OID=.;OPOS=22960704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:37:36:45:48:0.571429:18:27:19:18:20:28:18:18 chr8 22974325 . G A 130.08 PASS AF=0.866667;AO=11;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0514888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.032;QD=34.6889;RBI=0.0836018;REFB=-0.119265;REVB=0.0658647;RO=1;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815441;STB=0.583203;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0334271;OID=.;OPOS=22974325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:1:2:11:13:0.866667:6:5:1:0:8:5:2:0 chr8 22974450 . T C 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0411338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.697;QD=35.5741;RBI=0.077578;REFB=0;REVB=-0.0657751;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00214533;OID=.;OPOS=22974450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr8 23001988 . A G 722.13 PASS AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00671586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.233;QD=54.5001;RBI=0.107921;REFB=0.00655477;REVB=-0.107712;RO=1;SAF=28;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165215;STB=0.508471;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.000746693;OID=.;OPOS=23001988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:53:1:1:51:52:0.981132:23:28:1:0:23:29:1:0 chr8 23021346 . G A 781.79 PASS AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00531759;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.615;QD=52.1196;RBI=0.00817302;REFB=0.0126054;REVB=0.00620658;RO=2;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336561;STB=0.526307;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-7.85312e-05;OID=.;OPOS=23021346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:60:60:2:3:57:57:0.95:27:30:0:2:27:30:0:3 chr8 23049292 . C T 850.2 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.178;QD=57.6404;RBI=0.0575065;REFB=0;REVB=0.0375131;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001385;OID=.;OPOS=23049292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:59:0:0:56:59:1:24:32:0:0:25:34:0:0 chr8 23059324 . C G 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0239;QD=61.6826;RBI=0.0475299;REFB=0;REVB=0.0328384;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000930386;OID=.;OPOS=23059324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0 chr8 23060256 . T C 1008.46 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2693;QD=59.3212;RBI=0.0441296;REFB=0;REVB=0.0314911;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60063e-06;OID=.;OPOS=23060256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0 chr8 23117740 . C T 449.02 PASS AF=0.462264;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.00118892;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=258.613;QD=16.9442;RBI=0.00373054;REFB=-0.00695583;REVB=-0.00353601;RO=57;SAF=18;SAR=31;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00111417;STB=0.500621;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.00699698;OID=.;OPOS=23117740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:57:57:49:49:0.462264:31:18:21:36:31:18:21:36 chr8 23118304 . C T 728.97 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00808616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.576;QD=57.1739;RBI=0.0167008;REFB=0;REVB=0.0146127;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113128;OID=.;OPOS=23118304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr8 23147564 . G A 776.91 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.668;QD=62.1524;RBI=0.140973;REFB=-0.11006;REVB=0.0980046;RO=1;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00656266;OID=.;OPOS=23147564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:50:50:1:0:49:50:1:23:26:0:1:24:26:0:0 chr8 23148930 . A G 2407.92 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.743;QD=64.2113;RBI=0.0360789;REFB=0;REVB=0.0230797;RO=0;SAF=72;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74596e-05;OID=.;OPOS=23148930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:78:72:0:0:78:72:0:0 chr8 23148940 . G A 2359.82 PASS AF=1;AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233194;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.766;QD=61.2941;RBI=0.036945;REFB=0;REVB=0.0286555;RO=0;SAF=74;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15448e-05;OID=.;OPOS=23148940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:155:154:0:0:154:154:1:80:74:0:0:80:74:0:0 chr8 23150878 . T G 1767.75 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.786;QD=60.957;RBI=0.0278323;REFB=0;REVB=0.00770866;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97575e-05;OID=.;OPOS=23150878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:116:0:0:114:116:1:59:55:0:0:59:57:0:0 chr8 23152334 . A G 1208.81 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.091;QD=61.2056;RBI=0.0386726;REFB=0;REVB=0.00655991;RO=0;SAF=19;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69287e-05;OID=.;OPOS=23152334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:60:19:0:0:60:19:0:0 chr8 23153022 . T C 1651.53 PASS AF=1;AO=109;DP=112;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00865971;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.167;QD=60.6067;RBI=0.00866659;REFB=0;REVB=-0.000345066;RO=0;SAF=52;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53715e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93931e-05;OID=.;OPOS=23153022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:109:0:0:109:109:1:57:52:0:0:57:52:0:0 chr8 23154982 . C T 144.17 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.317;QD=44.3608;RBI=0.0316796;REFB=0;REVB=0.0249382;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185485;OID=.;OPOS=23154982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:11:13:1:2:9:0:0:3:10:0:0 chr8 23154989 . T G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00609855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.026;QD=45.8068;RBI=0.0516762;REFB=0;REVB=0.0513151;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046053;OID=.;OPOS=23154989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr8 23155130 . A C 51.54 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0143215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.4039;QD=18.7432;RBI=0.0157193;REFB=-0.00331459;REVB=-0.00648007;RO=3;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505826;STB=0.567381;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=-8.25867e-05;OID=.;OPOS=23155130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:3:4:7:7:0.636364:3:4:2:1:3:4:3:1 chr8 23167353 . T G 246.59 PASS AF=0.521739;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.018875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.607;QD=21.4429;RBI=0.0249679;REFB=-0.0273731;REVB=0.0163442;RO=22;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968126;STB=0.518503;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0293315;OID=.;OPOS=23167353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:23:24:0.521739:14:9:11:11:14:10:10:12 chr8 23174499 . G A 125.83 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.104241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5243;QD=18.6419;RBI=0.118766;REFB=-0.0311812;REVB=0.0569138;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224043;STB=0.512802;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0364794;OID=.;OPOS=23174499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:10:4:4:9:10:4:4:9 chr8 23186007 . T C 466.35 PASS AF=0.542169;AO=44;DP=82;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0491481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.104;QD=22.4747;RBI=0.0497187;REFB=-0.00166494;REVB=0.00751035;RO=38;SAF=24;SAR=20;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147928;STB=0.585069;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0022367;OID=.;OPOS=23186007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:38:38:44:45:0.542169:20:24:14:24:20:25:14:24 chr8 23190926 . C T 304.13 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00948612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.453;QD=17.379;RBI=0.0177144;REFB=-0.0226142;REVB=-0.0149603;RO=37;SAF=24;SAR=9;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593092;STB=0.533313;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0171556;OID=.;OPOS=23190926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:9:24:25:12:9:24:25:12 chr8 23190941 . T C 360.81 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.005026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.638;QD=17.6005;RBI=0.0481342;REFB=-0.0176897;REVB=-0.0478711;RO=43;SAF=27;SAR=11;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407961;STB=0.518423;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0244102;OID=.;OPOS=23190941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:43:44:38:38:0.463415:11:27:29:14:11:27:30:14 chr8 23392733 . C T 210.86 PASS AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0796275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0698;QD=12.0494;RBI=0.080857;REFB=-0.0200822;REVB=0.0140469;RO=42;SAF=10;SAR=16;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416177;STB=0.516117;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.048356;OID=.;OPOS=23392733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:42:44:26:26:0.371429:16:10:16:26:16:10:18:26 chr8 23423669 . A G 102.43 PASS AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0156054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.35;QD=7.73067;RBI=0.022226;REFB=-0.00108812;REVB=-0.0158261;RO=39;SAF=6;SAR=8;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131295;STB=0.58053;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00241164;OID=.;OPOS=23423669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:39:39:14:14:0.264151:8:6:21:18:8:6:21:18 chr8 23423758 . G A 190.92 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00947923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.56;QD=11.5707;RBI=0.0186925;REFB=-0.0123629;REVB=-0.0161107;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330507;STB=0.519117;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0188912;OID=.;OPOS=23423758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:11:13:24:18:11:13:24:18 chr8 23431192 . G T 232.56 PASS AF=0.368421;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0731475;FXX=0.0256377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9037;QD=12.2402;RBI=0.0756718;REFB=-0.00390367;REVB=0.0193822;RO=50;SAF=15;SAR=13;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117872;STB=0.557103;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00523482;OID=.;OPOS=23431192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:76:50:48:28:28:0.368421:13:15:32:18:13:15:30:18 chr8 23431344 . C A 249.13 PASS AF=0.510638;AO=22;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.164115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1202;QD=21.2027;RBI=0.164442;REFB=-0.0189065;REVB=-0.0103635;RO=23;SAF=5;SAR=17;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18536;STB=0.556189;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.116151;OID=.;OPOS=23431344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:23:23:22:24:0.510638:17:5:9:14:17:7:9:14 chr8 23431407 . A G 267.06 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.016198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.817;QD=20.1551;RBI=0.0174148;REFB=-0.027886;REVB=-0.00639528;RO=25;SAF=16;SAR=12;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210461;STB=0.616939;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0233002;OID=.;OPOS=23431407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:12:16:8:17:12:16:8:17 chr8 23431700 . C G 319.67 PASS AF=0.559322;AO=30;DP=57;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0148181;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.658;QD=21.6723;RBI=0.0166745;REFB=-0.0304169;REVB=0.00764611;RO=27;SAF=10;SAR=20;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349622;STB=0.524985;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0256521;OID=.;OPOS=23431700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:27:26:30:33:0.559322:20:10:10:17:22:11:10:16 chr8 23432033 . C A 289.05 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0864495;FXX=0.0263123;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.5717;QD=15.6241;RBI=0.086556;REFB=-0.0242248;REVB=0.00429207;RO=41;SAF=13;SAR=19;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224333;STB=0.632199;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0245699;OID=.;OPOS=23432033;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:42:32:32:0.432432:19:13:26:15:19:13:27:15 chr8 23432213 . T C 262.51 PASS AF=0.491525;AO=28;DP=58;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0670254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.239;QD=17.7971;RBI=0.0681537;REFB=-0.0241172;REVB=0.0123502;RO=30;SAF=9;SAR=19;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467927;STB=0.512187;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0240192;OID=.;OPOS=23432213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:30:30:28:29:0.491525:19:9:11:19:19:10:11:19 chr8 23432314 . T C 197.7 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0221605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.214;QD=18.8286;RBI=0.0250557;REFB=-0.0127848;REVB=-0.0116919;RO=22;SAF=4;SAR=16;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246983;STB=0.641818;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0178763;OID=.;OPOS=23432314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:16:4:9:13:16:4:9:13 chr8 23432326 . T A 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.899;QD=62.6703;RBI=0.0108614;REFB=0;REVB=-0.00101044;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.515e-05;OID=.;OPOS=23432326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:31:13:0:0:31:13:0:0 chr8 23432776 . A C 1559.35 PASS AF=0.981481;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0070804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.955;QD=57.7535;RBI=0.0212567;REFB=-0.0217967;REVB=0.0200429;RO=2;SAF=50;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000997665;STB=0.500526;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.000115686;OID=.;OPOS=23432776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:108:108:2:2:106:106:0.981481:56:50:1:1:56:50:1:1 chr8 23563908 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.314;QD=62.022;RBI=0.0260388;REFB=0;REVB=0.0167606;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09523e-05;OID=.;OPOS=23563908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chr8 24208847 . G A 422.14 PASS AF=0.367647;AO=48;DP=134;FAO=50;FDP=136;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=-0.00768999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.314;QD=12.416;RBI=0.0195455;REFB=-0.0194685;REVB=-0.0179692;RO=86;SAF=22;SAR=26;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987437;STB=0.541968;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0351526;OID=.;OPOS=24208847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:86:86:48:50:0.367647:26:22:47:39:26:24:47:39 chr8 24211278 . C T 676.72 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.994;QD=61.5196;RBI=0.0207014;REFB=0;REVB=-0.0142985;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166795;OID=.;OPOS=24211278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:13:30:0:0:13:31:0:0 chr8 24211331 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00667664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.029;QD=61.684;RBI=0.0103874;REFB=0;REVB=-0.00795737;RO=0;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.26021e-06;OID=.;OPOS=24211331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:10:31:0:0:10:31:0:0 chr8 24211869 . G T 276.06 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0258783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.46;QD=13.3039;RBI=0.0284492;REFB=-0.01756;REVB=-0.0118182;RO=50;SAF=13;SAR=19;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101422;STB=0.564316;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0299016;OID=.;OPOS=24211869;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:50:51:32:32:0.385542:19:13:25:25:19:13:26:25 chr8 24211884 . A ATGTC 1002.87 PASS AF=0.860465;AO=73;DP=86;FAO=74;FDP=86;FR=.;FRO=12;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00108402;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=301.302;QD=46.645;RBI=0.0211591;REFB=-0.0298719;REVB=0.0211313;RO=12;SAF=32;SAR=41;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388588;STB=0.521318;STBP=0.312;TYPE=ins;VARB=0.00547962;OID=.;OPOS=24211885;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=ATGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.860465:73:86:74:86:12:32:42:7:5:59:12:32:41:7:5 chr8 24774683 . C A 1138.62 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3502;QD=59.149;RBI=0.00782554;REFB=0;REVB=0.00339871;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540116;OID=.;OPOS=24774683;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:31:44:0:0:32:45:0:0 chr8 24776423 . C T 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.029783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4523;QD=19.1559;RBI=0.0348744;REFB=0.0150201;REVB=-0.0181438;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420279;STB=0.523787;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.018987;OID=.;OPOS=24776423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:11:12:10:11:11:12 chr8 24810088 . T A 186.09 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0771946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8556;QD=10.484;RBI=0.081531;REFB=-0.00922407;REVB=-0.0262355;RO=47;SAF=4;SAR=20;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499525;STB=0.794608;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0173342;OID=.;OPOS=24810088;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:20:4:27:20:20:4:27:20 chr8 25182969 . C T 492.28 PASS AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00439682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.368;QD=22.6333;RBI=0.0204315;REFB=-0.0103795;REVB=-0.0199528;RO=36;SAF=22;SAR=25;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134432;STB=0.560403;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0127527;OID=.;OPOS=25182969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:36:40:47:47:0.54023:25:22:23:13:25:22:24:16 chr8 25203022 . A G 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.567;QD=58.5996;RBI=0.0294516;REFB=0;REVB=-0.00716298;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26404e-05;OID=.;OPOS=25203022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr8 25222165 . A G 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0168433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.986;QD=14.7941;RBI=0.0257774;REFB=-0.0169769;REVB=-0.0195135;RO=27;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122911;STB=0.571347;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0334324;OID=.;OPOS=25222165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:12:6:12:15:12:6:12:15 chr8 25230168 . C T 1193.74 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00613675;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9922;QD=61.2174;RBI=0.0428414;REFB=0;REVB=0.0423996;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407064;OID=.;OPOS=25230168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:34:43:0:0:35:43:0:0 chr8 25231117 . C CT,CTT 567.77 PASS AF=1,0;AO=81,24;DP=141;FAO=134,0;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=54,0;FSAR=80,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362633,-0.0222436;FXX=0.00740686;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=7.18593,9.16998;QD=16.9483;RBI=0.126921,0.0635805;REFB=0.00380826,0.00669214;REVB=-0.12163,-0.0595626;RO=32;SAF=37,9;SAR=44,15;SRF=12;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0436732,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00315187,0;OID=.,.;OPOS=25231118,25231118;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:81,24:141:134,0:134:0:54,0:80,0:0:0:6:32:37,9:44,15:12:20 chr8 25234858 . A G 1449.62 PASS AF=0.980198;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.100762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1577;QD=57.4108;RBI=0.102958;REFB=-0.0759222;REVB=-0.0211475;RO=1;SAF=38;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123185;STB=0.512818;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0076173;OID=.;OPOS=25234858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:101:101:1:2:99:99:0.980198:61:38:1:0:61:38:2:0 chr8 25267622 . A G 501.64 PASS AF=1;AO=28;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.296;QD=59.0166;RBI=0.0632849;REFB=0;REVB=-0.0192337;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237126;OID=.;OPOS=25267622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:28:34:1:16:12:0:0:16:18:0:0 chr8 25280800 . C G 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.22;QD=59.8558;RBI=0.0161999;REFB=0;REVB=-0.00842088;RO=0;SAF=29;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19302e-05;OID=.;OPOS=25280800;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:42:29:0:0:42:29:0:0 chr8 25323777 . T C 729.0 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.873;QD=57.1764;RBI=0.0477532;REFB=0;REVB=0.0256505;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.92459e-05;OID=.;OPOS=25323777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0 chr8 25325730 . T C 719.02 PASS AF=0.403061;AO=78;DP=196;FAO=79;FDP=196;FR=.;FRO=117;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=-0.00585007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.879;QD=14.6738;RBI=0.0752239;REFB=-0.00130165;REVB=0.0749961;RO=118;SAF=46;SAR=32;SRF=53;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150759;STB=0.577287;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00172491;OID=.;OPOS=25325730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:118:117:78:79:0.403061:32:46:53:65:33:46:53:64 chr8 25364834 . A T 509.09 PASS AF=0.545455;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0194011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.192;QD=23.1405;RBI=0.0243395;REFB=-0.0303022;REVB=0.0146973;RO=39;SAF=29;SAR=19;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118199;STB=0.571056;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.021137;OID=.;OPOS=25364834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:39:40:48:48:0.545455:19:29:18:21:19:29:18:22 chr8 25364960 . A G 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.00678001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.895;QD=17.1562;RBI=0.0145201;REFB=-0.00450566;REVB=-0.0128399;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164313;STB=0.593443;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00897144;OID=.;OPOS=25364960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:6:14:9:8:6:14 chr8 26240646 . A G 2102.37 PASS AF=0.992647;AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0159944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.821;QD=61.8345;RBI=0.0579765;REFB=-0.0444566;REVB=-0.0557266;RO=1;SAF=79;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597952;STB=0.503105;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000306459;OID=.;OPOS=26240646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:135:136:1:1:134:135:0.992647:55:79:1:0:55:80:1:0 chr8 26269191 . C T 227.32 PASS AF=0.448276;AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0142007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.191;QD=15.6771;RBI=0.0156118;REFB=-0.00402021;REVB=0.00648623;RO=32;SAF=13;SAR=12;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232303;STB=0.637833;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00285445;OID=.;OPOS=26269191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:32:32:25:26:0.448276:12:13:24:8:13:13:24:8 chr8 26362201 . A T 902.28 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00137711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.698;QD=58.2117;RBI=0.0161018;REFB=0;REVB=0.0160428;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91113e-05;OID=.;OPOS=26362201;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0 chr8 26481666 . C T 732.37 PASS AF=0.555556;AO=69;DP=125;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.00636114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.189;QD=23.2498;RBI=0.0127601;REFB=0.00168828;REVB=0.0110615;RO=56;SAF=30;SAR=39;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392209;STB=0.524131;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.00166093;OID=.;OPOS=26481666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:56:56:69:70:0.555556:39:30:27:29:40:30:27:29 chr8 26481697 . G A 463.87 PASS AF=0.419355;AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=124;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0425655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.334;QD=14.9636;RBI=0.0500299;REFB=-0.00967418;REVB=0.02629;RO=71;SAF=24;SAR=28;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323907;STB=0.522379;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0142959;OID=.;OPOS=26481697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:71:72:52:52:0.419355:28:24:35:36:28:24:36:36 chr8 26481771 . T C 1568.51 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2522;QD=64.0209;RBI=0.00748057;REFB=0;REVB=0.00726717;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15981e-05;OID=.;OPOS=26481771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:55:43:0:0:55:43:0:0 chr8 26510792 . T C 2128.85 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.143;QD=62.6132;RBI=0.0432304;REFB=0;REVB=0.0306729;RO=0;SAF=62;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48793e-05;OID=.;OPOS=26510792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:73:62:0:0:74:62:0:0 chr8 26515138 . C T 382.94 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00557903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.509;QD=52.8194;RBI=0.0767162;REFB=0.0213355;REVB=0.076513;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518505;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00266521;OID=.;OPOS=26515138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:29:0:1:28:28:0.965517:14:14:0:0:15:13:1:0 chr8 26628028 . A G 1008.33 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.5;QD=59.3135;RBI=0.0215943;REFB=0;REVB=0.0101644;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26856e-05;OID=.;OPOS=26628028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:41:26:0:0:41:27:0:0 chr8 26636906 . T A 346.09 PASS AF=0.5;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0303452;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5578;QD=19.2273;RBI=0.047906;REFB=-0.00264083;REVB=0.0370696;RO=36;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758524;STB=0.54223;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00277061;OID=.;OPOS=26636906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:36:36:36:36:0.5:21:15:18:18:21:15:18:18 chr8 26636925 . T C 842.52 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0325247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7155;QD=54.3559;RBI=0.0325891;REFB=0.0012208;REVB=0.00204786;RO=2;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000612217;OID=.;OPOS=26636925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:30:30:1:1:30:30:1:1 chr8 26716715 . G A 467.71 PASS AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=-0.0152816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.101;QD=20.1166;RBI=0.0276134;REFB=-0.027024;REVB=-0.0229994;RO=47;SAF=14;SAR=32;SRF=11;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078505;STB=0.543361;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0228492;OID=.;OPOS=26716715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:32:14:11:36:32:14:11:36 chr8 26944733 . G A 955.17 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00420203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.058;QD=58.7799;RBI=0.0340894;REFB=0;REVB=-0.0338294;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.71255e-05;OID=.;OPOS=26944733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0 chr8 27101204 . T A 1966.63 PASS AF=1;AO=127;DP=130;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753914;FXX=0.0230751;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.999;QD=61.9411;RBI=0.0137949;REFB=-0.0585516;REVB=0.0115525;RO=0;SAF=78;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.73763e-05;OID=.;OPOS=27101204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:130:127:0:0:127:127:1:49:78:0:0:49:78:0:0 chr8 27101206 . A C 2011.58 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00643484;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.021;QD=62.3745;RBI=0.0581081;REFB=0;REVB=-0.0577507;RO=0;SAF=80;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3659e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.77483e-05;OID=.;OPOS=27101206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:49:80:0:0:49:80:0:0 chr8 27315936 . A G 101.46 PASS AF=0.254237;AO=15;DP=60;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0420185;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6485;QD=6.87831;RBI=0.0445649;REFB=-0.00979508;REVB=-0.0148482;RO=44;SAF=9;SAR=6;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148969;STB=0.591714;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0369895;OID=.;OPOS=27315936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:44:44:15:15:0.254237:6:9:21:23:6:9:21:23 chr8 27324822 . T C 1378.15 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206249;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.726;QD=61.251;RBI=0.0218906;REFB=0;REVB=0.00733585;RO=0;SAF=28;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.51223e-05;OID=.;OPOS=27324822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:87:90:1:59:28:0:0:60:30:0:0 chr8 27324844 . G A 1300.77 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5814;QD=61.9416;RBI=0.0632723;REFB=0;REVB=0.0041885;RO=0;SAF=25;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370306;OID=.;OPOS=27324844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:58:25:0:0:58:26:0:0 chr8 27328511 . G A 592.18 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00538443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.108;QD=59.218;RBI=0.00718427;REFB=0;REVB=-0.00475622;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267753;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81605e-05;OID=.;OPOS=27328511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:40:40:1:0:39:40:1:17:22:0:1:18:22:0:0 chr8 27373865 . G A 441.65 PASS AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-1.79411e-06;FXX=0.042851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.366;QD=26.3674;RBI=0.0118538;REFB=-0.0171504;REVB=-0.0118538;RO=26;SAF=13;SAR=28;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112682;STB=0.561767;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.010226;OID=.;OPOS=27373865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:28:13:12:14:28:13:12:14 chr8 27401964 . A C 153.26 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0751134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7888;QD=13.6228;RBI=0.0807618;REFB=-0.00989987;REVB=0.0296724;RO=28;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610216;STB=0.535478;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00948004;OID=.;OPOS=27401964;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:10:7:10:18:10:7:10:18 chr8 27591164 . C T 972.97 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1587;QD=58.0877;RBI=0.0576864;REFB=0;REVB=0.0130404;RO=0;SAF=19;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00242382;OID=.;OPOS=27591164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:67:0:0:62:67:1:43:19:0:0:46:21:0:0 chr8 27592828 . G A 2292.51 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245184;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7827;QD=61.1335;RBI=0.0848883;REFB=0;REVB=0.0812704;RO=0;SAF=63;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503209;OID=.;OPOS=27592828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:150:0:0:148:150:1:85:63:0:0:85:65:0:0 chr8 27631179 . A C 497.33 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.073;QD=58.5088;RBI=0.0378079;REFB=0;REVB=-0.0225128;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37715e-05;OID=.;OPOS=27631179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:16:15:0:0:19:15:0:0 chr8 27737198 . A G 233.41 PASS AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0150903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.654;QD=12.7896;RBI=0.018066;REFB=-0.029621;REVB=-0.00993296;RO=45;SAF=16;SAR=12;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654134;STB=0.537522;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0324298;OID=.;OPOS=27737198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:45:45:28:28:0.383562:12:16:23:22:12:16:23:22 chr8 27767231 . C G 1310.11 PASS AF=0.956044;AO=87;DP=92;FAO=87;FDP=91;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00665597;FXX=0.0108684;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.656;QD=57.5874;RBI=0.0286896;REFB=-0.093569;REVB=0.0279069;RO=4;SAF=50;SAR=37;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00634997;STB=0.503355;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.000285285;OID=.;OPOS=27767231;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:92:91:4:4:87:87:0.956044:37:50:2:2:37:50:2:2 chr8 27779545 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0291226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2068;QD=33.4285;RBI=0.148455;REFB=0;REVB=0.14557;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00934629;OID=.;OPOS=27779545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr8 27903069 . C T 417.4 PASS AF=0.410256;AO=48;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=25;FWDB=-0.00321663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.546;QD=14.27;RBI=0.00611477;REFB=-0.0188653;REVB=-0.00520035;RO=69;SAF=19;SAR=29;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249564;STB=0.640321;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0191934;OID=.;OPOS=27903069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:69:69:48:48:0.410256:29:19:44:25:29:19:44:25 chr8 27915830 . T C 2915.81 PASS AF=0.979695;AO=193;DP=197;FAO=193;FDP=197;FR=.;FRO=4;FSAF=98;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0236167;FXX=0.0198995;HRUN=5;LEN=1;MLLD=57.8312;QD=59.2044;RBI=0.0332675;REFB=-0.156115;REVB=0.0234303;RO=4;SAF=98;SAR=95;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996411;STB=0.505234;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00332909;OID=.;OPOS=27915830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:197:197:4:4:193:193:0.979695:95:98:1:3:95:98:1:3 chr8 27918057 . T C 601.15 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00139206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=339.868;QD=58.6486;RBI=0.0254208;REFB=-0.0159112;REVB=0.0253827;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191432;STB=0.510199;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=4.60468e-05;OID=.;OPOS=27918057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:16:24:1:0:16:24:1:0 chr8 27927849 . C G 670.78 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.543;QD=62.3982;RBI=0.0580785;REFB=0;REVB=0.0297401;RO=0;SAF=9;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27702e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573695;OID=.;OPOS=27927849;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:33:9:0:0:33:10:0:0 chr8 28196783 . C G 518.87 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0129467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.156;QD=22.8075;RBI=0.0404499;REFB=-0.0381116;REVB=0.038322;RO=41;SAF=18;SAR=31;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415818;STB=0.518387;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0280904;OID=.;OPOS=28196783;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:42:49:49:0.538462:31:18:17:24:31:18:17:25 chr8 28286174 . T G 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0558881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.514;QD=63.2863;RBI=0.0665154;REFB=0;REVB=0.0360668;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.68259e-05;OID=.;OPOS=28286174;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0 chr8 28304769 . C T 281.25 PASS AF=0.54717;AO=28;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0128445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.974;QD=21.2267;RBI=0.0128519;REFB=-0.00573811;REVB=-0.000435988;RO=24;SAF=10;SAR=18;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160373;STB=0.502073;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00341307;OID=.;OPOS=28304769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:28:29:0.54717:18:10:9:15:18:11:9:15 chr8 28384712 . A G 2102.54 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.104;QD=62.7625;RBI=0.00205889;REFB=0;REVB=0.00167334;RO=0;SAF=64;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.5657e-06;OID=.;OPOS=28384712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:70:64:0:0:70:64:0:0 chr8 28420903 . C G 380.51 PASS AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0245555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2986;QD=16.9116;RBI=0.0245559;REFB=-0.00679037;REVB=0.000137836;RO=50;SAF=20;SAR=20;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594187;STB=0.533317;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00904786;OID=.;OPOS=28420903;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:50:40:40:0.444444:20:20:22:28:20:20:22:28 chr8 28574803 . G A 781.15 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00188165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.622;QD=63.7675;RBI=0.033254;REFB=0;REVB=0.0332007;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41037e-05;OID=.;OPOS=28574803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:26:21:0:0:28:21:0:0 chr8 28908874 . T TAACC 159.32 PASS AF=0.357143;AO=18;DP=91;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0132199;FXX=0.0666556;HRUN=2;LEN=4;MLLD=237.771;QD=11.3803;RBI=0.0143384;REFB=-0.0101474;REVB=-0.00555195;RO=71;SAF=4;SAR=14;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251424;STB=0.642704;STBP=0.126;TYPE=ins;VARB=0.0160927;OID=.;OPOS=28908875;OREF=-;OALT=AACC;OMAPALT=TAACC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.357143:18:91:20:56:36:5:15:16:20:99:71:4:14:28:43 chr8 28927615 . AG A 110.46 PASS AF=0.736842;AO=13;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0720417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.1923;QD=23.254;RBI=0.0855513;REFB=-0.0472906;REVB=-0.0461412;RO=5;SAF=11;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042346;STB=0.529368;STBP=0.846;TYPE=del;VARB=0.00424835;OID=.;OPOS=28927616;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.736842:13:19:14:19:5:12:2:4:1:28:5:11:2:4:1 chr8 29005093 . A G 409.77 PASS AF=0.482759;AO=41;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0090981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2927;QD=18.8402;RBI=0.00980528;REFB=-0.016717;REVB=-0.00365625;RO=45;SAF=19;SAR=22;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00306761;STB=0.504937;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0225252;OID=.;OPOS=29005093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:45:45:41:42:0.482759:22:19:21:24:22:20:21:24 chr8 29048477 . C T 296.56 PASS AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0124728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.94;QD=13.1806;RBI=0.0126108;REFB=-0.0181902;REVB=-0.00186073;RO=55;SAF=20;SAR=14;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14484;STB=0.588183;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.021462;OID=.;OPOS=29048477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:56:34:34:0.377778:14:20:25:30:14:20:25:31 chr8 29197672 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.006;QD=53.2766;RBI=0.0108136;REFB=0;REVB=-0.00921454;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.86677e-06;OID=.;OPOS=29197672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0 chr8 29927300 . C G 1336.97 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.568;QD=62.1844;RBI=0.0459204;REFB=0;REVB=-0.00597886;RO=0;SAF=33;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01785e-05;OID=.;OPOS=29927300;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:86:0:0:81:86:1:48:33:0:0:48:38:0:0 chr8 29927321 . A G 1098.71 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.865;QD=60.2034;RBI=0.0612453;REFB=0;REVB=0.0344437;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014523;OID=.;OPOS=29927321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0 chr8 29965519 . T C 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2529;QD=58.586;RBI=0.0548125;REFB=0;REVB=0.0470057;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149313;OID=.;OPOS=29965519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr8 29989564 . A G 785.54 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.992;QD=57.1302;RBI=0.0828891;REFB=0;REVB=0.0779332;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000760446;OID=.;OPOS=29989564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:29:25:0:0:30:25:0:0 chr8 29996158 . A G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.333;QD=63.2868;RBI=0.0319213;REFB=0;REVB=0.0265974;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76491e-05;OID=.;OPOS=29996158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:14:32:0:0:14:32:0:0 chr8 29996256 . T C 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00540611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.655;QD=58.1408;RBI=0.0681664;REFB=0;REVB=0.0679517;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336164;OID=.;OPOS=29996256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr8 30423886 . C CAG 901.72 PASS AF=0.561644;AO=81;DP=148;FAO=82;FDP=146;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0178598;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=2;MLLD=161.995;QD=24.7048;RBI=0.0183611;REFB=-0.0155228;REVB=0.00426131;RO=66;SAF=33;SAR=48;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649948;STB=0.529859;STBP=0.443;TYPE=ins;VARB=0.0127654;OID=.;OPOS=30423887;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.561644:81:148:82:146:64:33:49:30:34:99:66:33:48:32:34 chr8 30501232 . C T 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.000744266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.84;QD=21.0073;RBI=0.0208278;REFB=-0.0122668;REVB=0.0208145;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136709;STB=0.523784;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0231619;OID=.;OPOS=30501232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:17:19:19:0.527778:11:8:7:9:11:8:8:9 chr8 30503255 . G A 30.39 PASS AF=0.384615;AO=3;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.021111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.116;QD=9.35061;RBI=0.0798992;REFB=-0.013751;REVB=0.0770598;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.618996;STB=0.545263;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0354747;OID=.;OPOS=30503255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:8:3:5:0.384615:0:3:5:2:1:4:6:2 chr8 30608976 . C T 1024.47 PASS AF=1;AO=67;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.932;QD=59.3898;RBI=0.0325214;REFB=0;REVB=0.030935;RO=0;SAF=45;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133032;OID=.;OPOS=30608976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:67:69:1:22:45:0:0:24:45:0:0 chr8 30620840 . G GT,T 666.26 PASS AF=1,0;AO=50,3;DP=63;FAO=60,0;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119966,-0.0500676;FXX=0.0163908;HRUN=4,2;LEN=1,1;MLLD=15.4807,10.5625;QD=44.4173;RBI=0.054365,0.0704263;REFB=0,0;REVB=-0.0530249,-0.0495288;RO=7;SAF=15,1;SAR=35,2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0719192,-0.240731;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00106206,0;OID=.,.;OPOS=30620841,30620840;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:63:60:7:0:50,3:60,0:1,0:35,2:15,1:4:3:41,0:19,0:0:0 chr8 30695226 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0495185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.34;QD=35.5759;RBI=0.120203;REFB=0;REVB=-0.109529;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0053197;OID=.;OPOS=30695226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr8 30924557 . C T 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.887;QD=58.6002;RBI=0.0346803;REFB=0;REVB=0.0344431;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012962;OID=.;OPOS=30924557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:28:36:0:0:28:36:0:0 chr8 30973957 . G T 484.78 PASS AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00308865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.263;QD=21.0775;RBI=0.0208961;REFB=-0.000116949;REVB=0.0206666;RO=44;SAF=19;SAR=28;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124765;STB=0.563907;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.000213022;OID=.;OPOS=30973957;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:44:45:47:47:0.51087:28:19:24:20:28:19:24:21 chr8 30999280 . G T 356.57 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00320493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.441;QD=19.2742;RBI=0.014431;REFB=-5.00299e-05;REVB=-0.0140706;RO=36;SAF=15;SAR=22;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606574;STB=0.527721;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=2.28511e-05;OID=.;OPOS=30999280;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:37:37:37:0.5:22:15:17:19:22:15:17:20 chr8 31024638 . C T 458.97 PASS AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0227055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5072;QD=18.3589;RBI=0.0651124;REFB=0.0246151;REVB=-0.0610253;RO=54;SAF=28;SAR=18;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894568;STB=0.549978;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=-0.0302493;OID=.;OPOS=31024638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:0.46:18:28:28:26:18:28:28:26 chr8 32453358 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0084;QD=63.2858;RBI=0.0109103;REFB=0;REVB=0.00158823;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9216e-05;OID=.;OPOS=32453358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr8 32505372 . G A 527.04 PASS AF=0.524752;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0219981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.394;QD=20.8727;RBI=0.0354103;REFB=-0.0114607;REVB=0.0277484;RO=47;SAF=14;SAR=39;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362694;STB=0.528741;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00954002;OID=.;OPOS=32505372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:48:53:53:0.524752:39:14:14:33:39:14:15:33 chr8 32621844 . G T 191.53 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00502764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4199;QD=22.5332;RBI=0.0177854;REFB=-0.0005731;REVB=0.01706;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501505;STB=0.509544;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00133932;OID=.;OPOS=32621844;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:15:19:19:0.558824:11:8:5:9:11:8:6:9 chr8 32663420 . A G 1676.37 PASS AF=0.99115;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0219809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.707;QD=59.3404;RBI=0.0238245;REFB=0.0303498;REVB=-0.00918934;RO=1;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904262;STB=0.504672;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.000286077;OID=.;OPOS=32663420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:113:1:1:111:112:0.99115:52:59:0:1:53:59:0:1 chr8 33246538 . A G 923.5 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0723475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.646;QD=56.8306;RBI=0.0734789;REFB=-0.060182;REVB=-0.012845;RO=1;SAF=25;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185161;STB=0.509801;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000525639;OID=.;OPOS=33246538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:39:25:1:0:39:25:1:0 chr8 33246591 . G C 739.66 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294884;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.034;QD=61.6385;RBI=0.0328395;REFB=-0.135125;REVB=0.0144523;RO=1;SAF=12;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375754;STB=0.519991;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000369627;OID=.;OPOS=33246591;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:35:12:1:0:35:12:1:0 chr8 33246685 . G A 508.37 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0119965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1743;QD=56.4858;RBI=0.0214444;REFB=0.0101938;REVB=0.0177749;RO=1;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017657;STB=0.509429;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=4.75314e-05;OID=.;OPOS=33246685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:26:9:0:1:26:9:0:1 chr8 33313329 . G A 590.82 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.367;QD=60.5973;RBI=0.04789;REFB=0;REVB=0.028696;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315842;OID=.;OPOS=33313329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:24:14:0:0:24:15:0:0 chr8 33356074 . A G 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0144065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.268;QD=13.9481;RBI=0.0242756;REFB=-0.0119223;REVB=-0.0195386;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199556;STB=0.511614;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0166912;OID=.;OPOS=33356074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:11:6:10:17:11:6:10:17 chr8 33369944 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7306;QD=61.3356;RBI=0.0377617;REFB=0;REVB=-0.0362925;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000755219;OID=.;OPOS=33369944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0 chr8 33369994 . A G 468.95 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00993834;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0235;QD=58.6181;RBI=0.0114055;REFB=0;REVB=0.005596;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.65666e-05;OID=.;OPOS=33369994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr8 33371062 . C T 296.85 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00845227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.78;QD=15.6234;RBI=0.011306;REFB=0.00850706;REVB=-0.00750891;RO=43;SAF=14;SAR=19;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065003;STB=0.536701;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.00978515;OID=.;OPOS=33371062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:19:14:21:22:19:14:21:22 chr8 33416189 . G A 698.89 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0150455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2399;QD=54.815;RBI=0.0400544;REFB=0.109565;REVB=0.0371213;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513508;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.0018283;OID=.;OPOS=33416189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:32:18:0:0:32:18:1:0 chr8 33416222 . C T 714.74 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0739587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3089;QD=60.8293;RBI=0.0766836;REFB=-0.151334;REVB=-0.0202605;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253996;STB=0.513508;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.003316;OID=.;OPOS=33416222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:28:18:1:0:28:18:1:0 chr8 33437926 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.774;QD=62.3506;RBI=0.0148462;REFB=0;REVB=0.0043276;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33952e-05;OID=.;OPOS=33437926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr8 33573577 . A G 163.21 PASS AF=0.607143;AO=16;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0159853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9484;QD=23.3156;RBI=0.0189845;REFB=-0.0697504;REVB=0.0102413;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125162;STB=0.517221;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0113896;OID=.;OPOS=33573577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:16:17:0.607143:7:9:6:5:7:10:6:5 chr8 37456438 . A G 135.95 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00153918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.532;QD=17.542;RBI=0.0405923;REFB=-0.012613;REVB=-0.0405631;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365465;STB=0.708067;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0193328;OID=.;OPOS=37456438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:5:10:4:12:5:10:4:12 chr8 37728017 . A G 651.2 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.914;QD=62.0192;RBI=0.0176124;REFB=0;REVB=0.0151929;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142626;OID=.;OPOS=37728017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr8 37728019 . T G 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.587;QD=62.0209;RBI=0.0365028;REFB=0;REVB=6.85348e-05;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000575503;OID=.;OPOS=37728019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr8 37979919 . G C 584.98 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0087289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.439;QD=59.998;RBI=0.0138487;REFB=0;REVB=0.0107514;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330283;OID=.;OPOS=37979919;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:19:19:0:0:19:20:0:0 chr8 37985897 . A G 806.06 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1672;QD=55.59;RBI=0.0749906;REFB=-0.0788947;REVB=-0.0734422;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105965;OID=.;OPOS=37985897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:58:58:0:0:58:58:1:38:20:0:0:38:20:0:0 chr8 38005835 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.311;QD=62.022;RBI=0.062163;REFB=0;REVB=0.0510019;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251193;OID=.;OPOS=38005835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr8 38095662 . C T 220.62 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.000844529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.634;QD=14.2332;RBI=0.0254471;REFB=0.00642825;REVB=-0.0254331;RO=36;SAF=20;SAR=6;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282932;STB=0.662688;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.00845152;OID=.;OPOS=38095662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:6:20:19:17:6:20:19:17 chr8 38458552 . G GTCT 1725.1 PASS AF=1;AO=112;DP=128;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254951;FXX=0.0423693;HRUN=0;LEN=3;MLLD=183.288;QD=61.0656;RBI=0.0394654;REFB=0;REVB=0.030125;RO=13;SAF=76;SAR=36;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00309911;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000294089;OID=.;OPOS=38458553;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=GTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:112:128:113:113:0:77:36:0:0:9:13:76:36:9:4 chr8 38458659 . C T 1048.1 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0465293;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.253;QD=58.2275;RBI=0.0465331;REFB=-0.0414002;REVB=-0.000600372;RO=1;SAF=33;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141139;STB=0.507461;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000122248;OID=.;OPOS=38458659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:38:33:1:0:38:33:1:0 chr8 38601582 . T G 392.02 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.0207932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5843;QD=16.8611;RBI=0.0746735;REFB=-0.00259783;REVB=0.0717202;RO=52;SAF=22;SAR=19;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169453;STB=0.594859;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00415338;OID=.;OPOS=38601582;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:19:22:19:33:19:22:19:33 chr8 38677932 . A G 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00482332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.45;QD=16.5359;RBI=0.00713873;REFB=-0.0182018;REVB=-0.0052628;RO=23;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215693;STB=0.624479;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0255103;OID=.;OPOS=38677932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:13:5:11:12:13:5:11:12 chr8 38684853 . T C 557.38 PASS AF=0.544554;AO=55;DP=101;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.00485895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.359;QD=22.0743;RBI=0.00498786;REFB=-0.0227771;REVB=-0.00112664;RO=46;SAF=22;SAR=33;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15592;STB=0.585626;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0167552;OID=.;OPOS=38684853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:46:46:55:55:0.544554:33:22:27:19:33:22:27:19 chr8 38695996 . T C 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.000869146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.386;QD=21.7443;RBI=0.000906002;REFB=-0.00944871;REVB=0.000255782;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193864;STB=0.608996;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00680159;OID=.;OPOS=38695996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:7:8:3:8:7:8:3:8 chr8 38707452 . A T 225.07 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.014261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.025;QD=11.3961;RBI=0.0402023;REFB=-0.0191551;REVB=-0.0375879;RO=45;SAF=18;SAR=10;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185859;STB=0.510755;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0457414;OID=.;OPOS=38707452;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:51:28:28:0.35443:10:18:29:16:10:18:32:19 chr8 38827185 . GCCT GCT,GCTG 1037.36 PASS AF=1,0;AO=63,7;DP=74;FAO=74,0;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0;FSAR=38,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828063,-0.012117;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=24.8409,170.437;QD=56.0734;RBI=0.173042,0.0305888;REFB=0,0;REVB=0.151943,-0.0280865;RO=2;SAF=34,0;SAR=29,7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.319864,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0269675,-0.804017;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00437784,0;OID=.,.;OPOS=38827186,38827187;OREF=C,CT;OALT=-,TG;OMAPALT=GCT,GCTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:63,7:74:74,0:74:0:36,0:38,0:0:0:6:2:34,0:29,7:2:0 chr8 38835666 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.935;QD=50.4135;RBI=0.0259695;REFB=0;REVB=0.0171513;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031882;OID=.;OPOS=38835666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0 chr8 38848850 . C T 982.49 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.871;QD=58.6558;RBI=0.0350193;REFB=0;REVB=0.0318478;RO=0;SAF=20;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181065;OID=.;OPOS=38848850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:67:0:0:61:67:1:41:20:0:0:45:22:0:0 chr8 38964647 . G A 892.13 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189237;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.183;QD=58.5001;RBI=0.0192297;REFB=0;REVB=-0.00341681;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019161;OID=.;OPOS=38964647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:26:35:0:0:26:35:0:0 chr8 38965271 . C T 2106.16 PASS AF=0.958333;AO=137;DP=144;FAO=138;FDP=144;FR=.;FRO=6;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0363313;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.858;QD=58.5044;RBI=0.0568435;REFB=-0.218115;REVB=0.0437175;RO=1;SAF=61;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621469;STB=0.516461;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.000922969;OID=.;OPOS=38965271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:144:144:1:6:137:138:0.958333:76:61:0:1:77:61:5:1 chr8 39080632 . C G 1549.2 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.706;QD=63.8844;RBI=0.0174632;REFB=0;REVB=-0.011775;RO=0;SAF=54;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03044e-06;OID=.;OPOS=39080632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:43:54:0:0:43:54:0:0 chr8 39091526 . T C 913.4 PASS AF=0.403101;AO=104;DP=258;FAO=104;FDP=258;FR=.;FRO=154;FSAF=23;FSAR=81;FSRF=45;FSRR=109;FWDB=0.0336778;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.948;QD=14.1613;RBI=0.0401416;REFB=-0.00281091;REVB=0.0218438;RO=154;SAF=23;SAR=81;SRF=45;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102203;STB=0.557591;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00363725;OID=.;OPOS=39091526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:154:154:104:104:0.403101:81:23:45:109:81:23:45:109 chr8 39128387 . C T 110.78 PASS AF=0.297872;AO=13;DP=46;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0248252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.368;QD=9.42844;RBI=0.0260567;REFB=-0.0115081;REVB=0.00791575;RO=28;SAF=7;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043696;STB=0.531869;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0283158;OID=.;OPOS=39128387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:28:33:13:14:0.297872:6:7:14:14:7:7:18:15 chr8 39311600 . C T 2291.63 PASS AF=0.979866;AO=145;DP=149;FAO=146;FDP=149;FR=.;FRO=3;FSAF=80;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00175239;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.103;QD=61.5202;RBI=0.0621652;REFB=-0.0786116;REVB=-0.0621405;RO=2;SAF=80;SAR=65;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144056;STB=0.51111;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000531857;OID=.;OPOS=39311600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:149:149:2:3:145:146:0.979866:65:80:0:2:66:80:0:3 chr8 39312886 . G A 1496.15 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.033;QD=59.2534;RBI=0.0667743;REFB=0;REVB=0.0590387;RO=0;SAF=57;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190886;OID=.;OPOS=39312886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:101:0:0:94:101:1:37:57:0:0:43:58:0:0 chr8 39840234 . A G 308.42 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0095245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8098;QD=18.4129;RBI=0.0118969;REFB=-0.0130669;REVB=-0.00712882;RO=34;SAF=19;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427783;STB=0.523883;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00251338;OID=.;OPOS=39840234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:14:19:18:16:14:19:18:16 chr8 39872866 . A C 854.55 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013546;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6964;QD=57.9358;RBI=0.0161638;REFB=0;REVB=0.00881887;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536342;OID=.;OPOS=39872866;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr8 39872935 . T A 126.79 PASS AF=0.285714;AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.00137352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.047;QD=8.04987;RBI=0.00997331;REFB=-0.0125245;REVB=-0.00987827;RO=45;SAF=8;SAR=10;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234787;STB=0.63999;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.028249;OID=.;OPOS=39872935;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:45:45:18:18:0.285714:10:8:29:16:10:8:29:16 chr8 39873478 . T C 230.28 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0218959;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.0436;QD=46.0553;RBI=0.0399593;REFB=-0.0130293;REVB=0.0334262;RO=1;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399998;STB=0.521716;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00109596;OID=.;OPOS=39873478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:11:8:0:1:11:8:0:1 chr8 39873483 . TT AA 107.1 PASS AF=0.631579;AO=11;DP=18;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0111594;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=211.162;QD=22.5477;RBI=0.023856;REFB=-0.0152334;REVB=0.0210849;RO=7;SAF=2;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41657;STB=0.74422;STBP=0.017;TYPE=mnp;VARB=0.0121801;OID=.;OPOS=39873483;OREF=TT;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:19:7:7:11:12:0.631579:9:2:5:2:10:2:5:2 chr8 40011079 . G A 561.11 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503766;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.978;QD=60.6603;RBI=0.0562228;REFB=0;REVB=-0.0249639;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139816;OID=.;OPOS=40011079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0 chr8 40012684 . C G 467.06 PASS AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00889787;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.885;QD=21.9791;RBI=0.0153652;REFB=0.00634641;REVB=0.0125266;RO=39;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260797;STB=0.507883;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00367425;OID=.;OPOS=40012684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:39:40:45:45:0.529412:21:24:22:17:21:24:22:18 chr8 41132742 . A T 675.83 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189463;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.385;QD=62.8683;RBI=0.0416137;REFB=0;REVB=0.0370505;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000905797;OID=.;OPOS=41132742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:9:34:0:0:9:34:0:0 chr8 41391704 . A G 593.4 PASS AF=0.42;AO=62;DP=149;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=50;FWDB=0.0330498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2986;QD=15.8239;RBI=0.0453734;REFB=0.00845704;REVB=0.0310878;RO=87;SAF=37;SAR=25;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178215;STB=0.603142;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.0085322;OID=.;OPOS=41391704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:87:87:62:63:0.42:25:37:37:50:25:38:37:50 chr8 41391748 . C A 408.31 PASS AF=0.379845;AO=47;DP=129;FAO=49;FDP=129;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=-0.0211019;FXX=0.015266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1782;QD=12.6607;RBI=0.0342052;REFB=0.00224838;REVB=-0.0269204;RO=78;SAF=28;SAR=19;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188573;STB=0.610386;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.0067372;OID=.;OPOS=41391748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:78:80:47:49:0.379845:19:28:33:45:20:29:33:47 chr8 41517958 . A AG 1905.78 PASS AF=1;AO=159;DP=188;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114402;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.5815;QD=42.8265;RBI=0.114603;REFB=0;REVB=-0.00677436;RO=17;SAF=64;SAR=95;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350697;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000844341;OID=.;OPOS=41517959;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:159:188:178:178:0:72:106:0:0:37:17:64:95:10:7 chr8 41519462 . A G 728.23 PASS AF=0.98;AO=44;DP=44;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0709212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.307;QD=58.2582;RBI=0.101607;REFB=0.00619663;REVB=0.0727609;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000949522;OID=.;OPOS=41519462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:50:0:1:44:49:0.98:28:16:0:0:28:21:1:0 chr8 41521663 . T C 460.79 PASS AF=0.677419;AO=42;DP=62;FAO=42;FDP=62;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0148272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5697;QD=29.7286;RBI=0.0167154;REFB=-0.0405439;REVB=-0.00771739;RO=20;SAF=18;SAR=24;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131518;STB=0.571395;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0064731;OID=.;OPOS=41521663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:20:20:42:42:0.677419:24:18:13:7:24:18:13:7 chr8 41553928 . C G 272.76 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0216405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5561;QD=24.2457;RBI=0.0673956;REFB=-0.000362883;REVB=0.0638268;RO=20;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759698;STB=0.542338;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00159098;OID=.;OPOS=41553928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:9:16:11:9:9:16:11:9 chr8 41585438 . G A 259.51 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0119432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.331;QD=11.9316;RBI=0.012334;REFB=-0.00186954;REVB=0.00308019;RO=55;SAF=19;SAR=12;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137393;STB=0.57397;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00572164;OID=.;OPOS=41585438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:12:19:27:28:12:19:28:28 chr8 41787705 . CTCATT C 62.65 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00231418;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=5;MLLD=315.894;QD=16.7058;RBI=0.00708644;REFB=-0.0137782;REVB=-0.00669792;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526249;STBP=0.917;TYPE=del;VARB=0.0131221;OID=.;OPOS=41787706;OREF=TCATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.533333:8:17:8:15:7:3:5:3:4:49:8:3:5:3:5 chr8 41791283 . G A 294.17 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0294993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.008;QD=17.5624;RBI=0.0348758;REFB=-0.0144256;REVB=0.018604;RO=34;SAF=17;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828103;STB=0.538652;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0179929;OID=.;OPOS=41791283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:35:32:32:0.477612:15:17:15:19:15:17:16:19 chr8 41794796 . ATCT A 307.87 PASS AF=0.485294;AO=31;DP=71;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00666793;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=3;MLLD=298.338;QD=18.1099;RBI=0.0108608;REFB=-0.0122387;REVB=0.00857292;RO=35;SAF=14;SAR=17;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218841;STB=0.617346;STBP=0.086;TYPE=del;VARB=0.0141031;OID=.;OPOS=41794797;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.485294:31:71:33:68:35:15:18:24:11:99:35:14:17:24:11 chr8 41798417 . C T 427.33 PASS AF=0.436364;AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00367137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.382;QD=15.5391;RBI=0.00691104;REFB=-0.0174829;REVB=-0.00585521;RO=60;SAF=27;SAR=21;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292853;STB=0.526365;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0225377;OID=.;OPOS=41798417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:60:62:48:48:0.436364:21:27:32:28:21:27:32:30 chr8 41906095 . A G 236.36 PASS AF=0.4;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0270828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4454;QD=13.5065;RBI=0.0274126;REFB=-0.00962076;REVB=0.00423906;RO=42;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19819;STB=0.620604;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.021996;OID=.;OPOS=41906095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:42:42:27:28:0.4:11:16:17:25:11:17:17:25 chr8 42013563 . T TATG 881.03 PASS AF=0.96875;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00549348;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=3;MLLD=309.697;QD=55.0641;RBI=0.00567749;REFB=-0.0432594;REVB=0.00143373;RO=2;SAF=36;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487824;STB=0.502584;STBP=0.879;TYPE=ins;VARB=-0.000132022;OID=.;OPOS=42013564;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=TATG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.96875:62:65:62:64:2:36:26:1:1:6:2:36:26:1:1 chr8 42044954 . G A 416.3 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0218871;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.837;QD=19.1405;RBI=0.0331697;REFB=-0.00655227;REVB=0.0249236;RO=44;SAF=11;SAR=31;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224148;STB=0.632586;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0113941;OID=.;OPOS=42044954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:44:45:42:42:0.482759:31:11:21:23:31:11:22:23 chr8 42176987 . TTTTCTC T,TTTTCTT 39.6 PASS AF=0.333333,0;AO=6,2;DP=20;FAO=6,0;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3,0;FSAR=3,0;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00596631,-0.024059;FXX=0.09995;HRUN=5,1;LEN=6,1;MLLD=276.427,197.704;QD=8.79968;RBI=0.00905851,0.0250049;REFB=0.00802292,0.00289443;REVB=-0.00681614,-0.00681228;RO=12;SAF=3,0;SAR=3,2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.177981,-0.505787;STB=0.610759,0.5;STBP=0.585,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0192162,0;OID=.,.;OPOS=42176988,42176993;OREF=TTTCTC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTTTCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333,0:6,2:20:6,0:18:12:3,0:3,0:4:8:39:12:3,0:3,2:4:8 chr8 42882555 . A ATTTGT 1284.92 PASS AF=0.921569;AO=84;DP=102;FAO=94;FDP=102;FR=.;FRO=8;FSAF=53;FSAR=41;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0106745;FXX=0.0285687;HRUN=3;LEN=5;MLLD=280.416;QD=50.389;RBI=0.0209899;REFB=-0.031697;REVB=-0.0180729;RO=8;SAF=51;SAR=33;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0030747;STB=0.504882;STBP=0.731;TYPE=ins;VARB=0.0012326;OID=.;OPOS=42882556;OREF=-;OALT=TTTGT;OMAPALT=ATTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.921569:84:102:94:102:8:53:41:5:3:28:8:51:33:5:3 chr8 43054553 . T C 1135.25 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.812;QD=60.5468;RBI=0.0226761;REFB=0;REVB=0.0157545;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60957e-05;OID=.;OPOS=43054553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:27:48:0:0:27:48:0:0 chr8 46951721 . C G 955.09 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6719;QD=58.7749;RBI=0.0201982;REFB=0;REVB=0.0133324;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250268;OID=.;OPOS=46951721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0 chr8 46951809 . G A 512.13 PASS AF=0.972222;AO=28;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0655073;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.063;QD=56.9033;RBI=0.0873457;REFB=-0.114353;REVB=0.057776;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51612;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00375577;OID=.;OPOS=46951809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:36:0:1:28:35:0.972222:15:13:0:0:15:20:0:1 chr8 46951813 . GGGG GGGC,TGGG 502.45 PASS AF=0.027027,0.972973;AO=3,25;DP=36;FAO=1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=1,20;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.144985,0.0155911;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=3.13294,28.0475;QD=54.3193;RBI=0.166884,0.0377893;REFB=0,0;REVB=-0.0826418,-0.0344231;RO=0;SAF=3,14;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.99383e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.161257,0.0117297;OID=.,.;OPOS=46951816,46951813;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=GGGC,TGGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:36:37:0:0:3,25:1,36:0.027027,0.972973:0,11:3,14:0:0:0,16:1,20:0:0 chr8 47979781 . G C 1135.13 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1314;QD=60.5403;RBI=0.0170401;REFB=0;REVB=-0.000203701;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121619;OID=.;OPOS=47979781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chr8 48102786 . C T 1358.11 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00904971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.642;QD=62.442;RBI=0.00918946;REFB=0;REVB=-0.00159654;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.53539e-05;OID=.;OPOS=48102786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0 chr8 48102987 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.143;QD=58.5869;RBI=0.0636063;REFB=0;REVB=0.00396581;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054066;OID=.;OPOS=48102987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0 chr8 48103328 . C T 475.06 PASS AF=0.476636;AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.00912216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.19;QD=17.7594;RBI=0.012715;REFB=-0.0104774;REVB=0.00885767;RO=56;SAF=29;SAR=22;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372111;STB=0.520653;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.011803;OID=.;OPOS=48103328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:56:56:51:51:0.476636:22:29:34:22:22:29:34:22 chr8 48104722 . G A,T 1058.47 PASS AF=0.0416667,0.958333;AO=3,69;DP=72;FAO=3,69;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=1,32;FSAR=2,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285144,-0.0550736;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=28.1655,76.9069;QD=58.8041;RBI=0.0128904,0.0627207;REFB=0,0;REVB=-0.012571,-0.0300129;RO=0;SAF=1,32;SAR=2,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.131469,-0.000938133;OID=.,.;OPOS=48104722,48104722;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:72:72:0:0:3,69:3,69:0.0416667,0.958333:2,37:1,32:0:0:2,37:1,32:0:0 chr8 48792052 . CTTTTTC CTTTTC,CTTTTCT 231.2 PASS AF=0.853659,0;AO=20,5;DP=42;FAO=35,0;FDP=41;FR=.;FRO=6;FSAF=25,0;FSAR=10,0;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.115431,-0.132318;FXX=0.0238039;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.6038,148.908;QD=22.5565;RBI=0.252453,0.132846;REFB=-0.121648,-0.0130748;REVB=0.224518,0.0118354;RO=12;SAF=16,5;SAR=4,0;SRF=2;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.4589,0.799835;STB=0.564478,0.5;STBP=0.071,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.133419,0;OID=.,.;OPOS=48792053,48792057;OREF=T,TC;OALT=-,CT;OMAPALT=CTTTTC,CTTTTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.853659,0:20,5:42:35,0:41:6:25,0:10,0:2:4:17:12:16,5:4,0:2:10 chr8 48885436 . T A 964.61 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.014577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.31;QD=55.9192;RBI=0.0259354;REFB=-0.0607672;REVB=0.0214513;RO=2;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022494;STB=0.511901;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000405387;OID=.;OPOS=48885436;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:41:26:0:2:41:26:0:2 chr8 49375958 . T C 1114.67 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759937;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.583;QD=60.2523;RBI=0.0108256;REFB=0;REVB=0.00770991;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.16621e-05;OID=.;OPOS=49375958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:74:0:0:71:74:1:29:42:0:0:29:45:0:0 chr8 50242991 . G T 176.57 PASS AF=0.360656;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0072181;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.417;QD=11.5782;RBI=0.00735498;REFB=-0.00484686;REVB=-0.00141239;RO=39;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423195;STB=0.524568;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00704595;OID=.;OPOS=50242991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:39:39:22:22:0.360656:11:11:18:21:11:11:18:21 chr8 51571172 . G A 95.18 PASS AF=0.352941;AO=13;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00817345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.559;QD=11.1982;RBI=0.0145011;REFB=-0.00794152;REVB=-0.0119781;RO=21;SAF=3;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418191;STB=0.726884;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0215016;OID=.;OPOS=51571172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:21:22:13:12:0.352941:10:3:13:8:9:3:13:9 chr8 52233408 . C T 361.62 PASS AF=0.36;AO=43;DP=125;FAO=45;FDP=125;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0122013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=359.147;QD=11.5719;RBI=0.0157453;REFB=-0.00899441;REVB=-0.00995208;RO=78;SAF=24;SAR=19;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179198;STB=0.604818;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0200006;OID=.;OPOS=52233408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:78:80:43:45:0.36:19:24:31:47:19:26:33:47 chr8 52321243 . T C 2464.34 PASS AF=0.987879;AO=156;DP=157;FAO=163;FDP=165;FR=.;FRO=2;FSAF=88;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0448008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.439;QD=59.7415;RBI=0.0453263;REFB=0.012177;REVB=-0.00688195;RO=1;SAF=81;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00630122;STB=0.506578;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-6.02556e-05;OID=.;OPOS=52321243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:157:165:1:2:156:163:0.987879:75:81:0:1:75:88:0:2 chr8 52366200 . G A 652.44 PASS AF=0.433735;AO=72;DP=166;FAO=72;FDP=166;FR=.;FRO=94;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.00306974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.396;QD=15.7215;RBI=0.00347824;REFB=-0.0101158;REVB=0.0016355;RO=94;SAF=29;SAR=43;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121559;STB=0.567878;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0114819;OID=.;OPOS=52366200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:94:94:72:72:0.433735:43:29:49:45:43:29:49:45 chr8 52730521 . C T 1572.1 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00643922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5771;QD=59.3246;RBI=0.0536988;REFB=0;REVB=0.0533113;RO=0;SAF=58;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315347;OID=.;OPOS=52730521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:106:0:0:103:106:1:45:58:0:0:48:58:0:0 chr8 52730864 . T C 597.88 PASS AF=0.769231;AO=50;DP=65;FAO=50;FDP=65;FR=.;FRO=15;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0232378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.501;QD=36.7929;RBI=0.0297776;REFB=0.0145217;REVB=0.0186201;RO=15;SAF=27;SAR=23;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031593;STB=0.516979;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00317991;OID=.;OPOS=52730864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:65:65:15:15:50:50:0.769231:23:27:7:8:23:27:7:8 chr8 52731494 . G A 33.46 PASS AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.049475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4761;QD=2.09152;RBI=0.0571697;REFB=-0.00845831;REVB=-0.0286462;RO=57;SAF=3;SAR=4;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955582;STB=0.571896;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0573888;OID=.;OPOS=52731494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:64:64:57:57:7:7:0.109375:4:3:20:37:4:3:20:37 chr8 52733050 . T A 217.97 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0690075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.826;QD=15.5689;RBI=0.0690921;REFB=7.59789e-05;REVB=-0.00341791;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059523;STB=0.533689;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.000451567;OID=.;OPOS=52733050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:13:12:13:18:13:12:13:18 chr8 52746153 . C T 227.94 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0105383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.571;QD=11.5413;RBI=0.0394453;REFB=-0.0147687;REVB=-0.0380115;RO=50;SAF=18;SAR=10;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141102;STB=0.58872;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0253281;OID=.;OPOS=52746153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:50:51:28:28:0.35443:10:18:26:24:10:18:26:25 chr8 53084487 . G A 405.2 PASS AF=0.408696;AO=46;DP=114;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.00257955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.072;QD=14.0938;RBI=0.00721483;REFB=-0.0190385;REVB=0.00673794;RO=68;SAF=26;SAR=20;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537772;STB=0.535739;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0259677;OID=.;OPOS=53084487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:68:68:46:47:0.408696:20:26:35:33:20:27:35:33 chr8 53586706 . A G 551.06 PASS AF=0.5;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.013923;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.772;QD=19.3353;RBI=0.0187393;REFB=-0.0156194;REVB=-0.0125423;RO=56;SAF=22;SAR=35;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104968;STB=0.562892;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0127139;OID=.;OPOS=53586706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:56:57:57:57:0.5:35:22:28:28:35:22:29:28 chr8 54745538 . C G 1048.77 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230208;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8209;QD=59.9298;RBI=0.0232292;REFB=0;REVB=0.00310436;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170084;OID=.;OPOS=54745538;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0 chr8 54859219 . T G 34.63 PASS AF=0.0909091;AO=9;DP=99;FAO=9;FDP=99;FR=.;FRO=90;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0436695;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=168.89;QD=1.3992;RBI=0.045306;REFB=-0.00378647;REVB=-0.012067;RO=87;SAF=8;SAR=1;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469307;STB=0.86869;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0836819;OID=.;OPOS=54859219;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:99:99:87:90:9:9:0.0909091:1:8:43:44:1:8:46:44 chr8 55539057 . G A 374.36 PASS AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00598984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.182;QD=31.8605;RBI=0.0118213;REFB=0.00217103;REVB=-0.0101914;RO=16;SAF=12;SAR=19;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111664;STB=0.561141;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.000724757;OID=.;OPOS=55539057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:19:12:9:7:19:12:9:7 chr8 55539466 . G A 209.69 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0346719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0655;QD=18.6392;RBI=0.0401421;REFB=-0.0125464;REVB=-0.0202299;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061468;STB=0.534851;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0113662;OID=.;OPOS=55539466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:10:11:11:13:10:11:11:13 chr8 55541450 . G A 324.73 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0208158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.631;QD=17.0912;RBI=0.0216038;REFB=-9.59683e-05;REVB=0.00578145;RO=41;SAF=21;SAR=14;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245381;STB=0.637229;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.000261076;OID=.;OPOS=55541450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:14:21:14:27:14:21:14:27 chr8 55541513 . T C 167.63 PASS AF=0.418605;AO=17;DP=42;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00078619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.978;QD=15.5931;RBI=0.000809639;REFB=-0.00394197;REVB=0.000193446;RO=25;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25379;STB=0.621973;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00513796;OID=.;OPOS=55541513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:25:25:17:18:0.418605:6:11:10:15:7:11:10:15 chr8 55541617 . A G 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0111361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.685;QD=18.6371;RBI=0.0230245;REFB=-0.00633409;REVB=-0.0201523;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113657;STB=0.564438;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00768366;OID=.;OPOS=55541617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:9:7:5:11:9:7:5:11 chr8 55632762 . C T 846.26 PASS AF=0.531646;AO=84;DP=159;FAO=84;FDP=158;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00137332;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.982;QD=21.4243;RBI=0.00239207;REFB=-0.0152248;REVB=0.00195857;RO=74;SAF=33;SAR=51;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822291;STB=0.545063;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0133581;OID=.;OPOS=55632762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:74:74:84:84:0.531646:51:33:36:38:51:33:36:38 chr8 56651746 . G A 48.85 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0214067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.212;QD=13.9584;RBI=0.0550743;REFB=-0.0357918;REVB=0.0507437;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0406381;OID=.;OPOS=56651746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:3:4:4:3:3:4 chr8 56652048 . CAT C 723.88 PASS AF=0.390698;AO=83;DP=217;FAO=84;FDP=215;FR=.;FRO=131;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=65;FSRR=66;FWDB=-0.00351319;FXX=0.0137608;HRUN=1;LEN=2;MLLD=256.748;QD=13.4675;RBI=0.0168907;REFB=-0.00613779;REVB=0.0165213;RO=131;SAF=41;SAR=42;SRF=65;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00239799;STB=0.504928;STBP=0.917;TYPE=del;VARB=0.0100486;OID=.;OPOS=56652049;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.390698:83:217:84:215:131:41:43:65:66:99:131:41:42:65:66 chr8 56657801 . C T 260.54 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.000387814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7118;QD=18.9486;RBI=0.0250807;REFB=0.0334777;REVB=0.0250777;RO=27;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175439;STB=0.509797;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0434936;OID=.;OPOS=56657801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:13:15:15:12:13:15:15:12 chr8 56686224 . T C 1048.06 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0190684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2715;QD=58.2253;RBI=0.0219383;REFB=0.0703251;REVB=0.0108484;RO=1;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108712;STB=0.505746;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000189905;OID=.;OPOS=56686224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:43:28:0:1:43:28:0:1 chr8 56699216 . G C 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0254557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1702;QD=18.2899;RBI=0.0254748;REFB=-0.00536523;REVB=0.000985659;RO=33;SAF=14;SAR=18;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126809;STB=0.570534;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00877769;OID=.;OPOS=56699216;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:18:14:10:23:18:14:10:23 chr8 56821700 . T G 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.042;QD=58.7817;RBI=0.0231124;REFB=0;REVB=0.0180847;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101114;OID=.;OPOS=56821700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0 chr8 56821795 . T G 1114.84 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.38;QD=60.2616;RBI=0.0293489;REFB=0;REVB=-0.000980514;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25383e-05;OID=.;OPOS=56821795;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:35:37:0:0:35:39:0:0 chr8 56821809 . C T 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.451;QD=60.2045;RBI=0.0176839;REFB=0;REVB=0.00621522;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.1165e-05;OID=.;OPOS=56821809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0 chr8 56821945 . G A 976.86 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00552248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7495;QD=57.462;RBI=0.0658546;REFB=-0.0905981;REVB=0.0656227;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00174167;OID=.;OPOS=56821945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:0:1:67:67:0.985294:37:30:0:0:37:30:0:1 chr8 57872679 . T C 149.08 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0121032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6264;QD=18.6349;RBI=0.0121487;REFB=0.000170862;REVB=-0.00105046;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295272;STB=0.665112;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.000765128;OID=.;OPOS=57872679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:7:9:14:2:7:9:14:2 chr8 59329438 . A G 483.44 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=0.041404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1338;QD=19.146;RBI=0.0464924;REFB=-0.00481174;REVB=-0.0211484;RO=51;SAF=25;SAR=25;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152324;STB=0.584126;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00535765;OID=.;OPOS=59329438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:51:50:50:0.49505:25:25:17:34:25:25:17:34 chr8 59496490 . A G 283.13 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0192413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.398;QD=17.4231;RBI=0.0207064;REFB=-0.0241508;REVB=0.0076503;RO=34;SAF=16;SAR=15;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952966;STB=0.553306;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0265494;OID=.;OPOS=59496490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:15:16:21:13:15:16:21:13 chr8 59512334 . G A 1463.35 PASS AF=0.99;AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0085761;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.929;QD=58.5341;RBI=0.0258282;REFB=-0.0353958;REVB=0.0243629;RO=1;SAF=38;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771347;STB=0.504064;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00100333;OID=.;OPOS=59512334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:100:1:1:99:99:0.99:61:38:0:1:61:38:0:1 chr8 59547804 . C A 251.78 PASS AF=0.37037;AO=29;DP=80;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0148241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.217;QD=12.4334;RBI=0.0319923;REFB=-0.0346919;REVB=-0.0283506;RO=51;SAF=14;SAR=15;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189873;STB=0.61721;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0311264;OID=.;OPOS=59547804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:51:51:29:30:0.37037:15:14:16:35:15:15:16:35 chr8 62490978 . T C 215.13 PASS AF=0.294737;AO=27;DP=95;FAO=28;FDP=95;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.0277363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.235;QD=9.05814;RBI=0.0284949;REFB=-0.0199357;REVB=-0.00653125;RO=67;SAF=15;SAR=12;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181553;STB=0.617129;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0315973;OID=.;OPOS=62490978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:67:67:27:28:0.294737:12:15:27:40:12:16:27:40 chr8 62491095 . C T 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0403859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.708;QD=6.57345;RBI=0.0570854;REFB=-0.000143087;REVB=0.040345;RO=16;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.603731;STB=0.877291;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00262351;OID=.;OPOS=62491095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:1:5:4:12:1:5:4:12 chr8 62491107 . G A 36.16 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00480246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.205;QD=6.57455;RBI=0.0157059;REFB=-0.00225502;REVB=-0.0149537;RO=16;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.603731;STB=0.877291;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00284967;OID=.;OPOS=62491107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:1:5:4:12:1:5:4:12 chr8 62491943 . G A 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00262924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1037;QD=11.9193;RBI=0.00779541;REFB=-0.0117673;REVB=0.00733863;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150213;STB=0.509065;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0159966;OID=.;OPOS=62491943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:4:3:4:5:4:3:4:5 chr8 62544428 . G T 524.89 PASS AF=0.520833;AO=47;DP=93;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0214993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9741;QD=21.8706;RBI=0.0233176;REFB=-0.00489177;REVB=-0.00902729;RO=46;SAF=24;SAR=23;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145353;STB=0.591286;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00629596;OID=.;OPOS=62544428;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:46:46:47:50:0.520833:23:24:16:30:23:27:16:30 chr8 62555416 . GAA AAG,GA 40.57 PASS AF=0.416667,0.5;AO=2,2;DP=11;FAO=5,6;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=2,1;FSAR=3,5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.251916,-1.50715;FXX=0.076864;HRUN=1,14;LEN=3,1;MLLD=9.93288,2.76492;QD=13.5242;RBI=0.26144,1.51436;REFB=-0.104758,-0.228732;REVB=0.0699221,0.147653;RO=0;SAF=1,0;SAR=1,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.571154,0.54531;STBP=0.616,0.659;TYPE=mnp,del;VARB=0.0927295,-0.1816;OID=.,.;OPOS=62555416,62555417;OREF=GAA,A;OALT=AAG,-;OMAPALT=AAG,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:11:12:0:1:2,2:5,6:0.416667,0.5:1,2:1,0:0:0:3,5:2,1:0:1 chr8 62595068 . C T 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00995249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.538;QD=18.1751;RBI=0.0117563;REFB=-0.00212899;REVB=-0.00625771;RO=30;SAF=11;SAR=20;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103844;STB=0.576872;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00172149;OID=.;OPOS=62595068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:32:31:31:0.492063:20:11:14:16:20:11:16:16 chr8 63659610 . G A 2201.05 PASS AF=1;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000260458;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.249;QD=63.3396;RBI=0.0272433;REFB=0;REVB=0.027242;RO=0;SAF=79;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56062e-05;OID=.;OPOS=63659610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:139:0:0:139:139:1:60:79:0:0:60:79:0:0 chr8 63902715 . T G 147.03 PASS AF=0.684211;AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0039017;FXX=0.049975;HRUN=6;LEN=1;MLLD=252.449;QD=30.9539;RBI=0.0149411;REFB=-0.0406441;REVB=-0.0144227;RO=3;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903656;STB=0.538402;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00489482;OID=.;OPOS=63902715;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:20:19:3:3:12:13:0.684211:7:5:2:1:7:6:2:1 chr8 63978658 . TAA TA,T 220.67 PASS AF=1,0;AO=29,5;DP=40;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.140073,-0.077518;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=7.68833,9.12288;QD=22.0668;RBI=0.162176,0.0880733;REFB=0.0427177,0.0600561;REVB=0.0817366,0.0418074;RO=4;SAF=10,4;SAR=19,1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0237844,0.425125;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00134429,0;OID=.,.;OPOS=63978659,63978659;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:29,5:40:40,0:40:0:17,0:23,0:0:0:4:4:10,4:19,1:1:3 chr8 64098729 . A AG 1301.94 PASS AF=1;AO=84;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00882622;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=262.288;QD=61.2676;RBI=0.0362367;REFB=0;REVB=0.0351453;RO=3;SAF=44;SAR=40;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00934929;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.34687e-05;OID=.;OPOS=64098730;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:84:87:85:85:0:44:41:0:0:7:3:44:40:2:1 chr8 65290650 . C T 178.95 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.000917266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.565;QD=15.2296;RBI=0.00187327;REFB=-0.0149263;REVB=0.00163333;RO=28;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313019;STB=0.679557;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0203239;OID=.;OPOS=65290650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:7:12:9:19:7:12:9:19 chr8 65488962 . G A 1156.86 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00372941;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.23;QD=60.8876;RBI=0.0130783;REFB=0;REVB=0.0125353;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67831e-05;OID=.;OPOS=65488962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr8 66515783 . G A 198.36 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.026943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9219;QD=13.224;RBI=0.0274722;REFB=-0.0162981;REVB=0.00536613;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290639;STB=0.516653;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00842482;OID=.;OPOS=66515783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:12:12:19:17:12:12:19:17 chr8 66516490 . C T 175.61 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0299324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8598;QD=13.7737;RBI=0.0445478;REFB=-0.00276332;REVB=0.0329933;RO=30;SAF=10;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10423;STB=0.56856;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0093709;OID=.;OPOS=66516490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:31:20:20:0.392157:10:10:18:12:10:10:19:12 chr8 66517486 . C T 210.28 PASS AF=0.416667;AO=24;DP=59;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0163882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5544;QD=14.0187;RBI=0.060498;REFB=-0.00477038;REVB=-0.058236;RO=31;SAF=15;SAR=9;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564334;STB=0.571374;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00269316;OID=.;OPOS=66517486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:31:35:24:25:0.416667:9:15:21:10:10:15:25:10 chr8 66701147 . G A 168.42 PASS AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0640288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5438;QD=10.3646;RBI=0.0699107;REFB=0.00468645;REVB=-0.0280682;RO=43;SAF=11;SAR=11;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131402;STB=0.507685;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0124867;OID=.;OPOS=66701147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:11:11:22:21:11:11:22:21 chr8 67380528 . T C 489.56 PASS AF=0.534091;AO=44;DP=86;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0110862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9715;QD=22.2528;RBI=0.0353787;REFB=0.0188746;REVB=0.0335968;RO=42;SAF=20;SAR=24;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102917;STB=0.574436;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0129595;OID=.;OPOS=67380528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:42:41:44:47:0.534091:24:20:24:18:27:20:24:17 chr8 67590460 . C T 213.84 PASS AF=0.538462;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0131068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.767;QD=21.9321;RBI=0.025143;REFB=-0.00632048;REVB=-0.0214565;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155024;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00682198;OID=.;OPOS=67590460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:18:18:20:21:0.538462:13:7:6:12:14:7:6:12 chr8 67592152 . T C 411.04 PASS AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0210393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9848;QD=23.8286;RBI=0.0714991;REFB=-0.000996797;REVB=0.0683335;RO=29;SAF=27;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102972;STB=0.556672;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00210725;OID=.;OPOS=67592152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:13:27:16:13:13:27:16:13 chr8 68864728 . G A 532.56 PASS AF=0.561798;AO=44;DP=84;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0359813;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.003;QD=23.9353;RBI=0.0425028;REFB=-0.0286843;REVB=0.0226237;RO=40;SAF=27;SAR=17;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185018;STB=0.602899;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0268708;OID=.;OPOS=68864728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:89:40:39:44:50:0.561798:17:27:16:24:18:32:16:23 chr8 68968166 . C A 443.57 PASS AF=0.449541;AO=49;DP=110;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0115816;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.82;QD=16.2777;RBI=0.0241214;REFB=-0.0187147;REVB=-0.0211591;RO=60;SAF=25;SAR=24;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428655;STB=0.523942;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0267078;OID=.;OPOS=68968166;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:60:60:49:49:0.449541:24:25:28:32:24:25:28:32 chr8 68968171 . G A 444.2 PASS AF=0.457944;AO=48;DP=108;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.00571691;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.337;QD=16.6056;RBI=0.00580014;REFB=-0.0198513;REVB=-0.000979033;RO=59;SAF=24;SAR=24;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250745;STB=0.524199;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0263612;OID=.;OPOS=68968171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:59:58:48:49:0.457944:24:24:28:31:24:25:27:31 chr8 68993013 . AT GC 1017.91 PASS AF=0.959459;AO=65;DP=71;FAO=71;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0136378;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=136.222;QD=55.022;RBI=0.0347713;REFB=-0.000166844;REVB=0.0319852;RO=3;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043544;STB=0.521121;STBP=0.13;TYPE=mnp;VARB=0.00600641;OID=.;OPOS=68993013;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:71:74:3:3:65:71:0.959459:31:34:0:3:34:37:0:3 chr8 69009268 . C T 662.94 PASS AF=0.471831;AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=142;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.00644596;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.44;QD=18.6743;RBI=0.0156918;REFB=-0.0178708;REVB=-0.0143067;RO=74;SAF=24;SAR=43;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164615;STB=0.588247;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0160988;OID=.;OPOS=69009268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:74:75:67:67:0.471831:43:24:39:35:43:24:39:36 chr8 69012364 . G A 357.94 PASS AF=0.383929;AO=43;DP=112;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.00430731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.657;QD=12.7836;RBI=0.0330067;REFB=-0.00344496;REVB=-0.0327245;RO=69;SAF=23;SAR=20;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10813;STB=0.561411;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00673844;OID=.;OPOS=69012364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:69:69:43:43:0.383929:20:23:30:39:20:23:30:39 chr8 69020496 . T C 417.86 PASS AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0346293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2861;QD=22.587;RBI=0.0360556;REFB=0.00432584;REVB=0.0100407;RO=33;SAF=14;SAR=27;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123192;STB=0.567988;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00248042;OID=.;OPOS=69020496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:27:14:16:17:27:14:16:17 chr8 69046409 . G A 795.92 PASS AF=0.520548;AO=75;DP=144;FAO=76;FDP=146;FR=.;FRO=70;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0099032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6571;QD=21.8059;RBI=0.0400837;REFB=-0.0120012;REVB=0.0388411;RO=69;SAF=39;SAR=36;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490483;STB=0.52683;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0197341;OID=.;OPOS=69046409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:69:70:75:76:0.520548:36:39:32:37:37:39:32:38 chr8 69730432 . G A 81.95 PASS AF=0.25;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0901267;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2962;QD=7.44962;RBI=0.147609;REFB=-0.0164701;REVB=-0.1169;RO=30;SAF=5;SAR=6;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327453;STB=0.698479;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0352906;OID=.;OPOS=69730432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:46:44:30:33:11:11:0.25:6:5:22:8:6:5:24:9 chr8 69730488 . G C 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.011171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.705;QD=10.9363;RBI=0.0176136;REFB=-0.0107798;REVB=-0.0136179;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134796;STB=0.579903;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0220754;OID=.;OPOS=69730488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:8:8:21:13:8:8:21:13 chr8 70498703 . G A 450.41 PASS AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.00667485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.829;QD=18.5734;RBI=0.00933812;REFB=-0.00333813;REVB=-0.00653045;RO=50;SAF=21;SAR=25;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00328048;STB=0.502936;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0029086;OID=.;OPOS=70498703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:51:46:46:0.474227:25:21:23:27:25:21:23:28 chr8 70571313 . G A 229.1 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0325917;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4135;QD=17.6233;RBI=0.0395109;REFB=-0.00534708;REVB=-0.0223358;RO=26;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966341;STB=0.546304;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00801761;OID=.;OPOS=70571313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:27:25:25:0.480769:16:9:12:14:16:9:12:15 chr8 70571531 . G A 375.72 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00138119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.676;QD=23.855;RBI=0.00164486;REFB=-0.0133217;REVB=-0.000893239;RO=26;SAF=20;SAR=17;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305584;STB=0.516787;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00867032;OID=.;OPOS=70571531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:26:37:37:0.587302:17:20:13:13:17:20:13:13 chr8 70573004 . G A 404.43 PASS AF=0.442105;AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0133719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.191;QD=17.0284;RBI=0.0133986;REFB=-0.0146184;REVB=0.000844279;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760186;STB=0.54256;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0221202;OID=.;OPOS=70573004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:53:42:42:0.442105:19:23:33:20:19:23:33:20 chr8 70602259 . T C 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0117781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0393;QD=8.8111;RBI=0.0578673;REFB=0.0199155;REVB=-0.056656;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141704;STB=0.58795;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.0402321;OID=.;OPOS=70602259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:3:3:4:7:3:3:4:7 chr8 70602299 . A G 523.67 PASS AF=0.652174;AO=36;DP=69;FAO=45;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0223119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9464;QD=30.3578;RBI=0.0294002;REFB=0.00634725;REVB=-0.0191455;RO=21;SAF=14;SAR=22;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933032;STB=0.556478;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.00227616;OID=.;OPOS=70602299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:21:21:36:45:0.652174:22:14:11:10:29:16:11:10 chr8 70602341 . A G 2676.74 PASS AF=0.921569;AO=188;DP=204;FAO=188;FDP=204;FR=.;FRO=16;FSAF=83;FSAR=105;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00254901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.102;QD=52.4851;RBI=0.0310985;REFB=0.00986125;REVB=0.0309938;RO=16;SAF=83;SAR=105;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276009;STB=0.514542;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.00122385;OID=.;OPOS=70602341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:204:204:16:16:188:188:0.921569:105:83:10:6:105:83:10:6 chr8 70602526 . A G 61.82 PASS AF=0.236842;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00641876;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8655;QD=6.50786;RBI=0.0215013;REFB=0.0215682;REVB=-0.0205208;RO=27;SAF=1;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.589475;STB=0.888025;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0358592;OID=.;OPOS=70602526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:39:38:27:29:9:9:0.236842:8:1:16:11:8:1:18:11 chr8 70602538 . T A 84.77 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.013165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.682;QD=10.9375;RBI=0.0136;REFB=-0.0150217;REVB=-0.00341211;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969096;STB=0.558174;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0292905;OID=.;OPOS=70602538;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:4:7:11:9:4:7:11:9 chr8 70602595 . G A 116.67 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0660564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7688;QD=11.6671;RBI=0.0865916;REFB=0.00127451;REVB=-0.055988;RO=25;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416075;STB=0.753081;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00832403;OID=.;OPOS=70602595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:26:14:14:0.35:4:10:8:17:4:10:8:18 chr8 70612637 . C A 215.57 PASS AF=0.380282;AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0147012;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.857;QD=12.1447;RBI=0.0188975;REFB=0.00341869;REVB=0.0118739;RO=43;SAF=14;SAR=12;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726538;STB=0.536714;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=-0.005811;OID=.;OPOS=70612637;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:43:44:26:27:0.380282:12:14:26:17:12:15:27:17 chr8 70612692 . G A 66.64 PASS AF=0.391304;AO=8;DP=22;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0466399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9106;QD=11.5893;RBI=0.0606549;REFB=-0.0106918;REVB=0.038778;RO=14;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477517;STB=0.691844;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0223242;OID=.;OPOS=70612692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:23:14:14:8:9:0.391304:7:1:7:7:7:2:7:7 chr8 70835081 . C T 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0618659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8616;QD=9.11039;RBI=0.0642113;REFB=-0.00709675;REVB=-0.017196;RO=16;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529846;STB=0.832408;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.010303;OID=.;OPOS=70835081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:7:1:9:7:7:1:9:7 chr8 70964399 . A G 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000231859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.296;QD=62.67;RBI=0.0254218;REFB=0;REVB=-0.0254208;RO=0;SAF=34;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.0672e-05;OID=.;OPOS=70964399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:10:34:0:0:10:34:0:0 chr8 70967607 . T C 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7944;QD=53.2745;RBI=0.0859831;REFB=0;REVB=-0.0691692;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000327806;OID=.;OPOS=70967607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr8 70978690 . C T 727.76 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.038;QD=63.2835;RBI=0.0133574;REFB=0;REVB=-0.00214113;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14423e-05;OID=.;OPOS=70978690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0 chr8 71575184 . A G 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0546473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7637;QD=17.2293;RBI=0.0670362;REFB=0.0651234;REVB=-0.0388269;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861157;STB=0.549882;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.0572071;OID=.;OPOS=71575184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:1:5:6:2:1:5 chr8 72111599 . A G 426.29 PASS AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0418704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.037;QD=19.1592;RBI=0.0530641;REFB=-0.0326237;REVB=-0.0325986;RO=43;SAF=20;SAR=23;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210222;STB=0.529275;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0385797;OID=.;OPOS=72111599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:43:46:43:43:0.483146:23:20:21:22:23:20:24:22 chr8 72129009 . G A 533.87 PASS AF=0.581395;AO=48;DP=88;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0105761;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5153;QD=24.831;RBI=0.0123335;REFB=-0.0108234;REVB=0.00634521;RO=36;SAF=24;SAR=24;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434409;STB=0.514919;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0218845;OID=.;OPOS=72129009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:36:36:48:50:0.581395:24:24:20:16:24:26:20:16 chr8 72246578 . A G 111.23 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0185059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.583;QD=15.8894;RBI=0.0220049;REFB=0.00213535;REVB=0.0119058;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664503;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.00241055;OID=.;OPOS=72246578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:7:6:8:7:7:6:8:7 chr8 72383124 . T C 212.12 PASS AF=0.45098;AO=22;DP=50;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0201779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.993;QD=16.6371;RBI=0.0203187;REFB=-0.0120595;REVB=-0.00238798;RO=28;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227035;STB=0.636247;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0118623;OID=.;OPOS=72383124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:28:28:22:23:0.45098:9:13:10:18:9:14:10:18 chr8 72914433 . CTTTTT CTTTCT,CTTTTC,CTT,CTTT 149.65 PASS AF=0.0909091,0.363636,0.272727,0.272727;AO=3,3,3,4;DP=24;FAO=2,8,6,6;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0,6,6;FSAR=0,8,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014913,0.0162886,0.188034,0.278741;FXX=0.119952;HRUN=16,16,16,16;LEN=1,1,3,2;MLLD=208.858,205.627,14.2348,6.9943;QD=27.2084;RBI=0.0371144,0.0380944,0.188817,0.279212;REFB=0.0395301,0.0427035,0.16755,0.184824;REVB=0.0339865,0.0344364,0.0171791,0.01622;RO=0;SAF=1,0,3,4;SAR=2,3,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,snp,del,del;VARB=-0.0585937,-0.030257,0.166356,0.086395;OID=.,.,.,.;OPOS=72914437,72914438,72914434,72914434;OREF=T,T,TTT,TT;OALT=C,C,-,-;OMAPALT=CTTTCT,CTTTTC,CTT,CTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0.0909091,0.363636,0.272727,0.272727:3,3,3,4:24:2,8,6,6:22:0:2,0,6,6:0,8,0,0:0:0:27:0:1,0,3,4:2,3,0,0:0:0 chr8 72935008 . C T 355.04 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00407527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.268;QD=16.3237;RBI=0.0082156;REFB=-0.00987044;REVB=0.0071336;RO=49;SAF=18;SAR=20;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117906;STB=0.566231;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00781056;OID=.;OPOS=72935008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:49:38:38:0.436782:20:18:29:20:20:18:29:20 chr8 72935039 . C T 399.06 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.000261237;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.559;QD=15.3483;RBI=0.0140898;REFB=-0.00864839;REVB=-0.0140874;RO=57;SAF=23;SAR=22;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00233304;STB=0.508123;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0133494;OID=.;OPOS=72935039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:59:45:45:0.432692:22:23:29:28:22:23:31:28 chr8 72935045 . G C 424.11 PASS AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0109342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4704;QD=15.1466;RBI=0.0151846;REFB=-0.0216205;REVB=-0.0105364;RO=63;SAF=23;SAR=25;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291152;STB=0.520825;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0268843;OID=.;OPOS=72935045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:64:48:48:0.428571:25:23:32:31:25:23:33:31 chr8 72936145 . T C 240.6 PASS AF=0.367089;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.00415343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.574;QD=12.1821;RBI=0.0375045;REFB=-0.00721984;REVB=0.0372738;RO=50;SAF=14;SAR=15;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409177;STB=0.523544;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0137069;OID=.;OPOS=72936145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:50:50:29:29:0.367089:15:14:26:24:15:14:26:24 chr8 72942210 . G T 902.71 PASS AF=1;AO=52;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.655;QD=58.2393;RBI=0.0348985;REFB=0;REVB=0.00602239;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165271;OID=.;OPOS=72942210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:52:62:1:15:37:0:0:25:37:0:0 chr8 72964965 . G A 1010.64 PASS AF=0.593333;AO=89;DP=150;FAO=89;FDP=150;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0192599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.476;QD=26.9505;RBI=0.0213665;REFB=0.00277185;REVB=0.0092511;RO=61;SAF=35;SAR=54;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759142;STB=0.54124;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00206884;OID=.;OPOS=72964965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:61:61:89:89:0.593333:54:35:30:31:54:35:30:31 chr8 72966002 . G A 955.18 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8714;QD=58.7804;RBI=0.042153;REFB=0;REVB=-0.0318625;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000588215;OID=.;OPOS=72966002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0 chr8 72975801 . T G 1090.44 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0204074;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=295.992;QD=57.3918;RBI=0.0240668;REFB=-0.174911;REVB=-0.0127573;RO=1;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122874;STB=0.512817;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.000401914;OID=.;OPOS=72975801;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:76:1:2:74:74:0.973684:38:36:0:1:38:36:0:2 chr8 72981327 . A G 1921.36 PASS AF=0.992126;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00724225;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.621;QD=60.5152;RBI=0.00728108;REFB=0.0027382;REVB=0.000750993;RO=0;SAF=56;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44067e-08;STB=0.503496;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000268548;OID=.;OPOS=72981327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:125:127:0:1:125:126:0.992126:69:56:0:0:71:55:0:1 chr8 72984041 . C G 619.54 PASS AF=0.591398;AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=93;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.012678;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3869;QD=26.6469;RBI=0.0129673;REFB=0.00795984;REVB=-0.00272392;RO=37;SAF=31;SAR=24;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573481;STB=0.526244;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=-0.00566686;OID=.;OPOS=72984041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:37:38:55:55:0.591398:24:31:18:19:24:31:19:19 chr8 72987638 . G A 346.09 PASS AF=0.5;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0068629;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.921;QD=19.2272;RBI=0.0235023;REFB=-0.0306679;REVB=-0.0224779;RO=36;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501957;STB=0.527935;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0250228;OID=.;OPOS=72987638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:36:36:36:36:0.5:16:20:18:18:16:20:18:18 chr8 73925128 . A G 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00547692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6979;QD=14.794;RBI=0.0502345;REFB=-0.00363419;REVB=0.0499351;RO=27;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982302;STB=0.556898;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00964767;OID=.;OPOS=73925128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:11:7:13:14:11:7:13:14 chr8 73944312 . A G 67.4 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0445913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.818;QD=13.4798;RBI=0.0450936;REFB=0.00521267;REVB=0.00671209;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202897;STB=0.620415;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.0039542;OID=.;OPOS=73944312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:6:3:6:5:6:3:6:5 chr8 74234193 . G A 426.34 PASS AF=0.531646;AO=37;DP=74;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0705891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.187;QD=21.5869;RBI=0.0844721;REFB=-0.0518587;REVB=0.0463975;RO=36;SAF=12;SAR=25;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282861;STB=0.624941;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0392484;OID=.;OPOS=74234193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:79:36:37:37:42:0.531646:25:12:23:13:26:16:24:13 chr8 74527996 . C T 169.06 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0142417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.231;QD=13.0047;RBI=0.014978;REFB=-0.010218;REVB=-0.00463847;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123459;STB=0.581313;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0206372;OID=.;OPOS=74527996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:12:8:16:15:12:8:17:15 chr8 74581290 . A AG 890.39 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254764;FXX=0.031741;HRUN=0;LEN=1;MLLD=236.082;QD=58.3863;RBI=0.0402007;REFB=0;REVB=0.0310974;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.22225e-05;OID=.;OPOS=74581291;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:60:62:61:61:0:31:30:0:0:5:0:30:30:0:0 chr8 74893880 . C T 279.93 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=-0.00589083;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.426;QD=26.0397;RBI=0.0248077;REFB=-0.00384011;REVB=-0.0240981;RO=17;SAF=21;SAR=4;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155348;STB=0.591377;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00218282;OID=.;OPOS=74893880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:43:17:18:25:25:0.581395:4:21:16:1:4:21:17:1 chr8 74917084 . A G 1571.68 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00669684;FXX=0.0101;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.4896;QD=64.15;RBI=0.0301449;REFB=0;REVB=-0.0293917;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210525;OID=.;OPOS=74917084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:53:45:0:0:53:45:0:0 chr8 75262798 . G C 1495.15 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365017;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.101;QD=63.6235;RBI=0.0720692;REFB=0;REVB=0.0621417;RO=0;SAF=50;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000456498;OID=.;OPOS=75262798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:44:50:0:0:44:50:0:0 chr8 75460784 . T TG 1549.29 PASS AF=0.992701;AO=121;DP=189;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0263992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.1018;QD=45.2346;RBI=0.0284917;REFB=0.0914534;REVB=-0.0107171;RO=57;SAF=42;SAR=79;SRF=51;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322592;STB=0.504672;STBP=0.29;TYPE=ins;VARB=-0.000844645;OID=.;OPOS=75460785;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.992701:121:189:136:137:1:53:83:1:0:22:57:42:79:51:6 chr8 75460789 . A AG 1356.01 PASS AF=1;AO=127;DP=137;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305927;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.4065;QD=41.405;RBI=0.0462427;REFB=0;REVB=-0.0346766;RO=9;SAF=52;SAR=75;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389997;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000220598;OID=.;OPOS=75460790;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:127:137:131:131:0:52:79:0:0:27:9:52:75:1:8 chr8 75614617 . A G 332.94 PASS AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0610135;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0984;QD=21.4799;RBI=0.0800397;REFB=-0.00654833;REVB=0.0518044;RO=28;SAF=11;SAR=23;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211397;STB=0.617225;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00731772;OID=.;OPOS=75614617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:28:34:34:0.548387:23:11:16:12:23:11:16:12 chr8 75664694 . CA C 251.31 PASS AF=0.414286;AO=26;DP=71;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0139092;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.479;QD=14.3605;RBI=0.0142277;REFB=-0.0125473;REVB=-0.00299344;RO=43;SAF=13;SAR=13;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377641;STB=0.523274;STBP=0.779;TYPE=del;VARB=0.0175667;OID=.;OPOS=75664695;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.414286:26:71:29:70:41:16:13:21:20:99:43:13:13:23:20 chr8 75737667 . C T 451.75 PASS AF=0.446429;AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.00927904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2984;QD=16.134;RBI=0.0147261;REFB=-0.00952698;REVB=-0.011435;RO=62;SAF=19;SAR=31;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199453;STB=0.611505;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.010965;OID=.;OPOS=75737667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:62:62:50:50:0.446429:31:19:36:26:31:19:36:26 chr8 76452313 . G A 558.01 PASS AF=0.565217;AO=48;DP=88;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0092086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5477;QD=24.2613;RBI=0.0332448;REFB=-0.0247107;REVB=0.031944;RO=40;SAF=26;SAR=22;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962398;STB=0.532596;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0254377;OID=.;OPOS=76452313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:92:40:40:48:52:0.565217:22:26:17:23:26:26:17:23 chr8 76468282 . G A 1198.29 PASS AF=0.48374;AO=119;DP=248;FAO=119;FDP=246;FR=.;FRO=127;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=85;FSRR=42;FWDB=-0.0483907;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3159;QD=19.4843;RBI=0.0484748;REFB=-0.0108502;REVB=0.00285431;RO=125;SAF=57;SAR=62;SRF=84;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179091;STB=0.597595;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0106185;OID=.;OPOS=76468282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:246:125:127:119:119:0.48374:62:57:84:41:62:57:85:42 chr8 76476396 . G A 308.21 PASS AF=0.380435;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.0385461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2701;QD=13.4003;RBI=0.0672633;REFB=0.0101932;REVB=-0.055123;RO=57;SAF=11;SAR=24;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145986;STB=0.583734;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.0189361;OID=.;OPOS=76476396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:57:57:35:35:0.380435:24:11:25:32:24:11:25:32 chr8 76476457 . G A 297.87 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0563423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.998;QD=15.8864;RBI=0.0580719;REFB=0.00443603;REVB=0.0140674;RO=42;SAF=9;SAR=24;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151461;STB=0.585861;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00537302;OID=.;OPOS=76476457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:24:9:17:25:24:9:17:25 chr8 76478768 . C T 1600.2 PASS AF=0.368932;AO=190;DP=514;FAO=190;FDP=515;FR=.;FRO=325;FSAF=96;FSAR=94;FSRF=165;FSRR=160;FWDB=-0.0163472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.662;QD=12.4287;RBI=0.0188749;REFB=-0.00497587;REVB=0.0094356;RO=322;SAF=96;SAR=94;SRF=163;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00105835;STB=0.501533;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00767797;OID=.;OPOS=76478768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:514:515:322:325:190:190:0.368932:94:96:163:159:94:96:165:160 chr8 77048621 . C A 1577.74 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.565;QD=59.5374;RBI=0.0275418;REFB=0;REVB=-0.0135757;RO=0;SAF=45;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.56037e-05;OID=.;OPOS=77048621;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:60:45:0:0:61:45:0:0 chr8 77618821 . G A 362.31 PASS AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0394865;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6944;QD=23.3745;RBI=0.0394876;REFB=-0.00117351;REVB=-0.000290676;RO=26;SAF=19;SAR=17;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796659;STB=0.543804;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.000140915;OID=.;OPOS=77618821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:26:26:36:36:0.580645:17:19:11:15:17:19:11:15 chr8 77690563 . T C 2929.36 PASS AF=0.989418;AO=187;DP=189;FAO=187;FDP=189;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=107;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00333174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.321;QD=61.9971;RBI=0.00514257;REFB=-0.0622922;REVB=0.00391733;RO=1;SAF=80;SAR=107;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591475;STB=0.50078;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00038559;OID=.;OPOS=77690563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:189:189:1:2:187:187:0.989418:107:80:1:0:107:80:1:1 chr8 77745635 . G A 324.99 PASS AF=0.341667;AO=42;DP=119;FAO=41;FDP=120;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=-0.0419156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.208;QD=10.8328;RBI=0.0432767;REFB=-0.00863046;REVB=-0.0107685;RO=77;SAF=22;SAR=20;SRF=27;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194529;STB=0.595097;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.015854;OID=.;OPOS=77745635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:77:79:42:41:0.341667:20:22:27:50:20:21:29:50 chr8 77754904 . G A 589.85 PASS AF=0.512821;AO=60;DP=117;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.0220464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3328;QD=20.1657;RBI=0.0276595;REFB=-0.0163585;REVB=0.0167034;RO=57;SAF=28;SAR=32;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249769;STB=0.513757;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0161946;OID=.;OPOS=77754904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:57:57:60:60:0.512821:32:28:25:32:32:28:25:32 chr8 77764207 . G A 73.44 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0692047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.575;QD=9.47553;RBI=0.0749811;REFB=-0.0103837;REVB=-0.0288597;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138194;STB=0.583176;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0224347;OID=.;OPOS=77764207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:6:4:6:15:6:4:6:15 chr8 77767797 . C T 150.95 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0110417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5024;QD=12.5793;RBI=0.0236079;REFB=-0.00609378;REVB=0.0208666;RO=31;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143006;STB=0.583241;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0099643;OID=.;OPOS=77767797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:10:7:9:22:10:7:9:22 chr8 77768290 . C A 462.67 PASS AF=0.416;AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0100899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.966;QD=14.8054;RBI=0.0206729;REFB=-0.00369331;REVB=0.0180433;RO=70;SAF=26;SAR=26;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730884;STB=0.543983;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00428432;OID=.;OPOS=77768290;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:70:73:52:52:0.416:26:26:30:40:26:26:31:42 chr8 77777735 . C G 216.69 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=81;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00499809;FXX=0.0987532;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.237;QD=11.8732;RBI=0.0400651;REFB=-0.00152947;REVB=-0.0397522;RO=37;SAF=16;SAR=10;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107446;STB=0.568912;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00341358;OID=.;OPOS=77777735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:73:37:47:26:26:0.356164:10:16:19:18:10:16:24:23 chr8 77779291 . T G 141.05 PASS AF=0.28169;AO=20;DP=71;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0219413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.248;QD=7.94634;RBI=0.0226666;REFB=-0.0140149;REVB=-0.00568798;RO=51;SAF=7;SAR=13;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303182;STB=0.681203;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.042297;OID=.;OPOS=77779291;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:51:51:20:20:0.28169:13:7:31:20:13:7:31:20 chr8 77895865 . A G 740.83 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014942;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.815;QD=56.9872;RBI=0.0284973;REFB=0;REVB=0.0242659;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7519e-05;OID=.;OPOS=77895865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0 chr8 79610710 . A G 1102.44 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048293;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.172;QD=60.4077;RBI=0.0205227;REFB=0;REVB=0.0199464;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.54954e-06;OID=.;OPOS=79610710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0 chr8 80678427 . T C 407.54 PASS AF=0.5;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0190891;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5715;QD=19.8798;RBI=0.0343623;REFB=-0.0217124;REVB=-0.0285722;RO=41;SAF=16;SAR=25;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679939;STB=0.537781;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0131734;OID=.;OPOS=80678427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:41:41:41:41:0.5:25:16:19:22:25:16:19:22 chr8 80941997 . T C 242.22 PASS AF=0.522727;AO=24;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0777882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7435;QD=22.0201;RBI=0.0853677;REFB=-0.0160157;REVB=-0.0351659;RO=20;SAF=4;SAR=20;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.549793;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.013535;OID=.;OPOS=80941997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:24:23:0.522727:20:4:5:15:19:4:5:16 chr8 80949457 . C T 192.99 PASS AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0144064;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=293.439;QD=10.0255;RBI=0.0156208;REFB=-0.00048977;REVB=-0.00603849;RO=52;SAF=8;SAR=17;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822319;STB=0.548347;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0010224;OID=.;OPOS=80949457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:52:52:25:25:0.324675:17:8:20:32:17:8:20:32 chr8 81116920 . G C 513.64 PASS AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0132897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2764;QD=24.4592;RBI=0.0133524;REFB=-0.00343703;REVB=0.00129198;RO=35;SAF=19;SAR=29;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667469;STB=0.541122;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00265378;OID=.;OPOS=81116920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:35:36:48:48:0.571429:29:19:11:24:29:19:11:25 chr8 81887722 . CA C 55.59 PASS AF=0.421053;AO=17;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.154969;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.844;QD=5.85124;RBI=0.195273;REFB=-0.0913799;REVB=0.118811;RO=19;SAF=15;SAR=2;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529776;STB=0.802839;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=0.127877;OID=.;OPOS=81887723;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421053:17:39:16:38:22:14:2:10:12:55:19:15:2:8:11 chr8 81905397 . A G 670.23 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.802;QD=62.347;RBI=0.0400972;REFB=0;REVB=0.0132212;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180244;OID=.;OPOS=81905397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr8 82355621 . A G 256.4 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0123322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.535;QD=22.7913;RBI=0.0123342;REFB=-0.0109302;REVB=-0.000224169;RO=21;SAF=14;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903595;STB=0.550519;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00992336;OID=.;OPOS=82355621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:10:14:10:11:10:14:10:11 chr8 82357112 . T C 687.21 PASS AF=0.472603;AO=69;DP=146;FAO=69;FDP=146;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.0106585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.288;QD=18.8275;RBI=0.0106855;REFB=-0.00323494;REVB=-0.000757951;RO=77;SAF=38;SAR=31;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175237;STB=0.509707;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00376695;OID=.;OPOS=82357112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:77:77:69:69:0.472603:31:38:41:36:31:38:41:36 chr8 82606782 . A G 298.07 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00067131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.767;QD=20.9175;RBI=0.0439208;REFB=0.0205159;REVB=0.0439157;RO=25;SAF=12;SAR=19;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933626;STB=0.558103;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.0110426;OID=.;OPOS=82606782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:25:26:31:31:0.54386:19:12:7:18:19:12:7:19 chr8 82607752 . G C 96.53 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0229616;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.099;QD=11.3565;RBI=0.0309839;REFB=0.0113698;REVB=-0.020803;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00846107;STB=0.505042;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.0201918;OID=.;OPOS=82607752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:35:34:22:22:12:12:0.352941:5:7:13:9:5:7:13:9 chr8 82608238 . A T 272.54 PASS AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0378307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7288;QD=12.5305;RBI=0.0415419;REFB=0.000647551;REVB=-0.017163;RO=55;SAF=19;SAR=13;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1143;STB=0.565681;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.000693383;OID=.;OPOS=82608238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:55:32:32:0.367816:13:19:27:28:13:19:27:28 chr8 82633452 . C G 352.59 PASS AF=0.537313;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0262307;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.695;QD=21.0504;RBI=0.026772;REFB=-0.0198292;REVB=-0.00535627;RO=28;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443619;STB=0.518384;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0154223;OID=.;OPOS=82633452;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:28:31:36:36:0.537313:16:20:14:14:16:20:16:15 chr8 82727569 . T C 106.79 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0104807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8025;QD=12.2048;RBI=0.0135624;REFB=-0.015892;REVB=0.00860769;RO=22;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168049;STB=0.59984;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.028981;OID=.;OPOS=82727569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:4:9:12:10:4:9:12:10 chr8 86057703 . A C 237.56 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0412829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.187;QD=21.5966;RBI=0.0430349;REFB=-0.0122294;REVB=-0.0121544;RO=18;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607908;STB=0.52172;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0128341;OID=.;OPOS=86057703;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:18:21:23:23:0.522727:11:12:8:10:11:12:10:11 chr8 86057894 . GTATT G 701.28 PASS AF=1;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425024;FXX=0.0576812;HRUN=1;LEN=4;MLLD=258.872;QD=57.2471;RBI=0.0445988;REFB=0;REVB=0.0135129;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000161572;OID=.;OPOS=86057895;OREF=TATT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:48:51:49:49:0:23:26:0:0:4:0:23:25:0:0 chr8 86089787 . C G 62.5 PASS AF=1;AO=4;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9129;QD=35.7132;RBI=0.16196;REFB=0;REVB=0.157711;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216896;OID=.;OPOS=86089787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:4:7:1:2:2:0:0:4:3:0:0 chr8 86126827 . C CAACATT,T 859.29 PASS AF=0.837838,0.0405405;AO=62,3;DP=75;FAO=62,3;FDP=74;FR=.;FRO=9;FSAF=28,0;FSAR=34,3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0150171,-0.0438911;FXX=0.0133316;HRUN=2,1;LEN=6,1;MLLD=263.003,68.5439;QD=46.4483;RBI=0.0162966,0.0442655;REFB=0.00420364,0.00437957;REVB=0.00632974,0.00574544;RO=9;SAF=28,0;SAR=34,3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0777397,-0.740238;STB=0.541388,0.997223;STBP=0.07,0.024;TYPE=ins,snp;VARB=8.1739e-05,-0.00196304;OID=.,.;OPOS=86126828,86126827;OREF=-,C;OALT=AACATT,T;OMAPALT=CAACATT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:75:74:9:9:62,3:62,3:0.837838,0.0405405:34,3:28,0:7:2:34,3:28,0:7:2 chr8 86351997 . G A 1265.26 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00441374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.67;QD=58.1728;RBI=0.00593135;REFB=-0.226902;REVB=-0.0039623;RO=2;SAF=37;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024913;STB=0.507895;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.000914361;OID=.;OPOS=86351997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:87:87:2:3:84:84:0.965517:47:37:2:0:47:37:2:1 chr8 86389403 . T C 2010.83 PASS AF=0.992366;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0135722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0454;QD=61.3993;RBI=0.0214345;REFB=0.0970517;REVB=-0.0165902;RO=1;SAF=70;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798676;STB=0.504201;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00496244;OID=.;OPOS=86389403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:130:131:1:1:129:130:0.992366:59:70:0:1:59:71:0:1 chr8 87076520 . C A 284.66 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0130828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.203;QD=17.7912;RBI=0.0142158;REFB=-0.0200098;REVB=0.00556151;RO=33;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114035;STB=0.563778;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.019025;OID=.;OPOS=87076520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:14:17:14:19:14:17:14:19 chr8 87241847 . G A 319.25 PASS AF=0.378947;AO=36;DP=95;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0230961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4026;QD=13.442;RBI=0.045094;REFB=-0.0235784;REVB=-0.0387303;RO=58;SAF=17;SAR=19;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114197;STB=0.512003;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0297377;OID=.;OPOS=87241847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:58:59:36:36:0.378947:19:17:28:30:19:17:29:30 chr8 87666251 . T G 1268.93 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.108;QD=60.4251;RBI=0.0331048;REFB=-0.207797;REVB=0.0138761;RO=1;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111436;STB=0.505881;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000701134;OID=.;OPOS=87666251;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:42:41:0:1:42:41:0:1 chr8 87679303 . A C 2064.21 PASS AF=0.992537;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.166;QD=61.6183;RBI=0.0203995;REFB=-0.0887522;REVB=-0.0010942;RO=0;SAF=63;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.77216e-08;STB=0.503936;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-8.08187e-05;OID=.;OPOS=87679303;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:134:134:0:1:133:133:0.992537:70:63:0:0:70:63:1:0 chr8 88622043 . T A,G 794.97 PASS AF=0.02,0.98;AO=2,48;DP=50;FAO=1,49;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=0,28;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015772,0.00286991;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.552,156.906;QD=63.5972;RBI=0.0445973,0.047782;REFB=0,0;REVB=-0.0445694,0.0476957;RO=0;SAF=0,28;SAR=2,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.56477e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.110586,0.000112651;OID=.,.;OPOS=88622043,88622043;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:50:50:0:0:2,48:1,49:0.02,0.98:2,20:0,28:0:0:1,21:0,28:0:0 chr8 89081730 . T C 1522.99 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.101795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6069;QD=58.5764;RBI=0.10184;REFB=-0.0509534;REVB=0.00302557;RO=0;SAF=27;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503267;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.000883295;OID=.;OPOS=89081730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:0:1:103:103:0.990385:76:27:0:0:76:27:0:1 chr8 89340162 . G C 375.77 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00983913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.75;QD=20.8763;RBI=0.0109938;REFB=-0.0327704;REVB=-0.00490472;RO=30;SAF=17;SAR=21;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954748;STB=0.538836;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0348561;OID=.;OPOS=89340162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:72:30:34:38:38:0.527778:21:17:17:13:21:17:18:16 chr8 90958422 . T C 440.7 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.00277778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.85;QD=19.5868;RBI=0.0349987;REFB=-0.00954303;REVB=0.0348883;RO=46;SAF=20;SAR=24;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121371;STB=0.567374;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0114743;OID=.;OPOS=90958422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:24:20:27:19:24:20:27:19 chr8 90967711 . A G 496.03 PASS AF=0.477477;AO=53;DP=111;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.029227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.413;QD=17.8748;RBI=0.0293838;REFB=-0.0163475;REVB=0.00303166;RO=58;SAF=19;SAR=34;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185798;STB=0.603301;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0125868;OID=.;OPOS=90967711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:58:53:53:0.477477:34:19:32:26:34:19:32:26 chr8 90990479 . C G 778.82 PASS AF=0.455556;AO=82;DP=178;FAO=82;FDP=180;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=3.2094e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7622;QD=17.3072;RBI=0.0258145;REFB=-0.00736146;REVB=-0.0258145;RO=95;SAF=44;SAR=38;SRF=52;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105121;STB=0.507909;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0081896;OID=.;OPOS=90990479;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:95:98:82:82:0.455556:38:44:52:43:38:44:54:44 chr8 90995019 . C T 228.02 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0195398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.121;QD=13.8192;RBI=0.020377;REFB=-0.00608199;REVB=-0.00578091;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302594;STB=0.510197;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00894409;OID=.;OPOS=90995019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:39:27:27:0.409091:15:12:18:20:15:12:18:21 chr8 91031074 . G A 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0314686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8141;QD=15.2622;RBI=0.0501411;REFB=-0.00445203;REVB=-0.0390365;RO=16;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00534704;STB=0.503101;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.00335043;OID=.;OPOS=91031074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:4:9:11:5:4:9:11:5 chr8 91940446 . C T 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168536;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.395;QD=63.2868;RBI=0.0182146;REFB=0;REVB=0.00690863;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.78845e-06;OID=.;OPOS=91940446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0 chr8 92083424 . A G 354.11 PASS AF=0.405941;AO=41;DP=102;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.000382159;FXX=0.0194156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3089;QD=14.0242;RBI=0.0172205;REFB=-0.00672522;REVB=0.0172163;RO=60;SAF=19;SAR=22;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733534;STB=0.541486;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00929212;OID=.;OPOS=92083424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:60:60:41:41:0.405941:22:19:32:28:22:19:32:28 chr8 92136728 . C T 353.97 PASS AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0132217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.145;QD=16.0895;RBI=0.0249754;REFB=-0.00368104;REVB=-0.0211886;RO=50;SAF=12;SAR=26;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216073;STB=0.6221;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00578345;OID=.;OPOS=92136728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:26:12:26:24:26:12:26:24 chr8 92971404 . GTTTTT GTTTT,GTTTTA 244.04 PASS AF=0.636364,0.0727273;AO=28,4;DP=55;FAO=35,4;FDP=55;FR=.;FRO=16;FSAF=15,2;FSAR=20,2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.106941,-0.0202544;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=11.3845,14.2813;QD=17.7481;RBI=0.178638,0.0460293;REFB=0.0650495,0.00426719;REVB=-0.143091,-0.0413335;RO=15;SAF=12,2;SAR=16,2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0185901,0.113234;STB=0.502856,0.549753;STBP=0.962,0.895;TYPE=del,snp;VARB=-0.048276,0.0438112;OID=.,.;OPOS=92971405,92971409;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=GTTTT,GTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.636364,0.0727273:28,4:55:35,4:55:16:15,2:20,2:7:9:72:15:12,2:16,2:6:9 chr8 94746698 . G T 115.13 PASS AF=0.5;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0577597;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.378;QD=17.7115;RBI=0.0592791;REFB=-0.018078;REVB=0.0133352;RO=11;SAF=1;SAR=12;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505934;STB=0.84144;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.027321;OID=.;OPOS=94746698;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:26:11:13:13:13:0.5:12:1:5:6:12:1:7:6 chr8 94794620 . C T 200.98 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00166443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.127;QD=15.1681;RBI=0.0134165;REFB=-0.00709189;REVB=-0.0133129;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353687;STB=0.520117;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00557957;OID=.;OPOS=94794620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:13:10:12:18:13:10:12:18 chr8 94808165 . A G 570.04 PASS AF=0.508621;AO=58;DP=117;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.00979048;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3631;QD=19.6565;RBI=0.0111106;REFB=-0.00388977;REVB=0.00525286;RO=56;SAF=37;SAR=21;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124111;STB=0.51594;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00471778;OID=.;OPOS=94808165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:56:57:58:59:0.508621:21:37:35:21:21:38:35:22 chr8 94827660 . A C 293.26 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0206087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.92;QD=23.001;RBI=0.0222774;REFB=-0.0298804;REVB=0.00845954;RO=22;SAF=11;SAR=18;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300347;STB=0.665675;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0123807;OID=.;OPOS=94827660;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:18:11:17:5:18:11:17:5 chr8 94935937 . T C 272.32 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00384204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4351;QD=24.2064;RBI=0.0345441;REFB=-0.0342084;REVB=0.0343298;RO=19;SAF=11;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569105;STB=0.540951;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0225118;OID=.;OPOS=94935937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:20:25:25:0.555556:14:11:7:12:14:11:7:13 chr8 94936532 . G C 212.4 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0136169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.821;QD=14.3999;RBI=0.0162341;REFB=-0.0057717;REVB=-0.0088388;RO=34;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218289;STB=0.624063;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00664044;OID=.;OPOS=94936532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:10:15:13:21:10:15:13:21 chr8 95143171 . C CG 104.46 PASS AF=1;AO=2;DP=17;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.56745e-10;FXX=0.352734;HRUN=0;LEN=1;MLLD=31.2384;QD=37.9844;RBI=0.00796592;REFB=0;REVB=-0.00796592;RO=15;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.650927;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-9.65008e-05;OID=.;OPOS=95143172;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:2:17:11:11:0:0:11:0:0:3:15:2:0:4:11 chr8 95143172 . T C,G 203.15 PASS AF=0.117647,0.882353;AO=2,15;DP=17;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2,4;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194069,-0.0349128;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=150.691,135.998;QD=47.7993;RBI=0.0194473,0.0397913;REFB=0,0;REVB=0.00125168,-0.0190904;RO=0;SAF=2,4;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.33019e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00374201,-0.00200382;OID=.,.;OPOS=95143172,95143172;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:17:17:0:0:2,15:2,15:0.117647,0.882353:0,11:2,4:0:0:0,11:2,4:0:0 chr8 95143186 . C G 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.603;QD=49.5987;RBI=0.0215752;REFB=0;REVB=0.00327007;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.8404e-05;OID=.;OPOS=95143186;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr8 95158382 . C T 1359.03 PASS AF=0.967742;AO=87;DP=91;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00435067;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.21;QD=58.4528;RBI=0.0470116;REFB=-0.15921;REVB=0.0468098;RO=4;SAF=35;SAR=52;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350606;STB=0.513511;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.000784813;OID=.;OPOS=95158382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:91:93:4:3:87:90:0.967742:52:35:0:4:54:36:0:3 chr8 95186382 . G A 410.31 PASS AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0126285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.468;QD=18.2362;RBI=0.0432646;REFB=-0.00216453;REVB=0.0413805;RO=48;SAF=21;SAR=21;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059728;STB=0.533318;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00278826;OID=.;OPOS=95186382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:21:21:21:27:21:21:21:27 chr8 95188850 . T C 868.35 PASS AF=0.486188;AO=88;DP=181;FAO=88;FDP=181;FR=.;FRO=93;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.0101272;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.824;QD=19.19;RBI=0.0101273;REFB=-0.00313154;REVB=-3.82345e-05;RO=92;SAF=57;SAR=31;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172577;STB=0.598267;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00355733;OID=.;OPOS=95188850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:92:93:88:88:0.486188:31:57:43:49:31:57:43:50 chr8 95272598 . C T 194.82 PASS AF=0.357143;AO=24;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0230837;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.3;QD=11.1324;RBI=0.0232071;REFB=0.00816268;REVB=-0.00238953;RO=45;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192894;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0206583;OID=.;OPOS=95272598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:45:45:24:25:0.357143:14:10:18:27:15:10:18:27 chr8 95416309 . T A 184.1 PASS AF=0.328767;AO=23;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0146052;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2711;QD=10.0875;RBI=0.0172444;REFB=-0.0182617;REVB=-0.0091684;RO=50;SAF=14;SAR=9;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173161;STB=0.618458;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0863342;OID=.;OPOS=95416309;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:50:49:23:24:0.328767:9:14:23:27:9:15:22:27 chr8 95419698 . A G 2077.9 PASS AF=0.978417;AO=135;DP=141;FAO=136;FDP=139;FR=.;FRO=3;FSAF=77;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00163551;FXX=0.0141834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.88;QD=59.7957;RBI=0.00855284;REFB=-0.0751344;REVB=0.00839501;RO=3;SAF=76;SAR=59;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00435561;STB=0.505107;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.000210603;OID=.;OPOS=95419698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:141:139:3:3:135:136:0.978417:59:76:2:1:59:77:1:2 chr8 95531419 . T C 430.67 PASS AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.018666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.572;QD=20.0309;RBI=0.0222856;REFB=-0.0181435;REVB=0.0121748;RO=43;SAF=25;SAR=18;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126175;STB=0.57;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0182913;OID=.;OPOS=95531419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:18:25:19:24:18:25:19:24 chr8 95538468 . T C 220.41 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00592786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.251;QD=24.4898;RBI=0.0077493;REFB=0.00714049;REVB=0.0049912;RO=15;SAF=4;SAR=17;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3188;STB=0.679808;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00857839;OID=.;OPOS=95538468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:17:4:8:7:17:4:8:7 chr8 95541302 . A G 163.59 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0497278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7751;QD=20.4483;RBI=0.108231;REFB=-0.0337833;REVB=0.0961303;RO=15;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00326109;STB=0.501843;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0345229;OID=.;OPOS=95541302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:8:9:8:7:8:9:8:7 chr8 95541371 . T A 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000778988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.558;QD=59.8382;RBI=0.0729375;REFB=0;REVB=0.0729333;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052781;OID=.;OPOS=95541371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr8 95559092 . T C 754.11 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.218;QD=56.914;RBI=0.0368922;REFB=0;REVB=-0.030559;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16557e-05;OID=.;OPOS=95559092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0 chr8 95680229 . C T 1212.24 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0757355;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0023;QD=61.3793;RBI=0.0829071;REFB=0;REVB=-0.0337301;RO=0;SAF=47;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011647;OID=.;OPOS=95680229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:32:47:0:0:32:47:0:0 chr8 95690579 . T C 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.568;QD=59.8558;RBI=0.0909159;REFB=0;REVB=-0.0694163;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.57126e-05;OID=.;OPOS=95690579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0 chr8 95719387 . A T 294.12 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.00629632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.034;QD=15.083;RBI=0.0262865;REFB=-0.011751;REVB=-0.0255213;RO=45;SAF=17;SAR=16;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117205;STB=0.566188;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0148033;OID=.;OPOS=95719387;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:16:17:18:27:16:17:18:27 chr8 95732283 . G C 39.59 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0295448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.16;QD=13.1973;RBI=0.0509021;REFB=-0.0179859;REVB=-0.0414503;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0529563;OID=.;OPOS=95732283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:5:1:1:5:5:1:1:5 chr8 95877787 . T C 454.32 PASS AF=0.464646;AO=45;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00457786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.199;QD=18.3565;RBI=0.00863124;REFB=-0.0147762;REVB=-0.00731721;RO=53;SAF=14;SAR=31;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203866;STB=0.617649;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.016741;OID=.;OPOS=95877787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:53:53:45:46:0.464646:31:14:27:26:32:14:27:26 chr8 95888307 . C T 143.31 PASS AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0388628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6666;QD=9.88307;RBI=0.122469;REFB=0.00609944;REVB=-0.11614;RO=34;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551477;STB=0.578864;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0280475;OID=.;OPOS=95888307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:39:19:19:0.327586:8:11:18:16:8:11:18:21 chr8 95918288 . C T 594.3 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.62;QD=60.9534;RBI=0.0358628;REFB=0;REVB=0.0288526;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127461;OID=.;OPOS=95918288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:14:24:0:0:14:25:0:0 chr8 95938422 . C A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.764;QD=57.1063;RBI=0.0141521;REFB=0;REVB=0.00689601;RO=0;SAF=41;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69696e-05;OID=.;OPOS=95938422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:14:41:0:0:14:41:0:0 chr8 95939382 . A G 176.14 PASS AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00936355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9734;QD=10.211;RBI=0.0234632;REFB=-0.0149916;REVB=-0.0215139;RO=46;SAF=16;SAR=7;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185878;STB=0.609425;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0391674;OID=.;OPOS=95939382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:46:46:23:23:0.333333:7:16:25:21:7:16:25:21 chr8 95942244 . G A 740.68 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101333;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.263;QD=56.9754;RBI=0.0279499;REFB=0;REVB=0.0260483;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39345e-05;OID=.;OPOS=95942244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0 chr8 95951916 . GTGAC G 198.9 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0240722;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=4;MLLD=308.142;QD=11.2058;RBI=0.0240722;REFB=-0.00521298;REVB=-2.11517e-05;RO=46;SAF=10;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275961;STB=0.659218;STBP=0.055;TYPE=del;VARB=0.0099355;OID=.;OPOS=95951917;OREF=TGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.352113:25:72:25:71:46:10:15:30:16:99:46:10:15:30:16 chr8 96053782 . GCT G 797.34 PASS AF=1;AO=51;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515213;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.266;QD=56.9526;RBI=0.0253775;REFB=0;REVB=0.024849;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000326043;OID=.;OPOS=96053783;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:51:56:56:56:0:21:35:0:0:4:0:17:34:0:0 chr8 97614625 . G A 109.6 PASS AF=0.419355;AO=12;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0254272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.637;QD=14.1426;RBI=0.0582699;REFB=-0.0166797;REVB=0.0524294;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304347;STB=0.688722;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.025172;OID=.;OPOS=97614625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:18:18:12:13:0.419355:7:5:13:5:8:5:13:5 chr8 97847203 . A G 247.28 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0291322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.641;QD=13.7375;RBI=0.0318205;REFB=0.00211959;REVB=0.0128007;RO=43;SAF=15;SAR=14;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127407;STB=0.57247;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00245758;OID=.;OPOS=97847203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:14:15:17:26:14:15:17:26 chr8 97847358 . G T 1389.99 PASS AF=0.951456;AO=98;DP=103;FAO=98;FDP=103;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0105567;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.2269;QD=53.9803;RBI=0.033389;REFB=-0.0854384;REVB=-0.0316762;RO=5;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498336;STB=0.52631;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0043826;OID=.;OPOS=97847358;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:103:103:5:5:98:98:0.951456:45:53:0:5:45:53:0:5 chr8 98289986 . C T 588.59 PASS AF=0.582418;AO=53;DP=93;FAO=53;FDP=91;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0078771;FXX=0.0215031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.336;QD=25.8719;RBI=0.010012;REFB=-0.0256389;REVB=0.00617988;RO=38;SAF=26;SAR=27;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00720774;STB=0.503939;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0216816;OID=.;OPOS=98289986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:91:38:38:53:53:0.582418:27:26:19:19:27:26:19:19 chr8 98787994 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8848;QD=48.737;RBI=0.0503173;REFB=0;REVB=-0.0371111;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.17584e-05;OID=.;OPOS=98787994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0 chr8 98827530 . AG A,AA 101.02 PASS AF=0.8,0.2;AO=4,6;DP=10;FAO=8,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=3,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101862,-0.00124763;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=212.541,210.329;QD=40.4093;RBI=0.0401731,0.0343106;REFB=0,0;REVB=0.0388602,0.0342879;RO=0;SAF=1,4;SAR=3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0110407,-0.0133118;OID=.,.;OPOS=98827531,98827531;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.8,0.2:4,6:10:8,2:10:0:5,0:3,2:0:0:13:0:1,4:3,2:0:0 chr8 98943446 . T C 345.24 PASS AF=0.62963;AO=33;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0172694;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.67;QD=25.5734;RBI=0.0296116;REFB=-0.0164315;REVB=0.0240544;RO=19;SAF=13;SAR=20;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172483;STB=0.573945;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00879492;OID=.;OPOS=98943446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:19:20:33:34:0.62963:20:13:3:16:21:13:4:16 chr8 98943545 . A G 138.4 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.000102295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.425;QD=11.7786;RBI=0.0240513;REFB=-0.0157196;REVB=-0.024051;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129908;STB=0.507683;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0332457;OID=.;OPOS=98943545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:11:5:10:21:11:5:10:21 chr8 98943598 . C T 106.91 PASS AF=0.388889;AO=12;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00856488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.825;QD=11.8791;RBI=0.0170278;REFB=-0.00606971;REVB=-0.014717;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139567;STB=0.616766;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.018102;OID=.;OPOS=98943598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:12:14:0.388889:7:5:12:10:9:5:12:10 chr8 98954012 . T C 805.93 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506601;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6615;QD=57.5662;RBI=0.0506624;REFB=0;REVB=-0.000481985;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131163;OID=.;OPOS=98954012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0 chr8 99115144 . A G 253.11 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.000487621;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.415;QD=15.1112;RBI=0.00443211;REFB=-0.0117694;REVB=-0.0044052;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064795;STB=0.546427;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0145023;OID=.;OPOS=99115144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:38:29:29:0.432836:19:10:15:22:19:10:16:22 chr8 99142281 . C G 271.05 PASS AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0664516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9515;QD=30.1164;RBI=0.0995302;REFB=0.0278256;REVB=-0.0740975;RO=12;SAF=11;SAR=13;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253442;STB=0.513942;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.0245821;OID=.;OPOS=99142281;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:13:11:6:6:13:11:6:6 chr8 99205612 . C T 1861.9 PASS AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0214909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.685;QD=60.5496;RBI=0.0384408;REFB=-0.0167382;REVB=0.0318722;RO=1;SAF=61;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772447;STB=0.504064;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=8.16217e-05;OID=.;OPOS=99205612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:123:1:1:122:122:0.99187:61:61:0:1:61:61:0:1 chr8 99208190 . A C 784.45 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.026458;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.489;QD=54.1001;RBI=0.0739777;REFB=-0.094253;REVB=0.0690846;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140753;STB=0.50746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00103268;OID=.;OPOS=99208190;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:33:23:0:1:33:24:0:1 chr8 99234772 . T G 206.45 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0401731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8869;QD=15.0148;RBI=0.0427715;REFB=-0.0626382;REVB=0.0146808;RO=30;SAF=3;SAR=21;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287184;STB=0.661258;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0961482;OID=.;OPOS=99234772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:31:24:24:0.436364:21:3:9:21:21:3:9:22 chr8 99441904 . G T 1262.98 PASS AF=1;AO=72;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.727;QD=60.1419;RBI=0.0264567;REFB=0;REVB=0.0175868;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116173;OID=.;OPOS=99441904;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:72:84:1:28:44:0:0:35:49:0:0 chr8 100133706 . T G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.504;QD=59.4356;RBI=0.0192971;REFB=0;REVB=0.0128128;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11792e-05;OID=.;OPOS=100133706;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr8 100844758 . T C 350.49 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0160192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.227;QD=18.447;RBI=0.0168963;REFB=-0.0256954;REVB=0.00537311;RO=39;SAF=20;SAR=17;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698619;STB=0.538884;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0208584;OID=.;OPOS=100844758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:17:20:24:15:17:20:24:15 chr8 100975002 . A G 535.53 PASS AF=0.948718;AO=36;DP=38;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00482483;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=126.767;QD=54.9265;RBI=0.0174122;REFB=-0.0832295;REVB=0.0167304;RO=2;SAF=13;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147385;STB=0.508316;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.000945979;OID=.;OPOS=100975002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:38:39:2:2:36:37:0.948718:23:13:1:1:24:13:1:1 chr8 101153024 . G A 453.74 PASS AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.000694658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.845;QD=22.4071;RBI=0.00923805;REFB=-0.00443254;REVB=-0.0092119;RO=35;SAF=23;SAR=21;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986401;STB=0.553417;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00470603;OID=.;OPOS=101153024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:35:37:44:44:0.54321:21:23:14:21:21:23:15:22 chr8 101252680 . T C 320.66 PASS AF=0.486111;AO=31;DP=68;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00495147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.784;QD=17.8146;RBI=0.00557148;REFB=-0.0244529;REVB=0.00255428;RO=37;SAF=16;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286567;STB=0.515143;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0237368;OID=.;OPOS=101252680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:72:37:37:31:35:0.486111:15:16:18:19:19:16:18:19 chr8 101253184 . G A 223.74 PASS AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0102446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.561;QD=12.785;RBI=0.0205565;REFB=-0.00700431;REVB=0.0178218;RO=43;SAF=10;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202331;STB=0.616118;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.012555;OID=.;OPOS=101253184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:17:10:24:19:17:10:24:19 chr8 101648164 . C G 482.33 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0476256;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3934;QD=20.0973;RBI=0.0529545;REFB=-0.0142445;REVB=0.0231512;RO=48;SAF=23;SAR=24;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0096946;STB=0.500222;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0144817;OID=.;OPOS=101648164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:48:49:47:47:0.489583:24:23:24:24:24:23:24:25 chr8 101670026 . G T 68.77 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0257349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.2222;QD=15.2823;RBI=0.0416644;REFB=-0.0726629;REVB=0.0327664;RO=8;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315978;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0657528;OID=.;OPOS=101670026;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:7:2:2:6:7:2:2:7 chr8 101721705 . G T 51.5 PASS AF=0.105691;AO=13;DP=123;FAO=13;FDP=123;FR=.;FRO=110;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=51;FWDB=-0.0340417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.55;QD=1.67466;RBI=0.0358668;REFB=-0.00291916;REVB=0.0112957;RO=110;SAF=5;SAR=8;SRF=59;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180792;STB=0.634244;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0125558;OID=.;OPOS=101721705;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:123:123:110:110:13:13:0.105691:8:5:59:51:8:5:59:51 chr8 101721709 . T A 81.29 PASS AF=0.141732;AO=17;DP=128;FAO=18;FDP=127;FR=.;FRO=109;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=58;FSRR=51;FWDB=-0.00755061;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.778;QD=2.56018;RBI=0.0193035;REFB=-0.004278;REVB=-0.0177655;RO=110;SAF=6;SAR=11;SRF=58;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217293;STB=0.669969;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0762679;OID=.;OPOS=101721709;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:128:127:110:109:17:18:0.141732:11:6:58:52:12:6:58:51 chr8 101721727 . G A 89.4 PASS AF=0.139706;AO=19;DP=136;FAO=19;FDP=136;FR=.;FRO=117;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=61;FSRR=56;FWDB=0.0079224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.414;QD=2.62952;RBI=0.0143644;REFB=-0.00231628;REVB=-0.0119821;RO=117;SAF=6;SAR=13;SRF=61;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259553;STB=0.677633;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0115535;OID=.;OPOS=101721727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:136:136:117:117:19:19:0.139706:13:6:61:56:13:6:61:56 chr8 101721756 . A C 154.05 PASS AF=0.181208;AO=27;DP=149;FAO=27;FDP=149;FR=.;FRO=122;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=66;FSRR=56;FWDB=-0.0266678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.714;QD=4.13567;RBI=0.0274174;REFB=-0.00680981;REVB=-0.00636712;RO=122;SAF=14;SAR=13;SRF=66;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288126;STB=0.518431;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0280359;OID=.;OPOS=101721756;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:122:122:27:27:0.181208:13:14:66:56:13:14:66:56 chr8 101721812 . G A 183.13 PASS AF=0.186441;AO=33;DP=178;FAO=33;FDP=177;FR=.;FRO=144;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=67;FSRR=77;FWDB=-0.0132804;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.08;QD=4.13858;RBI=0.0227059;REFB=-0.00540346;REVB=0.0184171;RO=144;SAF=18;SAR=15;SRF=67;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102579;STB=0.564956;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0171409;OID=.;OPOS=101721812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:144:144:33:33:0.186441:15:18:67:77:15:18:67:77 chr8 101721817 . T C 181.38 PASS AF=0.183333;AO=33;DP=180;FAO=33;FDP=180;FR=.;FRO=147;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=68;FSRR=79;FWDB=0.0356785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1838;QD=4.03064;RBI=0.0364401;REFB=0.0124303;REVB=-0.00741121;RO=146;SAF=18;SAR=15;SRF=68;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102014;STB=0.567364;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.0605584;OID=.;OPOS=101721817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:146:147:33:33:0.183333:15:18:68:78:15:18:68:79 chr8 101721839 . C A 161.85 PASS AF=0.167568;AO=31;DP=187;FAO=31;FDP=185;FR=.;FRO=154;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=68;FSRR=86;FWDB=-0.0123774;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.524;QD=3.4995;RBI=0.0164984;REFB=-0.00333964;REVB=-0.0109086;RO=153;SAF=16;SAR=15;SRF=68;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919327;STB=0.561852;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0123505;OID=.;OPOS=101721839;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:185:153:154:31:31:0.167568:15:16:68:85:15:16:68:86 chr8 101721870 . G A 84.17 PASS AF=0.121951;AO=20;DP=165;FAO=20;FDP=164;FR=.;FRO=144;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=65;FSRR=79;FWDB=-0.00409456;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.273;QD=2.05287;RBI=0.0173015;REFB=-0.00186637;REVB=-0.01681;RO=143;SAF=11;SAR=9;SRF=64;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126884;STB=0.585872;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0147432;OID=.;OPOS=101721870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:165:164:143:144:20:20:0.121951:9:11:64:79:9:11:65:79 chr8 101721899 . C A 39.23 PASS AF=0.0833333;AO=11;DP=144;FAO=12;FDP=144;FR=.;FRO=132;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=64;FSRR=68;FWDB=-0.00354286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.108;QD=1.08986;RBI=0.0185162;REFB=0.000505599;REVB=-0.0181741;RO=132;SAF=9;SAR=2;SRF=64;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372631;STB=0.744345;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00608881;OID=.;OPOS=101721899;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:144:144:132:132:11:12:0.0833333:2:9:64:68:3:9:64:68 chr8 102209357 . A T 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.639;QD=56.9365;RBI=0.0217273;REFB=0;REVB=-0.0103682;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72231e-05;OID=.;OPOS=102209357;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr8 102504974 . C G 98.38 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0502197;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.518;QD=11.9254;RBI=0.0502318;REFB=-0.0187378;REVB=-0.00110412;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625616;STB=0.52627;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0278406;OID=.;OPOS=102504974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:35:33:22:21:12:12:0.363636:10:2:3:19:10:2:4:17 chr8 102631911 . G A 520.64 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0251699;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.585;QD=22.8851;RBI=0.026717;REFB=-0.012845;REVB=0.00895944;RO=41;SAF=33;SAR=16;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893834;STB=0.508975;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00897911;OID=.;OPOS=102631911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:41:42:49:49:0.538462:16:33:28:13:16:33:29:13 chr8 102680499 . CA C 276.08 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00848405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.891;QD=13.305;RBI=0.0226109;REFB=-0.00654209;REVB=-0.0209588;RO=51;SAF=13;SAR=19;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915911;STB=0.552377;STBP=0.463;TYPE=del;VARB=0.0131024;OID=.;OPOS=102680500;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.385542:32:83:32:83:51:13:19:25:26:99:51:13:19:25:26 chr8 102681337 . C T 475.82 PASS AF=0.481481;AO=49;DP=104;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00375952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9368;QD=17.6229;RBI=0.0240026;REFB=-0.00734015;REVB=0.0237064;RO=55;SAF=28;SAR=21;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250876;STB=0.521731;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00465349;OID=.;OPOS=102681337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:55:56:49:52:0.481481:21:28:30:25:22:30:30:26 chr8 102700636 . A T 225.38 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00566751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.293;QD=17.6767;RBI=0.0121974;REFB=-0.0138898;REVB=0.0108008;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14889;STB=0.567514;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0160262;OID=.;OPOS=102700636;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:27:24:24:0.470588:15:9:6:20:15:9:7:20 chr8 102859580 . C T 756.09 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00650399;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.428;QD=57.0634;RBI=0.0424295;REFB=0;REVB=0.041928;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219591;OID=.;OPOS=102859580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0 chr8 103137693 . T C 3679.25 PASS AF=0.984127;AO=235;DP=241;FAO=248;FDP=252;FR=.;FRO=4;FSAF=110;FSAR=138;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0847066;FXX=0.00395241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2979;QD=58.4009;RBI=0.0848133;REFB=-0.0510952;REVB=0.00425195;RO=5;SAF=102;SAR=133;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00669635;STB=0.504921;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0110726;OID=.;OPOS=103137693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:241:252:5:4:235:248:0.984127:133:102:3:2:138:110:3:1 chr8 103298802 . T C 302.8 PASS AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.014606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.012;QD=17.0592;RBI=0.0299901;REFB=-0.00930627;REVB=0.0261929;RO=38;SAF=24;SAR=9;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213746;STB=0.620612;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00980292;OID=.;OPOS=103298802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:9:24:20:18:9:24:20:18 chr8 103572992 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105951;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.532;QD=46.8479;RBI=0.0147021;REFB=0;REVB=0.010193;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13549e-06;OID=.;OPOS=103572992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr8 103573001 . C G 67.41 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.000688852;FXX=0.210416;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.062;QD=17.9768;RBI=0.00369113;REFB=-0.0113685;REVB=-0.00362628;RO=7;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368153;STB=0.521684;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0094775;OID=.;OPOS=103573001;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:19:15:7:7:8:8:0.533333:2:6:5:2:2:6:5:2 chr8 103573006 . G A 118.42 PASS AF=0.45;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00419031;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4198;QD=23.6846;RBI=0.0139304;REFB=-0.0430271;REVB=0.0132852;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041038;STB=0.523757;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00347974;OID=.;OPOS=103573006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:20:7:7:9:9:0.45:3:6:5:2:3:6:5:2 chr8 103573015 . A G 118.57 PASS AF=0.518519;AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0224394;FXX=0.0689417;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4118;QD=17.5662;RBI=0.0255333;REFB=0.000178477;REVB=0.0121828;RO=13;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148023;STB=0.568769;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00616477;OID=.;OPOS=103573015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:13:14:0.518519:5:8:10:3:5:9:10:3 chr8 103573019 . C G 80.68 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0133393;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.627;QD=11.5255;RBI=0.0153231;REFB=-0.0361866;REVB=-0.00754062;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335292;STB=0.683245;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0460017;OID=.;OPOS=103573019;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:26:28:15:17:11:11:0.392857:6:5:12:3:6:5:13:4 chr8 103573033 . A G 138.91 PASS AF=0.484848;AO=15;DP=32;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0167646;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6355;QD=16.8374;RBI=0.0180881;REFB=-0.0239368;REVB=-0.00679187;RO=16;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316095;STB=0.666465;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0458815;OID=.;OPOS=103573033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:16:17:15:16:0.484848:10:5:11:5:10:6:12:5 chr8 103573037 . G C 171.1 PASS AF=0.513514;AO=16;DP=34;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0074342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.324;QD=18.4977;RBI=0.0204743;REFB=-0.024579;REVB=0.0190769;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259185;STB=0.643309;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0173484;OID=.;OPOS=103573037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:37:18:18:16:19:0.513514:9:7:13:5:11:8:13:5 chr8 103840360 . G A 142.14 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0180427;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.898;QD=20.3063;RBI=0.0191825;REFB=0.00699443;REVB=0.00651371;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323297;STB=0.666444;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00530175;OID=.;OPOS=103840360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:12:13:15:15:0.535714:5:10:3:9:5:10:4:9 chr8 103845372 . G A 284.12 PASS AF=0.426667;AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00540212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.497;QD=15.1533;RBI=0.0201338;REFB=-0.0055945;REVB=-0.0193955;RO=43;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671557;STB=0.528949;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00765752;OID=.;OPOS=103845372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:43:31:32:0.426667:15:16:25:18:15:17:25:18 chr8 103851052 . T C 172.0 PASS AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0172038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.249;QD=9.29733;RBI=0.0186886;REFB=-0.00895498;REVB=-0.00730023;RO=51;SAF=12;SAR=11;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124902;STB=0.573398;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0170352;OID=.;OPOS=103851052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:11:12:32:19:11:12:32:19 chr8 103876780 . C T 124.16 PASS AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0242364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.973;QD=27.5918;RBI=0.10648;REFB=-0.0156921;REVB=0.103685;RO=5;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205918;STB=0.615207;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0138441;OID=.;OPOS=103876780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:8:5:4:1:8:5:4:1 chr8 104064973 . T C 361.05 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00436001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.069;QD=20.3409;RBI=0.039575;REFB=-0.00986571;REVB=0.0393341;RO=34;SAF=18;SAR=19;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113108;STB=0.562609;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.006763;OID=.;OPOS=104064973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:19:18:21:13:19:18:21:13 chr8 104081226 . A G 265.27 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=0.00969675;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.44;QD=15.6039;RBI=0.0150707;REFB=-0.00711192;REVB=0.0115369;RO=36;SAF=19;SAR=11;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127008;STB=0.581447;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0088922;OID=.;OPOS=104081226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:38:30:30:0.441176:11:19:27:9:11:19:29:9 chr8 104082307 . C T 581.44 PASS AF=0.569892;AO=53;DP=93;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00712564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.267;QD=25.0081;RBI=0.00871461;REFB=-0.0217216;REVB=0.00501695;RO=40;SAF=30;SAR=23;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130263;STB=0.571286;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0202325;OID=.;OPOS=104082307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:40:40:53:53:0.569892:23:30:16:24:23:30:16:24 chr8 104098842 . ATAGT A 83.09 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00123977;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=275.14;QD=9.49621;RBI=0.00583845;REFB=-0.00582527;REVB=0.00570531;RO=24;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246225;STB=0.649215;STBP=0.271;TYPE=del;VARB=0.0106049;OID=.;OPOS=104098843;OREF=TAGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.314286:11:35:11:35:24:4:7:14:10:83:24:4:7:14:10 chr8 104100865 . G A 198.04 PASS AF=0.47619;AO=19;DP=41;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00206183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.316;QD=18.861;RBI=0.00249768;REFB=0.014227;REVB=0.00140969;RO=22;SAF=15;SAR=4;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137304;STB=0.586573;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.00528481;OID=.;OPOS=104100865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:22:22:19:20:0.47619:4:15:15:7:4:16:15:7 chr8 104100875 . AG AA,A 193.22 PASS AF=0.0754717,0.377358;AO=4,15;DP=49;FAO=4,20;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=4,15;FSAR=0,5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0614027,-0.0311951;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.4473,23.8233;QD=14.5825;RBI=0.0614594,0.0664563;REFB=-0.0272456,0.000625169;REVB=0.00264034,0.0586797;RO=29;SAF=4,11;SAR=0,4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.591044,0.223614;STB=0.996832,0.614335;STBP=0.063,0.22;TYPE=snp,del;VARB=-0.00324699,-0.00555069;OID=.,.;OPOS=104100876,104100876;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0754717,0.377358:4,15:49:4,20:53:29:4,15:0,5:17:12:99:29:4,11:0,4:16:13 chr8 104100919 . G A 325.54 PASS AF=0.4375;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00243834;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.01;QD=16.2768;RBI=0.0139047;REFB=-0.0186953;REVB=-0.0136892;RO=44;SAF=23;SAR=12;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094177;STB=0.56094;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0245181;OID=.;OPOS=104100919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:44:45:35:35:0.4375:12:23:25:19:12:23:25:20 chr8 104312341 . A G 1170.52 PASS AF=0.941176;AO=80;DP=85;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0173443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.648;QD=55.0833;RBI=0.0178647;REFB=-0.0835261;REVB=-0.00428065;RO=3;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399549;STB=0.510495;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00107645;OID=.;OPOS=104312341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:85:85:3:5:80:80:0.941176:34:46:0:3:34:46:2:3 chr8 104337096 . A G 1472.57 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.019;QD=63.3363;RBI=0.0275256;REFB=0;REVB=-0.00789808;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22132e-05;OID=.;OPOS=104337096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0 chr8 104337367 . A C 785.86 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00348279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.841;QD=64.1515;RBI=0.0324324;REFB=0;REVB=0.0322449;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201938;OID=.;OPOS=104337367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr8 104343686 . G A 1350.31 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0493504;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.241;QD=61.3777;RBI=0.0510523;REFB=-0.00198122;REVB=0.0130721;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.000109069;OID=.;OPOS=104343686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:89:88:0:1:87:87:0.988636:43:44:0:0:43:44:1:0 chr8 104343822 . A G 787.56 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0065631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.276;QD=55.2673;RBI=0.01048;REFB=-0.143608;REVB=-0.00817044;RO=1;SAF=24;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192399;STB=0.5102;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.000275213;OID=.;OPOS=104343822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:57:57:1:1:56:56:0.982456:32:24:1:0:32:24:1:0 chr8 104394744 . T C 3461.64 PASS AF=1;AO=222;DP=223;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390638;FXX=0.0044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.581;QD=62.372;RBI=0.0590878;REFB=-0.0828692;REVB=0.0443327;RO=0;SAF=94;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355298;OID=.;OPOS=104394744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:223:222:0:0:222:222:1:128:94:0:0:128:94:0:0 chr8 105261725 . G A 514.03 PASS AF=0.521277;AO=49;DP=93;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00412545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0591;QD=21.8738;RBI=0.0481065;REFB=0.0150377;REVB=-0.0479293;RO=44;SAF=21;SAR=28;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214786;STB=0.612567;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0145737;OID=.;OPOS=105261725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:44:45:49:49:0.521277:28:21:30:14:28:21:30:15 chr8 105263979 . C T 287.96 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0112085;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.835;QD=25.0397;RBI=0.011429;REFB=-0.012197;REVB=-0.00223419;RO=20;SAF=9;SAR=17;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457621;STB=0.525435;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00742337;OID=.;OPOS=105263979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:17:9:8:12:17:9:8:12 chr8 105478933 . G A 504.94 PASS AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.0596306;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.7611;QD=20.1975;RBI=0.0848605;REFB=-0.0008578;REVB=0.0603779;RO=51;SAF=27;SAR=22;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716919;STB=0.539693;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0026064;OID=.;OPOS=105478933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:22:27:32:19:22:27:32:19 chr8 106815952 . TCA CAA,TAC,TC 33.4 PASS AF=0.0566038,0.0377358,0.113208;AO=3,2,12;DP=53;FAO=3,2,6;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=3,2,5;FSAR=0,0,1;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0472007,-0.0497355,-0.205974;FXX=0.0185151;HRUN=4,1,7;LEN=2,2,1;MLLD=28.1562,116.59,8.22703;QD=2.52102;RBI=0.121018,0.0519758,0.292691;REFB=0.0646868,-0.00547111,-0.115975;REVB=-0.111434,-0.0150953,0.207949;RO=30;SAF=3,2,11;SAR=0,0,1;SRF=9;SRR=21;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.643692,0.565343,0.696802;STB=0.997051,0.995713,0.854151;STBP=0.035,0.096,0.116;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0.00252654,0.220963,0.073081;OID=.,.,.;OPOS=106815952,106815953,106815954;OREF=TC,CA,A;OALT=CA,AC,-;OMAPALT=CAA,TAC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:15:53:53:30:42:3,2,12:3,2,6:0.0566038,0.0377358,0.113208:0,0,1:3,2,11:9:21:0,0,1:3,2,5:17:25 chr8 106815994 . GGTTAT G 125.87 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00108442;FXX=0.173044;HRUN=2;LEN=5;MLLD=286.125;QD=11.7085;RBI=0.0265604;REFB=-0.00961384;REVB=0.0265382;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612775;STB=0.51469;STBP=0.829;TYPE=del;VARB=0.0107664;OID=.;OPOS=106815995;OREF=GTTAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.44186:19:51:19:43:24:10:9:12:12:99:22:10:9:13:9 chr8 107710044 . T A 2015.29 PASS AF=0.984962;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0515231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9763;QD=60.6101;RBI=0.0555141;REFB=0.0415481;REVB=-0.0206685;RO=2;SAF=60;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00120823;STB=0.500636;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000147837;OID=.;OPOS=107710044;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:133:2:2:131:131:0.984962:71:60:1:1:71:60:1:1 chr8 107782065 . A G 160.27 PASS AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00952186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.112;QD=10.3398;RBI=0.0152143;REFB=-0.023271;REVB=-0.0118663;RO=41;SAF=9;SAR=12;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148798;STB=0.587073;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0238828;OID=.;OPOS=107782065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:12:9:23:18:12:9:23:18 chr8 107782395 . G A 334.4 PASS AF=0.666667;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0739006;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3044;QD=31.8471;RBI=0.0863071;REFB=0.0130393;REVB=0.0445828;RO=14;SAF=14;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434379;STB=0.523793;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=-0.00315943;OID=.;OPOS=107782395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:14:14:28:28:0.666667:14:14:6:8:14:14:6:8 chr8 108970367 . A G 724.96 PASS AF=0.503546;AO=71;DP=141;FAO=71;FDP=141;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.00148906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.154;QD=20.5663;RBI=0.00200881;REFB=-0.0013466;REVB=-0.00134834;RO=70;SAF=36;SAR=35;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323043;STB=0.517788;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.00123265;OID=.;OPOS=108970367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:70:70:71:71:0.503546:35:36:38:32:35:36:38:32 chr8 109455863 . C T 126.19 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.020156;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.094;QD=10.9731;RBI=0.020967;REFB=-0.0251761;REVB=-0.00577491;RO=31;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23715;STB=0.639825;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0501349;OID=.;OPOS=109455863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:7:8:10:21:7:8:10:21 chr8 110657514 . G A 912.15 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0391465;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.489;QD=57.0091;RBI=0.0514971;REFB=-0.125805;REVB=0.033459;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012593;STB=0.506665;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000394409;OID=.;OPOS=110657514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:64:1:1:63:63:0.984375:37:26:0:1:37:26:0:1 chr8 110984500 . G T 364.52 PASS AF=0.411765;AO=41;DP=103;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.00264263;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.921;QD=14.2947;RBI=0.0123462;REFB=-0.0105864;REVB=0.0120601;RO=57;SAF=27;SAR=14;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106759;STB=0.553165;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0177442;OID=.;OPOS=110984500;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:57:60:41:42:0.411765:14:27:32:25:14:28:35:25 chr8 111946844 . G C 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5492;QD=56.188;RBI=0.032755;REFB=0;REVB=0.0197051;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104797;OID=.;OPOS=111946844;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0 chr8 113241088 . T G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.64;QD=62.022;RBI=0.0347712;REFB=0;REVB=0.0229673;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64995e-05;OID=.;OPOS=113241088;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr8 113323089 . T C 125.85 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0164777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.758;QD=18.6449;RBI=0.0169012;REFB=-0.0164428;REVB=0.00375977;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973626;STB=0.555477;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0188975;OID=.;OPOS=113323089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:7:7:8:5:7:7:8:5 chr8 113364696 . A G 106.79 PASS AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0788726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0652;QD=6.88968;RBI=0.0879941;REFB=-0.0198682;REVB=0.0390138;RO=46;SAF=13;SAR=3;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491526;STB=0.802084;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0739633;OID=.;OPOS=113364696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:46:46:16:16:0.258065:3:13:19:27:3:13:19:27 chr8 113516208 . TG T,TA 1006.12 PASS AF=0.130435,0.869565;AO=26,43;DP=71;FAO=9,60;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=2,15;FSAR=7,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165373,0.0174093;FXX=0.0142837;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=186.701,190.793;QD=58.326;RBI=0.0243839,0.0329487;REFB=0,0;REVB=0.017919,0.0279738;RO=0;SAF=6,10;SAR=20,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.14057e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0038264,0.00888538;OID=.,.;OPOS=113516209,113516209;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.130435,0.869565:26,43:71:9,60:69:0:2,15:7,45:0:0:20:0:6,10:20,33:0:0 chr8 113655752 . T C 319.94 PASS AF=0.328;AO=41;DP=124;FAO=41;FDP=125;FR=.;FRO=84;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.00577662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.6331;QD=10.2379;RBI=0.0374691;REFB=-0.00241365;REVB=-0.0370212;RO=83;SAF=22;SAR=19;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354279;STB=0.516626;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00548939;OID=.;OPOS=113655752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:83:84:41:41:0.328:19:22:42:41:19:22:43:41 chr8 113988139 . T C 773.2 PASS AF=0.443243;AO=82;DP=185;FAO=82;FDP=185;FR=.;FRO=103;FSAF=64;FSAR=18;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=0.00250886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.269;QD=16.7178;RBI=0.00439978;REFB=-0.0218092;REVB=-0.00361438;RO=103;SAF=64;SAR=18;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262483;STB=0.64736;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0290972;OID=.;OPOS=113988139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:103:103:82:82:0.443243:18:64:58:45:18:64:58:45 chr8 114186003 . T C 612.24 PASS AF=0.473684;AO=63;DP=133;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.011876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.783;QD=18.4132;RBI=0.0132493;REFB=-0.0177823;REVB=0.00587419;RO=69;SAF=26;SAR=37;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491891;STB=0.523918;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0232697;OID=.;OPOS=114186003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:69:70:63:63:0.473684:37:26:32:37:37:26:32:38 chr8 116423424 . T C 1312.82 PASS AF=0.956044;AO=87;DP=92;FAO=87;FDP=91;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.015151;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.511;QD=57.7064;RBI=0.0184479;REFB=0.00478356;REVB=0.0105249;RO=3;SAF=36;SAR=51;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00523876;STB=0.507438;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-3.73108e-05;OID=.;OPOS=116423424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:92:91:3:4:87:87:0.956044:51:36:1:2:51:36:1:3 chr8 116423490 . A T 1533.37 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193841;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.42;QD=63.8905;RBI=0.0387388;REFB=0;REVB=0.0335402;RO=0;SAF=35;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87364e-05;OID=.;OPOS=116423490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:61:35:0:0:61:35:0:0 chr8 116424270 . A AC,C 681.69 PASS AF=0.977778,0;AO=24,19;DP=47;FAO=44,0;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=21,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0454245,-0.0824101;FXX=0.0425441;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=204.962,194.707;QD=60.5943;RBI=0.0454253,0.0824134;REFB=-0.0295825,-0.14142;REVB=0.000281819,0.000745736;RO=3;SAF=6,15;SAR=18,4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0712357,0.24748;STB=0.510633,0.5;STBP=0.525,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00158553,0.00906809;OID=.,.;OPOS=116424271,116424270;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:45:3:1:24,19:44,0:0.977778,0:18,4:6,15:0:3:23,0:21,0:0:1 chr8 116635872 . T TA 221.81 PASS AF=0.430233;AO=34;DP=89;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.020119;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.059;QD=10.3166;RBI=0.0250647;REFB=0.035029;REVB=-0.0149488;RO=53;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213905;STB=0.517341;STBP=0.812;TYPE=ins;VARB=-0.0482856;OID=.;OPOS=116635873;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.430233:34:89:37:86:49:17:20:24:25:99:53:16:18:26:27 chr8 117035009 . C T 1606.99 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.476;QD=60.0745;RBI=0.0261689;REFB=0;REVB=-0.00391937;RO=0;SAF=43;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8584e-05;OID=.;OPOS=117035009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:64:43:0:0:64:43:0:0 chr8 117791733 . T C 632.84 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000971616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.446;QD=61.7404;RBI=0.0296943;REFB=0;REVB=0.0296784;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167401;OID=.;OPOS=117791733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:17:23:0:0:18:23:0:0 chr8 117858389 . G A 1542.34 PASS AF=1;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198959;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.159;QD=59.8966;RBI=0.00625189;REFB=0;REVB=0.00592686;RO=0;SAF=39;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015137;OID=.;OPOS=117858389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:103:0:0:103:103:1:64:39:0:0:64:39:0:0 chr8 117864217 . A G 885.24 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000982551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.591;QD=58.0482;RBI=0.00332713;REFB=0;REVB=-0.00317874;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7899e-06;OID=.;OPOS=117864217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:25:35:0:0:26:35:0:0 chr8 117950768 . G C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.478;QD=37.4885;RBI=0.0128489;REFB=0;REVB=0.00141607;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001359;OID=.;OPOS=117950768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr8 118030465 . C G 175.71 PASS AF=0.6;AO=17;DP=29;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00163554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.804;QD=23.4285;RBI=0.00455248;REFB=-0.0260048;REVB=0.00424854;RO=12;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399905;STB=0.533296;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0338537;OID=.;OPOS=118030465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:30:12:12:17:18:0.6:9:8:5:7:9:9:5:7 chr8 118184783 . C T 982.85 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=70;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0423627;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.841;QD=57.8145;RBI=0.042573;REFB=0.00553958;REVB=0.00422599;RO=1;SAF=34;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136967;STB=0.507244;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97912e-05;OID=.;OPOS=118184783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:68:1:1:67:67:0.985294:33:34:1:0:33:34:1:0 chr8 118819578 . C T 917.95 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.132;QD=55.6335;RBI=0.0532243;REFB=-0.108443;REVB=0.0394937;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433289;OID=.;OPOS=118819578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:62:66:0:0:60:66:1:35:25:0:0:37:29:0:0 chr8 119964016 . G A 971.05 PASS AF=0.48731;AO=96;DP=197;FAO=96;FDP=197;FR=.;FRO=101;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=65;FSRR=36;FWDB=0.00854859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.375;QD=19.7168;RBI=0.031083;REFB=-0.0147898;REVB=0.0298843;RO=100;SAF=53;SAR=43;SRF=65;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928704;STB=0.547879;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0164524;OID=.;OPOS=119964016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:100:101:96:96:0.48731:43:53:65:35:43:53:65:36 chr8 119964052 . G C 4503.81 PASS AF=1;AO=282;DP=284;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000926656;FXX=0.0139368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.394;QD=63.658;RBI=0.027099;REFB=0;REVB=0.0270831;RO=0;SAF=163;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.92394e-05;OID=.;OPOS=119964052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:284:283:0:0:282:283:1:119:163:0:0:119:164:0:0 chr8 120569877 . T G 401.28 PASS AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.026815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.061;QD=18.8836;RBI=0.031198;REFB=-0.0117104;REVB=0.0159458;RO=44;SAF=23;SAR=18;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990423;STB=0.555145;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0115842;OID=.;OPOS=120569877;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:0.482353:18:23:20:24:18:23:20:24 chr8 120596023 . A G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000960496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.912;QD=62.9829;RBI=0.021036;REFB=0;REVB=0.0210141;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98247e-05;OID=.;OPOS=120596023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr8 120724209 . T C 492.42 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0104514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.386;QD=20.0986;RBI=0.0172676;REFB=-0.00739198;REVB=0.0137455;RO=50;SAF=18;SAR=30;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489682;STB=0.502716;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00723371;OID=.;OPOS=120724209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:50:50:48:48:0.489796:30:18:19:31:30:18:19:31 chr8 120790304 . T C 300.6 PASS AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0190787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.31;QD=23.1234;RBI=0.0229345;REFB=-0.00985536;REVB=0.0127277;RO=21;SAF=12;SAR=18;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583965;STB=0.543278;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00483631;OID=.;OPOS=120790304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:21:22:30:30:0.576923:18:12:10:11:18:12:11:11 chr8 120803637 . C G 423.19 PASS AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0106693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0664;QD=23.8419;RBI=0.0255804;REFB=-0.0194622;REVB=-0.0232492;RO=30;SAF=22;SAR=19;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180759;STB=0.599;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0101266;OID=.;OPOS=120803637;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:0.577465:19:22:9:21:19:22:9:21 chr8 120847078 . C G 88.98 PASS AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00774757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.455;QD=7.1185;RBI=0.0124695;REFB=-0.0100612;REVB=0.0097705;RO=38;SAF=7;SAR=5;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378737;STB=0.52377;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0292003;OID=.;OPOS=120847078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:50:50:38:38:12:12:0.24:5:7:21:17:5:7:21:17 chr8 120847123 . C T 87.41 PASS AF=0.21875;AO=14;DP=64;FAO=14;FDP=64;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0102877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.037;QD=5.46327;RBI=0.0143516;REFB=-0.00198354;REVB=-0.0100066;RO=48;SAF=8;SAR=6;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015;STB=0.50684;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00512022;OID=.;OPOS=120847123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:64:64:48:50:14:14:0.21875:6:8:28:20:6:8:29:21 chr8 120847188 . T C 198.04 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0030696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.894;QD=11.1572;RBI=0.0095668;REFB=-0.0112953;REVB=-0.00906098;RO=46;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465501;STB=0.527005;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0220052;OID=.;OPOS=120847188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:46:46:25:25:0.352113:12:13:22:24:12:13:22:24 chr8 120903471 . C CA 1197.16 PASS AF=1;AO=77;DP=82;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026307;FXX=0.0370325;HRUN=0;LEN=1;MLLD=231.732;QD=61.3928;RBI=0.0542194;REFB=0;REVB=0.0474097;RO=3;SAF=44;SAR=33;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00690136;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00025709;OID=.;OPOS=120903472;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:77:82:78:78:0:44:34:0:0:6:3:44:33:2:1 chr8 121013770 . A G 904.26 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127417;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.06;QD=58.3392;RBI=0.017865;REFB=0;REVB=0.0125222;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1706e-05;OID=.;OPOS=121013770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr8 121061879 . G A 1565.98 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072858;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.818;QD=63.9177;RBI=0.0811415;REFB=0;REVB=0.0357164;RO=0;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262839;OID=.;OPOS=121061879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:98:0:0:96:98:1:55:41:0:0:56:42:0:0 chr8 121210069 . T C 1043.73 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0138;QD=59.6414;RBI=0.0475614;REFB=0;REVB=0.0138466;RO=0;SAF=48;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366544;OID=.;OPOS=121210069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:22:48:0:0:22:48:0:0 chr8 121215991 . T C 1572.83 PASS AF=1;AO=103;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.367;QD=59.9174;RBI=0.0107638;REFB=0;REVB=0.00126037;RO=0;SAF=36;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2555e-05;OID=.;OPOS=121215991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:103:105:1:67:36:0:0:68:37:0:0 chr8 121228679 . A C 2299.18 PASS AF=0.986577;AO=146;DP=148;FAO=147;FDP=149;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0722471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4134;QD=61.723;RBI=0.0934326;REFB=-0.0910851;REVB=0.0592454;RO=2;SAF=64;SAR=82;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114572;STB=0.506023;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0021621;OID=.;OPOS=121228679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:148:149:2:2:146:147:0.986577:82:64:0:2:82:65:0:2 chr8 121256150 . T C 902.65 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.688;QD=58.2352;RBI=0.0929337;REFB=0;REVB=-0.075159;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126855;OID=.;OPOS=121256150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0 chr8 121259862 . G A 2282.98 PASS AF=0.987013;AO=151;DP=154;FAO=152;FDP=154;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00761125;FXX=0.0128197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.66;QD=59.2983;RBI=0.0262523;REFB=0.108421;REVB=0.0251248;RO=2;SAF=82;SAR=69;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00107817;STB=0.500516;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=2.82618e-05;OID=.;OPOS=121259862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:154:154:2:2:151:152:0.987013:69:82:1:1:70:82:1:1 chr8 121383048 . T C 223.93 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00413591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5268;QD=20.3574;RBI=0.0047104;REFB=-0.00861581;REVB=0.00225435;RO=22;SAF=9;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121921;STB=0.568687;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0201997;OID=.;OPOS=121383048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:13:9:12:10:13:9:12:10 chr8 121530190 . A G 324.8 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00246244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.496;QD=17.0946;RBI=0.00786956;REFB=-0.00376142;REVB=0.00747438;RO=40;SAF=17;SAR=18;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848956;STB=0.540517;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00556511;OID=.;OPOS=121530190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:41:35:35:0.460526:18:17:23:17:18:17:23:18 chr8 123964431 . G A 306.46 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00109018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.626;QD=27.2407;RBI=0.0139629;REFB=-0.0153882;REVB=-0.0139203;RO=18;SAF=20;SAR=7;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31713;STB=0.676019;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00617698;OID=.;OPOS=123964431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:7:20:6:12:7:20:6:12 chr8 123964953 . C T 341.24 PASS AF=0.622642;AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0124298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3593;QD=25.7537;RBI=0.0125929;REFB=0.00323403;REVB=0.00202022;RO=20;SAF=16;SAR=17;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791054;STB=0.543353;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=-0.0044884;OID=.;OPOS=123964953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:20:20:33:33:0.622642:17:16:12:8:17:16:12:8 chr8 123965740 . A G 181.1 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0115146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.863;QD=11.3185;RBI=0.0623922;REFB=-0.0199115;REVB=-0.0613205;RO=40;SAF=9;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147793;STB=0.578443;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.058854;OID=.;OPOS=123965740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:40:41:23:23:0.359375:14:9:21:19:14:9:21:20 chr8 123966085 . G A 412.84 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00826793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.725;QD=18.7653;RBI=0.0137381;REFB=-0.0373991;REVB=0.0109716;RO=42;SAF=19;SAR=23;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216989;STB=0.51361;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0364198;OID=.;OPOS=123966085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:46:42:42:0.477273:23:19:18:24:23:19:22:24 chr8 123966159 . G C 295.55 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.019126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1697;QD=15.3532;RBI=0.107339;REFB=-0.0129414;REVB=0.105621;RO=43;SAF=16;SAR=17;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185283;STB=0.595824;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0193469;OID=.;OPOS=123966159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:43:44:33:33:0.428571:17:16:13:30:17:16:14:30 chr8 124027562 . C T 478.9 PASS AF=0.449153;AO=52;DP=117;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0267106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.081;QD=16.2339;RBI=0.0294245;REFB=-0.0145665;REVB=-0.0123428;RO=65;SAF=30;SAR=22;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115096;STB=0.568324;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0208337;OID=.;OPOS=124027562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:65:65:52:53:0.449153:22:30:30:35:22:31:30:35 chr8 124027628 . T C 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0666699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.152;QD=13.9955;RBI=0.0667202;REFB=-0.0104295;REVB=-0.00259095;RO=42;SAF=22;SAR=7;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425247;STB=0.742629;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0312088;OID=.;OPOS=124027628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:7:22:15:27:7:22:15:27 chr8 124169554 . G A 1643.62 PASS AF=0.990991;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00914033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.384;QD=59.2296;RBI=0.010131;REFB=-0.041984;REVB=-0.00436928;RO=1;SAF=54;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00840219;STB=0.504424;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-9.25323e-07;OID=.;OPOS=124169554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:111:111:1:1:110:110:0.990991:56:54:0:1:56:54:0:1 chr8 124206324 . G A 349.89 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00450767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.884;QD=17.7161;RBI=0.0288368;REFB=0.00549243;REVB=0.0284823;RO=41;SAF=26;SAR=11;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239012;STB=0.640965;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00352375;OID=.;OPOS=124206324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:42:37:37:0.468354:11:26:19:22:11:26:19:23 chr8 124525483 . C T 1392.63 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.042;QD=62.59;RBI=0.0466921;REFB=0;REVB=0.0408335;RO=0;SAF=34;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208292;OID=.;OPOS=124525483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:54:34:0:0:55:34:0:0 chr8 124594546 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.543;QD=51.1845;RBI=0.0140211;REFB=0;REVB=0.0139313;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132745;OID=.;OPOS=124594546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0 chr8 124658210 . C T 163.92 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00595104;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.084;QD=11.1135;RBI=0.0237334;REFB=-0.0144131;REVB=-0.0229751;RO=38;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00277585;STB=0.501617;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.034084;OID=.;OPOS=124658210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:59:38:38:21:21:0.355932:11:10:18:20:11:10:18:20 chr8 124663895 . G A 196.26 PASS AF=0.342466;AO=25;DP=73;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0038006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.133;QD=10.7538;RBI=0.0215142;REFB=-0.00694595;REVB=-0.0211759;RO=48;SAF=13;SAR=12;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481968;STB=0.52803;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0140198;OID=.;OPOS=124663895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:48:48:25:25:0.342466:12:13:27:21:12:13:27:21 chr8 124663987 . C G 35.75 PASS AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0244169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.915;QD=5.95795;RBI=0.0247598;REFB=-0.0154476;REVB=-0.00410597;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0647499;OID=.;OPOS=124663987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:3:3:9:9:3:3:9:9 chr8 124664130 . C T 163.8 PASS AF=0.314286;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0405473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7248;QD=9.35976;RBI=0.0442118;REFB=0.00027372;REVB=-0.0176239;RO=48;SAF=9;SAR=13;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130323;STB=0.576953;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-5.1614e-05;OID=.;OPOS=124664130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:48:48:22:22:0.314286:13:9:25:23:13:9:25:23 chr8 124664167 . T C 349.27 PASS AF=0.404255;AO=37;DP=95;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0136895;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.392;QD=14.8627;RBI=0.0296946;REFB=-0.00964648;REVB=0.0263508;RO=56;SAF=19;SAR=18;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332441;STB=0.526302;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0131295;OID=.;OPOS=124664167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:56:56:37:38:0.404255:18:19:27:29:18:20:27:29 chr8 124664792 . C T 324.81 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0153278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.288;QD=17.095;RBI=0.0225716;REFB=-0.0183432;REVB=-0.0165691;RO=41;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575906;STB=0.532301;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0186295;OID=.;OPOS=124664792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:20:15:20:21:20:15:20:21 chr8 124664873 . AT GC 350.2 PASS AF=0.4;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0142104;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=2;MLLD=263.962;QD=14.0082;RBI=0.0160303;REFB=-0.00469133;REVB=-0.00741855;RO=58;SAF=19;SAR=21;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00813155;STB=0.505008;STBP=0.973;TYPE=mnp;VARB=0.00739594;OID=.;OPOS=124664873;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:58:60:40:40:0.4:21:19:28:30:21:19:29:31 chr8 124696867 . C T 1873.03 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.386;QD=61.4107;RBI=0.0337365;REFB=0;REVB=0.0270282;RO=0;SAF=56;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.93519e-05;OID=.;OPOS=124696867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:122:0:0:120:122:1:64:56:0:0:66:56:0:0 chr8 124710729 . C T 268.65 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00190559;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.883;QD=16.2818;RBI=0.00711711;REFB=-0.00406464;REVB=0.00685726;RO=33;SAF=13;SAR=17;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00865263;STB=0.521458;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0120556;OID=.;OPOS=124710729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:33:36:30:30:0.454545:17:13:14:19:17:13:17:19 chr8 124749610 . C T 756.45 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.046768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4976;QD=55.0147;RBI=0.0467734;REFB=-0.140026;REVB=-0.000712791;RO=1;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149611;STB=0.507934;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00224505;OID=.;OPOS=124749610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:55:55:1:1:54:54:0.981818:31:23:0:1:31:23:0:1 chr8 124824826 . G A 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00279659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.722;QD=62.9079;RBI=0.0352504;REFB=0;REVB=0.0351393;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186681;OID=.;OPOS=124824826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0 chr8 124987478 . T C 1102.51 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0194779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.528;QD=58.8004;RBI=0.0224134;REFB=-0.022503;REVB=0.0110893;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.506492;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000113191;OID=.;OPOS=124987478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:36:38:0:0:36:38:1:0 chr8 125035788 . G C 553.23 PASS AF=0.97561;AO=17;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00999609;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.346;QD=53.9739;RBI=0.100221;REFB=-0.0969376;REVB=0.099721;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.509799;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00349173;OID=.;OPOS=125035788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:17:40:0.97561:2:15:0:0:25:15:0:1 chr8 125061895 . G A 913.62 PASS AF=0.466346;AO=94;DP=205;FAO=97;FDP=208;FR=.;FRO=111;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=66;FSRR=45;FWDB=0.0173371;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.684;QD=17.5696;RBI=0.020019;REFB=-0.0144806;REVB=-0.0100091;RO=111;SAF=49;SAR=45;SRF=66;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721111;STB=0.536957;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0155695;OID=.;OPOS=125061895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:208:111:111:94:97:0.466346:45:49:66:45:46:51:66:45 chr8 125072426 . T C 162.5 PASS AF=0.37037;AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00643339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.079;QD=12.0373;RBI=0.0251999;REFB=-0.0205706;REVB=0.0243649;RO=34;SAF=11;SAR=8;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104791;STB=0.507685;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.036838;OID=.;OPOS=125072426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:34:34:19:20:0.37037:8:11:20:14:8:12:20:14 chr8 125076589 . T G 472.63 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0250613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9002;QD=17.5048;RBI=0.0344237;REFB=-0.0244909;REVB=0.0235992;RO=56;SAF=29;SAR=22;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314332;STB=0.513269;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0388355;OID=.;OPOS=125076589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:57:51:51:0.472222:22:29:30:26:22:29:31:26 chr8 125107201 . G A 245.25 PASS AF=0.293103;AO=34;DP=115;FAO=34;FDP=116;FR=.;FRO=82;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.0123912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.681;QD=8.45673;RBI=0.0244598;REFB=0.00170252;REVB=0.0210888;RO=80;SAF=13;SAR=21;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221342;STB=0.505885;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=-0.00326646;OID=.;OPOS=125107201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:80:82:34:34:0.293103:21:13:32:48:21:13:32:50 chr8 125107207 . C T 238.21 PASS AF=0.294643;AO=33;DP=113;FAO=33;FDP=112;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.00452081;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.918;QD=8.50765;RBI=0.00948426;REFB=-0.00613187;REVB=-0.00833747;RO=78;SAF=12;SAR=21;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429066;STB=0.52165;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0237947;OID=.;OPOS=125107207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:78:79:33:33:0.294643:21:12:31:47:21:12:31:48 chr8 125568175 . T C 248.61 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0122145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.364;QD=25.4981;RBI=0.012805;REFB=-0.0125286;REVB=-0.00384395;RO=16;SAF=12;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108071;STB=0.559948;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00494083;OID=.;OPOS=125568175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:11:12:6:10:11:12:6:10 chr8 125568623 . A G 230.74 PASS AF=0.457627;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0251302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.549;QD=15.643;RBI=0.0252026;REFB=-0.0134641;REVB=0.00190973;RO=32;SAF=8;SAR=18;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199818;STB=0.595165;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0202174;OID=.;OPOS=125568623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:32:32:26:27:0.457627:18:8:16:16:18:9:16:16 chr8 125579973 . C T 310.56 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0395865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.712;QD=16.3454;RBI=0.0396639;REFB=-0.0181574;REVB=-0.00247664;RO=42;SAF=17;SAR=17;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233865;STB=0.51315;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0316547;OID=.;OPOS=125579973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:17:17:22:20:17:17:22:20 chr8 125579990 . C T 357.25 PASS AF=0.447059;AO=37;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00248347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.498;QD=16.8118;RBI=0.00382502;REFB=-0.0023842;REVB=-0.00290915;RO=47;SAF=17;SAR=20;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720684;STB=0.532161;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00353847;OID=.;OPOS=125579990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:37:38:0.447059:20:17:25:22:20:18:25:22 chr8 126142476 . G C 393.42 PASS AF=0.431373;AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0244916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8809;QD=15.4282;RBI=0.0456007;REFB=-0.00278018;REVB=-0.0384653;RO=58;SAF=21;SAR=23;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294567;STB=0.51654;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00373217;OID=.;OPOS=126142476;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:58:58:44:44:0.431373:23:21:26:32:23:21:26:32 chr8 126283111 . G T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.738;QD=55.6561;RBI=0.0289782;REFB=0;REVB=0.0246494;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60787e-05;OID=.;OPOS=126283111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr8 126449406 . C T 550.04 PASS AF=0.464;AO=58;DP=125;FAO=58;FDP=125;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.0215856;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.87;QD=17.6012;RBI=0.0221879;REFB=-0.0181518;REVB=-0.00513484;RO=65;SAF=43;SAR=15;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143471;STB=0.574264;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0216522;OID=.;OPOS=126449406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:67:58:58:0.464:15:43:40:25:15:43:42:25 chr8 126450286 . ATTTTG A 197.74 PASS AF=0.407407;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00548814;FXX=0.03571;HRUN=4;LEN=5;MLLD=243.731;QD=9.76515;RBI=0.00552509;REFB=0.00204135;REVB=-0.000637923;RO=20;SAF=18;SAR=15;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031422;STB=0.56372;STBP=0.35;TYPE=del;VARB=-0.00332227;OID=.;OPOS=126450287;OREF=TTTTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407407:33:63:33:81:48:18:15:21:27:99:20:18:15:10:10 chr8 127565184 . A G 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0485006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.978;QD=14.2705;RBI=0.05107;REFB=-0.0192396;REVB=-0.0159948;RO=33;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577191;STB=0.532915;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0246987;OID=.;OPOS=127565184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:13:11:17:16:13:11:17:16 chr8 127683850 . T C 1770.76 PASS AF=1;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465331;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.145;QD=61.0607;RBI=0.0640412;REFB=0;REVB=0.0439993;RO=0;SAF=62;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193502;OID=.;OPOS=127683850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:116:0:0:116:116:1:54:62:0:0:54:62:0:0 chr8 128428638 . G A 1260.98 PASS AF=0.504098;AO=122;DP=244;FAO=123;FDP=244;FR=.;FRO=121;FSAF=72;FSAR=51;FSRF=65;FSRR=56;FWDB=0.00984684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.002;QD=20.6718;RBI=0.0102;REFB=-0.00904973;REVB=-0.00266064;RO=120;SAF=72;SAR=50;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448934;STB=0.524399;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00988711;OID=.;OPOS=128428638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:120:121:122:123:0.504098:50:72:65:55:51:72:65:56 chr8 128428795 . G A 575.81 PASS AF=0.508621;AO=58;DP=115;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0380471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2768;QD=19.8554;RBI=0.0386563;REFB=0.00603229;REVB=-0.00683592;RO=57;SAF=24;SAR=34;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548035;STB=0.533621;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00391441;OID=.;OPOS=128428795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:57:57:58:59:0.508621:34:24:27:30:35:24:27:30 chr8 128428823 . G C 714.33 PASS AF=0.571429;AO=68;DP=120;FAO=68;FDP=119;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0062624;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.814;QD=24.0111;RBI=0.00766576;REFB=-0.013359;REVB=-0.00442111;RO=52;SAF=32;SAR=36;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233829;STB=0.508422;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00606473;OID=.;OPOS=128428823;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:52:51:68:68:0.571429:36:32:26:26:36:32:25:26 chr8 128429262 . G C 357.56 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0470205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.694;QD=49.3183;RBI=0.0519086;REFB=-0.0713704;REVB=0.0219904;RO=2;SAF=6;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131958;STB=0.571372;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00581413;OID=.;OPOS=128429262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:21:6:2:0:21:6:2:0 chr8 128429315 . T A 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.589;QD=39.2055;RBI=0.0173696;REFB=0;REVB=-0.0120492;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71056e-06;OID=.;OPOS=128429315;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr8 128429510 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6104;QD=55.0984;RBI=0.0673165;REFB=0;REVB=0.0644258;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000982224;OID=.;OPOS=128429510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr8 128429519 . G A 464.74 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.135;QD=58.093;RBI=0.0297121;REFB=0;REVB=0.0265249;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259708;OID=.;OPOS=128429519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr8 128429660 . T C 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7133;QD=59.6775;RBI=0.0040438;REFB=0;REVB=-0.00115504;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.72873e-05;OID=.;OPOS=128429660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr8 128429721 . T C 747.07 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0497;QD=63.5803;RBI=0.0543595;REFB=0;REVB=0.00760609;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374225;OID=.;OPOS=128429721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:30:17:0:0:30:17:0:0 chr8 128429732 . C T 273.92 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169926;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.219;QD=52.1752;RBI=0.0214379;REFB=0;REVB=0.0130705;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.84883e-05;OID=.;OPOS=128429732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:15:5:0:0:16:5:0:0 chr8 128430225 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.049;QD=35.5759;RBI=0.0275664;REFB=0;REVB=-0.0101385;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107835;OID=.;OPOS=128430225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr8 128430478 . G T 160.47 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158038;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.918;QD=45.8485;RBI=0.0616121;REFB=0;REVB=0.0595508;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374905;OID=.;OPOS=128430478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:4:9:0:0:5:9:0:0 chr8 128430807 . C A 286.1 PASS AF=0.535714;AO=31;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00100547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.844;QD=20.4359;RBI=0.0128143;REFB=-0.0220379;REVB=0.0127747;RO=25;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443868;STB=0.511104;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0086209;OID=.;OPOS=128430807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:26:31:30:0.535714:19:12:11:14:18:12:11:15 chr8 128430872 . A AATG 356.08 PASS AF=0.931034;AO=25;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0141269;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=313.991;QD=49.1149;RBI=0.0184846;REFB=-0.0349974;REVB=0.0119211;RO=2;SAF=15;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142411;STB=0.506591;STBP=0.86;TYPE=ins;VARB=0.0035575;OID=.;OPOS=128430873;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=AATG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.931034:25:29:27:29:2:16:11:1:1:9:2:15:10:1:1 chr8 128431694 . A G 351.23 PASS AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00569909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.157;QD=28.6717;RBI=0.0097494;REFB=-0.0217038;REVB=0.0079102;RO=19;SAF=17;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102842;STB=0.556579;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0212872;OID=.;OPOS=128431694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:19:19:30:30:0.612245:13:17:8:11:13:17:8:11 chr8 128432206 . C A 282.13 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0597987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.917;QD=23.0311;RBI=0.0604198;REFB=-0.0250493;REVB=0.00864061;RO=23;SAF=2;SAR=24;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13608;STB=0.576856;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.024333;OID=.;OPOS=128432206;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:24:2:3:20:24:2:3:20 chr8 129011513 . T C 359.57 PASS AF=0.416667;AO=39;DP=97;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0357693;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1321;QD=14.982;RBI=0.0392674;REFB=-0.00821883;REVB=0.0162013;RO=52;SAF=20;SAR=19;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848912;STB=0.527212;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0172205;OID=.;OPOS=129011513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:52:56:39:40:0.416667:19:20:31:21:19:21:32:24 chr8 129021179 . G A 410.87 PASS AF=0.909091;AO=30;DP=35;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00724434;FXX=0.0571265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.468;QD=49.8026;RBI=0.0171622;REFB=0.00978051;REVB=0.0155583;RO=3;SAF=15;SAR=15;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281616;STB=0.515141;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.00107751;OID=.;OPOS=129021179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:35:33:3:3:30:30:0.909091:15:15:2:1:15:15:2:1 chr8 129022785 . T C 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000902151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.553;QD=62.9817;RBI=0.00264127;REFB=0;REVB=0.00248243;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.41116e-06;OID=.;OPOS=129022785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr8 129022816 . G A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=314.43;QD=57.1775;RBI=0.0216597;REFB=0;REVB=-0.000549064;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29681e-05;OID=.;OPOS=129022816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr8 129022818 . T A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.806;QD=64.4152;RBI=0.0315171;REFB=0;REVB=0.0186654;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.07141e-05;OID=.;OPOS=129022818;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr8 129162433 . G T 114.21 PASS AF=0.388889;AO=13;DP=32;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0206685;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=46.7643;QD=12.6896;RBI=0.0639441;REFB=-0.0187888;REVB=0.0605116;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145442;STB=0.590033;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0132742;OID=.;OPOS=129162433;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:36:19:22:13:14:0.388889:5:8:9:10:5:9:11:11 chr8 130760850 . A G 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00106261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.928;QD=64.4143;RBI=0.0200934;REFB=0;REVB=0.0200653;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.76083e-05;OID=.;OPOS=130760850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr8 130762291 . G A 396.94 PASS AF=0.40708;AO=46;DP=114;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=23;FWDB=-0.00697429;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.046;QD=14.0511;RBI=0.0194366;REFB=-0.0138193;REVB=-0.0181422;RO=64;SAF=24;SAR=22;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157268;STB=0.580711;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0228599;OID=.;OPOS=130762291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:64:67:46:46:0.40708:22:24:43:21:22:24:44:23 chr8 131124559 . T C 995.97 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.201;QD=58.5864;RBI=0.0272634;REFB=0;REVB=0.0268628;RO=0;SAF=14;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106539;OID=.;OPOS=131124559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:53:14:0:0:54:14:0:0 chr8 131353139 . T C 283.66 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0818728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.875;QD=19.9058;RBI=0.0820977;REFB=-0.0206994;REVB=0.0060716;RO=26;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218986;STB=0.628094;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0147114;OID=.;OPOS=131353139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:27:30:30:0.526316:16:14:19:7:16:14:20:7 chr8 131921956 . A G 2258.37 PASS AF=0.993056;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00765023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.591;QD=62.7325;RBI=0.00930232;REFB=-0.133413;REVB=0.00529217;RO=0;SAF=69;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12649e-08;STB=0.503597;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000130097;OID=.;OPOS=131921956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:143:144:0:1:143:143:0.993056:74:69:0:0:74:69:1:0 chr8 132947786 . C T 1044.39 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.307;QD=59.6794;RBI=0.0240077;REFB=0;REVB=-0.0138769;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.3706e-05;OID=.;OPOS=132947786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:33:36:0:0:33:37:0:0 chr8 133048593 . C T 413.14 PASS AF=0.8;AO=31;DP=39;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.021823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.921;QD=41.3141;RBI=0.0233611;REFB=-0.0200956;REVB=-0.0083366;RO=8;SAF=26;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361538;STB=0.698132;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.013411;OID=.;OPOS=133048593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:39:40:8:8:31:32:0.8:5:26:1:7:5:27:1:7 chr8 133048619 . T C 710.25 PASS AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0112433;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.22;QD=54.6344;RBI=0.0160167;REFB=-0.0414628;REVB=0.0114071;RO=1;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268819;STB=0.513508;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000855181;OID=.;OPOS=133048619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:50:51:0.980769:17:33:0:1:18:33:0:1 chr8 133053309 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.566;QD=60.9785;RBI=0.0398833;REFB=0;REVB=0.0139129;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135853;OID=.;OPOS=133053309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0 chr8 133053318 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.64;QD=61.3363;RBI=0.0254165;REFB=0;REVB=-0.0129789;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116841;OID=.;OPOS=133053318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0 chr8 133067315 . G A 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.005;QD=62.9829;RBI=0.0331395;REFB=0;REVB=0.0275701;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107011;OID=.;OPOS=133067315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr8 133089975 . A G 1925.93 PASS AF=0.935252;AO=130;DP=140;FAO=130;FDP=139;FR=.;FRO=9;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.00200317;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.17;QD=55.4225;RBI=0.0787005;REFB=-0.0411916;REVB=-0.078675;RO=9;SAF=50;SAR=80;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782226;STB=0.541278;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.010487;OID=.;OPOS=133089975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:140:139:9:9:130:130:0.935252:80:50:9:0:80:50:9:0 chr8 133101818 . G A 361.9 PASS AF=0.407767;AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=103;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.00291854;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.575;QD=14.0543;RBI=0.0199888;REFB=-0.0124716;REVB=-0.0197745;RO=61;SAF=13;SAR=29;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251836;STB=0.642821;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0155595;OID=.;OPOS=133101818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:61:61:42:42:0.407767:29:13:33:28:29:13:33:28 chr8 133107830 . T C 453.42 PASS AF=0.418033;AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.0235351;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.315;QD=14.8662;RBI=0.0242442;REFB=-0.00860585;REVB=-0.00582071;RO=72;SAF=24;SAR=27;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00170522;STB=0.503387;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00920515;OID=.;OPOS=133107830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:72:71:51:51:0.418033:27:24:34:38:27:24:33:38 chr8 133112392 . G A 177.67 PASS AF=0.37931;AO=21;DP=57;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0045758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.827;QD=12.2533;RBI=0.00695726;REFB=0.000800493;REVB=-0.00524075;RO=36;SAF=3;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.491024;STB=0.747045;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0013466;OID=.;OPOS=133112392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:36:36:21:22:0.37931:18:3:19:17:18:4:19:17 chr8 133113531 . A T 292.77 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00224288;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.006;QD=17.2216;RBI=0.0334421;REFB=-0.0258762;REVB=-0.0333668;RO=34;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223437;STB=0.624922;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0287215;OID=.;OPOS=133113531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:34:36:32:32:0.470588:12:20:13:21:12:20:14:22 chr8 133175736 . T C 327.01 PASS AF=0.62;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0127371;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4674;QD=26.1604;RBI=0.0471747;REFB=0.000386369;REVB=0.0454227;RO=20;SAF=17;SAR=14;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279802;STB=0.645481;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.000444988;OID=.;OPOS=133175736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:20:19:31:31:0.62:14:17:3:17:14:17:3:16 chr8 133723166 . A G 1731.31 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.837;QD=60.7476;RBI=0.00706901;REFB=0;REVB=0.0040805;RO=0;SAF=60;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76389e-06;OID=.;OPOS=133723166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:54:60:0:0:54:60:0:0 chr8 133769554 . TGA T 525.36 PASS AF=0.394558;AO=57;DP=148;FAO=58;FDP=147;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=39;FWDB=0.00326858;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=2;MLLD=166.468;QD=14.2954;RBI=0.0108004;REFB=-0.0144798;REVB=0.0102939;RO=85;SAF=19;SAR=38;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238263;STB=0.644809;STBP=0.01;TYPE=del;VARB=0.0194967;OID=.;OPOS=133769555;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.394558:57:148:58:147:89:19:39:50:39:99:85:19:38:47:38 chr8 133844508 . C T 501.1 PASS AF=0.394366;AO=55;DP=141;FAO=56;FDP=142;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=44;FWDB=0.00765859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.286;QD=14.1154;RBI=0.0145058;REFB=0.00924294;REVB=-0.0123193;RO=85;SAF=31;SAR=24;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875948;STB=0.539592;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=-0.0172446;OID=.;OPOS=133844508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:85:86:55:56:0.394366:24:31:41:44:25:31:42:44 chr8 133858712 . G A 561.63 PASS AF=0.468254;AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.00590274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.137;QD=17.8296;RBI=0.0271454;REFB=-0.00405025;REVB=-0.0264959;RO=67;SAF=37;SAR=22;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160432;STB=0.589206;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00305563;OID=.;OPOS=133858712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:67:67:59:59:0.468254:22:37:31:36:22:37:31:36 chr8 133859871 . T A 112.4 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0226563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.651;QD=16.0564;RBI=0.0263907;REFB=0.0159504;REVB=0.0135338;RO=15;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274687;STB=0.515899;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.0136019;OID=.;OPOS=133859871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:9:4:5:10:9:4:5:10 chr8 133859877 . G T 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.044026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.321;QD=17.1002;RBI=0.044731;REFB=0.0304328;REVB=0.0079102;RO=14;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069643;STB=0.552414;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.0351981;OID=.;OPOS=133859877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:9:5:4:10:9:5:4:11 chr8 133900252 . T G 493.73 PASS AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00783953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.943;QD=20.3598;RBI=0.0137808;REFB=-0.0328231;REVB=0.0113336;RO=49;SAF=22;SAR=26;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00859039;STB=0.50476;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0268716;OID=.;OPOS=133900252;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:49:49:48:48:0.494845:26:22:22:27:26:22:22:27 chr8 133900386 . T C 290.11 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00437935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.737;QD=16.5779;RBI=0.00932252;REFB=-0.00793937;REVB=0.00822987;RO=38;SAF=11;SAR=21;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534331;STB=0.530078;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00749066;OID=.;OPOS=133900386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:21:11:15:23:21:11:15:23 chr8 133909974 . A G 278.44 PASS AF=0.5;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0038748;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8964;QD=18.5626;RBI=0.0266673;REFB=0.00196935;REVB=-0.0263842;RO=30;SAF=4;SAR=26;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413826;STB=0.735662;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00342955;OID=.;OPOS=133909974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:30:30:30:30:0.5:26:4:14:16:26:4:14:16 chr8 133920518 . A G 265.04 PASS AF=0.330097;AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=103;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=-0.0224913;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.452;QD=10.2926;RBI=0.0229093;REFB=-0.0134821;REVB=-0.00435621;RO=66;SAF=14;SAR=20;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574337;STB=0.544884;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0208114;OID=.;OPOS=133920518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:66:69:34:34:0.330097:20:14:24:42:20:14:24:45 chr8 133931748 . T C 356.57 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0120997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.029;QD=19.2738;RBI=0.0126138;REFB=-0.0194923;REVB=-0.00356447;RO=37;SAF=17;SAR=20;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988791;STB=0.554867;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0139084;OID=.;OPOS=133931748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:20:17:13:24:20:17:13:24 chr8 133975283 . G A 202.24 PASS AF=0.410714;AO=14;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0220733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.454;QD=14.446;RBI=0.0252486;REFB=-0.0167955;REVB=0.0122581;RO=32;SAF=4;SAR=10;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38554;STB=0.584833;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0292729;OID=.;OPOS=133975283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:14:23:0.410714:10:4:20:12:12:11:20:12 chr8 134108453 . C T 240.7 PASS AF=0.405797;AO=27;DP=72;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00549746;FXX=0.0416609;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4547;QD=13.9534;RBI=0.0127066;REFB=-0.00115888;REVB=-0.0114558;RO=45;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245231;STB=0.523388;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00157813;OID=.;OPOS=134108453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:69:45:41:27:28:0.405797:12:15:26:19:12:16:25:16 chr8 134108546 . T C 491.45 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.012592;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.881;QD=19.4633;RBI=0.0125923;REFB=-0.00272022;REVB=-8.77081e-05;RO=48;SAF=34;SAR=17;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172954;STB=0.606853;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00177201;OID=.;OPOS=134108546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:48:50:51:51:0.50495:17:34:23:25:17:34:23:27 chr8 134114771 . C T 131.26 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0110095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.88;QD=14.1901;RBI=0.0117743;REFB=-0.00572383;REVB=0.00417434;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194053;STB=0.612754;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00290641;OID=.;OPOS=134114771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:9:6:13:9:9:6:13:9 chr8 134125682 . G A 183.02 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00477804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.069;QD=11.8074;RBI=0.00838723;REFB=-0.00977807;REVB=-0.00689319;RO=39;SAF=6;SAR=17;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157766;STB=0.591955;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0379918;OID=.;OPOS=134125682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:17:6:15:24:17:6:15:24 chr8 134260948 . A G 208.38 PASS AF=0.525;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.00831083;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.0387;QD=20.8378;RBI=0.0476192;REFB=-0.0155327;REVB=-0.0468884;RO=21;SAF=9;SAR=11;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1535;STB=0.602317;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00736959;OID=.;OPOS=134260948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:21:19:20:21:0.525:11:9:6:15:11:10:5:14 chr8 134292516 . A G 375.95 PASS AF=0.909091;AO=28;DP=32;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0404822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.7262;QD=45.5698;RBI=0.0633314;REFB=-0.118099;REVB=0.0487038;RO=4;SAF=11;SAR=17;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258326;STB=0.509272;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0100604;OID=.;OPOS=134292516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:32:33:4:3:28:30:0.909091:17:11:2:2:17:13:1:2 chr8 134310668 . G A 373.43 PASS AF=0.686275;AO=33;DP=49;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0494707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5851;QD=29.2885;RBI=0.053689;REFB=-0.0180566;REVB=0.0208605;RO=16;SAF=13;SAR=20;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102971;STB=0.542349;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00584248;OID=.;OPOS=134310668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:16:16:33:35:0.686275:20:13:9:7:20:15:9:7 chr8 135612595 . A G 222.82 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.011;QD=49.5147;RBI=0.0490376;REFB=0;REVB=0.0484656;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285349;OID=.;OPOS=135612595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0 chr8 135614705 . A G 1116.42 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3797;QD=60.347;RBI=0.0311042;REFB=0;REVB=-0.019423;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000354474;OID=.;OPOS=135614705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0 chr8 136659426 . G A 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0013255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=343.45;QD=57.6807;RBI=0.00134452;REFB=0;REVB=0.00022533;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45727e-06;OID=.;OPOS=136659426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0 chr8 139143942 . A G 740.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.954;QD=56.9941;RBI=0.031757;REFB=0;REVB=0.0121308;RO=0;SAF=15;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000420653;OID=.;OPOS=139143942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:36:15:0:0:36:16:0:0 chr8 139144914 . G A 665.57 PASS AF=0.576577;AO=63;DP=110;FAO=64;FDP=111;FR=.;FRO=47;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0027623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.538;QD=23.9845;RBI=0.0104041;REFB=-0.0339932;REVB=0.0100307;RO=47;SAF=41;SAR=22;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132588;STB=0.56691;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0281937;OID=.;OPOS=139144914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:47:47:63:64:0.576577:22:41:23:24:23:41:23:24 chr8 139164192 . G A 265.22 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00117292;FXX=0.0322529;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.264;QD=17.681;RBI=0.015082;REFB=-0.00655654;REVB=0.0150363;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356394;STB=0.519986;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00610158;OID=.;OPOS=139164192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:31:31:29:29:0.483333:12:17:17:14:12:17:17:14 chr8 139164570 . C T 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0147926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.572;QD=25.3678;RBI=0.0256056;REFB=-0.0145273;REVB=0.0209004;RO=14;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519436;STB=0.528898;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0159817;OID=.;OPOS=139164570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:12:9:7:7:12:9:7:7 chr8 139165068 . C T 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00774285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.76;QD=14.1695;RBI=0.00835395;REFB=0.013273;REVB=-0.00313637;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151473;STB=0.58807;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.0396949;OID=.;OPOS=139165068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:9:3:4:6:9:3 chr8 139165272 . TG CA,CG 936.21 PASS AF=0.5,0.5;AO=33,33;DP=66;FAO=33,33;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=16,16;FSAR=17,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113006,0.0199708;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=147.56,207.454;QD=56.7401;RBI=0.0123786,0.0306698;REFB=0,0;REVB=-0.00505251,0.0232767;RO=0;SAF=16,16;SAR=17,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.60901e-08,-4.60901e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00572607,0.00146506;OID=.,.;OPOS=139165272,139165272;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:66:66:0:0:33,33:33,33:0.5,0.5:17,17:16,16:0:0:17,17:16,16:0:0 chr8 139165289 . T C 924.12 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0132774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3508;QD=56.8689;RBI=0.0987352;REFB=-0.193402;REVB=0.0978383;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00241156;OID=.;OPOS=139165289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:35:29:0:0:35:29:0:1 chr8 139626176 . C G 1912.95 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6934;QD=61.7079;RBI=0.0310513;REFB=0;REVB=-0.0152537;RO=0;SAF=51;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215228;OID=.;OPOS=139626176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:73:51:0:0:73:51:0:0 chr8 139647262 . A G 260.1 PASS AF=0.447761;AO=28;DP=65;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.00855884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.798;QD=15.5286;RBI=0.0112941;REFB=-0.0172785;REVB=0.00736908;RO=35;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221764;STB=0.631391;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0231545;OID=.;OPOS=139647262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:35:37:28:30:0.447761:12:16:12:23:13:17:12:25 chr8 139672671 . T C 670.23 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.2;QD=62.3472;RBI=0.0236499;REFB=0;REVB=-0.00869404;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132012;OID=.;OPOS=139672671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:30:13:0:0:30:13:0:0 chr8 139691926 . G A 93.54 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00671773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.7439;QD=10.1125;RBI=0.0415579;REFB=-0.0235718;REVB=-0.0410114;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208428;STB=0.596253;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0454005;OID=.;OPOS=139691926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:35:37:23:25:12:12:0.324324:5:7:9:14:5:7:11:14 chr8 139697478 . T C 1715.62 PASS AF=0.463351;AO=172;DP=379;FAO=177;FDP=382;FR=.;FRO=205;FSAF=85;FSAR=92;FSRF=101;FSRR=104;FWDB=0.0196703;FXX=0.00779201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.645;QD=17.9646;RBI=0.0215833;REFB=-0.0174808;REVB=-0.00888361;RO=197;SAF=80;SAR=92;SRF=94;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117094;STB=0.506691;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0229436;OID=.;OPOS=139697478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:382:197:205:172:177:0.463351:92:80:94:103:92:85:101:104 chr8 139701209 . G T 673.32 PASS AF=0.503759;AO=67;DP=133;FAO=67;FDP=133;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00604149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.436;QD=20.2503;RBI=0.0157472;REFB=-0.0211929;REVB=-0.0145422;RO=66;SAF=28;SAR=39;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00817333;STB=0.504503;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0192118;OID=.;OPOS=139701209;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:66:66:67:67:0.503759:39:28:27:39:39:28:27:39 chr8 139712323 . A G 834.32 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.52;QD=57.539;RBI=0.0112741;REFB=0;REVB=-0.00483074;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01813e-05;OID=.;OPOS=139712323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr8 139737662 . C CG,G 39.61 PASS AF=0.16,0.02;AO=6,2;DP=50;FAO=8,1;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=5,0;FSAR=3,1;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0708994,0.0601928;FXX=0.019604;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=29.6096,72.0587;QD=3.16902;RBI=0.0906824,0.0710985;REFB=-0.0127958,-0.00242047;REVB=-0.0565382,-0.0378395;RO=39;SAF=3,0;SAR=3,2;SRF=16;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.10641,-0.381836;STB=0.671228,0.988354;STBP=0.332,0.48;TYPE=ins,snp;VARB=0.112466,0.0611532;OID=.,.;OPOS=139737663,139737662;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:50:50:39:41:6,2:8,1:0.16,0.02:3,2:3,0:16:23:3,1:5,0:17:24 chr8 139749799 . G T 250.51 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0359824;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2466;QD=16.7003;RBI=0.0462024;REFB=-0.00630339;REVB=-0.0289815;RO=32;SAF=10;SAR=18;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806023;STB=0.545182;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00769632;OID=.;OPOS=139749799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:32:32:28:28:0.466667:18:10:9:23:18:10:9:23 chr8 139768085 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.737;QD=53.911;RBI=0.0249884;REFB=0;REVB=-0.0213206;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3507e-05;OID=.;OPOS=139768085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr8 139824057 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.601;QD=60.2298;RBI=0.042465;REFB=0;REVB=0.0400024;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293055;OID=.;OPOS=139824057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr8 139838912 . T C 1473.3 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.811;QD=63.3677;RBI=0.0550898;REFB=0;REVB=0.0540641;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197237;OID=.;OPOS=139838912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:45:47:0:0:46:47:0:0 chr8 140945896 . G A 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0179424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.704;QD=15.6454;RBI=0.0264412;REFB=-0.0376832;REVB=-0.0194219;RO=29;SAF=17;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259387;STB=0.649533;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.03179;OID=.;OPOS=140945896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:5:17:16:13:5:17:16:13 chr8 141310644 . G A 694.94 PASS AF=0.396907;AO=77;DP=196;FAO=77;FDP=194;FR=.;FRO=117;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=68;FSRR=49;FWDB=-0.0152443;FXX=0.0102036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.078;QD=14.3287;RBI=0.0153941;REFB=0.00445039;REVB=0.00214217;RO=114;SAF=46;SAR=31;SRF=66;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020285;STB=0.510117;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.00785813;OID=.;OPOS=141310644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:194:114:117:77:77:0.396907:31:46:66:48:31:46:68:49 chr8 141461062 . G A 613.64 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0853285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9942;QD=61.3644;RBI=0.1086;REFB=0;REVB=0.0671788;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186428;OID=.;OPOS=141461062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:23:16:0:0:24:16:0:0 chr8 141461185 . A G 304.47 PASS AF=1;AO=15;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.814;QD=46.8416;RBI=0.0498395;REFB=0;REVB=0.0480737;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00873028;OID=.;OPOS=141461185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:15:26:1:4:11:0:0:15:11:0:0 chr8 141461266 . A G 765.37 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7051;QD=55.6629;RBI=0.034103;REFB=0;REVB=-0.0251891;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00499531;OID=.;OPOS=141461266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:55:0:0:52:55:1:25:27:0:0:26:29:0:0 chr8 141559358 . G A 742.72 PASS AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00258337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.335;QD=53.0517;RBI=0.0361902;REFB=-0.0396922;REVB=0.0360979;RO=2;SAF=29;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031395;STB=0.516661;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00220243;OID=.;OPOS=141559358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:25:29:2:0:25:29:2:0 chr8 141566311 . C T 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.777;QD=57.1046;RBI=0.0395148;REFB=0;REVB=0.0223866;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017264;OID=.;OPOS=141566311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0 chr8 141568622 . G A 1736.72 PASS AF=0.991379;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00412402;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9722;QD=59.887;RBI=0.0167001;REFB=-0.0736808;REVB=-0.0161829;RO=0;SAF=53;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19391e-08;STB=0.503999;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000479225;OID=.;OPOS=141568622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:117:116:0:1:115:115:0.991379:62:53:0:0:62:53:0:1 chr8 141679817 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.007;QD=54.5161;RBI=0.0241223;REFB=0;REVB=0.000651707;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151834;OID=.;OPOS=141679817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr8 142146708 . T C 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.945;QD=62.0213;RBI=0.0115256;REFB=0;REVB=0.00457436;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28745e-05;OID=.;OPOS=142146708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr8 142152442 . A G 1519.5 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.408;QD=59.5882;RBI=0.0828243;REFB=0;REVB=0.076854;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357988;OID=.;OPOS=142152442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:51:50:0:0:52:50:0:0 chr8 142154291 . G A 1112.06 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.763;QD=60.1111;RBI=0.0152414;REFB=0;REVB=0.0101074;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46431e-05;OID=.;OPOS=142154291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:31:42:0:0:31:43:0:0 chr8 142161032 . A C 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.537;QD=60.7158;RBI=0.025384;REFB=0;REVB=-0.0196955;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.52087e-06;OID=.;OPOS=142161032;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chr8 142161873 . C T 568.44 PASS AF=0.95122;AO=36;DP=40;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.136011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4957;QD=55.4576;RBI=0.136589;REFB=-0.0296539;REVB=0.0125554;RO=2;SAF=6;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301943;STB=0.515617;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00397903;OID=.;OPOS=142161873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:41:2:2:36:39:0.95122:30:6:0:2:31:8:0:2 chr8 142161888 . G A 501.3 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.641;QD=58.9764;RBI=0.0204286;REFB=0;REVB=-0.0107309;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91862e-05;OID=.;OPOS=142161888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:25:9:0:0:25:9:0:0 chr8 142200467 . G A 683.0 PASS AF=0.961538;AO=49;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0097454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.427;QD=52.5382;RBI=0.0189808;REFB=-0.00657153;REVB=0.016288;RO=2;SAF=23;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391734;STB=0.519992;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000354501;OID=.;OPOS=142200467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:52:2:2:49:50:0.961538:26:23:2:0:26:24:2:0 chr8 142202856 . C T 557.35 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.902;QD=60.2541;RBI=0.102556;REFB=0;REVB=0.018624;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322599;OID=.;OPOS=142202856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:37:1:0:34:37:1:18:16:1:0:18:19:0:0 chr8 142202884 . T C 545.24 PASS AF=0.973684;AO=29;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0415062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.559;QD=57.3931;RBI=0.0435506;REFB=-0.0877452;REVB=0.0131869;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517232;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00269723;OID=.;OPOS=142202884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:0:1:29:37:0.973684:22:7:0:0:23:14:1:0 chr8 142204326 . C G 358.0 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.746;QD=55.0771;RBI=0.0505017;REFB=0;REVB=0.0504817;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67299e-05;OID=.;OPOS=142204326;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:10:16:0:0 chr8 142218119 . G A 446.73 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0753;QD=57.6423;RBI=0.0444888;REFB=0;REVB=0.0444638;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000434653;OID=.;OPOS=142218119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:10:20:0:0:10:21:0:0 chr8 142221361 . C G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.832;QD=50.4135;RBI=0.00654413;REFB=0;REVB=0.00566361;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41437e-05;OID=.;OPOS=142221361;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr8 142222374 . A G 1799.6 PASS AF=1;AO=117;DP=121;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465606;FXX=0.0330551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1063;QD=61.5249;RBI=0.0327023;REFB=0;REVB=-0.0323692;RO=0;SAF=57;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136377;OID=.;OPOS=142222374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:117:0:0:117:117:1:60:57:0:0:60:57:0:0 chr8 142222445 . T C 2314.65 PASS AF=0.993197;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0217505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.119;QD=62.9837;RBI=0.0268184;REFB=0.00945955;REVB=0.0156889;RO=0;SAF=52;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502645;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-1.33043e-05;OID=.;OPOS=142222445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:147:147:0:1:146:146:0.993197:94:52:0:0:94:52:0:1 chr8 142228809 . T C 501.5 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7255;QD=58.9994;RBI=0.0472013;REFB=0;REVB=0.0216148;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000271038;OID=.;OPOS=142228809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr8 142228909 . G A 403.14 PASS AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0518463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.2;QD=48.8659;RBI=0.067551;REFB=-0.0642544;REVB=0.0433024;RO=2;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581794;STB=0.545424;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00425248;OID=.;OPOS=142228909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:33:33:2:3:30:30:0.909091:15:15:0:2:15:15:0:3 chr8 142229891 . A G 2406.33 PASS AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371589;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.057;QD=61.3078;RBI=0.0394667;REFB=0;REVB=0.0132979;RO=0;SAF=78;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67162e-05;OID=.;OPOS=142229891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:79:78:0:0:79:78:0:0 chr8 142266691 . A C 1676.44 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.093;QD=59.8727;RBI=0.0297508;REFB=0;REVB=0.024171;RO=0;SAF=55;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273208;OID=.;OPOS=142266691;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:112:0:0:109:112:1:54:55:0:0:57:55:0:0 chr8 142367335 . T C 53.39 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0311568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8492;QD=7.62781;RBI=0.0851211;REFB=-0.0387823;REVB=-0.0792141;RO=20;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398056;STB=0.749375;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0393416;OID=.;OPOS=142367335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:6:2:12:8:6:2:12:8 chr8 142367400 . G A 159.49 PASS AF=0.472222;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0146513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.963;QD=17.7214;RBI=0.0170903;REFB=-0.0169993;REVB=0.00879878;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557722;STB=0.519977;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0207296;OID=.;OPOS=142367400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:16:17:0.472222:11:5:5:14:12:5:5:14 chr8 142367559 . G A 124.12 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0121077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.424;QD=17.12;RBI=0.0219843;REFB=-0.0200975;REVB=0.0183497;RO=15;SAF=10;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34729;STB=0.69971;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0114145;OID=.;OPOS=142367559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:4:10:5:10:4:10:5:10 chr8 142446923 . C T 746.76 PASS AF=0.489933;AO=73;DP=150;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0275103;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.476;QD=20.0472;RBI=0.0280693;REFB=-0.0283427;REVB=0.00557404;RO=75;SAF=32;SAR=41;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263058;STB=0.518211;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0236538;OID=.;OPOS=142446923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:75:76:73:73:0.489933:41:32:35:40:41:32:36:40 chr8 142458039 . C T 661.51 PASS AF=0.647727;AO=57;DP=88;FAO=57;FDP=88;FR=.;FRO=31;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0496637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5877;QD=30.0686;RBI=0.0667506;REFB=-0.022004;REVB=-0.0445999;RO=31;SAF=33;SAR=24;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202878;STB=0.510999;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0118433;OID=.;OPOS=142458039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:31:31:57:57:0.647727:24:33:17:14:24:33:17:14 chr8 142458053 . A G 185.41 PASS AF=0.277108;AO=20;DP=85;FAO=23;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0231455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.515;QD=8.93542;RBI=0.0612722;REFB=-0.014411;REVB=0.0567324;RO=52;SAF=17;SAR=3;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366537;STB=0.614352;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0172257;OID=.;OPOS=142458053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:83:52:52:20:23:0.277108:3:17:32:20:6:17:31:21 chr8 142459814 . C T 1539.84 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.849;QD=59.7995;RBI=0.0253685;REFB=0;REVB=0.0175638;RO=0;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.55797e-07;OID=.;OPOS=142459814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:55:48:0:0:55:48:0:0 chr8 142488837 . G A 449.21 PASS AF=0.517647;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0122997;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.468;QD=21.1395;RBI=0.0284718;REFB=-0.0110938;REVB=0.025678;RO=41;SAF=16;SAR=28;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19628;STB=0.608646;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.013818;OID=.;OPOS=142488837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:41:41:44:44:0.517647:28:16:24:17:28:16:24:17 chr8 142489410 . A G 760.16 PASS AF=0.52518;AO=73;DP=138;FAO=73;FDP=139;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0232942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3967;QD=21.875;RBI=0.0292913;REFB=-0.016671;REVB=-0.0177583;RO=64;SAF=27;SAR=46;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128152;STB=0.57836;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0168669;OID=.;OPOS=142489410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:64:66:73:73:0.52518:46:27:33:31:46:27:35:31 chr8 142490079 . G A 1138.2 PASS AF=0.987013;AO=53;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010073;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.945;QD=59.127;RBI=0.0217433;REFB=0;REVB=0.0192693;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262829;OID=.;OPOS=142490079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:77:0:0:53:76:0.987013:18:35:0:0:32:44:0:0 chr8 142490080 . T A 144.54 PASS AF=0.265823;AO=20;DP=78;FAO=21;FDP=79;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.00416178;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=88.8329;QD=7.31858;RBI=0.0424196;REFB=-0.00679549;REVB=0.0422149;RO=58;SAF=7;SAR=13;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36058;STB=0.693563;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00240606;OID=.;OPOS=142490080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:58:58:20:21:0.265823:13:7:38:20:13:8:38:20 chr8 142490120 . G T 1093.14 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179967;FXX=0.0266631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5167;QD=59.8979;RBI=0.0276641;REFB=0;REVB=0.0210101;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556551;OID=.;OPOS=142490120;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:32:38:0:0:33:40:0:0 chr8 142505038 . T C 218.06 PASS AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.00665761;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.027;QD=11.477;RBI=0.0246903;REFB=-0.0213626;REVB=-0.0237758;RO=49;SAF=10;SAR=17;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223916;STB=0.629534;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0348222;OID=.;OPOS=142505038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:17:10:28:21:17:10:28:21 chr8 142505578 . C A 678.91 PASS AF=0.515385;AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.0596278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1465;QD=20.8895;RBI=0.0597625;REFB=-0.00549743;REVB=0.00401064;RO=60;SAF=23;SAR=44;SRF=19;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256389;STB=0.513995;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00406202;OID=.;OPOS=142505578;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:60:63:67:67:0.515385:44:23:19:41:44:23:20:43 chr8 142506461 . A G 529.63 PASS AF=0.631579;AO=47;DP=75;FAO=48;FDP=76;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0390284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.436;QD=27.875;RBI=0.0456632;REFB=-0.0253784;REVB=-0.0237048;RO=28;SAF=20;SAR=27;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048341;STB=0.522718;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0152136;OID=.;OPOS=142506461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:28:28:47:48:0.631579:27:20:10:18:28:20:10:18 chr8 143329060 . G A 240.14 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0159292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.062;QD=16.5616;RBI=0.0215224;REFB=-0.0134469;REVB=0.0144732;RO=30;SAF=13;SAR=14;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235121;STB=0.620954;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0165419;OID=.;OPOS=143329060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:31:27:27:0.465517:14:13:22:8:14:13:22:9 chr8 143413136 . C T 352.94 PASS AF=0.392523;AO=42;DP=107;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0134165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.387;QD=13.1941;RBI=0.0143315;REFB=-0.00201288;REVB=0.00503867;RO=65;SAF=27;SAR=15;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116755;STB=0.566401;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00237124;OID=.;OPOS=143413136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:65:65:42:42:0.392523:15:27:35:30:15:27:35:30 chr8 143425720 . T C 356.02 PASS AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0493644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.459;QD=30.2997;RBI=0.0509124;REFB=-0.0366085;REVB=0.0124591;RO=16;SAF=15;SAR=15;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119166;STB=0.574419;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0129007;OID=.;OPOS=143425720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:17:30:30:0.638298:15:15:11:5:15:15:12:5 chr8 143427178 . C G 294.81 PASS AF=0.484848;AO=29;DP=63;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00502791;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.092;QD=17.867;RBI=0.0462433;REFB=-0.00795998;REVB=0.0459692;RO=29;SAF=20;SAR=9;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.537886;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00506307;OID=.;OPOS=143427178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:66:29:34:29:32:0.484848:9:20:20:9:11:21:20:14 chr8 143436034 . A G 294.92 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0112044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.319;QD=17.8737;RBI=0.0139484;REFB=-0.00818859;REVB=0.00830776;RO=34;SAF=11;SAR=21;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020802;STB=0.511621;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0129748;OID=.;OPOS=143436034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:21:11:11:23:21:11:11:23 chr8 143603418 . G C 1587.0 PASS AF=0.973214;AO=108;DP=112;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0588832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9241;QD=56.6786;RBI=0.0652525;REFB=-0.00695679;REVB=0.0281186;RO=3;SAF=68;SAR=40;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342704;STB=0.517644;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00164751;OID=.;OPOS=143603418;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:112:112:3:3:108:109:0.973214:40:68:0:3:41:68:0:3 chr8 143623372 . C A 655.44 PASS AF=0.674699;AO=56;DP=83;FAO=56;FDP=83;FR=.;FRO=27;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00262765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.446;QD=31.5873;RBI=0.00678053;REFB=-0.0311828;REVB=0.00625069;RO=27;SAF=33;SAR=23;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721748;STB=0.538968;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0147232;OID=.;OPOS=143623372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:27:27:56:56:0.674699:23:33:19:8:23:33:19:8 chr8 143694775 . G C 859.92 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.714;QD=57.3279;RBI=0.0436021;REFB=0;REVB=0.0367227;RO=0;SAF=19;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136085;OID=.;OPOS=143694775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:40:19:0:0:40:20:0:0 chr8 143746087 . CCA C 439.02 PASS AF=0.948718;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00485463;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=296.913;QD=45.0277;RBI=0.0242339;REFB=-0.0814407;REVB=0.0237427;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.500693;STBP=0.87;TYPE=del;VARB=0.00106746;OID=.;OPOS=143746088;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.948718:37:38:37:39:2:18:19:1:1:4:0:18:19:0:0 chr8 143808951 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.866;QD=46.848;RBI=0.0352232;REFB=0;REVB=-0.0158709;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175627;OID=.;OPOS=143808951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr8 143867905 . C T 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00368401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.125;QD=11.4397;RBI=0.00385471;REFB=-0.0248094;REVB=-0.00113439;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175766;STB=0.605818;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0279857;OID=.;OPOS=143867905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:7:7:3:6:7:7 chr8 143922620 . C T 234.12 PASS AF=0.333333;AO=29;DP=87;FAO=29;FDP=87;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=16;FWDB=0.00775794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1629;QD=10.7643;RBI=0.0238128;REFB=-0.0147743;REVB=-0.0225136;RO=57;SAF=16;SAR=13;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221706;STB=0.618972;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.041744;OID=.;OPOS=143922620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:57:58:29:29:0.333333:13:16:42:15:13:16:42:16 chr8 143956693 . G A 69.52 PASS AF=0.232558;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0336687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.163;QD=6.46678;RBI=0.0369517;REFB=-0.0072501;REVB=-0.0152266;RO=30;SAF=3;SAR=7;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246252;STB=0.689757;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0357493;OID=.;OPOS=143956693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:43:43:30:33:10:10:0.232558:7:3:15:15:7:3:18:15 chr8 143957163 . C G 237.06 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0299533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2541;QD=19.7551;RBI=0.0333928;REFB=-0.00844035;REVB=-0.0147608;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465511;STB=0.526293;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0161198;OID=.;OPOS=143957163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:9:14:14:11:9:14:14:11 chr8 143959188 . G T 188.6 PASS AF=0.383333;AO=20;DP=58;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0452257;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.965;QD=12.5733;RBI=0.0456634;REFB=-0.0226708;REVB=0.00630676;RO=37;SAF=15;SAR=5;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23078;STB=0.555506;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0368781;OID=.;OPOS=143959188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:37:37:20:23:0.383333:5:15:21:16:8:15:21:16 chr8 143959250 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7976;QD=59.3222;RBI=0.036294;REFB=0;REVB=-0.0349352;RO=1;SAF=34;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136967;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000239188;OID=.;OPOS=143959250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:1:0:67:68:1:33:34:1:0:33:35:0:0 chr8 143960597 . G A 219.06 PASS AF=0.714286;AO=18;DP=27;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.140398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.8526;QD=31.2936;RBI=0.179248;REFB=-0.0556449;REVB=0.111438;RO=8;SAF=4;SAR=14;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393627;STB=0.668944;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0290251;OID=.;OPOS=143960597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:28:8:8:18:20:0.714286:14:4:7:1:14:6:7:1 chr8 143961005 . T C 679.46 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00602352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.761;QD=61.7694;RBI=0.0370907;REFB=0;REVB=0.0365983;RO=0;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35085e-05;OID=.;OPOS=143961005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:44:0:0:41:44:1:10:31:0:0:11:33:0:0 chr8 143961102 . C T 173.37 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0168837;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.032;QD=18.2497;RBI=0.0329585;REFB=-0.0192467;REVB=-0.0283055;RO=17;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267745;STB=0.659828;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0172792;OID=.;OPOS=143961102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:17:20:18:18:0.473684:7:11:5:12:7:11:6:14 chr8 143961141 . C T 127.84 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0252487;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.817;QD=18.9398;RBI=0.0374472;REFB=-0.0319283;REVB=0.0276549;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21949;STB=0.624826;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0151786;OID=.;OPOS=143961141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:4:9:6:8:4:9 chr8 143994041 . C T 422.7 PASS AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0106614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.038;QD=14.9628;RBI=0.0251621;REFB=-0.00872651;REVB=-0.0227918;RO=65;SAF=17;SAR=31;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192757;STB=0.608486;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0175805;OID=.;OPOS=143994041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:31:17:35:30:31:17:35:30 chr8 143994702 . G T 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.786;QD=54.5144;RBI=0.0687087;REFB=0;REVB=0.0558131;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000850711;OID=.;OPOS=143994702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr8 143995761 . C T 817.12 PASS AF=0.534722;AO=77;DP=144;FAO=77;FDP=144;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.00245392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.762;QD=22.6977;RBI=0.007581;REFB=-0.034108;REVB=0.00717285;RO=67;SAF=43;SAR=34;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689699;STB=0.537782;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.027041;OID=.;OPOS=143995761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:67:67:77:77:0.534722:34:43:32:35:34:43:32:35 chr8 143996539 . T C 625.62 PASS AF=0.617978;AO=55;DP=90;FAO=55;FDP=89;FR=.;FRO=34;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0367533;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4598;QD=28.1179;RBI=0.068901;REFB=-0.0213033;REVB=-0.0582798;RO=34;SAF=32;SAR=23;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375369;STB=0.520426;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0133457;OID=.;OPOS=143996539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:34:34:55:55:0.617978:23:32:18:16:23:32:18:16 chr8 143996553 . G A 544.05 PASS AF=0.595238;AO=47;DP=81;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0305946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.407;QD=25.907;RBI=0.0319977;REFB=-0.0253956;REVB=0.00937164;RO=34;SAF=24;SAR=23;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143982;STB=0.504309;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0180981;OID=.;OPOS=143996553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:34:34:47:50:0.595238:23:24:18:16:23:27:18:16 chr8 143997877 . C G 232.01 PASS AF=0.322222;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=0.00671202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.38;QD=10.3116;RBI=0.0191959;REFB=-0.019326;REVB=-0.0179842;RO=59;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129263;STB=0.57964;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0377496;OID=.;OPOS=143997877;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:59:61:29:29:0.322222:21:8:22:37:21:8:23:38 chr8 144124609 . T C 287.62 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.342;QD=52.2942;RBI=0.0423521;REFB=0;REVB=-0.0383124;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232204;OID=.;OPOS=144124609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:9:13:0:0 chr8 144239859 . A G 402.06 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=0.00132732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.276;QD=16.5799;RBI=0.024055;REFB=-0.00806701;REVB=0.0240183;RO=55;SAF=31;SAR=11;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102477;STB=0.55786;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0118567;OID=.;OPOS=144239859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:11:31:36:19:11:31:36:19 chr8 144240257 . C G 487.17 PASS AF=0.421875;AO=54;DP=128;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=0.0197275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9713;QD=15.2239;RBI=0.0203187;REFB=0.0172519;REVB=0.00486554;RO=73;SAF=24;SAR=30;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188566;STB=0.601338;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0249512;OID=.;OPOS=144240257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:73:74:54:54:0.421875:30:24:46:27:30:24:46:28 chr8 144295154 . C T 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.020768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.938;QD=14.6539;RBI=0.0266561;REFB=-0.0518285;REVB=0.0167105;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105859;STB=0.562346;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0257219;OID=.;OPOS=144295154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:3:5:4:4:3:5 chr8 144295782 . G T 620.9 PASS AF=0.496063;AO=62;DP=126;FAO=63;FDP=127;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.0908334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1256;QD=19.5558;RBI=0.125098;REFB=0.00634271;REVB=0.0860164;RO=64;SAF=24;SAR=38;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919157;STB=0.545207;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00472709;OID=.;OPOS=144295782;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:64:64:62:63:0.496063:38:24:31:33:38:25:31:33 chr8 144332012 . T C 728.82 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8925;QD=57.1621;RBI=0.0479657;REFB=0;REVB=0.00392824;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000366648;OID=.;OPOS=144332012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:28:22:0:0:29:22:0:0 chr8 144332082 . T C 676.37 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.592;QD=61.4877;RBI=0.0454036;REFB=0;REVB=0.0193096;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542833;OID=.;OPOS=144332082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:23:21:0:0 chr8 144333315 . G A 1477.54 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287473;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.355;QD=58.5165;RBI=0.0408251;REFB=-0.0218513;REVB=0.0289875;RO=1;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939351;STB=0.50495;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.000208965;OID=.;OPOS=144333315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:101:1:1:100:100:0.990099:50:50:0:1:50:50:0:1 chr8 144333434 . G A 810.87 PASS AF=0.936508;AO=59;DP=64;FAO=59;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0961956;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.046;QD=51.4841;RBI=0.101945;REFB=-0.0934296;REVB=0.0337529;RO=1;SAF=23;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200708;STB=0.539986;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0012502;OID=.;OPOS=144333434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:64:63:1:4:59:59:0.936508:36:23:1:0:36:23:4:0 chr8 144351631 . CA C,CG 1065.59 PASS AF=0.0138889,0.986111;AO=12,57;DP=71;FAO=1,71;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=1,30;FSAR=0,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346657,0.0324911;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=211.675,220.511;QD=59.1994;RBI=0.0468563,0.0429564;REFB=0,0;REVB=0.0315247,0.0280994;RO=0;SAF=4,27;SAR=8,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0278556,0.00219544;OID=.,.;OPOS=144351632,144351632;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0138889,0.986111:12,57:71:1,71:72:0:1,30:0,41:0:0:4:0:4,27:8,30:0:0 chr8 144357213 . G C 501.6 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.893;QD=59.0123;RBI=0.0358949;REFB=0;REVB=0.029941;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25531e-05;OID=.;OPOS=144357213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0 chr8 144358381 . G A 142.01 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316583;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=76.3354;QD=43.6949;RBI=0.100789;REFB=0;REVB=0.0956878;RO=1;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128042;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174189;OID=.;OPOS=144358381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:1:0:12:13:1:3:9:0:1:4:9:0:0 chr8 144378184 . C G 81.8 PASS AF=0.9;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00842395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.758;QD=32.7207;RBI=0.113734;REFB=-0.072697;REVB=0.113422;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080241;STB=0.545355;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00153917;OID=.;OPOS=144378184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:10:1:1:8:9:0.9:3:5:1:0:4:5:1:0 chr8 144378868 . A G 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6444;QD=37.4853;RBI=0.12821;REFB=0;REVB=0.116849;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0137816;OID=.;OPOS=144378868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr8 144391924 . CT TC 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270001;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=152.869;QD=43.4857;RBI=0.0271166;REFB=0;REVB=0.0025111;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000465659;OID=.;OPOS=144391924;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0 chr8 144391930 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.182;QD=44.6898;RBI=0.0062688;REFB=0;REVB=-0.00453684;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.85558e-06;OID=.;OPOS=144391930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:11:2:0:0:11:2:0:0 chr8 144392368 . G A 71.21 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0990563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.633;QD=35.6034;RBI=0.10102;REFB=0;REVB=-0.0198213;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116509;OID=.;OPOS=144392368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:1:6:0:0:1:7:0:0 chr8 144409934 . C A 2580.93 PASS AF=0.977011;AO=170;DP=174;FAO=170;FDP=174;FR=.;FRO=4;FSAF=93;FSAR=77;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0196267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.918;QD=59.3316;RBI=0.0251862;REFB=-0.00256779;REVB=0.015784;RO=4;SAF=93;SAR=77;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020027;STB=0.510525;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00020956;OID=.;OPOS=144409934;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:174:174:4:4:170:170:0.977011:77:93:4:0:77:93:4:0 chr8 144409938 . A AG,G 2434.82 PASS AF=0.988024,0.011976;AO=152,7;DP=173;FAO=165,2;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=92,2;FSAR=73,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021393,0.0166814;FXX=0.00595203;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=24.8524,4.78506;QD=58.3191;RBI=0.0393156,0.0167553;REFB=0,0;REVB=-0.0392574,0.00157152;RO=8;SAF=84,7;SAR=68,0;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0189917,0.739967;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000599889,-0.0291291;OID=.,.;OPOS=144409939,144409938;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:173:167:8:0:152,7:165,2:0.988024,0.011976:68,0:84,7:6:2:73,0:92,2:0:0 chr8 144620183 . T C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.263;QD=53.908;RBI=0.102409;REFB=0;REVB=0.100979;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00092591;OID=.;OPOS=144620183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr8 144623574 . T C 1566.13 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.031;QD=59.662;RBI=0.0433913;REFB=0;REVB=-0.0338967;RO=0;SAF=52;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.49634e-05;OID=.;OPOS=144623574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:53:52:0:0:53:52:0:0 chr8 144642178 . T C 631.42 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.511;QD=61.6022;RBI=0.110503;REFB=0;REVB=0.00862862;RO=0;SAF=3;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298909;OID=.;OPOS=144642178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:37:3:0:0:37:4:0:0 chr8 144642596 . T C 191.15 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676154;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3988;QD=47.7872;RBI=0.0686499;REFB=0;REVB=-0.0118725;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215734;OID=.;OPOS=144642596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr8 144642626 . A G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00963308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.911;QD=47.8223;RBI=0.0412632;REFB=0;REVB=-0.040123;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120059;OID=.;OPOS=144642626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr8 144649968 . C T 859.24 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367073;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8161;QD=57.2826;RBI=0.0890453;REFB=0;REVB=0.0811273;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017801;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109299;OID=.;OPOS=144649968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:1:0:59:60:1:26:33:0:1:27:33:0:0 chr8 144650342 . G A 163.95 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0117299;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.904;QD=20.4942;RBI=0.0119002;REFB=-0.0177855;REVB=-0.00200631;RO=13;SAF=12;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605684;STB=0.521713;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0129957;OID=.;OPOS=144650342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:32:13:15:17:17:0.53125:5:12:10:3:5:12:10:5 chr8 144654249 . G A 923.51 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0444359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.907;QD=56.8311;RBI=0.0454391;REFB=-0.109454;REVB=0.00949541;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.509088;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000583048;OID=.;OPOS=144654249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:37:27:0:0:37:27:1:0 chr8 144654255 . A G 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0034537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.989;QD=59.3228;RBI=0.0662508;REFB=0;REVB=-0.0661607;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350578;OID=.;OPOS=144654255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0 chr8 144654594 . G T 239.36 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7084;QD=50.3918;RBI=0.0308307;REFB=0;REVB=-0.0148723;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00137673;OID=.;OPOS=144654594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr8 144654693 . G C 696.01 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00652913;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=150.82;QD=60.5222;RBI=0.0313857;REFB=-0.0824367;REVB=0.030699;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000369331;OID=.;OPOS=144654693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:46:46:0:1:45:45:0.978261:17:28:0:0:17:28:1:0 chr8 144658711 . G A 1016.09 PASS AF=0.972222;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0178694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.9246;QD=56.4495;RBI=0.018063;REFB=-0.0365816;REVB=-0.00263731;RO=1;SAF=27;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171851;STB=0.517236;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00199799;OID=.;OPOS=144658711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:70:72:1:2:69:70:0.972222:42:27:1:0:42:28:2:0 chr8 144662353 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.011;QD=54.5177;RBI=0.032712;REFB=0;REVB=0.0287649;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181446;OID=.;OPOS=144662353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0 chr8 144671244 . C A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.207;QD=56.1916;RBI=0.0578314;REFB=0;REVB=0.052182;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025277;OID=.;OPOS=144671244;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0 chr8 144671685 . G C 214.2 PASS AF=0.947368;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0358074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.748;QD=45.0946;RBI=0.041213;REFB=-0.0501309;REVB=0.0204044;RO=1;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129916;STB=0.571342;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00452733;OID=.;OPOS=144671685;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:19:1:1:17:18:0.947368:3:14:0:1:3:15:0:1 chr8 144671922 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7989;QD=35.5759;RBI=0.0958753;REFB=0;REVB=0.092991;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00573558;OID=.;OPOS=144671922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr8 144681777 . G T 1331.06 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0279896;FXX=0.0224694;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.0589;QD=61.198;RBI=0.0290995;REFB=0.0407192;REVB=-0.00796004;RO=1;SAF=40;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116972;STB=0.506171;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000831448;OID=.;OPOS=144681777;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:87:87:1:1:86:86:0.988506:46:40:1:0:46:40:1:0 chr8 144682311 . G C 2325.22 PASS AF=0.975;AO=156;DP=160;FAO=156;FDP=160;FR=.;FRO=4;FSAF=79;FSAR=77;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0172523;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.78;QD=58.1305;RBI=0.0206509;REFB=-0.0616283;REVB=0.0113497;RO=3;SAF=79;SAR=77;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00575227;STB=0.506091;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=8.19951e-06;OID=.;OPOS=144682311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:160:160:3:4:156:156:0.975:77:79:2:1:77:79:3:1 chr8 144688736 . C G 490.11 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00395837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.918;QD=56.0121;RBI=0.0567809;REFB=-0.0903377;REVB=0.0566428;RO=0;SAF=27;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32246e-08;STB=0.509086;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00124913;OID=.;OPOS=144688736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:7:27:0:0:7:27:1:0 chr8 144694890 . G C 75.8 PASS AF=0.366667;AO=9;DP=28;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0595296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5449;QD=10.1068;RBI=0.0667296;REFB=-0.0158505;REVB=0.0301508;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262988;STB=0.578172;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0242418;OID=.;OPOS=144694890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:28:30:19:19:9:11:0.366667:5:4:8:11:5:6:8:11 chr8 144732363 . T C 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.251;QD=63.582;RBI=0.0653986;REFB=0;REVB=0.0569359;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000514282;OID=.;OPOS=144732363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0 chr8 144732418 . A G 563.78 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0181577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.924;QD=57.8234;RBI=0.0231821;REFB=0.0392291;REVB=-0.0144121;RO=1;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253186;STB=0.513506;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=-0.000542088;OID=.;OPOS=144732418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:18:20:0:1:18:20:0:1 chr8 144735977 . T C 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.86;QD=63.5821;RBI=0.0447024;REFB=0;REVB=0.026564;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152174;OID=.;OPOS=144735977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0 chr8 144774233 . T C 135.34 PASS AF=0.292308;AO=17;DP=62;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0241643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.635;QD=8.32849;RBI=0.0251939;REFB=-0.0173799;REVB=0.00712882;RO=45;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321066;STB=0.559076;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0303001;OID=.;OPOS=144774233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:45:46:17:19:0.292308:11:6:17:28:13:6:18:28 chr8 144775871 . C A 208.77 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00354534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.086;QD=18.1536;RBI=0.0145365;REFB=-0.00333344;REVB=-0.0140975;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799634;STB=0.545411;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00435976;OID=.;OPOS=144775871;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:11:10:14:11:11:10:14:11 chr8 144776109 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.83;QD=54.5175;RBI=0.0251314;REFB=0;REVB=-0.000642485;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340499;OID=.;OPOS=144776109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0 chr8 144802735 . AG CC 739.99 PASS AF=1;AO=44;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474065;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=209.788;QD=62.9778;RBI=0.128126;REFB=0;REVB=0.119033;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000877438;OID=.;OPOS=144802735;OREF=AG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:44:47:1:16:28:0:0:18:29:0:0 chr8 144811338 . C G 522.8 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.742;QD=58.0889;RBI=0.0329566;REFB=0;REVB=0.00314845;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378055;OID=.;OPOS=144811338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:9:26:0:0:10:26:0:0 chr8 144822037 . G T 1603.65 PASS AF=0.973913;AO=109;DP=114;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.010573;FXX=0.00861995;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.771;QD=55.7792;RBI=0.0403948;REFB=-0.139144;REVB=0.0389865;RO=4;SAF=51;SAR=58;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147035;STB=0.50366;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.00128525;OID=.;OPOS=144822037;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:114:115:4:3:109:112:0.973913:58:51:1:3:59:53:1:2 chr8 144885580 . A G 1732.37 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.130621;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.7754;QD=60.785;RBI=0.14193;REFB=0;REVB=-0.0555174;RO=0;SAF=41;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154222;OID=.;OPOS=144885580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:114:0:0:113:114:1:72:41:0:0:73:41:0:0 chr8 144889172 . A G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.521;QD=63.2867;RBI=0.055851;REFB=0;REVB=0.00653568;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166476;OID=.;OPOS=144889172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr8 144890873 . A T 501.56 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00051594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.954;QD=59.0066;RBI=0.00528444;REFB=0;REVB=0.0052592;RO=0;SAF=2;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96411e-05;OID=.;OPOS=144890873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:32:2:0:0:32:2:0:0 chr8 144894496 . G A 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.205;QD=57.3853;RBI=0.0302138;REFB=0;REVB=0.00208043;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.26846e-05;OID=.;OPOS=144894496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0 chr8 144895553 . G A 640.53 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.080737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.205;QD=56.9358;RBI=0.0810242;REFB=-0.0993987;REVB=0.00681635;RO=2;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493531;STB=0.526303;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0327116;OID=.;OPOS=144895553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:18:25:0:2:18:25:0:2 chr8 144904690 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00674341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0759;QD=52.6125;RBI=0.016932;REFB=0;REVB=0.0155312;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000410283;OID=.;OPOS=144904690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:18:4:0:0:18:4:0:0 chr8 144940222 . A C 547.99 PASS AF=0.495652;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=9;FSAR=48;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0198943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.73;QD=19.0605;RBI=0.0254438;REFB=-0.0177801;REVB=-0.0158621;RO=58;SAF=9;SAR=48;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490238;STB=0.774086;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0109139;OID=.;OPOS=144940222;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:58:58:57:57:0.495652:48:9:36:22:48:9:36:22 chr8 144940230 . G C 815.85 PASS AF=0.562963;AO=76;DP=135;FAO=76;FDP=135;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0117586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.336;QD=24.1735;RBI=0.0432676;REFB=-0.030995;REVB=0.0416391;RO=59;SAF=23;SAR=53;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258394;STB=0.641397;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0231841;OID=.;OPOS=144940230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:59:59:76:76:0.562963:53:23:36:23:53:23:36:23 chr8 144940290 . C G 48.35 PASS AF=0.0867052;AO=15;DP=173;FAO=15;FDP=173;FR=.;FRO=158;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=55;FSRR=103;FWDB=0.00716769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3794;QD=1.11785;RBI=0.0292187;REFB=-0.00511836;REVB=-0.0283259;RO=156;SAF=5;SAR=10;SRF=55;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024669;STB=0.515001;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0581291;OID=.;OPOS=144940290;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:173:173:156:158:15:15:0.0867052:10:5:55:101:10:5:55:103 chr8 144940300 . G A 1629.84 PASS AF=0.77381;AO=129;DP=168;FAO=130;FDP=168;FR=.;FRO=38;FSAF=42;FSAR=88;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00399379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102;QD=38.8056;RBI=0.00803411;REFB=-0.012643;REVB=0.00697113;RO=39;SAF=41;SAR=88;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106084;STB=0.550658;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00273175;OID=.;OPOS=144940300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:39:38:129:130:0.77381:88:41:21:18:88:42:20:18 chr8 144940331 . C T 196.65 PASS AF=0.18617;AO=35;DP=189;FAO=35;FDP=188;FR=.;FRO=153;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=58;FSRR=95;FWDB=-0.00749443;FXX=0.00529073;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.364;QD=4.18406;RBI=0.00848025;REFB=-0.00033118;REVB=0.0039684;RO=151;SAF=7;SAR=28;SRF=58;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28193;STB=0.678738;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0014888;OID=.;OPOS=144940331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:151:153:35:35:0.18617:28:7:58:93:28:7:58:95 chr8 144994566 . G A 552.57 PASS AF=0.408163;AO=60;DP=147;FAO=60;FDP=147;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=0.00320419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3273;QD=15.0359;RBI=0.0452489;REFB=-0.00377301;REVB=0.0451353;RO=87;SAF=30;SAR=30;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181419;STB=0.510201;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0121314;OID=.;OPOS=144994566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:87:87:60:60:0.408163:30:30:45:42:30:30:45:42 chr8 145027872 . G C 618.95 PASS AF=0.496124;AO=63;DP=127;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=0.00120785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5795;QD=19.1924;RBI=0.0446558;REFB=-0.0152697;REVB=-0.0446394;RO=64;SAF=34;SAR=29;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123026;STB=0.566434;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0150965;OID=.;OPOS=145027872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:129:64:65:63:64:0.496124:29:34:43:21:30:34:43:22 chr8 145066886 . A G 692.96 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090531;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.893;QD=62.9959;RBI=0.0131009;REFB=0;REVB=-0.00946972;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.25519e-05;OID=.;OPOS=145066886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr8 145107795 . G A 854.42 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0183275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.42;QD=56.0278;RBI=0.0193561;REFB=-0.0429562;REVB=0.00622574;RO=1;SAF=21;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219399;STB=0.511624;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=9.90774e-05;OID=.;OPOS=145107795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:39:21:1:0:39:21:1:0 chr8 145150832 . A G 223.18 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.204;QD=49.5944;RBI=0.0478917;REFB=0;REVB=0.0174058;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488914;OID=.;OPOS=145150832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr8 145160646 . T C 613.98 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.552;QD=61.3979;RBI=0.0272269;REFB=0;REVB=0.00489958;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97579e-05;OID=.;OPOS=145160646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:18:21:0:0:19:21:0:0 chr8 145161823 . G A 147.49 PASS AF=0.882353;AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.03369;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=138.233;QD=34.7043;RBI=0.0926809;REFB=-0.174729;REVB=0.0863408;RO=2;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347762;STB=0.52171;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00304864;OID=.;OPOS=145161823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:16:17:2:2:14:15:0.882353:5:9:1:1:5:10:1:1 chr8 145161896 . T C 465.98 PASS AF=0.916667;AO=32;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000884142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.107;QD=51.7759;RBI=0.00128533;REFB=-0.0709676;REVB=-0.000932929;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444293;STB=0.522714;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0214956;OID=.;OPOS=145161896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:2:2:32:33:0.916667:12:20:2:0:12:21:2:0 chr8 145163414 . C G 619.86 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00809885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9371;QD=59.0342;RBI=0.0511652;REFB=-0.208293;REVB=0.0505202;RO=1;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0212218;OID=.;OPOS=145163414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:23:18:0:1:23:18:0:1 chr8 145163647 . T C 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.247;QD=37.4874;RBI=0.0369663;REFB=0;REVB=0.0343813;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00085608;OID=.;OPOS=145163647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr8 145164847 . A G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1619;QD=42.1825;RBI=0.0747304;REFB=0;REVB=-0.0688405;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00562247;OID=.;OPOS=145164847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0 chr8 145168611 . A G 521.57 PASS AF=0.811321;AO=43;DP=55;FAO=43;FDP=53;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0120264;FXX=0.036357;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.676;QD=39.3639;RBI=0.0189448;REFB=-0.0957922;REVB=0.014638;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.59555;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00214023;OID=.;OPOS=145168611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:55:53:0:10:43:43:0.811321:17:26:0:0:17:26:1:9 chr8 145170440 . A C 1062.44 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.247;QD=59.8558;RBI=0.0397999;REFB=0;REVB=0.0104372;RO=0;SAF=11;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.62411e-05;OID=.;OPOS=145170440;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:59:11:0:0:60:11:0:0 chr8 145170704 . A T 193.35 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7566;QD=45.4939;RBI=0.123485;REFB=0;REVB=-0.012749;RO=1;SAF=5;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828326;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00883561;OID=.;OPOS=145170704;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:1:0:16:17:1:11:5:1:0:11:6:0:0 chr8 145223288 . C G,T 332.59 PASS AF=0.08,0.92;AO=2,23;DP=25;FAO=2,23;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1,7;FSAR=1,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00650903,0.105914;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.796,95.5064;QD=53.2148;RBI=0.00710496,0.111779;REFB=0,0;REVB=-0.00284833,0.0357341;RO=0;SAF=1,7;SAR=1,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.186973,0.00375154;OID=.,.;OPOS=145223288,145223288;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:25:25:0:0:2,23:2,23:0.08,0.92:1,16:1,7:0:0:1,16:1,7:0:0 chr8 145578296 . A G 231.06 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=3;FWDB=0.00576302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.806;QD=16.5042;RBI=0.115995;REFB=0.00407763;REVB=-0.115852;RO=29;SAF=22;SAR=4;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983638;STB=0.559958;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.00699397;OID=.;OPOS=145578296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:30:26:26:0.464286:4:22:26:3:4:22:27:3 chr8 145603114 . A C 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0224071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.3;QD=20.7383;RBI=0.0311022;REFB=-0.0310269;REVB=-0.02157;RO=16;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046583;STB=0.526286;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0334855;OID=.;OPOS=145603114;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:10:8:8:8:10:8:8:8 chr8 145623963 . G A 192.91 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0305875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.75;QD=13.7796;RBI=0.0432098;REFB=-0.019513;REVB=0.0305204;RO=33;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322148;STB=0.683735;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0443623;OID=.;OPOS=145623963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:8:15:11:22:8:15:11:22 chr8 145639726 . T C 1305.58 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483337;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3614;QD=62.1703;RBI=0.0861237;REFB=0;REVB=0.0712822;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192397;OID=.;OPOS=145639726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:40:44:0:0:40:44:0:0 chr8 145640411 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.982;QD=60.6103;RBI=0.0270759;REFB=0;REVB=-0.00592371;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09964e-05;OID=.;OPOS=145640411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr8 145661320 . G A 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0297837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.529;QD=12.8607;RBI=0.0297844;REFB=-0.0122577;REVB=0.000214756;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172968;STB=0.603481;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0264553;OID=.;OPOS=145661320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:3:5:3:4:3:5 chr8 145661675 . G A 36.86 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00759264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5681;QD=7.75934;RBI=0.0157918;REFB=-0.0080334;REVB=0.0138468;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538331;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0182607;OID=.;OPOS=145661675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:12:13:6:6:0.315789:2:4:8:4:2:4:8:5 chr8 145665516 . T C 148.16 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0171783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.798;QD=17.9592;RBI=0.0541074;REFB=-0.00709186;REVB=-0.0513081;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301645;STB=0.51722;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00684221;OID=.;OPOS=145665516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:7:9:9:8:7:9:9:8 chr8 145689915 . G A 1281.9 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.028;QD=61.7784;RBI=0.0699239;REFB=0;REVB=0.0589401;RO=0;SAF=25;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356339;OID=.;OPOS=145689915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:58:25:0:0:58:25:0:0 chr8 145690308 . C T 1459.51 PASS AF=0.989474;AO=92;DP=94;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0344792;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.637;QD=61.4531;RBI=0.0425129;REFB=-0.0375357;REVB=0.0248704;RO=1;SAF=35;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824513;STB=0.504347;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000673239;OID=.;OPOS=145690308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:95:1:1:92:94:0.989474:57:35:0:1:57:37:0:1 chr8 145690348 . G A 1403.9 PASS AF=0.968421;AO=81;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0377097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9074;QD=59.1115;RBI=0.154479;REFB=0.0701316;REVB=0.149806;RO=2;SAF=36;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205785;STB=0.513271;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00122912;OID=.;OPOS=145690348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:95:95:2:3:81:92:0.968421:45:36:0:2:55:37:0:3 chr8 145690396 . A C 1249.03 PASS AF=1;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454414;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3968;QD=61.6805;RBI=0.0465994;REFB=0;REVB=0.0103239;RO=0;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328342;OID=.;OPOS=145690396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:80:81:1:40:40:0:0:41:40:0:0 chr8 145692385 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6335;QD=51.1846;RBI=0.0590073;REFB=0;REVB=-0.00170922;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100733;OID=.;OPOS=145692385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr8 145693720 . A G 2122.5 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.696;QD=62.8888;RBI=0.0281271;REFB=0;REVB=0.0270377;RO=0;SAF=84;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49404e-05;OID=.;OPOS=145693720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:135:0:0:134:135:1:50:84:0:0:50:85:0:0 chr8 145724275 . T C 367.42 PASS AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00335543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9971;QD=21.9356;RBI=0.0132461;REFB=-0.00225765;REVB=-0.012814;RO=30;SAF=19;SAR=18;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016097;STB=0.50888;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00148937;OID=.;OPOS=145724275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:18:19:16:14:18:19:16:14 chr8 145729727 . C A 460.64 PASS AF=0.439655;AO=50;DP=115;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.00138084;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.683;QD=15.8842;RBI=0.0128125;REFB=-0.035295;REVB=-0.0127379;RO=62;SAF=27;SAR=23;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071551;STB=0.54654;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0418746;OID=.;OPOS=145729727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:62:65:50:51:0.439655:23:27:29:33:24:27:29:36 chr8 145737323 . C T 1285.37 PASS AF=0.57346;AO=121;DP=211;FAO=121;FDP=211;FR=.;FRO=90;FSAF=85;FSAR=36;FSRF=64;FSRR=26;FWDB=0.0334556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.385;QD=24.3673;RBI=0.0360121;REFB=-0.0408762;REVB=0.0133265;RO=89;SAF=85;SAR=36;SRF=64;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156384;STB=0.504419;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0229338;OID=.;OPOS=145737323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:89:90:121:121:0.57346:36:85:64:25:36:85:64:26 chr8 145737636 . A G 613.29 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0080243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5442;QD=61.3289;RBI=0.048091;REFB=0;REVB=-0.0474169;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000976701;OID=.;OPOS=145737636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chr8 145737816 . C T 99.64 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0296954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.053;QD=26.5713;RBI=0.0555665;REFB=-0.0381096;REVB=0.0469662;RO=4;SAF=9;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335749;STB=0.691912;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00946466;OID=.;OPOS=145737816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:2:9:1:3:2:9:1:3 chr8 145738767 . CG C 251.23 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0884351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.1847;QD=41.871;RBI=0.109057;REFB=0;REVB=-0.0638174;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00157471;OID=.;OPOS=145738768;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:24:24:24:0:9:15:0:0:5:0:9:14:0:0 chr8 145741702 . C G 149.65 PASS AF=0.516129;AO=14;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.219576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.318;QD=19.3094;RBI=0.219604;REFB=-0.0191274;REVB=0.00352867;RO=10;SAF=2;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366468;STB=0.757498;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0079633;OID=.;OPOS=145741702;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:10:15:14:16:0.516129:12:2:5:5:13:3:10:5 chr8 145742514 . A G 2885.56 PASS AF=1;AO=182;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118343;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.355;QD=63.0723;RBI=0.0167137;REFB=0;REVB=0.0118024;RO=0;SAF=95;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.08544e-05;OID=.;OPOS=145742514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:183:183:0:0:182:183:1:87:95:0:0:88:95:0:0 chr8 145742879 . T C 36.47 PASS AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.105682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4749;QD=6.07794;RBI=0.124378;REFB=-0.024353;REVB=-0.0655824;RO=18;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420114;STB=0.780226;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0572564;OID=.;OPOS=145742879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:24:24:18:18:6:6:0.25:1:5:9:9:1:5:9:9 chr8 145745182 . T C 1043.45 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0481428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0566;QD=59.626;RBI=0.0505066;REFB=0;REVB=-0.0152702;RO=0;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000610485;OID=.;OPOS=145745182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:24:46:0:0:24:46:0:0 chr8 145753789 . CAAAAAAA CAAAAAAG,CCAAAAAA 34.09 PASS AF=0.0444444,0;AO=5,5;DP=136;FAO=6,0;FDP=135;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=122;FSAF=4,0;FSAR=2,0;FSRF=52;FSRR=70;FWDB=-0.00408109,-0.0638117;FXX=0.0073524;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=28.3998,28.4788;QD=1.01009;RBI=0.0117545,0.0666143;REFB=-0.0200408,-0.0211781;REVB=-0.0110233,-0.0191189;RO=81;SAF=4,2;SAR=1,3;SRF=26;SRR=55;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.44257,0.0846105;STB=0.719309,0.5;STBP=0.329,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.182715,0;OID=.,.;OPOS=145753796,145753790;OREF=A,A;OALT=G,C;OMAPALT=CAAAAAAG,CCAAAAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.0444444,0:5,5:136:6,0:135:122:4,0:2,0:52:70:9:81:4,2:1,3:26:55 chr8 145755229 . GCCCCCA GCCCC,GCCCCA 124.85 PASS AF=0,1;AO=3,9;DP=17;FAO=0,19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421341,-0.168815;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=149.144,10.733;QD=26.285;RBI=0.0462704,0.184368;REFB=-0.0218284,-0.0471696;REVB=0.0191225,0.0741141;RO=2;SAF=3,5;SAR=0,4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0.326531,0.326531;SSSB=0.74993,0.176689;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.0400036;OID=.,.;OPOS=145755234,145755230;OREF=CA,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCC,GCCCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,1:3,9:17:0,19:19:0:0,10:0,9:0:0:4:2:3,5:0,4:0:2 chr8 145756170 . G A 586.5 PASS AF=0.521739;AO=59;DP=114;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=0.00929031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.798;QD=20.4001;RBI=0.0522966;REFB=-0.0198649;REVB=0.0514648;RO=55;SAF=20;SAR=39;SRF=39;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320925;STB=0.678102;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0131539;OID=.;OPOS=145756170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:55:55:59:60:0.521739:39:20:39:16:40:20:39:16 chr8 146010776 . T C 257.82 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0120135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.866;QD=23.4378;RBI=0.0128106;REFB=-0.039343;REVB=0.00444851;RO=19;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16322;STB=0.58326;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0240116;OID=.;OPOS=146010776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:20:24:24:0.545455:18:6:8:11:18:6:8:12 chr8 146010817 . C A 254.55 PASS AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.000255494;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.12;QD=21.2129;RBI=0.0323731;REFB=0.00421626;REVB=-0.032372;RO=24;SAF=6;SAR=18;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479559;STB=0.527004;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.00472061;OID=.;OPOS=146010817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:24:24:24:24:0.5:18:6:7:17:18:6:7:17 chr8 146045868 . T C 279.99 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0219158;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.79;QD=16.2315;RBI=0.027464;REFB=0.00551104;REVB=-0.0165521;RO=39;SAF=15;SAR=16;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154886;STB=0.580954;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00820863;OID=.;OPOS=146045868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:69:39:38:31:31:0.449275:16:15:25:14:16:15:24:14 chr8 146067054 . G A 330.04 PASS AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0313382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.656;QD=18.3356;RBI=0.035222;REFB=-0.0350335;REVB=-0.0160782;RO=37;SAF=17;SAR=18;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175339;STB=0.597391;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0327592;OID=.;OPOS=146067054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:18:17:11:26:18:17:11:26 chr8 146068322 . C T 226.79 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.017817;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.929;QD=20.1587;RBI=0.0180683;REFB=-0.0113178;REVB=-0.00300308;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609466;STB=0.534382;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.00790791;OID=.;OPOS=146068322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:12:10:12:11:12:10:12:11 chr8 146068594 . T C 255.89 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.122;QD=51.1788;RBI=0.0186463;REFB=0;REVB=0.0172219;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282922;OID=.;OPOS=146068594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr8 146076708 . C T 441.49 PASS AF=0.386364;AO=51;DP=127;FAO=51;FDP=132;FR=.;FRO=81;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.0662387;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=67.5417;QD=13.3785;RBI=0.0694255;REFB=-0.0153797;REVB=-0.0207928;RO=76;SAF=22;SAR=29;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453644;STB=0.523456;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0189928;OID=.;OPOS=146076708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:132:76:81:51:51:0.386364:29:22:36:40:29:22:38:43 chr8 146115367 . A G 1508.4 PASS AF=1;AO=89;DP=91;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341322;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6128;QD=62.2021;RBI=0.0430648;REFB=0;REVB=0.0262598;RO=1;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012308;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00854297;OID=.;OPOS=146115367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:97:1:0:89:97:1:38:51:0:1:42:55:0:0 chr8 146115588 . A G 118.28 PASS AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.000451003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.511;QD=12.7871;RBI=0.0209054;REFB=-0.0287736;REVB=0.0209006;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263461;STB=0.654953;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0386254;OID=.;OPOS=146115588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:22:23:13:14:0.378378:8:5:14:8:9:5:14:9 chr8 146156247 . C A 431.93 PASS AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0136726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.296;QD=23.0362;RBI=0.0163618;REFB=-0.0208554;REVB=0.00898716;RO=33;SAF=18;SAR=24;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455948;STB=0.525084;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0153843;OID=.;OPOS=146156247;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:24:18:16:17:24:18:16:17 chr8 146157339 . T C 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0287254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.122;QD=16.4541;RBI=0.0769283;REFB=-0.017261;REVB=0.071364;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.681121;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0114009;OID=.;OPOS=146157339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:1:5:2:2:1:5:2:2 chr8 146171437 . A G 264.8 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00873544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.084;QD=20.7689;RBI=0.0181719;REFB=-0.0186608;REVB=-0.0159346;RO=23;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17035;STB=0.603373;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0151716;OID=.;OPOS=146171437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:24:27:27:0.529412:15:12:15:8:15:12:16:8 chr8 146203412 . A G 397.85 PASS AF=0.6875;AO=32;DP=48;FAO=33;FDP=48;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0107076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.386;QD=33.1538;RBI=0.0519769;REFB=-0.00868906;REVB=0.0508621;RO=14;SAF=19;SAR=13;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536228;STB=0.534506;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00428479;OID=.;OPOS=146203412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:14:15:32:33:0.6875:13:19:7:7:14:19:7:8 chr8 146229161 . T A,G 480.88 PASS AF=0.852941,0.147059;AO=30,2;DP=33;FAO=29,5;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=12,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100109,-0.00240996;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.706,133.341;QD=56.5742;RBI=0.0100422,0.00424603;REFB=0,0;REVB=0.00079302,0.00349584;RO=0;SAF=17,0;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.63861e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000351289,0.0892741;OID=.,.;OPOS=146229161,146229161;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:23:33:34:0:0:30,2:29,5:0.852941,0.147059:13,2:17,0:0:0:12,5:17,0:0:0 chr9 118173 . C G 894.28 PASS AF=0.915493;AO=64;DP=70;FAO=65;FDP=71;FR=.;FRO=6;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0332121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.767;QD=50.3819;RBI=0.0716443;REFB=-0.0851337;REVB=0.0634811;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.537561;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.000805566;OID=.;OPOS=118173;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:70:71:0:6:64:65:0.915493:26:38:0:0:26:39:1:5 chr9 154795 . T C 1292.9 PASS AF=0.977011;AO=84;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0241726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.281;QD=59.4439;RBI=0.0348671;REFB=-0.010096;REVB=0.0251277;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.510414;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.000669161;OID=.;OPOS=154795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:87:87:0:2:84:85:0.977011:38:46:0:0:38:47:2:0 chr9 162405 . C G 305.92 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000657337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.0157;QD=53.2034;RBI=0.00281028;REFB=0;REVB=0.00273232;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58615e-05;OID=.;OPOS=162405;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:10:12:0:0:11:12:0:0 chr9 163985 . A G 100.83 PASS AF=0.245902;AO=16;DP=62;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.0314007;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.556;QD=6.61179;RBI=0.0320555;REFB=-0.0113609;REVB=-0.00644611;RO=46;SAF=1;SAR=15;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521544;STB=0.83213;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0283671;OID=.;OPOS=163985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:46:46:16:15:0.245902:15:1:15:31:14:1:15:31 chr9 215269 . A C 1044.36 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000991594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.28;QD=59.6774;RBI=0.0377768;REFB=0;REVB=0.0377638;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08875e-05;OID=.;OPOS=215269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0 chr9 215534 . C T 1396.45 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.146;QD=62.7619;RBI=0.00897896;REFB=0;REVB=0.00871976;RO=0;SAF=52;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57365e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85211e-06;OID=.;OPOS=215534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:36:52:0:0:36:53:0:0 chr9 271638 . C T 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0444359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4397;QD=61.6831;RBI=0.0456691;REFB=0;REVB=-0.0105411;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000736824;OID=.;OPOS=271638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr9 286593 . C A 1559.29 PASS AF=0.964286;AO=106;DP=112;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0159188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.83;QD=55.6888;RBI=0.016905;REFB=0.010876;REVB=0.00568965;RO=4;SAF=52;SAR=54;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017887;STB=0.509595;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.00225705;OID=.;OPOS=286593;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:112:112:4:4:106:108:0.964286:54:52:3:1:56:52:3:1 chr9 421032 . C G 186.81 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0100123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.586;QD=19.6639;RBI=0.0150312;REFB=-0.0326841;REVB=-0.0112112;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23132;STB=0.630007;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0211455;OID=.;OPOS=421032;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:9:10:5:14:9:10:5:14 chr9 429719 . T C 1307.88 PASS AF=1;AO=83;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00805716;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8563;QD=61.5471;RBI=0.0337651;REFB=0;REVB=0.0327897;RO=1;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141351;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199733;OID=.;OPOS=429719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:1:0:83:85:1:33:50:0:1:34:51:0:0 chr9 433978 . A G 854.2 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00938373;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.967;QD=57.9117;RBI=0.0235558;REFB=0;REVB=-0.021606;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.03234e-05;OID=.;OPOS=433978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0 chr9 441952 . G A 923.69 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00385575;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.149;QD=58.6472;RBI=0.00406513;REFB=0;REVB=0.00128784;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43661e-06;OID=.;OPOS=441952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr9 742342 . A G 391.45 PASS AF=1;AO=23;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6366;QD=55.9208;RBI=0.0400306;REFB=0;REVB=0.0312256;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0218624;OID=.;OPOS=742342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:23:28:1:11:12:0:0:16:12:0:0 chr9 841971 . T A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.056882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2644;QD=42.1826;RBI=0.114496;REFB=0;REVB=0.0993671;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142634;OID=.;OPOS=841971;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0 chr9 990840 . C T 160.81 PASS AF=0.666667;AO=11;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0179037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.846;QD=26.8015;RBI=0.0837613;REFB=-0.0625084;REVB=0.0818255;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335209;STB=0.568876;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0332746;OID=.;OPOS=990840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:24:24:8:8:11:16:0.666667:6:5:4:4:11:5:4:4 chr9 991114 . A G 1080.52 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0825278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9989;QD=60.0287;RBI=0.0844914;REFB=0;REVB=-0.0181097;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000885781;OID=.;OPOS=991114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:28:44:0:0:28:44:0:0 chr9 1056728 . G C 325.41 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0196828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.539;QD=24.5595;RBI=0.0201087;REFB=-0.0140812;REVB=0.00411679;RO=20;SAF=19;SAR=13;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670299;STB=0.528398;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00962347;OID=.;OPOS=1056728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:20:21:32:32:0.603774:13:19:10:10:13:19:11:10 chr9 1056959 . G C 257.35 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.00929579;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.089;QD=19.7961;RBI=0.0151658;REFB=-0.0060382;REVB=-0.011983;RO=24;SAF=7;SAR=20;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108348;STB=0.56603;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00487589;OID=.;OPOS=1056959;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:24:25:27:27:0.519231:20:7:4:20:20:7:4:21 chr9 1057555 . T C 554.8 PASS AF=0.573034;AO=51;DP=89;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0137982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.712;QD=24.9348;RBI=0.0258168;REFB=-0.0115521;REVB=-0.0218202;RO=38;SAF=24;SAR=27;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639315;STB=0.534993;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00880896;OID=.;OPOS=1057555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:38:38:51:51:0.573034:27:24:21:17:27:24:21:17 chr9 2032972 . C T 655.22 PASS AF=0.547009;AO=64;DP=117;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.00557788;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.692;QD=22.4007;RBI=0.0472816;REFB=0.00164359;REVB=-0.0469515;RO=53;SAF=37;SAR=27;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706576;STB=0.538642;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.00211709;OID=.;OPOS=2032972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:53:53:64:64:0.547009:27:37:35:18:27:37:35:18 chr9 2101545 . T A 237.62 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00497175;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8764;QD=15.8412;RBI=0.0258576;REFB=0.0195309;REVB=-0.0253751;RO=32;SAF=17;SAR=10;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676627;STB=0.548351;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.0145631;OID=.;OPOS=2101545;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:33:27:27:0.45:10:17:18:14:10:17:18:15 chr9 2191309 . C G 212.82 PASS AF=0.5;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00900052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.672;QD=20.2681;RBI=0.0106072;REFB=-0.0199872;REVB=-0.00561287;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194188;STB=0.594507;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0187547;OID=.;OPOS=2191309;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:20:21:0.5:9:11:7:14:10:11:7:14 chr9 2654349 . CA C 30.39 PASS AF=0.375;AO=5;DP=23;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.138175;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.1958;QD=5.06479;RBI=0.140424;REFB=-0.0542025;REVB=0.025032;RO=14;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342111;STB=0.675319;STBP=0.25;TYPE=del;VARB=0.106366;OID=.;OPOS=2654350;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:5:23:9:24:15:4:5:11:4:30:14:2:3:10:4 chr9 2717922 . C G 584.75 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.466;QD=59.974;RBI=0.0808773;REFB=0;REVB=0.0606157;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023509;OID=.;OPOS=2717922;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:12:24:0:0:13:26:0:0 chr9 2718534 . C G 688.98 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6352;QD=62.6349;RBI=0.0156377;REFB=0;REVB=0.0060896;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149889;OID=.;OPOS=2718534;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0 chr9 2718659 . T G 287.28 PASS AF=0.553191;AO=25;DP=46;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00573124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.434;QD=24.4496;RBI=0.0334004;REFB=-0.0211117;REVB=0.032905;RO=21;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099776;STB=0.54234;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0207455;OID=.;OPOS=2718659;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:21:21:25:26:0.553191:16:9:10:11:16:10:10:11 chr9 2811505 . G A 443.73 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0318663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.004;QD=17.2323;RBI=0.0495461;REFB=-0.0461521;REVB=-0.0379388;RO=54;SAF=31;SAR=17;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14413;STB=0.576224;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0437278;OID=.;OPOS=2811505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:55:48:48:0.466019:17:31:27:27:17:31:28:27 chr9 2828765 . C G 195.4 PASS AF=0.367647;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0422427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.647;QD=11.494;RBI=0.0476299;REFB=-0.0125346;REVB=-0.0220038;RO=42;SAF=13;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475723;STB=0.519984;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0237868;OID=.;OPOS=2828765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:42:43:25:25:0.367647:12:13:20:22:12:13:21:22 chr9 4386423 . A G 1549.27 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.878;QD=63.8872;RBI=0.0359303;REFB=0;REVB=0.0330124;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113958;OID=.;OPOS=4386423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:45:52:0:0:45:52:0:0 chr9 4564432 . G A 1062.36 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.141;QD=59.851;RBI=0.0380854;REFB=0;REVB=-0.00752451;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138926;OID=.;OPOS=4564432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:40:31:0:0:40:31:0:0 chr9 4576680 . T C 1418.7 PASS AF=1;AO=89;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341868;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.336;QD=63.0534;RBI=0.0427368;REFB=0;REVB=0.0256457;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212399;OID=.;OPOS=4576680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:89:90:1:45:44:0:0:46:44:0:0 chr9 4664749 . C T 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0254233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.594;QD=15.2618;RBI=0.0256602;REFB=-0.0156286;REVB=0.00347909;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27196;STB=0.656028;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0354594;OID=.;OPOS=4664749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:6:7:4:12:6:7:4:12 chr9 4685008 . C T 243.97 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0254389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6237;QD=17.4261;RBI=0.0318956;REFB=-0.024147;REVB=-0.0192404;RO=28;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0808904;STB=0.553153;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0230063;OID=.;OPOS=4685008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:28:29:27:27:0.482143:14:13:11:17:14:13:11:18 chr9 4706214 . C T 276.11 PASS AF=0.426667;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0124819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.541;QD=14.7257;RBI=0.0224058;REFB=-0.0273498;REVB=-0.018607;RO=38;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174545;STB=0.616583;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0179127;OID=.;OPOS=4706214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:75:38:43:31:32:0.426667:14:17:14:24:15:17:14:29 chr9 4711440 . T A 255.99 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0278824;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5454;QD=15.7532;RBI=0.071491;REFB=-0.00470695;REVB=0.0658295;RO=37;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304838;STB=0.524903;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.00730219;OID=.;OPOS=4711440;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:37:36:29:29:0.446154:14:15:18:19:14:15:17:19 chr9 4860300 . A G 414.82 PASS AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.026433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3366;QD=16.7605;RBI=0.0717071;REFB=-0.0258105;REVB=0.0666574;RO=56;SAF=25;SAR=18;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046815;STB=0.526303;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0357577;OID=.;OPOS=4860300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:56:43:43:0.434343:18:25:30:26:18:25:30:26 chr9 5050706 . C T 347.81 PASS AF=0.385321;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.00209811;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7028;QD=12.7637;RBI=0.110187;REFB=0.00219441;REVB=-0.110167;RO=64;SAF=18;SAR=24;SRF=42;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238948;STB=0.620099;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00282118;OID=.;OPOS=5050706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:64:67:42:42:0.385321:24:18:42:22:24:18:42:25 chr9 5081780 . G A 1169.15 PASS AF=0.862745;AO=87;DP=103;FAO=88;FDP=102;FR=.;FRO=14;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.00180884;FXX=0.0555504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.9547;QD=45.8492;RBI=0.00201249;REFB=0.00370785;REVB=-0.000882158;RO=14;SAF=38;SAR=49;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128216;STB=0.568166;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000588673;OID=.;OPOS=5081780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:103:102:14:14:87:88:0.862745:49:38:13:1:50:38:13:1 chr9 5092466 . G A 695.65 PASS AF=0.618557;AO=60;DP=97;FAO=60;FDP=97;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.00108916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.356;QD=28.6866;RBI=0.00871934;REFB=0.00684423;REVB=-0.00865105;RO=36;SAF=26;SAR=34;SRF=8;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152241;STB=0.575279;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00623175;OID=.;OPOS=5092466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:36:37:60:60:0.618557:34:26:8:28:34:26:9:28 chr9 5094034 . G A 205.36 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.000945016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.527;QD=14.6688;RBI=0.00158762;REFB=-0.00487162;REVB=0.00127573;RO=32;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179338;STB=0.601187;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00569685;OID=.;OPOS=5094034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:14:10:8:24:14:10:8:24 chr9 5095049 . ATAGAG A 180.78 PASS AF=0.6;AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00108889;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=316.689;QD=24.1043;RBI=0.0197241;REFB=-0.0262837;REVB=0.019694;RO=11;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630185;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0189311;OID=.;OPOS=5095050;OREF=TAGAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.6:17:30:18:30:12:12:6:8:4:96:11:11:6:8:3 chr9 5095095 . A C 155.21 PASS AF=0.386364;AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0340149;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.034;QD=14.1097;RBI=0.0535611;REFB=-0.000485653;REVB=0.0413736;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740772;STB=0.562091;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000173513;OID=.;OPOS=5095095;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:27:27:16:17:0.386364:7:9:17:10:8:9:17:10 chr9 5095167 . A C 98.36 PASS AF=0.413793;AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00451436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.754;QD=13.5663;RBI=0.00474797;REFB=-0.0224689;REVB=-0.00147099;RO=16;SAF=1;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.501904;STB=0.724211;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0166501;OID=.;OPOS=5095167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:29:16:17:11:12:0.413793:10:1:7:9:10:2:8:9 chr9 5095191 . T A 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00879652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.392;QD=15.2616;RBI=0.019089;REFB=-0.0139715;REVB=0.0169414;RO=16;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357536;STB=0.711851;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0195668;OID=.;OPOS=5095191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:11:2:7:9:11:2:7:9 chr9 5096433 . A G 238.26 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00423335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.346;QD=16.1532;RBI=0.0433665;REFB=-0.00527709;REVB=0.0431594;RO=32;SAF=8;SAR=19;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21073;STB=0.619473;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00834037;OID=.;OPOS=5096433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:19:8:16:16:19:8:16:16 chr9 5098223 . T C 209.72 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0194361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5461;QD=18.6422;RBI=0.0244808;REFB=0.017969;REVB=-0.0148844;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178323;STB=0.600747;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.0236116;OID=.;OPOS=5098223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:10:11:8:16:10:11:8:16 chr9 5109431 . G A 390.34 PASS AF=0.493827;AO=39;DP=80;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0655382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5862;QD=19.276;RBI=0.0680166;REFB=-0.0182922;REVB=0.0181934;RO=41;SAF=13;SAR=26;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814196;STB=0.549873;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0179208;OID=.;OPOS=5109431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:41:41:39:40:0.493827:26:13:17:24:27:13:17:24 chr9 5109485 . G T 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0206669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.194;QD=20.156;RBI=0.0257081;REFB=-0.00505716;REVB=-0.01529;RO=24;SAF=6;SAR=22;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249861;STB=0.633793;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00827204;OID=.;OPOS=5109485;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:25:28:28:0.528302:22:6:11:13:22:6:11:14 chr9 5231712 . T A 101.49 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0315396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9288;QD=16.915;RBI=0.0443867;REFB=0.0137695;REVB=-0.0312319;RO=11;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10822;STB=0.545377;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.0176102;OID=.;OPOS=5231712;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:8:4:5:6:8:4:5:7 chr9 5557672 . T C 2296.26 PASS AF=0.993151;AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0211706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7011;QD=62.9113;RBI=0.0542466;REFB=-0.0993095;REVB=-0.049945;RO=0;SAF=64;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503875;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00528249;OID=.;OPOS=5557672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:145:146:0:1:145:145:0.993151:81:64:0:0:81:64:1:0 chr9 5732483 . T C 2051.81 PASS AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189934;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.122;QD=61.7087;RBI=0.0878374;REFB=0.0789167;REVB=0.0857593;RO=1;SAF=55;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613319;STB=0.503225;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-9.20137e-05;OID=.;OPOS=5732483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:133:1:1:132:132:0.992481:77:55:0:1:77:55:0:1 chr9 5774225 . T G 620.58 PASS AF=0.414201;AO=70;DP=169;FAO=70;FDP=169;FR=.;FRO=99;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=40;FSRR=59;FWDB=-0.0136258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.216;QD=14.6882;RBI=0.0216992;REFB=-0.00979531;REVB=0.0168877;RO=99;SAF=25;SAR=45;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523775;STB=0.529403;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0129584;OID=.;OPOS=5774225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:99:99:70:70:0.414201:45:25:40:59:45:25:40:59 chr9 6012734 . A C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.419;QD=43.4861;RBI=0.0492798;REFB=0;REVB=0.0325887;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000689439;OID=.;OPOS=6012734;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr9 6015011 . T C 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.617;QD=62.7619;RBI=0.0224712;REFB=0;REVB=0.0199775;RO=0;SAF=58;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25523e-05;OID=.;OPOS=6015011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:31:58:0:0:31:58:0:0 chr9 6253571 . C T 1609.58 PASS AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000104032;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7866;QD=60.1711;RBI=0.018907;REFB=0;REVB=0.0189067;RO=0;SAF=35;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08685e-05;OID=.;OPOS=6253571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:72:35:0:0:72:35:0:0 chr9 6328947 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000712596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.917;QD=52.6132;RBI=0.0112568;REFB=0;REVB=-0.0112342;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.59974e-05;OID=.;OPOS=6328947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:17:5:0:0:17:5:0:0 chr9 6329888 . A G 976.07 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568782;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.382;QD=59.1559;RBI=0.0627003;REFB=0;REVB=0.0263855;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154422;OID=.;OPOS=6329888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0 chr9 6330380 . A C,T 922.62 PASS AF=0.939394,0.0454545;AO=62,3;DP=67;FAO=62,3;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=39,1;FSAR=23,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0013536,0.0124564;FXX=0.0149231;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=213.495,71.1581;QD=55.9161;RBI=0.0267776,0.0504346;REFB=-0.0130066,0.0968966;REVB=-0.0267434,-0.0488722;RO=0;SAF=39,1;SAR=23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.75648e-08,0;STB=0.510635,0.59939;STBP=0.302,0.681;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000259901,0.180413;OID=.,.;OPOS=6330380,6330380;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:67:66:0:1:62,3:62,3:0.939394,0.0454545:23,2:39,1:0:0:23,2:39,1:0:1 chr9 6330915 . G A 689.29 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00519596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.678;QD=62.6627;RBI=0.00535106;REFB=0;REVB=-0.001279;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.40055e-05;OID=.;OPOS=6330915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr9 6469904 . A C 278.92 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0245332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.554;QD=13.9461;RBI=0.0278547;REFB=0.000937708;REVB=0.0131913;RO=48;SAF=10;SAR=22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1432;STB=0.581858;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.00140355;OID=.;OPOS=6469904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:22:10:21:27:22:10:21:27 chr9 6595046 . C T 61.75 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0818975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3829;QD=7.26526;RBI=0.100163;REFB=-0.0194591;REVB=-0.0576673;RO=25;SAF=4;SAR=5;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27261;STB=0.668445;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0443171;OID=.;OPOS=6595046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:5:4:17:8:5:4:17:8 chr9 6984172 . G A 236.59 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.000211266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.361;QD=15.7725;RBI=0.0133576;REFB=-0.0201726;REVB=-0.013356;RO=33;SAF=14;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621751;STB=0.535116;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0204345;OID=.;OPOS=6984172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:13:14:15:18:13:14:15:18 chr9 7046901 . C G 309.6 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0498152;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.723;QD=18.2118;RBI=0.0523717;REFB=-0.00593443;REVB=-0.0161627;RO=35;SAF=16;SAR=17;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255591;STB=0.514277;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.00528743;OID=.;OPOS=7046901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:35:35:33:33:0.485294:17:16:16:19:17:16:16:19 chr9 7076463 . G A 226.42 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00498867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.859;QD=17.0885;RBI=0.0266861;REFB=-0.0176052;REVB=-0.0262157;RO=28;SAF=15;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225242;STB=0.626766;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0140261;OID=.;OPOS=7076463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:10:15:10:18:10:15:10:18 chr9 7798435 . C T 963.09 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.374;QD=58.3689;RBI=0.0178718;REFB=0;REVB=-0.0090483;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0266e-05;OID=.;OPOS=7798435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:24:40:0:0:25:41:0:0 chr9 7798518 . G C 1571.79 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550333;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9785;QD=64.1546;RBI=0.078669;REFB=0;REVB=0.0562151;RO=0;SAF=63;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054701;OID=.;OPOS=7798518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:35:63:0:0:35:63:0:0 chr9 7799606 . C A 701.34 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.328;QD=62.3416;RBI=0.0436335;REFB=0;REVB=0.0249695;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76973e-05;OID=.;OPOS=7799606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:45:0:0:41:45:1:27:14:0:0:30:15:0:0 chr9 7799653 . G T 766.31 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349782;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.882;QD=63.8594;RBI=0.0392561;REFB=0;REVB=0.0178204;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156743;OID=.;OPOS=7799653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr9 8389364 . C G 2479.06 PASS AF=0.993865;AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=163;FR=.;FRO=1;FSAF=95;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0255831;FXX=0.00609719;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.948;QD=60.8357;RBI=0.0266891;REFB=-0.00412236;REVB=0.00760365;RO=1;SAF=95;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704897;STB=0.503703;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=2.16016e-05;OID=.;OPOS=8389364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:164:163:1:1:162:162:0.993865:67:95:0:1:67:95:0:1 chr9 8454566 . T C 198.6 PASS AF=0.305882;AO=26;DP=85;FAO=26;FDP=85;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0664439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3084;QD=9.34563;RBI=0.0681829;REFB=0.0006938;REVB=0.0153006;RO=58;SAF=9;SAR=17;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105325;STB=0.569323;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.000648283;OID=.;OPOS=8454566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:58:59:26:26:0.305882:17:9:25:33:17:9:26:33 chr9 8465598 . A G 825.25 PASS AF=0.51875;AO=83;DP=160;FAO=83;FDP=160;FR=.;FRO=77;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.021999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.498;QD=20.6312;RBI=0.0220033;REFB=-0.0031926;REVB=-0.000433893;RO=77;SAF=45;SAR=38;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856168;STB=0.504697;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00241786;OID=.;OPOS=8465598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:77:77:83:83:0.51875:38:45:41:36:38:45:41:36 chr9 8518052 . G C 549.47 PASS AF=0.377907;AO=65;DP=172;FAO=65;FDP=172;FR=.;FRO=107;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=60;FSRR=47;FWDB=-0.0055189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8186;QD=12.7783;RBI=0.0344318;REFB=-0.0082078;REVB=-0.0339867;RO=107;SAF=37;SAR=28;SRF=60;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00948312;STB=0.505371;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0147897;OID=.;OPOS=8518052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:107:107:65:65:0.377907:28:37:60:47:28:37:60:47 chr9 8518143 . T C 746.41 PASS AF=0.437158;AO=79;DP=182;FAO=80;FDP=183;FR=.;FRO=103;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=59;FWDB=0.0362044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.762;QD=16.315;RBI=0.036436;REFB=-0.0117454;REVB=-0.00410147;RO=102;SAF=38;SAR=41;SRF=43;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603989;STB=0.534019;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0222169;OID=.;OPOS=8518143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:102:103:79:80:0.437158:41:38:43:59:41:39:44:59 chr9 8528506 . A G 213.51 PASS AF=0.44;AO=17;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0291544;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=56.3005;QD=17.0805;RBI=0.0297794;REFB=-0.0215625;REVB=-0.00606929;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935847;STB=0.598422;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0276764;OID=.;OPOS=8528506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:28:17:22:0.44:10:7:6:13:14:8:15:13 chr9 9442211 . G A 248.54 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00144327;FXX=0.0444346;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.744;QD=23.1199;RBI=0.0163872;REFB=-0.0191813;REVB=-0.0163236;RO=20;SAF=15;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32814;STB=0.683013;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0227521;OID=.;OPOS=9442211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:8:15:5:15:8:15:5:15 chr9 12764879 . C T 615.65 PASS AF=0.516667;AO=62;DP=120;FAO=62;FDP=120;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00374251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.925;QD=20.5218;RBI=0.0337538;REFB=-0.0273291;REVB=-0.0335457;RO=58;SAF=25;SAR=37;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00961667;STB=0.505294;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0272113;OID=.;OPOS=12764879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:58:58:62:62:0.516667:37:25:24:34:37:25:24:34 chr9 12775889 . A G 501.64 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3386;QD=59.0165;RBI=0.046536;REFB=0;REVB=0.0409067;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000745164;OID=.;OPOS=12775889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0 chr9 13105959 . T G 1516.18 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6367;QD=63.1744;RBI=0.060094;REFB=0;REVB=0.0569429;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552828;OID=.;OPOS=13105959;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:52:43:0:0:53:43:0:0 chr9 13112116 . A G 2814.88 PASS AF=0.989071;AO=181;DP=183;FAO=181;FDP=183;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=101;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0382688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.617;QD=61.5274;RBI=0.0469787;REFB=-0.142208;REVB=-0.0272488;RO=2;SAF=80;SAR=101;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117518;STB=0.506172;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00111277;OID=.;OPOS=13112116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:183:183:2:2:181:181:0.989071:101:80:2:0:101:80:2:0 chr9 13150531 . T C 877.61 PASS AF=0.497175;AO=88;DP=174;FAO=88;FDP=177;FR=.;FRO=89;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=50;FSRR=39;FWDB=0.00914132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.938;QD=19.833;RBI=0.00935828;REFB=-0.0116072;REVB=0.00200344;RO=85;SAF=40;SAR=48;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983913;STB=0.553834;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0107448;OID=.;OPOS=13150531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:177:85:89:88:88:0.497175:48:40:48:37:48:40:50:39 chr9 13176312 . C T 421.5 PASS AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.00991453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.546;QD=15.9057;RBI=0.00999151;REFB=-0.00898195;REVB=-0.00123786;RO=59;SAF=29;SAR=18;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12739;STB=0.571398;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0132419;OID=.;OPOS=13176312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:59:47:47:0.443396:18:29:29:30:18:29:29:30 chr9 14618856 . C T 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.014195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.912;QD=17.9527;RBI=0.0143882;REFB=-0.0071937;REVB=-0.00235027;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477169;STB=0.526729;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.00463032;OID=.;OPOS=14618856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:15:12:11:17:15:12:11:17 chr9 14737506 . T G 614.38 PASS AF=0.635294;AO=54;DP=85;FAO=54;FDP=85;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00268373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1794;QD=28.9121;RBI=0.0287345;REFB=-0.0608213;REVB=-0.0286089;RO=31;SAF=25;SAR=29;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357811;STB=0.519434;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0285891;OID=.;OPOS=14737506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:31:31:54:54:0.635294:29:25:16:15:29:25:16:15 chr9 14747412 . A G 440.71 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0251692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.035;QD=19.587;RBI=0.0262434;REFB=-0.0128037;REVB=-0.00743139;RO=46;SAF=21;SAR=23;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160281;STB=0.588816;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0127869;OID=.;OPOS=14747412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:23:21:30:16:23:21:30:16 chr9 14770658 . G T 4015.07 PASS AF=1;AO=256;DP=256;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.153;QD=62.2491;RBI=0.0407419;REFB=0;REVB=0.0346458;RO=0;SAF=117;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05039e-05;OID=.;OPOS=14770658;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:256:258:0:0:256:258:1:139:117:0:0:141:117:0:0 chr9 14775853 . A G 1288.49 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00264099;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.435;QD=62.0957;RBI=0.00558131;REFB=0;REVB=0.00491693;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113119;OID=.;OPOS=14775853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr9 14775859 . G A 1434.37 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.985;QD=63.0494;RBI=0.0301588;REFB=0;REVB=0.0196963;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63775e-05;OID=.;OPOS=14775859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:45:46:0:0:45:46:0:0 chr9 14776027 . C T 778.86 PASS AF=0.540146;AO=74;DP=137;FAO=74;FDP=137;FR=.;FRO=63;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0206957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.251;QD=22.7404;RBI=0.0246191;REFB=-0.0147124;REVB=0.0133337;RO=63;SAF=46;SAR=28;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190345;STB=0.604271;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0162367;OID=.;OPOS=14776027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:63:63:74:74:0.540146:28:46:25:38:28:46:25:38 chr9 14776140 . C T 279.21 PASS AF=0.347368;AO=33;DP=95;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.000494238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1673;QD=11.7562;RBI=0.00734072;REFB=-0.012472;REVB=0.00732406;RO=62;SAF=13;SAR=20;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121547;STB=0.570275;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0272932;OID=.;OPOS=14776140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:62:62:33:33:0.347368:20:13:31:31:20:13:31:31 chr9 14819370 . G T 484.35 PASS AF=0.489796;AO=47;DP=99;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0151949;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4757;QD=19.7695;RBI=0.0335817;REFB=0.013814;REVB=0.0299474;RO=49;SAF=26;SAR=21;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170006;STB=0.509087;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.0146112;OID=.;OPOS=14819370;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:49:50:47:48:0.489796:21:26:28:21:21:27:29:21 chr9 14819438 . C A 206.63 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00880863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.616;QD=13.1196;RBI=0.00888459;REFB=-0.0106694;REVB=0.00115925;RO=37;SAF=14;SAR=11;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00801478;STB=0.511619;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0136696;OID=.;OPOS=14819438;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:38:25:25:0.396825:11:14:21:16:11:14:22:16 chr9 14859356 . T C 402.0 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0518695;FXX=0.0422476;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2448;QD=23.6472;RBI=0.055924;REFB=-0.0113551;REVB=-0.0209056;RO=32;SAF=22;SAR=17;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103597;STB=0.578472;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00695713;OID=.;OPOS=14859356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:68:32:29:39:39:0.573529:17:22:14:18:17:22:11:18 chr9 15188106 . T C 2046.0 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0025056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.871;QD=62.4733;RBI=0.022005;REFB=0;REVB=0.0218619;RO=0;SAF=61;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26079e-05;OID=.;OPOS=15188106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:70:61:0:0:70:61:0:0 chr9 15464898 . C A 537.71 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9988;QD=59.7455;RBI=0.124532;REFB=0;REVB=-0.122078;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153103;OID=.;OPOS=15464898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0 chr9 15591372 . T A 197.59 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00451084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.117;QD=18.8177;RBI=0.00555447;REFB=-0.00896268;REVB=0.00324106;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109584;STB=0.573387;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.010975;OID=.;OPOS=15591372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:22:20:20:0.47619:9:11:9:12:9:11:9:13 chr9 15784631 . A G 193.14 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.00411311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.989;QD=12.0714;RBI=0.0101376;REFB=-0.00568087;REVB=0.00926567;RO=40;SAF=9;SAR=15;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152053;STB=0.586889;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00824001;OID=.;OPOS=15784631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:40:40:24:24:0.375:15:9:10:30:15:9:10:30 chr9 15922137 . A G 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.392;QD=60.7157;RBI=0.0526076;REFB=0;REVB=0.0476641;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.84597e-05;OID=.;OPOS=15922137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0 chr9 16410956 . G C 383.93 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.759;QD=54.8471;RBI=0.0657237;REFB=0;REVB=0.0261544;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101341;OID=.;OPOS=16410956;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:13:15:0:0 chr9 16411463 . G T 801.28 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2381;QD=57.2341;RBI=0.0470987;REFB=0;REVB=-0.017113;RO=0;SAF=40;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01924e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000617703;OID=.;OPOS=16411463;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:16:40:0:0:16:40:0:0 chr9 16417431 . G A 2384.32 PASS AF=1;AO=155;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000593984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.047;QD=61.1365;RBI=0.00973902;REFB=0;REVB=0.00972089;RO=0;SAF=72;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52557e-05;OID=.;OPOS=16417431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:155:156:0:0:155:156:1:83:72:0:0:83:73:0:0 chr9 16418440 . TGGCCCCTCAA T 586.47 PASS AF=1;AO=46;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147627;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=10;MLLD=282.411;QD=47.8749;RBI=0.00465103;REFB=0;REVB=-0.00441052;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-8.13672e-07;OID=.;OPOS=16418441;OREF=GGCCCCTCAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:46:48:49:49:0:28:21:0:0:10:0:27:19:0:0 chr9 16418658 . C T 36.61 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.028095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.114;QD=7.32251;RBI=0.0336883;REFB=-0.0238536;REVB=-0.0185895;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41176;STB=0.768237;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0603889;OID=.;OPOS=16418658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:5:1:7:7:5:1:7:7 chr9 16685539 . T C 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0395241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0039;QD=10.0742;RBI=0.0557168;REFB=-0.0340977;REVB=-0.0392709;RO=13;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376558;STB=0.764832;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0477849;OID=.;OPOS=16685539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:7:1:5:8:7:1:6:8 chr9 17001122 . C A 1659.58 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.194;QD=60.3485;RBI=0.0520059;REFB=0;REVB=-0.0379777;RO=0;SAF=69;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79859e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.64543e-06;OID=.;OPOS=17001122;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:109:110:1:40:69:0:0:41:69:0:0 chr9 17001200 . C A 2459.35 PASS AF=1;AO=159;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119267;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.943;QD=61.4836;RBI=0.0291885;REFB=0;REVB=0.0266406;RO=0;SAF=101;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60242e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25246e-05;OID=.;OPOS=17001200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:160:0:0:159:160:1:58:101:0:0:58:102:0:0 chr9 17001216 . A C 2340.47 PASS AF=1;AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232354;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.215;QD=61.1888;RBI=0.0236616;REFB=0;REVB=0.00447099;RO=0;SAF=95;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.37085e-05;OID=.;OPOS=17001216;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:153:153:0:0:153:153:1:58:95:0:0:58:95:0:0 chr9 17053994 . G A 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7051;QD=57.5445;RBI=0.0163168;REFB=0;REVB=0.0149831;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9928e-05;OID=.;OPOS=17053994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:39:19:0:0:39:19:0:0 chr9 17054142 . A G 1225.09 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00240537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5909;QD=59.7605;RBI=0.0197696;REFB=-0.0297565;REVB=0.0196227;RO=0;SAF=26;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00200426;OID=.;OPOS=17054142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:82:0:1:81:81:0.987805:55:26:0:0:55:26:1:0 chr9 17135115 . C T 613.38 PASS AF=0.679487;AO=53;DP=78;FAO=53;FDP=78;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0334194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4676;QD=31.4554;RBI=0.0371273;REFB=0.0190714;REVB=0.0161735;RO=25;SAF=24;SAR=29;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162106;STB=0.508769;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.00418102;OID=.;OPOS=17135115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:25:25:53:53:0.679487:29:24:12:13:29:24:12:13 chr9 17342383 . C T 1116.95 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.471;QD=60.3759;RBI=0.0225941;REFB=0;REVB=0.0137248;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3916e-05;OID=.;OPOS=17342383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0 chr9 17394536 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.12;QD=52.6132;RBI=0.027593;REFB=0;REVB=-0.0232327;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.10823e-05;OID=.;OPOS=17394536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr9 17394996 . T C 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00089438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.568;QD=59.8556;RBI=0.0289395;REFB=0;REVB=0.0289257;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62628e-05;OID=.;OPOS=17394996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0 chr9 17409366 . G A 1194.33 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0162617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.256;QD=59.7163;RBI=0.017404;REFB=0.153257;REVB=0.00620133;RO=1;SAF=28;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166052;STB=0.50877;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-1.68639e-05;OID=.;OPOS=17409366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:51:28:1:0:51:28:1:0 chr9 18504916 . T A 335.97 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0037321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.666;QD=19.7628;RBI=0.0143977;REFB=-0.0137175;REVB=0.0139056;RO=31;SAF=24;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182745;STB=0.618596;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0154761;OID=.;OPOS=18504916;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:33:35:35:0.514706:11:24:15:16:11:24:15:18 chr9 18651156 . C T 213.51 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0139372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9082;QD=16.1142;RBI=0.0149157;REFB=-0.0143794;REVB=0.00531357;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166439;STB=0.509426;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0174558;OID=.;OPOS=18651156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:15:14:12:12:15:14 chr9 18651282 . A G 388.17 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0231219;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.081;QD=18.2668;RBI=0.0254924;REFB=-0.0177222;REVB=-0.010735;RO=45;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105343;STB=0.505879;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0173939;OID=.;OPOS=18651282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:20:20:23:22:20:20:23:22 chr9 18681821 . A G 1175.34 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199179;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.062;QD=61.0566;RBI=0.0330694;REFB=0;REVB=-0.0263982;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12552e-05;OID=.;OPOS=18681821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0 chr9 18775810 . C A 337.39 PASS AF=0.461538;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0542807;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.664;QD=17.3018;RBI=0.0545531;REFB=-0.0165576;REVB=-0.0054447;RO=42;SAF=18;SAR=18;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137601;STB=0.576881;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0196716;OID=.;OPOS=18775810;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:42:42:36:36:0.461538:18:18:15:27:18:18:15:27 chr9 18776840 . A C 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.753;QD=58.4196;RBI=0.0510943;REFB=0;REVB=-0.0493617;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206621;OID=.;OPOS=18776840;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0 chr9 18777368 . T C 1295.71 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.704;QD=61.7004;RBI=0.0306006;REFB=0;REVB=-0.011574;RO=0;SAF=57;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51495e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84358e-05;OID=.;OPOS=18777368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:26:57:0:0:27:57:0:0 chr9 18887908 . G C 359.1 PASS AF=0.403846;AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0308529;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8836;QD=13.8117;RBI=0.0335992;REFB=-0.0169325;REVB=-0.0133044;RO=62;SAF=21;SAR=21;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169906;STB=0.509611;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0179642;OID=.;OPOS=18887908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:104:62:62:42:42:0.403846:21:21:32:30:21:21:32:30 chr9 19087138 . C A 61.81 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00912827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2146;QD=7.27147;RBI=0.00928226;REFB=0.0184486;REVB=-0.00168375;RO=24;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.554197;STB=0.862433;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.0512961;OID=.;OPOS=19087138;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:24:25:9:9:0.264706:8:1:13:11:8:1:14:11 chr9 19345978 . G A 329.64 PASS AF=0.589286;AO=32;DP=55;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0256747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.666;QD=23.5456;RBI=0.0298725;REFB=-0.0347281;REVB=-0.01527;RO=23;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312499;STB=0.522539;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00752717;OID=.;OPOS=19345978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:23:23:32:33:0.589286:14:18:12:11:14:19:12:11 chr9 19576949 . T G 1247.02 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039612;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.174;QD=61.5812;RBI=0.0496758;REFB=0;REVB=0.0299762;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112953;OID=.;OPOS=19576949;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:46:35:0:0:46:35:0:0 chr9 19622268 . T C 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.24;QD=63.2857;RBI=0.039833;REFB=0;REVB=0.0391018;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159957;OID=.;OPOS=19622268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0 chr9 19786217 . G A 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00850026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.465;QD=21.9715;RBI=0.0306336;REFB=0.0191832;REVB=-0.0294306;RO=21;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424814;STB=0.523789;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.0135858;OID=.;OPOS=19786217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:12:11:9:12:12:11:9:12 chr9 20413754 . A T 479.95 PASS AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.013989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.71;QD=18.2838;RBI=0.0172424;REFB=-0.0333601;REVB=0.0100801;RO=54;SAF=31;SAR=20;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849822;STB=0.54718;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0285351;OID=.;OPOS=20413754;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:54:54:51:51:0.485714:20:31:28:26:20:31:28:26 chr9 20418323 . T C 244.26 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00647907;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.552;QD=15.2665;RBI=0.0197737;REFB=-0.0146767;REVB=-0.0186821;RO=36;SAF=22;SAR=6;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327503;STB=0.687353;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0177413;OID=.;OPOS=20418323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:36:36:28:28:0.4375:6:22:18:18:6:22:18:18 chr9 20866974 . C G 1293.58 PASS AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0137951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3691;QD=59.4751;RBI=0.0324563;REFB=-0.155074;REVB=0.0293787;RO=1;SAF=36;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129769;STB=0.51351;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00456384;OID=.;OPOS=20866974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:87:87:1:2:85:85:0.977011:49:36:1:0:49:36:2:0 chr9 20988426 . A G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00793834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.117;QD=58.6006;RBI=0.00823011;REFB=0;REVB=-0.00217196;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30205e-06;OID=.;OPOS=20988426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr9 21029330 . T C 778.45 PASS AF=0.982456;AO=55;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0268117;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.792;QD=54.6277;RBI=0.040184;REFB=-0.0678326;REVB=0.0299313;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.508194;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000457428;OID=.;OPOS=21029330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:57:0:1:55:56:0.982456:26:29:0:0:26:30:1:0 chr9 21077716 . G A 251.65 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00815384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.097;QD=20.5424;RBI=0.0217118;REFB=-0.0135253;REVB=0.0201225;RO=25;SAF=15;SAR=9;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540851;STB=0.530362;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0248023;OID=.;OPOS=21077716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:9:15:17:8:9:15:17:8 chr9 21187121 . T A 86.87 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0265378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.046;QD=12.8698;RBI=0.0353725;REFB=-0.0233967;REVB=0.0233871;RO=16;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185847;STB=0.611425;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0214962;OID=.;OPOS=21187121;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:2:9:11:5:2:9:11:5 chr9 21187222 . G A 141.3 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0185791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.908;QD=13.4572;RBI=0.0384317;REFB=-0.0115958;REVB=-0.0336424;RO=26;SAF=11;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284533;STB=0.666455;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0206038;OID=.;OPOS=21187222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:5:11:11:15:5:11:11:15 chr9 21187311 . C T 1072.23 PASS AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00114189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.226;QD=57.1854;RBI=0.00172737;REFB=-0.0244622;REVB=0.00129611;RO=2;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225138;STB=0.511901;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.000830567;OID=.;OPOS=21187311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:41:32:0:2:41:32:0:2 chr9 21206763 . G T 210.6 PASS AF=0.444444;AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0158807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8543;QD=15.6001;RBI=0.0214227;REFB=-0.0746673;REVB=0.0143784;RO=30;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191462;STB=0.578156;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0576929;OID=.;OPOS=21206763;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:30:30:22:24:0.444444:13:9:18:12:13:11:18:12 chr9 21207000 . C G 105.07 PASS AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00939208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.801;QD=6.46607;RBI=0.0321176;REFB=-0.00601672;REVB=-0.0307136;RO=48;SAF=9;SAR=7;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258939;STB=0.522565;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0206783;OID=.;OPOS=21207000;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:48:49:16:16:0.246154:7:9:28:20:7:9:29:20 chr9 21207005 . C G 114.05 PASS AF=0.257576;AO=17;DP=66;FAO=17;FDP=66;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0165847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.72;QD=6.91212;RBI=0.0242465;REFB=0.000803763;REVB=-0.0176873;RO=48;SAF=10;SAR=7;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0061101;STB=0.512805;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=-0.00233627;OID=.;OPOS=21207005;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:48:49:17:17:0.257576:7:10:28:20:7:10:28:21 chr9 21207031 . T C 75.11 PASS AF=0.177215;AO=13;DP=78;FAO=14;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=65;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.00199982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.215;QD=3.80282;RBI=0.0732238;REFB=-0.0182372;REVB=-0.0731965;RO=53;SAF=9;SAR=4;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453054;STB=0.588656;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0726157;OID=.;OPOS=21207031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:78:79:53:65:13:14:0.177215:4:9:35:18:5:9:35:30 chr9 21207037 . A T 101.47 PASS AF=0.193182;AO=17;DP=88;FAO=17;FDP=88;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0257188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.117;QD=4.61231;RBI=0.056556;REFB=-0.0157223;REVB=-0.0503699;RO=71;SAF=9;SAR=8;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251603;STB=0.51611;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0591372;OID=.;OPOS=21207037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:71:71:17:17:0.193182:8:9:39:32:8:9:39:32 chr9 21207104 . T C 334.75 PASS AF=0.313869;AO=43;DP=137;FAO=43;FDP=137;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=0.000920399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.457;QD=9.77385;RBI=0.0395441;REFB=0.000519532;REVB=0.0395334;RO=94;SAF=21;SAR=22;SRF=45;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113875;STB=0.506623;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.000443835;OID=.;OPOS=21207104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:94:94:43:43:0.313869:22:21:45:49:22:21:45:49 chr9 21227622 . A C 73.7 PASS AF=0.171053;AO=12;DP=75;FAO=13;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0331289;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1281;QD=3.87915;RBI=0.0509886;REFB=0.00488701;REVB=0.0387597;RO=45;SAF=6;SAR=6;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151701;STB=0.590225;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.0206516;OID=.;OPOS=21227622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:75:76:45:63:12:13:0.171053:6:6:28:17:7:6:36:27 chr9 21227651 . A G 31.78 PASS AF=0.101449;AO=6;DP=69;FAO=7;FDP=69;FR=.;FRO=62;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0069271;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.397;QD=1.84244;RBI=0.00782677;REFB=-0.00319602;REVB=-0.00364331;RO=63;SAF=2;SAR=4;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160108;STB=0.683223;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0192787;OID=.;OPOS=21227651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:63:62:6:7:0.101449:4:2:30:33:5:2:30:32 chr9 21227942 . G T 334.42 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0348513;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7136;QD=16.5147;RBI=0.0387818;REFB=-0.0101244;REVB=0.0170122;RO=45;SAF=17;SAR=19;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821867;STB=0.546176;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00901785;OID=.;OPOS=21227942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:45:45:36:36:0.444444:19:17:25:20:19:17:25:20 chr9 21228040 . C G 140.11 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0227193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.227;QD=12.7371;RBI=0.0302269;REFB=-0.00315604;REVB=-0.0199373;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774906;STB=0.545398;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00815096;OID=.;OPOS=21228040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:8:8:12:16:8:8:12:16 chr9 21228182 . GC TG 292.95 PASS AF=0.385185;AO=45;DP=131;FAO=52;FDP=135;FR=.;FRO=83;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=-0.00477987;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.131;QD=8.67987;RBI=0.0245843;REFB=-0.0351707;REVB=0.0241151;RO=82;SAF=24;SAR=21;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238703;STB=0.500713;STBP=0.983;TYPE=mnp;VARB=0.0693953;OID=.;OPOS=21228182;OREF=GC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:135:82:83:45:52:0.385185:21:24:42:40:25:27:43:40 chr9 21304803 . G A 285.8 PASS AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.00140724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.939;QD=13.1402;RBI=0.013564;REFB=-0.0117714;REVB=0.0134908;RO=54;SAF=16;SAR=17;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104804;STB=0.559796;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0208917;OID=.;OPOS=21304803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:54:54:33:33:0.37931:17:16:21:33:17:16:21:33 chr9 21350620 . G A 261.64 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00512927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.587;QD=14.7404;RBI=0.0160691;REFB=-0.00404593;REVB=-0.0152284;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309655;STB=0.530283;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00686148;OID=.;OPOS=21350620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:41:30:30:0.422535:16:14:17:22:16:14:17:24 chr9 21441116 . C T 355.04 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0124262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.129;QD=16.3237;RBI=0.0657179;REFB=-0.0110942;REVB=-0.0645325;RO=49;SAF=11;SAR=27;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176769;STB=0.599945;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0212918;OID=.;OPOS=21441116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:49:38:38:0.436782:27:11:22:27:27:11:22:27 chr9 21441143 . T C 386.78 PASS AF=0.418367;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0449256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3231;QD=15.787;RBI=0.0711709;REFB=0.00134887;REVB=0.0551995;RO=56;SAF=15;SAR=26;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067686;STB=0.544481;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=-0.00538104;OID=.;OPOS=21441143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:56:57:41:41:0.418367:26:15:24:32:26:15:25:32 chr9 21699406 . G A 670.23 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3897;QD=62.3465;RBI=0.047045;REFB=0;REVB=0.0461151;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577592;OID=.;OPOS=21699406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr9 21699444 . C T 888.46 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00717209;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2502;QD=58.2594;RBI=0.00737462;REFB=0;REVB=0.00171643;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000239337;OID=.;OPOS=21699444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0 chr9 21816758 . G A 837.98 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0202099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.484;QD=55.8653;RBI=0.0398585;REFB=-0.148915;REVB=0.0343549;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.509088;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000693573;OID=.;OPOS=21816758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:32:27:0:0:32:27:1:0 chr9 21968199 . C G 975.82 PASS AF=0.985294;AO=68;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0524528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1531;QD=57.4012;RBI=0.0734251;REFB=0.0155723;REVB=-0.0513804;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.507934;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00132888;OID=.;OPOS=21968199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:0:1:68:67:0.985294:32:36:0:0:31:36:0:1 chr9 21968712 . C A 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00733698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.149;QD=19.5769;RBI=0.00821731;REFB=-0.0103343;REVB=-0.00370038;RO=31;SAF=10;SAR=23;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520747;STB=0.529007;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00716513;OID=.;OPOS=21968712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:23:10:11:20:23:10:11:20 chr9 21971163 . G C 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0205829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.871;QD=15.1969;RBI=0.0473646;REFB=-0.0371778;REVB=-0.0426585;RO=18;SAF=12;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338916;STB=0.70096;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0394007;OID=.;OPOS=21971163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:2:12:11:7:2:12:11:7 chr9 22029445 . G A 1034.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.208;QD=59.1082;RBI=0.00731817;REFB=0;REVB=-0.000760333;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66684e-05;OID=.;OPOS=22029445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:23:47:0:0:23:47:0:0 chr9 22447655 . T A 213.2 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.000814986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.338;QD=12.5413;RBI=0.0040359;REFB=-0.0236323;REVB=-0.00395276;RO=42;SAF=9;SAR=17;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290918;STB=0.666913;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0549259;OID=.;OPOS=22447655;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:42:26:26:0.382353:17:9:26:16:17:9:26:16 chr9 24543732 . C T 410.6 PASS AF=0.678571;AO=37;DP=55;FAO=38;FDP=56;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.135132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3223;QD=29.3283;RBI=0.135139;REFB=-0.02512;REVB=-0.00140295;RO=18;SAF=12;SAR=25;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114854;STB=0.554406;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0114064;OID=.;OPOS=24543732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:18:18:37:38:0.678571:25:12:9:9:25:13:9:9 chr9 24545513 . G A 1214.24 PASS AF=0.954023;AO=81;DP=85;FAO=83;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0108564;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.01;QD=55.827;RBI=0.02382;REFB=-0.17684;REVB=0.0212021;RO=3;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041115;STB=0.528564;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.000550205;OID=.;OPOS=24545513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:85:87:3:4:81:83:0.954023:33:48:0:3:33:50:0:4 chr9 24905556 . A G 1716.28 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124627;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.043;QD=60.7531;RBI=0.0129692;REFB=0;REVB=0.0035891;RO=0;SAF=51;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76126e-05;OID=.;OPOS=24905556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:62:51:0:0:62:51:0:0 chr9 25677953 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00284571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.377;QD=33.4282;RBI=0.0332043;REFB=0;REVB=0.0330821;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00187292;OID=.;OPOS=25677953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr9 25678640 . T A 1242.16 PASS AF=0.97619;AO=81;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.109067;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.783;QD=59.1504;RBI=0.115424;REFB=-0.0864897;REVB=0.0377774;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.512192;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000518229;OID=.;OPOS=25678640;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:0:2:81:82:0.97619:41:40:0:0:42:40:2:0 chr9 26116150 . G T 411.03 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.899;QD=56.6943;RBI=0.054339;REFB=0;REVB=0.0341882;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169957;OID=.;OPOS=26116150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr9 26116157 . G A 393.17 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00584354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0519;QD=56.1665;RBI=0.0422737;REFB=0;REVB=-0.0418678;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00112084;OID=.;OPOS=26116157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr9 26892654 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.513;QD=63.8719;RBI=0.0210241;REFB=0;REVB=0.0119179;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.71779e-05;OID=.;OPOS=26892654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0 chr9 26895808 . A G 740.83 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214144;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.305;QD=56.9867;RBI=0.0362375;REFB=0;REVB=-0.0292332;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07124e-05;OID=.;OPOS=26895808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr9 26978168 . ATA ATG,GAT 1672.69 PASS AF=0.973451,0.0265487;AO=103,4;DP=113;FAO=110,3;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50,0;FSAR=60,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767541,0.00350718;FXX=0.0173898;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=175.408,172.882;QD=59.2103;RBI=0.0367857,0.0220551;REFB=0,0;REVB=0.0359761,0.0217744;RO=0;SAF=49,0;SAR=54,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.95759e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=9.67611e-05,-0.00650005;OID=.,.;OPOS=26978170,26978168;OREF=A,ATA;OALT=G,GAT;OMAPALT=ATG,GAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:113:113:0:0:103,4:110,3:0.973451,0.0265487:54,4:49,0:0:0:60,3:50,0:0:0 chr9 26978259 . A G 1482.45 PASS AF=0.979381;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0162438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.807;QD=61.1319;RBI=0.0163316;REFB=-0.0296898;REVB=0.00169102;RO=1;SAF=39;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120031;STB=0.512497;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=7.31035e-05;OID=.;OPOS=26978259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:97:97:1:2:95:95:0.979381:56:39:1:0:56:39:2:0 chr9 27183463 . A C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.88;QD=61.3364;RBI=0.00888771;REFB=0;REVB=-0.00627369;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.97086e-08;OID=.;OPOS=27183463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0 chr9 27296705 . A G 197.78 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0161942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.621;QD=14.6505;RBI=0.0214425;REFB=0.00208517;REVB=-0.0140545;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146121;STB=0.583261;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00347498;OID=.;OPOS=27296705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:13:10:18:13:13:10:18:13 chr9 27328886 . C A 432.8 PASS AF=0.441441;AO=43;DP=105;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0165871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.523;QD=15.5965;RBI=0.0179145;REFB=-0.0082306;REVB=-0.00676743;RO=59;SAF=16;SAR=27;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126196;STB=0.522184;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0101671;OID=.;OPOS=27328886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:111:59:62:43:49:0.441441:27:16:29:30:28:21:29:33 chr9 27328964 . C T 2476.11 PASS AF=1;AO=159;DP=160;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.828;QD=60.7635;RBI=0.0425464;REFB=0;REVB=0.00185017;RO=1;SAF=70;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621664;OID=.;OPOS=27328964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:160:163:1:0:159:163:1:89:70:1:0:90:73:0:0 chr9 27524731 . A G 1047.26 PASS AF=1;AO=62;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8864;QD=59.8432;RBI=0.0828919;REFB=0;REVB=0.0812955;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000713154;OID=.;OPOS=27524731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:62:70:1:36:26:0:0:44:26:0:0 chr9 27550639 . A G 276.08 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00803199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.223;QD=13.3048;RBI=0.0257651;REFB=0.0048918;REVB=-0.0244812;RO=51;SAF=13;SAR=19;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915911;STB=0.552377;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.00803852;OID=.;OPOS=27550639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:19:13:25:26:19:13:25:26 chr9 32069857 . T G 530.7 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4101;QD=58.9664;RBI=0.0886316;REFB=0;REVB=-0.0715775;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000831723;OID=.;OPOS=32069857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0 chr9 32425910 . A G 800.55 PASS AF=0.474286;AO=81;DP=173;FAO=83;FDP=175;FR=.;FRO=92;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=0.0119237;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0388;QD=18.2982;RBI=0.0195877;REFB=-0.00927928;REVB=-0.0155403;RO=91;SAF=57;SAR=24;SRF=49;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173788;STB=0.587958;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00921872;OID=.;OPOS=32425910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:175:91:92:81:83:0.474286:24:57:49:42:26:57:49:43 chr9 32436014 . A G 382.89 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=0.00640105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.505;QD=17.404;RBI=0.0069823;REFB=-0.0169177;REVB=-0.00278908;RO=48;SAF=25;SAR=15;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11213;STB=0.56247;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0256791;OID=.;OPOS=32436014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:15:25:35:13:15:25:35:13 chr9 32450187 . T C 221.67 PASS AF=0.470588;AO=21;DP=48;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00744995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.3;QD=17.3856;RBI=0.00745091;REFB=-0.0233728;REVB=0.000120007;RO=27;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388002;STB=0.666536;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0201267;OID=.;OPOS=32450187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:51:27:27:21:24:0.470588:7:14:7:20:10:14:7:20 chr9 32459450 . T G 379.45 PASS AF=0.43956;AO=39;DP=90;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00337505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.682;QD=16.6792;RBI=0.0221304;REFB=-0.00887718;REVB=0.0218715;RO=50;SAF=16;SAR=23;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709126;STB=0.525921;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0122678;OID=.;OPOS=32459450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:50:51:39:40:0.43956:23:16:24:26:23:17:24:27 chr9 32485280 . A G 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0451118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.266;QD=14.7985;RBI=0.0457985;REFB=-0.00205472;REVB=-0.00790103;RO=13;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716338;STB=0.542088;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00391399;OID=.;OPOS=32485280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:9:2:3:10:9:2:3:10 chr9 32487521 . T C 730.0 PASS AF=0.5;AO=71;DP=144;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.00569911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.125;QD=20.2777;RBI=0.00600677;REFB=-0.0042111;REVB=0.00189774;RO=73;SAF=33;SAR=38;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135222;STB=0.51395;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00512522;OID=.;OPOS=32487521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:73:72:71:72:0.5:38:33:35:38:39:33:35:37 chr9 32492529 . G A 247.1 PASS AF=0.402778;AO=26;DP=69;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0130938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.569;QD=13.7278;RBI=0.0212028;REFB=-0.0141136;REVB=-0.0166766;RO=43;SAF=12;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214721;STB=0.503873;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0251023;OID=.;OPOS=32492529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:72:43:43:26:29:0.402778:14:12:19:24:16:13:19:24 chr9 32498291 . A G 646.19 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00934105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.193;QD=61.5415;RBI=0.0375935;REFB=0;REVB=0.0364145;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43781e-05;OID=.;OPOS=32498291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:42:0:0:38:42:1:16:22:0:0:19:23:0:0 chr9 32568024 . A G 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00977391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.87;QD=17.6438;RBI=0.011259;REFB=0.00328016;REVB=0.00558897;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955156;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00381698;OID=.;OPOS=32568024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:3:4:4:5:3:4 chr9 32568168 . A T 303.49 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0161739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.425;QD=22.0718;RBI=0.0248836;REFB=-0.0127728;REVB=-0.0189102;RO=24;SAF=14;SAR=17;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00534757;STB=0.502957;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00863927;OID=.;OPOS=32568168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:17:14:11:13:17:14:11:13 chr9 32630472 . T C 599.98 PASS AF=0.445946;AO=62;DP=145;FAO=66;FDP=148;FR=.;FRO=82;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.0116419;FXX=0.0512788;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.823;QD=16.2156;RBI=0.0366149;REFB=-0.018366;REVB=-0.0347148;RO=58;SAF=37;SAR=25;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713751;STB=0.568944;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0191533;OID=.;OPOS=32630472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:148:58:82:62:66:0.445946:25:37:30:28:25:41:41:41 chr9 32631369 . C T 1398.65 PASS AF=0.487805;AO=140;DP=287;FAO=140;FDP=287;FR=.;FRO=147;FSAF=69;FSAR=71;FSRF=73;FSRR=74;FWDB=-0.0233091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.34;QD=19.4934;RBI=0.0263431;REFB=0.00491019;REVB=-0.0122737;RO=147;SAF=69;SAR=71;SRF=73;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00348788;STB=0.501916;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00504617;OID=.;OPOS=32631369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:287:147:147:140:140:0.487805:71:69:73:74:71:69:73:74 chr9 32784838 . T C 292.75 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0081644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.382;QD=27.2321;RBI=0.00907263;REFB=-0.00770568;REVB=0.00395666;RO=17;SAF=14;SAR=12;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904628;STB=0.549962;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00477399;OID=.;OPOS=32784838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:12:14:7:10:12:14:7:10 chr9 32785399 . C T 2879.43 PASS AF=1;AO=183;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00625032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.373;QD=62.9383;RBI=0.0764507;REFB=0;REVB=-0.0761948;RO=0;SAF=88;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.48518e-05;OID=.;OPOS=32785399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:183:183:0:0:183:183:1:95:88:0:0:95:88:0:0 chr9 32785888 . G C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00305026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=340.045;QD=50.4135;RBI=0.0132979;REFB=0;REVB=0.0129434;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.66119e-05;OID=.;OPOS=32785888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0 chr9 32786553 . T C 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.221;QD=59.4347;RBI=0.0227032;REFB=0;REVB=-0.0174025;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31699e-05;OID=.;OPOS=32786553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0 chr9 32786586 . G T 383.83 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.568;QD=54.8329;RBI=0.0308578;REFB=0;REVB=0.0285844;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203829;OID=.;OPOS=32786586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:14:14:0:0 chr9 32786653 . G T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.016;QD=60.9786;RBI=0.0392845;REFB=0;REVB=0.000316209;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.05917e-05;OID=.;OPOS=32786653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr9 32786762 . T C 268.21 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-3.85081e-06;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.632;QD=18.4975;RBI=0.00847618;REFB=-0.021376;REVB=0.00847618;RO=29;SAF=12;SAR=17;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935263;STB=0.55231;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0226149;OID=.;OPOS=32786762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:17:12:15:14:17:12:15:14 chr9 32820257 . C T 1204.26 PASS AF=0.97561;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00628003;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.732;QD=58.7443;RBI=0.00907874;REFB=-0.0327289;REVB=0.00655628;RO=1;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133348;STB=0.513885;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=2.26357e-05;OID=.;OPOS=32820257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:83:82:1:2:80:80:0.97561:35:45:0:1:35:45:0:2 chr9 33026572 . T C 337.59 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0228588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.15;QD=20.1549;RBI=0.0378137;REFB=0.0096807;REVB=-0.0301223;RO=32;SAF=17;SAR=18;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177862;STB=0.59823;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00967004;OID=.;OPOS=33026572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:18:17:9:23:18:17:9:23 chr9 33062128 . G A 192.29 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0264526;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.036;QD=13.4939;RBI=0.0275307;REFB=-0.00531658;REVB=-0.00762875;RO=34;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290285;STB=0.665538;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00450079;OID=.;OPOS=33062128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:34:34:23:23:0.403509:14:9:23:11:14:9:23:11 chr9 33240225 . G A 1064.64 PASS AF=0.960526;AO=73;DP=76;FAO=73;FDP=76;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0445083;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206;QD=56.0337;RBI=0.0576568;REFB=-0.0953772;REVB=0.0366512;RO=3;SAF=39;SAR=34;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350016;STB=0.518513;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.000716958;OID=.;OPOS=33240225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:76:76:3:3:73:73:0.960526:34:39:3:0:34:39:3:0 chr9 33387073 . G A 44.05 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0744255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.099;QD=6.52622;RBI=0.0798449;REFB=-0.00298141;REVB=-0.0289146;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257095;STB=0.666173;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00679739;OID=.;OPOS=33387073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:5:2:10:10:5:2:10:10 chr9 33395196 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.927;QD=56.1916;RBI=0.0217827;REFB=0;REVB=-0.00209002;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.36374e-05;OID=.;OPOS=33395196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr9 33442952 . G A 237.52 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.024863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.368;QD=20.2143;RBI=0.0414912;REFB=-0.000222902;REVB=0.0332168;RO=23;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794133;STB=0.535342;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000734734;OID=.;OPOS=33442952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:24:23:23:0.489362:14:9:11:12:14:9:11:13 chr9 33447424 . C G 1217.99 PASS AF=0.517391;AO=119;DP=230;FAO=119;FDP=230;FR=.;FRO=111;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=49;FSRR=62;FWDB=0.00609263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.167;QD=21.1824;RBI=0.00655231;REFB=-0.0159503;REVB=-0.00241094;RO=109;SAF=55;SAR=64;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192124;STB=0.510082;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0157047;OID=.;OPOS=33447424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:109:111:119:119:0.517391:64:55:48:61:64:55:49:62 chr9 33461567 . A G 137.86 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0280555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.402;QD=19.0156;RBI=0.0513683;REFB=-0.00819536;REVB=0.0430301;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325116;STB=0.518494;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0101499;OID=.;OPOS=33461567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:7:8:8:6:7:8:8:6 chr9 33524684 . G A 661.71 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.722;QD=61.5546;RBI=0.0469996;REFB=0;REVB=0.0377003;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47463e-05;OID=.;OPOS=33524684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:43:0:0:39:43:1:20:19:0:0:21:22:0:0 chr9 33618358 . A G 2048.54 PASS AF=1;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00679858;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.844;QD=62.5509;RBI=0.00749045;REFB=0;REVB=-0.00314422;RO=0;SAF=44;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95615e-05;OID=.;OPOS=33618358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:131:0:0:131:131:1:87:44:0:0:87:44:0:0 chr9 33618460 . A T 727.42 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.294;QD=63.2541;RBI=0.0498568;REFB=0;REVB=0.0257205;RO=0;SAF=7;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243353;OID=.;OPOS=33618460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:39:7:0:0:39:7:0:0 chr9 33618497 . G A 501.56 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00757049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2479;QD=59.0073;RBI=0.0095314;REFB=0;REVB=-0.00579097;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77151e-05;OID=.;OPOS=33618497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:30:4:0:0:30:4:0:0 chr9 33625185 . C T 1609.4 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.142;QD=64.376;RBI=0.0542232;REFB=0;REVB=0.00610853;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26552e-05;OID=.;OPOS=33625185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:100:0:0:95:100:1:51:44:0:0:51:49:0:0 chr9 33750845 . G C 202.03 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0223576;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=149.007;QD=21.2659;RBI=0.0238566;REFB=-0.0258733;REVB=0.00832305;RO=17;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592807;STB=0.521717;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0217393;OID=.;OPOS=33750845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:8:12:9:8:8:12:10:8 chr9 33794797 . TGA T 31.81 PASS AF=0.102941;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=68;FR=.;FRO=61;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0399663;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.969;QD=1.87093;RBI=0.0605421;REFB=-0.00899713;REVB=-0.0454757;RO=58;SAF=1;SAR=6;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37468;STB=0.797075;STBP=0.154;TYPE=del;VARB=0.113529;OID=.;OPOS=33794798;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.102941:7:67:7:68:61:1:6:26:35:31:58:1:6:25:33 chr9 33794809 . G A 56.63 PASS AF=0.148649;AO=11;DP=74;FAO=11;FDP=74;FR=.;FRO=63;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0618571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8419;QD=3.06101;RBI=0.061943;REFB=0.00763824;REVB=-0.00326029;RO=63;SAF=3;SAR=8;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225702;STB=0.657524;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.034098;OID=.;OPOS=33794809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:74:74:63:63:11:11:0.148649:8:3:28:35:8:3:28:35 chr9 33794811 . GG AT,GT 51.48 PASS AF=0.0405405,0.108108;AO=3,8;DP=74;FAO=3,8;FDP=74;FR=.;FRO=63;FSAF=1,2;FSAR=2,6;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=-0.0152926,-0.00790935;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=244.281,186.043;QD=2.78251;RBI=0.015673,0.0112097;REFB=-0.0038236,-0.00382184;REVB=0.00343216,0.00794345;RO=62;SAF=1,2;SAR=2,6;SRF=27;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0892814,-0.23502;STB=0.609774,0.686529;STBP=0.702,0.291;TYPE=mnp,snp;VARB=0.027541,0.0193928;OID=.,.;OPOS=33794811,33794812;OREF=GG,G;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:36:74:74:62:63:3,8:3,8:0.0405405,0.108108:2,6:1,2:27:35:2,6:1,2:28:35 chr9 33796660 . T C 51.09 PASS AF=0.104839;AO=13;DP=124;FAO=13;FDP=124;FR=.;FRO=111;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=0.00392462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.767;QD=1.6481;RBI=0.0109038;REFB=-0.00250614;REVB=-0.010173;RO=111;SAF=9;SAR=4;SRF=58;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207917;STB=0.656603;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0220001;OID=.;OPOS=33796660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:124:124:111:111:13:13:0.104839:4:9:58:53:4:9:58:53 chr9 33796672 . TG CA 47.6 PASS AF=0.0962963;AO=13;DP=136;FAO=13;FDP=135;FR=.;FRO=122;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=63;FSRR=59;FWDB=0.00412609;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=2;MLLD=233.642;QD=1.4104;RBI=0.0179769;REFB=1.3161e-05;REVB=-0.017497;RO=122;SAF=8;SAR=5;SRF=63;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117604;STB=0.590402;STBP=0.525;TYPE=mnp;VARB=-0.000343813;OID=.;OPOS=33796672;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:136:135:122:122:13:13:0.0962963:5:8:63:59:5:8:63:59 chr9 33796777 . A G 84.93 PASS AF=0.126667;AO=19;DP=150;FAO=19;FDP=150;FR=.;FRO=131;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=67;FSRR=64;FWDB=-0.0303952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.835;QD=2.26489;RBI=0.0407444;REFB=0.000989733;REVB=-0.0271337;RO=129;SAF=13;SAR=6;SRF=65;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228471;STB=0.65451;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.0217092;OID=.;OPOS=33796777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:150:150:129:131:19:19:0.126667:6:13:65:64:6:13:67:64 chr9 33796785 . C G 94.92 PASS AF=0.13986;AO=20;DP=143;FAO=20;FDP=143;FR=.;FRO=123;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=65;FSRR=58;FWDB=0.00860338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.453;QD=2.65511;RBI=0.00988494;REFB=-0.00343435;REVB=0.00486764;RO=122;SAF=13;SAR=7;SRF=65;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151388;STB=0.607367;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0178103;OID=.;OPOS=33796785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:143:143:122:123:20:20:0.13986:7:13:65:57:7:13:65:58 chr9 33796799 . A T 145.89 PASS AF=0.2;AO=25;DP=125;FAO=25;FDP=125;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=-0.00248425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.276;QD=4.66847;RBI=0.00594886;REFB=-0.00345849;REVB=0.00540532;RO=100;SAF=16;SAR=9;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192271;STB=0.621261;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0158494;OID=.;OPOS=33796799;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:100:100:25:25:0.2:9:16:49:51:9:16:49:51 chr9 33797962 . A G 40.81 PASS AF=0.115385;AO=9;DP=78;FAO=9;FDP=78;FR=.;FRO=69;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0222731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.937;QD=2.0928;RBI=0.0231763;REFB=-0.00462348;REVB=-0.00640702;RO=69;SAF=8;SAR=1;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493217;STB=0.871853;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0476831;OID=.;OPOS=33797962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:78:78:69:69:9:9:0.115385:1:8:34:35:1:8:34:35 chr9 33797987 . G T 50.53 PASS AF=0.138889;AO=10;DP=75;FAO=10;FDP=72;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0117989;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.663;QD=2.80718;RBI=0.0243244;REFB=-0.00557082;REVB=-0.0212711;RO=62;SAF=9;SAR=1;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512925;STB=0.87723;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0252465;OID=.;OPOS=33797987;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:75:72:62:62:10:10:0.138889:1:9:32:30:1:9:31:31 chr9 33797999 . A G 59.74 PASS AF=0.161765;AO=11;DP=68;FAO=11;FDP=68;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00979786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4373;QD=3.51383;RBI=0.0216654;REFB=-0.00143826;REVB=0.0193233;RO=56;SAF=9;SAR=2;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381997;STB=0.769382;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00316061;OID=.;OPOS=33797999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:68:68:56:57:11:11:0.161765:2:9:30:26:2:9:30:27 chr9 33798016 . CA CG,TG 819.01 PASS AF=0.857143,0.111111;AO=51,8;DP=63;FAO=54,7;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=27,5;FSAR=27,2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.026572,0.00489875;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=110.522,129.168;QD=52.0006;RBI=0.027658,0.0236835;REFB=0.000904267,0.00143844;REVB=-0.00767428,-0.0231714;RO=2;SAF=24,6;SAR=27,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00209533,0.108557;STB=0.5,0.55539;STBP=1,0.597;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00342513,0.0202436;OID=.,.;OPOS=33798017,33798016;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:34:63:63:2:2:51,8:54,7:0.857143,0.111111:27,2:24,6:1:1:27,2:27,5:1:1 chr9 33798037 . T C 40.27 PASS AF=0.125;AO=8;DP=64;FAO=8;FDP=64;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0416728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.637;QD=2.517;RBI=0.046666;REFB=-0.00076502;REVB=-0.0210022;RO=56;SAF=7;SAR=1;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458517;STB=0.843893;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00852038;OID=.;OPOS=33798037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:64:64:56:56:8:8:0.125:1:7:29:27:1:7:29:27 chr9 33798042 . G C 39.25 PASS AF=0.121212;AO=8;DP=66;FAO=8;FDP=66;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0344816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.947;QD=2.37877;RBI=0.0424066;REFB=-0.00603841;REVB=0.0246848;RO=58;SAF=7;SAR=1;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46963;STB=0.852719;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0492218;OID=.;OPOS=33798042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:66:66:58:58:8:8:0.121212:1:7:29:29:1:7:29:29 chr9 33798075 . T C 49.98 PASS AF=0.15;AO=9;DP=60;FAO=9;FDP=60;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.00278067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.199;QD=3.33224;RBI=0.0109419;REFB=-0.00313267;REVB=-0.0105826;RO=51;SAF=7;SAR=2;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41758;STB=0.788462;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0124964;OID=.;OPOS=33798075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:60:60:51:51:9:9:0.15:2:7:22:29:2:7:22:29 chr9 33798543 . A G 48.04 PASS AF=0.111111;AO=11;DP=97;FAO=11;FDP=99;FR=.;FRO=88;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=-0.00958215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.728;QD=1.94106;RBI=0.0264944;REFB=-0.0020574;REVB=-0.0247009;RO=86;SAF=8;SAR=3;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326219;STB=0.746421;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0175346;OID=.;OPOS=33798543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:97:99:86:88:11:11:0.111111:3:8:39:47:3:8:39:49 chr9 33798574 . G A 81.49 PASS AF=0.16129;AO=15;DP=93;FAO=15;FDP=93;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.032267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263;QD=3.50476;RBI=0.0328186;REFB=-0.00453076;REVB=-0.00599171;RO=78;SAF=11;SAR=4;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301346;STB=0.702545;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0276276;OID=.;OPOS=33798574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:93:93:78:78:15:15:0.16129:4:11:39:39:4:11:39:39 chr9 33798596 . T C 92.5 PASS AF=0.183908;AO=16;DP=87;FAO=16;FDP=87;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.00402268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4683;QD=4.25301;RBI=0.0430085;REFB=0.00118978;REVB=-0.04282;RO=71;SAF=11;SAR=5;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232718;STB=0.651657;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.009201;OID=.;OPOS=33798596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:87:87:71:71:16:16:0.183908:5:11:36:35:5:11:36:35 chr9 33923478 . TGG AGT,TG 187.21 PASS AF=0.027027,0.918919;AO=3,16;DP=36;FAO=1,34;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=1,11;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0229392,0.22856;FXX=0.0263089;HRUN=1,7;LEN=3,1;MLLD=203.545,8.03584;QD=20.2386;RBI=0.0760675,0.257339;REFB=-0.00962004,-0.0438463;REVB=-0.0725262,-0.118252;RO=9;SAF=3,0;SAR=0,16;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.612869,-0.84663;STB=0.993266,0.520821;STBP=0.226,0.413;TYPE=mnp,del;VARB=0.0564422,0.0397895;OID=.,.;OPOS=33923478,33923479;OREF=TGG,G;OALT=AGT,-;OMAPALT=AGT,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:9:36:37:9:2:3,16:1,34:0.027027,0.918919:0,16:3,0:6:3:0,23:1,11:0:2 chr9 33927899 . G A 1387.46 PASS AF=0.978261;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0352906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.797;QD=60.3246;RBI=0.0460338;REFB=-0.0705744;REVB=0.0295582;RO=2;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210544;STB=0.511109;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00126336;OID=.;OPOS=33927899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:92:92:2:2:90:90:0.978261:44:46:0:2:44:46:0:2 chr9 33935736 . A G 729.0 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.462;QD=57.1763;RBI=0.026672;REFB=0;REVB=0.0266226;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001091;OID=.;OPOS=33935736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0 chr9 33971740 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.228;QD=56.9569;RBI=0.0434228;REFB=0;REVB=0.0422501;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.80213e-05;OID=.;OPOS=33971740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr9 34017106 . C T 740.79 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00848089;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.288;QD=56.9837;RBI=0.00892936;REFB=0;REVB=-0.00279428;RO=0;SAF=16;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.21148e-05;OID=.;OPOS=34017106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:36:16:0:0:36:16:0:0 chr9 34088022 . G GAAAGA 124.04 PASS AF=1;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124614;FXX=0.153728;HRUN=0;LEN=5;MLLD=240.922;QD=45.1039;RBI=0.0127732;REFB=0;REVB=0.00280508;RO=2;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29369;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-7.59006e-05;OID=.;OPOS=34088023;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=GAAAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:11:13:11:11:0:9:2:0:0:3:2:9:2:0:2 chr9 34107505 . C T 194.89 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0343321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.406;QD=17.3237;RBI=0.0343324;REFB=0.00788996;REVB=0.000150388;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895806;STB=0.55097;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00919423;OID=.;OPOS=34107505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:16:9:9:11:16:9 chr9 34220956 . C T 250.38 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.000151267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2551;QD=20.03;RBI=0.0512115;REFB=-0.0085775;REVB=-0.0512113;RO=26;SAF=16;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295528;STB=0.666528;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0097617;OID=.;OPOS=34220956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:8:16:9:17:8:16:9:17 chr9 34251943 . G C 471.31 PASS AF=0.711864;AO=41;DP=59;FAO=42;FDP=59;FR=.;FRO=17;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=-0.0180902;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7091;QD=31.953;RBI=0.0369426;REFB=-0.0564801;REVB=-0.0322103;RO=17;SAF=31;SAR=10;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980572;STB=0.550329;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0204605;OID=.;OPOS=34251943;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:17:17:41:42:0.711864:10:31:15:2:10:32:15:2 chr9 34252466 . GCTAA G 745.82 PASS AF=1;AO=42;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687773;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=4;MLLD=305.55;QD=63.4738;RBI=0.0160711;REFB=0;REVB=0.0145251;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000295017;OID=.;OPOS=34252467;OREF=CTAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:42:49:47:47:0:26:21:0:0:4:0:22:20:0:0 chr9 34256347 . C T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00860768;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=299.194;QD=20.7383;RBI=0.008939;REFB=-0.019224;REVB=-0.00241112;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122168;STB=0.506889;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.018504;OID=.;OPOS=34256347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:10:6:7:11:10:6 chr9 34257979 . C T 169.16 PASS AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0257365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.162;QD=12.0831;RBI=0.0271239;REFB=-0.0068597;REVB=-0.00856395;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206123;STB=0.511934;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0144553;OID=.;OPOS=34257979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:11:10:16:19:11:10:16:19 chr9 34310927 . T C 439.41 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0100079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.638;QD=19.3147;RBI=0.0373728;REFB=-0.017585;REVB=0.0360079;RO=47;SAF=23;SAR=21;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283945;STB=0.515782;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0190441;OID=.;OPOS=34310927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:21:23:26:21:21:23:26:21 chr9 34370020 . T A 94.29 PASS AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0143687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2477;QD=29.0108;RBI=0.107655;REFB=-0.167224;REVB=0.106692;RO=2;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399473;STB=0.522347;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0474622;OID=.;OPOS=34370020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:2:2:11:11:0.846154:4:7:1:1:4:7:1:1 chr9 34371788 . A T 695.09 PASS AF=0.468354;AO=73;DP=155;FAO=74;FDP=158;FR=.;FRO=84;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.000346775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.673;QD=17.5971;RBI=0.00840679;REFB=-0.0310131;REVB=-0.00839963;RO=82;SAF=44;SAR=29;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292763;STB=0.526775;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0374405;OID=.;OPOS=34371788;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:158:82:84:73:74:0.468354:29:44:47:35:29:45:47:37 chr9 34372783 . G C 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.083;QD=59.8389;RBI=0.0386403;REFB=0;REVB=0.0296471;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140547;OID=.;OPOS=34372783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0 chr9 34372873 . C G 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00580738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.729;QD=63.5829;RBI=0.00744953;REFB=0;REVB=-0.00466583;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96345e-06;OID=.;OPOS=34372873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:17:30:0:0:17:30:0:0 chr9 34382726 . A G 2369.17 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1142;QD=64.0316;RBI=0.0188955;REFB=0;REVB=-0.00667242;RO=0;SAF=60;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64415e-05;OID=.;OPOS=34382726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:147:148:0:0:147:148:1:87:60:0:0:88:60:0:0 chr9 34397545 . A G 467.69 PASS AF=0.479592;AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=-0.0304801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.105;QD=19.0893;RBI=0.0351226;REFB=0.00070809;REVB=-0.0174516;RO=51;SAF=36;SAR=10;SRF=38;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502513;STB=0.514892;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.000863717;OID=.;OPOS=34397545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:51:51:46:47:0.479592:10:36:38:13:11:36:38:13 chr9 34521148 . G A 716.45 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.929;QD=62.2998;RBI=0.0369593;REFB=0;REVB=0.0186005;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362942;OID=.;OPOS=34521148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:44:46:1:23:21:0:0:24:22:0:0 chr9 34557903 . G A 338.07 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0167223;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.25;QD=28.7723;RBI=0.0237644;REFB=-0.0290937;REVB=-0.0168853;RO=16;SAF=14;SAR=15;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293866;STB=0.536058;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0177621;OID=.;OPOS=34557903;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:18:29:29:0.617021:15:14:7:9:15:14:7:11 chr9 34622032 . C T 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00827383;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.2257;QD=16.0641;RBI=0.02536;REFB=-0.00768319;REVB=0.0239724;RO=31;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525914;STB=0.529707;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00841988;OID=.;OPOS=34622032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:14:12:16:15:14:12:16:15 chr9 34622389 . A C 726.85 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0231064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6461;QD=52.8621;RBI=0.0439166;REFB=-0.0220188;REVB=-0.0373464;RO=2;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427715;STB=0.522719;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0055574;OID=.;OPOS=34622389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:21:32:0:2:21:32:0:2 chr9 34649442 . A G 300.92 PASS AF=0.55102;AO=25;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0287425;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7034;QD=24.5648;RBI=0.0702145;REFB=-0.048961;REVB=0.064062;RO=23;SAF=13;SAR=12;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147024;STB=0.573767;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.025847;OID=.;OPOS=34649442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:23:22:25:27:0.55102:12:13:8:15:14:13:7:15 chr9 34661994 . G A 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0209919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.458;QD=9.7602;RBI=0.0387781;REFB=-0.0536706;REVB=0.0326049;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520913;STB=0.810067;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0315323;OID=.;OPOS=34661994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:5:2:10:2:5:2:10:2 chr9 34725047 . C T 389.09 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00626437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.543;QD=18.7515;RBI=0.008546;REFB=-0.00494015;REVB=0.00581307;RO=41;SAF=21;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116758;STB=0.506937;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00578529;OID=.;OPOS=34725047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:43:40:40:0.481928:19:21:21:20:19:21:22:21 chr9 34725112 . C T 134.23 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0235664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8991;QD=16.2708;RBI=0.0471601;REFB=0.0250456;REVB=0.0408497;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292343;STB=0.669327;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.0267771;OID=.;OPOS=34725112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:4:11:8:10:4:11:8:10 chr9 34726155 . C T 420.49 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.00144968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.278;QD=16.4899;RBI=0.0127602;REFB=-0.0146563;REVB=-0.0126776;RO=56;SAF=19;SAR=27;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205276;STB=0.511469;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0126046;OID=.;OPOS=34726155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:27:19:22:34:27:19:22:34 chr9 34726182 . A G 533.62 PASS AF=0.456;AO=55;DP=123;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.0229068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.754;QD=17.0758;RBI=0.0254985;REFB=-0.00990612;REVB=-0.0112005;RO=68;SAF=26;SAR=29;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755997;STB=0.551318;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0130962;OID=.;OPOS=34726182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:68:68:55:57:0.456:29:26:27:41:29:28:27:41 chr9 34726418 . T C 160.74 PASS AF=0.25;AO=23;DP=92;FAO=23;FDP=92;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.000625665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2873;QD=6.98855;RBI=0.00813334;REFB=-0.0107345;REVB=-0.00810924;RO=69;SAF=16;SAR=7;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207492;STB=0.627021;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0296714;OID=.;OPOS=34726418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:69:69:23:23:0.25:7:16:37:32:7:16:37:32 chr9 34726524 . G A 832.21 PASS AF=0.521739;AO=83;DP=160;FAO=84;FDP=161;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=0.0203126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.384;QD=20.6759;RBI=0.0292189;REFB=-0.0233873;REVB=0.0210033;RO=77;SAF=40;SAR=43;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126485;STB=0.504151;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0238413;OID=.;OPOS=34726524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:77:77:83:84:0.521739:43:40:36:41:44:40:36:41 chr9 34726671 . G A 397.79 PASS AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.00157268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.408;QD=18.0813;RBI=0.00938439;REFB=0.000128458;REVB=0.00925168;RO=47;SAF=30;SAR=11;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106911;STB=0.559969;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.000110692;OID=.;OPOS=34726671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:0.465909:11:30:30:17:11:30:30:17 chr9 34726821 . A C 432.86 PASS AF=0.448598;AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.00825766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.972;QD=16.1815;RBI=0.0293098;REFB=-0.0123968;REVB=0.0281225;RO=59;SAF=23;SAR=25;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381048;STB=0.521289;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0136656;OID=.;OPOS=34726821;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:59:59:48:48:0.448598:25:23:26:33:25:23:26:33 chr9 34835217 . C T 508.1 PASS AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.00792003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.15;QD=20.7389;RBI=0.0146875;REFB=-0.0136962;REVB=-0.0123691;RO=49;SAF=22;SAR=27;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562754;STB=0.531118;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0131478;OID=.;OPOS=34835217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:49:49:49:49:0.5:27:22:19:30:27:22:19:30 chr9 34835861 . C G 121.32 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0208057;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4654;QD=14.2728;RBI=0.0233747;REFB=-0.0238815;REVB=-0.0106537;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367422;STB=0.713979;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.046311;OID=.;OPOS=34835861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:20:20:14:14:0.411765:10:4:13:7:10:4:13:7 chr9 34978431 . G A 340.56 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00541832;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.342;QD=17.9241;RBI=0.0161329;REFB=-0.00795563;REVB=-0.0151958;RO=39;SAF=24;SAR=12;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175158;STB=0.59254;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00610773;OID=.;OPOS=34978431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:40:36:36:0.473684:12:24:19:20:12:24:20:20 chr9 35043291 . G T 157.81 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.047064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2258;QD=12.1393;RBI=0.0470891;REFB=0.00964522;REVB=-0.00153729;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514927;STB=0.517727;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.0197034;OID=.;OPOS=35043291;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:32:33:19:19:0.365385:11:8:12:20:11:8:13:20 chr9 35044493 . T A 129.47 PASS AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0179426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.963;QD=32.3682;RBI=0.02328;REFB=-0.0580547;REVB=0.0148332;RO=3;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436406;STB=0.524235;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0135197;OID=.;OPOS=35044493;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:6:7:2:1:6:7:2:1 chr9 35062972 . C T 152.15 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00435612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.485;QD=13.2307;RBI=0.033415;REFB=0.00140558;REVB=0.0331299;RO=29;SAF=6;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181259;STB=0.606172;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00294128;OID=.;OPOS=35062972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:11:6:15:14:11:6:15:14 chr9 35089403 . G A 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0222398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7118;QD=20.2681;RBI=0.0320485;REFB=0.0098495;REVB=0.023076;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260103;STB=0.645036;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00566107;OID=.;OPOS=35089403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:10:11:17:4:10:11:17:4 chr9 35105257 . G A 726.34 PASS AF=0.507143;AO=71;DP=140;FAO=71;FDP=140;FR=.;FRO=69;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=0.00938608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3194;QD=20.7525;RBI=0.0325363;REFB=-0.000510603;REVB=0.0311531;RO=69;SAF=37;SAR=34;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052694;STB=0.528988;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000725441;OID=.;OPOS=35105257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:69:69:71:71:0.507143:34:37:40:29:34:37:40:29 chr9 35107858 . C T 368.79 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339529;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=314.793;QD=52.6841;RBI=0.0343929;REFB=-0.154733;REVB=0.005484;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488676;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000563173;OID=.;OPOS=35107858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:28:28:1:0:27:28:1:18:9:1:0:18:10:0:0 chr9 35480564 . T C 1115.37 PASS AF=0.55615;AO=104;DP=186;FAO=104;FDP=187;FR=.;FRO=83;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=0.00461686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.592;QD=23.8581;RBI=0.00620151;REFB=-0.0214228;REVB=0.00414044;RO=82;SAF=60;SAR=44;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131916;STB=0.504837;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0179704;OID=.;OPOS=35480564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:82:83:104:104:0.55615:44:60:46:36:44:60:47:36 chr9 35546735 . A G 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.758;QD=59.8376;RBI=0.017976;REFB=0;REVB=-0.00738113;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0966e-05;OID=.;OPOS=35546735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0 chr9 35562387 . GCCCCCA GCCCCA,GCCCCCATAGT 56.28 PASS AF=0,0.363636;AO=3,4;DP=22;FAO=0,8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=0,5;FSAR=0,3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.077671,0.00579971;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,4;MLLD=14.7525,271.603;QD=10.2324;RBI=0.24729,0.00584514;REFB=-0.0759628,-0.0408781;REVB=-0.234775,-0.000727372;RO=10;SAF=0,4;SAR=3,0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0.478673,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.831614,0;STB=0.5,0.562351;STBP=1,0.712;TYPE=del,ins;VARB=0.034348,0.0478666;OID=.,.;OPOS=35562388,35562394;OREF=C,-;OALT=-,TAGT;OMAPALT=GCCCCA,GCCCCCATAGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.363636:3,4:22:0,8:22:14:0,5:0,3:10:4:54:10:0,4:3,0:10:0 chr9 35660990 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.432;QD=60.9779;RBI=0.0174638;REFB=0;REVB=0.0100864;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133057;OID=.;OPOS=35660990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr9 35662251 . T C 452.7 PASS AF=0.646154;AO=42;DP=65;FAO=42;FDP=65;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0034133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.372;QD=27.8582;RBI=0.0132686;REFB=-0.0427618;REVB=0.0128221;RO=23;SAF=20;SAR=22;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296072;STB=0.516121;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0248707;OID=.;OPOS=35662251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:23:23:42:42:0.646154:22:20:12:11:22:20:12:11 chr9 35663228 . G C 121.67 PASS AF=0.301887;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0171875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.5;QD=9.18233;RBI=0.0296067;REFB=-0.00751615;REVB=-0.0241071;RO=35;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120795;STB=0.571675;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0379818;OID=.;OPOS=35663228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:35:37:16:16:0.301887:7:9:16:19:7:9:17:20 chr9 35674053 . G A 192.41 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00711998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.856;QD=16.0337;RBI=0.00904952;REFB=-0.00758227;REVB=0.00558566;RO=28;SAF=12;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208877;STB=0.619716;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0142554;OID=.;OPOS=35674053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:8:12:11:17:8:12:11:17 chr9 35705759 . G A 385.18 PASS AF=0.401786;AO=45;DP=112;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0436349;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.759;QD=13.7563;RBI=0.0438023;REFB=-0.0159186;REVB=-0.00382567;RO=67;SAF=22;SAR=23;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196448;STB=0.511106;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0227938;OID=.;OPOS=35705759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:67:67:45:45:0.401786:23:22:34:33:23:22:34:33 chr9 35712003 . G A 101.57 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0506874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.162;QD=16.9288;RBI=0.0539005;REFB=-0.0222647;REVB=-0.0183316;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144848;STB=0.583198;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0265707;OID=.;OPOS=35712003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:4:8:6:6:4:8 chr9 35749845 . G C 267.47 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.00721973;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.713;QD=16.4594;RBI=0.0211337;REFB=-0.0176787;REVB=0.0198623;RO=35;SAF=6;SAR=24;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184766;STB=0.638993;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0188812;OID=.;OPOS=35749845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:24:6:12:23:25:5:12:23 chr9 35752124 . G A 252.68 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0288237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3448;QD=21.0562;RBI=0.0299255;REFB=0.00782804;REVB=0.00804568;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370741;STB=0.520816;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=-0.00829246;OID=.;OPOS=35752124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:12:12:11:13:12:12:11:13 chr9 35870001 . T C 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0808638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.85;QD=55.6529;RBI=0.0809588;REFB=0;REVB=0.00391904;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00167764;OID=.;OPOS=35870001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr9 35906475 . G A 348.04 PASS AF=0.607143;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0110183;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.672;QD=24.8598;RBI=0.0114586;REFB=-0.0229542;REVB=0.00314595;RO=19;SAF=17;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172416;STB=0.517847;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0138431;OID=.;OPOS=35906475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:56:19:22:34:34:0.607143:17:17:9:10:17:17:10:12 chr9 36066899 . T C 146.85 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0041712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.707;QD=11.2962;RBI=0.00445377;REFB=-0.00609861;REVB=0.00156113;RO=34;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983387;STB=0.557629;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0160771;OID=.;OPOS=36066899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:9:9:14:20:9:9:14:20 chr9 36085307 . C T 138.97 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0287061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.747;QD=12.0843;RBI=0.0288411;REFB=-0.0240448;REVB=0.00278675;RO=30;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.452231;STB=0.765633;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0229062;OID=.;OPOS=36085307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:4:12:10:20:4:12:10:20 chr9 36087876 . G A 598.18 PASS AF=0.525862;AO=59;DP=115;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0202999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.773;QD=20.627;RBI=0.022759;REFB=-0.021448;REVB=0.0102901;RO=55;SAF=23;SAR=36;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106819;STB=0.564499;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0248579;OID=.;OPOS=36087876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:55:55:59:61:0.525862:36:23:28:27:38:23:28:27 chr9 36105264 . A G 386.69 PASS AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.000614962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.67;QD=20.9021;RBI=0.00143717;REFB=-0.0149968;REVB=-0.00129895;RO=35;SAF=16;SAR=23;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603211;STB=0.533316;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.013399;OID=.;OPOS=36105264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:23:16:12:23:23:16:12:23 chr9 36110063 . T A 187.25 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0633466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5573;QD=14.6859;RBI=0.0636678;REFB=-0.00483736;REVB=-0.00638792;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287219;STB=0.664082;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0105195;OID=.;OPOS=36110063;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:8:13:10:20:8:13:10:20 chr9 36169598 . T C 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00150228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.535;QD=13.5766;RBI=0.0134067;REFB=-0.014809;REVB=0.0133222;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118539;STB=0.569272;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0123085;OID=.;OPOS=36169598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:11:8:7:6:11:8 chr9 36674842 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00250739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.356;QD=62.671;RBI=0.0406321;REFB=0;REVB=-0.0405546;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000391624;OID=.;OPOS=36674842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0 chr9 36840623 . G A 481.42 PASS AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.129375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9261;QD=53.4912;RBI=0.157447;REFB=0.0478778;REVB=0.0897305;RO=2;SAF=18;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491493;STB=0.5263;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000213949;OID=.;OPOS=36840623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:16:18:2:0:16:18:2:0 chr9 37429814 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.731;QD=54.5172;RBI=0.036503;REFB=0;REVB=-0.0323099;RO=0;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34264e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013454;OID=.;OPOS=37429814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:23:2:0:0:23:2:0:0 chr9 37439785 . G GAAAC,GAAACA 465.03 PASS AF=0.942857,0;AO=28,4;DP=38;FAO=33,0;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=17,0;FSAR=16,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0188525,0.0170846;FXX=0.0277701;HRUN=3,3;LEN=4,5;MLLD=283.212,268.375;QD=53.1457;RBI=0.0213774,0.0176756;REFB=0.0679426,0.0576004;REVB=0.0100785,0.00453249;RO=5;SAF=15,1;SAR=13,3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0749276,-0.460738;STB=0.500866,0.5;STBP=0.865,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00274226,0;OID=.,.;OPOS=37439786,37439786;OREF=-,-;OALT=AAAC,AAACA;OMAPALT=GAAAC,GAAACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.942857,0:28,4:38:33,0:35:2:17,0:16,0:1:1:9:5:15,1:13,3:4:1 chr9 37441808 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.269;QD=58.5878;RBI=0.0274707;REFB=0;REVB=-0.000606465;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155667;OID=.;OPOS=37441808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr9 37492367 . C T 1419.39 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.394;QD=61.7127;RBI=0.0129059;REFB=-0.00505529;REVB=-0.00377286;RO=1;SAF=48;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977343;STB=0.505154;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=1.92842e-05;OID=.;OPOS=37492367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:43:48:1:0:43:48:1:0 chr9 37492679 . G T 1418.77 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405344;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.749;QD=63.0566;RBI=0.0405503;REFB=0;REVB=0.00113549;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012838;OID=.;OPOS=37492679;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:48:42:0:0:48:42:0:0 chr9 37493588 . C T 1023.2 PASS AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00072573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.589;QD=57.6453;RBI=0.0459893;REFB=-0.00799891;REVB=0.0459836;RO=1;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013701;STB=0.50704;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=8.78315e-05;OID=.;OPOS=37493588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:34:35:0:1:35:35:0:1 chr9 37500895 . T C 651.18 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8341;QD=62.0173;RBI=0.0203381;REFB=0;REVB=-0.0158543;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.78764e-05;OID=.;OPOS=37500895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr9 37501844 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0733377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.528;QD=56.7063;RBI=0.0744177;REFB=0;REVB=0.0126324;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206114;OID=.;OPOS=37501844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr9 37503087 . G A 1330.44 PASS AF=0.988636;AO=84;DP=85;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00371465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4643;QD=60.4748;RBI=0.108495;REFB=-0.132183;REVB=0.108431;RO=1;SAF=41;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114132;STB=0.506023;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00275619;OID=.;OPOS=37503087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:85:88:1:1:84:87:0.988636:43:41:1:0:46:41:1:0 chr9 37503124 . G A 1325.36 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517843;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4281;QD=62.3697;RBI=0.057591;REFB=0;REVB=0.0252015;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362301;OID=.;OPOS=37503124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:43:42:0:0:43:42:0:0 chr9 37692654 . A C 597.32 PASS AF=0.556604;AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.000264816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.652;QD=22.5405;RBI=0.0359458;REFB=-0.00888992;REVB=0.0359448;RO=47;SAF=33;SAR=26;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119404;STB=0.565196;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0074152;OID=.;OPOS=37692654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:47:47:59:59:0.556604:26:33:33:14:26:33:33:14 chr9 37729786 . C T 645.59 PASS AF=0.464789;AO=66;DP=142;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.0204354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.8633;QD=18.1857;RBI=0.0216505;REFB=-0.00823281;REVB=-0.00715115;RO=76;SAF=34;SAR=32;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526336;STB=0.529202;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0117136;OID=.;OPOS=37729786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:76:76:66:66:0.464789:32:34:35:41:32:34:35:41 chr9 37740637 . T C 328.3 PASS AF=0.514706;AO=34;DP=67;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00552683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.243;QD=19.3118;RBI=0.00563986;REFB=-0.00457813;REVB=-0.00112349;RO=33;SAF=22;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226707;STB=0.630061;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00561103;OID=.;OPOS=37740637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:33:33:34:35:0.514706:12:22:13:20:12:23:13:20 chr9 37745413 . G A 100.29 PASS AF=0.5;AO=10;DP=22;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0108443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.114;QD=16.7154;RBI=0.0205174;REFB=-0.0286199;REVB=0.0174173;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170018;STB=0.628352;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0292754;OID=.;OPOS=37745413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:22:24:12:12:10:12:0.5:6:4:7:5:8:4:7:5 chr9 37782111 . C T 80.3 PASS AF=0.255814;AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0204837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.379;QD=7.47001;RBI=0.0318349;REFB=0.00391488;REVB=0.0243696;RO=32;SAF=6;SAR=5;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170193;STB=0.510619;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.00994648;OID=.;OPOS=37782111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:43:43:32:32:11:11:0.255814:5:6:17:15:5:6:17:15 chr9 37866739 . ATTTTTTTTA ATTTTTTA,ATTTTTTTAT 178.19 PASS AF=0.954545,0;AO=7,3;DP=22;FAO=21,0;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=19,0;FSAR=2,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.19879,-0.0999968;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=2,2;MLLD=13.017,20.2135;QD=32.3986;RBI=0.287206,0.104141;REFB=-0.0679345,-0.154351;REVB=0.207292,-0.0290852;RO=0;SAF=6,3;SAR=1,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.512808,0.5;STBP=0.631,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0122472,0.0954695;OID=.,.;OPOS=37866740,37866747;OREF=TT,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=ATTTTTTA,ATTTTTTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.954545,0:7,3:22:21,0:22:1:19,0:2,0:1:0:4:0:6,3:1,0:0:0 chr9 37974743 . T C 428.46 PASS AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=0.00839963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.257;QD=14.402;RBI=0.0131708;REFB=-0.00221255;REVB=0.0101448;RO=69;SAF=29;SAR=20;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437551;STB=0.520949;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00352687;OID=.;OPOS=37974743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:69:70:49:49:0.411765:20:29:38:31:20:29:39:31 chr9 38395928 . C T 463.93 PASS AF=0.451327;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=0.0113325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.626;QD=16.4223;RBI=0.0121566;REFB=0.000893244;REVB=0.00439962;RO=61;SAF=28;SAR=23;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140182;STB=0.572112;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.00117081;OID=.;OPOS=38395928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:61:62:51:51:0.451327:23:28:42:19:23:28:42:20 chr9 38395940 . T C 1373.15 PASS AF=0.989362;AO=82;DP=105;FAO=93;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0640439;FXX=0.104752;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8845;QD=58.4319;RBI=0.0873761;REFB=-0.0214845;REVB=0.0594387;RO=0;SAF=59;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000284829;OID=.;OPOS=38395940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:105:94:0:1:82:93:0.989362:23:59:0:0:32:61:1:0 chr9 38396002 . C T 261.63 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0185648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.861;QD=14.7398;RBI=0.0344406;REFB=-0.0309775;REVB=-0.0290087;RO=41;SAF=15;SAR=15;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870082;STB=0.549263;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0141941;OID=.;OPOS=38396002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:15:15:24:17:15:15:24:17 chr9 38396065 . G T 226.43 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0142177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7635;QD=17.0892;RBI=0.0446461;REFB=-0.0215017;REVB=0.0423217;RO=28;SAF=8;SAR=17;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00153589;STB=0.500866;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0305447;OID=.;OPOS=38396065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:17:8:9:19:17:8:9:19 chr9 38396502 . G A 938.15 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0425;QD=58.6343;RBI=0.0330431;REFB=0;REVB=0.00188827;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259094;OID=.;OPOS=38396502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:26:37:0:0:26:38:0:0 chr9 38397355 . G C 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.773;QD=55.6537;RBI=0.049911;REFB=0;REVB=0.0487132;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308764;OID=.;OPOS=38397355;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr9 38397915 . G A 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00642309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.448;QD=14.6539;RBI=0.00989306;REFB=-0.00976112;REVB=0.00752439;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0106718;OID=.;OPOS=38397915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:3:5:5:3:3:5 chr9 38398150 . G C 674.99 PASS AF=0.540984;AO=66;DP=122;FAO=66;FDP=122;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.000782491;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.537;QD=22.1309;RBI=0.0156564;REFB=-0.00846725;REVB=0.0156368;RO=55;SAF=30;SAR=36;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303258;STB=0.51274;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0041754;OID=.;OPOS=38398150;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:55:56:66:66:0.540984:36:30:27:28:36:30:27:29 chr9 38528531 . T C 1153.56 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.354;QD=60.7135;RBI=0.0306954;REFB=0;REVB=0.0286942;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07677e-05;OID=.;OPOS=38528531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:45:30:0:0:46:30:0:0 chr9 38615698 . C T 378.4 PASS AF=0.353846;AO=46;DP=131;FAO=46;FDP=130;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0261438;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5041;QD=11.6431;RBI=0.0449789;REFB=-0.00684955;REVB=-0.0366006;RO=84;SAF=24;SAR=22;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647106;STB=0.537058;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0134283;OID=.;OPOS=38615698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:84:84:46:46:0.353846:22:24:39:45:22:24:39:45 chr9 38621344 . G A 357.11 PASS AF=0.641509;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=53;FR=.;FRO=19;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0176378;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.868;QD=26.9515;RBI=0.02175;REFB=-0.0435852;REVB=0.0127267;RO=19;SAF=24;SAR=10;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113555;STB=0.561764;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0282915;OID=.;OPOS=38621344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:19:19:34:34:0.641509:10:24:16:3:10:24:16:3 chr9 39118196 . C A 207.11 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2825;QD=48.7312;RBI=0.0338336;REFB=0;REVB=-0.00298806;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112018;OID=.;OPOS=39118196;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0 chr9 39118205 . G T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0019034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.219;QD=51.1843;RBI=0.0336993;REFB=0;REVB=-0.0336455;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256206;OID=.;OPOS=39118205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr9 39118207 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6691;QD=51.1846;RBI=0.0828572;REFB=0;REVB=-0.0801182;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00318125;OID=.;OPOS=39118207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr9 39287976 . C T 514.77 PASS AF=0.808511;AO=38;DP=47;FAO=38;FDP=47;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0663804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.877;QD=43.8103;RBI=0.0665767;REFB=-0.0275365;REVB=-0.00510844;RO=9;SAF=11;SAR=27;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648803;STB=0.534988;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00518926;OID=.;OPOS=39287976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:47:47:9:9:38:38:0.808511:27:11:4:5:27:11:4:5 chr9 40503085 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.731;QD=57.2024;RBI=0.0214298;REFB=0;REVB=0.0170148;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46669e-05;OID=.;OPOS=40503085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr9 40774051 . T A 260.52 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00179333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.164;QD=14.4733;RBI=0.0123702;REFB=-0.0149593;REVB=-0.0122395;RO=42;SAF=16;SAR=14;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981684;STB=0.505572;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0254424;OID=.;OPOS=40774051;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:14:16:22:20:14:16:22:20 chr9 40784183 . A G 978.33 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569478;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.413;QD=59.2929;RBI=0.0573333;REFB=0;REVB=0.00663735;RO=0;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17617e-05;OID=.;OPOS=40784183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:42:19:0:0:42:24:0:0 chr9 43685298 . G T 363.18 PASS AF=0.580645;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0444425;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9866;QD=23.4312;RBI=0.0445;REFB=-0.0261122;REVB=-0.00226172;RO=26;SAF=8;SAR=28;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886945;STB=0.548991;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.021413;OID=.;OPOS=43685298;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:26:26:36:36:0.580645:28:8:8:18:28:8:8:18 chr9 43685357 . C A 119.1 PASS AF=0.341463;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0319539;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.607;QD=11.6195;RBI=0.0338101;REFB=-0.0276707;REVB=0.0110488;RO=26;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106728;STB=0.529371;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0223851;OID=.;OPOS=43685357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:26:27:14:14:0.341463:11:3:4:22:11:3:5:22 chr9 43818062 . T A 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.876;QD=60.9785;RBI=0.034052;REFB=0;REVB=0.0286054;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84099e-05;OID=.;OPOS=43818062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:11:28:0:0:11:28:0:0 chr9 66457151 . G C 35.04 PASS AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00140204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.944;QD=5.00554;RBI=0.0220631;REFB=-0.0111754;REVB=-0.0220185;RO=22;SAF=4;SAR=2;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148013;STB=0.599658;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0500585;OID=.;OPOS=66457151;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:2:4:12:10:2:4:12:10 chr9 66457169 . AGAG A,AGGG 43.47 PASS AF=0.208333,0.0833333;AO=4,2;DP=25;FAO=5,2;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3,2;FSAR=2,0;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0583703,-0.0320659;FXX=0.039984;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=173.101,179.831;QD=7.24488;RBI=0.0644935,0.0342203;REFB=-0.0153327,-0.0153044;REVB=-0.0274285,-0.0119502;RO=19;SAF=3,2;SAR=1,0;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.267813,0.505018;STB=0.555331,0.994258;STBP=0.729,0.17;TYPE=del,snp;VARB=0.0504841,0.0387146;OID=.,.;OPOS=66457170,66457171;OREF=GAG,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,AGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.208333,0.0833333:4,2:25:5,2:24:17:3,2:2,0:9:8:30:19:3,2:1,0:10:9 chr9 66457216 . A G 79.19 PASS AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00820553;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.847;QD=15.8388;RBI=0.0604686;REFB=-0.00114896;REVB=-0.0599093;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241623;STB=0.655927;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00115423;OID=.;OPOS=66457216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:9:10:0.5:6:3:6:4:7:3:6:4 chr9 66457228 . A C 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0145991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.206;QD=7.83658;RBI=0.0212853;REFB=-0.010434;REVB=0.0154897;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147359;STB=0.59233;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0689872;OID=.;OPOS=66457228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:4:3:9:7:4:3:9:7 chr9 66457233 . G C 54.94 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0193116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0325;QD=9.55524;RBI=0.019434;REFB=-0.0552951;REVB=-0.00217798;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303091;STB=0.683772;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0429445;OID=.;OPOS=66457233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:23:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:10:5:5:3:10:5 chr9 66457236 . AG AA,GA 66.27 PASS AF=0.235294,0.235294;AO=3,4;DP=21;FAO=4,4;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=1,3;FSAR=3,1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0508609,0.0130039;FXX=0.190386;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=25.7193,21.076;QD=15.593;RBI=0.0748617,0.0454499;REFB=-0.0929069,-0.0557066;REVB=-0.0549314,-0.0435499;RO=5;SAF=1,3;SAR=2,1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0671606,0.320004;STB=0.665777,0.665777;STBP=0.471,0.491;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0584561,0.171248;OID=.,.;OPOS=66457237,66457236;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:21:17:5:6:3,4:4,4:0.235294,0.235294:2,1:1,3:2:3:3,1:1,3:3:3 chr9 66457253 . A C 64.6 PASS AF=0.421053;AO=6;DP=23;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0127277;FXX=0.239904;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.221;QD=13.6004;RBI=0.0179366;REFB=-0.015131;REVB=-0.0126383;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177981;STB=0.578755;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0256344;OID=.;OPOS=66457253;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:23:19:12:11:6:8:0.421053:3:3:8:4:4:4:7:4 chr9 66457265 . C A 48.97 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=-0.0280917;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4276;QD=8.90366;RBI=0.042216;REFB=-0.0381907;REVB=-0.0315127;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.472327;STB=0.77989;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0623735;OID=.;OPOS=66457265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:22:15:15:7:7:0.318182:4:3:13:2:4:3:13:2 chr9 66457270 . G A 44.53 PASS AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.00393379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3172;QD=7.12506;RBI=0.0524547;REFB=0.0335272;REVB=0.052307;RO=18;SAF=3;SAR=4;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52069;STB=0.807911;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.042561;OID=.;OPOS=66457270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:4:3:16:2:4:3:16:2 chr9 66457313 . G A 56.25 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0178423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.743;QD=11.2509;RBI=0.017956;REFB=-0.0523681;REVB=-0.00201762;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105261;STB=0.562358;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0679038;OID=.;OPOS=66457313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:1:7:11:1:1:7:11:1 chr9 66457388 . T G 35.42 PASS AF=0.272727;AO=4;DP=20;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.00105551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.556;QD=6.43976;RBI=0.0573298;REFB=-0.00829196;REVB=0.0573201;RO=16;SAF=4;SAR=0;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.558073;STB=0.759458;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0363075;OID=.;OPOS=66457388;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:22:16:16:4:6:0.272727:0:4:15:1:2:4:15:1 chr9 66457440 . A G 33.72 PASS AF=0.106061;AO=7;DP=66;FAO=7;FDP=66;FR=.;FRO=59;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.00271783;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.637;QD=2.04374;RBI=0.00435201;REFB=-0.000348974;REVB=0.00339903;RO=58;SAF=2;SAR=5;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305178;STB=0.725859;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0043125;OID=.;OPOS=66457440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:66:66:58:59:7:7:0.106061:5:2:32:26:5:2:32:27 chr9 66457451 . T C 109.65 PASS AF=0.236111;AO=17;DP=72;FAO=17;FDP=72;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00890595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.505;QD=6.09153;RBI=0.0103981;REFB=0.0030552;REVB=0.00536691;RO=55;SAF=5;SAR=12;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292859;STB=0.682055;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.00474205;OID=.;OPOS=66457451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:55:55:17:17:0.236111:12:5:29:26:12:5:29:26 chr9 66457460 . G A 41.18 PASS AF=0.116883;AO=9;DP=77;FAO=9;FDP=77;FR=.;FRO=68;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0159513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.466;QD=2.13908;RBI=0.0249307;REFB=-0.0019749;REVB=-0.0191598;RO=67;SAF=3;SAR=6;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192966;STB=0.648788;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0364649;OID=.;OPOS=66457460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:77:77:67:68:9:9:0.116883:6:3:33:34:6:3:34:34 chr9 66457465 . T G 183.23 PASS AF=0.347826;AO=27;DP=73;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00358745;FXX=0.0920931;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.438;QD=10.6221;RBI=0.0491622;REFB=-0.00766374;REVB=-0.0490311;RO=45;SAF=9;SAR=18;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289586;STB=0.702139;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0180208;OID=.;OPOS=66457465;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:69:45:45:27:24:0.347826:18:9:27:18:17:7:27:18 chr9 66457467 . GTTTTTTTC GTTTTTTC,GTTTTTTT,GTTTTTTTT 251.95 PASS AF=0.363636,0.272727,0.163636;AO=15,15,8;DP=70;FAO=20,15,9;FDP=55;FR=.;FRO=11;FSAF=4,7,4;FSAR=16,8,5;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.034862,-0.0465458,-0.00778893;FXX=0.214255;HRUN=7,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=7.22041,21.5663,24.181;QD=18.3234;RBI=0.168101,0.0702395,0.0497499;REFB=-0.337038,-0.0416837,0.142528;REVB=-0.164446,-0.0526031,0.0491364;RO=9;SAF=4,7,4;SAR=11,8,4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.415203,-0.279526,-0.355666;STB=0.766842,0.6832,0.744243;STBP=0,0.034,0.1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0927172,0.0475563,-0.0460055;OID=.,.,.;OPOS=66457468,66457475,66457475;OREF=T,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=GTTTTTTC,GTTTTTTT,GTTTTTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.363636,0.272727,0.163636:15,15,8:70:20,15,9:55:11:4,7,4:16,8,5:10:1:78:9:4,7,4:11,8,4:8:1 chr9 66457480 . G A 113.18 PASS AF=0.216867;AO=18;DP=84;FAO=18;FDP=83;FR=.;FRO=65;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.00599184;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6981;QD=5.45431;RBI=0.0654463;REFB=-0.00703869;REVB=0.0651714;RO=62;SAF=7;SAR=11;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186335;STB=0.509106;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0283678;OID=.;OPOS=66457480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:62:65:18:18:0.216867:11:7:25:37:11:7:26:39 chr9 66457498 . G T 55.83 PASS AF=0.122449;AO=12;DP=99;FAO=12;FDP=98;FR=.;FRO=86;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=-0.00690184;FXX=0.0101;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.647;QD=2.27883;RBI=0.0390531;REFB=-0.00322208;REVB=-0.0384384;RO=86;SAF=5;SAR=7;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269844;STB=0.519334;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0158923;OID=.;OPOS=66457498;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:99:98:86:86:12:12:0.122449:7:5:34:52:7:5:34:52 chr9 66457549 . A G 60.7 PASS AF=0.118644;AO=14;DP=130;FAO=14;FDP=118;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=61;FWDB=-0.0071206;FXX=0.0923006;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.209;QD=2.05759;RBI=0.0423686;REFB=-0.00775274;REVB=-0.0417659;RO=102;SAF=5;SAR=9;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703771;STB=0.552353;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0361219;OID=.;OPOS=66457549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:130:118:102:104:14:14:0.118644:9:5:42:60:9:5:43:61 chr9 66457562 . C T 33.83 PASS AF=0.0793651;AO=10;DP=127;FAO=10;FDP=126;FR=.,HEALED;FRO=116;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=68;FWDB=-0.0254646;FXX=0.0078734;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.065;QD=1.07393;RBI=0.0409574;REFB=-0.00749846;REVB=-0.032079;RO=95;SAF=2;SAR=8;SRF=42;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302818;STB=0.724147;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0554243;OID=.;OPOS=66457562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:127:126:95:116:10:10:0.0793651:8:2:42:53:8:2:48:68 chr9 66457585 . G T 71.97 PASS AF=0.138889;AO=13;DP=107;FAO=15;FDP=108;FR=.;FRO=93;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=57;FWDB=-0.0255774;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.563;QD=2.66547;RBI=0.0277607;REFB=-0.00636599;REVB=0.0107912;RO=93;SAF=1;SAR=12;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485897;STB=0.778746;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0307601;OID=.;OPOS=66457585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:107:108:93:93:13:15:0.138889:12:1:37:56:13:2:36:57 chr9 66457588 . T C 267.34 PASS AF=0.327103;AO=35;DP=107;FAO=35;FDP=107;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=-0.0312401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.755;QD=9.99385;RBI=0.0362104;REFB=-0.00615817;REVB=-0.0183097;RO=71;SAF=14;SAR=21;SRF=24;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760673;STB=0.547593;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0221596;OID=.;OPOS=66457588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:71:72:35:35:0.327103:21:14:24:47:21:14:24:48 chr9 66457594 . A G 668.27 PASS AF=0.630435;AO=55;DP=89;FAO=58;FDP=92;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.00375398;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.373;QD=29.055;RBI=0.0200911;REFB=-0.0414223;REVB=0.0197372;RO=31;SAF=25;SAR=30;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111376;STB=0.569539;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.021609;OID=.;OPOS=66457594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:92:31:34:55:58:0.630435:30:25:9:22:32:26:9:25 chr9 66457605 . C T 43.36 PASS AF=0.10989;AO=10;DP=91;FAO=10;FDP=91;FR=.;FRO=81;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.0160734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.461;QD=1.90575;RBI=0.0253486;REFB=-0.0065241;REVB=-0.019601;RO=80;SAF=2;SAR=8;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296187;STB=0.72313;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0500575;OID=.;OPOS=66457605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:91:91:80:81:10:10:0.10989:8:2:34:46:8:2:34:47 chr9 66457628 . G A 113.55 PASS AF=0.227848;AO=17;DP=78;FAO=18;FDP=79;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.107311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7781;QD=5.74944;RBI=0.108699;REFB=-0.018445;REVB=-0.0173196;RO=61;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161408;STB=0.620127;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0711056;OID=.;OPOS=66457628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:61:61:17:18:0.227848:9:8:21:40:9:9:21:40 chr9 66457652 . C T 39.73 PASS AF=0.123077;AO=8;DP=67;FAO=8;FDP=65;FR=.;FRO=57;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.0327277;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.255;QD=2.44493;RBI=0.0376052;REFB=0.0056858;REVB=-0.0185214;RO=56;SAF=4;SAR=4;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129509;STB=0.58441;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=-0.0167818;OID=.;OPOS=66457652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:67:65:56:57:8:8:0.123077:4:4:22:34:4:4:23:34 chr9 66458150 . C T 51.33 PASS AF=0.0903614;AO=14;DP=164;FAO=15;FDP=166;FR=.;FRO=151;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=84;FSRR=67;FWDB=-0.0198725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.439;QD=1.23695;RBI=0.0203675;REFB=-0.00278517;REVB=0.00446333;RO=145;SAF=6;SAR=8;SRF=80;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141944;STB=0.639629;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0327324;OID=.;OPOS=66458150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:164:166:145:151:14:15:0.0903614:8:6:80:65:9:6:84:67 chr9 66458154 . A AC 41.16 PASS AF=0.138365;AO=22;DP=166;FAO=22;FDP=159;FR=.;FRO=137;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=72;FSRR=65;FWDB=0.00724002;FXX=0.0421661;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.5323;QD=1.03551;RBI=0.0198701;REFB=-0.000288574;REVB=0.0185041;RO=143;SAF=11;SAR=11;SRF=78;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572704;STB=0.521993;STBP=0.834;TYPE=ins;VARB=-0.00465005;OID=.;OPOS=66458155;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.138365:22:166:22:159:137:11:11:72:65:41:143:11:11:78:65 chr9 66458183 . A G 64.93 PASS AF=0.101124;AO=15;DP=175;FAO=18;FDP=178;FR=.;FRO=160;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=79;FSRR=81;FWDB=0.0211342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7009;QD=1.45903;RBI=0.0297401;REFB=0.000673932;REVB=-0.0209242;RO=154;SAF=7;SAR=8;SRF=75;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237065;STB=0.555494;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.00448054;OID=.;OPOS=66458183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:175:178:154:160:15:18:0.101124:8:7:75:79:8:10:79:81 chr9 66458195 . TC GA,GC 194.83 PASS AF=0.0647059,0.147059;AO=11,25;DP=170;FAO=11,25;FDP=170;FR=.;FRO=134;FSAF=5,13;FSAR=6,12;FSRF=67;FSRR=67;FWDB=-0.0268891,-0.0174594;FXX=0.00584761;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=171.536,70.9474;QD=4.58414;RBI=0.0277286,0.0187079;REFB=0.000544134,-0.00232463;REVB=0.00677135,0.00671975;RO=132;SAF=5,13;SAR=6,12;SRF=67;SRR=65;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0587752,0.0158601;STB=0.541956,0.516846;STBP=0.816,0.88;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0102845,0.00530853;OID=.,.;OPOS=66458195,66458195;OREF=TC,T;OALT=GA,G;OMAPALT=GA,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:170:170:132:134:11,25:11,25:0.0647059,0.147059:6,12:5,13:67:65:6,12:5,13:67:67 chr9 66458231 . GC G 729.05 PASS AF=0.773585;AO=77;DP=110;FAO=82;FDP=106;FR=.;FRO=24;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00022684;FXX=0.109235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.6172;QD=27.5115;RBI=0.0201792;REFB=-0.0802209;REVB=-0.0201779;RO=25;SAF=43;SAR=34;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545859;STB=0.530016;STBP=0.261;TYPE=del;VARB=0.0244923;OID=.;OPOS=66458232;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.773585:77:110:82:106:24:45:37:10:14:84:25:43:34:11:14 chr9 66499336 . A C 33.69 PASS AF=0.0873786;AO=9;DP=103;FAO=9;FDP=103;FR=.;FRO=94;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=-0.0168282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.781;QD=1.30821;RBI=0.0170473;REFB=0.000213069;REVB=0.0027248;RO=94;SAF=2;SAR=7;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270294;STB=0.722478;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00158365;OID=.;OPOS=66499336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:103:103:94:94:9:9:0.0873786:7:2:42:52:7:2:42:52 chr9 66499356 . G A 31.63 PASS AF=0.091954;AO=8;DP=87;FAO=8;FDP=87;FR=.;FRO=79;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.0206531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.115;QD=1.45439;RBI=0.0207017;REFB=-0.00235862;REVB=0.0014182;RO=79;SAF=2;SAR=6;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206497;STB=0.668341;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0163938;OID=.;OPOS=66499356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:87:87:79:79:8:8:0.091954:6:2:33:46:6:2:33:46 chr9 68415318 . G A 63.58 PASS AF=0.10303;AO=17;DP=164;FAO=17;FDP=165;FR=.;FRO=148;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=63;FSRR=85;FWDB=-0.0273417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.793;QD=1.54128;RBI=0.0277174;REFB=-0.00502426;REVB=0.00454809;RO=146;SAF=9;SAR=8;SRF=61;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134852;STB=0.592251;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0551971;OID=.;OPOS=68415318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:164:165:146:148:17:17:0.10303:8:9:61:85:8:9:63:85 chr9 68415322 . A G 47.46 PASS AF=0.0886076;AO=14;DP=158;FAO=14;FDP=158;FR=.;FRO=144;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=60;FSRR=84;FWDB=-0.0272275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.664;QD=1.20143;RBI=0.0272938;REFB=-0.00017952;REVB=0.00190078;RO=143;SAF=9;SAR=5;SRF=59;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262803;STB=0.698683;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0017369;OID=.;OPOS=68415322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:158:158:143:144:14:14:0.0886076:5:9:59:84:5:9:60:84 chr9 68415338 . A C 122.23 PASS AF=0.167883;AO=22;DP=137;FAO=23;FDP=137;FR=.;FRO=114;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=67;FWDB=-0.0607539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4262;QD=3.56866;RBI=0.0607541;REFB=-0.00200189;REVB=0.000182102;RO=113;SAF=9;SAR=13;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00264806;STB=0.519127;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00875505;OID=.;OPOS=68415338;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:113:114:22:23:0.167883:13:9:46:67:13:10:47:67 chr9 68415352 . A G 33.75 PASS AF=0.0819672;AO=10;DP=122;FAO=10;FDP=122;FR=.;FRO=112;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=64;FWDB=-0.00827137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.527;QD=1.10654;RBI=0.0206673;REFB=-0.00292733;REVB=-0.0189399;RO=111;SAF=4;SAR=6;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374037;STB=0.526973;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.046783;OID=.;OPOS=68415352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:122:122:111:112:10:10:0.0819672:6:4:48:63:6:4:48:64 chr9 68415353 . T G 58.9 PASS AF=0.115702;AO=14;DP=120;FAO=14;FDP=121;FR=.;FRO=107;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=-0.0142781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.047;QD=1.94726;RBI=0.0148215;REFB=-0.00327285;REVB=-0.00397637;RO=105;SAF=5;SAR=9;SRF=46;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102434;STB=0.567269;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0165117;OID=.;OPOS=68415353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:120:121:105:107:14:14:0.115702:9:5:46:59:9:5:46:61 chr9 68415386 . G A 112.61 PASS AF=0.239437;AO=17;DP=76;FAO=17;FDP=71;FR=.;FRO=54;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.0125616;FXX=0.0657808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7444;QD=6.34392;RBI=0.017328;REFB=-0.0009736;REVB=-0.011936;RO=59;SAF=2;SAR=15;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456122;STB=0.792542;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00455602;OID=.;OPOS=68415386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:71:59:54:17:17:0.239437:15:2:24:35:15:2:22:32 chr9 68415387 . GA AT,GT 520.9 PASS AF=0.0555556,0.611111;AO=4,44;DP=72;FAO=4,44;FDP=72;FR=.;FRO=24;FSAF=1,16;FSAR=3,28;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0827675,-0.0251155;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=69.938,158.296;QD=28.9391;RBI=0.0837219,0.0251172;REFB=-0.00544361,-0.0183524;REVB=-0.0126054,0.000296124;RO=24;SAF=1,16;SAR=3,28;SRF=8;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.112636,0.0213761;STB=0.586496,0.511623;STBP=0.777,0.847;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00481936,0.00891759;OID=.,.;OPOS=68415387,68415388;OREF=GA,A;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:72:72:24:24:4,44:4,44:0.0555556,0.611111:3,28:1,16:8:16:3,28:1,16:8:16 chr9 68415397 . T C 42.0 PASS AF=0.131148;AO=8;DP=60;FAO=8;FDP=61;FR=.;FRO=53;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.000239975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.699;QD=2.75392;RBI=0.00534455;REFB=-0.00963118;REVB=0.00533916;RO=51;SAF=2;SAR=6;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144773;STB=0.593809;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0168099;OID=.;OPOS=68415397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:60:61:51:53:8:8:0.131148:6:2:18:33:6:2:18:35 chr9 69002317 . T C 80.63 PASS AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00909781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.449;QD=7.67869;RBI=0.0254842;REFB=-0.000471221;REVB=-0.0238049;RO=31;SAF=4;SAR=7;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218958;STB=0.636116;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000326636;OID=.;OPOS=69002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:7:4:17:14:7:4:17:14 chr9 69181585 . G C 33.05 PASS AF=0.107692;AO=7;DP=65;FAO=7;FDP=65;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=11;FWDB=-0.0201444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.644;QD=2.03407;RBI=0.0290791;REFB=-0.0045913;REVB=-0.0209713;RO=58;SAF=3;SAR=4;SRF=47;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46724;STB=0.815731;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0562341;OID=.;OPOS=69181585;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:65:65:58:58:7:7:0.107692:4:3:47:11:4:3:47:11 chr9 69247550 . G A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.574;QD=35.5759;RBI=0.0142601;REFB=0;REVB=0.00780616;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029761;OID=.;OPOS=69247550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr9 69256816 . G A 510.15 PASS AF=0.38961;AO=60;DP=154;FAO=60;FDP=154;FR=.;FRO=94;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=0.00161372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.357;QD=13.2506;RBI=0.0195151;REFB=-0.00151764;REVB=-0.0194483;RO=94;SAF=28;SAR=32;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100111;STB=0.505655;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00262164;OID=.;OPOS=69256816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:94:94:60:60:0.38961:32:28:43:51:32:28:43:51 chr9 70999315 . T C 449.06 PASS AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.00351971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.981;QD=18.9078;RBI=0.00352038;REFB=-0.00141204;REVB=6.8683e-05;RO=49;SAF=23;SAR=22;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134548;STB=0.568799;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00190645;OID=.;OPOS=70999315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:49:50:45:45:0.473684:22:23:18:31:22:23:19:31 chr9 71396746 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.724;QD=60.6101;RBI=0.0584208;REFB=0;REVB=-0.00192531;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397464;OID=.;OPOS=71396746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chr9 71397734 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.556;QD=55.0982;RBI=0.042418;REFB=0;REVB=0.0170599;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000195668;OID=.;OPOS=71397734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr9 71397747 . T C 293.63 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142942;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1157;QD=53.3869;RBI=0.0318331;REFB=0;REVB=-0.0284433;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00216964;OID=.;OPOS=71397747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr9 71628207 . G C 85.27 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.000687617;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.14;QD=10.336;RBI=0.0267869;REFB=-0.011973;REVB=0.0267781;RO=21;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416825;STB=0.767765;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0149416;OID=.;OPOS=71628207;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:33:33:21:22:11:11:0.333333:2:9:10:11:2:9:10:12 chr9 71841018 . A G 397.2 PASS AF=0.410714;AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.0204714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.122;QD=14.1858;RBI=0.0210555;REFB=-0.0113092;REVB=0.00492506;RO=66;SAF=20;SAR=26;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489603;STB=0.502761;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0162147;OID=.;OPOS=71841018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:66:66:46:46:0.410714:26:20:29:37:26:20:29:37 chr9 71843023 . C A 149.22 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00865796;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=36.9423;QD=12.4351;RBI=0.0287973;REFB=-0.0315082;REVB=0.0274649;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234306;STB=0.646886;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.057801;OID=.;OPOS=71843023;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:48:28:31:17:17:0.354167:11:6:16:12:11:6:18:13 chr9 71862975 . C T 402.42 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.012519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.154;QD=16.5948;RBI=0.0133933;REFB=-0.0165422;REVB=0.0047598;RO=55;SAF=14;SAR=28;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202721;STB=0.61423;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0201778;OID=.;OPOS=71862975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:28:14:29:26:28:14:29:26 chr9 71862987 . G A 419.45 PASS AF=0.452632;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00686512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.665;QD=17.6609;RBI=0.0143298;REFB=-0.00629693;REVB=0.0125782;RO=51;SAF=14;SAR=29;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18794;STB=0.600988;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00636285;OID=.;OPOS=71862987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:51:52:43:43:0.452632:29:14:26:25:29:14:26:26 chr9 72131577 . A C 468.88 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00827483;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.86;QD=58.6096;RBI=0.0136504;REFB=0;REVB=-0.0108564;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.32891e-05;OID=.;OPOS=72131577;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:33:32:1:19:14:0:0:19:13:0:0 chr9 72373624 . A G 2438.83 PASS AF=1;AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.201;QD=61.3542;RBI=0.00551726;REFB=0;REVB=0.00363754;RO=0;SAF=61;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53011e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.91962e-06;OID=.;OPOS=72373624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:159:159:0:0:159:159:1:98:61:0:0:98:61:0:0 chr9 72472831 . C T 561.01 PASS AF=0.434783;AO=60;DP=138;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=0.00713008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.992;QD=16.2612;RBI=0.0116599;REFB=0.00687896;REVB=0.00922575;RO=76;SAF=38;SAR=22;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201469;STB=0.605951;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00896431;OID=.;OPOS=72472831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:76:78:60:60:0.434783:22:38:33:43:22:38:35:43 chr9 72741247 . C T 277.0 PASS AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0137474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.8;QD=13.5121;RBI=0.0228907;REFB=-0.00485733;REVB=-0.0183028;RO=50;SAF=15;SAR=17;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525181;STB=0.529935;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0121071;OID=.;OPOS=72741247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:50:32:32:0.390244:17:15:21:29:17:15:21:29 chr9 72741298 . G A 182.33 PASS AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0202499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190;QD=11.5764;RBI=0.0202591;REFB=-0.000343213;REVB=-0.000610538;RO=40;SAF=12;SAR=11;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310715;STB=0.51799;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.000796989;OID=.;OPOS=72741298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:11:12:22:18:11:12:22:18 chr9 72741312 . G A 820.38 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278894;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.497;QD=57.5704;RBI=0.0320474;REFB=0;REVB=0.0157866;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029271;OID=.;OPOS=72741312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr9 72755128 . TAAA T 82.26 PASS AF=0.285714;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0122823;FXX=0.0666556;HRUN=3;LEN=3;MLLD=123.112;QD=5.87602;RBI=0.0128096;REFB=-0.00731089;REVB=0.00363745;RO=40;SAF=10;SAR=6;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121072;STB=0.573301;STBP=0.516;TYPE=del;VARB=0.0188594;OID=.;OPOS=72755129;OREF=AAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:16:59:16:56:40:10:6:21:19:82:40:10:6:21:19 chr9 72841360 . A T 265.23 PASS AF=0.517241;AO=28;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.076717;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1166;QD=18.2918;RBI=0.077045;REFB=-0.0146902;REVB=-0.00710148;RO=29;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049778;STB=0.501154;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.016603;OID=.;OPOS=72841360;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:29:28:28:30:0.517241:16:12:14:15:16:14:13:15 chr9 72897434 . G A 1524.85 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0131587;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.17;QD=58.6479;RBI=0.0137524;REFB=0.0240138;REVB=0.00399723;RO=1;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854954;STB=0.504504;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-2.77291e-05;OID=.;OPOS=72897434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:104:1:1:103:103:0.990385:55:48:0:1:55:48:0:1 chr9 72897440 . T C 282.08 PASS AF=0.342857;AO=36;DP=105;FAO=36;FDP=105;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00392909;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.13;QD=10.7459;RBI=0.0184406;REFB=0.00121203;REVB=0.0180172;RO=69;SAF=18;SAR=18;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908257;STB=0.552352;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.00234178;OID=.;OPOS=72897440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:69:69:36:36:0.342857:18:18:29:40:18:18:29:40 chr9 73150984 . C T 1821.37 PASS AF=1;AO=116;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013325;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.498;QD=61.2226;RBI=0.0241357;REFB=0;REVB=0.0201241;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.96377e-05;OID=.;OPOS=73150984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:116:119:1:63:53:0:0:64:55:0:0 chr9 73151715 . C T 1549.2 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.147;QD=63.8846;RBI=0.024949;REFB=0;REVB=-0.00977962;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72693e-05;OID=.;OPOS=73151715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:48:48:0:0:49:48:0:0 chr9 73151970 . C T 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00342359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.569;QD=61.2133;RBI=0.0242301;REFB=0;REVB=0.0239871;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42558e-05;OID=.;OPOS=73151970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0 chr9 73376414 . G T 469.17 PASS AF=0.463636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0103278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.166;QD=17.0609;RBI=0.0119701;REFB=-6.23687e-05;REVB=-0.00605147;RO=59;SAF=21;SAR=30;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616255;STB=0.534338;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=8.98548e-05;OID=.;OPOS=73376414;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:59:59:51:51:0.463636:30:21:28:31:30:21:28:31 chr9 73391369 . T C 249.49 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0071837;FXX=0.013887;HRUN=6;LEN=1;MLLD=264.554;QD=14.0559;RBI=0.00776107;REFB=-0.0185656;REVB=-0.00293747;RO=42;SAF=17;SAR=12;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157655;STB=0.508976;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0245456;OID=.;OPOS=73391369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:42:42:29:29:0.408451:12:17:24:18:12:17:24:18 chr9 73391409 . C CA 211.38 PASS AF=1;AO=29;DP=52;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135795;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.94794;QD=20.1314;RBI=0.159834;REFB=-0.0213862;REVB=-0.084302;RO=19;SAF=12;SAR=17;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264923;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0143495;OID=.;OPOS=73391410;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:29:52:42:42:0:21:21:0:0:3:19:12:17:15:4 chr9 73408518 . T G 4604.79 PASS AF=1;AO=288;DP=290;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408682;FXX=0.00684908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.785;QD=63.5143;RBI=0.0421565;REFB=-0.0121431;REVB=0.0103419;RO=0;SAF=175;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105108;OID=.;OPOS=73408518;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:290:290:0:0:288:290:1:113:175:0:0:114:176:0:0 chr9 74360096 . C T 311.57 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0248456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.491;QD=19.1736;RBI=0.0263728;REFB=-0.0303795;REVB=-0.00884424;RO=31;SAF=8;SAR=25;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396343;STB=0.728012;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0234108;OID=.;OPOS=74360096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:32:33:33:0.507692:25:8:21:10:25:8:22:10 chr9 74360209 . G C 385.41 PASS AF=0.575758;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.00338147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.81;QD=23.3581;RBI=0.00440478;REFB=-0.0161274;REVB=-0.00282272;RO=27;SAF=15;SAR=23;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231574;STB=0.633789;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0130586;OID=.;OPOS=74360209;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:27:28:38:38:0.575758:23:15:19:8:23:15:20:8 chr9 74834384 . C T 281.96 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00297148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.631;QD=14.6473;RBI=0.00386218;REFB=-0.00529278;REVB=-0.00246714;RO=44;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00300655;STB=0.509634;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00650612;OID=.;OPOS=74834384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:45:32:32:0.415584:19:13:18:26:19:13:19:26 chr9 74846104 . A G 475.55 PASS AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00689872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.062;QD=19.2142;RBI=0.0081554;REFB=-0.00551694;REVB=-0.00434951;RO=51;SAF=19;SAR=28;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635196;STB=0.541045;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00750825;OID=.;OPOS=74846104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:51:52:47:47:0.474747:28:19:24:27:28:19:25:27 chr9 74975136 . T C 1268.58 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0164613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0883;QD=60.4087;RBI=0.0351488;REFB=-0.0336499;REVB=0.0310558;RO=1;SAF=32;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145697;STB=0.50769;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000653167;OID=.;OPOS=74975136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:51:32:1:0:51:32:1:0 chr9 74979391 . G C 252.41 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.00469792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.671;QD=21.0344;RBI=0.0277644;REFB=-0.0233182;REVB=0.0273641;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219854;STB=0.623187;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0147813;OID=.;OPOS=74979391;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:10:14:8:16:10:14:8:16 chr9 75303653 . C T 190.66 PASS AF=0.431373;AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0429863;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.748;QD=14.9536;RBI=0.0465847;REFB=-0.0068065;REVB=-0.0179532;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097583;STB=0.535682;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00795189;OID=.;OPOS=75303653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:26:29:21:22:0.431373:10:11:11:15:10:12:14:15 chr9 75315438 . G A 239.56 PASS AF=0.37037;AO=24;DP=75;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0130851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.358;QD=11.8299;RBI=0.0292064;REFB=-0.0204517;REVB=0.0261112;RO=50;SAF=13;SAR=11;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00193182;STB=0.511271;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0354646;OID=.;OPOS=75315438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:81:50:51:24:30:0.37037:11:13:27:23:13:17:28:23 chr9 75545882 . G A 706.71 PASS AF=0.587719;AO=67;DP=114;FAO=67;FDP=114;FR=.;FRO=47;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00970815;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=339.813;QD=24.7969;RBI=0.0130669;REFB=-0.00360451;REVB=0.00874612;RO=47;SAF=32;SAR=35;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571617;STB=0.531126;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0024414;OID=.;OPOS=75545882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:47:47:67:67:0.587719:35:32:26:21:35:32:26:21 chr9 77257565 . C T 434.91 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.000633083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.417;QD=20.9596;RBI=0.0102014;REFB=0.00312188;REVB=-0.0101818;RO=40;SAF=25;SAR=18;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621652;STB=0.534326;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00364211;OID=.;OPOS=77257565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:18:25:26:14:18:25:26:14 chr9 77376647 . T C 862.95 PASS AF=0.5;AO=87;DP=174;FAO=87;FDP=174;FR=.;FRO=87;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=0.0113713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.537;QD=19.838;RBI=0.0117599;REFB=-0.0130891;REVB=0.00299822;RO=87;SAF=48;SAR=39;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0133052;OID=.;OPOS=77376647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:87:87:87:87:0.5:39:48:48:39:39:48:48:39 chr9 77377410 . C T 299.34 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0126792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.281;QD=23.9472;RBI=0.0239879;REFB=-0.000339189;REVB=-0.0203631;RO=23;SAF=8;SAR=19;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270327;STB=0.650974;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-1.56178e-05;OID=.;OPOS=77377410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:19:8:14:9:19:8:14:9 chr9 77391060 . T C 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00139447;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.485;QD=21.7466;RBI=0.0125551;REFB=-0.0184906;REVB=-0.0124775;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387148;STB=0.521719;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0152207;OID=.;OPOS=77391060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:10:12:10:10:10:12:10:10 chr9 77397519 . T C 382.31 PASS AF=0.368;AO=46;DP=125;FAO=46;FDP=125;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=0.0052495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.524;QD=12.2339;RBI=0.0153934;REFB=0.0028543;REVB=-0.0144707;RO=79;SAF=31;SAR=15;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152759;STB=0.587475;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.0033012;OID=.;OPOS=77397519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:79:79:46:46:0.368:15:31:43:36:15:31:43:36 chr9 77407636 . C T 708.93 PASS AF=0.561983;AO=67;DP=121;FAO=68;FDP=121;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=16;FWDB=-0.00088119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.185;QD=23.4356;RBI=0.00311296;REFB=-0.0119837;REVB=-0.00298564;RO=54;SAF=38;SAR=29;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996949;STB=0.562763;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0101453;OID=.;OPOS=77407636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:54:53:67:68:0.561983:29:38:37:17:30:38:37:16 chr9 77415000 . T C 138.42 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=29;FWDB=0.00162319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9212;QD=11.7806;RBI=0.00447541;REFB=-0.00356685;REVB=0.00417067;RO=31;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344965;STB=0.694742;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00737443;OID=.;OPOS=77415000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:12:4:2:29:12:4:2:29 chr9 77415284 . A C 479.85 PASS AF=0.464286;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=-0.0192695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.583;QD=17.1374;RBI=0.0192695;REFB=0.000345351;REVB=-2.53599e-05;RO=60;SAF=27;SAR=25;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143397;STB=0.579555;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.000341577;OID=.;OPOS=77415284;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:60:60:52:52:0.464286:25:27:40:20:25:27:40:20 chr9 77472604 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.482;QD=54.5177;RBI=0.042149;REFB=0;REVB=-0.00296562;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347506;OID=.;OPOS=77472604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0 chr9 77518062 . C G 221.92 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0252596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.553;QD=25.3618;RBI=0.0267841;REFB=-0.017662;REVB=0.00890744;RO=14;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191618;STB=0.605965;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0049542;OID=.;OPOS=77518062;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:10:11:11:3:10:11:11:3 chr9 77684690 . A C 286.37 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0195522;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4632;QD=15.4795;RBI=0.0482024;REFB=-0.0142596;REVB=0.0440588;RO=42;SAF=16;SAR=16;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119807;STB=0.567526;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0160783;OID=.;OPOS=77684690;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:32:32:0.432432:16:16:16:26:16:16:16:26 chr9 78291861 . G T 387.64 PASS AF=0.458824;AO=27;DP=87;FAO=39;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00548412;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.434;QD=18.2418;RBI=0.00789428;REFB=-0.0110606;REVB=0.00567838;RO=44;SAF=13;SAR=14;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045458;STB=0.532451;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0191619;OID=.;OPOS=78291861;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:44:44:27:39:0.458824:14:13:21:23:18:21:21:23 chr9 78773953 . G A 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.878;QD=60.3767;RBI=0.0323231;REFB=0;REVB=0.0155224;RO=0;SAF=26;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16077e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109961;OID=.;OPOS=78773953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:48:26:0:0:48:26:0:0 chr9 78790153 . A G 256.47 PASS AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0520326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9143;QD=44.6037;RBI=0.055367;REFB=-0.0761011;REVB=0.018924;RO=2;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615001;STB=0.533302;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0124998;OID=.;OPOS=78790153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:14:7:0:2:14:7:0:2 chr9 79009106 . A C 137.61 PASS AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00572885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.735;QD=39.318;RBI=0.00695325;REFB=-0.0374293;REVB=0.00394056;RO=1;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603742;STB=0.533282;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00683985;OID=.;OPOS=79009106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:7:6:0:1:7:6:0:1 chr9 79118661 . A G 419.53 PASS AF=0.554054;AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0112013;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.436;QD=22.6772;RBI=0.0130199;REFB=-0.0272358;REVB=0.00663694;RO=33;SAF=17;SAR=24;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799879;STB=0.504405;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0145995;OID=.;OPOS=79118661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:33:33:41:41:0.554054:24:17:14:19:24:17:14:19 chr9 79119752 . C T 185.82 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0501036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.286;QD=19.0581;RBI=0.0547584;REFB=-0.0132945;REVB=-0.0220932;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721724;STB=0.54094;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0191913;OID=.;OPOS=79119752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:8:11:10:10:8:11:10:10 chr9 79120475 . A T 51.89 PASS AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.000622065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.767;QD=6.10491;RBI=0.00954695;REFB=-0.00810135;REVB=-0.00952666;RO=25;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30493;STB=0.703752;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0285695;OID=.;OPOS=79120475;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:34:25:26:8:8:0.235294:3:5:9:16:3:5:9:17 chr9 79121085 . G T 2120.8 PASS AF=0.992701;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0309263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0685;QD=61.9211;RBI=0.0414919;REFB=-0.0806418;REVB=-0.0276612;RO=1;SAF=59;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798889;STB=0.504201;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00669192;OID=.;OPOS=79121085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:137:1:1:135:136:0.992701:76:59:1:0:77:59:1:0 chr9 79121906 . C T 271.38 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0557722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.101;QD=23.5979;RBI=0.0745015;REFB=-0.0168918;REVB=-0.0493956;RO=21;SAF=8;SAR=17;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28786;STB=0.660647;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0353759;OID=.;OPOS=79121906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:17:8:14:7:17:8:14:7 chr9 79186729 . T C 68.49 PASS AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149162;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.931;QD=39.1347;RBI=0.0784946;REFB=0;REVB=0.0770643;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00687917;OID=.;OPOS=79186729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr9 79186750 . G T 129.48 PASS AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00252104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.726;QD=32.3698;RBI=0.0346113;REFB=-0.0395887;REVB=0.0345194;RO=3;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142717;STB=0.578833;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00601171;OID=.;OPOS=79186750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:5:8:3:0:5:8:3:0 chr9 79186765 . C G 147.67 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0339071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.786;QD=26.8491;RBI=0.0339112;REFB=-0.0660647;REVB=-0.000525841;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143879;STB=0.580534;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0315263;OID=.;OPOS=79186765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:5:10:3:4:5:10:3:4 chr9 79186781 . T C 186.55 PASS AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0256635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8335;QD=27.6364;RBI=0.0292793;REFB=-0.0298258;REVB=0.0140947;RO=9;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347362;STB=0.519292;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0114488;OID=.;OPOS=79186781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:9:9:18:18:0.666667:7:11:5:4:7:11:5:4 chr9 79186787 . C T 62.69 PASS AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00281523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.581;QD=8.08967;RBI=0.0118481;REFB=-0.00162108;REVB=-0.0115088;RO=22;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381968;STB=0.523756;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0026237;OID=.;OPOS=79186787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:3:6:14:8:3:6:14:8 chr9 79186820 . A C 389.87 PASS AF=0.679245;AO=36;DP=53;FAO=36;FDP=53;FR=.;FRO=17;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0285928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2574;QD=29.4241;RBI=0.0647525;REFB=0.000799368;REVB=-0.0580977;RO=17;SAF=25;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108929;STB=0.559448;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.00187549;OID=.;OPOS=79186820;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:17:17:36:36:0.679245:11:25:9:8:11:25:9:8 chr9 79318375 . GGTGACAGCCTGCAAC G 50.0 PASS AO=96;DP=122;LEN=15;RO=26;SAF=39;SAR=47;SRF=16;SRR=20;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=79318376;OREF=GTGACAGCCTGCAAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:122:26:96:47:39:16:20 chr9 79318471 . C T 1130.34 PASS AF=0.974359;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0159353;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.77;QD=57.9661;RBI=0.0160011;REFB=-0.0629043;REVB=-0.00144926;RO=2;SAF=32;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392447;STB=0.502074;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00188667;OID=.;OPOS=79318471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:79:78:2:2:76:76:0.974359:44:32:1:1:44:32:1:1 chr9 79318677 . T C 1528.92 PASS AF=0.990476;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0225963;FXX=0.00943307;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.2186;QD=58.2445;RBI=0.0606603;REFB=-0.0256918;REVB=0.0562946;RO=1;SAF=60;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784321;STB=0.504064;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00103388;OID=.;OPOS=79318677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:105:1:1:103:104:0.990476:43:60:1:0:43:61:1:0 chr9 79318921 . A G 315.48 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0155618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.289;QD=22.5343;RBI=0.0164692;REFB=-0.0415536;REVB=0.00539125;RO=23;SAF=12;SAR=20;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081517;STB=0.537359;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0206472;OID=.;OPOS=79318921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:24:32:32:0.571429:20:12:11:12:20:12:11:13 chr9 79318998 . A G 340.52 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.003;QD=54.4829;RBI=0.0272364;REFB=0;REVB=-0.00329471;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207819;OID=.;OPOS=79318998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0 chr9 79320095 . T G 353.65 PASS AF=0.438202;AO=37;DP=87;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.00843216;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.233;QD=15.8943;RBI=0.00915378;REFB=-0.0166521;REVB=0.00356236;RO=48;SAF=13;SAR=24;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199681;STB=0.526789;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0304069;OID=.;OPOS=79320095;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:48:50:37:39:0.438202:24:13:16:32:24:15:17:33 chr9 79320640 . C T 943.82 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171146;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.628;QD=58.0814;RBI=0.0508619;REFB=0;REVB=0.0478959;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556804;OID=.;OPOS=79320640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:65:0:0:62:65:1:35:27:0:0:37:28:0:0 chr9 79320847 . G C 119.65 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.000204687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.406;QD=13.6746;RBI=0.0140175;REFB=-0.0234255;REVB=-0.014016;RO=20;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176831;STB=0.594448;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.019315;OID=.;OPOS=79320847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:21:14:14:0.4:3:11:13:7:3:11:14:7 chr9 79321276 . T C 801.25 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0086;QD=57.2323;RBI=0.0533093;REFB=0;REVB=0.0394139;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00067099;OID=.;OPOS=79321276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0 chr9 79321871 . C T 524.2 PASS AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00356587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.845;QD=21.3959;RBI=0.0105286;REFB=-0.0267213;REVB=-0.00990632;RO=48;SAF=30;SAR=20;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108764;STB=0.560142;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0261123;OID=.;OPOS=79321871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:20:30:23:25:20:30:23:25 chr9 79322068 . G T 303.99 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0544533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7341;QD=19.9334;RBI=0.0633968;REFB=0.016942;REVB=-0.0324652;RO=29;SAF=13;SAR=19;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963235;STB=0.553556;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.0168436;OID=.;OPOS=79322068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:19:13:15:14:19:13:15:14 chr9 79322674 . A G 1323.9 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0849781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9467;QD=60.8688;RBI=0.0862152;REFB=-0.134987;REVB=0.0145524;RO=1;SAF=42;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111471;STB=0.505881;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00248148;OID=.;OPOS=79322674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:44:42:1:0:44:42:1:0 chr9 79322720 . A G 824.54 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153799;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.753;QD=55.9012;RBI=0.0159388;REFB=-0.0741628;REVB=0.00418384;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419761;OID=.;OPOS=79322720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:59:59:0:0:58:59:1:31:27:0:0:31:28:0:0 chr9 79324179 . G A 161.81 PASS AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0183058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.282;QD=28.1411;RBI=0.0278968;REFB=-0.00811411;REVB=0.0210507;RO=7;SAF=1;SAR=15;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.641942;STB=0.867176;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00455869;OID=.;OPOS=79324179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:7:7:16:16:0.695652:15:1:6:1:15:1:6:1 chr9 79324439 . A G 435.74 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.00285523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.578;QD=18.5423;RBI=0.00393938;REFB=-0.0145559;REVB=-0.0027141;RO=50;SAF=21;SAR=23;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742024;STB=0.541324;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0096754;OID=.;OPOS=79324439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:23:21:20:30:23:21:20:30 chr9 79324741 . T C 534.86 PASS AF=0.459677;AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=-0.0044401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8945;QD=17.2534;RBI=0.0750294;REFB=0.014376;REVB=0.0748979;RO=67;SAF=32;SAR=25;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124592;STB=0.569306;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.0178127;OID=.;OPOS=79324741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:67:57:57:0.459677:25:32:29:38:25:32:29:38 chr9 79324955 . C T 230.64 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00778913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.252;QD=17.7417;RBI=0.00808019;REFB=-0.0140989;REVB=-0.00214918;RO=27;SAF=8;SAR=17;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159316;STB=0.590008;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0191395;OID=.;OPOS=79324955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:17:8:13:14:17:8:13:14 chr9 79325297 . T G 1210.03 PASS AF=0.566502;AO=115;DP=203;FAO=115;FDP=203;FR=.;FRO=88;FSAF=69;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=0.0135263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.027;QD=23.843;RBI=0.0177376;REFB=-0.0127373;REVB=0.0114744;RO=88;SAF=69;SAR=46;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540611;STB=0.529407;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00860691;OID=.;OPOS=79325297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:88:88:115:115:0.566502:46:69:47:41:46:69:47:41 chr9 79325381 . AT A 41.1 PASS AF=0.194872;AO=50;DP=200;FAO=38;FDP=195;FR=.;FRO=157;FSAF=34;FSAR=4;FSRF=75;FSRR=82;FWDB=-0.126497;FXX=0.0249988;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.11842;QD=0.843051;RBI=0.279991;REFB=-0.0718076;REVB=0.249786;RO=123;SAF=45;SAR=5;SRF=56;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0.34375;SSSB=0.611194;STB=0.870026;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.075218;OID=.;OPOS=79325382;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.194872:50:200:38:195:157:34:4:75:82:41:123:45:5:56:67 chr9 79325558 . G C 267.88 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0312667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6383;QD=16.2353;RBI=0.0395987;REFB=0.00187527;REVB=-0.0242992;RO=35;SAF=17;SAR=13;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089568;STB=0.556331;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=-0.00269939;OID=.;OPOS=79325558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:35:36:30:30:0.454545:13:17:23:12:13:17:24:12 chr9 79325615 . A G 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.618;QD=60.6098;RBI=0.0185944;REFB=0;REVB=-0.0128524;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000473797;OID=.;OPOS=79325615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:10:28:0:0:10:28:0:0 chr9 79325759 . C T 300.33 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0127235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.26;QD=24.5165;RBI=0.0582508;REFB=0.00928971;REVB=-0.0568443;RO=22;SAF=21;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267792;STB=0.650152;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00383648;OID=.;OPOS=79325759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:6:21:11:11:6:21:11:11 chr9 79471995 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.527;QD=57.6807;RBI=0.0407002;REFB=0;REVB=0.00644001;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90159e-05;OID=.;OPOS=79471995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0 chr9 80049298 . C T 2003.33 PASS AF=0.977612;AO=131;DP=134;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00938292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.873;QD=59.8009;RBI=0.0219945;REFB=-0.215606;REVB=0.0198927;RO=1;SAF=71;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785553;STB=0.512193;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00087897;OID=.;OPOS=80049298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:134:134:1:3:131:131:0.977612:60:71:0:1:60:71:0:3 chr9 80250143 . C T 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.903;QD=52.6132;RBI=0.0791633;REFB=0;REVB=0.0163647;RO=0;SAF=3;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384167;OID=.;OPOS=80250143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:19:3:0:0:19:3:0:0 chr9 80335438 . A C 304.06 PASS AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.000431328;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=66.8657;QD=14.8322;RBI=0.00297113;REFB=-0.00339687;REVB=-0.00293966;RO=48;SAF=13;SAR=21;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146764;STB=0.508316;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00260523;OID=.;OPOS=80335438;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:21:13:19:29:21:13:19:29 chr9 80780470 . C T 792.84 PASS AF=0.516779;AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0436587;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.2476;QD=21.2843;RBI=0.0591151;REFB=-0.0114732;REVB=-0.0398562;RO=66;SAF=40;SAR=37;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547003;STB=0.522824;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0188651;OID=.;OPOS=80780470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:66:72:77:77:0.516779:37:40:30:36:37:40:34:38 chr9 80851350 . G C 480.11 PASS AF=0.534091;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0617684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8833;QD=21.823;RBI=0.0633117;REFB=-0.0336807;REVB=-0.0138937;RO=39;SAF=25;SAR=22;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266951;STB=0.525075;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.034899;OID=.;OPOS=80851350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:39:41:47:47:0.534091:22:25:22:17:22:25:24:17 chr9 80912115 . G C 382.57 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7356;QD=52.768;RBI=0.0800262;REFB=-0.0716011;REVB=-0.0774662;RO=1;SAF=18;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251595;STB=0.513504;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00948709;OID=.;OPOS=80912115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:10:18:1:0:10:18:1:0 chr9 80919756 . T G 193.12 PASS AF=0.375;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0209894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.587;QD=12.0701;RBI=0.0213722;REFB=-0.00330079;REVB=-0.00402701;RO=39;SAF=8;SAR=16;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145633;STB=0.593326;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0070291;OID=.;OPOS=80919756;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:39:40:24:24:0.375:16:8:18:21:16:8:19:21 chr9 82187750 . A G 1607.13 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0071888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.693;QD=64.2853;RBI=0.0188124;REFB=0;REVB=-0.0173847;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72321e-05;OID=.;OPOS=82187750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:54:45:0:0:54:46:0:0 chr9 82341457 . GAAAA G 50.0 PASS AO=51;DP=86;LEN=4;RO=35;SAF=32;SAR=43;SRF=6;SRR=5;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=82341458;OREF=AAAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:86:35:51:43:32:6:5 chr9 84267147 . T C 356.23 PASS AF=0.39;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.00874185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3943;QD=14.2494;RBI=0.0110569;REFB=-0.00991052;REVB=0.00677011;RO=61;SAF=23;SAR=16;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355887;STB=0.520242;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0138549;OID=.;OPOS=84267147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:61:61:39:39:0.39:16:23:34:27:16:23:34:27 chr9 84607758 . T A 1048.37 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0318847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.841;QD=58.2425;RBI=0.0478062;REFB=-0.149211;REVB=0.0356202;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.508194;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000652738;OID=.;OPOS=84607758;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:30:41:0:0:30:41:0:1 chr9 85627408 . G A 439.46 PASS AF=0.441441;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.0221551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.181;QD=15.8366;RBI=0.0263004;REFB=-0.00811728;REVB=0.0141725;RO=59;SAF=27;SAR=22;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250447;STB=0.516772;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0097217;OID=.;OPOS=85627408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:62:49:49:0.441441:22:27:34:25:22:27:36:26 chr9 86278817 . C A 471.17 PASS AF=0.505495;AO=45;DP=90;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00387791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.865;QD=20.7109;RBI=0.0109758;REFB=-0.0139935;REVB=0.0102679;RO=45;SAF=23;SAR=22;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401505;STB=0.516771;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0125778;OID=.;OPOS=86278817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:45:45:45:46:0.505495:22:23:25:20:22:24:25:20 chr9 86284178 . C A 1588.52 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.401;QD=64.1824;RBI=0.00982649;REFB=0;REVB=0.0095045;RO=0;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15154e-06;OID=.;OPOS=86284178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:99:0:0:97:99:1:40:57:0:0:40:59:0:0 chr9 86327898 . C T 1102.05 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020036;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.227;QD=60.3866;RBI=0.0208677;REFB=0;REVB=0.00583263;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.23517e-05;OID=.;OPOS=86327898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0 chr9 86414186 . C T 322.99 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0744158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.971;QD=21.8979;RBI=0.0822889;REFB=-0.0194381;REVB=-0.0351247;RO=26;SAF=19;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611461;STB=0.533798;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0207255;OID=.;OPOS=86414186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:14:19:13:13:14:19:13:13 chr9 86468715 . A T 935.83 PASS AF=0.930556;AO=67;DP=72;FAO=67;FDP=72;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0191356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.972;QD=51.9906;RBI=0.034081;REFB=-0.0557334;REVB=0.0282018;RO=5;SAF=25;SAR=42;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856179;STB=0.545441;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.000466848;OID=.;OPOS=86468715;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:72:72:5:5:67:67:0.930556:42:25:5:0:42:25:5:0 chr9 86474115 . T C 580.7 PASS AF=0.487805;AO=60;DP=123;FAO=60;FDP=123;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0155288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.717;QD=18.8846;RBI=0.0160401;REFB=-0.00668861;REVB=0.00401758;RO=62;SAF=35;SAR=25;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17947;STB=0.59511;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0123847;OID=.;OPOS=86474115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:62:63:60:60:0.487805:25:35:24:38:25:35:25:38 chr9 86518796 . T C 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0509621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4678;QD=19.3695;RBI=0.061388;REFB=0.00916789;REVB=-0.034225;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24656;STB=0.639826;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00898919;OID=.;OPOS=86518796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:10:6:10:5:10:6:10:5 chr9 86585776 . A T 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00486164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.103;QD=15.7382;RBI=0.00673062;REFB=-0.0109167;REVB=0.00465464;RO=36;SAF=20;SAR=9;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347623;STB=0.696068;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00850376;OID=.;OPOS=86585776;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:9:20:12:24:9:20:12:24 chr9 86591903 . T C 398.86 PASS AF=0.38843;AO=47;DP=121;FAO=47;FDP=121;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00510864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.015;QD=13.1854;RBI=0.0618018;REFB=0.000782798;REVB=0.0615903;RO=72;SAF=23;SAR=24;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00347551;STB=0.501759;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=-0.00129097;OID=.;OPOS=86591903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:72:74:47:47:0.38843:24:23:35:37:24:23:36:38 chr9 86617265 . A G 820.16 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.001;QD=55.6038;RBI=0.0391417;REFB=0.0141417;REVB=0.0256979;RO=1;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159891;STB=0.508472;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.000729802;OID=.;OPOS=86617265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:29:29:0:1:29:29:0:1 chr9 86618231 . T TA 309.78 PASS AF=1;AO=6;DP=51;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797617;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=8.13653;QD=25.8146;RBI=0.0654273;REFB=0;REVB=-0.0649393;RO=43;SAF=1;SAR=5;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452789;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-3.91499e-05;OID=.;OPOS=86618232;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:51:48:48:0:24:24:0:0:8:43:1:5:24:19 chr9 86618233 . C A,T 615.82 PASS AF=0.843137,0.117647;AO=39,6;DP=47;FAO=43,6;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=23,1;FSAR=20,5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00793323,0.00450019;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.0325,17.9087;QD=48.2998;RBI=0.0369083,0.00611836;REFB=-0.184416,-0.0446537;REVB=0.0360456,0.00414519;RO=1;SAF=21,1;SAR=18,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0253303,0.0789211;STB=0.501557,0.624528;STBP=0.868,0.369;TYPE=snp,snp;VARB=0.0134069,0.0859046;OID=.,.;OPOS=86618233,86618233;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:18:47:51:1:2:39,6:43,6:0.843137,0.117647:18,5:21,1:0:1:20,5:23,1:1:1 chr9 86618699 . ACAT A 171.11 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00582479;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=3;MLLD=347.498;QD=12.4443;RBI=0.012397;REFB=-0.00703545;REVB=-0.0109433;RO=33;SAF=12;SAR=9;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00468065;STB=0.510628;STBP=0.917;TYPE=del;VARB=0.0121757;OID=.;OPOS=86618700;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.381818:21:56:21:55:34:12:9:20:14:99:33:12:9:19:14 chr9 86895771 . G A 347.45 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.0310649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.35;QD=17.1581;RBI=0.0310649;REFB=-0.00743774;REVB=-1.53257e-05;RO=42;SAF=19;SAR=18;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123765;STB=0.579435;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00775259;OID=.;OPOS=86895771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:44:37:37:0.45679:18:19:27:15:18:19:29:15 chr9 86900926 . G A 527.1 PASS AF=0.470588;AO=56;DP=119;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=0.0199664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.688;QD=17.7176;RBI=0.0208566;REFB=-0.0186406;REVB=0.00602833;RO=62;SAF=22;SAR=34;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218394;STB=0.506622;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.018229;OID=.;OPOS=86900926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:62:63:56:56:0.470588:34:22:23:39:34:22:24:39 chr9 86907537 . C A 208.38 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.0680677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.863;QD=11.418;RBI=0.0681414;REFB=-0.0137586;REVB=-0.00316689;RO=47;SAF=10;SAR=16;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298864;STB=0.672004;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0316705;OID=.;OPOS=86907537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:16:10:31:16:16:10:31:16 chr9 86920236 . T C 901.62 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00208638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.535;QD=58.1693;RBI=0.00709739;REFB=0;REVB=0.0067838;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53473e-05;OID=.;OPOS=86920236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:40:21:0:0:40:22:0:0 chr9 88275838 . T A 919.3 PASS AF=0.50838;AO=91;DP=178;FAO=91;FDP=179;FR=.;FRO=88;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.0169689;FXX=0.0110491;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0929;QD=20.5431;RBI=0.0203382;REFB=-0.0120536;REVB=-0.0112116;RO=87;SAF=43;SAR=48;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526501;STB=0.525745;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0142368;OID=.;OPOS=88275838;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:87:88:91:91:0.50838:48:43:36:51:48:43:37:51 chr9 88692336 . C T 425.41 PASS AF=0.525;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0165714;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.058;QD=21.2704;RBI=0.0494591;REFB=0.0136279;REVB=0.0466003;RO=39;SAF=25;SAR=17;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417398;STB=0.531235;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=-0.00996473;OID=.;OPOS=88692336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:39:38:42:42:0.525:17:25:25:14:17:25:25:13 chr9 88694179 . G T 208.71 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0249876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.62;QD=18.1488;RBI=0.0250173;REFB=-0.0324423;REVB=0.00121861;RO=25;SAF=6;SAR=15;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43925;STB=0.748276;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0765967;OID=.;OPOS=88694179;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:15:6:19:6:15:6:19:6 chr9 88937851 . ATTT A 794.67 PASS AF=1;AO=63;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0462382;FXX=0.0294074;HRUN=7;LEN=3;MLLD=36.0278;QD=48.1617;RBI=0.0860169;REFB=0;REVB=0.0725324;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.87341e-05;OID=.;OPOS=88937852;OREF=TTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:63:66:66:66:0:41:25:0:0:14:0:38:25:0:0 chr9 88959938 . C T 1179.52 PASS AF=0.952381;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0163573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.32;QD=56.1674;RBI=0.0177658;REFB=0.0188545;REVB=-0.0069327;RO=2;SAF=47;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416352;STB=0.504291;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.00221531;OID=.;OPOS=88959938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:84:84:2:4:80:80:0.952381:33:47:1:1:33:47:2:2 chr9 89772284 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.185;QD=52.6129;RBI=0.0393002;REFB=0;REVB=0.0390385;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342677;OID=.;OPOS=89772284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr9 90321583 . C T 35.2 PASS AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0252696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.028;QD=5.21551;RBI=0.0255726;REFB=-0.0226834;REVB=0.00392479;RO=20;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832872;STB=0.540403;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0567432;OID=.;OPOS=90321583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:20:21:6:6:0.222222:4:2:8:12:4:2:8:13 chr9 90322023 . G A 937.88 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.844;QD=58.6173;RBI=0.0346131;REFB=0;REVB=0.0340937;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11923e-05;OID=.;OPOS=90322023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:23:40:0:0:23:41:0:0 chr9 90343780 . A C 727.77 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.076;QD=63.2847;RBI=0.0499371;REFB=0;REVB=2.07883e-05;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188727;OID=.;OPOS=90343780;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:27:18:0:0:28:18:0:0 chr9 90388539 . T A 1240.24 PASS AF=0.987805;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0568873;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.665;QD=60.4995;RBI=0.0677568;REFB=-0.0915539;REVB=0.0368079;RO=1;SAF=47;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00996796;STB=0.505153;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000420474;OID=.;OPOS=90388539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:80:81:0.987805:33:47:1:0:33:48:1:0 chr9 90396135 . G A 576.35 PASS AF=0.508621;AO=59;DP=116;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0307464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.914;QD=19.8742;RBI=0.0334044;REFB=-0.0117823;REVB=-0.0130582;RO=57;SAF=37;SAR=22;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774653;STB=0.542773;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0124065;OID=.;OPOS=90396135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:57:59:59:0.508621:22:37:31:26:22:37:31:26 chr9 90500405 . A C 463.81 PASS AF=0.480769;AO=48;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00310999;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.595;QD=17.8389;RBI=0.00379951;REFB=-0.00772549;REVB=0.00218272;RO=53;SAF=20;SAR=28;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348442;STB=0.522718;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00841722;OID=.;OPOS=90500405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:53:54:48:50:0.480769:28:20:24:29:29:21:25:29 chr9 90501448 . C A 681.97 PASS AF=0.539062;AO=64;DP=123;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00206747;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.252;QD=21.3117;RBI=0.025713;REFB=-0.0273646;REVB=0.0256297;RO=55;SAF=26;SAR=38;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178288;STB=0.581435;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0460237;OID=.;OPOS=90501448;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:128:55:59:64:69:0.539062:38:26:34:21:38:31:37:22 chr9 90502458 . T A 267.51 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0308753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4035;QD=21.8376;RBI=0.0519524;REFB=-0.0385636;REVB=-0.0417824;RO=24;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163095;STB=0.591522;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0364587;OID=.;OPOS=90502458;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:9:16:11:13:9:16:11:13 chr9 90502819 . T C 775.97 PASS AF=0.532374;AO=74;DP=139;FAO=74;FDP=139;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.0217749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.021;QD=22.3301;RBI=0.0264683;REFB=-0.00751951;REVB=-0.0150474;RO=65;SAF=32;SAR=42;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384237;STB=0.521066;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00774734;OID=.;OPOS=90502819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:65:65:74:74:0.532374:42:32:31:34:42:32:31:34 chr9 90503007 . A G 203.04 PASS AF=0.27451;AO=28;DP=101;FAO=28;FDP=102;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=0.015179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5509;QD=7.96234;RBI=0.0251725;REFB=-0.0155271;REVB=-0.0200812;RO=71;SAF=12;SAR=16;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078132;STB=0.561754;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0300916;OID=.;OPOS=90503007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:71:74:28:28:0.27451:16:12:35:36:16:12:38:36 chr9 90503451 . G A 390.97 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00253638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7693;QD=16.6368;RBI=0.0108753;REFB=-0.00231918;REVB=-0.0105754;RO=53;SAF=24;SAR=17;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133406;STB=0.574963;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00397047;OID=.;OPOS=90503451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:17:24:24:29:17:24:24:29 chr9 90538288 . C T 313.34 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.158353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4566;QD=50.1337;RBI=0.158607;REFB=-0.0458235;REVB=0.00897363;RO=1;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343222;STB=0.518503;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00346294;OID=.;OPOS=90538288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:13:11:0:1:13:11:0:1 chr9 91652414 . A T 1157.22 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0488823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.619;QD=59.3445;RBI=0.0488825;REFB=0.0187234;REVB=-0.000136599;RO=1;SAF=44;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106357;STB=0.505617;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=6.28075e-05;OID=.;OPOS=91652414;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:33:44:1:0:33:44:1:0 chr9 91656963 . T C 1028.67 PASS AF=0.972973;AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00489337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.547;QD=55.6039;RBI=0.00556748;REFB=-0.000969234;REVB=-0.0026555;RO=2;SAF=40;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00333423;STB=0.501912;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000101051;OID=.;OPOS=91656963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:74:74:2:2:71:72:0.972973:31:40:1:1:31:41:1:1 chr9 92003679 . C T 1460.1 PASS AF=1;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00228598;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.428;QD=63.4825;RBI=0.00238382;REFB=0;REVB=0.000675913;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.59647e-05;OID=.;OPOS=92003679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:92:0:0:92:92:1:49:43:0:0:49:43:0:0 chr9 92221010 . C T 218.99 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0150591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9261;QD=23.6745;RBI=0.0199501;REFB=0.027111;REVB=-0.0130854;RO=15;SAF=2;SAR=19;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763205;STB=0.535176;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0201205;OID=.;OPOS=92221010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:16:21:21:0.567568:19:2:2:13:19:2:2:14 chr9 93629630 . T C 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.789;QD=57.712;RBI=0.0345081;REFB=0;REVB=0.0123232;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3627e-05;OID=.;OPOS=93629630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chr9 93637015 . C T 1939.39 PASS AF=0.984496;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0236622;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.062;QD=60.1361;RBI=0.0285783;REFB=-0.136198;REVB=0.0160256;RO=1;SAF=66;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0071454;STB=0.507352;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.000978365;OID=.;OPOS=93637015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:128:129:1:2:126:127:0.984496:60:66:1:0:60:67:2:0 chr9 93639973 . G C 1866.43 PASS AF=0.984;AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=125;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0390689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.318;QD=59.7259;RBI=0.0417791;REFB=-0.110221;REVB=0.0148024;RO=2;SAF=68;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01696;STB=0.508927;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000733287;OID=.;OPOS=93639973;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:125:125:2:2:123:123:0.984:55:68:0:2:55:68:0:2 chr9 93640009 . G A 2053.47 PASS AF=0.985185;AO=133;DP=135;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00631256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.471;QD=60.8436;RBI=0.038702;REFB=0.000367168;REVB=0.0381838;RO=2;SAF=63;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148484;STB=0.507811;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=2.13268e-05;OID=.;OPOS=93640009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:135:135:2:2:133:133:0.985185:70:63:2:0:70:63:2:0 chr9 93641175 . C T 1606.86 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.708;QD=60.0694;RBI=0.0267998;REFB=0;REVB=-0.0060217;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.34898e-05;OID=.;OPOS=93641175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:53:54:0:0:53:54:0:0 chr9 93641199 . T C 1414.58 PASS AF=0.968421;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0075918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=324.885;QD=59.5612;RBI=0.0080358;REFB=0.019865;REVB=-0.00263413;RO=1;SAF=48;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977435;STB=0.505957;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=-0.000184643;OID=.;OPOS=93641199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:95:95:1:3:92:92:0.968421:44:48:1:0:44:48:1:2 chr9 94456643 . G C 275.62 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00652233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.027;QD=18.0731;RBI=0.00965124;REFB=-0.0139359;REVB=-0.00711376;RO=31;SAF=13;SAR=17;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735077;STB=0.54103;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0354599;OID=.;OPOS=94456643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:17:13:11:20:17:13:11:20 chr9 94456705 . T A 95.11 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0235594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.6153;QD=12.6813;RBI=0.0333337;REFB=-0.0616815;REVB=-0.0235815;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1654;STB=0.545363;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.102574;OID=.;OPOS=94456705;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:30:30:10:17:8:10:0.333333:6:2:4:6:6:4:8:9 chr9 94456714 . C T 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00110916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=372.506;QD=14.0975;RBI=0.00146293;REFB=-0.00242668;REVB=-0.000953899;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660375;STB=0.522354;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00313175;OID=.;OPOS=94456714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:7:6:9:8:7:6:9:9 chr9 94486321 . C T 144.82 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=0.0127088;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5513;QD=14.8529;RBI=0.0164101;REFB=-0.00343131;REVB=0.0103816;RO=23;SAF=13;SAR=3;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103439;STB=0.559254;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00227608;OID=.;OPOS=94486321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:23:23:16:16:0.410256:3:13:20:3:3:13:20:3 chr9 94518328 . C T 461.13 PASS AF=0.529412;AO=44;DP=87;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00803089;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.963;QD=21.7002;RBI=0.0205968;REFB=-0.0108827;REVB=-0.0189666;RO=40;SAF=20;SAR=24;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918489;STB=0.545435;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00942786;OID=.;OPOS=94518328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:40:40:44:45:0.529412:24:20:14:26:25:20:14:26 chr9 95219248 . A G 1302.11 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0994011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6936;QD=62.005;RBI=0.102358;REFB=0;REVB=0.0244257;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327749;OID=.;OPOS=95219248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0 chr9 95219597 . G A 673.86 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437319;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.837;QD=62.6849;RBI=0.0447389;REFB=0;REVB=-0.00943906;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137652;OID=.;OPOS=95219597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0 chr9 95237024 . CTCA C 102.43 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=30;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00801491;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=3;MLLD=141.055;QD=14.6335;RBI=0.0875738;REFB=-0.0593277;REVB=-0.0872063;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268092;STB=0.586802;STBP=0.467;TYPE=del;VARB=0.0876657;OID=.;OPOS=95237025;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:9:30:12:28:16:9:3:10:6:99:14:6:3:9:5 chr9 95284982 . T G 1775.34 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.743;QD=60.6955;RBI=0.0477073;REFB=0;REVB=0.00726487;RO=0;SAF=62;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.22196e-05;OID=.;OPOS=95284982;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:112:117:0:0:112:117:1:50:62:0:0:52:65:0:0 chr9 95380726 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.232;QD=53.9111;RBI=0.0360222;REFB=0;REVB=-0.0297449;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000732253;OID=.;OPOS=95380726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr9 95475352 . G A 219.04 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.123;QD=46.1131;RBI=0.0493259;REFB=-0.0942105;REVB=0.01263;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00651258;OID=.;OPOS=95475352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:19:19:0:0:18:19:1:8:10:0:0:9:10:0:0 chr9 95609564 . C T 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.513;QD=57.5453;RBI=0.027821;REFB=0;REVB=0.0260135;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.89864e-05;OID=.;OPOS=95609564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0 chr9 95780465 . A G 1457.45 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0026632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.858;QD=62.0193;RBI=0.0360271;REFB=-0.114785;REVB=0.0359286;RO=0;SAF=36;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09153e-08;STB=0.504347;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00143844;OID=.;OPOS=95780465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:94:0:1:93:93:0.989362:57:36:0:0:57:36:0:1 chr9 95887320 . G T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.705;QD=58.5875;RBI=0.0720817;REFB=0;REVB=0.0361458;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103655;OID=.;OPOS=95887320;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr9 96015256 . C T 310.14 PASS AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0278336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.969;QD=28.8497;RBI=0.0278488;REFB=-0.0337225;REVB=-0.000922002;RO=16;SAF=8;SAR=19;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152989;STB=0.58455;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0178458;OID=.;OPOS=96015256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:19:8:8:8:19:8:8:8 chr9 96021312 . G A 233.6 PASS AF=0.424242;AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=0.0532142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.413;QD=14.1573;RBI=0.0547074;REFB=-0.00783441;REVB=0.0126946;RO=38;SAF=3;SAR=24;SRF=5;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505129;STB=0.534733;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0108394;OID=.;OPOS=96021312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:38:38:27:28:0.424242:24:3:5:33:25:3:5:33 chr9 96024371 . G A 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0365223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.119;QD=17.6438;RBI=0.0549833;REFB=-0.0159763;REVB=0.0411008;RO=7;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569092;STB=0.533255;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0112919;OID=.;OPOS=96024371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:8:1:1:6:8:1:1:6 chr9 96051521 . A G 223.18 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.902;QD=49.5951;RBI=0.0189174;REFB=0;REVB=0.00485299;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.87808e-05;OID=.;OPOS=96051521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr9 96051839 . C A 111.6 PASS AF=0.464286;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00289399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3783;QD=15.9427;RBI=0.0868823;REFB=-0.0350409;REVB=0.0868341;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173698;STB=0.615207;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0458374;OID=.;OPOS=96051839;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:28:15:15:12:13:0.464286:7:5:9:6:8:5:9:6 chr9 96097747 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.904;QD=55.6561;RBI=0.0537888;REFB=0;REVB=0.0462115;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258005;OID=.;OPOS=96097747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr9 96209943 . T C 219.21 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00285283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.223;QD=13.9183;RBI=0.00587149;REFB=-0.0223946;REVB=0.00513184;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791394;STB=0.537672;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.033175;OID=.;OPOS=96209943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:37:26:26:0.412698:11:15:18:18:11:15:19:18 chr9 96214928 . G A 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00117111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.783;QD=11.8308;RBI=0.00670052;REFB=-0.0100426;REVB=0.00659738;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254975;STB=0.652768;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0176585;OID=.;OPOS=96214928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:8:3:9:9:8:3:9:9 chr9 96238578 . C T 237.61 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00347072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.941;QD=13.7745;RBI=0.0169325;REFB=-0.00891906;REVB=-0.016573;RO=41;SAF=15;SAR=13;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522613;STB=0.529759;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0101084;OID=.;OPOS=96238578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:13:15:24:17:13:15:24:17 chr9 96278460 . G A 104.64 PASS AF=0.209877;AO=17;DP=81;FAO=17;FDP=81;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=16;FWDB=-0.0462411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.32;QD=5.16739;RBI=0.0463138;REFB=-0.010975;REVB=-0.00259369;RO=64;SAF=11;SAR=6;SRF=48;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15137;STB=0.593859;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0436133;OID=.;OPOS=96278460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:64:64:17:17:0.209877:6:11:48:16:6:11:48:16 chr9 96407983 . C T 578.02 PASS AF=0.472868;AO=60;DP=129;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0451817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.891;QD=17.923;RBI=0.0466116;REFB=-0.0035875;REVB=0.0114567;RO=67;SAF=27;SAR=33;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165172;STB=0.509479;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00462758;OID=.;OPOS=96407983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:67:68:60:61:0.472868:33:27:29:38:33:28:30:38 chr9 96439007 . G T 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0429205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.461;QD=11.0196;RBI=0.0438115;REFB=-0.0187769;REVB=0.00879087;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389464;STB=0.721754;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00209683;OID=.;OPOS=96439007;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:5:1:0:8:5:1:0:8 chr9 96441750 . C T 230.58 PASS AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0224543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.299;QD=12.1357;RBI=0.0245022;REFB=-0.00247152;REVB=0.00980621;RO=48;SAF=14;SAR=14;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114459;STB=0.565743;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00557349;OID=.;OPOS=96441750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:48:48:28:28:0.368421:14:14:19:29:14:14:19:29 chr9 96714491 . C G 126.94 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0486081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5879;QD=19.5293;RBI=0.0486849;REFB=-0.0106694;REVB=0.00273366;RO=9;SAF=12;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311305;STB=0.760131;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0073479;OID=.;OPOS=96714491;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:24:26:9:12:14:14:0.538462:2:12:5:4:2:12:5:7 chr9 96860722 . T A 81.96 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0689177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.136;QD=8.62781;RBI=0.07168;REFB=-0.00405862;REVB=-0.0197072;RO=27;SAF=5;SAR=6;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201073;STB=0.622427;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00594453;OID=.;OPOS=96860722;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:6:5:17:10:6:5:17:10 chr9 97055310 . C T 314.6 PASS AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=-0.0286113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5027;QD=24.1996;RBI=0.0375953;REFB=-0.0175572;REVB=-0.0243886;RO=21;SAF=26;SAR=5;SRF=21;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266781;STB=0.643764;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.011098;OID=.;OPOS=97055310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:5:26:21:0:5:26:21:0 chr9 97080944 . GAGA G 320.19 PASS AF=1;AO=21;DP=26;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.01619e-06;FXX=0.148093;HRUN=1;LEN=3;MLLD=215.094;QD=55.6856;RBI=0.0123573;REFB=0;REVB=-0.0123573;RO=4;SAF=0;SAR=21;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.862203;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-3.57949e-05;OID=.;OPOS=97080945;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:21:26:23:23:0:0:23:0:0:3:4:0:21:3:1 chr9 97081010 . T G 35.31 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.00820118;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.331;QD=4.55555;RBI=0.0249566;REFB=-0.0100549;REVB=-0.0235705;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275166;STB=0.676903;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0402352;OID=.;OPOS=97081010;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:32:31:22:25:6:6:0.193548:3:3:6:16:3:3:7:18 chr9 97081252 . G C 42.3 PASS AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0331529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.718;QD=4.70049;RBI=0.0353799;REFB=-0.00205245;REVB=-0.0123539;RO=29;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300576;STB=0.691864;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0248622;OID=.;OPOS=97081252;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:36:36:29:29:7:7:0.194444:4:3:6:23:4:3:6:23 chr9 97081263 . G C 41.97 PASS AF=0.184211;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=38;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=-0.00850848;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.009;QD=4.4184;RBI=0.0136891;REFB=-0.0171183;REVB=-0.0107237;RO=31;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323681;STB=0.706854;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0375226;OID=.;OPOS=97081263;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:38:31:31:7:7:0.184211:4:3:6:25:4:3:6:25 chr9 97222891 . CC TG 156.78 PASS AF=0.318182;AO=21;DP=67;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0048062;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=2;MLLD=232.63;QD=9.50153;RBI=0.0195715;REFB=-0.00220472;REVB=-0.0189721;RO=45;SAF=14;SAR=7;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135941;STB=0.580566;STBP=0.369;TYPE=mnp;VARB=0.00852761;OID=.;OPOS=97222891;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:45:45:21:21:0.318182:7:14:25:20:7:14:25:20 chr9 97349666 . C G 1210.14 PASS AF=0.987805;AO=78;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200802;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.603;QD=59.0312;RBI=0.0493853;REFB=-0.0204701;REVB=0.0451187;RO=1;SAF=32;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145613;STB=0.507245;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000263362;OID=.;OPOS=97349666;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:78:81:0.987805:46:32:1:0:47:34:1:0 chr9 97365720 . T C 1037.69 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.971;QD=59.2964;RBI=0.0506873;REFB=0;REVB=0.0490142;RO=0;SAF=45;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47552e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48817e-05;OID=.;OPOS=97365720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:70:0:0:66:70:1:21:45:0:0:22:48:0:0 chr9 97369149 . C T 1134.27 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.5758;QD=60.4943;RBI=0.0195814;REFB=0;REVB=-0.00670565;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000201688;OID=.;OPOS=97369149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0 chr9 97369151 . G A 1102.49 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00766735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.732;QD=58.7997;RBI=0.0161496;REFB=-0.0560856;REVB=0.0142134;RO=1;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133249;STB=0.50704;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=4.60441e-05;OID=.;OPOS=97369151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:35:39:0:1:35:39:0:1 chr9 97768286 . T C 724.2 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00194996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.735;QD=54.6564;RBI=0.0215531;REFB=-0.167781;REVB=0.0214647;RO=1;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144938;STB=0.507689;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000695835;OID=.;OPOS=97768286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:32:20:0:1:32:20:0:1 chr9 97849090 . A G 708.49 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.573;QD=62.9769;RBI=0.025161;REFB=0;REVB=0.0216851;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70765e-05;OID=.;OPOS=97849090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0 chr9 98209594 . G A 340.39 PASS AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0304698;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=274.678;QD=48.6274;RBI=0.0311575;REFB=-0.107844;REVB=0.00651041;RO=2;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925505;STB=0.549961;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.000576197;OID=.;OPOS=98209594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:9:17:0:2:9:17:0:2 chr9 98638288 . A G 314.68 PASS AF=0.416667;AO=34;DP=83;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00414129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.886;QD=14.9846;RBI=0.00866332;REFB=-0.0271612;REVB=0.0076094;RO=49;SAF=14;SAR=20;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186349;STB=0.611311;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0348057;OID=.;OPOS=98638288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:49:49:34:35:0.416667:20:14:29:20:21:14:29:20 chr9 98638306 . C T 577.35 PASS AF=0.604651;AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.00936698;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.254;QD=26.8535;RBI=0.0207378;REFB=-0.0242032;REVB=-0.0185018;RO=34;SAF=30;SAR=22;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120126;STB=0.565504;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0167413;OID=.;OPOS=98638306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:34:34:52:52:0.604651:22:30:14:20:22:30:14:20 chr9 98729382 . A C 483.34 PASS AF=0.505376;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0539532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7237;QD=20.7888;RBI=0.0592391;REFB=-0.0193082;REVB=-0.0244607;RO=43;SAF=21;SAR=26;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247651;STB=0.506021;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0171816;OID=.;OPOS=98729382;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:43:46:47:47:0.505376:26:21:18:25:26:21:20:26 chr9 98775459 . G A 157.74 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00368323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.738;QD=11.2668;RBI=0.0114259;REFB=-0.00897771;REVB=-0.0108159;RO=36;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176128;STB=0.602373;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0182256;OID=.;OPOS=98775459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:9:11:14:22:9:11:14:22 chr9 98997810 . C T 457.88 PASS AF=0.614286;AO=43;DP=70;FAO=43;FDP=70;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0171615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.428;QD=26.1647;RBI=0.017163;REFB=-0.0257628;REVB=0.000224669;RO=27;SAF=21;SAR=22;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00486782;STB=0.502658;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0224176;OID=.;OPOS=98997810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:27:27:43:43:0.614286:22:21:13:14:22:21:13:14 chr9 99521928 . C T 322.36 PASS AF=0.592593;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00405041;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.415;QD=23.8783;RBI=0.0113196;REFB=-0.0290756;REVB=0.0105701;RO=22;SAF=10;SAR=22;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249241;STB=0.62002;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0144809;OID=.;OPOS=99521928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:22:22:32:32:0.592593:22:10:14:8:22:10:13:9 chr9 99525909 . T C 165.06 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00420422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.695;QD=14.0472;RBI=0.00422367;REFB=-0.0202854;REVB=0.000404868;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107266;STB=0.506227;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.028669;OID=.;OPOS=99525909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:11:7:11:18:11:7:11:18 chr9 99537071 . T C 227.89 PASS AF=0.35443;AO=27;DP=78;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00390073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.322;QD=11.5388;RBI=0.0409897;REFB=-0.0178604;REVB=0.0408036;RO=51;SAF=13;SAR=14;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539366;STB=0.518974;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0325678;OID=.;OPOS=99537071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:51:51:27:28:0.35443:14:13:27:24:14:14:27:24 chr9 99538365 . G A 443.47 PASS AF=0.608696;AO=42;DP=69;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0400551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.805;QD=25.7084;RBI=0.0455254;REFB=-0.0290618;REVB=0.0216367;RO=27;SAF=21;SAR=21;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662765;STB=0.536215;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0200747;OID=.;OPOS=99538365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:27:27:42:42:0.608696:21:21:11:16:21:21:11:16 chr9 99581811 . C T 489.65 PASS AF=0.582278;AO=45;DP=79;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.0054437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.237;QD=24.7925;RBI=0.0219513;REFB=-0.0280147;REVB=-0.0212656;RO=33;SAF=21;SAR=24;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176563;STB=0.599413;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0163313;OID=.;OPOS=99581811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:33:33:45:46:0.582278:24:21:23:10:25:21:23:10 chr9 99581916 . C G 238.36 PASS AF=0.3625;AO=26;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.00310017;FXX=0.0476134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.053;QD=11.9181;RBI=0.00365304;REFB=-0.00268024;REVB=0.00193226;RO=51;SAF=5;SAR=21;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504996;STB=0.723983;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0107205;OID=.;OPOS=99581916;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:51:51:26:29:0.3625:21:5:32:19:21:8:32:19 chr9 99691351 . T G 140.7 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0166762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.259;QD=13.088;RBI=0.0584102;REFB=-0.0115111;REVB=0.0559791;RO=27;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236323;STB=0.635614;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0166324;OID=.;OPOS=99691351;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:10:6:5:22:10:6:5:22 chr9 100043849 . G A 655.2 PASS AF=0.455782;AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.0122132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5946;QD=17.8286;RBI=0.0293637;REFB=-0.0340866;REVB=0.0267032;RO=79;SAF=24;SAR=43;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161281;STB=0.593447;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0463017;OID=.;OPOS=100043849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:79:80:67:67:0.455782:43:24:41:38:43:24:42:38 chr9 100087345 . A G 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0257939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4995;QD=13.2123;RBI=0.058838;REFB=0.00538552;REVB=-0.0528827;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144044;STB=0.583225;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.0195963;OID=.;OPOS=100087345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:10:4:4:18:10:4:4:18 chr9 100092917 . G GC 55.16 PASS AF=0.434783;AO=4;DP=26;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0593417;FXX=0.079968;HRUN=0;LEN=1;MLLD=213.152;QD=9.59341;RBI=0.062964;REFB=-0.0525113;REVB=0.0210482;RO=22;SAF=4;SAR=0;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.61016;STB=0.636061;STBP=0.332;TYPE=ins;VARB=0.0931375;OID=.;OPOS=100092918;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.434783:4:26:10:23:13:8:2:8:5:55:22:4:0:13:9 chr9 100092918 . G C 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.015179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.205;QD=8.6914;RBI=0.0460557;REFB=-0.0260506;REVB=0.0434825;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22957;STB=0.639677;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0401287;OID=.;OPOS=100092918;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:12:5:4:4:12:5 chr9 100105735 . T C 556.85 PASS AF=0.680556;AO=49;DP=72;FAO=49;FDP=72;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00630354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.275;QD=30.9361;RBI=0.00641957;REFB=-0.0199301;REVB=0.00121503;RO=23;SAF=24;SAR=25;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121274;STB=0.565584;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00959786;OID=.;OPOS=100105735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:23:23:49:49:0.680556:25:24:16:7:25:24:16:7 chr9 100133973 . G A 411.54 PASS AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0265369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.138;QD=18.496;RBI=0.0267904;REFB=0.00805622;REVB=-0.00367651;RO=47;SAF=17;SAR=25;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409178;STB=0.522829;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00550366;OID=.;OPOS=100133973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:25:17:21:26:25:17:21:26 chr9 100139161 . A G 239.07 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0264028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8841;QD=20.7887;RBI=0.0414019;REFB=-0.0198102;REVB=-0.0318906;RO=21;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0186629;OID=.;OPOS=100139161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:23:23:23:0.5:14:9:7:14:14:9:9:14 chr9 100190780 . A G 220.4 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0176375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.597;QD=16.0289;RBI=0.0207006;REFB=-0.00680715;REVB=0.0108366;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632598;STB=0.525527;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.00771643;OID=.;OPOS=100190780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:13:12:12:17:13:12:13:17 chr9 100194406 . T C 663.72 PASS AF=0.546218;AO=65;DP=119;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.00753137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.84;QD=22.3098;RBI=0.00939922;REFB=-0.00731317;REVB=0.00562351;RO=54;SAF=27;SAR=38;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00897224;STB=0.504915;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.00843688;OID=.;OPOS=100194406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:54:54:65:65:0.546218:38:27:23:31:38:27:23:31 chr9 100201551 . A G 544.1 PASS AF=0.513761;AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00652395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.594;QD=19.9669;RBI=0.0093233;REFB=-0.00617503;REVB=0.00666048;RO=53;SAF=32;SAR=24;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385644;STB=0.521269;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00508636;OID=.;OPOS=100201551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:53:53:56:56:0.513761:24:32:28:25:24:32:28:25 chr9 100243142 . A G 625.89 PASS AF=0.424242;AO=70;DP=165;FAO=70;FDP=165;FR=.;FRO=95;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=58;FSRR=37;FWDB=0.00485428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.337;QD=15.1731;RBI=0.00942869;REFB=-0.00724748;REVB=0.00808307;RO=95;SAF=32;SAR=38;SRF=58;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156911;STB=0.587604;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00782414;OID=.;OPOS=100243142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:95:95:70:70:0.424242:38:32:58:37:38:32:58:37 chr9 100388119 . G T 621.02 PASS AF=0.463768;AO=64;DP=138;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.00428592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.083;QD=18.0005;RBI=0.00735949;REFB=-0.00380139;REVB=0.00598272;RO=74;SAF=35;SAR=29;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148808;STB=0.582521;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00428973;OID=.;OPOS=100388119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:74:74:64:64:0.463768:29:35:29:45:29:35:29:45 chr9 100616583 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.32;QD=49.5992;RBI=0.0134709;REFB=0;REVB=0.00284791;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00014433;OID=.;OPOS=100616583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr9 100617375 . T C 2408.7 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000585453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.017;QD=64.2319;RBI=0.0120011;REFB=0;REVB=0.0119868;RO=0;SAF=77;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03112e-05;OID=.;OPOS=100617375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:73:77:0:0:73:77:0:0 chr9 100617479 . G T 792.86 PASS AF=0.966102;AO=55;DP=57;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0547169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2719;QD=53.7533;RBI=0.0607007;REFB=0.00148755;REVB=-0.0262799;RO=2;SAF=26;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00180786;STB=0.500894;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=6.90082e-06;OID=.;OPOS=100617479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:57:59:2:2:55:57:0.966102:29:26:1:1:30:27:1:1 chr9 100617583 . T C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.841;QD=57.5449;RBI=0.00796174;REFB=0;REVB=-0.002022;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44185e-05;OID=.;OPOS=100617583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0 chr9 100672338 . C T 785.83 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00293438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.795;QD=64.1492;RBI=0.00302057;REFB=0;REVB=-0.000716439;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0736e-05;OID=.;OPOS=100672338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0 chr9 100823084 . T C 369.27 PASS AF=0.40404;AO=38;DP=97;FAO=40;FDP=99;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.00844142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.756;QD=14.9199;RBI=0.00848197;REFB=-0.00982337;REVB=-0.000828421;RO=57;SAF=21;SAR=17;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101921;STB=0.554967;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0153166;OID=.;OPOS=100823084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:57:59:38:40:0.40404:17:21:26:31:18:22:27:32 chr9 100823135 . G C 357.33 PASS AF=0.380531;AO=42;DP=113;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.00879904;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.006;QD=12.6489;RBI=0.0337238;REFB=-0.0107488;REVB=0.0325557;RO=70;SAF=24;SAR=18;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943746;STB=0.559674;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0260723;OID=.;OPOS=100823135;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:70:70:42:43:0.380531:18:24:34:36:18:25:34:36 chr9 100843417 . A G 171.51 PASS AF=0.370968;AO=18;DP=57;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0155793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.151;QD=11.065;RBI=0.0336072;REFB=-0.0101749;REVB=0.029778;RO=38;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151337;STB=0.521527;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0233916;OID=.;OPOS=100843417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:62:38:39:18:23:0.370968:9:9:14:24:14:9:14:25 chr9 100854765 . C G 239.13 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0296953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.709;QD=21.2558;RBI=0.0360633;REFB=-0.00191655;REVB=0.0204634;RO=22;SAF=8;SAR=15;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220981;STB=0.622332;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00466597;OID=.;OPOS=100854765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:15:8:3:19:15:8:3:19 chr9 101051309 . A G 257.98 PASS AF=0.5;AO=27;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0100699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.426;QD=18.4268;RBI=0.0139624;REFB=-0.000910991;REVB=0.00967189;RO=28;SAF=4;SAR=23;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441877;STB=0.718574;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000758943;OID=.;OPOS=101051309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:28:28:27:28:0.5:23:4:15:13:23:5:15:13 chr9 101051879 . G A 450.51 PASS AF=0.5;AO=44;DP=92;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0439167;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7507;QD=20.0229;RBI=0.0516365;REFB=-0.00774207;REVB=-0.0271598;RO=45;SAF=17;SAR=27;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826432;STB=0.511623;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00892373;OID=.;OPOS=101051879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:45:45:44:45:0.5:27:17:17:28:27:18:17:28 chr9 101056122 . T C 1277.87 PASS AF=0.617486;AO=113;DP=183;FAO=113;FDP=183;FR=.;FRO=70;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.0297949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.018;QD=27.9317;RBI=0.0302111;REFB=-0.0203277;REVB=0.00499783;RO=70;SAF=51;SAR=62;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649481;STB=0.535098;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0105643;OID=.;OPOS=101056122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:70:70:113:113:0.617486:62:51:38:32:62:51:38:32 chr9 101068406 . C T 302.39 PASS AF=0.471429;AO=30;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0556062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0968;QD=17.2796;RBI=0.0897315;REFB=-0.0067962;REVB=0.070425;RO=30;SAF=18;SAR=12;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263975;STB=0.575712;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00566961;OID=.;OPOS=101068406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:37:30:33:0.471429:12:18:9:21:14:19:16:21 chr9 101068580 . G A 434.49 PASS AF=0.426087;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=0.0116017;FXX=0.00861995;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.219;QD=15.1128;RBI=0.0251166;REFB=-0.0151365;REVB=0.0222765;RO=65;SAF=28;SAR=21;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142601;STB=0.584124;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0165458;OID=.;OPOS=101068580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:65:66:49:49:0.426087:21:28:28:37:21:28:28:38 chr9 101533220 . C T 677.84 PASS AF=0.944444;AO=49;DP=52;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0200962;FXX=0.0181785;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.226;QD=50.2103;RBI=0.0219743;REFB=-0.150372;REVB=0.00888893;RO=2;SAF=23;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00226552;STB=0.508718;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00149611;OID=.;OPOS=101533220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:52:54:2:3:49:51:0.944444:26:23:1:1:26:25:1:2 chr9 101611335 . G C 817.73 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8138;QD=57.3847;RBI=0.0712953;REFB=0;REVB=-0.0666892;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115932;OID=.;OPOS=101611335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0 chr9 101611545 . A G 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.307;QD=60.2045;RBI=0.0443323;REFB=0;REVB=0.00880705;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110416;OID=.;OPOS=101611545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:34:39:0:0:34:39:0:0 chr9 101765841 . C T 188.7 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00791649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.452;QD=14.2416;RBI=0.00862602;REFB=-0.0112089;REVB=-0.003426;RO=30;SAF=6;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249511;STB=0.654127;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0220151;OID=.;OPOS=101765841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:31:22:22:0.415094:16:6:15:15:16:6:16:15 chr9 101778265 . G T 1098.54 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9971;QD=60.194;RBI=0.0572192;REFB=0;REVB=-0.000136975;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510828;OID=.;OPOS=101778265;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0 chr9 101796880 . A T 51.49 PASS AF=0.151515;AO=8;DP=68;FAO=10;FDP=66;FR=.;FRO=56;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=48;FWDB=-0.0162106;FXX=0.0294074;HRUN=28;LEN=1;MLLD=162.504;QD=3.12049;RBI=0.0162417;REFB=-0.00343079;REVB=0.00100448;RO=56;SAF=0;SAR=8;SRF=8;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.551825;STB=0.586761;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0187176;OID=.;OPOS=101796880;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:68:66:56:56:8:10:0.151515:8:0:8:48:9:1:8:48 chr9 101796881 . A C 33.88 PASS AF=0.134328;AO=5;DP=68;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=51;FWDB=-0.0187501;FXX=0.0147037;HRUN=28;LEN=1;MLLD=134.382;QD=2.02261;RBI=0.0200392;REFB=-0.00225253;REVB=-0.00707122;RO=56;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.636396;STB=0.647787;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0118567;OID=.;OPOS=101796881;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:68:67:56:58:5:9:0.134328:2:3:5:51:7:2:7:51 chr9 101947879 . ATGT A 612.95 PASS AF=0.535088;AO=59;DP=115;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00172512;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=3;MLLD=288.502;QD=21.507;RBI=0.00462447;REFB=-8.43609e-05;REVB=0.00429064;RO=47;SAF=26;SAR=33;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570006;STB=0.548687;STBP=0.307;TYPE=del;VARB=0.000107517;OID=.;OPOS=101947880;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.535088:59:115:61:114:53:27:34:29:24:99:47:26:33:24:23 chr9 102067887 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.589;QD=33.4285;RBI=0.103572;REFB=0;REVB=0.0960591;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125757;OID=.;OPOS=102067887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr9 102068770 . T C 1479.67 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.862;QD=62.3021;RBI=0.028587;REFB=-0.136808;REVB=0.0260618;RO=1;SAF=58;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129878;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697836;OID=.;OPOS=102068770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:95:95:1:0:94:95:1:36:58:0:1:37:58:0:0 chr9 102068832 . G A 2142.99 PASS AF=0.992754;AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.09372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7354;QD=62.1156;RBI=0.103549;REFB=0.0699782;REVB=0.0440335;RO=1;SAF=75;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760616;STB=0.503999;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00133722;OID=.;OPOS=102068832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:138:138:1:1:137:137:0.992754:62:75:0:1:62:75:0:1 chr9 102595685 . C T 1048.11 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0249377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.525;QD=58.2282;RBI=0.025543;REFB=-0.0790017;REVB=0.00552754;RO=1;SAF=18;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884037;STB=0.504672;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00022041;OID=.;OPOS=102595685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:53:18:0:1:53:18:0:1 chr9 102713580 . G A 407.54 PASS AF=0.525641;AO=38;DP=75;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0622112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.962;QD=20.8993;RBI=0.0628128;REFB=-0.00958135;REVB=-0.00867322;RO=36;SAF=12;SAR=26;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220507;STB=0.639208;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0075354;OID=.;OPOS=102713580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:78:36:37:38:41:0.525641:26:12:20:16:29:12:21:16 chr9 102732237 . T C 104.85 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00648579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.195;QD=10.7536;RBI=0.0160176;REFB=-0.0269201;REVB=-0.0146457;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880921;STB=0.552763;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0377891;OID=.;OPOS=102732237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:12:14:8:5:12:14 chr9 102736844 . A G 328.67 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0038507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.608;QD=18.0093;RBI=0.00450557;REFB=-0.00385812;REVB=-0.00233928;RO=38;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139809;STB=0.57808;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00333806;OID=.;OPOS=102736844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:15:20:16:22:15:20:16:22 chr9 103054951 . T C 82.32 PASS AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0132078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.128;QD=8.89997;RBI=0.0146586;REFB=0.00221566;REVB=-0.00635815;RO=26;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243363;STB=0.648512;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00375508;OID=.;OPOS=103054951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:4:7:11:15:4:7:11:15 chr9 103060386 . T G 368.36 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0127942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3299;QD=16.7438;RBI=0.043511;REFB=-0.0114388;REVB=0.0415875;RO=49;SAF=11;SAR=28;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121088;STB=0.568299;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0193308;OID=.;OPOS=103060386;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:28:11:19:30:28:11:19:30 chr9 103064530 . G A 209.73 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00998708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.466;QD=18.6422;RBI=0.0102721;REFB=-0.0134987;REVB=-0.00240312;RO=24;SAF=13;SAR=8;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301036;STB=0.669947;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.011741;OID=.;OPOS=103064530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:8:13:7:17:8:13:7:17 chr9 104133628 . C T 519.98 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.338;QD=59.4267;RBI=0.0498993;REFB=0;REVB=0.0487479;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233486;OID=.;OPOS=104133628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr9 104302625 . A G 161.44 PASS AF=0.30137;AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.025789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8644;QD=8.84587;RBI=0.0263783;REFB=0.00662446;REVB=-0.00554465;RO=51;SAF=8;SAR=14;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835373;STB=0.549692;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.0164657;OID=.;OPOS=104302625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:51:51:22:22:0.30137:14:8:22:29:14:8:22:29 chr9 104333172 . C T 789.05 PASS AF=0.531915;AO=75;DP=141;FAO=75;FDP=141;FR=.;FRO=66;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=0.000443633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.446;QD=22.3844;RBI=0.000737461;REFB=-0.02268;REVB=-0.000589099;RO=66;SAF=42;SAR=33;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136791;STB=0.507495;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0182576;OID=.;OPOS=104333172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:66:66:75:75:0.531915:33:42:38:28:33:42:38:28 chr9 104335586 . T A 590.59 PASS AF=0.476562;AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=0.011592;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.861;QD=18.4558;RBI=0.0172904;REFB=-0.0170045;REVB=0.0128289;RO=67;SAF=31;SAR=30;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1125;STB=0.562239;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.023556;OID=.;OPOS=104335586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:67:67:61:61:0.476562:30:31:42:25:30:31:42:25 chr9 104335690 . C T 871.26 PASS AF=0.449761;AO=94;DP=210;FAO=94;FDP=209;FR=.;FRO=115;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=57;FSRR=58;FWDB=-0.00408728;FXX=0.00476168;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.225;QD=16.6748;RBI=0.0167602;REFB=-0.0115804;REVB=-0.0162542;RO=115;SAF=46;SAR=48;SRF=57;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00623962;STB=0.503462;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.015429;OID=.;OPOS=104335690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:115:115:94:94:0.449761:48:46:57:58:48:46:57:58 chr9 104432873 . T G 341.61 PASS AF=0.420455;AO=36;DP=87;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0329053;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.71;QD=15.5279;RBI=0.0389844;REFB=-0.0247274;REVB=0.0209051;RO=51;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148102;STB=0.589695;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0189648;OID=.;OPOS=104432873;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:51:51:36:37:0.420455:16:20:21:30:16:21:21:30 chr9 104433034 . A G 218.14 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0144004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.525;QD=15.5813;RBI=0.0174891;REFB=-0.0182342;REVB=0.00992454;RO=31;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528555;STB=0.529903;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0216293;OID=.;OPOS=104433034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:14:11:12:19:14:11:12:19 chr9 104433235 . C T 453.3 PASS AF=0.478723;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00537394;FXX=0.0105252;HRUN=6;LEN=1;MLLD=283.999;QD=19.2891;RBI=0.00582869;REFB=-0.00754881;REVB=-0.00225707;RO=49;SAF=21;SAR=24;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07892;STB=0.54389;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00734404;OID=.;OPOS=104433235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:49:49:45:45:0.478723:24:21:27:22:24:21:27:22 chr9 104433347 . G A 120.37 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00311617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.808;QD=24.0735;RBI=0.00796672;REFB=-0.00105407;REVB=0.00733199;RO=7;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681814;STB=0.538402;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.000838945;OID=.;OPOS=104433347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:7:6:4:3:7:6:4:3 chr9 104449063 . C T 681.27 PASS AF=0.489209;AO=68;DP=136;FAO=68;FDP=139;FR=.;FRO=71;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.00971332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.979;QD=19.605;RBI=0.0170834;REFB=-0.0139591;REVB=-0.0140533;RO=67;SAF=38;SAR=30;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195886;STB=0.504928;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00962461;OID=.;OPOS=104449063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:139:67:71:68:68:0.489209:30:38:36:31:30:38:39:32 chr9 104449294 . G A 469.25 PASS AF=0.485149;AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.0201055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.71;QD=18.5839;RBI=0.0213037;REFB=-0.00601255;REVB=0.00704393;RO=51;SAF=25;SAR=24;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144506;STB=0.584173;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00467325;OID=.;OPOS=104449294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:52:49:49:0.485149:24:25:18:33:24:25:18:34 chr9 104499575 . T C 2283.74 PASS AF=1;AO=142;DP=143;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0326254;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5362;QD=62.9997;RBI=0.0338101;REFB=0;REVB=-0.00887144;RO=0;SAF=61;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000711209;OID=.;OPOS=104499575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:145:0:0:142:145:1:81:61:0:0:81:64:0:0 chr9 105018910 . A C 158.12 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0156191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.015;QD=16.6437;RBI=0.0214721;REFB=-0.0080129;REVB=0.014734;RO=21;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169315;STB=0.597327;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0061868;OID=.;OPOS=105018910;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:6:11:10:11:6:11:10:11 chr9 105340650 . C A 385.83 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0199208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.318;QD=15.589;RBI=0.0199314;REFB=-0.0174964;REVB=-0.000648827;RO=58;SAF=13;SAR=28;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327428;STB=0.518509;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0247673;OID=.;OPOS=105340650;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:58:58:41:41:0.414141:28:13:20:38:28:13:20:38 chr9 105340677 . G A 394.34 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.00641118;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.395;QD=17.145;RBI=0.0165669;REFB=-0.00241412;REVB=0.0152761;RO=51;SAF=12;SAR=29;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112046;STB=0.563075;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00327395;OID=.;OPOS=105340677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:51:51:41:41:0.445652:29:12:20:31:29:12:20:31 chr9 105405415 . G A 374.42 PASS AF=0.659574;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.023021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.364;QD=31.8659;RBI=0.0256185;REFB=-0.0194063;REVB=-0.0112402;RO=15;SAF=12;SAR=19;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00809456;STB=0.504345;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.00857;OID=.;OPOS=105405415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:15:16:31:31:0.659574:19:12:6:9:19:12:6:10 chr9 105780618 . G A 2903.86 PASS AF=1;AO=184;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8448;QD=63.1274;RBI=0.0932002;REFB=0;REVB=0.0587674;RO=0;SAF=95;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000476382;OID=.;OPOS=105780618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:184:184:0:0:184:184:1:89:95:0:0:89:95:0:0 chr9 107266596 . T C 429.9 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=-0.00499712;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=303.753;QD=17.3697;RBI=0.00524583;REFB=-0.00347526;REVB=-0.0015961;RO=55;SAF=20;SAR=24;SRF=42;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302325;STB=0.667794;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00409405;OID=.;OPOS=107266596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:24:20:42:13:24:20:42:13 chr9 107266774 . C G 557.9 PASS AF=0.487395;AO=58;DP=119;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0166333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.056;QD=18.7531;RBI=0.0213199;REFB=-0.0300925;REVB=-0.0133367;RO=60;SAF=22;SAR=36;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288488;STB=0.510201;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0305823;OID=.;OPOS=107266774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:60:61:58:58:0.487395:36:22:21:39:36:22:22:39 chr9 107266844 . A G 479.61 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.0186956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.247;QD=20.1939;RBI=0.0194202;REFB=-0.0124552;REVB=0.00525524;RO=48;SAF=15;SAR=32;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570929;STB=0.531708;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0169158;OID=.;OPOS=107266844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:48:48:47:47:0.494737:32:15:18:30:32:15:18:30 chr9 107266943 . G A 198.31 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0336942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.323;QD=13.2204;RBI=0.0341504;REFB=0.00185132;REVB=-0.005563;RO=36;SAF=7;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260204;STB=0.64987;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00292373;OID=.;OPOS=107266943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:17:7:19:17:17:7:19:17 chr9 107267304 . C T 804.81 PASS AF=0.477011;AO=83;DP=176;FAO=83;FDP=174;FR=.;FRO=91;FSAF=60;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0205943;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4964;QD=18.5013;RBI=0.0223082;REFB=-0.00847724;REVB=-0.00857498;RO=89;SAF=60;SAR=23;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203841;STB=0.608682;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0146908;OID=.;OPOS=107267304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:174:89:91:83:83:0.477011:23:60:47:42:23:60:49:42 chr9 107331504 . C A 1286.7 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199633;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.86;QD=62.0095;RBI=0.0226963;REFB=0;REVB=-0.0107977;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69202e-06;OID=.;OPOS=107331504;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:37:46:0:0:37:46:0:0 chr9 107360768 . GT G 447.19 PASS AF=0.479592;AO=44;DP=101;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0153508;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.058;QD=18.2524;RBI=0.0213584;REFB=-0.0140261;REVB=0.0148504;RO=53;SAF=16;SAR=28;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128437;STB=0.547149;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=0.014858;OID=.;OPOS=107360769;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.479592:44:101:47:98:51:18:29:24:27:99:53:16:28:26:27 chr9 107360826 . A G 401.34 PASS AF=0.428571;AO=42;DP=98;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0144251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3866;QD=16.3812;RBI=0.0480994;REFB=0.00973701;REVB=0.0458854;RO=56;SAF=14;SAR=28;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229375;STB=0.629308;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0112184;OID=.;OPOS=107360826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:56:56:42:42:0.428571:28:14:31:25:28:14:31:25 chr9 107360851 . T C 399.28 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0161762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.784;QD=15.357;RBI=0.0739422;REFB=-0.00236297;REVB=0.0721511;RO=58;SAF=18;SAR=27;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20316;STB=0.618268;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00376455;OID=.;OPOS=107360851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:59:45:45:0.432692:27:18:35:23:27:18:36:23 chr9 107360922 . A G 1767.52 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.642;QD=60.949;RBI=0.0302541;REFB=0;REVB=0.0272817;RO=0;SAF=62;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41848e-05;OID=.;OPOS=107360922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:53:62:0:0:53:63:0:0 chr9 107361129 . C T 521.61 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.000103571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.854;QD=23.4431;RBI=0.00633632;REFB=-0.00169021;REVB=0.00633547;RO=39;SAF=27;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09292;STB=0.55655;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00132759;OID=.;OPOS=107361129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:40:49:49:0.550562:22:27:17:22:22:27:17:23 chr9 107361312 . T C 515.92 PASS AF=0.880952;AO=25;DP=42;FAO=37;FDP=42;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0413635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.732;QD=49.1356;RBI=0.0413656;REFB=-0.0109177;REVB=0.000408841;RO=5;SAF=8;SAR=17;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158371;STB=0.531233;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0014981;OID=.;OPOS=107361312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:42:42:5:5:25:37:0.880952:17:8:4:1:17:20:4:1 chr9 107361439 . G C 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.252;QD=56.9478;RBI=0.0312222;REFB=-0.0703003;REVB=-0.0270284;RO=1;SAF=18;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252932;STB=0.513506;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00355152;OID=.;OPOS=107361439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:18:18:1:0:18:18:1:0 chr9 107361451 . GC AG 319.03 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0852489;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=217.402;QD=47.263;RBI=0.182991;REFB=0;REVB=0.161921;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0108684;OID=.;OPOS=107361451;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:17:9:0:0:17:10:0:0 chr9 107361460 . G A 347.7 PASS AF=0.962963;AO=27;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0515264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.1456;QD=51.5106;RBI=0.0627811;REFB=0.0102429;REVB=0.0358677;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51514;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00157702;OID=.;OPOS=107361460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:0:1:27:26:0.962963:17:10:0:0:16:10:0:1 chr9 107361490 . A T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00779491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.814;QD=50.4134;RBI=0.0108664;REFB=0;REVB=0.00757091;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.78522e-05;OID=.;OPOS=107361490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr9 107361599 . G C 193.92 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00273089;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1067;QD=16.1596;RBI=0.0275375;REFB=-0.0113401;REVB=-0.0274017;RO=28;SAF=10;SAR=10;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10902;STB=0.562438;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.011518;OID=.;OPOS=107361599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:28:28:20:20:0.416667:10:10:17:11:10:10:17:11 chr9 107361642 . G A 506.99 PASS AF=0.539326;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00249749;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.271;QD=22.7861;RBI=0.00666651;REFB=5.1994e-05;REVB=0.00618102;RO=42;SAF=24;SAR=24;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-3.82745e-05;OID=.;OPOS=107361642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:42:41:48:48:0.539326:24:24:21:21:24:24:21:20 chr9 107361710 . G A 401.23 PASS AF=0.428571;AO=42;DP=98;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0622875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.382;QD=16.3769;RBI=0.0622883;REFB=-0.0131968;REVB=0.000298619;RO=56;SAF=19;SAR=23;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429304;STB=0.524127;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0161609;OID=.;OPOS=107361710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:56:56:42:42:0.428571:23:19:23:33:23:19:23:33 chr9 107367008 . T C 430.88 PASS AF=0.444444;AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0109093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.81;QD=15.9585;RBI=0.0117558;REFB=-0.00972673;REVB=-0.00438037;RO=58;SAF=26;SAR=22;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00992989;STB=0.504664;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0126254;OID=.;OPOS=107367008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:60:48:48:0.444444:22:26:32:26:22:26:33:27 chr9 107367132 . G A 399.32 PASS AF=0.42;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0656781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.762;QD=15.9729;RBI=0.0668501;REFB=-0.0189547;REVB=-0.0124628;RO=58;SAF=17;SAR=25;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00878292;STB=0.504948;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0220562;OID=.;OPOS=107367132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:58:42:42:0.42:25:17:23:35:25:17:23:35 chr9 107367392 . TGTTA T 129.61 PASS AF=0.340909;AO=14;DP=46;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00811328;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=4;MLLD=293.271;QD=11.783;RBI=0.0124582;REFB=-0.0139294;REVB=0.00945412;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573915;STB=0.558206;STBP=0.598;TYPE=del;VARB=0.0259782;OID=.;OPOS=107367393;OREF=GTTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.340909:14:46:15:44:29:8:7:18:11:99:29:8:6:18:11 chr9 107367431 . A T 59.37 PASS AF=0.204545;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00990313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.619;QD=5.39764;RBI=0.0152082;REFB=-0.00267427;REVB=-0.011542;RO=35;SAF=4;SAR=5;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221857;STB=0.643262;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.012868;OID=.;OPOS=107367431;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:44:44:35:35:9:9:0.204545:5:4:22:13:5:4:22:13 chr9 107367612 . C T 161.04 PASS AF=0.33871;AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0118969;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.331;QD=10.3898;RBI=0.0188367;REFB=-0.00256786;REVB=-0.0146043;RO=41;SAF=11;SAR=10;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183209;STB=0.606436;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00453512;OID=.;OPOS=107367612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:41:41:21:21:0.33871:10:11:28:13:10:11:28:13 chr9 107367664 . AGC A 55.1 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00952418;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=2;MLLD=287.19;QD=7.59951;RBI=0.0146677;REFB=-0.00800233;REVB=-0.0111548;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295682;STB=0.671854;STBP=0.273;TYPE=del;VARB=0.0223333;OID=.;OPOS=107367665;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.275862:8:31:8:29:21:3:5:13:8:55:22:3:5:14:8 chr9 107367841 . A T 463.84 PASS AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0115047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.176;QD=19.3266;RBI=0.0131757;REFB=-0.000404899;REVB=0.00642182;RO=50;SAF=19;SAR=27;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638027;STB=0.535501;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000372924;OID=.;OPOS=107367841;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:27:19:24:26:27:19:24:26 chr9 107379895 . G T 180.82 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0279849;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7726;QD=15.3891;RBI=0.0554223;REFB=-0.0158433;REVB=0.047838;RO=27;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681024;STB=0.548482;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0168857;OID=.;OPOS=107379895;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:27:28:19:19:0.404255:10:9:11:16:10:9:11:17 chr9 107380177 . A G 220.77 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00156508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.349;QD=12.0972;RBI=0.00852019;REFB=-0.0141972;REVB=0.00837521;RO=46;SAF=11;SAR=16;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149093;STB=0.585898;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0307739;OID=.;OPOS=107380177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:16:11:25:21:16:11:25:21 chr9 107380215 . T A 249.53 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00545745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.268;QD=14.2591;RBI=0.0617315;REFB=0.00272274;REVB=0.0614898;RO=41;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102264;STB=0.558169;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.00174381;OID=.;OPOS=107380215;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:17:12:21:20:17:12:21:20 chr9 107380396 . T G 178.04 PASS AF=0.343284;AO=23;DP=67;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00127667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.603;QD=10.6294;RBI=0.00328917;REFB=-0.0180757;REVB=-0.0030313;RO=44;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525392;STB=0.530612;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0370205;OID=.;OPOS=107380396;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:44:44:23:23:0.343284:12:11:19:25:12:11:19:25 chr9 107380414 . C A 476.89 PASS AF=0.637681;AO=44;DP=69;FAO=44;FDP=69;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0012247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2668;QD=27.6459;RBI=0.0185828;REFB=-0.0506609;REVB=-0.0185424;RO=25;SAF=19;SAR=25;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00553959;STB=0.503017;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0232982;OID=.;OPOS=107380414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:25:25:44:44:0.637681:25:19:11:14:25:19:11:14 chr9 107456933 . C T 758.18 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389902;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.795;QD=57.2214;RBI=0.0390306;REFB=0;REVB=-0.00177652;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40407e-05;OID=.;OPOS=107456933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr9 107457532 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3961;QD=59.8384;RBI=0.0577581;REFB=0;REVB=-0.0215352;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00132714;OID=.;OPOS=107457532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0 chr9 107457725 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.219;QD=58.2395;RBI=0.025061;REFB=0;REVB=0.0143389;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.71708e-05;OID=.;OPOS=107457725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0 chr9 107510145 . G C 304.25 PASS AF=0.684211;AO=26;DP=38;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0270077;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.1988;QD=32.0263;RBI=0.0276367;REFB=0.0147752;REVB=0.0058626;RO=12;SAF=5;SAR=21;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241885;STB=0.513235;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=-0.00466585;OID=.;OPOS=107510145;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:38:38:12:12:26:26:0.684211:21:5:2:10:21:5:2:10 chr9 107531152 . G C 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0216545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.438;QD=21.0649;RBI=0.0491072;REFB=-0.0288389;REVB=-0.0440749;RO=24;SAF=17;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272569;STB=0.653713;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0181829;OID=.;OPOS=107531152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:7:17:10:14:7:17:10:14 chr9 107533175 . C G 735.22 PASS AF=0.517986;AO=71;DP=139;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=-0.0210838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.729;QD=21.1573;RBI=0.0345763;REFB=-0.0182942;REVB=-0.0274042;RO=67;SAF=32;SAR=39;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128694;STB=0.566549;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0207513;OID=.;OPOS=107533175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:67:67:71:72:0.517986:39:32:40:27:39:33:40:27 chr9 107562804 . T C 192.41 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00478667;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=363.992;QD=16.0341;RBI=0.00483229;REFB=-0.0103897;REVB=-0.000662407;RO=28;SAF=5;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280914;STB=0.662617;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0125171;OID=.;OPOS=107562804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:15:5:14:14:15:5:14:14 chr9 107586753 . T C 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.396;QD=61.695;RBI=0.0277692;REFB=0;REVB=0.0276504;RO=0;SAF=28;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65796e-05;OID=.;OPOS=107586753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:54:28:0:0:54:28:0:0 chr9 107588033 . C T 1102.18 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00761647;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.673;QD=60.3932;RBI=0.00831814;REFB=0;REVB=-0.00334378;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.30015e-05;OID=.;OPOS=107588033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:46:27:0:0:46:27:0:0 chr9 107591272 . G T 1489.8 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354124;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.5;QD=63.3959;RBI=0.0354522;REFB=0;REVB=-0.00167907;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.7479e-05;OID=.;OPOS=107591272;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0 chr9 108152199 . G A 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=315.929;QD=59.8559;RBI=0.0153835;REFB=0;REVB=-0.00428697;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28959e-05;OID=.;OPOS=108152199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0 chr9 108292884 . C T 235.63 PASS AF=0.341176;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.00952569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.159;QD=11.0884;RBI=0.0427483;REFB=-0.0151583;REVB=-0.0416734;RO=56;SAF=8;SAR=21;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172842;STB=0.601034;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.027391;OID=.;OPOS=108292884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:56:56:29:29:0.341176:21:8:23:33:21:8:23:33 chr9 108398331 . T G 324.79 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00353082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7747;QD=17.0942;RBI=0.0199049;REFB=0.00785824;REVB=0.0195893;RO=41;SAF=22;SAR=13;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184595;STB=0.603599;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00858624;OID=.;OPOS=108398331;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:13:22:18:23:13:22:18:23 chr9 108536426 . AT A 466.43 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021206;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.038;QD=47.8388;RBI=0.102494;REFB=0;REVB=-0.100276;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0038406;OID=.;OPOS=108536427;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:39:39:39:0:22:17:0:0:8:0:22:17:0:0 chr9 109622659 . G A 2623.79 PASS AF=0.994152;AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=103;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.756;QD=61.3752;RBI=0.0253442;REFB=-0.0551044;REVB=0.0169695;RO=0;SAF=103;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06075e-08;STB=0.502415;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=2.46242e-05;OID=.;OPOS=109622659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:171:171:0:1:170:170:0.994152:67:103:0:0:67:103:1:0 chr9 110068823 . C T 272.65 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0147235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.798;QD=24.2351;RBI=0.0505623;REFB=-0.056575;REVB=0.0483711;RO=20;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411624;STB=0.522917;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0415494;OID=.;OPOS=110068823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:10:15:11:9:10:15:11:9 chr9 110093355 . C CT,CTT 97.56 PASS AF=0.95,0;AO=12,3;DP=21;FAO=19,0;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=13,0;FSAR=6,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0122727,0.00318016;FXX=0.0475964;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=8.13588,7.30187;QD=19.5116;RBI=0.0467351,0.0317031;REFB=-0.0117761,-0.0105161;REVB=-0.0450949,-0.0315432;RO=5;SAF=9,1;SAR=3,2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0981189,-0.247694;STB=0.518499,0.5;STBP=0.612,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00949572,0;OID=.,.;OPOS=110093356,110093356;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.95,0:12,3:21:19,0:20:1:13,0:6,0:1:0:6:5:9,1:3,2:3:2 chr9 110093970 . CAAAAAAAAA ACAAAAAAAC,CAAAAAAAA,CAAAAAAA 266.86 PASS AF=0.352941,0.0588235,0.588235;AO=3,9,9;DP=37;FAO=12,2,20;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0,0;FSAR=0,2,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0814336,0.0691619,0.0272801;FXX=0.0810592;HRUN=1,12,12;LEN=10,1,2;MLLD=237.914,4.35647,8.15347;QD=31.3949;RBI=0.0829475,0.197822,0.106582;REFB=-0.0457321,-0.0976885,-0.134387;REVB=0.0157749,0.185338,0.103032;RO=2;SAF=3,0,0;SAR=0,9,9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.74993,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.000258484,0.0116647,0.0702155;OID=.,.,.;OPOS=110093970,110093971,110093971;OREF=CAAAAAAAAA,A,AA;OALT=ACAAAAAAAC,-,-;OMAPALT=ACAAAAAAAC,CAAAAAAAA,CAAAAAAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:94:37:34:2:0:3,9,9:12,2,20:0.352941,0.0588235,0.588235:0,9,9:3,0,0:0:2:0,2,20:12,0,0:0:0 chr9 111617341 . A G 740.78 PASS AF=0.510638;AO=70;DP=139;FAO=72;FDP=141;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0276691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.287;QD=21.015;RBI=0.0286034;REFB=-0.0046536;REVB=-0.0072507;RO=68;SAF=32;SAR=38;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277328;STB=0.518411;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.00494721;OID=.;OPOS=111617341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:141:68:69:70:72:0.510638:38:32:29:39:38:34:30:39 chr9 111617650 . G A 279.11 PASS AF=0.444444;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0461889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4884;QD=15.5059;RBI=0.0493768;REFB=-0.0323528;REVB=0.0174543;RO=39;SAF=19;SAR=12;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200072;STB=0.607015;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0314615;OID=.;OPOS=111617650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:39:40:31:32:0.444444:12:19:16:23:13:19:16:24 chr9 111618163 . G A 223.82 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0271959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.069;QD=19.4623;RBI=0.0311838;REFB=-0.0147406;REVB=0.0152583;RO=24;SAF=10;SAR=12;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194024;STB=0.609278;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0153745;OID=.;OPOS=111618163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:12:10:16:8:12:10:16:8 chr9 111618602 . A G 868.23 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.689;QD=57.8818;RBI=0.017467;REFB=0;REVB=-0.0129859;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.51854e-06;OID=.;OPOS=111618602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0 chr9 111618796 . C T 327.35 PASS AF=0.472973;AO=34;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00104785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.124;QD=17.6944;RBI=0.00773332;REFB=-0.0169832;REVB=-0.007662;RO=38;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557845;STB=0.544721;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0168361;OID=.;OPOS=111618796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:39:34:35:0.472973:15:19:19:19:15:20:19:20 chr9 111618926 . A G 557.89 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0015057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.271;QD=23.0058;RBI=0.013796;REFB=-0.0461475;REVB=-0.0137136;RO=45;SAF=19;SAR=33;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702761;STB=0.538704;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0232992;OID=.;OPOS=111618926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:33:19:20:25:33:19:20:25 chr9 111625913 . A G 801.28 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.825;QD=57.234;RBI=0.038835;REFB=0;REVB=0.0118962;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231473;OID=.;OPOS=111625913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0 chr9 111644396 . G A 182.82 PASS AF=0.44186;AO=17;DP=41;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0561102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.825;QD=17.0065;RBI=0.0567638;REFB=-0.0017071;REVB=-0.00858886;RO=24;SAF=12;SAR=5;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338011;STB=0.708634;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00413258;OID=.;OPOS=111644396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:24:24:17:19:0.44186:5:12:9:15:5:14:9:15 chr9 111659439 . T C 453.73 PASS AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.00688675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.9188;QD=22.4065;RBI=0.00704565;REFB=0.0145056;REVB=-0.00148793;RO=37;SAF=25;SAR=19;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687722;STB=0.537822;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.0139264;OID=.;OPOS=111659439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:44:44:0.54321:19:25:24:13:19:25:24:13 chr9 111659483 . T G 436.82 PASS AF=0.505747;AO=43;DP=85;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.054516;FXX=0.0113623;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.237;QD=20.0836;RBI=0.0564594;REFB=-0.016653;REVB=0.0146854;RO=42;SAF=25;SAR=18;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569327;STB=0.530314;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0156033;OID=.;OPOS=111659483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:42:43:43:44:0.505747:18:25:27:15:19:25:27:16 chr9 111660851 . C T 197.54 PASS AF=0.5;AO=18;DP=38;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0258564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8516;QD=19.7543;RBI=0.056207;REFB=-0.0244434;REVB=0.0499066;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381998;STB=0.52629;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0254493;OID=.;OPOS=111660851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:20:20:18:20:0.5:7:11:13:7:8:12:13:7 chr9 111679872 . G A 403.81 PASS AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0188121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4692;QD=22.1265;RBI=0.0203586;REFB=-0.00569122;REVB=0.007783;RO=33;SAF=21;SAR=19;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329291;STB=0.518154;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00434858;OID=.;OPOS=111679872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:33:40:40:0.547945:19:21:16:17:19:21:16:17 chr9 111718134 . AAT A,ATT 57.14 PASS AF=0.237288,0;AO=15,9;DP=81;FAO=14,0;FDP=59;FR=.;FRO=45;FSAF=2,0;FSAR=12,0;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.262685,-0.00772299;FXX=0.0166639;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=20.8357,19.7428;QD=3.87423;RBI=0.275785,0.0694366;REFB=-0.0774603,0.00546086;REVB=-0.0839877,0.0690058;RO=51;SAF=4,9;SAR=11,0;SRF=21;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.199223,0.718308;STB=0.739858,0.5;STBP=0.071,1;TYPE=del,snp;VARB=0.175697,0;OID=.,.;OPOS=111718135,111718135;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.237288,0:15,9:81:14,0:59:45:2,0:12,0:17:28:58:51:4,9:11,0:21:30 chr9 111754288 . T C 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.703;QD=60.8835;RBI=0.0299075;REFB=0;REVB=0.0153261;RO=0;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97984e-05;OID=.;OPOS=111754288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:49:28:0:0:49:28:0:0 chr9 111782670 . G A 166.74 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0958665;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.963;QD=15.1584;RBI=0.120663;REFB=-0.0120854;REVB=0.0732742;RO=25;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101062;STB=0.545404;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0176018;OID=.;OPOS=111782670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:25:26:18:18:0.409091:9:9:10:15:9:9:11:15 chr9 111938926 . C T 476.24 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.00335749;FXX=0.0319115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.595;QD=20.9337;RBI=0.0106573;REFB=-0.0205582;REVB=-0.0101146;RO=40;SAF=22;SAR=24;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102475;STB=0.581714;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0179054;OID=.;OPOS=111938926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:40:45:46:46:0.505495:24:22:24:16:24:22:29:16 chr9 111945049 . T G 729.67 PASS AF=0.483221;AO=72;DP=149;FAO=72;FDP=149;FR=.;FRO=77;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=0.0151624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2331;QD=19.5884;RBI=0.0276085;REFB=-0.00285586;REVB=-0.0230723;RO=77;SAF=37;SAR=35;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906595;STB=0.550033;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00298928;OID=.;OPOS=111945049;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:77:77:72:72:0.483221:35:37:47:30:35:37:47:30 chr9 112069477 . T A 115.63 PASS AF=0.4;AO=13;DP=34;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.035648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.23;QD=13.2148;RBI=0.037624;REFB=-0.00241377;REVB=-0.0120327;RO=21;SAF=12;SAR=1;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.542697;STB=0.838085;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00986457;OID=.;OPOS=112069477;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:21:21:13:14:0.4:1:12:12:9:1:13:12:9 chr9 112629397 . G A 158.2 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0323795;FXX=0.079984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.047;QD=13.7561;RBI=0.0346482;REFB=-0.00502041;REVB=0.0123315;RO=23;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412186;STB=0.606172;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00381619;OID=.;OPOS=112629397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:46:23:29:17:17:0.369565:11:6:9:14:11:6:15:14 chr9 112629858 . A G 1008.37 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.596;QD=59.3158;RBI=0.0248559;REFB=0;REVB=0.0247198;RO=0;SAF=17;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98692e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2376e-05;OID=.;OPOS=112629858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:51:17:0:0:51:17:0:0 chr9 112687381 . G T 352.95 PASS AF=0.486842;AO=34;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0318443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8914;QD=18.5765;RBI=0.0321779;REFB=-0.024248;REVB=-0.00462092;RO=33;SAF=17;SAR=17;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120886;STB=0.552846;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0222401;OID=.;OPOS=112687381;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:39:34:37:0.486842:17:17:21:12:19:18:23:16 chr9 112710511 . CA C 155.69 PASS AF=0.47619;AO=27;DP=64;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.121982;FXX=0.0156226;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.999;QD=9.8848;RBI=0.213822;REFB=-0.0270719;REVB=-0.175615;RO=30;SAF=8;SAR=19;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142862;STB=0.515244;STBP=0.83;TYPE=del;VARB=0.0398524;OID=.;OPOS=112710512;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.47619:27:64:30:63:33:11:19:13:20:99:30:8:19:13:17 chr9 112713075 . C CA 398.07 PASS AF=1;AO=36;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430563;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9175;QD=37.9114;RBI=0.0122671;REFB=0;REVB=0.0114866;RO=3;SAF=18;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07184;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00127591;OID=.;OPOS=112713076;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:36:42:42:42:0:23:19:0:0:7:3:18:18:3:0 chr9 112899361 . A C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.244;QD=60.2305;RBI=0.0640574;REFB=0;REVB=0.0621109;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240118;OID=.;OPOS=112899361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr9 112900785 . A G 239.45 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7439;QD=50.4114;RBI=0.0744123;REFB=0;REVB=-0.0170647;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185221;OID=.;OPOS=112900785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr9 112931646 . G A 741.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258754;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5978;QD=57.0334;RBI=0.0380381;REFB=0;REVB=0.0278811;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00278615;OID=.;OPOS=112931646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0 chr9 112932329 . G A 1465.91 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.723;QD=63.0497;RBI=0.0186086;REFB=0;REVB=0.0163224;RO=0;SAF=38;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102272;OID=.;OPOS=112932329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:93:0:0:91:93:1:53:38:0:0:54:39:0:0 chr9 112932540 . GTTTTTTA GTTTT,GTTTTTA 79.74 PASS AF=0.225806,0.354839;AO=4,7;DP=32;FAO=7,11;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=7,4;FSAR=0,7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0142712,-0.00278732;FXX=0.0882094;HRUN=6,6;LEN=3,1;MLLD=25.7922,10.6347;QD=10.2884;RBI=0.0214061,0.0600036;REFB=-0.00754809,-0.0791281;REVB=0.0159547,0.0599389;RO=11;SAF=4,3;SAR=0,4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.371429,0.371429;SSSB=0.701405,-0.0263346;STB=0.998143,0.555453;STBP=0.006,0.634;TYPE=del,del;VARB=0.0495801,0.0857828;OID=.,.;OPOS=112932545,112932541;OREF=TTA,T;OALT=-,-;OMAPALT=GTTTT,GTTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.225806,0.354839:4,7:32:7,11:31:13:7,4:0,7:6:7:38:11:4,3:0,4:5:6 chr9 112960869 . A G 1326.66 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134379;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.312;QD=62.4309;RBI=0.0137404;REFB=0;REVB=0.00286747;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000622021;OID=.;OPOS=112960869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0 chr9 112963504 . A G 1161.32 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00352366;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.972;QD=59.555;RBI=0.00592932;REFB=-0.108421;REVB=-0.00476871;RO=1;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126197;STB=0.506665;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-4.85539e-05;OID=.;OPOS=112963504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:78:1:1:77:77:0.987179:37:40:0:1:37:40:0:1 chr9 113006420 . A G 1070.04 PASS AF=1;AO=50;DP=78;FAO=74;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=57;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963668;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6068;QD=57.8401;RBI=0.100498;REFB=0;REVB=0.100035;RO=1;SAF=38;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01223;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142401;OID=.;OPOS=113006420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:74:1:0:50:74:1:12:38:1:0:17:57:0:0 chr9 113006421 . T G 222.62 PASS AF=0.358974;AO=25;DP=75;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=12;FWDB=-0.0200856;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.837;QD=11.4165;RBI=0.0372498;REFB=-0.0416044;REVB=0.0313707;RO=49;SAF=22;SAR=3;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252164;STB=0.561734;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00486405;OID=.;OPOS=113006421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:78:49:50:25:28:0.358974:3:22:37:12:5:23:38:12 chr9 113128561 . TGAGGGTAG T 96.47 PASS AF=0.234375;AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00106536;FXX=0;HRUN=1;LEN=8;MLLD=372.75;QD=6.02939;RBI=0.0110647;REFB=-0.00456758;REVB=-0.0110133;RO=49;SAF=8;SAR=7;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727695;STB=0.545204;STBP=0.72;TYPE=del;VARB=0.0167477;OID=.;OPOS=113128562;OREF=GAGGGTAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.234375:15:64:15:64:49:8:7:29:20:96:49:8:7:29:20 chr9 113166697 . T A 498.03 PASS AF=0.453782;AO=54;DP=119;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.0246945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.264;QD=16.7403;RBI=0.0304163;REFB=-0.00539393;REVB=0.0177577;RO=65;SAF=26;SAR=28;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00447222;STB=0.502493;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00776788;OID=.;OPOS=113166697;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:65:65:54:54:0.453782:28:26:31:34:28:26:31:34 chr9 113169630 . TG CA 173.58 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0114267;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=2;MLLD=153.713;QD=18.2721;RBI=0.0118689;REFB=-0.0114106;REVB=-0.00320939;RO=20;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968595;STB=0.55549;STBP=0.602;TYPE=mnp;VARB=0.0114107;OID=.;OPOS=113169630;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:20:20:18:18:0.473684:4:14:14:6:4:14:14:6 chr9 113192655 . T G 328.77 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0132806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.219;QD=15.4716;RBI=0.0142967;REFB=0.0013064;REVB=0.00529357;RO=49;SAF=26;SAR=10;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331489;STB=0.687816;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00235029;OID=.;OPOS=113192655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:10:26:20:29:10:26:20:29 chr9 113208250 . T G 438.33 PASS AF=0.551282;AO=41;DP=76;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0237853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.2;QD=22.4784;RBI=0.0241;REFB=-0.0146572;REVB=-0.00388171;RO=35;SAF=18;SAR=23;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107452;STB=0.558797;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00947376;OID=.;OPOS=113208250;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:35:35:41:43:0.551282:23:18:11:24:24:19:11:24 chr9 113220820 . C T 393.11 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.0260899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1185;QD=19.6553;RBI=0.0278045;REFB=-0.0322037;REVB=-0.00961289;RO=40;SAF=13;SAR=27;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259273;STB=0.514381;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.036992;OID=.;OPOS=113220820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:27:13:12:28:27:13:12:28 chr9 113233720 . G A 802.68 PASS AF=0.526316;AO=80;DP=152;FAO=80;FDP=152;FR=.;FRO=72;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0100423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.414;QD=21.1231;RBI=0.0119157;REFB=-0.0207613;REVB=-0.00641368;RO=72;SAF=50;SAR=30;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14719;STB=0.580788;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0164572;OID=.;OPOS=113233720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:72:72:80:80:0.526316:30:50:33:39:30:50:33:39 chr9 113261483 . C T 696.41 PASS AF=0.471338;AO=74;DP=157;FAO=74;FDP=157;FR=.;FRO=83;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.00569429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.066;QD=17.743;RBI=0.0585516;REFB=-0.00950383;REVB=-0.058274;RO=83;SAF=36;SAR=38;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186558;STB=0.510328;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0105359;OID=.;OPOS=113261483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:83:83:74:74:0.471338:38:36:42:41:38:36:42:41 chr9 113457799 . A G 631.47 PASS AF=0.608247;AO=50;DP=88;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0148532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.868;QD=26.04;RBI=0.0496303;REFB=-0.0244432;REVB=0.0473556;RO=38;SAF=25;SAR=25;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062224;STB=0.501073;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0190067;OID=.;OPOS=113457799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:97:38:38:50:59:0.608247:25:25:16:22:34:25:16:22 chr9 113459655 . C T 464.92 PASS AF=0.535714;AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.00115204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.048;QD=22.139;RBI=0.00738163;REFB=-0.00765141;REVB=0.00729118;RO=39;SAF=21;SAR=24;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136203;STB=0.574847;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00546382;OID=.;OPOS=113459655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:39:45:45:0.535714:24:21:12:27:24:21:12:27 chr9 113524511 . AT A 177.22 PASS AF=0.364486;AO=39;DP=112;FAO=39;FDP=107;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.0983861;FXX=0.0446389;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.6914;QD=6.62509;RBI=0.111752;REFB=-0.0184117;REVB=0.0529964;RO=65;SAF=18;SAR=21;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682642;STB=0.541464;STBP=0.504;TYPE=del;VARB=0.0547962;OID=.;OPOS=113524512;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.364486:39:112:39:107:68:18:21:27:41:99:65:18:21:26:39 chr9 113636353 . T G 96.73 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0316947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.409;QD=12.4817;RBI=0.0391988;REFB=-0.00442947;REVB=-0.0230649;RO=19;SAF=11;SAR=1;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.586932;STB=0.857435;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0245503;OID=.;OPOS=113636353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:1:11:9:10:1:11:9:10 chr9 113636379 . C T 147.19 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0091349;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.78;QD=16.3541;RBI=0.0456174;REFB=0.0111522;REVB=-0.0446934;RO=20;SAF=15;SAR=1;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616685;STB=0.867828;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.0130431;OID=.;OPOS=113636379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:1:15:10:10:1:15:10:10 chr9 113636387 . ATTTTTTTA ATTTTTAAA,ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA 65.89 PASS AF=0,0.458333,0.0416667,0;AO=4,4,5,3;DP=36;FAO=0,11,1,0;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=0,4,1,0;FSAR=0,7,0,0;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0292433,-0.0427716,0.0120529,0.0560096;FXX=0.272645;HRUN=7,7,7,7;LEN=2,2,1,1;MLLD=28.5255,19.1541,9.37922,11.5972;QD=10.9812;RBI=0.107268,0.15385,0.0546795,0.20515;REFB=-0.0556812,-0.055774,-0.141359,-0.106396;REVB=0.103205,-0.147785,0.0533346,0.197357;RO=12;SAF=4,1,5,3;SAR=0,3,0,0;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.664388,-0.365665,0.699781,0.613239;STB=0.5,0.65597,0.98645,0.5;STBP=1,0.173,0.52,1;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0,0.0246273,0.0670721,-0.0642009;OID=.,.,.,.;OPOS=113636393,113636394,113636388,113636394;OREF=TT,TA,T,T;OALT=AA,-,-,A;OMAPALT=ATTTTTAAA,ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.458333,0.0416667,0:4,4,5,3:36:0,11,1,0:24:12:0,4,1,0:0,7,0,0:8:4:63:12:4,1,5,3:0,3,0,0:7:5 chr9 114124116 . C T 152.85 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0476291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.446;QD=11.9885;RBI=0.0502349;REFB=-0.00931987;REVB=-0.0159692;RO=29;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331006;STB=0.533297;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0268686;OID=.;OPOS=114124116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:51:29:33:18:18:0.352941:8:10:17:12:8:10:20:13 chr9 114146832 . C T 1457.29 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139981;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.409;QD=63.3603;RBI=0.0325548;REFB=0;REVB=-0.0293916;RO=0;SAF=38;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09023e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.39218e-05;OID=.;OPOS=114146832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:54:38:0:0:54:38:0:0 chr9 114174384 . C T 1232.24 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116486;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.631;QD=61.6118;RBI=0.0120701;REFB=0;REVB=-0.00316188;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138389;OID=.;OPOS=114174384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:50:30:0:0:50:30:0:0 chr9 114174415 . T C 871.85 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00721084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.669;QD=56.2484;RBI=0.0415708;REFB=-0.0763168;REVB=0.0409406;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00012349;OID=.;OPOS=114174415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:0:1:61:61:0.983871:40:21:0:0:40:21:0:1 chr9 114182353 . C T 1553.6 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00795018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.79;QD=62.7718;RBI=0.0144048;REFB=-0.14033;REVB=-0.0120121;RO=1;SAF=51;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920984;STB=0.504853;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000327487;OID=.;OPOS=114182353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:47:51:1:0:47:51:1:0 chr9 114184477 . C A,T 760.21 PASS AF=0.0408163,0.959184;AO=2,47;DP=49;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,25;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0501012,0.00538157;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.854,55.3;QD=62.0582;RBI=0.0546333,0.00682809;REFB=0,0;REVB=-0.0217868,0.00420256;RO=0;SAF=2,25;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.198196,0.00107414;OID=.,.;OPOS=114184477,114184477;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:49:49:0:0:2,47:2,47:0.0408163,0.959184:0,22:2,25:0:0:0,22:2,25:0:0 chr9 114326505 . T G 591.6 PASS AF=0.517241;AO=60;DP=116;FAO=60;FDP=116;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.033095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.487;QD=20.4001;RBI=0.0422922;REFB=-0.00812723;REVB=0.0263315;RO=56;SAF=29;SAR=31;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108322;STB=0.559579;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00598926;OID=.;OPOS=114326505;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:56:56:60:60:0.517241:31:29:34:22:31:29:34:22 chr9 114359624 . C A 1320.89 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00146353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.17;QD=62.1594;RBI=0.0185909;REFB=0;REVB=-0.0185332;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.66632e-05;OID=.;OPOS=114359624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0 chr9 114366094 . G C 264.82 PASS AF=0.529412;AO=26;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00674966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.378;QD=20.7705;RBI=0.0478317;REFB=-0.0247539;REVB=-0.0473531;RO=23;SAF=11;SAR=15;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143885;STB=0.573938;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.015035;OID=.;OPOS=114366094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:24:26:27:0.529412:15:11:6:17:15:12:7:17 chr9 114371322 . T A 267.89 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0727772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8441;QD=16.2356;RBI=0.0921629;REFB=-0.00403845;REVB=0.0565462;RO=36;SAF=10;SAR=20;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875346;STB=0.549417;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00860346;OID=.;OPOS=114371322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:20:10:15:21:20:10:15:21 chr9 114371493 . C T 309.04 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0127318;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.66;QD=26.8726;RBI=0.0286227;REFB=-0.0269202;REVB=-0.0256351;RO=20;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147049;STB=0.548638;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.010614;OID=.;OPOS=114371493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:46:20:19:27:27:0.586957:10:17:16:4:10:17:14:5 chr9 114411945 . G T 982.66 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0242928;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=190.795;QD=56.1521;RBI=0.0262018;REFB=-0.0399111;REVB=0.00981821;RO=2;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277826;STB=0.514702;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-6.70338e-05;OID=.;OPOS=114411945;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:70:70:2:2:68:68:0.971429:33:35:0:2:33:35:0:2 chr9 114454544 . T C 1434.56 PASS AF=0.953271;AO=101;DP=107;FAO=102;FDP=107;FR=.;FRO=5;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0217298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0426;QD=53.6283;RBI=0.0239517;REFB=-0.0382156;REVB=-0.0100746;RO=6;SAF=45;SAR=56;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236936;STB=0.50702;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00182634;OID=.;OPOS=114454544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:107:107:6:5:101:102:0.953271:56:45:4:2:56:46:3:2 chr9 114454580 . A G 1470.67 PASS AF=0.969388;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0181185;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.023;QD=60.0273;RBI=0.0183464;REFB=-0.123285;REVB=0.00288292;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507691;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.000881492;OID=.;OPOS=114454580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:98:98:0:3:95:95:0.969388:55:40:0:0:55:40:2:1 chr9 114456644 . TAAAAA TAAAA,TAAAAT 119.83 PASS AF=0.536585,0.0487805;AO=19,2;DP=41;FAO=22,2;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9,2;FSAR=13,0;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.109996,-0.0500151;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=10.627,214.355;QD=11.6909;RBI=0.280662,0.0516316;REFB=-0.108499,-0.00187053;REVB=0.258209,0.0128185;RO=18;SAF=11,2;SAR=8,0;SRF=8;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.116263,0.545442;STB=0.578383,0.993741;STBP=0.272,0.185;TYPE=del,snp;VARB=0.0925196,0.035496;OID=.,.;OPOS=114456645,114456649;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TAAAA,TAAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.536585,0.0487805:19,2:41:22,2:41:17:9,2:13,0:10:7:81:18:11,2:8,0:8:10 chr9 114462322 . A G 2158.83 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.628;QD=63.0316;RBI=0.0707878;REFB=0;REVB=-0.0447398;RO=0;SAF=50;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.89963e-06;OID=.;OPOS=114462322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:136:137:0:0:136:137:1:86:50:0:0:87:50:0:0 chr9 114464487 . T C 1116.92 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00337575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8459;QD=60.3741;RBI=0.0327293;REFB=0;REVB=0.0325547;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151323;OID=.;OPOS=114464487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:37:36:0:0:38:36:0:0 chr9 114470127 . A G 248.38 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0146804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8466;QD=13.9933;RBI=0.071695;REFB=0.00694225;REVB=0.070176;RO=40;SAF=10;SAR=19;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875245;STB=0.552977;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.0169434;OID=.;OPOS=114470127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:42:29:29:0.408451:19:10:17:23:19:10:18:24 chr9 114490308 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.392;QD=56.1912;RBI=0.0261628;REFB=0;REVB=0.0141791;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75331e-05;OID=.;OPOS=114490308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr9 114694486 . A G 359.52 PASS AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0145946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.387;QD=19.9732;RBI=0.0566454;REFB=-0.00718677;REVB=0.054733;RO=35;SAF=21;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152464;STB=0.502726;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.00708239;OID=.;OPOS=114694486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:15:21:21:14:15:22:21:14 chr9 115095743 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00437635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.613;QD=58.5872;RBI=0.0362921;REFB=0;REVB=0.0360273;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35718e-05;OID=.;OPOS=115095743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr9 115248746 . C T 353.79 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00155932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.079;QD=18.6204;RBI=0.0233272;REFB=-0.00972302;REVB=-0.023275;RO=36;SAF=16;SAR=21;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181777;STB=0.580396;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0146954;OID=.;OPOS=115248746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:39:37:37:0.486842:21:16:23:13:21:16:23:16 chr9 115567184 . T C 976.15 PASS AF=0.985294;AO=66;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0658742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.877;QD=57.4205;RBI=0.0693848;REFB=-0.10666;REVB=0.0217907;RO=1;SAF=23;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200972;STB=0.510201;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00243171;OID=.;OPOS=115567184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:66:67:0.985294:43:23:1:0:43:24:1:0 chr9 115580008 . G C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000952207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.992;QD=58.2395;RBI=0.00335875;REFB=0;REVB=0.00322095;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77586e-06;OID=.;OPOS=115580008;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0 chr9 115600848 . T C 1102.06 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00552841;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.992;QD=60.3869;RBI=0.0201954;REFB=0;REVB=0.0194239;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7136e-05;OID=.;OPOS=115600848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0 chr9 115617061 . T C 1009.71 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.31;QD=58.534;RBI=0.0117763;REFB=0;REVB=-0.00806414;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82965e-05;OID=.;OPOS=115617061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:69:0:0:68:69:1:32:36:0:0:33:36:0:0 chr9 115632969 . A G 1571.44 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.097;QD=59.8645;RBI=0.0593823;REFB=0;REVB=0.0245532;RO=0;SAF=46;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142495;OID=.;OPOS=115632969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:59:46:0:0:59:46:0:0 chr9 115635641 . C G 1480.06 PASS AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0252246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.598;QD=58.6161;RBI=0.0253195;REFB=-0.0760112;REVB=0.00218967;RO=0;SAF=60;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504131;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.000263352;OID=.;OPOS=115635641;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:0:1:100:100:0.990099:40:60:0:0:40:60:1:0 chr9 115637049 . CG CGT,CGTT,GT 375.72 PASS AF=0.961538,0,0.0384615;AO=34,8,2;DP=53;FAO=50,0,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0,2;FSAR=19,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312035,-0.0193589,-0.0103106;FXX=0.0188644;HRUN=7,7,1;LEN=1,2,2;MLLD=9.05451,8.25586,134.325;QD=28.9015;RBI=0.120447,0.0689564,0.0139688;REFB=0.0274629,0.0331343,0.00524231;REVB=-0.116335,-0.0661833,-0.00942444;RO=4;SAF=20,5,2;SAR=14,3,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0329496,-0.0788369,0.569412;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=-0.0429691,0.0604189,-0.00297419;OID=.,.,.;OPOS=115637051,115637051,115637049;OREF=-,-,CG;OALT=T,TT,GT;OMAPALT=CGT,CGTT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:8:53:52:4:0:34,8,2:50,0,2:0.961538,0,0.0384615:14,3,0:20,5,2:3:1:19,0,0:31,0,2:0:0 chr9 115652836 . G A 209.72 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00712136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.659;QD=18.6418;RBI=0.0285697;REFB=-0.0134952;REVB=0.0276679;RO=24;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178323;STB=0.600747;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.019897;OID=.;OPOS=115652836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:11:10:16:8:11:10:16:8 chr9 115652881 . G T 113.12 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0141555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.989;QD=17.4025;RBI=0.0263791;REFB=-0.00914142;REVB=0.0222594;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668703;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0123173;OID=.;OPOS=115652881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:6:7:6:7:6:7 chr9 115818949 . A T 236.26 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0285292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.307;QD=17.5004;RBI=0.0384155;REFB=0.00727771;REVB=0.0257261;RO=28;SAF=18;SAR=8;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147534;STB=0.508299;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.00814707;OID=.;OPOS=115818949;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:8:18:19:9:8:18:19:9 chr9 115873890 . G C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.263;QD=50.4135;RBI=0.0453848;REFB=0;REVB=0.0438425;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105771;OID=.;OPOS=115873890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr9 115926197 . TG T 1284.72 PASS AF=1;AO=103;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515625;FXX=0.0181802;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.8823;QD=47.5822;RBI=0.116824;REFB=0;REVB=-0.104829;RO=0;SAF=56;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.677419;SSEP=0;SSSB=-3.97864e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00183331;OID=.;OPOS=115926198;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:103:108:108:108:0:58:50:0:0:23:0:56:47:0:0 chr9 115926263 . C G 548.57 PASS AF=0.523364;AO=55;DP=108;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00744697;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.362;QD=20.5071;RBI=0.00828778;REFB=-0.0271791;REVB=-0.00363731;RO=51;SAF=25;SAR=30;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183664;STB=0.603793;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0111861;OID=.;OPOS=115926263;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:51:51:55:56:0.523364:30:25:34:17:31:25:34:17 chr9 115928275 . T C 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.041;QD=57.1062;RBI=0.0415528;REFB=0;REVB=0.0329532;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011295;OID=.;OPOS=115928275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0 chr9 115931703 . G A 389.96 PASS AF=0.416667;AO=45;DP=108;FAO=45;FDP=108;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=-0.0199627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.829;QD=14.4428;RBI=0.0342739;REFB=-0.00582256;REVB=0.0278602;RO=62;SAF=10;SAR=35;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174147;STB=0.595699;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0104462;OID=.;OPOS=115931703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:62:63:45:45:0.416667:35:10:22:40:35:10:22:41 chr9 115950706 . A C 378.1 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00293748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.448;QD=18.9048;RBI=0.00967253;REFB=-0.0157429;REVB=0.0092157;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444117;STB=0.524714;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0174508;OID=.;OPOS=115950706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:19:20:23:18:19:20:23:18 chr9 115983540 . G A 794.39 PASS AF=0.50625;AO=81;DP=160;FAO=81;FDP=160;FR=.;FRO=79;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=24;FWDB=0.00547718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.719;QD=19.8598;RBI=0.0330859;REFB=-0.00399808;REVB=0.0326294;RO=79;SAF=52;SAR=29;SRF=55;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053945;STB=0.529605;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00492399;OID=.;OPOS=115983540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:79:79:81:81:0.50625:29:52:55:24:29:52:55:24 chr9 115985499 . G C 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00488595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.043;QD=16.5359;RBI=0.0119215;REFB=0.00724185;REVB=-0.0108743;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201114;STB=0.614849;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.0108392;OID=.;OPOS=115985499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:10:8:15:8:10:8:15:8 chr9 116044998 . A G 116.21 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00210695;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=289.797;QD=20.2097;RBI=0.00249947;REFB=-0.00600616;REVB=-0.00134467;RO=10;SAF=3;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708289;STB=0.540476;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00520815;OID=.;OPOS=116044998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:10:3:3:7:10:3:3:7 chr9 116060124 . T C 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00239914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4738;QD=17.1567;RBI=0.00509921;REFB=-0.00474834;REVB=-0.00449957;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283926;STB=0.664025;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00561779;OID=.;OPOS=116060124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:4:13:10:10:4:13:10:10 chr9 116060221 . C T 120.87 PASS AF=0.4;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0065622;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9954;QD=13.814;RBI=0.013856;REFB=-0.0193266;REVB=0.0122036;RO=21;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101877;STB=0.55924;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0300078;OID=.;OPOS=116060221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:21:21:14:14:0.4:6:8:14:7:6:8:14:7 chr9 116060487 . T C 178.64 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.170975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6295;QD=22.3299;RBI=0.173346;REFB=-0.0122838;REVB=-0.0285684;RO=13;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166068;STB=0.604208;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00294303;OID=.;OPOS=116060487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:13:14:18:18:0.5625:10:8:3:10:10:8:3:11 chr9 116061628 . T C 216.53 PASS AF=0.380282;AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.00469845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7299;QD=12.1987;RBI=0.0166831;REFB=-0.0351289;REVB=0.0160079;RO=44;SAF=11;SAR=15;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253115;STB=0.630676;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0626474;OID=.;OPOS=116061628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:44:44:26:27:0.380282:15:11:29:15:15:12:29:15 chr9 116061671 . C T 189.36 PASS AF=0.352941;AO=23;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0414364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.3;QD=11.139;RBI=0.0423943;REFB=-0.0184241;REVB=0.00896104;RO=44;SAF=7;SAR=16;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278456;STB=0.639881;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0328963;OID=.;OPOS=116061671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:44:23:24:0.352941:16:7:24:20:16:8:24:20 chr9 116122954 . A G 350.2 PASS AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.000353112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.861;QD=28.0163;RBI=0.00335433;REFB=-0.0178079;REVB=-0.0033357;RO=20;SAF=18;SAR=12;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381517;STB=0.520995;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.012969;OID=.;OPOS=116122954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:12:18:13:7:12:18:13:7 chr9 116136198 . C T 116.21 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.00417698;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.468;QD=20.2097;RBI=0.00471637;REFB=-0.000554795;REVB=0.00219021;RO=10;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638491;STB=0.536526;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.000505685;OID=.;OPOS=116136198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:2:11:8:2:2:11:8:2 chr9 116356373 . G C 127.81 PASS AF=0.253333;AO=19;DP=75;FAO=19;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=43;FWDB=-0.00281791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9334;QD=6.81625;RBI=0.0947901;REFB=-0.0163171;REVB=-0.0947482;RO=55;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328637;STB=0.684197;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0403742;OID=.;OPOS=116356373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:55:56:19:19:0.253333:10:9:12:43:10:9:13:43 chr9 116764283 . C T 326.47 PASS AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.0114524;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.537;QD=14.5097;RBI=0.0181012;REFB=-0.00489698;REVB=0.0140177;RO=54;SAF=13;SAR=23;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520335;STB=0.529589;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00614134;OID=.;OPOS=116764283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:23:13:22:32:23:13:22:32 chr9 116770776 . C T 174.31 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.0144364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.797;QD=11.6208;RBI=0.0177666;REFB=-0.0101094;REVB=0.0103558;RO=34;SAF=12;SAR=10;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109607;STB=0.589984;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0151316;OID=.;OPOS=116770776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:38:22:22:0.366667:10:12:22:12:10:12:26:12 chr9 116770785 . G A 164.17 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.0236199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.413;QD=11.1305;RBI=0.0245776;REFB=-0.00581569;REVB=-0.00679416;RO=38;SAF=12;SAR=9;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130769;STB=0.575689;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00710004;OID=.;OPOS=116770785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:9:12:26:12:9:12:26:12 chr9 116813001 . T C 358.38 PASS AF=0.447059;AO=39;DP=83;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=37;FWDB=-0.136009;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5978;QD=16.8651;RBI=0.13637;REFB=-0.000887876;REVB=-0.0099203;RO=44;SAF=16;SAR=23;SRF=7;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262589;STB=0.610117;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00149897;OID=.;OPOS=116813001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:44:47:39:38:0.447059:23:16:7:37:23:15:10:37 chr9 116822510 . G A 1715.44 PASS AF=0.486111;AO=174;DP=359;FAO=175;FDP=360;FR=.;FRO=185;FSAF=101;FSAR=74;FSRF=96;FSRR=89;FWDB=0.0239257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.209;QD=19.0604;RBI=0.0242568;REFB=-0.00771553;REVB=0.00399411;RO=184;SAF=101;SAR=73;SRF=96;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558343;STB=0.53036;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00911754;OID=.;OPOS=116822510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:360:184:185:174:175:0.486111:73:101:96:88:74:101:96:89 chr9 116854854 . G A 228.11 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00213422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.362;QD=13.6183;RBI=0.00397252;REFB=-0.0111555;REVB=-0.00335052;RO=39;SAF=11;SAR=16;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213433;STB=0.628042;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0119646;OID=.;OPOS=116854854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:39:40:27:27:0.402985:16:11:24:15:16:11:25:15 chr9 116931099 . G A 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0873541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9573;QD=22.5855;RBI=0.0873687;REFB=-0.0242069;REVB=0.00159486;RO=6;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159979;STB=0.509075;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0161155;OID=.;OPOS=116931099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:9:2:1:5:9:2:1:5 chr9 116940594 . A G 665.08 PASS AF=0.571429;AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.011386;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.599;QD=23.7528;RBI=0.011532;REFB=-0.0419088;REVB=-0.00182944;RO=48;SAF=29;SAR=35;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166413;STB=0.59073;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0241334;OID=.;OPOS=116940594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:48:48:64:64:0.571429:35:29:32:16:35:29:32:16 chr9 116958216 . C T 1549.27 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.058;QD=63.8872;RBI=0.0101975;REFB=0;REVB=0.00751496;RO=0;SAF=59;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66457e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32507e-05;OID=.;OPOS=116958216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:38:59:0:0:38:59:0:0 chr9 116967405 . G T 378.74 PASS AF=0.356589;AO=46;DP=129;FAO=46;FDP=129;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=51;FWDB=0.0678835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.824;QD=11.744;RBI=0.0682525;REFB=-0.00537183;REVB=0.00708813;RO=82;SAF=26;SAR=20;SRF=32;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194073;STB=0.614057;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00657922;OID=.;OPOS=116967405;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:82:83:46:46:0.356589:20:26:32:50:20:26:32:51 chr9 116967438 . A G 627.43 PASS AF=0.583333;AO=56;DP=96;FAO=56;FDP=96;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00986371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.922;QD=26.1429;RBI=0.0110284;REFB=-0.0489634;REVB=-0.00493279;RO=40;SAF=22;SAR=34;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025535;STB=0.513949;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0244305;OID=.;OPOS=116967438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:40:40:56:56:0.583333:34:22:17:23:34:22:17:23 chr9 116968512 . C T 461.74 PASS AF=0.416;AO=52;DP=125;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=0.0574099;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.3147;QD=14.7757;RBI=0.0948218;REFB=-0.0432619;REVB=-0.0754671;RO=73;SAF=28;SAR=24;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126148;STB=0.570687;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0490189;OID=.;OPOS=116968512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:73:73:52:52:0.416:24:28:48:25:24:28:48:25 chr9 116980052 . C T 144.9 PASS AF=0.30303;AO=20;DP=66;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=-0.00893735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7455;QD=8.78187;RBI=0.0252549;REFB=-0.00674997;REVB=0.0236206;RO=46;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311794;STB=0.5185;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0165157;OID=.;OPOS=116980052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:46:46:20:20:0.30303:13:7:15:31:13:7:15:31 chr9 116980089 . T C 357.14 PASS AF=0.641509;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=53;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.006481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.711;QD=26.9542;RBI=0.00685198;REFB=-0.00976953;REVB=0.002224;RO=19;SAF=11;SAR=23;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331326;STB=0.518137;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00500557;OID=.;OPOS=116980089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:19:19:34:34:0.641509:23:11:7:12:23:11:7:12 chr9 117002517 . C T 641.25 PASS AF=0.432927;AO=71;DP=164;FAO=71;FDP=164;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=45;FWDB=0.0247023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.811;QD=15.6402;RBI=0.025334;REFB=-0.00310163;REVB=0.00562195;RO=92;SAF=26;SAR=45;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161045;STB=0.587277;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00319358;OID=.;OPOS=117002517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:92:93:71:71:0.432927:45:26:48:44:45:26:48:45 chr9 117033028 . T C 336.8 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00810527;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.491;QD=14.6433;RBI=0.0376936;REFB=-0.0153023;REVB=-0.0368119;RO=55;SAF=23;SAR=14;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102469;STB=0.55822;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0463763;OID=.;OPOS=117033028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:55:55:37:37:0.402174:14:23:29:26:14:23:29:26 chr9 117044751 . T C 875.23 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00364582;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.184;QD=56.4665;RBI=0.0122412;REFB=-0.0991551;REVB=0.0116857;RO=1;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171613;STB=0.509088;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00173137;OID=.;OPOS=117044751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:27:34:0:1:27:34:0:1 chr9 117050998 . G A 382.02 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0013074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.162;QD=19.8452;RBI=0.032858;REFB=-0.0309101;REVB=0.032832;RO=38;SAF=18;SAR=21;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839872;STB=0.546535;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0375669;OID=.;OPOS=117050998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:21:18:14:24:21:18:14:24 chr9 117051020 . A G 378.57 PASS AF=0.4875;AO=37;DP=78;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0034377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=359.636;QD=18.9284;RBI=0.0143309;REFB=-0.0143832;REVB=0.0139124;RO=40;SAF=14;SAR=23;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454982;STB=0.543456;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0155185;OID=.;OPOS=117051020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:40:41:37:39:0.4875:23:14:17:23:25:14:18:23 chr9 117051586 . C G 126.28 PASS AF=0.2;AO=21;DP=105;FAO=21;FDP=105;FR=.;FRO=84;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.0143708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1994;QD=4.81077;RBI=0.0329514;REFB=0.00130237;REVB=-0.0296526;RO=77;SAF=18;SAR=3;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477554;STB=0.81198;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00728779;OID=.;OPOS=117051586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:77:84:21:21:0.2:3:18:40:37:3:18:43:41 chr9 117064405 . C G 73.83 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00638674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9469;QD=9.84428;RBI=0.0213715;REFB=0.00946763;REVB=-0.0203948;RO=20;SAF=8;SAR=2;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150214;STB=0.592391;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0077697;OID=.;OPOS=117064405;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:2:8:14:6:2:8:14:6 chr9 117085526 . G A 642.76 PASS AF=0.897959;AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0191888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.98;QD=52.4702;RBI=0.0208177;REFB=-0.00611681;REVB=-0.00807274;RO=5;SAF=29;SAR=15;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539836;STB=0.528862;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00072127;OID=.;OPOS=117085526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:49:49:5:5:44:44:0.897959:15:29:2:3:15:29:2:3 chr9 117085635 . TTTT CTTT,TTTC 625.85 PASS AF=0.911111,0.0666667;AO=29,4;DP=44;FAO=41,3;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19,3;FSAR=22,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0960433,-0.0695972;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=37.0194,196.161;QD=55.6307;RBI=0.112347,0.0759863;REFB=0.110401,0.0877468;REVB=0.0582888,-0.0304983;RO=1;SAF=7,4;SAR=22,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0619467,0;STB=0.512814,0.5;STBP=0.312,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00238292,0.0639246;OID=.,.;OPOS=117085635,117085638;OREF=T,T;OALT=C,C;OMAPALT=CTTT,TTTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:44:45:1:1:29,4:41,3:0.911111,0.0666667:22,0:7,4:1:0:22,0:19,3:1:0 chr9 117092366 . A C 188.58 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.00312845;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.157;QD=10.6239;RBI=0.00360747;REFB=-0.0160535;REVB=0.00179628;RO=47;SAF=6;SAR=18;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690642;STB=0.540506;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0284578;OID=.;OPOS=117092366;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:18:6:14:33:18:6:14:33 chr9 117094200 . C T 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0144755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0472;QD=12.3287;RBI=0.0362782;REFB=-0.0105899;REVB=-0.0332651;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118806;STB=0.507029;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0254198;OID=.;OPOS=117094200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:4:7:11:6:4:7:11:6 chr9 117103973 . A G 919.89 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.534;QD=58.4057;RBI=0.0206067;REFB=0;REVB=-0.00338433;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35636e-05;OID=.;OPOS=117103973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0 chr9 117108971 . C T 233.43 PASS AF=0.329545;AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0094403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.321;QD=10.6106;RBI=0.03341;REFB=-0.0102487;REVB=-0.0320486;RO=59;SAF=21;SAR=8;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384505;STB=0.723983;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0171659;OID=.;OPOS=117108971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:59:59:29:29:0.329545:8:21:23:36:8:21:23:36 chr9 117110112 . T C 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0170168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.366;QD=17.3784;RBI=0.0175426;REFB=-0.0049909;REVB=0.00426259;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320029;STB=0.518484;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00194203;OID=.;OPOS=117110112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:4:7:6:4:4:7:6:4 chr9 117110180 . G A 48.85 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.041401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7165;QD=13.9565;RBI=0.0468005;REFB=-0.00699633;REVB=0.0218231;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235769;STB=0.639615;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0213803;OID=.;OPOS=117110180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:3:4:2:5:3:4:2:5 chr9 117120333 . G A 735.45 PASS AF=0.484277;AO=77;DP=160;FAO=77;FDP=159;FR=.;FRO=82;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=0.0262946;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3929;QD=18.5019;RBI=0.0578023;REFB=-0.0113682;REVB=0.0514752;RO=79;SAF=43;SAR=34;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248671;STB=0.524039;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0166257;OID=.;OPOS=117120333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:79:82:77:77:0.484277:34:43:42:37:34:43:42:40 chr9 117136363 . G A 264.79 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0179501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.156;QD=20.7677;RBI=0.0190801;REFB=-0.0107361;REVB=-0.00646872;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170595;STB=0.594528;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0137931;OID=.;OPOS=117136363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:15:12:6:18:15:12:6:18 chr9 117138278 . C T 35.94 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.796;QD=6.25037;RBI=0.00677796;REFB=-0.00590317;REVB=0.00677796;RO=16;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0348638;OID=.;OPOS=117138278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:16:17:6:6:0.26087:6:0:0:16:6:0:0:17 chr9 117138846 . G T 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0159162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.797;QD=18.6369;RBI=0.0450467;REFB=-0.00147261;REVB=0.0421412;RO=16;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574449;STB=0.532745;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0017331;OID=.;OPOS=117138846;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:6:10:9:7:6:10:9:7 chr9 117166206 . G T 307.09 PASS AF=0.454545;AO=33;DP=75;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0387315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6986;QD=15.9526;RBI=0.0557927;REFB=-0.0376666;REVB=0.0401584;RO=42;SAF=11;SAR=22;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263109;STB=0.508375;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0430373;OID=.;OPOS=117166206;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:42:42:33:35:0.454545:22:11:15:27:22:13:15:27 chr9 117166246 . A G 330.55 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0183252;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.244;QD=17.8677;RBI=0.0464858;REFB=-0.0212855;REVB=-0.0427214;RO=39;SAF=12;SAR=23;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999176;STB=0.505586;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.026517;OID=.;OPOS=117166246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:39:39:35:35:0.472973:23:12:13:26:23:12:13:26 chr9 117166338 . G C 357.56 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0101046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.683;QD=49.3186;RBI=0.0386692;REFB=-0.0804173;REVB=0.0373257;RO=2;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422613;STB=0.522711;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00106136;OID=.;OPOS=117166338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:21:6:0:2:21:6:0:2 chr9 117169033 . A G 1302.14 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00956799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8201;QD=62.0067;RBI=0.020019;REFB=0;REVB=0.0175845;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27138e-05;OID=.;OPOS=117169033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:35:49:0:0:35:49:0:0 chr9 117186677 . A G 1148.04 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128016;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.476;QD=59.6386;RBI=0.0402075;REFB=-0.0574264;REVB=0.0381152;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445528;OID=.;OPOS=117186677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:77:77:0:0:76:77:1:47:29:0:0:47:30:0:0 chr9 117186712 . C T 256.33 PASS AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=0.00252893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.989;QD=13.4911;RBI=0.0102199;REFB=-0.00928655;REVB=0.0099021;RO=46;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317565;STB=0.679312;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0155742;OID=.;OPOS=117186712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:46:46:30:30:0.394737:13:17:12:34:13:17:12:34 chr9 117188566 . C T 1639.19 PASS AF=0.973684;AO=110;DP=115;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00532671;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.615;QD=57.5156;RBI=0.0348194;REFB=-0.0610482;REVB=0.0344095;RO=1;SAF=65;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00724815;STB=0.511276;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.000205539;OID=.;OPOS=117188566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:115:114:1:3:110:111:0.973684:45:65:1:0:46:65:3:0 chr9 117377843 . G C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.16;QD=62.9828;RBI=0.0309647;REFB=0;REVB=0.0295585;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111292;OID=.;OPOS=117377843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr9 117429019 . A G 359.17 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0896936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.981;QD=49.5412;RBI=0.0909468;REFB=-0.138338;REVB=0.0150456;RO=2;SAF=6;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131958;STB=0.571372;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00216496;OID=.;OPOS=117429019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:29:29:2:2:27:27:0.931034:21:6:2:0:21:6:2:0 chr9 117430611 . A T 1339.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00914614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.934;QD=62.3147;RBI=0.0411657;REFB=0;REVB=-0.0401369;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.48923e-05;OID=.;OPOS=117430611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:34:52:0:0:34:52:0:0 chr9 117552885 . T C 1715.37 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.616;QD=59.6651;RBI=0.0392734;REFB=-0.116492;REVB=-0.0173889;RO=1;SAF=55;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00855555;STB=0.504504;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00154895;OID=.;OPOS=117552885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:115:1:1:114:114:0.991304:59:55:1:0:59:55:1:0 chr9 117553249 . T C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0786492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8129;QD=59.0171;RBI=0.0816246;REFB=0;REVB=0.0218375;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000713166;OID=.;OPOS=117553249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr9 117554069 . A G 664.49 PASS AF=0.576577;AO=64;DP=111;FAO=64;FDP=111;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=49;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0177712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.685;QD=23.9456;RBI=0.0178997;REFB=-0.0198515;REVB=0.00214043;RO=47;SAF=15;SAR=49;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164979;STB=0.59054;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0134223;OID=.;OPOS=117554069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:47:47:64:64:0.576577:49:15:19:28:49:15:19:28 chr9 117668142 . C T 666.65 PASS AF=0.485507;AO=67;DP=138;FAO=67;FDP=138;FR=.;FRO=71;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.00564542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.227;QD=19.3232;RBI=0.00583548;REFB=-0.00542142;REVB=-0.00147717;RO=70;SAF=33;SAR=34;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857935;STB=0.550581;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00538301;OID=.;OPOS=117668142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:70:71:67:67:0.485507:34:33:28:42:34:33:28:43 chr9 117792583 . C G 513.85 PASS AF=0.521277;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00265086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4741;QD=21.8658;RBI=0.0512234;REFB=-0.0109272;REVB=0.0511548;RO=45;SAF=24;SAR=25;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570082;STB=0.531441;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0103019;OID=.;OPOS=117792583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:45:45:49:49:0.521277:25:24:25:20:25:24:25:20 chr9 117797597 . T C 278.65 PASS AF=0.405063;AO=31;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0144765;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.342;QD=14.1087;RBI=0.014631;REFB=-0.0097632;REVB=0.00212109;RO=47;SAF=16;SAR=15;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14048;STB=0.599939;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0157586;OID=.;OPOS=117797597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:31:32:0.405063:15:16:18:29:15:17:17:30 chr9 117835931 . G A 496.67 PASS AF=0.378378;AO=56;DP=147;FAO=56;FDP=148;FR=.;FRO=92;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=-0.0140442;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.709;QD=13.4234;RBI=0.01675;REFB=-0.0193121;REVB=0.00912828;RO=90;SAF=38;SAR=18;SRF=40;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260515;STB=0.642095;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0271496;OID=.;OPOS=117835931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:90:92:56:56:0.378378:18:38:40:50:18:38:42:50 chr9 117846570 . C T 342.54 PASS AF=0.386792;AO=40;DP=105;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.00766149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.781;QD=12.9259;RBI=0.0112669;REFB=-0.00871755;REVB=-0.00826098;RO=64;SAF=22;SAR=18;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204225;STB=0.523444;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.014153;OID=.;OPOS=117846570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:64:65:40:41:0.386792:18:22:34:30:18:23:34:31 chr9 117848201 . T C 229.58 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00652238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.203;QD=22.3983;RBI=0.00676634;REFB=-0.0163998;REVB=-0.00180052;RO=19;SAF=18;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427462;STB=0.742024;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0116408;OID=.;OPOS=117848201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:4:18:7:12:4:18:7:12 chr9 117848394 . T C 833.13 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.386;QD=56.4837;RBI=0.0473801;REFB=0;REVB=0.0248128;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339994;OID=.;OPOS=117848394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:59:0:0:55:59:1:27:28:0:0:27:32:0:0 chr9 118163563 . C T 1572.55 PASS AF=0.964286;AO=108;DP=113;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0154895;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0693;QD=56.1624;RBI=0.0305937;REFB=-0.00950324;REVB=0.0263827;RO=4;SAF=47;SAR=61;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00446176;STB=0.502353;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00163635;OID=.;OPOS=118163563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:113:112:4:4:108:108:0.964286:61:47:2:2:61:47:2:2 chr9 119106881 . C A 1958.94 PASS AF=1;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352816;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.07;QD=61.699;RBI=0.045633;REFB=0;REVB=0.028941;RO=0;SAF=55;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17875e-05;OID=.;OPOS=119106881;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:127:0:0:126:127:1:71:55:0:0:72:55:0:0 chr9 119158814 . T C 600.31 PASS AF=0.6;AO=50;DP=86;FAO=54;FDP=90;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.00207605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.142;QD=26.6802;RBI=0.00849952;REFB=-0.021225;REVB=0.00824208;RO=36;SAF=30;SAR=20;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223397;STB=0.598986;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0153801;OID=.;OPOS=119158814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:36:36:50:54:0.6:20:30:11:25:24:30:11:25 chr9 119162545 . C A 664.25 PASS AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.477;QD=59.0446;RBI=0.0151391;REFB=-0.0624659;REVB=-0.0103622;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.508768;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000320457;OID=.;OPOS=119162545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:45:0:1:43:44:0.977778:15:28:0:0:16:28:1:0 chr9 119163067 . T C 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.016689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.712;QD=19.6968;RBI=0.0170212;REFB=0.000776674;REVB=-0.00334637;RO=22;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146473;STB=0.582703;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.000695082;OID=.;OPOS=119163067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:12:9:13:9:12:9:13:9 chr9 119187839 . C T 179.99 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0179727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0537;QD=23.2249;RBI=0.0658544;REFB=0.0137807;REVB=0.0633545;RO=13;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287626;STB=0.516111;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=-0.00829548;OID=.;OPOS=119187839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:9:9:7:6:9:9:7:6 chr9 119199820 . C G 1181.53 PASS AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0515298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1447;QD=58.3473;RBI=0.0655793;REFB=-0.119808;REVB=-0.0405625;RO=2;SAF=34;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270302;STB=0.514282;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00569988;OID=.;OPOS=119199820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:81:81:2:2:79:79:0.975309:45:34:2:0:45:34:2:0 chr9 119462112 . C T 1061.66 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.145;QD=59.8119;RBI=0.024757;REFB=0;REVB=-0.00124954;RO=0;SAF=24;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.99884e-05;OID=.;OPOS=119462112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:47:24:0:0:47:24:0:0 chr9 119463189 . T C 251.69 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0113077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.409;QD=17.0637;RBI=0.0163304;REFB=-0.0197797;REVB=-0.0117821;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066429;STB=0.546308;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0323724;OID=.;OPOS=119463189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:31:28:28:0.474576:16:12:15:15:16:12:16:15 chr9 119491303 . C T 537.23 PASS AF=0.401274;AO=63;DP=157;FAO=63;FDP=157;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=0.00375533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.428;QD=13.6874;RBI=0.00445593;REFB=-0.0279523;REVB=-0.0023985;RO=92;SAF=25;SAR=38;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110678;STB=0.5565;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0398098;OID=.;OPOS=119491303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:92:94:63:63:0.401274:38:25:46:46:38:25:46:48 chr9 119495697 . T C 1933.61 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=356.102;QD=61.8756;RBI=0.0109985;REFB=0;REVB=0.0100138;RO=0;SAF=58;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74048e-06;OID=.;OPOS=119495697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:67:58:0:0:67:58:0:0 chr9 119770480 . C T 2605.14 PASS AF=0.971751;AO=169;DP=178;FAO=172;FDP=177;FR=.;FRO=5;FSAF=94;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00915866;FXX=0.0111726;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.103;QD=58.8732;RBI=0.00956673;REFB=-0.0174218;REVB=0.0027643;RO=4;SAF=91;SAR=78;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023777;STB=0.515526;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.000108595;OID=.;OPOS=119770480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:178:177:4:5:169:172:0.971751:78:91:0:4:78:94:0:5 chr9 120039299 . T C 2159.1 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00988085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.488;QD=63.0395;RBI=0.0309626;REFB=0;REVB=0.0293437;RO=0;SAF=63;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.57773e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16702e-05;OID=.;OPOS=120039299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:136:137:0:0:136:137:1:73:63:0:0:73:64:0:0 chr9 120053674 . G A 365.11 PASS AF=0.338346;AO=45;DP=133;FAO=45;FDP=133;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.0109852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.095;QD=10.9807;RBI=0.0124405;REFB=-0.00720587;REVB=0.00583885;RO=86;SAF=23;SAR=22;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392078;STB=0.522368;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0143176;OID=.;OPOS=120053674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:86:88:45:45:0.338346:22:23:41:45:22:23:42:46 chr9 120053695 . G A 370.66 PASS AF=0.330935;AO=44;DP=138;FAO=46;FDP=139;FR=.;FRO=93;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=0.0192852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.878;QD=10.6664;RBI=0.0193375;REFB=-0.0111176;REVB=0.00142194;RO=93;SAF=23;SAR=21;SRF=41;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956226;STB=0.539551;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0275164;OID=.;OPOS=120053695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:93:93:44:46:0.330935:21:23:41:52:23:23:41:52 chr9 120053776 . T C 1716.28 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00205899;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.879;QD=60.7532;RBI=0.0102136;REFB=0;REVB=0.0100039;RO=0;SAF=40;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59302e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11762e-05;OID=.;OPOS=120053776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:73:40:0:0:73:40:0:0 chr9 120470358 . G A 1171.99 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.795;QD=60.8828;RBI=0.0343741;REFB=0;REVB=0.0225197;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015985;OID=.;OPOS=120470358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0 chr9 121928928 . T G 284.53 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00497032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.235;QD=17.7834;RBI=0.0527865;REFB=-0.0193486;REVB=0.052552;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462129;STB=0.501525;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0210013;OID=.;OPOS=121928928;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:33:31:31:0.484375:17:14:12:18:17:14:15:18 chr9 122001000 . G A 405.22 PASS AF=0.405172;AO=47;DP=116;FAO=47;FDP=116;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0184822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.717;QD=13.9731;RBI=0.0194751;REFB=-0.0094097;REVB=0.00613902;RO=69;SAF=24;SAR=23;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064588;STB=0.536445;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0122322;OID=.;OPOS=122001000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:69:69:47:47:0.405172:23:24:31:38:23:24:31:38 chr9 123170732 . A AG 349.3 PASS AF=1;AO=3;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399908;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=64.142;QD=46.5731;RBI=0.0735764;REFB=0;REVB=0.0617595;RO=27;SAF=3;SAR=0;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599993;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00130215;OID=.;OPOS=123170733;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:30:30:30:0:15:15:0:0:3:27:3:0:11:16 chr9 123170733 . C G 355.19 PASS AF=0.9;AO=27;DP=31;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0384321;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.716;QD=47.3588;RBI=0.0583046;REFB=-0.20699;REVB=0.0438452;RO=3;SAF=11;SAR=16;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.559955;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0053144;OID=.;OPOS=123170733;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:31:30:3:3:27:27:0.9:16:11:3:0:16:11:3:0 chr9 123220829 . A G 559.05 PASS AF=0.460938;AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.00823419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.608;QD=17.4704;RBI=0.0139067;REFB=-0.0131596;REVB=-0.0112069;RO=67;SAF=27;SAR=32;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104622;STB=0.557825;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0142257;OID=.;OPOS=123220829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:67:69:59:59:0.460938:32:27:38:29:32:27:39:30 chr9 123291036 . C G 509.71 PASS AF=0.55814;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0263346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.244;QD=23.7075;RBI=0.0274716;REFB=-0.0204462;REVB=0.00782173;RO=37;SAF=30;SAR=18;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00285644;STB=0.509255;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0207539;OID=.;OPOS=123291036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:37:38:48:48:0.55814:18:30:23:14:18:30:23:15 chr9 123301346 . T G 489.19 PASS AF=0.52809;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00702585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.429;QD=21.986;RBI=0.00704463;REFB=-0.00716507;REVB=0.000514048;RO=42;SAF=31;SAR=16;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598877;STB=0.533076;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00541919;OID=.;OPOS=123301346;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:42:42:47:47:0.52809:16:31:25:17:16:31:25:17 chr9 123342259 . C A 769.99 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266134;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.973;QD=64.1659;RBI=0.0335611;REFB=0;REVB=0.020447;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148531;OID=.;OPOS=123342259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr9 123342275 . A G 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00800464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.02;QD=62.981;RBI=0.0363077;REFB=0;REVB=-0.0354143;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000337773;OID=.;OPOS=123342275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr9 123583192 . A G 188.79 PASS AF=0.396552;AO=22;DP=56;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.120013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.859;QD=13.0197;RBI=0.120015;REFB=-0.0225472;REVB=0.000632665;RO=34;SAF=12;SAR=10;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353757;STB=0.691141;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0288603;OID=.;OPOS=123583192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:34:35:22:23:0.396552:10:12:7:27:11:12:7:28 chr9 123586737 . T G 502.93 PASS AF=0.490741;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.015933;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.151;QD=18.627;RBI=0.0171243;REFB=-0.0136364;REVB=-0.00627537;RO=55;SAF=24;SAR=29;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851471;STB=0.547152;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0216742;OID=.;OPOS=123586737;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:55:55:53:53:0.490741:29:24:30:25:29:24:30:25 chr9 123618971 . A G 340.49 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00177273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.395;QD=23.4818;RBI=0.0165716;REFB=-0.0233692;REVB=0.0164765;RO=23;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478693;STB=0.517231;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0109372;OID=.;OPOS=123618971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:23:24:34:34:0.586207:17:17:13:10:17:17:13:11 chr9 123632003 . T C 165.74 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00606547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.121;QD=21.3858;RBI=0.00609078;REFB=-0.00510567;REVB=0.000554685;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805621;STB=0.545401;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00474871;OID=.;OPOS=123632003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:9:8:8:6:9:8:8:6 chr9 123632045 . A G 255.21 PASS AF=0.533333;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0451525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.11;QD=22.685;RBI=0.0473613;REFB=-0.0273744;REVB=0.0142949;RO=21;SAF=10;SAR=13;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116308;STB=0.552636;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0215359;OID=.;OPOS=123632045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:23:24:0.533333:13:10:12:9:13:11:12:9 chr9 123671520 . G A 238.49 PASS AF=0.952381;AO=18;DP=19;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00452573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0502;QD=45.427;RBI=0.0139934;REFB=0.00465346;REVB=0.0132413;RO=1;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483018;STB=0.526289;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000671513;OID=.;OPOS=123671520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:21:1:1:18:20:0.952381:9:9:0:1:9:11:0:1 chr9 123675801 . G A 94.52 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0276071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2089;QD=21.0037;RBI=0.0608767;REFB=-0.0230653;REVB=-0.054257;RO=7;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327739;STB=0.685949;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0136126;OID=.;OPOS=123675801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:4:7:1:6:4:7:1:6 chr9 123725971 . C T 249.92 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00619207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.312;QD=16.6612;RBI=0.00854103;REFB=-0.00948548;REVB=-0.0058828;RO=32;SAF=21;SAR=7;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320754;STB=0.68168;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0113905;OID=.;OPOS=123725971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:7:21:14:18:7:21:14:18 chr9 123731408 . G A 1529.59 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000147641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.32;QD=63.7328;RBI=0.0103313;REFB=0;REVB=0.0103303;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60747e-06;OID=.;OPOS=123731408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:44:51:0:0:45:51:0:0 chr9 123734287 . GAAAC G 82.48 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00937898;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=4;MLLD=304.025;QD=10.6422;RBI=0.00950672;REFB=-0.0062556;REVB=0.00155323;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147914;STB=0.586076;STBP=0.424;TYPE=del;VARB=0.00842321;OID=.;OPOS=123734288;OREF=AAAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.419355:13:31:13:31:18:7:6:7:11:82:18:7:6:7:11 chr9 123739070 . T C 422.3 PASS AF=0.357143;AO=49;DP=139;FAO=50;FDP=140;FR=.;FRO=90;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=0.0132927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.343;QD=12.0656;RBI=0.0190696;REFB=-0.00809381;REVB=0.013673;RO=90;SAF=22;SAR=27;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327596;STB=0.511476;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0145764;OID=.;OPOS=123739070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:90:90:49:50:0.357143:27:22:43:47:27:23:43:47 chr9 123783934 . T C 940.73 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196874;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.754;QD=58.7954;RBI=0.0217613;REFB=0;REVB=0.00927154;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6521e-05;OID=.;OPOS=123783934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0 chr9 123800218 . C T 311.91 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00346696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.432;QD=14.1777;RBI=0.0702609;REFB=-0.0211814;REVB=-0.0701753;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249774;STB=0.520197;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0369213;OID=.;OPOS=123800218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:52:53:35:35:0.397727:16:19:27:25:16:19:27:26 chr9 123880640 . A G 434.48 PASS AF=0.463158;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00805039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.749;QD=18.2939;RBI=0.00944444;REFB=-0.0100098;REVB=0.00493848;RO=51;SAF=18;SAR=26;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412811;STB=0.523051;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0115171;OID=.;OPOS=123880640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:51:51:44:44:0.463158:26:18:23:28:26:18:23:28 chr9 123886324 . C T 378.08 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.00331196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.881;QD=18.9039;RBI=0.0059218;REFB=-0.00633243;REVB=-0.00490904;RO=41;SAF=17;SAR=22;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13718;STB=0.576042;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00992086;OID=.;OPOS=123886324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:22:17:12:29:22:17:12:29 chr9 123933546 . G A 288.69 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00748114;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.116;QD=18.3292;RBI=0.0336584;REFB=-0.0114537;REVB=-0.0328165;RO=33;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890631;STB=0.525531;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00719207;OID=.;OPOS=123933546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:63:33:32:31:31:0.492063:13:18:16:17:13:18:17:15 chr9 124043867 . C T 227.14 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00116901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.082;QD=15.6647;RBI=0.0903213;REFB=0.00388676;REVB=0.0903138;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545155;STB=0.530808;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=-0.00697032;OID=.;OPOS=124043867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:12:14:19:13:12:14:19:13 chr9 124044995 . C T 205.36 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0113399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.505;QD=14.6687;RBI=0.0201574;REFB=-0.010264;REVB=-0.0166652;RO=31;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278114;STB=0.646085;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0186935;OID=.;OPOS=124044995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:32:24:24:0.428571:11:13:8:23:11:13:9:23 chr9 124045949 . GTTCA G 90.13 PASS AF=0.385965;AO=17;DP=42;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.01714;FXX=0.239968;HRUN=2;LEN=4;MLLD=183.318;QD=6.32483;RBI=0.0190857;REFB=-0.0257699;REVB=-0.0083956;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.696777;STBP=0.032;TYPE=del;VARB=0.062682;OID=.;OPOS=124045950;OREF=TTCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.385965:17:42:22:57:35:5:17:18:17:90:0:11:6:0:0 chr9 124046691 . G T 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00379198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.997;QD=14.1389;RBI=0.0146475;REFB=-0.027595;REVB=0.0141481;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021973;STB=0.512802;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0414889;OID=.;OPOS=124046691;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:6:8:11:9:6:8:11:9 chr9 124046722 . C T 174.02 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0126761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.776;QD=19.335;RBI=0.0155952;REFB=-0.00746286;REVB=0.0090844;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507894;STB=0.528814;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0233667;OID=.;OPOS=124046722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:7:11:10:8:7:11:10:8 chr9 124046830 . CT CC,C 488.15 PASS AF=0.027027,0.972973;AO=3,29;DP=34;FAO=1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=1,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021988,-0.0354481;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=8.59548,23.1803;QD=52.7734;RBI=0.00273073,0.104017;REFB=0,0;REVB=0.00161931,-0.0977902;RO=1;SAF=1,17;SAR=2,12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.266641,-0.0266159;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0497045,0.00175275;OID=.,.;OPOS=124046831,124046831;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.027027,0.972973:3,29:34:1,36:37:0:0,19:1,17:0:0:4:1:1,17:2,12:1:0 chr9 124047237 . T C 128.09 PASS AF=0.56;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0320684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.264;QD=20.4938;RBI=0.0320739;REFB=-0.0558073;REVB=-0.000598167;RO=10;SAF=3;SAR=11;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450164;STB=0.741965;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0246539;OID=.;OPOS=124047237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:24:25:10:11:14:14:0.56:11:3:8:2:11:3:8:3 chr9 124047246 . A C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.028;QD=44.6898;RBI=0.0276428;REFB=0;REVB=0.00621885;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102503;OID=.;OPOS=124047246;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr9 124089725 . C G 133.22 PASS AF=0.405405;AO=16;DP=38;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0574493;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8267;QD=14.4025;RBI=0.0718039;REFB=-0.00198722;REVB=0.043074;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128177;STB=0.603631;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00492256;OID=.;OPOS=124089725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:22:22:16:15:0.405405:10:6:11:11:10:5:11:11 chr9 124218133 . C T 323.71 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.000271354;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.737;QD=16.6004;RBI=0.0157809;REFB=-0.0332845;REVB=-0.0157786;RO=43;SAF=21;SAR=14;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133524;STB=0.575086;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0195656;OID=.;OPOS=124218133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:43:43:35:35:0.448718:14:21:20:23:14:21:20:23 chr9 124257091 . C T 126.65 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0364079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2958;QD=11.2576;RBI=0.0779105;REFB=-0.013362;REVB=-0.0688804;RO=29;SAF=4;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361664;STB=0.724249;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0281078;OID=.;OPOS=124257091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:30:15:15:0.333333:11:4:17:12:11:4:18:12 chr9 124547609 . C T 452.07 PASS AF=0.478723;AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0103501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.95;QD=19.2368;RBI=0.010365;REFB=0.000981701;REVB=-0.000556493;RO=49;SAF=19;SAR=26;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139767;STB=0.577743;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.00198714;OID=.;OPOS=124547609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:49:49:45:45:0.478723:26:19:28:21:26:19:28:21 chr9 124914613 . C T 210.41 PASS AF=0.444444;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00598767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.351;QD=15.5859;RBI=0.0172177;REFB=-0.000135515;REVB=-0.016143;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153618;STB=0.596252;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=9.52792e-05;OID=.;OPOS=124914613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:30:30:23:24:0.444444:11:12:11:19:11:13:11:19 chr9 124966449 . C T 202.89 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00521467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4551;QD=12.2965;RBI=0.107989;REFB=-0.00345316;REVB=-0.107863;RO=40;SAF=10;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108527;STB=0.555511;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00238074;OID=.;OPOS=124966449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:15:10:20:20:15:10:20:21 chr9 124975989 . GC G,GG 52.89 PASS AF=0.625,0;AO=4,2;DP=16;FAO=10,0;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=8,0;FSAR=2,0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0505315,-0.0173514;FXX=0.0587889;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.4054,16.2604;QD=13.2215;RBI=0.0883504,0.071189;REFB=-0.0833607,-0.0386626;REVB=0.0724731,0.0690421;RO=5;SAF=2,2;SAR=2,0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.467015,0;STB=0.636145,0.5;STBP=0.305,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0728298,0.0508242;OID=.,.;OPOS=124975990,124975990;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.625,0:4,2:16:10,0:16:6:8,0:2,0:6:0:32:5:2,2:2,0:5:0 chr9 125133479 . T C 1117.86 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0543894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.201;QD=58.8345;RBI=0.0580244;REFB=-0.12507;REVB=0.0202144;RO=1;SAF=18;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255553;STB=0.51351;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000553422;OID=.;OPOS=125133479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:57:18:1:0:57:18:1:0 chr9 125239253 . T C 95.68 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00380916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.037;QD=11.5972;RBI=0.0104757;REFB=-0.00168115;REVB=-0.00975861;RO=21;SAF=9;SAR=3;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166256;STB=0.599822;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00241992;OID=.;OPOS=125239253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:3:9:13:8:3:9:13:8 chr9 125289083 . A G 126.89 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0241572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.467;QD=19.522;RBI=0.0373852;REFB=-0.00283531;REVB=-0.0285321;RO=12;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256161;STB=0.644963;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00150398;OID=.;OPOS=125289083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:6:8:3:9:6:8:3:9 chr9 125289521 . G A 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00515264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.105;QD=19.3696;RBI=0.00528005;REFB=0.0259079;REVB=0.00115294;RO=15;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192921;STB=0.609618;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.0155483;OID=.;OPOS=125289521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:6:10:6:9:6:10:6:9 chr9 125315542 . C T 441.44 PASS AF=0.558442;AO=40;DP=74;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0108469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.932;QD=22.9318;RBI=0.014436;REFB=-0.0169402;REVB=-0.00952588;RO=33;SAF=19;SAR=21;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329291;STB=0.518108;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0119879;OID=.;OPOS=125315542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:77:33:34:40:43:0.558442:21:19:17:16:22:21:18:16 chr9 125315557 . T C 435.55 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00942733;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5123;QD=20.9905;RBI=0.0302708;REFB=-0.0220377;REVB=0.0287654;RO=39;SAF=20;SAR=23;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190474;STB=0.516846;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0187145;OID=.;OPOS=125315557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:40:43:43:0.518072:23:20:19:20:23:20:20:20 chr9 125315778 . G C 224.29 PASS AF=0.337349;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.057959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5258;QD=10.809;RBI=0.0691439;REFB=-0.0343082;REVB=-0.0377046;RO=54;SAF=14;SAR=14;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147529;STB=0.590299;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.053011;OID=.;OPOS=125315778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:54:55:28:28:0.337349:14:14:34:20:14:14:35:20 chr9 125316033 . T C 241.97 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00891474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.257;QD=16.9804;RBI=0.0209892;REFB=-0.0120051;REVB=0.0190019;RO=30;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209526;STB=0.617674;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0178862;OID=.;OPOS=125316033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:11:16:11:19:11:16:11:19 chr9 125316042 . T C 146.64 PASS AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0319474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.508;QD=10.4742;RBI=0.0320651;REFB=-0.00123081;REVB=-0.00274475;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130767;STB=0.507684;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00156874;OID=.;OPOS=125316042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:11:8:16:21:11:8:16:21 chr9 125316179 . T G 214.16 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0638161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0605;QD=12.7857;RBI=0.0642137;REFB=-0.0313575;REVB=0.00713396;RO=41;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173532;STB=0.509957;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0513329;OID=.;OPOS=125316179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:15:11:18:23:15:11:18:23 chr9 125316350 . C T 725.58 PASS AF=0.538462;AO=70;DP=130;FAO=70;FDP=130;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=-0.0245821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3317;QD=22.3255;RBI=0.0443974;REFB=-0.0195744;REVB=-0.036971;RO=59;SAF=26;SAR=44;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254598;STB=0.635688;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0192049;OID=.;OPOS=125316350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:59:60:70:70:0.538462:44:26:40:19:44:26:40:20 chr9 125316455 . C T 267.06 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.100613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.597;QD=20.1554;RBI=0.100743;REFB=-0.0109652;REVB=-0.00511033;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208437;STB=0.616025;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0080027;OID=.;OPOS=125316455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:17:11:16:9:17:11:16:9 chr9 125330125 . C G 126.69 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0498737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0633;QD=11.261;RBI=0.0518871;REFB=-0.0274161;REVB=-0.0143138;RO=30;SAF=5;SAR=10;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263247;STB=0.656506;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0227551;OID=.;OPOS=125330125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:10:5:17:13:10:5:17:13 chr9 125330325 . C G 206.95 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00608965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.159;QD=17.2458;RBI=0.0674764;REFB=-0.0206035;REVB=-0.067201;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650418;STB=0.537154;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0265121;OID=.;OPOS=125330325;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:13:8:12:15:13:8:12:15 chr9 125330678 . T G 806.12 PASS AF=0.435897;AO=85;DP=195;FAO=85;FDP=195;FR=.;FRO=110;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=63;FSRR=47;FWDB=-0.014538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.224;QD=16.5359;RBI=0.0152645;REFB=-0.0119927;REVB=-0.00465304;RO=110;SAF=52;SAR=33;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411563;STB=0.522936;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0175986;OID=.;OPOS=125330678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:110:110:85:85:0.435897:33:52:63:47:33:52:63:47 chr9 125330739 . G A 946.08 PASS AF=0.489583;AO=94;DP=192;FAO=94;FDP=192;FR=.;FRO=98;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=0.0127398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8657;QD=19.71;RBI=0.0172139;REFB=-0.00763699;REVB=0.0115765;RO=98;SAF=45;SAR=49;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480677;STB=0.526468;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00722479;OID=.;OPOS=125330739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:98:98:94:94:0.489583:49:45:52:46:49:45:52:46 chr9 125330752 . T C 944.39 PASS AF=0.508197;AO=93;DP=183;FAO=93;FDP=183;FR=.;FRO=90;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=0.0464143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2872;QD=20.6425;RBI=0.0568347;REFB=-0.0219598;REVB=0.0328008;RO=90;SAF=49;SAR=44;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638314;STB=0.53504;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0223406;OID=.;OPOS=125330752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:90:90:93:93:0.508197:44:49:41:49:44:49:41:49 chr9 125377087 . A G 891.8 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354913;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.859;QD=58.4786;RBI=0.0363793;REFB=0;REVB=0.00798905;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325081;OID=.;OPOS=125377087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0 chr9 125377375 . A G 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0303565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.638;QD=16.4169;RBI=0.0324477;REFB=-0.0181246;REVB=0.01146;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157511;STB=0.591261;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0096297;OID=.;OPOS=125377375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:10:4:7:9:10:4:7:9 chr9 125377505 . A G 323.02 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.964;QD=53.836;RBI=0.0497347;REFB=0;REVB=0.0248082;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253104;OID=.;OPOS=125377505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:16:7:0:0:17:7:0:0 chr9 125377734 . A G 271.08 PASS AF=0.581395;AO=24;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0599986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.881;QD=25.2164;RBI=0.0600002;REFB=-0.00410237;REVB=0.000440746;RO=18;SAF=7;SAR=17;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130348;STB=0.520591;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00201689;OID=.;OPOS=125377734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:24:25:0.581395:17:7:5:13:17:8:5:13 chr9 125378014 . T G 249.37 PASS AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00934906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.941;QD=33.2499;RBI=0.0181834;REFB=0.0140188;REVB=-0.0155958;RO=8;SAF=9;SAR=13;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081429;STB=0.544546;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.00503647;OID=.;OPOS=125378014;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:13:9:2:6:13:9:2:6 chr9 125390874 . A C 897.89 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.85;QD=57.9283;RBI=0.0265286;REFB=0;REVB=0.0211123;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20286e-05;OID=.;OPOS=125390874;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:36:23:0:0:38:24:0:0 chr9 125391026 . A C 888.03 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.116;QD=57.2923;RBI=0.0911247;REFB=0;REVB=0.0844233;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209591;OID=.;OPOS=125391026;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:62:0:0:58:62:1:25:33:0:0:25:37:0:0 chr9 125391127 . C T 575.76 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.134;QD=60.6062;RBI=0.0450454;REFB=0;REVB=0.0414124;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359674;OID=.;OPOS=125391127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr9 125391241 . G A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.824;QD=60.6102;RBI=0.0235435;REFB=0;REVB=0.0172826;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86111e-06;OID=.;OPOS=125391241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0 chr9 125391369 . A G 224.59 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0282655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1346;QD=17.6151;RBI=0.0282667;REFB=-0.0102672;REVB=0.000266003;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221646;STB=0.615667;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00614599;OID=.;OPOS=125391369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:27:24:24:0.470588:15:9:16:10:15:9:16:11 chr9 125391677 . T C 273.91 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.00978009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.526;QD=17.6719;RBI=0.0103721;REFB=-0.01665;REVB=-0.00345395;RO=32;SAF=11;SAR=19;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154598;STB=0.585903;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0224596;OID=.;OPOS=125391677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:19:11:7:25:19:11:7:25 chr9 125437611 . T C 135.65 PASS AF=0.35;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0107786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.314;QD=13.5647;RBI=0.0281022;REFB=-0.0148138;REVB=-0.0259529;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00669221;STB=0.507681;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0266595;OID=.;OPOS=125437611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:23:24:14:14:0.35:6:8:13:10:6:8:14:10 chr9 125486968 . G A 1878.48 PASS AF=0.984252;AO=122;DP=127;FAO=125;FDP=127;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=86;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0576339;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.412;QD=59.1647;RBI=0.0596762;REFB=-0.0699828;REVB=0.0154785;RO=3;SAF=36;SAR=86;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379489;STB=0.512498;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00117932;OID=.;OPOS=125486968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:127:127:3:2:122:125:0.984252:86:36:3:0:86:39:2:0 chr9 125512193 . C A 1328.32 PASS AF=0.988506;AO=80;DP=82;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.162684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5435;QD=61.0722;RBI=0.172785;REFB=-0.056353;REVB=0.0582113;RO=0;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3274e-08;STB=0.505375;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0044383;OID=.;OPOS=125512193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:87:0:1:80:86:0.988506:46:34:0:0:46:40:0:1 chr9 125512575 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.812;QD=56.1915;RBI=0.0437719;REFB=0;REVB=0.0138437;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247059;OID=.;OPOS=125512575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr9 125512770 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5203;QD=59.1431;RBI=0.0425873;REFB=0;REVB=0.034756;RO=0;SAF=4;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468823;OID=.;OPOS=125512770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:62:4:0:0:63:4:0:0 chr9 125512788 . G A 1488.77 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0353;QD=63.3519;RBI=0.0833818;REFB=0;REVB=0.0665647;RO=0;SAF=13;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592928;OID=.;OPOS=125512788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:94:0:0:91:94:1:78:13:0:0:80:14:0:0 chr9 125512795 . G C 1513.42 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0972607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.109;QD=59.9374;RBI=0.0986576;REFB=0;REVB=-0.0165432;RO=0;SAF=16;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112554;OID=.;OPOS=125512795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:85:16:0:0:85:16:0:0 chr9 125512826 . G A 2103.27 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.6545;QD=62.7841;RBI=0.0474428;REFB=0;REVB=0.0136528;RO=0;SAF=31;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232135;OID=.;OPOS=125512826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:134:0:0:133:134:1:102:31:0:0:102:32:0:0 chr9 125524836 . A G 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00462762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.664;QD=57.545;RBI=0.0228695;REFB=0;REVB=0.0223964;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135436;OID=.;OPOS=125524836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0 chr9 125582173 . C T 114.69 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.034155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.057;QD=10.4264;RBI=0.034376;REFB=1.88748e-05;REVB=-0.00389232;RO=30;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273214;STB=0.663231;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.00092286;OID=.;OPOS=125582173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:5:9:12:18:5:9:12:18 chr9 125637471 . A T 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00463726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.563;QD=64.4125;RBI=0.00497127;REFB=0;REVB=0.00179147;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.81858e-06;OID=.;OPOS=125637471;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0 chr9 125637648 . T C 446.89 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0318903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9198;QD=57.6633;RBI=0.064982;REFB=0;REVB=0.0566186;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506528;OID=.;OPOS=125637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr9 125652757 . G A 333.75 PASS AF=0.530303;AO=34;DP=65;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0113625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.076;QD=20.2275;RBI=0.0380887;REFB=-0.0248178;REVB=-0.0363544;RO=30;SAF=20;SAR=14;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997018;STB=0.53844;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0210537;OID=.;OPOS=125652757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:30:31:34:35:0.530303:14:20:21:9:14:21:21:10 chr9 125672326 . G A 171.08 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00816194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9741;QD=17.5462;RBI=0.0135354;REFB=0.0136146;REVB=0.0107977;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00788839;STB=0.504499;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.0152821;OID=.;OPOS=125672326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:13:8:7:11:13:8 chr9 125782663 . A G 400.43 PASS AF=0.476744;AO=38;DP=83;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0114077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.426;QD=18.6248;RBI=0.014382;REFB=-0.000495256;REVB=-0.0087581;RO=45;SAF=13;SAR=25;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337597;STB=0.531371;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000555268;OID=.;OPOS=125782663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:86:45:45:38:41:0.476744:25:13:14:31:26:15:14:31 chr9 125866070 . G C 470.43 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00375262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.497;QD=20.6783;RBI=0.00375394;REFB=-0.0036292;REVB=-9.96734e-05;RO=45;SAF=26;SAR=20;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883566;STB=0.548923;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00462557;OID=.;OPOS=125866070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:20:26:21:24:20:26:21:24 chr9 126028395 . C G 754.63 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.03;QD=54.8823;RBI=0.0320372;REFB=-0.0407856;REVB=0.0166925;RO=1;SAF=41;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348675;STB=0.518512;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.000489688;OID=.;OPOS=126028395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:13:41:0:1:13:41:0:1 chr9 126125318 . C A 1236.37 PASS AF=0.97619;AO=81;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0131217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2543;QD=58.8747;RBI=0.0131217;REFB=-0.0522103;REVB=-1.33066e-05;RO=2;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249049;STB=0.512817;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00609934;OID=.;OPOS=126125318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:81:82:0.97619:37:44:0:2:38:44:0:2 chr9 126128211 . T C 851.24 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.917;QD=57.7113;RBI=0.0487776;REFB=0;REVB=0.0211289;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174099;OID=.;OPOS=126128211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:36:22:0:0:36:23:0:0 chr9 126128253 . G C 603.51 PASS AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00489596;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.163;QD=57.4774;RBI=0.145008;REFB=-0.213978;REVB=0.144925;RO=2;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323315;STB=0.50847;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0114579;OID=.;OPOS=126128253;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:2:1:40:41:0.97619:28:12:0:2:29:12:0:1 chr9 126129545 . C T 628.69 PASS AF=0.484848;AO=64;DP=132;FAO=64;FDP=132;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=-0.00665011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.773;QD=19.0512;RBI=0.00805011;REFB=-0.0167225;REVB=0.00453655;RO=68;SAF=26;SAR=38;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231855;STB=0.512816;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0167552;OID=.;OPOS=126129545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:68:68:64:64:0.484848:38:26:26:42:38:26:26:42 chr9 126129904 . C T 5637.17 PASS AF=1;AO=363;DP=371;FAO=367;FDP=367;FR=.;FRO=0;FSAF=187;FSAR=180;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036794;FXX=0.0160854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9188;QD=61.4406;RBI=0.0390717;REFB=-0.100478;REVB=-0.0131452;RO=5;SAF=183;SAR=180;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128557;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125435;OID=.;OPOS=126129904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:371:367:5:0:363:367:1:180:183:5:0:180:187:0:0 chr9 126131161 . G A 804.93 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0255321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.477;QD=55.5124;RBI=0.0407343;REFB=-0.158601;REVB=0.0317395;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000769073;OID=.;OPOS=126131161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:58:58:0:1:57:57:0.982759:30:27:0:0:30:27:1:0 chr9 126133547 . T C 289.34 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.725;QD=52.6064;RBI=0.128204;REFB=0;REVB=0.0467542;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112694;OID=.;OPOS=126133547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr9 126134542 . G A 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.598;QD=61.0487;RBI=0.0461471;REFB=0;REVB=0.0214142;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113135;OID=.;OPOS=126134542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:43:35:0:0:43:35:0:0 chr9 126520068 . T C 635.0 PASS AF=0.457746;AO=65;DP=143;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=0.0155505;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5398;QD=17.8873;RBI=0.0166981;REFB=0.00530934;REVB=0.00608341;RO=77;SAF=35;SAR=30;SRF=28;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169421;STB=0.593957;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.00769719;OID=.;OPOS=126520068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:77:77:65:65:0.457746:30:35:28:49:30:35:28:49 chr9 126770250 . C G 975.75 PASS AF=0.541436;AO=86;DP=170;FAO=98;FDP=181;FR=.;FRO=83;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=0.0222482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.973;QD=21.5635;RBI=0.0243674;REFB=-0.0184003;REVB=0.00993911;RO=83;SAF=46;SAR=40;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00654751;STB=0.513641;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.013997;OID=.;OPOS=126770250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:181:83:83:86:98:0.541436:40:46:45:38:42:56:45:38 chr9 126783433 . G C 384.9 PASS AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00509652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.55;QD=23.3272;RBI=0.0167306;REFB=-0.00382534;REVB=-0.0159354;RO=28;SAF=17;SAR=21;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408437;STB=0.52246;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00229546;OID=.;OPOS=126783433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:21:17:14:14:21:17:14:14 chr9 127076271 . A G 132.08 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0187274;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.646;QD=13.2081;RBI=0.0661789;REFB=-0.0327879;REVB=-0.0634739;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941367;STB=0.526281;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0536115;OID=.;OPOS=127076271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:25:15:15:0.375:6:9:14:9:6:9:16:9 chr9 127101924 . C T 1605.98 PASS AF=0.891473;AO=115;DP=129;FAO=115;FDP=129;FR=.;FRO=14;FSAF=69;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0330125;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0192;QD=49.7977;RBI=0.0368815;REFB=0.00333665;REVB=-0.0164444;RO=12;SAF=69;SAR=46;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792844;STB=0.54285;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.00207499;OID=.;OPOS=127101924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:129:129:12:14:115:115:0.891473:46:69:2:10:46:69:3:11 chr9 127113660 . A G 554.85 PASS AF=0.56044;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0151346;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.218;QD=24.3889;RBI=0.0159421;REFB=0.00377665;REVB=0.00500922;RO=40;SAF=19;SAR=32;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194414;STB=0.510654;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.00279856;OID=.;OPOS=127113660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:91:40:40:51:51:0.56044:32:19:14:26:32:19:14:26 chr9 127113732 . C T 261.29 PASS AF=0.447761;AO=29;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.00890581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.109;QD=15.5995;RBI=0.0204962;REFB=0.00447949;REVB=-0.0184603;RO=38;SAF=6;SAR=23;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237925;STB=0.646046;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.0138742;OID=.;OPOS=127113732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:37:29:30:0.447761:23:6:15:23:24:6:15:22 chr9 127214450 . C T 394.51 PASS AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00166684;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=239.555;QD=19.9754;RBI=0.0419701;REFB=-0.0147037;REVB=-0.0419369;RO=39;SAF=18;SAR=22;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130152;STB=0.57195;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.011829;OID=.;OPOS=127214450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:22:18:12:27:22:18:12:27 chr9 127216839 . C T 686.11 PASS AF=0.503704;AO=68;DP=135;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0280592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3781;QD=20.3291;RBI=0.0304335;REFB=-0.00767685;REVB=0.0117848;RO=67;SAF=42;SAR=26;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128866;STB=0.571089;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00833954;OID=.;OPOS=127216839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:67:67:68:68:0.503704:26:42:32:35:26:42:32:35 chr9 127220952 . T C 237.68 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00701607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.051;QD=18.6417;RBI=0.0202685;REFB=-0.00803717;REVB=-0.0190154;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207613;STB=0.617065;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00936839;OID=.;OPOS=127220952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:8:17:12:14:8:17:12:14 chr9 127228596 . A G 574.46 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.799;QD=60.4695;RBI=0.0201974;REFB=0;REVB=0.0198748;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87831e-05;OID=.;OPOS=127228596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:24:13:0:0:25:13:0:0 chr9 127230813 . G A 429.84 PASS AF=0.456311;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=103;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0180713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.289;QD=16.6927;RBI=0.0182858;REFB=-0.0310352;REVB=0.00279285;RO=55;SAF=24;SAR=23;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00149604;STB=0.503926;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0384605;OID=.;OPOS=127230813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:56:47:47:0.456311:23:24:28:27:23:24:29:27 chr9 127230891 . G A 359.77 PASS AF=0.403846;AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.00722552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.151;QD=13.8374;RBI=0.00921204;REFB=-0.0195976;REVB=-0.00571433;RO=62;SAF=20;SAR=22;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810491;STB=0.504585;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0266924;OID=.;OPOS=127230891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:62:42:42:0.403846:22:20:30:32:22:20:30:32 chr9 127231503 . G A 107.01 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.000384021;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.611;QD=11.5687;RBI=0.0216484;REFB=-0.0163791;REVB=0.021645;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132226;STB=0.578393;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.059143;OID=.;OPOS=127231503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:14:10:7:6:14:10 chr9 127231774 . C G 314.33 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1019;QD=50.2928;RBI=0.0344283;REFB=-0.125635;REVB=-0.0246842;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514274;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00697371;OID=.;OPOS=127231774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:25:25:0:1:24:24:0.96:17:7:0:0:17:7:0:1 chr9 127369679 . C T 187.92 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.00938545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.375;QD=10.8941;RBI=0.00988187;REFB=-0.0405895;REVB=-0.00309267;RO=45;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213449;STB=0.623092;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0530617;OID=.;OPOS=127369679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:12:12:14:31:12:12:14:31 chr9 127563364 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.947;QD=51.1846;RBI=0.0653535;REFB=0;REVB=0.0555989;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000840373;OID=.;OPOS=127563364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0 chr9 127566378 . A G 493.87 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195061;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.197;QD=59.8628;RBI=0.0317519;REFB=0;REVB=-0.0250539;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243111;OID=.;OPOS=127566378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0 chr9 127616537 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7019;QD=50.4115;RBI=0.0825146;REFB=0;REVB=-0.0532962;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208145;OID=.;OPOS=127616537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr9 127618776 . A G 446.97 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00487115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5055;QD=57.6738;RBI=0.00524583;REFB=0;REVB=0.00194695;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.60487e-05;OID=.;OPOS=127618776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr9 127618839 . C G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7966;QD=62.9819;RBI=0.0255482;REFB=0;REVB=0.00123447;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000347348;OID=.;OPOS=127618839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0 chr9 127643456 . T C 708.49 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00880394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.429;QD=62.977;RBI=0.0110566;REFB=0;REVB=-0.00668878;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12793e-05;OID=.;OPOS=127643456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr9 127661645 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9517;QD=57.1059;RBI=0.0900783;REFB=0;REVB=0.0154852;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000863847;OID=.;OPOS=127661645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0 chr9 127674200 . A C 854.14 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025183;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.533;QD=57.9079;RBI=0.0293294;REFB=0;REVB=0.0150344;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132148;OID=.;OPOS=127674200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr9 127818276 . C T 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0637114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.147;QD=59.0186;RBI=0.0649983;REFB=0;REVB=-0.01287;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000528534;OID=.;OPOS=127818276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr9 127951863 . G A 246.48 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0115363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7658;QD=46.9493;RBI=0.0159865;REFB=-0.0443037;REVB=0.0110671;RO=1;SAF=19;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300595;STB=0.666453;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00327108;OID=.;OPOS=127951863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:1:19:0:1:1:19:0:1 chr9 127962916 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.556;QD=57.2025;RBI=0.0694246;REFB=0;REVB=0.0597533;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353071;OID=.;OPOS=127962916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr9 128074807 . T C 411.07 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.083;QD=56.6998;RBI=0.0375371;REFB=0;REVB=-0.0239485;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00130083;OID=.;OPOS=128074807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0 chr9 128246786 . G A 248.25 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.000820441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.374;QD=16.279;RBI=0.0152521;REFB=-0.00751486;REVB=0.01523;RO=33;SAF=8;SAR=20;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264704;STB=0.649888;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0105139;OID=.;OPOS=128246786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:20:8:18:15:20:8:18:15 chr9 129102840 . G A 339.3 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.037939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.255;QD=20.5633;RBI=0.0380072;REFB=0.00129519;REVB=-0.00227481;RO=29;SAF=15;SAR=20;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732694;STB=0.556489;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.0014577;OID=.;OPOS=129102840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:31:35:35:0.530303:20:15:15:14:20:15:17:14 chr9 129102907 . G A 256.44 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0194379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.028;QD=22.7946;RBI=0.019846;REFB=-0.0121316;REVB=-0.00400386;RO=21;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166495;STB=0.593142;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00756597;OID=.;OPOS=129102907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:15:9:12:9:15:9:12:9 chr9 129143435 . A G 306.09 PASS AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.00230994;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.395;QD=14.4042;RBI=0.00460595;REFB=-0.0103808;REVB=0.00398484;RO=50;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126052;STB=0.576427;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0134401;OID=.;OPOS=129143435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:51:34:34:0.4:17:17:19:31:17:17:19:32 chr9 129265715 . C G 1401.92 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471266;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0579;QD=63.0078;RBI=0.0869544;REFB=0;REVB=0.0868266;RO=0;SAF=54;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284045;OID=.;OPOS=129265715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:35:54:0:0:35:54:0:0 chr9 129453229 . A G 297.54 PASS AF=0.5;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0225329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.191;QD=18.5961;RBI=0.0225602;REFB=-0.0383393;REVB=-0.00110952;RO=30;SAF=18;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836259;STB=0.531476;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0372687;OID=.;OPOS=129453229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:30:32:32:32:0.5:14:18:14:16:14:18:16:16 chr9 129460914 . A G 108.83 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0129671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.02;QD=24.1849;RBI=0.0648957;REFB=-0.0221901;REVB=0.063587;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510973;STB=0.528799;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.019512;OID=.;OPOS=129460914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:5:7:4:2:5:7:4:2 chr9 129595895 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.83;QD=57.6807;RBI=0.0327449;REFB=0;REVB=-0.00449685;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45871e-05;OID=.;OPOS=129595895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr9 129641810 . T A 361.17 PASS AF=0.653846;AO=33;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0446456;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.099;QD=27.7824;RBI=0.0446457;REFB=-0.0115856;REVB=0.000113504;RO=18;SAF=14;SAR=19;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133042;STB=0.511621;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00187433;OID=.;OPOS=129641810;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:18:18:33:34:0.653846:19:14:8:10:20:14:8:10 chr9 129643535 . G A 464.93 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.647;QD=58.1166;RBI=0.00718536;REFB=0;REVB=0.00701743;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90041e-05;OID=.;OPOS=129643535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chr9 129643665 . T C 55.29 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0746839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.901;QD=22.1155;RBI=0.0746839;REFB=-0.289985;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.016727;OID=.;OPOS=129643665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:6:10:0:0:6:10:1:0:6:0:0:0:10:0:0 chr9 129644258 . C G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0012426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.935;QD=51.1846;RBI=0.00140972;REFB=0;REVB=0.000665779;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.6663e-06;OID=.;OPOS=129644258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr9 129644688 . C G 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1117;QD=63.8694;RBI=0.0467699;REFB=0;REVB=0.0215429;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000225413;OID=.;OPOS=129644688;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:35:13:0:0:35:13:0:0 chr9 129645390 . CA C,CC,CG 1487.41 PASS AF=0,0.96875,0.03125;AO=11,79,6;DP=97;FAO=0,93,3;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=0,38,3;FSAR=0,55,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026468,0.0311941,-0.0359703;FXX=0.0103082;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=26.351,42.1341,15.4808;QD=61.9753;RBI=0.0302702,0.077748,0.0360795;REFB=0,0,0;REVB=-0.0146877,0.0712158,0.00280493;RO=0;SAF=1,35,5;SAR=10,44,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.37809e-08,-3.18042e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0124897,0.00715402,0.132492;OID=.,.,.;OPOS=129645391,129645391,129645391;OREF=A,A,A;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CC,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.96875,0.03125:11,79,6:97:0,93,3:96:0:0,38,3:0,55,0:0:0:4:0:1,35,5:10,44,1:0:0 chr9 129645610 . C T 145.23 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7849;QD=44.6868;RBI=0.0506697;REFB=0;REVB=0.0481016;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162369;OID=.;OPOS=129645610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr9 129646774 . TA GA,TG 939.35 PASS AF=0.0434783,0.927536;AO=3,20;DP=83;FAO=3,64;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=0,7;FSAR=3,57;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0199486,-0.0350105;FXX=0.188213;HRUN=11,3;LEN=1,1;MLLD=130.615,162.679;QD=54.4549;RBI=0.023329,0.0369407;REFB=-0.124445,-0.125096;REVB=0.0120954,0.0117847;RO=0;SAF=1,2;SAR=2,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.19193e-08;STB=0.995982,0.562479;STBP=0.069,0.007;TYPE=snp,snp;VARB=0.0739437,0.0013699;OID=.,.;OPOS=129646774,129646775;OREF=T,A;OALT=G,G;OMAPALT=GA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:83:69:0:2:3,20:3,64:0.0434783,0.927536:2,18:1,2:0:0:3,57:0,7:2:0 chr9 129647034 . A G 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.896;QD=57.675;RBI=0.0413674;REFB=0;REVB=-0.00510545;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88354e-05;OID=.;OPOS=129647034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr9 129647580 . TG T 215.17 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0787032;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.2192;QD=12.6568;RBI=0.0876615;REFB=-0.0318376;REVB=-0.038605;RO=35;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132448;STB=0.573727;STBP=0.283;TYPE=del;VARB=0.0308926;OID=.;OPOS=129647581;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.485294:33:69:33:68:35:15:18:11:24:99:35:15:18:11:24 chr9 129831659 . T A 1340.2 PASS AF=0.932039;AO=98;DP=105;FAO=96;FDP=103;FR=.;FRO=7;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00034017;FXX=0.0190458;HRUN=9;LEN=1;MLLD=246.526;QD=52.0464;RBI=0.00798357;REFB=-0.0316512;REVB=0.00797632;RO=7;SAF=55;SAR=43;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351167;STB=0.518228;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=8.02978e-05;OID=.;OPOS=129831659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:105:103:7:7:98:96:0.932039:43:55:2:5:43:53:2:5 chr9 129946247 . C T 398.36 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277057;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.211;QD=56.9088;RBI=0.0443972;REFB=0;REVB=0.0346916;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142695;OID=.;OPOS=129946247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0 chr9 129958862 . G C,T 1458.62 PASS AF=0.0571429,0.92381;AO=4,97;DP=103;FAO=6,97;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=0,53;FSAR=6,44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00211497,0.0066445;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=105.09,187.121;QD=55.5665;RBI=0.00950876,0.0108102;REFB=-0.168024,-0.0394776;REVB=-0.00927056,-0.00852702;RO=2;SAF=0,53;SAR=4,44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.725637,0.00179218;STB=0.997033,0.500945;STBP=0.109,0.871;TYPE=snp,snp;VARB=0.043936,-9.07795e-05;OID=.,.;OPOS=129958862,129958862;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:103:105:2:2:4,97:6,97:0.0571429,0.92381:4,44:0,53:1:1:6,44:0,53:1:1 chr9 130164957 . G A 250.79 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0774851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.156;QD=20.0635;RBI=0.0881675;REFB=-0.0248965;REVB=0.0420663;RO=26;SAF=16;SAR=8;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684376;STB=0.53843;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0301737;OID=.;OPOS=130164957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:8:16:19:7:8:16:19:7 chr9 130169874 . A G 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0422942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.337;QD=15.1604;RBI=0.0428466;REFB=-0.0133313;REVB=-0.00685784;RO=22;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300606;STB=0.672868;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0235119;OID=.;OPOS=130169874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:6:10:7:15:6:10:7:15 chr9 130191186 . C T 955.11 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7474;QD=58.7762;RBI=0.0325871;REFB=0;REVB=-0.00642762;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000366819;OID=.;OPOS=130191186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0 chr9 130197414 . A G 1255.9 PASS AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0549448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2533;QD=59.1013;RBI=0.0747955;REFB=0.0192055;REVB=-0.0507487;RO=0;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509089;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00151773;OID=.;OPOS=130197414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:85:0:2:83:83:0.976471:54:29:0:0:54:29:0:2 chr9 130206762 . C T 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0102154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.254;QD=16.626;RBI=0.0225732;REFB=-0.0197837;REVB=0.0201295;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298971;STB=0.517215;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0211222;OID=.;OPOS=130206762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:6:8:7:6:6:8 chr9 130219669 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.434;QD=47.8223;RBI=0.0392661;REFB=0;REVB=0.0260268;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286358;OID=.;OPOS=130219669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr9 130242166 . A G 824.48 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.012;QD=56.861;RBI=0.0484457;REFB=0;REVB=0.040586;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136161;OID=.;OPOS=130242166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:56:58:1:22:34:0:0:24:34:0:0 chr9 130259618 . A C 805.04 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0525343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1475;QD=64.4033;RBI=0.0604159;REFB=0;REVB=-0.0298368;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00103736;OID=.;OPOS=130259618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr9 130267777 . C G 272.46 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.444;QD=51.8972;RBI=0.0846897;REFB=0;REVB=0.0836091;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323399;OID=.;OPOS=130267777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:5:15:0:0:6:15:0:0 chr9 130279255 . G A 141.9 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.14263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2666;QD=13.8441;RBI=0.144691;REFB=-0.0341769;REVB=0.0243361;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372972;STB=0.722292;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0453334;OID=.;OPOS=130279255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:10:6:18:6:10:6:19:6 chr9 130279279 . T C 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0322681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1856;QD=15.7841;RBI=0.0329418;REFB=-0.0207041;REVB=-0.00662819;RO=17;SAF=3;SAR=11;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473863;STB=0.774248;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.018988;OID=.;OPOS=130279279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:11:3:12:5:11:3:12:5 chr9 130457332 . TTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA TTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA,TTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGG 138.01 PASS AF=0.5,0.181818;AO=6,4;DP=28;FAO=11,4;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=6,2;FSAR=5,2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00441767,-0.0265785;FXX=0.153787;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=93.5496,107.079;QD=25.0919;RBI=0.028284,0.0353185;REFB=-0.101068,-0.0493599;REVB=-0.0279369,-0.0232589;RO=7;SAF=3,2;SAR=3,2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.191087,-0.213092;STB=0.566892,0.635732;STBP=0.493,0.501;TYPE=del,snp;VARB=0.0695574,0.0598172;OID=.,.;OPOS=130457333,130457371;OREF=TGA,A;OALT=-,G;OMAPALT=TTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA,TTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5,0.181818:6,4:28:11,4:22:7:6,2:5,2:5:2:53:7:3,2:3,2:5:2 chr9 130489779 . G T 42.84 PASS AF=0.269231;AO=6;DP=25;FAO=7;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00399484;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.8684;QD=6.59089;RBI=0.0623196;REFB=-0.0828626;REVB=0.0621914;RO=15;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493865;STB=0.813829;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.188242;OID=.;OPOS=130489779;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:25:26:15:19:6:7:0.269231:5:1:9:6:6:1:10:9 chr9 130494957 . T C 1431.27 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.566;QD=62.9131;RBI=0.0545629;REFB=0;REVB=0.0248811;RO=0;SAF=41;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105767;OID=.;OPOS=130494957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:50:41:0:0:50:41:0:0 chr9 130536717 . G A 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.493;QD=62.9829;RBI=0.0494131;REFB=0;REVB=0.0292502;RO=0;SAF=10;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80297e-05;OID=.;OPOS=130536717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:35:10:0:0:35:10:0:0 chr9 130551564 . C T 270.01 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0130216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.474;QD=22.9799;RBI=0.0238582;REFB=-0.00883827;REVB=-0.0199913;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168597;STB=0.593836;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00533829;OID=.;OPOS=130551564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:13:12:15:7:13:12:15:7 chr9 130630639 . A G 898.22 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00296736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.589;QD=57.9497;RBI=0.0961124;REFB=0;REVB=0.0960666;RO=0;SAF=38;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000862651;OID=.;OPOS=130630639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:62:0:0:56:62:1:18:38:0:0:24:38:0:0 chr9 130647583 . T C 1556.0 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2767;QD=63.5102;RBI=0.0451139;REFB=0;REVB=-0.0398123;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90939e-05;OID=.;OPOS=130647583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:43:53:0:0:45:53:0:0 chr9 130648680 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00862574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.346;QD=44.6898;RBI=0.0473653;REFB=0;REVB=0.0465732;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000874387;OID=.;OPOS=130648680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr9 130670310 . A G 175.27 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.327;QD=46.7397;RBI=0.065035;REFB=0;REVB=0.0615223;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129954;OID=.;OPOS=130670310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:2:12:0:0:3:12:0:0 chr9 130690412 . G C 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0590591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.649;QD=21.7465;RBI=0.0598497;REFB=-0.0391163;REVB=0.00969598;RO=20;SAF=3;SAR=19;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287319;STB=0.66416;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.023959;OID=.;OPOS=130690412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:19:3:7:13:19:3:7:13 chr9 130698029 . G C 261.63 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0262413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.976;QD=14.7394;RBI=0.0416092;REFB=-0.00640206;REVB=-0.0322912;RO=41;SAF=17;SAR=13;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310199;STB=0.517591;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0164521;OID=.;OPOS=130698029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:13:17:22:19:13:17:22:19 chr9 130698043 . A G 222.71 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0121626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.907;QD=12.5473;RBI=0.0134128;REFB=-0.00969255;REVB=-0.00565452;RO=42;SAF=14;SAR=13;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310071;STB=0.50261;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0156856;OID=.;OPOS=130698043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:44:27:27:0.380282:13:14:23:19:13:14:23:21 chr9 130703789 . G A 248.91 PASS AF=0.509804;AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.000775726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.295;QD=19.5219;RBI=0.0320562;REFB=0.000679282;REVB=0.0320468;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167808;STB=0.588906;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000376077;OID=.;OPOS=130703789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:24:25:25:26:0.509804:17:8:12:12:17:9:13:12 chr9 130703852 . A AAAC 46.38 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0260525;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=278.21;QD=9.76411;RBI=0.026168;REFB=0.00188481;REVB=-0.0024558;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224998;STB=0.676997;STBP=0.387;TYPE=ins;VARB=-0.00284244;OID=.;OPOS=130703853;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.368421:7:20:7:19:12:4:3:10:2:46:13:4:3:10:3 chr9 130707081 . A G 509.85 PASS AF=0.602564;AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0154354;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.373;QD=26.1459;RBI=0.0302317;REFB=-0.0261215;REVB=-0.0259943;RO=31;SAF=22;SAR=25;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107271;STB=0.558475;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0184983;OID=.;OPOS=130707081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:31:31:47:47:0.602564:25:22:10:21:25:22:10:21 chr9 130829039 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.115;QD=48.7371;RBI=0.0317397;REFB=0;REVB=-0.0306173;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000707704;OID=.;OPOS=130829039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr9 130860866 . T C 803.9 PASS AF=1;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195187;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.79;QD=57.4213;RBI=0.0359978;REFB=0;REVB=0.0302466;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97171e-05;OID=.;OPOS=130860866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:55:56:1:34:21:0:0:35:21:0:0 chr9 130864676 . T C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3055;QD=59.0181;RBI=0.0612744;REFB=0;REVB=0.0218125;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00055021;OID=.;OPOS=130864676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0 chr9 130869499 . A T 1011.79 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356176;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3962;QD=59.517;RBI=0.0376262;REFB=0;REVB=0.012129;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014848;OID=.;OPOS=130869499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:29:39:0:0:29:39:0:0 chr9 130883511 . C T 1785.86 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.13;QD=61.0551;RBI=0.0206077;REFB=0;REVB=0.0155494;RO=0;SAF=54;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20287e-05;OID=.;OPOS=130883511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:63:54:0:0:63:54:0:0 chr9 130891351 . C T 145.68 PASS AF=0.30303;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.00350096;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8963;QD=8.82894;RBI=0.00350582;REFB=-0.000937121;REVB=0.00018436;RO=47;SAF=10;SAR=10;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626363;STB=0.54541;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00207336;OID=.;OPOS=130891351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:47:46:20:20:0.30303:10:10:21:26:10:10:20:26 chr9 130984755 . C T 210.81 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0124848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.571;QD=19.6106;RBI=0.0186966;REFB=-0.00798764;REVB=0.0139173;RO=21;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126575;STB=0.582703;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00604197;OID=.;OPOS=130984755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:22:21:21:0.488372:12:9:12:9:12:9:13:9 chr9 131019738 . T C 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0331905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.728;QD=15.6261;RBI=0.0332018;REFB=-0.00555328;REVB=0.00086449;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234869;STB=0.623733;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00687635;OID=.;OPOS=131019738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:23:17:17:0.425:11:6:13:9:11:6:13:10 chr9 131027963 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0381042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.47;QD=55.0986;RBI=0.0383796;REFB=0;REVB=-0.00458946;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000267681;OID=.;OPOS=131027963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr9 131028226 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00823848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.837;QD=45.8068;RBI=0.0185696;REFB=0;REVB=-0.0166421;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180347;OID=.;OPOS=131028226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr9 131085373 . G C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000168793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.073;QD=51.9167;RBI=0.00190625;REFB=0;REVB=-0.00189876;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09526e-05;OID=.;OPOS=131085373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr9 131235321 . A G 465.92 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.75;QD=58.2397;RBI=0.0317154;REFB=0;REVB=0.0220168;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.76053e-05;OID=.;OPOS=131235321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:30:32:1:20:10:0:0:22:10:0:0 chr9 131262911 . G GT 337.17 PASS AF=1;AO=29;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110181;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.2276;QD=33.7167;RBI=0.260385;REFB=-0.0154997;REVB=-0.235924;RO=7;SAF=14;SAR=15;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13402;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00227694;OID=.;OPOS=131262912;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:29:40:40:40:0:22:18:0:0:6:7:14:15:6:1 chr9 131346218 . A C 1281.85 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.631;QD=61.0404;RBI=0.0338476;REFB=0;REVB=0.0199354;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.36004e-05;OID=.;OPOS=131346218;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:82:84:1:43:39:0:0:44:40:0:0 chr9 131360750 . C T 507.32 PASS AF=0.972222;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0249598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.038;QD=56.3686;RBI=0.061401;REFB=0.00669023;REVB=0.0560989;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.51612;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=4.11005e-05;OID=.;OPOS=131360750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:36:0:1:33:35:0.972222:18:15:0:0:20:15:1:0 chr9 131375701 . A G 709.23 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.599;QD=63.0422;RBI=0.0164585;REFB=0;REVB=0.0112119;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.4958e-06;OID=.;OPOS=131375701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0 chr9 131379967 . C T 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00310316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.101;QD=59.1431;RBI=0.0212231;REFB=0;REVB=0.020995;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72519e-05;OID=.;OPOS=131379967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:44:23:0:0:44:23:0:0 chr9 131397479 . G A 1470.33 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.781;QD=63.2401;RBI=0.0173309;REFB=0;REVB=0.00981224;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2391e-05;OID=.;OPOS=131397479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:46:46:0:0:47:46:0:0 chr9 131398636 . C T 447.55 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.422;QD=57.7478;RBI=0.0696268;REFB=0;REVB=0.00920622;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710467;OID=.;OPOS=131398636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:14:17:0:0 chr9 131399277 . C T 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=0.00892401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9198;QD=15.1562;RBI=0.0392978;REFB=-0.0291203;REVB=0.0382711;RO=32;SAF=12;SAR=13;SRF=28;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392582;STB=0.718088;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0208624;OID=.;OPOS=131399277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:13:12:28:4:13:12:28:4 chr9 131403096 . A G 306.22 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.047;QD=53.2558;RBI=0.0197722;REFB=0;REVB=-0.00568642;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167139;OID=.;OPOS=131403096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr9 131465167 . A G 239.44 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0888799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5876;QD=50.408;RBI=0.101108;REFB=0;REVB=-0.0482002;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0047479;OID=.;OPOS=131465167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr9 131479023 . T C 505.49 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141505;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.313;QD=59.4698;RBI=0.0221448;REFB=0;REVB=0.017034;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99253e-05;OID=.;OPOS=131479023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0 chr9 131483551 . T A 127.4 PASS AF=0.309091;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00764862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.234;QD=9.26524;RBI=0.00940915;REFB=-0.0167629;REVB=0.00548002;RO=36;SAF=11;SAR=6;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010179;STB=0.530997;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0368205;OID=.;OPOS=131483551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:36:38:17:17:0.309091:6:11:23:13:6:11:23:15 chr9 131483749 . T A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.403;QD=57.6803;RBI=0.0203737;REFB=0;REVB=-0.0104421;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29678e-05;OID=.;OPOS=131483749;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr9 131492849 . CT C,CC 157.25 PASS AF=0.0714286,0.928571;AO=3,11;DP=14;FAO=1,13;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076749,0.107897;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=141.813,155.37;QD=44.9276;RBI=0.0769529,0.10817;REFB=0,0;REVB=0.00559808,0.0076717;RO=0;SAF=3,6;SAR=0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0590425,0.00184659;OID=.,.;OPOS=131492850,131492850;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0714286,0.928571:3,11:14:1,13:14:0:1,8:0,5:0:0:4:0:3,6:0,5:0:0 chr9 131553884 . C T 117.11 PASS AF=0.518519;AO=13;DP=26;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.00964626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.4475;QD=17.3494;RBI=0.129485;REFB=-0.0243319;REVB=-0.129125;RO=13;SAF=13;SAR=0;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.843865;STB=0.898716;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0153919;OID=.;OPOS=131553884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:27:13:13:13:14:0.518519:0:13:3:10:1:13:3:10 chr9 131565554 . T C 285.58 PASS AF=0.470588;AO=31;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.012627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.411;QD=16.7987;RBI=0.0150741;REFB=-0.0330295;REVB=-0.00823332;RO=37;SAF=17;SAR=14;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599994;STB=0.54794;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0391121;OID=.;OPOS=131565554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:36:31:32:0.470588:14:17:18:19:14:18:17:19 chr9 131583071 . C A 140.53 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0129358;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.61;QD=18.1325;RBI=0.0132541;REFB=-0.029514;REVB=0.00288713;RO=15;SAF=12;SAR=3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510191;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0161778;OID=.;OPOS=131583071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:16:15:15:0.483871:3:12:12:3:3:12:13:3 chr9 131585069 . A G 108.81 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0154366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.155;QD=24.1802;RBI=0.0208856;REFB=-0.0155884;REVB=0.0140684;RO=5;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522328;STB=0.555464;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0107589;OID=.;OPOS=131585069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:5:6:12:12:0.666667:6:6:2:3:6:6:2:4 chr9 131586374 . G A 74.2 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0568934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1389;QD=10.2346;RBI=0.0642286;REFB=-0.0189126;REVB=0.0298069;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300856;STB=0.679662;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.034288;OID=.;OPOS=131586374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:6:4:13:6:6:4:13:6 chr9 131588652 . T C 223.18 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0730761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0673;QD=49.5954;RBI=0.0905778;REFB=0;REVB=-0.0535185;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532332;OID=.;OPOS=131588652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:5:12:0:0:6:12:0:0 chr9 131588888 . G C 137.85 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=-0.0444598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9159;QD=19.0141;RBI=0.0621658;REFB=-0.020364;REVB=-0.0434501;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523435;STB=0.791348;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0149191;OID=.;OPOS=131588888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:0:14:5:10:0:14 chr9 131670919 . T C 183.09 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0160329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1818;QD=25.2539;RBI=0.032165;REFB=-0.042419;REVB=0.0278842;RO=10;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289752;STB=0.503872;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0353794;OID=.;OPOS=131670919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:10:11:18:18:0.62069:10:8:4:6:10:8:5:6 chr9 131689361 . G A 229.44 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0189356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.779;QD=14.1193;RBI=0.0254081;REFB=-0.0101682;REVB=0.0169414;RO=37;SAF=15;SAR=12;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687048;STB=0.529595;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0129594;OID=.;OPOS=131689361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:37:38:27:27:0.415385:12:15:23:14:12:15:23:15 chr9 131702891 . A G 236.13 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0596927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7219;QD=17.491;RBI=0.0749325;REFB=-0.0119686;REVB=-0.0452953;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978313;STB=0.554872;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00944312;OID=.;OPOS=131702891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:14:12:10:18:14:12:10:18 chr9 131767668 . A C 126.57 PASS AF=0.428571;AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0466851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.345;QD=14.4649;RBI=0.0840163;REFB=-0.0586753;REVB=-0.0698516;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231534;STB=0.586091;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0643975;OID=.;OPOS=131767668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:35:19:20:13:15:0.428571:9:4:10:9:9:6:11:9 chr9 131771505 . C T 256.65 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00380418;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.491;QD=22.8135;RBI=0.015173;REFB=-0.0235078;REVB=0.0146884;RO=21;SAF=8;SAR=16;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31586;STB=0.676325;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0147323;OID=.;OPOS=131771505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:16:8:15:6:16:8:15:6 chr9 131823611 . T C 140.05 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0303664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0715;QD=20.7478;RBI=0.0488612;REFB=0.0182358;REVB=0.0382792;RO=12;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135688;STB=0.507682;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.030912;OID=.;OPOS=131823611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:6:9:7:5:6:9:7:5 chr9 131832212 . C T 65.74 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0053118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.304;QD=11.9533;RBI=0.0183568;REFB=-0.0290648;REVB=-0.0175715;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288925;STB=0.517204;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0514983;OID=.;OPOS=131832212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:22:22:13:13:9:9:0.409091:6:3:4:9:6:3:4:9 chr9 131846957 . T C 214.36 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0145581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.474;QD=16.1778;RBI=0.0321954;REFB=-0.0285373;REVB=0.028716;RO=26;SAF=17;SAR=7;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173108;STB=0.595363;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0271571;OID=.;OPOS=131846957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:29:24:24:0.45283:7:17:14:12:7:17:16:13 chr9 131860901 . G T 877.11 PASS AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00733572;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.956;QD=54.8192;RBI=0.0324808;REFB=-0.159913;REVB=0.0316416;RO=2;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325305;STB=0.517236;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000532125;OID=.;OPOS=131860901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:28:34:0:2:28:34:0:2 chr9 132377900 . C T 102.44 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0235012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8959;QD=17.8155;RBI=0.0331799;REFB=-0.0752252;REVB=0.0234221;RO=11;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116603;STB=0.567449;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0540705;OID=.;OPOS=132377900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:23:23:11:11:12:12:0.521739:3:9:7:4:3:9:7:4 chr9 132400480 . G A 89.54 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00413353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.963;QD=15.5715;RBI=0.0130227;REFB=-0.0174909;REVB=0.0123493;RO=12;SAF=1;SAR=10;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.651797;STB=0.884185;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.011133;OID=.;OPOS=132400480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:10:1:9:3:10:1:9:3 chr9 132402908 . C G 1062.12 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00262706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2014;QD=59.8375;RBI=0.0166119;REFB=0;REVB=0.0164028;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143533;OID=.;OPOS=132402908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:28:43:0:0:28:43:0:0 chr9 132404257 . G T 544.76 PASS AF=0.487179;AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.0134888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.224;QD=18.6242;RBI=0.0184405;REFB=-0.0137777;REVB=0.012574;RO=60;SAF=30;SAR=27;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531438;STB=0.529401;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0178351;OID=.;OPOS=132404257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:60:60:57:57:0.487179:27:30:35:25:27:30:35:25 chr9 132618578 . T C 223.7 PASS AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0829185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.826;QD=49.71;RBI=0.0840334;REFB=0;REVB=0.0136431;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456679;OID=.;OPOS=132618578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:8:8:0:0:8:10:0:0 chr9 132620364 . T C 460.99 PASS AF=1;AO=27;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.346;QD=57.6243;RBI=0.0483721;REFB=0;REVB=0.0241196;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.60601e-05;OID=.;OPOS=132620364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:27:32:1:15:12:0:0:16:16:0:0 chr9 132623293 . C T 501.52 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6984;QD=59.0019;RBI=0.0940782;REFB=0;REVB=0.0905366;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000751478;OID=.;OPOS=132623293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr9 132623868 . T C 972.8 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000235699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3158;QD=58.9573;RBI=0.00762549;REFB=0;REVB=-0.00762185;RO=0;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.007e-05;OID=.;OPOS=132623868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:29:37:0:0:29:37:0:0 chr9 132631680 . T C 926.66 PASS AF=1;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00389637;FXX=0.0307645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.325;QD=58.8357;RBI=0.0362182;REFB=0;REVB=0.036008;RO=0;SAF=18;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18913e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44382e-05;OID=.;OPOS=132631680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:63:0:0:63:63:1:45:18:0:0:45:18:0:0 chr9 132636031 . A G 283.3 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9063;QD=49.2697;RBI=0.0287782;REFB=0;REVB=-0.00887986;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0208866;OID=.;OPOS=132636031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:10:11:0:0:10:13:0:0 chr9 132636033 . T C 306.14 PASS AF=1;AO=21;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.405;QD=53.2421;RBI=0.0479936;REFB=0;REVB=0.0310565;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13261e-06;OID=.;OPOS=132636033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:21:23:1:10:11:0:0:10:13:0:0 chr9 132649662 . A G,T 1008.5 PASS AF=0.929577,0.056338;AO=66,4;DP=70;FAO=66,4;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=34,4;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00435425,-0.0116659;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=219.9,168.746;QD=56.8167;RBI=0.0444104,0.0528099;REFB=-0.0790387,-0.195682;REVB=0.0441964,0.0515052;RO=0;SAF=34,4;SAR=32,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.75585e-08,0;STB=0.50769,0.995941;STBP=0.315,0.099;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000987224,0.0178462;OID=.,.;OPOS=132649662,132649662;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:70:71:0:1:66,4:66,4:0.929577,0.056338:32,0:34,4:0:0:32,0:34,4:0:1 chr9 132651363 . G C 33.54 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00350321;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=203.101;QD=19.163;RBI=0.00350321;REFB=-0.0489717;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270861;OID=.;OPOS=132651363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:1:2:5:5:0.714286:0:5:1:0:0:5:2:0 chr9 132662786 . C T 323.3 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6352;QD=53.8829;RBI=0.125997;REFB=0;REVB=0.0332145;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0041086;OID=.;OPOS=132662786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0 chr9 132671359 . T TG 146.39 PASS AF=1;AO=16;DP=28;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.253414;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.69038;QD=24.3975;RBI=0.261551;REFB=0;REVB=0.0647309;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140152;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0236898;OID=.;OPOS=132671360;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:16:28:24:24:0:8:16:0:0:3:10:5:11:5:5 chr9 132686186 . A G 977.55 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601744;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.054;QD=59.2453;RBI=0.015106;REFB=0;REVB=-0.0138557;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.34289e-05;OID=.;OPOS=132686186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:65:66:1:31:34:0:0:31:35:0:0 chr9 132871091 . TAGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC T 102.6 PASS AF=0.254237;AO=15;DP=67;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00291572;FXX=0.106045;HRUN=1;LEN=24;MLLD=424.651;QD=6.95575;RBI=0.00293854;REFB=-0.00420718;REVB=0.000365454;RO=39;SAF=5;SAR=10;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188768;STB=0.611612;STBP=0.338;TYPE=del;VARB=0.0142417;OID=.;OPOS=132871092;OREF=AGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.254237:15:67:15:59:44:5:10:21:23:99:39:5:10:19:20 chr9 132872686 . A G 670.2 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.54;QD=62.344;RBI=0.0232077;REFB=0;REVB=0.00286061;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260148;OID=.;OPOS=132872686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr9 132883161 . C CCTT 1140.93 PASS AF=0.898876;AO=79;DP=92;FAO=80;FDP=89;FR=.;FRO=9;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00782485;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=3;MLLD=232.722;QD=51.2778;RBI=0.0358796;REFB=-0.0593314;REVB=0.035016;RO=11;SAF=37;SAR=42;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387223;STB=0.520693;STBP=0.251;TYPE=ins;VARB=0.00489804;OID=.;OPOS=132883162;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.898876:79:92:80:89:9:37:43:6:3:37:11:37:42:7:4 chr9 132988709 . T G 171.86 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0311655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5244;QD=11.0878;RBI=0.0695026;REFB=-0.021134;REVB=-0.0621235;RO=39;SAF=12;SAR=10;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494359;STB=0.51927;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0315011;OID=.;OPOS=132988709;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:39:40:22:22:0.354839:10:12:23:16:10:12:23:17 chr9 133048501 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.686;QD=59.4353;RBI=0.0308269;REFB=0;REVB=0.0027896;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212742;OID=.;OPOS=133048501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr9 133224410 . C A 248.1 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0695477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4376;QD=16.269;RBI=0.112394;REFB=-0.0122478;REVB=0.0882917;RO=33;SAF=7;SAR=21;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165604;STB=0.593988;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0181792;OID=.;OPOS=133224410;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:21:7:13:20:21:7:13:20 chr9 133284310 . G A 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.105218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1224;QD=16.2709;RBI=0.106969;REFB=-0.0186796;REVB=0.0192721;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165557;STB=0.595613;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0223495;OID=.;OPOS=133284310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:10:5:9:9:10:5:9:9 chr9 133294244 . G A 165.27 PASS AF=0.580645;AO=16;DP=29;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0333114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.896;QD=21.3246;RBI=0.0404734;REFB=-0.045177;REVB=0.022988;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09158;STB=0.525519;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.029535;OID=.;OPOS=133294244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:31:13:13:16:18:0.580645:8:8:8:5:8:10:8:5 chr9 133346920 . A G 1361.98 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049776;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.752;QD=62.6197;RBI=0.0499308;REFB=0;REVB=-0.00392944;RO=0;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17915e-05;OID=.;OPOS=133346920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:53:34:0:0:53:34:0:0 chr9 133553993 . C T 209.28 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0320586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.987;QD=11.6267;RBI=0.0427062;REFB=-0.0116294;REVB=-0.0282147;RO=42;SAF=14;SAR=12;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222314;STB=0.602546;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0266819;OID=.;OPOS=133553993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:46:26:26:0.361111:12:14:31:11:12:14:32:14 chr9 133558282 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.809;QD=57.5452;RBI=0.0330852;REFB=0;REVB=0.0154615;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77462e-05;OID=.;OPOS=133558282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0 chr9 133576256 . T C 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0369074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.494;QD=11.1309;RBI=0.0485081;REFB=-0.00507303;REVB=0.0314782;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313073;STB=0.685368;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00533258;OID=.;OPOS=133576256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:6:4:12:5:6:4:12:5 chr9 133710803 . G GC 574.79 PASS AF=1;AO=7;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401394;FXX=0.0153822;HRUN=0;LEN=1;MLLD=131.209;QD=35.9243;RBI=0.0703168;REFB=0;REVB=0.0577345;RO=57;SAF=1;SAR=6;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.534383;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000240444;OID=.;OPOS=133710804;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:65:64:64:0:37:27:0:0:13:57:1:6:36:21 chr9 133710804 . T C 822.28 PASS AF=0.898551;AO=60;DP=69;FAO=62;FDP=69;FR=.;FRO=7;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00278569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.567;QD=47.6684;RBI=0.0168716;REFB=-0.0177882;REVB=0.01664;RO=7;SAF=40;SAR=20;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11097;STB=0.553889;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00116364;OID=.;OPOS=133710804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:7:7:60:62:0.898551:20:40:1:6:22:40:1:6 chr9 133710819 . T TC 1280.66 PASS AF=1;AO=84;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769646;FXX=0.0114929;HRUN=0;LEN=1;MLLD=44.1631;QD=59.5657;RBI=0.0778043;REFB=0;REVB=0.0113997;RO=1;SAF=43;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108888;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000934477;OID=.;OPOS=133710820;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:84:87:86:86:0:44:42:0:0:7:1:43:41:1:0 chr9 133787225 . A G 361.24 PASS AF=0.403846;AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00410171;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.437;QD=13.8939;RBI=0.00789022;REFB=-0.0333375;REVB=-0.0067403;RO=58;SAF=18;SAR=24;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144076;STB=0.580784;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0273473;OID=.;OPOS=133787225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:62:42:42:0.403846:24:18:33:25:24:18:35:27 chr9 133901819 . CC AG 207.64 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0087524;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=199.987;QD=15.101;RBI=0.00881188;REFB=-0.017064;REVB=-0.00102211;RO=31;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112108;STB=0.563584;STBP=0.414;TYPE=mnp;VARB=0.0202782;OID=.;OPOS=133901819;OREF=CC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:12:12:19:12:12:12:19:12 chr9 133911598 . A G 727.38 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314988;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.114;QD=57.0492;RBI=0.00413253;REFB=0;REVB=0.00267509;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191481;OID=.;OPOS=133911598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0 chr9 133911706 . C T 575.8 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043829;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.926;QD=60.6102;RBI=0.061911;REFB=0;REVB=0.0437263;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387219;OID=.;OPOS=133911706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:20:17:0:0:20:18:0:0 chr9 133936571 . C G 146.33 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0189745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4466;QD=16.7234;RBI=0.0214921;REFB=-0.0399439;REVB=0.0100936;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158357;STB=0.50908;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0459841;OID=.;OPOS=133936571;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:9:7:8:11:9:7:8:11 chr9 133946909 . G A 258.2 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00518417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.731;QD=16.3939;RBI=0.00707291;REFB=-0.0067533;REVB=0.00481149;RO=34;SAF=11;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118634;STB=0.566882;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0164253;OID=.;OPOS=133946909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:18:11:17:17:18:11:17:17 chr9 133946915 . C G 273.92 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0115962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.756;QD=17.672;RBI=0.0117195;REFB=-0.0170797;REVB=0.00169554;RO=32;SAF=10;SAR=20;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189927;STB=0.606668;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0243436;OID=.;OPOS=133946915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:20:10:17:15:20:10:17:15 chr9 133948049 . A G 473.49 PASS AF=0.489583;AO=45;DP=94;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00250272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.123;QD=19.7288;RBI=0.0090561;REFB=-0.0399007;REVB=-0.00870341;RO=49;SAF=30;SAR=15;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229038;STB=0.633751;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.033199;OID=.;OPOS=133948049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:49:49:45:47:0.489583:15:30:21:28:15:32:21:28 chr9 133963008 . G A 141.36 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00280291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.778;QD=13.4631;RBI=0.0224171;REFB=-0.0450601;REVB=-0.0222412;RO=26;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122584;STB=0.571341;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0560751;OID=.;OPOS=133963008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:8:8:16:10:8:8:16:10 chr9 133986980 . T G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00363901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.63;QD=56.7066;RBI=0.0110334;REFB=0;REVB=-0.010416;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.04083e-05;OID=.;OPOS=133986980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0 chr9 133987060 . G A 198.54 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0607066;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.731;QD=44.1208;RBI=0.0662385;REFB=-0.16248;REVB=0.0265;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00198501;OID=.;OPOS=133987060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:9:8:0:1:9:8:0:1 chr9 133996460 . T G 703.49 PASS AF=0.963636;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000422685;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.1756;QD=51.1627;RBI=0.0214843;REFB=0.128899;REVB=0.0214802;RO=3;SAF=42;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12215;STB=0.54165;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.000744098;OID=.;OPOS=133996460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:3:2:52:53:0.963636:10:42:0:3:11:42:0:2 chr9 133996503 . T A 710.27 PASS AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0398901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.275;QD=54.6364;RBI=0.0416921;REFB=0.0405332;REVB=0.0121248;RO=1;SAF=38;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03761;STB=0.519992;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-3.68436e-05;OID=.;OPOS=133996503;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:51:52:1:1:50:51:0.980769:12:38:0:1:12:39:0:1 chr9 134020092 . C T 262.97 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.651;QD=47.8118;RBI=0.0374888;REFB=0.0622088;REVB=0.0356947;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835989;STB=0.545409;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-0.00175666;OID=.;OPOS=134020092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:16:5:1:0:16:5:1:0 chr9 134133539 . G T 793.42 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.938;QD=63.4734;RBI=0.0439022;REFB=0;REVB=0.0112427;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368229;OID=.;OPOS=134133539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:26:22:0:0:27:23:0:0 chr9 134136515 . A G 1694.97 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.42;QD=60.5345;RBI=0.0552862;REFB=0;REVB=-0.0511436;RO=0;SAF=58;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.78397e-05;OID=.;OPOS=134136515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:54:58:0:0:54:58:0:0 chr9 134136677 . A G 708.53 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.333;QD=62.9803;RBI=0.0327834;REFB=0;REVB=0.01095;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181186;OID=.;OPOS=134136677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:23:21:0:0:23:22:0:0 chr9 134334588 . A G 283.1 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0884674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1147;QD=17.4215;RBI=0.0936834;REFB=-0.0201664;REVB=0.0308236;RO=34;SAF=9;SAR=22;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185249;STB=0.604325;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0179455;OID=.;OPOS=134334588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:22:9:16:18:22:9:16:18 chr9 134346315 . T C 411.08 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00523667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3308;QD=56.7003;RBI=0.0302012;REFB=0;REVB=-0.0297437;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000468242;OID=.;OPOS=134346315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr9 134350323 . C G 255.9 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.581;QD=51.1803;RBI=0.0615481;REFB=0;REVB=0.0392076;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000598128;OID=.;OPOS=134350323;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr9 134350458 . C T 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.197;QD=63.583;RBI=0.0489978;REFB=0;REVB=0.0479599;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123131;OID=.;OPOS=134350458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr9 134350647 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.925;QD=62.022;RBI=0.0228555;REFB=0;REVB=0.0152236;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21015e-05;OID=.;OPOS=134350647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:26:15:0:0:26:16:0:0 chr9 134351065 . G T 451.25 PASS AF=0.916667;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0566769;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.1231;QD=50.1383;RBI=0.0695213;REFB=-0.0867154;REVB=0.0402608;RO=1;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283046;STB=0.51264;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.00753427;OID=.;OPOS=134351065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:36:36:1:3:33:33:0.916667:16:17:0:1:16:17:2:1 chr9 134351343 . C T 77.28 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0620018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1349;QD=13.4408;RBI=0.0653032;REFB=-0.0207607;REVB=-0.0205007;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426955;STB=0.754173;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0335262;OID=.;OPOS=134351343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:2:8:5:8:2:8:5:8 chr9 134373770 . G C 255.9 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00415242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5512;QD=51.1808;RBI=0.0119654;REFB=0;REVB=-0.0112218;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000521958;OID=.;OPOS=134373770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0 chr9 134385436 . A G 868.24 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0669433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.731;QD=57.8826;RBI=0.0673355;REFB=0;REVB=-0.00725688;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000322926;OID=.;OPOS=134385436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0 chr9 134386744 . T C 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00240698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.431;QD=58.9627;RBI=0.0279052;REFB=0;REVB=0.0278012;RO=0;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65876e-05;OID=.;OPOS=134386744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:44:22:0:0:44:22:0:0 chr9 134387488 . T C 769.11 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1468;QD=56.9712;RBI=0.0200877;REFB=0;REVB=0.0200086;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40063e-05;OID=.;OPOS=134387488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr9 134401335 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3922;QD=53.9108;RBI=0.0189471;REFB=0;REVB=0.0076722;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352775;OID=.;OPOS=134401335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr9 134406071 . C G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0683915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.401;QD=42.1826;RBI=0.0684313;REFB=0;REVB=0.00233373;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00199564;OID=.;OPOS=134406071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr9 134497321 . C T 458.79 PASS AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0337196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.208;QD=18.3514;RBI=0.0378422;REFB=-0.0451317;REVB=0.0171761;RO=54;SAF=24;SAR=22;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328363;STB=0.518317;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0450878;OID=.;OPOS=134497321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:0.46:22:24:30:24:22:24:30:24 chr9 134658234 . G A 329.76 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0110681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.364;QD=20.9371;RBI=0.0176718;REFB=-0.0204796;REVB=0.0137763;RO=29;SAF=23;SAR=11;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170996;STB=0.594967;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0197696;OID=.;OPOS=134658234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:11:23:14:15:11:23:14:15 chr9 135073877 . C T 394.12 PASS AF=0.455556;AO=37;DP=86;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00340045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.157;QD=17.5163;RBI=0.0199518;REFB=-0.00230386;REVB=0.0196599;RO=48;SAF=27;SAR=10;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252062;STB=0.595877;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00254116;OID=.;OPOS=135073877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:48:49:37:41:0.455556:10:27:24:24:14:27:24:25 chr9 135102254 . C T 741.74 PASS AF=0.546154;AO=71;DP=130;FAO=71;FDP=130;FR=.;FRO=59;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00541541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.381;QD=22.8227;RBI=0.0203324;REFB=-0.0280335;REVB=-0.019598;RO=59;SAF=45;SAR=26;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163953;STB=0.589843;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0162258;OID=.;OPOS=135102254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:59:59:71:71:0.546154:26:45:26:33:26:45:26:33 chr9 135105944 . G A 242.84 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0456924;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.3;QD=16.7473;RBI=0.0521243;REFB=-0.0297456;REVB=0.0250828;RO=29;SAF=10;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042321;STB=0.527645;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0345592;OID=.;OPOS=135105944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:58:29:31:27:27:0.465517:17:10:12:17:17:10:13:18 chr9 135105964 . A G 840.08 PASS AF=1;AO=46;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.106;QD=56.0053;RBI=0.0531795;REFB=0;REVB=0.0165703;RO=0;SAF=6;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00518825;OID=.;OPOS=135105964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:46:60:1:40:6:0:0:40:20:0:0 chr9 135140209 . GAC CGA,GA 1044.14 PASS AF=0.0909091,0.909091;AO=7,25;DP=96;FAO=9,90;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=0,46;FSAR=9,44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701161,0.897465;FXX=0;HRUN=2,4;LEN=3,1;MLLD=202.812,14.8679;QD=42.1874;RBI=0.0920182,0.903973;REFB=0.0247142,-0.00915321;REVB=-0.059591,0.108276;RO=49;SAF=0,1;SAR=7,24;SRF=43;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0.309091;SSSB=-0.81838,-0.830918;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.0773495,0.040707;OID=.,.;OPOS=135140209,135140211;OREF=GAC,C;OALT=CGA,-;OMAPALT=CGA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:26:96:99:49:0:7,25:9,90:0.0909091,0.909091:7,24:0,1:43:6:9,44:0,46:0:0 chr9 135172412 . A G 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00434281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.68;QD=16.923;RBI=0.00561553;REFB=-0.00989902;REVB=-0.00356009;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593248;STB=0.533311;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0107554;OID=.;OPOS=135172412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:16:14:18:16:16:14:18:16 chr9 135173685 . T C 218.0 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00653124;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.299;QD=13.6247;RBI=0.0344031;REFB=-0.00142539;REVB=-0.0337774;RO=37;SAF=9;SAR=17;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204644;STB=0.624902;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00408967;OID=.;OPOS=135173685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:37:38:26:26:0.40625:17:9:20:17:17:9:21:17 chr9 135202829 . T C 76.96 PASS AF=0.323529;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0398505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.79;QD=9.05386;RBI=0.0399388;REFB=-0.0255487;REVB=-0.00265387;RO=23;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406483;STB=0.513489;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0609749;OID=.;OPOS=135202829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:33:34:23:23:10:11:0.323529:6:4:10:13:6:5:10:13 chr9 135203231 . C T 131.43 PASS AF=0.271429;AO=20;DP=69;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00646564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3896;QD=7.51052;RBI=0.00808313;REFB=0.000572805;REVB=-0.00485104;RO=44;SAF=10;SAR=10;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527466;STB=0.512035;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.00669606;OID=.;OPOS=135203231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:44:51:20:19:0.271429:10:10:20:24:10:9:25:26 chr9 135203409 . A C 213.28 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.00198004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.323;QD=12.546;RBI=0.0128674;REFB=-0.00872425;REVB=0.0127141;RO=40;SAF=16;SAR=10;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097389;STB=0.566454;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00998811;OID=.;OPOS=135203409;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:42:26:26:0.382353:10:16:28:12:10:16:30:12 chr9 135203530 . A C 165.06 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00293187;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.551;QD=14.0472;RBI=0.00321983;REFB=-0.000591205;REVB=-0.00133095;RO=29;SAF=11;SAR=7;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107266;STB=0.506227;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00155568;OID=.;OPOS=135203530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:7:11:18:11:7:11:18:11 chr9 135205006 . G C 119.81 PASS AF=0.411765;AO=12;DP=32;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0218897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.89;QD=14.0948;RBI=0.0323901;REFB=-0.00186142;REVB=-0.0238739;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212814;STB=0.57884;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00470347;OID=.;OPOS=135205006;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:34:20:20:12:14:0.411765:6:6:14:6:6:8:14:6 chr9 135206460 . A G 70.13 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00458461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.417;QD=10.0186;RBI=0.00805346;REFB=-0.0109038;REVB=-0.00662114;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331982;STB=0.6996;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0350915;OID=.;OPOS=135206460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:28:28:18:18:10:10:0.357143:3:7:7:11:3:7:7:11 chr9 135263573 . G T 182.08 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0052759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9264;QD=16.9378;RBI=0.0159621;REFB=-0.029606;REVB=-0.015065;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190857;STB=0.620562;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0364375;OID=.;OPOS=135263573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:12:7:13:10:12:7:14:10 chr9 135273607 . C G 1358.62 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0558772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.777;QD=62.4651;RBI=0.0563881;REFB=0;REVB=-0.0075736;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155262;OID=.;OPOS=135273607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0 chr9 135277007 . C T 369.67 PASS AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00435009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.572;QD=22.4039;RBI=0.00581612;REFB=-0.0230888;REVB=0.00386056;RO=29;SAF=12;SAR=25;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217375;STB=0.620121;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00887827;OID=.;OPOS=135277007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:25:12:17:12:25:12:17:12 chr9 135277130 . C A 149.64 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00882736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.183;QD=11.9714;RBI=0.0110683;REFB=0.000199334;REVB=0.00667718;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265116;STB=0.653685;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.000181018;OID=.;OPOS=135277130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:9:8:8:25:9:8:8:25 chr9 135296997 . TGAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG T 50.0 PASS AO=60;DP=50;LEN=76;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=6;SRR=0;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=135296998;OREF=GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 1/1:99:50:0:60:24:21:6:0 chr9 135297016 . T G 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.32;QD=14.0438;RBI=0.0231608;REFB=0.0143921;REVB=-0.0231608;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00306489;OID=.;OPOS=135297016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:5:0:0:4:5:0:0:4 chr9 135297022 . G C 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.468;QD=19.134;RBI=0.00111777;REFB=0.0116671;REVB=-0.00111777;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00875329;OID=.;OPOS=135297022;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:5:0:0:2:5:0:0:2 chr9 135448320 . C A 515.28 PASS AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00778515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.143;QD=55.7055;RBI=0.0166672;REFB=0.0477089;REVB=-0.0147373;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217573;STB=0.511621;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000473808;OID=.;OPOS=135448320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:14:21:1:0:15:21:1:0 chr9 135470414 . T C 830.48 PASS AF=0.525316;AO=83;DP=158;FAO=83;FDP=158;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.0183318;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.137;QD=21.0247;RBI=0.0286341;REFB=-0.0103915;REVB=-0.0219968;RO=75;SAF=37;SAR=46;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110311;STB=0.560448;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00728244;OID=.;OPOS=135470414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:75:75:83:83:0.525316:46:37:43:32:46:37:43:32 chr9 135763816 . C T 242.63 PASS AF=0.430769;AO=27;DP=64;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.014814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.651;QD=14.9308;RBI=0.0223772;REFB=-0.0259411;REVB=-0.0167715;RO=36;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373917;STB=0.518259;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0367369;OID=.;OPOS=135763816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:36:37:27:28:0.430769:14:13:16:20:15:13:16:21 chr9 135771332 . GA G,GG 147.26 PASS AF=0.555556,0.037037;AO=12,2;DP=25;FAO=15,1;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=6,0;FSAR=9,1;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0485561,-0.0417547;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=27.738,27.1561;QD=21.8156;RBI=0.0586755,0.0427758;REFB=0.0177765,-0.00661472;REVB=-0.0329412,0.00929075;RO=11;SAF=4,1;SAR=8,1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.452793,-0.515617;STB=0.705634,0.996651;STBP=0.026,0.066;TYPE=del,snp;VARB=-0.0145686,-0.00827573;OID=.,.;OPOS=135771333,135771333;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.555556,0.037037:12,2:25:15,1:27:11:6,0:9,1:10:1:87:11:4,1:8,1:10:1 chr9 135957091 . A G 336.29 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00691419;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.302;QD=14.3103;RBI=0.026897;REFB=-0.0164039;REVB=-0.0259931;RO=56;SAF=16;SAR=21;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072106;STB=0.535943;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0282318;OID=.;OPOS=135957091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:56:57:37:37:0.393617:21:16:28:28:21:16:28:29 chr9 135961809 . T C 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.652;QD=64.1538;RBI=0.0229495;REFB=0;REVB=-0.010093;RO=0;SAF=10;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95526e-05;OID=.;OPOS=135961809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:39:10:0:0:39:10:0:0 chr9 135968511 . C CTG 517.0 PASS AF=0.526882;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00615354;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=2;MLLD=264.882;QD=22.2364;RBI=0.00756941;REFB=-0.0231114;REVB=-0.00440794;RO=44;SAF=20;SAR=29;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194417;STB=0.510712;STBP=0.852;TYPE=ins;VARB=0.0161074;OID=.;OPOS=135968512;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.526882:49:94:49:93:44:20:29:17:27:99:44:20:29:17:27 chr9 135974079 . G C 196.31 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00791095;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.153;QD=17.45;RBI=0.0979092;REFB=-0.0191864;REVB=0.097589;RO=25;SAF=13;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929098;STB=0.553137;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0167423;OID=.;OPOS=135974079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:25:25:20:20:0.444444:7:13:14:11:7:13:14:11 chr9 135974100 . G A 196.74 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00946593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.892;QD=18.3017;RBI=0.0471093;REFB=-0.0058896;REVB=0.0461485;RO=23;SAF=16;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275592;STB=0.658647;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00796663;OID=.;OPOS=135974100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:4:16:13:10:4:16:13:10 chr9 135976698 . G A 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00209255;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.724;QD=9.11038;RBI=0.016609;REFB=-0.0109909;REVB=-0.0164767;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390509;STB=0.734775;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0284336;OID=.;OPOS=135976698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:3:5:4:12:3:5:4:12 chr9 135985796 . C T 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0365604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.903;QD=16.6154;RBI=0.0382126;REFB=-0.00570408;REVB=0.0111151;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168577;STB=0.581444;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00835066;OID=.;OPOS=135985796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:21:17:17:0.447368:9:8:13:7:9:8:13:8 chr9 136004699 . G A 496.73 PASS AF=0.505263;AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00502626;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.366;QD=20.9149;RBI=0.00532507;REFB=-0.0137047;REVB=-0.00175873;RO=47;SAF=24;SAR=24;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028533;STB=0.515783;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.010737;OID=.;OPOS=136004699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:47:47:48:48:0.505263:24:24:22:25:24:24:22:25 chr9 136031346 . A G 300.85 PASS AF=0.55102;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0227895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.528;QD=24.5588;RBI=0.0358265;REFB=-0.0311832;REVB=0.0276437;RO=22;SAF=15;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101251;STB=0.545421;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0231928;OID=.;OPOS=136031346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:22:22:26:27:0.55102:11:15:10:12:12:15:10:12 chr9 136037742 . G A 285.81 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0342248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6319;QD=18.1463;RBI=0.0521069;REFB=-0.0302865;REVB=0.0392912;RO=32;SAF=18;SAR=13;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130338;STB=0.572848;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0320638;OID=.;OPOS=136037742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:13:18:14:18:13:18:14:18 chr9 136083580 . T G 352.89 PASS AF=0.392523;AO=42;DP=107;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.00832836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.827;QD=13.1923;RBI=0.0135614;REFB=-0.0130747;REVB=0.0107028;RO=65;SAF=18;SAR=24;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191449;STB=0.510864;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0163836;OID=.;OPOS=136083580;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:65:65:42:42:0.392523:24:18:29:36:24:18:29:36 chr9 136131289 . C T 638.9 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00264552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.795;QD=59.4325;RBI=0.0246352;REFB=-0.121382;REVB=0.0244928;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.514279;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00117427;OID=.;OPOS=136131289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:25:17:0:0:25:17:1:0 chr9 136131347 . G A 771.99 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.659;QD=55.1422;RBI=0.014698;REFB=-0.150812;REVB=0.00965936;RO=1;SAF=28;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165384;STB=0.508769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000666539;OID=.;OPOS=136131347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:56:56:1:1:55:55:0.982143:27:28:1:0:27:28:1:0 chr9 136131437 . C T 669.99 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3173;QD=62.3246;RBI=0.0666704;REFB=0;REVB=0.0559495;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135202;OID=.;OPOS=136131437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr9 136131472 . A T 435.85 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00146328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.008;QD=54.481;RBI=0.0461206;REFB=-0.0570596;REVB=-0.0460974;RO=1;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00056275;OID=.;OPOS=136131472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:13:18:1:0:13:18:1:0 chr9 136132873 . T C 1645.34 PASS AF=1;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314395;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.439;QD=60.3795;RBI=0.0329584;REFB=0;REVB=-0.00989009;RO=0;SAF=55;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96116e-05;OID=.;OPOS=136132873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:108:109:1:53:55:0:0:53:56:0:0 chr9 136177993 . G A 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.729;QD=59.1432;RBI=0.023804;REFB=0;REVB=0.0195858;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.54885e-05;OID=.;OPOS=136177993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0 chr9 136219448 . C G 608.37 PASS AF=0.56701;AO=54;DP=96;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0300721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.873;QD=25.0874;RBI=0.0301931;REFB=-0.0146635;REVB=-0.00270042;RO=42;SAF=21;SAR=33;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911555;STB=0.552826;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0109253;OID=.;OPOS=136219448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:42:42:54:55:0.56701:33:21:21:21:34:21:21:21 chr9 136227260 . A G 1541.56 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.107;QD=59.8664;RBI=0.0833009;REFB=0;REVB=0.0692362;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132003;OID=.;OPOS=136227260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:99:103:0:0:98:103:1:42:56:0:0:45:58:0:0 chr9 136237783 . C A 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.357;QD=57.2374;RBI=0.0481393;REFB=0;REVB=0.0324177;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116858;OID=.;OPOS=136237783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0 chr9 136268038 . C T 1575.07 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453672;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3942;QD=60.0027;RBI=0.0567529;REFB=0;REVB=0.0340986;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020825;OID=.;OPOS=136268038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:105:0:0:105:105:1:51:54:0:0:51:54:0:0 chr9 136277480 . A G 651.19 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.811;QD=62.018;RBI=0.0457731;REFB=0;REVB=0.0402646;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1821e-05;OID=.;OPOS=136277480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr9 136291063 . C T 1086.29 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00991736;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.861;QD=58.7184;RBI=0.0264407;REFB=-0.102015;REVB=0.0245103;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508195;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000208002;OID=.;OPOS=136291063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:74:74:0:1:73:73:0.986486:30:43:0:0:30:43:0:1 chr9 136295290 . A C 963.5 PASS AF=0.985294;AO=58;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0347005;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.3257;QD=56.6765;RBI=0.0589195;REFB=-0.0985169;REVB=0.0476171;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154654;STB=0.50746;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00183093;OID=.;OPOS=136295290;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:67:68:1:1:58:67:0.985294:28:30:1:0:34:33:1:0 chr9 136304497 . A G,T 785.07 PASS AF=0.94,0.06;AO=47,3;DP=50;FAO=47,3;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=24,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450012,0.0164617;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.143,61.6285;QD=62.8057;RBI=0.0165458,0.0287225;REFB=0,0;REVB=-0.015922,-0.0235371;RO=0;SAF=23,2;SAR=24,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00229706,0.0871267;OID=.,.;OPOS=136304497,136304497;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:50:50:0:0:47,3:47,3:0.94,0.06:24,1:23,2:0:0:24,1:23,2:0:0 chr9 136308542 . C T 958.38 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391501;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.83;QD=58.977;RBI=0.0406824;REFB=0;REVB=-0.0110601;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34293e-05;OID=.;OPOS=136308542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:43:22:0:0:43:22:0:0 chr9 136328657 . T C 575.59 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0785327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.401;QD=60.5882;RBI=0.0825567;REFB=0;REVB=0.0254601;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224329;OID=.;OPOS=136328657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr9 136340200 . T G 685.72 PASS AF=0.957447;AO=42;DP=43;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0227087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.31;QD=58.3593;RBI=0.0738551;REFB=-0.075142;REVB=0.0702772;RO=1;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302621;STB=0.526304;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00172933;OID=.;OPOS=136340200;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:47:1:2:42:45:0.957447:15:27:0:1:18:27:0:2 chr9 136379890 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.92;QD=57.6801;RBI=0.020227;REFB=0;REVB=-0.015796;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.62314e-05;OID=.;OPOS=136379890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr9 136412170 . C T 254.09 PASS AF=0.432836;AO=30;DP=68;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0028094;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.574;QD=15.1697;RBI=0.0438152;REFB=-0.0243363;REVB=-0.043725;RO=37;SAF=19;SAR=11;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198802;STB=0.634562;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.027709;OID=.;OPOS=136412170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:37:38:30:29:0.432836:11:19:16:21:10:19:16:22 chr9 136412236 . A T 336.07 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0318426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.28;QD=17.0163;RBI=0.0319282;REFB=-0.0180483;REVB=0.00233713;RO=41;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16498;STB=0.580554;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0234561;OID=.;OPOS=136412236;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:41:43:36:36:0.455696:14:22:18:23:14:22:20:23 chr9 136412255 . A C 355.22 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00891919;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.841;QD=18.6959;RBI=0.0195645;REFB=-0.000446517;REVB=-0.0174131;RO=39;SAF=22;SAR=15;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192401;STB=0.607161;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.000312853;OID=.;OPOS=136412255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:39:39:37:37:0.486842:15:22:15:24:15:22:15:24 chr9 136419629 . G A 402.81 PASS AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00245086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.4;QD=19.1812;RBI=0.00759003;REFB=-0.0198607;REVB=-0.00718344;RO=43;SAF=20;SAR=21;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423563;STB=0.523549;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0243039;OID=.;OPOS=136419629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:21:20:19:24:21:20:19:24 chr9 136419770 . G A 97.65 PASS AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.041852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.058;QD=24.4125;RBI=0.047509;REFB=0.0152471;REVB=0.0224838;RO=5;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304345;STB=0.51721;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.00250752;OID=.;OPOS=136419770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:6:5:2:3:6:5:2:3 chr9 136433778 . G A 472.0 PASS AF=0.444444;AO=52;DP=117;FAO=52;FDP=117;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.00793062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.655;QD=16.1367;RBI=0.0343367;REFB=-0.0242913;REVB=0.0334083;RO=64;SAF=33;SAR=19;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152382;STB=0.581466;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0281546;OID=.;OPOS=136433778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:65:52:52:0.444444:19:33:31:33:19:33:32:33 chr9 136434598 . A G 918.51 PASS AF=0.42735;AO=99;DP=234;FAO=100;FDP=234;FR=.;FRO=134;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=0.0246664;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.882;QD=15.701;RBI=0.0249115;REFB=-0.0127863;REVB=-0.00348545;RO=134;SAF=45;SAR=54;SRF=59;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148409;STB=0.511373;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0101182;OID=.;OPOS=136434598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:134:134:99:100:0.42735:54:45:59:75:54:46:59:75 chr9 136434610 . C G 937.69 PASS AF=0.446429;AO=100;DP=225;FAO=100;FDP=224;FR=.;FRO=124;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=56;FSRR=68;FWDB=-0.00891752;FXX=0.00444425;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.697;QD=16.7444;RBI=0.0105573;REFB=-0.0162475;REVB=-0.00565113;RO=124;SAF=45;SAR=55;SRF=56;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00162468;STB=0.500902;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0191293;OID=.;OPOS=136434610;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:124:124:100:100:0.446429:55:45:56:68:55:45:56:68 chr9 136518097 . A G 749.76 PASS AF=0.549618;AO=72;DP=131;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.00770769;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.923;QD=22.8935;RBI=0.0148404;REFB=-0.0149448;REVB=-0.0126818;RO=59;SAF=36;SAR=36;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907848;STB=0.549605;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0133431;OID=.;OPOS=136518097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:59:59:72:72:0.549618:36:36:23:36:36:36:23:36 chr9 136536679 . G A 280.39 PASS AF=0.508475;AO=29;DP=58;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00255728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.398;QD=19.0097;RBI=0.126519;REFB=-0.00798184;REVB=0.126493;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215401;STB=0.624921;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0150253;OID=.;OPOS=136536679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:29:29:29:30:0.508475:15:14:21:8:16:14:21:8 chr9 136536793 . C G 559.75 PASS AF=0.527778;AO=56;DP=107;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.030885;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=70.5055;QD=20.7316;RBI=0.031583;REFB=-0.0135802;REVB=0.0066033;RO=51;SAF=27;SAR=29;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159276;STB=0.590482;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00553408;OID=.;OPOS=136536793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:51:51:56:57:0.527778:29:27:34:17:30:27:34:17 chr9 136573412 . G A 1283.36 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.128;QD=61.8485;RBI=0.0357283;REFB=0;REVB=0.00774429;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113145;OID=.;OPOS=136573412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:41:42:0:0:41:42:0:0 chr9 136599146 . C T 1520.57 PASS AF=0.526882;AO=147;DP=279;FAO=147;FDP=279;FR=.;FRO=132;FSAF=74;FSAR=73;FSRF=86;FSRR=46;FWDB=0.00846871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6294;QD=21.8003;RBI=0.0493346;REFB=-0.012791;REVB=0.0486023;RO=131;SAF=74;SAR=73;SRF=86;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132555;STB=0.570136;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.011742;OID=.;OPOS=136599146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:279:131:132:147:147:0.526882:73:74:86:45:73:74:86:46 chr9 136628770 . T C 1061.77 PASS AF=0.972973;AO=69;DP=72;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.012085;FXX=0.0749906;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.493;QD=57.3931;RBI=0.0519169;REFB=-0.0494941;REVB=0.0504907;RO=1;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129508;STB=0.500753;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00147297;OID=.;OPOS=136628770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:74:1:2:69:72:0.972973:36:33:0:1:38:34:1:1 chr9 136628771 . G C 33.71 PASS AF=0.0987654;AO=8;DP=80;FAO=8;FDP=81;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0051285;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=70.5205;QD=1.66476;RBI=0.0127026;REFB=-0.0355164;REVB=-0.0116213;RO=72;SAF=6;SAR=2;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334883;STB=0.75397;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0285705;OID=.;OPOS=136628771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:80:81:72:73:8:8:0.0987654:2:6:33:39:2:6:34:39 chr9 136643961 . C T 524.25 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=-0.00732763;FXX=0.0416632;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.278;QD=18.2348;RBI=0.00733113;REFB=-0.0172536;REVB=0.000226592;RO=54;SAF=19;SAR=36;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00632805;STB=0.50702;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0195057;OID=.;OPOS=136643961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:115:54:60:55:55:0.478261:36:19:19:35:36:19:20:40 chr9 136898627 . A G 196.73 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00746969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.353;QD=18.3008;RBI=0.0102204;REFB=-0.0146957;REVB=-0.00697573;RO=22;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135421;STB=0.565971;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0107512;OID=.;OPOS=136898627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:23:20:20:0.465116:8:12:10:12:8:12:11:12 chr9 136907005 . G A 268.04 PASS AF=0.5;AO=22;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.149314;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.273;QD=21.443;RBI=0.156145;REFB=-0.0799513;REVB=0.0456776;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159319;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0270521;OID=.;OPOS=136907005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:25:22:25:0.5:12:10:9:10:12:13:13:12 chr9 136913355 . T C 191.62 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0144821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.801;QD=15.6426;RBI=0.0144858;REFB=-0.00282134;REVB=-0.000329049;RO=29;SAF=5;SAR=15;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1201;STB=0.569547;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00408831;OID=.;OPOS=136913355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:15:5:10:19:15:5:10:19 chr9 136915508 . C T 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0182565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4814;QD=17.2277;RBI=0.0247346;REFB=0.0229709;REVB=-0.0166883;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861157;STB=0.549882;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.0204751;OID=.;OPOS=136915508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:2:6:5:1:2:6:5:1 chr9 137005023 . C T 678.07 PASS AF=0.55;AO=65;DP=120;FAO=66;FDP=120;FR=.;FRO=54;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.0440987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.212;QD=22.6024;RBI=0.0448006;REFB=-0.036459;REVB=0.00789911;RO=53;SAF=40;SAR=25;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227795;STB=0.504031;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0335283;OID=.;OPOS=137005023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:53:54:65:66:0.55:25:40:34:19:25:41:34:20 chr9 137271318 . C A 446.51 PASS AF=0.470588;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00979353;FXX=0.0097078;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.697;QD=17.51;RBI=0.0160547;REFB=-0.01074;REVB=0.0127216;RO=48;SAF=18;SAR=30;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116293;STB=0.548449;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00730835;OID=.;OPOS=137271318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:102:48:54:48:48:0.470588:30:18:24:24:30:18:25:29 chr9 137330560 . C T 406.5 PASS AF=0.571429;AO=37;DP=67;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0216938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.537;QD=23.2285;RBI=0.0223402;REFB=-0.0209746;REVB=0.00533482;RO=30;SAF=11;SAR=26;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343932;STB=0.507882;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0174251;OID=.;OPOS=137330560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:30:30:37:40:0.571429:26:11:10:20:26:14:10:20 chr9 137332311 . T G 746.25 PASS AF=0.484472;AO=78;DP=161;FAO=78;FDP=161;FR=.;FRO=83;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.00650596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.151;QD=18.5404;RBI=0.0144203;REFB=-0.0230098;REVB=0.0128692;RO=83;SAF=35;SAR=43;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141631;STB=0.507817;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0259595;OID=.;OPOS=137332311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:83:83:78:78:0.484472:43:35:36:47:43:35:36:47 chr9 137630587 . T C 428.99 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6976;QD=57.1985;RBI=0.057567;REFB=0;REVB=-0.0537125;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000723311;OID=.;OPOS=137630587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr9 137686906 . C T 1194.82 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.01873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.305;QD=59.7408;RBI=0.0379586;REFB=-0.136217;REVB=-0.0330157;RO=1;SAF=52;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901803;STB=0.504761;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000168803;OID=.;OPOS=137686906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:27:52:1:0:27:52:1:0 chr9 137690318 . A T 955.34 PASS AF=1;AO=55;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0862352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7262;QD=57.8993;RBI=0.0954779;REFB=0;REVB=0.0409819;RO=0;SAF=12;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98168e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00256917;OID=.;OPOS=137690318;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:55:66:1:43:12:0:0:49:17:0:0 chr9 137690319 . G T 32.24 PASS AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=-0.0267704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.707;QD=1.92465;RBI=0.0316428;REFB=-0.0172212;REVB=0.0168704;RO=60;SAF=1;SAR=6;SRF=16;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208259;STB=0.670483;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.104261;OID=.;OPOS=137690319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:67:67:60:60:7:7:0.104478:6:1:16:44:6:1:16:44 chr9 137708934 . T G 179.79 PASS AF=0.487179;AO=18;DP=38;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00629337;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.419;QD=18.4401;RBI=0.0136965;REFB=-0.0291951;REVB=0.012165;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974848;STB=0.539042;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0200488;OID=.;OPOS=137708934;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:20:20:18:19:0.487179:10:8:11:9:10:9:11:9 chr9 137711997 . G C 344.02 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0997935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1816;QD=20.2362;RBI=0.101015;REFB=-0.00123363;REVB=0.01566;RO=31;SAF=20;SAR=16;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166634;STB=0.584369;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000582274;OID=.;OPOS=137711997;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:31:32:36:36:0.529412:16:20:11:20:16:20:12:20 chr9 137735232 . GCTAT G 647.2 PASS AF=0.466216;AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=148;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.0105664;FXX=0.0389585;HRUN=1;LEN=4;MLLD=281.111;QD=17.4918;RBI=0.0113702;REFB=-0.0264128;REVB=-0.00419924;RO=72;SAF=29;SAR=40;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00343918;STB=0.505515;STBP=0.905;TYPE=del;VARB=0.0278555;OID=.;OPOS=137735233;OREF=CTAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466216:69:149:69:148:79:29:40:34:45:99:72:29:40:30:42 chr9 137735274 . A T 727.03 PASS AF=0.570248;AO=69;DP=122;FAO=69;FDP=121;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0347524;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3786;QD=24.034;RBI=0.0446045;REFB=-0.0135254;REVB=-0.0279613;RO=51;SAF=26;SAR=43;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287554;STB=0.520943;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0131321;OID=.;OPOS=137735274;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:51:52:69:69:0.570248:43:26:21:30:43:26:22:30 chr9 137742597 . A G 64.3 PASS AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0134447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.375;QD=23.3819;RBI=0.016796;REFB=0.0369548;REVB=0.0100671;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185472;STB=0.608384;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00450087;OID=.;OPOS=137742597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:7:1:1:2:7:1:1:2 chr9 137775139 . A G 530.88 PASS AF=0.524272;AO=53;DP=101;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0297113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1014;QD=20.6165;RBI=0.0697117;REFB=-0.009362;REVB=-0.0630631;RO=47;SAF=27;SAR=26;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00102857;STB=0.505762;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00642027;OID=.;OPOS=137775139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:47:49:53:54:0.524272:26:27:24:23:26:28:26:23 chr9 137775155 . T C 482.7 PASS AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0111318;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.601;QD=22.7154;RBI=0.0271065;REFB=0.0043605;REVB=-0.0247153;RO=39;SAF=24;SAR=22;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00744066;STB=0.504097;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.00559439;OID=.;OPOS=137775155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:39:39:46:46:0.541176:22:24:20:19:22:24:20:19 chr9 137775212 . G A 178.92 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00654765;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0381;QD=12.5556;RBI=0.118176;REFB=0.0100208;REVB=0.117994;RO=35;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112908;STB=0.565158;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=-0.0140543;OID=.;OPOS=137775212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:13:9:18:17:13:9:18:17 chr9 137801314 . A G 731.65 PASS AF=1;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00522547;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.995;QD=56.2808;RBI=0.0274488;REFB=0;REVB=0.0269469;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000689285;OID=.;OPOS=137801314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:25:27:0:0 chr9 137801416 . T C 273.87 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.502;QD=49.7951;RBI=0.0601782;REFB=0;REVB=0.0134981;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000963449;OID=.;OPOS=137801416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:10:12:0:0 chr9 137801800 . T C 1265.84 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0003;QD=60.278;RBI=0.0191073;REFB=-0.121279;REVB=-0.00291016;RO=1;SAF=44;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106431;STB=0.505617;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.003414;OID=.;OPOS=137801800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:39:44:1:0:39:44:1:0 chr9 137804360 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2701;QD=49.599;RBI=0.0458693;REFB=0;REVB=0.021887;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000504655;OID=.;OPOS=137804360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr9 137809685 . C A 846.24 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175221;FXX=0.0166639;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.141;QD=57.3724;RBI=0.0531404;REFB=0;REVB=0.0501685;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264805;OID=.;OPOS=137809685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:29:29:0:0:29:30:0:0 chr9 137968919 . G A,GAA 1390.72 PASS AF=0.0222222,0.977778;AO=4,85;DP=95;FAO=2,88;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=0,47;FSAR=2,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00740716,0.0214502;FXX=0.0217368;HRUN=2,0;LEN=1,2;MLLD=27.673,256.933;QD=61.8097;RBI=0.0874475,0.0379169;REFB=0.0390781,-0.0332369;REVB=0.0871333,0.0312663;RO=3;SAF=2,46;SAR=2,39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.357477,-0.0298935;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0373708,0.000590967;OID=.,.;OPOS=137968919,137968920;OREF=G,-;OALT=A,AA;OMAPALT=A,GAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:95:90:3:0:4,85:2,88:0.0222222,0.977778:2,39:2,46:3:0:2,41:0,47:0:0 chr9 137978552 . A G 360.8 PASS AF=0.506667;AO=37;DP=74;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0394036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7906;QD=19.2428;RBI=0.040537;REFB=-0.0302973;REVB=-0.00951871;RO=33;SAF=12;SAR=25;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120157;STB=0.561764;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0203397;OID=.;OPOS=137978552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:33:37:37:38:0.506667:25:12:15:18:25:13:17:20 chr9 137982127 . T C 610.88 PASS AF=0.5;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00927425;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.714;QD=19.7057;RBI=0.00928106;REFB=-0.0239991;REVB=-0.000355544;RO=63;SAF=28;SAR=34;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359975;STB=0.52453;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0211535;OID=.;OPOS=137982127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:63:62:62:62:0.5:34:28:26:37:34:28:25:37 chr9 138236031 . A G 584.8 PASS AF=0.473214;AO=50;DP=113;FAO=53;FDP=112;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=-0.0148359;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.182;QD=20.8857;RBI=0.0246933;REFB=-0.0267369;REVB=-0.0197397;RO=46;SAF=23;SAR=27;SRF=11;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197569;STB=0.614824;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0248948;OID=.;OPOS=138236031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:46:48:50:53:0.473214:27:23:11:35:27:26:12:36 chr9 138236212 . T G 725.02 PASS AF=0.510791;AO=67;DP=136;FAO=71;FDP=139;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.00636823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.431;QD=20.864;RBI=0.012941;REFB=0.0016476;REVB=0.0112657;RO=66;SAF=36;SAR=31;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737536;STB=0.502556;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.00184334;OID=.;OPOS=138236212;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:139:66:68:67:71:0.510791:31:36:36:30:32:39:37:31 chr9 138376649 . T C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.621;QD=57.5447;RBI=0.0827193;REFB=0;REVB=0.0656121;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174723;OID=.;OPOS=138376649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0 chr9 138376972 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.992;QD=44.6897;RBI=0.0433151;REFB=0;REVB=-0.0160299;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176974;OID=.;OPOS=138376972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr9 138377657 . T C 1434.24 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.8137e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.972;QD=63.0437;RBI=0.032556;REFB=0;REVB=0.0325559;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42795e-05;OID=.;OPOS=138377657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:44:47:0:0:44:47:0:0 chr9 138377853 . A G 1326.29 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00263492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.546;QD=60.9788;RBI=0.044737;REFB=0;REVB=0.0446594;RO=0;SAF=51;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51863e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242995;OID=.;OPOS=138377853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:87:0:0:80:87:1:29:51:0:0:36:51:0:0 chr9 138377915 . G A 793.11 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234289;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4202;QD=57.681;RBI=0.0390092;REFB=0;REVB=0.0311898;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00487718;OID=.;OPOS=138377915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0 chr9 138378856 . A G 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.762;QD=62.6143;RBI=0.0467998;REFB=0;REVB=-0.0285038;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44464e-05;OID=.;OPOS=138378856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr9 138379002 . T G 371.73 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046263;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.816;QD=55.0712;RBI=0.0495459;REFB=0;REVB=0.0177351;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650023;OID=.;OPOS=138379002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:8:18:0:0:9:18:0:0 chr9 138379059 . G T 657.22 PASS AF=0.977273;AO=44;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000361561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4466;QD=59.7472;RBI=0.0820424;REFB=-0.0762334;REVB=0.0820416;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0385573;OID=.;OPOS=138379059;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:0:1:44:43:0.977273:19:25:0:0:19:24:1:0 chr9 138380334 . T C 797.88 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.836;QD=56.9912;RBI=0.0434442;REFB=0;REVB=0.0409894;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34952e-05;OID=.;OPOS=138380334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:32:22:0:0:34:22:0:0 chr9 138380425 . A G 204.51 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.037812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3557;QD=22.7235;RBI=0.0378225;REFB=-0.00486067;REVB=0.000888853;RO=16;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207543;STB=0.511616;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00819156;OID=.;OPOS=138380425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:12:8:6:10:12:8:6:10 chr9 138394124 . C T 243.91 PASS AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0271076;FXX=0.0434594;HRUN=6;LEN=1;MLLD=170.261;QD=44.3463;RBI=0.0291968;REFB=-0.0713855;REVB=0.010846;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514836;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.000701095;OID=.;OPOS=138394124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:22:22:0:2:20:20:0.909091:7:13:0:0:7:13:1:1 chr9 138395122 . G A 1295.05 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0054271;FXX=0.0229859;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.772;QD=60.9435;RBI=0.00975998;REFB=-0.100809;REVB=0.00811196;RO=1;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997231;STB=0.505262;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000170295;OID=.;OPOS=138395122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:47:37:0:1:47:37:0:1 chr9 138440525 . C G 1267.38 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307867;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.699;QD=61.8234;RBI=0.0580231;REFB=0;REVB=0.0491819;RO=0;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149259;OID=.;OPOS=138440525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:37:45:0:0:37:45:0:0 chr9 138440527 . T C 1320.93 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.352;QD=62.1612;RBI=0.0165801;REFB=0;REVB=0.00285433;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13517e-05;OID=.;OPOS=138440527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:37:48:0:0:37:48:0:0 chr9 138440641 . T C 1080.47 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.909;QD=60.026;RBI=0.0478412;REFB=0;REVB=0.0160893;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06182e-05;OID=.;OPOS=138440641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:70:72:1:31:39:0:0:31:41:0:0 chr9 138456155 . C A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.112;QD=61.684;RBI=0.0395066;REFB=0;REVB=0.0149352;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120014;OID=.;OPOS=138456155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr9 138457209 . C G 1153.39 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.18;QD=60.7046;RBI=0.0870304;REFB=0;REVB=0.0836922;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253232;OID=.;OPOS=138457209;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0 chr9 138457475 . CT C 527.53 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.202;QD=57.0299;RBI=0.0673923;REFB=0;REVB=0.0039963;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.394e-05;OID=.;OPOS=138457476;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:35:36:37:37:0:10:27:0:0:4:0:9:26:0:0 chr9 138458462 . C T 2168.33 PASS AF=0.980132;AO=141;DP=145;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0499086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2248;QD=57.4391;RBI=0.0500284;REFB=-0.0945635;REVB=-0.00346042;RO=4;SAF=62;SAR=79;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00320528;STB=0.502394;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.00445102;OID=.;OPOS=138458462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:145:151:4:3:141:148:0.980132:79:62:2:2:81:67:1:2 chr9 138458570 . C T 2328.47 PASS AF=0.993548;AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=95;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0132349;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.412;QD=60.0894;RBI=0.0548256;REFB=-0.0720113;REVB=0.0532042;RO=0;SAF=95;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=3.75236e-05;OID=.;OPOS=138458570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:155:155:0:1:154:154:0.993548:59:95:0:0:59:95:0:1 chr9 138516345 . CCA C,CC 654.67 PASS AF=0,1;AO=17,25;DP=43;FAO=0,42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.186026,0.203895;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=231.133,247.282;QD=62.3495;RBI=0.186265,0.204036;REFB=0,0;REVB=0.00942101,0.00757555;RO=0;SAF=16,2;SAR=1,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.34264e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000959295;OID=.,.;OPOS=138516346,138516347;OREF=CA,A;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:17,25:43:0,42:42:0:0,18:0,24:0:0:4:0:16,2:1,23:0:0 chr9 138518010 . A G 1530.03 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.346;QD=63.7513;RBI=0.0210426;REFB=0;REVB=0.00656763;RO=0;SAF=61;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.19147e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64287e-05;OID=.;OPOS=138518010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:96:0:0:94:96:1:33:61:0:0:33:63:0:0 chr9 138523332 . C A 920.61 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.693;QD=58.4512;RBI=0.0284384;REFB=0;REVB=0.0259711;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06367e-05;OID=.;OPOS=138523332;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:40:22:0:0:41:22:0:0 chr9 138586198 . G A 673.55 PASS AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0122687;FXX=0.0377287;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.277;QD=52.8274;RBI=0.0264447;REFB=-0.0501681;REVB=0.0234265;RO=2;SAF=18;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049451;STB=0.526305;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.000285518;OID=.;OPOS=138586198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:31:18:2:0:31:18:2:0 chr9 138586966 . GC AA 1776.51 PASS AF=1;AO=115;DP=119;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209365;FXX=0.025208;HRUN=4;LEN=2;MLLD=166.058;QD=61.2589;RBI=0.0247491;REFB=0;REVB=0.0131979;RO=0;SAF=65;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=9.31202e-06;OID=.;OPOS=138586966;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:116:0:0:115:116:1:50:65:0:0:51:65:0:0 chr9 138590928 . C T 120.88 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00253899;FXX=0.0270197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.375;QD=13.4315;RBI=0.0211295;REFB=-0.0188824;REVB=-0.0209764;RO=21;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494203;STB=0.516106;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.033503;OID=.;OPOS=138590928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:22:14:14:0.388889:6:8:11:10:6:8:12:10 chr9 138591266 . A G 335.77 PASS AF=0.41573;AO=36;DP=88;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0056299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.523;QD=15.0906;RBI=0.0157452;REFB=-0.00736772;REVB=-0.0147043;RO=48;SAF=18;SAR=18;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210991;STB=0.525853;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0133754;OID=.;OPOS=138591266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:48:52:36:37:0.41573:18:18:25:23:18:19:29:23 chr9 138644203 . T C 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00739264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.056;QD=15.379;RBI=0.0171429;REFB=-0.0117689;REVB=-0.015467;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109955;STB=0.545378;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0107791;OID=.;OPOS=138644203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:14:12:12:0.461538:5:7:6:7:5:7:7:7 chr9 138662273 . G A 770.76 PASS AF=0.462857;AO=81;DP=175;FAO=81;FDP=175;FR=.;FRO=94;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.00877524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.212;QD=17.6174;RBI=0.00878273;REFB=-0.011578;REVB=0.000362613;RO=94;SAF=32;SAR=49;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517922;STB=0.528718;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0164545;OID=.;OPOS=138662273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:94:94:81:81:0.462857:49:32:42:52:49:32:42:52 chr9 138669261 . G A 888.57 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00366535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4347;QD=56.4168;RBI=0.0482653;REFB=-0.0679121;REVB=0.048126;RO=1;SAF=35;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132996;STB=0.50704;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00150683;OID=.;OPOS=138669261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:27:35:1:0:27:35:1:0 chr9 138712896 . C T 412.15 PASS AF=0.445545;AO=44;DP=100;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.031802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.192;QD=16.3228;RBI=0.0349558;REFB=-0.0202158;REVB=-0.01451;RO=56;SAF=27;SAR=17;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254545;STB=0.519231;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0158183;OID=.;OPOS=138712896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:56:56:44:45:0.445545:17:27:33:23:17:28:33:23 chr9 138714620 . G A 145.44 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0573173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3114;QD=16.1598;RBI=0.0578575;REFB=-0.0384713;REVB=-0.00788821;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212598;STB=0.610967;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0492502;OID=.;OPOS=138714620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:5:11:9:10:5:11:10:10 chr9 138838140 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00192957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.979;QD=62.022;RBI=0.00264246;REFB=0;REVB=0.00180537;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11871e-05;OID=.;OPOS=138838140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0 chr9 138898893 . C G 1357.92 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0055925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.66;QD=62.4332;RBI=0.00924195;REFB=0;REVB=-0.00735783;RO=0;SAF=53;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.47085e-06;OID=.;OPOS=138898893;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:34:53:0:0:34:53:0:0 chr9 138899253 . G GCA 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896408;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.352;QD=37.4885;RBI=0.0983474;REFB=0;REVB=0.0404567;RO=1;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286738;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00253697;OID=.;OPOS=138899254;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:8:9:8:8:0:1:7:0:0:4:1:1:7:1:0 chr9 138903671 . A G 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0143;QD=47.82;RBI=0.0607495;REFB=0;REVB=0.0204376;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164032;OID=.;OPOS=138903671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr9 138905136 . C T 2144.74 PASS AF=0.992754;AO=135;DP=136;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00890159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.456;QD=62.1664;RBI=0.037991;REFB=-0.101796;REVB=0.0369334;RO=1;SAF=58;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613402;STB=0.503184;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000502766;OID=.;OPOS=138905136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:136:138:1:1:135:137:0.992754:77:58:0:1:78:59:0:1 chr9 138908250 . C T 275.19 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0169898;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0754;QD=17.7541;RBI=0.0174792;REFB=-0.0307467;REVB=0.00410728;RO=32;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116659;STB=0.565267;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0226771;OID=.;OPOS=138908250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:16:14:19:13:16:14:19:13 chr9 139006647 . T G 292.7 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00756119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5056;QD=27.2278;RBI=0.0399774;REFB=-0.00380351;REVB=-0.0392559;RO=17;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188606;STB=0.604236;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00139519;OID=.;OPOS=139006647;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:16:10:11:6:16:10:11:6 chr9 139110654 . C T 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00452005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.412;QD=16.1724;RBI=0.0125651;REFB=-0.0175059;REVB=-0.0117239;RO=20;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243716;STB=0.638729;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0216503;OID=.;OPOS=139110654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:8:8:5:15:8:8:5:15 chr9 139142710 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.839;QD=48.7373;RBI=0.0449403;REFB=0;REVB=0.0441898;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240915;OID=.;OPOS=139142710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr9 139142808 . T C 517.85 PASS AF=0.947368;AO=37;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.019898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8312;QD=54.5101;RBI=0.0710484;REFB=0.00434679;REVB=0.0682052;RO=1;SAF=12;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374231;STB=0.541643;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.000565051;OID=.;OPOS=139142808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:38:38:1:2:37:36:0.947368:25:12:1:0:25:11:2:0 chr9 139252495 . G A 2792.83 PASS AF=1;AO=177;DP=182;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549985;FXX=0.0219768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.517;QD=62.7602;RBI=0.080575;REFB=0;REVB=0.0588855;RO=0;SAF=85;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50668e-05;OID=.;OPOS=139252495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:182:178:0:0:177:178:1:92:85:0:0:92:86:0:0 chr9 139273402 . C T 365.07 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.961;QD=52.1527;RBI=0.0397201;REFB=-0.114589;REVB=0.0377601;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344248;STB=0.518505;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.000805995;OID=.;OPOS=139273402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:14:13:1:0:14:13:1:0 chr9 139340132 . G A 384.16 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.00543425;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.615;QD=17.6623;RBI=0.0274513;REFB=-0.0190497;REVB=-0.0269081;RO=47;SAF=27;SAR=13;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247246;STB=0.638604;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0229191;OID=.;OPOS=139340132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:13:27:20:27:13:27:20:27 chr9 139343719 . C T 591.91 PASS AF=1;AO=29;DP=35;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.157539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.789;QD=60.7085;RBI=0.157552;REFB=0;REVB=0.00201531;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289601;OID=.;OPOS=139343719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:39:0:0:29:39:1:21:8:0:0:23:16:0:0 chr9 139369282 . G A 159.83 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0128678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.382;QD=26.6377;RBI=0.0202686;REFB=-0.0115828;REVB=-0.01566;RO=8;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149749;STB=0.583232;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00440339;OID=.;OPOS=139369282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:8:8:6:2:8:8:6:2 chr9 139388932 . CA C 30.2 PASS AF=0.25641;AO=11;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.127328;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.43147;QD=3.09735;RBI=0.135791;REFB=-0.072998;REVB=0.0471891;RO=24;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202101;STB=0.587453;STBP=0.53;TYPE=del;VARB=0.112435;OID=.;OPOS=139388933;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25641:11:39:10:39:29:6:4:14:15:30:24:7:4:11:13 chr9 139391636 . G A 2923.03 PASS AF=1;AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.544;QD=63.2007;RBI=0.0161957;REFB=0;REVB=0.015295;RO=0;SAF=99;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.96708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0343e-06;OID=.;OPOS=139391636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:185:185:0:0:185:185:1:86:99:0:0:86:99:0:0 chr9 139397707 . G A 725.72 PASS AF=0.979592;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0474737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.993;QD=59.2421;RBI=0.0582433;REFB=-0.143739;REVB=0.0337421;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00273274;OID=.;OPOS=139397707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:48:49:0:1:46:48:0.979592:19:27:0:0:21:27:1:0 chr9 139407932 . A G,T 694.7 PASS AF=0.955556,0.0444444;AO=43,2;DP=45;FAO=43,2;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265282,0.0128651;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.1334,100.126;QD=61.7513;RBI=0.0566238,0.0175311;REFB=0,0;REVB=-0.050025,-0.0119092;RO=0;SAF=23,2;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00119893,0.154921;OID=.,.;OPOS=139407932,139407932;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:45:45:0:0:43,2:43,2:0.955556,0.0444444:20,0:23,2:0:0:20,0:23,2:0:0 chr9 139418260 . A G 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.787;QD=53.9058;RBI=0.0139853;REFB=0;REVB=-0.0112389;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.23577e-05;OID=.;OPOS=139418260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr9 139510820 . G A 122.32 PASS AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.0344539;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.468;QD=8.43604;RBI=0.0345899;REFB=-0.0135807;REVB=0.00306424;RO=41;SAF=7;SAR=10;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311662;STB=0.684731;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0270758;OID=.;OPOS=139510820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:10:7:28:13:10:7:28:13 chr9 139510938 . T C 35.94 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0188744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.941;QD=6.25113;RBI=0.020007;REFB=-0.0087671;REVB=-0.00663584;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.522784;STB=0.819712;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0571439;OID=.;OPOS=139510938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:4:2:14:3:4:2:14:3 chr9 139616742 . A G 341.16 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.129;QD=54.586;RBI=0.0421414;REFB=0;REVB=0.00176486;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178379;OID=.;OPOS=139616742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:13:11:0:0:13:12:0:0 chr9 139621326 . G A 116.67 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0212735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.383;QD=11.6673;RBI=0.0222682;REFB=0.00111343;REVB=-0.00658105;RO=26;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233898;STB=0.63619;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-0.00250547;OID=.;OPOS=139621326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:8:6:6:20:8:6:6:20 chr9 139634495 . G A 159.79 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00470659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.151;QD=11.6211;RBI=0.020521;REFB=-0.0123087;REVB=-0.019974;RO=34;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637573;STB=0.527246;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0175558;OID=.;OPOS=139634495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:35:20:20:0.363636:10:10:15:19:10:10:16:19 chr9 139635430 . C T 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0293934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.552;QD=16.6157;RBI=0.0304582;REFB=0.00486884;REVB=0.00798321;RO=21;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166384;STB=0.509543;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.0059389;OID=.;OPOS=139635430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:10:7:9:12:10:7:9:12 chr9 139648918 . T G 35.56 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0110339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.77;QD=5.68927;RBI=0.0172616;REFB=-0.00876922;REVB=0.0132747;RO=19;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44328;STB=0.796042;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0234701;OID=.;OPOS=139648918;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:1:5:9:10:1:5:9:10 chr9 139649580 . G A 173.73 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=0.0521281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4296;QD=12.869;RBI=0.0657223;REFB=0.00653696;REVB=0.0400261;RO=33;SAF=12;SAR=9;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284286;STB=0.660885;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00688511;OID=.;OPOS=139649580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:9:12:27:6:9:12:27:6 chr9 139649612 . C A 396.86 PASS AF=0.565217;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0100226;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.886;QD=23.0063;RBI=0.0125949;REFB=-0.021387;REVB=-0.00762752;RO=29;SAF=30;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261924;STB=0.639922;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0154566;OID=.;OPOS=139649612;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:29:30:39:39:0.565217:9:30:14:15:9:30:15:15 chr9 139650060 . C A 261.55 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0596885;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.3323;QD=17.732;RBI=0.073206;REFB=-0.0104253;REVB=0.042384;RO=30;SAF=16;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196419;STB=0.609626;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00990716;OID=.;OPOS=139650060;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:13:16:10:20:13:16:10:20 chr9 139652329 . G C 291.15 PASS AF=0.365591;AO=34;DP=93;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=-0.0256251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.83;QD=12.5226;RBI=0.0262409;REFB=-0.00485478;REVB=0.00565141;RO=56;SAF=12;SAR=22;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380701;STB=0.502073;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0111517;OID=.;OPOS=139652329;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:56:59:34:34:0.365591:22:12:18:38:22:12:21:38 chr9 139652338 . C G 547.02 PASS AF=0.595238;AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0124469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9005;QD=26.0486;RBI=0.019813;REFB=0.0167678;REVB=0.0154152;RO=34;SAF=15;SAR=35;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117735;STB=0.564489;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.00710316;OID=.;OPOS=139652338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:34:34:50:50:0.595238:35:15:15:19:35:15:15:19 chr9 139656670 . T C,G 1607.86 PASS AF=0.981481,0.0185185;AO=103,5;DP=108;FAO=106,2;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=65,1;FSAR=41,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0472762,-0.0820553;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=148.171,21.8031;QD=59.5504;RBI=0.0634236,0.0848234;REFB=0,0;REVB=0.042279,-0.021493;RO=0;SAF=62,4;SAR=41,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000204914,0.148163;OID=.,.;OPOS=139656670,139656670;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:108:108:0:0:103,5:106,2:0.981481,0.0185185:41,1:62,4:0:0:41,1:65,1:0:0 chr9 139656706 . A C 2141.08 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158434;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.677;QD=62.0603;RBI=0.00567559;REFB=0;REVB=-0.00544997;RO=0;SAF=78;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034856;OID=.;OPOS=139656706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:138:0:0:135:138:1:57:78:0:0:59:79:0:0 chr9 139657834 . G C 1036.1 PASS AF=0.972603;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0101947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.648;QD=56.7726;RBI=0.0402392;REFB=-0.0286413;REVB=0.0389264;RO=2;SAF=39;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023628;STB=0.512496;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00181795;OID=.;OPOS=139657834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:73:2:2:70:71:0.972603:31:39:2:0:32:39:2:0 chr9 139690840 . G A 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0027886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.205;QD=57.5452;RBI=0.035753;REFB=0;REVB=0.0356441;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60817e-05;OID=.;OPOS=139690840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0 chr9 139693596 . T C 1227.14 PASS AF=0.524229;AO=119;DP=230;FAO=119;FDP=227;FR=.;FRO=108;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=44;FSRR=64;FWDB=-0.024702;FXX=0.0130429;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3071;QD=21.6236;RBI=0.0288782;REFB=-0.0108075;REVB=-0.0149587;RO=105;SAF=52;SAR=67;SRF=42;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032402;STB=0.510308;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0168804;OID=.;OPOS=139693596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:227:105:108:119:119:0.524229:67:52:42:63:68:51:44:64 chr9 139694521 . T G 324.87 PASS AF=0.378641;AO=39;DP=102;FAO=39;FDP=103;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0155096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.917;QD=12.6163;RBI=0.0197463;REFB=-0.0174412;REVB=-0.0122217;RO=63;SAF=15;SAR=24;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101855;STB=0.553818;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0367621;OID=.;OPOS=139694521;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:63:64:39:39:0.378641:24:15:30:33:24:15:30:34 chr9 139694569 . A C 115.37 PASS AF=0.285714;AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00642357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4602;QD=8.24054;RBI=0.00658399;REFB=-0.0077666;REVB=0.00144452;RO=40;SAF=4;SAR=12;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233415;STB=0.642666;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0140661;OID=.;OPOS=139694569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:40:40:16:16:0.285714:12:4:17:23:12:4:17:23 chr9 139700605 . T C 613.33 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0958;QD=61.3329;RBI=0.0574438;REFB=0;REVB=0.0552973;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000959673;OID=.;OPOS=139700605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0 chr9 139701108 . A C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0827826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4526;QD=53.2762;RBI=0.0897909;REFB=0;REVB=0.0347772;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126392;OID=.;OPOS=139701108;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr9 139726239 . A G 847.63 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7154;QD=57.4667;RBI=0.0244194;REFB=0;REVB=0.00960834;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126482;OID=.;OPOS=139726239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:31:27:0:0:31:28:0:0 chr9 139732331 . G C 1884.83 PASS AF=0.984127;AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0373661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.367;QD=59.8359;RBI=0.0432474;REFB=-0.0237069;REVB=0.021774;RO=1;SAF=67;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826253;STB=0.508619;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000223735;OID=.;OPOS=139732331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:126:126:1:2:124:124:0.984127:57:67:0:1:57:67:0:2 chr9 139739643 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.386;QD=45.8067;RBI=0.0647559;REFB=0;REVB=0.0592781;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362577;OID=.;OPOS=139739643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr9 139749067 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0868978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.978;QD=57.0007;RBI=0.0879429;REFB=0;REVB=0.0135179;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474491;OID=.;OPOS=139749067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr9 139751848 . C T 109.64 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0635041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0844;QD=14.6186;RBI=0.0749272;REFB=-0.0445712;REVB=0.0397657;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26923;STB=0.658418;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0737652;OID=.;OPOS=139751848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:3:10:9:8:3:10:9:8 chr9 139752899 . T G 450.65 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.093914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.667;QD=56.3306;RBI=0.103353;REFB=0;REVB=0.0431501;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101421;OID=.;OPOS=139752899;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:32:0:0:20:32:1:11:9:0:0:12:20:0:0 chr9 139753246 . C T 367.42 PASS AF=0.714286;AO=30;DP=42;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0427043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1915;QD=34.9921;RBI=0.0531203;REFB=0.00431587;REVB=0.0315929;RO=12;SAF=16;SAR=14;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10456;STB=0.556924;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00127083;OID=.;OPOS=139753246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:12:12:30:30:0.714286:14:16:4:8:14:16:4:8 chr9 139839904 . T G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0827315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2738;QD=48.737;RBI=0.0919768;REFB=0;REVB=-0.0401898;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0024111;OID=.;OPOS=139839904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr9 139840543 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8447;QD=40.7628;RBI=0.0538754;REFB=0;REVB=-0.0401895;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000252481;OID=.;OPOS=139840543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr9 139848688 . C T 2159.67 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.109;QD=63.0559;RBI=0.0280803;REFB=0;REVB=0.0246881;RO=0;SAF=65;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58983e-05;OID=.;OPOS=139848688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:72:65:0:0:72:65:0:0 chr9 139872048 . A G 2409.01 PASS AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.677;QD=64.2403;RBI=0.0456696;REFB=0;REVB=-0.0424695;RO=0;SAF=85;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.0664e-05;OID=.;OPOS=139872048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:65:85:0:0:65:85:0:0 chr9 139878317 . C T 279.72 PASS AF=0.641026;AO=24;DP=38;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0229303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.098;QD=28.6889;RBI=0.0237018;REFB=-0.0494278;REVB=0.00599816;RO=13;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127139;STB=0.572539;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0208568;OID=.;OPOS=139878317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:13:14:24:25:0.641026:14:10:8:5:14:11:9:5 chr9 139878622 . T C 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.172223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.567;QD=19.134;RBI=0.174863;REFB=-0.0768737;REVB=-0.0302731;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171367;STB=0.59965;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0711531;OID=.;OPOS=139878622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:0:2:4:1:0:2 chr9 139878828 . T C 248.6 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.016681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.629;QD=25.4972;RBI=0.0228755;REFB=-0.0242844;REVB=0.0156536;RO=16;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142262;STB=0.578638;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.014608;OID=.;OPOS=139878828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:10:13:12:4:10:13:12:4 chr9 139879170 . G A 154.94 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0736328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6389;QD=22.9534;RBI=0.0745091;REFB=-0.0511104;REVB=0.0113937;RO=10;SAF=11;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140152;STB=0.601858;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.021329;OID=.;OPOS=139879170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:10:11:16:16:0.592593:5:11:5:5:5:11:5:6 chr9 139902166 . G A 222.0 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0268776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.395;QD=14.5571;RBI=0.0304525;REFB=-0.0206341;REVB=-0.0143159;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217767;STB=0.622862;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0396409;OID=.;OPOS=139902166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:13:13:25:10:13:13:25:10 chr9 139902214 . A G 1213.59 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265928;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1475;QD=61.4478;RBI=0.0621336;REFB=0;REVB=-0.0561552;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41419e-05;OID=.;OPOS=139902214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:35:44:0:0:35:44:0:0 chr9 139902438 . C CG,G 61.09 PASS AF=0.220588,0;AO=7,4;DP=69;FAO=15,0;FDP=68;FR=.;FRO=53;FSAF=13,0;FSAR=2,0;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0269269,0.00152872;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=75.4995,189.107;QD=3.59331;RBI=0.0866858,0.00153751;REFB=-0.00272701,0.000364008;REVB=-0.0823977,0.00016422;RO=53;SAF=6,4;SAR=1,0;SRF=21;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.518458,0.573452;STB=0.866178,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0932691,0;OID=.,.;OPOS=139902439,139902438;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:69:68:53:53:7,4:15,0:0.220588,0:1,0:6,4:21:32:2,0:13,0:21:32 chr9 139904037 . A G 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00373552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.432;QD=15.2627;RBI=0.0586998;REFB=-0.00773988;REVB=-0.0585808;RO=16;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665616;STB=0.538404;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0161806;OID=.;OPOS=139904037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:4:9:12:4:4:9:12:4 chr9 139906359 . G A 169.2 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0102801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.907;QD=13.0151;RBI=0.0187035;REFB=-0.00753844;REVB=0.015625;RO=32;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00690635;STB=0.503996;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0109531;OID=.;OPOS=139906359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:12:8:13:19:12:8:13:19 chr9 139912484 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.83;QD=45.8057;RBI=0.0291164;REFB=0;REVB=-0.010379;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150491;OID=.;OPOS=139912484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr9 139913239 . T G 1080.89 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.158;QD=60.0497;RBI=0.0587471;REFB=0;REVB=0.0533908;RO=1;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171851;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27731e-05;OID=.;OPOS=139913239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:72:1:0:69:72:1:27:42:0:1:30:42:0:0 chr9 139923265 . A G 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.467;QD=57.3858;RBI=0.0485053;REFB=0;REVB=0.0417211;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122156;OID=.;OPOS=139923265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0 chr9 139926402 . T C 330.43 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0482148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8388;QD=50.8358;RBI=0.0577662;REFB=0.0642031;REVB=-0.0318162;RO=1;SAF=8;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054487;STB=0.529388;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.0120903;OID=.;OPOS=139926402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:17:8:1:0:17:8:1:0 chr9 139937795 . T C 1491.7 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000213878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.144;QD=63.4764;RBI=0.0267356;REFB=0;REVB=0.0267347;RO=0;SAF=33;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.19147e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08614e-05;OID=.;OPOS=139937795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:61:33:0:0:61:33:0:0 chr9 139937799 . G A 1552.56 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034717;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.349;QD=64.0229;RBI=0.0451247;REFB=0;REVB=-0.0288265;RO=0;SAF=35;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81934e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76134e-05;OID=.;OPOS=139937799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:62:35:0:0:62:35:0:0 chr9 139943112 . A G 980.39 PASS AF=0.945205;AO=69;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00695489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.931;QD=53.7198;RBI=0.0230713;REFB=-0.090033;REVB=0.0219981;RO=4;SAF=50;SAR=19;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363299;STB=0.519225;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.000776442;OID=.;OPOS=139943112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:73:73:4:4:69:69:0.945205:19:50:4:0:19:50:4:0 chr9 139943549 . G A 214.24 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0817117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.216;QD=45.1031;RBI=0.0852369;REFB=-0.0712349;REVB=0.0242598;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521715;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00114897;OID=.;OPOS=139943549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:7:11:0:0:7:11:1:0 chr9 139944736 . C G 739.72 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000841771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.482;QD=54.7943;RBI=0.00165863;REFB=-0.164208;REVB=0.00142915;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.51219;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000941465;OID=.;OPOS=139944736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:33:20:0:0:33:20:1:0 chr9 139945363 . G A 411.4 PASS AF=1;AO=24;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1515;QD=56.7441;RBI=0.180758;REFB=0;REVB=0.180133;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00556085;OID=.;OPOS=139945363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:24:29:1:17:7:0:0:22:7:0:0 chr9 139981627 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00212507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.665;QD=50.4131;RBI=0.0366409;REFB=0;REVB=-0.0365792;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000618367;OID=.;OPOS=139981627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0 chr9 139996099 . G A 249.71 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0091877;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.145;QD=16.3743;RBI=0.0116425;REFB=-0.0241477;REVB=-0.00715086;RO=33;SAF=17;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119285;STB=0.567293;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0321465;OID=.;OPOS=139996099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:11:17:16:17:11:17:16:17 chr9 140108857 . T C 183.54 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.012314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.564;QD=11.8414;RBI=0.013563;REFB=-0.0131016;REVB=-0.00568494;RO=39;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112693;STB=0.565161;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0246509;OID=.;OPOS=140108857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:10:13:18:21:10:13:18:21 chr9 140108868 . G A 368.94 PASS AF=0.648148;AO=35;DP=54;FAO=35;FDP=54;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.014565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.766;QD=27.3286;RBI=0.0219206;REFB=-0.00100544;REVB=0.0163821;RO=19;SAF=15;SAR=20;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130705;STB=0.571388;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.000820833;OID=.;OPOS=140108868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:19:19:35:35:0.648148:20:15:12:7:20:15:12:7 chr9 140109141 . C T 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0137973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.049;QD=17.4017;RBI=0.0180859;REFB=-0.0138281;REVB=0.0116932;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263617;STB=0.650935;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00895216;OID=.;OPOS=140109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:8:5:9:4:8:5:9:4 chr9 140119572 . C T 1738.32 PASS AF=0.701923;AO=145;DP=208;FAO=146;FDP=208;FR=.;FRO=62;FSAF=85;FSAR=61;FSRF=9;FSRR=53;FWDB=0.0138798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.046;QD=33.4293;RBI=0.0148855;REFB=-0.015697;REVB=-0.00537873;RO=61;SAF=84;SAR=61;SRF=9;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235683;STB=0.628225;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00652388;OID=.;OPOS=140119572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:61:62:145:146:0.701923:61:84:9:52:61:85:9:53 chr9 140120396 . C T 51.76 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0519814;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5248;QD=14.7877;RBI=0.0639236;REFB=-0.0684733;REVB=0.0372042;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235769;STB=0.639615;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0139448;OID=.;OPOS=140120396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:14:14:7:7:7:7:0.5:3:4:2:5:3:4:2:5 chr9 140123132 . C G 68.75 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0444622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9923;QD=15.278;RBI=0.0556689;REFB=0.0234845;REVB=-0.0334983;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419704;STB=0.754021;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.0280318;OID=.;OPOS=140123132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:8:1:4:5:8:1:4:5 chr9 140127051 . G A 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00856827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.151;QD=13.959;RBI=0.0108286;REFB=-0.0695618;REVB=0.00662138;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358511;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0372617;OID=.;OPOS=140127051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:2:5:2:5:2:5 chr9 140130606 . A G,T 729.38 PASS AF=0.0384615,0.961538;AO=2,50;DP=52;FAO=2,50;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=1,28;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228339,-0.0304168;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=159.131,61.8658;QD=56.1058;RBI=0.0255994,0.0335239;REFB=0,0;REVB=-0.0115735,-0.014095;RO=0;SAF=1,28;SAR=1,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.15703e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0847015,-0.00393073;OID=.,.;OPOS=140130606,140130606;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:52:52:0:0:2,50:2,50:0.0384615,0.961538:1,22:1,28:0:0:1,22:1,28:0:0 chr9 140139184 . A G 205.33 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0131773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.96;QD=14.6666;RBI=0.0208756;REFB=-0.00729557;REVB=0.016191;RO=27;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228265;STB=0.611014;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00966999;OID=.;OPOS=140139184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:32:24:24:0.428571:17:7:14:13:17:7:15:17 chr9 140139757 . G A 379.52 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00921654;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.407;QD=56.2251;RBI=0.0691489;REFB=0;REVB=0.0685319;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000499438;OID=.;OPOS=140139757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0 chr9 140147273 . C T 592.13 PASS AF=0.546296;AO=59;DP=108;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.00385282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.293;QD=21.9306;RBI=0.0262904;REFB=-0.028881;REVB=0.0260066;RO=49;SAF=20;SAR=39;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259177;STB=0.514221;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0249603;OID=.;OPOS=140147273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:49:49:59:59:0.546296:39:20:18:31:39:20:18:31 chr9 140175422 . C T 56.75 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0851812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.066;QD=11.9479;RBI=0.107497;REFB=-0.00863543;REVB=0.0655724;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763832;STB=0.565062;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.025248;OID=.;OPOS=140175422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:10:11:8:8:0.421053:3:5:7:3:3:5:8:3 chr9 140177040 . A T 1098.64 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0687117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6108;QD=60.1995;RBI=0.0801228;REFB=0;REVB=-0.0412112;RO=1;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103952;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100283;OID=.;OPOS=140177040;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:1:0:72:73:1:45:27:0:1:46:27:0:0 chr9 140201604 . C T 292.73 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0223753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.939;QD=27.2305;RBI=0.0224014;REFB=-0.0519114;REVB=0.00108116;RO=15;SAF=9;SAR=17;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130862;STB=0.576211;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0403302;OID=.;OPOS=140201604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:15:17:26:26:0.604651:17:9:8:7:17:9:9:8 chr9 140243844 . C T 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00587189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.796;QD=15.2619;RBI=0.0198103;REFB=-0.0314292;REVB=0.0189201;RO=15;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277322;STB=0.646177;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0328368;OID=.;OPOS=140243844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:9:4:9:6:9:4:9:7 chr9 140243968 . C T 105.85 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00320838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.917;QD=21.1709;RBI=0.0166494;REFB=-0.041965;REVB=0.0163373;RO=8;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10909;STB=0.56239;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0237454;OID=.;OPOS=140243968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:9:3:3:5:9:3:3:5 chr9 140247143 . T G 834.11 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2253;QD=57.5249;RBI=0.0694601;REFB=0;REVB=-0.0677048;RO=0;SAF=41;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000544105;OID=.;OPOS=140247143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:17:41:0:0:17:41:0:0 chr9 140250818 . C G,T 1199.17 PASS AF=0.0731707,0.914634;AO=6,73;DP=81;FAO=6,75;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=4,40;FSAR=2,35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00329849,-0.0141314;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=14.2231,138.674;QD=58.496;RBI=0.0143291,0.0212242;REFB=0.0743356,-0.118092;REVB=-0.0139443,0.0158358;RO=1;SAF=4,39;SAR=2,34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0962265,-0.0119748;STB=0.555378,0.506171;STBP=0.618,0.529;TYPE=snp,snp;VARB=0.0167666,0.00116621;OID=.,.;OPOS=140250818,140250818;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:81:82:1:1:6,73:6,75:0.0731707,0.914634:2,34:4,39:1:0:2,35:4,40:1:0 chr9 140262426 . C T 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0495773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.845;QD=7.8369;RBI=0.0535243;REFB=-0.00438471;REVB=0.0201728;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27463;STB=0.631241;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0134357;OID=.;OPOS=140262426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:15:16:7:7:0.304348:3:4:12:3:3:4:12:4 chr9 140330976 . T C 851.04 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.382;QD=57.6977;RBI=0.120353;REFB=0;REVB=-0.118569;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200996;OID=.;OPOS=140330976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr9 140332478 . A G 847.75 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.252;QD=57.4747;RBI=0.0361393;REFB=0;REVB=-0.00221787;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97119e-05;OID=.;OPOS=140332478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:24:34:0:0:25:34:0:0 chr9 140356422 . G C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00253195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.2;QD=61.6839;RBI=0.0294267;REFB=0;REVB=0.0293176;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.71835e-05;OID=.;OPOS=140356422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr9 140357972 . A G 501.64 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5063;QD=59.0166;RBI=0.0348012;REFB=0;REVB=-0.0301687;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187357;OID=.;OPOS=140357972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr9 140374861 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.105;QD=60.9773;RBI=0.018685;REFB=0;REVB=-0.00480771;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04896e-05;OID=.;OPOS=140374861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr9 140392616 . G A 211.51 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.012635;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7333;QD=18.3919;RBI=0.0127552;REFB=0.000953744;REVB=-0.00174728;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111266;STB=0.506323;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.000748447;OID=.;OPOS=140392616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:12:9:11:14:12:9:11:14 chr9 140414410 . C T 423.41 PASS AF=0.483146;AO=42;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0051667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.889;QD=19.0296;RBI=0.0220278;REFB=-0.0218097;REVB=0.0214132;RO=45;SAF=18;SAR=24;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359099;STB=0.507664;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0280621;OID=.;OPOS=140414410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:45:46:42:43:0.483146:24:18:21:24:24:19:21:25 chr9 140777306 . C G 346.53 PASS AF=0.378378;AO=41;DP=110;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.0305013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.074;QD=12.4876;RBI=0.0340322;REFB=-0.0144752;REVB=0.0150951;RO=66;SAF=22;SAR=19;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03972;STB=0.510304;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00816086;OID=.;OPOS=140777306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:66:69:41:42:0.378378:19:22:33:33:20:22:35:34 chr9 140786918 . T C 217.48 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0113365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.475;QD=15.5344;RBI=0.0347846;REFB=-0.0166539;REVB=0.0328854;RO=31;SAF=9;SAR=16;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156815;STB=0.589029;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0123221;OID=.;OPOS=140786918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:16:9:16:15:16:9:16:15 chr9 140881314 . A C 261.05 PASS AF=0.509091;AO=26;DP=53;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0122714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.347;QD=18.9857;RBI=0.0135124;REFB=-0.0243137;REVB=-0.00565648;RO=27;SAF=22;SAR=4;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388454;STB=0.72838;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0279966;OID=.;OPOS=140881314;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:27:27:26:28:0.509091:4:22:14:13:4:24:14:13 chr9 140911670 . C T 295.77 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0246774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.923;QD=20.3977;RBI=0.0248384;REFB=0.00209056;REVB=-0.00282356;RO=27;SAF=13;SAR=18;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214988;STB=0.511938;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=-0.00289209;OID=.;OPOS=140911670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:18:13:12:15:18:13:12:15 chr9 141016262 . T G 1556.4 PASS AF=0.990566;AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0236329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.275;QD=58.7319;RBI=0.0306798;REFB=-0.0896403;REVB=0.0195637;RO=0;SAF=72;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507461;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.000513029;OID=.;OPOS=141016262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:0:1:104:105:0.990566:32:72:0:0:33:72:0:1 chr9 141069563 . A G 374.61 PASS AF=1;AO=24;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0318621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.222;QD=55.4977;RBI=0.0594943;REFB=0;REVB=0.0502432;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171369;OID=.;OPOS=141069563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:24:27:1:14:10:0:0:16:11:0:0 chr9 141069905 . C T 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0829865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.489;QD=18.0506;RBI=0.0832365;REFB=-0.0119272;REVB=-0.00644713;RO=8;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298625;STB=0.666417;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00681789;OID=.;OPOS=141069905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:8:2:0:8:8:2:0:8 chr9 141070283 . T C 545.21 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0199501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.814;QD=57.3905;RBI=0.0379478;REFB=-0.154559;REVB=0.0322805;RO=1;SAF=12;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374231;STB=0.519989;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00177038;OID=.;OPOS=141070283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:25:12:1:0:25:12:1:0 chr9 141070335 . T G 289.29 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4287;QD=52.5983;RBI=0.0708798;REFB=0;REVB=0.0417189;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000245667;OID=.;OPOS=141070335;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr9 141070916 . G A 92.45 PASS AF=1;AO=7;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344915;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.978;QD=41.0882;RBI=0.0479776;REFB=0;REVB=0.0333495;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.51646e-05;OID=.;OPOS=141070916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:9:0:0:7:9:1:5:2:0:0:7:2:0:0 chr9 141071438 . A G 1083.46 PASS AF=0.986486;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0848798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.43;QD=58.5655;RBI=0.0867867;REFB=-0.074364;REVB=0.0180927;RO=1;SAF=31;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150093;STB=0.507461;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000200101;OID=.;OPOS=141071438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:73:74:1:1:71:73:0.986486:40:31:1:0:40:33:1:0 chr9 141071475 . C G 1396.28 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4135;QD=62.7544;RBI=0.0601542;REFB=0;REVB=-0.0544835;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000554331;OID=.;OPOS=141071475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:51:38:0:0:51:38:0:0 chr9 141107536 . GGCAGCAGCAGCA G 224.99 PASS AF=0.658537;AO=26;DP=31;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0394594;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=12;MLLD=420;QD=21.9505;RBI=0.0550291;REFB=-0.026363;REVB=0.0383556;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.596939;STBP=0.106;TYPE=del;VARB=0.0106658;OID=.;OPOS=141107537;OREF=GCAGCAGCAGCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.658537:26:31:27:41:14:7:20:7:7:80:0:6:20:0:0 chr10 93711 . C T 57.64 PASS AF=0.152778;AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0470267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4193;QD=3.20199;RBI=0.0471201;REFB=-0.0170032;REVB=-0.00296558;RO=61;SAF=4;SAR=7;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140761;STB=0.59672;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0427468;OID=.;OPOS=93711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:72:72:61:61:11:11:0.152778:7:4:29:32:7:4:29:32 chr10 93714 . A C 57.85 PASS AF=0.150685;AO=11;DP=74;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.000785876;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.999;QD=3.16979;RBI=0.0215538;REFB=-0.00461637;REVB=0.0215395;RO=62;SAF=5;SAR=6;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363443;STB=0.524954;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0328862;OID=.;OPOS=93714;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:74:73:62:62:11:11:0.150685:6:5:30:32:6:5:30:32 chr10 93945 . G A 212.89 PASS AF=0.284314;AO=27;DP=100;FAO=29;FDP=102;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.027997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2524;QD=8.34858;RBI=0.0407158;REFB=-0.00831009;REVB=0.0295625;RO=73;SAF=7;SAR=20;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302969;STB=0.695956;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.025955;OID=.;OPOS=93945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:102:73:73:27:29:0.284314:20:7:36:37:22:7:36:37 chr10 94018 . T C 42.54 PASS AF=0.133333;AO=8;DP=60;FAO=8;FDP=60;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.0338977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1893;QD=2.83632;RBI=0.039052;REFB=-0.00473616;REVB=-0.0193907;RO=52;SAF=2;SAR=6;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854269;STB=0.562336;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0346777;OID=.;OPOS=94018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:60:60:52:52:8:8:0.133333:6:2:16:36:6:2:16:36 chr10 94026 . G A 194.83 PASS AF=0.423077;AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00404473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.401;QD=14.9873;RBI=0.00453844;REFB=-0.0137427;REVB=-0.00205853;RO=29;SAF=6;SAR=15;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300316;STB=0.509991;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0191383;OID=.;OPOS=94026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:30:21:22:0.423077:15:6:9:20:15:7:10:20 chr10 94545 . C T 249.15 PASS AF=0.357143;AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.0204725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.741;QD=11.8643;RBI=0.0302744;REFB=-0.0151888;REVB=0.0223028;RO=54;SAF=16;SAR=14;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457829;STB=0.526383;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0223654;OID=.;OPOS=94545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:54:54:30:30:0.357143:14:16:31:23:14:16:31:23 chr10 294953 . A G 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9094;QD=56.1904;RBI=0.0543866;REFB=0;REVB=-0.0403803;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105246;OID=.;OPOS=294953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0 chr10 370931 . C T 255.68 PASS AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.123072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.703;QD=29.2201;RBI=0.124642;REFB=-0.0141821;REVB=0.0197206;RO=12;SAF=9;SAR=14;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213058;STB=0.616347;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00466455;OID=.;OPOS=370931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:14:9:1:11:14:9:1:11 chr10 429977 . G A 286.52 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00689305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.88;QD=24.3844;RBI=0.0464508;REFB=-0.00793091;REVB=-0.0459365;RO=19;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197063;STB=0.587209;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00688824;OID=.;OPOS=429977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:19:21:26:26:0.553191:15:11:13:6:15:11:13:8 chr10 445061 . C T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.825;QD=58.5874;RBI=0.0507731;REFB=0;REVB=0.0461275;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000544431;OID=.;OPOS=445061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr10 459940 . G A 310.13 PASS AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0125033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.537;QD=28.849;RBI=0.013889;REFB=-0.0463791;REVB=0.00604744;RO=16;SAF=13;SAR=14;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11505;STB=0.563212;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0281125;OID=.;OPOS=459940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:14:13:5:11:14:13:5:11 chr10 696237 . G A 331.45 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0204458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.51;QD=18.6735;RBI=0.0211663;REFB=-0.0283483;REVB=0.00547544;RO=34;SAF=16;SAR=19;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141453;STB=0.577556;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0277368;OID=.;OPOS=696237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:36:35:35:0.492958:19:16:21:13:19:16:22:14 chr10 855694 . C A 801.61 PASS AF=0.568182;AO=73;DP=131;FAO=75;FDP=132;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=0.0732551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3206;QD=24.2911;RBI=0.073823;REFB=-0.0276014;REVB=0.00913863;RO=57;SAF=32;SAR=41;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154374;STB=0.582257;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0176505;OID=.;OPOS=855694;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:57:57:73:75:0.568182:41:32:36:21:42:33:36:21 chr10 1018585 . T G 1312.13 PASS AF=0.977273;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0130082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.773;QD=59.6423;RBI=0.0132317;REFB=-0.0883861;REVB=-0.00242189;RO=1;SAF=38;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123045;STB=0.501339;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00172358;OID=.;OPOS=1018585;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:87:88:1:2:86:86:0.977273:48:38:1:0:48:38:1:1 chr10 1046712 . G A 1514.95 PASS AF=0.989796;AO=95;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0175976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.248;QD=61.8349;RBI=0.0906485;REFB=-0.1096;REVB=0.088924;RO=0;SAF=56;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000918876;OID=.;OPOS=1046712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:97:98:0:1:95:97:0.989796:39:56:0:0:41:56:0:1 chr10 1089616 . T C 714.96 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0196097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.554;QD=60.8477;RBI=0.0204503;REFB=-0.0903112;REVB=0.00580317;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000877787;OID=.;OPOS=1089616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:0:1:22:24:0:1 chr10 1142208 . T C 1587.3 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.36;QD=64.1333;RBI=0.0659983;REFB=0;REVB=0.0147924;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156529;OID=.;OPOS=1142208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:55:44:0:0:55:44:0:0 chr10 1175939 . C T 947.25 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0311209;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.336;QD=55.7203;RBI=0.0366792;REFB=-0.0898314;REVB=0.0194126;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136944;STB=0.514281;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000330685;OID=.;OPOS=1175939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:68:1:2:66:66:0.970588:34:32:0:1:34:32:0:2 chr10 1230968 . C T 923.63 PASS AF=0.516854;AO=91;DP=178;FAO=92;FDP=178;FR=.;FRO=86;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=0.0814617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.959;QD=20.7558;RBI=0.0823492;REFB=-0.0189485;REVB=0.0120573;RO=87;SAF=51;SAR=40;SRF=40;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898585;STB=0.554128;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0179321;OID=.;OPOS=1230968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:87:86:91:92:0.516854:40:51:40:47:40:52:39:47 chr10 1233758 . G T 416.16 PASS AF=0.602941;AO=40;DP=68;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00303081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.141;QD=24.4802;RBI=0.0573485;REFB=-0.0120394;REVB=0.0572684;RO=28;SAF=25;SAR=15;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423476;STB=0.533013;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00698255;OID=.;OPOS=1233758;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:27:40:41:0.602941:15:25:16:12:15:26:15:12 chr10 3143643 . A C 563.79 PASS AF=0.974359;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0147505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.127;QD=57.8247;RBI=0.0293359;REFB=-0.122657;REVB=0.0253578;RO=1;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019929;STB=0.510199;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00189384;OID=.;OPOS=3143643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:39:1:1:37:38:0.974359:23:14:0:1:24:14:0:1 chr10 3155620 . A G 1530.62 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3139;QD=63.7758;RBI=0.0395479;REFB=0;REVB=-0.0200114;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85262e-05;OID=.;OPOS=3155620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:51:44:0:0:51:45:0:0 chr10 3159006 . C T 404.16 PASS AF=0.493976;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0139491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.496;QD=19.4776;RBI=0.0280447;REFB=-0.0140467;REVB=-0.0243295;RO=41;SAF=15;SAR=26;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11408;STB=0.558253;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0204173;OID=.;OPOS=3159006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:42:41:41:0.493976:26:15:20:21:26:15:20:22 chr10 3174554 . C T 109.25 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0193367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.062;QD=14.0971;RBI=0.0201766;REFB=-0.000991027;REVB=0.00576082;RO=17;SAF=2;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212327;STB=0.656438;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0031405;OID=.;OPOS=3174554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:11:2:5:12:11:2:6:12 chr10 3179758 . G A 632.41 PASS AF=0.460993;AO=65;DP=141;FAO=65;FDP=141;FR=.;FRO=76;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.0047822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.566;QD=17.9406;RBI=0.019817;REFB=-0.00693543;REVB=0.0192313;RO=76;SAF=39;SAR=26;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161471;STB=0.589716;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00623181;OID=.;OPOS=3179758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:76:76:65:65:0.460993:26:39:33:43:26:39:33:43 chr10 3180227 . T C 1828.12 PASS AF=0.991736;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.008111;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3636;QD=60.4336;RBI=0.0103116;REFB=0.00757145;REVB=0.00636718;RO=1;SAF=65;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725225;STB=0.503816;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-1.20021e-05;OID=.;OPOS=3180227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:121:1:1:120:120:0.991736:55:65:1:0:55:65:1:0 chr10 3180316 . T C 428.08 PASS AF=0.552632;AO=41;DP=75;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0309873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.404;QD=22.5303;RBI=0.0352957;REFB=-0.0369143;REVB=0.0168989;RO=34;SAF=18;SAR=23;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476377;STB=0.531792;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0227911;OID=.;OPOS=3180316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:34:34:41:42:0.552632:23:18:13:21:23:19:13:21 chr10 3181003 . A G 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.611;QD=61.6829;RBI=0.0564759;REFB=0;REVB=0.0302338;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447704;OID=.;OPOS=3181003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0 chr10 3181107 . G A 524.16 PASS AF=0.505051;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0240658;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3403;QD=21.1783;RBI=0.0433615;REFB=0.0182791;REVB=0.0360701;RO=50;SAF=23;SAR=27;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362394;STB=0.514801;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.0180293;OID=.;OPOS=3181107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:50:49:50:50:0.505051:27:23:25:25:27:23:24:25 chr10 3181157 . G C 415.18 PASS AF=0.438776;AO=42;DP=96;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.021626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0937;QD=16.946;RBI=0.041998;REFB=0.00958268;REVB=0.0360021;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112725;STB=0.565187;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.0114968;OID=.;OPOS=3181157;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:53:55:42:43:0.438776:19:23:23:30:20:23:23:32 chr10 3186526 . G C 167.45 PASS AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=35;FWDB=-0.0261525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.024;QD=10.1486;RBI=0.0306268;REFB=-0.0010652;REVB=-0.0159389;RO=44;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161237;STB=0.593144;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00228859;OID=.;OPOS=3186526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:15:7:9:35:15:7:9:35 chr10 3189380 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00173818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.812;QD=57.8847;RBI=0.0430265;REFB=0;REVB=-0.0429913;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.7708e-05;OID=.;OPOS=3189380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:29:30:0:0:30:30:0:0 chr10 3190265 . A G 180.69 PASS AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0913363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9459;QD=12.9063;RBI=0.111445;REFB=0.000813588;REVB=0.0638575;RO=34;SAF=9;SAR=13;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187789;STB=0.607967;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0033323;OID=.;OPOS=3190265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:13:9:20:14:13:9:20:14 chr10 3200292 . G A 182.99 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00290186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.55;QD=17.4272;RBI=0.00483885;REFB=-0.00214677;REVB=0.00387217;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971332;STB=0.571351;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00189855;OID=.;OPOS=3200292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:6:13:13:9:6:13:13:10 chr10 3202065 . T C 606.28 PASS AF=0.492063;AO=62;DP=126;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.0185892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.682;QD=19.2468;RBI=0.0537611;REFB=-0.0195936;REVB=0.050445;RO=64;SAF=32;SAR=30;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000463653;STB=0.500256;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0158802;OID=.;OPOS=3202065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:64:64:62:62:0.492063:30:32:33:31:30:32:33:31 chr10 3206027 . A G 252.16 PASS AF=0.319588;AO=31;DP=97;FAO=31;FDP=97;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00308803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.455;QD=10.3983;RBI=0.0130061;REFB=-0.00402934;REVB=-0.0126342;RO=66;SAF=22;SAR=9;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289503;STB=0.669783;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00637147;OID=.;OPOS=3206027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:66:66:31:31:0.319588:9:22:31:35:9:22:31:35 chr10 3208557 . A G 69.82 PASS AF=0.196429;AO=11;DP=56;FAO=11;FDP=56;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.00868106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.357;QD=4.98687;RBI=0.00869219;REFB=-0.00177175;REVB=0.000439777;RO=45;SAF=8;SAR=3;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438331;STB=0.780019;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.013654;OID=.;OPOS=3208557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:56:56:45:45:11:11:0.196429:3:8:16:29:3:8:16:29 chr10 3214369 . A G 747.81 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00318286;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.681;QD=56.4388;RBI=0.0364718;REFB=0;REVB=0.0363326;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116962;OID=.;OPOS=3214369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:19:33:0:0:19:34:0:0 chr10 5004755 . C T 44.6 PASS AF=0.0705882;AO=18;DP=255;FAO=18;FDP=255;FR=.;FRO=237;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=112;FSRR=125;FWDB=-0.0419421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4347;QD=0.699541;RBI=0.0487756;REFB=-0.00215919;REVB=-0.0248982;RO=237;SAF=9;SAR=9;SRF=112;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302064;STB=0.525462;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0347442;OID=.;OPOS=5004755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:255:255:237:237:18:18:0.0705882:9:9:112:125:9:9:112:125 chr10 5019959 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00316129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.232;QD=61.684;RBI=0.0121877;REFB=0;REVB=0.0117706;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05461e-05;OID=.;OPOS=5019959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0 chr10 5042664 . C T 391.94 PASS AF=0.396552;AO=45;DP=115;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00225287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.27;QD=13.5151;RBI=0.012266;REFB=-0.00345964;REVB=-0.0120573;RO=69;SAF=24;SAR=21;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104982;STB=0.560512;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00673028;OID=.;OPOS=5042664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:69:70:45:46:0.396552:21:24:30:39:21:25:31:39 chr10 5046957 . A T 224.43 PASS AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0107191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.152;QD=42.7476;RBI=0.0160244;REFB=-0.116329;REVB=0.0119114;RO=2;SAF=10;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834716;STB=0.545407;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00187549;OID=.;OPOS=5046957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:9:10:2:0:9:10:2:0 chr10 5120157 . G T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.982;QD=62.671;RBI=0.0387757;REFB=0;REVB=0.0375199;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.98177e-05;OID=.;OPOS=5120157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr10 5136651 . C G 2027.25 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.702;QD=62.3768;RBI=0.0268394;REFB=0;REVB=0.017277;RO=0;SAF=67;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09692e-05;OID=.;OPOS=5136651;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:63:67:0:0:63:67:0:0 chr10 5139685 . G A 1183.47 PASS AF=1;AO=64;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.635;QD=60.6907;RBI=0.0303453;REFB=0;REVB=0.0178092;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215673;OID=.;OPOS=5139685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:64:78:1:33:31:0:0:39:39:0:0 chr10 5149701 . AGG AGA,AG 662.6 PASS AF=0.485714,0.342857;AO=33,23;DP=72;FAO=34,24;FDP=70;FR=.;FRO=12;FSAF=9,24;FSAR=25,0;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00837585,0.0254271;FXX=0.0277739;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=230.493,18.5127;QD=37.8626;RBI=0.0101433,0.0259852;REFB=0.000229684,0.076073;REVB=0.00572117,0.00535674;RO=12;SAF=8,23;SAR=25,0;SRF=2;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0.447038;SSSB=0.0522488,0.871372;STB=0.564425,0.999421;STBP=0.255,0;TYPE=snp,del;VARB=0.00356868,0.0653428;OID=.,.;OPOS=5149703,5149702;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AGA,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.485714,0.342857:33,23:72:34,24:70:12:9,24:25,0:1:11:99:12:8,23:25,0:2:10 chr10 5197881 . A G 197.94 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0334384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.846;QD=21.9934;RBI=0.0400299;REFB=-0.00442158;REVB=0.0220061;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11225;STB=0.562441;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00452278;OID=.;OPOS=5197881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:6:14:13:3:6:14:13:3 chr10 5199934 . G C 775.89 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0288;QD=56.4284;RBI=0.151553;REFB=0;REVB=0.13159;RO=1;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00254015;OID=.;OPOS=5199934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:1:0:54:55:1:28:26:0:1:29:26:0:0 chr10 5202060 . C T 490.1 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.051466;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.0737;QD=56.0113;RBI=0.0646247;REFB=0.0124409;REVB=0.0390845;RO=1;SAF=15;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301451;STB=0.51612;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.000683378;OID=.;OPOS=5202060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:19:15:1:0:19:15:1:0 chr10 5202104 . C T 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3819;QD=59.0174;RBI=0.0409479;REFB=0;REVB=-0.0401525;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000955416;OID=.;OPOS=5202104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr10 5202145 . T A 161.84 PASS AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0293778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.805;QD=28.1452;RBI=0.0320614;REFB=0.00159529;REVB=-0.0128405;RO=7;SAF=8;SAR=8;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196226;STB=0.608566;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.000982829;OID=.;OPOS=5202145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:7:7:16:16:0.695652:8:8:1:6:8:8:1:6 chr10 5244441 . A G 165.17 PASS AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0222585;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.93;QD=9.30558;RBI=0.0228164;REFB=-0.0164358;REVB=0.00501501;RO=48;SAF=13;SAR=9;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338329;STB=0.528152;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0265612;OID=.;OPOS=5244441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:48:49:22:22:0.309859:9:13:27:21:9:13:27:22 chr10 5246584 . C A 261.75 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.021738;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.305;QD=14.5419;RBI=0.0234454;REFB=-0.00866851;REVB=-0.00878332;RO=42;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176062;STB=0.599933;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0145034;OID=.;OPOS=5246584;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:12:18:18:24:12:18:18:24 chr10 5255025 . A AG,G 1374.34 PASS AF=0.247423,0.71134;AO=12,80;DP=105;FAO=24,69;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=24,27;FSAR=0,42;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00941154,-0.0135938;FXX=0.029997;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=221.952,129.69;QD=56.6739;RBI=0.01943,0.031311;REFB=-0.0522268,-0.16173;REVB=-0.0169985,-0.0282061;RO=12;SAF=12,37;SAR=0,43;SRF=10;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.778772,-0.0909199;STB=0.5,0.534473;STBP=1,0.016;TYPE=ins,snp;VARB=0.0152238,0.0409593;OID=.,.;OPOS=5255026,5255025;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:74:105:97:12:4:12,80:24,69:0.247423,0.71134:0,43:12,37:10:2:0,42:24,27:4:0 chr10 5415954 . A G 462.34 PASS AF=0.632353;AO=43;DP=67;FAO=43;FDP=68;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0275186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.445;QD=27.1963;RBI=0.0276907;REFB=-0.0173987;REVB=0.00308241;RO=24;SAF=16;SAR=27;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00204402;STB=0.504767;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00986698;OID=.;OPOS=5415954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:24:25:43:43:0.632353:27:16:9:15:27:16:9:16 chr10 5435918 . G A 1289.63 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6685;QD=60.6884;RBI=0.0229296;REFB=-0.103159;REVB=0.00819006;RO=1;SAF=35;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133408;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119174;OID=.;OPOS=5435918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:85:85:1:0:84:85:1:49:35:1:0:49:36:0:0 chr10 5436260 . A G 1569.46 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.089;QD=62.7785;RBI=0.0616779;REFB=0;REVB=-0.00797253;RO=0;SAF=41;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183047;OID=.;OPOS=5436260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:100:0:0:91:100:1:50:41:0:0:50:50:0:0 chr10 5437365 . A G 1008.97 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.482;QD=59.351;RBI=0.025408;REFB=0;REVB=-0.0215271;RO=0;SAF=21;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66015e-05;OID=.;OPOS=5437365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:46:21:0:0:46:22:0:0 chr10 5446794 . C T 812.27 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7992;QD=56.0186;RBI=0.0178519;REFB=0;REVB=-0.00333611;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57652e-05;OID=.;OPOS=5446794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:58:0:0:57:58:1:30:27:0:0:30:28:0:0 chr10 5471200 . C T 2077.84 PASS AF=0.978261;AO=135;DP=138;FAO=135;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0107066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3006;QD=60.2273;RBI=0.0264061;REFB=-0.0310948;REVB=0.0241381;RO=3;SAF=60;SAR=75;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00928405;STB=0.504885;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00107194;OID=.;OPOS=5471200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:138:138:3:3:135:135:0.978261:75:60:2:1:75:60:2:1 chr10 5495218 . T C 817.68 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.8;QD=57.3808;RBI=0.0449674;REFB=0;REVB=0.0390831;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147162;OID=.;OPOS=5495218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:37:20:0:0:37:20:0:0 chr10 5499703 . ATA AT,ATT,TAT 1254.93 PASS AF=1,0,0;AO=44,59,6;DP=121;FAO=83,0,0;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37,0,0;FSAR=46,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343022,-0.0384114,-0.0377547;FXX=0.0459717;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,3;MLLD=155.712,148.285,136.132;QD=60.4787;RBI=0.184394,0.105922,0.110049;REFB=0,0,0;REVB=0.181175,0.0987121,0.10337;RO=5;SAF=10,47,4;SAR=34,12,2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.00744789,0.124197,0.344857;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.00180139,0.00377049,0.00459022;OID=.,.,.;OPOS=5499705,5499705,5499703;OREF=A,A,ATA;OALT=-,T,TAT;OMAPALT=AT,ATT,TAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:121:83:5:0:44,59,6:83,0,0:1,0,0:34,12,2:10,47,4:1:4:46,0,0:37,0,0:0:0 chr10 5567366 . G A 587.65 PASS AF=0.536364;AO=59;DP=110;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00909611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8981;QD=21.3691;RBI=0.0135041;REFB=-0.0157579;REVB=-0.00998101;RO=51;SAF=33;SAR=26;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255169;STB=0.514014;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0122062;OID=.;OPOS=5567366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:51:51:59:59:0.536364:26:33:27:24:26:33:27:24 chr10 5567695 . G A 2202.99 PASS AF=1;AO=138;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054381;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.481;QD=63.3953;RBI=0.0596383;REFB=0;REVB=0.0244833;RO=0;SAF=85;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102768;OID=.;OPOS=5567695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:139:0:0:138:139:1:53:85:0:0:54:85:0:0 chr10 5567967 . G T 508.53 PASS AF=0.551724;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00314949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.464;QD=23.3806;RBI=0.0106092;REFB=-0.0202289;REVB=0.010131;RO=39;SAF=19;SAR=29;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118199;STB=0.564999;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0179908;OID=.;OPOS=5567967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:39:39:48:48:0.551724:29:19:21:18:29:19:21:18 chr10 5673528 . G A 161.51 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00127434;FXX=0.0270197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.183;QD=17.9456;RBI=0.00757913;REFB=-0.00688122;REVB=0.00747123;RO=19;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116975;STB=0.56693;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00874185;OID=.;OPOS=5673528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:6:11:10:9:6:11:10:9 chr10 5765637 . C T 700.88 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.724;QD=62.3006;RBI=0.0265065;REFB=0;REVB=0.00676766;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101298;OID=.;OPOS=5765637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:45:0:0:40:45:1:24:16:0:0:25:20:0:0 chr10 5781628 . T G 904.46 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0120737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0805;QD=56.5287;RBI=0.0983808;REFB=-0.0469519;REVB=-0.0976371;RO=1;SAF=19;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106134;STB=0.505616;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00391518;OID=.;OPOS=5781628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:44:19:0:1:44:19:0:1 chr10 5781969 . A T 613.34 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3406;QD=61.3344;RBI=0.07419;REFB=0;REVB=0.0584003;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129911;OID=.;OPOS=5781969;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0 chr10 5788608 . G C 593.74 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.376;QD=60.8961;RBI=0.0352211;REFB=0;REVB=0.0214275;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.48939e-05;OID=.;OPOS=5788608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr10 5789966 . CCTGCCTCAG C 299.48 PASS AF=1;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205373;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=9;MLLD=328.292;QD=46.0745;RBI=0.0205439;REFB=0;REVB=0.000523521;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-5.09199e-05;OID=.;OPOS=5789967;OREF=CTGCCTCAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:25:27:26:26:0:17:9:0:0:5:0:17:8:0:0 chr10 5790420 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.304;QD=51.9166;RBI=0.0348855;REFB=0;REVB=0.0114164;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182556;OID=.;OPOS=5790420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr10 5790616 . A G 955.05 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.417;QD=58.7721;RBI=0.0496608;REFB=0;REVB=0.0351994;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245725;OID=.;OPOS=5790616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0 chr10 5804531 . G A 1102.05 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651338;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.318;QD=60.3864;RBI=0.0208334;REFB=0;REVB=0.0197891;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14285e-05;OID=.;OPOS=5804531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:45:28:0:0:45:28:0:0 chr10 5920121 . T C 307.23 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.792;QD=53.4316;RBI=0.079398;REFB=0;REVB=0.0786257;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523224;OID=.;OPOS=5920121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:3:18:0:0:5:18:0:0 chr10 5925971 . C A 447.14 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.7942;QD=57.6959;RBI=0.0263401;REFB=0;REVB=0.00811347;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00039268;OID=.;OPOS=5925971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:20:10:0:0:21:10:0:0 chr10 6008172 . C T 233.43 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00232144;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.63;QD=12.4494;RBI=0.00342907;REFB=-0.0140388;REVB=0.00252377;RO=45;SAF=10;SAR=18;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192735;STB=0.598754;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0248786;OID=.;OPOS=6008172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:45:47:28:28:0.373333:18:10:24:21:18:10:24:23 chr10 6191733 . G A 209.71 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0373309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3471;QD=18.641;RBI=0.0446564;REFB=-0.00470549;REVB=-0.0245072;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106569;STB=0.560452;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0057197;OID=.;OPOS=6191733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:9:12:11:13:9:12:11:13 chr10 6191735 . T C 689.34 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00435647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6211;QD=62.6676;RBI=0.00770591;REFB=0;REVB=0.00635628;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19797e-05;OID=.;OPOS=6191735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr10 6287695 . G A 91.8 PASS AF=0.55;AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00902809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.538;QD=18.3601;RBI=0.0138361;REFB=0.0194611;REVB=0.0104848;RO=9;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453193;STB=0.504579;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0178965;OID=.;OPOS=6287695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:20:9:9:10:11:0.55:5:5:5:4:5:6:5:4 chr10 6392848 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0073415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.445;QD=57.3858;RBI=0.0364955;REFB=0;REVB=0.0357495;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77048e-05;OID=.;OPOS=6392848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:20:37:0:0:20:37:0:0 chr10 6393009 . A G 453.15 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0701874;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.8196;QD=58.4705;RBI=0.0707218;REFB=0;REVB=0.00867742;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00254165;OID=.;OPOS=6393009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr10 6393260 . C G 276.65 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00100857;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.841;QD=52.6953;RBI=0.0414507;REFB=0;REVB=0.0414385;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.37878e-06;OID=.;OPOS=6393260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0 chr10 6393706 . ACAGG A,GGAGA 479.14 PASS AF=1,0;AO=24,2;DP=37;FAO=33,0;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615358,-0.0142483;FXX=0.0571265;HRUN=1,1;LEN=4,5;MLLD=150.925,179.712;QD=58.0775;RBI=0.0774572,0.0223816;REFB=0,0;REVB=0.0470421,0.0172605;RO=0;SAF=9,2;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.000465261,0;OID=.,.;OPOS=6393707,6393706;OREF=CAGG,ACAGG;OALT=-,GGAGA;OMAPALT=A,GGAGA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:33:0:0:24,2:33,0:1,0:15,0:9,2:0:0:22,0:11,0:0:0 chr10 6527143 . G A 866.81 PASS AF=0.953846;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0114479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.706;QD=53.3422;RBI=0.0530086;REFB=-0.0091713;REVB=0.0517577;RO=3;SAF=35;SAR=27;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00905279;STB=0.504799;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.000208963;OID=.;OPOS=6527143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:65:65:3:3:62:62:0.953846:27:35:2:1:27:35:2:1 chr10 7285632 . A G 557.11 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6396;QD=60.228;RBI=0.0827757;REFB=0;REVB=0.0378408;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123289;OID=.;OPOS=7285632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:9:28:0:0:9:28:0:0 chr10 7528721 . A C 528.41 PASS AF=0.44186;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.0292169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.599;QD=16.3849;RBI=0.0320834;REFB=-0.0362668;REVB=0.0132559;RO=72;SAF=27;SAR=30;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00146504;STB=0.500818;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0400566;OID=.;OPOS=7528721;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:72:72:57:57:0.44186:30:27:34:38:30:27:34:38 chr10 7528738 . G A 1659.57 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6878;QD=60.3479;RBI=0.0406062;REFB=0;REVB=0.0311491;RO=0;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55327e-05;OID=.;OPOS=7528738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:109:110:1:55:54:0:0:55:55:0:0 chr10 7605067 . C T 691.74 PASS AF=0.928571;AO=52;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0175022;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.907;QD=49.4097;RBI=0.0475198;REFB=-0.229722;REVB=0.0441792;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5102;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00225543;OID=.;OPOS=7605067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:56:56:0:4:52:52:0.928571:20:32:0:0:20:32:3:1 chr10 7605077 . TC T 673.98 PASS AF=1;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323757;FXX=0.0526223;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.6936;QD=49.9245;RBI=0.0571213;REFB=0;REVB=-0.0470601;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.213368;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00241802;OID=.;OPOS=7605078;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:53:56:54:54:0:36:18:0:0:12:0:36:17:0:0 chr10 7605101 . A G 956.42 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698175;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1933;QD=58.8563;RBI=0.077179;REFB=0;REVB=-0.0328954;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381526;OID=.;OPOS=7605101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:62:65:1:23:39:0:0:23:42:0:0 chr10 7618501 . A G 475.56 PASS AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=-0.0114005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.083;QD=19.2145;RBI=0.0238636;REFB=-0.0207591;REVB=-0.0209643;RO=52;SAF=24;SAR=23;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992868;STB=0.555149;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0188679;OID=.;OPOS=7618501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:23:24:32:20:23:24:32:20 chr10 7618686 . T G 276.21 PASS AF=0.415385;AO=22;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0463064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.548;QD=16.9975;RBI=0.0478999;REFB=-0.0282412;REVB=-0.0122523;RO=34;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029352;STB=0.530098;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0300056;OID=.;OPOS=7618686;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:22:27:0.415385:9:13:21:13:9:18:21:13 chr10 7679393 . C T 206.81 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0286839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.285;QD=17.2345;RBI=0.0346469;REFB=0.000876828;REVB=-0.0194331;RO=27;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224607;STB=0.628446;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00143439;OID=.;OPOS=7679393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:7:14:12:15:7:14:12:15 chr10 7763661 . A G 1380.82 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203687;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.186;QD=62.7647;RBI=0.0233307;REFB=0;REVB=0.011377;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65248e-05;OID=.;OPOS=7763661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0 chr10 7797903 . C CAACT,CT 268.61 PASS AF=0.740741,0.111111;AO=20,3;DP=27;FAO=20,3;FDP=27;FR=.;FRO=4;FSAF=14,3;FSAR=6,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0054891,-0.0545847;FXX=0;HRUN=2,0;LEN=4,1;MLLD=282.442,84.3879;QD=39.7939;RBI=0.00950089,0.0549323;REFB=-0.0495164,-0.0766828;REVB=-0.00775479,-0.00616953;RO=4;SAF=14,3;SAR=6,0;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.151952,0.729277;STB=0.583246,0.996186;STBP=0.099,0.049;TYPE=ins,ins;VARB=0.00519611,0.13604;OID=.,.;OPOS=7797904,7797904;OREF=-,-;OALT=AACT,T;OMAPALT=CAACT,CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.740741,0.111111:20,3:27:20,3:27:4:14,3:6,0:1:3:22:4:14,3:6,0:1:3 chr10 7798033 . A T 457.29 PASS AF=0.969697;AO=25;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.176965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0031;QD=55.4293;RBI=0.276213;REFB=-0.129314;REVB=0.212078;RO=1;SAF=17;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026521;STB=0.514277;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00509947;OID=.;OPOS=7798033;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:25:32:0.969697:8:17:1:0:15:17:1:0 chr10 8006798 . A G 828.42 PASS AF=0.967213;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.026769;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.968;QD=54.3224;RBI=0.0296469;REFB=-0.113933;REVB=0.0127421;RO=1;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154685;STB=0.516124;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00226754;OID=.;OPOS=8006798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:61:1:2:59:59:0.967213:30:29:0:1:30:29:0:2 chr10 8007559 . GT CC 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0789863;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=161.604;QD=58.5878;RBI=0.0826618;REFB=0;REVB=0.0243747;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000445254;OID=.;OPOS=8007559;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr10 11373418 . A ATC 981.26 PASS AF=0.694215;AO=81;DP=122;FAO=84;FDP=121;FR=.;FRO=37;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0127195;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=2;MLLD=249.841;QD=32.4383;RBI=0.0224027;REFB=-0.00458222;REVB=-0.0184416;RO=37;SAF=51;SAR=30;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710232;STB=0.52962;STBP=0.326;TYPE=ins;VARB=0.00115197;OID=.;OPOS=11373419;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=ATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.694215:81:122:84:121:37:51:33:19:18:99:37:51:30:19:18 chr10 11373420 . G C 163.17 PASS AF=0.224138;AO=26;DP=126;FAO=26;FDP=116;FR=.;FRO=90;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=52;FSRR=38;FWDB=0.00666405;FXX=0.0793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5167;QD=5.62669;RBI=0.0321533;REFB=0.00275232;REVB=-0.0314552;RO=89;SAF=16;SAR=10;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551843;STB=0.530363;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00266895;OID=.;OPOS=11373420;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:116:89:90:26:26:0.224138:10:16:51:38:10:16:52:38 chr10 11504313 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0782;QD=62.3504;RBI=0.0175858;REFB=0;REVB=-0.0019166;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256302;OID=.;OPOS=11504313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0 chr10 11789382 . G A 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5186;QD=61.6826;RBI=0.0397301;REFB=0;REVB=-0.0373447;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000829423;OID=.;OPOS=11789382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:14:27:0:0:14:27:0:0 chr10 11789405 . G A 747.09 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.832;QD=63.5822;RBI=0.0236327;REFB=0;REVB=0.0132884;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171334;OID=.;OPOS=11789405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:17:29:0:0:18:29:0:0 chr10 11797436 . T C 902.67 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1724;QD=58.2369;RBI=0.0392787;REFB=0;REVB=-0.0264453;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000569022;OID=.;OPOS=11797436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0 chr10 11797467 . G A 1004.2 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012558;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.075;QD=59.0703;RBI=0.0924456;REFB=0;REVB=0.0915886;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791263;OID=.;OPOS=11797467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:43:24:0:0:44:24:0:0 chr10 11805339 . C T 272.85 PASS AF=0.424658;AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0149775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.381;QD=14.9507;RBI=0.0162964;REFB=-0.0191658;REVB=-0.00642231;RO=41;SAF=8;SAR=22;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294394;STB=0.667197;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0255445;OID=.;OPOS=11805339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:41:42:30:31:0.424658:22:8:22:19:23:8:22:20 chr10 11805354 . A G 251.86 PASS AF=0.426471;AO=28;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0140867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.343;QD=14.8154;RBI=0.0157967;REFB=-0.0174971;REVB=-0.00714846;RO=38;SAF=8;SAR=20;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354724;STB=0.699859;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.026538;OID=.;OPOS=11805354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:39:28:29:0.426471:20:8:24:14:21:8:24:15 chr10 11805357 . G A 251.86 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.029917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3401;QD=14.8152;RBI=0.0413223;REFB=-0.00514671;REVB=0.0285046;RO=38;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317017;STB=0.6873;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00874684;OID=.;OPOS=11805357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:39:29:29:0.426471:21:8:22:16:21:8:23:16 chr10 12111090 . T C 1171.91 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5557;QD=60.8787;RBI=0.044808;REFB=0;REVB=0.0209278;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157995;OID=.;OPOS=12111090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:28:49:0:0:28:49:0:0 chr10 12131081 . T G 784.83 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.403;QD=64.068;RBI=0.0458955;REFB=0;REVB=0.0166725;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106727;OID=.;OPOS=12131081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0 chr10 12143105 . C G 919.98 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00613769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.841;QD=58.4112;RBI=0.0385257;REFB=0;REVB=-0.0380337;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119446;OID=.;OPOS=12143105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0 chr10 12148259 . A C 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.728;QD=64.1539;RBI=0.0219068;REFB=0;REVB=-0.0214858;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97759e-05;OID=.;OPOS=12148259;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0 chr10 12148286 . T C 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.0274;QD=56.9365;RBI=0.0487438;REFB=0;REVB=0.048731;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316771;OID=.;OPOS=12148286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr10 12149939 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.11;QD=56.1914;RBI=0.0301795;REFB=0;REVB=0.0251435;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160573;OID=.;OPOS=12149939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr10 12212186 . T A 358.44 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00388755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.732;QD=55.1453;RBI=0.0217834;REFB=0;REVB=0.0214337;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3771e-05;OID=.;OPOS=12212186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:18:7:0:0:19:7:0:0 chr10 12292344 . A G 253.74 PASS AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0208502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.155;QD=28.1928;RBI=0.0210741;REFB=0.00171813;REVB=0.00306366;RO=13;SAF=11;SAR=12;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215915;STB=0.618485;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.000822533;OID=.;OPOS=12292344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:12:11:2:11:12:11:2:11 chr10 12292454 . A G 378.97 PASS AF=0.688889;AO=31;DP=45;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0413861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4622;QD=33.686;RBI=0.0414326;REFB=-0.0111002;REVB=-0.0019611;RO=14;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498776;STB=0.527203;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00470048;OID=.;OPOS=12292454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:14:14:31:31:0.688889:16:15:8:6:16:15:8:6 chr10 12620763 . T G 333.26 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00596967;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9004;QD=16.2566;RBI=0.027892;REFB=-0.000578856;REVB=0.0272456;RO=47;SAF=18;SAR=18;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748761;STB=0.548754;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00104394;OID=.;OPOS=12620763;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:47:46:36:36:0.439024:18:18:20:27:18:18:19:27 chr10 12867598 . C G 91.1 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0881318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2311;QD=8.28197;RBI=0.0881333;REFB=-0.0112293;REVB=-0.000524757;RO=32;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206716;STB=0.626659;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0319891;OID=.;OPOS=12867598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:5:7:13:19:5:7:13:19 chr10 12940455 . A G 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.883;QD=58.141;RBI=0.0468724;REFB=0;REVB=0.0158041;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.6959e-05;OID=.;OPOS=12940455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr10 13151224 . G A 468.88 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215694;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.817;QD=58.6101;RBI=0.029355;REFB=0;REVB=0.0199118;RO=0;SAF=5;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.48502e-06;OID=.;OPOS=13151224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:27:5:0:0:27:5:0:0 chr10 13158262 . C T 394.01 PASS AF=1;AO=23;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.185;QD=56.2876;RBI=0.059142;REFB=0;REVB=0.0587364;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000519949;OID=.;OPOS=13158262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:23:28:1:9:14:0:0:13:15:0:0 chr10 13166076 . A G 705.83 PASS AF=0.978261;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0361281;FXX=0.041658;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.153;QD=61.3765;RBI=0.0406509;REFB=-0.0895934;REVB=0.0186348;RO=1;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229092;STB=0.511623;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00086306;OID=.;OPOS=13166076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:46:1:1:44:45:0.978261:20:24:0:1:21:24:0:1 chr10 13206233 . A T 1135.17 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00718433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.855;QD=60.5425;RBI=0.02105;REFB=0;REVB=0.019786;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3972e-05;OID=.;OPOS=13206233;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0 chr10 13230950 . C T 257.49 PASS AF=0.460317;AO=27;DP=62;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0134535;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.992;QD=16.3488;RBI=0.0166608;REFB=-0.037068;REVB=0.00982777;RO=35;SAF=12;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153961;STB=0.55673;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0507888;OID=.;OPOS=13230950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:35:34:27:29:0.460317:15:12:21:14:15:14:20:14 chr10 13275553 . T G 369.43 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.815;QD=54.7298;RBI=0.0524371;REFB=0;REVB=0.0432117;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123057;OID=.;OPOS=13275553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:17:9:0:0:17:10:0:0 chr10 13337588 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.348;QD=55.6561;RBI=0.0183269;REFB=0;REVB=-0.00146068;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.75777e-05;OID=.;OPOS=13337588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0 chr10 13375906 . T C 337.6 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.000655104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.365;QD=20.1554;RBI=0.00133874;REFB=0.00834246;REVB=0.0011675;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119671;STB=0.566289;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00618552;OID=.;OPOS=13375906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:17:18:12:20:17:18:12:20 chr10 13534851 . A G 823.22 PASS AF=1;AO=49;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.963;QD=56.7736;RBI=0.0506822;REFB=0;REVB=0.0472433;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000910982;OID=.;OPOS=13534851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:58:0:0:49:58:1:18:31:0:0:27:31:0:0 chr10 13633835 . A G 1453.37 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.087946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3568;QD=63.1899;RBI=0.0941025;REFB=0;REVB=-0.0334782;RO=0;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307711;OID=.;OPOS=13633835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:43:49:0:0:43:49:0:0 chr10 13685766 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.222;QD=59.0186;RBI=0.0224172;REFB=0;REVB=0.00382128;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.70987e-05;OID=.;OPOS=13685766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr10 13687890 . G A 397.91 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103229;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.398;QD=56.8443;RBI=0.103548;REFB=0;REVB=0.00812886;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00029912;OID=.;OPOS=13687890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr10 13769842 . A G 214.74 PASS AF=0.454545;AO=21;DP=53;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0327127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.07;QD=15.6173;RBI=0.0339052;REFB=-0.0311545;REVB=0.008913;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215344;STB=0.601078;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0340528;OID=.;OPOS=13769842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:29:30:21:25:0.454545:10:11:9:20:12:13:10:20 chr10 14425204 . T A 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00095916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4458;QD=64.4122;RBI=0.0522568;REFB=0;REVB=0.052248;RO=0;SAF=13;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.32377e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511523;OID=.;OPOS=14425204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:37:13:0:0:37:13:0:0 chr10 14705417 . T C 184.73 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0107795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0496;QD=18.4733;RBI=0.0125009;REFB=-0.00219607;REVB=-0.00633053;RO=21;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955612;STB=0.554319;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00170586;OID=.;OPOS=14705417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:11:8:11:10:11:8:11:10 chr10 14976414 . G A 325.79 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0084875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.5;QD=24.5876;RBI=0.0160425;REFB=-0.00687385;REVB=0.0136134;RO=21;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00653925;STB=0.503595;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00475419;OID=.;OPOS=14976414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:14:18:12:9:14:18:12:9 chr10 15180451 . G A 138.97 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00132912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.524;QD=12.084;RBI=0.0103583;REFB=-0.0100445;REVB=-0.0102727;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14212;STB=0.58368;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0140496;OID=.;OPOS=15180451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:7:9:13:17:7:9:13:17 chr10 15573050 . A G 464.21 PASS AF=0.386861;AO=53;DP=137;FAO=53;FDP=137;FR=.;FRO=84;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.0382244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.066;QD=13.5537;RBI=0.0386165;REFB=-0.0190127;REVB=0.00548921;RO=84;SAF=37;SAR=16;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214887;STB=0.622259;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0418605;OID=.;OPOS=15573050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:84:84:53:53:0.386861:16:37:43:41:16:37:43:41 chr10 15713667 . C G 48.28 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0163951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.65;QD=12.8737;RBI=0.0229762;REFB=-0.0200822;REVB=0.0160968;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235769;STB=0.666221;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0172625;OID=.;OPOS=15713667;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:4:3:5:2:4:3:6:2 chr10 16547058 . A G 526.15 PASS AF=0.4;AO=56;DP=145;FAO=58;FDP=145;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=-0.00323965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.937;QD=14.5146;RBI=0.00346536;REFB=-0.00887801;REVB=0.00123021;RO=86;SAF=31;SAR=25;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032738;STB=0.503462;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0152322;OID=.;OPOS=16547058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:86:87:56:58:0.4:25:31:45:41:27:31:46:41 chr10 16562600 . G A 2057.5 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.124;QD=62.3486;RBI=0.0532721;REFB=0;REVB=0.0137282;RO=0;SAF=62;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.83631e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207942;OID=.;OPOS=16562600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:132:0:0:131:132:1:69:62:0:0:69:63:0:0 chr10 16796919 . C A 386.49 PASS AF=0.414141;AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0170838;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.493;QD=15.6155;RBI=0.0241797;REFB=-0.0101928;REVB=0.0171115;RO=57;SAF=20;SAR=21;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216141;STB=0.507143;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.011441;OID=.;OPOS=16796919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:57:58:41:41:0.414141:21:20:29:28:21:20:29:29 chr10 16858993 . T C 513.75 PASS AF=0.526882;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0213398;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.238;QD=22.0968;RBI=0.0224884;REFB=-0.00754816;REVB=0.00709518;RO=44;SAF=23;SAR=26;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846239;STB=0.54663;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.00658929;OID=.;OPOS=16858993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:44:44:49:49:0.526882:26:23:25:19:26:23:25:19 chr10 16882518 . T C 1030.09 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0088071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.114;QD=58.033;RBI=0.0375646;REFB=-0.113308;REVB=0.0365176;RO=1;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141118;STB=0.507461;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.000419473;OID=.;OPOS=16882518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:33:37:0:1:33:37:0:1 chr10 16916402 . GG TA 382.97 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0124381;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=296.889;QD=17.4078;RBI=0.0217795;REFB=-0.00165084;REVB=-0.0178785;RO=46;SAF=18;SAR=22;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18787;STB=0.588743;STBP=0.155;TYPE=mnp;VARB=0.00167074;OID=.;OPOS=16916402;OREF=GG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:46:48:40:40:0.454545:22:18:12:34:22:18:14:34 chr10 16916405 . G A 381.83 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=0.00650167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.644;QD=17.1609;RBI=0.0183089;REFB=-0.00141294;REVB=0.0171157;RO=49;SAF=18;SAR=22;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166925;STB=0.593019;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00185578;OID=.;OPOS=16916405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:49:40:40:0.449438:22:18:14:35:22:18:14:35 chr10 16918972 . A G 477.76 PASS AF=0.427419;AO=53;DP=124;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.00194945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.976;QD=15.4115;RBI=0.00242517;REFB=-0.0110367;REVB=0.00144259;RO=71;SAF=29;SAR=24;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267446;STB=0.514997;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0141249;OID=.;OPOS=16918972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:71:71:53:53:0.427419:24:29:37:34:24:29:37:34 chr10 16943371 . G C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.162;QD=58.7817;RBI=0.0211181;REFB=0;REVB=0.0114415;RO=0;SAF=19;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.6312e-06;OID=.;OPOS=16943371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:46:19:0:0:46:19:0:0 chr10 16967401 . C T 712.26 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222709;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.807;QD=63.3123;RBI=0.0280627;REFB=0;REVB=-0.0279742;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243224;OID=.;OPOS=16967401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:30:15:0:0:30:15:0:0 chr10 16967586 . C G 464.31 PASS AF=0.586667;AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00159433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.762;QD=24.7629;RBI=0.0243092;REFB=0.0203162;REVB=-0.0242569;RO=31;SAF=26;SAR=18;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329415;STB=0.518049;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.0091595;OID=.;OPOS=16967586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:31:31:44:44:0.586667:18:26:17:14:18:26:17:14 chr10 16979606 . G T 192.01 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00772348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0878;QD=16.001;RBI=0.0458429;REFB=-0.0106485;REVB=0.0451876;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284123;STB=0.663625;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0190949;OID=.;OPOS=16979606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:14:6:16:12:14:6:16:12 chr10 16979661 . T C 1093.08 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00954498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.463;QD=59.8949;RBI=0.00957891;REFB=0;REVB=-0.000805614;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5161e-05;OID=.;OPOS=16979661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:70:73:1:38:32:0:0:41:32:0:0 chr10 16982061 . C T 213.28 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0216597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.861;QD=12.546;RBI=0.0509635;REFB=-0.0168807;REVB=-0.0461317;RO=42;SAF=19;SAR=7;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100613;STB=0.505776;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0275288;OID=.;OPOS=16982061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:42:26:26:0.382353:7:19:31:11:7:19:31:11 chr10 16990552 . G A 624.5 PASS AF=0.581633;AO=54;DP=94;FAO=57;FDP=98;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0457462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5568;QD=25.49;RBI=0.0848369;REFB=-0.0220253;REVB=0.0714464;RO=39;SAF=21;SAR=33;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057754;STB=0.515337;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0199881;OID=.;OPOS=16990552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:98:39:41:54:57:0.581633:33:21:18:21:34:23:18:23 chr10 17113563 . C T 478.93 PASS AF=0.427419;AO=53;DP=125;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=-0.00539909;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8519;QD=15.4492;RBI=0.0186113;REFB=-0.0152041;REVB=-0.0178109;RO=71;SAF=22;SAR=31;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165365;STB=0.592681;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0192347;OID=.;OPOS=17113563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:71:71:53:53:0.427419:31:22:41:30:31:22:41:30 chr10 17147521 . G T 314.55 PASS AF=0.34188;AO=40;DP=117;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0178117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2664;QD=10.754;RBI=0.0416762;REFB=-0.0135606;REVB=-0.0376783;RO=74;SAF=22;SAR=18;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162176;STB=0.587743;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0303368;OID=.;OPOS=17147521;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:74:77:40:40:0.34188:18:22:30:44:18:22:32:45 chr10 17156151 . A G 258.62 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0235044;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.255;QD=16.4201;RBI=0.023513;REFB=-0.00201058;REVB=0.000634528;RO=34;SAF=16;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778604;STB=0.543829;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00248366;OID=.;OPOS=17156151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:13:16:16:18:13:16:16:18 chr10 17187661 . C G 214.49 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0100672;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0963;QD=12.6173;RBI=0.0202459;REFB=0.0120888;REVB=-0.0175655;RO=40;SAF=12;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119544;STB=0.567516;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.0143745;OID=.;OPOS=17187661;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:42:26:26:0.382353:14:12:23:17:14:12:24:18 chr10 17194026 . A G 207.59 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.069158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5653;QD=19.3105;RBI=0.0856992;REFB=0.0290271;REVB=-0.0506115;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611111;STB=0.534489;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.0305198;OID=.;OPOS=17194026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:10:11:13:9:10:11:13:9 chr10 17196670 . T C 441.12 PASS AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0573506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9459;QD=17.4701;RBI=0.0647749;REFB=0.0069863;REVB=0.0301114;RO=54;SAF=23;SAR=24;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989175;STB=0.555065;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.00618276;OID=.;OPOS=17196670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:47:47:0.465347:24:23:32:22:24:23:32:22 chr10 17199778 . C A 128.27 PASS AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0400285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.556;QD=12.2166;RBI=0.0573372;REFB=-0.00662633;REVB=-0.0410522;RO=27;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168743;STB=0.599863;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00999627;OID=.;OPOS=17199778;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:5:10:14:13:5:10:14:13 chr10 17204187 . G A 323.58 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0808379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9306;QD=16.8092;RBI=0.0815194;REFB=-0.00111111;REVB=-0.0105194;RO=42;SAF=14;SAR=21;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523293;STB=0.529395;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.000119919;OID=.;OPOS=17204187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:21:14:19:23:21:14:19:23 chr10 17204247 . AAAAAAAAAAA AAAAAACAAAC,TAAAAAAAAAA 217.95 PASS AF=0.653846,0.307692;AO=2,2;DP=26;FAO=17,8;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=4,1;FSAR=13,7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0342104,-0.168677;FXX=0.0370233;HRUN=15,15;LEN=5,1;MLLD=220.778,11.5928;QD=33.5313;RBI=0.0546164,0.306832;REFB=0.0022272,-0.0121617;REVB=-0.0425746,-0.256309;RO=0;SAF=0,0;SAR=2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.555487,0.666169;STBP=0.165,0.104;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0414159,-0.228414;OID=.,.;OPOS=17204253,17204247;OREF=AAAAA,A;OALT=CAAAC,T;OMAPALT=AAAAAACAAAC,TAAAAAAAAAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:57:26:26:0:1:2,2:17,8:0.653846,0.307692:2,2:0,0:0:0:13,7:4,1:1:0 chr10 17210822 . A C 260.18 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0213897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.242;QD=24.7792;RBI=0.0321699;REFB=-0.0223785;REVB=0.0240288;RO=18;SAF=6;SAR=18;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223096;STB=0.624888;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0190191;OID=.;OPOS=17210822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:18:6:9:9:18:6:9:9 chr10 17210881 . A G 217.78 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0181404;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.588;QD=16.7526;RBI=0.0386152;REFB=-0.0200667;REVB=0.034089;RO=28;SAF=7;SAR=17;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492348;STB=0.527755;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0219834;OID=.;OPOS=17210881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:17:7:7:21:17:7:7:21 chr10 17216556 . C T 188.89 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0312926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5731;QD=11.1112;RBI=0.0606836;REFB=-0.000946781;REVB=0.051993;RO=43;SAF=7;SAR=17;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348079;STB=0.70816;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00294383;OID=.;OPOS=17216556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:43:44:24:24:0.352941:17:7:26:17:17:7:27:17 chr10 17256265 . ATTTTTTA ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTAA 228.35 PASS AF=0.373913,0,0;AO=16,19,7;DP=123;FAO=43,0,0;FDP=115;FR=.;FRO=72;FSAF=40,0,0;FSAR=3,0,0;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.20082,-0.300308,-0.108962;FXX=0.0336106;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=24.7615,12.4539,16.9629;QD=7.94255;RBI=0.208198,0.30031,0.121866;REFB=-0.00137351,0.00801121,0.00944782;REVB=-0.0549371,-0.00102389,0.0545759;RO=59;SAF=12,16,7;SAR=4,3,0;SRF=23;SRR=36;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.437357,0.556671,0.669314;STB=0.898661,0.5,0.5;STBP=0,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0320019,0.00892626,0;OID=.,.,.;OPOS=17256271,17256266,17256271;OREF=TA,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.373913,0,0:16,19,7:123:43,0,0:115:72:40,0,0:3,0,0:29:43:99:59:12,16,7:4,3,0:23:36 chr10 17756596 . T C 181.45 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0116915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0584;QD=16.4955;RBI=0.0207755;REFB=-0.0234201;REVB=0.0171735;RO=24;SAF=13;SAR=6;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275801;STB=0.50276;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0209233;OID=.;OPOS=17756596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:6:13:17:7:6:13:17:8 chr10 17891705 . A G 501.61 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.959;QD=59.0125;RBI=0.0131303;REFB=0;REVB=0.00493231;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105569;OID=.;OPOS=17891705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0 chr10 17891731 . T C 347.68 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0475055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5952;QD=51.5082;RBI=0.0522231;REFB=-0.0286568;REVB=0.0216904;RO=1;SAF=12;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371368;STB=0.519985;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00244835;OID=.;OPOS=17891731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:14:12:1:0:14:12:1:0 chr10 18122716 . A G 314.46 PASS AF=0.411765;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0539859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4833;QD=14.7981;RBI=0.0612733;REFB=0.0131938;REVB=0.0289818;RO=50;SAF=26;SAR=9;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174027;STB=0.599304;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0167436;OID=.;OPOS=18122716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:50:35:35:0.411765:9:26:30:20:9:26:30:20 chr10 18138639 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.534;QD=50.4134;RBI=0.0207612;REFB=0;REVB=0.0173758;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019624;OID=.;OPOS=18138639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0 chr10 18242304 . T C 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.617;QD=57.1049;RBI=0.0218803;REFB=0;REVB=0.00662692;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94276e-05;OID=.;OPOS=18242304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0 chr10 18254606 . C A 237.62 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0137311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.629;QD=13.7749;RBI=0.0168236;REFB=0.00039182;REVB=-0.00972058;RO=41;SAF=9;SAR=19;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13228;STB=0.575702;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.000677683;OID=.;OPOS=18254606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:19:9:18:23:19:9:18:23 chr10 18266989 . G A 157.02 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0121731;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.881;QD=15.3193;RBI=0.0127647;REFB=0.00135802;REVB=-0.00384103;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129645;STB=0.548137;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=-0.0017747;OID=.;OPOS=18266989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:24:24:17:17:0.414634:7:10:17:7:7:10:16:8 chr10 18828371 . C T 79.14 PASS AF=0.234043;AO=11;DP=47;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0108253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.575;QD=6.73534;RBI=0.0349472;REFB=-0.00387493;REVB=-0.0332283;RO=36;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325595;STB=0.520623;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0191956;OID=.;OPOS=18828371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:47:47:36:36:11:11:0.234043:7:4:14:22:7:4:14:22 chr10 18829222 . A ATGT 90.33 PASS AF=0.237288;AO=12;DP=61;FAO=14;FDP=59;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0370873;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=226.503;QD=6.12398;RBI=0.0375727;REFB=0.00343564;REVB=-0.0060198;RO=45;SAF=1;SAR=11;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.63061;STB=0.915812;STBP=0;TYPE=ins;VARB=-0.0137814;OID=.;OPOS=18829223;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=ATGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.237288:12:61:14:59:45:1:13:26:19:90:45:1:11:26:19 chr10 18829981 . A ATGTT 1138.57 PASS AF=0.854167;AO=78;DP=96;FAO=82;FDP=96;FR=.;FRO=14;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00177182;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=242.22;QD=47.4403;RBI=0.00231128;REFB=-0.0234155;REVB=-0.00148414;RO=14;SAF=40;SAR=38;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167838;STB=0.510414;STBP=0.62;TYPE=ins;VARB=0.00306856;OID=.;OPOS=18829982;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=ATGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.854167:78:96:82:96:14:41:41:8:6:72:14:40:38:8:6 chr10 18965160 . G A 308.16 PASS AF=0.542373;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0142662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.662;QD=20.892;RBI=0.0245094;REFB=-0.0182544;REVB=-0.0199295;RO=27;SAF=11;SAR=21;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151095;STB=0.583928;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0170874;OID=.;OPOS=18965160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:27:27:32:32:0.542373:21:11:14:13:21:11:14:13 chr10 18965960 . G T 952.26 PASS AF=0.554217;AO=91;DP=165;FAO=92;FDP=166;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=0.0034735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.103;QD=22.9461;RBI=0.0431656;REFB=0.0134718;REVB=0.0430256;RO=74;SAF=37;SAR=54;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00101185;STB=0.501497;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=-0.0102696;OID=.;OPOS=18965960;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:74:74:91:92:0.554217:54:37:30:44:55:37:30:44 chr10 18966490 . C T 150.38 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00214784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.702;QD=12.2757;RBI=0.0253077;REFB=-0.00302461;REVB=-0.0252164;RO=32;SAF=12;SAR=5;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102053;STB=0.560366;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00694423;OID=.;OPOS=18966490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:5:12:20:12:5:12:20:12 chr10 19492832 . A C 886.01 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.68;QD=58.0987;RBI=0.0632374;REFB=0;REVB=0.00563216;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131092;OID=.;OPOS=19492832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:32:28:0:0:32:29:0:0 chr10 19498278 . G A 1438.49 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.554;QD=61.8705;RBI=0.0229356;REFB=-0.0557027;REVB=0.00927421;RO=1;SAF=35;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133499;STB=0.507041;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000528866;OID=.;OPOS=19498278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:1:1:91:92:0.989247:56:35:1:0:57:35:1:0 chr10 19676553 . A G 452.6 PASS AF=0.45045;AO=49;DP=110;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=-0.00020896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.802;QD=16.3099;RBI=0.0071945;REFB=-0.0165789;REVB=-0.00719146;RO=61;SAF=35;SAR=14;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685619;STB=0.542151;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0223128;OID=.;OPOS=19676553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:61:61:49:50:0.45045:14:35:40:21:14:36:40:21 chr10 19676561 . G A 455.93 PASS AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.0108558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.006;QD=15.3253;RBI=0.0110407;REFB=-0.0119569;REVB=-0.00201199;RO=68;SAF=37;SAR=14;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111791;STB=0.562986;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00806562;OID=.;OPOS=19676561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:68:68:51:51:0.428571:14:37:43:25:14:37:43:25 chr10 19678286 . C T 2027.24 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.288;QD=62.3768;RBI=0.034113;REFB=0;REVB=0.00867988;RO=0;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24411e-05;OID=.;OPOS=19678286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:80:50:0:0:80:50:0:0 chr10 19678449 . A G 538.86 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0222093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.108;QD=21.772;RBI=0.0232693;REFB=-0.00933007;REVB=-0.00694324;RO=48;SAF=27;SAR=24;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044151;STB=0.524366;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0124835;OID=.;OPOS=19678449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:24:27:23:25:24:27:23:25 chr10 19678497 . G A 1171.99 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7512;QD=60.8825;RBI=0.0148665;REFB=0;REVB=-0.00117462;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.23079e-05;OID=.;OPOS=19678497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr10 19778072 . A G 1564.05 PASS AF=0.99;AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00370368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.36;QD=62.5619;RBI=0.00494259;REFB=0.0398242;REVB=-0.0032729;RO=1;SAF=36;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00758961;STB=0.503936;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=2.55491e-05;OID=.;OPOS=19778072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:1:1:98:99:0.99:62:36:0:1:63:36:0:1 chr10 19780543 . C T 512.61 PASS AF=0.514851;AO=51;DP=100;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0190084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.683;QD=20.3013;RBI=0.0388901;REFB=-0.00777979;REVB=0.0339282;RO=48;SAF=25;SAR=26;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280147;STB=0.524743;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00784615;OID=.;OPOS=19780543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:48:49:51:52:0.514851:26:25:22:26:26:26:22:27 chr10 19787418 . T G 306.94 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.039923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.994;QD=18.0551;RBI=0.0409534;REFB=-0.0230362;REVB=-0.00912876;RO=35;SAF=26;SAR=7;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274333;STB=0.65488;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0185971;OID=.;OPOS=19787418;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:7:26:19:16:7:26:19:16 chr10 19896830 . C A 271.89 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00365021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.334;QD=19.4209;RBI=0.00602262;REFB=-0.0120448;REVB=0.0047904;RO=27;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358835;STB=0.519986;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00993303;OID=.;OPOS=19896830;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:16:13:11:16:16:13:11:16 chr10 20036605 . A AGT 68.13 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00402058;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=119.766;QD=5.56168;RBI=0.0187714;REFB=-0.00172368;REVB=-0.0183357;RO=42;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.607801;STB=0.902821;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.00238106;OID=.;OPOS=20036606;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.204082:10:52:10:49:39:9:1:15:24:68:42:9:1:17:25 chr10 20036609 . C A 49.96 PASS AF=0.170213;AO=7;DP=49;FAO=8;FDP=47;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0207398;FXX=0.040808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2184;QD=4.25217;RBI=0.0207432;REFB=-0.00475834;REVB=0.000376629;RO=39;SAF=7;SAR=0;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.717177;STB=0.887403;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0521;OID=.;OPOS=20036609;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:49:47:39:39:7:8:0.170213:0:7:15:24:1:7:15:24 chr10 20357183 . A G 209.65 PASS AF=0.416667;AO=24;DP=63;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0430319;FXX=0.0476115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.75;QD=13.9765;RBI=0.0434652;REFB=0.0122152;REVB=0.00612208;RO=33;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175007;STB=0.608607;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00629049;OID=.;OPOS=20357183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:60:33:35:24:25:0.416667:15:9:18:15:16:9:19:16 chr10 20500592 . T C 621.81 PASS AF=0.5;AO=63;DP=126;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00027015;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.28;QD=19.7399;RBI=0.0284462;REFB=-0.0115905;REVB=0.0284449;RO=63;SAF=40;SAR=23;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119439;STB=0.566016;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0103119;OID=.;OPOS=20500592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:63:63:63:63:0.5:23:40:32:31:23:40:32:31 chr10 20506418 . G A 633.45 PASS AF=0.492308;AO=64;DP=128;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=-0.0424599;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.052;QD=19.4907;RBI=0.042608;REFB=0.00639323;REVB=-0.00354896;RO=63;SAF=21;SAR=43;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29242;STB=0.671821;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00464377;OID=.;OPOS=20506418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:130:63:66:64:64:0.492308:43:21:41:22:43:21:44:22 chr10 20534333 . A G 285.35 PASS AF=0.346154;AO=36;DP=104;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=-0.0359493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4094;QD=10.975;RBI=0.0391745;REFB=0.0068027;REVB=0.0155658;RO=68;SAF=15;SAR=21;SRF=25;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057895;STB=0.533315;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=-0.0113566;OID=.;OPOS=20534333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:68:68:36:36:0.346154:21:15:25:43:21:15:25:43 chr10 21071191 . G C 211.23 PASS AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.00905266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.969;QD=12.07;RBI=0.0098628;REFB=-0.0122165;REVB=0.00391461;RO=44;SAF=14;SAR=12;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10874;STB=0.562453;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0157123;OID=.;OPOS=21071191;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:44:44:26:26:0.371429:12:14:28:16:12:14:28:16 chr10 21074344 . A G 640.19 PASS AF=0.516129;AO=63;DP=124;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.0371038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5075;QD=20.6512;RBI=0.0736935;REFB=-0.0102836;REVB=0.0636713;RO=60;SAF=36;SAR=27;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786183;STB=0.546319;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00963809;OID=.;OPOS=21074344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:60:60:63:64:0.516129:27:36:29:31:27:37:29:31 chr10 21074455 . T C 745.52 PASS AF=0.496774;AO=77;DP=155;FAO=77;FDP=155;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.00413658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.204;QD=19.2392;RBI=0.0048432;REFB=-0.012058;REVB=0.00251899;RO=78;SAF=37;SAR=40;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763093;STB=0.542;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0125061;OID=.;OPOS=21074455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:78:78:77:77:0.496774:40:37:31:47:40:37:31:47 chr10 21414892 . C G 315.66 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00799731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.924;QD=17.5366;RBI=0.0599271;REFB=-0.0114287;REVB=-0.0593911;RO=38;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446841;STB=0.524985;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0082086;OID=.;OPOS=21414892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:15:19:23:15:15:19:23:15 chr10 21415006 . T C 721.25 PASS AF=0.409326;AO=79;DP=193;FAO=79;FDP=193;FR=.;FRO=114;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=67;FSRR=47;FWDB=-5.96022e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.129;QD=14.9482;RBI=0.00287542;REFB=-0.0100446;REVB=-0.0028748;RO=114;SAF=37;SAR=42;SRF=67;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125277;STB=0.570143;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0132128;OID=.;OPOS=21415006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:114:114:79:79:0.409326:42:37:67:47:42:37:67:47 chr10 21435340 . ACACT A,ACTCT 217.79 PASS AF=0.373134,0.0298507;AO=24,3;DP=68;FAO=25,2;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=6,2;FSAR=19,0;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0160469,0.0214654;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=229.003,84.2782;QD=13.0023;RBI=0.021007,0.036531;REFB=-0.00919427,-0.00682791;REVB=-0.013557,0.0295593;RO=40;SAF=6,2;SAR=18,1;SRF=20;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.296066,0.16255;STB=0.678418,0.994809;STBP=0.037,0.184;TYPE=del,snp;VARB=0.0141202,0.0639688;OID=.,.;OPOS=21435341,21435342;OREF=CACT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ACTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.373134,0.0298507:24,3:68:25,2:67:40:6,2:19,0:20:20:99:40:6,2:18,1:20:20 chr10 21803421 . TAAAAAAAAAAAAAAAAAG TAAAAAAAAAAAAAAAAGT 34.79 PASS AF=0.214286;AO=2;DP=17;FAO=3;FDP=14;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-1.63133e-14;FXX=0.176367;HRUN=17;LEN=2;MLLD=19.8015;QD=9.93856;RBI=0.202168;REFB=-0.194197;REVB=-0.202168;RO=1;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0820943;OID=.;OPOS=21803438;OREF=AG;OALT=GT;OMAPALT=TAAAAAAAAAAAAAAAAGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.214286:2:17:3:14:6:0:3:0:6:23:1:0:2:0:1 chr10 21804721 . C A 226.01 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0124452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6519;QD=20.5465;RBI=0.019208;REFB=0.00791855;REVB=-0.014631;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821771;STB=0.546177;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.00668513;OID=.;OPOS=21804721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:10:12:14:8:10:12:14:8 chr10 21950592 . A G 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0335619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.848;QD=18.8856;RBI=0.0364289;REFB=-0.0457138;REVB=0.0141657;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260045;STB=0.646763;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0288834;OID=.;OPOS=21950592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:2:6:5:0:2:6:5:0 chr10 22048330 . C T 244.33 PASS AF=0.5;AO=24;DP=50;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0984207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.416;QD=18.7947;RBI=0.0988061;REFB=-0.00514055;REVB=-0.00871831;RO=26;SAF=17;SAR=7;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275691;STB=0.665471;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0191748;OID=.;OPOS=22048330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:26:26:24:26:0.5:7:17:11:15:7:19:11:15 chr10 22498749 . A T 1677.16 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7945;QD=60.438;RBI=0.0266289;REFB=0;REVB=0.0174808;RO=0;SAF=51;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155509;OID=.;OPOS=22498749;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:60:51:0:0:60:51:0:0 chr10 22825596 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5168;QD=51.1835;RBI=0.0857425;REFB=0;REVB=0.0466798;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215216;OID=.;OPOS=22825596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr10 22862282 . T C 158.13 PASS AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0092202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.976;QD=9.88286;RBI=0.0326289;REFB=0.00341469;REVB=0.0312991;RO=43;SAF=7;SAR=14;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197404;STB=0.511617;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=-0.0174416;OID=.;OPOS=22862282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:14:7:15:28:14:7:15:28 chr10 23003226 . A G 469.18 PASS AF=0.463636;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.00943288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.843;QD=17.0609;RBI=0.0261238;REFB=-0.0346676;REVB=-0.0243613;RO=58;SAF=21;SAR=30;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118215;STB=0.561531;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0201682;OID=.;OPOS=23003226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:58:59:51:51:0.463636:30:21:31:27:30:21:31:28 chr10 23297301 . C T 981.45 PASS AF=0.446352;AO=103;DP=236;FAO=104;FDP=233;FR=.;FRO=129;FSAF=32;FSAR=72;FSRF=36;FSRR=93;FWDB=-0.0105971;FXX=0.0168769;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.277;QD=16.849;RBI=0.0367032;REFB=-0.0151001;REVB=-0.0351401;RO=124;SAF=31;SAR=72;SRF=34;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318574;STB=0.518864;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0147225;OID=.;OPOS=23297301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:233:124:129:103:104:0.446352:72:31:34:90:72:32:36:93 chr10 23393091 . A G 407.95 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00629456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.317;QD=17.7369;RBI=0.0130074;REFB=-0.0131924;REVB=0.011383;RO=49;SAF=23;SAR=19;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362286;STB=0.515097;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0152337;OID=.;OPOS=23393091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:50:42:42:0.456522:19:23:25:24:19:23:26:24 chr10 23482635 . T C 161.16 PASS AF=1;AO=9;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.142855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.23;QD=46.0468;RBI=0.144414;REFB=0;REVB=0.0211629;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00199088;OID=.;OPOS=23482635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:9:14:1:8:1:0:0:9:5:0:0 chr10 23556110 . A G 1094.04 PASS AF=0.949367;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0151922;FXX=0.0124984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=142.714;QD=55.3942;RBI=0.0276325;REFB=-0.171669;REVB=0.0230814;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.523803;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00190235;OID=.;OPOS=23556110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:79:79:0:4:75:75:0.949367:40:35:0:0:40:35:0:4 chr10 23633566 . C A 2102.74 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597415;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.235;QD=62.7684;RBI=0.046372;REFB=0;REVB=0.0459856;RO=0;SAF=73;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.72667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69651e-05;OID=.;OPOS=23633566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:61:73:0:0:61:73:0:0 chr10 23688486 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.951;QD=42.1826;RBI=0.0138364;REFB=0;REVB=0.010345;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230078;OID=.;OPOS=23688486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr10 23688521 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00703861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.279;QD=45.8068;RBI=0.0287212;REFB=0;REVB=0.0278453;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102457;OID=.;OPOS=23688521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr10 23688542 . T A 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274917;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=105.273;QD=45.8024;RBI=0.0274927;REFB=0;REVB=-0.000233854;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204035;OID=.;OPOS=23688542;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr10 24564653 . CT TG,TT 108.59 PASS AF=0,0.451613;AO=4,11;DP=32;FAO=0,14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=0,8;FSAR=0,6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0280922,-0.00495278;FXX=0.0312402;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=136.273,216.355;QD=14.0119;RBI=0.0518357,0.00900615;REFB=-0.00746136,-0.00213505;REVB=-0.0435634,-0.00752202;RO=17;SAF=0,8;SAR=4,3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.653209,0.27891;STB=0.5,0.555476;STBP=1,0.567;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00986394;OID=.,.;OPOS=24564653,24564653;OREF=CT,C;OALT=TG,T;OMAPALT=TG,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:32:31:17:17:4,11:0,14:0,0.451613:4,3:0,8:8:9:0,6:0,8:8:9 chr10 24813550 . G A 91.33 PASS AF=0.5;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0961299;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7988;QD=16.6059;RBI=0.100161;REFB=-0.0458943;REVB=0.02813;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.569484;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0209937;OID=.;OPOS=24813550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:22:22:10:11:10:11:0.5:8:2:2:8:9:2:3:8 chr10 24832885 . C T 250.39 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0186468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.894;QD=20.0308;RBI=0.0266334;REFB=-0.0146395;REVB=0.0190166;RO=26;SAF=15;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829761;STB=0.546835;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.016535;OID=.;OPOS=24832885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:9:15:14:12:9:15:14:12 chr10 24873369 . C G 920.08 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.234;QD=58.4179;RBI=0.0307233;REFB=0;REVB=0.0299166;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14574e-05;OID=.;OPOS=24873369;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:25:37:0:0:26:37:0:0 chr10 24879281 . A G 1218.93 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.379;QD=60.9463;RBI=0.0190923;REFB=0;REVB=0.0146117;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.81624e-05;OID=.;OPOS=24879281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:77:80:0:0:76:80:1:31:45:0:0:34:46:0:0 chr10 24908686 . T C 232.08 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00717823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8801;QD=14.7351;RBI=0.0242236;REFB=-0.0255764;REVB=-0.0231356;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0298504;OID=.;OPOS=24908686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:12:15:20:16:12:15:20:16 chr10 24929141 . G A 2727.67 PASS AF=0.988764;AO=176;DP=179;FAO=176;FDP=178;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.01507;FXX=0.0111105;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.769;QD=61.296;RBI=0.0374445;REFB=-0.141106;REVB=0.034278;RO=0;SAF=81;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50045;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.000174958;OID=.;OPOS=24929141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:179:178:0:2:176:176:0.988764:95:81:0:0:95:81:1:1 chr10 25312689 . A G 1190.35 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.836;QD=61.0435;RBI=0.0759211;REFB=0;REVB=-0.0668942;RO=0;SAF=28;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000258951;OID=.;OPOS=25312689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:50:28:0:0:50:28:0:0 chr10 25313818 . C T 237.5 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7635;QD=47.5006;RBI=0.031502;REFB=0;REVB=0.0162516;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0196732;OID=.;OPOS=25313818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:18:20:1:10:8:0:0:12:8:0:0 chr10 25314637 . G C 1899.06 PASS AF=0.992;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0162481;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.419;QD=60.77;RBI=0.0194258;REFB=-0.0616882;REVB=0.0106471;RO=1;SAF=71;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664527;STB=0.503496;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000100925;OID=.;OPOS=25314637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:125:125:1:1:124:124:0.992:53:71:1:0:53:71:1:0 chr10 25701341 . C G 488.9 PASS AF=0.447154;AO=53;DP=114;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0445774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4401;QD=15.8992;RBI=0.0463936;REFB=-0.0305279;REVB=-0.012854;RO=61;SAF=21;SAR=32;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078035;STB=0.561882;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.033548;OID=.;OPOS=25701341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:123:61:68:53:55:0.447154:32:21:29:32:32:23:36:32 chr10 25888180 . A G 255.9 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.972;QD=51.1796;RBI=0.0401588;REFB=0;REVB=0.026222;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362237;OID=.;OPOS=25888180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr10 26355906 . G A 291.41 PASS AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.02984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.702;QD=14.3907;RBI=0.0724283;REFB=-0.000756104;REVB=-0.0659957;RO=48;SAF=18;SAR=15;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475687;STB=0.527011;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.000363346;OID=.;OPOS=26355906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:15:18:24:24:15:18:24:24 chr10 26355992 . A G 171.98 PASS AF=0.310811;AO=22;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=0.0425444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.7753;QD=9.29607;RBI=0.04282;REFB=-0.00707637;REVB=0.0048504;RO=48;SAF=5;SAR=17;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127855;STB=0.56092;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0247377;OID=.;OPOS=26355992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:48:51:22:23:0.310811:17:5:15:33:17:6:17:34 chr10 26357747 . CG TA 109.72 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0167672;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=2;MLLD=169.391;QD=13.2998;RBI=0.0365067;REFB=-0.00165437;REVB=-0.0324283;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121279;STB=0.571317;STBP=0.555;TYPE=mnp;VARB=0.00152685;OID=.;OPOS=26357747;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:10:10:8:5:10:10 chr10 26446312 . G A 1602.45 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016114;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.001;QD=59.9046;RBI=0.0161633;REFB=0;REVB=0.0012613;RO=0;SAF=49;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10812e-05;OID=.;OPOS=26446312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:57:49:0:0:58:49:0:0 chr10 26462790 . G A 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0642113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1144;QD=54.5164;RBI=0.0642745;REFB=0;REVB=0.00284903;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00169817;OID=.;OPOS=26462790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chr10 26463043 . A T 392.31 PASS AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00690976;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=320.211;QD=50.6201;RBI=0.0109276;REFB=0.0307594;REVB=-0.00846565;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.517796;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-9.27532e-05;OID=.;OPOS=26463043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:31:31:0:2:29:29:0.935484:21:8:0:0:21:8:1:1 chr10 26463130 . C A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.793;QD=59.4356;RBI=0.00837404;REFB=0;REVB=-0.008022;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.71296e-05;OID=.;OPOS=26463130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr10 26505822 . G A 1348.49 PASS AF=0.9375;AO=88;DP=95;FAO=90;FDP=96;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0914446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3818;QD=56.1873;RBI=0.147632;REFB=-0.153545;REVB=0.115901;RO=7;SAF=47;SAR=41;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545173;STB=0.522217;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00935566;OID=.;OPOS=26505822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:95:96:7:6:88:90:0.9375:41:47:1:6:43:47:1:5 chr10 26991067 . CG C 61.13 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0369362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.8792;QD=7.64113;RBI=0.0387256;REFB=0.00931046;REVB=0.0116356;RO=22;SAF=5;SAR=4;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150529;STB=0.6041;STBP=0.53;TYPE=del;VARB=-0.0210424;OID=.;OPOS=26991068;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.28125:9:32:9:32:23:5:4:16:7:61:22:5:4:15:7 chr10 26993597 . AT A 212.51 PASS AF=0.542373;AO=29;DP=61;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00158477;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=22.3042;QD=14.4073;RBI=0.111673;REFB=-0.0261651;REVB=0.111662;RO=28;SAF=19;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119322;STB=0.520535;STBP=0.769;TYPE=del;VARB=0.0288968;OID=.;OPOS=26993598;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.542373:29:61:32:59:27:20:12:18:9:99:28:19:10:18:10 chr10 26998637 . T G 787.78 PASS AF=0.593496;AO=73;DP=123;FAO=73;FDP=123;FR=.;FRO=50;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00126637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.355;QD=25.6189;RBI=0.00539774;REFB=-0.000222884;REVB=0.00524708;RO=50;SAF=38;SAR=35;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899308;STB=0.548876;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.000129931;OID=.;OPOS=26998637;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:50:50:73:73:0.593496:35:38:20:30:35:38:20:30 chr10 27303605 . A T 589.74 PASS AF=0.541284;AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0768767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6086;QD=21.6417;RBI=0.0798634;REFB=-0.0181296;REVB=0.0216362;RO=50;SAF=26;SAR=33;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690925;STB=0.537861;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.01525;OID=.;OPOS=27303605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:50:50:59:59:0.541284:33:26:18:32:33:26:18:32 chr10 27317840 . C T 272.79 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0648455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.726;QD=14.9472;RBI=0.0664241;REFB=-0.000235323;REVB=-0.0143954;RO=42;SAF=14;SAR=17;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493231;STB=0.527932;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00123259;OID=.;OPOS=27317840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:17:14:21:21:17:14:21:21 chr10 27324405 . G A 349.12 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.000912501;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4272;QD=19.9494;RBI=0.00726123;REFB=0.0160903;REVB=-0.00720366;RO=32;SAF=19;SAR=17;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501305;STB=0.513506;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=-0.0167068;OID=.;OPOS=27324405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:32:34:36:36:0.514286:17:19:15:17:17:19:17:17 chr10 27353007 . T C 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0640802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3175;QD=16.7274;RBI=0.0737601;REFB=-0.0239658;REVB=0.0365278;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170379;STB=0.567606;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0315381;OID=.;OPOS=27353007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:11:5:3:15:11:5:4:15 chr10 27381349 . T C 152.11 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0291233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6912;QD=13.2267;RBI=0.0357494;REFB=-0.0178498;REVB=0.0207329;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216105;STB=0.624864;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0186976;OID=.;OPOS=27381349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:9:8:8:21:9:8:8:21 chr10 27389197 . T C 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0394656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.54;QD=47.8152;RBI=0.0411543;REFB=-0.103523;REVB=0.0116681;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517225;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00132885;OID=.;OPOS=27389197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:22:0:1:21:21:0.954545:14:7:0:0:14:7:0:1 chr10 27400861 . G A 61.53 PASS AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00890927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.424;QD=7.03215;RBI=0.0105651;REFB=-0.000374151;REVB=-0.00567854;RO=26;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242969;STB=0.653501;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0022728;OID=.;OPOS=27400861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:3:6:12:14:3:6:12:14 chr10 27434483 . G A 475.78 PASS AF=0.452174;AO=52;DP=116;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0160777;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.926;QD=16.549;RBI=0.0182504;REFB=-0.0135019;REVB=-0.00863637;RO=62;SAF=25;SAR=27;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658747;STB=0.532229;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.014152;OID=.;OPOS=27434483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:62:63:52:52:0.452174:27:25:34:28:27:25:34:29 chr10 27458898 . C A 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0352479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.777;QD=16.4269;RBI=0.0594912;REFB=-0.0188838;REVB=0.0479248;RO=11;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783488;STB=0.545372;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0122463;OID=.;OPOS=27458898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:6:5:6:5:6:5:6:5 chr10 27497191 . G A 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.035801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.958;QD=11.6341;RBI=0.053761;REFB=0.00480988;REVB=-0.0401065;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129195;STB=0.576773;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.0197459;OID=.;OPOS=27497191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:6:10:5:5:6:10 chr10 27499771 . G A 271.49 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0115425;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.771;QD=16.7072;RBI=0.0235618;REFB=-0.00874574;REVB=0.020541;RO=35;SAF=15;SAR=15;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136721;STB=0.507687;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00950619;OID=.;OPOS=27499771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:35:35:30:30:0.461538:15:15:17:18:15:15:17:18 chr10 27499804 . T C 314.35 PASS AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0166823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.533;QD=17.2245;RBI=0.0287547;REFB=-0.0172748;REVB=-0.0234208;RO=38;SAF=19;SAR=15;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030932;STB=0.510996;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0202167;OID=.;OPOS=27499804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:39:34:34:0.465753:15:19:20:18:15:19:21:18 chr10 27499979 . G T 178.86 PASS AF=0.6;AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0649579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7228;QD=23.8484;RBI=0.0706334;REFB=-0.0112192;REVB=0.0277408;RO=12;SAF=11;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34499;STB=0.672479;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00873724;OID=.;OPOS=27499979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:17:18:0.6:6:11:2:10:7:11:2:10 chr10 27506961 . G A 164.66 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0327253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.095;QD=9.54532;RBI=0.0354076;REFB=-0.0088411;REVB=0.0135186;RO=43;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268524;STB=0.625376;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0171208;OID=.;OPOS=27506961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:69:43:47:22:22:0.318841:9:13:15:28:9:13:19:28 chr10 27538071 . TG CA 182.78 PASS AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00203635;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=271.984;QD=9.74829;RBI=0.00569831;REFB=-0.00172863;REVB=0.00532203;RO=51;SAF=11;SAR=13;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142531;STB=0.508373;STBP=0.943;TYPE=mnp;VARB=0.00313649;OID=.;OPOS=27538071;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:51:51:24:24:0.32:13:11:24:27:13:11:24:27 chr10 27538204 . T C 169.79 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00269993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.788;QD=8.82012;RBI=0.00966317;REFB=-0.0184909;REVB=-0.00927833;RO=54;SAF=8;SAR=15;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141661;STB=0.58434;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.040121;OID=.;OPOS=27538204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:54:54:23:23:0.298701:15:8:25:29:15:8:25:29 chr10 27538569 . G A 739.13 PASS AF=0.605263;AO=68;DP=114;FAO=69;FDP=114;FR=.;FRO=45;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0330192;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2417;QD=25.9343;RBI=0.06669;REFB=-0.00555352;REVB=0.0579421;RO=46;SAF=40;SAR=28;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340219;STB=0.518667;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00327626;OID=.;OPOS=27538569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:46:45:68:69:0.605263:28:40:25:21:29:40:24:21 chr10 27538735 . G A 166.45 PASS AF=0.280488;AO=23;DP=82;FAO=23;FDP=82;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0520457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6651;QD=8.1195;RBI=0.053158;REFB=0.00517019;REVB=0.0108177;RO=58;SAF=13;SAR=10;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163993;STB=0.516634;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.010976;OID=.;OPOS=27538735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:58:59:23:23:0.280488:10:13:32:26:10:13:32:27 chr10 27539137 . T C 232.24 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0163027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.355;QD=23.8191;RBI=0.0251228;REFB=-0.00728671;REVB=0.0191149;RO=17;SAF=16;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376235;STB=0.520939;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00516072;OID=.;OPOS=27539137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:6:16:13:4:6:16:13:4 chr10 27539166 . G A 194.34 PASS AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00900023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.748;QD=24.293;RBI=0.0165974;REFB=0.00376223;REVB=0.0139453;RO=12;SAF=12;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263955;STB=0.526854;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.0023609;OID=.;OPOS=27539166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:12:13:19:19:0.59375:7:12:8:4:7:12:9:4 chr10 27624494 . G A 559.95 PASS AF=0.547368;AO=50;DP=93;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0330522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2578;QD=23.5769;RBI=0.0831153;REFB=-0.00827277;REVB=0.0762608;RO=43;SAF=26;SAR=24;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655733;STB=0.534964;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00744986;OID=.;OPOS=27624494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:43:43:50:52:0.547368:24:26:19:24:25:27:19:24 chr10 27687225 . A G 555.13 PASS AF=0.525253;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00691572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.534;QD=22.4293;RBI=0.0110163;REFB=-0.00442073;REVB=0.00857505;RO=47;SAF=31;SAR=21;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147784;STB=0.581446;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00427691;OID=.;OPOS=27687225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:47:47:52:52:0.525253:21:31:20:27:21:31:20:27 chr10 27687534 . C CT 47.17 PASS AF=0.416667;AO=9;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0734904;FXX=0.039984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.3978;QD=7.86111;RBI=0.105768;REFB=-0.0397129;REVB=-0.0760654;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128213;STB=0.5998;STBP=0.448;TYPE=ins;VARB=0.0454278;OID=.;OPOS=27687535;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.416667:9:24:10:24:14:6:4:6:8:46:14:5:4:6:8 chr10 27687775 . T C 1213.03 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0089494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.136;QD=59.9027;RBI=0.0102463;REFB=-0.0938636;REVB=-0.00498946;RO=0;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.85194e-08;STB=0.507935;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000357584;OID=.;OPOS=27687775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:31:49:0:0:31:49:0:1 chr10 27687965 . A G 52.05 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0807517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.125;QD=6.30917;RBI=0.081455;REFB=-0.0104124;REVB=0.0106804;RO=25;SAF=2;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246785;STB=0.660587;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0259485;OID=.;OPOS=27687965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:6:2:11:14:6:2:11:14 chr10 27692279 . A G 317.93 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00923419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.78;QD=15.5087;RBI=0.0103482;REFB=-0.00457152;REVB=0.00467074;RO=47;SAF=16;SAR=19;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758806;STB=0.542833;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00836192;OID=.;OPOS=27692279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:19:16:25:22:19:16:25:22 chr10 27702624 . G T 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0130689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.037;QD=10.634;RBI=0.0133196;REFB=-0.0164629;REVB=0.00257175;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442988;STB=0.776954;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0290136;OID=.;OPOS=27702624;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:1:7:7:6:1:7:7:6 chr10 27794104 . T G 193.22 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.000789963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.912;QD=16.4438;RBI=0.00800116;REFB=0.00405761;REVB=0.00796207;RO=27;SAF=6;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080528;STB=0.546294;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.00531077;OID=.;OPOS=27794104;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:14:6:10:17:14:6:10:17 chr10 28101455 . C A 775.13 PASS AF=0.524823;AO=73;DP=141;FAO=74;FDP=141;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0224431;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6097;QD=21.9895;RBI=0.0235012;REFB=-0.00219453;REVB=-0.00697241;RO=67;SAF=32;SAR=41;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047619;STB=0.528857;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00188297;OID=.;OPOS=28101455;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:67:67:73:74:0.524823:41:32:33:34:42:32:33:34 chr10 28224075 . G A 292.68 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00190927;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.569;QD=16.9669;RBI=0.00989796;REFB=0.00570511;REVB=0.00971207;RO=37;SAF=22;SAR=10;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170267;STB=0.509548;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00865602;OID=.;OPOS=28224075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:10:22:26:11:10:22:26:11 chr10 28228865 . A G 1305.44 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00983233;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.399;QD=62.1636;RBI=0.00984477;REFB=0;REVB=0.000494676;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40033e-05;OID=.;OPOS=28228865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:37:47:0:0:37:47:0:0 chr10 28228926 . C T 479.33 PASS AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0136066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.014;QD=22.5565;RBI=0.0138479;REFB=-0.0101023;REVB=-0.00257429;RO=38;SAF=24;SAR=22;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610836;STB=0.539309;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00744658;OID=.;OPOS=28228926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:38:39:46:46:0.541176:22:24:17:21:22:24:17:22 chr10 28260151 . A G 689.69 PASS AF=0.479167;AO=69;DP=144;FAO=69;FDP=144;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.000891489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.807;QD=19.1581;RBI=0.00580817;REFB=-0.0166648;REVB=-0.00573934;RO=75;SAF=30;SAR=39;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555915;STB=0.530765;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.014303;OID=.;OPOS=28260151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:75:75:69:69:0.479167:39:30:37:38:39:30:37:38 chr10 28378613 . G A 1881.81 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281613;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.727;QD=61.6986;RBI=0.0404375;REFB=0;REVB=-0.0403393;RO=0;SAF=63;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16135e-05;OID=.;OPOS=28378613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:59:63:0:0:59:63:0:0 chr10 28378758 . T C 1433.26 PASS AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0311586;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.208;QD=59.7192;RBI=0.0312601;REFB=-0.190824;REVB=0.00251677;RO=3;SAF=47;SAR=46;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101859;STB=0.505375;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.000418818;OID=.;OPOS=28378758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:96:96:3:3:93:93:0.96875:46:47:1:2:46:47:1:2 chr10 28909299 . GT G 784.38 PASS AF=1;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0589851;FXX=0.0441112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.2606;QD=48.2696;RBI=0.0683555;REFB=0;REVB=-0.0345432;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00186968;OID=.;OPOS=28909300;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:65:68:65:65:0:31:34:0:0:14:0:31:34:0:0 chr10 28970487 . C T 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00599765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.657;QD=58.142;RBI=0.0488614;REFB=0;REVB=-0.0484919;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000216642;OID=.;OPOS=28970487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr10 29163413 . G A 435.85 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0191619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.676;QD=54.4811;RBI=0.0217509;REFB=-0.0532189;REVB=-0.0102919;RO=1;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227606;STB=0.512187;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000480622;OID=.;OPOS=29163413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:20:11:0:1:20:11:0:1 chr10 29578084 . A G 937.56 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2601;QD=58.5972;RBI=0.0745371;REFB=0;REVB=-0.0737712;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000507038;OID=.;OPOS=29578084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0 chr10 29746346 . C CTGTT 195.81 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0210736;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=282.863;QD=17.8006;RBI=0.0255573;REFB=-0.00529677;REVB=0.0144596;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160183;STB=0.590821;STBP=0.302;TYPE=ins;VARB=0.00586505;OID=.;OPOS=29746347;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.454545:20:44:20:44:24:10:10:8:16:99:24:10:10:8:16 chr10 29747417 . C T 408.35 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00254192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.314;QD=20.4175;RBI=0.0193802;REFB=-0.0201387;REVB=0.0192128;RO=37;SAF=24;SAR=17;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00816661;STB=0.510633;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0176748;OID=.;OPOS=29747417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:39:41:41:0.5125:17:24:22:15:17:24:22:17 chr10 29754609 . T C 541.64 PASS AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=40;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00019419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.455;QD=24.9031;RBI=0.014088;REFB=0.000126797;REVB=0.0140867;RO=37;SAF=40;SAR=10;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187971;STB=0.603728;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-5.25809e-05;OID=.;OPOS=29754609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:10:40:23:14:10:40:23:14 chr10 29759225 . A G 363.26 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00984662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0232;QD=18.1628;RBI=0.0312058;REFB=-0.00101575;REVB=-0.0296115;RO=42;SAF=18;SAR=20;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042654;STB=0.523797;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.000538604;OID=.;OPOS=29759225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:20:18:18:24:20:18:18:24 chr10 29779936 . G A 118.32 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.024012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.222;QD=12.7912;RBI=0.0250993;REFB=-0.0114863;REVB=0.00730762;RO=23;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230725;STB=0.637465;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0208476;OID=.;OPOS=29779936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:11:3:9:14:11:3:9:14 chr10 29783885 . A G 1069.99 PASS AF=0.83871;AO=78;DP=93;FAO=78;FDP=93;FR=.;FRO=15;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0106661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.241;QD=46.0211;RBI=0.0135134;REFB=-0.00892466;REVB=-0.00829733;RO=15;SAF=38;SAR=40;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139888;STB=0.507444;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.00121157;OID=.;OPOS=29783885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:93:93:15:15:78:78:0.83871:40:38:8:7:40:38:8:7 chr10 29783908 . A G 179.14 PASS AF=0.25;AO=27;DP=108;FAO=27;FDP=108;FR=.;FRO=81;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=-0.0266649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.41;QD=6.6348;RBI=0.0390095;REFB=-0.00800446;REVB=-0.0284732;RO=81;SAF=16;SAR=11;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122968;STB=0.57453;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0334407;OID=.;OPOS=29783908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:81:81:27:27:0.25:11:16:40:41:11:16:40:41 chr10 29784072 . G C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.878;QD=58.1421;RBI=0.051156;REFB=0;REVB=0.0503096;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206986;OID=.;OPOS=29784072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr10 29784114 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.343;QD=55.0982;RBI=0.0526912;REFB=0;REVB=-0.013198;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291914;OID=.;OPOS=29784114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr10 29812602 . G T 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.542;QD=60.7162;RBI=0.0146267;REFB=0;REVB=-0.00648198;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11399e-05;OID=.;OPOS=29812602;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chr10 29812889 . G A 177.44 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0311776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.354;QD=21.5084;RBI=0.0394079;REFB=0.0111562;REVB=-0.0241027;RO=15;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00940499;STB=0.505294;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=-0.00927094;OID=.;OPOS=29812889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:11:7:6:9:11:7:6:9 chr10 29821089 . C T 1669.44 PASS AF=0.957983;AO=113;DP=120;FAO=114;FDP=119;FR=.;FRO=5;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.012978;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.484;QD=56.1156;RBI=0.02517;REFB=-0.0657535;REVB=0.0215662;RO=1;SAF=60;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784829;STB=0.513727;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00113716;OID=.;OPOS=29821089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:120:119:1:5:113:114:0.957983:53:60:1:0:54:60:1:4 chr10 29821523 . T C 870.36 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00250515;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5709;QD=56.1524;RBI=0.0180083;REFB=-0.105885;REVB=-0.0178332;RO=1;SAF=33;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140901;STB=0.50746;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00189078;OID=.;OPOS=29821523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:28:33:1:0:28:33:1:0 chr10 29822032 . C T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.615;QD=58.5877;RBI=0.0215581;REFB=0;REVB=0.0156212;RO=0;SAF=30;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237217;OID=.;OPOS=29822032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:3:30:0:0:3:30:0:0 chr10 29822159 . T C 1219.31 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.010009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.47;QD=58.7619;RBI=0.0134624;REFB=0.0274516;REVB=-0.00900309;RO=2;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220125;STB=0.511625;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.000291077;OID=.;OPOS=29822159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:83:83:2:2:81:81:0.975904:42:39:0:2:42:39:0:2 chr10 29833998 . A G 224.58 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0115637;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.481;QD=14.7268;RBI=0.0117818;REFB=-0.0104583;REVB=-0.00225645;RO=38;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273486;STB=0.524571;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0187844;OID=.;OPOS=29833998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:61:38:35:26:26:0.42623:13:13:18:20:13:13:16:19 chr10 29834003 . G A 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0136478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.048;QD=12.7241;RBI=0.0217745;REFB=-0.0298932;REVB=-0.0169666;RO=36;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359884;STB=0.520692;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0212795;OID=.;OPOS=29834003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:12:11:16:20:12:11:16:20 chr10 29839787 . A G 228.92 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0096205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.294;QD=16.0643;RBI=0.0163157;REFB=-0.00341437;REVB=0.0131775;RO=31;SAF=6;SAR=20;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416499;STB=0.736354;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00326861;OID=.;OPOS=29839787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:20:6:20:11:20:6:20:11 chr10 29839798 . A G 320.02 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0142366;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.028;QD=20.9847;RBI=0.016841;REFB=-0.0239221;REVB=-0.00899652;RO=28;SAF=20;SAR=13;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288949;STB=0.659461;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0238983;OID=.;OPOS=29839798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:28:28:33:33:0.540984:13:20:7:21:13:20:7:21 chr10 29839864 . A C 1641.78 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5215;QD=60.2488;RBI=0.0435683;REFB=0;REVB=-0.0423222;RO=0;SAF=43;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69419e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273386;OID=.;OPOS=29839864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:66:43:0:0:66:43:0:0 chr10 29840038 . A G 496.93 PASS AF=0.45;AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=-0.0192192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.067;QD=16.5642;RBI=0.0211239;REFB=-0.0186194;REVB=-0.00876594;RO=66;SAF=23;SAR=31;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032428;STB=0.518077;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0189974;OID=.;OPOS=29840038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:66:66:54:54:0.45:31:23:26:40:31:23:26:40 chr10 29840164 . A G 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0262441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.914;QD=15.8821;RBI=0.0328803;REFB=-0.00883738;REVB=-0.0198081;RO=10;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414935;STB=0.739926;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00704929;OID=.;OPOS=29840164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:3:7:2:8:3:7:2:8 chr10 29843833 . C T 219.03 PASS AF=0.458333;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0106201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1124;QD=18.2529;RBI=0.056597;REFB=-0.0262877;REVB=-0.0555917;RO=25;SAF=5;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265213;STB=0.650752;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0291381;OID=.;OPOS=29843833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:25:26:21:22:0.458333:16:5:12:13:17:5:12:14 chr10 30306804 . G A 191.03 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0196115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.234;QD=13.4057;RBI=0.0208685;REFB=0.0163787;REVB=-0.00713304;RO=34;SAF=18;SAR=5;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305568;STB=0.677251;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.0227657;OID=.;OPOS=30306804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:5:18:18:16:5:18:18:16 chr10 30316072 . C G 373.12 PASS AF=0.458824;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0314618;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2028;QD=17.5588;RBI=0.0320906;REFB=-0.0134373;REVB=-0.00632157;RO=46;SAF=28;SAR=11;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262309;STB=0.514698;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0151949;OID=.;OPOS=30316072;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:46:46:39:39:0.458824:11:28:32:14:11:28:32:14 chr10 30317949 . C T 478.79 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0116621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.876;QD=25.1996;RBI=0.0140283;REFB=-0.0147559;REVB=-0.00779671;RO=30;SAF=22;SAR=23;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897313;STB=0.554815;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00940535;OID=.;OPOS=30317949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:30:31:45:45:0.592105:23:22:11:19:23:22:11:20 chr10 30629226 . G A 157.02 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00223127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.12;QD=16.1043;RBI=0.0122141;REFB=-0.00338771;REVB=0.0120086;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279872;STB=0.51611;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0058503;OID=.;OPOS=30629226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:5:12:15:7:5:12:15:7 chr10 30728101 . T C 389.16 PASS AF=0.427184;AO=44;DP=103;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0061804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.725;QD=15.1131;RBI=0.0520352;REFB=-0.00181204;REVB=0.0516669;RO=57;SAF=19;SAR=25;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110483;STB=0.504725;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00279554;OID=.;OPOS=30728101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:57:59:44:44:0.427184:25:19:24:33:25:19:25:34 chr10 30728250 . A G 547.99 PASS AF=0.495652;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0107412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.784;QD=19.0604;RBI=0.0108304;REFB=-0.0239718;REVB=-0.00138711;RO=58;SAF=28;SAR=29;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707931;STB=0.539106;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0265418;OID=.;OPOS=30728250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:58:58:57:57:0.495652:29:28:24:34:29:28:24:34 chr10 30901756 . G A 190.27 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0103074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.561;QD=21.7448;RBI=0.0227082;REFB=-0.0301294;REVB=-0.0202341;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295473;STB=0.516599;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0217596;OID=.;OPOS=30901756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:10:9:7:9:10:9:7:9 chr10 30918549 . G C 533.5 PASS AF=0.388889;AO=61;DP=161;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=0.00313876;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.5;QD=13.1728;RBI=0.0127992;REFB=-0.00287017;REVB=-0.0124084;RO=99;SAF=30;SAR=31;SRF=56;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806575;STB=0.535311;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00423621;OID=.;OPOS=30918549;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:99:99:61:63:0.388889:31:30:56:43:31:32:56:43 chr10 30918597 . T C 319.21 PASS AF=0.328;AO=41;DP=125;FAO=41;FDP=125;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0294898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.119;QD=10.2146;RBI=0.0304032;REFB=0.0112717;REVB=-0.00739671;RO=84;SAF=24;SAR=17;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00242757;STB=0.501406;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=-0.0219687;OID=.;OPOS=30918597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:84:84:41:41:0.328:17:24:49:35:17:24:49:35 chr10 30989188 . G C 1531.39 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.063;QD=63.8077;RBI=0.0634506;REFB=0;REVB=-0.00134825;RO=0;SAF=44;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.35233e-05;OID=.;OPOS=30989188;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:96:0:0:94:96:1:50:44:0:0:50:46:0:0 chr10 30993404 . G A 412.7 PASS AF=0.639344;AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0771683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1574;QD=27.0621;RBI=0.0771753;REFB=-0.00332661;REVB=-0.00103878;RO=22;SAF=22;SAR=17;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143478;STB=0.577991;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00358686;OID=.;OPOS=30993404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:22:22:39:39:0.639344:17:22:17:5:17:22:17:5 chr10 30993413 . T G 166.39 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00255919;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.354;QD=11.4749;RBI=0.00317504;REFB=-0.0153881;REVB=-0.00187921;RO=38;SAF=17;SAR=4;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312867;STB=0.690853;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0235561;OID=.;OPOS=30993413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:58:38:37:21:21:0.362069:4:17:22:16:4:17:21:16 chr10 30993448 . G A 902.69 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.39;QD=58.2379;RBI=0.0331576;REFB=0;REVB=0.02454;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101505;OID=.;OPOS=30993448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:22:40:0:0:22:40:0:0 chr10 31001494 . A C 275.27 PASS AF=0.537037;AO=25;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00150975;FXX=0.0181785;HRUN=7;LEN=1;MLLD=68.2425;QD=20.3906;RBI=0.0137277;REFB=0.00688754;REVB=0.0136444;RO=17;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00560647;STB=0.50773;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.0355544;OID=.;OPOS=31001494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:17:25:25:29:0.537037:9:16:11:6:10:19:16:9 chr10 31651824 . T C 191.54 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0209432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.385;QD=22.5346;RBI=0.0210434;REFB=-0.00756867;REVB=-0.00205142;RO=15;SAF=10;SAR=9;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203087;STB=0.613382;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00568937;OID=.;OPOS=31651824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:9:10:4:11:9:10:4:11 chr10 31816596 . C T 376.42 PASS AF=0.425532;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.0256089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1234;QD=16.0179;RBI=0.0274014;REFB=-0.00342059;REVB=-0.00974795;RO=54;SAF=30;SAR=10;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127619;STB=0.57233;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00373773;OID=.;OPOS=31816596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:54:40:40:0.425532:10:30:35:19:10:30:35:19 chr10 32045045 . A C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.35;QD=59.0187;RBI=0.0337326;REFB=0;REVB=0.018437;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167283;OID=.;OPOS=32045045;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr10 32095666 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00869383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.96;QD=61.684;RBI=0.0142917;REFB=0;REVB=-0.0113433;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.82379e-06;OID=.;OPOS=32095666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr10 32120677 . TC T,TT 564.46 PASS AF=0.0263158,0.973684;AO=6,32;DP=39;FAO=1,37;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,18;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216578,-0.0308892;FXX=0.0256345;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=24.7084,36.4629;QD=59.4164;RBI=0.0366739,0.117842;REFB=0,0;REVB=0.0295959,0.113721;RO=0;SAF=1,18;SAR=5,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.127079,0.00993328;OID=.,.;OPOS=32120678,32120678;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0263158,0.973684:6,32:39:1,37:38:0:1,18:0,19:0:0:5:0:1,18:5,14:0:0 chr10 32128611 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.423;QD=54.5177;RBI=0.0282112;REFB=0;REVB=0.0127474;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13554e-05;OID=.;OPOS=32128611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr10 32141460 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.94;QD=58.0611;RBI=0.034939;REFB=0;REVB=0.032259;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41511e-05;OID=.;OPOS=32141460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0 chr10 32345710 . G A 2439.83 PASS AF=0.993789;AO=160;DP=161;FAO=160;FDP=161;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.392;QD=60.617;RBI=0.0156643;REFB=-0.0877044;REVB=-0.00506837;RO=1;SAF=82;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576741;STB=0.50303;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0013887;OID=.;OPOS=32345710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:161:161:1:1:160:160:0.993789:78:82:1:0:78:82:1:0 chr10 32974969 . A G 428.97 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750682;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.7426;QD=57.196;RBI=0.0304309;REFB=0;REVB=0.0294905;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510875;OID=.;OPOS=32974969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:19:10:0:0:20:10:0:0 chr10 33018351 . G C 1975.63 PASS AF=1;AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024674;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.077;QD=62.2245;RBI=0.0247019;REFB=0;REVB=-0.00117409;RO=0;SAF=66;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.97965e-05;OID=.;OPOS=33018351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:127:0:0:127:127:1:61:66:0:0:60:67:0:0 chr10 33123824 . G C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.459;QD=60.6103;RBI=0.0308352;REFB=0;REVB=0.0109263;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123305;OID=.;OPOS=33123824;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr10 33143396 . G A 1001.57 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00246053;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3235;QD=59.7954;RBI=0.00275138;REFB=0;REVB=-0.0012312;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000820178;OID=.;OPOS=33143396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0 chr10 33190285 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.042;QD=48.7369;RBI=0.0314972;REFB=0;REVB=0.030028;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156741;OID=.;OPOS=33190285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr10 33190567 . C A 498.62 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=391.402;QD=58.6616;RBI=0.014485;REFB=0;REVB=-0.000618488;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36394e-05;OID=.;OPOS=33190567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:24:9:0:0:25:9:0:0 chr10 33209266 . G T 1268.12 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142536;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.851;QD=61.8595;RBI=0.0236658;REFB=0;REVB=0.018892;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49254e-05;OID=.;OPOS=33209266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0 chr10 33214802 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.654;QD=61.6834;RBI=0.0732617;REFB=0;REVB=0.0670337;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566462;OID=.;OPOS=33214802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr10 33466566 . C T 1043.67 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.55;QD=59.6382;RBI=0.0346959;REFB=0;REVB=0.000722685;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48108e-05;OID=.;OPOS=33466566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:32:37:0:0:32:38:0:0 chr10 33466843 . T C 279.61 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0227868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8233;QD=48.6276;RBI=0.0613502;REFB=-0.0795553;REVB=0.0569614;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519982;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0046486;OID=.;OPOS=33466843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:23:23:0:1:22:22:0.956522:12:10:0:0:12:10:0:1 chr10 33468014 . T C 725.38 PASS AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0244161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.301;QD=59.215;RBI=0.040151;REFB=-0.176957;REVB=0.0318741;RO=2;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447272;STB=0.523799;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0020609;OID=.;OPOS=33468014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:49:49:2:2:47:47:0.959184:20:27:0:2:20:27:0:2 chr10 33469181 . A G 1029.68 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545679;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.005;QD=59.6919;RBI=0.0570588;REFB=0;REVB=0.0166748;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149378;OID=.;OPOS=33469181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:33:36:0:0 chr10 33495267 . C T 1343.88 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0525404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.783;QD=61.0856;RBI=0.0528942;REFB=-0.05184;REVB=0.00610771;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000311359;OID=.;OPOS=33495267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:88:0:1:86:87:0.988636:45:41:0:0:46:41:0:1 chr10 33502240 . C T 1698.24 PASS AF=1;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508701;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9227;QD=60.6513;RBI=0.0509397;REFB=0;REVB=0.00266092;RO=0;SAF=70;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56796e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170063;OID=.;OPOS=33502240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:112:0:0:112:112:1:42:70:0:0:42:70:0:0 chr10 33510663 . G A 1556.48 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.293;QD=59.8645;RBI=0.0279149;REFB=0;REVB=0.0208714;RO=0;SAF=62;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82812e-05;OID=.;OPOS=33510663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:42:62:0:0:42:62:0:0 chr10 33510768 . G A 1126.84 PASS AF=1;AO=65;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00370377;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.76;QD=58.5373;RBI=0.0503025;REFB=0;REVB=0.0501659;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031235;OID=.;OPOS=33510768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:77:0:0:65:77:1:25:40:0:0:35:42:0:0 chr10 33552695 . CA CG,TG 1458.69 PASS AF=0.416667,0.583333;AO=40,56;DP=96;FAO=40,56;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=20,34;FSAR=20,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315933,-0.0101976;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=55.4274,306.425;QD=60.7786;RBI=0.0317256,0.0111873;REFB=0,0;REVB=0.00289486,-0.00460048;RO=0;SAF=20,34;SAR=20,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.43892e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00773205,0.00198272;OID=.,.;OPOS=33552696,33552695;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:96:96:0:0:40,56:40,56:0.416667,0.583333:20,22:20,34:0:0:20,22:20,34:0:0 chr10 34591402 . C T 575.49 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0746;QD=60.5778;RBI=0.0685533;REFB=0;REVB=-0.0265501;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000670586;OID=.;OPOS=34591402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0 chr10 34620220 . C T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.374;QD=58.9625;RBI=0.0278673;REFB=0;REVB=-0.0013266;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.54483e-05;OID=.;OPOS=34620220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr10 34688287 . G A 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00133998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0452;QD=57.545;RBI=0.050122;REFB=0;REVB=-0.0501041;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000409931;OID=.;OPOS=34688287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr10 35302705 . C T 168.69 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.048357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.315;QD=16.0652;RBI=0.0502975;REFB=-0.0367101;REVB=-0.0138363;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137426;STB=0.57886;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.021701;OID=.;OPOS=35302705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:14:10:10:8:14:10 chr10 35321414 . C T 170.34 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0157811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.577;QD=17.0335;RBI=0.0173985;REFB=-0.00281026;REVB=-0.00732566;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584155;STB=0.56243;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00438581;OID=.;OPOS=35321414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:22:18:18:0.45:7:11:11:9:7:11:11:11 chr10 35338699 . G A 288.82 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.00224257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.075;QD=16.2714;RBI=0.0062523;REFB=0.00104854;REVB=-0.00583627;RO=39;SAF=19;SAR=13;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250234;STB=0.640364;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00103085;OID=.;OPOS=35338699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:13:19:13:26:13:19:13:26 chr10 35362977 . A G 175.26 PASS AF=0.328571;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0203391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.022;QD=10.0149;RBI=0.0288939;REFB=-0.0168903;REVB=-0.0205225;RO=46;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125509;STB=0.581061;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0203059;OID=.;OPOS=35362977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:46:47:23:23:0.328571:14:9:23:23:14:9:24:23 chr10 35426755 . A G 361.51 PASS AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0189342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.944;QD=20.6575;RBI=0.0189589;REFB=-0.0104473;REVB=0.000966519;RO=33;SAF=20;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475045;STB=0.526302;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0109508;OID=.;OPOS=35426755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:17:20:16:17:17:20:16:17 chr10 35464778 . C T 273.69 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.00739448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.312;QD=17.6572;RBI=0.00762434;REFB=-0.00925778;REVB=-0.00185802;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112499;STB=0.581604;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00899933;OID=.;OPOS=35464778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:32:30:30:0.483871:17:13:9:20:17:13:9:23 chr10 35772402 . G A 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00909534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.302;QD=23.5282;RBI=0.0241877;REFB=-0.0145572;REVB=-0.0224125;RO=15;SAF=7;SAR=13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720767;STB=0.540154;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0129565;OID=.;OPOS=35772402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:13:7:4:11:13:7:4:11 chr10 36723415 . C A 1265.54 PASS AF=1;AO=78;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109682;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.854;QD=61.7338;RBI=0.040637;REFB=0;REVB=-0.0406222;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714787;OID=.;OPOS=36723415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:78:82:1:46:32:0:0:50:32:0:0 chr10 36812362 . C T 1688.49 PASS AF=0.974359;AO=113;DP=116;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0150936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9619;QD=57.7262;RBI=0.0258986;REFB=0.0166791;REVB=-0.0210457;RO=3;SAF=60;SAR=53;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00668864;STB=0.503609;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.000443795;OID=.;OPOS=36812362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:116:117:3:3:113:114:0.974359:53:60:2:1:54:60:2:1 chr10 37447358 . T G 234.17 PASS AF=0.333333;AO=29;DP=87;FAO=29;FDP=87;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.00202879;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.314;QD=10.7662;RBI=0.00512569;REFB=0.000956824;REVB=0.0047071;RO=58;SAF=12;SAR=17;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138452;STB=0.580564;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00195093;OID=.;OPOS=37447358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:58:58:29:29:0.333333:17:12:31:27:17:12:31:27 chr10 37451617 . T C 862.37 PASS AF=0.439252;AO=94;DP=214;FAO=94;FDP=214;FR=.;FRO=120;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=63;FSRR=57;FWDB=0.00289236;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.23;QD=16.119;RBI=0.00340318;REFB=-0.0117593;REVB=-0.00179328;RO=120;SAF=54;SAR=40;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505588;STB=0.528125;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0135363;OID=.;OPOS=37451617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:120:120:94:94:0.439252:40:54:63:57:40:54:63:57 chr10 37488689 . G C 580.13 PASS AF=0.424837;AO=65;DP=153;FAO=65;FDP=153;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=-0.0238449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.007;QD=15.1668;RBI=0.0267716;REFB=-0.0183364;REVB=-0.0121713;RO=88;SAF=22;SAR=43;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150133;STB=0.584262;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0188123;OID=.;OPOS=37488689;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:88:88:65:65:0.424837:43:22:42:46:43:22:42:46 chr10 37505141 . G A 182.1 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0337879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.706;QD=16.9392;RBI=0.0344985;REFB=-0.0329258;REVB=-0.006966;RO=24;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274918;STB=0.656168;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0252982;OID=.;OPOS=37505141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:11:8:17:7:11:8:17:7 chr10 37505192 . C T 344.29 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0119783;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.957;QD=18.6105;RBI=0.0121823;REFB=-0.0146858;REVB=-0.00221993;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100928;STB=0.540069;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0212065;OID=.;OPOS=37505192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:74:36:38:36:36:0.486486:17:19:23:13:17:19:23:15 chr10 37508450 . A C 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0586661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.502;QD=20.156;RBI=0.0596402;REFB=-0.0152785;REVB=0.0107352;RO=24;SAF=7;SAR=21;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334986;STB=0.680276;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00783809;OID=.;OPOS=37508450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:25:28:28:0.528302:21:7:15:9:21:7:15:10 chr10 37891465 . G T 227.14 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0810132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7439;QD=21.1289;RBI=0.0900311;REFB=0.0260682;REVB=0.0392742;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228018;STB=0.512809;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.0279261;OID=.;OPOS=37891465;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:12:10:9:12:12:10:9:12 chr10 37891576 . G A 341.83 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0387598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.804;QD=18.4776;RBI=0.05848;REFB=0.0114914;REVB=0.0437903;RO=38;SAF=13;SAR=23;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459235;STB=0.525564;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.0125931;OID=.;OPOS=37891576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:23:13:12:26:23:13:12:26 chr10 38344700 . C G 269.11 PASS AF=0.520833;AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0140412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.156;QD=22.4261;RBI=0.0141258;REFB=-0.0152023;REVB=0.00154406;RO=23;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103053;STB=0.548635;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0107949;OID=.;OPOS=38344700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:23:23:24:25:0.520833:10:14:16:7:10:15:16:7 chr10 38407519 . A G 158.05 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00997917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.497;QD=25.2874;RBI=0.010084;REFB=-0.014105;REVB=0.00145034;RO=9;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154841;STB=0.50866;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00635141;OID=.;OPOS=38407519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:11:5:3:6:11:5:3:6 chr10 38645403 . T C 512.4 PASS AF=0.458333;AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00169436;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.866;QD=17.0801;RBI=0.00591069;REFB=-0.0280134;REVB=-0.00566264;RO=65;SAF=25;SAR=30;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00823644;STB=0.504585;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0253199;OID=.;OPOS=38645403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:65:65:55:55:0.458333:30:25:29:36:30:25:29:36 chr10 38672144 . A C 287.57 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0139294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.244;QD=15.9762;RBI=0.0166135;REFB=-0.00751561;REVB=0.00905425;RO=39;SAF=10;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13174;STB=0.568921;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00774596;OID=.;OPOS=38672144;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:39:40:32:32:0.444444:22:10:17:22:22:10:17:23 chr10 38740000 . T C 107.4 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.106553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.892;QD=12.6356;RBI=0.107857;REFB=-0.00653569;REVB=-0.016721;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126383;STB=0.581958;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0126811;OID=.;OPOS=38740000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:21:13:13:0.382353:9:4:8:11:9:4:9:12 chr10 38740029 . C T 66.13 PASS AF=0.321429;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0124372;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.013;QD=9.44722;RBI=0.013061;REFB=-0.0234479;REVB=0.00398802;RO=21;SAF=1;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466663;STB=0.761192;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0337006;OID=.;OPOS=38740029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:30:28:21:19:9:9:0.321429:8:1:9:12:8:1:7:12 chr10 38740050 . C T 53.99 PASS AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0105069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.942;QD=8.30592;RBI=0.0115729;REFB=-0.00532663;REVB=-0.0048515;RO=18;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39729;STB=0.755988;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0267547;OID=.;OPOS=38740050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:7:1:7:11:7:1:7:11 chr10 38740353 . T C 68.87 PASS AF=0.181818;AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=-0.0422327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.954;QD=4.17378;RBI=0.0422919;REFB=-0.00329122;REVB=0.00223606;RO=54;SAF=7;SAR=5;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110201;STB=0.571694;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0142959;OID=.;OPOS=38740353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:66:66:54:54:12:12:0.181818:5:7:36:18:5:7:36:18 chr10 38740382 . T C 141.06 PASS AF=0.28169;AO=20;DP=71;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0172019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.157;QD=7.94686;RBI=0.0180723;REFB=-0.00857254;REVB=0.00554108;RO=51;SAF=11;SAR=9;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949765;STB=0.556779;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0174783;OID=.;OPOS=38740382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:51:51:20:20:0.28169:9:11:32:19:9:11:32:19 chr10 38740546 . G T 283.65 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.023785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.646;QD=19.9052;RBI=0.0238466;REFB=-0.0181311;REVB=0.00171372;RO=26;SAF=5;SAR=25;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137199;STB=0.571377;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0144977;OID=.;OPOS=38740546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:27:30:30:0.526316:25:5:7:19:25:5:7:20 chr10 38740590 . A G 88.45 PASS AF=0.478261;AO=9;DP=21;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00805391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.659;QD=15.3829;RBI=0.0112507;REFB=-0.00137879;REVB=-0.00785572;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645154;STB=0.566257;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00373263;OID=.;OPOS=38740590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:21:23:11:12:9:11:0.478261:7:2:3:8:7:4:3:9 chr10 42907201 . G A 626.15 PASS AF=0.570093;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00752639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.381;QD=23.4073;RBI=0.011648;REFB=-0.00374039;REVB=-0.00888986;RO=46;SAF=24;SAR=37;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00176281;STB=0.500963;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00289969;OID=.;OPOS=42907201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:46:46:61:61:0.570093:37:24:18:28:37:24:18:28 chr10 42907260 . T C 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0234891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.81;QD=13.6197;RBI=0.0267187;REFB=-0.00232505;REVB=-0.0127339;RO=38;SAF=8;SAR=18;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211603;STB=0.621386;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00323497;OID=.;OPOS=42907260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:18:8:19:19:18:8:19:19 chr10 42920832 . G A 312.24 PASS AF=0.532258;AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0174796;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.311;QD=20.1446;RBI=0.0175825;REFB=-0.00618178;REVB=-0.0018995;RO=29;SAF=20;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955409;STB=0.558246;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00643959;OID=.;OPOS=42920832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:32:33:0.532258:12:20:15:14:12:21:15:14 chr10 42920884 . C T 224.65 PASS AF=0.564103;AO=20;DP=41;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00343251;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9284;QD=23.0412;RBI=0.0127067;REFB=-0.010507;REVB=0.0122343;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256977;STB=0.648014;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0407887;OID=.;OPOS=42920884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:39:21:17:20:22:0.564103:6:14:9:12:8:14:5:12 chr10 42941685 . T TA 30.75 PASS AF=0.272727;AO=5;DP=31;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0706399;FXX=0.185117;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.316;QD=5.59131;RBI=0.0859733;REFB=0.0553224;REVB=0.0490043;RO=25;SAF=4;SAR=1;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675667;STB=0.594887;STBP=0.675;TYPE=ins;VARB=-0.166424;OID=.;OPOS=42941686;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.272727:5:31:6:22:16:5:1:12:4:30:25:4:1:19:6 chr10 42949664 . A T 274.11 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0199786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3371;QD=19.579;RBI=0.0202666;REFB=-0.0224947;REVB=-0.00340484;RO=25;SAF=15;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069222;STB=0.518506;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0309735;OID=.;OPOS=42949664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:27:29:29:0.517857:14:15:15:10:14:15:15:12 chr10 42965636 . C T 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00510438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.251;QD=16.0641;RBI=0.0404518;REFB=-0.00365886;REVB=-0.0401285;RO=27;SAF=11;SAR=15;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494418;STB=0.520151;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0117145;OID=.;OPOS=42965636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:31:26:26:0.45614:15:11:10:17:15:11:12:19 chr10 43281089 . T C 323.82 PASS AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00517706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.309;QD=14.3921;RBI=0.00844477;REFB=-0.0198285;REVB=-0.00667174;RO=54;SAF=16;SAR=20;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393967;STB=0.522376;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0253503;OID=.;OPOS=43281089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:20:16:26:28:20:16:26:28 chr10 43292647 . A G 43.68 PASS AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0212031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8356;QD=21.8422;RBI=0.0700432;REFB=-0.0679099;REVB=0.0667568;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173071;STB=0.599697;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0350473;OID=.;OPOS=43292647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:0:2:4:2:0:2 chr10 43606687 . A G 3930.09 PASS AF=1;AO=247;DP=248;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168698;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.082;QD=60.6963;RBI=0.0170951;REFB=0;REVB=-0.00276634;RO=0;SAF=110;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108098;OID=.;OPOS=43606687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:248:259:0:0:247:259:1:137:110:0:0:137:122:0:0 chr10 43690189 . G A 1731.31 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.577;QD=60.7476;RBI=0.0215961;REFB=0;REVB=0.0111819;RO=0;SAF=54;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84263e-05;OID=.;OPOS=43690189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:60:54:0:0:60:54:0:0 chr10 43691691 . C T 483.29 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8057;QD=58.5804;RBI=0.0641714;REFB=0;REVB=-0.0333333;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392113;OID=.;OPOS=43691691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0 chr10 43837352 . A G 621.38 PASS AF=0.978723;AO=43;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00204898;FXX=0.0961354;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.808;QD=52.883;RBI=0.031734;REFB=0.0572368;REVB=0.0316678;RO=1;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034749;STB=0.517234;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=3.7222e-05;OID=.;OPOS=43837352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:47:1:1:43:46:0.978723:13:30:0:1:14:32:0:1 chr10 43978087 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00231378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6441;QD=59.0177;RBI=0.0117787;REFB=0;REVB=0.0115492;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168549;OID=.;OPOS=43978087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr10 44285777 . T C 220.58 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0250246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.995;QD=14.2308;RBI=0.0264009;REFB=0.0143386;REVB=0.00841287;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253934;STB=0.642758;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00617281;OID=.;OPOS=44285777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:12:14:28:8:12:14:28:8 chr10 44788758 . G A 1181.04 PASS AF=0.559406;AO=112;DP=201;FAO=113;FDP=202;FR=.;FRO=89;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=0.00487568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.333;QD=23.387;RBI=0.00745229;REFB=-0.000388488;REVB=-0.00563599;RO=89;SAF=52;SAR=60;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097368;STB=0.550642;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.000342281;OID=.;OPOS=44788758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:89:89:112:113:0.559406:60:52:52:37:60:53:52:37 chr10 44793299 . C T 380.99 PASS AF=0.4875;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00297833;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.356;QD=19.0496;RBI=0.0282026;REFB=-0.0228197;REVB=-0.0280449;RO=41;SAF=18;SAR=21;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466948;STB=0.525998;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0240626;OID=.;OPOS=44793299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:41:41:39:39:0.4875:21:18:21:20:21:18:21:20 chr10 44865770 . T C 277.1 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0106332;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.043;QD=20.5258;RBI=0.0338105;REFB=-0.0116565;REVB=-0.0320949;RO=25;SAF=13;SAR=16;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144557;STB=0.58;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00843547;OID=.;OPOS=44865770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:16:13:7:18:16:13:7:18 chr10 45430462 . C T 403.76 PASS AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00296144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.146;QD=22.1241;RBI=0.0209596;REFB=-0.0153549;REVB=-0.0207493;RO=32;SAF=24;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824198;STB=0.539306;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0144406;OID=.;OPOS=45430462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:32:33:40:40:0.547945:16:24:16:16:16:24:17:16 chr10 45467099 . C T 400.25 PASS AF=0.435644;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00457117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.371;QD=15.8514;RBI=0.00580145;REFB=-0.0088537;REVB=-0.00357228;RO=57;SAF=26;SAR=18;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101398;STB=0.556947;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0093629;OID=.;OPOS=45467099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:57:44:44:0.435644:18:26:28:29:18:26:28:29 chr10 45473317 . C T 336.83 PASS AF=0.376147;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0150366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.916;QD=12.3606;RBI=0.0202232;REFB=-0.0244141;REVB=0.0135232;RO=66;SAF=15;SAR=26;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212462;STB=0.612541;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0404275;OID=.;OPOS=45473317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:66:68:41:41:0.376147:26:15:37:29:26:15:37:31 chr10 45496120 . A T 1276.94 PASS AF=0.915094;AO=94;DP=106;FAO=97;FDP=106;FR=.;FRO=9;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0613797;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8058;QD=48.1863;RBI=0.0805185;REFB=-0.161664;REVB=0.052113;RO=11;SAF=45;SAR=49;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022828;STB=0.502536;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0138166;OID=.;OPOS=45496120;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:106:106:11:9:94:97:0.915094:49:45:4:7:51:46:4:5 chr10 45499799 . T A,C 435.77 PASS AF=0.0967742,0.903226;AO=3,28;DP=31;FAO=3,28;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=3,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033959,0.080192;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=51.935,92.5195;QD=56.2283;RBI=0.035155,0.0808023;REFB=0,0;REVB=-0.00909212,-0.00991263;RO=0;SAF=0,10;SAR=3,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00846346,-0.000142591;OID=.,.;OPOS=45499799,45499799;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:31:31:0:0:3,28:3,28:0.0967742,0.903226:3,18:0,10:0:0:3,18:0,10:0:0 chr10 45499886 . TC T,TT 86.64 PASS AF=0.407407,0;AO=11,2;DP=29;FAO=11,0;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2,0;FSAR=9,0;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0146696,0.023643;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=301.83,298.432;QD=12.8359;RBI=0.0156949,0.0246186;REFB=-0.00160781,-0.000369315;REVB=0.00557973,0.00686166;RO=16;SAF=2,0;SAR=9,2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.37532,-0.534299;STB=0.725348,0.5;STBP=0.086,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00208556,0;OID=.,.;OPOS=45499887,45499887;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407407,0:11,2:29:11,0:27:16:2,0:9,0:8:8:85:16:2,0:9,2:8:8 chr10 45499897 . A AAAAATT 248.28 PASS AF=1;AO=20;DP=25;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000320356;FXX=0.0951928;HRUN=6;LEN=6;MLLD=324.374;QD=52.2695;RBI=0.00929161;REFB=0;REVB=-0.00928609;RO=5;SAF=4;SAR=16;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276821;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=2.02594e-05;OID=.;OPOS=45499898;OREF=-;OALT=AAAATT;OMAPALT=AAAAATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:25:19:19:0:4:15:0:0:4:5:4:16:4:1 chr10 45499974 . A G 94.31 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0486208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.462;QD=20.9572;RBI=0.053148;REFB=-0.0562434;REVB=0.0214644;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795615;STB=0.545372;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0231797;OID=.;OPOS=45499974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:3:4:5:6:3:4 chr10 45500221 . A G 324.8 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0174162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.885;QD=17.0948;RBI=0.0177801;REFB=-0.0086513;REVB=-0.00357849;RO=41;SAF=23;SAR=12;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214687;STB=0.620593;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.013502;OID=.;OPOS=45500221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:12:23:18:23:12:23:18:23 chr10 46965018 . C G 179.71 PASS AF=0.254902;AO=26;DP=103;FAO=26;FDP=102;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=0.00671003;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.671;QD=7.04765;RBI=0.0136128;REFB=-0.00659746;REVB=-0.0118441;RO=76;SAF=18;SAR=8;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118147;STB=0.571849;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0218652;OID=.;OPOS=46965018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:76:76:26:26:0.254902:8:18:46:30:8:18:46:30 chr10 46965727 . G A 236.11 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00194136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.786;QD=19.2746;RBI=0.0425803;REFB=-0.00700944;REVB=-0.042536;RO=26;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00659676;STB=0.503728;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00838868;OID=.;OPOS=46965727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:14:9:10:16:14:9:10:16 chr10 46967672 . C T 294.5 PASS AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0072548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.466;QD=28.048;RBI=0.0138968;REFB=-0.0185263;REVB=-0.0118529;RO=15;SAF=16;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101466;STB=0.545419;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.018183;OID=.;OPOS=46967672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:15:16:26:26:0.619048:10:16:7:8:10:16:8:8 chr10 46970792 . G C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00194051;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.065;QD=12.0517;RBI=0.00491909;REFB=-0.0201132;REVB=0.00452016;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170594;STB=0.510181;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0273115;OID=.;OPOS=46970792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:5:4:6:7:5:4:6:7 chr10 46998894 . G A 495.87 PASS AF=0.763636;AO=42;DP=62;FAO=42;FDP=55;FR=.;FRO=13;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00839672;FXX=0.112885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.5518;QD=36.0634;RBI=0.0720918;REFB=-0.114364;REVB=0.0716011;RO=10;SAF=22;SAR=20;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273568;STB=0.521729;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.038457;OID=.;OPOS=46998894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:62:55:10:13:42:42:0.763636:20:22:6:4:20:22:8:5 chr10 46998995 . C G 321.24 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00698987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.82;QD=16.2651;RBI=0.0158076;REFB=-0.0312978;REVB=0.0141783;RO=44;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761537;STB=0.542791;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0304316;OID=.;OPOS=46998995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:18:17:18:26:18:17:18:26 chr10 46998999 . G A 456.25 PASS AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.049692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8311;QD=23.1011;RBI=0.0523407;REFB=-0.0174189;REVB=0.0164394;RO=35;SAF=18;SAR=26;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629838;STB=0.534649;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0200618;OID=.;OPOS=46998999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:26:18:17:18:26:18:17:18 chr10 46999019 . G A 397.08 PASS AF=0.565217;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00469678;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.616;QD=23.0191;RBI=0.0507205;REFB=-0.0264585;REVB=0.0505026;RO=30;SAF=16;SAR=23;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721359;STB=0.539722;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0202204;OID=.;OPOS=46999019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:30:30:39:39:0.565217:23:16:15:15:23:16:15:15 chr10 46999030 . C T 222.02 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00042908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.529;QD=14.5589;RBI=0.00894374;REFB=-0.0338698;REVB=0.00893345;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432477;STB=0.524571;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0464481;OID=.;OPOS=46999030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:13:13:16:19:13:13:16:19 chr10 46999151 . T C 268.75 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0341685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.43;QD=22.3955;RBI=0.0459987;REFB=-0.0204905;REVB=0.030796;RO=23;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470952;STB=0.526295;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.027177;OID=.;OPOS=46999151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:10:15:15:8:10:15:15:8 chr10 46999178 . A C 142.47 PASS AF=0.390244;AO=12;DP=37;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00190466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.029;QD=13.8997;RBI=0.0038662;REFB=-0.0202669;REVB=0.00336449;RO=24;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.574043;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0238609;OID=.;OPOS=46999178;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:41:24:25:12:16:0.390244:4:8:16:8:7:9:17:8 chr10 46999189 . CA CG,TG 575.24 PASS AF=0.425,0.575;AO=16,24;DP=40;FAO=17,23;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11,15;FSAR=6,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229679,0.0253068;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=92.5493,146.906;QD=57.5241;RBI=0.0234402,0.0290505;REFB=0,0;REVB=-0.00468169,-0.0142653;RO=0;SAF=10,16;SAR=6,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0176532,0.00545838;OID=.,.;OPOS=46999190,46999189;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:40:40:0:0:16,24:17,23:0.425,0.575:6,8:10,16:0:0:6,8:11,15:0:0 chr10 46999198 . G T 264.97 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0125073;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.919;QD=25.8509;RBI=0.0141801;REFB=-0.0180025;REVB=-0.00668164;RO=17;SAF=16;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163614;STB=0.509083;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0162386;OID=.;OPOS=46999198;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:8:16:11:6:8:16:11:6 chr10 46999465 . A G 69.12 PASS AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0994822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0237;QD=15.3595;RBI=0.116877;REFB=-0.045369;REVB=0.0613478;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153362;STB=0.615147;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0315956;OID=.;OPOS=46999465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:17:18:9:9:8:9:0.5:5:3:2:7:5:4:2:7 chr10 46999484 . G T 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00473146;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=347.815;QD=13.631;RBI=0.00796269;REFB=-0.00864259;REVB=-0.0064045;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295251;STB=0.676948;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0119174;OID=.;OPOS=46999484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:5:4:6:2:5:4 chr10 46999577 . G T 123.09 PASS AF=0.684211;AO=10;DP=20;FAO=13;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0274039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.257;QD=25.9129;RBI=0.178478;REFB=-0.00936643;REVB=0.176362;RO=7;SAF=9;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267997;STB=0.509419;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00612419;OID=.;OPOS=46999577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:19:7:6:10:13:0.684211:1:9:5:2:4:9:4:2 chr10 46999596 . G A 165.58 PASS AF=0.708333;AO=15;DP=23;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0465455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8315;QD=27.5967;RBI=0.177752;REFB=0.00497012;REVB=0.171549;RO=6;SAF=13;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357903;STB=0.519976;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00524355;OID=.;OPOS=46999596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:24:6:7:15:17:0.708333:2:13:5:1:4:13:5:2 chr10 46999604 . A G 333.43 PASS AF=0.961538;AO=22;DP=27;FAO=25;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00228476;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.425;QD=51.2966;RBI=0.11279;REFB=0.00719101;REVB=0.112766;RO=1;SAF=19;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237245;STB=0.51281;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.000205079;OID=.;OPOS=46999604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:27:26:1:1:22:25:0.961538:3:19:1:0:6:19:1:0 chr10 46999732 . G A 664.05 PASS AF=0.478571;AO=67;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.00288296;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=197.301;QD=18.9729;RBI=0.00917658;REFB=-0.0109227;REVB=0.00871195;RO=73;SAF=42;SAR=25;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167483;STB=0.592806;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0107245;OID=.;OPOS=46999732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:73:73:67:67:0.478571:25:42:33:40:25:42:33:40 chr10 46999747 . T C 721.09 PASS AF=0.493056;AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=144;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.00847884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6441;QD=20.0303;RBI=0.0225497;REFB=-0.0289579;REVB=-0.0208949;RO=72;SAF=29;SAR=42;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147494;STB=0.584797;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0305854;OID=.;OPOS=46999747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:72:73:71:71:0.493056:42:29:41:31:42:29:42:31 chr10 46999897 . G A 50.45 PASS AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.000901239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.285;QD=4.92232;RBI=0.0022639;REFB=-0.00621022;REVB=0.00207678;RO=33;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160465;STB=0.608405;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0319309;OID=.;OPOS=46999897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:6:2:12:21:6:2:12:21 chr10 46999922 . G T 196.77 PASS AF=0.612903;AO=17;DP=29;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00641754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.206;QD=25.3891;RBI=0.0421257;REFB=-0.0218166;REVB=0.041634;RO=12;SAF=6;SAR=11;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159474;STB=0.570179;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0108573;OID=.;OPOS=46999922;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:29:31:12:12:17:19:0.612903:11:6:2:10:13:6:2:10 chr10 47000004 . T C 575.63 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7338;QD=60.5928;RBI=0.0152402;REFB=0;REVB=-0.0122231;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.15269e-05;OID=.;OPOS=47000004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0 chr10 47000071 . G A 274.59 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0213984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.299;QD=18.006;RBI=0.040474;REFB=-0.00332984;REVB=-0.0343548;RO=31;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161685;STB=0.590106;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0109431;OID=.;OPOS=47000071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:15:15:10:21:15:15:10:21 chr10 47000079 . T C 277.42 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.000606072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.368;QD=18.4948;RBI=0.00975432;REFB=-0.0197627;REVB=-0.00973547;RO=30;SAF=10;SAR=20;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157407;STB=0.588175;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0168823;OID=.;OPOS=47000079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:20:10:15:15:20:10:15:15 chr10 47000146 . C T 290.11 PASS AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00543857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.089;QD=30.5379;RBI=0.0217957;REFB=-0.0781197;REVB=0.0211062;RO=7;SAF=7;SAR=17;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663458;STB=0.558853;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0163405;OID=.;OPOS=47000146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:38:38:7:11:24:24:0.631579:17:7:3:4:17:7:5:6 chr10 47000188 . A G 176.71 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3796;QD=44.1782;RBI=0.0841981;REFB=0;REVB=-0.0798383;RO=1;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100822;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000621616;OID=.;OPOS=47000188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:1:0:15:16:1:11:4:1:0:11:5:0:0 chr10 47000239 . C T 65.31 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00587923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.633;QD=10.8849;RBI=0.039253;REFB=-0.0147063;REVB=-0.0388102;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750523;STB=0.545351;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0232508;OID=.;OPOS=47000239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:9:6:3:6:9:6 chr10 47000321 . G A 420.4 PASS AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0150179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.143;QD=17.8895;RBI=0.0370732;REFB=-0.00627143;REVB=0.0338952;RO=51;SAF=20;SAR=23;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156675;STB=0.587386;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0100521;OID=.;OPOS=47000321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:51:51:43:43:0.457447:23:20:32:19:23:20:32:19 chr10 47000366 . C G 595.56 PASS AF=0.495935;AO=61;DP=123;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.0233948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9347;QD=19.3677;RBI=0.0454994;REFB=-0.0142908;REVB=0.0390241;RO=62;SAF=33;SAR=28;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515211;STB=0.528435;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0100301;OID=.;OPOS=47000366;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:62:62:61:61:0.495935:28:33:37:25:28:33:37:25 chr10 47000374 . T C 596.1 PASS AF=0.491935;AO=61;DP=125;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0194534;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.546;QD=19.2291;RBI=0.0266579;REFB=-0.00453383;REVB=-0.0182266;RO=63;SAF=33;SAR=28;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282482;STB=0.515607;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00390178;OID=.;OPOS=47000374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:63:63:61:61:0.491935:28:33:36:27:28:33:36:27 chr10 47000381 . T C 1925.6 PASS AF=0.984375;AO=126;DP=129;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0130273;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.659;QD=60.1751;RBI=0.0243938;REFB=-0.010589;REVB=0.0206239;RO=1;SAF=72;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0065543;STB=0.501139;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=9.16338e-05;OID=.;OPOS=47000381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:129:128:1:2:126:126:0.984375:54:72:1:0:54:72:1:1 chr10 47000426 . T C 2406.36 PASS AF=1;AO=153;DP=154;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321002;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5505;QD=60.9206;RBI=0.0359245;REFB=0;REVB=0.0161291;RO=0;SAF=80;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61154e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143475;OID=.;OPOS=47000426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:158:0:0:153:158:1:73:80:0:0:75:83:0:0 chr10 47000487 . G A 737.41 PASS AF=0.5;AO=72;DP=143;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.000393536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.402;QD=20.4835;RBI=0.00314813;REFB=-0.00964031;REVB=-0.00312344;RO=71;SAF=36;SAR=36;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190447;STB=0.506943;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00934497;OID=.;OPOS=47000487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:71:72:72:72:0.5:36:36:34:37:36:36:35:37 chr10 47000547 . G T 384.82 PASS AF=0.465909;AO=37;DP=85;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00477299;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.348;QD=17.4919;RBI=0.00499526;REFB=-0.0013257;REVB=-0.00147351;RO=47;SAF=16;SAR=21;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359092;STB=0.510539;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00192579;OID=.;OPOS=47000547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:88:47:47:37:41:0.465909:21:16:22:25:21:20:22:25 chr10 47000728 . T C 558.98 PASS AF=0.536082;AO=43;DP=88;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0143983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.357;QD=23.0509;RBI=0.0210024;REFB=-0.0318471;REVB=0.0152901;RO=45;SAF=23;SAR=20;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627487;STB=0.53332;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0278148;OID=.;OPOS=47000728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:97:45:45:43:52:0.536082:20:23:21:24:24:28:21:24 chr10 47000863 . A G 1629.22 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.75;QD=59.7877;RBI=0.0364482;REFB=0;REVB=0.00435778;RO=0;SAF=38;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37942e-05;OID=.;OPOS=47000863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:109:0:0:104:109:1:66:38:0:0:66:43:0:0 chr10 47000873 . T A,G 1617.13 PASS AF=0.544643,0.455357;AO=61,49;DP=110;FAO=61,51;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=20,25;FSAR=41,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151263,0.00526284;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.7408,140.803;QD=57.7545;RBI=0.0166255,0.0138823;REFB=0,0;REVB=-0.00689941,-0.0128461;RO=0;SAF=20,25;SAR=41,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.14674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0051669,0.0194656;OID=.,.;OPOS=47000873,47000873;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:110:112:0:0:61,49:61,51:0.544643,0.455357:41,24:20,25:0:0:41,26:20,25:0:0 chr10 47000898 . C T 407.81 PASS AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.0223023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.278;QD=14.3091;RBI=0.0398701;REFB=-0.0258157;REVB=-0.033049;RO=67;SAF=24;SAR=23;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158877;STB=0.589249;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0264681;OID=.;OPOS=47000898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:67:67:47:47:0.412281:23:24:24:43:23:24:24:43 chr10 47001032 . G A 337.42 PASS AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00930055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.44;QD=22.8758;RBI=0.0210515;REFB=-0.0336523;REVB=-0.0188855;RO=23;SAF=14;SAR=20;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819107;STB=0.546531;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0304597;OID=.;OPOS=47001032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:23:25:34:34:0.576271:20:14:12:11:20:14:13:12 chr10 47001098 . C T 197.82 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0182007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.832;QD=14.6533;RBI=0.0327223;REFB=-0.0310884;REVB=-0.0271935;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288886;STB=0.546885;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0351216;OID=.;OPOS=47001098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:28:31:23:23:0.425926:10:13:15:13:10:13:15:16 chr10 47001371 . C G 1436.67 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.213;QD=61.7925;RBI=0.0320846;REFB=-0.0181404;REVB=0.0258558;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=7.22279e-05;OID=.;OPOS=47001371;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:0:1:91:92:0.989247:39:52:0:0:39:53:1:0 chr10 47001409 . G A 1065.98 PASS AF=0.733333;AO=88;DP=120;FAO=88;FDP=120;FR=.;FRO=32;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0130228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.354;QD=35.5328;RBI=0.0219651;REFB=-0.0326603;REVB=0.0176882;RO=31;SAF=51;SAR=37;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823223;STB=0.538544;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0115809;OID=.;OPOS=47001409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:31:32:88:88:0.733333:37:51:23:8:37:51:23:9 chr10 47001485 . A T 581.51 PASS AF=0.448529;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=136;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=26;FWDB=-0.00776176;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4737;QD=17.1032;RBI=0.00890325;REFB=-0.00524436;REVB=-0.00436153;RO=74;SAF=34;SAR=27;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923023;STB=0.554274;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.015912;OID=.;OPOS=47001485;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:74:75:61:61:0.448529:27:34:48:26:27:34:49:26 chr10 47001504 . G T 643.86 PASS AF=0.461538;AO=64;DP=141;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=0.0238974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.038;QD=18.0101;RBI=0.0249412;REFB=-0.0083117;REVB=0.00713971;RO=77;SAF=32;SAR=32;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829175;STB=0.537404;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0100735;OID=.;OPOS=47001504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:77:77:64:66:0.461538:32:32:45:32:32:34:45:32 chr10 47001543 . C T 675.54 PASS AF=0.478873;AO=68;DP=142;FAO=68;FDP=142;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.0147093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.324;QD=19.0292;RBI=0.0147097;REFB=-0.012841;REVB=-0.000114168;RO=74;SAF=33;SAR=35;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116164;STB=0.506427;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0106284;OID=.;OPOS=47001543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:74:74:68:68:0.478873:35:33:35:39:35:33:35:39 chr10 47001786 . A C 327.93 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.014972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.203;QD=20.4959;RBI=0.0170271;REFB=-0.0156988;REVB=-0.00810929;RO=30;SAF=24;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190369;STB=0.605995;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0164032;OID=.;OPOS=47001786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:10:24:15:15:10:24:15:15 chr10 47001946 . T C 153.54 PASS AF=0.258824;AO=22;DP=85;FAO=22;FDP=85;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00830977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.79;QD=7.22534;RBI=0.0098048;REFB=-0.00467301;REVB=-0.00520403;RO=61;SAF=9;SAR=13;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121253;STB=0.573668;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0124284;OID=.;OPOS=47001946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:61:63:22:22:0.258824:13:9:31:30:13:9:32:31 chr10 47001954 . C T 438.29 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00546934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.428;QD=21.6439;RBI=0.0130777;REFB=-0.0289993;REVB=0.011879;RO=36;SAF=19;SAR=24;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139399;STB=0.56419;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0145396;OID=.;OPOS=47001954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:81:36:38:43:43:0.530864:24:19:22:14:24:19:22:16 chr10 47001984 . G A 932.54 PASS AF=0.917808;AO=67;DP=74;FAO=67;FDP=73;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0179643;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.171;QD=51.0983;RBI=0.0360537;REFB=-0.122114;REVB=0.0312595;RO=2;SAF=35;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00122819;STB=0.511891;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00269633;OID=.;OPOS=47001984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:74:73:2:6:67:67:0.917808:32:35:1:1:32:35:4:2 chr10 47002079 . T C 719.19 PASS AF=0.47973;AO=70;DP=148;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.00688242;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8009;QD=19.4377;RBI=0.0488809;REFB=-0.0194658;REVB=0.048394;RO=71;SAF=39;SAR=31;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589092;STB=0.542584;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0212995;OID=.;OPOS=47002079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:71:77:70:71:0.47973:31:39:35:36:32:39:36:41 chr10 47002118 . T A 894.42 PASS AF=0.458937;AO=95;DP=211;FAO=95;FDP=207;FR=.;FRO=112;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=47;FSRR=65;FWDB=0.00150227;FXX=0.0189564;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.632;QD=17.2834;RBI=0.0517521;REFB=-0.0131606;REVB=0.0517303;RO=107;SAF=48;SAR=47;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063257;STB=0.546276;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0155784;OID=.;OPOS=47002118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:207:107:112:95:95:0.458937:47:48:47:60:47:48:47:65 chr10 47002127 . T C 3240.36 PASS AF=1;AO=208;DP=214;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926067;FXX=0.0232547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.235;QD=61.7211;RBI=0.0378101;REFB=-0.0185417;REVB=0.0366584;RO=0;SAF=92;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62466e-05;OID=.;OPOS=47002127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:214:210:0:0:208:210:1:116:92:0:0:118:92:0:0 chr10 47002135 . A G 1017.09 PASS AF=0.475336;AO=103;DP=219;FAO=106;FDP=223;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=55;FSRR=62;FWDB=-0.0383098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.327;QD=18.2438;RBI=0.0655205;REFB=-0.0188299;REVB=-0.0531535;RO=116;SAF=44;SAR=59;SRF=55;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456471;STB=0.529406;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0196478;OID=.;OPOS=47002135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:223:116:117:103:106:0.475336:59:44:55:61:62:44:55:62 chr10 47002501 . T A 371.45 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.943;QD=22.8583;RBI=0.0661027;REFB=-0.0262672;REVB=0.0659103;RO=28;SAF=13;SAR=24;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351653;STB=0.519376;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0194003;OID=.;OPOS=47002501;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:24:13:11:17:24:13:11:17 chr10 47002529 . C G 114.89 PASS AF=0.225;AO=18;DP=80;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.00477478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.326;QD=5.74467;RBI=0.0315069;REFB=-0.00603726;REVB=0.0311429;RO=62;SAF=8;SAR=10;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115384;STB=0.571352;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.015052;OID=.;OPOS=47002529;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:62:62:18:18:0.225:10:8:22:40:10:8:22:40 chr10 47002542 . C A 1340.46 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00626078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.475;QD=62.3468;RBI=0.0123985;REFB=0;REVB=-0.0107017;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75964e-05;OID=.;OPOS=47002542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:52:33:0:0:53:33:0:0 chr10 47002606 . G A 511.32 PASS AF=0.509615;AO=52;DP=103;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0420609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3412;QD=19.6663;RBI=0.0430169;REFB=-0.0199772;REVB=-0.00901821;RO=51;SAF=24;SAR=28;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814767;STB=0.500546;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0209471;OID=.;OPOS=47002606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:51:51:52:53:0.509615:28:24:24:27:28:25:24:27 chr10 47002617 . T C 451.4 PASS AF=0.473684;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.032308;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5413;QD=19.0062;RBI=0.0427637;REFB=0.0256059;REVB=-0.0280166;RO=50;SAF=27;SAR=18;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962177;STB=0.553624;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.0362134;OID=.;OPOS=47002617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:50:50:45:45:0.473684:18:27:25:25:18:27:25:25 chr10 47002724 . G A 316.91 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0386653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3546;QD=20.4456;RBI=0.0388391;REFB=-0.0484849;REVB=0.00367033;RO=28;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467495;STB=0.533313;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0340579;OID=.;OPOS=47002724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:16:17:16:12:16:17:17:12 chr10 47002757 . A G 713.51 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.070854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7722;QD=55.9612;RBI=0.0881533;REFB=0;REVB=0.0524473;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00229838;OID=.;OPOS=47002757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:51:0:0:47:51:1:24:23:0:0:26:25:0:0 chr10 47002792 . T C 211.77 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0240447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9784;QD=16.6097;RBI=0.0293991;REFB=-0.0253634;REVB=0.0169161;RO=28;SAF=5;SAR=18;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212632;STB=0.621914;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0348657;OID=.;OPOS=47002792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:18:5:11:17:18:5:11:17 chr10 47002911 . A AC 433.27 PASS AF=1;AO=14;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763059;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5066;QD=29.3744;RBI=0.193899;REFB=-0.0057616;REVB=-0.193749;RO=46;SAF=1;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613814;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000333786;OID=.;OPOS=47002912;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:14:61:59:59:0:22:37:0:0:8:46:1:13:23:23 chr10 47002917 . T C 788.35 PASS AF=0.884058;AO=57;DP=66;FAO=61;FDP=69;FR=.;FRO=8;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0608931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.347;QD=45.7012;RBI=0.0619315;REFB=-0.0208167;REVB=0.0112936;RO=9;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115791;STB=0.554037;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00356387;OID=.;OPOS=47002917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:66:69:9:8:57:61:0.884058:32:25:0:9:33:28:0:8 chr10 47002937 . A G 229.93 PASS AF=0.358974;AO=27;DP=77;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0291549;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.143;QD=11.7912;RBI=0.0612442;REFB=0.0109678;REVB=-0.0538595;RO=50;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739456;STB=0.554693;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.0142248;OID=.;OPOS=47002937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:50:50:27:28:0.358974:15:12:19:31:15:13:19:31 chr10 47002942 . C G 251.62 PASS AF=0.37037;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.086491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6491;QD=12.4257;RBI=0.0871185;REFB=0.0273595;REVB=0.0104371;RO=51;SAF=15;SAR=15;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140069;STB=0.580195;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.0444728;OID=.;OPOS=47002942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:51:51:30:30:0.37037:15:15:19:32:15:15:19:32 chr10 47003115 . C T 337.23 PASS AF=0.352941;AO=34;DP=118;FAO=42;FDP=119;FR=.;FRO=77;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=53;FWDB=-0.0742617;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7731;QD=11.3356;RBI=0.0742667;REFB=-0.00352697;REVB=-0.000857556;RO=66;SAF=10;SAR=24;SRF=21;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324679;STB=0.501635;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0139024;OID=.;OPOS=47003115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:66:77:34:42:0.352941:24:10:21:45:29:13:24:53 chr10 47003177 . A G 205.81 PASS AF=0.290323;AO=27;DP=93;FAO=27;FDP=93;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=45;FWDB=0.0203408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.702;QD=8.85214;RBI=0.0278081;REFB=-0.0148783;REVB=0.0189616;RO=66;SAF=6;SAR=21;SRF=21;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147916;STB=0.588714;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0220291;OID=.;OPOS=47003177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:66:66:27:27:0.290323:21:6:21:45:21:6:21:45 chr10 47003215 . T C 206.64 PASS AF=0.346667;AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00254127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.466;QD=11.0205;RBI=0.0084402;REFB=-0.0103563;REVB=-0.00804853;RO=49;SAF=12;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318627;STB=0.518504;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0172851;OID=.;OPOS=47003215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:49:49:26:26:0.346667:14:12:24:25:14:12:24:25 chr10 47003229 . C G 145.86 PASS AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0173724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.701;QD=8.97579;RBI=0.0200697;REFB=-0.0134966;REVB=0.0100495;RO=45;SAF=12;SAR=8;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105066;STB=0.562437;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0668353;OID=.;OPOS=47003229;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:45:45:20:20:0.307692:8:12:23:22:8:12:23:22 chr10 47003250 . C T 183.1 PASS AF=0.363636;AO=23;DP=65;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0452882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.563;QD=11.0971;RBI=0.0458471;REFB=-0.0160882;REVB=0.00713649;RO=42;SAF=13;SAR=10;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198196;STB=0.523176;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0302372;OID=.;OPOS=47003250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:42:42:23:24:0.363636:10:13:23:19:10:14:23:19 chr10 47003615 . C T 538.11 PASS AF=0.6125;AO=49;DP=80;FAO=49;FDP=80;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0018163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.434;QD=26.9054;RBI=0.0196759;REFB=-0.0114306;REVB=-0.0195919;RO=30;SAF=27;SAR=22;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590054;STB=0.538603;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00804825;OID=.;OPOS=47003615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:30:31:49:49:0.6125:22:27:14:16:22:27:14:17 chr10 47003896 . C T 386.01 PASS AF=0.470588;AO=39;DP=83;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0110253;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.493;QD=18.1652;RBI=0.0126878;REFB=0.00121383;REVB=0.0062786;RO=44;SAF=13;SAR=26;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20825;STB=0.611523;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00152872;OID=.;OPOS=47003896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:44:45:39:40:0.470588:26:13:24:20:26:14:25:20 chr10 47004068 . T C 302.07 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.00220272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.19;QD=14.3844;RBI=0.0034207;REFB=-0.00635407;REVB=0.0026171;RO=50;SAF=23;SAR=11;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195429;STB=0.511105;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00692457;OID=.;OPOS=47004068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:50:34:34:0.404762:11:23:33:17:11:23:33:17 chr10 47004182 . G A 714.9 PASS AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.043991;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.3158;QD=57.1917;RBI=0.0545512;REFB=-0.169501;REVB=0.0322586;RO=1;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229327;STB=0.514725;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00371389;OID=.;OPOS=47004182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:50:50:1:3:47:47:0.94:20:27:0:1:20:27:1:2 chr10 47004217 . T C 101.9 PASS AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0120282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.463;QD=8.86086;RBI=0.0133722;REFB=-0.00331187;REVB=0.00584269;RO=33;SAF=4;SAR=9;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148262;STB=0.591095;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0114183;OID=.;OPOS=47004217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:9:4:14:19:9:4:14:19 chr10 47004289 . C T 59.81 PASS AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0539274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5948;QD=5.69617;RBI=0.0629149;REFB=-0.013316;REVB=0.0324055;RO=33;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140368;STB=0.589974;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0361061;OID=.;OPOS=47004289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:42:33:33:9:9:0.214286:5:4:11:22:5:4:11:22 chr10 47004355 . C CA 203.9 PASS AF=0.446809;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0083153;FXX=0.040808;HRUN=0;LEN=1;MLLD=228.961;QD=17.3531;RBI=0.0185664;REFB=-0.0152938;REVB=-0.0166002;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318301;STB=0.662577;STBP=0.064;TYPE=ins;VARB=0.0220252;OID=.;OPOS=47004356;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.446809:20:48:21:47:26:12:9:7:19:99:26:12:8:7:19 chr10 47004362 . C T 236.12 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00745624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.417;QD=19.275;RBI=0.0121541;REFB=0.00725245;REVB=-0.00959825;RO=26;SAF=15;SAR=8;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349981;STB=0.696909;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.00235068;OID=.;OPOS=47004362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:8:15:7:19:8:15:7:19 chr10 47004463 . G A 92.32 PASS AF=0.214286;AO=14;DP=69;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0769864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.843;QD=5.27541;RBI=0.0769947;REFB=-0.0031908;REVB=-0.0011296;RO=54;SAF=5;SAR=9;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896035;STB=0.514773;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0114037;OID=.;OPOS=47004463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:69:70:54:55:14:15:0.214286:9:5:23:31:9:6:23:32 chr10 47004633 . CA GA,TG 109.02 PASS AF=0.047619,0.285714;AO=2,12;DP=42;FAO=2,12;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=1,6;FSAR=1,6;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0021894,-0.00667799;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=63.3478,143.959;QD=10.3828;RBI=0.0181274,0.0365125;REFB=-0.00422673,-0.00118703;REVB=-0.0179947,-0.0358967;RO=27;SAF=1,6;SAR=1,6;SRF=9;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.159394,0.191962;STB=0.665195,0.624805;STBP=0.737,0.31;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0570792,0.00847047;OID=.,.;OPOS=47004633,47004633;OREF=C,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=GA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:94:42:42:27:28:2,12:2,12:0.047619,0.285714:1,6:1,6:9:18:1,6:1,6:9:19 chr10 47004702 . A G 193.06 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.000525124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1374;QD=16.4305;RBI=0.0355292;REFB=0.0118548;REVB=-0.0355253;RO=27;SAF=6;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080528;STB=0.546294;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.0154434;OID=.;OPOS=47004702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:14:6:10:17:14:6:10:17 chr10 47004971 . A G 150.96 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0162625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.405;QD=12.5796;RBI=0.0225284;REFB=-0.000660727;REVB=0.0155903;RO=31;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115458;STB=0.568162;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00126182;OID=.;OPOS=47004971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:12:5:12:19:12:5:12:19 chr10 47004994 . A G 79.22 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.000686586;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.986;QD=12.187;RBI=0.00262054;REFB=-0.0287897;REVB=0.00252899;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015192;STB=0.509073;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0454187;OID=.;OPOS=47004994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:26:26:16:16:10:10:0.384615:7:3:5:11:7:3:5:11 chr10 47005224 . C T 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.000657018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.951;QD=18.2488;RBI=0.0711815;REFB=-0.0456237;REVB=-0.0711785;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365471;STB=0.708774;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0385878;OID=.;OPOS=47005224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:4:9:3:9:4:9:3:9 chr10 47005267 . C T 310.38 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00184672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.454;QD=21.4055;RBI=0.0188889;REFB=-0.000226505;REVB=-0.0187984;RO=25;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190584;STB=0.612697;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00010739;OID=.;OPOS=47005267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:25:26:32:32:0.551724:18:14:17:8:18:14:18:8 chr10 47005466 . C T 1000.57 PASS AF=0.539326;AO=96;DP=179;FAO=96;FDP=178;FR=.;FRO=82;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=0.0187645;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.61;QD=22.4847;RBI=0.0192456;REFB=-0.00535826;REVB=-0.00427603;RO=82;SAF=48;SAR=48;SRF=49;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823107;STB=0.544935;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00508872;OID=.;OPOS=47005466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:82:82:96:96:0.539326:48:48:49:33:48:48:49:33 chr10 47005504 . T C 876.91 PASS AF=0.456311;AO=94;DP=205;FAO=94;FDP=206;FR=.;FRO=112;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=65;FSRR=47;FWDB=-0.00829838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.849;QD=17.0274;RBI=0.0139219;REFB=-0.0239359;REVB=0.0111784;RO=111;SAF=56;SAR=38;SRF=65;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010284;STB=0.508654;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0219114;OID=.;OPOS=47005504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:111:112:94:94:0.456311:38:56:65:46:38:56:65:47 chr10 47005575 . C T 850.88 PASS AF=0.446701;AO=87;DP=197;FAO=88;FDP=197;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=58;FWDB=-0.00418563;FXX=0.0100497;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.534;QD=17.2767;RBI=0.00685142;REFB=-0.000696749;REVB=0.00542425;RO=108;SAF=41;SAR=46;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00830681;STB=0.501101;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00103369;OID=.;OPOS=47005575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:108:109:87:88:0.446701:46:41:50:58:47:41:51:58 chr10 47005611 . CAGA C 181.99 PASS AF=0.20979;AO=28;DP=141;FAO=30;FDP=143;FR=.;FRO=113;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=53;FSRR=60;FWDB=0.0021794;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=3;MLLD=278.043;QD=5.09049;RBI=0.0123684;REFB=-0.0066196;REVB=-0.0121748;RO=107;SAF=15;SAR=13;SRF=49;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985206;STB=0.57689;STBP=0.354;TYPE=del;VARB=0.0257183;OID=.;OPOS=47005612;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.20979:28:141:30:143:113:17:13:53:60:99:107:15:13:49:58 chr10 47086915 . C T 462.4 PASS AF=0.229814;AO=72;DP=321;FAO=74;FDP=322;FR=.;FRO=248;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=129;FSRR=119;FWDB=-0.0207156;FXX=0.00309588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.658;QD=5.74415;RBI=0.0208932;REFB=-0.00461546;REVB=-0.00271864;RO=245;SAF=37;SAR=35;SRF=129;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161528;STB=0.505124;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0259397;OID=.;OPOS=47086915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:322:245:248:72:74:0.229814:35:37:129:116:36:38:129:119 chr10 47086978 . G A 506.86 PASS AF=0.241486;AO=78;DP=324;FAO=78;FDP=323;FR=.;FRO=245;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=124;FSRR=121;FWDB=-0.0251628;FXX=0.00308632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.044;QD=6.27693;RBI=0.0255629;REFB=-0.00619249;REVB=0.00450513;RO=246;SAF=37;SAR=41;SRF=124;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376216;STB=0.524091;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0197092;OID=.;OPOS=47086978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:323:246:245:78:78:0.241486:41:37:124:122:41:37:124:121 chr10 47087474 . C T 2240.93 PASS AF=0.986755;AO=148;DP=151;FAO=149;FDP=151;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0228073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8488;QD=59.3623;RBI=0.0284869;REFB=-0.018695;REVB=0.0170685;RO=1;SAF=73;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647089;STB=0.500133;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000506187;OID=.;OPOS=47087474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:151:151:1:2:148:149:0.986755:75:73:1:0:76:73:1:1 chr10 47087608 . TG CA,CG 1706.66 PASS AF=0.270492,0.713115;AO=33,85;DP=124;FAO=33,87;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=15,49;FSAR=18,38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00553288,-0.0035412;FXX=0.0161277;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=75.4858,131.569;QD=55.9561;RBI=0.0431689,0.0560181;REFB=-0.192035,-0.177279;REVB=0.0428129,0.0559061;RO=4;SAF=15,49;SAR=18,36;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0931601,0.0497733;STB=0.5263,0.512818;STBP=0.242,0.141;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0273043,0.0113405;OID=.,.;OPOS=47087608,47087608;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:124:122:4:2:33,85:33,87:0.270492,0.713115:18,36:15,49:0:4:18,38:15,49:0:2 chr10 47087680 . C T 1818.48 PASS AF=0.975806;AO=121;DP=124;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0141466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9767;QD=58.6606;RBI=0.0506159;REFB=-0.0993917;REVB=0.0485988;RO=3;SAF=57;SAR=64;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00635137;STB=0.503344;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00232736;OID=.;OPOS=47087680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:124:124:3:3:121:121:0.975806:64:57:1:2:64:57:1:2 chr10 47087731 . C T 1343.82 PASS AF=0.91;AO=89;DP=100;FAO=91;FDP=100;FR=.;FRO=9;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.106368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0361;QD=53.7527;RBI=0.106667;REFB=-0.159036;REVB=-0.00798098;RO=9;SAF=32;SAR=57;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11627;STB=0.558428;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0129919;OID=.;OPOS=47087731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:100:100:9:9:89:91:0.91:57:32:9:0:57:34:9:0 chr10 47087830 . G A 868.18 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.084;QD=57.8786;RBI=0.0390884;REFB=0;REVB=-0.00393257;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.7368e-05;OID=.;OPOS=47087830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:41:19:0:0:41:19:0:0 chr10 47416908 . A G 7578.43 PASS AF=0.747512;AO=594;DP=803;FAO=601;FDP=804;FR=.;FRO=203;FSAF=361;FSAR=240;FSRF=90;FSRR=113;FWDB=-0.00128986;FXX=0.00124222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.339;QD=37.7036;RBI=0.0810024;REFB=-0.0106939;REVB=0.0809922;RO=199;SAF=359;SAR=235;SRF=90;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738823;STB=0.540718;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00259558;OID=.;OPOS=47416908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:803:804:199:203:594:601:0.747512:235:359:90:109:240:361:90:113 chr10 47756065 . C T 95.98 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0159034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.9699;QD=22.5825;RBI=0.0438559;REFB=-0.0225814;REVB=0.0408707;RO=6;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204503;STB=0.511607;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.013011;OID=.;OPOS=47756065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:7:4:2:4:7:4:2:4 chr10 47911590 . GT AG 149.45 PASS AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011309;FXX=0.0713776;HRUN=2;LEN=2;MLLD=238.238;QD=45.9847;RBI=0.0118481;REFB=0;REVB=-0.00353337;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000109796;OID=.;OPOS=47911590;OREF=GT;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr10 48370595 . G A 447.81 PASS AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=0.0598551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3433;QD=18.0934;RBI=0.0651898;REFB=-0.0361691;REVB=0.0258277;RO=48;SAF=24;SAR=22;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210774;STB=0.606017;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0413996;OID=.;OPOS=48370595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:48:53:46:46:0.464646:22:24:14:34:23:23:16:37 chr10 48428941 . T C 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0446324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6832;QD=10.3912;RBI=0.0528769;REFB=-0.0326045;REVB=-0.0283534;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357723;STB=0.723655;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.015999;OID=.;OPOS=48428941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:10:11:7:7:0.388889:3:4:9:1:3:4:10:1 chr10 49420008 . T C 374.33 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0372984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8146;QD=20.7961;RBI=0.0393022;REFB=-0.0223077;REVB=0.0123892;RO=34;SAF=25;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141789;STB=0.578661;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0179084;OID=.;OPOS=49420008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:13:25:17:17:13:25:17:17 chr10 49659083 . GC G,GG 561.86 PASS AF=1,0;AO=36,18;DP=61;FAO=61,0;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32,0;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171379,0.111079;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=12.1306,10.4377;QD=36.8432;RBI=0.204495,0.211428;REFB=-0.00334227,0.0485072;REVB=0.111568,-0.179898;RO=6;SAF=28,0;SAR=8,18;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.100023,-0.846907;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00837459,0;OID=.,.;OPOS=49659084,49659084;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1,0:36,18:61:61,0:61:0:32,0:29,0:0:0:3:6:28,0:8,18:3:3 chr10 49659553 . GCCCCA GCCCAT 174.28 PASS AF=0.947368;AO=2;DP=39;FAO=18;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0340431;FXX=0.499868;HRUN=4;LEN=2;MLLD=47.7047;QD=36.6905;RBI=0.0681236;REFB=-0.198276;REVB=-0.0590076;RO=25;SAF=2;SAR=0;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.574267;STB=0.526287;STBP=0.516;TYPE=mnp;VARB=0.0122453;OID=.;OPOS=49659557;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=GCCCAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.947368:2:39:18:19:1:9:9:1:0:8:25:2:0:8:17 chr10 49659559 . C T 513.21 PASS AF=0.948718;AO=36;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0470501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.758;QD=52.6366;RBI=0.0547858;REFB=-0.0922064;REVB=0.0280673;RO=2;SAF=16;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549698;STB=0.527763;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000512665;OID=.;OPOS=49659559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:39:39:2:2:36:37:0.948718:20:16:2:0:20:17:2:0 chr10 49659637 . T C 128.04 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0325543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6995;QD=20.4859;RBI=0.0418747;REFB=-0.0295374;REVB=0.0263383;RO=11;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21872;STB=0.624812;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0173947;OID=.;OPOS=49659637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:10:4:6:5:10:4:6:5 chr10 49659644 . A G 50.33 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0086259;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.557;QD=11.1848;RBI=0.00866573;REFB=-0.0234254;REVB=-0.000829855;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283636;STB=0.540869;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0679521;OID=.;OPOS=49659644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:19:18:10:11:7:7:0.388889:4:3:4:6:4:3:4:7 chr10 49667795 . T C 894.04 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.898;QD=57.6798;RBI=0.0321604;REFB=0;REVB=0.0315016;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66095e-05;OID=.;OPOS=49667795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0 chr10 49860258 . A G 59.75 PASS AF=0.236842;AO=8;DP=37;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00346368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.185;QD=6.28932;RBI=0.0160181;REFB=-0.00279662;REVB=-0.0156391;RO=29;SAF=5;SAR=3;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856909;STB=0.605841;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00834531;OID=.;OPOS=49860258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:37:38:29:29:8:9:0.236842:3:5:20:9:4:5:20:9 chr10 49933974 . T C 454.25 PASS AF=0.462963;AO=49;DP=107;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.00179708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.143;QD=16.8239;RBI=0.0176682;REFB=-0.0168976;REVB=-0.0175766;RO=58;SAF=24;SAR=25;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404057;STB=0.527767;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0215982;OID=.;OPOS=49933974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:58:58:49:50:0.462963:25:24:26:32:25:25:26:32 chr10 49998780 . G A 440.89 PASS AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0211839;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.355;QD=17.4611;RBI=0.0648751;REFB=-0.0116645;REVB=0.061319;RO=51;SAF=25;SAR=22;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160954;STB=0.507182;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0134707;OID=.;OPOS=49998780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:54:47:47:0.465347:22:25:28:23:22:25:28:26 chr10 50004372 . C T 379.54 PASS AF=0.359375;AO=46;DP=128;FAO=46;FDP=128;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=-0.0228881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8139;QD=11.8605;RBI=0.0988294;REFB=-0.00377262;REVB=-0.0961425;RO=81;SAF=21;SAR=25;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275468;STB=0.511312;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00604581;OID=.;OPOS=50004372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:81:82:46:46:0.359375:25:21:35:46:25:21:36:46 chr10 50013402 . T C 319.35 PASS AF=0.466667;AO=34;DP=74;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0203083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.164;QD=17.0322;RBI=0.0225038;REFB=-0.0237162;REVB=-0.00969511;RO=40;SAF=14;SAR=20;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376953;STB=0.511621;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0286011;OID=.;OPOS=50013402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:40:40:34:35:0.466667:20:14:18:22:20:15:18:22 chr10 50025396 . G A 831.27 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.177;QD=57.3291;RBI=0.054014;REFB=0;REVB=0.0120461;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010319;OID=.;OPOS=50025396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:56:58:1:31:25:0:0:31:27:0:0 chr10 50038800 . A G 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.899;QD=64.4141;RBI=0.01194;REFB=0;REVB=0.000988624;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09856e-05;OID=.;OPOS=50038800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0 chr10 50083111 . T C 1350.07 PASS AF=0.977778;AO=87;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00633175;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.7837;QD=60.003;RBI=0.0156683;REFB=-0.162037;REVB=0.014332;RO=2;SAF=42;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000734801;STB=0.500253;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00383108;OID=.;OPOS=50083111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:90:90:2:2:87:88:0.977778:45:42:1:1:45:43:1:1 chr10 50109902 . G A 767.05 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0323;QD=63.9209;RBI=0.0512253;REFB=0;REVB=-0.00189034;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465653;OID=.;OPOS=50109902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:22:25:0:0:22:26:0:0 chr10 50121784 . T C 1985.09 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0024895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8336;QD=62.034;RBI=0.0387752;REFB=0;REVB=0.0386952;RO=0;SAF=44;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.30822e-05;OID=.;OPOS=50121784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:84:44:0:0:84:44:0:0 chr10 50122181 . C A 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.331;QD=60.7158;RBI=0.00366852;REFB=0;REVB=0.00133285;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10951e-06;OID=.;OPOS=50122181;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr10 50184949 . C T 164.4 PASS AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.021013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.092;QD=13.6999;RBI=0.0238289;REFB=0.00415287;REVB=0.0112369;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953373;STB=0.555494;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.00700083;OID=.;OPOS=50184949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:14:16:8:10:14:16 chr10 50186415 . C T 267.59 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0125843;FXX=0.0151492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=113.518;QD=16.4668;RBI=0.0141401;REFB=-0.0199047;REVB=-0.00644802;RO=34;SAF=11;SAR=19;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740286;STB=0.550986;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0309281;OID=.;OPOS=50186415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:34:35:30:30:0.461538:19:11:15:19:19:11:16:19 chr10 50227785 . T C 1627.7 PASS AF=0.990991;AO=109;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0468474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.69;QD=58.656;RBI=0.0523004;REFB=-0.143485;REVB=0.023252;RO=1;SAF=39;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0067338;STB=0.503545;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000625672;OID=.;OPOS=50227785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:111:111:1:1:109:110:0.990991:70:39:0:1:70:40:0:1 chr10 50531214 . C G 92.19 PASS AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.01255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0062;QD=8.9946;RBI=0.0406819;REFB=-0.0179131;REVB=0.0386977;RO=29;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599727;STB=0.536525;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0445475;OID=.;OPOS=50531214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:6:6:13:16:6:6:13:16 chr10 50531549 . G T 167.9 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0143225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.832;QD=15.6183;RBI=0.0308142;REFB=-0.0106703;REVB=-0.0272833;RO=24;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271363;STB=0.664811;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0392483;OID=.;OPOS=50531549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:25:18:18:0.418605:11:7:16:8:11:7:17:8 chr10 50531604 . T C 388.75 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.254;QD=55.5353;RBI=0.064297;REFB=0;REVB=0.0303597;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170479;OID=.;OPOS=50531604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:14:13:0:0:14:14:0:0 chr10 50531606 . C A 98.66 PASS AF=0.428571;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.013868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.328;QD=14.0938;RBI=0.0145014;REFB=-0.038794;REVB=0.00423896;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358412;STB=0.666389;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.03271;OID=.;OPOS=50531606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:27:28:16:16:11:12:0.428571:8:3:10:6:8:4:10:6 chr10 50531972 . A C 185.6 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.046775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.08;QD=13.7479;RBI=0.0501823;REFB=-0.0385306;REVB=-0.0181761;RO=32;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206416;STB=0.617837;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0356244;OID=.;OPOS=50531972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:10:12:11:21:10:12:11:21 chr10 50532683 . T C 95.1 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0472836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2531;QD=34.5834;RBI=0.0891861;REFB=0.00702264;REVB=0.0756203;RO=1;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990155;STB=0.555443;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.0108442;OID=.;OPOS=50532683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:6:4:1:0:6:4:1:0 chr10 50533237 . G A 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.052711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2663;QD=18.8859;RBI=0.0754713;REFB=0.0680138;REVB=-0.0540136;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453777;STB=0.526251;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.053747;OID=.;OPOS=50533237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:6:2:1:4:6:2:1:4 chr10 50533613 . AGGGT AGGGC,AGGT 218.83 PASS AF=0.407407,0.407407;AO=9,11;DP=29;FAO=11,11;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=4,0;FSAR=7,11;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0378353,-0.183573;FXX=0.0357015;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=46.3091,20.2982;QD=32.4192;RBI=0.0834078,0.185268;REFB=-0.0106626,-0.00895129;REVB=-0.0743327,0.0249993;RO=5;SAF=2,0;SAR=7,11;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0.549261;SSEP=0,0;SSSB=-0.275108,-0.821629;STB=0.636115,0.998632;STBP=0.151,0;TYPE=snp,del;VARB=0.0745977,0.00742869;OID=.,.;OPOS=50533617,50533614;OREF=T,G;OALT=C,-;OMAPALT=AGGGC,AGGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.407407,0.407407:9,11:29:11,11:27:5:4,0:7,11:4:1:92:5:2,0:7,11:3:2 chr10 50534646 . C T 157.85 PASS AF=0.447368;AO=20;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0310136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2718;QD=16.6153;RBI=0.0314658;REFB=-0.00874554;REVB=0.00531516;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226531;STB=0.715739;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0161183;OID=.;OPOS=50534646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:21:20:17:0.447368:11:9:13:5:11:6:16:5 chr10 50534862 . T C 1641.93 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.474;QD=60.2544;RBI=0.040996;REFB=0;REVB=0.0375354;RO=0;SAF=42;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153651;OID=.;OPOS=50534862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:66:42:0:0:66:43:0:0 chr10 50535186 . C T 532.2 PASS AF=0.590361;AO=49;DP=83;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.0593369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.244;QD=25.6483;RBI=0.0593862;REFB=-0.0279763;REVB=-0.00241842;RO=34;SAF=13;SAR=36;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188457;STB=0.601899;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.020316;OID=.;OPOS=50535186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:34:34:49:49:0.590361:36:13:3:31:36:13:3:31 chr10 50723684 . G A 1169.8 PASS AF=1;AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00197578;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.59;QD=60.7686;RBI=0.00573471;REFB=0;REVB=0.00538361;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124556;OID=.;OPOS=50723684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:76:77:1:40:36:0:0:40:37:0:0 chr10 50724016 . C T 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.76514e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.988;QD=60.3767;RBI=0.0201181;REFB=0;REVB=0.020118;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21366e-05;OID=.;OPOS=50724016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:32:42:0:0:32:42:0:0 chr10 50732280 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.436;QD=56.9569;RBI=0.0702147;REFB=0;REVB=0.0433396;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290094;OID=.;OPOS=50732280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0 chr10 50740600 . C T 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.179;QD=57.7121;RBI=0.0382291;REFB=0;REVB=-0.0109117;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.67619e-05;OID=.;OPOS=50740600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:22:37:0:0:22:37:0:0 chr10 50740655 . T C 33.1 PASS AF=0.097561;AO=7;DP=82;FAO=8;FDP=82;FR=.;FRO=74;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=-0.0192294;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.96;QD=1.61476;RBI=0.0201684;REFB=-0.00705673;REVB=0.00608231;RO=75;SAF=1;SAR=6;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453862;STB=0.884368;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0721558;OID=.;OPOS=50740655;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:82:82:75:74:7:8:0.097561:6:1:42:33:7:1:42:32 chr10 50819182 . T C 340.54 PASS AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-7.13624e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.575;QD=15.6568;RBI=0.00611272;REFB=-0.0267685;REVB=0.00611272;RO=50;SAF=22;SAR=15;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977164;STB=0.555175;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0388798;OID=.;OPOS=50819182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:50:37:37:0.425287:15:22:25:25:15:22:25:25 chr10 50820345 . C A 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.865;QD=59.3226;RBI=0.0567388;REFB=0;REVB=0.0199743;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.67045e-05;OID=.;OPOS=50820345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0 chr10 50820424 . G T 265.16 PASS AF=0.491525;AO=28;DP=58;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0673049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4459;QD=17.977;RBI=0.108961;REFB=0.00330306;REVB=0.0856893;RO=30;SAF=4;SAR=24;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273494;STB=0.620596;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.000243757;OID=.;OPOS=50820424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:30:30:28:29:0.491525:24:4:10:20:24:5:10:20 chr10 50820693 . G T 368.58 PASS AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0106795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.45;QD=19.399;RBI=0.0177418;REFB=-0.0314274;REVB=0.0141675;RO=38;SAF=14;SAR=24;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191738;STB=0.606685;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0247278;OID=.;OPOS=50820693;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:24:14:22:16:24:14:22:16 chr10 50824117 . G A 239.96 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0017012;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.024;QD=20.4223;RBI=0.00293784;REFB=-0.031483;REVB=0.00239517;RO=25;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465511;STB=0.535342;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0349245;OID=.;OPOS=50824117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:25:24:23:23:0.489362:14:9:11:14:14:9:11:13 chr10 50824619 . G A 375.45 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.0265186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.119;QD=18.3146;RBI=0.0280216;REFB=-0.0211704;REVB=-0.00905372;RO=43;SAF=16;SAR=23;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107416;STB=0.559706;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0199618;OID=.;OPOS=50824619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:23:16:13:30:23:16:13:30 chr10 50856652 . G A 435.83 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000424975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.881;QD=54.4787;RBI=0.0670863;REFB=-0.0421712;REVB=0.0670849;RO=1;SAF=20;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227606;STB=0.512187;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00126971;OID=.;OPOS=50856652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:11:20:1:0:11:20:1:0 chr10 50863147 . T C 1513.35 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.187;QD=59.9345;RBI=0.0242535;REFB=0;REVB=-0.00444072;RO=0;SAF=51;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.36001e-05;OID=.;OPOS=50863147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:50:51:0:0:50:51:0:0 chr10 50901938 . C T 527.04 PASS AF=0.504587;AO=54;DP=108;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00747056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.629;QD=19.3409;RBI=0.0256193;REFB=-0.0154993;REVB=0.0245059;RO=53;SAF=29;SAR=25;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586087;STB=0.540887;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00885893;OID=.;OPOS=50901938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:53:54:54:55:0.504587:25:29:25:28:25:30:25:29 chr10 50916484 . A G 786.62 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.106;QD=64.2141;RBI=0.0318644;REFB=0;REVB=0.0106471;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33707e-05;OID=.;OPOS=50916484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:30:18:0:0:30:19:0:0 chr10 50942763 . C T 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3555;QD=57.1052;RBI=0.0493545;REFB=0;REVB=-0.0231443;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000539163;OID=.;OPOS=50942763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0 chr10 50960209 . G A 763.14 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.635;QD=56.5287;RBI=0.082647;REFB=0;REVB=0.0800113;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143489;OID=.;OPOS=50960209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:54:0:0:50:54:1:21:29:0:0:25:29:0:0 chr10 51465552 . A T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00129429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.013;QD=54.5177;RBI=0.00528965;REFB=0;REVB=0.00512886;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01389e-05;OID=.;OPOS=51465552;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr10 51549545 . G T 781.88 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00885293;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.002;QD=63.8268;RBI=0.0194172;REFB=0;REVB=0.0172815;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65727e-06;OID=.;OPOS=51549545;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:26:21:0:0:28:21:0:0 chr10 51623147 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0703025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.316;QD=14.0965;RBI=0.121362;REFB=0.00695859;REVB=0.0989252;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173528;STB=0.59984;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00205899;OID=.;OPOS=51623147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:3:8:12:2:3:8:12:2 chr10 51623174 . C A 40.33 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.012228;FXX=0.0666222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.426;QD=11.5228;RBI=0.0229783;REFB=-0.00161231;REVB=-0.0194545;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0022636;OID=.;OPOS=51623174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:15:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:6:2:2:4:6:2 chr10 51623866 . A G 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0473029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.938;QD=16.1991;RBI=0.0477306;REFB=-0.0170516;REVB=-0.00637577;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0043539;OID=.;OPOS=51623866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:1:2:1:4:1:2 chr10 51748684 . G A 320.57 PASS AF=0.378947;AO=36;DP=95;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=0.00994556;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.116;QD=13.4976;RBI=0.0175186;REFB=-0.00799195;REVB=0.0144217;RO=59;SAF=25;SAR=11;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102582;STB=0.558809;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0135895;OID=.;OPOS=51748684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:59:59:36:36:0.378947:11:25:36:23:11:25:36:23 chr10 51827763 . A G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.581;QD=47.8221;RBI=0.046033;REFB=0;REVB=0.0400817;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048596;OID=.;OPOS=51827763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr10 52002980 . T G 228.28 PASS AF=0.391304;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.00092339;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.988;QD=13.2335;RBI=0.00106707;REFB=-0.00512812;REVB=-0.000534777;RO=43;SAF=20;SAR=7;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578754;STB=0.538329;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00748073;OID=.;OPOS=52002980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:43:42:27:27:0.391304:7:20:30:13:7:20:29:13 chr10 52005153 . A G 320.17 PASS AF=0.357143;AO=39;DP=111;FAO=40;FDP=112;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.027859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.966;QD=11.4347;RBI=0.0384063;REFB=-0.0247766;REVB=-0.0264372;RO=71;SAF=23;SAR=16;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624248;STB=0.547421;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0488444;OID=.;OPOS=52005153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:71:72:39:40:0.357143:16:23:38:33:16:24:38:34 chr10 52103707 . A G 377.48 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0252635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.13;QD=16.2355;RBI=0.0259821;REFB=-0.0129783;REVB=-0.0060682;RO=53;SAF=19;SAR=21;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110956;STB=0.562369;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0178377;OID=.;OPOS=52103707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:53:53:40:40:0.430108:21:19:31:22:21:19:31:22 chr10 53059406 . T C 494.81 PASS AF=0.413534;AO=53;DP=131;FAO=55;FDP=133;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=55;FWDB=0.0425945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.702;QD=14.8815;RBI=0.0454783;REFB=-0.0146921;REVB=0.0159368;RO=77;SAF=24;SAR=29;SRF=22;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18188;STB=0.586167;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0298297;OID=.;OPOS=53059406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:77:78:53:55:0.413534:29:24:22:55:31:24:23:55 chr10 54053817 . C T 528.53 PASS AF=0.526316;AO=50;DP=95;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0184956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.851;QD=22.2541;RBI=0.0187409;REFB=-0.0174091;REVB=-0.00302262;RO=45;SAF=29;SAR=21;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776165;STB=0.54269;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0141868;OID=.;OPOS=54053817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:45:45:50:50:0.526316:21:29:30:15:21:29:30:15 chr10 54074757 . A G 501.44 PASS AF=0.461538;AO=53;DP=116;FAO=54;FDP=117;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0176023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.431;QD=17.1431;RBI=0.0178449;REFB=-0.0247461;REVB=0.00293262;RO=61;SAF=31;SAR=22;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748091;STB=0.546374;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0250529;OID=.;OPOS=54074757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:61:63:53:54:0.461538:22:31:31:30:22:32:32:31 chr10 54405572 . A G 411.09 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.968;QD=56.7016;RBI=0.00579797;REFB=0;REVB=0.00074683;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60184e-05;OID=.;OPOS=54405572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0 chr10 54528266 . G C 689.31 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.484;QD=62.6643;RBI=0.0163689;REFB=0;REVB=-0.00259962;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.58196e-05;OID=.;OPOS=54528266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr10 55568972 . T G 545.52 PASS AF=0.456693;AO=58;DP=127;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=-0.0172329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.201;QD=17.1816;RBI=0.0255187;REFB=-0.0459787;REVB=0.0188211;RO=67;SAF=25;SAR=33;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163927;STB=0.518033;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0611027;OID=.;OPOS=55568972;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:67:69:58:58:0.456693:33:25:30:37:33:25:32:37 chr10 55582200 . A T 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0118529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.463;QD=11.1041;RBI=0.0249434;REFB=-0.00719972;REVB=0.0219473;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392579;STB=0.737044;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.010203;OID=.;OPOS=55582200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:7:3:5:2:7:3 chr10 55582905 . G T 472.02 PASS AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00676144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.009;QD=18.3307;RBI=0.0152941;REFB=-0.0138066;REVB=-0.0137184;RO=53;SAF=28;SAR=22;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005685;STB=0.503153;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.012931;OID=.;OPOS=55582905;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:22:28:30:23:22:28:30:23 chr10 55590946 . CAGAC TAGAT 843.74 PASS AF=1;AO=3;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162539;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=5;MLLD=66.1248;QD=52.7338;RBI=0.238221;REFB=0;REVB=0.174156;RO=0;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00170429;OID=.;OPOS=55590946;OREF=CAGAC;OALT=TAGAT;OMAPALT=TAGAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:64:0:0:3:64:1:2:1:0:0:41:23:0:0 chr10 55755491 . C T 190.04 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00513187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.271;QD=11.3456;RBI=0.016982;REFB=-0.0108078;REVB=-0.0161881;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458802;STB=0.519335;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0203996;OID=.;OPOS=55755491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:42:43:24:24:0.358209:11:13:21:21:11:13:22:21 chr10 55949151 . G A 206.61 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=-0.021806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.175;QD=13.118;RBI=0.0761813;REFB=-0.00583371;REVB=-0.0729937;RO=38;SAF=16;SAR=9;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182746;STB=0.603424;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00807178;OID=.;OPOS=55949151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:9:16:30:8:9:16:30:8 chr10 55955444 . T G 467.8 PASS AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00621637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.049;QD=20.1203;RBI=0.0542938;REFB=-0.00390648;REVB=0.0539368;RO=47;SAF=29;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113067;STB=0.562806;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00368263;OID=.;OPOS=55955444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:17:29:24:23:17:29:24:23 chr10 55955485 . A G 483.0 PASS AF=0.472727;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.00176716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2085;QD=17.5635;RBI=0.0456015;REFB=-0.0191143;REVB=0.0455672;RO=56;SAF=27;SAR=25;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657817;STB=0.526306;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0217222;OID=.;OPOS=55955485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:58:52:52:0.472727:25:27:33:23:25:27:33:25 chr10 55955610 . C T 533.17 PASS AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.000866321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.84;QD=23.1815;RBI=0.00514123;REFB=-0.0174034;REVB=0.00506771;RO=41;SAF=23;SAR=27;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827323;STB=0.539984;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0142743;OID=.;OPOS=55955610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:41:42:50:50:0.543478:27:23:23:18:27:23:23:19 chr10 56287569 . T C 403.55 PASS AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0153672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.645;QD=17.3571;RBI=0.015435;REFB=-0.00894358;REVB=0.00144491;RO=50;SAF=23;SAR=19;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142682;STB=0.584607;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0135834;OID=.;OPOS=56287569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:51:42:42:0.451613:19:23:20:30:19:23:20:31 chr10 56335031 . A G 395.23 PASS AF=0.428571;AO=41;DP=97;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0358584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.063;QD=16.1317;RBI=0.0358846;REFB=-0.0107502;REVB=0.00137165;RO=55;SAF=21;SAR=20;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00315987;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0180333;OID=.;OPOS=56335031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:55:56:41:42:0.428571:20:21:28:27:21:21:28:28 chr10 56335060 . TAAAAAAA TAAAAAA,TAAAAAAG 885.71 PASS AF=0.507937,0.47619;AO=32,52;DP=132;FAO=64,60;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=36,24;FSAR=28,36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0127423,-0.0170482;FXX=0.0526276;HRUN=11,11;LEN=1,1;MLLD=3.78986,203.718;QD=28.1178;RBI=0.0237756,0.0170782;REFB=-0.0207181,-0.00751105;REVB=-0.0200727,0.00101229;RO=19;SAF=15,20;SAR=17,32;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00336249,-0.0461609;STB=0.517236,0.513509;STBP=0.141,0.309;TYPE=del,snp;VARB=0.100359,0.000622337;OID=.,.;OPOS=56335061,56335067;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.507937,0.47619:32,52:132:64,60:126:2:36,24:28,36:0:2:99:19:15,20:17,32:9:10 chr10 56345303 . T C 319.21 PASS AF=0.581818;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.012036;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.632;QD=23.2153;RBI=0.0152564;REFB=-0.0187494;REVB=0.00937501;RO=23;SAF=10;SAR=22;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20343;STB=0.612518;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0174653;OID=.;OPOS=56345303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:23:23:32:32:0.581818:22:10:13:10:22:10:13:10 chr10 56345335 . T C 315.56 PASS AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0277011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9604;QD=24.2738;RBI=0.031328;REFB=7.5481e-05;REVB=-0.0146319;RO=21;SAF=8;SAR=23;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222577;STB=0.62331;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.000136276;OID=.;OPOS=56345335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:23:8:11:10:23:8:11:10 chr10 57357632 . G A 635.05 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279439;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3297;QD=61.956;RBI=0.0550103;REFB=0;REVB=-0.0473843;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000944127;OID=.;OPOS=57357632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0 chr10 57358664 . C A 710.56 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0368152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1504;QD=54.6585;RBI=0.0386231;REFB=-0.0869647;REVB=-0.0116782;RO=1;SAF=27;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171217;STB=0.509087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00195674;OID=.;OPOS=57358664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:24:27:1:0:24:27:1:0 chr10 57358667 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.046;QD=64.415;RBI=0.0150539;REFB=0;REVB=0.000623313;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01609e-05;OID=.;OPOS=57358667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr10 57359727 . G A 288.2 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0115018;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.688;QD=16.0109;RBI=0.0221406;REFB=-0.0243993;REVB=-0.0189187;RO=40;SAF=20;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12648;STB=0.571383;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0208335;OID=.;OPOS=57359727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:40:40:32:32:0.444444:12:20:20:20:12:20:20:20 chr10 58118630 . T C 1529.93 PASS AF=1;AO=98;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1453;QD=58.2829;RBI=0.0553611;REFB=0;REVB=-0.0144089;RO=2;SAF=43;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00235663;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127877;OID=.;OPOS=58118630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:105:2:0:98:105:1:55:43:1:1:57:48:0:0 chr10 59956041 . C T 406.84 PASS AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0157307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.937;QD=15.9546;RBI=0.0224492;REFB=-0.0133075;REVB=-0.016016;RO=57;SAF=20;SAR=25;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11638;STB=0.565188;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0154204;OID=.;OPOS=59956041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:57:57:45:45:0.441176:25:20:32:25:25:20:32:25 chr10 60128583 . A G 332.7 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0187619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.66;QD=26.616;RBI=0.0192112;REFB=-0.00605324;REVB=0.00413039;RO=19;SAF=10;SAR=19;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592377;STB=0.558782;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00244755;OID=.;OPOS=60128583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:21:29:29:0.58:19:10:8:11:19:10:10:11 chr10 60573753 . G T 563.67 PASS AF=0.441176;AO=58;DP=135;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.0108071;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.237;QD=16.5786;RBI=0.0408285;REFB=-0.0165111;REVB=0.0393723;RO=76;SAF=31;SAR=27;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319765;STB=0.534912;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0319489;OID=.;OPOS=60573753;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:76:76:58:60:0.441176:27:31:43:33:29:31:44:32 chr10 60577393 . T C 443.3 PASS AF=0.423729;AO=50;DP=118;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.0341017;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.831;QD=15.027;RBI=0.0480196;REFB=0.00407971;REVB=0.0338077;RO=68;SAF=27;SAR=23;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194724;STB=0.510932;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00777268;OID=.;OPOS=60577393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:68:68:50:50:0.423729:23:27:38:30:23:27:38:30 chr10 60588553 . T C 540.95 PASS AF=0.439394;AO=58;DP=133;FAO=58;FDP=132;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.00479565;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.356;QD=16.3923;RBI=0.014397;REFB=-0.00383693;REVB=-0.0135748;RO=73;SAF=32;SAR=26;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313292;STB=0.521549;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00486526;OID=.;OPOS=60588553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:73:74:58:58:0.439394:26:32:38:35:26:32:38:36 chr10 61005244 . G C 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.777;QD=57.8842;RBI=0.0468505;REFB=0;REVB=0.0432228;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265389;OID=.;OPOS=61005244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0 chr10 61122268 . T TTA 701.7 PASS AF=1;AO=48;DP=58;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458969;FXX=0.0754575;HRUN=1;LEN=2;MLLD=214.623;QD=57.2819;RBI=0.056688;REFB=0;REVB=0.0332716;RO=8;SAF=27;SAR=21;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169999;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000181903;OID=.;OPOS=61122269;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:48:58:49:49:0:27:22:0:0:4:8:27:21:5:3 chr10 61414011 . G T 486.58 PASS AF=0.5;AO=48;DP=104;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00588879;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.062;QD=18.0216;RBI=0.0159678;REFB=-0.00784607;REVB=0.0148423;RO=56;SAF=22;SAR=26;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057555;STB=0.527806;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00938738;OID=.;OPOS=61414011;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:56:54:48:54:0.5:26:22:29:27:29:25:28:26 chr10 61549657 . AT A 485.65 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0986458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.0857;QD=46.2528;RBI=0.117203;REFB=0;REVB=0.0632898;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00523937;OID=.;OPOS=61549658;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:42:42:42:42:0:24:18:0:0:9:0:24:18:0:0 chr10 61551428 . T C 330.02 PASS AF=0.666667;AO=28;DP=42;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00155559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.772;QD=31.4306;RBI=0.00406187;REFB=-0.0292528;REVB=0.00375218;RO=14;SAF=12;SAR=16;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090103;STB=0.549261;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0103886;OID=.;OPOS=61551428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:14:14:28:28:0.666667:16:12:4:10:16:12:4:10 chr10 61552692 . G T 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00850742;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.645;QD=13.9118;RBI=0.0218927;REFB=-0.0167985;REVB=-0.0201721;RO=31;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238511;STB=0.636894;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0262059;OID=.;OPOS=61552692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:8:13:12:19:8:13:12:19 chr10 61552774 . C T 181.14 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0344619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5493;QD=16.4669;RBI=0.0667503;REFB=-0.0299517;REVB=-0.0571663;RO=25;SAF=17;SAR=2;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475798;STB=0.780555;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.038096;OID=.;OPOS=61552774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:2:17:14:11:2:17:14:11 chr10 61665886 . C A 870.79 PASS AF=0.514793;AO=87;DP=169;FAO=87;FDP=169;FR=.;FRO=82;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=0.0138502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.284;QD=20.6105;RBI=0.0214064;REFB=-0.0225622;REVB=-0.016322;RO=79;SAF=49;SAR=38;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717961;STB=0.548596;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0236103;OID=.;OPOS=61665886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:79:82:87:87:0.514793:38:49:38:41:38:49:38:44 chr10 61719159 . C T 268.61 PASS AF=0.333333;AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.00562581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.211;QD=10.5336;RBI=0.0177201;REFB=-0.0096001;REVB=-0.0168033;RO=68;SAF=26;SAR=8;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34712;STB=0.703018;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0172482;OID=.;OPOS=61719159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:68:68:34:34:0.333333:8:26:33:35:8:26:33:35 chr10 61719232 . A AT 987.51 PASS AF=1;AO=82;DP=88;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.3283;QD=46.4709;RBI=0.147873;REFB=0;REVB=-0.14716;RO=3;SAF=49;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281116;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00201857;OID=.;OPOS=61719233;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:82:88:85:85:0:49:36:0:0:18:3:49:33:3:0 chr10 61719385 . T G 198.05 PASS AF=0.442308;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00318623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8403;QD=15.2345;RBI=0.0288085;REFB=-0.0257843;REVB=0.0286318;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164418;STB=0.578967;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0285274;OID=.;OPOS=61719385;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:29:29:22:23:0.442308:10:12:11:18:11:12:11:18 chr10 61840347 . G A 381.92 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0232898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.844;QD=19.8398;RBI=0.0361626;REFB=-0.0228865;REVB=0.0276644;RO=38;SAF=18;SAR=21;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173362;STB=0.595991;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0300707;OID=.;OPOS=61840347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:21:18:25:13:21:18:25:13 chr10 61841573 . CTTTT CTTT,CTTTC 1187.8 PASS AF=0.943182,0.0568182;AO=74,6;DP=89;FAO=83,5;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=62,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.125936,0.0276782;FXX=0.0112347;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=21.5034,7.93607;QD=53.9909;RBI=0.181564,0.0459238;REFB=0,0;REVB=-0.130789,-0.0366458;RO=0;SAF=14,2;SAR=60,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.422397,0;SSEP=0,0;SSSB=3.09086e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00987983,-0.0681584;OID=.,.;OPOS=61841574,61841577;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTT,CTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.943182,0.0568182:74,6:89:83,5:88:0:21,2:62,3:0:0:13:0:14,2:60,4:0:0 chr10 62645873 . A G 291.07 PASS AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0446034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.449;QD=26.4611;RBI=0.0543441;REFB=-0.041523;REVB=0.0310453;RO=18;SAF=18;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681934;STB=0.537819;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.023974;OID=.;OPOS=62645873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:18:18:26:26:0.590909:8:18:11:7:8:18:11:7 chr10 63172694 . A G 815.43 PASS AF=0.562963;AO=76;DP=135;FAO=76;FDP=135;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0238991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5061;QD=24.1608;RBI=0.0259258;REFB=0.0157481;REVB=0.0100488;RO=59;SAF=33;SAR=43;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463804;STB=0.525313;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.0112419;OID=.;OPOS=63172694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:59:59:76:76:0.562963:43:33:29:30:43:33:29:30 chr10 63422751 . CTGG CTGGGGCCGACCCCGGCA,CTGGGGGCCGACCCCGGCA,GGCA 1089.18 PASS AF=0.189189,0.630631,0.045045;AO=32,41,5;DP=118;FAO=21,70,5;FDP=111;FR=.;FRO=15;FSAF=21,34,5;FSAR=0,36,0;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.00556159,0.0320364,-0.033386;FXX=0.0347796;HRUN=5,5,3;LEN=14,15,4;MLLD=236.692,244.124,256.282;QD=39.2496;RBI=0.00558059,0.0320425,0.0339267;REFB=-0.00352358,-0.00381923,0.000224076;REVB=-0.000460067,0.000627423,-0.00603296;RO=22;SAF=32,7,5;SAR=0,34,0;SRF=3;SRR=19;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.883532,0.0401191,0.808255;STB=0.999444,0.586183,0.998997;STBP=0,0,0;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=0.0735388,0.00267171,0.0432441;OID=.,.,.;OPOS=63422755,63422755,63422751;OREF=-,-,CTGG;OALT=GGCCGACCCCGGCA,GGGCCGACCCCGGCA,GGCA;OMAPALT=CTGGGGCCGACCCCGGCA,CTGGGGGCCGACCCCGGCA,GGCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:58:118:111:22:15:32,41,5:21,70,5:0.189189,0.630631,0.045045:0,34,0:32,7,5:3:19:0,36,0:21,34,5:0:15 chr10 63422754 . G GGGGCCGACCCCGGCA 50.0 PASS AO=29;DP=159;LEN=15;RO=130;SAF=49;SAR=36;SRF=29;SRR=45;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=63422755;OREF=-;OALT=GGGCCGACCCCGGCA;OMAPALT=GGGGCCGACCCCGGCA GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:159:130:29:36:49:29:45 chr10 63450379 . G A 285.09 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00052608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1735;QD=23.7578;RBI=0.016557;REFB=-0.0279781;REVB=-0.0165487;RO=22;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157879;STB=0.508796;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0232155;OID=.;OPOS=63450379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:9:17:14:8:9:17:14:8 chr10 63520698 . T C 2162.33 PASS AF=1;AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188503;FXX=0.00724585;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.612;QD=63.1336;RBI=0.0203204;REFB=0;REVB=0.00758842;RO=0;SAF=62;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.34722e-06;OID=.;OPOS=63520698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:137:0:0:137:137:1:75:62:0:0:75:62:0:0 chr10 63851034 . G A 93.08 PASS AF=0.5;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00682828;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.989;QD=16.9244;RBI=0.00935806;REFB=-0.0568336;REVB=0.00639905;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783488;STB=0.545372;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0514758;OID=.;OPOS=63851034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:23:22:11:11:11:11:0.5:5:6:5:6:5:6:5:6 chr10 63958112 . T C 1428.6 PASS AF=0.978723;AO=91;DP=95;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0642773;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.059;QD=60.7914;RBI=0.0678597;REFB=-0.0701401;REVB=0.0217569;RO=2;SAF=42;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220344;STB=0.511625;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.000766739;OID=.;OPOS=63958112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:94:2:2:91:92:0.978723:49:42:2:0:50:42:2:0 chr10 63995983 . C T 2008.44 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.476;QD=62.2772;RBI=0.0229779;REFB=0;REVB=-0.0223688;RO=0;SAF=50;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.78557e-05;OID=.;OPOS=63995983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:79:50:0:0:79:50:0:0 chr10 64000878 . T G 301.76 PASS AF=0.923077;AO=21;DP=23;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0246415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0022;QD=46.4242;RBI=0.053746;REFB=0.02193;REVB=0.0477643;RO=2;SAF=11;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767822;STB=0.541632;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-7.8467e-05;OID=.;OPOS=64000878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:26:2:2:21:24:0.923077:10:11:2:0:13:11:2:0 chr10 64110037 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.102;QD=42.1825;RBI=0.0192403;REFB=0;REVB=0.00371207;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000565053;OID=.;OPOS=64110037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr10 64159333 . G T 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0216676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.003;QD=15.8391;RBI=0.0358922;REFB=-0.00258518;REVB=-0.0286141;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17296;STB=0.622369;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00464559;OID=.;OPOS=64159333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:5:3:1:5:5:3:1:6 chr10 64415184 . A G 2347.9 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.589;QD=63.8883;RBI=0.0741056;REFB=0;REVB=0.0280963;RO=0;SAF=70;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102786;OID=.;OPOS=64415184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:77:70:0:0:77:70:0:0 chr10 64565011 . G A 331.34 PASS AF=0.397849;AO=35;DP=91;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.000225864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0015;QD=14.2513;RBI=0.0198104;REFB=-0.021869;REVB=-0.0198091;RO=56;SAF=22;SAR=13;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0041184;STB=0.502163;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0314743;OID=.;OPOS=64565011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:56:56:35:37:0.397849:13:22:35:21:14:23:35:21 chr10 64566572 . T C 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.671;QD=57.2019;RBI=0.0350044;REFB=0;REVB=0.0127045;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450631;OID=.;OPOS=64566572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr10 64567364 . C T 3202.19 PASS AF=1;AO=207;DP=207;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00537059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5704;QD=61.878;RBI=0.00639;REFB=0;REVB=-0.0034625;RO=0;SAF=118;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.04279e-05;OID=.;OPOS=64567364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:207:207:0:0:207:207:1:89:118:0:0:89:118:0:0 chr10 64567938 . C T 746.3 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00559834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.461;QD=63.5147;RBI=0.0217664;REFB=0;REVB=0.0210341;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01208e-05;OID=.;OPOS=64567938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:22:24:0:0:23:24:0:0 chr10 64572037 . ATTTTTTTTC ATTTTTTTC,ATTTTTTTCT 445.46 PASS AF=1,0;AO=47,2;DP=56;FAO=55,0;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.129232,0.00664014;FXX=0.017854;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=9.90567,14.9401;QD=32.3973;RBI=0.15492,0.108238;REFB=0,0;REVB=0.0854369,0.108034;RO=2;SAF=21,0;SAR=26,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0348091,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.000858765,0;OID=.,.;OPOS=64572038,64572045;OREF=T,TC;OALT=-,CT;OMAPALT=ATTTTTTTC,ATTTTTTTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:47,2:56:55,0:55:0:23,0:32,0:0:0:3:2:21,0:26,2:0:2 chr10 64572093 . T C 241.17 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0275743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.058;QD=14.6164;RBI=0.0275792;REFB=-0.0187706;REVB=-0.000517923;RO=38;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187759;STB=0.605988;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0285941;OID=.;OPOS=64572093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:14:14:12:26:14:14:12:26 chr10 64573312 . T G 260.16 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.079304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.095;QD=16.7847;RBI=0.0827002;REFB=-0.0217549;REVB=-0.0234563;RO=33;SAF=14;SAR=15;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113621;STB=0.563715;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0258865;OID=.;OPOS=64573312;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:15:14:12:21:15:14:12:21 chr10 64573771 . C T 451.11 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377619;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.103;QD=58.208;RBI=0.043676;REFB=0;REVB=0.0219461;RO=0;SAF=27;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290516;OID=.;OPOS=64573771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:4:27:0:0:4:27:0:0 chr10 64869942 . A G 83.47 PASS AF=0.226415;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0154472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1767;QD=6.29976;RBI=0.0387943;REFB=-0.00580456;REVB=0.0355863;RO=40;SAF=7;SAR=5;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131907;STB=0.574009;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0410537;OID=.;OPOS=64869942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:52:53:40:41:12:12:0.226415:5:7:19:21:5:7:20:21 chr10 64914016 . T A,TA 928.64 PASS AF=0.030303,0.969697;AO=3,60;DP=65;FAO=2,64;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=2,35;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113496,0.0458975;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=253.295,28.9197;QD=56.2812;RBI=0.0265489,0.132145;REFB=0,0;REVB=-0.0240007,-0.123918;RO=2;SAF=3,31;SAR=0,29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0294747;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0189997,-0.00702968;OID=.,.;OPOS=64914016,64914017;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:65:66:2:0:3,60:2,64:0.030303,0.969697:0,29:3,31:2:0:0,29:2,35:0:0 chr10 64914518 . CATA C 979.3 PASS AF=1;AO=64;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207652;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=3;MLLD=250.784;QD=59.3513;RBI=0.0371941;REFB=0;REVB=0.0308578;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000100919;OID=.;OPOS=64914519;OREF=ATA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:64:68:66:66:0:28:38:0:0:5:0:26:38:0:0 chr10 64927823 . C G 832.25 PASS AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6404;QD=55.483;RBI=0.104032;REFB=-0.118821;REVB=0.0295574;RO=1;SAF=32;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145145;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259629;OID=.;OPOS=64927823;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:60:1:0:58:60:1:26:32:1:0:27:33:0:0 chr10 64945363 . AG AA,GA 367.86 PASS AF=0.925926,0.0740741;AO=25,2;DP=27;FAO=25,2;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12,2;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408978,-0.00539902;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=80.1148,90.4729;QD=54.4976;RBI=0.0658043,0.0150169;REFB=0,0;REVB=-0.0515517,-0.0140128;RO=0;SAF=12,2;SAR=13,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.94263e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000958997,0.0325217;OID=.,.;OPOS=64945364,64945363;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:27:27:0:0:25,2:25,2:0.925926,0.0740741:13,0:12,2:0:0:13,0:12,2:0:0 chr10 64967043 . C G 172.13 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0106314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.155;QD=18.1185;RBI=0.0158671;REFB=-0.00626268;REVB=0.0117787;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171901;STB=0.509793;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00505178;OID=.;OPOS=64967043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:6:12:13:7:6:12:13:7 chr10 64967445 . A T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9559;QD=58.9623;RBI=0.0371216;REFB=0;REVB=0.0201734;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374294;OID=.;OPOS=64967445;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0 chr10 64974537 . A T 816.85 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.891;QD=57.3224;RBI=0.034543;REFB=0;REVB=0.00358396;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012913;OID=.;OPOS=64974537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr10 68685929 . G C 787.32 PASS AF=0.966102;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0179109;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.076;QD=53.3774;RBI=0.0341463;REFB=-0.0980711;REVB=0.0290718;RO=1;SAF=38;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122487;STB=0.506327;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000859348;OID=.;OPOS=68685929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:1:2:56:57:0.966102:18:38:1:0:19:38:1:1 chr10 69676830 . T C 137.83 PASS AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00796459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.302;QD=10.0236;RBI=0.0111095;REFB=0.00217059;REVB=0.00774514;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196386;STB=0.511615;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.00531109;OID=.;OPOS=69676830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:7:11:22:15:7:11:22:15 chr10 69773841 . G A 1418.04 PASS AF=0.961165;AO=99;DP=103;FAO=99;FDP=103;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0606602;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.1798;QD=55.0694;RBI=0.0616388;REFB=-0.0496529;REVB=-0.0109396;RO=4;SAF=50;SAR=49;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180308;STB=0.509513;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.000900804;OID=.;OPOS=69773841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:103:103:4:4:99:99:0.961165:49:50:3:1:49:50:3:1 chr10 69917921 . C T 1268.59 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.019954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.85;QD=60.4093;RBI=0.0206139;REFB=-0.0599196;REVB=-0.00517408;RO=1;SAF=40;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116936;STB=0.506171;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000468653;OID=.;OPOS=69917921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:43:40:1:0:43:40:1:0 chr10 69917925 . T C 1170.92 PASS AF=0.941176;AO=80;DP=85;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0108726;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=311.489;QD=55.1021;RBI=0.0129001;REFB=-0.00477393;REVB=-0.00694262;RO=3;SAF=39;SAR=41;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122538;STB=0.50515;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.000167455;OID=.;OPOS=69917925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:85:85:3:5:80:80:0.941176:41:39:2:1:41:39:2:3 chr10 69926097 . T C 680.06 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.054;QD=61.8237;RBI=0.00733879;REFB=0;REVB=-0.00257332;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74897e-06;OID=.;OPOS=69926097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:19:25:0:0 chr10 69926319 . C A 306.23 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00563391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4718;QD=53.2569;RBI=0.00683423;REFB=0;REVB=-0.00386856;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02904e-05;OID=.;OPOS=69926319;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr10 69926325 . C T 276.35 PASS AF=1;AO=11;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209376;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.291;QD=52.6379;RBI=0.0382766;REFB=0;REVB=0.0320424;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205943;OID=.;OPOS=69926325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:11:21:1:1:10:0:0:11:10:0:0 chr10 69948844 . T C 1824.85 PASS AF=1;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00604211;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.642;QD=61.3396;RBI=0.009589;REFB=0;REVB=0.00744592;RO=0;SAF=55;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.80035e-05;OID=.;OPOS=69948844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:119:0:0:119:119:1:64:55:0:0:64:55:0:0 chr10 69991749 . T G 557.03 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00676104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.318;QD=60.2193;RBI=0.0288167;REFB=0;REVB=0.0280123;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08982e-05;OID=.;OPOS=69991749;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0 chr10 70044031 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9554;QD=55.6556;RBI=0.0363456;REFB=0;REVB=0.0323152;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239293;OID=.;OPOS=70044031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:22:5:0:0:22:5:0:0 chr10 70051810 . A G 364.64 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00474957;FXX=0.0144907;HRUN=8;LEN=1;MLLD=252.729;QD=21.4495;RBI=0.00580944;REFB=0.00499625;REVB=-0.00334532;RO=31;SAF=17;SAR=20;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142739;STB=0.567154;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.00307928;OID=.;OPOS=70051810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:20:17:9:22:21:16:9:22 chr10 70051928 . A G 557.82 PASS AF=0.504348;AO=47;DP=115;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.0206616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.88;QD=19.4025;RBI=0.0290114;REFB=-0.0237101;REVB=-0.0203657;RO=54;SAF=24;SAR=23;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187818;STB=0.55916;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.02652;OID=.;OPOS=70051928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:54:57:47:58:0.504348:23:24:17:37:33:25:18:39 chr10 70102936 . T A 1230.69 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0872802;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4222;QD=61.5345;RBI=0.0882626;REFB=0;REVB=-0.0131323;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000644972;OID=.;OPOS=70102936;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:37:41:0:0:38:42:0:0 chr10 70103272 . G C 295.66 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.00965546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1731;QD=17.9189;RBI=0.00996034;REFB=-0.0187088;REVB=-0.0024455;RO=34;SAF=16;SAR=16;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190493;STB=0.605997;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0354736;OID=.;OPOS=70103272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:16:16:10:24:16:16:10:24 chr10 70105178 . C T 349.87 PASS AF=0.468354;AO=35;DP=77;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0479908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1954;QD=17.7149;RBI=0.0488958;REFB=0.00449575;REVB=0.00936395;RO=42;SAF=17;SAR=18;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324474;STB=0.53245;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.00428299;OID=.;OPOS=70105178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:42:42:35:37:0.468354:18:17:19:23:18:19:19:23 chr10 70105286 . C A 207.94 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00263923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8522;QD=13.4157;RBI=0.00374531;REFB=0.00234309;REVB=0.00265741;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133135;STB=0.584348;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.00366877;OID=.;OPOS=70105286;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:37:25:25:0.403226:10:15:17:19:10:15:17:20 chr10 70105560 . G A 340.57 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00451109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4827;QD=23.4873;RBI=0.0362649;REFB=-0.0302027;REVB=-0.0359833;RO=24;SAF=9;SAR=25;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638814;STB=0.535243;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0190945;OID=.;OPOS=70105560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:25:9:8:16:25:9:8:16 chr10 70221267 . T C 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0406465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.549;QD=17.3249;RBI=0.0417581;REFB=0.00184835;REVB=0.00957094;RO=25;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350307;STB=0.698735;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.000709046;OID=.;OPOS=70221267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:7:13:7:18:7:13:7:18 chr10 70225504 . G T 303.53 PASS AF=0.471429;AO=32;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0652638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4138;QD=17.3444;RBI=0.065676;REFB=0.0195901;REVB=0.00734647;RO=38;SAF=20;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728804;STB=0.553101;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=-0.0229024;OID=.;OPOS=70225504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:37:32:33:0.471429:12:20:21:17:12:21:20:17 chr10 70230336 . A C 92.24 PASS AF=0.28125;AO=6;DP=31;FAO=9;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.00990415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.54;QD=11.53;RBI=0.0482316;REFB=-0.0208508;REVB=0.0472037;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367368;STB=0.677087;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0329437;OID=.;OPOS=70230336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:31:32:20:20:6:9:0.28125:3:3:4:16:5:4:4:16 chr10 70230366 . G A 73.83 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0126929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=322.918;QD=9.84393;RBI=0.0131801;REFB=0.00108559;REVB=-0.00355039;RO=20;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222928;STB=0.631357;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=-0.00273779;OID=.;OPOS=70230366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:7:3:3:17:7:3:3:17 chr10 70405539 . A G 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0126352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.868;QD=10.6345;RBI=0.0609281;REFB=-0.00316017;REVB=0.0596036;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31536;STB=0.689206;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00405528;OID=.;OPOS=70405539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:9:4:5:3:9:4 chr10 70495544 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9461;QD=60.2301;RBI=0.0410759;REFB=0;REVB=0.0315372;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050956;OID=.;OPOS=70495544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0 chr10 70502288 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000133929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.428;QD=57.106;RBI=0.000824728;REFB=0;REVB=-0.00081378;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08569e-06;OID=.;OPOS=70502288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0 chr10 70534744 . A C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00308682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3133;QD=37.4885;RBI=0.0237573;REFB=0;REVB=-0.0235559;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000494916;OID=.;OPOS=70534744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr10 70641860 . T C 753.51 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0245727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9169;QD=61.5112;RBI=0.0269673;REFB=-0.0731937;REVB=0.0111093;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.51219;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00147602;OID=.;OPOS=70641860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:28:20:1:0:28:20:1:0 chr10 70696713 . C T 871.03 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883417;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.087;QD=58.0688;RBI=0.0273714;REFB=0;REVB=0.0259065;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24269e-05;OID=.;OPOS=70696713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr10 70700944 . A G 239.44 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0269;QD=50.4084;RBI=0.0305159;REFB=0;REVB=-0.0296499;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000772142;OID=.;OPOS=70700944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr10 70748703 . GCCCGG GCCCG,GCCG,GCCGGC,GCCGG 533.3 PASS AF=0.888889,0,0.047619,0;AO=17,21,3,7;DP=64;FAO=56,0,3,0;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=25,0,2,0;FSAR=31,0,1,0;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.513013,-0.000562444,-0.0968426,-0.522078;FXX=0.0156226;HRUN=3,3,3,3;LEN=1,2,3,1;MLLD=13.739,13.1394,172.054,15.75;QD=33.8606;RBI=0.520006,0.119732,0.137777,0.613777;REFB=-0.0901351,0.0753833,0.0528585,0.222019;REVB=0.0849948,-0.119731,-0.0979994,-0.322734;RO=11;SAF=0,10,2,7;SAR=17,11,1,0;SRF=6;SRR=5;SSEN=0.257812,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.840766,-0.0430355,0.136146,0.755432;STB=0.530292,0.5,0.831735,0.5;STBP=0.095,1,0.4,1;TYPE=del,del,mnp,del;VARB=0.0614536,0.00743187,0.0817212,0;OID=.,.,.,.;OPOS=70748707,70748706,70748706,70748704;OREF=G,CG,CGG,C;OALT=-,-,GGC,-;OMAPALT=GCCCG,GCCG,GCCGGC,GCCGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.888889,0,0.047619,0:17,21,3,7:64:56,0,3,0:63:4:25,0,2,0:31,0,1,0:0:4:11:11:0,10,2,7:17,11,1,0:6:5 chr10 70856852 . G A 279.9 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0211738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.087;QD=14.1724;RBI=0.0225609;REFB=-0.0130205;REVB=-0.00778853;RO=47;SAF=18;SAR=14;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054658;STB=0.531081;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0247731;OID=.;OPOS=70856852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:14:18:24:23:14:18:24:23 chr10 70863699 . C T 466.6 PASS AF=0.542169;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0115025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.908;QD=22.4868;RBI=0.0196511;REFB=-0.0235348;REVB=-0.0159329;RO=37;SAF=26;SAR=19;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141661;STB=0.512942;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0313459;OID=.;OPOS=70863699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:37:38:45:45:0.542169:19:26:22:15:19:26:23:15 chr10 70992664 . C T 322.71 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0117949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.875;QD=19.2665;RBI=0.0379394;REFB=-0.0199079;REVB=0.0360593;RO=33;SAF=23;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179391;STB=0.600125;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0173751;OID=.;OPOS=70992664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:11:23:16:17:11:23:16:17 chr10 71018660 . T C 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.844;QD=59.3228;RBI=0.0175502;REFB=0;REVB=-0.0124193;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70519e-05;OID=.;OPOS=71018660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0 chr10 71026510 . C A 389.33 PASS AF=0.622951;AO=37;DP=60;FAO=38;FDP=61;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0414637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.026;QD=25.5299;RBI=0.0457485;REFB=-0.0443004;REVB=0.0193308;RO=23;SAF=15;SAR=22;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522765;STB=0.532485;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0300107;OID=.;OPOS=71026510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:23:23:37:38:0.622951:22:15:11:12:23:15:11:12 chr10 71027231 . G C 657.87 PASS AF=0.496241;AO=66;DP=133;FAO=66;FDP=133;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=2.43817e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.332;QD=19.7857;RBI=0.0105833;REFB=-0.0367525;REVB=0.0105833;RO=64;SAF=23;SAR=43;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113591;STB=0.560986;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0413762;OID=.;OPOS=71027231;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:64:67:66:66:0.496241:43:23:30:34:43:23:31:36 chr10 71055459 . T C 255.05 PASS AF=0.913043;AO=9;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.049168;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=34.6339;QD=44.3556;RBI=0.0815726;REFB=-0.0533513;REVB=0.0650891;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506323;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00760348;OID=.;OPOS=71055459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:0:2:9:21:0.913043:3:6:0:0:12:9:1:1 chr10 71060610 . A G 416.67 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209428;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1814;QD=57.4711;RBI=0.0344036;REFB=0;REVB=0.0272948;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100767;OID=.;OPOS=71060610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr10 71060621 . C T 51.15 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0144802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3155;QD=6.19968;RBI=0.0150057;REFB=-0.0389321;REVB=0.00393659;RO=23;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201057;STB=0.512165;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0608903;OID=.;OPOS=71060621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:33:33:23:25:8:8:0.242424:5:3:9:14:5:3:9:16 chr10 71060634 . G A 375.51 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0616;QD=55.6315;RBI=0.0139488;REFB=0;REVB=0.000607507;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010086;OID=.;OPOS=71060634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:21:5:0:0:21:6:0:0 chr10 71098295 . T A 360.77 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00738646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.701;QD=17.5986;RBI=0.0206671;REFB=-0.0130385;REVB=0.019302;RO=44;SAF=11;SAR=27;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218785;STB=0.623009;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0206812;OID=.;OPOS=71098295;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:0.463415:27:11:22:22:27:11:22:22 chr10 71098376 . T G 208.1 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.000438148;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.141;QD=14.1082;RBI=0.00674049;REFB=-0.0178932;REVB=0.00672623;RO=33;SAF=5;SAR=19;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327367;STB=0.677256;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0205214;OID=.;OPOS=71098376;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:35:24:24:0.40678:19:5:16:17:19:5:16:19 chr10 71129194 . C T 420.47 PASS AF=0.538462;AO=40;DP=75;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00503046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.973;QD=21.5624;RBI=0.0168757;REFB=-0.0278615;REVB=-0.0161085;RO=35;SAF=28;SAR=12;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219447;STB=0.622429;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0152563;OID=.;OPOS=71129194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:78:35:36:40:42:0.538462:12:28:16:19:12:30:17:19 chr10 71142420 . G A 284.56 PASS AF=0.5;AO=23;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0689438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.3209;QD=18.3588;RBI=0.107693;REFB=-0.0565897;REVB=0.0827313;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428164;STB=0.577836;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0619952;OID=.;OPOS=71142420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:31:31:23:31:0.5:8:15:19:12:8:23:19:12 chr10 71168685 . A T 651.21 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.8186e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.149;QD=62.0201;RBI=0.0608789;REFB=0;REVB=0.0608789;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115227;OID=.;OPOS=71168685;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr10 71168727 . C T 409.08 PASS AF=0.438776;AO=40;DP=97;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0439676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9149;QD=16.6971;RBI=0.0871496;REFB=-0.0158338;REVB=0.0752456;RO=54;SAF=17;SAR=23;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771446;STB=0.537894;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0138222;OID=.;OPOS=71168727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:54:55:40:43:0.438776:23:17:27:27:24:19:28:27 chr10 71390392 . C T 714.09 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356454;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.816;QD=63.4743;RBI=0.0707482;REFB=0;REVB=0.0611123;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174106;OID=.;OPOS=71390392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0 chr10 71392557 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.742;QD=60.9784;RBI=0.0220297;REFB=0;REVB=0.00328198;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23202e-05;OID=.;OPOS=71392557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr10 71392692 . T C 1556.5 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0593843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.019;QD=59.8655;RBI=0.0643154;REFB=0;REVB=0.0246977;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.6818e-05;OID=.;OPOS=71392692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:56:48:0:0:56:48:0:0 chr10 71562437 . G A 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00187661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.175;QD=13.4592;RBI=0.0102321;REFB=-0.00551132;REVB=0.0100585;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322429;STB=0.687266;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00954305;OID=.;OPOS=71562437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:26:16:16:0.380952:11:5:15:9:11:5:16:10 chr10 71582188 . C T 631.25 PASS AF=0.976744;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0193299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.02;QD=58.7213;RBI=0.0193645;REFB=-0.163149;REVB=-0.00115619;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253524;STB=0.513507;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000289093;OID=.;OPOS=71582188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:43:1:1:41:42:0.976744:18:23:0:1:18:24:0:1 chr10 71620403 . G A 168.69 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.000358618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.446;QD=16.0653;RBI=0.00300715;REFB=-0.000804524;REVB=0.00298569;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113876;STB=0.565147;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000977998;OID=.;OPOS=71620403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:8:16:10:8:8:16 chr10 71620436 . A AC,C 643.13 PASS AF=0.958333,0;AO=42,3;DP=48;FAO=46,0;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=16,0;FSAR=30,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0190576,-0.0513109;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.0501,5.67495;QD=53.5945;RBI=0.0642548,0.120849;REFB=-0.0586399,-0.0857601;REVB=-0.0613636,-0.109415;RO=2;SAF=14,2;SAR=28,1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.062438,-0.272699;STB=0.529399,0.5;STBP=0.098,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00649152,0;OID=.,.;OPOS=71620437,71620436;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:48:48:2:2:42,3:46,0:0.958333,0:28,1:14,2:2:0:30,0:16,0:2:0 chr10 71657272 . A G 715.17 PASS AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00455156;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.691;QD=57.2136;RBI=0.012703;REFB=-0.0184959;REVB=-0.0118596;RO=3;SAF=29;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00592548;STB=0.503155;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.000325932;OID=.;OPOS=71657272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:50:50:3:3:47:47:0.94:18:29:2:1:18:29:2:1 chr10 71658512 . G A 1320.92 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.76;QD=62.1611;RBI=0.0197595;REFB=0;REVB=-0.0184696;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.69343e-05;OID=.;OPOS=71658512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0 chr10 71678058 . C G 278.79 PASS AF=0.336449;AO=36;DP=107;FAO=36;FDP=107;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=57;FSRR=14;FWDB=0.0206859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7719;QD=10.4222;RBI=0.104051;REFB=0.0361392;REVB=-0.101974;RO=71;SAF=25;SAR=11;SRF=57;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158784;STB=0.590655;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0693833;OID=.;OPOS=71678058;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:71:71:36:36:0.336449:11:25:57:14:11:25:57:14 chr10 71851664 . AG A 36.51 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0706267;FXX=0.0587889;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.3439;QD=9.12792;RBI=0.0710357;REFB=-0.12258;REVB=0.00761164;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404365;STB=0.730929;STBP=0.192;TYPE=del;VARB=0.123385;OID=.;OPOS=71851665;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4375:7:17:7:16:9:1:6:4:5:32:8:1:6:4:4 chr10 71872410 . C T 1224.5 PASS AF=0.987805;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00876893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.858;QD=59.7316;RBI=0.0137384;REFB=-0.0811016;REVB=0.0105759;RO=1;SAF=47;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00996796;STB=0.505153;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.06803e-05;OID=.;OPOS=71872410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:80:81:0.987805:33:47:1:0:33:48:1:0 chr10 71874683 . G A 926.19 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.011482;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.005;QD=56.9963;RBI=0.0286941;REFB=-0.0884441;REVB=0.0262966;RO=1;SAF=37;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125954;STB=0.506665;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.000900948;OID=.;OPOS=71874683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:65:1:1:64:64:0.984615:27:37:1:0:27:37:1:0 chr10 71874734 . G A 1434.31 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4951;QD=63.0468;RBI=0.0490584;REFB=0;REVB=0.00837071;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350941;OID=.;OPOS=71874734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:47:44:0:0:47:44:0:0 chr10 71874784 . C T 1647.95 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000915899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.94;QD=59.9253;RBI=0.00471967;REFB=0;REVB=0.00462995;RO=0;SAF=54;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377271;OID=.;OPOS=71874784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:110:0:0:108:110:1:54:54:0:0:55:55:0:0 chr10 71880858 . A G 267.42 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0172792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.015;QD=13.7137;RBI=0.0174769;REFB=-0.0258586;REVB=-0.00262173;RO=47;SAF=14;SAR=17;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0051283;STB=0.502922;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0406425;OID=.;OPOS=71880858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:17:14:21:26:17:14:21:26 chr10 71905569 . C A 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.592;QD=47.8204;RBI=0.0718282;REFB=0;REVB=0.0664188;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000600223;OID=.;OPOS=71905569;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chr10 72043389 . T G 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.517;QD=53.9058;RBI=0.0314157;REFB=0;REVB=-0.00614508;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102871;OID=.;OPOS=72043389;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr10 72043460 . T G 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00612289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2153;QD=14.6525;RBI=0.0164459;REFB=0.0180254;REVB=0.0152636;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392076;STB=0.739831;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.00707718;OID=.;OPOS=72043460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:3:2:5:1:3:2 chr10 72179746 . C T 140.53 PASS AF=0.6;AO=14;DP=24;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0312518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.948;QD=22.484;RBI=0.0331757;REFB=-0.00329519;REVB=0.0111333;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375461;STB=0.708097;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00171146;OID=.;OPOS=72179746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:25:10:10:14:15:0.6:7:7:0:10:7:8:0:10 chr10 72181460 . G T 575.73 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9148;QD=60.6034;RBI=0.0755996;REFB=0;REVB=-0.0714664;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00171398;OID=.;OPOS=72181460;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr10 72195439 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=17;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1132;QD=59.0184;RBI=0.044054;REFB=0;REVB=0.039782;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101108;OID=.;OPOS=72195439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:17:34:1:12:5:0:0:12:22:0:0 chr10 72289701 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.298;QD=55.6561;RBI=0.0256514;REFB=0;REVB=0.00952547;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123114;OID=.;OPOS=72289701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0 chr10 72307101 . C T 1175.91 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0881109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.803;QD=59.5396;RBI=0.0888251;REFB=-0.111033;REVB=0.0112411;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000287075;OID=.;OPOS=72307101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:0:1:78:78:0.987342:47:31:0:0:47:31:0:1 chr10 72324143 . A G 1209.3 PASS AF=0.922222;AO=83;DP=90;FAO=83;FDP=90;FR=.;FRO=7;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0016611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1594;QD=53.7469;RBI=0.0452676;REFB=0.0152978;REVB=-0.0452371;RO=7;SAF=45;SAR=38;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255244;STB=0.51351;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.00845098;OID=.;OPOS=72324143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:90:90:7:7:83:83:0.922222:38:45:5:2:38:45:5:2 chr10 72358577 . G A 465.61 PASS AF=0.47619;AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0267385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1523;QD=17.7375;RBI=0.0757945;REFB=-0.0179906;REVB=0.0709215;RO=55;SAF=20;SAR=30;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702069;STB=0.539047;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0247432;OID=.;OPOS=72358577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:55:55:50:50:0.47619:30:20:26:29:30:20:26:29 chr10 72500762 . CT C,CC 781.15 PASS AF=0.959184,0.0408163;AO=9,35;DP=44;FAO=47,2;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14,2;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148614,0.214371;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=219.464,211.657;QD=63.7674;RBI=0.184146,0.251782;REFB=0,0;REVB=-0.108737,-0.132058;RO=0;SAF=9,2;SAR=0,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-3.30325e-05,-0.0560824;OID=.,.;OPOS=72500763,72500763;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.959184,0.0408163:9,35:44:47,2:49:0:14,2:33,0:0:0:8:0:9,2:0,33:0:0 chr10 72500863 . C G 401.09 PASS AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0726707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.337;QD=24.3085;RBI=0.0731371;REFB=-0.00698586;REVB=0.0082463;RO=27;SAF=9;SAR=30;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196688;STB=0.608635;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00308461;OID=.;OPOS=72500863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:27:27:39:39:0.590909:30:9:12:15:30:9:12:15 chr10 72503344 . G A 638.54 PASS AF=0.464286;AO=65;DP=135;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.00388015;FXX=0.0070917;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.906;QD=18.244;RBI=0.0164042;REFB=-0.00801188;REVB=-0.0159387;RO=69;SAF=46;SAR=19;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242666;STB=0.644813;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00847501;OID=.;OPOS=72503344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:140:69:75:65:65:0.464286:19:46:32:37:19:46:34:41 chr10 72505208 . A G 55.34 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0175591;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.554;QD=9.62475;RBI=0.0175593;REFB=-0.00453475;REVB=-8.01212e-05;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399996;STB=0.726564;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0337646;OID=.;OPOS=72505208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:24:23:14:15:6:6:0.26087:2:4:4:10:2:4:5:10 chr10 72513635 . C A 698.71 PASS AF=0.474359;AO=73;DP=156;FAO=74;FDP=156;FR=.;FRO=82;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=0.014405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.93;QD=17.9157;RBI=0.0202515;REFB=0.00171652;REVB=0.0142344;RO=78;SAF=44;SAR=29;SRF=51;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505193;STB=0.507657;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00140455;OID=.;OPOS=72513635;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:78:82:73:74:0.474359:29:44:51:27:29:45:51:31 chr10 72513682 . C T 543.27 PASS AF=0.442748;AO=58;DP=133;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=0.126758;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.002;QD=16.5884;RBI=0.126758;REFB=-0.017972;REVB=-6.05e-05;RO=71;SAF=37;SAR=21;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00440408;STB=0.512867;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0285175;OID=.;OPOS=72513682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:131:71:73:58:58:0.442748:21:37:45:26:21:37:45:28 chr10 72517837 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.279;QD=62.3509;RBI=0.0272532;REFB=0;REVB=0.0106212;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74069e-05;OID=.;OPOS=72517837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr10 72520330 . A G 354.48 PASS AF=0.545455;AO=35;DP=65;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0218873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.426;QD=21.4835;RBI=0.02189;REFB=-0.0216567;REVB=0.000343721;RO=29;SAF=17;SAR=18;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144877;STB=0.59086;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0211193;OID=.;OPOS=72520330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:29:30:35:36:0.545455:18:17:9:20:18:18:9:21 chr10 72520567 . A G 243.87 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0220097;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.025;QD=22.6853;RBI=0.0336168;REFB=-0.0273567;REVB=-0.0254099;RO=20;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595626;STB=0.533304;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.026284;OID=.;OPOS=72520567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:12:11:11:9:12:11:11:9 chr10 72520835 . C T 408.86 PASS AF=0.571429;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0273078;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.524;QD=23.3633;RBI=0.0280682;REFB=0.00726836;REVB=0.0064892;RO=29;SAF=8;SAR=32;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154287;STB=0.580602;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00742923;OID=.;OPOS=72520835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:29:30:40:40:0.571429:32:8:10:19:32:8:10:20 chr10 72532037 . C T 489.46 PASS AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0282178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.253;QD=18.2976;RBI=0.0402861;REFB=-0.0190139;REVB=-0.0287528;RO=54;SAF=30;SAR=22;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037301;STB=0.516477;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0187826;OID=.;OPOS=72532037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:54:55:52:52:0.485981:22:30:29:25:22:30:30:25 chr10 72535007 . C T 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0108775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.91;QD=21.9719;RBI=0.029405;REFB=-0.0144767;REVB=-0.0273192;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0092715;STB=0.505193;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0226761;OID=.;OPOS=72535007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:9:14:13:8:9:14:13:8 chr10 72536936 . A G 314.18 PASS AF=0.596154;AO=28;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0501027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.8754;QD=24.1677;RBI=0.0734426;REFB=-0.0317254;REVB=-0.0536986;RO=17;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957971;STB=0.580474;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0216665;OID=.;OPOS=72536936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:21:28:31:0.596154:12:16:12:5:15:16:15:6 chr10 72619205 . C T 2148.77 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.28;QD=62.7378;RBI=0.0496994;REFB=0;REVB=0.0317081;RO=0;SAF=68;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76136e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.44101e-05;OID=.;OPOS=72619205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:133:137:0:0:133:137:1:65:68:0:0:67:70:0:0 chr10 73046617 . A G 286.7 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.000195826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.335;QD=24.4;RBI=0.0143056;REFB=-0.0356003;REVB=0.0143043;RO=21;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225518;STB=0.625311;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0153536;OID=.;OPOS=73046617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:16:10:14:7:16:10:14:7 chr10 73046625 . C T 214.53 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=39;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00098518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.9;QD=20.9296;RBI=0.0222473;REFB=-0.0107737;REVB=0.0222255;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207215;STB=0.630017;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0137348;OID=.;OPOS=73046625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:17:20:20:21:0.512195:11:9:12:5:12:9:14:6 chr10 73051388 . T C 624.41 PASS AF=0.557522;AO=60;DP=110;FAO=63;FDP=113;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00650989;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.656;QD=22.1031;RBI=0.0183714;REFB=-0.0256052;REVB=0.0171793;RO=44;SAF=29;SAR=31;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100751;STB=0.531917;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0260925;OID=.;OPOS=73051388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:44:50:60:63:0.557522:31:29:27:17:31:32:29:21 chr10 73057755 . G C 777.16 PASS AF=0.423469;AO=83;DP=197;FAO=83;FDP=196;FR=.;FRO=113;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=47;FSRR=66;FWDB=-0.00927053;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9775;QD=15.8604;RBI=0.0383677;REFB=-0.0120291;REVB=-0.0372309;RO=113;SAF=29;SAR=54;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735043;STB=0.541129;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0148466;OID=.;OPOS=73057755;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:113:113:83:83:0.423469:54:29:47:66:54:29:47:66 chr10 73104054 . C T 146.85 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0804711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.803;QD=11.2962;RBI=0.0813987;REFB=-0.00632685;REVB=-0.0122535;RO=34;SAF=8;SAR=10;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12679;STB=0.574386;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00975914;OID=.;OPOS=73104054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:10:8:19:15:10:8:19:15 chr10 73104056 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.953;QD=56.9567;RBI=0.048302;REFB=0;REVB=-0.00812847;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106435;OID=.;OPOS=73104056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0 chr10 73111408 . C T 446.81 PASS AF=0.431034;AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=0.00346346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7969;QD=15.4072;RBI=0.0113782;REFB=0.0265603;REVB=0.0108382;RO=66;SAF=27;SAR=23;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210837;STB=0.511817;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.0338949;OID=.;OPOS=73111408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:66:66:50:50:0.431034:23:27:37:29:23:27:37:29 chr10 73115941 . TG CA 1438.41 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00844858;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=170.77;QD=61.8671;RBI=0.0132852;REFB=-0.0322733;REVB=0.0102527;RO=1;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114219;STB=0.506023;STBP=0.293;TYPE=mnp;VARB=0.000611358;OID=.;OPOS=73115941;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:41:51:0:1:41:51:0:1 chr10 73121913 . A G 785.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.152069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.464;QD=64.0888;RBI=0.15227;REFB=0;REVB=0.00782166;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428781;OID=.;OPOS=73121913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:20:27:0:0:20:29:0:0 chr10 73121945 . T C 710.22 PASS AF=0.980769;AO=42;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0353976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.682;QD=54.6325;RBI=0.0357597;REFB=-0.0932488;REVB=0.00507628;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.51428;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000446898;OID=.;OPOS=73121945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:42:51:0.980769:11:31:0:0:17:34:0:1 chr10 73270906 . T C 423.41 PASS AF=0.462366;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0152611;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.463;QD=18.2111;RBI=0.0231056;REFB=-0.011861;REVB=-0.0173485;RO=48;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503934;STB=0.538444;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0110896;OID=.;OPOS=73270906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:48:50:43:43:0.462366:21:22:22:26:21:22:22:28 chr10 73270982 . G A 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0868822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.82;QD=11.1304;RBI=0.0879651;REFB=0.00721943;REVB=0.0137602;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522173;STB=0.531188;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.0179129;OID=.;OPOS=73270982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:6:4:6:11:6:4:6:11 chr10 73434888 . G C 221.76 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0468434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6439;QD=18.4799;RBI=0.0496956;REFB=-0.0142309;REVB=0.0165935;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519593;STB=0.517226;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0154016;OID=.;OPOS=73434888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:25:26:22:22:0.458333:12:10:10:15:12:10:11:15 chr10 73455201 . T C 306.05 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0607645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.793;QD=20.4032;RBI=0.0641377;REFB=0.00459744;REVB=-0.0205261;RO=27;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458672;STB=0.516656;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=-0.00539859;OID=.;OPOS=73455201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:27:28:32:32:0.533333:16:16:12:15:16:16:13:15 chr10 73455273 . T C 269.3 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0235936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.177;QD=16.5723;RBI=0.0242598;REFB=-0.0126744;REVB=-0.00564639;RO=35;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464336;STB=0.502611;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0173046;OID=.;OPOS=73455273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:13:17:20:15:13:17:20:15 chr10 73472553 . G A 250.74 PASS AF=0.489796;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0147522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.044;QD=20.4682;RBI=0.0470342;REFB=-0.00846804;REVB=0.0446608;RO=24;SAF=16;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11363;STB=0.563298;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0120486;OID=.;OPOS=73472553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:24:25:23:24:0.489796:7:16:14:10:7:17:15:10 chr10 73472868 . C G 219.37 PASS AF=0.433333;AO=19;DP=62;FAO=26;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00326618;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.614;QD=14.6244;RBI=0.04084;REFB=-0.00798338;REVB=0.0407092;RO=35;SAF=15;SAR=4;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152822;STB=0.514275;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0155389;OID=.;OPOS=73472868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:60:35:34:19:26:0.433333:4:15:24:11:9:17:23:11 chr10 73472882 . C T 242.35 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=0.0175613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.49;QD=14.9137;RBI=0.0182064;REFB=-0.011357;REVB=0.00480362;RO=36;SAF=16;SAR=12;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157806;STB=0.594407;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0146138;OID=.;OPOS=73472882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:37:28:28:0.430769:12:16:26:10:12:16:27:10 chr10 73492079 . A G 233.54 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00520432;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2732;QD=18.3166;RBI=0.0393492;REFB=-0.0301712;REVB=0.0390035;RO=26;SAF=22;SAR=3;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246754;STB=0.641267;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0327752;OID=.;OPOS=73492079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:26:26:25:25:0.490196:3:22:19:7:3:22:19:7 chr10 73501556 . G A 283.75 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0121511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.017;QD=23.163;RBI=0.0438034;REFB=0.0116564;REVB=0.0420843;RO=23;SAF=8;SAR=18;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192889;STB=0.608022;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.00841517;OID=.;OPOS=73501556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:18:8:12:11:18:8:12:11 chr10 73520632 . A C 1094.56 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105403;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9847;QD=59.9759;RBI=0.0623554;REFB=0;REVB=0.0614581;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334204;OID=.;OPOS=73520632;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:72:73:1:40:32:0:0:41:32:0:0 chr10 73521578 . G A 785.86 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.694;QD=64.1522;RBI=0.04586;REFB=0;REVB=0.0358229;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182287;OID=.;OPOS=73521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr10 73544093 . C G 1190.26 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.58;QD=61.0388;RBI=0.0509653;REFB=0;REVB=-0.0496914;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111544;OID=.;OPOS=73544093;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0 chr10 73550117 . C G 906.15 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.325;QD=57.5335;RBI=0.0588182;REFB=0;REVB=0.0083198;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244407;OID=.;OPOS=73550117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:32:30:0:0:33:30:0:0 chr10 73576307 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.097;QD=48.7373;RBI=0.0443303;REFB=0;REVB=0.0316472;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000678957;OID=.;OPOS=73576307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0 chr10 73585526 . A G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116519;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.363;QD=62.9829;RBI=0.0120053;REFB=0;REVB=0.00289146;RO=0;SAF=37;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50278e-05;OID=.;OPOS=73585526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:8:37:0:0:8:37:0:0 chr10 73819046 . T C 108.52 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00735628;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=141.133;QD=13.5647;RBI=0.0124887;REFB=-0.00581743;REVB=0.0100923;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21212;STB=0.635611;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0109832;OID=.;OPOS=73819046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:32:17:19:13:13:0.40625:3:10:10:7:3:10:11:8 chr10 73822343 . T C 286.5 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00403423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.167;QD=24.3827;RBI=0.0111236;REFB=-0.0229507;REVB=-0.0103662;RO=21;SAF=14;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500831;STB=0.527847;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0173732;OID=.;OPOS=73822343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:12:14:10:11:12:14:10:11 chr10 74237247 . C CT 181.11 PASS AF=0.477612;AO=30;DP=68;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0102902;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.254;QD=10.8128;RBI=0.205975;REFB=0.0309798;REVB=-0.205717;RO=37;SAF=15;SAR=15;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927095;STB=0.568203;STBP=0.327;TYPE=ins;VARB=-0.0251121;OID=.;OPOS=74237248;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477612:30:68:32:67:35:15:17:21:14:99:37:15:15:22:15 chr10 74830335 . A G 332.7 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.022875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.58;QD=26.6163;RBI=0.0240165;REFB=-0.0179772;REVB=0.00731615;RO=21;SAF=21;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209916;STB=0.616607;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0174329;OID=.;OPOS=74830335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:8:21:10:11:8:21:10:11 chr10 74834651 . T C 195.36 PASS AF=0.418182;AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00992564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.335;QD=14.2079;RBI=0.0526896;REFB=-0.0340884;REVB=-0.0517463;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108098;STB=0.509083;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0489051;OID=.;OPOS=74834651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:31:32:22:23:0.418182:13:9:13:18:14:9:13:19 chr10 74894375 . T C 384.24 PASS AF=0.373984;AO=46;DP=123;FAO=46;FDP=123;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.0120201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.854;QD=12.4957;RBI=0.0385491;REFB=-0.00737179;REVB=0.0366272;RO=76;SAF=24;SAR=22;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00502037;STB=0.501416;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0126282;OID=.;OPOS=74894375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:76:77:46:46:0.373984:22:24:40:36:22:24:40:37 chr10 74896664 . T C 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00286832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9098;QD=19.8495;RBI=0.0135965;REFB=0.014978;REVB=0.0132905;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132271;STB=0.574782;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.00874687;OID=.;OPOS=74896664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:9:4:7:8:9:4 chr10 74897816 . C T 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0098094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3712;QD=10.3902;RBI=0.0376657;REFB=-0.0417134;REVB=0.0363659;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090156;STB=0.555391;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0671833;OID=.;OPOS=74897816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:5:2:4:7:5:2:4:7 chr10 74899134 . C G 150.38 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0749238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5724;QD=12.2759;RBI=0.0749654;REFB=-0.0055412;REVB=-0.00249714;RO=32;SAF=6;SAR=11;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328475;STB=0.69209;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00537706;OID=.;OPOS=74899134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:11:6:21:11:11:6:21:11 chr10 74916173 . T A 144.59 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0165268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8015;QD=15.6308;RBI=0.0273663;REFB=-0.0107472;REVB=-0.0218123;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384175;STB=0.522156;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0461396;OID=.;OPOS=74916173;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:7:9:11:10:7:9:11:10 chr10 74923562 . C T 486.24 PASS AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0263277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.14;QD=21.3732;RBI=0.0271042;REFB=-0.00503868;REVB=0.00644131;RO=43;SAF=30;SAR=17;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114326;STB=0.558524;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00471557;OID=.;OPOS=74923562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:43:44:47:47:0.516484:17:30:22:21:17:30:23:21 chr10 74934442 . C T 153.77 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.047988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7178;QD=14.3042;RBI=0.048193;REFB=-0.0106435;REVB=-0.00444062;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229786;STB=0.632285;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0126088;OID=.;OPOS=74934442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:9:8:18:8:9:8:18:8 chr10 74995086 . C T 343.19 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.0110188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.638;QD=18.805;RBI=0.037535;REFB=-0.00368772;REVB=-0.0358812;RO=37;SAF=13;SAR=23;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643019;STB=0.535725;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00487973;OID=.;OPOS=74995086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:23:13:11:26:23:13:11:26 chr10 75000698 . T C 260.0 PASS AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00451961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.37;QD=31.5157;RBI=0.00605198;REFB=-0.0258271;REVB=0.00402487;RO=10;SAF=5;SAR=18;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198881;STB=0.610065;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0196238;OID=.;OPOS=75000698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:10:10:23:23:0.69697:18:5:5:5:18:5:5:5 chr10 75000739 . G A 287.11 PASS AF=0.694444;AO=25;DP=36;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0119473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.906;QD=31.901;RBI=0.0156934;REFB=-0.0427511;REVB=0.0101757;RO=11;SAF=5;SAR=20;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19178;STB=0.605968;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0175064;OID=.;OPOS=75000739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:36:11:11:25:25:0.694444:20:5:5:6:20:5:5:6 chr10 75009107 . T A 375.76 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00596135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.548;QD=23.8575;RBI=0.0163327;REFB=-0.00403694;REVB=0.0152059;RO=26;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096665;STB=0.553054;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00255641;OID=.;OPOS=75009107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:26:37:37:0.587302:19:18:16:10:19:18:16:10 chr10 75035257 . T C 219.2 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00843689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7971;QD=13.9176;RBI=0.0868183;REFB=0.0124276;REVB=0.0864073;RO=37;SAF=10;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188947;STB=0.60776;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=-0.0111476;OID=.;OPOS=75035257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:16:10:21:16:16:10:21:16 chr10 75056863 . A C 397.16 PASS AF=0.555556;AO=39;DP=71;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00498993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.118;QD=22.0641;RBI=0.00515019;REFB=-0.0193989;REVB=0.00127479;RO=32;SAF=20;SAR=19;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359913;STB=0.513882;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0150622;OID=.;OPOS=75056863;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:32:32:39:40:0.555556:19:20:15:17:20:20:15:17 chr10 75095253 . G A 286.5 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0284891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.958;QD=24.3826;RBI=0.0285483;REFB=0.00298303;REVB=-0.00183688;RO=20;SAF=9;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12691;STB=0.583125;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.0023933;OID=.;OPOS=75095253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:21:26:26:0.553191:17:9:10:10:17:9:11:10 chr10 75148116 . A G 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00422919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.422;QD=16.9229;RBI=0.0338681;REFB=-0.0132625;REVB=-0.033603;RO=34;SAF=19;SAR=11;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158827;STB=0.508923;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0155228;OID=.;OPOS=75148116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:11:19:21:13:11:19:21:13 chr10 75289359 . C A 250.23 PASS AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0505743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.461;QD=26.3404;RBI=0.0521536;REFB=-0.0427007;REVB=0.0127375;RO=15;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554829;STB=0.530779;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0244082;OID=.;OPOS=75289359;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:9:14:8:7:9:14:8:7 chr10 75532454 . C T 49.61 PASS AF=0.538462;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00590191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.816;QD=15.2652;RBI=0.158066;REFB=-0.00452453;REVB=0.157956;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666317;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00571148;OID=.;OPOS=75532454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:12:13:6:6:6:7:0.538462:0:6:6:0:1:6:6:0 chr10 75632760 . C T 1011.97 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.56;QD=57.8267;RBI=0.0274694;REFB=-0.136029;REVB=0.0141539;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000682325;OID=.;OPOS=75632760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:0:1:69:69:0.985714:40:29:0:0:40:29:0:1 chr10 75673101 . T C 555.53 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.871;QD=60.057;RBI=0.0209217;REFB=0;REVB=0.00192931;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113717;OID=.;OPOS=75673101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:8:28:0:0:9:28:0:0 chr10 75849894 . C T 253.61 PASS AF=0.375;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=-0.00597721;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.059;QD=12.6804;RBI=0.0304982;REFB=0.00492625;REVB=-0.0299068;RO=50;SAF=14;SAR=16;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252383;STB=0.643589;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.0129618;OID=.;OPOS=75849894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:50:50:30:30:0.375:16:14:35:15:16:14:35:15 chr10 76781905 . GGAA AGAG,G 464.97 PASS AF=0.0363636,0.763636;AO=3,36;DP=48;FAO=2,42;FDP=55;FR=.;FRO=11;FSAF=2,16;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.00068523,0.0360185;FXX=0.017854;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=101.299,173.289;QD=33.8162;RBI=0.0725613,0.0919573;REFB=-0.0674152,-0.0801719;REVB=0.0725581,0.0846097;RO=0;SAF=2,12;SAR=1,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.998448,0.587263;STBP=0.001,0.031;TYPE=mnp,del;VARB=-0.0281576,0.0267489;OID=.,.;OPOS=76781905,76781906;OREF=GGAA,GAA;OALT=AGAG,-;OMAPALT=AGAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:75:48:55:0:11:3,36:2,42:0.0363636,0.763636:1,24:2,12:0:0:0,26:2,16:0:11 chr10 76788860 . C T 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00428774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.636;QD=19.3436;RBI=0.00498743;REFB=-0.0158637;REVB=0.00254751;RO=18;SAF=5;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262847;STB=0.649825;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0158844;OID=.;OPOS=76788860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:13:5:10:8:13:5:10:8 chr10 76789077 . G A 333.12 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0443454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.74;QD=16.4503;RBI=0.0444231;REFB=-0.0197287;REVB=0.00262665;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125798;STB=0.57061;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0208675;OID=.;OPOS=76789077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:17:19:18:27:17:19:18:27 chr10 76790612 . TG T 256.47 PASS AF=0.738095;AO=30;DP=42;FAO=31;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0394113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.1181;QD=24.4261;RBI=0.0643544;REFB=0.0058407;REVB=0.0508748;RO=11;SAF=17;SAR=13;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.464789;SSSB=-0.226215;STB=0.62215;STBP=0.021;TYPE=del;VARB=0.00202394;OID=.;OPOS=76790613;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.738095:30:42:31:42:11:17:14:11:0:49:11:17:13:11:0 chr10 76803567 . T G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00430261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.418;QD=58.6005;RBI=0.0220494;REFB=0;REVB=0.0216255;RO=0;SAF=45;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45163e-05;OID=.;OPOS=76803567;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:19:45:0:0:19:45:0:0 chr10 76854564 . C T 1513.42 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.367;QD=59.9375;RBI=0.0409805;REFB=0;REVB=0.0021595;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.29937e-05;OID=.;OPOS=76854564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:48:53:0:0:48:53:0:0 chr10 76855412 . G A 304.1 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00947418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.465;QD=19.941;RBI=0.0149852;REFB=-0.0133646;REVB=0.0116101;RO=29;SAF=5;SAR=27;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279201;STB=0.657421;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0107067;OID=.;OPOS=76855412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:27:5:11:18:27:5:11:18 chr10 76855421 . G A 249.92 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=-0.0196834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7758;QD=16.6612;RBI=0.0227089;REFB=0.0102701;REVB=0.0113252;RO=32;SAF=11;SAR=17;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252735;STB=0.640125;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00756491;OID=.;OPOS=76855421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:17:11:5:27:17:11:5:27 chr10 76861680 . T C 937.51 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0629;QD=58.5944;RBI=0.0325669;REFB=0;REVB=-0.00237731;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184949;OID=.;OPOS=76861680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:42:22:0:0:42:22:0:0 chr10 76867899 . T C 149.33 PASS AF=0.354167;AO=16;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0256269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6562;QD=12.4444;RBI=0.0276835;REFB=-0.0294066;REVB=0.0104709;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394229;STB=0.701902;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0491342;OID=.;OPOS=76867899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:31:16:17:0.354167:11:5:21:10:11:6:21:10 chr10 76990776 . A G 154.43 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.021071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.915;QD=15.4433;RBI=0.0210734;REFB=-0.00294343;REVB=0.000317646;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114925;STB=0.538876;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00686492;OID=.;OPOS=76990776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:23:17:17:0.425:10:7:8:12:10:7:11:12 chr10 76994171 . GCCCG GCC,GCCG 147.73 PASS AF=0,1;AO=4,8;DP=16;FAO=0,16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296583,0.28287;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=7.42037,13.775;QD=36.9323;RBI=0.0887699,0.293912;REFB=0,0;REVB=-0.0836689,0.0798053;RO=4;SAF=3,7;SAR=1,1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.338535,-0.196883;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.00564686,0.0331493;OID=.,.;OPOS=76994174,76994172;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCC,GCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:4,8:16:0,16:16:0:0,14:0,2:0:0:3:4:3,7:1,1:4:0 chr10 77807027 . T C 437.96 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0211271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1641;QD=19.0418;RBI=0.0257584;REFB=-0.0144645;REVB=-0.0147357;RO=47;SAF=24;SAR=20;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675504;STB=0.531048;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0151252;OID=.;OPOS=77807027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:47:48:44:44:0.478261:20:24:29:18:20:24:29:19 chr10 78629795 . C G 244.39 PASS AF=0.459016;AO=27;DP=63;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.00898124;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.985;QD=16.0252;RBI=0.0279459;REFB=-0.00568968;REVB=0.0264634;RO=27;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101948;STB=0.588176;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00597936;OID=.;OPOS=78629795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:27:33:27:28:0.459016:15:12:9:18:16:12:9:24 chr10 78944590 . G A 223.52 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0131981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.627;QD=14.9014;RBI=0.0649982;REFB=-0.00756942;REVB=0.0636441;RO=34;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587296;STB=0.533308;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0102925;OID=.;OPOS=78944590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:13:13:19:15:13:13:19:15 chr10 79553803 . C T 410.98 PASS AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=0.0258752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.717;QD=23.8247;RBI=0.0276125;REFB=-0.0349462;REVB=0.00963988;RO=29;SAF=23;SAR=17;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205884;STB=0.612209;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0143142;OID=.;OPOS=79553803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:17:23:24:5:17:23:24:5 chr10 79584178 . G C 158.04 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0221906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.454;QD=25.2864;RBI=0.0241402;REFB=-0.0521727;REVB=-0.00950417;RO=9;SAF=5;SAR=11;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698094;STB=0.538875;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0369848;OID=.;OPOS=79584178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:11:5:2:7:11:5:2:7 chr10 79616605 . T C 1919.3 PASS AF=1;AO=122;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248303;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.456;QD=61.913;RBI=0.0266972;REFB=0;REVB=0.00980778;RO=0;SAF=58;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149862;OID=.;OPOS=79616605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:122:124:1:64:58:0:0:65:59:0:0 chr10 79628875 . A G 288.41 PASS AF=0.565217;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.022359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.413;QD=25.0793;RBI=0.0332949;REFB=-0.0315206;REVB=-0.0246704;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170731;STB=0.593788;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0154126;OID=.;OPOS=79628875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:19:20:25:26:0.565217:12:13:14:5:12:14:15:5 chr10 79628961 . G A 256.86 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0578079;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.3547;QD=16.0534;RBI=0.0770463;REFB=-0.0273388;REVB=0.050935;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071818;STB=0.545424;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0387973;OID=.;OPOS=79628961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:35:29:29:0.453125:14:15:19:13:14:15:21:14 chr10 79814709 . A C 351.1 PASS AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0574058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.732;QD=15.2651;RBI=0.0583595;REFB=-0.0155021;REVB=-0.0105072;RO=54;SAF=23;SAR=15;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532268;STB=0.530126;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0145779;OID=.;OPOS=79814709;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:54:38:38:0.413043:15:23:30:24:15:23:30:24 chr10 80310636 . G A 901.59 PASS AF=0.461538;AO=96;DP=208;FAO=96;FDP=208;FR=.;FRO=112;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=58;FSRR=54;FWDB=-0.00386847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.035;QD=17.3383;RBI=0.00452112;REFB=0.000153968;REVB=-0.00233997;RO=112;SAF=53;SAR=43;SRF=58;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335227;STB=0.518556;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.000281438;OID=.;OPOS=80310636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:112:112:96:96:0.461538:43:53:58:54:43:53:58:54 chr10 81045207 . T C 474.28 PASS AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.000146095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.024;QD=18.9713;RBI=0.00136533;REFB=-0.0200946;REVB=0.00135749;RO=51;SAF=25;SAR=22;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573987;STB=0.521934;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0359042;OID=.;OPOS=81045207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:53:47:47:0.47:22:25:24:27:22:25:26:27 chr10 81045280 . T C 675.27 PASS AF=0.51145;AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0780074;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5723;QD=20.6188;RBI=0.0780118;REFB=-0.000219897;REVB=-0.000829003;RO=64;SAF=26;SAR=41;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00239513;STB=0.501318;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.000577402;OID=.;OPOS=81045280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:64:64:67:67:0.51145:41:26:25:39:41:26:25:39 chr10 81053475 . G A 351.12 PASS AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0261389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2074;QD=23.4082;RBI=0.0261734;REFB=-0.00354483;REVB=-0.00134302;RO=25;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146805;STB=0.5806;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00202283;OID=.;OPOS=81053475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:18:17:17:8:18:17:17:8 chr10 81145701 . G C 124.84 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.0193891;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8218;QD=16.6448;RBI=0.0485115;REFB=-0.0163531;REVB=-0.0444683;RO=17;SAF=9;SAR=5;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201882;STB=0.645891;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0238181;OID=.;OPOS=81145701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:17:16:14:14:0.466667:5:9:14:3:5:9:14:2 chr10 81270253 . A G 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0585413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.744;QD=8.81109;RBI=0.058902;REFB=0.0285159;REVB=0.00650906;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357304;STB=0.691681;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.030092;OID=.;OPOS=81270253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:10:11:6:6:0.352941:4:2:7:3:4:2:7:4 chr10 81270319 . T A 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.000426164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.535;QD=10.3905;RBI=0.013093;REFB=-0.0522023;REVB=-0.013086;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263346;STB=0.516083;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0523357;OID=.;OPOS=81270319;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:5:6:4:3:5:6 chr10 81319423 . C T 972.77 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0741127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.822;QD=58.9557;RBI=0.0819311;REFB=0;REVB=0.0349285;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150052;OID=.;OPOS=81319423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0 chr10 81319483 . A G 740.54 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.124;QD=56.9647;RBI=0.0381301;REFB=0;REVB=0.0292399;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07197e-05;OID=.;OPOS=81319483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:30:21:0:0:31:21:0:0 chr10 81371729 . C G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.797;QD=37.4885;RBI=0.0233822;REFB=0;REVB=-0.0160569;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000901534;OID=.;OPOS=81371729;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr10 81471458 . A C 63.67 PASS AF=0.177419;AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=62;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0149095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.31;QD=4.10772;RBI=0.0173544;REFB=0.00273625;REVB=-0.00888163;RO=51;SAF=6;SAR=5;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290577;STB=0.519253;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.0114781;OID=.;OPOS=81471458;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:62:62:51:51:11:11:0.177419:5:6:29:22:5:6:29:22 chr10 81701722 . T C 312.68 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=13;FWDB=-0.0942479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3683;QD=14.376;RBI=0.094977;REFB=0.00176606;REVB=-0.0117457;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233293;STB=0.656596;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00164172;OID=.;OPOS=81701722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:46:52:35:35:0.402299:18:17:33:13:18:17:39:13 chr10 81841692 . G T 207.03 PASS AF=0.396825;AO=24;DP=62;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0140901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.555;QD=13.1448;RBI=0.0145787;REFB=-0.011289;REVB=0.00374274;RO=38;SAF=8;SAR=16;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129345;STB=0.555362;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0172856;OID=.;OPOS=81841692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:38:38:24:25:0.396825:16:8:17:21:16:9:17:21 chr10 81915136 . T C 1076.4 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5677;QD=59.8001;RBI=0.0777594;REFB=0;REVB=0.0767017;RO=0;SAF=24;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649119;OID=.;OPOS=81915136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:47:24:0:0:48:24:0:0 chr10 81917708 . A G 262.12 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00565609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.575;QD=25.5723;RBI=0.00604792;REFB=-0.0160444;REVB=-0.00214147;RO=17;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041074;STB=0.522802;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0068142;OID=.;OPOS=81917708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:10:14:9:8:10:14:9:8 chr10 81926702 . G A 1267.24 PASS AF=0.555046;AO=120;DP=217;FAO=121;FDP=218;FR=.;FRO=97;FSAF=78;FSAR=43;FSRF=60;FSRR=37;FWDB=-0.00194186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.789;QD=23.2522;RBI=0.0133051;REFB=-0.0091828;REVB=0.0131627;RO=95;SAF=78;SAR=42;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255994;STB=0.512566;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00710238;OID=.;OPOS=81926702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:95:97:120:121:0.555046:42:78:59:36:43:78:60:37 chr10 82012954 . A G 230.79 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0248619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.708;QD=17.7528;RBI=0.0267577;REFB=-0.0129684;REVB=-0.00989267;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875473;STB=0.536979;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00984736;OID=.;OPOS=82012954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:27:25:25:0.480769:11:14:17:9:11:14:17:10 chr10 82012967 . G T 260.49 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0102964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.465;QD=18.9448;RBI=0.0150291;REFB=-0.032689;REVB=-0.0109479;RO=27;SAF=16;SAR=12;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052687;STB=0.529391;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0368235;OID=.;OPOS=82012967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:12:16:17:10:12:16:17:10 chr10 82013119 . G A 531.58 PASS AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.00676008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.759;QD=22.8636;RBI=0.00678933;REFB=-0.0150339;REVB=0.000629472;RO=43;SAF=26;SAR=24;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091278;STB=0.550153;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0162927;OID=.;OPOS=82013119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:24:26:27:16:24:26:27:16 chr10 82013134 . C T 393.84 PASS AF=0.435644;AO=44;DP=103;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0126024;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.901;QD=15.5976;RBI=0.0193675;REFB=-0.0206457;REVB=0.0147065;RO=59;SAF=28;SAR=16;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100032;STB=0.554692;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0172944;OID=.;OPOS=82013134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:101:59:57:44:44:0.435644:16:28:32:27:16:28:31:26 chr10 82013146 . T C 336.74 PASS AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0173567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.651;QD=14.8017;RBI=0.0220269;REFB=-0.0132762;REVB=-0.013562;RO=54;SAF=23;SAR=14;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130234;STB=0.57391;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0085493;OID=.;OPOS=82013146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:54:54:37:37:0.406593:14:23:27:27:14:23:27:27 chr10 82033594 . G A 457.51 PASS AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0157384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.156;QD=20.5624;RBI=0.020406;REFB=-0.0195951;REVB=-0.0129887;RO=44;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500668;STB=0.527724;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.017376;OID=.;OPOS=82033594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:44:44:45:45:0.505618:21:24:21:23:21:24:21:23 chr10 82034842 . A G 1098.68 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00292453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4404;QD=60.2019;RBI=0.0228032;REFB=0;REVB=0.0226149;RO=0;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187463;OID=.;OPOS=82034842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:43:29:0:0:44:29:0:0 chr10 82034854 . T C 1049.79 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140389;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.994;QD=58.3214;RBI=0.0255568;REFB=0.0736363;REVB=0.0213555;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000297223;OID=.;OPOS=82034854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:72:0:1:70:71:0.986111:45:25:0:0:46:25:1:0 chr10 82040052 . A G 739.09 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5171;QD=55.78;RBI=0.0720327;REFB=0;REVB=0.0185531;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794511;OID=.;OPOS=82040052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:30:22:0:0:30:23:0:0 chr10 82095968 . T G 289.5 PASS AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00555803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.053;QD=46.3198;RBI=0.00750468;REFB=-0.000922728;REVB=-0.00504266;RO=1;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237537;STB=0.524979;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=5.83085e-05;OID=.;OPOS=82095968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:25:25:1:2:23:23:0.92:19:4:0:1:19:4:0:2 chr10 82192713 . T A 481.21 PASS AF=1;AO=29;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.766;QD=58.3289;RBI=0.0488038;REFB=0;REVB=0.0101198;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00625194;OID=.;OPOS=82192713;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:29:33:1:21:8:0:0:24:9:0:0 chr10 82363340 . C A 764.14 PASS AF=0.509934;AO=77;DP=151;FAO=77;FDP=151;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.016992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.728;QD=20.2421;RBI=0.0225441;REFB=-0.0398549;REVB=-0.0148158;RO=72;SAF=39;SAR=38;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799852;STB=0.54322;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0309094;OID=.;OPOS=82363340;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:72:74:77:77:0.509934:38:39:43:29:38:39:44:30 chr10 82363404 . A G 465.78 PASS AF=0.47619;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.0184858;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3692;QD=17.7438;RBI=0.018812;REFB=-0.00519994;REVB=0.00348763;RO=55;SAF=31;SAR=19;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00181715;STB=0.50101;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.00603506;OID=.;OPOS=82363404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:55:55:50:50:0.47619:19:31:34:21:19:31:34:21 chr10 82369219 . T A 452.1 PASS AF=0.556962;AO=38;DP=74;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00553665;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4158;QD=22.8909;RBI=0.096763;REFB=-0.0401375;REVB=0.0966045;RO=35;SAF=18;SAR=20;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104283;STB=0.524159;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0414623;OID=.;OPOS=82369219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:79:35:35:38:44:0.556962:20:18:17:18:25:19:17:18 chr10 84745256 . C G,T 773.32 PASS AF=0.0363636,0.963636;AO=2,53;DP=55;FAO=2,53;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181469,0.0560738;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.14,62.3825;QD=56.2416;RBI=0.0188226,0.0574709;REFB=0,0;REVB=0.00499795,0.0125948;RO=0;SAF=1,22;SAR=1,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.76368e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00384531,0.00811087;OID=.,.;OPOS=84745256,84745256;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:55:55:0:0:2,53:2,53:0.0363636,0.963636:1,31:1,22:0:0:1,31:1,22:0:0 chr10 85960395 . A G 353.73 PASS AF=0.725;AO=29;DP=40;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0419727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3731;QD=35.3731;RBI=0.0489684;REFB=-0.0161169;REVB=0.025223;RO=11;SAF=12;SAR=17;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262258;STB=0.514276;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00877928;OID=.;OPOS=85960395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:11:11:29:29:0.725:17:12:4:7:17:12:4:7 chr10 85972043 . A G 207.9 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=32;FSRR=5;FWDB=0.0165534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2163;QD=13.4126;RBI=0.0487559;REFB=-0.0188134;REVB=-0.0458598;RO=37;SAF=23;SAR=2;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161406;STB=0.594009;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0259496;OID=.;OPOS=85972043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:2:23:32:5:2:23:32:5 chr10 85974236 . T C 644.53 PASS AF=0.449664;AO=66;DP=148;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.00250318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.342;QD=17.3027;RBI=0.00360682;REFB=-0.0166771;REVB=0.00259677;RO=82;SAF=25;SAR=41;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748727;STB=0.54487;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0221523;OID=.;OPOS=85974236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:82:82:66:67:0.449664:41:25:37:45:42:25:37:45 chr10 85978939 . G A 332.15 PASS AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0142997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4053;QD=13.8395;RBI=0.0144111;REFB=-0.0139669;REVB=0.00178896;RO=59;SAF=15;SAR=22;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203927;STB=0.511622;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0134735;OID=.;OPOS=85978939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:59:59:37:37:0.385417:22:15:25:34:22:15:25:34 chr10 85981801 . T G 187.66 PASS AF=0.513514;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0139746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.97;QD=20.2872;RBI=0.0164432;REFB=-0.0130452;REVB=0.0086653;RO=18;SAF=1;SAR=17;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.592349;STB=0.852125;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0068264;OID=.;OPOS=85981801;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:18:18:18:19:0.513514:17:1:8:10:18:1:8:10 chr10 85981842 . A G 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0282981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.223;QD=12.7299;RBI=0.0286339;REFB=-0.00804535;REVB=-0.00437284;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303064;STB=0.682485;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0143046;OID=.;OPOS=85981842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:7:2:6:6:7:2:6:6 chr10 85984423 . C T 417.81 PASS AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.000161514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.153;QD=22.5842;RBI=0.0116239;REFB=-0.0200048;REVB=0.0116228;RO=33;SAF=24;SAR=17;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154969;STB=0.585324;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0145199;OID=.;OPOS=85984423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:17:24:13:20:17:24:13:20 chr10 85984723 . G A 283.09 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0139709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.776;QD=17.4209;RBI=0.013971;REFB=-0.00690582;REVB=2.02714e-05;RO=34;SAF=16;SAR=15;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675715;STB=0.537824;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00679862;OID=.;OPOS=85984723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:15:16:20:14:15:16:20:14 chr10 85992478 . T C 303.47 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0145826;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.78;QD=19.5789;RBI=0.0323795;REFB=-0.012962;REVB=0.0289099;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075051;STB=0.535102;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0149091;OID=.;OPOS=85992478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:31:30:32:32:0.516129:14:18:20:11:14:18:19:11 chr10 85992511 . T C 324.45 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0265358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.592;QD=19.6637;RBI=0.0379085;REFB=-0.00140944;REVB=-0.0270723;RO=32;SAF=20;SAR=14;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333363;STB=0.518508;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00138298;OID=.;OPOS=85992511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:14:20:20:12:14:20:20:12 chr10 85993836 . A G 714.1 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153418;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.419;QD=63.4759;RBI=0.0244568;REFB=0;REVB=0.0190463;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112209;OID=.;OPOS=85993836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr10 85993910 . G A 306.36 PASS AF=0.485294;AO=32;DP=67;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0287058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1923;QD=18.0214;RBI=0.0455091;REFB=-0.0330599;REVB=0.0353136;RO=35;SAF=18;SAR=14;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176822;STB=0.588806;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0412122;OID=.;OPOS=85993910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:35:35:32:33:0.485294:14:18:13:22:15:18:13:22 chr10 87359678 . A T 582.33 PASS AF=0.857143;AO=44;DP=53;FAO=54;FDP=63;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.112638;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.4149;QD=36.973;RBI=0.121667;REFB=-0.197132;REVB=0.045995;RO=8;SAF=1;SAR=43;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798374;STB=0.539117;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0550096;OID=.;OPOS=87359678;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:53:63:8:9:44:54:0.857143:43:1:0:8:53:1:0:9 chr10 88126072 . G A 339.77 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.619;QD=54.3623;RBI=0.0538794;REFB=0;REVB=0.0449138;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000720525;OID=.;OPOS=88126072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr10 88203068 . T C 838.83 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223718;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.485;QD=57.8504;RBI=0.0565753;REFB=0;REVB=0.0519641;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273162;OID=.;OPOS=88203068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:29:29:0:0 chr10 88414570 . G A 203.92 PASS AF=0.512195;AO=19;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0.129065;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6903;QD=19.8951;RBI=0.129131;REFB=-0.0237263;REVB=0.00413812;RO=20;SAF=0;SAR=19;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666556;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0131921;OID=.;OPOS=88414570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:19:21:0.512195:19:0:0:20:20:1:0:20 chr10 88422116 . C T 815.58 PASS AF=0.531034;AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=18;FSRR=50;FWDB=0.0312037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.918;QD=22.4986;RBI=0.0322544;REFB=-0.0327626;REVB=0.00816571;RO=65;SAF=34;SAR=43;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156363;STB=0.585751;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0205977;OID=.;OPOS=88422116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:65:68:77:77:0.531034:43:34:17:48:43:34:18:50 chr10 88422151 . C A 1033.67 PASS AF=0.612245;AO=89;DP=146;FAO=90;FDP=147;FR=.;FRO=57;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0665937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.219;QD=28.1272;RBI=0.0677186;REFB=-0.0101133;REVB=0.0122916;RO=57;SAF=42;SAR=47;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880452;STB=0.545361;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00477645;OID=.;OPOS=88422151;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:57:57:89:90:0.612245:47:42:20:37:48:42:20:37 chr10 88439899 . G A 379.52 PASS AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.016779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.723;QD=22.001;RBI=0.0176515;REFB=-0.00275313;REVB=-0.00548082;RO=31;SAF=15;SAR=23;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208609;STB=0.511511;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00383102;OID=.;OPOS=88439899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:23:15:13:18:23:15:13:18 chr10 88683890 . T A 465.81 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00333964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.903;QD=54.8013;RBI=0.0131821;REFB=-0.116408;REVB=0.0127521;RO=1;SAF=8;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548081;STB=0.526299;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00209076;OID=.;OPOS=88683890;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:33:34:1:1:32:33:0.970588:24:8:1:0:24:9:1:0 chr10 88702350 . G C 217.28 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4954;QD=48.2843;RBI=0.145798;REFB=0;REVB=0.0778417;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00363997;OID=.;OPOS=88702350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:8:9:0:0:9:9:0:0 chr10 88717140 . T A 1560.77 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885001;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.395;QD=60.0295;RBI=0.0174839;REFB=0;REVB=0.0150786;RO=0;SAF=61;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99311e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22446e-05;OID=.;OPOS=88717140;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:43:61:0:0:43:61:0:0 chr10 88717154 . C T 1476.73 PASS AF=0.971698;AO=102;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.025574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.455;QD=55.7256;RBI=0.058529;REFB=-0.120435;REVB=0.0526461;RO=2;SAF=58;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210747;STB=0.516126;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.000566962;OID=.;OPOS=88717154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:106:106:2:3:102:103:0.971698:44:58:0:2:45:58:0:3 chr10 88730106 . C T 214.21 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.194721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7372;QD=45.096;RBI=0.207233;REFB=-0.0317249;REVB=0.0709187;RO=1;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262699;STB=0.51427;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0124244;OID=.;OPOS=88730106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:17:1:0:1:17:1:0:1 chr10 88730177 . A G 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00216082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.889;QD=46.8453;RBI=0.0705224;REFB=0;REVB=0.0704893;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00072579;OID=.;OPOS=88730177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0 chr10 88730312 . T C 457.31 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122974;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4844;QD=55.4312;RBI=0.0262005;REFB=0.0174627;REVB=-0.0231352;RO=1;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321794;STB=0.517231;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.000837889;OID=.;OPOS=88730312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:33:1:1:32:32:0.969697:14:18:0:1:14:18:0:1 chr10 88768253 . A G 972.49 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.247;QD=58.9386;RBI=0.0423356;REFB=0;REVB=0.0297382;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198476;OID=.;OPOS=88768253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0 chr10 88768657 . C T 902.69 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7815;QD=58.2382;RBI=0.0478517;REFB=0;REVB=0.0024204;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454481;OID=.;OPOS=88768657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:30:32:0:0:30:32:0:0 chr10 88782084 . A G 323.43 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0665267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7144;QD=53.9049;RBI=0.0708143;REFB=0;REVB=0.0242665;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00124904;OID=.;OPOS=88782084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr10 88782151 . C T 145.19 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.049;QD=44.6744;RBI=0.0780919;REFB=0;REVB=0.0571843;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017329;OID=.;OPOS=88782151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr10 88820789 . T C 1227.47 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.136;QD=61.3737;RBI=0.0249438;REFB=0;REVB=0.0211633;RO=0;SAF=51;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51863e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41819e-05;OID=.;OPOS=88820789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:29:51:0:0:29:51:0:0 chr10 88917856 . C T 116.21 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0215705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9983;QD=20.2095;RBI=0.0788632;REFB=0.00507533;REVB=-0.0758559;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180782;STB=0.602495;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.00848706;OID=.;OPOS=88917856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:6:7:3:7:6:7:3:7 chr10 88988115 . G A 127.73 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00664148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.534;QD=11.8817;RBI=0.00674875;REFB=-0.0278047;REVB=-0.00119846;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082336;STB=0.548526;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0488552;OID=.;OPOS=88988115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:8:7:11:17:8:7:11:17 chr10 89267957 . C T 1476.52 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0153573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.795;QD=62.1694;RBI=0.0161534;REFB=-0.0693088;REVB=-0.00500841;RO=0;SAF=35;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06074e-08;STB=0.507041;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000565608;OID=.;OPOS=89267957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:0:1:94:94:0.989474:59:35:0:0:59:35:1:0 chr10 89420789 . A G 579.08 PASS AF=0.569892;AO=53;DP=93;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.057282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.132;QD=24.9064;RBI=0.0573937;REFB=-0.0188683;REVB=-0.00357809;RO=40;SAF=24;SAR=29;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175377;STB=0.5096;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.013086;OID=.;OPOS=89420789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:40:40:53:53:0.569892:29:24:19:21:29:24:19:21 chr10 89527413 . T G 169.51 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.0203989;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.911;QD=10.5941;RBI=0.0206155;REFB=-0.00373709;REVB=-0.00298088;RO=42;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119294;STB=0.569217;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00658664;OID=.;OPOS=89527413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:13:9:13:29:13:9:13:29 chr10 89720907 . T G 868.85 PASS AF=0.410256;AO=96;DP=236;FAO=96;FDP=234;FR=.;FRO=138;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=57;FSRR=81;FWDB=0.0446168;FXX=0.00847422;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9978;QD=14.8522;RBI=0.0449419;REFB=0.00125537;REVB=0.00539596;RO=140;SAF=41;SAR=55;SRF=59;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00612561;STB=0.508479;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=-0.00177406;OID=.;OPOS=89720907;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:234:140:138:96:96:0.410256:55:41:59:81:55:41:57:81 chr10 90305177 . C T 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0302236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.591;QD=11.1045;RBI=0.0488681;REFB=-0.0399735;REVB=-0.0384008;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164676;STB=0.599717;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0345282;OID=.;OPOS=90305177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:3:4:4:6:3:4:4:6 chr10 90342837 . C G 2607.57 PASS AF=0.994118;AO=169;DP=171;FAO=169;FDP=170;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0781389;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8805;QD=61.3545;RBI=0.0824088;REFB=-0.135704;REVB=0.0261825;RO=0;SAF=76;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502673;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000860185;OID=.;OPOS=90342837;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:171:170:0:1:169:169:0.994118:93:76:0:0:93:76:0:1 chr10 90356598 . A G 1317.22 PASS AF=0.988506;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00196633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3908;QD=60.562;RBI=0.021349;REFB=0.0636228;REVB=-0.0212583;RO=1;SAF=22;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210421;STB=0.510636;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.000689692;OID=.;OPOS=90356598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:87:1:1:85:86:0.988506:63:22:1:0:63:23:1:0 chr10 90425327 . T C 417.26 PASS AF=0.431193;AO=46;DP=108;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0158138;FXX=0.0603396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.298;QD=15.3123;RBI=0.0160365;REFB=-0.00705277;REVB=0.00266347;RO=62;SAF=30;SAR=16;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11202;STB=0.553709;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0149225;OID=.;OPOS=90425327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:62:62:46:47:0.431193:16:30:34:28:17:30:34:28 chr10 90429652 . A G 281.94 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0111889;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.909;QD=14.6463;RBI=0.0112525;REFB=-0.0134053;REVB=-0.00119471;RO=45;SAF=15;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043671;STB=0.524761;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0234925;OID=.;OPOS=90429652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:17:15:23:22:17:15:23:22 chr10 90433345 . T A 316.92 PASS AF=0.363636;AO=35;DP=97;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.00572621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.724;QD=12.8048;RBI=0.0109599;REFB=-0.0116538;REVB=-0.00934507;RO=62;SAF=18;SAR=17;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560698;STB=0.527935;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.014252;OID=.;OPOS=90433345;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:62:63:35:36:0.363636:17:18:35:27:17:19:36:27 chr10 90438207 . A G 276.93 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0236445;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.546;QD=13.3461;RBI=0.0246099;REFB=-0.00590717;REVB=0.00682539;RO=50;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648927;STB=0.544983;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00894755;OID=.;OPOS=90438207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:50:51:32:32:0.385542:21:11:20:30:21:11:21:30 chr10 90490921 . G A 253.72 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0153448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.719;QD=15.1475;RBI=0.0154066;REFB=-0.000263127;REVB=0.00137854;RO=38;SAF=15;SAR=14;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172735;STB=0.509777;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00043977;OID=.;OPOS=90490921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:14:15:19:19:14:15:19:19 chr10 90503075 . T C 439.79 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00927921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.964;QD=21.9893;RBI=0.0106306;REFB=-0.000336769;REVB=-0.00518711;RO=37;SAF=15;SAR=28;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985074;STB=0.55443;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000204239;OID=.;OPOS=90503075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:0.5375:28:15:17:20:28:15:17:20 chr10 90512306 . G C 406.81 PASS AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0251434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.831;QD=20.0896;RBI=0.0268559;REFB=-0.0124479;REVB=-0.00943666;RO=40;SAF=20;SAR=21;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331014;STB=0.518353;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.014946;OID=.;OPOS=90512306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:21:20:21:19:21:20:21:19 chr10 90524237 . T C 432.04 PASS AF=0.505882;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.00449308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.523;QD=20.3313;RBI=0.0226577;REFB=-0.010918;REVB=0.0222078;RO=42;SAF=15;SAR=28;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812383;STB=0.504502;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0112071;OID=.;OPOS=90524237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:0.505882:28:15:15:27:28:15:15:27 chr10 90530660 . C A 377.52 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0555693;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2724;QD=13.9822;RBI=0.0562317;REFB=0.0170818;REVB=0.00860553;RO=64;SAF=21;SAR=23;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041911;STB=0.523658;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.0586552;OID=.;OPOS=90530660;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:23:21:28:36:23:21:28:36 chr10 90537942 . C T 865.23 PASS AF=0.571429;AO=79;DP=140;FAO=80;FDP=140;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0471756;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4016;QD=24.7207;RBI=0.0474303;REFB=0.0113547;REVB=0.00490909;RO=61;SAF=37;SAR=42;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084076;STB=0.53922;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.0084141;OID=.;OPOS=90537942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:61:60:79:80:0.571429:42:37:35:26:42:38:34:26 chr10 90749256 . G A 1306.47 PASS AF=1;AO=82;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177931;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.725;QD=62.2129;RBI=0.0283688;REFB=0;REVB=0.0220951;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72737e-05;OID=.;OPOS=90749256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:82:84:1:41:41:0:0:43:41:0:0 chr10 90771829 . T C 463.86 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0305845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1972;QD=54.5716;RBI=0.0661502;REFB=0.111424;REVB=-0.0586552;RO=1;SAF=4;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163899;STB=0.508767;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00593743;OID=.;OPOS=90771829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:32:33:0.970588:28:4:0:1:28:5:0:1 chr10 90966546 . C T 142.61 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.014989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.811;QD=14.2613;RBI=0.0294687;REFB=-0.0410385;REVB=-0.025372;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215761;STB=0.634807;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0670969;OID=.;OPOS=90966546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:7:9:8:15:7:9:8:16 chr10 90966996 . C G 200.84 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0209143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2595;QD=20.5993;RBI=0.0222239;REFB=-0.0175328;REVB=0.0075162;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134987;STB=0.5877;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0152809;OID=.;OPOS=90966996;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:19:20:20:0.512821:11:9:11:7:11:9:12:7 chr10 91007339 . C T 283.62 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0366868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.44;QD=19.9035;RBI=0.0490229;REFB=-0.0198832;REVB=0.0325166;RO=26;SAF=18;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117237;STB=0.574418;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0114262;OID=.;OPOS=91007339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:27:30:30:0.526316:12:18:12:14:12:18:12:15 chr10 91007360 . T G 217.82 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00228549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.25;QD=16.7551;RBI=0.00590258;REFB=-0.0127006;REVB=0.00544214;RO=28;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140899;STB=0.579552;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0162923;OID=.;OPOS=91007360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:13:11:17:11:13:11:17:11 chr10 91066460 . T A 1098.73 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00232089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.215;QD=60.2045;RBI=0.0146854;REFB=0;REVB=-0.0145009;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.93532e-05;OID=.;OPOS=91066460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:41:30:0:0:41:32:0:0 chr10 91066769 . C A 1138.61 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049341;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.768;QD=60.7259;RBI=0.00827639;REFB=0;REVB=-0.0066448;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.02837e-05;OID=.;OPOS=91066769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0 chr10 91067595 . C G 1832.06 PASS AF=0.991667;AO=106;DP=119;FAO=119;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.718;QD=61.0687;RBI=0.0352219;REFB=0;REVB=0.00463282;RO=0;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218954;OID=.;OPOS=91067595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:119:120:0:0:106:119:0.991667:58:48:0:0:60:59:0:0 chr10 91099943 . C G 725.65 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00435361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.168;QD=56.9136;RBI=0.0124494;REFB=0;REVB=0.0116633;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.36989e-05;OID=.;OPOS=91099943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:21:29:0:0:22:29:0:0 chr10 91100068 . C A 483.32 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.936;QD=58.5838;RBI=0.0288861;REFB=0;REVB=0.016373;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123753;OID=.;OPOS=91100068;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr10 91143529 . T A 1153.58 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.636;QD=60.7147;RBI=0.0227313;REFB=0;REVB=0.0172704;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95418e-05;OID=.;OPOS=91143529;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:29:47:0:0:29:47:0:0 chr10 91162497 . A G 579.48 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100759;FXX=0.0256345;HRUN=6;LEN=1;MLLD=287.483;QD=60.9979;RBI=0.0117702;REFB=0;REVB=0.006084;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.46381e-06;OID=.;OPOS=91162497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:39:38:1:22:17:0:0:21:17:0:0 chr10 91162677 . C T 555.96 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.36;QD=60.1041;RBI=0.0184221;REFB=0;REVB=-0.00253463;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162568;OID=.;OPOS=91162677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:21:15:0:0:21:16:0:0 chr10 91172555 . AAG A,AA 609.1 PASS AF=0,1;AO=5,33;DP=39;FAO=0,40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041638,0.043377;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=264.874,280.674;QD=60.91;RBI=0.0467512,0.0490504;REFB=0,0;REVB=0.0212592,0.0228994;RO=0;SAF=4,13;SAR=1,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.82173e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.00030906;OID=.,.;OPOS=91172556,91172557;OREF=AG,G;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:5,33:39:0,40:40:0:0,18:0,22:0:0:4:0:4,13:1,20:0:0 chr10 91178000 . C T 293.81 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464476;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.524;QD=53.42;RBI=0.0250647;REFB=0;REVB=-0.0246306;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.04846e-05;OID=.;OPOS=91178000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr10 91222287 . A C 272.53 PASS AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.00822269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7356;QD=12.5301;RBI=0.00828761;REFB=0.00578154;REVB=-0.00103529;RO=55;SAF=18;SAR=14;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138318;STB=0.57935;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.0102061;OID=.;OPOS=91222287;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:55:32:32:0.367816:14:18:24:31:14:18:24:31 chr10 91352966 . G A 1861.89 PASS AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0256038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3791;QD=60.5492;RBI=0.0315832;REFB=-0.0294095;REVB=0.0184917;RO=0;SAF=49;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50505;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0002265;OID=.;OPOS=91352966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:123:0:1:122:122:0.99187:73:49:0:0:73:49:1:0 chr10 91404448 . C G 74.48 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.000237828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.912;QD=22.9154;RBI=0.0413961;REFB=-0.0496449;REVB=0.0413954;RO=3;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204298;STB=0.642573;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0213089;OID=.;OPOS=91404448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:3:4:9:9:0.692308:4:5:3:0:4:5:4:0 chr10 91468925 . C G 111.74 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0314332;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.133;QD=14.8985;RBI=0.0314924;REFB=-0.00342831;REVB=-0.00193159;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41818;STB=0.744292;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0095927;OID=.;OPOS=91468925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:17:17:13:13:0.433333:3:10:6:11:3:10:6:11 chr10 91470834 . A C 145.52 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0512358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6234;QD=16.1691;RBI=0.0568392;REFB=-0.00599126;REVB=0.0246086;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155931;STB=0.589544;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0058469;OID=.;OPOS=91470834;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:12:8:9:7:12:8 chr10 91484780 . G A 287.94 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00349535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.925;QD=18.5769;RBI=0.00851065;REFB=-0.0110878;REVB=-0.00775974;RO=31;SAF=13;SAR=18;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586453;STB=0.532748;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0119877;OID=.;OPOS=91484780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:18:13:15:16:18:13:15:16 chr10 91487649 . A T 290.39 PASS AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.00282658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6089;QD=14.1652;RBI=0.0114437;REFB=-0.0249264;REVB=-0.0110891;RO=49;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155838;STB=0.508861;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0348808;OID=.;OPOS=91487649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:20:13:20:29:20:13:20:29 chr10 91488979 . A T 247.34 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0120237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.351;QD=13.7412;RBI=0.012372;REFB=-0.0105547;REVB=0.00291492;RO=43;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921382;STB=0.552419;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0144714;OID=.;OPOS=91488979;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:15:14:17:26:15:14:17:26 chr10 91497631 . T A 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0358688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.662;QD=12.3961;RBI=0.0390604;REFB=0.00661036;REVB=-0.0154643;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487487;STB=0.798798;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0122499;OID=.;OPOS=91497631;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:1:4:1:4:1:4:1:4 chr10 91497902 . C CTAAAAG 211.99 PASS AF=0.244275;AO=29;DP=138;FAO=32;FDP=131;FR=.;FRO=99;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=60;FWDB=-0.00101041;FXX=0.0296274;HRUN=1;LEN=6;MLLD=302.696;QD=6.47282;RBI=0.00819947;REFB=-0.00622504;REVB=-0.00813698;RO=102;SAF=12;SAR=17;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413575;STB=0.557129;STBP=0.485;TYPE=ins;VARB=0.0206561;OID=.;OPOS=91497903;OREF=-;OALT=TAAAAG;OMAPALT=CTAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.244275:29:138:32:131:99:15:17:39:60:99:102:12:17:39:63 chr10 91498127 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.192;QD=60.2301;RBI=0.0253713;REFB=0;REVB=-0.00985524;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103324;OID=.;OPOS=91498127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:25:12:0:0:25:12:0:0 chr10 91498254 . A G 338.47 PASS AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0216158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.276;QD=26.5464;RBI=0.0221661;REFB=-0.0124672;REVB=-0.00490842;RO=19;SAF=7;SAR=25;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254895;STB=0.640929;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00862379;OID=.;OPOS=91498254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:25:7:10:9:25:7:10:9 chr10 91498318 . A G 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00943718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.991;QD=13.631;RBI=0.0247218;REFB=-0.0316137;REVB=0.0228497;RO=9;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.545356;STB=0.829585;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0176021;OID=.;OPOS=91498318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:7:1:6:3:7:1:6:3 chr10 91503660 . A G 81.61 PASS AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0429794;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.685;QD=8.37075;RBI=0.0441134;REFB=-0.00180411;REVB=0.00993798;RO=27;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03129;STB=0.532651;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.00821539;OID=.;OPOS=91503660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:39:39:27:28:11:11:0.282051:5:6:14:13:5:6:14:14 chr10 91738556 . C A 1917.38 PASS AF=0.992063;AO=126;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0352316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9584;QD=60.8692;RBI=0.0458883;REFB=-0.0380905;REVB=-0.0294019;RO=0;SAF=69;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=4.8532e-05;OID=.;OPOS=91738556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:126:126:0:1:126:125:0.992063:57:69:0:0:56:69:0:1 chr10 91923501 . G A 1415.37 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.477;QD=62.9055;RBI=0.0306648;REFB=0;REVB=-0.00394595;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34197e-05;OID=.;OPOS=91923501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:45:45:0:0:45:45:0:0 chr10 92456074 . C T 1575.24 PASS AF=1;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017511;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.144;QD=64.2955;RBI=0.0391982;REFB=0;REVB=-0.0350695;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.75602e-05;OID=.;OPOS=92456074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:98:0:0:98:98:1:43:55:0:0:43:55:0:0 chr10 92456132 . T C 1970.35 PASS AF=0.992248;AO=127;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0347941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.01;QD=61.0962;RBI=0.0403068;REFB=-0.00194505;REVB=0.0203472;RO=1;SAF=68;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693714;STB=0.503649;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=8.4895e-05;OID=.;OPOS=92456132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:129:1:1:127:128:0.992248:59:68:1:0:60:68:1:0 chr10 92654561 . T C 285.09 PASS AF=0.541667;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0500451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.045;QD=23.7572;RBI=0.0502938;REFB=-0.020744;REVB=-0.00499575;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163482;STB=0.59706;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0486785;OID=.;OPOS=92654561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:22:22:25:26:0.541667:11:14:8:14:11:15:8:14 chr10 93667635 . C T 803.42 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0327843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.389;QD=55.4079;RBI=0.0405281;REFB=0.0510686;REVB=0.0238269;RO=1;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229942;STB=0.512191;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.000559654;OID=.;OPOS=93667635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:20:37:0:1:20:37:0:1 chr10 93810972 . TGA ATG,TG 43.02 PASS AF=0,0.478261;AO=5,5;DP=23;FAO=0,11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=0,4;FSAR=0,7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0260849,0.0196689;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=3,1;MLLD=21.3301,9.42379;QD=7.48113;RBI=0.211024,0.265416;REFB=-0.0285499,-0.0484706;REVB=0.209405,0.264686;RO=9;SAF=0,4;SAR=5,1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.739778,0.291052;STB=0.5,0.615787;STBP=1,0.315;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0780485;OID=.,.;OPOS=93810972,93810974;OREF=TGA,A;OALT=ATG,-;OMAPALT=ATG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:43:23:23:9:12:5,5:0,11:0,0.478261:5,1:0,4:5:4:0,7:0,4:7:5 chr10 93841227 . A G 1492.39 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.437;QD=63.5061;RBI=0.126613;REFB=0;REVB=0.0130344;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295919;OID=.;OPOS=93841227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:45:48:0:0:45:49:0:0 chr10 93999850 . A G 102.08 PASS AF=1;AO=7;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.482;QD=40.8316;RBI=0.185257;REFB=0;REVB=0.181715;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0041806;OID=.;OPOS=93999850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:7:10:1:3:4:0:0:6:4:0:0 chr10 94397295 . A T 122.73 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0736761;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.139;QD=14.8758;RBI=0.0736803;REFB=-0.00685696;REVB=-0.000782716;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357417;STB=0.520803;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00832706;OID=.;OPOS=94397295;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:10:4:6:13:10:4:6:13 chr10 94594565 . G A 177.77 PASS AF=0.292683;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0317629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7158;QD=8.67183;RBI=0.0334093;REFB=0.00469737;REVB=0.0103586;RO=56;SAF=7;SAR=17;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889787;STB=0.543801;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.0142494;OID=.;OPOS=94594565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:56:58:24:24:0.292683:17:7:20:36:17:7:20:38 chr10 94695617 . C T 785.18 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.884;QD=57.1042;RBI=0.00798188;REFB=0;REVB=0.00656079;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.33847e-05;OID=.;OPOS=94695617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:35:20:0:0:35:20:0:0 chr10 95072906 . T C 1472.58 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.609;QD=63.3368;RBI=0.021732;REFB=0;REVB=0.00583967;RO=0;SAF=33;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66335e-05;OID=.;OPOS=95072906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:60:33:0:0:60:33:0:0 chr10 95168634 . A G 439.39 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.00640332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2189;QD=19.3139;RBI=0.014887;REFB=-0.00688424;REVB=-0.0134395;RO=45;SAF=15;SAR=29;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305564;STB=0.512599;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00850384;OID=.;OPOS=95168634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:45:47:44:44:0.483516:29:15:14:31:29:15:15:32 chr10 95237963 . A G 3221.79 PASS AF=0.990566;AO=209;DP=212;FAO=210;FDP=212;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=127;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0152042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5595;QD=60.7884;RBI=0.0322817;REFB=0.034339;REVB=-0.0284771;RO=3;SAF=82;SAR=127;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773922;STB=0.501033;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=-0.0022173;OID=.;OPOS=95237963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:212:212:3:2:209:210:0.990566:127:82:2:1:127:83:1:1 chr10 95259979 . C G 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.047295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2725;QD=12.8607;RBI=0.0486088;REFB=-0.0141989;REVB=0.0112248;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639024;STB=0.538351;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0113196;OID=.;OPOS=95259979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:4:3:4:4:4:3:4:4 chr10 95262981 . A G 562.21 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3361;QD=59.1798;RBI=0.0798055;REFB=0;REVB=0.0386171;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253062;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205295;OID=.;OPOS=95262981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:1:0:37:38:1:18:19:0:1:19:19:0:0 chr10 95276742 . G C 830.32 PASS AF=0.447917;AO=85;DP=191;FAO=86;FDP=192;FR=.;FRO=106;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=52;FSRR=54;FWDB=0.00144252;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.593;QD=17.2983;RBI=0.0241323;REFB=0.00228836;REVB=0.0240891;RO=104;SAF=51;SAR=34;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110257;STB=0.564088;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.00208866;OID=.;OPOS=95276742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:192:104:106:85:86:0.447917:34:51:51:53:34:52:52:54 chr10 95279653 . A G 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00975076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.742;QD=56.9476;RBI=0.040358;REFB=-0.116878;REVB=0.0391624;RO=1;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170248;STB=0.509086;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00308895;OID=.;OPOS=95279653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:27:9:0:1:27:9:0:1 chr10 95288874 . A G 265.38 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00494746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.908;QD=17.9915;RBI=0.0143647;REFB=-0.0133515;REVB=0.0134858;RO=30;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450249;STB=0.525188;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0150468;OID=.;OPOS=95288874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:15:14:13:17:15:14:13:17 chr10 95326676 . C T 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0178804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.305;QD=17.4009;RBI=0.0291729;REFB=-0.0592599;REVB=0.023051;RO=13;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135944;STB=0.578191;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0549738;OID=.;OPOS=95326676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:5:8:6:7:5:8:6:7 chr10 95381773 . T A 1008.07 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.161;QD=59.2984;RBI=0.0144215;REFB=0;REVB=0.0141498;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35203e-05;OID=.;OPOS=95381773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0 chr10 95389041 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.766;QD=63.8717;RBI=0.0322187;REFB=0;REVB=0.000581061;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75766e-05;OID=.;OPOS=95389041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr10 95389083 . A G 623.37 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00443806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.209;QD=60.8164;RBI=0.00447114;REFB=0;REVB=0.000542866;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.18924e-05;OID=.;OPOS=95389083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:21:20:0:0 chr10 95395364 . C G 362.79 PASS AF=0.875;AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0015678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.768;QD=45.3487;RBI=0.00658713;REFB=0.000178628;REVB=-0.00639783;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.562456;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-3.8667e-05;OID=.;OPOS=95395364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:32:32:0:4:28:28:0.875:14:14:0:0:14:14:0:4 chr10 95431668 . A G 246.59 PASS AF=0.451613;AO=27;DP=61;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.013953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.351;QD=15.9092;RBI=0.0159739;REFB=-0.00639141;REVB=-0.00777694;RO=33;SAF=12;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069021;STB=0.535689;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0646505;OID=.;OPOS=95431668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:33:34:27:28:0.451613:15:12:17:16:15:13:18:16 chr10 95433124 . A G 342.88 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0292617;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.056;QD=21.4301;RBI=0.0297585;REFB=-0.0105539;REVB=0.00541494;RO=28;SAF=4;SAR=31;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399201;STB=0.736897;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00823911;OID=.;OPOS=95433124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:29:35:35:0.546875:31:4:12:16:31:4:13:16 chr10 95454681 . G C 228.84 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.000529315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.584;QD=16.0587;RBI=0.0390554;REFB=-0.0197253;REVB=-0.0390518;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189304;STB=0.606963;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0296893;OID=.;OPOS=95454681;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:10:16:13:18:10:16:13:18 chr10 95458141 . A G 328.65 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00908787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.685;QD=18.0082;RBI=0.0264055;REFB=0.00331756;REVB=0.0247924;RO=38;SAF=18;SAR=17;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159809;STB=0.588927;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.00284275;OID=.;OPOS=95458141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:17:18:26:12:17:18:26:12 chr10 95459817 . C T 762.78 PASS AF=0.5;AO=73;DP=148;FAO=74;FDP=148;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.0170271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2304;QD=20.6156;RBI=0.0263625;REFB=-0.0248903;REVB=-0.0201262;RO=74;SAF=36;SAR=37;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555177;STB=0.533775;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0169722;OID=.;OPOS=95459817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:74:73:74:0.5:37:36:32:42:37:37:32:42 chr10 95552653 . T C 888.55 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0211839;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=82.5094;QD=56.4158;RBI=0.029832;REFB=-0.0336302;REVB=0.0210045;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000332957;OID=.;OPOS=95552653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:34:28:0:0:34:28:1:0 chr10 95791613 . T C 153.9 PASS AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0126443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.492;QD=11.6152;RBI=0.0227981;REFB=-0.00656761;REVB=-0.0189704;RO=34;SAF=13;SAR=6;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465225;STB=0.767277;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00727375;OID=.;OPOS=95791613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:6:13:8:26:6:13:8:26 chr10 95791763 . G A 374.47 PASS AF=0.416667;AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.00581893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.653;QD=15.6029;RBI=0.00896281;REFB=-0.0131357;REVB=-0.00681704;RO=56;SAF=27;SAR=13;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309908;STB=0.674912;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0200773;OID=.;OPOS=95791763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:56:56:40:40:0.416667:13:27:21:35:13:27:21:35 chr10 96039597 . G C 818.58 PASS AF=1;AO=48;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00714381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.855;QD=57.4442;RBI=0.142816;REFB=0;REVB=0.142637;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000641802;OID=.;OPOS=96039597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:48:57:1:27:21:0:0:36:21:0:0 chr10 96058298 . C T 403.78 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0287972;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.96;QD=21.8257;RBI=0.0371999;REFB=0.00885596;REVB=0.0235489;RO=34;SAF=12;SAR=28;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131234;STB=0.572689;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.00667422;OID=.;OPOS=96058298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:34:34:40:40:0.540541:28:12:15:19:28:12:15:19 chr10 96066341 . A G 500.75 PASS AF=0.521739;AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0117169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.141;QD=21.7716;RBI=0.0250494;REFB=-0.000602471;REVB=0.0221402;RO=44;SAF=16;SAR=32;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291921;STB=0.516122;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.000517483;OID=.;OPOS=96066341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:44:44:48:48:0.521739:32:16:16:28:32:16:16:28 chr10 96106240 . G C 239.11 PASS AF=0.5;AO=19;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0030092;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.871;QD=19.1286;RBI=0.0162045;REFB=-0.00371637;REVB=0.0159226;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.559952;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00547476;OID=.;OPOS=96106240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:25:19:25:0.5:9:10:10:9:11:14:11:14 chr10 96122543 . A G 181.3 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0271686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9485;QD=16.4814;RBI=0.0302147;REFB=0.00372128;REVB=0.013221;RO=25;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00627176;STB=0.503593;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00924732;OID=.;OPOS=96122543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:9:10:13:12:9:10:13:12 chr10 96163039 . C G 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0509715;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.2737;QD=16.4544;RBI=0.0509715;REFB=0.000568663;REVB=0;RO=4;SAF=6;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0043108;OID=.;OPOS=96163039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:0:6:4:0:0:6:4:0 chr10 96493058 . C T 353.61 PASS AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0308131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.782;QD=23.9737;RBI=0.0642283;REFB=-0.00187336;REVB=-0.0563545;RO=24;SAF=23;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154148;STB=0.584894;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00107521;OID=.;OPOS=96493058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:12:23:11:13:12:23:11:13 chr10 96541616 . G A 202.27 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00511116;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.533;QD=19.264;RBI=0.0239379;REFB=-0.0247384;REVB=-0.0233859;RO=12;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169239;STB=0.536549;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0267076;OID=.;OPOS=96541616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:12:21:20:20:0.47619:10:10:9:3:10:10:9:12 chr10 96602622 . C T 415.43 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0192428;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.138;QD=18.8833;RBI=0.0206403;REFB=-0.0228371;REVB=0.00746562;RO=44;SAF=17;SAR=25;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130492;STB=0.561922;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0207601;OID=.;OPOS=96602622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:44:46:42:42:0.477273:25:17:24:20:25:17:24:22 chr10 96827178 . T C 198.36 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00679048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.579;QD=13.224;RBI=0.00936359;REFB=-0.0123639;REVB=0.00644717;RO=34;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102812;STB=0.541632;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0145059;OID=.;OPOS=96827178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:36:24:24:0.4:11:13:15:19:11:13:17:19 chr10 97072008 . T C 191.36 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.00752743;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5415;QD=13.429;RBI=0.025385;REFB=0.000552242;REVB=0.0242433;RO=35;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0976283;STB=0.565293;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.000364738;OID=.;OPOS=97072008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:35:34:23:23:0.403509:11:12:15:20:11:12:14:20 chr10 97106165 . T C 301.51 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00138867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.2039;QD=16.7506;RBI=0.00816394;REFB=-0.0151515;REVB=0.00804497;RO=39;SAF=20;SAR=13;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419008;STB=0.523546;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0160233;OID=.;OPOS=97106165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:13:20:22:17:13:20:22:17 chr10 97116219 . C T 353.91 PASS AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0187597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.327;QD=29.4925;RBI=0.0406191;REFB=-0.0120302;REVB=0.0360276;RO=18;SAF=14;SAR=16;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535469;STB=0.529392;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0110915;OID=.;OPOS=97116219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:16:14:7:11:16:14:7:11 chr10 97116981 . C T 178.94 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0320742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.165;QD=15.2291;RBI=0.0327037;REFB=-0.0021113;REVB=-0.00638564;RO=28;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268523;STB=0.515497;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00308294;OID=.;OPOS=97116981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:12:7:11:17:12:7:11:17 chr10 97127462 . C A 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0238314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.754;QD=19.8494;RBI=0.0241658;REFB=-0.0403602;REVB=0.00400664;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517022;STB=0.529372;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0285543;OID=.;OPOS=97127462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:6:7:9:6:6:7 chr10 97141523 . G A 537.43 PASS AF=0.51;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.0299786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4633;QD=21.4973;RBI=0.0319646;REFB=-0.0150117;REVB=-0.0110914;RO=49;SAF=27;SAR=24;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741508;STB=0.540909;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0145533;OID=.;OPOS=97141523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:49:49:51:51:0.51:24:27:30:19:24:27:30:19 chr10 97192324 . A G 2189.95 PASS AF=0.973684;AO=148;DP=151;FAO=148;FDP=152;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0112526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8438;QD=57.6303;RBI=0.0116014;REFB=-0.0352578;REVB=-0.00282344;RO=2;SAF=61;SAR=87;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108073;STB=0.50441;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00413889;OID=.;OPOS=97192324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:151:152:2:4:148:148:0.973684:87:61:0:2:87:61:1:3 chr10 97447373 . A T 2999.34 PASS AF=1;AO=189;DP=189;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.999;QD=63.4782;RBI=0.0484575;REFB=0;REVB=0.0438998;RO=0;SAF=93;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10173e-05;OID=.;OPOS=97447373;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:189:189:0:0:189:189:1:96:93:0:0:96:93:0:0 chr10 97599508 . G A 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.04085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.157;QD=10.0752;RBI=0.0453104;REFB=-0.00740214;REVB=-0.0196038;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133032;STB=0.581189;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0118547;OID=.;OPOS=97599508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:3:5:7:7:3:5:7:7 chr10 97684602 . G A 103.51 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.000468158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.847;QD=18.8207;RBI=0.00308155;REFB=0.0152594;REVB=0.00304579;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140099;STB=0.580507;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.0188171;OID=.;OPOS=97684602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:8:4:5:5:8:4:5:5 chr10 97698370 . C T 767.44 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.791;QD=56.8476;RBI=0.0454138;REFB=0;REVB=-0.00565422;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104274;OID=.;OPOS=97698370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:54:0:0:51:54:1:25:26:0:0:25:29:0:0 chr10 97784683 . C T 528.21 PASS AF=0.405594;AO=58;DP=143;FAO=58;FDP=143;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.000122907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.754;QD=14.7751;RBI=0.00440544;REFB=-0.0154642;REVB=0.00440372;RO=85;SAF=27;SAR=31;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104424;STB=0.55874;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0205473;OID=.;OPOS=97784683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:85:85:58:58:0.405594:31:27:48:37:31:27:48:37 chr10 97817650 . G T 258.37 PASS AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0203081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.203;QD=13.9657;RBI=0.0217182;REFB=-0.0239975;REVB=-0.0076982;RO=43;SAF=7;SAR=23;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228358;STB=0.62627;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0432015;OID=.;OPOS=97817650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:44:30:30:0.405405:23:7:18:25:23:7:18:26 chr10 97818692 . T C 99.23 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0165407;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=100.92;QD=14.7006;RBI=0.016579;REFB=0.00850061;REVB=0.00112616;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832381;STB=0.548308;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.00487221;OID=.;OPOS=97818692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:7:5:5:10:7:5:5:10 chr10 97920062 . G A 269.3 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00479565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.723;QD=16.5726;RBI=0.0123369;REFB=-0.000554381;REVB=-0.0113667;RO=35;SAF=11;SAR=19;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062484;STB=0.535187;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.000559957;OID=.;OPOS=97920062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:19:11:15:20:19:11:15:20 chr10 97920099 . T TC 716.29 PASS AF=1;AO=61;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00816293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.3757;QD=44.7679;RBI=0.0985216;REFB=0;REVB=0.0981828;RO=3;SAF=25;SAR=36;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699777;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00154031;OID=.;OPOS=97920100;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:61:64:64:64:0:26:38:0:0:14:3:25:36:1:2 chr10 98078127 . C T 1560.39 PASS AF=0.95;AO=104;DP=118;FAO=114;FDP=120;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00179587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9804;QD=52.013;RBI=0.0303862;REFB=-0.111291;REVB=0.0303331;RO=13;SAF=56;SAR=48;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096677;STB=0.517541;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0052546;OID=.;OPOS=98078127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:118:120:13:6:104:114:0.95:48:56:1:12:55:59:1:5 chr10 98078239 . A G 1520.71 PASS AF=0.979798;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0120099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4677;QD=61.4429;RBI=0.0136319;REFB=-0.107785;REVB=0.00644913;RO=2;SAF=32;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145887;STB=0.507691;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00704539;OID=.;OPOS=98078239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:99:2:2:96:97:0.979798:64:32:0:2:64:33:0:2 chr10 98082401 . A T 450.69 PASS AF=0.478723;AO=44;DP=93;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00583664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.929;QD=19.1783;RBI=0.00633618;REFB=-0.0106981;REVB=0.00246592;RO=49;SAF=19;SAR=25;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112856;STB=0.555531;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00997751;OID=.;OPOS=98082401;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:49:49:44:45:0.478723:25:19:27:22:25:20:27:22 chr10 98287261 . G C 713.53 PASS AF=0.962963;AO=53;DP=55;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00543075;FXX=0.0181785;HRUN=6;LEN=1;MLLD=253.725;QD=52.8541;RBI=0.0287971;REFB=-0.072136;REVB=0.0282804;RO=2;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336247;STB=0.51785;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00053557;OID=.;OPOS=98287261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:55:54:2:2:53:52:0.962963:27:26:0:2:27:25:0:2 chr10 98319503 . A T 194.54 PASS AF=0.521739;AO=21;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.101063;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=38.3636;QD=16.9168;RBI=0.101182;REFB=-0.0363398;REVB=-0.004908;RO=23;SAF=3;SAR=18;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185667;STB=0.629874;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0213887;OID=.;OPOS=98319503;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:23:22:21:24:0.521739:18:3:6:17:21:3:6:16 chr10 98380277 . C T 683.87 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.168;QD=62.1697;RBI=0.0868451;REFB=0;REVB=0.0260161;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000905845;OID=.;OPOS=98380277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:22:22:0:0 chr10 98386558 . G A 1540.4 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9559;QD=59.8214;RBI=0.0288514;REFB=0;REVB=-0.026847;RO=1;SAF=59;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109059;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209915;OID=.;OPOS=98386558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:1:0:102:103:1:43:59:0:1:44:59:0:0 chr10 98469507 . C A 157.83 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0488415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.148;QD=16.6133;RBI=0.0489817;REFB=-0.0161285;REVB=0.00370285;RO=21;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241845;STB=0.63814;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0286439;OID=.;OPOS=98469507;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:7:10:7:14:7:10:7:14 chr10 98808866 . C G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.108;QD=63.2868;RBI=0.0209283;REFB=0;REVB=0.00682785;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.63754e-05;OID=.;OPOS=98808866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr10 98819317 . A G 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.558;QD=64.1536;RBI=0.0552852;REFB=0;REVB=0.00704991;RO=0;SAF=14;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72399e-05;OID=.;OPOS=98819317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:35:14:0:0:35:14:0:0 chr10 98901433 . C T 3936.53 PASS AF=1;AO=252;DP=252;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222654;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8738;QD=61.9926;RBI=0.0146421;REFB=0;REVB=0.0144719;RO=0;SAF=126;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109524;OID=.;OPOS=98901433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:252:254:0:0:252:254:1:126:126:0:0:128:126:0:0 chr10 98985612 . C T 115.67 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0230168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.758;QD=11.0158;RBI=0.029066;REFB=-0.00902601;REVB=-0.01775;RO=28;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176372;STB=0.605901;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0165549;OID=.;OPOS=98985612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:10:4:12:16:10:4:12:16 chr10 99019177 . A G 273.94 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00119519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.781;QD=15.2188;RBI=0.00315326;REFB=-0.0129753;REVB=-0.00291797;RO=41;SAF=7;SAR=24;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255148;STB=0.645753;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0288519;OID=.;OPOS=99019177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:24:7:18:23:24:7:18:23 chr10 99057275 . C T 217.17 PASS AF=0.552632;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0232172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.831;QD=22.8604;RBI=0.0245;REFB=-0.00702846;REVB=0.00782374;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112803;STB=0.57136;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0049415;OID=.;OPOS=99057275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:17:17:20:21:0.552632:9:11:7:10:9:12:7:10 chr10 99080246 . CT C 265.97 PASS AF=0.616667;AO=35;DP=60;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0653055;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.451;QD=17.7313;RBI=0.0847558;REFB=-0.0113504;REVB=0.0540252;RO=22;SAF=22;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219339;STB=0.610505;STBP=0.03;TYPE=del;VARB=0.0138001;OID=.;OPOS=99080247;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.616667:35:60:37:60:23:22:15:7:16:99:22:22:13:7:15 chr10 99080871 . G T 203.59 PASS AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0251329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.962;QD=38.7786;RBI=0.051169;REFB=0.0800547;REVB=0.0445714;RO=3;SAF=6;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942463;STB=0.551665;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.0114944;OID=.;OPOS=99080871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:21:21:3:3:18:18:0.857143:12:6:2:1:12:6:2:1 chr10 99080981 . G T 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0233118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1895;QD=23.2199;RBI=0.0808263;REFB=-0.142119;REVB=-0.0773916;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0322777;OID=.;OPOS=99080981;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1 chr10 99125949 . C T 193.71 PASS AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0383494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.171;QD=10.195;RBI=0.0483799;REFB=-0.00721538;REVB=-0.0294948;RO=50;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113872;STB=0.559239;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0222932;OID=.;OPOS=99125949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:50:51:25:25:0.328947:12:13:21:29:12:13:22:29 chr10 99160965 . A G 187.1 PASS AF=0.396552;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0393513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8778;QD=12.9034;RBI=0.0723854;REFB=-0.0587517;REVB=-0.0607546;RO=33;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180648;STB=0.507036;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0578396;OID=.;OPOS=99160965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:35:22:23:0.396552:15:7:11:22:16:7:11:24 chr10 99181008 . G A 65.56 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00665804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3292;QD=11.401;RBI=0.0256027;REFB=-0.039175;REVB=-0.0247218;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208265;STB=0.605818;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0635335;OID=.;OPOS=99181008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:13:14:9:9:0.391304:6:3:7:6:6:3:7:7 chr10 99205686 . A G 210.24 PASS AF=0.416667;AO=23;DP=58;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00238785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.897;QD=14.0162;RBI=0.00616143;REFB=-0.0160054;REVB=0.00567991;RO=35;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246064;STB=0.608611;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0270016;OID=.;OPOS=99205686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:35:35:23:25:0.416667:9:14:13:22:11:14:13:22 chr10 99219885 . G A 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00538195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.879;QD=13.5518;RBI=0.0198233;REFB=-0.00772894;REVB=-0.0190787;RO=35;SAF=7;SAR=17;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299352;STB=0.671888;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0130942;OID=.;OPOS=99219885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:17:7:20:15:17:7:20:15 chr10 99220707 . C T 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0155685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4269;QD=12.7811;RBI=0.0352769;REFB=-0.0283684;REVB=-0.0316557;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825183;STB=0.562383;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0322313;OID=.;OPOS=99220707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:23:24:13:14:10:10:0.416667:3:7:10:3:3:7:11:3 chr10 99229394 . G A 393.87 PASS AF=0.612903;AO=38;DP=62;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00621947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.561;QD=25.4108;RBI=0.0581809;REFB=-0.00754376;REVB=0.0578475;RO=24;SAF=24;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036228;STB=0.519845;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00691669;OID=.;OPOS=99229394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:24:24:38:38:0.612903:14:24:14:10:14:24:14:10 chr10 99240048 . C T 158.82 PASS AF=0.333333;AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0371013;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.5513;QD=10.0837;RBI=0.0388167;REFB=-0.0158957;REVB=0.011412;RO=41;SAF=11;SAR=10;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406156;STB=0.51587;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0264224;OID=.;OPOS=99240048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:41:42:21:21:0.333333:10:11:20:21:10:11:21:21 chr10 99240758 . G C 1592.26 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137913;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.832;QD=60.0853;RBI=0.0255407;REFB=0;REVB=0.0214971;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95199e-05;OID=.;OPOS=99240758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:48:58:0:0:48:58:0:0 chr10 99332488 . AG CG,GA 234.89 PASS AF=0.442623,0;AO=19,3;DP=56;FAO=27,0;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=18,0;FSAR=9,0;FSRF=29;FSRR=5;FWDB=-0.010892,0.00792562;FXX=0.0468677;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=154.204,69.5419;QD=15.4027;RBI=0.108744,0.173951;REFB=-0.0180351,0.007515;REVB=0.108197,-0.173771;RO=27;SAF=18,0;SAR=1,3;SRF=26;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0878709,-0.839992;STB=0.626586,0.5;STBP=0.15,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0202164,0.0465552;OID=.,.;OPOS=99332488,99332488;OREF=A,AG;OALT=C,GA;OMAPALT=CG,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:61:27:34:19,3:27,0:0.442623,0:1,3:18,0:26:1:9,0:18,0:29:5 chr10 99337572 . G A 356.2 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.014356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9335;QD=21.9199;RBI=0.0217419;REFB=-0.0220972;REVB=0.0163284;RO=29;SAF=16;SAR=20;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114363;STB=0.563105;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0239745;OID=.;OPOS=99337572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:20:16:17:12:20:16:17:12 chr10 99371344 . C A 2082.21 PASS AF=0.958042;AO=137;DP=143;FAO=137;FDP=143;FR=.;FRO=6;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0344579;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.203;QD=58.2435;RBI=0.0376288;REFB=-0.0571941;REVB=0.0151188;RO=3;SAF=72;SAR=65;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193934;STB=0.501074;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00101905;OID=.;OPOS=99371344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:143:143:3:6:137:137:0.958042:65:72:3:0:65:72:3:3 chr10 99376092 . T C 304.8 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0527407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8412;QD=15.0521;RBI=0.0544624;REFB=-0.00575646;REVB=-0.0135859;RO=47;SAF=13;SAR=21;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462276;STB=0.52618;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00804751;OID=.;OPOS=99376092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:21:13:20:27:21:13:20:27 chr10 99376152 . A G 466.27 PASS AF=0.592105;AO=42;DP=73;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00636794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.278;QD=24.5406;RBI=0.0180117;REFB=-0.0193769;REVB=-0.0168484;RO=30;SAF=17;SAR=25;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224053;STB=0.517871;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0137523;OID=.;OPOS=99376152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:76:30:31:42:45:0.592105:25:17:13:17:28:17:13:18 chr10 99410790 . T C 473.51 PASS AF=0.516854;AO=45;DP=88;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0361274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8607;QD=21.2814;RBI=0.042295;REFB=-0.00803537;REVB=0.0219927;RO=43;SAF=19;SAR=26;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672763;STB=0.532335;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0141141;OID=.;OPOS=99410790;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:43:43:45:46:0.516854:26:19:15:28:27:19:15:28 chr10 99434760 . C T 76.13 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0131811;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.418;QD=12.1815;RBI=0.0392827;REFB=-0.0101985;REVB=0.0370053;RO=15;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714454;STB=0.54229;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0155988;OID=.;OPOS=99434760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:6:4:5:10:6:4:5:10 chr10 99439541 . G C 278.86 PASS AF=0.54902;AO=29;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0635291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7027;QD=21.8713;RBI=0.0645317;REFB=0.0284023;REVB=0.011331;RO=22;SAF=9;SAR=20;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160314;STB=0.617196;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.0238101;OID=.;OPOS=99439541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:23:29:28:0.54902:20:9:11:11:20:8:12:11 chr10 99473729 . C G 55.57 PASS AF=0.32;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.000385446;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.798;QD=8.89106;RBI=0.0126785;REFB=0.00209456;REVB=0.0126727;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187422;STB=0.59976;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00530451;OID=.;OPOS=99473729;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:26:25:18:17:8:8:0.32:4:4:6:12:4:4:6:11 chr10 99498234 . G A 155.53 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0090386;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6114;QD=14.4676;RBI=0.0201366;REFB=-0.00381222;REVB=-0.0179941;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166926;STB=0.609632;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00512102;OID=.;OPOS=99498234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:27:26:17:17:0.395349:9:8:17:10:9:8:17:9 chr10 99504630 . G T 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0603956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5683;QD=9.56894;RBI=0.0703973;REFB=0.00948787;REVB=0.0361683;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185755;STB=0.615076;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-0.0117736;OID=.;OPOS=99504630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:6:2:6:9:6:2:6:9 chr10 99969475 . A C 267.5 PASS AF=0.510204;AO=24;DP=48;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00340494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.735;QD=21.8364;RBI=0.024497;REFB=-0.00484232;REVB=0.0242592;RO=24;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751199;STB=0.54996;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00487691;OID=.;OPOS=99969475;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:24:24:24:25:0.510204:14:10:12:12:15:10:12:12 chr10 99991408 . A G 1469.5 PASS AF=0.979167;AO=94;DP=98;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0326787;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.681;QD=61.2291;RBI=0.0364651;REFB=-0.154366;REVB=0.0161804;RO=2;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220401;STB=0.511625;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0007664;OID=.;OPOS=99991408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:96:2:2:94:94:0.979167:42:52:0:2:42:52:0:2 chr10 100013438 . C T 418.67 PASS AF=0.413793;AO=47;DP=115;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0080211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.294;QD=14.437;RBI=0.010983;REFB=-0.00625976;REVB=-0.00750261;RO=64;SAF=26;SAR=21;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707471;STB=0.53308;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00648075;OID=.;OPOS=100013438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:64:68:47:48:0.413793:21:26:31:33:22:26:33:35 chr10 100017453 . T G 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0403501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.206;QD=16.8837;RBI=0.0456493;REFB=-0.00753881;REVB=-0.0213476;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236024;STB=0.526281;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00700777;OID=.;OPOS=100017453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:9:6:6:10:9:6:6:11 chr10 100018844 . G A 290.1 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0302469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8931;QD=16.5771;RBI=0.0330528;REFB=-0.0245558;REVB=0.0133272;RO=38;SAF=12;SAR=20;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00678926;STB=0.503814;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0264248;OID=.;OPOS=100018844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:20:12:14:24:20:12:14:24 chr10 100144782 . C T 158.97 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0241048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5467;QD=17.6632;RBI=0.0377373;REFB=-0.0231739;REVB=-0.0290355;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417334;STB=0.523782;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0402096;OID=.;OPOS=100144782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:12:7:7:10:12:7 chr10 100147060 . A G 276.24 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.00812235;FXX=0.0266631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.9121;QD=15.1364;RBI=0.0296881;REFB=-0.00112047;REVB=-0.0285553;RO=40;SAF=15;SAR=16;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211615;STB=0.628826;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00123524;OID=.;OPOS=100147060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:40:42:31:31:0.424658:16:15:11:29:16:15:11:31 chr10 100148176 . A G 730.6 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191785;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6679;QD=63.5304;RBI=0.0365966;REFB=0;REVB=0.0311689;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402601;OID=.;OPOS=100148176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr10 100167396 . G A 676.73 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00884188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.138;QD=60.1537;RBI=0.0348923;REFB=-0.0311279;REVB=0.0337534;RO=1;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025382;STB=0.513507;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000342735;OID=.;OPOS=100167396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:18:26:0:1:18:26:0:1 chr10 100179851 . T C 206.62 PASS AF=0.45283;AO=22;DP=51;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00778736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.946;QD=15.5938;RBI=0.0195575;REFB=-0.00791487;REVB=-0.0179402;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883814;STB=0.56751;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0125;OID=.;OPOS=100179851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:29:29:22:24:0.45283:8:14:16:13:8:16:16:13 chr10 100183570 . G C 193.63 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00777792;FXX=0.0285633;HRUN=5;LEN=1;MLLD=288.744;QD=22.78;RBI=0.0149652;REFB=-0.00298891;REVB=-0.0127852;RO=15;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170272;STB=0.509544;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00279904;OID=.;OPOS=100183570;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:15:15:19:19:0.558824:8:11:9:6:8:11:9:6 chr10 100184062 . CC AG 255.17 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0344423;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=229.115;QD=22.1888;RBI=0.0355809;REFB=0.00344807;REVB=0.00892893;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388191;STB=0.521721;STBP=0.784;TYPE=mnp;VARB=-0.00294483;OID=.;OPOS=100184062;OREF=CC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:12:12:10:12:12:12:10:12 chr10 100190920 . G A 346.81 PASS AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00608428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.347;QD=22.3749;RBI=0.0849598;REFB=-0.0211216;REVB=0.0847416;RO=27;SAF=14;SAR=21;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00608143;STB=0.503354;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0127413;OID=.;OPOS=100190920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:21:14:11:16:21:14:11:16 chr10 100219314 . G A 1477.03 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0509336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.781;QD=62.1909;RBI=0.0537588;REFB=-0.145856;REVB=0.017198;RO=1;SAF=46;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101963;STB=0.505375;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000741439;OID=.;OPOS=100219314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:48:46:1:0:48:46:1:0 chr10 100219373 . AT A,AA 1339.17 PASS AF=0.0229885,0.977011;AO=12,75;DP=87;FAO=2,85;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=1,40;FSAR=1,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00428444,0.00384845;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=255.127,267.493;QD=61.5709;RBI=0.0315359,0.0341556;REFB=0,0;REVB=0.0312435,0.0339381;RO=0;SAF=6,35;SAR=6,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.71047e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.02106,0.000426375;OID=.,.;OPOS=100219374,100219374;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0229885,0.977011:12,75:87:2,85:87:0:1,40:1,45:0:0:4:0:6,35:6,40:0:0 chr10 101090428 . T G 940.68 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.062324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0148;QD=57.0109;RBI=0.0805752;REFB=-0.0153091;REVB=-0.0510695;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00166008;OID=.;OPOS=101090428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:25:40:0:0:25:40:0:1 chr10 101473218 . A G 134.17 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00595963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8351;QD=16.2629;RBI=0.0228336;REFB=-0.0191347;REVB=-0.0220422;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668581;STB=0.555481;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0274929;OID=.;OPOS=101473218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:18:15:15:0.454545:6:9:9:8:6:9:9:9 chr10 101542578 . C T 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00666032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.379;QD=14.6658;RBI=0.00904831;REFB=-0.00804007;REVB=-0.00612471;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218022;STB=0.626207;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00815243;OID=.;OPOS=101542578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:8:13:6:9:8:13 chr10 101544447 . A T 1512.3 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.891;QD=59.8929;RBI=0.0385149;REFB=0;REVB=0.00858316;RO=0;SAF=55;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83563e-05;OID=.;OPOS=101544447;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:45:55:0:0:46:55:0:0 chr10 101604207 . C T 318.61 PASS AF=0.454545;AO=34;DP=78;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.050136;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.658;QD=16.5511;RBI=0.0502407;REFB=-0.00544019;REVB=-0.0032422;RO=42;SAF=20;SAR=14;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314563;STB=0.526702;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0063497;OID=.;OPOS=101604207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:42:42:34:35:0.454545:14:20:26:16:15:20:26:16 chr10 101639796 . G A 546.4 PASS AF=0.42446;AO=59;DP=139;FAO=59;FDP=139;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=0.0127606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.181;QD=15.7238;RBI=0.0158007;REFB=-0.0215773;REVB=0.00931828;RO=77;SAF=24;SAR=35;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036176;STB=0.532806;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0253552;OID=.;OPOS=101639796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:77:80:59:59:0.42446:35:24:34:43:35:24:37:43 chr10 101639877 . A C 695.25 PASS AF=0.527132;AO=68;DP=129;FAO=68;FDP=129;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.0058674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.34;QD=21.558;RBI=0.0199735;REFB=-0.0104984;REVB=0.0190922;RO=61;SAF=34;SAR=34;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00705871;STB=0.503875;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.00886035;OID=.;OPOS=101639877;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:61:61:68:68:0.527132:34:34:30:31:34:34:30:31 chr10 101645498 . T C 305.8 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0227147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.144;QD=20.3868;RBI=0.0235282;REFB=-0.00720279;REVB=0.00613365;RO=28;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145682;STB=0.580696;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00428523;OID=.;OPOS=101645498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:17:15:18:10:17:15:18:10 chr10 101657880 . G A 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00764788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.432;QD=14.9203;RBI=0.0320967;REFB=-0.0108232;REVB=-0.0311723;RO=36;SAF=21;SAR=7;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165334;STB=0.588718;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00741514;OID=.;OPOS=101657880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:37:28:28:0.430769:7:21:22:14:7:21:23:14 chr10 101673723 . A G 264.84 PASS AF=0.47541;AO=28;DP=65;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0077588;FXX=0.0757461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.229;QD=17.3662;RBI=0.0171926;REFB=-0.0316738;REVB=0.0153423;RO=35;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104974;STB=0.510825;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0353076;OID=.;OPOS=101673723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:61:35:32:28:29:0.47541:13:15:15:20:13:16:17:15 chr10 101689378 . G C 210.82 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00796661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.418;QD=14.0544;RBI=0.0126049;REFB=-0.00551967;REVB=-0.00976812;RO=35;SAF=14;SAR=11;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102519;STB=0.558254;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00660626;OID=.;OPOS=101689378;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:11:14:23:12:11:14:23:12 chr10 101690379 . A G 415.31 PASS AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.0490532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1381;QD=15.2405;RBI=0.0492416;REFB=-0.00145479;REVB=0.00430354;RO=62;SAF=27;SAR=20;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433996;STB=0.524365;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0019;OID=.;OPOS=101690379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:62:62:47:47:0.431193:20:27:33:29:20:27:33:29 chr10 101715899 . G A 1500.21 PASS AF=0.962963;AO=104;DP=108;FAO=104;FDP=108;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.004417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.102;QD=55.5633;RBI=0.00621336;REFB=-0.0700118;REVB=0.0043699;RO=4;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371692;STB=0.519604;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.000212577;OID=.;OPOS=101715899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:108:108:4:4:104:104:0.962963:49:55:0:4:49:55:0:4 chr10 102107251 . C G 467.0 PASS AF=0.459459;AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00372369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2435;QD=16.8286;RBI=0.0604546;REFB=0.0027151;REVB=0.0603398;RO=59;SAF=26;SAR=25;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150531;STB=0.50371;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=-0.00251313;OID=.;OPOS=102107251;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:60:51:51:0.459459:25:26:31:28:25:26:31:29 chr10 102116311 . A C 454.83 PASS AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00372697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.227;QD=19.9925;RBI=0.024947;REFB=-0.0225012;REVB=-0.024667;RO=46;SAF=25;SAR=20;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00892146;STB=0.504948;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0231305;OID=.;OPOS=102116311;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:20:25:26:20:20:25:26:20 chr10 102222957 . G C 290.08 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00286551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4843;QD=16.5761;RBI=0.00431322;REFB=-0.0173453;REVB=-0.00322378;RO=38;SAF=11;SAR=21;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534331;STB=0.530078;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0203834;OID=.;OPOS=102222957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:21:11:15:23:21:11:15:23 chr10 102247408 . C A 289.48 PASS AF=0.342593;AO=37;DP=105;FAO=37;FDP=108;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.00148662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.363;QD=10.7213;RBI=0.0113357;REFB=-0.00752053;REVB=-0.0112378;RO=68;SAF=24;SAR=13;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896376;STB=0.568682;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0137425;OID=.;OPOS=102247408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:108:68:71:37:37:0.342593:13:24:39:29:13:24:39:32 chr10 102247526 . G C 729.26 PASS AF=0.514493;AO=71;DP=138;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0283467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.408;QD=21.1379;RBI=0.0313325;REFB=-0.0155167;REVB=0.0133488;RO=67;SAF=39;SAR=32;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00262464;STB=0.501443;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0163727;OID=.;OPOS=102247526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:67:67:71:71:0.514493:32:39:37:30:32:39:37:30 chr10 102265183 . G A 144.15 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0272158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.665;QD=24.0254;RBI=0.0275541;REFB=-0.00335692;REVB=0.00430485;RO=9;SAF=13;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462036;STB=0.76429;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00538809;OID=.;OPOS=102265183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:2:13:3:6:2:13:3:6 chr10 102265815 . A G 192.9 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0190482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5653;QD=23.3815;RBI=0.0452775;REFB=-0.0220229;REVB=0.0410758;RO=14;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946752;STB=0.553134;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0179775;OID=.;OPOS=102265815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:13:6:6:8:13:6:6:8 chr10 102265847 . A C 227.1 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0243129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.204;QD=21.1254;RBI=0.0254309;REFB=-0.0123193;REVB=0.00745733;RO=21;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594698;STB=0.533447;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0111024;OID=.;OPOS=102265847;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:13:9:10:11:13:9:10:11 chr10 102269085 . C A 325.61 PASS AF=0.486111;AO=34;DP=71;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0247179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.989;QD=18.0894;RBI=0.0526758;REFB=-0.0144917;REVB=0.0465163;RO=37;SAF=20;SAR=14;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323379;STB=0.526516;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0112352;OID=.;OPOS=102269085;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:37:37:34:35:0.486111:14:20:23:14:15:20:23:14 chr10 102269206 . A G 165.06 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0104354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.614;QD=14.0472;RBI=0.0140042;REFB=-0.00452048;REVB=0.00933915;RO=29;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916266;STB=0.553133;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0104191;OID=.;OPOS=102269206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:9:9:12:17:9:9:12:17 chr10 102295836 . C G 527.26 PASS AF=0.524752;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0229568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5732;QD=20.8817;RBI=0.0768585;REFB=0.01559;REVB=-0.07335;RO=48;SAF=36;SAR=17;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128833;STB=0.571168;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.0149273;OID=.;OPOS=102295836;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:48:48:53:53:0.524752:17:36:26:22:17:36:26:22 chr10 102309220 . G C 298.48 PASS AF=0.54386;AO=29;DP=56;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0308354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.957;QD=20.946;RBI=0.0308616;REFB=-0.00116737;REVB=-0.00127206;RO=26;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216825;STB=0.513165;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00100116;OID=.;OPOS=102309220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:26:26:29:31:0.54386:16:13:11:15:17:14:11:15 chr10 102313607 . A G 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0122159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.36;QD=21.7463;RBI=0.0136952;REFB=0.0113913;REVB=0.00619116;RO=20;SAF=18;SAR=4;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470564;STB=0.526293;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0049809;OID=.;OPOS=102313607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:4:18:17:3:4:18:17:3 chr10 102506070 . G C 3634.7 PASS AF=1;AO=178;DP=233;FAO=230;FDP=230;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=104;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.239208;FXX=0.012875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4313;QD=63.2122;RBI=0.243044;REFB=0;REVB=-0.0430109;RO=0;SAF=53;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.3803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000735105;OID=.;OPOS=102506070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:233:230:0:0:178:230:1:125:53:0:0:126:104:0:0 chr10 102734778 . C G 269.16 PASS AF=0.5;AO=29;DP=59;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00891855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.185;QD=17.9439;RBI=0.080599;REFB=-0.00980144;REVB=-0.0801041;RO=30;SAF=21;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253625;STB=0.624913;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00460855;OID=.;OPOS=102734778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:30:30:29:30:0.5:8:21:14:16:9:21:14:16 chr10 102745062 . G T 471.92 PASS AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00473763;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.9011;QD=18.3271;RBI=0.0366615;REFB=0.00145781;REVB=-0.0363541;RO=53;SAF=26;SAR=24;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604843;STB=0.533528;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.00329327;OID=.;OPOS=102745062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:24:26:31:22:24:26:31:22 chr10 102746503 . C T 176.27 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0145095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.23;QD=20.7382;RBI=0.0145107;REFB=-0.0246041;REVB=-0.000188202;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246085;STB=0.638558;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0134945;OID=.;OPOS=102746503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:5:11:7:11:5:11 chr10 102750623 . T C 282.69 PASS AF=0.362637;AO=32;DP=90;FAO=33;FDP=91;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.00916525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.902;QD=12.426;RBI=0.0270272;REFB=-0.0178594;REVB=0.0254257;RO=57;SAF=16;SAR=16;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975587;STB=0.501333;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0259958;OID=.;OPOS=102750623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:57:58:32:33:0.362637:16:16:28:29:17:16:28:30 chr10 102750783 . C A 84.34 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0299951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.041;QD=10.5422;RBI=0.0325482;REFB=-0.0309813;REVB=0.0126364;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075548;STB=0.545372;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0398911;OID=.;OPOS=102750783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:5:6:10:11:5:6:10:11 chr10 102766574 . A G 89.51 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0285258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8448;QD=15.5666;RBI=0.0553338;REFB=-0.0139981;REVB=-0.0474143;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293955;STB=0.671941;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0477236;OID=.;OPOS=102766574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:3:8:5:7:3:8:5:7 chr10 102770082 . T G 873.55 PASS AF=0.486631;AO=76;DP=173;FAO=91;FDP=187;FR=.;FRO=96;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.000281952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1452;QD=18.6855;RBI=0.0472462;REFB=-0.0316171;REVB=0.0472454;RO=96;SAF=38;SAR=38;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313282;STB=0.524487;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0360587;OID=.;OPOS=102770082;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:187:96:96:76:91:0.486631:38:38:45:51:44:47:45:51 chr10 102770327 . A G 54.26 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0399762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.202;QD=8.68228;RBI=0.089604;REFB=-0.0227441;REVB=-0.0801921;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203766;STB=0.627564;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0650509;OID=.;OPOS=102770327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:2:6:10:7:2:6:10:7 chr10 102826129 . C T 705.25 PASS AF=0.486111;AO=70;DP=144;FAO=70;FDP=144;FR=.;FRO=74;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0176443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.764;QD=19.5904;RBI=0.0245626;REFB=-0.0346752;REVB=0.017088;RO=74;SAF=36;SAR=34;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258526;STB=0.514282;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0310385;OID=.;OPOS=102826129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:74:74:70:70:0.486111:34:36:36:38:34:36:36:38 chr10 102925957 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.084208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.299;QD=58.5877;RBI=0.0918441;REFB=0;REVB=0.0366653;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106349;OID=.;OPOS=102925957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chr10 103124606 . A G 4197.04 PASS AF=0.835135;AO=308;DP=373;FAO=309;FDP=370;FR=.;FRO=61;FSAF=80;FSAR=229;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.00623466;FXX=0.00804268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.887;QD=45.3734;RBI=0.00632866;REFB=0.00408779;REVB=-0.00108671;RO=63;SAF=79;SAR=229;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635138;STB=0.534738;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.000144576;OID=.;OPOS=103124606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:373:370:63:61:308:309:0.835135:229:79:26:37:229:80:26:35 chr10 103124647 . A G 4418.41 PASS AF=0.824873;AO=324;DP=393;FAO=325;FDP=394;FR=.;FRO=69;FSAF=92;FSAR=233;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0273093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.373;QD=44.8569;RBI=0.02739;REFB=0.00116402;REVB=0.00209997;RO=69;SAF=92;SAR=232;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05421;STB=0.528858;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.000147958;OID=.;OPOS=103124647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:393:394:69:69:324:325:0.824873:232:92:29:40:233:92:29:40 chr10 103124696 . T C 3709.26 PASS AF=0.811765;AO=269;DP=333;FAO=276;FDP=340;FR=.;FRO=64;FSAF=86;FSAR=190;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.0239525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.315;QD=43.6384;RBI=0.0247405;REFB=-0.00733313;REVB=0.00619415;RO=64;SAF=86;SAR=183;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228522;STB=0.513765;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000865409;OID=.;OPOS=103124696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:340:64:64:269:276:0.811765:183:86:24:40:190:86:24:40 chr10 103124715 . A G 2832.69 PASS AF=0.802974;AO=209;DP=262;FAO=216;FDP=269;FR=.;FRO=53;FSAF=78;FSAR=138;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0492935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.716;QD=42.1218;RBI=0.0494629;REFB=-0.0388408;REVB=0.0040895;RO=53;SAF=72;SAR=137;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372827;STB=0.515419;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00517235;OID=.;OPOS=103124715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:269:53:53:209:216:0.802974:137:72:23:30:138:78:23:30 chr10 103124726 . A G 2187.32 PASS AF=0.773756;AO=171;DP=221;FAO=171;FDP=221;FR=.;FRO=50;FSAF=60;FSAR=111;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0374036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.422;QD=39.5895;RBI=0.040976;REFB=-0.0309966;REVB=0.0167332;RO=50;SAF=60;SAR=111;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04105;STB=0.521841;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00418822;OID=.;OPOS=103124726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:50:50:171:171:0.773756:111:60:22:28:111:60:22:28 chr10 103124736 . C T 1626.26 PASS AF=0.740331;AO=127;DP=174;FAO=134;FDP=181;FR=.;FRO=47;FSAF=42;FSAR=92;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00509727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.015;QD=35.9396;RBI=0.0182992;REFB=-0.0166877;REVB=0.0175749;RO=46;SAF=42;SAR=85;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336295;STB=0.526845;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0118708;OID=.;OPOS=103124736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:181:46:47:127:134:0.740331:85:42:18:28:92:42:19:28 chr10 103124746 . G A 1111.55 PASS AF=0.678832;AO=92;DP=136;FAO=93;FDP=137;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=61;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0167322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.876;QD=32.4539;RBI=0.0167528;REFB=-0.0159302;REVB=-0.000831039;RO=44;SAF=31;SAR=61;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328372;STB=0.514898;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00836391;OID=.;OPOS=103124746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:44:44:92:93:0.678832:61:31:17:27:61:32:17:27 chr10 103825864 . C T 242.36 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0576255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.361;QD=12.5903;RBI=0.0588766;REFB=-0.00366745;REVB=0.0120731;RO=48;SAF=15;SAR=14;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493164;STB=0.528283;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.00643414;OID=.;OPOS=103825864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:48:48:29:29:0.376623:14:15:27:21:14:15:27:21 chr10 103826923 . C T 41.51 PASS AF=0.357143;AO=4;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.114275;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=28.4585;QD=11.8594;RBI=0.143327;REFB=-0.0242259;REVB=0.0865088;RO=7;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198753;STB=0.665925;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0196319;OID=.;OPOS=103826923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:14:14:7:7:4:5:0.357143:1:3:4:3:1:4:4:3 chr10 103827737 . T G 192.41 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00288598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.019;QD=16.0341;RBI=0.00568716;REFB=-0.0108489;REVB=0.0049005;RO=28;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194119;STB=0.611003;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0139142;OID=.;OPOS=103827737;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:11:9:18:10:11:9:18:10 chr10 103904763 . TC T,TT 101.57 PASS AF=0.625,0.0357143;AO=22,2;DP=55;FAO=35,2;FDP=56;FR=.;FRO=19;FSAF=21,1;FSAR=14,1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.236246,0.136318;FXX=0.0175408;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.64302,15.2255;QD=7.2553;RBI=0.239731,0.155748;REFB=0.0489299,0.00423623;REVB=0.0407322,0.0753328;RO=19;SAF=12,1;SAR=10,1;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0594771,0.0256614;STB=0.545428,0.523574;STBP=0.338,0.873;TYPE=del,snp;VARB=0.0350131,-0.0393212;OID=.,.;OPOS=103904764,103904764;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.625,0.0357143:22,2:55:35,2:56:19:21,1:14,1:9:10:59:19:12,1:10,1:9:10 chr10 103991381 . G A 373.54 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0027715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1241;QD=23.3464;RBI=0.107867;REFB=0.016025;REVB=0.107831;RO=27;SAF=14;SAR=23;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194018;STB=0.60675;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00974523;OID=.;OPOS=103991381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:23:14:17:10:23:14:17:10 chr10 104136469 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00639675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.116;QD=60.9785;RBI=0.0413533;REFB=0;REVB=0.0408556;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121462;OID=.;OPOS=104136469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0 chr10 104140339 . CAC CACGTGCATCT,TCT 161.07 PASS AF=0.311111,0.0888889;AO=14,4;DP=48;FAO=14,4;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7,4;FSAR=7,0;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.019643,0.00321588;FXX=0.062487;HRUN=4,1;LEN=8,3;MLLD=334.294,225.097;QD=14.3169;RBI=0.0236417,0.0105249;REFB=-0.00533552,0.000134512;REVB=0.0131561,0.0100216;RO=24;SAF=7,4;SAR=7,0;SRF=15;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.134352,0.58992;STB=0.585247,0.996628;STBP=0.508,0.089;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0029602,0.0489518;OID=.,.;OPOS=104140342,104140339;OREF=-,CAC;OALT=GTGCATCT,TCT;OMAPALT=CACGTGCATCT,TCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:45:24:27:14,4:14,4:0.311111,0.0888889:7,0:7,4:15:9:7,0:7,4:17:10 chr10 104160434 . A G 654.97 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112227;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.018;QD=62.3783;RBI=0.0112235;REFB=0;REVB=-0.000135892;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9136e-05;OID=.;OPOS=104160434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:40:42:1:21:19:0:0:23:19:0:0 chr10 104174895 . G A 159.73 PASS AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0698508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.913;QD=10.305;RBI=0.0711688;REFB=-0.0283351;REVB=0.0136335;RO=40;SAF=12;SAR=9;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00408904;STB=0.509425;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0469353;OID=.;OPOS=104174895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:40:41:21:21:0.33871:9:12:23:17:9:12:24:17 chr10 104184953 . C G 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00151779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.904;QD=16.0426;RBI=0.0307417;REFB=-0.0364057;REVB=-0.0307042;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170097;STB=0.597059;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0276091;OID=.;OPOS=104184953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:10:9:8:18:10:9:8:18 chr10 104214048 . A T 341.82 PASS AF=0.644444;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0449295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.849;QD=30.3837;RBI=0.0530889;REFB=-0.0511912;REVB=0.0282802;RO=16;SAF=16;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337262;STB=0.518506;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0202981;OID=.;OPOS=104214048;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:16:16:29:29:0.644444:13:16:8:8:13:16:8:8 chr10 104229785 . C T 171.78 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0493245;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.847;QD=11.0826;RBI=0.0493956;REFB=-0.00798354;REVB=0.00264873;RO=40;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988257;STB=0.557225;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0167464;OID=.;OPOS=104229785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:13:9:13:27:13:9:13:27 chr10 104231054 . A G 132.43 PASS AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0250737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.245;QD=9.9947;RBI=0.0420711;REFB=-0.0205943;REVB=-0.033783;RO=36;SAF=8;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968805;STB=0.557455;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0512556;OID=.;OPOS=104231054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:9:8:20:16:9:8:20:16 chr10 104236457 . C T 465.12 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0062502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.423;QD=58.14;RBI=0.0108238;REFB=0;REVB=0.00883688;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16617e-05;OID=.;OPOS=104236457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr10 104239100 . T C 212.82 PASS AF=0.454545;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-4.96415e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.566;QD=15.4775;RBI=0.0271553;REFB=-0.00889928;REVB=0.0271553;RO=29;SAF=13;SAR=11;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146536;STB=0.599043;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0120637;OID=.;OPOS=104239100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:29:30:24:25:0.454545:11:13:20:9:12:13:21:9 chr10 104386934 . T C 427.84 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0329196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8308;QD=19.4473;RBI=0.036281;REFB=0.0034085;REVB=-0.0152516;RO=45;SAF=21;SAR=22;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143421;STB=0.579521;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.00460678;OID=.;OPOS=104386934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:22:21:29:16:22:21:29:16 chr10 104389932 . T G 1591.85 PASS AF=1;AO=88;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057331;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.72;QD=64.3171;RBI=0.066613;REFB=0;REVB=0.0339181;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196108;OID=.;OPOS=104389932;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:99:0:0:88:99:1:47:41:0:0:50:49:0:0 chr10 104435746 . C T 1277.51 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488148;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.447;QD=61.5667;RBI=0.00952811;REFB=0;REVB=-0.00818267;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29671e-05;OID=.;OPOS=104435746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:84:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0 chr10 104436641 . C T 215.18 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.000879417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.345;QD=21.5176;RBI=0.0223948;REFB=-0.0125915;REVB=0.0223775;RO=18;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2338;STB=0.642219;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00831422;OID=.;OPOS=104436641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:13:8:12:6:13:8:13:6 chr10 104596924 . C A 1321.27 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.653;QD=62.1775;RBI=0.00848533;REFB=0;REVB=0.00827738;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95639e-06;OID=.;OPOS=104596924;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:44:40:0:0:44:41:0:0 chr10 104596981 . G A 1591.1 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146352;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.842;QD=64.287;RBI=0.0475469;REFB=0;REVB=0.0452385;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020715;OID=.;OPOS=104596981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:54:45:0:0:54:45:0:0 chr10 104638723 . T C 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00714162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.887;QD=17.5598;RBI=0.0130361;REFB=-0.00603855;REVB=0.0109059;RO=21;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224476;STB=0.512806;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00738027;OID=.;OPOS=104638723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:9:9:11:10:9:9:11:10 chr10 104661484 . T C 185.6 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0035437;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=371.802;QD=13.748;RBI=0.00604066;REFB=-0.00271918;REVB=-0.00489201;RO=31;SAF=6;SAR=16;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267498;STB=0.646918;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0047266;OID=.;OPOS=104661484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:16:6:16:15:16:6:16:16 chr10 104814162 . T C 1789.16 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387128;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2417;QD=61.1679;RBI=0.0380662;REFB=0;REVB=0.0378688;RO=0;SAF=57;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.00151e-06;OID=.;OPOS=104814162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:60:57:0:0:60:57:0:0 chr10 104836940 . C T 104.54 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.007489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6223;QD=19.9127;RBI=0.0109656;REFB=-0.00874482;REVB=-0.00800993;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902331;STB=0.551636;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00589184;OID=.;OPOS=104836940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:8:4:4:5:8:4:4:5 chr10 104837816 . G A 1284.13 PASS AF=1;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0976499;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.11;QD=61.149;RBI=0.0985047;REFB=0;REVB=0.0129489;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539217;OID=.;OPOS=104837816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:83:84:1:43:40:0:0:43:41:0:0 chr10 104849468 . G A 280.92 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.00417354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.019;QD=14.4061;RBI=0.00708626;REFB=-0.0215137;REVB=0.00572684;RO=46;SAF=20;SAR=12;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105928;STB=0.559823;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0337617;OID=.;OPOS=104849468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:12:20:33:13:12:20:33:13 chr10 104851396 . G T 1244.93 PASS AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0378159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266;QD=57.9039;RBI=0.0438513;REFB=-0.0331328;REVB=0.0222012;RO=0;SAF=28;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.525418;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000285793;OID=.;OPOS=104851396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:86:86:0:3:83:83:0.965116:55:28:0:0:55:28:3:0 chr10 104855670 . G A 428.99 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00562894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1474;QD=57.1988;RBI=0.0461473;REFB=0;REVB=-0.0458027;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00093489;OID=.;OPOS=104855670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr10 104934709 . T C 195.81 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.000726038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.787;QD=17.8005;RBI=0.0308149;REFB=-0.0161199;REVB=0.0308063;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119924;STB=0.568115;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0108818;OID=.;OPOS=104934709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:10:10:15:9:10:10:15:9 chr10 105049105 . C G 1212.22 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187251;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.874;QD=61.3783;RBI=0.0190626;REFB=0;REVB=0.00357072;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32152e-05;OID=.;OPOS=105049105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0 chr10 105154089 . A G 412.72 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0302619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2335;QD=18.7601;RBI=0.0333678;REFB=-0.0336221;REVB=-0.0140579;RO=46;SAF=23;SAR=19;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044852;STB=0.524988;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0333984;OID=.;OPOS=105154089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:19:23:23:23:19:23:23:23 chr10 105174796 . T C 602.57 PASS AF=0.476923;AO=61;DP=130;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=-0.00368851;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.897;QD=18.5405;RBI=0.0106581;REFB=-0.0176071;REVB=0.00999947;RO=68;SAF=29;SAR=32;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120814;STB=0.562078;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0193701;OID=.;OPOS=105174796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:68:68:61:62:0.476923:32:29:41:27:32:30:41:27 chr10 105174869 . G A 716.62 PASS AF=0.469136;AO=76;DP=162;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.0054912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.509;QD=17.6943;RBI=0.0283167;REFB=-0.0122274;REVB=0.0277792;RO=84;SAF=39;SAR=37;SRF=37;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689084;STB=0.531637;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0132873;OID=.;OPOS=105174869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:84:86:76:76:0.469136:37:39:37:47:37:39:39:47 chr10 105194086 . C T 428.99 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.9992;QD=57.1983;RBI=0.0665517;REFB=0;REVB=-0.0441679;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112798;OID=.;OPOS=105194086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:8:22:0:0:8:22:0:0 chr10 105205302 . A C 320.25 PASS AF=0.53125;AO=31;DP=61;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.020905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7458;QD=20.0155;RBI=0.0516453;REFB=-0.0110333;REVB=0.0472252;RO=30;SAF=19;SAR=12;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159995;STB=0.57297;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.018785;OID=.;OPOS=105205302;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:64:30:30:31:34:0.53125:12:19:13:17:14:20:13:17 chr10 105215016 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00949267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.625;QD=64.4149;RBI=0.0347063;REFB=0;REVB=0.0333829;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.17987e-05;OID=.;OPOS=105215016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0 chr10 105218252 . A G 1568.51 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.816;QD=64.0207;RBI=0.0372818;REFB=0;REVB=0.00413923;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92114e-05;OID=.;OPOS=105218252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:53:45:0:0:53:45:0:0 chr10 105218359 . T C 1098.26 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.381;QD=60.1787;RBI=0.0126217;REFB=0;REVB=0.00643555;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63093e-05;OID=.;OPOS=105218359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:30:43:0:0:30:43:0:0 chr10 105233110 . C T 194.31 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0298709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7973;QD=12.3373;RBI=0.123835;REFB=0.00143406;REVB=0.120179;RO=39;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229851;STB=0.632301;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00187551;OID=.;OPOS=105233110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:9:15:16:23:9:15:16:23 chr10 105359988 . C T 459.62 PASS AF=0.462963;AO=50;DP=108;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.00381712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.356;QD=17.0231;RBI=0.00735184;REFB=-0.0161412;REVB=-0.00628324;RO=58;SAF=19;SAR=31;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102062;STB=0.556934;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0203434;OID=.;OPOS=105359988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:58:50:50:0.462963:31:19:28:30:31:19:28:30 chr10 105361816 . T G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00361479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.778;QD=46.8469;RBI=0.017454;REFB=0;REVB=-0.0170755;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138085;OID=.;OPOS=105361816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr10 105362104 . G A 80.82 PASS AF=0.305556;AO=9;DP=34;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00339199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.091;QD=8.98005;RBI=0.0388047;REFB=0.00177984;REVB=0.0386562;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264784;STB=0.704283;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.00930254;OID=.;OPOS=105362104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:34:36:25:25:9:11:0.305556:6:3:14:11:8:3:14:11 chr10 105362179 . G A 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00783387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.94;QD=21.0155;RBI=0.0189451;REFB=-0.0104384;REVB=0.0172496;RO=13;SAF=12;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13083;STB=0.57437;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00592303;OID=.;OPOS=105362179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:4:12:8:5:4:12:8:5 chr10 105362209 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.457;QD=53.9108;RBI=0.0259957;REFB=0;REVB=-0.0132334;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91293e-05;OID=.;OPOS=105362209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0 chr10 105657316 . G C 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.038;QD=64.1539;RBI=0.0344865;REFB=0;REVB=0.0181259;RO=0;SAF=34;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114225;OID=.;OPOS=105657316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:15:34:0:0:15:34:0:0 chr10 105657363 . C G 295.75 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0384843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5575;QD=20.3967;RBI=0.0395521;REFB=0.0245935;REVB=0.00912839;RO=27;SAF=20;SAR=11;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198218;STB=0.510995;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.0214011;OID=.;OPOS=105657363;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:11:20:18:9:11:20:18:9 chr10 105659826 . T C 1513.39 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.51;QD=59.9363;RBI=0.0532485;REFB=0;REVB=0.0393915;RO=0;SAF=56;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149595;OID=.;OPOS=105659826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:45:56:0:0:45:56:0:0 chr10 105758670 . A G 460.64 PASS AF=0.46729;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0148271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.277;QD=17.2203;RBI=0.0153242;REFB=0.0110796;REVB=0.00387125;RO=57;SAF=20;SAR=30;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00349406;STB=0.501945;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=-0.01255;OID=.;OPOS=105758670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:57:50:50:0.46729:30:20:23:34:30:20:23:34 chr10 105793750 . T C 325.75 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0430458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.795;QD=24.5845;RBI=0.0444103;REFB=-0.0117963;REVB=-0.0109239;RO=21;SAF=12;SAR=20;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108735;STB=0.55955;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.007941;OID=.;OPOS=105793750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:20:12:5:16:20:12:5:16 chr10 105796819 . A G 670.14 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2394;QD=62.339;RBI=0.109388;REFB=0;REVB=-0.108849;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00183612;OID=.;OPOS=105796819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr10 105798872 . T C 1838.98 PASS AF=1;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.181;QD=61.2992;RBI=0.0339915;REFB=0;REVB=0.0281811;RO=0;SAF=61;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37164e-06;OID=.;OPOS=105798872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:119:120:1:58:61:0:0:58:62:0:0 chr10 105799216 . G T 1844.54 PASS AF=0.983871;AO=121;DP=123;FAO=122;FDP=124;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0332787;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2386;QD=59.5013;RBI=0.037726;REFB=-0.0708039;REVB=0.0177701;RO=2;SAF=63;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160967;STB=0.508473;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.001259;OID=.;OPOS=105799216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:123:124:2:2:121:122:0.983871:58:63:0:2:58:64:0:2 chr10 105801253 . G A 728.13 PASS AF=0.964286;AO=33;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0437944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1041;QD=52.0096;RBI=0.150451;REFB=-0.114207;REVB=0.143936;RO=2;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346005;STB=0.517235;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00650825;OID=.;OPOS=105801253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:2:2:33:54:0.964286:26:7:0:2:28:26:0:2 chr10 105805497 . C T 542.01 PASS AF=0.509091;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00318269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9818;QD=19.7095;RBI=0.010232;REFB=-0.00136333;REVB=-0.00972447;RO=54;SAF=27;SAR=29;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323556;STB=0.517851;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00148078;OID=.;OPOS=105805497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:54:54:56:56:0.509091:29:27:28:26:29:27:28:26 chr10 105810400 . T C 441.94 PASS AF=0.420168;AO=50;DP=119;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0126209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.678;QD=14.8552;RBI=0.0141325;REFB=-0.00741511;REVB=0.00635934;RO=69;SAF=15;SAR=35;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137867;STB=0.577829;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00994389;OID=.;OPOS=105810400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:69:69:50:50:0.420168:35:15:29:40:35:15:29:40 chr10 105816916 . C T 2201.04 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948451;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.191;QD=63.3392;RBI=0.0185328;REFB=0;REVB=0.015922;RO=0;SAF=72;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23363e-05;OID=.;OPOS=105816916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:67:72:0:0:67:72:0:0 chr10 105817891 . G A 387.83 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0125743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.513;QD=15.993;RBI=0.0372627;REFB=-0.00737167;REVB=-0.035077;RO=56;SAF=22;SAR=19;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921661;STB=0.551906;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00969359;OID=.;OPOS=105817891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:19:22:25:31:19:22:25:31 chr10 105819956 . G A 617.32 PASS AF=0.453901;AO=63;DP=141;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.0245111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4355;QD=17.5127;RBI=0.033207;REFB=-0.0236871;REVB=-0.0224033;RO=77;SAF=37;SAR=26;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937178;STB=0.546661;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0263316;OID=.;OPOS=105819956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:77:77:63:64:0.453901:26:37:38:39:27:37:38:39 chr10 105824333 . G A 274.54 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0332938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.948;QD=19.9666;RBI=0.0338847;REFB=0.00604094;REVB=0.00630021;RO=26;SAF=6;SAR=23;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159817;STB=0.589677;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00580772;OID=.;OPOS=105824333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:23:6:9:17:23:6:9:17 chr10 105957714 . A G 701.53 PASS AF=0.462963;AO=75;DP=162;FAO=75;FDP=162;FR=.;FRO=87;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=-0.0147402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8048;QD=17.3218;RBI=0.0462812;REFB=-0.00872706;REVB=0.0438711;RO=85;SAF=36;SAR=39;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698693;STB=0.538451;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0128134;OID=.;OPOS=105957714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:85:87:75:75:0.462963:39:36:47:38:39:36:48:39 chr10 105963553 . A G 98.53 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0142761;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.4009;QD=14.0752;RBI=0.0169359;REFB=-0.0141066;REVB=0.00911147;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422461;STB=0.524651;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0312855;OID=.;OPOS=105963553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:5:7:10:6:5:7:10:6 chr10 106022789 . C A 340.79 PASS AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00937877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.103;QD=15.6684;RBI=0.0160683;REFB=-0.00547311;REVB=-0.0130472;RO=49;SAF=14;SAR=23;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196102;STB=0.605206;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00843433;OID=.;OPOS=106022789;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:50:37:37:0.425287:23:14:28:21:23:14:28:22 chr10 106028154 . G A 263.46 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00685998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.35;QD=17.5638;RBI=0.0134087;REFB=-0.0245547;REVB=-0.011521;RO=29;SAF=18;SAR=11;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126275;STB=0.55578;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0235845;OID=.;OPOS=106028154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:31:29:29:0.483333:11:18:14:15:11:18:16:15 chr10 106028157 . G T 252.39 PASS AF=0.482759;AO=27;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0076243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.104;QD=17.4059;RBI=0.0315591;REFB=-0.0253491;REVB=0.0306243;RO=30;SAF=18;SAR=9;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163983;STB=0.576867;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.041191;OID=.;OPOS=106028157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:30:30:27:28:0.482759:9:18:15:15:10:18:15:15 chr10 106039185 . A G 577.39 PASS AF=0.604651;AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00444037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.344;QD=26.8553;RBI=0.00459987;REFB=-0.0261245;REVB=0.00120078;RO=34;SAF=26;SAR=26;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04265;STB=0.523247;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0159676;OID=.;OPOS=106039185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:34:34:52:52:0.604651:26:26:19:15:26:26:19:15 chr10 106602537 . C T 149.8 PASS AF=0.346939;AO=16;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0110983;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.216;QD=12.2283;RBI=0.0129597;REFB=-0.0290151;REVB=-0.00669194;RO=31;SAF=11;SAR=5;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092354;STB=0.560366;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0349062;OID=.;OPOS=106602537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:31:32:16:17:0.346939:5:11:19:12:5:12:20:12 chr10 106907440 . C T 1032.4 PASS AF=0.515625;AO=99;DP=175;FAO=99;FDP=192;FR=.;FRO=93;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.0498248;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.789;QD=21.5084;RBI=0.0573566;REFB=-0.0470182;REVB=0.0284125;RO=75;SAF=48;SAR=51;SRF=25;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12083;STB=0.510905;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0463002;OID=.;OPOS=106907440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:192:75:93:99:99:0.515625:51:48:25:50:51:48:43:50 chr10 108380213 . G A 834.69 PASS AF=0.515337;AO=84;DP=163;FAO=84;FDP=163;FR=.;FRO=79;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.00174158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.878;QD=20.4832;RBI=0.0028259;REFB=0.000559766;REVB=0.00222545;RO=78;SAF=42;SAR=42;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112502;STB=0.503067;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=-0.000489682;OID=.;OPOS=108380213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:78:79:84:84:0.515337:42:42:40:38:42:42:40:39 chr10 108389111 . A G 920.76 PASS AF=0.514124;AO=91;DP=177;FAO=91;FDP=177;FR=.;FRO=86;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=0.0094536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.649;QD=20.8081;RBI=0.0094536;REFB=-0.00617667;REVB=-4.49113e-07;RO=86;SAF=39;SAR=52;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104829;STB=0.557524;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00655838;OID=.;OPOS=108389111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:86:86:91:91:0.514124:52:39:47:39:52:39:47:39 chr10 108729824 . C T 1787.69 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1418;QD=60.0905;RBI=0.0246657;REFB=0.0822504;REVB=-0.021848;RO=0;SAF=56;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.000880163;OID=.;OPOS=108729824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:119:0:1:118:118:0.991597:62:56:0:0:62:56:1:0 chr10 109221364 . G A 1362.87 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.09;QD=61.2524;RBI=0.0184867;REFB=-0.0827385;REVB=-0.000282062;RO=0;SAF=23;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510636;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.000145732;OID=.;OPOS=109221364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:0:1:88:88:0.988764:65:23:0:0:65:23:1:0 chr10 111893124 . AG CT 208.86 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0180241;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=133.62;QD=25.3158;RBI=0.0188618;REFB=-0.00271707;REVB=-0.00555901;RO=13;SAF=9;SAR=11;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218446;STB=0.620579;STBP=0.105;TYPE=mnp;VARB=0.00201066;OID=.;OPOS=111893124;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:11:9:2:11:11:9:2:11 chr10 112044842 . TAAAAC T 81.97 PASS AF=0.285714;AO=15;DP=25;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0201144;FXX=0.0967586;HRUN=4;LEN=5;MLLD=201.082;QD=5.85509;RBI=0.0210475;REFB=-0.00783376;REVB=0.00619744;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.31058;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.736787;STBP=0.037;TYPE=del;VARB=0.0200891;OID=.;OPOS=112044843;OREF=AAAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:15:25:16:56:40:3:13:19:21:81:0:3:12:0:0 chr10 112266771 . C T 255.92 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=29;FWDB=0.0896512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0161;QD=15.7488;RBI=0.113196;REFB=-0.00317091;REVB=0.0691089;RO=36;SAF=5;SAR=24;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367089;STB=0.520781;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00725331;OID=.;OPOS=112266771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:24:5:7:29:24:5:7:29 chr10 112266822 . GC AT 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370977;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.133;QD=62.022;RBI=0.0387968;REFB=0;REVB=-0.0113558;RO=0;SAF=3;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000128496;OID=.;OPOS=112266822;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:39:3:0:0:39:3:0:0 chr10 112271241 . GGTT G 194.08 PASS AF=0.407895;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00318127;FXX=0.0499937;HRUN=2;LEN=3;MLLD=267.249;QD=10.2146;RBI=0.0163832;REFB=-0.0132424;REVB=0.0160713;RO=33;SAF=16;SAR=15;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112333;STB=0.555426;STBP=0.44;TYPE=del;VARB=0.0132202;OID=.;OPOS=112271242;OREF=GTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407895:31:69:31:76:45:16:15:19:26:99:33:16:15:13:20 chr10 112361870 . A G 1415.42 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6047;QD=62.9073;RBI=0.0589931;REFB=0;REVB=0.029416;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365318;OID=.;OPOS=112361870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:54:36:0:0:54:36:0:0 chr10 112402492 . G T 1525.93 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.104;QD=59.8403;RBI=0.0288849;REFB=0;REVB=-0.021903;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.5377e-06;OID=.;OPOS=112402492;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:102:0:0:101:102:1:51:50:0:0:51:51:0:0 chr10 112572458 . G C 768.27 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222722;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.583;QD=56.9091;RBI=0.010825;REFB=0;REVB=0.0105934;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121969;OID=.;OPOS=112572458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:22:32:0:0 chr10 112595719 . G A,C 1008.78 PASS AF=0.0434783,0.956522;AO=4,63;DP=67;FAO=3,66;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=3,42;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000369568,0.00152756;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=143.989,183.763;QD=58.4798;RBI=0.121487,0.108852;REFB=0,0;REVB=0.121487,0.108841;RO=0;SAF=4,41;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.016865,-0.000773441;OID=.,.;OPOS=112595719,112595719;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:67:69:0:0:4,63:3,66:0.0434783,0.956522:0,22:4,41:0:0:0,24:3,42:0:0 chr10 112641053 . A G 954.29 PASS AF=0.971014;AO=66;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0305157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.686;QD=55.3213;RBI=0.0885034;REFB=0.0162004;REVB=0.0830762;RO=1;SAF=46;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230342;STB=0.506251;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.000555064;OID=.;OPOS=112641053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:69:69:1:2:66:67:0.971014:20:46:0:1:21:46:1:1 chr10 112658060 . G A 646.35 PASS AF=0.591837;AO=57;DP=96;FAO=58;FDP=98;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0147686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.44;QD=26.3816;RBI=0.0165759;REFB=-0.00980728;REVB=-0.00752653;RO=39;SAF=18;SAR=39;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233315;STB=0.634638;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0124114;OID=.;OPOS=112658060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:39:40:57:58:0.591837:39:18:24:15:40:18:25:15 chr10 112838892 . C A 248.22 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0327308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.801;QD=16.277;RBI=0.0355944;REFB=-0.0295276;REVB=0.0139877;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387593;STB=0.521826;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0265089;OID=.;OPOS=112838892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:15:13:14:19:15:13:14:19 chr10 112840171 . A G 637.74 PASS AF=0.44;AO=65;DP=150;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=0.00215908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.516;QD=17.0064;RBI=0.0160461;REFB=-0.000530386;REVB=-0.0159002;RO=84;SAF=42;SAR=23;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116986;STB=0.568422;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00038031;OID=.;OPOS=112840171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:84:84:65:66:0.44:23:42:45:39:23:43:45:39 chr10 113913222 . T C 220.78 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0485777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.295;QD=12.0975;RBI=0.0491251;REFB=-0.0300742;REVB=0.00731358;RO=46;SAF=13;SAR=14;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752706;STB=0.543291;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0300433;OID=.;OPOS=113913222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:14:13:19:27:14:13:19:27 chr10 113917085 . T A 508.69 PASS AF=0.482143;AO=54;DP=112;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0187229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.306;QD=18.1674;RBI=0.0191337;REFB=-0.00470938;REVB=-0.00394356;RO=57;SAF=31;SAR=23;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119771;STB=0.511788;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00583524;OID=.;OPOS=113917085;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:57:58:54:54:0.482143:23:31:32:25:23:31:32:26 chr10 113920465 . G A 1194.39 PASS AF=0.53211;AO=116;DP=219;FAO=116;FDP=218;FR=.;FRO=102;FSAF=59;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=-0.010985;FXX=0.013574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.456;QD=21.9154;RBI=0.0345894;REFB=-0.0264741;REVB=0.0327987;RO=101;SAF=59;SAR=57;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045306;STB=0.522368;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0325881;OID=.;OPOS=113920465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:101:102:116:116:0.53211:57:59:46:55:57:59:47:55 chr10 113935379 . T C 178.16 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0461701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.0826;QD=14.5438;RBI=0.0545337;REFB=0.0204523;REVB=-0.0290216;RO=30;SAF=6;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204447;STB=0.618918;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.0322394;OID=.;OPOS=113935379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:13:6:15:15:13:6:15:15 chr10 113940329 . T C 320.16 PASS AF=0.382979;AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=94;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.0754007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.775;QD=13.6239;RBI=0.0757178;REFB=-0.012134;REVB=0.00692265;RO=58;SAF=19;SAR=17;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826522;STB=0.547054;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0170453;OID=.;OPOS=113940329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:58:58:36:36:0.382979:17:19:35:23:17:19:35:23 chr10 114053546 . C G 583.38 PASS AF=0.406061;AO=67;DP=164;FAO=67;FDP=165;FR=.;FRO=98;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=0.0106824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9481;QD=14.1425;RBI=0.0320805;REFB=0.0168605;REVB=0.0302497;RO=96;SAF=29;SAR=38;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511127;STB=0.52746;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.0244914;OID=.;OPOS=114053546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:96:98:67:67:0.406061:38:29:37:59:38:29:38:60 chr10 114059330 . TCTCTGTTTTC T 137.68 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.000693871;FXX=0.102538;HRUN=1;LEN=10;MLLD=347.184;QD=15.7348;RBI=0.00995405;REFB=-0.00848371;REVB=0.00992983;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839727;STB=0.592478;STBP=0.401;TYPE=del;VARB=0.0112331;OID=.;OPOS=114059331;OREF=CTCTGTTTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:15:36:15:35:20:6:9:5:15:99:16:6:9:5:11 chr10 114186624 . G A 1624.41 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00107424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5767;QD=60.1635;RBI=0.00151158;REFB=0;REVB=0.00106343;RO=0;SAF=59;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97893e-06;OID=.;OPOS=114186624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:49:59:0:0:49:59:0:0 chr10 114200355 . G A 393.48 PASS AF=0.612903;AO=38;DP=62;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0482194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2543;QD=25.3856;RBI=0.0601931;REFB=0.0202044;REVB=-0.0360291;RO=24;SAF=21;SAR=17;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211594;STB=0.615519;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.013705;OID=.;OPOS=114200355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:24:24:38:38:0.612903:17:21:6:18:17:21:6:18 chr10 114831434 . A T 219.85 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.02968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.041;QD=17.588;RBI=0.0343445;REFB=-0.0169408;REVB=0.0172813;RO=28;SAF=14;SAR=8;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00691157;STB=0.503933;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0192664;OID=.;OPOS=114831434;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:8:14:18:10:8:14:18:10 chr10 115334124 . C T 912.18 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0487153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.771;QD=55.2836;RBI=0.0491135;REFB=-0.154683;REVB=-0.00624127;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51562;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00399124;OID=.;OPOS=115334124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:0:2:64:64:0.969697:31:33:0:0:31:33:0:2 chr10 115370254 . A G 1422.74 PASS AF=0.978723;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0147774;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.808;QD=60.5422;RBI=0.0592443;REFB=-0.0365706;REVB=-0.0573718;RO=2;SAF=39;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023687;STB=0.512497;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.000577774;OID=.;OPOS=115370254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:95:94:2:2:92:92:0.978723:53:39:2:0:53:39:2:0 chr10 115370274 . T C 1452.84 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1288;QD=63.167;RBI=0.0160765;REFB=0;REVB=0.00893015;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120096;OID=.;OPOS=115370274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:53:39:0:0:53:39:0:0 chr10 115377290 . T C 284.03 PASS AF=0.370787;AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0241557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5287;QD=12.7653;RBI=0.028252;REFB=0.00083877;REVB=0.014652;RO=56;SAF=17;SAR=16;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753091;STB=0.543142;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.000964117;OID=.;OPOS=115377290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:56:33:33:0.370787:16:17:25:31:16:17:25:31 chr10 115381747 . G A 1178.78 PASS AF=0.497872;AO=117;DP=235;FAO=117;FDP=235;FR=.;FRO=118;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=-0.00241033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.63;QD=20.0644;RBI=0.00412973;REFB=-0.0137471;REVB=-0.00335336;RO=118;SAF=61;SAR=56;SRF=63;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114856;STB=0.506306;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0137935;OID=.;OPOS=115381747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:118:118:117:117:0.497872:56:61:63:55:56:61:63:55 chr10 115389356 . G A 102.76 PASS AF=0.235294;AO=16;DP=68;FAO=16;FDP=68;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=10;FWDB=0.0245254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4244;QD=6.04465;RBI=0.0595863;REFB=-0.00169209;REVB=0.0543051;RO=52;SAF=7;SAR=9;SRF=42;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45249;STB=0.768037;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00867718;OID=.;OPOS=115389356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:52:52:16:16:0.235294:9:7:42:10:9:7:42:10 chr10 115389366 . G A 140.43 PASS AF=0.273973;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=11;FWDB=-0.0668308;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3658;QD=7.69477;RBI=0.0685971;REFB=0.0068316;REVB=-0.0154664;RO=52;SAF=9;SAR=11;SRF=41;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403378;STB=0.738937;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0275038;OID=.;OPOS=115389366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:52:53:20:20:0.273973:11:9:41:11:11:9:42:11 chr10 115405615 . T C 361.42 PASS AF=0.40625;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0283486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.848;QD=15.0592;RBI=0.0288537;REFB=0.00286409;REVB=0.00537556;RO=57;SAF=20;SAR=19;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051072;STB=0.528893;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.00688691;OID=.;OPOS=115405615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:57:39:39:0.40625:19:20:32:25:19:20:32:25 chr10 115405664 . C T 302.06 PASS AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0192305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.475;QD=14.3836;RBI=0.0334919;REFB=0.00394099;REVB=-0.0274207;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124214;STB=0.570489;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00733419;OID=.;OPOS=115405664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:50:34:34:0.404762:19:15:28:22:19:15:28:22 chr10 115411614 . A G 338.36 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0373686;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.863;QD=17.577;RBI=0.0398075;REFB=-0.00948062;REVB=-0.0137196;RO=38;SAF=24;SAR=12;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298728;STB=0.672318;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0115107;OID=.;OPOS=115411614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:41:36:36:0.467532:12:24:13:25:12:24:14:27 chr10 115417289 . G A 364.1 PASS AF=0.423913;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0557975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.971;QD=15.8304;RBI=0.055867;REFB=-0.00764185;REVB=-0.00278615;RO=51;SAF=18;SAR=21;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127044;STB=0.581354;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00812968;OID=.;OPOS=115417289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:51:53:39:39:0.423913:21:18:30:21:21:18:32:21 chr10 115422474 . A G 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0173266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.059;QD=16.2364;RBI=0.0175779;REFB=-0.0123679;REVB=-0.00296193;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923656;STB=0.558244;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0177068;OID=.;OPOS=115422474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:36:30:30:0.454545:16:14:13:22:16:14:13:23 chr10 115439569 . C T 515.93 PASS AF=0.578313;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0175822;FXX=0.0119033;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.957;QD=24.8639;RBI=0.0196769;REFB=-0.0294982;REVB=0.0088344;RO=35;SAF=25;SAR=23;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391024;STB=0.521402;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.026172;OID=.;OPOS=115439569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:35:35:48:48:0.578313:23:25:20:15:23:25:20:15 chr10 115439640 . CTT C 202.33 PASS AF=0.469697;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0552064;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=37.4444;QD=12.2626;RBI=0.0560087;REFB=0.0261607;REVB=-0.0094457;RO=32;SAF=15;SAR=15;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115342;STB=0.559883;STBP=0.372;TYPE=del;VARB=-0.0303061;OID=.;OPOS=115439641;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.469697:30:66:31:66:35:16:15:22:13:99:32:15:15:20:12 chr10 115457264 . T G 735.43 PASS AF=0.496552;AO=71;DP=145;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.000412303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.549;QD=20.2877;RBI=0.118022;REFB=-0.0203702;REVB=-0.118021;RO=73;SAF=40;SAR=31;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111877;STB=0.510106;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0221779;OID=.;OPOS=115457264;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:73:73:71:72:0.496552:31:40:42:31:32:40:42:31 chr10 115525175 . T C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.138;QD=59.6794;RBI=0.024508;REFB=0;REVB=0.018077;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39593e-05;OID=.;OPOS=115525175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0 chr10 115529576 . T A 1152.64 PASS AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0290204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.183;QD=56.9203;RBI=0.0379578;REFB=-0.0240376;REVB=0.0244666;RO=3;SAF=35;SAR=43;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00817543;STB=0.504322;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00162733;OID=.;OPOS=115529576;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:3:3:78:78:0.962963:43:35:1:2:43:35:1:2 chr10 115535599 . T C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.134;QD=62.9829;RBI=0.0378855;REFB=0;REVB=0.0159158;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19962e-05;OID=.;OPOS=115535599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr10 115540411 . T C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.988;QD=63.583;RBI=0.0395308;REFB=0;REVB=-0.0159547;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63723e-05;OID=.;OPOS=115540411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr10 115609915 . C G 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00728456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.947;QD=58.4194;RBI=0.00772282;REFB=0;REVB=0.00256458;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.81979e-05;OID=.;OPOS=115609915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:36:27:0:0:36:27:0:0 chr10 115644040 . G A 332.66 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.000207961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.183;QD=26.6127;RBI=0.0048095;REFB=-0.0372881;REVB=0.004805;RO=21;SAF=9;SAR=20;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174805;STB=0.596945;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0185043;OID=.;OPOS=115644040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:20:9:11:10:20:9:11:10 chr10 115668149 . A G 427.33 PASS AF=0.45283;AO=47;DP=105;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0186635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.831;QD=16.1257;RBI=0.0303303;REFB=-0.00122341;REVB=0.0239082;RO=57;SAF=23;SAR=24;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671709;STB=0.535925;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00197145;OID=.;OPOS=115668149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:57:58:47:48:0.45283:24:23:24:33:25:23:24:34 chr10 115675025 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.662;QD=58.5878;RBI=0.0492903;REFB=0;REVB=-0.0315553;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000826341;OID=.;OPOS=115675025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr10 115805056 . G C 129.75 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.484;QD=43.2492;RBI=0.030557;REFB=0;REVB=0.0275311;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293306;OID=.;OPOS=115805056;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr10 116032519 . A G 314.25 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0382713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6676;QD=17.7041;RBI=0.0949433;REFB=-0.00669774;REVB=-0.0868881;RO=37;SAF=18;SAR=16;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612455;STB=0.534204;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00500906;OID=.;OPOS=116032519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:16:18:22:15:16:18:22:15 chr10 116050008 . A G 195.59 PASS AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0254561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.83;QD=12.6184;RBI=0.0256102;REFB=0.00170381;REVB=0.00280515;RO=38;SAF=9;SAR=15;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163548;STB=0.594183;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.00289001;OID=.;OPOS=116050008;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:15:9:20:18:15:9:20:18 chr10 116060387 . T C 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0157925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.945;QD=19.8495;RBI=0.0209863;REFB=0.00095952;REVB=0.013821;RO=13;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303438;STB=0.673226;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.000678997;OID=.;OPOS=116060387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:11:4:8:5:11:4:8:5 chr10 116073696 . C T 1513.42 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1152;QD=59.9373;RBI=0.00765779;REFB=0;REVB=-0.00513356;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76496e-06;OID=.;OPOS=116073696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:46:55:0:0:46:55:0:0 chr10 116085784 . C CCCG 668.19 PASS AF=0.977778;AO=41;DP=54;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0180116;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=3;MLLD=133.719;QD=59.3942;RBI=0.0229377;REFB=-0.0783751;REVB=-0.0142028;RO=10;SAF=28;SAR=13;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950548;STB=0.508471;STBP=0.614;TYPE=ins;VARB=0.00294909;OID=.;OPOS=116085785;OREF=-;OALT=CCG;OMAPALT=CCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.977778:41:54:44:45:1:29:15:1:0:5:10:28:13:9:1 chr10 116593175 . C T 217.94 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0369297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2397;QD=15.5672;RBI=0.0383906;REFB=-0.0116704;REVB=-0.01049;RO=31;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223791;STB=0.625967;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0156457;OID=.;OPOS=116593175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:12:13:9:22:12:13:9:22 chr10 116602805 . A G 382.28 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0175747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.458;QD=19.8585;RBI=0.0178882;REFB=-0.00815803;REVB=-0.00333402;RO=38;SAF=19;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011399;STB=0.506326;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00732507;OID=.;OPOS=116602805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:20:19:19:19:20:19:19:19 chr10 116621893 . A C 320.81 PASS AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0297972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.454;QD=21.3875;RBI=0.0360358;REFB=-0.00705424;REVB=0.0202658;RO=27;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038817;STB=0.521459;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0097618;OID=.;OPOS=116621893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:18:15:11:16:18:15:11:16 chr10 116623277 . G C 509.54 PASS AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0159401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2154;QD=21.0121;RBI=0.0297401;REFB=-0.011151;REVB=0.0251075;RO=48;SAF=30;SAR=19;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102887;STB=0.556971;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00959879;OID=.;OPOS=116623277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:19:30:24:24:19:30:24:24 chr10 116659253 . A G 289.71 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0419676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8884;QD=18.9975;RBI=0.0692925;REFB=-0.0167336;REVB=-0.0551377;RO=30;SAF=13;SAR=18;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720245;STB=0.540167;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0183377;OID=.;OPOS=116659253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:18:13:15:15:18:13:15:15 chr10 116931101 . C CTT,T 507.27 PASS AF=0.857143,0.142857;AO=29,5;DP=41;FAO=30,5;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16,2;FSAR=14,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002202,-0.00739151;FXX=0.0277701;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=46.3326,243.038;QD=57.9735;RBI=0.0243014,0.0110218;REFB=0,0;REVB=-0.0242014,-0.00817594;RO=7;SAF=15,2;SAR=14,3;SRF=7;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.175168,-0.542846;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00840478,0.0267435;OID=.,.;OPOS=116931102,116931101;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:26:41:35:7:0:29,5:30,5:0.857143,0.142857:14,3:15,2:7:0:14,3:16,2:0:0 chr10 117075175 . G A 1549.24 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.11;QD=63.8861;RBI=0.0221192;REFB=0;REVB=0.0110602;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.572e-05;OID=.;OPOS=117075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0 chr10 117823739 . A G 464.57 PASS AF=0.5;AO=45;DP=91;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00104725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.904;QD=20.1986;RBI=0.0327876;REFB=0.00273397;REVB=0.0327709;RO=46;SAF=25;SAR=20;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508986;STB=0.521812;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=-0.00216295;OID=.;OPOS=117823739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:46:46:45:46:0.5:20:25:23:23:21:25:23:23 chr10 117884950 . G A 286.41 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.000334456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.869;QD=15.6937;RBI=0.0186565;REFB=-0.0129854;REVB=0.0186536;RO=40;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246396;STB=0.506845;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0172396;OID=.;OPOS=117884950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:41:32:32:0.438356:16:16:19:21:16:16:20:21 chr10 118228763 . T C 3098.55 PASS AF=0.994898;AO=194;DP=196;FAO=195;FDP=196;FR=.;FRO=1;FSAF=90;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0666243;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5114;QD=63.2357;RBI=0.0709276;REFB=-0.0744154;REVB=-0.0243294;RO=1;SAF=89;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451407;STB=0.502369;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000655936;OID=.;OPOS=118228763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:196:196:1:1:194:195:0.994898:105:89:0:1:105:90:0:1 chr10 118231305 . A G 1510.86 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138064;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.385;QD=63.615;RBI=0.0222584;REFB=0;REVB=0.0222155;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73055e-05;OID=.;OPOS=118231305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:45:50:0:0:45:50:0:0 chr10 118231360 . G A 1018.77 PASS AF=0.985915;AO=68;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.511;QD=57.3958;RBI=0.0247868;REFB=-0.0793278;REVB=0.0142856;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145412;STB=0.507461;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=2.73737e-05;OID=.;OPOS=118231360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:71:1:1:68:70:0.985915:32:36:0:1:33:37:0:1 chr10 118231363 . A G 1040.45 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.121;QD=58.617;RBI=0.0353989;REFB=0;REVB=0.0282319;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050803;OID=.;OPOS=118231363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:71:0:0:66:71:1:33:33:0:0:34:37:0:0 chr10 118363642 . T C 2389.4 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00263568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.968;QD=64.1449;RBI=0.0332303;REFB=0;REVB=0.0331256;RO=0;SAF=60;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41677e-05;OID=.;OPOS=118363642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:149:0:0:149:149:1:89:60:0:0:89:60:0:0 chr10 118380511 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.243;QD=57.2026;RBI=0.0548262;REFB=0;REVB=0.042425;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249235;OID=.;OPOS=118380511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr10 118383461 . AGA AGAG,GAG 1483.05 PASS AF=1,0;AO=97,4;DP=107;FAO=105,0;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0;FSAR=54,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135026,0.0771608;FXX=0.00943307;HRUN=1,4;LEN=1,3;MLLD=25.252,8.11918;QD=56.4971;RBI=0.142092,0.0801003;REFB=0,0;REVB=0.0442499,-0.0215004;RO=3;SAF=48,0;SAR=49,4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.028718,-0.782218;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00240001,0;OID=.,.;OPOS=118383464,118383461;OREF=-,AGA;OALT=G,GAG;OMAPALT=AGAG,GAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:105:3:0:97,4:105,0:1,0:49,4:48,0:3:0:54,0:51,0:0:0 chr10 118387282 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.466;QD=60.6101;RBI=0.0272815;REFB=0;REVB=0.0100464;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79638e-05;OID=.;OPOS=118387282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0 chr10 118439031 . G A 386.55 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00370143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.773;QD=18.1907;RBI=0.0135845;REFB=0.000311182;REVB=0.0130705;RO=45;SAF=23;SAR=17;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10321;STB=0.557629;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.000381956;OID=.;OPOS=118439031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:17:23:21:24:17:23:21:24 chr10 118616110 . C T 785.89 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.3;QD=64.1539;RBI=0.0662125;REFB=0;REVB=0.0543573;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024367;OID=.;OPOS=118616110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:20:28:0:0:20:29:0:0 chr10 118890573 . T C 795.59 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0778414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3217;QD=56.8278;RBI=0.0785147;REFB=0;REVB=-0.0102604;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000548929;OID=.;OPOS=118890573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:33:21:0:0:33:23:0:0 chr10 119026566 . T C 680.42 PASS AF=0.492754;AO=68;DP=138;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.0190915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.558;QD=19.7222;RBI=0.031182;REFB=-0.00314063;REVB=0.0246542;RO=68;SAF=26;SAR=42;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555896;STB=0.53199;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00298096;OID=.;OPOS=119026566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:68:70:68:68:0.492754:42:26:30:38:42:26:31:39 chr10 119133968 . G C 617.81 PASS AF=0.428571;AO=69;DP=162;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.00587288;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.114;QD=15.3494;RBI=0.0168111;REFB=-0.00872676;REVB=-0.0157519;RO=92;SAF=36;SAR=33;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333448;STB=0.518633;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0121857;OID=.;OPOS=119133968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:92:92:69:69:0.428571:33:36:45:47:33:36:45:47 chr10 119134058 . T C 776.52 PASS AF=0.503356;AO=74;DP=147;FAO=75;FDP=149;FR=.;FRO=74;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0639303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1787;QD=20.8461;RBI=0.0758686;REFB=-0.00210642;REVB=-0.0408528;RO=72;SAF=43;SAR=31;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07359;STB=0.550385;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00146504;OID=.;OPOS=119134058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:72:74:74:75:0.503356:31:43:36:36:31:44:36:38 chr10 119768551 . C T 1719.01 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013956;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.693;QD=60.85;RBI=0.0291371;REFB=0;REVB=-0.0255774;RO=0;SAF=80;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161532;OID=.;OPOS=119768551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:33:80:0:0:33:80:0:0 chr10 120069611 . T C 327.77 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00692604;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.264;QD=54.6275;RBI=0.0146451;REFB=0;REVB=0.0129039;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185253;OID=.;OPOS=120069611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr10 120070427 . G T 62.2 PASS AF=0.571429;AO=7;DP=15;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00108329;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.914;QD=17.7706;RBI=0.0103938;REFB=-0.00793611;REVB=0.0103372;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183303;STB=0.555414;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00803897;OID=.;OPOS=120070427;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:15:14:6:6:7:8:0.571429:5:2:3:3:5:3:3:3 chr10 120353910 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.057;QD=59.4356;RBI=0.0285594;REFB=0;REVB=5.61318e-05;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110425;OID=.;OPOS=120353910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0 chr10 120791060 . A C 349.95 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.477;QD=53.8389;RBI=0.0437922;REFB=0;REVB=0.0342233;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389149;OID=.;OPOS=120791060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:24:26:1:14:10:0:0:15:11:0:0 chr10 120791778 . TAAATACC T 506.77 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00397468;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=7;MLLD=304.021;QD=47.1415;RBI=0.0145675;REFB=0;REVB=0.0140148;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=1.38809e-05;OID=.;OPOS=120791779;OREF=AAATACC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:41:42:43:43:0:23:20:0:0:9:0:23:18:0:0 chr10 120792297 . G GCTA 577.88 PASS AF=0.854167;AO=41;DP=48;FAO=41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00520331;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=340.654;QD=48.1562;RBI=0.00791251;REFB=-0.00422862;REVB=-0.00596099;RO=7;SAF=24;SAR=17;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00390051;STB=0.502091;STBP=0.955;TYPE=ins;VARB=0.000566856;OID=.;OPOS=120792298;OREF=-;OALT=CTA;OMAPALT=GCTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.854167:41:48:41:48:7:24:17:4:3:40:7:24:17:4:3 chr10 120792684 . A G 358.52 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00521059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.197;QD=55.1576;RBI=0.0657757;REFB=0;REVB=0.0655689;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284831;OID=.;OPOS=120792684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:14:12:0:0 chr10 120792703 . C A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.355;QD=61.3358;RBI=0.0242954;REFB=0;REVB=0.00334825;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126351;OID=.;OPOS=120792703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0 chr10 120820528 . A G 293.4 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109582;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.0559;QD=53.3447;RBI=0.0383138;REFB=0;REVB=0.0367133;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117963;OID=.;OPOS=120820528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr10 120828969 . A G,T 316.49 PASS AF=0.916667,0.0833333;AO=22,2;DP=24;FAO=22,2;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=9,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430838,0.0256348;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=210.72,85.9588;QD=52.7484;RBI=0.0549673,0.0317369;REFB=0,0;REVB=0.0341349,-0.0187106;RO=0;SAF=13,0;SAR=9,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.2029e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00153693,0.144141;OID=.,.;OPOS=120828969,120828969;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:24:24:0:0:22,2:22,2:0.916667,0.0833333:9,2:13,0:0:0:9,2:13,0:0:0 chr10 120896027 . G A 823.81 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169286;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.139;QD=57.8109;RBI=0.023021;REFB=0;REVB=-0.0156009;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42439e-05;OID=.;OPOS=120896027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr10 120909785 . C T 854.22 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0020788;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.493;QD=57.913;RBI=0.0108296;REFB=0;REVB=0.0106282;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.0549e-06;OID=.;OPOS=120909785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:20:39:0:0:20:39:0:0 chr10 120917445 . G A 648.78 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00890029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2308;QD=61.7884;RBI=0.0426646;REFB=0;REVB=0.041726;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226549;OID=.;OPOS=120917445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:19:23:0:0 chr10 120919246 . T C 446.99 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9046;QD=57.6761;RBI=0.0498547;REFB=0;REVB=-0.0132062;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331716;OID=.;OPOS=120919246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr10 120920588 . T C 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6914;QD=62.0207;RBI=0.0159694;REFB=0;REVB=-0.0150373;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149546;OID=.;OPOS=120920588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr10 120928033 . G T 277.3 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00254996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4886;QD=18.4865;RBI=0.0222936;REFB=-0.00745429;REVB=-0.0221472;RO=30;SAF=19;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123457;STB=0.569077;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00879519;OID=.;OPOS=120928033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:11:19:15:15:11:19:15:15 chr10 120933324 . G A 382.57 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0456781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.763;QD=52.7689;RBI=0.0497899;REFB=-0.0265241;REVB=-0.0198126;RO=0;SAF=1;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509084;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=-7.10082e-06;OID=.;OPOS=120933324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:27:1:0:0:27:1:0:1 chr10 121196335 . G A 972.86 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.826;QD=58.9612;RBI=0.0157768;REFB=0;REVB=0.0094123;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76149e-05;OID=.;OPOS=121196335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0 chr10 121589402 . T G 1320.93 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00317966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.1832;QD=62.1613;RBI=0.0221577;REFB=0;REVB=0.0219284;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1257e-05;OID=.;OPOS=121589402;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0 chr10 121679013 . A G 1846.59 PASS AF=0.991803;AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00626562;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.19;QD=60.544;RBI=0.00987188;REFB=0.00913343;REVB=0.00762864;RO=1;SAF=44;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613003;STB=0.503225;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=3.65714e-06;OID=.;OPOS=121679013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:122:1:1:121:121:0.991803:77:44:0:1:77:44:0:1 chr10 122216862 . C T 2365.59 PASS AF=1;AO=143;DP=143;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5574;QD=63.9348;RBI=0.0519578;REFB=0;REVB=0.0159452;RO=0;SAF=56;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.32469e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125439;OID=.;OPOS=122216862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:143:148:0:0:143:148:1:87:56:0:0:87:61:0:0 chr10 122358342 . G C 1430.4 PASS AF=0.980392;AO=98;DP=102;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0469731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.181;QD=56.0941;RBI=0.0594665;REFB=-0.0558442;REVB=0.0364664;RO=4;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035754;STB=0.509257;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00150985;OID=.;OPOS=122358342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:102:102:4:2:98:100:0.980392:51:47:0:4:53:47:0:2 chr10 122358604 . C T 471.88 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164958;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.503;QD=55.5149;RBI=0.0239945;REFB=-0.131004;REVB=0.0174248;RO=1;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183273;STB=0.509798;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00304334;OID=.;OPOS=122358604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:25:8:0:1:25:8:0:1 chr10 122358657 . A AGTGT,T 206.85 PASS AF=0.117647,0.882353;AO=2,15;DP=18;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,2;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103898,0.142453;FXX=0.0555247;HRUN=0,3;LEN=4,1;MLLD=222.312,74.0411;QD=48.6703;RBI=0.0197757,0.144206;REFB=0,0;REVB=0.0168265,0.0224153;RO=0;SAF=0,2;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0306759,0.00661233;OID=.,.;OPOS=122358658,122358657;OREF=-,A;OALT=GTGT,T;OMAPALT=AGTGT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:18:17:0:0:2,15:2,15:0.117647,0.882353:2,13:0,2:0:0:2,13:0,2:0:0 chr10 122358876 . TGA T 219.0 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00871798;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=278.949;QD=23.6753;RBI=0.0275461;REFB=-0.00811561;REVB=-0.0261301;RO=16;SAF=15;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23189;STB=0.630122;STBP=0.077;TYPE=del;VARB=0.00511322;OID=.;OPOS=122358877;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.567568:21:37:21:37:16:15:6:7:9:99:16:15:6:7:9 chr10 122359040 . A G 145.63 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0137375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.248;QD=16.1807;RBI=0.0142845;REFB=-0.00760035;REVB=-0.00391498;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230244;STB=0.642687;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00727081;OID=.;OPOS=122359040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:19:20:16:16:0.444444:9:7:13:6:9:7:14:6 chr10 122359580 . C A 338.23 PASS AF=0.538462;AO=32;DP=62;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0313996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.467;QD=20.8141;RBI=0.0314978;REFB=-0.00621338;REVB=0.00248563;RO=29;SAF=18;SAR=14;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27005;STB=0.664581;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00685849;OID=.;OPOS=122359580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:29:30:32:35:0.538462:14:18:7:22:14:21:7:23 chr10 122624679 . G A 197.72 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0381861;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4166;QD=12.9654;RBI=0.0381999;REFB=-0.0131347;REVB=0.00102809;RO=37;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142685;STB=0.50819;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0204552;OID=.;OPOS=122624679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:12:12:19:18:12:12:19:18 chr10 122645376 . A T 133.32 PASS AF=0.315789;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0812261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.613;QD=9.35588;RBI=0.0903853;REFB=-0.0202494;REVB=-0.0396462;RO=38;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374253;STB=0.731945;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0764785;OID=.;OPOS=122645376;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:38:39:18:18:0.315789:4:14:18:20:4:14:18:21 chr10 122663585 . G A 497.85 PASS AF=0.510638;AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0161136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.609;QD=21.1852;RBI=0.0300286;REFB=0.00127323;REVB=-0.0253391;RO=46;SAF=17;SAR=31;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245887;STB=0.635982;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0014205;OID=.;OPOS=122663585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:46:48:48:0.510638:31:17:29:17:31:17:29:17 chr10 122665459 . C G 595.9 PASS AF=0.428571;AO=63;DP=147;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0324892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2699;QD=16.2149;RBI=0.0335432;REFB=-0.00214076;REVB=-0.00834231;RO=84;SAF=29;SAR=34;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125143;STB=0.569933;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00240649;OID=.;OPOS=122665459;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:84:84:63:63:0.428571:34:29:49:35:34:29:49:35 chr10 123298158 . T C 3095.26 PASS AF=1;AO=194;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.593;QD=63.8198;RBI=0.0382636;REFB=0;REVB=0.0344392;RO=0;SAF=99;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91423e-05;OID=.;OPOS=123298158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:194:194:0:0:194:194:1:95:99:0:0:95:99:0:0 chr10 123310871 . A G 503.27 PASS AF=0.490741;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0184963;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2431;QD=18.6395;RBI=0.0186791;REFB=-0.0403813;REVB=0.00260657;RO=55;SAF=25;SAR=28;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158363;STB=0.508769;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0306637;OID=.;OPOS=123310871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:55:55:53:53:0.490741:28:25:25:30:28:25:25:30 chr10 123549691 . T G 82.7 PASS AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00325591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.299;QD=9.18859;RBI=0.00588147;REFB=-0.000441438;REVB=-0.00489803;RO=25;SAF=2;SAR=9;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.551349;STB=0.833561;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00101987;OID=.;OPOS=123549691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:9:2:17:8:9:2:17:8 chr10 123596254 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4672;QD=49.5988;RBI=0.107006;REFB=0;REVB=0.0784776;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00518711;OID=.;OPOS=123596254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0 chr10 123673339 . T C 546.83 PASS AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0128553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.234;QD=53.3491;RBI=0.0414103;REFB=-0.0895903;REVB=0.0393644;RO=2;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667634;STB=0.551696;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00155882;OID=.;OPOS=123673339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:41:41:2:3:38:38:0.926829:13:25:0:2:13:25:0:3 chr10 123810060 . G A 134.94 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0821328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2263;QD=16.8677;RBI=0.0826045;REFB=-0.0257321;REVB=-0.00881491;RO=17;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788801;STB=0.545393;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0432699;OID=.;OPOS=123810060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:5:10:10:7:5:10:10:7 chr10 123842825 . C G 76.7 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.016009;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=266.505;QD=12.7828;RBI=0.0198865;REFB=-0.0021218;REVB=0.0117977;RO=12;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252837;STB=0.705428;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00182954;OID=.;OPOS=123842825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:12:14:10:10:0.416667:8:2:5:7:8:2:7:7 chr10 123845322 . T C 801.28 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00146852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.891;QD=57.2345;RBI=0.00928118;REFB=0;REVB=-0.00916427;RO=0;SAF=43;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60164e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45459e-05;OID=.;OPOS=123845322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:13:43:0:0:13:43:0:0 chr10 123846490 . C T 621.11 PASS AF=0.406977;AO=70;DP=176;FAO=70;FDP=172;FR=.;FRO=102;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=22;FSRR=80;FWDB=0.0191471;FXX=0.022726;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.552;QD=14.4445;RBI=0.0216782;REFB=-0.015929;REVB=0.0101653;RO=102;SAF=18;SAR=52;SRF=22;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593637;STB=0.533204;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0251175;OID=.;OPOS=123846490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:172:102:102:70:70:0.406977:52:18:22:80:52:18:22:80 chr10 123848113 . G A 244.29 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00153467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.383;QD=13.029;RBI=0.0292821;REFB=-0.00729897;REVB=0.0292418;RO=46;SAF=18;SAR=11;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24366;STB=0.639249;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0072283;OID=.;OPOS=123848113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:11:18:18:28:11:18:18:28 chr10 123970530 . T C 356.18 PASS AF=0.388889;AO=41;DP=108;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=-0.0703405;FXX=0.052627;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.505;QD=13.1919;RBI=0.0714198;REFB=-0.0284755;REVB=0.012369;RO=64;SAF=20;SAR=21;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147105;STB=0.57891;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0312189;OID=.;OPOS=123970530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:66:41:42:0.388889:21:20:40:24:22:20:40:26 chr10 123970587 . C T 615.41 PASS AF=0.402299;AO=70;DP=176;FAO=70;FDP=174;FR=.;FRO=104;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=0.0266446;FXX=0.011363;HRUN=6;LEN=1;MLLD=84.7169;QD=14.1474;RBI=0.0266668;REFB=-0.00394791;REVB=-0.00108763;RO=98;SAF=30;SAR=40;SRF=53;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117021;STB=0.565771;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00433119;OID=.;OPOS=123970587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:174:98:104:70:70:0.402299:40:30:53:45:40:30:56:48 chr10 123976391 . C A 1375.93 PASS AF=0.925234;AO=98;DP=106;FAO=99;FDP=107;FR=.;FRO=8;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0278614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.25;QD=51.4365;RBI=0.0278919;REFB=-0.0851288;REVB=0.00130287;RO=8;SAF=46;SAR=52;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756595;STB=0.539992;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00245942;OID=.;OPOS=123976391;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:106:107:8:8:98:99:0.925234:52:46:8:0:53:46:8:0 chr10 123996934 . G A 271.51 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0248939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.521;QD=23.6097;RBI=0.0326117;REFB=-0.00492644;REVB=-0.0210671;RO=20;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411624;STB=0.535685;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00486628;OID=.;OPOS=123996934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:21:25:25:0.543478:15:10:9:11:15:10:10:11 chr10 124066731 . T G 170.9 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00874335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.349;QD=17.5286;RBI=0.0557249;REFB=-0.000320522;REVB=0.0550347;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750124;STB=0.542809;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00152678;OID=.;OPOS=124066731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:10:11:8:10:10:11 chr10 124089036 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.466;QD=57.3856;RBI=0.0352264;REFB=0;REVB=0.0103248;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6897e-05;OID=.;OPOS=124089036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0 chr10 124089075 . G A 243.78 PASS AF=0.5;AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0233646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2921;QD=18.0579;RBI=0.0444918;REFB=-0.020106;REVB=0.0378631;RO=27;SAF=10;SAR=16;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498472;STB=0.520045;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0248733;OID=.;OPOS=124089075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:26:27:0.5:16:10:9:18:17:10:9:18 chr10 124094467 . T C 165.72 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0224887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.579;QD=14.4104;RBI=0.0225144;REFB=-0.0185241;REVB=0.00107529;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374803;STB=0.521715;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.033475;OID=.;OPOS=124094467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:9:9:13:15:9:9:13:15 chr10 124096035 . T C 72.91 PASS AF=0.285714;AO=9;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.000231873;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.606;QD=8.33255;RBI=0.0098558;REFB=-0.0154671;REVB=-0.00985307;RO=26;SAF=8;SAR=1;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.603406;STB=0.882619;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0298014;OID=.;OPOS=124096035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:26:25:9:10:0.285714:1:8:10:16:1:9:10:15 chr10 124096041 . T C 71.38 PASS AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0640644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.342;QD=7.71671;RBI=0.0642695;REFB=-0.0265685;REVB=-0.00513065;RO=26;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.598809;STB=0.883577;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0670378;OID=.;OPOS=124096041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:37:26:27:10:10:0.27027:1:9:11:15:1:9:11:16 chr10 124096061 . A C 107.24 PASS AF=0.304348;AO=12;DP=45;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00127792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.366;QD=9.32502;RBI=0.0104394;REFB=-0.0143743;REVB=0.0103609;RO=32;SAF=11;SAR=1;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606853;STB=0.808023;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0429445;OID=.;OPOS=124096061;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:32:32:12:14:0.304348:1:11:15:17:2:12:15:17 chr10 124183698 . T G 232.48 PASS AF=0.251852;AO=33;DP=138;FAO=34;FDP=135;FR=.;FRO=101;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=66;FSRR=35;FWDB=-0.000888657;FXX=0.0217376;HRUN=22;LEN=1;MLLD=155.046;QD=6.88822;RBI=0.00999354;REFB=-0.000569903;REVB=-0.00995395;RO=99;SAF=17;SAR=16;SRF=64;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165664;STB=0.614751;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00119002;OID=.;OPOS=124183698;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:99:101:33:34:0.251852:16:17:64:35:17:17:66:35 chr10 124183699 . T G 95.44 PASS AF=0.143885;AO=18;DP=141;FAO=20;FDP=139;FR=.;FRO=119;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=73;FSRR=46;FWDB=-0.00351382;FXX=0.0141834;HRUN=22;LEN=1;MLLD=152.976;QD=2.74659;RBI=0.0121024;REFB=0.00143404;REVB=-0.0115811;RO=118;SAF=10;SAR=8;SRF=73;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813764;STB=0.597029;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=-0.00630007;OID=.;OPOS=124183699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:141:139:118:119:18:20:0.143885:8:10:73:45:10:10:73:46 chr10 124183732 . T C 4532.36 PASS AF=1;AO=286;DP=287;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103431;FXX=0.0069442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1771;QD=63.3897;RBI=0.0258754;REFB=0.00747744;REVB=-0.0237183;RO=1;SAF=146;SAR=140;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00325517;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141514;OID=.;OPOS=124183732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:287:286:1:0:286:286:1:140:146:1:0:140:146:0:0 chr10 124189197 . A G 803.46 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.051144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3259;QD=55.4113;RBI=0.0587802;REFB=-0.0772384;REVB=0.0289725;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.506022;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00156339;OID=.;OPOS=124189197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:16:41:0:0:16:41:1:0 chr10 124214355 . C T 736.17 PASS AF=0.487342;AO=77;DP=158;FAO=77;FDP=158;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.00134995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.99;QD=18.6371;RBI=0.0121594;REFB=-0.0345092;REVB=0.0120843;RO=80;SAF=36;SAR=41;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692325;STB=0.500825;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.030903;OID=.;OPOS=124214355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:80:81:77:77:0.487342:41:36:38:42:41:36:38:43 chr10 124214448 . G T 349.13 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.000919547;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.28;QD=19.9501;RBI=0.00522793;REFB=-0.0169392;REVB=-0.00514643;RO=34;SAF=18;SAR=18;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257245;STB=0.514278;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0147185;OID=.;OPOS=124214448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:34:34:36:36:0.514286:18:18:18:16:18:18:18:16 chr10 124329672 . TC CT 662.76 PASS AF=0.974359;AO=78;DP=80;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.142764;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=2;MLLD=186.247;QD=33.9878;RBI=0.153362;REFB=-0.0603901;REVB=0.0560213;RO=1;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114055;STB=0.512817;STBP=0.222;TYPE=mnp;VARB=0.00150517;OID=.;OPOS=124329672;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:80:78:1:2:78:76:0.974359:41:37:0:1:38:38:0:2 chr10 124329710 . C A 1208.83 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00109857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.962;QD=61.2064;RBI=0.00323553;REFB=0;REVB=-0.00304333;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.98445e-06;OID=.;OPOS=124329710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:39:39:0:0:39:40:0:0 chr10 124329746 . A T 1005.73 PASS AF=0.972222;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00255741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.269;QD=55.874;RBI=0.0252638;REFB=-0.00146938;REVB=0.025134;RO=2;SAF=36;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00115919;STB=0.500397;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=6.27559e-05;OID=.;OPOS=124329746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:72:2:2:69:70:0.972222:33:36:1:1:34:36:1:1 chr10 124330427 . C T 1460.63 PASS AF=0.99;AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0428301;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9632;QD=58.4252;RBI=0.0429984;REFB=-0.0084408;REVB=-0.0038011;RO=1;SAF=60;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123176;STB=0.506328;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000256988;OID=.;OPOS=124330427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:1:1:98:99:0.99:38:60:0:1:39:60:0:1 chr10 124331867 . C T 1749.8 PASS AF=0.991453;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00765416;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.608;QD=59.8221;RBI=0.0148811;REFB=-0.120972;REVB=-0.0127616;RO=0;SAF=43;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-3.58927e-05;OID=.;OPOS=124331867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:117:0:1:116:116:0.991453:73:43:0:0:73:43:1:0 chr10 124339332 . T C 1525.48 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0615591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.934;QD=59.8229;RBI=0.064227;REFB=0;REVB=0.018319;RO=0;SAF=51;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134136;OID=.;OPOS=124339332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:51:51:0:0:51:51:0:0 chr10 124339378 . A G 1491.63 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.582;QD=63.4738;RBI=0.050756;REFB=0;REVB=0.0455345;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116264;OID=.;OPOS=124339378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:49:45:0:0:49:45:0:0 chr10 124348684 . C T 320.44 PASS AF=0.208178;AO=57;DP=269;FAO=56;FDP=269;FR=.;FRO=213;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=103;FSRR=110;FWDB=0.0254426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.482;QD=4.76483;RBI=0.0274699;REFB=-0.0151758;REVB=-0.0103571;RO=212;SAF=25;SAR=32;SRF=102;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548939;STB=0.543881;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0561294;OID=.;OPOS=124348684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:212:213:57:56:0.208178:32:25:102:110:32:24:103:110 chr10 124351954 . G A 4288.96 PASS AF=0.975439;AO=278;DP=285;FAO=278;FDP=285;FR=.;FRO=7;FSAF=140;FSAR=138;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0176042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.756;QD=60.1959;RBI=0.028583;REFB=-0.0739671;REVB=0.0225184;RO=6;SAF=140;SAR=138;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656664;STB=0.505175;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000275579;OID=.;OPOS=124351954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:285:285:6:7:278:278:0.975439:138:140:4:2:138:140:5:2 chr10 124351992 . C T 1334.9 PASS AF=0.501873;AO=134;DP=267;FAO=134;FDP=267;FR=.;FRO=133;FSAF=70;FSAR=64;FSRF=75;FSRR=58;FWDB=0.00709442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.037;QD=19.9986;RBI=0.00717738;REFB=-0.00440606;REVB=-0.00108814;RO=133;SAF=70;SAR=64;SRF=75;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037877;STB=0.52076;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00431577;OID=.;OPOS=124351992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:267:133:133:134:134:0.501873:64:70:75:58:64:70:75:58 chr10 124402677 . A G 1572.74 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306827;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.518;QD=64.1935;RBI=0.0328581;REFB=0;REVB=-0.011757;RO=0;SAF=62;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95992e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162503;OID=.;OPOS=124402677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:98:0:0:96:98:1:34:62:0:0:34:64:0:0 chr10 124457452 . C T 1572.87 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00524839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.553;QD=59.9189;RBI=0.0164997;REFB=0;REVB=0.0156427;RO=0;SAF=56;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1335e-05;OID=.;OPOS=124457452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:49:56:0:0:49:56:0:0 chr10 124457906 . C T 2421.08 PASS AF=1;AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00773394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.404;QD=61.2932;RBI=0.0105901;REFB=0;REVB=0.0072344;RO=0;SAF=80;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38159e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36286e-05;OID=.;OPOS=124457906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:158:158:0:0:158:158:1:78:80:0:0:78:80:0:0 chr10 124459139 . T C 803.44 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4683;QD=55.4097;RBI=0.0123958;REFB=0.00700313;REVB=-0.00470089;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511624;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000142713;OID=.;OPOS=124459139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:36:21:0:0:36:21:1:0 chr10 124585833 . T C 311.0 PASS AF=0.393258;AO=34;DP=89;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0178544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.327;QD=13.9775;RBI=0.0180041;REFB=0.00152091;REVB=-0.00231686;RO=51;SAF=10;SAR=24;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719588;STB=0.571913;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00190979;OID=.;OPOS=124585833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:51:54:34:35:0.393258:24:10:18:33:25:10:21:33 chr10 124816515 . C G 520.03 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2241;QD=59.4324;RBI=0.0472268;REFB=0;REVB=0.00664388;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00070445;OID=.;OPOS=124816515;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr10 125426565 . G C 1491.68 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00378469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.434;QD=63.4755;RBI=0.0190543;REFB=0;REVB=0.0186746;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8047e-05;OID=.;OPOS=125426565;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:47:47:0:0:47:47:0:0 chr10 125449015 . G A 131.25 PASS AF=0.271429;AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0716373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.366;QD=7.50003;RBI=0.0733124;REFB=-0.00511961;REVB=-0.015582;RO=50;SAF=10;SAR=9;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794723;STB=0.540498;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0188052;OID=.;OPOS=125449015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:50:51:19:19:0.271429:9:10:23:27:9:10:24:27 chr10 125450857 . C G 993.52 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.038;QD=57.5951;RBI=0.107534;REFB=0;REVB=0.0677416;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000666034;OID=.;OPOS=125450857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:69:0:0:65:69:1:35:30:0:0:35:34:0:0 chr10 125472862 . A G 442.78 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00717459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.505;QD=22.7068;RBI=0.00884885;REFB=0.000454119;REVB=0.00517952;RO=35;SAF=25;SAR=18;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320623;STB=0.517653;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.000369211;OID=.;OPOS=125472862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:18:25:19:16:18:25:19:16 chr10 125506302 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.841;QD=63.872;RBI=0.0100874;REFB=0;REVB=-0.00565461;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55513e-06;OID=.;OPOS=125506302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0 chr10 125528048 . G A 964.91 PASS AF=0.416;AO=104;DP=249;FAO=104;FDP=250;FR=.;FRO=146;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=61;FSRR=85;FWDB=-0.00350203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.015;QD=15.4385;RBI=0.00433093;REFB=-0.00564283;REVB=0.00254808;RO=145;SAF=42;SAR=62;SRF=61;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181634;STB=0.508438;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0103162;OID=.;OPOS=125528048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:145:146:104:104:0.416:62:42:61:84:62:42:61:85 chr10 125601975 . G A 125.23 PASS AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00382037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.354;QD=10.4362;RBI=0.0107703;REFB=0.00339709;REVB=-0.0100699;RO=33;SAF=11;SAR=4;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1306;STB=0.578837;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.0107404;OID=.;OPOS=125601975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:4:11:21:12:4:11:21:12 chr10 126089434 . G A 879.87 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191623;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.513;QD=57.6965;RBI=0.0272043;REFB=0;REVB=0.0193101;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155753;OID=.;OPOS=126089434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:60:61:1:35:25:0:0:36:25:0:0 chr10 126172863 . A G 268.77 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0236721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.719;QD=22.3972;RBI=0.0337723;REFB=-0.0324285;REVB=-0.0240874;RO=23;SAF=10;SAR=15;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249641;STB=0.639235;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.020317;OID=.;OPOS=126172863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:15:10:16:7:15:10:16:7 chr10 126517989 . G A 84.12 PASS AF=0.235294;AO=10;DP=50;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00770524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8361;QD=6.59764;RBI=0.0109937;REFB=-0.0110798;REVB=-0.00784163;RO=39;SAF=5;SAR=5;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110208;STB=0.505042;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0377581;OID=.;OPOS=126517989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:50:51:39:39:10:12:0.235294:5:5:23:16:5:7:23:16 chr10 126670356 . G A 191.96 PASS AF=0.45;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.00115216;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6398;QD=19.1956;RBI=0.0158395;REFB=-0.00917817;REVB=-0.0157976;RO=20;SAF=3;SAR=15;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052925;STB=0.530268;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.00515624;OID=.;OPOS=126670356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:20:20:18:18:0.45:15:3:4:16:15:3:4:16 chr10 126674093 . T C 244.33 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0110003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.484;QD=17.4518;RBI=0.0170034;REFB=0.000268713;REVB=0.0129657;RO=29;SAF=17;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138954;STB=0.578172;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-9.64259e-05;OID=.;OPOS=126674093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:10:17:14:15:10:17:14:15 chr10 126674227 . C CT 1645.08 PASS AF=1;AO=141;DP=159;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147245;FXX=0.0125778;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.6324;QD=41.9129;RBI=0.0850199;REFB=-0.00914399;REVB=-0.0837351;RO=10;SAF=68;SAR=73;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147981;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0011257;OID=.;OPOS=126674228;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:141:159:157:157:0:74:83:0:0:27:10:68:73:6:4 chr10 126674876 . A G 135.21 PASS AF=0.75;AO=9;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0542889;FXX=0.407257;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6915;QD=33.8012;RBI=0.138477;REFB=-0.0657993;REVB=0.127392;RO=4;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34935;STB=0.716928;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0445159;OID=.;OPOS=126674876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:16:4:4:9:12:0.75:8:1:2:2:11:1:2:2 chr10 126675759 . A AAGAT 264.7 PASS AF=0.382716;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0157996;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=321.559;QD=13.0718;RBI=0.0223143;REFB=-0.0121996;REVB=-0.0157575;RO=51;SAF=16;SAR=15;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176888;STB=0.59582;STBP=0.189;TYPE=ins;VARB=0.0183205;OID=.;OPOS=126675760;OREF=-;OALT=AGAT;OMAPALT=AAGAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.382716:31:82:31:81:50:16:15:18:32:99:51:16:15:18:33 chr10 126677239 . GAAGAAAAG GAAGAA,GAAG 145.46 PASS AF=0.173913,0.565217;AO=4,12;DP=23;FAO=4,13;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=3,10;FSAR=1,3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00297664,0.0017818;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,5;MLLD=236.433,241.994;QD=25.2967;RBI=0.00418199,0.00240179;REFB=-0.0224015,-0.0164384;REVB=-0.00293745,-0.00161052;RO=5;SAF=3,9;SAR=1,3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.590845,0.402251;STB=0.873682,0.749605;STBP=0.235,0.004;TYPE=del,del;VARB=0.0372907,-0.00774871;OID=.,.;OPOS=126677245,126677240;OREF=AAG,AAGAA;OALT=-,-;OMAPALT=GAAGAA,GAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.173913,0.565217:4,12:23:4,13:23:6:3,10:1,3:0:6:38:5:3,9:1,3:0:5 chr10 126677367 . T G 35.37 PASS AF=0.116667;AO=5;DP=58;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0122203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.276;QD=2.3583;RBI=0.0139557;REFB=-0.00458745;REVB=0.00673975;RO=51;SAF=4;SAR=1;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342634;STB=0.829764;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0665979;OID=.;OPOS=126677367;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:58:60:51:53:5:7:0.116667:1:4:25:26:1:6:27:26 chr10 126683087 . T C 58.06 PASS AF=0.104895;AO=15;DP=143;FAO=15;FDP=143;FR=.;FRO=128;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=69;FWDB=-0.00515481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.673;QD=1.62394;RBI=0.0154301;REFB=-0.00294519;REVB=0.0145436;RO=128;SAF=7;SAR=8;SRF=59;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693133;STB=0.505148;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0231866;OID=.;OPOS=126683087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:143:143:128:128:15:15:0.104895:8:7:59:69:8:7:59:69 chr10 126683103 . C T 36.56 PASS AF=0.0774194;AO=12;DP=156;FAO=12;FDP=155;FR=.;FRO=143;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=64;FSRR=79;FWDB=-0.0431662;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.189;QD=0.943555;RBI=0.0545122;REFB=-0.007177;REVB=-0.0332905;RO=139;SAF=4;SAR=8;SRF=64;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146193;STB=0.609678;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.101911;OID=.;OPOS=126683103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:156:155:139:143:12:12:0.0774194:8:4:64:75:8:4:64:79 chr10 126683123 . A C 120.57 PASS AF=0.163121;AO=23;DP=141;FAO=23;FDP=141;FR=.;FRO=118;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=64;FWDB=-0.0428422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2372;QD=3.42043;RBI=0.0428721;REFB=-0.00798742;REVB=-0.00160063;RO=118;SAF=9;SAR=14;SRF=54;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862234;STB=0.556768;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0370496;OID=.;OPOS=126683123;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:118:118:23:23:0.163121:14:9:54:64:14:9:54:64 chr10 126683150 . AC AT,GT 134.88 PASS AF=0.155738,0.0491803;AO=19,6;DP=123;FAO=19,6;FDP=122;FR=.;FRO=97;FSAF=7,2;FSAR=12,4;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=-0.00105316,-0.00335304;FXX=0.00812942;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=84.2796,118.725;QD=4.42219;RBI=0.0431965,0.0394178;REFB=0.00182672,-0.00355163;REVB=-0.0431837,-0.0392749;RO=97;SAF=7,2;SAR=12,4;SRF=43;SRR=54;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0979907,-0.111415;STB=0.564902,0.607739;STBP=0.597,0.639;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0208035,0.00027402;OID=.,.;OPOS=126683151,126683150;OREF=C,AC;OALT=T,GT;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:123:122:97:97:19,6:19,6:0.155738,0.0491803:12,4:7,2:43:54:12,4:7,2:43:54 chr10 126683162 . C T 124.5 PASS AF=0.189655;AO=22;DP=117;FAO=22;FDP=116;FR=.;FRO=94;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=0.0119192;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.663;QD=4.29314;RBI=0.0124795;REFB=-0.00255028;REVB=-0.00369752;RO=93;SAF=8;SAR=14;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601521;STB=0.543761;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0051819;OID=.;OPOS=126683162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:93:94:22:22:0.189655:14:8:38:55:14:8:39:55 chr10 126683190 . C A 98.66 PASS AF=0.178947;AO=17;DP=95;FAO=17;FDP=95;FR=.;FRO=78;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=-0.0152434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.909;QD=4.15425;RBI=0.0187987;REFB=0.00211043;REVB=-0.0110012;RO=78;SAF=7;SAR=10;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702275;STB=0.545402;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=-0.00834753;OID=.;OPOS=126683190;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:95:95:78:78:17:17:0.178947:10:7:28:50:10:7:28:50 chr10 126714714 . G C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.37;QD=52.6124;RBI=0.0541361;REFB=0;REVB=0.0288803;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395211;OID=.;OPOS=126714714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr10 126714966 . A G 227.24 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230774;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2216;QD=50.4973;RBI=0.0325353;REFB=0;REVB=-0.0229342;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000731956;OID=.;OPOS=126714966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr10 126715243 . GC G 67.76 PASS AF=0.714286;AO=11;DP=19;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.247508;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.0958;QD=12.9061;RBI=0.24922;REFB=-0.0311364;REVB=0.0291639;RO=6;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190712;STB=0.556886;STBP=0.463;TYPE=del;VARB=0.104613;OID=.;OPOS=126715244;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.714286:11:19:15:21:6:8:7:2:4:16:6:7:4:2:4 chr10 126715692 . C T 269.18 PASS AF=0.326531;AO=31;DP=99;FAO=32;FDP=98;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0274237;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.044;QD=10.9869;RBI=0.0337654;REFB=-0.0136684;REVB=-0.0196988;RO=66;SAF=12;SAR=19;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133459;STB=0.563831;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0242964;OID=.;OPOS=126715692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:66:66:31:32:0.326531:19:12:33:33:19:13:33:33 chr10 126721441 . C A 301.24 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=359.615;QD=52.3902;RBI=0.0581496;REFB=0;REVB=0.0142987;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.56291e-05;OID=.;OPOS=126721441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:18:4:0:0:18:5:0:0 chr10 127265374 . T C 286.48 PASS AF=0.349057;AO=35;DP=104;FAO=37;FDP=106;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.0104437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.637;QD=10.8105;RBI=0.0113221;REFB=-0.0168838;REVB=-0.00437255;RO=68;SAF=14;SAR=21;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139352;STB=0.500264;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0272171;OID=.;OPOS=127265374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:68:69:35:37:0.349057:21:14:28:40:22:15:28:41 chr10 127445408 . G T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3118;QD=40.7629;RBI=0.066255;REFB=0;REVB=-0.0566746;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00558916;OID=.;OPOS=127445408;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr10 127462525 . A G 289.34 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.091;QD=52.608;RBI=0.0458445;REFB=0;REVB=-0.0203863;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262117;OID=.;OPOS=127462525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0 chr10 127530325 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.759;QD=58.0608;RBI=0.0282828;REFB=0;REVB=0.0166313;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100119;OID=.;OPOS=127530325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0 chr10 127579210 . T C 167.41 PASS AF=0.1875;AO=30;DP=160;FAO=30;FDP=160;FR=.;FRO=130;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=68;FSRR=62;FWDB=0.00284112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4853;QD=4.18533;RBI=0.0170207;REFB=0.00392061;REVB=0.0167819;RO=130;SAF=12;SAR=18;SRF=68;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157522;STB=0.599933;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.0171326;OID=.;OPOS=127579210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:130:130:30:30:0.1875:18:12:68:62:18:12:68:62 chr10 127579238 . G T 253.75 PASS AF=0.24375;AO=39;DP=160;FAO=39;FDP=160;FR=.;FRO=121;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=60;FWDB=-0.0105727;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.889;QD=6.34364;RBI=0.0243922;REFB=-0.0060446;REVB=-0.0219817;RO=121;SAF=20;SAR=19;SRF=61;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108866;STB=0.506569;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0174713;OID=.;OPOS=127579238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:121:121:39:39:0.24375:19:20:61:60:19:20:61:60 chr10 127585173 . T C 30.49 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.010835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.933;QD=11.0883;RBI=0.046894;REFB=-0.0517909;REVB=0.0456251;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162496;STB=0.6423;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0424325;OID=.;OPOS=127585173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:6:5:5:0.454545:2:3:2:3:2:3:2:4 chr10 127585179 . G C 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0143448;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.367;QD=30.7904;RBI=0.0157388;REFB=0.0104101;REVB=0.00647581;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.00143113;OID=.;OPOS=127585179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:4:4:1:0:4:4:1:0 chr10 127668431 . A G 1285.38 PASS AF=1;AO=80;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.973;QD=61.9461;RBI=0.0128094;REFB=0;REVB=0.00747098;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98328e-06;OID=.;OPOS=127668431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:80:83:1:44:36:0:0:44:39:0:0 chr10 127677374 . A G 365.07 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0431341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.35;QD=52.1523;RBI=0.0432807;REFB=-0.0357847;REVB=-0.00355993;RO=1;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226895;STB=0.512186;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.000695819;OID=.;OPOS=127677374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:20:7:0:1:20:7:0:1 chr10 127730728 . C T 509.38 PASS AF=0.504762;AO=52;DP=104;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.00469592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.08;QD=19.4051;RBI=0.00469664;REFB=-0.0167995;REVB=8.18642e-05;RO=52;SAF=26;SAR=26;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521548;STB=0.533201;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0149734;OID=.;OPOS=127730728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:52:52:52:53:0.504762:26:26:23:29:26:27:23:29 chr10 127834139 . T G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.58;QD=57.2026;RBI=0.0100782;REFB=0;REVB=-0.000461622;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8974e-05;OID=.;OPOS=127834139;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:22:8:0:0:22:8:0:0 chr10 128019025 . C G 418.5 PASS AF=0.455446;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0370858;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.9196;QD=16.5744;RBI=0.0480979;REFB=-0.016881;REVB=0.0306277;RO=55;SAF=21;SAR=25;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198397;STB=0.511077;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.021079;OID=.;OPOS=128019025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:55:55:46:46:0.455446:25:21:24:31:25:21:24:31 chr10 128158622 . A AG,G 31.82 PASS AF=0.222222,0;AO=8,2;DP=38;FAO=8,0;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=1,0;FSAR=7,0;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.06062,-0.0469645;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.1401,32.171;QD=3.5352;RBI=0.0633005,0.0475211;REFB=-0.0740147,-0.0328056;REVB=0.0182256,0.00725143;RO=28;SAF=1,0;SAR=7,2;SRF=12;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.44084,-0.437493;STB=0.797377,0.5;STBP=0.104,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.182407,0.102183;OID=.,.;OPOS=128158623,128158622;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:38:36:28:28:8,2:8,0:0.222222,0:7,2:1,0:12:16:7,0:1,0:12:16 chr10 128192985 . C T 281.88 PASS AF=0.517241;AO=29;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00388842;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.999;QD=19.44;RBI=0.0211089;REFB=-0.0141838;REVB=-0.0207477;RO=29;SAF=25;SAR=4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38861;STB=0.71216;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0107301;OID=.;OPOS=128192985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:28:29:30:0.517241:4:25:16:13:4:26:16:12 chr10 128202435 . T C 1198.42 PASS AF=0.952941;AO=81;DP=85;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0189419;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.2107;QD=56.3962;RBI=0.0647928;REFB=-0.153037;REVB=0.0619621;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.526309;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00297423;OID=.;OPOS=128202435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:85:85:0:4:81:81:0.952941:36:45:0:0:36:45:0:4 chr10 128926013 . A G 2102.82 PASS AF=1;AO=133;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.957;QD=62.7708;RBI=0.0336868;REFB=0;REVB=0.0253173;RO=0;SAF=75;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30537e-05;OID=.;OPOS=128926013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:134:0:0:133:134:1:58:75:0:0:59:75:0:0 chr10 128974621 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.711;QD=33.4285;RBI=0.0774863;REFB=0;REVB=0.0187492;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226661;OID=.;OPOS=128974621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr10 129216658 . T C 480.71 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00764047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.59;QD=20.2404;RBI=0.0470617;REFB=-0.0235448;REVB=-0.0464374;RO=48;SAF=28;SAR=19;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117065;STB=0.506491;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0199277;OID=.;OPOS=129216658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:48:48:47:47:0.494737:19:28:28:20:19:28:28:20 chr10 129242515 . G A 317.01 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0114833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.324;QD=17.8595;RBI=0.013289;REFB=-0.0198232;REVB=0.00668817;RO=37;SAF=16;SAR=18;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112581;STB=0.562778;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0182466;OID=.;OPOS=129242515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:18:16:13:24:18:16:13:24 chr10 129249662 . G A 976.33 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0137901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.837;QD=57.431;RBI=0.0510422;REFB=-0.161048;REVB=0.049144;RO=1;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136967;STB=0.507244;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00327099;OID=.;OPOS=129249662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:34:33:0:1:34:33:0:1 chr10 129249676 . C T 834.76 PASS AF=0.898551;AO=62;DP=69;FAO=62;FDP=69;FR=.;FRO=7;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.033625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.299;QD=48.3918;RBI=0.0521264;REFB=-0.0634269;REVB=0.0398311;RO=7;SAF=36;SAR=26;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057179;STB=0.530408;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00702118;OID=.;OPOS=129249676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:7:7:62:62:0.898551:26:36:2:5:26:36:2:5 chr10 129249693 . G A 1175.95 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0247501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.706;QD=59.5418;RBI=0.0511814;REFB=-0.115647;REVB=0.0447992;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.506665;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000627902;OID=.;OPOS=129249693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:0:1:78:78:0.987342:37:41:0:0:37:41:0:1 chr10 129249701 . C G 1102.65 PASS AF=0.986667;AO=71;DP=72;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0628565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1905;QD=58.8082;RBI=0.0923149;REFB=-0.0097858;REVB=0.0676099;RO=1;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150093;STB=0.507461;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00210769;OID=.;OPOS=129249701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:72:75:1:1:71:74:0.986667:31:40:0:1:33:41:0:1 chr10 129249925 . T C 2116.81 PASS AF=0.985612;AO=128;DP=132;FAO=137;FDP=139;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0101367;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.814;QD=60.9153;RBI=0.0628709;REFB=-0.089171;REVB=0.0620484;RO=4;SAF=78;SAR=50;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365043;STB=0.508473;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.000145161;OID=.;OPOS=129249925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:132:139:4:2:128:137:0.985612:50:78:0:4:58:79:0:2 chr10 129534478 . A AGCGCGGC,C 206.02 PASS AF=0.772727,0.0454545;AO=15,4;DP=23;FAO=17,1;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=11,1;FSAR=6,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00160944,-0.00494141;FXX=0.119952;HRUN=1,1;LEN=7,1;MLLD=223.543,59.1425;QD=37.4592;RBI=0.00602367,0.0172444;REFB=-0.0835441,0.0136753;REVB=-0.00580468,-0.0165212;RO=4;SAF=9,4;SAR=6,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0602786,0.687804;STB=0.521714,0.98415;STBP=0.747,0.538;TYPE=ins,snp;VARB=0.0171414,-0.054058;OID=.,.;OPOS=129534479,129534478;OREF=-,A;OALT=GCGCGGC,C;OMAPALT=AGCGCGGC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:23:22:4:4:15,4:17,1:0.772727,0.0454545:6,0:9,4:3:1:6,0:11,1:3:1 chr10 129534679 . T C 1513.65 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.6;QD=59.9465;RBI=0.0627145;REFB=0;REVB=0.062057;RO=0;SAF=64;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13626e-05;OID=.;OPOS=129534679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:101:0:0:99:101:1:35:64:0:0:36:65:0:0 chr10 129534739 . C G 2070.72 PASS AF=0.978873;AO=137;DP=142;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00744193;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.71;QD=58.3302;RBI=0.00764341;REFB=-0.150124;REVB=0.00174338;RO=1;SAF=83;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569375;STB=0.501528;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00674689;OID=.;OPOS=129534739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:142:142:1:3:137:139:0.978873:54:83:1:0:56:83:2:1 chr10 129534864 . A C 1396.41 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.741;QD=62.7602;RBI=0.0490607;REFB=0;REVB=0.00267888;RO=0;SAF=55;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27148e-05;OID=.;OPOS=129534864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:34:55:0:0:34:55:0:0 chr10 129845903 . C T 517.27 PASS AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0337872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.814;QD=25.2327;RBI=0.0337935;REFB=-0.0356324;REVB=0.000652195;RO=34;SAF=27;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00282855;STB=0.501547;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0290868;OID=.;OPOS=129845903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:21:27:19:15:21:27:19:15 chr10 129859992 . T C 345.13 PASS AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=0.00950824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.326;QD=16.6327;RBI=0.0150667;REFB=-0.0030952;REVB=0.0116876;RO=46;SAF=15;SAR=22;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280556;STB=0.656844;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00333812;OID=.;OPOS=129859992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:22:15:32:14:22:15:32:14 chr10 129882401 . C T 399.87 PASS AF=0.460674;AO=40;DP=91;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=15;FWDB=0.00172576;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.465;QD=17.9716;RBI=0.0263115;REFB=0.00207105;REVB=-0.0262548;RO=47;SAF=24;SAR=16;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105536;STB=0.557831;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.0040378;OID=.;OPOS=129882401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:89:47:48:40:41:0.460674:16:24:33:14:17:24:33:15 chr10 129883370 . A G 1130.11 PASS AF=0.533654;AO=111;DP=208;FAO=111;FDP=208;FR=.;FRO=97;FSAF=60;FSAR=51;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=0.0460687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0833;QD=21.7329;RBI=0.0490699;REFB=-0.00692524;REVB=-0.0168976;RO=96;SAF=60;SAR=51;SRF=54;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188077;STB=0.507594;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00636321;OID=.;OPOS=129883370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:96:97:111:111:0.533654:51:60:54:42:51:60:54:43 chr10 129883933 . C T 477.78 PASS AF=0.534884;AO=45;DP=85;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.00134863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.958;QD=22.2222;RBI=0.0102443;REFB=-0.00435755;REVB=-0.0101551;RO=39;SAF=19;SAR=26;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147363;STB=0.580353;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00385116;OID=.;OPOS=129883933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:39:40:45:46:0.534884:26:19:10:29:27:19:10:30 chr10 129899578 . T C 585.58 PASS AF=0.433566;AO=62;DP=143;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=32;FWDB=0.0164407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.045;QD=16.3798;RBI=0.0220631;REFB=-0.0153292;REVB=0.0147133;RO=79;SAF=27;SAR=35;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183896;STB=0.595181;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0164128;OID=.;OPOS=129899578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:79:81:62:62:0.433566:35:27:49:30:35:27:49:32 chr10 129899778 . G C 489.6 PASS AF=0.48;AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0232304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4391;QD=19.5841;RBI=0.0234331;REFB=-0.0139479;REVB=-0.0030751;RO=51;SAF=23;SAR=25;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010244;STB=0.510838;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0141854;OID=.;OPOS=129899778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:52:48:48:0.48:25:23:25:26:25:23:26:26 chr10 129899922 . T C 259.11 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0237906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9887;QD=24.1035;RBI=0.0607916;REFB=0.029161;REVB=0.055943;RO=19;SAF=7;SAR=17;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137644;STB=0.576002;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=-0.0213445;OID=.;OPOS=129899922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:17:7:3:16:17:7:3:16 chr10 129901393 . T C 875.55 PASS AF=0.57554;AO=80;DP=139;FAO=80;FDP=139;FR=.;FRO=59;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.00290382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.449;QD=25.1957;RBI=0.00323107;REFB=-0.0195173;REVB=-0.00141691;RO=59;SAF=41;SAR=39;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108666;STB=0.55911;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0205008;OID=.;OPOS=129901393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:59:59:80:80:0.57554:39:41:22:37:39:41:22:37 chr10 129901570 . C T 527.62 PASS AF=0.435115;AO=57;DP=132;FAO=57;FDP=131;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0469263;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.64;QD=16.1106;RBI=0.0477621;REFB=-0.0162746;REVB=-0.00889623;RO=74;SAF=20;SAR=37;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142783;STB=0.580038;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.013026;OID=.;OPOS=129901570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:74:74:57:57:0.435115:37:20:36:38:37:20:36:38 chr10 129901722 . G A 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00397696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.816;QD=15.7383;RBI=0.00397702;REFB=-0.00458141;REVB=-2.21148e-05;RO=35;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427383;STB=0.514276;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00408328;OID=.;OPOS=129901722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:17:12:13:22:17:12:14:22 chr10 129901726 . C T 267.55 PASS AF=0.454545;AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00718748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.145;QD=16.2151;RBI=0.0539651;REFB=-0.00117765;REVB=0.0534843;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935705;STB=0.540514;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00210935;OID=.;OPOS=129901726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:34:36:29:30:0.454545:16:13:12:22:17:13:13:23 chr10 129901825 . T C 480.95 PASS AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00919991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.507;QD=22.9024;RBI=0.0109084;REFB=-0.0210937;REVB=-0.00586128;RO=38;SAF=29;SAR=17;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00100959;STB=0.500555;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0188252;OID=.;OPOS=129901825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:17:29:24:14:17:29:24:14 chr10 129901946 . T G 453.62 PASS AF=0.48913;AO=44;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00206867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.645;QD=19.7226;RBI=0.013387;REFB=-0.0239405;REVB=0.0132262;RO=39;SAF=23;SAR=21;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00844564;STB=0.53215;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0269397;OID=.;OPOS=129901946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:39:47:44:45:0.48913:21:23:20:19:21:24:28:19 chr10 129902158 . C T 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.07519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6814;QD=14.2701;RBI=0.0752578;REFB=-0.0211642;REVB=-0.00319335;RO=33;SAF=6;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266613;STB=0.653328;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0280169;OID=.;OPOS=129902158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:18:6:16:17:18:6:16:17 chr10 129902281 . G A 105.55 PASS AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00524474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.462;QD=11.11;RBI=0.00623315;REFB=-0.00600596;REVB=-0.00336822;RO=25;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632438;STB=0.537756;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0095479;OID=.;OPOS=129902281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:8:5:11:14:8:5:11:14 chr10 129903016 . T C 250.67 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00939086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.192;QD=14.5318;RBI=0.0112348;REFB=-0.0130705;REVB=0.00616708;RO=40;SAF=16;SAR=13;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764279;STB=0.543294;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0167873;OID=.;OPOS=129903016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:13:16:25:15:13:16:25:15 chr10 129903094 . G T 534.31 PASS AF=0.537634;AO=52;DP=94;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0229678;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.074;QD=22.9812;RBI=0.0243017;REFB=-0.0209045;REVB=0.0079406;RO=40;SAF=28;SAR=24;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107334;STB=0.52256;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0162597;OID=.;OPOS=129903094;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:40:43:52:50:0.537634:24:28:21:19:22:28:22:21 chr10 129903802 . A G 396.32 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0173628;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.628;QD=19.8159;RBI=0.0226732;REFB=-0.00515823;REVB=-0.014581;RO=36;SAF=18;SAR=22;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00480727;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0112251;OID=.;OPOS=129903802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:36:40:40:40:0.5:22:18:16:20:22:18:18:22 chr10 129904477 . C T 207.67 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0136039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.161;QD=15.1029;RBI=0.0145481;REFB=-0.00983994;REVB=-0.00515558;RO=31;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479693;STB=0.52725;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0186432;OID=.;OPOS=129904477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:12:12:17:14:12:12:17:14 chr10 129904560 . C T 84.79 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00845143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.464;QD=10.9411;RBI=0.0084848;REFB=-0.00672143;REVB=-0.000751683;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261867;STB=0.65491;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00822138;OID=.;OPOS=129904560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:6:5:14:6:6:5:14:6 chr10 129906468 . C T 661.06 PASS AF=0.488889;AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=135;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0155172;FXX=0.0287749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.988;QD=19.587;RBI=0.0159511;REFB=-0.0116044;REVB=-0.00369511;RO=73;SAF=29;SAR=37;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11579;STB=0.571503;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0103346;OID=.;OPOS=129906468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:135:73:69:66:66:0.488889:37:29:41:32:37:29:40:29 chr10 129907544 . G C 149.92 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0120497;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5433;QD=18.1724;RBI=0.015844;REFB=-0.0341116;REVB=0.0102878;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243709;STB=0.638925;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0139441;OID=.;OPOS=129907544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:11:6:10:6:11:6 chr10 129911856 . C G 164.16 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.0342072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.198;QD=11.1293;RBI=0.0350167;REFB=-0.00318532;REVB=-0.0074858;RO=38;SAF=6;SAR=15;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108226;STB=0.562444;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00449247;OID=.;OPOS=129911856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:15:6:8:30:15:6:8:30 chr10 129913960 . A T 490.46 PASS AF=0.456897;AO=51;DP=114;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.000894165;FXX=0.00854628;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.346;QD=16.9123;RBI=0.00458247;REFB=-0.0126172;REVB=-0.00449439;RO=63;SAF=22;SAR=29;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16887;STB=0.601514;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00934936;OID=.;OPOS=129913960;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:63:63:51:53:0.456897:29:22:38:25:31:22:38:25 chr10 129917560 . T C 246.27 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0266995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6493;QD=13.4941;RBI=0.0300352;REFB=-0.0111406;REVB=0.0137568;RO=44;SAF=12;SAR=17;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185811;STB=0.605931;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.023227;OID=.;OPOS=129917560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:44:44:29:29:0.39726:17:12:26:18:17:12:26:18 chr10 132303374 . G C 976.1 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174528;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.397;QD=59.1575;RBI=0.0178409;REFB=0;REVB=0.00370111;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53775e-05;OID=.;OPOS=132303374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:22:44:0:0:22:44:0:0 chr10 133918372 . G A 591.28 PASS AF=0.368421;AO=69;DP=190;FAO=70;FDP=190;FR=.;FRO=120;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=48;FSRR=72;FWDB=-0.000719202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.954;QD=12.448;RBI=0.07244;REFB=-0.0273724;REVB=0.0724365;RO=118;SAF=40;SAR=29;SRF=48;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190779;STB=0.607113;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0463772;OID=.;OPOS=133918372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:118:120:69:70:0.368421:29:40:48:70:30:40:48:72 chr10 133948634 . T C 905.88 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0093809;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.422;QD=58.4437;RBI=0.0208303;REFB=0;REVB=0.0185983;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.32127e-06;OID=.;OPOS=133948634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0 chr10 133950642 . T C 559.24 PASS AF=0.625;AO=50;DP=82;FAO=50;FDP=80;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00860729;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.605;QD=27.9622;RBI=0.0113708;REFB=-0.00996012;REVB=-0.00743038;RO=30;SAF=22;SAR=28;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00466199;STB=0.502537;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00506805;OID=.;OPOS=133950642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:30:30:50:50:0.625:28:22:13:17:28:22:13:17 chr10 133954011 . C T 906.06 PASS AF=0.529762;AO=89;DP=168;FAO=89;FDP=168;FR=.;FRO=79;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=57;FSRR=22;FWDB=-0.00246862;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.311;QD=21.5728;RBI=0.0027439;REFB=-0.0132021;REVB=0.00119787;RO=76;SAF=49;SAR=40;SRF=55;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150348;STB=0.58256;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0101686;OID=.;OPOS=133954011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:76:79:89:89:0.529762:40:49:55:21:40:49:57:22 chr10 133955427 . A G 386.57 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0142453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.831;QD=18.1913;RBI=0.0176639;REFB=-0.00503773;REVB=0.0104445;RO=45;SAF=23;SAR=17;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462045;STB=0.52576;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.00726884;OID=.;OPOS=133955427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:17:23:28:17:17:23:28:17 chr10 133963466 . A G 1767.56 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8944;QD=60.9503;RBI=0.0288514;REFB=0;REVB=0.023724;RO=0;SAF=40;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133254;OID=.;OPOS=133963466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:76:40:0:0:76:40:0:0 chr10 133981682 . G A 382.57 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.020756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.8742;QD=52.768;RBI=0.0211789;REFB=-0.09292;REVB=0.00421097;RO=1;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344547;STB=0.518505;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00159719;OID=.;OPOS=133981682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:13:15:0:1:13:15:0:1 chr10 134013990 . G A 195.21 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828548;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.091;QD=48.8016;RBI=0.0837679;REFB=0;REVB=-0.0123347;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282182;OID=.;OPOS=134013990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr10 134017295 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.806;QD=58.5867;RBI=0.0217646;REFB=0;REVB=-0.0184683;RO=0;SAF=28;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.2594e-05;OID=.;OPOS=134017295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:5:28:0:0:5:28:0:0 chr10 134017388 . C G 367.13 PASS AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00596668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.444;QD=14.3973;RBI=0.0122374;REFB=-0.0256707;REVB=-0.0106842;RO=58;SAF=23;SAR=19;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00426406;STB=0.511326;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0341684;OID=.;OPOS=134017388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:58:60:42:42:0.411765:19:23:32:26:19:23:34:26 chr10 134018834 . C T 885.44 PASS AF=0.566434;AO=81;DP=143;FAO=81;FDP=143;FR=.;FRO=62;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.00353893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.323;QD=24.7675;RBI=0.00894319;REFB=-0.0261922;REVB=0.0082132;RO=62;SAF=48;SAR=33;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361221;STB=0.519697;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0187987;OID=.;OPOS=134018834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:62:62:81:81:0.566434:33:48:34:28:33:48:34:28 chr10 134018867 . G A 616.61 PASS AF=0.488372;AO=62;DP=128;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0121206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.836;QD=19.1198;RBI=0.0121276;REFB=-0.034479;REVB=-0.000410662;RO=66;SAF=34;SAR=28;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0027569;STB=0.505225;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0339582;OID=.;OPOS=134018867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:66:66:62:63:0.488372:28:34:36:30:28:35:36:30 chr10 134036193 . A G 627.97 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1616;QD=61.2651;RBI=0.0551409;REFB=0;REVB=-0.0544152;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000584619;OID=.;OPOS=134036193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:16:24:0:0:17:24:0:0 chr10 134039242 . C T 231.06 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00261574;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.433;QD=16.5042;RBI=0.00611596;REFB=-0.0241562;REVB=0.00552837;RO=28;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386212;STB=0.523725;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0233294;OID=.;OPOS=134039242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:30:26:26:0.464286:15:11:13:15:15:11:14:16 chr10 134062574 . G A 1849.04 PASS AF=0.983871;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=124;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0350076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.077;QD=59.6463;RBI=0.0438823;REFB=-0.0978145;REVB=0.0264598;RO=2;SAF=51;SAR=71;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182624;STB=0.509614;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00025942;OID=.;OPOS=134062574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:124:124:2:2:122:122:0.983871:71:51:2:0:71:51:2:0 chr10 134143942 . C T 85.65 PASS AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0042684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.362;QD=6.58821;RBI=0.0312386;REFB=-0.00896293;REVB=-0.0309456;RO=40;SAF=9;SAR=3;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319895;STB=0.703726;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0417222;OID=.;OPOS=134143942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:40:40:12:12:0.230769:3:9:20:20:3:9:20:20 chr10 134143985 . GC TT 88.19 PASS AF=0.236364;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00673186;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=244.871;QD=6.41364;RBI=0.0115776;REFB=-0.00397464;REVB=-0.00941932;RO=41;SAF=9;SAR=4;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199073;STB=0.617722;STBP=0.374;TYPE=mnp;VARB=0.0106687;OID=.;OPOS=134143985;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:56:55:41:42:13:13:0.236364:4:9:22:19:4:9:23:19 chr10 134144005 . T C 89.87 PASS AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00464635;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.654;QD=6.65673;RBI=0.0307911;REFB=-0.0189963;REVB=0.0304385;RO=41;SAF=9;SAR=4;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170379;STB=0.60719;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0498196;OID=.;OPOS=134144005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:54:54:41:41:13:13:0.240741:4:9:23:18:4:9:23:18 chr10 134145136 . A G 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0227331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.199;QD=15.1603;RBI=0.0480911;REFB=0.00288763;REVB=-0.0423788;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106752;STB=0.561964;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=-0.0133384;OID=.;OPOS=134145136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:9:13:11:5:9:13 chr10 134145138 . C G 144.0 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0179547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7636;QD=15.158;RBI=0.0233364;REFB=-0.0146438;REVB=0.0149069;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106752;STB=0.561964;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0214386;OID=.;OPOS=134145138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:9:13:11:5:9:13 chr10 134145166 . T C 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.123358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.983;QD=15.2615;RBI=0.123359;REFB=-0.0242894;REVB=-0.000638742;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665616;STB=0.538404;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0237819;OID=.;OPOS=134145166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:9:4:4:12:9:4:4:12 chr10 134145293 . G T 74.47 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0314979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6493;QD=22.9153;RBI=0.032682;REFB=-0.0853419;REVB=0.00871727;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107529;STB=0.561271;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.02675;OID=.;OPOS=134145293;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:1:3:5:4:1:3 chr10 134145336 . G T 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000325225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.839;QD=18.7667;RBI=0.0575313;REFB=-0.0137748;REVB=-0.0575304;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236104;STB=0.635975;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0089658;OID=.;OPOS=134145336;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:4:2:0:3:4:2:0:3 chr10 134161633 . A G 770.69 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0168522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.066;QD=55.0494;RBI=0.0180783;REFB=-0.11626;REVB=0.00654428;RO=1;SAF=15;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303841;STB=0.516123;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000322468;OID=.;OPOS=134161633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:40:15:1:0:40:15:1:0 chr10 134218269 . C T 260.44 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0387879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.812;QD=24.8035;RBI=0.0390701;REFB=-0.0157505;REVB=0.00468774;RO=18;SAF=12;SAR=12;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347515;STB=0.69034;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00619669;OID=.;OPOS=134218269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:12:12:1:17:12:12:1:17 chr10 134219036 . G A 330.63 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0315552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.634;QD=23.6162;RBI=0.0316007;REFB=-0.0125286;REVB=-0.00169487;RO=22;SAF=16;SAR=17;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07704;STB=0.532953;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0182263;OID=.;OPOS=134219036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:22:23:33:33:0.589286:17:16:13:9:17:16:13:10 chr10 134219045 . C T 373.63 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0110591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.898;QD=23.3517;RBI=0.0139799;REFB=-0.0295412;REVB=0.00855194;RO=26;SAF=17;SAR=20;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881106;STB=0.540519;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0200064;OID=.;OPOS=134219045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:26:27:37:37:0.578125:20:17:15:11:20:17:15:12 chr10 134598628 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.507;QD=56.1914;RBI=0.0437344;REFB=0;REVB=0.0123302;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175048;OID=.;OPOS=134598628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr10 134622089 . A G 130.05 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00334657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.547;QD=13.3385;RBI=0.00579062;REFB=-0.00535209;REVB=0.00472565;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252682;STB=0.646282;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00736268;OID=.;OPOS=134622089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:8:7:17:7:8:7:17:7 chr10 134622408 . T C 115.07 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0325594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.438;QD=11.8025;RBI=0.0493878;REFB=-0.00178962;REVB=0.0371354;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893784;STB=0.564012;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0023529;OID=.;OPOS=134622408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:24:25:14:14:0.358974:7:7:10:14:7:7:10:15 chr10 134623959 . T C 226.88 PASS AF=0.402985;AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0241576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.981;QD=13.5451;RBI=0.024281;REFB=-0.0093844;REVB=-0.00244396;RO=40;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671044;STB=0.525948;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0143061;OID=.;OPOS=134623959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:40:40:26:27:0.402985:14:12:21:19:14:13:21:19 chr10 134624225 . G A 204.51 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00357727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.492;QD=22.7229;RBI=0.0287686;REFB=-0.0395078;REVB=0.0285453;RO=16;SAF=13;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124868;STB=0.570104;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0418408;OID=.;OPOS=134624225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:7:13:8:8:7:13:8:8 chr10 134646988 . C T 217.81 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00516345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.158;QD=16.7543;RBI=0.014635;REFB=-0.0133423;REVB=-0.0136939;RO=28;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122249;STB=0.569248;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0106383;OID=.;OPOS=134646988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:15:9:14:14:15:9:14:14 chr10 134659572 . C T 31.58 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0329793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5558;QD=14.0375;RBI=0.03565;REFB=-0.0356368;REVB=0.0135385;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744193;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0193857;OID=.;OPOS=134659572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:2:3:2:2:2:3:2:2 chr10 134659626 . A G 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00208612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.303;QD=15.8391;RBI=0.0552563;REFB=-0.00876598;REVB=-0.0552169;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446316;STB=0.526249;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00687056;OID=.;OPOS=134659626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:3:4:5:3:3:4 chr10 134672609 . C T 363.2 PASS AF=0.475;AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0183364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.874;QD=18.1601;RBI=0.0183434;REFB=-0.00170993;REVB=0.000506988;RO=42;SAF=23;SAR=14;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311922;STB=0.676833;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00279873;OID=.;OPOS=134672609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:42:42:37:38:0.475:14:23:12:30:14:24:12:30 chr10 134682802 . C T 240.52 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0794606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1817;QD=21.3798;RBI=0.0806145;REFB=-0.0233124;REVB=0.0135907;RO=22;SAF=13;SAR=10;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288685;STB=0.660886;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.032859;OID=.;OPOS=134682802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:10:13:5:17:10:13:5:17 chr10 134682855 . C T 215.99 PASS AF=0.461538;AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00130689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.907;QD=16.6145;RBI=0.0031028;REFB=-0.0267221;REVB=0.00281414;RO=28;SAF=6;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288279;STB=0.670062;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0379867;OID=.;OPOS=134682855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:28:28:23:24:0.461538:17:6:15:13:18:6:15:13 chr10 134698626 . T C 320.83 PASS AF=0.382979;AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=94;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.016073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.963;QD=13.6523;RBI=0.0165245;REFB=-0.000251635;REVB=-0.00383605;RO=56;SAF=24;SAR=12;SRF=38;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144069;STB=0.507932;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.000348947;OID=.;OPOS=134698626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:56:58:36:36:0.382979:12:24:38:18:12:24:38:20 chr10 134722022 . A G 242.37 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.03256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.205;QD=14.9153;RBI=0.0436881;REFB=-0.0214285;REVB=-0.0291289;RO=37;SAF=13;SAR=15;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200456;STB=0.612719;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0288104;OID=.;OPOS=134722022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:15:13:10:27:15:13:10:27 chr10 134735672 . A G 680.97 PASS AF=0.523438;AO=67;DP=128;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.00679891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.076;QD=21.2804;RBI=0.0135823;REFB=0.00190275;REVB=0.0117581;RO=61;SAF=33;SAR=34;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562085;STB=0.530869;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=-0.00296472;OID=.;OPOS=134735672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:61:61:67:67:0.523438:34:33:34:27:34:33:34:27 chr10 134736026 . G A 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00201499;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.228;QD=11.1978;RBI=0.0020735;REFB=-0.0101109;REVB=0.000489082;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233847;STB=0.639763;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.016287;OID=.;OPOS=134736026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:4:8:10:12:4:8:10:12 chr10 134736052 . G T 121.51 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0263553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.323;QD=15.1888;RBI=0.0265754;REFB=-0.026731;REVB=0.0034133;RO=17;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32343;STB=0.670813;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.043112;OID=.;OPOS=134736052;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:5:9:5:12:5:9:6:12 chr10 134736076 . T G 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00498615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.047;QD=13.0914;RBI=0.0206605;REFB=0.00340705;REVB=-0.0200498;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28075;STB=0.678966;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00235545;OID=.;OPOS=134736076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:20:13:13:0.393939:4:9:8:11:4:9:8:12 chr10 134738232 . A G 596.68 PASS AF=0.428571;AO=62;DP=147;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.0256875;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.681;QD=16.2363;RBI=0.0314062;REFB=-0.017587;REVB=-0.0180693;RO=85;SAF=33;SAR=29;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033712;STB=0.518303;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0233006;OID=.;OPOS=134738232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:85:84:62:63:0.428571:29:33:48:37:29:34:48:36 chr10 134748331 . C T 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00790821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.974;QD=61.2126;RBI=0.0245612;REFB=0;REVB=-0.0232532;RO=0;SAF=29;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.10005e-05;OID=.;OPOS=134748331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:50:29:0:0:50:29:0:0 chr10 134756013 . T C 280.07 PASS AF=0.956522;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0525514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.502;QD=48.7069;RBI=0.090278;REFB=-0.138474;REVB=0.0734062;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538425;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00149114;OID=.;OPOS=134756013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:21:23:0:1:21:22:0.956522:15:6:0:0:16:6:1:0 chr10 134777790 . G A 998.28 PASS AF=0.945946;AO=70;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00496358;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.387;QD=53.9612;RBI=0.0341873;REFB=-0.0851176;REVB=0.033825;RO=3;SAF=16;SAR=54;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255447;STB=0.517852;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000565964;OID=.;OPOS=134777790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:74:74:3:4:70:70:0.945946:54:16:0:3:54:16:0:4 chr10 134884516 . G A 114.27 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0231946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.035;QD=10.1577;RBI=0.0241718;REFB=-0.0166235;REVB=-0.00680346;RO=31;SAF=5;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254683;STB=0.65278;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0188881;OID=.;OPOS=134884516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:9:5:18:13:9:5:18:13 chr10 134884546 . A G 176.59 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00539401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.348;QD=14.127;RBI=0.0337756;REFB=-0.0245317;REVB=0.0333422;RO=30;SAF=7;SAR=12;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276145;STB=0.649844;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.04254;OID=.;OPOS=134884546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:30:31:19:19:0.38:12:7:19:11:12:7:19:12 chr10 134884595 . G A 217.59 PASS AF=0.4;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0104279;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.808;QD=13.39;RBI=0.0112954;REFB=-0.0169701;REVB=0.00434114;RO=39;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544041;STB=0.546727;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.02161;OID=.;OPOS=134884595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:39:39:26:26:0.4:14:12:16:23:14:12:15:24 chr10 134884610 . C G 264.65 PASS AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0331954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8014;QD=13.069;RBI=0.0383992;REFB=0.000969706;REVB=0.0193019;RO=49;SAF=12;SAR=19;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685242;STB=0.546395;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00232283;OID=.;OPOS=134884610;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:50:31:31:0.382716:19:12:22:27:19:12:23:27 chr10 134886618 . G C 172.13 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0157392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.423;QD=18.1192;RBI=0.0173139;REFB=-0.00749209;REVB=-0.00721437;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519108;STB=0.502955;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00871067;OID=.;OPOS=134886618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:11:9:8:10:11:9 chr10 134942166 . A G 579.14 PASS AF=0.483871;AO=60;DP=124;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=47;FWDB=0.00038695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3486;QD=18.6819;RBI=0.0336828;REFB=-0.0302755;REVB=-0.0336806;RO=64;SAF=26;SAR=34;SRF=17;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163851;STB=0.590218;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0274269;OID=.;OPOS=134942166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:64:64:60:60:0.483871:34:26:17:47:34:26:17:47 chr10 134942832 . G A 149.14 PASS AF=0.354167;AO=16;DP=47;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0358085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.7891;QD=12.4286;RBI=0.0386076;REFB=-0.0260874;REVB=0.0144325;RO=31;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124388;STB=0.587681;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.037379;OID=.;OPOS=134942832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:31:31:16:17:0.354167:10:6:15:16:11:6:15:16 chr10 135051543 . T C 324.9 PASS AF=1;AO=20;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155911;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.471;QD=54.1501;RBI=0.0357009;REFB=0;REVB=0.0321166;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00079451;OID=.;OPOS=135051543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:20:24:1:10:10:0:0:14:10:0:0 chr10 135051562 . A G 332.82 PASS AF=1;AO=20;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6986;QD=53.2509;RBI=0.0363791;REFB=0;REVB=0.0101803;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0137873;OID=.;OPOS=135051562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:20:25:1:11:9:0:0:16:9:0:0 chr10 135061112 . C T 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00686909;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.152;QD=57.7126;RBI=0.0317179;REFB=0;REVB=0.0309652;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107537;OID=.;OPOS=135061112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr10 135076596 . T C 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0200416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.272;QD=11.8307;RBI=0.0203953;REFB=-0.0131666;REVB=0.00378157;RO=18;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278876;STB=0.669074;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0245773;OID=.;OPOS=135076596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:2:9:11:7:2:9:11:7 chr10 135077225 . G A 588.48 PASS AF=0.531532;AO=59;DP=104;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0127405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.153;QD=21.2066;RBI=0.0127671;REFB=-0.0236414;REVB=0.000822807;RO=44;SAF=22;SAR=37;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668915;STB=0.57064;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0202083;OID=.;OPOS=135077225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:111:44:52:59:59:0.531532:37:22:20:24:37:22:27:25 chr10 135081618 . C T 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0121526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.211;QD=13.7531;RBI=0.021647;REFB=-0.00933489;REVB=-0.0179139;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333056;STB=0.519409;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0230635;OID=.;OPOS=135081618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:8:7:10:13:8:7:10:13 chr10 135082346 . A G 122.32 PASS AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00824282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2693;QD=8.43608;RBI=0.0579071;REFB=-0.00380359;REVB=-0.0573174;RO=41;SAF=8;SAR=9;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134538;STB=0.580552;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0108468;OID=.;OPOS=135082346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:9:8:24:17:9:8:24:17 chr10 135084232 . C CAGA 482.38 PASS AF=0.38;AO=55;DP=153;FAO=57;FDP=150;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=-0.0244993;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=3;MLLD=241.369;QD=12.8634;RBI=0.024582;REFB=-0.0227038;REVB=0.00201566;RO=95;SAF=27;SAR=28;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191747;STB=0.511232;STBP=0.838;TYPE=ins;VARB=0.0317511;OID=.;OPOS=135084233;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.38:55:153:57:150:93:28:29:44:49:99:95:27:28:45:50 chr10 135084322 . A G 498.17 PASS AF=0.453782;AO=54;DP=119;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0752649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3519;QD=16.7453;RBI=0.0870715;REFB=-0.00940223;REVB=-0.0437793;RO=65;SAF=18;SAR=36;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133831;STB=0.574822;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0102139;OID=.;OPOS=135084322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:65:65:54:54:0.453782:36:18:30:35:36:18:30:35 chr10 135085321 . C T 152.35 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0024055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.225;QD=21.014;RBI=0.0176214;REFB=-0.0395182;REVB=0.0174564;RO=13;SAF=4;SAR=12;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205909;STB=0.511614;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0308172;OID=.;OPOS=135085321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:12:4:3:10:12:4:3:10 chr10 135085426 . A G 173.09 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00177486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.358;QD=18.7119;RBI=0.0244962;REFB=-0.0166841;REVB=-0.0244319;RO=19;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181892;STB=0.603655;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.018355;OID=.;OPOS=135085426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:12:6:10:9:12:6:10:9 chr10 135085754 . G A 560.15 PASS AF=0.543689;AO=56;DP=105;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00816706;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.595;QD=21.7535;RBI=0.00908579;REFB=-0.00163382;REVB=0.00398129;RO=46;SAF=14;SAR=42;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10085;STB=0.563612;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00114997;OID=.;OPOS=135085754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:103:46:47:56:56:0.543689:42:14:16:30:42:14:17:30 chr10 135087521 . G A 199.37 PASS AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0148915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.12;QD=27.4996;RBI=0.017472;REFB=-0.0266202;REVB=-0.00913858;RO=10;SAF=16;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145987;STB=0.581724;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0146023;OID=.;OPOS=135087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:3:16:7:3:3:16:7:3 chr10 135089035 . A G 562.14 PASS AF=0.468254;AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.0112183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1081;QD=17.8458;RBI=0.0133062;REFB=-0.0235196;REVB=-0.00715574;RO=66;SAF=19;SAR=40;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284582;STB=0.512816;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0248109;OID=.;OPOS=135089035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:66:67:59:59:0.468254:40:19:23:43:40:19:23:44 chr10 135097434 . A G 312.5 PASS AF=0.627907;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.02425;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.655;QD=29.07;RBI=0.0242504;REFB=-0.0186262;REVB=0.000136637;RO=16;SAF=9;SAR=18;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204455;STB=0.612817;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0267614;OID=.;OPOS=135097434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:16:16:27:27:0.627907:18:9:10:6:18:9:10:6 chr10 135098672 . G A 216.68 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0103121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.069;QD=13.3343;RBI=0.0114073;REFB=-0.0175906;REVB=0.00487721;RO=39;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188773;STB=0.607993;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0194184;OID=.;OPOS=135098672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:10:16:17:22:10:16:17:22 chr10 135098830 . T C 198.16 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00788025;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.898;QD=18.0147;RBI=0.0219769;REFB=-0.0163416;REVB=-0.0205155;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260366;STB=0.514836;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0223506;OID=.;OPOS=135098830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:7:13:15:9:7:13:15:9 chr10 135098845 . C T 213.73 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0106304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.317;QD=20.852;RBI=0.0109942;REFB=-0.00788724;REVB=0.00280505;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483382;STB=0.547127;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0112795;OID=.;OPOS=135098845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:16:20:20:21:0.512195:6:14:12:4:7:14:15:5 chr10 135160950 . C T 230.27 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0112041;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.5107;QD=46.0539;RBI=0.0528896;REFB=-0.0939584;REVB=0.0516892;RO=1;SAF=4;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101694;STB=0.555494;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00217189;OID=.;OPOS=135160950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:15:4:1:0:15:4:1:0 chr10 135165790 . A G 785.86 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.752;QD=64.1518;RBI=0.045625;REFB=0;REVB=-0.0243134;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50954e-05;OID=.;OPOS=135165790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr10 135180430 . A G 1435.98 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0102987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.954;QD=61.7624;RBI=0.0155131;REFB=0.0174954;REVB=-0.0116014;RO=1;SAF=31;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00783573;STB=0.504064;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-8.21055e-05;OID=.;OPOS=135180430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:1:1:91:92:0.989247:60:31:0:1:61:31:0:1 chr10 135184126 . G A 2235.68 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.903;QD=63.4236;RBI=0.0457365;REFB=0;REVB=0.0439812;RO=0;SAF=72;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63774e-05;OID=.;OPOS=135184126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:69:72:0:0:69:72:0:0 chr10 135186806 . A G 302.44 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2247;QD=52.5988;RBI=0.0448246;REFB=0;REVB=0.0290415;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000987878;OID=.;OPOS=135186806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr10 135204950 . C G 837.21 PASS AF=0.983607;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0507572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.999;QD=54.8989;RBI=0.0508447;REFB=-0.0913152;REVB=-0.00298175;RO=1;SAF=23;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200708;STB=0.506847;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00125334;OID=.;OPOS=135204950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:61:1:1:59:60:0.983607:36:23:1:0:36:24:0:1 chr10 135205009 . C G 1403.03 PASS AF=1;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318166;FXX=0.0219756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.961;QD=63.0577;RBI=0.0318673;REFB=0;REVB=0.00179696;RO=0;SAF=49;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86707e-05;OID=.;OPOS=135205009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:89:0:0:89:89:1:40:49:0:0:40:49:0:0 chr10 135233541 . A G 1343.13 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027021;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.669;QD=62.471;RBI=0.0276105;REFB=0;REVB=0.0274779;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63965e-05;OID=.;OPOS=135233541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0 chr10 135269955 . C T 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0122735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1826;QD=17.3793;RBI=0.0210216;REFB=0.021499;REVB=-0.0170666;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576918;STB=0.571292;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00593559;OID=.;OPOS=135269955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:9:10:11:11:0.52381:8:3:3:6:8:3:4:6 chr10 135271789 . C T 400.34 PASS AF=0.424242;AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.00170779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.033;QD=16.1753;RBI=0.00599401;REFB=-0.0192294;REVB=-0.00574557;RO=57;SAF=24;SAR=18;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785719;STB=0.504423;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0300932;OID=.;OPOS=135271789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:57:57:42:42:0.424242:18:24:33:24:18:24:33:24 chr10 135278193 . A G 34.29 PASS AF=0.181818;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0415743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.694;QD=4.15607;RBI=0.0416841;REFB=0.00221251;REVB=-0.00302313;RO=27;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179959;STB=0.624574;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.0160654;OID=.;OPOS=135278193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:33:33:27:27:6:6:0.181818:4:2:13:14:4:2:13:14 chr10 135279810 . TC GC,T 505.4 PASS AF=0.444444,0.291667;AO=32,15;DP=73;FAO=32,21;FDP=72;FR=.;FRO=19;FSAF=20,1;FSAR=12,20;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00313578,-0.0126617;FXX=0.0136968;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=197.553,19.0899;QD=28.0775;RBI=0.00803677,0.247155;REFB=-0.0194946,-0.0722909;REVB=0.00739977,-0.24683;RO=17;SAF=20,0;SAR=12,15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0634461,-0.82349;STB=0.558339,0.869083;STBP=0.278,0;TYPE=snp,del;VARB=0.00744626,-0.0879216;OID=.,.;OPOS=135279810,135279811;OREF=T,C;OALT=G,-;OMAPALT=GC,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:73:72:17:19:32,15:32,21:0.444444,0.291667:12,15:20,0:9:8:12,20:20,1:9:10 chr10 135280765 . C T 734.46 PASS AF=0.618182;AO=68;DP=111;FAO=68;FDP=110;FR=.;FRO=42;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.000392908;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.213;QD=26.7076;RBI=0.0172822;REFB=-0.0111436;REVB=0.0172778;RO=41;SAF=44;SAR=24;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00873954;STB=0.501754;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.00742984;OID=.;OPOS=135280765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:41:42:68:68:0.618182:24:44:27:14:24:44:27:15 chr10 135347397 . T C 1396.56 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00744231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2627;QD=62.7667;RBI=0.0122711;REFB=0;REVB=0.00975658;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.44652e-05;OID=.;OPOS=135347397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:50:38:0:0:50:39:0:0 chr10 135351362 . T C 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00490372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.696;QD=58.4191;RBI=0.00551973;REFB=0;REVB=0.00253396;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25863e-06;OID=.;OPOS=135351362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:39:24:0:0:39:24:0:0 chr10 135368163 . A G 82.32 PASS AF=0.297297;AO=10;DP=36;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00906978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.477;QD=8.89999;RBI=0.0111673;REFB=0.00601396;REVB=0.00651522;RO=25;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232757;STB=0.561287;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.0150765;OID=.;OPOS=135368163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:37:25:26:10:11:0.297297:8:2:9:16:8:3:9:17 chr10 135368590 . T C 365.68 PASS AF=0.528571;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00540812;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.29;QD=20.8961;RBI=0.0233021;REFB=-0.0047972;REVB=-0.0226658;RO=33;SAF=22;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690521;STB=0.538258;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00435305;OID=.;OPOS=135368590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:33:33:37:37:0.528571:15:22:17:16:15:22:17:16 chr10 135369532 . T C 292.43 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0829534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4164;QD=17.4583;RBI=0.0999065;REFB=-0.0174905;REVB=-0.0556781;RO=35;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425018;STB=0.523795;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0168199;OID=.;OPOS=135369532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:17:15:18:17:17:15:18:17 chr10 135370343 . G A 464.92 PASS AF=0.484211;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0497729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3456;QD=19.5754;RBI=0.0506865;REFB=-0.0176887;REVB=0.00958003;RO=49;SAF=27;SAR=19;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183987;STB=0.602141;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0242126;OID=.;OPOS=135370343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:49:49:46:46:0.484211:19:27:19:30:19:27:19:30 chr10 135370633 . C T 76.66 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00268255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3263;QD=12.7772;RBI=0.0652749;REFB=-0.00885763;REVB=-0.0652198;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00809613;OID=.;OPOS=135370633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:7:7:5:5:7:7 chr10 135370639 . C A 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0201742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.709;QD=13.4416;RBI=0.0229478;REFB=-0.0134789;REVB=0.0109363;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036821;STB=0.521696;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0146006;OID=.;OPOS=135370639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:5:5:6:7:5:5:6:7 chr10 135372870 . C G 341.04 PASS AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00467064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.308;QD=20.987;RBI=0.0243621;REFB=-0.0219932;REVB=-0.0239102;RO=29;SAF=16;SAR=19;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774939;STB=0.535191;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0206504;OID=.;OPOS=135372870;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:30:35:35:0.538462:19:16:16:13:19:16:16:14 chr10 135373591 . C T 181.54 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0011845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.803;QD=24.2047;RBI=0.0171639;REFB=-0.0270241;REVB=0.0171229;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157894;STB=0.588138;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0098984;OID=.;OPOS=135373591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:10:8:8:4:10:8:8:4 chr10 135381425 . G A 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.000303614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1173;QD=10.3901;RBI=0.0398837;REFB=-0.0128956;REVB=0.0398825;RO=11;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734487;STB=0.545316;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0154985;OID=.;OPOS=135381425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:6:1:2:9:6:1:2:9 chr10 135381443 . C T 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0262187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.239;QD=12.0502;RBI=0.0298663;REFB=-0.0259644;REVB=0.014303;RO=13;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1059;STB=0.562372;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.035899;OID=.;OPOS=135381443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:7:2:2:11:7:2:2:11 chr10 135381623 . T C 402.82 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.34;QD=55.5618;RBI=0.0387336;REFB=0;REVB=-0.018672;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000633649;OID=.;OPOS=135381623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:10:19:0:0 chr10 135381766 . C T 489.64 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0538021;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.436;QD=55.9583;RBI=0.062421;REFB=-0.0531888;REVB=0.0316499;RO=1;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198968;STB=0.510632;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000422865;OID=.;OPOS=135381766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:23:11:0:1:23:11:0:1 chr10 135381927 . T G 445.14 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000382259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.782;QD=57.437;RBI=0.0329789;REFB=0;REVB=-0.0329767;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134929;OID=.;OPOS=135381927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:19:12:0:0 chr10 135438929 . T G 32.91 PASS AF=0.0705882;AO=12;DP=170;FAO=12;FDP=170;FR=.;FRO=158;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=90;FSRR=68;FWDB=-0.0301627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2192;QD=0.774448;RBI=0.0308652;REFB=-0.00230974;REVB=0.00654751;RO=158;SAF=5;SAR=7;SRF=90;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165123;STB=0.639199;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00462864;OID=.;OPOS=135438929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:170:170:158:158:12:12:0.0705882:7:5:90:68:7:5:90:68 chr10 135438951 . G A 40.84 PASS AF=0.0777778;AO=14;DP=180;FAO=14;FDP=180;FR=.;FRO=166;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=98;FSRR=68;FWDB=-0.0171104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.23;QD=0.907449;RBI=0.0180921;REFB=-0.00248229;REVB=-0.0058788;RO=166;SAF=6;SAR=8;SRF=98;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180908;STB=0.645764;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0382939;OID=.;OPOS=135438951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:180:180:166:166:14:14:0.0777778:8:6:98:68:8:6:98:68 chr10 135438955 . C T 35.78 PASS AF=0.0726257;AO=13;DP=180;FAO=13;FDP=179;FR=.;FRO=166;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=100;FSRR=66;FWDB=-0.00402429;FXX=0.00555525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.133;QD=0.799582;RBI=0.0231729;REFB=-0.00495525;REVB=-0.0228208;RO=165;SAF=6;SAR=7;SRF=99;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153071;STB=0.628625;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.047761;OID=.;OPOS=135438955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:180:179:165:166:13:13:0.0726257:7:6:99:66:7:6:100:66 chr10 135438967 . C T 34.92 PASS AF=0.0710383;AO=13;DP=183;FAO=13;FDP=183;FR=.;FRO=170;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=102;FSRR=68;FWDB=-0.0116129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.199;QD=0.763252;RBI=0.0305093;REFB=-0.000585598;REVB=-0.0282128;RO=169;SAF=6;SAR=7;SRF=101;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149447;STB=0.62668;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00717567;OID=.;OPOS=135438967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:183:183:169:170:13:13:0.0710383:7:6:101:68:7:6:102:68 chr10 135438977 . G A 37.02 PASS AF=0.0747126;AO=13;DP=174;FAO=13;FDP=174;FR=.;FRO=161;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=99;FSRR=62;FWDB=-0.0218545;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.021;QD=0.851126;RBI=0.0227484;REFB=-0.00477903;REVB=-0.00631432;RO=159;SAF=6;SAR=7;SRF=99;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18064;STB=0.639485;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0353295;OID=.;OPOS=135438977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:174:174:159:161:13:13:0.0747126:7:6:99:60:7:6:99:62 chr11 193112 . C T 53.1 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=-0.0316294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.007;QD=7.32441;RBI=0.0317919;REFB=-0.00456691;REVB=0.00320979;RO=21;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26636;STB=0.658246;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0131361;OID=.;OPOS=193112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:7:1:1:20:7:1:1:20 chr11 193722 . A G 91.49 PASS AF=0.211268;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=71;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.0300137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.285;QD=5.15454;RBI=0.0435543;REFB=-0.0103027;REVB=-0.0315619;RO=53;SAF=10;SAR=5;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154573;STB=0.57989;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0372689;OID=.;OPOS=193722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:70:71:53:56:15:15:0.211268:5:10:29:24:5:10:32:24 chr11 193863 . T C 806.62 PASS AF=0.680412;AO=66;DP=97;FAO=66;FDP=97;FR=.;FRO=31;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.027703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.498;QD=33.2626;RBI=0.0303163;REFB=-0.0124803;REVB=-0.0123135;RO=31;SAF=34;SAR=32;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197186;STB=0.510635;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00680268;OID=.;OPOS=193863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:31:31:66:66:0.680412:32:34:17:14:32:34:17:14 chr11 193865 . T G 461.44 PASS AF=0.469388;AO=45;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.000557389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.042;QD=18.8341;RBI=0.00230988;REFB=-0.0276512;REVB=-0.00224162;RO=52;SAF=30;SAR=15;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256516;STB=0.633364;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0248788;OID=.;OPOS=193865;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:52:52:45:46:0.469388:15:30:21:31:16:30:21:31 chr11 197337 . G A 228.81 PASS AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00507288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.242;QD=11.734;RBI=0.00598583;REFB=-0.00542156;REVB=0.00317742;RO=48;SAF=14;SAR=14;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091492;STB=0.564058;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00865159;OID=.;OPOS=197337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:48:50:28:28:0.358974:14:14:20:28:14:14:20:30 chr11 223796 . A G 35.04 PASS AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0285697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.573;QD=5.00554;RBI=0.0328101;REFB=-0.00181356;REVB=0.0161331;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217505;STB=0.64242;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0126706;OID=.;OPOS=223796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:3:3:7:15:3:3:7:15 chr11 237087 . A G 246.31 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0221392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.855;QD=13.4965;RBI=0.0610922;REFB=-0.0249522;REVB=-0.0569396;RO=43;SAF=14;SAR=15;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545428;STB=0.524063;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0416038;OID=.;OPOS=237087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:44:29:29:0.39726:15:14:23:20:15:14:23:21 chr11 244106 . A G 141.46 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0113853;FXX=0.0185151;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6591;QD=10.6761;RBI=0.0171573;REFB=-0.00337373;REVB=-0.0128354;RO=35;SAF=7;SAR=11;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142152;STB=0.565237;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00532887;OID=.;OPOS=244106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:11:7:18:17:11:7:17:18 chr11 244108 . A G 143.0 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00260046;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.043;QD=10.7925;RBI=0.0172218;REFB=-0.0102494;REVB=-0.0170244;RO=35;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110656;STB=0.565237;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0163221;OID=.;OPOS=244108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:11:7:17:18:11:7:17:18 chr11 244115 . G A 159.79 PASS AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0638105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.276;QD=11.6207;RBI=0.0642755;REFB=-0.0158354;REVB=-0.00771701;RO=34;SAF=7;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167549;STB=0.5897;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0390514;OID=.;OPOS=244115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:35:20:20:0.363636:13:7:17:17:13:7:17:18 chr11 244129 . C T 177.38 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0462903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8948;QD=13.3871;RBI=0.0679868;REFB=-0.0572669;REVB=-0.0497937;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173577;STB=0.554678;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0419242;OID=.;OPOS=244129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:32:21:21:0.396226:13:8:15:12:13:8:15:17 chr11 244141 . G A 126.16 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00404327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.045;QD=10.9704;RBI=0.0207636;REFB=-0.0071337;REVB=-0.0203661;RO=31;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141254;STB=0.584499;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0218863;OID=.;OPOS=244141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:10:5:14:17:10:5:14:17 chr11 244167 . C T 128.84 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0104395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.58;QD=12.5693;RBI=0.0109755;REFB=-0.00175696;REVB=-0.00338787;RO=26;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605125;STB=0.535666;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0157117;OID=.;OPOS=244167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:10:5:10:16:10:5:10:16 chr11 244171 . T C 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0114825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.415;QD=13.336;RBI=0.0215548;REFB=-0.0135383;REVB=-0.0182418;RO=24;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094546;STB=0.55548;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0216481;OID=.;OPOS=244171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:10:5:10:14:10:5:10:14 chr11 244197 . T C 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00928931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.456;QD=9.13225;RBI=0.0146119;REFB=-0.00658178;REVB=-0.0112791;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431152;STB=0.526264;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0186852;OID=.;OPOS=244197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:6:4:8:14:6:4:8:14 chr11 244414 . C T 117.2 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00434599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8417;QD=12.0202;RBI=0.010358;REFB=-0.0251118;REVB=-0.0094022;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152478;STB=0.589619;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0161431;OID=.;OPOS=244414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:7:7:9:16:7:7:9:16 chr11 244490 . ATACCTTTTAG A 65.09 PASS AF=0.214286;AO=8;DP=40;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.000389438;FXX=0.142828;HRUN=1;LEN=10;MLLD=295.055;QD=6.19919;RBI=0.0120548;REFB=-0.00101051;REVB=0.0120485;RO=24;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241479;STB=0.669756;STBP=0.323;TYPE=del;VARB=0.00600556;OID=.;OPOS=244491;OREF=TACCTTTTAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.214286:8:40:9:42:33:5:4:11:22:65:24:5:3:10:14 chr11 284538 . T C 534.13 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1325;QD=59.348;RBI=0.0676375;REFB=0;REVB=-0.0638437;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000234698;OID=.;OPOS=284538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:36:0:0:32:36:1:23:9:0:0:24:12:0:0 chr11 290816 . A G 361.06 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0114398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.792;QD=20.3415;RBI=0.0160508;REFB=-0.00920591;REVB=-0.0112588;RO=33;SAF=21;SAR=16;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197441;STB=0.615266;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00650326;OID=.;OPOS=290816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:34:37:37:0.521127:16:21:11:22:16:21:11:23 chr11 290891 . T C 434.64 PASS AF=0.73913;AO=34;DP=46;FAO=34;FDP=46;FR=.;FRO=12;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0174336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.667;QD=37.795;RBI=0.0368615;REFB=-0.0147284;REVB=-0.0324783;RO=11;SAF=19;SAR=15;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779375;STB=0.551152;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00753832;OID=.;OPOS=290891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:46:46:11:12:34:34:0.73913:15:19:8:3:15:19:9:3 chr11 290918 . G A 336.81 PASS AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0112746;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.003;QD=26.4168;RBI=0.0207956;REFB=-0.0265111;REVB=0.017474;RO=19;SAF=19;SAR=13;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142407;STB=0.577732;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0107263;OID=.;OPOS=290918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:13:19:15:4:13:19:15:4 chr11 293188 . T C 224.86 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.118432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7809;QD=19.9874;RBI=0.118484;REFB=-0.0217222;REVB=0.00348914;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177949;STB=0.599913;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0248068;OID=.;OPOS=293188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:11:11:16:7:11:11:16:7 chr11 299411 . C G 470.67 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0170132;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.718;QD=55.3725;RBI=0.0170139;REFB=-0.171765;REVB=0.000156173;RO=1;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252499;STB=0.513505;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000361048;OID=.;OPOS=299411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:18:15:0:1:18:15:0:1 chr11 308290 . T C 751.85 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0948;QD=62.6541;RBI=0.0234348;REFB=0;REVB=-0.0204762;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000902555;OID=.;OPOS=308290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:27:19:0:0:28:20:0:0 chr11 308314 . T C 520.01 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.007;QD=59.43;RBI=0.00528089;REFB=0;REVB=0.00470072;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37138e-06;OID=.;OPOS=308314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:28:7:0:0:28:7:0:0 chr11 308362 . T TC 149.38 PASS AF=1;AO=4;DP=17;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.183988;FXX=0.117578;HRUN=0;LEN=1;MLLD=152.663;QD=39.8352;RBI=0.184462;REFB=0;REVB=-0.0132113;RO=12;SAF=0;SAR=4;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.608656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00406677;OID=.;OPOS=308363;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:4:17:15:15:0:3:12:0:0:3:12:0:4:2:10 chr11 308363 . G C 182.53 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.634;QD=42.9487;RBI=0.030174;REFB=0.099691;REVB=0.00942741;RO=1;SAF=2;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180626;STB=0.599858;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00155584;OID=.;OPOS=308363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:14:2:1:0:14:2:1:0 chr11 308426 . G C 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1113;QD=37.485;RBI=0.0164497;REFB=0;REVB=-0.0101566;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199744;OID=.;OPOS=308426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr11 309127 . A G 188.7 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00426639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.106;QD=14.2416;RBI=0.0324214;REFB=-0.0142093;REVB=-0.0321395;RO=31;SAF=16;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355423;STB=0.704035;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0208126;OID=.;OPOS=309127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:6:16:12:19:6:16:12:19 chr11 314207 . C G 807.37 PASS AF=0.983051;AO=53;DP=58;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.042761;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3454;QD=54.7366;RBI=0.0821692;REFB=0.000757215;REVB=0.0701661;RO=4;SAF=36;SAR=17;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107562;STB=0.506664;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00244234;OID=.;OPOS=314207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:59:4:1:53:58:0.983051:17:36:3:1:21:37:1:0 chr11 320772 . A G 177.8 PASS AF=0.475;AO=18;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0282203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.878;QD=17.7801;RBI=0.0343892;REFB=-0.0112856;REVB=-0.0196527;RO=21;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224476;STB=0.526288;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0141828;OID=.;OPOS=320772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:18:19:0.475:9:9:10:11:9:10:10:11 chr11 400109 . A G 428.99 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.081;QD=57.1981;RBI=0.0392741;REFB=0;REVB=0.00136141;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256879;OID=.;OPOS=400109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:28:2:0:0:28:2:0:0 chr11 403749 . C T 292.1 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00967242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.039;QD=14.6052;RBI=0.00989095;REFB=-0.00994438;REVB=-0.00206766;RO=47;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.515142;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0168035;OID=.;OPOS=403749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:17:16:24:23:17:16:24:23 chr11 403980 . G A 441.18 PASS AF=0.544304;AO=43;DP=76;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0106503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.834;QD=22.3382;RBI=0.0477038;REFB=-0.0384395;REVB=-0.0464997;RO=33;SAF=17;SAR=26;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12048;STB=0.548831;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0295744;OID=.;OPOS=403980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:33:36:43:43:0.544304:26:17:18:15:26:17:18:18 chr11 404317 . C T 103.85 PASS AF=0.317073;AO=11;DP=39;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0908295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7832;QD=10.132;RBI=0.15552;REFB=-0.0231023;REVB=0.12624;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176595;STB=0.547457;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.061338;OID=.;OPOS=404317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:28:28:11:13:0.317073:6:5:17:11:6:7:17:11 chr11 404468 . G A 183.51 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0265013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4516;QD=11.8393;RBI=0.0835822;REFB=-0.0208173;REVB=0.0792696;RO=39;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24078;STB=0.638885;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0358862;OID=.;OPOS=404468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:14:9:24:15:14:9:24:15 chr11 406043 . G A 1506.68 PASS AF=1;AO=81;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.398;QD=59.6706;RBI=0.0414646;REFB=0;REVB=0.00458189;RO=0;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107521;OID=.;OPOS=406043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:81:101:1:33:48:0:0:46:55:0:0 chr11 406473 . A C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.141;QD=35.5756;RBI=0.068967;REFB=0;REVB=0.0171745;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131751;OID=.;OPOS=406473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr11 406483 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.295;QD=33.4242;RBI=0.0666673;REFB=0;REVB=0.0146457;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00292863;OID=.;OPOS=406483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr11 428385 . A G 260.18 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118989;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.212;QD=52.0357;RBI=0.0187467;REFB=0;REVB=0.0144864;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.28297e-05;OID=.;OPOS=428385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr11 428489 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.337;QD=45.8068;RBI=0.0306268;REFB=0;REVB=0.0177252;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385428;OID=.;OPOS=428489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr11 429659 . C T 246.93 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00172161;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.48;QD=19.3671;RBI=0.0108447;REFB=-0.0192154;REVB=-0.0107072;RO=24;SAF=12;SAR=14;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389078;STB=0.530465;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0143147;OID=.;OPOS=429659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:25:26:26:0.509804:14:12:10:14:14:12:10:15 chr11 431757 . C T 187.54 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0375461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.443;QD=12.7146;RBI=0.0433564;REFB=-0.00624182;REVB=0.0216809;RO=36;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817891;STB=0.547018;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0212637;OID=.;OPOS=431757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:11:12:16:20:11:12:16:20 chr11 431834 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.537;QD=46.8478;RBI=0.053122;REFB=0;REVB=0.0144927;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000894149;OID=.;OPOS=431834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:13:2:0:0:13:2:0:0 chr11 433387 . A G 800.87 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00598311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.505;QD=57.2048;RBI=0.00637085;REFB=0;REVB=-0.00218864;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.42528e-05;OID=.;OPOS=433387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0 chr11 490484 . A G 100.74 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0328262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.504;QD=16.119;RBI=0.0421813;REFB=-0.00485967;REVB=-0.0264897;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109955;STB=0.563652;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00725618;OID=.;OPOS=490484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:7:6:7:5:7:6 chr11 499120 . G A 553.65 PASS AF=0.52;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0237746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.31;QD=22.1461;RBI=0.0777077;REFB=-0.0196078;REVB=0.0739815;RO=47;SAF=14;SAR=38;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156612;STB=0.582999;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0185981;OID=.;OPOS=499120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:47:48:52:52:0.52:38:14:20:27:38:14:20:28 chr11 549959 . C T 807.27 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320024;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.901;QD=57.6621;RBI=0.0420756;REFB=0;REVB=0.0273167;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193281;OID=.;OPOS=549959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:58:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr11 551753 . G A 1808.62 PASS AF=0.97561;AO=118;DP=128;FAO=120;FDP=123;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0144255;FXX=0.046508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.445;QD=58.8168;RBI=0.0690434;REFB=-0.0847137;REVB=0.0675196;RO=2;SAF=46;SAR=72;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130097;STB=0.509932;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=9.14799e-05;OID=.;OPOS=551753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:128:123:2:3:118:120:0.97561:72:46:0:2:74:46:0:3 chr11 554166 . C G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.641;QD=62.6705;RBI=0.0427375;REFB=0;REVB=0.00318064;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157784;OID=.;OPOS=554166;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr11 554214 . G C 538.5 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.774;QD=59.8335;RBI=0.0406766;REFB=0;REVB=0.00954518;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468293;OID=.;OPOS=554214;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0 chr11 556521 . C G 651.16 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3662;QD=62.015;RBI=0.0443575;REFB=0;REVB=-0.00387827;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000695122;OID=.;OPOS=556521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:22:20:0:0 chr11 556857 . G C 919.1 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.922;QD=58.3554;RBI=0.0658511;REFB=0;REVB=0.0516461;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272573;OID=.;OPOS=556857;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:33:28:0:0:33:30:0:0 chr11 557989 . C T 530.59 PASS AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0693312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1272;QD=20.6054;RBI=0.0747628;REFB=0.00108498;REVB=0.0279761;RO=49;SAF=32;SAR=22;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107675;STB=0.559337;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.000108782;OID=.;OPOS=557989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:49:49:54:54:0.524272:22:32:23:26:22:32:23:26 chr11 558884 . C T 115.98 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.19;QD=42.1741;RBI=0.135686;REFB=0;REVB=0.0116153;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354728;OID=.;OPOS=558884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0 chr11 559016 . C T 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9092;QD=45.8032;RBI=0.0194512;REFB=0;REVB=0.00983471;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000657279;OID=.;OPOS=559016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr11 562219 . C G 154.93 PASS AF=0.425;AO=16;DP=39;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=-0.0648037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.6615;QD=15.4927;RBI=0.0648126;REFB=-0.00211096;REVB=-0.00107318;RO=23;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294619;STB=0.652482;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.000259597;OID=.;OPOS=562219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:23:23:16:17:0.425:10:6:3:20:11:6:3:20 chr11 562421 . G A 274.55 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00372318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.483;QD=19.9671;RBI=0.0283298;REFB=-0.0174647;REVB=-0.0280841;RO=26;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810822;STB=0.504513;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0124863;OID=.;OPOS=562421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:12:17:15:11:12:17:15:11 chr11 563257 . G A 303.45 PASS AF=0.574074;AO=29;DP=53;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0329694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.492;QD=22.4777;RBI=0.0342343;REFB=-0.00394533;REVB=-0.00921979;RO=23;SAF=8;SAR=21;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182616;STB=0.589752;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00276805;OID=.;OPOS=563257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:23:23:29:31:0.574074:21:8:11:12:22:9:11:12 chr11 563649 . C T 172.1 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.189105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8724;QD=18.1157;RBI=0.189741;REFB=-0.0238532;REVB=0.0155269;RO=20;SAF=3;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294396;STB=0.670515;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0338264;OID=.;OPOS=563649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:15:3:8:12:15:3:8:12 chr11 610277 . T C 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0382513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.333;QD=17.6896;RBI=0.0574725;REFB=-0.00999883;REVB=-0.0428943;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127841;STB=0.57253;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0165118;OID=.;OPOS=610277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:10:11:17:9:10:11:17:9 chr11 614864 . C T 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0222215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.013;QD=18.49;RBI=0.0287329;REFB=-0.0165345;REVB=0.018215;RO=25;SAF=16;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13892;STB=0.571361;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0227954;OID=.;OPOS=614864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:26:22:22:0.458333:6:16:15:10:6:16:16:10 chr11 616970 . A T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00329386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.921;QD=55.0987;RBI=0.02057;REFB=0;REVB=0.0203045;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20986e-05;OID=.;OPOS=616970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0 chr11 617537 . C T 287.68 PASS AF=0.457143;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0874388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4297;QD=16.4387;RBI=0.0874388;REFB=-0.0226265;REVB=4.24706e-05;RO=38;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419369;STB=0.511357;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0257899;OID=.;OPOS=617537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:31:32:0.457143:20:11:15:23:20:12:15:23 chr11 617967 . C G 971.96 PASS AF=1;AO=66;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.017;QD=57.1741;RBI=0.0730845;REFB=-0.0727202;REVB=0.00669075;RO=2;SAF=32;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028614;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00051947;OID=.;OPOS=617967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:68:68:2:0:66:68:1:34:32:2:0:34:34:0:0 chr11 618998 . G A 74.49 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0906356;FXX=0.039984;HRUN=5;LEN=1;MLLD=80.0057;QD=12.4153;RBI=0.0910687;REFB=-0.0173612;REVB=0.00887041;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174364;STB=0.555452;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0160528;OID=.;OPOS=618998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:24:24:11:14:10:10:0.416667:8:2:1:10:8:2:2:12 chr11 619789 . T G 52.92 PASS AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0352967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.521;QD=21.169;RBI=0.0487488;REFB=0.0018792;REVB=0.0336242;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21311;STB=0.624624;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00273046;OID=.;OPOS=619789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:5:2:2:1:5:2:2:1 chr11 654043 . G A 208.78 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00380474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.066;QD=18.1543;RBI=0.0591407;REFB=0.0108855;REVB=0.0590182;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696018;STB=0.539644;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.0117482;OID=.;OPOS=654043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:14:7:10:15:14:7:10:15 chr11 688365 . G A 386.57 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0339893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.027;QD=18.1915;RBI=0.0360999;REFB=-0.0137172;REVB=0.0121626;RO=45;SAF=19;SAR=21;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716459;STB=0.539945;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0182967;OID=.;OPOS=688365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:21:19:18:27:21:19:18:27 chr11 704583 . A G 112.22 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.019688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.9031;QD=16.6255;RBI=0.0213199;REFB=-0.0257137;REVB=-0.00818055;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234553;STB=0.513493;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0207411;OID=.;OPOS=704583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:4:10:9:4:4:10 chr11 704604 . GA G,GC 78.61 PASS AF=0.346154,0.0769231;AO=9,2;DP=26;FAO=9,2;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=3,0;FSAR=6,2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0188568,0.0110697;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.387,109.453;QD=12.0938;RBI=0.0203522,0.0176003;REFB=0.00322426,0.00591749;REVB=-0.00765713,-0.0136833;RO=14;SAF=3,0;SAR=6,2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0557404,-0.475704;STB=0.5,0.993007;STBP=1,0.317;TYPE=del,snp;VARB=-0.00792772,-0.114519;OID=.,.;OPOS=704605,704605;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.346154,0.0769231:9,2:26:9,2:26:15:3,0:6,2:5:10:62:14:3,0:6,2:4:10 chr11 709401 . A G 94.45 PASS AF=0.55;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.119637;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3438;QD=18.8901;RBI=0.130287;REFB=-0.000888262;REVB=-0.0515926;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394734;STB=0.726859;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00965861;OID=.;OPOS=709401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:21:20:9:9:11:11:0.55:8:3:7:2:8:3:7:2 chr11 726178 . G C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.202;QD=35.5758;RBI=0.0242788;REFB=0;REVB=0.0188399;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66715e-05;OID=.;OPOS=726178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr11 771034 . A G 651.18 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1741;QD=62.0174;RBI=0.0354575;REFB=0;REVB=-0.0163028;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137648;OID=.;OPOS=771034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0 chr11 772490 . G A 888.44 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0285586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7892;QD=56.4086;RBI=0.0390094;REFB=-0.0563542;REVB=0.0265732;RO=0;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99858e-08;STB=0.511624;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000842904;OID=.;OPOS=772490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:41:21:0:0:41:21:1:0 chr11 802379 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0622212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0582;QD=50.4126;RBI=0.0973453;REFB=0;REVB=-0.074864;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00497269;OID=.;OPOS=802379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr11 804212 . C A 1198.48 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.208;QD=60.6823;RBI=0.0735031;REFB=0;REVB=0.0719957;RO=0;SAF=46;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043361;OID=.;OPOS=804212;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:32:46:0:0:33:46:0:0 chr11 823809 . C G 238.8 PASS AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0704348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.4495;QD=18.729;RBI=0.0747428;REFB=-0.0377794;REVB=0.0250087;RO=14;SAF=19;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136211;STB=0.55168;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0132939;OID=.;OPOS=823809;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:14:26:24:25:0.490196:5:19:9:5:5:20:19:7 chr11 823861 . C CG 35.05 PASS AF=0.3;AO=16;DP=41;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0261606;FXX=0.0243843;HRUN=0;LEN=1;MLLD=77.9805;QD=3.50493;RBI=0.0596301;REFB=-0.00566814;REVB=-0.0535852;RO=24;SAF=14;SAR=2;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487344;STB=0.854837;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=0.184383;OID=.;OPOS=823862;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3:16:41:12:40:28:11:1:15:13:35:24:14:2:12:12 chr11 828916 . G A 769.48 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.816;QD=56.9987;RBI=0.0212825;REFB=0;REVB=0.00439677;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.96673e-05;OID=.;OPOS=828916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0 chr11 829539 . A G 1301.82 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.085;QD=61.9916;RBI=0.0188029;REFB=0;REVB=0.00353869;RO=0;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.09618e-05;OID=.;OPOS=829539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:53:31:0:0:53:31:0:0 chr11 830487 . C T 255.4 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.067;QD=51.0791;RBI=0.148506;REFB=0;REVB=0.0217498;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00261356;OID=.;OPOS=830487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr11 830670 . G T 387.86 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0493336;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.271;QD=53.4972;RBI=0.053953;REFB=-0.0428353;REVB=0.0218431;RO=1;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032084;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000844309;OID=.;OPOS=830670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:14:14:1:0:14:14:1:0 chr11 831122 . C T 879.91 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.741;QD=57.6989;RBI=0.0260349;REFB=0;REVB=0.0228988;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338571;OID=.;OPOS=831122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:34:24:0:0:34:27:0:0 chr11 837582 . G A 1116.9 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5702;QD=60.3732;RBI=0.0558899;REFB=0;REVB=0.0479465;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000726743;OID=.;OPOS=837582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:32:42:0:0:32:42:0:0 chr11 840477 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0804641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.129;QD=53.2762;RBI=0.0811385;REFB=0;REVB=0.0104394;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000975507;OID=.;OPOS=840477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr11 862652 . T C 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0266;QD=62.9824;RBI=0.0713996;REFB=0;REVB=-0.0676688;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126239;OID=.;OPOS=862652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0 chr11 865510 . CA AC 31.97 PASS AF=0.125;AO=8;DP=57;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0462387;FXX=0.0175408;HRUN=5;LEN=2;MLLD=90.4093;QD=2.28379;RBI=0.0604593;REFB=-0.00649211;REVB=-0.0389526;RO=43;SAF=6;SAR=2;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198176;STB=0.651721;STBP=0.444;TYPE=mnp;VARB=0.118722;OID=.;OPOS=865510;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:57:56:43:49:8:7:0.125:2:6:26:17:2:5:27:22 chr11 865614 . C T 263.53 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0236627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.99;QD=17.5685;RBI=0.0240505;REFB=0.00271104;REVB=-0.00430149;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18251;STB=0.602216;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00184926;OID=.;OPOS=865614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:17:12:19:12:17:12:19:12 chr11 870446 . G A 760.08 PASS AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0222823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.899;QD=53.339;RBI=0.0279091;REFB=-0.097866;REVB=0.0168053;RO=1;SAF=31;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149647;STB=0.515619;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00130872;OID=.;OPOS=870446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:57:57:1:2:55:55:0.964912:24:31:1:0:24:31:2:0 chr11 900929 . C G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.459;QD=49.5992;RBI=0.0352131;REFB=0;REVB=0.0107372;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158018;OID=.;OPOS=900929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0 chr11 903070 . G C 792.27 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.574;QD=63.382;RBI=0.0339513;REFB=0;REVB=0.0231385;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287231;OID=.;OPOS=903070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:28:21:0:0:28:22:0:0 chr11 985547 . C T 179.36 PASS AF=0.422222;AO=17;DP=43;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0227554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.238;QD=15.9433;RBI=0.0227588;REFB=-0.0204196;REVB=-0.000395055;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092905;STB=0.54605;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0267668;OID=.;OPOS=985547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:45:26:26:17:19:0.422222:10:7:13:13:11:8:13:13 chr11 993907 . C G 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0192109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.655;QD=11.0197;RBI=0.0239249;REFB=-0.0631768;REVB=0.0142599;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162008;STB=0.599657;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0577795;OID=.;OPOS=993907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:4:4:4:2:4:4 chr11 1010694 . C T 205.01 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0386354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0709;QD=16.401;RBI=0.0465094;REFB=-0.0182509;REVB=-0.0258927;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14578;STB=0.583256;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0234861;OID=.;OPOS=1010694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:11:18:10:11:11:18 chr11 1016588 . G C 43.21 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0144092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.798;QD=5.57556;RBI=0.0216141;REFB=-0.00529661;REVB=-0.0161104;RO=24;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655922;STB=0.542737;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0109506;OID=.;OPOS=1016588;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:31:31:24:24:7:7:0.225806:4:3:9:15:4:3:9:15 chr11 1016594 . A G 117.03 PASS AF=0.368421;AO=16;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0238271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7335;QD=12.3186;RBI=0.112069;REFB=-0.0236329;REVB=-0.109506;RO=21;SAF=3;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29884;STB=0.62837;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0856789;OID=.;OPOS=1016594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:24:16:14:0.368421:13:3:9:12:11:3:9:15 chr11 1016604 . ACT GGC 172.89 PASS AF=0.4;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0153167;FXX=0.062487;HRUN=1;LEN=3;MLLD=127.795;QD=15.3682;RBI=0.0436477;REFB=-0.00651873;REVB=-0.040872;RO=27;SAF=6;SAR=12;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440337;STB=0.525396;STBP=0.801;TYPE=mnp;VARB=0.0131781;OID=.;OPOS=1016604;OREF=ACT;OALT=GGC;OMAPALT=GGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:45:27:27:18:18:0.4:12:6:8:19:12:6:8:19 chr11 1016614 . G T 292.35 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0277766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0274;QD=17.1972;RBI=0.0316675;REFB=0.00530019;REVB=0.0152083;RO=33;SAF=8;SAR=24;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270768;STB=0.519219;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00918326;OID=.;OPOS=1016614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:36:32:32:0.470588:24:8:9:24:24:8:10:26 chr11 1016618 . G C 420.36 PASS AF=0.557143;AO=38;DP=72;FAO=39;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0174547;FXX=0.0277739;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.661;QD=24.0205;RBI=0.0195338;REFB=-0.0434599;REVB=-0.00876932;RO=20;SAF=8;SAR=30;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197692;STB=0.550432;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0234661;OID=.;OPOS=1016618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:20:28:38:39:0.557143:30:8:9:11:30:9:9:19 chr11 1016665 . C T 106.21 PASS AF=0.18;AO=18;DP=100;FAO=18;FDP=100;FR=.;FRO=82;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=61;FWDB=-0.0341359;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.179;QD=4.24839;RBI=0.055608;REFB=-0.0157641;REVB=-0.0438976;RO=80;SAF=2;SAR=16;SRF=20;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292531;STB=0.704703;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0606461;OID=.;OPOS=1016665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:80:82:18:18:0.18:16:2:20:60:16:2:21:61 chr11 1016704 . C A 56.68 PASS AF=0.118644;AO=14;DP=115;FAO=14;FDP=118;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=75;FWDB=-0.0197734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3442;QD=1.9213;RBI=0.0406203;REFB=-0.00948823;REVB=-0.0354827;RO=101;SAF=5;SAR=9;SRF=28;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113993;STB=0.578408;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0623479;OID=.;OPOS=1016704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:115:118:101:104:14:14:0.118644:9:5:28:73:9:5:29:75 chr11 1016713 . T C 89.04 PASS AF=0.151261;AO=15;DP=119;FAO=18;FDP=119;FR=.;FRO=101;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=73;FWDB=-0.00515747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.197;QD=2.99309;RBI=0.0109756;REFB=-0.00295152;REVB=-0.00968834;RO=99;SAF=8;SAR=7;SRF=28;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317583;STB=0.648292;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00832;OID=.;OPOS=1016713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:119:119:99:101:15:18:0.151261:7:8:28:71:10:8:28:73 chr11 1016722 . T G 51.77 PASS AF=0.109244;AO=12;DP=117;FAO=13;FDP=119;FR=.;FRO=106;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=75;FWDB=-0.00462241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.361;QD=1.74018;RBI=0.0141763;REFB=-0.0078131;REVB=-0.0134015;RO=102;SAF=6;SAR=6;SRF=28;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284509;STB=0.71293;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0458306;OID=.;OPOS=1016722;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:117:119:102:106:12:13:0.109244:6:6:28:74:6:7:31:75 chr11 1016724 . A G 131.14 PASS AF=0.193277;AO=23;DP=119;FAO=23;FDP=119;FR=.;FRO=96;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=68;FWDB=-0.0329205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.188;QD=4.40794;RBI=0.0356594;REFB=-0.0152709;REVB=-0.0137051;RO=91;SAF=10;SAR=13;SRF=25;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218124;STB=0.621069;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.04143;OID=.;OPOS=1016724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:91:96:23:23:0.193277:13:10:25:66:13:10:28:68 chr11 1016776 . C T 275.33 PASS AF=0.333333;AO=34;DP=130;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.00467955;FXX=0.215368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.061;QD=10.7972;RBI=0.0272417;REFB=-0.033458;REVB=-0.0268368;RO=66;SAF=16;SAR=18;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033575;STB=0.509821;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0475146;OID=.;OPOS=1016776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:102:66:68:34:34:0.333333:18:16:33:33:18:16:33:35 chr11 1016789 . T A 76.61 PASS AF=0.12;AO=18;DP=150;FAO=18;FDP=150;FR=.;FRO=132;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=56;FSRR=76;FWDB=-0.0101577;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8101;QD=2.04282;RBI=0.0227636;REFB=-0.00286631;REVB=-0.0203716;RO=131;SAF=4;SAR=14;SRF=55;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269844;STB=0.69976;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0279036;OID=.;OPOS=1016789;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:150:150:131:132:18:18:0.12:14:4:55:76:14:4:56:76 chr11 1016800 . G A 121.44 PASS AF=0.165468;AO=19;DP=139;FAO=23;FDP=139;FR=.;FRO=116;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=60;FSRR=56;FWDB=0.00633359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.725;QD=3.49476;RBI=0.0331121;REFB=-0.0114861;REVB=-0.0325007;RO=116;SAF=4;SAR=15;SRF=60;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394863;STB=0.801836;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0893336;OID=.;OPOS=1016800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:116:116:19:23:0.165468:15:4:60:56:19:4:60:56 chr11 1016802 . T A 83.31 PASS AF=0.137405;AO=18;DP=131;FAO=18;FDP=131;FR=.;FRO=113;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=60;FSRR=53;FWDB=0.00531988;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6755;QD=2.54383;RBI=0.0580138;REFB=-0.0157372;REVB=-0.0577693;RO=110;SAF=4;SAR=14;SRF=60;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405958;STB=0.769456;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.127899;OID=.;OPOS=1016802;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:131:131:110:113:18:18:0.137405:14:4:60:50:14:4:60:53 chr11 1016809 . G T 46.43 PASS AF=0.0935252;AO=13;DP=139;FAO=13;FDP=139;FR=.;FRO=126;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=67;FSRR=59;FWDB=0.00691814;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.408;QD=1.33616;RBI=0.0121844;REFB=-0.00311836;REVB=-0.0100299;RO=125;SAF=1;SAR=12;SRF=67;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542545;STB=0.919298;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0280307;OID=.;OPOS=1016809;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:139:139:125:126:13:13:0.0935252:12:1:67:58:12:1:67:59 chr11 1016810 . G T 104.69 PASS AF=0.151079;AO=21;DP=138;FAO=21;FDP=139;FR=.;FRO=118;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=0.00298253;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.737;QD=3.01266;RBI=0.0224236;REFB=-0.00996929;REVB=-0.0222244;RO=110;SAF=5;SAR=16;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418796;STB=0.75374;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0488968;OID=.;OPOS=1016810;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:110:118:21:21:0.151079:16:5:63:47:16:5:63:55 chr11 1016819 . G T 64.25 PASS AF=0.0935961;AO=19;DP=203;FAO=19;FDP=203;FR=.;FRO=184;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=64;FSRR=120;FWDB=-0.0111476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.93;QD=1.26596;RBI=0.0570868;REFB=-0.0139501;REVB=-0.0559878;RO=184;SAF=10;SAR=9;SRF=64;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215109;STB=0.659356;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.11908;OID=.;OPOS=1016819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:203:203:184:184:19:19:0.0935961:9:10:64:120:9:10:64:120 chr11 1016825 . G A 105.7 PASS AF=0.116883;AO=27;DP=231;FAO=27;FDP=231;FR=.;FRO=204;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=76;FSRR=128;FWDB=0.00400383;FXX=0.00431016;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.142;QD=1.83033;RBI=0.0244025;REFB=-0.00709527;REVB=-0.0240718;RO=204;SAF=4;SAR=23;SRF=76;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340689;STB=0.752648;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0986827;OID=.;OPOS=1016825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:204:204:27:27:0.116883:23:4:76:128:23:4:76:128 chr11 1016834 . G A 236.46 PASS AF=0.178862;AO=44;DP=246;FAO=44;FDP=246;FR=.;FRO=202;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=63;FSRR=139;FWDB=0.0164165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1776;QD=3.84486;RBI=0.0239021;REFB=-0.00803179;REVB=0.0173727;RO=188;SAF=19;SAR=25;SRF=61;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146067;STB=0.603131;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0564008;OID=.;OPOS=1016834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:188:202:44:44:0.178862:25:19:61:127:25:19:63:139 chr11 1016869 . AGG CAG,CAT,TGG 517.92 PASS AF=0,0,0.35;AO=13,14,62;DP=203;FAO=0,0,63;FDP=180;FR=.;FRO=117;FSAF=0,0,37;FSAR=0,0,26;FSRF=35;FSRR=82;FWDB=0.00718789,0.00959589,0.00248567;FXX=0.113295;HRUN=2,2,2;LEN=2,3,1;MLLD=121.77,151.722,110.062;QD=11.5093;RBI=0.00857924,0.0124986,0.0405168;REFB=-0.0108367,-0.0112247,-0.0172173;REVB=-0.00468374,-0.0080083,-0.0404405;RO=99;SAF=3,3,36;SAR=10,11,26;SRF=30;SRR=69;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.11047,-0.139613,0.295338;STB=0.5,0.5,0.680928;STBP=1,1,0.001;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0.0705606,0,0.0250365;OID=.,.,.;OPOS=1016869,1016869,1016869;OREF=AG,AGG,A;OALT=CA,CAT,T;OMAPALT=CAG,CAT,TGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:99:203:180:99:117:13,14,62:0,0,63:0,0,0.35:10,11,26:3,3,36:30:69:0,0,26:0,0,37:35:82 chr11 1016887 . G A 54.21 PASS AF=0.0924855;AO=14;DP=173;FAO=16;FDP=173;FR=.;FRO=157;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=76;FSRR=81;FWDB=-0.0117145;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.426;QD=1.25334;RBI=0.0155724;REFB=-0.00463567;REVB=-0.0102601;RO=156;SAF=2;SAR=12;SRF=76;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408385;STB=0.784196;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0532349;OID=.;OPOS=1016887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:173:173:156:157:14:16:0.0924855:12:2:76:80:13:3:76:81 chr11 1016889 . GG AA,GA 480.94 PASS AF=0.128834,0.251534;AO=20,41;DP=158;FAO=21,41;FDP=163;FR=.;FRO=101;FSAF=2,22;FSAR=19,19;FSRF=54;FSRR=47;FWDB=0.00569086,0.00311875;FXX=0.0121205;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=148.926,177.242;QD=11.8022;RBI=0.019128,0.0306041;REFB=-0.00967069,-0.0171541;REVB=-0.0182619,-0.0304448;RO=94;SAF=2,22;SAR=18,19;SRF=53;SRR=41;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.601665,-0.032726;STB=0.889237,0.501381;STBP=0,0.996;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0227238,0.0308431;OID=.,.;OPOS=1016889,1016890;OREF=GG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:158:163:94:101:20,41:21,41:0.128834,0.251534:18,19:2,22:53:41:19,19:2,22:54:47 chr11 1016894 . G A 117.86 PASS AF=0.157534;AO=23;DP=146;FAO=23;FDP=146;FR=.;FRO=123;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=58;FSRR=65;FWDB=-0.017202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.823;QD=3.22909;RBI=0.0188419;REFB=-0.00705016;REVB=-0.00768813;RO=121;SAF=16;SAR=7;SRF=57;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287101;STB=0.689655;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0903915;OID=.;OPOS=1016894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:121:123:23:23:0.157534:7:16:57:64:7:16:58:65 chr11 1016914 . G T 388.71 PASS AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=0.0310656;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4526;QD=17.0861;RBI=0.083458;REFB=-0.0121175;REVB=0.0774607;RO=50;SAF=20;SAR=21;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247642;STB=0.637657;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0148625;OID=.;OPOS=1016914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:50:50:41:41:0.450549:21:20:37:13:21:20:37:13 chr11 1016928 . C G 603.27 PASS AF=0.693333;AO=51;DP=75;FAO=52;FDP=75;FR=.;FRO=23;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0123353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.635;QD=32.1743;RBI=0.0219541;REFB=-0.0392814;REVB=-0.018161;RO=21;SAF=36;SAR=15;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11219;STB=0.566856;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0178769;OID=.;OPOS=1016928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:21:23:51:52:0.693333:15:36:11:10:15:37:12:11 chr11 1016933 . C T 197.53 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.00309628;FXX=0.0263123;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.708;QD=10.6771;RBI=0.0159501;REFB=-0.027082;REVB=-0.0156467;RO=47;SAF=14;SAR=11;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141222;STB=0.577594;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0335752;OID=.;OPOS=1016933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:74:47:49:25:25:0.337838:11:14:32:15:11:14:33:16 chr11 1016957 . T G 37.77 PASS AF=0.131148;AO=7;DP=62;FAO=8;FDP=61;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.0228728;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.041;QD=2.47669;RBI=0.0256507;REFB=-0.0205334;REVB=-0.01161;RO=53;SAF=3;SAR=4;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160466;STB=0.662255;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0691575;OID=.;OPOS=1016957;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:62:61:53:53:7:8:0.131148:4:3:30:23:5:3:30:23 chr11 1016963 . G T 42.56 PASS AF=0.133333;AO=7;DP=60;FAO=8;FDP=60;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0144034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.636;QD=2.83764;RBI=0.0215071;REFB=-0.00319577;REVB=-0.0159717;RO=49;SAF=3;SAR=4;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120454;STB=0.608969;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0250705;OID=.;OPOS=1016963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:60:60:49:52:7:8:0.133333:4:3:26:23:5:3:26:26 chr11 1016978 . T G 34.0 PASS AF=0.118644;AO=7;DP=62;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=-0.0392581;FXX=0.0922935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.9926;QD=2.30518;RBI=0.0534916;REFB=-0.0120072;REVB=-0.0363339;RO=52;SAF=6;SAR=1;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.588022;STB=0.91476;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0731925;OID=.;OPOS=1016978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:62:59:52:52:7:7:0.118644:1:6:16:36:1:6:15:37 chr11 1016991 . T G 35.83 PASS AF=0.108108;AO=8;DP=71;FAO=8;FDP=74;FR=.;FRO=66;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=54;FWDB=-0.105892;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1414;QD=1.93692;RBI=0.152249;REFB=-0.00340863;REVB=-0.109391;RO=63;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.514939;STB=0.847671;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.000790414;OID=.;OPOS=1016991;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:71:74:63:66:8:8:0.108108:3:5:12:51:3:5:12:54 chr11 1017023 . G A 91.54 PASS AF=0.146154;AO=19;DP=130;FAO=19;FDP=130;FR=.;FRO=111;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=99;FWDB=0.00983235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.398;QD=2.81652;RBI=0.0343366;REFB=-0.012103;REVB=-0.0328987;RO=111;SAF=1;SAR=18;SRF=12;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230158;STB=0.666444;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0588676;OID=.;OPOS=1017023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:130:130:111:111:19:19:0.146154:18:1:12:99:18:1:12:99 chr11 1017029 . T G 581.59 PASS AF=0.451852;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=4;FSAR=57;FSRF=10;FSRR=64;FWDB=-0.0126097;FXX=0.0217376;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1891;QD=17.2323;RBI=0.0475166;REFB=-0.0240526;REVB=-0.0458129;RO=76;SAF=4;SAR=57;SRF=10;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208582;STB=0.622417;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0282814;OID=.;OPOS=1017029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:76:74:61:61:0.451852:57:4:10:66:57:4:10:64 chr11 1017036 . G A 150.74 PASS AF=0.184932;AO=25;DP=145;FAO=27;FDP=146;FR=.;FRO=119;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=103;FWDB=0.0250129;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.538;QD=4.12976;RBI=0.0262814;REFB=-0.0175909;REVB=0.00806634;RO=117;SAF=1;SAR=24;SRF=16;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377029;STB=0.773792;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0456062;OID=.;OPOS=1017036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:117:119:25:27:0.184932:24:1:16:101:26:1:16:103 chr11 1017041 . GT TG 148.97 PASS AF=0.184397;AO=26;DP=144;FAO=26;FDP=141;FR=.;FRO=115;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=98;FWDB=-0.00234228;FXX=0.0208319;HRUN=2;LEN=2;MLLD=147.484;QD=4.22609;RBI=0.0435446;REFB=-0.00620423;REVB=-0.0434815;RO=115;SAF=2;SAR=24;SRF=17;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22612;STB=0.651286;STBP=0.264;TYPE=mnp;VARB=0.0723903;OID=.;OPOS=1017041;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:141:115:115:26:26:0.184397:24:2:17:98:24:2:17:98 chr11 1017045 . G T 149.96 PASS AF=0.176471;AO=27;DP=153;FAO=27;FDP=153;FR=.;FRO=126;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=104;FWDB=0.00737373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.426;QD=3.92063;RBI=0.0505037;REFB=-0.0108022;REVB=-0.0499625;RO=125;SAF=2;SAR=25;SRF=21;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279391;STB=0.699113;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0574631;OID=.;OPOS=1017045;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:125:126:27:27:0.176471:25:2:21:104:25:2:22:104 chr11 1017069 . G A 88.04 PASS AF=0.116402;AO=22;DP=189;FAO=22;FDP=189;FR=.;FRO=167;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=134;FWDB=0.000609229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1145;QD=1.8633;RBI=0.00469708;REFB=-0.0048682;REVB=-0.0046574;RO=166;SAF=5;SAR=17;SRF=33;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529581;STB=0.538867;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0251844;OID=.;OPOS=1017069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:189:189:166:167:22:22:0.116402:17:5:33:133:17:5:33:134 chr11 1017084 . G A 370.53 PASS AF=0.270833;AO=52;DP=190;FAO=52;FDP=192;FR=.;FRO=140;FSAF=11;FSAR=41;FSRF=27;FSRR=113;FWDB=-0.00178302;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.765;QD=7.71932;RBI=0.0308105;REFB=-0.0141664;REVB=-0.0307589;RO=138;SAF=11;SAR=41;SRF=26;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441088;STB=0.520902;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0479857;OID=.;OPOS=1017084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:192:138:140:52:52:0.270833:41:11:26:112:41:11:27:113 chr11 1017110 . C T 349.07 PASS AF=0.261111;AO=46;DP=179;FAO=47;FDP=180;FR=.;FRO=133;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=102;FWDB=-0.0195736;FXX=0.08629;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.573;QD=7.75703;RBI=0.0246683;REFB=-0.035077;REVB=0.0150132;RO=131;SAF=11;SAR=35;SRF=31;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00425794;STB=0.50099;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0689109;OID=.;OPOS=1017110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:180:131:133:46:47:0.261111:35:11:31:100:36:11:31:102 chr11 1017112 . GT CC,GC 513.84 PASS AF=0.257485,0.125749;AO=45,38;DP=194;FAO=43,21;FDP=167;FR=.;FRO=103;FSAF=11,5;FSAR=32,16;FSRF=25;FSRR=78;FWDB=0.00697918,0.0414591;FXX=0.139168;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=138.41,109.152;QD=12.3076;RBI=0.0291524,0.0450868;REFB=-0.0234237,-0.0250747;REVB=0.0283046,0.0177189;RO=98;SAF=11,4;SAR=34,34;SRF=25;SRR=73;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0168149,-0.321928;STB=0.512272,0.505258;STBP=0.89,0.982;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0444102,0.0149466;OID=.,.;OPOS=1017112,1017113;OREF=GT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:167:98:103:45,38:43,21:0.257485,0.125749:34,34:11,4:25:73:32,16:11,5:25:78 chr11 1017135 . G A 41.77 PASS AF=0.0723982;AO=16;DP=222;FAO=16;FDP=221;FR=.;FRO=205;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=45;FSRR=160;FWDB=0.00840766;FXX=0.0045043;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.813;QD=0.755953;RBI=0.0243928;REFB=-0.00221493;REVB=-0.022898;RO=203;SAF=4;SAR=12;SRF=44;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052234;STB=0.539138;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0316784;OID=.;OPOS=1017135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:222:221:203:205:16:16:0.0723982:12:4:44:159:12:4:45:160 chr11 1017154 . T G 51.55 PASS AF=0.0803571;AO=18;DP=224;FAO=18;FDP=224;FR=.;FRO=206;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=47;FSRR=159;FWDB=-0.0154286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.057;QD=0.920502;RBI=0.0350359;REFB=-0.000755103;REVB=-0.0314559;RO=201;SAF=6;SAR=12;SRF=46;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152391;STB=0.617214;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0270979;OID=.;OPOS=1017154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:224:224:201:206:18:18:0.0803571:12:6:46:155:12:6:47:159 chr11 1017158 . G T 40.92 PASS AF=0.0714286;AO=16;DP=220;FAO=16;FDP=224;FR=.;FRO=208;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=48;FSRR=160;FWDB=-0.0305604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5337;QD=0.730737;RBI=0.0346683;REFB=-0.00198314;REVB=0.0163693;RO=204;SAF=5;SAR=11;SRF=48;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110111;STB=0.594469;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0288263;OID=.;OPOS=1017158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:220:224:204:208:16:16:0.0714286:11:5:48:156:11:5:48:160 chr11 1017173 . G A 612.17 PASS AF=0.357143;AO=75;DP=211;FAO=75;FDP=210;FR=.;FRO=135;FSAF=16;FSAR=59;FSRF=34;FSRR=101;FWDB=0.0191136;FXX=0.00473911;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.639;QD=11.6604;RBI=0.0205835;REFB=-0.0242649;REVB=0.00763899;RO=134;SAF=16;SAR=59;SRF=34;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646594;STB=0.53538;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0380365;OID=.;OPOS=1017173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:134:135:75:75:0.357143:59:16:34:100:59:16:34:101 chr11 1017183 . G T 426.62 PASS AF=0.286432;AO=57;DP=199;FAO=57;FDP=199;FR=.;FRO=142;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=103;FWDB=0.0662429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9964;QD=8.57529;RBI=0.0671481;REFB=-0.00820883;REVB=-0.0109883;RO=142;SAF=14;SAR=43;SRF=39;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461676;STB=0.52717;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0296186;OID=.;OPOS=1017183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:142:142:57:57:0.286432:43:14:39:103:43:14:39:103 chr11 1017220 . T C 1053.56 PASS AF=0.652482;AO=91;DP=141;FAO=92;FDP=141;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0153137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.999;QD=29.8883;RBI=0.0164017;REFB=-0.0663577;REVB=0.00587412;RO=49;SAF=31;SAR=60;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102417;STB=0.508195;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0623621;OID=.;OPOS=1017220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:49:49:91:92:0.652482:60:31:16:33:60:32:16:33 chr11 1017231 . A G 934.4 PASS AF=0.643411;AO=74;DP=120;FAO=83;FDP=129;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.0247342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.514;QD=28.9735;RBI=0.030621;REFB=-0.0493899;REVB=0.0180517;RO=45;SAF=29;SAR=45;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768844;STB=0.522322;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0291409;OID=.;OPOS=1017231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:129:45:46:74:83:0.643411:45:29:13:32:53:30:14:32 chr11 1017239 . CG TA 759.25 PASS AF=0.627273;AO=68;DP=118;FAO=69;FDP=110;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.00611358;FXX=0.0677909;HRUN=2;LEN=2;MLLD=186.326;QD=27.609;RBI=0.00897209;REFB=-0.026272;REVB=0.00656677;RO=38;SAF=20;SAR=48;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249826;STB=0.516063;STBP=0.711;TYPE=mnp;VARB=0.0123355;OID=.;OPOS=1017239;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:110:38:41:68:69:0.627273:48:20:10:28:48:21:11:30 chr11 1017302 . G C 84.94 PASS AF=0.158416;AO=15;DP=101;FAO=16;FDP=101;FR=.;FRO=85;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=61;FWDB=0.0309015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3984;QD=3.36413;RBI=0.0555088;REFB=-0.0108167;REVB=0.0461121;RO=86;SAF=7;SAR=8;SRF=24;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249444;STB=0.637038;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0881461;OID=.;OPOS=1017302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:101:101:86:85:15:16:0.158416:8:7:24:62:9:7:24:61 chr11 1017314 . TGGGGT TGGG,TGGGT,TGGTGT 419.17 PASS AF=0,0.444444,0.283951;AO=9,21,22;DP=82;FAO=0,36,23;FDP=81;FR=.;FRO=22;FSAF=0,0,4;FSAR=0,36,19;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0447351,0.0644436,0.000487995;FXX=0.0240935;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=22.6854,10.8849,184.439;QD=20.6999;RBI=0.196968,0.106833,0.0612869;REFB=-0.0535303,-0.124822,-0.0388459;REVB=-0.19182,-0.085208,-0.061285;RO=23;SAF=0,0,4;SAR=9,21,18;SRF=17;SRR=6;SSEN=0.368421,0.368421,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.811043,-0.859647,-0.524541;STB=0.5,0.999607,0.805784;STBP=1,0,0;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.0189197,0.0841614;OID=.,.,.;OPOS=1017318,1017315,1017317;OREF=GT,G,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=TGGG,TGGGT,TGGTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.444444,0.283951:9,21,22:82:0,36,23:81:22:0,0,4:0,36,19:17:5:99:23:0,0,4:9,21,18:17:6 chr11 1017325 . A C 332.25 PASS AF=0.366071;AO=40;DP=111;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=57;FWDB=0.0232497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1615;QD=11.8659;RBI=0.0233736;REFB=-0.0338541;REVB=-0.00240336;RO=71;SAF=9;SAR=31;SRF=14;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459662;STB=0.541852;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0693405;OID=.;OPOS=1017325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:71:71:40:41:0.366071:31:9:14:57:31:10:14:57 chr11 1017337 . TC CA 47.09 PASS AF=0.101695;AO=11;DP=117;FAO=12;FDP=118;FR=.;FRO=106;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=85;FWDB=-0.0129843;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=169.62;QD=1.59619;RBI=0.0396078;REFB=-0.00552388;REVB=-0.037419;RO=105;SAF=3;SAR=8;SRF=21;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120051;STB=0.566163;STBP=0.707;TYPE=mnp;VARB=0.0665729;OID=.;OPOS=1017337;OREF=TC;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:117:118:105:106:11:12:0.101695:8:3:21:84:9:3:21:85 chr11 1017363 . C G 62.3 PASS AF=0.122807;AO=14;DP=111;FAO=14;FDP=114;FR=.;FRO=100;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=68;FWDB=-0.0230567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.403;QD=2.18611;RBI=0.0547413;REFB=-0.00425231;REVB=-0.0496488;RO=97;SAF=1;SAR=13;SRF=32;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450744;STB=0.84055;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.043232;OID=.;OPOS=1017363;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:111:114:97:100:14:14:0.122807:13:1:32:65:13:1:32:68 chr11 1017381 . G C 269.04 PASS AF=0.351648;AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.003149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.142;QD=11.826;RBI=0.00869431;REFB=-0.00462899;REVB=0.008104;RO=58;SAF=5;SAR=27;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438856;STB=0.754264;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0297774;OID=.;OPOS=1017381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:58:59:32:32:0.351648:27:5:28:30:27:5:28:31 chr11 1017384 . G C 317.18 PASS AF=0.411765;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.000788576;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.676;QD=14.9263;RBI=0.000800438;REFB=-0.00900385;REVB=-0.000137294;RO=49;SAF=7;SAR=28;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386657;STB=0.717255;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.010278;OID=.;OPOS=1017384;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:49:50:35:35:0.411765:28:7:26:23:28:7:26:24 chr11 1017421 . G T 55.55 PASS AF=0.191176;AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0282168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2242;QD=3.26761;RBI=0.253822;REFB=-0.0564307;REVB=-0.252248;RO=31;SAF=3;SAR=10;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.677203;STB=0.758217;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.157544;OID=.;OPOS=1017421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:68:68:31:55:13:13:0.191176:10:3:28:3:10:3:30:25 chr11 1017443 . C G 103.92 PASS AF=0.188889;AO=17;DP=96;FAO=17;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.0276726;FXX=0.0816243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.674;QD=4.61858;RBI=0.0411654;REFB=-0.00142019;REVB=-0.0304765;RO=71;SAF=2;SAR=15;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44168;STB=0.797184;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0129092;OID=.;OPOS=1017443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:90:71:73:17:17:0.188889:15:2:28:43:15:2:29:44 chr11 1017514 . A G 33.26 PASS AF=0.0810811;AO=7;DP=148;FAO=12;FDP=148;FR=.;FRO=136;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=107;FWDB=-0.0163079;FXX=0.0389585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.758;QD=0.899025;RBI=0.0313939;REFB=-0.00887957;REVB=-0.0268259;RO=137;SAF=4;SAR=3;SRF=30;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365645;STB=0.635168;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.124297;OID=.;OPOS=1017514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:148:148:137:136:7:12:0.0810811:3:4:30:107:8:4:29:107 chr11 1017529 . G A 59.31 PASS AF=0.0909091;AO=17;DP=197;FAO=18;FDP=198;FR=.;FRO=180;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=151;FWDB=0.00628618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.647;QD=1.19822;RBI=0.0339818;REFB=-0.00672006;REVB=-0.0333953;RO=180;SAF=2;SAR=15;SRF=29;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101713;STB=0.597468;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0643152;OID=.;OPOS=1017529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:197:198:180:180:17:18:0.0909091:15:2:29:151:16:2:29:151 chr11 1017556 . G A 143.92 PASS AF=0.16568;AO=28;DP=169;FAO=28;FDP=169;FR=.;FRO=141;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=119;FWDB=0.0764429;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9441;QD=3.40648;RBI=0.0773071;REFB=-0.00447698;REVB=0.0115268;RO=141;SAF=3;SAR=25;SRF=22;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136001;STB=0.591223;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0237235;OID=.;OPOS=1017556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:141:141:28:28:0.16568:25:3:22:119:25:3:22:119 chr11 1017566 . G A 57.71 PASS AF=0.103448;AO=15;DP=144;FAO=15;FDP=145;FR=.;FRO=130;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=107;FWDB=0.0137702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9913;QD=1.59204;RBI=0.0415934;REFB=-0.00195883;REVB=0.0392479;RO=129;SAF=1;SAR=14;SRF=23;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287822;STB=0.734818;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0212038;OID=.;OPOS=1017566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:144:145:129:130:15:15:0.103448:14:1:23:106:14:1:23:107 chr11 1017575 . C T 93.16 PASS AF=0.149606;AO=19;DP=128;FAO=19;FDP=127;FR=.;FRO=108;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=85;FWDB=-0.00809383;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.652;QD=2.9342;RBI=0.0132352;REFB=-0.00315261;REVB=-0.0104719;RO=106;SAF=1;SAR=18;SRF=23;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421679;STB=0.807029;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0113289;OID=.;OPOS=1017575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:128:127:106:108:19:19:0.149606:18:1:23:83:18:1:23:85 chr11 1017588 . CTTCG CTTGC 38.06 PASS AF=0.101124;AO=9;DP=101;FAO=9;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=60;FWDB=-0.0285895;FXX=0.0824657;HRUN=1;LEN=2;MLLD=148.924;QD=1.71044;RBI=0.0436567;REFB=-0.00370196;REVB=-0.0329931;RO=67;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184266;STB=0.711289;STBP=0.294;TYPE=mnp;VARB=0.0514442;OID=.;OPOS=1017591;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=CTTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.101124:9:101:9:89:80:1:8:20:60:38:67:1:8:13:54 chr11 1017597 . T G 35.92 PASS AF=0.0957447;AO=10;DP=94;FAO=9;FDP=94;FR=.;FRO=85;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=61;FWDB=-0.0184678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8766;QD=1.52854;RBI=0.0285936;REFB=0.00237582;REVB=-0.0218297;RO=82;SAF=2;SAR=8;SRF=22;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110865;STB=0.742831;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-0.0279943;OID=.;OPOS=1017597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:94:94:82:85:10:9:0.0957447:8:2:22:60:8:1:24:61 chr11 1017684 . G A 49.66 PASS AF=0.100775;AO=13;DP=130;FAO=13;FDP=129;FR=.;FRO=116;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=96;FWDB=-0.0118066;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.916;QD=1.53998;RBI=0.0446041;REFB=-0.0146609;REVB=-0.0430131;RO=116;SAF=3;SAR=10;SRF=20;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109939;STB=0.580181;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0822528;OID=.;OPOS=1017684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:130:129:116:116:13:13:0.100775:10:3:20:96:10:3:20:96 chr11 1017691 . C G 253.14 PASS AF=0.257143;AO=36;DP=134;FAO=36;FDP=140;FR=.;FRO=104;FSAF=3;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=86;FWDB=-0.0559723;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.841;QD=7.23249;RBI=0.0714987;REFB=-0.0238573;REVB=-0.0444878;RO=93;SAF=3;SAR=33;SRF=17;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274588;STB=0.659891;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0783252;OID=.;OPOS=1017691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:140:93:104:36:36:0.257143:33:3:17:76:33:3:18:86 chr11 1017693 . T A 33.28 PASS AF=0.0769231;AO=12;DP=155;FAO=12;FDP=156;FR=.;FRO=144;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=125;FWDB=-0.0222541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.787;QD=0.853343;RBI=0.022414;REFB=-0.00622253;REVB=-0.00267284;RO=142;SAF=3;SAR=9;SRF=18;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240953;STB=0.669786;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.057685;OID=.;OPOS=1017693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:155:156:142:144:12:12:0.0769231:9:3:18:124:9:3:19:125 chr11 1017710 . G T 73.13 PASS AF=0.113208;AO=17;DP=158;FAO=18;FDP=159;FR=.;FRO=141;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=125;FWDB=-0.0149846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.261;QD=1.83974;RBI=0.024413;REFB=-0.0153751;REVB=-0.0192732;RO=140;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419836;STB=0.756727;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0639558;OID=.;OPOS=1017710;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:158:159:140:141:17:18:0.113208:11:6:16:124:12:6:16:125 chr11 1017744 . T C 110.47 PASS AF=0.141176;AO=24;DP=170;FAO=24;FDP=170;FR=.;FRO=146;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=112;FWDB=0.00378168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.423;QD=2.5992;RBI=0.00394279;REFB=-0.00606897;REVB=0.00111558;RO=146;SAF=1;SAR=23;SRF=34;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473498;STB=0.855962;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0295087;OID=.;OPOS=1017744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:146:146:24:24:0.141176:23:1:34:112:23:1:34:112 chr11 1017746 . T G 448.18 PASS AF=0.335294;AO=57;DP=170;FAO=57;FDP=170;FR=.;FRO=113;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=22;FSRR=91;FWDB=-0.00466605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.3087;QD=10.5455;RBI=0.00470058;REFB=-0.00958418;REVB=-0.000568645;RO=113;SAF=13;SAR=44;SRF=22;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570291;STB=0.532614;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0316203;OID=.;OPOS=1017746;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:113:113:57:57:0.335294:44:13:22:91:44:13:22:91 chr11 1017767 . G C 152.59 PASS AF=0.162162;AO=30;DP=184;FAO=30;FDP=185;FR=.;FRO=155;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=112;FWDB=-0.0140315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.559;QD=3.29932;RBI=0.0190981;REFB=-0.00665946;REVB=-0.0129559;RO=153;SAF=12;SAR=18;SRF=43;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169095;STB=0.611697;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0484816;OID=.;OPOS=1017767;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:185:153:155:30:30:0.162162:18:12:43:110:18:12:43:112 chr11 1017773 . G A 186.56 PASS AF=0.178571;AO=33;DP=195;FAO=35;FDP=196;FR=.;FRO=161;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=58;FSRR=103;FWDB=0.000563348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1283;QD=3.80727;RBI=0.0140802;REFB=-0.0114724;REVB=0.0140689;RO=158;SAF=4;SAR=29;SRF=57;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405798;STB=0.781742;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0563384;OID=.;OPOS=1017773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:158:161:33:35:0.178571:29:4:57:101:31:4:58:103 chr11 1017783 . A G 489.95 PASS AF=0.3125;AO=63;DP=203;FAO=65;FDP=208;FR=.;FRO=143;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=50;FSRR=93;FWDB=-0.00781762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.329;QD=9.42208;RBI=0.0390383;REFB=-0.00860177;REVB=-0.0382475;RO=140;SAF=16;SAR=47;SRF=49;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137705;STB=0.587331;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0153823;OID=.;OPOS=1017783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:208:140:143:63:65:0.3125:47:16:49:91:49:16:50:93 chr11 1017789 . A C 99.65 PASS AF=0.117371;AO=25;DP=211;FAO=25;FDP=213;FR=.;FRO=188;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=62;FSRR=126;FWDB=-0.0129898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.09;QD=1.8713;RBI=0.0316663;REFB=0.000392493;REVB=-0.0288794;RO=183;SAF=9;SAR=16;SRF=60;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445122;STB=0.529389;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=-0.00513355;OID=.;OPOS=1017789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:213:183:188:25:25:0.117371:16:9:60:123:16:9:62:126 chr11 1017793 . T G 104.51 PASS AF=0.119816;AO=27;DP=216;FAO=26;FDP=217;FR=.;FRO=191;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=76;FSRR=115;FWDB=0.00194804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3751;QD=1.9265;RBI=0.0164574;REFB=0.00358288;REVB=-0.0163417;RO=189;SAF=2;SAR=25;SRF=75;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505646;STB=0.870354;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0288958;OID=.;OPOS=1017793;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:217:189:191:27:26:0.119816:25:2:75:114:24:2:76:115 chr11 1017797 . C G 89.9 PASS AF=0.113208;AO=19;DP=208;FAO=24;FDP=212;FR=.;FRO=188;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=75;FSRR=113;FWDB=-0.00876785;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.847;QD=1.69619;RBI=0.0115028;REFB=-0.0075978;REVB=-0.00744577;RO=182;SAF=2;SAR=17;SRF=74;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419644;STB=0.862164;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0580754;OID=.;OPOS=1017797;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:208:212:182:188:19:24:0.113208:17:2:74:108:22:2:75:113 chr11 1017833 . C T 66.56 PASS AF=0.0979381;AO=18;DP=194;FAO=19;FDP=194;FR=.;FRO=175;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=61;FSRR=114;FWDB=-0.0133527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.717;QD=1.3723;RBI=0.0426712;REFB=-0.00756569;REVB=-0.0405282;RO=169;SAF=7;SAR=11;SRF=60;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433084;STB=0.519414;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0584964;OID=.;OPOS=1017833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:194:194:169:175:18:19:0.0979381:11:7:60:109:12:7:61:114 chr11 1017834 . G A 48.93 PASS AF=0.0833333;AO=15;DP=190;FAO=16;FDP=192;FR=.;FRO=176;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=65;FSRR=111;FWDB=-0.0286922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.849;QD=1.0193;RBI=0.02971;REFB=-0.0059959;REVB=0.00770973;RO=175;SAF=3;SAR=12;SRF=64;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218243;STB=0.703537;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0520456;OID=.;OPOS=1017834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:190:192:175:176:15:16:0.0833333:12:3:64:111:13:3:65:111 chr11 1017844 . TC CG,TG 492.32 PASS AF=0.078534,0.267016;AO=14,49;DP=191;FAO=15,51;FDP=191;FR=.;FRO=125;FSAF=6,14;FSAR=9,37;FSRF=55;FSRR=70;FWDB=-0.0267853,-0.0533429;FXX=0.00520806;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=140.016,148.618;QD=10.3103;RBI=0.0279508,0.0549797;REFB=-0.0212051,-0.0359317;REVB=-0.00798736,-0.0133155;RO=120;SAF=5,14;SAR=9,35;SRF=53;SRR=67;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.104691,-0.205587;STB=0.536608,0.630161;STBP=0.778,0.049;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0435042,0.0573695;OID=.,.;OPOS=1017844,1017845;OREF=TC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:191:191:120:125:14,49:15,51:0.078534,0.267016:9,35:5,14:53:67:9,37:6,14:55:70 chr11 1017858 . A G 469.82 PASS AF=0.31;AO=62;DP=201;FAO=62;FDP=200;FR=.;FRO=138;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=62;FSRR=76;FWDB=-0.036728;FXX=0.0147776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.757;QD=9.39645;RBI=0.061021;REFB=-0.0286239;REVB=-0.04873;RO=136;SAF=19;SAR=43;SRF=62;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189589;STB=0.606336;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0706618;OID=.;OPOS=1017858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:136:138:62:62:0.31:43:19:62:74:43:19:62:76 chr11 1017883 . C A 142.91 PASS AF=0.152632;AO=29;DP=189;FAO=29;FDP=190;FR=.;FRO=161;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=73;FSRR=88;FWDB=-0.0312842;FXX=0.0155432;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4899;QD=3.00855;RBI=0.031584;REFB=-0.0134964;REVB=0.00434145;RO=157;SAF=7;SAR=22;SRF=72;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297011;STB=0.695509;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0557221;OID=.;OPOS=1017883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:157:161:29:29:0.152632:22:7:72:85:22:7:73:88 chr11 1017891 . GCAT GCGT,GTGC,TGAT 120.77 PASS AF=0.0380435,0.048913,0.076087;AO=7,9,14;DP=190;FAO=7,9,14;FDP=184;FR=.;FRO=154;FSAF=1,3,3;FSAR=6,6,11;FSRF=65;FSRR=89;FWDB=-0.00391984,-0.00691435,-0.00815395;FXX=0.0315773;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,2;MLLD=119.251,154.747,95.466;QD=2.62548;RBI=0.0700817,0.0624084,0.0790631;REFB=-0.00327813,-0.00376388,-0.0143889;REVB=-0.069972,-0.0620242,-0.0786415;RO=148;SAF=1,3,3;SAR=6,6,11;SRF=61;SRR=87;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.265725,-0.082936,-0.251308;STB=0.805548,0.588542,0.713411;STBP=0.123,0.566,0.112;TYPE=snp,mnp,mnp;VARB=0.0605146,0.039854,0.0634343;OID=.,.,.;OPOS=1017893,1017892,1017891;OREF=A,CAT,GC;OALT=G,TGC,TG;OMAPALT=GCGT,GTGC,TGAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:43:190:184:148:154:7,9,14:7,9,14:0.0380435,0.048913,0.076087:6,6,11:1,3,3:61:87:6,6,11:1,3,3:65:89 chr11 1017899 . A T 38.72 PASS AF=0.0740741;AO=14;DP=189;FAO=14;FDP=189;FR=.;FRO=175;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=73;FSRR=102;FWDB=-0.00970666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.755;QD=0.819514;RBI=0.0302992;REFB=-0.00310861;REVB=-0.0287023;RO=166;SAF=3;SAR=11;SRF=70;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253005;STB=0.711163;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0358325;OID=.;OPOS=1017899;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:189:189:166:175:14:14:0.0740741:11:3:70:96:11:3:73:102 chr11 1017917 . A T 37.96 PASS AF=0.0740741;AO=14;DP=189;FAO=14;FDP=189;FR=.;FRO=175;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=67;FSRR=108;FWDB=-0.045881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.47;QD=0.803441;RBI=0.053502;REFB=-0.00525498;REVB=-0.0275208;RO=174;SAF=3;SAR=11;SRF=67;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21368;STB=0.682944;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0734773;OID=.;OPOS=1017917;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:189:189:174:175:14:14:0.0740741:11:3:67:107:11:3:67:108 chr11 1017921 . C T 60.64 PASS AF=0.0977011;AO=16;DP=183;FAO=17;FDP=174;FR=.;FRO=157;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=60;FSRR=97;FWDB=-0.0606318;FXX=0.0594562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2424;QD=1.39409;RBI=0.0606877;REFB=-0.00740627;REVB=0.00260304;RO=154;SAF=3;SAR=13;SRF=58;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260565;STB=0.725627;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0455327;OID=.;OPOS=1017921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:183:174:154:157:16:17:0.0977011:13:3:58:96:14:3:60:97 chr11 1017935 . A G 222.92 PASS AF=0.231788;AO=35;DP=160;FAO=35;FDP=151;FR=.;FRO=116;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=70;FWDB=-0.046284;FXX=0.0562465;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2949;QD=5.90526;RBI=0.0595059;REFB=-0.0137846;REVB=-0.0373998;RO=116;SAF=7;SAR=28;SRF=46;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295735;STB=0.683755;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0282652;OID=.;OPOS=1017935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:151:116:116:35:35:0.231788:28:7:46:70:28:7:46:70 chr11 1017945 . A G 53.06 PASS AF=0.101449;AO=14;DP=137;FAO=14;FDP=138;FR=.;FRO=124;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=78;FWDB=-0.093889;FXX=0.00719373;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5932;QD=1.53803;RBI=0.118864;REFB=-0.00193886;REVB=-0.0728934;RO=123;SAF=3;SAR=11;SRF=47;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229684;STB=0.66847;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00833195;OID=.;OPOS=1017945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:137:138:123:124:14:14:0.101449:11:3:47:76:11:3:46:78 chr11 1017963 . G A 59.81 PASS AF=0.122642;AO=13;DP=106;FAO=13;FDP=106;FR=.;FRO=93;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=58;FWDB=-0.0231989;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.27;QD=2.25679;RBI=0.0472261;REFB=-0.0060004;REVB=-0.0411354;RO=93;SAF=8;SAR=5;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287047;STB=0.700688;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0608528;OID=.;OPOS=1017963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:106:106:93:93:13:13:0.122642:5:8:35:58:5:8:35:58 chr11 1017968 . T A 67.06 PASS AF=0.145833;AO=13;DP=96;FAO=14;FDP=96;FR=.;FRO=82;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=53;FWDB=-0.0123995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3455;QD=2.79436;RBI=0.0161712;REFB=-0.00264765;REVB=-0.0103807;RO=82;SAF=8;SAR=5;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316783;STB=0.679879;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0262381;OID=.;OPOS=1017968;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:96:96:82:82:13:14:0.145833:5:8:29:53:6:8:29:53 chr11 1017974 . C G 60.9 PASS AF=0.146341;AO=12;DP=82;FAO=12;FDP=82;FR=.;FRO=70;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.052923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.882;QD=2.97081;RBI=0.0624952;REFB=-0.00410619;REVB=-0.0332386;RO=68;SAF=2;SAR=10;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367559;STB=0.770529;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0279731;OID=.;OPOS=1017974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:82:82:68:70:12:12:0.146341:10:2:29:39:10:2:31:39 chr11 1017979 . G A 58.23 PASS AF=0.15493;AO=10;DP=72;FAO=11;FDP=71;FR=.;FRO=60;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0147217;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.923;QD=3.28055;RBI=0.0276695;REFB=-0.0109502;REVB=-0.0234281;RO=60;SAF=2;SAR=8;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350332;STB=0.76652;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0400672;OID=.;OPOS=1017979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:72:71:60:60:10:11:0.15493:8:2:28:32:9:2:28:32 chr11 1017981 . T A 78.78 PASS AF=0.203125;AO=13;DP=65;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0108578;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.851;QD=4.9235;RBI=0.0455782;REFB=-0.00507365;REVB=-0.044266;RO=49;SAF=8;SAR=5;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204579;STB=0.644331;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.031178;OID=.;OPOS=1017981;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:65:64:49:51:13:13:0.203125:5:8:22:27:5:8:22:29 chr11 1017988 . G T 112.16 PASS AF=0.283019;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0162207;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.359;QD=8.46459;RBI=0.026495;REFB=-0.00935468;REVB=0.0209493;RO=38;SAF=1;SAR=14;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.731449;STB=0.939491;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0210097;OID=.;OPOS=1017988;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:38:38:15:15:0.283019:14:1:27:11:14:1:27:11 chr11 1018031 . G A 72.02 PASS AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00396878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.518;QD=8.23076;RBI=0.0229197;REFB=-0.010145;REVB=-0.0225734;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956655;STB=0.542772;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0313033;OID=.;OPOS=1018031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:35:24:25:10:10:0.285714:5:5:10:14:5:5:11:14 chr11 1018295 . T C 54.27 PASS AF=0.32;AO=7;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0123226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.765;QD=8.68247;RBI=0.0243652;REFB=-0.0116027;REVB=-0.0210194;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281128;STB=0.605793;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0209152;OID=.;OPOS=1018295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:7:8:0.32:2:5:8:9:3:5:8:9 chr11 1018374 . T A 157.03 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0159038;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6008;QD=15.3202;RBI=0.0191268;REFB=-0.0164254;REVB=-0.0106257;RO=24;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197608;STB=0.613508;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0146718;OID=.;OPOS=1018374;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:24:24:17:17:0.414634:8:9:8:16:8:9:8:16 chr11 1018456 . G A 59.4 PASS AF=0.172414;AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0254677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.715;QD=4.09689;RBI=0.0330502;REFB=-0.0013823;REVB=-0.0210644;RO=47;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172579;STB=0.620463;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0115449;OID=.;OPOS=1018456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:58:58:47:48:10:10:0.172414:5:5:17:30:5:5:17:31 chr11 1018483 . C G 100.9 PASS AF=0.242857;AO=20;DP=70;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=42;FWDB=-0.0473925;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.0159;QD=5.76583;RBI=0.155177;REFB=-0.054924;REVB=-0.147763;RO=43;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183075;STB=0.704467;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.112291;OID=.;OPOS=1018483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:43:53:20:17:0.242857:12:8:11:32:9:8:11:42 chr11 1018523 . A G 52.26 PASS AF=0.147059;AO=10;DP=68;FAO=10;FDP=68;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=48;FWDB=-0.0753643;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5632;QD=3.0744;RBI=0.104104;REFB=0.000200584;REVB=-0.0718188;RO=58;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341415;STB=0.719674;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.0110989;OID=.;OPOS=1018523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:68:68:58:58:10:10:0.147059:6:4:10:48:6:4:10:48 chr11 1019375 . C T 1589.89 PASS AF=0.990741;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.684;QD=58.8848;RBI=0.0317384;REFB=-0.0699583;REVB=0.0250326;RO=0;SAF=38;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503649;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000281034;OID=.;OPOS=1019375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:108:0:1:106:107:0.990741:68:38:0:0:68:39:0:1 chr11 1027811 . C T 318.84 PASS AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00540383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9712;QD=26.5698;RBI=0.0102456;REFB=-0.0220235;REVB=0.00870469;RO=20;SAF=17;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15732;STB=0.587024;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0172814;OID=.;OPOS=1027811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:11:17:8:12:11:17:8:12 chr11 1078591 . A T 32.39 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0599325;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9037;QD=11.7791;RBI=0.0782955;REFB=-0.0109648;REVB=-0.0503814;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621951;STB=0.538311;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0149419;OID=.;OPOS=1078591;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:2:4:3:2:2:4 chr11 1080576 . G A 239.61 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0261488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.228;QD=18.084;RBI=0.0262532;REFB=-0.00470752;REVB=-0.00233882;RO=27;SAF=17;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195152;STB=0.609779;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00591212;OID=.;OPOS=1080576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:9:17:12:15:9:17:12:15 chr11 1093710 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.452;QD=46.8469;RBI=0.0901975;REFB=0;REVB=0.0863584;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017038;OID=.;OPOS=1093710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr11 1094690 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.01;QD=53.2771;RBI=0.0429434;REFB=0;REVB=0.00764125;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369236;OID=.;OPOS=1094690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:22:1:0:0:22:1:0:0 chr11 1094748 . A AC 277.17 PASS AF=1;AO=8;DP=36;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113663;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9531;QD=35.7634;RBI=0.119804;REFB=-0.0534386;REVB=-0.0378634;RO=28;SAF=0;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.703887;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0198665;OID=.;OPOS=1094749;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:8:36:31:31:0:12:19:0:0:4:28:0:8:11:17 chr11 1094753 . A C 251.22 PASS AF=0.757576;AO=21;DP=30;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0318831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8613;QD=30.4508;RBI=0.0394502;REFB=6.12815e-05;REVB=0.0232333;RO=9;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249999;STB=0.617559;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00433983;OID=.;OPOS=1094753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:33:9:8:21:25:0.757576:12:9:0:9:13:12:0:8 chr11 1096494 . T C 1476.99 PASS AF=0.989474;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0375971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.52;QD=62.1892;RBI=0.0463127;REFB=0.0334623;REVB=0.027043;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.000917198;OID=.;OPOS=1096494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:95:0:1:92:94:0.989474:49:43:0:0:49:45:1:0 chr11 1101649 . T C 708.25 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00753163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1251;QD=62.9556;RBI=0.0239204;REFB=0;REVB=0.0227037;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468861;OID=.;OPOS=1101649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:15:30:0:0:15:30:0:0 chr11 1158073 . T C 1491.68 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00439724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.248;QD=63.4758;RBI=0.0147486;REFB=0;REVB=0.0140778;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00726e-05;OID=.;OPOS=1158073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0 chr11 1161315 . T C,G 455.6 PASS AF=0.9375,0.0625;AO=30,2;DP=32;FAO=30,2;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=22,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227515,-0.011027;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=74.4036,196.989;QD=56.9494;RBI=0.0239866,0.0172635;REFB=0,0;REVB=0.00759782,-0.0132828;RO=0;SAF=8,0;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00442028,0.0620298;OID=.,.;OPOS=1161315,1161315;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:32:32:0:0:30,2:30,2:0.9375,0.0625:22,2:8,0:0:0:22,2:8,0:0:0 chr11 1212877 . A G 169.2 PASS AF=0.242991;AO=26;DP=106;FAO=26;FDP=107;FR=.;FRO=81;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.0160209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.36;QD=6.32535;RBI=0.0325605;REFB=-0.0143045;REVB=-0.0283463;RO=78;SAF=11;SAR=15;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482258;STB=0.525911;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0590977;OID=.;OPOS=1212877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:78:81:26:26:0.242991:15:11:36:42:15:11:37:44 chr11 1212878 . C G 35.93 PASS AF=0.0862069;AO=10;DP=114;FAO=10;FDP=116;FR=.;FRO=106;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=46;FSRR=60;FWDB=0.0147232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.918;QD=1.23903;RBI=0.0221448;REFB=-0.00901011;REVB=-0.0165414;RO=101;SAF=2;SAR=8;SRF=45;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301878;STB=0.737946;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0508537;OID=.;OPOS=1212878;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:114:116:101:106:10:10:0.0862069:8:2:45:56:8:2:46:60 chr11 1212887 . C T 51.27 PASS AF=0.105691;AO=13;DP=123;FAO=13;FDP=123;FR=.;FRO=110;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=66;FWDB=-0.00785042;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.644;QD=1.6674;RBI=0.0289166;REFB=-0.00652442;REVB=-0.0278306;RO=109;SAF=6;SAR=7;SRF=44;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708527;STB=0.555754;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0632337;OID=.;OPOS=1212887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:123:123:109:110:13:13:0.105691:7:6:44:65:7:6:44:66 chr11 1212921 . C T 86.73 PASS AF=0.194805;AO=16;DP=78;FAO=15;FDP=77;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=-0.0135575;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.93;QD=4.50535;RBI=0.0149023;REFB=-0.0041054;REVB=-0.00618646;RO=60;SAF=10;SAR=6;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409808;STB=0.723876;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0173558;OID=.;OPOS=1212921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:78:77:60:62:16:15:0.194805:6:10:17:43:6:9:19:43 chr11 1212954 . C A 105.78 PASS AF=0.283019;AO=14;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0294415;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.185;QD=7.98345;RBI=0.0318555;REFB=-0.0202045;REVB=0.0121644;RO=39;SAF=2;SAR=12;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377045;STB=0.672641;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0473464;OID=.;OPOS=1212954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:39:38:14:15:0.283019:12:2:15:24:12:3:15:23 chr11 1213047 . T C 51.56 PASS AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0886748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.723;QD=5.72905;RBI=0.133489;REFB=-0.0250495;REVB=-0.0997799;RO=27;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348968;STB=0.728477;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0854302;OID=.;OPOS=1213047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:36:36:27:28:8:8:0.222222:7:1:9:18:7:1:9:19 chr11 1213125 . G A 76.26 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0288351;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.84;QD=6.22562;RBI=0.096529;REFB=-0.0287164;REVB=-0.0921216;RO=28;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147251;STB=0.641954;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0535104;OID=.;OPOS=1213125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:50:49:28:38:10:10:0.204082:6:4:8:20:6:4:9:29 chr11 1213131 . T C 32.64 PASS AF=0.106061;AO=7;DP=66;FAO=7;FDP=66;FR=.;FRO=59;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=48;FWDB=-0.0220046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.834;QD=1.97842;RBI=0.0346636;REFB=-0.000526441;REVB=-0.0267837;RO=59;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337923;STB=0.735358;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00570092;OID=.;OPOS=1213131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:66:66:59:59:7:7:0.106061:4:3:11:48:4:3:11:48 chr11 1213135 . C T 39.83 PASS AF=0.121212;AO=9;DP=67;FAO=8;FDP=66;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=47;FWDB=0.0378066;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5898;QD=2.41396;RBI=0.0425942;REFB=-0.0008623;REVB=0.0196195;RO=58;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196637;STB=0.689894;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0070636;OID=.;OPOS=1213135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:67:66:58:58:9:8:0.121212:6:3:12:46:5:3:11:47 chr11 1213174 . A G 83.83 PASS AF=0.202899;AO=14;DP=69;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=48;FWDB=-0.0104595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.224;QD=4.85971;RBI=0.0204925;REFB=-0.0145024;REVB=-0.0176222;RO=52;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218752;STB=0.616585;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0441088;OID=.;OPOS=1213174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:69:69:52:55:14:14:0.202899:11:3:6:46:11:3:7:48 chr11 1213177 . C T 100.77 PASS AF=0.225352;AO=16;DP=71;FAO=16;FDP=71;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=48;FWDB=-0.0161361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.768;QD=5.67704;RBI=0.0374217;REFB=-0.0118361;REVB=-0.0337641;RO=55;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321223;STB=0.690688;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0371229;OID=.;OPOS=1213177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:55:55:16:16:0.225352:11:5:7:48:11:5:7:48 chr11 1213204 . C G 120.27 PASS AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=41;FWDB=0.00609981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.231;QD=6.77552;RBI=0.00635115;REFB=-0.00332623;REVB=-0.00176903;RO=53;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158784;STB=0.595409;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0135793;OID=.;OPOS=1213204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:53:53:18:18:0.253521:12:6:12:41:12:6:12:41 chr11 1246941 . A G 160.52 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0189278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.133;QD=18.3452;RBI=0.0189384;REFB=0.0133425;REVB=-0.000633101;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326321;STB=0.685035;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00994521;OID=.;OPOS=1246941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:11:6:13:5:11:6:13:5 chr11 1247458 . C T 591.71 PASS AF=0.422819;AO=63;DP=149;FAO=63;FDP=149;FR=.;FRO=86;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=59;FWDB=0.0151924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.995;QD=15.8848;RBI=0.020712;REFB=-0.0359108;REVB=0.0140776;RO=82;SAF=32;SAR=31;SRF=27;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181002;STB=0.611561;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0410858;OID=.;OPOS=1247458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:82:86:63:63:0.422819:31:32:27:55:31:32:27:59 chr11 1250488 . C T 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.189;QD=61.0481;RBI=0.0555575;REFB=0;REVB=0.0295166;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193684;OID=.;OPOS=1250488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0 chr11 1252708 . G C 693.57 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00680739;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.316;QD=63.0515;RBI=0.00925137;REFB=0;REVB=0.00626476;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131722;OID=.;OPOS=1252708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr11 1253942 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.542;QD=61.3362;RBI=0.0427775;REFB=0;REVB=0.0182244;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341456;OID=.;OPOS=1253942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:28:12:0:0:28:12:0:0 chr11 1253969 . A G 62.09 PASS AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0193433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.076;QD=7.52631;RBI=0.0201684;REFB=0.00160469;REVB=0.00570967;RO=24;SAF=2;SAR=7;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106465;STB=0.567408;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.00631593;OID=.;OPOS=1253969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:7:2:7:17:7:2:7:17 chr11 1253976 . A G 34.88 PASS AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0780028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.492;QD=4.81087;RBI=0.0820263;REFB=-0.0191582;REVB=-0.0253749;RO=23;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101746;STB=0.567356;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0550255;OID=.;OPOS=1253976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:4:2:6:17:4:2:6:17 chr11 1255773 . C T 1512.61 PASS AF=0.989691;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492281;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.648;QD=62.3758;RBI=0.0519727;REFB=-0.0575375;REVB=0.0166659;RO=1;SAF=52;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903231;STB=0.504761;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000980864;OID=.;OPOS=1255773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:96:97:1:1:95:96:0.989691:43:52:1:0:44:52:1:0 chr11 1258217 . T G 31.91 PASS AF=0.0930233;AO=8;DP=86;FAO=8;FDP=86;FR=.;FRO=78;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=-0.0349534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.425;QD=1.48414;RBI=0.0468968;REFB=-0.00240794;REVB=-0.0312661;RO=78;SAF=5;SAR=3;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28417;STB=0.717737;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0226591;OID=.;OPOS=1258217;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:86:86:78:78:8:8:0.0930233:3:5:29:49:3:5:29:49 chr11 1258226 . C T 31.63 PASS AF=0.091954;AO=8;DP=87;FAO=8;FDP=87;FR=.;FRO=79;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.010836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.439;QD=1.45437;RBI=0.028545;REFB=-0.00214086;REVB=-0.0264083;RO=77;SAF=5;SAR=3;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279375;STB=0.711843;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0122154;OID=.;OPOS=1258226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:87:87:77:79:8:8:0.091954:3:5:29:48:3:5:30:49 chr11 1258240 . CA TG 31.36 PASS AF=0.0909091;AO=8;DP=88;FAO=8;FDP=88;FR=.;FRO=80;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0247181;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.252;QD=1.42547;RBI=0.0293001;REFB=-0.00306753;REVB=-0.0157324;RO=79;SAF=5;SAR=3;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260603;STB=0.706045;STBP=0.264;TYPE=mnp;VARB=0.0481918;OID=.;OPOS=1258240;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:88:88:79:80:8:8:0.0909091:3:5:31:48:3:5:31:49 chr11 1258283 . G A 50.32 PASS AF=0.120879;AO=11;DP=91;FAO=11;FDP=91;FR=.;FRO=80;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0162255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.602;QD=2.21176;RBI=0.0190094;REFB=-0.0045104;REVB=-0.00990407;RO=80;SAF=5;SAR=6;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835386;STB=0.559975;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0337518;OID=.;OPOS=1258283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:91:91:80:80:11:11:0.120879:6:5:31:49:6:5:31:49 chr11 1258286 . C T 43.9 PASS AF=0.11236;AO=10;DP=89;FAO=10;FDP=89;FR=.;FRO=79;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.00734995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.332;QD=1.97303;RBI=0.0297246;REFB=-0.00753713;REVB=-0.0288016;RO=79;SAF=5;SAR=5;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130132;STB=0.595322;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0466249;OID=.;OPOS=1258286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:89:89:79:79:10:10:0.11236:5:5:31:48:5:5:31:48 chr11 1258295 . A G 40.4 PASS AF=0.113924;AO=9;DP=79;FAO=9;FDP=79;FR=.;FRO=70;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=-0.026836;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.645;QD=2.04541;RBI=0.0284055;REFB=-0.0058265;REVB=0.00931147;RO=68;SAF=3;SAR=6;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134024;STB=0.589082;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0568048;OID=.;OPOS=1258295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:79:79:68:70:9:9:0.113924:6:3:30:38:6:3:30:40 chr11 1264823 . T C 160.25 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.778;QD=45.7864;RBI=0.133906;REFB=0;REVB=0.00214371;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044063;OID=.;OPOS=1264823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:14:0:0:12:14:1:12:0:0:0:12:2:0:0 chr11 1267562 . C T 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00243547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.717;QD=26.0262;RBI=0.0233231;REFB=-0.00194369;REVB=0.0231956;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281147;STB=0.666027;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.000229379;OID=.;OPOS=1267562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:5:1:1:0:5:1:1:0 chr11 1268513 . G C 272.53 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.874;QD=51.9096;RBI=0.079291;REFB=0;REVB=0.00806451;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421225;OID=.;OPOS=1268513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:14:6:0:0:14:7:0:0 chr11 1268608 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.332;QD=39.2068;RBI=0.162006;REFB=0;REVB=-0.00669249;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158213;OID=.;OPOS=1268608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr11 1269627 . C T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.875;QD=40.7628;RBI=0.0309992;REFB=0;REVB=0.0149359;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521131;OID=.;OPOS=1269627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0 chr11 1269672 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1768;QD=33.4283;RBI=0.0152474;REFB=0;REVB=-0.0152474;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0014853;OID=.;OPOS=1269672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr11 1272226 . A C 192.0 PASS AF=1;AO=12;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.01;QD=47.9993;RBI=0.105934;REFB=0;REVB=0.00139599;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00337861;OID=.;OPOS=1272226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:16:0:0:12:16:1:11:1:0:0:11:5:0:0 chr11 1272258 . C T 103.53 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0285547;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1538;QD=18.8233;RBI=0.0363295;REFB=-0.0635941;REVB=-0.0224603;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125598;STB=0.571317;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0321456;OID=.;OPOS=1272258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:8:4:2:8:8:4:2:8 chr11 1272858 . C T 374.98 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00726252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.475;QD=55.5521;RBI=0.0104365;REFB=0;REVB=0.00749508;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93239e-05;OID=.;OPOS=1272858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr11 1482851 . T C 47.65 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.085951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9184;QD=11.9123;RBI=0.0987074;REFB=-0.0265635;REVB=0.0485342;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150213;STB=0.509065;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0221117;OID=.;OPOS=1482851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:4:3:4:5:4:3:4:5 chr11 1491096 . G A 34.73 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00615799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.337;QD=5.55696;RBI=0.0280789;REFB=-0.00832117;REVB=-0.0273954;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167553;STB=0.610731;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0389304;OID=.;OPOS=1491096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:9:10:4:2:9:10 chr11 1501670 . G C 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3925;QD=57.0005;RBI=0.0111034;REFB=0;REVB=-0.00148227;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118259;OID=.;OPOS=1501670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr11 1502097 . A G 1246.11 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00509503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.059;QD=61.5363;RBI=0.00533569;REFB=0;REVB=0.00158435;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.665e-06;OID=.;OPOS=1502097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:47:34:0:0:47:34:0:0 chr11 1507731 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.674;QD=51.9167;RBI=0.0124875;REFB=0;REVB=0.00448064;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57269e-05;OID=.;OPOS=1507731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr11 1576079 . C T 1498.31 PASS AF=1;AO=93;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036142;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.367;QD=63.7579;RBI=0.0268888;REFB=0;REVB=0.0266448;RO=0;SAF=89;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127692;OID=.;OPOS=1576079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:93:94:1:4:89:0:0:4:90:0:0 chr11 1576137 . C T 1385.63 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3882;QD=62.2754;RBI=0.0463894;REFB=0;REVB=0.0458777;RO=0;SAF=72;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.17255e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000781654;OID=.;OPOS=1576137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:89:0:0:86:89:1:14:72:0:0:14:75:0:0 chr11 1628965 . G A 446.22 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.303;QD=57.5772;RBI=0.0757017;REFB=0;REVB=0.0195047;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262633;OID=.;OPOS=1628965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr11 1628991 . AGC A,AAC,AC,GAC 236.56 PASS AF=0.0526316,0.631579,0.157895,0.157895;AO=2,14,2,2;DP=20;FAO=1,12,3,3;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,3,3,1;FSAR=0,9,0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122514,0.0848329,0.118457,0.162807;FXX=0.049975;HRUN=1,1,1,1;LEN=2,1,1,2;MLLD=72.3534,92.0648,87.8917,43.5658;QD=49.8012;RBI=0.123089,0.0850041,0.121011,0.163538;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0118911,0.00539181,0.02473,0.0154503;RO=0;SAF=2,5,2,0;SAR=0,9,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,snp,del,mnp;VARB=0.0670935,-0.0171707,0.0431048,0.035594;OID=.,.,.,.;OPOS=1628992,1628992,1628992,1628991;OREF=GC,G,G,AG;OALT=-,A,-,GA;OMAPALT=A,AAC,AC,GAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:15:20:19:0:0:2,14,2,2:1,12,3,3:0.0526316,0.631579,0.157895,0.157895:0,9,0,2:2,5,2,0:0:0:0,9,0,2:1,3,3,1:0:0 chr11 1651540 . C G 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.115044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.034;QD=16.199;RBI=0.123701;REFB=-0.0663108;REVB=0.0454615;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0364539;OID=.;OPOS=1651540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:1:2:1:4:1:2 chr11 1651550 . C T 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000283206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.607;QD=19.1341;RBI=0.0340227;REFB=0.0337641;REVB=-0.0340215;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.00707998;OID=.;OPOS=1651550;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:1:2:5:5:0.714286:2:3:0:1:2:3:1:1 chr11 1651830 . G T 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0404121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.63;QD=14.6495;RBI=0.0579297;REFB=-0.0152594;REVB=0.0415056;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299292;STB=0.672041;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0565086;OID=.;OPOS=1651830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:14:5:8:6:14:5 chr11 1651917 . C T 142.61 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0313895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0558;QD=14.2613;RBI=0.0751741;REFB=0.00642161;REVB=0.068307;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243225;STB=0.642666;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.00520667;OID=.;OPOS=1651917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:12:4:11:13:12:4:11:13 chr11 1652021 . C A 112.21 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00359482;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.432;QD=16.6232;RBI=0.0175408;REFB=-0.0336173;REVB=-0.0171685;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106228;STB=0.561308;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0328742;OID=.;OPOS=1652021;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:7:7:8:5:7:7 chr11 1652103 . G C 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0105949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.72;QD=16.9317;RBI=0.0464392;REFB=-0.0281439;REVB=0.0452145;RO=12;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784743;STB=0.545377;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0236548;OID=.;OPOS=1652103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:4:8:7:5:4:8:7:5 chr11 1853107 . C T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7031;QD=44.6896;RBI=0.0161795;REFB=0;REVB=0.0058265;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487239;OID=.;OPOS=1853107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr11 1855854 . G C 1664.43 PASS AF=0.877698;AO=113;DP=131;FAO=122;FDP=139;FR=.;FRO=17;FSAF=31;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0343459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.041;QD=47.8971;RBI=0.0840311;REFB=-0.128414;REVB=0.0766915;RO=6;SAF=29;SAR=84;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113378;STB=0.542707;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00451646;OID=.;OPOS=1855854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:131:139:6:17:113:122:0.877698:84:29:1:5:91:31:0:17 chr11 1857173 . T C 727.79 PASS AF=1;AO=37;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.797;QD=63.2861;RBI=0.10563;REFB=0;REVB=0.00904848;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.19892e-05;OID=.;OPOS=1857173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:37:46:1:22:15:0:0:25:21:0:0 chr11 1857747 . T C 349.25 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0265774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2322;QD=20.2461;RBI=0.0435251;REFB=-0.00315084;REVB=-0.0344684;RO=33;SAF=26;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299155;STB=0.66657;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00314977;OID=.;OPOS=1857747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:10:26:13:20:10:26:13:20 chr11 1857751 . C G 361.01 PASS AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0281369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8285;QD=20.3386;RBI=0.0289921;REFB=-0.0106046;REVB=-0.00698964;RO=34;SAF=26;SAR=11;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287286;STB=0.659705;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00997629;OID=.;OPOS=1857751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:11:26:13:21:11:26:13:21 chr11 1858262 . C T 43.61 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00333379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.411;QD=6.01528;RBI=0.0037851;REFB=-0.00533432;REVB=0.00179244;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187877;STB=0.621021;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0173903;OID=.;OPOS=1858262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:3:4:9:13:3:4:9:13 chr11 1858572 . C T 74.27 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0778692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5636;QD=22.8532;RBI=0.0860104;REFB=-0.0363893;REVB=-0.0365262;RO=4;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212429;STB=0.512168;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.063299;OID=.;OPOS=1858572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:2:7:3:1:2:7:3:1 chr11 1861760 . T C 769.48 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.853;QD=56.9988;RBI=0.0413454;REFB=0;REVB=0.0409021;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123446;OID=.;OPOS=1861760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0 chr11 1874404 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.839;QD=53.9112;RBI=0.0681051;REFB=0;REVB=0.0438118;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366012;OID=.;OPOS=1874404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0 chr11 1887806 . T A,C 491.31 PASS AF=0.941176,0.0588235;AO=32,2;DP=34;FAO=32,2;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=18,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347369,0.022757;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.21,119.607;QD=57.8012;RBI=0.0364661,0.0245313;REFB=0,0;REVB=0.0110962,-0.0091599;RO=0;SAF=14,0;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00222497,0.027832;OID=.,.;OPOS=1887806,1887806;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:34:34:0:0:32,2:32,2:0.941176,0.0588235:18,2:14,0:0:0:18,2:14,0:0:0 chr11 1890990 . G A 651.14 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.794;QD=62.0135;RBI=0.0565389;REFB=0;REVB=0.0369107;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336431;OID=.;OPOS=1890990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr11 1891722 . C T 426.8 PASS AF=0.864865;AO=31;DP=36;FAO=32;FDP=37;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00784032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4512;QD=46.1404;RBI=0.011044;REFB=-0.0561914;REVB=0.00777814;RO=4;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132569;STB=0.553997;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0123581;OID=.;OPOS=1891722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:36:37:4:5:31:32:0.864865:12:19:0:4:13:19:1:4 chr11 1902768 . G A 1818.27 PASS AF=0.991803;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0445902;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.51;QD=59.6154;RBI=0.074189;REFB=-0.0900688;REVB=0.0592936;RO=1;SAF=48;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979297;STB=0.505154;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000432267;OID=.;OPOS=1902768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:122:122:1:1:120:121:0.991803:72:48:1:0:73:48:1:0 chr11 1910707 . T C 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.98;QD=35.5719;RBI=0.0548173;REFB=0;REVB=0.0526348;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413395;OID=.;OPOS=1910707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0 chr11 1911115 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5651;QD=40.7629;RBI=0.0109186;REFB=0;REVB=0.00396958;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000854188;OID=.;OPOS=1911115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0 chr11 1959707 . C T 282.02 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0327044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.518;QD=14.6505;RBI=0.0461971;REFB=-0.0239467;REVB=0.0326281;RO=44;SAF=16;SAR=16;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139747;STB=0.571385;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0260401;OID=.;OPOS=1959707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:45:32:32:0.415584:16:16:28:16:16:16:28:17 chr11 1974029 . G A 285.99 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00262073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.489;QD=21.9989;RBI=0.0366971;REFB=-0.0220998;REVB=0.0366034;RO=23;SAF=10;SAR=19;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.002644;STB=0.501465;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0170639;OID=.;OPOS=1974029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:19:10:8:15:19:10:8:15 chr11 1977552 . G A 312.97 PASS AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0104827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.148;QD=21.9626;RBI=0.0168731;REFB=-0.0443354;REVB=-0.0132217;RO=25;SAF=18;SAR=14;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973538;STB=0.553812;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0280345;OID=.;OPOS=1977552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:25:25:32:32:0.561404:14:18:11:14:14:18:11:14 chr11 1993823 . AG A 68.71 PASS AF=0.439024;AO=16;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0231591;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9166;QD=6.70301;RBI=0.0836318;REFB=-0.0279976;REVB=-0.0803613;RO=22;SAF=1;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.646296;STB=0.897559;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0225423;OID=.;OPOS=1993824;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.439024:16:41:18:41:23:1:17:13:10:68:22:1:15:12:10 chr11 1993975 . C A 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.278;QD=57.2362;RBI=0.0577345;REFB=0;REVB=0.035099;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378059;OID=.;OPOS=1993975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr11 2016619 . A G 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0281811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.096;QD=13.2053;RBI=0.110883;REFB=-0.0518488;REVB=-0.107242;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345446;STB=0.713468;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0229639;OID=.;OPOS=2016619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:3:3:1:5:3:3 chr11 2016659 . T C 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0188891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.475;QD=12.3961;RBI=0.0458869;REFB=-0.00450198;REVB=-0.0418188;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363118;STB=0.726279;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.000733289;OID=.;OPOS=2016659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:1:4:2:3:1:4:2:3 chr11 2016662 . T C 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0439387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.424;QD=14.044;RBI=0.0979868;REFB=-0.0419265;REVB=-0.0875832;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425125;STB=0.760793;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0100445;OID=.;OPOS=2016662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:1:4:1:3:1:4:1:3 chr11 2016908 . G A 105.14 PASS AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00519764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.785;QD=32.3518;RBI=0.0747553;REFB=0.0296438;REVB=0.0745744;RO=2;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128043;STB=0.571303;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.000613681;OID=.;OPOS=2016908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:5:6:2:0:5:6:2:0 chr11 2017017 . A C 188.67 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.000692235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3057;QD=20.9634;RBI=0.0757689;REFB=0.0160684;REVB=-0.0757658;RO=17;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198665;STB=0.612668;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.0123196;OID=.;OPOS=2017017;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:5:14:9:8:5:14:9:8 chr11 2017110 . C G 605.05 PASS AF=0.550459;AO=60;DP=109;FAO=60;FDP=109;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.00678171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1384;QD=22.2037;RBI=0.00730758;REFB=-0.0203724;REVB=-0.00272196;RO=48;SAF=25;SAR=35;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527284;STB=0.532581;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0144673;OID=.;OPOS=2017110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:48:49:60:60:0.550459:35:25:17:31:35:25:17:32 chr11 2017439 . C G 271.12 PASS AF=0.47619;AO=29;DP=62;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.000165564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.138;QD=17.2138;RBI=0.00319304;REFB=-0.0113098;REVB=-0.00318875;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864879;STB=0.564313;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0112749;OID=.;OPOS=2017439;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:32:33:29:30:0.47619:18:11:15:17:19:11:16:17 chr11 2018336 . A T 331.29 PASS AF=0.381443;AO=37;DP=97;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=0.0250198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.684;QD=13.6612;RBI=0.0270397;REFB=-0.0209375;REVB=-0.0102547;RO=58;SAF=25;SAR=12;SRF=43;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834688;STB=0.529511;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0272304;OID=.;OPOS=2018336;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:58:60:37:37:0.381443:12:25:43:15:12:25:43:17 chr11 2018449 . A G 90.89 PASS AF=0.423077;AO=10;DP=27;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0146222;FXX=0.0714031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.807;QD=13.9827;RBI=0.0152779;REFB=-0.00422765;REVB=-0.00442778;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.481956;STB=0.817603;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00336081;OID=.;OPOS=2018449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:27:26:13:15:10:11:0.423077:2:8:4:9:2:9:4:11 chr11 2018853 . G A 692.12 PASS AF=0.519084;AO=68;DP=131;FAO=68;FDP=131;FR=.;FRO=63;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.00850645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.359;QD=21.1335;RBI=0.0318676;REFB=-0.0410097;REVB=0.0307113;RO=59;SAF=43;SAR=25;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799453;STB=0.530981;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0340204;OID=.;OPOS=2018853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:59:63:68:68:0.519084:25:43:32:27:25:43:36:27 chr11 2167543 . T G 69.85 PASS AF=0.529412;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00415489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.687;QD=16.4346;RBI=0.00439085;REFB=-0.003116;REVB=-0.00142001;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23873;STB=0.65587;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0036341;OID=.;OPOS=2167543;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:8:9:0.529412:2:6:4:4:2:7:4:4 chr11 2167618 . A G 87.78 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00183877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3813;QD=13.5042;RBI=0.0396951;REFB=-0.0397941;REVB=-0.0396525;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206119;STB=0.620478;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0584531;OID=.;OPOS=2167618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:5:6:5:10:5:6:5:10 chr11 2168375 . G T 140.17 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0100458;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=143.04;QD=20.7651;RBI=0.0318313;REFB=-0.0242026;REVB=0.0302046;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261199;STB=0.624232;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0121497;OID=.;OPOS=2168375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:26:27:11:12:15:15:0.555556:7:8:2:9:7:8:3:9 chr11 2169014 . A G 95.02 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0530899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7342;QD=22.3571;RBI=0.0636335;REFB=-0.0218166;REVB=-0.0350811;RO=5;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298303;STB=0.651862;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0227924;OID=.;OPOS=2169014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:5:6:11:11:0.647059:9:2:3:2:9:2:3:3 chr11 2190951 . C T 214.67 PASS AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.105409;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6532;QD=20.4447;RBI=0.10779;REFB=-0.000220876;REVB=0.0225297;RO=21;SAF=3;SAR=18;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210558;STB=0.620559;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0027901;OID=.;OPOS=2190951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:21:21:21:21:0.5:18:3:6:15:18:3:6:15 chr11 2291715 . G T 44.01 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0249907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5826;QD=6.51991;RBI=0.0415447;REFB=-0.0221997;REVB=-0.0331877;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222717;STB=0.637355;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0343397;OID=.;OPOS=2291715;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:2:5:17:3:2:5:17:3 chr11 2291982 . T A 208.28 PASS AF=0.525;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0165365;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7951;QD=20.8281;RBI=0.0287175;REFB=-0.0545201;REVB=0.0234785;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123879;STB=0.589395;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0179403;OID=.;OPOS=2291982;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:19:20:21:0.525:13:7:4:14:13:8:4:15 chr11 2337218 . G A 147.15 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00752249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.678;QD=17.3122;RBI=0.014792;REFB=-0.042514;REVB=0.0127364;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154651;STB=0.588128;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0153964;OID=.;OPOS=2337218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:8:8:12:6:8:8:12:6 chr11 2337693 . G A 187.39 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00773385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.414;QD=14.6975;RBI=0.0124727;REFB=-0.00767109;REVB=0.00978554;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300506;STB=0.517225;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00990646;OID=.;OPOS=2337693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:12:9:12:18:12:9:12:18 chr11 2343016 . C T 135.88 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.045333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4739;QD=17.5322;RBI=0.047048;REFB=-0.0017031;REVB=-0.0125867;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236024;STB=0.513496;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00283959;OID=.;OPOS=2343016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:6:10:9:6:6:10 chr11 2416198 . C T 329.22 PASS AF=0.423529;AO=33;DP=82;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0540429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8547;QD=15.4928;RBI=0.0614845;REFB=-0.0159758;REVB=0.0293208;RO=49;SAF=21;SAR=12;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136802;STB=0.559538;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0231737;OID=.;OPOS=2416198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:85:49:49:33:36:0.423529:12:21:25:24:14:22:25:24 chr11 2424541 . C G 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0137477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.96;QD=17.4015;RBI=0.0277308;REFB=-0.0174042;REVB=-0.0240831;RO=13;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884388;STB=0.551099;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.013341;OID=.;OPOS=2424541;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:10:3:4:9:10:3:4:9 chr11 2424684 . A C 754.42 PASS AF=1;AO=34;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.435;QD=56.9373;RBI=0.132305;REFB=0;REVB=0.125518;RO=0;SAF=28;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73777e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011595;OID=.;OPOS=2424684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:34:53:1:6:28:0:0:19:34:0:0 chr11 2427291 . A C 256.57 PASS AF=0.509091;AO=21;DP=58;FAO=28;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0380408;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.0988;QD=18.6596;RBI=0.0688088;REFB=-0.0475042;REVB=-0.0573371;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104963;STB=0.586898;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0230925;OID=.;OPOS=2427291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:55:25:27:21:28:0.509091:14:7:6:19:16:12:7:20 chr11 2432964 . T C 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00263316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.223;QD=10.2403;RBI=0.0282962;REFB=-0.00720516;REVB=-0.0281734;RO=19;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480245;STB=0.801238;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00980141;OID=.;OPOS=2432964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:1:9:11:8:1:9:11:8 chr11 2435956 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.877;QD=33.4285;RBI=0.0368758;REFB=0;REVB=0.0271181;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04951e-05;OID=.;OPOS=2435956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr11 2439542 . A G 769.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.192;QD=56.9943;RBI=0.0214789;REFB=0;REVB=0.000840852;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.20265e-05;OID=.;OPOS=2439542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:30:24:0:0 chr11 2439767 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00842306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.173;QD=55.0987;RBI=0.0233791;REFB=0;REVB=0.021809;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.71417e-05;OID=.;OPOS=2439767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr11 2870108 . A G 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.204;QD=58.5998;RBI=0.0310104;REFB=0;REVB=0.00503888;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.97421e-05;OID=.;OPOS=2870108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0 chr11 2920666 . C T 630.79 PASS AF=0.525;AO=63;DP=120;FAO=63;FDP=120;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00543065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6491;QD=21.0262;RBI=0.0116224;REFB=-0.011524;REVB=0.0102756;RO=57;SAF=27;SAR=36;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699293;STB=0.538449;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0180735;OID=.;OPOS=2920666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:57:57:63:63:0.525:36:27:29:28:36:27:29:28 chr11 2924610 . G A 862.7 PASS AF=0.968254;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0689396;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.21;QD=54.7744;RBI=0.0693283;REFB=-0.0405556;REVB=-0.00733116;RO=2;SAF=25;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362693;STB=0.519224;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000371642;OID=.;OPOS=2924610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:64:63:2:2:61:61:0.968254:36:25:2:0:36:25:2:0 chr11 2929552 . A G 508.0 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0720745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.706;QD=58.0572;RBI=0.0721596;REFB=0;REVB=0.00350338;RO=0;SAF=6;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.07945e-05;OID=.;OPOS=2929552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:27:6:0:0:27:8:0:0 chr11 2943671 . G C 1070.83 PASS AF=0.548913;AO=101;DP=184;FAO=101;FDP=184;FR=.;FRO=83;FSAF=57;FSAR=44;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=-0.00690499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.177;QD=23.279;RBI=0.00970656;REFB=-0.0348776;REVB=-0.0068219;RO=81;SAF=57;SAR=44;SRF=49;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338748;STB=0.51753;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0261485;OID=.;OPOS=2943671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:81:83:101:101:0.548913:44:57:49:32:44:57:50:33 chr11 2999507 . G T 246.99 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0100257;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.444;QD=19.3714;RBI=0.0101569;REFB=-0.0276417;REVB=-0.00162719;RO=24;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14349;STB=0.58817;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0219249;OID=.;OPOS=2999507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:24:25:26:26:0.509804:13:13:16:8:13:13:17:8 chr11 3026622 . A G 75.2 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0108728;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4228;QD=10.0272;RBI=0.0385767;REFB=-0.00561127;REVB=-0.0370128;RO=20;SAF=3;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32941;STB=0.6996;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.018829;OID=.;OPOS=3026622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:31:30:20:20:10:10:0.333333:7:3:12:8:7:3:12:8 chr11 3028140 . G A 86.55 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0171595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.676;QD=12.3648;RBI=0.0317575;REFB=-0.00486965;REVB=-0.0267225;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185652;STB=0.632838;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.010894;OID=.;OPOS=3028140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:28:16:17:11:11:0.392857:3:8:9:7:3:8:9:8 chr11 3061780 . C T 374.84 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0117264;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9035;QD=23.0671;RBI=0.0189715;REFB=0.0161559;REVB=0.0149134;RO=28;SAF=20;SAR=17;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318208;STB=0.51752;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.0194949;OID=.;OPOS=3061780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:28:28:37:37:0.569231:17:20:14:14:17:20:14:14 chr11 3109403 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000497396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.477;QD=48.7373;RBI=0.0360559;REFB=0;REVB=0.0360524;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129662;OID=.;OPOS=3109403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr11 3109408 . C T 217.34 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.545;QD=45.7564;RBI=0.0765691;REFB=-0.160813;REVB=0.0727862;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184031;OID=.;OPOS=3109408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:19:19:0:0:18:19:1:5:13:0:0:6:13:0:0 chr11 3243346 . C T 130.44 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00322007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5837;QD=43.4795;RBI=0.0558967;REFB=0;REVB=0.0558039;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00305243;OID=.;OPOS=3243346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr11 3243367 . G T 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.239;QD=39.2068;RBI=0.0137312;REFB=0;REVB=-0.0076324;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155561;OID=.;OPOS=3243367;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr11 3243427 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8316;QD=47.8221;RBI=0.0634154;REFB=0;REVB=-0.054642;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000656874;OID=.;OPOS=3243427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr11 3243638 . A G 721.45 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.247;QD=61.4003;RBI=0.0608267;REFB=-0.0266285;REVB=0.0107751;RO=1;SAF=12;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03755;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118079;OID=.;OPOS=3243638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:46:47:1:0:45:47:1:33:12:1:0:34:13:0:0 chr11 3243665 . C T 695.76 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330336;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8594;QD=63.251;RBI=0.0377341;REFB=0;REVB=0.0182386;RO=0;SAF=7;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9155e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272748;OID=.;OPOS=3243665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:37:7:0:0:37:7:0:0 chr11 3243673 . G C 759.66 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0981;QD=62.0129;RBI=0.222713;REFB=0;REVB=0.00337835;RO=1;SAF=8;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551974;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00320413;OID=.;OPOS=3243673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:1:0:47:49:1:39:8:1:0:39:10:0:0 chr11 3243908 . TGG GTA,TAG 265.3 PASS AF=0.047619,0.952381;AO=2,15;DP=21;FAO=1,20;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139544,-0.0144277;FXX=0;HRUN=1,6;LEN=3,1;MLLD=37.0467,65.8775;QD=50.5341;RBI=0.0845787,0.0238574;REFB=0,0;REVB=-0.0834196,-0.0190005;RO=0;SAF=0,8;SAR=2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0892761,-0.0054196;OID=.,.;OPOS=3243908,3243909;OREF=TGG,G;OALT=GTA,A;OMAPALT=GTA,TAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:21:21:0:0:2,15:1,20:0.047619,0.952381:2,7:0,8:0:0:1,10:0,10:0:0 chr11 3244005 . TC T 778.91 PASS AF=1;AO=64;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844332;FXX=0.0144907;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.654;QD=45.8181;RBI=0.132476;REFB=0;REVB=-0.102083;RO=1;SAF=35;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133044;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000232556;OID=.;OPOS=3244006;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:64:68:68:68:0:36:32:0:0:14:1:35:29:1:0 chr11 3249552 . C T 106.9 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0322301;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.418;QD=20.3618;RBI=0.03225;REFB=-0.0219458;REVB=0.00113189;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416756;STB=0.52377;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0122022;OID=.;OPOS=3249552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:22:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:5:4:6:6:5:4 chr11 3249984 . C T 182.07 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0094011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.437;QD=16.9371;RBI=0.0451316;REFB=-0.0114695;REVB=-0.0441416;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777901;STB=0.544507;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0158099;OID=.;OPOS=3249984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:8:11:12:12:8:11:12:12 chr11 3361087 . T C 93.81 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00402305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.132;QD=10.1415;RBI=0.0043443;REFB=0.00308244;REVB=-0.0016395;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186435;STB=0.621431;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.0152014;OID=.;OPOS=3361087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:37:24:25:12:12:0.324324:6:6:8:16:6:6:8:17 chr11 3381369 . G C 314.35 PASS AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00550563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.251;QD=17.2246;RBI=0.00553914;REFB=-0.0187657;REVB=-0.000608369;RO=39;SAF=21;SAR=13;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781175;STB=0.543833;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0241111;OID=.;OPOS=3381369;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:39:39:34:34:0.465753:13:21:21:18:13:21:21:18 chr11 3400237 . G T 920.38 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051782;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.056;QD=58.4366;RBI=0.0578574;REFB=0;REVB=0.0258089;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92751e-05;OID=.;OPOS=3400237;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0 chr11 3436492 . A G 272.51 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0650723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7058;QD=51.9059;RBI=0.0784884;REFB=0;REVB=0.0438864;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000408931;OID=.;OPOS=3436492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0 chr11 3660295 . C T 61.38 PASS AF=0.615385;AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.041585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.391;QD=18.8864;RBI=0.0426059;REFB=-0.00386608;REVB=0.00927095;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775494;STB=0.574292;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00792707;OID=.;OPOS=3660295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:13:5:5:7:8:0.615385:2:5:4:1:3:5:4:1 chr11 3661140 . T C 575.12 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.279;QD=60.5389;RBI=0.0426706;REFB=0;REVB=0.0331634;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115751;OID=.;OPOS=3661140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:38:0:0:35:38:1:17:18:0:0:20:18:0:0 chr11 3661585 . A ATGG,G 240.06 PASS AF=0.909091,0;AO=18,2;DP=22;FAO=20,0;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=9,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.02078,-0.0324782;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=168.686,157.014;QD=43.6464;RBI=0.0217925,0.0327897;REFB=-0.0305935,0.0116969;REVB=-0.00656543,-0.00450933;RO=2;SAF=8,1;SAR=10,1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0833329,0.390188;STB=0.541626,0.5;STBP=0.307,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00353023,0;OID=.,.;OPOS=3661586,3661585;OREF=-,A;OALT=TGG,G;OMAPALT=ATGG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:2:2:18,2:20,0:0.909091,0:10,1:8,1:0:2:11,0:9,0:0:2 chr11 3681063 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0222057;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.581;QD=14.0966;RBI=0.0222758;REFB=-0.0198358;REVB=0.00176555;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164026;STB=0.594883;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0125498;OID=.;OPOS=3681063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:7:4:3:11:7:4:3:11 chr11 3681115 . A G 163.7 PASS AF=0.53125;AO=18;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0204418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.336;QD=20.4629;RBI=0.0252411;REFB=-0.00412782;REVB=-0.014807;RO=14;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435261;STB=0.501843;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135177;OID=.;OPOS=3681115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:15:18:17:0.53125:10:8:7:7:9:8:7:8 chr11 3681519 . T C 465.06 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.084;QD=58.1324;RBI=0.0417047;REFB=0;REVB=-0.0281213;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06296e-06;OID=.;OPOS=3681519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:16:16:0:0 chr11 3686429 . A G 248.61 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.00347165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.898;QD=25.4981;RBI=0.00835193;REFB=0.00195374;REVB=-0.00759621;RO=15;SAF=7;SAR=16;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392973;STB=0.706224;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00281407;OID=.;OPOS=3686429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:16:23:23:0.589744:16:7:13:2:16:7:13:3 chr11 3688814 . T C 173.69 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.000402912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.501;QD=19.2992;RBI=0.0456096;REFB=-0.0136738;REVB=-0.0456078;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248975;STB=0.64135;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0144305;OID=.;OPOS=3688814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:6:12:7:11:6:12:7:11 chr11 3692643 . G T 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.000358208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.304;QD=19.0177;RBI=0.0370175;REFB=-0.00951461;REVB=-0.0370158;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149262;STB=0.585249;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.008856;OID=.;OPOS=3692643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:10:5:7:7:10:5:7:7 chr11 3714489 . C T 309.83 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00242992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4304;QD=18.7777;RBI=0.00937614;REFB=-0.0274377;REVB=0.0090558;RO=33;SAF=27;SAR=6;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123875;STB=0.569575;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0316286;OID=.;OPOS=3714489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:6:27:24:9:6:27:24:9 chr11 3838910 . G C 130.46 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.728;QD=43.486;RBI=0.0778933;REFB=0;REVB=0.05573;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00266533;OID=.;OPOS=3838910;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:5:6:0:0:6:6:0:0 chr11 3838953 . T C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.088;QD=39.2068;RBI=0.0590697;REFB=0;REVB=0.0525873;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073225;OID=.;OPOS=3838953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr11 4148453 . C T 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00755034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.38;QD=16.7315;RBI=0.0131638;REFB=-0.00589216;REVB=-0.0107832;RO=36;SAF=13;SAR=18;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300852;STB=0.516888;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00600056;OID=.;OPOS=4148453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:18:13:14:22:18:13:14:22 chr11 4159466 . G A 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.615;QD=63.2867;RBI=0.0431173;REFB=0;REVB=0.00336566;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179291;OID=.;OPOS=4159466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0 chr11 4389404 . AG A 131.72 PASS AF=0.362319;AO=24;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0576286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.6078;QD=7.63614;RBI=0.0999228;REFB=0.00315539;REVB=0.0816303;RO=44;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171795;STB=0.584709;STBP=0.328;TYPE=del;VARB=-0.0031386;OID=.;OPOS=4389405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.362319:24:69:25:69:44:13:12:17:27:99:44:13:11:17:27 chr11 4411241 . C T 570.19 PASS AF=0.517857;AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0513265;FXX=0.0175423;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2843;QD=20.3638;RBI=0.058758;REFB=0.000609605;REVB=0.0286023;RO=56;SAF=36;SAR=22;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946444;STB=0.541946;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.000251713;OID=.;OPOS=4411241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:56:54:58:58:0.517857:22:36:29:27:22:36:29:25 chr11 4510285 . A G 572.52 PASS AF=0.458015;AO=57;DP=129;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.0283078;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.001;QD=17.4814;RBI=0.0369041;REFB=-0.0263397;REVB=0.0236765;RO=64;SAF=24;SAR=33;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908437;STB=0.553758;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0280131;OID=.;OPOS=4510285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:64:71:57:60:0.458015:33:24:33:31:33:27:39:32 chr11 4510587 . C T 107.43 PASS AF=0.272727;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0132734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.507;QD=7.81326;RBI=0.0225768;REFB=-0.0163054;REVB=-0.0182628;RO=39;SAF=7;SAR=8;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244031;STB=0.524239;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0371065;OID=.;OPOS=4510587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:39:40:15:15:0.272727:8:7:19:20:8:7:20:20 chr11 4566711 . C T 615.12 PASS AF=0.447552;AO=64;DP=143;FAO=64;FDP=143;FR=.;FRO=79;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.0174029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.752;QD=17.2061;RBI=0.0178153;REFB=-0.0149054;REVB=-0.00381097;RO=79;SAF=32;SAR=32;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13208;STB=0.573404;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0144855;OID=.;OPOS=4566711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:79:79:64:64:0.447552:32:32:29:50:32:32:29:50 chr11 4567335 . C G 102.54 PASS AF=0.521739;AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0287441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1781;QD=17.8324;RBI=0.0618073;REFB=-0.00808253;REVB=0.0547167;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160306;STB=0.605879;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00925035;OID=.;OPOS=4567335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:22:23:11:11:11:12:0.521739:7:4:6:5:8:4:6:5 chr11 4592708 . C CAG 1609.54 PASS AF=0.847826;AO=117;DP=140;FAO=117;FDP=138;FR=.;FRO=21;FSAF=72;FSAR=45;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00879881;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=2;MLLD=310.25;QD=46.6535;RBI=0.0090447;REFB=-0.00198127;REVB=-0.00209468;RO=20;SAF=72;SAR=45;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189267;STB=0.514617;STBP=0.443;TYPE=ins;VARB=0.000321635;OID=.;OPOS=4592709;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.847826:117:140:117:138:21:72:45:11:10:99:20:72:45:11:9 chr11 4594610 . C T 850.94 PASS AF=0.438679;AO=93;DP=212;FAO=93;FDP=212;FR=.;FRO=119;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=61;FSRR=58;FWDB=-0.00311718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0266;QD=16.0555;RBI=0.0353394;REFB=-0.0114221;REVB=-0.0352016;RO=119;SAF=47;SAR=46;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00729666;STB=0.504058;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0108389;OID=.;OPOS=4594610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:119:119:93:93:0.438679:46:47:61:58:46:47:61:58 chr11 4615234 . A G 585.96 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.06;QD=58.5956;RBI=0.0597901;REFB=-0.15597;REVB=0.0313482;RO=1;SAF=22;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208236;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00431223;OID=.;OPOS=4615234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:39:40:1:0:38:40:1:16:22:1:0:17:23:0:0 chr11 4615390 . C T 1302.05 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0685;QD=62.0023;RBI=0.0250963;REFB=0;REVB=0.0238791;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90176e-05;OID=.;OPOS=4615390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:34:50:0:0:34:50:0:0 chr11 4703165 . C A 1217.85 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0368376;FXX=0.0240935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9615;QD=60.1408;RBI=0.0635267;REFB=-0.177311;REVB=0.0517555;RO=3;SAF=55;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534844;STB=0.509801;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00709842;OID=.;OPOS=4703165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:81:3:1:80:80:0.987654:25:55:0:3:25:55:0:1 chr11 4712079 . A G 442.14 PASS AF=0.420168;AO=50;DP=119;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.000205414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.602;QD=14.8619;RBI=0.00295347;REFB=-0.00296786;REVB=0.00294632;RO=69;SAF=18;SAR=32;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126759;STB=0.571399;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00347266;OID=.;OPOS=4712079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:69:69:50:50:0.420168:32:18:33:36:32:18:33:36 chr11 4712656 . C T 357.03 PASS AF=0.434783;AO=31;DP=83;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0716441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1224;QD=15.523;RBI=0.100971;REFB=-0.000259621;REVB=0.0711492;RO=52;SAF=13;SAR=18;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130249;STB=0.609319;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00792279;OID=.;OPOS=4712656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:92:52:52:31:40:0.434783:18:13:28:24:26:14:28:24 chr11 4730985 . C T 864.2 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.261;QD=56.6689;RBI=0.0322998;REFB=0;REVB=0.0280585;RO=1;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171579;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000749401;OID=.;OPOS=4730985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:61:61:1:0:60:61:1:27:33:0:1:28:33:0:0 chr11 4731180 . G A 2240.26 PASS AF=0.993007;AO=140;DP=141;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00331341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6483;QD=62.6645;RBI=0.0194574;REFB=-0.0746162;REVB=-0.0191732;RO=0;SAF=70;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503448;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=9.74406e-05;OID=.;OPOS=4731180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:141:143:0:1:140:142:0.993007:70:70:0:0:70:72:1:0 chr11 4731468 . G A 1244.61 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8242;QD=61.4623;RBI=0.0439564;REFB=0;REVB=0.00205018;RO=0;SAF=42;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029238;OID=.;OPOS=4731468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:39:42:0:0:39:42:0:0 chr11 4731583 . C T 1539.6 PASS AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.012755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.949;QD=58.6515;RBI=0.0236435;REFB=-0.0929314;REVB=0.0199079;RO=1;SAF=48;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978349;STB=0.505154;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-1.47704e-05;OID=.;OPOS=4731583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:56:48:1:0:56:48:1:0 chr11 4928621 . G A 621.76 PASS AF=0.433333;AO=63;DP=148;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=-0.0212954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4677;QD=16.5801;RBI=0.0228452;REFB=0.00470959;REVB=0.0082708;RO=83;SAF=29;SAR=34;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396874;STB=0.530397;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.0101407;OID=.;OPOS=4928621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:83:85:63:65:0.433333:34:29:35:48:34:31:36:49 chr11 4929061 . C G 61.81 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00993352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.94;QD=7.2719;RBI=0.0176168;REFB=0.00624913;REVB=0.0145491;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348376;STB=0.716524;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.0126223;OID=.;OPOS=4929061;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:6:3:16:9:6:3:16:9 chr11 4945196 . T G 393.22 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0074;QD=56.1741;RBI=0.0372791;REFB=0;REVB=0.0202592;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095458;OID=.;OPOS=4945196;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0 chr11 4964753 . A G 564.08 PASS AF=0.417219;AO=63;DP=151;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=52;FWDB=0.000397082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.869;QD=14.9424;RBI=0.016575;REFB=-0.00739888;REVB=-0.0165702;RO=88;SAF=34;SAR=29;SRF=36;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135055;STB=0.575645;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0108323;OID=.;OPOS=4964753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:88:88:63:63:0.417219:29:34:36:52:29:34:36:52 chr11 4965301 . G T 1078.69 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0705977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9112;QD=59.9274;RBI=0.079682;REFB=0;REVB=-0.0369484;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334334;OID=.;OPOS=4965301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:37:34:0:0:38:34:0:0 chr11 4967468 . G A 267.05 PASS AF=0.340426;AO=32;DP=94;FAO=32;FDP=94;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0112427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.64;QD=11.3638;RBI=0.0123809;REFB=-0.0238025;REVB=-0.00518531;RO=62;SAF=16;SAR=16;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551106;STB=0.531895;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0465909;OID=.;OPOS=4967468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:62:62:32:32:0.340426:16:16:28:34:16:16:28:34 chr11 4967532 . G C 552.89 PASS AF=0.588235;AO=48;DP=86;FAO=60;FDP=102;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.014775;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.2859;QD=21.6821;RBI=0.131453;REFB=-0.125658;REVB=0.13062;RO=36;SAF=21;SAR=27;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156623;STB=0.567141;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0659589;OID=.;OPOS=4967532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:102:36:42:48:60:0.588235:27:21:23:13:38:22:22:20 chr11 4968198 . C A 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0115353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8066;QD=16.9322;RBI=0.0529219;REFB=0.023299;REVB=-0.0516494;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0413707;OID=.;OPOS=4968198;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:5:7:7:5:5:7:7:5 chr11 4976241 . C G 118.92 PASS AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0220565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.408;QD=33.9784;RBI=0.0223886;REFB=-0.0680539;REVB=0.00384185;RO=2;SAF=9;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902947;STB=0.549921;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0139502;OID=.;OPOS=4976241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:3:9:2:0:3:9:2:0 chr11 5020416 . A G 1912.82 PASS AF=0.992126;AO=116;DP=120;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0661416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.317;QD=60.2463;RBI=0.0675403;REFB=-0.00532543;REVB=0.0136744;RO=0;SAF=67;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19736e-08;STB=0.505154;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000191822;OID=.;OPOS=5020416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:127:0:1:116:126:0.992126:49:67:0:0:48:78:0:1 chr11 5021055 . C G 634.1 PASS AF=0.507812;AO=62;DP=126;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.00105103;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.449;QD=19.8156;RBI=0.0143216;REFB=-0.0177589;REVB=0.014283;RO=62;SAF=25;SAR=37;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301443;STB=0.501103;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0154755;OID=.;OPOS=5021055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:62:63:62:65:0.507812:37:25:27:35:37:28:27:36 chr11 5067984 . A G 767.23 PASS AF=0.479042;AO=80;DP=167;FAO=80;FDP=167;FR=.;FRO=87;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.0123874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.975;QD=18.3768;RBI=0.0237255;REFB=-0.0122912;REVB=-0.0202349;RO=86;SAF=47;SAR=33;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613892;STB=0.537256;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0153211;OID=.;OPOS=5067984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:86:87:80:80:0.479042:33:47:45:41:33:47:45:42 chr11 5068137 . G A 169.45 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.00422763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2364;QD=16.5317;RBI=0.00884517;REFB=-0.045001;REVB=0.00776943;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324408;STB=0.682751;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0735241;OID=.;OPOS=5068137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:9:9:19:4:9:9:19:4 chr11 5068177 . A T 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.000893009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.322;QD=18.4438;RBI=0.0262598;REFB=-0.00626087;REVB=0.0262446;RO=9;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283331;STB=0.660123;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0064517;OID=.;OPOS=5068177;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:5:6:8:1:5:6:8:1 chr11 5068661 . A G 181.53 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0436518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.352;QD=24.2041;RBI=0.0521429;REFB=-0.00363057;REVB=0.0285202;RO=12;SAF=13;SAR=5;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44516;STB=0.747935;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00407804;OID=.;OPOS=5068661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:5:13:1:11:5:13:1:11 chr11 5079946 . C T 390.4 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0173659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.616;QD=19.0438;RBI=0.0178883;REFB=-0.00361049;REVB=-0.00429142;RO=42;SAF=12;SAR=28;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131982;STB=0.573732;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00380863;OID=.;OPOS=5079946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:28:12:18:24:28:12:18:24 chr11 5080068 . G A 195.54 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00140258;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6143;QD=17.0031;RBI=0.0248389;REFB=-0.0201861;REVB=-0.0247993;RO=26;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770416;STB=0.544141;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0220515;OID=.;OPOS=5080068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:13:7:11:15:13:7:11:15 chr11 5080234 . T C 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00885924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.087;QD=22.5815;RBI=0.0389786;REFB=-0.0576088;REVB=0.0379584;RO=7;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303269;STB=0.517212;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0504557;OID=.;OPOS=5080234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:9:3:2:5:9:3:2:5 chr11 5141902 . T C 204.5 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00414809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.759;QD=22.722;RBI=0.0199381;REFB=-0.016194;REVB=0.0195018;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255391;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0127298;OID=.;OPOS=5141902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:15:16:20:20:0.555556:10:10:8:7:10:10:8:8 chr11 5141980 . A G 263.27 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00748795;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.008;QD=19.5011;RBI=0.00797246;REFB=-0.0139941;REVB=0.00273693;RO=26;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948994;STB=0.553034;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0191362;OID=.;OPOS=5141980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:26:26:28:28:0.518519:18:10:12:14:18:10:12:14 chr11 5142270 . T G 379.64 PASS AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00977244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.073;QD=22.008;RBI=0.0157225;REFB=0.000602789;REVB=0.0123165;RO=31;SAF=21;SAR=17;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13423;STB=0.573993;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.000348923;OID=.;OPOS=5142270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:17:21:12:19:17:21:12:19 chr11 5172786 . A G 1552.72 PASS AF=1;AO=79;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00433535;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.184;QD=64.0297;RBI=0.0324761;REFB=0;REVB=0.0321854;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180182;OID=.;OPOS=5172786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:79:97:1:41:38:0:0:59:38:0:0 chr11 5269583 . GTGA AGAG 890.04 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412126;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=4;MLLD=315.924;QD=58.3634;RBI=0.0467517;REFB=0;REVB=0.0220736;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=9.96966e-05;OID=.;OPOS=5269583;OREF=GTGA;OALT=AGAG;OMAPALT=AGAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr11 5322249 . C G 205.08 PASS AF=0.42;AO=20;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0506693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6507;QD=16.4066;RBI=0.0573482;REFB=0.0166939;REVB=-0.0268595;RO=30;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694126;STB=0.563507;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.0224445;OID=.;OPOS=5322249;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:30:29:20:21:0.42:10:10:13:17:10:11:12:17 chr11 5322737 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00628612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.258;QD=59.4356;RBI=0.00647087;REFB=0;REVB=-0.00153519;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.132e-05;OID=.;OPOS=5322737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr11 5323071 . C T 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.403;QD=58.4194;RBI=0.0190934;REFB=0;REVB=0.00944208;RO=0;SAF=21;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25814e-05;OID=.;OPOS=5323071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:42:21:0:0:42:21:0:0 chr11 5364276 . G A 180.08 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0225652;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.852;QD=23.2362;RBI=0.0228669;REFB=-0.00708239;REVB=-0.00370227;RO=13;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705339;STB=0.539524;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00547949;OID=.;OPOS=5364276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:10:8:7:6:10:8:7:6 chr11 5364450 . A G 76.65 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00596981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6597;QD=12.775;RBI=0.00631908;REFB=-0.0131241;REVB=0.00207174;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998889;STB=0.559202;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0168002;OID=.;OPOS=5364450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:7:7:6:4:7:7 chr11 5372863 . T A 565.3 PASS AF=0.504348;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.00737071;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.854;QD=19.6627;RBI=0.0295376;REFB=-0.00848831;REVB=0.0286031;RO=57;SAF=27;SAR=31;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859518;STB=0.547425;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0101554;OID=.;OPOS=5372863;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:57:57:58:58:0.504348:31:27:32:25:31:27:32:25 chr11 5373114 . G A 569.75 PASS AF=0.414013;AO=65;DP=157;FAO=65;FDP=157;FR=.;FRO=92;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=0.00259029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.393;QD=14.5159;RBI=0.01486;REFB=-0.0142136;REVB=-0.0146325;RO=89;SAF=37;SAR=28;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777481;STB=0.534523;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0296643;OID=.;OPOS=5373114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:89:92:65:65:0.414013:28:37:44:45:28:37:47:45 chr11 5410934 . T G 291.61 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0893313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.33;QD=19.4409;RBI=0.100117;REFB=-0.0151305;REVB=0.045203;RO=28;SAF=7;SAR=24;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275388;STB=0.648544;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0173996;OID=.;OPOS=5410934;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:29:31:31:0.516667:24:7:14:14:24:7:14:15 chr11 5411031 . C T 130.64 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0477449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1408;QD=22.7195;RBI=0.0494258;REFB=-0.0155126;REVB=-0.0127801;RO=9;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643851;STB=0.536371;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0118828;OID=.;OPOS=5411031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:9:5:4:5:9:5:4:5 chr11 5411239 . T C 127.74 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0057629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.976;QD=11.8824;RBI=0.0131306;REFB=-0.0113591;REVB=-0.0117984;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00263309;STB=0.501556;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0237447;OID=.;OPOS=5411239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:8:7:13:15:8:7:13:15 chr11 5411395 . C A 632.44 PASS AF=0.558559;AO=62;DP=111;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=0.0208653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.774;QD=22.7906;RBI=0.0562857;REFB=-0.0136225;REVB=0.0522754;RO=48;SAF=26;SAR=36;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211782;STB=0.619583;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0113045;OID=.;OPOS=5411395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:48:49:62:62:0.558559:36:26:33:15:36:26:34:15 chr11 5411398 . T G 612.13 PASS AF=0.529915;AO=61;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.00069207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8678;QD=20.9274;RBI=0.000747413;REFB=-0.0131546;REVB=-0.000282248;RO=55;SAF=27;SAR=34;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165929;STB=0.593677;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0228943;OID=.;OPOS=5411398;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:55:61:62:0.529915:34:27:35:20:35:27:35:20 chr11 5411579 . GT AC 402.42 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.00719475;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.615;QD=16.5948;RBI=0.00842828;REFB=-0.00677409;REVB=-0.00438993;RO=55;SAF=20;SAR=22;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403684;STB=0.522672;STBP=0.698;TYPE=mnp;VARB=0.0112254;OID=.;OPOS=5411579;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:22:20:24:31:22:20:24:31 chr11 5424050 . G A 251.68 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0298751;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1119;QD=14.3815;RBI=0.0367692;REFB=0.000457445;REVB=-0.0214348;RO=40;SAF=15;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00793142;STB=0.511345;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.00168565;OID=.;OPOS=5424050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:40:41:29:29:0.414286:14:15:21:19:14:15:22:19 chr11 5424701 . T C 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00269878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.891;QD=16.4544;RBI=0.0855777;REFB=-0.0275223;REVB=-0.0855351;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.681121;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0257908;OID=.;OPOS=5424701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:1:5:2:2:1:5:2:2 chr11 5443442 . G C 613.27 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00703648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.246;QD=61.3268;RBI=0.0549439;REFB=0;REVB=0.0544915;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386771;OID=.;OPOS=5443442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0 chr11 5443700 . C T 787.11 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657758;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.993;QD=57.2445;RBI=0.00714848;REFB=0;REVB=-0.00279933;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.23275e-05;OID=.;OPOS=5443700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0 chr11 5443739 . T C 670.93 PASS AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0298403;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=277.64;QD=50.6358;RBI=0.0370672;REFB=-0.0494903;REVB=0.0219893;RO=3;SAF=24;SAR=26;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552805;STB=0.5294;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000398995;OID=.;OPOS=5443739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:53:53:3:3:50:50:0.943396:26:24:3:0:26:24:3:0 chr11 5443867 . C T 384.77 PASS AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0335944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1615;QD=48.0964;RBI=0.034026;REFB=-0.183681;REVB=0.00540238;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.542828;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00726877;OID=.;OPOS=5443867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:32:32:0:3:29:29:0.90625:13:16:0:0:13:16:3:0 chr11 5443887 . T C 357.23 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.161;QD=54.959;RBI=0.0530382;REFB=0;REVB=0.0529558;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415409;OID=.;OPOS=5443887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0 chr11 5443893 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6146;QD=55.0985;RBI=0.0494154;REFB=0;REVB=0.0467664;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000636622;OID=.;OPOS=5443893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr11 5443963 . G A 223.18 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4801;QD=49.5964;RBI=0.0747753;REFB=0;REVB=0.0712182;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218148;OID=.;OPOS=5443963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr11 5444061 . G A 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0070661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.802;QD=57.1054;RBI=0.0200451;REFB=0;REVB=0.0187583;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96778e-05;OID=.;OPOS=5444061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0 chr11 5444136 . C T 1511.14 PASS AF=1;AO=100;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277868;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9463;QD=59.8472;RBI=0.0332066;REFB=0;REVB=0.0181817;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.90324e-05;OID=.;OPOS=5444136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:100:101:1:43:57:0:0:44:57:0:0 chr11 5444353 . T C 659.17 PASS AF=0.93617;AO=43;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0275138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9755;QD=56.0997;RBI=0.0279683;REFB=-0.118547;REVB=0.00502206;RO=4;SAF=19;SAR=24;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494577;STB=0.513613;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00952025;OID=.;OPOS=5444353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:47:47:4:3:43:44:0.93617:24:19:3:1:24:20:2:1 chr11 5462085 . G A 192.9 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00967869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.953;QD=23.3816;RBI=0.00970249;REFB=-0.0110965;REVB=0.000679126;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114403;STB=0.564035;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00909513;OID=.;OPOS=5462085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:11:8:8:6:11:8:8:6 chr11 5462105 . T C 166.09 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.000189029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.401;QD=22.1455;RBI=0.00635102;REFB=-0.00806445;REVB=0.00634821;RO=13;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392056;STB=0.522062;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00480611;OID=.;OPOS=5462105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:10:7:6:7:10:7:6:7 chr11 5462255 . C G 306.73 PASS AF=0.561404;AO=30;DP=56;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0307463;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9143;QD=21.5248;RBI=0.0312957;REFB=-0.0468647;REVB=-0.00583847;RO=25;SAF=15;SAR=15;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114844;STB=0.574654;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0261886;OID=.;OPOS=5462255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:25:25:30:32:0.561404:15:15:16:9:17:15:16:9 chr11 5462374 . C T 431.92 PASS AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0131878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6136;QD=23.0358;RBI=0.0313973;REFB=-0.00851019;REVB=0.0284934;RO=33;SAF=12;SAR=30;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294577;STB=0.66257;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00799212;OID=.;OPOS=5462374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:30:12:21:12:30:12:21:12 chr11 5462702 . G A 246.83 PASS AF=0.709677;AO=21;DP=30;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0371725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.844;QD=31.8495;RBI=0.0398519;REFB=-0.0296292;REVB=0.0143659;RO=9;SAF=6;SAR=15;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337277;STB=0.68694;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00576887;OID=.;OPOS=5462702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:30:31:9:9:21:22:0.709677:15:6:8:1:16:6:8:1 chr11 5475118 . A G 1031.11 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.57;QD=58.9205;RBI=0.0299748;REFB=0;REVB=0.0278698;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011892;OID=.;OPOS=5475118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:25:44:0:0:25:45:0:0 chr11 5510284 . A G 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.499;QD=63.0522;RBI=0.0535675;REFB=0;REVB=0.0188281;RO=0;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128039;OID=.;OPOS=5510284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:49:42:0:0:49:42:0:0 chr11 5510341 . C T 2046.06 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.171;QD=62.475;RBI=0.0242253;REFB=0;REVB=0.0236639;RO=0;SAF=66;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57708e-05;OID=.;OPOS=5510341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:65:66:0:0:65:66:0:0 chr11 5510423 . ATCT A,TTCA 1907.79 PASS AF=0.937008,0.0629921;AO=104,7;DP=121;FAO=119,8;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=56,5;FSAR=63,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692983,-0.0435063;FXX=0.0378759;HRUN=1,1;LEN=3,4;MLLD=185.677,117.914;QD=60.0878;RBI=0.069301,0.0457917;REFB=0,0;REVB=-0.000603583,0.0142856;RO=0;SAF=48,5;SAR=56,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00140483,0.0263573;OID=.,.;OPOS=5510424,5510423;OREF=TCT,ATCT;OALT=-,TTCA;OMAPALT=A,TTCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:22:121:127:0:0:104,7:119,8:0.937008,0.0629921:56,2:48,5:0:0:63,3:56,5:0:0 chr11 5510497 . T C 1530.03 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.277;QD=63.7512;RBI=0.028317;REFB=0;REVB=0.00827029;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110136;OID=.;OPOS=5510497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0 chr11 5510626 . T C 1232.17 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379048;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.585;QD=61.6086;RBI=0.0395893;REFB=0;REVB=0.0394075;RO=0;SAF=50;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21676e-05;OID=.;OPOS=5510626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:30:50:0:0:30:50:0:0 chr11 5510928 . G A 289.87 PASS AF=1;AO=20;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102613;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2058;QD=52.7039;RBI=0.0182774;REFB=0;REVB=0.0151251;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00248271;OID=.;OPOS=5510928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:20:22:1:11:9:0:0:13:9:0:0 chr11 5529206 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.19;QD=51.9167;RBI=0.0187757;REFB=0;REVB=0.00935682;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.56186e-05;OID=.;OPOS=5529206;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr11 5529865 . G A 632.19 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.066;QD=61.6769;RBI=0.0253577;REFB=0;REVB=0.0211301;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04526e-05;OID=.;OPOS=5529865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0 chr11 5536415 . C T 972.87 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.593;QD=58.9617;RBI=0.0362041;REFB=0;REVB=0.0248862;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.09321e-06;OID=.;OPOS=5536415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0 chr11 5536537 . A C 1934.38 PASS AF=0.984496;AO=125;DP=127;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.073497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0286;QD=59.9807;RBI=0.0791736;REFB=0.0763926;REVB=-0.0294388;RO=2;SAF=73;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00258499;STB=0.501186;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.00304152;OID=.;OPOS=5536537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:127:129:2:2:125:127:0.984496:52:73:1:1:54:73:1:1 chr11 5536852 . A G 1952.26 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00592844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.109;QD=61.9766;RBI=0.0379603;REFB=0;REVB=0.0374945;RO=0;SAF=64;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47389e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45548e-05;OID=.;OPOS=5536852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:124:126:0:0:124:126:1:60:64:0:0:60:66:0:0 chr11 5537045 . T G 483.24 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.491;QD=58.5745;RBI=0.0273934;REFB=0;REVB=0.0142906;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.02027e-05;OID=.;OPOS=5537045;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:19:13:0:0:19:14:0:0 chr11 5537161 . A G 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.238;QD=59.1431;RBI=0.0171863;REFB=0;REVB=0.0168118;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.59326e-05;OID=.;OPOS=5537161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0 chr11 5537780 . C A 631.96 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1182;QD=61.6546;RBI=0.026733;REFB=0;REVB=-0.0264539;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000472911;OID=.;OPOS=5537780;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:14:27:0:0:14:27:0:0 chr11 5565906 . A G 362.85 PASS AF=0.414894;AO=38;DP=93;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=0.00818348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.81;QD=15.4405;RBI=0.0107549;REFB=-0.00555838;REVB=-0.00697844;RO=55;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25839;STB=0.650059;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00642908;OID=.;OPOS=5565906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:55:55:38:39:0.414894:16:22:18:37:16:23:18:37 chr11 5566030 . A G 638.85 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0050177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.291;QD=60.8429;RBI=0.0334623;REFB=0;REVB=0.033084;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192213;OID=.;OPOS=5566030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:18:23:0:0:19:23:0:0 chr11 5566051 . C A 197.56 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00308825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0781;QD=18.8148;RBI=0.0146374;REFB=-0.00805291;REVB=-0.014308;RO=19;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199125;STB=0.62252;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00654103;OID=.;OPOS=5566051;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:22:20:20:0.47619:12:8:12:7:12:8:14:8 chr11 5566112 . C T 164.82 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0288786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.172;QD=21.267;RBI=0.0299383;REFB=-0.0306807;REVB=-0.00789495;RO=14;SAF=5;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180671;STB=0.602384;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0275559;OID=.;OPOS=5566112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:12:5:7:7:12:5:7:7 chr11 5566365 . T C 1411.42 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263691;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.099;QD=62.0406;RBI=0.129853;REFB=-0.0922544;REVB=0.127148;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.505746;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000842041;OID=.;OPOS=5566365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:91:0:1:90:90:0.989011:47:43:0:0:47:43:1:0 chr11 5566489 . C T 699.35 PASS AF=0.631579;AO=58;DP=93;FAO=60;FDP=95;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00620391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.502;QD=29.4464;RBI=0.0353025;REFB=-0.0355313;REVB=0.0347531;RO=32;SAF=30;SAR=28;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522519;STB=0.549003;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0113524;OID=.;OPOS=5566489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:32:35:58:60:0.631579:28:30:14:18:28:32:14:21 chr11 5602275 . A G 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0343897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.195;QD=13.5805;RBI=0.0355632;REFB=-0.0109735;REVB=0.00906024;RO=28;SAF=8;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693722;STB=0.540422;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.016891;OID=.;OPOS=5602275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:9:8:15:13:9:8:15:13 chr11 5602438 . T A 399.0 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.025183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0375;QD=23.8208;RBI=0.0255346;REFB=-0.0542748;REVB=0.00422249;RO=28;SAF=17;SAR=22;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615111;STB=0.533735;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0132904;OID=.;OPOS=5602438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:22:17:10:18:22:17:10:18 chr11 5602605 . G A 411.22 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0023629;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.115;QD=23.1674;RBI=0.0176657;REFB=-0.0284222;REVB=-0.017507;RO=31;SAF=25;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115445;STB=0.563604;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0183623;OID=.;OPOS=5602605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:31:31:40:40:0.56338:15:25:15:16:15:25:15:16 chr11 5602615 . A G 428.42 PASS AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.012451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5874;QD=22.2554;RBI=0.0328779;REFB=-0.0333683;REVB=0.0304291;RO=35;SAF=23;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039605;STB=0.502182;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0579882;OID=.;OPOS=5602615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:35:35:42:42:0.545455:19:23:19:16:19:23:19:16 chr11 5602679 . T C 359.46 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0276355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.786;QD=19.9701;RBI=0.0421086;REFB=-0.0141107;REVB=-0.0317712;RO=35;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076034;STB=0.542146;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0134213;OID=.;OPOS=5602679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:18:19:21:14:18:19:21:14 chr11 5602790 . A G 579.85 PASS AF=0.517544;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.000213137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.928;QD=20.3457;RBI=0.0197675;REFB=-0.000730427;REVB=-0.0197664;RO=54;SAF=30;SAR=29;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234324;STB=0.508472;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000606222;OID=.;OPOS=5602790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:55:59:59:0.517544:29:30:26:28:29:30:27:28 chr11 5602928 . G C 307.67 PASS AF=0.320611;AO=37;DP=127;FAO=42;FDP=131;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=0.00247799;FXX=0.036762;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.254;QD=9.39458;RBI=0.00322008;REFB=-0.0198234;REVB=-0.00205632;RO=88;SAF=12;SAR=25;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151451;STB=0.531107;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0346073;OID=.;OPOS=5602928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:131:88:89:37:42:0.320611:25:12:39:49:25:17:40:49 chr11 5602968 . G A 424.88 PASS AF=0.367647;AO=50;DP=136;FAO=50;FDP=136;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=48;FWDB=-0.00771612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.6;QD=12.4964;RBI=0.0195925;REFB=-0.0131444;REVB=0.0180091;RO=86;SAF=19;SAR=31;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712875;STB=0.540681;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0237345;OID=.;OPOS=5602968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:86:86:50:50:0.367647:31:19:38:48:31:19:38:48 chr11 5625847 . A G 786.79 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220019;FXX=0.017854;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.773;QD=57.2213;RBI=0.024803;REFB=0;REVB=-0.0114502;RO=0;SAF=14;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04607e-05;OID=.;OPOS=5625847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:39:14:0:0:41:14:0:0 chr11 5629607 . G A 655.91 PASS AF=0.429412;AO=72;DP=169;FAO=73;FDP=170;FR=.;FRO=97;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=34;FSRR=63;FWDB=0.0192267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.69;QD=15.4332;RBI=0.0224059;REFB=-0.0108536;REVB=0.0115047;RO=94;SAF=24;SAR=48;SRF=32;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00806903;STB=0.51392;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0150245;OID=.;OPOS=5629607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:94:97:72:73:0.429412:48:24:32:62:49:24:34:63 chr11 5632212 . G A 3121.05 PASS AF=0.954338;AO=209;DP=219;FAO=209;FDP=219;FR=.;FRO=10;FSAF=96;FSAR=113;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0110431;FXX=0.0223204;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.524;QD=57.0054;RBI=0.0249922;REFB=-0.0800539;REVB=0.0224201;RO=9;SAF=96;SAR=113;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163682;STB=0.511042;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00027285;OID=.;OPOS=5632212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:219:219:9:10:209:209:0.954338:113:96:6:3:113:96:7:3 chr11 5664831 . C A 1373.94 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.167;QD=62.452;RBI=0.0317047;REFB=0;REVB=0.0214334;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97494e-05;OID=.;OPOS=5664831;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:43:43:0:0:45:43:0:0 chr11 5691191 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.261;QD=43.4861;RBI=0.0249602;REFB=0;REVB=0.0212006;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000731733;OID=.;OPOS=5691191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0 chr11 5700340 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0601529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.614;QD=62.3503;RBI=0.0718375;REFB=0;REVB=0.0392717;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118566;OID=.;OPOS=5700340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr11 5701001 . C T 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0130249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.917;QD=10.1734;RBI=0.0387291;REFB=0.0029448;REVB=0.0364733;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389464;STB=0.736367;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.00193839;OID=.;OPOS=5701001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:8:9:6:6:0.4:1:5:8:0:1:5:9:0 chr11 5701074 . C A 108.6 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00931694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8287;QD=13.575;RBI=0.102687;REFB=-0.0137988;REVB=-0.102263;RO=19;SAF=10;SAR=3;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172805;STB=0.60224;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0210248;OID=.;OPOS=5701074;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:3:10:12:7:3:10:12:7 chr11 5701409 . G C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0871946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2288;QD=9.44481;RBI=0.0896851;REFB=-0.00937417;REVB=-0.0209887;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.543832;STB=0.811862;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0252131;OID=.;OPOS=5701409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:0:10:3:3:0:10 chr11 5719667 . T C 993.86 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00451035;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.397;QD=59.3351;RBI=0.0661321;REFB=0;REVB=0.0659781;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339673;OID=.;OPOS=5719667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:25:41:0:0:26:41:0:0 chr11 5758062 . T C 1697.4 PASS AF=1;AO=112;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.784;QD=59.0402;RBI=0.102178;REFB=0;REVB=0.00530502;RO=2;SAF=52;SAR=60;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179083;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534817;OID=.;OPOS=5758062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:114:115:2:0:112:115:1:60:52:2:0:60:55:0:0 chr11 5758118 . A C 1540.6 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.531;QD=59.829;RBI=0.0279734;REFB=0;REVB=0.0150353;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.35962e-05;OID=.;OPOS=5758118;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:44:59:0:0:44:59:0:0 chr11 5758646 . T C 467.3 PASS AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.00109585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.494;QD=20.0991;RBI=0.0511566;REFB=-0.0275916;REVB=-0.0511448;RO=47;SAF=24;SAR=22;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126047;STB=0.569802;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0427799;OID=.;OPOS=5758646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:22:24:18:29:22:24:18:29 chr11 5776287 . C T 3193.25 PASS AF=1;AO=207;DP=210;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379867;FXX=0.0280361;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.425;QD=61.4086;RBI=0.0180294;REFB=-0.06455;REVB=0.0176247;RO=1;SAF=117;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00526343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147836;OID=.;OPOS=5776287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:210:208:1:0:207:208:1:90:117:0:1:90:118:0:0 chr11 5776470 . T C,G 934.52 PASS AF=0.0615385,0.938462;AO=3,62;DP=65;FAO=4,61;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=4,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115752,0.0651813;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.258,56.0346;QD=57.509;RBI=0.0187717,0.0823163;REFB=0,0;REVB=-0.014778,0.0502729;RO=0;SAF=0,21;SAR=3,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-2.99858e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0981207,0.00677426;OID=.,.;OPOS=5776470,5776470;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:65:65:0:0:3,62:4,61:0.0615385,0.938462:3,41:0,21:0:0:4,40:0,21:0:0 chr11 5776592 . ATTT ATT,ATTG 728.22 PASS AF=0.0377358,0.962264;AO=8,43;DP=52;FAO=2,51;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=1,29;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216895,0.0959058;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=24.3278,38.2597;QD=54.9596;RBI=0.0599254,0.0972443;REFB=0,0;REVB=0.0558625,-0.0160786;RO=0;SAF=6,24;SAR=2,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0760872,0.00297393;OID=.,.;OPOS=5776593,5776595;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=ATT,ATTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0377358,0.962264:8,43:52:2,51:53:0:1,29:1,22:0:0:5:0:6,24:2,19:0:0 chr11 5776623 . A T 902.62 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00668089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.639;QD=58.2338;RBI=0.0382433;REFB=0;REVB=0.0376552;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69814e-05;OID=.;OPOS=5776623;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:23:39:0:0:23:39:0:0 chr11 5799468 . C T 871.24 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311376;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.215;QD=58.0829;RBI=0.0390172;REFB=0;REVB=0.0235116;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256308;OID=.;OPOS=5799468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0 chr11 5809230 . G A 2203.53 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123209;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.045;QD=63.4109;RBI=0.0186428;REFB=0;REVB=0.013991;RO=0;SAF=56;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66754e-05;OID=.;OPOS=5809230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:139:0:0:138:139:1:82:56:0:0:83:56:0:0 chr11 5809308 . A T 1268.64 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0411855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.125;QD=60.4112;RBI=0.0418693;REFB=-0.0610871;REVB=-0.00753629;RO=1;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937926;STB=0.504949;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000114414;OID=.;OPOS=5809308;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:50:33:0:1:50:33:0:1 chr11 5809548 . G A 1518.18 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160329;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.084;QD=63.9234;RBI=0.0293966;REFB=0;REVB=0.0293529;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032907;OID=.;OPOS=5809548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:44:51:0:0:44:51:0:0 chr11 5809811 . G T 932.29 PASS AF=0.985075;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0614763;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1474;QD=55.6591;RBI=0.116918;REFB=-0.121427;REVB=0.0994513;RO=1;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013692;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00337249;OID=.;OPOS=5809811;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:67:67:1:1:65:66:0.985075:34:31:0:1:35:31:0:1 chr11 5809990 . G A 465.11 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.8339;QD=58.1392;RBI=0.121446;REFB=0;REVB=0.0595154;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00322624;OID=.;OPOS=5809990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chr11 5862532 . A C 582.53 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0117334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.619;QD=58.2527;RBI=0.0460912;REFB=-0.0961784;REVB=0.0445727;RO=1;SAF=20;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228628;STB=0.512189;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000947228;OID=.;OPOS=5862532;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:19:20:1:0:19:20:1:0 chr11 5862653 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000252341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.714;QD=59.1432;RBI=0.00257603;REFB=0;REVB=-0.00256364;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93743e-06;OID=.;OPOS=5862653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0 chr11 5862731 . A G 978.75 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116203;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.5;QD=59.3181;RBI=0.0745895;REFB=0;REVB=-0.0736788;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.24412e-05;OID=.;OPOS=5862731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr11 5862780 . T C 723.12 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8588;QD=56.7155;RBI=0.0719255;REFB=0;REVB=0.0302707;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000292872;OID=.;OPOS=5862780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:24:26:0:0:24:27:0:0 chr11 5862845 . A G 673.3 PASS AF=0.977778;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0292118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.966;QD=59.8487;RBI=0.0292683;REFB=0.0348525;REVB=0.00181695;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208679;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000348475;OID=.;OPOS=5862845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:43:44:0.977778:21:22:1:0:22:22:1:0 chr11 5862937 . C A 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0845143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.575;QD=64.1525;RBI=0.0845798;REFB=0;REVB=0.00332791;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022134;OID=.;OPOS=5862937;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chr11 5862984 . G C 729.0 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.513;QD=57.1764;RBI=0.0231129;REFB=0;REVB=0.00544886;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.87205e-05;OID=.;OPOS=5862984;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0 chr11 5863013 . T C 961.98 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201427;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.673;QD=59.1985;RBI=0.0525564;REFB=0;REVB=0.0485433;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000335731;OID=.;OPOS=5863013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:27:37:0:0:28:37:0:0 chr11 5863113 . G A 1477.77 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202651;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.308;QD=63.5598;RBI=0.0249177;REFB=0;REVB=0.0144988;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21321e-05;OID=.;OPOS=5863113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:50:43:0:0:50:43:0:0 chr11 5906048 . G A 761.69 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7755;QD=63.4745;RBI=0.0562265;REFB=0;REVB=0.0316194;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000858337;OID=.;OPOS=5906048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0 chr11 5906073 . G T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.081;QD=62.0219;RBI=0.0205012;REFB=0;REVB=-0.0126368;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29434e-05;OID=.;OPOS=5906073;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0 chr11 5906192 . A C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000124417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.07;QD=62.671;RBI=0.0256556;REFB=0;REVB=0.0256553;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4504e-05;OID=.;OPOS=5906192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr11 5906205 . G A 673.88 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699555;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.411;QD=62.6861;RBI=0.010165;REFB=0;REVB=0.00737495;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74471e-05;OID=.;OPOS=5906205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr11 5989293 . G A 388.19 PASS AF=0.534247;AO=38;DP=72;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00420114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.691;QD=21.2707;RBI=0.0084371;REFB=0.00494832;REVB=0.00731676;RO=34;SAF=22;SAR=16;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167026;STB=0.584164;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.003537;OID=.;OPOS=5989293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:34:34:38:39:0.534247:16:22:13:21:17:22:13:21 chr11 5989415 . C A,T 1117.35 PASS AF=0.480519,0.519481;AO=33,40;DP=73;FAO=37,40;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=18,27;FSAR=19,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284466,0.0103832;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=29.0978,218.754;QD=58.0444;RBI=0.093805,0.0104208;REFB=0,0;REVB=0.0893877,0.000884141;RO=0;SAF=18,27;SAR=15,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.64315e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0505466,0.0306612;OID=.,.;OPOS=5989415,5989415;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:73:77:0:0:33,40:37,40:0.480519,0.519481:15,13:18,27:0:0:19,13:18,27:0:0 chr11 6007272 . A G 955.07 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00304737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.838;QD=58.7732;RBI=0.0549372;REFB=0;REVB=0.0548526;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138818;OID=.;OPOS=6007272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0 chr11 6007613 . T G 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136371;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.6;QD=60.7162;RBI=0.0178314;REFB=0;REVB=-0.0114886;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.49436e-06;OID=.;OPOS=6007613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr11 6007680 . A G 939.78 PASS AF=0.985075;AO=64;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0280465;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.175;QD=56.106;RBI=0.0454346;REFB=-0.117207;REVB=0.035745;RO=1;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149923;STB=0.50746;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00493496;OID=.;OPOS=6007680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:67:1:1:64:66:0.985075:31:33:0:1:33:33:0:1 chr11 6007743 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6382;QD=61.6839;RBI=0.0299946;REFB=0;REVB=-0.0106732;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153123;OID=.;OPOS=6007743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0 chr11 6007899 . C T 236.74 PASS AF=0.560976;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0292072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.423;QD=23.0968;RBI=0.0336174;REFB=-0.0318811;REVB=-0.0166454;RO=18;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104337;STB=0.558089;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.016037;OID=.;OPOS=6007899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:18:18:23:23:0.560976:12:11:11:7:12:11:11:7 chr11 6129837 . C T 706.12 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3391;QD=62.7666;RBI=0.0755084;REFB=0;REVB=0.0314211;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153275;OID=.;OPOS=6129837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr11 6173364 . T A 411.1 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1945;QD=56.7035;RBI=0.0493042;REFB=0;REVB=-0.0428539;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00155528;OID=.;OPOS=6173364;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr11 6221169 . A G 1208.95 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.05;QD=61.2129;RBI=0.0547948;REFB=0;REVB=-0.0287515;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3517e-05;OID=.;OPOS=6221169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:40:39:0:0:40:39:0:0 chr11 6221214 . T A 371.16 PASS AF=0.389381;AO=44;DP=115;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.0446232;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.776;QD=13.1384;RBI=0.058381;REFB=-0.00671271;REVB=0.0376446;RO=68;SAF=13;SAR=31;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202796;STB=0.620752;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0133081;OID=.;OPOS=6221214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:113:68:69:44:44:0.389381:31:13:32:36:31:13:33:36 chr11 6231731 . C T 291.06 PASS AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0352156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.809;QD=26.4603;RBI=0.0358815;REFB=-0.0387392;REVB=0.00688046;RO=17;SAF=14;SAR=12;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904628;STB=0.538432;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0294581;OID=.;OPOS=6231731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:17:18:26:26:0.590909:12:14:7:10:12:14:8:10 chr11 6232189 . G C 48.97 PASS AF=0.132653;AO=14;DP=103;FAO=13;FDP=98;FR=.;FRO=85;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=64;FSRR=21;FWDB=-0.0210977;FXX=0.0754646;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.2114;QD=1.99863;RBI=0.0901306;REFB=-0.0134611;REVB=-0.0876265;RO=81;SAF=12;SAR=2;SRF=63;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163052;STB=0.627568;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.120545;OID=.;OPOS=6232189;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:103:98:81:85:14:13:0.132653:2:12:63:18:2:11:64:21 chr11 6243804 . A G 1324.55 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0341733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.366;QD=60.8989;RBI=0.0356321;REFB=-0.13363;REVB=-0.0100911;RO=1;SAF=58;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00809968;STB=0.504273;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.00076243;OID=.;OPOS=6243804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:87:87:1:1:86:86:0.988506:28:58:1:0:28:58:1:0 chr11 6340525 . A T 310.9 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154344;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.719;QD=54.0693;RBI=0.0185925;REFB=0;REVB=0.0103664;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022218;OID=.;OPOS=6340525;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr11 6340706 . A G 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.929;QD=62.3495;RBI=0.0394941;REFB=0;REVB=0.0370789;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183066;OID=.;OPOS=6340706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr11 6341684 . C G 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00617929;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.0369;QD=37.4828;RBI=0.0135677;REFB=0;REVB=0.0120788;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139085;OID=.;OPOS=6341684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr11 6411935 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.128;QD=57.6804;RBI=0.0482178;REFB=0;REVB=0.0175761;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354472;OID=.;OPOS=6411935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr11 6549779 . A C 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00560137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.002;QD=58.5998;RBI=0.00629916;REFB=0;REVB=0.00288167;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10375e-05;OID=.;OPOS=6549779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0 chr11 6549995 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.226;QD=59.8394;RBI=0.0546739;REFB=0;REVB=-0.00227633;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000363096;OID=.;OPOS=6549995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr11 6550004 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.978;QD=58.5877;RBI=0.00933465;REFB=0;REVB=0.00461592;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61345e-05;OID=.;OPOS=6550004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr11 6550309 . G A 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00358475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.289;QD=58.7817;RBI=0.00560671;REFB=0;REVB=0.00431101;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9576e-07;OID=.;OPOS=6550309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0 chr11 6555365 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.417;QD=57.6796;RBI=0.126698;REFB=0;REVB=0.0288806;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196904;OID=.;OPOS=6555365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr11 6566241 . C T 301.46 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0460068;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=165.291;QD=16.7476;RBI=0.0461798;REFB=-0.00475345;REVB=-0.00399294;RO=38;SAF=25;SAR=8;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277977;STB=0.652075;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0112447;OID=.;OPOS=6566241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:39:33:33:0.458333:8:25:19:19:8:25:20:19 chr11 6567895 . C A,CTGCCCTACTGCA 442.56 PASS AF=0.0769231,0.769231;AO=2,30;DP=42;FAO=3,30;FDP=39;FR=.;FRO=6;FSAF=3,16;FSAR=0,14;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00692514,-0.0179997;FXX=0.133304;HRUN=1,1;LEN=1,12;MLLD=99.3181,289.034;QD=45.3904;RBI=0.0122591,0.0312557;REFB=-0.00379468,-0.0124607;REVB=0.0101158,-0.0255525;RO=6;SAF=2,16;SAR=0,14;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.606693,0.0103185;STB=0.99556,0.505572;STBP=0.109,0.919;TYPE=snp,ins;VARB=0.00166273,0.00111602;OID=.,.;OPOS=6567895,6567896;OREF=C,-;OALT=A,TGCCCTACTGCA;OMAPALT=A,CTGCCCTACTGCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:38:42:39:6:6:2,30:3,30:0.0769231,0.769231:0,14:2,16:3:3:0,14:3,16:3:3 chr11 6585007 . G A 851.19 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8777;QD=57.708;RBI=0.0262388;REFB=0;REVB=-0.00788231;RO=0;SAF=17;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107873;OID=.;OPOS=6585007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:42:17:0:0:42:17:0:0 chr11 6622714 . G A 1302.13 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2201;QD=62.006;RBI=0.0153608;REFB=0;REVB=0.0117984;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90015e-05;OID=.;OPOS=6622714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0 chr11 6626049 . G A 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0128071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8658;QD=17.6891;RBI=0.0533916;REFB=-0.0242668;REVB=-0.0518328;RO=26;SAF=15;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260685;STB=0.649202;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0283842;OID=.;OPOS=6626049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:6:15:12:14:6:15:12:14 chr11 6626072 . C A 188.56 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0110926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.249;QD=14.2312;RBI=0.0232528;REFB=0.00130746;REVB=-0.0204364;RO=31;SAF=15;SAR=7;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242561;STB=0.639302;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00114103;OID=.;OPOS=6626072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:7:15:14:17:7:15:14:17 chr11 6629665 . C T 284.33 PASS AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.0278372;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0967;QD=12.6371;RBI=0.0739087;REFB=0.0107305;REVB=-0.0684659;RO=55;SAF=21;SAR=12;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212711;STB=0.503266;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.00789109;OID=.;OPOS=6629665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:57:33:33:0.366667:12:21:34:21:12:21:36:21 chr11 6630028 . TCCCCCAT TCCCCAT,TCCCCATC 1096.27 PASS AF=1,0;AO=79,4;DP=92;FAO=92,0;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47,0;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116087,0.111506;FXX=0.0107515;HRUN=5,5;LEN=1,3;MLLD=15.7409,5.18753;QD=47.664;RBI=0.116186,0.121294;REFB=0,0;REVB=0.00479844,-0.0477362;RO=3;SAF=37,2;SAR=42,2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.650794,0;SSSB=-0.0368436,-0.357477;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00139728,0.0739778;OID=.,.;OPOS=6630029,6630033;OREF=C,CAT;OALT=-,ATC;OMAPALT=TCCCCAT,TCCCCATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:79,4:92:92,0:92:0:47,0:45,0:0:0:7:3:37,2:42,2:3:0 chr11 6630833 . G A 356.96 PASS AF=0.380531;AO=43;DP=113;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.0154793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.094;QD=12.6357;RBI=0.0191596;REFB=-0.0033134;REVB=-0.0112909;RO=70;SAF=10;SAR=33;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390549;STB=0.723575;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00715309;OID=.;OPOS=6630833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:70:70:43:43:0.380531:33:10:40:30:33:10:40:30 chr11 6634149 . C T 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00587171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.27;QD=63.1952;RBI=0.0264661;REFB=0;REVB=0.0258065;RO=0;SAF=34;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80318e-05;OID=.;OPOS=6634149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:58:34:0:0:58:34:0:0 chr11 6634189 . G A 492.3 PASS AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0251926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.228;QD=22.6343;RBI=0.0255006;REFB=-0.012546;REVB=-0.00395156;RO=40;SAF=20;SAR=27;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652767;STB=0.53588;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0123751;OID=.;OPOS=6634189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:40:40:47:47:0.54023:27:20:14:26:27:20:14:26 chr11 6636106 . T A 308.41 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0358365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4846;QD=18.4127;RBI=0.0455391;REFB=0.00696426;REVB=-0.028099;RO=34;SAF=8;SAR=25;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156371;STB=0.587849;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.00828676;OID=.;OPOS=6636106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:25:8:13:21:25:8:13:21 chr11 6638506 . A T 233.81 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.00735119;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.938;QD=12.4697;RBI=0.00808594;REFB=-0.0130086;REVB=-0.00336786;RO=41;SAF=12;SAR=16;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357625;STB=0.678849;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.01789;OID=.;OPOS=6638506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:41:47:28:28:0.373333:16:12:32:9:16:12:34:13 chr11 6640148 . T TG 39.3 PASS AF=0.30303;AO=11;DP=35;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=-0.0108071;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.8663;QD=4.76339;RBI=0.0882238;REFB=-0.0724584;REVB=-0.0875594;RO=24;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335788;STB=0.749658;STBP=0.154;TYPE=ins;VARB=0.165785;OID=.;OPOS=6640149;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.30303:11:35:10:33:23:4:6:2:21:39:24:4:7:3:21 chr11 6648414 . A G 187.95 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0256133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.236;QD=20.3185;RBI=0.0583289;REFB=-0.0118183;REVB=-0.0524043;RO=18;SAF=14;SAR=5;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399843;STB=0.725984;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0123608;OID=.;OPOS=6648414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:5:14:5:13:5:14:5:13 chr11 6648424 . G A 202.02 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.024965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.118;QD=21.265;RBI=0.0341979;REFB=-0.0262135;REVB=0.0233719;RO=18;SAF=17;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468273;STB=0.767436;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0150197;OID=.;OPOS=6648424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:3:17:7:11:3:17:7:11 chr11 6648573 . T C 91.18 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0290354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4153;QD=17.3676;RBI=0.0355057;REFB=0.0129673;REVB=-0.0204353;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116602;STB=0.567442;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.0154289;OID=.;OPOS=6648573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:4:7:5:5:4:7:5:5 chr11 6652618 . C T 278.89 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0100882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.764;QD=16.4053;RBI=0.0159412;REFB=-0.0111049;REVB=0.0123429;RO=37;SAF=17;SAR=14;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111826;STB=0.562873;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0124078;OID=.;OPOS=6652618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:14:17:16:21:14:17:16:21 chr11 6655433 . G A 240.89 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00609456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.118;QD=14.5991;RBI=0.00786571;REFB=-0.01387;REVB=0.0049725;RO=38;SAF=17;SAR=11;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00199619;STB=0.501133;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0153912;OID=.;OPOS=6655433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:11:17:23:15:11:17:23:15 chr11 6661810 . C G 64.45 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0161352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3082;QD=9.91525;RBI=0.0662132;REFB=0.000976916;REVB=0.0642172;RO=16;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325515;STB=0.719105;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00414745;OID=.;OPOS=6661810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:16:17:9:9:0.346154:2:7:8:8:2:7:8:9 chr11 6735869 . A G 447.52 PASS AF=0.626866;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.00423239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6831;QD=26.7173;RBI=0.00504725;REFB=-0.0478718;REVB=-0.00274983;RO=25;SAF=22;SAR=20;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111669;STB=0.560878;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0267627;OID=.;OPOS=6735869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:25:25:42:42:0.626866:20:22:9:16:20:22:9:16 chr11 6736745 . G A 157.03 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0275778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.171;QD=16.106;RBI=0.0276926;REFB=-0.0304484;REVB=0.00251828;RO=22;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104869;STB=0.560437;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0286466;OID=.;OPOS=6736745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:6:11:12:10:6:11:12:10 chr11 6737138 . T C 353.57 PASS AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0133102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.08;QD=23.9706;RBI=0.0160685;REFB=-0.0141842;REVB=0.0090019;RO=24;SAF=18;SAR=17;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105751;STB=0.505811;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0104493;OID=.;OPOS=6737138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:17:18:12:12:17:18:12:12 chr11 6737258 . C T 225.97 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0183208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7015;QD=20.543;RBI=0.0235111;REFB=0.0147548;REVB=-0.014735;RO=21;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594698;STB=0.523284;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.0145537;OID=.;OPOS=6737258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:22:22:22:0.5:13:9:10:11:13:9:10:12 chr11 6737893 . C T 88.76 PASS AF=0.5;AO=6;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00969757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.112;QD=16.1384;RBI=0.0354917;REFB=-0.0244823;REVB=0.0341411;RO=11;SAF=6;SAR=0;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.78856;STB=0.633914;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0317175;OID=.;OPOS=6737893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:22:22:11:11:6:11:0.5:0:6:3:8:5:6:3:8 chr11 6737927 . G A 103.51 PASS AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00472709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.246;QD=9.85817;RBI=0.060927;REFB=-0.00127582;REVB=-0.0607433;RO=29;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152806;STB=0.509211;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.000971579;OID=.;OPOS=6737927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:6:7:16:13:6:7:16:13 chr11 6737979 . T C 351.13 PASS AF=0.583333;AO=36;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0497126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5883;QD=23.4089;RBI=0.0537756;REFB=-0.0106992;REVB=-0.0205054;RO=24;SAF=24;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129771;STB=0.592538;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00873507;OID=.;OPOS=6737979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:24:25:36:35:0.583333:12:24:12:12:11:24:12:13 chr11 6738291 . C T 275.62 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0119488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0449;QD=18.0731;RBI=0.0408549;REFB=-0.0399214;REVB=-0.0390685;RO=31;SAF=7;SAR=23;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690643;STB=0.538773;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00908483;OID=.;OPOS=6738291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:23:7:9:22:23:7:9:22 chr11 6738728 . T C 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0016721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.313;QD=15.6256;RBI=0.0135441;REFB=-0.00262296;REVB=0.0134404;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864659;STB=0.54994;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00617292;OID=.;OPOS=6738728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:13:10:6:11:13:10 chr11 6738952 . G T 376.1 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0213466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.116;QD=23.8794;RBI=0.0270821;REFB=0.00256305;REVB=0.0166662;RO=25;SAF=10;SAR=27;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20703;STB=0.624206;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00277402;OID=.;OPOS=6738952;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:25:26:37:37:0.587302:27:10:13:12:27:10:14:12 chr11 6739109 . G A 205.35 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0577724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3411;QD=14.6682;RBI=0.0577725;REFB=0.044854;REVB=8.49778e-05;RO=32;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655112;STB=0.537352;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.0603638;OID=.;OPOS=6739109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:15:9:14:18:15:9:14:18 chr11 6739407 . A G 346.14 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00349217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4853;QD=19.5009;RBI=0.00367025;REFB=0.001869;REVB=0.00112938;RO=35;SAF=19;SAR=17;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373201;STB=0.52074;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=-0.00311681;OID=.;OPOS=6739407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:17:19:17:18:17:19:17:18 chr11 6739551 . T C 168.55 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0261312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.399;QD=16.0525;RBI=0.0266426;REFB=-0.000314322;REVB=0.00519471;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258698;STB=0.647513;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.000376075;OID=.;OPOS=6739551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:17:7:10:8:17:7 chr11 6739809 . C T 144.18 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00559083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2881;QD=24.0297;RBI=0.03956;REFB=0.0533125;REVB=-0.039163;RO=9;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468954;STB=0.526281;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=-0.0345618;OID=.;OPOS=6739809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:9:6:3:6:9:6:3:6 chr11 6739814 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.149;QD=53.9112;RBI=0.0329452;REFB=0;REVB=0.031383;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244904;OID=.;OPOS=6739814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr11 6739822 . T C 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0586617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4063;QD=11.4398;RBI=0.0635828;REFB=0.0096788;REVB=-0.0245272;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268092;STB=0.516093;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.0129549;OID=.;OPOS=6739822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:6:3:5:9:6:3:5:9 chr11 6739841 . G A 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0606193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.86;QD=22.9576;RBI=0.0611159;REFB=-0.000677522;REVB=-0.0077748;RO=11;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340571;STB=0.519102;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00120824;OID=.;OPOS=6739841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:11:5:3:8:11:5:3:8 chr11 6740136 . G A 238.09 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0172101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6351;QD=20.2627;RBI=0.0536096;REFB=-0.00313566;REVB=-0.0507721;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17163;STB=0.596182;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00828255;OID=.;OPOS=6740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:11:12:17:7:11:12:17:7 chr11 6740206 . C T 272.75 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0144946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.088;QD=24.2445;RBI=0.0281989;REFB=-0.025164;REVB=-0.0241885;RO=19;SAF=12;SAR=13;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280638;STB=0.662448;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0208394;OID=.;OPOS=6740206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:19:20:25:25:0.555556:13:12:16:3:13:12:17:3 chr11 6740285 . G A 324.09 PASS AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00577882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.024;QD=28.8081;RBI=0.0079456;REFB=0.00453701;REVB=0.00545323;RO=17;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447417;STB=0.524625;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00255877;OID=.;OPOS=6740285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:15:13:9:8:15:13:9:8 chr11 6740308 . C T 104.39 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00595813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.681;QD=10.4387;RBI=0.0148945;REFB=-0.00945761;REVB=0.0136509;RO=27;SAF=5;SAR=8;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111237;STB=0.566825;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0168307;OID=.;OPOS=6740308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:8:5:13:14:8:5:13:14 chr11 6740462 . G C 109.15 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0365957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.332;QD=14.0838;RBI=0.037594;REFB=-0.0353907;REVB=-0.00860591;RO=17;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339284;STB=0.723285;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0440215;OID=.;OPOS=6740462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:11:2:7:10:11:2:8:10 chr11 6790106 . T C 2180.77 PASS AF=0.992857;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0121334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4795;QD=62.3076;RBI=0.0151887;REFB=-0.116658;REVB=0.00913661;RO=0;SAF=62;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503225;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00101761;OID=.;OPOS=6790106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:140:140:0:1:139:139:0.992857:77:62:0:0:77:62:0:1 chr11 6807243 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.00528108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.807;QD=11.0198;RBI=0.00939818;REFB=-0.0162244;REVB=-0.00777406;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43608;STB=0.749459;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0169527;OID=.;OPOS=6807243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:0:8:4:2:0:8 chr11 6816778 . A G 176.78 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00155212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.413;QD=13.3416;RBI=0.00311465;REFB=-0.00980678;REVB=0.00270036;RO=32;SAF=5;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242663;STB=0.641205;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0113222;OID=.;OPOS=6816778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:16:5:14:18:16:5:14:18 chr11 6816875 . G A 236.51 PASS AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0125667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.705;QD=13.5147;RBI=0.0265151;REFB=-0.00666919;REVB=-0.023348;RO=42;SAF=11;SAR=17;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389085;STB=0.52223;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0122207;OID=.;OPOS=6816875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:42:42:28:28:0.4:17:11:18:24:17:11:18:24 chr11 6867894 . T C 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0295339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.077;QD=13.5054;RBI=0.0340759;REFB=-0.00662929;REVB=0.0169976;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449392;STB=0.526273;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0104964;OID=.;OPOS=6867894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:8:4:5:12:8:4:5:12 chr11 6891113 . A G 856.31 PASS AF=0.505882;AO=86;DP=172;FAO=86;FDP=170;FR=.;FRO=84;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.0172294;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1658;QD=20.1485;RBI=0.0368206;REFB=-0.0213921;REVB=0.0325409;RO=79;SAF=51;SAR=35;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991799;STB=0.540878;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0210502;OID=.;OPOS=6891113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:170:79:84:86:86:0.505882:35:51:38:41:35:51:43:41 chr11 6891528 . C G 154.98 PASS AF=0.295775;AO=21;DP=73;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0557866;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3672;QD=8.73146;RBI=0.0563276;REFB=-0.00504606;REVB=0.00778745;RO=47;SAF=8;SAR=13;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285415;STB=0.543134;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0111333;OID=.;OPOS=6891528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:47:50:21:21:0.295775:13:8:19:28:13:8:22:28 chr11 6891605 . A G 179.02 PASS AF=0.296296;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.00421059;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5524;QD=8.84034;RBI=0.0103777;REFB=-0.0237763;REVB=0.00948508;RO=57;SAF=8;SAR=16;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1324;STB=0.57888;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0563608;OID=.;OPOS=6891605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:57:57:24:24:0.296296:16:8:25:32:16:8:25:32 chr11 6891704 . T C 318.71 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00917548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1352;QD=20.8991;RBI=0.013372;REFB=-0.0191239;REVB=0.00972731;RO=28;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673239;STB=0.537291;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0181491;OID=.;OPOS=6891704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:15:18:13:15:15:18:13:15 chr11 6891758 . A C 198.71 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0101275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.669;QD=19.3859;RBI=0.0495829;REFB=-0.015246;REVB=0.0485376;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1535;STB=0.586384;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0326557;OID=.;OPOS=6891758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:15:6:9:11:15:6 chr11 6898663 . G A 190.15 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.059874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.576;QD=21.7312;RBI=0.0600611;REFB=-0.0191263;REVB=-0.004738;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720853;STB=0.540498;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0166904;OID=.;OPOS=6898663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:10:9:9:7:10:9:9:7 chr11 6898758 . A C 167.15 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00939624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.117;QD=15.1959;RBI=0.0170941;REFB=-0.0136262;REVB=0.0142801;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211975;STB=0.62176;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0163993;OID=.;OPOS=6898758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:8:10:9:17:8:10:9:17 chr11 6913127 . A G 96.82 PASS AF=0.6875;AO=10;DP=15;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.208166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.927;QD=24.2042;RBI=0.208234;REFB=0.00574309;REVB=0.00530895;RO=5;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671499;STB=0.512173;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00171773;OID=.;OPOS=6913127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:15:16:5:5:10:11:0.6875:7:3:2:3:7:4:2:3 chr11 6913244 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.519;QD=62.3503;RBI=0.0490893;REFB=0;REVB=-0.0398556;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.95345e-05;OID=.;OPOS=6913244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr11 6913290 . A G 210.71 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0272142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.484;QD=19.1552;RBI=0.0301959;REFB=-0.0213995;REVB=-0.0130836;RO=23;SAF=9;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00584432;STB=0.503308;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0264773;OID=.;OPOS=6913290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:12:9:10:13:12:9:10:13 chr11 6942476 . C A 151.19 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0101534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3071;QD=20.1586;RBI=0.0129336;REFB=-0.00572584;REVB=0.00801162;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164179;STB=0.593102;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00932562;OID=.;OPOS=6942476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:10:6:8:6:10:6:8:6 chr11 6942628 . A C 293.28 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0133284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.622;QD=15.6416;RBI=0.0256813;REFB=-0.0124001;REVB=-0.0219518;RO=42;SAF=11;SAR=22;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269034;STB=0.515142;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0183844;OID=.;OPOS=6942628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:22:11:13:29:22:11:13:29 chr11 6942726 . G C 250.58 PASS AF=0.42029;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0296914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2423;QD=14.5264;RBI=0.0585052;REFB=-0.0430132;REVB=0.0504111;RO=40;SAF=6;SAR=22;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237454;STB=0.611029;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0360044;OID=.;OPOS=6942726;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:28:29:0.42029:22:6:16:24:22:7:16:24 chr11 6942952 . T C 336.77 PASS AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.00913131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.352;QD=14.8033;RBI=0.0182088;REFB=-0.00215843;REVB=-0.0157537;RO=54;SAF=14;SAR=23;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319866;STB=0.518138;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00352258;OID=.;OPOS=6942952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:54:54:37:37:0.406593:23:14:22:32:23:14:22:32 chr11 6943254 . C T 298.97 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00855802;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7368;QD=20.9804;RBI=0.0394849;REFB=0.000649552;REVB=-0.0385463;RO=26;SAF=20;SAR=11;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305013;STB=0.668789;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00146147;OID=.;OPOS=6943254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:26:26:31:31:0.54386:11:20:7:19:11:20:7:19 chr11 6953858 . A G 53.69 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0259465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9456;QD=7.95458;RBI=0.031097;REFB=-0.00108689;REVB=-0.0171405;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062059;STB=0.538369;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=9.4565e-05;OID=.;OPOS=6953858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:6:2:4:15:6:2:4:15 chr11 6976988 . A T 454.08 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000314664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.635;QD=55.0395;RBI=0.116109;REFB=-0.138943;REVB=0.116109;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516119;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000579415;OID=.;OPOS=6976988;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:15:17:0:0:15:17:0:1 chr11 6976996 . C T 121.35 PASS AF=0.424242;AO=12;DP=31;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0131456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.146;QD=14.709;RBI=0.0240356;REFB=-0.0198889;REVB=0.0201222;RO=18;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378639;STB=0.656431;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0286751;OID=.;OPOS=6976996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:33:18:19:12:14:0.424242:3:9:7:11:5:9:7:12 chr11 7022038 . A G 481.81 PASS AF=0.481132;AO=50;DP=104;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0256237;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9727;QD=18.1815;RBI=0.0284529;REFB=0.0188422;REVB=-0.0123691;RO=54;SAF=24;SAR=26;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00138715;STB=0.50037;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=-0.0130151;OID=.;OPOS=7022038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:54:55:50:51:0.481132:26:24:26:28:26:25:27:28 chr11 7022160 . A G 1142.6 PASS AF=0.987179;AO=71;DP=71;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0256424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.464;QD=58.5948;RBI=0.0562474;REFB=-0.0543154;REVB=0.0500623;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506327;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000282678;OID=.;OPOS=7022160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:78:0:1:71:77:0.987179:33:38:0:0:39:38:0:1 chr11 7022531 . A T 1276.41 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.898;QD=61.5138;RBI=0.0355293;REFB=0;REVB=0.0158242;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20305e-05;OID=.;OPOS=7022531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:38:44:0:0:38:45:0:0 chr11 7022717 . T C 858.6 PASS AF=0.983607;AO=61;DP=62;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00886954;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.848;QD=56.3018;RBI=0.0331922;REFB=-0.0846878;REVB=0.0319852;RO=1;SAF=24;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192603;STB=0.510635;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.000212918;OID=.;OPOS=7022717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:62:61:1:1:61:60:0.983607:37:24:1:0:37:23:1:0 chr11 7059960 . A C 868.27 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.192;QD=57.8847;RBI=0.0249341;REFB=0;REVB=0.00949122;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125737;OID=.;OPOS=7059960;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:32:26:0:0:33:27:0:0 chr11 7063755 . C T 2178.5 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00680196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.287;QD=63.1448;RBI=0.00748448;REFB=0;REVB=0.00312263;RO=0;SAF=64;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.60952e-06;OID=.;OPOS=7063755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:74:64:0:0:74:64:0:0 chr11 7071031 . G A 1290.3 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0909876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3904;QD=61.4429;RBI=0.100359;REFB=0;REVB=-0.0423456;RO=0;SAF=28;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868483;OID=.;OPOS=7071031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:55:28:0:0:55:29:0:0 chr11 7079038 . G A 2389.71 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.564;QD=64.1533;RBI=0.0390409;REFB=0;REVB=-0.00271656;RO=0;SAF=67;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.67496e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12897e-05;OID=.;OPOS=7079038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:149:0:0:149:149:1:82:67:0:0:82:67:0:0 chr11 7110363 . G A 831.2 PASS AF=0.509091;AO=84;DP=165;FAO=84;FDP=165;FR=.;FRO=81;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.0185655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.43;QD=20.1504;RBI=0.0187365;REFB=-0.0199351;REVB=-0.00252544;RO=81;SAF=39;SAR=45;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485082;STB=0.526652;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0162884;OID=.;OPOS=7110363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:81:81:84:84:0.509091:45:39:42:39:45:39:42:39 chr11 7273437 . C T 149.08 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0281369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.962;QD=18.6355;RBI=0.0360524;REFB=-0.0435699;REVB=-0.0225409;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054861;STB=0.531211;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0367817;OID=.;OPOS=7273437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:9:7:8:8:9:7 chr11 7324475 . T C 1397.0 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.697;QD=62.7865;RBI=0.113941;REFB=0;REVB=-0.00803911;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106885;OID=.;OPOS=7324475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:89:0:0:87:89:1:48:39:0:0:48:41:0:0 chr11 7439264 . C T 594.59 PASS AF=0.551402;AO=59;DP=107;FAO=59;FDP=107;FR=.;FRO=48;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0148736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8034;QD=22.2275;RBI=0.0361616;REFB=0.029653;REVB=0.0329611;RO=47;SAF=38;SAR=21;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130688;STB=0.567706;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-0.021905;OID=.;OPOS=7439264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:47:48:59:59:0.551402:21:38:23:24:21:38:24:24 chr11 7441737 . T C 566.88 PASS AF=0.483607;AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.0137068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1855;QD=18.5861;RBI=0.0256435;REFB=8.61906e-05;REVB=0.0216729;RO=63;SAF=26;SAR=33;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092466;STB=0.551208;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000133883;OID=.;OPOS=7441737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:63:63:59:59:0.483607:33:26:34:29:33:26:34:29 chr11 7488666 . C G 289.02 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00290456;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.076;QD=16.0564;RBI=0.0179137;REFB=-0.0176663;REVB=-0.0176767;RO=40;SAF=16;SAR=16;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986873;STB=0.555521;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0204811;OID=.;OPOS=7488666;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:40:40:32:32:0.444444:16:16:24:16:16:16:24:16 chr11 7509566 . A T 207.68 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0700006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4284;QD=17.6747;RBI=0.0700298;REFB=-0.0147288;REVB=0.00202122;RO=26;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275555;STB=0.656992;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0264194;OID=.;OPOS=7509566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:7:14:10:16:7:14:10:16 chr11 7619518 . T C 1731.27 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000365511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.57;QD=60.7462;RBI=0.032295;REFB=0;REVB=0.0322929;RO=0;SAF=50;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25896e-05;OID=.;OPOS=7619518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:64:50:0:0:64:50:0:0 chr11 7619549 . G A 415.01 PASS AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0782089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.372;QD=16.768;RBI=0.0792583;REFB=-0.00751671;REVB=0.0128551;RO=55;SAF=16;SAR=27;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140421;STB=0.584376;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0111718;OID=.;OPOS=7619549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:56:43:43:0.434343:27:16:28:27:27:16:29:27 chr11 7662732 . C T 270.0 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00832169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.283;QD=22.9783;RBI=0.0131123;REFB=-0.0207984;REVB=-0.0101332;RO=22;SAF=18;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241571;STB=0.635573;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0266928;OID=.;OPOS=7662732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:7:18:10:12:7:18:10:12 chr11 7670440 . A G 1510.75 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.891;QD=63.6107;RBI=0.0188165;REFB=0;REVB=0.0179387;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.93542e-05;OID=.;OPOS=7670440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:56:38:0:0:56:39:0:0 chr11 7673015 . G A 510.37 PASS AF=0.5;AO=48;DP=103;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0156035;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.652;QD=18.9024;RBI=0.016069;REFB=-0.0199195;REVB=0.00383963;RO=54;SAF=27;SAR=21;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112258;STB=0.584343;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0175753;OID=.;OPOS=7673015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:108:54:54:48:54:0.5:21:27:24:30:21:33:24:30 chr11 7686602 . G GTGTT 195.6 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00665341;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=4;MLLD=278.602;QD=17.0089;RBI=0.00694862;REFB=0.00905847;REVB=-0.00200386;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687895;STB=0.54995;STBP=0.595;TYPE=ins;VARB=-0.0109114;OID=.;OPOS=7686603;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=GTGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.434783:20:47:20:46:26:11:9:12:14:99:27:11:9:13:14 chr11 7686674 . T C 298.44 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0149242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.579;QD=18.6528;RBI=0.0222229;REFB=-0.0106746;REVB=-0.0164659;RO=32;SAF=13;SAR=19;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119492;STB=0.56635;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0172408;OID=.;OPOS=7686674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:19:13:9:23:19:13:9:23 chr11 7687146 . G A 154.09 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0145371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.62;QD=14.3342;RBI=0.0155127;REFB=-0.00767847;REVB=0.0054144;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192031;STB=0.621481;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.021415;OID=.;OPOS=7687146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:7:10:10:15:7:10:10:16 chr11 7687715 . T C 421.29 PASS AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0090557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.536;QD=15.8976;RBI=0.0105237;REFB=-0.00723076;REVB=0.00536124;RO=59;SAF=22;SAR=25;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570009;STB=0.531901;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00652245;OID=.;OPOS=7687715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:59:47:47:0.443396:25:22:31:28:25:22:31:28 chr11 7710877 . C T 325.81 PASS AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00534369;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.432;QD=14.4804;RBI=0.00756489;REFB=-0.0109054;REVB=-0.00535467;RO=54;SAF=21;SAR=15;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108309;STB=0.561533;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0189269;OID=.;OPOS=7710877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:15:21:26:28:15:21:26:28 chr11 7711207 . T C 302.84 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0211152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.883;QD=14.5947;RBI=0.0220192;REFB=0.000656279;REVB=0.00624447;RO=49;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125717;STB=0.571186;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.00091417;OID=.;OPOS=7711207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:49:49:34:34:0.409639:16:18:20:29:16:18:20:29 chr11 7712471 . C T 309.14 PASS AF=0.384615;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00284275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.328;QD=13.5884;RBI=0.00337124;REFB=-0.00810234;REVB=-0.00181219;RO=55;SAF=24;SAR=11;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218834;STB=0.620618;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0136855;OID=.;OPOS=7712471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:55:56:35:35:0.384615:11:24:27:28:11:24:28:28 chr11 7712523 . G A 549.11 PASS AF=0.60241;AO=50;DP=83;FAO=50;FDP=83;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.0114345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.82;QD=26.463;RBI=0.0117884;REFB=-0.0222638;REVB=-0.00286683;RO=32;SAF=25;SAR=25;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134409;STB=0.578283;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00482677;OID=.;OPOS=7712523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:32:33:50:50:0.60241:25:25:22:10:25:25:23:10 chr11 7712561 . T A 457.02 PASS AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00697856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3682;QD=23.1401;RBI=0.0603474;REFB=-0.0142448;REVB=0.0599426;RO=35;SAF=26;SAR=18;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315955;STB=0.517357;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00880978;OID=.;OPOS=7712561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:18:26:22:13:18:26:22:13 chr11 7716855 . T A 2492.9 PASS AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00168653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9301;QD=61.553;RBI=0.0273485;REFB=0;REVB=-0.0272964;RO=0;SAF=130;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.96799e-05;OID=.;OPOS=7716855;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:32:130:0:0:32:130:0:0 chr11 7717219 . A T 57.14 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00408898;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=278.397;QD=28.5704;RBI=0.0498541;REFB=-0.112484;REVB=0.0496861;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.666107;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00248368;OID=.;OPOS=7717219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:1:6:0:1:1:6:0:1 chr11 7721870 . G A 2580.04 PASS AF=0.98324;AO=171;DP=179;FAO=176;FDP=179;FR=.;FRO=3;FSAF=101;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0596544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8616;QD=57.6545;RBI=0.094624;REFB=-0.0899429;REVB=0.073451;RO=6;SAF=99;SAR=72;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00521397;STB=0.501591;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0136312;OID=.;OPOS=7721870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:179:179:6:3:171:176:0.98324:72:99:3:3:75:101:2:1 chr11 7727886 . C T 232.15 PASS AF=0.325843;AO=29;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0119667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.266;QD=10.4339;RBI=0.016586;REFB=-0.00124195;REVB=-0.0114844;RO=60;SAF=20;SAR=9;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264534;STB=0.654843;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00592964;OID=.;OPOS=7727886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:60:60:29:29:0.325843:9:20:28:32:9:20:28:32 chr11 7847208 . T C 239.22 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0159937;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.612;QD=16.2183;RBI=0.0290478;REFB=0.00236495;REVB=-0.0242482;RO=32;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215465;STB=0.621599;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00352507;OID=.;OPOS=7847208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:32:32:27:27:0.457627:10:17:13:19:10:17:13:19 chr11 7847466 . A G 38.99 PASS AF=0.170732;AO=6;DP=40;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0267982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.267;QD=3.80363;RBI=0.0282276;REFB=-0.00987074;REVB=-0.00886875;RO=34;SAF=1;SAR=5;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363429;STB=0.638682;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.048947;OID=.;OPOS=7847466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:40:41:34:34:6:7:0.170732:5:1:15:19:5:2:15:19 chr11 7847472 . C T 70.22 PASS AF=0.243902;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0321885;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.394;QD=6.8505;RBI=0.033079;REFB=0.00298546;REVB=0.00762346;RO=31;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161417;STB=0.510184;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.009482;OID=.;OPOS=7847472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:41:41:31:31:10:10:0.243902:6:4:12:19:6:4:12:19 chr11 7871011 . A G 410.69 PASS AF=0.433962;AO=41;DP=102;FAO=46;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0129892;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.355;QD=15.4978;RBI=0.0158621;REFB=-0.00659818;REVB=0.00910422;RO=39;SAF=23;SAR=18;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200445;STB=0.549897;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00656677;OID=.;OPOS=7871011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:106:39:60:41:46:0.433962:18:23:21:18:22:24:26:34 chr11 7949350 . A G 2267.78 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.756;QD=63.4345;RBI=0.0221325;REFB=0;REVB=-0.0192546;RO=0;SAF=74;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.49116e-06;OID=.;OPOS=7949350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:143:0:0:142:143:1:68:74:0:0:68:75:0:0 chr11 7949791 . A C 135.49 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0198462;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.9749;QD=18.0656;RBI=0.040627;REFB=0.0201996;REVB=0.0354497;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589223;STB=0.533588;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=-0.0164606;OID=.;OPOS=7949791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:8:7:6:9:8:7:6:9 chr11 7949860 . G A 190.27 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0255669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.383;QD=21.7452;RBI=0.0324253;REFB=-0.00048236;REVB=-0.0199433;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10719;STB=0.55994;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000719101;OID=.;OPOS=7949860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:12:7:4:12:12:7:4:12 chr11 7950024 . A G 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0158394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4548;QD=14.6567;RBI=0.0372858;REFB=-0.00854891;REVB=-0.0337542;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198112;STB=0.615207;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0114405;OID=.;OPOS=7950024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:7:10:5:8:7:10 chr11 7960593 . G C 262.08 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00522159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.353;QD=25.5684;RBI=0.00949733;REFB=-0.0127148;REVB=0.00793311;RO=17;SAF=13;SAR=11;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17121;STB=0.59452;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0123385;OID=.;OPOS=7960593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:11:13:13:4:11:13:13:4 chr11 7961130 . C T 208.86 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.023694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.88;QD=25.3158;RBI=0.0239229;REFB=-0.0244966;REVB=0.0033016;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257122;STB=0.642718;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0159799;OID=.;OPOS=7961130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:12:8:10:3:12:8:10:3 chr11 8014479 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.375;QD=53.277;RBI=0.0240539;REFB=0;REVB=0.02125;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67079e-05;OID=.;OPOS=8014479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr11 8061231 . G A 296.41 PASS AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0159088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.602;QD=28.9178;RBI=0.0213265;REFB=-0.0206403;REVB=0.0142033;RO=15;SAF=12;SAR=14;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135562;STB=0.57457;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00875406;OID=.;OPOS=8061231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:14:12:10:5:14:12:10:5 chr11 8115699 . T C 1090.84 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165182;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.303;QD=60.6024;RBI=0.0346569;REFB=0;REVB=0.0304672;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381518;OID=.;OPOS=8115699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0 chr11 8123499 . G A 529.8 PASS AF=0.526316;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.0118696;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.203;QD=22.3073;RBI=0.0130054;REFB=-0.0102584;REVB=-0.00531551;RO=48;SAF=28;SAR=22;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116769;STB=0.584972;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00785547;OID=.;OPOS=8123499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:95:48:45:50:50:0.526316:22:28:33:15:22:28:33:12 chr11 8127495 . T C 1548.69 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270201;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.3059;QD=63.8637;RBI=0.0757787;REFB=0;REVB=-0.0707978;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000285799;OID=.;OPOS=8127495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0 chr11 8251921 . G C 379.59 PASS AF=0.418367;AO=40;DP=97;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0254947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.068;QD=15.4936;RBI=0.0277757;REFB=-0.029154;REVB=0.0110233;RO=57;SAF=15;SAR=25;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269797;STB=0.524301;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0348446;OID=.;OPOS=8251921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:57:57:40:41:0.418367:25:15:20:37:25:16:20:37 chr11 8284860 . G T 283.81 PASS AF=0.657895;AO=24;DP=37;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0277427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.657;QD=29.8742;RBI=0.080446;REFB=-0.0419777;REVB=0.075511;RO=13;SAF=13;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00205596;STB=0.507457;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00921643;OID=.;OPOS=8284860;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:13:13:24:25:0.657895:11:13:7:6:11:14:7:6 chr11 8435077 . CA TC 530.61 PASS AF=0.4;AO=58;DP=150;FAO=58;FDP=145;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.00459489;FXX=0.0333311;HRUN=1;LEN=2;MLLD=156.311;QD=14.6374;RBI=0.0128389;REFB=-0.0096366;REVB=-0.0119885;RO=87;SAF=25;SAR=33;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921341;STB=0.551953;STBP=0.319;TYPE=mnp;VARB=0.0136692;OID=.;OPOS=8435077;OREF=CA;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:145:87:87:58:58:0.4:33:25:45:42:33:25:45:42 chr11 8486310 . C A 1642.55 PASS AF=0.990991;AO=109;DP=112;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0488483;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.875;QD=59.1909;RBI=0.0519091;REFB=-0.0442895;REVB=0.0175612;RO=1;SAF=56;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840163;STB=0.504347;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000192078;OID=.;OPOS=8486310;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:111:1:1:109:110:0.990991:53:56:1:0:53:57:1:0 chr11 8646670 . T G 322.35 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0162853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.437;QD=16.5307;RBI=0.0794269;REFB=0.0145775;REVB=-0.0777394;RO=42;SAF=13;SAR=22;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261368;STB=0.65212;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0221356;OID=.;OPOS=8646670;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:43:35:35:0.448718:22:13:27:15:22:13:28:15 chr11 8646763 . G C 148.13 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0016791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.569;QD=17.9556;RBI=0.0395613;REFB=-0.0276955;REVB=0.0395257;RO=17;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304714;STB=0.674109;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0361072;OID=.;OPOS=8646763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:11:5:11:6:11:5:11:6 chr11 8669609 . CAAAAC CAAAC,CAAACA 49.07 PASS AF=0.325,0.025;AO=15,2;DP=40;FAO=13,1;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=6,1;FSAR=7,0;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.175925,-0.0376308;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=13.5668,209.974;QD=4.90678;RBI=0.225139,0.0398125;REFB=-0.131507,0.00249637;REVB=0.140492,-0.0129985;RO=22;SAF=9,2;SAR=6,0;SRF=7;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.281943,0.589202;STB=0.551921,0.991964;STBP=0.659,0.215;TYPE=del,mnp;VARB=0.114141,0.011787;OID=.,.;OPOS=8669610,8669613;OREF=A,AC;OALT=-,CA;OMAPALT=CAAAC,CAAACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.325,0.025:15,2:40:13,1:40:26:6,1:7,0:10:16:44:22:9,2:6,0:7:15 chr11 8693405 . G A 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.472;QD=62.7618;RBI=0.0188344;REFB=0;REVB=0.00292683;RO=0;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.00444e-05;OID=.;OPOS=8693405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:38:51:0:0:38:51:0:0 chr11 8717003 . C T 237.68 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0159748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.488;QD=18.6416;RBI=0.0339181;REFB=-0.00272205;REVB=-0.0299206;RO=25;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071161;STB=0.529757;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0027705;OID=.;OPOS=8717003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:26:25:25:0.490196:12:13:11:14:12:13:12:14 chr11 8788168 . A T 285.61 PASS AF=0.438356;AO=31;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00279208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.994;QD=15.6499;RBI=0.0182017;REFB=-0.00326463;REVB=-0.0179863;RO=41;SAF=21;SAR=10;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487533;STB=0.533959;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.00331221;OID=.;OPOS=8788168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:31:32:0.438356:10:21:26:15:10:22:26:15 chr11 8788225 . A C 188.21 PASS AF=0.363636;AO=22;DP=64;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0149075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.126;QD=11.4068;RBI=0.0233606;REFB=-0.00799793;REVB=0.0179857;RO=40;SAF=10;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504962;STB=0.541632;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0127179;OID=.;OPOS=8788225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:40:42:22:24:0.363636:12:10:20:20:13:11:22:20 chr11 8797709 . A G 32.13 PASS AF=0.545455;AO=4;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0450955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6307;QD=11.6846;RBI=0.0452064;REFB=-0.0743541;REVB=0.00316412;RO=6;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.742829;STB=0.739831;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.160735;OID=.;OPOS=8797709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:10:11:6:5:4:6:0.545455:0:4:2:4:1:5:2:3 chr11 8866808 . C G 354.0 PASS AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0143013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2269;QD=29.5001;RBI=0.0169092;REFB=-0.0339157;REVB=-0.00902185;RO=18;SAF=13;SAR=17;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310282;STB=0.517034;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0189992;OID=.;OPOS=8866808;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:17:13:7:11:17:13:7:11 chr11 8938934 . C T 269.72 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0517991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6787;QD=23.4538;RBI=0.0520546;REFB=-0.029427;REVB=0.0051509;RO=21;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639746;STB=0.535685;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0135855;OID=.;OPOS=8938934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:15:10:10:11:15:10:10:11 chr11 8942942 . C T 657.87 PASS AF=0.462069;AO=67;DP=145;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=32;FWDB=0.00958643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.74;QD=18.148;RBI=0.0103319;REFB=-0.0136768;REVB=0.00385351;RO=78;SAF=27;SAR=40;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180708;STB=0.600299;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0114618;OID=.;OPOS=8942942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:78:78:67:67:0.462069:40:27:46:32:40:27:46:32 chr11 8942999 . G A 2284.37 PASS AF=0.987013;AO=148;DP=151;FAO=152;FDP=154;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0412229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.359;QD=59.3344;RBI=0.0413772;REFB=-0.0277622;REVB=-0.00356963;RO=1;SAF=72;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656013;STB=0.500085;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=6.60954e-05;OID=.;OPOS=8942999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:151:154:1:2:148:152:0.987013:76:72:1:0:77:75:1:1 chr11 8947021 . A G 522.76 PASS AF=1;AO=26;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.214742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9708;QD=59.7444;RBI=0.225538;REFB=0;REVB=-0.0689444;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00284315;OID=.;OPOS=8947021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:26:35:1:14:12:0:0:14:21:0:0 chr11 8947179 . G A 487.76 PASS AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00840638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.098;QD=21.6783;RBI=0.0256022;REFB=-0.0321501;REVB=-0.0241827;RO=42;SAF=26;SAR=21;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166543;STB=0.585879;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0303169;OID=.;OPOS=8947179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:43:47:47:0.522222:21:26:15:27:21:26:16:27 chr11 8947283 . G C 331.23 PASS AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0145789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6812;QD=18.6607;RBI=0.0480819;REFB=-0.02966;REVB=0.0458184;RO=36;SAF=10;SAR=25;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108501;STB=0.560712;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.031552;OID=.;OPOS=8947283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:25:10:14:22:25:10:14:22 chr11 8947437 . C T 191.03 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0161734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.202;QD=13.4057;RBI=0.0173036;REFB=0.00258242;REVB=0.00615107;RO=34;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120336;STB=0.568663;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=-0.0035687;OID=.;OPOS=8947437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:13:10:11:23:13:10:11:23 chr11 8948680 . A T 346.5 PASS AF=0.634615;AO=33;DP=52;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0114199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1115;QD=26.6541;RBI=0.0114303;REFB=-0.000325443;REVB=0.000489094;RO=18;SAF=11;SAR=22;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396831;STB=0.53519;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.000437903;OID=.;OPOS=8948680;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:18:19:33:33:0.634615:22:11:7:11:22:11:8:11 chr11 8959370 . G A 378.52 PASS AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.00234413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.992;QD=16.4574;RBI=0.0224081;REFB=-0.0131438;REVB=0.0222852;RO=52;SAF=26;SAR=14;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581966;STB=0.53277;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.012571;OID=.;OPOS=8959370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:14:26:31:21:14:26:31:21 chr11 8959511 . T G 450.15 PASS AF=0.891892;AO=33;DP=37;FAO=33;FDP=37;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00277616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.997;QD=48.6644;RBI=0.0148052;REFB=-0.0335611;REVB=0.0145426;RO=4;SAF=16;SAR=17;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473726;STB=0.525436;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.000490098;OID=.;OPOS=8959511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:37:37:4:4:33:33:0.891892:17:16:1:3:17:16:1:3 chr11 8959545 . C A 282.27 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0309038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.334;QD=22.5817;RBI=0.0383956;REFB=-0.00226724;REVB=-0.0227854;RO=24;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139675;STB=0.577922;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00522864;OID=.;OPOS=8959545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:14:12:15:9:14:12:15:9 chr11 8968878 . GAGGACAT G 55.2 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00564578;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=7;MLLD=354.662;QD=7.61403;RBI=0.00564652;REFB=-0.00346666;REVB=9.11211e-05;RO=21;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171993;STB=0.608422;STBP=0.52;TYPE=del;VARB=0.00898208;OID=.;OPOS=8968879;OREF=AGGACAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.275862:8:30:8:29:21:3:5:11:10:55:21:3:5:11:10 chr11 8969309 . T C 260.59 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00236703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8494;QD=24.8185;RBI=0.00909725;REFB=0.0171525;REVB=-0.00878391;RO=18;SAF=14;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221129;STB=0.512285;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=-0.00766048;OID=.;OPOS=8969309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:10:14:11:7:10:14:11:7 chr11 8977830 . A G 83.13 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0168258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8954;QD=9.50031;RBI=0.0450791;REFB=0.00313339;REVB=0.0418212;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315535;STB=0.669769;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00125726;OID=.;OPOS=8977830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:35:23:24:11:11:0.314286:5:6:6:17:5:6:7:17 chr11 9005036 . T A 1116.94 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.8;QD=60.3752;RBI=0.0358542;REFB=0;REVB=-0.000755606;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8044e-05;OID=.;OPOS=9005036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:41:33:0:0:41:33:0:0 chr11 9009175 . A G 154.78 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.0179246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6925;QD=14.7411;RBI=0.0281568;REFB=-0.0129077;REVB=-0.0217144;RO=25;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185257;STB=0.605751;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0212728;OID=.;OPOS=9009175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:11:6:5:20:11:6:5:20 chr11 9045960 . T A 663.8 PASS AF=0.478571;AO=67;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=-0.00110594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.074;QD=18.9656;RBI=0.00913992;REFB=-0.00933135;REVB=-0.00907277;RO=72;SAF=28;SAR=39;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00119704;STB=0.50361;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0130807;OID=.;OPOS=9045960;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:72:73:67:67:0.478571:39:28:30:42:39:28:31:42 chr11 9052423 . A C 1020.29 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.91;QD=59.1473;RBI=0.130452;REFB=0;REVB=0.0310564;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343509;OID=.;OPOS=9052423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:35:33:0:0:35:34:0:0 chr11 9069046 . G A 311.94 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0221081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.059;QD=14.1791;RBI=0.0240212;REFB=-0.0176385;REVB=0.00939424;RO=53;SAF=17;SAR=18;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549866;STB=0.531232;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0261951;OID=.;OPOS=9069046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:53:53:35:35:0.397727:18:17:23:30:18:17:23:30 chr11 9305051 . T C 263.52 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0264957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1661;QD=17.5677;RBI=0.0282417;REFB=-0.0070804;REVB=-0.00977614;RO=31;SAF=7;SAR=22;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22734;STB=0.628476;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00791718;OID=.;OPOS=9305051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:22:7:14:17:22:7:14:17 chr11 9316937 . G A 987.9 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00121847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.82;QD=58.9789;RBI=0.014564;REFB=0;REVB=0.014513;RO=0;SAF=20;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74631e-05;OID=.;OPOS=9316937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:45:20:0:0:46:21:0:0 chr11 9406349 . T C 1252.65 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.816;QD=61.1048;RBI=0.0531618;REFB=0;REVB=0.0186199;RO=0;SAF=28;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50795e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.87679e-05;OID=.;OPOS=9406349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:53:28:0:0:54:28:0:0 chr11 9537904 . G C 594.51 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104163;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.087;QD=60.975;RBI=0.0147037;REFB=0;REVB=0.0103778;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95727e-05;OID=.;OPOS=9537904;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0 chr11 9748483 . T C 360.84 PASS AF=0.405941;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.00506946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.388;QD=14.2908;RBI=0.0159572;REFB=-0.0127268;REVB=-0.0151306;RO=60;SAF=21;SAR=20;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222206;STB=0.512566;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0177307;OID=.;OPOS=9748483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:60:60:41:41:0.405941:20:21:32:28:20:21:32:28 chr11 9749645 . A C 361.97 PASS AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0404843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0699;QD=17.875;RBI=0.045109;REFB=0.0011009;REVB=-0.0198959;RO=42;SAF=26;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162162;STB=0.598273;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00109396;OID=.;OPOS=9749645;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:43:38:38:0.469136:12:26:22:20:12:26:22:21 chr11 9754221 . C T 192.88 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=7.69222e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.741;QD=23.3797;RBI=0.0178283;REFB=-0.0114731;REVB=0.0178283;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200656;STB=0.61154;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0157957;OID=.;OPOS=9754221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:9:10:11:3:9:10:11:3 chr11 9769483 . C T 433.57 PASS AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00505465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.814;QD=23.4361;RBI=0.0231087;REFB=-0.0226662;REVB=-0.0225491;RO=32;SAF=14;SAR=28;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164173;STB=0.590432;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0290466;OID=.;OPOS=9769483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:28:14:17:15:28:14:17:15 chr11 9769562 . C G 350.29 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.00267736;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.726;QD=17.5143;RBI=0.00291635;REFB=-0.0209548;REVB=-0.00115622;RO=43;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878787;STB=0.549126;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0220186;OID=.;OPOS=9769562;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:19:18:17:26:19:18:17:26 chr11 9771886 . TCAAAA T 56.61 PASS AF=0.25;AO=5;DP=33;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00799733;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=215.102;QD=6.29024;RBI=0.0134014;REFB=-0.00799098;REVB=-0.0107537;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247279;STB=0.555432;STBP=0.735;TYPE=del;VARB=0.0281676;OID=.;OPOS=9771887;OREF=CAAAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25:5:33:9:36:27:4:5:14:13:56:11:3:2:4:7 chr11 9800601 . G A 679.02 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.672;QD=61.7286;RBI=0.0419099;REFB=0;REVB=-0.0102505;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35497e-05;OID=.;OPOS=9800601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:42:44:1:20:22:0:0:22:22:0:0 chr11 9800821 . T C 79.71 PASS AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0243004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8997;QD=7.08559;RBI=0.0609704;REFB=-0.0069168;REVB=0.0559186;RO=34;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162281;STB=0.510186;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0216739;OID=.;OPOS=9800821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:45:45:34:34:11:11:0.244444:5:6:19:15:5:6:19:15 chr11 9853777 . G C 338.5 PASS AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0244601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2193;QD=26.5493;RBI=0.0519448;REFB=0.0355159;REVB=0.0458254;RO=19;SAF=20;SAR=12;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141763;STB=0.57784;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0170198;OID=.;OPOS=9853777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:12:20:8:11:12:20:8:11 chr11 10521764 . T C 1139.14 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00819612;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.385;QD=60.7544;RBI=0.00827801;REFB=0;REVB=-0.00116151;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95338e-06;OID=.;OPOS=10521764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:41:33:0:0:42:33:0:0 chr11 10530491 . G A 258.53 PASS AF=0.5;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00177142;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.096;QD=18.4661;RBI=0.0182738;REFB=-0.0168657;REVB=0.0181877;RO=28;SAF=18;SAR=10;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2254;STB=0.626198;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0164786;OID=.;OPOS=10530491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:28:28:28:28:0.5:10:18:11:17:10:18:11:17 chr11 10555589 . A G 2029.09 PASS AF=0.992424;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000681448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9207;QD=61.4877;RBI=0.0273784;REFB=-0.0129101;REVB=0.0273699;RO=1;SAF=72;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798748;STB=0.504201;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00023963;OID=.;OPOS=10555589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:132:132:1:1:131:131:0.992424:59:72:0:1:59:72:0:1 chr11 10597081 . G A 1757.55 PASS AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208008;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.469;QD=61.1321;RBI=0.0290907;REFB=0;REVB=0.020337;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121585;OID=.;OPOS=10597081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:67:48:0:0:67:48:0:0 chr11 10647702 . G A 2565.07 PASS AF=1;AO=164;DP=164;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.078;QD=61.8089;RBI=0.0383207;REFB=0;REVB=0.0202983;RO=0;SAF=86;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.29459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.68613e-05;OID=.;OPOS=10647702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:164:166:0:0:164:166:1:78:86:0:0:80:86:0:0 chr11 10650329 . C T 510.09 PASS AF=0.947368;AO=34;DP=36;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0494337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.8192;QD=53.6933;RBI=0.0823525;REFB=-0.100498;REVB=0.0658653;RO=2;SAF=14;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622008;STB=0.531232;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0103441;OID=.;OPOS=10650329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:36:38:2:2:34:36:0.947368:20:14:2:0:21:15:2:0 chr11 10655609 . C T 1227.44 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6496;QD=61.372;RBI=0.0524729;REFB=0;REVB=-0.00628225;RO=0;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194636;OID=.;OPOS=10655609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:46:34:0:0:46:34:0:0 chr11 10673739 . T C,G 4305.73 PASS AF=0.939068,0.0609319;AO=263,15;DP=279;FAO=262,17;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=106,17;FSAR=156,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172578,-0.0303204;FXX=0.0035713;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=219.632,85.2911;QD=61.7309;RBI=0.0186259,0.0339289;REFB=0,0;REVB=0.00700651,-0.0152265;RO=0;SAF=107,15;SAR=156,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.08541e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00124169,0.048623;OID=.,.;OPOS=10673739,10673739;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:30:279:279:0:0:263,15:262,17:0.939068,0.0609319:156,0:107,15:0:0:156,0:106,17:0:0 chr11 10715124 . T C 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.399;QD=60.5473;RBI=0.0709005;REFB=0;REVB=0.0605322;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73905e-05;OID=.;OPOS=10715124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chr11 10786142 . C T 519.98 PASS AF=0.544444;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.00330302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7412;QD=23.11;RBI=0.0150226;REFB=-0.00737652;REVB=-0.014655;RO=41;SAF=21;SAR=28;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117376;STB=0.564331;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00596522;OID=.;OPOS=10786142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:41:41:49:49:0.544444:28:21:12:29:28:21:12:29 chr11 10786175 . C T 407.09 PASS AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.00577098;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6889;QD=17.3231;RBI=0.0101571;REFB=0.0133854;REVB=-0.00835843;RO=52;SAF=12;SAR=30;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133008;STB=0.574876;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.0227443;OID=.;OPOS=10786175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:30:12:21:31:30:12:21:31 chr11 10822350 . C T 2307.78 PASS AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.221;QD=61.1333;RBI=0.0139769;REFB=0;REVB=0.0123338;RO=0;SAF=60;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00268e-06;OID=.;OPOS=10822350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:91:60:0:0:91:60:0:0 chr11 10823079 . T C 241.49 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0066729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.694;QD=12.3839;RBI=0.0128053;REFB=-0.00544257;REVB=0.0109292;RO=48;SAF=9;SAR=20;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279874;STB=0.66715;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0279205;OID=.;OPOS=10823079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:48:49:29:29:0.371795:20:9:27:21:20:9:28:21 chr11 10828361 . C A 392.88 PASS AF=0.506329;AO=39;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.076096;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2136;QD=19.8927;RBI=0.0785273;REFB=0.0135421;REVB=0.019389;RO=40;SAF=20;SAR=19;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125255;STB=0.569586;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.011534;OID=.;OPOS=10828361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:39:39:40:0.506329:19:20:15:25:20:20:14:25 chr11 11354346 . T C 238.74 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0258136;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.317;QD=13.8397;RBI=0.0287942;REFB=-0.0183911;REVB=0.0127577;RO=40;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516604;STB=0.536206;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0305391;OID=.;OPOS=11354346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:14:14:22:18:14:14:23:18 chr11 11373508 . T C 785.19 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4402;QD=57.1047;RBI=0.0209993;REFB=0;REVB=0.011041;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299045;OID=.;OPOS=11373508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr11 11373587 . A G 1822.52 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.292;QD=61.2612;RBI=0.0348232;REFB=0;REVB=0.0187556;RO=0;SAF=63;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06526e-05;OID=.;OPOS=11373587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:56:63:0:0:56:63:0:0 chr11 11373635 . C T 2090.44 PASS AF=0.985401;AO=135;DP=137;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00957731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7505;QD=61.0347;RBI=0.0096155;REFB=0.00345417;REVB=-0.000856096;RO=2;SAF=69;SAR=66;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135777;STB=0.507142;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.000155579;OID=.;OPOS=11373635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:137:137:2:2:135:135:0.985401:66:69:2:0:66:69:2:0 chr11 11373808 . T G 1767.53 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.762;QD=60.9493;RBI=0.0436145;REFB=0;REVB=-0.0407375;RO=0;SAF=51;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27579e-05;OID=.;OPOS=11373808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:65:51:0:0:65:51:0:0 chr11 11373925 . A C 2214.84 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352192;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7732;QD=63.2812;RBI=0.0462396;REFB=0;REVB=-0.0299619;RO=0;SAF=63;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000307703;OID=.;OPOS=11373925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:77:63:0:0:77:63:0:0 chr11 11373960 . C T 586.05 PASS AF=0.469231;AO=61;DP=130;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.0321434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.562;QD=18.0323;RBI=0.0367005;REFB=-0.00937797;REVB=-0.0177126;RO=69;SAF=29;SAR=32;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530164;STB=0.529402;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0153137;OID=.;OPOS=11373960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:69:69:61:61:0.469231:32:29:29:40:32:29:29:40 chr11 11374016 . T A 2141.41 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.025;QD=62.9827;RBI=0.0252949;REFB=0;REVB=-0.0133334;RO=0;SAF=61;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39144e-06;OID=.;OPOS=11374016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:74:61:0:0:74:62:0:0 chr11 11374269 . A G 736.34 PASS AF=0.441341;AO=79;DP=179;FAO=79;FDP=179;FR=.;FRO=100;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=42;FWDB=0.0501993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.117;QD=16.4545;RBI=0.0504623;REFB=-0.021324;REVB=-0.00514555;RO=100;SAF=43;SAR=36;SRF=58;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362552;STB=0.520167;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.021772;OID=.;OPOS=11374269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:100:100:79:79:0.441341:36:43:58:42:36:43:58:42 chr11 11374283 . T G 3155.99 PASS AF=1;AO=197;DP=198;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029847;FXX=0.00505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.331;QD=64.081;RBI=0.0298548;REFB=0;REVB=0.000684251;RO=0;SAF=110;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21767e-05;OID=.;OPOS=11374283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:198:197:0:0:197:197:1:87:110:0:0:87:110:0:0 chr11 11913585 . G T 1534.04 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00751949;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=306.93;QD=62.6138;RBI=0.0125782;REFB=-0.109363;REVB=-0.0100831;RO=1;SAF=44;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106569;STB=0.505617;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000145057;OID=.;OPOS=11913585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:53:44:1:0:53:44:1:0 chr11 11976628 . G A 510.18 PASS AF=0.390728;AO=58;DP=151;FAO=59;FDP=151;FR=.;FRO=92;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=0.0425087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8598;QD=13.5147;RBI=0.0434702;REFB=0.000435595;REVB=-0.00909195;RO=93;SAF=30;SAR=28;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152959;STB=0.577802;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.000152508;OID=.;OPOS=11976628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:93:92:58:59:0.390728:28:30:35:58:29:30:35:57 chr11 11977573 . T C 330.74 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0110103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.546;QD=15.9395;RBI=0.0126063;REFB=-0.0132601;REVB=0.00613932;RO=46;SAF=20;SAR=16;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141357;STB=0.573293;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0148069;OID=.;OPOS=11977573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:46:47:36:36:0.433735:16:20:19:27:16:20:20:27 chr11 11978815 . T TGA 641.02 PASS AF=0.461538;AO=65;DP=145;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=0.00645619;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=2;MLLD=277.138;QD=17.9306;RBI=0.00648372;REFB=-0.012139;REVB=0.000596903;RO=78;SAF=33;SAR=32;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326768;STB=0.525617;STBP=0.582;TYPE=ins;VARB=0.0185906;OID=.;OPOS=11978816;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.461538:65:145:66:143:77:34:32:36:41:99:78:33:32:37:41 chr11 11986061 . T C 1396.28 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.646;QD=62.7541;RBI=0.0406059;REFB=0;REVB=-0.00668417;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26685e-05;OID=.;OPOS=11986061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:89:0:0:85:89:1:41:44:0:0:41:48:0:0 chr11 12023772 . AC A,AA 382.92 PASS AF=0.4,0.0181818;AO=15,23;DP=105;FAO=44,2;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=30,1;FSAR=14,1;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.0139599,0.0115212;FXX=0.0350846;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=217.078,217.706;QD=13.9243;RBI=0.0151092,0.0126077;REFB=-0.0106262,-0.00924034;REVB=-0.00578004,-0.00511998;RO=58;SAF=11,12;SAR=4,11;SRF=24;SRR=34;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.392493,0.129078;STB=0.622734,0.515001;STBP=0.045,0.865;TYPE=del,snp;VARB=0.0123207,0.0413056;OID=.,.;OPOS=12023773,12023773;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4,0.0181818:15,23:105:44,2:110:64:30,1:14,1:31:33:99:58:11,12:4,11:24:34 chr11 12225945 . GT G,GG 1510.95 PASS AF=0.134615,0.865385;AO=16,88;DP=104;FAO=14,90;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=0,48;FSAR=14,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397769,0.0391566;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=289.958,311.473;QD=58.1136;RBI=0.0602444,0.0565915;REFB=0,0;REVB=0.0452459,0.0408578;RO=0;SAF=2,46;SAR=14,42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0314461,-0.00386728;OID=.,.;OPOS=12225946,12225946;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.134615,0.865385:16,88:104:14,90:104:0:0,48:14,42:0:0:60:0:2,46:14,42:0:0 chr11 12246233 . G C 1337.86 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.162;QD=62.2262;RBI=0.0141804;REFB=0;REVB=-0.00211133;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107888;OID=.;OPOS=12246233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:85:86:1:56:29:0:0:56:30:0:0 chr11 12265542 . A G 415.2 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0245345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.272;QD=19.3118;RBI=0.0246026;REFB=-0.0136512;REVB=0.00182943;RO=44;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10785;STB=0.559971;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0168598;OID=.;OPOS=12265542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:18:24:20:24:18:24:20:24 chr11 12285090 . C T 794.27 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.505;QD=56.7338;RBI=0.0425657;REFB=0;REVB=0.0416206;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120641;OID=.;OPOS=12285090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:21:33:0:0:22:34:0:0 chr11 12285297 . A T 117.44 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00112446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.372;QD=21.3532;RBI=0.0116789;REFB=0.0024572;REVB=-0.0116247;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147025;STB=0.583207;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00206558;OID=.;OPOS=12285297;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:6:7:3:6:6:7:3:6 chr11 12315186 . G A 1438.34 PASS AF=0.978947;AO=92;DP=97;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0463488;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.71;QD=60.5619;RBI=0.05928;REFB=-0.158671;REVB=-0.0369583;RO=1;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957698;STB=0.500567;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000708969;OID=.;OPOS=12315186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:97:95:1:2:92:93:0.978947:49:43:0:1:49:44:1:1 chr11 12315256 . A C 321.33 PASS AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0149078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.919;QD=18.9015;RBI=0.0154736;REFB=-0.0316665;REVB=-0.00414603;RO=34;SAF=15;SAR=19;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136746;STB=0.57585;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0237693;OID=.;OPOS=12315256;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:19:15:10:24:19:15:10:24 chr11 12315407 . G C 411.09 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.9762;QD=56.7015;RBI=0.0865715;REFB=0;REVB=0.08395;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175144;OID=.;OPOS=12315407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0 chr11 12315716 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.026;QD=55.0987;RBI=0.0427235;REFB=0;REVB=0.00375744;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161045;OID=.;OPOS=12315716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr11 12315891 . G A 397.19 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445176;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.634;QD=56.7418;RBI=0.051289;REFB=0;REVB=0.0254705;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278222;OID=.;OPOS=12315891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0 chr11 12315915 . A G 104.39 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00547841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.286;QD=10.4387;RBI=0.017196;REFB=-0.0154516;REVB=-0.0163;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170118;STB=0.510188;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0304132;OID=.;OPOS=12315915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:5:8:17:10:5:8:17:10 chr11 12316085 . T A 364.31 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00968415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.732;QD=21.1193;RBI=0.0139632;REFB=0.00159563;REVB=-0.0100592;RO=32;SAF=10;SAR=27;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16211;STB=0.590113;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00162183;OID=.;OPOS=12316085;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:27:10:14:18:27:10:14:18 chr11 12534707 . G A 770.69 PASS AF=0.982143;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0270553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.939;QD=55.0493;RBI=0.0349738;REFB=0.0337423;REVB=0.0221625;RO=1;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149611;STB=0.507689;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000286212;OID=.;OPOS=12534707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:56:1:1:54:55:0.982143:31:23:0:1:32:23:0:1 chr11 12550368 . TATA T 746.91 PASS AF=0.496599;AO=71;DP=146;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.0197888;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=273.414;QD=20.324;RBI=0.0199085;REFB=-0.00935519;REVB=0.00217974;RO=74;SAF=30;SAR=41;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347444;STB=0.524984;STBP=0.594;TYPE=del;VARB=0.00868008;OID=.;OPOS=12550369;OREF=ATA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.496599:71:146:73:147:74:30:43:34:40:99:74:30:41:34:40 chr11 12903443 . C T 220.44 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0216114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.664;QD=24.493;RBI=0.0232551;REFB=-0.0148462;REVB=0.00858764;RO=15;SAF=6;SAR=15;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992364;STB=0.555501;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00983529;OID=.;OPOS=12903443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:15:6:6:9:15:6:6:9 chr11 13374828 . G A 263.8 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.000430583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.299;QD=12.8682;RBI=0.00195062;REFB=-0.00306185;REVB=-0.0019025;RO=49;SAF=18;SAR=13;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119632;STB=0.580593;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00626965;OID=.;OPOS=13374828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:51:31:31:0.378049:13:18:23:26:13:18:23:28 chr11 13398129 . T A 1591.56 PASS AF=0.990741;AO=104;DP=105;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00375354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.454;QD=58.9466;RBI=0.067555;REFB=-0.047445;REVB=0.0674506;RO=1;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958601;STB=0.504761;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=3.95151e-05;OID=.;OPOS=13398129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:105:108:1:1:104:107:0.990741:49:55:0:1:52:55:0:1 chr11 13929046 . T A 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00374778;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=299.765;QD=12.7823;RBI=0.0390446;REFB=0.00233565;REVB=-0.0388644;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275052;STB=0.663456;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=-0.00421926;OID=.;OPOS=13929046;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:7:3:8:6:7:3:8:6 chr11 13984583 . C T 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.101409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.591;QD=20.8978;RBI=0.101455;REFB=-0.0201397;REVB=-0.00304323;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215906;STB=0.624687;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0163691;OID=.;OPOS=13984583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:3:5:1:3:3:5:1:3 chr11 14101493 . G GC 900.33 PASS AF=1;AO=77;DP=83;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.7258;QD=45.0164;RBI=0.0696886;REFB=0;REVB=0.0557267;RO=4;SAF=45;SAR=32;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402283;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00230128;OID=.;OPOS=14101494;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:77:83:80:80:0:48:32:0:0:16:4:45:32:4:0 chr11 14632570 . A C 146.0 PASS AF=0.369565;AO=15;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0093188;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.797;QD=12.6955;RBI=0.0136425;REFB=-0.0146097;REVB=0.00996387;RO=29;SAF=8;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593827;STB=0.53604;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0213794;OID=.;OPOS=14632570;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:29:29:15:17:0.369565:7:8:17:12:8:9:17:12 chr11 14810762 . A G 332.54 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0195301;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.953;QD=16.0261;RBI=0.020035;REFB=0.000990431;REVB=-0.0044695;RO=47;SAF=18;SAR=18;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117802;STB=0.566229;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00123982;OID=.;OPOS=14810762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:18:18:29:18:18:18:29:18 chr11 14991539 . T C 2686.14 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4335;QD=62.1073;RBI=0.0628135;REFB=0;REVB=-0.0606017;RO=0;SAF=103;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000284824;OID=.;OPOS=14991539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:173:0:0:173:173:1:70:103:0:0:70:103:0:0 chr11 15199957 . T C 256.94 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0311572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.278;QD=16.0585;RBI=0.0341812;REFB=-0.0253891;REVB=-0.0140564;RO=35;SAF=22;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295901;STB=0.668162;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.029288;OID=.;OPOS=15199957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:7:22:17:18:7:22:17:18 chr11 16812397 . G A 184.19 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0541268;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0995;QD=13.3954;RBI=0.1193;REFB=-0.034767;REVB=0.106314;RO=33;SAF=9;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485094;STB=0.527893;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0519177;OID=.;OPOS=16812397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:13:9:15:18:13:9:15:18 chr11 16847973 . C T 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0278138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.154;QD=13.9117;RBI=0.0282006;REFB=-0.0142596;REVB=0.00465502;RO=31;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255701;STB=0.514692;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0158824;OID=.;OPOS=16847973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:11:10:14:17:11:10:14:17 chr11 17035718 . A G 34.24 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0527131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.447;QD=22.8238;RBI=0.14851;REFB=-0.182635;REVB=-0.13884;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0441121;OID=.;OPOS=17035718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:1:4:0:0:1:4:1:0 chr11 17108868 . ACT A 246.18 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00479625;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=2;MLLD=224.515;QD=17.5843;RBI=0.0163961;REFB=-0.00318264;REVB=-0.0156789;RO=29;SAF=7;SAR=20;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232456;STB=0.631475;STBP=0.089;TYPE=del;VARB=0.00607416;OID=.;OPOS=17108869;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.482143:27:57:27:56:29:7:20:14:15:99:29:7:20:14:15 chr11 17172133 . T C 243.15 PASS AF=0.311321;AO=32;DP=106;FAO=33;FDP=106;FR=.;FRO=73;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=52;FSRR=21;FWDB=0.0456535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.667;QD=9.17549;RBI=0.0456803;REFB=-0.0149738;REVB=0.00156405;RO=74;SAF=12;SAR=20;SRF=52;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374957;STB=0.727148;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0228492;OID=.;OPOS=17172133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:74:73:32:33:0.311321:20:12:52:22:21:12:52:21 chr11 17333663 . G A 465.1 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9098;QD=58.138;RBI=0.0233928;REFB=0;REVB=-0.00031842;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383887;OID=.;OPOS=17333663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr11 17339127 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000216259;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.853;QD=59.4357;RBI=0.0270765;REFB=0;REVB=0.0270756;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81443e-05;OID=.;OPOS=17339127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0 chr11 17351683 . C G 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0206052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0418;QD=11.9533;RBI=0.0254822;REFB=-0.0310498;REVB=-0.0149922;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131886;STB=0.578755;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0387458;OID=.;OPOS=17351683;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:4:7:4:4:4:7 chr11 17352476 . TTACA T,TT 207.73 PASS AF=0,0.438596;AO=9,14;DP=56;FAO=0,25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=0,9;FSAR=0,16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.022971,0.0239832;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=4,3;MLLD=309.893,316.711;QD=14.5773;RBI=0.0282599,0.028768;REFB=-0.0140156,-0.0149773;REVB=0.0164606,0.0158872;RO=30;SAF=5,2;SAR=4,12;SRF=18;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.054457,-0.550217;STB=0.5,0.63177;STBP=1,0.101;TYPE=del,del;VARB=0,0.0143746;OID=.,.;OPOS=17352477,17352478;OREF=TACA,ACA;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.438596:9,14:56:0,25:57:32:0,9:0,16:19:13:99:30:5,2:4,12:18:12 chr11 17408251 . G A 130.66 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.000718899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.525;QD=13.7535;RBI=0.0121064;REFB=0.00416927;REVB=-0.012085;RO=20;SAF=13;SAR=2;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.53045;STB=0.839818;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00262044;OID=.;OPOS=17408251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:23:15:15:0.394737:2:13:8:12:2:13:8:15 chr11 17408404 . C T 227.63 PASS AF=0.298077;AO=31;DP=104;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.000113258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.256;QD=8.755;RBI=0.00912041;REFB=-0.0205534;REVB=-0.00911971;RO=71;SAF=15;SAR=16;SRF=21;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227494;STB=0.619452;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0357495;OID=.;OPOS=17408404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:71:73:31:31:0.298077:16:15:21:50:16:15:23:50 chr11 17408630 . C T 217.7 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0206118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.842;QD=15.5502;RBI=0.0669517;REFB=-0.0159104;REVB=-0.0636999;RO=30;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833889;STB=0.537773;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0198294;OID=.;OPOS=17408630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:30:31:25:25:0.446429:13:12:17:13:13:12:17:14 chr11 17409069 . G A 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00517507;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.54;QD=13.4559;RBI=0.0121705;REFB=-0.0174749;REVB=0.0110154;RO=15;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496106;STB=0.793558;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0277084;OID=.;OPOS=17409069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:2:9:5:10:2:9:5:10 chr11 17409572 . T C 307.41 PASS AF=0.574074;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.000130328;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.062;QD=22.7708;RBI=0.00750558;REFB=-0.0434171;REVB=0.00750445;RO=23;SAF=21;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129897;STB=0.571936;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0341518;OID=.;OPOS=17409572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:23:23:31:31:0.574074:10:21:12:11:10:21:12:11 chr11 17418477 . C A 588.46 PASS AF=0.609195;AO=52;DP=87;FAO=53;FDP=87;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.013681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7286;QD=27.0558;RBI=0.0374348;REFB=-0.023465;REVB=0.0348453;RO=34;SAF=22;SAR=30;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141048;STB=0.579283;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0124759;OID=.;OPOS=17418477;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:34:34:52:53:0.609195:30:22:21:13:31:22:21:13 chr11 17448704 . G A 558.08 PASS AF=0.974359;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00190809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.708;QD=57.2385;RBI=0.0321369;REFB=0.0015496;REVB=0.0320802;RO=1;SAF=21;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021769;STB=0.510633;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000110416;OID=.;OPOS=17448704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:39:1:1:36:38:0.974359:15:21:1:0:15:23:1:0 chr11 17522638 . G A 313.76 PASS AF=0.561404;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.05395;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.94;QD=22.018;RBI=0.078663;REFB=0.00225222;REVB=-0.0572473;RO=26;SAF=16;SAR=16;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623041;STB=0.543832;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.0017854;OID=.;OPOS=17522638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:26:25:32:32:0.561404:16:16:15:11:16:16:15:10 chr11 17542439 . T C,G 1885.75 PASS AF=0.944444,0.0555556;AO=115,10;DP=125;FAO=119,7;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=71,2;FSAR=48,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000986704,-0.000120247;FXX=0.0078734;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=205.065,162.745;QD=59.8651;RBI=0.00567105,0.00522476;REFB=0,0;REVB=0.00558455,0.00522337;RO=0;SAF=71,2;SAR=44,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.35954e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000456358,0.0553197;OID=.,.;OPOS=17542439,17542439;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:125:126:0:0:115,10:119,7:0.944444,0.0555556:44,8:71,2:0:0:48,5:71,2:0:0 chr11 17627613 . G C 762.52 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.841;QD=56.4828;RBI=0.0456969;REFB=0;REVB=0.0387121;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6565e-05;OID=.;OPOS=17627613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:22:32:0:0 chr11 17795089 . G A 223.5 PASS AF=0.583333;AO=20;DP=33;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0634976;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.35;QD=24.8331;RBI=0.0662888;REFB=-0.00915117;REVB=0.0190331;RO=13;SAF=13;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00547027;OID=.;OPOS=17795089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:36:13:15:20:21:0.583333:7:13:8:5:7:14:10:5 chr11 17948311 . T C 441.34 PASS AF=0.6;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0134392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.794;QD=25.2192;RBI=0.0134575;REFB=-0.0116312;REVB=0.000701865;RO=28;SAF=22;SAR=20;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017419;STB=0.509532;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00705623;OID=.;OPOS=17948311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:28:42:42:0.6:20:22:14:14:20:22:14:14 chr11 17981047 . C T 207.95 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00242984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.738;QD=13.4158;RBI=0.0263281;REFB=-0.0105755;REVB=-0.0262157;RO=37;SAF=18;SAR=7;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206331;STB=0.618811;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0207932;OID=.;OPOS=17981047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:7:18:20:17:7:18:20:17 chr11 18022305 . TCAC T 287.8 PASS AF=0.492063;AO=30;DP=65;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0068773;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=3;MLLD=285.345;QD=18.2727;RBI=0.00949164;REFB=-0.0151614;REVB=-0.00654172;RO=31;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431898;STB=0.539911;STBP=0.596;TYPE=del;VARB=0.0143106;OID=.;OPOS=18022306;OREF=CAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.492063:30:65:31:63:32:13:18:11:21:99:31:12:18:11:20 chr11 18127530 . A ACCTCCT 117.81 PASS AF=0.264706;AO=16;DP=68;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0598122;FXX=0;HRUN=2;LEN=6;MLLD=210.933;QD=6.92991;RBI=0.0603069;REFB=-0.0233745;REVB=0.00770817;RO=47;SAF=4;SAR=12;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30973;STB=0.722157;STBP=0.037;TYPE=ins;VARB=0.0493626;OID=.;OPOS=18127531;OREF=-;OALT=CCTCCT;OMAPALT=ACCTCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.264706:16:68:18:68:50:4:14:25:25:99:47:4:12:23:24 chr11 18159169 . A G 1867.57 PASS AF=1;AO=120;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207402;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.953;QD=61.2317;RBI=0.025487;REFB=0;REVB=-0.0148131;RO=0;SAF=63;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000267737;OID=.;OPOS=18159169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:122:0:0:120:122:1:57:63:0:0:59:63:0:0 chr11 18159254 . A G 1609.51 PASS AF=0.965217;AO=108;DP=113;FAO=111;FDP=115;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0124054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.285;QD=55.9831;RBI=0.0348112;REFB=-0.0335702;REVB=-0.0325257;RO=4;SAF=46;SAR=62;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223589;STB=0.511589;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00108116;OID=.;OPOS=18159254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:113:115:4:4:108:111:0.965217:62:46:3:1:64:47:3:1 chr11 18194827 . C G 84.33 PASS AF=0.314286;AO=10;DP=36;FAO=11;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0050054;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.274;QD=9.63741;RBI=0.0298379;REFB=-0.00591331;REVB=0.0294151;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978809;STB=0.644926;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0126456;OID=.;OPOS=18194827;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:36:35:19:24:10:11:0.314286:4:6:13:6:5:6:18:6 chr11 18194878 . T G 206.09 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.00772034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2221;QD=16.8235;RBI=0.00885981;REFB=0.00118322;REVB=-0.00434655;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28019;STB=0.658948;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00255271;OID=.;OPOS=18194878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:20:8:12:9:20:8 chr11 18194944 . T A 252.7 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0331963;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.908;QD=17.1321;RBI=0.034058;REFB=-0.00815337;REVB=-0.00761252;RO=31;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2336;STB=0.631045;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0118389;OID=.;OPOS=18194944;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:31:31:28:28:0.474576:11:17:11:20:11:17:11:20 chr11 18194964 . A G 284.65 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0282318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.956;QD=17.7907;RBI=0.0320489;REFB=-0.0264286;REVB=-0.0151689;RO=33;SAF=10;SAR=21;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214094;STB=0.620173;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0369046;OID=.;OPOS=18194964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:21:10:18:15:21:10:18:15 chr11 18195051 . T C 1077.36 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0657808;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.286;QD=58.2358;RBI=0.0738567;REFB=0.00461779;REVB=0.0335813;RO=1;SAF=32;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145519;STB=0.50769;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-6.52861e-05;OID=.;OPOS=18195051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:41:32:1:0:41:32:1:0 chr11 18195448 . C T 586.89 PASS AF=0.588889;AO=53;DP=90;FAO=53;FDP=90;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.012308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.676;QD=26.0839;RBI=0.0123921;REFB=-0.00452214;REVB=-0.00144181;RO=37;SAF=17;SAR=36;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135155;STB=0.574003;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00474747;OID=.;OPOS=18195448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:37:37:53:53:0.588889:36:17:18:19:36:17:18:19 chr11 18210580 . C T 337.38 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.037809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.196;QD=20.1419;RBI=0.108791;REFB=-0.0200951;REVB=0.10201;RO=32;SAF=15;SAR=20;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141877;STB=0.578678;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0109809;OID=.;OPOS=18210580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:20:15:19:13:20:15:19:13 chr11 18231749 . T G 621.08 PASS AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.031237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3204;QD=59.1502;RBI=0.0482643;REFB=-0.120277;REVB=0.0367926;RO=2;SAF=20;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446131;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0059179;OID=.;OPOS=18231749;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:42:42:2:1:40:41:0.97619:20:20:2:0:20:21:1:0 chr11 18231915 . T C 515.54 PASS AF=0.972222;AO=36;DP=38;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.01944;FXX=0.0526177;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.966;QD=57.2824;RBI=0.0198194;REFB=-0.0384461;REVB=-0.00385908;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510198;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.000135645;OID=.;OPOS=18231915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:36:0:1:36:35:0.972222:12:24:0:0:11:24:1:0 chr11 18253176 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.511;QD=55.0986;RBI=0.0359482;REFB=0;REVB=0.0214026;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.77293e-05;OID=.;OPOS=18253176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr11 18267027 . C T 1418.87 PASS AF=0.98913;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0177852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.831;QD=61.6901;RBI=0.0206905;REFB=-0.0681233;REVB=0.0105727;RO=1;SAF=38;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123092;STB=0.506328;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000380663;OID=.;OPOS=18267027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:92:1:1:90:91:0.98913:52:38:1:0:52:39:1:0 chr11 18267463 . A G 109.18 PASS AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0179764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1127;QD=8.5632;RBI=0.0187093;REFB=-0.0281775;REVB=-0.00518555;RO=37;SAF=8;SAR=6;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028236;STB=0.517217;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0357739;OID=.;OPOS=18267463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:6:8:22:15:6:8:22:15 chr11 18267471 . A G 224.7 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0102422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.6;QD=19.9733;RBI=0.0127648;REFB=-0.0271598;REVB=-0.00761818;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512184;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0225961;OID=.;OPOS=18267471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:23:22:22:0.488889:10:12:12:10:10:12:12:11 chr11 18267478 . G A 112.24 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0320048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.679;QD=9.97672;RBI=0.0320076;REFB=-0.00590882;REVB=-0.000422304;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438412;STB=0.538406;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0393208;OID=.;OPOS=18267478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:31:14:14:0.311111:6:8:16:14:6:8:16:15 chr11 18291321 . T C 610.95 PASS AF=0.5;AO=63;DP=125;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00136021;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.374;QD=19.7081;RBI=0.00189312;REFB=-0.0153003;REVB=-0.00131671;RO=62;SAF=37;SAR=26;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10851;STB=0.556877;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0160018;OID=.;OPOS=18291321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:62:62:63:62:0.5:26:37:29:33:26:36:29:33 chr11 18327684 . G T 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.177;QD=57.6799;RBI=0.017454;REFB=0;REVB=-0.00505902;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13665e-05;OID=.;OPOS=18327684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0 chr11 18388128 . G C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.596;QD=59.018;RBI=0.026098;REFB=0;REVB=0.0144607;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.92894e-05;OID=.;OPOS=18388128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr11 18424451 . C T 239.01 PASS AF=0.306122;AO=30;DP=98;FAO=30;FDP=98;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0153052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.939;QD=9.75565;RBI=0.0349787;REFB=-0.00299642;REVB=-0.0314525;RO=66;SAF=12;SAR=18;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136042;STB=0.580193;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00904837;OID=.;OPOS=18424451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:66:68:30:30:0.306122:18:12:34:32:18:12:35:33 chr11 18424487 . A G 282.04 PASS AF=0.351064;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.000313839;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1247;QD=12.0015;RBI=0.0188879;REFB=-0.00157247;REVB=-0.0188852;RO=61;SAF=16;SAR=17;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630759;STB=0.536359;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00167815;OID=.;OPOS=18424487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:61:61:33:33:0.351064:17:16:33:28:17:16:33:28 chr11 18467821 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.62;QD=58.7817;RBI=0.0404564;REFB=0;REVB=0.0244715;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.69094e-05;OID=.;OPOS=18467821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0 chr11 18505552 . G A 185.83 PASS AF=0.407407;AO=14;DP=56;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00918229;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.176;QD=13.7654;RBI=0.0201286;REFB=-0.0208885;REVB=-0.0179121;RO=28;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410956;STB=0.563701;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0213786;OID=.;OPOS=18505552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:54:28:32:14:22:0.407407:8:6:11:17:10:12:14:18 chr11 18555901 . C G 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0125332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.27;QD=18.9665;RBI=0.013276;REFB=0.00365872;REVB=-0.00437828;RO=25;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482031;STB=0.527248;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.00310526;OID=.;OPOS=18555901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:13:9:9:16:13:9:9:16 chr11 18555949 . T C 190.96 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.00956847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.119;QD=13.4006;RBI=0.00981276;REFB=-0.0175218;REVB=-0.00217594;RO=34;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186555;STB=0.605975;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0196955;OID=.;OPOS=18555949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:13:10:9:25:13:10:9:25 chr11 18600322 . T G 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0013375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.305;QD=17.4014;RBI=0.00314842;REFB=-0.0095298;REVB=0.0028502;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136804;STB=0.578197;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0119431;OID=.;OPOS=18600322;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:7:6:4:9:7:6:4:9 chr11 18724558 . C T 521.03 PASS AF=0.947368;AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0206547;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.406;QD=54.8457;RBI=0.0246431;REFB=-0.00988635;REVB=0.0134411;RO=2;SAF=23;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389783;STB=0.520822;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000914686;OID=.;OPOS=18724558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:39:38:2:2:36:36:0.947368:13:23:2:0:13:23:2:0 chr11 18735396 . G T 239.46 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.122;QD=50.4132;RBI=0.0273596;REFB=0;REVB=0.016408;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231562;OID=.;OPOS=18735396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:7:11:0:0:7:12:0:0 chr11 18735947 . T C 785.65 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0783648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.777;QD=64.1345;RBI=0.0894952;REFB=0;REVB=0.0432243;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000826925;OID=.;OPOS=18735947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr11 18737095 . C T 1135.67 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.681;QD=60.5689;RBI=0.052291;REFB=0;REVB=0.0107576;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017158;OID=.;OPOS=18737095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:44:30:0:0:44:31:0:0 chr11 18738281 . C T 501.61 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00846421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.754;QD=59.0126;RBI=0.0561389;REFB=0;REVB=-0.0554971;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000391851;OID=.;OPOS=18738281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr11 18743091 . G A 1302.09 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.5;QD=62.0042;RBI=0.0658026;REFB=0;REVB=0.0328933;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174144;OID=.;OPOS=18743091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:35:49:0:0:35:49:0:0 chr11 18955744 . C T 123.79 PASS AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00382978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.863;QD=8.6872;RBI=0.00951754;REFB=-0.0100579;REVB=0.008713;RO=40;SAF=9;SAR=8;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113623;STB=0.567772;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.02086;OID=.;OPOS=18955744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:40:40:17:17:0.298246:8:9:25:15:8:9:25:15 chr11 18956194 . T C 505.29 PASS AF=0.321429;AO=63;DP=198;FAO=63;FDP=196;FR=.;FRO=133;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=65;FSRR=68;FWDB=-0.0114466;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.075;QD=10.312;RBI=0.0170687;REFB=-0.00445307;REVB=-0.0126615;RO=134;SAF=31;SAR=32;SRF=66;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000558166;STB=0.502268;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00866254;OID=.;OPOS=18956194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:196:134:133:63:63:0.321429:32:31:66:68:32:31:65:68 chr11 18956196 . C T 386.19 PASS AF=0.270936;AO=55;DP=203;FAO=55;FDP=203;FR=.;FRO=148;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=73;FSRR=75;FWDB=-0.00133562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4787;QD=7.60972;RBI=0.0202168;REFB=-0.0061204;REVB=0.0201727;RO=148;SAF=23;SAR=32;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932865;STB=0.555194;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.013096;OID=.;OPOS=18956196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:148:148:55:55:0.270936:32:23:73:75:32:23:73:75 chr11 19167850 . A G 1528.24 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5523;QD=63.6766;RBI=0.0416441;REFB=0;REVB=0.00373505;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000277317;OID=.;OPOS=19167850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:50:46:0:0:50:46:0:0 chr11 19245854 . T C 1515.51 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972157;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.96;QD=63.811;RBI=0.0170916;REFB=0;REVB=0.0140575;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365474;OID=.;OPOS=19245854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:48:47:0:0:48:47:0:0 chr11 19263369 . CCTTTTTTTTTTTTTTTG CCTTTTTCTTTTTTTTTG,CCTTTTTTTTTTTTTG,CCTTTTTTTTTTTTTGTT,CCTTTTTTTTTTTTTTG,TCCTTTTTTTTTTTTTTG,TTTTTCTTTTTTTTTTTG 470.59 PASS AF=0.282353,0.670588,0.0470588,0,0,0;AO=8,14,3,9,4,3;DP=85;FAO=24,57,4,0,0,0;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=0,47,4,0,0,0;FSAR=24,10,0,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764246,0.0583776,0.0703202,0.11458,0.0120948,0.0144022;FXX=0.0449388;HRUN=15,15,15,15,2,2;LEN=1,2,3,1,3,6;MLLD=125.065,6.60265,45.0135,3.5187,8.36887,35.8451;QD=22.1455;RBI=0.0346313,0.148938,0.100986,0.323272,0.203276,0.0737116;REFB=0,0,0,0,0,0;REVB=-0.0337775,-0.13702,-0.0724794,-0.302285,-0.202916,-0.0722909;RO=8;SAF=0,14,3,9,4,0;SAR=8,0,0,0,0,3;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0,0;SSSB=-0.844818,0,0,0,0,-0.819744;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,mnp,del,mnp,mnp;VARB=0.0754424,-0.167251,0.0587959,-0.369987,0,0;OID=.,.,.,.,.,.;OPOS=19263376,19263371,19263384,19263371,19263369,19263369;OREF=T,TT,TTG,T,CCT,CCTTTT;OALT=C,-,GTT,-,TCC,TTTTTC;OMAPALT=CCTTTTTCTTTTTTTTTG,CCTTTTTTTTTTTTTG,CCTTTTTTTTTTTTTGTT,CCTTTTTTTTTTTTTTG,TCCTTTTTTTTTTTTTTG,TTTTTCTTTTTTTTTTTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:85:85:8:0:8,14,3,9,4,3:24,57,4,0,0,0:0.282353,0.670588,0.0470588,0,0,0:8,0,0,0,0,3:0,14,3,9,4,0:8:0:24,10,0,0,0,0:0,47,4,0,0,0:0:0 chr11 19612775 . C T 766.28 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0983;QD=63.8569;RBI=0.0714499;REFB=0;REVB=-0.0432749;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171687;OID=.;OPOS=19612775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr11 19735987 . A G 474.93 PASS AF=0.477064;AO=50;DP=107;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0222447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.647;QD=17.4287;RBI=0.0230952;REFB=-0.0072885;REVB=-0.00620987;RO=56;SAF=18;SAR=32;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154513;STB=0.586473;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00936692;OID=.;OPOS=19735987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:56:57:50:52:0.477064:32:18:29:27:33:19:30:27 chr11 19799525 . CCG C,CC,CCC 2380.25 PASS AF=0,1,0;AO=22,138,7;DP=167;FAO=0,156,0;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=0,65,0;FSAR=0,91,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263881,0.0744692,0.145388;FXX=0.0429422;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=85.0434,102.679,86.4775;QD=61.0321;RBI=0.0265938,0.0746939,0.145552;REFB=0,0,0;REVB=0.00330122,0.00579009,0.00689084;RO=0;SAF=21,42,4;SAR=1,96,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.4,0,0;SSEP=0.492063,0,0;SSSB=-3.62339e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.000105203,0;OID=.,.,.;OPOS=19799526,19799527,19799527;OREF=CG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1,0:22,138,7:167:0,156,0:156:0:0,65,0:0,91,0:0:0:13:0:21,42,4:1,96,3:0:0 chr11 19854088 . G A 1735.9 PASS AF=0.991453;AO=115;DP=116;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0256003;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.031;QD=59.3471;RBI=0.0363335;REFB=-0.102499;REVB=-0.0257827;RO=1;SAF=56;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798107;STB=0.504201;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00119634;OID=.;OPOS=19854088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:116:117:1:1:115:116:0.991453:59:56:0:1:59:57:0:1 chr11 19901632 . G A 278.85 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00441933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9763;QD=16.403;RBI=0.0333055;REFB=-0.0473013;REVB=-0.0330109;RO=35;SAF=10;SAR=21;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164133;STB=0.595078;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0560361;OID=.;OPOS=19901632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:37:31:31:0.455882:21:10:17:18:21:10:18:19 chr11 19955500 . A G 1339.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00443374;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.971;QD=62.3147;RBI=0.00574324;REFB=0;REVB=0.00365058;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0984e-06;OID=.;OPOS=19955500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:39:47:0:0:39:47:0:0 chr11 19970501 . T C 250.2 PASS AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00687517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2352;QD=26.3369;RBI=0.0355463;REFB=0.013962;REVB=0.034875;RO=15;SAF=18;SAR=5;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184172;STB=0.510195;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00856522;OID=.;OPOS=19970501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:5:18:12:3:5:18:12:3 chr11 19970558 . T C 1062.0 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00500195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.094;QD=59.8311;RBI=0.00579899;REFB=0;REVB=0.00293409;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07347e-05;OID=.;OPOS=19970558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:69:71:1:32:37:0:0:33:38:0:0 chr11 19970579 . C G,T 1399.4 PASS AF=0.0434783,0.956522;AO=4,86;DP=90;FAO=4,88;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=1,40;FSAR=3,48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439173,0.00680305;FXX=0.0107515;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=20.523,118.171;QD=60.8433;RBI=0.0514611,0.00875047;REFB=-0.0232136,-0.0787664;REVB=-0.0512733,-0.00550357;RO=0;SAF=1,39;SAR=3,47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.157807,0.000341386;OID=.,.;OPOS=19970579,19970579;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:90:92:0:0:4,86:4,88:0.0434783,0.956522:3,47:1,39:0:0:3,48:1,40:0:0 chr11 20044696 . A G 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0285854;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.628;QD=19.5233;RBI=0.0287882;REFB=0.00583522;REVB=-0.00341105;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120721;STB=0.568865;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.0041504;OID=.;OPOS=20044696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:9:5:6:6:9:5:6:6 chr11 20065673 . G T 241.49 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0101418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.802;QD=12.384;RBI=0.0312506;REFB=-0.00825873;REVB=0.0295592;RO=49;SAF=10;SAR=19;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743353;STB=0.542827;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0182533;OID=.;OPOS=20065673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:19:10:20:29:19:10:20:29 chr11 20065779 . C G 289.36 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6658;QD=52.6112;RBI=0.0692582;REFB=0;REVB=-0.0348054;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000763341;OID=.;OPOS=20065779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chr11 20067064 . C T 205.38 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.028034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.272;QD=12.8365;RBI=0.0419408;REFB=-0.005404;REVB=0.0311949;RO=39;SAF=8;SAR=17;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132922;STB=0.576599;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0135483;OID=.;OPOS=20067064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:17:8:17:22:17:8:17:22 chr11 20089792 . G C 668.29 PASS AF=0.456376;AO=68;DP=149;FAO=68;FDP=149;FR=.;FRO=81;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0195263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9957;QD=17.9407;RBI=0.0358965;REFB=-0.0107314;REVB=-0.0301211;RO=81;SAF=32;SAR=36;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468969;STB=0.526059;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0125576;OID=.;OPOS=20089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:81:81:68:68:0.456376:36:32:42:39:36:32:42:39 chr11 20089944 . T C 183.02 PASS AF=0.365079;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0413198;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.871;QD=11.6206;RBI=0.04132;REFB=-0.0059219;REVB=-0.000125747;RO=40;SAF=7;SAR=16;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563921;STB=0.503265;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.011325;OID=.;OPOS=20089944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:40:40:23:23:0.365079:16:7:12:28:16:7:12:28 chr11 20099112 . A T 1083.78 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271563;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.089;QD=60.2099;RBI=0.027352;REFB=0;REVB=0.00326652;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.1648e-05;OID=.;OPOS=20099112;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0 chr11 20099541 . C T 593.62 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6744;QD=60.8843;RBI=0.0779784;REFB=0;REVB=0.0422033;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114728;OID=.;OPOS=20099541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr11 20101704 . C T 1571.92 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331967;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.61;QD=64.16;RBI=0.0561165;REFB=0;REVB=0.0452443;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62789e-05;OID=.;OPOS=20101704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:55:43:0:0:55:43:0:0 chr11 20101744 . C A 1400.82 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101906;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.598;QD=62.9584;RBI=0.0188318;REFB=0;REVB=-0.0158362;RO=0;SAF=30;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.64046e-05;OID=.;OPOS=20101744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:59:30:0:0:59:30:0:0 chr11 20104669 . G A 409.12 PASS AF=0.571429;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0012937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.041;QD=23.3781;RBI=0.00567455;REFB=-0.00650583;REVB=-0.00552512;RO=30;SAF=17;SAR=23;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101603;STB=0.555694;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00363811;OID=.;OPOS=20104669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:30:40:40:0.571429:23:17:9:21:23:17:9:21 chr11 20112417 . A C 367.82 PASS AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00475461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.018;QD=21.9591;RBI=0.00888351;REFB=-0.0145829;REVB=0.00750403;RO=30;SAF=12;SAR=25;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205712;STB=0.613823;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0103181;OID=.;OPOS=20112417;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:25:12:17:13:25:12:17:13 chr11 20112492 . G A 349.89 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=32;FWDB=-0.0120756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.431;QD=17.7162;RBI=0.0143745;REFB=-0.0147624;REVB=0.00779786;RO=42;SAF=21;SAR=16;SRF=10;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306641;STB=0.670127;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00998258;OID=.;OPOS=20112492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:16:21:10:32:16:21:10:32 chr11 20117232 . T C 1627.28 PASS AF=1;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00913854;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.346;QD=60.2696;RBI=0.0354972;REFB=0;REVB=0.0343007;RO=0;SAF=60;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.8949e-05;OID=.;OPOS=20117232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:108:0:0:108:108:1:48:60:0:0:48:60:0:0 chr11 20124914 . A C 288.83 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00668894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.363;QD=16.2719;RBI=0.0271841;REFB=0.000139594;REVB=-0.0263483;RO=39;SAF=13;SAR=19;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129929;STB=0.573157;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.000422986;OID=.;OPOS=20124914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:19:13:21:18:19:13:21:18 chr11 20139937 . C T 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0036153;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=287.398;QD=16.0426;RBI=0.00476944;REFB=-0.00556559;REVB=0.00311082;RO=26;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157432;STB=0.59081;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0083274;OID=.;OPOS=20139937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:13:6:12:14:13:6:12:14 chr11 20140387 . A G 599.76 PASS AF=0.492063;AO=61;DP=125;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.0501179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7239;QD=19.04;RBI=0.0573811;REFB=-0.0132602;REVB=-0.0279425;RO=64;SAF=34;SAR=27;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342776;STB=0.515155;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0130598;OID=.;OPOS=20140387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:64:64:61:62:0.492063:27:34:38:26:27:35:38:26 chr11 20140471 . A G 471.51 PASS AF=0.414062;AO=52;DP=127;FAO=53;FDP=128;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0187418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.1968;QD=14.7346;RBI=0.0290838;REFB=-0.0141227;REVB=0.0222398;RO=75;SAF=31;SAR=21;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673174;STB=0.542357;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0297345;OID=.;OPOS=20140471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:75:75:52:53:0.414062:21:31:40:35:21:32:40:35 chr11 20142377 . GTCAC G 221.85 PASS AF=0.301075;AO=27;DP=98;FAO=28;FDP=93;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=-0.0090394;FXX=0.0510152;HRUN=1;LEN=4;MLLD=326.727;QD=9.54189;RBI=0.0119247;REFB=-0.00623404;REVB=0.00777737;RO=61;SAF=9;SAR=18;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300315;STB=0.667054;STBP=0.033;TYPE=del;VARB=0.018688;OID=.;OPOS=20142378;OREF=TCAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.301075:27:98:28:93:65:10:18:39:26:99:61:9:18:36:25 chr11 20142448 . T C 293.06 PASS AF=0.361702;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0316266;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.4764;QD=12.4705;RBI=0.0333528;REFB=0.00709655;REVB=0.010591;RO=59;SAF=11;SAR=23;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265048;STB=0.657466;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0125916;OID=.;OPOS=20142448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:59:60:34:34:0.361702:23:11:33:26:23:11:34:26 chr11 20404613 . T G 1110.58 PASS AF=1;AO=62;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.028;QD=60.0312;RBI=0.0690413;REFB=0;REVB=0.0292415;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177134;OID=.;OPOS=20404613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:62:74:1:32:30:0:0:34:40:0:0 chr11 20429454 . T C 1482.87 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00187447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.819;QD=62.4367;RBI=0.0266772;REFB=0;REVB=0.0266113;RO=1;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108899;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53683e-05;OID=.;OPOS=20429454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:86:95:1:0:85:95:1:43:42:0:1:53:42:0:0 chr11 20486026 . G A 224.79 PASS AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0148179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.675;QD=13.0315;RBI=0.0153243;REFB=-0.0221628;REVB=0.00390706;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339856;STB=0.519466;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0363414;OID=.;OPOS=20486026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:12:15:22:20:12:15:22:20 chr11 20529886 . G A 1522.94 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.289;QD=58.5747;RBI=0.039848;REFB=-0.00368493;REVB=-0.0344552;RO=0;SAF=53;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95161e-08;STB=0.504672;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-1.44277e-05;OID=.;OPOS=20529886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:104:0:1:103:103:0.990385:50:53:0:0:50:53:1:0 chr11 20622975 . G A 173.07 PASS AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0815175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9777;QD=18.7101;RBI=0.0992545;REFB=-0.00984353;REVB=0.0566247;RO=19;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155642;STB=0.519978;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0151872;OID=.;OPOS=20622975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:19:19:17:18:0.486486:6:11:12:7:6:12:12:7 chr11 20623023 . C T 157.71 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.00409626;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.233;QD=11.2646;RBI=0.0081195;REFB=-0.0223363;REVB=-0.00701049;RO=35;SAF=14;SAR=6;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541594;STB=0.524975;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.039412;OID=.;OPOS=20623023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:36:20:20:0.357143:6:14:23:12:6:14:24:12 chr11 20623042 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255699;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.194;QD=57.3858;RBI=0.0282434;REFB=0;REVB=0.0119946;RO=0;SAF=40;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71172e-05;OID=.;OPOS=20623042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:17:40:0:0:17:40:0:0 chr11 20623156 . C G 1540.31 PASS AF=1;AO=76;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00755325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1435;QD=64.1797;RBI=0.202583;REFB=0;REVB=0.202442;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133018;OID=.;OPOS=20623156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:76:96:1:33:43:0:0:53:43:0:0 chr11 20629164 . G A 400.52 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0326007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.491;QD=21.361;RBI=0.034027;REFB=-0.00577053;REVB=-0.00974829;RO=35;SAF=15;SAR=25;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724022;STB=0.540049;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00384089;OID=.;OPOS=20629164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:25:15:16:19:25:15:16:19 chr11 20639400 . A G 1318.86 PASS AF=1;AO=85;DP=88;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010083;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3872;QD=61.3422;RBI=0.0189236;REFB=-0.0257064;REVB=-0.0160137;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661382;OID=.;OPOS=20639400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:88:86:0:0:85:86:1:56:29:0:0:57:29:0:0 chr11 20673867 . G A 2646.74 PASS AF=1;AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469994;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.375;QD=62.2762;RBI=0.0480796;REFB=0;REVB=0.0101343;RO=0;SAF=99;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65172e-05;OID=.;OPOS=20673867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:172:170:0:0:170:170:1:71:99:0:0:71:99:0:0 chr11 20805286 . G A 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00998586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.044;QD=57.6807;RBI=0.0199571;REFB=0;REVB=-0.0172792;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.91733e-05;OID=.;OPOS=20805286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr11 20959355 . GT GC,G 1374.04 PASS AF=0.036036,0.927928;AO=4,19;DP=111;FAO=4,103;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=4,29;FSAR=0,74;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.1233,-0.279823;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=210.974,21.0455;QD=49.5149;RBI=0.129166,1.00083;REFB=0.0653328,0.102663;REVB=0.0384824,0.960919;RO=78;SAF=4,19;SAR=0,0;SRF=4;SRR=74;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.818826,0.884724;STB=0.5,0.532252;STBP=1,0.006;TYPE=snp,del;VARB=0.185684,-0.00893696;OID=.,.;OPOS=20959356,20959356;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=GC,G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.036036,0.927928:4,19:111:4,103:111:4:4,29:0,74:4:0:8:78:4,19:0,0:4:74 chr11 21305927 . T C 1921.04 PASS AF=0.992063;AO=125;DP=127;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0330491;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.01;QD=60.9853;RBI=0.0371932;REFB=-0.101189;REVB=0.0170614;RO=0;SAF=58;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000305129;OID=.;OPOS=21305927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:127:126:0:1:125:125:0.992063:67:58:0:0:67:58:1:0 chr11 21596579 . G A 267.5 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00502082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.676;QD=21.8363;RBI=0.0443396;REFB=-0.0264595;REVB=-0.0440544;RO=24;SAF=11;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124989;STB=0.569977;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0154386;OID=.;OPOS=21596579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:14:11:14:10:14:11:14:10 chr11 22242729 . T C 377.08 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0431183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.53;QD=13.9658;RBI=0.0448549;REFB=-0.0063929;REVB=0.0123604;RO=64;SAF=13;SAR=31;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18095;STB=0.602729;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00788658;OID=.;OPOS=22242729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:31:13:29:35:31:13:29:35 chr11 22271870 . A T 735.28 PASS AF=0.529851;AO=72;DP=134;FAO=71;FDP=134;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.025026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.669;QD=21.9487;RBI=0.0254073;REFB=-0.0116026;REVB=-0.00438536;RO=62;SAF=27;SAR=45;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676441;STB=0.546465;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00766542;OID=.;OPOS=22271870;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:62:63:72:71:0.529851:45:27:28:34:45:26:29:34 chr11 22646571 . T C 766.0 PASS AF=0.462857;AO=80;DP=174;FAO=81;FDP=175;FR=.;FRO=94;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=58;FSRR=36;FWDB=-0.0116973;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.139;QD=17.5086;RBI=0.0256655;REFB=-0.0129377;REVB=0.0228449;RO=94;SAF=49;SAR=31;SRF=58;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464538;STB=0.500149;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0121037;OID=.;OPOS=22646571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:94:94:80:81:0.462857:31:49:58:36:31:50:58:36 chr11 22696451 . A G 1192.05 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00383494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.092;QD=60.3571;RBI=0.0695591;REFB=0;REVB=0.0694533;RO=0;SAF=47;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256099;OID=.;OPOS=22696451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:79:0:0:75:79:1:28:47:0:0:32:47:0:0 chr11 22709973 . C A 2774.54 PASS AF=1;AO=177;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262586;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4441;QD=62.7014;RBI=0.0320325;REFB=0;REVB=-0.0183457;RO=0;SAF=84;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010631;OID=.;OPOS=22709973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:177:0:0:177:177:1:93:84:0:0:93:84:0:0 chr11 22834189 . C T 479.35 PASS AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.00634915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8732;QD=18.2609;RBI=0.0637182;REFB=-0.0106002;REVB=-0.0634011;RO=54;SAF=25;SAR=26;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076975;STB=0.542648;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0129602;OID=.;OPOS=22834189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:54:54:51:51:0.485714:26:25:22:32:26:25:22:32 chr11 22881002 . C T 520.37 PASS AF=0.451613;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0305277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.421;QD=16.786;RBI=0.0444154;REFB=-0.0276021;REVB=-0.0322613;RO=68;SAF=26;SAR=30;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496399;STB=0.527672;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0330111;OID=.;OPOS=22881002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:68:68:56:56:0.451613:30:26:35:33:30:26:35:33 chr11 24759855 . G A 327.34 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0130542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4758;QD=17.6942;RBI=0.01863;REFB=-0.0125509;REVB=-0.0132916;RO=38;SAF=16;SAR=19;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888411;STB=0.556208;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0150569;OID=.;OPOS=24759855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:39:35:35:0.472973:19:16:21:17:19:16:22:17 chr11 25098938 . G C 3145.13 PASS AF=1;AO=178;DP=180;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6166;QD=63.8605;RBI=0.121376;REFB=0;REVB=-0.0187964;RO=1;SAF=55;SAR=123;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385494;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185141;OID=.;OPOS=25098938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:180:197:1:0:178:197:1:123:55:0:1:125:72:0:0 chr11 26481611 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.611;QD=59.0187;RBI=0.0126875;REFB=0;REVB=0.0110954;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0136e-05;OID=.;OPOS=26481611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0 chr11 26568966 . A G 3112.01 PASS AF=1;AO=195;DP=196;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215882;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3581;QD=63.188;RBI=0.0316301;REFB=-0.0965238;REVB=0.0231173;RO=1;SAF=79;SAR=116;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00408811;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000885394;OID=.;OPOS=26568966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:196:197:1:0:195:197:1:116:79:0:1:116:81:0:0 chr11 26574886 . T C 285.62 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0339093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.371;QD=18.1348;RBI=0.0343813;REFB=-0.0195763;REVB=-0.00567778;RO=32;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422491;STB=0.523599;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.015847;OID=.;OPOS=26574886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:16:15:14:18:16:15:14:18 chr11 26586801 . G A 753.29 PASS AF=0.503268;AO=77;DP=152;FAO=77;FDP=153;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=15;FSRR=61;FWDB=-0.0175683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.444;QD=19.6939;RBI=0.0226671;REFB=-0.00743239;REVB=0.0143231;RO=74;SAF=22;SAR=55;SRF=14;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111536;STB=0.556341;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00869683;OID=.;OPOS=26586801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:74:76:77:77:0.503268:55:22:14:60:55:22:15:61 chr11 26587133 . T C 1141.41 PASS AF=0.533333;AO=110;DP=208;FAO=112;FDP=210;FR=.;FRO=98;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=0.0188331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.641;QD=21.7411;RBI=0.0293564;REFB=-0.017216;REVB=0.0225191;RO=97;SAF=46;SAR=64;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931632;STB=0.547937;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0179858;OID=.;OPOS=26587133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:210:97:98:110:112:0.533333:64:46:51:46:64:48:52:46 chr11 26621117 . A C 841.64 PASS AF=0.457895;AO=87;DP=190;FAO=87;FDP=190;FR=.;FRO=103;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=54;FSRR=49;FWDB=-0.00194537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.923;QD=17.7186;RBI=0.0123039;REFB=-0.0174378;REVB=-0.0121492;RO=103;SAF=40;SAR=47;SRF=54;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631271;STB=0.534988;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0211628;OID=.;OPOS=26621117;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:103:103:87:87:0.457895:47:40:54:49:47:40:54:49 chr11 26677947 . C T 519.38 PASS AF=0.404255;AO=57;DP=144;FAO=57;FDP=141;FR=.;FRO=84;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=-0.0149914;FXX=0.0208319;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0498;QD=14.734;RBI=0.0397127;REFB=0.0231835;REVB=-0.0367744;RO=86;SAF=21;SAR=36;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143962;STB=0.594479;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.0328447;OID=.;OPOS=26677947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:141:86:84:57:57:0.404255:36:21:43:43:36:21:44:40 chr11 26692733 . T C 391.67 PASS AF=0.364341;AO=47;DP=129;FAO=47;FDP=129;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=0.0150735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5404;QD=12.1448;RBI=0.0177398;REFB=0.0235886;REVB=-0.00935351;RO=82;SAF=21;SAR=26;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126651;STB=0.572243;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.041958;OID=.;OPOS=26692733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:82:82:47:47:0.364341:26:21:46:36:26:21:46:36 chr11 26692742 . G A 386.31 PASS AF=0.380165;AO=46;DP=121;FAO=46;FDP=121;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.0149285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.536;QD=12.7707;RBI=0.0176857;REFB=0.00498438;REVB=-0.00948283;RO=74;SAF=21;SAR=25;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910823;STB=0.555731;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00478342;OID=.;OPOS=26692742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:74:75:46:46:0.380165:25:21:40:34:25:21:41:34 chr11 26702664 . C T 2109.13 PASS AF=0.992647;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00583951;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4381;QD=62.0334;RBI=0.0232866;REFB=0.0292635;REVB=-0.0225425;RO=0;SAF=53;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84364e-08;STB=0.50303;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000103979;OID=.;OPOS=26702664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:136:0:1:135:135:0.992647:82:53:0:0:82:53:0:1 chr11 26743115 . G A 577.82 PASS AF=0.47619;AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0127827;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.165;QD=18.3434;RBI=0.0158343;REFB=-0.00753995;REVB=-0.00934482;RO=67;SAF=33;SAR=27;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454114;STB=0.521732;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00652881;OID=.;OPOS=26743115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:67:66:60:60:0.47619:27:33:40:27:27:33:39:27 chr11 27076977 . C T 287.92 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00702599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0681;QD=18.5751;RBI=0.00709181;REFB=0.00248848;REVB=0.000963946;RO=30;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736561;STB=0.551234;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=-0.00220577;OID=.;OPOS=27076977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:31:31:31:0.5:11:20:17:13:11:20:17:14 chr11 27077118 . C T 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.382;QD=62.9079;RBI=0.022644;REFB=0;REVB=0.00694004;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36837e-05;OID=.;OPOS=27077118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:54:36:0:0:54:36:0:0 chr11 27362359 . T G 251.88 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.000566455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.713;QD=14.8166;RBI=0.0132272;REFB=-0.00255504;REVB=0.013215;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156242;STB=0.59491;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00578019;OID=.;OPOS=27362359;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:39:29:29:0.426471:13:16:15:23:13:16:15:24 chr11 27388910 . T C 610.03 PASS AF=0.466667;AO=63;DP=135;FAO=63;FDP=135;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=-0.00953047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.717;QD=18.075;RBI=0.0110437;REFB=-0.0152947;REVB=0.00557979;RO=72;SAF=37;SAR=26;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00392872;STB=0.502181;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0154587;OID=.;OPOS=27388910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:72:72:63:63:0.466667:26:37:42:30:26:37:42:30 chr11 27390089 . T C 1375.89 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.191;QD=61.8376;RBI=0.0572862;REFB=0;REVB=-0.0562354;RO=0;SAF=56;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00429e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44018e-05;OID=.;OPOS=27390089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:89:0:0:87:89:1:31:56:0:0:33:56:0:0 chr11 27679010 . GTT G,GT,TGT 325.88 PASS AF=0,1,0;AO=8,34,4;DP=66;FAO=0,68,0;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=0,33,0;FSAR=0,35,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573504,-0.11246,-0.118183;FXX=0.0144907;HRUN=8,8,1;LEN=2,1,2;MLLD=8.96929,6.76516,11.9399;QD=19.1696;RBI=0.136328,0.272072,0.162196;REFB=-0.00238015,-0.00193839,0.0131503;REVB=0.123678,0.247742,0.111087;RO=16;SAF=4,16,4;SAR=4,18,0;SRF=3;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.349536,0.169169,0.774184;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0,0.00473045,0;OID=.,.,.;OPOS=27679011,27679011,27679010;OREF=TT,T,GT;OALT=-,-,TG;OMAPALT=G,GT,TGT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:4:66:68:16:0:8,34,4:0,68,0:0,1,0:4,18,0:4,16,4:3:13:0,35,0:0,33,0:0:0 chr11 27679662 . T C 772.13 PASS AF=1;AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.33;QD=55.1522;RBI=0.0465844;REFB=-0.0685104;REVB=0.0308374;RO=1;SAF=30;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154512;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358063;OID=.;OPOS=27679662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:56:56:1:0:54:56:1:24:30:1:0:24:32:0:0 chr11 27679916 . C T 676.63 PASS AF=0.545455;AO=65;DP=121;FAO=66;FDP=121;FR=.;FRO=55;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0158596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.808;QD=22.3678;RBI=0.0196403;REFB=-0.00894867;REVB=-0.0115851;RO=54;SAF=43;SAR=22;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110383;STB=0.559505;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00581579;OID=.;OPOS=27679916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:54:55:65:66:0.545455:22:43:29:25:22:44:30:25 chr11 28134974 . C A 214.85 PASS AF=0.281818;AO=30;DP=110;FAO=31;FDP=110;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.00273185;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.024;QD=7.81285;RBI=0.00533832;REFB=0.0017934;REVB=-0.00458635;RO=80;SAF=19;SAR=11;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745019;STB=0.547914;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=-0.00415406;OID=.;OPOS=28134974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:80:79:30:31:0.281818:11:19:46:34:11:20:46:33 chr11 30034043 . G A 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0181056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.237;QD=23.8999;RBI=0.0318901;REFB=-0.0398457;REVB=-0.026252;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059602;STB=0.533094;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0315691;OID=.;OPOS=30034043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:17:10:7:16:17:10:7:16 chr11 30034868 . G C 339.29 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0139354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.22;QD=20.5628;RBI=0.0243302;REFB=-0.0344398;REVB=-0.019944;RO=31;SAF=15;SAR=20;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474494;STB=0.526301;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0322154;OID=.;OPOS=30034868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:20:15:15:16:20:15:15:16 chr11 30255185 . C T 411.17 PASS AF=0.518987;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00540547;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.257;QD=20.8186;RBI=0.0126759;REFB=-0.00938331;REVB=0.0114655;RO=38;SAF=22;SAR=19;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836609;STB=0.546228;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00947676;OID=.;OPOS=30255185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:38:38:41:41:0.518987:19:22:24:14:19:22:24:14 chr11 30432220 . A T 829.64 PASS AF=0.423963;AO=91;DP=217;FAO=92;FDP=217;FR=.;FRO=125;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=63;FWDB=-0.0862148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5815;QD=15.2929;RBI=0.0902973;REFB=-0.00343168;REVB=0.0268442;RO=126;SAF=52;SAR=39;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748357;STB=0.546547;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0049782;OID=.;OPOS=30432220;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:126:125:91:92:0.423963:39:52:63:63:39:53:62:63 chr11 31458730 . T G 207.26 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.239;QD=48.7676;RBI=0.0544525;REFB=0;REVB=0.0375307;RO=1;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701691;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062598;OID=.;OPOS=31458730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:1:0:16:17:1:10:6:1:0:10:7:0:0 chr11 31838128 . G A 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.737;QD=62.0208;RBI=0.0607022;REFB=0;REVB=0.0509767;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255681;OID=.;OPOS=31838128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr11 32124978 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0480491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6199;QD=59.1431;RBI=0.0560757;REFB=0;REVB=0.0289097;RO=0;SAF=21;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140114;OID=.;OPOS=32124978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:46:21:0:0:46:21:0:0 chr11 32125961 . C T 554.64 PASS AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0252644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.931;QD=55.4635;RBI=0.0264418;REFB=-0.00727732;REVB=-0.00780256;RO=2;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334545;STB=0.517848;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.000150112;OID=.;OPOS=32125961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:27:11:0:2:27:11:0:2 chr11 32417945 . T C 555.27 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6444;QD=60.0288;RBI=0.0530697;REFB=0;REVB=0.0490832;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124678;OID=.;OPOS=32417945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr11 32449661 . G A 994.67 PASS AF=0.985507;AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0425656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5045;QD=57.662;RBI=0.183592;REFB=-0.0221475;REVB=0.178589;RO=1;SAF=54;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00867142;STB=0.504586;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00257088;OID=.;OPOS=32449661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:69:1:1:66:68:0.985507:12:54:1:0:14:54:1:0 chr11 32722320 . A T 1653.71 PASS AF=0.899329;AO=113;DP=138;FAO=134;FDP=149;FR=.;FRO=15;FSAF=74;FSAR=60;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0921978;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=31.9646;QD=44.395;RBI=0.0953881;REFB=-0.117187;REVB=0.0244635;RO=25;SAF=57;SAR=56;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100949;STB=0.525347;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0120244;OID=.;OPOS=32722320;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:138:149:25:15:113:134:0.899329:56:57:20:5:60:74:12:3 chr11 32874926 . G A 320.82 PASS AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0186473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.663;QD=21.3882;RBI=0.0190804;REFB=-0.00257185;REVB=-0.00404204;RO=26;SAF=13;SAR=20;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866404;STB=0.540516;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00144814;OID=.;OPOS=32874926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:27:33:33:0.55:20:13:13:13:20:13:13:14 chr11 32954344 . G A 1236.75 PASS AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=2.76775e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.994;QD=58.8928;RBI=0.0122347;REFB=-0.0241598;REVB=0.0122347;RO=2;SAF=35;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262894;STB=0.513885;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-2.5773e-06;OID=.;OPOS=32954344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:47:35:2:0:47:35:2:0 chr11 32956244 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.205;QD=52.6124;RBI=0.0144111;REFB=0;REVB=0.00957152;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000587802;OID=.;OPOS=32956244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0 chr11 32956620 . A G 839.06 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00918607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.603;QD=55.9376;RBI=0.00964597;REFB=-0.132598;REVB=-0.00294295;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222061;OID=.;OPOS=32956620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:60:0:0:59:60:1:28:31:0:0:28:32:0:0 chr11 33053107 . C T 251.85 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.038922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1862;QD=14.8149;RBI=0.0448419;REFB=-0.0427694;REVB=-0.0222684;RO=37;SAF=12;SAR=17;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731361;STB=0.527931;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0347139;OID=.;OPOS=33053107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:37:39:29:29:0.426471:17:12:18:19:17:12:18:21 chr11 33065394 . C T 564.25 PASS AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0238832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.141;QD=26.8689;RBI=0.0299958;REFB=-0.00328349;REVB=-0.0181478;RO=33;SAF=25;SAR=26;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025708;STB=0.514013;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0021278;OID=.;OPOS=33065394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:26:25:15:18:26:25:15:18 chr11 33076191 . T C 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00848918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6346;QD=62.3499;RBI=0.0101634;REFB=0;REVB=-0.00558825;RO=0;SAF=32;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05339e-05;OID=.;OPOS=33076191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:11:32:0:0:11:32:0:0 chr11 33076209 . A G 128.27 PASS AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=0.0307368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139;QD=12.2166;RBI=0.0404699;REFB=-0.0145943;REVB=-0.0263261;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278485;STB=0.661049;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0160181;OID=.;OPOS=33076209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:7:8:21:6:7:8:21:6 chr11 33078230 . A G 391.87 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.000271112;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.591;QD=19.1158;RBI=0.0164393;REFB=-0.0271599;REVB=0.016437;RO=42;SAF=23;SAR=17;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697299;STB=0.538821;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0359696;OID=.;OPOS=33078230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:42:42:40:40:0.487805:17:23:21:21:17:23:21:21 chr11 33078251 . A T 515.27 PASS AF=0.495413;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0132396;FXX=0.00909008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=299.547;QD=18.9089;RBI=0.0174833;REFB=-0.00300951;REVB=0.0114183;RO=55;SAF=27;SAR=27;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414534;STB=0.522927;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00300313;OID=.;OPOS=33078251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:55:55:54:54:0.495413:27:27:30:25:27:27:30:25 chr11 33079580 . A G 217.93 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.000940843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0298;QD=13.6207;RBI=0.0552688;REFB=-0.0165656;REVB=0.0552608;RO=38;SAF=12;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673112;STB=0.538432;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0231955;OID=.;OPOS=33079580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:14:12:20:18:14:12:20:18 chr11 33564123 . T C 417.97 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0102885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.852;QD=53.9319;RBI=0.0248306;REFB=-0.00173679;REVB=0.0225988;RO=1;SAF=21;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216881;STB=0.51162;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000255316;OID=.;OPOS=33564123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:9:21:1:0:9:21:1:0 chr11 33565593 . C T 209.29 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.00752907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1589;QD=11.6271;RBI=0.0369157;REFB=0.0103768;REVB=0.0361397;RO=45;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103151;STB=0.564684;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.0179104;OID=.;OPOS=33565593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:45:46:26:26:0.361111:15:11:15:30:15:11:15:31 chr11 33572769 . A G 571.49 PASS AF=0.540816;AO=53;DP=98;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.116425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6692;QD=23.326;RBI=0.135754;REFB=-0.0269569;REVB=-0.069816;RO=45;SAF=24;SAR=29;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00707379;STB=0.503887;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0207706;OID=.;OPOS=33572769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:45:45:53:53:0.540816:29:24:20:25:29:24:20:25 chr11 33581306 . G A 234.06 PASS AF=0.333333;AO=29;DP=87;FAO=29;FDP=87;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0439901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5726;QD=10.7614;RBI=0.0466509;REFB=-0.00116533;REVB=0.0155301;RO=58;SAF=12;SAR=17;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00227349;OID=.;OPOS=33581306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:58:58:29:29:0.333333:17:12:24:34:17:12:24:34 chr11 33604885 . C T 205.16 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0172839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.969;QD=15.7818;RBI=0.0172887;REFB=-0.0238034;REVB=-0.000404395;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00441764;STB=0.50251;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0305757;OID=.;OPOS=33604885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:11:12:15:14:11:12:15:14 chr11 33604960 . C T 128.65 PASS AF=0.348837;AO=13;DP=41;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0706684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.44;QD=11.9672;RBI=0.0711422;REFB=-0.00921527;REVB=0.00819672;RO=28;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00984234;STB=0.504848;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0196361;OID=.;OPOS=33604960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:28:28:13:15:0.348837:8:5:11:17:9:6:11:17 chr11 33631423 . G A 351.04 PASS AF=0.529412;AO=34;DP=67;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.000672492;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.51;QD=20.6495;RBI=0.017605;REFB=-0.00665955;REVB=0.0175921;RO=33;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152286;STB=0.518262;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00568329;OID=.;OPOS=33631423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:33:32:34:36:0.529412:15:19:19:14:16:20:19:13 chr11 33640104 . A C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.93;QD=58.2393;RBI=0.030436;REFB=0;REVB=0.0226161;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109425;OID=.;OPOS=33640104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0 chr11 33667333 . A G 490.02 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00133331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.277;QD=56.0021;RBI=0.0154983;REFB=-0.0620185;REVB=0.0154408;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000111706;OID=.;OPOS=33667333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:0:1:17:17:0:1 chr11 33680371 . C T 433.37 PASS AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0591193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.715;QD=20.6369;RBI=0.0639666;REFB=-0.0128145;REVB=-0.0244262;RO=41;SAF=27;SAR=16;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190101;STB=0.605332;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0148796;OID=.;OPOS=33680371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:16:27:17:24:16:27:17:24 chr11 33881016 . T C 176.6 PASS AF=0.42;AO=16;DP=45;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0988856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.498;QD=14.1276;RBI=0.099383;REFB=-0.0243596;REVB=0.00993141;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120805;STB=0.642058;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0431073;OID=.;OPOS=33881016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:50:29:29:16:21:0.42:10:6:8:21:10:11:8:21 chr11 33886294 . A G 206.37 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.019375;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.463;QD=12.898;RBI=0.0207951;REFB=0.00558248;REVB=-0.00755276;RO=39;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113041;STB=0.506488;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00553405;OID=.;OPOS=33886294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:39:39:25:25:0.390625:10:15:23:16:10:15:23:16 chr11 33903328 . A G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166784;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2541;QD=42.1816;RBI=0.0362453;REFB=0;REVB=-0.03218;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00285147;OID=.;OPOS=33903328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr11 34093349 . AT A 790.41 PASS AF=1;AO=76;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109757;FXX=0.0112347;HRUN=6;LEN=1;MLLD=13.4283;QD=35.9278;RBI=0.238242;REFB=0;REVB=0.211454;RO=4;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.368421;SSSB=0.0572336;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00211796;OID=.;OPOS=34093350;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:76:89:88:88:0:51:37:0:0:16:4:45:31:0:4 chr11 34122369 . G T 2000.16 PASS AF=0.984848;AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0004014;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.52;QD=60.611;RBI=0.00962741;REFB=-0.0256024;REVB=-0.00961904;RO=1;SAF=71;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664708;STB=0.506943;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-3.96429e-06;OID=.;OPOS=34122369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:132:1:2:130:130:0.984848:59:71:1:0:59:71:2:0 chr11 34152939 . T C 1196.38 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.461;QD=60.5763;RBI=0.117562;REFB=0;REVB=0.117402;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245975;OID=.;OPOS=34152939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:77:79:1:37:40:0:0:38:41:0:0 chr11 34154641 . C T 358.1 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.6282;QD=55.0926;RBI=0.0345778;REFB=0;REVB=-0.0244884;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.97119e-07;OID=.;OPOS=34154641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr11 34378381 . G C 474.95 PASS AF=0.385714;AO=54;DP=140;FAO=54;FDP=140;FR=.;FRO=86;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=48;FWDB=-0.024154;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0898;QD=13.5699;RBI=0.0256268;REFB=-0.0289077;REVB=0.00856244;RO=84;SAF=26;SAR=28;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314096;STB=0.524407;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0306133;OID=.;OPOS=34378381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:84:86:54:54:0.385714:28:26:38:46:28:26:38:48 chr11 34482908 . C T 1422.18 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0962726;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.297;QD=61.834;RBI=0.10092;REFB=-0.102872;REVB=0.0302721;RO=0;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000952442;OID=.;OPOS=34482908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:92:0:1:91:91:0.98913:43:48:0:0:43:48:0:1 chr11 34501596 . A G 994.09 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417595;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.806;QD=59.3487;RBI=0.0590713;REFB=0;REVB=0.04178;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025302;OID=.;OPOS=34501596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:65:67:1:23:42:0:0:23:44:0:0 chr11 34643955 . G A 2017.01 PASS AF=0.992424;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0711376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.988;QD=61.1217;RBI=0.0715597;REFB=-0.0324401;REVB=0.00776039;RO=0;SAF=69;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503546;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000225103;OID=.;OPOS=34643955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:131:132:0:1:130:131:0.992424:61:69:0:0:61:70:1:0 chr11 34668143 . C T 659.89 PASS AF=0.5;AO=63;DP=129;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.0342216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.454;QD=19.9966;RBI=0.0342996;REFB=-0.0219465;REVB=0.00231243;RO=66;SAF=34;SAR=29;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134229;STB=0.582852;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0242775;OID=.;OPOS=34668143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:132:66:66:63:66:0.5:29:34:26:40:29:37:26:40 chr11 34680634 . G A 905.95 PASS AF=0.984375;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000555481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.311;QD=56.6219;RBI=0.00315187;REFB=0.111067;REVB=-0.00310253;RO=1;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132996;STB=0.506847;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-5.8621e-06;OID=.;OPOS=34680634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:64:1:1:62:63:0.984375:35:27:0:1:36:27:0:1 chr11 34680853 . G T 332.0 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0154882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.843;QD=16.1949;RBI=0.0239328;REFB=-0.0169149;REVB=-0.0182454;RO=46;SAF=14;SAR=22;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091403;STB=0.551503;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0263206;OID=.;OPOS=34680853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:0.439024:22:14:22:24:22:14:22:24 chr11 34909926 . T G 481.67 PASS AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.00414445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=378.447;QD=17.3573;RBI=0.00642714;REFB=-0.00295457;REVB=0.00491239;RO=59;SAF=28;SAR=24;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03647;STB=0.520272;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.00318455;OID=.;OPOS=34909926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:0.468468:24:28:34:25:24:28:34:25 chr11 34910397 . C T 419.13 PASS AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.000167451;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.508;QD=16.9347;RBI=0.0144567;REFB=-0.00675602;REVB=-0.0144557;RO=56;SAF=23;SAR=20;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710436;STB=0.539888;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.010851;OID=.;OPOS=34910397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:56:43:43:0.434343:20:23:26:30:20:23:26:30 chr11 34918375 . A G 351.88 PASS AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0116371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.571;QD=15.6389;RBI=0.0150648;REFB=-0.00668215;REVB=-0.00956696;RO=52;SAF=10;SAR=28;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337356;STB=0.691253;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0107808;OID=.;OPOS=34918375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:52:52:38:38:0.422222:28:10:30:22:28:10:30:22 chr11 34937813 . G A 382.45 PASS AF=0.513158;AO=38;DP=75;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00495906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.56;QD=20.129;RBI=0.00825963;REFB=-0.0227832;REVB=0.00660525;RO=36;SAF=22;SAR=16;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209495;STB=0.524521;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.020814;OID=.;OPOS=34937813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:36:37:38:39:0.513158:16:22:20:16:16:23:20:17 chr11 34937931 . G A 97.65 PASS AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0674055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.259;QD=24.4137;RBI=0.0811757;REFB=-0.0482236;REVB=0.0452327;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134614;STB=0.576329;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0179501;OID=.;OPOS=34937931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:7:4:3:2:7:4:3:2 chr11 34938265 . C T 433.46 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00337977;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.576;QD=20.8894;RBI=0.00345041;REFB=-0.0183869;REVB=-0.000694637;RO=40;SAF=23;SAR=20;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035224;STB=0.519472;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0153697;OID=.;OPOS=34938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:20:23:23:17:20:23:23:17 chr11 34963416 . T C 351.57 PASS AF=0.392523;AO=39;DP=106;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.00300419;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.524;QD=13.1427;RBI=0.00506372;REFB=-0.017466;REVB=0.00407629;RO=55;SAF=15;SAR=24;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938416;STB=0.557613;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0154863;OID=.;OPOS=34963416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:55:65:39:42:0.392523:24:15:26:29:24:18:34:31 chr11 34969060 . G A 434.25 PASS AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0186682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.592;QD=17.0294;RBI=0.0243013;REFB=-0.0240424;REVB=-0.0155579;RO=55;SAF=22;SAR=25;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221103;STB=0.512333;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0231809;OID=.;OPOS=34969060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:0.460784:25:22:27:28:25:22:27:28 chr11 34991727 . T C 159.58 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00619059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2322;QD=17.7316;RBI=0.0149079;REFB=-0.0244886;REVB=-0.0135618;RO=19;SAF=4;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206349;STB=0.618896;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.026186;OID=.;OPOS=34991727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:13:4:8:11:13:4:8:11 chr11 34999745 . C G 185.06 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0096672;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7336;QD=13.7081;RBI=0.0118553;REFB=-0.00159815;REVB=-0.00686241;RO=31;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115523;STB=0.574008;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00278353;OID=.;OPOS=34999745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:11:11:12:19:11:11:12:20 chr11 35017205 . G T 387.29 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.00458269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.597;QD=23.8331;RBI=0.00740002;REFB=0.00138107;REVB=-0.00581027;RO=26;SAF=20;SAR=18;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132859;STB=0.579669;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.000996782;OID=.;OPOS=35017205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:26:27:38:38:0.584615:18:20:9:17:18:20:9:18 chr11 35017363 . C A 158.69 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.032624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.633;QD=17.1554;RBI=0.0326241;REFB=-0.0131479;REVB=-2.02184e-05;RO=20;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168577;STB=0.596104;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0170194;OID=.;OPOS=35017363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:8:9:7:13:8:9:7:13 chr11 35226155 . A G 872.0 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0183975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.059;QD=56.2583;RBI=0.0194511;REFB=-0.11818;REVB=0.00631489;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.508472;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000399754;OID=.;OPOS=35226155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:32:29:1:0:32:29:1:0 chr11 35229673 . T C 1373.96 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127182;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.979;QD=63.1706;RBI=0.0242767;REFB=0;REVB=0.0206786;RO=0;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49046e-05;OID=.;OPOS=35229673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:86:87:1:35:51:0:0:36:51:0:0 chr11 35274829 . A G 1021.13 PASS AF=0.434109;AO=111;DP=257;FAO=112;FDP=258;FR=.;FRO=146;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=71;FSRR=75;FWDB=0.014006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.07;QD=15.8315;RBI=0.0396918;REFB=-0.0240241;REVB=0.0371385;RO=143;SAF=56;SAR=55;SRF=69;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222732;STB=0.5128;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0451685;OID=.;OPOS=35274829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:258:143:146:111:112:0.434109:55:56:69:74:55:57:71:75 chr11 35492351 . G A 269.31 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00681035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.574;QD=16.5732;RBI=0.00691464;REFB=-0.0187422;REVB=0.00119641;RO=35;SAF=16;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728516;STB=0.540956;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0244768;OID=.;OPOS=35492351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:14:16:16:19:14:16:16:19 chr11 36103228 . A G 332.86 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00673978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.719;QD=19.0205;RBI=0.0300911;REFB=0.00288997;REVB=0.0293266;RO=35;SAF=17;SAR=18;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128042;STB=0.571156;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00348701;OID=.;OPOS=36103228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:18:17:22:13:18:17:22:13 chr11 36293048 . G A 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00465321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.691;QD=19.9928;RBI=0.0166946;REFB=-0.00745714;REVB=0.016033;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180797;STB=0.510195;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.00534685;OID=.;OPOS=36293048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:13:10:10:12:13:10 chr11 36472800 . A G 1744.68 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4233;QD=60.6844;RBI=0.0119716;REFB=0;REVB=-0.0116512;RO=0;SAF=68;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28385e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.73481e-05;OID=.;OPOS=36472800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:47:68:0:0:47:68:0:0 chr11 36484208 . T C 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.458;QD=57.106;RBI=0.0312286;REFB=0;REVB=0.0305375;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47983e-05;OID=.;OPOS=36484208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:37:18:0:0:37:18:0:0 chr11 36595600 . A G 102.97 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0384158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0808;QD=18.7212;RBI=0.0650609;REFB=-0.0550588;REVB=-0.0525086;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579899;STB=0.533277;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.025584;OID=.;OPOS=36595600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:22:22:10:10:12:12:0.545455:8:4:4:6:8:4:4:6 chr11 36597313 . A G 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0140197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3662;QD=17.2466;RBI=0.0420421;REFB=0.00967153;REVB=0.0396357;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052726;STB=0.530092;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.0112532;OID=.;OPOS=36597313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:14:13:9:12:14:13 chr11 36601170 . G A 396.35 PASS AF=0.420561;AO=45;DP=107;FAO=45;FDP=107;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=-0.0430226;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6026;QD=14.8168;RBI=0.0432331;REFB=0.000496187;REVB=-0.0042607;RO=62;SAF=21;SAR=24;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149754;STB=0.584122;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-9.3901e-05;OID=.;OPOS=36601170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:62:62:45:45:0.420561:24:21:38:24:24:21:38:24 chr11 40137543 . T C 880.98 PASS AF=0.559211;AO=85;DP=152;FAO=85;FDP=152;FR=.;FRO=67;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0191065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.239;QD=23.1836;RBI=0.0191066;REFB=-0.0179189;REVB=5.13306e-05;RO=67;SAF=52;SAR=33;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867534;STB=0.547357;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.015572;OID=.;OPOS=40137543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:67:67:85:85:0.559211:33:52:34:33:33:52:34:33 chr11 43357486 . G A 684.11 PASS AF=0.527559;AO=67;DP=128;FAO=67;FDP=127;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00154464;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.692;QD=21.5468;RBI=0.00164329;REFB=-0.00652948;REVB=-0.000560792;RO=60;SAF=36;SAR=31;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837515;STB=0.545917;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00610116;OID=.;OPOS=43357486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:60:60:67:67:0.527559:31:36:38:22:31:36:38:22 chr11 43911365 . T C 1185.38 PASS AF=0.9875;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00513148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.78;QD=59.2692;RBI=0.0242257;REFB=-0.0529398;REVB=0.0236759;RO=1;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116869;STB=0.506023;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000955722;OID=.;OPOS=43911365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:78:79:0.9875:40:38:0:1:41:38:0:1 chr11 43940644 . G T 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.847;QD=60.3766;RBI=0.0225397;REFB=0;REVB=0.0133854;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76683e-05;OID=.;OPOS=43940644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0 chr11 43946967 . A G 1510.67 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00607245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.294;QD=63.6072;RBI=0.0319686;REFB=0;REVB=-0.0313865;RO=0;SAF=41;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000183225;OID=.;OPOS=43946967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:54:41:0:0:54:41:0:0 chr11 43947990 . T C 375.64 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.5218;QD=55.6498;RBI=0.0519316;REFB=0;REVB=-0.0456866;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000497502;OID=.;OPOS=43947990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0 chr11 44080210 . T C 1080.51 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.663;QD=60.0284;RBI=0.0442938;REFB=0;REVB=0.0278566;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134935;OID=.;OPOS=44080210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0 chr11 44096238 . G A,C 588.38 PASS AF=0.975,0.025;AO=37,2;DP=40;FAO=39,1;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16,1;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05888,-0.0418559;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=139.954,61.4049;QD=58.838;RBI=0.0589084,0.0443186;REFB=0,0;REVB=0.00182831,-0.0145679;RO=0;SAF=15,2;SAR=22,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.82408e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000499154,0.0704339;OID=.,.;OPOS=44096238,44096238;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:40:40:0:0:37,2:39,1:0.975,0.025:22,0:15,2:0:0:23,0:16,1:0:0 chr11 44286566 . G A 715.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421902;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.832;QD=57.2702;RBI=0.0482358;REFB=0;REVB=0.0233811;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34277e-05;OID=.;OPOS=44286566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:31:18:0:0:31:19:0:0 chr11 44297054 . T C 2330.51 PASS AF=1;AO=152;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00185736;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.543;QD=60.9285;RBI=0.0205638;REFB=0;REVB=0.0204798;RO=0;SAF=79;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.3138e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.02787e-05;OID=.;OPOS=44297054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:153:153:0:0:152:153:1:73:79:0:0:73:80:0:0 chr11 44331509 . C G 636.2 PASS AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0076384;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.002;QD=50.8963;RBI=0.026149;REFB=-0.0989624;REVB=0.0250085;RO=1;SAF=17;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268575;STB=0.501844;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.000902168;OID=.;OPOS=44331509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:50:50:1:3:47:47:0.94:30:17:1:0:30:17:1:2 chr11 44636833 . G A 754.85 PASS AF=0.416244;AO=76;DP=191;FAO=82;FDP=197;FR=.;FRO=115;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=0.0122262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.419;QD=15.327;RBI=0.0135068;REFB=-0.00808855;REVB=0.00574059;RO=115;SAF=35;SAR=41;SRF=49;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037238;STB=0.543137;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0110432;OID=.;OPOS=44636833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:197:115:115:76:82:0.416244:41:35:49:66:41:41:49:66 chr11 44640268 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00295685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.37;QD=59.4355;RBI=0.0168282;REFB=0;REVB=0.0165664;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125847;OID=.;OPOS=44640268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0 chr11 44925038 . A G 2216.82 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000605144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.64;QD=63.3379;RBI=0.0322214;REFB=0;REVB=0.0322157;RO=0;SAF=46;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24168e-05;OID=.;OPOS=44925038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:140:0:0:139:140:1:93:46:0:0:93:47:0:0 chr11 45672261 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.705;QD=56.9379;RBI=0.0167086;REFB=0;REVB=0.00321648;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119615;OID=.;OPOS=45672261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr11 45793218 . G C 460.43 PASS AF=0.432203;AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=0.00226624;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.0774;QD=15.6077;RBI=0.0400634;REFB=-0.0263633;REVB=0.0399992;RO=67;SAF=25;SAR=26;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734309;STB=0.54111;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0410711;OID=.;OPOS=45793218;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:67:67:51:51:0.432203:26:25:28:39:26:25:28:39 chr11 45834198 . T C 397.78 PASS AF=0.518987;AO=39;DP=75;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00177294;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.3;QD=20.1407;RBI=0.0130604;REFB=-0.0173677;REVB=-0.0129395;RO=36;SAF=11;SAR=28;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159473;STB=0.581728;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0190941;OID=.;OPOS=45834198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:79:36:38:39:41:0.518987:28:11:16:20:28:13:18:20 chr11 45848271 . A G 53.53 PASS AF=0.115385;AO=12;DP=104;FAO=12;FDP=104;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.0120656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.459;QD=2.05866;RBI=0.0282212;REFB=-0.00276893;REVB=-0.0255119;RO=90;SAF=6;SAR=6;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0187644;OID=.;OPOS=45848271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:104:104:90:92:12:12:0.115385:6:6:45:45:6:6:46:46 chr11 45848275 . T C 53.49 PASS AF=0.115385;AO=12;DP=104;FAO=12;FDP=104;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.00204714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.073;QD=2.05733;RBI=0.0295435;REFB=-0.00348574;REVB=0.0294725;RO=91;SAF=6;SAR=6;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665993;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0194006;OID=.;OPOS=45848275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:104:104:91:92:12:12:0.115385:6:6:45:46:6:6:46:46 chr11 45903613 . A C 169.19 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.000498072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.438;QD=13.0148;RBI=0.0358504;REFB=-0.020418;REVB=-0.0358469;RO=32;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151136;STB=0.586874;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0217057;OID=.;OPOS=45903613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:11:9:10:22:11:9:10:22 chr11 45903814 . A AGT 67.53 PASS AF=0.346154;AO=7;DP=31;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0289063;FXX=0.103413;HRUN=1;LEN=2;MLLD=126.898;QD=10.3898;RBI=0.048047;REFB=-0.0336346;REVB=0.0383788;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402521;STB=0.808172;STBP=0.047;TYPE=ins;VARB=0.0721304;OID=.;OPOS=45903815;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.346154:7:31:9:26:17:1:8:8:9:67:21:1:6:9:12 chr11 45937267 . C T 137.61 PASS AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0312624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.251;QD=39.3184;RBI=0.0341678;REFB=-0.0972375;REVB=0.0137875;RO=1;SAF=2;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17901;STB=0.599828;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00223706;OID=.;OPOS=45937267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:11:2:1:0:11:2:1:0 chr11 45975130 . C T 472.91 PASS AF=0.436975;AO=51;DP=120;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=48;FWDB=-0.0250159;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.414;QD=15.8961;RBI=0.0250931;REFB=-0.0191033;REVB=0.00196643;RO=66;SAF=18;SAR=33;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737059;STB=0.551001;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0278855;OID=.;OPOS=45975130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:66:67:51:52:0.436975:33:18:19:47:33:19:19:48 chr11 46342081 . TG GT,T 877.9 PASS AF=0,1;AO=3,60;DP=63;FAO=0,63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=0,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0744106,-0.115827;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=3.78588,26.2198;QD=55.7399;RBI=0.0812928,0.116493;REFB=0,0;REVB=0.0327351,-0.0124455;RO=0;SAF=1,26;SAR=2,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,-0.00271457;OID=.,.;OPOS=46342081,46342082;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:5:63:63:0:0:3,60:0,63:0,1:2,34:1,26:0:0:0,36:0,27:0:0 chr11 46342258 . CA AG,CAG 500.12 PASS AF=0.027027,0.972973;AO=2,32;DP=38;FAO=1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=1,12;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0809887,0.177494;FXX=0.0263089;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=6.14776,22.4072;QD=54.0674;RBI=0.0847289,0.198963;REFB=0,0;REVB=0.024896,0.0899007;RO=0;SAF=1,11;SAR=1,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=0.083278,0.00144707;OID=.,.;OPOS=46342258,46342260;OREF=CA,-;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,CAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:38:37:0:0:2,32:1,36:0.027027,0.972973:1,21:1,11:0:0:0,24:1,12:0:0 chr11 46401517 . A G 215.89 PASS AF=0.291667;AO=28;DP=95;FAO=28;FDP=96;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0340145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.733;QD=8.99521;RBI=0.0341649;REFB=-0.00858369;REVB=0.00320282;RO=66;SAF=15;SAR=13;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13195;STB=0.576869;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0261982;OID=.;OPOS=46401517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:66:68:28:28:0.291667:13:15:28:38:13:15:29:39 chr11 46702920 . T C 1664.37 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00605791;FXX=0.00884877;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.402;QD=59.4419;RBI=0.00775835;REFB=0.0268617;REVB=0.00484703;RO=1;SAF=50;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771984;STB=0.504064;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-8.92471e-06;OID=.;OPOS=46702920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:112:1:1:111:111:0.991071:61:50:0:1:61:50:0:1 chr11 46724716 . CAGTGGTGACAGAA CA,CAGTGGAGTCTGCT 158.08 PASS AF=0.857143,0.142857;AO=12,2;DP=14;FAO=12,2;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=5,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532917,0.047598;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=12,8;MLLD=442.469,307.097;QD=45.1651;RBI=0.0563342,0.0479252;REFB=0,0;REVB=-0.0182631,-0.00559046;RO=0;SAF=7,0;SAR=5,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00030876,0.0205712;OID=.,.;OPOS=46724717,46724722;OREF=AGTGGTGACAGA,TGACAGAA;OALT=-,AGTCTGCT;OMAPALT=CA,CAGTGGAGTCTGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.857143,0.142857:12,2:14:12,2:14:0:7,0:5,2:0:0:13:0:7,0:5,2:0:0 chr11 46727345 . G C 178.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0293025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.728;QD=14.8515;RBI=0.0325793;REFB=-0.0189863;REVB=-0.0142398;RO=29;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451536;STB=0.52605;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0172015;OID=.;OPOS=46727345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:11:8:11:18:11:8:11:18 chr11 46745003 . C T 331.14 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0892802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.936;QD=50.9442;RBI=0.0899676;REFB=-0.184424;REVB=0.0111006;RO=1;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487725;STB=0.526294;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00537193;OID=.;OPOS=46745003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:9:16:0:1:9:16:0:1 chr11 46780569 . G A 288.6 PASS AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.0160918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0244;QD=16.4913;RBI=0.0166579;REFB=0.000941431;REVB=0.00430558;RO=38;SAF=7;SAR=24;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216725;STB=0.529394;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.000370738;OID=.;OPOS=46780569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:38:38:31:32:0.457143:24:7:8:30:24:8:8:30 chr11 46801502 . T C 344.63 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487317;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.729;QD=55.141;RBI=0.0836168;REFB=0;REVB=0.0834746;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791608;OID=.;OPOS=46801502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr11 46879990 . T C 343.26 PASS AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.499;QD=50.8527;RBI=0.0558081;REFB=-0.0608317;REVB=0.0552622;RO=2;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771382;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00562386;OID=.;OPOS=46879990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:2:0:25:27:1:11:14:0:2:13:14:0:0 chr11 46890197 . G A 389.56 PASS AF=1;AO=23;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.601;QD=53.7329;RBI=0.251273;REFB=0;REVB=0.25025;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440445;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000946011;OID=.;OPOS=46890197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:1:0:23:29:1:10:13:0:1:16:13:0:0 chr11 46897446 . G A 2518.72 PASS AF=0.988024;AO=165;DP=168;FAO=165;FDP=167;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0289872;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.591;QD=60.3287;RBI=0.0339811;REFB=-0.0232028;REVB=0.0177329;RO=2;SAF=71;SAR=94;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100166;STB=0.505263;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=5.15564e-05;OID=.;OPOS=46897446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:168:167:2:2:165:165:0.988024:94:71:0:2:94:71:0:2 chr11 46914583 . T C 669.7 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.128122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5652;QD=62.2981;RBI=0.141218;REFB=0;REVB=-0.0593917;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0027514;OID=.;OPOS=46914583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr11 46914598 . A G 766.38 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00530255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4245;QD=63.8646;RBI=0.00898077;REFB=0;REVB=0.00724825;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.48976e-05;OID=.;OPOS=46914598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0 chr11 46969616 . T C 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00632205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.443;QD=60.5472;RBI=0.0522961;REFB=0;REVB=0.0519125;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66117e-05;OID=.;OPOS=46969616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chr11 47188314 . T C 1063.06 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.007;QD=59.8909;RBI=0.0574945;REFB=0;REVB=0.00609553;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.30945e-05;OID=.;OPOS=47188314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:71:0:0:68:71:1:34:34:0:0:35:36:0:0 chr11 47196982 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.869;QD=59.4355;RBI=0.0313082;REFB=0;REVB=-0.0103969;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155937;OID=.;OPOS=47196982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0 chr11 47204011 . C T 200.53 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0746578;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.827;QD=13.595;RBI=0.0747354;REFB=-0.0166996;REVB=-0.00340401;RO=34;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728923;STB=0.550029;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0140434;OID=.;OPOS=47204011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:34:35:24:24:0.40678:11:13:16:18:11:13:16:19 chr11 47238522 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.115;QD=59.4355;RBI=0.0469197;REFB=0;REVB=0.00314977;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026492;OID=.;OPOS=47238522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr11 47259668 . T C 230.76 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0108056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.827;QD=17.7505;RBI=0.020101;REFB=-0.0235568;REVB=-0.0169496;RO=27;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140118;STB=0.578804;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0371031;OID=.;OPOS=47259668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:14:11:16:11:14:11:16:11 chr11 47266808 . T G 194.9 PASS AF=0.444444;AO=19;DP=44;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0276918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.338;QD=17.3245;RBI=0.0338865;REFB=-0.0230686;REVB=-0.019531;RO=23;SAF=13;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247046;STB=0.63968;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.014473;OID=.;OPOS=47266808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:23:25:19:20:0.444444:6:13:10:13:7:13:10:15 chr11 47269159 . T C 551.11 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0179501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1778;QD=20.7966;RBI=0.0216262;REFB=-0.00181312;REVB=-0.0120617;RO=50;SAF=27;SAR=29;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707561;STB=0.53889;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00129654;OID=.;OPOS=47269159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:29:27:20:30:29:27:20:30 chr11 47270255 . C T 342.85 PASS AF=0.538462;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00798196;FXX=0.0298463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.3569;QD=21.0984;RBI=0.0916594;REFB=-0.00745963;REVB=-0.0913112;RO=28;SAF=14;SAR=21;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00599527;STB=0.51612;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00481689;OID=.;OPOS=47270255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:28:30:35:35:0.538462:21:14:11:17:21:14:11:19 chr11 47282024 . C T 252.44 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00263239;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2215;QD=19.0523;RBI=0.0214344;REFB=-0.00136694;REVB=0.0212721;RO=26;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215813;STB=0.620697;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00334013;OID=.;OPOS=47282024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:17:10:16:10:17:10:16:10 chr11 47282893 . C A 30.9 PASS AF=0.116505;AO=9;DP=105;FAO=12;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=91;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=-0.0777821;FXX=0.0190458;HRUN=7;LEN=1;MLLD=22.2977;QD=1.19993;RBI=0.162015;REFB=0.00378038;REVB=0.142123;RO=60;SAF=8;SAR=1;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.592845;STB=0.90823;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0741803;OID=.;OPOS=47282893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:105:103:60:91:9:12:0.116505:1:8:22:38:1:11:43:48 chr11 47298360 . G A 107.75 PASS AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0633207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.898;QD=6.95172;RBI=0.0637254;REFB=-0.000565623;REVB=-0.00717057;RO=44;SAF=13;SAR=3;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211009;STB=0.63915;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00295794;OID=.;OPOS=47298360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:44:46:16:16:0.258065:3:13:30:14:3:13:31:15 chr11 47303275 . T C 263.72 PASS AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0293186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.415;QD=26.372;RBI=0.0326096;REFB=-0.0192619;REVB=0.0142762;RO=16;SAF=9;SAR=15;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488322;STB=0.527005;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.00859002;OID=.;OPOS=47303275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:15:9:5:11:15:9:5:11 chr11 47306585 . G A 300.65 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00762369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.829;QD=21.475;RBI=0.0391368;REFB=-0.0301639;REVB=0.0383871;RO=25;SAF=20;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00453496;STB=0.502511;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0211619;OID=.;OPOS=47306585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:11:20:16:9:11:20:16:9 chr11 47331116 . T C 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.792;QD=61.0482;RBI=0.0191652;REFB=0;REVB=0.0121302;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95488e-05;OID=.;OPOS=47331116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:40:38:0:0:40:38:0:0 chr11 47346145 . G A 232.77 PASS AF=0.511111;AO=24;DP=46;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0106523;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.428;QD=20.6902;RBI=0.0117999;REFB=-0.0406762;REVB=0.00507614;RO=22;SAF=7;SAR=17;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338676;STB=0.685997;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0235041;OID=.;OPOS=47346145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:22:22:24:23:0.511111:17:7:15:7:16:7:15:7 chr11 47354787 . C T 252.55 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00361965;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.195;QD=17.1222;RBI=0.0104889;REFB=-0.0114359;REVB=-0.00984457;RO=32;SAF=24;SAR=4;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483071;STB=0.768071;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0187481;OID=.;OPOS=47354787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:32:31:28:28:0.474576:4:24:14:18:4:24:14:17 chr11 47364762 . A G 731.37 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124387;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.181;QD=63.5971;RBI=0.0280968;REFB=0;REVB=0.0251935;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2012e-05;OID=.;OPOS=47364762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr11 47431728 . A G 404.26 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3104;QD=53.9012;RBI=0.0327048;REFB=0;REVB=0.0254959;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00678575;OID=.;OPOS=47431728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:30:0:0:27:30:1:12:15:0:0:13:17:0:0 chr11 47434986 . G A 174.29 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=0.0325628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.771;QD=11.6191;RBI=0.0387594;REFB=-0.0213594;REVB=0.0210227;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=5;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345359;STB=0.694491;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0191574;OID=.;OPOS=47434986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:13:9:5:33:13:9:5:33 chr11 47460306 . A G 374.81 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0501251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0116;QD=55.5276;RBI=0.0604311;REFB=0;REVB=0.0337549;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194631;OID=.;OPOS=47460306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr11 47469439 . A G 1415.32 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.705;QD=62.9029;RBI=0.0313753;REFB=0;REVB=-0.00129199;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.53737e-05;OID=.;OPOS=47469439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:43:47:0:0:43:47:0:0 chr11 47579092 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.55;QD=33.4285;RBI=0.00311593;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34337e-05;OID=.;OPOS=47579092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr11 47579094 . A G 49.46 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.606;QD=32.9732;RBI=0.171169;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0187356;OID=.;OPOS=47579094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr11 47579103 . CCG ATA 79.39 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.34343e-05;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=3;MLLD=303.829;QD=39.6948;RBI=9.34343e-05;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-2.53021e-05;OID=.;OPOS=47579103;OREF=CCG;OALT=ATA;OMAPALT=ATA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0 chr11 47579119 . A T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0565281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.999;QD=59.4356;RBI=0.0576249;REFB=0;REVB=0.0111894;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197222;OID=.;OPOS=47579119;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0 chr11 47593945 . A C 785.73 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.597;QD=57.1437;RBI=0.0860733;REFB=0;REVB=0.0860167;RO=0;SAF=16;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211803;OID=.;OPOS=47593945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:38:16:0:0:39:16:0:0 chr11 47609867 . G A 1034.78 PASS AF=0.924051;AO=73;DP=79;FAO=73;FDP=79;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0511155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.295;QD=52.3941;RBI=0.0666475;REFB=-0.0384183;REVB=0.042768;RO=2;SAF=33;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278028;STB=0.509114;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00209141;OID=.;OPOS=47609867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:79:79:2:6:73:73:0.924051:40:33:2:0:40:33:2:4 chr11 47640429 . G C 165.04 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0240571;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.167;QD=21.2959;RBI=0.0273676;REFB=0.00245939;REVB=-0.0130476;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150576;STB=0.58452;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00250282;OID=.;OPOS=47640429;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:9:8:4:10:9:8:4:10 chr11 47681370 . T G 58.61 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00796835;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.726;QD=14.6521;RBI=0.0287944;REFB=-0.00398453;REVB=0.0276699;RO=7;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468349;STB=0.749374;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0231467;OID=.;OPOS=47681370;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:7:8:8:8:0.5:6:2:6:1:6:2:6:2 chr11 47701528 . C A 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00594167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.219;QD=18.49;RBI=0.00602092;REFB=-0.00619135;REVB=-0.000973684;RO=26;SAF=18;SAR=4;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297783;STB=0.671466;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00825653;OID=.;OPOS=47701528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:4:18:15:11:4:18:15:11 chr11 47748509 . T A,C 688.74 PASS AF=0.0392157,0.941176;AO=3,47;DP=51;FAO=2,48;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=2,26;FSAR=0,22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294292,0.00436136;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.6609,108.208;QD=54.0189;RBI=0.0297117,0.0661814;REFB=-0.0542484,0.0286287;REVB=-0.00408778,0.0660376;RO=1;SAF=2,26;SAR=1,21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.163246,-0.0177461;STB=0.5,0.50943;STBP=1,0.51;TYPE=snp,snp;VARB=0.0424625,-0.00829697;OID=.,.;OPOS=47748509,47748509;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:51:51:1:1:3,47:2,48:0.0392157,0.941176:1,21:2,26:1:0:0,22:2,26:1:0 chr11 47826090 . A C 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0129815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.556;QD=21.0076;RBI=0.0156031;REFB=-0.0200503;REVB=0.00865674;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799136;STB=0.5045;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0199707;OID=.;OPOS=47826090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:7:10:11:8:7:10 chr11 47834592 . G A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.734;QD=42.1826;RBI=0.026125;REFB=0;REVB=0.0202462;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492609;OID=.;OPOS=47834592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr11 47857253 . T C 253.42 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0347144;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1339;QD=20.6874;RBI=0.0348805;REFB=-0.00755426;REVB=-0.00340054;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18642;STB=0.612702;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00629369;OID=.;OPOS=47857253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:25:24:24:0.489796:14:10:14:8:14:10:16:9 chr11 47869855 . C T 914.67 PASS AF=0.554688;AO=66;DP=134;FAO=71;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=6;FSRR=35;FWDB=0.0513;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.284;QD=28.5835;RBI=0.0516292;REFB=-0.0574787;REVB=0.00582092;RO=39;SAF=23;SAR=43;SRF=6;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155134;STB=0.582572;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0439768;OID=.;OPOS=47869855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:128:39:41:66:71:0.554688:43:23:6:33:47:24:6:35 chr11 48118347 . T TA 532.68 PASS AF=1;AO=46;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.1195;QD=42.6146;RBI=0.133544;REFB=0;REVB=-0.0840951;RO=3;SAF=21;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625489;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00535458;OID=.;OPOS=48118348;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:46:51:50:50:0:25:25:0:0:10:3:21:25:3:0 chr11 48145247 . T C 693.69 PASS AF=0.523077;AO=68;DP=130;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.00715772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.214;QD=21.3442;RBI=0.0144312;REFB=-0.0177872;REVB=0.012531;RO=62;SAF=32;SAR=36;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165478;STB=0.509088;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0199658;OID=.;OPOS=48145247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:62:62:68:68:0.523077:36:32:28:34:36:32:28:34 chr11 48145375 . A C 167.38 PASS AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0916566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2058;QD=10.1441;RBI=0.137947;REFB=0.00580851;REVB=0.103094;RO=44;SAF=8;SAR=14;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133221;STB=0.578275;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.0116401;OID=.;OPOS=48145375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:14:8:21:23:14:8:21:23 chr11 48146622 . G A 536.41 PASS AF=0.495575;AO=56;DP=113;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.00553058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.147;QD=18.9878;RBI=0.00974882;REFB=-0.00969482;REVB=-0.00802821;RO=57;SAF=22;SAR=34;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267654;STB=0.514807;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00956437;OID=.;OPOS=48146622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:57:57:56:56:0.495575:34:22:24:33:34:22:24:33 chr11 48166267 . G C 315.61 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0151433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.154;QD=17.5338;RBI=0.0185094;REFB=-0.00303318;REVB=0.0106434;RO=38;SAF=16;SAR=18;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277631;STB=0.515539;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00337126;OID=.;OPOS=48166267;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:18:16:19:19:18:16:19:19 chr11 48190383 . A T 1246.78 PASS AF=1;AO=69;DP=85;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00301282;FXX=0.0470533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.232;QD=61.5695;RBI=0.0137157;REFB=0;REVB=0.0133807;RO=0;SAF=22;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.68211e-05;OID=.;OPOS=48190383;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:81:0:0:69:81:1:47:22:0:0:53:28:0:0 chr11 48190527 . T C 740.33 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9078;QD=56.9486;RBI=0.0115308;REFB=0;REVB=0.0054506;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180676;OID=.;OPOS=48190527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr11 48238421 . T G 1641.87 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.699;QD=60.252;RBI=0.0531338;REFB=0;REVB=0.0196612;RO=0;SAF=62;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158322;OID=.;OPOS=48238421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:47:62:0:0:47:62:0:0 chr11 48238549 . G A 677.87 PASS AF=0.507463;AO=67;DP=133;FAO=68;FDP=134;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0371141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6034;QD=20.2349;RBI=0.039192;REFB=-0.0375254;REVB=0.0125921;RO=66;SAF=30;SAR=37;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336193;STB=0.521694;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0340638;OID=.;OPOS=48238549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:66:66:67:68:0.507463:37:30:32:34:38:30:32:34 chr11 48239182 . C A 139.42 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00271443;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.226;QD=25.3484;RBI=0.0344013;REFB=0.00105703;REVB=-0.0342941;RO=11;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21872;STB=0.538405;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.000956918;OID=.;OPOS=48239182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:25:22:11:8:14:14:0.636364:10:4:6:5:10:4:3:5 chr11 48267589 . A G 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0884106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7134;QD=47.8188;RBI=0.0922329;REFB=0;REVB=0.0262769;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00440909;OID=.;OPOS=48267589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr11 48285842 . A G 1217.48 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.211;QD=60.8742;RBI=0.0588235;REFB=0;REVB=0.0540231;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125885;OID=.;OPOS=48285842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:76:80:0:0:76:80:1:31:45:0:0:35:45:0:0 chr11 48285856 . C T 231.61 PASS AF=0.358025;AO=27;DP=80;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0368206;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0142;QD=11.4373;RBI=0.0371419;REFB=-0.00839011;REVB=-0.00487426;RO=45;SAF=21;SAR=6;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326749;STB=0.704979;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0292515;OID=.;OPOS=48285856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:45:52:27:29:0.358025:6:21:23:22:7:22:24:28 chr11 48285981 . CCTT C 79.69 PASS AF=0.301887;AO=17;DP=55;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0196274;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=3;MLLD=223.984;QD=6.01409;RBI=0.0222286;REFB=-0.00905512;REVB=-0.0104345;RO=33;SAF=12;SAR=5;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194097;STB=0.60943;STBP=0.34;TYPE=del;VARB=0.0193052;OID=.;OPOS=48285982;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.301887:17:55:16:53:37:11:5:20:17:79:33:12:5:18:15 chr11 48328644 . C T 265.13 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0164442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.976;QD=17.9747;RBI=0.0204412;REFB=-0.012752;REVB=-0.0121421;RO=30;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086055;STB=0.548272;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0172418;OID=.;OPOS=48328644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:10:19:17:13:10:19:17:13 chr11 48346513 . T C 55.61 PASS AF=0.122449;AO=12;DP=98;FAO=12;FDP=98;FR=.;FRO=86;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=0.000339257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.449;QD=2.26998;RBI=0.00128125;REFB=-0.000930371;REVB=0.00123551;RO=85;SAF=2;SAR=10;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35438;STB=0.767222;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00665478;OID=.;OPOS=48346513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:98:98:85:86:12:12:0.122449:10:2:36:49:10:2:37:49 chr11 48346523 . C T 71.63 PASS AF=0.14433;AO=14;DP=97;FAO=14;FDP=97;FR=.;FRO=83;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.0205734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2693;QD=2.95385;RBI=0.0238329;REFB=0.00543542;REVB=0.0120309;RO=81;SAF=4;SAR=10;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180547;STB=0.636738;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.0313931;OID=.;OPOS=48346523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:97:97:81:83:14:14:0.14433:10:4:34:47:10:4:36:47 chr11 48346535 . G C 69.25 PASS AF=0.135922;AO=14;DP=102;FAO=14;FDP=103;FR=.;FRO=89;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=-0.105445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.003;QD=2.68942;RBI=0.106352;REFB=-0.00635622;REVB=-0.0138598;RO=88;SAF=5;SAR=9;SRF=36;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679995;STB=0.553363;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0188189;OID=.;OPOS=48346535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:102:103:88:89:14:14:0.135922:9:5:36:52:9:5:37:52 chr11 48346541 . A T 75.81 PASS AF=0.142857;AO=15;DP=105;FAO=15;FDP=105;FR=.;FRO=90;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=50;FWDB=-0.019335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.432;QD=2.88802;RBI=0.0292186;REFB=-0.0102006;REVB=-0.0219063;RO=89;SAF=6;SAR=9;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630842;STB=0.53901;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0402326;OID=.;OPOS=48346541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:105:105:89:90:15:15:0.142857:9:6:40:49:9:6:40:50 chr11 48346547 . C T 62.85 PASS AF=0.123894;AO=14;DP=113;FAO=14;FDP=113;FR=.;FRO=99;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.000438247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.123;QD=2.22494;RBI=0.0266213;REFB=-0.000767611;REVB=-0.0266177;RO=99;SAF=6;SAR=8;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00544193;STB=0.50387;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.00508271;OID=.;OPOS=48346547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:113:113:99:99:14:14:0.123894:8:6:42:57:8:6:42:57 chr11 48346551 . C A 58.91 PASS AF=0.115702;AO=14;DP=121;FAO=14;FDP=121;FR=.;FRO=107;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=-0.0144634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.394;QD=1.94741;RBI=0.0375906;REFB=-0.00805946;REVB=-0.0346967;RO=107;SAF=7;SAR=7;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743099;STB=0.553643;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0507728;OID=.;OPOS=48346551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:121:121:107:107:14:14:0.115702:7:7:47:60:7:7:47:60 chr11 48346579 . C A 111.8 PASS AF=0.160584;AO=21;DP=136;FAO=22;FDP=137;FR=.;FRO=115;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.0218186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.274;QD=3.2641;RBI=0.0225332;REFB=-0.00958839;REVB=0.00562974;RO=114;SAF=12;SAR=9;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178243;STB=0.599123;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0497227;OID=.;OPOS=48346579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:114:115:21:22:0.160584:9:12:49:65:10:12:49:66 chr11 48346588 . A C 155.18 PASS AF=0.184932;AO=27;DP=146;FAO=27;FDP=146;FR=.;FRO=119;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=68;FWDB=-0.00675106;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.244;QD=4.25155;RBI=0.0152572;REFB=-0.0146005;REVB=-0.0136823;RO=119;SAF=15;SAR=12;SRF=51;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161198;STB=0.602335;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0384092;OID=.;OPOS=48346588;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:119:119:27:27:0.184932:12:15:51:68:12:15:51:68 chr11 48346604 . T G 193.79 PASS AF=0.195402;AO=34;DP=174;FAO=34;FDP=174;FR=.;FRO=140;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=60;FSRR=80;FWDB=-0.00629478;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.816;QD=4.45493;RBI=0.0194237;REFB=-0.00454943;REVB=-0.0183754;RO=139;SAF=17;SAR=17;SRF=60;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877028;STB=0.557438;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.020232;OID=.;OPOS=48346604;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:139:140:34:34:0.195402:17:17:60:79:17:17:60:80 chr11 48346615 . G A 209.16 PASS AF=0.190722;AO=37;DP=195;FAO=37;FDP=194;FR=.;FRO=157;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=68;FSRR=89;FWDB=-0.0198784;FXX=0.00512794;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6321;QD=4.31266;RBI=0.0300558;REFB=0.00261263;REVB=-0.0225433;RO=151;SAF=19;SAR=18;SRF=66;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979549;STB=0.564845;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0116832;OID=.;OPOS=48346615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:194:151:157:37:37:0.190722:18:19:66:85:18:19:68:89 chr11 48346660 . TTTGCTGATC T 111.42 PASS AF=0.184332;AO=38;DP=225;FAO=40;FDP=217;FR=.;FRO=177;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=79;FSRR=98;FWDB=-0.0154946;FXX=0.0136357;HRUN=5;LEN=9;MLLD=334.747;QD=2.05379;RBI=0.026661;REFB=-0.00178428;REVB=-0.0216962;RO=166;SAF=21;SAR=17;SRF=76;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121473;STB=0.58394;STBP=0.246;TYPE=del;VARB=0.0105563;OID=.;OPOS=48346661;OREF=TTGCTGATC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.184332:38:225:40:217:177:22:18:79:98:99:166:21:17:76:90 chr11 48346681 . G A 329.49 PASS AF=0.217213;AO=53;DP=244;FAO=53;FDP=244;FR=.;FRO=191;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=83;FSRR=108;FWDB=0.008341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.636;QD=5.40147;RBI=0.0184093;REFB=-0.0022455;REVB=-0.0164113;RO=191;SAF=31;SAR=22;SRF=83;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190609;STB=0.616353;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00430576;OID=.;OPOS=48346681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:191:191:53:53:0.217213:22:31:83:108:22:31:83:108 chr11 48346729 . G C 225.65 PASS AF=0.19697;AO=38;DP=197;FAO=39;FDP=198;FR=.;FRO=159;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=69;FSRR=90;FWDB=0.00374228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.721;QD=4.55851;RBI=0.00652318;REFB=-0.00517113;REVB=-0.00534296;RO=158;SAF=13;SAR=25;SRF=69;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127356;STB=0.563061;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0230305;OID=.;OPOS=48346729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:158:159:38:39:0.19697:25:13:69:89:25:14:69:90 chr11 48346791 . C T 228.81 PASS AF=0.241379;AO=32;DP=144;FAO=35;FDP=145;FR=.;FRO=110;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=66;FWDB=0.00349621;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.094;QD=6.31193;RBI=0.00792327;REFB=-0.00660903;REVB=-0.00711018;RO=109;SAF=9;SAR=23;SRF=43;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159836;STB=0.571386;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0190133;OID=.;OPOS=48346791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:109:110:32:35:0.241379:23:9:43:66:24:11:44:66 chr11 48346822 . A C 203.56 PASS AF=0.263158;AO=29;DP=114;FAO=30;FDP=114;FR=.;FRO=84;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=47;FWDB=0.00953326;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.311;QD=7.14245;RBI=0.0219146;REFB=-0.00453212;REVB=0.0197324;RO=83;SAF=8;SAR=21;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227364;STB=0.612089;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0146566;OID=.;OPOS=48346822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:83:84:29:30:0.263158:21:8:37:46:21:9:37:47 chr11 48346843 . C T 250.16 PASS AF=0.31;AO=31;DP=100;FAO=31;FDP=100;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.0115727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.342;QD=10.0065;RBI=0.0126728;REFB=-0.00145708;REVB=-0.00516456;RO=67;SAF=9;SAR=22;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313172;STB=0.675451;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00265566;OID=.;OPOS=48346843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:67:69:31:31:0.31:22:9:37:30:22:9:37:32 chr11 48346916 . G C 369.45 PASS AF=0.357143;AO=45;DP=127;FAO=45;FDP=126;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=51;FSRR=30;FWDB=-0.0331512;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.022;QD=11.7285;RBI=0.0418348;REFB=-0.0128865;REVB=-0.0255176;RO=81;SAF=12;SAR=33;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407435;STB=0.73323;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0221443;OID=.;OPOS=48346916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:81:81:45:45:0.357143:33:12:51:30:33:12:51:30 chr11 48346924 . T C 374.34 PASS AF=0.371901;AO=44;DP=121;FAO=45;FDP=121;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=0.0122708;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8412;QD=12.3749;RBI=0.0433701;REFB=0.00424988;REVB=0.041598;RO=77;SAF=14;SAR=30;SRF=50;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362084;STB=0.706239;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00675399;OID=.;OPOS=48346924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:77:76:44:45:0.371901:30:14:50:27:31:14:49:27 chr11 48346932 . G A 405.64 PASS AF=0.375;AO=48;DP=128;FAO=48;FDP=128;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=25;FWDB=0.00170944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.245;QD=12.6761;RBI=0.00297991;REFB=-0.00610158;REVB=-0.00244083;RO=80;SAF=14;SAR=34;SRF=55;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422936;STB=0.7395;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00692643;OID=.;OPOS=48346932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:80:80:48:48:0.375:34:14:55:25:34:14:55:25 chr11 48346961 . AA TG 447.59 PASS AF=0.379562;AO=51;DP=137;FAO=52;FDP=137;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=54;FSRR=31;FWDB=-0.0264643;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=212.203;QD=13.0685;RBI=0.0275071;REFB=-0.0111141;REVB=-0.00750208;RO=85;SAF=14;SAR=37;SRF=54;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39657;STB=0.714443;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0238236;OID=.;OPOS=48346961;OREF=AA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:85:85:51:52:0.379562:37:14:54:31:37:15:54:31 chr11 48346999 . T G 621.89 PASS AF=0.433333;AO=65;DP=150;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=18;FSAR=47;FSRF=54;FSRR=31;FWDB=0.0334326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1716;QD=16.5836;RBI=0.0340376;REFB=-0.0144593;REVB=0.00638949;RO=84;SAF=18;SAR=47;SRF=53;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364363;STB=0.706702;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0187182;OID=.;OPOS=48346999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:84:85:65:65:0.433333:47:18:53:31:47:18:54:31 chr11 48347014 . G A 543.0 PASS AF=0.406452;AO=62;DP=155;FAO=63;FDP=155;FR=.;FRO=92;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=58;FSRR=34;FWDB=0.0208274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.572;QD=14.0128;RBI=0.025493;REFB=-0.00649678;REVB=-0.0147007;RO=91;SAF=15;SAR=47;SRF=57;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417803;STB=0.728456;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0494784;OID=.;OPOS=48347014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:91:92:62:63:0.406452:47:15:57:34:47:16:58:34 chr11 48347023 . C T 597.18 PASS AF=0.426752;AO=61;DP=157;FAO=67;FDP=157;FR=.;FRO=90;FSAF=17;FSAR=50;FSRF=58;FSRR=32;FWDB=0.000642215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.441;QD=15.2149;RBI=0.00663822;REFB=-0.0127172;REVB=-0.00660708;RO=75;SAF=16;SAR=45;SRF=55;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457547;STB=0.728935;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0115982;OID=.;OPOS=48347023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:75:90:61:67:0.426752:45:16:55:20:50:17:58:32 chr11 48347067 . C T 566.66 PASS AF=0.417808;AO=61;DP=146;FAO=61;FDP=146;FR=.;FRO=85;FSAF=16;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=-0.027529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.813;QD=15.525;RBI=0.0289184;REFB=-0.020928;REVB=-0.00885608;RO=85;SAF=16;SAR=45;SRF=52;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373647;STB=0.710236;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0329189;OID=.;OPOS=48347067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:85:85:61:61:0.417808:45:16:52:33:45:16:52:33 chr11 48347100 . C T 389.05 PASS AF=0.389831;AO=46;DP=118;FAO=46;FDP=118;FR=.;FRO=72;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.0400431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.36;QD=13.1883;RBI=0.04205;REFB=-0.00341375;REVB=0.0128358;RO=72;SAF=13;SAR=33;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305953;STB=0.67417;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00673096;OID=.;OPOS=48347100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:72:72:46:46:0.389831:33:13:40:32:33:13:40:32 chr11 48347124 . A G 389.26 PASS AF=0.412844;AO=45;DP=108;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0299125;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0415;QD=14.2846;RBI=0.0906811;REFB=-0.0121028;REVB=-0.0856055;RO=63;SAF=10;SAR=35;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319272;STB=0.686826;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0129983;OID=.;OPOS=48347124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:63:64:45:45:0.412844:35:10:31:32:35:10:32:32 chr11 48347130 . C G 372.35 PASS AF=0.396396;AO=45;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.00228929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3873;QD=13.418;RBI=0.0107565;REFB=0.016981;REVB=-0.01051;RO=66;SAF=11;SAR=34;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268361;STB=0.674135;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0243134;OID=.;OPOS=48347130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:66:67:45:44:0.396396:34:11:31:35:34:10:32:35 chr11 48347140 . T C 799.03 PASS AF=0.648649;AO=72;DP=111;FAO=72;FDP=111;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00146592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.61;QD=28.7939;RBI=0.0102973;REFB=-0.0230927;REVB=0.0101925;RO=39;SAF=22;SAR=50;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198729;STB=0.607748;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00681034;OID=.;OPOS=48347140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:39:39:72:72:0.648649:50:22:23:16:50:22:23:16 chr11 48347142 . C T 369.53 PASS AF=0.389381;AO=44;DP=113;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.0117071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.71;QD=13.0807;RBI=0.0271712;REFB=-0.00287421;REVB=-0.0245197;RO=69;SAF=10;SAR=34;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362911;STB=0.707605;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00509822;OID=.;OPOS=48347142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:69:69:44:44:0.389381:34:10:37:32:34:10:37:32 chr11 48347144 . T C 343.83 PASS AF=0.371681;AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0250451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.967;QD=12.1709;RBI=0.031251;REFB=-0.0186211;REVB=0.0186914;RO=71;SAF=10;SAR=32;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365608;STB=0.710039;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0295188;OID=.;OPOS=48347144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:71:71:42:42:0.371681:32:10:39:32:32:10:39:32 chr11 48347267 . T C 287.06 PASS AF=0.267974;AO=40;DP=152;FAO=41;FDP=153;FR=.;FRO=112;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=65;FSRR=47;FWDB=0.00905812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.391;QD=7.50485;RBI=0.0100985;REFB=-0.000740109;REVB=0.0044643;RO=109;SAF=15;SAR=25;SRF=62;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236711;STB=0.637328;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00519348;OID=.;OPOS=48347267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:109:112:40:41:0.267974:25:15:62:47:25:16:65:47 chr11 48347306 . G T 254.34 PASS AF=0.24375;AO=38;DP=160;FAO=39;FDP=160;FR=.;FRO=121;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=68;FSRR=53;FWDB=-0.00401389;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.901;QD=6.35855;RBI=0.0148014;REFB=-0.00359319;REVB=0.0142468;RO=117;SAF=14;SAR=24;SRF=67;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25306;STB=0.652373;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.011398;OID=.;OPOS=48347306;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:117:121:38:39:0.24375:24:14:67:50:25:14:68:53 chr11 48347342 . G A 158.91 PASS AF=0.19708;AO=27;DP=137;FAO=27;FDP=137;FR=.;FRO=110;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=55;FSRR=55;FWDB=-0.0571651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.712;QD=4.63972;RBI=0.0596349;REFB=-0.00739223;REVB=-0.0169846;RO=110;SAF=7;SAR=20;SRF=55;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318756;STB=0.702394;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0320012;OID=.;OPOS=48347342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:110:110:27:27:0.19708:20:7:55:55:20:7:55:55 chr11 48347346 . A T 151.74 PASS AF=0.19697;AO=26;DP=131;FAO=26;FDP=132;FR=.;FRO=106;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=55;FSRR=51;FWDB=-0.00527349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.339;QD=4.59825;RBI=0.0249642;REFB=-0.010434;REVB=-0.0244009;RO=104;SAF=8;SAR=18;SRF=54;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272883;STB=0.672463;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0488705;OID=.;OPOS=48347346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:104:106:26:26:0.19697:18:8:54:50:18:8:55:51 chr11 48347358 . C T 127.12 PASS AF=0.184;AO=22;DP=124;FAO=23;FDP=125;FR=.;FRO=102;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=54;FSRR=48;FWDB=-0.0177671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.84;QD=4.06773;RBI=0.021981;REFB=-0.0136647;REVB=0.012942;RO=100;SAF=5;SAR=17;SRF=52;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38327;STB=0.723207;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0107362;OID=.;OPOS=48347358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:100:102:22:23:0.184:17:5:52:48:17:6:54:48 chr11 48347363 . C T 136.7 PASS AF=0.192;AO=24;DP=125;FAO=24;FDP=125;FR=.;FRO=101;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=52;FSRR=49;FWDB=-0.025255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.453;QD=4.3743;RBI=0.0255906;REFB=-0.000175227;REVB=-0.00413088;RO=101;SAF=6;SAR=18;SRF=52;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347042;STB=0.721801;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00073099;OID=.;OPOS=48347363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:101:101:24:24:0.192:18:6:52:49:18:6:52:49 chr11 48347392 . T C 183.68 PASS AF=0.274725;AO=25;DP=91;FAO=25;FDP=91;FR=.;FRO=66;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.00695378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.59;QD=8.07374;RBI=0.0130676;REFB=-0.00290396;REVB=0.0110638;RO=66;SAF=8;SAR=17;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242153;STB=0.645451;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00672301;OID=.;OPOS=48347392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:66:66:25:25:0.274725:17:8:34:32:17:8:34:32 chr11 48347419 . A G 125.71 PASS AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00459414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6689;QD=9.67026;RBI=0.0404193;REFB=-0.00800968;REVB=0.0401574;RO=36;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230035;STB=0.636629;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0100029;OID=.;OPOS=48347419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:7:9:13:23:7:9:13:23 chr11 48347492 . G A 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=3.30487e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4052;QD=19.3693;RBI=0.0428071;REFB=0.0153248;REVB=-0.0428071;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137855;STB=0.578216;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=-0.0160793;OID=.;OPOS=48347492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:7:9:6:9:7:9:6:9 chr11 48347498 . A T 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0318456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.223;QD=21.0155;RBI=0.0350806;REFB=-0.0153022;REVB=-0.014714;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140495;STB=0.5793;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0114687;OID=.;OPOS=48347498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:7:9:5:8:7:9:5:8 chr11 48366958 . T G 331.54 PASS AF=0.377551;AO=37;DP=99;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.011233;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.174;QD=13.5324;RBI=0.0123458;REFB=-0.000497656;REVB=0.00512244;RO=57;SAF=18;SAR=19;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324223;STB=0.503309;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00025349;OID=.;OPOS=48366958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:57:61:37:37:0.377551:19:18:26:31:19:18:30:31 chr11 48366971 . GG CA 393.23 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00529694;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=329.958;QD=17.0969;RBI=0.00745814;REFB=-0.0113828;REVB=-0.00525036;RO=50;SAF=22;SAR=19;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945186;STB=0.558111;STBP=0.339;TYPE=mnp;VARB=0.0164921;OID=.;OPOS=48366971;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:50:51:41:41:0.445652:19:22:22:28:19:22:22:29 chr11 48367050 . T TAG 264.63 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0113943;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=2;MLLD=266.307;QD=15.1216;RBI=0.0190742;REFB=-0.0178972;REVB=0.015297;RO=40;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588454;STB=0.533311;STBP=0.67;TYPE=ins;VARB=0.0205931;OID=.;OPOS=48367051;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:30:72:30:70:40:14:16:21:19:99:40:14:16:21:19 chr11 48367073 . A C 711.48 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000255575;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=286.646;QD=52.7019;RBI=0.0107112;REFB=0.236903;REVB=0.0107081;RO=2;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336162;STB=0.51785;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=9.87488e-06;OID=.;OPOS=48367073;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:27:25:0:2:27:25:0:2 chr11 48367097 . A G 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0100706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.229;QD=15.1962;RBI=0.0130324;REFB=-0.029466;REVB=-0.008272;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00460525;STB=0.502657;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0435745;OID=.;OPOS=48367097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:11:7:10:16:11:7:10:16 chr11 48367133 . C A 125.22 PASS AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=-0.0295024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9334;QD=10.4349;RBI=0.0795124;REFB=-0.0305459;REVB=-0.0738365;RO=33;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135855;STB=0.580056;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0545668;OID=.;OPOS=48367133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:11:4:6:27:11:4:6:27 chr11 48367136 . C T 126.19 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=26;FWDB=0.00845438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.619;QD=10.9731;RBI=0.0381495;REFB=-0.0278628;REVB=-0.0372009;RO=31;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169677;STB=0.599074;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0382713;OID=.;OPOS=48367136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:11:4:5:26:11:4:5:26 chr11 48367155 . T A 49.78 PASS AF=0.177778;AO=8;DP=44;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0862826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7262;QD=4.42506;RBI=0.0886844;REFB=-0.0154237;REVB=-0.0204997;RO=34;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176016;STB=0.666173;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0435983;OID=.;OPOS=48367155;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:44:45:34:37:8:8:0.177778:7:1:7:27:7:1:9:28 chr11 48367159 . C T 41.07 PASS AF=0.159091;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.00565064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.415;QD=3.73378;RBI=0.0232972;REFB=-0.00183735;REVB=0.0226016;RO=37;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189538;STB=0.637844;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00655068;OID=.;OPOS=48367159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:44:44:37:37:7:7:0.159091:6:1:9:28:6:1:9:28 chr11 48367190 . A T 40.79 PASS AF=0.152174;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.00782524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=319.367;QD=3.54654;RBI=0.0137118;REFB=-0.00289609;REVB=-0.0112596;RO=39;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446442;STB=0.531163;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0117755;OID=.;OPOS=48367190;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:46:46:39:39:7:7:0.152174:5:2:10:29:5:2:10:29 chr11 48367195 . C T 56.77 PASS AF=0.173077;AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.0104523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6478;QD=4.36719;RBI=0.0263373;REFB=-0.000956642;REVB=-0.0241744;RO=42;SAF=4;SAR=5;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208019;STB=0.642575;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00740253;OID=.;OPOS=48367195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:52:42:43:9:9:0.173077:5:4:12:30:5:4:12:31 chr11 48367249 . C T 90.17 PASS AF=0.202703;AO=15;DP=74;FAO=15;FDP=74;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.00423111;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.566;QD=4.87406;RBI=0.00742983;REFB=-0.00405466;REVB=-0.00610738;RO=58;SAF=5;SAR=10;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211728;STB=0.642009;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0162558;OID=.;OPOS=48367249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:74:74:58:59:15:15:0.202703:10:5:29:29:10:5:30:29 chr11 48367252 . G A 109.08 PASS AF=0.232877;AO=16;DP=72;FAO=17;FDP=73;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0557795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.108;QD=5.97704;RBI=0.0602923;REFB=-0.0140646;REVB=0.0228869;RO=56;SAF=7;SAR=9;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776995;STB=0.568101;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0463925;OID=.;OPOS=48367252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:56:56:16:17:0.232877:9:7:28:28:10:7:28:28 chr11 48367311 . T C 290.85 PASS AF=0.350515;AO=34;DP=97;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.00155794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4393;QD=11.9936;RBI=0.00203227;REFB=-0.0105289;REVB=0.00130498;RO=60;SAF=13;SAR=21;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239677;STB=0.641619;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0144532;OID=.;OPOS=48367311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:60:63:34:34:0.350515:21:13:36:24:21:13:38:25 chr11 48367363 . C T 379.23 PASS AF=0.409091;AO=44;DP=108;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0236726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1029;QD=13.7902;RBI=0.0363024;REFB=-0.0479091;REVB=0.0275222;RO=64;SAF=15;SAR=29;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266579;STB=0.650239;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0650514;OID=.;OPOS=48367363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:110:64:65:44:45:0.409091:29:15:38:26:30:15:38:27 chr11 48367387 . C T 387.53 PASS AF=0.418367;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.082065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.763;QD=15.8176;RBI=0.0860021;REFB=-0.00468083;REVB=0.0257235;RO=56;SAF=16;SAR=25;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963941;STB=0.549847;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00633617;OID=.;OPOS=48367387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:56:57:41:41:0.418367:25:16:27:29:25:16:27:30 chr11 48367419 . G A 432.32 PASS AF=0.453608;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00448291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.9;QD=17.8275;RBI=0.00448438;REFB=-0.00584178;REVB=0.000114865;RO=50;SAF=21;SAR=23;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00260586;STB=0.50727;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00807954;OID=.;OPOS=48367419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:53:44:44:0.453608:23:21:24:26:23:21:26:27 chr11 48367424 . C G 406.81 PASS AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00259827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.797;QD=17.4973;RBI=0.00399842;REFB=-0.00205865;REVB=-0.00303914;RO=51;SAF=21;SAR=21;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288063;STB=0.516121;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00272886;OID=.;OPOS=48367424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:51:42:42:0.451613:21:21:24:27:21:21:24:27 chr11 48367455 . G A 257.15 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0174225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=304.516;QD=16.0718;RBI=0.017837;REFB=-0.00179641;REVB=-0.00382273;RO=35;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197298;STB=0.611464;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00249867;OID=.;OPOS=48367455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:10:19:16:19:10:19:16:19 chr11 48367469 . TG CA 231.06 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00549612;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.226;QD=16.504;RBI=0.0140315;REFB=-0.0432996;REVB=-0.0129102;RO=29;SAF=19;SAR=7;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254034;STB=0.637083;STBP=0.074;TYPE=mnp;VARB=0.0283305;OID=.;OPOS=48367469;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:30:26:26:0.464286:7:19:14:15:7:19:15:15 chr11 48367474 . A G 230.79 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0117206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.412;QD=17.7534;RBI=0.0143768;REFB=-0.00548876;REVB=-0.00832573;RO=27;SAF=22;SAR=3;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487879;STB=0.780525;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00388539;OID=.;OPOS=48367474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:3:22:13:14:3:22:13:14 chr11 48367499 . A G 216.31 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0120803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.993;QD=22.1861;RBI=0.0220753;REFB=-0.016241;REVB=-0.0184766;RO=18;SAF=19;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536085;STB=0.808147;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0205117;OID=.;OPOS=48367499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:2:19:8:10:2:19:8:10 chr11 48373748 . C G 71.04 PASS AF=0.190476;AO=12;DP=63;FAO=12;FDP=63;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0187728;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.556;QD=4.51049;RBI=0.0456144;REFB=0.00646399;REVB=-0.0415723;RO=50;SAF=4;SAR=8;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162955;STB=0.615188;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.0333622;OID=.;OPOS=48373748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:63:63:50:51:12:12:0.190476:8:4:23:27:8:4:24:27 chr11 48373770 . T A 77.9 PASS AF=0.2;AO=13;DP=65;FAO=13;FDP=65;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0201778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.891;QD=4.79374;RBI=0.0201791;REFB=-0.00200939;REVB=0.000230605;RO=52;SAF=5;SAR=8;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144473;STB=0.593157;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0260804;OID=.;OPOS=48373770;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:65:65:52:52:13:13:0.2:8:5:26:26:8:5:26:26 chr11 48373797 . C T 51.19 PASS AF=0.142857;AO=10;DP=70;FAO=10;FDP=70;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00892349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.298;QD=2.92491;RBI=0.0399903;REFB=-0.00204075;REVB=-0.038982;RO=60;SAF=6;SAR=4;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103071;STB=0.572109;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0317196;OID=.;OPOS=48373797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:70:70:60:60:10:10:0.142857:4:6:31:29:4:6:31:29 chr11 48373805 . G A 47.26 PASS AF=0.126582;AO=10;DP=79;FAO=10;FDP=79;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.041464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.908;QD=2.39311;RBI=0.0492466;REFB=-0.00719281;REVB=-0.0265699;RO=69;SAF=7;SAR=3;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206018;STB=0.649558;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0279347;OID=.;OPOS=48373805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:79:79:69:69:10:10:0.126582:3:7:37:32:3:7:37:32 chr11 48373815 . A G 49.43 PASS AF=0.117021;AO=11;DP=94;FAO=11;FDP=94;FR=.;FRO=83;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=0.04788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1751;QD=2.1034;RBI=0.0668496;REFB=-0.00329429;REVB=-0.0466517;RO=83;SAF=8;SAR=3;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165737;STB=0.62314;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0252614;OID=.;OPOS=48373815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:94:94:83:83:11:11:0.117021:3:8:50:33:3:8:50:33 chr11 48373817 . C T 49.73 PASS AF=0.11828;AO=11;DP=93;FAO=11;FDP=93;FR=.;FRO=82;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=-0.0104129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.4;QD=2.13899;RBI=0.0230264;REFB=-0.00221457;REVB=-0.0205374;RO=80;SAF=8;SAR=3;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1393;STB=0.616516;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0435849;OID=.;OPOS=48373817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:93:93:80:82:11:11:0.11828:3:8:50:30:3:8:50:32 chr11 48373820 . A C 49.3 PASS AF=0.117021;AO=11;DP=95;FAO=11;FDP=94;FR=.;FRO=83;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=-0.00409848;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.905;QD=2.09794;RBI=0.026326;REFB=0.000514129;REVB=0.026005;RO=82;SAF=9;SAR=2;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267103;STB=0.708404;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.00540151;OID=.;OPOS=48373820;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:95:94:82:83:11:11:0.117021:2:9:52:30:2:9:52:31 chr11 48373827 . G A 88.43 PASS AF=0.163265;AO=16;DP=98;FAO=16;FDP=98;FR=.;FRO=82;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=-0.0196793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.767;QD=3.60945;RBI=0.0289898;REFB=-0.00354675;REVB=-0.0212869;RO=82;SAF=14;SAR=2;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403638;STB=0.779991;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00883164;OID=.;OPOS=48373827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:98:98:82:82:16:16:0.163265:2:14:51:31:2:14:51:31 chr11 48373885 . A G 401.86 PASS AF=0.315476;AO=53;DP=168;FAO=53;FDP=168;FR=.;FRO=115;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=52;FSRR=63;FWDB=-0.00501724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.107;QD=9.56811;RBI=0.014945;REFB=-0.00930201;REVB=-0.0140777;RO=113;SAF=20;SAR=33;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100447;STB=0.553052;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0246836;OID=.;OPOS=48373885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:113:115:53:53:0.315476:33:20:52:61:33:20:52:63 chr11 48373900 . A G 426.92 PASS AF=0.331325;AO=55;DP=166;FAO=55;FDP=166;FR=.;FRO=111;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=50;FSRR=61;FWDB=-0.00229004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6316;QD=10.2871;RBI=0.00623493;REFB=-0.000623671;REVB=-0.00579914;RO=111;SAF=20;SAR=35;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105011;STB=0.560618;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00207678;OID=.;OPOS=48373900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:111:111:55:55:0.331325:35:20:50:61:35:20:50:61 chr11 48373936 . A G 495.42 PASS AF=0.37037;AO=60;DP=162;FAO=60;FDP=162;FR=.;FRO=102;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=-0.00144465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.734;QD=12.2326;RBI=0.0115515;REFB=-0.00764031;REVB=0.0114609;RO=102;SAF=19;SAR=41;SRF=50;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202513;STB=0.615495;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0112243;OID=.;OPOS=48373936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:102:102:60:60:0.37037:41:19:50:52:41:19:50:52 chr11 48373946 . C A 103.0 PASS AF=0.139241;AO=22;DP=158;FAO=22;FDP=158;FR=.;FRO=136;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=60;FSRR=76;FWDB=-0.0196461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.407;QD=2.60758;RBI=0.030382;REFB=-0.00408914;REVB=-0.0231754;RO=134;SAF=9;SAR=13;SRF=60;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498122;STB=0.528243;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0222477;OID=.;OPOS=48373946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:134:136:22:22:0.139241:13:9:60:74:13:9:60:76 chr11 48373976 . T G 432.52 PASS AF=0.381679;AO=50;DP=134;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.0175786;FXX=0.0223864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.957;QD=13.2067;RBI=0.0207816;REFB=-0.0101604;REVB=-0.0110846;RO=84;SAF=18;SAR=32;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145637;STB=0.570309;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0149344;OID=.;OPOS=48373976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:131:84:81:50:50:0.381679:32:18:41:43:32:18:38:43 chr11 48373986 . A G 436.35 PASS AF=0.433628;AO=49;DP=113;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.047765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.464;QD=15.4459;RBI=0.0477681;REFB=-0.0230944;REVB=-0.000548429;RO=63;SAF=17;SAR=32;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18317;STB=0.598985;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0130979;OID=.;OPOS=48373986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:63:64:49:49:0.433628:32:17:33:30:32:17:33:31 chr11 48374000 . C CT 75.48 PASS AF=0.345238;AO=24;DP=94;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0145907;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.6649;QD=3.59426;RBI=0.0856904;REFB=-0.0328448;REVB=0.084439;RO=64;SAF=9;SAR=15;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135279;STB=0.502957;STBP=0.985;TYPE=ins;VARB=0.0336532;OID=.;OPOS=48374001;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.345238:24:94:29:84:55:12:17:23:32:75:64:9:15:31:33 chr11 48387098 . A C 56.81 PASS AF=0.163934;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=61;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0050015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.083;QD=3.72518;RBI=0.0133019;REFB=-0.00537012;REVB=-0.0123258;RO=50;SAF=8;SAR=2;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406698;STB=0.783201;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0168291;OID=.;OPOS=48387098;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:61:61:50:51:10:10:0.163934:2:8:24:26:2:8:24:27 chr11 48387107 . T C 56.0 PASS AF=0.16129;AO=10;DP=62;FAO=10;FDP=62;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.025245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.329;QD=3.61303;RBI=0.0473752;REFB=-0.00209692;REVB=-0.0400887;RO=52;SAF=8;SAR=2;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422937;STB=0.788885;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0888834;OID=.;OPOS=48387107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:62:62:52:52:10:10:0.16129:2:8:24:28:2:8:24:28 chr11 48387115 . G A 49.98 PASS AF=0.15;AO=9;DP=60;FAO=9;FDP=60;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0031921;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.36;QD=3.33225;RBI=0.0247712;REFB=-0.0114361;REVB=-0.0245646;RO=51;SAF=7;SAR=2;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41758;STB=0.788462;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0640128;OID=.;OPOS=48387115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:60:60:51:51:9:9:0.15:2:7:22:29:2:7:22:29 chr11 48387118 . G A 49.98 PASS AF=0.15;AO=9;DP=60;FAO=9;FDP=60;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0102974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.016;QD=3.33193;RBI=0.0208318;REFB=0.000374349;REVB=-0.0181088;RO=51;SAF=7;SAR=2;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435896;STB=0.799361;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.00718055;OID=.;OPOS=48387118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:60:60:51:51:9:9:0.15:2:7:21:30:2:7:21:30 chr11 48387154 . A G 43.61 PASS AF=0.1;AO=5;DP=50;FAO=5;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.00208556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.284;QD=3.48855;RBI=0.0162341;REFB=-0.00079606;REVB=0.0160996;RO=38;SAF=3;SAR=2;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29131;STB=0.725018;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00569072;OID=.;OPOS=48387154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:50:50:38:42:5:5:0.1:2:3:13:25:2:3:14:28 chr11 48387164 . G A 39.74 PASS AF=0.137255;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=51;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0159025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.22;QD=3.11679;RBI=0.0378261;REFB=-0.00437336;REVB=-0.0343209;RO=44;SAF=5;SAR=2;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448035;STB=0.80734;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0239031;OID=.;OPOS=48387164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:51:51:44:44:7:7:0.137255:2:5:14:30:2:5:14:30 chr11 48387186 . A G 194.65 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0635185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4636;QD=17.3021;RBI=0.0641158;REFB=-0.00411324;REVB=-0.00873139;RO=25;SAF=6;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227108;STB=0.630196;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00531263;OID=.;OPOS=48387186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:14:6:13:12:14:6:13:12 chr11 48387301 . G A 45.33 PASS AF=0.142857;AO=8;DP=56;FAO=8;FDP=56;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00584615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3995;QD=3.23806;RBI=0.0164661;REFB=-0.0244809;REVB=-0.0153934;RO=46;SAF=4;SAR=4;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792665;STB=0.553439;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0724727;OID=.;OPOS=48387301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:56:56:46:48:8:8:0.142857:4:4:20:26:4:4:21:27 chr11 48387335 . C A 129.68 PASS AF=0.260274;AO=18;DP=73;FAO=19;FDP=73;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0127388;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.33;QD=7.10588;RBI=0.0127388;REFB=-0.0106914;REVB=1.46377e-05;RO=54;SAF=10;SAR=8;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112962;STB=0.546714;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0306841;OID=.;OPOS=48387335;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:54:54:18:19:0.260274:8:10:25:29:9:10:25:29 chr11 48387370 . A G 213.95 PASS AF=0.293478;AO=27;DP=90;FAO=27;FDP=92;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.00131209;FXX=0.0416623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.983;QD=9.30225;RBI=0.0140626;REFB=-0.00452728;REVB=-0.0140013;RO=62;SAF=18;SAR=9;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325139;STB=0.704079;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00833191;OID=.;OPOS=48387370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:62:65:27:27:0.293478:9:18:24:38:9:18:24:41 chr11 48387424 . G T 312.33 PASS AF=0.357798;AO=39;DP=110;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.00231881;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.895;QD=11.4618;RBI=0.00704333;REFB=-0.00499251;REVB=0.00665068;RO=69;SAF=18;SAR=21;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137653;STB=0.502839;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00677154;OID=.;OPOS=48387424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:69:70:39:39:0.357798:21:18:31:38:21:18:32:38 chr11 48387490 . G A 401.13 PASS AF=0.414414;AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.0450744;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2405;QD=14.4553;RBI=0.0511781;REFB=-0.021875;REVB=-0.0242382;RO=65;SAF=15;SAR=31;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197296;STB=0.611541;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.024114;OID=.;OPOS=48387490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:65:65:46:46:0.414414:31:15:33:32:31:15:33:32 chr11 48387506 . A G 342.17 PASS AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.00854855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4685;QD=12.9119;RBI=0.0228117;REFB=-0.0137699;REVB=-0.0211494;RO=63;SAF=13;SAR=28;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213435;STB=0.631715;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0383598;OID=.;OPOS=48387506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:63:65:41:41:0.386792:28:13:32:31:28:13:34:31 chr11 48387526 . G T 325.04 PASS AF=0.38;AO=38;DP=101;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0066576;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.51;QD=13.0017;RBI=0.0104488;REFB=-0.00737779;REVB=0.00805314;RO=62;SAF=12;SAR=26;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226923;STB=0.629885;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00896609;OID=.;OPOS=48387526;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:62:62:38:38:0.38:26:12:32:30:26:12:32:30 chr11 48387535 . T C 269.22 PASS AF=0.351648;AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00733946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1556;QD=11.8338;RBI=0.0085996;REFB=-0.0132082;REVB=0.00448168;RO=59;SAF=8;SAR=24;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347217;STB=0.701622;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0281121;OID=.;OPOS=48387535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:59:59:32:32:0.351648:24:8:32:27:24:8:32:27 chr11 48387540 . G T 271.73 PASS AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0189957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.578;QD=12.3515;RBI=0.0220687;REFB=-0.00616894;REVB=0.0112334;RO=56;SAF=7;SAR=25;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397959;STB=0.730616;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0138015;OID=.;OPOS=48387540;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:56:56:32:32:0.363636:25:7:31:25:25:7:31:25 chr11 48387580 . G T 79.84 PASS AF=0.218182;AO=12;DP=54;FAO=12;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0777988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.286;QD=5.80668;RBI=0.089436;REFB=-0.0020814;REVB=0.0441151;RO=42;SAF=2;SAR=10;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505275;STB=0.827668;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00471734;OID=.;OPOS=48387580;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:54:55:42:43:12:12:0.218182:10:2:24:18:10:2:25:18 chr11 48387582 . C T 78.36 PASS AF=0.214286;AO=12;DP=56;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0477215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8544;QD=5.59745;RBI=0.0491876;REFB=-0.0266961;REVB=-0.0119193;RO=44;SAF=2;SAR=10;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502886;STB=0.82262;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0354104;OID=.;OPOS=48387582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:56:56:44:44:12:12:0.214286:10:2:25:19:10:2:25:19 chr11 48387584 . A T 78.36 PASS AF=0.214286;AO=12;DP=56;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0154388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.815;QD=5.59744;RBI=0.0168572;REFB=-0.0193377;REVB=0.00676804;RO=43;SAF=2;SAR=10;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494515;STB=0.82262;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0353334;OID=.;OPOS=48387584;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:56:56:43:44:12:12:0.214286:10:2:24:19:10:2:25:19 chr11 48387591 . A G 85.65 PASS AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00375837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.505;QD=6.5882;RBI=0.0432233;REFB=-0.0199451;REVB=-0.0430596;RO=40;SAF=2;SAR=10;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48712;STB=0.810268;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0564482;OID=.;OPOS=48387591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:40:40:12:12:0.230769:10:2:22:18:10:2:22:18 chr11 48387604 . C T 80.02 PASS AF=0.234043;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00168263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.528;QD=6.80979;RBI=0.0034116;REFB=-0.00650524;REVB=-0.00296779;RO=35;SAF=2;SAR=9;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480381;STB=0.797824;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0131292;OID=.;OPOS=48387604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:46:47:35:36:11:11:0.234043:9:2:20:15:9:2:20:16 chr11 48387919 . G A 31.47 PASS AF=0.0709677;AO=11;DP=154;FAO=11;FDP=155;FR=.;FRO=144;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=83;FSRR=61;FWDB=-0.00777618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.931;QD=0.812209;RBI=0.0122123;REFB=-0.00117218;REVB=-0.00941653;RO=140;SAF=7;SAR=4;SRF=81;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655875;STB=0.558174;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00762068;OID=.;OPOS=48387919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:154:155:140:144:11:11:0.0709677:4:7:81:59:4:7:83:61 chr11 48387930 . T C 48.76 PASS AF=0.0909091;AO=14;DP=154;FAO=14;FDP=154;FR=.;FRO=140;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=81;FSRR=59;FWDB=0.0298168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.303;QD=1.26649;RBI=0.0335443;REFB=-0.00505538;REVB=-0.0153683;RO=140;SAF=8;SAR=6;SRF=81;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085299;STB=0.506632;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0206312;OID=.;OPOS=48387930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:154:154:140:140:14:14:0.0909091:6:8:81:59:6:8:81:59 chr11 48387946 . G T 87.24 PASS AF=0.132867;AO=19;DP=144;FAO=19;FDP=143;FR=.;FRO=124;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=74;FSRR=50;FWDB=-0.000843346;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.679;QD=2.44034;RBI=0.00169061;REFB=-0.00220302;REVB=-0.00146524;RO=119;SAF=13;SAR=6;SRF=74;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859327;STB=0.58231;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.00767784;OID=.;OPOS=48387946;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:144:143:119:124:19:19:0.132867:6:13:74:45:6:13:74:50 chr11 48387960 . T C 128.76 PASS AF=0.167832;AO=24;DP=143;FAO=24;FDP=143;FR=.;FRO=119;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=69;FSRR=50;FWDB=0.0166608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6381;QD=3.60154;RBI=0.028465;REFB=-0.0108899;REVB=0.0230798;RO=119;SAF=14;SAR=10;SRF=69;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.004588;STB=0.502991;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.06425;OID=.;OPOS=48387960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:119:119:24:24:0.167832:10:14:69:50:10:14:69:50 chr11 48387978 . T A 135.57 PASS AF=0.167785;AO=25;DP=149;FAO=25;FDP=149;FR=.;FRO=124;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=69;FSRR=55;FWDB=0.00237559;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.649;QD=3.63933;RBI=0.00859839;REFB=-0.00459908;REVB=-0.00826371;RO=124;SAF=14;SAR=11;SRF=69;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459281;STB=0.502992;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0219266;OID=.;OPOS=48387978;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:124:124:25:25:0.167785:11:14:69:55:11:14:69:55 chr11 48387983 . T C 146.55 PASS AF=0.180556;AO=26;DP=144;FAO=26;FDP=144;FR=.;FRO=118;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=69;FSRR=49;FWDB=0.0138293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.883;QD=4.0709;RBI=0.0146987;REFB=-0.0014717;REVB=0.00498014;RO=117;SAF=15;SAR=11;SRF=69;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168386;STB=0.506574;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0131264;OID=.;OPOS=48387983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:117:118:26:26:0.180556:11:15:69:48:11:15:69:49 chr11 48510654 . A C 364.1 PASS AF=0.411765;AO=41;DP=101;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.00105277;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.426;QD=14.2785;RBI=0.00842405;REFB=-0.00452946;REVB=-0.00835801;RO=58;SAF=25;SAR=16;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18576;STB=0.600329;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00628964;OID=.;OPOS=48510654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:58:60:41:42:0.411765:16:25:25:33:16:26:27:33 chr11 48510777 . G A 444.74 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.00909843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.505;QD=16.4719;RBI=0.00932415;REFB=-0.0208936;REVB=0.00203923;RO=59;SAF=28;SAR=21;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622162;STB=0.534745;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0302019;OID=.;OPOS=48510777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:21:28:30:29:21:28:30:29 chr11 48997107 . G A 569.61 PASS AF=0.542857;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=105;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0607133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3596;QD=21.6995;RBI=0.093616;REFB=-0.062948;REVB=-0.0712591;RO=47;SAF=36;SAR=21;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256202;STB=0.635952;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0512605;OID=.;OPOS=48997107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:47:48:57:57:0.542857:21:36:15:32:21:36:16:32 chr11 48997334 . T G 240.13 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0028454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.197;QD=16.5606;RBI=0.0138815;REFB=-0.0192174;REVB=-0.0135867;RO=29;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707764;STB=0.541636;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0332466;OID=.;OPOS=48997334;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:31:27:27:0.465517:16:11:14:15:16:11:15:16 chr11 49000423 . C G 534.47 PASS AF=0.486957;AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0119098;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.606;QD=18.5903;RBI=0.0119103;REFB=-0.00889812;REVB=0.000110405;RO=59;SAF=32;SAR=24;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105763;STB=0.558582;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00903218;OID=.;OPOS=49000423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:59:59:56:56:0.486957:24:32:27:32:24:32:27:32 chr11 49000522 . C T 263.26 PASS AF=0.434783;AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0358363;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9788;QD=15.2613;RBI=0.0372933;REFB=0.000568983;REVB=-0.0103221;RO=39;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225454;STB=0.626491;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.000826964;OID=.;OPOS=49000522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:39:39:29:30:0.434783:10:19:17:22:11:19:16:23 chr11 49000558 . G A 111.99 PASS AF=0.419355;AO=9;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0381252;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.553;QD=14.4503;RBI=0.0436452;REFB=-0.0139377;REVB=-0.0212455;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141412;STB=0.507032;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.058045;OID=.;OPOS=49000558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:11:18:9:13:0.419355:8:1:2:9:10:3:4:14 chr11 49055751 . T C 200.01 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.0368394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.667;QD=20.0011;RBI=0.0382308;REFB=-0.0142113;REVB=-0.0102201;RO=19;SAF=13;SAR=6;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480807;STB=0.777531;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00646524;OID=.;OPOS=49055751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:19:20:19:20:0.5:6:13:2:17:6:14:2:18 chr11 49059362 . C A 580.4 PASS AF=0.418919;AO=62;DP=148;FAO=62;FDP=148;FR=.;FRO=86;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=0.0042774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1238;QD=15.6864;RBI=0.0203734;REFB=-0.0217839;REVB=-0.0199194;RO=86;SAF=29;SAR=33;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695128;STB=0.538968;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0279729;OID=.;OPOS=49059362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:86:86:62:62:0.418919:33:29:46:40:33:29:46:40 chr11 49075605 . G A 401.37 PASS AF=0.428571;AO=42;DP=98;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0142084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.477;QD=16.3826;RBI=0.0168983;REFB=-0.00882178;REVB=0.00914733;RO=56;SAF=19;SAR=23;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00610461;STB=0.503433;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0128072;OID=.;OPOS=49075605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:56:56:42:42:0.428571:23:19:25:31:23:19:25:31 chr11 49077889 . AT A,ATT 59.81 PASS AF=0.477612,0;AO=31,9;DP=68;FAO=32,0;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17,0;FSAR=15,0;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.130359,0.120063;FXX=0.0147037;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.68827,6.11038;QD=3.57071;RBI=0.245616,0.221261;REFB=0.00926926,-0.0214638;REVB=0.208167,-0.185853;RO=22;SAF=17,2;SAR=14,7;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.067373,-0.466156;STB=0.506088,0.5;STBP=0.932,1;TYPE=del,ins;VARB=0.0795047,0.0378329;OID=.,.;OPOS=49077890,49077890;OREF=T,-;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477612,0:31,9:68:32,0:67:35:17,0:15,0:19:16:64:22:17,2:14,7:14:8 chr11 49080616 . T C 376.44 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.000903578;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0932;QD=20.9131;RBI=0.0234782;REFB=-0.014493;REVB=0.0234608;RO=34;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475298;STB=0.526302;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0202793;OID=.;OPOS=49080616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:34:34:38:38:0.527778:18:20:16:18:18:20:16:18 chr11 49598178 . G A 2387.28 PASS AF=1;AO=156;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363297;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.353;QD=61.2123;RBI=0.0435826;REFB=0;REVB=0.0240747;RO=0;SAF=63;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010903;OID=.;OPOS=49598178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:156:0:0:156:156:1:93:63:0:0:93:63:0:0 chr11 49598207 . T C 2350.99 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2536;QD=63.9725;RBI=0.0459289;REFB=0;REVB=-0.0275397;RO=0;SAF=55;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16577e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92057e-05;OID=.;OPOS=49598207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:92:55:0:0:92:55:0:0 chr11 49598209 . T C 2219.63 PASS AF=0.992958;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0352077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.418;QD=62.5248;RBI=0.0352607;REFB=-0.0432781;REVB=0.00193233;RO=1;SAF=54;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872358;STB=0.504587;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000221666;OID=.;OPOS=49598209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:142:142:1:1:141:141:0.992958:87:54:1:0:87:54:1:0 chr11 49830142 . G T 2241.62 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127248;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.695;QD=63.592;RBI=0.0167192;REFB=0;REVB=0.0108448;RO=0;SAF=64;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86071e-05;OID=.;OPOS=49830142;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:77:64:0:0:77:64:0:0 chr11 49973979 . C T 244.06 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0125988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3918;QD=18.774;RBI=0.0183632;REFB=-0.0201484;REVB=-0.0133596;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203727;STB=0.613949;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0260349;OID=.;OPOS=49973979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:9:17:11:15:9:17 chr11 49974371 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.568;QD=61.684;RBI=0.0359166;REFB=0;REVB=-0.0244972;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5272e-06;OID=.;OPOS=49974371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0 chr11 49974931 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.146;QD=57.2023;RBI=0.0625881;REFB=0;REVB=0.0541904;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353462;OID=.;OPOS=49974931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr11 50003191 . C A 1461.98 PASS AF=1;AO=96;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230025;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3272;QD=59.6728;RBI=0.0289061;REFB=0;REVB=0.0175055;RO=0;SAF=58;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157284;OID=.;OPOS=50003191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:96:98:1:38:58:0:0:40:58:0:0 chr11 50003561 . G A 327.71 PASS AF=0.651163;AO=27;DP=42;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00692003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.349;QD=30.4847;RBI=0.00780343;REFB=-0.0156496;REVB=-0.00360649;RO=15;SAF=13;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531219;STB=0.522597;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00787507;OID=.;OPOS=50003561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:15:15:27:28:0.651163:14:13:6:9:15:13:6:9 chr11 50233954 . C A 341.86 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00190528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.721;QD=18.4786;RBI=0.00740924;REFB=-0.00404695;REVB=0.00716008;RO=38;SAF=20;SAR=16;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271502;STB=0.515143;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0040855;OID=.;OPOS=50233954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:16:20:20:18:16:20:20:18 chr11 51516000 . C T 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.1584;QD=58.5992;RBI=0.0400445;REFB=0;REVB=0.0221047;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000586442;OID=.;OPOS=51516000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr11 51516036 . G A 779.72 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.421;QD=63.6502;RBI=0.0850176;REFB=0;REVB=0.0176346;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313849;OID=.;OPOS=51516036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:24:23:0:0:24:25:0:0 chr11 55111238 . C A 1320.91 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.352;QD=62.1604;RBI=0.0226179;REFB=0;REVB=-0.00553592;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1892e-05;OID=.;OPOS=55111238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:53:32:0:0:53:32:0:0 chr11 55111584 . A T 1462.11 PASS AF=0.990099;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126585;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.604;QD=57.9053;RBI=0.0163794;REFB=-0.0597117;REVB=0.0103945;RO=1;SAF=31;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150537;STB=0.503649;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.000199865;OID=.;OPOS=55111584;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:1:1:99:100:0.990099:68:31:1:0:68:32:0:1 chr11 55135435 . C T 491.24 PASS AF=0.484848;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00156665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.879;QD=19.848;RBI=0.0261155;REFB=0.00733323;REVB=-0.0260685;RO=50;SAF=27;SAR=21;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578912;STB=0.537468;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.00744947;OID=.;OPOS=55135435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:50:51:48:48:0.484848:21:27:25:25:21:27:25:26 chr11 55322211 . A G 583.57 PASS AF=0.495868;AO=60;DP=121;FAO=60;FDP=121;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.00876438;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.31;QD=19.2916;RBI=0.00880105;REFB=-0.00131096;REVB=0.00080257;RO=61;SAF=27;SAR=33;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978833;STB=0.55407;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00137306;OID=.;OPOS=55322211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:61:61:60:60:0.495868:33:27:34:27:33:27:34:27 chr11 55322539 . G A 189.69 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00769467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.071;QD=13.0817;RBI=0.032215;REFB=-0.0111534;REVB=0.0312826;RO=35;SAF=16;SAR=7;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798708;STB=0.546034;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0108569;OID=.;OPOS=55322539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:7:16:22:13:7:16:22:13 chr11 55339652 . C T 475.29 PASS AF=0.68254;AO=43;DP=63;FAO=43;FDP=63;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0105433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7057;QD=30.1773;RBI=0.0422838;REFB=0.0186733;REVB=-0.0409483;RO=20;SAF=19;SAR=24;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926759;STB=0.550272;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.0159068;OID=.;OPOS=55339652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:20:20:43:43:0.68254:24:19:12:8:24:19:12:8 chr11 55339676 . G T 220.75 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0100977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.657;QD=12.0956;RBI=0.0127283;REFB=0.00271989;REVB=-0.00774903;RO=46;SAF=17;SAR=10;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191061;STB=0.610174;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.00363573;OID=.;OPOS=55339676;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:10:17:21:25:10:17:21:25 chr11 55339702 . C T 299.23 PASS AF=0.390805;AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00726185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.391;QD=13.7578;RBI=0.0221357;REFB=-0.0243964;REVB=-0.0209106;RO=52;SAF=23;SAR=11;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21596;STB=0.61847;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00557699;OID=.;OPOS=55339702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:52:53:34:34:0.390805:11:23:25:27:11:23:26:27 chr11 55339798 . C T 397.21 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0258199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.869;QD=20.6344;RBI=0.0437029;REFB=-0.0289478;REVB=-0.0352601;RO=37;SAF=28;SAR=12;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00279533;STB=0.501547;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.026925;OID=.;OPOS=55339798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:12:28:26:11:12:28:26:11 chr11 55339829 . A G 1161.79 PASS AF=1;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222616;FXX=0.0256377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.787;QD=61.1468;RBI=0.0309211;REFB=0;REVB=0.02146;RO=0;SAF=53;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013137;OID=.;OPOS=55339829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:76:0:0:76:76:1:23:53:0:0:23:53:0:0 chr11 55340264 . C T 539.63 PASS AF=0.568182;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0293348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.463;QD=24.5286;RBI=0.0301849;REFB=-0.017806;REVB=0.00711305;RO=38;SAF=31;SAR=19;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055444;STB=0.530406;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0186724;OID=.;OPOS=55340264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:38:38:50:50:0.568182:19:31:21:17:19:31:21:17 chr11 55340379 . T C 1721.95 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1036;QD=60.4192;RBI=0.0334363;REFB=0;REVB=0.031056;RO=0;SAF=70;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207371;OID=.;OPOS=55340379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:114:0:0:113:114:1:43:70:0:0:43:71:0:0 chr11 55371807 . A T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.121172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.701;QD=33.4265;RBI=0.170085;REFB=0;REVB=0.119358;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177275;OID=.;OPOS=55371807;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr11 55433040 . T C 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0131699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.489;QD=9.13215;RBI=0.0267963;REFB=0.00410427;REVB=-0.0233366;RO=22;SAF=8;SAR=2;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176947;STB=0.609928;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=-0.0112652;OID=.;OPOS=55433040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:2:8:15:7:2:8:15:7 chr11 55541098 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7366;QD=63.8718;RBI=0.0195369;REFB=0;REVB=-0.0194764;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162588;OID=.;OPOS=55541098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0 chr11 55541807 . T C 52.37 PASS AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0243497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6622;QD=6.54623;RBI=0.051865;REFB=0.00995573;REVB=0.0457938;RO=23;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911203;STB=0.533815;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.02584;OID=.;OPOS=55541807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:23:24:8:8:0.25:5:3:7:16:5:3:8:16 chr11 55563776 . T G 1076.23 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=76;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0375353;FXX=0.0394685;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.307;QD=58.9717;RBI=0.0475117;REFB=-0.108938;REVB=0.0291284;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000932751;OID=.;OPOS=55563776;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:76:73:0:1:72:72:0.986301:35:37:0:0:35:37:1:0 chr11 55587117 . T A 538.53 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00982466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.348;QD=59.8369;RBI=0.0136922;REFB=0;REVB=0.00953689;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193118;OID=.;OPOS=55587117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0 chr11 55587511 . A G 2253.24 PASS AF=0.980519;AO=152;DP=155;FAO=151;FDP=154;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.018238;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.042;QD=58.5258;RBI=0.0182384;REFB=-0.0265284;REVB=-0.00012381;RO=3;SAF=62;SAR=90;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022456;STB=0.511998;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=1.83774e-05;OID=.;OPOS=55587511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:155:154:3:3:152:151:0.980519:90:62:3:0:90:61:3:0 chr11 55587914 . A G 246.69 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0025632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.36;QD=15.9152;RBI=0.0138758;REFB=-0.0250202;REVB=0.013637;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244004;STB=0.637403;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0362951;OID=.;OPOS=55587914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:11:17:12:22:11:17:12:22 chr11 55606302 . G T 544.85 PASS AF=0.536842;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.000949284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.094;QD=22.9411;RBI=0.00986395;REFB=-0.0213231;REVB=-0.00981817;RO=42;SAF=29;SAR=22;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765193;STB=0.542603;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0154723;OID=.;OPOS=55606302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:42:44:51:51:0.536842:22:29:20:22:22:29:21:23 chr11 55606818 . C T 42.3 PASS AF=0.194444;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.034542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.838;QD=4.70019;RBI=0.0369462;REFB=-0.00696159;REVB=0.01311;RO=28;SAF=2;SAR=5;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374365;STB=0.756883;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0337798;OID=.;OPOS=55606818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:35:36:28:29:7:7:0.194444:5:2:17:11:5:2:18:11 chr11 55652963 . A G 69.69 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0173058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.675;QD=16.3974;RBI=0.0314398;REFB=-0.047049;REVB=0.0262483;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238988;STB=0.639683;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0263809;OID=.;OPOS=55652963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:3:5:3:6:3:5 chr11 55652971 . C A 230.29 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00520597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.014;QD=46.0582;RBI=0.014059;REFB=0.0229839;REVB=0.0130596;RO=1;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483869;STB=0.526288;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.000109958;OID=.;OPOS=55652971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:9:10:0:1:9:10:0:1 chr11 55653164 . G A 253.23 PASS AF=0.575;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0239982;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.64;QD=25.3232;RBI=0.0249842;REFB=-0.0174324;REVB=-0.00694954;RO=19;SAF=7;SAR=16;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595207;STB=0.50515;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0185995;OID=.;OPOS=55653164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:40:19:17:23:23:0.575:16:7:7:12:16:7:5:12 chr11 55656483 . T A 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.111;QD=63.5829;RBI=0.0347815;REFB=0;REVB=0.0291753;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13997e-05;OID=.;OPOS=55656483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr11 55681336 . G A 373.03 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0152544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5133;QD=20.4399;RBI=0.0193854;REFB=-0.0079232;REVB=-0.0119623;RO=34;SAF=21;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199758;STB=0.504732;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00736984;OID=.;OPOS=55681336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:35:38:38:0.520548:17:21:18:16:17:21:19:16 chr11 55681494 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.478;QD=56.7064;RBI=0.0256045;REFB=0;REVB=0.0250624;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129476;OID=.;OPOS=55681494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr11 55746891 . G A 3445.47 PASS AF=1;AO=222;DP=225;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000448859;FXX=0.0133327;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.561;QD=62.0806;RBI=0.0202661;REFB=-0.0102659;REVB=-0.0202611;RO=2;SAF=102;SAR=120;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00787453;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28192e-05;OID=.;OPOS=55746891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:225:222:2:0:222:222:1:120:102:0:2:120:102:0:0 chr11 55761221 . C T 1098.72 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0435;QD=60.2039;RBI=0.0325358;REFB=0;REVB=0.0288308;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287263;OID=.;OPOS=55761221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:38:34:0:0:38:35:0:0 chr11 55761738 . T G 729.59 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188008;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.637;QD=57.2228;RBI=0.0210406;REFB=0;REVB=0.00944669;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152155;OID=.;OPOS=55761738;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:29:21:0:0:29:22:0:0 chr11 55762060 . T C 256.44 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0459657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.41;QD=22.795;RBI=0.0467534;REFB=-0.0118303;REVB=-0.00854633;RO=20;SAF=8;SAR=16;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184293;STB=0.615286;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0147861;OID=.;OPOS=55762060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:21:24:24:0.533333:16:8:11:9:16:8:12:9 chr11 55798152 . G A 601.15 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00927773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.587;QD=58.6487;RBI=0.0105304;REFB=-0.0377873;REVB=-0.00498137;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.513507;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=6.93112e-06;OID=.;OPOS=55798152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:18:22:0:0:18:22:0:1 chr11 55872876 . C T 3132.07 PASS AF=0.990338;AO=204;DP=207;FAO=205;FDP=207;FR=.;FRO=2;FSAF=88;FSAR=117;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0488971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.706;QD=60.5231;RBI=0.0494213;REFB=-0.0872466;REVB=0.00717933;RO=2;SAF=87;SAR=117;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108226;STB=0.505617;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000284334;OID=.;OPOS=55872876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:207:207:2:2:204:205:0.990338:117:87:2:0:117:88:2:0 chr11 55873024 . A G 2296.43 PASS AF=0.993151;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0180943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.362;QD=62.916;RBI=0.0187255;REFB=-0.102597;REVB=0.00482067;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.503225;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.000147701;OID=.;OPOS=55873024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:146:0:1:145:145:0.993151:68:77:0:0:68:77:1:0 chr11 55873368 . G A 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.706;QD=57.2371;RBI=0.0194404;REFB=0;REVB=0.00560063;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.42146e-05;OID=.;OPOS=55873368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0 chr11 55890257 . C T 2028.22 PASS AF=0.970803;AO=133;DP=137;FAO=133;FDP=137;FR=.;FRO=4;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0141776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.5322;QD=59.2182;RBI=0.0498309;REFB=0.124286;REVB=-0.0477715;RO=4;SAF=77;SAR=56;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00974531;STB=0.505129;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00199694;OID=.;OPOS=55890257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:137:137:4:4:133:133:0.970803:56:77:3:1:56:77:3:1 chr11 56000403 . C G 1283.42 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.111;QD=61.8515;RBI=0.0419609;REFB=0;REVB=0.0407169;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40576e-05;OID=.;OPOS=56000403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0 chr11 56000600 . G T 96.2 PASS AF=0.375;AO=9;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0253026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.82;QD=12.0244;RBI=0.0267178;REFB=0.00802334;REVB=-0.00858018;RO=18;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431551;STB=0.814671;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0104428;OID=.;OPOS=56000600;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:18:20:9:12:0.375:7:2:11:7:10:2:13:7 chr11 56043604 . A G 645.22 PASS AF=0.5625;AO=61;DP=111;FAO=63;FDP=112;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.011129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.335;QD=23.0437;RBI=0.0113173;REFB=-0.0316262;REVB=-0.0020559;RO=46;SAF=30;SAR=31;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277776;STB=0.516855;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0258751;OID=.;OPOS=56043604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:46:49:61:63:0.5625:31:30:21:25:31:32:23:26 chr11 56043702 . G C 240.49 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0108515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.595;QD=21.3766;RBI=0.0347993;REFB=-0.0187041;REVB=-0.0330641;RO=22;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212546;STB=0.618947;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0253737;OID=.;OPOS=56043702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:13:10:15:7:13:10:15:7 chr11 56058197 . G A 403.66 PASS AF=0.425926;AO=46;DP=108;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00948952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.24;QD=14.9505;RBI=0.011573;REFB=-0.0104556;REVB=0.00662453;RO=62;SAF=24;SAR=22;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1207;STB=0.567734;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0128974;OID=.;OPOS=56058197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:62:62:46:46:0.425926:22:24:25:37:22:24:25:37 chr11 56086147 . T G 205.9 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0614676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9489;QD=23.5319;RBI=0.0624244;REFB=-0.0165128;REVB=0.0108876;RO=15;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193409;STB=0.608582;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0119765;OID=.;OPOS=56086147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:14:6:8:7:14:6:8:7 chr11 56113516 . T C 391.44 PASS AF=0.603175;AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00282968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.773;QD=24.8531;RBI=0.0300474;REFB=-0.028404;REVB=0.0299139;RO=25;SAF=26;SAR=12;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270994;STB=0.648801;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0126036;OID=.;OPOS=56113516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:25:25:38:38:0.603175:12:26:8:17:12:26:8:17 chr11 56113575 . A G 692.8 PASS AF=0.553719;AO=66;DP=121;FAO=67;FDP=121;FR=.;FRO=54;FSAF=48;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.00408435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.377;QD=22.9025;RBI=0.0130132;REFB=-0.00847446;REVB=0.0123556;RO=53;SAF=48;SAR=18;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24578;STB=0.632217;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00697153;OID=.;OPOS=56113575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:53:54:66:67:0.553719:18:48:24:29:19:48:24:30 chr11 56113593 . C A 797.77 PASS AF=0.520548;AO=76;DP=146;FAO=76;FDP=146;FR=.;FRO=70;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.00101681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.908;QD=21.8568;RBI=0.0342507;REFB=-0.0133113;REVB=-0.0342356;RO=70;SAF=51;SAR=25;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158625;STB=0.587308;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0103234;OID=.;OPOS=56113593;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:70:70:76:76:0.520548:25:51:35:35:25:51:35:35 chr11 56127746 . A G 1098.73 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00378203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.052;QD=60.2043;RBI=0.0297043;REFB=0;REVB=0.0294626;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37196e-05;OID=.;OPOS=56127746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:32:41:0:0 chr11 56128081 . A G 503.58 PASS AF=0.436508;AO=55;DP=126;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0409061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.398;QD=15.9868;RBI=0.0409157;REFB=-0.0121904;REVB=-0.00088312;RO=69;SAF=32;SAR=23;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607642;STB=0.526739;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0161528;OID=.;OPOS=56128081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:69:71:55:55:0.436508:23:32:36:33:23:32:38:33 chr11 56128524 . C T 998.09 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00139622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.039;QD=58.711;RBI=0.02242;REFB=0;REVB=-0.0223765;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.15607e-05;OID=.;OPOS=56128524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:32:36:0:0 chr11 56143103 . G A 48.58 PASS AF=0.113402;AO=11;DP=97;FAO=11;FDP=97;FR=.;FRO=86;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=-0.011688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.794;QD=2.0035;RBI=0.0265996;REFB=-0.00665229;REVB=-0.0238941;RO=78;SAF=1;SAR=10;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.571801;STB=0.895653;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0123756;OID=.;OPOS=56143103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:97:97:78:86:11:11:0.113402:10:1:44:34:10:1:44:42 chr11 56143108 . C G 56.13 PASS AF=0.122449;AO=12;DP=101;FAO=12;FDP=98;FR=.;FRO=86;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=45;FSRR=41;FWDB=0.0100181;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.919;QD=2.29114;RBI=0.0237998;REFB=-0.00549995;REVB=-0.0215886;RO=86;SAF=1;SAR=11;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.557011;STB=0.906099;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0377259;OID=.;OPOS=56143108;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:101:98:86:86:12:12:0.122449:11:1:45:41:11:1:45:41 chr11 56143125 . C T 44.42 PASS AF=0.100917;AO=11;DP=109;FAO=11;FDP=109;FR=.;FRO=98;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=0.00958323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9303;QD=1.63023;RBI=0.0284471;REFB=0.00417888;REVB=0.0267843;RO=96;SAF=1;SAR=10;SRF=44;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480189;STB=0.87877;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0372186;OID=.;OPOS=56143125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:109:109:96:98:11:11:0.100917:10:1:44:52:10:1:45:53 chr11 56143156 . C T 665.13 PASS AF=0.515625;AO=66;DP=127;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.018129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.318;QD=20.7853;RBI=0.0197014;REFB=-0.00651255;REVB=0.00771256;RO=61;SAF=19;SAR=47;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317823;STB=0.672037;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00473013;OID=.;OPOS=56143156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:61:62:66:66:0.515625:47:19:39:22:47:19:39:23 chr11 56143158 . A G 679.18 PASS AF=0.51938;AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=129;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.0208775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.277;QD=21.0598;RBI=0.023359;REFB=-0.0135999;REVB=0.0104773;RO=62;SAF=20;SAR=47;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285627;STB=0.657453;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0186345;OID=.;OPOS=56143158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:62:62:67:67:0.51938:47:20:38:24:47:20:38:24 chr11 56143434 . C G 446.1 PASS AF=0.459184;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0137985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.508;QD=18.2083;RBI=0.0279427;REFB=-0.0161926;REVB=0.0242981;RO=52;SAF=19;SAR=26;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095652;STB=0.54642;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0164637;OID=.;OPOS=56143434;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:52:53:45:45:0.459184:26:19:17:35:26:19:18:35 chr11 56143570 . A G 62.17 PASS AF=0.115385;AO=15;DP=130;FAO=15;FDP=130;FR=.;FRO=115;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.0028093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.548;QD=1.91286;RBI=0.00286895;REFB=-0.00385178;REVB=-0.000582022;RO=113;SAF=9;SAR=6;SRF=55;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138677;STB=0.607219;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0398729;OID=.;OPOS=56143570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:130:130:113:115:15:15:0.115385:6:9:55:58:6:9:55:60 chr11 56143592 . C T 479.26 PASS AF=0.418605;AO=52;DP=128;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=29;FWDB=-0.00790162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.932;QD=14.8609;RBI=0.0102324;REFB=-0.0317907;REVB=-0.00650133;RO=75;SAF=20;SAR=32;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237888;STB=0.629329;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0422307;OID=.;OPOS=56143592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:75:75:52:54:0.418605:32:20:46:29:33:21:46:29 chr11 56143690 . C A 241.0 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0562289;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5424;QD=14.3879;RBI=0.0576922;REFB=-0.00872402;REVB=-0.0129113;RO=39;SAF=10;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214275;STB=0.621942;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0204605;OID=.;OPOS=56143690;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:39:39:28:28:0.41791:18:10:22:17:18:10:22:17 chr11 56143696 . C T 150.43 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0122762;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.606;QD=10.0283;RBI=0.0717161;REFB=-0.0352083;REVB=0.0706576;RO=36;SAF=6;SAR=16;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342991;STB=0.713649;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0929567;OID=.;OPOS=56143696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:36:38:22:22:0.366667:16:6:21:15:16:6:23:15 chr11 56143716 . TG CA 98.87 PASS AF=0.241935;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00277364;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=2;MLLD=170.684;QD=6.37852;RBI=0.0199056;REFB=-0.0191164;REVB=-0.0197114;RO=46;SAF=2;SAR=13;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.553581;STB=0.850527;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.0714806;OID=.;OPOS=56143716;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:46:47:15:15:0.241935:13:2:26:20:13:2:27:20 chr11 56143723 . T C 104.28 PASS AF=0.242424;AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0116254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.625;QD=6.31973;RBI=0.0371394;REFB=-0.0052831;REVB=-0.035273;RO=50;SAF=3;SAR=13;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453009;STB=0.782761;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0171811;OID=.;OPOS=56143723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:50:50:16:16:0.242424:13:3:27:23:13:3:27:23 chr11 56143725 . C G 96.47 PASS AF=0.234375;AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0131757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.719;QD=6.0294;RBI=0.0336891;REFB=-0.00596723;REVB=-0.0310058;RO=49;SAF=3;SAR=12;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425745;STB=0.767836;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0402674;OID=.;OPOS=56143725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:64:64:49:49:15:15:0.234375:12:3:26:23:12:3:26:23 chr11 56143729 . CC TG 80.31 PASS AF=0.209677;AO=13;DP=62;FAO=13;FDP=62;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00749218;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=242.78;QD=5.18113;RBI=0.026908;REFB=-0.00509484;REVB=-0.0258439;RO=49;SAF=3;SAR=10;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3814;STB=0.745112;STBP=0.062;TYPE=mnp;VARB=0.0188911;OID=.;OPOS=56143729;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:62:62:49:49:13:13:0.209677:10:3:26:23:10:3:26:23 chr11 56143966 . C T 486.25 PASS AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00979823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.762;QD=21.3735;RBI=0.0112698;REFB=-0.00840311;REVB=0.00556796;RO=44;SAF=25;SAR=22;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119061;STB=0.506576;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00622129;OID=.;OPOS=56143966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:22:25:24:20:22:25:24:20 chr11 56143977 . A G 503.77 PASS AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00550966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.232;QD=22.3897;RBI=0.0189941;REFB=-0.0131343;REVB=0.0181774;RO=42;SAF=27;SAR=21;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331238;STB=0.518251;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0130127;OID=.;OPOS=56143977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:42:48:48:0.533333:21:27:22:20:21:27:22:20 chr11 56184888 . G A 403.18 PASS AF=0.321212;AO=52;DP=163;FAO=53;FDP=165;FR=.;FRO=112;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=64;FSRR=48;FWDB=-0.017949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.089;QD=9.77398;RBI=0.018008;REFB=-0.00292341;REVB=0.00145648;RO=109;SAF=22;SAR=30;SRF=63;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180108;STB=0.605319;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00578563;OID=.;OPOS=56184888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:109:112:52:53:0.321212:30:22:63:46:31:22:64:48 chr11 56185159 . A G 171.09 PASS AF=0.461538;AO=19;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0825144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1836;QD=17.5481;RBI=0.098352;REFB=-0.00088566;REVB=-0.0535209;RO=19;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184613;STB=0.623093;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00193553;OID=.;OPOS=56185159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:21:19:18:0.461538:8:11:7:12:7:11:8:13 chr11 56185327 . T C 187.93 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00957423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.515;QD=20.3167;RBI=0.0100102;REFB=-0.0149547;REVB=-0.002922;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422077;STB=0.538864;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0181911;OID=.;OPOS=56185327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:11:8:8:9:11:8:9:9 chr11 56185345 . A G 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.106;QD=60.609;RBI=0.0705535;REFB=0;REVB=0.0656723;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602004;OID=.;OPOS=56185345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chr11 56185689 . A G 243.67 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0111542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.073;QD=15.2291;RBI=0.0281056;REFB=-0.0081421;REVB=0.0257975;RO=35;SAF=14;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140354;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0100703;OID=.;OPOS=56185689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:36:28:28:0.4375:14:14:18:17:14:14:18:18 chr11 56237410 . A G 120.85 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00876124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.108;QD=14.6483;RBI=0.031425;REFB=-0.00387591;REVB=-0.0301789;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698633;STB=0.556441;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00363468;OID=.;OPOS=56237410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:6:8:9:9:6:8:9:10 chr11 56237722 . T A 294.44 PASS AF=0.492308;AO=30;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0176238;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.632;QD=18.1196;RBI=0.0186764;REFB=-0.0108334;REVB=0.00618144;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204666;STB=0.632102;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0102181;OID=.;OPOS=56237722;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:34:33:30:32:0.492308:12:18:13:21:12:20:12:21 chr11 56294275 . T C 603.1 PASS AF=0.55;AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00198187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.687;QD=24.1238;RBI=0.0271292;REFB=-0.0111543;REVB=-0.0270567;RO=44;SAF=26;SAR=29;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221426;STB=0.517285;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00963564;OID=.;OPOS=56294275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:44:45:55:55:0.55:29:26:22:22:29:26:23:22 chr11 56294338 . G A 1532.64 PASS AF=0.946903;AO=107;DP=113;FAO=107;FDP=113;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0218898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.502;QD=54.2526;RBI=0.0469154;REFB=-0.110758;REVB=0.0414957;RO=5;SAF=59;SAR=48;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012929;STB=0.511672;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00157752;OID=.;OPOS=56294338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:113:113:5:6:107:107:0.946903:48:59:2:3:48:59:2:4 chr11 56310222 . C T 632.17 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000281959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.333;QD=61.675;RBI=0.0277305;REFB=0;REVB=-0.0277291;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016122;OID=.;OPOS=56310222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0 chr11 56344260 . A G 246.86 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0217916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8734;QD=17.9534;RBI=0.0589884;REFB=0.00779801;REVB=0.0548157;RO=26;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149125;STB=0.583722;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00919516;OID=.;OPOS=56344260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:28:27:27:0.490909:11:16:11:15:11:16:12:16 chr11 56344993 . C A 1097.97 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00315133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.585;QD=60.163;RBI=0.0335954;REFB=0;REVB=0.0334473;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31672e-05;OID=.;OPOS=56344993;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:34:36:0:0:37:36:0:0 chr11 56380134 . C G 416.06 PASS AF=0.452632;AO=39;DP=93;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.000459457;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.364;QD=17.5184;RBI=0.0156262;REFB=-0.00626747;REVB=0.0156194;RO=51;SAF=19;SAR=20;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563508;STB=0.510443;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00571921;OID=.;OPOS=56380134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:51:52:39:43:0.452632:20:19:22:29:24:19:22:30 chr11 56380546 . CCAGA C 260.1 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.00714692;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=4;MLLD=281.81;QD=11.0683;RBI=0.00925695;REFB=-0.0182129;REVB=0.00588326;RO=53;SAF=14;SAR=27;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596685;STB=0.522173;STBP=0.734;TYPE=del;VARB=0.0226601;OID=.;OPOS=56380547;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.43617:41:96:41:94:53:14:27:20:33:99:53:14:27:21:32 chr11 56431216 . C T 1804.06 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.887;QD=61.1546;RBI=0.0468571;REFB=0;REVB=0.0360957;RO=0;SAF=57;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.03988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69593e-05;OID=.;OPOS=56431216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:61:57:0:0:61:57:0:0 chr11 56431667 . G A 346.28 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.019547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.783;QD=16.8918;RBI=0.033362;REFB=-0.0135902;REVB=-0.0270359;RO=45;SAF=19;SAR=18;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089151;STB=0.549973;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0280211;OID=.;OPOS=56431667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:18:19:19:26:18:19:19:26 chr11 56467881 . T C 426.63 PASS AF=0.373134;AO=50;DP=134;FAO=50;FDP=134;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=-0.00548054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0132;QD=12.7352;RBI=0.0250232;REFB=0.00457196;REVB=0.0244156;RO=84;SAF=26;SAR=24;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892783;STB=0.505079;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.00935695;OID=.;OPOS=56467881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:84:84:50:50:0.373134:24:26:43:41:24:26:43:41 chr11 56467926 . A G 596.88 PASS AF=0.362694;AO=70;DP=193;FAO=70;FDP=193;FR=.;FRO=123;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=67;FSRR=56;FWDB=-0.0311139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7456;QD=12.3705;RBI=0.0371549;REFB=0.00333713;REVB=-0.020308;RO=123;SAF=37;SAR=33;SRF=67;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181819;STB=0.510332;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.00739016;OID=.;OPOS=56467926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:123:123:70:70:0.362694:33:37:67:56:33:37:67:56 chr11 56467945 . G T 205.6 PASS AF=0.176471;AO=39;DP=221;FAO=39;FDP=221;FR=.;FRO=182;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=92;FSRR=90;FWDB=-0.0142646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.271;QD=3.72137;RBI=0.0162666;REFB=-0.00728885;REVB=-0.00781817;RO=182;SAF=21;SAR=18;SRF=92;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425301;STB=0.527183;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0316103;OID=.;OPOS=56467945;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:182:182:39:39:0.176471:18:21:92:90:18:21:92:90 chr11 56468020 . TG CA 674.96 PASS AF=0.361607;AO=81;DP=226;FAO=81;FDP=224;FR=.;FRO=143;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=75;FSRR=68;FWDB=-0.0343647;FXX=0.00884917;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.697;QD=12.0529;RBI=0.034397;REFB=-0.0113098;REVB=-0.00148943;RO=140;SAF=32;SAR=49;SRF=74;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150309;STB=0.583377;STBP=0.056;TYPE=mnp;VARB=0.0225964;OID=.;OPOS=56468020;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:224:140:143:81:81:0.361607:49:32:74:66:49:32:75:68 chr11 56468044 . T G 2879.65 PASS AF=0.974747;AO=192;DP=202;FAO=193;FDP=198;FR=.;FRO=5;FSAF=83;FSAR=110;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00481128;FXX=0.0246293;HRUN=6;LEN=1;MLLD=259.194;QD=58.1746;RBI=0.0081145;REFB=-0.138634;REVB=-0.00653427;RO=1;SAF=83;SAR=109;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0043491;STB=0.500774;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=-2.64486e-05;OID=.;OPOS=56468044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:202:198:1:5:192:193:0.974747:109:83:0:1:110:83:2:3 chr11 56468047 . AC GT 3113.27 PASS AF=1;AO=193;DP=198;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146825;FXX=0.0251244;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.653;QD=64.1912;RBI=0.0147585;REFB=0;REVB=0.00149592;RO=0;SAF=90;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.83618e-06;OID=.;OPOS=56468047;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:198:194:0:0:193:194:1:103:90:0:0:104:90:0:0 chr11 56468111 . C T 650.05 PASS AF=0.405556;AO=73;DP=179;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=0.0139342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.313;QD=14.4456;RBI=0.0141702;REFB=-0.0186261;REVB=-0.00257541;RO=106;SAF=28;SAR=45;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553396;STB=0.528731;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0215654;OID=.;OPOS=56468111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:180:106:107:73:73:0.405556:45:28:46:60:45:28:46:61 chr11 56468198 . A G 560.09 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.0116696;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.885;QD=19.1484;RBI=0.0410792;REFB=-0.0325281;REVB=-0.0393868;RO=59;SAF=29;SAR=29;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386557;STB=0.52136;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0341228;OID=.;OPOS=56468198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:59:59:58:58:0.495726:29:29:32:27:29:29:32:27 chr11 56468200 . C T 560.96 PASS AF=0.495726;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.0214936;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5294;QD=19.178;RBI=0.0271142;REFB=0.00202809;REVB=0.016529;RO=60;SAF=29;SAR=29;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612978;STB=0.538448;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=-0.00186695;OID=.;OPOS=56468200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:60:59:58:58:0.495726:29:29:34:26:29:29:34:25 chr11 56468202 . G A 551.16 PASS AF=0.495652;AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00363084;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.052;QD=19.1707;RBI=0.0252322;REFB=-0.029833;REVB=0.0249696;RO=58;SAF=29;SAR=28;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392259;STB=0.521678;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0289625;OID=.;OPOS=56468202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:58:58:57:57:0.495652:28:29:32:26:28:29:32:26 chr11 56468212 . G A 514.11 PASS AF=0.495413;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.00218118;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.039;QD=18.8663;RBI=0.016307;REFB=-0.0194683;REVB=0.0161604;RO=54;SAF=27;SAR=27;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033493;STB=0.522927;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0117211;OID=.;OPOS=56468212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:54:55:54:54:0.495413:27:27:29:25:27:27:30:25 chr11 56468259 . C T 612.57 PASS AF=0.539823;AO=61;DP=113;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00330642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.458;QD=21.684;RBI=0.0099318;REFB=-0.0483804;REVB=0.00936527;RO=47;SAF=45;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189597;STB=0.587598;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0253829;OID=.;OPOS=56468259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:47:52:61:61:0.539823:16:45:25:22:16:45:30:22 chr11 56468368 . C T 54.49 PASS AF=0.0880829;AO=17;DP=193;FAO=17;FDP=193;FR=.;FRO=176;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=91;FSRR=85;FWDB=-0.019948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.682;QD=1.12922;RBI=0.080655;REFB=-0.00268341;REVB=-0.0781492;RO=175;SAF=6;SAR=11;SRF=90;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188352;STB=0.649247;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0345556;OID=.;OPOS=56468368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:193:193:175:176:17:17:0.0880829:11:6:90:85:11:6:91:85 chr11 56468403 . G A 31.27 PASS AF=0.0643564;AO=13;DP=205;FAO=13;FDP=202;FR=.;FRO=189;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=90;FSRR=99;FWDB=-0.00898706;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.585;QD=0.61912;RBI=0.0153282;REFB=-0.00135632;REVB=-0.0124172;RO=187;SAF=2;SAR=11;SRF=88;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351425;STB=0.820907;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0710226;OID=.;OPOS=56468403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:205:202:187:189:13:13:0.0643564:11:2:88:99:11:2:90:99 chr11 56468416 . G A 46.74 PASS AF=0.079602;AO=16;DP=201;FAO=16;FDP=201;FR=.;FRO=185;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=85;FSRR=100;FWDB=0.0617199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1195;QD=0.930099;RBI=0.0681442;REFB=-0.00407199;REVB=0.0288838;RO=185;SAF=4;SAR=12;SRF=85;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247661;STB=0.704218;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0509364;OID=.;OPOS=56468416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:201:201:185:185:16:16:0.079602:12:4:85:100:12:4:85:100 chr11 56468440 . G T 48.01 PASS AF=0.0816327;AO=16;DP=196;FAO=16;FDP=196;FR=.;FRO=180;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=75;FSRR=105;FWDB=-0.0194641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.336;QD=0.979818;RBI=0.0196412;REFB=-9.08213e-05;REVB=-0.00263158;RO=180;SAF=5;SAR=11;SRF=75;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125988;STB=0.602607;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.000856153;OID=.;OPOS=56468440;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:196:196:180:180:16:16:0.0816327:11:5:75:105:11:5:75:105 chr11 56468452 . A C 34.91 PASS AF=0.0710383;AO=13;DP=183;FAO=13;FDP=183;FR=.;FRO=170;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=72;FSRR=98;FWDB=-0.0334861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3096;QD=0.763119;RBI=0.033633;REFB=-0.000471493;REVB=0.00313932;RO=169;SAF=5;SAR=8;SRF=72;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466978;STB=0.537464;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0131641;OID=.;OPOS=56468452;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:183:183:169:170:13:13:0.0710383:8:5:72:97:8:5:72:98 chr11 56468493 . A G 48.12 PASS AF=0.0897436;AO=14;DP=156;FAO=14;FDP=156;FR=.;FRO=142;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=63;FSRR=79;FWDB=-0.0173809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.574;QD=1.23373;RBI=0.0194116;REFB=0.00207931;REVB=0.00864374;RO=141;SAF=6;SAR=8;SRF=62;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132039;STB=0.513946;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.018607;OID=.;OPOS=56468493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:156:156:141:142:14:14:0.0897436:8:6:62:79:8:6:63:79 chr11 56468554 . A C 96.96 PASS AF=0.131737;AO=22;DP=168;FAO=22;FDP=167;FR=.;FRO=145;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=76;FSRR=69;FWDB=-0.0227478;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1015;QD=2.32251;RBI=0.0392054;REFB=-0.00622818;REVB=-0.0319312;RO=146;SAF=12;SAR=10;SRF=77;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227843;STB=0.518583;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0374489;OID=.;OPOS=56468554;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:168:167:146:145:22:22:0.131737:10:12:77:69:10:12:76:69 chr11 56468560 . TA CG 94.52 PASS AF=0.127907;AO=22;DP=172;FAO=22;FDP=172;FR=.;FRO=150;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=79;FSRR=71;FWDB=0.000362026;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=183.444;QD=2.19822;RBI=0.00856463;REFB=-0.00418354;REVB=-0.00855698;RO=148;SAF=12;SAR=10;SRF=79;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147246;STB=0.516457;STBP=0.884;TYPE=mnp;VARB=0.0285874;OID=.;OPOS=56468560;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:172:172:148:150:22:22:0.127907:10:12:79:69:10:12:79:71 chr11 56468637 . C T 102.18 PASS AF=0.126316;AO=24;DP=190;FAO=24;FDP=190;FR=.;FRO=166;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=91;FSRR=75;FWDB=-0.0157058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.807;QD=2.15118;RBI=0.0423884;REFB=-0.00672723;REVB=-0.0393714;RO=166;SAF=11;SAR=13;SRF=91;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112319;STB=0.577965;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0335176;OID=.;OPOS=56468637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:166:166:24:24:0.126316:13:11:91:75:13:11:91:75 chr11 56468646 . C T 104.04 PASS AF=0.12973;AO=24;DP=185;FAO=24;FDP=185;FR=.;FRO=161;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=86;FSRR=75;FWDB=-0.0186234;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.201;QD=2.24952;RBI=0.0221768;REFB=-0.00228735;REVB=0.0120408;RO=161;SAF=11;SAR=13;SRF=86;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951137;STB=0.56567;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0130254;OID=.;OPOS=56468646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:161:161:24:24:0.12973:13:11:86:75:13:11:86:75 chr11 56468694 . C T 49.71 PASS AF=0.101562;AO=13;DP=128;FAO=13;FDP=128;FR=.;FRO=115;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=63;FSRR=52;FWDB=-0.0268465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.253;QD=1.55341;RBI=0.042131;REFB=-0.00548875;REVB=-0.0324698;RO=115;SAF=7;SAR=6;SRF=63;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112289;STB=0.508462;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.034861;OID=.;OPOS=56468694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:128:128:115:115:13:13:0.101562:6:7:63:52:6:7:63:52 chr11 56468699 . T A 40.52 PASS AF=0.092437;AO=11;DP=119;FAO=11;FDP=119;FR=.;FRO=108;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=61;FSRR=47;FWDB=-0.0246258;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.021;QD=1.36208;RBI=0.0266556;REFB=-0.00219084;REVB=-0.0102026;RO=107;SAF=5;SAR=6;SRF=60;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123067;STB=0.598916;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0158561;OID=.;OPOS=56468699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:119:119:107:108:11:11:0.092437:6:5:60:47:6:5:61:47 chr11 56468704 . T C 44.8 PASS AF=0.101852;AO=11;DP=108;FAO=11;FDP=108;FR=.;FRO=97;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=-0.00966357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6371;QD=1.65919;RBI=0.0140778;REFB=-0.00210432;REVB=-0.0102372;RO=96;SAF=6;SAR=5;SRF=54;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204268;STB=0.510186;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0144617;OID=.;OPOS=56468704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:108:108:96:97:11:11:0.101852:5:6:54:42:5:6:54:43 chr11 56468720 . T C 49.43 PASS AF=0.117021;AO=11;DP=94;FAO=11;FDP=94;FR=.;FRO=83;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0259079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.188;QD=2.10328;RBI=0.0270062;REFB=-0.00486717;REVB=-0.00762342;RO=82;SAF=6;SAR=5;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107971;STB=0.502919;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0308239;OID=.;OPOS=56468720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:94:94:82:83:11:11:0.117021:5:6:44:38:5:6:45:38 chr11 56508525 . A G 806.77 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.426;QD=55.6396;RBI=0.0425189;REFB=-0.0986231;REVB=0.0349601;RO=1;SAF=22;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209528;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629621;OID=.;OPOS=56508525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:58:58:1:0:57:58:1:35:22:1:0:35:23:0:0 chr11 56510672 . T C 214.25 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0511652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.645;QD=45.1042;RBI=0.0517105;REFB=0.0841974;REVB=-0.00748969;RO=1;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611153;STB=0.533296;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.00052039;OID=.;OPOS=56510672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:11:7:1:0:11:7:1:0 chr11 56756664 . G A 531.58 PASS AF=0.495575;AO=53;DP=112;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.0769802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3939;QD=18.817;RBI=0.0883441;REFB=-0.0176488;REVB=-0.0433443;RO=55;SAF=21;SAR=32;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21926;STB=0.609961;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0220973;OID=.;OPOS=56756664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:55:57:53:56:0.495575:32:21:35:20:32:24:37:20 chr11 56949691 . G A 138.69 PASS AF=0.340426;AO=15;DP=46;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.00117413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.891;QD=11.803;RBI=0.00906363;REFB=-0.0164752;REVB=-0.00898726;RO=31;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505293;STB=0.763971;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0291573;OID=.;OPOS=56949691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:31:31:15:16:0.340426:4:11:8:23:5:11:8:23 chr11 56954846 . C T 675.97 PASS AF=0.485714;AO=65;DP=138;FAO=68;FDP=140;FR=.;FRO=72;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=0.0156584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.949;QD=19.3135;RBI=0.021987;REFB=-0.0285983;REVB=0.015435;RO=72;SAF=40;SAR=25;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857175;STB=0.539695;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0293426;OID=.;OPOS=56954846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:72:72:65:68:0.485714:25:40:38:34:27:41:38:34 chr11 56956516 . G A 304.88 PASS AF=0.364583;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0705597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8761;QD=12.7035;RBI=0.0722913;REFB=-0.0136248;REVB=-0.0157278;RO=61;SAF=12;SAR=23;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1887;STB=0.608552;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0207403;OID=.;OPOS=56956516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:61:61:35:35:0.364583:23:12:31:30:23:12:31:30 chr11 57004344 . G T 200.44 PASS AF=0.5;AO=17;DP=37;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00541324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.92;QD=20.0442;RBI=0.0244112;REFB=-0.0248417;REVB=0.0238035;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115476;STB=0.52629;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0271849;OID=.;OPOS=57004344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:40:20:20:17:20:0.5:9:8:7:13:12:8:7:13 chr11 57004577 . C T 490.8 PASS AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00763379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1496;QD=20.2393;RBI=0.00905072;REFB=-0.0372178;REVB=0.00486218;RO=48;SAF=23;SAR=25;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566998;STB=0.525647;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0629383;OID=.;OPOS=57004577;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:49:48:48:0.494845:25:23:20:28:25:23:21:28 chr11 57077464 . T C 1084.16 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0126776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9687;QD=58.6034;RBI=0.0436708;REFB=0.0528391;REVB=-0.0417902;RO=1;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129584;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.00144667;OID=.;OPOS=57077464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:36:37:0:1:36:37:0:1 chr11 57147016 . A G 1530.03 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0041743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.19;QD=63.7513;RBI=0.0065981;REFB=0;REVB=-0.0051098;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16307e-05;OID=.;OPOS=57147016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:48:48:0:0:48:48:0:0 chr11 57148175 . A G 1531.12 PASS AF=1;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282746;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.969;QD=60.0439;RBI=0.0283509;REFB=0;REVB=0.00207863;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371055;OID=.;OPOS=57148175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:102:102:1:48:54:0:0:48:54:0:0 chr11 57155001 . G A 3000.73 PASS AF=0.985075;AO=197;DP=202;FAO=198;FDP=201;FR=.;FRO=3;FSAF=106;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0239108;FXX=0.00495025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.763;QD=59.7159;RBI=0.0242619;REFB=-0.0837248;REVB=0.00411254;RO=3;SAF=106;SAR=91;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00587914;STB=0.503029;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00102728;OID=.;OPOS=57155001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:202:201:3:3:197:198:0.985075:91:106:1:2:92:106:1:2 chr11 57155288 . T C 3750.12 PASS AF=1;AO=236;DP=238;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269896;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.666;QD=63.5613;RBI=0.0396708;REFB=0;REVB=0.0290747;RO=0;SAF=121;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84448e-05;OID=.;OPOS=57155288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:238:236:0:0:236:236:1:115:121:0:0:115:121:0:0 chr11 57313469 . C G 778.66 PASS AF=0.52349;AO=77;DP=148;FAO=78;FDP=149;FR=.;FRO=71;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.012319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.7585;QD=20.9037;RBI=0.0248439;REFB=-0.042504;REVB=-0.0215745;RO=59;SAF=43;SAR=34;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535761;STB=0.56781;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0575381;OID=.;OPOS=57313469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:59:71:77:78:0.52349:34:43:29:30:35:43:29:42 chr11 57334508 . G A 94.21 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.102586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4014;QD=10.468;RBI=0.102892;REFB=-0.000477046;REVB=0.00792676;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234146;STB=0.638675;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00139065;OID=.;OPOS=57334508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:6:6:7:17:6:6:7:17 chr11 57353983 . T G 330.42 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000723527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.445;QD=50.8333;RBI=0.0028117;REFB=0.127105;REVB=0.00271702;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403161;STB=0.521722;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.00113843;OID=.;OPOS=57353983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:11:14:0:1:11:14:0:1 chr11 57391106 . G C 212.24 PASS AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0273243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4545;QD=27.3852;RBI=0.0383659;REFB=-0.0204801;REVB=-0.0269318;RO=11;SAF=9;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562032;STB=0.531117;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0108101;OID=.;OPOS=57391106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:11:9:4:7:11:9:4:7 chr11 57463500 . T C 732.04 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.754;QD=56.3106;RBI=0.040869;REFB=0;REVB=0.0199596;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00416153;OID=.;OPOS=57463500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:24:28:0:0 chr11 57468129 . T C 1130.17 PASS AF=0.974359;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0653955;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7411;QD=57.9573;RBI=0.072892;REFB=-0.0353045;REVB=0.0321974;RO=2;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193086;STB=0.510201;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000684447;OID=.;OPOS=57468129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:79:78:2:2:76:76:0.974359:48:28:0:2:48:28:0:2 chr11 57571232 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.593;QD=61.6839;RBI=0.0481026;REFB=0;REVB=-0.0460977;RO=0;SAF=11;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000461271;OID=.;OPOS=57571232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:30:11:0:0:30:11:0:0 chr11 57798439 . C A 675.62 PASS AF=0.9375;AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0210692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8255;QD=56.302;RBI=0.0642237;REFB=0.00278164;REVB=-0.0606694;RO=3;SAF=26;SAR=19;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107001;STB=0.505701;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.000838799;OID=.;OPOS=57798439;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:48:3:3:45:45:0.9375:19:26:2:1:19:26:2:1 chr11 57947264 . C G 1074.58 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.771;QD=59.699;RBI=0.0256459;REFB=0;REVB=0.014703;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017461;OID=.;OPOS=57947264;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:24:47:0:0:24:48:0:0 chr11 57948952 . G A 365.29 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.081;QD=54.1178;RBI=0.0488938;REFB=0;REVB=0.0308218;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00309803;OID=.;OPOS=57948952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:12:13:0:0:13:14:0:0 chr11 57958775 . C T 1506.84 PASS AF=0.979798;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0407057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.648;QD=60.8825;RBI=0.0427306;REFB=-0.152534;REVB=-0.012998;RO=2;SAF=48;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193473;STB=0.509998;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00111372;OID=.;OPOS=57958775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:99:2:2:96:97:0.979798:48:48:2:0:48:49:2:0 chr11 57958972 . C A 784.98 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4034;QD=57.0895;RBI=0.0266722;REFB=0;REVB=0.00988479;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162741;OID=.;OPOS=57958972;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0 chr11 57971195 . G A 888.54 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0470338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8872;QD=56.4149;RBI=0.0477766;REFB=0.0350618;REVB=-0.0083923;RO=1;SAF=21;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219486;STB=0.511624;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000242777;OID=.;OPOS=57971195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:41:21:1:0:41:21:1:0 chr11 57971201 . G A 941.01 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0312086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.449;QD=57.0309;RBI=0.0317445;REFB=-0.040692;REVB=-0.00580863;RO=1;SAF=23;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200938;STB=0.510635;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000139143;OID=.;OPOS=57971201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:42:23:1:0:42:23:1:0 chr11 57982229 . A G 1407.1 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00133797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.343;QD=61.8504;RBI=0.0130588;REFB=0;REVB=0.0129901;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20265e-05;OID=.;OPOS=57982229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:91:0:0:88:91:1:37:51:0:0:40:51:0:0 chr11 57982584 . T C 1263.72 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0866622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.465;QD=58.1019;RBI=0.0880067;REFB=-0.125611;REVB=0.0153242;RO=3;SAF=27;SAR=57;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497632;STB=0.526309;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00301069;OID=.;OPOS=57982584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:87:87:3:3:84:84:0.965517:57:27:3:0:57:27:3:0 chr11 57982620 . A G 1212.31 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328261;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.3;QD=61.3826;RBI=0.0407489;REFB=0;REVB=-0.0241437;RO=0;SAF=27;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04889e-05;OID=.;OPOS=57982620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:52:27:0:0:52:27:0:0 chr11 57982726 . G T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.284;QD=56.7065;RBI=0.0402849;REFB=0;REVB=0.0179754;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258197;OID=.;OPOS=57982726;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr11 57982763 . A G 275.23 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00518674;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.462;QD=52.4249;RBI=0.0417716;REFB=0;REVB=0.0414484;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00030594;OID=.;OPOS=57982763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr11 57982832 . T A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8742;QD=57.6801;RBI=0.0979435;REFB=0;REVB=0.066554;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288493;OID=.;OPOS=57982832;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr11 57982896 . G T 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00157803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.695;QD=62.762;RBI=0.00280862;REFB=0;REVB=-0.0023234;RO=0;SAF=62;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.05025e-07;OID=.;OPOS=57982896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:27:62:0:0:27:62:0:0 chr11 57983194 . A G 574.96 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0890811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.087;QD=60.5219;RBI=0.0893117;REFB=0;REVB=-0.00641382;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114975;OID=.;OPOS=57983194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chr11 57996312 . C G 1713.95 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.514;QD=60.6707;RBI=0.0265465;REFB=0;REVB=-5.39328e-05;RO=0;SAF=66;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.58827e-05;OID=.;OPOS=57996312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:46:66:0:0:46:67:0:0 chr11 58034543 . C T 1544.62 PASS AF=0.990566;AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00720517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.787;QD=58.2877;RBI=0.0111784;REFB=-0.0307807;REVB=0.00854651;RO=1;SAF=56;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839887;STB=0.504347;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.000149726;OID=.;OPOS=58034543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:1:1:104:105:0.990566:48:56:1:0:48:57:1:0 chr11 58123152 . T C 1670.48 PASS AF=0.974138;AO=113;DP=116;FAO=113;FDP=116;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00991235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.277;QD=57.6028;RBI=0.0355498;REFB=-0.0455628;REVB=0.0341399;RO=2;SAF=49;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189829;STB=0.506124;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00108371;OID=.;OPOS=58123152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:116:116:2:3:113:113:0.974138:64:49:2:0:64:49:2:1 chr11 58125620 . T C 1175.69 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00721186;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.663;QD=61.0748;RBI=0.0377092;REFB=0;REVB=-0.0370131;RO=0;SAF=50;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161724;OID=.;OPOS=58125620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:27:50:0:0:27:50:0:0 chr11 58126305 . A T 835.66 PASS AF=0.938462;AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=65;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0202802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=325.764;QD=51.4254;RBI=0.0207338;REFB=-0.0374148;REVB=-0.00431324;RO=4;SAF=19;SAR=42;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578253;STB=0.530719;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00100729;OID=.;OPOS=58126305;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:65:65:4:4:61:61:0.938462:42:19:3:1:42:19:3:1 chr11 58207204 . A G 1270.11 PASS AF=0.965909;AO=84;DP=89;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0346481;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.294;QD=57.7324;RBI=0.0367101;REFB=-0.114429;REVB=0.01213;RO=1;SAF=46;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101866;STB=0.507124;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.000758479;OID=.;OPOS=58207204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:89:88:1:3:84:85:0.965909:38:46:1:0:39:46:1:2 chr11 58318619 . C G 1522.8 PASS AF=0.979798;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00174167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.615;QD=61.5271;RBI=0.017807;REFB=-0.105709;REVB=0.0177216;RO=2;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169324;STB=0.508927;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000347764;OID=.;OPOS=58318619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:99:99:2:2:97:97:0.979798:55:42:0:2:55:42:0:2 chr11 58478084 . T C 2109.7 PASS AF=1;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00496137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9134;QD=62.0501;RBI=0.0189444;REFB=-0.0511239;REVB=0.0182832;RO=1;SAF=63;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655692;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164421;OID=.;OPOS=58478084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:136:136:1:0:135:136:1:72:63:0:1:73:63:0:0 chr11 58892558 . C T 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0194517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.495;QD=20.2683;RBI=0.0194858;REFB=-0.0214133;REVB=-0.00115215;RO=21;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170524;STB=0.596238;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0196242;OID=.;OPOS=58892558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:8:13:9:12:8:13:9:12 chr11 58894253 . T C 433.56 PASS AF=0.426087;AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00449717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.992;QD=15.0804;RBI=0.0166619;REFB=-0.00772848;REVB=0.0160435;RO=66;SAF=23;SAR=26;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621724;STB=0.53487;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.012466;OID=.;OPOS=58894253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:49:49:0.426087:26:23:27:39:26:23:27:39 chr11 58894303 . G T 241.45 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.061638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8204;QD=12.3822;RBI=0.0952876;REFB=-7.41868e-05;REVB=0.072667;RO=49;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20941;STB=0.621213;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0002975;OID=.;OPOS=58894303;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:21:8:22:27:21:8:22:27 chr11 58894368 . G A 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0921718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.801;QD=12.6376;RBI=0.0923895;REFB=0.0094947;REVB=-0.00633851;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213639;STB=0.628346;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.0225441;OID=.;OPOS=58894368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:11:2:6:15:11:2:6:15 chr11 58919813 . A G 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00189432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.193;QD=17.3253;RBI=0.0452102;REFB=-0.0234736;REVB=0.0451705;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682441;STB=0.538936;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0356289;OID=.;OPOS=58919813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:11:9:13:12:11:9:13:12 chr11 58978940 . C T 289.27 PASS AF=0.450704;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0114938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.531;QD=16.2967;RBI=0.0179648;REFB=-0.0148233;REVB=0.0138067;RO=39;SAF=8;SAR=23;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227708;STB=0.610547;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0331764;OID=.;OPOS=58978940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:39:39:31:32:0.450704:23:8:18:21:23:9:18:21 chr11 59058590 . C G 397.98 PASS AF=0.410714;AO=46;DP=113;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=0.00147922;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.342;QD=14.2134;RBI=0.0281765;REFB=-0.00606588;REVB=0.0281377;RO=67;SAF=26;SAR=20;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153924;STB=0.582654;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00751153;OID=.;OPOS=59058590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:67:66:46:46:0.410714:20:26:28:39:20:26:28:38 chr11 59132798 . G C 352.58 PASS AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.00139325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2565;QD=21.0494;RBI=0.0226466;REFB=-0.0239531;REVB=0.0226037;RO=31;SAF=22;SAR=14;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088831;STB=0.548993;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0216617;OID=.;OPOS=59132798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:14:22:22:9:14:22:22:9 chr11 59132882 . A G 218.94 PASS AF=0.689655;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00595519;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.776;QD=30.1989;RBI=0.0127965;REFB=-0.026225;REVB=0.0113263;RO=10;SAF=11;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030303;STB=0.532839;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0145397;OID=.;OPOS=59132882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:29:10:9:20:20:0.689655:9:11:5:5:9:11:4:5 chr11 59211188 . G A 254.21 PASS AF=0.5;AO=27;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0517042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0066;QD=18.1575;RBI=0.0545031;REFB=-0.00212427;REVB=0.0172415;RO=28;SAF=17;SAR=10;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305882;STB=0.674878;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00305233;OID=.;OPOS=59211188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:28:28:27:28:0.5:10:17:8:20:10:18:8:20 chr11 59211265 . T C 154.95 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00200974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.771;QD=22.9551;RBI=0.00700808;REFB=0.00232359;REVB=-0.00671373;RO=11;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11353;STB=0.56402;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=-0.00437284;OID=.;OPOS=59211265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:5:11:6:5:5:11:6:5 chr11 59224720 . A G 1557.17 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.187;QD=59.8913;RBI=0.0906361;REFB=0;REVB=-0.00509156;RO=0;SAF=40;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144447;OID=.;OPOS=59224720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:104:0:0:102:104:1:62:40:0:0:62:42:0:0 chr11 59224738 . T C 509.05 PASS AF=0.504762;AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00278225;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.268;QD=19.3925;RBI=0.0138401;REFB=-0.0130151;REVB=-0.0135576;RO=52;SAF=28;SAR=25;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769486;STB=0.542503;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.010829;OID=.;OPOS=59224738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:52:53:53:0.504762:25:28:23:29:25:28:23:29 chr11 59225129 . GC G,GG 173.92 PASS AF=0.372881,0;AO=19,3;DP=62;FAO=22,0;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=9,0;FSAR=13,0;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.000929165,0.000825108;FXX=0.0483793;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=250.824,250.267;QD=11.7909;RBI=0.0045373,0.00189198;REFB=-0.00623209,-0.00502098;REVB=0.00444115,0.00170258;RO=40;SAF=8,1;SAR=11,2;SRF=18;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0337776,-0.116402;STB=0.549251,0.5;STBP=0.549,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0104179,0.0300639;OID=.,.;OPOS=59225130,59225130;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.372881,0:19,3:62:22,0:59:37:9,0:13,0:18:19:99:40:8,1:11,2:18:22 chr11 59225221 . T C 171.25 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0295485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.596;QD=12.4548;RBI=0.0348975;REFB=-0.017607;REVB=-0.0185666;RO=34;SAF=5;SAR=16;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280557;STB=0.663863;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.031152;OID=.;OPOS=59225221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:16:5:16:18:16:5:16:18 chr11 59271637 . T C 459.14 PASS AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0201226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.865;QD=20.87;RBI=0.03351;REFB=-0.0322109;REVB=0.0267955;RO=42;SAF=26;SAR=19;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110028;STB=0.56662;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0192766;OID=.;OPOS=59271637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:43:45:45:0.511364:19:26:19:23:19:26:19:24 chr11 59323951 . G A 2215.71 PASS AF=0.97931;AO=142;DP=145;FAO=142;FDP=145;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0142974;FXX=0.00684885;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.674;QD=61.1231;RBI=0.0198759;REFB=0.00695041;REVB=0.0138071;RO=3;SAF=70;SAR=72;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199391;STB=0.510488;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-9.30714e-05;OID=.;OPOS=59323951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:145:145:3:3:142:142:0.97931:72:70:3:0:72:70:3:0 chr11 59362554 . CTTTTTT CTTTTT,CTTTTTG 128.77 PASS AF=0.522727,0.0681818;AO=20,4;DP=44;FAO=23,3;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=7,2;FSAR=16,1;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0679994,-0.0184943;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=9.23709,11.0619;QD=11.7063;RBI=0.0681896,0.154017;REFB=-0.0846507,-0.101088;REVB=0.00509002,-0.152903;RO=13;SAF=5,2;SAR=15,2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0.446429,0;SSSB=-0.42742,-0.415747;STB=0.66361,0.5;STBP=0.032,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0520234,0.0867084;OID=.,.;OPOS=59362555,59362560;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=CTTTTT,CTTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.522727,0.0681818:20,4:44:23,3:44:18:7,2:16,1:12:6:63:13:5,2:15,2:11:2 chr11 59480951 . T C 415.11 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220523;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.712;QD=57.2568;RBI=0.0104077;REFB=0;REVB=-0.0101714;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.79641e-05;OID=.;OPOS=59480951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr11 59814173 . G A 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0127699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3907;QD=12.9138;RBI=0.036233;REFB=-0.0197754;REVB=-0.0339081;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130213;STB=0.565932;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.028787;OID=.;OPOS=59814173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:13:11:21:15:13:11:21:16 chr11 59829026 . T C 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0102008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.583;QD=18.2488;RBI=0.0223318;REFB=-0.015322;REVB=0.0198658;RO=12;SAF=2;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310086;STB=0.681092;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0126197;OID=.;OPOS=59829026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:11:2:5:7:11:2:5:7 chr11 59831716 . C A 417.11 PASS AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.00275723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.709;QD=17.2002;RBI=0.00643757;REFB=-0.00914919;REVB=0.00581721;RO=54;SAF=22;SAR=21;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621782;STB=0.534823;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0176722;OID=.;OPOS=59831716;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:0.443299:21:22:31:23:21:22:31:23 chr11 59837097 . C T 452.21 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.00550239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.67;QD=19.4499;RBI=0.00580318;REFB=-0.00739223;REVB=-0.00184406;RO=48;SAF=33;SAR=12;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119953;STB=0.566979;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00796801;OID=.;OPOS=59837097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:12:33:30:18:12:33:30:18 chr11 59837721 . T TTATGAAAA 310.58 PASS AF=0.581818;AO=30;DP=61;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0092053;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=8;MLLD=355.438;QD=22.5873;RBI=0.0105971;REFB=-0.00731379;REVB=-0.00524977;RO=29;SAF=6;SAR=24;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.484062;STB=0.719502;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.00420813;OID=.;OPOS=59837722;OREF=-;OALT=TATGAAAA;OMAPALT=TTATGAAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.581818:30:61:32:55:23:7:25:16:7:99:29:6:24:21:8 chr11 59945745 . T C 251.05 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00981355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.101;QD=17.0205;RBI=0.0141663;REFB=-0.0124977;REVB=0.0102165;RO=29;SAF=6;SAR=22;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376058;STB=0.700675;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0112032;OID=.;OPOS=59945745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:31:28:28:0.474576:22:6:17:12:22:6:17:14 chr11 59946301 . TC T,TT 760.44 PASS AF=0.0208333,0.979167;AO=6,42;DP=48;FAO=1,47;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=1,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064263,0.0108918;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=288.169,310.297;QD=63.3697;RBI=0.0201344,0.0217081;REFB=0,0;REVB=0.0190814,0.018778;RO=0;SAF=5,19;SAR=1,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0210918,0.000221145;OID=.,.;OPOS=59946302,59946302;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0208333,0.979167:6,42:48:1,47:48:0:0,24:1,23:0:0:5:0:5,19:1,23:0:0 chr11 59947252 . C T 518.43 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.00328057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.799;QD=18.0323;RBI=0.0229554;REFB=-0.00908246;REVB=0.0227197;RO=60;SAF=31;SAR=24;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130061;STB=0.507216;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0183888;OID=.;OPOS=59947252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:60:60:55:55:0.478261:24:31:33:27:24:31:33:27 chr11 60050125 . A G 257.33 PASS AF=0.4;AO=29;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0176276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.061;QD=13.7243;RBI=0.0467208;REFB=-0.00743043;REVB=-0.0432677;RO=45;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17165;STB=0.605566;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00977913;OID=.;OPOS=60050125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:45:29:30:0.4:14:15:16:29:14:16:16:29 chr11 60070176 . A G 238.35 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0112876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.851;QD=16.438;RBI=0.0227314;REFB=-0.0348888;REVB=-0.0197309;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104332;STB=0.558818;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0584499;OID=.;OPOS=60070176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:11:16:15:16:11:16:15:16 chr11 60073597 . C T 2297.18 PASS AF=0.981013;AO=153;DP=158;FAO=155;FDP=158;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0208324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5158;QD=58.1563;RBI=0.0284717;REFB=-0.0499892;REVB=0.0194074;RO=3;SAF=81;SAR=72;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194044;STB=0.510066;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00458951;OID=.;OPOS=60073597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:158:158:3:3:153:155:0.981013:72:81:0:3:73:82:0:3 chr11 60105366 . T C 420.43 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00507069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.053;QD=16.4875;RBI=0.00770571;REFB=-0.00672716;REVB=0.00580224;RO=56;SAF=22;SAR=24;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213597;STB=0.51194;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00960106;OID=.;OPOS=60105366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:24:22:28:28:24:22:28:28 chr11 60152563 . T A 1899.05 PASS AF=0.992;AO=121;DP=122;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0313898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.701;QD=60.7696;RBI=0.0623538;REFB=-0.0879319;REVB=0.0538765;RO=1;SAF=69;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904767;STB=0.504761;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000256042;OID=.;OPOS=60152563;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:125:1:1:121:124:0.992:52:69:0:1:52:72:0:1 chr11 60152584 . G A 2293.25 PASS AF=1;AO=143;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2552;QD=63.7013;RBI=0.0676809;REFB=0;REVB=-0.0320901;RO=0;SAF=80;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.53149e-05;OID=.;OPOS=60152584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:143:144:1:63:80:0:0:63:81:0:0 chr11 60157107 . T G 772.68 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0330668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.752;QD=61.8144;RBI=0.0370037;REFB=0.0420928;REVB=0.016609;RO=1;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192048;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-3.70566e-05;OID=.;OPOS=60157107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:24:25:0:1:24:25:0:1 chr11 60157166 . C T 592.23 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.591;QD=59.2226;RBI=0.0346737;REFB=0;REVB=0.0106117;RO=0;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195951;OID=.;OPOS=60157166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:39:40:0:0:39:40:1:28:11:0:0:28:12:0:0 chr11 60165352 . ATT A 1328.83 PASS AF=1;AO=106;DP=111;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231297;FXX=0.0446389;HRUN=2;LEN=2;MLLD=199.795;QD=49.676;RBI=0.0260762;REFB=0;REVB=-0.0120409;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=9.69706e-06;OID=.;OPOS=60165353;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:106:111:107:107:0:55:52:0:0:23:0:54:52:0:0 chr11 60172087 . C T 642.44 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0274356;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.273;QD=59.7615;RBI=0.047371;REFB=-0.00275073;REVB=0.0386174;RO=1;SAF=18;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253627;STB=0.513507;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000230684;OID=.;OPOS=60172087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:24:18:1:0:24:18:1:0 chr11 60173360 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213;QD=49.5991;RBI=0.0104521;REFB=0;REVB=0.00679436;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4193e-05;OID=.;OPOS=60173360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr11 60182970 . A T 310.4 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00523472;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.491;QD=21.4066;RBI=0.00644945;REFB=0.00423066;REVB=0.00376738;RO=26;SAF=19;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459175;STB=0.525426;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=-0.00357057;OID=.;OPOS=60182970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:13:19:14:12:13:19:14:12 chr11 60184191 . G A 241.7 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00538114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.154;QD=21.9723;RBI=0.0346601;REFB=-0.0220798;REVB=0.0342398;RO=21;SAF=5;SAR=18;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411516;STB=0.732119;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0219139;OID=.;OPOS=60184191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:18:5:14:7:18:5:14:7 chr11 60198328 . C T 342.87 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0341866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4202;QD=21.4291;RBI=0.0361111;REFB=0.0258798;REVB=-0.0116313;RO=29;SAF=17;SAR=18;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258313;STB=0.514278;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.0211564;OID=.;OPOS=60198328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:18:17:15:14:18:17:15:14 chr11 60285575 . A G 2195.47 PASS AF=1;AO=137;DP=141;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457883;FXX=0.0680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.309;QD=64.1013;RBI=0.0116799;REFB=0;REVB=-0.0107449;RO=0;SAF=72;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.58487e-06;OID=.;OPOS=60285575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:137:0:0:137:137:1:65:72:0:0:65:72:0:0 chr11 60291413 . C T 238.75 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0209687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.921;QD=14.0442;RBI=0.0289278;REFB=-0.0140458;REVB=-0.0199281;RO=40;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148502;STB=0.508451;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.017877;OID=.;OPOS=60291413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:15:13:18:22:15:13:18:22 chr11 60296879 . C T 452.21 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00722229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.778;QD=19.4501;RBI=0.0457282;REFB=-0.0239311;REVB=-0.0451542;RO=48;SAF=23;SAR=22;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672394;STB=0.53734;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0283459;OID=.;OPOS=60296879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:22:23:28:20:22:23:28:20 chr11 60504436 . T C 154.49 PASS AF=0.551724;AO=17;DP=30;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00392589;FXX=0.0333222;HRUN=16;LEN=1;MLLD=210.12;QD=21.309;RBI=0.0089168;REFB=-0.00754767;REVB=-0.00800604;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522387;STB=0.51722;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00249538;OID=.;OPOS=60504436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:29:13:13:17:16:0.551724:9:8:7:6:8:8:7:6 chr11 60531264 . A G 342.88 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0112657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.616;QD=21.43;RBI=0.0183693;REFB=-0.00513212;REVB=-0.0145092;RO=29;SAF=13;SAR=22;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660664;STB=0.536564;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00398914;OID=.;OPOS=60531264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:22:13:13:16:22:13:13:16 chr11 60531346 . T G 172.13 PASS AF=0.369565;AO=15;DP=50;FAO=17;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0117952;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.634;QD=14.9679;RBI=0.0293586;REFB=-0.0059411;REVB=0.026885;RO=27;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01619;STB=0.56596;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0108369;OID=.;OPOS=60531346;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:46:27:27:15:17:0.369565:8:7:13:14:7:10:13:14 chr11 60559805 . A G,T 857.85 PASS AF=0.951613,0.0483871;AO=58,3;DP=62;FAO=59,3;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=36,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540874,0.0504535;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=95.9226,43.9837;QD=55.3449;RBI=0.0629754,0.0507466;REFB=0,0;REVB=0.0322561,-0.00544615;RO=1;SAF=22,0;SAR=36,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0209573,-0.727144;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000971382,0.161785;OID=.,.;OPOS=60559805,60559805;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:62:62:1:0:58,3:59,3:0.951613,0.0483871:36,3:22,0:1:0:36,3:23,0:0:0 chr11 60609972 . A G 366.01 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00455522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.676;QD=21.5298;RBI=0.0108734;REFB=-0.0029273;REVB=-0.00987324;RO=31;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042927;STB=0.52372;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00240745;OID=.;OPOS=60609972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:16:21:16:15:16:21:16:15 chr11 60610065 . G A 306.94 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0124403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.254;QD=18.0551;RBI=0.0129659;REFB=-0.0100804;REVB=-0.00365455;RO=35;SAF=10;SAR=23;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128526;STB=0.572094;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00993438;OID=.;OPOS=60610065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:23:10:15:20:23:10:15:20 chr11 60620585 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.429;QD=56.7065;RBI=0.0302176;REFB=0;REVB=0.00157979;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124391;OID=.;OPOS=60620585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:7:22:0:0:7:22:0:0 chr11 60620590 . C G 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.361;QD=56.7052;RBI=0.0415345;REFB=0;REVB=-0.0325339;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145649;OID=.;OPOS=60620590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:7:22:0:0:7:22:0:0 chr11 60635091 . T C 239.43 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4429;QD=50.4056;RBI=0.0337258;REFB=0;REVB=0.00328108;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000604283;OID=.;OPOS=60635091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr11 60638461 . C T 483.51 PASS AF=0.49505;AO=49;DP=100;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00678142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.247;QD=19.1488;RBI=0.00678473;REFB=-0.00721494;REVB=0.00021195;RO=49;SAF=15;SAR=34;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197634;STB=0.611669;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00648081;OID=.;OPOS=60638461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:49:51:49:50:0.49505:34:15:25:24:34:16:27:24 chr11 60638470 . A G 1506.63 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.311;QD=63.4371;RBI=0.0325704;REFB=0;REVB=-0.00591102;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89362e-05;OID=.;OPOS=60638470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:56:38:0:0:56:39:0:0 chr11 60666341 . G A 281.41 PASS AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0132238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.427;QD=19.4076;RBI=0.0339114;REFB=-0.0315996;REVB=0.0312269;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359131;STB=0.519987;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0242524;OID=.;OPOS=60666341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:13:17:17:11:13:17:17:11 chr11 60673868 . T C 70.57 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0651708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.515;QD=17.6437;RBI=0.0654158;REFB=-0.0138615;REVB=-0.0056561;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955156;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0146357;OID=.;OPOS=60673868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:3:4:4:5:3:4 chr11 60687275 . G A 187.65 PASS AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0384334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4247;QD=11.5476;RBI=0.0384395;REFB=-0.00342034;REVB=-0.000685231;RO=40;SAF=7;SAR=17;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406027;STB=0.738938;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00527507;OID=.;OPOS=60687275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:40:41:24:24:0.369231:17:7:27:13:17:7:28:13 chr11 60689445 . T C 1283.9 PASS AF=1;AO=67;DP=70;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.17839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.407;QD=59.7165;RBI=0.178456;REFB=0;REVB=0.0048662;RO=0;SAF=12;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115708;OID=.;OPOS=60689445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:70:86:0:0:67:86:1:55:12:0:0:56:30:0:0 chr11 60695301 . C A 1175.86 PASS AF=0.987342;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0427945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.977;QD=59.5373;RBI=0.0540939;REFB=-0.0642626;REVB=0.0330874;RO=1;SAF=33;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141253;STB=0.507461;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000570526;OID=.;OPOS=60695301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:79:1:1:77:78:0.987342:44:33:1:0:45:33:1:0 chr11 60698054 . G A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0288542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.183;QD=14.7986;RBI=0.0357849;REFB=-4.94629e-05;REVB=-0.0211658;RO=13;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452513;STB=0.526269;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.00108955;OID=.;OPOS=60698054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:9:2:2:11:9:2:2:11 chr11 60701136 . C G 311.56 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0134788;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=213.99;QD=19.1731;RBI=0.0159372;REFB=-0.0290035;REVB=-0.00850397;RO=31;SAF=16;SAR=17;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855468;STB=0.538798;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0254618;OID=.;OPOS=60701136;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:32:33:33:0.507692:17:16:12:19:17:16:13:19 chr11 60703777 . G A 383.88 PASS AF=0.673469;AO=30;DP=48;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0287923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.648;QD=31.3369;RBI=0.0925546;REFB=-0.00763016;REVB=0.0879622;RO=16;SAF=21;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00940122;STB=0.540959;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00381164;OID=.;OPOS=60703777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:16:16:30:33:0.673469:9:21:11:5:12:21:12:4 chr11 60704213 . C T 706.6 PASS AF=0.48951;AO=70;DP=143;FAO=70;FDP=143;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.00787347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7795;QD=19.7649;RBI=0.00832937;REFB=-0.020879;REVB=0.00271789;RO=71;SAF=36;SAR=34;SRF=43;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837644;STB=0.538266;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0218592;OID=.;OPOS=60704213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:71:73:70:70:0.48951:34:36:43:28:34:36:43:30 chr11 60705454 . A G 788.74 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291863;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0345;QD=57.3626;RBI=0.036203;REFB=0;REVB=0.0214199;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240686;OID=.;OPOS=60705454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0 chr11 60776186 . C T 120.79 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0140948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.009;QD=14.641;RBI=0.014156;REFB=-0.00230119;REVB=-0.00131452;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300736;STB=0.675417;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00546421;OID=.;OPOS=60776186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:10:4:11:8:10:4:11:8 chr11 60776306 . C T 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.101407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.587;QD=13.959;RBI=0.105631;REFB=-0.0154041;REVB=0.0295702;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456174;STB=0.76852;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0150929;OID=.;OPOS=60776306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:1:6:2:5:1:6 chr11 60785352 . A G 368.54 PASS AF=0.590164;AO=34;DP=59;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00669012;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.441;QD=24.1664;RBI=0.0124817;REFB=-0.0262651;REVB=0.0105374;RO=25;SAF=22;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164591;STB=0.597645;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0110165;OID=.;OPOS=60785352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:25:25:34:36:0.590164:12:22:11:14:12:24:11:14 chr11 60785464 . G A 260.58 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0107381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.157;QD=24.8173;RBI=0.0154377;REFB=-0.0142067;REVB=-0.0110912;RO=18;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183917;STB=0.602323;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0127339;OID=.;OPOS=60785464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:15:9:11:7:15:9:11:7 chr11 60892606 . A C,G 797.94 PASS AF=0.0526316,0.947368;AO=2,54;DP=57;FAO=3,54;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=2,23;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140325,0.0907379;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.203,55.3566;QD=55.9961;RBI=0.0167012,0.0919708;REFB=0,0;REVB=-0.00905632,0.0150087;RO=0;SAF=1,23;SAR=1,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.6027e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.243381,-0.0052432;OID=.,.;OPOS=60892606,60892606;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:57:57:0:0:2,54:3,54:0.0526316,0.947368:1,31:1,23:0:0:1,31:2,23:0:0 chr11 60893235 . C T 919.53 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.201;QD=58.383;RBI=0.0398106;REFB=0;REVB=0.010578;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12789e-05;OID=.;OPOS=60893235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:27:36:0:0 chr11 60899767 . A G 685.87 PASS AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0676447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3379;QD=58.372;RBI=0.0692149;REFB=0.0526029;REVB=0.0146591;RO=2;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669533;STB=0.535698;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.00441606;OID=.;OPOS=60899767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:47:47:2:2:45:45:0.957447:13:32:0:2:13:32:0:2 chr11 61106892 . G C 889.88 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00233402;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5881;QD=58.3527;RBI=0.0370169;REFB=0;REVB=-0.0369433;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000211385;OID=.;OPOS=61106892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0 chr11 61108974 . G A 417.67 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0494383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4066;QD=53.8926;RBI=0.127679;REFB=-0.140744;REVB=0.117719;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510197;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00661406;OID=.;OPOS=61108974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:31:31:0:1:30:30:0.967742:24:6:0:0:24:6:0:1 chr11 61112802 . C T 704.49 PASS AF=1;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9917;QD=55.2543;RBI=0.0884033;REFB=0;REVB=0.0718069;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132331;OID=.;OPOS=61112802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:49:51:1:20:29:0:0:20:31:0:0 chr11 61165269 . C A 231.48 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0172279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8048;QD=12.3455;RBI=0.0320847;REFB=-0.00850193;REVB=0.0270671;RO=47;SAF=17;SAR=11;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107108;STB=0.561666;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0137117;OID=.;OPOS=61165269;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:11:17:24:23:11:17:24:23 chr11 61165280 . G A 1224.31 PASS AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124915;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.119;QD=61.2157;RBI=0.0176676;REFB=0;REVB=-0.0124943;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000336188;OID=.;OPOS=61165280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:78:80:1:35:43:0:0:35:45:0:0 chr11 61165731 . C CA 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127904;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=333.062;QD=39.2068;RBI=0.0128007;REFB=0;REVB=0.000513233;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000132347;OID=.;OPOS=61165732;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:9:9:9:0:6:3:0:0:4:0:6:3:0:0 chr11 61165741 . G C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.48;QD=40.7629;RBI=0.0358464;REFB=0;REVB=0.00522442;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291296;OID=.;OPOS=61165741;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr11 61166306 . G A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.417;QD=39.2068;RBI=0.0192508;REFB=0;REVB=-0.0192508;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426481;OID=.;OPOS=61166306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:9:0:0:0:9:0:0:0 chr11 61179285 . G A 1568.5 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00273118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.696;QD=64.0203;RBI=0.0255824;REFB=0;REVB=0.0254362;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.26861e-05;OID=.;OPOS=61179285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:52:46:0:0:52:46:0:0 chr11 61204361 . A C 939.91 PASS AF=0.984848;AO=66;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0374599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.652;QD=56.964;RBI=0.0542887;REFB=-0.0251761;REVB=0.039294;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.50746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00335542;OID=.;OPOS=61204361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:0:1:66:65:0.984848:32:34:0:0:32:33:1:0 chr11 61249383 . C A 755.71 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231393;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0071;QD=57.0343;RBI=0.0111399;REFB=0;REVB=0.0108969;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109395;OID=.;OPOS=61249383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0 chr11 61277300 . CCG C,CCC 30.14 PASS AF=0.1875,0;AO=7,10;DP=46;FAO=6,0;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=5,0;FSAR=1,0;FSRF=25;FSRR=1;FWDB=-0.014535,-0.00176485;FXX=0.0302939;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=22.8681,17.195;QD=3.76715;RBI=0.179118,0.0600621;REFB=-0.0173725,-0.0121585;REVB=-0.178528,-0.0600361;RO=25;SAF=5,0;SAR=2,10;SRF=23;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.39277,-0.85987;STB=0.749527,0.5;STBP=0.847,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0539766,0;OID=.,.;OPOS=61277301,61277302;OREF=CG,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.1875,0:7,10:46:6,0:32:26:5,0:1,0:25:1:30:25:5,0:2,10:23:2 chr11 61277698 . A G 270.2 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00448369;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.949;QD=16.3758;RBI=0.00691759;REFB=-0.016716;REVB=-0.0052678;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174567;STB=0.506325;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0208343;OID=.;OPOS=61277698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:34:36:30:30:0.454545:12:18:21:13:12:18:22:14 chr11 61277775 . A G 354.1 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0310961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.391;QD=21.4607;RBI=0.0407438;REFB=-0.00531492;REVB=-0.0263266;RO=30;SAF=23;SAR=13;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00494148;STB=0.502731;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00689051;OID=.;OPOS=61277775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:13:23:19:11:13:23:19:11 chr11 61277882 . TGGG TGGA,TGG 511.05 PASS AF=0.493506,0.337662;AO=36,16;DP=78;FAO=38,26;FDP=77;FR=.;FRO=13;FSAF=27,23;FSAR=11,3;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.0276784,0.00223228;FXX=0.0253133;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=201.083,7.19686;QD=26.5481;RBI=0.0806734,0.31357;REFB=-0.0575876,-0.452976;REVB=-0.0757767,-0.313562;RO=14;SAF=26,16;SAR=10,0;SRF=14;SRR=0;SSEN=0,0.416667;SSEP=0,0.388489;SSSB=-0.197427,0;STB=0.569687,0.532971;STBP=0.178,0.778;TYPE=snp,del;VARB=0.048074,0.0544021;OID=.,.;OPOS=61277885,61277883;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=TGGA,TGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.493506,0.337662:36,16:78:38,26:77:13:27,23:11,3:12:1:99:14:26,16:10,0:14:0 chr11 61278246 . T C 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0278765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.519;QD=15.6452;RBI=0.0599387;REFB=-0.00748565;REVB=-0.0530617;RO=29;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515473;STB=0.529385;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0040668;OID=.;OPOS=61278246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:11:11:13:16:11:11:13:16 chr11 61487690 . G A 405.64 PASS AF=0.375;AO=48;DP=128;FAO=48;FDP=128;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=0.0609702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.708;QD=12.6763;RBI=0.0609729;REFB=-0.00257288;REVB=-0.000571228;RO=80;SAF=20;SAR=28;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234183;STB=0.513328;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00543835;OID=.;OPOS=61487690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:80:80:48:48:0.375:28:20:35:45:28:20:35:45 chr11 61505168 . G A 1401.83 PASS AF=0.989011;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.129;QD=61.6191;RBI=0.0223507;REFB=0.101868;REVB=0.0107392;RO=1;SAF=52;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902749;STB=0.504672;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.000346695;OID=.;OPOS=61505168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:91:1:1:89:90:0.989011:37:52:1:0:37:53:1:0 chr11 61524974 . G A 318.0 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0077517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.69;QD=17.9157;RBI=0.00778299;REFB=-0.00798344;REVB=-0.000697127;RO=36;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218413;STB=0.518062;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00765704;OID=.;OPOS=61524974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:37:34:34:0.478873:20:14:14:22:20:14:14:23 chr11 61534872 . A C 824.64 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.472;QD=56.8715;RBI=0.063505;REFB=0;REVB=0.0537133;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365157;OID=.;OPOS=61534872;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:54:58:0:0:54:58:1:25:29:0:0:25:33:0:0 chr11 61551356 . T C 183.87 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0109043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.763;QD=17.9384;RBI=0.0110576;REFB=-0.0144179;REVB=-0.0018346;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215067;STB=0.5837;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0225877;OID=.;OPOS=61551356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:22:19:19:0.463415:11:8:4:16:11:8:6:16 chr11 61564299 . G T 50.45 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0116065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.705;QD=16.8181;RBI=0.0218821;REFB=-0.0244057;REVB=-0.0185504;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0294048;OID=.;OPOS=61564299;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:4:3:3:2:4:3:3:2 chr11 61582708 . T C 61.5 PASS AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0235158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8656;QD=7.02824;RBI=0.13398;REFB=0.0032301;REVB=-0.1319;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417813;STB=0.541309;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.0248747;OID=.;OPOS=61582708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:25:26:9:9:0.257143:4:5:13:12:4:5:13:13 chr11 61593816 . C T 217.63 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0267309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.123;QD=22.908;RBI=0.0267664;REFB=-0.0108365;REVB=0.00137773;RO=17;SAF=12;SAR=9;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263961;STB=0.646925;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0163898;OID=.;OPOS=61593816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:9:12:4:13:9:12:4:13 chr11 61658800 . C T 130.42 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0770397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7236;QD=43.4736;RBI=0.0973442;REFB=0;REVB=-0.0595044;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386807;OID=.;OPOS=61658800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr11 61669946 . G A 227.02 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0144816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.875;QD=13.5535;RBI=0.0230855;REFB=-0.0111976;REVB=0.0179784;RO=40;SAF=18;SAR=9;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181699;STB=0.604087;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0119575;OID=.;OPOS=61669946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:9:18:20:20:9:18:20:20 chr11 61672235 . T C 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0375761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.801;QD=14.657;RBI=0.0405837;REFB=-0.00806831;REVB=-0.015332;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142857;STB=0.583204;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00580095;OID=.;OPOS=61672235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:9:8:8:5:9:8 chr11 61672265 . T C 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.013085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.746;QD=13.0912;RBI=0.0131838;REFB=-0.00119496;REVB=0.00161084;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17156;STB=0.600783;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00184747;OID=.;OPOS=61672265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:11:9:8:5:11:9 chr11 61719387 . T C 330.4 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0284164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3352;QD=50.8304;RBI=0.0434918;REFB=-0.173718;REVB=-0.0329248;RO=1;SAF=18;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250902;STB=0.513503;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0147394;OID=.;OPOS=61719387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:7:18:1:0:7:18:1:0 chr11 61722645 . C A 417.95 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0079447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.437;QD=53.9294;RBI=0.0533291;REFB=-0.102572;REVB=0.052734;RO=1;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216881;STB=0.51162;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00297552;OID=.;OPOS=61722645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:21:9:0:1:21:9:0:1 chr11 61730234 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.601;QD=51.1839;RBI=0.0314128;REFB=0;REVB=0.0227722;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449486;OID=.;OPOS=61730234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr11 61906374 . T C 218.99 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0594332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7366;QD=23.6746;RBI=0.0640141;REFB=0.0436721;REVB=-0.0237803;RO=16;SAF=7;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357462;STB=0.519981;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0554635;OID=.;OPOS=61906374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:14:7:6:10:14:7:6:10 chr11 62010863 . C T 531.13 PASS AF=0.448819;AO=57;DP=127;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0105517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.693;QD=16.7285;RBI=0.0122189;REFB=-0.0120289;REVB=-0.0061614;RO=70;SAF=22;SAR=35;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143065;STB=0.579865;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0133299;OID=.;OPOS=62010863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:70:70:57:57:0.448819:35:22:37:33:35:22:37:33 chr11 62236219 . T C 231.45 PASS AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00836528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6814;QD=30.8593;RBI=0.00861823;REFB=-0.0680879;REVB=0.00207268;RO=9;SAF=10;SAR=11;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017341;STB=0.509545;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0159349;OID=.;OPOS=62236219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:11:10:4:5:11:10:4:5 chr11 62285721 . G T 209.3 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.00230474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.892;QD=11.6275;RBI=0.0232255;REFB=-0.0067265;REVB=-0.0231108;RO=46;SAF=11;SAR=15;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011377;STB=0.506574;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0151137;OID=.;OPOS=62285721;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:46:46:26:26:0.361111:15:11:19:27:15:11:19:27 chr11 62290979 . T C 196.33 PASS AF=0.387097;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.000635293;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.5791;QD=12.6662;RBI=0.0284091;REFB=0.0114937;REVB=0.028402;RO=38;SAF=15;SAR=9;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136168;STB=0.578446;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=-0.0104648;OID=.;OPOS=62290979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:38:38:24:24:0.387097:9:15:19:19:9:15:19:19 chr11 62292882 . G T 1191.69 PASS AF=0.975904;AO=80;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0176126;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.3917;QD=57.4309;RBI=0.0252784;REFB=-0.0275562;REVB=-0.0181326;RO=1;SAF=37;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126242;STB=0.500746;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00212401;OID=.;OPOS=62292882;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:83:83:1:2:80:81:0.975904:43:37:1:0:43:38:1:1 chr11 62293822 . C T 352.91 PASS AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00203499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.923;QD=15.861;RBI=0.0160374;REFB=-0.0113972;REVB=-0.0159078;RO=49;SAF=31;SAR=7;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368732;STB=0.71303;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0198704;OID=.;OPOS=62293822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:51:38:38:0.426966:7:31:25:24:7:31:26:25 chr11 62298597 . C A 265.65 PASS AF=0.531915;AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0636416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7397;QD=22.6086;RBI=0.0637428;REFB=-0.0217706;REVB=-0.00359179;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949181;STB=0.572824;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0307345;OID=.;OPOS=62298597;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:22:24:25:0.531915:12:12:9:14:12:13:8:14 chr11 62378687 . G T 178.04 PASS AF=0.343284;AO=23;DP=67;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.00507936;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.932;QD=10.6295;RBI=0.0147126;REFB=-0.00516303;REVB=-0.013808;RO=44;SAF=11;SAR=12;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10097;STB=0.558811;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0124817;OID=.;OPOS=62378687;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:44:44:23:23:0.343284:12:11:25:19:12:11:25:19 chr11 62381106 . G C 114.88 PASS AF=1;AO=7;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.2789;QD=41.7737;RBI=0.261539;REFB=0;REVB=0.258439;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.024928;OID=.;OPOS=62381106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:7:11:1:0:7:0:0:2:9:0:0 chr11 62383715 . G C 272.19 PASS AF=1;AO=6;DP=24;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0875291;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.5741;QD=49.4892;RBI=0.088587;REFB=0;REVB=-0.0136496;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0593142;OID=.;OPOS=62383715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:22:0:0:6:22:1:4:2:0:0:14:8:0:0 chr11 62383718 . A C 71.64 PASS AF=0.407407;AO=8;DP=24;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.00802857;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=146.771;QD=10.6138;RBI=0.00859285;REFB=-0.0551463;REVB=-0.00306252;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.514314;STB=0.818792;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.020219;OID=.;OPOS=62383718;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:24:27:16:16:8:11:0.407407:3:5:2:14:3:8:2:14 chr11 62430659 . T A 499.67 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02567;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.065;QD=58.7848;RBI=0.0259362;REFB=0;REVB=0.00370628;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02108e-05;OID=.;OPOS=62430659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:35:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0 chr11 62439569 . G A 769.49 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.303;QD=56.999;RBI=0.0591718;REFB=0;REVB=0.0556622;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251324;OID=.;OPOS=62439569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0 chr11 62563353 . G A 594.32 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.172;QD=60.9559;RBI=0.0258125;REFB=0;REVB=0.0230636;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.84432e-05;OID=.;OPOS=62563353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr11 62564009 . T C 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0750257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7468;QD=25.2765;RBI=0.093357;REFB=0.0107422;REVB=0.0555579;RO=12;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140022;STB=0.507804;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.00770105;OID=.;OPOS=62564009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:13:6:4:8:13:6:4:8 chr11 62569105 . T TAC 82.98 PASS AF=0.314286;AO=10;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00655367;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=268.972;QD=9.48339;RBI=0.00665908;REFB=-0.00976421;REVB=0.00118016;RO=23;SAF=3;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34695;STB=0.674818;STBP=0.188;TYPE=ins;VARB=0.0238705;OID=.;OPOS=62569106;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=TAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.314286:10:35:11:35:24:4:7:15:9:82:23:3:7:14:9 chr11 62575025 . A T 240.14 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0306263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.56;QD=16.5617;RBI=0.0306467;REFB=0.0111406;REVB=0.00111915;RO=31;SAF=12;SAR=15;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555086;STB=0.531227;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.0124448;OID=.;OPOS=62575025;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:15:12:12:19:15:12:12:19 chr11 62592961 . T C 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0233284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.473;QD=17.247;RBI=0.0234021;REFB=-0.0338743;REVB=-0.00185638;RO=27;SAF=4;SAR=17;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1494;STB=0.586118;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.043134;OID=.;OPOS=62592961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:17:4:8:19:17:4:8:19 chr11 62602983 . A G 351.14 PASS AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0494635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3132;QD=23.4091;RBI=0.0717122;REFB=-0.0628129;REVB=-0.051923;RO=24;SAF=23;SAR=12;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261316;STB=0.525972;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0342683;OID=.;OPOS=62602983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:24:25:35:35:0.583333:12:23:15:9:12:23:15:10 chr11 62607068 . A G 187.9 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00356127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1992;QD=20.3133;RBI=0.0292416;REFB=-0.0219944;REVB=-0.0290239;RO=18;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171802;STB=0.596445;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0210263;OID=.;OPOS=62607068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:10:9:5:13:10:9:5:13 chr11 62609112 . A G 680.18 PASS AF=0.554622;AO=66;DP=119;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00416413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4716;QD=22.8631;RBI=0.0224509;REFB=-0.000362901;REVB=-0.0220613;RO=53;SAF=35;SAR=31;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447636;STB=0.524474;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=3.18816e-05;OID=.;OPOS=62609112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:53:53:66:66:0.554622:31:35:31:22:31:35:31:22 chr11 62609171 . TATT CTGC 1660.68 PASS AF=0.716578;AO=130;DP=193;FAO=134;FDP=187;FR=.;FRO=53;FSAF=69;FSAR=65;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00486586;FXX=0.0360806;HRUN=1;LEN=4;MLLD=207.796;QD=35.5226;RBI=0.0390474;REFB=-0.0316039;REVB=0.038743;RO=52;SAF=68;SAR=62;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288651;STB=0.51451;STBP=0.515;TYPE=mnp;VARB=0.0110957;OID=.;OPOS=62609171;OREF=TATT;OALT=CTGC;OMAPALT=CTGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:187:52:53:130:134:0.716578:62:68:30:22:65:69:30:23 chr11 62623051 . T C 238.13 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00281619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.461;QD=20.2667;RBI=0.00465001;REFB=-0.0102785;REVB=0.00370023;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943123;STB=0.553027;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00700988;OID=.;OPOS=62623051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:9:15:12:11:9:15 chr11 62847453 . T C 126.57 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0364278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3164;QD=11.2509;RBI=0.0374142;REFB=-0.0207287;REVB=0.0085347;RO=30;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437304;STB=0.758288;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0578984;OID=.;OPOS=62847453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:4:11:10:20:4:11:10:20 chr11 62848487 . A C 385.17 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.022471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.324;QD=20.5426;RBI=0.0278484;REFB=-0.0152054;REVB=0.0164495;RO=36;SAF=21;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00930292;STB=0.505152;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.010827;OID=.;OPOS=62848487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:18:21:19:17:18:21:19:17 chr11 62886319 . G C 35.75 PASS AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00965272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7121;QD=5.95777;RBI=0.0142387;REFB=-0.000324698;REVB=-0.0104674;RO=18;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133793;STB=0.587933;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.000664438;OID=.;OPOS=62886319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:2:4:10:8:2:4:10:8 chr11 62902172 . A C 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.806;QD=56.9374;RBI=0.0344369;REFB=0;REVB=0.0337309;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166865;OID=.;OPOS=62902172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr11 62910849 . T C 648.38 PASS AF=0.567568;AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00579422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.995;QD=23.3652;RBI=0.00581429;REFB=-0.019143;REVB=0.00048268;RO=48;SAF=36;SAR=27;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571578;STB=0.53124;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0115695;OID=.;OPOS=62910849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:48:48:63:63:0.567568:27:36:24:24:27:36:24:24 chr11 62911079 . G C 137.27 PASS AF=0.301587;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0121773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.805;QD=8.71567;RBI=0.0182295;REFB=-0.00299975;REVB=-0.0135657;RO=44;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985152;STB=0.558405;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00694176;OID=.;OPOS=62911079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:44:44:19:19:0.301587:11:8:15:29:11:8:15:29 chr11 63057925 . G A 902.7 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.858;QD=58.2385;RBI=0.0417153;REFB=0;REVB=0.00818621;RO=0;SAF=17;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52065e-05;OID=.;OPOS=63057925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:45:17:0:0:45:17:0:0 chr11 63064823 . T C 1176.76 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0518599;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.6088;QD=59.5829;RBI=0.0747285;REFB=-0.127387;REVB=0.0538042;RO=1;SAF=24;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019311;STB=0.510201;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00181438;OID=.;OPOS=63064823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:79:1:1:78:78:0.987342:54:24:1:0:54:24:1:0 chr11 63072310 . C T 1246.1 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.241;QD=61.5358;RBI=0.037841;REFB=0;REVB=-0.0368985;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.09142e-05;OID=.;OPOS=63072310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0 chr11 63129876 . T G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0028087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.077;QD=61.3362;RBI=0.0180899;REFB=0;REVB=-0.0178705;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.58621e-05;OID=.;OPOS=63129876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr11 63258416 . T C 1252.74 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.818;QD=61.1094;RBI=0.0195973;REFB=0;REVB=0.00530587;RO=0;SAF=58;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000858737;OID=.;OPOS=63258416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:23:58:0:0:24:58:0:0 chr11 63313644 . T C 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00553552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.288;QD=62.6136;RBI=0.0340445;REFB=0;REVB=0.0335914;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.32145e-05;OID=.;OPOS=63313644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:41:47:0:0:41:47:0:0 chr11 63413962 . AAAAT A 868.0 PASS AF=1;AO=65;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513058;FXX=0.013887;HRUN=4;LEN=4;MLLD=291.106;QD=48.9015;RBI=0.0513059;REFB=0;REVB=0.000123014;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000112348;OID=.;OPOS=63413963;OREF=AAAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:65:71:71:71:0:28:43:0:0:15:0:25:40:0:0 chr11 63487386 . T C 657.98 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.674;QD=61.2072;RBI=0.0187549;REFB=0;REVB=0.0130688;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385941;OID=.;OPOS=63487386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:20:22:0:0:21:22:0:0 chr11 63585804 . C A 118.32 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0195364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.972;QD=12.7911;RBI=0.0197325;REFB=-0.0154374;REVB=-0.0027744;RO=23;SAF=2;SAR=12;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.566714;STB=0.835559;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0100833;OID=.;OPOS=63585804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:12:2:15:8:12:2:15:8 chr11 63656446 . C T 326.31 PASS AF=0.493151;AO=35;DP=66;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00789108;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.584;QD=17.8799;RBI=0.0779225;REFB=-0.014954;REVB=-0.0775219;RO=30;SAF=17;SAR=18;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437748;STB=0.547919;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0165218;OID=.;OPOS=63656446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:73:30:37:35:36:0.493151:18:17:13:17:18:18:15:22 chr11 63661820 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.643;QD=62.022;RBI=0.0368823;REFB=0;REVB=0.0126723;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99099e-05;OID=.;OPOS=63661820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:21:21:0:0 chr11 63673603 . CTGTG C,CTG 168.66 PASS AF=0.2,0.8;AO=3,10;DP=16;FAO=3,12;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2,5;FSAR=1,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504087,0.0526336;FXX=0.062461;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=70.5048,119.672;QD=44.9751;RBI=0.0508994,0.0879252;REFB=0,0;REVB=0.00705076,0.0704312;RO=0;SAF=2,4;SAR=1,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0574228,0.0244927;OID=.,.;OPOS=63673604,63673604;OREF=TGTG,TG;OALT=-,-;OMAPALT=C,CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.2,0.8:3,10:16:3,12:15:0:2,5:1,7:0:0:16:0:2,4:1,6:0:0 chr11 63681513 . T C 707.42 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.043672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0543;QD=62.8819;RBI=0.0740947;REFB=0;REVB=0.0598563;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248622;OID=.;OPOS=63681513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:9:36:0:0:9:36:0:0 chr11 63883985 . T C 347.44 PASS AF=0.45679;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0586642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.328;QD=17.1575;RBI=0.0620183;REFB=-0.00535209;REVB=-0.0201191;RO=42;SAF=27;SAR=9;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201238;STB=0.600863;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0089568;OID=.;OPOS=63883985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:42:44:36:37:0.45679:9:27:24:18:10:27:25:19 chr11 63884027 . C T 176.65 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00319191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.695;QD=14.132;RBI=0.00392959;REFB=-0.00657277;REVB=0.00229203;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04531;STB=0.526288;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00859956;OID=.;OPOS=63884027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:9:10:15:16:9:10:15:16 chr11 63884453 . C T 720.08 PASS AF=0.489655;AO=69;DP=143;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0285223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5665;QD=19.8644;RBI=0.0325085;REFB=-0.0129991;REVB=0.0155973;RO=73;SAF=35;SAR=34;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258488;STB=0.517377;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0206392;OID=.;OPOS=63884453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:73:74:69:71:0.489655:34:35:35:38:35:36:35:39 chr11 63884474 . C T 639.25 PASS AF=0.512;AO=63;DP=124;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0469289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2898;QD=20.456;RBI=0.0469333;REFB=-0.0457488;REVB=-0.000639299;RO=61;SAF=30;SAR=33;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743809;STB=0.544528;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0484554;OID=.;OPOS=63884474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:61:61:63:64:0.512:33:30:24:37:33:31:24:37 chr11 63885305 . C T 64.77 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0195889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.888;QD=10.363;RBI=0.0241448;REFB=-0.00669504;REVB=-0.0141154;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244812;STB=0.648314;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00591709;OID=.;OPOS=63885305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:9:7:6:3:9:7 chr11 63885632 . A G 695.47 PASS AF=0.978261;AO=46;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0482919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3963;QD=60.4754;RBI=0.0659772;REFB=-0.103297;REVB=0.0449542;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00345919;OID=.;OPOS=63885632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:0:1:46:45:0.978261:22:24:0:0:21:24:0:1 chr11 63885704 . C T 140.09 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0860011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6306;QD=20.7537;RBI=0.0860282;REFB=-0.0227481;REVB=0.00215949;RO=12;SAF=5;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0235536;OID=.;OPOS=63885704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:10:5:4:8:10:5:4:8 chr11 63886539 . C T 354.18 PASS AF=0.373913;AO=43;DP=115;FAO=43;FDP=115;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.0307889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.661;QD=12.3194;RBI=0.0319216;REFB=-0.0200515;REVB=-0.00842823;RO=71;SAF=18;SAR=25;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974452;STB=0.560053;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0234013;OID=.;OPOS=63886539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:71:72:43:43:0.373913:25:18:36:35:25:18:37:35 chr11 63988045 . G A 183.94 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0183867;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.923;QD=17.9458;RBI=0.031027;REFB=-0.0333211;REVB=0.0249921;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612775;STB=0.534847;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0397994;OID=.;OPOS=63988045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:13:9:9:10:13:9 chr11 63988102 . C T 235.22 PASS AF=0.442623;AO=26;DP=60;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0142237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.12;QD=15.4243;RBI=0.0162624;REFB=-0.0258658;REVB=0.00788367;RO=34;SAF=8;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115237;STB=0.572547;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.025355;OID=.;OPOS=63988102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:34:34:26:27:0.442623:18:8:14:20:19:8:14:20 chr11 63991801 . T C 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00273338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.423;QD=14.3347;RBI=0.0261157;REFB=-0.0146345;REVB=0.0259723;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297103;STB=0.680363;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0184775;OID=.;OPOS=63991801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:8:1:3:7:8:1:3:7 chr11 63994696 . T C 1387.9 PASS AF=0.93;AO=93;DP=100;FAO=93;FDP=100;FR=.;FRO=7;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0504247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2174;QD=55.5161;RBI=0.0537983;REFB=-0.0374984;REVB=0.0187511;RO=6;SAF=40;SAR=53;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659804;STB=0.540221;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0449287;OID=.;OPOS=63994696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:100:100:6:7:93:93:0.93:53:40:6:0:53:40:7:0 chr11 63997329 . A G 1606.86 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00024136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2844;QD=60.0694;RBI=0.0269978;REFB=0;REVB=-0.0269968;RO=0;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.46154e-05;OID=.;OPOS=63997329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:60:47:0:0:60:47:0:0 chr11 63997338 . T C 1632.21 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.745;QD=59.8977;RBI=0.0603977;REFB=0;REVB=0.0582057;RO=0;SAF=48;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46076e-05;OID=.;OPOS=63997338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:109:0:0:107:109:1:59:48:0:0:60:49:0:0 chr11 64011441 . T C 918.73 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0750899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.673;QD=58.3321;RBI=0.07604;REFB=0;REVB=0.0119832;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133691;OID=.;OPOS=64011441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:28:35:0:0 chr11 64012225 . G C 226.43 PASS AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.025321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.322;QD=43.1295;RBI=0.0697212;REFB=-0.146832;REVB=0.0649607;RO=2;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917561;STB=0.549948;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0119848;OID=.;OPOS=64012225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:21:21:2:2:19:19:0.904762:9:10:0:2:9:10:0:2 chr11 64012784 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.096568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.2317;QD=33.4278;RBI=0.0967507;REFB=0;REVB=0.00594229;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0106473;OID=.;OPOS=64012784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr11 64022459 . A G 1874.81 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.069;QD=61.4692;RBI=0.0454133;REFB=0;REVB=0.041049;RO=0;SAF=44;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.36327e-05;OID=.;OPOS=64022459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:78:44:0:0:78:44:0:0 chr11 64026144 . G A 107.58 PASS AF=0.325;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=25;FWDB=0.0264287;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7324;QD=10.7577;RBI=0.0334211;REFB=0.00950221;REVB=0.020457;RO=27;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114313;STB=0.506839;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000271266;OID=.;OPOS=64026144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:27:27:13:13:0.325:12:1:2:25:12:1:2:25 chr11 64034866 . G A 161.16 PASS AF=0.586207;AO=16;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00355577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.153;QD=22.229;RBI=0.035333;REFB=-0.0455483;REVB=0.0351537;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341381;STB=0.508918;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.032727;OID=.;OPOS=64034866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:29:29:12:12:16:17:0.586207:6:10:8:4:6:11:8:4 chr11 64039225 . TC T 44.03 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.132008;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.4561;QD=5.17942;RBI=0.160304;REFB=-0.106327;REVB=-0.0909469;RO=15;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0.459459;SSEP=0;SSSB=-0.162948;STB=0.663474;STBP=0.132;TYPE=del;VARB=0.119759;OID=.;OPOS=64039226;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.411765:14:31:14:34:20:4:10:11:9:44:15:5:9:8:7 chr11 64068310 . C T 181.09 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0104489;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.426;QD=15.7469;RBI=0.0145249;REFB=-0.00105966;REVB=-0.0100893;RO=26;SAF=14;SAR=5;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296716;STB=0.682725;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.000765359;OID=.;OPOS=64068310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:27:19:19:0.413043:5:14:12:14:5:14:12:15 chr11 64081445 . G A 402.45 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.00107436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.269;QD=16.5957;RBI=0.0155625;REFB=-0.00706548;REVB=0.0155254;RO=55;SAF=28;SAR=14;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220224;STB=0.624053;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0109691;OID=.;OPOS=64081445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:14:28:25:30:14:28:25:30 chr11 64084113 . A G 1245.9 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000959567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.434;QD=61.5258;RBI=0.00100499;REFB=0;REVB=-0.000298733;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02123e-06;OID=.;OPOS=64084113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:44:37:0:0:44:37:0:0 chr11 64085785 . A G 538.44 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.388;QD=59.8267;RBI=0.0319505;REFB=0;REVB=0.00592862;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261703;OID=.;OPOS=64085785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0 chr11 64107735 . G A 104.6 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0201563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.269;QD=19.9246;RBI=0.02144;REFB=-0.0206939;REVB=-0.0073071;RO=9;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652227;STB=0.537129;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0189508;OID=.;OPOS=64107735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:5:7:6:3:5:7:6:3 chr11 64109118 . T G 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0131362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.155;QD=17.6438;RBI=0.0140905;REFB=-0.0225966;REVB=0.0050973;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186168;STB=0.608447;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0246281;OID=.;OPOS=64109118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:3:6:3:4:3:6:3:4 chr11 64110668 . G A 439.9 PASS AF=0.409836;AO=49;DP=116;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.00598693;FXX=0.0161277;HRUN=5;LEN=1;MLLD=189.443;QD=14.4229;RBI=0.0236672;REFB=-0.026259;REVB=-0.0228975;RO=62;SAF=27;SAR=22;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299879;STB=0.502658;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0358689;OID=.;OPOS=64110668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:122:62:72:49:50:0.409836:22:27:36:26:22:28:40:32 chr11 64110683 . G C 516.92 PASS AF=0.482456;AO=53;DP=112;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0237441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.639;QD=18.1374;RBI=0.0350384;REFB=-0.019003;REVB=0.0257665;RO=59;SAF=27;SAR=26;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047374;STB=0.53536;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0288063;OID=.;OPOS=64110683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:59:59:53:55:0.482456:26:27:33:26:28:27:33:26 chr11 64111928 . T C 156.98 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.000537098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.733;QD=16.1004;RBI=0.0254227;REFB=-0.00678124;REVB=-0.025417;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114925;STB=0.501556;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0107437;OID=.;OPOS=64111928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:20:22:17:17:0.435897:10:7:8:12:10:7:9:13 chr11 64116843 . A C 402.25 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0974102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6642;QD=55.4831;RBI=0.100671;REFB=0;REVB=0.0254152;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488676;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132501;OID=.;OPOS=64116843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:1:0:27:29:1:18:9:1:0:18:11:0:0 chr11 64121509 . G A 221.23 PASS AF=0.714286;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=5.50995e-05;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.915;QD=31.6042;RBI=0.0170264;REFB=-0.0211463;REVB=0.0170263;RO=7;SAF=10;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336717;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0145568;OID=.;OPOS=64121509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:29:28:7:8:20:20:0.714286:10:10:3:4:10:10:4:4 chr11 64124515 . T C 179.5 PASS AF=0.452381;AO=18;DP=41;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0188391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.8;QD=17.0947;RBI=0.0323386;REFB=-0.0122161;REVB=0.0262845;RO=22;SAF=6;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330109;STB=0.684017;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0205942;OID=.;OPOS=64124515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:22:23:18:19:0.452381:12:6:15:7:13:6:15:8 chr11 64124823 . C T 456.18 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00839831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.092;QD=20.2747;RBI=0.0258438;REFB=-0.0130478;REVB=-0.0244412;RO=44;SAF=27;SAR=18;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340903;STB=0.511623;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0118842;OID=.;OPOS=64124823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:45:45:45:0.5:18:27:28:16:18:27:28:17 chr11 64124940 . T G 176.09 PASS AF=0.392857;AO=19;DP=54;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0360932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8701;QD=12.5782;RBI=0.123027;REFB=-0.0208593;REVB=0.117614;RO=29;SAF=13;SAR=6;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286345;STB=0.696939;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0129934;OID=.;OPOS=64124940;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:29:34:19:22:0.392857:6:13:12:17:7:15:12:22 chr11 64127744 . A G 138.94 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0246386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0067;QD=19.8491;RBI=0.0258206;REFB=0.00497538;REVB=-0.00772303;RO=13;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417939;STB=0.523777;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.00405721;OID=.;OPOS=64127744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:4:11:9:4:4:11:9:4 chr11 64136167 . G T 196.52 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0631324;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2817;QD=17.4681;RBI=0.0761624;REFB=-0.0334488;REVB=0.0426029;RO=25;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828906;STB=0.547124;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0457995;OID=.;OPOS=64136167;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:25:25:20:20:0.444444:8:12:17:8:8:12:17:8 chr11 64367325 . A G 1413.09 PASS AF=0.989011;AO=80;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5711;QD=62.1138;RBI=0.0564461;REFB=0;REVB=0.0221816;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0045764;OID=.;OPOS=64367325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:92:91:0:0:80:90:0.989011:50:30:0:0:53:37:0:0 chr11 64367861 . CT CC,C 874.28 PASS AF=0.968254,0.031746;AO=48,10;DP=63;FAO=61,2;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=50,2;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.147797,-0.00835344;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=37.7013,20.1779;QD=55.5098;RBI=0.148798,0.074211;REFB=0,0;REVB=-0.0172252,-0.0737393;RO=0;SAF=37,10;SAR=11,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.14038e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.00492732,0.00312703;OID=.,.;OPOS=64367862,64367862;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.968254,0.031746:48,10:63:61,2:63:0:50,2:11,0:0:0:5:0:37,10:11,0:0:0 chr11 64374718 . TGGGGGC TGGGGC,TGGGGCG 332.33 PASS AF=0.692308,0.166667;AO=36,3;DP=82;FAO=54,13;FDP=78;FR=.;FRO=11;FSAF=15,13;FSAR=39,0;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00340896,-0.066262;FXX=0.0370325;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=8.19423,58.3058;QD=17.0426;RBI=0.0310771,0.0665325;REFB=-0.277922,-0.0652941;REVB=0.0308895,-0.00599346;RO=16;SAF=3,3;SAR=33,0;SRF=3;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.162351,0.745916;STB=0.517813,0.998909;STBP=0.589,0;TYPE=del,mnp;VARB=0.190707,0.0365468;OID=.,.;OPOS=64374719,64374723;OREF=G,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=TGGGGC,TGGGGCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.692308,0.166667:36,3:82:54,13:78:11:15,13:39,0:4:7:44:16:3,3:33,0:3:13 chr11 64415767 . G A 716.74 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251022;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.559;QD=63.7102;RBI=0.0358282;REFB=0;REVB=0.0255644;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000918312;OID=.;OPOS=64415767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0 chr11 64507680 . A C 222.53 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7603;QD=49.4515;RBI=0.108603;REFB=0;REVB=-0.0992046;RO=0;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00147486;OID=.;OPOS=64507680;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:3:14:0:0:3:15:0:0 chr11 64511050 . G C 1187.57 PASS AF=0.952941;AO=80;DP=84;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0201772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.954;QD=55.8855;RBI=0.0420159;REFB=-0.209689;REVB=0.036854;RO=4;SAF=25;SAR=55;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033195;STB=0.517237;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00276372;OID=.;OPOS=64511050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:84:85:4:4:80:81:0.952941:55:25:0:4:56:25:0:4 chr11 64559898 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.679;QD=44.6898;RBI=0.0237249;REFB=0;REVB=0.023642;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577263;OID=.;OPOS=64559898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr11 64572018 . T C 453.69 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0513226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.882;QD=54.9926;RBI=0.0699499;REFB=-0.0392765;REVB=0.0475288;RO=1;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227759;STB=0.512188;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00364164;OID=.;OPOS=64572018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:20:12:0:1:20:12:0:1 chr11 64572557 . A G 556.79 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00214445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.809;QD=60.1936;RBI=0.0305319;REFB=0;REVB=0.0304565;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313075;OID=.;OPOS=64572557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:15:21:0:0:15:22:0:0 chr11 64572602 . G A 618.35 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523045;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.413;QD=61.8354;RBI=0.0537121;REFB=0;REVB=0.0122158;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537172;OID=.;OPOS=64572602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:16:23:0:0:16:24:0:0 chr11 64591679 . G A 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0335508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.051;QD=18.2489;RBI=0.0371741;REFB=-0.0151125;REVB=-0.0160079;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167751;STB=0.596124;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0248744;OID=.;OPOS=64591679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:5:7:5:8:5:7 chr11 64597205 . G T 68.08 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0426171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3945;QD=14.3336;RBI=0.0483288;REFB=-0.00419523;REVB=-0.0227916;RO=9;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496201;STB=0.822687;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0191848;OID=.;OPOS=64597205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:10:9:9:0.473684:1:8:4:5:1:8:4:6 chr11 64601933 . T C 58.63 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0317142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.798;QD=14.6583;RBI=0.0481919;REFB=-0.0294758;REVB=-0.0362859;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108737;STB=0.564352;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0356914;OID=.;OPOS=64601933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:4:4:3:5:4:4 chr11 64606177 . C T 251.59 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=0.0389543;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.7175;QD=16.7729;RBI=0.0526019;REFB=-0.0401726;REVB=0.0353486;RO=29;SAF=21;SAR=7;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539229;STB=0.54648;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0399022;OID=.;OPOS=64606177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:60:29:32:28:28:0.466667:7:21:23:6:7:21:26:6 chr11 64621856 . A G 287.29 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.888;QD=52.2337;RBI=0.0965423;REFB=0;REVB=0.0886184;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00069199;OID=.;OPOS=64621856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:12:8:0:0:14:8:0:0 chr11 64656757 . G A 163.61 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0580261;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.2623;QD=20.4509;RBI=0.0638807;REFB=-0.0104229;REVB=0.0267155;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326553;STB=0.68212;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0123747;OID=.;OPOS=64656757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:9:8:13:2:9:8:13:2 chr11 64677293 . G C 82.04 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0140316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2299;QD=32.8144;RBI=0.0618893;REFB=-0.031228;REVB=0.0602777;RO=1;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080744;STB=0.545355;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0333211;OID=.;OPOS=64677293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:4:5:1:0:4:5:1:0 chr11 64851453 . CT C 221.83 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.5371;QD=49.2965;RBI=0.0458443;REFB=0;REVB=-0.0137311;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00402957;OID=.;OPOS=64851454;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:18:18:18:18:0:7:11:0:0:4:0:7:11:0:0 chr11 64852421 . T C 572.2 PASS AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0473211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7128;QD=54.4955;RBI=0.0482392;REFB=-0.180843;REVB=0.00936667;RO=2;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425724;STB=0.521728;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0151381;OID=.;OPOS=64852421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:41:42:2:2:39:40:0.952381:21:18:0:2:22:18:0:2 chr11 64856500 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5574;QD=37.4884;RBI=0.0593256;REFB=0;REVB=0.0547086;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015533;OID=.;OPOS=64856500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr11 64863880 . CGGGG CGGG,CGGGC 149.89 PASS AF=0.947368,0;AO=11,3;DP=18;FAO=18,0;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=4,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.120645,-0.0695234;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.3665,9.01179;QD=31.5552;RBI=0.281339,0.177801;REFB=-0.0368931,-0.0455318;REVB=0.254158,0.163645;RO=4;SAF=0,3;SAR=11,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.782218;STB=0.517223,0.5;STBP=0.64,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0346465,0;OID=.,.;OPOS=64863881,64863884;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGGG,CGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.947368,0:11,3:18:18,0:19:1:4,0:14,0:0:1:5:4:0,3:11,0:0:4 chr11 64878661 . T C 706.48 PASS AF=0.981132;AO=47;DP=50;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.142923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1863;QD=53.319;RBI=0.155799;REFB=-0.15329;REVB=0.0620185;RO=1;SAF=19;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024107;STB=0.510634;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00709864;OID=.;OPOS=64878661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:53:1:1:47:52:0.981132:28:19:1:0:29:23:1:0 chr11 64880090 . G C 68.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5838;QD=34.1266;RBI=0.080341;REFB=0;REVB=0.0772075;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0183453;OID=.;OPOS=64880090;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:4:3:0:0:5:3:0:0 chr11 64884052 . G A 661.57 PASS AF=0.925926;AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0302533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.323;QD=49.0052;RBI=0.0341098;REFB=-0.170422;REVB=0.0157548;RO=1;SAF=32;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014486;STB=0.508882;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00123372;OID=.;OPOS=64884052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:54:54:1:4:50:50:0.925926:18:32:1:0:18:32:3:1 chr11 64895202 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00477511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.815;QD=57.5452;RBI=0.00995252;REFB=0;REVB=0.00873218;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9393e-06;OID=.;OPOS=64895202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0 chr11 64948277 . A C 1185.55 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00749972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.504;QD=60.7974;RBI=0.0206753;REFB=0;REVB=-0.0192671;RO=0;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.43948e-05;OID=.;OPOS=64948277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:25:52:0:0:25:53:0:0 chr11 64950970 . C T 727.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.067;QD=63.2652;RBI=0.0643548;REFB=0;REVB=0.0487664;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295197;OID=.;OPOS=64950970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:23:22:0:0:24:22:0:0 chr11 64981522 . C A 468.76 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00646251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.199;QD=55.1479;RBI=0.0813056;REFB=-0.118527;REVB=0.0810484;RO=1;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207543;STB=0.510632;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00142612;OID=.;OPOS=64981522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:34:1:1:32:33:0.970588:22:10:0:1:23:10:0:1 chr11 64981587 . G A 668.5 PASS AF=1;AO=39;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.651;QD=59.4224;RBI=0.0579722;REFB=-0.118505;REVB=0.0295154;RO=1;SAF=15;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302234;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488628;OID=.;OPOS=64981587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:41:45:1:0:39:45:1:24:15:1:0:27:18:0:0 chr11 64981837 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.703;QD=55.6561;RBI=0.0468936;REFB=0;REVB=0.0239107;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301435;OID=.;OPOS=64981837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr11 64990041 . G C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.239;QD=59.0184;RBI=0.0593395;REFB=0;REVB=0.0104783;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254175;OID=.;OPOS=64990041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr11 65000719 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337075;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.57;QD=53.2767;RBI=0.0415658;REFB=0;REVB=0.0243212;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290653;OID=.;OPOS=65000719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr11 65004301 . G T 1303.38 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0910239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5891;QD=62.0658;RBI=0.110756;REFB=0;REVB=0.0630991;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811429;OID=.;OPOS=65004301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:84:0:0:80:84:1:38:42:0:0:41:43:0:0 chr11 65089792 . G C 594.47 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509167;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.6266;QD=60.971;RBI=0.0592948;REFB=0;REVB=0.0303868;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819347;OID=.;OPOS=65089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0 chr11 65120386 . CTTTTT CTTTTC,CTTTT 250.52 PASS AF=0.409091,0.454545;AO=14,8;DP=45;FAO=18,20;FDP=44;FR=.;FRO=6;FSAF=8,6;FSAR=10,14;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.04091,0.235502;FXX=0.0222173;HRUN=10,10;LEN=1,1;MLLD=206.356,4.2411;QD=22.7742;RBI=0.0425383,0.259179;REFB=0.0319581,0.294478;REVB=0.0116567,0.108223;RO=10;SAF=6,3;SAR=8,5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0531474,-0.119124;STB=0.596225,0.631011;STBP=0.115,0.021;TYPE=snp,del;VARB=-0.0074248,0.0824245;OID=.,.;OPOS=65120391,65120387;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CTTTTC,CTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.409091,0.454545:14,8:45:18,20:44:6:8,6:10,14:5:1:99:10:6,3:8,5:5:5 chr11 65144075 . T C 344.69 PASS AF=1;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186059;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.813;QD=55.1502;RBI=0.0255769;REFB=0;REVB=0.0175499;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205588;OID=.;OPOS=65144075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:24:25:1:14:10:0:0:15:10:0:0 chr11 65161129 . C T 247.43 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0113625;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.353;QD=17.6738;RBI=0.0125418;REFB=-0.0603476;REVB=-0.00530941;RO=29;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075151;STB=0.542271;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.04459;OID=.;OPOS=65161129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:29:29:27:27:0.482143:10:17:16:13:10:17:16:13 chr11 65164357 . C T 371.41 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0235433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.94;QD=22.856;RBI=0.029637;REFB=-0.0208601;REVB=0.0180017;RO=28;SAF=17;SAR=20;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00379816;STB=0.502091;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0177685;OID=.;OPOS=65164357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:20:17:13:15:20:17:13:15 chr11 65180883 . A G 1498.69 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438461;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.526;QD=63.774;RBI=0.0443253;REFB=0;REVB=0.00650041;RO=0;SAF=31;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022145;OID=.;OPOS=65180883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:63:31:0:0:63:31:0:0 chr11 65211940 . C A 302.84 PASS AF=0.402299;AO=32;DP=80;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0436948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.8726;QD=13.9237;RBI=0.0625798;REFB=-0.0419775;REVB=0.0447995;RO=47;SAF=21;SAR=11;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223079;STB=0.616372;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0306815;OID=.;OPOS=65211940;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:87:47:52:32:35:0.402299:11:21:21:26:14:21:21:31 chr11 65222952 . T C 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00397321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.404;QD=14.7421;RBI=0.00548862;REFB=-0.00568425;REVB=-0.00378663;RO=25;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255107;STB=0.646249;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00617668;OID=.;OPOS=65222952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:9:8:18:7:9:8:18:7 chr11 65338944 . T G 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00961789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.177;QD=21.1727;RBI=0.0201233;REFB=0.0040995;REVB=-0.0176761;RO=8;SAF=1;SAR=11;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2735;STB=0.659672;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00240915;OID=.;OPOS=65338944;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:11:1:2:6:11:1:2:6 chr11 65347636 . G C 764.28 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0082896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5197;QD=63.6899;RBI=0.0864438;REFB=0;REVB=0.0860454;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000979917;OID=.;OPOS=65347636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr11 65349756 . T G 66.49 PASS AF=0.428571;AO=8;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0290945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.486;QD=12.6639;RBI=0.0293914;REFB=-0.0148623;REVB=0.00416722;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284261;STB=0.687091;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0210536;OID=.;OPOS=65349756;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:20:21:12:12:8:9:0.428571:3:5:4:8:3:6:4:8 chr11 65349849 . A T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4472;QD=45.8044;RBI=0.0817218;REFB=0;REVB=0.0758921;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00468042;OID=.;OPOS=65349849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr11 65351074 . G A 83.48 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00433308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.617;QD=9.82171;RBI=0.00760323;REFB=-0.017222;REVB=-0.00624769;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750187;STB=0.545372;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0401702;OID=.;OPOS=65351074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:5:6:11:12:5:6:11:12 chr11 65380916 . G A 562.39 PASS AF=0.614458;AO=51;DP=83;FAO=51;FDP=83;FR=.;FRO=32;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00330471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7291;QD=27.1029;RBI=0.00469192;REFB=-0.0186541;REVB=0.00333062;RO=32;SAF=27;SAR=24;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682178;STB=0.537128;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0189615;OID=.;OPOS=65380916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:32:32:51:51:0.614458:24:27:20:12:24:27:20:12 chr11 65383896 . G C 1607.13 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7766;QD=64.2851;RBI=0.0437553;REFB=0;REVB=-0.0368668;RO=0;SAF=53;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350348;OID=.;OPOS=65383896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:47:53:0:0:47:53:0:0 chr11 65384727 . C T 367.32 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0154321;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.769;QD=18.8369;RBI=0.0158219;REFB=-0.00963387;REVB=0.00349017;RO=40;SAF=14;SAR=24;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257574;STB=0.643357;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00681612;OID=.;OPOS=65384727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:40:40:38:38:0.487179:24:14:26:14:24:14:26:14 chr11 65385606 . A G 1527.76 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7107;QD=63.6567;RBI=0.0665212;REFB=0;REVB=-0.0410118;RO=0;SAF=31;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72489e-05;OID=.;OPOS=65385606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:64:31:0:0:64:32:0:0 chr11 65387012 . C T 390.77 PASS AF=0.666667;AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0189312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.221;QD=32.5644;RBI=0.0233201;REFB=-0.0372765;REVB=0.0136176;RO=15;SAF=19;SAR=13;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152836;STB=0.573445;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0197104;OID=.;OPOS=65387012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:15:16:32:32:0.666667:13:19:5:10:13:19:6:10 chr11 65387378 . T A 228.61 PASS AF=0.440678;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0483594;FXX=0.063482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9026;QD=15.4987;RBI=0.0486205;REFB=-0.00395939;REVB=0.00503223;RO=32;SAF=16;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221286;STB=0.50549;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00358617;OID=.;OPOS=65387378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:59:32:33:26:26:0.440678:10:16:19:13:10:16:20:13 chr11 65408937 . C T 270.5 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00421009;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.822;QD=22.5413;RBI=0.0222918;REFB=-0.0111426;REVB=-0.0218906;RO=23;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703223;STB=0.539332;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00672248;OID=.;OPOS=65408937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:14:11:12:11:14:11:12:11 chr11 65423082 . G A 1152.82 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00799334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2169;QD=60.6749;RBI=0.0218651;REFB=0;REVB=0.0203516;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011106;OID=.;OPOS=65423082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:28:46:0:0:30:46:0:0 chr11 65429235 . GT GTG,TG 90.97 PASS AF=0.295775,0;AO=17,7;DP=71;FAO=21,0;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=19,0;FSAR=2,0;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0219471,-0.0774789;FXX=0.013887;HRUN=1,5;LEN=1,2;MLLD=12.6069,19.2448;QD=5.12514;RBI=0.0608171,0.0894215;REFB=-0.0570072,-0.00241715;REVB=-0.056719,0.0446456;RO=46;SAF=15,7;SAR=2,0;SRF=21;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.564262,0.673741;STB=0.853184,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.10921,0.0208811;OID=.,.;OPOS=65429237,65429235;OREF=-,GT;OALT=G,TG;OMAPALT=GTG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:71:71:46:50:17,7:21,0:0.295775,0:2,0:15,7:21:25:2,0:19,0:25:25 chr11 65487477 . A G 341.86 PASS AF=0.644444;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0130786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.243;QD=30.3876;RBI=0.0131077;REFB=-0.0114026;REVB=0.000872463;RO=16;SAF=15;SAR=14;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212991;STB=0.616362;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0126374;OID=.;OPOS=65487477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:16:16:29:29:0.644444:14:15:3:13:14:15:3:13 chr11 65487790 . CCTT C 116.02 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0385591;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=285.427;QD=12.2125;RBI=0.0413298;REFB=-0.0128841;REVB=-0.0148778;RO=20;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0066627;STB=0.505611;STBP=0.97;TYPE=del;VARB=0.0160158;OID=.;OPOS=65487791;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.447368:17:38:17:38:21:5:12:6:15:99:20:5:12:6:14 chr11 65617113 . AGGGGGT AGGGGT,AGGGGTC,CAGGGGT 541.69 PASS AF=1,0,0;AO=35,2,2;DP=42;FAO=42,0,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0,0;FSAR=18,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0860882,-0.0410305,0.0305861;FXX=0;HRUN=5,5,1;LEN=1,2,2;MLLD=18.4083,90.0785,6.761;QD=51.5894;RBI=0.102562,0.0424325,0.0370146;REFB=0,0,0;REVB=-0.055748,-0.0108171,-0.0208464;RO=0;SAF=19,1,2;SAR=16,1,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-4.1382e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.000677924,0,0;OID=.,.,.;OPOS=65617114,65617118,65617113;OREF=G,GT,AG;OALT=-,TC,CA;OMAPALT=AGGGGT,AGGGGTC,CAGGGGT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:35,2,2:42,0,0:1,0,0:16,1,0:19,1,2:0:0:18,0,0:24,0,0:0:0 chr11 65625824 . T C 358.56 PASS AF=0.402062;AO=39;DP=97;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0192105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.62;QD=14.7861;RBI=0.0210592;REFB=-0.0161225;REVB=-0.00862822;RO=58;SAF=17;SAR=22;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498619;STB=0.528267;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.034439;OID=.;OPOS=65625824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:58:58:39:39:0.402062:22:17:28:30:22:17:28:30 chr11 65636053 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.519;QD=44.6897;RBI=0.0489844;REFB=0;REVB=0.0100829;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584056;OID=.;OPOS=65636053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0 chr11 65649774 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.934;QD=62.6706;RBI=0.0283167;REFB=0;REVB=-0.0136041;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45321e-05;OID=.;OPOS=65649774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr11 65655393 . G C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.579;QD=57.3858;RBI=0.0176469;REFB=0;REVB=0.0115375;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.85002e-06;OID=.;OPOS=65655393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0 chr11 65664346 . T C 791.85 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00641114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.384;QD=53.6846;RBI=0.0066087;REFB=-0.112562;REVB=0.00160381;RO=2;SAF=21;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428118;STB=0.522719;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.000356486;OID=.;OPOS=65664346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:36:21:2:0:36:21:2:0 chr11 65684929 . C T 727.12 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0315891;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=312.714;QD=52.8814;RBI=0.0317565;REFB=-0.00295749;REVB=-0.00325683;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501032;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=2.35254e-05;OID=.;OPOS=65684929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:55:55:0:2:53:53:0.963636:25:28:0:0:25:28:1:1 chr11 65685225 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00671166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.45;QD=49.5992;RBI=0.0262507;REFB=0;REVB=-0.0253782;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000179314;OID=.;OPOS=65685225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr11 65685317 . G A 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0350211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.619;QD=20.8978;RBI=0.0369337;REFB=-0.00535166;REVB=-0.0117313;RO=4;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171168;STB=0.599732;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00913377;OID=.;OPOS=65685317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:2:6:2:2:2:6:2:2 chr11 65685767 . A G 180.08 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00656035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.179;QD=23.2362;RBI=0.0277249;REFB=-0.0180698;REVB=0.0269376;RO=13;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287626;STB=0.516111;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0145595;OID=.;OPOS=65685767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:9:9:6:7:9:9:6:7 chr11 65687242 . C A 67.42 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0535219;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.1933;QD=13.483;RBI=0.0638865;REFB=-0.0127244;REVB=-0.0348838;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202897;STB=0.620415;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0158645;OID=.;OPOS=65687242;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:5:6:3:6:5:6 chr11 65713207 . T C 766.41 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.347;QD=63.8675;RBI=0.00750929;REFB=0;REVB=-0.00633474;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.64002e-05;OID=.;OPOS=65713207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chr11 65715210 . G A 189.15 PASS AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00887693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.085;QD=15.1319;RBI=0.0774225;REFB=-0.0128201;REVB=0.0769119;RO=30;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866919;STB=0.54995;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0211518;OID=.;OPOS=65715210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:11:9:16:14:11:9:16:14 chr11 65727301 . A G 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0136663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.174;QD=19.9928;RBI=0.0155073;REFB=-0.00404348;REVB=-0.00732851;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139686;STB=0.578444;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00390389;OID=.;OPOS=65727301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:16:7:10:12:16:7 chr11 65727315 . G A 192.47 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00618808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.932;QD=16.0387;RBI=0.0146616;REFB=-6.10164e-05;REVB=0.0132917;RO=25;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189338;STB=0.62487;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000163103;OID=.;OPOS=65727315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:28:20:20:0.416667:6:14:13:12:6:14:14:14 chr11 65727339 . A G 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00114368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7912;QD=16.9409;RBI=0.0187314;REFB=0.01008;REVB=-0.0186964;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150284;STB=0.50859;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.0146996;OID=.;OPOS=65727339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:11:13:10:9:11:13 chr11 65732651 . G A 348.94 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0339573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.395;QD=22.8811;RBI=0.0339621;REFB=-0.055881;REVB=-0.000574355;RO=26;SAF=19;SAR=16;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568636;STB=0.531292;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0406032;OID=.;OPOS=65732651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:16:19:16:10:16:19:16:10 chr11 65735174 . G C 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0116564;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.327;QD=19.6454;RBI=0.0117302;REFB=-0.0385005;REVB=0.00131337;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188135;STB=0.608486;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0243107;OID=.;OPOS=65735174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:8:3:4:4:8:3:4:4 chr11 65746136 . G T 229.56 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.034834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.823;QD=22.3963;RBI=0.0349873;REFB=-0.051509;REVB=0.00327166;RO=19;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280213;STB=0.515681;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0336362;OID=.;OPOS=65746136;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:10:12:11:8:10:12:11:8 chr11 65766092 . C T 344.63 PASS AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.012207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.102;QD=19.1463;RBI=0.012288;REFB=-0.0596408;REVB=-0.00140844;RO=35;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134231;STB=0.513946;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0625853;OID=.;OPOS=65766092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:36:36:36:0.5:17:19:19:16:17:19:20:16 chr11 65788072 . C T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.653;QD=40.7629;RBI=0.0448149;REFB=0;REVB=0.0390985;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000700825;OID=.;OPOS=65788072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr11 65790527 . G T 254.54 PASS AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.00430251;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.15;QD=21.212;RBI=0.00655321;REFB=-0.00966303;REVB=0.00494297;RO=24;SAF=8;SAR=16;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864761;STB=0.548348;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0126124;OID=.;OPOS=65790527;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:24:24:24:24:0.5:16:8:6:18:16:8:6:18 chr11 65793121 . C T 157.86 PASS AF=0.365385;AO=18;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00268598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.964;QD=12.1434;RBI=0.0108656;REFB=-0.00831651;REVB=-0.0105284;RO=32;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268064;STB=0.54094;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0243605;OID=.;OPOS=65793121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:32:33:18:19:0.365385:8:10:17:15:8:11:17:16 chr11 65793454 . C T 100.75 PASS AF=0.48;AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0103881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=351.823;QD=16.1192;RBI=0.0122831;REFB=-0.0106222;REVB=0.0065545;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777652;STB=0.519967;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0130177;OID=.;OPOS=65793454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:11:12:0.48:5:6:6:7:6:6:6:7 chr11 65809875 . C A 745.91 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035013;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.357;QD=55.2525;RBI=0.0387227;REFB=-0.0618527;REVB=0.016539;RO=1;SAF=19;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241485;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391172;OID=.;OPOS=65809875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:54:54:1:0:53:54:1:34:19:1:0:34:20:0:0 chr11 65810209 . C T 61.57 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.441;QD=35.1808;RBI=0.126929;REFB=0;REVB=0.0178102;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00532157;OID=.;OPOS=65810209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:4:2:0:0:4:3:0:0 chr11 65810749 . T C 207.12 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.738;QD=48.734;RBI=0.0510053;REFB=0;REVB=0.0374435;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405332;OID=.;OPOS=65810749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr11 65820673 . A G 458.98 PASS AF=0.432203;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0140342;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.423;QD=15.5587;RBI=0.0151819;REFB=-0.0174314;REVB=-0.00579069;RO=66;SAF=31;SAR=20;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802133;STB=0.558251;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0278814;OID=.;OPOS=65820673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:66:67:51:51:0.432203:20:31:35:31:20:31:34:33 chr11 65868310 . T A 435.53 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0257493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4926;QD=54.4416;RBI=0.0361442;REFB=-0.00156596;REVB=-0.0253648;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.513505;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.000662846;OID=.;OPOS=65868310;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:18:13:0:0:18:13:0:1 chr11 65985000 . A C 637.03 PASS AF=0.88;AO=45;DP=50;FAO=44;FDP=50;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0147691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7271;QD=50.9627;RBI=0.0498747;REFB=-0.112963;REVB=-0.0476379;RO=3;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551974;STB=0.517328;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00966329;OID=.;OPOS=65985000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:50:50:3:6:45:44:0.88:24:21:0:3:23:21:2:4 chr11 66010633 . T C 557.08 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.1;QD=60.2252;RBI=0.0365467;REFB=0;REVB=-0.0266536;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190176;OID=.;OPOS=66010633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr11 66035286 . CA C 666.8 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6007;QD=62.0279;RBI=0.159133;REFB=0;REVB=-0.15653;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000822685;OID=.;OPOS=66035287;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:43:43:43:43:0:24:19:0:0:4:0:24:19:0:0 chr11 66052931 . G A 493.63 PASS AF=0.489796;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.00229004;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9775;QD=20.148;RBI=0.0496257;REFB=-0.00325334;REVB=0.0495728;RO=51;SAF=30;SAR=18;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820994;STB=0.54165;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00313916;OID=.;OPOS=66052931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:51:50:48:48:0.489796:18:30:36:15:18:30:35:15 chr11 66100152 . T C 954.45 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478829;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6234;QD=58.7354;RBI=0.0972306;REFB=0;REVB=0.0846228;RO=1;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125954;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052678;OID=.;OPOS=66100152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:1:0:64:65:1:37:27:0:1:38:27:0:0 chr11 66102088 . G A 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00101216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.88;QD=11.6342;RBI=0.0139166;REFB=-0.0123269;REVB=0.0138798;RO=16;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397865;STB=0.523762;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0135121;OID=.;OPOS=66102088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:6:4:7:9:6:4:7:9 chr11 66107674 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00461395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.164;QD=53.9112;RBI=0.0166792;REFB=0;REVB=-0.0160283;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.6009e-05;OID=.;OPOS=66107674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr11 66114900 . C T 377.81 PASS AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.0606349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2645;QD=16.4263;RBI=0.0893719;REFB=-0.000280756;REVB=0.0656563;RO=52;SAF=12;SAR=28;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233567;STB=0.631876;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00267697;OID=.;OPOS=66114900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:28:12:27:25:28:12:27:25 chr11 66206169 . C T 70.57 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0442335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.042;QD=17.6437;RBI=0.0444764;REFB=-0.0166735;REVB=-0.00464192;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193732;STB=0.613759;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0158917;OID=.;OPOS=66206169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:3:4:7:2:3:4 chr11 66240882 . T C 192.9 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0182685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.447;QD=23.3816;RBI=0.0256161;REFB=-0.0223036;REVB=0.0179569;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343481;STB=0.519211;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00831851;OID=.;OPOS=66240882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:10:9:6:8:10:9:6:8 chr11 66254085 . G T 294.91 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0266296;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.984;QD=27.4339;RBI=0.05453;REFB=-0.00368841;REVB=0.0475856;RO=17;SAF=8;SAR=18;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213239;STB=0.618226;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0044471;OID=.;OPOS=66254085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:18:8:10:7:18:8:10:7 chr11 66272142 . A G 689.35 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.813;QD=62.6683;RBI=0.00310762;REFB=0;REVB=0.00290212;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.51885e-06;OID=.;OPOS=66272142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr11 66272237 . G A 119.86 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0286074;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4933;QD=12.9581;RBI=0.0418616;REFB=-0.0246103;REVB=0.0305616;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00734615;STB=0.50632;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0459273;OID=.;OPOS=66272237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:23:14:14:0.378378:5:9:14:8:5:9:15:8 chr11 66276849 . G A 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0133365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.952;QD=13.4858;RBI=0.0345212;REFB=0.00202936;REVB=0.0318411;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769224;STB=0.545355;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.00628215;OID=.;OPOS=66276849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:7:4:4:5:7:4 chr11 66282095 . G A 107.31 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0185435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.236;QD=12.6245;RBI=0.0209265;REFB=5.72419e-05;REVB=0.0096982;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142088;STB=0.567464;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.000141655;OID=.;OPOS=66282095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:6:7:8:12:6:7:9:12 chr11 66325213 . G A 50.27 PASS AF=0.190476;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0206912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.753;QD=4.78734;RBI=0.0207791;REFB=0.00349257;REVB=-0.0019095;RO=34;SAF=4;SAR=4;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0167732;OID=.;OPOS=66325213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:42:42:34:34:8:8:0.190476:4:4:17:17:4:4:17:17 chr11 66327673 . G A 1135.25 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.337;QD=60.5467;RBI=0.0629217;REFB=0;REVB=0.0537245;RO=0;SAF=24;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327396;OID=.;OPOS=66327673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:50:24:0:0:51:24:0:0 chr11 66328055 . A G 250.55 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0111019;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9907;QD=25.6978;RBI=0.0706099;REFB=-0.030736;REVB=0.0697317;RO=17;SAF=8;SAR=15;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188887;STB=0.616335;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0370283;OID=.;OPOS=66328055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:17:16:23:23:0.589744:15:8:10:7:15:8:10:6 chr11 66328095 . T C 639.59 PASS AF=0.976744;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0252439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.779;QD=59.4965;RBI=0.0277092;REFB=-0.148212;REVB=-0.0114256;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.509429;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000695665;OID=.;OPOS=66328095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:43:0:1:41:42:0.976744:25:16:0:0:26:16:0:1 chr11 66328719 . T C 855.59 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338013;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.126;QD=58.0062;RBI=0.0396435;REFB=0;REVB=0.0207142;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305425;OID=.;OPOS=66328719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:22:37:0:0:22:37:0:0 chr11 66328741 . A C 295.76 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0180414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.947;QD=20.3969;RBI=0.0188526;REFB=-0.0423892;REVB=-0.00547053;RO=27;SAF=21;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449392;STB=0.524984;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0395167;OID=.;OPOS=66328741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:10:21:17:10:10:21:17:10 chr11 66329732 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4896;QD=61.336;RBI=0.0356086;REFB=0;REVB=0.0320087;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437499;OID=.;OPOS=66329732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chr11 66331000 . A G 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.0144553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.218;QD=12.7239;RBI=0.0196368;REFB=-0.0106124;REVB=-0.0132909;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20767;STB=0.618144;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0151138;OID=.;OPOS=66331000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:13:10:9:27:13:10:9:27 chr11 66331458 . A G 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6942;QD=64.4123;RBI=0.0154333;REFB=0;REVB=-0.00884314;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90268e-05;OID=.;OPOS=66331458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:16:34:0:0:16:34:0:0 chr11 66333598 . C T 455.2 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2082;QD=55.1754;RBI=0.0412043;REFB=-0.0915508;REVB=-0.0315671;RO=1;SAF=13;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345573;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251584;OID=.;OPOS=66333598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:33:33:1:0:32:33:1:19:13:1:0:19:14:0:0 chr11 66335548 . A G 639.65 PASS AF=0.976744;AO=37;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0588968;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.618;QD=59.5023;RBI=0.0603677;REFB=-0.00114866;REVB=0.0132445;RO=2;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00129717;STB=0.512814;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000140244;OID=.;OPOS=66335548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:43:2:1:37:42:0.976744:18:19:1:1:23:19:1:0 chr11 66360512 . G A 272.88 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0252644;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2645;QD=23.7284;RBI=0.0413111;REFB=-0.0425398;REVB=0.0326851;RO=21;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689383;STB=0.559952;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0343276;OID=.;OPOS=66360512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:21:21:25:25:0.543478:14:11:11:10:14:11:12:9 chr11 66468469 . A G 166.01 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0375717;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7837;QD=11.4487;RBI=0.0604848;REFB=-0.0338712;REVB=-0.0474002;RO=37;SAF=9;SAR=12;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180617;STB=0.60478;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0495393;OID=.;OPOS=66468469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:37:37:21:21:0.362069:12:9:22:15:12:9:22:15 chr11 66472274 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.878;QD=33.4285;RBI=0.0156201;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239534;OID=.;OPOS=66472274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr11 66807561 . A C 170.33 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00904118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.08;QD=17.0333;RBI=0.00909261;REFB=-0.00362889;REVB=-0.00096574;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291993;STB=0.657554;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00435994;OID=.;OPOS=66807561;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:13:5:12:9:13:5:12:10 chr11 66811231 . C T 363.26 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.0121812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.289;QD=18.1631;RBI=0.0123499;REFB=-0.0106069;REVB=-0.00203428;RO=42;SAF=8;SAR=30;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690946;STB=0.538731;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0105103;OID=.;OPOS=66811231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:30:8:11:31:30:8:11:31 chr11 66834252 . C T 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0162781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.706;QD=20.739;RBI=0.0241849;REFB=-0.00776938;REVB=0.0178866;RO=16;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198161;STB=0.612117;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00701767;OID=.;OPOS=66834252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:6:12:7:9:6:12:7:9 chr11 66837965 . T C 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.836;QD=55.6545;RBI=0.024313;REFB=0;REVB=0.0166093;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255221;OID=.;OPOS=66837965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr11 66995603 . T C 1090.42 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0157618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.568;QD=57.3905;RBI=0.0179345;REFB=0.0735216;REVB=0.00855644;RO=2;SAF=45;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315076;STB=0.516662;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.000169115;OID=.;OPOS=66995603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:76:2:2:74:74:0.973684:29:45:0:2:29:45:0:2 chr11 67021929 . GC AA 153.63 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-9.02385e-05;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=2;MLLD=192.531;QD=13.3594;RBI=0.0122565;REFB=-0.00671618;REVB=-0.0122562;RO=29;SAF=7;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114474;STB=0.566931;STBP=0.49;TYPE=mnp;VARB=0.00921951;OID=.;OPOS=67021929;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:29:29:17:17:0.369565:10:7:15:14:10:7:15:14 chr11 67050292 . G A 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0277455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.677;QD=20.1601;RBI=0.0336995;REFB=-0.0346038;REVB=0.019127;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110236;STB=0.562422;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0315744;OID=.;OPOS=67050292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:9:7:8:6:9:7:8:6 chr11 67054011 . TA T 206.27 PASS AF=1;AO=19;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156936;FXX=0.0689417;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.7133;QD=30.558;RBI=0.19455;REFB=-0.0299751;REVB=0.114981;RO=1;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263155;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0126833;OID=.;OPOS=67054012;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:28:27:27:0:3:24:0:0:4:1:2:17:0:1 chr11 67068859 . T C 783.34 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0556672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7833;QD=63.9458;RBI=0.0564547;REFB=0;REVB=0.00939678;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000316518;OID=.;OPOS=67068859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:16:33:0:0:16:33:0:0 chr11 67071584 . C G 957.24 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0470363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4376;QD=57.1488;RBI=0.0470926;REFB=-0.121947;REVB=-0.00230232;RO=0;SAF=18;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99443e-08;STB=0.513509;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00198298;OID=.;OPOS=67071584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:0:1:66:66:0.985075:48:18:0:0:48:18:1:0 chr11 67075131 . C T 322.25 PASS AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.000936567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.886;QD=28.0214;RBI=0.00638308;REFB=-0.0346245;REVB=0.00631399;RO=18;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194263;STB=0.607066;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0171333;OID=.;OPOS=67075131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:17:11:12:6:17:11:12:6 chr11 67130122 . A G 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0053669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.605;QD=11.6341;RBI=0.0113122;REFB=-0.00578047;REVB=0.00995798;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154872;STB=0.593026;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00766362;OID=.;OPOS=67130122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:3:7:9:7:3:7:9:7 chr11 67160961 . A G 223.6 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00140897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7291;QD=26.3054;RBI=0.0376481;REFB=-0.0181013;REVB=-0.0376217;RO=13;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310577;STB=0.517225;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0156405;OID=.;OPOS=67160961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:12:9:5:8:12:9:5:8 chr11 67171736 . C T 240.12 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00743248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9134;QD=16.5597;RBI=0.00901724;REFB=0.031068;REVB=-0.00510577;RO=31;SAF=20;SAR=7;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268607;STB=0.652362;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.0371407;OID=.;OPOS=67171736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:7:20:15:16:7:20:15:16 chr11 67176898 . A G 115.07 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0198303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.845;QD=19.1778;RBI=0.0202959;REFB=-0.0188373;REVB=-0.0043224;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181889;STB=0.602692;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0126619;OID=.;OPOS=67176898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:2:9:8:5:2:9 chr11 67177278 . G A 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.703;QD=60.978;RBI=0.0200753;REFB=0;REVB=0.0137709;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40556e-06;OID=.;OPOS=67177278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr11 67191449 . T C 390.87 PASS AF=0.43617;AO=40;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0184421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.745;QD=16.6329;RBI=0.0224948;REFB=-0.024033;REVB=-0.0128804;RO=53;SAF=17;SAR=23;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12385;STB=0.560946;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0339317;OID=.;OPOS=67191449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:40:41:0.43617:23:17:29:24:23:18:29:24 chr11 67192555 . G A 407.31 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.012544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.332;QD=22.947;RBI=0.0150426;REFB=-0.028496;REVB=0.00830228;RO=31;SAF=28;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186528;STB=0.603023;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0150087;OID=.;OPOS=67192555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:31:31:40:40:0.56338:12:28:15:16:12:28:15:16 chr11 67200819 . C T 215.07 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0287872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.362;QD=21.5073;RBI=0.0715789;REFB=-0.00592262;REVB=0.065535;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866726;STB=0.548647;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0103782;OID=.;OPOS=67200819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:11:10:11:8:11:10:11:8 chr11 67220015 . C T 82.31 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0171928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9809;QD=19.3671;RBI=0.0210844;REFB=-0.0286772;REVB=0.0122048;RO=7;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103689;STB=0.559875;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0231199;OID=.;OPOS=67220015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:7:3:3:4:7:3:3:4 chr11 67257556 . C T 250.23 PASS AF=0.605263;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0210062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.954;QD=26.3399;RBI=0.0217219;REFB=-0.0745077;REVB=0.00552992;RO=12;SAF=13;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926435;STB=0.51275;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0468018;OID=.;OPOS=67257556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:12:15:23:23:0.605263:10:13:5:7:10:13:8:7 chr11 67257823 . C A 313.31 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0525997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3153;QD=50.1288;RBI=0.0575165;REFB=0.0145259;REVB=-0.0232685;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52379;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.00345729;OID=.;OPOS=67257823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:10:14:0:0:10:14:0:1 chr11 67258391 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.633;QD=59.0177;RBI=0.0355147;REFB=0;REVB=-0.0300915;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.35861e-05;OID=.;OPOS=67258391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr11 67263767 . A G 165.03 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000276145;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.908;QD=47.1515;RBI=0.0201924;REFB=0;REVB=0.0201905;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497227;OID=.;OPOS=67263767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:2:12:0:0:2:12:0:0 chr11 67288594 . C T 464.15 PASS AF=0.586667;AO=43;DP=74;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.012;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.596;QD=24.7545;RBI=0.0164448;REFB=-0.0158832;REVB=0.0112442;RO=31;SAF=13;SAR=30;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100993;STB=0.546537;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0132266;OID=.;OPOS=67288594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:31:31:43:44:0.586667:30:13:13:18:30:14:13:18 chr11 67351585 . C G 231.33 PASS AF=0.481481;AO=25;DP=53;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00718179;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7023;QD=17.1352;RBI=0.054356;REFB=-0.0466138;REVB=-0.0538795;RO=26;SAF=18;SAR=7;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714957;STB=0.554939;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0168266;OID=.;OPOS=67351585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:26:28:25:26:0.481481:7:18:17:9:7:19:18:10 chr11 67399190 . GT TG 33.02 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0218044;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=97.3171;QD=4.26066;RBI=0.0350721;REFB=-0.00666098;REVB=-0.0274703;RO=22;SAF=5;SAR=1;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292052;STB=0.670988;STBP=0.456;TYPE=mnp;VARB=0.17262;OID=.;OPOS=67399190;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:22:25:6:6:0.193548:1:5:14:8:1:5:17:8 chr11 67430698 . G A 308.37 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0227789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.975;QD=18.4099;RBI=0.0242687;REFB=-0.00787679;REVB=-0.00837204;RO=34;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397967;STB=0.522199;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0090889;OID=.;OPOS=67430698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:17:16:15:19:17:16:15:19 chr11 67430762 . T C 248.39 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.00930615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.44;QD=13.994;RBI=0.0166337;REFB=-0.00181904;REVB=0.0137868;RO=42;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224333;STB=0.627067;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00259478;OID=.;OPOS=67430762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:16:13:28:14:16:13:28:14 chr11 67431914 . G A 349.24 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00230576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.713;QD=20.2458;RBI=0.00688934;REFB=-0.00216063;REVB=0.00649203;RO=33;SAF=11;SAR=25;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141517;STB=0.578761;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00202667;OID=.;OPOS=67431914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:25:11:15:18:25:11:15:18 chr11 67431974 . C T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.018404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.072;QD=12.724;RBI=0.0248925;REFB=-0.0171364;REVB=0.0167609;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080605;STB=0.546243;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0263686;OID=.;OPOS=67431974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:13:10:13:23:13:10:13:23 chr11 67432804 . T C 380.54 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0252491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.228;QD=52.4886;RBI=0.0769885;REFB=-0.0175053;REVB=0.0727304;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538433;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.000539288;OID=.;OPOS=67432804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:29:0:1:28:28:0.965517:6:22:0:0:6:22:0:1 chr11 67432854 . T C 544.89 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0111004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0315;QD=57.3565;RBI=0.0880926;REFB=-0.098304;REVB=0.0873905;RO=1;SAF=27;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170335;STB=0.509086;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00267987;OID=.;OPOS=67432854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:10:27:1:0:10:27:1:0 chr11 67433869 . C T 36.6 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.000696115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5167;QD=7.32014;RBI=0.019788;REFB=-0.0174115;REVB=0.0197758;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0444765;OID=.;OPOS=67433869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:3:3:7:7:3:3:7:7 chr11 67434416 . C A 110.5 PASS AF=0.448276;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0183431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.075;QD=15.2414;RBI=0.0264815;REFB=-0.0129681;REVB=0.0190997;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270626;STB=0.670447;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0181592;OID=.;OPOS=67434416;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:16:16:12:13:0.448276:9:3:8:8:10:3:8:8 chr11 67564162 . A G 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0252551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.462;QD=10.3791;RBI=0.0429771;REFB=-0.000110526;REVB=-0.0347737;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124735;STB=0.576289;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=-0.00146648;OID=.;OPOS=67564162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:7:2:5:11:7:2:5:11 chr11 67564197 . T C 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.541;QD=53.9107;RBI=0.0287448;REFB=0;REVB=0.0266663;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454302;OID=.;OPOS=67564197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0 chr11 67564238 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210593;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.092;QD=47.8224;RBI=0.0328127;REFB=0;REVB=0.0251631;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33221e-05;OID=.;OPOS=67564238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr11 67564241 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.725;QD=47.8223;RBI=0.126276;REFB=0;REVB=-0.00316001;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121556;OID=.;OPOS=67564241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr11 67572698 . G T 179.85 PASS AF=1;AO=12;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305471;FXX=0.062461;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.919;QD=47.959;RBI=0.0464989;REFB=0;REVB=0.0350575;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542228;OID=.;OPOS=67572698;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:12:15:1:2:10:0:0:5:10:0:0 chr11 67663113 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.424;QD=37.4885;RBI=0.0320505;REFB=0;REVB=-0.0234588;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.71606e-05;OID=.;OPOS=67663113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr11 67663116 . T A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.177;QD=37.4885;RBI=0.0246757;REFB=0;REVB=0.00516421;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000490661;OID=.;OPOS=67663116;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr11 67763224 . G A 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0771934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.51;QD=12.7823;RBI=0.0771946;REFB=-0.00242136;REVB=-0.000433011;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044472;STB=0.526264;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0133784;OID=.;OPOS=67763224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:5:9:6:4:5:9 chr11 67765163 . A AG,G 576.04 PASS AF=1,0;AO=34,3;DP=41;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108936,0.055229;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=24.4679,3.94762;QD=57.6044;RBI=0.162352,0.055683;REFB=0,0;REVB=0.12038,-0.00709631;RO=4;SAF=12,2;SAR=22,1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0222562,0.348651;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00788917,0;OID=.,.;OPOS=67765164,67765163;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:4:0:34,3:40,0:1,0:22,1:12,2:1:3:26,0:14,0:0:0 chr11 67782947 . G T 138.43 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0697578;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.8988;QD=21.2961;RBI=0.0824114;REFB=-0.0189121;REVB=0.0438804;RO=11;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052179;STB=0.529373;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0202273;OID=.;OPOS=67782947;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:5:10:8:3:5:10:8:3 chr11 67786064 . A AC,C 1034.67 PASS AF=0.986486,0;AO=66,5;DP=74;FAO=73,0;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=18,0;FSAR=55,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00434736,-0.130663;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=26.1056,5.08145;QD=55.9279;RBI=0.00572455,0.170465;REFB=-0.0214294,0.00201913;REVB=0.00372438,-0.109478;RO=3;SAF=17,1;SAR=49,4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0280529,0.23409;STB=0.504503,0.5;STBP=0.621,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00131728,0.0207269;OID=.,.;OPOS=67786065,67786064;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:3:1:66,5:73,0:0.986486,0:49,4:17,1:0:3:55,0:18,0:0:1 chr11 67789293 . G GC 639.43 PASS AF=1;AO=51;DP=55;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203556;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.704;QD=49.1866;RBI=0.0210502;REFB=0;REVB=0.00536276;RO=2;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268968;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00087933;OID=.;OPOS=67789294;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:51:55:52:52:0:17:35:0:0:11:2:17:34:0:2 chr11 67795299 . G A 323.06 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.010123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.286;QD=21.9022;RBI=0.0176022;REFB=-0.0196358;REVB=0.0144;RO=25;SAF=13;SAR=20;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279473;STB=0.504308;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0154263;OID=.;OPOS=67795299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:26:33:33:0.559322:20:13:9:16:20:13:10:16 chr11 67795353 . G A 149.75 PASS AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0361028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.724;QD=28.5242;RBI=0.0685766;REFB=-0.0495005;REVB=0.0583038;RO=6;SAF=6;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359305;STB=0.519974;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0162798;OID=.;OPOS=67795353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:9:6:2:4:9:6:2:4 chr11 67795378 . G GC 204.57 PASS AF=1;AO=19;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.4239;QD=37.195;RBI=0.0384408;REFB=-0.0332155;REVB=-0.00889449;RO=4;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409274;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00173883;OID=.;OPOS=67795379;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:23:22:22:0:7:15:0:0:3:4:7:12:1:3 chr11 67810475 . G C 273.73 PASS AF=0.252427;AO=5;DP=104;FAO=26;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.0227893;FXX=0.0190458;HRUN=6;LEN=1;MLLD=21.4627;QD=10.6301;RBI=0.0234139;REFB=-0.10552;REVB=-0.00537231;RO=30;SAF=2;SAR=3;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175513;STB=0.859816;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0180607;OID=.;OPOS=67810475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:30:46:5:26:0.252427:3:2:8:22:4:22:12:34 chr11 67814979 . G C 1556.41 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4715;QD=59.8618;RBI=0.0469231;REFB=0;REVB=-0.0176675;RO=0;SAF=53;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014072;OID=.;OPOS=67814979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:51:53:0:0:51:53:0:0 chr11 67957518 . A T 769.46 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.087;QD=56.9973;RBI=0.0856718;REFB=0;REVB=0.0225789;RO=0;SAF=10;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293251;OID=.;OPOS=67957518;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:44:10:0:0:44:10:0:0 chr11 68030015 . C T 45.56 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0660583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.339;QD=26.0339;RBI=0.0895679;REFB=0.048861;REVB=0.0604873;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599655;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.000118648;OID=.;OPOS=68030015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:0:1:6:6:0.857143:4:2:0:0:4:2:1:0 chr11 68171013 . T C 1268.69 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0051532;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=156.012;QD=60.4138;RBI=0.0165488;REFB=-0.129529;REVB=0.015726;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.506492;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000130526;OID=.;OPOS=68171013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:45:38:0:0:45:38:1:0 chr11 68177510 . C T 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.781;QD=61.2132;RBI=0.0196763;REFB=0;REVB=0.00458876;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2653e-05;OID=.;OPOS=68177510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0 chr11 68201295 . C T 279.68 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.435;QD=50.8508;RBI=0.101668;REFB=0;REVB=0.100826;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117705;OID=.;OPOS=68201295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:4:17:0:0:5:17:0:0 chr11 68358106 . CTTTTATTTTG CTTTT,CTTTTG 252.52 PASS AF=0,1;AO=4,11;DP=20;FAO=0,20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194178,0.0257987;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=6,5;MLLD=74.5238,191.068;QD=50.5044;RBI=0.0250105,0.0353262;REFB=0,0;REVB=-0.015763,0.0241324;RO=0;SAF=4,4;SAR=0,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000127867;OID=.,.;OPOS=68358111,68358107;OREF=ATTTTG,TTTTA;OALT=-,-;OMAPALT=CTTTT,CTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:4,11:20:0,20:20:0:0,9:0,11:0:0:4:0:4,4:0,7:0:0 chr11 68381223 . A T 57.48 PASS AF=0.455882;AO=4;DP=7;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00474642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7972;QD=3.38128;RBI=0.015686;REFB=-0.248496;REVB=0.0149507;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.602036;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.396742;OID=.;OPOS=68381223;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:7:68:2:37:4:31:0.455882:0:4:2:0:9:22:20:17 chr11 68549340 . A G 789.88 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0362105;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.786;QD=55.4302;RBI=0.0513243;REFB=-0.0514534;REVB=0.0363729;RO=1;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171432;STB=0.509088;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000682499;OID=.;OPOS=68549340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:57:1:1:56:56:0.982456:27:29:0:1:27:29:0:1 chr11 68560787 . C T 530.08 PASS AF=0.445312;AO=56;DP=127;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.01571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.405;QD=16.565;RBI=0.0377201;REFB=-0.010144;REVB=0.0342929;RO=71;SAF=22;SAR=34;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074001;STB=0.545155;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.012647;OID=.;OPOS=68560787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:71:71:56:57:0.445312:34:22:33:38:35:22:33:38 chr11 68671280 . G GCCGCCGCCATCTTC 187.76 PASS AF=0.273684;AO=23;DP=100;FAO=26;FDP=95;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=0.0011314;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=14;MLLD=361.954;QD=7.90581;RBI=0.0133975;REFB=-0.0139895;REVB=0.0133496;RO=73;SAF=15;SAR=8;SRF=20;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.445562;STB=0.70971;STBP=0.023;TYPE=ins;VARB=0.0375675;OID=.;OPOS=68671281;OREF=-;OALT=CCGCCGCCATCTTC;OMAPALT=GCCGCCGCCATCTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.273684:23:100:26:95:69:15:11:19:50:99:73:15:8:20:53 chr11 68678962 . T C 330.88 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00676939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.487;QD=15.9462;RBI=0.0107419;REFB=-0.00684515;REVB=0.00834055;RO=46;SAF=17;SAR=19;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135475;STB=0.581459;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00781647;OID=.;OPOS=68678962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:47:36:36:0.433735:19:17:28:18:19:17:29:18 chr11 68703959 . A G 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00684598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.69;QD=27.2217;RBI=0.0180014;REFB=-0.0192919;REVB=-0.0166488;RO=15;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883466;STB=0.548767;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0133701;OID=.;OPOS=68703959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:11:13:10:5:11:13:10:5 chr11 68704264 . C T 443.58 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0103803;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.733;QD=22.1791;RBI=0.0126612;REFB=-0.0113149;REVB=-0.00724951;RO=36;SAF=23;SAR=20;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590111;STB=0.509914;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0105984;OID=.;OPOS=68704264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:36:37:43:43:0.5375:20:23:19:17:20:23:19:18 chr11 68748003 . T C 259.33 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0257707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.948;QD=14.2099;RBI=0.0267574;REFB=-0.0218305;REVB=-0.00719941;RO=43;SAF=15;SAR=15;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18157;STB=0.602674;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0402672;OID=.;OPOS=68748003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:0.410959:15:15:14:29:15:15:14:29 chr11 68773403 . G A 337.9 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00769277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.011;QD=17.5531;RBI=0.0232652;REFB=-8.60792e-05;REVB=0.0219565;RO=39;SAF=18;SAR=18;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107582;STB=0.545429;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.000182238;OID=.;OPOS=68773403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:41:36:36:0.467532:18:18:15:24:18:18:17:24 chr11 68822739 . T C 870.55 PASS AF=1;AO=52;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.762;QD=58.0366;RBI=0.0741129;REFB=0;REVB=0.0728171;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116548;OID=.;OPOS=68822739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:52:60:1:26:26:0:0:32:28:0:0 chr11 68834968 . T C 594.52 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.006;QD=60.9766;RBI=0.0100464;REFB=0;REVB=0.0047444;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.05721e-05;OID=.;OPOS=68834968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr11 68840397 . T C 89.53 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0305492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.485;QD=15.5706;RBI=0.0359876;REFB=-0.0180117;REVB=-0.0190224;RO=12;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293955;STB=0.671941;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0178293;OID=.;OPOS=68840397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:8:3:7:5:8:3:7:5 chr11 68840399 . G A 89.53 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0468846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8055;QD=15.5712;RBI=0.0623179;REFB=0.0258713;REVB=0.0410531;RO=12;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293955;STB=0.671941;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.0118814;OID=.;OPOS=68840399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:8:3:7:5:8:3:7:5 chr11 68840412 . C G 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0727483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.619;QD=14.9787;RBI=0.0740256;REFB=-0.036717;REVB=-0.0136917;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355177;STB=0.710646;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0182725;OID=.;OPOS=68840412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:8:2:6:5:8:2:6:5 chr11 68851414 . T C 243.78 PASS AF=0.32967;AO=30;DP=91;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=-0.00393885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.905;QD=10.7158;RBI=0.027157;REFB=-0.00951022;REVB=-0.0268698;RO=60;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334216;STB=0.686325;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0179112;OID=.;OPOS=68851414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:60:61:30:30:0.32967:12:18:18:42:12:18:19:42 chr11 68851466 . G T 244.25 PASS AF=0.326316;AO=27;DP=91;FAO=31;FDP=95;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=0.0236436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.644;QD=10.2844;RBI=0.0293232;REFB=-0.017669;REVB=0.0173444;RO=62;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275346;STB=0.666343;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.028857;OID=.;OPOS=68851466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:95:62:64:27:31:0.326316:11:16:22:40:12:19:23:41 chr11 69063136 . C T 271.69 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00454151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.952;QD=14.6859;RBI=0.0202528;REFB=0.0116048;REVB=0.0197371;RO=43;SAF=21;SAR=10;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822013;STB=0.546739;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00848587;OID=.;OPOS=69063136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:10:21:26:17:10:21:26:17 chr11 69063393 . T C 314.98 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0101742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.649;QD=19.9988;RBI=0.0123935;REFB=-0.0123321;REVB=-0.00707698;RO=30;SAF=16;SAR=17;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730383;STB=0.540516;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0118492;OID=.;OPOS=69063393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:17:16:12:18:17:16:12:18 chr11 69063476 . C T 210.27 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0214013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2083;QD=15.5758;RBI=0.0291532;REFB=-0.00118282;REVB=-0.0197963;RO=30;SAF=14;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146767;STB=0.583264;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00231157;OID=.;OPOS=69063476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:10:14:13:17:10:14:13:17 chr11 69063572 . A G 260.79 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.000305433;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.385;QD=20.4543;RBI=0.0265255;REFB=-0.00950948;REVB=-0.0265238;RO=24;SAF=7;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297034;STB=0.666536;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0127537;OID=.;OPOS=69063572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:24:24:27:27:0.529412:20:7:14:10:20:7:14:10 chr11 69063984 . C T 278.88 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.00403893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2321;QD=13.9442;RBI=0.0197286;REFB=-0.00178881;REVB=-0.0193108;RO=48;SAF=16;SAR=16;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13207;STB=0.574954;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00386016;OID=.;OPOS=69063984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:16:16:18:30:16:16:18:30 chr11 69462910 . G A 412.7 PASS AF=0.711538;AO=37;DP=52;FAO=37;FDP=52;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0231156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.017;QD=31.7459;RBI=0.0270228;REFB=0.020706;REVB=-0.0139964;RO=15;SAF=19;SAR=18;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13096;STB=0.570947;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.0128194;OID=.;OPOS=69462910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:15:15:37:37:0.711538:18:19:4:11:18:19:4:11 chr11 70007311 . A G 343.12 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0146584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4675;QD=18.8012;RBI=0.0381836;REFB=0.0328483;REVB=-0.0352579;RO=37;SAF=18;SAR=18;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614821;STB=0.534228;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.0340991;OID=.;OPOS=70007311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:18:18:16:21:18:18:16:21 chr11 70007392 . A G 361.73 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0120992;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.332;QD=22.6084;RBI=0.0142783;REFB=-0.0325036;REVB=-0.00758151;RO=26;SAF=18;SAR=18;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176463;STB=0.5937;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0205315;OID=.;OPOS=70007392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:26:28:36:36:0.5625:18:18:7:19:18:18:8:20 chr11 70016247 . T TG 269.44 PASS AF=0.453704;AO=38;DP=112;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0638575;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.4243;QD=9.97924;RBI=0.115772;REFB=-0.00822881;REVB=0.0965679;RO=72;SAF=23;SAR=15;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197716;STB=0.519448;STBP=0.765;TYPE=ins;VARB=0.0118264;OID=.;OPOS=70016248;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.453704:38:112:49:108:59:25:24:28:31:99:72:23:15:31:41 chr11 70757244 . GTTTTA GTATTT,GTTTA,GTTTT 767.25 PASS AF=0.0909091,0,0.909091;AO=6,7,11;DP=64;FAO=6,0,60;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,33;FSAR=6,0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573295,-0.247952,0.928555;FXX=0.0294074;HRUN=4,4,2;LEN=4,1,1;MLLD=139.231,12.7706,16.9593;QD=46.5;RBI=0.0751161,0.411788,0.928964;REFB=0,0,0;REVB=-0.074897,-0.328769,-0.0275688;RO=25;SAF=0,7,0;SAR=6,0,11;SRF=23;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.333333,0;SSSB=-0.841487,0.625336,-0.862743;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.0932025,0,0.0355816;OID=.,.,.;OPOS=70757246,70757245,70757249;OREF=TTTA,T,A;OALT=ATTT,-,-;OMAPALT=GTATTT,GTTTA,GTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.0909091,0,0.909091:6,7,11:64:6,0,60:66:0:0,0,33:6,0,27:0:0:23:25:0,7,0:6,0,11:23:2 chr11 70798902 . G T 212.34 PASS AF=0.477273;AO=2;DP=41;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0220749;FXX=0.0222173;HRUN=7;LEN=1;MLLD=127.437;QD=19.304;RBI=0.0229301;REFB=-1.06435e-05;REVB=0.00620403;RO=16;SAF=2;SAR=0;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.488772;STB=0.529383;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=1.28048e-05;OID=.;OPOS=70798902;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:44:16:23:2:21:0.477273:0:2:10:6:8:13:13:10 chr11 71184678 . A C 2497.18 PASS AF=0.987952;AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=166;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0520109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.513;QD=60.1729;RBI=0.0619315;REFB=-0.0452784;REVB=0.033621;RO=2;SAF=83;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000139861;STB=0.500073;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000295861;OID=.;OPOS=71184678;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:166:166:2:2:164:164:0.987952:81:83:1:1:81:83:1:1 chr11 71249386 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.323;QD=50.4134;RBI=0.0170493;REFB=0;REVB=-0.00955215;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42322e-05;OID=.;OPOS=71249386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr11 71260243 . T C 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00205467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.68;QD=16.8738;RBI=0.0081179;REFB=-0.00207382;REVB=-0.00785358;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12494;STB=0.571358;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00358491;OID=.;OPOS=71260243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:11:9:15:11:11:9:15:11 chr11 71260296 . G A 199.75 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0296357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3662;QD=19.9747;RBI=0.0333089;REFB=0.0150726;REVB=-0.0152056;RO=20;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449437;STB=0.525356;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.0147207;OID=.;OPOS=71260296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:9:11:12:8:9:11:12:8 chr11 71276632 . T C 60.53 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00217823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.301;QD=17.2932;RBI=0.0126012;REFB=-0.0316089;REVB=0.0124115;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325838;STB=0.6918;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00859821;OID=.;OPOS=71276632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:4:2:6:2:4:2 chr11 71277598 . A C 830.54 PASS AF=0.598425;AO=76;DP=127;FAO=76;FDP=127;FR=.;FRO=51;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0224519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.004;QD=26.1586;RBI=0.0229829;REFB=-0.0168855;REVB=0.0049116;RO=51;SAF=41;SAR=35;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217269;STB=0.5118;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0102215;OID=.;OPOS=71277598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:51:51:76:76:0.598425:35:41:29:22:35:41:29:22 chr11 71277647 . CCGCT C 211.72 PASS AF=0.56;AO=24;DP=45;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0222287;FXX=0.0565931;HRUN=2;LEN=4;MLLD=277.482;QD=16.9373;RBI=0.0241895;REFB=-0.00842509;REVB=-0.00954018;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204678;STB=0.647944;STBP=0.021;TYPE=del;VARB=0.00942551;OID=.;OPOS=71277648;OREF=CGCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.56:24:45:28:50:22:16:12:5:17:99:20:12:12:5:15 chr11 71279936 . A C 60.9 PASS AF=0.166667;AO=11;DP=64;FAO=11;FDP=66;FR=.;FRO=55;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0305801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9092;QD=3.69071;RBI=0.0867162;REFB=-0.00492812;REVB=-0.0811453;RO=53;SAF=4;SAR=7;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269444;STB=0.663665;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0187573;OID=.;OPOS=71279936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:64:66:53:55:11:11:0.166667:7:4:31:22:7:4:31:24 chr11 71318195 . G A 92.08 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0136969;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.698;QD=18.4157;RBI=0.0374044;REFB=-0.0506298;REVB=-0.0348063;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795615;STB=0.504579;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0482218;OID=.;OPOS=71318195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:20:20:7:9:11:11:0.55:5:6:3:4:5:6:5:4 chr11 71544269 . C T 243.54 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00790958;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8754;QD=12.6516;RBI=0.00832324;REFB=-0.0125373;REVB=0.00259128;RO=49;SAF=13;SAR=16;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023242;STB=0.506325;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0190465;OID=.;OPOS=71544269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:49:48:29:29:0.376623:16:13:23:26:16:13:22:26 chr11 71548465 . A G 165.83 PASS AF=0.277108;AO=23;DP=82;FAO=23;FDP=83;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.120874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.903;QD=7.99179;RBI=0.121666;REFB=0.00140159;REVB=-0.0138647;RO=59;SAF=15;SAR=8;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137583;STB=0.58944;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00136073;OID=.;OPOS=71548465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:59:60:23:23:0.277108:8:15:32:27:8:15:32:28 chr11 71548492 . C T 117.29 PASS AF=0.22619;AO=18;DP=83;FAO=19;FDP=84;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0163041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2208;QD=5.58526;RBI=0.0227895;REFB=-0.00614695;REVB=-0.0159229;RO=65;SAF=11;SAR=7;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927041;STB=0.531773;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0345295;OID=.;OPOS=71548492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:65:65:18:19:0.22619:7:11:35:30:8:11:35:30 chr11 71548520 . A T 98.96 PASS AF=0.216216;AO=16;DP=74;FAO=16;FDP=74;FR=.;FRO=58;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.000373045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=343.324;QD=5.34932;RBI=0.00880031;REFB=-0.00250629;REVB=-0.0087924;RO=58;SAF=9;SAR=7;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035169;STB=0.522156;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00812794;OID=.;OPOS=71548520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:74:74:58:58:16:16:0.216216:7:9:31:27:7:9:31:27 chr11 71548544 . A G 71.15 PASS AF=0.2;AO=11;DP=55;FAO=11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.024295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.837;QD=5.17486;RBI=0.0248378;REFB=-0.000191379;REVB=0.00516422;RO=44;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13924;STB=0.590003;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00335349;OID=.;OPOS=71548544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:55:55:44:44:11:11:0.2:5:6:19:25:5:6:19:25 chr11 71707489 . T C 641.97 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3878;QD=61.1396;RBI=0.00385912;REFB=0;REVB=0.00125326;RO=0;SAF=9;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011814;OID=.;OPOS=71707489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:32:9:0:0:32:10:0:0 chr11 71708013 . G A 786.59 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.496;QD=64.2111;RBI=0.0287171;REFB=0;REVB=0.0119523;RO=0;SAF=11;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92393e-05;OID=.;OPOS=71708013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:37:11:0:0:38:11:0:0 chr11 71714526 . G C 1256.26 PASS AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0164439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.222;QD=59.118;RBI=0.0764376;REFB=-0.15227;REVB=0.0746478;RO=2;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225409;STB=0.511902;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00041405;OID=.;OPOS=71714526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:41:42:0:2:41:42:0:2 chr11 71718298 . C T 717.8 PASS AF=0.518519;AO=70;DP=135;FAO=70;FDP=135;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.0266335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.951;QD=21.2682;RBI=0.029719;REFB=-0.016742;REVB=0.0131863;RO=65;SAF=28;SAR=42;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0153627;OID=.;OPOS=71718298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:65:65:70:70:0.518519:42:28:26:39:42:28:26:39 chr11 71939792 . CG GC 40.59 PASS AF=0.144578;AO=13;DP=83;FAO=12;FDP=83;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=0.00608791;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=28.3445;QD=1.95625;RBI=0.0925264;REFB=-0.0306093;REVB=-0.0923259;RO=59;SAF=11;SAR=2;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.629794;STB=0.937204;STBP=0.004;TYPE=mnp;VARB=0.155383;OID=.;OPOS=71939792;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:83:83:59:71:13:12:0.144578:2:11:17:42:1:11:24:47 chr11 71941212 . A G 766.44 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0740706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2084;QD=63.8698;RBI=0.0741342;REFB=0;REVB=0.00307107;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000670081;OID=.;OPOS=71941212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0 chr11 72281818 . A G 888.57 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.030215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.759;QD=56.4169;RBI=0.0303503;REFB=-0.00608438;REVB=0.00286242;RO=1;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209743;STB=0.511108;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000433848;OID=.;OPOS=72281818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:22:40:0:1:22:40:0:1 chr11 72281884 . C T 1483.67 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.773;QD=63.1348;RBI=0.0615396;REFB=0;REVB=0.00479077;RO=0;SAF=56;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335531;OID=.;OPOS=72281884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:94:0:0:92:94:1:36:56:0:0:36:58:0:0 chr11 72287350 . A G 313.34 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0304522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.366;QD=50.1336;RBI=0.0398121;REFB=-0.165082;REVB=0.025645;RO=1;SAF=1;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197387;STB=0.510629;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00215755;OID=.;OPOS=72287350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:23:1:0:1:23:1:0:1 chr11 72291927 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.486;QD=55.0985;RBI=0.0501145;REFB=0;REVB=0.0375813;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11764e-05;OID=.;OPOS=72291927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0 chr11 72293602 . A G 940.39 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00172148;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.841;QD=58.7744;RBI=0.0673407;REFB=0;REVB=0.0673187;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139023;OID=.;OPOS=72293602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0 chr11 72295502 . T C 1524.95 PASS AF=1;AO=101;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143182;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.721;QD=59.8018;RBI=0.0157191;REFB=0;REVB=-0.00648677;RO=0;SAF=29;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16949e-05;OID=.;OPOS=72295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:101:102:1:72:29:0:0:72:30:0:0 chr11 72295906 . A G 611.32 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.891;QD=59.6411;RBI=0.0619174;REFB=0;REVB=0.015581;RO=1;SAF=15;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302234;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109235;OID=.;OPOS=72295906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:1:0:39:41:1:24:15:1:0:24:17:0:0 chr11 72408055 . G C 205.09 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0125326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.529;QD=16.4072;RBI=0.0143871;REFB=-0.0187812;REVB=0.00706543;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635824;STB=0.536364;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0266118;OID=.;OPOS=72408055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:17:12:10:11:17:12 chr11 72409068 . G A 276.16 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00451541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.965;QD=16.0093;RBI=0.0113147;REFB=-0.0124266;REVB=0.0103747;RO=36;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645122;STB=0.520137;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0150276;OID=.;OPOS=72409068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:38:31:31:0.449275:16:15:15:21:16:15:17:21 chr11 72532569 . G T 613.27 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2404;QD=61.3269;RBI=0.0633902;REFB=0;REVB=0.0206162;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000959603;OID=.;OPOS=72532569;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0 chr11 72532621 . T G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.081;QD=59.4356;RBI=0.0221682;REFB=0;REVB=0.0136123;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14821e-05;OID=.;OPOS=72532621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr11 72532708 . C T 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330324;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.678;QD=58.1421;RBI=0.0337635;REFB=0;REVB=0.00698781;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82219e-05;OID=.;OPOS=72532708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0 chr11 72945341 . C T 2054.47 PASS AF=0.964286;AO=135;DP=140;FAO=135;FDP=140;FR=.;FRO=5;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00670934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8903;QD=58.699;RBI=0.00679431;REFB=-0.0291174;REVB=-0.00107115;RO=5;SAF=64;SAR=71;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221369;STB=0.511656;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00873885;OID=.;OPOS=72945341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:140:140:5:5:135:135:0.964286:71:64:4:1:71:64:4:1 chr11 72946020 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.945;QD=53.9112;RBI=0.0652633;REFB=0;REVB=0.00887792;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038321;OID=.;OPOS=72946020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr11 73441772 . A C 508.39 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00455817;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=248.824;QD=56.4877;RBI=0.0107036;REFB=-0.0198476;REVB=0.00968458;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283378;STB=0.515143;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000224881;OID=.;OPOS=73441772;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:16:19:0:1:16:19:0:1 chr11 73543621 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.263;QD=62.3509;RBI=0.0574805;REFB=0;REVB=0.0452176;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378419;OID=.;OPOS=73543621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0 chr11 73620537 . C G 1731.53 PASS AF=0.966942;AO=117;DP=121;FAO=117;FDP=121;FR=.;FRO=4;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.000643162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0093;QD=57.2408;RBI=0.0527733;REFB=0.0202542;REVB=-0.0527694;RO=4;SAF=58;SAR=59;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000268068;STB=0.500141;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00560053;OID=.;OPOS=73620537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:121:121:4:4:117:117:0.966942:59:58:2:2:59:58:2:2 chr11 73670645 . T C 1475.36 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00730256;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.474;QD=63.4562;RBI=0.0127857;REFB=0;REVB=0.0104951;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22679e-05;OID=.;OPOS=73670645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0 chr11 73689104 . G A 834.15 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3382;QD=57.5278;RBI=0.048277;REFB=0;REVB=0.0253727;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574876;OID=.;OPOS=73689104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0 chr11 73715542 . G A 623.65 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.162;QD=59.3953;RBI=0.0321823;REFB=-0.0940611;REVB=0.0286043;RO=1;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218198;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000907879;OID=.;OPOS=73715542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:42:42:1:0:41:42:1:21:20:0:1:22:20:0:0 chr11 73717254 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00468413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.594;QD=62.3507;RBI=0.032942;REFB=0;REVB=0.0326073;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001631;OID=.;OPOS=73717254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr11 73785326 . T C 1097.63 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000923795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.814;QD=60.1441;RBI=0.0267428;REFB=0;REVB=0.0267269;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90946e-05;OID=.;OPOS=73785326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0 chr11 73806443 . C T 641.46 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.034;QD=61.0919;RBI=0.0457044;REFB=0;REVB=-0.0245795;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379398;OID=.;OPOS=73806443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:25:16:0:0:25:17:0:0 chr11 73825503 . T C 2065.26 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.039;QD=62.5837;RBI=0.0315069;REFB=0;REVB=0.028012;RO=0;SAF=57;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76815e-05;OID=.;OPOS=73825503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:132:0:0:131:132:1:74:57:0:0:75:57:0:0 chr11 73978243 . G A 1212.61 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00390478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.487;QD=59.8819;RBI=0.0243596;REFB=-0.0658474;REVB=0.0240446;RO=1;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114082;STB=0.506023;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000546665;OID=.;OPOS=73978243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:41:39:0:1:41:39:0:1 chr11 73988167 . C T 1370.24 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215945;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.792;QD=62.2836;RBI=0.0217268;REFB=0;REVB=-0.00239347;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.88017e-05;OID=.;OPOS=73988167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:87:88:1:42:45:0:0:43:45:0:0 chr11 74043707 . AGT AAT,AT,ATA 758.07 PASS AF=0.959184,0,0.0408163;AO=31,12,3;DP=49;FAO=47,0,2;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0,2;FSAR=24,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0781127,0.0293534,0.0367549;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=126.636,117.855,104.505;QD=61.8834;RBI=0.0823806,0.0388225,0.0436452;REFB=0,0,0;REVB=0.0261718,0.0254079,0.0235369;RO=0;SAF=16,7,2;SAR=15,5,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.00134874,-0.0204834,-0.0411203;OID=.,.,.;OPOS=74043708,74043708,74043708;OREF=G,G,GT;OALT=A,-,TA;OMAPALT=AAT,AT,ATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.959184,0,0.0408163:31,12,3:49:47,0,2:49:0:23,0,2:24,0,0:0:0:7:0:16,7,2:15,5,1:0:0 chr11 74046975 . C T 1268.73 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00325272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.344;QD=60.4159;RBI=0.0038911;REFB=-0.114973;REVB=0.00213553;RO=1;SAF=49;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137257;STB=0.507245;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-7.34186e-06;OID=.;OPOS=74046975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:34:49:0:1:34:49:0:1 chr11 74049569 . A G 1587.8 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00132944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.346;QD=64.1536;RBI=0.00476264;REFB=0;REVB=0.00457333;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77002e-05;OID=.;OPOS=74049569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:98:99:1:42:56:0:0:42:57:0:0 chr11 74053547 . C T 1422.67 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00749551;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.786;QD=63.2298;RBI=0.00794345;REFB=0;REVB=0.00262979;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.53503e-05;OID=.;OPOS=74053547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:49:41:0:0:49:41:0:0 chr11 74109166 . A G 105.82 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0237836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.108;QD=11.4396;RBI=0.0238609;REFB=-0.0260962;REVB=-0.00191905;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143377;STB=0.584621;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0391982;OID=.;OPOS=74109166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:16:8:6:7:16:8 chr11 74110353 . A G 176.28 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00501051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.685;QD=20.7388;RBI=0.00731669;REFB=-0.00505569;REVB=0.00533187;RO=15;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221291;STB=0.612117;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00818311;OID=.;OPOS=74110353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:12:6:9:6:12:6:9:7 chr11 74167409 . T C 224.9 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0437997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4028;QD=19.9911;RBI=0.0844353;REFB=0.0235153;REVB=-0.0721866;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177586;STB=0.599911;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.0257724;OID=.;OPOS=74167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:12:10:15:8:12:10:15:8 chr11 74168411 . A G 213.51 PASS AF=0.44898;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0949874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3901;QD=17.4291;RBI=0.101615;REFB=0.000279954;REVB=0.0360968;RO=27;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682584;STB=0.526292;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.0012226;OID=.;OPOS=74168411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:27:27:21:22:0.44898:10:11:16:11:10:12:16:11 chr11 74203308 . T A 379.32 PASS AF=0.642857;AO=36;DP=56;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0175987;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6218;QD=27.0939;RBI=0.0249759;REFB=-0.0774332;REVB=0.0177223;RO=20;SAF=20;SAR=16;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692441;STB=0.537828;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0318865;OID=.;OPOS=74203308;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:20:20:36:36:0.642857:16:20:9:11:16:20:9:11 chr11 74204269 . T G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.158;QD=59.8393;RBI=0.0540558;REFB=0;REVB=0.0490213;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200944;OID=.;OPOS=74204269;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0 chr11 74208029 . C T 485.31 PASS AF=0.477064;AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0688162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.257;QD=17.8095;RBI=0.0722624;REFB=-0.0128624;REVB=-0.0220497;RO=57;SAF=28;SAR=24;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114905;STB=0.50638;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0148621;OID=.;OPOS=74208029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:57:57:52:52:0.477064:24:28:30:27:24:28:30:27 chr11 74208214 . G A 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0192277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.985;QD=16.6273;RBI=0.0203056;REFB=-0.003933;REVB=-0.0065278;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985294;STB=0.556731;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00342765;OID=.;OPOS=74208214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:8:6:7:6:8:6 chr11 74208592 . G T 248.14 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0247933;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7446;QD=23.6319;RBI=0.0387842;REFB=-0.00539271;REVB=-0.0298246;RO=21;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195315;STB=0.58434;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00289386;OID=.;OPOS=74208592;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:42:21:19:23:23:0.547619:8:15:9:12:8:15:9:10 chr11 74278090 . C T 623.81 PASS AF=0.419162;AO=70;DP=166;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=50;FSRR=47;FWDB=-0.00877735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.806;QD=14.9414;RBI=0.0178143;REFB=-0.0164805;REVB=-0.0155019;RO=96;SAF=36;SAR=34;SRF=49;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00400016;STB=0.500685;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0234532;OID=.;OPOS=74278090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:96:97:70:70:0.419162:34:36:49:47:34:36:50:47 chr11 74278176 . C T 358.36 PASS AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0611067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5125;QD=17.065;RBI=0.0655731;REFB=-0.0163353;REVB=-0.0237865;RO=46;SAF=18;SAR=20;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168223;STB=0.509429;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0236925;OID=.;OPOS=74278176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:20:18:21:25:20:18:21:25 chr11 74329615 . T C 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.000676387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.821;QD=20.0175;RBI=0.0298772;REFB=-0.00827677;REVB=0.0298695;RO=17;SAF=15;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506536;STB=0.789125;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00568984;OID=.;OPOS=74329615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:3:15:5:12:3:15:5:12 chr11 74396330 . C T 729.01 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.127;QD=57.1771;RBI=0.0124491;REFB=0;REVB=0.0111481;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10017e-05;OID=.;OPOS=74396330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:16:34:0:0:17:34:0:0 chr11 74413872 . A G 223.23 PASS AF=0.329412;AO=28;DP=85;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0509811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8829;QD=10.5048;RBI=0.0860392;REFB=0.0179791;REVB=-0.0693086;RO=57;SAF=13;SAR=15;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912785;STB=0.553189;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.0374926;OID=.;OPOS=74413872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:57:57:28:28:0.329412:15:13:31:26:15:13:31:26 chr11 74419357 . C T 368.97 PASS AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00395499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0397;QD=22.3616;RBI=0.00477054;REFB=-0.027235;REVB=0.00266759;RO=29;SAF=20;SAR=17;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367675;STB=0.520254;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0252304;OID=.;OPOS=74419357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:17:20:17:12:17:20:17:12 chr11 74429871 . T A 173.26 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.042972;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.227;QD=17.7698;RBI=0.0556607;REFB=-0.0110556;REVB=-0.0353768;RO=21;SAF=3;SAR=15;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172758;STB=0.599877;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0197231;OID=.;OPOS=74429871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:21:21:18:18:0.461538:15:3:6:15:15:3:6:15 chr11 74546905 . G A 417.74 PASS AF=0.639344;AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00780766;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.055;QD=27.3927;RBI=0.0200199;REFB=-0.0405993;REVB=0.0184347;RO=25;SAF=20;SAR=19;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337159;STB=0.504623;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0211591;OID=.;OPOS=74546905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:61:25:22:39:39:0.639344:19:20:14:11:19:20:11:11 chr11 74553074 . C T 358.09 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0156966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2024;QD=22.3808;RBI=0.0532741;REFB=-0.0145719;REVB=-0.0509092;RO=28;SAF=16;SAR=20;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416698;STB=0.522956;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00709469;OID=.;OPOS=74553074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:20:16:11:17:20:16:11:17 chr11 74660631 . G A 229.43 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.00435388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.429;QD=14.1189;RBI=0.0043754;REFB=-0.00325939;REVB=-0.000433427;RO=38;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144698;STB=0.582031;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00447626;OID=.;OPOS=74660631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:14:13:13:25:14:13:13:25 chr11 74679321 . G A 85.03 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0725733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.295;QD=22.6747;RBI=0.0739067;REFB=-0.032084;REVB=-0.0139754;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295997;STB=0.666369;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00242148;OID=.;OPOS=74679321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:5:0:5:5:5:0 chr11 74705696 . T C 180.05 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0121216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.676;QD=23.2316;RBI=0.019244;REFB=-0.045489;REVB=-0.0149466;RO=13;SAF=5;SAR=13;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274539;STB=0.515401;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0344312;OID=.;OPOS=74705696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:13:5:4:9:13:5:4:9 chr11 74862391 . A G 306.24 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.825;QD=53.2592;RBI=0.0566286;REFB=0;REVB=-0.0451944;RO=0;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.31797e-05;OID=.;OPOS=74862391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:3:20:0:0:3:20:0:0 chr11 74904362 . T C 1480.56 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0564271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.065;QD=63.0025;RBI=0.0645969;REFB=0;REVB=0.0314441;RO=0;SAF=54;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.96098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40959e-05;OID=.;OPOS=74904362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:39:54:0:0:40:54:0:0 chr11 74907582 . C T 1143.48 PASS AF=0.518349;AO=109;DP=215;FAO=113;FDP=218;FR=.;FRO=105;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=0.00937991;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.061;QD=20.9813;RBI=0.0249514;REFB=-0.0143442;REVB=0.0231212;RO=106;SAF=49;SAR=60;SRF=48;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298511;STB=0.507145;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0132435;OID=.;OPOS=74907582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:218:106:105:109:113:0.518349:60:49:48:58:63:50:48:57 chr11 74977067 . C T 289.44 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0150793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.678;QD=25.728;RBI=0.0157406;REFB=-0.0101201;REVB=-0.00451454;RO=19;SAF=9;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103221;STB=0.557332;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00843343;OID=.;OPOS=74977067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:17:9:9:10:17:9:9:10 chr11 74977087 . GGCC G,GGC,GG 339.62 PASS AF=0.027027,0.486486,0.486486;AO=8,15,9;DP=40;FAO=1,18,18;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4,7;FSAR=1,14,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111941,0.212506,0.115729;FXX=0.0749813;HRUN=4,5,5;LEN=3,1,2;MLLD=19.1011,12.8649,18.4824;QD=36.7157;RBI=0.112329,0.254108,0.135683;REFB=-0.0459103,-0.030063,-0.0474009;REVB=-0.00932787,0.139328,0.0708284;RO=2;SAF=0,4,6;SAR=8,11,3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.30137,0.30137;SSSB=-0.793829,-0.0615517,0.0586432;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0382338,0.0146043,0.0229469;OID=.,.,.;OPOS=74977088,74977089,74977089;OREF=GCC,C,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=G,GGC,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0.027027,0.486486,0.486486:8,15,9:40:1,18,18:37:0:0,4,7:1,14,11:0:0:72:2:0,4,6:8,11,3:1:1 chr11 74994411 . C T 222.38 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00154078;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.943;QD=18.1533;RBI=0.00302104;REFB=-0.00562437;REVB=-0.00259859;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150844;STB=0.587705;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00782623;OID=.;OPOS=74994411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:25:27:22:22:0.44898:14:8:13:12:14:8:14:13 chr11 74995350 . C T 215.85 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0250939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.193;QD=15.1475;RBI=0.0312672;REFB=-0.0132594;REVB=0.0186531;RO=31;SAF=19;SAR=6;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.482291;STB=0.766131;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.041865;OID=.;OPOS=74995350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:31:32:25:25:0.438596:6:19:8:23:6:19:9:23 chr11 75110576 . G A 207.31 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-2.00508e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.709;QD=24.3898;RBI=0.000470167;REFB=-0.0364968;REVB=0.00046974;RO=14;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370888;STB=0.520689;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0232267;OID=.;OPOS=75110576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:9:11:7:7:9:11:7:7 chr11 75115214 . C T 178.21 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00497407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.794;QD=14.8511;RBI=0.0148472;REFB=-0.0116876;REVB=-0.0139892;RO=28;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156503;STB=0.583241;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0240526;OID=.;OPOS=75115214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:29:19:19:0.395833:14:5:11:17:14:5:11:18 chr11 75145952 . A G 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.056;QD=57.1062;RBI=0.0170665;REFB=0;REVB=0.00336909;RO=0;SAF=43;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98168e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55488e-05;OID=.;OPOS=75145952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:12:43:0:0:12:43:0:0 chr11 75152243 . C T 381.71 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0097117;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.411;QD=56.549;RBI=0.0329601;REFB=0;REVB=0.0314968;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000664593;OID=.;OPOS=75152243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0 chr11 75160575 . G A 2492.89 PASS AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.575;QD=61.5529;RBI=0.0440434;REFB=0;REVB=0.0439315;RO=0;SAF=99;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5119e-05;OID=.;OPOS=75160575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:63:99:0:0:63:99:0:0 chr11 75167793 . G A 222.7 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0213814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2126;QD=12.5465;RBI=0.0420449;REFB=0.00657645;REVB=0.0362023;RO=44;SAF=17;SAR=10;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118928;STB=0.568449;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.00662027;OID=.;OPOS=75167793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:10:17:23:21:10:17:23:21 chr11 75277628 . A G 668.3 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.905;QD=62.1677;RBI=0.0374907;REFB=0;REVB=0.0333505;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76644e-05;OID=.;OPOS=75277628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:29:12:0:0:31:12:0:0 chr11 75277992 . C T 278.87 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00678973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.919;QD=21.8719;RBI=0.00868212;REFB=-0.0171835;REVB=-0.00541098;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529508;STB=0.529391;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0120933;OID=.;OPOS=75277992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:14:14:13:10:14:14:13:10 chr11 76115231 . G A 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00140914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.47;QD=19.3695;RBI=0.067711;REFB=0.00865646;REVB=-0.0676963;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589001;STB=0.533293;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00812511;OID=.;OPOS=76115231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:4:12:12:3:4:12:12:3 chr11 76183722 . A G 378.85 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.000926901;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.673;QD=16.2945;RBI=0.0114706;REFB=-0.00848338;REVB=0.0114331;RO=50;SAF=24;SAR=16;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609562;STB=0.541829;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0110391;OID=.;OPOS=76183722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:50:53:40:40:0.430108:16:24:27:23:16:24:28:25 chr11 76207633 . G A 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.276;QD=57.0006;RBI=0.00898673;REFB=0;REVB=0.00413497;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.93492e-05;OID=.;OPOS=76207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0 chr11 76368553 . A G 1044.34 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8329;QD=59.6763;RBI=0.0328193;REFB=0;REVB=-0.0125163;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167658;OID=.;OPOS=76368553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:42:28:0:0:42:28:0:0 chr11 76368639 . A C 480.77 PASS AF=0.6;AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=75;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.010418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.38;QD=25.6409;RBI=0.0175472;REFB=-0.025786;REVB=-0.0141199;RO=30;SAF=16;SAR=29;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15968;STB=0.587437;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0148004;OID=.;OPOS=76368639;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:30:30:45:45:0.6:29:16:17:13:29:16:17:13 chr11 76370792 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.426;QD=60.6103;RBI=0.0345105;REFB=0;REVB=-0.000871874;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113892;OID=.;OPOS=76370792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:19:19:0:0 chr11 76372052 . A G 93.39 PASS AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=-0.0355741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0191;QD=9.83008;RBI=0.0401187;REFB=-0.00201291;REVB=-0.018547;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259522;STB=0.651965;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00151909;OID=.;OPOS=76372052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:4:8:22:4:4:8:22:4 chr11 76372418 . T C 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.007241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2144;QD=18.2505;RBI=0.0740585;REFB=0.00406792;REVB=0.0737037;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598629;STB=0.5342;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.00151665;OID=.;OPOS=76372418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:9:6:7:8:9:6:7:8 chr11 76405613 . C T 388.31 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0189462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.956;QD=21.2775;RBI=0.0190585;REFB=0.00338609;REVB=-0.00206607;RO=34;SAF=25;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733913;STB=0.54062;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.00407705;OID=.;OPOS=76405613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:14:25:19:15:14:25:19:15 chr11 76415209 . G A 266.41 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.078913;FXX=0.0285673;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.3381;QD=15.6714;RBI=0.0887379;REFB=-0.0120959;REVB=0.0405852;RO=38;SAF=17;SAR=13;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168965;STB=0.595268;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.017154;OID=.;OPOS=76415209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:38:38:30:30:0.441176:13:17:15:23:13:17:15:23 chr11 76418737 . A G 146.32 PASS AF=0.457143;AO=17;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0941308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.418;QD=16.7225;RBI=0.0944982;REFB=-0.0217619;REVB=0.0083254;RO=18;SAF=11;SAR=6;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41417;STB=0.714041;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0227985;OID=.;OPOS=76418737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:19:17:16:0.457143:6:11:3:15:6:10:4:15 chr11 76427674 . G C 220.44 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0023064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.216;QD=24.493;RBI=0.0144051;REFB=-0.0383445;REVB=0.0142193;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289103;STB=0.516114;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0344592;OID=.;OPOS=76427674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:12:9:7:8:12:9:7:8 chr11 76427823 . T C 272.69 PASS AF=0.555556;AO=22;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0370342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5532;QD=24.2393;RBI=0.0439742;REFB=-0.018085;REVB=0.0237108;RO=18;SAF=14;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217906;STB=0.504501;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00574958;OID=.;OPOS=76427823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:20:22:25:0.555556:8:14:11:7:11:14:11:9 chr11 76430585 . C T 179.63 PASS AF=0.475;AO=18;DP=39;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0392517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6223;QD=17.9625;RBI=0.10714;REFB=-0.0348709;REVB=0.0996904;RO=19;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227404;STB=0.607885;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0134956;OID=.;OPOS=76430585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:19:21:18:19:0.475:6:12:8:11:7:12:9:12 chr11 76430597 . A G 211.72 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0105428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.393;QD=19.6947;RBI=0.0130528;REFB=0.00874704;REVB=0.00769579;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313206;STB=0.676756;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0206472;OID=.;OPOS=76430597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:7:14:7:15:7:14:7:15 chr11 76507692 . T A 1984.07 PASS AF=0.977612;AO=127;DP=132;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0368377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0715;QD=59.2261;RBI=0.0418329;REFB=-0.0185901;REVB=0.0198237;RO=3;SAF=49;SAR=78;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179233;STB=0.509201;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00668101;OID=.;OPOS=76507692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:132:134:3:3:127:131:0.977612:78:49:0:3:80:51:0:3 chr11 76637651 . G A 464.92 PASS AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0186119;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.352;QD=19.172;RBI=0.0186171;REFB=0.00244049;REVB=-0.000438401;RO=51;SAF=23;SAR=23;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463053;STB=0.525762;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.0076529;OID=.;OPOS=76637651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:23:23:23:28:23:23:23:28 chr11 76637680 . G A 464.15 PASS AF=0.511111;AO=36;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0823966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.319;QD=20.6288;RBI=0.082402;REFB=0.00249687;REVB=0.00093862;RO=44;SAF=14;SAR=22;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436924;STB=0.522784;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00750553;OID=.;OPOS=76637680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:44:36:46:0.511111:22:14:19:25:24:22:19:25 chr11 76687399 . A C 315.98 PASS AF=0.363636;AO=36;DP=99;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=0.00386892;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.367;QD=12.7666;RBI=0.0065235;REFB=0.00121891;REVB=-0.00525237;RO=62;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154667;STB=0.592707;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00213065;OID=.;OPOS=76687399;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:62:63:36:36:0.363636:17:19:24:38:17:19:24:39 chr11 76701606 . G A 260.45 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00476475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.871;QD=14.4696;RBI=0.00615526;REFB=-0.0230195;REVB=-0.00389671;RO=42;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14138;STB=0.580205;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0220664;OID=.;OPOS=76701606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:13:17:18:24:13:17:18:24 chr11 76709795 . G A 87.38 PASS AF=0.21875;AO=14;DP=64;FAO=14;FDP=64;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0130458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.461;QD=5.46123;RBI=0.0235263;REFB=-0.00993168;REVB=-0.0195779;RO=50;SAF=9;SAR=5;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248821;STB=0.656857;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0471836;OID=.;OPOS=76709795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:64:64:50:50:14:14:0.21875:5:9:22:28:5:9:22:28 chr11 76732308 . G A 447.95 PASS AF=0.573333;AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0038551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.148;QD=23.8907;RBI=0.00385551;REFB=0.0184308;REVB=5.63623e-05;RO=25;SAF=20;SAR=23;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0907757;STB=0.541492;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.0100535;OID=.;OPOS=76732308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:25:32:43:43:0.573333:23:20:15:10:23:20:18:14 chr11 76732949 . T C 151.15 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0125913;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=112.345;QD=20.1536;RBI=0.0223334;REFB=0.00522849;REVB=0.0184455;RO=14;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117832;STB=0.566585;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00227513;OID=.;OPOS=76732949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:8:8:5:9:8:8:5:9 chr11 76733024 . A G 116.21 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0228593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.922;QD=20.2097;RBI=0.0262818;REFB=-0.0127805;REVB=0.0129687;RO=10;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206183;STB=0.616272;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00821608;OID=.;OPOS=76733024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:7:6:2:8:7:6:2:8 chr11 76751541 . CT C 242.07 PASS AF=1;AO=22;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.089292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.6988;QD=40.3447;RBI=0.126619;REFB=0;REVB=-0.0897738;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00775096;OID=.;OPOS=76751542;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:22:24:24:24:0:14:10:0:0:5:0:14:8:0:0 chr11 76751584 . CT C,CG 734.66 PASS AF=1,0;AO=51,2;DP=53;FAO=53,0;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000714004,0.00135845;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=264.027,240.26;QD=55.446;RBI=0.0350481,0.0708137;REFB=0,0;REVB=-0.0350409,-0.0708007;RO=0;SAF=34,0;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000353369,0.0567925;OID=.,.;OPOS=76751585,76751585;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:51,2:53:53,0:53:0:34,0:19,0:0:0:4:0:34,0:17,2:0:0 chr11 76751587 . G A 185.58 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=0.00236163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.0893;QD=13.7469;RBI=0.0384261;REFB=-0.00914455;REVB=0.0383534;RO=32;SAF=11;SAR=11;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26107;STB=0.648025;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0390296;OID=.;OPOS=76751587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:11:11:24:8:11:11:24:8 chr11 76751603 . CT C 894.6 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0757569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.6855;QD=49.019;RBI=0.105782;REFB=0;REVB=-0.0738296;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00270345;OID=.;OPOS=76751604;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:72:73:73:73:0:45:28:0:0:16:0:44:28:0:0 chr11 76799004 . T C 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00123852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.234;QD=62.9822;RBI=0.0427625;REFB=0;REVB=0.0427446;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29817e-05;OID=.;OPOS=76799004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0 chr11 76836864 . G A 1017.42 PASS AF=0.521277;AO=98;DP=188;FAO=98;FDP=188;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=40;FSRR=50;FWDB=-0.00105544;FXX=0.00529073;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.135;QD=21.6472;RBI=0.00780971;REFB=-0.0160466;REVB=-0.00773806;RO=89;SAF=43;SAR=55;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0093965;STB=0.502753;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0138643;OID=.;OPOS=76836864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:89:90:98:98:0.521277:55:43:40:49:55:43:40:50 chr11 76853783 . T C 707.31 PASS AF=0.929825;AO=53;DP=57;FAO=53;FDP=57;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0290027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.81;QD=49.6356;RBI=0.0353562;REFB=-0.0221749;REVB=0.0202213;RO=4;SAF=14;SAR=39;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391827;STB=0.52086;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00318605;OID=.;OPOS=76853783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:57:57:4:4:53:53:0.929825:39:14:2:2:39:14:2:2 chr11 76917220 . A G 193.74 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0163899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0773;QD=16.145;RBI=0.0219562;REFB=-0.0110363;REVB=0.0146097;RO=26;SAF=3;SAR=17;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542165;STB=0.801554;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00842068;OID=.;OPOS=76917220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:28:20:20:0.416667:17:3:17:9:17:3:17:11 chr11 76919478 . C A 190.27 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0315292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.887;QD=21.7452;RBI=0.0318002;REFB=-0.0282678;REVB=0.0041427;RO=16;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00309739;STB=0.50174;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0125093;OID=.;OPOS=76919478;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:6:13:11:5:6:13:11:5 chr11 76922946 . G A 243.06 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00352871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.614;QD=22.61;RBI=0.0400796;REFB=-0.0141542;REVB=0.039924;RO=19;SAF=9;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194543;STB=0.597476;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00813464;OID=.;OPOS=76922946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:19:20:23:23:0.534884:14:9:12:7:14:9:12:8 chr11 76923017 . G A 272.77 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.015732;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.4;QD=24.2458;RBI=0.0224929;REFB=-0.0167865;REVB=0.0160759;RO=20;SAF=9;SAR=16;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232795;STB=0.629592;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0161316;OID=.;OPOS=76923017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:16:9:13:7:16:9:13:7 chr11 76928025 . A G 860.29 PASS AF=0.54902;AO=84;DP=153;FAO=84;FDP=153;FR=.;FRO=69;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.00600418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.718;QD=22.4912;RBI=0.0094714;REFB=-0.0170743;REVB=0.00732511;RO=69;SAF=42;SAR=42;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778198;STB=0.542474;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.01373;OID=.;OPOS=76928025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:69:69:84:84:0.54902:42:42:28:41:42:42:28:41 chr11 76928149 . A G 2966.91 PASS AF=0.97449;AO=191;DP=196;FAO=191;FDP=196;FR=.;FRO=5;FSAF=66;FSAR=125;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0161458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.314;QD=60.5492;RBI=0.0168312;REFB=-0.0335421;REVB=0.00475403;RO=4;SAF=66;SAR=125;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00413024;STB=0.501534;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00031128;OID=.;OPOS=76928149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:196:196:4:5:191:191:0.97449:125:66:1:3:125:66:2:3 chr11 77377868 . A T 358.34 PASS AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0192331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.91;QD=17.0636;RBI=0.0235589;REFB=-0.0143198;REVB=-0.0136055;RO=46;SAF=19;SAR=19;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849838;STB=0.547594;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0187646;OID=.;OPOS=77377868;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:19:19:19:27:19:19:19:27 chr11 77614592 . C T 30.11 PASS AF=0.0808081;AO=8;DP=98;FAO=8;FDP=99;FR=.;FRO=91;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.0118907;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.32;QD=1.21675;RBI=0.0163513;REFB=-0.00888666;REVB=-0.0112239;RO=89;SAF=2;SAR=6;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328971;STB=0.774949;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0549607;OID=.;OPOS=77614592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:98:99:89:91:8:8:0.0808081:6:2:49:40:6:2:51:40 chr11 77629132 . A AT 58.43 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00445037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.8028;QD=12.9846;RBI=0.0411507;REFB=-0.0229484;REVB=0.0409093;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119124;STB=0.571247;STBP=0.579;TYPE=ins;VARB=0.0330199;OID=.;OPOS=77629133;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.444444:8:18:8:18:10:3:5:5:5:58:10:3:5:5:5 chr11 77734209 . T C 638.76 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.078;QD=59.4195;RBI=0.0323729;REFB=-0.0775137;REVB=-0.0245459;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218287;STB=0.511622;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000484033;OID=.;OPOS=77734209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:21:21:1:0:21:21:1:0 chr11 77790653 . T C 1788.12 PASS AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.021335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.114;QD=60.1049;RBI=0.0343105;REFB=0.00501278;REVB=-0.0268707;RO=1;SAF=54;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736387;STB=0.503875;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.000121435;OID=.;OPOS=77790653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:119:1:1:118:118:0.991597:64:54:0:1:64:54:0:1 chr11 77920563 . G T 295.38 PASS AF=0.55102;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00101725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.797;QD=24.1123;RBI=0.0203401;REFB=-0.0108128;REVB=0.0203147;RO=21;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149145;STB=0.580684;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00924315;OID=.;OPOS=77920563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:21:22:26:27:0.55102:17:9:11:10:17:10:12:10 chr11 77920863 . C A 130.68 PASS AF=0.565217;AO=8;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0869694;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=31.1865;QD=22.7269;RBI=0.136286;REFB=-0.0215562;REVB=0.10493;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21129;STB=0.631952;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00342172;OID=.;OPOS=77920863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:23:23:6:8:8:13:0.565217:2:6:3:3:2:11:5:3 chr11 77920930 . A G 159.83 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.004472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.741;QD=26.6374;RBI=0.0813747;REFB=-0.0421327;REVB=0.0812518;RO=8;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817028;STB=0.545399;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0178534;OID=.;OPOS=77920930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:6:10:6:2:6:10:6:2 chr11 77921527 . G C 281.66 PASS AF=0.508197;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0222495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.284;QD=18.4697;RBI=0.0229438;REFB=-0.0165892;REVB=-0.00560146;RO=29;SAF=11;SAR=19;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106386;STB=0.574536;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0151992;OID=.;OPOS=77921527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:29:30:30:31:0.508197:19:11:14:15:20:11:15:15 chr11 77928185 . C CATTA 306.63 PASS AF=0.471429;AO=29;DP=72;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0125132;FXX=0.0540468;HRUN=1;LEN=4;MLLD=273.611;QD=17.5216;RBI=0.0148635;REFB=-0.0410686;REVB=0.00802147;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532392;STB=0.508639;STBP=0.898;TYPE=ins;VARB=0.043813;OID=.;OPOS=77928186;OREF=-;OALT=ATTA;OMAPALT=CATTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.471429:29:72:33:70:37:13:20:14:23:99:37:10:19:11:26 chr11 77930138 . T C 218.99 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0088537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.774;QD=23.6747;RBI=0.024683;REFB=-0.0320511;REVB=0.0230404;RO=15;SAF=16;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205263;STB=0.634008;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.019936;OID=.;OPOS=77930138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:16:21:21:0.567568:5:16:8:7:5:16:8:8 chr11 77930345 . T C 374.2 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0197894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.412;QD=23.3876;RBI=0.0201966;REFB=-0.011295;REVB=-0.00403497;RO=27;SAF=17;SAR=20;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453954;STB=0.524965;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0128231;OID=.;OPOS=77930345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:20:17:14:13:20:17:14:13 chr11 77936166 . A G 128.03 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0138886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.294;QD=20.4854;RBI=0.0315626;REFB=-0.00166178;REVB=0.0283427;RO=11;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910022;STB=0.55165;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00148441;OID=.;OPOS=77936166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:8:6:6:5:8:6:6:5 chr11 77937687 . G A 66.24 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0241116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1355;QD=12.0444;RBI=0.0938717;REFB=-0.00271514;REVB=0.0907222;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392213;STB=0.727732;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00530033;OID=.;OPOS=77937687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:5:4:11:2:5:4:11:2 chr11 77937800 . G A 732.38 PASS AF=0.681319;AO=45;DP=90;FAO=62;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0834097;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.894;QD=32.1923;RBI=0.0834098;REFB=-0.0134528;REVB=8.08385e-05;RO=28;SAF=6;SAR=39;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295506;STB=0.514303;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00774142;OID=.;OPOS=77937800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:28:29:45:62:0.681319:39:6:11:17:41:21:11:18 chr11 78277277 . A G 186.09 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0255354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.78;QD=10.4841;RBI=0.0314006;REFB=-0.0113708;REVB=-0.018274;RO=47;SAF=11;SAR=13;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111172;STB=0.506488;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0225895;OID=.;OPOS=78277277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:13:11:22:25:13:11:22:25 chr11 78279790 . T G 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0012359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.951;QD=16.7315;RBI=0.0118863;REFB=0.00140463;REVB=-0.0118219;RO=36;SAF=7;SAR=24;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194233;STB=0.610093;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00119786;OID=.;OPOS=78279790;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:24:7:14:22:24:7:14:22 chr11 78290350 . G A 323.59 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00943343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.546;QD=16.8099;RBI=0.0175077;REFB=-0.00662763;REVB=-0.0147489;RO=42;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023711;STB=0.5133;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0084323;OID=.;OPOS=78290350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:15:20:25:17:15:20:25:17 chr11 78364513 . A G 349.87 PASS AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.00818606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.541;QD=15.2117;RBI=0.00819274;REFB=0.00821768;REVB=-0.000330645;RO=54;SAF=22;SAR=16;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442175;STB=0.525016;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=-0.010616;OID=.;OPOS=78364513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:54:38:38:0.413043:16:22:29:25:16:22:29:25 chr11 78372536 . G A 691.91 PASS AF=0.422222;AO=76;DP=180;FAO=76;FDP=180;FR=.;FRO=104;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=57;FSRR=47;FWDB=0.0190322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.239;QD=15.3757;RBI=0.0203135;REFB=-0.0224044;REVB=0.00710025;RO=104;SAF=30;SAR=46;SRF=57;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159451;STB=0.589199;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0329604;OID=.;OPOS=78372536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:104:104:76:76:0.422222:46:30:57:47:46:30:57:47 chr11 78443586 . G A 217.51 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0389817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4577;QD=16.7319;RBI=0.0410827;REFB=-0.0255256;REVB=0.0129699;RO=28;SAF=6;SAR=18;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329132;STB=0.687335;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0287908;OID=.;OPOS=78443586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:18:6:16:12:18:6:16:12 chr11 78498022 . C T 153.4 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00884658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.406;QD=13.9457;RBI=0.0285788;REFB=-0.00903195;REVB=-0.0271751;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277166;STB=0.51611;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00953558;OID=.;OPOS=78498022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:8:9:15:12:8:9:15:12 chr11 81264998 . G T 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0018151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.472;QD=57.1772;RBI=0.00615048;REFB=0;REVB=0.00587655;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03138e-05;OID=.;OPOS=81264998;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0 chr11 82443672 . C G 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00787444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.57;QD=49.5984;RBI=0.00901797;REFB=0;REVB=-0.0043951;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123034;OID=.;OPOS=82443672;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr11 82443817 . G A 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4446;QD=59.0175;RBI=0.0411133;REFB=0;REVB=0.0148132;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692225;OID=.;OPOS=82443817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr11 82535963 . C T 579.48 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161009;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.064;QD=60.9974;RBI=0.0370357;REFB=0;REVB=0.0333527;RO=0;SAF=27;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255401;OID=.;OPOS=82535963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:11:27:0:0:11:27:0:0 chr11 82625814 . G A 289.85 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00594589;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.624;QD=25.204;RBI=0.026015;REFB=-0.0051054;REVB=-0.0253264;RO=21;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119491;STB=0.576864;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00428362;OID=.;OPOS=82625814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:21:20:26:26:0.565217:11:15:9:12:11:15:8:12 chr11 85195025 . A C 2672.91 PASS AF=0.967033;AO=176;DP=182;FAO=176;FDP=182;FR=.;FRO=6;FSAF=60;FSAR=116;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0285192;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.885;QD=58.7454;RBI=0.0364793;REFB=0.035739;REVB=-0.0227463;RO=6;SAF=60;SAR=116;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225449;STB=0.511857;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00272763;OID=.;OPOS=85195025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:182:182:6:6:176:176:0.967033:116:60:4:2:116:60:4:2 chr11 85195075 . T C 3541.97 PASS AF=0.954918;AO=233;DP=244;FAO=233;FDP=244;FR=.;FRO=11;FSAF=73;FSAR=160;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00904626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.852;QD=58.0651;RBI=0.0184155;REFB=-0.00492212;REVB=0.0160404;RO=11;SAF=73;SAR=160;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139973;STB=0.507358;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=2.60241e-06;OID=.;OPOS=85195075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:244:244:11:11:233:233:0.954918:160:73:5:6:160:73:5:6 chr11 85195154 . A T 3211.34 PASS AF=0.981395;AO=210;DP=214;FAO=211;FDP=215;FR=.;FRO=4;FSAF=78;FSAR=133;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0360028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.453;QD=59.7458;RBI=0.0602888;REFB=0.0313326;REVB=0.0483585;RO=4;SAF=77;SAR=133;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00510177;STB=0.502598;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-7.98066e-05;OID=.;OPOS=85195154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:214:215:4:4:210:211:0.981395:133:77:2:2:133:78:2:2 chr11 85195185 . T C 2084.15 PASS AF=0.964789;AO=136;DP=142;FAO=137;FDP=142;FR=.;FRO=5;FSAF=50;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0222075;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.583;QD=58.7084;RBI=0.027578;REFB=-0.0189087;REVB=0.0163515;RO=4;SAF=50;SAR=86;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00688057;STB=0.50133;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00112786;OID=.;OPOS=85195185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:142:142:4:5:136:137:0.964789:86:50:1:3:87:50:2:3 chr11 85195190 . CA GG 1611.34 PASS AF=0.964912;AO=108;DP=112;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00795447;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=2;MLLD=289.834;QD=56.5381;RBI=0.0240903;REFB=-0.00703252;REVB=0.0227392;RO=4;SAF=40;SAR=68;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938656;STB=0.505154;STBP=0.578;TYPE=mnp;VARB=0.000214858;OID=.;OPOS=85195190;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:112:114:4:4:108:110:0.964912:68:40:2:2:70:40:2:2 chr11 85195226 . T C 485.72 PASS AF=0.897436;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00100351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.07;QD=49.8175;RBI=0.00208906;REFB=0.00193134;REVB=-0.00183225;RO=4;SAF=20;SAR=15;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139054;STB=0.507458;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=-0.000400896;OID=.;OPOS=85195226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:39:39:4:4:35:35:0.897436:15:20:2:2:15:20:2:2 chr11 85374993 . C T 179.46 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00184778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.654;QD=21.753;RBI=0.00743629;REFB=-0.0219694;REVB=-0.00720307;RO=14;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125302;STB=0.510193;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0153886;OID=.;OPOS=85374993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:14:15:18:18:0.545455:10:8:6:8:10:8:7:8 chr11 85393897 . T C 81.99 PASS AF=0.366667;AO=10;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0231947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.28;QD=10.9319;RBI=0.0235321;REFB=-0.0354818;REVB=0.00397109;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03601;STB=0.555457;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.12823;OID=.;OPOS=85393897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:30:30:19:19:10:11:0.366667:4:6:12:7:5:6:12:7 chr11 85435730 . C T 505.44 PASS AF=0.551724;AO=47;DP=87;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0078657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.456;QD=23.2386;RBI=0.0585997;REFB=-0.0148498;REVB=-0.0580694;RO=38;SAF=17;SAR=30;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513897;STB=0.528689;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0129316;OID=.;OPOS=85435730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:38:39:47:48:0.551724:30:17:16:22:30:18:17:22 chr11 85436352 . G A 549.94 PASS AF=0.430657;AO=59;DP=137;FAO=59;FDP=137;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.0110241;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.525;QD=16.0567;RBI=0.0121709;REFB=-0.00743044;REVB=0.00515764;RO=77;SAF=37;SAR=22;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189784;STB=0.602873;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00729435;OID=.;OPOS=85436352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:77:78:59:59:0.430657:22:37:34:43:22:37:35:43 chr11 85436394 . T C 459.87 PASS AF=0.439655;AO=51;DP=116;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.00138746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.85;QD=15.8577;RBI=0.0152019;REFB=0.000828369;REVB=0.0151384;RO=65;SAF=28;SAR=23;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875865;STB=0.549;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=-0.000765013;OID=.;OPOS=85436394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:65:65:51:51:0.439655:23:28:30:35:23:28:30:35 chr11 85436500 . T C 292.01 PASS AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0125464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.193;QD=21.6304;RBI=0.0179161;REFB=-0.0292284;REVB=0.0127896;RO=24;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115205;STB=0.563867;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0235916;OID=.;OPOS=85436500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:18:12:13:11:18:12:13:11 chr11 85436699 . A G 1541.25 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.002;QD=59.8545;RBI=0.0309095;REFB=0;REVB=0.027881;RO=0;SAF=50;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54075e-05;OID=.;OPOS=85436699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:52:50:0:0:53:50:0:0 chr11 85436868 . G C 467.21 PASS AF=0.641791;AO=43;DP=67;FAO=43;FDP=67;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0281132;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.888;QD=27.8932;RBI=0.0283205;REFB=-0.0221283;REVB=-0.0034207;RO=24;SAF=13;SAR=30;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758781;STB=0.541188;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0116998;OID=.;OPOS=85436868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:24:24:43:43:0.641791:30:13:5:19:30:13:5:19 chr11 85437896 . A G 274.74 PASS AF=0.442857;AO=30;DP=69;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0397047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9887;QD=15.6992;RBI=0.0455332;REFB=-0.0187628;REVB=0.0222891;RO=39;SAF=16;SAR=14;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147885;STB=0.572956;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0235678;OID=.;OPOS=85437896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:39:39:30:31:0.442857:14:16:15:24:15:16:15:24 chr11 85447611 . T C 424.72 PASS AF=0.398374;AO=49;DP=123;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0553761;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5409;QD=13.812;RBI=0.0601513;REFB=0.00397149;REVB=0.0234875;RO=73;SAF=26;SAR=23;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686422;STB=0.534646;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.00374344;OID=.;OPOS=85447611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:73:74:49:49:0.398374:23:26:34:39:23:26:35:39 chr11 85456703 . T C 789.83 PASS AF=0.598361;AO=73;DP=122;FAO=73;FDP=122;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00155931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3753;QD=25.8959;RBI=0.0251227;REFB=-0.0161429;REVB=-0.0250742;RO=49;SAF=35;SAR=38;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378025;STB=0.520542;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0105145;OID=.;OPOS=85456703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:49:49:73:73:0.598361:38:35:26:23:38:35:26:23 chr11 85565397 . G A 384.18 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=-0.0113635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.109;QD=17.6634;RBI=0.0243074;REFB=-0.0171197;REVB=-0.0214877;RO=46;SAF=11;SAR=29;SRF=11;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441029;STB=0.528441;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0214502;OID=.;OPOS=85565397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:46:47:40:40:0.45977:29:11:11:35:29:11:11:36 chr11 85692181 . A C 1624.41 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7053;QD=60.1633;RBI=0.0515142;REFB=0;REVB=-0.037613;RO=0;SAF=38;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05189e-05;OID=.;OPOS=85692181;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:70:38:0:0:70:38:0:0 chr11 85718641 . T C 1571.12 PASS AF=0.964286;AO=108;DP=112;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0502949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1526;QD=56.1116;RBI=0.0503057;REFB=-0.0693626;REVB=-0.00104454;RO=2;SAF=45;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206254;STB=0.521273;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.000913549;OID=.;OPOS=85718641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:112:112:2:4:108:108:0.964286:63:45:2:0:63:45:4:0 chr11 85725937 . C T 1511.0 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.728;QD=59.2549;RBI=0.0545003;REFB=0;REVB=0.0463078;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126832;OID=.;OPOS=85725937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:102:0:0:98:102:1:47:51:0:0:48:54:0:0 chr11 85968623 . C T 199.45 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0314021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.467;QD=15.6429;RBI=0.0356601;REFB=-0.0155352;REVB=0.0168982;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411415;STB=0.523445;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0215144;OID=.;OPOS=85968623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:10:12:17:12:10:12:17:12 chr11 86098680 . T C 345.95 PASS AF=0.395833;AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0221041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8475;QD=14.4145;RBI=0.0339319;REFB=-0.0194091;REVB=0.0257446;RO=58;SAF=14;SAR=24;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143586;STB=0.581692;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0330964;OID=.;OPOS=86098680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:58:58:38:38:0.395833:24:14:29:29:24:14:29:29 chr11 86175193 . A G 227.96 PASS AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=0.00670031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.636;QD=11.5424;RBI=0.0094197;REFB=-0.00393823;REVB=0.00662093;RO=50;SAF=10;SAR=18;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308227;STB=0.682414;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00700744;OID=.;OPOS=86175193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:50:51:28:28:0.35443:18:10:32:18:18:10:33:18 chr11 86267633 . C T 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00353463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.057;QD=61.3756;RBI=0.0202581;REFB=0;REVB=0.0199474;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.37145e-05;OID=.;OPOS=86267633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0 chr11 86267714 . C A 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00125772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.871;QD=62.0082;RBI=0.007766;REFB=0;REVB=-0.00766348;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.11098e-05;OID=.;OPOS=86267714;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0 chr11 86520632 . G A 1376.05 PASS AF=0.967742;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00649359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.313;QD=59.1849;RBI=0.0214361;REFB=-0.0729344;REVB=0.0204289;RO=3;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029292;STB=0.51546;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00046047;OID=.;OPOS=86520632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:93:93:3:3:90:90:0.967742:47:43:0:3:47:43:0:3 chr11 86520752 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.075;QD=64.4154;RBI=0.0178055;REFB=0;REVB=0.0177749;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33634e-05;OID=.;OPOS=86520752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr11 86659524 . G A 361.9 PASS AF=0.410526;AO=37;DP=93;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.00438644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.323;QD=15.2378;RBI=0.0128946;REFB=-0.0231719;REVB=-0.0121256;RO=55;SAF=18;SAR=19;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337195;STB=0.513507;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0323891;OID=.;OPOS=86659524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:55:56:37:39:0.410526:19:18:25:30:20:19:26:30 chr11 86660886 . G A 1868.58 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00255248;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.292;QD=61.7712;RBI=0.0186208;REFB=0;REVB=-0.018445;RO=0;SAF=54;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.29485e-05;OID=.;OPOS=86660886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:67:54:0:0:67:54:0:0 chr11 87013438 . G A 1524.91 PASS AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.023071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.01;QD=57.5438;RBI=0.0236159;REFB=0.0296524;REVB=0.00504356;RO=2;SAF=55;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00103601;STB=0.500546;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-1.02524e-05;OID=.;OPOS=87013438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:106:106:2:2:104:104:0.981132:49:55:1:1:49:55:1:1 chr11 87032664 . G A 156.43 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0220575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.881;QD=24.066;RBI=0.0223949;REFB=-0.0211138;REVB=-0.00387291;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432421;STB=0.524241;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0143237;OID=.;OPOS=87032664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:9:7:5:5:9:7:5:5 chr11 87908448 . A G 929.4 PASS AF=0.571429;AO=83;DP=146;FAO=84;FDP=147;FR=.;FRO=63;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.0124756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0697;QD=25.2898;RBI=0.0623847;REFB=0.0196963;REVB=-0.0611246;RO=63;SAF=43;SAR=40;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118584;STB=0.56171;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0130511;OID=.;OPOS=87908448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:63:63:83:84:0.571429:40:43:42:21:40:44:42:21 chr11 88045583 . A G 1606.51 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1861;QD=64.2606;RBI=0.0366881;REFB=0;REVB=0.0213305;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291667;OID=.;OPOS=88045583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:50:50:0:0:50:50:0:0 chr11 88645129 . T A 463.5 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0152439;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=305.762;QD=52.971;RBI=0.015244;REFB=-0.210191;REVB=5.85248e-05;RO=1;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283046;STB=0.529394;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0013397;OID=.;OPOS=88645129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:1:2:33:33:0.942857:16:17:0:1:16:17:0:2 chr11 89133449 . C T 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.111;QD=64.1538;RBI=0.00460382;REFB=0;REVB=0.00151327;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.5394e-06;OID=.;OPOS=89133449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:56:43:0:0:56:43:0:0 chr11 89604128 . G A 192.21 PASS AF=0.230769;AO=30;DP=130;FAO=30;FDP=130;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=48;FSRR=52;FWDB=-0.00979913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.961;QD=5.91407;RBI=0.0100504;REFB=-0.00760108;REVB=-0.00223313;RO=100;SAF=16;SAR=14;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669745;STB=0.540956;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0267922;OID=.;OPOS=89604128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:100:100:30:30:0.230769:14:16:48:52:14:16:48:52 chr11 89606445 . A G 171.72 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.0322368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.321;QD=11.0788;RBI=0.0437525;REFB=-0.0163899;REVB=-0.0295816;RO=40;SAF=16;SAR=6;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069969;STB=0.540887;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0430011;OID=.;OPOS=89606445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:6:16:27:13:6:16:27:13 chr11 89868755 . G A 398.88 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00821215;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9947;QD=15.3414;RBI=0.0466995;REFB=0.00486829;REVB=-0.0459718;RO=59;SAF=19;SAR=26;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337599;STB=0.518934;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.00499381;OID=.;OPOS=89868755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:59:59:45:45:0.432692:26:19:23:36:26:19:23:36 chr11 89916080 . G C 789.28 PASS AF=0.564885;AO=74;DP=131;FAO=74;FDP=131;FR=.;FRO=57;FSAF=50;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0350186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.951;QD=24.1;RBI=0.0353038;REFB=0.00318134;REVB=0.00447793;RO=56;SAF=50;SAR=24;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602241;STB=0.53824;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.00210695;OID=.;OPOS=89916080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:56:57:74:74:0.564885:24:50:34:22:24:50:34:23 chr11 89935586 . G T 2174.94 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0068182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.738;QD=63.0416;RBI=0.00829439;REFB=0;REVB=-0.00472324;RO=0;SAF=67;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5523e-06;OID=.;OPOS=89935586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:138:0:0:137:138:1:70:67:0:0:70:68:0:0 chr11 89939448 . G A 577.9 PASS AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00625731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4809;QD=57.7899;RBI=0.0613803;REFB=-0.0186238;REVB=-0.0610606;RO=1;SAF=13;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346745;STB=0.518509;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00939778;OID=.;OPOS=89939448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:40:1:1:38:39:0.975:25:13:1:0:26:13:1:0 chr11 91545212 . C G,T 579.23 PASS AF=0.923077,0.0769231;AO=35,3;DP=38;FAO=36,3;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=25,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367331,-0.098934;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=64.5978,23.4176;QD=59.4079;RBI=0.0709903,0.0989483;REFB=0,0;REVB=0.0607479,0.00168098;RO=0;SAF=11,0;SAR=24,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00128929,0.141465;OID=.,.;OPOS=91545212,91545212;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:38:39:0:0:35,3:36,3:0.923077,0.0769231:24,3:11,0:0:0:25,3:11,0:0:0 chr11 92531356 . A G 239.65 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00804739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.516;QD=18.0872;RBI=0.0097304;REFB=-0.00958589;REVB=0.00546993;RO=27;SAF=5;SAR=21;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217768;STB=0.623657;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0117974;OID=.;OPOS=92531356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:21:5:10:17:21:5:10:17 chr11 92532677 . T C 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00111739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5562;QD=13.4554;RBI=0.0401532;REFB=0.0041635;REVB=0.0401377;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119577;STB=0.507029;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00368821;OID=.;OPOS=92532677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:5:6:8:7:5:6:8:7 chr11 92533057 . A G 230.87 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0240554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.932;QD=16.4906;RBI=0.0240843;REFB=-0.030071;REVB=0.00117909;RO=30;SAF=10;SAR=16;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159195;STB=0.58906;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0327369;OID=.;OPOS=92533057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:16:10:7:23:16:10:7:23 chr11 92534442 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000163285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.796;QD=55.0976;RBI=0.0276416;REFB=0;REVB=0.0276411;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.88626e-05;OID=.;OPOS=92534442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:7:19:0:0:7:19:0:0 chr11 92573911 . G T 667.71 PASS AF=0.550847;AO=65;DP=119;FAO=65;FDP=118;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.0176173;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.509;QD=22.6342;RBI=0.0231446;REFB=-0.00837811;REVB=-0.0150101;RO=54;SAF=32;SAR=33;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101316;STB=0.551708;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00679447;OID=.;OPOS=92573911;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:54:53:65:65:0.550847:33:32:20:34:33:32:20:33 chr11 92590448 . A G 2050.0 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209508;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.936;QD=62.5955;RBI=0.0229654;REFB=0;REVB=0.00940607;RO=0;SAF=68;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06969e-05;OID=.;OPOS=92590448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:63:68:0:0:63:68:0:0 chr11 92623877 . G A 453.51 PASS AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0140812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.922;QD=19.718;RBI=0.0148256;REFB=-0.021309;REVB=-0.00463897;RO=47;SAF=28;SAR=17;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125338;STB=0.569696;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0197343;OID=.;OPOS=92623877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:17:28:23:24:17:28:23:24 chr11 92627848 . A G 2127.93 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217907;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.459;QD=63.0498;RBI=0.0236904;REFB=0;REVB=0.00929525;RO=0;SAF=72;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202797;OID=.;OPOS=92627848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:135:0:0:134:135:1:62:72:0:0:63:72:0:0 chr11 92629305 . C T 1973.54 PASS AF=0.992248;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0201515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7485;QD=61.1949;RBI=0.0208683;REFB=-0.00719829;REVB=-0.00542262;RO=1;SAF=71;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664653;STB=0.503496;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000442105;OID=.;OPOS=92629305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:129:1:1:128:128:0.992248:57:71:1:0:57:71:1:0 chr11 92629599 . G A 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00449519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2096;QD=40.7611;RBI=0.0149549;REFB=0;REVB=-0.0142633;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426425;OID=.;OPOS=92629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0 chr11 92718127 . G C 161.01 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00331551;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.831;QD=15.3347;RBI=0.00782275;REFB=-0.00734166;REVB=-0.00708539;RO=25;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132462;STB=0.576513;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00470177;OID=.;OPOS=92718127;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:42:25:25:17:17:0.404762:8:9:10:15:8:9:10:15 chr11 93085537 . T G 1321.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0564105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.405;QD=62.1722;RBI=0.0605281;REFB=0;REVB=0.0219432;RO=0;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.26951e-05;OID=.;OPOS=93085537;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:49:35:0:0:50:35:0:0 chr11 93129483 . GA CG 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00799636;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=132.549;QD=55.0975;RBI=0.014108;REFB=0;REVB=0.011623;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000192731;OID=.;OPOS=93129483;OREF=GA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0 chr11 93141580 . C A 815.84 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.177;QD=57.252;RBI=0.0269033;REFB=0;REVB=0.00862458;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91121e-05;OID=.;OPOS=93141580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:53:57:0:0:53:57:1:25:28:0:0:26:31:0:0 chr11 93211764 . A G 435.31 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00289317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3877;QD=18.5238;RBI=0.0175976;REFB=-0.0266404;REVB=0.0173581;RO=50;SAF=14;SAR=30;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865116;STB=0.548365;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0354197;OID=.;OPOS=93211764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:30:14:20:30:30:14:20:30 chr11 93212245 . C T 599.33 PASS AF=0.630952;AO=53;DP=84;FAO=53;FDP=84;FR=.;FRO=31;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0120436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.821;QD=28.5394;RBI=0.0181366;REFB=-0.00474273;REVB=0.0135606;RO=31;SAF=32;SAR=21;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295739;STB=0.516062;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00201616;OID=.;OPOS=93212245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:31:31:53:53:0.630952:21:32:20:11:21:32:20:11 chr11 93212254 . C T 270.11 PASS AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.00181251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.553;QD=12.0049;RBI=0.00682526;REFB=-0.00303098;REVB=-0.00658019;RO=58;SAF=21;SAR=11;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103732;STB=0.559962;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00368235;OID=.;OPOS=93212254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:11:21:33:25:11:21:33:25 chr11 93400796 . C T 920.03 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.557;QD=58.4147;RBI=0.0395387;REFB=0;REVB=0.0209569;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178035;OID=.;OPOS=93400796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr11 93402006 . A G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.019;QD=58.2392;RBI=0.0420209;REFB=0;REVB=0.0320835;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144387;OID=.;OPOS=93402006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0 chr11 93402096 . C A 310.28 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.12147;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.268;QD=53.9616;RBI=0.121814;REFB=0;REVB=0.0091524;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000802856;OID=.;OPOS=93402096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0 chr11 93408831 . G A 993.89 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170363;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.045;QD=59.3369;RBI=0.0236304;REFB=0;REVB=-0.0163756;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91697e-07;OID=.;OPOS=93408831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0 chr11 93425159 . C A 2603.18 PASS AF=1;AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7966;QD=61.9805;RBI=0.0305205;REFB=0;REVB=0.0071879;RO=0;SAF=83;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99347e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.17009e-05;OID=.;OPOS=93425159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:168:168:0:0:168:168:1:85:83:0:0:85:83:0:0 chr11 93431931 . C A 669.91 PASS AF=1;AO=31;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.557;QD=62.317;RBI=0.0618589;REFB=0;REVB=0.0273172;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003683;OID=.;OPOS=93431931;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:31:43:1:19:12:0:0:21:22:0:0 chr11 93432551 . G C 201.1 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.0444939;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7723;QD=17.1149;RBI=0.0462152;REFB=-0.00113806;REVB=-0.0124954;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251679;STB=0.642721;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=4.24506e-05;OID=.;OPOS=93432551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:26:26:19:19:0.404255:10:9:6:20:10:9:6:20 chr11 93460160 . A C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.314;QD=56.7064;RBI=0.0234624;REFB=0;REVB=0.0112131;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.01682e-05;OID=.;OPOS=93460160;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:8:21:0:0:8:21:0:0 chr11 93474570 . T A,TGCGTGA 1927.15 PASS AF=0.0588235,0.904412;AO=8,121;DP=140;FAO=8,123;FDP=136;FR=.;FRO=5;FSAF=5,51;FSAR=3,72;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0103381,-0.0141205;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=75.6686,215.18;QD=56.6809;RBI=0.0151823,0.0166295;REFB=0.028624,-0.0123706;REVB=0.0111188,0.00878365;RO=9;SAF=5,50;SAR=3,71;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.153362,-0.0488468;STB=0.510178,0.507438;STBP=0.994,0.408;TYPE=snp,ins;VARB=0.0303031,0.000523534;OID=.,.;OPOS=93474570,93474571;OREF=T,-;OALT=A,GCGTGA;OMAPALT=A,TGCGTGA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:21:140:136:9:5:8,121:8,123:0.0588235,0.904412:3,71:5,50:7:2:3,72:5,51:3:2 chr11 93517874 . C G 237.34 PASS AF=0.490566;AO=24;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.046374;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.967;QD=17.9123;RBI=0.04763;REFB=-0.0123457;REVB=0.0108661;RO=27;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422146;STB=0.548553;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.01502;OID=.;OPOS=93517874;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:27:27:24:26:0.490566:15:9:9:18:16:10:8:19 chr11 93517886 . G C 230.27 PASS AF=0.52381;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0637907;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.229;QD=21.9307;RBI=0.0642167;REFB=-0.0594668;REVB=-0.0073839;RO=20;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760701;STB=0.554746;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0208246;OID=.;OPOS=93517886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:21:22:0.52381:13:8:6:14:13:9:6:14 chr11 93529655 . G A 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00467806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.357;QD=17.5599;RBI=0.0145458;REFB=-0.0115949;REVB=-0.0137731;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299893;STB=0.670179;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0150516;OID=.;OPOS=93529655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:11:7:15:6:11:7:15:6 chr11 93797619 . A G 671.98 PASS AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0657471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3687;QD=52.7047;RBI=0.0727509;REFB=-0.126631;REVB=0.0311451;RO=2;SAF=18;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049451;STB=0.526305;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00518677;OID=.;OPOS=93797619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:31:18:2:0:31:18:2:0 chr11 93845511 . A G 1513.11 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.606;QD=59.9253;RBI=0.0594034;REFB=0;REVB=0.0442177;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27298e-05;OID=.;OPOS=93845511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:56:45:0:0:56:45:0:0 chr11 93845694 . T TTA 38.37 PASS AF=0.0925926;AO=13;DP=114;FAO=10;FDP=108;FR=.;FRO=98;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=53;FSRR=45;FWDB=0.100475;FXX=0.0357111;HRUN=6;LEN=2;MLLD=23.4912;QD=1.42106;RBI=0.130255;REFB=-0.0153717;REVB=-0.0828929;RO=96;SAF=4;SAR=9;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237703;STB=0.714905;STBP=0.184;TYPE=ins;VARB=0.0959164;OID=.;OPOS=93845695;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.0925926:13:114:10:108:98:3:7:53:45:38:96:4:9:48:48 chr11 93913036 . A G 2140.63 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.81;QD=62.9597;RBI=0.023677;REFB=0;REVB=-0.00515762;RO=0;SAF=51;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91465e-05;OID=.;OPOS=93913036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:84:51:0:0:84:52:0:0 chr11 94225807 . C T 335.64 PASS AF=0.461538;AO=34;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00274157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.713;QD=17.2121;RBI=0.00927011;REFB=-0.000905386;REVB=-0.00885543;RO=42;SAF=20;SAR=14;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560804;STB=0.548079;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00120062;OID=.;OPOS=94225807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:42:34:36:0.461538:14:20:27:15:16:20:27:15 chr11 94225920 . C T 429.82 PASS AF=0.46;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0150249;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0359;QD=17.193;RBI=0.0199137;REFB=-0.00189037;REVB=0.0130693;RO=54;SAF=7;SAR=39;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394452;STB=0.723785;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00333041;OID=.;OPOS=94225920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:54:54:46:46:0.46:39:7:25:29:39:7:25:29 chr11 94231257 . C G 326.98 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0110063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.544;QD=19.817;RBI=0.0251626;REFB=-0.0274043;REVB=0.0226279;RO=31;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474346;STB=0.532768;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0268511;OID=.;OPOS=94231257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:32:34:34:0.515152:15:19:19:12:15:19:20:12 chr11 94231847 . G A 185.6 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00605693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.192;QD=13.7478;RBI=0.00749315;REFB=0.00725229;REVB=0.00441146;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128216;STB=0.581866;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.00942483;OID=.;OPOS=94231847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:10:12:13:18:10:12:13:19 chr11 94245740 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.976;QD=57.0005;RBI=0.0196686;REFB=0;REVB=0.0145615;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.47848e-05;OID=.;OPOS=94245740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:36:18:0:0:36:18:0:0 chr11 94261255 . C G 1830.12 PASS AF=0.98374;AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0376264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.486;QD=59.5161;RBI=0.0423648;REFB=-0.18088;REVB=0.0194686;RO=1;SAF=55;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085588;STB=0.500745;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000609186;OID=.;OPOS=94261255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:123:123:1:2:121:121:0.98374:66:55:1:0:66:55:1:1 chr11 94282014 . G A 400.74 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00349508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.34;QD=53.4324;RBI=0.00609696;REFB=-0.191106;REVB=0.00499573;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.517229;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00162972;OID=.;OPOS=94282014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:14:15:0:0:14:15:0:1 chr11 94320237 . T C 834.37 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468297;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.574;QD=57.543;RBI=0.0519982;REFB=0;REVB=0.0226006;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.38801e-05;OID=.;OPOS=94320237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0 chr11 94322352 . AG TA 769.88 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454399;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=260.652;QD=57.0284;RBI=0.053243;REFB=0;REVB=0.0277494;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000109702;OID=.;OPOS=94322352;OREF=AG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:31:23:0:0 chr11 94326765 . G C 1153.59 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4315;QD=60.7153;RBI=0.0201749;REFB=0;REVB=-0.0107495;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223395;OID=.;OPOS=94326765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:30:46:0:0:30:46:0:0 chr11 94337220 . C T 1302.12 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.829;QD=62.0056;RBI=0.0360038;REFB=0;REVB=0.010127;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110143;OID=.;OPOS=94337220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:36:48:0:0:36:48:0:0 chr11 94533373 . C T 1316.02 PASS AF=0.496269;AO=132;DP=275;FAO=133;FDP=268;FR=.;FRO=135;FSAF=68;FSAR=65;FSRF=65;FSRR=70;FWDB=0.00221279;FXX=0.0289845;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.073;QD=19.642;RBI=0.00877109;REFB=-0.0122877;REVB=0.00848738;RO=134;SAF=67;SAR=65;SRF=66;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138015;STB=0.515005;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0117017;OID=.;OPOS=94533373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:268:134:135:132:133:0.496269:65:67:66:68:65:68:65:70 chr11 94699507 . A AT,T 1605.88 PASS AF=1,0;AO=97,5;DP=114;FAO=111,0;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=50,0;FSAR=61,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262867,-0.0184601;FXX=0.0176975;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=27.4376,259.039;QD=57.8694;RBI=0.113114,0.0350976;REFB=0,0;REVB=0.113083,-0.0298507;RO=6;SAF=38,5;SAR=59,0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0315625,0.716421;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00170734,0;OID=.,.;OPOS=94699508,94699507;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:111:6:0:97,5:111,0:1,0:59,0:38,5:4:2:61,0:50,0:0:0 chr11 94731759 . G A 520.04 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.448;QD=59.4334;RBI=0.035613;REFB=0;REVB=0.0291518;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000625083;OID=.;OPOS=94731759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr11 94758838 . C T 245.1 PASS AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0179802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.202;QD=13.2488;RBI=0.023188;REFB=-0.00850475;REVB=-0.0146422;RO=45;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113804;STB=0.565011;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0155524;OID=.;OPOS=94758838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:13:16:20:25:13:16:20:25 chr11 94759059 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.289;QD=37.4885;RBI=0.0289836;REFB=0;REVB=-0.0232916;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454107;OID=.;OPOS=94759059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr11 94800902 . G GC 1061.08 PASS AF=1;AO=94;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.157306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.069;QD=42.0229;RBI=0.162785;REFB=0;REVB=0.0418767;RO=1;SAF=41;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011424;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00345329;OID=.;OPOS=94800903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:94:101:101:101:0:47:54:0:0:21:1:41:53:1:0 chr11 94862577 . G T 804.54 PASS AF=0.438144;AO=85;DP=195;FAO=85;FDP=194;FR=.;FRO=109;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=54;FWDB=-0.10156;FXX=0.00512794;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.331;QD=16.5884;RBI=0.103042;REFB=-0.000466933;REVB=0.0174121;RO=106;SAF=43;SAR=42;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00587305;STB=0.500728;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.000478547;OID=.;OPOS=94862577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:194:106:109:85:85:0.438144:42:43:53:53:42:43:55:54 chr11 94963937 . G A 76.57 PASS AF=0.75;AO=7;DP=11;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.127302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5097;QD=25.5236;RBI=0.130125;REFB=-0.101435;REVB=-0.0269555;RO=3;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506482;STB=0.666295;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0459183;OID=.;OPOS=94963937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:3:3:7:9:0.75:6:1:3:0:6:3:3:0 chr11 95825797 . A G 208.71 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00629888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7191;QD=18.149;RBI=0.0491717;REFB=0.00211169;REVB=-0.0487666;RO=25;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258183;STB=0.646917;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0043531;OID=.;OPOS=95825797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:7:14:10:15:7:14:10:15 chr11 96125435 . CTT C 312.47 PASS AF=0.5;AO=44;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00626252;FXX=0.0217368;HRUN=3;LEN=2;MLLD=47.7039;QD=13.8873;RBI=0.0212242;REFB=0.00494732;REVB=0.0202792;RO=44;SAF=25;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102731;STB=0.555917;STBP=0.308;TYPE=del;VARB=-0.00501832;OID=.;OPOS=96125436;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:44:90:45:90:45:26:19:21:24:99:44:25:19:20:24 chr11 96126361 . A G 266.5 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0720289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5962;QD=21.3201;RBI=0.0727371;REFB=-0.021182;REVB=0.010125;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186228;STB=0.618957;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0556002;OID=.;OPOS=96126361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:24:25:24:25:0.5:12:12:7:17:12:13:7:18 chr11 96126690 . AAT A,ATT 55.61 PASS AF=0.27027,0;AO=9,4;DP=45;FAO=10,0;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=8,0;FSAR=2,0;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0340834,0.0355117;FXX=0.0512689;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=24.7125,19.535;QD=6.01237;RBI=0.0382625,0.0491479;REFB=-0.0439033,0.0125794;REVB=0.0173879,0.0339769;RO=28;SAF=8,4;SAR=1,0;SRF=6;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.705439,0.74103;STB=0.880145,0.5;STBP=0.016,1;TYPE=del,snp;VARB=0.139044,0;OID=.,.;OPOS=96126691,96126691;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.27027,0:9,4:45:10,0:37:27:8,0:2,0:5:22:56:28:8,4:1,0:6:22 chr11 97716872 . A G 89.54 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00590232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.092;QD=15.5715;RBI=0.0159565;REFB=-0.019313;REVB=0.0148248;RO=12;SAF=1;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.61366;STB=0.864614;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0198169;OID=.;OPOS=97716872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:10:1:8:4:10:1:8:4 chr11 99690286 . T G 492.96 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00719779;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.993;QD=19.5232;RBI=0.00723227;REFB=-0.00799928;REVB=-0.000705338;RO=49;SAF=25;SAR=26;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017744;STB=0.504852;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0109434;OID=.;OPOS=99690286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:49:50:51:51:0.50495:26:25:25:24:26:25:25:25 chr11 99690376 . C T 275.26 PASS AF=0.380952;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0220906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.906;QD=13.1077;RBI=0.0222868;REFB=-0.0288104;REVB=-0.00295032;RO=51;SAF=17;SAR=15;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192081;STB=0.504481;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0212162;OID=.;OPOS=99690376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:51:52:32:32:0.380952:15:17:28:23:15:17:28:24 chr11 99690428 . T G 143.15 PASS AF=0.289855;AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0258729;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5569;QD=8.29861;RBI=0.086333;REFB=-0.00485529;REVB=-0.0823649;RO=49;SAF=16;SAR=4;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382152;STB=0.731774;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0122066;OID=.;OPOS=99690428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:49:49:20:20:0.289855:4:16:25:24:4:16:25:24 chr11 100061865 . A G 571.91 PASS AF=0.416667;AO=65;DP=156;FAO=65;FDP=156;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.0157565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.659;QD=14.6643;RBI=0.0202414;REFB=-0.0351019;REVB=-0.0127062;RO=90;SAF=37;SAR=28;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106513;STB=0.562913;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.048455;OID=.;OPOS=100061865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:90:91:65:65:0.416667:28:37:42:48:28:37:42:49 chr11 100226883 . T A 706.42 PASS AF=0.48951;AO=70;DP=143;FAO=70;FDP=143;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.00395865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.432;QD=19.76;RBI=0.016733;REFB=-0.0259044;REVB=-0.016258;RO=73;SAF=36;SAR=34;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321934;STB=0.517774;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0325839;OID=.;OPOS=100226883;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:73:73:70:70:0.48951:34:36:35:38:34:36:35:38 chr11 100792335 . G A 431.35 PASS AF=0.61194;AO=40;DP=66;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.000634165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.591;QD=25.7524;RBI=0.00576281;REFB=0.000907059;REVB=0.00572781;RO=26;SAF=23;SAR=17;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267662;STB=0.508845;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.000808283;OID=.;OPOS=100792335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:26:26:40:41:0.61194:17:23:14:12:18:23:14:12 chr11 100814570 . A G 513.76 PASS AF=0.427481;AO=56;DP=132;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=-0.00142022;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.877;QD=15.6873;RBI=0.00266236;REFB=-0.000770174;REVB=0.00225192;RO=71;SAF=24;SAR=32;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079239;STB=0.548516;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.000943383;OID=.;OPOS=100814570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:71:75:56:56:0.427481:32:24:25:46:32:24:26:49 chr11 100830579 . G A 393.11 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0476292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.216;QD=17.0915;RBI=0.0476394;REFB=-0.00627745;REVB=-0.000984374;RO=51;SAF=21;SAR=20;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559267;STB=0.531334;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0102644;OID=.;OPOS=100830579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:20:21:29:22:20:21:29:22 chr11 100846936 . A C,G 724.73 PASS AF=0.0208333,0.958333;AO=2,46;DP=48;FAO=1,46;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=1,18;FSAR=0,28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000525866,0.06141;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=188.591,186.154;QD=60.3945;RBI=0.00644612,0.0618358;REFB=-0.0293235,-0.0960698;REVB=-0.00642464,-0.00724436;RO=0;SAF=1,18;SAR=1,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.06241e-08;STB=0.989913,0.508768;STBP=0.496,0.513;TYPE=snp,snp;VARB=0.0287985,7.11947e-05;OID=.,.;OPOS=100846936,100846936;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:48:48:0:1:2,46:1,46:0.0208333,0.958333:1,28:1,18:0:0:0,28:1,18:0:1 chr11 100847050 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.751;QD=62.6711;RBI=0.0294336;REFB=0;REVB=0.0162095;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40677e-05;OID=.;OPOS=100847050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:32:12:0:0:32:12:0:0 chr11 100847069 . G A 548.59 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165884;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.034;QD=60.9546;RBI=0.0232305;REFB=0;REVB=0.0162629;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111459;OID=.;OPOS=100847069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0 chr11 100863096 . A G 460.55 PASS AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0150442;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.518;QD=23.9246;RBI=0.025404;REFB=-0.0115132;REVB=0.0204703;RO=33;SAF=19;SAR=25;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656134;STB=0.536017;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0105904;OID=.;OPOS=100863096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:25:19:17:16:25:19:17:16 chr11 100863196 . T C 257.54 PASS AF=0.394737;AO=31;DP=77;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0043963;FXX=0.0129853;HRUN=6;LEN=1;MLLD=280.239;QD=13.5546;RBI=0.00742038;REFB=-0.0128626;REVB=0.00597784;RO=46;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626648;STB=0.548355;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.016997;OID=.;OPOS=100863196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:46:46:31:30:0.394737:18:13:22:24:18:12:22:24 chr11 100863319 . A C 624.42 PASS AF=0.564815;AO=61;DP=109;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0401048;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7941;QD=23.1267;RBI=0.0412692;REFB=0.030925;REVB=0.00973414;RO=48;SAF=33;SAR=28;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665512;STB=0.54097;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.023644;OID=.;OPOS=100863319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:48:47:61:61:0.564815:28:33:22:26:28:33:21:26 chr11 100863354 . C A 342.49 PASS AF=0.38;AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00824079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1175;QD=13.6994;RBI=0.0101773;REFB=0.00853308;REVB=-0.00597219;RO=62;SAF=19;SAR=19;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175297;STB=0.509995;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=-0.0104997;OID=.;OPOS=100863354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:62:62:38:38:0.38:19:19:32:30:19:19:32:30 chr11 100863611 . G A 585.11 PASS AF=0.5;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.000993078;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.08;QD=19.5037;RBI=0.00179682;REFB=-0.0188998;REVB=0.00149745;RO=59;SAF=28;SAR=32;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831214;STB=0.541607;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0208084;OID=.;OPOS=100863611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:60:60:60:0.5:32:28:33:26:32:28:33:27 chr11 100863814 . T A 528.34 PASS AF=0.526316;AO=50;DP=95;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0464307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.293;QD=22.246;RBI=0.0584014;REFB=0.00398588;REVB=-0.0354248;RO=44;SAF=35;SAR=15;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145713;STB=0.576439;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00477704;OID=.;OPOS=100863814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:44:45:50:50:0.526316:15:35:24:20:15:35:25:20 chr11 100863983 . TA T,TT 42.01 PASS AF=0.210526,0.0526316;AO=10,2;DP=38;FAO=8,2;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=6,2;FSAR=2,0;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.11829,-0.026661;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=15.098,28.8125;QD=4.42237;RBI=0.119946,0.0285939;REFB=-0.0396646,-0.0227092;REVB=-0.0198638,-0.0103345;RO=26;SAF=6,2;SAR=4,0;SRF=6;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.415998,0.630761;STB=0.856462,0.99734;STBP=0.06,0.026;TYPE=del,snp;VARB=0.0282296,0.0137208;OID=.,.;OPOS=100863984,100863984;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.210526,0.0526316:10,2:38:8,2:38:28:6,2:2,0:6:22:32:26:6,2:4,0:6:20 chr11 100864367 . G A 710.6 PASS AF=0.5;AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0156606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.518;QD=20.303;RBI=0.0247128;REFB=-0.0245254;REVB=-0.0191172;RO=70;SAF=36;SAR=34;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388568;STB=0.521414;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0276794;OID=.;OPOS=100864367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:70:70:70:70:0.5:34:36:33:37:34:36:33:37 chr11 100907714 . T G 59.17 PASS AF=0.117647;AO=11;DP=92;FAO=12;FDP=102;FR=.,HEALED;FRO=89;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.0833535;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=23.2725;QD=2.32047;RBI=0.124088;REFB=-0.0197184;REVB=-0.0919241;RO=55;SAF=11;SAR=0;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.694363;STB=0.893916;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0526171;OID=.;OPOS=100907714;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:92:102:55:89:11:12:0.117647:0:11:31:24:1:11:46:43 chr11 101454192 . G A 172.85 PASS AF=0.486486;AO=19;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0343947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.7286;QD=18.6864;RBI=0.0344112;REFB=-0.0429462;REVB=-0.00106405;RO=17;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146892;STB=0.555096;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.045034;OID=.;OPOS=101454192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:19:19:18:0.486486:14:5:7:10:13:5:7:12 chr11 101771248 . G A 757.38 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0168331;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.908;QD=55.0825;RBI=0.0169693;REFB=-0.18095;REVB=0.00214556;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.507244;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000697173;OID=.;OPOS=101771248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:20:34:0:0:20:34:1:0 chr11 101826949 . T C 185.56 PASS AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0115662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.942;QD=19.5326;RBI=0.0139416;REFB=-0.0080933;REVB=-0.00778408;RO=19;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132058;STB=0.588698;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00951456;OID=.;OPOS=101826949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:19:19:18:19:0.5:12:6:4:15:12:7:4:15 chr11 101832478 . G T 160.3 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3505;QD=45.8006;RBI=0.065211;REFB=0;REVB=-0.0630494;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00387299;OID=.;OPOS=101832478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr11 101832708 . A T 162.55 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-2.48003e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.72;QD=19.7024;RBI=0.0384101;REFB=-0.0104618;REVB=0.0384101;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129484;STB=0.57339;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.015007;OID=.;OPOS=101832708;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:10:7:9:7:10:7:9:7 chr11 101833644 . C T 676.78 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00441823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.052;QD=60.1582;RBI=0.00581723;REFB=-0.0407533;REVB=0.00378411;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.510633;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=9.76993e-05;OID=.;OPOS=101833644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:23:21:0:0:23:21:0:1 chr11 101857758 . G A 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9487;QD=56.1891;RBI=0.0293002;REFB=0;REVB=-0.027937;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000377642;OID=.;OPOS=101857758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0 chr11 102207499 . G T 213.93 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00972473;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.32;QD=14.5036;RBI=0.0294136;REFB=-0.00131112;REVB=-0.0277595;RO=34;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122053;STB=0.569177;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.000984479;OID=.;OPOS=102207499;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:59:34:34:25:25:0.423729:14:11:11:23:14:11:11:23 chr11 102477377 . G T 1181.53 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3644;QD=59.0766;RBI=0.16366;REFB=0;REVB=0.151983;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00264512;OID=.;OPOS=102477377;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:80:0:0:74:80:1:30:44:0:0:35:45:0:0 chr11 102477395 . A G 1120.48 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0081739;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2895;QD=60.5665;RBI=0.0113437;REFB=0;REVB=-0.00786558;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.12918e-06;OID=.;OPOS=102477395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0 chr11 102495998 . T G 981.86 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7317;QD=58.6188;RBI=0.105056;REFB=0;REVB=-0.0185824;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000758331;OID=.;OPOS=102495998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:33:32:0:0:35:32:0:0 chr11 102554130 . T C 290.29 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0310648;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3238;QD=16.3542;RBI=0.0320037;REFB=-0.0214026;REVB=0.00769518;RO=37;SAF=17;SAR=15;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349143;STB=0.532367;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0210745;OID=.;OPOS=102554130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:37:39:32:32:0.450704:15:17:21:16:15:17:23:16 chr11 102563739 . C T 657.05 PASS AF=0.465278;AO=67;DP=142;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.0392589;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.733;QD=18.2513;RBI=0.0415068;REFB=-0.00269321;REVB=-0.0134743;RO=75;SAF=19;SAR=48;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243497;STB=0.643387;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000923564;OID=.;OPOS=102563739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:75:77:67:67:0.465278:48:19:39:36:48:19:41:36 chr11 102567207 . T A 381.64 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0254208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.132;QD=17.1524;RBI=0.0255145;REFB=-0.0228388;REVB=-0.00218388;RO=46;SAF=27;SAR=13;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294428;STB=0.649781;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0429852;OID=.;OPOS=102567207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:49:40:40:0.449438:13:27:17:29:13:27:20:29 chr11 102576358 . T C 993.67 PASS AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00802284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.939;QD=57.6042;RBI=0.00812515;REFB=-0.0195235;REVB=0.0012853;RO=1;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178273;STB=0.509088;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=5.64206e-05;OID=.;OPOS=102576358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:26:41:0:1:27:41:0:1 chr11 102576375 . G A 930.93 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3204;QD=58.1828;RBI=0.0818462;REFB=0;REVB=-0.0798574;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000913806;OID=.;OPOS=102576375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:26:37:0:0:27:37:0:0 chr11 102576382 . G A 231.97 PASS AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0339527;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.489;QD=14.4983;RBI=0.0358949;REFB=-0.0217631;REVB=-0.0116471;RO=35;SAF=12;SAR=15;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18178;STB=0.616355;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0302703;OID=.;OPOS=102576382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:37:27:27:0.421875:15:12:22:13:15:12:24:13 chr11 102587062 . G A 426.25 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0059363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.575;QD=19.3749;RBI=0.0694544;REFB=-0.035029;REVB=0.0692003;RO=45;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209162;STB=0.511622;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.029424;OID=.;OPOS=102587062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:22:21:23:22:22:21:23:22 chr11 102593248 . T C 708.95 PASS AF=0.5;AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.0336036;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.4445;QD=20.2558;RBI=0.0490498;REFB=0.0124557;REVB=-0.0357306;RO=70;SAF=26;SAR=44;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812097;STB=0.54482;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.0132712;OID=.;OPOS=102593248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:70:70:70:70:0.5:44:26:32:38:44:26:32:38 chr11 102595492 . G A 210.12 PASS AF=0.5;AO=19;DP=45;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00763933;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.125;QD=20.0116;RBI=0.0129882;REFB=-0.015891;REVB=-0.010504;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232385;STB=0.666508;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0147219;OID=.;OPOS=102595492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:42:19:21:19:21:0.5:12:7:12:7:14:7:14:7 chr11 102666316 . T C 1117.22 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.8;QD=60.3902;RBI=0.0441036;REFB=0;REVB=-0.00493689;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61622e-05;OID=.;OPOS=102666316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:42:31:0:0:42:32:0:0 chr11 102709425 . A G 1304.74 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.011;QD=62.1303;RBI=0.0995688;REFB=0;REVB=0.0261102;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226146;OID=.;OPOS=102709425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:84:0:0:79:84:1:45:34:0:0:45:39:0:0 chr11 102713465 . A G 1862.57 PASS AF=1;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108959;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.086;QD=61.5724;RBI=0.0239129;REFB=0;REVB=0.0212863;RO=0;SAF=70;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.00207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17535e-05;OID=.;OPOS=102713465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:120:121:1:50:70:0:0:50:71:0:0 chr11 102713620 . T C 696.34 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000251386;FXX=0.0192271;HRUN=6;LEN=1;MLLD=58.6634;QD=54.615;RBI=0.00246151;REFB=0.00740454;REVB=-0.00244864;RO=1;SAF=30;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154349;STB=0.508193;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.000798945;OID=.;OPOS=102713620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:20:30:1:0:20:30:1:0 chr11 102738795 . G T 708.33 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5897;QD=62.9628;RBI=0.0449378;REFB=0;REVB=-0.0401112;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279496;OID=.;OPOS=102738795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:27:17:0:0:28:17:0:0 chr11 103029516 . A G 1000.51 PASS AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0519005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.276;QD=56.3667;RBI=0.0550196;REFB=-0.198917;REVB=0.0182617;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514282;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000948485;OID=.;OPOS=103029516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:71:0:2:69:69:0.971831:35:34:0:0:35:34:2:0 chr11 103047007 . C A 2368.4 PASS AF=0.993631;AO=157;DP=157;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0446431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6721;QD=60.3414;RBI=0.128459;REFB=0.000291161;REVB=-0.120452;RO=0;SAF=82;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.86153e-08;STB=0.503067;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000574274;OID=.;OPOS=103047007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:157:157:0:1:157:156:0.993631:75:82:0:0:75:81:1:0 chr11 103052558 . T C 678.98 PASS AF=0.391753;AO=76;DP=195;FAO=76;FDP=194;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=68;FSRR=50;FWDB=0.0155935;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.538;QD=13.9995;RBI=0.0156194;REFB=-0.00739613;REVB=-0.000899089;RO=119;SAF=41;SAR=35;SRF=68;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349375;STB=0.522597;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0105297;OID=.;OPOS=103052558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:194:119:118:76:76:0.391753:35:41:68:51:35:41:68:50 chr11 103057048 . A G 577.79 PASS AF=0.48;AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.00853002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.228;QD=18.4891;RBI=0.00996329;REFB=-0.00275587;REVB=-0.00514839;RO=62;SAF=43;SAR=17;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126838;STB=0.570127;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00322813;OID=.;OPOS=103057048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:62:65:60:60:0.48:17:43:37:25:17:43:39:26 chr11 103058126 . C T 429.52 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0288332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.554;QD=17.3544;RBI=0.029365;REFB=-0.0210794;REVB=-0.00556332;RO=54;SAF=25;SAR=19;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157487;STB=0.592753;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0372644;OID=.;OPOS=103058126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:54:55:44:44:0.444444:19:25:22:32:19:25:22:33 chr11 103082590 . G A 2790.26 PASS AF=1;AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.26;QD=62.7024;RBI=0.0127318;REFB=0;REVB=-0.00221842;RO=0;SAF=87;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95979e-05;OID=.;OPOS=103082590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:178:0:0:178:178:1:91:87:0:0:91:87:0:0 chr11 103229027 . T C 920.03 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8491;QD=58.4148;RBI=0.0223281;REFB=0;REVB=0.0159465;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4065e-06;OID=.;OPOS=103229027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:21:42:0:0:21:42:0:0 chr11 103275034 . G T 701.46 PASS AF=0.614679;AO=59;DP=102;FAO=67;FDP=109;FR=.;FRO=42;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0555148;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6436;QD=25.7417;RBI=0.0555148;REFB=-0.0264453;REVB=-3.95658e-05;RO=43;SAF=33;SAR=26;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551318;STB=0.517803;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.00897692;OID=.;OPOS=103275034;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:109:43:42:59:67:0.614679:26:33:21:22:32:35:20:22 chr11 103277984 . G T 132.34 PASS AF=0.279412;AO=19;DP=68;FAO=19;FDP=68;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0122075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1768;QD=7.78476;RBI=0.0355248;REFB=0.00606994;REVB=0.0333615;RO=48;SAF=6;SAR=13;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155218;STB=0.602537;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.0151605;OID=.;OPOS=103277984;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:48:49:19:19:0.279412:13:6:21:27:13:6:22:27 chr11 103278083 . C G 132.26 PASS AF=0.315789;AO=16;DP=55;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00525089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.409;QD=9.28155;RBI=0.00545444;REFB=-0.00584805;REVB=-0.00147615;RO=38;SAF=2;SAR=14;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.514067;STB=0.823109;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0375548;OID=.;OPOS=103278083;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:38:39:16:18:0.315789:14:2:19:19:16:2:19:20 chr11 103278129 . C CTCTA 106.87 PASS AF=0.382353;AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0267146;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=321.608;QD=12.5731;RBI=0.0267494;REFB=-0.0040359;REVB=0.00136305;RO=23;SAF=1;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.642327;STB=0.793315;STBP=0.019;TYPE=ins;VARB=0.00478907;OID=.;OPOS=103278130;OREF=-;OALT=TCTA;OMAPALT=CTCTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.382353:12:36:13:34:21:2:11:12:9:99:23:1:11:14:9 chr11 103279098 . C T 705.22 PASS AF=0.486111;AO=70;DP=144;FAO=70;FDP=144;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0347053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0409;QD=19.5895;RBI=0.0510471;REFB=-0.0252667;REVB=-0.0374346;RO=74;SAF=27;SAR=43;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192198;STB=0.510622;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0154265;OID=.;OPOS=103279098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:74:74:70:70:0.486111:43:27:30:44:43:27:30:44 chr11 103908735 . G A 210.32 PASS AF=0.444444;AO=23;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00932342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.347;QD=15.5794;RBI=0.0145224;REFB=-0.0127766;REVB=-0.0111343;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00441764;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0205823;OID=.;OPOS=103908735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:30:23:24:0.444444:11:12:15:14:12:12:15:15 chr11 103908968 . C T 275.18 PASS AF=0.555556;AO=24;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00933046;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.014;QD=24.4601;RBI=0.0142747;REFB=-0.00853323;REVB=0.0108032;RO=21;SAF=8;SAR=16;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127357;STB=0.563301;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0105223;OID=.;OPOS=103908968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:20:24:25:0.555556:16:8:10:11:17:8:9:11 chr11 103909897 . A G 242.39 PASS AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0568791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.998;QD=29.3801;RBI=0.0568792;REFB=-0.00917446;REVB=-9.49998e-05;RO=11;SAF=9;SAR=13;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836791;STB=0.546176;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00452306;OID=.;OPOS=103909897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:13:9:6:5:13:9:6:5 chr11 104758035 . G A 594.47 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6262;QD=60.9713;RBI=0.0225558;REFB=0;REVB=-0.00465278;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000325486;OID=.;OPOS=104758035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr11 104761100 . T C 747.06 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.873;QD=63.5798;RBI=0.0426824;REFB=0;REVB=0.0407784;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176718;OID=.;OPOS=104761100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0 chr11 104761206 . C T 1011.86 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107677;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4328;QD=59.5215;RBI=0.0341556;REFB=0;REVB=-0.0324139;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000656908;OID=.;OPOS=104761206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0 chr11 104763117 . G A 1380.87 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126142;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.2;QD=62.7667;RBI=0.0167632;REFB=0;REVB=0.0110403;RO=0;SAF=49;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41122e-05;OID=.;OPOS=104763117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:39:49:0:0:39:49:0:0 chr11 104763716 . A G 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149768;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=314.067;QD=59.6795;RBI=0.0172985;REFB=0;REVB=-0.00865655;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18418e-06;OID=.;OPOS=104763716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0 chr11 104768000 . G A,T 1070.47 PASS AF=0.931507,0.0684932;AO=67,6;DP=73;FAO=68,5;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=24,3;FSAR=44,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.006184,-0.0344353;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=56.3652,17.6369;QD=58.6557;RBI=0.0561493,0.0346411;REFB=0,0;REVB=0.0558077,0.00376995;RO=0;SAF=23,4;SAR=44,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.11549e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00284368,0.161761;OID=.,.;OPOS=104768000,104768000;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:73:73:0:0:67,6:68,5:0.931507,0.0684932:44,2:23,4:0:0:44,2:24,3:0:0 chr11 104768098 . T C 1086.75 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463612;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.092;QD=60.3752;RBI=0.0563724;REFB=0;REVB=0.03207;RO=0;SAF=23;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385731;OID=.;OPOS=104768098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:49:23:0:0:49:23:0:0 chr11 104819327 . T C 994.23 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00476734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.615;QD=57.6363;RBI=0.0156345;REFB=-0.00713408;REVB=-0.01489;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129488;STB=0.506847;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-3.79333e-05;OID=.;OPOS=104819327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:36:32:0:1:36:32:0:1 chr11 104839222 . A G 734.23 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00588029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.627;QD=61.1856;RBI=0.00640717;REFB=-0.10814;REVB=0.0025444;RO=1;SAF=21;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218674;STB=0.511623;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000341899;OID=.;OPOS=104839222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:26:21:1:0:26:21:1:0 chr11 104869708 . G C 2161.34 PASS AF=0.985816;AO=138;DP=141;FAO=139;FDP=141;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00292045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.801;QD=61.3145;RBI=0.0233499;REFB=-0.156639;REVB=0.0231666;RO=0;SAF=67;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507245;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.000850347;OID=.;OPOS=104869708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:141:141:0:2:138:139:0.985816:71:67:0:0:71:68:2:0 chr11 105223502 . T C 1523.08 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0314975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9601;QD=58.5802;RBI=0.0545595;REFB=0.0644642;REVB=-0.0445494;RO=1;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771574;STB=0.504064;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-0.00376052;OID=.;OPOS=105223502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:61:42:0:1:61:42:0:1 chr11 105782654 . C T 3095.47 PASS AF=0.504174;AO=302;DP=599;FAO=302;FDP=599;FR=.;FRO=297;FSAF=157;FSAR=145;FSRF=145;FSRR=152;FWDB=-0.0020947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.482;QD=20.6709;RBI=0.00406138;REFB=-0.00275584;REVB=0.00347952;RO=295;SAF=157;SAR=145;SRF=145;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256475;STB=0.515698;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00217667;OID=.;OPOS=105782654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:599:599:295:297:302:302:0.504174:145:157:145:150:145:157:145:152 chr11 105852683 . AC A 608.49 PASS AF=0.43125;AO=70;DP=162;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.0210781;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4553;QD=15.2123;RBI=0.0420087;REFB=-0.0264093;REVB=-0.036338;RO=90;SAF=41;SAR=29;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175417;STB=0.606172;STBP=0.026;TYPE=del;VARB=0.0336521;OID=.;OPOS=105852684;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.43125:70:162:69:160:91:41:28:37:54:99:90:41:29:37:53 chr11 105878844 . C T 207.53 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0433687;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.123;QD=16.941;RBI=0.0481118;REFB=-0.00934975;REVB=-0.0208302;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142358;STB=0.581318;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0165585;OID=.;OPOS=105878844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:28:28:21:21:0.428571:9:12:12:16:9:12:12:16 chr11 107286943 . C T 109.23 PASS AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00961637;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.286;QD=8.56735;RBI=0.0303169;REFB=-0.00460384;REVB=-0.0287514;RO=37;SAF=10;SAR=4;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280485;STB=0.67226;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00736807;OID=.;OPOS=107286943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:4:10:18:19:4:10:18:19 chr11 107299623 . A C 447.92 PASS AF=0.357616;AO=53;DP=149;FAO=54;FDP=151;FR=.;FRO=97;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=0.0371774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8361;QD=11.8655;RBI=0.0377062;REFB=-0.00809311;REVB=0.00629256;RO=96;SAF=24;SAR=29;SRF=44;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00625405;STB=0.500616;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0175735;OID=.;OPOS=107299623;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:96:97:53:54:0.357616:29:24:44:52:29:25:45:52 chr11 107420530 . A G 403.66 PASS AF=0.425926;AO=46;DP=108;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.0269862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.024;QD=14.9504;RBI=0.031106;REFB=-0.0023628;REVB=0.0154702;RO=62;SAF=18;SAR=28;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145545;STB=0.581871;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00260833;OID=.;OPOS=107420530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:62:62:46:46:0.425926:28:18:33:29:28:18:33:29 chr11 107578721 . C G 912.35 PASS AF=1;AO=61;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116682;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.971;QD=57.9266;RBI=0.117513;REFB=0;REVB=0.013952;RO=1;SAF=19;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241918;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000310283;OID=.;OPOS=107578721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:1:0:61:63:1:42:19:1:0:42:21:0:0 chr11 107650473 . G A 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00144965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.049;QD=11.0924;RBI=0.00683201;REFB=-0.0106336;REVB=-0.00667644;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231195;STB=0.639509;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0203401;OID=.;OPOS=107650473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:5:1:2:3:5:1 chr11 107917087 . A G 255.59 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0175309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3688;QD=17.9363;RBI=0.0178495;REFB=-0.0190714;REVB=0.00335761;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165419;STB=0.59315;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0238158;OID=.;OPOS=107917087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:8:20:16:13:8:20:16:13 chr11 108043988 . C T 293.61 PASS AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0185297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.978;QD=19.9054;RBI=0.036384;REFB=-0.0227619;REVB=-0.031312;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331252;STB=0.526299;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0176158;OID=.;OPOS=108043988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:27:28:31:31:0.525424:16:15:12:15:16:15:12:16 chr11 108044091 . T A 82.62 PASS AF=0.282051;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00640717;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2233;QD=8.47367;RBI=0.0409542;REFB=-0.00804178;REVB=0.0404499;RO=29;SAF=5;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153479;STB=0.608104;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0213739;OID=.;OPOS=108044091;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:40:39:29:28:11:11:0.282051:6:5:17:12:6:5:17:11 chr11 108061245 . G A 260.54 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0240448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.835;QD=18.9485;RBI=0.0241561;REFB=-0.0133082;REVB=0.00231644;RO=27;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800724;STB=0.544715;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00929558;OID=.;OPOS=108061245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:15:13:15:12:15:13:15:12 chr11 108093208 . A T 538.46 PASS AF=0.52381;AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0185136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.879;QD=20.5129;RBI=0.0218647;REFB=-0.00517315;REVB=0.0116324;RO=49;SAF=19;SAR=36;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198994;STB=0.605544;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00342963;OID=.;OPOS=108093208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:49:50:55:55:0.52381:36:19:28:21:36:19:28:22 chr11 108183167 . A G 601.14 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.922;QD=58.6474;RBI=0.0313939;REFB=0.0235819;REVB=0.0265875;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-5.64291e-05;OID=.;OPOS=108183167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:20:20:0:0:20:20:1:0 chr11 108345515 . G GA 208.73 PASS AF=0.387097;AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0137198;FXX=0.0106372;HRUN=0;LEN=1;MLLD=208.773;QD=8.97758;RBI=0.0191236;REFB=-0.00192953;REVB=0.0133221;RO=57;SAF=26;SAR=10;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350185;STB=0.700009;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.00328293;OID=.;OPOS=108345516;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.387097:36:93:36:93:57:26:10:23:34:99:57:26:10:23:34 chr11 108380335 . T C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.285;QD=58.9627;RBI=0.0226503;REFB=0;REVB=0.0039866;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.53992e-05;OID=.;OPOS=108380335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0 chr11 108381247 . C T 494.43 PASS AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00782839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.885;QD=18.8352;RBI=0.0255633;REFB=-0.0160715;REVB=-0.0243351;RO=52;SAF=32;SAR=20;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363458;STB=0.516123;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0162336;OID=.;OPOS=108381247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:53:52:52:0.495238:20:32:30:22:20:32:31:22 chr11 108384207 . C T 259.14 PASS AF=0.631579;AO=23;DP=37;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0151138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.278;QD=27.2779;RBI=0.0158317;REFB=-0.0462215;REVB=-0.00471328;RO=14;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148729;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0262544;OID=.;OPOS=108384207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:14:14:23:24:0.631579:12:11:7:7:12:12:7:7 chr11 108409784 . T A 145.41 PASS AF=0.298507;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0378173;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.342;QD=8.68122;RBI=0.0380927;REFB=-0.0204973;REVB=-0.00457207;RO=47;SAF=8;SAR=12;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22765;STB=0.635162;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0364627;OID=.;OPOS=108409784;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:47:47:20:20:0.298507:12:8:28:19:12:8:28:19 chr11 109296550 . A G 207.33 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0653576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1334;QD=17.2773;RBI=0.0754682;REFB=-0.0395796;REVB=-0.0377337;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110904;STB=0.506323;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0412043;OID=.;OPOS=109296550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:8:13:17:10:8:13:17:10 chr11 109298127 . T G 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00983034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.026;QD=13.5764;RBI=0.0125828;REFB=1.60301e-05;REVB=0.00785438;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231534;STB=0.636147;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.000114316;OID=.;OPOS=109298127;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:9:4:10:9:9:4:10:9 chr11 110050628 . CTTTTTT CTTTTTC,CTT,TTCTTTT,TTTTCTT,TTTTTCT 201.76 PASS AF=0.48,0.48,0,0.04,0;AO=6,4,2,2,2;DP=21;FAO=12,12,0,1,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,0,0,0;FSAR=12,4,0,1,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117093,0.0989405,0.00330173,-0.00374847,-0.00179865;FXX=0.0384468;HRUN=16,16,1,1,1;LEN=1,4,3,5,6;MLLD=124.759,16.1165,15.7651,25.4275,27.218;QD=32.2809;RBI=0.06485,0.139431,0.0812658,0.0515892,0.0430595;REFB=-0.0994267,-0.411383,-0.3839,-0.218232,-0.18621;REVB=0.0637841,0.0982438,0.0811987,0.0514529,0.0430219;RO=0;SAF=0,2,2,0,0;SAR=6,2,0,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,mnp,mnp,mnp;VARB=0.024988,0.150393,0,-0.0757859,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=110050634,110050629,110050628,110050628,110050628;OREF=T,TTTT,CTT,CTTTT,CTTTTT;OALT=C,-,TTC,TTTTC,TTTTTC;OMAPALT=CTTTTTC,CTT,TTCTTTT,TTTTCTT,TTTTTCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:82:21:25:0:0:6,4,2,2,2:12,12,0,1,0:0.48,0.48,0,0.04,0:6,2,0,2,2:0,2,2,0,0:0:0:12,4,0,1,0:0,8,0,0,0:0:0 chr11 110451885 . A G 322.98 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0171364;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.807;QD=16.3531;RBI=0.0186125;REFB=0.00346075;REVB=0.00726423;RO=44;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815118;STB=0.545822;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.00413284;OID=.;OPOS=110451885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:17:18:19:25:17:18:19:25 chr11 111325007 . C T 281.13 PASS AF=0.727273;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=33;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00324118;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.505;QD=34.0765;RBI=0.0443641;REFB=0.00642093;REVB=-0.0442455;RO=9;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202025;STB=0.610594;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00371333;OID=.;OPOS=111325007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:33:9:9:24:24:0.727273:15:9:7:2:15:9:7:2 chr11 111327213 . G A 646.95 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.691;QD=61.6145;RBI=0.0682014;REFB=0;REVB=0.0161373;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257067;OID=.;OPOS=111327213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:40:42:1:30:10:0:0:30:12:0:0 chr11 111368047 . G T 1012.1 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000615324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.361;QD=57.8345;RBI=0.00885941;REFB=0.0299656;REVB=-0.00883801;RO=1;SAF=28;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165827;STB=0.508769;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.000168538;OID=.;OPOS=111368047;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:41:28:1:0:41:28:1:0 chr11 111420364 . A G 1607.13 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.828;QD=64.2852;RBI=0.0527243;REFB=0;REVB=0.0330563;RO=0;SAF=35;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104301;OID=.;OPOS=111420364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:65:35:0:0:65:35:0:0 chr11 111431656 . GAAT G 828.15 PASS AF=0.895349;AO=76;DP=85;FAO=77;FDP=86;FR=.;FRO=9;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0272562;FXX=0.0337041;HRUN=2;LEN=3;MLLD=272.738;QD=38.5184;RBI=0.0274003;REFB=-0.0242089;REVB=0.00280628;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500506;STBP=0.962;TYPE=del;VARB=0.00253482;OID=.;OPOS=111431657;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.895349:76:85:77:86:9:51:26:6:3:16:0:51:25:0:0 chr11 111553862 . T C 44.05 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0141025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.415;QD=6.52645;RBI=0.0504918;REFB=0.00100414;REVB=0.0484824;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146512;STB=0.594953;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.00236069;OID=.;OPOS=111553862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:2:5:12:8:2:5:12:8 chr11 111553893 . T C 598.19 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294356;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.083;QD=61.3529;RBI=0.0383296;REFB=0;REVB=0.0245501;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138508;OID=.;OPOS=111553893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr11 111692182 . G A 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00091214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.012;QD=22.1885;RBI=0.0173269;REFB=-0.00954611;REVB=0.0173029;RO=18;SAF=15;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147786;STB=0.58325;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0130951;OID=.;OPOS=111692182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:6:15:10:8:6:15:10:8 chr11 111724133 . C T 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0123843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.34;QD=13.4559;RBI=0.0747762;REFB=-0.00148059;REVB=-0.0737435;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542807;STB=0.531857;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.000547769;OID=.;OPOS=111724133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:5:6:9:6:5:6:9:6 chr11 111747297 . A G 440.7 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0359689;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.369;QD=19.5868;RBI=0.0362336;REFB=0.00525598;REVB=0.00437171;RO=46;SAF=26;SAR=18;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163596;STB=0.590868;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.00795697;OID=.;OPOS=111747297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:18:26:19:27:18:26:19:27 chr11 111749349 . A T 1102.0 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00468331;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.729;QD=60.3838;RBI=0.00780316;REFB=0;REVB=0.00624146;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1352e-06;OID=.;OPOS=111749349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:45:28:0:0:45:28:0:0 chr11 111750347 . C T 243.27 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=59;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0248824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.874;QD=15.4459;RBI=0.0277621;REFB=-0.0230306;REVB=-0.0123127;RO=35;SAF=8;SAR=16;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752563;STB=0.516267;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0335825;OID=.;OPOS=111750347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:63:35:35:24:28:0.444444:16:8:14:21:16:12:14:21 chr11 111754574 . A C 67.44 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0480443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7078;QD=13.4875;RBI=0.0603762;REFB=-0.0087362;REVB=0.0365654;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356162;STB=0.709231;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00835511;OID=.;OPOS=111754574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:3:8:3:6:3:8 chr11 111781047 . A C 217.76 PASS AF=0.462963;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0035879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.516;QD=16.1303;RBI=0.00367642;REFB=-0.00808497;REVB=-0.00080192;RO=29;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979372;STB=0.541633;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0125263;OID=.;OPOS=111781047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:29:24:25:0.462963:10:14:14:15:11:14:14:15 chr11 111848531 . C T 165.01 PASS AF=0.375;AO=17;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0272176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.019;QD=13.7504;RBI=0.0468528;REFB=-0.0117114;REVB=0.0381364;RO=30;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03206;STB=0.534845;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0250133;OID=.;OPOS=111848531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:30:30:17:18:0.375:8:9:15:15:8:10:15:15 chr11 111853106 . G GC 360.72 PASS AF=1;AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.173859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.4748;QD=43.7235;RBI=0.18177;REFB=0;REVB=0.0530389;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300873;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0098451;OID=.;OPOS=111853107;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:31:33:33:33:0:17:16:0:0:7:1:15:16:1:0 chr11 111896324 . C T 167.17 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0111346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.01;QD=15.1968;RBI=0.0130915;REFB=-0.0135672;REVB=-0.00688529;RO=25;SAF=15;SAR=3;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225503;STB=0.624844;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0190031;OID=.;OPOS=111896324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:26:18:18:0.409091:3:15:17:8:3:15:18:8 chr11 111908162 . T C 90.68 PASS AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00608956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9206;QD=6.71704;RBI=0.0371962;REFB=-0.00486594;REVB=-0.0366944;RO=41;SAF=4;SAR=9;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170379;STB=0.60719;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00870688;OID=.;OPOS=111908162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:9:4:18:23:9:4:18:23 chr11 111916647 . G A 164.69 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0667348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0195;QD=9.54701;RBI=0.0688941;REFB=-0.0070804;REVB=-0.0171132;RO=45;SAF=9;SAR=13;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16706;STB=0.611664;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0124323;OID=.;OPOS=111916647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:47:22:22:0.318841:13:9:25:20:13:9:27:20 chr11 111953921 . TTAT TTA,TT,TTT 493.59 PASS AF=0.552632,0.447368,0;AO=18,18,11;DP=75;FAO=42,34,0;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=21,17,0;FSAR=21,17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148899,0.00283075,0.0016148;FXX=0.0617208;HRUN=9,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=4.50358,171.46,171.455;QD=25.9782;RBI=0.341493,0.0119888,0.00168155;REFB=0.0706,-0.0160786,-0.0253974;REVB=0.307321,0.0116498,-0.000469107;RO=16;SAF=7,9,5;SAR=11,9,6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.146424,-0.0521025,-0.107964;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.112444,-0.0119803,0.00478808;OID=.,.,.;OPOS=111953924,111953922,111953923;OREF=T,TA,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=TTA,TT,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.552632,0.447368,0:18,18,11:75:42,34,0:76:0:21,17,0:21,17,0:0:0:99:16:7,9,5:11,9,6:9:7 chr11 111956989 . C A 1339.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0047727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.52;QD=62.3147;RBI=0.0509653;REFB=0;REVB=0.0507414;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75666e-05;OID=.;OPOS=111956989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:45:41:0:0:45:41:0:0 chr11 112065434 . T C,G 1320.83 PASS AF=0.976744,0.0232558;AO=82,3;DP=85;FAO=84,2;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43,1;FSAR=41,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000591797,-0.00877566;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.887,97.1894;QD=61.4338;RBI=0.00592434,0.00962862;REFB=0,0;REVB=0.00589471,0.00396209;RO=0;SAF=42,2;SAR=40,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=9.3966e-05,0.0146409;OID=.,.;OPOS=112065434,112065434;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:85:86:0:0:82,3:84,2:0.976744,0.0232558:40,1:42,2:0:0:41,1:43,1:0:0 chr11 112088499 . A C 2563.72 PASS AF=0.988304;AO=168;DP=171;FAO=169;FDP=171;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0201002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.761;QD=59.9701;RBI=0.10354;REFB=-0.143485;REVB=0.10157;RO=3;SAF=81;SAR=87;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161253;STB=0.505617;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00266505;OID=.;OPOS=112088499;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:171:171:3:2:168:169:0.988304:87:81:0:3:88:81:0:2 chr11 112123095 . A G 817.6 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.608;QD=57.3753;RBI=0.0970468;REFB=0;REVB=-0.0968706;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105952;OID=.;OPOS=112123095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr11 112223299 . G A 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00493413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.677;QD=62.6701;RBI=0.0134722;REFB=0;REVB=0.0125362;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56567e-05;OID=.;OPOS=112223299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr11 112832339 . GC G 485.86 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.6253;QD=48.5864;RBI=0.0722912;REFB=0;REVB=-0.0641205;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00323527;OID=.;OPOS=112832340;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:39:40:40:40:0:25:15:0:0:8:0:24:15:0:0 chr11 112832353 . T C 545.56 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.353;QD=57.427;RBI=0.0216715;REFB=-0.108237;REVB=0.0109431;RO=1;SAF=22;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208135;STB=0.511105;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-7.69007e-05;OID=.;OPOS=112832353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:15:22:1:0:15:22:1:0 chr11 112832358 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.322;QD=60.2305;RBI=0.0284806;REFB=0;REVB=-0.0217552;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.49466e-06;OID=.;OPOS=112832358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:14:23:0:0 chr11 113103996 . T G 1794.0 PASS AF=0.9;AO=126;DP=140;FAO=126;FDP=140;FR=.;FRO=14;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0119771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6347;QD=51.2573;RBI=0.0252;REFB=-0.0820742;REVB=0.0221718;RO=13;SAF=66;SAR=60;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654316;STB=0.530926;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.051226;OID=.;OPOS=113103996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:140:140:13:14:126:126:0.9:60:66:2:11:60:66:3:11 chr11 113113515 . G A 257.14 PASS AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=0.0170652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.185;QD=13.5336;RBI=0.0264299;REFB=-0.0273921;REVB=-0.0201821;RO=45;SAF=19;SAR=11;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351288;STB=0.703577;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0443623;OID=.;OPOS=113113515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:46:30:30:0.394737:11:19:13:32:11:19:13:33 chr11 113146785 . T C 560.31 PASS AF=0.475806;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=0.00147496;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.287;QD=18.0745;RBI=0.0229834;REFB=-0.0163009;REVB=-0.022936;RO=62;SAF=32;SAR=27;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815433;STB=0.53879;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0200435;OID=.;OPOS=113146785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:62:65:59:59:0.475806:27:32:39:23:27:32:40:25 chr11 113200709 . G A 642.65 PASS AF=0.435583;AO=71;DP=163;FAO=71;FDP=163;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=-0.000421727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.607;QD=15.7706;RBI=0.00443379;REFB=-0.00800804;REVB=0.00441369;RO=92;SAF=33;SAR=38;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194893;STB=0.510868;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0108965;OID=.;OPOS=113200709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:92:92:71:71:0.435583:38:33:41:51:38:33:41:51 chr11 113212553 . T C 322.38 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00248307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.465;QD=16.5324;RBI=0.0372586;REFB=-0.0199963;REVB=-0.0371757;RO=43;SAF=22;SAR=13;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722907;STB=0.540683;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0302429;OID=.;OPOS=113212553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:13:22:24:19:13:22:24:19 chr11 113264272 . T C 1742.93 PASS AF=0.983051;AO=116;DP=119;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00197897;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.12;QD=59.0823;RBI=0.0520833;REFB=-0.127913;REVB=0.0520456;RO=2;SAF=57;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00027751;STB=0.500146;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000647784;OID=.;OPOS=113264272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:119:118:2:2:116:116:0.983051:59:57:1:1:59:57:1:1 chr11 113264470 . A C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00826901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.302;QD=57.5451;RBI=0.0224862;REFB=0;REVB=0.0209105;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.03903e-05;OID=.;OPOS=113264470;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0 chr11 113270374 . C T 2271.01 PASS AF=0.986928;AO=151;DP=154;FAO=151;FDP=153;FR=.;FRO=2;FSAF=92;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0151023;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.718;QD=59.3727;RBI=0.0664165;REFB=-0.148329;REVB=0.0646766;RO=2;SAF=92;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158483;STB=0.508332;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.000488181;OID=.;OPOS=113270374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:154:153:2:2:151:151:0.986928:59:92:0:2:59:92:0:2 chr11 113670052 . T A 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.885;QD=57.2377;RBI=0.00935535;REFB=0;REVB=0.00751924;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33967e-05;OID=.;OPOS=113670052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0 chr11 113679119 . C T 538.52 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4776;QD=59.8357;RBI=0.0413848;REFB=0;REVB=0.0368943;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000777873;OID=.;OPOS=113679119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr11 113803104 . G A 316.88 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00914952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8541;QD=17.8526;RBI=0.0251311;REFB=-0.00414925;REVB=-0.0234064;RO=37;SAF=14;SAR=20;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266206;STB=0.648214;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00421388;OID=.;OPOS=113803104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:20:14:26:11:20:14:26:11 chr11 113846077 . C T 599.12 PASS AF=0.476923;AO=61;DP=129;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.011034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.629;QD=18.4345;RBI=0.0221515;REFB=-0.0410958;REVB=-0.0192078;RO=68;SAF=38;SAR=23;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920866;STB=0.554246;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0545389;OID=.;OPOS=113846077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:68:68:61:62:0.476923:23:38:36:32:23:39:36:32 chr11 113848273 . A T 120.12 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.139011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8506;QD=14.1319;RBI=0.139627;REFB=-0.00250531;REVB=-0.013099;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182963;STB=0.607315;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.0033515;OID=.;OPOS=113848273;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:10:4:9:11:10:4:9:11 chr11 113860425 . A G 170.62 PASS AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0336975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.657;QD=10.8329;RBI=0.0421784;REFB=-0.0191102;REVB=-0.0253672;RO=41;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117257;STB=0.568656;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0298641;OID=.;OPOS=113860425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:15:7:17:24:15:7:17:24 chr11 113934694 . C T 172.36 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00216038;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.688;QD=26.5168;RBI=0.0121059;REFB=-0.0112404;REVB=0.0119116;RO=9;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198959;STB=0.610978;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00424136;OID=.;OPOS=113934694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:26:26:9:9:17:17:0.653846:11:6:6:3:11:6:6:3 chr11 113934733 . G A 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0179645;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.36;QD=21.1726;RBI=0.0200891;REFB=-0.0153087;REVB=0.00899168;RO=8;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0113006;OID=.;OPOS=113934733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:6:6:4:4:6:6:4:4 chr11 113935226 . A G 305.52 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0307681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.659;QD=17.7111;RBI=0.0317519;REFB=-0.0245524;REVB=0.00784257;RO=36;SAF=21;SAR=12;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792629;STB=0.544417;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.021963;OID=.;OPOS=113935226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:12:21:20:16:12:21:20:16 chr11 114393652 . C T 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00731137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.12;QD=63.0525;RBI=0.0237928;REFB=0;REVB=0.0226416;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52007e-05;OID=.;OPOS=114393652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:45:46:0:0:45:46:0:0 chr11 114401577 . T C 1571.2 PASS AF=0.964286;AO=108;DP=112;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00413742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.126;QD=56.1142;RBI=0.0110714;REFB=-0.204191;REVB=0.0102693;RO=0;SAF=41;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81585e-08;STB=0.504925;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=-0.000320763;OID=.;OPOS=114401577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:112:112:0:4:108:108:0.964286:67:41:0:0:67:41:1:3 chr11 114421857 . T C 105.07 PASS AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.00811278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.349;QD=6.46588;RBI=0.0114114;REFB=0.000286092;REVB=0.00802508;RO=49;SAF=8;SAR=8;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163197;STB=0.59988;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.000845241;OID=.;OPOS=114421857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:49:49:16:16:0.246154:8:8:18:31:8:8:18:31 chr11 114421861 . G A 105.05 PASS AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.02877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5026;QD=6.46485;RBI=0.0287702;REFB=0.00584622;REVB=-0.00011382;RO=47;SAF=8;SAR=8;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14286;STB=0.59988;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.0230089;OID=.;OPOS=114421861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:47:49:16:16:0.246154:8:8:18:29:8:8:18:31 chr11 114421895 . G A 80.36 PASS AF=0.215686;AO=11;DP=54;FAO=11;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0330363;FXX=0.0555453;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.373;QD=6.30243;RBI=0.0410591;REFB=-0.0136155;REVB=-0.0243813;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355593;STB=0.69933;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0197281;OID=.;OPOS=114421895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:54:51:29:39:11:11:0.215686:5:6:7:22:5:6:11:28 chr11 114421909 . T C 78.59 PASS AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.0391479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.39;QD=6.41543;RBI=0.039171;REFB=-0.00295503;REVB=-0.00134477;RO=38;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523084;STB=0.820708;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0137499;OID=.;OPOS=114421909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:49:49:38:38:11:11:0.22449:3:8:10:28:3:8:10:28 chr11 114421912 . A G 78.86 PASS AF=0.229167;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0128321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.96;QD=6.57178;RBI=0.0155008;REFB=0.00299021;REVB=0.00869553;RO=37;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540622;STB=0.828948;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0384597;OID=.;OPOS=114421912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:48:48:37:37:11:11:0.229167:3:8:9:28:3:8:9:28 chr11 114441943 . G A 1170.25 PASS AF=0.941176;AO=80;DP=85;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0193719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.707;QD=55.0704;RBI=0.034853;REFB=0.0246479;REVB=-0.0289735;RO=5;SAF=33;SAR=47;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665088;STB=0.535202;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.000671474;OID=.;OPOS=114441943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:85:85:5:5:80:80:0.941176:47:33:5:0:47:33:5:0 chr11 114442103 . A G 223.75 PASS AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00655127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.07;QD=49.722;RBI=0.0294811;REFB=0;REVB=0.0287439;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441538;OID=.;OPOS=114442103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:3:13:0:0:3:15:0:0 chr11 114569054 . A G 1708.7 PASS AF=1;AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075902;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6308;QD=60.4849;RBI=0.075962;REFB=0;REVB=-0.00301941;RO=0;SAF=69;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020196;OID=.;OPOS=114569054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:112:113:1:43:69:0:0:43:70:0:0 chr11 114576626 . A T 437.86 PASS AF=0.544304;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00751405;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.3373;QD=22.1702;RBI=0.0135108;REFB=-0.00927216;REVB=0.0112286;RO=33;SAF=27;SAR=16;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116791;STB=0.547611;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0082386;OID=.;OPOS=114576626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:33:36:43:43:0.544304:16:27:16:17:16:27:19:17 chr11 116633825 . C T 689.35 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.167;QD=62.6686;RBI=0.0210639;REFB=0;REVB=0.0144524;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02305e-05;OID=.;OPOS=116633825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr11 116661826 . T C 1228.91 PASS AF=1;AO=68;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217825;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.165;QD=61.4454;RBI=0.0363262;REFB=0;REVB=0.0290709;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135828;OID=.;OPOS=116661826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:80:0:0:68:80:1:27:41:0:0:31:49:0:0 chr11 116662579 . C T 724.05 PASS AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.014901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.496;QD=59.106;RBI=0.014937;REFB=0.0363414;REVB=-0.00103609;RO=2;SAF=17;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011445;STB=0.506089;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.00205249;OID=.;OPOS=116662579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:49:49:2:2:47:47:0.959184:30:17:1:1:30:17:1:1 chr11 116692334 . C T 648.53 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.645;QD=61.7651;RBI=0.0782192;REFB=0;REVB=0.0721333;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465203;OID=.;OPOS=116692334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:18:23:0:0:19:23:0:0 chr11 116692449 . G A 265.84 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0178177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.722;QD=15.6374;RBI=0.0224668;REFB=-0.0206085;REVB=0.0136853;RO=38;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330335;STB=0.518652;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0271273;OID=.;OPOS=116692449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:14:16:19:19:14:16:19:19 chr11 116693464 . C T 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.515;QD=63.2856;RBI=0.0507025;REFB=0;REVB=-0.0359233;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58335e-07;OID=.;OPOS=116693464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0 chr11 116701535 . T C 556.23 PASS AF=0.974359;AO=32;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0556159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.046;QD=57.0492;RBI=0.0676803;REFB=-0.121166;REVB=0.0385681;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000996599;OID=.;OPOS=116701535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:0:1:32:38:0.974359:22:10:0:0:22:16:1:0 chr11 117030703 . G A 390.54 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00787689;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.172;QD=21.3996;RBI=0.0125182;REFB=-0.0228653;REVB=0.0097293;RO=33;SAF=16;SAR=23;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011962;STB=0.514794;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0179902;OID=.;OPOS=117030703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:34:39:39:0.534247:23:16:14:19:23:16:15:19 chr11 117042377 . G A 1193.78 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018666;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.669;QD=61.2193;RBI=0.029116;REFB=0;REVB=0.0223455;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81763e-05;OID=.;OPOS=117042377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0 chr11 117053433 . C A 644.73 PASS AF=0.897959;AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0826055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2064;QD=52.6311;RBI=0.086957;REFB=-0.0911286;REVB=0.0271633;RO=5;SAF=20;SAR=24;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103981;STB=0.55553;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00357207;OID=.;OPOS=117053433;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:49:49:5:5:44:44:0.897959:24:20:5:0:24:20:5:0 chr11 117074109 . G A 865.24 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5555;QD=57.6828;RBI=0.105809;REFB=0;REVB=0.0207908;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000618673;OID=.;OPOS=117074109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:25:30:0:0:26:34:0:0 chr11 117076875 . G A 405.2 PASS AF=0.405172;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=116;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.0105463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.706;QD=13.9725;RBI=0.0259269;REFB=-0.00704735;REVB=0.023685;RO=67;SAF=26;SAR=21;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624955;STB=0.533618;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0097698;OID=.;OPOS=117076875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:67:69:47:47:0.405172:21:26:41:26:21:26:42:27 chr11 117077034 . A G 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.548;QD=58.9625;RBI=0.0438129;REFB=0;REVB=0.0128797;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177141;OID=.;OPOS=117077034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0 chr11 117096652 . G A 387.04 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4338;QD=55.2918;RBI=0.0657542;REFB=0;REVB=-0.0280411;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000720821;OID=.;OPOS=117096652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:4:24:0:0:4:24:0:0 chr11 117156552 . T C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4581;QD=60.6093;RBI=0.0270918;REFB=0;REVB=0.021142;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37841e-05;OID=.;OPOS=117156552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0 chr11 117159878 . A T 415.04 PASS AF=0.396694;AO=48;DP=122;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.00477678;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.511;QD=13.7202;RBI=0.0065572;REFB=-0.00245426;REVB=-0.00449213;RO=73;SAF=22;SAR=26;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051164;STB=0.528908;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0036925;OID=.;OPOS=117159878;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:73:73:48:48:0.396694:26:22:30:43:26:22:30:43 chr11 117160347 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00650414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.408;QD=61.6834;RBI=0.0118093;REFB=0;REVB=-0.00985679;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.87243e-05;OID=.;OPOS=117160347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr11 117163824 . C G 346.71 PASS AF=0.45122;AO=36;DP=81;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.0145253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8624;QD=16.9129;RBI=0.0543056;REFB=-0.0240497;REVB=0.052327;RO=45;SAF=22;SAR=14;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131952;STB=0.581354;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0335357;OID=.;OPOS=117163824;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:45:45:36:37:0.45122:14:22:33:12:15:22:33:12 chr11 117252489 . T C 2574.18 PASS AF=1;AO=116;DP=166;FAO=167;FDP=167;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=115;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.685;QD=61.6569;RBI=0.048472;REFB=0;REVB=0.014229;RO=0;SAF=70;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25992e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0031072;OID=.;OPOS=117252489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:166:167:0:0:116:167:1:46:70:0:0:52:115:0:0 chr11 117266312 . C G 433.47 PASS AF=0.511905;AO=42;DP=83;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00704256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.422;QD=20.6412;RBI=0.0216867;REFB=-0.0170393;REVB=0.0205114;RO=41;SAF=19;SAR=23;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120237;STB=0.512815;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0153574;OID=.;OPOS=117266312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:41:41:42:43:0.511905:23:19:18:23:23:20:18:23 chr11 117267884 . A G 493.88 PASS AF=0.546512;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.00581954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.204;QD=22.9713;RBI=0.0307689;REFB=-0.0260188;REVB=-0.0302135;RO=39;SAF=23;SAR=24;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193834;STB=0.606123;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0206571;OID=.;OPOS=117267884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:39:39:47:47:0.546512:24:23:10:29:24:23:10:29 chr11 117280724 . TC T 58.56 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.033522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2727;QD=14.6404;RBI=0.0683054;REFB=0.00307368;REVB=-0.0595139;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327753;STB=0.699398;STBP=0.212;TYPE=del;VARB=-0.00666343;OID=.;OPOS=117280725;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:8:16:8:16:8:1:7:3:5:55:8:1:7:3:5 chr11 117282800 . G T 613.34 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.887;QD=61.3344;RBI=0.0951607;REFB=0;REVB=0.0612912;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00092722;OID=.;OPOS=117282800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr11 117309989 . C T 310.37 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00563219;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.852;QD=53.9781;RBI=0.0831188;REFB=0;REVB=-0.0829278;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100178;OID=.;OPOS=117309989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0 chr11 117310022 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00431442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.792;QD=54.5176;RBI=0.0277718;REFB=0;REVB=-0.0274347;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132191;OID=.;OPOS=117310022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0 chr11 117335722 . T C 964.6 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0977;QD=58.4609;RBI=0.0532245;REFB=0;REVB=-0.00312882;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403362;OID=.;OPOS=117335722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:66:0:0:60:66:1:24:36:0:0:26:40:0:0 chr11 117376413 . G A 400.31 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0251863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.9913;QD=21.3501;RBI=0.0410897;REFB=-0.0404978;REVB=0.0324656;RO=35;SAF=19;SAR=21;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331911;STB=0.518336;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0190506;OID=.;OPOS=117376413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:21:19:18:17:21:19:18:17 chr11 117403235 . G T 1156.61 PASS AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0375141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.622;QD=59.3131;RBI=0.0375152;REFB=-0.058;REVB=0.000286042;RO=1;SAF=25;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918967;STB=0.504853;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000344654;OID=.;OPOS=117403235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:51:25:0:1:51:26:0:1 chr11 117691352 . C T 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.00278872;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.624;QD=21.9718;RBI=0.0137495;REFB=-0.0167779;REVB=0.0134638;RO=20;SAF=7;SAR=16;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427499;STB=0.510579;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0153167;OID=.;OPOS=117691352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:16:7:6:14:16:7:6:15 chr11 117693255 . T C 479.65 PASS AF=0.452174;AO=52;DP=119;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.0335107;FXX=0.0336106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.588;QD=16.6836;RBI=0.0423361;REFB=-0.0333208;REVB=-0.0258724;RO=67;SAF=22;SAR=30;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100333;STB=0.514791;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0385821;OID=.;OPOS=117693255;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:115:67:63:52:52:0.452174:30:22:29:38:30:22:25:38 chr11 117695340 . C T 336.14 PASS AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0259155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6754;QD=28.0116;RBI=0.169562;REFB=-0.0505832;REVB=0.16757;RO=19;SAF=17;SAR=12;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156357;STB=0.586147;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0180482;OID=.;OPOS=117695340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:12:17:7:12:12:17:7:12 chr11 117698762 . G A 390.65 PASS AF=0.653061;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0810936;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6392;QD=31.8901;RBI=0.0898742;REFB=0.0229089;REVB=0.0387451;RO=18;SAF=11;SAR=21;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182109;STB=0.608626;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.00933644;OID=.;OPOS=117698762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:18:17:32:32:0.653061:21:11:11:7:21:11:11:6 chr11 117711836 . C T 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0137591;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=221.917;QD=19.156;RBI=0.0160719;REFB=-0.0094519;REVB=-0.0083062;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267774;STB=0.529383;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00919996;OID=.;OPOS=117711836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:23:21:21:0.477273:8:13:13:9:8:13:13:10 chr11 117774291 . A C 619.92 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0154187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9495;QD=59.0398;RBI=0.0731176;REFB=0.022132;REVB=-0.0714734;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.0159378;OID=.;OPOS=117774291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:18:23:1:0:18:23:1:0 chr11 117781435 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.449;QD=61.684;RBI=0.03957;REFB=0;REVB=0.0199758;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123771;OID=.;OPOS=117781435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0 chr11 117789342 . TGGG CGGC 213.56 PASS AF=0.38806;AO=23;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0581185;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=4;MLLD=110.742;QD=12.75;RBI=0.0616544;REFB=-0.0551579;REVB=0.0205791;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174729;STB=0.520694;STBP=0.804;TYPE=mnp;VARB=0.0981211;OID=.;OPOS=117789342;OREF=TGGG;OALT=CGGC;OMAPALT=CGGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:41:23:26:0.38806:8:15:15:16:11:15:25:16 chr11 117864047 . A G 788.26 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239595;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.974;QD=55.3165;RBI=0.0240414;REFB=0.0734353;REVB=0.00198214;RO=1;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012575;STB=0.506664;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.000358512;OID=.;OPOS=117864047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:37:19:0:1:37:19:0:1 chr11 117869670 . A G 301.49 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.968;QD=52.4337;RBI=0.034188;REFB=0;REVB=0.0318366;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207755;OID=.;OPOS=117869670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:16:6:0:0:16:7:0:0 chr11 117965595 . C T 205.08 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0244205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.46;QD=16.4063;RBI=0.0259291;REFB=-0.00650382;REVB=-0.00871539;RO=29;SAF=7;SAR=14;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673758;STB=0.538426;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0210056;OID=.;OPOS=117965595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:14:7:8:21:14:7:8:21 chr11 117965602 . C T 316.74 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0224496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2896;QD=25.8561;RBI=0.0225679;REFB=0.0247174;REVB=-0.00230771;RO=21;SAF=8;SAR=20;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440978;STB=0.524458;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-0.0202678;OID=.;OPOS=117965602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:20:8:7:14:20:8:7:14 chr11 117982495 . T G 542.92 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00943738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.025;QD=57.1499;RBI=0.0211476;REFB=-0.00725849;REVB=0.0189251;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000277383;OID=.;OPOS=117982495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:38:0:1:37:37:0.973684:18:19:0:0:19:18:1:0 chr11 117988082 . T C 930.66 PASS AF=0.970149;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00500324;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.499;QD=55.5618;RBI=0.0107837;REFB=-0.030706;REVB=0.00955283;RO=2;SAF=33;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000433733;STB=0.50023;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.000167299;OID=.;OPOS=117988082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:67:2:2:65:65:0.970149:32:33:1:1:32:33:1:1 chr11 117988654 . G C 128.04 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0360187;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.517;QD=20.4857;RBI=0.0422273;REFB=-0.0317422;REVB=-0.0220408;RO=11;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21872;STB=0.624812;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0286556;OID=.;OPOS=117988654;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:10:4:6:5:10:4:6:5 chr11 118074337 . A G 446.44 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0556673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6586;QD=57.6049;RBI=0.0842152;REFB=0;REVB=0.0631929;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161905;OID=.;OPOS=118074337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr11 118081345 . A T 1587.78 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.492;QD=64.1527;RBI=0.0179908;REFB=0;REVB=0.0147406;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77316e-05;OID=.;OPOS=118081345;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:60:39:0:0:60:39:0:0 chr11 118083664 . A G 1533.83 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0279841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.9406;QD=62.6052;RBI=0.0356483;REFB=-0.0284757;REVB=0.0220837;RO=0;SAF=40;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58683e-08;STB=0.506172;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000229864;OID=.;OPOS=118083664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:0:1:97:97:0.989796:57:40:0:0:57:40:1:0 chr11 118107805 . A G 1320.95 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.367;QD=62.1622;RBI=0.00899463;REFB=0;REVB=0.00810148;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48432e-05;OID=.;OPOS=118107805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:36:48:0:0:37:48:0:0 chr11 118110977 . T C 1576.46 PASS AF=0.973214;AO=108;DP=112;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0403355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.3104;QD=56.3021;RBI=0.046633;REFB=-0.0363795;REVB=-0.0234027;RO=3;SAF=68;SAR=40;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00203708;STB=0.50097;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.000737403;OID=.;OPOS=118110977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:112:112:3:3:108:109:0.973214:40:68:2:1:40:69:2:1 chr11 118179197 . A G 582.37 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0640014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.297;QD=58.2372;RBI=0.0648002;REFB=-0.0665412;REVB=0.0101433;RO=1;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228628;STB=0.512189;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000867562;OID=.;OPOS=118179197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:20:19:0:1:20:19:0:1 chr11 118182829 . T A 95.65 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00764525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.636;QD=11.594;RBI=0.0119734;REFB=-0.00217644;REVB=-0.00921474;RO=21;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160135;STB=0.59558;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0049378;OID=.;OPOS=118182829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:4:8:11:10:4:8:11:10 chr11 118184576 . C T 143.19 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0184577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.824;QD=22.9105;RBI=0.0207908;REFB=-0.0207741;REVB=0.00956927;RO=9;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215071;STB=0.608537;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0206132;OID=.;OPOS=118184576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:25:25:9:10:15:15:0.6:12:3:4:5:12:3:4:6 chr11 118221349 . TG CT 953.28 PASS AF=1;AO=64;DP=67;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313488;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=2;MLLD=196.286;QD=53.7057;RBI=0.156222;REFB=0;REVB=0.153044;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000234742;OID=.;OPOS=118221349;OREF=TG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:71:0:0:64:71:1:30:34:0:0:35:36:0:0 chr11 118359176 . CTTTTTTAC CTTTTTAC,CTTTTTACT 42.19 PASS AF=0.145161,0.0806452;AO=14,5;DP=65;FAO=9,5;FDP=62;FR=.;FRO=48;FSAF=7,5;FSAR=2,0;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.093651,-0.101577;FXX=0.0461467;HRUN=6,6;LEN=1,3;MLLD=9.50358,73.6683;QD=2.72224;RBI=0.17085,0.10158;REFB=-0.113451,-0.0189038;REVB=0.142896,-0.000780565;RO=37;SAF=11,5;SAR=3,0;SRF=18;SRR=19;SSEN=0.456311,0;SSEP=0,0;SSSB=0.380867,0.628255;STB=0.717432,0.997669;STBP=0.204,0.025;TYPE=del,mnp;VARB=0.0772169,0.112465;OID=.,.;OPOS=118359177,118359182;OREF=T,TAC;OALT=-,ACT;OMAPALT=CTTTTTAC,CTTTTTACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.145161,0.0806452:14,5:65:9,5:62:48:7,5:2,0:26:22:26:37:11,5:3,0:18:19 chr11 118393396 . A G 852.71 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0195756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4753;QD=55.9151;RBI=0.0260366;REFB=-0.0464566;REVB=0.0171668;RO=1;SAF=41;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113736;STB=0.506022;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00133404;OID=.;OPOS=118393396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:19:41:1:0:19:41:1:0 chr11 118404804 . G A 505.36 PASS AF=0.791667;AO=37;DP=48;FAO=38;FDP=48;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0568934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6865;QD=42.1137;RBI=0.0581572;REFB=-0.0640505;REVB=0.012058;RO=10;SAF=25;SAR=12;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10531;STB=0.554063;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0130802;OID=.;OPOS=118404804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:48:48:10:10:37:38:0.791667:12:25:9:1:12:26:9:1 chr11 118405303 . GCG CGA,GCA 74.45 PASS AF=0,0.357143;AO=2,10;DP=28;FAO=0,10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=0,8;FSAR=0,2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00312747,0.0795901;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=3,1;MLLD=38.915,120.092;QD=10.635;RBI=0.0181528,0.0795913;REFB=-0.00684316,-0.0107796;REVB=-0.0178814,0.000445496;RO=16;SAF=2,8;SAR=0,2;SRF=5;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.621068,0.501911;STB=0.5,0.775545;STBP=1,0.033;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0368936;OID=.,.;OPOS=118405303,118405305;OREF=GCG,G;OALT=CGA,A;OMAPALT=CGA,GCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:74:28:28:16:18:2,10:0,10:0,0.357143:0,2:2,8:5:11:0,2:0,8:7:11 chr11 118405835 . G A 227.15 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=-0.112508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.167;QD=21.1301;RBI=0.113604;REFB=-0.0109274;REVB=0.0157394;RO=21;SAF=7;SAR=15;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31189;STB=0.67111;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0139793;OID=.;OPOS=118405835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:15:7:1:20:15:7:1:20 chr11 118430519 . C T 202.07 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0411027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7849;QD=21.2701;RBI=0.0434552;REFB=-0.027047;REVB=-0.014104;RO=18;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142322;STB=0.58056;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0252425;OID=.;OPOS=118430519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:15:5:7:11:15:5:7:11 chr11 118471423 . T C 551.28 PASS AF=0.56044;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.021284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1693;QD=24.2323;RBI=0.0217172;REFB=0.0291416;REVB=-0.00431569;RO=40;SAF=12;SAR=39;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289099;STB=0.659634;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0174574;OID=.;OPOS=118471423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:40:40:51:51:0.56044:39:12:22:18:39:12:22:18 chr11 118472354 . C A 507.58 PASS AF=0.494949;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00254235;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9621;QD=20.5083;RBI=0.0542825;REFB=-0.0309835;REVB=0.0542229;RO=50;SAF=26;SAR=23;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00859297;STB=0.50476;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0348167;OID=.;OPOS=118472354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:50:50:49:49:0.494949:23:26:27:23:23:26:27:23 chr11 118505676 . GT G 1341.97 PASS AF=1;AO=92;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322573;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5142;QD=57.1053;RBI=0.0902268;REFB=0;REVB=-0.0842636;RO=0;SAF=42;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000132675;OID=.;OPOS=118505677;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:92:95:94:94:0:41:53:0:0:8:0:42:50:0:0 chr11 118509668 . A G 1061.98 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.668;QD=59.8296;RBI=0.0360618;REFB=0;REVB=-0.0159382;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00026034;OID=.;OPOS=118509668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0 chr11 118514625 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.079;QD=37.4885;RBI=0.00959585;REFB=0;REVB=0.00959585;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169567;OID=.;OPOS=118514625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0 chr11 118529017 . T G 179.79 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727005;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.242;QD=47.9426;RBI=0.077401;REFB=0;REVB=0.0770588;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118204;OID=.;OPOS=118529017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr11 118529044 . C CG 232.95 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258487;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=237.225;QD=49.0411;RBI=0.0536575;REFB=0;REVB=0.047021;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0001448;OID=.;OPOS=118529045;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:18:19:19:19:0:10:9:0:0:4:0:9:9:0:0 chr11 118529069 . G C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8598;QD=54.5172;RBI=0.076954;REFB=0;REVB=0.0747276;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161056;OID=.;OPOS=118529069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr11 118529078 . G C 330.39 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0247506;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2985;QD=50.8288;RBI=0.099907;REFB=-0.0361466;REVB=0.0967926;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487725;STB=0.526294;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.003861;OID=.;OPOS=118529078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:1:0:16:9:1:0 chr11 118529127 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.575;QD=56.7064;RBI=0.0193028;REFB=0;REVB=-0.00332514;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34021e-05;OID=.;OPOS=118529127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr11 118530611 . T C 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.863;QD=59.6788;RBI=0.0196056;REFB=0;REVB=0.0144181;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6668e-06;OID=.;OPOS=118530611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0 chr11 118534082 . C T 2027.15 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00478763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.007;QD=62.3739;RBI=0.0323989;REFB=0;REVB=0.0320432;RO=0;SAF=61;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92607e-05;OID=.;OPOS=118534082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:69:61:0:0:69:61:0:0 chr11 118621764 . A T 42.99 PASS AF=0.212121;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0225199;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=212.93;QD=5.21085;RBI=0.0234051;REFB=0.000334842;REVB=-0.00637563;RO=22;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.612593;STB=0.868864;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.00316699;OID=.;OPOS=118621764;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:33:22:26:7:7:0.212121:2:5:3:19:2:5:4:22 chr11 118621777 . G A 74.46 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00923125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.301;QD=22.9114;RBI=0.0155493;REFB=-0.00812968;REVB=0.0125125;RO=4;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514675;STB=0.529348;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0101358;OID=.;OPOS=118621777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:6:3:1:3:6:3:1:3 chr11 118621825 . G GT,T 655.85 PASS AF=0.977273,0.0227273;AO=41,3;DP=44;FAO=43,1;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27,1;FSAR=16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487464,-0.00634305;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=27.1441,36.219;QD=59.6223;RBI=0.124568,0.0197472;REFB=0,0;REVB=0.114634,0.0187007;RO=0;SAF=25,3;SAR=16,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.1719e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00652986,0.00243442;OID=.,.;OPOS=118621826,118621825;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:44:44:0:0:41,3:43,1:0.977273,0.0227273:16,0:25,3:0:0:16,0:27,1:0:0 chr11 118622744 . G A 345.73 PASS AF=0.870968;AO=27;DP=31;FAO=27;FDP=31;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0316522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7089;QD=44.6101;RBI=0.033088;REFB=-0.0258509;REVB=-0.0096411;RO=4;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883989;STB=0.547585;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0038005;OID=.;OPOS=118622744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:31:31:4:4:27:27:0.870968:19:8:0:4:19:8:0:4 chr11 118744701 . A AAAAG 60.23 PASS AF=1;AO=4;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=4;LEN=4;MLLD=109.134;QD=34.4186;RBI=0.099634;REFB=0;REVB=0.099634;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00200504;OID=.;OPOS=118744702;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=AAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:4:8:7:7:0:0:7:0:0:3:3:0:4:0:3 chr11 118757191 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000333128;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=245.251;QD=45.8068;RBI=0.00555975;REFB=0;REVB=-0.00554976;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60045e-05;OID=.;OPOS=118757191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr11 118757201 . C G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-6.19931e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.542;QD=45.8062;RBI=0.00317882;REFB=0;REVB=0.00317821;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3227e-05;OID=.;OPOS=118757201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr11 118757219 . C G 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0147308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9347;QD=15.8821;RBI=0.0161653;REFB=0.0148098;REVB=0.00665747;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873356;STB=0.550917;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.00664817;OID=.;OPOS=118757219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:5:5:4:6:5:5 chr11 118898435 . AC A 506.47 PASS AF=0.978723;AO=44;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0260954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3409;QD=43.1039;RBI=0.0742714;REFB=0.0626883;REVB=0.0695361;RO=2;SAF=27;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975376;STB=0.514279;STBP=0.283;TYPE=del;VARB=-1.67041e-05;OID=.;OPOS=118898436;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.978723:44:47:46:47:1:29:17:0:1:4:2:27:17:1:1 chr11 118919206 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.323;QD=57.6806;RBI=0.0493758;REFB=0;REVB=0.0079752;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400121;OID=.;OPOS=118919206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr11 118922200 . G A 457.7 PASS AF=0.447368;AO=48;DP=112;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.00444588;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.612;QD=16.0597;RBI=0.00516501;REFB=-0.0194124;REVB=-0.00262896;RO=62;SAF=31;SAR=17;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151932;STB=0.58883;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0222112;OID=.;OPOS=118922200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:62:63:48:51:0.447368:17:31:31:31:18:33:31:32 chr11 118925341 . G A 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.525;QD=58.1421;RBI=0.025187;REFB=0;REVB=0.0219933;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14992e-05;OID=.;OPOS=118925341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr11 118927013 . T TC 528.74 PASS AF=1;AO=47;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.461;QD=39.1662;RBI=0.11775;REFB=-0.00829871;REVB=0.0833423;RO=6;SAF=15;SAR=32;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00345397;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00692403;OID=.;OPOS=118927014;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:47:54:54:54:0:17:37:0:0:9:6:15:32:2:4 chr11 118947634 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.11;QD=51.9158;RBI=0.0950694;REFB=0;REVB=-0.0726814;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102159;OID=.;OPOS=118947634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr11 118962230 . G T 263.45 PASS AF=0.5;AO=25;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0290437;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.8771;QD=17.5632;RBI=0.0347441;REFB=-0.112025;REVB=0.0190687;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901406;STB=0.551572;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0505872;OID=.;OPOS=118962230;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:24:30:25:30:0.5:12:13:10:14:17:13:10:20 chr11 118967758 . T C 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.008;QD=63.2866;RBI=0.0094524;REFB=0;REVB=0.00606292;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60123e-05;OID=.;OPOS=118967758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0 chr11 119005088 . C T 765.39 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.921;QD=63.7826;RBI=0.0790877;REFB=0;REVB=0.0536724;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000798877;OID=.;OPOS=119005088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:30:16:0:0:32:16:0:0 chr11 119005132 . C T 177.46 PASS AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0619892;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.56;QD=39.4349;RBI=0.0619923;REFB=-0.0144011;REVB=-0.000620213;RO=2;SAF=1;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.442185;STB=0.749581;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.000351972;OID=.;OPOS=119005132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:15:1:2:0:15:1:2:0 chr11 119043656 . C T 982.81 PASS AF=0.945205;AO=69;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0102113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.75;QD=53.8526;RBI=0.0231189;REFB=-0.10811;REVB=0.0207416;RO=3;SAF=39;SAR=30;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185112;STB=0.517486;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.000800666;OID=.;OPOS=119043656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:73:73:3:4:69:69:0.945205:30:39:1:2:30:39:1:3 chr11 119044332 . G T 533.79 PASS AF=0.549451;AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.069327;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.52;QD=23.4632;RBI=0.0701073;REFB=-0.00235032;REVB=0.0104306;RO=37;SAF=27;SAR=23;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834658;STB=0.523569;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00169623;OID=.;OPOS=119044332;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:37:41:50:50:0.549451:23:27:16:21:23:27:20:21 chr11 119052826 . C A 3318.07 PASS AF=1;AO=214;DP=217;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749094;FXX=0.0138242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3024;QD=62.02;RBI=0.0981264;REFB=-0.0834851;REVB=0.0633828;RO=1;SAF=122;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00515028;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373892;OID=.;OPOS=119052826;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:217:214:1:0:214:214:1:92:122:0:1:92:122:0:0 chr11 119054488 . C T 800.92 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00747314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.736;QD=57.2085;RBI=0.0477639;REFB=0;REVB=0.0471756;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179712;OID=.;OPOS=119054488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr11 119059404 . G A 251.53 PASS AF=0.88;AO=18;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0161756;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.4289;QD=40.2446;RBI=0.0202975;REFB=-0.0757046;REVB=0.0122612;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.536554;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00745695;OID=.;OPOS=119059404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:0:3:18:22:0.88:3:15:0:0:3:19:3:0 chr11 119063908 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4589;QD=51.916;RBI=0.135126;REFB=0;REVB=0.0396971;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315762;OID=.;OPOS=119063908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr11 119065661 . C T 147.24 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00374623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.784;QD=17.3226;RBI=0.0128016;REFB=-0.0139988;REVB=0.0122412;RO=16;SAF=3;SAR=13;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15776;STB=0.643363;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0149668;OID=.;OPOS=119065661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:18:16:16:0.470588:13:3:5:11:13:3:7:11 chr11 119065709 . G C 447.0 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8127;QD=57.6779;RBI=0.0337298;REFB=0;REVB=-0.000268521;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000497212;OID=.;OPOS=119065709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr11 119181170 . T C 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0417196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6712;QD=15.9165;RBI=0.0421648;REFB=-0.0191037;REVB=-0.00611071;RO=15;SAF=11;SAR=2;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429378;STB=0.752978;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0134441;OID=.;OPOS=119181170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:2:11:7:8:2:11:7:8 chr11 119206375 . G A 167.43 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0175313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.162;QD=23.0943;RBI=0.0225995;REFB=-0.0340395;REVB=0.0142616;RO=12;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399495;STB=0.522362;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0221006;OID=.;OPOS=119206375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:12:5:3:9:12:5:3:9 chr11 119206912 . G T 92.1 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00117634;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.532;QD=8.3728;RBI=0.0171308;REFB=-0.00380475;REVB=0.0170904;RO=30;SAF=3;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376737;STB=0.732162;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00517906;OID=.;OPOS=119206912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:45:44:30:32:12:12:0.272727:9:3:17:13:9:3:18:14 chr11 119213303 . C T 459.72 PASS AF=0.505618;AO=42;DP=88;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00475042;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.841;QD=20.6615;RBI=0.00906672;REFB=-0.0172565;REVB=-0.00772262;RO=42;SAF=30;SAR=12;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168288;STB=0.589312;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0164929;OID=.;OPOS=119213303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:42:44:42:45:0.505618:12:30:23:19:14:31:23:21 chr11 119215046 . C T 329.57 PASS AF=0.373737;AO=37;DP=99;FAO=37;FDP=99;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00539619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.673;QD=13.3162;RBI=0.0210005;REFB=-0.0083196;REVB=-0.0202954;RO=62;SAF=18;SAR=19;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085376;STB=0.548748;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0152411;OID=.;OPOS=119215046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:62:62:37:37:0.373737:19:18:35:27:19:18:35:27 chr11 119216231 . A G 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=6.69219e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.081;QD=15.7385;RBI=0.00972255;REFB=-0.0116295;REVB=0.00972232;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941007;STB=0.553201;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0114617;OID=.;OPOS=119216231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:11:18:19:17:11:18:19:17 chr11 119229964 . G A 1511.41 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433138;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.53;QD=59.8577;RBI=0.0171905;REFB=0;REVB=0.0166359;RO=0;SAF=57;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.17359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18333e-05;OID=.;OPOS=119229964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:44:57:0:0:44:57:0:0 chr11 119244095 . C T 613.08 PASS AF=0.976744;AO=40;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0299368;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.5;QD=57.0303;RBI=0.0384084;REFB=-0.122933;REVB=0.0240623;RO=1;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183934;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.001097;OID=.;OPOS=119244095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:43:43:1:1:40:42:0.976744:25:15:0:1:27:15:1:0 chr11 119252199 . T G 3211.76 PASS AF=1;AO=199;DP=199;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.848;QD=64.2352;RBI=0.063212;REFB=0;REVB=0.0386113;RO=0;SAF=115;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0547e-05;OID=.;OPOS=119252199;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:199:200:0:0:199:200:1:84:115:0:0:84:116:0:0 chr11 119290034 . G C 285.31 PASS AF=0.884615;AO=23;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000497281;FXX=0.0370233;HRUN=6;LEN=1;MLLD=250.056;QD=43.8938;RBI=0.0379734;REFB=-0.00632449;REVB=0.0379701;RO=3;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302969;STB=0.666495;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00014109;OID=.;OPOS=119290034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:26:26:3:3:23:23:0.884615:3:20:0:3:3:20:0:3 chr11 119508832 . G A 200.78 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0285957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.235;QD=20.5933;RBI=0.0287721;REFB=-0.00513278;REVB=-0.00318051;RO=19;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164463;STB=0.593123;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00661657;OID=.;OPOS=119508832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:6:14:10:9:6:14:10:9 chr11 119510644 . A C 3824.07 PASS AF=1;AO=248;DP=250;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00257587;FXX=0.00796781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2666;QD=61.4308;RBI=0.002753;REFB=0.0537991;REVB=-0.000971555;RO=1;SAF=124;SAR=124;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00382867;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.28097e-05;OID=.;OPOS=119510644;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:250:249:1:0:248:249:1:124:124:0:1:125:124:0:0 chr11 119879425 . T C 972.75 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3271;QD=58.9545;RBI=0.0512185;REFB=0;REVB=0.0508879;RO=0;SAF=20;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232619;OID=.;OPOS=119879425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:45:20:0:0:46:20:0:0 chr11 119993897 . CCT C 605.2 PASS AF=0.918033;AO=55;DP=59;FAO=56;FDP=61;FR=.;FRO=5;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.100998;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=2;MLLD=265.587;QD=39.6852;RBI=0.101452;REFB=-0.128512;REVB=0.00959473;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.524581;STBP=0.231;TYPE=del;VARB=0.00379873;OID=.;OPOS=119993898;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.918033:55:59:56:61:5:28:28:4:1:8:0:27:28:0:0 chr11 119999191 . A G 1530.01 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.956;QD=63.7505;RBI=0.0556248;REFB=0;REVB=-0.00659054;RO=0;SAF=61;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113007;OID=.;OPOS=119999191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:35:61:0:0:35:61:0:0 chr11 120040695 . C T 137.69 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.13543;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.7194;QD=17.2113;RBI=0.144481;REFB=-0.0467182;REVB=-0.0503325;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458804;STB=0.526281;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0538904;OID=.;OPOS=120040695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:17:17:15:15:0.46875:9:6:6:11:9:6:6:11 chr11 120041110 . T A 636.5 PASS AF=0.568807;AO=62;DP=109;FAO=62;FDP=109;FR=.;FRO=47;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.009991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.804;QD=23.3577;RBI=0.0102783;REFB=0.00154772;REVB=0.0024132;RO=47;SAF=32;SAR=30;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09694;STB=0.552896;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00116704;OID=.;OPOS=120041110;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:47:47:62:62:0.568807:30:32:30:17:30:32:30:17 chr11 120041444 . C T 199.94 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.00921447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2533;QD=11.5908;RBI=0.0108869;REFB=0.0160458;REVB=0.00579804;RO=44;SAF=16;SAR=9;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322048;STB=0.685314;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0260409;OID=.;OPOS=120041444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:9:16:15:29:9:16:15:29 chr11 120042081 . G A 298.84 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0163822;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.529;QD=20.9714;RBI=0.0177814;REFB=0.0128672;REVB=-0.00691368;RO=26;SAF=7;SAR=24;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129494;STB=0.572231;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00150118;OID=.;OPOS=120042081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:24:7:9:17:24:7:9:17 chr11 120042082 . G A 226.98 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0234034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.014;QD=15.6539;RBI=0.0235857;REFB=-0.00338467;REVB=-0.00292656;RO=32;SAF=9;SAR=17;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145273;STB=0.58148;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00199084;OID=.;OPOS=120042082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:17:9:7:25:17:9:7:25 chr11 120042087 . T C 240.14 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.0258251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.508;QD=16.5617;RBI=0.0365555;REFB=-0.0141699;REVB=0.0258721;RO=31;SAF=9;SAR=18;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120698;STB=0.56752;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0165411;OID=.;OPOS=120042087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:18:9:7:24:18:9:7:24 chr11 120175749 . A G 1780.3 PASS AF=1;AO=110;DP=111;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2612;QD=59.8419;RBI=0.042811;REFB=0;REVB=0.0403232;RO=0;SAF=65;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58497e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131377;OID=.;OPOS=120175749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:111:119:0:0:110:119:1:45:65:0:0:53:66:0:0 chr11 120292570 . T A 858.95 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.175;QD=57.2635;RBI=0.0483831;REFB=0;REVB=0.0196515;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497743;OID=.;OPOS=120292570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:34:21:0:0:35:25:0:0 chr11 120355230 . A G 437.89 PASS AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00686562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3103;QD=19.0386;RBI=0.0231742;REFB=-0.00493378;REVB=0.0221338;RO=47;SAF=19;SAR=25;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539746;STB=0.535876;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0104207;OID=.;OPOS=120355230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:48:44:44:0.478261:25:19:23:24:25:19:24:24 chr11 120745874 . C T 408.19 PASS AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00498408;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.306;QD=17.5564;RBI=0.0141063;REFB=-0.0161553;REVB=-0.0131965;RO=51;SAF=26;SAR=16;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115924;STB=0.50649;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0190989;OID=.;OPOS=120745874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:51:42:42:0.451613:16:26:31:20:16:26:31:20 chr11 120776001 . G A 1005.79 PASS AF=1;AO=41;DP=63;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319668;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.789;QD=60.0472;RBI=0.125781;REFB=0;REVB=0.121651;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634437;OID=.;OPOS=120776001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:67:0:0:41:67:1:11:30:0:0:35:32:0:0 chr11 120827609 . A G 887.03 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0941577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7409;QD=56.3196;RBI=0.104485;REFB=-0.141267;REVB=-0.0452921;RO=1;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125907;STB=0.506665;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00374112;OID=.;OPOS=120827609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:37:25:0:1:37:25:0:1 chr11 120996292 . A G 394.21 PASS AF=0.471264;AO=40;DP=86;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0148403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.889;QD=18.1245;RBI=0.0208039;REFB=-0.0267183;REVB=0.0145797;RO=45;SAF=20;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526896;STB=0.540854;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0286528;OID=.;OPOS=120996292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:45:46:40:41:0.471264:20:20:25:20:21:20:26:20 chr11 120998942 . C T 469.78 PASS AF=0.436975;AO=52;DP=118;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.0218611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.468;QD=15.7909;RBI=0.0246958;REFB=0.00598001;REVB=-0.0114881;RO=66;SAF=21;SAR=31;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103112;STB=0.500503;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=-0.00655245;OID=.;OPOS=120998942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:66:67:52:52:0.436975:31:21:26:40:31:21:27:40 chr11 121000784 . T C 214.09 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0367452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.527;QD=14.7647;RBI=0.036989;REFB=-0.0151444;REVB=-0.00423997;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175106;STB=0.59878;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.026479;OID=.;OPOS=121000784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:24:9:11:14:24:9 chr11 121032978 . G A 609.16 PASS AF=0.97619;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0270687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.353;QD=58.015;RBI=0.0293974;REFB=-0.0364896;REVB=-0.0114672;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.509799;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00154897;OID=.;OPOS=121032978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:42:0:1:39:41:0.97619:16:23:0:0:16:25:1:0 chr11 121038810 . C T 401.44 PASS AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.00830479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.037;QD=18.8914;RBI=0.0125617;REFB=-0.0222256;REVB=0.00942481;RO=44;SAF=21;SAR=20;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746305;STB=0.541527;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0256906;OID=.;OPOS=121038810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:0.482353:20:21:19:25:20:21:19:25 chr11 121403229 . T C 1712.47 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00211342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.735;QD=60.6185;RBI=0.0144859;REFB=0;REVB=-0.0143309;RO=0;SAF=51;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09545e-05;OID=.;OPOS=121403229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:62:51:0:0:62:51:0:0 chr11 121437819 . C G 741.01 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051152;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.867;QD=57.0008;RBI=0.0511542;REFB=0;REVB=-0.000476554;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000487148;OID=.;OPOS=121437819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0 chr11 121448090 . T G 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.134;QD=57.3857;RBI=0.00770502;REFB=0;REVB=-0.00155262;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.84753e-05;OID=.;OPOS=121448090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0 chr11 121475922 . T A 888.51 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0521524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.724;QD=56.4131;RBI=0.055619;REFB=0.0137336;REVB=0.0193287;RO=1;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129354;STB=0.506847;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.000195353;OID=.;OPOS=121475922;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:36:26:0:1:36:26:0:1 chr11 121491782 . G A 1510.79 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.727;QD=63.6123;RBI=0.0387617;REFB=0;REVB=-0.0387371;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123406;OID=.;OPOS=121491782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:55:40:0:0:55:40:0:0 chr11 122322268 . A C 1896.35 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4579;QD=61.6699;RBI=0.0591923;REFB=0;REVB=-0.0303984;RO=0;SAF=33;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011189;OID=.;OPOS=122322268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:90:33:0:0:90:33:0:0 chr11 122430682 . C A 1040.05 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.949;QD=59.4312;RBI=0.0425228;REFB=0;REVB=0.0404376;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104803;OID=.;OPOS=122430682;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:40:28:0:0:42:28:0:0 chr11 122665437 . A G 195.22 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0142619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.498;QD=14.198;RBI=0.0145112;REFB=-0.0210674;REVB=0.00267819;RO=32;SAF=7;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148557;STB=0.585289;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0270825;OID=.;OPOS=122665437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:16:7:14:18:16:7:14:18 chr11 122738718 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.622;QD=40.7629;RBI=0.0484659;REFB=0;REVB=-0.0351838;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00278e-05;OID=.;OPOS=122738718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr11 122742050 . T C 393.1 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.191;QD=56.1572;RBI=0.0243004;REFB=0;REVB=0.0235698;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016152;OID=.;OPOS=122742050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:11:17:0:0 chr11 122795677 . G A 101.58 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0394466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0779;QD=16.9292;RBI=0.0400697;REFB=-0.00867223;REVB=-0.0070387;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374635;STB=0.717016;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0232181;OID=.;OPOS=122795677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:8:4:9:3:8:4 chr11 122795688 . T C 90.33 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0130112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.937;QD=16.4244;RBI=0.0130201;REFB=-0.00287883;REVB=0.00048214;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377341;STB=0.716172;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00636168;OID=.;OPOS=122795688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:4:7:2:9:4:7:2:9 chr11 122805487 . A G 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0108476;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.738;QD=11.9168;RBI=0.0154984;REFB=-0.00903285;REVB=-0.0110693;RO=37;SAF=8;SAR=14;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276134;STB=0.659432;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00976074;OID=.;OPOS=122805487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:14:8:23:14:14:8:23:14 chr11 122848486 . A G 43.92 PASS AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=7;FWDB=-0.0112535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.146;QD=3.37836;RBI=0.0500848;REFB=-0.00178774;REVB=-0.0488041;RO=42;SAF=1;SAR=7;SRF=37;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.760477;STB=0.949342;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.112042;OID=.;OPOS=122848486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:52:52:42:44:8:8:0.153846:7:1:37:5:7:1:37:7 chr11 122928622 . A G 161.84 PASS AF=0.45;AO=15;DP=38;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.058917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.26;QD=16.1844;RBI=0.058918;REFB=-0.0313164;REVB=-0.000343191;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149229;STB=0.524972;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0371403;OID=.;OPOS=122928622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:22:22:15:18:0.45:9:6:12:10:9:9:12:10 chr11 122929624 . A G 502.49 PASS AF=0.580247;AO=47;DP=81;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0162589;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.961;QD=24.8144;RBI=0.0178743;REFB=-0.00381295;REVB=0.00742554;RO=34;SAF=20;SAR=27;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108099;STB=0.505918;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00307915;OID=.;OPOS=122929624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:34:34:47:47:0.580247:27:20:14:20:27:20:14:20 chr11 122943802 . T C 107.15 PASS AF=0.419355;AO=11;DP=29;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0033568;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.502;QD=13.8257;RBI=0.00591417;REFB=-0.00932425;REVB=0.00486922;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697097;STB=0.502614;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0106991;OID=.;OPOS=122943802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:31:18:18:11:13:0.419355:6:5:7:11:8:5:7:11 chr11 122955402 . C T 177.46 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.000305027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.238;QD=21.5108;RBI=0.00614802;REFB=-0.0427937;REVB=0.00614045;RO=15;SAF=5;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226244;STB=0.628102;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0350204;OID=.;OPOS=122955402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:13:5:8:7:13:5:8:7 chr11 123485524 . C T 265.7 PASS AF=0.529412;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0217133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0349;QD=20.8389;RBI=0.0480734;REFB=-0.0365424;REVB=0.0428903;RO=23;SAF=3;SAR=23;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108262;STB=0.516841;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0342723;OID=.;OPOS=123485524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:23:24:26:27:0.529412:23:3:4:19:23:4:4:20 chr11 123600475 . A G 440.32 PASS AF=0.461538;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.00745763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4963;QD=16.9355;RBI=0.0309394;REFB=-0.00854501;REVB=0.0300271;RO=56;SAF=17;SAR=31;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111722;STB=0.562421;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0119921;OID=.;OPOS=123600475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:56:48:48:0.461538:31:17:26:30:31:17:26:30 chr11 123676413 . G A 347.59 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0463058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.727;QD=19.8624;RBI=0.047717;REFB=-0.0299658;REVB=-0.0115192;RO=34;SAF=12;SAR=24;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748637;STB=0.541643;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0351689;OID=.;OPOS=123676413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:24:12:14:20:24:12:14:20 chr11 123753937 . A G 468.12 PASS AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0115826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.213;QD=22.8349;RBI=0.0119475;REFB=-0.0111489;REVB=0.0029299;RO=37;SAF=23;SAR=22;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00197058;STB=0.501084;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0121407;OID=.;OPOS=123753937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:22:23:19:18:22:23:19:18 chr11 123754844 . T C 754.63 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0250193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.177;QD=54.8821;RBI=0.0360035;REFB=-0.0904132;REVB=0.0258899;RO=1;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177809;STB=0.50943;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0040221;OID=.;OPOS=123754844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:26:28:0:1:26:28:0:1 chr11 123777497 . G A 237.72 PASS AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0450592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.542;QD=30.6734;RBI=0.0523181;REFB=-0.0449702;REVB=0.0265865;RO=9;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192277;STB=0.510564;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0295719;OID=.;OPOS=123777497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:31:31:9:9:22:22:0.709677:9:13:5:4:9:13:5:4 chr11 123777536 . G A 367.35 PASS AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0140238;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.854;QD=24.4898;RBI=0.0243163;REFB=-0.0203166;REVB=0.0198649;RO=23;SAF=18;SAR=18;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463718;STB=0.533315;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0178051;OID=.;OPOS=123777536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:23:24:36:36:0.6:18:18:13:10:18:18:14:10 chr11 123777986 . T C 262.91 PASS AF=0.373494;AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0149508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.824;QD=12.6705;RBI=0.0149636;REFB=-0.00945812;REVB=-0.000619177;RO=51;SAF=15;SAR=16;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078664;STB=0.550319;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0162995;OID=.;OPOS=123777986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:52:31:31:0.373494:16:15:21:30:16:15:21:31 chr11 123778031 . G A 181.26 PASS AF=0.311688;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.0132639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.571;QD=9.41611;RBI=0.0161597;REFB=0.000807527;REVB=-0.00923061;RO=50;SAF=13;SAR=11;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162137;STB=0.599062;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00165241;OID=.;OPOS=123778031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:50:53:24:24:0.311688:11:13:20:30:11:13:21:32 chr11 123811013 . G A 479.35 PASS AF=0.647059;AO=44;DP=68;FAO=44;FDP=68;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0209876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.38;QD=28.1973;RBI=0.0218091;REFB=-0.0347581;REVB=0.00592961;RO=24;SAF=22;SAR=22;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0189453;OID=.;OPOS=123811013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:24:24:44:44:0.647059:22:22:12:12:22:22:12:12 chr11 123811344 . C T 164.82 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.0761086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3379;QD=21.2674;RBI=0.0770384;REFB=-0.0166794;REVB=-0.011933;RO=14;SAF=3;SAR=14;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590941;STB=0.83233;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00923149;OID=.;OPOS=123811344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:14:3:13:1:14:3:13:1 chr11 123813795 . T C 412.79 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.0176752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.068;QD=18.7631;RBI=0.0211703;REFB=-0.0287257;REVB=-0.0116521;RO=46;SAF=17;SAR=25;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780333;STB=0.543359;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0262519;OID=.;OPOS=123813795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:25:17:15:31:25:17:15:31 chr11 123814261 . G A 276.96 PASS AF=0.336735;AO=32;DP=97;FAO=33;FDP=98;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0156334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.443;QD=11.3046;RBI=0.0194926;REFB=-0.00500543;REVB=-0.011643;RO=65;SAF=22;SAR=10;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314591;STB=0.666566;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00709325;OID=.;OPOS=123814261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:65:65:32:33:0.336735:10:22:27:38:11:22:27:38 chr11 123814356 . G A 392.98 PASS AF=0.445652;AO=40;DP=91;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0329685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2279;QD=17.0862;RBI=0.0366732;REFB=-0.00307086;REVB=0.0160626;RO=47;SAF=24;SAR=16;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247227;STB=0.647234;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00455483;OID=.;OPOS=123814356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:47:51:40:41:0.445652:16:24:16:31:17:24:16:35 chr11 123814478 . A G 149.67 PASS AF=0.283784;AO=21;DP=74;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0426225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.01;QD=8.0903;RBI=0.0428724;REFB=-0.00729193;REVB=0.00462237;RO=53;SAF=9;SAR=12;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119188;STB=0.571361;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0193376;OID=.;OPOS=123814478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:53:53:21:21:0.283784:12:9:28:25:12:9:28:25 chr11 123886308 . A G 478.12 PASS AF=0.394161;AO=53;DP=135;FAO=54;FDP=137;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=-0.0246127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8503;QD=13.9596;RBI=0.0251059;REFB=-0.030726;REVB=0.00495203;RO=81;SAF=25;SAR=28;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693751;STB=0.532629;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0428823;OID=.;OPOS=123886308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:81:83:53:54:0.394161:28:25:33:48:29:25:34:49 chr11 123886466 . C T 44.32 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0623908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.071;QD=6.81853;RBI=0.0625099;REFB=0.00148276;REVB=-0.00385574;RO=19;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169726;STB=0.609427;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00184786;OID=.;OPOS=123886466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:5:2:8:11:5:2:8:11 chr11 123886681 . A G 76.74 PASS AF=0.168675;AO=14;DP=83;FAO=14;FDP=83;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0324713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7281;QD=3.69845;RBI=0.038399;REFB=-0.0123977;REVB=-0.0204963;RO=67;SAF=7;SAR=7;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843819;STB=0.55414;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0398146;OID=.;OPOS=123886681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:83:83:67:69:14:14:0.168675:7:7:29:38:7:7:30:39 chr11 123886717 . G A 60.07 PASS AF=0.142857;AO=12;DP=84;FAO=12;FDP=84;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0341891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.663;QD=2.86067;RBI=0.0343284;REFB=-0.00238627;REVB=-0.0030892;RO=72;SAF=7;SAR=5;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204086;STB=0.639852;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0202132;OID=.;OPOS=123886717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:84:84:72:72:12:12:0.142857:5:7:30:42:5:7:30:42 chr11 123886822 . C T 643.97 PASS AF=0.492424;AO=65;DP=132;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.000549286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.5;QD=19.5142;RBI=0.00887891;REFB=-0.0153971;REVB=-0.00886191;RO=67;SAF=44;SAR=21;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810745;STB=0.544878;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0141185;OID=.;OPOS=123886822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:67:65:65:0.492424:21:44:40:27:21:44:40:27 chr11 123886865 . T A 682.44 PASS AF=0.463087;AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=0.0171753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9356;QD=18.3206;RBI=0.0230931;REFB=-0.0275495;REVB=0.0154371;RO=80;SAF=44;SAR=25;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516342;STB=0.528684;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0321346;OID=.;OPOS=123886865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:80:80:69:69:0.463087:25:44:47:33:25:44:47:33 chr11 123886984 . A G 828.57 PASS AF=0.59375;AO=76;DP=128;FAO=76;FDP=128;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0104235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.51;QD=25.8929;RBI=0.0256607;REFB=0.0120152;REVB=-0.0234482;RO=52;SAF=29;SAR=47;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768906;STB=0.541833;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=-0.00584669;OID=.;OPOS=123886984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:52:52:76:76:0.59375:47:29:25:27:47:29:25:27 chr11 123887164 . A C 207.55 PASS AF=0.436364;AO=23;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0094728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.508;QD=15.0945;RBI=0.0113425;REFB=-0.0187827;REVB=-0.00623838;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174729;STB=0.607503;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.022;OID=.;OPOS=123887164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:23:24:0.436364:15:8:16:15:16:8:16:15 chr11 123887184 . T G 167.82 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0255518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.215;QD=15.6108;RBI=0.0255794;REFB=-0.00291537;REVB=-0.00118631;RO=25;SAF=6;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195225;STB=0.612774;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00813714;OID=.;OPOS=123887184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:12:6:13:12:12:6:13:12 chr11 123893745 . C T 517.91 PASS AF=0.410072;AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.0497698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5978;QD=14.9037;RBI=0.0509296;REFB=-0.0148269;REVB=0.010807;RO=82;SAF=28;SAR=29;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986664;STB=0.555424;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0209198;OID=.;OPOS=123893745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:82:82:57:57:0.410072:29:28:48:34:29:28:48:34 chr11 123893904 . C T 98.54 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0534322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.166;QD=14.0777;RBI=0.0540845;REFB=-0.0200075;REVB=-0.00837477;RO=16;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822464;STB=0.548112;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0252158;OID=.;OPOS=123893904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:7:5:8:8:7:5:8:8 chr11 123894136 . A G 155.38 PASS AF=0.268293;AO=22;DP=82;FAO=22;FDP=82;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0104886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.254;QD=7.57969;RBI=0.0106799;REFB=-0.0122293;REVB=-0.00201237;RO=60;SAF=15;SAR=7;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283371;STB=0.670984;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0233253;OID=.;OPOS=123894136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:60:60:22:22:0.268293:7:15:27:33:7:15:27:33 chr11 123894234 . A G 468.58 PASS AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0267885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.798;QD=18.0221;RBI=0.0280839;REFB=-0.00896645;REVB=-0.00843072;RO=52;SAF=26;SAR=24;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360696;STB=0.529581;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0121889;OID=.;OPOS=123894234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:54:50:50:0.480769:24:26:25:27:24:26:25:29 chr11 123894246 . A G 518.53 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0221916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2807;QD=18.0357;RBI=0.0227544;REFB=-0.00583649;REVB=-0.00502968;RO=59;SAF=28;SAR=27;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954269;STB=0.548135;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00471028;OID=.;OPOS=123894246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:60:55:55:0.478261:27:28:24:35:27:28:25:35 chr11 123894317 . G T 553.13 PASS AF=0.518182;AO=50;DP=103;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0250033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.915;QD=20.1139;RBI=0.0305798;REFB=-0.00978123;REVB=0.0176056;RO=53;SAF=16;SAR=34;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168826;STB=0.580616;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00877531;OID=.;OPOS=123894317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:110:53:53:50:57:0.518182:34:16:26:27:38:19:26:27 chr11 123894329 . C G 514.69 PASS AF=0.514563;AO=51;DP=102;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.000912754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.315;QD=19.9878;RBI=0.00113312;REFB=-0.0226388;REVB=0.000671452;RO=50;SAF=16;SAR=35;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196334;STB=0.602764;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0175002;OID=.;OPOS=123894329;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:50:50:51:53:0.514563:35:16:26:24:36:17:26:24 chr11 123894402 . A G 240.83 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00268661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.68;QD=14.5957;RBI=0.0780046;REFB=-0.0262984;REVB=0.0779583;RO=37;SAF=5;SAR=24;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427876;STB=0.745152;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.071691;OID=.;OPOS=123894402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:24:5:20:17:24:5:20:17 chr11 123894556 . A G 146.45 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00441368;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.511;QD=22.5305;RBI=0.013664;REFB=0.0147222;REVB=-0.0129315;RO=10;SAF=4;SAR=11;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324202;STB=0.668272;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.0172141;OID=.;OPOS=123894556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:27:26:10:11:15:15:0.576923:11:4:7:3:11:4:7:4 chr11 123900694 . A G 358.82 PASS AF=0.383929;AO=43;DP=113;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=23;FWDB=-0.0123128;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.396;QD=12.8148;RBI=0.0157301;REFB=-0.0168202;REVB=-0.00978938;RO=69;SAF=10;SAR=33;SRF=46;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470308;STB=0.767317;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0223817;OID=.;OPOS=123900694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:69:69:43:43:0.383929:33:10:46:23:33:10:46:23 chr11 123900916 . C T 519.55 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0126091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.983;QD=22.8372;RBI=0.0126912;REFB=-0.00933719;REVB=0.00144091;RO=42;SAF=20;SAR=29;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237362;STB=0.513054;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0072656;OID=.;OPOS=123900916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:29:20:16:26:29:20:16:26 chr11 123909099 . G T 810.58 PASS AF=0.527778;AO=75;DP=147;FAO=76;FDP=144;FR=.;FRO=68;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.00858436;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.778;QD=22.5162;RBI=0.00881588;REFB=-0.0166675;REVB=0.00200711;RO=68;SAF=41;SAR=34;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053345;STB=0.53193;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0127003;OID=.;OPOS=123909099;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:144:68:68:75:76:0.527778:34:41:33:35:34:42:33:35 chr11 123909422 . C T 141.94 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0547247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.332;QD=13.8477;RBI=0.0548058;REFB=-0.00700314;REVB=-0.00298028;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924333;STB=0.553442;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0239776;OID=.;OPOS=123909422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:6:19:11:5:6:19 chr11 123909627 . T C 185.73 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.000391155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.215;QD=13.7578;RBI=0.0522718;REFB=0.000529302;REVB=-0.0522704;RO=29;SAF=17;SAR=5;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354459;STB=0.715908;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00137716;OID=.;OPOS=123909627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:29:32:22:22:0.407407:5:17:13:16:5:17:14:18 chr11 123909695 . G C 436.39 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0125501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.24;QD=21.2874;RBI=0.0404735;REFB=-0.00653398;REVB=0.0384786;RO=39;SAF=16;SAR=27;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360903;STB=0.519917;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00741213;OID=.;OPOS=123909695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:39:39:43:43:0.52439:27:16:13:26:27:16:13:26 chr11 124015994 . C T 1047.64 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493854;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.874;QD=59.8653;RBI=0.0505771;REFB=0;REVB=-0.0109144;RO=0;SAF=42;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22784e-05;OID=.;OPOS=124015994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:28:42:0:0:28:42:0:0 chr11 124056377 . T C 1571.52 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00249018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2938;QD=62.8609;RBI=0.00390944;REFB=-0.0368668;REVB=0.00301375;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000406207;OID=.;OPOS=124056377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:0:1:99:99:0.99:45:54:0:0:45:54:0:1 chr11 124056566 . G A 638.75 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00871592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4308;QD=59.4188;RBI=0.0762966;REFB=0.063474;REVB=0.0757971;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00131413;OID=.;OPOS=124056566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:43:0:1:42:42:0.976744:21:21:0:0:21:21:1:0 chr11 124056732 . T G 1089.44 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0723;QD=59.6952;RBI=0.0748513;REFB=0;REVB=0.0442876;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287734;OID=.;OPOS=124056732;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:73:0:0:64:73:1:42:22:0:0:42:31:0:0 chr11 124056787 . G A 767.2 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.392;QD=63.9334;RBI=0.0558096;REFB=0;REVB=-0.0454641;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.13991e-05;OID=.;OPOS=124056787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:30:17:0:0:30:18:0:0 chr11 124121199 . G C 2013.08 PASS AF=0.992366;AO=129;DP=131;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00137451;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.8;QD=61.468;RBI=0.00648677;REFB=0.036526;REVB=0.00633947;RO=0;SAF=70;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503546;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=5.9103e-05;OID=.;OPOS=124121199;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:131:131:0:1:129:130:0.992366:59:70:0:0:60:70:1:0 chr11 124134743 . G A 542.26 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478399;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4346;QD=60.2514;RBI=0.0634912;REFB=0;REVB=-0.041743;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94708e-05;OID=.;OPOS=124134743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr11 124135009 . G A 1029.46 PASS AF=1;AO=68;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0881;QD=56.409;RBI=0.0464771;REFB=-0.0450357;REVB=0.0090882;RO=1;SAF=28;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165801;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0038764;OID=.;OPOS=124135009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:71:73:1:0:68:73:1:40:28:1:0:41:32:0:0 chr11 124135438 . G A 1552.04 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0083011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4293;QD=62.7086;RBI=0.0391732;REFB=0.0576459;REVB=-0.0382835;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.00361916;OID=.;OPOS=124135438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:0:1:98:98:0.989899:52:46:0:0:52:46:0:1 chr11 124135481 . C T 1587.69 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0778286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5033;QD=64.1492;RBI=0.0839908;REFB=0;REVB=0.031578;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665835;OID=.;OPOS=124135481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0 chr11 124179835 . C T 1759.07 PASS AF=1;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325807;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0654;QD=61.1849;RBI=0.0342841;REFB=0;REVB=-0.0106722;RO=0;SAF=53;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013357;OID=.;OPOS=124179835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:115:0:0:115:115:1:62:53:0:0:62:53:0:0 chr11 124180082 . A G 629.78 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.119;QD=61.4415;RBI=0.03036;REFB=0;REVB=0.0195852;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.95013e-06;OID=.;OPOS=124180082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:26:14:0:0:27:14:0:0 chr11 124180282 . A C 727.57 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.722;QD=63.2672;RBI=0.00595857;REFB=0;REVB=-0.00396801;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.18334e-05;OID=.;OPOS=124180282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0 chr11 124266912 . A G,T 789.32 PASS AF=0.96,0.04;AO=48,2;DP=50;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295295,0.00977042;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=85.098,47.6272;QD=63.1454;RBI=0.0670482,0.0336553;REFB=0,0;REVB=0.0601953,0.0322058;RO=0;SAF=31,0;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00105881,0.124506;OID=.,.;OPOS=124266912,124266912;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:50:50:0:0:48,2:48,2:0.96,0.04:17,2:31,0:0:0:17,2:31,0:0:0 chr11 124267177 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.067571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.384;QD=43.4861;RBI=0.0690996;REFB=0;REVB=-0.0144543;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00066588;OID=.;OPOS=124267177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr11 124267189 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.852;QD=40.7629;RBI=0.0151814;REFB=0;REVB=0.00661706;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101483;OID=.;OPOS=124267189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0 chr11 124294703 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.032;QD=49.5992;RBI=0.0253994;REFB=0;REVB=0.0231658;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154334;OID=.;OPOS=124294703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr11 124310622 . A G 435.84 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00489457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.188;QD=54.4804;RBI=0.0204313;REFB=0.0082325;REVB=0.0198364;RO=1;SAF=6;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183034;STB=0.509798;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.0076266;OID=.;OPOS=124310622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:25:6:0:1:25:6:0:1 chr11 124440617 . C T 1388.73 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0475899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.953;QD=62.4149;RBI=0.0487705;REFB=0;REVB=0.0106663;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.26351e-05;OID=.;OPOS=124440617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:89:0:0:85:89:1:37:48:0:0:41:48:0:0 chr11 124493199 . C A 782.16 PASS AF=0.513699;AO=75;DP=146;FAO=75;FDP=146;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.0011947;FXX=0.00680226;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.149;QD=21.4291;RBI=0.029118;REFB=-0.0292029;REVB=0.0290935;RO=70;SAF=25;SAR=50;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116855;STB=0.568609;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0265695;OID=.;OPOS=124493199;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:70:71:75:75:0.513699:50:25:32:38:50:25:33:38 chr11 124622048 . G T 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0160307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.494;QD=9.19977;RBI=0.0287005;REFB=-0.0136601;REVB=0.0238062;RO=13;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260866;STB=0.66611;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0312595;OID=.;OPOS=124622048;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:6:1:4:9:6:1:4:9 chr11 124742365 . G A 1449.64 PASS AF=1;AO=91;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8258;QD=62.3502;RBI=0.0777465;REFB=0;REVB=0.076734;RO=1;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957612;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275544;OID=.;OPOS=124742365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:1:0:91:93:1:49:42:0:1:50:43:0:0 chr11 124747837 . G A 1358.51 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2435;QD=62.4601;RBI=0.0189449;REFB=0;REVB=0.0123142;RO=0;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.15628e-06;OID=.;OPOS=124747837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:57:30:0:0:57:30:0:0 chr11 124750447 . CCGGAGT C 121.18 PASS AF=0.8;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0555984;FXX=0.117578;HRUN=2;LEN=6;MLLD=278.316;QD=32.3147;RBI=0.0602822;REFB=-0.036181;REVB=0.0232973;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521702;STBP=0.883;TYPE=del;VARB=0.00939917;OID=.;OPOS=124750448;OREF=CGGAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.8:12:17:12:15:3:3:9:1:2:16:0:3:9:0:0 chr11 124766128 . A G 2216.78 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.723;QD=63.3366;RBI=0.0290925;REFB=0;REVB=-0.0198787;RO=0;SAF=63;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58012e-06;OID=.;OPOS=124766128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:77:63:0:0:77:63:0:0 chr11 124767067 . T C 340.23 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.759;QD=54.4363;RBI=0.0598784;REFB=0;REVB=0.031607;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000719668;OID=.;OPOS=124767067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr11 124767125 . G A 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0789831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1026;QD=46.8474;RBI=0.150672;REFB=0;REVB=0.128311;RO=0;SAF=14;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0098182;OID=.;OPOS=124767125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:1:14:0:0:1:14:0:0 chr11 124789755 . T C 1594.79 PASS AF=1;AO=98;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00598403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.067;QD=63.7916;RBI=0.0273276;REFB=0;REVB=0.0266644;RO=0;SAF=38;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58789e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114126;OID=.;OPOS=124789755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:98:100:1:60:38:0:0:62:38:0:0 chr11 124793682 . T C 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.272;QD=64.415;RBI=0.0276896;REFB=0;REVB=0.0201336;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34173e-06;OID=.;OPOS=124793682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr11 124857708 . G A 155.87 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00841599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.178;QD=15.9864;RBI=0.0277091;REFB=-0.0047027;REVB=-0.0264001;RO=21;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198035;STB=0.624856;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00973869;OID=.;OPOS=124857708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:22:17:17:0.435897:7:10:8:13:7:10:8:14 chr11 124862514 . A G 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0561817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6271;QD=16.9412;RBI=0.0575799;REFB=-0.010704;REVB=-0.0126119;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138984;STB=0.579127;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0154236;OID=.;OPOS=124862514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:8:16:10:9:8:16 chr11 124863136 . C A 301.27 PASS AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0434083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.606;QD=16.2848;RBI=0.0499413;REFB=-0.0445462;REVB=-0.0246952;RO=33;SAF=12;SAR=21;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244537;STB=0.603997;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0589872;OID=.;OPOS=124863136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:40:33:33:0.445946:21:12:21:12:21:12:22:18 chr11 124908352 . T C 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00441971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.517;QD=14.1386;RBI=0.00497649;REFB=0.0148589;REVB=0.00228727;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021973;STB=0.512802;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=-0.0210627;OID=.;OPOS=124908352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:6:8:11:9:6:8:11:9 chr11 124947149 . G A 195.19 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.00352698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.005;QD=14.1955;RBI=0.0132659;REFB=-0.0275168;REVB=0.0127885;RO=32;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353356;STB=0.69984;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0433054;OID=.;OPOS=124947149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:14:9:24:8:14:9:24:8 chr11 124947396 . A G 323.08 PASS AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0242457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.949;QD=25.34;RBI=0.0243931;REFB=0.00525031;REVB=-0.00267765;RO=20;SAF=16;SAR=15;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11816;STB=0.564902;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.00427383;OID=.;OPOS=124947396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:15:16:7:13:15:16:7:13 chr11 124955032 . T C 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00607027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.741;QD=19.8494;RBI=0.0550907;REFB=-0.0187898;REVB=0.0547552;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132271;STB=0.574782;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0288678;OID=.;OPOS=124955032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:9:4:7:8:9:4 chr11 124972208 . A G 525.23 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139241;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.23;QD=60.0259;RBI=0.0146912;REFB=0;REVB=0.00468506;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108401;OID=.;OPOS=124972208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr11 124972518 . A G 866.27 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00875714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6532;QD=55.8884;RBI=0.143935;REFB=0;REVB=0.143669;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017801;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00351833;OID=.;OPOS=124972518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:61:62:1:0:59:62:1:26:33:0:1:29:33:0:0 chr11 124972522 . T C 879.72 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000158166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.542;QD=55.8553;RBI=0.0569026;REFB=-0.13758;REVB=0.0569024;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017801;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000755674;OID=.;OPOS=124972522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:63:1:0:59:63:1:26:33:0:1:29:34:0:0 chr11 125003003 . TA T,TG 353.59 PASS AF=0.0384615,0.961538;AO=4,22;DP=26;FAO=1,25;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595943,0.0560694;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=176.225,192.958;QD=54.3991;RBI=0.0645774,0.0618325;REFB=0,0;REVB=0.0248751,0.026067;RO=0;SAF=1,3;SAR=3,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0401895,0.000408559;OID=.,.;OPOS=125003004,125003004;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0384615,0.961538:4,22:26:1,25:26:0:0,4:1,21:0:0:5:0:1,3:3,19:0:0 chr11 125301587 . T C 1211.86 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714902;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.925;QD=61.36;RBI=0.0366498;REFB=0;REVB=-0.0359458;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.69452e-05;OID=.;OPOS=125301587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:35:44:0:0:35:44:0:0 chr11 125452300 . A AC 904.4 PASS AF=0.965517;AO=83;DP=89;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0289495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.1984;QD=41.5817;RBI=0.0442102;REFB=0.0588261;REVB=-0.0334136;RO=6;SAF=24;SAR=59;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056929;STB=0.515869;STBP=0.185;TYPE=ins;VARB=-0.00587255;OID=.;OPOS=125452301;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.965517:83:89:84:87:3:24:60:2:1:5:6:24:59:4:2 chr11 125479363 . G A 1319.11 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5931;QD=62.0759;RBI=0.0207782;REFB=0;REVB=-0.0142044;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00836e-06;OID=.;OPOS=125479363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:52:33:0:0:52:33:0:0 chr11 125479496 . C T 1556.49 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.923;QD=59.8652;RBI=0.0207787;REFB=0;REVB=-0.0022328;RO=0;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40605e-05;OID=.;OPOS=125479496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:53:51:0:0:53:51:0:0 chr11 125525195 . A G 2178.53 PASS AF=1;AO=136;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.771;QD=63.1458;RBI=0.00578549;REFB=0;REVB=-0.0050535;RO=0;SAF=71;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.77427e-06;OID=.;OPOS=125525195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:138:0:0:136:138:1:65:71:0:0:66:72:0:0 chr11 125617610 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.001;QD=57.5452;RBI=0.0222904;REFB=0;REVB=-0.0148915;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61852e-06;OID=.;OPOS=125617610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr11 125648503 . G A 1098.58 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00870581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.648;QD=60.1963;RBI=0.00893238;REFB=0;REVB=-0.00199911;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18446e-05;OID=.;OPOS=125648503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:44:29:0:0:44:29:0:0 chr11 125707761 . A C 261.12 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0120038;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.924;QD=23.7382;RBI=0.0130042;REFB=-0.0394837;REVB=-0.00500178;RO=20;SAF=16;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261468;STB=0.64603;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0354873;OID=.;OPOS=125707761;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:8:16:7:13:8:16:7:13 chr11 125708198 . C T 460.92 PASS AF=1;AO=29;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00558656;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.097;QD=57.6144;RBI=0.0159287;REFB=0;REVB=0.0149169;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131429;OID=.;OPOS=125708198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:29:32:1:10:19:0:0:10:22:0:0 chr11 125763746 . C G 764.02 PASS AF=0.481928;AO=80;DP=166;FAO=80;FDP=166;FR=.;FRO=86;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=0.0275102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9463;QD=18.4101;RBI=0.0467723;REFB=-0.0237798;REVB=0.0378265;RO=86;SAF=35;SAR=45;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516655;STB=0.528498;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0299683;OID=.;OPOS=125763746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:86:86:80:80:0.481928:45:35:33:53:45:35:33:53 chr11 125766044 . C A,T 804.29 PASS AF=0.964912,0.0350877;AO=55,2;DP=57;FAO=55,2;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=33,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185601,0.00397538;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.502,146.391;QD=56.4412;RBI=0.0197737,0.0158197;REFB=0,0;REVB=-0.00682073,0.0153121;RO=0;SAF=22,0;SAR=33,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-9.22703e-06,0.0202054;OID=.,.;OPOS=125766044,125766044;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:57:57:0:0:55,2:55,2:0.964912,0.0350877:33,2:22,0:0:0:33,2:22,0:0:0 chr11 125766173 . A C 714.62 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506816;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.881;QD=57.1693;RBI=0.0535463;REFB=0;REVB=0.0172798;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311717;OID=.;OPOS=125766173;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0 chr11 125769354 . T C 299.05 PASS AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.019126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.606;QD=16.1647;RBI=0.0194616;REFB=-0.0134526;REVB=-0.00359847;RO=41;SAF=6;SAR=27;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387338;STB=0.720918;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0138684;OID=.;OPOS=125769354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:27:6:21:20:27:6:21:20 chr11 125788678 . T C 916.2 PASS AF=0.432314;AO=100;DP=230;FAO=99;FDP=229;FR=.;FRO=130;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=61;FSRR=69;FWDB=0.0212159;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.321;QD=16.0035;RBI=0.0227762;REFB=-0.0079516;REVB=0.00828509;RO=130;SAF=51;SAR=49;SRF=61;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414008;STB=0.520324;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0105722;OID=.;OPOS=125788678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:130:130:100:99:0.432314:49:51:61:69:49:50:61:69 chr11 125830697 . T C 245.25 PASS AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0135019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1292;QD=13.2565;RBI=0.0243433;REFB=0.0129539;REVB=-0.0202557;RO=45;SAF=20;SAR=9;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268167;STB=0.653737;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0208399;OID=.;OPOS=125830697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:9:20:20:25:9:20:20:25 chr11 125830970 . A T 801.3 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.142;QD=57.236;RBI=0.0255636;REFB=0;REVB=0.0151347;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96802e-05;OID=.;OPOS=125830970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0 chr11 125831701 . G A 411.77 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00234229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2309;QD=18.932;RBI=0.0343281;REFB=-0.00386218;REVB=0.0342481;RO=44;SAF=14;SAR=28;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280732;STB=0.661461;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00487977;OID=.;OPOS=125831701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:45:42:42:0.482759:28:14:28:16:28:14:29:16 chr11 125848261 . C T 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00200523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.926;QD=19.8494;RBI=0.00309905;REFB=-0.00390641;REVB=0.00236287;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121067;STB=0.56863;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00403321;OID=.;OPOS=125848261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:8:7:8:5:8:7:8:5 chr11 125891269 . C T 444.76 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0043684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.615;QD=16.4726;RBI=0.0103439;REFB=0.00192855;REVB=-0.0093762;RO=59;SAF=24;SAR=25;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679737;STB=0.537923;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00281869;OID=.;OPOS=125891269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:25:24:33:26:25:24:33:26 chr11 126045822 . T C 428.93 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3081;QD=57.1908;RBI=0.0303561;REFB=0;REVB=-0.0267002;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0002699;OID=.;OPOS=126045822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0 chr11 126074192 . A G 1324.5 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0423175;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.9029;QD=60.8964;RBI=0.0499541;REFB=-0.107869;REVB=-0.0265451;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00167378;OID=.;OPOS=126074192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:0:1:86:86:0.988506:47:39:0:0:47:39:0:1 chr11 126081403 . T C 921.6 PASS AF=1;AO=61;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00231223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.965;QD=56.7137;RBI=0.00301911;REFB=0;REVB=-0.00194129;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161178;OID=.;OPOS=126081403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:65:0:0:61:65:1:24:37:0:0:26:39:0:0 chr11 126135973 . C T 1358.6 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.748;QD=62.4642;RBI=0.0123038;REFB=0;REVB=0.00680129;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.99023e-06;OID=.;OPOS=126135973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:48:39:0:0:48:39:0:0 chr11 126139100 . T C 725.33 PASS AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018052;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.294;QD=54.7416;RBI=0.056114;REFB=-0.028027;REVB=0.053131;RO=1;SAF=36;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129032;STB=0.506664;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000313776;OID=.;OPOS=126139100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:53:1:1:51:52:0.981132:15:36:1:0:15:37:1:0 chr11 126139313 . T A 761.09 PASS AF=0.964912;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000228787;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4101;QD=53.4101;RBI=0.0314558;REFB=-0.0628356;REVB=-0.031455;RO=2;SAF=25;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362231;STB=0.519224;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00889326;OID=.;OPOS=126139313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:58:57:2:2:55:55:0.964912:30:25:2:0:30:25:2:0 chr11 126174164 . C T 751.28 PASS AF=1;AO=45;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9304;QD=55.6506;RBI=0.118559;REFB=0;REVB=0.109283;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00295131;OID=.;OPOS=126174164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:45:54:1:26:19:0:0:33:21:0:0 chr11 126176578 . G A 902.45 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.021;QD=58.2223;RBI=0.0255142;REFB=0;REVB=-0.02391;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.14606e-05;OID=.;OPOS=126176578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0 chr11 126228403 . G C 591.44 PASS AF=0.556701;AO=54;DP=97;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.00817415;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.487;QD=24.3895;RBI=0.00839534;REFB=-0.00222105;REVB=-0.00191442;RO=43;SAF=19;SAR=35;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234766;STB=0.512859;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00201131;OID=.;OPOS=126228403;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:43:43:54:54:0.556701:35:19:14:29:35:19:14:29 chr11 126277216 . C T 284.27 PASS AF=0.370787;AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.00618566;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.912;QD=12.7762;RBI=0.00619838;REFB=-0.00540567;REVB=-0.000396859;RO=55;SAF=15;SAR=18;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216165;STB=0.627693;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.009939;OID=.;OPOS=126277216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:56:33:33:0.370787:18:15:36:19:18:15:37:19 chr11 126278075 . C T 236.27 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0342821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.308;QD=17.5011;RBI=0.0429502;REFB=-0.0142548;REVB=-0.0258738;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203727;STB=0.594828;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0183294;OID=.;OPOS=126278075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:28:26:26:0.481481:11:15:9:17:11:15:11:17 chr11 126278203 . T C 476.61 PASS AF=0.424;AO=53;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.00336144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.769;QD=15.2516;RBI=0.0191468;REFB=-0.0197006;REVB=-0.0188494;RO=72;SAF=24;SAR=29;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200329;STB=0.511242;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0316568;OID=.;OPOS=126278203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:72:72:53:53:0.424:29:24:34:38:29:24:34:38 chr11 126294817 . G A 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.881;QD=56.7054;RBI=0.0895736;REFB=0;REVB=0.0685277;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000810499;OID=.;OPOS=126294817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0 chr11 126310119 . A G 354.35 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.020822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.59;QD=21.4756;RBI=0.0217513;REFB=-0.0207384;REVB=-0.00629012;RO=30;SAF=22;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661074;STB=0.536565;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0180115;OID=.;OPOS=126310119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:14:22:16:14:14:22:16:14 chr11 126310299 . T C 363.51 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0543031;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6169;QD=55.9252;RBI=0.0543146;REFB=0;REVB=-0.0011206;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322648;OID=.;OPOS=126310299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr11 126870418 . C T 324.8 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0120808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.026;QD=17.0949;RBI=0.0122316;REFB=-0.0175867;REVB=0.0019146;RO=41;SAF=18;SAR=17;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923093;STB=0.551669;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0155358;OID=.;OPOS=126870418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:17:18:25:16:17:18:25:16 chr11 127277853 . G A 455.71 PASS AF=0.38806;AO=52;DP=136;FAO=52;FDP=134;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.00155654;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7948;QD=13.6033;RBI=0.0477199;REFB=-0.0115162;REVB=0.0476946;RO=80;SAF=22;SAR=30;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429236;STB=0.532583;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0202242;OID=.;OPOS=127277853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:134:80:82:52:52:0.38806:30:22:37:43:30:22:39:43 chr11 128328913 . G A 338.71 PASS AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.0213618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.467;QD=15.2231;RBI=0.0434436;REFB=-0.013889;REVB=-0.0378288;RO=52;SAF=18;SAR=19;SRF=13;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248745;STB=0.639245;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0198589;OID=.;OPOS=128328913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:19:18:13:39:19:18:13:39 chr11 128333503 . T C 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9864;QD=64.4117;RBI=0.0581919;REFB=0;REVB=0.0343064;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000933862;OID=.;OPOS=128333503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr11 128638215 . CTGGGGGGGC CTGGGGGC,CTGGGGGGC,CTGGGGGGCA,GCTGGGGGGC 341.55 PASS AF=0,0.915789,0,0;AO=16,37,4,4;DP=96;FAO=0,87,0,0;FDP=95;FR=.;FRO=8;FSAF=0,45,0,0;FSAR=0,42,0,0;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.049725,0.0961669,0.0740656,0.00418923;FXX=0.0104156;HRUN=7,7,7,1;LEN=2,1,2,3;MLLD=11.0744,7.26131,19.6024,42.1624;QD=14.3812;RBI=0.0729813,0.146913,0.0792472,0.0675984;REFB=-0.018439,-0.0459871,-0.0189838,0.00957148;REVB=-0.0534201,-0.111064,-0.0281851,-0.0674684;RO=28;SAF=4,23,1,3;SAR=12,14,3,1;SRF=18;SRR=10;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.425675,-0.0177449,-0.420941,0.139064;STB=0.5,0.519646,0.5,0.5;STBP=1,0.199,1,1;TYPE=del,del,mnp,mnp;VARB=0,0.0461418,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=128638217,128638217,128638223,128638215;OREF=GG,G,GC,CTG;OALT=-,-,CA,GCT;OMAPALT=CTGGGGGC,CTGGGGGGC,CTGGGGGGCA,GCTGGGGGGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:19:96:95:28:8:16,37,4,4:0,87,0,0:0,0.915789,0,0:12,14,3,1:4,23,1,3:18:10:0,42,0,0:0,45,0,0:6:2 chr11 128708009 . G A 315.56 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00111836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.908;QD=17.5312;RBI=0.00154093;REFB=-0.0107541;REVB=0.00106006;RO=38;SAF=10;SAR=24;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160238;STB=0.590109;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0134436;OID=.;OPOS=128708009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:24:10:17:21:24:10:17:21 chr11 128781339 . T C 1789.01 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241116;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.225;QD=61.1629;RBI=0.026286;REFB=0;REVB=0.0104682;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70036e-05;OID=.;OPOS=128781339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:65:52:0:0:65:52:0:0 chr11 128781978 . T G 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.522;QD=57.1034;RBI=0.0228052;REFB=0;REVB=-0.0225615;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228045;OID=.;OPOS=128781978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0 chr11 128782002 . T C 1043.63 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.423;QD=59.6362;RBI=0.0212903;REFB=0;REVB=0.0208109;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.66371e-05;OID=.;OPOS=128782002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0 chr11 128782012 . C G 1062.39 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00183565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.742;QD=59.8531;RBI=0.0287169;REFB=0;REVB=-0.0286582;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.45138e-05;OID=.;OPOS=128782012;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0 chr11 128787554 . C T 306.32 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0892;QD=53.2728;RBI=0.14733;REFB=0;REVB=0.0342265;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00394712;OID=.;OPOS=128787554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr11 128805548 . G A 521.38 PASS AF=0.652778;AO=47;DP=72;FAO=47;FDP=72;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00604538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.357;QD=28.9655;RBI=0.0167574;REFB=-0.000867608;REVB=0.015629;RO=25;SAF=23;SAR=24;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195776;STB=0.510634;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.000348315;OID=.;OPOS=128805548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:25:25:47:47:0.652778:24:23:13:12:24:23:13:12 chr11 128805557 . T C 517.13 PASS AF=0.643836;AO=46;DP=72;FAO=47;FDP=73;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0142342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.305;QD=28.3361;RBI=0.0244359;REFB=-0.022233;REVB=0.019862;RO=26;SAF=21;SAR=25;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289793;STB=0.511392;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0085903;OID=.;OPOS=128805557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:26:26:46:47:0.643836:25:21:13:13:25:22:13:13 chr11 128814046 . C T 1618.6 PASS AF=1;AO=106;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0046029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.658;QD=59.9483;RBI=0.0351809;REFB=0;REVB=0.0348785;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1909e-05;OID=.;OPOS=128814046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:106:108:1:49:57:0:0:49:59:0:0 chr11 128868239 . T C 1509.0 PASS AF=0.97;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.000929332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.7;QD=60.3601;RBI=0.00469302;REFB=-0.0116946;REVB=-0.00460009;RO=3;SAF=48;SAR=49;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028718;STB=0.515148;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00413658;OID=.;OPOS=128868239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:100:100:3:3:97:97:0.97:49:48:3:0:49:48:3:0 chr11 129072915 . C G 400.22 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0159442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4247;QD=53.3623;RBI=0.0543718;REFB=-0.0281272;REVB=-0.0519815;RO=1;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238907;STB=0.512812;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-3.84643e-05;OID=.;OPOS=129072915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:19:10:0:1:19:10:0:1 chr11 129312660 . C T 937.48 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2855;QD=58.5924;RBI=0.0373374;REFB=0;REVB=-0.00679145;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305309;OID=.;OPOS=129312660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:25:39:0:0:25:39:0:0 chr11 129321817 . GT G,GG 231.98 PASS AF=0.0526316,0.947368;AO=2,16;DP=19;FAO=1,18;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,15;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228441,0.0130975;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=65.2225,76.3054;QD=48.8378;RBI=0.0632972,0.0513293;REFB=0,0;REVB=0.0590312,0.0496301;RO=0;SAF=1,15;SAR=1,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.026393,0.00719661;OID=.,.;OPOS=129321818,129321818;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0526316,0.947368:2,16:19:1,18:19:0:1,15:0,3:0:0:5:0:1,15:1,1:0:0 chr11 129873028 . C T 990.14 PASS AF=0.569697;AO=94;DP=165;FAO=94;FDP=165;FR=.;FRO=71;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0341701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2108;QD=24.0033;RBI=0.0341762;REFB=-0.0409558;REVB=-0.000644603;RO=70;SAF=51;SAR=43;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115442;STB=0.509039;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0258157;OID=.;OPOS=129873028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:70:71:94:94:0.569697:43:51:39:31:43:51:40:31 chr11 130066334 . A AT 141.66 PASS AF=1;AO=4;DP=28;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369734;FXX=0.142806;HRUN=0;LEN=1;MLLD=71.9487;QD=23.6103;RBI=0.0379135;REFB=0;REVB=0.00839073;RO=23;SAF=3;SAR=1;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353723;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000664588;OID=.;OPOS=130066335;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:4:28:24:24:0:13:11:0:0:3:23:3:1:10:13 chr11 130066335 . C G,T 368.1 PASS AF=0.148148,0.851852;AO=4,23;DP=27;FAO=4,23;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=3,10;FSAR=1,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0946031,-0.0340501;FXX=0.0357015;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=28.5857,108.751;QD=54.5332;RBI=0.111954,0.0346413;REFB=0,0;REVB=-0.0598657,0.00637228;RO=0;SAF=3,10;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.164633,0.00655094;OID=.,.;OPOS=130066335,130066335;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:17:27:27:0:0:4,23:4,23:0.148148,0.851852:1,13:3,10:0:0:1,13:3,10:0:0 chr11 130271678 . T G 785.15 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00976055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.786;QD=57.1018;RBI=0.0377188;REFB=0;REVB=0.0364341;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100309;OID=.;OPOS=130271678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:19:36:0:0:19:36:0:0 chr11 130281488 . G A 417.96 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0304417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.329;QD=53.9298;RBI=0.0483161;REFB=-0.0525197;REVB=0.0375199;RO=1;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198449;STB=0.510631;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00108318;OID=.;OPOS=130281488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:23:7:0:1:23:7:0:1 chr11 130340962 . A G 586.92 PASS AF=0.433566;AO=62;DP=143;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=0.00600967;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.85;QD=16.4173;RBI=0.0136614;REFB=-0.0235556;REVB=-0.0122686;RO=80;SAF=38;SAR=24;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116299;STB=0.561902;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0273561;OID=.;OPOS=130340962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:80:81:62:62:0.433566:24:38:40:40:24:38:41:40 chr11 130542882 . C T 1587.21 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0704;QD=64.1298;RBI=0.0377218;REFB=0;REVB=-0.00157822;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247605;OID=.;OPOS=130542882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:46:53:0:0:46:53:0:0 chr11 130750642 . A C 1080.5 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.044;QD=60.0278;RBI=0.022093;REFB=0;REVB=0.0160119;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33988e-05;OID=.;OPOS=130750642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0 chr11 130775688 . C T 1208.97 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.798;QD=61.2137;RBI=0.0409855;REFB=0;REVB=0.00856812;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57641e-05;OID=.;OPOS=130775688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:44:34:0:0:44:35:0:0 chr11 130775782 . C T 1525.84 PASS AF=0.954955;AO=106;DP=110;FAO=106;FDP=111;FR=.;FRO=5;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0109179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.277;QD=54.9852;RBI=0.0186408;REFB=-0.141896;REVB=0.0151089;RO=3;SAF=61;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0048758;STB=0.51038;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.000473748;OID=.;OPOS=130775782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:110:111:3:5:106:106:0.954955:45:61:2:1:45:61:4:1 chr11 130776524 . T C 612.36 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.036546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.841;QD=56.9632;RBI=0.036582;REFB=-0.170088;REVB=0.00162357;RO=1;SAF=16;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284198;STB=0.529397;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00327771;OID=.;OPOS=130776524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:43:43:1:2:41:41:0.953488:25:16:1:0:25:16:2:0 chr11 130776613 . A G 601.14 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00781223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.167;QD=58.6481;RBI=0.0091707;REFB=-0.055506;REVB=-0.00480321;RO=1;SAF=16;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284076;STB=0.515144;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00104346;OID=.;OPOS=130776613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:24:16:1:0:24:16:1:0 chr11 130777886 . G A 475.46 PASS AF=0.448276;AO=52;DP=117;FAO=52;FDP=116;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0131738;FXX=0.0169477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.255;QD=16.3951;RBI=0.0180003;REFB=-0.0242684;REVB=-0.0122662;RO=63;SAF=17;SAR=35;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755001;STB=0.538841;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0404607;OID=.;OPOS=130777886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:63:64:52:52:0.448276:35:17:25:38:35:17:25:39 chr11 130780015 . C T 1418.78 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200341;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.088;QD=63.057;RBI=0.0403768;REFB=0;REVB=0.035056;RO=0;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21731e-05;OID=.;OPOS=130780015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:53:37:0:0:53:37:0:0 chr11 130780225 . C A 1416.26 PASS AF=0.959184;AO=94;DP=98;FAO=94;FDP=98;FR=.;FRO=4;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0790135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4218;QD=57.8065;RBI=0.0795946;REFB=-0.175159;REVB=0.00960064;RO=2;SAF=46;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201665;STB=0.520829;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00968135;OID=.;OPOS=130780225;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:98:98:2:4:94:94:0.959184:48:46:2:0:48:46:4:0 chr11 130784396 . G A 366.99 PASS AF=0.351562;AO=45;DP=128;FAO=45;FDP=128;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=-0.00715351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.498;QD=11.4683;RBI=0.0216382;REFB=-0.0058713;REVB=0.0204215;RO=82;SAF=22;SAR=23;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563179;STB=0.527988;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0113189;OID=.;OPOS=130784396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:82:83:45:45:0.351562:23:22:36:46:23:22:37:46 chr11 130784488 . A G 264.13 PASS AF=0.326531;AO=32;DP=98;FAO=32;FDP=98;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=0.00130516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.027;QD=10.7807;RBI=0.0721589;REFB=-0.00278572;REVB=-0.0721471;RO=66;SAF=16;SAR=16;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877508;STB=0.550989;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00678518;OID=.;OPOS=130784488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:66:66:32:32:0.326531:16:16:38:28:16:16:38:28 chr11 130784616 . T C 52.25 PASS AF=0.470588;AO=7;DP=16;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0156737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.559;QD=12.2951;RBI=0.0201865;REFB=-0.0297644;REVB=-0.0127213;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318742;STB=0.646722;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0187156;OID=.;OPOS=130784616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:16:17:9:9:7:8:0.470588:4:3:7:2:4:4:7:2 chr11 130784694 . C T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.018859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.962;QD=13.486;RBI=0.0217828;REFB=-0.0171207;REVB=-0.0109009;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119999;STB=0.571265;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0200985;OID=.;OPOS=130784694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:6:5:3:6:6:5 chr11 130784707 . C T 100.74 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00843268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.12;QD=16.119;RBI=0.0180813;REFB=0.00374687;REVB=-0.0159945;RO=13;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285023;STB=0.66637;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.00264849;OID=.;OPOS=130784707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:3:9:6:7:3:9:6:7 chr11 130784754 . C G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.471;QD=61.6837;RBI=0.0299741;REFB=0;REVB=-0.0202991;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000457904;OID=.;OPOS=130784754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:12:29:0:0:12:29:0:0 chr11 130784971 . C G 766.13 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00630264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.104;QD=63.8441;RBI=0.0422467;REFB=0;REVB=0.0417739;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216092;OID=.;OPOS=130784971;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr11 130785205 . G A 148.13 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00439251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6405;QD=17.9553;RBI=0.0213764;REFB=-0.00534721;REVB=-0.0209202;RO=17;SAF=14;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475184;STB=0.777366;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00606652;OID=.;OPOS=130785205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:2:14:8:9:2:14:8:9 chr11 130785304 . T C 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.017074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.858;QD=13.7531;RBI=0.028461;REFB=-0.00055825;REVB=-0.0227707;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32362;STB=0.689773;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00111279;OID=.;OPOS=130785304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:4:11:10:13:4:11:10:13 chr11 131531000 . T C 3061.66 PASS AF=1;AO=178;DP=178;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.122;QD=63.127;RBI=0.0255189;REFB=0;REVB=0.0105628;RO=0;SAF=74;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.4924e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37326e-06;OID=.;OPOS=131531000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:178:194:0:0:178:194:1:104:74:0:0:115:79:0:0 chr11 131531015 . T G 3154.89 PASS AF=0.981132;AO=204;DP=208;FAO=208;FDP=212;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=127;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0174366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.055;QD=59.5262;RBI=0.0199805;REFB=-0.0381623;REVB=-0.00975615;RO=3;SAF=80;SAR=124;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00793166;STB=0.502191;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.000325768;OID=.;OPOS=131531015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:208:212:3:4:204:208:0.981132:124:80:2:1:127:81:2:2 chr11 131531223 . A G 1572.47 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00491894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0407;QD=62.8986;RBI=0.0149073;REFB=-0.0256659;REVB=-0.0140724;RO=1;SAF=37;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126468;STB=0.506665;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00294947;OID=.;OPOS=131531223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:62:37:1:0:62:37:1:0 chr11 131531564 . A T 1822.51 PASS AF=0.991736;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0100675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.933;QD=60.2481;RBI=0.0424031;REFB=-0.0421454;REVB=-0.0411907;RO=1;SAF=62;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0075998;STB=0.503936;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00135112;OID=.;OPOS=131531564;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:121:1:1:119:120:0.991736:57:62:1:0:57:63:1:0 chr11 131531720 . C T 1172.11 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00652263;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.584;QD=60.8891;RBI=0.00816607;REFB=0;REVB=0.00491324;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.52464e-05;OID=.;OPOS=131531720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:37:40:0:0:37:40:0:0 chr11 132177633 . A C 1545.96 PASS AF=1;AO=101;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143184;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=355.799;QD=58.8938;RBI=0.0185683;REFB=0;REVB=0.0118221;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031335;OID=.;OPOS=132177633;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:105:0:0:101:105:1:51:50:0:0:53:52:0:0 chr11 133714522 . G A 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5448;QD=59.1424;RBI=0.113867;REFB=0;REVB=0.00729999;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403812;OID=.;OPOS=133714522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:32:35:0:0:32:35:0:0 chr11 133788992 . T C 137.76 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0242028;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.383;QD=10.8049;RBI=0.0323536;REFB=-0.0176926;REVB=-0.0214705;RO=35;SAF=12;SAR=5;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271459;STB=0.523133;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0305724;OID=.;OPOS=133788992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:35:34:17:17:0.333333:5:12:24:11:5:12:23:11 chr11 133805585 . C T 322.91 PASS AF=0.363636;AO=40;DP=111;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=0.0155386;FXX=0.0090082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.182;QD=11.7421;RBI=0.0161939;REFB=-0.00394764;REVB=0.00455996;RO=66;SAF=18;SAR=22;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104032;STB=0.567901;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0065692;OID=.;OPOS=133805585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:66:70:40:40:0.363636:22:18:36:30:22:18:39:31 chr11 133814191 . A G 2325.62 PASS AF=1;AO=145;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.185;QD=63.7156;RBI=0.00848496;REFB=0;REVB=0.0081521;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00122e-05;OID=.;OPOS=133814191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:146:0:0:145:146:1:68:77:0:0:69:77:0:0 chr11 134151975 . G C 1625.6 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00232168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.514;QD=60.2073;RBI=0.0404274;REFB=0;REVB=0.0403607;RO=0;SAF=45;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77626e-05;OID=.;OPOS=134151975;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:108:0:0:105:108:1:60:45:0:0:63:45:0:0 chr11 134179686 . C T 1682.31 PASS AF=0.99115;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00976614;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.956;QD=59.5507;RBI=0.0295886;REFB=-0.0393159;REVB=0.0279304;RO=1;SAF=54;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008116;STB=0.504273;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000513866;OID=.;OPOS=134179686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:113:1:1:112:112:0.99115:58:54:0:1:58:54:0:1 chr11 134182375 . G A 1048.2 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0251445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.624;QD=58.2334;RBI=0.0647188;REFB=-0.127141;REVB=0.0596345;RO=1;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106271;STB=0.505616;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000850103;OID=.;OPOS=134182375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:44:27:0:1:44:27:0:1 chr11 134188542 . T C 495.62 PASS AF=0.442623;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=122;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0307278;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.679;QD=16.2497;RBI=0.0308093;REFB=-0.00368032;REVB=0.00224043;RO=67;SAF=33;SAR=21;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903426;STB=0.55512;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00371607;OID=.;OPOS=134188542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:67:68:54:54:0.442623:21:33:35:32:21:33:35:33 chr11 134244123 . C G 791.86 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0229215;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.108;QD=53.6854;RBI=0.0296119;REFB=-0.0714297;REVB=0.0187475;RO=1;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136707;STB=0.514281;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000399394;OID=.;OPOS=134244123;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:1:2:57:57:0.966102:34:23:0:1:34:23:0:2 chr11 134249321 . T C 1541.19 PASS AF=1;AO=76;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.92;QD=62.9055;RBI=0.0665576;REFB=0;REVB=0.064695;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000840781;OID=.;OPOS=134249321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:98:0:0:76:98:1:31:45:0:0:53:45:0:0 chr12 90902 . C T 2251.55 PASS AF=0.993056;AO=141;DP=143;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0713879;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.313;QD=62.5431;RBI=0.0767994;REFB=-0.119712;REVB=0.028318;RO=1;SAF=60;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583436;STB=0.503067;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.000621669;OID=.;OPOS=90902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:143:144:1:1:141:143:0.993056:81:60:0:1:81:62:0:1 chr12 92119 . T C 123.79 PASS AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0484032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.182;QD=8.68722;RBI=0.0997412;REFB=-0.0229789;REVB=-0.0872091;RO=40;SAF=12;SAR=5;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754078;STB=0.545399;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0558504;OID=.;OPOS=92119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:40:40:17:17:0.298246:5:12:26:14:5:12:26:14 chr12 92920 . C G 42.05 PASS AF=0.0902256;AO=12;DP=133;FAO=12;FDP=133;FR=.;FRO=121;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=77;FSRR=44;FWDB=0.0614401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8034;QD=1.26452;RBI=0.0688571;REFB=-0.00430969;REVB=-0.0310873;RO=121;SAF=6;SAR=6;SRF=77;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161481;STB=0.623866;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0412073;OID=.;OPOS=92920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:133:133:121:121:12:12:0.0902256:6:6:77:44:6:6:77:44 chr12 92991 . C G 126.17 PASS AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00966918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6438;QD=10.9715;RBI=0.0271487;REFB=0.000607937;REVB=-0.0253684;RO=31;SAF=10;SAR=5;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104373;STB=0.562414;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00513744;OID=.;OPOS=92991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:5:10:18:13:5:10:18:13 chr12 235022 . C T 214.24 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016849;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.34;QD=45.104;RBI=0.0633779;REFB=0.0200897;REVB=0.0610973;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517223;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.000994858;OID=.;OPOS=235022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:4:14:0:0:4:14:1:0 chr12 248445 . G T 470.94 PASS AF=0.46789;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.03997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.969;QD=17.2822;RBI=0.0427782;REFB=-0.0322133;REVB=0.0152436;RO=58;SAF=20;SAR=31;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217357;STB=0.62084;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0404924;OID=.;OPOS=248445;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:58:58:51:51:0.46789:31:20:36:22:31:20:36:22 chr12 280349 . C A 778.03 PASS AF=0.426471;AO=87;DP=204;FAO=87;FDP=204;FR=.;FRO=117;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=58;FSRR=59;FWDB=-0.000129356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6815;QD=15.2556;RBI=0.0274475;REFB=-0.0164121;REVB=0.0274472;RO=115;SAF=45;SAR=42;SRF=57;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220544;STB=0.512341;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0226707;OID=.;OPOS=280349;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:115:117:87:87:0.426471:42:45:57:58:42:45:58:59 chr12 284058 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2188;QD=44.6887;RBI=0.0154142;REFB=0;REVB=0.00401462;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456264;OID=.;OPOS=284058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0 chr12 311949 . A G 229.35 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.0109926;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6842;QD=13.9;RBI=0.0532419;REFB=0.0145174;REVB=-0.0520948;RO=39;SAF=13;SAR=14;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238188;STB=0.634415;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.0308838;OID=.;OPOS=311949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:39:39:27:27:0.409091:14:13:10:29:14:13:10:29 chr12 319111 . T C 270.11 PASS AF=0.355556;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.023859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.158;QD=12.005;RBI=0.0243115;REFB=-0.0225246;REVB=-0.00466831;RO=57;SAF=11;SAR=21;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207641;STB=0.625452;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0355371;OID=.;OPOS=319111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:57:58:32:32:0.355556:21:11:30:27:21:11:31:27 chr12 319125 . A G 214.75 PASS AF=0.3375;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00335662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.615;QD=10.7376;RBI=0.0209474;REFB=-0.0102508;REVB=-0.0206767;RO=52;SAF=11;SAR=16;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127383;STB=0.580405;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0170421;OID=.;OPOS=319125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:53:27:27:0.3375:16:11:27:25:16:11:28:25 chr12 332362 . C T 205.22 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0128268;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.617;QD=22.1863;RBI=0.0200237;REFB=-0.0184639;REVB=-0.015376;RO=17;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199317;STB=0.612074;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0299949;OID=.;OPOS=332362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:17:17:20:20:0.540541:7:13:7:10:7:13:7:10 chr12 393489 . CTTTTTTTTTTTT CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA,TCTTTTTTTTTTT 382.32 PASS AF=0.3,0.66,0.02;AO=9,15,2;DP=53;FAO=15,33,1;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=7,14,0;FSAR=8,19,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.314174,-0.215706,-0.0222053;FXX=0.0740604;HRUN=12,12,2;LEN=1,1,2;MLLD=6.91469,16.5425,158.591;QD=30.5856;RBI=0.320566,0.23068,0.0815341;REFB=0.0845874,0.026563,0.0093323;REVB=-0.0637002,-0.0817577,-0.0784521;RO=6;SAF=2,6,0;SAR=7,9,2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.232701,-0.0527419,-0.606693;STB=0.529373,0.512813,0.5;STBP=0.534,0.524,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.194492,-0.0557933,0.0462279;OID=.,.,.;OPOS=393490,393501,393489;OREF=T,T,CT;OALT=-,A,TC;OMAPALT=CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA,TCTTTTTTTTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:54:53:50:6:1:9,15,2:15,33,1:0.3,0.66,0.02:7,9,2:2,6,0:3:3:8,19,1:7,14,0:0:1 chr12 406292 . G A 1568.52 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00239989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.982;QD=64.0212;RBI=0.0129914;REFB=0;REVB=0.0127678;RO=0;SAF=33;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37112e-05;OID=.;OPOS=406292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:65:33:0:0:65:33:0:0 chr12 427575 . A G 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.067354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3058;QD=57.7111;RBI=0.0675112;REFB=0;REVB=0.00460403;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000407765;OID=.;OPOS=427575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0 chr12 498114 . G A 725.87 PASS AF=0.503546;AO=69;DP=140;FAO=71;FDP=141;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=0.0206698;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.535;QD=20.5921;RBI=0.0217263;REFB=-0.0150021;REVB=0.00669268;RO=71;SAF=31;SAR=38;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532892;STB=0.51752;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0134101;OID=.;OPOS=498114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:71:70:69:71:0.503546:38:31:36:35:38:33:35:35 chr12 662448 . T C 1525.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.239;QD=59.8331;RBI=0.0430011;REFB=0;REVB=0.0239007;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47753e-05;OID=.;OPOS=662448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:54:48:0:0:54:48:0:0 chr12 666860 . G A 201.17 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0251714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.792;QD=20.6329;RBI=0.069122;REFB=-0.0201512;REVB=-0.0643759;RO=19;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682328;STB=0.538423;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0205605;OID=.;OPOS=666860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:10:10:8:11:10:10:8:11 chr12 862989 . T C 990.29 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5439;QD=59.1218;RBI=0.0721991;REFB=0;REVB=-0.0532433;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105716;OID=.;OPOS=862989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:26:41:0:0:26:41:0:0 chr12 939302 . A G 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.191;QD=64.4145;RBI=0.0492417;REFB=0;REVB=0.0105476;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392221;OID=.;OPOS=939302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0 chr12 974404 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.256;QD=59.4357;RBI=0.0258932;REFB=0;REVB=0.0170892;RO=0;SAF=3;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24882e-05;OID=.;OPOS=974404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:32:3:0:0:32:3:0:0 chr12 987482 . G A 715.0 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0317806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.534;QD=60.8514;RBI=0.0370807;REFB=-0.00242752;REVB=-0.0191043;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507689;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=7.20985e-05;OID=.;OPOS=987482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:47:0:1:46:46:0.978723:32:14:0:0:32:14:0:1 chr12 990912 . A C 850.43 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00801514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.683;QD=57.6563;RBI=0.00846503;REFB=0;REVB=-0.00272289;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.08609e-05;OID=.;OPOS=990912;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:29:28:0:0:29:30:0:0 chr12 993930 . C T 867.53 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.406;QD=57.8353;RBI=0.0394821;REFB=0;REVB=0.0155333;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211075;OID=.;OPOS=993930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0 chr12 994487 . G C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.987;QD=57.5451;RBI=0.031081;REFB=0;REVB=0.0293216;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74812e-05;OID=.;OPOS=994487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:36:22:0:0:36:22:0:0 chr12 1017197 . C G,T 278.85 PASS AF=0.136364,0.863636;AO=3,18;DP=21;FAO=3,19;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3,8;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277936,-0.00973812;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=63.0867,84.2951;QD=50.6992;RBI=0.0695021,0.0142155;REFB=0,0;REVB=-0.0637028,-0.0103561;RO=0;SAF=3,8;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.096206,0.000898625;OID=.,.;OPOS=1017197,1017197;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:21:22:0:0:3,18:3,19:0.136364,0.863636:0,10:3,8:0:0:0,11:3,8:0:0 chr12 1017780 . AG AGC,GC 65.59 PASS AF=0.234043,0.0638298;AO=9,2;DP=48;FAO=11,3;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=8,3;FSAR=3,0;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0924339,-0.0285056;FXX=0.020829;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=18.9689,146.275;QD=5.58195;RBI=0.0926905,0.0285221;REFB=-0.0579522,6.25528e-05;REVB=-0.00689208,0.000969851;RO=35;SAF=6,2;SAR=3,0;SRF=14;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.317037,0.483574;STB=0.761451,0.997233;STBP=0.081,0.023;TYPE=ins,mnp;VARB=0.19822,0.171697;OID=.,.;OPOS=1017782,1017780;OREF=-,AG;OALT=C,GC;OMAPALT=AGC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:48:47:35:33:9,2:11,3:0.234043,0.0638298:3,0:6,2:14:21:3,0:8,3:12:21 chr12 1020506 . C CACTA 864.91 PASS AF=0.913043;AO=62;DP=70;FAO=63;FDP=69;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0127485;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=4;MLLD=221.706;QD=50.1399;RBI=0.0220003;REFB=-0.0232062;REVB=0.0179301;RO=6;SAF=35;SAR=27;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456969;STB=0.509801;STBP=0.614;TYPE=ins;VARB=0.00155558;OID=.;OPOS=1020507;OREF=-;OALT=ACTA;OMAPALT=CACTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.913043:62:70:63:69:6:35:28:4:2:25:6:35:27:5:1 chr12 1590013 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000547733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.679;QD=55.6558;RBI=0.0134129;REFB=0;REVB=0.0134017;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134165;OID=.;OPOS=1590013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr12 1590069 . G A 238.54 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6543;QD=50.2181;RBI=0.0241183;REFB=0;REVB=-0.0240901;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000842948;OID=.;OPOS=1590069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr12 1902766 . T G 1500.02 PASS AF=0.945946;AO=106;DP=112;FAO=105;FDP=111;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0183156;FXX=0.00892777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.261;QD=54.0548;RBI=0.0210754;REFB=-0.0212341;REVB=-0.0104263;RO=2;SAF=47;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158148;STB=0.524585;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.000316059;OID=.;OPOS=1902766;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:112:111:2:6:106:105:0.945946:59:47:0:2:58:47:0:6 chr12 1955786 . G A 89.96 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.00682333;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.129;QD=13.3279;RBI=0.0245659;REFB=0.012076;REVB=-0.0235992;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153343;STB=0.567454;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.0149097;OID=.;OPOS=1955786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:29:27:18:16:11:11:0.407407:8:3:3:15:8:3:3:13 chr12 1965210 . C T 379.21 PASS AF=0.387931;AO=45;DP=116;FAO=45;FDP=116;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.024533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1308;QD=13.0762;RBI=0.0247478;REFB=-0.0120327;REVB=0.00325355;RO=69;SAF=24;SAR=21;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742363;STB=0.533319;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0124231;OID=.;OPOS=1965210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:69:71:45:45:0.387931:21:24:32:37:21:24:34:37 chr12 1965369 . G A 530.93 PASS AF=0.504587;AO=55;DP=109;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0501589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4984;QD=19.4838;RBI=0.0503571;REFB=-0.0196653;REVB=0.00446334;RO=54;SAF=23;SAR=32;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743305;STB=0.541074;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0213638;OID=.;OPOS=1965369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:54:54:55:55:0.504587:32:23:27:27:32:23:27:27 chr12 1995403 . T C 1861.92 PASS AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0189591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.883;QD=60.5503;RBI=0.0976574;REFB=0.0416846;REVB=0.0957994;RO=1;SAF=71;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664454;STB=0.503496;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00038227;OID=.;OPOS=1995403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:123:1:1:122:122:0.99187:51:71:1:0:51:71:1:0 chr12 2022196 . G A 179.05 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00698378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4454;QD=12.5652;RBI=0.0538024;REFB=-0.0131601;REVB=0.0533473;RO=35;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07608;STB=0.54382;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0190726;OID=.;OPOS=2022196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:11:11:15:20:11:11:15:20 chr12 2062323 . T TTGC 418.83 PASS AF=0.842105;AO=26;DP=49;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.118454;FXX=0.0499875;HRUN=2;LEN=3;MLLD=182.065;QD=44.0868;RBI=0.139279;REFB=-0.161029;REVB=0.0732611;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869229;STB=0.526865;STBP=0.485;TYPE=ins;VARB=0.0339636;OID=.;OPOS=2062324;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=TTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.842105:26:49:32:38:6:21:11:3:3:34:20:17:9:11:9 chr12 2705260 . G T 178.71 PASS AF=0.387755;AO=18;DP=48;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0223472;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.385;QD=14.5886;RBI=0.0224058;REFB=-0.0223217;REVB=-0.00161964;RO=30;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324644;STB=0.665807;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0298913;OID=.;OPOS=2705260;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:30:30:18:19:0.387755:7:11:9:21:8:11:9:21 chr12 2788879 . G A 269.53 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0055373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.957;QD=16.5865;RBI=0.00704069;REFB=-0.0120164;REVB=0.00434853;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123787;STB=0.562458;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0173955;OID=.;OPOS=2788879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:34:35:30:30:0.461538:12:18:16:18:12:18:17:18 chr12 2791130 . CGA TAG 271.18 PASS AF=0.430556;AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00126458;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=178.711;QD=15.0653;RBI=0.0208806;REFB=-0.0128391;REVB=-0.0208423;RO=41;SAF=7;SAR=23;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422282;STB=0.743498;STBP=0.003;TYPE=mnp;VARB=0.0166516;OID=.;OPOS=2791130;OREF=CGA;OALT=TAG;OMAPALT=TAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:30:31:0.430556:23:7:26:15:24:7:26:15 chr12 2791205 . A G 1106.71 PASS AF=0.986842;AO=73;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0160936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.479;QD=58.2477;RBI=0.018022;REFB=-0.0847624;REVB=0.00811101;RO=1;SAF=33;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141179;STB=0.507244;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000205768;OID=.;OPOS=2791205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:73:75:0.986842:40:33:1:0:41:34:1:0 chr12 2968458 . T C 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=68.623;QD=53.275;RBI=0.0684892;REFB=0;REVB=-0.0559907;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00207468;OID=.;OPOS=2968458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr12 2973615 . T C 248.33 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=-0.00489196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.116;QD=11.6859;RBI=0.00779373;REFB=-0.0112781;REVB=0.00606721;RO=55;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283399;STB=0.662236;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0131446;OID=.;OPOS=2973615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:13:17:17:38:13:17:17:38 chr12 2996113 . A G 272.01 PASS AF=0.355556;AO=31;DP=89;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.00246668;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.307;QD=12.0892;RBI=0.00300004;REFB=0.00027157;REVB=0.00170755;RO=57;SAF=15;SAR=16;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106472;STB=0.564276;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.000594936;OID=.;OPOS=2996113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:57:58:31:32:0.355556:16:15:33:24:17:15:33:25 chr12 2996174 . A G 1044.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.556;QD=59.6791;RBI=0.0285922;REFB=0;REVB=0.0258314;RO=0;SAF=42;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77591e-05;OID=.;OPOS=2996174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:28:42:0:0:28:42:0:0 chr12 2997397 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000312693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.215;QD=56.7064;RBI=0.0232299;REFB=0;REVB=0.0232278;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028178;OID=.;OPOS=2997397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr12 3046802 . A G 332.87 PASS AF=0.5;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00720023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.058;QD=19.0212;RBI=0.0130511;REFB=-0.0131345;REVB=0.0108852;RO=34;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126586;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0159297;OID=.;OPOS=3046802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:34:35:35:35:0.5:18:17:17:17:18:17:17:18 chr12 3049698 . T C 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00650365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.244;QD=22.6322;RBI=0.017854;REFB=-0.0205458;REVB=0.0166273;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145706;STB=0.581968;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0188514;OID=.;OPOS=3049698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:7:6:2:6:7:6:2:6 chr12 3310439 . C T 377.35 PASS AF=0.5;AO=37;DP=76;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.010641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.029;QD=19.3514;RBI=0.0106411;REFB=-0.0196623;REVB=2.88073e-05;RO=39;SAF=18;SAR=19;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713605;STB=0.538391;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0229473;OID=.;OPOS=3310439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:39:39:37:39:0.5:19:18:22:17:20:19:22:17 chr12 3387697 . T C 586.59 PASS AF=0.504202;AO=60;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0565099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7093;QD=19.7173;RBI=0.0639878;REFB=-0.00587193;REVB=-0.0300179;RO=57;SAF=34;SAR=26;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204601;STB=0.503702;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00507682;OID=.;OPOS=3387697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:57:59:60:60:0.504202:26:34:31:26:26:34:33:26 chr12 3391032 . T G 416.91 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0119296;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.71;QD=19.3909;RBI=0.0206462;REFB=-0.0136838;REVB=-0.0168509;RO=42;SAF=21;SAR=21;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858642;STB=0.534867;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0102581;OID=.;OPOS=3391032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:42:44:42:42:0.488372:21:21:17:25:21:21:19:25 chr12 3393419 . C T 543.31 PASS AF=0.53125;AO=51;DP=96;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00916545;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.658;QD=22.6379;RBI=0.0109202;REFB=-0.00788233;REVB=0.0059367;RO=45;SAF=22;SAR=29;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872497;STB=0.54805;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00703431;OID=.;OPOS=3393419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:45:45:51:51:0.53125:29:22:24:21:29:22:24:21 chr12 3409277 . C T 786.93 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00967019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.686;QD=55.2234;RBI=0.0153785;REFB=-0.10104;REVB=0.0119576;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000573637;OID=.;OPOS=3409277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:35:21:0:0:35:21:0:1 chr12 3701464 . G A 240.02 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.00657239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.616;QD=14.5466;RBI=0.00660583;REFB=0.00334234;REVB=0.000663798;RO=38;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280533;STB=0.658121;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.00513458;OID=.;OPOS=3701464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:12:16:11:27:12:16:11:27 chr12 3749874 . T C 308.41 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00744151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.535;QD=18.4127;RBI=0.0174903;REFB=-0.0208263;REVB=0.0158283;RO=33;SAF=16;SAR=17;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135613;STB=0.567137;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.014573;OID=.;OPOS=3749874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:34:33:33:0.492537:17:16:21:12:17:16:21:13 chr12 3782647 . A T 393.11 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00345431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.819;QD=19.6553;RBI=0.0095567;REFB=-0.0196449;REVB=-0.00891056;RO=40;SAF=27;SAR=13;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144694;STB=0.580604;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0114545;OID=.;OPOS=3782647;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:13:27:21:19:13:27:21:19 chr12 3782701 . C T 368.6 PASS AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0322149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.085;QD=19.3999;RBI=0.0342062;REFB=-0.0034609;REVB=-0.0115006;RO=38;SAF=27;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229769;STB=0.628308;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00662597;OID=.;OPOS=3782701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:11:27:18:20:11:27:18:20 chr12 4388084 . C G 194.26 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0927202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9625;QD=17.2671;RBI=0.0930573;REFB=0.0108864;REVB=-0.00791435;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398935;STB=0.5333;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-0.0164056;OID=.;OPOS=4388084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:10:10:11:13:10:10:11:14 chr12 4414126 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.582;QD=45.8068;RBI=0.00228599;REFB=0;REVB=-0.00228599;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.55362e-05;OID=.;OPOS=4414126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:14:0:0:0:14:0:0:0 chr12 4459032 . G A 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.077766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.244;QD=16.2714;RBI=0.0922104;REFB=0.0026731;REVB=-0.0495501;RO=18;SAF=12;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285111;STB=0.66642;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.00793884;OID=.;OPOS=4459032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:3:12:10:8:3:12:10:8 chr12 4462161 . C T 109.24 PASS AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00863729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.149;QD=8.56766;RBI=0.0748079;REFB=-0.00406906;REVB=-0.0743076;RO=37;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101049;STB=0.561709;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00934718;OID=.;OPOS=4462161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:8:6:19:18:8:6:19:18 chr12 4554548 . G C 1487.03 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7216;QD=63.2781;RBI=0.0888756;REFB=0;REVB=0.0660135;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00087508;OID=.;OPOS=4554548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:51:42:0:0:52:42:0:0 chr12 4702173 . C T 112.08 PASS AF=0.283019;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0576386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9334;QD=8.4587;RBI=0.0602142;REFB=-0.00244827;REVB=0.0174224;RO=38;SAF=9;SAR=6;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179757;STB=0.608878;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00323383;OID=.;OPOS=4702173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:38:38:15:15:0.283019:6:9:17:21:6:9:17:21 chr12 4705317 . C T 206.93 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0160165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2505;QD=17.2444;RBI=0.0173628;REFB=-0.00685366;REVB=0.00670359;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159191;STB=0.509082;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00955142;OID=.;OPOS=4705317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:15:12:9:12:15:12 chr12 4714247 . A T 340.41 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0336108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.616;QD=18.1552;RBI=0.0389786;REFB=0.0037606;REVB=0.0197395;RO=39;SAF=13;SAR=23;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282971;STB=0.515781;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.00336551;OID=.;OPOS=4714247;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:23:13:13:26:23:13:13:26 chr12 4716513 . C T 180.85 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0172904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.855;QD=13.9118;RBI=0.0212283;REFB=-0.027061;REVB=-0.012316;RO=31;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579029;STB=0.533301;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0378226;OID=.;OPOS=4716513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:12:9:15:16:12:9:15:16 chr12 4716572 . C A 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.064467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4372;QD=14.0974;RBI=0.0658577;REFB=-0.0121099;REVB=-0.0134627;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147914;STB=0.586076;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0150055;OID=.;OPOS=4716572;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:7:11:6:7:7:11 chr12 4735734 . T C 507.07 PASS AF=0.477876;AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0140229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.86;QD=17.9493;RBI=0.0160218;REFB=-0.000115892;REVB=0.0077495;RO=59;SAF=32;SAR=22;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127919;STB=0.571024;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00024802;OID=.;OPOS=4735734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:59:59:54:54:0.477876:22:32:27:32:22:32:27:32 chr12 4735737 . A G 594.08 PASS AF=0.547009;AO=58;DP=106;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.0197611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5811;QD=20.3103;RBI=0.121954;REFB=-0.0327543;REVB=-0.120342;RO=48;SAF=26;SAR=32;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195618;STB=0.597836;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.044331;OID=.;OPOS=4735737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:117:48:53:58:64:0.547009:32:26:33:15:38:26:33:20 chr12 4735894 . G A 207.64 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00665199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6152;QD=15.1011;RBI=0.0114143;REFB=-0.00357733;REVB=-0.00927566;RO=31;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675675;STB=0.538429;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00523364;OID=.;OPOS=4735894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:14:10:15:16:14:10:15:16 chr12 4736086 . A G 115.11 PASS AF=0.325581;AO=13;DP=42;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0437804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5735;QD=10.7076;RBI=0.060434;REFB=0.00822736;REVB=0.04166;RO=29;SAF=10;SAR=3;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35114;STB=0.724929;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.0225342;OID=.;OPOS=4736086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:29:29:13:14:0.325581:3:10:14:15:3:11:14:15 chr12 4736495 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.244;QD=57.0006;RBI=0.0467124;REFB=0;REVB=0.0232607;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.53253e-05;OID=.;OPOS=4736495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:21:33:0:0:21:33:0:0 chr12 4736631 . A G 1589.82 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.3749;QD=59.9934;RBI=0.0127491;REFB=0;REVB=-0.00298039;RO=0;SAF=43;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01834e-05;OID=.;OPOS=4736631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:63:43:0:0:63:43:0:0 chr12 4736677 . G C,T 1432.58 PASS AF=0.945652,0.0543478;AO=87,5;DP=92;FAO=87,5;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42,0;FSAR=45,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00877114,-0.0195598;FXX=0.0315756;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.6705,157.828;QD=62.2862;RBI=0.0269374,0.0195901;REFB=0,0;REVB=0.0254694,0.00108939;RO=0;SAF=42,0;SAR=45,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.519e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00311914,0.110397;OID=.,.;OPOS=4736677,4736677;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:92:92:0:0:87,5:87,5:0.945652,0.0543478:45,5:42,0:0:0:45,5:42,0:0:0 chr12 4736690 . A G 1491.54 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1478;QD=63.4698;RBI=0.0235011;REFB=0;REVB=-0.0193395;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164018;OID=.;OPOS=4736690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:93:94:1:51:42:0:0:51:43:0:0 chr12 4737318 . A G 37.14 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00252402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.372;QD=8.25379;RBI=0.0114414;REFB=-0.0126063;REVB=-0.0111596;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.583773;STB=0.860959;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0440256;OID=.;OPOS=4737318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:3:9:1:5:3:9 chr12 4737459 . C T 176.78 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00126912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.941;QD=13.3417;RBI=0.00693798;REFB=-0.00763724;REVB=-0.00682092;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222055;STB=0.627786;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0132717;OID=.;OPOS=4737459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:13:8:19:13:13:8:19:13 chr12 4737715 . C T 407.05 PASS AF=0.5;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0183993;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.392;QD=19.8563;RBI=0.0189088;REFB=-0.0168573;REVB=0.00435973;RO=41;SAF=14;SAR=27;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11675;STB=0.564964;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0171312;OID=.;OPOS=4737715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:41:41:41:41:0.5:27:14:19:22:27:14:19:22 chr12 4740515 . A T 785.25 PASS AF=0.490909;AO=81;DP=165;FAO=81;FDP=165;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.00450609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.077;QD=19.0365;RBI=0.0166897;REFB=-0.013012;REVB=0.0160699;RO=83;SAF=34;SAR=47;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801253;STB=0.547409;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0109288;OID=.;OPOS=4740515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:83:84:81:81:0.490909:47:34:42:41:47:34:43:41 chr12 4794351 . A G 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000349744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.48;QD=60.8833;RBI=0.0228077;REFB=0;REVB=0.022805;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04108e-05;OID=.;OPOS=4794351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0 chr12 4921228 . T C 439.28 PASS AF=0.458333;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0326951;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3417;QD=18.3035;RBI=0.0486148;REFB=-0.0108831;REVB=0.0359782;RO=51;SAF=31;SAR=13;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291942;STB=0.659173;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0116165;OID=.;OPOS=4921228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:96:51:52:44:44:0.458333:13:31:21:30:13:31:22:30 chr12 4921301 . T C 270.04 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00142037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.7;QD=22.9822;RBI=0.00165492;REFB=-0.00170277;REVB=-0.0008493;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079192;STB=0.504421;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.00138575;OID=.;OPOS=4921301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:10:15:13:9:10:15:13:9 chr12 4922030 . C G 672.22 PASS AF=0.61165;AO=63;DP=103;FAO=63;FDP=103;FR=.;FRO=40;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0043195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.485;QD=26.1057;RBI=0.0147169;REFB=-0.0240625;REVB=0.0140687;RO=39;SAF=32;SAR=31;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146096;STB=0.503082;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0135583;OID=.;OPOS=4922030;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:39:40:63:63:0.61165:31:32:19:20:31:32:20:20 chr12 4922734 . A G 177.47 PASS AF=0.487179;AO=18;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0067678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.361;QD=18.2023;RBI=0.0107938;REFB=-0.00742004;REVB=-0.00840847;RO=21;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969551;STB=0.517223;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00957944;OID=.;OPOS=4922734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:20:18:19:0.487179:12:6:9:12:12:7:8:12 chr12 4923049 . T C 298.71 PASS AF=0.5;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0163048;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.602;QD=18.6693;RBI=0.0185534;REFB=0.0148068;REVB=0.00885349;RO=29;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12549;STB=0.578536;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0146976;OID=.;OPOS=4923049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:64:29:32:32:32:0.5:19:13:16:13:19:13:18:14 chr12 4923364 . T C 367.23 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0107717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.762;QD=19.0766;RBI=0.0145408;REFB=-0.00639743;REVB=-0.00976766;RO=39;SAF=18;SAR=20;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034558;STB=0.519221;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0064528;OID=.;OPOS=4923364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:20:18:17:22:20:18:17:22 chr12 4923697 . G T 613.41 PASS AF=0.496063;AO=50;DP=130;FAO=63;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.00295779;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.785;QD=19.32;RBI=0.0121724;REFB=-0.0109032;REVB=0.0118076;RO=65;SAF=20;SAR=30;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185913;STB=0.607809;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0113261;OID=.;OPOS=4923697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:127:65:64:50:63:0.496063:30:20:38:27:39:24:38:26 chr12 5021228 . T C 352.8 PASS AF=0.480519;AO=36;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0274441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.324;QD=18.3273;RBI=0.0277795;REFB=-0.0140232;REVB=0.00430401;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021012;STB=0.504948;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0108233;OID=.;OPOS=5021228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:40:40:36:37:0.480519:17:19:22:18:17:20:22:18 chr12 5021348 . G C 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0506076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.372;QD=16.199;RBI=0.0529082;REFB=-0.0130637;REVB=0.015432;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0117206;OID=.;OPOS=5021348;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:1:2:2:3:1:2 chr12 5021984 . T A 972.7 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.888;QD=58.9513;RBI=0.0448249;REFB=0;REVB=0.0254849;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381569;OID=.;OPOS=5021984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0 chr12 5022041 . G A 127.66 PASS AF=0.56;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0195891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.224;QD=20.4258;RBI=0.0277401;REFB=-7.01766e-05;REVB=0.0196413;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976611;STB=0.57133;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=8.06806e-05;OID=.;OPOS=5022041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:25:11:11:13:14:0.56:5:8:8:3:6:8:8:3 chr12 5022438 . C T 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0142288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.846;QD=12.1431;RBI=0.026986;REFB=-0.00600479;REVB=-0.02293;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779767;STB=0.545407;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0117589;OID=.;OPOS=5022438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:9:10:15:18:9:10:15:18 chr12 5023713 . T C 244.17 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00723124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.108;QD=15.2606;RBI=0.0966785;REFB=-0.0100773;REVB=0.0964077;RO=34;SAF=20;SAR=8;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767275;STB=0.56696;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00884455;OID=.;OPOS=5023713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:36:28:28:0.4375:8:20:22:12:8:20:22:14 chr12 5023959 . A T 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0122509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2729;QD=22.3964;RBI=0.0122515;REFB=0.024757;REVB=0.000115912;RO=23;SAF=19;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117188;STB=0.565902;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0316517;OID=.;OPOS=5023959;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:6:19:15:8:6:19:15:8 chr12 5025094 . T C 632.95 PASS AF=0.6;AO=60;DP=106;FAO=63;FDP=105;FR=.;FRO=42;FSAF=47;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.00166046;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.701;QD=24.1124;RBI=0.0549996;REFB=-0.0130137;REVB=0.0549745;RO=40;SAF=47;SAR=13;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352151;STB=0.508445;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00703035;OID=.;OPOS=5025094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:40:42:60:63:0.6:13:47:30:10:16:47:32:10 chr12 5026471 . C T 114.28 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0420983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0425;QD=10.1581;RBI=0.043114;REFB=-0.0114819;REVB=0.00930342;RO=31;SAF=6;SAR=8;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244568;STB=0.645764;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0135957;OID=.;OPOS=5026471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:8:6:20:11:8:6:20:11 chr12 5154462 . T C,G 818.57 PASS AF=0.916667,0.0666667;AO=55,4;DP=60;FAO=55,4;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30,0;FSAR=25,4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0630209,-0.0200854;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=88.619,152.139;QD=54.5714;RBI=0.0671358,0.0203526;REFB=-0.0568537,-0.0573246;REVB=0.0231424,-0.00328698;RO=0;SAF=30,0;SAR=25,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5098,0.5;STBP=0.336,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00265868,0.109235;OID=.,.;OPOS=5154462,5154462;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:16:60:60:0:1:55,4:55,4:0.916667,0.0666667:25,4:30,0:0:0:25,4:30,0:0:1 chr12 5155663 . A T 1017.11 PASS AF=0.5;AO=99;DP=198;FAO=99;FDP=198;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=66;FSRF=40;FSRR=59;FWDB=-0.00588977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.779;QD=20.5476;RBI=0.0105855;REFB=-0.0167968;REVB=0.00879565;RO=98;SAF=33;SAR=66;SRF=39;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064176;STB=0.538737;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0148385;OID=.;OPOS=5155663;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:98:99:99:99:0.5:66:33:39:59:66:33:40:59 chr12 5603632 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.51;QD=56.7066;RBI=0.0423683;REFB=0;REVB=0.00979733;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186153;OID=.;OPOS=5603632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr12 5674754 . G A 586.45 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.301;QD=60.1487;RBI=0.0418813;REFB=0;REVB=0.041341;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112655;OID=.;OPOS=5674754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0 chr12 6054395 . A G 152.15 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0265933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.809;QD=13.23;RBI=0.0277972;REFB=-0.0019134;REVB=0.00809209;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582759;STB=0.534205;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.002708;OID=.;OPOS=6054395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:13:4:8:21:13:4:8:21 chr12 6091000 . A G 1951.15 PASS AF=1;AO=125;DP=126;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.989;QD=61.4537;RBI=0.0262996;REFB=0;REVB=0.00326115;RO=1;SAF=61;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772572;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98832e-05;OID=.;OPOS=6091000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:126:127:1:0:125:127:1:64:61:1:0:65:62:0:0 chr12 6105387 . G A 689.32 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00631635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.464;QD=62.6653;RBI=0.0072025;REFB=0;REVB=0.00346117;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71925e-05;OID=.;OPOS=6105387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr12 6127535 . T G 108.56 PASS AF=0.173913;AO=19;DP=114;FAO=20;FDP=115;FR=.;FRO=95;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=50;FSRR=45;FWDB=-0.00850795;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.225;QD=3.77616;RBI=0.0281166;REFB=-0.00891711;REVB=-0.0267985;RO=95;SAF=14;SAR=5;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280116;STB=0.650118;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0392937;OID=.;OPOS=6127535;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:95:95:19:20:0.173913:5:14:50:45:6:14:50:45 chr12 6127891 . C A 187.83 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0672871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.5307;QD=10.8886;RBI=0.0696227;REFB=-0.00465205;REVB=-0.0178821;RO=45;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622878;STB=0.536202;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00986025;OID=.;OPOS=6127891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:12:12:20:25:12:12:20:25 chr12 6127919 . T G 198.27 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.00532323;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.319;QD=10.7174;RBI=0.00533086;REFB=-0.0141015;REVB=-0.000285148;RO=48;SAF=12;SAR=13;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695297;STB=0.546888;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.025418;OID=.;OPOS=6127919;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:48:49:25:25:0.337838:13:12:26:22:13:12:27:22 chr12 6127943 . A G 196.26 PASS AF=0.342466;AO=25;DP=73;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.023364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.982;QD=10.7538;RBI=0.0239397;REFB=-0.00350983;REVB=0.00521864;RO=48;SAF=12;SAR=13;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116414;STB=0.567632;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00417323;OID=.;OPOS=6127943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:48:48:25:25:0.342466:13:12:28:20:13:12:28:20 chr12 6128443 . T C 200.31 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0162971;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2386;QD=19.5422;RBI=0.0276007;REFB=-0.0310092;REVB=-0.0222756;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180259;STB=0.510194;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0323443;OID=.;OPOS=6128443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:21:21:20:20:0.487805:12:8:8:13:12:8:8:13 chr12 6143984 . T C 413.51 PASS AF=0.525641;AO=40;DP=79;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.026474;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.514;QD=21.2054;RBI=0.0273783;REFB=0.00274888;REVB=0.00697837;RO=37;SAF=26;SAR=14;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247017;STB=0.521462;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.00257833;OID=.;OPOS=6143984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:37:37:40:41:0.525641:14:26:25:12:15:26:25:12 chr12 6172202 . T C 627.37 PASS AF=0.442953;AO=62;DP=142;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=-0.00592457;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.351;QD=16.8421;RBI=0.0233624;REFB=-0.041704;REVB=-0.0225987;RO=79;SAF=28;SAR=34;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067746;STB=0.520254;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0483165;OID=.;OPOS=6172202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:149:79:83:62:66:0.442953:34:28:41:38:35:31:42:41 chr12 6173433 . C T 771.56 PASS AF=0.513889;AO=74;DP=145;FAO=74;FDP=144;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00292744;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.307;QD=21.4323;RBI=0.0154317;REFB=-0.00541932;REVB=0.0151515;RO=69;SAF=40;SAR=34;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080109;STB=0.54053;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0045847;OID=.;OPOS=6173433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:69:70:74:74:0.513889:34:40:31:38:34:40:32:38 chr12 6174414 . T G 279.91 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0056669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.106;QD=14.1724;RBI=0.005684;REFB=-0.0169998;REVB=-0.000440626;RO=47;SAF=17;SAR=15;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24262;STB=0.636922;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0254953;OID=.;OPOS=6174414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:15:17:14:33:15:17:14:33 chr12 6174423 . T A 280.92 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.00965066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.832;QD=14.406;RBI=0.0267453;REFB=-0.0163172;REVB=-0.0249435;RO=46;SAF=17;SAR=15;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234119;STB=0.632042;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0159785;OID=.;OPOS=6174423;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:15:17:14:32:15:17:14:32 chr12 6204902 . CA C 272.47 PASS AF=0.685714;AO=24;DP=35;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00547787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7425;QD=31.1395;RBI=0.00911051;REFB=-0.0180127;REVB=-0.00727972;RO=11;SAF=13;SAR=11;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548556;STB=0.530096;STBP=0.6;TYPE=del;VARB=0.0150168;OID=.;OPOS=6204903;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.685714:24:35:24:35:11:13:11:7:4:80:11:13:11:7:4 chr12 6344600 . C A 384.14 PASS AF=0.47619;AO=38;DP=82;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00741228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.555;QD=18.2922;RBI=0.0273163;REFB=0.000205215;REVB=0.0262914;RO=43;SAF=18;SAR=20;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526437;STB=0.509634;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=6.89495e-05;OID=.;OPOS=6344600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:43:44:38:40:0.47619:20:18:18:25:22:18:19:25 chr12 6484709 . T C 702.12 PASS AF=1;AO=30;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.695;QD=55.0683;RBI=0.117562;REFB=0;REVB=0.0531366;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248513;OID=.;OPOS=6484709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:30:51:1:14:16:0:0:14:37:0:0 chr12 6495275 . C A 972.0 PASS AF=0.957746;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00991706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.589;QD=54.7604;RBI=0.0204618;REFB=-0.0432951;REVB=0.0178979;RO=3;SAF=26;SAR=42;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00414429;STB=0.502194;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00214399;OID=.;OPOS=6495275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:71:71:3:3:68:68:0.957746:42:26:1:2:42:26:1:2 chr12 6500105 . T G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.483;QD=49.5992;RBI=0.042581;REFB=0;REVB=0.00138537;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0004045;OID=.;OPOS=6500105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr12 6554628 . G A 262.05 PASS AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=0.00333755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.062;QD=12.4784;RBI=0.0104798;REFB=0.00603945;REVB=0.00993409;RO=53;SAF=12;SAR=19;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786026;STB=0.544976;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.011566;OID=.;OPOS=6554628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:53:53:31:31:0.369048:19:12:17:36:19:12:17:36 chr12 6560473 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.392;QD=45.8068;RBI=0.0543363;REFB=0;REVB=-0.0445447;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135084;OID=.;OPOS=6560473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr12 6562285 . C T 256.12 PASS AF=0.5;AO=24;DP=52;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.005007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.132;QD=18.2944;RBI=0.00773233;REFB=-0.0254363;REVB=-0.00589227;RO=28;SAF=8;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231975;STB=0.58991;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0213702;OID=.;OPOS=6562285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:56:28:28:24:28:0.5:16:8:16:12:17:11:16:12 chr12 6562293 . C T 208.87 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0102305;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.976;QD=16.3822;RBI=0.0360205;REFB=-0.0375181;REVB=-0.0345371;RO=26;SAF=8;SAR=15;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218565;STB=0.606232;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.032212;OID=.;OPOS=6562293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:26:28:23:23:0.45098:15:8:15:11:15:8:15:13 chr12 6562753 . A G 708.52 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2434;QD=62.9795;RBI=0.0315285;REFB=0;REVB=0.0265407;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510524;OID=.;OPOS=6562753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:23:21:0:0:23:22:0:0 chr12 6562768 . G C 153.29 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0273948;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=73.4869;QD=13.9356;RBI=0.0276046;REFB=-0.00990935;REVB=-0.00339661;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192031;STB=0.588131;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.042463;OID=.;OPOS=6562768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:44:25:27:17:17:0.386364:7:10:10:15:7:10:12:15 chr12 6562810 . A G 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.76;QD=53.2754;RBI=0.0283891;REFB=0;REVB=-0.00175113;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229482;OID=.;OPOS=6562810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr12 6562823 . C T 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0106055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.395;QD=10.6348;RBI=0.0192303;REFB=-0.0182143;REVB=-0.0160414;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912387;STB=0.555414;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0380994;OID=.;OPOS=6562823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:3:5:7:6:3:5:7:6 chr12 6562836 . G A 46.09 PASS AF=0.368421;AO=6;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00387137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.406;QD=9.70283;RBI=0.0266633;REFB=-0.00180879;REVB=0.0263807;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545324;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00415163;OID=.;OPOS=6562836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:19:12:12:6:7:0.368421:3:3:6:6:3:4:6:6 chr12 6572048 . A G 616.98 PASS AF=0.976744;AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0284444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2366;QD=57.3931;RBI=0.0344103;REFB=-0.000859475;REVB=-0.0193645;RO=1;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208513;STB=0.511106;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000826763;OID=.;OPOS=6572048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:41:42:0.976744:22:19:0:1:22:20:0:1 chr12 6573146 . T C 374.08 PASS AF=0.52;AO=38;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0843932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9395;QD=19.951;RBI=0.0847515;REFB=-0.00103205;REVB=-0.00778478;RO=36;SAF=20;SAR=18;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168423;STB=0.585788;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.000697209;OID=.;OPOS=6573146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:36:36:38:39:0.52:18:20:12:24:19:20:12:24 chr12 6575044 . G T 344.8 PASS AF=0.6;AO=29;DP=49;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0326827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7988;QD=27.5842;RBI=0.0348434;REFB=0.000750381;REVB=-0.0120792;RO=20;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138096;STB=0.580591;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.000565587;OID=.;OPOS=6575044;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:20:20:29:30:0.6:17:12:12:8:18:12:12:8 chr12 6619284 . C G 255.68 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0171008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.227;QD=17.9423;RBI=0.017229;REFB=-0.0146927;REVB=-0.00209797;RO=29;SAF=11;SAR=17;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114913;STB=0.564449;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0157196;OID=.;OPOS=6619284;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:17:11:15:14:17:11:15:14 chr12 6637845 . T C 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0103481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.49;QD=16.2716;RBI=0.0303037;REFB=-0.00650818;REVB=0.0284821;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198855;STB=0.614306;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0108341;OID=.;OPOS=6637845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:11:7:9:6:11:7 chr12 6639088 . A G 398.18 PASS AF=0.435644;AO=44;DP=100;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0155639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.43;QD=15.7695;RBI=0.0158925;REFB=-0.0322383;REVB=0.00321504;RO=54;SAF=23;SAR=21;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508048;STB=0.509087;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0336835;OID=.;OPOS=6639088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:54:57:44:44:0.435644:21:23:31:23:20:24:32:25 chr12 6646320 . T C 248.03 PASS AF=0.5;AO=25;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0276952;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4917;QD=18.3723;RBI=0.0310278;REFB=-0.0318361;REVB=0.0139894;RO=26;SAF=8;SAR=17;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653606;STB=0.54051;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0112568;OID=.;OPOS=6646320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:27:25:27:0.5:17:8:10:16:18:9:11:16 chr12 6647109 . T C 144.03 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0917579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.596;QD=15.161;RBI=0.0919165;REFB=-0.0260543;REVB=0.00539617;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454969;STB=0.526283;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0284454;OID=.;OPOS=6647109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:8:8:12:10:8:8:12:10 chr12 6835068 . A G 244.2 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0475403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7737;QD=23.2572;RBI=0.0487238;REFB=-0.0165198;REVB=0.0106739;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123796;STB=0.569013;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00538383;OID=.;OPOS=6835068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:12:11:12:7:12:11:12:7 chr12 6835081 . G A 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00831416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.557;QD=19.3695;RBI=0.0290679;REFB=0.00153134;REVB=0.0278535;RO=14;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041916;STB=0.511613;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.000469082;OID=.;OPOS=6835081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:15:16:16:0.516129:5:11:9:5:5:11:10:5 chr12 6836852 . A G 207.84 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.031039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4841;QD=17.6888;RBI=0.0316478;REFB=-0.0264723;REVB=0.0061777;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15506;STB=0.588392;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0333826;OID=.;OPOS=6836852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:13:8:14:12:13:8:14:12 chr12 6836913 . G T 167.07 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00478484;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.339;QD=14.5277;RBI=0.00567291;REFB=-0.00511406;REVB=-0.00304748;RO=26;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139073;STB=0.584519;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00709126;OID=.;OPOS=6836913;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:26:28:18:18:0.391304:12:6:12:14:12:6:13:15 chr12 6840209 . G A 200.63 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0264512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5748;QD=15.1422;RBI=0.0340467;REFB=-0.031355;REVB=0.0214362;RO=30;SAF=7;SAR=16;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357661;STB=0.703407;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0507481;OID=.;OPOS=6840209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:16:7:20:10:16:7:20:10 chr12 6887020 . T C 1395.3 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260348;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.174;QD=62.0134;RBI=0.0596236;REFB=0;REVB=0.0536393;RO=1;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111493;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177885;OID=.;OPOS=6887020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:1:0:88:90:1:42:46:0:1:44:46:0:0 chr12 6925149 . C T 101.82 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00443736;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.834;QD=15.6647;RBI=0.00969285;REFB=-0.0230446;REVB=0.0086175;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13274;STB=0.576798;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0266638;OID=.;OPOS=6925149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:5:9:6:6:5:9 chr12 6926363 . T C 569.27 PASS AF=1;AO=28;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133213;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.0908;QD=52.955;RBI=0.133727;REFB=0;REVB=-0.0117137;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00577268;OID=.;OPOS=6926363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:28:43:1:25:3:0:0:25:18:0:0 chr12 6928075 . T C 239.08 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.835;QD=50.3317;RBI=0.0527416;REFB=0;REVB=0.0410351;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610689;OID=.;OPOS=6928075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:12:7:0:0 chr12 6928569 . T A 372.18 PASS AF=0.448276;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0132789;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.443;QD=17.1119;RBI=0.0139921;REFB=-0.0307429;REVB=-0.00441028;RO=50;SAF=20;SAR=19;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673572;STB=0.527452;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0345601;OID=.;OPOS=6928569;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:50:48:39:39:0.448276:19:20:29:21:19:20:27:21 chr12 6928586 . CA AG 898.23 PASS AF=0.970149;AO=63;DP=68;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.116504;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=2;MLLD=45.5397;QD=53.6257;RBI=0.116655;REFB=-0.0454386;REVB=-0.00592174;RO=4;SAF=29;SAR=34;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0044918;STB=0.514281;STBP=0.219;TYPE=mnp;VARB=0.00351931;OID=.;OPOS=6928586;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:67:4:2:63:65:0.970149:34:29:2:2:34:31:0:2 chr12 6933787 . A G 133.85 PASS AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0131016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.902;QD=25.4947;RBI=0.0259622;REFB=-0.0302899;REVB=-0.0224139;RO=7;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853821;STB=0.547876;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0147778;OID=.;OPOS=6933787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:8:6:4:3:8:6:4:3 chr12 6939850 . A G 276.29 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0848747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.731;QD=15.7877;RBI=0.0848784;REFB=-0.00629819;REVB=0.000788608;RO=39;SAF=18;SAR=13;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240598;STB=0.63521;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0131379;OID=.;OPOS=6939850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:13:18:13:26:13:18:13:26 chr12 6942823 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.079;QD=60.9782;RBI=0.0666197;REFB=0;REVB=0.0163584;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026112;OID=.;OPOS=6942823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0 chr12 6946718 . G A 198.36 PASS AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00637242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.42;QD=13.2237;RBI=0.00699485;REFB=0.00428456;REVB=0.00288448;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590533;STB=0.53387;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.0100119;OID=.;OPOS=6946718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:14:10:17:19:14:10:17:19 chr12 6950930 . AT A 628.77 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0928681;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=22.1543;QD=44.9123;RBI=0.0991747;REFB=0;REVB=-0.0348013;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0031071;OID=.;OPOS=6950931;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:55:56:56:56:0:30:26:0:0:12:0:29:26:0:0 chr12 6954812 . C T 342.87 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0168928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.61;QD=21.4294;RBI=0.0168937;REFB=0.0123814;REVB=-0.000169475;RO=29;SAF=26;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212744;STB=0.618335;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.0190754;OID=.;OPOS=6954812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:9:26:15:14:9:26:15:14 chr12 6954875 . C T 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.118;QD=60.7161;RBI=0.0521203;REFB=0;REVB=0.0198446;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112766;OID=.;OPOS=6954875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr12 6965194 . A G 1989.68 PASS AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.718;QD=62.1774;RBI=0.0109091;REFB=0;REVB=0.00739087;RO=0;SAF=43;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.82188e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53841e-05;OID=.;OPOS=6965194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:84:43:0:0:85:43:0:0 chr12 6976688 . A G 2078.59 PASS AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018759;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.369;QD=62.514;RBI=0.0199661;REFB=0;REVB=0.00683699;RO=0;SAF=77;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.11904e-05;OID=.;OPOS=6976688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:133:133:0:0:132:133:1:55:77:0:0:56:77:0:0 chr12 6980442 . G A 123.73 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0366253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.443;QD=17.0662;RBI=0.0896446;REFB=-0.0118993;REVB=0.0818214;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14117;STB=0.604239;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.010629;OID=.;OPOS=6980442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:4:10:8:6:4:10:8:7 chr12 6980482 . C T 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0341622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.519;QD=12.7823;RBI=0.048002;REFB=-0.0221539;REVB=-0.0337214;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20469;STB=0.639072;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0302064;OID=.;OPOS=6980482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:13:14:10:10:0.416667:4:6:5:8:4:6:5:9 chr12 7015075 . A C 228.32 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.00293709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6754;QD=21.7446;RBI=0.0172606;REFB=0.0229317;REVB=-0.0170089;RO=20;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362271;STB=0.701079;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0183316;OID=.;OPOS=7015075;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:13:9:17:3:13:9:17:3 chr12 7015707 . G T 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.335;QD=60.7158;RBI=0.0279508;REFB=0;REVB=-0.0184946;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18514e-06;OID=.;OPOS=7015707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:31:45:0:0:31:45:0:0 chr12 7021957 . G A 313.81 PASS AF=0.479452;AO=31;DP=69;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0156543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.603;QD=17.195;RBI=0.114039;REFB=-0.0279865;REVB=0.112959;RO=38;SAF=14;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123995;STB=0.593353;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0408306;OID=.;OPOS=7021957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:73:38:38:31:35:0.479452:17:14:22:16:21:14:22:16 chr12 7023123 . A G 353.72 PASS AF=0.59322;AO=34;DP=58;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0178748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6083;QD=23.981;RBI=0.0315001;REFB=0.0260314;REVB=-0.0259374;RO=24;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505811;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=-0.0191237;OID=.;OPOS=7023123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:24:24:34:35:0.59322:17:17:12:12:17:18:12:12 chr12 7026307 . G C 837.22 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0596163;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2756;QD=55.8147;RBI=0.0826913;REFB=-0.134457;REVB=0.0573039;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.509088;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00141922;OID=.;OPOS=7026307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:0:1:59:59:0.983333:27:32:0:0:27:32:0:1 chr12 7055860 . T C 219.85 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00738493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.03;QD=17.5881;RBI=0.0143487;REFB=-0.0250652;REVB=-0.0123024;RO=28;SAF=9;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125275;STB=0.571363;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0243216;OID=.;OPOS=7055860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:13:9:15:13:13:9:15:13 chr12 7065635 . T C 787.48 PASS AF=1;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360013;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.605;QD=57.271;RBI=0.0425561;REFB=0;REVB=0.022692;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.19741e-05;OID=.;OPOS=7065635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:54:55:1:26:28:0:0:27:28:0:0 chr12 7079215 . T G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.901;QD=62.0218;RBI=0.00770112;REFB=0;REVB=0.00457832;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6088e-05;OID=.;OPOS=7079215;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr12 7080212 . T C 291.74 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109478;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.772;QD=53.0435;RBI=0.0667531;REFB=0;REVB=0.0658493;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048611;OID=.;OPOS=7080212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0 chr12 7090742 . G A 180.28 PASS AF=0.403846;AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0112218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.234;QD=13.8676;RBI=0.0291439;REFB=-0.0224978;REVB=-0.0268968;RO=30;SAF=14;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187376;STB=0.594502;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0252398;OID=.;OPOS=7090742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:30:31:20:21:0.403846:6:14:16:14:7:14:16:15 chr12 7241055 . A G 332.58 PASS AF=0.366071;AO=41;DP=112;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=-0.000506758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.984;QD=11.8778;RBI=0.0188669;REFB=0.00143903;REVB=-0.0188601;RO=71;SAF=22;SAR=19;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949771;STB=0.554274;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.00303755;OID=.;OPOS=7241055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:71:71:41:41:0.366071:19:22:32:39:19:22:32:39 chr12 7242204 . C T 357.42 PASS AF=0.481013;AO=36;DP=77;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0391278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5903;QD=18.0973;RBI=0.119397;REFB=-0.0176489;REVB=0.112803;RO=41;SAF=14;SAR=22;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119543;STB=0.547754;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0249293;OID=.;OPOS=7242204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:41:41:36:38:0.481013:22:14:21:20:22:16:21:20 chr12 7242299 . G A 493.05 PASS AF=0.486239;AO=52;DP=108;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.0149493;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.154;QD=18.0934;RBI=0.0158265;REFB=-0.018682;REVB=0.00519583;RO=55;SAF=27;SAR=25;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243714;STB=0.503821;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0151967;OID=.;OPOS=7242299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:55:56:52:53:0.486239:25:27:30:25:25:28:30:26 chr12 7244956 . A T 598.48 PASS AF=0.580645;AO=54;DP=93;FAO=54;FDP=93;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=8;FSRR=31;FWDB=0.00185924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0009;QD=25.7413;RBI=0.0263168;REFB=-0.015994;REVB=-0.026251;RO=39;SAF=19;SAR=35;SRF=8;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129177;STB=0.570235;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00631764;OID=.;OPOS=7244956;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:39:39:54:54:0.580645:35:19:8:31:35:19:8:31 chr12 7244962 . T G 398.79 PASS AF=0.488095;AO=40;DP=83;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=-0.0526024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.791;QD=18.99;RBI=0.053128;REFB=-0.0423795;REVB=-0.00745423;RO=42;SAF=10;SAR=30;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144747;STB=0.508193;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0568466;OID=.;OPOS=7244962;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:42:43:40:41:0.488095:30:10:11:31:30:11:11:32 chr12 7249598 . T C 379.68 PASS AF=0.596774;AO=36;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00669623;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.599;QD=24.4952;RBI=0.00843756;REFB=-0.0123883;REVB=-0.00513351;RO=24;SAF=19;SAR=17;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171141;STB=0.588188;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00410222;OID=.;OPOS=7249598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:24:25:36:37:0.596774:17:19:7:17:17:20:8:17 chr12 7277236 . T A 375.66 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.271;QD=55.6535;RBI=0.0270509;REFB=0;REVB=0.00413815;RO=0;SAF=1;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011839;OID=.;OPOS=7277236;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:25:1:0:0:26:1:0:0 chr12 7309199 . G A 95.4 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0364324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6559;QD=34.6914;RBI=0.0578622;REFB=-0.0919419;REVB=0.0449524;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545364;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0144562;OID=.;OPOS=7309199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:0:1:10:10:0.909091:5:5:0:0:5:5:0:1 chr12 7309471 . C A 811.0 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0307821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.858;QD=54.0669;RBI=0.0328508;REFB=-0.203976;REVB=0.0114732;RO=1;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200666;STB=0.520826;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0017898;OID=.;OPOS=7309471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:60:60:1:2:58:58:0.966667:23:35:0:1:23:35:0:2 chr12 7309473 . G C 868.18 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.963;QD=57.8789;RBI=0.00433941;REFB=0;REVB=-0.00408701;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.53448e-05;OID=.;OPOS=7309473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0 chr12 7528471 . G A 554.18 PASS AF=0.471545;AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=-0.00835518;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.491;QD=18.0222;RBI=0.012526;REFB=-0.0134462;REVB=-0.00933224;RO=65;SAF=25;SAR=33;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152237;STB=0.51679;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0121964;OID=.;OPOS=7528471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:65:65:58:58:0.471545:33:25:27:38:33:25:26:39 chr12 7551022 . A T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.632;QD=57.0008;RBI=0.0291155;REFB=0;REVB=0.0198808;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69477e-05;OID=.;OPOS=7551022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0 chr12 7551050 . A C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00121247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=354.991;QD=57.7124;RBI=0.0247861;REFB=0;REVB=0.0247564;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10378e-05;OID=.;OPOS=7551050;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0 chr12 7585971 . A G 511.89 PASS AF=0.564706;AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0240321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.954;QD=24.0889;RBI=0.0414022;REFB=-0.0184515;REVB=0.0337135;RO=37;SAF=25;SAR=23;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155369;STB=0.585046;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.010122;OID=.;OPOS=7585971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:37:37:48:48:0.564706:23:25:12:25:23:25:12:25 chr12 7637795 . A G 169.5 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=6;FWDB=-0.00184432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.895;QD=10.594;RBI=0.0165129;REFB=-0.0146347;REVB=0.0164096;RO=42;SAF=21;SAR=1;SRF=36;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359577;STB=0.720318;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0263203;OID=.;OPOS=7637795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:1:21:36:6:1:21:36:6 chr12 7649484 . T C 275.62 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0221191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0323;QD=18.0731;RBI=0.0225646;REFB=-0.0167012;REVB=-0.00446178;RO=31;SAF=16;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156743;STB=0.508766;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0121972;OID=.;OPOS=7649484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:14:16:16:15:14:16:16:15 chr12 7772997 . G A 333.3 PASS AF=0.384615;AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0183394;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104;QD=12.8192;RBI=0.0184618;REFB=-0.0134734;REVB=0.00212226;RO=63;SAF=19;SAR=21;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103465;STB=0.553665;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0247596;OID=.;OPOS=7772997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:63:64:40:40:0.384615:21:19:36:27:21:19:36:28 chr12 7773058 . C A 336.22 PASS AF=0.35;AO=42;DP=120;FAO=42;FDP=120;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=45;FWDB=-0.0231159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.186;QD=11.2073;RBI=0.0247738;REFB=-0.0117578;REVB=0.00891043;RO=76;SAF=16;SAR=26;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317648;STB=0.528617;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0293432;OID=.;OPOS=7773058;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:76:78:42:42:0.35:26:16:31:45:26:16:33:45 chr12 7773096 . T C 405.53 PASS AF=0.429907;AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.0482028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5329;QD=15.1598;RBI=0.0533173;REFB=-0.0132097;REVB=0.0227865;RO=61;SAF=24;SAR=22;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162958;STB=0.591238;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0127552;OID=.;OPOS=7773096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:61:61:46:46:0.429907:22:24:22:39:22:24:22:39 chr12 7779227 . A G 360.0 PASS AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.118109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.53;QD=19.9999;RBI=0.118109;REFB=-0.000824575;REVB=-0.000123587;RO=35;SAF=13;SAR=23;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103519;STB=0.564576;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00271879;OID=.;OPOS=7779227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:23:13:9:26:23:14:9:26 chr12 7805236 . C G 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00117286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.143;QD=10.1406;RBI=0.0190726;REFB=-0.0140107;REVB=-0.0190365;RO=28;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.53722;STB=0.825561;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.021004;OID=.;OPOS=7805236;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:2:11:11:17:2:11:11:17 chr12 7966958 . C T 620.97 PASS AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00293109;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.124;QD=55.197;RBI=0.00762903;REFB=-0.0672854;REVB=0.0070435;RO=3;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208155;STB=0.511106;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00528004;OID=.;OPOS=7966958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:45:45:3:3:42:42:0.933333:21:21:1:2:21:21:1:2 chr12 7967076 . A G 105.77 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0420977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1214;QD=11.4342;RBI=0.0427015;REFB=0.019696;REVB=-0.00715549;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177174;STB=0.604781;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.040804;OID=.;OPOS=7967076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:9:15:6:7:9:15 chr12 8043688 . G C 1102.09 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162737;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.769;QD=60.3886;RBI=0.0168686;REFB=0;REVB=0.00444014;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14397e-05;OID=.;OPOS=8043688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:45:28:0:0:45:28:0:0 chr12 8048082 . T C 36.88 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0519143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5077;QD=7.76368;RBI=0.0726435;REFB=-0.00137621;REVB=-0.0508133;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414775;STB=0.526228;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.00860932;OID=.;OPOS=8048082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:7:6:3:3:7:6 chr12 8073897 . G A 155.34 PASS AF=0.208;AO=27;DP=125;FAO=26;FDP=125;FR=.;FRO=99;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=0.00974202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3727;QD=4.97084;RBI=0.0319966;REFB=-0.00818733;REVB=-0.0304774;RO=97;SAF=9;SAR=18;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208749;STB=0.660633;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0423014;OID=.;OPOS=8073897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:97:99:27:26:0.208:18:9:48:49:18:8:50:49 chr12 8073901 . T C 183.16 PASS AF=0.226562;AO=29;DP=128;FAO=29;FDP=128;FR=.;FRO=99;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=50;FWDB=-0.00279006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.725;QD=5.72389;RBI=0.00499633;REFB=-0.00507822;REVB=-0.00414474;RO=98;SAF=9;SAR=20;SRF=49;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245427;STB=0.64794;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0118678;OID=.;OPOS=8073901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:98:99:29:29:0.226562:20:9:49:49:20:9:49:50 chr12 8074055 . T C 89.48 PASS AF=0.138686;AO=18;DP=137;FAO=19;FDP=137;FR=.;FRO=118;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=67;FWDB=0.00207953;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.274;QD=2.61256;RBI=0.00955354;REFB=-0.00439102;REVB=-0.00932446;RO=119;SAF=10;SAR=8;SRF=52;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147324;STB=0.624399;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.026465;OID=.;OPOS=8074055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:137:137:119:118:18:19:0.138686:8:10:52:67:8:11:51:67 chr12 8074192 . G A 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00497132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.511;QD=10.1407;RBI=0.00950036;REFB=-0.004633;REVB=0.00809585;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207149;STB=0.622902;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00554946;OID=.;OPOS=8074192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:7:6:8:20:7:6:8:20 chr12 8192590 . G C 1415.4 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.192;QD=62.9069;RBI=0.0621739;REFB=0;REVB=-0.0431392;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38444e-06;OID=.;OPOS=8192590;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0 chr12 8208084 . A T 502.91 PASS AF=0.810345;AO=12;DP=43;FAO=47;FDP=58;FR=.;FRO=11;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.00623211;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=111.201;QD=34.6833;RBI=0.0652018;REFB=-0.185737;REVB=0.0649033;RO=3;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108501;STB=0.575313;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00741877;OID=.;OPOS=8208084;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:43:58:3:11:12:47:0.810345:11:1:0:3:31:16:0:11 chr12 8249050 . C G 727.56 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0957517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5264;QD=63.2657;RBI=0.100315;REFB=0;REVB=0.029913;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0009658;OID=.;OPOS=8249050;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr12 8329652 . A G 37.42 PASS AF=0.125;AO=7;DP=56;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.0544823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9833;QD=2.67307;RBI=0.0665101;REFB=0.0031845;REVB=0.0381479;RO=49;SAF=3;SAR=4;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191929;STB=0.639617;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.0141474;OID=.;OPOS=8329652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:56:56:49:49:7:7:0.125:4:3:29:20:4:3:29:20 chr12 8329833 . G A 33.51 PASS AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0792239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3397;QD=3.43657;RBI=0.0813685;REFB=-0.00694026;REVB=-0.0185581;RO=33;SAF=2;SAR=4;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447209;STB=0.799201;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0239925;OID=.;OPOS=8329833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:4:2:24:9:4:2:24:9 chr12 8374770 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.733;QD=49.5991;RBI=0.0745344;REFB=0;REVB=0.0636122;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000896527;OID=.;OPOS=8374770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0 chr12 8374781 . C CACG 82.32 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0234462;FXX=0;HRUN=0;LEN=3;MLLD=270.278;QD=19.3688;RBI=0.0329506;REFB=-0.031094;REVB=0.023152;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468762;STB=0.581939;STBP=0.508;TYPE=ins;VARB=0.0161408;OID=.;OPOS=8374782;OREF=-;OALT=ACG;OMAPALT=CACG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.588235:10:18:10:17:7:7:3:6:1:47:8:7:3:6:2 chr12 8374812 . G A 32.41 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0165932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.84;QD=16.207;RBI=0.0264204;REFB=-0.0192543;REVB=0.0205597;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23409;STB=0.635921;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.004982;OID=.;OPOS=8374812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:3:0:1:4:3:0 chr12 8375112 . G T 47.2 PASS AF=0.150943;AO=8;DP=53;FAO=8;FDP=53;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.000364275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.645;QD=3.56251;RBI=0.07716;REFB=-0.00171298;REVB=0.0771591;RO=45;SAF=2;SAR=6;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454306;STB=0.808006;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00920608;OID=.;OPOS=8375112;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:53:53:45:45:8:8:0.150943:6:2:29:16:6:2:29:16 chr12 8376110 . T C 670.68 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.28;QD=62.3887;RBI=0.020738;REFB=0;REVB=0.0146849;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04191e-05;OID=.;OPOS=8376110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:25:16:0:0:27:16:0:0 chr12 8637403 . G T 3267.3 PASS AF=1;AO=207;DP=209;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118167;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.876;QD=61.9393;RBI=0.0506542;REFB=0;REVB=0.0492566;RO=0;SAF=104;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95298e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71152e-06;OID=.;OPOS=8637403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:209:211:0:0:207:211:1:103:104:0:0:106:105:0:0 chr12 8757481 . G A 621.66 PASS AF=0.433962;AO=68;DP=158;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=-0.0120328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7353;QD=15.6392;RBI=0.030072;REFB=-0.0110124;REVB=0.0275597;RO=88;SAF=31;SAR=37;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00136197;STB=0.509924;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0150382;OID=.;OPOS=8757481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:88:90:68:69:0.433962:37:31:40:48:38:31:42:48 chr12 8808006 . T C 157.87 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0294552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.885;QD=16.6179;RBI=0.0306572;REFB=-0.0132443;REVB=-0.0085003;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610493;STB=0.517664;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0132082;OID=.;OPOS=8808006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:20:21:17:17:0.447368:10:7:7:13:10:7:8:13 chr12 8926011 . T C 2790.31 PASS AF=1;AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.804;QD=62.7037;RBI=0.0529905;REFB=0;REVB=0.0490846;RO=0;SAF=77;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81584e-05;OID=.;OPOS=8926011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:178:0:0:178:178:1:101:77:0:0:101:77:0:0 chr12 8975901 . C T 504.12 PASS AF=0.638889;AO=46;DP=72;FAO=46;FDP=72;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0219684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.645;QD=28.0068;RBI=0.0223449;REFB=-0.0187947;REVB=-0.00408453;RO=26;SAF=18;SAR=28;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742855;STB=0.540455;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0112686;OID=.;OPOS=8975901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:26:26:46:46:0.638889:28:18:13:13:28:18:13:13 chr12 9004512 . G A 1049.89 PASS AF=0.986301;AO=70;DP=71;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0146878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.662;QD=57.5282;RBI=0.0151476;REFB=0.0532647;REVB=0.00370384;RO=1;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145457;STB=0.50769;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00467608;OID=.;OPOS=9004512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:73:1:1:70:72:0.986301:32:38:0:1:32:40:0:1 chr12 9004892 . C A 632.21 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.599;QD=61.6791;RBI=0.0368681;REFB=0;REVB=0.0343865;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153291;OID=.;OPOS=9004892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr12 9013755 . C T 715.01 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0266644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6841;QD=60.8518;RBI=0.0266797;REFB=-0.0111933;REVB=-0.000902345;RO=1;SAF=4;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110662;STB=0.50588;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.000554932;OID=.;OPOS=9013755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:42:4:0:1:42:4:0:1 chr12 9016573 . A G 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.828;QD=62.1621;RBI=0.0112261;REFB=0;REVB=0.0017734;RO=0;SAF=53;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82371e-05;OID=.;OPOS=9016573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:32:53:0:0:32:53:0:0 chr12 9020489 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.952;QD=45.8067;RBI=0.0356693;REFB=0;REVB=0.0238735;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433069;OID=.;OPOS=9020489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr12 9020912 . A G 321.33 PASS AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0457976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5917;QD=18.9017;RBI=0.046646;REFB=0.00856388;REVB=0.00885598;RO=34;SAF=22;SAR=12;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285912;STB=0.515938;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00731203;OID=.;OPOS=9020912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:12:22:21:13:12:22:21:13 chr12 9070366 . T A 1012.11 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.681;QD=57.8347;RBI=0.0219149;REFB=0.0130234;REVB=0.00966697;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129508;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=4.73005e-05;OID=.;OPOS=9070366;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:33:36:1:0:33:36:1:0 chr12 9074259 . C T 375.6 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.068;QD=55.6448;RBI=0.0595652;REFB=0;REVB=0.0117383;RO=0;SAF=24;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408887;OID=.;OPOS=9074259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:3:24:0:0:3:24:0:0 chr12 9085218 . C T 58.34 PASS AF=0.183673;AO=9;DP=49;FAO=9;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.0016402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.907;QD=4.76252;RBI=0.0102351;REFB=-0.00142962;REVB=-0.0101028;RO=40;SAF=7;SAR=2;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00488767;STB=0.503261;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00317408;OID=.;OPOS=9085218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:49:49:40:40:9:9:0.183673:2:7:31:9:2:7:31:9 chr12 9086898 . A G 562.96 PASS AF=0.504348;AO=58;DP=115;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0137284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.862;QD=19.5813;RBI=0.0184531;REFB=-0.00263301;REVB=0.0123307;RO=57;SAF=42;SAR=16;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214963;STB=0.619259;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00184341;OID=.;OPOS=9086898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:57:58:58:0.504348:16:42:29:28:16:42:29:28 chr12 9093001 . G A 147.54 PASS AF=0.346939;AO=15;DP=46;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0269449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0586;QD=12.0437;RBI=0.0310167;REFB=-0.00859985;REVB=-0.0153627;RO=31;SAF=13;SAR=2;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.503906;STB=0.825647;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0176378;OID=.;OPOS=9093001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:31:32:15:17:0.346939:2:13:15:16:2:15:15:17 chr12 9248233 . T C 1899.04 PASS AF=0.992;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.702;QD=60.7694;RBI=0.0306335;REFB=0.0298627;REVB=0.0244567;RO=1;SAF=79;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597677;STB=0.503144;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00042609;OID=.;OPOS=9248233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:125:125:1:1:124:124:0.992:45:79:1:0:45:79:1:0 chr12 9303296 . A T 291.5 PASS AF=0.354167;AO=34;DP=96;FAO=34;FDP=96;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.00776965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0889;QD=12.1459;RBI=0.0148948;REFB=-0.00881495;REVB=0.0127078;RO=62;SAF=18;SAR=16;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510533;STB=0.529394;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.019868;OID=.;OPOS=9303296;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:62:62:34:34:0.354167:16:18:30:32:16:18:30:32 chr12 9305473 . T C 697.65 PASS AF=0.480263;AO=73;DP=152;FAO=73;FDP=152;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.00590284;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.861;QD=18.3592;RBI=0.00942853;REFB=-0.0125837;REVB=0.00735211;RO=78;SAF=26;SAR=47;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158417;STB=0.506166;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0132661;OID=.;OPOS=9305473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:78:79:73:73:0.480263:47:26:29:49:47:26:29:50 chr12 9307373 . T G 1975.75 PASS AF=0.992308;AO=125;DP=129;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0344726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6835;QD=60.7925;RBI=0.0540549;REFB=0.000198798;REVB=0.0416362;RO=2;SAF=54;SAR=71;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172698;STB=0.504424;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=2.52237e-05;OID=.;OPOS=9307373;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:130:2:1:125:129:0.992308:71:54:2:0:73:56:1:0 chr12 9317784 . A G 311.13 PASS AF=0.384615;AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0286839;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.615;QD=13.676;RBI=0.0318109;REFB=-0.0170336;REVB=0.0137537;RO=56;SAF=14;SAR=21;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119985;STB=0.506845;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.019842;OID=.;OPOS=9317784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:56:56:35:35:0.384615:21:14:23:33:21:14:23:33 chr12 9345273 . A G 1223.84 PASS AF=1;AO=35;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279859;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0305;QD=57.5924;RBI=0.0811855;REFB=0;REVB=0.0762094;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458301;OID=.;OPOS=9345273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:35:85:1:11:24:0:0:60:25:0:0 chr12 9439294 . T C 1824.08 PASS AF=0.953488;AO=123;DP=129;FAO=123;FDP=129;FR=.;FRO=6;FSAF=52;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0542737;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.774;QD=56.5605;RBI=0.0542737;REFB=-0.0375484;REVB=-6.92422e-05;RO=6;SAF=52;SAR=71;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219638;STB=0.511578;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00088079;OID=.;OPOS=9439294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:129:129:6:6:123:123:0.953488:71:52:4:2:71:52:4:2 chr12 9447029 . T C 105.77 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0158404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.252;QD=11.4351;RBI=0.0544812;REFB=-0.0501599;REVB=-0.0521276;RO=24;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342312;STB=0.700909;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0537878;OID=.;OPOS=9447029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:5:8:7:17:5:8:7:17 chr12 9447492 . T C 168.4 PASS AF=0.761905;AO=14;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0122472;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.388;QD=32.0754;RBI=0.0736674;REFB=-0.0489726;REVB=0.0726422;RO=5;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211852;STB=0.585692;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0234742;OID=.;OPOS=9447492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:21:21:5:5:14:16:0.761905:5:9:1:4:7:9:1:4 chr12 9450357 . A G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0697661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.857;QD=42.1826;RBI=0.0709784;REFB=0;REVB=0.0130624;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00245319;OID=.;OPOS=9450357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr12 9451818 . T C 88.13 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6669;QD=39.1704;RBI=0.0224513;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00196197;OID=.;OPOS=9451818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0 chr12 9571670 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.802;QD=33.4285;RBI=0.0071616;REFB=0;REVB=0.0071616;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123763;OID=.;OPOS=9571670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr12 9572819 . C T 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0106555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7881;QD=11.9197;RBI=0.0231601;REFB=-0.0378776;REVB=0.0205633;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318742;STB=0.689164;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0183365;OID=.;OPOS=9572819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:2:7:3:4:2:7 chr12 9573130 . C T 271.77 PASS AF=0.418919;AO=30;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00603467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.478;QD=14.6905;RBI=0.0341948;REFB=-0.0170782;REVB=0.0336581;RO=42;SAF=12;SAR=18;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291865;STB=0.657508;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0262503;OID=.;OPOS=9573130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:42:43:30:31:0.418919:18:12:29:13:18:13:30:13 chr12 9573223 . C A 521.46 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00433259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8029;QD=23.4364;RBI=0.0144426;REFB=-0.0207334;REVB=0.0137774;RO=40;SAF=39;SAR=10;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255248;STB=0.641534;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0444803;OID=.;OPOS=9573223;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:40:40:49:49:0.550562:10:39:22:18:10:39:22:18 chr12 9573224 . C T 369.63 PASS AF=0.443182;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=10;FWDB=0.0174964;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.887;QD=16.8014;RBI=0.0303882;REFB=-0.0163659;REVB=0.0248459;RO=49;SAF=22;SAR=17;SRF=39;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244611;STB=0.635744;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0174452;OID=.;OPOS=9573224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:49:49:39:39:0.443182:17:22:39:10:17:22:39:10 chr12 9574002 . C T 1338.6 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.566;QD=61.5446;RBI=0.0431421;REFB=0;REVB=0.0302389;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119793;OID=.;OPOS=9574002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:87:0:0:82:87:1:38:44:0:0:42:45:0:0 chr12 9574042 . C A 355.81 PASS AF=0.405941;AO=40;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.0175767;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.908;QD=14.0916;RBI=0.0189572;REFB=-0.0222623;REVB=-0.00710167;RO=60;SAF=20;SAR=20;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706046;STB=0.532414;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0344577;OID=.;OPOS=9574042;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:60:60:40:41:0.405941:20:20:34:26:20:21:34:26 chr12 9578197 . A T 687.2 PASS AF=0.944444;AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0131974;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3906;QD=50.9038;RBI=0.0252587;REFB=-0.0205183;REVB=0.0215367;RO=3;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040906;STB=0.521731;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00520322;OID=.;OPOS=9578197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:55:54:3:3:51:51:0.944444:33:18:0:3:33:18:0:3 chr12 9580395 . C G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.58;QD=35.5759;RBI=0.0341535;REFB=0;REVB=-0.0231257;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000511874;OID=.;OPOS=9580395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr12 9581791 . T C 166.44 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0112365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.768;QD=14.7943;RBI=0.0112859;REFB=-0.0143745;REVB=-0.001055;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103537;STB=0.568454;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0156379;OID=.;OPOS=9581791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:8:10:17:9:8:10:18:9 chr12 9590052 . G A 233.17 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0333135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.647;QD=16.958;RBI=0.0335408;REFB=-0.0193956;REVB=0.00389837;RO=28;SAF=19;SAR=7;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383161;STB=0.708588;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0364112;OID=.;OPOS=9590052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:29:26:26:0.472727:7:19:9:19:7:19:10:19 chr12 9597776 . G A 1936.39 PASS AF=0.929078;AO=131;DP=142;FAO=131;FDP=141;FR=.;FRO=10;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00740603;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.985;QD=54.9331;RBI=0.0196197;REFB=-0.0767832;REVB=0.0181681;RO=10;SAF=69;SAR=62;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305112;STB=0.516095;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00161666;OID=.;OPOS=9597776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:142:141:10:10:131:131:0.929078:62:69:3:7:62:69:3:7 chr12 9750669 . A G 561.09 PASS AF=0.527778;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0290988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.384;QD=20.7811;RBI=0.0321975;REFB=-0.0173393;REVB=-0.013782;RO=51;SAF=32;SAR=25;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111604;STB=0.561382;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0142261;OID=.;OPOS=9750669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:51:51:57:57:0.527778:25:32:22:29:25:32:22:29 chr12 9833524 . C G 554.06 PASS AF=0.538462;AO=56;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0079477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.991;QD=21.31;RBI=0.01339;REFB=-0.00333165;REVB=0.0107762;RO=48;SAF=32;SAR=24;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781078;STB=0.542921;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00311133;OID=.;OPOS=9833524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:48:48:56:56:0.538462:24:32:23:25:24:32:23:25 chr12 9833628 . C T 362.48 PASS AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0.00480857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.925;QD=27.8829;RBI=0.0181081;REFB=-0.0167604;REVB=-0.0174579;RO=17;SAF=6;SAR=28;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216562;STB=0.621563;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0087268;OID=.;OPOS=9833628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:18:34:34:0.653846:28:6:0:17:28:6:0:18 chr12 9885707 . A ATAAGT 117.12 PASS AF=0.236842;AO=18;DP=76;FAO=18;FDP=76;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.00506942;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=281.885;QD=6.16442;RBI=0.0186865;REFB=-0.00256902;REVB=-0.0179857;RO=58;SAF=10;SAR=8;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475344;STB=0.529379;STBP=0.763;TYPE=ins;VARB=0.00768409;OID=.;OPOS=9885708;OREF=-;OALT=TAAGT;OMAPALT=ATAAGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.236842:18:76:18:76:58:10:8:30:28:99:58:10:8:30:28 chr12 9905690 . A G 498.92 PASS AF=0.566265;AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00425371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.361;QD=24.0441;RBI=0.0107053;REFB=-0.00905156;REVB=0.00982393;RO=36;SAF=29;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731423;STB=0.540164;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00708025;OID=.;OPOS=9905690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:36:36:47:47:0.566265:18:29:19:17:18:29:19:17 chr12 9906143 . GT G,TG 248.96 PASS AF=0.433333,0.5;AO=10,12;DP=31;FAO=13,15;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=11,0;FSAR=2,15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.193745,-0.0635877;FXX=0.0624805;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=9.78579,26.305;QD=33.1952;RBI=0.202055,0.124165;REFB=-0.103722,-0.0413636;REVB=-0.05735,-0.106647;RO=2;SAF=8,0;SAR=2,12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.461538,0;SSSB=0.125826,-0.825249;STB=0.578814,0.998718;STBP=0.241,0.051;TYPE=del,mnp;VARB=0.0495681,-0.0370842;OID=.,.;OPOS=9906144,9906143;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:97:31:30:2:2:10,12:13,15:0.433333,0.5:2,12:8,0:1:1:2,15:11,0:1:1 chr12 9906151 . GAAAAAC AGAAAAC,GAAAAC,GAAAACA,GAAAACAC,GTAAAAC 267.71 PASS AF=0,0.966667,0.0333333,0,0;AO=9,8,2,3,3;DP=30;FAO=0,29,1,0,0;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,1,0,0;FSAR=0,19,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202246,0.197682,0.0780734,-0.0810612,-0.0671789;FXX=0;HRUN=1,5,5,0,5;LEN=2,1,2,1,1;MLLD=5.02141,12.4793,8.16286,160.808,31.1175;QD=35.6946;RBI=0.338607,0.20016,0.0823315,0.10381,0.0672476;REFB=-0.0296477,-0.0125092,0.00656966,0.00482231,0.0385163;REVB=-0.271572,-0.0313987,0.0261348,-0.0648503,0.00304024;RO=3;SAF=0,1,2,3,3;SAR=9,7,0,0,0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0.461538,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.810396,-0.379258,0.599865,0.664835,0.664835;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp,ins,snp;VARB=0,0.0301336,-0.201545,0,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=9906151,9906152,9906156,9906156,9906152;OREF=GA,A,AC,-,A;OALT=AG,-,CA,C,T;OMAPALT=AGAAAAC,GAAAAC,GAAAACA,GAAAACAC,GTAAAAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:4:30:30:3:0:9,8,2,3,3:0,29,1,0,0:0,0.966667,0.0333333,0,0:9,7,0,0,0:0,1,2,3,3:2:1:0,19,0,0,0:0,10,1,0,0:0:0 chr12 9994445 . GTGT G 1212.41 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247831;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=3;MLLD=302.876;QD=61.3879;RBI=0.030102;REFB=0;REVB=0.0170858;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.60626e-05;OID=.;OPOS=9994446;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:79:80:79:79:0:39:40:0:0:6:0:39:40:0:0 chr12 10015177 . A G 1157.45 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0167679;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.494;QD=59.3563;RBI=0.0168299;REFB=0.0250482;REVB=0.00144391;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111359;STB=0.505881;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-1.44481e-05;OID=.;OPOS=10015177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:42:35:0:1:42:35:0:1 chr12 10041364 . G A 1536.26 PASS AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00208686;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.296;QD=64.0109;RBI=0.0307329;REFB=0;REVB=-0.030662;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84595e-05;OID=.;OPOS=10041364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0 chr12 10046052 . C A 1949.77 PASS AF=0.992308;AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0423654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2632;QD=59.993;RBI=0.0472631;REFB=0.018456;REVB=-0.0209517;RO=2;SAF=61;SAR=67;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000686636;STB=0.504064;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00154017;OID=.;OPOS=10046052;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:130:130:2:1:128:129:0.992308:67:61:1:1:68:61:1:0 chr12 10069302 . C T 573.66 PASS AF=0.540816;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.020416;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.746;QD=23.4146;RBI=0.0223313;REFB=-0.0219377;REVB=-0.00904832;RO=45;SAF=30;SAR=23;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481438;STB=0.526431;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0178376;OID=.;OPOS=10069302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:45:45:53:53:0.540816:23:30:28:17:23:30:28:17 chr12 10078946 . CAAATT C 291.1 PASS AF=0.614035;AO=34;DP=58;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00391409;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=5;MLLD=309.16;QD=20.4282;RBI=0.00553496;REFB=0.000320551;REVB=0.00391353;RO=20;SAF=11;SAR=23;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163335;STB=0.613351;STBP=0.037;TYPE=del;VARB=-0.000168617;OID=.;OPOS=10078947;OREF=AAATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.614035:34:58:35:57:22:11:24:13:9:99:20:11:23:11:9 chr12 10136672 . G A 1433.32 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.972;QD=62.3183;RBI=0.0291475;REFB=0;REVB=0.0211331;RO=0;SAF=24;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47731e-05;OID=.;OPOS=10136672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:83:92:0:0:82:92:1:58:24:0:0:63:29:0:0 chr12 10137557 . A C 352.01 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126985;FXX=0.0666445;HRUN=7;LEN=1;MLLD=233.643;QD=50.2874;RBI=0.0150095;REFB=-0.147996;REVB=-0.00800206;RO=1;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299926;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00095584;OID=.;OPOS=10137557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:30:28:1:1:27:27:0.964286:15:12:0:1:16:11:0:1 chr12 10147850 . T C 471.27 PASS AF=0.485437;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00766759;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.8;QD=18.3019;RBI=0.0151955;REFB=-0.0102822;REVB=0.0131192;RO=53;SAF=30;SAR=20;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219875;STB=0.51219;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0107259;OID=.;OPOS=10147850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:53:53:50:50:0.485437:20:30:33:20:20:30:33:20 chr12 10149406 . T C 1041.83 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2695;QD=59.5331;RBI=0.0511462;REFB=0;REVB=-0.0492753;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000560593;OID=.;OPOS=10149406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:31:39:0:0:31:39:0:0 chr12 10149851 . C T 1785.86 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00263597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.862;QD=61.0551;RBI=0.00785316;REFB=0;REVB=-0.00739755;RO=0;SAF=47;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19108e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13381e-06;OID=.;OPOS=10149851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:70:47:0:0:70:47:0:0 chr12 10151642 . T C 1543.02 PASS AF=0.990476;AO=101;DP=103;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00496948;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.806;QD=58.7819;RBI=0.119072;REFB=-0.0982272;REVB=0.118969;RO=0;SAF=57;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.17359e-08;STB=0.505375;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00128306;OID=.;OPOS=10151642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:105:0:1:101:104:0.990476:44:57:0:0:46:58:0:1 chr12 10165469 . A G 566.6 PASS AF=0.390533;AO=65;DP=168;FAO=66;FDP=169;FR=.;FRO=103;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=0.0112687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.988;QD=13.4105;RBI=0.0169975;REFB=-0.0194404;REVB=0.0127252;RO=101;SAF=29;SAR=36;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116505;STB=0.565897;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0309352;OID=.;OPOS=10165469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:101:103:65:66:0.390533:36:29:56:45:36:30:58:45 chr12 10167277 . G C 176.65 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.876;QD=14.1318;RBI=0.013637;REFB=-0.0146582;REVB=0.00342423;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13593;STB=0.578864;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0299418;OID=.;OPOS=10167277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:8:11:14:17:8:11:14:17 chr12 10206925 . A G 386.56 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.010889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.919;QD=18.191;RBI=0.0108892;REFB=0.000709354;REVB=-6.26243e-05;RO=45;SAF=18;SAR=22;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790903;STB=0.544147;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=-0.000818787;OID=.;OPOS=10206925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:22:18:24:21:22:18:24:21 chr12 10236797 . A G 868.18 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.69;QD=57.8789;RBI=0.0239456;REFB=0;REVB=-0.0139464;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38939e-05;OID=.;OPOS=10236797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0 chr12 10236824 . C T 907.29 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212931;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.409;QD=58.535;RBI=0.00297664;REFB=0;REVB=-0.00208;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289027;OID=.;OPOS=10236824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0 chr12 10236921 . G T 379.48 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340231;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4919;QD=56.2189;RBI=0.0460084;REFB=0;REVB=0.030971;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.76362e-05;OID=.;OPOS=10236921;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr12 10236942 . C G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00505474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.449;QD=51.1846;RBI=0.00553283;REFB=0;REVB=0.00224985;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31114e-05;OID=.;OPOS=10236942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr12 10237014 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.822;QD=35.5759;RBI=0.104318;REFB=0;REVB=-0.0118133;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00152119;OID=.;OPOS=10237014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr12 10251445 . C G 740.21 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7363;QD=56.939;RBI=0.0509407;REFB=0;REVB=-0.0138786;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000864499;OID=.;OPOS=10251445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr12 10271055 . T C 1167.96 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.21;QD=60.6733;RBI=0.0266348;REFB=0;REVB=0.016697;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77491e-05;OID=.;OPOS=10271055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:30:45:0:0:30:47:0:0 chr12 10462052 . T G 1433.88 PASS AF=0.989362;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.139606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.95;QD=61.0161;RBI=0.142839;REFB=-0.0905135;REVB=0.0302209;RO=2;SAF=51;SAR=41;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182262;STB=0.504761;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00166202;OID=.;OPOS=10462052;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:2:1:92:93:0.989362:41:51:2:0:41:52:1:0 chr12 10467533 . T A 323.92 PASS AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0146102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.114;QD=28.7929;RBI=0.0180893;REFB=-0.0218707;REVB=-0.0106659;RO=17;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266157;STB=0.645863;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00853748;OID=.;OPOS=10467533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:16:12:14:3:16:12:14:3 chr12 10525740 . C T 1514.82 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0208322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.444;QD=62.4667;RBI=0.0588516;REFB=-0.106501;REVB=-0.0550411;RO=1;SAF=35;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133556;STB=0.507041;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00029558;OID=.;OPOS=10525740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:61:35:1:0:61:35:1:0 chr12 10532111 . T G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=324.02;QD=44.6898;RBI=0.0284886;REFB=0;REVB=-0.0203839;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16563e-06;OID=.;OPOS=10532111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0 chr12 10532326 . T C 994.23 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.553;QD=57.6365;RBI=0.0334914;REFB=-0.0316931;REVB=0.0310102;RO=1;SAF=31;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150024;STB=0.507934;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000241898;OID=.;OPOS=10532326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:37:31:1:0:37:31:1:0 chr12 10560957 . T C 1181.9 PASS AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0101502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.664;QD=58.3653;RBI=0.010304;REFB=-0.123617;REVB=0.00177405;RO=2;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295601;STB=0.515621;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00170374;OID=.;OPOS=10560957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:81:81:2:2:79:79:0.975309:31:48:0:2:31:48:0:2 chr12 10562025 . C T 1914.98 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.887;QD=61.7737;RBI=0.0124731;REFB=0;REVB=0.00709736;RO=0;SAF=65;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48103e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14668e-05;OID=.;OPOS=10562025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:59:65:0:0:59:65:0:0 chr12 10562089 . A C 2715.33 PASS AF=1;AO=173;DP=178;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172411;FXX=0.0280883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.327;QD=62.7822;RBI=0.0215536;REFB=0;REVB=0.0129345;RO=0;SAF=96;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92139e-05;OID=.;OPOS=10562089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:173:0:0:173:173:1:77:96:0:0:77:96:0:0 chr12 10570965 . C G 1805.18 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272216;FXX=0.0409802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9179;QD=61.7154;RBI=0.031359;REFB=0;REVB=0.0155683;RO=0;SAF=51;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137286;OID=.;OPOS=10570965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:66:51:0:0:66:51:0:0 chr12 10571042 . A G 1799.01 PASS AF=0.983471;AO=119;DP=123;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0419125;FXX=0.0162588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1252;QD=59.4715;RBI=0.0505253;REFB=-0.0873066;REVB=0.0282162;RO=1;SAF=53;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714286;STB=0.507461;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00312167;OID=.;OPOS=10571042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:123:121:1:2:119:119:0.983471:66:53:0:1:66:53:0:2 chr12 10571091 . T G 1208.94 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.472;QD=61.2121;RBI=0.0265693;REFB=0;REVB=-0.00630591;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.89337e-05;OID=.;OPOS=10571091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:45:34:0:0:45:34:0:0 chr12 10571106 . G C 926.97 PASS AF=1;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275976;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6473;QD=58.8552;RBI=0.00537056;REFB=0;REVB=-0.00460724;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283229;OID=.;OPOS=10571106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0 chr12 10572982 . A G 1804.0 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8717;QD=61.1525;RBI=0.0609305;REFB=0;REVB=0.021798;RO=0;SAF=49;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15086e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368869;OID=.;OPOS=10572982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:68:49:0:0:69:49:0:0 chr12 10573094 . CA GG 881.24 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00935623;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=2;MLLD=282.629;QD=55.9515;RBI=0.0107617;REFB=-0.0402964;REVB=-0.00531745;RO=1;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111083;STB=0.50588;STBP=0.613;TYPE=mnp;VARB=0.000666618;OID=.;OPOS=10573094;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:63:1:1:61:62:0.984127:42:19:0:1:42:20:0:1 chr12 10587111 . A G 12358.3 PASS AF=1;AO=781;DP=793;FAO=783;FDP=783;FR=.;FRO=0;FSAF=450;FSAR=333;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00422172;FXX=0.0150941;HRUN=5;LEN=1;MLLD=308.496;QD=63.1333;RBI=0.00519253;REFB=-0.00107356;REVB=-0.00302315;RO=8;SAF=450;SAR=331;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398672;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11238e-06;OID=.;OPOS=10587111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:793:783:8:0:781:783:1:331:450:3:5:333:450:0:0 chr12 10587631 . C T 1363.34 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00136447;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.06;QD=62.6824;RBI=0.0419412;REFB=0;REVB=0.041919;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.67441e-05;OID=.;OPOS=10587631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:39:48:0:0:39:48:0:0 chr12 10588530 . C G 684.62 PASS AF=0.390244;AO=81;DP=205;FAO=80;FDP=205;FR=.;FRO=125;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=62;FWDB=-0.0355193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8847;QD=13.3585;RBI=0.0360521;REFB=0.00717438;REVB=-0.00617548;RO=123;SAF=39;SAR=42;SRF=62;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242241;STB=0.51006;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=-0.0130718;OID=.;OPOS=10588530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:123:125:81:80:0.390244:42:39:62:61:41:39:63:62 chr12 10588581 . T C 341.62 PASS AF=0.303448;AO=44;DP=145;FAO=44;FDP=145;FR=.;FRO=101;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=57;FWDB=0.00819701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.457;QD=9.42386;RBI=0.0145694;REFB=-0.0157385;REVB=-0.0120448;RO=100;SAF=22;SAR=22;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834005;STB=0.544807;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0286909;OID=.;OPOS=10588581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:100:101:44:44:0.303448:22:22:43:57:22:22:44:57 chr12 10603670 . T C 2678.46 PASS AF=0.900943;AO=189;DP=212;FAO=191;FDP=212;FR=.;FRO=21;FSAF=106;FSAR=85;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.00997841;FXX=0.00934536;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.659;QD=50.5369;RBI=0.0173073;REFB=-0.0992804;REVB=0.0141412;RO=22;SAF=105;SAR=84;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741303;STB=0.536253;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0008757;OID=.;OPOS=10603670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:212:212:22:21:189:191:0.900943:84:105:4:18:85:106:4:17 chr12 10659438 . T C 2961.16 PASS AF=1;AO=187;DP=187;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00747345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.414;QD=63.3403;RBI=0.0176069;REFB=0;REVB=0.0159421;RO=0;SAF=68;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26121e-06;OID=.;OPOS=10659438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:187:187:0:0:187:187:1:119:68:0:0:119:68:0:0 chr12 10659964 . C G 1362.01 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017609;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.662;QD=62.6214;RBI=0.019028;REFB=0;REVB=0.0189463;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92774e-05;OID=.;OPOS=10659964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0 chr12 10675250 . G C 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5484;QD=57.711;RBI=0.0251085;REFB=0;REVB=-0.0192723;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000320112;OID=.;OPOS=10675250;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0 chr12 10763205 . T C 223.19 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.994;QD=49.5984;RBI=0.160032;REFB=0;REVB=-0.0078508;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6403e-05;OID=.;OPOS=10763205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:10:7:0:0:11:7:0:0 chr12 10763236 . G C 583.79 PASS AF=1;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274833;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1712;QD=61.4519;RBI=0.0299167;REFB=0;REVB=-0.0118186;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239761;OID=.;OPOS=10763236;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0 chr12 10771779 . C T 1312.6 PASS AF=0.35307;AO=158;DP=452;FAO=161;FDP=456;FR=.;FRO=295;FSAF=79;FSAR=82;FSRF=133;FSRR=162;FWDB=0.00397467;FXX=0.00436672;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4178;QD=11.514;RBI=0.0179465;REFB=0.00132856;REVB=-0.0175009;RO=294;SAF=79;SAR=79;SRF=134;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506894;STB=0.525801;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.00304529;OID=.;OPOS=10771779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:456:294:295:158:161:0.35307:79:79:134:160:82:79:133:162 chr12 10782115 . T C 425.95 PASS AF=0.538462;AO=41;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0430322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.892;QD=21.8436;RBI=0.0434766;REFB=-0.00345677;REVB=-0.00620006;RO=36;SAF=21;SAR=20;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107753;STB=0.564072;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00161396;OID=.;OPOS=10782115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:36:41:42:0.538462:20:21:23:13:21:21:23:13 chr12 10783729 . A G 474.09 PASS AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0258285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1866;QD=19.1552;RBI=0.0310513;REFB=-0.0253137;REVB=0.0172358;RO=52;SAF=27;SAR=20;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124908;STB=0.569493;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0220882;OID=.;OPOS=10783729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:20:27:23:29:20:27:23:29 chr12 10854625 . G A 748.27 PASS AF=0.529412;AO=72;DP=136;FAO=72;FDP=136;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.00330547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.431;QD=22.0081;RBI=0.00597244;REFB=-0.0229699;REVB=0.00497432;RO=64;SAF=33;SAR=39;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142242;STB=0.577932;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.020058;OID=.;OPOS=10854625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:64:64:72:72:0.529412:39:33:40:24:39:33:40:24 chr12 10856219 . C T 538.35 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.515;QD=59.8166;RBI=0.0714707;REFB=0;REVB=0.0226887;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394588;OID=.;OPOS=10856219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr12 10871667 . A G 1304.0 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551084;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1279;QD=62.0953;RBI=0.140968;REFB=0;REVB=0.12975;RO=0;SAF=29;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129173;OID=.;OPOS=10871667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:55:29:0:0:55:29:0:0 chr12 10958658 . T C 1587.8 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00962415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.34;QD=64.1536;RBI=0.0536379;REFB=0;REVB=0.0527674;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76491e-05;OID=.;OPOS=10958658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:51:48:0:0:51:48:0:0 chr12 10959031 . C T 1123.83 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00754191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.572;QD=59.9378;RBI=0.0215878;REFB=0;REVB=-0.0202275;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.10136e-05;OID=.;OPOS=10959031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0 chr12 10962115 . A C,G 946.8 PASS AF=0.0757576,0.924242;AO=4,60;DP=64;FAO=5,61;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=3,26;FSAR=2,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526454,0.075868;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=233.469,73.1881;QD=57.3819;RBI=0.00985881,0.076269;REFB=0,0;REVB=-0.00833551,-0.00781087;RO=0;SAF=3,25;SAR=1,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,-5.89445e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0590003,0.00408331;OID=.,.;OPOS=10962115,10962115;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:17:64:66:0:0:4,60:5,61:0.0757576,0.924242:1,35:3,25:0:0:2,35:3,26:0:0 chr12 10978402 . G A 344.74 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00934655;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.582;QD=55.1591;RBI=0.0126682;REFB=0;REVB=-0.00855126;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.25195e-05;OID=.;OPOS=10978402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr12 10999708 . T C 1768.08 PASS AF=1;AO=115;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00945675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.209;QD=60.9682;RBI=0.0551967;REFB=0;REVB=0.0543805;RO=1;SAF=76;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120196;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9892e-05;OID=.;OPOS=10999708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:1:0:115:116:1:39:76:0:1:40:76:0:0 chr12 10999780 . C T 1716.82 PASS AF=1;AO=112;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545548;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2123;QD=60.2391;RBI=0.0374004;REFB=0;REVB=0.0370004;RO=0;SAF=95;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212618;OID=.;OPOS=10999780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:114:0:0:112:114:1:17:95:0:0:17:97:0:0 chr12 11001963 . ATT ATA,AT,ATTT 32.45 PASS AF=0.0555556,0.277778,0;AO=2,9,4;DP=37;FAO=2,10,0;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=0,6,0;FSAR=2,4,0;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=0.00569709,0.114198,-0.111526;FXX=0.0270197;HRUN=7,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=209.043,10.3196,8.72398;QD=3.60606;RBI=0.0104235,0.160901,0.113493;REFB=-0.000444226,-0.0210876,0.0163482;REVB=-0.00872883,-0.113349,0.0210374;RO=18;SAF=0,5,4;SAR=2,4,0;SRF=14;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.666653,-0.259858,0.580913;STB=0.997694,0.683914,0.5;STBP=0.012,0.254,1;TYPE=snp,del,ins;VARB=0.0260182,0.0627179,-0.0167773;OID=.,.,.;OPOS=11001965,11001964,11001964;OREF=T,T,-;OALT=A,-,T;OMAPALT=ATA,AT,ATTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0555556,0.277778,0:2,9,4:37:2,10,0:36:24:0,6,0:2,4,0:20:4:25:18:0,5,4:2,4,0:14:4 chr12 11061122 . T C 715.02 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.243;QD=60.8525;RBI=0.033342;REFB=0.0461948;REVB=0.0275446;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200022;STB=0.510634;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000215545;OID=.;OPOS=11061122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:23:23:1:0:23:23:1:0 chr12 11083356 . A G 296.24 PASS AF=0.181208;AO=54;DP=298;FAO=54;FDP=298;FR=.;FRO=244;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=109;FSRR=135;FWDB=-0.0646248;FXX=0.00334437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7659;QD=3.97643;RBI=0.0647025;REFB=0.00315693;REVB=-0.00316994;RO=242;SAF=24;SAR=30;SRF=109;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00780537;STB=0.501886;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-0.0157171;OID=.;OPOS=11083356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:242:244:54:54:0.181208:30:24:109:133:30:24:109:135 chr12 11083677 . T C 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.155;QD=56.9569;RBI=0.0172552;REFB=0;REVB=-0.00999137;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46303e-05;OID=.;OPOS=11083677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr12 11091432 . C T 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00685002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.059;QD=48.626;RBI=0.0167325;REFB=0.0866613;REVB=0.0152661;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031885;STB=0.517226;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.00117633;OID=.;OPOS=11091432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:8:14:1:0:8:14:1:0 chr12 11138683 . C T 1141.84 PASS AF=1;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00231839;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.801;QD=60.8981;RBI=0.0182483;REFB=0;REVB=0.0181004;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55372e-06;OID=.;OPOS=11138683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0 chr12 11138852 . C T 1822.38 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.474;QD=61.2565;RBI=0.0371566;REFB=0;REVB=-0.0168756;RO=0;SAF=56;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81048e-05;OID=.;OPOS=11138852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:63:56:0:0:63:56:0:0 chr12 11149711 . C A 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.22;QD=62.1623;RBI=0.0156393;REFB=0;REVB=0.00875521;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18468e-05;OID=.;OPOS=11149711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:53:32:0:0:53:32:0:0 chr12 11149720 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836996;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.237;QD=62.7622;RBI=0.010172;REFB=0;REVB=-0.00578049;RO=0;SAF=36;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.42343e-05;OID=.;OPOS=11149720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:53:36:0:0:53:36:0:0 chr12 11149769 . T C 1529.33 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.858;QD=63.7223;RBI=0.0416133;REFB=0;REVB=0.0404015;RO=0;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122473;OID=.;OPOS=11149769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:54:42:0:0:54:42:0:0 chr12 11150033 . G T 1515.42 PASS AF=1;AO=88;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378378;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.154;QD=60.0165;RBI=0.0556473;REFB=0;REVB=0.0408035;RO=0;SAF=32;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.82247e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200439;OID=.;OPOS=11150033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:88:101:1:56:32:0:0:62:39:0:0 chr12 11150046 . G T 1358.87 PASS AF=0.967391;AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.01451;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9269;QD=59.0814;RBI=0.015673;REFB=-0.0210361;REVB=-0.00592464;RO=1;SAF=35;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869637;STB=0.51351;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00108161;OID=.;OPOS=11150046;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:92:92:1:3:89:89:0.967391:54:35:0:1:54:35:0:3 chr12 11150214 . G A 689.66 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122658;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6253;QD=62.6962;RBI=0.0422796;REFB=0;REVB=-0.0404613;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000981221;OID=.;OPOS=11150214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:27:16:0:0:28:16:0:0 chr12 11150319 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00267289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.012;QD=54.5172;RBI=0.00747936;REFB=0;REVB=0.00698545;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97667e-05;OID=.;OPOS=11150319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr12 11174327 . C T 40.88 PASS AF=0.0932203;AO=11;DP=118;FAO=11;FDP=118;FR=.;FRO=107;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=66;FWDB=0.000803374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.108;QD=1.38585;RBI=0.00615587;REFB=0.00016498;REVB=-0.00610322;RO=107;SAF=2;SAR=9;SRF=41;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270959;STB=0.720222;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.00230301;OID=.;OPOS=11174327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:118:118:107:107:11:11:0.0932203:9:2:41:66:9:2:41:66 chr12 11174372 . C G 47.48 PASS AF=0.102564;AO=12;DP=117;FAO=12;FDP=117;FR=.;FRO=105;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=67;FWDB=-0.0126151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3857;QD=1.62327;RBI=0.0819957;REFB=-0.00283783;REVB=-0.0810195;RO=105;SAF=3;SAR=9;SRF=38;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15266;STB=0.61788;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0316493;OID=.;OPOS=11174372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:117:117:105:105:12:12:0.102564:9:3:38:67:9:3:38:67 chr12 11174380 . C T 50.61 PASS AF=0.109091;AO=12;DP=110;FAO=12;FDP=110;FR=.;FRO=98;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=-0.0159222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.249;QD=1.84032;RBI=0.0288239;REFB=-0.00284301;REVB=-0.0240271;RO=95;SAF=3;SAR=9;SRF=36;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175759;STB=0.622122;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0357679;OID=.;OPOS=11174380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:110:110:95:98:12:12:0.109091:9:3:36:59:9:3:36:62 chr12 11174390 . G A 43.16 PASS AF=0.0982143;AO=11;DP=112;FAO=11;FDP=112;FR=.;FRO=101;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=-0.00947272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.328;QD=1.54152;RBI=0.02225;REFB=-0.00120284;REVB=-0.0201328;RO=101;SAF=2;SAR=9;SRF=40;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28745;STB=0.729265;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0505204;OID=.;OPOS=11174390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:112:112:101:101:11:11:0.0982143:9:2:40:61:9:2:40:61 chr12 11174397 . T A 43.17 PASS AF=0.0982143;AO=11;DP=112;FAO=11;FDP=112;FR=.;FRO=101;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=0.00591642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.277;QD=1.5419;RBI=0.00613091;REFB=0.000501338;REVB=0.0016075;RO=101;SAF=2;SAR=9;SRF=40;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28745;STB=0.729265;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.00685108;OID=.;OPOS=11174397;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:112:112:101:101:11:11:0.0982143:9:2:40:61:9:2:40:61 chr12 11174416 . A G 52.43 PASS AF=0.113208;AO=12;DP=106;FAO=12;FDP=106;FR=.;FRO=94;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=0.00745559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3601;QD=1.97845;RBI=0.0287444;REFB=-0.00151694;REVB=0.0277606;RO=94;SAF=3;SAR=9;SRF=39;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217398;STB=0.662868;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0147473;OID=.;OPOS=11174416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:106:106:94:94:12:12:0.113208:9:3:39:55:9:3:39:55 chr12 11174466 . G A 34.68 PASS AF=0.0909091;AO=9;DP=99;FAO=9;FDP=99;FR=.;FRO=90;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0035015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.506;QD=1.40132;RBI=0.00970566;REFB=0.0006308;REVB=-0.00905203;RO=90;SAF=2;SAR=7;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302742;STB=0.744114;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00941684;OID=.;OPOS=11174466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:99:99:90:90:9:9:0.0909091:7:2:43:47:7:2:43:47 chr12 11174753 . G A 240.88 PASS AF=0.5;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00286437;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.107;QD=19.2704;RBI=0.0349018;REFB=-0.0104621;REVB=0.034784;RO=25;SAF=16;SAR=8;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992057;STB=0.54445;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0121756;OID=.;OPOS=11174753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:24:25:0.5:8:16:19:6:9:16:18:7 chr12 11183451 . A T 681.97 PASS AF=0.492754;AO=68;DP=138;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=-0.0442001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6035;QD=19.7674;RBI=0.0633031;REFB=0.00151019;REVB=-0.045317;RO=69;SAF=31;SAR=37;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151828;STB=0.586904;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00200989;OID=.;OPOS=11183451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:69:70:68:68:0.492754:37:31:43:26:37:31:44:26 chr12 11183506 . T A 35.99 PASS AF=0.0820896;AO=11;DP=134;FAO=11;FDP=134;FR=.;FRO=123;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=65;FSRR=58;FWDB=0.017375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.345;QD=1.07447;RBI=0.0176585;REFB=-0.000497831;REVB=0.00315123;RO=123;SAF=7;SAR=4;SRF=65;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123504;STB=0.600922;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00641846;OID=.;OPOS=11183506;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:134:134:123:123:11:11:0.0820896:4:7:65:58:4:7:65:58 chr12 11183524 . T C 93.12 PASS AF=0.141791;AO=19;DP=135;FAO=19;FDP=134;FR=.;FRO=115;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=57;FWDB=-0.0111414;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.427;QD=2.77957;RBI=0.0120451;REFB=-0.000882393;REVB=-0.00457757;RO=113;SAF=11;SAR=8;SRF=57;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942623;STB=0.564257;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0128131;OID=.;OPOS=11183524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:135:134:113:115:19:19:0.141791:8:11:57:56:8:11:58:57 chr12 11183576 . T C 207.36 PASS AF=0.252033;AO=31;DP=123;FAO=31;FDP=123;FR=.;FRO=92;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=0.00659267;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9666;QD=6.74351;RBI=0.0237598;REFB=-0.00297624;REVB=-0.0228269;RO=92;SAF=16;SAR=15;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204735;STB=0.512341;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0186062;OID=.;OPOS=11183576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:92:92:31:31:0.252033:15:16:49:43:15:16:49:43 chr12 11183642 . A G 339.76 PASS AF=0.355932;AO=42;DP=120;FAO=42;FDP=118;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.0207063;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1408;QD=11.5174;RBI=0.0216501;REFB=-0.0147984;REVB=0.00632243;RO=76;SAF=18;SAR=24;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167859;STB=0.596108;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0280492;OID=.;OPOS=11183642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:118:76:76:42:42:0.355932:24:18:44:32:24:18:44:32 chr12 11183676 . C T 300.14 PASS AF=0.348624;AO=38;DP=110;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.0246386;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.006;QD=11.0142;RBI=0.0251655;REFB=-0.00578783;REVB=-0.00512275;RO=71;SAF=18;SAR=20;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536395;STB=0.530872;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00910245;OID=.;OPOS=11183676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:71:71:38:38:0.348624:20:18:37:34:20:18:37:34 chr12 11183697 . C A 167.12 PASS AF=0.258065;AO=23;DP=92;FAO=24;FDP=93;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.00901735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.107;QD=7.18776;RBI=0.0229799;REFB=-0.0105461;REVB=0.0211368;RO=67;SAF=10;SAR=13;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125553;STB=0.588477;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0241377;OID=.;OPOS=11183697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:67:69:23:24:0.258065:13:10:36:31:14:10:37:32 chr12 11183708 . T C 117.09 PASS AF=0.216867;AO=18;DP=83;FAO=18;FDP=83;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=-0.0128728;FXX=0.0568117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0892;QD=5.64295;RBI=0.0155745;REFB=-0.00597161;REVB=0.00876665;RO=55;SAF=6;SAR=12;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301363;STB=0.67181;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0151421;OID=.;OPOS=11183708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:55:65:18:18:0.216867:12:6:32:23:12:6:36:29 chr12 11183722 . A C 94.86 PASS AF=0.195122;AO=16;DP=81;FAO=16;FDP=82;FR=.;FRO=66;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0328655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7703;QD=4.62727;RBI=0.0365772;REFB=-0.00443569;REVB=0.0160547;RO=65;SAF=8;SAR=8;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482417;STB=0.53654;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0164373;OID=.;OPOS=11183722;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:81:82:65:66:16:16:0.195122:8:8:35:30:8:8:36:30 chr12 11183752 . T C 68.87 PASS AF=0.181818;AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.000280378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.365;QD=4.17421;RBI=0.0033661;REFB=-0.00704112;REVB=0.0033544;RO=54;SAF=6;SAR=6;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923614;STB=0.560507;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0322891;OID=.;OPOS=11183752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:66:66:54:54:12:12:0.181818:6:6:31:23:6:6:31:23 chr12 11244166 . G C 922.28 PASS AF=0.929577;AO=66;DP=71;FAO=66;FDP=71;FR=.;FRO=5;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00590856;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.018;QD=51.9594;RBI=0.00606945;REFB=-0.0214753;REVB=0.00138822;RO=5;SAF=26;SAR=40;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557001;STB=0.529558;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00111274;OID=.;OPOS=11244166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:71:71:5:5:66:66:0.929577:40:26:4:1:40:26:4:1 chr12 11244194 . T C 945.03 PASS AF=0.943662;AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00228032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.192;QD=53.241;RBI=0.00697827;REFB=-0.00071294;REVB=-0.00659518;RO=4;SAF=28;SAR=39;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360342;STB=0.519101;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=1.12815e-05;OID=.;OPOS=11244194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:71:71:4:4:67:67:0.943662:39:28:3:1:39:28:3:1 chr12 11244725 . C G 601.14 PASS AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.364;QD=58.6482;RBI=0.0230502;REFB=-0.0335058;REVB=0.0032277;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253303;STB=0.512814;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00190985;OID=.;OPOS=11244725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:39:40:0.97561:21:18:1:0:21:19:1:0 chr12 11338613 . CA GG 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104175;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=303.869;QD=64.4154;RBI=0.0121896;REFB=0;REVB=0.00632949;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.68377e-05;OID=.;OPOS=11338613;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0 chr12 11338781 . C A 1803.99 PASS AF=0.991667;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000337355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.019;QD=60.133;RBI=0.0826687;REFB=0.0656314;REVB=-0.082668;RO=1;SAF=57;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0075998;STB=0.503999;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-0.000894508;OID=.;OPOS=11338781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:120:120:1:1:119:119:0.991667:62:57:0:1:62:57:0:1 chr12 11338957 . A G 255.37 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.082443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5412;QD=51.0739;RBI=0.084127;REFB=0;REVB=0.0167485;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00222889;OID=.;OPOS=11338957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0 chr12 11338983 . T C 115.9 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.745;QD=38.6322;RBI=0.0449057;REFB=-0.0828232;REVB=0.0390303;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599362;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112024;OID=.;OPOS=11338983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:12:12:1:0:11:12:1:7:4:0:1:8:4:0:0 chr12 11339020 . T A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0874361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.861;QD=33.4285;RBI=0.0909075;REFB=0;REVB=0.0248817;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000662063;OID=.;OPOS=11339020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr12 11418954 . A G 564.06 PASS AF=0.649351;AO=49;DP=77;FAO=50;FDP=77;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00850759;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.613;QD=29.3018;RBI=0.0136441;REFB=-0.0123138;REVB=0.0106668;RO=27;SAF=23;SAR=26;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563256;STB=0.533528;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00587511;OID=.;OPOS=11418954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:27:27:49:50:0.649351:26:23:15:12:27:23:15:12 chr12 11420375 . G A 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0572378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9537;QD=19.1341;RBI=0.0981322;REFB=-0.073575;REVB=0.0797105;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212944;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0124509;OID=.;OPOS=11420375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:2:0:2:3:2:0 chr12 11461292 . C G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.477;QD=35.5756;RBI=0.0506701;REFB=0;REVB=-0.024884;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000561417;OID=.;OPOS=11461292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr12 11462275 . A G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00936714;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.08;QD=57.1775;RBI=0.0113567;REFB=0;REVB=0.00642112;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90842e-06;OID=.;OPOS=11462275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr12 11506893 . C T 50.09 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.5023;QD=33.3948;RBI=0.0292842;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00292862;OID=.;OPOS=11506893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr12 12044393 . T TTA 117.05 PASS AF=0.164179;AO=22;DP=203;FAO=22;FDP=134;FR=.;FRO=112;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=64;FSRR=48;FWDB=-0.0193874;FXX=0.0359686;HRUN=2;LEN=2;MLLD=268.778;QD=3.49404;RBI=0.0433925;REFB=-0.00750915;REVB=-0.0388206;RO=179;SAF=17;SAR=5;SRF=92;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328459;STB=0.689707;STBP=0.061;TYPE=ins;VARB=0.0262673;OID=.;OPOS=12044394;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.164179:22:203:22:134:112:17:5:64:48:99:179:17:5:92:87 chr12 12045264 . G T 298.94 PASS AF=0.390805;AO=31;DP=88;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0355851;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.017;QD=13.7443;RBI=0.0378468;REFB=-0.0184703;REVB=0.0128871;RO=55;SAF=6;SAR=25;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245517;STB=0.608587;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.032397;OID=.;OPOS=12045264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:55:53:31:34:0.390805:25:6:20:35:27:7:18:35 chr12 12230938 . C A,G 332.65 PASS AF=0.08,0.92;AO=2,23;DP=25;FAO=2,23;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1,12;FSAR=1,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415155,-0.00181362;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=159.061,142.762;QD=53.2244;RBI=0.00585282,0.011215;REFB=0,0;REVB=0.00412555,-0.0110674;RO=0;SAF=1,12;SAR=1,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00426985,0.00213596;OID=.,.;OPOS=12230938,12230938;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:25:25:0:0:2,23:2,23:0.08,0.92:1,11:1,12:0:0:1,11:1,12:0:0 chr12 12240199 . C T 497.84 PASS AF=0.481818;AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00170543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.415;QD=18.1032;RBI=0.00246407;REFB=-0.00432148;REVB=-0.00177853;RO=57;SAF=25;SAR=28;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510091;STB=0.528291;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00517967;OID=.;OPOS=12240199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:57:57:53:53:0.481818:28:25:30:27:28:25:30:27 chr12 12301898 . C T 1300.59 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0218623;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9961;QD=61.2042;RBI=0.027703;REFB=-0.0477348;REVB=0.0170145;RO=1;SAF=35;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133408;STB=0.507041;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00309734;OID=.;OPOS=12301898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:85:1:1:84:84:0.988235:49:35:1:0:49:35:1:0 chr12 12483275 . G A 356.17 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00115512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9926;QD=21.918;RBI=0.0402514;REFB=0.0172516;REVB=0.0402348;RO=29;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194336;STB=0.510724;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.0129838;OID=.;OPOS=12483275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:17:19:16:13:17:19:16:13 chr12 12483713 . A G 188.71 PASS AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0504082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.9553;QD=29.0323;RBI=0.0506669;REFB=0.0925095;REVB=0.00511346;RO=8;SAF=9;SAR=9;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139101;STB=0.57684;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.0239725;OID=.;OPOS=12483713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:9:9:2:6:9:9:2:6 chr12 12509865 . C T 71.88 PASS AF=0.6;AO=8;DP=14;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0223591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=381.432;QD=19.1681;RBI=0.0224639;REFB=-0.0148286;REVB=-0.00216688;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122361;STB=0.588041;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.00863224;OID=.;OPOS=12509865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:15:6:6:8:9:0.6:4:4:2:4:4:5:2:4 chr12 12510003 . G A 499.26 PASS AF=0.516129;AO=48;DP=93;FAO=48;FDP=93;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0041193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6419;QD=21.4736;RBI=0.00413729;REFB=-0.0136578;REVB=-0.000385412;RO=45;SAF=30;SAR=18;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608068;STB=0.533514;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.011571;OID=.;OPOS=12510003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:45:45:48:48:0.516129:18:30:31:14:18:30:31:14 chr12 12510097 . C T 562.9 PASS AF=0.437956;AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.00417345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9614;QD=16.4349;RBI=0.0172727;REFB=-0.000742621;REVB=-0.016761;RO=76;SAF=32;SAR=28;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202514;STB=0.50781;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00103969;OID=.;OPOS=12510097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:76:77:60:60:0.437956:28:32:39:37:28:32:40:37 chr12 12618690 . G A 66.64 PASS AF=0.8;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0430129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.451;QD=26.654;RBI=0.0434977;REFB=0.0430302;REVB=0.0064766;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422723;STB=0.666221;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00141453;OID=.;OPOS=12618690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:10:2:2:7:8:0.8:1:6:0:2:2:6:0:2 chr12 12814330 . T C 597.33 PASS AF=0.556604;AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0144044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.5838;QD=22.5407;RBI=0.0333905;REFB=-0.00187859;REVB=0.0301237;RO=47;SAF=29;SAR=30;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498978;STB=0.527316;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00160205;OID=.;OPOS=12814330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:47:47:59:59:0.556604:30:29:26:21:30:29:26:21 chr12 12814818 . C T 1268.62 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0270992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.746;QD=60.4106;RBI=0.0432723;REFB=0.0519309;REVB=-0.0337362;RO=1;SAF=28;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166127;STB=0.50877;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.000241112;OID=.;OPOS=12814818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:55:28:1:0:55:28:1:0 chr12 12879254 . T G 149.05 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0681515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1668;QD=18.6311;RBI=0.068173;REFB=-0.0120574;REVB=0.00171425;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0149632;OID=.;OPOS=12879254;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:11:5:5:11:11:5:5:11 chr12 12941884 . C T 1148.67 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00621552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.45;QD=60.4564;RBI=0.00622028;REFB=0;REVB=-0.000243253;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.49963e-05;OID=.;OPOS=12941884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:36:39:0:0:36:40:0:0 chr12 12941956 . A ATCCT 166.77 PASS AF=0.305556;AO=22;DP=78;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.00466375;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=4;MLLD=312.956;QD=9.26512;RBI=0.0107918;REFB=-0.00691281;REVB=0.00973202;RO=55;SAF=7;SAR=15;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38889;STB=0.716722;STBP=0.022;TYPE=ins;VARB=0.0144105;OID=.;OPOS=12941957;OREF=-;OALT=TCCT;OMAPALT=ATCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.305556:22:78:22:72:50:7:15:32:18:99:55:7:15:36:19 chr12 12967127 . C T 875.25 PASS AF=0.543624;AO=81;DP=149;FAO=81;FDP=149;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0387356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.548;QD=23.4967;RBI=0.0436658;REFB=0.0192585;REVB=-0.0201556;RO=68;SAF=39;SAR=42;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00318578;STB=0.501742;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=-0.0161928;OID=.;OPOS=12967127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:68:68:81:81:0.543624:42:39:33:35:42:39:33:35 chr12 13028436 . G A 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00555612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.831;QD=14.0975;RBI=0.00620723;REFB=-0.00677162;REVB=0.00276752;RO=18;SAF=3;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301131;STB=0.67767;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00490429;OID=.;OPOS=13028436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:10:3:9:9:10:3:9:9 chr12 13028652 . CA C,CG 321.93 PASS AF=0.0833333,0.916667;AO=5,19;DP=24;FAO=2,22;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2,7;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464869,0.0543622;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=229.076,250.631;QD=53.6542;RBI=0.0497986,0.0567033;REFB=0,0;REVB=0.0178569,0.0161249;RO=0;SAF=5,4;SAR=0,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.00629e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0288355,0.00530819;OID=.,.;OPOS=13028653,13028653;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0833333,0.916667:5,19:24:2,22:24:0:2,7:0,15:0:0:7:0:5,4:0,15:0:0 chr12 13136623 . T C 229.4 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0115432;FXX=0.0333278;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.669;QD=15.8206;RBI=0.0263206;REFB=0.00326276;REVB=-0.0236544;RO=25;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877992;STB=0.621856;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0057377;OID=.;OPOS=13136623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:58:25:32:26:26:0.448276:17:9:11:14:17:9:18:14 chr12 13208552 . C T 395.55 PASS AF=0.455556;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=14;FWDB=-0.00200576;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1695;QD=17.5801;RBI=0.028182;REFB=0.00591489;REVB=-0.0281105;RO=48;SAF=20;SAR=21;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232953;STB=0.622585;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0137907;OID=.;OPOS=13208552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:49:41:41:0.455556:21:20:35:13:21:20:35:14 chr12 13214537 . A G 503.94 PASS AF=0.509804;AO=52;DP=103;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0263955;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.044;QD=19.7624;RBI=0.0341345;REFB=-0.0320514;REVB=-0.0216436;RO=49;SAF=22;SAR=30;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069467;STB=0.542238;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.02424;OID=.;OPOS=13214537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:49:50:52:52:0.509804:30:22:17:32:30:22:17:33 chr12 13221606 . T C 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.9334;QD=57.3852;RBI=0.0276952;REFB=0;REVB=-0.0153644;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000247679;OID=.;OPOS=13221606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0 chr12 13349823 . C T 361.33 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0253598;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6875;QD=20.0737;RBI=0.0405442;REFB=0.00624618;REVB=0.0316341;RO=35;SAF=19;SAR=18;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508537;STB=0.528202;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00740399;OID=.;OPOS=13349823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:35:35:37:37:0.513889:18:19:20:15:18:19:20:15 chr12 13369574 . A G 430.36 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00223969;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.471;QD=22.0698;RBI=0.00259159;REFB=-0.00708353;REVB=-0.00130389;RO=36;SAF=31;SAR=11;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248343;STB=0.63779;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0104037;OID=.;OPOS=13369574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:78:36:36:42:42:0.538462:11:31:17:19:11:31:17:19 chr12 13527882 . G A 1421.66 PASS AF=1;AO=79;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.506;QD=63.1849;RBI=0.0531183;REFB=0;REVB=0.0264255;RO=0;SAF=47;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204012;OID=.;OPOS=13527882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:79:90:1:32:47:0:0:38:52:0:0 chr12 13593879 . G A 282.29 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0734608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.966;QD=22.5828;RBI=0.0735583;REFB=-0.0159621;REVB=-0.00378687;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172453;STB=0.596257;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0143671;OID=.;OPOS=13593879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:15:11:15:9:15:11:15:9 chr12 13715975 . A G 415.35 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0144642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.673;QD=19.3187;RBI=0.0215199;REFB=-0.0145038;REVB=0.0159341;RO=44;SAF=24;SAR=18;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128429;STB=0.571395;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0137408;OID=.;OPOS=13715975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:18:24:19:25:18:24:19:25 chr12 13717508 . G A 374.92 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.00619959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.375;QD=14.5601;RBI=0.014075;REFB=-0.0103719;REVB=0.012636;RO=60;SAF=16;SAR=27;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234926;STB=0.632371;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0221701;OID=.;OPOS=13717508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:27:16:36:24:27:16:36:24 chr12 13761741 . G A 507.43 PASS AF=0.514851;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0138962;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5101;QD=20.096;RBI=0.0165926;REFB=-0.00522691;REVB=-0.00906702;RO=48;SAF=27;SAR=25;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710448;STB=0.53403;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0101141;OID=.;OPOS=13761741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:48:49:52:52:0.514851:25:27:21:27:25:27:22:27 chr12 13836561 . T A 206.48 PASS AF=0.384615;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.00524302;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4199;QD=12.7066;RBI=0.0276575;REFB=-0.017693;REVB=0.027156;RO=39;SAF=17;SAR=8;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161337;STB=0.503523;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0186181;OID=.;OPOS=13836561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:39:40:25:25:0.384615:8:17:26:13:8:17:27:13 chr12 13836650 . G A 435.53 PASS AF=0.575342;AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00703437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.481;QD=23.8644;RBI=0.0122361;REFB=-0.0116228;REVB=0.010012;RO=31;SAF=19;SAR=23;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258529;STB=0.514185;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0094087;OID=.;OPOS=13836650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:31:31:42:42:0.575342:23:19:13:18:23:19:13:18 chr12 14577892 . A T 131.29 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0422785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1092;QD=14.1935;RBI=0.0738039;REFB=-0.0023883;REVB=0.0604942;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307812;STB=0.674507;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0074518;OID=.;OPOS=14577892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:9:6:3:19:9:6:3:19 chr12 14656768 . G C 1065.41 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0107365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2177;QD=58.3787;RBI=0.0385146;REFB=-0.14937;REVB=0.0369878;RO=1;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185398;STB=0.509801;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0106842;OID=.;OPOS=14656768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:25:47:0:1:25:47:0:1 chr12 14664595 . A G 145.83 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0181081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9661;QD=25.3609;RBI=0.0754177;REFB=-0.0300769;REVB=0.0732115;RO=8;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574481;STB=0.532121;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0181934;OID=.;OPOS=14664595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:7:8:5:3:7:8:5:3 chr12 14688644 . C T 1491.69 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.196;QD=63.4763;RBI=0.0167953;REFB=0;REVB=-0.0148191;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.06841e-05;OID=.;OPOS=14688644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:56:38:0:0:56:38:0:0 chr12 14794062 . G A 1399.94 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00879717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5517;QD=61.5356;RBI=0.0150222;REFB=-0.0179516;REVB=-0.0121769;RO=1;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108952;STB=0.505746;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-2.37177e-05;OID=.;OPOS=14794062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:43:47:0:1:43:47:0:1 chr12 14827463 . AATC A 1286.65 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131755;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=3;MLLD=348.94;QD=49.0154;RBI=0.0137814;REFB=0;REVB=-0.00404145;RO=0;SAF=65;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02925e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=6.02057e-06;OID=.;OPOS=14827464;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:105:106:105:105:0:65:40:0:0:23:0:65:40:0:0 chr12 14829893 . A C 4048.69 PASS AF=1;AO=258;DP=259;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.483;QD=62.2876;RBI=0.0618531;REFB=0;REVB=0.0303152;RO=0;SAF=121;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219639;OID=.;OPOS=14829893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:259:260:0:0:258:260:1:137:121:0:0:138:122:0:0 chr12 14927825 . C G 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00931403;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=332.26;QD=15.1969;RBI=0.02456;REFB=-0.00433448;REVB=-0.0227254;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275051;STB=0.660139;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00489301;OID=.;OPOS=14927825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:8:10:4:10:8:10 chr12 14927994 . T C 407.85 PASS AF=0.619048;AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0257132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7474;QD=25.8953;RBI=0.0578228;REFB=0.0128368;REVB=-0.051791;RO=24;SAF=19;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669022;STB=0.536567;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.00934381;OID=.;OPOS=14927994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:24:24:39:39:0.619048:20:19:14:10:20:19:14:10 chr12 14928016 . G T 374.97 PASS AF=0.631579;AO=31;DP=55;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00444469;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=175.367;QD=26.314;RBI=0.0176942;REFB=-0.0429938;REVB=0.0171269;RO=7;SAF=22;SAR=9;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127643;STB=0.515266;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0128776;OID=.;OPOS=14928016;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:7:21:31:36:0.631579:9:22:7:0:14:22:12:9 chr12 14929721 . C T 173.95 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.016242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9555;QD=19.3277;RBI=0.0821903;REFB=0.00167573;REVB=-0.0805695;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00581532;OID=.;OPOS=14929721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:10:8:8:10:10:8:8:10 chr12 14929872 . A G 1472.42 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.304;QD=63.3297;RBI=0.0312115;REFB=0;REVB=0.0132505;RO=0;SAF=44;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01166e-05;OID=.;OPOS=14929872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:49:44:0:0:49:44:0:0 chr12 14930055 . G T 231.69 PASS AF=0.421875;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.00501358;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.992;QD=14.4804;RBI=0.0471268;REFB=-0.00375468;REVB=-0.0468594;RO=34;SAF=9;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838719;STB=0.528714;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00566246;OID=.;OPOS=14930055;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:34:37:27:27:0.421875:18:9:14:20:18:9:14:23 chr12 14959391 . T C 467.44 PASS AF=0.459459;AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.00260393;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.087;QD=16.8448;RBI=0.00352311;REFB=0.00178351;REVB=-0.00237316;RO=60;SAF=18;SAR=33;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179807;STB=0.600396;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00240059;OID=.;OPOS=14959391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:60:60:51:51:0.459459:33:18:32:28:33:18:32:28 chr12 14976063 . A G 356.57 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0111795;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.436;QD=19.2741;RBI=0.0159018;REFB=-0.00121536;REVB=-0.0113087;RO=37;SAF=17;SAR=20;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243926;STB=0.513566;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00105744;OID=.;OPOS=14976063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:20:17:18:19:20:17:18:19 chr12 14976178 . T A 579.8 PASS AF=0.662338;AO=51;DP=77;FAO=51;FDP=77;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00954951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.754;QD=30.1193;RBI=0.00974828;REFB=-0.0219161;REVB=-0.00195852;RO=26;SAF=26;SAR=25;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00610672;STB=0.50331;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0117079;OID=.;OPOS=14976178;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:26:26:51:51:0.662338:25:26:13:13:25:26:13:13 chr12 14993439 . C T 279.91 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00450268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.99;QD=14.1724;RBI=0.00554838;REFB=0.000605559;REVB=-0.00324197;RO=47;SAF=23;SAR=9;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25707;STB=0.646962;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.000858155;OID=.;OPOS=14993439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:9:23:23:24:9:23:23:24 chr12 14993608 . G A 732.39 PASS AF=0.555556;AO=70;DP=126;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.0154169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.772;QD=23.2506;RBI=0.0310269;REFB=-0.0236241;REVB=0.0269256;RO=56;SAF=36;SAR=34;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113034;STB=0.561719;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0164106;OID=.;OPOS=14993608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:56:56:70:70:0.555556:34:36:21:35:34:36:21:35 chr12 14993854 . A G 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0170565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.818;QD=21.0646;RBI=0.0176318;REFB=-0.00610751;REVB=-0.00446704;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741341;STB=0.541632;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00300202;OID=.;OPOS=14993854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:11:13:11:13:11:13 chr12 15035081 . T C 597.51 PASS AF=0.508333;AO=60;DP=121;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00580976;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.921;QD=19.917;RBI=0.0177818;REFB=-0.0104181;REVB=0.0168059;RO=59;SAF=32;SAR=28;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713376;STB=0.50769;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0167456;OID=.;OPOS=15035081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:59:59:60:61:0.508333:28:32:31:28:28:33:31:28 chr12 15081897 . AG CA,CG 905.64 PASS AF=0.5,0.5;AO=32,32;DP=65;FAO=32,32;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=18,20;FSAR=14,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102513,0.0171918;FXX=0.0153822;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=138.857,160.004;QD=56.6024;RBI=0.0566733,0.0728171;REFB=0,0;REVB=-0.0557385,-0.0707586;RO=0;SAF=18,20;SAR=14,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.000455366,0.00712794;OID=.,.;OPOS=15081897,15081897;OREF=AG,A;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:65:64:0:0:32,32:32,32:0.5,0.5:14,12:18,20:0:0:14,12:18,20:0:0 chr12 15095558 . C G 546.96 PASS AF=0.573034;AO=48;DP=86;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0321732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.012;QD=24.5826;RBI=0.032569;REFB=-0.0242774;REVB=-0.00506202;RO=38;SAF=18;SAR=30;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610018;STB=0.515598;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0204796;OID=.;OPOS=15095558;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:89:38:38:48:51:0.573034:30:18:17:21:30:21:17:21 chr12 15103605 . A G 2188.64 PASS AF=1;AO=138;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5;QD=62.5326;RBI=0.0574518;REFB=0;REVB=0.0345495;RO=1;SAF=78;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605659;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0005493;OID=.;OPOS=15103605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:139:140:1:0:138:140:1:60:78:1:0:60:80:0:0 chr12 15134353 . A G 270.45 PASS AF=0.291339;AO=36;DP=126;FAO=37;FDP=127;FR=.;FRO=90;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0413304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.051;QD=8.51794;RBI=0.0494601;REFB=-0.0106639;REVB=-0.027168;RO=88;SAF=15;SAR=21;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738645;STB=0.552114;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0300328;OID=.;OPOS=15134353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:88:90:36:37:0.291339:21:15:42:46:22:15:43:47 chr12 15262179 . G A 352.95 PASS AF=0.447059;AO=36;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.00637863;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.862;QD=16.6093;RBI=0.0128403;REFB=-0.0132555;REVB=0.0111439;RO=47;SAF=12;SAR=24;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226722;STB=0.603718;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0219005;OID=.;OPOS=15262179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:36:38:0.447059:24:12:26:21:24:14:26:21 chr12 15669737 . T C 799.26 PASS AF=0.596774;AO=72;DP=122;FAO=74;FDP=124;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=-0.00733872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.13;QD=25.7827;RBI=0.00767017;REFB=-0.0131251;REVB=0.00223039;RO=50;SAF=32;SAR=40;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111888;STB=0.560306;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00831151;OID=.;OPOS=15669737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:124:50:50:72:74:0.596774:40:32:15:35:41:33:15:35 chr12 15813614 . C A 919.47 PASS AF=0.466346;AO=97;DP=212;FAO=97;FDP=208;FR=.;FRO=111;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=-0.0127642;FXX=0.018867;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.908;QD=17.6821;RBI=0.0153042;REFB=-0.00690949;REVB=-0.00844353;RO=111;SAF=37;SAR=60;SRF=57;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13026;STB=0.572109;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0070535;OID=.;OPOS=15813614;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:208:111:111:97:97:0.466346:60:37:57:54:60:37:57:54 chr12 16189694 . T A 2067.51 PASS AF=0.992537;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.016326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.695;QD=61.7168;RBI=0.0164246;REFB=-0.0624574;REVB=-0.00179722;RO=0;SAF=57;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85809e-08;STB=0.503267;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000130987;OID=.;OPOS=16189694;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:134:134:0:1:133:133:0.992537:76:57:0:0:76:57:0:1 chr12 16347308 . G A 655.29 PASS AF=0.439024;AO=72;DP=164;FAO=72;FDP=164;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=38;FWDB=-0.00489418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6646;QD=15.9827;RBI=0.0376411;REFB=-0.0103859;REVB=-0.0373216;RO=92;SAF=44;SAR=28;SRF=54;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253949;STB=0.51416;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0143981;OID=.;OPOS=16347308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:92:92:72:72:0.439024:28:44:54:38:28:44:54:38 chr12 16369828 . A T 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.068;QD=57.2377;RBI=0.0252129;REFB=0;REVB=0.0251151;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79669e-05;OID=.;OPOS=16369828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0 chr12 16397677 . G A 2373.47 PASS AF=1;AO=155;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.324;QD=60.8582;RBI=0.00357623;REFB=0;REVB=-0.00201389;RO=0;SAF=55;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83552e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.06078e-05;OID=.;OPOS=16397677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:155:156:0:0:155:156:1:100:55:0:0:101:55:0:0 chr12 16397734 . C A 461.44 PASS AF=0.451327;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.0515662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0512;QD=16.3343;RBI=0.0544113;REFB=0.00938599;REVB=-0.0173642;RO=62;SAF=18;SAR=33;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00203978;STB=0.501139;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.0125623;OID=.;OPOS=16397734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:62:62:51:51:0.451327:33:18:22:40:33:18:22:40 chr12 16430284 . G A 939.96 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00618092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.602;QD=56.9672;RBI=0.0097098;REFB=-0.130943;REVB=-0.00748841;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122705;STB=0.506491;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000427815;OID=.;OPOS=16430284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:38:27:0:1:38:27:0:1 chr12 18435398 . GCCC G 74.42 PASS AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0212151;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=61.3177;QD=12.4029;RBI=0.0333132;REFB=-0.0104518;REVB=-0.0256843;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.472222;SSSB=-0.133539;STB=0.545372;STBP=0.735;TYPE=del;VARB=0.0109542;OID=.;OPOS=18435399;OREF=CCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.458333:10:24:11:24:13:5:6:7:6:74:13:4:6:7:6 chr12 18435452 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.017782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.873;QD=14.0965;RBI=0.0363711;REFB=0.00908152;REVB=-0.0317278;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067129;STB=0.50393;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=-0.0127354;OID=.;OPOS=18435452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:9:5:4:7:9:5 chr12 18649057 . C T 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0096742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.229;QD=14.7347;RBI=0.00997333;REFB=-0.0120101;REVB=-0.00242428;RO=36;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561771;STB=0.531891;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0104634;OID=.;OPOS=18649057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:15:12:18:18:15:12:18:18 chr12 18691183 . T TTGCTGTCG 361.19 PASS AF=0.354839;AO=41;DP=135;FAO=44;FDP=124;FR=.;FRO=80;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=-0.00902762;FXX=0.0387567;HRUN=3;LEN=8;MLLD=339.692;QD=11.6513;RBI=0.00965895;REFB=-0.00329669;REVB=0.00343474;RO=88;SAF=11;SAR=30;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336968;STB=0.662519;STBP=0.015;TYPE=ins;VARB=0.00381457;OID=.;OPOS=18691184;OREF=-;OALT=TGCTGTCG;OMAPALT=TTGCTGTCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.354839:41:135:44:124:80:13:31:43:37:99:88:11:30:48:40 chr12 19329493 . T C 64.86 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0767238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.901;QD=10.3778;RBI=0.0776828;REFB=-0.00735744;REVB=-0.0121689;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920876;STB=0.535635;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00960641;OID=.;OPOS=19329493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:4:5:7:8:4:5:8:8 chr12 19598956 . C A 138.95 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.076378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.169;QD=12.0826;RBI=0.0793976;REFB=0.00291861;REVB=-0.0216885;RO=30;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314431;STB=0.683991;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00926222;OID=.;OPOS=19598956;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:6:10:10:20:6:10:10:20 chr12 19626205 . T C 131.44 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0152622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.033;QD=14.2097;RBI=0.0182784;REFB=0.00210354;REVB=0.0100581;RO=21;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199743;STB=0.626174;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.0033345;OID=.;OPOS=19626205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:21:22:15:15:0.405405:7:8:7:14:7:8:7:15 chr12 20704503 . CG CC,C 1150.21 PASS AF=0,0.635359;AO=12,100;DP=182;FAO=0,115;FDP=181;FR=.;FRO=66;FSAF=0,14;FSAR=0,101;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=-0.115111,-0.00287997;FXX=0.0054942;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.9563,19.3424;QD=25.419;RBI=0.123095,0.0315426;REFB=-0.0737618,-0.0666435;REVB=0.0436097,0.0314108;RO=64;SAF=12,1;SAR=0,99;SRF=22;SRR=42;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.758864,-0.778101;STB=0.5,0.649544;STBP=1,0.001;TYPE=snp,del;VARB=0.00675368,0.0311345;OID=.,.;OPOS=20704504,20704504;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.635359:12,100:182:0,115:181:66:0,14:0,101:23:43:99:64:12,1:0,99:22:42 chr12 20704509 . T G 1031.34 PASS AF=0.573964;AO=97;DP=169;FAO=97;FDP=169;FR=.;FRO=72;FSAF=10;FSAR=87;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=-0.0403497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.837;QD=24.4105;RBI=0.0467055;REFB=-0.0183925;REVB=-0.0235224;RO=70;SAF=10;SAR=87;SRF=24;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343216;STB=0.694364;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.031725;OID=.;OPOS=20704509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:70:72:97:97:0.573964:87:10:24:46:87:10:25:47 chr12 20766559 . C T 1475.68 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896579;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.282;QD=63.47;RBI=0.0896598;REFB=0;REVB=0.000577845;RO=0;SAF=31;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.99747e-05;OID=.;OPOS=20766559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:62:31:0:0:62:31:0:0 chr12 20903757 . T C 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00931412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.575;QD=59.3228;RBI=0.0101111;REFB=0;REVB=-0.00393461;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83885e-05;OID=.;OPOS=20903757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0 chr12 20905250 . C T 1460.52 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.137;QD=62.8179;RBI=0.0191921;REFB=0;REVB=0.0140951;RO=0;SAF=54;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09023e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07926e-05;OID=.;OPOS=20905250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:38:54:0:0:38:55:0:0 chr12 21011480 . T G 1803.48 PASS AF=1;AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.013;QD=61.1348;RBI=0.02089;REFB=0;REVB=0.0161406;RO=0;SAF=51;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84699e-05;OID=.;OPOS=21011480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:117:118:1:66:51:0:0:67:51:0:0 chr12 21011792 . A G 287.81 PASS AF=0.438356;AO=31;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.013587;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.886;QD=15.7706;RBI=0.013684;REFB=-0.0245016;REVB=-0.00162647;RO=41;SAF=17;SAR=14;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134029;STB=0.582572;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0197954;OID=.;OPOS=21011792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:31:32:0.438356:14:17:17:24:14:18:17:24 chr12 21011813 . C T 1400.2 PASS AF=0.989011;AO=87;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0496614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6348;QD=61.5472;RBI=0.0536677;REFB=-0.0124182;REVB=0.0203461;RO=3;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342141;STB=0.505746;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00152882;OID=.;OPOS=21011813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:3:1:87:90:0.989011:40:47:0:3:43:47:0:1 chr12 21013948 . C T 557.09 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4586;QD=60.2261;RBI=0.0655204;REFB=0;REVB=-0.0637636;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00142858;OID=.;OPOS=21013948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0 chr12 21015760 . G A 1713.07 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6224;QD=60.6396;RBI=0.00897331;REFB=0;REVB=0.00400258;RO=0;SAF=56;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57857e-05;OID=.;OPOS=21015760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:57:56:0:0:57:56:0:0 chr12 21036411 . A G 1698.17 PASS AF=1;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368211;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.073;QD=60.6488;RBI=0.0375696;REFB=0;REVB=0.00746202;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.58177e-05;OID=.;OPOS=21036411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:112:0:0:112:112:1:52:60:0:0:52:60:0:0 chr12 21054369 . G A 520.98 PASS AF=0.419118;AO=57;DP=136;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=0.0114359;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.29;QD=15.3231;RBI=0.0125611;REFB=-0.0208605;REVB=-0.00519633;RO=79;SAF=33;SAR=24;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140631;STB=0.57892;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0303053;OID=.;OPOS=21054369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:79:79:57:57:0.419118:24:33:35:44:24:33:35:44 chr12 21054918 . T C 337.55 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.00344824;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.083;QD=14.3638;RBI=0.0333223;REFB=0.00323927;REVB=0.0331434;RO=55;SAF=18;SAR=19;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052962;STB=0.539771;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=-0.00509655;OID=.;OPOS=21054918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:55:57:37:37:0.393617:19:18:24:31:19:18:24:33 chr12 21176135 . T C 3683.91 PASS AF=1;AO=231;DP=233;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154228;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4442;QD=63.2432;RBI=0.132112;REFB=0;REVB=0.131208;RO=1;SAF=116;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00412602;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222494;OID=.;OPOS=21176135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:233:233:1:0:231:233:1:115:116:0:1:116:117:0:0 chr12 21243001 . C T 315.65 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0516559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.456;QD=17.5359;RBI=0.0524605;REFB=-0.0007988;REVB=0.00915277;RO=37;SAF=10;SAR=24;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144168;STB=0.575599;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000612626;OID=.;OPOS=21243001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:37:38:34:34:0.472222:24:10:16:21:24:10:16:22 chr12 21329738 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.096253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6749;QD=59.8389;RBI=0.105976;REFB=0;REVB=0.0443418;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0021866;OID=.;OPOS=21329738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr12 21331549 . T C 815.67 PASS AF=0.538462;AO=77;DP=143;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0586656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7033;QD=22.816;RBI=0.0606972;REFB=-0.0244445;REVB=0.0155723;RO=66;SAF=39;SAR=38;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00547439;STB=0.502997;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0193834;OID=.;OPOS=21331549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:66:66:77:77:0.538462:38:39:33:33:38:39:33:33 chr12 21331625 . C T 2156.21 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.227;QD=62.955;RBI=0.0432665;REFB=0;REVB=0.00240823;RO=0;SAF=59;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.07973e-05;OID=.;OPOS=21331625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:135:137:0:0:135:137:1:76:59:0:0:78:59:0:0 chr12 21428246 . A C 1492.2 PASS AF=0.551724;AO=143;DP=261;FAO=144;FDP=261;FR=.;FRO=117;FSAF=91;FSAR=53;FSRF=67;FSRR=50;FWDB=0.0241805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4684;QD=22.869;RBI=0.0554262;REFB=-0.0356914;REVB=0.0498735;RO=111;SAF=91;SAR=52;SRF=65;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435238;STB=0.528142;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0228173;OID=.;OPOS=21428246;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:111:117:143:144:0.551724:52:91:65:46:53:91:67:50 chr12 21609773 . A G 200.95 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00818454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0943;QD=15.1657;RBI=0.0669516;REFB=-0.0322511;REVB=0.0664495;RO=30;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769762;STB=0.54388;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0181394;OID=.;OPOS=21609773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:14:9:14:16:14:9:14:16 chr12 21622051 . A C 463.38 PASS AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0102179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.676;QD=21.8061;RBI=0.0103693;REFB=-0.00655915;REVB=-0.00176492;RO=40;SAF=17;SAR=28;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12868;STB=0.57109;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00728331;OID=.;OPOS=21622051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:28:17:21:19:28:17:21:19 chr12 21623179 . T C 161.19 PASS AF=0.485714;AO=16;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0143652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.807;QD=18.4212;RBI=0.0277442;REFB=-0.0309902;REVB=-0.0237357;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515134;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0332878;OID=.;OPOS=21623179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:18:18:16:17:0.485714:8:8:9:9:8:9:9:9 chr12 21623969 . A G 273.95 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0389028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.342;QD=15.2195;RBI=0.0462595;REFB=-0.0129661;REVB=-0.0250301;RO=41;SAF=20;SAR=11;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301472;STB=0.670086;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0135665;OID=.;OPOS=21623969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:11:20:14:27:11:20:14:27 chr12 21654831 . G T 731.23 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666464;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.947;QD=63.5853;RBI=0.070201;REFB=0;REVB=0.0220555;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227358;OID=.;OPOS=21654831;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:30:14:0:0:30:16:0:0 chr12 21670252 . G C 84.79 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0139658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.338;QD=10.9409;RBI=0.0143522;REFB=-0.00124266;REVB=-0.00330783;RO=20;SAF=2;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435346;STB=0.764184;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00764218;OID=.;OPOS=21670252;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:9:2:11:9:9:2:11:9 chr12 21712574 . C T 233.67 PASS AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.00472803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2744;QD=12.9818;RBI=0.0298219;REFB=0.00691309;REVB=0.0294447;RO=44;SAF=19;SAR=9;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354228;STB=0.702193;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.011363;OID=.;OPOS=21712574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:9:19:15:29:9:19:15:29 chr12 21713402 . T C 609.47 PASS AF=0.5;AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.0211841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.178;QD=19.6602;RBI=0.0237264;REFB=-0.00490833;REVB=-0.0106853;RO=62;SAF=32;SAR=30;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102904;STB=0.556699;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00311195;OID=.;OPOS=21713402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:62:62:62:0.5:30:32:39:23:30:32:39:23 chr12 21797029 . A G 903.21 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.992;QD=58.2715;RBI=0.0581246;REFB=0;REVB=0.0145093;RO=0;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159001;OID=.;OPOS=21797029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:42:19:0:0:42:20:0:0 chr12 22017422 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.014;QD=48.7372;RBI=0.028923;REFB=0;REVB=-0.00411651;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268959;OID=.;OPOS=22017422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr12 22063115 . A G 1660.87 PASS AF=0.991071;AO=108;DP=109;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0183218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.264;QD=59.3169;RBI=0.0313455;REFB=-0.0341085;REVB=0.0254333;RO=1;SAF=56;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840107;STB=0.504273;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.000419218;OID=.;OPOS=22063115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:112:1:1:108:111:0.991071:52:56:1:0:53:58:1:0 chr12 22213786 . C T 473.23 PASS AF=0.56962;AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0141482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.132;QD=23.961;RBI=0.0141772;REFB=-0.0110611;REVB=-0.000905401;RO=34;SAF=21;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492377;STB=0.527015;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00766944;OID=.;OPOS=22213786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:34:34:45:45:0.56962:24:21:18:16:24:21:18:16 chr12 22346779 . GATTAT G 214.33 PASS AF=0.248062;AO=20;DP=124;FAO=32;FDP=129;FR=.;FRO=97;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.00851737;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=5;MLLD=262.656;QD=6.64602;RBI=0.00925698;REFB=-0.0140056;REVB=0.00362576;RO=76;SAF=14;SAR=6;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180906;STB=0.56627;STBP=0.4;TYPE=del;VARB=0.0425806;OID=.;OPOS=22346780;OREF=ATTAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.248062:20:124:32:129:97:14:18:51:46:99:76:14:6:43:33 chr12 22348500 . A G 519.6 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=116;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.0280565;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.843;QD=18.073;RBI=0.0333307;REFB=-0.0154697;REVB=-0.0179936;RO=60;SAF=27;SAR=28;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854865;STB=0.504742;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0185305;OID=.;OPOS=22348500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:60:60:55:55:0.478261:28:27:30:30:28:27:30:30 chr12 22354466 . CC AT 221.45 PASS AF=0.511628;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00279929;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=106.218;QD=20.6004;RBI=0.00366476;REFB=-0.0134206;REVB=0.00236526;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850945;STB=0.536448;STBP=0.65;TYPE=mnp;VARB=0.0124734;OID=.;OPOS=22354466;OREF=CC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:21:21:21:22:0.511628:10:11:13:8:10:12:13:8 chr12 22354921 . A G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.029;QD=59.0187;RBI=0.019482;REFB=0;REVB=0.000324173;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.06046e-05;OID=.;OPOS=22354921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0 chr12 22478425 . A G 1577.23 PASS AF=0.95614;AO=109;DP=114;FAO=109;FDP=114;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0159644;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.247;QD=55.3413;RBI=0.0170361;REFB=-0.117545;REVB=-0.00594681;RO=1;SAF=53;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088725;STB=0.504991;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.000974014;OID=.;OPOS=22478425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:114:114:1:5:109:109:0.95614:56:53:1:0:56:53:3:2 chr12 22814036 . A G 1199.66 PASS AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0289608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.311;QD=58.5199;RBI=0.0492375;REFB=-0.120216;REVB=0.0398196;RO=2;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024902;STB=0.513155;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0186831;OID=.;OPOS=22814036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:37:43:0:2:37:43:0:2 chr12 22839581 . A G 165.18 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0184296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7971;QD=12.4664;RBI=0.0188881;REFB=0.000598973;REVB=0.00413621;RO=33;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507968;STB=0.529502;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=-0.00309658;OID=.;OPOS=22839581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:13:7:13:20:13:7:13:20 chr12 24859899 . G A 1612.75 PASS AF=1;AO=107;DP=110;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234418;FXX=0.0181802;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.895;QD=59.7313;RBI=0.0346824;REFB=0;REVB=0.0255607;RO=1;SAF=38;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00682978;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81167e-05;OID=.;OPOS=24859899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:108:1:0:107:108:1:69:38:0:1:70:38:0:0 chr12 24964383 . T C 365.06 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.030305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2036;QD=52.1518;RBI=0.0346127;REFB=-0.0721212;REVB=0.0167226;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.517229;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00318351;OID=.;OPOS=24964383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:14:13:0:0:14:13:0:1 chr12 24964523 . C T 817.65 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8902;QD=57.3792;RBI=0.0389653;REFB=0;REVB=0.00402148;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000319336;OID=.;OPOS=24964523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0 chr12 24968131 . G A 222.81 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.13;QD=49.5139;RBI=0.0362883;REFB=0;REVB=0.023294;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338249;OID=.;OPOS=24968131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:11:6:0:0:12:6:0:0 chr12 24968150 . A C 323.26 PASS AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0161912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.635;QD=47.891;RBI=0.0337348;REFB=-0.123217;REVB=0.0295952;RO=2;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579364;STB=0.531225;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000928271;OID=.;OPOS=24968150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:15:10:0:2:15:10:0:2 chr12 24970708 . G A,T 1126.98 PASS AF=0.961039,0.038961;AO=72,3;DP=75;FAO=74,3;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30,3;FSAR=44,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151772,0.000869219;FXX=0.0128189;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=81.5888,131.359;QD=58.5443;RBI=0.017709,0.0122237;REFB=0,0;REVB=0.00912487,-0.0121928;RO=0;SAF=30,3;SAR=42,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.1178e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00851872,0.0542274;OID=.,.;OPOS=24970708,24970708;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:75:77:0:0:72,3:74,3:0.961039,0.038961:42,0:30,3:0:0:44,0:30,3:0:0 chr12 25054891 . G A 1227.36 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5133;QD=61.3681;RBI=0.0211329;REFB=0;REVB=-0.00935077;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97911e-05;OID=.;OPOS=25054891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:41:39:0:0:41:39:0:0 chr12 25148755 . C G 1476.27 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00172205;FXX=0.0106372;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.741;QD=63.4957;RBI=0.0450925;REFB=0;REVB=0.0450596;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.06871e-05;OID=.;OPOS=25148755;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:48:45:0:0:48:45:0:0 chr12 25242595 . C G 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.382;QD=60.5472;RBI=0.0255644;REFB=0;REVB=-0.000974641;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00020495;OID=.;OPOS=25242595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0 chr12 25243115 . G C 759.24 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.004;QD=61.979;RBI=0.0424875;REFB=0;REVB=0.00958563;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000646005;OID=.;OPOS=25243115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:36:10:0:0:36:13:0:0 chr12 25261735 . G T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.914;QD=40.7629;RBI=0.00552115;REFB=0;REVB=0.00450787;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12861e-05;OID=.;OPOS=25261735;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr12 25343516 . C T 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1833;QD=53.9079;RBI=0.0271927;REFB=0;REVB=-0.0268078;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000303548;OID=.;OPOS=25343516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr12 25357574 . CAA C 523.66 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03099;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=155.427;QD=46.5473;RBI=0.0590173;REFB=0;REVB=0.0502261;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000932089;OID=.;OPOS=25357575;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:43:43:45:45:0:21:24:0:0:10:0:21:22:0:0 chr12 25357628 . TA T 148.01 PASS AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0559;QD=42.2895;RBI=0.0330059;REFB=0;REVB=0.00139856;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0251477;OID=.;OPOS=25357629;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:13:14:14:14:0:3:11:0:0:4:0:3:10:0:0 chr12 25361091 . T C 3098.6 PASS AF=1;AO=193;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00509629;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.242;QD=63.8887;RBI=0.0361076;REFB=0;REVB=0.0357461;RO=0;SAF=87;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.77638e-07;OID=.;OPOS=25361091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:195:194:0:0:193:194:1:106:87:0:0:107:87:0:0 chr12 25362217 . A G 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.074;QD=60.0305;RBI=0.0477461;REFB=0;REVB=0.026525;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100321;OID=.;OPOS=25362217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0 chr12 25362465 . G A 289.29 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.834;QD=52.5973;RBI=0.0312439;REFB=0;REVB=0.0179122;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012243;OID=.;OPOS=25362465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr12 25362552 . A C 465.11 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3042;QD=58.1391;RBI=0.0464333;REFB=0;REVB=-0.0447195;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143924;OID=.;OPOS=25362552;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0 chr12 25368462 . C T 1361.95 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149411;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.445;QD=62.6182;RBI=0.019591;REFB=0;REVB=0.0126716;RO=0;SAF=35;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.77625e-05;OID=.;OPOS=25368462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:52:35:0:0:52:35:0:0 chr12 25671759 . T A 1867.81 PASS AF=1;AO=119;DP=120;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6117;QD=59.2957;RBI=0.149205;REFB=0;REVB=0.147123;RO=0;SAF=66;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.00457e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00653865;OID=.;OPOS=25671759;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:126:0:0:119:126:1:53:66:0:0:60:66:0:0 chr12 26273996 . T TTTTTG 71.97 PASS AF=0.232558;AO=8;DP=52;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0306106;FXX=0.0652032;HRUN=6;LEN=5;MLLD=219.723;QD=6.69443;RBI=0.0307582;REFB=-0.000705867;REVB=-0.00301005;RO=41;SAF=6;SAR=2;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350665;STB=0.669509;STBP=0.229;TYPE=ins;VARB=0.0030396;OID=.;OPOS=26273997;OREF=-;OALT=TTTTG;OMAPALT=TTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.232558:8:52:10:43:33:7:3:16:17:71:41:6:2:19:22 chr12 26491838 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.071;QD=63.8714;RBI=0.0293152;REFB=0;REVB=0.0162038;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05079e-05;OID=.;OPOS=26491838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr12 26784850 . G A 1543.67 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.452;QD=62.3706;RBI=0.0866804;REFB=0;REVB=0.0691579;RO=1;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099842;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389576;OID=.;OPOS=26784850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:1:0:97:99:1:47:50:0:1:48:51:0:0 chr12 26809316 . G A 1281.14 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.014;QD=61.7418;RBI=0.0456885;REFB=0;REVB=0.0449742;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115198;OID=.;OPOS=26809316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:40:41:0:0:40:43:0:0 chr12 26810777 . T C 1621.72 PASS AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104784;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.668;QD=59.5126;RBI=0.0444385;REFB=0;REVB=0.0431854;RO=0;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.49552e-06;OID=.;OPOS=26810777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:55:54:0:0:55:54:0:0 chr12 26810816 . T G 1282.51 PASS AF=0.904762;AO=94;DP=103;FAO=95;FDP=105;FR=.;FRO=10;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0197404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0343;QD=48.8574;RBI=0.0322367;REFB=-0.0625108;REVB=0.0254856;RO=8;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821849;STB=0.542636;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0260485;OID=.;OPOS=26810816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:103:105:8:10:94:95:0.904762:42:52:0:8:43:52:1:9 chr12 26834804 . T C,TACTC 1529.97 PASS AF=0.108108,0.864865;AO=12,95;DP=112;FAO=12,96;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=12,53;FSAR=0,43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0110004,0.00374516;FXX=0.00892777;HRUN=2,1;LEN=1,4;MLLD=135.097,257.216;QD=55.134;RBI=0.0168222,0.0284118;REFB=-0.112095,0.01877;REVB=0.012727,0.0281638;RO=3;SAF=12,52;SAR=0,43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0265697;STB=0.5,0.513759;STBP=1,0.125;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00162398,-0.00116721;OID=.,.;OPOS=26834804,26834805;OREF=T,-;OALT=C,ACTC;OMAPALT=C,TACTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:51:112:111:3:3:12,95:12,96:0.108108,0.864865:0,43:12,52:3:0:0,43:12,53:3:0 chr12 27064232 . C T 1896.41 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.442;QD=61.672;RBI=0.0239129;REFB=0;REVB=0.0163816;RO=0;SAF=51;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.80326e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18824e-05;OID=.;OPOS=27064232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:71:51:0:0:72:51:0:0 chr12 27175640 . A G 1331.56 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0370432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8189;QD=61.9332;RBI=0.0483948;REFB=0;REVB=-0.0311425;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000425281;OID=.;OPOS=27175640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:38:46:0:0:40:46:0:0 chr12 27470866 . G A 734.77 PASS AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0116089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.099;QD=53.4377;RBI=0.0232591;REFB=0.0390079;REVB=-0.0201549;RO=1;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269038;STB=0.513508;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.000151014;OID=.;OPOS=27470866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:53:54:0.981818:17:36:0:1:18:36:0:1 chr12 27627805 . G A 1194.36 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0160121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.61;QD=59.7182;RBI=0.0333659;REFB=-0.00493884;REVB=0.0292728;RO=1;SAF=30;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155173;STB=0.508195;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=3.31921e-05;OID=.;OPOS=27627805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:49:30:1:0:49:30:1:0 chr12 27800746 . G T 2299.75 PASS AF=0.993464;AO=151;DP=153;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00934507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8753;QD=60.1241;RBI=0.0256085;REFB=-0.105777;REVB=0.0238425;RO=1;SAF=75;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621784;STB=0.503311;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00120812;OID=.;OPOS=27800746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:153:153:1:1:151:152:0.993464:76:75:0:1:77:75:1:0 chr12 27832952 . GGC G 43.73 PASS AF=0.285714;AO=9;DP=49;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.030055;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=26.4446;QD=4.16459;RBI=0.0508013;REFB=-0.058733;REVB=-0.0409569;RO=37;SAF=6;SAR=3;SRF=15;SRR=22;SSEN=0.509542;SSEP=0;SSSB=0.311967;STB=0.650922;STBP=0.259;TYPE=del;VARB=0.125989;OID=.;OPOS=27832953;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:9:49:12:42:30:7:5:11:19:43:37:6:3:15:22 chr12 27849795 . CA CG,TG 688.25 PASS AF=0.372549,0.54902;AO=19,29;DP=54;FAO=19,28;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9,15;FSAR=10,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753247,-0.0108097;FXX=0.0555453;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=37.2617,149.191;QD=53.9802;RBI=0.0583697,0.0253297;REFB=0,0;REVB=-0.0578816,-0.0229072;RO=0;SAF=9,16;SAR=10,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.33753e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0109168,0.011694;OID=.,.;OPOS=27849796,27849795;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:54:51:0:0:19,29:19,28:0.372549,0.54902:10,13:9,16:0:0:10,13:9,15:0:0 chr12 27867706 . C T 184.79 PASS AF=0.642857;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00964696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.171;QD=26.399;RBI=0.0287833;REFB=-0.0295997;REVB=-0.0271185;RO=10;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359018;STB=0.519978;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0110011;OID=.;OPOS=27867706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:10:10:18:18:0.642857:8:10:5:5:8:10:5:5 chr12 27915718 . A T 308.41 PASS AF=0.492537;AO=32;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0277682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.478;QD=18.4127;RBI=0.029617;REFB=-0.00561584;REVB=-0.0103004;RO=34;SAF=19;SAR=13;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245306;STB=0.641056;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00645357;OID=.;OPOS=27915718;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:34:34:32:33:0.492537:13:19:11:23:13:20:11:23 chr12 27952707 . T C 291.59 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00812273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.476;QD=19.4395;RBI=0.0304932;REFB=0.00210051;REVB=0.0293914;RO=29;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000966427;STB=0.500538;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00331562;OID=.;OPOS=27952707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:16:15:14:15:16:15:14:15 chr12 28122893 . A G 428.09 PASS AF=0.494253;AO=42;DP=86;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0270939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.898;QD=19.6822;RBI=0.0274023;REFB=-0.016287;REVB=0.00409938;RO=44;SAF=24;SAR=18;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304735;STB=0.505152;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0122283;OID=.;OPOS=28122893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:44:44:42:43:0.494253:18:24:25:19:19:24:25:19 chr12 28412372 . G A 605.66 PASS AF=0.545455;AO=60;DP=109;FAO=60;FDP=110;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0288747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.184;QD=22.0242;RBI=0.0293874;REFB=-0.00546099;REVB=0.0054653;RO=49;SAF=29;SAR=31;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00530564;STB=0.507578;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00430647;OID=.;OPOS=28412372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:49:50:60:60:0.545455:31:29:24:25:31:29:25:25 chr12 28457618 . A C 2273.82 PASS AF=0.993377;AO=149;DP=153;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024143;FXX=0.0194793;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.625;QD=60.2337;RBI=0.026544;REFB=-0.120394;REVB=0.0110319;RO=1;SAF=67;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576538;STB=0.50303;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000686185;OID=.;OPOS=28457618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:153:151:1:1:149:150:0.993377:82:67:0:1:82:68:0:1 chr12 28605426 . G A 537.17 PASS AF=0.42029;AO=58;DP=141;FAO=58;FDP=138;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00871975;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.179;QD=15.5702;RBI=0.0142102;REFB=-0.00927793;REVB=-0.0112204;RO=78;SAF=40;SAR=18;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205984;STB=0.609913;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0171492;OID=.;OPOS=28605426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:138:78:80:58:58:0.42029:18:40:39:39:18:40:41:39 chr12 28637115 . G A 251.65 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00506999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.056;QD=20.5428;RBI=0.0117373;REFB=-0.00572656;REVB=-0.0105858;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104174;STB=0.558773;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00530662;OID=.;OPOS=28637115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:16:8:11:14:16:8:11:14 chr12 29423460 . G A 445.04 PASS AF=0.6;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00234302;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.043;QD=25.4309;RBI=0.025523;REFB=-9.86775e-05;REVB=0.0254152;RO=28;SAF=20;SAR=22;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114217;STB=0.562385;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.000169717;OID=.;OPOS=29423460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:28:28:42:42:0.6:22:20:9:19:22:20:9:19 chr12 29630081 . G A 891.62 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8407;QD=57.5241;RBI=0.0240023;REFB=0;REVB=-0.0198235;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.00352e-05;OID=.;OPOS=29630081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:25:37:0:0:25:37:0:0 chr12 29648275 . G A 430.38 PASS AF=0.440367;AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0288075;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.029;QD=15.7939;RBI=0.0292292;REFB=-0.0206539;REVB=-0.00494715;RO=61;SAF=21;SAR=27;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382603;STB=0.521428;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0258583;OID=.;OPOS=29648275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:61:61:48:48:0.440367:27:21:29:32:27:21:29:32 chr12 29653884 . T TAG 933.31 PASS AF=0.346505;AO=114;DP=335;FAO=114;FDP=329;FR=.;FRO=215;FSAF=43;FSAR=71;FSRF=97;FSRR=118;FWDB=0.00107038;FXX=0.0120117;HRUN=3;LEN=2;MLLD=283.758;QD=11.3472;RBI=0.0217749;REFB=-0.0115814;REVB=-0.0217486;RO=210;SAF=43;SAR=71;SRF=92;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723179;STB=0.550165;STBP=0.19;TYPE=ins;VARB=0.0219132;OID=.;OPOS=29653885;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.346505:114:335:114:329:215:43:71:97:118:99:210:43:71:92:118 chr12 29736480 . A G 131.31 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0175462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.69;QD=14.1954;RBI=0.032069;REFB=-0.0062481;REVB=0.0268431;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149229;STB=0.58684;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0164636;OID=.;OPOS=29736480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:9:6:12:10:9:6:12:10 chr12 30781912 . A G 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.171;QD=57.1063;RBI=0.0112855;REFB=0;REVB=0.0085741;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.54817e-05;OID=.;OPOS=30781912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0 chr12 30782076 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.253;QD=54.5177;RBI=0.0357333;REFB=0;REVB=0.0347757;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162505;OID=.;OPOS=30782076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr12 30783546 . G T 1467.05 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0121549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.8974;QD=57.5315;RBI=0.0380163;REFB=0.0206432;REVB=0.0360209;RO=1;SAF=56;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839647;STB=0.504424;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=-0.00155703;OID=.;OPOS=30783546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:102:1:1:100:101:0.990196:44:56:1:0:45:56:1:0 chr12 30823971 . A G 1716.99 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0517262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0838;QD=59.7213;RBI=0.0594291;REFB=-0.103335;REVB=-0.0292613;RO=1;SAF=43;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109144;STB=0.505746;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000487817;OID=.;OPOS=30823971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:115:115:1:1:114:114:0.991304:71:43:1:0:71:43:1:0 chr12 30868002 . C T 1641.94 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00605075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.752;QD=60.2547;RBI=0.019305;REFB=0;REVB=0.0183323;RO=0;SAF=49;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56602e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20984e-05;OID=.;OPOS=30868002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:60:49:0:0:60:49:0:0 chr12 30881809 . T C 404.64 PASS AF=0.372093;AO=48;DP=129;FAO=48;FDP=129;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=0.00616179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.545;QD=12.5471;RBI=0.047927;REFB=-0.00336674;REVB=0.0475292;RO=80;SAF=21;SAR=27;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109824;STB=0.558656;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00626938;OID=.;OPOS=30881809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:80:81:48:48:0.372093:27:21:43:37:27:21:43:38 chr12 30948848 . G C 300.16 PASS AF=0.472222;AO=27;DP=65;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.019025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.772;QD=16.6754;RBI=0.0199184;REFB=-0.0261695;REVB=0.00589826;RO=36;SAF=8;SAR=19;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752083;STB=0.523796;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0296684;OID=.;OPOS=30948848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:72:36:38:27:34:0.472222:19:8:13:23:20:14:14:24 chr12 31107131 . A G 176.52 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0117173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.142;QD=14.1212;RBI=0.0128621;REFB=0.00418869;REVB=0.00530468;RO=31;SAF=12;SAR=7;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126949;STB=0.573834;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=-0.00781809;OID=.;OPOS=31107131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:7:12:16:15:7:12:16:15 chr12 31107955 . G A 500.84 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.154;QD=58.9228;RBI=0.0172457;REFB=0;REVB=0.0150719;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57967e-05;OID=.;OPOS=31107955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:17:14:0:0:17:17:0:0 chr12 31135478 . T C 2297.31 PASS AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361346;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1522;QD=60.8559;RBI=0.0466361;REFB=0;REVB=-0.0294825;RO=0;SAF=97;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000247995;OID=.;OPOS=31135478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:54:97:0:0:54:97:0:0 chr12 31135579 . T C 389.5 PASS AF=0.389831;AO=46;DP=118;FAO=46;FDP=118;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.0629454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.262;QD=13.2033;RBI=0.0681181;REFB=-0.0279597;REVB=-0.0260374;RO=72;SAF=14;SAR=32;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179111;STB=0.602035;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0398452;OID=.;OPOS=31135579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:72:72:46:46:0.389831:32:14:33:39:32:14:33:39 chr12 31231138 . G T 358.12 PASS AF=0.410526;AO=38;DP=94;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=-0.0079107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8682;QD=15.0786;RBI=0.0551475;REFB=-0.0124695;REVB=0.0545772;RO=56;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540369;STB=0.54005;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0194959;OID=.;OPOS=31231138;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:56:56:38:39:0.410526:24:14:18:38:24:15:18:38 chr12 31237700 . G A 57.23 PASS AF=0.166667;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=-0.00399664;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.892;QD=3.81526;RBI=0.012069;REFB=0.00152902;REVB=-0.011388;RO=50;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194444;STB=0.62751;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.00972194;OID=.;OPOS=31237700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:61:60:50:50:10:10:0.166667:6:4:13:37:6:4:13:37 chr12 31240862 . A T 336.04 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.011107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3439;QD=17.0146;RBI=0.0199245;REFB=-0.0474545;REVB=0.0165414;RO=42;SAF=14;SAR=22;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862193;STB=0.542792;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0546817;OID=.;OPOS=31240862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:22:14:20:22:22:14:20:23 chr12 31240925 . A G 505.57 PASS AF=0.509804;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.00248594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.384;QD=19.8261;RBI=0.0340413;REFB=0.0012884;REVB=0.0339504;RO=50;SAF=18;SAR=34;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125305;STB=0.569351;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.00113646;OID=.;OPOS=31240925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:50:50:52:52:0.509804:34:18:24:26:34:18:24:26 chr12 31242399 . T C 499.04 PASS AF=0.318408;AO=64;DP=201;FAO=64;FDP=201;FR=.;FRO=137;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=-0.0304352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.951;QD=9.93113;RBI=0.0518427;REFB=-0.0142507;REVB=-0.0419686;RO=137;SAF=32;SAR=32;SRF=63;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473785;STB=0.527355;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0341907;OID=.;OPOS=31242399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:137:137:64:64:0.318408:32:32:63:74:32:32:63:74 chr12 31247682 . T C 74.23 PASS AF=0.140187;AO=15;DP=107;FAO=15;FDP=107;FR=.;FRO=92;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=35;FWDB=-0.014198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.734;QD=2.7748;RBI=0.0144634;REFB=-0.00541175;REVB=-0.00275804;RO=92;SAF=7;SAR=8;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190953;STB=0.629602;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0330326;OID=.;OPOS=31247682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:107:107:92:92:15:15:0.140187:8:7:57:35:8:7:57:35 chr12 31249861 . C G 265.58 PASS AF=0.3875;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=10;FWDB=0.0489106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4431;QD=13.2788;RBI=0.113012;REFB=-0.00886522;REVB=0.10188;RO=49;SAF=22;SAR=9;SRF=39;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11955;STB=0.567695;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0182408;OID=.;OPOS=31249861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:49:49:31:31:0.3875:9:22:39:10:9:22:39:10 chr12 31253995 . C T 465.77 PASS AF=0.542169;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0664912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.393;QD=22.4467;RBI=0.0701678;REFB=-0.0409305;REVB=-0.0224151;RO=37;SAF=18;SAR=27;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726098;STB=0.546777;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0282157;OID=.;OPOS=31253995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:38:45:45:0.542169:27:18:18:19:27:18:19:19 chr12 31255263 . G A 237.63 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0152447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.853;QD=13.7758;RBI=0.0210997;REFB=-0.0393434;REVB=0.0145875;RO=40;SAF=8;SAR=20;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161294;STB=0.601775;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.046668;OID=.;OPOS=31255263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:20:8:17:23:20:8:18:23 chr12 31255405 . C T 465.39 PASS AF=0.5625;AO=44;DP=79;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0217979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.567;QD=23.2696;RBI=0.0219504;REFB=-0.0281186;REVB=-0.00258302;RO=35;SAF=31;SAR=13;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192494;STB=0.608912;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0238073;OID=.;OPOS=31255405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:35:35:44:45:0.5625:13:31:17:18:13:32:17:18 chr12 31256905 . T C 253.51 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.024774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.853;QD=18.1078;RBI=0.0252943;REFB=-0.0498201;REVB=-0.00510391;RO=27;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504529;STB=0.517982;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0426905;OID=.;OPOS=31256905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:28:28:28:0.5:15:13:11:16:15:13:12:16 chr12 31267744 . A C 85.4 PASS AF=0.180723;AO=15;DP=83;FAO=15;FDP=83;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0242229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.7;QD=4.11586;RBI=0.0242385;REFB=-0.00634726;REVB=0.000869118;RO=68;SAF=5;SAR=10;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229847;STB=0.650204;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0222188;OID=.;OPOS=31267744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:83:83:68:68:15:15:0.180723:10:5:35:33:10:5:35:33 chr12 31283446 . T G 179.94 PASS AF=0.431818;AO=18;DP=43;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0157222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.711;QD=16.3583;RBI=0.101805;REFB=-0.00661345;REVB=0.100583;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763977;STB=0.526288;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0108379;OID=.;OPOS=31283446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:25:25:18:19:0.431818:8:10:12:13:9:10:12:13 chr12 31297871 . G C 228.82 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0281604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8025;QD=16.0576;RBI=0.0284132;REFB=-0.000548391;REVB=-0.00378177;RO=31;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981343;STB=0.555512;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00127883;OID=.;OPOS=31297871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:16:10:15:16:16:10:15:16 chr12 31300891 . C A 736.36 PASS AF=0.484277;AO=77;DP=159;FAO=77;FDP=159;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=0.00160117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.755;QD=18.5247;RBI=0.00627096;REFB=-0.0133271;REVB=-0.0060631;RO=82;SAF=36;SAR=41;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154792;STB=0.585312;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0139315;OID=.;OPOS=31300891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:82:82:77:77:0.484277:41:36:52:30:41:36:52:30 chr12 31549334 . C T 46.35 PASS AF=0.388889;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00113194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.955;QD=10.3011;RBI=0.038413;REFB=-0.00262668;REVB=-0.0383963;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357304;STB=0.756881;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0271476;OID=.;OPOS=31549334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:17:18:10:11:6:7:0.388889:2:4:3:7:2:5:3:8 chr12 31648826 . C T 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0164169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.946;QD=10.6346;RBI=0.0174187;REFB=-0.0100904;REVB=0.00582216;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242792;STB=0.646696;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0166756;OID=.;OPOS=31648826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:8:5:5:3:8:5 chr12 31944567 . T G 63.94 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00061061;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.068;QD=19.6744;RBI=0.000812934;REFB=0.0118618;REVB=0.000536672;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266181;STB=0.631318;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.00664897;OID=.;OPOS=31944567;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:14:13:6:5:8:8:0.615385:7:1:0:6:7:1:0:5 chr12 32134240 . C T 817.66 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00754572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.458;QD=57.3797;RBI=0.00849385;REFB=0;REVB=-0.00389969;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.56838e-06;OID=.;OPOS=32134240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0 chr12 32134638 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.955;QD=55.0987;RBI=0.0208862;REFB=0;REVB=0.00173978;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.21758e-05;OID=.;OPOS=32134638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr12 32135441 . T C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.151;QD=48.7373;RBI=0.0479626;REFB=0;REVB=0.0187273;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303894;OID=.;OPOS=32135441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr12 32136750 . T C 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.014496;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.88;QD=12.7299;RBI=0.0230023;REFB=-0.00661935;REVB=-0.0178598;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286527;STB=0.666349;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0132104;OID=.;OPOS=32136750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:2:10:5:4:2:10 chr12 32137901 . A G 131.15 PASS AF=0.320755;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0289331;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.235;QD=9.89798;RBI=0.0289415;REFB=-0.00769561;REVB=-0.000694791;RO=35;SAF=6;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217686;STB=0.638229;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0148951;OID=.;OPOS=32137901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:35:36:17:17:0.320755:11:6:19:16:11:6:20:16 chr12 32260876 . G C 225.2 PASS AF=0.440678;AO=25;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0207753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.6245;QD=15.2681;RBI=0.0538959;REFB=0.0134451;REVB=-0.0497308;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867125;STB=0.559277;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.0224342;OID=.;OPOS=32260876;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:33:33:25:26:0.440678:13:12:13:20:13:13:13:20 chr12 32261419 . G A 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0172451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.803;QD=9.569;RBI=0.0205336;REFB=0.00225579;REVB=-0.0111462;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237275;STB=0.644803;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=-0.00286956;OID=.;OPOS=32261419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:9:6:5:3:9:6 chr12 32261435 . A G 55.13 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.000698812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.116;QD=10.0239;RBI=0.0295709;REFB=-0.0212293;REVB=-0.0295626;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204846;STB=0.624687;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.08903;OID=.;OPOS=32261435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:8:6:5:3:8:6 chr12 32481093 . G C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00440311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.206;QD=63.5829;RBI=0.0115052;REFB=0;REVB=0.0106293;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14199e-05;OID=.;OPOS=32481093;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr12 32490764 . G A 107.98 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0431044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.284;QD=13.0886;RBI=0.0471673;REFB=-0.0158634;REVB=-0.0191512;RO=20;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498891;STB=0.529366;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0272781;OID=.;OPOS=32490764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:9:4:7:13:9:4:7:13 chr12 32552769 . C G 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00343748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.098;QD=13.5766;RBI=0.0085485;REFB=-0.0151378;REVB=-0.00782692;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385393;STB=0.522578;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0160773;OID=.;OPOS=32552769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:5:8:11:8:5:8:11:8 chr12 38712142 . C G 3499.58 PASS AF=1;AO=222;DP=222;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110498;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.538;QD=62.7728;RBI=0.0127317;REFB=0;REVB=0.00632423;RO=0;SAF=100;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33381e-06;OID=.;OPOS=38712142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:222:223:0:0:222:223:1:122:100:0:0:123:100:0:0 chr12 39233771 . A G 311.9 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0056969;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.987;QD=14.1774;RBI=0.00570986;REFB=-0.00334446;REVB=0.000384557;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249774;STB=0.508813;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.00802977;OID=.;OPOS=39233771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:53:35:35:0.397727:16:19:27:25:16:19:28:25 chr12 39713776 . C A 793.47 PASS AF=0.460674;AO=82;DP=183;FAO=82;FDP=178;FR=.;FRO=96;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=49;FWDB=0.00245671;FXX=0.0326069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.616;QD=17.8308;RBI=0.0158084;REFB=-0.00817575;REVB=-0.0156163;RO=91;SAF=41;SAR=41;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00522695;STB=0.505617;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00649879;OID=.;OPOS=39713776;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:178:91:96:82:82:0.460674:41:41:45:46:41:41:47:49 chr12 40152900 . G A 1605.85 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.497;QD=60.0318;RBI=0.0421811;REFB=0;REVB=0.038515;RO=0;SAF=65;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93175e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80224e-05;OID=.;OPOS=40152900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:107:0:0:106:107:1:41:65:0:0:41:66:0:0 chr12 40619082 . G A 1624.01 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.968;QD=60.1485;RBI=0.0225237;REFB=0;REVB=-0.0181976;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.80948e-06;OID=.;OPOS=40619082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:60:48:0:0:60:48:0:0 chr12 40631791 . T C 343.24 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0089195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.846;QD=18.8076;RBI=0.0224587;REFB=-0.0151072;REVB=0.0206115;RO=37;SAF=19;SAR=17;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036397;STB=0.520264;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0189074;OID=.;OPOS=40631791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:17:19:21:16:17:19:21:16 chr12 40645257 . C A 624.79 PASS AF=0.508065;AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0122232;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=315.942;QD=20.1545;RBI=0.0124584;REFB=-0.0036665;REVB=-0.00240931;RO=61;SAF=28;SAR=35;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144012;STB=0.579298;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.003389;OID=.;OPOS=40645257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:61:61:63:63:0.508065:35:28:37:24:35:28:37:24 chr12 40713834 . C A 157.84 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00105962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.003;QD=16.615;RBI=0.00993672;REFB=-0.0140418;REVB=-0.00988006;RO=21;SAF=12;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235218;STB=0.635595;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0221523;OID=.;OPOS=40713834;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:5:12:10:11:5:12:10:11 chr12 40713873 . A G 278.41 PASS AF=0.472727;AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0262261;FXX=0.0350816;HRUN=8;LEN=1;MLLD=320.765;QD=20.2479;RBI=0.0274454;REFB=-0.0161883;REVB=0.00808961;RO=16;SAF=14;SAR=11;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258752;STB=0.59315;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00728924;OID=.;OPOS=40713873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:55:16:19:25:26:0.472727:11:14:3:13:12:14:6:13 chr12 40713901 . T A 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.014594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.16;QD=16.923;RBI=0.0150028;REFB=-0.01786;REVB=0.00347855;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315782;STB=0.517733;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.027886;OID=.;OPOS=40713901;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:14:16:17:17:14:16:17:17 chr12 40716260 . T C 584.74 PASS AF=0.465649;AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=49;FWDB=0.0394519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.593;QD=17.8545;RBI=0.044382;REFB=-0.0189423;REVB=0.02033;RO=70;SAF=28;SAR=33;SRF=21;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156875;STB=0.586735;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0218055;OID=.;OPOS=40716260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:70:70:61:61:0.465649:33:28:21:49:33:28:21:49 chr12 40742254 . G A 265.56 PASS AF=0.441176;AO=29;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00785995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.734;QD=15.6212;RBI=0.00842506;REFB=-0.00816397;REVB=0.0030336;RO=36;SAF=19;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158542;STB=0.597871;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00870824;OID=.;OPOS=40742254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:36:38:29:30:0.441176:10:19:18:18:10:20:19:19 chr12 40758652 . T C 199.94 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00154773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.094;QD=11.5908;RBI=0.0121797;REFB=-0.000577546;REVB=0.012081;RO=44;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182602;STB=0.605831;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0010069;OID=.;OPOS=40758652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:9:16:21:23:9:16:21:23 chr12 40805875 . CAAAAAAAAG CAAAAAAAG,CAAAAAAAGT,CAAAAAAG 106.36 PASS AF=0.714286,0.0571429,0;AO=14,2,5;DP=35;FAO=25,2,0;FDP=35;FR=.;FRO=8;FSAF=15,0,0;FSAR=10,2,0;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.120976,-0.02513,-0.0662662;FXX=0;HRUN=8,8,8;LEN=1,2,2;MLLD=6.85288,139.058,11.3511;QD=12.1553;RBI=0.289533,0.0283783,0.15488;REFB=-0.140204,-0.0091728,-0.0792607;REVB=0.263048,0.0131837,0.139988;RO=13;SAF=9,0,5;SAR=5,2,0;SRF=6;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.157376,-0.540126,0.722799;STB=0.506324,0.99502,0.5;STBP=0.944,0.184,1;TYPE=del,mnp,del;VARB=0.079626,0.157891,0.0648377;OID=.,.,.;OPOS=40805876,40805883,40805876;OREF=A,AG,AA;OALT=-,GT,-;OMAPALT=CAAAAAAAG,CAAAAAAAGT,CAAAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.714286,0.0571429,0:14,2,5:35:25,2,0:35:8:15,0,0:10,2,0:5:3:16:13:9,0,5:5,2,0:6:7 chr12 40820208 . G A 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0296554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.326;QD=13.7844;RBI=0.0301911;REFB=-0.00440893;REVB=-0.00566225;RO=33;SAF=9;SAR=14;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248927;STB=0.642081;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00374767;OID=.;OPOS=40820208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:14:9:21:12:14:9:21:12 chr12 40821176 . G A 355.22 PASS AF=0.314685;AO=45;DP=143;FAO=45;FDP=143;FR=.;FRO=98;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=0.0143347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5943;QD=9.93625;RBI=0.0245003;REFB=0.0149194;REVB=-0.0198691;RO=97;SAF=31;SAR=14;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237344;STB=0.635473;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.0320973;OID=.;OPOS=40821176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:97:98:45:45:0.314685:14:31:48:49:14:31:49:49 chr12 40821867 . G A 803.01 PASS AF=0.433673;AO=84;DP=195;FAO=85;FDP=196;FR=.;FRO=111;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=35;FSRR=76;FWDB=0.0020893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.38;QD=16.3879;RBI=0.0192393;REFB=-0.0109913;REVB=0.0191256;RO=106;SAF=34;SAR=50;SRF=30;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130814;STB=0.550965;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0146884;OID=.;OPOS=40821867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:106:111:84:85:0.433673:50:34:30:76:51:34:35:76 chr12 40832126 . C T 525.92 PASS AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00310274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.728;QD=21.6874;RBI=0.0167457;REFB=-0.00813923;REVB=-0.0164557;RO=47;SAF=26;SAR=24;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101346;STB=0.555899;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0112361;OID=.;OPOS=40832126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:24:26:19:28:24:26:19:28 chr12 40832161 . T C 255.75 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0502527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.857;QD=15.7383;RBI=0.0506979;REFB=-0.0070976;REVB=0.00670372;RO=36;SAF=9;SAR=20;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863417;STB=0.548891;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00842445;OID=.;OPOS=40832161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:20:9:14:22:20:9:14:22 chr12 40834376 . C G 316.53 PASS AF=0.421687;AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0084436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.806;QD=15.2545;RBI=0.010048;REFB=-0.0103736;REVB=0.0054469;RO=48;SAF=25;SAR=9;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224288;STB=0.632572;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0182872;OID=.;OPOS=40834376;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:48:48:34:35:0.421687:9:25:26:22:9:26:26:22 chr12 40834955 . C A 1251.58 PASS AF=0.542986;AO=120;DP=223;FAO=120;FDP=221;FR=.;FRO=101;FSAF=47;FSAR=73;FSRF=51;FSRR=50;FWDB=-0.0308699;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.474;QD=22.6531;RBI=0.0311565;REFB=-0.0166939;REVB=0.0042166;RO=101;SAF=47;SAR=73;SRF=51;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972363;STB=0.553064;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0191143;OID=.;OPOS=40834955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:221:101:101:120:120:0.542986:73:47:51:50:73:47:51:50 chr12 40835734 . C G 582.26 PASS AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0107585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1675;QD=17.5115;RBI=0.0180424;REFB=-0.0163772;REVB=-0.0144839;RO=72;SAF=31;SAR=30;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485093;STB=0.526968;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0188477;OID=.;OPOS=40835734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:72:72:61:61:0.458647:30:31:33:39:30:31:33:39 chr12 40835749 . T C 688.63 PASS AF=0.523077;AO=68;DP=130;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0123916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.996;QD=21.1885;RBI=0.0127551;REFB=-0.00312291;REVB=0.00302308;RO=61;SAF=36;SAR=32;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465237;STB=0.521733;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00298358;OID=.;OPOS=40835749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:61:62:68:68:0.523077:32:36:29:32:32:36:30:32 chr12 40837264 . T C 199.86 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0159176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.023;QD=13.7833;RBI=0.0338229;REFB=-0.0238814;REVB=0.0298432;RO=32;SAF=9;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973269;STB=0.575158;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.043458;OID=.;OPOS=40837264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:34:24:24:0.413793:15:9:15:17:15:9:17:17 chr12 40838216 . T C 755.32 PASS AF=0.433155;AO=81;DP=187;FAO=81;FDP=187;FR=.;FRO=106;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=0.0359128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1498;QD=16.1565;RBI=0.0359852;REFB=-0.033056;REVB=0.00228128;RO=105;SAF=43;SAR=38;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841906;STB=0.544149;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0506287;OID=.;OPOS=40838216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:105:106:81:81:0.433155:38:43:47:58:38:43:48:58 chr12 40840325 . T C 611.99 PASS AF=0.435374;AO=63;DP=147;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.0127908;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1167;QD=16.6528;RBI=0.0228315;REFB=-0.00492349;REVB=0.0189122;RO=84;SAF=36;SAR=27;SRF=37;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133627;STB=0.581414;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00850889;OID=.;OPOS=40840325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:84:83:63:64:0.435374:27:36:37:47:27:37:36:47 chr12 40841938 . G T 487.93 PASS AF=0.407407;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=0.000105422;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.351;QD=14.4572;RBI=0.000440687;REFB=-0.00794007;REVB=-0.000427892;RO=80;SAF=24;SAR=31;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119468;STB=0.57451;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0121366;OID=.;OPOS=40841938;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:135:80:80:55:55:0.407407:31:24:44:36:31:24:45:35 chr12 40843504 . A C 380.68 PASS AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0184541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.834;QD=19.5223;RBI=0.0184714;REFB=-0.0037001;REVB=-0.000797822;RO=38;SAF=24;SAR=15;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338868;STB=0.526735;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00302112;OID=.;OPOS=40843504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:39:39:39:0.5:15:24:22:16:15:24:22:17 chr12 40857943 . A C 326.17 PASS AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0246453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.433;QD=20.072;RBI=0.0247973;REFB=-0.0144064;REVB=-0.00274105;RO=31;SAF=16;SAR=18;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723797;STB=0.540123;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00768543;OID=.;OPOS=40857943;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:18:16:12:19:18:16:12:19 chr12 40930709 . G C 252.76 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.061642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4679;QD=21.0637;RBI=0.0835915;REFB=-0.0109581;REVB=-0.0564606;RO=24;SAF=10;SAR=14;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117379;STB=0.565641;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00915833;OID=.;OPOS=40930709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:14:10:7:17:14:10:7:17 chr12 40933367 . G A 914.93 PASS AF=0.403042;AO=103;DP=260;FAO=106;FDP=263;FR=.;FRO=157;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=81;FSRR=76;FWDB=0.00135538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.365;QD=13.9152;RBI=0.0087432;REFB=-0.0163939;REVB=0.0086375;RO=155;SAF=43;SAR=60;SRF=80;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106418;STB=0.566526;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.023944;OID=.;OPOS=40933367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:263:155:157:103:106:0.403042:60:43:80:75:63:43:81:76 chr12 41337435 . C T 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.901;QD=63.0521;RBI=0.0363406;REFB=0;REVB=-0.0348906;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.57223e-05;OID=.;OPOS=41337435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:39:52:0:0:39:52:0:0 chr12 41587983 . T A 468.91 PASS AF=0.420635;AO=48;DP=123;FAO=53;FDP=126;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00868415;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8875;QD=14.8862;RBI=0.00868494;REFB=-0.0103423;REVB=-0.000116688;RO=74;SAF=30;SAR=18;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079108;STB=0.533321;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0147817;OID=.;OPOS=41587983;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:74:73:48:53:0.420635:18:30:41:33:21:32:40:33 chr12 41966306 . G A 376.01 PASS AF=0.42;AO=41;DP=101;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0361819;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5465;QD=15.0404;RBI=0.042519;REFB=-0.0317584;REVB=0.0223325;RO=59;SAF=28;SAR=13;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243284;STB=0.630074;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0429219;OID=.;OPOS=41966306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:59:58:41:42:0.42:13:28:27:32:14:28:26:32 chr12 41967677 . G A 368.25 PASS AF=0.385965;AO=44;DP=114;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0181973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.956;QD=12.9211;RBI=0.0382283;REFB=-0.00621523;REVB=-0.0336193;RO=70;SAF=16;SAR=28;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196247;STB=0.611599;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0117485;OID=.;OPOS=41967677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:70:70:44:44:0.385965:28:16:38:32:28:16:38:32 chr12 42503467 . T C 386.82 PASS AF=0.418367;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0336113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.633;QD=15.7884;RBI=0.034456;REFB=0.0102476;REVB=-0.00758275;RO=57;SAF=17;SAR=24;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118433;STB=0.506677;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=-0.0145229;OID=.;OPOS=42503467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:57:57:41:41:0.418367:24:17:23:34:24:17:23:34 chr12 42554505 . A G 306.02 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00863309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2136;QD=20.4014;RBI=0.00865297;REFB=0.0224944;REVB=-0.000586275;RO=28;SAF=14;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529595;STB=0.529393;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.0176541;OID=.;OPOS=42554505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:18:14:14:14:18:14:14:14 chr12 42599696 . T A 267.53 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00502896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.463;QD=21.839;RBI=0.013989;REFB=-0.00555173;REVB=0.0130538;RO=23;SAF=15;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686647;STB=0.529388;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0058368;OID=.;OPOS=42599696;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:10:15:12:11:10:15:13:11 chr12 42606229 . T C 165.73 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0110884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.975;QD=14.4116;RBI=0.0118255;REFB=-0.019656;REVB=0.00410963;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750195;STB=0.54343;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0335364;OID=.;OPOS=42606229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:9:9:16:12:9:9:16:12 chr12 42629550 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.301;QD=59.3224;RBI=0.0370092;REFB=0;REVB=0.0185321;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.75438e-05;OID=.;OPOS=42629550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0 chr12 42631933 . GCCCCG GCCC,GCCCG 214.54 PASS AF=0,1;AO=7,11;DP=22;FAO=0,22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0815704,0.248028;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=6.67122,15.3517;QD=39.0078;RBI=0.282859,0.271914;REFB=0,0;REVB=-0.270842,0.111444;RO=3;SAF=5,11;SAR=2,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.202067,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.0199531;OID=.,.;OPOS=42631937,42631934;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCC,GCCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:7,11:22:0,22:22:0:0,19:0,3:0:0:4:3:5,11:2,0:3:0 chr12 42636124 . A G 805.97 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00407993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.211;QD=64.478;RBI=0.0379279;REFB=0;REVB=0.0377078;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.44082e-05;OID=.;OPOS=42636124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:24:25:0:0:25:25:0:0 chr12 42792751 . C T 453.37 PASS AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.00171397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1809;QD=16.3377;RBI=0.0130289;REFB=-0.00309009;REVB=-0.0129157;RO=61;SAF=17;SAR=33;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224406;STB=0.51254;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00401526;OID=.;OPOS=42792751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:61:50:50:0.45045:33:17:22:39:33:17:22:39 chr12 42839836 . A C 990.54 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0564019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0398;QD=59.1368;RBI=0.0582117;REFB=0;REVB=-0.0144021;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395629;OID=.;OPOS=42839836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0 chr12 42853084 . C A 351.5 PASS AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00493684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.935;QD=28.6938;RBI=0.00514538;REFB=-0.0329697;REVB=0.00144999;RO=18;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00791169;STB=0.508469;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0207544;OID=.;OPOS=42853084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:18:19:30:30:0.612245:12:18:11:7:12:18:11:8 chr12 42853520 . A G 682.64 PASS AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00362796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.893;QD=52.511;RBI=0.0051844;REFB=-0.109016;REVB=0.0037035;RO=1;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014486;STB=0.505821;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-1.65619e-05;OID=.;OPOS=42853520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:32:18:0:1:32:18:1:1 chr12 42854205 . A G 309.97 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=72;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00357669;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.017;QD=16.1023;RBI=0.0143751;REFB=-0.0211587;REVB=0.013923;RO=42;SAF=16;SAR=14;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394404;STB=0.531232;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.02153;OID=.;OPOS=42854205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:77:42:42:30:35:0.454545:14:16:24:18:17:18:24:18 chr12 42863262 . A G 393.4 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0106843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9738;QD=22.4803;RBI=0.0299501;REFB=-0.0569026;REVB=-0.0279795;RO=31;SAF=15;SAR=24;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00210485;STB=0.50116;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0481198;OID=.;OPOS=42863262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:24:15:12:19:24:15:12:19 chr12 43860526 . A G 1342.78 PASS AF=0.988636;AO=84;DP=84;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0105213;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.978;QD=61.0355;RBI=0.0187223;REFB=0.0298575;REVB=0.0154863;RO=0;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06517e-08;STB=0.504949;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.000314524;OID=.;OPOS=43860526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:88:0:1:84:87:0.988636:50:34:0:0:50:37:0:1 chr12 44148259 . T C 638.33 PASS AF=0.427711;AO=71;DP=166;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=0.00200903;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.0837;QD=15.3814;RBI=0.0020092;REFB=-0.0019726;REVB=-2.65696e-05;RO=92;SAF=40;SAR=31;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108176;STB=0.569279;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00252052;OID=.;OPOS=44148259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:92:95:71:71:0.427711:31:40:42:50:31:40:42:53 chr12 44180295 . G A 641.38 PASS AF=0.481481;AO=65;DP=136;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.00393826;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.902;QD=19.0038;RBI=0.00798547;REFB=-0.000107287;REVB=-0.00694679;RO=70;SAF=31;SAR=34;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617155;STB=0.534142;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=8.23994e-05;OID=.;OPOS=44180295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:70:70:65:65:0.481481:34:31:38:32:34:31:38:32 chr12 44191625 . G A 147.05 PASS AF=0.3125;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.00049173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.549;QD=9.1906;RBI=0.0216169;REFB=0.00599221;REVB=-0.0216113;RO=44;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324841;STB=0.691305;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.0217032;OID=.;OPOS=44191625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:44:44:20:20:0.3125:7:13:16:28:7:13:16:28 chr12 45269284 . C T 262.79 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0215885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.382;QD=15.0164;RBI=0.031868;REFB=-0.00834827;REVB=-0.0234415;RO=40;SAF=12;SAR=18;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102517;STB=0.5581;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0144366;OID=.;OPOS=45269284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:18:12:20:20:18:12:20:20 chr12 45307633 . T C 520.99 PASS AF=0.419118;AO=57;DP=136;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=54;FWDB=0.000773917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.74;QD=15.3232;RBI=0.00090117;REFB=-6.31053e-05;REVB=0.000461691;RO=79;SAF=23;SAR=34;SRF=25;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958281;STB=0.553592;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=9.10051e-05;OID=.;OPOS=45307633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:79:79:57:57:0.419118:34:23:25:54:34:23:25:54 chr12 45410075 . A G 1153.59 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.099;QD=60.7152;RBI=0.0335036;REFB=0;REVB=0.0299983;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.83583e-05;OID=.;OPOS=45410075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr12 45417666 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.108;QD=62.3508;RBI=0.0398469;REFB=0;REVB=0.0295421;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61143e-05;OID=.;OPOS=45417666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0 chr12 45610426 . C T 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00222822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.313;QD=13.4591;RBI=0.0113393;REFB=-0.00191454;REVB=-0.0111182;RO=26;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427778;STB=0.749687;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00769633;OID=.;OPOS=45610426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:4:12:9:17:4:12:9:17 chr12 45610529 . C A 587.13 PASS AF=0.472868;AO=61;DP=129;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.0377245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5644;QD=18.2057;RBI=0.0526575;REFB=-0.0232753;REVB=0.0367379;RO=67;SAF=38;SAR=23;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20842;STB=0.619263;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0234718;OID=.;OPOS=45610529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:67:68:61:61:0.472868:23:38:27:40:23:38:27:41 chr12 45824840 . A T 322.73 PASS AF=0.363636;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.0211675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8794;QD=11.7358;RBI=0.0261897;REFB=-0.00681629;REVB=0.015422;RO=70;SAF=18;SAR=22;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715532;STB=0.540963;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0107529;OID=.;OPOS=45824840;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:70:70:40:40:0.363636:22:18:36:34:22:18:36:34 chr12 45825730 . C G 326.17 PASS AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0234072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.73;QD=20.072;RBI=0.0234775;REFB=-0.0116312;REVB=-0.00181575;RO=31;SAF=11;SAR=23;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303197;STB=0.516844;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0109496;OID=.;OPOS=45825730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:23:11:11:20:23:11:11:20 chr12 46367944 . A G 1035.08 PASS AF=0.924051;AO=72;DP=79;FAO=73;FDP=79;FR=.;FRO=6;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00878841;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.634;QD=52.4091;RBI=0.0204705;REFB=0.0379824;REVB=0.0184879;RO=4;SAF=35;SAR=37;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0013813;STB=0.50052;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=-0.000646792;OID=.;OPOS=46367944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:79:79:4:6:72:73:0.924051:37:35:2:2:37:36:3:3 chr12 46577071 . G A 161.13 PASS AF=0.252747;AO=23;DP=91;FAO=23;FDP=91;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0288553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.401;QD=7.08279;RBI=0.0467284;REFB=-0.0136876;REVB=-0.0367547;RO=68;SAF=11;SAR=12;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064144;STB=0.538871;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0333747;OID=.;OPOS=46577071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:68:68:23:23:0.252747:12:11:29:39:12:11:29:39 chr12 46589988 . C T 193.01 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0455267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6218;QD=13.7864;RBI=0.0658826;REFB=-0.0228562;REVB=-0.0476218;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110308;STB=0.566443;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0275991;OID=.;OPOS=46589988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:33:23:23:0.410714:8:15:17:14:8:15:18:15 chr12 46758494 . A G 337.38 PASS AF=1;AO=19;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000280569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.156;QD=53.9809;RBI=0.0192222;REFB=0;REVB=0.0192202;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025836;OID=.;OPOS=46758494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:19:25:1:12:7:0:0:16:9:0:0 chr12 46758945 . C T 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0124687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.534;QD=13.7844;RBI=0.0126662;REFB=-0.00999132;REVB=-0.00222804;RO=32;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222592;STB=0.634034;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0128494;OID=.;OPOS=46758945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:10:13:11:21:10:13:11:22 chr12 46759017 . T A 520.33 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.373;QD=59.4664;RBI=0.01046;REFB=0;REVB=-0.0103367;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.64587e-05;OID=.;OPOS=46759017;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:20:15:0:0 chr12 46761127 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.178;QD=53.2772;RBI=0.0456752;REFB=0;REVB=0.000546089;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148753;OID=.;OPOS=46761127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr12 47168898 . G A 1661.72 PASS AF=0.982609;AO=112;DP=115;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0224543;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.068;QD=57.7988;RBI=0.0330176;REFB=-0.0546268;REVB=0.0242067;RO=2;SAF=41;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00479839;STB=0.502576;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.000630911;OID=.;OPOS=47168898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:115:115:2:2:112:113:0.982609:71:41:1:1:72:41:1:1 chr12 47170764 . G A 277.42 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00849351;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.877;QD=14.9957;RBI=0.011411;REFB=-0.00374149;REVB=-0.00762045;RO=40;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732603;STB=0.561699;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0134338;OID=.;OPOS=47170764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:40:43:31:31:0.418919:14:17:19:21:14:17:19:24 chr12 47470223 . T A,TTACTA 706.33 PASS AF=0.0588235,0.941176;AO=3,45;DP=57;FAO=3,48;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=2,29;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105552,0.00360314;FXX=0.0555453;HRUN=3,3;LEN=1,5;MLLD=139.282,273.832;QD=55.3983;RBI=0.0105589,0.00423744;REFB=0,0;REVB=0.000280383,0.00223009;RO=7;SAF=2,27;SAR=1,18;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.102358,0.00747404;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0199847,0.000135976;OID=.,.;OPOS=47470223,47470224;OREF=T,-;OALT=A,TACTA;OMAPALT=A,TTACTA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:57:51:7:0:3,45:3,48:0.0588235,0.941176:1,18:2,27:4:3:1,19:2,29:0:0 chr12 47581629 . T C 1964.34 PASS AF=0.977444;AO=119;DP=125;FAO=130;FDP=133;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0289439;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.565;QD=59.078;RBI=0.0460105;REFB=0.0103633;REVB=0.0357661;RO=3;SAF=61;SAR=58;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227838;STB=0.511449;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.000358062;OID=.;OPOS=47581629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:125:133:3:3:119:130:0.977444:58:61:3:0:66:64:3:0 chr12 47740069 . C A 2348.47 PASS AF=1;AO=146;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.309;QD=63.9039;RBI=0.07095;REFB=0;REVB=0.0690538;RO=0;SAF=78;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78483e-05;OID=.;OPOS=47740069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:146:147:0:0:146:147:1:68:78:0:0:68:79:0:0 chr12 48144925 . T C 1136.78 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.983;QD=60.6285;RBI=0.0895948;REFB=0;REVB=0.0729128;RO=0;SAF=52;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76945e-05;OID=.;OPOS=48144925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:75:0:0:72:75:1:20:52:0:0:22:53:0:0 chr12 48176792 . C T 909.64 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4192;QD=57.7547;RBI=0.104357;REFB=0;REVB=0.10148;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130302;OID=.;OPOS=48176792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:63:0:0:60:63:1:28:32:0:0:30:33:0:0 chr12 48176900 . T G 282.46 PASS AF=1;AO=17;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.2634;QD=51.3566;RBI=0.0326073;REFB=0;REVB=-0.0301164;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000526744;OID=.;OPOS=48176900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:17:22:1:11:6:0:0:13:9:0:0 chr12 48177170 . C G 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0100001;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=314.759;QD=19.6977;RBI=0.0180298;REFB=-0.0125864;REVB=-0.0150025;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189913;STB=0.613764;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0146821;OID=.;OPOS=48177170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:22:21:21:0.488372:13:8:4:17:13:8:4:18 chr12 48177238 . A G 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00475536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.754;QD=60.8835;RBI=0.0092973;REFB=0;REVB=0.00798913;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14124e-06;OID=.;OPOS=48177238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:50:27:0:0:50:27:0:0 chr12 48178513 . A G 176.29 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00828068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.755;QD=20.7401;RBI=0.0166949;REFB=0.00979041;REVB=-0.0144965;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521025;STB=0.529379;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0106403;OID=.;OPOS=48178513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:7:9:9:9:7:9 chr12 48295133 . C T 390.3 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0186442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.055;QD=19.039;RBI=0.0186456;REFB=-0.01938;REVB=0.000221786;RO=42;SAF=23;SAR=17;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00335948;STB=0.501869;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0210039;OID=.;OPOS=48295133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:17:23:24:18:17:23:24:18 chr12 48375568 . A G 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.293;QD=63.2866;RBI=0.0130008;REFB=0;REVB=0.0107127;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42269e-05;OID=.;OPOS=48375568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr12 48375965 . C T 412.63 PASS AF=1;AO=25;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0770583;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4334;QD=56.9138;RBI=0.096943;REFB=0;REVB=0.0588214;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170573;OID=.;OPOS=48375965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:25:29:1:14:11:0:0:15:14:0:0 chr12 48376291 . G A 541.82 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404368;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.528;QD=60.2024;RBI=0.0933091;REFB=0;REVB=0.0932215;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041568;OID=.;OPOS=48376291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr12 48380682 . G A 609.87 PASS AF=0.555556;AO=60;DP=110;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00134162;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.107;QD=22.5878;RBI=0.0027478;REFB=-0.0190938;REVB=0.00239801;RO=50;SAF=28;SAR=32;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442526;STB=0.514847;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0135449;OID=.;OPOS=48380682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:108:50:48:60:60:0.555556:32:28:26:24:32:28:24:24 chr12 48389643 . A C 150.38 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0145667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3255;QD=12.2755;RBI=0.0221129;REFB=-0.00918513;REVB=0.0166371;RO=32;SAF=1;SAR=16;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519585;STB=0.821916;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0173592;OID=.;OPOS=48389643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:16:1:10:22:16:1:10:22 chr12 48391416 . G T 435.81 PASS AF=0.5;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0223444;FXX=0.0337041;HRUN=6;LEN=1;MLLD=136.978;QD=20.2701;RBI=0.022375;REFB=-0.0017822;REVB=0.00117059;RO=40;SAF=27;SAR=16;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158158;STB=0.594669;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00370873;OID=.;OPOS=48391416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:40:43:43:43:0.5:16:27:18:22:16:27:19:24 chr12 48398080 . T A 680.07 PASS AF=1;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123641;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.752;QD=63.2621;RBI=0.0519218;REFB=0;REVB=0.0504282;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000727748;OID=.;OPOS=48398080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr12 48413944 . C T 268.49 PASS AF=0.397436;AO=32;DP=79;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.112048;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.546;QD=13.7686;RBI=0.112128;REFB=-0.00999232;REVB=0.00421475;RO=47;SAF=8;SAR=24;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376706;STB=0.711199;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.013914;OID=.;OPOS=48413944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:47:47:32:31:0.397436:24:8:28:19:23:8:28:19 chr12 48413950 . A C 219.19 PASS AF=0.375;AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0196542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5676;QD=12.1772;RBI=0.0444096;REFB=-0.0257455;REVB=0.0398237;RO=45;SAF=4;SAR=22;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531095;STB=0.812747;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.043251;OID=.;OPOS=48413950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:45:45:26:27:0.375:22:4:27:18:23:4:27:18 chr12 48418710 . T C 354.57 PASS AF=0.493333;AO=34;DP=72;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0130305;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8603;QD=18.9104;RBI=0.0228195;REFB=-0.0216862;REVB=0.0187333;RO=38;SAF=21;SAR=13;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123116;STB=0.519547;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0259738;OID=.;OPOS=48418710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:75:38:38:34:37:0.493333:13:21:23:15:16:21:23:15 chr12 48438140 . CATATATATATATATATATG CATATATATATATATATA,CATATATATATATATATG 160.76 PASS AF=0,1;AO=2,12;DP=14;FAO=0,14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161822,0.212224;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=152.8,205.788;QD=45.9312;RBI=0.161823,0.212826;REFB=0,0;REVB=0.000503495,0.0159968;RO=0;SAF=2,8;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.00258752;OID=.,.;OPOS=48438158,48438141;OREF=TG,AT;OALT=-,-;OMAPALT=CATATATATATATATATA,CATATATATATATATATG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:2,12:14:0,14:14:0:0,10:0,4:0:0:4:0:2,8:0,4:0:0 chr12 48477422 . A G 267.36 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00399158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.769;QD=18.4388;RBI=0.0168631;REFB=0.00719712;REVB=-0.0163839;RO=29;SAF=9;SAR=20;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31197;STB=0.674577;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.00482504;OID=.;OPOS=48477422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:20:9:19:10:20:9:19:10 chr12 48501161 . A T 312.4 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00726933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.54;QD=16.6611;RBI=0.00838936;REFB=-0.00256811;REVB=0.00418786;RO=40;SAF=19;SAR=15;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104794;STB=0.552208;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.00469056;OID=.;OPOS=48501161;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:40:41:34:34:0.453333:15:19:18:22:15:19:19:22 chr12 48512285 . C A 1169.73 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00321957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.259;QD=60.7653;RBI=0.034461;REFB=0;REVB=0.0343103;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3553e-05;OID=.;OPOS=48512285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:77:0:0:71:77:1:37:34:0:0:41:36:0:0 chr12 48512331 . C T 592.42 PASS AF=0.689189;AO=50;DP=75;FAO=51;FDP=74;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00353721;FXX=0.0263123;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.945;QD=32.0224;RBI=0.0149315;REFB=-0.0224159;REVB=0.0145065;RO=22;SAF=17;SAR=33;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149451;STB=0.59044;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00951122;OID=.;OPOS=48512331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:22:23:50:51:0.689189:33:17:13:9:34:17:14:9 chr12 48525861 . A G 322.48 PASS AF=0.622642;AO=21;DP=53;FAO=33;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0118626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.219;QD=24.3384;RBI=0.0158431;REFB=0.00463434;REVB=0.0105016;RO=20;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105504;STB=0.534524;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.0028543;OID=.;OPOS=48525861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:20:20:21:33:0.622642:9:12:9:11:21:12:9:11 chr12 48526712 . G A 350.5 PASS AF=0.417582;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=0.00951562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6924;QD=15.4065;RBI=0.0101404;REFB=-0.0155393;REVB=0.00350446;RO=53;SAF=14;SAR=24;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508311;STB=0.528748;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0272903;OID=.;OPOS=48526712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:53:53:38:38:0.417582:24:14:22:31:24:14:22:31 chr12 48541757 . A G 179.4 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0144365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.941;QD=22.4248;RBI=0.0345294;REFB=0.0120589;REVB=0.0313666;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992905;STB=0.555494;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.0043189;OID=.;OPOS=48541757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:12:14:18:18:0.5625:10:8:7:5:10:8:8:6 chr12 48578325 . A C 169.93 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0192755;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.125;QD=23.4392;RBI=0.026168;REFB=-0.0481186;REVB=0.0176979;RO=12;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829262;STB=0.546504;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0393488;OID=.;OPOS=48578325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:29:12:12:17:17:0.586207:8:9:5:7:8:9:5:7 chr12 48578809 . T C 171.9 PASS AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0546495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.425;QD=9.29169;RBI=0.0548785;REFB=0.00600395;REVB=0.00500856;RO=51;SAF=7;SAR=16;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039114;STB=0.52314;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.0228903;OID=.;OPOS=48578809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:16:7:17:34:16:7:17:34 chr12 48596241 . A G 443.73 PASS AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.00644646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.314;QD=17.2322;RBI=0.0147686;REFB=-0.0125148;REVB=0.0132874;RO=55;SAF=27;SAR=21;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367179;STB=0.520438;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0104382;OID=.;OPOS=48596241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:55:48:48:0.466019:21:27:33:22:21:27:33:22 chr12 48597053 . A G 143.33 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0209993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.678;QD=14.7;RBI=0.036092;REFB=-0.00868776;REVB=0.0293541;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289144;STB=0.664231;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0188983;OID=.;OPOS=48597053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:9:7:4:19:9:7:4:19 chr12 48723595 . G A 177.51 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0299958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.672;QD=14.4907;RBI=0.0527715;REFB=-0.0393714;REVB=0.0434175;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980003;STB=0.556686;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0465902;OID=.;OPOS=48723595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:9:10:13:17:9:10:13:17 chr12 48866585 . A C 418.81 PASS AF=0.477778;AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0131904;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.496;QD=18.6136;RBI=0.0144801;REFB=0.00107081;REVB=0.00597377;RO=48;SAF=28;SAR=14;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262234;STB=0.65452;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.000978899;OID=.;OPOS=48866585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:47:42:43:0.477778:14:28:19:29:14:29:18:29 chr12 48866792 . C T 239.92 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0323316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.559;QD=14.3233;RBI=0.0347568;REFB=-0.000100737;REVB=-0.0127556;RO=39;SAF=19;SAR=9;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179474;STB=0.602416;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.000332048;OID=.;OPOS=48866792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:9:19:20:19:9:19:20:19 chr12 48879946 . A G 248.37 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.025015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.342;QD=13.9926;RBI=0.0299372;REFB=-0.00105335;REVB=0.0164465;RO=42;SAF=17;SAR=12;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141799;STB=0.580194;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00202747;OID=.;OPOS=48879946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:12:17:30:12:12:17:30:12 chr12 48919556 . A G 426.47 PASS AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0185121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.172;QD=16.4029;RBI=0.020519;REFB=-0.0112961;REVB=0.00885063;RO=57;SAF=29;SAR=18;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159742;STB=0.589344;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0126557;OID=.;OPOS=48919556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:57:47:47:0.451923:18:29:26:31:18:29:26:31 chr12 48919659 . T C 147.67 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0132429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.022;QD=26.8496;RBI=0.0266789;REFB=-0.0216572;REVB=0.0231601;RO=7;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016877;STB=0.509421;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.00634773;OID=.;OPOS=48919659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:6:9:4:3:6:9:4:3 chr12 48919796 . C T 95.68 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00880124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.799;QD=11.5971;RBI=0.00883867;REFB=0.00378197;REVB=0.000812558;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164807;STB=0.597828;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.00752093;OID=.;OPOS=48919796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:7:5:12:9:7:5:12:9 chr12 48920006 . G A 311.07 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0515746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7164;QD=18.8525;RBI=0.0517474;REFB=-0.0447644;REVB=-0.00422444;RO=32;SAF=12;SAR=21;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401554;STB=0.532144;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0304223;OID=.;OPOS=48920006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:33:33:33:0.5:21:12:13:19:21:12:14:19 chr12 48953682 . G A 181.85 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00871606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6121;QD=17.3193;RBI=0.00923207;REFB=-0.0178269;REVB=-0.00304327;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129043;STB=0.57349;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0282669;OID=.;OPOS=48953682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:9:10:9:14:9:10:9:14 chr12 48953932 . G A 244.13 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0261506;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.7662;QD=23.2501;RBI=0.0768642;REFB=0.0127314;REVB=0.072279;RO=18;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518098;STB=0.517804;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00924854;OID=.;OPOS=48953932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:19:23:23:0.547619:13:10:9:9:13:10:9:10 chr12 48954030 . G A 217.81 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00504895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.35;QD=16.7542;RBI=0.00530854;REFB=-0.017657;REVB=0.00163973;RO=28;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339897;STB=0.519215;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0283214;OID=.;OPOS=48954030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:12:12:13:15:12:12:13:15 chr12 48954040 . A G 229.99 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0375835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.926;QD=16.4281;RBI=0.0384643;REFB=-0.00549571;REVB=-0.00818425;RO=29;SAF=13;SAR=13;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484183;STB=0.517843;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00589251;OID=.;OPOS=48954040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:30:26:26:0.464286:13:13:13:16:13:13:14:16 chr12 48954175 . C T 302.25 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0107788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.759;QD=19.4997;RBI=0.0117671;REFB=-0.0214905;REVB=-0.00472035;RO=30;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140237;STB=0.578044;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0209885;OID=.;OPOS=48954175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:19:13:17:13:19:13:17:13 chr12 48954225 . G C 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0107592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3681;QD=20.1559;RBI=0.0128989;REFB=-0.013713;REVB=0.00711477;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143077;STB=0.579751;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.014076;OID=.;OPOS=48954225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:17:11:14:11:17:11:14:11 chr12 49048738 . G T 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0155417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.435;QD=16.7316;RBI=0.0157127;REFB=-0.0117264;REVB=-0.00231189;RO=36;SAF=20;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144045;STB=0.581109;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0141572;OID=.;OPOS=49048738;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:11:20:18:18:11:20:18:18 chr12 49075811 . T G 191.6 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0469314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5106;QD=15.6408;RBI=0.0501473;REFB=-0.0174905;REVB=-0.0176691;RO=28;SAF=15;SAR=5;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911024;STB=0.569547;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0163785;OID=.;OPOS=49075811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:5:15:19:9:5:15:19:10 chr12 49086963 . G A 439.47 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0167607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.139;QD=21.9735;RBI=0.026754;REFB=-0.0415015;REVB=-0.0208532;RO=36;SAF=23;SAR=20;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289156;STB=0.522412;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0263785;OID=.;OPOS=49086963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:36:37:43:43:0.5375:20:23:18:18:20:23:18:19 chr12 49177113 . T G 519.12 PASS AF=0.410072;AO=57;DP=140;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=-0.0125536;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.338;QD=14.9387;RBI=0.012567;REFB=-0.0152222;REVB=0.000580205;RO=83;SAF=33;SAR=24;SRF=51;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386521;STB=0.526224;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0214687;OID=.;OPOS=49177113;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:83:82:57:57:0.410072:24:33:51:32:24:33:51:31 chr12 49221622 . G A 433.7 PASS AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0090789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.804;QD=23.4432;RBI=0.0223002;REFB=-0.0280922;REVB=0.0203685;RO=32;SAF=14;SAR=28;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258356;STB=0.642133;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0173921;OID=.;OPOS=49221622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:28:14:21:11:28:14:21:11 chr12 49222217 . T C 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0633961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.797;QD=17.2289;RBI=0.0681212;REFB=-0.0302413;REVB=-0.0249285;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246937;STB=0.642528;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.013567;OID=.;OPOS=49222217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:1:5:4:4:1:5 chr12 49230035 . T G 48.85 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0984328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.686;QD=13.9565;RBI=0.0986971;REFB=-0.0195872;REVB=0.007217;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00964152;OID=.;OPOS=49230035;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:3:4:4:3:3:4 chr12 49255798 . G C 239.91 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00377736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.504;QD=14.3227;RBI=0.0227891;REFB=-0.0280817;REVB=-0.0224739;RO=38;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362794;STB=0.513359;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0390038;OID=.;OPOS=49255798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:38:39:28:28:0.41791:15:13:19:19:15:13:19:20 chr12 49308284 . A G 191.61 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0339024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0611;QD=15.6419;RBI=0.062238;REFB=-0.00669405;REVB=-0.0521939;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532089;STB=0.530582;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00709073;OID=.;OPOS=49308284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:10:10:13:16:10:10:13:16 chr12 49312593 . A G 434.19 PASS AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0101251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4714;QD=17.0271;RBI=0.0427187;REFB=0.0171618;REVB=0.0415014;RO=55;SAF=27;SAR=20;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462613;STB=0.525815;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.0193098;OID=.;OPOS=49312593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:0.460784:20:27:29:26:20:27:29:26 chr12 49314862 . C A 490.99 PASS AF=0.464912;AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.02875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6214;QD=17.2278;RBI=0.0481105;REFB=-0.0153551;REVB=-0.0385753;RO=60;SAF=26;SAR=27;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104411;STB=0.553186;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0178557;OID=.;OPOS=49314862;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:60:61:53:53:0.464912:27:26:36:24:27:26:36:25 chr12 49314994 . A G 144.74 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.000919948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.976;QD=15.6478;RBI=0.00862736;REFB=-0.0088157;REVB=0.00857817;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552059;STB=0.531874;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0149271;OID=.;OPOS=49314994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:10:6:9:12:10:6:9:12 chr12 49332092 . G A 242.15 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0197801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7465;QD=16.9933;RBI=0.0287974;REFB=-0.00108122;REVB=0.0209294;RO=30;SAF=13;SAR=14;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110609;STB=0.562131;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00198634;OID=.;OPOS=49332092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:14:13:18:12:14:13:18:12 chr12 49332366 . C T 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0557137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.003;QD=20.898;RBI=0.0662302;REFB=-0.0449158;REVB=-0.0358109;RO=4;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31147;STB=0.681335;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0381253;OID=.;OPOS=49332366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:2:6:1:3:2:6:1:3 chr12 49334762 . G C 802.33 PASS AF=0.982759;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0159333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.868;QD=55.3331;RBI=0.0163864;REFB=0.0154463;REVB=0.00382676;RO=1;SAF=27;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017135;STB=0.508194;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-8.88156e-05;OID=.;OPOS=49334762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:58:1:1:54:57:0.982759:27:27:1:0:27:30:1:0 chr12 49359587 . T G 353.08 PASS AF=0.422222;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0181835;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.738;QD=15.6925;RBI=0.0182648;REFB=-0.0280322;REVB=0.00172134;RO=52;SAF=15;SAR=23;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108716;STB=0.506132;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0306168;OID=.;OPOS=49359587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:52:52:38:38:0.422222:23:15:20:32:23:15:20:32 chr12 49359989 . G A 170.27 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0330617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.967;QD=17.027;RBI=0.0356572;REFB=-0.015024;REVB=0.0133551;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981228;STB=0.505612;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0195954;OID=.;OPOS=49359989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:12:10:8:10:12:10 chr12 49391196 . TC CT,T 158.97 PASS AF=0.102041,0.278912;AO=15,49;DP=148;FAO=15,41;FDP=147;FR=.;FRO=91;FSAF=0,6;FSAR=15,35;FSRF=62;FSRR=29;FWDB=-0.0187492,-0.0816262;FXX=0.0454516;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=113.808,10.2827;QD=4.32561;RBI=0.0689299,0.116533;REFB=-0.0174363,-0.170455;REVB=-0.0663309,-0.0831684;RO=73;SAF=0,11;SAR=15,38;SRF=53;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0.381818;SSSB=-0.796773,-0.518946;STB=0.999447,0.860899;STBP=0,0;TYPE=mnp,del;VARB=0.134448,0.121009;OID=.,.;OPOS=49391196,49391197;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:82:148:147:73:91:15,49:15,41:0.102041,0.278912:15,38:0,11:53:20:15,35:0,6:62:29 chr12 49424534 . G A 67.44 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00964516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.835;QD=13.4872;RBI=0.0351833;REFB=-0.0110586;REVB=0.0338354;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356162;STB=0.709231;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0155678;OID=.;OPOS=49424534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:6:3:8:3:6:3:8:3 chr12 49500398 . G A 382.22 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.012667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.716;QD=19.8557;RBI=0.0143163;REFB=-0.00491566;REVB=-0.00667118;RO=38;SAF=22;SAR=17;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149888;STB=0.583125;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00484126;OID=.;OPOS=49500398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:17:22:15:23:17:22:15:23 chr12 49500509 . C T 168.67 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0116585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.088;QD=16.0636;RBI=0.0169506;REFB=-0.0176373;REVB=-0.0123046;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192488;STB=0.618923;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.013467;OID=.;OPOS=49500509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:23:24:18:18:0.428571:9:9:7:16:9:9:7:17 chr12 49522578 . T C 32.86 PASS AF=0.157895;AO=5;DP=36;FAO=6;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=-0.00565494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5278;QD=3.45916;RBI=0.0749913;REFB=-0.00427812;REVB=0.0747778;RO=27;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038728;STB=0.571171;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0669856;OID=.;OPOS=49522578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:36:38:27:32:5:6:0.157895:4:1:6:21:5:1:7:25 chr12 49522605 . C T 69.42 PASS AF=0.227273;AO=10;DP=44;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.01206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.077;QD=6.31106;RBI=0.0159556;REFB=-0.00284106;REVB=-0.0104469;RO=34;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225114;STB=0.639756;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00765605;OID=.;OPOS=49522605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:44:44:34:34:10:10:0.227273:6:4:8:26:6:4:8:26 chr12 49579696 . C G 296.72 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00380843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.112;QD=15.617;RBI=0.0134645;REFB=-0.00937548;REVB=0.0129146;RO=43;SAF=15;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106691;STB=0.50602;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0141904;OID=.;OPOS=49579696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:18:15:20:23:18:15:20:23 chr12 49580180 . T C 382.06 PASS AF=0.449438;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0205199;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9906;QD=17.1712;RBI=0.0236071;REFB=0.00238283;REVB=-0.0116717;RO=48;SAF=14;SAR=26;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171827;STB=0.602497;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00362545;OID=.;OPOS=49580180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:48:49:40:40:0.449438:26:14:25:23:26:14:26:23 chr12 49667103 . A T 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.513;QD=61.6833;RBI=0.0136019;REFB=0;REVB=0.000441399;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26145e-05;OID=.;OPOS=49667103;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0 chr12 50185334 . A G 222.03 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.323;QD=49.3411;RBI=0.0453682;REFB=0;REVB=0.00971777;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173489;OID=.;OPOS=50185334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:5:12:0:0:5:13:0:0 chr12 50189807 . C A 323.6 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4786;QD=53.9338;RBI=0.00295921;REFB=0;REVB=-0.000184752;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.5082e-05;OID=.;OPOS=50189807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:4:19:0:0:5:19:0:0 chr12 50189834 . T G 252.81 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2249;QD=50.5621;RBI=0.0995569;REFB=0;REVB=0.0801284;RO=0;SAF=17;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000616807;OID=.;OPOS=50189834;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:2:17:0:0:3:17:0:0 chr12 50263148 . G A 1049.46 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0827772;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.085;QD=59.9693;RBI=0.0832607;REFB=0;REVB=0.00895929;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510618;OID=.;OPOS=50263148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:42:28:0:0:42:28:0:0 chr12 50348078 . T C 272.35 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0194074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.04;QD=17.2923;RBI=0.019585;REFB=-0.0341248;REVB=-0.00263207;RO=33;SAF=12;SAR=18;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234378;STB=0.513149;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0302012;OID=.;OPOS=50348078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:18:12:14:19:18:12:14:19 chr12 50352393 . G C 106.85 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0400563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1926;QD=12.2115;RBI=0.0408798;REFB=-0.026279;REVB=0.00816426;RO=22;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673734;STB=0.539937;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0406851;OID=.;OPOS=50352393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:9:4:8:14:9:4:8:14 chr12 50452708 . C G 523.85 PASS AF=0.514286;AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0138699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.062;QD=19.9562;RBI=0.0169097;REFB=-0.037316;REVB=-0.00967278;RO=51;SAF=29;SAR=25;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240573;STB=0.513269;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.03522;OID=.;OPOS=50452708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:51:51:54:54:0.514286:25:29:26:25:25:29:26:25 chr12 50476158 . G T 896.35 PASS AF=0.536585;AO=88;DP=164;FAO=88;FDP=164;FR=.;FRO=76;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=0.00436478;FXX=0.00606024;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.574;QD=21.8622;RBI=0.0118911;REFB=-0.00998523;REVB=-0.0110611;RO=76;SAF=47;SAR=41;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722357;STB=0.539465;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00907896;OID=.;OPOS=50476158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:76:76:88:88:0.536585:41:47:47:29:41:47:47:29 chr12 50523947 . A G 610.43 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.106787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.943;QD=56.784;RBI=0.106787;REFB=-0.110242;REVB=-0.000322629;RO=2;SAF=23;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390665;STB=0.520823;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00392691;OID=.;OPOS=50523947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:18:23:2:0:18:23:2:0 chr12 50523964 . T C 613.27 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.613;QD=61.3268;RBI=0.049971;REFB=0;REVB=0.00547451;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316907;OID=.;OPOS=50523964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr12 50526814 . G A 87.33 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0138253;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.045;QD=11.6443;RBI=0.0141057;REFB=-0.0213443;REVB=0.0027988;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120689;STB=0.572193;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0375882;OID=.;OPOS=50526814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:31:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:9:10:7:4:9:10 chr12 50529314 . C T 407.31 PASS AF=0.673469;AO=33;DP=49;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00267692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.554;QD=33.2496;RBI=0.01086;REFB=-0.0262625;REVB=-0.0105249;RO=16;SAF=20;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653763;STB=0.535692;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0143054;OID=.;OPOS=50529314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:16:16:33:33:0.673469:13:20:8:8:13:20:8:8 chr12 50529736 . G A 81.28 PASS AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00166329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.357;QD=8.12757;RBI=0.0499635;REFB=-0.0121252;REVB=0.0499358;RO=29;SAF=8;SAR=3;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223921;STB=0.639731;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0209396;OID=.;OPOS=50529736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:3:8:16:13:3:8:16:13 chr12 50537815 . A G 1042.32 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00535989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.697;QD=59.5612;RBI=0.0137024;REFB=0;REVB=0.0126106;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49935e-05;OID=.;OPOS=50537815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:35:34:0:0:36:34:0:0 chr12 50616346 . A G 222.47 PASS AF=0.431818;AO=9;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0274193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.4052;QD=20.2245;RBI=0.253642;REFB=0.0636752;REVB=-0.252156;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363009;STB=0.804388;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0512664;OID=.;OPOS=50616346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:16:20:9:19:0.431818:6:3:11:5:16:3:14:6 chr12 50650057 . T C 597.97 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405371;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2778;QD=61.33;RBI=0.0468872;REFB=0;REVB=0.0235618;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000362042;OID=.;OPOS=50650057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr12 50727706 . G C 249.73 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00371215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.573;QD=18.4985;RBI=0.0252725;REFB=-0.00950858;REVB=-0.0249984;RO=27;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135887;STB=0.576214;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.01072;OID=.;OPOS=50727706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:10:17:13:14:10:17:13:14 chr12 50744119 . G A 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00391449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.344;QD=13.459;RBI=0.00583681;REFB=-0.0112503;REVB=0.00432956;RO=26;SAF=13;SAR=3;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382903;STB=0.726958;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0304599;OID=.;OPOS=50744119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:3:13:13:13:3:13:13:13 chr12 50744171 . T C 246.17 PASS AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0341068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.972;QD=13.4889;RBI=0.0355561;REFB=-0.00753456;REVB=0.010048;RO=43;SAF=17;SAR=12;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712614;STB=0.531475;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0146918;OID=.;OPOS=50744171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:44:29:29:0.39726:12:17:28:15:12:17:28:16 chr12 50744753 . T C 106.68 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0226492;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.698;QD=11.5331;RBI=0.024446;REFB=-0.00783136;REVB=-0.009199;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130276;STB=0.577857;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0162709;OID=.;OPOS=50744753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:4:9:14:10:4:9:14:10 chr12 50749221 . G C 374.45 PASS AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.055504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7685;QD=49.9262;RBI=0.055744;REFB=-0.0337418;REVB=0.00516653;RO=1;SAF=16;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282029;STB=0.504851;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0179359;OID=.;OPOS=50749221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:30:1:2:28:28:0.933333:12:16:1:0:12:16:1:1 chr12 50749227 . T G 395.71 PASS AF=0.90625;AO=32;DP=35;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00971079;FXX=0.0856898;HRUN=6;LEN=1;MLLD=193.366;QD=49.4636;RBI=0.00971608;REFB=-0.109711;REVB=0.000320775;RO=1;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345573;STB=0.565171;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00109046;OID=.;OPOS=50749227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:35:32:1:3:32:29:0.90625:13:19:0:1:10:19:0:3 chr12 50749294 . A G 253.93 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0139961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.653;QD=21.6113;RBI=0.0400222;REFB=0.00110116;REVB=-0.0374952;RO=23;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553909;STB=0.531058;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00175069;OID=.;OPOS=50749294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:11:13:11:12:11:13:11:12 chr12 50749554 . G T 374.36 PASS AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00781878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.233;QD=31.8603;RBI=0.0601709;REFB=-0.0288338;REVB=-0.0596608;RO=16;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221981;STB=0.621034;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0237559;OID=.;OPOS=50749554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:17:14:13:3:17:14:13:3 chr12 50749738 . CAT C 337.34 PASS AF=0.7;AO=28;DP=41;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00192582;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=2;MLLD=235.744;QD=33.7338;RBI=0.0264334;REFB=-0.039768;REVB=0.0263632;RO=12;SAF=11;SAR=17;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839926;STB=0.54577;STBP=0.402;TYPE=del;VARB=0.0145174;OID=.;OPOS=50749739;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.7:28:41:28:40:12:11:17:3:9:93:12:11:17:3:9 chr12 50754563 . T G 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00574443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.623;QD=21.9446;RBI=0.0098888;REFB=-0.00617559;REVB=0.00804922;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190956;STB=0.607015;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00619322;OID=.;OPOS=50754563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:8:8:3:9:8:8:3:9 chr12 50824275 . C G 785.6 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8051;QD=64.1309;RBI=0.0706189;REFB=0;REVB=0.0512934;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124146;OID=.;OPOS=50824275;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0 chr12 50870145 . G A 2984.25 PASS AF=1;AO=187;DP=189;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253945;FXX=0.00529073;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.707;QD=63.4947;RBI=0.0255139;REFB=0;REVB=-0.00246477;RO=0;SAF=96;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84148e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92955e-05;OID=.;OPOS=50870145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:189:188:0:0:187:188:1:91:96:0:0:92:96:0:0 chr12 51112586 . T C 1378.23 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.304;QD=62.6466;RBI=0.0546134;REFB=0;REVB=0.0430068;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020753;OID=.;OPOS=51112586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:45:41:0:0:45:43:0:0 chr12 51135275 . T C 1033.27 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00751793;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4631;QD=58.2125;RBI=0.0828664;REFB=-0.0413907;REVB=0.0825247;RO=1;SAF=36;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129528;STB=0.506847;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00238366;OID=.;OPOS=51135275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:71:1:1:70:70:0.985915:34:36:1:0:34:36:1:0 chr12 51235317 . A G 398.14 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224443;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.954;QD=56.8768;RBI=0.0529758;REFB=0;REVB=-0.0479864;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046279;OID=.;OPOS=51235317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0 chr12 51236802 . T C 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0479731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7232;QD=10.3903;RBI=0.0527679;REFB=-0.0306915;REVB=0.0219781;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263346;STB=0.516083;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0499501;OID=.;OPOS=51236802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:5:6:4:3:5:6 chr12 51333796 . C CA 109.41 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00629195;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.2048;QD=9.94663;RBI=0.0296374;REFB=0.00326714;REVB=-0.0289618;RO=28;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141393;STB=0.517222;STBP=0.878;TYPE=ins;VARB=-0.00986209;OID=.;OPOS=51333797;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.409091:18:47:18:44:26:6:12:8:18:99:28:6:12:9:19 chr12 51354803 . C T 793.78 PASS AF=0.523179;AO=79;DP=151;FAO=79;FDP=151;FR=.;FRO=72;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=0.0079219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9559;QD=21.0272;RBI=0.0405973;REFB=-0.0331999;REVB=-0.0398168;RO=71;SAF=47;SAR=32;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184875;STB=0.5981;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0254884;OID=.;OPOS=51354803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:71:72:79:79:0.523179:32:47:27:44:32:47:28:44 chr12 51393116 . C T 141.95 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0155974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.592;QD=13.8492;RBI=0.0199324;REFB=0.00156809;REVB=-0.0124105;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173098;STB=0.599883;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-0.00319243;OID=.;OPOS=51393116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:9:7:7:18:9:7:7:18 chr12 51402905 . T G 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.346;QD=63.2846;RBI=0.0792516;REFB=0;REVB=0.0755909;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000436989;OID=.;OPOS=51402905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0 chr12 51442944 . G A 1630.34 PASS AF=1;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133437;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.758;QD=60.383;RBI=0.0286151;REFB=0;REVB=0.0253135;RO=0;SAF=55;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.617e-05;OID=.;OPOS=51442944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:108:0:0:108:108:1:53:55:0:0:53:55:0:0 chr12 51518787 . C G 641.14 PASS AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.86;QD=59.6404;RBI=0.0581679;REFB=0;REVB=0.0519613;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407188;OID=.;OPOS=51518787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:41:43:1:21:20:0:0:23:20:0:0 chr12 51636259 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.774;QD=62.6711;RBI=0.0237245;REFB=0;REVB=0.0129608;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57169e-05;OID=.;OPOS=51636259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr12 51681903 . T C 1606.73 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00409117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.631;QD=64.2693;RBI=0.0295298;REFB=0;REVB=0.029245;RO=0;SAF=38;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5137e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50013e-05;OID=.;OPOS=51681903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:61:38:0:0:62:38:0:0 chr12 51685831 . T C 274.84 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152517;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.151;QD=49.9701;RBI=0.0226805;REFB=-0.0261249;REVB=0.0167866;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236028;OID=.;OPOS=51685831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:22:22:1:0:21:22:1:16:5:1:0:16:6:0:0 chr12 51685881 . G A 147.67 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0118863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.719;QD=26.8493;RBI=0.0138062;REFB=0.00109662;REVB=0.00702321;RO=7;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951497;STB=0.552779;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.000581027;OID=.;OPOS=51685881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:11:4:1:6:11:4:1:6 chr12 51696500 . G A 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0189923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1177;QD=11.1978;RBI=0.0606798;REFB=-0.0421441;REVB=-0.0576309;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233847;STB=0.639763;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0229325;OID=.;OPOS=51696500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:4:8:10:12:4:8:10:12 chr12 51707626 . C T 341.9 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0230058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.573;QD=18.4812;RBI=0.023478;REFB=-0.0102393;REVB=0.00468497;RO=38;SAF=13;SAR=23;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226258;STB=0.626253;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00856967;OID=.;OPOS=51707626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:23:13:23:15:23:13:23:15 chr12 51722311 . C T 310.65 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.000742628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.471;QD=16.3499;RBI=0.02171;REFB=-0.00752863;REVB=-0.0216973;RO=42;SAF=12;SAR=22;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23964;STB=0.634865;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00910989;OID=.;OPOS=51722311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:22:12:25:17:22:12:25:17 chr12 51733734 . G A 356.57 PASS AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0575758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.928;QD=19.2741;RBI=0.0584383;REFB=-0.0439572;REVB=0.0100028;RO=37;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243285;STB=0.513526;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0300475;OID=.;OPOS=51733734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:19:18:17:20:19:18:17:20 chr12 51737607 . G A 148.96 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00847046;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.644;QD=17.0234;RBI=0.0250629;REFB=-0.0220999;REVB=-0.0235881;RO=18;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00651334;STB=0.519831;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0266043;OID=.;OPOS=51737607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:18:19:16:16:0.457143:7:9:10:8:7:9:10:9 chr12 51740387 . ACTGG A 66.53 PASS AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000552509;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=4;MLLD=340.655;QD=38.0149;RBI=0.0231265;REFB=0;REVB=0.0231199;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000252622;OID=.;OPOS=51740388;OREF=CTGG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:8:7:7:0:4:3:0:0:4:0:4:3:0:0 chr12 51740409 . TA AC,GG 100.32 PASS AF=0.2,0.8;AO=2,8;DP=10;FAO=2,8;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2,5;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00546238,0.0111493;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=137.983,189.716;QD=40.1275;RBI=0.0215312,0.0240614;REFB=0,0;REVB=-0.0208268,-0.0213224;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=-0.0123562,0.00137657;OID=.,.;OPOS=51740409,51740409;OREF=TA,TA;OALT=AC,GG;OMAPALT=AC,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:10:10:0:0:2,8:2,8:0.2,0.8:0,3:2,5:0:0:0,3:2,5:0:0 chr12 51901390 . A G 454.27 PASS AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0375883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5619;QD=17.9908;RBI=0.0439205;REFB=-0.015666;REVB=-0.0227184;RO=52;SAF=18;SAR=30;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102381;STB=0.562633;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0234983;OID=.;OPOS=51901390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:52:53:48:48:0.475248:30:18:25:27:30:18:26:27 chr12 51902249 . C T 275.25 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0931893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.663;QD=13.2652;RBI=0.0942443;REFB=-0.0386387;REVB=-0.0140621;RO=51;SAF=18;SAR=14;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161054;STB=0.591871;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0363522;OID=.;OPOS=51902249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:14:18:21:30:14:18:21:30 chr12 52080965 . C T 1142.03 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.481;QD=59.3262;RBI=0.0304122;REFB=0;REVB=0.00894748;RO=1;SAF=22;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210175;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.29224e-05;OID=.;OPOS=52080965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:1:0:75:77:1:53:22:1:0:54:23:0:0 chr12 52182545 . A G 308.42 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00939547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.07;QD=18.413;RBI=0.0163858;REFB=-0.0175487;REVB=-0.0134245;RO=33;SAF=11;SAR=22;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301917;STB=0.511104;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0264638;OID=.;OPOS=52182545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:34:33:33:0.492537:22:11:12:21:22:11:12:22 chr12 52184271 . T C 150.1 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0465502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.539;QD=19.3682;RBI=0.0465849;REFB=-0.0175288;REVB=-0.00179866;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106233;STB=0.578413;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0130855;OID=.;OPOS=52184271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:15:16:16:0.516129:10:6:7:7:10:6:8:7 chr12 52200742 . C A 44.79 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0264901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4841;QD=7.78928;RBI=0.0561667;REFB=-0.0176186;REVB=-0.0495275;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426633;STB=0.764002;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0374687;OID=.;OPOS=52200742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:16:16:7:7:0.304348:2:5:5:11:2:5:5:11 chr12 52204246 . T C 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00787134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.341;QD=54.7459;RBI=0.00787308;REFB=0.0467448;REVB=-0.00016548;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.511624;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.000213474;OID=.;OPOS=52204246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:21:32:0:0:21:32:0:1 chr12 52211942 . G A 495.52 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166902;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.218;QD=58.2965;RBI=0.00982605;REFB=0;REVB=0.00968327;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123671;OID=.;OPOS=52211942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:19:15:0:0 chr12 52213814 . C T 42.16 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.135165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3712;QD=18.7395;RBI=0.135262;REFB=-0.049445;REVB=0.00511462;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.502096;STB=0.79893;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0369688;OID=.;OPOS=52213814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:0:3:1:5:0:3 chr12 52215102 . T G 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.564;QD=39.2065;RBI=0.0579568;REFB=0;REVB=0.0386702;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10955e-05;OID=.;OPOS=52215102;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr12 52282060 . C T 295.29 PASS AF=0.373626;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=38;FWDB=0.00166544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1123;QD=12.9799;RBI=0.0294382;REFB=-0.0212547;REVB=0.0293911;RO=55;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643275;STB=0.53299;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0355227;OID=.;OPOS=52282060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:57:34:34:0.373626:21:13:18:37:21:13:19:38 chr12 52282873 . A T 217.79 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0149034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.505;QD=16.7532;RBI=0.0482327;REFB=-0.0379423;REVB=-0.0458725;RO=27;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137635;STB=0.588161;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.042745;OID=.;OPOS=52282873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:27:28:24:24:0.461538:15:9:14:13:15:9:15:13 chr12 52284233 . T C 708.91 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.675;QD=63.0146;RBI=0.0222227;REFB=0;REVB=-0.0165426;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.2197e-06;OID=.;OPOS=52284233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:30:14:0:0:30:15:0:0 chr12 52284500 . A G 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00166449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.888;QD=19.3435;RBI=0.0153337;REFB=-0.0248867;REVB=0.0152431;RO=18;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248975;STB=0.64135;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0275993;OID=.;OPOS=52284500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:12:6:11:7:12:6:11:7 chr12 52565322 . G T 566.42 PASS AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00454785;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.089;QD=53.9446;RBI=0.0207738;REFB=-0.261413;REVB=0.0202699;RO=2;SAF=35;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905604;STB=0.541773;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00125056;OID=.;OPOS=52565322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:42:42:2:3:39:39:0.928571:4:35:1:1:4:35:2:1 chr12 52574519 . GAAAAA GAAAA,GAAAAG 69.85 PASS AF=0.419355,0.0322581;AO=13,2;DP=30;FAO=13,1;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=2,0;FSAR=11,1;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.221058,0.0880589;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.0112,19.7517;QD=9.01233;RBI=0.282386,0.10832;REFB=-0.0904896,-0.0756443;REVB=-0.175713,-0.0630774;RO=13;SAF=1,0;SAR=12,2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.614861,-0.601607;STB=0.732918,0.989094;STBP=0.047,0.436;TYPE=del,snp;VARB=0.0971368,0.00913223;OID=.,.;OPOS=52574520,52574524;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAAAA,GAAAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.419355,0.0322581:13,2:30:13,1:31:17:2,0:11,1:8:9:63:13:1,0:12,2:8:5 chr12 52601958 . C T 352.93 PASS AF=0.545455;AO=32;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00907291;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.164;QD=21.3898;RBI=0.00949366;REFB=-0.00510826;REVB=-0.00279499;RO=22;SAF=24;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180429;STB=0.613141;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00630224;OID=.;OPOS=52601958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:22:30:32:36:0.545455:8:24:12:10:10:26:15:15 chr12 52602013 . C T 1444.83 PASS AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0240501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.147;QD=60.8348;RBI=0.0329127;REFB=-0.161632;REVB=0.0224685;RO=2;SAF=46;SAR=47;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000214551;STB=0.500113;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00056561;OID=.;OPOS=52602013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:47:46:1:1:47:46:1:1 chr12 52631313 . A G 1984.65 PASS AF=0.992366;AO=127;DP=128;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=84;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0424978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8164;QD=60.6001;RBI=0.0873137;REFB=0.0920471;REVB=0.0762733;RO=1;SAF=83;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569131;STB=0.502958;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000174244;OID=.;OPOS=52631313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:131:1:1:127:130:0.992366:44:83:1:0:46:84:1:0 chr12 52635360 . G A 246.49 PASS AF=0.521739;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00066996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9388;QD=21.4338;RBI=0.0697591;REFB=-0.00164857;REVB=0.0697559;RO=22;SAF=6;SAR=17;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132749;STB=0.538431;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00222509;OID=.;OPOS=52635360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:23:24:0.521739:17:6:6:16:17:7:5:17 chr12 52639302 . G C 697.87 PASS AF=0.980392;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0657164;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6804;QD=54.7352;RBI=0.0856917;REFB=-0.100712;REVB=0.0549948;RO=0;SAF=14;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22152e-08;STB=0.506847;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00293572;OID=.;OPOS=52639302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:49:50:0.980392:35:14:0:0:36:14:0:1 chr12 52661302 . C A 562.3 PASS AF=0.974359;AO=39;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0196294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1979;QD=57.6715;RBI=0.080814;REFB=0.0586639;REVB=0.0783938;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517232;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=-0.000428313;OID=.;OPOS=52661302;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:0:1:39:38:0.974359:15:24:0:0:14:24:0:1 chr12 52681925 . A C 1585.78 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.42;QD=63.431;RBI=0.0214428;REFB=0;REVB=-0.00273335;RO=0;SAF=40;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.04617e-05;OID=.;OPOS=52681925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:59:40:0:0:60:40:0:0 chr12 52699548 . T C 569.4 PASS AF=0.377778;AO=63;DP=175;FAO=68;FDP=180;FR=.;FRO=112;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=70;FWDB=-0.0169977;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.759;QD=12.6533;RBI=0.0304869;REFB=-0.0379039;REVB=-0.0253087;RO=112;SAF=38;SAR=25;SRF=42;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25267;STB=0.621704;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0702049;OID=.;OPOS=52699548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:180:112:112:63:68:0.377778:25:38:42:70:29:39:42:70 chr12 52708420 . G A 559.69 PASS AF=0.450382;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.00496176;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.79;QD=17.0897;RBI=0.0272274;REFB=-0.00395871;REVB=0.0267714;RO=68;SAF=29;SAR=30;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00600518;STB=0.510613;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.00256872;OID=.;OPOS=52708420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:68:72:59:59:0.450382:30:29:33:35:30:29:34:38 chr12 52708565 . A G 209.16 PASS AF=0.456522;AO=20;DP=45;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00750169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.489;QD=18.1874;RBI=0.0149103;REFB=-0.0126757;REVB=0.0128857;RO=24;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250896;STB=0.538426;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0196811;OID=.;OPOS=52708565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:24:25:20:21:0.456522:8:12:15:9:9:12:16:9 chr12 52712975 . G A 260.37 PASS AF=0.360465;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0262453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.165;QD=12.11;RBI=0.0349846;REFB=-0.0211188;REVB=-0.0231323;RO=54;SAF=15;SAR=16;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849219;STB=0.553847;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0327646;OID=.;OPOS=52712975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:54:55:31:31:0.360465:16:15:22:32:16:15:22:33 chr12 52753861 . C T 373.22 PASS AF=0.413462;AO=41;DP=103;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.010997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9186;QD=14.3546;RBI=0.0137155;REFB=-0.0178008;REVB=0.00819635;RO=60;SAF=19;SAR=22;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384846;STB=0.515688;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0169652;OID=.;OPOS=52753861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:60:61:41:43:0.413462:22:19:30:30:23:20:30:31 chr12 52774235 . A G 834.31 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.919;QD=57.5389;RBI=0.031028;REFB=0;REVB=0.0132897;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254004;OID=.;OPOS=52774235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0 chr12 52777502 . A G 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.948;QD=62.3143;RBI=0.00999461;REFB=0;REVB=-0.00929792;RO=0;SAF=31;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.00135e-06;OID=.;OPOS=52777502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:55:31:0:0:55:31:0:0 chr12 52789509 . T C 728.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.168;QD=63.3519;RBI=0.046068;REFB=0;REVB=-0.0290534;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06409e-05;OID=.;OPOS=52789509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:18:27:0:0:18:28:0:0 chr12 52789597 . A G 453.85 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0138156;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.078;QD=55.012;RBI=0.0140776;REFB=-0.078914;REVB=-0.00270325;RO=1;SAF=21;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217181;STB=0.511621;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.000295142;OID=.;OPOS=52789597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:11:21:1:0:11:21:1:0 chr12 52789605 . T A 447.01 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.127;QD=57.6783;RBI=0.032605;REFB=0;REVB=0.0155664;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.86202e-05;OID=.;OPOS=52789605;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0 chr12 52818504 . T G 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0032048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.831;QD=62.0075;RBI=0.0324993;REFB=0;REVB=0.0323409;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57866e-05;OID=.;OPOS=52818504;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0 chr12 52822258 . A G 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0766114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.607;QD=64.4153;RBI=0.0769712;REFB=0;REVB=0.0074331;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021618;OID=.;OPOS=52822258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0 chr12 52824352 . G A 2380.83 PASS AF=0.981481;AO=156;DP=163;FAO=159;FDP=162;FR=.;FRO=3;FSAF=76;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0366135;FXX=0.0121944;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.32;QD=58.7858;RBI=0.0454438;REFB=-0.00459818;REVB=0.0269182;RO=3;SAF=73;SAR=83;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168822;STB=0.508875;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000107314;OID=.;OPOS=52824352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:163:162:3:3:156:159:0.981481:83:73:0:3:83:76:0:3 chr12 52825363 . G A 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0084315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.644;QD=57.2376;RBI=0.0106583;REFB=0;REVB=-0.00651983;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33237e-06;OID=.;OPOS=52825363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0 chr12 52827818 . T C 1318.47 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.127;QD=62.0456;RBI=0.0158836;REFB=0;REVB=-0.00269158;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2486e-05;OID=.;OPOS=52827818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:45:39:0:0:46:39:0:0 chr12 52841765 . G A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0068781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.066;QD=58.4195;RBI=0.0109225;REFB=0;REVB=0.00848482;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38349e-05;OID=.;OPOS=52841765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:37:26:0:0:37:26:0:0 chr12 52842736 . T C 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0753881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.023;QD=51.9141;RBI=0.0761348;REFB=0;REVB=0.0106369;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177782;OID=.;OPOS=52842736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr12 52843581 . A G 92.02 PASS AF=0.128834;AO=21;DP=163;FAO=21;FDP=163;FR=.;FRO=142;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=77;FSRR=65;FWDB=0.00836109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.738;QD=2.25808;RBI=0.022593;REFB=-0.00100476;REVB=-0.0209889;RO=142;SAF=8;SAR=13;SRF=77;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200566;STB=0.638967;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00536052;OID=.;OPOS=52843581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:163:163:142:142:21:21:0.128834:13:8:77:65:13:8:77:65 chr12 52843779 . T C 476.81 PASS AF=0.311881;AO=57;DP=198;FAO=63;FDP=202;FR=.;FRO=139;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=85;FWDB=0.00950923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.854;QD=9.44186;RBI=0.0168896;REFB=-0.0104163;REVB=-0.0139583;RO=139;SAF=27;SAR=30;SRF=54;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104495;STB=0.592477;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0210819;OID=.;OPOS=52843779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:202:139:139:57:63:0.311881:30:27:54:85:30:33:54:85 chr12 52844265 . T C 1492.36 PASS AF=0.828358;AO=111;DP=134;FAO=111;FDP=134;FR=.;FRO=23;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0299407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.924;QD=44.548;RBI=0.0319361;REFB=-0.0655466;REVB=0.0111115;RO=23;SAF=43;SAR=68;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00133306;STB=0.500708;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00838529;OID=.;OPOS=52844265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:23:23:111:111:0.828358:68:43:9:14:68:43:9:14 chr12 52845801 . T C 746.14 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4091;QD=63.5011;RBI=0.0527609;REFB=0;REVB=-0.00414712;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335087;OID=.;OPOS=52845801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr12 52863038 . G A 746.16 PASS AF=1;AO=43;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.337;QD=63.5032;RBI=0.112202;REFB=0;REVB=0.111451;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127827;OID=.;OPOS=52863038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:43:47:1:19:24:0:0:23:24:0:0 chr12 52863213 . C T 1952.9 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.522;QD=61.9968;RBI=0.0420773;REFB=0;REVB=0.00602765;RO=0;SAF=64;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72406e-05;OID=.;OPOS=52863213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:61:64:0:0:62:64:0:0 chr12 52863621 . T G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00435625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.551;QD=61.3364;RBI=0.00444232;REFB=0;REVB=-0.000870219;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.99856e-06;OID=.;OPOS=52863621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr12 52864970 . G A 267.37 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0416149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.325;QD=13.711;RBI=0.0419706;REFB=-0.00922052;REVB=0.00545251;RO=46;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042001;STB=0.512187;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0227091;OID=.;OPOS=52864970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:47:31:31:0.397436:21:10:15:31:21:10:16:31 chr12 52881541 . G T 470.89 PASS AF=0.46789;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0257425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7981;QD=17.2805;RBI=0.0266175;REFB=0.00816135;REVB=-0.00676841;RO=58;SAF=25;SAR=26;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401421;STB=0.522326;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.00944362;OID=.;OPOS=52881541;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:58:58:51:51:0.46789:26:25:26:32:26:25:26:32 chr12 52882208 . C T 481.94 PASS AF=0.5;AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00700287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7181;QD=20.5081;RBI=0.0154349;REFB=-0.0366548;REVB=0.0137549;RO=47;SAF=26;SAR=21;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171519;STB=0.594846;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0363316;OID=.;OPOS=52882208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:47:47:47:47:0.5:21:26:17:30:21:26:17:30 chr12 52885316 . A G 428.42 PASS AF=0.378788;AO=50;DP=132;FAO=50;FDP=132;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=-0.0081655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.154;QD=12.9823;RBI=0.027569;REFB=0.00845548;REVB=-0.026332;RO=80;SAF=32;SAR=18;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102257;STB=0.559416;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.0205856;OID=.;OPOS=52885316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:80:82:50:50:0.378788:18:32:44:36:18:32:45:37 chr12 52885339 . CC TT 322.03 PASS AF=0.306569;AO=39;DP=133;FAO=42;FDP=137;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=0.0121818;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=197.07;QD=9.4022;RBI=0.0177739;REFB=-0.0108688;REVB=-0.0129427;RO=94;SAF=24;SAR=15;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771592;STB=0.54399;STBP=0.526;TYPE=mnp;VARB=0.0226068;OID=.;OPOS=52885339;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:137:94:95:39:42:0.306569:15:24:52:42:16:26:53:42 chr12 52885344 . G C 311.15 PASS AF=0.29927;AO=41;DP=138;FAO=41;FDP=137;FR=.;FRO=96;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=53;FSRR=43;FWDB=-0.0255976;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.584;QD=9.08468;RBI=0.0453523;REFB=0.00715927;REVB=-0.0374378;RO=96;SAF=26;SAR=15;SRF=53;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102083;STB=0.559941;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.021624;OID=.;OPOS=52885344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:96:96:41:41:0.29927:15:26:53:43:15:26:53:43 chr12 52885350 . T C 319.61 PASS AF=0.3;AO=41;DP=139;FAO=42;FDP=140;FR=.;FRO=98;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=0.0121529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.436;QD=9.13175;RBI=0.0221707;REFB=-0.00542099;REVB=-0.0185431;RO=97;SAF=25;SAR=16;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102767;STB=0.563606;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00627427;OID=.;OPOS=52885350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:97:98:41:42:0.3:16:25:51:46:16:26:52:46 chr12 52885374 . G C 142.78 PASS AF=0.180556;AO=25;DP=142;FAO=26;FDP=144;FR=.;FRO=118;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=56;FWDB=-0.0313633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5822;QD=3.96613;RBI=0.0362393;REFB=-0.00528702;REVB=-0.0181558;RO=117;SAF=11;SAR=14;SRF=61;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103744;STB=0.552199;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0132204;OID=.;OPOS=52885374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:117:118:25:26:0.180556:14:11:61:56:14:12:62:56 chr12 52885377 . A G 137.55 PASS AF=0.173611;AO=25;DP=140;FAO=25;FDP=144;FR=.;FRO=119;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=-0.0251968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.413;QD=3.82085;RBI=0.0258424;REFB=-0.00229725;REVB=-0.0057403;RO=115;SAF=12;SAR=13;SRF=61;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643118;STB=0.547634;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0134313;OID=.;OPOS=52885377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:144:115:119:25:25:0.173611:13:12:61:54:13:12:64:55 chr12 52885381 . C T 138.14 PASS AF=0.174825;AO=26;DP=144;FAO=25;FDP=143;FR=.;FRO=118;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=-0.0132446;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.202;QD=3.86397;RBI=0.0159247;REFB=-0.00412282;REVB=-0.00884171;RO=118;SAF=13;SAR=13;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324849;STB=0.544353;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0179256;OID=.;OPOS=52885381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:118:118:26:25:0.174825:13:13:62:56:13:12:63:55 chr12 52886478 . T C 1199.46 PASS AF=1;AO=79;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.007;QD=57.8053;RBI=0.0506014;REFB=-0.0317405;REVB=0.0361226;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120046;OID=.;OPOS=52886478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:83:83:0:0:79:83:1:35:44:0:0:39:44:0:0 chr12 52886490 . A G 1419.92 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305192;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.193;QD=63.1076;RBI=0.0327413;REFB=0;REVB=0.0118562;RO=0;SAF=53;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.458e-05;OID=.;OPOS=52886490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:36:53:0:0:37:53:0:0 chr12 52912906 . G T 905.57 PASS AF=1;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441664;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0577;QD=58.4236;RBI=0.0759456;REFB=0;REVB=-0.0617824;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166088;OID=.;OPOS=52912906;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:61:62:1:28:33:0:0:28:34:0:0 chr12 52912909 . G T 875.22 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.012726;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.997;QD=56.4659;RBI=0.0239767;REFB=-0.0283166;REVB=0.0203208;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000654442;OID=.;OPOS=52912909;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:62:0:1:61:61:0.983871:27:34:0:0:27:34:0:1 chr12 52938364 . T C 546.93 PASS AF=0.471545;AO=56;DP=121;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.00104058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.052;QD=17.7864;RBI=0.0139904;REFB=-0.0107579;REVB=0.0139517;RO=65;SAF=24;SAR=32;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135666;STB=0.582229;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0101708;OID=.;OPOS=52938364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:65:65:56:58:0.471545:32:24:37:28:34:24:37:28 chr12 52938497 . A C 140.93 PASS AF=0.6;AO=14;DP=24;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.106809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.8712;QD=22.5487;RBI=0.11186;REFB=-0.0888337;REVB=-0.0332336;RO=10;SAF=12;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366468;STB=0.716191;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0624211;OID=.;OPOS=52938497;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:24:25:10:10:14:15:0.6:2:12:5:5:2:13:5:5 chr12 52939407 . AGAG A 75.58 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.00598621;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=3;MLLD=292.613;QD=10.4254;RBI=0.00714954;REFB=-0.0142689;REVB=0.00390912;RO=18;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211339;STB=0.596835;STBP=0.51;TYPE=del;VARB=0.0248728;OID=.;OPOS=52939408;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.344828:10:30:10:29:19:4:6:5:14:75:18:4:6:4:14 chr12 52943144 . G A 209.27 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0235282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.709;QD=13.7228;RBI=0.0580954;REFB=-0.00674609;REVB=0.0531178;RO=34;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10926;STB=0.560736;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0104677;OID=.;OPOS=52943144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:36:25:25:0.409836:12:13:14:20:12:13:15:21 chr12 52965173 . T G 402.15 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0128153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.473;QD=21.7378;RBI=0.0224117;REFB=-0.00640479;REVB=-0.0183862;RO=34;SAF=19;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696741;STB=0.538442;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00614456;OID=.;OPOS=52965173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:34:40:40:0.540541:21:19:19:15:21:19:19:15 chr12 52965722 . T C 266.56 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0148826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.604;QD=15.9138;RBI=0.0193959;REFB=-0.0195762;REVB=-0.0124383;RO=37;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112675;STB=0.563594;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.023804;OID=.;OPOS=52965722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:12:18:18:19:12:18:18:19 chr12 52965761 . C T 1035.27 PASS AF=0.972603;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0244372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.491;QD=56.7274;RBI=0.0490102;REFB=-0.0402492;REVB=0.0424832;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501363;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00146698;OID=.;OPOS=52965761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:73:0:2:71:71:0.972603:32:39:0:0:32:39:1:1 chr12 52965782 . T C 281.7 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.06297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4251;QD=17.0726;RBI=0.0692674;REFB=0.00166713;REVB=-0.0288576;RO=33;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890631;STB=0.535691;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.00497925;OID=.;OPOS=52965782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:33:35:31:31:0.469697:13:18:16:17:13:18:18:17 chr12 52967117 . C T 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0509697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.049;QD=12.7291;RBI=0.0510569;REFB=-0.0131783;REVB=-0.00298268;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436487;STB=0.760275;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0140744;OID=.;OPOS=52967117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:7:2:8:4:7:2:8:4 chr12 52967436 . G A 322.46 PASS AF=0.460526;AO=34;DP=77;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.012341;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.947;QD=16.9718;RBI=0.0263068;REFB=-0.0324214;REVB=-0.0232324;RO=40;SAF=16;SAR=18;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14254;STB=0.591478;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0260595;OID=.;OPOS=52967436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:40:41:34:35:0.460526:18:16:13:27:18:17:13:28 chr12 52981512 . G A 307.6 PASS AF=0.37234;AO=35;DP=94;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=0.0195925;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.414;QD=13.0892;RBI=0.0391196;REFB=-0.0111023;REVB=-0.0338597;RO=58;SAF=20;SAR=15;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115018;STB=0.558327;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0181288;OID=.;OPOS=52981512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:58:59:35:35:0.37234:15:20:39:19:15:20:39:20 chr12 52981627 . A T 143.94 PASS AF=0.444444;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00809498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.361;QD=15.9932;RBI=0.0110489;REFB=-0.0191437;REVB=-0.00751991;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243281;STB=0.616297;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0248554;OID=.;OPOS=52981627;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:20:20:15:16:0.444444:9:6:13:7:9:7:13:7 chr12 53045626 . T C 82.05 PASS AF=0.9;AO=10;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.10821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.104;QD=32.8219;RBI=0.108285;REFB=-0.0600036;REVB=-0.00404827;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00488257;OID=.;OPOS=53045626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:10:0:1:10:9:0.9:5:5:0:0:4:5:0:1 chr12 53069014 . T C 1070.76 PASS AF=1;AO=69;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9592;QD=59.4864;RBI=0.019734;REFB=0;REVB=0.00905041;RO=1;SAF=30;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154963;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58189e-05;OID=.;OPOS=53069014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:1:0:69:72:1:39:30:1:0:40:32:0:0 chr12 53070121 . T G 1134.03 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7877;QD=60.4814;RBI=0.0490505;REFB=0;REVB=-0.0469729;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00051699;OID=.;OPOS=53070121;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0 chr12 53085089 . T C 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0509965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.125;QD=53.9092;RBI=0.0585282;REFB=0;REVB=0.0287212;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.74805e-05;OID=.;OPOS=53085089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0 chr12 53088484 . C T 1098.69 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7111;QD=60.2022;RBI=0.0262307;REFB=0;REVB=0.00557077;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013443;OID=.;OPOS=53088484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:30:43:0:0:30:43:0:0 chr12 53096913 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.948;QD=47.8224;RBI=0.00836437;REFB=0;REVB=-0.00836437;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18045e-05;OID=.;OPOS=53096913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:15:0:0:0:16:0:0:0 chr12 53162638 . G A 260.93 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.0142681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.903;QD=14.2974;RBI=0.0194975;REFB=-0.00657529;REVB=0.0132881;RO=41;SAF=16;SAR=14;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155541;STB=0.584361;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0113589;OID=.;OPOS=53162638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:43:30:30:0.410959:14:16:28:13:14:16:29:14 chr12 53162773 . A G 682.47 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.085;QD=60.6642;RBI=0.0775972;REFB=0;REVB=-0.0395716;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00432337;OID=.;OPOS=53162773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:16:27:0:0:16:29:0:0 chr12 53164848 . G A 526.7 PASS AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=6;FWDB=0.00456905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.814;QD=24.4976;RBI=0.0139876;REFB=-0.00142758;REVB=0.0132203;RO=37;SAF=33;SAR=16;SRF=31;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156471;STB=0.585111;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00203365;OID=.;OPOS=53164848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:16:33:31:6:16:33:31:6 chr12 53165940 . C T 283.67 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=0.0125639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1411;QD=19.9067;RBI=0.0220055;REFB=-0.0201239;REVB=-0.0180663;RO=27;SAF=16;SAR=14;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213807;STB=0.618065;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0141096;OID=.;OPOS=53165940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:14:16:21:6:14:16:21:6 chr12 53186122 . G A 898.54 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.329;QD=57.9705;RBI=0.0329018;REFB=0;REVB=0.00938693;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.5439e-05;OID=.;OPOS=53186122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:24:37:0:0:24:38:0:0 chr12 53204614 . C T 916.0 PASS AF=1;AO=61;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119342;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.484;QD=57.2501;RBI=0.0212348;REFB=0;REVB=0.0175639;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221728;OID=.;OPOS=53204614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:61:64:1:33:28:0:0:36:28:0:0 chr12 53217701 . C A 716.01 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520337;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.247;QD=57.2809;RBI=0.0540344;REFB=0;REVB=-0.0145672;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37246e-05;OID=.;OPOS=53217701;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:29:19:0:0:31:19:0:0 chr12 53227803 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.311;QD=48.737;RBI=0.0357214;REFB=0;REVB=-0.0345497;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000184806;OID=.;OPOS=53227803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0 chr12 53242440 . A G 832.71 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.127;QD=57.4284;RBI=0.0276415;REFB=0;REVB=0.0263893;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166276;OID=.;OPOS=53242440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:26:31:0:0:27:31:0:0 chr12 53294381 . T C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.316;QD=53.2772;RBI=0.0319074;REFB=0;REVB=-0.00852362;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132526;OID=.;OPOS=53294381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chr12 53343461 . A AC 42.46 PASS AF=0.44;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0548517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.7651;QD=6.79386;RBI=0.0550508;REFB=-0.0585828;REVB=0.00467701;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167304;STB=0.654398;STBP=0.177;TYPE=ins;VARB=0.0278686;OID=.;OPOS=53343462;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.44:10:26:11:25:14:7:4:5:9:42:16:6:4:7:9 chr12 53343493 . G A 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0619672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.8293;QD=16.627;RBI=0.0619951;REFB=0.0296814;REVB=0.00185945;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230409;STB=0.632566;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0327761;OID=.;OPOS=53343493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:9:5:8:5:9:5 chr12 53433089 . C A 1524.61 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00330271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.309;QD=58.6388;RBI=0.0455537;REFB=-0.0822028;REVB=0.0454338;RO=1;SAF=52;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921324;STB=0.504853;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.000403577;OID=.;OPOS=53433089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:104:104:1:1:103:103:0.990385:51:52:0:1:51:52:0:1 chr12 53433486 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00535224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.836;QD=56.9569;RBI=0.0196477;REFB=0;REVB=-0.0189047;RO=0;SAF=35;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96037e-05;OID=.;OPOS=53433486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:17:35:0:0:17:35:0:0 chr12 53434105 . C A 71.65 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0459116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1972;QD=19.1059;RBI=0.0467542;REFB=0.00535698;REVB=-0.0088362;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787225;STB=0.545355;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=-0.00764489;OID=.;OPOS=53434105;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:5:4:2:4:5:4:2:4 chr12 53452263 . CCAGGTGGCAGG C 396.18 PASS AF=0.847826;AO=37;DP=43;FAO=39;FDP=46;FR=.;FRO=7;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0114644;FXX=0.061212;HRUN=2;LEN=11;MLLD=324.556;QD=34.4502;RBI=0.0422389;REFB=-0.0665522;REVB=0.0406533;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.511335;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.559293;STBP=0.103;TYPE=del;VARB=0.00664439;OID=.;OPOS=53452264;OREF=CAGGTGGCAGG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.847826:37:43:39:46:7:26:13:7:0:23:0:25:12:0:0 chr12 53454685 . G A 305.01 PASS AF=0.397727;AO=34;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=5;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.00648078;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7172;QD=13.8641;RBI=0.0407023;REFB=-0.00386328;REVB=0.040183;RO=50;SAF=5;SAR=29;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195344;STB=0.652748;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00886099;OID=.;OPOS=53454685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:53:34:35:0.397727:29:5:13:37:30:5:16:37 chr12 53497402 . A G 187.89 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.100582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1119;QD=14.1801;RBI=0.206019;REFB=0.000158268;REVB=-0.179797;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294718;STB=0.687995;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00915312;OID=.;OPOS=53497402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:29:31:22:22:0.415094:6:16:13:16:6:16:13:18 chr12 53497927 . C G 137.07 PASS AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00689762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.6;QD=11.1891;RBI=0.035912;REFB=-0.0162218;REVB=-0.0352434;RO=33;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226466;STB=0.634351;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0586022;OID=.;OPOS=53497927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:6:10:14:19:6:10:14:19 chr12 53509933 . C T 392.05 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.00709897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.989;QD=16.8624;RBI=0.00740831;REFB=-0.0197573;REVB=-0.00211843;RO=50;SAF=22;SAR=19;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113951;STB=0.552565;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.027001;OID=.;OPOS=53509933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:50:52:41:41:0.44086:19:22:21:29:19:22:23:29 chr12 53581376 . C T 181.53 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0483648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.932;QD=24.2041;RBI=0.0510515;REFB=-0.00917833;REVB=0.0163433;RO=12;SAF=4;SAR=14;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598288;STB=0.533298;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00488564;OID=.;OPOS=53581376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:14:4:2:10:14:4:2:10 chr12 53604768 . A G 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00176709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.78;QD=9.19979;RBI=0.00216609;REFB=-0.017342;REVB=-0.00125272;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476186;STB=0.529329;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.015248;OID=.;OPOS=53604768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:8:5:3:4:8:5 chr12 53607263 . AG A,GA 143.97 PASS AF=0.567568,0.189189;AO=18,4;DP=35;FAO=21,7;FDP=37;FR=.;FRO=9;FSAF=19,0;FSAR=2,7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.017653,-0.0110146;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=9.2914,86.7442;QD=15.5645;RBI=0.150054,0.118049;REFB=-0.154766,-0.0254782;REVB=-0.149012,-0.117534;RO=9;SAF=16,0;SAR=2,4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.798025;STB=0.593648,0.998392;STBP=0.287,0;TYPE=del,mnp;VARB=0.180384,0.0121769;OID=.,.;OPOS=53607264,53607263;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:35:37:9:9:18,4:21,7:0.567568,0.189189:2,4:16,0:8:1:2,7:19,0:7:2 chr12 53647373 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.467;QD=58.142;RBI=0.0183739;REFB=0;REVB=0.0156219;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34444e-05;OID=.;OPOS=53647373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr12 53662624 . C A 550.07 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0352217;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.933;QD=57.9016;RBI=0.0354497;REFB=0.0616169;REVB=0.00401415;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-0.000215563;OID=.;OPOS=53662624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:18:19:1:0:18:19:1:0 chr12 53670545 . C A 1744.27 PASS AF=0.991525;AO=113;DP=114;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0130167;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=75.4377;QD=59.1278;RBI=0.0462369;REFB=-0.0989101;REVB=0.0443668;RO=1;SAF=61;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0090437;STB=0.504424;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00185873;OID=.;OPOS=53670545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:114:118:1:1:113:117:0.991525:52:61:0:1:56:61:0:1 chr12 53681883 . A T 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.047;QD=57.6795;RBI=0.0143802;REFB=0;REVB=0.0143429;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118016;OID=.;OPOS=53681883;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr12 53682326 . G A 1889.86 PASS AF=0.948148;AO=128;DP=135;FAO=128;FDP=135;FR=.;FRO=7;FSAF=78;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.034743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0868;QD=55.9959;RBI=0.108336;REFB=-0.235561;REVB=0.102614;RO=7;SAF=79;SAR=49;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034195;STB=0.509802;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0123324;OID=.;OPOS=53682326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:135:135:7:7:128:128:0.948148:49:79:2:5:50:78:3:4 chr12 53686703 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1971;QD=56.706;RBI=0.100385;REFB=0;REVB=0.0757714;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00289547;OID=.;OPOS=53686703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr12 53693532 . AA GC 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322646;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=131.928;QD=33.4285;RBI=0.0465325;REFB=0;REVB=-0.0335301;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-4.8965e-05;OID=.;OPOS=53693532;OREF=AA;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr12 53700848 . C T 1066.14 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0186931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8706;QD=58.4185;RBI=0.02706;REFB=-0.0762326;REVB=0.0195655;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0011857;OID=.;OPOS=53700848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:0:1:72:72:0.986301:35:37:0:0:35:37:0:1 chr12 53700860 . A G 1285.63 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146059;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.77;QD=61.9579;RBI=0.0149624;REFB=0;REVB=0.00324652;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397941;OID=.;OPOS=53700860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:43:40:0:0:43:40:0:0 chr12 53703021 . G A 753.2 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0463881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1518;QD=61.4855;RBI=0.0537888;REFB=0.043284;REVB=0.0272282;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.51219;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.000443973;OID=.;OPOS=53703021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:28:20:1:0:28:20:1:0 chr12 53722098 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.123;QD=53.2768;RBI=0.0302006;REFB=0;REVB=-0.0266253;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.07215e-05;OID=.;OPOS=53722098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr12 53722128 . G A 211.23 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11695;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0486;QD=49.7012;RBI=0.12152;REFB=0;REVB=0.033012;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00379145;OID=.;OPOS=53722128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0 chr12 53722629 . TG T 174.39 PASS AF=0.941176;AO=14;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.2289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.7381;QD=41.0336;RBI=0.249316;REFB=-0.00997359;REVB=0.0988094;RO=2;SAF=12;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.610169;SSEP=0;SSSB=-0.069999;STB=0.518496;STBP=0.638;TYPE=del;VARB=0.0259068;OID=.;OPOS=53722630;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.941176:14:17:16:17:1:13:3:1:0:4:2:12:2:2:0 chr12 54067544 . A G 82.49 PASS AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0497269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.563;QD=32.9947;RBI=0.0545897;REFB=-0.153484;REVB=-0.0225228;RO=1;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524171;STB=0.529348;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0186825;OID=.;OPOS=54067544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:0.9:8:1:0:1:8:1:0:1 chr12 54105074 . T C 543.12 PASS AF=0.449612;AO=58;DP=129;FAO=58;FDP=129;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0131255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.363;QD=16.8408;RBI=0.0131497;REFB=-0.0239904;REVB=-0.0007977;RO=71;SAF=19;SAR=39;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212901;STB=0.619005;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0167735;OID=.;OPOS=54105074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:71:71:58:58:0.449612:39:19:38:33:39:19:38:33 chr12 54109659 . C T 692.03 PASS AF=0.519084;AO=68;DP=131;FAO=68;FDP=131;FR=.;FRO=63;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=17;FWDB=0.0857386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0793;QD=21.1306;RBI=0.113889;REFB=0.00288732;REVB=0.0749641;RO=63;SAF=39;SAR=29;SRF=46;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143895;STB=0.578752;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00120446;OID=.;OPOS=54109659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:63:63:68:68:0.519084:29:39:46:17:29:39:46:17 chr12 54109733 . A G 1136.88 PASS AF=0.594286;AO=104;DP=175;FAO=104;FDP=175;FR=.;FRO=71;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=-0.00920398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1062;QD=25.9858;RBI=0.0334184;REFB=-0.0486186;REVB=-0.032126;RO=71;SAF=58;SAR=46;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257681;STB=0.513964;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0290865;OID=.;OPOS=54109733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:71:71:104:104:0.594286:46:58:42:29:46:58:42:29 chr12 54110197 . A G 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.000297624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.244;QD=11.0198;RBI=0.0354463;REFB=-0.00920559;REVB=-0.0354451;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264432;STB=0.66603;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.00782678;OID=.;OPOS=54110197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:5:3:1:5:5:3 chr12 54340077 . G A 1358.62 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.831;QD=62.4654;RBI=0.0188885;REFB=0;REVB=-0.00942834;RO=0;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.42865e-05;OID=.;OPOS=54340077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:40:47:0:0:40:47:0:0 chr12 54340204 . CTTTTTTA CTTTTT,CTTTTTA,CTTTTTAA 68.23 PASS AF=0.171717,0,0;AO=19,14,6;DP=110;FAO=17,0,0;FDP=99;FR=.;FRO=82;FSAF=14,0,0;FSAR=3,0,0;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=-0.042875,-0.134002,-0.09769;FXX=0.009999;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=23.8102,11.7888,20.6054;QD=2.75659;RBI=0.044913,0.137536,0.0992368;REFB=-0.0291443,-0.0363227,-0.00827074;REVB=-0.0133759,-0.0309777,-0.0174527;RO=60;SAF=15,9,6;SAR=4,5,0;SRF=27;SRR=33;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.431893,0.239578,0.611976;STB=0.795088,0.5,0.5;STBP=0.01,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.14873,0,0;OID=.,.,.;OPOS=54340210,54340205,54340210;OREF=TA,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=CTTTTT,CTTTTTA,CTTTTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.171717,0,0:19,14,6:110:17,0,0:99:82:14,0,0:3,0,0:40:42:68:60:15,9,6:4,5,0:27:33 chr12 54367061 . T G 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.205;QD=58.9627;RBI=0.0235994;REFB=0;REVB=0.0193967;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70791e-05;OID=.;OPOS=54367061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr12 54369667 . T TGCCCCACTACTTTAGGG,TGCCCCACTACTTTAGGGG,TTAGGGG 156.24 PASS AF=0.0526316,0.684211,0;AO=4,6,3;DP=28;FAO=1,13,0;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=0,1,0;FSAR=1,12,0;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0512259,0.0479054,-0.0394763;FXX=0.269127;HRUN=1,1,2;LEN=17,18,6;MLLD=443.527,451.505,198.436;QD=32.8918;RBI=0.0552096,0.0520977,0.0428243;REFB=-0.0234003,-0.0208415,-0.0119945;REVB=0.0205915,0.0204754,0.0165994;RO=7;SAF=0,0,3;SAR=4,6,0;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0.812474;STB=0.5,0.586092,0.5;STBP=1,0.641,1;TYPE=ins,ins,ins;VARB=-0.00208788,0.0174637,0;OID=.,.,.;OPOS=54369668,54369668,54369668;OREF=-,-,-;OALT=GCCCCACTACTTTAGGG,GCCCCACTACTTTAGGGG,TAGGGG;OMAPALT=TGCCCCACTACTTTAGGG,TGCCCCACTACTTTAGGGG,TTAGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0526316,0.684211,0:4,6,3:28:1,13,0:19:5:0,1,0:1,12,0:0:5:36:7:0,0,3:4,6,0:0:7 chr12 54369911 . CTTTT CTTTC,CT,CTT,CTTT 241.26 PASS AF=0.189189,0.810811,0,0;AO=2,7,10,5;DP=38;FAO=7,30,0,0;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,23,0,0;FSAR=7,7,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446015,0.351914,0.52374,1.00501;FXX=0.0975372;HRUN=16,16,16,16;LEN=1,3,2,1;MLLD=128.696,7.22338,5.42763,2.69089;QD=26.0821;RBI=0.184568,0.55746,0.826859,1.56028;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.179098,-0.432339,-0.639837,-1.19349;RO=2;SAF=0,5,10,5;SAR=2,2,0,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.727176,-0.145918,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=0.0606271,0.0162076,0.128454,0;OID=.,.,.,.;OPOS=54369915,54369912,54369912,54369912;OREF=T,TTT,TT,T;OALT=C,-,-,-;OMAPALT=CTTTC,CT,CTT,CTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.189189,0.810811,0,0:2,7,10,5:38:7,30,0,0:37:0:0,23,0,0:7,7,0,0:0:0:33:2:0,5,10,5:2,2,0,0:2:0 chr12 54385599 . C T 206.15 PASS AF=0.396825;AO=24;DP=62;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0295037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.486;QD=13.0889;RBI=0.0297133;REFB=-0.0116731;REVB=-0.00352248;RO=38;SAF=2;SAR=22;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490592;STB=0.730245;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0136422;OID=.;OPOS=54385599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:38:38:24:25:0.396825:22:2:14:24:22:3:14:24 chr12 54406292 . G A 180.42 PASS AF=0.307692;AO=24;DP=78;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=51;FWDB=0.0256532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5242;QD=9.25223;RBI=0.0306845;REFB=-0.0212086;REVB=-0.0168361;RO=54;SAF=3;SAR=21;SRF=3;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230639;STB=0.631493;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.025524;OID=.;OPOS=54406292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:54:54:24:24:0.307692:21:3:3:51:21:3:3:51 chr12 54496166 . G T 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.755;QD=61.3362;RBI=0.0514808;REFB=0;REVB=-0.0240139;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226921;OID=.;OPOS=54496166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0 chr12 54496219 . A G 155.85 PASS AF=0.53125;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0162016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.796;QD=19.4813;RBI=0.0356576;REFB=0.0028392;REVB=-0.0317643;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213749;STB=0.606184;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00138338;OID=.;OPOS=54496219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:16:17:0.53125:7:9:12:3:7:10:12:3 chr12 54767812 . G A 271.14 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0452405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.563;QD=19.3673;RBI=0.0467557;REFB=0.00010431;REVB=0.0118065;RO=27;SAF=22;SAR=7;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101626;STB=0.556921;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.000182645;OID=.;OPOS=54767812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:7:22:18:9:7:22:18:9 chr12 54792388 . TCTTTTTG GTCTTTTG,TCTTTT,TCTTTTG 38.78 PASS AF=0.05,0,0.175;AO=2,6,6;DP=40;FAO=2,0,7;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=0,0,3;FSAR=2,0,4;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0488242,-0.173407,-0.0725803;FXX=0;HRUN=1,5,5;LEN=3,2,1;MLLD=142.815,25.7519,13.7216;QD=3.8782;RBI=0.132341,0.217306,0.154332;REFB=-0.0127957,-0.023852,-0.112208;REVB=-0.123006,-0.130966,-0.1362;RO=24;SAF=0,5,5;SAR=2,1,1;SRF=13;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.505776,0.385824,0.385824;STB=0.996084,0.5,0.671079;STBP=0.072,1,0.351;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.0932324,0.084363,0.195658;OID=.,.,.;OPOS=54792388,54792394,54792390;OREF=TCT,TG,T;OALT=GTC,-,-;OMAPALT=GTCTTTTG,TCTTTT,TCTTTTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:27:40:40:24:31:2,6,6:2,0,7:0.05,0,0.175:2,1,1:0,5,5:13:11:2,0,4:0,0,3:20:11 chr12 54799450 . A G 368.82 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00211511;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.796;QD=52.688;RBI=0.00866086;REFB=0.0249237;REVB=-0.00839862;RO=1;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299926;STB=0.516117;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.0027067;OID=.;OPOS=54799450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:29:28:1:1:27:27:0.964286:15:12:0:1:15:12:0:1 chr12 54905815 . C G 1039.86 PASS AF=0.986301;AO=69;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0476907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.672;QD=56.9787;RBI=0.0491825;REFB=-0.0631724;REVB=0.0120211;RO=1;SAF=38;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122785;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000581889;OID=.;OPOS=54905815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:69:72:0.986301:31:38:1:0:32:40:1:0 chr12 54970454 . T C 405.84 PASS AF=0.441176;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.01341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.121;QD=15.9151;RBI=0.0312676;REFB=-0.0359374;REVB=-0.0282459;RO=54;SAF=19;SAR=26;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109832;STB=0.562103;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0399667;OID=.;OPOS=54970454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:54:57:45:45:0.441176:26:19:17:37:26:19:18:39 chr12 54972992 . T C 249.23 PASS AF=0.575;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.00673412;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5092;QD=24.9232;RBI=0.0301508;REFB=-0.008204;REVB=-0.0293892;RO=16;SAF=2;SAR=21;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812078;STB=0.538426;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00504563;OID=.;OPOS=54972992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:16:17:23:23:0.575:21:2:2:14:21:2:2:15 chr12 54973623 . T C 1006.17 PASS AF=1;AO=68;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.146;QD=57.4954;RBI=0.0248519;REFB=-0.0712958;REVB=-0.0136392;RO=1;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113897;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000787365;OID=.;OPOS=54973623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:70:70:1:0:68:70:1:41:27:0:1:42:28:0:0 chr12 54975837 . T C 1752.26 PASS AF=0.991736;AO=117;DP=120;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0772225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2917;QD=57.9259;RBI=0.0866637;REFB=-0.186844;REVB=-0.0393355;RO=3;SAF=47;SAR=70;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293473;STB=0.50495;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00733964;OID=.;OPOS=54975837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:120:121:3:1:117:120:0.991736:70:47:3:0:70:50:1:0 chr12 55248357 . G T 480.03 PASS AF=0.464286;AO=51;DP=112;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0453425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.943;QD=17.1441;RBI=0.0466333;REFB=-0.0042275;REVB=-0.010896;RO=60;SAF=25;SAR=26;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714976;STB=0.544626;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00483553;OID=.;OPOS=55248357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:60:60:51:52:0.464286:26:25:25:35:26:26:25:35 chr12 55250612 . A G 1438.4 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00776204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.853;QD=61.8665;RBI=0.00994611;REFB=-0.0414107;REVB=0.00621899;RO=1;SAF=44;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106524;STB=0.505617;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00121203;OID=.;OPOS=55250612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:48:44:1:0:48:44:1:0 chr12 55344024 . G A 1606.03 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8286;QD=64.2413;RBI=0.0946609;REFB=0;REVB=0.0919279;RO=0;SAF=66;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046643;OID=.;OPOS=55344024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:34:66:0:0:34:66:0:0 chr12 55344133 . C G 2178.69 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.556;QD=63.1505;RBI=0.0169585;REFB=0;REVB=-0.00519838;RO=0;SAF=76;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.99367e-06;OID=.;OPOS=55344133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:62:76:0:0:62:76:0:0 chr12 55355033 . C T 942.02 PASS AF=0.558282;AO=90;DP=162;FAO=91;FDP=163;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.00666526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4846;QD=23.1169;RBI=0.0150599;REFB=0.0166627;REVB=0.0135047;RO=72;SAF=32;SAR=58;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769902;STB=0.538255;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.0127494;OID=.;OPOS=55355033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:72:72:90:91:0.558282:58:32:32:40:58:33:32:40 chr12 55368245 . G A 1119.81 PASS AF=0.504505;AO=112;DP=222;FAO=112;FDP=222;FR=.;FRO=110;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=62;FSRR=48;FWDB=0.0119841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.224;QD=20.1768;RBI=0.0132788;REFB=-0.00769756;REVB=-0.00571903;RO=110;SAF=57;SAR=55;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494832;STB=0.527138;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00639161;OID=.;OPOS=55368245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:110:110:112:112:0.504505:55:57:62:48:55:57:62:48 chr12 55688267 . G A 1211.19 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102597;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9867;QD=61.3259;RBI=0.0152677;REFB=0;REVB=0.0113068;RO=0;SAF=23;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.71135e-05;OID=.;OPOS=55688267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:56:23:0:0:56:23:0:0 chr12 55714772 . G A 557.07 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.835;QD=60.2238;RBI=0.00484754;REFB=0;REVB=0.000867124;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19394e-05;OID=.;OPOS=55714772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0 chr12 55714876 . C G 1171.96 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8278;QD=60.8808;RBI=0.0052768;REFB=0;REVB=0.00125639;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30726e-05;OID=.;OPOS=55714876;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0 chr12 55715119 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.39;QD=56.9382;RBI=0.0519591;REFB=0;REVB=0.0083251;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166606;OID=.;OPOS=55715119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr12 55794976 . A G 898.42 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122631;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.582;QD=56.1513;RBI=0.0196812;REFB=0;REVB=0.0153937;RO=1;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145261;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66217e-05;OID=.;OPOS=55794976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:64:64:1:0:62:64:1:32:30:0:1:34:30:0:0 chr12 55806238 . A G 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.958;QD=61.0492;RBI=0.0162684;REFB=0;REVB=0.0143428;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26963e-05;OID=.;OPOS=55806238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:40:38:0:0:40:38:0:0 chr12 55807293 . A G 133.08 PASS AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0115216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.087;QD=35.4879;RBI=0.017245;REFB=-0.124644;REVB=0.0128313;RO=2;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029065;STB=0.516104;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00796114;OID=.;OPOS=55807293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:8:5:1:1:8:5:1:1 chr12 55807356 . G A 213.51 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0124411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.633;QD=16.1141;RBI=0.0220549;REFB=-0.0244483;REVB=0.0182109;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1503;STB=0.584837;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0206117;OID=.;OPOS=55807356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:10:19:12:12:10:19 chr12 55808469 . C G 1580.55 PASS AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160166;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.467;QD=59.0861;RBI=0.062343;REFB=-0.0269235;REVB=-0.0602505;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000469651;OID=.;OPOS=55808469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:107:0:1:106:106:0.990654:55:51:0:0:55:51:0:1 chr12 55820121 . C T 1643.16 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379691;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.793;QD=60.2995;RBI=0.0468535;REFB=0;REVB=-0.0274516;RO=0;SAF=51;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000736119;OID=.;OPOS=55820121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:58:51:0:0:58:51:0:0 chr12 55863224 . C G 1813.94 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5061;QD=60.9729;RBI=0.0491515;REFB=0;REVB=-0.0145582;RO=0;SAF=40;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122775;OID=.;OPOS=55863224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:78:40:0:0:79:40:0:0 chr12 55863381 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8432;QD=50.412;RBI=0.0801819;REFB=0;REVB=-0.0691394;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000639837;OID=.;OPOS=55863381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0 chr12 55886294 . G A 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.89;QD=58.1418;RBI=0.0022999;REFB=0;REVB=-0.00172449;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69693e-05;OID=.;OPOS=55886294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0 chr12 55886486 . G GA 405.13 PASS AF=1;AO=6;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348122;FXX=0.0476077;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.848;QD=40.513;RBI=0.058666;REFB=0;REVB=-0.0472209;RO=35;SAF=3;SAR=3;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849288;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000315271;OID=.;OPOS=55886487;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:42:40:40:0:22:18:0:0:8:35:3:3:20:15 chr12 55886489 . T A 468.98 PASS AF=0.833333;AO=34;DP=42;FAO=35;FDP=42;FR=.;FRO=7;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0354948;FXX=0.0232504;HRUN=6;LEN=1;MLLD=51.7269;QD=44.6647;RBI=0.0978883;REFB=-0.0947442;REVB=0.0912263;RO=7;SAF=18;SAR=16;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133665;STB=0.504798;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0225188;OID=.;OPOS=55886489;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:42:42:7:7:34:35:0.833333:16:18:4:3:16:19:4:3 chr12 55945119 . A G 683.44 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394809;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.273;QD=56.9535;RBI=0.0429875;REFB=0;REVB=0.0170052;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00413505;OID=.;OPOS=55945119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:19:27:0:0:19:29:0:0 chr12 56031611 . A G 177.44 PASS AF=1;AO=14;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9327;QD=44.3587;RBI=0.0720863;REFB=0;REVB=-0.0140516;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0188044;OID=.;OPOS=56031611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:16:0:0:14:16:1:9:5:0:0:9:7:0:0 chr12 56089357 . C T 1029.9 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.071696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.936;QD=58.0226;RBI=0.0722501;REFB=-0.105696;REVB=0.00893071;RO=1;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108697;STB=0.505745;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000551197;OID=.;OPOS=56089357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:43:27:0:1:43:27:0:1 chr12 56236531 . A G 1746.44 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.397;QD=60.7456;RBI=0.0592927;REFB=0;REVB=0.0465012;RO=0;SAF=79;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197048;OID=.;OPOS=56236531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:112:115:0:0:112:115:1:33:79:0:0:33:82:0:0 chr12 56295734 . A G 88.33 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.072;QD=39.257;RBI=0.0354971;REFB=0;REVB=0.0276395;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793911;OID=.;OPOS=56295734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:5:3:0:0:6:3:0:0 chr12 56330572 . G A 1557.78 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0278809;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.849;QD=58.7843;RBI=0.0684829;REFB=-0.0645928;REVB=0.0625505;RO=1;SAF=33;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0065464;STB=0.503448;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00106013;OID=.;OPOS=56330572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:106:1:1:105:105:0.990566:72:33:0:1:72:33:0:1 chr12 56335107 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.907;QD=58.5878;RBI=0.0211084;REFB=0;REVB=0.0140175;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66735e-05;OID=.;OPOS=56335107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr12 56348028 . G A 329.92 PASS AF=0.928571;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0327546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9479;QD=47.131;RBI=0.0327667;REFB=-0.101304;REVB=-0.000891071;RO=2;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09246;STB=0.549961;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00533411;OID=.;OPOS=56348028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:27:28:2:2:25:26:0.928571:9:16:0:2:9:17:0:2 chr12 56351346 . G A 445.81 PASS AF=0.617647;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0154475;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.772;QD=26.2242;RBI=0.0182968;REFB=-0.0150778;REVB=-0.00980537;RO=25;SAF=13;SAR=29;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184287;STB=0.594938;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0100825;OID=.;OPOS=56351346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:25:26:42:42:0.617647:29:13:14:11:29:13:14:12 chr12 56351843 . G A 213.05 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.102801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.7821;QD=16.0793;RBI=0.105564;REFB=0.014517;REVB=0.0239953;RO=28;SAF=7;SAR=17;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725634;STB=0.534167;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.0107963;OID=.;OPOS=56351843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:17:7:10:18:17:7:10:19 chr12 56388479 . A G 89.01 PASS AF=0.116883;AO=28;DP=240;FAO=27;FDP=231;FR=.,HEALED;FRO=204;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=76;FSRR=128;FWDB=-0.0785002;FXX=0.0374984;HRUN=7;LEN=1;MLLD=30.1887;QD=1.54135;RBI=0.117298;REFB=-0.0283738;REVB=-0.0871585;RO=147;SAF=19;SAR=9;SRF=44;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458792;STB=0.744401;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.209201;OID=.;OPOS=56388479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:240:231:147:204:28:27:0.116883:9:19:44:103:9:18:76:128 chr12 56398454 . G C 994.69 PASS AF=1;AO=68;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2225;QD=56.8393;RBI=0.0367147;REFB=-0.0843094;REVB=0.0285092;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129488;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117244;OID=.;OPOS=56398454;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:70:70:1:0:68:70:1:36:32:0:1:38:32:0:0 chr12 56435929 . C G 374.72 PASS AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0529173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3462;QD=49.9621;RBI=0.0592061;REFB=0.0204755;REVB=-0.026554;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.562453;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00080295;OID=.;OPOS=56435929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:30:0:2:28:28:0.933333:7:21:0:0:7:21:0:2 chr12 56435978 . TG T 30.3 PASS AF=0.347826;AO=3;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0606768;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.7858;QD=5.26902;RBI=0.11971;REFB=-0.0168918;REVB=0.103193;RO=12;SAF=3;SAR=0;SRF=10;SRR=2;SSEN=0.416667;SSEP=0;SSSB=0.549463;STB=0.683772;STBP=0.237;TYPE=del;VARB=0.060815;OID=.;OPOS=56435979;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.347826:3:23:8:23:15:3:5:10:5:30:12:3:0:10:2 chr12 56494991 . G A 670.02 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2112;QD=62.327;RBI=0.158452;REFB=0;REVB=0.141388;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00331738;OID=.;OPOS=56494991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr12 56647911 . G C 417.98 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0585347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9528;QD=53.9323;RBI=0.0645264;REFB=-0.0583247;REVB=0.0271541;RO=1;SAF=15;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300657;STB=0.516118;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00223005;OID=.;OPOS=56647911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:15:15:1:0:15:15:1:0 chr12 56649601 . A G 2230.26 PASS AF=1;AO=139;DP=139;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.835;QD=63.2699;RBI=0.0591661;REFB=0;REVB=0.040198;RO=0;SAF=66;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10193e-05;OID=.;OPOS=56649601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:141:0:0:139:141:1:73:66:0:0:73:68:0:0 chr12 56722060 . T G 1080.52 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00336826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.012;QD=60.0289;RBI=0.058127;REFB=0;REVB=0.0580293;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319276;OID=.;OPOS=56722060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:41:31:0:0:41:31:0:0 chr12 56755652 . C T 150.36 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0495192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.58;QD=19.4011;RBI=0.0558194;REFB=-0.0398553;REVB=0.0257614;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818777;STB=0.5465;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0166486;OID=.;OPOS=56755652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:9:7:8:7:9:7:8:7 chr12 56814653 . G A 252.12 PASS AF=0.320388;AO=33;DP=103;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0162117;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.4101;QD=9.79095;RBI=0.0179899;REFB=-0.0032196;REVB=-0.00779855;RO=70;SAF=22;SAR=11;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232159;STB=0.635678;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0074996;OID=.;OPOS=56814653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:70:70:33:33:0.320388:11:22:33:37:11:22:33:37 chr12 56815922 . C T 181.31 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0254994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.717;QD=16.4823;RBI=0.0265328;REFB=-0.011838;REVB=-0.00733263;RO=24;SAF=17;SAR=2;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486642;STB=0.780555;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0154278;OID=.;OPOS=56815922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:2:17:13:11:2:17:14:11 chr12 56818922 . C T 244.26 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0389146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.078;QD=23.2632;RBI=0.0412431;REFB=-0.0106857;REVB=0.0136619;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00371334;STB=0.502073;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00832127;OID=.;OPOS=56818922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:12:11:9:10:12:11:9:10 chr12 56822378 . T A 176.22 PASS AF=0.529412;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00296595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6961;QD=20.7317;RBI=0.0734084;REFB=-0.0184069;REVB=0.0733485;RO=16;SAF=10;SAR=7;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283242;STB=0.640877;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0146492;OID=.;OPOS=56822378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:17:18:0.529412:7:10:4:12:8:10:4:12 chr12 56825311 . C T 168.89 PASS AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00988919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.289;QD=24.127;RBI=0.0332393;REFB=0.00320974;REVB=-0.0317341;RO=11;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307576;STB=0.517221;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.00255748;OID=.;OPOS=56825311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:10:7:5:6:10:7:5:6 chr12 56827694 . C G 86.7 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0708507;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5268;QD=11.5594;RBI=0.0711359;REFB=-0.00678534;REVB=-0.00636416;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020408;STB=0.512173;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00609566;OID=.;OPOS=56827694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:31:30:19:19:11:11:0.366667:6:5:9:10:6:5:9:10 chr12 56848079 . C T 238.81 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00162873;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.686;QD=19.901;RBI=0.00495193;REFB=-0.00612193;REVB=0.00467642;RO=25;SAF=16;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175538;STB=0.599515;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00933351;OID=.;OPOS=56848079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:25:25:23:23:0.479167:7:16:13:12:7:16:13:12 chr12 56862886 . T C,G 606.05 PASS AF=0.975,0.025;AO=38,2;DP=40;FAO=39,1;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16,1;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382732,-0.0209643;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.6457,40.1987;QD=60.6054;RBI=0.00806983,0.0485169;REFB=0,0;REVB=0.00710449,-0.0437537;RO=0;SAF=15,2;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000545735,0.0763272;OID=.,.;OPOS=56862886,56862886;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:40:40:0:0:38,2:39,1:0.975,0.025:23,0:15,2:0:0:23,0:16,1:0:0 chr12 56863770 . G C 261.99 PASS AF=0.369048;AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0699248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.809;QD=12.4755;RBI=0.0699878;REFB=-0.0332699;REVB=-0.0029681;RO=52;SAF=15;SAR=16;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666714;STB=0.543534;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0653038;OID=.;OPOS=56863770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:52:53:31:31:0.369048:16:15:22:30:16:15:22:31 chr12 56865338 . A G 415.1 PASS AF=0.65;AO=37;DP=58;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.00744543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.207;QD=27.6734;RBI=0.0162078;REFB=-0.0310856;REVB=0.0143965;RO=21;SAF=21;SAR=16;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185245;STB=0.596561;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.016744;OID=.;OPOS=56865338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:21:21:37:39:0.65:16:21:6:15:17:22:6:15 chr12 56956213 . T C 195.8 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00389088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.245;QD=17.8002;RBI=0.00390404;REFB=0.00329054;REVB=0.000320321;RO=24;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136729;STB=0.577903;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=-0.00422626;OID=.;OPOS=56956213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:12:8:13:11:12:8:13:11 chr12 57106660 . A T 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00645033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.93;QD=13.0909;RBI=0.0286085;REFB=0.0110789;REVB=-0.0278718;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244114;STB=0.641996;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.0108463;OID=.;OPOS=57106660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:7:6:14:6:7:6:14:6 chr12 57108203 . A G 198.97 PASS AF=0.357143;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00130229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.022;QD=11.3698;RBI=0.00955285;REFB=-0.013909;REVB=0.00946367;RO=45;SAF=12;SAR=13;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15737;STB=0.590838;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0357786;OID=.;OPOS=57108203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:45:45:25:25:0.357143:13:12:28:17:13:12:28:17 chr12 57109792 . A G 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00429005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.196;QD=11.3693;RBI=0.0362697;REFB=-0.002723;REVB=-0.0360151;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760866;STB=0.545372;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00705766;OID=.;OPOS=57109792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:9:10:5:6:9:10 chr12 57109931 . A T 64.34 PASS AF=0.529412;AO=7;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0433505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.444;QD=15.1384;RBI=0.0772825;REFB=-0.0351209;REVB=0.063979;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439386;STB=0.639683;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0151983;OID=.;OPOS=57109931;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:7:8:7:9:0.529412:1:6:3:4:3:6:3:5 chr12 57114100 . A G 99.25 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0273783;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.964;QD=14.7037;RBI=0.0341374;REFB=-0.0299814;REVB=-0.0203911;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154012;STB=0.588097;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0335081;OID=.;OPOS=57114100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:15:12:12:0.444444:7:5:3:9:7:5:4:11 chr12 57114307 . A T 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.030056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0145;QD=13.0911;RBI=0.0366416;REFB=-0.0172301;REVB=0.0209581;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17156;STB=0.600783;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0298733;OID=.;OPOS=57114307;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:5:8:9:11:5:8:9:11 chr12 57133140 . T G 60.51 PASS AF=0.230769;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0260557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5617;QD=6.206;RBI=0.0339011;REFB=-0.00887105;REVB=-0.0216884;RO=30;SAF=4;SAR=5;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054457;STB=0.534807;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0239271;OID=.;OPOS=57133140;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:39:39:30:30:9:9:0.230769:5:4:12:18:5:4:12:18 chr12 57137828 . T A 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00760969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.219;QD=13.5804;RBI=0.0240641;REFB=-0.000904506;REVB=0.0228292;RO=28;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570636;STB=0.533294;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00178274;OID=.;OPOS=57137828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:10:7:13:15:10:7:13:15 chr12 57255195 . T C 290.51 PASS AF=0.5;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.01441;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8222;QD=18.7425;RBI=0.0601498;REFB=-0.016926;REVB=0.0583982;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115227;STB=0.564274;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0207277;OID=.;OPOS=57255195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:31:31:31:31:0.5:14:17:13:18:14:17:13:18 chr12 57430827 . T TC 51.17 PASS AF=0.196078;AO=9;DP=61;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0220192;FXX=0.149975;HRUN=0;LEN=1;MLLD=28.8707;QD=4.01308;RBI=0.0513684;REFB=-0.00131161;REVB=-0.0464097;RO=40;SAF=1;SAR=8;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590482;STB=0.909332;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=-0.136854;OID=.;OPOS=57430828;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.196078:9:61:10:51:41:1:9:26:15:51:40:1:8:24:16 chr12 57433051 . G A 284.92 PASS AF=0.375;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0321131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.271;QD=12.9508;RBI=0.0388372;REFB=-0.00227078;REVB=-0.0218421;RO=54;SAF=13;SAR=20;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156251;STB=0.584093;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00264675;OID=.;OPOS=57433051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:54:55:33:33:0.375:20:13:29:25:20:13:29:26 chr12 57487207 . AGGCT ACACT,AGCT,AGCTC,AGGCTC 432.83 PASS AF=0,0.72093,0,0.27907;AO=2,25,4,8;DP=45;FAO=0,31,0,12;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31,0,0;FSAR=0,0,0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0868936,-0.177728,-0.0593334,0.0428215;FXX=0.0444346;HRUN=2,2,2,0;LEN=2,1,3,1;MLLD=114.011,17.6208,8.49281,21.9095;QD=40.2636;RBI=0.109896,0.323648,0.206768,0.105323;REFB=0.028263,-0.10791,-0.0815747,-0.00567569;REVB=-0.0672804,-0.270482,-0.198072,-0.096225;RO=1;SAF=2,25,1,0;SAR=0,0,3,8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0.302763,0,0;SSSB=0,0,-0.272709,-0.803989;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp,ins;VARB=0.140477,-0.00311682,0.0617304,0.011028;OID=.,.,.,.;OPOS=57487208,57487208,57487209,57487212;OREF=GG,G,GCT,-;OALT=CA,-,CTC,C;OMAPALT=ACACT,AGCT,AGCTC,AGGCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/4:0,0.72093,0,0.27907:2,25,4,8:45:0,31,0,12:43:0:0,31,0,0:0,0,0,12:0:0:88:1:2,25,1,0:0,0,3,8:1:0 chr12 57489648 . C T 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6721;QD=57.1034;RBI=0.0533537;REFB=0;REVB=-0.0341178;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53863e-05;OID=.;OPOS=57489648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0 chr12 57548466 . C T 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.587;QD=57.1056;RBI=0.0293143;REFB=0;REVB=0.0179746;RO=0;SAF=19;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57596e-05;OID=.;OPOS=57548466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:36:19:0:0:36:19:0:0 chr12 57567762 . C T 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.845;QD=55.0956;RBI=0.0636219;REFB=0;REVB=0.0369244;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570582;OID=.;OPOS=57567762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr12 57588433 . G A 2711.92 PASS AF=1;AO=175;DP=177;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195012;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.045;QD=61.6346;RBI=0.0260795;REFB=0.0881515;REVB=0.017316;RO=1;SAF=77;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483273;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.97772e-07;OID=.;OPOS=57588433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:177:176:1:0:175:176:1:98:77:0:1:99:77:0:0 chr12 57589659 . C T 1249.13 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0846151;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.394;QD=61.6853;RBI=0.0906395;REFB=0;REVB=0.0324931;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346025;OID=.;OPOS=57589659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:34:47:0:0:34:47:0:0 chr12 57589784 . A C 408.44 PASS AF=1;AO=25;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9021;QD=56.3368;RBI=0.130765;REFB=0;REVB=0.00312488;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00345631;OID=.;OPOS=57589784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:25:29:1:13:12:0:0:13:16:0:0 chr12 57590797 . C T 2608.51 PASS AF=1;AO=168;DP=169;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.091;QD=61.3767;RBI=0.0612164;REFB=-0.0495009;REVB=0.0423548;RO=1;SAF=89;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598635;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172675;OID=.;OPOS=57590797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:169:170:1:0:168:170:1:79:89:0:1:81:89:0:0 chr12 57590869 . T C 2698.34 PASS AF=1;AO=174;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167245;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.718;QD=62.0308;RBI=0.0167939;REFB=0.0325507;REVB=0.00152477;RO=0;SAF=95;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15058e-06;OID=.;OPOS=57590869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:175:174:0:0:174:174:1:79:95:0:0:79:95:0:0 chr12 57619362 . G A 887.53 PASS AF=1;AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018521;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.33;QD=57.26;RBI=0.0321248;REFB=0;REVB=0.0262483;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05588e-05;OID=.;OPOS=57619362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:62:0:0:61:62:1:25:36:0:0:25:37:0:0 chr12 57627074 . G T 900.05 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739659;FXX=0.0757461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.218;QD=59.0199;RBI=0.0775113;REFB=0;REVB=0.0231744;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59798e-06;OID=.;OPOS=57627074;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:61:0:0:65:61:1:35:30:0:0:36:25:0:0 chr12 57871555 . A G 191.28 PASS AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.967;QD=47.8205;RBI=0.0549617;REFB=0;REVB=0.00735963;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186728;OID=.;OPOS=57871555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:11:2:0:0:12:4:0:0 chr12 57873498 . T G 416.37 PASS AF=0.40678;AO=47;DP=117;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.0721327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.0902;QD=14.1142;RBI=0.130867;REFB=0.00690207;REVB=-0.109193;RO=68;SAF=26;SAR=21;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117104;STB=0.579081;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.0122324;OID=.;OPOS=57873498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:68:70:47:48:0.40678:21:26:30:38:21:27:30:40 chr12 57911160 . G A 195.23 PASS AF=0.431373;AO=23;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0250022;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4772;QD=15.3119;RBI=0.0467265;REFB=-0.0191012;REVB=0.0394748;RO=28;SAF=8;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118673;STB=0.570305;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0296017;OID=.;OPOS=57911160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:28:29:23:22:0.431373:15:8:13:15:14:8:14:15 chr12 57919584 . TC CT 89.02 PASS AF=0.517241;AO=10;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=21.7596;QD=12.2793;RBI=0.16015;REFB=-0.117432;REVB=0.16015;RO=16;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.172058;OID=.;OPOS=57919584;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:16:14:10:15:0.517241:10:0:0:16:15:0:0:14 chr12 57958313 . A G 293.43 PASS AF=0.516129;AO=31;DP=61;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00173017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.676;QD=18.931;RBI=0.00881479;REFB=-0.027425;REVB=0.00864333;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163053;STB=0.517231;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0263743;OID=.;OPOS=57958313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:30:31:32:0.516129:17:14:13:17:17:15:13:17 chr12 57985204 . C T 1510.8 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.509;QD=63.6127;RBI=0.0209497;REFB=0;REVB=0.0199247;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82555e-05;OID=.;OPOS=57985204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:52:43:0:0:52:43:0:0 chr12 57994743 . T G 1525.67 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9188;QD=59.8303;RBI=0.0556376;REFB=0;REVB=-0.0496881;RO=0;SAF=40;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000413513;OID=.;OPOS=57994743;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:62:40:0:0:62:40:0:0 chr12 57995089 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.039;QD=61.3364;RBI=0.0325525;REFB=0;REVB=0.0280753;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75708e-05;OID=.;OPOS=57995089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0 chr12 58002599 . C T 774.14 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7134;QD=61.9311;RBI=0.062198;REFB=0;REVB=0.042562;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000838862;OID=.;OPOS=58002599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:19:29:0:0:20:30:0:0 chr12 58010163 . A G 1320.91 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.22;QD=62.1605;RBI=0.0123383;REFB=0;REVB=-0.00695492;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55638e-06;OID=.;OPOS=58010163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr12 58017701 . T G 688.78 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.241;QD=62.6166;RBI=0.0597492;REFB=0;REVB=-0.0487839;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.73517e-05;OID=.;OPOS=58017701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0 chr12 58019472 . T G 471.9 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0583077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6411;QD=55.5176;RBI=0.158095;REFB=0.0895792;REVB=-0.14695;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.512813;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.0267484;OID=.;OPOS=58019472;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:0:1:33:33:0.970588:14:19:0:0:14:19:1:0 chr12 58119044 . TG CT,T 310.15 PASS AF=0,0.975;AO=2,30;DP=40;FAO=0,39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=0,8;FSAR=0,31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000695058,-0.021641;FXX=0.0243843;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=80.0546,10.8807;QD=31.0154;RBI=0.00826057,0.162924;REFB=0.0211072,-0.0460184;REVB=-0.00823128,0.161481;RO=4;SAF=0,6;SAR=2,24;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.569412,-0.0168585;STB=0.5,0.507932;STBP=1,0.638;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0184771;OID=.,.;OPOS=58119044,58119045;OREF=TG,G;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:6:40:40:4:1:2,30:0,39:0,0.975:2,24:0,6:1:3:0,31:0,8:0:1 chr12 58174306 . T C 156.61 PASS AF=0.350877;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0077626;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.355;QD=10.9904;RBI=0.0095542;REFB=-0.000209799;REVB=-0.00556999;RO=36;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339989;STB=0.703698;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.000829072;OID=.;OPOS=58174306;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:36:37:20:20:0.350877:7:13:12:24:7:13:12:25 chr12 58176614 . T C 177.44 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0234085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2829;QD=21.5081;RBI=0.0496674;REFB=0.0344795;REVB=-0.0438052;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118771;STB=0.566935;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.0352506;OID=.;OPOS=58176614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:7:11:7:8:7:11:7:8 chr12 58177437 . C T 63.44 PASS AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.106237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.073;QD=23.0708;RBI=0.106384;REFB=0.0276375;REVB=0.00559976;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185472;STB=0.608384;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.000432358;OID=.;OPOS=58177437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:7:1:1:2:7:1:1:2 chr12 58197324 . G C 227.09 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0455317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6548;QD=21.1247;RBI=0.0460031;REFB=-0.000994171;REVB=0.00656875;RO=21;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181635;STB=0.602013;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.000242887;OID=.;OPOS=58197324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:13:9:13:8:13:9:13:8 chr12 58204283 . T C 1467.48 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0922145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.1374;QD=63.1173;RBI=0.0924055;REFB=0;REVB=0.00593785;RO=0;SAF=54;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.96098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200136;OID=.;OPOS=58204283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:39:54:0:0:39:54:0:0 chr12 58207989 . C T 328.0 PASS AF=0.651163;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0135168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.292;QD=30.5114;RBI=0.0208068;REFB=-0.00858899;REVB=-0.0158183;RO=15;SAF=15;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00152024;STB=0.500834;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00561994;OID=.;OPOS=58207989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:15:15:28:28:0.651163:13:15:8:7:13:15:8:7 chr12 58220816 . A G 31.41 PASS AF=0.101449;AO=7;DP=69;FAO=7;FDP=69;FR=.;FRO=62;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.0388147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.677;QD=1.82109;RBI=0.0410775;REFB=0.00815055;REVB=0.0134454;RO=61;SAF=2;SAR=5;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358081;STB=0.764003;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.0263167;OID=.;OPOS=58220816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:61:62:7:7:0.101449:5:2:37:24:5:2:37:25 chr12 58220823 . C T 31.0 PASS AF=0.1;AO=7;DP=70;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.000100736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.971;QD=1.77149;RBI=0.0142935;REFB=0.0010609;REVB=-0.0142932;RO=63;SAF=2;SAR=5;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320992;STB=0.747354;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.0286313;OID=.;OPOS=58220823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:70:70:63:63:7:7:0.1:5:2:36:27:5:2:36:27 chr12 58335626 . A T 540.11 PASS AF=0.504505;AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00673267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.764;QD=19.4634;RBI=0.0110385;REFB=-0.0294097;REVB=0.00874753;RO=55;SAF=30;SAR=26;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727775;STB=0.540179;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0305353;OID=.;OPOS=58335626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:55:55:56:56:0.504505:26:30:25:30:26:30:25:30 chr12 58350631 . C T 466.39 PASS AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.0327432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4677;QD=19.8464;RBI=0.0393645;REFB=-0.0141686;REVB=-0.0218507;RO=48;SAF=29;SAR=17;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270572;STB=0.649981;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0108285;OID=.;OPOS=58350631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:17:29:16:32:17:29:16:32 chr12 59279660 . A T 89.46 PASS AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0181743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.599;QD=7.30282;RBI=0.0191898;REFB=0.00658728;REVB=-0.00615989;RO=36;SAF=1;SAR=11;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508819;STB=0.8414;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0373263;OID=.;OPOS=59279660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:49:49:36:37:12:12:0.244898:11:1:14:22:11:1:15:22 chr12 59284551 . G T 283.86 PASS AF=0.330357;AO=37;DP=112;FAO=37;FDP=112;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.00224719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.653;QD=10.1379;RBI=0.0150529;REFB=-0.00852519;REVB=-0.0148842;RO=74;SAF=13;SAR=24;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169507;STB=0.506326;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0184443;OID=.;OPOS=59284551;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:74:75:37:37:0.330357:24:13:27:47:24:13:27:48 chr12 60169111 . ATTTTTTG ATTTTGTC,ATTTTGTT,ATTTTTG,ATTTTTGT 826.42 PASS AF=0,0.00917431,0.688073,0.302752;AO=4,6,16,4;DP=113;FAO=0,1,75,33;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,22,33;FSAR=0,0,53,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0660784,-0.0807764,-0.526581,-0.0450609;FXX=0.0353951;HRUN=6,6,6,6;LEN=3,3,1,2;MLLD=138.374,145.945,9.48281,155.751;QD=30.3274;RBI=0.144249,0.145244,1.21923,0.110631;REFB=0.03016,-0.00262024,0.0712713,-0.0124253;REVB=0.128224,0.120711,1.09965,0.101038;RO=44;SAF=4,6,14,4;SAR=0,0,2,0;SRF=2;SRR=42;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0.44898,0;SSSB=0.843073,0.859294,0.799098,0.843073;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,mnp,del,mnp;VARB=0,0.0487717,0.0593683,-0.0437039;OID=.,.,.,.;OPOS=60169116,60169116,60169112,60169117;OREF=TTG,TTG,T,TG;OALT=GTC,GTT,-,GT;OMAPALT=ATTTTGTC,ATTTTGTT,ATTTTTG,ATTTTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/4:0,0.00917431,0.688073,0.302752:4,6,16,4:113:0,1,75,33:109:0:0,1,22,33:0,0,53,0:0:0:99:44:4,6,14,4:0,0,2,0:2:42 chr12 62114671 . T C 266.16 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00626947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9369;QD=21.293;RBI=0.0461021;REFB=0.027079;REVB=0.0456738;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715684;STB=0.540161;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.0254714;OID=.;OPOS=62114671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:11:14:12:13:11:14:12:13 chr12 62778065 . A G 1072.19 PASS AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0135955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2934;QD=57.1837;RBI=0.0145128;REFB=0.117247;REVB=0.00507765;RO=2;SAF=48;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193011;STB=0.510201;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=-0.00309679;OID=.;OPOS=62778065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:25:48:2:0:25:48:2:0 chr12 62810961 . AG A,AA 1601.59 PASS AF=0.724771,0.275229;AO=42,61;DP=103;FAO=79,30;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=37,16;FSAR=42,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137016,-0.0128779;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=287.516,285.681;QD=58.7738;RBI=0.0139518,0.0130205;REFB=0,0;REVB=0.0026301,-0.001922;RO=0;SAF=20,28;SAR=22,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0139166,0.0175642;OID=.,.;OPOS=62810962,62810962;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.724771,0.275229:42,61:103:79,30:109:0:37,16:42,14:0:0:54:0:20,28:22,33:0:0 chr12 62894636 . T A 867.26 PASS AF=0.463918;AO=84;DP=188;FAO=90;FDP=194;FR=.;FRO=104;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=0.0219571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.6;QD=17.8817;RBI=0.0229239;REFB=-0.0297591;REVB=0.00658723;RO=103;SAF=40;SAR=44;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391521;STB=0.536834;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0370992;OID=.;OPOS=62894636;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:194:103:104:84:90:0.463918:44:40:45:58:44:46:46:58 chr12 62926398 . G A 148.14 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.00100475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.91;QD=17.9561;RBI=0.014036;REFB=-0.0104005;REVB=-0.014;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079858;STB=0.545399;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00942576;OID=.;OPOS=62926398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:5:12:10:6:5:12 chr12 62928633 . G A 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0102407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.4;QD=15.6456;RBI=0.010252;REFB=-0.0216497;REVB=0.000482949;RO=29;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130599;STB=0.574401;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0235503;OID=.;OPOS=62928633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:12:10:17:12:12:10:17:12 chr12 62986620 . G A 423.73 PASS AF=0.385827;AO=46;DP=126;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0461187;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.408;QD=13.3458;RBI=0.04613;REFB=-0.0209868;REVB=0.00102205;RO=80;SAF=25;SAR=21;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899204;STB=0.56754;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0401272;OID=.;OPOS=62986620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:80:78:46:49:0.385827:21:25:37:43:21:28:36:42 chr12 62990871 . C A 248.26 PASS AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0171418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.72;QD=16.2791;RBI=0.0183889;REFB=-0.00452416;REVB=-0.00665647;RO=33;SAF=19;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166943;STB=0.594423;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00599393;OID=.;OPOS=62990871;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:9:19:17:16:9:19:17:16 chr12 63359168 . G A 1769.97 PASS AF=0.991525;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00363239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.6;QD=59.999;RBI=0.0169786;REFB=-0.136377;REVB=0.0165855;RO=0;SAF=61;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000330473;OID=.;OPOS=63359168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:118:0:1:117:117:0.991525:56:61:0:0:56:61:0:1 chr12 63359409 . C A 817.71 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.374;QD=57.3833;RBI=0.066449;REFB=0;REVB=-0.0650104;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197969;OID=.;OPOS=63359409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr12 63359549 . ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC,ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT 409.08 PASS AF=1,0;AO=24,3;DP=29;FAO=30,0;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636613,0.06211;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=6,5;MLLD=262.947,238.74;QD=54.5444;RBI=0.0857726,0.0814002;REFB=0,0;REVB=0.0574819,0.0526151;RO=0;SAF=14,0;SAR=10,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000303255,0;OID=.,.;OPOS=63359550,63359576;OREF=CTGCTG,GCTGC;OALT=-,-;OMAPALT=ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC,ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:24,3:29:30,0:30:0:16,0:14,0:0:0:4:0:14,0:10,3:0:0 chr12 63544209 . A G 424.69 PASS AF=0.373134;AO=50;DP=134;FAO=50;FDP=134;FR=.;FRO=84;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=-0.0367945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.2025;QD=12.6774;RBI=0.0374049;REFB=-0.02059;REVB=-0.00672982;RO=84;SAF=18;SAR=32;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387387;STB=0.522064;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.029452;OID=.;OPOS=63544209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:84:84:50:50:0.373134:32:18:33:51:32:18:33:51 chr12 64062023 . A C 740.32 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00371191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.807;QD=56.9479;RBI=0.00439032;REFB=0;REVB=0.00234449;RO=0;SAF=14;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.48822e-06;OID=.;OPOS=64062023;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:38:14:0:0:38:14:0:0 chr12 64062052 . G A 940.69 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510591;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.052;QD=58.7933;RBI=0.0103099;REFB=0;REVB=-0.00895678;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2642e-05;OID=.;OPOS=64062052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr12 64062065 . T C 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.205;QD=57.8844;RBI=0.0174407;REFB=0;REVB=-0.00842048;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.35947e-05;OID=.;OPOS=64062065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:26:34:0:0:26:34:0:0 chr12 64472803 . A T 1840.76 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7197;QD=61.3587;RBI=0.0314296;REFB=0;REVB=0.0171349;RO=0;SAF=68;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024289;OID=.;OPOS=64472803;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:52:68:0:0:52:68:0:0 chr12 64519806 . T C 512.43 PASS AF=0.490909;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-7.85893e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.539;QD=18.6338;RBI=0.0150804;REFB=-0.00628927;REVB=-0.0150804;RO=56;SAF=37;SAR=17;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229604;STB=0.627513;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00578743;OID=.;OPOS=64519806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:56:54:54:0.490909:17:37:25:31:17:37:25:31 chr12 64587633 . C A 693.12 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00525225;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.648;QD=63.0108;RBI=0.010153;REFB=0;REVB=-0.00868898;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33844e-05;OID=.;OPOS=64587633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:17:26:0:0:18:26:0:0 chr12 64609562 . C T 886.28 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026908;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.55;QD=58.1166;RBI=0.0321877;REFB=0;REVB=0.0176638;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231334;OID=.;OPOS=64609562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0 chr12 64669090 . C A 3001.06 PASS AF=0.994764;AO=190;DP=191;FAO=190;FDP=191;FR=.;FRO=1;FSAF=118;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0462908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9709;QD=62.8494;RBI=0.0983094;REFB=0.0724561;REVB=-0.0867289;RO=1;SAF=118;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0040187;STB=0.502109;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.000863145;OID=.;OPOS=64669090;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:191:191:1:1:190:190:0.994764:72:118:1:0:72:118:1:0 chr12 64712511 . A G 715.87 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171331;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.739;QD=57.2699;RBI=0.0249444;REFB=0;REVB=0.0181295;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000176332;OID=.;OPOS=64712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0 chr12 64712546 . A AGTT 596.61 PASS AF=0.901961;AO=46;DP=53;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0210661;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=3;MLLD=200.208;QD=46.7931;RBI=0.0550527;REFB=-0.0471725;REVB=0.0508627;RO=7;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098776;STB=0.533717;STBP=0.136;TYPE=ins;VARB=0.00380105;OID=.;OPOS=64712547;OREF=-;OALT=GTT;OMAPALT=AGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.901961:46:53:46:51:5:25:21:1:4:24:7:25:21:1:6 chr12 64746833 . C T 117.4 PASS AF=0.341463;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00527293;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.563;QD=11.4539;RBI=0.011086;REFB=-0.0106622;REVB=-0.00975173;RO=27;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192428;STB=0.590415;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0177994;OID=.;OPOS=64746833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:27:27:14:14:0.341463:10:4:12:15:10:4:11:16 chr12 64838922 . G T 114.05 PASS AF=0.358974;AO=13;DP=38;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=0.0293256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.268;QD=11.6974;RBI=0.0297116;REFB=-0.00532599;REVB=0.00477397;RO=25;SAF=2;SAR=11;SRF=2;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184601;STB=0.649515;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0123619;OID=.;OPOS=64838922;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:25:25:13:14:0.358974:11:2:2:23:11:3:2:23 chr12 64875787 . T A 180.43 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.065501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.982;QD=16.0383;RBI=0.0661092;REFB=-0.00692618;REVB=-0.00894701;RO=26;SAF=3;SAR=16;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352361;STB=0.706373;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00848525;OID=.;OPOS=64875787;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:16:3:11:15:16:3:11:15 chr12 65108160 . G C 720.89 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.245;QD=62.6859;RBI=0.023798;REFB=0;REVB=0.0195416;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43189e-05;OID=.;OPOS=65108160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:25:20:0:0:26:20:0:0 chr12 65122781 . G T 510.17 PASS AF=0.55814;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0749902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3369;QD=23.729;RBI=0.0778123;REFB=0.0272349;REVB=-0.0207658;RO=38;SAF=20;SAR=28;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892098;STB=0.548999;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.0211726;OID=.;OPOS=65122781;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:38:38:48:48:0.55814:28:20:20:18:28:20:20:18 chr12 65146532 . C T 1320.42 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0882254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.775;QD=62.1376;RBI=0.0883469;REFB=0;REVB=-0.00463254;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000325816;OID=.;OPOS=65146532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0 chr12 65150485 . C T 776.98 PASS AF=0.983051;AO=56;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0230806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4128;QD=52.6767;RBI=0.085595;REFB=-0.0461648;REVB=0.0824244;RO=1;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132829;STB=0.506664;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00725696;OID=.;OPOS=65150485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:59:59:1:1:56:58:0.983051:35:21:0:1:37:21:0:1 chr12 65264387 . A G 277.34 PASS AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0335096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.024;QD=26.4135;RBI=0.0350705;REFB=-0.0231821;REVB=0.0103463;RO=17;SAF=7;SAR=18;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361024;STB=0.700226;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0112953;OID=.;OPOS=65264387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:18:7:13:4:18:7:13:4 chr12 65448986 . G A 356.18 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0165122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.093;QD=21.919;RBI=0.0165184;REFB=-0.0254557;REVB=-0.000451919;RO=29;SAF=15;SAR=21;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312433;STB=0.517232;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.017441;OID=.;OPOS=65448986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:21:15:11:18:21:15:11:18 chr12 65514266 . T C 1321.84 PASS AF=0.978022;AO=87;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.116549;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4578;QD=58.1027;RBI=0.123255;REFB=-0.214418;REVB=0.0401019;RO=3;SAF=37;SAR=50;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368748;STB=0.501378;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0123313;OID=.;OPOS=65514266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:91:91:3:2:87:89:0.978022:50:37:3:0:50:39:1:1 chr12 65641020 . G T 280.41 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.015333;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2473;QD=16.4949;RBI=0.0299438;REFB=0.0187488;REVB=-0.0257202;RO=37;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881116;STB=0.549705;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.0166612;OID=.;OPOS=65641020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:37:37:31:31:0.455882:21:10:15:22:21:10:15:22 chr12 65641985 . C T 1077.28 PASS AF=0.561111;AO=101;DP=180;FAO=101;FDP=180;FR=.;FRO=79;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=47;FSRR=32;FWDB=0.0110257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.2987;QD=23.9394;RBI=0.0250346;REFB=0.00373653;REVB=-0.0224758;RO=78;SAF=48;SAR=53;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914677;STB=0.552376;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.00352793;OID=.;OPOS=65641985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:78:79:101:101:0.561111:53:48:46:32:53:48:47:32 chr12 65672579 . C T 295.56 PASS AF=0.566038;AO=28;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0168522;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.2097;QD=22.3063;RBI=0.0168642;REFB=-0.00181571;REVB=-0.000635436;RO=14;SAF=8;SAR=20;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101006;STB=0.585714;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00111117;OID=.;OPOS=65672579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:14:23:28:30:0.566038:20:8:6:8:21:9:11:12 chr12 65857555 . T A 269.29 PASS AF=0.461538;AO=28;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00482393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.817;QD=16.5714;RBI=0.0073155;REFB=-0.0296443;REVB=-0.00549966;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347599;STB=0.528478;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0585373;OID=.;OPOS=65857555;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:34:35:28:30:0.461538:15:13:17:17:17:13:17:18 chr12 66358347 . C T 1227.5 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0718738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5844;QD=61.375;RBI=0.0724469;REFB=0;REVB=0.00909396;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000436868;OID=.;OPOS=66358347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:35:45:0:0:35:45:0:0 chr12 66359752 . C A 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.393;QD=61.2133;RBI=0.0143725;REFB=0;REVB=0.00807387;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21264e-05;OID=.;OPOS=66359752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:44:35:0:0:44:35:0:0 chr12 66546100 . A G 96.01 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-7.8738e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.329;QD=12.0018;RBI=0.0457267;REFB=-0.001165;REVB=-0.0457266;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242187;STB=0.642627;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00287195;OID=.;OPOS=66546100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:13:7:7:5:13:7 chr12 66605228 . A G 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.326;QD=63.2862;RBI=0.0338115;REFB=0;REVB=-0.0176351;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11966e-05;OID=.;OPOS=66605228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0 chr12 66725160 . C T 480.95 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0107851;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.242;QD=20.0397;RBI=0.0111981;REFB=-0.00438382;REVB=0.00301294;RO=49;SAF=17;SAR=30;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845015;STB=0.546964;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.00471041;OID=.;OPOS=66725160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:30:17:22:27:30:17:22:27 chr12 66725202 . C T 310.86 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.010768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.196;QD=14.13;RBI=0.0161649;REFB=-0.00709822;REVB=0.0120563;RO=52;SAF=9;SAR=26;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201316;STB=0.62268;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0133193;OID=.;OPOS=66725202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:53:35:35:0.397727:26:9:22:30:26:9:23:30 chr12 66731864 . C A 227.15 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0198894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.209;QD=21.1299;RBI=0.0205179;REFB=-0.00234431;REVB=-0.0050396;RO=20;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042422;STB=0.511617;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00218415;OID=.;OPOS=66731864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:21:22:22:0.511628:11:11:9:11:11:11:10:11 chr12 66739539 . A G 256.43 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00161928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.334;QD=22.7936;RBI=0.00781835;REFB=-0.00175313;REVB=-0.00764882;RO=21;SAF=9;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877268;STB=0.549091;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00212887;OID=.;OPOS=66739539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:15:9:10:11:15:9:10:11 chr12 66786091 . G C 306.34 PASS AF=1;AO=12;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.745;QD=53.2772;RBI=0.0330393;REFB=0;REVB=0.00206463;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338695;OID=.;OPOS=66786091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:12:23:1:10:2:0:0:10:13:0:0 chr12 66814487 . C A 337.4 PASS AF=0.38835;AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=-0.0173132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.63;QD=13.103;RBI=0.0173533;REFB=0.000141003;REVB=0.00117824;RO=62;SAF=18;SAR=22;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157204;STB=0.503433;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.000192638;OID=.;OPOS=66814487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:62:63:40:40:0.38835:22:18:27:35:22:18:28:35 chr12 67706466 . G A 288.86 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0280816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1188;QD=21.0078;RBI=0.0481239;REFB=-0.00273573;REVB=-0.0390811;RO=25;SAF=13;SAR=17;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10397;STB=0.557677;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00140111;OID=.;OPOS=67706466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:17:13:14:11:17:13:14:11 chr12 68052178 . G T 645.97 PASS AF=0.892857;AO=49;DP=55;FAO=50;FDP=56;FR=.;FRO=6;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00956232;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=99.6469;QD=46.1411;RBI=0.0316508;REFB=-0.170855;REVB=0.0301718;RO=3;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552651;STB=0.537788;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00291738;OID=.;OPOS=68052178;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:55:56:3:6:49:50:0.892857:24:25:0:3:24:26:1:5 chr12 68595787 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.093;QD=60.9783;RBI=0.0215201;REFB=0;REVB=0.0181987;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74269e-05;OID=.;OPOS=68595787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr12 69042495 . A G 430.17 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0497742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3136;QD=22.6405;RBI=0.0503851;REFB=-0.0260143;REVB=0.00782237;RO=34;SAF=13;SAR=29;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09309;STB=0.551383;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0209437;OID=.;OPOS=69042495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:29:13:14:20:29:13:14:20 chr12 69082805 . G A 235.94 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0332529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1585;QD=19.2607;RBI=0.033351;REFB=0.00508605;REVB=-0.00255583;RO=26;SAF=6;SAR=17;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283473;STB=0.66133;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00535377;OID=.;OPOS=69082805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:17:6:14:12:17:6:14:12 chr12 69115698 . G A 450.27 PASS AF=0.466667;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=0.0514447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7243;QD=17.153;RBI=0.065407;REFB=0.0167294;REVB=-0.0403922;RO=56;SAF=24;SAR=25;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12774;STB=0.570955;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.0125918;OID=.;OPOS=69115698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:56:56:49:49:0.466667:25:24:20:36:25:24:20:36 chr12 69145882 . C T 573.09 PASS AF=0.5;AO=59;DP=118;FAO=59;FDP=118;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0167058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.452;QD=19.4268;RBI=0.0168856;REFB=0.000270601;REVB=0.00245754;RO=59;SAF=33;SAR=26;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470119;STB=0.525937;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.00027259;OID=.;OPOS=69145882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:59:59:59:59:0.5:26:33:36:23:26:33:36:23 chr12 69186904 . G A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.742;QD=60.61;RBI=0.0322529;REFB=0;REVB=0.0307032;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338793;OID=.;OPOS=69186904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr12 69187427 . T A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.089;QD=56.7065;RBI=0.0135147;REFB=0;REVB=0.0134343;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49719e-05;OID=.;OPOS=69187427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr12 69187585 . G GA 679.91 PASS AF=1;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280836;FXX=0.017854;HRUN=0;LEN=1;MLLD=63.1559;QD=49.4477;RBI=0.0424696;REFB=0;REVB=0.0318587;RO=1;SAF=29;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159783;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-2.10478e-05;OID=.;OPOS=69187586;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:55:57:55:55:0:29:26:0:0:12:1:29:26:1:0 chr12 69265578 . A G 359.63 PASS AF=0.457831;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.0158373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7988;QD=17.3317;RBI=0.0169347;REFB=-0.0200584;REVB=-0.00599695;RO=45;SAF=18;SAR=20;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115698;STB=0.564627;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0223271;OID=.;OPOS=69265578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:45:38:38:0.457831:20:18:16:29:20:18:16:29 chr12 69645864 . A G 66.58 PASS AF=0.444444;AO=5;DP=17;FAO=8;FDP=18;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0105065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.815;QD=14.795;RBI=0.011201;REFB=-0.0278056;REVB=0.00388281;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543107;STB=0.538364;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0189166;OID=.;OPOS=69645864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:17:18:4:9:5:8:0.444444:4:1:1:3:5:3:4:5 chr12 69646914 . G A 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0176666;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.762;QD=16.9415;RBI=0.0181115;REFB=-0.0185212;REVB=0.0039898;RO=24;SAF=4;SAR=15;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363432;STB=0.710065;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0168411;OID=.;OPOS=69646914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:15:4:13:11:15:4:13:11 chr12 69967862 . G A 528.11 PASS AF=0.405594;AO=58;DP=143;FAO=58;FDP=143;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=31;FWDB=-0.0290854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.598;QD=14.7724;RBI=0.04301;REFB=-0.0187377;REVB=-0.0316844;RO=82;SAF=31;SAR=27;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924487;STB=0.560693;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0286313;OID=.;OPOS=69967862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:82:85:58:58:0.405594:27:31:51:31:27:31:54:31 chr12 69971500 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.4;QD=48.7373;RBI=0.0127439;REFB=0;REVB=-0.00642946;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49739e-06;OID=.;OPOS=69971500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0 chr12 69971713 . C T 1525.75 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.602;QD=59.8332;RBI=0.0274686;REFB=0;REVB=0.0201035;RO=0;SAF=63;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51818e-05;OID=.;OPOS=69971713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:39:63:0:0:39:63:0:0 chr12 69972381 . G A 306.15 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00615836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0356;QD=53.2442;RBI=0.042271;REFB=0;REVB=-0.04182;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000717396;OID=.;OPOS=69972381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr12 69973192 . CA C 171.94 PASS AF=0.589744;AO=21;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0110138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7037;QD=17.6352;RBI=0.0703038;REFB=0.0268312;REVB=-0.0694357;RO=16;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667197;STB=0.552527;STBP=0.465;TYPE=del;VARB=-0.0195771;OID=.;OPOS=69973193;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.589744:21:39:23:39:16:10:13:9:7:96:16:10:11:9:7 chr12 70037520 . G A 510.14 PASS AF=0.38961;AO=60;DP=153;FAO=60;FDP=154;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=-0.00325031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.52;QD=13.2504;RBI=0.0168941;REFB=-0.00366042;REVB=-0.0165785;RO=93;SAF=25;SAR=35;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141906;STB=0.583306;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0067856;OID=.;OPOS=70037520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:93:94:60:60:0.38961:35:25:51:42:35:25:52:42 chr12 70091432 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.446;QD=62.0217;RBI=0.0891655;REFB=0;REVB=0.0873911;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341252;OID=.;OPOS=70091432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr12 70190408 . A C 413.79 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0376792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2293;QD=19.0246;RBI=0.106714;REFB=0.00341353;REVB=0.0998403;RO=45;SAF=21;SAR=21;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103234;STB=0.505744;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.00137689;OID=.;OPOS=70190408;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:45:42:42:0.482759:21:21:23:22:21:21:23:22 chr12 70321450 . C T 649.91 PASS AF=1;AO=37;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.598;QD=61.8959;RBI=0.0299925;REFB=0;REVB=0.0141993;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247657;OID=.;OPOS=70321450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:37:42:1:14:23:0:0:19:23:0:0 chr12 70330087 . A G 937.95 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.77;QD=58.6217;RBI=0.0311633;REFB=0;REVB=0.0153551;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.53123e-05;OID=.;OPOS=70330087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:31:32:0:0:32:32:0:0 chr12 70351684 . C A 88.2 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0108032;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.373;QD=10.6909;RBI=0.020863;REFB=-0.00822269;REVB=-0.0178481;RO=18;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219335;STB=0.576134;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00947931;OID=.;OPOS=70351684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:34:33:18:21:11:11:0.333333:5:6:6:12:5:6:9:12 chr12 70352021 . C T 348.48 PASS AF=0.381818;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=110;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=-0.0169339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.495;QD=12.6718;RBI=0.0263398;REFB=-0.0181538;REVB=-0.0201749;RO=66;SAF=22;SAR=20;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105866;STB=0.549236;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0268885;OID=.;OPOS=70352021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:66:68:42:42:0.381818:20:22:41:25:20:22:41:27 chr12 70912510 . C T 1485.34 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011746;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.383;QD=60.0137;RBI=0.0133905;REFB=0;REVB=0.00642937;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37357e-05;OID=.;OPOS=70912510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:63:36:0:0:63:36:0:0 chr12 70928616 . G A 229.68 PASS AF=0.363636;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0631874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.498;QD=11.9313;RBI=0.0633023;REFB=-0.0289322;REVB=-0.00381235;RO=49;SAF=12;SAR=16;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090499;STB=0.552201;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.03981;OID=.;OPOS=70928616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:49:49:28:28:0.363636:16:12:25:24:16:12:25:24 chr12 70928724 . A G 874.11 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.696;QD=57.3188;RBI=0.0231925;REFB=0;REVB=0.0129984;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539352;OID=.;OPOS=70928724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:31:29:0:0:31:30:0:0 chr12 70990054 . T C 795.83 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.931;QD=56.8447;RBI=0.0390921;REFB=0;REVB=-0.0364577;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.32711e-05;OID=.;OPOS=70990054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:32:23:0:0:32:24:0:0 chr12 71002865 . T A 1842.48 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010732;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.943;QD=61.416;RBI=0.0206454;REFB=0;REVB=0.0176368;RO=0;SAF=61;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677507;OID=.;OPOS=71002865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:120:0:0:118:120:1:57:61:0:0:59:61:0:0 chr12 71002893 . C T 2281.34 PASS AF=0.986395;AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=147;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0116718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2593;QD=62.0772;RBI=0.0160885;REFB=-0.0635489;REVB=0.0110729;RO=2;SAF=71;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000267733;STB=0.500141;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00242415;OID=.;OPOS=71002893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:147:147:2:2:145:145:0.986395:74:71:1:1:74:71:1:1 chr12 71003524 . CTT C,CCT 1120.11 PASS AF=0.986667,0.0133333;AO=64,3;DP=70;FAO=74,1;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=44,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426748,-0.0247452;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=326.005,24.9858;QD=59.7391;RBI=0.0433496,0.057518;REFB=0,0;REVB=0.00761895,-0.051923;RO=0;SAF=27,1;SAR=37,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.1743e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000609756,-0.175973;OID=.,.;OPOS=71003525,71003525;OREF=TT,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.986667,0.0133333:64,3:70:74,1:75:0:30,0:44,1:0:0:3:0:27,1:37,2:0:0 chr12 71029733 . C T 360.12 PASS AF=0.40625;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0122154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3391;QD=15.0049;RBI=0.0125944;REFB=0.0058013;REVB=0.00306628;RO=57;SAF=9;SAR=30;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325331;STB=0.685818;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00954297;OID=.;OPOS=71029733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:57:39:39:0.40625:30:9:29:28:30:9:29:28 chr12 71054946 . C A 367.28 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0461464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4089;QD=16.5068;RBI=0.0487537;REFB=-0.0178472;REVB=-0.0157301;RO=50;SAF=16;SAR=23;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130357;STB=0.573296;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0210807;OID=.;OPOS=71054946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:50:50:39:39:0.438202:23:16:27:23:23:16:27:23 chr12 71094952 . C A 313.82 PASS AF=0.347826;AO=40;DP=115;FAO=40;FDP=115;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.0153655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.394;QD=10.9156;RBI=0.0539001;REFB=-0.00504147;REVB=0.0516636;RO=74;SAF=23;SAR=17;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227343;STB=0.516755;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0101202;OID=.;OPOS=71094952;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:74:75:40:40:0.347826:17:23:44:30:17:23:45:30 chr12 71139664 . T C 1766.68 PASS AF=0.991597;AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00543471;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.304;QD=59.3844;RBI=0.0450315;REFB=-0.00726049;REVB=0.0447023;RO=1;SAF=56;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840555;STB=0.504424;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000154786;OID=.;OPOS=71139664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:119:119:1:1:117:118:0.991597:61:56:1:0:62:56:1:0 chr12 71509652 . T A 894.45 PASS AF=0.45933;AO=93;DP=208;FAO=96;FDP=209;FR=.;FRO=113;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=63;FSRR=50;FWDB=0.00844854;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9284;QD=17.1186;RBI=0.0213408;REFB=-0.013869;REVB=-0.0195972;RO=115;SAF=47;SAR=46;SRF=63;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423076;STB=0.536685;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0151332;OID=.;OPOS=71509652;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:115:113:93:96:0.45933:46:47:63:52:49:47:63:50 chr12 71519096 . G C 270.35 PASS AF=0.351648;AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0179226;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.44;QD=11.8834;RBI=0.0363532;REFB=-0.0114804;REVB=-0.0316281;RO=58;SAF=17;SAR=15;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101369;STB=0.551668;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0266108;OID=.;OPOS=71519096;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:58:59:32:32:0.351648:15:17:36:22:15:17:36:23 chr12 71519173 . G A 356.76 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00993434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.924;QD=21.9544;RBI=0.0162294;REFB=-0.0338744;REVB=-0.0128336;RO=28;SAF=17;SAR=19;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00631739;STB=0.523064;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.022781;OID=.;OPOS=71519173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:28:29:36:36:0.553846:19:17:13:15:18:18:13:16 chr12 71523134 . A C 60.55 PASS AF=0.230769;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0245879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.531;QD=6.21;RBI=0.0259377;REFB=-0.00471069;REVB=0.0082584;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102596;STB=0.555429;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0223798;OID=.;OPOS=71523134;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:39:39:29:30:9:9:0.230769:3:6:17:12:3:6:18:12 chr12 71523199 . TAAAAAAAAAA TAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAC,TAAAAAAAAAC 256.75 PASS AF=0.181818,0.0454545,0.772727;AO=3,3,9;DP=23;FAO=4,1,17;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1,1,8;FSAR=3,0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.123189,-0.109566,-0.0924643;FXX=0.0434594;HRUN=12,1,12;LEN=2,1,1;MLLD=8.49087,201.016,202.466;QD=46.6825;RBI=0.135435,0.109567,0.0924658;REFB=0,0,0;REVB=-0.0562785,0.000346475,-0.000520269;RO=0;SAF=1,1,5;SAR=2,2,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,ins,snp;VARB=0.0315746,0.0186141,-0.00738318;OID=.,.,.;OPOS=71523200,71523210,71523209;OREF=AA,-,A;OALT=-,C,C;OMAPALT=TAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAC,TAAAAAAAAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.181818,0.0454545,0.772727:3,3,9:23:4,1,17:22:0:1,1,8:3,0,9:0:0:23:0:1,1,5:2,2,4:0:0 chr12 71533494 . C T 617.54 PASS AF=0.488372;AO=63;DP=129;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=-0.0231256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.895;QD=19.1487;RBI=0.0240513;REFB=-0.00861942;REVB=0.00660846;RO=66;SAF=26;SAR=37;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325868;STB=0.518002;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00879822;OID=.;OPOS=71533494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:66:66:63:63:0.488372:37:26:25:41:37:26:25:41 chr12 71533534 . C G 532.75 PASS AF=0.452381;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00863245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.074;QD=16.9126;RBI=0.0114819;REFB=-0.00431468;REVB=-0.00757071;RO=68;SAF=23;SAR=34;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231676;STB=0.509507;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0056062;OID=.;OPOS=71533534;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:68:69:57:57:0.452381:34:23:29:39:34:23:29:40 chr12 71533581 . G A 539.07 PASS AF=0.555556;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.013324;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.199;QD=23.9587;RBI=0.0183667;REFB=0.000176326;REVB=-0.0126415;RO=40;SAF=21;SAR=29;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045308;STB=0.524877;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=-8.73221e-05;OID=.;OPOS=71533581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:40:40:50:50:0.555556:29:21:19:21:29:21:19:21 chr12 71960208 . G A 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00761883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.217;QD=63.8712;RBI=0.0168653;REFB=0;REVB=0.0150463;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33086e-05;OID=.;OPOS=71960208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0 chr12 72004285 . T C 249.21 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0183379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8116;QD=16.6139;RBI=0.02172;REFB=-0.0116142;REVB=0.0116397;RO=31;SAF=9;SAR=19;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220773;STB=0.633236;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0182555;OID=.;OPOS=72004285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:32:28:28:0.466667:19:9:17:14:19:9:18:14 chr12 72004883 . AG A,AA 35.18 PASS AF=0.277778,0.0555556;AO=3,2;DP=20;FAO=5,1;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1,0;FSAR=4,1;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.00273335,0.00321608;FXX=0.09995;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=178.102,177.142;QD=7.81671;RBI=0.0344236,0.00693294;REFB=-0.0350871,-0.033128;REVB=-0.0343149,-0.00614186;RO=15;SAF=1,0;SAR=2,2;SRF=2;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.312014,-0.427206;STB=0.651703,0.981786;STBP=0.782,0.611;TYPE=del,snp;VARB=0.0397577,0.149047;OID=.,.;OPOS=72004884,72004884;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.277778,0.0555556:3,2:20:5,1:18:12:1,0:4,1:1:11:26:15:1,0:2,2:2:13 chr12 72018028 . A G 586.21 PASS AF=0.54;AO=53;DP=100;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0781012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9568;QD=23.4485;RBI=0.0854727;REFB=-0.0491862;REVB=0.0347245;RO=46;SAF=28;SAR=25;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128713;STB=0.511503;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.042518;OID=.;OPOS=72018028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:46:46:53:54:0.54:25:28:25:21:26:28:25:21 chr12 72071045 . A G 657.58 PASS AF=0.977273;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0255497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.824;QD=59.7797;RBI=0.0275372;REFB=-0.0581625;REVB=-0.0102718;RO=1;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347354;STB=0.51851;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000374701;OID=.;OPOS=72071045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:44:1:1:42:43:0.977273:13:29:0:1:13:30:0:1 chr12 72164395 . C T 223.85 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0041544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6129;QD=19.4653;RBI=0.0552739;REFB=0.0036273;REVB=0.0551175;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180797;STB=0.519982;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00226943;OID=.;OPOS=72164395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:23:24:22:22:0.478261:10:12:13:10:10:12:14:10 chr12 72307616 . A G 765.91 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1127;QD=63.8257;RBI=0.0478423;REFB=0;REVB=-0.0240983;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000735995;OID=.;OPOS=72307616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:31:16:0:0:31:17:0:0 chr12 72312268 . G A 1358.61 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.593;QD=62.4648;RBI=0.0256174;REFB=0;REVB=-0.00414516;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.81135e-05;OID=.;OPOS=72312268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:50:37:0:0:50:37:0:0 chr12 72314552 . T A 606.09 PASS AF=0.606742;AO=54;DP=89;FAO=54;FDP=89;FR=.;FRO=35;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0570884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.988;QD=27.2398;RBI=0.0573187;REFB=-0.0110225;REVB=0.00513335;RO=35;SAF=31;SAR=23;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146014;STB=0.57953;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00740416;OID=.;OPOS=72314552;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:35:35:54:54:0.606742:23:31:13:22:23:31:13:22 chr12 72416235 . A T 704.27 PASS AF=0.482759;AO=69;DP=145;FAO=70;FDP=145;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.00533674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.715;QD=19.4282;RBI=0.00534324;REFB=-0.0114461;REVB=0.000263574;RO=76;SAF=31;SAR=38;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144354;STB=0.515919;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0123313;OID=.;OPOS=72416235;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:76:75:69:70:0.482759:38:31:33:43:38:32:32:43 chr12 73058186 . G A 2320.45 PASS AF=1;AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000773459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.794;QD=61.0645;RBI=0.00386334;REFB=0;REVB=-0.00378512;RO=0;SAF=72;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.96827e-06;OID=.;OPOS=73058186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:152:152:0:0:152:152:1:80:72:0:0:80:72:0:0 chr12 74851233 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00576132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.692;QD=44.6898;RBI=0.0692845;REFB=0;REVB=0.0690446;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000889079;OID=.;OPOS=74851233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0 chr12 74932159 . G C 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0052331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.016;QD=60.8836;RBI=0.0317872;REFB=0;REVB=0.0313535;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43063e-05;OID=.;OPOS=74932159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0 chr12 74932327 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.742;QD=47.8224;RBI=0.0241179;REFB=0;REVB=-0.0188325;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91683e-06;OID=.;OPOS=74932327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr12 74932565 . T C 1152.56 PASS AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0443546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3927;QD=56.9167;RBI=0.0499165;REFB=-0.0157559;REVB=-0.0228982;RO=3;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464773;STB=0.524584;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00435755;OID=.;OPOS=74932565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:81:3:3:78:78:0.962963:29:49:0:3:29:49:0:3 chr12 74933166 . G A 1494.93 PASS AF=0.971698;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0147051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.941;QD=56.4126;RBI=0.0461254;REFB=-0.0505098;REVB=0.0437186;RO=3;SAF=54;SAR=49;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256288;STB=0.513511;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=8.1207e-05;OID=.;OPOS=74933166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:106:106:3:3:103:103:0.971698:49:54:3:0:49:54:3:0 chr12 74934634 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.637;QD=63.8719;RBI=0.0482978;REFB=0;REVB=0.0343596;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130643;OID=.;OPOS=74934634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr12 74934637 . T C 705.02 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00296463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.541;QD=58.7514;RBI=0.0141963;REFB=-0.136753;REVB=0.0138833;RO=2;SAF=19;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700837;STB=0.50373;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00110759;OID=.;OPOS=74934637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:48:48:2:2:46:46:0.958333:27:19:1:1:27:19:1:1 chr12 74934909 . AGTGTGTGTGTGTGTGTA AGTGTGTGTA,AGTGTGTGTATGTGTGTG 558.02 PASS AF=0.947368,0.0526316;AO=33,3;DP=41;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=23,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00731286,0.0493194;FXX=0.0499875;HRUN=1,1;LEN=8,9;MLLD=216.442,115.914;QD=58.7384;RBI=0.0252045,0.0657321;REFB=0,0;REVB=0.0241203,-0.0434547;RO=0;SAF=13,0;SAR=20,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.82173e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00119998,0.0577014;OID=.,.;OPOS=74934910,74934918;OREF=GTGTGTGT,GTGTGTGTA;OALT=-,ATGTGTGTG;OMAPALT=AGTGTGTGTA,AGTGTGTGTATGTGTGTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.947368,0.0526316:33,3:41:36,2:38:0:13,0:23,2:0:0:9:0:13,0:20,3:0:0 chr12 75710214 . A G 566.41 PASS AF=0.537736;AO=57;DP=106;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0580422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.309;QD=21.3741;RBI=0.0684273;REFB=0.00250933;REVB=0.0362409;RO=49;SAF=31;SAR=26;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234356;STB=0.512867;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.0015626;OID=.;OPOS=75710214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:49:49:57:57:0.537736:26:31:28:21:26:31:28:21 chr12 75737595 . T C 271.35 PASS AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00461702;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.506;QD=12.334;RBI=0.0599396;REFB=-0.0132846;REVB=0.0597615;RO=55;SAF=19;SAR=13;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492073;STB=0.520759;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0238902;OID=.;OPOS=75737595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:55:56:32:32:0.363636:13:19:35:20:13:19:35:21 chr12 75760742 . G A 2695.27 PASS AF=0.977401;AO=167;DP=177;FAO=173;FDP=177;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=71;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0162319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.2592;QD=60.91;RBI=0.0243558;REFB=-0.0816188;REVB=0.0181586;RO=1;SAF=65;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046433;STB=0.502439;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-6.86729e-05;OID=.;OPOS=75760742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:177:177:1:1:167:173:0.977401:102:65:0:1:102:71:0:1 chr12 75785100 . C T 754.39 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0210463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0161;QD=54.865;RBI=0.0624702;REFB=-0.058994;REVB=0.0588182;RO=1;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017135;STB=0.509088;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00151248;OID=.;OPOS=75785100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:27:27:0:1:27:27:0:1 chr12 75816814 . G GACA 401.68 PASS AF=0.644068;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00790749;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=278.282;QD=27.2324;RBI=0.00797002;REFB=-0.00655577;REVB=-0.000996393;RO=22;SAF=14;SAR=24;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122924;STB=0.574546;STBP=0.13;TYPE=ins;VARB=0.00364982;OID=.;OPOS=75816815;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=GACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.644068:38:60:38:59:21:14:24:12:9:99:22:14:24:12:10 chr12 75893388 . T A 1390.19 PASS AF=0.98913;AO=90;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00733589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.391;QD=60.4429;RBI=0.0318252;REFB=-0.0636606;REVB=0.0309682;RO=2;SAF=46;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000457871;STB=0.505375;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00101728;OID=.;OPOS=75893388;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:92:92:2:1:90:91:0.98913:44:46:1:1:45:46:1:0 chr12 75893404 . C A 1116.91 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4226;QD=60.3737;RBI=0.0212904;REFB=0;REVB=0.0146233;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.25465e-06;OID=.;OPOS=75893404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:36:38:0:0:36:38:0:0 chr12 76351726 . C G 137.89 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0227074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7508;QD=11.4911;RBI=0.0585605;REFB=-0.00397842;REVB=0.0539787;RO=32;SAF=8;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703329;STB=0.541615;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0135573;OID=.;OPOS=76351726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:8:8:18:14:8:8:18:14 chr12 76424937 . TTGCTGCTGCTGCTGC CTGTTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGCTGG 427.38 PASS AF=0.16129,0.774194,0.0645161;AO=8,19,2;DP=31;FAO=5,24,2;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=5,12,1;FSAR=0,12,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021139,0.0270949,0.00594732;FXX=0;HRUN=2,1,1;LEN=4,3,1;MLLD=227.823,168.781,92.9399;QD=55.1456;RBI=0.0651983,0.0650888,0.00613069;REFB=0,0,0;REVB=0.0616763,0.0591812,0.00148822;RO=0;SAF=5,11,1;SAR=3,8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.46938e-08,-3.41338e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0479049,0.0105718,0.0345249;OID=.,.,.;OPOS=76424937,76424938,76424952;OREF=TTGC,TGC,C;OALT=CTGT,-,G;OMAPALT=CTGTTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGCTGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:36:31:31:0:0:8,19,2:5,24,2:0.16129,0.774194,0.0645161:3,8,1:5,11,1:0:0:0,12,1:5,12,1:0:0 chr12 76426110 . GGA G 564.9 PASS AF=0.873016;AO=54;DP=60;FAO=55;FDP=63;FR=.;FRO=8;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0417708;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=2;MLLD=264.607;QD=35.8667;RBI=0.0421046;REFB=-0.0314811;REVB=-0.00529115;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526306;STBP=0.285;TYPE=del;VARB=0.00996744;OID=.;OPOS=76426111;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.873016:54:60:55:63:8:25:30:2:6:21:0:25:29:0:0 chr12 76427547 . C CTTAAT 190.65 PASS AF=1;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247626;FXX=0.210416;HRUN=2;LEN=5;MLLD=272.214;QD=50.8408;RBI=0.030112;REFB=0;REVB=0.0171332;RO=5;SAF=11;SAR=4;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168538;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000204865;OID=.;OPOS=76427548;OREF=-;OALT=TTAAT;OMAPALT=CTTAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:15:22:15:15:0:11:4:0:0:3:5:11:4:5:0 chr12 76449900 . T C 837.17 PASS AF=0.984127;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0499893;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=49.8858;QD=53.1536;RBI=0.0604988;REFB=-0.0666672;REVB=-0.0340761;RO=2;SAF=19;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230088;STB=0.50588;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00267074;OID=.;OPOS=76449900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:63:2:1:59:62:0.984127:40:19:0:2:42:20:0:1 chr12 76453966 . G A 1062.43 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.956;QD=59.8555;RBI=0.033862;REFB=0;REVB=-0.0115933;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103797;OID=.;OPOS=76453966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0 chr12 76709606 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=343.883;QD=62.022;RBI=0.00968284;REFB=0;REVB=0.00609992;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.83574e-06;OID=.;OPOS=76709606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr12 76709610 . T C 629.1 PASS AF=0.976744;AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0260392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.852;QD=58.5209;RBI=0.0273456;REFB=-0.0336464;REVB=0.00835109;RO=1;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267986;STB=0.513507;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000581749;OID=.;OPOS=76709610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:41:42:0.976744:17:24:0:1:18:24:0:1 chr12 76740220 . A G 214.11 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0218205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.986;QD=14.7662;RBI=0.0270955;REFB=-0.00771685;REVB=-0.0160634;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135335;STB=0.576862;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0137998;OID=.;OPOS=76740220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:14:19:11:14:14:19 chr12 77256681 . T G 177.3 PASS AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00209345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3504;QD=12.2274;RBI=0.0614572;REFB=0.00277783;REVB=0.0614215;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596837;STB=0.534452;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-0.00349468;OID=.;OPOS=77256681;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:11:11:16:20:11:11:16:20 chr12 77417509 . G T 374.21 PASS AF=0.46988;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0413234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.522;QD=18.0342;RBI=0.0430793;REFB=0.00156114;REVB=-0.012174;RO=37;SAF=15;SAR=24;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115805;STB=0.538442;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.0027608;OID=.;OPOS=77417509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:37:44:39:39:0.46988:24:15:19:18:24:15:20:24 chr12 77438436 . T C 304.31 PASS AF=0.344538;AO=40;DP=119;FAO=41;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=36;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.00294253;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.638;QD=10.2288;RBI=0.179612;REFB=-0.00837953;REVB=-0.179588;RO=54;SAF=36;SAR=4;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337396;STB=0.802732;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0109509;OID=.;OPOS=77438436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:54:78:40:41:0.344538:4:36:39:15:5:36:40:38 chr12 77449790 . A G 2626.56 PASS AF=0.988439;AO=169;DP=172;FAO=171;FDP=173;FR=.;FRO=2;FSAF=91;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00588486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.681;QD=60.7298;RBI=0.0115672;REFB=-0.0927067;REVB=0.00995829;RO=1;SAF=89;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531778;STB=0.505434;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.000126366;OID=.;OPOS=77449790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:172:173:1:2:169:171:0.988439:80:89:1:0:80:91:2:0 chr12 78225374 . A G 1065.51 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00554958;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.063;QD=60.0287;RBI=0.0163332;REFB=0;REVB=-0.0153615;RO=0;SAF=21;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.42324e-05;OID=.;OPOS=78225374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:50:21:0:0:50:21:0:0 chr12 78530979 . G A,T 732.77 PASS AF=0.957447,0.0425532;AO=45,2;DP=47;FAO=45,2;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224273,0.0142146;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.785,86.0311;QD=62.3637;RBI=0.022438,0.0148722;REFB=0,0;REVB=-0.000692837,0.00437337;RO=0;SAF=28,0;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000490681,0.0284601;OID=.,.;OPOS=78530979,78530979;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:47:47:0:0:45,2:45,2:0.957447,0.0425532:17,2:28,0:0:0:17,2:28,0:0:0 chr12 78542699 . T C 390.6 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0741952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.968;QD=53.8764;RBI=0.0742312;REFB=0;REVB=-0.00231046;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734672;OID=.;OPOS=78542699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:28:29:0:0:28:29:1:18:10:0:0:18:11:0:0 chr12 78598891 . G A 1472.52 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.499;QD=63.3341;RBI=0.0288161;REFB=0;REVB=0.0174121;RO=0;SAF=34;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.20828e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77566e-05;OID=.;OPOS=78598891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:59:34:0:0:59:34:0:0 chr12 79685913 . C A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5964;QD=61.3359;RBI=0.0384977;REFB=0;REVB=-0.0276422;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000627974;OID=.;OPOS=79685913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0 chr12 80014907 . A T 373.8 PASS AF=0.4;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.00045843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.651;QD=13.5928;RBI=0.00955861;REFB=-0.0112231;REVB=-0.00954761;RO=64;SAF=22;SAR=22;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655912;STB=0.52726;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0149341;OID=.;OPOS=80014907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:110:64:66:44:44:0.4:22:22:36:28:22:22:36:30 chr12 80712420 . G A 1641.93 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.067;QD=60.2542;RBI=0.0194665;REFB=0;REVB=0.000190463;RO=0;SAF=55;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75911e-05;OID=.;OPOS=80712420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:54:55:0:0:54:55:0:0 chr12 80735771 . T C 857.71 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149687;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.443;QD=57.1805;RBI=0.0248563;REFB=0;REVB=0.0198438;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89961e-05;OID=.;OPOS=80735771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:33:26:0:0:34:26:0:0 chr12 80737521 . C T 1571.32 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.612;QD=62.8529;RBI=0.011405;REFB=-0.108544;REVB=-0.00184503;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000293175;OID=.;OPOS=80737521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:0:1:99:99:0.99:46:53:0:0:46:53:0:1 chr12 80747242 . A G 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1539;QD=57.2368;RBI=0.125176;REFB=0;REVB=0.0109214;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167748;OID=.;OPOS=80747242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0 chr12 80752660 . A G 1120.35 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413083;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.894;QD=60.5594;RBI=0.0417612;REFB=0;REVB=0.00613334;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85988e-05;OID=.;OPOS=80752660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:42:32:0:0:42:32:0:0 chr12 80761430 . G A 1048.09 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=3.54581e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.9;QD=58.227;RBI=0.0132779;REFB=0.0156104;REVB=-0.0132778;RO=1;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137051;STB=0.507244;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000406011;OID=.;OPOS=80761430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:34:37:0:1:34:37:0:1 chr12 80761465 . G A 994.18 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306338;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.33;QD=59.3539;RBI=0.0317398;REFB=0;REVB=-0.0315917;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000365878;OID=.;OPOS=80761465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0 chr12 80765800 . A G 1012.11 PASS AF=0.985714;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00460423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.437;QD=57.8349;RBI=0.013569;REFB=-0.0657586;REVB=0.012764;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129488;STB=0.506665;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=1.77976e-05;OID=.;OPOS=80765800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:68:69:0.985714:32:36:1:0:32:37:1:0 chr12 80771813 . G A 770.61 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00331825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.905;QD=55.0439;RBI=0.0106797;REFB=-0.095734;REVB=0.0101511;RO=1;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145046;STB=0.507689;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000562628;OID=.;OPOS=80771813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:32:23:0:1:32:23:0:1 chr12 80816492 . C T 708.5 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9611;QD=62.9781;RBI=0.0427251;REFB=0;REVB=-0.0419313;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000573384;OID=.;OPOS=80816492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr12 80818876 . A G 2867.27 PASS AF=1;AO=183;DP=184;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0595099;FXX=0.00543449;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.7963;QD=62.6726;RBI=0.0604279;REFB=-0.109197;REVB=-0.0104931;RO=0;SAF=73;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249049;OID=.;OPOS=80818876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:184:183:0:0:183:183:1:110:73:0:0:110:73:0:0 chr12 81329536 . A C 631.27 PASS AF=0.48855;AO=64;DP=132;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0497758;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.259;QD=19.2755;RBI=0.075892;REFB=-0.0184548;REVB=0.0572884;RO=63;SAF=33;SAR=31;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360082;STB=0.518761;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0173303;OID=.;OPOS=81329536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:63:67:64:64:0.48855:31:33:35:28:31:33:37:30 chr12 82617454 . T G 389.99 PASS AF=0.42268;AO=39;DP=96;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.010312;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.213;QD=16.082;RBI=0.0383243;REFB=-0.0337375;REVB=0.0369109;RO=57;SAF=17;SAR=22;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158646;STB=0.506132;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.046112;OID=.;OPOS=82617454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:57:56:39:41:0.42268:22:17:24:33:23:18:24:32 chr12 82783668 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.755;QD=62.022;RBI=0.0301277;REFB=0;REVB=-0.00493429;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.42642e-05;OID=.;OPOS=82783668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr12 82792787 . C A 582.7 PASS AF=0.975;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0216321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.438;QD=58.2703;RBI=0.0304031;REFB=-0.0169163;REVB=0.0213635;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000426918;OID=.;OPOS=82792787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:40:0:1:38:39:0.975:19:19:0:0:20:19:0:1 chr12 83359554 . TCCCCC CTCCCC,TCCCC,TCCCCT 40.39 PASS AF=0.0666667,0.2,0.0666667;AO=2,4,2;DP=30;FAO=2,6,2;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=0,2,0;FSAR=2,4,2;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00267877,-0.0476733,0.0482809;FXX=0;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=28.6556,15.4715,33.8337;QD=5.38529;RBI=0.0515233,0.048035,0.101724;REFB=-0.0349546,-0.0557252,-0.0334151;REVB=0.0514536,0.00588399,0.089536;RO=21;SAF=0,2,0;SAR=2,2,2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.613472,-0.254429,-0.613472;STB=0.996827,0.789902,0.996827;STBP=0.036,0.149,0.036;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0926142,-0.0131113,0.11926;OID=.,.,.;OPOS=83359554,83359555,83359559;OREF=TC,C,C;OALT=CT,-,T;OMAPALT=CTCCCC,TCCCC,TCCCCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:21:30:30:21:20:2,4,2:2,6,2:0.0666667,0.2,0.0666667:2,2,2:0,2,0:15:6:2,4,2:0,2,0:15:5 chr12 83415669 . G A 100.16 PASS AF=0.461538;AO=13;DP=24;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0403123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.6665;QD=15.4099;RBI=0.230533;REFB=-0.027705;REVB=-0.226981;RO=11;SAF=11;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252667;STB=0.689293;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0137037;OID=.;OPOS=83415669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:24:26:11:14:13:12:0.461538:2:11:7:4:2:10:8:6 chr12 83415719 . G C 271.89 PASS AF=0.517857;AO=21;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0177494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3778;QD=19.4208;RBI=0.018316;REFB=0.00627513;REVB=-0.00452018;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113285;STB=0.590511;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-0.00601222;OID=.;OPOS=83415719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:22:27:21:29:0.517857:7:14:17:5:14:15:19:8 chr12 85432040 . T A 481.33 PASS AF=0.37415;AO=55;DP=147;FAO=55;FDP=147;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.0293731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5506;QD=13.0973;RBI=0.054848;REFB=-0.00241979;REVB=-0.0463198;RO=92;SAF=26;SAR=29;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0058977;STB=0.503349;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00466872;OID=.;OPOS=85432040;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:92:92:55:55:0.37415:29:26:43:49:29:26:43:49 chr12 85438499 . G A 307.46 PASS AF=0.376344;AO=35;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0892168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.827;QD=13.2241;RBI=0.0892185;REFB=-0.00739724;REVB=-0.000547561;RO=57;SAF=8;SAR=27;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228071;STB=0.638967;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00919233;OID=.;OPOS=85438499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:58:35:35:0.376344:27:8:23:34:27:8:24:34 chr12 85449465 . T A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.452;QD=51.9167;RBI=0.0152712;REFB=0;REVB=0.0089867;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012576;OID=.;OPOS=85449465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr12 85466723 . G A 662.23 PASS AF=0.571429;AO=64;DP=112;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=8;FWDB=-0.015654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.912;QD=23.651;RBI=0.0217171;REFB=-0.0128529;REVB=0.0150527;RO=48;SAF=33;SAR=31;SRF=40;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253496;STB=0.637425;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0151262;OID=.;OPOS=85466723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:48:48:64:64:0.571429:31:33:40:8:31:33:40:8 chr12 88440676 . G C 674.44 PASS AF=0.468966;AO=68;DP=147;FAO=68;FDP=145;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=-0.00455868;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.446;QD=18.6052;RBI=0.00469129;REFB=-0.0216842;REVB=-0.00110754;RO=78;SAF=32;SAR=36;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530134;STB=0.519085;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0257958;OID=.;OPOS=88440676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:145:78:77:68:68:0.468966:36:32:41:37:36:32:39:38 chr12 88500847 . T C 322.44 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0109644;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.3569;QD=16.5356;RBI=0.0173188;REFB=-0.00475093;REVB=0.0134061;RO=43;SAF=19;SAR=16;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00787006;STB=0.504422;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00499337;OID=.;OPOS=88500847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:16:19:23:20:16:19:23:20 chr12 88505078 . T C 594.5 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5288;QD=60.9742;RBI=0.0773286;REFB=0;REVB=0.0606314;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018194;OID=.;OPOS=88505078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0 chr12 88508258 . T C 299.33 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0177241;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.108;QD=15.9645;RBI=0.0247245;REFB=-0.0101152;REVB=0.0172382;RO=41;SAF=11;SAR=22;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206845;STB=0.623776;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00948808;OID=.;OPOS=88508258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:42:33:33:0.44:22:11:22:19:22:11:23:19 chr12 88508962 . GAAAAAAG GAAAAAGA 83.49 PASS AF=0.295455;AO=10;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=30;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=28;FWDB=-0.110344;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=61.7369;QD=7.58963;RBI=0.118332;REFB=-0.00854678;REVB=-0.04274;RO=21;SAF=8;SAR=2;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.679933;STB=0.895557;STBP=0.009;TYPE=mnp;VARB=0.120244;OID=.;OPOS=88508968;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GAAAAAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.295455:10:44:13:44:30:10:3:2:28:78:21:8:2:2:19 chr12 88533318 . C T 860.41 PASS AF=0.518072;AO=86;DP=166;FAO=86;FDP=166;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=27;FWDB=0.0267845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.211;QD=20.7329;RBI=0.0299753;REFB=-0.0307864;REVB=0.0134575;RO=78;SAF=41;SAR=45;SRF=51;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153089;STB=0.588952;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0341659;OID=.;OPOS=88533318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:78:80:86:86:0.518072:45:41:51:27:45:41:53:27 chr12 88547277 . T C 902.7 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.419;QD=58.2384;RBI=0.0479735;REFB=0;REVB=0.0464985;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021195;OID=.;OPOS=88547277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0 chr12 89743223 . G A 2092.78 PASS AF=1;AO=132;DP=132;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127598;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.537;QD=62.9409;RBI=0.0157786;REFB=0;REVB=0.00928193;RO=0;SAF=58;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128492;OID=.;OPOS=89743223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:133:0:0:132:133:1:74:58:0:0:75:58:0:0 chr12 89853408 . G A 328.76 PASS AF=0.413793;AO=31;DP=89;FAO=36;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0181267;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.74;QD=15.1152;RBI=0.0210341;REFB=-0.00851213;REVB=-0.0106703;RO=47;SAF=11;SAR=20;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102267;STB=0.560182;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0162526;OID=.;OPOS=89853408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:47:50:31:36:0.413793:20:11:21:26:23:13:23:27 chr12 89917518 . A G 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0599774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.862;QD=15.1564;RBI=0.0603899;REFB=-0.0258062;REVB=-0.00704716;RO=32;SAF=19;SAR=6;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163749;STB=0.59367;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0433598;OID=.;OPOS=89917518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:6:19:20:12:6:19:20:12 chr12 91348786 . G T 427.07 PASS AF=0.594203;AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00894243;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.619;QD=24.7579;RBI=0.0256211;REFB=-0.0266913;REVB=-0.0240099;RO=28;SAF=29;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560549;STB=0.530767;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0167963;OID=.;OPOS=91348786;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:28:28:41:41:0.594203:12:29:18:10:12:29:18:10 chr12 91449984 . C T 178.72 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0222424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0242;QD=22.3395;RBI=0.0273709;REFB=0.0179996;REVB=0.0159512;RO=14;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125302;STB=0.507034;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.012048;OID=.;OPOS=91449984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:8:10:8:6:8:10:8:6 chr12 91449990 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0159897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.641;QD=13.5055;RBI=0.0166163;REFB=-0.0206513;REVB=-0.00451994;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144712;STB=0.585219;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.024227;OID=.;OPOS=91449990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:4:8:9:8:4:8:9:8 chr12 92818482 . C T 147.66 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0280027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5745;QD=26.8471;RBI=0.0455601;REFB=0.0265583;REVB=-0.0359385;RO=7;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596536;STB=0.533289;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.0169848;OID=.;OPOS=92818482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:7:8:3:4:7:8:3:4 chr12 92818786 . A G 309.88 PASS AF=0.923077;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0176519;FXX=0.0370233;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.488;QD=47.6731;RBI=0.0197533;REFB=-0.0657748;REVB=-0.00886592;RO=2;SAF=11;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00596561;STB=0.503223;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.000484319;OID=.;OPOS=92818786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:27:26:2:2:24:24:0.923077:13:11:1:1:13:11:1:1 chr12 92818999 . G T 36.61 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.023956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.643;QD=7.32292;RBI=0.026226;REFB=-0.00698064;REVB=-0.010673;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34828;STB=0.728298;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0119619;OID=.;OPOS=92818999;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:5:1:6:8:5:1:6:8 chr12 92819139 . A C 289.5 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7879;QD=52.6361;RBI=0.0768691;REFB=0;REVB=0.0622465;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00206872;OID=.;OPOS=92819139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:6:15:0:0:6:16:0:0 chr12 92819466 . C T 468.54 PASS AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0148106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.145;QD=18.0206;RBI=0.0251295;REFB=0.0047383;REVB=0.0203012;RO=54;SAF=23;SAR=27;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720208;STB=0.539984;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.00405677;OID=.;OPOS=92819466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:0.480769:27:23:29:25:27:23:29:25 chr12 92819699 . A G 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0765409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.411;QD=16.3856;RBI=0.0769009;REFB=-0.0278278;REVB=0.00743236;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14199;STB=0.583142;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0330436;OID=.;OPOS=92819699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:6:3:4:4:6:3:4:4 chr12 92821860 . CT C,CC 584.51 PASS AF=0.447552,0.00699301;AO=59,5;DP=141;FAO=64,1;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=25,1;FSAR=39,0;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=0.00891469,0.00317059;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=101.69,104.936;QD=16.3499;RBI=0.0115766,0.0136772;REFB=-0.0157423,-0.0131785;REVB=-0.00738551,-0.0133047;RO=77;SAF=21,4;SAR=38,1;SRF=37;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.131398,0.314603;STB=0.55436,0.990309;STBP=0.284,0.277;TYPE=del,snp;VARB=0.0163345,-0.000192349;OID=.,.;OPOS=92821861,92821861;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.447552,0.00699301:59,5:141:64,1:143:78:25,1:39,0:38:40:99:77:21,4:38,1:37:40 chr12 92822903 . G C 205.09 PASS AF=0.555556;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0881883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.604;QD=22.7879;RBI=0.0899111;REFB=-0.00154111;REVB=-0.0175166;RO=15;SAF=3;SAR=16;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382586;STB=0.666481;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00140026;OID=.;OPOS=92822903;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:15:16:19:20:0.555556:16:3:8:7:16:4:8:8 chr12 93102295 . G A 1480.39 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.624;QD=62.9952;RBI=0.0369237;REFB=0;REVB=-0.0196482;RO=0;SAF=50;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198584;OID=.;OPOS=93102295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:43:50:0:0:44:50:0:0 chr12 93147907 . A T 2178.65 PASS AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.135;QD=63.1494;RBI=0.0692595;REFB=0;REVB=0.0284772;RO=0;SAF=75;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158558;OID=.;OPOS=93147907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:63:75:0:0:63:75:0:0 chr12 93150102 . T C 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.999;QD=64.1526;RBI=0.0142647;REFB=0;REVB=0.0104676;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.22174e-05;OID=.;OPOS=93150102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr12 93155535 . G A 498.88 PASS AF=0.566265;AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00823764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.827;QD=24.0422;RBI=0.012229;REFB=-0.02754;REVB=-0.00903821;RO=36;SAF=22;SAR=25;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130508;STB=0.571399;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0195342;OID=.;OPOS=93155535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:36:36:47:47:0.566265:25:22:11:25:25:22:11:25 chr12 93166538 . A G 1257.94 PASS AF=0.976744;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00156104;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=270.141;QD=58.509;RBI=0.021341;REFB=-0.0550204;REVB=0.0212839;RO=1;SAF=42;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111436;STB=0.511902;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.000139153;OID=.;OPOS=93166538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:86:86:1:2:83:84:0.976744:41:42:1:0:41:43:0:2 chr12 93166927 . TTA T,TAA 59.98 PASS AF=0.3,0;AO=9,11;DP=72;FAO=15,0;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=8,0;FSAR=7,0;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.00812442,-0.236874;FXX=0.0565931;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=14.5144,11.328;QD=4.79812;RBI=0.216731,0.237083;REFB=-0.0289881,0.0184266;REVB=0.216578,0.00996908;RO=38;SAF=3,9;SAR=6,2;SRF=13;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0119576,0.552285;STB=0.727025,0.5;STBP=0.061,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0752932,0;OID=.,.;OPOS=93166928,93166928;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3,0:9,11:72:15,0:50:35:8,0:7,0:7:28:61:38:3,9:6,2:13:25 chr12 93196422 . T G 512.04 PASS AF=0.972222;AO=36;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0174861;FXX=0.0270197;HRUN=9;LEN=1;MLLD=268.405;QD=56.8927;RBI=0.0183176;REFB=-0.0598982;REVB=-0.00545612;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199188;STB=0.510632;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000112092;OID=.;OPOS=93196422;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:36:1:1:36:35:0.972222:23:13:0:1:23:12:0:1 chr12 93202801 . C T 770.11 PASS AF=0.50641;AO=74;DP=155;FAO=79;FDP=156;FR=.;FRO=77;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.00893498;FXX=0.0249984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.894;QD=19.7465;RBI=0.0237185;REFB=-0.0193638;REVB=0.0219712;RO=81;SAF=42;SAR=32;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468523;STB=0.506848;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.018984;OID=.;OPOS=93202801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:81:77:74:79:0.50641:32:42:42:39:37:42:42:35 chr12 93692934 . G A 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0022198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.763;QD=60.9786;RBI=0.00729699;REFB=0;REVB=0.00695116;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78344e-05;OID=.;OPOS=93692934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr12 94243853 . C T 530.9 PASS AF=0.64;AO=47;DP=74;FAO=48;FDP=75;FR=.;FRO=27;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.00230662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.421;QD=28.3148;RBI=0.0237925;REFB=-0.0341035;REVB=0.0236805;RO=27;SAF=26;SAR=21;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129406;STB=0.566238;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0188431;OID=.;OPOS=94243853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:27:27:47:48:0.64:21:26:20:7:21:27:20:7 chr12 94543506 . C T 388.0 PASS AF=0.47619;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.153312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4543;QD=18.4762;RBI=0.153313;REFB=-0.0365319;REVB=-0.000418706;RO=41;SAF=25;SAR=15;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23522;STB=0.624937;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0479721;OID=.;OPOS=94543506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:41:44:40:40:0.47619:15:25:15:26:15:25:17:27 chr12 94645255 . A G 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.94;QD=64.1539;RBI=0.0139322;REFB=0;REVB=-0.00694857;RO=0;SAF=62;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08678e-06;OID=.;OPOS=94645255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:37:62:0:0:37:62:0:0 chr12 94671743 . G C 1324.85 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0322891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.519;QD=60.9129;RBI=0.0397577;REFB=-0.0281553;REVB=0.0231968;RO=1;SAF=41;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114156;STB=0.506023;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=9.45522e-05;OID=.;OPOS=94671743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:45:41:1:0:45:41:1:0 chr12 94673509 . GC G 83.13 PASS AF=0.583333;AO=12;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00533038;FXX=0.039984;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.6353;QD=13.8557;RBI=0.180106;REFB=0.0626885;REVB=-0.180027;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.365854;SSSB=-0.0213307;STB=0.519203;STBP=0.883;TYPE=del;VARB=-0.0499979;OID=.;OPOS=94673510;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:12:25:14:24:10:5:9:4:6:47:9:5:7:4:5 chr12 94694743 . T C 323.72 PASS AF=0.409091;AO=35;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.0151815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.42;QD=14.7145;RBI=0.0193589;REFB=-0.0126658;REVB=-0.012012;RO=52;SAF=12;SAR=23;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417503;STB=0.534849;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0160319;OID=.;OPOS=94694743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:52:35:36:0.409091:23:12:16:36:23:13:16:36 chr12 94769758 . A G 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.73;QD=59.6795;RBI=0.00909075;REFB=0;REVB=-0.00587276;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05434e-07;OID=.;OPOS=94769758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:43:27:0:0:43:27:0:0 chr12 94909304 . A G 576.94 PASS AF=0.975;AO=35;DP=35;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0387253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8828;QD=57.6943;RBI=0.0547982;REFB=-0.0446922;REVB=0.0387711;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.512814;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00648761;OID=.;OPOS=94909304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:40:0:1:35:39:0.975:19:16:0:0:19:20:0:1 chr12 94955644 . G T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.877;QD=60.9785;RBI=0.0142352;REFB=0;REVB=0.00991435;RO=0;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021461;OID=.;OPOS=94955644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:28:11:0:0:28:11:0:0 chr12 94975799 . G A 197.33 PASS AF=0.352113;AO=23;DP=70;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00945049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.748;QD=11.1169;RBI=0.0118263;REFB=0.00101966;REVB=0.00710987;RO=46;SAF=13;SAR=10;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746165;STB=0.53904;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00140088;OID=.;OPOS=94975799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:46:46:23:25:0.352113:10:13:23:23:11:14:23:23 chr12 94976084 . T C 215.56 PASS AF=0.341772;AO=25;DP=79;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00105206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.512;QD=10.9145;RBI=0.0055971;REFB=-0.0116769;REVB=-0.00549734;RO=52;SAF=12;SAR=13;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000887637;STB=0.524818;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.019197;OID=.;OPOS=94976084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:52:52:25:27:0.341772:13:12:25:27:13:14:25:27 chr12 94976159 . T C 99.95 PASS AF=0.259259;AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0103341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.602;QD=7.40378;RBI=0.0116307;REFB=-0.00482228;REVB=0.00533653;RO=38;SAF=9;SAR=5;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319389;STB=0.675921;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.015901;OID=.;OPOS=94976159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:38:40:14:14:0.259259:5:9:14:24:5:9:16:24 chr12 95228286 . G C 358.11 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0385702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.19;QD=22.3817;RBI=0.0442824;REFB=-0.00224823;REVB=0.0217548;RO=28;SAF=13;SAR=23;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171;STB=0.594421;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00147747;OID=.;OPOS=95228286;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:23:13:16:12:23:13:16:12 chr12 95470600 . A ATCTT 221.9 PASS AF=0.385714;AO=24;DP=81;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00445144;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=4;MLLD=247.155;QD=12.6802;RBI=0.0218842;REFB=-0.0234741;REVB=-0.0214267;RO=52;SAF=15;SAR=9;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23337;STB=0.616118;STBP=0.138;TYPE=ins;VARB=0.0356957;OID=.;OPOS=95470601;OREF=-;OALT=TCTT;OMAPALT=ATCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.385714:24:81:27:70:43:17:10:19:24:99:52:15:9:22:30 chr12 95475220 . A G 226.01 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00696731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.781;QD=20.5465;RBI=0.0127492;REFB=-0.00718786;REVB=0.0106771;RO=22;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442443;STB=0.524865;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00725424;OID=.;OPOS=95475220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:14:8:7:15:14:8:7:15 chr12 95478353 . C T 206.1 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.01707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.214;QD=16.8243;RBI=0.0219055;REFB=0.00236142;REVB=-0.0137283;RO=26;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106976;STB=0.561345;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=-0.00462338;OID=.;OPOS=95478353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:28:21:21:0.428571:12:9:14:12:12:9:15:13 chr12 95500727 . C G 167.88 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0206197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1983;QD=15.6171;RBI=0.0776257;REFB=-0.0306261;REVB=0.074837;RO=25;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134157;STB=0.577341;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0409515;OID=.;OPOS=95500727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:11:7:13:12:11:7:13:12 chr12 95681554 . C T 578.17 PASS AF=0.552083;AO=53;DP=97;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0124338;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.3;QD=24.0903;RBI=0.0125984;REFB=0.00439641;REVB=0.00203004;RO=43;SAF=22;SAR=31;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076437;STB=0.541856;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=-0.00422311;OID=.;OPOS=95681554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:43:43:53:53:0.552083:31:22:14:29:31:22:14:29 chr12 95694394 . G A 670.13 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.077;QD=62.3372;RBI=0.0159958;REFB=0;REVB=0.00457592;RO=0;SAF=11;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13527e-05;OID=.;OPOS=95694394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:32:11:0:0:32:11:0:0 chr12 95906603 . C A 525.43 PASS AF=0.556818;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0270562;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.351;QD=23.8833;RBI=0.0290349;REFB=-0.0227413;REVB=-0.0105351;RO=39;SAF=19;SAR=30;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468492;STB=0.525681;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0141008;OID=.;OPOS=95906603;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:39:39:49:49:0.556818:30:19:13:26:30:19:13:26 chr12 95927762 . T C 1209.82 PASS AF=0.987805;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0784278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2691;QD=59.0155;RBI=0.0810367;REFB=-0.079479;REVB=0.0203969;RO=1;SAF=35;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133348;STB=0.506848;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00179409;OID=.;OPOS=95927762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:80:81:0.987805:45:35:1:0:45:36:1:0 chr12 96052721 . G A 232.4 PASS AF=0.564103;AO=21;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00231995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.647;QD=23.8361;RBI=0.0110603;REFB=-0.0237;REVB=0.0108142;RO=17;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121483;STB=0.553143;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0137104;OID=.;OPOS=96052721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:17:17:21:22:0.564103:13:8:9:8:13:9:9:8 chr12 96252833 . A G 473.91 PASS AF=0.511111;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=-0.00196381;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.662;QD=21.0625;RBI=0.0145439;REFB=-0.0310699;REVB=-0.0144108;RO=44;SAF=21;SAR=25;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125019;STB=0.568936;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0330489;OID=.;OPOS=96252833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:44:44:46:46:0.511111:25:21:14:30:25:21:14:30 chr12 96284650 . A G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.165;QD=62.9818;RBI=0.029213;REFB=0;REVB=-0.0256138;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.62946e-05;OID=.;OPOS=96284650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0 chr12 96288860 . T C 680.65 PASS AF=0.445783;AO=74;DP=166;FAO=74;FDP=166;FR=.;FRO=92;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=0.0383008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.53;QD=16.4012;RBI=0.0392957;REFB=-0.0200003;REVB=0.00878625;RO=92;SAF=36;SAR=38;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00820007;STB=0.504562;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0253015;OID=.;OPOS=96288860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:92:92:74:74:0.445783:38:36:44:48:38:36:44:48 chr12 96346594 . T C 300.32 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0135256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2819;QD=24.5159;RBI=0.055518;REFB=0.038862;REVB=0.0538452;RO=22;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219436;STB=0.621735;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.0296792;OID=.;OPOS=96346594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:16:11:15:7:16:11:15:7 chr12 96374563 . T C 1357.18 PASS AF=0.967391;AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00757269;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=304.384;QD=59.0078;RBI=0.00789898;REFB=0.0717345;REVB=0.00224683;RO=3;SAF=36;SAR=53;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167436;STB=0.508841;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=5.41053e-06;OID=.;OPOS=96374563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:92:92:3:3:89:89:0.967391:53:36:2:1:53:36:2:1 chr12 96374614 . C T 810.14 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00771982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.058;QD=56.8516;RBI=0.0355268;REFB=0;REVB=0.034678;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242243;OID=.;OPOS=96374614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:57:0:0:55:57:1:35:20:0:0:37:20:0:0 chr12 96384249 . T C 764.82 PASS AF=1;AO=39;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5933;QD=63.735;RBI=0.0515549;REFB=0;REVB=0.0501187;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447334;OID=.;OPOS=96384249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:39:48:1:19:20:0:0:27:21:0:0 chr12 96387621 . A G 1218.55 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0145539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2339;QD=58.7255;RBI=0.0147834;REFB=-0.0819668;REVB=0.00259462;RO=1;SAF=33;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014132;STB=0.502308;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00360974;OID=.;OPOS=96387621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:83:83:1:2:81:81:0.975904:48:33:1:0:48:33:1:1 chr12 96387765 . T A 1108.51 PASS AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0374879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7256;QD=57.5851;RBI=0.0502672;REFB=-0.142163;REVB=0.0334881;RO=1;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150175;STB=0.502318;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00401232;OID=.;OPOS=96387765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:77:1:2:75:75:0.974026:31:44:0:1:31:44:1:1 chr12 96641016 . C T 145.54 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0174708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.494;QD=16.1711;RBI=0.0180963;REFB=0.00170801;REVB=0.00471676;RO=20;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144044;STB=0.583225;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.00164913;OID=.;OPOS=96641016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:11:5:9:11:11:5:9:11 chr12 96673764 . T C 220.43 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0181561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8514;QD=24.492;RBI=0.0212858;REFB=-0.0439459;REVB=0.0111103;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713466;STB=0.503975;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0152717;OID=.;OPOS=96673764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:7:8:11:10:7:8 chr12 96676330 . C A 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00619442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.162;QD=15.1567;RBI=0.00774147;REFB=-0.0159349;REVB=-0.00464322;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278056;STB=0.523925;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0195637;OID=.;OPOS=96676330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:13:12:14:17:13:12:14:18 chr12 96697149 . C T 340.89 PASS AF=0.486486;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0469514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5142;QD=18.4266;RBI=0.0471791;REFB=4.83196e-05;REVB=0.00463012;RO=38;SAF=23;SAR=12;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282821;STB=0.510198;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.000629012;OID=.;OPOS=96697149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:35:36:0.486486:12:23:26:12:12:24:26:12 chr12 96821251 . A T 297.85 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0505977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9944;QD=15.8852;RBI=0.0577591;REFB=-0.0153533;REVB=0.0278565;RO=42;SAF=15;SAR=18;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115727;STB=0.565178;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0197672;OID=.;OPOS=96821251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:18:15:24:18:18:15:24:18 chr12 96900801 . G T 902.7 PASS AF=1;AO=60;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043863;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130;QD=58.2388;RBI=0.0466214;REFB=0;REVB=0.0157986;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00176975;OID=.;OPOS=96900801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:62:0:0:60:62:1:24:36:0:0:25:37:0:0 chr12 96992494 . C T 236.01 PASS AF=0.4375;AO=27;DP=63;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0366777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.755;QD=14.7506;RBI=0.0382556;REFB=0.00876414;REVB=-0.0108737;RO=36;SAF=16;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382511;STB=0.530001;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.0180873;OID=.;OPOS=96992494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:36:36:27:28:0.4375:11:16:20:16:11:17:20:16 chr12 97045481 . C T 377.08 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-4.96159e-07;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.088;QD=13.9658;RBI=0.00735382;REFB=-0.00583662;REVB=-0.00735382;RO=64;SAF=19;SAR=25;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443699;STB=0.525032;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.00747795;OID=.;OPOS=97045481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:25:19:25:39:25:19:25:39 chr12 97098549 . T C 154.72 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0327873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5518;QD=14.7353;RBI=0.0335729;REFB=0.00147012;REVB=0.00722044;RO=25;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32844;STB=0.689158;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00186509;OID=.;OPOS=97098549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:6:11:8:17:6:11:8:17 chr12 97102578 . G A 56.26 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0699131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8534;QD=11.2512;RBI=0.0709061;REFB=-0.004876;REVB=-0.0118248;RO=12;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.523804;STB=0.822616;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000726681;OID=.;OPOS=97102578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:7:1:7:5:7:1:7:5 chr12 97114231 . G A 271.69 PASS AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.110037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7242;QD=20.8991;RBI=0.113315;REFB=-0.0218884;REVB=0.027059;RO=24;SAF=19;SAR=9;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112977;STB=0.562458;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0199866;OID=.;OPOS=97114231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:9:19:19:5:9:19:19:5 chr12 97136218 . T C 164.68 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.00610705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.301;QD=9.54645;RBI=0.0281431;REFB=7.26064e-05;REVB=0.0274725;RO=47;SAF=14;SAR=8;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00241639;STB=0.501423;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317186;OID=.;OPOS=97136218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:47:47:22:22:0.318841:8:14:30:17:8:14:30:17 chr12 97136239 . G A 153.52 PASS AF=0.304348;AO=21;DP=69;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0075588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.036;QD=8.89945;RBI=0.0197768;REFB=-0.0101775;REVB=-0.0182753;RO=48;SAF=11;SAR=10;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951229;STB=0.556276;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0185372;OID=.;OPOS=97136239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:48:48:21:21:0.304348:10:11:29:19:10:11:29:19 chr12 97254620 . G A 549.77 PASS AF=0.4;AO=60;DP=148;FAO=60;FDP=150;FR=.;FRO=90;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=43;FWDB=-0.00869538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.742;QD=14.6604;RBI=0.00884744;REFB=-0.0151163;REVB=-0.00163328;RO=88;SAF=31;SAR=29;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00641115;STB=0.503337;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0321895;OID=.;OPOS=97254620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:88:90:60:60:0.4:29:31:46:42:29:31:47:43 chr12 98332904 . TCA T 97.33 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00672255;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=2;MLLD=292.701;QD=11.45;RBI=0.0179073;REFB=-0.0114505;REVB=-0.0165976;RO=23;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119645;STB=0.588093;STBP=0.451;TYPE=del;VARB=0.0202512;OID=.;OPOS=98332905;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.352941:12:37:12:34:22:6:6:14:8:97:23:6:6:14:9 chr12 98897267 . C T 293.61 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0148412;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.005;QD=26.0988;RBI=0.0421697;REFB=-0.00745739;REVB=0.0394718;RO=19;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429704;STB=0.523791;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00244681;OID=.;OPOS=98897267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:19:19:26:26:0.577778:11:15:12:7:11:15:12:7 chr12 99007623 . C T 296.58 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00928226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9301;QD=15.6094;RBI=0.0853381;REFB=-0.00358347;REVB=-0.0848318;RO=42;SAF=20;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199418;STB=0.618485;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00341265;OID=.;OPOS=99007623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:43:33:33:0.434211:13:20:17:25:13:20:17:26 chr12 99477625 . T C 1212.56 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0219676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.396;QD=59.8797;RBI=0.0426081;REFB=-0.0722139;REVB=-0.0365086;RO=1;SAF=37;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126242;STB=0.506665;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00180381;OID=.;OPOS=99477625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:43:37:1:0:43:37:1:0 chr12 99640428 . T C 2034.81 PASS AF=1;AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964112;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.536;QD=62.6096;RBI=0.0139881;REFB=0;REVB=0.0101349;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43781e-05;OID=.;OPOS=99640428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:130:0:0:130:130:1:70:60:0:0:70:60:0:0 chr12 99640557 . T C 1695.28 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.722;QD=60.5458;RBI=0.0442721;REFB=0;REVB=0.0243231;RO=0;SAF=54;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40765e-05;OID=.;OPOS=99640557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:58:54:0:0:58:54:0:0 chr12 101017445 . T C 1608.24 PASS AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.503;QD=59.0181;RBI=0.0427628;REFB=0.0281622;REVB=0.03937;RO=1;SAF=47;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00999205;STB=0.505262;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.000175441;OID=.;OPOS=101017445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:1:1:108:108:0.990826:61:47:1:0:61:47:1:0 chr12 101520689 . A G 322.39 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0205515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.886;QD=16.5329;RBI=0.0249971;REFB=-0.00846064;REVB=0.01423;RO=43;SAF=18;SAR=17;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00260814;STB=0.501465;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0132748;OID=.;OPOS=101520689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:17:18:22:21:17:18:22:21 chr12 101522078 . C G 102.42 PASS AF=0.2;AO=17;DP=85;FAO=17;FDP=85;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0108084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5084;QD=4.81957;RBI=0.0141607;REFB=-0.00712406;REVB=0.00914892;RO=68;SAF=13;SAR=4;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267661;STB=0.67325;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0388685;OID=.;OPOS=101522078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:68:68:17:17:0.2:4:13:39:29:4:13:39:29 chr12 101552075 . G A 191.92 PASS AF=0.268041;AO=26;DP=97;FAO=26;FDP=97;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0487783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1656;QD=7.91417;RBI=0.0509341;REFB=-0.00929374;REVB=-0.0146615;RO=71;SAF=14;SAR=12;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383866;STB=0.523035;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0214847;OID=.;OPOS=101552075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:71:71:26:26:0.268041:12:14:36:35:12:14:36:35 chr12 101560328 . C A 312.88 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0189986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9581;QD=14.3853;RBI=0.0328429;REFB=0.0030146;REVB=-0.0267901;RO=52;SAF=15;SAR=20;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266892;STB=0.515143;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.00468079;OID=.;OPOS=101560328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:20:15:21:31:20:15:21:31 chr12 101561940 . A T 189.46 PASS AF=0.423077;AO=21;DP=51;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0208195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.294;QD=14.5736;RBI=0.0213171;REFB=-0.0245028;REVB=0.00457878;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906091;STB=0.561986;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0239748;OID=.;OPOS=101561940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:30:30:21:22:0.423077:8:13:16:14:8:14:16:14 chr12 101587518 . C T 321.31 PASS AF=0.5;AO=33;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00110346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.981;QD=18.9003;RBI=0.0142812;REFB=-0.011706;REVB=-0.0142385;RO=33;SAF=12;SAR=21;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21901;STB=0.617578;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0161705;OID=.;OPOS=101587518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:34:33:34:0.5:21:12:20:13:21:13:21:13 chr12 101683929 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=44;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.955;QD=56.9569;RBI=0.0176314;REFB=0;REVB=0.00616282;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06942e-05;OID=.;OPOS=101683929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:44:52:1:26:18:0:0:31:21:0:0 chr12 101732670 . C T 159.45 PASS AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.294;QD=45.5584;RBI=0.0403591;REFB=0;REVB=0.0389564;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029719;OID=.;OPOS=101732670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:6:7:0:0:6:8:0:0 chr12 101750814 . T A 1190.26 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.185;QD=61.0391;RBI=0.0108571;REFB=0;REVB=-0.0107565;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.88819e-05;OID=.;OPOS=101750814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr12 101755809 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.096;QD=58.0611;RBI=0.0242182;REFB=0;REVB=0.0177474;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7795e-05;OID=.;OPOS=101755809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0 chr12 101866174 . C A 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6143;QD=58.0606;RBI=0.0267402;REFB=0;REVB=-0.0246858;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000254377;OID=.;OPOS=101866174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0 chr12 102064118 . T C 1153.15 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6687;QD=60.6923;RBI=0.068491;REFB=0;REVB=-0.0671717;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00061016;OID=.;OPOS=102064118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0 chr12 102069077 . A G 283.75 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00834638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.543;QD=23.1632;RBI=0.0160562;REFB=0.00577603;REVB=0.0137164;RO=22;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317299;STB=0.50788;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=-0.00414246;OID=.;OPOS=102069077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:23:26:26:0.530612:12:14:11:11:12:14:12:11 chr12 102079418 . G A 1434.42 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.82;QD=63.0516;RBI=0.0596126;REFB=0;REVB=0.0586423;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149678;OID=.;OPOS=102079418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:46:45:0:0:46:45:0:0 chr12 102108301 . T C 566.8 PASS AF=0.458015;AO=58;DP=126;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.0049819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6409;QD=17.307;RBI=0.0280682;REFB=-0.0422476;REVB=-0.0276226;RO=68;SAF=28;SAR=30;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118249;STB=0.508697;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.049283;OID=.;OPOS=102108301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:131:68:71:58:60:0.458015:30:28:32:36:32:28:32:39 chr12 102117581 . T C 558.08 PASS AF=0.571429;AO=51;DP=89;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0405225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7707;QD=24.531;RBI=0.0468214;REFB=0.0160358;REVB=0.0234558;RO=38;SAF=21;SAR=30;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351433;STB=0.516965;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.0107438;OID=.;OPOS=102117581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:38:39:51:52:0.571429:30:21:14:24:30:22:15:24 chr12 102117589 . C T 1385.86 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.898;QD=62.2859;RBI=0.0154974;REFB=0;REVB=-0.0100675;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255289;OID=.;OPOS=102117589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:50:38:0:0:51:38:0:0 chr12 102158763 . T C 613.28 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.701;QD=61.3281;RBI=0.0198764;REFB=0;REVB=0.0116136;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104728;OID=.;OPOS=102158763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr12 102173654 . T C 671.33 PASS AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0244434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.172;QD=52.6535;RBI=0.0544462;REFB=-0.00811896;REVB=0.0486508;RO=1;SAF=21;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218744;STB=0.52173;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000477401;OID=.;OPOS=102173654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:51:1:2:48:49:0.960784:27:21:1:0:27:22:2:0 chr12 102279193 . G A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00122421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9766;QD=61.3359;RBI=0.041061;REFB=0;REVB=-0.0410428;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000631711;OID=.;OPOS=102279193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:12:28:0:0:12:28:0:0 chr12 102315358 . TG T,TT 647.08 PASS AF=0.952381,0.047619;AO=13,27;DP=40;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0785998,-0.0768077;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.416,181.168;QD=61.6265;RBI=0.0803747,0.0794284;REFB=0,0;REVB=-0.0167976,-0.0202349;RO=0;SAF=5,17;SAR=8,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.60098e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.011735,0.0239722;OID=.,.;OPOS=102315359,102315359;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.952381,0.047619:13,27:40:40,2:42:0:23,0:17,2:0:0:8:0:5,17:8,10:0:0 chr12 102317232 . C A 253.6 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00289972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4459;QD=17.4896;RBI=0.0732092;REFB=0.0110344;REVB=-0.0731518;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187115;STB=0.604804;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.0125264;OID=.;OPOS=102317232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:16:12:19:11:16:12:19:11 chr12 102321583 . C T 982.76 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1722;QD=58.6722;RBI=0.0183022;REFB=0;REVB=-0.00470093;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023147;OID=.;OPOS=102321583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:39:27:0:0:40:27:0:0 chr12 102455729 . G A 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.163;QD=60.0307;RBI=0.0299655;REFB=0;REVB=0.00523797;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31031e-05;OID=.;OPOS=102455729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0 chr12 102517804 . G A 739.04 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-6.72485e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.217;QD=54.7439;RBI=0.00392118;REFB=0.0716845;REVB=-0.0039206;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165303;STB=0.508769;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-1.8693e-05;OID=.;OPOS=102517804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:28:25:0:1:28:25:0:1 chr12 102545563 . A G 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.265;QD=58.5991;RBI=0.0174734;REFB=0;REVB=0.0131976;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65965e-05;OID=.;OPOS=102545563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr12 102611371 . T G 340.66 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3494;QD=54.5057;RBI=0.0680228;REFB=0;REVB=0.0618683;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248553;OID=.;OPOS=102611371;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:7:17:0:0:8:17:0:0 chr12 103237468 . G C 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.341;QD=60.7157;RBI=0.0836672;REFB=0;REVB=-0.0836591;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113043;OID=.;OPOS=103237468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0 chr12 103246700 . C T 711.54 PASS AF=0.962963;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0657195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.932;QD=52.7067;RBI=0.082494;REFB=-0.0705798;REVB=0.0498619;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521731;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000628229;OID=.;OPOS=103246700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:54:0:2:51:52:0.962963:29:22:0:0:30:22:2:0 chr12 103558235 . G A 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0651153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.557;QD=58.6001;RBI=0.0652016;REFB=0;REVB=0.00335249;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130498;OID=.;OPOS=103558235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:25:39:0:0:25:39:0:0 chr12 103670917 . A G 560.82 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700638;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.028;QD=60.629;RBI=0.0701014;REFB=0;REVB=0.00229313;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020107;OID=.;OPOS=103670917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0 chr12 103761909 . C T 162.18 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0874847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0146;QD=12.0136;RBI=0.0956837;REFB=-0.0123966;REVB=-0.038753;RO=34;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211379;STB=0.622145;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0125444;OID=.;OPOS=103761909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:9:11:12:22:9:11:12:22 chr12 103872172 . T G 191.02 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0130328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.217;QD=13.4051;RBI=0.0132102;REFB=-0.00349586;REVB=-0.00215749;RO=34;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682366;STB=0.539136;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00429361;OID=.;OPOS=103872172;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:10:13:17:17:10:13:17:17 chr12 104067812 . C T 955.16 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.839;QD=58.7788;RBI=0.0369862;REFB=0;REVB=0.004969;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.39729e-05;OID=.;OPOS=104067812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0 chr12 104086631 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.352;QD=56.9568;RBI=0.0536822;REFB=0;REVB=0.00134408;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.90759e-05;OID=.;OPOS=104086631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0 chr12 104092996 . T C 2404.05 PASS AF=1;AO=156;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255505;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.174;QD=61.2498;RBI=0.0282508;REFB=0;REVB=0.012053;RO=0;SAF=84;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714072;OID=.;OPOS=104092996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:156:157:1:72:84:0:0:72:85:0:0 chr12 104100617 . C T 4129.78 PASS AF=1;AO=264;DP=265;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492512;FXX=0.00375926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.856;QD=62.3364;RBI=0.049253;REFB=-0.0613546;REVB=-0.000423516;RO=1;SAF=141;SAR=123;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00386039;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3214e-05;OID=.;OPOS=104100617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:265:265:1:0:264:265:1:123:141:0:1:123:142:0:0 chr12 104131540 . T A 422.59 PASS AF=0.462366;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=-0.028402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.024;QD=18.1758;RBI=0.0317108;REFB=0.0115409;REVB=-0.0141032;RO=49;SAF=22;SAR=21;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196118;STB=0.61319;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.0139459;OID=.;OPOS=104131540;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:49:50:43:43:0.462366:21:22:15:34:21:22:15:35 chr12 104153004 . C G 1212.74 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.623;QD=59.8884;RBI=0.0219813;REFB=0.000558721;REVB=0.0085865;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.505881;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=3.46688e-05;OID=.;OPOS=104153004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:42:38:0:0:42:38:0:1 chr12 104156158 . C A 339.27 PASS AF=0.349593;AO=37;DP=118;FAO=43;FDP=123;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=0.0365174;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.29;QD=11.033;RBI=0.0366262;REFB=-0.0100366;REVB=-0.00282067;RO=81;SAF=16;SAR=21;SRF=31;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602653;STB=0.588506;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.022594;OID=.;OPOS=104156158;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:123:81:80:37:43:0.349593:21:16:31:50:21:22:30:50 chr12 104186946 . G T 834.27 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.743;QD=57.5358;RBI=0.0273049;REFB=0;REVB=-0.0119598;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130746;OID=.;OPOS=104186946;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0 chr12 104254932 . G A 927.02 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1105;QD=57.9384;RBI=0.0541735;REFB=0;REVB=-0.049522;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000251978;OID=.;OPOS=104254932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:27:36:0:0:28:36:0:0 chr12 104309559 . C T 1538.02 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0318465;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.552;QD=62.7764;RBI=0.0389179;REFB=-0.130852;REVB=0.0223696;RO=1;SAF=46;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101988;STB=0.505375;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0015699;OID=.;OPOS=104309559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:51:46:1:0:51:46:1:0 chr12 104341103 . C T 582.43 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.117;QD=58.2426;RBI=0.0258134;REFB=0.00271038;REVB=0.0232318;RO=1;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=8.15321e-05;OID=.;OPOS=104341103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:22:17:0:1:22:17:0:1 chr12 104359779 . C T 87.07 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00602934;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.8729;QD=12.0098;RBI=0.0340218;REFB=-0.0217156;REVB=-0.0334833;RO=18;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216945;STB=0.631311;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0481256;OID=.;OPOS=104359779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:30:29:18:18:11:11:0.37931:9:2:6:12:9:2:6:12 chr12 104408794 . C T 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0842803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.376;QD=59.8373;RBI=0.0843964;REFB=0;REVB=0.00442542;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101431;OID=.;OPOS=104408794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr12 104512918 . T G 229.04 PASS AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0108085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.926;QD=30.538;RBI=0.03779;REFB=-0.0227359;REVB=-0.0362114;RO=9;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017341;STB=0.509545;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.012566;OID=.;OPOS=104512918;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:10:11:5:4:10:11:5:4 chr12 104645363 . G A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.715;QD=61.3364;RBI=0.0383883;REFB=0;REVB=0.00907482;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146755;OID=.;OPOS=104645363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr12 104645405 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.568;QD=63.8719;RBI=0.0379167;REFB=0;REVB=0.0195229;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143007;OID=.;OPOS=104645405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chr12 104698582 . A G 144.77 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00962638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.011;QD=15.6509;RBI=0.0214296;REFB=-0.00937272;REVB=-0.0191458;RO=21;SAF=12;SAR=4;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414625;STB=0.739422;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0125775;OID=.;OPOS=104698582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:4:12:7:14:4:12:7:14 chr12 105245665 . T C 315.02 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0616303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.39;QD=20.0013;RBI=0.0621272;REFB=-0.0076046;REVB=0.00784217;RO=30;SAF=11;SAR=22;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317307;STB=0.517636;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00731504;OID=.;OPOS=105245665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:22:11:11:19:22:11:11:19 chr12 105380143 . G A 286.26 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=0.0354751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.913;QD=18.1751;RBI=0.0355393;REFB=-0.0042081;REVB=0.00213573;RO=32;SAF=11;SAR=20;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213079;STB=0.617615;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00403835;OID=.;OPOS=105380143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:20:11:5:27:20:11:5:27 chr12 105380152 . A C 277.74 PASS AF=0.484375;AO=30;DP=63;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0302559;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3283;QD=17.3585;RBI=0.0451262;REFB=-0.00280827;REVB=-0.0334807;RO=33;SAF=10;SAR=20;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208378;STB=0.622572;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00506204;OID=.;OPOS=105380152;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:33:33:30:31:0.484375:20:10:5:28:20:11:5:28 chr12 105433523 . T A 359.75 PASS AF=0.403846;AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0045717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.454;QD=13.8366;RBI=0.0138856;REFB=-0.014252;REVB=-0.0131114;RO=62;SAF=23;SAR=19;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333456;STB=0.518868;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0189938;OID=.;OPOS=105433523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:62:42:42:0.403846:19:23:32:30:19:23:32:30 chr12 105434467 . C T 304.1 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.026686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.648;QD=19.9409;RBI=0.0310495;REFB=0.00310366;REVB=-0.0158722;RO=28;SAF=14;SAR=18;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227958;STB=0.505194;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00271796;OID=.;OPOS=105434467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:29:32:32:0.52459:18:14:13:15:18:14:13:16 chr12 105546172 . G A 1731.2 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.407;QD=60.7439;RBI=0.0160757;REFB=0;REVB=0.00680333;RO=0;SAF=47;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3323e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76815e-05;OID=.;OPOS=105546172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:67:47:0:0:67:47:0:0 chr12 105561664 . C T 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.291;QD=63.8706;RBI=0.0237197;REFB=0;REVB=0.00605719;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.92293e-05;OID=.;OPOS=105561664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr12 105562788 . T C 389.41 PASS AF=0.386555;AO=46;DP=120;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.00547835;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.441;QD=13.0894;RBI=0.0103352;REFB=-0.00200909;REVB=0.00876378;RO=71;SAF=29;SAR=17;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135814;STB=0.586259;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00298505;OID=.;OPOS=105562788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:71:73:46:46:0.386555:17:29:36:35:17:29:36:37 chr12 105567068 . T A 958.45 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0123176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.158;QD=57.2206;RBI=0.0378788;REFB=-0.0826656;REVB=-0.0358202;RO=1;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141028;STB=0.50746;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000598474;OID=.;OPOS=105567068;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:33:33:0:1:33:33:0:1 chr12 105567070 . T A 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.696;QD=59.1432;RBI=0.0137817;REFB=0;REVB=0.00290407;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65941e-05;OID=.;OPOS=105567070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr12 105567089 . T A 901.41 PASS AF=0.955224;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00709479;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.8441;QD=53.8152;RBI=0.00714907;REFB=-0.112974;REVB=0.000879313;RO=3;SAF=33;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154053;STB=0.508164;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0055485;OID=.;OPOS=105567089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:67:67:3:3:64:64:0.955224:31:33:1:2:31:33:1:2 chr12 105567135 . T C 153.91 PASS AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0114245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4174;QD=11.6156;RBI=0.0279761;REFB=-0.00179376;REVB=0.0255371;RO=33;SAF=12;SAR=7;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416325;STB=0.510718;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00546045;OID=.;OPOS=105567135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:7:12:22:11:7:12:22:12 chr12 105568122 . G A 3079.03 PASS AF=1;AO=193;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0784211;FXX=0.0252513;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6141;QD=63.814;RBI=0.0788475;REFB=-0.0177511;REVB=0.00818911;RO=0;SAF=100;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269889;OID=.;OPOS=105568122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:195:193:0:0:193:193:1:93:100:0:0:93:100:0:0 chr12 105568176 . G A 2393.34 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368733;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.013;QD=64.2508;RBI=0.0373769;REFB=0;REVB=-0.00611549;RO=0;SAF=79;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.35223e-05;OID=.;OPOS=105568176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:149:0:0:149:149:1:70:79:0:0:70:79:0:0 chr12 106458571 . ACCCCCCCC ACCCCCCCA,ACCCCCCCAC,ACCCCCCC,ACCCCCCCCC 112.65 PASS AF=0.611111,0,0.277778,0.111111;AO=3,4,2,2;DP=18;FAO=11,0,5,2;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,0,0;FSAR=10,0,5,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080082,0.077825,0.0711468,-0.0711468;FXX=0;HRUN=9,0,9,9;LEN=1,1,1,1;MLLD=236.88,224.29,3.95041,4.12942;QD=25.0341;RBI=0.088235,0.0868239,0.407859,0.40921;REFB=-0.0147161,-0.0186106,0.0317801,-0.0303052;REVB=0.0370445,0.0384923,0.401606,-0.402978;RO=3;SAF=1,0,0,0;SAR=2,4,2,2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.352427,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,ins,del,ins;VARB=0.0118216,0,0.0948867,0.197473;OID=.,.,.,.;OPOS=106458579,106458579,106458572,106458572;OREF=C,-,C,-;OALT=A,A,-,C;OMAPALT=ACCCCCCCA,ACCCCCCCAC,ACCCCCCC,ACCCCCCCCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.611111,0,0.277778,0.111111:3,4,2,2:18:11,0,5,2:18:0:1,0,0,0:10,0,5,2:0:0:19:3:1,0,0,0:2,4,2,2:0:3 chr12 106633569 . C T 263.03 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0745118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4883;QD=15.0302;RBI=0.0890626;REFB=-0.0302121;REVB=0.0487867;RO=40;SAF=5;SAR=25;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387121;STB=0.722722;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0398597;OID=.;OPOS=106633569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:25:5:19:21:25:5:19:21 chr12 106647842 . C T 157.75 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0166732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6842;QD=16.605;RBI=0.0885983;REFB=-0.0130705;REVB=-0.0870153;RO=21;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291976;STB=0.516759;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0117037;OID=.;OPOS=106647842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:6:11:13:8:6:11:13:8 chr12 106838340 . T C 1044.26 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.427;QD=59.6723;RBI=0.0289415;REFB=0;REVB=0.0167397;RO=0;SAF=44;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112233;OID=.;OPOS=106838340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:26:44:0:0:26:44:0:0 chr12 106893863 . G T 1098.54 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.062;QD=60.1938;RBI=0.0498969;REFB=0;REVB=0.0221853;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158807;OID=.;OPOS=106893863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:30:43:0:0:30:43:0:0 chr12 106893930 . A T 1116.44 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.396;QD=60.3482;RBI=0.022875;REFB=0;REVB=-0.00259642;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15927e-05;OID=.;OPOS=106893930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0 chr12 106903321 . T C 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.269;QD=61.3753;RBI=0.0483211;REFB=0;REVB=0.0268593;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85439e-05;OID=.;OPOS=106903321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:36:44:0:0:36:44:0:0 chr12 107090201 . T C 354.38 PASS AF=0.367521;AO=43;DP=118;FAO=43;FDP=117;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=-0.00332242;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.319;QD=12.1157;RBI=0.00962241;REFB=-0.0104883;REVB=-0.00903063;RO=74;SAF=23;SAR=20;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157478;STB=0.589703;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0217382;OID=.;OPOS=107090201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:74:74:43:43:0.367521:20:23:29:45:20:23:29:45 chr12 107155511 . G A 655.86 PASS AF=0.524194;AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0114448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.321;QD=21.1569;RBI=0.0253576;REFB=-0.0145204;REVB=-0.0226279;RO=59;SAF=35;SAR=30;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181976;STB=0.509997;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0119154;OID=.;OPOS=107155511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:59:59:65:65:0.524194:30:35:33:26:30:35:33:26 chr12 107395106 . A G 822.55 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227579;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.856;QD=57.7229;RBI=0.0358524;REFB=0;REVB=0.0277032;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302115;OID=.;OPOS=107395106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:20:37:0:0:20:37:0:0 chr12 107713696 . G A 200.63 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0452008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.997;QD=20.5771;RBI=0.0459129;REFB=-0.0157525;REVB=0.00805509;RO=14;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11484;STB=0.609512;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0158609;OID=.;OPOS=107713696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:14:19:20:20:0.512821:7:13:11:3:7:13:16:3 chr12 108169925 . T C 196.72 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0189675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.409;QD=18.2998;RBI=0.01965;REFB=0.00510655;REVB=0.00513396;RO=23;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420163;STB=0.523905;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.015395;OID=.;OPOS=108169925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:13:7:9:14:13:7:9:14 chr12 108170359 . C T 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0137089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.235;QD=11.4398;RBI=0.0172839;REFB=-0.019071;REVB=-0.0105261;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168206;STB=0.599791;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0218264;OID=.;OPOS=108170359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:5:4:4:10:5:4:4:10 chr12 108618630 . C T 2140.65 PASS AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175;QD=62.9604;RBI=0.0200039;REFB=0;REVB=0.0185356;RO=0;SAF=63;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.57773e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55742e-05;OID=.;OPOS=108618630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:73:63:0:0:73:63:0:0 chr12 108634185 . C A 986.33 PASS AF=0.562874;AO=94;DP=167;FAO=94;FDP=167;FR=.;FRO=73;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.0106344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.398;QD=23.6246;RBI=0.012009;REFB=-0.0244081;REVB=-0.0055789;RO=73;SAF=41;SAR=53;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571795;STB=0.531151;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0234146;OID=.;OPOS=108634185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:73:73:94:94:0.562874:53:41:37:36:53:41:37:36 chr12 108643553 . C T 391.83 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0056954;FXX=0.0266631;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.047;QD=21.4702;RBI=0.00907147;REFB=-0.00680654;REVB=-0.00706073;RO=34;SAF=25;SAR=14;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196657;STB=0.608826;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00367832;OID=.;OPOS=108643553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:73:34:34:39:39:0.534247:14:25:14:20:14:25:14:20 chr12 108918146 . C T 2351.95 PASS AF=1;AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.613;QD=61.0897;RBI=0.0162626;REFB=0;REVB=0.00665666;RO=0;SAF=92;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.698e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13078e-05;OID=.;OPOS=108918146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:154:0:0:154:154:1:62:92:0:0:62:92:0:0 chr12 108923950 . A G 651.21 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.413;QD=62.0203;RBI=0.0646882;REFB=0;REVB=-0.0132071;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037212;OID=.;OPOS=108923950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:20:21:0:0:20:22:0:0 chr12 108954823 . C T 728.92 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2664;QD=57.1705;RBI=0.0210355;REFB=0;REVB=0.0143993;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367503;OID=.;OPOS=108954823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:24:26:0:0:24:27:0:0 chr12 108955106 . C CT 381.95 PASS AF=1;AO=31;DP=35;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387281;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.4042;QD=47.7444;RBI=0.0557122;REFB=0;REVB=-0.0400497;RO=4;SAF=16;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498038;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=6.31897e-05;OID=.;OPOS=108955107;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:31:35:32:32:0:17:15:0:0:7:4:16:15:3:1 chr12 108955158 . T A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.201;QD=50.4134;RBI=0.0398173;REFB=0;REVB=0.038135;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227179;OID=.;OPOS=108955158;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr12 108986031 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0616331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7837;QD=16.3858;RBI=0.0906179;REFB=0.0172104;REVB=0.0664302;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571344;STB=0.53326;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=-0.00608453;OID=.;OPOS=108986031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:5:3:4:5:5:3 chr12 109182049 . T C 223.6 PASS AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0627887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.007;QD=26.3057;RBI=0.0650884;REFB=-0.0183799;REVB=-0.0171489;RO=13;SAF=10;SAR=11;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226697;STB=0.62489;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0170234;OID=.;OPOS=109182049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:11:10:2:11:11:10:2:11 chr12 109219903 . C G 557.69 PASS AF=0.544554;AO=55;DP=101;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0106527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.56;QD=22.0867;RBI=0.0120998;REFB=-0.0074053;REVB=0.00573806;RO=46;SAF=27;SAR=28;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976194;STB=0.553539;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0061514;OID=.;OPOS=109219903;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:46:46:55:55:0.544554:28:27:28:18:28:27:28:18 chr12 109277492 . C A 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311619;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.44;QD=57.6807;RBI=0.0311626;REFB=0;REVB=-0.000217052;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106504;OID=.;OPOS=109277492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr12 109511256 . T C 747.62 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.588;QD=63.627;RBI=0.0513783;REFB=0;REVB=0.0364979;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291544;OID=.;OPOS=109511256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:15:31:0:0:16:31:0:0 chr12 109520769 . A G 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0586705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2639;QD=19.8493;RBI=0.0591987;REFB=-3.91431e-05;REVB=-0.00789061;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114631;STB=0.56513;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.00217226;OID=.;OPOS=109520769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:7:6:9:6:7:6 chr12 109577735 . C T 287.85 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00175273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.266;QD=25.0308;RBI=0.00851722;REFB=-0.0148734;REVB=0.00833493;RO=20;SAF=18;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381715;STB=0.521219;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0102201;OID=.;OPOS=109577735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:8:18:13:7:8:18:13:7 chr12 109605730 . C T 463.37 PASS AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00528933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.76;QD=21.8056;RBI=0.00598748;REFB=-0.0052993;REVB=0.00280588;RO=40;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713296;STB=0.503935;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00681078;OID=.;OPOS=109605730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:21:24:21:19:21:24:21:19 chr12 109617865 . T C 236.88 PASS AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.010804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.467;QD=17.8779;RBI=0.0177583;REFB=-0.0126658;REVB=0.0140937;RO=26;SAF=7;SAR=18;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714957;STB=0.51514;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0080124;OID=.;OPOS=109617865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:27:25:26:0.490566:18:7:9:17:18:8:9:18 chr12 109675029 . T C 1367.24 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.372;QD=61.449;RBI=0.0184978;REFB=-0.0922559;REVB=0.0179351;RO=0;SAF=39;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015566;OID=.;OPOS=109675029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:89:89:0:0:88:89:1:49:39:0:0:50:39:0:0 chr12 109693982 . C T 53.13 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.024588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.445;QD=7.32771;RBI=0.0397992;REFB=-0.00111947;REVB=-0.0312954;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137469;STB=0.585998;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00129529;OID=.;OPOS=109693982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:13:8:4:4:13:8 chr12 109696838 . G A 1560.23 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424655;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.057;QD=60.0088;RBI=0.0426238;REFB=0;REVB=0.00367005;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80861e-05;OID=.;OPOS=109696838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:56:48:0:0:56:48:0:0 chr12 109717697 . A G 267.36 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.019151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7319;QD=18.4383;RBI=0.0453379;REFB=-0.0191876;REVB=0.0410945;RO=29;SAF=18;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215798;STB=0.620606;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0226617;OID=.;OPOS=109717697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:11:18:11:18:11:18:11:18 chr12 109848567 . T C 202.02 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0235663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.131;QD=21.2649;RBI=0.0246064;REFB=-0.00893626;REVB=-0.00707864;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134987;STB=0.575841;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00943655;OID=.;OPOS=109848567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:9:11:7:11:9:11:7:11 chr12 109883374 . T C 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0147385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.703;QD=25.711;RBI=0.0207374;REFB=-0.013468;REVB=0.0145882;RO=6;SAF=3;SAR=10;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769806;STB=0.543408;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0086142;OID=.;OPOS=109883374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:10:3:2:4:10:3:2:4 chr12 109887525 . C T 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0032954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.529;QD=12.3961;RBI=0.0141036;REFB=0.00214416;REVB=0.0137132;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317065;STB=0.691596;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.000939329;OID=.;OPOS=109887525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:1:4:2:3:1:4 chr12 109921723 . A C 390.97 PASS AF=0.44086;AO=40;DP=92;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00818342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.077;QD=16.8161;RBI=0.0091253;REFB=-0.00334084;REVB=-0.00403767;RO=52;SAF=18;SAR=22;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889042;STB=0.541908;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00449936;OID=.;OPOS=109921723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:52:52:40:41:0.44086:22:18:28:24:22:19:28:24 chr12 109927806 . G C 384.11 PASS AF=0.414141;AO=40;DP=98;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.0138749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.445;QD=15.5197;RBI=0.0583938;REFB=-0.0230107;REVB=-0.0567214;RO=58;SAF=18;SAR=22;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124011;STB=0.57581;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0363686;OID=.;OPOS=109927806;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:58:58:40:41:0.414141:22:18:33:25:23:18:33:25 chr12 109937534 . G A 198.04 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0235087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.558;QD=11.1571;RBI=0.0235617;REFB=-0.00630503;REVB=-0.00157971;RO=46;SAF=12;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223269;STB=0.512955;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0116092;OID=.;OPOS=109937534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:46:46:25:25:0.352113:13:12:23:23:13:12:23:23 chr12 109993942 . G T 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00663612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.931;QD=13.5806;RBI=0.00843082;REFB=-0.0114535;REVB=0.00520005;RO=28;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102001;STB=0.559161;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0197181;OID=.;OPOS=109993942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:10:7:9:19:10:7:9:19 chr12 109994870 . A T 82.7 PASS AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0385339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.596;QD=9.18857;RBI=0.0435179;REFB=0.00262537;REVB=-0.0202224;RO=24;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110746;STB=0.555453;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=-0.0114869;OID=.;OPOS=109994870;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:36:24:25:11:11:0.305556:7:4:11:13:7:4:11:14 chr12 110024541 . A G 300.47 PASS AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.000930474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0995;QD=19.0776;RBI=0.0453227;REFB=0.013508;REVB=-0.0453131;RO=31;SAF=17;SAR=15;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183161;STB=0.601708;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00903466;OID=.;OPOS=110024541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:15:17:10:21:15:17:10:21 chr12 110029108 . C T 160.51 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00531425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3615;QD=18.344;RBI=0.019188;REFB=-0.0197081;REVB=0.0184375;RO=16;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183655;STB=0.633739;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0299916;OID=.;OPOS=110029108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:18:17:17:0.485714:11:6:9:7:11:6:11:7 chr12 110226379 . G A 337.97 PASS AF=0.406593;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.000119706;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.322;QD=14.856;RBI=0.00877952;REFB=-0.000171431;REVB=-0.0087787;RO=54;SAF=16;SAR=21;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147717;STB=0.583633;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.000397059;OID=.;OPOS=110226379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:54:54:37:37:0.406593:21:16:31:23:21:16:31:23 chr12 110226796 . A G 163.47 PASS AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0534112;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5708;QD=19.2317;RBI=0.0535999;REFB=-0.0183022;REVB=-0.00449405;RO=16;SAF=5;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191794;STB=0.62671;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0143064;OID=.;OPOS=110226796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:16:17:17:17:0.5:12:5:8:8:12:5:9:8 chr12 110240838 . T G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.482;QD=51.184;RBI=0.0741172;REFB=0;REVB=0.0428133;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125501;OID=.;OPOS=110240838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0 chr12 110342598 . G A 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0406904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4655;QD=14.9201;RBI=0.0828012;REFB=-0.0123619;REVB=0.0721134;RO=37;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764671;STB=0.543328;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0162453;OID=.;OPOS=110342598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:15:13:20:17:15:13:20:17 chr12 110390979 . T C 359.58 PASS AF=0.457831;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0176243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.878;QD=17.3291;RBI=0.0180194;REFB=-0.0104709;REVB=-0.0037527;RO=45;SAF=13;SAR=25;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105603;STB=0.55929;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0118544;OID=.;OPOS=110390979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:45:38:38:0.457831:25:13:20:25:25:13:20:25 chr12 110720416 . G T 323.0 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00593844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.099;QD=21.8982;RBI=0.0187656;REFB=-0.0189659;REVB=0.0178012;RO=26;SAF=10;SAR=23;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171265;STB=0.594991;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0186671;OID=.;OPOS=110720416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:23:10:13:13:23:10:13:13 chr12 111353556 . A G 133.4 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00830141;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.304;QD=14.0417;RBI=0.0313252;REFB=-0.0113282;REVB=0.0302052;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125503;STB=0.572859;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0237609;OID=.;OPOS=111353556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:7:8:15:8:7:8:15:8 chr12 111747963 . C T 692.93 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214095;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.372;QD=62.9939;RBI=0.0214564;REFB=0;REVB=0.00141714;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74989e-05;OID=.;OPOS=111747963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0 chr12 111760251 . G C 306.32 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.16;QD=53.2735;RBI=0.0331571;REFB=0;REVB=-0.0179291;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001822;OID=.;OPOS=111760251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr12 111785586 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.884;QD=60.9785;RBI=0.0992225;REFB=0;REVB=0.0986918;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384767;OID=.;OPOS=111785586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0 chr12 111786082 . G C 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.017;QD=47.8189;RBI=0.0535699;REFB=0;REVB=0.0478103;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109284;OID=.;OPOS=111786082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chr12 111786892 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.578;QD=60.9782;RBI=0.0226082;REFB=0;REVB=0.0196924;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128474;OID=.;OPOS=111786892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0 chr12 111798553 . A G 1504.91 PASS AF=0.97;AO=96;DP=99;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0292993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9205;QD=60.1962;RBI=0.0318773;REFB=-0.0544534;REVB=-0.0125585;RO=2;SAF=55;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00288141;STB=0.502748;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00200495;OID=.;OPOS=111798553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:99:100:2:3:96:97:0.97:41:55:1:1:41:56:2:1 chr12 111884608 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.592;QD=60.9786;RBI=0.0351398;REFB=0;REVB=-0.0173049;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82343e-05;OID=.;OPOS=111884608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr12 111886967 . T A 187.0 PASS AF=0.342857;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.000762257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.45;QD=10.6854;RBI=0.00768436;REFB=-0.00368904;REVB=0.00764646;RO=46;SAF=9;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30547;STB=0.676942;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0072701;OID=.;OPOS=111886967;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:46:46:24:24:0.342857:15:9:30:16:15:9:30:16 chr12 111993712 . C T 304.92 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.031833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7788;QD=26.5143;RBI=0.0358265;REFB=-0.0196571;REVB=0.0164377;RO=18;SAF=15;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806132;STB=0.555514;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0136788;OID=.;OPOS=111993712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:18:19:27:27:0.586957:12:15:8:10:12:15:8:11 chr12 112110489 . T C 238.22 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00410185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.935;QD=20.2743;RBI=0.0150073;REFB=-4.08119e-06;REVB=0.0144358;RO=24;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216262;STB=0.512185;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=7.7074e-05;OID=.;OPOS=112110489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:10:13:13:11:10:13:13:11 chr12 112191641 . G A 46.23 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00150848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.222;QD=7.11198;RBI=0.0540999;REFB=-0.0261747;REVB=0.0540788;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363483;STB=0.744008;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0499821;OID=.;OPOS=112191641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:18:19:7:7:0.269231:2:5:7:11:2:5:7:12 chr12 112194727 . C T 74.46 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00293645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.575;QD=22.9113;RBI=0.0340034;REFB=0.0114541;REVB=-0.0338763;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107529;STB=0.561271;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00953804;OID=.;OPOS=112194727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:4:5:3:1:4:5:3:1 chr12 112241766 . G A 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00786957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.336;QD=17.6438;RBI=0.0420936;REFB=0.0184958;REVB=0.0413514;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394541;STB=0.730799;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00692146;OID=.;OPOS=112241766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:2:5:2:7:2:5 chr12 112375990 . A C 191.87 PASS AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0233082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9737;QD=11.8075;RBI=0.0483524;REFB=-0.00995825;REVB=0.0423636;RO=41;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298416;STB=0.517227;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0182639;OID=.;OPOS=112375990;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:14:10:16:25:14:10:16:25 chr12 112416586 . C T 190.95 PASS AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0252011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6479;QD=30.5513;RBI=0.0844279;REFB=0.046255;REVB=0.080579;RO=7;SAF=6;SAR=12;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113625;STB=0.562434;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0169813;OID=.;OPOS=112416586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:12:6:1:6:12:6:1:6 chr12 112460147 . T G 43.02 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00114246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.029;QD=5.37733;RBI=0.0307893;REFB=0.00342334;REVB=-0.0307681;RO=25;SAF=4;SAR=3;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190123;STB=0.622323;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.0188749;OID=.;OPOS=112460147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:25:25:7:7:0.21875:3:4:18:7:3:4:18:7 chr12 112460749 . A G 2216.69 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.436;QD=63.334;RBI=0.0112595;REFB=0;REVB=-0.00880637;RO=0;SAF=67;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.62677e-06;OID=.;OPOS=112460749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:73:67:0:0:73:67:0:0 chr12 112464893 . C T 164.13 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0115754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.885;QD=12.8731;RBI=0.0153216;REFB=-0.0127625;REVB=-0.0100379;RO=32;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249578;STB=0.644298;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.024278;OID=.;OPOS=112464893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:8:11:11:21:8:11:11:21 chr12 112477055 . T C 251.7 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.00865437;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=246.609;QD=20.5471;RBI=0.0283193;REFB=-0.0273357;REVB=-0.0269645;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300219;STB=0.673342;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.022572;OID=.;OPOS=112477055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:25:24:24:0.489796:12:12:4:20:12:12:4:21 chr12 112577990 . T C 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0187478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.015;QD=22.5809;RBI=0.0193647;REFB=-0.0151707;REVB=0.00484869;RO=7;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139548;STB=0.578819;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00950733;OID=.;OPOS=112577990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:6:6:2:5:6:6:2:5 chr12 112580071 . C T 306.16 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=0.0561094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.007;QD=15.3078;RBI=0.0561465;REFB=0.00891709;REVB=-0.00204234;RO=46;SAF=14;SAR=20;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164804;STB=0.592426;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-0.015984;OID=.;OPOS=112580071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:20:14:12:34:20:14:12:34 chr12 112598321 . G A 364.45 PASS AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.000173762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.441;QD=23.8982;RBI=0.00567237;REFB=-0.0035303;REVB=0.0056697;RO=25;SAF=19;SAR=17;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542295;STB=0.529773;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00157586;OID=.;OPOS=112598321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:17:19:15:10:17:19:15:10 chr12 112667675 . T G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.926;QD=62.0216;RBI=0.0372129;REFB=0;REVB=0.0169729;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223265;OID=.;OPOS=112667675;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:29:13:0:0:29:13:0:0 chr12 112703732 . A C 194.62 PASS AF=0.328947;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0137369;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.183;QD=10.243;RBI=0.0182638;REFB=-0.0122544;REVB=0.012036;RO=51;SAF=12;SAR=13;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123861;STB=0.57227;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0189643;OID=.;OPOS=112703732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:51:51:25:25:0.328947:13:12:30:21:13:12:30:21 chr12 112704961 . A G 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0208826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.026;QD=15.3789;RBI=0.0215888;REFB=-0.0237413;REVB=-0.00547652;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781007;STB=0.545378;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0330944;OID=.;OPOS=112704961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:5:7:7:7:5:7:7:7 chr12 112705013 . C T 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0397317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3751;QD=16.3853;RBI=0.0398631;REFB=-0.00884046;REVB=-0.00323366;RO=8;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437433;STB=0.756168;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0057991;OID=.;OPOS=112705013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:2:7:2:6:2:7:2:6 chr12 113313470 . C T 3783.06 PASS AF=1;AO=238;DP=239;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221921;FXX=0.00416649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2704;QD=63.3148;RBI=0.0970182;REFB=-0.0165564;REVB=0.094446;RO=1;SAF=132;SAR=106;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359705;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052537;OID=.;OPOS=113313470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:239:239:1:0:238:239:1:106:132:1:0:106:133:0:0 chr12 113319600 . C T 1116.92 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8942;QD=60.3742;RBI=0.0222994;REFB=0;REVB=0.0137554;RO=0;SAF=45;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124607;OID=.;OPOS=113319600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:29:45:0:0:29:45:0:0 chr12 113325629 . T C 1229.81 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03362;FXX=0.0240935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.29;QD=60.7315;RBI=0.0338074;REFB=0;REVB=0.0035538;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07335e-06;OID=.;OPOS=113325629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:44:36:0:0:45:36:0:0 chr12 113348870 . G A 306.15 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00778001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3896;QD=15.3075;RBI=0.010214;REFB=-0.0123122;REVB=-0.00661788;RO=46;SAF=18;SAR=16;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520231;STB=0.529394;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0162737;OID=.;OPOS=113348870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:16:18:22:24:16:18:22:24 chr12 113357209 . G A 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0551666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.76;QD=12.7389;RBI=0.0564182;REFB=-0.00670682;REVB=-0.0118177;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341689;STB=0.705344;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00722199;OID=.;OPOS=113357209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:4:6:2:6:4:6 chr12 113357237 . G C 198.43 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00467449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4452;QD=19.3588;RBI=0.0057307;REFB=0.00185997;REVB=-0.00331511;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180259;STB=0.510194;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.0027778;OID=.;OPOS=113357237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:12:8:8:13:12:8:8:13 chr12 113357442 . G A 295.76 PASS AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0759705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9631;QD=22.3212;RBI=0.0972004;REFB=-0.000490441;REVB=0.0606333;RO=23;SAF=16;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432316;STB=0.523914;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00341891;OID=.;OPOS=113357442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:14:16:11:12:14:16:11:12 chr12 113369715 . TA T 189.98 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00284124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.646;QD=11.5138;RBI=0.00344784;REFB=-0.00186462;REVB=-0.00195319;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978871;STB=0.556628;STBP=0.491;TYPE=del;VARB=0.00369004;OID=.;OPOS=113369716;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636:24:66:24:66:42:13:11:19:23:99:42:13:11:19:23 chr12 113369759 . G C 180.09 PASS AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.057319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9937;QD=11.0822;RBI=0.0639277;REFB=0.00141402;REVB=-0.0283069;RO=42;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117253;STB=0.56781;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.00151936;OID=.;OPOS=113369759;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:13:10:14:28:13:10:14:28 chr12 113376388 . G A 115.39 PASS AF=0.451613;AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.108473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.3507;QD=14.8895;RBI=0.134961;REFB=-0.0713673;REVB=0.0803002;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048982;STB=0.509421;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0816831;OID=.;OPOS=113376388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:17:17:13:14:0.451613:7:6:7:10:8:6:7:10 chr12 113376452 . C T 64.35 PASS AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0340481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.279;QD=23.3999;RBI=0.0380819;REFB=-0.0645074;REVB=-0.0170575;RO=3;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509198;STB=0.529336;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0433197;OID=.;OPOS=113376452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:6:2:1:2:6:2:1:2 chr12 113379599 . A G 257.29 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0254842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.004;QD=23.3896;RBI=0.0256847;REFB=-0.0186403;REVB=-0.00320344;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00988379;OID=.;OPOS=113379599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:12:12:10:10:12:12:10:10 chr12 113386950 . T C 837.23 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0644535;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.699;QD=57.7398;RBI=0.0644938;REFB=0;REVB=0.00227996;RO=0;SAF=17;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.91953e-05;OID=.;OPOS=113386950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:41:17:0:0:41:17:0:0 chr12 113398918 . CG C,CA 729.87 PASS AF=0.0833333,0.916667;AO=5,42;DP=47;FAO=4,44;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=4,18;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01929,0.0374674;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=138.338,161.885;QD=60.8229;RBI=0.0224036,0.0395129;REFB=0,0;REVB=0.0113937,0.0125484;RO=0;SAF=5,17;SAR=0,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,2.98888e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0450176,0.000834465;OID=.,.;OPOS=113398919,113398919;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0833333,0.916667:5,42:47:4,44:48:0:4,18:0,26:0:0:11:0:5,17:0,25:0:0 chr12 113425154 . C G 130.31 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.228;QD=43.4349;RBI=0.0310675;REFB=0;REVB=-0.00444181;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145125;OID=.;OPOS=113425154;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0 chr12 113435450 . A T 1804.15 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.956;QD=61.1578;RBI=0.0365706;REFB=0;REVB=0.0342051;RO=0;SAF=62;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.24785e-05;OID=.;OPOS=113435450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:56:62:0:0:56:62:0:0 chr12 113448288 . A G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.524;QD=58.6006;RBI=0.0156384;REFB=0;REVB=0.0135967;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0961e-05;OID=.;OPOS=113448288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0 chr12 113546014 . A G 445.64 PASS AF=0.617647;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0244469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.006;QD=26.2143;RBI=0.0258987;REFB=-0.0200535;REVB=0.00854947;RO=26;SAF=11;SAR=31;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104598;STB=0.557334;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0112447;OID=.;OPOS=113546014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:26:26:42:42:0.617647:31:11:10:16:31:11:10:16 chr12 113553481 . C T 505.33 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319205;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.866;QD=59.4511;RBI=0.0351033;REFB=0;REVB=0.0146056;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167403;OID=.;OPOS=113553481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:26:8:0:0:26:8:0:0 chr12 113737736 . AG A 35.14 PASS AF=0.32;AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.166809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9947;QD=5.62272;RBI=0.222272;REFB=-0.114948;REVB=-0.146901;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.226804;SSSB=0.550754;STB=0.701598;STBP=0.188;TYPE=del;VARB=0.163931;OID=.;OPOS=113737737;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.32:7:24:8:25:17:6:2:8:9:35:14:6:1:5:9 chr12 113796566 . A C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8957;QD=45.8054;RBI=0.0240904;REFB=0;REVB=0.00485909;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000390652;OID=.;OPOS=113796566;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr12 114362483 . C T 629.23 PASS AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0100554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=359.028;QD=57.2025;RBI=0.0104473;REFB=-0.03025;REVB=-0.00283438;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50331;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.000211554;OID=.;OPOS=114362483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:44:44:0:2:42:42:0.954545:24:18:0:0:24:18:1:1 chr12 114374887 . T C 462.66 PASS AF=0.447368;AO=50;DP=114;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0303909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2447;QD=16.2337;RBI=0.0306558;REFB=-0.0261146;REVB=-0.0040213;RO=61;SAF=17;SAR=33;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140542;STB=0.580162;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0395947;OID=.;OPOS=114374887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:61:63:50:51:0.447368:33:17:29:32:33:18:31:32 chr12 114377835 . A G 506.88 PASS AF=0.545455;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00360062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.933;QD=23.04;RBI=0.00442754;REFB=-0.0176785;REVB=0.00257657;RO=39;SAF=25;SAR=23;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691908;STB=0.54346;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0146689;OID=.;OPOS=114377835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:39:40:48:48:0.545455:23:25:17:22:23:25:17:23 chr12 114377877 . T C 354.35 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0102984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.857;QD=21.4756;RBI=0.010419;REFB=-0.00831223;REVB=0.0015804;RO=30;SAF=20;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459741;STB=0.52541;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00541529;OID=.;OPOS=114377877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:16:20:15:15:16:20:15:15 chr12 114377899 . G C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.159;QD=59.3225;RBI=0.047656;REFB=0;REVB=0.0465203;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154246;OID=.;OPOS=114377899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0 chr12 114383651 . C T 263.26 PASS AF=0.364706;AO=29;DP=84;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00114596;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.773;QD=12.3885;RBI=0.0100488;REFB=-0.010966;REVB=-0.00998321;RO=55;SAF=11;SAR=18;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108396;STB=0.549616;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0215894;OID=.;OPOS=114383651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:55:54:29:31:0.364706:18:11:26:29:19:12:25:29 chr12 114386572 . C T 115.58 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00204844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.289;QD=11.0071;RBI=0.0191379;REFB=-0.00662157;REVB=-0.019028;RO=27;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140189;STB=0.571326;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0153549;OID=.;OPOS=114386572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:28:14:14:0.333333:6:8:12:15:6:8:13:15 chr12 114386639 . A G 190.92 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.0165996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.554;QD=11.5707;RBI=0.0233492;REFB=-0.0133958;REVB=-0.0164207;RO=42;SAF=18;SAR=6;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142679;STB=0.58326;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0159486;OID=.;OPOS=114386639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:6:18:27:15:6:18:27:15 chr12 114395651 . T C 637.45 PASS AF=0.532787;AO=62;DP=119;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00949695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8244;QD=20.9001;RBI=0.0166533;REFB=-0.0323927;REVB=0.01368;RO=57;SAF=31;SAR=31;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534747;STB=0.525112;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.029332;OID=.;OPOS=114395651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:122:57:57:62:65:0.532787:31:31:32:25:32:33:32:25 chr12 114793240 . C T 222.88 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.000454678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.414;QD=18.9688;RBI=0.0147941;REFB=-0.00956193;REVB=-0.0147871;RO=25;SAF=9;SAR=13;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17861;STB=0.601065;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0109377;OID=.;OPOS=114793240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:13:9:15:10:13:9:15:10 chr12 114793297 . T C 224.37 PASS AF=0.617647;AO=15;DP=38;FAO=21;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0446886;FXX=0.0810592;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.828;QD=26.3965;RBI=0.0456899;REFB=-0.123683;REVB=0.00951307;RO=17;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338505;STB=0.583014;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0580833;OID=.;OPOS=114793297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:38:34:17:12:15:21:0.617647:10:5:12:5:10:11:9:3 chr12 114793299 . T C 51.34 PASS AF=0.228571;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0381042;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=30.7928;QD=5.86759;RBI=0.0431728;REFB=-0.0780021;REVB=-0.0202969;RO=22;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.62025;STB=0.867277;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.166603;OID=.;OPOS=114793299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:36:35:22:25:8:8:0.228571:1:7:7:15:1:7:10:15 chr12 114942966 . T C 150.12 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.000326761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.926;QD=19.3696;RBI=0.00348434;REFB=-0.00245317;REVB=0.00346898;RO=15;SAF=2;SAR=14;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127426;STB=0.571349;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00159301;OID=.;OPOS=114942966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:14:2:1:14:14:2:1:14 chr12 116408538 . A G 1848.98 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00034596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.975;QD=61.1234;RBI=0.0212761;REFB=0;REVB=0.0212733;RO=0;SAF=57;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.17476e-05;OID=.;OPOS=116408538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:63:57:0:0:64:57:0:0 chr12 116446445 . C T 1283.06 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.156;QD=61.8343;RBI=0.013802;REFB=0;REVB=-0.00794035;RO=0;SAF=31;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90671e-05;OID=.;OPOS=116446445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:51:31:0:0:51:32:0:0 chr12 117014406 . A G 30.49 PASS AF=0.454545;AO=3;DP=13;FAO=5;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00189774;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=236.115;QD=11.0878;RBI=0.0291216;REFB=0.0201279;REVB=0.0290597;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294841;STB=0.749312;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.02326;OID=.;OPOS=117014406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:13:11:8:6:3:5:0.454545:2:1:1:7:3:2:0:6 chr12 117217141 . T C 805.62 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.22;QD=64.4497;RBI=0.0298665;REFB=0;REVB=0.0170592;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125988;OID=.;OPOS=117217141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:31:18:0:0:31:19:0:0 chr12 117289613 . G C 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00692848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.462;QD=17.6172;RBI=0.0246389;REFB=-0.0174453;REVB=0.0236447;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384386;STB=0.525403;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0165965;OID=.;OPOS=117289613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:27:24:24:0.470588:10:14:15:9:10:14:17:10 chr12 117290182 . T C,TTTCCCC 184.53 PASS AF=0.027027,0.486486;AO=2,17;DP=38;FAO=1,18;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=1,8;FSAR=0,10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0439402,-0.0112948;FXX=0.0263089;HRUN=3,3;LEN=1,6;MLLD=50.9014,269.247;QD=19.9494;RBI=0.0791775,0.0138144;REFB=-0.0361205,-0.0227404;REVB=-0.065866,-0.00795389;RO=18;SAF=2,7;SAR=0,10;SRF=5;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.631566,0.128736;STB=0.993738,0.585896;STBP=0.159,0.321;TYPE=snp,ins;VARB=-0.117843,0.0236497;OID=.,.;OPOS=117290182,117290183;OREF=T,-;OALT=C,TTCCCC;OMAPALT=C,TTTCCCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:38:37:18:18:2,17:1,18:0.027027,0.486486:0,10:2,7:5:13:0,10:1,8:5:13 chr12 117383320 . G A 885.4 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00412104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5222;QD=58.0589;RBI=0.0042587;REFB=0;REVB=0.00107401;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96566e-05;OID=.;OPOS=117383320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0 chr12 117465857 . T C 1179.92 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.995;QD=60.5087;RBI=0.0252204;REFB=0;REVB=0.0251627;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22108e-05;OID=.;OPOS=117465857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:28:49:0:0:29:49:0:0 chr12 117584066 . G A 482.8 PASS AF=0.608108;AO=45;DP=74;FAO=45;FDP=74;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00889198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.747;QD=26.0971;RBI=0.00986925;REFB=-0.00674403;REVB=0.00428192;RO=29;SAF=21;SAR=24;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134626;STB=0.573444;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00361081;OID=.;OPOS=117584066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:29:29:45:45:0.608108:24:21:19:10:24:21:19:10 chr12 117669914 . G A 245.85 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0250162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.886;QD=15.6094;RBI=0.0259401;REFB=-0.0116149;REVB=0.0068612;RO=34;SAF=9;SAR=19;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658498;STB=0.548271;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0116802;OID=.;OPOS=117669914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:19:9:13:21:19:9:14:21 chr12 117685270 . G A 1079.0 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000768409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.362;QD=59.9442;RBI=0.0155464;REFB=0;REVB=0.0155274;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72498e-05;OID=.;OPOS=117685270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:35:37:0:0 chr12 117693817 . G A 529.18 PASS AF=0.906977;AO=37;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0914191;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.217;QD=49.2262;RBI=0.106316;REFB=-0.17632;REVB=0.0542742;RO=5;SAF=9;SAR=28;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201606;STB=0.551309;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0184418;OID=.;OPOS=117693817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:43:43:5:4:37:39:0.906977:28:9:5:0:28:11:3:1 chr12 117890947 . T C 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.229;QD=62.3144;RBI=0.0118336;REFB=0;REVB=-0.000652713;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7443e-05;OID=.;OPOS=117890947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:39:47:0:0:39:47:0:0 chr12 118020115 . G A 165.58 PASS AF=0.323529;AO=22;DP=68;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0255263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.875;QD=9.73981;RBI=0.0259953;REFB=-0.0141988;REVB=0.00491585;RO=46;SAF=10;SAR=12;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102001;STB=0.559946;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0293959;OID=.;OPOS=118020115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:46:46:22:22:0.323529:12:10:25:21:12:10:25:21 chr12 118199286 . C G 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.922;QD=47.8202;RBI=0.0148005;REFB=0;REVB=0.0127732;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195163;OID=.;OPOS=118199286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr12 118467553 . A G,T 941.98 PASS AF=0.833333,0.166667;AO=55,11;DP=66;FAO=55,11;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31,8;FSAR=24,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000986243,-0.011486;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=138.621,68.2797;QD=57.0895;RBI=0.00487818,0.0120296;REFB=0,0;REVB=0.00477744,-0.00357541;RO=0;SAF=31,8;SAR=24,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=8.42687e-05,0.157185;OID=.,.;OPOS=118467553,118467553;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:48:66:66:0:0:55,11:55,11:0.833333,0.166667:24,3:31,8:0:0:24,3:31,8:0:0 chr12 118473054 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.02;QD=59.4356;RBI=0.0348179;REFB=0;REVB=0.0304744;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117089;OID=.;OPOS=118473054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr12 118506186 . A T 286.19 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00483078;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.208;QD=17.8869;RBI=0.00693093;REFB=-0.00840416;REVB=-0.00497005;RO=32;SAF=17;SAR=14;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156859;STB=0.51723;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0105713;OID=.;OPOS=118506186;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:32:33:31:31:0.484375:14:17:17:15:14:17:17:16 chr12 118506327 . TTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC TTCCTCCTCCTCCTCC,TTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCT 92.42 PASS AF=0.529412,0.117647;AO=8,3;DP=17;FAO=9,2;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=1,2;FSAR=8,0;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0267249,0.101649;FXX=0.0555247;HRUN=1,2;LEN=6,1;MLLD=162.663,42.7646;QD=21.7465;RBI=0.0352359,0.111599;REFB=-0.0489149,-0.0324549;REVB=0.0229641,0.0460634;RO=5;SAF=0,3;SAR=8,0;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.794084;STB=0.551599,0.996247;STBP=0.831,0.048;TYPE=del,snp;VARB=0.0268686,0.0564176;OID=.,.;OPOS=118506328,118506348;OREF=TCCTCC,C;OALT=-,T;OMAPALT=TTCCTCCTCCTCCTCC,TTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.529412,0.117647:8,3:17:9,2:17:6:1,2:8,0:1:5:43:5:0,3:8,0:0:5 chr12 118509191 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.672;QD=56.7061;RBI=0.0362901;REFB=0;REVB=0.00403453;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209666;OID=.;OPOS=118509191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:8:21:0:0:8:21:0:0 chr12 118520170 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.159;QD=57.1062;RBI=0.012284;REFB=0;REVB=0.00974334;RO=0;SAF=19;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20476e-05;OID=.;OPOS=118520170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:36:19:0:0:36:19:0:0 chr12 118855405 . A G 1491.7 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00354659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.97;QD=63.4765;RBI=0.0036475;REFB=0;REVB=0.000852032;RO=0;SAF=44;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.14272e-06;OID=.;OPOS=118855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:50:44:0:0:50:44:0:0 chr12 119431750 . G T 244.26 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.000923344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.809;QD=23.2632;RBI=0.0274089;REFB=-0.00666758;REVB=0.0273934;RO=19;SAF=7;SAR=16;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234572;STB=0.63146;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00478312;OID=.;OPOS=119431750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:16:7:11:8:16:7:11:8 chr12 119588962 . G A 270.59 PASS AF=0.413333;AO=30;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0191371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0601;QD=14.4314;RBI=0.0344572;REFB=0.00899575;REVB=0.0286544;RO=44;SAF=11;SAR=19;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046937;STB=0.534048;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.0342346;OID=.;OPOS=119588962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:30:31:0.413333:19:11:18:26:20:11:18:26 chr12 119871387 . A G 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.437;QD=57.3851;RBI=0.039187;REFB=0;REVB=0.0372676;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172919;OID=.;OPOS=119871387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0 chr12 119942969 . C G 32.2 PASS AF=0.0757576;AO=11;DP=132;FAO=10;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=121;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=58;FSRR=63;FWDB=-0.0883224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.8788;QD=0.975654;RBI=0.125113;REFB=-0.0109339;REVB=-0.0886136;RO=105;SAF=8;SAR=3;SRF=49;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302237;STB=0.702792;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.127494;OID=.;OPOS=119942969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:132:132:105:121:11:10:0.0757576:3:8:49:56:3:7:58:63 chr12 120067561 . T C 1514.28 PASS AF=1;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286687;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.069;QD=59.9714;RBI=0.02938;REFB=0;REVB=-0.00642554;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336812;OID=.;OPOS=120067561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:101:0:0:101:101:1:56:45:0:0:56:45:0:0 chr12 120171995 . T C 805.14 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0955729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5572;QD=64.4114;RBI=0.110245;REFB=0;REVB=-0.0549532;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00213535;OID=.;OPOS=120171995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0 chr12 120189879 . A G 651.2 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.309;QD=62.0191;RBI=0.0457078;REFB=0;REVB=0.0274658;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337125;OID=.;OPOS=120189879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr12 120189888 . T C 652.33 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5195;QD=62.1264;RBI=0.0822754;REFB=0;REVB=0.0744843;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000986273;OID=.;OPOS=120189888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:24:16:0:0:26:16:0:0 chr12 120457035 . A G 1212.83 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00681346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6268;QD=59.8929;RBI=0.00681523;REFB=-0.0791195;REVB=0.000155003;RO=1;SAF=30;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155191;STB=0.508195;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.000980147;OID=.;OPOS=120457035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:50:30:1:0:50:30:1:0 chr12 120536629 . C T 339.16 PASS AF=0.576271;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0181273;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.679;QD=22.9937;RBI=0.0301314;REFB=-0.00520691;REVB=-0.0240686;RO=25;SAF=15;SAR=19;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000917176;STB=0.500505;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00467773;OID=.;OPOS=120536629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:25:25:34:34:0.576271:19:15:11:14:19:15:11:14 chr12 120575549 . A C 1377.49 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.462;QD=62.6133;RBI=0.0199812;REFB=0;REVB=-0.000821163;RO=0;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40725e-05;OID=.;OPOS=120575549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:49:38:0:0:50:38:0:0 chr12 120589064 . G C 1065.98 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0310414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3174;QD=58.4101;RBI=0.0416454;REFB=-0.0674944;REVB=-0.0277628;RO=1;SAF=33;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141159;STB=0.507461;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00378115;OID=.;OPOS=120589064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:39:33:1:0:39:33:1:0 chr12 120589160 . A G 651.21 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.777;QD=62.0205;RBI=0.0450669;REFB=0;REVB=0.0314618;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128505;OID=.;OPOS=120589160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr12 120591143 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.337;QD=62.6711;RBI=0.0328879;REFB=0;REVB=0.0283666;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137584;OID=.;OPOS=120591143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0 chr12 120608031 . A G 575.72 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.53;QD=60.602;RBI=0.0311444;REFB=0;REVB=-0.0119795;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74851e-05;OID=.;OPOS=120608031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr12 120636549 . C A 178.72 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00680727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7295;QD=22.3403;RBI=0.0473892;REFB=-0.0017537;REVB=-0.0468977;RO=14;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695042;STB=0.538964;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-4.09036e-05;OID=.;OPOS=120636549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:8:10:9:5:8:10:9:5 chr12 120661977 . T C 293.33 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234276;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.191;QD=53.3327;RBI=0.0291666;REFB=0;REVB=0.0173735;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259886;OID=.;OPOS=120661977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr12 120882217 . G T 425.52 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.755;QD=56.7358;RBI=0.0172322;REFB=0;REVB=0.0164089;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166789;OID=.;OPOS=120882217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:14:15:0:0:15:15:0:0 chr12 120882263 . AAAAG A,AA 473.79 PASS AF=0,1;AO=5,32;DP=41;FAO=0,38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399887,-0.03076;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=4,3;MLLD=216.313,226.802;QD=49.8727;RBI=0.0407139,0.0319137;REFB=0,0;REVB=-0.00764994,-0.00850319;RO=1;SAF=5,16;SAR=0,16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0282865;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,-0.000127254;OID=.,.;OPOS=120882264,120882265;OREF=AAAG,AAG;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:5,32:41:0,38:38:0:0,21:0,17:0:0:8:1:5,16:0,16:1:0 chr12 120884328 . C T 393.27 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.824;QD=56.1809;RBI=0.1064;REFB=0;REVB=0.0982171;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108161;OID=.;OPOS=120884328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0 chr12 120934407 . C T 1133.64 PASS AF=0.987952;AO=75;DP=80;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.106822;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.0775;QD=54.6334;RBI=0.175067;REFB=-0.117657;REVB=0.138699;RO=5;SAF=43;SAR=32;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274607;STB=0.505262;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0115527;OID=.;OPOS=120934407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:80:83:5:1:75:82:0.987952:32:43:4:1:35:47:1:0 chr12 120934599 . G A 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0161838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.145;QD=16.9316;RBI=0.0181454;REFB=-0.00792364;REVB=-0.00820626;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00612466;OID=.;OPOS=120934599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:7:5:5:7:7:5:5:7 chr12 120934624 . A C 284.6 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.692;QD=51.746;RBI=0.0235296;REFB=0;REVB=0.0149134;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.65744e-06;OID=.;OPOS=120934624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:11:10:0:0:12:10:0:0 chr12 120966921 . A G 144.7 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.071;QD=44.5224;RBI=0.0853986;REFB=0;REVB=0.0720794;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107203;OID=.;OPOS=120966921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:11:13:1:7:4:0:0:8:5:0:0 chr12 121017171 . A G 885.12 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7714;QD=58.0406;RBI=0.0196231;REFB=0;REVB=-0.00773175;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.48332e-05;OID=.;OPOS=121017171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:29:31:0:0:29:32:0:0 chr12 121131891 . C T 788.04 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283063;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.131;QD=57.3123;RBI=0.0408549;REFB=0;REVB=-0.0294598;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0453e-05;OID=.;OPOS=121131891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0 chr12 121151093 . C T 207.63 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0178511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.566;QD=15.1001;RBI=0.0228865;REFB=-0.00831963;REVB=-0.0143223;RO=31;SAF=18;SAR=6;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401376;STB=0.728776;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0164046;OID=.;OPOS=121151093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:6:18:11:20:6:18:11:20 chr12 121174899 . T C 1491.62 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2311;QD=63.473;RBI=0.04621;REFB=0;REVB=0.030437;RO=0;SAF=39;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80717e-05;OID=.;OPOS=121174899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:55:39:0:0:55:39:0:0 chr12 121175984 . T C 293.49 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205125;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.714;QD=53.3626;RBI=0.0375149;REFB=0;REVB=0.0314103;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000349618;OID=.;OPOS=121175984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr12 121176083 . G A 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0304705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.557;QD=9.49528;RBI=0.0334359;REFB=-0.0115271;REVB=-0.013766;RO=24;SAF=8;SAR=3;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081694;STB=0.549906;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0315921;OID=.;OPOS=121176083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:3:8:16:8:3:8:16:8 chr12 121176679 . C T 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00327549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.975;QD=61.3361;RBI=0.00542168;REFB=0;REVB=-0.00432039;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26084e-05;OID=.;OPOS=121176679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr12 121416622 . C G 632.2 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000898054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.34;QD=61.6775;RBI=0.0397811;REFB=0;REVB=0.0397709;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176055;OID=.;OPOS=121416622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0 chr12 121416650 . A C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.604;QD=62.0216;RBI=0.0325908;REFB=0;REVB=-0.0128426;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18933e-05;OID=.;OPOS=121416650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0 chr12 121434630 . C CTCATTCAT 289.37 PASS AF=0.657895;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0154617;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=8;MLLD=271.363;QD=30.4603;RBI=0.0198135;REFB=-0.0344153;REVB=-0.0123901;RO=14;SAF=13;SAR=12;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336027;STB=0.532744;STBP=0.574;TYPE=ins;VARB=0.019456;OID=.;OPOS=121434631;OREF=-;OALT=TCATTCAT;OMAPALT=CTCATTCAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.657895:25:41:25:38:13:13:12:8:5:99:14:13:12:8:6 chr12 121435427 . G A,C 252.56 PASS AF=0.95,0.05;AO=18,2;DP=20;FAO=19,1;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12,1;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101179,0.011296;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.392,136.783;QD=50.5119;RBI=0.0223738,0.0117835;REFB=0,0;REVB=0.0199554,0.00335422;RO=0;SAF=12,1;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000357263,0.0438294;OID=.,.;OPOS=121435427,121435427;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:20:20:0:0:18,2:19,1:0.95,0.05:6,1:12,1:0:0:7,0:12,1:0:0 chr12 121435475 . G A 352.57 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.307;QD=54.2407;RBI=0.0627723;REFB=0;REVB=0.0550745;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313745;OID=.;OPOS=121435475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:8:17:0:0:8:18:0:0 chr12 121435586 . TG T,TT 531.29 PASS AF=0.0277778,0.972222;AO=8,28;DP=36;FAO=1,35;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15;FSAR=1,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124856,0.0128154;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.456,169.192;QD=59.0327;RBI=0.0742001,0.0741041;REFB=0,0;REVB=0.073142,0.0729875;RO=0;SAF=3,12;SAR=5,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0198856,0.00916906;OID=.,.;OPOS=121435587,121435587;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0277778,0.972222:8,28:36:1,35:36:0:0,15:1,20:0:0:5:0:3,12:5,16:0:0 chr12 121437221 . T C 1044.28 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0727942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.211;QD=59.6734;RBI=0.0757164;REFB=0;REVB=0.0208322;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129525;OID=.;OPOS=121437221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr12 121437382 . A G 160.42 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00515711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.859;QD=45.8343;RBI=0.0338406;REFB=0;REVB=0.0334454;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158043;OID=.;OPOS=121437382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:12:1:0:0:13:1:0:0 chr12 121454257 . T A 641.72 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9734;QD=61.1158;RBI=0.0269157;REFB=0;REVB=0.0146365;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00362824;OID=.;OPOS=121454257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:18:23:0:0:19:23:0:0 chr12 121471337 . G A 1847.84 PASS AF=1;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410259;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.229;QD=61.5947;RBI=0.0437807;REFB=0;REVB=0.0152846;RO=0;SAF=58;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.84183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210361;OID=.;OPOS=121471337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:120:0:0:120:120:1:62:58:0:0:62:58:0:0 chr12 121605355 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00806444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.665;QD=64.4152;RBI=0.0255404;REFB=0;REVB=0.0242338;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47323e-05;OID=.;OPOS=121605355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0 chr12 121622520 . A T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00263506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.803;QD=55.656;RBI=0.00340152;REFB=0;REVB=-0.00215101;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.92147e-05;OID=.;OPOS=121622520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr12 121693405 . A G 137.9 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0139842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.566;QD=11.4912;RBI=0.0201193;REFB=-0.0176931;REVB=-0.0144647;RO=32;SAF=11;SAR=5;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151525;STB=0.590278;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0355818;OID=.;OPOS=121693405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:5:11:18:14:5:11:18:14 chr12 121701681 . G A 120.79 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00197374;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.8843;QD=14.6408;RBI=0.00251513;REFB=-0.00942387;REVB=-0.00155891;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192804;STB=0.647927;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0173148;OID=.;OPOS=121701681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:33:17:19:14:14:0.424242:4:10:9:8:4:10:9:10 chr12 121712077 . T A 58.8 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0128632;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1017;QD=12.3791;RBI=0.0347019;REFB=-0.00161838;REVB=0.0322298;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09343;STB=0.555425;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00410906;OID=.;OPOS=121712077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:20:19:11:11:8:8:0.421053:2:6:9:2:2:6:9:2 chr12 121853164 . T C 520.02 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0848075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6314;QD=59.4304;RBI=0.0856609;REFB=0;REVB=0.0120614;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000834823;OID=.;OPOS=121853164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr12 121870922 . G A 382.63 PASS AF=1;AO=22;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0815552;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6707;QD=56.6857;RBI=0.260933;REFB=0;REVB=0.24786;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00827756;OID=.;OPOS=121870922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:22:27:1:15:7:0:0:20:7:0:0 chr12 121871006 . A C 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0369177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.99;QD=47.8143;RBI=0.0369232;REFB=0.127151;REVB=0.000638588;RO=0;SAF=4;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.45803e-08;STB=0.555499;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00115715;OID=.;OPOS=121871006;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:17:4:0:0:17:4:1:0 chr12 121878659 . C T 1088.03 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.56;QD=59.6179;RBI=0.0175798;REFB=0;REVB=0.0149243;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25926e-05;OID=.;OPOS=121878659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:35:35:0:0:37:36:0:0 chr12 121880520 . G A,C 971.72 PASS AF=0.913043,0.0869565;AO=63,5;DP=69;FAO=63,6;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=33,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552246,0.0144563;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=150.947,82.8707;QD=56.3318;RBI=0.0731165,0.0393121;REFB=-0.0171095,-0.0713728;REVB=0.0479194,0.0365576;RO=1;SAF=30,0;SAR=33,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0140954,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000567147,0.217548;OID=.,.;OPOS=121880520,121880520;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:20:69:69:1:0:63,5:63,6:0.913043,0.0869565:33,5:30,0:0:1:33,6:30,0:0:0 chr12 121881848 . G A 769.36 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116264;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.869;QD=64.1135;RBI=0.0119258;REFB=0;REVB=0.00265533;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53327e-06;OID=.;OPOS=121881848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr12 122042844 . A G 123.15 PASS AF=0.923077;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0339319;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8836;QD=37.8914;RBI=0.0974174;REFB=-0.0251016;REVB=0.091317;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994753;STB=0.55546;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00899725;OID=.;OPOS=122042844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:13:1:1:11:12:0.923077:7:4:1:0:8:4:1:0 chr12 122079441 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0539033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.969;QD=44.6898;RBI=0.0601242;REFB=0;REVB=0.0266339;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000607522;OID=.;OPOS=122079441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0 chr12 122079668 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4314;QD=50.4128;RBI=0.0243381;REFB=0;REVB=-0.000982323;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000359324;OID=.;OPOS=122079668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr12 122186268 . C T 145.22 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9028;QD=44.6839;RBI=0.0635604;REFB=0;REVB=0.0454939;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00279355;OID=.;OPOS=122186268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr12 122186317 . G A 223.16 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1075;QD=49.5907;RBI=0.0363313;REFB=0;REVB=-0.0337849;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115247;OID=.;OPOS=122186317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0 chr12 122234089 . T A 807.73 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7767;QD=56.6828;RBI=0.0854349;REFB=0;REVB=0.0840025;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195075;OID=.;OPOS=122234089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:25:32:0:0 chr12 122243905 . C T 1189.64 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.592;QD=61.007;RBI=0.0201046;REFB=0;REVB=0.0159324;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78565e-05;OID=.;OPOS=122243905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:37:40:0:0:37:41:0:0 chr12 122248582 . C G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=376.026;QD=50.4135;RBI=0.0158977;REFB=0;REVB=0.0158977;RO=0;SAF=0;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68372e-05;OID=.;OPOS=122248582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:19:0:0:0:19:0:0:0 chr12 122261456 . G A 2035.04 PASS AF=1;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546132;FXX=0.0370343;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.808;QD=62.6167;RBI=0.0650406;REFB=0;REVB=0.0353225;RO=0;SAF=59;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232206;OID=.;OPOS=122261456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:129:130:1:70:59:0:0:70:60:0:0 chr12 122295335 . T C 649.36 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3518;QD=61.8438;RBI=0.0353457;REFB=0;REVB=0.0187027;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128247;OID=.;OPOS=122295335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0 chr12 122326812 . T C 239.41 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0661391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.021;QD=50.4013;RBI=0.0672785;REFB=0;REVB=-0.0123291;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00271984;OID=.;OPOS=122326812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr12 122332727 . C T 174.08 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0135395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.95;QD=19.3426;RBI=0.0164605;REFB=-0.0276616;REVB=0.00936106;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337366;STB=0.690701;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0333524;OID=.;OPOS=122332727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:6:12:5:13:6:12:5:13 chr12 122353796 . A G 86.68 PASS AF=0.375;AO=10;DP=27;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0479063;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=27.8263;QD=10.835;RBI=0.0506088;REFB=-0.0440918;REVB=-0.0163168;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282984;STB=0.576801;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0621409;OID=.;OPOS=122353796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:32:17:20:10:12:0.375:5:5:4:13:7:5:6:14 chr12 122355716 . C T 498.57 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00761346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.764;QD=58.655;RBI=0.0230481;REFB=0;REVB=0.0217544;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134071;OID=.;OPOS=122355716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:12:21:0:0:13:21:0:0 chr12 122369762 . C T 210.29 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00838746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2588;QD=15.5771;RBI=0.0101009;REFB=0.0360176;REVB=-0.00562843;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097989;STB=0.55551;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.0430263;OID=.;OPOS=122369762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:12:18:12:12:12:18 chr12 122372260 . A G 359.98 PASS AF=0.544118;AO=36;DP=66;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.00950548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.983;QD=21.1756;RBI=0.0211871;REFB=-0.00875836;REVB=-0.0189351;RO=30;SAF=15;SAR=21;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715328;STB=0.536367;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00784105;OID=.;OPOS=122372260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:30:31:36:37:0.544118:21:15:10:20:21:16:11:20 chr12 122396395 . C T 668.05 PASS AF=0.62;AO=61;DP=100;FAO=62;FDP=100;FR=.;FRO=38;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.00315205;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.36;QD=26.7222;RBI=0.00760093;REFB=-0.00486269;REVB=-0.00691656;RO=38;SAF=33;SAR=28;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838446;STB=0.542337;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00238561;OID=.;OPOS=122396395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:38:38:61:62:0.62:28:33:25:13:28:34:25:13 chr12 122405912 . G T 122.02 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0717546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7327;QD=17.4312;RBI=0.0924068;REFB=-0.0179726;REVB=-0.0582263;RO=14;SAF=13;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524293;STB=0.811913;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0119624;OID=.;OPOS=122405912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:1:13:8:6:1:13:8:6 chr12 122497001 . T C 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.021338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.388;QD=16.1562;RBI=0.0213382;REFB=-0.0126261;REVB=9.6986e-05;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122563;STB=0.506913;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0136433;OID=.;OPOS=122497001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:17:15:13:14:17:15 chr12 122617989 . A G 259.14 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0133089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.626;QD=24.1062;RBI=0.0183246;REFB=-0.035225;REVB=0.0125962;RO=19;SAF=6;SAR=18;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207455;STB=0.616334;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0239686;OID=.;OPOS=122617989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:18:6:9:10:18:6:9:10 chr12 122618131 . A G 59.44 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.613;QD=15.8517;RBI=0.0124576;REFB=-0.016282;REVB=-0.0124576;RO=7;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0214578;OID=.;OPOS=122618131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:8:0:0:7:8:0:0:7 chr12 122623000 . T C 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0232654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.1;QD=14.0975;RBI=0.0240201;REFB=-0.00597153;REVB=-0.0059738;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171008;STB=0.599845;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00836489;OID=.;OPOS=122623000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:10:8:8:5:10:8 chr12 122626842 . G A 733.29 PASS AF=0.589744;AO=69;DP=117;FAO=69;FDP=117;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0104367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.313;QD=25.0696;RBI=0.014489;REFB=-0.000119602;REVB=0.0100502;RO=47;SAF=29;SAR=40;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840037;STB=0.55026;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00019064;OID=.;OPOS=122626842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:47:48:69:69:0.589744:40:29:25:22:40:29:26:22 chr12 122628219 . T C 467.37 PASS AF=0.628571;AO=43;DP=69;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00337386;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.904;QD=26.707;RBI=0.0117788;REFB=0.0014911;REVB=0.0112853;RO=26;SAF=20;SAR=23;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506812;STB=0.531236;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00031366;OID=.;OPOS=122628219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:26:26:43:44:0.628571:23:20:14:12:24:20:14:12 chr12 122628516 . A T 319.12 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0207049;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2219;QD=15.567;RBI=0.0221225;REFB=0.0122942;REVB=-0.00779163;RO=48;SAF=12;SAR=23;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146189;STB=0.575802;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.0178972;OID=.;OPOS=122628516;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:48:47:35:35:0.426829:23:12:23:25:23:12:22:25 chr12 122674031 . CC CT,TT 622.58 PASS AF=0.930233,0.0465116;AO=38,2;DP=44;FAO=40,2;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00582981,-0.0412302;FXX=0.0227221;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=90.4506,36.4552;QD=57.914;RBI=0.00710154,0.0413339;REFB=-0.0650653,-0.0556704;REVB=0.00405525,0.00292589;RO=0;SAF=15,2;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.510633,0.993266;STBP=0.51,0.227;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0033788,0.00953348;OID=.,.;OPOS=122674032,122674031;OREF=C,CC;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:44:43:0:1:38,2:40,2:0.930233,0.0465116:23,0:15,2:0:0:23,0:17,2:0:1 chr12 122674758 . G A 823.3 PASS AF=1;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177849;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2965;QD=57.7755;RBI=0.0328252;REFB=0;REVB=0.0275897;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344397;OID=.;OPOS=122674758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0 chr12 122676013 . A C 971.5 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00224099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.551;QD=58.8786;RBI=0.00821901;REFB=0;REVB=-0.0079076;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.45708e-06;OID=.;OPOS=122676013;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:17:47:0:0:18:48:0:0 chr12 122689161 . C G 227.6 PASS AF=0.95;AO=18;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0241219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0804;QD=45.5208;RBI=0.21854;REFB=-0.0586852;REVB=0.217205;RO=2;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338663;STB=0.519979;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0248091;OID=.;OPOS=122689161;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:2:1:18:19:0.95:6:12:1:1:7:12:1:0 chr12 122689181 . C G 400.21 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.028809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.663;QD=53.3616;RBI=0.043968;REFB=0.046514;REVB=-0.0332149;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.51162;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.00620817;OID=.;OPOS=122689181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:30:0:1:29:29:0.966667:8:21:0:0:8:21:1:0 chr12 122689244 . C T 633.12 PASS AF=0.976744;AO=38;DP=39;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.054055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6569;QD=58.8949;RBI=0.0583923;REFB=-0.145701;REVB=0.0220844;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.511106;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00347607;OID=.;OPOS=122689244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:43:0:1:38:42:0.976744:18:20:0:0:20:22:1:0 chr12 122691738 . C A 417.62 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356809;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.786;QD=57.6032;RBI=0.112375;REFB=0;REVB=0.10656;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121962;OID=.;OPOS=122691738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0 chr12 122692820 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.82;QD=42.1826;RBI=0.0667441;REFB=0;REVB=0.0245396;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000670607;OID=.;OPOS=122692820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0 chr12 122756342 . G A 773.55 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.303;QD=63.1473;RBI=0.044134;REFB=0;REVB=0.043531;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10485e-05;OID=.;OPOS=122756342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:19:27:0:0:21:28:0:0 chr12 123087442 . A G 783.67 PASS AF=1;AO=32;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0980213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.119;QD=56.9941;RBI=0.102064;REFB=0;REVB=-0.0284414;RO=0;SAF=2;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218808;OID=.;OPOS=123087442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:32:55:1:30:2:0:0:30:25:0:0 chr12 123103014 . TTG T,TT,TTT 61.36 PASS AF=0.142857,0.857143,0;AO=2,4,3;DP=9;FAO=1,6,0;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4,0;FSAR=0,2,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126012,0.113445,0.102665;FXX=0;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=149.505,151.202,145.94;QD=35.0618;RBI=0.126544,0.113684,0.102672;REFB=0,0,0;REVB=0.0115923,0.00737497,0.00118615;RO=0;SAF=2,3,0;SAR=0,1,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00477311,-0.00316616,0.0171861;OID=.,.,.;OPOS=123103015,123103016,123103016;OREF=TG,G,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.142857,0.857143,0:2,4,3:9:1,6,0:7:0:1,4,0:0,2,0:0:0:6:0:2,3,0:0,1,3:0:0 chr12 123105143 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.578;QD=62.671;RBI=0.0256173;REFB=0;REVB=0.0020841;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84075e-05;OID=.;OPOS=123105143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0 chr12 123185864 . A G 85.11 PASS AF=0.141732;AO=18;DP=128;FAO=18;FDP=127;FR=.;FRO=109;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=51;FWDB=-0.00778958;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.108;QD=2.6806;RBI=0.0331743;REFB=-0.00371452;REVB=-0.0322468;RO=109;SAF=10;SAR=8;SRF=58;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296735;STB=0.52026;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0157015;OID=.;OPOS=123185864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:128:127:109:109:18:18:0.141732:8:10:58:51:8:10:58:51 chr12 123200247 . G C 267.89 PASS AF=0.310345;AO=36;DP=116;FAO=36;FDP=116;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.00670164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.61;QD=9.23752;RBI=0.00716644;REFB=-0.00571908;REVB=0.00253888;RO=80;SAF=27;SAR=9;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404226;STB=0.736708;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00725848;OID=.;OPOS=123200247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:80:80:36:36:0.310345:9:27:33:47:9:27:33:47 chr12 123200334 . T C 46.55 PASS AF=0.148148;AO=8;DP=54;FAO=8;FDP=54;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0555851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.699;QD=3.44822;RBI=0.0655281;REFB=-0.00397406;REVB=-0.0347021;RO=45;SAF=6;SAR=2;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43291;STB=0.788797;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.026224;OID=.;OPOS=123200334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:54:54:45:46:8:8:0.148148:2:6:17:28:2:6:18:28 chr12 123200693 . A G 266.13 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.016366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4886;QD=21.2901;RBI=0.0683566;REFB=-0.00192253;REVB=-0.0663685;RO=25;SAF=19;SAR=6;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407248;STB=0.729359;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.000639993;OID=.;OPOS=123200693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:6:19:8:17:6:19:8:17 chr12 123200768 . T G 417.21 PASS AF=0.606061;AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00362268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.196;QD=25.2854;RBI=0.00904005;REFB=-0.0063642;REVB=0.00828243;RO=26;SAF=22;SAR=18;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913152;STB=0.549975;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0046556;OID=.;OPOS=123200768;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:26:26:40:40:0.606061:18:22:11:15:18:22:11:15 chr12 123200937 . T G 165.87 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0571328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4849;QD=20.7333;RBI=0.0590236;REFB=-0.0475799;REVB=-0.0148198;RO=14;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150576;STB=0.596906;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0264365;OID=.;OPOS=123200937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:15:17:17:0.53125:8:9:10:4:8:9:11:4 chr12 123253852 . T C 90.03 PASS AF=0.229508;AO=14;DP=61;FAO=14;FDP=61;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0323637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.209;QD=5.90358;RBI=0.0487866;REFB=0.00293172;REVB=0.0365064;RO=46;SAF=12;SAR=2;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467889;STB=0.795105;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00474474;OID=.;OPOS=123253852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:61:61:46:47:14:14:0.229508:2:12:24:22:2:12:25:22 chr12 123253856 . C CAT,T 948.22 PASS AF=0.512821,0.397436;AO=38,31;DP=78;FAO=40,31;FDP=78;FR=.;FRO=7;FSAF=24,25;FSAR=16,6;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00988708,0.00504838;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=160.302,74.5504;QD=48.6265;RBI=0.0192168,0.0927013;REFB=-0.126927,-0.0226053;REVB=0.0164782,-0.0925637;RO=7;SAF=24,25;SAR=14,6;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.18592,0.337813;STB=0.589698,0.684078;STBP=0.003,0;TYPE=ins,snp;VARB=0.0483532,0.018309;OID=.,.;OPOS=123253857,123253856;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:78:78:7:7:38,31:40,31:0.512821,0.397436:14,6:24,25:0:7:16,6:24,25:0:7 chr12 123286117 . GT GC,G 117.83 PASS AF=0.0277778,0.416667;AO=3,14;DP=36;FAO=1,15;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=1,2;FSAR=0,13;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.012397,0.0547373;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=40.634,18.0729;QD=13.0926;RBI=0.0160475,0.0551034;REFB=-0.00466944,-0.0792121;REVB=-0.01019,0.00634172;RO=19;SAF=3,0;SAR=0,14;SRF=16;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.496188,-0.856136;STB=0.984229,0.872647;STBP=0.516,0.002;TYPE=snp,del;VARB=0.0406545,0.116324;OID=.,.;OPOS=123286118,123286118;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=GC,G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0277778,0.416667:3,14:36:1,15:36:20:1,2:0,13:16:4:99:19:3,0:0,14:16:3 chr12 123333065 . C T 694.95 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.268;QD=61.7736;RBI=0.0365308;REFB=0;REVB=0.00135091;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000850839;OID=.;OPOS=123333065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:32:12:0:0:33:12:0:0 chr12 123339931 . GC G,GG 151.68 PASS AF=0.652174,0;AO=12,14;DP=47;FAO=30,0;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=12,0;FSAR=18,0;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.174784,-0.021806;FXX=0.0212721;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=9.9852,16.4336;QD=13.1893;RBI=0.24675,0.0451077;REFB=-0.0812481,-0.0243832;REVB=0.174173,-0.0394868;RO=18;SAF=10,0;SAR=2,14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0.513514,0;SSEP=0,0;SSSB=0.529409,-0.793896;STB=0.532089,0.5;STBP=0.534,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0778829,0.160832;OID=.,.;OPOS=123339932,123339932;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.652174,0:12,14:47:30,0:46:16:12,0:18,0:5:11:73:18:10,0:2,14:6:12 chr12 123340154 . C T 250.38 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0460267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.002;QD=20.0305;RBI=0.0597812;REFB=-0.0250844;REVB=-0.0381488;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689873;STB=0.538819;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0319851;OID=.;OPOS=123340154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:11:13:16:10:11:13:16:10 chr12 123340453 . G GC 324.81 PASS AF=1;AO=20;DP=36;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257061;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.8784;QD=43.3082;RBI=0.0261556;REFB=0;REVB=0.00482818;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122137;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00188233;OID=.;OPOS=123340454;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:36:30:30:0:18:12:0:0:6:16:14:6:9:7 chr12 123340455 . G C 43.9 PASS AF=0.21875;AO=8;DP=33;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0473347;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.4106;QD=5.48748;RBI=0.0488961;REFB=0.0142485;REVB=0.0122579;RO=25;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480957;STB=0.784397;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.0220077;OID=.;OPOS=123340455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:33:32:25:25:8:7:0.21875:6:2:17:8:5:2:17:8 chr12 123345736 . C G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00463625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.681;QD=49.5992;RBI=0.0257588;REFB=0;REVB=0.0253381;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001147;OID=.;OPOS=123345736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr12 123350154 . CCTTT C 343.75 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0033994;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=4;MLLD=134.529;QD=47.4135;RBI=0.014023;REFB=0;REVB=0.0136047;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000789643;OID=.;OPOS=123350155;OREF=CTTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:29:29:29:29:0:12:17:0:0:6:0:12:17:0:0 chr12 123444738 . A G 106.42 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0165242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.181;QD=13.303;RBI=0.0232346;REFB=-0.0173704;REVB=-0.016334;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180198;STB=0.606048;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0234306;OID=.;OPOS=123444738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:4:9:10:9:4:9:10:9 chr12 123460823 . A G 601.86 PASS AF=0.555556;AO=59;DP=108;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=49;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.00155534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.903;QD=22.2911;RBI=0.0230174;REFB=-0.0485256;REVB=0.0229648;RO=47;SAF=49;SAR=10;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184433;STB=0.597525;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0413484;OID=.;OPOS=123460823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:47:48:59:60:0.555556:10:49:32:15:11:49:32:16 chr12 123469647 . G T 474.33 PASS AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.000659189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.204;QD=18.9731;RBI=0.0037396;REFB=-0.0213651;REVB=0.00368104;RO=52;SAF=18;SAR=29;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131219;STB=0.578457;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0211342;OID=.;OPOS=123469647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:52:53:47:47:0.47:29:18:27:25:29:18:28:25 chr12 123645803 . G A 1840.78 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.216;QD=61.3594;RBI=0.0247141;REFB=0;REVB=0.00407103;RO=0;SAF=67;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30167e-05;OID=.;OPOS=123645803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:53:67:0:0:53:67:0:0 chr12 123664514 . G A 120.13 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012606;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.408;QD=43.6822;RBI=0.0241342;REFB=0;REVB=0.0205802;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342258;OID=.;OPOS=123664514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr12 123665695 . A G 651.75 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454593;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.483;QD=62.0717;RBI=0.0505975;REFB=0;REVB=0.0222162;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.8808e-07;OID=.;OPOS=123665695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0 chr12 123746357 . C G 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0491389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.242;QD=61.683;RBI=0.0563433;REFB=0;REVB=-0.027567;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000895194;OID=.;OPOS=123746357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr12 123799974 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8725;QD=60.61;RBI=0.0747937;REFB=0;REVB=0.0529114;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000655621;OID=.;OPOS=123799974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr12 123810873 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.043;QD=51.1844;RBI=0.0220082;REFB=0;REVB=-0.011594;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177228;OID=.;OPOS=123810873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr12 123879666 . A G 140.14 PASS AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00383496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.385;QD=10.3803;RBI=0.0166193;REFB=-0.00504581;REVB=0.0161708;RO=36;SAF=12;SAR=6;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164254;STB=0.597291;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00935776;OID=.;OPOS=123879666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:36:36:18:18:0.333333:6:12:19:17:6:12:19:17 chr12 123879668 . G C 143.0 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00836347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7474;QD=10.7926;RBI=0.0110312;REFB=0.00942741;REVB=0.00719303;RO=35;SAF=12;SAR=6;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177932;STB=0.605143;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.00621867;OID=.;OPOS=123879668;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:6:12:18:17:6:12:18:17 chr12 123879768 . AA CG 64.57 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.0242254;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=146.459;QD=9.93324;RBI=0.0248885;REFB=0.0085961;REVB=0.00570664;RO=16;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.586961;STB=0.843921;STBP=0.048;TYPE=mnp;VARB=-0.0196374;OID=.;OPOS=123879768;OREF=AA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:26:16:17:9:9:0.346154:3:6:1:15:3:6:1:16 chr12 123892095 . T C 186.09 PASS AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0586641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.191;QD=10.484;RBI=0.05869;REFB=0.00225576;REVB=0.00174459;RO=47;SAF=7;SAR=17;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913136;STB=0.553549;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.0057876;OID=.;OPOS=123892095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:17:7:17:30:17:7:17:30 chr12 123892186 . T C 155.45 PASS AF=0.377778;AO=16;DP=46;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00361155;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.507;QD=13.8181;RBI=0.0193303;REFB=-0.00216571;REVB=-0.0189899;RO=30;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737539;STB=0.548756;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00374339;OID=.;OPOS=123892186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:30:28:16:17:0.377778:8:8:13:17:9:8:11:17 chr12 123892235 . G A 113.94 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0456921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.706;QD=18.2296;RBI=0.0462955;REFB=-0.017788;REVB=0.00744979;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281085;STB=0.516104;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0303927;OID=.;OPOS=123892235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:5:7:8:5:5:7 chr12 123892590 . C T 238.54 PASS AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.013086;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.583;QD=11.4959;RBI=0.0180175;REFB=-0.0136673;REVB=-0.0123849;RO=53;SAF=13;SAR=16;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131109;STB=0.581282;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0253121;OID=.;OPOS=123892590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:53:54:29:29:0.349398:16:13:30:23:16:13:31:23 chr12 123892824 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594522;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.561;QD=43.4858;RBI=0.0594977;REFB=0;REVB=-0.00232719;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359986;OID=.;OPOS=123892824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr12 123893723 . G A 220.44 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=35;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0192394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.793;QD=24.4937;RBI=0.0494964;REFB=-0.0232915;REVB=0.0456041;RO=11;SAF=0;SAR=14;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.813783;STB=0.559941;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0187461;OID=.;OPOS=123893723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:11:15:14:21:0.583333:14:0:4:7:14:7:7:8 chr12 123893830 . C T 369.64 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0115278;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.951;QD=52.8055;RBI=0.0120566;REFB=0.000133665;REVB=0.00353148;RO=1;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216358;STB=0.511619;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.000142695;OID=.;OPOS=123893830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:28:1:1:27:27:0.964286:21:6:0:1:21:6:0:1 chr12 124008073 . A G 1190.42 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00209974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.627;QD=61.047;RBI=0.0383255;REFB=0;REVB=-0.038268;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270153;OID=.;OPOS=124008073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr12 124069213 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00921719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6843;QD=46.848;RBI=0.0764394;REFB=0;REVB=-0.0758816;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00245837;OID=.;OPOS=124069213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr12 124090453 . A G 1587.81 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.115;QD=64.154;RBI=0.0218;REFB=0;REVB=-0.0126048;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82045e-06;OID=.;OPOS=124090453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:55:43:0:0:55:44:0:0 chr12 124209332 . T C 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.212;QD=49.5987;RBI=0.0133476;REFB=0;REVB=0.00860403;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60814e-05;OID=.;OPOS=124209332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr12 124210782 . T C 406.64 PASS AF=0.909091;AO=31;DP=34;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.010204;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.929;QD=49.2893;RBI=0.0840761;REFB=-0.0817882;REVB=0.0834546;RO=1;SAF=21;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217036;STB=0.533312;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00386946;OID=.;OPOS=124210782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:34:33:1:3:31:30:0.909091:10:21:1:0:9:21:3:0 chr12 124229429 . T C 1153.55 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00473836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.694;QD=60.7131;RBI=0.0233488;REFB=0;REVB=0.0228629;RO=0;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101259;OID=.;OPOS=124229429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:27:49:0:0:27:49:0:0 chr12 124243707 . T C 804.85 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.929;QD=64.3882;RBI=0.0369521;REFB=0;REVB=0.00448279;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013315;OID=.;OPOS=124243707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:33:16:0:0:34:16:0:0 chr12 124265687 . T C 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.088;QD=63.5822;RBI=0.0509624;REFB=0;REVB=0.0311738;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.78908e-05;OID=.;OPOS=124265687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0 chr12 124267703 . T C 1568.47 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.107;QD=64.019;RBI=0.0311511;REFB=0;REVB=0.0276802;RO=0;SAF=37;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76939e-05;OID=.;OPOS=124267703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:61:37:0:0:61:37:0:0 chr12 124274474 . A G 1143.14 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136185;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.545;QD=60.1652;RBI=0.0280152;REFB=0;REVB=0.0244824;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411757;OID=.;OPOS=124274474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:74:76:1:44:30:0:0:44:32:0:0 chr12 124325977 . T G 774.36 PASS AF=0.561538;AO=73;DP=129;FAO=73;FDP=130;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00771611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.135;QD=23.8265;RBI=0.0504689;REFB=-0.0108558;REVB=-0.0498756;RO=56;SAF=31;SAR=42;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113719;STB=0.509513;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00938069;OID=.;OPOS=124325977;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:56:57:73:73:0.561538:42:31:23:33:42:31:23:34 chr12 124387574 . G A 265.55 PASS AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0108525;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.982;QD=12.6453;RBI=0.0140119;REFB=0.00176417;REVB=0.00886317;RO=53;SAF=19;SAR=12;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115916;STB=0.566675;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00291554;OID=.;OPOS=124387574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:53:53:31:31:0.369048:12:19:27:26:12:19:27:26 chr12 124387586 . A G 309.18 PASS AF=0.384615;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0149861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.237;QD=13.5902;RBI=0.015646;REFB=-0.00460257;REVB=0.00449585;RO=54;SAF=20;SAR=15;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766879;STB=0.544278;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0079586;OID=.;OPOS=124387586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:54:56:35:35:0.384615:15:20:27:27:15:20:28:28 chr12 124393047 . G A 367.08 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0151552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.227;QD=16.4979;RBI=0.0203933;REFB=-0.0173691;REVB=0.0136457;RO=50;SAF=17;SAR=22;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00416498;STB=0.502341;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0203578;OID=.;OPOS=124393047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:50:50:39:39:0.438202:22:17:22:28:22:17:22:28 chr12 124417889 . C T 1077.17 PASS AF=0.480349;AO=110;DP=229;FAO=110;FDP=229;FR=.;FRO=119;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=60;FSRR=59;FWDB=0.030523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1027;QD=18.8152;RBI=0.066224;REFB=-0.00697885;REVB=0.0587704;RO=115;SAF=62;SAR=48;SRF=56;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716511;STB=0.531139;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00782902;OID=.;OPOS=124417889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:115:119:110:110:0.480349:48:62:56:59:48:62:60:59 chr12 124418674 . C T 92.92 PASS AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0151711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.546;QD=9.5306;RBI=0.0238253;REFB=-0.00285896;REVB=-0.0183708;RO=27;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323571;STB=0.519618;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00914458;OID=.;OPOS=124418674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:5:7:15:12:5:7:15:12 chr12 124419062 . A C 160.17 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.00544492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.122;QD=17.7966;RBI=0.00578954;REFB=-0.0142461;REVB=-0.00196764;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146892;STB=0.583241;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0148673;OID=.;OPOS=124419062;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:10:7:5:14:10:7:5:14 chr12 124427306 . T A 525.55 PASS AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0105614;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.2908;QD=21.6723;RBI=0.01362;REFB=0.00551831;REVB=0.00860007;RO=47;SAF=22;SAR=28;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129139;STB=0.571036;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.00733856;OID=.;OPOS=124427306;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:28:22:14:33:28:22:14:33 chr12 124798801 . C T 268.76 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0239488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.236;QD=22.3965;RBI=0.0287782;REFB=-0.0185562;REVB=0.0159573;RO=23;SAF=12;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00149175;STB=0.500834;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0154402;OID=.;OPOS=124798801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:13:12:11:12:13:12:11:12 chr12 124821447 . G A 65.31 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0371232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.342;QD=10.8848;RBI=0.0447779;REFB=-0.0286135;REVB=0.0250386;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.644613;STB=0.888024;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0592237;OID=.;OPOS=124821447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:8:1:11:4:8:1:11:4 chr12 124826379 . C T 257.76 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0378795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.598;QD=23.4327;RBI=0.0580991;REFB=-0.0310522;REVB=0.0440528;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163424;STB=0.590836;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0191606;OID=.;OPOS=124826379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:12:12:6:14:12:12:6:14 chr12 124826598 . T C 39.54 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.023333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0615;QD=13.181;RBI=0.023333;REFB=-0.0329734;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0301727;OID=.;OPOS=124826598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:0:6:6:0:0:6:6:0 chr12 124829234 . C T 348.15 PASS AF=0.4;AO=37;DP=96;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00395393;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.407;QD=14.6588;RBI=0.0164682;REFB=-0.00528262;REVB=0.0159865;RO=58;SAF=12;SAR=25;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214912;STB=0.603739;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0213744;OID=.;OPOS=124829234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:58:57:37:38:0.4:25:12:30:28:25:13:29:28 chr12 124829255 . A G 206.16 PASS AF=0.347222;AO=25;DP=73;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0416444;FXX=0.0649266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.345;QD=11.4533;RBI=0.0419334;REFB=-0.0135074;REVB=-0.00491482;RO=46;SAF=4;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445347;STB=0.758802;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0219192;OID=.;OPOS=124829255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:46:47:25:25:0.347222:21:4:23:23:21:4:23:24 chr12 124968349 . T C 345.57 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4322;QD=53.165;RBI=0.0974107;REFB=0;REVB=0.096496;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00546176;OID=.;OPOS=124968349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:12:14:0:0 chr12 124979789 . T G 920.88 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108957;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.941;QD=58.4685;RBI=0.0226782;REFB=0;REVB=0.0198894;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000331774;OID=.;OPOS=124979789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:62:63:1:37:25:0:0:37:26:0:0 chr12 125270773 . A G 226.98 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.009628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.138;QD=15.6537;RBI=0.0106346;REFB=-0.021707;REVB=-0.00451631;RO=32;SAF=18;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138838;STB=0.578884;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0297979;OID=.;OPOS=125270773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:8:18:18:14:8:18:18:14 chr12 125284748 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00808576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.298;QD=59.4353;RBI=0.0159287;REFB=0;REVB=-0.0137238;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115477;OID=.;OPOS=125284748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr12 125324553 . C T 115.98 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.225;QD=42.1755;RBI=0.0609161;REFB=0;REVB=-0.0592223;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000361675;OID=.;OPOS=125324553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr12 125324566 . G A 47.18 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.017174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.804;QD=11.1016;RBI=0.0173007;REFB=-0.0301988;REVB=0.0020904;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150213;STB=0.517192;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0223309;OID=.;OPOS=125324566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:17:9:10:7:7:0.411765:4:3:4:5:4:3:4:6 chr12 125324569 . A AT 73.55 PASS AF=1;AO=2;DP=18;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00709801;FXX=0.411523;HRUN=0;LEN=1;MLLD=132.305;QD=29.4213;RBI=0.148644;REFB=0;REVB=-0.148474;RO=16;SAF=1;SAR=1;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062606;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00113638;OID=.;OPOS=125324570;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:2:18:10:10:0:5:5:0:0:4:16:1:1:7:9 chr12 125324570 . C T 177.42 PASS AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.013632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.442;QD=39.4263;RBI=0.0731767;REFB=0.00373575;REVB=-0.0718957;RO=2;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012825;STB=0.507033;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.000559264;OID=.;OPOS=125324570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:9:7:1:1:9:7:1:1 chr12 125386076 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.264;QD=57.2023;RBI=0.0910204;REFB=0;REVB=0.0863721;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000696626;OID=.;OPOS=125386076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0 chr12 125397553 . T C 107.95 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0371671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4253;QD=13.0847;RBI=0.0389075;REFB=-0.0226249;REVB=-0.0115066;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119826;STB=0.507031;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0405343;OID=.;OPOS=125397553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:7:6:9:11:7:6:9:11 chr12 125397750 . A G 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00799376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.422;QD=57.2019;RBI=0.0770709;REFB=0;REVB=-0.0766552;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0015544;OID=.;OPOS=125397750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr12 125398500 . G A 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.275;QD=46.848;RBI=0.0304417;REFB=0;REVB=-0.0264387;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000572955;OID=.;OPOS=125398500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr12 125398733 . C T 169.4 PASS AF=0.607143;AO=16;DP=27;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0204998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.497;QD=24.1992;RBI=0.0231014;REFB=-0.0120176;REVB=-0.0106506;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20758;STB=0.622265;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00849407;OID=.;OPOS=125398733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:28:11:11:16:17:0.607143:7:9:3:8:7:10:3:8 chr12 125399286 . C T 665.56 PASS AF=0.61165;AO=59;DP=100;FAO=63;FDP=103;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0708987;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.289;QD=25.8469;RBI=0.0741518;REFB=-0.0117043;REVB=0.0217225;RO=40;SAF=29;SAR=30;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086623;STB=0.52973;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00663285;OID=.;OPOS=125399286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:103:40:40:59:63:0.61165:30:29:15:25:33:30:16:24 chr12 125424180 . G C 66.32 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0100323;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.542;QD=10.6108;RBI=0.0104277;REFB=0.000373149;REVB=0.00284418;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384764;STB=0.726074;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00113591;OID=.;OPOS=125424180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:13:3:5:4:13:3 chr12 125424510 . T A 97.47 PASS AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0080524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.093;QD=10.2604;RBI=0.00816092;REFB=-0.0196267;REVB=-0.00132649;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167492;STB=0.570018;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0264069;OID=.;OPOS=125424510;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:38:38:19:25:12:12:0.315789:7:5:11:8:7:5:13:12 chr12 125434580 . C T 271.67 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0227117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.834;QD=23.1206;RBI=0.0325078;REFB=-0.0126537;REVB=0.023258;RO=21;SAF=18;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219464;STB=0.614704;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0071775;OID=.;OPOS=125434580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:22:25:25:0.531915:7:18:10:11:7:18:11:11 chr12 125434716 . G A 277.42 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.00254493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.21;QD=18.4948;RBI=0.0320096;REFB=-0.0420787;REVB=-0.0319083;RO=30;SAF=11;SAR=19;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065637;STB=0.536562;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0441913;OID=.;OPOS=125434716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:19:11:9:21:19:11:9:21 chr12 125437019 . T C 73.82 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0569153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3976;QD=9.84222;RBI=0.0569211;REFB=-0.00665436;REVB=-0.000812627;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505151;STB=0.81741;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0112664;OID=.;OPOS=125437019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:1:9:11:9:1:9:11:9 chr12 125438516 . T C 309.4 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00680187;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.715;QD=18.1998;RBI=0.00762644;REFB=-0.00646693;REVB=-0.00344921;RO=35;SAF=15;SAR=18;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077901;STB=0.543452;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0112719;OID=.;OPOS=125438516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:18:15:13:22:18:15:13:22 chr12 125438523 . C T 297.83 PASS AF=0.445946;AO=32;DP=73;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00655177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.304;QD=16.0987;RBI=0.0399236;REFB=-0.0322954;REVB=0.0393824;RO=38;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147606;STB=0.522052;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0291809;OID=.;OPOS=125438523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:38:41:32:33:0.445946:19:13:16:22:19:14:19:22 chr12 125441359 . T C 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0298886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.899;QD=6.57346;RBI=0.0325048;REFB=-0.00727644;REVB=0.0127765;RO=16;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28974;STB=0.681292;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.036061;OID=.;OPOS=125441359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:3:3:12:4:3:3:12:4 chr12 125448960 . C T 322.88 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00654032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.532;QD=19.2766;RBI=0.0119525;REFB=-0.0215877;REVB=-0.0100043;RO=33;SAF=19;SAR=15;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145244;STB=0.580739;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0246405;OID=.;OPOS=125448960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:15:19:13:20:15:19:13:20 chr12 125451767 . G A 115.67 PASS AF=0.482759;AO=13;DP=28;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.026049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.876;QD=15.9551;RBI=0.0317272;REFB=-0.00888665;REVB=0.0181125;RO=14;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278084;STB=0.638091;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0117957;OID=.;OPOS=125451767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:14:15:13:14:0.482759:10:3:7:7:10:4:8:7 chr12 125467158 . C T 360.12 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.00329915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.855;QD=22.8646;RBI=0.046008;REFB=-0.0238369;REVB=-0.0458895;RO=27;SAF=23;SAR=13;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265449;STB=0.6461;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00920648;OID=.;OPOS=125467158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:13:23:8:19:13:23:8:19 chr12 125562784 . C T 261.64 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.0121004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.596;QD=14.7405;RBI=0.027781;REFB=-0.0160761;REVB=-0.0250073;RO=41;SAF=24;SAR=6;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163591;STB=0.593682;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0332175;OID=.;OPOS=125562784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:6:24:28:13:6:24:28:13 chr12 125562809 . G A 876.1 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0119299;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.812;QD=56.5225;RBI=0.018026;REFB=0.0883887;REVB=0.0135135;RO=1;SAF=45;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103763;STB=0.505493;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000166987;OID=.;OPOS=125562809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:16:45:1:0:16:45:1:0 chr12 125591780 . C T 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=0.00260846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.663;QD=19.6971;RBI=0.0333593;REFB=-0.0111588;REVB=0.0332571;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305299;STB=0.677056;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0108796;OID=.;OPOS=125591780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:22:21:21:0.488372:10:11:18:3:10:11:19:3 chr12 125834095 . C A 483.68 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.000923452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.593;QD=19.1556;RBI=0.0104508;REFB=-0.000216148;REVB=-0.01041;RO=44;SAF=31;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856128;STB=0.567276;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.000223143;OID=.;OPOS=125834095;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:44:51:50:50:0.49505:19:31:23:21:19:31:25:26 chr12 125834395 . T C 1135.18 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0461022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2419;QD=60.543;RBI=0.0484432;REFB=0;REVB=-0.0148772;RO=0;SAF=47;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000486705;OID=.;OPOS=125834395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:28:47:0:0:28:47:0:0 chr12 126068417 . T C 2677.65 PASS AF=1;AO=172;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.505;QD=62.271;RBI=0.0331047;REFB=0;REVB=0.00316681;RO=0;SAF=92;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.22873e-05;OID=.;OPOS=126068417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:172:172:0:0:172:172:1:80:92:0:0:80:92:0:0 chr12 126137060 . C T 262.53 PASS AF=0.323232;AO=32;DP=99;FAO=32;FDP=99;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=0.0189633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1031;QD=10.6072;RBI=0.0194455;REFB=0.00899307;REVB=-0.00430356;RO=66;SAF=23;SAR=9;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11051;STB=0.572008;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0179614;OID=.;OPOS=126137060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:66:67:32:32:0.323232:9:23:42:24:9:23:42:25 chr12 127067932 . A G 31.7 PASS AF=0.625;AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0126677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.282;QD=15.8503;RBI=0.0586901;REFB=-0.018691;REVB=0.0573067;RO=3;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725463;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00728106;OID=.;OPOS=127067932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:4:5:0.625:1:3:2:1:2:3:2:1 chr12 127068865 . A G 632.22 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.957;QD=61.6796;RBI=0.0353861;REFB=0;REVB=0.0320158;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257652;OID=.;OPOS=127068865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr12 127068892 . C T 836.88 PASS AF=1;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198298;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.493;QD=57.7156;RBI=0.056661;REFB=0;REVB=-0.0530777;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000174798;OID=.;OPOS=127068892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:57:58:1:34:23:0:0:35:23:0:0 chr12 127650467 . G C 4357.11 PASS AF=0.93125;AO=296;DP=318;FAO=298;FDP=320;FR=.;FRO=22;FSAF=146;FSAR=152;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00171158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2371;QD=54.4639;RBI=0.00371135;REFB=-0.0514255;REVB=0.00329311;RO=16;SAF=145;SAR=151;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192924;STB=0.519433;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00301852;OID=.;OPOS=127650467;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:318:320:16:22:296:298:0.93125:151:145:11:5:152:146:17:5 chr12 127650471 . AT GG 4798.89 PASS AF=0.952096;AO=293;DP=315;FAO=318;FDP=334;FR=.;FRO=16;FSAF=170;FSAR=148;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0269743;FXX=0.0147488;HRUN=1;LEN=2;MLLD=308.58;QD=57.4718;RBI=0.0295209;REFB=-0.018705;REVB=0.0119946;RO=16;SAF=150;SAR=143;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173206;STB=0.507367;STBP=0.27;TYPE=mnp;VARB=0.000958232;OID=.;OPOS=127650471;OREF=AT;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:315:334:16:16:293:318:0.952096:143:150:11:5:148:170:11:5 chr12 127650538 . A G 9727.27 PASS AF=0.956781;AO=642;DP=674;FAO=642;FDP=671;FR=.;FRO=29;FSAF=284;FSAR=358;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00161767;FXX=0.00445097;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1091;QD=57.9867;RBI=0.0642983;REFB=-0.0216183;REVB=-0.064278;RO=27;SAF=284;SAR=358;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232081;STB=0.510804;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00148118;OID=.;OPOS=127650538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:674:671:27:29:642:642:0.956781:358:284:20:7:358:284:20:9 chr12 127650583 . T G 8673.26 PASS AF=0.96587;AO=565;DP=585;FAO=566;FDP=586;FR=.;FRO=20;FSAF=247;FSAR=319;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0598996;FXX=0.00170355;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2004;QD=59.2032;RBI=0.0608804;REFB=0.020871;REVB=0.0108841;RO=19;SAF=247;SAR=318;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122386;STB=0.507396;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00117163;OID=.;OPOS=127650583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:585:586:19:20:565:566:0.96587:318:247:12:7:319:247:13:7 chr12 127650599 . A G 6268.99 PASS AF=0.973934;AO=338;DP=427;FAO=411;FDP=422;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=192;FSAR=219;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0500138;FXX=0.00938945;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.36;QD=59.4217;RBI=0.0506236;REFB=-0.061552;REVB=0.00783356;RO=15;SAF=129;SAR=209;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186324;STB=0.502049;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00194911;OID=.;OPOS=127650599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:427:422:15:11:338:411:0.973934:209:129:9:6:219:192:6:5 chr12 127650616 . G A 2509.67 PASS AF=0.6;AO=223;DP=376;FAO=225;FDP=375;FR=.;FRO=150;FSAF=104;FSAR=121;FSRF=58;FSRR=92;FWDB=-0.00622508;FXX=0.0026595;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.834;QD=26.7699;RBI=0.00992523;REFB=-0.00654643;REVB=0.00773036;RO=150;SAF=103;SAR=120;SRF=58;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566546;STB=0.530533;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00523161;OID=.;OPOS=127650616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:375:150:150:223:225:0.6:120:103:58:92:121:104:58:92 chr12 127650639 . A G 3357.5 PASS AF=0.98008;AO=166;DP=240;FAO=246;FDP=251;FR=.;FRO=5;FSAF=96;FSAR=150;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.039726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.822;QD=53.506;RBI=0.0471853;REFB=-0.0549357;REVB=0.0254618;RO=2;SAF=90;SAR=76;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000962131;STB=0.508543;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00376666;OID=.;OPOS=127650639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:240:251:2:5:166:246:0.98008:76:90:1:1:150:96:4:1 chr12 127650662 . T C 815.37 PASS AF=0.983051;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0105218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.275;QD=55.2791;RBI=0.0154683;REFB=-0.0223378;REVB=0.0113384;RO=1;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136677;STB=0.50704;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00103033;OID=.;OPOS=127650662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:59:1:1:56:58:0.983051:34:22:0:1:35:23:0:1 chr12 127650669 . A G 198.39 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0410552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6377;QD=44.0875;RBI=0.0420339;REFB=-0.0673075;REVB=-0.00901763;RO=1;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538535;STB=0.529377;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0169818;OID=.;OPOS=127650669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:8:9:0:1:8:9:0:1 chr12 127650883 . G T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.669;QD=43.4859;RBI=0.0625702;REFB=0;REVB=0.0526102;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128228;OID=.;OPOS=127650883;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:1:11:0:0:1:11:0:0 chr12 127650890 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025508;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.021;QD=44.6882;RBI=0.0319408;REFB=0;REVB=0.019224;RO=0;SAF=12;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.75824e-05;OID=.;OPOS=127650890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:1:12:0:0:1:12:0:0 chr12 128778703 . G A 180.91 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0277419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2132;QD=16.4463;RBI=0.0652805;REFB=-0.0237291;REVB=0.0590926;RO=25;SAF=16;SAR=3;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326542;STB=0.690797;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0356741;OID=.;OPOS=128778703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:3:16:15:10:3:16:15:10 chr12 128899673 . A G 379.35 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0165553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9966;QD=19.2078;RBI=0.0608819;REFB=-0.00151452;REVB=-0.0585878;RO=40;SAF=15;SAR=24;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084869;STB=0.547259;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00124261;OID=.;OPOS=128899673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:24:15:19:21:24:15:19:21 chr12 128899736 . G A 195.24 PASS AF=0.59375;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0546396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.746;QD=24.4048;RBI=0.056211;REFB=-0.0231936;REVB=-0.0131978;RO=12;SAF=13;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25187;STB=0.656397;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0217459;OID=.;OPOS=128899736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:12:13:19:19:0.59375:6:13:4:8:6:13:4:9 chr12 128900005 . G A 226.01 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00120203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.991;QD=20.5465;RBI=0.0044632;REFB=-0.022828;REVB=-0.00429828;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0197334;OID=.;OPOS=128900005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:12:10:10:12:12:10:10:12 chr12 129153986 . G A 1438.46 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.527;QD=61.8694;RBI=0.0369545;REFB=-0.0316698;REVB=0.0300311;RO=0;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00012553;OID=.;OPOS=129153986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:35:57:0:0:35:57:1:0 chr12 129181810 . A G 3667.39 PASS AF=1;AO=232;DP=232;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.231;QD=63.2308;RBI=0.0248745;REFB=0;REVB=-0.0224361;RO=0;SAF=139;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2795e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51699e-05;OID=.;OPOS=129181810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:232:232:0:0:232:232:1:93:139:0:0:93:139:0:0 chr12 129181834 . A G 3827.87 PASS AF=0.988142;AO=250;DP=253;FAO=250;FDP=253;FR=.;FRO=3;FSAF=150;FSAR=100;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0112703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6594;QD=60.5197;RBI=0.0211865;REFB=0.00577291;REVB=0.0179402;RO=3;SAF=150;SAR=100;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00943683;STB=0.50495;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-4.33828e-05;OID=.;OPOS=129181834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:253:253:3:3:250:250:0.988142:100:150:3:0:100:150:3:0 chr12 129190021 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7049;QD=50.4132;RBI=0.0327621;REFB=0;REVB=0.0227342;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155715;OID=.;OPOS=129190021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr12 129190266 . G A 305.12 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0124032;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.975;QD=17.4351;RBI=0.0154286;REFB=-0.0179196;REVB=0.00917611;RO=36;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400014;STB=0.515142;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0212558;OID=.;OPOS=129190266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:36:37:33:33:0.471429:16:17:17:19:16:17:18:19 chr12 129293346 . C T 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00867635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.15;QD=8.6914;RBI=0.0231914;REFB=-0.0133606;REVB=0.0215072;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097172;STB=0.559852;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0184361;OID=.;OPOS=129293346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:7:10:4:4:7:10 chr12 129298735 . C G 660.69 PASS AF=0.571429;AO=63;DP=110;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.0800451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7338;QD=23.596;RBI=0.0819102;REFB=-0.0575751;REVB=0.0173801;RO=47;SAF=38;SAR=25;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100759;STB=0.545414;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0463959;OID=.;OPOS=129298735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:47:48:63:64:0.571429:25:38:34:13:25:39:34:14 chr12 129298777 . G A 35.62 PASS AF=0.0925926;AO=11;DP=109;FAO=10;FDP=108;FR=.;FRO=98;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.0364677;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.01;QD=1.31942;RBI=0.0377957;REFB=-0.0190129;REVB=-0.00993071;RO=95;SAF=7;SAR=4;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156571;STB=0.581925;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.188972;OID=.;OPOS=129298777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:109:108:95:98:11:10:0.0925926:4:7:48:47:4:6:50:48 chr12 129298779 . C T 61.98 PASS AF=0.122807;AO=15;DP=114;FAO=14;FDP=114;FR=.;FRO=100;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.0996144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9667;QD=2.17471;RBI=0.0998201;REFB=-0.0155637;REVB=-0.00640453;RO=98;SAF=10;SAR=5;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26767;STB=0.658585;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.160732;OID=.;OPOS=129298779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:114:114:98:100:15:14:0.122807:5:10:44:54:5:9:46:54 chr12 129298797 . G A 45.97 PASS AF=0.1;AO=12;DP=120;FAO=12;FDP=120;FR=.;FRO=108;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=63;FWDB=-0.0354363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5807;QD=1.53237;RBI=0.0361874;REFB=-0.0153503;REVB=-0.00733473;RO=108;SAF=5;SAR=7;SRF=45;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1856e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0638091;OID=.;OPOS=129298797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:120:120:108:108:12:12:0.1:7:5:45:63:7:5:45:63 chr12 129298799 . T C 40.69 PASS AF=0.0932203;AO=11;DP=118;FAO=11;FDP=118;FR=.;FRO=107;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=63;FWDB=0.00244464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8979;QD=1.37927;RBI=0.0791715;REFB=-0.019074;REVB=-0.0791338;RO=106;SAF=5;SAR=6;SRF=44;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467831;STB=0.539835;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.105357;OID=.;OPOS=129298799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:118:118:106:107:11:11:0.0932203:6:5:44:62:6:5:44:63 chr12 129298819 . C T 307.98 PASS AF=0.376344;AO=35;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=47;FWDB=-0.0385924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7715;QD=13.2466;RBI=0.0397184;REFB=-0.0387339;REVB=-0.0093901;RO=54;SAF=10;SAR=25;SRF=10;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141731;STB=0.578272;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0439862;OID=.;OPOS=129298819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:54:58:35:35:0.376344:25:10:10:44:25:10:11:47 chr12 129328752 . C A 528.46 PASS AF=0.576471;AO=49;DP=85;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00885321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3669;QD=24.8689;RBI=0.0117975;REFB=-0.0391134;REVB=0.00779762;RO=36;SAF=28;SAR=21;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140946;STB=0.57715;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0275748;OID=.;OPOS=129328752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:36:36:49:49:0.576471:21:28:14:22:21:28:14:22 chr12 129329082 . T C 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0371953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.727;QD=9.19977;RBI=0.0377281;REFB=-0.0243507;REVB=-0.0063182;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577328;STB=0.57355;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0576895;OID=.;OPOS=129329082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:12:13:7:7:0.35:5:2:4:8:5:2:5:8 chr12 129383848 . GTGT G 755.71 PASS AF=0.521429;AO=68;DP=141;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.011586;FXX=0.0277759;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.84;QD=21.5916;RBI=0.011663;REFB=-0.00675078;REVB=-0.00133721;RO=65;SAF=29;SAR=39;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178067;STB=0.511272;STBP=0.796;TYPE=del;VARB=0.00561843;OID=.;OPOS=129383849;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.521429:68:141:73:140:67:31:42:30:37:99:65:29:39:29:36 chr12 129431952 . C T 443.71 PASS AF=0.392308;AO=51;DP=129;FAO=51;FDP=130;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=0.00742808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8243;QD=13.6527;RBI=0.0134851;REFB=-0.00107315;REVB=-0.0112549;RO=78;SAF=29;SAR=22;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141535;STB=0.576129;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00165443;OID=.;OPOS=129431952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:78:79:51:51:0.392308:22:29:34:44:22:29:35:44 chr12 129559557 . C T 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.253;QD=62.0214;RBI=0.0438776;REFB=0;REVB=0.00442199;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212085;OID=.;OPOS=129559557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr12 130647709 . G C 1011.51 PASS AF=0.451064;AO=106;DP=235;FAO=106;FDP=235;FR=.;FRO=129;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=69;FSRR=60;FWDB=0.00806173;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.798;QD=17.2172;RBI=0.0146681;REFB=-0.0421827;REVB=-0.0122541;RO=129;SAF=50;SAR=56;SRF=69;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625395;STB=0.534653;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0530167;OID=.;OPOS=130647709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:129:129:106:106:0.451064:56:50:69:60:56:50:69:60 chr12 130649316 . CTTTT CTTCT,CTTTC,CTT 526.54 PASS AF=0.318182,0.030303,0.651515;AO=13,3,10;DP=66;FAO=21,2,43;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,24;FSAR=20,2,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0533827,-0.0579325,-0.0736375;FXX=0.0571347;HRUN=13,13,13;LEN=1,1,2;MLLD=138.763,136.398,10.3712;QD=31.9116;RBI=0.0779082,0.0811142,0.131809;REFB=-0.0347866,-0.0368867,-0.043873;REVB=-0.0567448,-0.0567745,-0.109321;RO=0;SAF=0,0,4;SAR=13,3,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,del;VARB=0.0182974,0.0874461,-0.0684726;OID=.,.,.;OPOS=130649319,130649320,130649317;OREF=T,T,TT;OALT=C,C,-;OMAPALT=CTTCT,CTTTC,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.318182,0.030303,0.651515:13,3,10:66:21,2,43:66:0:1,0,24:20,2,19:0:0:99:0:0,0,4:13,3,6:0:0 chr12 130649543 . C G 1250.16 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0151337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.311;QD=60.2488;RBI=0.0263974;REFB=-0.128612;REVB=0.0216286;RO=1;SAF=29;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160483;STB=0.508473;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000495074;OID=.;OPOS=130649543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:53:29:1:0:53:29:1:0 chr12 130649770 . C T 359.6 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0188791;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.6991;QD=22.4749;RBI=0.0210709;REFB=0.00357708;REVB=0.00935748;RO=28;SAF=13;SAR=23;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345064;STB=0.519001;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.00138418;OID=.;OPOS=130649770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:28:28:36:36:0.5625:23:13:9:19:23:13:9:19 chr12 130649962 . C T 420.47 PASS AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00463544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1245;QD=17.8925;RBI=0.0522134;REFB=0.00908115;REVB=0.0520073;RO=49;SAF=19;SAR=24;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460837;STB=0.515735;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.0126536;OID=.;OPOS=130649962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:49:51:43:43:0.457447:24:19:24:25:24:19:24:27 chr12 130650016 . G C 427.91 PASS AF=0.483146;AO=41;DP=87;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.100306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.1;QD=19.2319;RBI=0.100406;REFB=-0.0211644;REVB=-0.00448628;RO=46;SAF=15;SAR=26;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0037843;STB=0.501398;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0234487;OID=.;OPOS=130650016;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:46:46:41:43:0.483146:26:15:17:29:27:16:17:29 chr12 130650041 . G A 364.44 PASS AF=0.479452;AO=33;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.000156491;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=281.631;QD=19.9691;RBI=0.0187056;REFB=-0.0397589;REVB=-0.018705;RO=23;SAF=13;SAR=20;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647921;STB=0.545929;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0276393;OID=.;OPOS=130650041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:23:30:33:35:0.479452:20:13:11:12:22:13:14:16 chr12 130839165 . G A 503.53 PASS AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0297974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.668;QD=22.3792;RBI=0.0298395;REFB=0.00464628;REVB=-0.00158469;RO=42;SAF=23;SAR=25;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104184;STB=0.557292;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00332151;OID=.;OPOS=130839165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:42:48:48:0.533333:25:23:15:27:25:23:15:27 chr12 130847389 . A G 335.97 PASS AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.011386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.918;QD=19.7627;RBI=0.0175675;REFB=-0.00291045;REVB=-0.0133782;RO=32;SAF=26;SAR=9;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262952;STB=0.64128;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00482453;OID=.;OPOS=130847389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:33:35:35:0.514706:9:26:15:17:9:26:16:17 chr12 131275484 . G A 348.66 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00092422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.332;QD=17.4329;RBI=0.0017135;REFB=-0.00289682;REVB=0.00144287;RO=43;SAF=16;SAR=21;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317848;STB=0.517799;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00251322;OID=.;OPOS=131275484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:21:16:20:23:21:16:20:23 chr12 131276448 . G T 1646.94 PASS AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.637;QD=59.3493;RBI=0.027208;REFB=-0.0750304;REVB=0.0153423;RO=1;SAF=52;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904204;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186297;OID=.;OPOS=131276448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:111:111:1:0:110:111:1:58:52:1:0:58:53:0:0 chr12 131299974 . A G 801.09 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.494;QD=57.2209;RBI=0.015347;REFB=0;REVB=-0.00761206;RO=0;SAF=14;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25191e-05;OID=.;OPOS=131299974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:42:14:0:0:42:14:0:0 chr12 131306314 . C G 165.04 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00695819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7325;QD=14.0456;RBI=0.0189471;REFB=-0.0190308;REVB=0.0176232;RO=29;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208556;STB=0.621042;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0322959;OID=.;OPOS=131306314;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:7:11:12:17:7:11:12:17 chr12 131466562 . T C 1425.82 PASS AF=1;AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.203;QD=62.6736;RBI=0.0297482;REFB=0;REVB=0.0279227;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832097;OID=.;OPOS=131466562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:89:91:1:44:45:0:0:46:45:0:0 chr12 131620588 . A G 251.94 PASS AF=0.483333;AO=27;DP=59;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.011034;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0995;QD=16.796;RBI=0.0864353;REFB=-0.0170622;REVB=0.0857281;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726809;STB=0.566965;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0132935;OID=.;OPOS=131620588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:32:31:27:29:0.483333:13:14:19:13:15:14:19:12 chr12 131622735 . T C 159.59 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0351623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.687;QD=17.7318;RBI=0.0410493;REFB=-0.00832002;REVB=0.0211815;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293785;STB=0.666481;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0116181;OID=.;OPOS=131622735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:10:7:14:5:10:7:14:5 chr12 132237848 . T C 231.76 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.726;QD=48.7906;RBI=0.00543897;REFB=0;REVB=0.00543897;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016505;OID=.;OPOS=132237848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:18:0:0:0:19:0:0:0 chr12 132271113 . T C 1172.01 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.429;QD=60.8835;RBI=0.0184973;REFB=0;REVB=0.0183049;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01631e-05;OID=.;OPOS=132271113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0 chr12 132285934 . G A 64.46 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0214912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1124;QD=9.91619;RBI=0.0708941;REFB=0.00798814;REVB=-0.0675581;RO=17;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019992;STB=0.512168;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=-0.0219297;OID=.;OPOS=132285934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:2:7:13:4:2:7:13:4 chr12 132325239 . G A 519.58 PASS AF=0.519608;AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0103587;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.025;QD=20.3758;RBI=0.0197062;REFB=-0.0155136;REVB=0.016764;RO=49;SAF=30;SAR=23;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206425;STB=0.613545;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0112942;OID=.;OPOS=132325239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:49:49:53:53:0.519608:23:30:16:33:23:30:16:33 chr12 132335477 . C G 313.21 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0444894;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5837;QD=16.7043;RBI=0.0996997;REFB=-0.0151838;REVB=0.0892229;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506663;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0197516;OID=.;OPOS=132335477;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:40:41:34:34:0.453333:17:17:20:20:17:17:20:21 chr12 132403161 . A G 785.58 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.329;QD=64.1292;RBI=0.0423652;REFB=0;REVB=0.00566205;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64868e-05;OID=.;OPOS=132403161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:31:17:0:0:31:18:0:0 chr12 132589649 . C T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00251802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.599;QD=12.7238;RBI=0.00433286;REFB=-0.00228906;REVB=-0.00352608;RO=36;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155889;STB=0.589211;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00253709;OID=.;OPOS=132589649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:12:11:12:24:12:11:12:24 chr12 132598995 . C T 94.25 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00305805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6311;QD=10.4721;RBI=0.0326442;REFB=0.00139748;REVB=-0.0325006;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186435;STB=0.610935;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00435338;OID=.;OPOS=132598995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:6:6:16:8:6:6:16:8 chr12 132624252 . G A 149.89 PASS AF=0.533333;AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0485837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.964;QD=19.9853;RBI=0.049114;REFB=-0.0331508;REVB=-0.00719798;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103688;STB=0.545399;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0297441;OID=.;OPOS=132624252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:30:14:14:15:16:0.533333:9:6:4:10:10:6:4:10 chr12 132626425 . G A 593.2 PASS AF=0.556701;AO=54;DP=97;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0162251;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.418;QD=24.4617;RBI=0.0249093;REFB=-0.0184308;REVB=0.0189002;RO=42;SAF=19;SAR=35;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163035;STB=0.512859;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0077561;OID=.;OPOS=132626425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:42:43:54:54:0.556701:35:19:14:28:35:19:14:29 chr12 132626668 . T C 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0165334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.632;QD=13.753;RBI=0.0209874;REFB=-0.014932;REVB=0.0129274;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209193;STB=0.585254;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0256391;OID=.;OPOS=132626668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:23:15:15:0.394737:7:8:6:13:7:8:9:14 chr12 132627365 . G A 278.86 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0219187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.847;QD=21.8716;RBI=0.0491985;REFB=-0.0208213;REVB=0.0440461;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175853;STB=0.597679;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0189753;OID=.;OPOS=132627365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:11:17:9:14:11:17:9:14 chr12 132628281 . C T 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00815242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.712;QD=22.5856;RBI=0.0101507;REFB=-0.0137522;REVB=-0.00604764;RO=6;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123875;STB=0.571283;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.00824304;OID=.;OPOS=132628281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:10:1:1:5:10:1:1:5 chr12 132628285 . G A 70.66 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.044837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.7708;QD=18.8416;RBI=0.0463352;REFB=-0.0365859;REVB=0.0116875;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234244;STB=0.649737;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0275935;OID=.;OPOS=132628285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:15:15:5:6:9:9:0.6:7:2:0:5:7:2:0:6 chr12 132635521 . T C 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0101776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.15;QD=13.5766;RBI=0.0236175;REFB=-0.0265793;REVB=-0.0213121;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383131;STB=0.538402;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0272258;OID=.;OPOS=132635521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:6:7:9:9:6:7:9:10 chr12 132635524 . AGGGGGGGC AGGGGGG,AGGGGGGC 61.27 PASS AF=0,0.6;AO=3,10;DP=28;FAO=0,18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=0,7;FSAR=0,11;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0439895,0.202252;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=15.8904,7.86823;QD=8.16997;RBI=0.158867,0.257888;REFB=0.0105537,-0.0955113;REVB=-0.152655,-0.160002;RO=10;SAF=3,4;SAR=0,6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.622111,-0.171427;STB=0.5,0.578859;STBP=1,0.327;TYPE=del,del;VARB=0,0.11163;OID=.,.;OPOS=132635531,132635525;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=AGGGGGG,AGGGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.6:3,10:28:0,18:30:12:0,7:0,11:7:5:35:10:3,4:0,6:6:4 chr12 132635581 . C T 95.17 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0317845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6783;QD=11.197;RBI=0.0329084;REFB=-0.00417226;REVB=0.00852689;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174446;STB=0.605864;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0100929;OID=.;OPOS=132635581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:10:2:6:16:10:2:6:16 chr12 132636864 . C T 44.8 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0106007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.286;QD=7.46703;RBI=0.0138565;REFB=-0.0148093;REVB=-0.00892342;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475485;STB=0.530034;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0504025;OID=.;OPOS=132636864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:3:4:9:8:3:4:9:8 chr12 132682481 . T G 739.95 PASS AF=0.486667;AO=72;DP=149;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.0210507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.021;QD=19.732;RBI=0.0265802;REFB=-0.0273667;REVB=0.0162289;RO=77;SAF=35;SAR=37;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173953;STB=0.50613;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0120159;OID=.;OPOS=132682481;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:77:77:72:73:0.486667:37:35:36:41:38:35:36:41 chr12 132682484 . A G 745.98 PASS AF=0.493243;AO=73;DP=148;FAO=73;FDP=148;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.00114905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.057;QD=20.1615;RBI=0.0124771;REFB=-0.0263543;REVB=-0.0124241;RO=74;SAF=35;SAR=38;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306935;STB=0.513269;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0263198;OID=.;OPOS=132682484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:75:73:73:0.493243:38:35:33:41:38:35:34:41 chr12 132688137 . A G 136.15 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0128836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.205;QD=10.4727;RBI=0.0388964;REFB=-0.0150886;REVB=-0.0367008;RO=35;SAF=8;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818899;STB=0.548476;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0373685;OID=.;OPOS=132688137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:9:8:19:16:9:8:19:16 chr12 132824441 . T TC 32.45 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0429292;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=86.0775;QD=4.63633;RBI=0.0436702;REFB=-0.00845624;REVB=-0.00801055;RO=20;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881715;STB=0.691801;STBP=0.236;TYPE=ins;VARB=0.119072;OID=.;OPOS=132824442;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:8:28:8:28:20:2:6:10:10:32:20:3:5:9:11 chr12 133181399 . T C 814.58 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.439;QD=57.1637;RBI=0.0412439;REFB=0;REVB=-0.00754328;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37905e-05;OID=.;OPOS=133181399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:31:25:0:0:32:25:0:0 chr12 133182818 . G A 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0127568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.418;QD=13.5765;RBI=0.021656;REFB=-0.00663596;REVB=0.0174999;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414547;STB=0.524235;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0346713;OID=.;OPOS=133182818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:6:7:11:8:6:7:11:8 chr12 133196596 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.864;QD=47.8223;RBI=0.0358813;REFB=0;REVB=0.0190878;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634653;OID=.;OPOS=133196596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr12 133201947 . T C 538.45 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0409414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4877;QD=59.828;RBI=0.0429938;REFB=0;REVB=-0.0131251;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000740778;OID=.;OPOS=133201947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0 chr12 133202004 . C T 43.21 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0224247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.017;QD=5.57553;RBI=0.0246426;REFB=-0.00683272;REVB=-0.0102173;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164658;STB=0.555396;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0428421;OID=.;OPOS=133202004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:31:31:21:24:7:7:0.225806:3:4:9:12:3:4:12:12 chr12 133208979 . T C 1449.94 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00626261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.462;QD=63.041;RBI=0.00656826;REFB=0;REVB=0.00198033;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77844e-05;OID=.;OPOS=133208979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:42:49:0:0:42:50:0:0 chr12 133219831 . T C 637.21 PASS AF=0.492424;AO=63;DP=132;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.0157343;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.435;QD=19.3095;RBI=0.0238352;REFB=-0.0116736;REVB=0.0179038;RO=67;SAF=31;SAR=32;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273843;STB=0.507244;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0169004;OID=.;OPOS=133219831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:67:63:65:0.492424:32:31:31:36:34:31:31:36 chr12 133236000 . C T 191.64 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.000285866;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.289;QD=14.7418;RBI=0.00691129;REFB=-0.00274973;REVB=-0.00690538;RO=29;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763129;STB=0.531886;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0037737;OID=.;OPOS=133236000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:29:30:22:22:0.423077:12:10:11:18:12:10:12:18 chr12 133253995 . G A 329.04 PASS AF=0.539683;AO=30;DP=59;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00120165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.624;QD=20.8917;RBI=0.00617764;REFB=-0.0042628;REVB=0.00605965;RO=29;SAF=14;SAR=16;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10892;STB=0.584367;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00429925;OID=.;OPOS=133253995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:63:29:29:30:34:0.539683:16:14:10:19:16:18:10:19 chr12 133272470 . G T 137.83 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0534042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5543;QD=19.0111;RBI=0.0540168;REFB=-0.00929499;REVB=0.00811232;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103688;STB=0.558748;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0120017;OID=.;OPOS=133272470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:6:9:10:4:6:9:10:4 chr12 133294333 . C T 364.99 PASS AF=0.433333;AO=38;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.0311123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2998;QD=16.2218;RBI=0.0371764;REFB=-0.0157634;REVB=-0.0203496;RO=51;SAF=19;SAR=19;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129832;STB=0.579177;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0221833;OID=.;OPOS=133294333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:51:38:39:0.433333:19:19:19:32:19:20:19:32 chr12 133295353 . C T 254.41 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0061379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.842;QD=15.4185;RBI=0.0139607;REFB=-0.013142;REVB=0.012539;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064795;STB=0.536697;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0150611;OID=.;OPOS=133295353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:19:10:15:22:19:10:15:22 chr12 133303973 . C G 112.95 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=41;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.036895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.6471;QD=10.757;RBI=0.0509227;REFB=-0.0307004;REVB=0.0350982;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984234;STB=0.52551;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.102452;OID=.;OPOS=133303973;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:28:28:13:14:0.333333:5:8:17:11:5:9:17:11 chr12 133306710 . C T 130.62 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0222633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2263;QD=13.7499;RBI=0.0367421;REFB=0.00979835;REVB=0.0292288;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333056;STB=0.519409;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0146568;OID=.;OPOS=133306710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:8:7:10:13:8:7:10:13 chr12 133331364 . G A 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00546168;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.256;QD=18.2901;RBI=0.0185249;REFB=-0.010239;REVB=-0.0177015;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139532;STB=0.570014;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0114577;OID=.;OPOS=133331364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:33:32:32:0.492308:14:18:13:19:14:18:14:19 chr12 133357412 . T C 243.68 PASS AF=0.909091;AO=20;DP=23;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0904227;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0496;QD=44.3049;RBI=0.0988674;REFB=-0.00642899;REVB=0.0399814;RO=2;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11466;STB=0.562436;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0063179;OID=.;OPOS=133357412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:23:22:2:2:20:20:0.909091:7:13:0:2:7:13:0:2 chr12 133363006 . G A 109.24 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0214127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.272;QD=14.0955;RBI=0.0639558;REFB=-0.0229138;REVB=0.0602647;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932572;STB=0.554372;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0259217;OID=.;OPOS=133363006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:7:6:10:8:7:6:10:8 chr12 133363376 . G T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.098;QD=63.872;RBI=0.0720505;REFB=0;REVB=-0.00280233;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125144;OID=.;OPOS=133363376;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0 chr12 133384864 . G A 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0541771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.345;QD=16.199;RBI=0.0542383;REFB=0.0266013;REVB=-0.00257564;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00734977;OID=.;OPOS=133384864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:2:1:4:1:2:1 chr12 133389998 . T C 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0527412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.391;QD=10.6346;RBI=0.0528256;REFB=-0.0242434;REVB=-0.0029855;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168369;STB=0.602151;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0448594;OID=.;OPOS=133389998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:7:6:5:3:7:6 chr12 133411987 . G C 1157.45 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.022932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.611;QD=59.3562;RBI=0.0258902;REFB=0.00829616;REVB=-0.0120178;RO=1;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104021;STB=0.505493;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-8.84776e-05;OID=.;OPOS=133411987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:45:32:0:1:45:32:0:1 chr12 133417982 . T TAA 93.03 PASS AF=0.451613;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0184109;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=2;MLLD=35.0285;QD=12.0036;RBI=0.0854248;REFB=0.0162729;REVB=0.0834172;RO=17;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156249;STB=0.538408;STBP=0.761;TYPE=ins;VARB=-0.0189058;OID=.;OPOS=133417983;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.451613:13:31:14:31:17:9:5:12:5:93:17:9:4:12:5 chr12 133423695 . A G 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00220051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.952;QD=11.9536;RBI=0.0504013;REFB=-5.47431e-05;REVB=-0.0503532;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043798;STB=0.52625;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.000694052;OID=.;OPOS=133423695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:6:5:4:4:6:5 chr12 133428242 . G A 172.17 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0319448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2182;QD=26.4881;RBI=0.0877935;REFB=-0.0034516;REVB=0.0817755;RO=9;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234293;STB=0.632083;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0033297;OID=.;OPOS=133428242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:3:14:5:4:3:14:5:4 chr12 133433173 . T C 676.68 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287748;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0886;QD=60.1491;RBI=0.0371466;REFB=0.00181961;REVB=-0.0234921;RO=1;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218451;STB=0.511623;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=9.11698e-06;OID=.;OPOS=133433173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:21:23:0:1:21:23:0:1 chr12 133435716 . T G 372.61 PASS AF=0.587302;AO=34;DP=60;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00303796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.208;QD=23.6575;RBI=0.0329711;REFB=-0.0077026;REVB=0.0328308;RO=25;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256823;STB=0.643689;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0073606;OID=.;OPOS=133435716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:25:26:34:37:0.587302:21:13:18:7:23:14:19:7 chr12 133435793 . C T 170.87 PASS AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0143795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.524;QD=10.8489;RBI=0.0144352;REFB=-0.00217642;REVB=0.00126622;RO=41;SAF=13;SAR=9;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115924;STB=0.567624;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00356554;OID=.;OPOS=133435793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:9:13:20:21:9:13:20:21 chr12 133587347 . C T 148.78 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00287458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7642;QD=18.5972;RBI=0.0253723;REFB=-0.0353305;REVB=0.0252089;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137869;STB=0.595118;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0388027;OID=.;OPOS=133587347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:10:6:8:7:10:6:9:7 chr12 133587980 . C T 689.35 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.085;QD=62.6686;RBI=0.0335621;REFB=0;REVB=7.15409e-07;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192934;OID=.;OPOS=133587980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0 chr12 133634450 . A C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.071;QD=55.6556;RBI=0.0164862;REFB=0;REVB=0.00991991;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71102e-05;OID=.;OPOS=133634450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr12 133660717 . CA CG,GT 291.7 PASS AF=0.913043,0.0869565;AO=19,2;DP=23;FAO=21,2;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7,2;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170684,0.00744038;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,2;MLLD=238.188,200.506;QD=50.7311;RBI=0.0187931,0.00874781;REFB=0,0;REVB=-0.00786458,-0.00460054;RO=0;SAF=6,2;SAR=13,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.851e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000314978,-0.0149705;OID=.,.;OPOS=133660718,133660717;OREF=A,CA;OALT=G,GT;OMAPALT=CG,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:23:23:0:0:19,2:21,2:0.913043,0.0869565:13,0:6,2:0:0:14,0:7,2:0:0 chr12 133781231 . GA G 812.39 PASS AF=0.986111;AO=68;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0761755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.4034;QD=45.1328;RBI=0.0998824;REFB=-0.0455429;REVB=0.0646048;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129488;STB=0.50769;STBP=0.319;TYPE=del;VARB=0.00337869;OID=.;OPOS=133781232;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.986111:68:72:71:72:1:32:39:1:0:10:1:32:36:0:1 chr12 133781428 . A C 1102.61 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286372;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.106;QD=58.8058;RBI=0.0293503;REFB=-0.1401;REVB=0.00643032;RO=0;SAF=25;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.000366793;OID=.;OPOS=133781428;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:49:25:0:0:49:25:1:0 chr12 133781605 . A G 815.45 PASS AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0112934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.293;QD=52.6097;RBI=0.0135291;REFB=0.0117499;REVB=0.00744949;RO=2;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235832;STB=0.518512;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=3.36981e-05;OID=.;OPOS=133781605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:62:62:2:3:59:59:0.951613:39:20:0:2:39:20:0:3 chr12 133795885 . G A 2570.16 PASS AF=0.971429;AO=169;DP=176;FAO=170;FDP=175;FR=.;FRO=5;FSAF=80;FSAR=90;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0444428;FXX=0.0056815;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.2;QD=58.7465;RBI=0.045319;REFB=-0.157046;REVB=0.0088683;RO=2;SAF=80;SAR=89;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117482;STB=0.51515;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000557257;OID=.;OPOS=133795885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:176:175:2:5:169:170:0.971429:89:80:2:0:90:80:5:0 chr12 133795960 . A G 1361.64 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00949062;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.042;QD=61.1971;RBI=0.00955481;REFB=-0.065311;REVB=-0.00110569;RO=1;SAF=37;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126348;STB=0.506665;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=7.28926e-06;OID=.;OPOS=133795960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:51:37:1:0:51:37:1:0 chr13 19600126 . G A 501.5 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.991;QD=59.0001;RBI=0.0401928;REFB=0;REVB=-0.0332735;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.12206e-05;OID=.;OPOS=19600126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:15:18:0:0:15:19:0:0 chr13 19600200 . C T 313.51 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00575936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.756;QD=50.1613;RBI=0.0207006;REFB=-0.186403;REVB=0.0198833;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517227;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00463692;OID=.;OPOS=19600200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:14:10:0:0:14:10:0:1 chr13 19600475 . C A 1246.02 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00680127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3029;QD=61.5316;RBI=0.0126554;REFB=0;REVB=-0.0106724;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.93424e-05;OID=.;OPOS=19600475;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:36:45:0:0:36:45:0:0 chr13 19751544 . C T 265.15 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0262534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.095;QD=15.5971;RBI=0.0335951;REFB=-0.0276011;REVB=-0.0209615;RO=38;SAF=13;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143556;STB=0.581001;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0244383;OID=.;OPOS=19751544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:17:13:22:16:17:13:22:16 chr13 19753585 . GT G,TG 1185.71 PASS AF=0.933884,0.0661157;AO=25,9;DP=115;FAO=113,8;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0;FSAR=62,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.00186,0.121524;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=12.7406,142.608;QD=39.1971;RBI=1.06812,0.121656;REFB=0,0;REVB=0.370339,0.00566783;RO=77;SAF=0,0;SAR=25,9;SRF=50;SRR=27;SSEN=0.326923,0;SSEP=0.324136,0;SSSB=-0.818192,-0.694963;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0356271,0.0343945;OID=.,.;OPOS=19753586,19753585;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:24:115:121:77:0:25,9:113,8:0.933884,0.0661157:25,9:0,0:50:27:62,8:51,0:0:0 chr13 19999890 . G A 291.12 PASS AF=0.827586;AO=24;DP=29;FAO=24;FDP=29;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0320771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3379;QD=40.155;RBI=0.0420243;REFB=-0.0331877;REVB=-0.0271497;RO=5;SAF=7;SAR=17;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111964;STB=0.561003;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00443335;OID=.;OPOS=19999890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:29:29:5:5:24:24:0.827586:17:7:3:2:17:7:3:2 chr13 19999913 . G A 351.14 PASS AF=0.9;AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0245159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.774;QD=46.8191;RBI=0.0265821;REFB=-0.0549129;REVB=0.0102752;RO=3;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714284;STB=0.538434;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00279448;OID=.;OPOS=19999913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:30:30:3:3:27:27:0.9:18:9:0:3:18:9:0:3 chr13 20000630 . T C 561.61 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00796694;FXX=0.0263089;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.911;QD=60.7148;RBI=0.0276829;REFB=0;REVB=-0.0265117;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000613285;OID=.;OPOS=20000630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0 chr13 20006620 . C T 444.42 PASS AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00117883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1769;QD=23.0867;RBI=0.0214999;REFB=-0.0332644;REVB=-0.0214676;RO=34;SAF=20;SAR=23;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193428;STB=0.510633;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0106663;OID=.;OPOS=20006620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:34:43:43:0.558442:23:20:15:19:23:20:15:19 chr13 20006680 . G C 32.59 PASS AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.000417306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6125;QD=2.77395;RBI=0.00388855;REFB=-0.0062865;REVB=0.00386609;RO=41;SAF=2;SAR=4;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18391;STB=0.637215;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0196084;OID=.;OPOS=20006680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:47:47:41:41:6:6:0.12766:4:2:20:21:4:2:20:21 chr13 20025375 . A G 385.52 PASS AF=0.419048;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.00349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.585;QD=14.6866;RBI=0.00673685;REFB=-0.00508429;REVB=0.00576239;RO=60;SAF=24;SAR=20;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918665;STB=0.545754;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00887046;OID=.;OPOS=20025375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:60:61:44:44:0.419048:20:24:38:22:20:24:38:23 chr13 20038584 . A G 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00616558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=318.001;QD=17.9407;RBI=0.0164029;REFB=-0.00457469;REVB=-0.0152001;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159409;STB=0.590698;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00397018;OID=.;OPOS=20038584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:11:8:13:9:11:8:13:9 chr13 20221516 . A G 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0318548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.455;QD=17.3782;RBI=0.0318995;REFB=-0.0323055;REVB=0.00168769;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200531;STB=0.615182;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0258983;OID=.;OPOS=20221516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:6:5:7:3:6:5:7:3 chr13 20224387 . A G 167.91 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00431452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.714;QD=15.6193;RBI=0.00808551;REFB=-0.00854396;REVB=0.00683816;RO=25;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155977;STB=0.589645;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.014161;OID=.;OPOS=20224387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:10:8:15:10:10:8:15:10 chr13 20233816 . A T 117.45 PASS AF=0.590909;AO=3;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00562989;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=204.851;QD=21.3536;RBI=0.0114521;REFB=0.00938887;REVB=0.00997267;RO=0;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555466;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=-0.00729193;OID=.;OPOS=20233816;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:0:9:3:13:0.590909:1:2:0:0:3:10:6:3 chr13 20277413 . T C 129.94 PASS AF=0.263889;AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=72;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0619472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.508;QD=7.21859;RBI=0.0620752;REFB=-0.015073;REVB=0.00398385;RO=52;SAF=11;SAR=8;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959505;STB=0.551568;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0394397;OID=.;OPOS=20277413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:52:53:19:19:0.263889:8:11:26:26:8:11:27:26 chr13 20311240 . C T 163.55 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0662516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9067;QD=20.4431;RBI=0.0877689;REFB=-0.00886237;REVB=0.0575683;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064699;STB=0.523781;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0122498;OID=.;OPOS=20311240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:15:17:17:0.53125:6:11:8:6:6:11:9:6 chr13 20398669 . T C 132.65 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0609692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3451;QD=15.1595;RBI=0.0764897;REFB=-0.02812;REVB=0.0461891;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072901;STB=0.558061;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0472732;OID=.;OPOS=20398669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:9:6:9:10:9:6:10:10 chr13 20398742 . C T 63.01 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0362131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2098;QD=8.40189;RBI=0.04596;REFB=-0.00300227;REVB=-0.0283008;RO=21;SAF=1;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504172;STB=0.82159;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00383484;OID=.;OPOS=20398742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:8:1:10:11:8:1:10:11 chr13 20411701 . C T 274.22 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0204558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.166;QD=24.9292;RBI=0.0205954;REFB=-0.011328;REVB=-0.00239376;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170902;STB=0.595252;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0115257;OID=.;OPOS=20411701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:8:17:9:10:8:17:9:10 chr13 20413021 . T C 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00808511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.268;QD=12.1432;RBI=0.0323488;REFB=-0.00475888;REVB=0.0313222;RO=33;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940035;STB=0.554996;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0104507;OID=.;OPOS=20413021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:13:6:13:20:13:6:13:20 chr13 20425539 . C T 550.69 PASS AF=0.402685;AO=60;DP=149;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=0.0378925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9104;QD=14.7837;RBI=0.0385382;REFB=0.024965;REVB=0.00702547;RO=89;SAF=29;SAR=31;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480262;STB=0.527027;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.0368205;OID=.;OPOS=20425539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:89:89:60:60:0.402685:31:29:39:50:31:29:39:50 chr13 20425911 . C A 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0184859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.359;QD=18.7441;RBI=0.0258345;REFB=-0.0101477;REVB=0.0180469;RO=4;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448465;STB=0.52624;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00517846;OID=.;OPOS=20425911;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:4:3:2:2:4:3:2:2 chr13 20425948 . T C 80.91 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00901385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.312;QD=17.9811;RBI=0.02038;REFB=-0.0164304;REVB=0.0182783;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172877;STB=0.5998;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0227708;OID=.;OPOS=20425948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:5:3:6:4:5:3 chr13 20539389 . A G 396.58 PASS AF=0.460674;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.00640475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.324;QD=17.8239;RBI=0.0111366;REFB=-0.0133258;REVB=0.00911057;RO=48;SAF=13;SAR=28;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245071;STB=0.637381;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0126805;OID=.;OPOS=20539389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:48:48:41:41:0.460674:28:13:27:21:28:13:27:21 chr13 20716411 . C T 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00760177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.341;QD=16.9311;RBI=0.0649409;REFB=-0.0325564;REVB=0.0644944;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0304708;OID=.;OPOS=20716411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:4:8:8:4:4:8 chr13 20716533 . G T 313.17 PASS AF=0.96;AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.281072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1471;QD=50.1065;RBI=0.283818;REFB=-0.0905854;REVB=0.0393854;RO=0;SAF=3;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545415;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00896909;OID=.;OPOS=20716533;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:23:25:0:1:22:24:0.96:19:3:0:0:19:5:1:0 chr13 21157165 . GAAAAAAAT GAAAAAA,GAAAAAAT,GAAAAAATT 88.9 PASS AF=0.0740741,0.666667,0;AO=5,11,2;DP=31;FAO=2,18,0;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=1,13,0;FSAR=1,5,0;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.118043,-0.185169,-0.061787;FXX=0.0357015;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=11.5364,8.35419,7.07583;QD=13.1708;RBI=0.142777,0.245645,0.119735;REFB=0.0247753,-0.046811,-0.0782191;REVB=0.0803182,0.161413,0.102561;RO=10;SAF=4,7,2;SAR=1,4,0;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.347085,0.116602,0.57573;STB=0.665187,0.502759,0.5;STBP=0.743,0.999,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0631494,0.108526,0;OID=.,.,.;OPOS=21157172,21157166,21157172;OREF=AT,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=GAAAAAA,GAAAAAAT,GAAAAAATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0740741,0.666667,0:5,11,2:31:2,18,0:27:7:1,13,0:1,5,0:5:2:24:10:4,7,2:1,4,0:5:5 chr13 21205192 . G A 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.018;QD=58.06;RBI=0.00829694;REFB=0;REVB=-0.00759887;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80186e-05;OID=.;OPOS=21205192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr13 21356650 . T A 773.03 PASS AF=0.383621;AO=89;DP=233;FAO=89;FDP=232;FR=.;FRO=143;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=74;FSRR=69;FWDB=-0.0153696;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.153;QD=13.328;RBI=0.0395123;REFB=-0.00389497;REVB=-0.0364005;RO=142;SAF=39;SAR=50;SRF=73;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08305;STB=0.549012;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0058933;OID=.;OPOS=21356650;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:142:143:89:89:0.383621:50:39:73:69:50:39:74:69 chr13 21358061 . A G 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0205836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6711;QD=18.0506;RBI=0.0337686;REFB=0.00887363;REVB=-0.02677;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201161;STB=0.511605;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.0108604;OID=.;OPOS=21358061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:3:5:6:4:3:5 chr13 21547317 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.869;QD=56.1913;RBI=0.0228148;REFB=0;REVB=0.0122106;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018098;OID=.;OPOS=21547317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr13 21562832 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00758566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.403;QD=55.0987;RBI=0.0144258;REFB=0;REVB=0.0122703;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95899e-05;OID=.;OPOS=21562832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr13 21562948 . G A 289.33 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.063;QD=52.6062;RBI=0.0692947;REFB=0;REVB=0.0451082;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000932058;OID=.;OPOS=21562948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0 chr13 21612791 . G A 409.4 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00655656;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.602;QD=23.0648;RBI=0.0123455;REFB=-0.0137354;REVB=-0.0104606;RO=31;SAF=12;SAR=28;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107041;STB=0.559075;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00641062;OID=.;OPOS=21612791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:31:31:40:40:0.56338:28:12:13:18:28:12:13:18 chr13 21620085 . T C 269.3 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.0029463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.114;QD=16.5725;RBI=0.00722704;REFB=-0.00782845;REVB=-0.0065992;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206047;STB=0.614991;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00528796;OID=.;OPOS=21620085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:16:14:9:26:16:14:9:26 chr13 21714920 . G A 752.32 PASS AF=0.948276;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0115188;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.9;QD=51.8842;RBI=0.020672;REFB=-0.0527177;REVB=0.0171654;RO=3;SAF=30;SAR=25;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207812;STB=0.511037;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0028369;OID=.;OPOS=21714920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:59:58:3:3:55:55:0.948276:25:30:1:2:25:30:1:2 chr13 21720956 . C T 613.34 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0521;QD=61.3341;RBI=0.0436909;REFB=0;REVB=-0.0179912;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000892191;OID=.;OPOS=21720956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0 chr13 21729252 . T C 428.5 PASS AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.00696537;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.341;QD=14.4034;RBI=0.00696582;REFB=-0.00518058;REVB=7.88418e-05;RO=70;SAF=32;SAR=17;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12128;STB=0.568499;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00705688;OID=.;OPOS=21729252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:70:70:49:49:0.411765:17:32:38:32:17:32:38:32 chr13 21729267 . G A 411.42 PASS AF=0.419643;AO=47;DP=113;FAO=47;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.00550663;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.554;QD=14.6937;RBI=0.00575628;REFB=-0.00974122;REVB=-0.00167682;RO=65;SAF=31;SAR=16;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115984;STB=0.565436;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00612028;OID=.;OPOS=21729267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:65:65:47:47:0.419643:16:31:36:29:16:31:36:29 chr13 21732094 . C T 1607.05 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.037;QD=60.0766;RBI=0.00431079;REFB=0;REVB=-0.00153039;RO=0;SAF=26;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.97633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.01204e-06;OID=.;OPOS=21732094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:81:26:0:0:81:26:0:0 chr13 21742311 . C T 1291.57 PASS AF=0.54185;AO=122;DP=226;FAO=123;FDP=227;FR=.;FRO=104;FSAF=66;FSAR=57;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=-0.0231484;FXX=0.0173153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7113;QD=22.7589;RBI=0.042307;REFB=-0.0280029;REVB=-0.0354124;RO=99;SAF=66;SAR=56;SRF=46;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628649;STB=0.543145;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0191965;OID=.;OPOS=21742311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:227:99:104:122:123:0.54185:56:66:46:53:57:66:46:58 chr13 21746600 . TG T 344.98 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0167669;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.811;QD=21.5614;RBI=0.0267308;REFB=-0.0175741;REVB=-0.0208185;RO=30;SAF=26;SAR=9;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25763;STB=0.64926;STBP=0.018;TYPE=del;VARB=0.00882721;OID=.;OPOS=21746601;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.546875:35:66:35:64:29:26:9:13:16:99:30:26:9:14:16 chr13 21750538 . G A 1061.21 PASS AF=0.593939;AO=98;DP=166;FAO=98;FDP=165;FR=.;FRO=67;FSAF=72;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0242687;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9985;QD=25.7262;RBI=0.0617863;REFB=-0.0261598;REVB=0.0568206;RO=65;SAF=72;SAR=26;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192269;STB=0.612742;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0186241;OID=.;OPOS=21750538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:65:67:98:98:0.593939:26:72:33:32:26:72:33:34 chr13 21752154 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00067625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.146;QD=56.7061;RBI=0.00832806;REFB=0;REVB=-0.00830055;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.20212e-05;OID=.;OPOS=21752154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr13 22275394 . A G 1491.04 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.272;QD=63.4487;RBI=0.0318168;REFB=0;REVB=0.0315957;RO=0;SAF=51;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70685e-05;OID=.;OPOS=22275394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:43:51:0:0:43:51:0:0 chr13 22275583 . G A 1413.83 PASS AF=1;AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.752;QD=62.1466;RBI=0.0240826;REFB=0;REVB=-0.0202288;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274475;OID=.;OPOS=22275583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:91:0:0:89:91:1:43:46:0:0:44:47:0:0 chr13 23251016 . CT C 310.71 PASS AF=1;AO=27;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277118;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.6938;QD=42.8566;RBI=0.117269;REFB=0;REVB=-0.113948;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00644289;OID=.;OPOS=23251017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:29:29:29:0:13:16:0:0:6:0:12:15:0:0 chr13 23253313 . T A,C 829.46 PASS AF=0.0338983,0.966102;AO=5,54;DP=59;FAO=2,57;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=0,36;FSAR=2,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130664,0.0234736;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.418,161.209;QD=56.2347;RBI=0.0906675,0.0991637;REFB=0,0;REVB=-0.089721,0.0963454;RO=0;SAF=0,36;SAR=5,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.180615,0.00340032;OID=.,.;OPOS=23253313,23253313;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:59:59:0:0:5,54:2,57:0.0338983,0.966102:5,18:0,36:0:0:2,21:0,36:0:0 chr13 23253410 . A G 75.99 PASS AF=0.211538;AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0352513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.446;QD=5.84536;RBI=0.0414176;REFB=-0.03351;REVB=-0.0217432;RO=39;SAF=10;SAR=1;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.683172;STB=0.925819;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0559747;OID=.;OPOS=23253410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:52:52:39:41:11:11:0.211538:1:10:12:27:1:10:13:28 chr13 23726765 . C T 125.23 PASS AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0201562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.267;QD=10.4361;RBI=0.0201562;REFB=0.00393398;REVB=7.59816e-06;RO=33;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209131;STB=0.512518;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=-0.0105477;OID=.;OPOS=23726765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:8:7:16:17:8:7:16:17 chr13 23824783 . T G 1896.28 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6101;QD=61.6677;RBI=0.0570577;REFB=0;REVB=0.0537113;RO=0;SAF=58;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78786e-05;OID=.;OPOS=23824783;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:65:58:0:0:65:58:0:0 chr13 23898509 . T C 540.6 PASS AF=0.409722;AO=58;DP=143;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=-0.021426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5182;QD=15.0166;RBI=0.021492;REFB=-0.0281044;REVB=-0.00168354;RO=85;SAF=30;SAR=28;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753384;STB=0.537301;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0397185;OID=.;OPOS=23898509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:85:85:58:59:0.409722:28:30:50:35:28:31:50:35 chr13 23898664 . A G 941.79 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240013;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.033;QD=58.8615;RBI=0.0295106;REFB=0;REVB=-0.01717;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14027e-05;OID=.;OPOS=23898664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0 chr13 23905711 . A G 287.95 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0159969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7855;QD=25.0395;RBI=0.0184309;REFB=0.00127903;REVB=0.00915412;RO=20;SAF=20;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166599;STB=0.593143;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.000327484;OID=.;OPOS=23905711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:6:20:12:8:6:20:12:8 chr13 23907677 . C T 1462.93 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.832;QD=62.9219;RBI=0.029216;REFB=0;REVB=-0.010199;RO=0;SAF=58;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.17443e-05;OID=.;OPOS=23907677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:35:58:0:0:35:58:0:0 chr13 23907909 . A G 187.91 PASS AF=0.389831;AO=22;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0170769;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.841;QD=12.7396;RBI=0.0226629;REFB=-0.00319272;REVB=-0.0148993;RO=36;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225534;STB=0.528676;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.00398733;OID=.;OPOS=23907909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:22:23:0.389831:9:13:22:14:10:13:22:14 chr13 23909162 . A G 149.75 PASS AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0294458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.246;QD=28.5245;RBI=0.0299186;REFB=-0.00366115;REVB=-0.00529796;RO=6;SAF=3;SAR=12;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272458;STB=0.515132;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00188067;OID=.;OPOS=23909162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:12:3:1:5:12:3:1:5 chr13 23911820 . A G 100.73 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0488915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4313;QD=16.1164;RBI=0.0498088;REFB=-0.00363903;REVB=0.00951541;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109955;STB=0.563652;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00804133;OID=.;OPOS=23911820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:5:7:6:7:5:7:6:7 chr13 23929842 . T C 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0219118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.6;QD=17.9529;RBI=0.0241249;REFB=-0.00484206;REVB=0.0100937;RO=28;SAF=17;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121395;STB=0.568194;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00627926;OID=.;OPOS=23929842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:10:17:14:14:10:17:14:14 chr13 24234517 . A G 508.79 PASS AF=0.482143;AO=54;DP=112;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.00618532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3938;QD=18.171;RBI=0.0356787;REFB=-0.0184101;REVB=-0.0351385;RO=58;SAF=37;SAR=17;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119189;STB=0.566301;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0220634;OID=.;OPOS=24234517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:58:58:54:54:0.482143:17:37:33:25:17:37:33:25 chr13 24243200 . T C 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00694975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.067;QD=63.8709;RBI=0.0217025;REFB=0;REVB=0.0205597;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.554e-05;OID=.;OPOS=24243200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr13 24411772 . T C 1266.85 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116588;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.799;QD=61.7977;RBI=0.0385503;REFB=0;REVB=0.0367451;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01541e-05;OID=.;OPOS=24411772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:80:82:1:41:39:0:0:43:39:0:0 chr13 24465717 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4701;QD=55.6558;RBI=0.0285725;REFB=0;REVB=-0.019528;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8864e-06;OID=.;OPOS=24465717;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0 chr13 24465743 . A G 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.5;QD=47.8206;RBI=0.0263321;REFB=0;REVB=-0.00287525;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294139;OID=.;OPOS=24465743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chr13 24468704 . G A 1862.56 PASS AF=0.947761;AO=126;DP=133;FAO=127;FDP=134;FR=.;FRO=7;FSAF=69;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.028419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0155;QD=55.5989;RBI=0.0784163;REFB=-0.161188;REVB=0.0730854;RO=7;SAF=69;SAR=57;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406052;STB=0.513524;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0141119;OID=.;OPOS=24468704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:133:134:7:7:126:127:0.947761:57:69:1:6:58:69:2:5 chr13 24471039 . T G 1458.59 PASS AF=0.628141;AO=125;DP=199;FAO=125;FDP=199;FR=.;FRO=74;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=22;FSRR=52;FWDB=-0.00828408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.19;QD=29.3184;RBI=0.017768;REFB=-0.0114952;REVB=-0.0157187;RO=73;SAF=62;SAR=63;SRF=22;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133436;STB=0.57397;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0107197;OID=.;OPOS=24471039;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:73:74:125:125:0.628141:63:62:22:51:63:62:22:52 chr13 24471048 . C T 1617.95 PASS AF=0.689119;AO=133;DP=193;FAO=133;FDP=193;FR=.;FRO=60;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=-0.00125482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.964;QD=33.5326;RBI=0.00218208;REFB=-0.0136595;REVB=0.00178519;RO=60;SAF=64;SAR=69;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862444;STB=0.546188;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00174421;OID=.;OPOS=24471048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:60:60:133:133:0.689119:69:64:20:40:69:64:20:40 chr13 24797913 . C T 252.16 PASS AF=0.758621;AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0312156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.368;QD=34.7811;RBI=0.0361511;REFB=-0.0411393;REVB=0.0182342;RO=7;SAF=13;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728723;STB=0.539899;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0133731;OID=.;OPOS=24797913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:7:7:22:22:0.758621:9:13:3:4:9:13:3:4 chr13 24798120 . T C 31.59 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0135274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6253;QD=14.0394;RBI=0.0398851;REFB=-0.0349705;REVB=-0.037521;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.665923;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0251293;OID=.;OPOS=24798120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:2:2:4:1:2:2 chr13 24876752 . T C 172.12 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0125628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.297;QD=18.1184;RBI=0.0499353;REFB=-0.0153481;REVB=0.0483292;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0182286;OID=.;OPOS=24876752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:20:18:18:0.473684:9:9:9:10:9:9:10:10 chr13 24895559 . A G 258.64 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4578;QD=49.2649;RBI=0.138676;REFB=0;REVB=0.0609381;RO=1;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541413;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00690993;OID=.;OPOS=24895559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:1:0:20:21:1:12:8:1:0:12:9:0:0 chr13 24895684 . A G 843.7 PASS AF=0.913043;AO=62;DP=69;FAO=63;FDP=69;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00629553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5703;QD=48.9103;RBI=0.0248683;REFB=0.0279731;REVB=0.0240582;RO=7;SAF=38;SAR=24;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497262;STB=0.536574;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00242311;OID=.;OPOS=24895684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:69:69:7:6:62:63:0.913043:24:38:6:1:25:38:6:0 chr13 25000617 . C G 154.35 PASS AF=0.308824;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00458308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.656;QD=9.07919;RBI=0.00540729;REFB=-0.00464456;REVB=0.00286953;RO=47;SAF=10;SAR=11;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139048;STB=0.582096;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00755147;OID=.;OPOS=25000617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:47:47:21:21:0.308824:11:10:28:19:11:10:28:19 chr13 25008588 . A G 1084.12 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188639;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5321;QD=60.2289;RBI=0.0374822;REFB=0;REVB=0.0323893;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.67551e-05;OID=.;OPOS=25008588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:41:31:0:0:41:31:0:0 chr13 25008630 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.82;QD=62.7621;RBI=0.0470359;REFB=0;REVB=0.0447998;RO=0;SAF=35;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.03159e-05;OID=.;OPOS=25008630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:54:35:0:0:54:35:0:0 chr13 25008903 . G T 399.67 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0554841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.722;QD=53.2897;RBI=0.0591021;REFB=-0.0459084;REVB=0.0203609;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518506;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000900214;OID=.;OPOS=25008903;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:16:13:0:0:16:13:1:0 chr13 25009099 . A C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.05;QD=62.3507;RBI=0.0536261;REFB=0;REVB=-0.053019;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000362285;OID=.;OPOS=25009099;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr13 25009297 . G T 137.6 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00315066;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.865;QD=11.9651;RBI=0.0034074;REFB=0.00430202;REVB=-0.00129759;RO=29;SAF=3;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436298;STB=0.752705;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.00585809;OID=.;OPOS=25009297;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:30:16:16:0.347826:13:3:16:13:13:3:16:14 chr13 25009441 . C G 271.73 PASS AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00084249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.553;QD=12.3514;RBI=0.00372031;REFB=-0.0201469;REVB=0.00362366;RO=56;SAF=12;SAR=20;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821422;STB=0.547307;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0153342;OID=.;OPOS=25009441;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:56:56:32:32:0.363636:20:12:25:31:20:12:25:31 chr13 25009485 . C G 205.86 PASS AF=0.390625;AO=24;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.083194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8586;QD=12.8664;RBI=0.090312;REFB=0.00148266;REVB=0.0351428;RO=39;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00709231;STB=0.506488;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.00340577;OID=.;OPOS=25009485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:24:25:0.390625:14:10:16:23:15:10:16:23 chr13 25016008 . C T 230.35 PASS AF=0.308511;AO=29;DP=94;FAO=29;FDP=94;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.00209139;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.084;QD=9.80202;RBI=0.00941907;REFB=-0.00437171;REVB=-0.00918396;RO=65;SAF=8;SAR=21;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319727;STB=0.688653;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00953936;OID=.;OPOS=25016008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:65:65:29:29:0.308511:21:8:35:30:21:8:35:30 chr13 25016092 . C T 108.0 PASS AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0361314;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2741;QD=6.9676;RBI=0.0427299;REFB=-0.0156093;REVB=-0.0228115;RO=46;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158437;STB=0.597699;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0386222;OID=.;OPOS=25016092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:46:46:16:16:0.258065:11:5:20:26:11:5:20:26 chr13 25020863 . G A 669.79 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.467;QD=62.3061;RBI=0.0268882;REFB=0;REVB=0.00641911;RO=0;SAF=10;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96961e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.51735e-05;OID=.;OPOS=25020863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:32:10:0:0:33:10:0:0 chr13 25021154 . C T 91.23 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0667832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8058;QD=17.378;RBI=0.0714845;REFB=-0.0299982;REVB=-0.0254957;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376028;STB=0.521699;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0232276;OID=.;OPOS=25021154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:5:5:5:6:5:5 chr13 25021200 . A C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.35;QD=54.5177;RBI=0.022392;REFB=0;REVB=0.0092307;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100511;OID=.;OPOS=25021200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr13 25021211 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.698;QD=55.0982;RBI=0.0356443;REFB=0;REVB=0.034768;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175062;OID=.;OPOS=25021211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr13 25021245 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.834;QD=56.1916;RBI=0.0106194;REFB=0;REVB=0.00194299;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013837;OID=.;OPOS=25021245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr13 25027744 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.037;QD=57.0006;RBI=0.014536;REFB=0;REVB=0.0105377;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151932;OID=.;OPOS=25027744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:36:18:0:0:36:18:0:0 chr13 25029218 . C T 1190.28 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7704;QD=61.0399;RBI=0.0785363;REFB=0;REVB=-0.0215073;RO=0;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337805;OID=.;OPOS=25029218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:45:33:0:0:45:33:0:0 chr13 25052261 . C T 263.45 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00778939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.175;QD=19.5151;RBI=0.0567727;REFB=-0.00984604;REVB=-0.0562358;RO=26;SAF=17;SAR=11;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786655;STB=0.543755;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0121628;OID=.;OPOS=25052261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:11:17:18:8:11:17:18:8 chr13 25075859 . C T 464.92 PASS AF=0.535714;AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0049595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.719;QD=22.1391;RBI=0.00520998;REFB=-0.0227973;REVB=-0.00159603;RO=39;SAF=18;SAR=27;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135378;STB=0.507459;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0189154;OID=.;OPOS=25075859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:39:45:45:0.535714:27:18:15:24:27:18:15:24 chr13 25265103 . A G 218.06 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0199472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.07;QD=15.5754;RBI=0.023521;REFB=-0.00623951;REVB=0.0124638;RO=31;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059523;STB=0.533689;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0049791;OID=.;OPOS=25265103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:12:13:18:13:12:13:18:13 chr13 25265139 . T C 270.75 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0470544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4613;QD=16.9219;RBI=0.059159;REFB=-0.0334972;REVB=-0.0358564;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242591;STB=0.513618;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0208879;OID=.;OPOS=25265139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:14:16:19:15:14:16:19:15 chr13 25266932 . C A 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00449488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.215;QD=11.9197;RBI=0.00450221;REFB=-0.00674406;REVB=0.000256812;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45597;STB=0.781686;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0133592;OID=.;OPOS=25266932;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:1:6:4:5:1:6:4:5 chr13 25356053 . T C 1230.84 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00983985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.0936;QD=60.0409;RBI=0.0158301;REFB=-0.11252;REVB=0.0124003;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.505375;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00113722;OID=.;OPOS=25356053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:46:35:0:0:46:35:0:1 chr13 25367301 . C T 698.8 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.050884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4124;QD=54.8082;RBI=0.0587742;REFB=-0.120389;REVB=0.0294147;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200269;STB=0.510634;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0160586;OID=.;OPOS=25367301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:23:27:0:1:23:27:0:1 chr13 25419176 . A G 922.33 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0113688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.356;QD=56.7587;RBI=0.0179121;REFB=-0.0367984;REVB=0.0138417;RO=1;SAF=27;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171708;STB=0.509088;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=8.74439e-06;OID=.;OPOS=25419176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:37:27:1:0:37:27:1:0 chr13 25460428 . A G 716.05 PASS AF=0.965517;AO=51;DP=57;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00214143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.388;QD=49.383;RBI=0.0121157;REFB=-0.0145493;REVB=0.011925;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.516123;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=7.31008e-05;OID=.;OPOS=25460428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:57:58:0:2:51:56:0.965517:25:26:0:0:30:26:0:2 chr13 25466955 . T C 1583.12 PASS AF=0.964912;AO=109;DP=114;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=76;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0132537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.968;QD=55.548;RBI=0.0144828;REFB=-0.120456;REVB=0.00583875;RO=4;SAF=76;SAR=33;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350158;STB=0.507794;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.000356686;OID=.;OPOS=25466955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:114:114:4:4:109:110:0.964912:33:76:1:3:34:76:2:2 chr13 25517089 . TC T 233.56 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.5087;QD=49.1702;RBI=0.0472003;REFB=0;REVB=-0.032083;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000264603;OID=.;OPOS=25517090;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:18:19:19:19:0:8:11:0:0:4:0:8:10:0:0 chr13 25671214 . T G 42.0 PASS AF=0.104762;AO=10;DP=106;FAO=11;FDP=105;FR=.;FRO=94;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=0.012008;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0459;QD=1.60013;RBI=0.052584;REFB=-0.00520547;REVB=-0.0511946;RO=94;SAF=3;SAR=7;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26849;STB=0.730617;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0371237;OID=.;OPOS=25671214;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:106:105:94:94:10:11:0.104762:7:3:50:44:8:3:50:44 chr13 25671271 . A G 92.92 PASS AF=0.116162;AO=23;DP=198;FAO=23;FDP=198;FR=.;FRO=175;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=76;FSRR=99;FWDB=0.00285751;FXX=0.00502487;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.94;QD=1.8771;RBI=0.0162039;REFB=-0.00222137;REVB=-0.01595;RO=175;SAF=13;SAR=10;SRF=76;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161204;STB=0.614121;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0144227;OID=.;OPOS=25671271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:198:198:175:175:23:23:0.116162:10:13:76:99:10:13:76:99 chr13 25671274 . C T 79.9 PASS AF=0.107692;AO=21;DP=196;FAO=21;FDP=195;FR=.;FRO=174;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=75;FSRR=99;FWDB=-0.00735231;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.68;QD=1.63904;RBI=0.0159722;REFB=0.000192554;REVB=-0.0141793;RO=173;SAF=12;SAR=9;SRF=74;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174421;STB=0.623262;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00139465;OID=.;OPOS=25671274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:196:195:173:174:21:21:0.107692:9:12:74:99:9:12:75:99 chr13 25671292 . C T 115.43 PASS AF=0.121849;AO=29;DP=238;FAO=29;FDP=238;FR=.;FRO=209;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=97;FSRR=112;FWDB=-0.0231087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5223;QD=1.93996;RBI=0.0895942;REFB=-0.00734676;REVB=-0.0865628;RO=209;SAF=15;SAR=14;SRF=97;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665541;STB=0.546527;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0924344;OID=.;OPOS=25671292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:209:209:29:29:0.121849:14:15:97:112:14:15:97:112 chr13 25671310 . TTATGA T 42.0 PASS AF=0.115079;AO=29;DP=253;FAO=29;FDP=252;FR=.;FRO=223;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=100;FSRR=123;FWDB=-0.0109045;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=320.626;QD=0.666644;RBI=0.0168481;REFB=-0.0061148;REVB=-0.0128433;RO=220;SAF=15;SAR=14;SRF=98;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894468;STB=0.560668;STBP=0.492;TYPE=del;VARB=0.046358;OID=.;OPOS=25671311;OREF=TATGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.115079:29:253:29:252:223:15:14:100:123:41:220:15:14:98:122 chr13 25671320 . A G 107.91 PASS AF=0.110687;AO=29;DP=262;FAO=29;FDP=262;FR=.;FRO=233;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=107;FSRR=126;FWDB=-0.00594811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4886;QD=1.64748;RBI=0.0801189;REFB=-0.00850264;REVB=-0.0798978;RO=229;SAF=15;SAR=14;SRF=107;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619181;STB=0.551435;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0859122;OID=.;OPOS=25671320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:229:233:29:29:0.110687:14:15:107:122:14:15:107:126 chr13 25671369 . G T 77.34 PASS AF=0.0909091;AO=25;DP=275;FAO=25;FDP=275;FR=.;FRO=250;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=115;FSRR=135;FWDB=-0.0270842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7175;QD=1.12501;RBI=0.0367549;REFB=-0.00266659;REVB=-0.0248468;RO=245;SAF=13;SAR=12;SRF=113;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699873;STB=0.554352;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0391779;OID=.;OPOS=25671369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:275:275:245:250:25:25:0.0909091:12:13:113:132:12:13:115:135 chr13 25671398 . C T 50.43 PASS AF=0.0753968;AO=19;DP=251;FAO=19;FDP=252;FR=.;FRO=233;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=111;FSRR=122;FWDB=-0.0211809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.801;QD=0.800544;RBI=0.0213521;REFB=-0.00166521;REVB=-0.00269871;RO=228;SAF=12;SAR=7;SRF=108;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17763;STB=0.642441;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0243024;OID=.;OPOS=25671398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:251:252:228:233:19:19:0.0753968:7:12:108:120:7:12:111:122 chr13 25743537 . A T 185.6 PASS AF=0.280899;AO=25;DP=90;FAO=25;FDP=89;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0121678;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.154;QD=8.34169;RBI=0.0196823;REFB=-0.0016558;REVB=-0.0154705;RO=60;SAF=13;SAR=12;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435966;STB=0.525586;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00492443;OID=.;OPOS=25743537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:60:64:25:25:0.280899:12:13:29:31:12:13:31:33 chr13 25825889 . T C 554.36 PASS AF=0.508929;AO=57;DP=113;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.031645;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9426;QD=19.7984;RBI=0.0374301;REFB=0.00684043;REVB=0.01999;RO=55;SAF=30;SAR=27;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315383;STB=0.517397;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00778765;OID=.;OPOS=25825889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:55:55:57:57:0.508929:27:30:27:28:27:30:27:28 chr13 25831888 . T C 601.62 PASS AF=0.443662;AO=59;DP=141;FAO=63;FDP=142;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=0.00121229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.434;QD=16.9471;RBI=0.0488765;REFB=-0.00333493;REVB=-0.0488614;RO=74;SAF=33;SAR=26;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497014;STB=0.510107;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00382586;OID=.;OPOS=25831888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:74:79:59:63:0.443662:26:33:45:29:26:37:45:34 chr13 25876011 . G A 585.13 PASS AF=0.433566;AO=62;DP=141;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=61;FWDB=0.0408337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.327;QD=16.3673;RBI=0.0408396;REFB=-0.0139482;REVB=0.000697181;RO=79;SAF=33;SAR=29;SRF=18;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303086;STB=0.658928;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0170971;OID=.;OPOS=25876011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:79:81:62:62:0.433566:29:33:18:61:29:33:20:61 chr13 26273385 . G C 1507.75 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0274885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1845;QD=58.5535;RBI=0.0312597;REFB=-0.0997446;REVB=-0.0148845;RO=1;SAF=60;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784264;STB=0.504131;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000761597;OID=.;OPOS=26273385;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:102:102:0.990291:42:60:1:0:42:60:1:0 chr13 26518714 . A T 119.42 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00659317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.705;QD=13.6481;RBI=0.0183281;REFB=-0.00739825;REVB=0.0171011;RO=21;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386799;STB=0.725488;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0239336;OID=.;OPOS=26518714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:4:10:7:14:4:10:7:14 chr13 26518724 . A G 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00670421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2846;QD=13.2122;RBI=0.029405;REFB=-0.00518393;REVB=-0.0286305;RO=22;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365339;STB=0.713979;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0086682;OID=.;OPOS=26518724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:4:10:8:14:4:10:8:14 chr13 26518853 . G T 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0254613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.691;QD=25.711;RBI=0.0254616;REFB=-0.0188343;REVB=0.000126803;RO=6;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114837;STB=0.564417;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0109076;OID=.;OPOS=26518853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:6:7:2:4:6:7:2:4 chr13 26788114 . A G 638.69 PASS AF=0.512;AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.0432343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0179;QD=20.4382;RBI=0.0632975;REFB=-0.0253589;REVB=0.0462317;RO=61;SAF=35;SAR=29;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923111;STB=0.550821;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0289474;OID=.;OPOS=26788114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:61:61:64:64:0.512:29:35:27:34:29:35:27:34 chr13 27976692 . C T 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0345204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.483;QD=14.0974;RBI=0.0387544;REFB=-0.0164891;REVB=-0.0176138;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248152;STB=0.642659;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0183106;OID=.;OPOS=27976692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:7:6:4:14:7:6:4:14 chr13 28009920 . G C 1088.32 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265277;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.296;QD=60.4621;RBI=0.0266983;REFB=0;REVB=0.00301388;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238301;OID=.;OPOS=28009920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0 chr13 28121707 . G A 429.9 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.03355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.488;QD=17.3697;RBI=0.0346094;REFB=-0.00707096;REVB=-0.00849758;RO=55;SAF=19;SAR=25;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509637;STB=0.528511;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00969743;OID=.;OPOS=28121707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:25:19:21:34:25:19:21:34 chr13 28143229 . A G 356.32 PASS AF=0.506849;AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0392139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.322;QD=19.5242;RBI=0.0592335;REFB=-0.0146959;REVB=-0.0443945;RO=36;SAF=22;SAR=14;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264383;STB=0.509086;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0131922;OID=.;OPOS=28143229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:36:36:36:37:0.506849:14:22:23:13:14:23:23:13 chr13 28239940 . G C 263.38 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0280973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2032;QD=19.5097;RBI=0.0300017;REFB=-0.0228098;REVB=0.0105188;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389841;STB=0.521724;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0174752;OID=.;OPOS=28239940;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:16:12:10:16:16:12:10:16 chr13 28239970 . G A 282.26 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00656197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.119;QD=22.5806;RBI=0.0153821;REFB=-0.0241748;REVB=-0.0139122;RO=24;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656402;STB=0.536713;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0238307;OID=.;OPOS=28239970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:16:10:11:13:16:10:11:13 chr13 28537242 . A C 184.76 PASS AF=0.387097;AO=23;DP=61;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=5;FWDB=0.0215967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.901;QD=11.9198;RBI=0.0372908;REFB=-0.00676387;REVB=-0.0304004;RO=34;SAF=13;SAR=10;SRF=29;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326097;STB=0.691049;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0232616;OID=.;OPOS=28537242;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:34:38:23:24:0.387097:10:13:29:5:10:14:33:5 chr13 28537317 . G A 240.04 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.0228578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.323;QD=16.5547;RBI=0.0388033;REFB=-0.0269996;REVB=0.0313563;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152283;STB=0.585207;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0210131;OID=.;OPOS=28537317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:11:16:23:8:11:16:23:8 chr13 28610183 . A G 695.85 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00144751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.504;QD=60.5085;RBI=0.00203239;REFB=-0.12777;REVB=0.00142666;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517234;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00135731;OID=.;OPOS=28610183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:14:31:0:0:14:31:0:1 chr13 28624294 . G A 1457.46 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0289528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.707;QD=62.0195;RBI=0.0289545;REFB=0.101808;REVB=-0.000306813;RO=1;SAF=52;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903078;STB=0.504761;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.000457973;OID=.;OPOS=28624294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:41:52:1:0:41:52:1:0 chr13 28636084 . G A 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.44;QD=57.0008;RBI=0.0111025;REFB=0;REVB=0.00413024;RO=0;SAF=16;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.91135e-06;OID=.;OPOS=28636084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:38:16:0:0:38:16:0:0 chr13 28835527 . T TC 2080.54 PASS AF=0.992537;AO=132;DP=138;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00925666;FXX=0.0289834;HRUN=0;LEN=1;MLLD=287.443;QD=62.1056;RBI=0.0116308;REFB=-0.0347266;REVB=-0.00704195;RO=2;SAF=65;SAR=67;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000214937;STB=0.503816;STBP=0.34;TYPE=ins;VARB=-1.02293e-05;OID=.;OPOS=28835528;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.992537:132:138:133:134:1:65:68:1:0:7:2:65:67:1:1 chr13 28883061 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.25;QD=56.7066;RBI=0.00731016;REFB=0;REVB=0.00675763;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01219e-05;OID=.;OPOS=28883061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr13 28970917 . C T 323.14 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0373;QD=53.8573;RBI=0.0536522;REFB=0;REVB=0.0454742;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500821;OID=.;OPOS=28970917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0 chr13 29233343 . G C 134.22 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0210861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3633;QD=16.2688;RBI=0.0579123;REFB=0.0317923;REVB=0.053937;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265355;STB=0.652855;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.0132918;OID=.;OPOS=29233343;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:10:5:11:7:10:5:11:7 chr13 29275102 . T C 741.62 PASS AF=1;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290856;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.957;QD=61.8014;RBI=0.0345756;REFB=-0.0944434;REVB=-0.0186949;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539234;OID=.;OPOS=29275102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:49:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:27:21:0:0 chr13 29275129 . C T 126.69 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0587758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.875;QD=11.261;RBI=0.0614114;REFB=-0.00214596;REVB=-0.0177982;RO=30;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.542675;STB=0.820104;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0131227;OID=.;OPOS=29275129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:3:12:9:21:3:12:9:21 chr13 29898768 . A C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.699;QD=60.6102;RBI=0.0401781;REFB=0;REVB=-0.0204066;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40224e-05;OID=.;OPOS=29898768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0 chr13 30084173 . G A 1510.77 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.145;QD=63.6112;RBI=0.0321372;REFB=0;REVB=-0.0103362;RO=0;SAF=62;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67732e-05;OID=.;OPOS=30084173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:33:62:0:0:33:62:0:0 chr13 30087768 . C T 127.18 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0510432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3754;QD=11.5615;RBI=0.064171;REFB=-0.011849;REVB=-0.038891;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205588;STB=0.604806;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0237524;OID=.;OPOS=30087768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:29:15:15:0.340909:8:7:8:20:8:7:9:20 chr13 30087778 . T A 692.31 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365141;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.429;QD=62.9368;RBI=0.0377971;REFB=0;REVB=0.00976445;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193513;OID=.;OPOS=30087778;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:26:17:0:0:27:17:0:0 chr13 30091714 . G A 1587.81 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.121;QD=64.1539;RBI=0.0311958;REFB=0;REVB=0.0230097;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66937e-05;OID=.;OPOS=30091714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:45:53:0:0:46:53:0:0 chr13 30091817 . AAG A,AA,AAC 2351.01 PASS AF=0.95625,0,0.04375;AO=33,32,97;DP=165;FAO=153,0,7;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=76,0,4;FSAR=77,0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109175,0.0347226,0.0121666;FXX=0;HRUN=5,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=175.669,169.137,159.265;QD=58.7752;RBI=0.136898,0.093586,0.104936;REFB=0,0,0;REVB=-0.082594,-0.0869061,-0.104229;RO=0;SAF=33,31,16;SAR=0,1,81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-8.06942e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.000973426,0,0.010185;OID=.,.,.;OPOS=30091818,30091819,30091819;OREF=AG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=A,AA,AAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.95625,0,0.04375:33,32,97:165:153,0,7:160:0:76,0,4:77,0,3:0:0:15:0:33,31,16:0,1,81:0:0 chr13 30107067 . G C 618.11 PASS AF=0.492188;AO=61;DP=126;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00730116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.972;QD=19.316;RBI=0.00777026;REFB=-0.0062364;REVB=0.00265895;RO=65;SAF=35;SAR=26;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076586;STB=0.540528;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0053681;OID=.;OPOS=30107067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:65:65:61:63:0.492188:26:35:32:33:27:36:32:33 chr13 30438728 . G A 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0410132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.593;QD=14.6525;RBI=0.0676181;REFB=0.00440538;REVB=-0.0537599;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247547;STB=0.651594;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.0203281;OID=.;OPOS=30438728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:2:3:5:1:2:3 chr13 30781111 . C A 224.94 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0253184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.02;QD=19.9942;RBI=0.0256291;REFB=-0.0094275;REVB=0.00397906;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199884;STB=0.621408;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00590165;OID=.;OPOS=30781111;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:22:23:22:22:0.488889:12:10:15:7:12:10:16:7 chr13 31036681 . A G 1121.24 PASS AF=0.986842;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0158747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.716;QD=59.0128;RBI=0.0201068;REFB=0.0729269;REVB=0.0123402;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.000113365;OID=.;OPOS=31036681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:76:0:1:74:75:0.986842:37:37:0:0:37:38:1:0 chr13 31221106 . C T 353.03 PASS AF=0.37069;AO=43;DP=116;FAO=43;FDP=116;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.011002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.519;QD=12.1735;RBI=0.0111728;REFB=-0.0122195;REVB=0.00194641;RO=73;SAF=23;SAR=20;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450215;STB=0.525665;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0177324;OID=.;OPOS=31221106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:73:73:43:43:0.37069:20:23:42:31:20:23:42:31 chr13 31231806 . T C 809.9 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00618121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.2024;QD=53.9936;RBI=0.0390099;REFB=-0.161256;REVB=0.0385171;RO=1;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200666;STB=0.503596;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00454654;OID=.;OPOS=31231806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:60:60:1:2:58:58:0.966667:23:35:0:1:23:35:1:1 chr13 31233063 . G A 236.85 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.87;QD=49.8627;RBI=0.0345474;REFB=0;REVB=0.00308936;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000505931;OID=.;OPOS=31233063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:9:9:0:0:9:10:0:0 chr13 31287979 . G GTA 226.88 PASS AF=0.480769;AO=23;DP=62;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0204994;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=2;MLLD=167.139;QD=17.4522;RBI=0.0210147;REFB=-0.0599036;REVB=0.0046253;RO=38;SAF=14;SAR=9;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0038805;STB=0.503997;STBP=0.97;TYPE=ins;VARB=0.0643822;OID=.;OPOS=31287980;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.480769:23:62:25:52:27:15:10:16:11:99:38:14:9:23:15 chr13 31531009 . G A 115.66 PASS AF=0.265625;AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0019598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8976;QD=7.22847;RBI=0.0299276;REFB=-0.00249897;REVB=0.0298633;RO=47;SAF=9;SAR=8;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124857;STB=0.57578;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0126104;OID=.;OPOS=31531009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:47:47:17:17:0.265625:8:9:20:27:8:9:20:27 chr13 31728703 . T C 205.09 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00354449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.771;QD=16.4074;RBI=0.0151242;REFB=-0.0077989;REVB=-0.014703;RO=26;SAF=9;SAR=12;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287769;STB=0.629094;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0152206;OID=.;OPOS=31728703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:29:21:21:0.42:12:9:19:7:12:9:19:10 chr13 31735769 . GC G,GG 50.72 PASS AF=0.3,0.05;AO=12,2;DP=40;FAO=12,2;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10,1;FSAR=2,1;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0280447,0.0323943;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.5873,30.1064;QD=5.0721;RBI=0.147308,0.0496068;REFB=-0.0438753,-0.0317886;REVB=-0.144613,-0.0375692;RO=26;SAF=10,1;SAR=2,1;SRF=14;SRR=12;SSEN=0.333333,0;SSEP=0,0;SSSB=0.395709,-0.0353747;STB=0.744221,0.535362;STBP=0.07,0.878;TYPE=del,snp;VARB=0.0485612,-0.0161258;OID=.,.;OPOS=31735770,31735770;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3,0.05:12,2:40:12,2:40:26:10,1:2,1:14:12:43:26:10,1:2,1:14:12 chr13 31821240 . C T 909.13 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0385878;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3599;QD=56.8205;RBI=0.0393885;REFB=-0.115875;REVB=-0.00790125;RO=1;SAF=33;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140954;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00154782;OID=.;OPOS=31821240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:64:1:1:63:63:0.984375:30:33:1:0:30:33:1:0 chr13 31821992 . T C 727.19 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0238503;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=160.541;QD=52.8862;RBI=0.0461072;REFB=-0.152487;REVB=0.0394593;RO=2;SAF=22;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597873;STB=0.503175;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0011436;OID=.;OPOS=31821992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:55:55:2:2:53:53:0.963636:31:22:1:1:31:22:1:1 chr13 31891746 . G A 1264.23 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1342;QD=61.6698;RBI=0.0503264;REFB=0;REVB=0.0486634;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029352;OID=.;OPOS=31891746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0 chr13 32335880 . G A 257.4 PASS AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00459636;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3773;QD=13.5476;RBI=0.0190922;REFB=-0.0141809;REVB=-0.0185306;RO=46;SAF=17;SAR=13;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249193;STB=0.500892;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0285538;OID=.;OPOS=32335880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:46:46:30:30:0.394737:13:17:25:21:13:17:26:20 chr13 32360547 . A G 1227.5 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=323.037;QD=61.3749;RBI=0.00465122;REFB=0;REVB=-0.000858002;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11516e-06;OID=.;OPOS=32360547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:41:39:0:0:41:39:0:0 chr13 32376718 . A G 941.05 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720407;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6594;QD=58.8159;RBI=0.072268;REFB=0;REVB=-0.00572729;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136685;OID=.;OPOS=32376718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0 chr13 32660137 . T G 1549.27 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.191;QD=63.8873;RBI=0.0123279;REFB=0;REVB=0.00683998;RO=0;SAF=38;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66457e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.39909e-06;OID=.;OPOS=32660137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:59:38:0:0:59:38:0:0 chr13 32676114 . A G 409.92 PASS AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00128034;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.661;QD=51.2402;RBI=0.0124652;REFB=-0.118771;REVB=0.0123993;RO=2;SAF=18;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120839;STB=0.506489;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00108478;OID=.;OPOS=32676114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:12:18:1:1:12:18:1:1 chr13 32776153 . T C 346.9 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0243921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1623;QD=17.1306;RBI=0.0261938;REFB=-0.00265445;REVB=0.00954665;RO=44;SAF=17;SAR=20;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083243;STB=0.546641;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0033365;OID=.;OPOS=32776153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:44:44:37:37:0.45679:20:17:24:20:20:17:24:20 chr13 32776616 . T A 506.86 PASS AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0196022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.639;QD=20.4793;RBI=0.0228866;REFB=-0.0266146;REVB=0.0118131;RO=50;SAF=22;SAR=27;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154921;STB=0.585721;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0199351;OID=.;OPOS=32776616;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:27:22:31:19:27:22:31:19 chr13 32832149 . T C 365.88 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0174977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.937;QD=18.763;RBI=0.0367542;REFB=-0.00497189;REVB=0.0323218;RO=40;SAF=16;SAR=22;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734949;STB=0.540962;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00549865;OID=.;OPOS=32832149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:22:16:20:20:22:16:20:20 chr13 32885654 . T C 259.92 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0530099;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.775;QD=51.9838;RBI=0.0549829;REFB=0;REVB=0.0145968;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000345967;OID=.;OPOS=32885654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr13 32885658 . G A 66.85 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0235136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.432;QD=12.7333;RBI=0.0236916;REFB=-0.0215497;REVB=0.00289884;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281248;STB=0.687091;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0222012;OID=.;OPOS=32885658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:6:3:7:4:6:3:8:4 chr13 32911888 . A G 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0143396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.96;QD=19.0005;RBI=0.0187823;REFB=-0.002854;REVB=0.0121305;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258665;STB=0.646886;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00211751;OID=.;OPOS=32911888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:11:6:11:6:11:6:11:6 chr13 32912299 . T C 140.67 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00737529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8389;QD=13.0858;RBI=0.0124131;REFB=-0.00911339;REVB=0.00998444;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173256;STB=0.580551;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0313388;OID=.;OPOS=32912299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:27:16:16:0.372093:10:6:6:20:10:6:7:20 chr13 32913055 . A G 1260.1 PASS AF=1;AO=79;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4934;QD=61.4684;RBI=0.026157;REFB=0;REVB=0.0188662;RO=0;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250007;OID=.;OPOS=32913055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:82:0:0:79:82:1:29:50:0:0:30:52:0:0 chr13 32915005 . G C 941.04 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00520737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9508;QD=57.0325;RBI=0.0229433;REFB=-0.0339471;REVB=-0.0223445;RO=1;SAF=42;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111164;STB=0.505881;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000236679;OID=.;OPOS=32915005;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:23:42:1:0:23:42:1:0 chr13 32929232 . A G 176.78 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0749106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5797;QD=13.3416;RBI=0.0752926;REFB=-0.0148631;REVB=-0.00757517;RO=32;SAF=3;SAR=18;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877344;STB=0.550968;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0330799;OID=.;OPOS=32929232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:18:3:6:26:18:3:6:26 chr13 32929387 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00303696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.523;QD=44.6898;RBI=0.00943231;REFB=0;REVB=0.00893003;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024028;OID=.;OPOS=32929387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr13 32972884 . A G 80.56 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0231974;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.414;QD=15.3452;RBI=0.0424583;REFB=0.00853057;REVB=0.035561;RO=11;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.526832;STB=0.81741;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0167328;OID=.;OPOS=32972884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:22:21:11:11:10:10:0.47619:9:1:6:5:9:1:6:5 chr13 32976608 . A G 872.26 PASS AF=0.534161;AO=74;DP=162;FAO=86;FDP=161;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.039637;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.802;QD=21.671;RBI=0.0403768;REFB=-0.0107195;REVB=0.00769407;RO=67;SAF=44;SAR=30;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639291;STB=0.510938;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0133314;OID=.;OPOS=32976608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:67:75:74:86:0.534161:30:44:35:32:41:45:41:34 chr13 32976640 . TTTG T 195.84 PASS AF=0.430556;AO=30;DP=76;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0143095;FXX=0.0270234;HRUN=3;LEN=3;MLLD=192.515;QD=10.8798;RBI=0.0159138;REFB=-0.000633178;REVB=-0.00696345;RO=44;SAF=4;SAR=26;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.479843;STB=0.759898;STBP=0.003;TYPE=del;VARB=0.000564548;OID=.;OPOS=32976641;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.430556:30:76:31:72:41:4:27:19:22:99:44:4:26:22:22 chr13 32976645 . T A 290.05 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00352748;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.946;QD=16.1141;RBI=0.00671339;REFB=-0.000246695;REVB=-0.00571196;RO=42;SAF=5;SAR=27;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36302;STB=0.689644;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.000366165;OID=.;OPOS=32976645;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:42:40:32:32:0.444444:27:5:18:24:27:5:16:24 chr13 32976648 . G C 294.05 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0236093;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4321;QD=17.297;RBI=0.0260521;REFB=-0.00408701;REVB=-0.0110141;RO=35;SAF=5;SAR=27;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345401;STB=0.706833;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00541592;OID=.;OPOS=32976648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:35:36:32:32:0.470588:27:5:15:20:27:5:16:20 chr13 32981142 . C T 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00254036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4294;QD=16.9313;RBI=0.0417635;REFB=-0.0339287;REVB=0.0416862;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722214;STB=0.541598;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.034113;OID=.;OPOS=32981142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:7:5:6:6:7:5 chr13 32981279 . T A 218.35 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.020896;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.188;QD=15.5965;RBI=0.0214087;REFB=-0.00881207;REVB=-0.004657;RO=31;SAF=2;SAR=23;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471448;STB=0.776336;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0108785;OID=.;OPOS=32981279;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:31:31:25:25:0.446429:23:2:11:20:23:2:11:20 chr13 33590851 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.526;QD=55.0987;RBI=0.0597267;REFB=0;REVB=-0.0582972;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000253335;OID=.;OPOS=33590851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0 chr13 33629393 . C T 711.26 PASS AF=0.4;AO=82;DP=198;FAO=82;FDP=205;FR=.;FRO=123;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=63;FSRR=60;FWDB=-0.0407915;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.95;QD=13.8783;RBI=0.0419467;REFB=-0.0232276;REVB=-0.00977642;RO=116;SAF=36;SAR=46;SRF=57;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551708;STB=0.544075;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0361996;OID=.;OPOS=33629393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:205:116:123:82:82:0.4:46:36:57:59:46:36:63:60 chr13 33635463 . T C 545.74 PASS AF=0.453125;AO=58;DP=128;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=50;FWDB=-0.00763179;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.555;QD=17.0545;RBI=0.00764444;REFB=-0.0337308;REVB=0.00043958;RO=69;SAF=16;SAR=42;SRF=19;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000610469;STB=0.5067;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0357473;OID=.;OPOS=33635463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:69:70:58:58:0.453125:42:16:19:50:42:16:20:50 chr13 33635835 . T C 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.574;QD=57.106;RBI=0.0451597;REFB=0;REVB=0.0411654;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14046e-05;OID=.;OPOS=33635835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr13 33678505 . C T 173.1 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0025242;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.257;QD=18.7134;RBI=0.0121796;REFB=-0.0136943;REVB=0.0119151;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126213;STB=0.571785;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0192948;OID=.;OPOS=33678505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:7:11:9:10:7:11:9:10 chr13 33704290 . G A 812.31 PASS AF=0.497006;AO=83;DP=168;FAO=83;FDP=167;FR=.;FRO=84;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=-0.0114251;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9466;QD=19.4565;RBI=0.0544842;REFB=0.00101391;REVB=0.0532728;RO=84;SAF=49;SAR=34;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289392;STB=0.515939;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=-0.000846934;OID=.;OPOS=33704290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:84:84:83:83:0.497006:34:49:47:37:34:49:47:37 chr13 34013847 . G C 538.52 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0309;QD=59.8353;RBI=0.0104961;REFB=0;REVB=-0.00738066;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000178951;OID=.;OPOS=34013847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr13 35751192 . T G 1012.89 PASS AF=0.456897;AO=106;DP=232;FAO=106;FDP=232;FR=.;FRO=126;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=63;FSRR=63;FWDB=-0.00451418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.954;QD=17.4636;RBI=0.00576653;REFB=-0.0154527;REVB=0.00358818;RO=126;SAF=53;SAR=53;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0165833;OID=.;OPOS=35751192;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:126:126:106:106:0.456897:53:53:63:63:53:53:63:63 chr13 36385031 . G T 457.54 PASS AF=0.396947;AO=53;DP=132;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.00160115;FXX=0.00757518;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.984;QD=13.9706;RBI=0.0121263;REFB=-0.00264025;REVB=-0.0120202;RO=78;SAF=32;SAR=21;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138059;STB=0.57761;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00324661;OID=.;OPOS=36385031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:78:79:53:52:0.396947:21:32:37:41:21:31:37:42 chr13 36402426 . A G 335.31 PASS AF=0.372727;AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.00730788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3807;QD=12.1931;RBI=0.0123495;REFB=-0.0105322;REVB=-0.00995512;RO=68;SAF=25;SAR=16;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106165;STB=0.565578;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0270211;OID=.;OPOS=36402426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:68:69:41:41:0.372727:16:25:35:33:16:25:35:34 chr13 36639771 . A C 249.2 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0282005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2245;QD=14.24;RBI=0.0783156;REFB=-0.0197334;REVB=0.0730621;RO=41;SAF=9;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14444;STB=0.582465;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0208198;OID=.;OPOS=36639771;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:20:9:18:23:20:9:18:23 chr13 36744800 . G A 982.46 PASS AF=0.425101;AO=105;DP=247;FAO=105;FDP=247;FR=.;FRO=142;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=74;FSRR=68;FWDB=-0.0129778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.101;QD=15.9103;RBI=0.0147764;REFB=-0.0185601;REVB=0.00706531;RO=142;SAF=55;SAR=50;SRF=74;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00277299;STB=0.501545;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0270032;OID=.;OPOS=36744800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:142:142:105:105:0.425101:50:55:74:68:50:55:74:68 chr13 36744910 . C T 428.61 PASS AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0335562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.537;QD=22.2652;RBI=0.041562;REFB=-0.0154833;REVB=-0.0245231;RO=34;SAF=22;SAR=20;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767846;STB=0.534809;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0123217;OID=.;OPOS=36744910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:35:42:42:0.545455:20:22:21:13:20:22:21:14 chr13 36801415 . C T 875.48 PASS AF=0.5;AO=88;DP=176;FAO=88;FDP=176;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=0.0320164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.807;QD=19.8972;RBI=0.0329059;REFB=-0.00626396;REVB=0.00759934;RO=88;SAF=52;SAR=36;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135048;STB=0.574307;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00783297;OID=.;OPOS=36801415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:88:88:88:88:0.5:36:52:39:49:36:52:39:49 chr13 36828237 . T C 307.98 PASS AF=0.365385;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0719838;FXX=0.0188661;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3415;QD=11.8454;RBI=0.0983075;REFB=-0.00850803;REVB=0.0669529;RO=68;SAF=16;SAR=22;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137518;STB=0.569506;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0249358;OID=.;OPOS=36828237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:104:68:66:38:38:0.365385:22:16:37:31:22:16:35:31 chr13 36855375 . C T 394.65 PASS AF=0.450549;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0426175;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.2406;QD=17.3472;RBI=0.0434711;REFB=0.0179471;REVB=0.00857208;RO=51;SAF=20;SAR=21;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949786;STB=0.548364;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.0242725;OID=.;OPOS=36855375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:51:50:41:41:0.450549:21:20:20:31:21:20:20:30 chr13 36855405 . A G 370.02 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0115362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.117;QD=19.7345;RBI=0.0120975;REFB=-0.00864585;REVB=0.00364221;RO=36;SAF=13;SAR=25;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121024;STB=0.561764;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0117066;OID=.;OPOS=36855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:37:38:38:0.506667:25:13:17:19:25:13:17:20 chr13 36857639 . T C 320.32 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.021461;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2463;QD=15.8181;RBI=0.0541714;REFB=-0.0235394;REVB=0.0497389;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123626;STB=0.569581;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0296631;OID=.;OPOS=36857639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:46:46:35:35:0.432099:18:17:28:18:18:17:28:18 chr13 36877978 . T C 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00858204;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=247.339;QD=13.7531;RBI=0.0139766;REFB=-0.00671987;REVB=-0.0110315;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106803;STB=0.546039;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0101514;OID=.;OPOS=36877978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:17:23:15:15:0.394737:7:8:11:6:7:8:14:9 chr13 36886469 . T C 267.55 PASS AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0401637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.414;QD=13.7203;RBI=0.0405212;REFB=-0.023727;REVB=0.0053707;RO=47;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199616;STB=0.612942;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0370809;OID=.;OPOS=36886469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:16:15:14:33:16:15:14:33 chr13 36939688 . C T 1713.24 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0716;QD=60.6458;RBI=0.0447025;REFB=0;REVB=-0.0421401;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222443;OID=.;OPOS=36939688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0 chr13 36939758 . A G 2202.6 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.719;QD=62.9314;RBI=0.0074474;REFB=0;REVB=0.00484731;RO=0;SAF=73;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14022e-05;OID=.;OPOS=36939758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:67:73:0:0:67:73:0:0 chr13 37269675 . C A 700.27 PASS AF=0.601852;AO=65;DP=111;FAO=65;FDP=108;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0142928;FXX=0.052627;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4762;QD=25.9359;RBI=0.0180768;REFB=-0.00839867;REVB=0.0110674;RO=43;SAF=30;SAR=35;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489575;STB=0.526611;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.011389;OID=.;OPOS=37269675;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:108:43:43:65:65:0.601852:35:30:17:26:35:30:17:26 chr13 37269835 . G A 1992.25 PASS AF=0.992308;AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0274704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.995;QD=61.3001;RBI=0.0290386;REFB=-0.0966892;REVB=0.00941375;RO=1;SAF=61;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693782;STB=0.503649;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00180052;OID=.;OPOS=37269835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:130:130:1:1:129:129:0.992308:68:61:0:1:68:61:0:1 chr13 37271428 . GCACACACACACACACACAT GCACACACACACACACAT,GCACACACACACACACATAA 305.78 PASS AF=0.782609,0.217391;AO=14,5;DP=24;FAO=18,5;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3,0;FSAR=15,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111,0.115982;FXX=0.0416493;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=205.026,187.742;QD=53.1789;RBI=0.120205,0.122451;REFB=0,0;REVB=0.0461326,0.039272;RO=0;SAF=1,0;SAR=13,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00105406,0.00722267;OID=.,.;OPOS=37271429,37271445;OREF=CA,CAT;OALT=-,TAA;OMAPALT=GCACACACACACACACAT,GCACACACACACACACATAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.782609,0.217391:14,5:24:18,5:23:0:3,0:15,5:0:0:28:0:1,0:13,5:0:0 chr13 37271707 . A T 1083.61 PASS AF=0.647887;AO=92;DP=143;FAO=92;FDP=142;FR=.;FRO=50;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.00323364;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.696;QD=30.5242;RBI=0.018012;REFB=-0.032329;REVB=0.0177194;RO=50;SAF=41;SAR=51;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436049;STB=0.523508;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0177864;OID=.;OPOS=37271707;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:50:50:92:92:0.647887:51:41:19:31:51:41:19:31 chr13 37372429 . T C 323.18 PASS AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00697517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2801;QD=47.8785;RBI=0.0118341;REFB=-0.0068721;REVB=0.00955991;RO=2;SAF=15;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579364;STB=0.531225;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0109229;OID=.;OPOS=37372429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:10:15:2:0:10:15:2:0 chr13 37393676 . CCG C,CGG 166.44 PASS AF=0.944444,0;AO=12,5;DP=24;FAO=17,0;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=15,0;FSAR=2,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.243081,-0.07268;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=22.2845,6.60943;QD=36.986;RBI=0.298543,0.255134;REFB=0.155647,0.118267;REVB=0.173318,0.244563;RO=4;SAF=11,5;SAR=1,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.139102,0;STB=0.51611,0.5;STBP=0.65,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00290722,0;OID=.,.;OPOS=37393677,37393677;OREF=CG,C;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.944444,0:12,5:24:17,0:18:1:15,0:2,0:1:0:6:4:11,5:1,0:4:0 chr13 37580139 . G A 483.35 PASS AF=0.505376;AO=48;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.00798723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.237;QD=20.7892;RBI=0.0104186;REFB=-0.0129403;REVB=0.00668966;RO=45;SAF=15;SAR=33;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043031;STB=0.540966;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0135247;OID=.;OPOS=37580139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:45:46:48:47:0.505376:33:15:16:29:33:14:17:29 chr13 37583831 . G A 281.85 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0567625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.836;QD=17.0817;RBI=0.0570412;REFB=0.00312116;REVB=-0.00563126;RO=35;SAF=6;SAR=25;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193409;STB=0.609678;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.00232996;OID=.;OPOS=37583831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:25:6:12:23:25:6:12:23 chr13 37600388 . GA G,GG 86.52 PASS AF=0.677419,0;AO=12,3;DP=31;FAO=21,0;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=5,0;FSAR=16,0;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.15796,0.0637258;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=8.62287,14.6533;QD=11.1635;RBI=0.266964,0.138656;REFB=-0.0438511,-0.0330888;REVB=0.215217,0.123144;RO=13;SAF=4,0;SAR=8,3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0261872,-0.576447;STB=0.566862,0.5;STBP=0.342,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0786905,0.005744;OID=.,.;OPOS=37600389,37600389;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.677419,0:12,3:31:21,0:31:10:5,0:16,0:4:6:34:13:4,0:8,3:4:9 chr13 37625601 . T C 613.24 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.666;QD=61.3241;RBI=0.0310918;REFB=0;REVB=0.019717;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0161e-05;OID=.;OPOS=37625601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0 chr13 37679268 . G T 407.11 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0319489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8179;QD=22.9357;RBI=0.0320458;REFB=-0.0284317;REVB=0.00249117;RO=30;SAF=32;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237041;STB=0.642257;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0144159;OID=.;OPOS=37679268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:31:40:40:0.56338:8:32:17:13:8:32:17:14 chr13 37679333 . G A 511.28 PASS AF=0.458333;AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=48;FSRR=17;FWDB=-0.00208447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.763;QD=17.0428;RBI=0.00352092;REFB=-0.0108003;REVB=-0.00283757;RO=65;SAF=38;SAR=17;SRF=48;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555648;STB=0.530853;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0103368;OID=.;OPOS=37679333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:65:65:55:55:0.458333:17:38:48:17:17:38:48:17 chr13 37679535 . G C 396.43 PASS AF=0.533333;AO=39;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0176585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.741;QD=21.1432;RBI=0.017665;REFB=0.00063273;REVB=-0.000481962;RO=35;SAF=20;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475539;STB=0.53163;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.00149329;OID=.;OPOS=37679535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:39:40:0.533333:19:20:16:19:19:21:16:19 chr13 37679729 . C T 190.95 PASS AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.105443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.844;QD=30.5521;RBI=0.107753;REFB=0.0205043;REVB=-0.0221896;RO=7;SAF=11;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210188;STB=0.511615;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.0103129;OID=.;OPOS=37679729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:7:11:4:3:7:11:4:3 chr13 37679776 . G A 126.56 PASS AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0200129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9162;QD=29.7794;RBI=0.0211946;REFB=-0.0177059;REVB=0.00697826;RO=4;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162773;STB=0.509077;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.00952141;OID=.;OPOS=37679776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:6:7:2:2:6:7:2:2 chr13 38429073 . G A 687.66 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0768;QD=62.5143;RBI=0.108492;REFB=0;REVB=0.0899768;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121023;OID=.;OPOS=38429073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0 chr13 38924083 . A T 2221.34 PASS AF=1;AO=138;DP=139;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00296946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8808;QD=63.0166;RBI=0.00415366;REFB=0;REVB=0.00290434;RO=0;SAF=74;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92634e-05;OID=.;OPOS=38924083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:139:141:0:0:138:141:1:64:74:0:0:66:75:0:0 chr13 38924263 . T C 2312.16 PASS AF=0.993243;AO=144;DP=146;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0327561;FXX=0.00671096;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5413;QD=62.4909;RBI=0.0329541;REFB=-0.0641361;REVB=0.00360699;RO=1;SAF=82;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576437;STB=0.502994;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00237106;OID=.;OPOS=38924263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:148:1:1:144:147:0.993243:62:82:1:0:64:83:1:0 chr13 38932206 . A T 102.06 PASS AF=0.246914;AO=11;DP=74;FAO=20;FDP=81;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=41;FSRR=20;FWDB=0.00553053;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.183;QD=5.04013;RBI=0.0796831;REFB=-0.00524486;REVB=-0.0794909;RO=61;SAF=10;SAR=1;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415854;STB=0.86878;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.027095;OID=.;OPOS=38932206;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:81:61:61:11:20:0.246914:1:10:41:20:1:19:41:20 chr13 39262057 . G A 1748.58 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.513;QD=60.82;RBI=0.0256893;REFB=0;REVB=0.00443905;RO=0;SAF=47;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3323e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.66648e-05;OID=.;OPOS=39262057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:115:0:0:114:115:1:67:47:0:0:67:48:0:0 chr13 39263714 . T C 618.5 PASS AF=1;AO=35;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9148;QD=60.341;RBI=0.0285874;REFB=0;REVB=-0.000866711;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0148088;OID=.;OPOS=39263714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:35:41:1:18:17:0:0:19:22:0:0 chr13 39263731 . C T 520.7 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.556;QD=59.5088;RBI=0.0618999;REFB=0;REVB=0.0389037;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343756;OID=.;OPOS=39263731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:17:17:0:0:17:18:0:0 chr13 39430314 . C T 356.45 PASS AF=0.321918;AO=46;DP=164;FAO=47;FDP=146;FR=.;FRO=99;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.00348052;FXX=0.120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.311;QD=9.76576;RBI=0.0458379;REFB=-0.00988033;REVB=-0.0457056;RO=97;SAF=29;SAR=17;SRF=42;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230745;STB=0.629832;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0153558;OID=.;OPOS=39430314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:146:97:99:46:47:0.321918:17:29:42:55:18:29:42:57 chr13 39433606 . A G 273.94 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0241439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.397;QD=15.2189;RBI=0.0289186;REFB=-0.0140286;REVB=-0.0159173;RO=40;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130524;STB=0.567013;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0208718;OID=.;OPOS=39433606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:41:31:31:0.430556:18:13:22:18:18:13:22:19 chr13 39540589 . TC T 230.61 PASS AF=0.421875;AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0117097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.983;QD=14.4131;RBI=0.0121846;REFB=-0.00735616;REVB=0.00336849;RO=37;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380814;STB=0.508765;STBP=0.906;TYPE=del;VARB=0.00988202;OID=.;OPOS=39540590;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421875:26:64:27:64:37:12:15:17:20:99:37:11:15:17:20 chr13 39586343 . G C 491.89 PASS AF=0.40146;AO=55;DP=137;FAO=55;FDP=137;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.00871068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.412;QD=14.3617;RBI=0.0362429;REFB=-0.00833639;REVB=0.0351806;RO=81;SAF=29;SAR=26;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300421;STB=0.52027;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.013178;OID=.;OPOS=39586343;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:81:82:55:55:0.40146:26:29:45:36:26:29:46:36 chr13 39587677 . A G 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0296484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4103;QD=17.8273;RBI=0.0366852;REFB=0.0174134;REVB=0.0216051;RO=11;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494616;STB=0.794549;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.01978;OID=.;OPOS=39587677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:11:1:5:6:11:1:5:6 chr13 39587865 . A C 109.54 PASS AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0149815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.792;QD=8.11432;RBI=0.0150942;REFB=-0.0225051;REVB=0.00184172;RO=39;SAF=6;SAR=9;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134765;STB=0.58198;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0443804;OID=.;OPOS=39587865;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:39:39:15:15:0.277778:9:6:20:19:9:6:20:19 chr13 39587889 . T C 131.29 PASS AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0197961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.981;QD=8.90093;RBI=0.0251807;REFB=-0.0156503;REVB=-0.0155622;RO=41;SAF=7;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11717;STB=0.569979;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0348294;OID=.;OPOS=39587889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:11:7:20:21:11:7:20:21 chr13 40229891 . G A 346.15 PASS AF=0.634615;AO=33;DP=52;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0209253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3484;QD=26.627;RBI=0.0477793;REFB=-0.0234745;REVB=0.0429533;RO=19;SAF=22;SAR=11;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537861;STB=0.529394;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0101936;OID=.;OPOS=40229891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:19:19:33:33:0.634615:11:22:14:5:11:22:14:5 chr13 40229957 . T A 350.76 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.00922705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.01;QD=20.6331;RBI=0.0104899;REFB=-0.0119759;REVB=0.00498987;RO=31;SAF=23;SAR=13;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964749;STB=0.55847;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0114194;OID=.;OPOS=40229957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:31:32:36:36:0.529412:13:23:23:8:13:23:24:8 chr13 40230229 . C T 613.82 PASS AF=0.420732;AO=69;DP=165;FAO=69;FDP=164;FR=.;FRO=95;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=0.00616938;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2852;QD=14.9713;RBI=0.00701232;REFB=-0.026022;REVB=-0.00333337;RO=91;SAF=22;SAR=47;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156062;STB=0.57755;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0103122;OID=.;OPOS=40230229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:91:95:69:69:0.420732:47:22:42:49:47:22:42:53 chr13 40230294 . T C 1146.24 PASS AF=0.463602;AO=120;DP=260;FAO=121;FDP=261;FR=.;FRO=140;FSAF=43;FSAR=78;FSRF=53;FSRR=87;FWDB=-0.0207397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.916;QD=17.5669;RBI=0.0242262;REFB=-0.0249081;REVB=0.0125209;RO=140;SAF=43;SAR=77;SRF=53;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212837;STB=0.513472;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0260529;OID=.;OPOS=40230294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:261:140:140:120:121:0.463602:77:43:53:87:78:43:53:87 chr13 40238175 . C T 276.69 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00319681;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.919;QD=18.1438;RBI=0.0059328;REFB=-0.0146274;REVB=-0.00499785;RO=31;SAF=12;SAR=18;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192791;STB=0.607771;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0110654;OID=.;OPOS=40238175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:18:12:19:12:18:12:19:12 chr13 40359621 . T C 376.24 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00720212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.654;QD=21.1966;RBI=0.0182776;REFB=-0.0218915;REVB=0.0167989;RO=33;SAF=19;SAR=19;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140387;STB=0.577425;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0175978;OID=.;OPOS=40359621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:19:19:11:22:19:19:11:22 chr13 41331026 . C G 485.95 PASS AF=0.560976;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0503052;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2846;QD=23.7049;RBI=0.0506311;REFB=-0.003607;REVB=-0.00573536;RO=34;SAF=25;SAR=21;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582979;STB=0.542501;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.00392231;OID=.;OPOS=41331026;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:34:36:46:46:0.560976:21:25:21:13:21:25:23:13 chr13 41382711 . A T 167.4 PASS AF=0.409091;AO=16;DP=43;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0210156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.809;QD=15.2186;RBI=0.0218484;REFB=-0.0122178;REVB=0.00597466;RO=26;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208797;STB=0.603057;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0173428;OID=.;OPOS=41382711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:26:26:16:18:0.409091:11:5:13:13:12:6:13:13 chr13 41705495 . A G 400.22 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0168317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.306;QD=53.3624;RBI=0.0305969;REFB=-0.0662397;REVB=0.0255513;RO=1;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300429;STB=0.516118;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000819963;OID=.;OPOS=41705495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:15:14:0:1:15:14:0:1 chr13 41706800 . A C,G 748.21 PASS AF=0.0188679,0.981132;AO=2,51;DP=54;FAO=1,52;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.128059,0.0135075;FXX=0.0185151;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=15.0191,256.338;QD=56.4686;RBI=0.130138,0.0135094;REFB=0,0;REVB=-0.0231678,0.000224985;RO=1;SAF=0,21;SAR=2,30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0154392;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0256772,-5.24291e-05;OID=.,.;OPOS=41706800,41706800;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:4:54:53:1:0:2,51:1,52:0.0188679,0.981132:2,30:0,21:0:1:1,31:0,21:0:0 chr13 41767338 . A G 191.02 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00982207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.697;QD=13.4049;RBI=0.0170205;REFB=-0.00550969;REVB=-0.0139005;RO=34;SAF=14;SAR=9;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423745;STB=0.524251;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0151663;OID=.;OPOS=41767338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:9:14:22:12:9:14:22:12 chr13 41767341 . A G 195.19 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0172661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.644;QD=14.196;RBI=0.0303435;REFB=-0.0191492;REVB=-0.0249522;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175009;STB=0.509991;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0189257;OID=.;OPOS=41767341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:9:14:20:12:9:14:20:12 chr13 41834744 . C T 354.84 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.013107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3822;QD=18.9249;RBI=0.015726;REFB=-0.00604319;REVB=0.00868994;RO=38;SAF=22;SAR=15;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20439;STB=0.613673;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00571323;OID=.;OPOS=41834744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:15:22:14:24:15:22:14:24 chr13 41902939 . T C 756.27 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492803;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3588;QD=57.077;RBI=0.0529196;REFB=0;REVB=-0.0192855;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328787;OID=.;OPOS=41902939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:29:24:0:0 chr13 42032572 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.984;QD=60.9786;RBI=0.0540612;REFB=0;REVB=0.0331107;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.47912e-05;OID=.;OPOS=42032572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr13 42385446 . T C 196.73 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00521569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.6;QD=18.3008;RBI=0.0424495;REFB=0.00467977;REVB=-0.0421278;RO=23;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102402;STB=0.558082;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.00611488;OID=.;OPOS=42385446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:10:10:14:9:10:10:14:9 chr13 42734176 . C T 513.43 PASS AF=0.550562;AO=48;DP=88;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00249244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.01;QD=23.0757;RBI=0.0056603;REFB=-0.0106238;REVB=0.005082;RO=40;SAF=26;SAR=22;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013849;STB=0.511784;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0103636;OID=.;OPOS=42734176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:40:40:48:49:0.550562:22:26:21:19:22:27:21:19 chr13 42772717 . G T 438.32 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00954352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.507;QD=21.6457;RBI=0.0101365;REFB=-0.00630738;REVB=-0.00341612;RO=37;SAF=12;SAR=31;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217141;STB=0.627785;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00325845;OID=.;OPOS=42772717;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:37:38:43:43:0.530864:31:12:19:18:31:12:20:18 chr13 42793479 . G A 194.34 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.00905927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1542;QD=12.3389;RBI=0.0266717;REFB=0.000155788;REVB=0.0250861;RO=39;SAF=8;SAR=16;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000662167;OID=.;OPOS=42793479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:16:8:13:26:16:8:13:26 chr13 42799444 . AG GA 96.96 PASS AF=0.155172;AO=9;DP=58;FAO=9;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00969935;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=32.4644;QD=6.68711;RBI=0.035724;REFB=-0.0104994;REVB=-0.0343821;RO=40;SAF=8;SAR=1;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606926;STB=0.895699;STBP=0.012;TYPE=mnp;VARB=0.131874;OID=.;OPOS=42799444;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:58:58:40:41:9:9:0.155172:1:8:15:25:1:8:16:25 chr13 42803341 . T C 3003.3 PASS AF=0.974747;AO=193;DP=198;FAO=193;FDP=198;FR=.;FRO=5;FSAF=94;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0184267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.926;QD=60.6727;RBI=0.020842;REFB=-0.0840548;REVB=0.00973883;RO=3;SAF=94;SAR=99;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142096;STB=0.512314;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00210958;OID=.;OPOS=42803341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:198:198:3:5:193:193:0.974747:99:94:0:3:99:94:0:5 chr13 43469157 . G A 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.931;QD=59.3226;RBI=0.0300797;REFB=0;REVB=-0.0204043;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70822e-06;OID=.;OPOS=43469157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0 chr13 43469211 . G A 1306.93 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116896;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.001;QD=62.2345;RBI=0.0124471;REFB=0;REVB=0.00427613;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04497e-05;OID=.;OPOS=43469211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:40:44:0:0:40:44:0:0 chr13 43788158 . G A 1104.68 PASS AF=0.986667;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0172483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.475;QD=58.9161;RBI=0.0216306;REFB=-0.149338;REVB=0.013053;RO=1;SAF=38;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122856;STB=0.506492;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=1.37548e-05;OID=.;OPOS=43788158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:74:75:1:1:73:74:0.986667:35:38:1:0:36:38:1:0 chr13 44411432 . A G 655.17 PASS AF=0.485294;AO=65;DP=137;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.0269099;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.891;QD=19.2697;RBI=0.0319887;REFB=-0.00491712;REVB=0.0172955;RO=70;SAF=32;SAR=33;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205879;STB=0.515147;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.00678595;OID=.;OPOS=44411432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:70:70:65:66:0.485294:33:32:36:34:34:32:36:34 chr13 44457925 . A G 592.62 PASS AF=0.433333;AO=65;DP=151;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=36;FWDB=0.0423414;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.82;QD=15.8031;RBI=0.0425861;REFB=-0.0260316;REVB=-0.00455873;RO=84;SAF=36;SAR=29;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180038;STB=0.513003;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0328834;OID=.;OPOS=44457925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:84:85:65:65:0.433333:29:36:48:36:29:36:49:36 chr13 45492146 . G A 150.12 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00177872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3181;QD=19.3706;RBI=0.00936911;REFB=-0.0188725;REVB=0.00919871;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892964;STB=0.550954;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0115735;OID=.;OPOS=45492146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:4:12:10:5:4:12:10:5 chr13 45515395 . G A 567.47 PASS AF=0.661765;AO=38;DP=69;FAO=45;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00843047;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.635;QD=33.3806;RBI=0.0101816;REFB=-0.00984737;REVB=0.00570892;RO=12;SAF=18;SAR=20;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254338;STB=0.507039;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00490172;OID=.;OPOS=45515395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:69:68:12:12:38:45:0.661765:20:18:5:7:24:21:6:6 chr13 45563464 . G C 738.4 PASS AF=0.487342;AO=77;DP=157;FAO=77;FDP=158;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.00209434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.385;QD=18.6936;RBI=0.00900524;REFB=-0.0184641;REVB=0.00875831;RO=79;SAF=33;SAR=44;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135329;STB=0.514702;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0191016;OID=.;OPOS=45563464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:79:81:77:77:0.487342:44:33:35:44:44:33:37:44 chr13 45914701 . AGT AG,TAG 53.11 PASS AF=0.363636,0.0909091;AO=8,2;DP=22;FAO=8,2;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6,0;FSAR=2,2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.109137,-0.00687731;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,3;MLLD=15.0473,98.6042;QD=9.65557;RBI=0.110727,0.0153737;REFB=-0.123247,-0.00311635;REVB=0.0186994,-0.0137497;RO=10;SAF=7,0;SAR=1,2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.51755,-0.542827;STB=0.666222,0.994326;STBP=0.271,0.18;TYPE=del,mnp;VARB=0.166677,0.017006;OID=.,.;OPOS=45914703,45914701;OREF=T,AGT;OALT=-,TAG;OMAPALT=AG,TAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:22:22:10:12:8,2:8,2:0.363636,0.0909091:1,2:7,0:4:6:2,2:6,0:6:6 chr13 46067593 . G A 201.83 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.0174588;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9389;QD=13.919;RBI=0.0244102;REFB=-0.000179531;REVB=0.0170601;RO=35;SAF=5;SAR=19;SRF=4;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166617;STB=0.621807;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00232961;OID=.;OPOS=46067593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:35:34:24:24:0.413793:19:5:4:31:19:5:3:31 chr13 46077381 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.402;QD=49.5992;RBI=0.0402482;REFB=0;REVB=0.0375051;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105114;OID=.;OPOS=46077381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr13 46103935 . A G 338.69 PASS AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.00305346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.56;QD=15.2222;RBI=0.0575621;REFB=-0.0144857;REVB=0.057481;RO=52;SAF=21;SAR=16;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103725;STB=0.505865;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0229966;OID=.;OPOS=46103935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:16:21:29:23:16:21:29:23 chr13 46108853 . TG CA 1517.49 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00894787;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=2;MLLD=282.375;QD=63.8943;RBI=0.009987;REFB=0;REVB=-0.00443573;RO=0;SAF=35;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-1.70139e-05;OID=.;OPOS=46108853;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:95:0:0:95:95:1:60:35:0:0:60:35:0:0 chr13 46109026 . T A 237.93 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0566855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.388;QD=20.2493;RBI=0.0607814;REFB=0.00202588;REVB=0.0219348;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560942;STB=0.531571;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00304082;OID=.;OPOS=46109026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:10:14:12:11:10:14 chr13 46115731 . C A 447.48 PASS AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.070236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7884;QD=16.7282;RBI=0.08087;REFB=-0.0170753;REVB=0.0400857;RO=58;SAF=25;SAR=24;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433974;STB=0.524199;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0196706;OID=.;OPOS=46115731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:58:58:49:49:0.457944:24:25:27:31:24:25:27:31 chr13 46137807 . T C 1067.74 PASS AF=0.537234;AO=101;DP=190;FAO=101;FDP=188;FR=.;FRO=87;FSAF=61;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=8.13932e-05;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9665;QD=22.7178;RBI=0.0171984;REFB=-0.0162973;REVB=-0.0171982;RO=87;SAF=61;SAR=40;SRF=34;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180912;STB=0.59884;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0123104;OID=.;OPOS=46137807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:87:87:101:101:0.537234:40:61:34:53:40:61:34:53 chr13 46137837 . T C 947.32 PASS AF=0.460829;AO=100;DP=219;FAO=100;FDP=217;FR=.;FRO=117;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=67;FSRR=50;FWDB=0.00347689;FXX=0.009132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.787;QD=17.4621;RBI=0.0111916;REFB=-0.0105074;REVB=0.0106378;RO=116;SAF=38;SAR=62;SRF=67;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192994;STB=0.60466;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0141652;OID=.;OPOS=46137837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:217:116:117:100:100:0.460829:62:38:67:49:62:38:67:50 chr13 46154128 . AATT A 160.75 PASS AF=0.461538;AO=21;DP=53;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.00970726;FXX=0.0714158;HRUN=5;LEN=3;MLLD=355.742;QD=12.365;RBI=0.0147527;REFB=-0.000746936;REVB=-0.0111091;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215344;STB=0.672283;STBP=0.04;TYPE=del;VARB=0.00134526;OID=.;OPOS=46154129;OREF=ATT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.461538:21:53:24:52:28:13:11:6:22:99:29:11:10:9:20 chr13 46154749 . A G 649.93 PASS AF=0.507812;AO=64;DP=127;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00818553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.729;QD=20.3102;RBI=0.0213331;REFB=-0.0367355;REVB=0.0197003;RO=63;SAF=32;SAR=32;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357011;STB=0.515752;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0312652;OID=.;OPOS=46154749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:63:63:64:65:0.507812:32:32:29:34:33:32:29:34 chr13 46170621 . A T 264.41 PASS AF=0.434783;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.012943;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0306;QD=15.328;RBI=0.0509627;REFB=-0.00302967;REVB=-0.0492917;RO=38;SAF=18;SAR=12;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605962;STB=0.524374;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00409414;OID=.;OPOS=46170621;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:38:39:30:30:0.434783:12:18:25:13:12:18:25:14 chr13 46306447 . T C 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.04214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.772;QD=8.69805;RBI=0.0513377;REFB=-0.00505324;REVB=-0.029322;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152225;STB=0.594327;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00838274;OID=.;OPOS=46306447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:6:8:3:4:6:8 chr13 46541673 . T A 1080.56 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.396;QD=60.031;RBI=0.0258757;REFB=0;REVB=0.0170212;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63766e-05;OID=.;OPOS=46541673;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:32:40:0:0:32:40:0:0 chr13 46562935 . A G 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.898;QD=59.8558;RBI=0.0152212;REFB=0;REVB=-0.0100863;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10901e-06;OID=.;OPOS=46562935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0 chr13 46629944 . A G 972.01 PASS AF=0.957746;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00102979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.606;QD=54.7609;RBI=0.0075728;REFB=-0.0232104;REVB=0.00750245;RO=3;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377688;STB=0.519994;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.000558954;OID=.;OPOS=46629944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:71:71:3:3:68:68:0.957746:36:32:0:3:36:32:0:3 chr13 46641466 . A G 378.5 PASS AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0118701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.44;QD=16.4566;RBI=0.0151623;REFB=-0.0157613;REVB=0.00943381;RO=52;SAF=28;SAR=12;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137485;STB=0.57763;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0182182;OID=.;OPOS=46641466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:12:28:30:22:12:28:30:22 chr13 46641481 . T C 1317.85 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.64;QD=62.0166;RBI=0.0257645;REFB=0;REVB=0.0223319;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39319e-05;OID=.;OPOS=46641481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:33:51:0:0:33:52:0:0 chr13 46648094 . C T 443.81 PASS AF=0.45;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.00696299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.346;QD=17.7524;RBI=0.00933519;REFB=-0.00484418;REVB=0.00621791;RO=54;SAF=23;SAR=22;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434502;STB=0.518906;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00568726;OID=.;OPOS=46648094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:55:45:45:0.45:22:23:30:24:22:23:30:25 chr13 46656669 . A G 746.73 PASS AF=0.525547;AO=72;DP=137;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.0131934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.401;QD=21.8024;RBI=0.0164576;REFB=-0.0130893;REVB=-0.00983793;RO=65;SAF=30;SAR=42;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158291;STB=0.586853;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00946921;OID=.;OPOS=46656669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:65:65:72:72:0.525547:42:30:39:26:42:30:39:26 chr13 46700641 . TG T,TT 923.79 PASS AF=0.046875,0.953125;AO=8,56;DP=65;FAO=3,61;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=2,28;FSAR=1,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259374,-0.00260122;FXX=0.0153822;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=244.166,263.616;QD=57.7367;RBI=0.0591767,0.0522433;REFB=0,0;REVB=0.0591198,0.0521785;RO=0;SAF=2,28;SAR=6,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00658371,0.000379905;OID=.,.;OPOS=46700642,46700642;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.046875,0.953125:8,56:65:3,61:64:0:2,28:1,33:0:0:7:0:2,28:6,28:0:0 chr13 46708291 . T C 1437.98 PASS AF=0.959596;AO=94;DP=99;FAO=95;FDP=99;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.000896998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.994;QD=58.1002;RBI=0.0210401;REFB=-0.247107;REVB=0.021021;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518515;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.000958479;OID=.;OPOS=46708291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:99:99:0:4:94:95:0.959596:51:43:0:0:52:43:0:4 chr13 46946157 . C T 331.63 PASS AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0277391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.805;QD=21.3958;RBI=0.0299816;REFB=-0.0288051;REVB=0.0113772;RO=28;SAF=13;SAR=21;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00905362;STB=0.505007;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0210975;OID=.;OPOS=46946157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:28:34:34:0.548387:21:13:11:17:21:13:11:17 chr13 46948548 . G A 115.59 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00200158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.75;QD=11.0084;RBI=0.00206932;REFB=-0.00623805;REVB=0.000525107;RO=28;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239502;STB=0.642653;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0140782;OID=.;OPOS=46948548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:9:5:16:12:9:5:16:12 chr13 47127813 . C T 164.89 PASS AF=0.382979;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.00397656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5769;QD=14.0329;RBI=0.0117778;REFB=0.00144171;REVB=-0.0110862;RO=29;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235171;STB=0.647993;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00478142;OID=.;OPOS=47127813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:29:29:17:18:0.382979:8:9:9:20:8:10:9:20 chr13 47260054 . T C 1393.19 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2603;QD=61.9194;RBI=0.0280769;REFB=0;REVB=-0.0130563;RO=1;SAF=33;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00838874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154307;OID=.;OPOS=47260054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:1:0:89:90:1:56:33:0:1:57:33:0:0 chr13 47273458 . G C 1175.83 PASS AF=0.975;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0115734;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.619;QD=58.7917;RBI=0.0155065;REFB=0.116789;REVB=0.0103203;RO=2;SAF=31;SAR=47;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005059;STB=0.502673;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.000219154;OID=.;OPOS=47273458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:81:80:2:2:78:78:0.975:47:31:1:1:47:31:1:1 chr13 47279454 . A G 1530.04 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.053;QD=63.7518;RBI=0.0129391;REFB=0;REVB=-0.0117651;RO=0;SAF=50;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29567e-05;OID=.;OPOS=47279454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:46:50:0:0:46:50:0:0 chr13 47308109 . A G 738.13 PASS AF=0.360996;AO=84;DP=241;FAO=87;FDP=241;FR=.;FRO=154;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=82;FSRR=72;FWDB=0.0063626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.584;QD=12.2511;RBI=0.00916675;REFB=-0.00694432;REVB=0.00659898;RO=153;SAF=41;SAR=43;SRF=81;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046852;STB=0.539054;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0124353;OID=.;OPOS=47308109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:153:154:84:87:0.360996:43:41:81:72:46:41:82:72 chr13 47315984 . T C 453.8 PASS AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00241907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.946;QD=22.4099;RBI=0.00248262;REFB=-0.0242269;REVB=0.000558139;RO=37;SAF=17;SAR=27;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238047;STB=0.630993;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0207451;OID=.;OPOS=47315984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:44:44:0.54321:27:17:25:12:27:17:25:12 chr13 47354101 . C T 209.29 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0302462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1397;QD=11.6269;RBI=0.0385708;REFB=0.0053136;REVB=0.0239348;RO=46;SAF=8;SAR=18;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152674;STB=0.588714;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.00829346;OID=.;OPOS=47354101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:46:46:26:26:0.361111:18:8:20:26:18:8:20:26 chr13 47469940 . G A 1556.51 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.99;QD=59.8658;RBI=0.00689605;REFB=0;REVB=0.00367217;RO=0;SAF=47;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71826e-06;OID=.;OPOS=47469940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:57:47:0:0:57:47:0:0 chr13 47470824 . C T 296.31 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0216315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4752;QD=49.3851;RBI=0.042689;REFB=-0.0474398;REVB=0.0368025;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402265;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00409158;OID=.;OPOS=47470824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:11:12:0:1:11:12:0:1 chr13 48033224 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3536;QD=56.9566;RBI=0.0533976;REFB=0;REVB=-0.0503725;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000361204;OID=.;OPOS=48033224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr13 48547467 . A T 101.98 PASS AF=0.242424;AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0100143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1017;QD=6.18093;RBI=0.0155626;REFB=-0.0127889;REVB=-0.0119126;RO=49;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929659;STB=0.562425;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0420872;OID=.;OPOS=48547467;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:49:50:16:16:0.242424:10:6:15:34:10:6:15:35 chr13 48611918 . A AGGAGTC 451.54 PASS AF=0.384058;AO=51;DP=140;FAO=53;FDP=138;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=-0.00739071;FXX=0.086087;HRUN=2;LEN=6;MLLD=266.442;QD=13.088;RBI=0.0220931;REFB=-0.0127334;REVB=-0.0208202;RO=85;SAF=37;SAR=14;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223455;STB=0.605073;STBP=0.062;TYPE=ins;VARB=0.0246015;OID=.;OPOS=48611919;OREF=-;OALT=GGAGTC;OMAPALT=AGGAGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.384058:51:140:53:138:85:37:16:46:39:99:85:37:14:46:39 chr13 49107241 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.248;QD=51.1846;RBI=0.050861;REFB=0;REVB=-0.0216182;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000485101;OID=.;OPOS=49107241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:18:2:0:0:18:2:0:0 chr13 49794650 . C A 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.646;QD=59.5017;RBI=0.0481768;REFB=0;REVB=0.0348542;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13683e-06;OID=.;OPOS=49794650;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0 chr13 49840024 . A G 1098.61 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00274137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8748;QD=60.1976;RBI=0.0252986;REFB=0;REVB=-0.0251496;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241775;OID=.;OPOS=49840024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:41:32:0:0:41:32:0:0 chr13 49866869 . G A,C 1865.67 PASS AF=0.0325203,0.96748;AO=7,116;DP=123;FAO=4,119;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=2,86;FSAR=2,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230047,0.0100056;FXX=0.0314936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=181.463,98.46;QD=60.672;RBI=0.020073,0.0100367;REFB=0,0;REVB=-0.0199407,-0.000788422;RO=0;SAF=5,83;SAR=2,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.16662,0.000124006;OID=.,.;OPOS=49866869,49866869;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:123:123:0:0:7,116:4,119:0.0325203,0.96748:2,33:5,83:0:0:2,33:2,86:0:0 chr13 49951142 . T C 303.32 PASS AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.000287435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.56;QD=25.8143;RBI=0.0161213;REFB=-0.0245008;REVB=-0.0161187;RO=20;SAF=17;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10334;STB=0.557334;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0139211;OID=.;OPOS=49951142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:10:17:10:10:10:17:10:10 chr13 49951193 . T C 252.07 PASS AF=0.474576;AO=27;DP=58;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00581263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.5812;QD=17.0896;RBI=0.00592957;REFB=-0.0152351;REVB=-0.00117182;RO=31;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985619;STB=0.544104;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.022266;OID=.;OPOS=49951193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:31:31:27:28:0.474576:12:15:14:17:13:15:14:17 chr13 50008301 . A G 923.42 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00302064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.943;QD=56.8261;RBI=0.0181511;REFB=0.0499343;REVB=0.017898;RO=1;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160049;STB=0.508194;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=7.44612e-05;OID=.;OPOS=50008301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:29:34:0:1:30:34:0:1 chr13 50050620 . A G 727.76 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0780819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.5209;QD=63.2832;RBI=0.0796098;REFB=0;REVB=-0.015522;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00134721;OID=.;OPOS=50050620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0 chr13 50057097 . G A 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6099;QD=63.5825;RBI=0.0111936;REFB=0;REVB=-0.00996384;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.62011e-05;OID=.;OPOS=50057097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0 chr13 50057633 . A G 758.2 PASS AF=0.418719;AO=85;DP=203;FAO=85;FDP=203;FR=.;FRO=118;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=75;FSRR=43;FWDB=-0.00368943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.107;QD=14.9399;RBI=0.00445358;REFB=-0.0143077;REVB=0.00249449;RO=115;SAF=52;SAR=33;SRF=74;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347144;STB=0.514672;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0210492;OID=.;OPOS=50057633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:115:118:85:85:0.418719:33:52:74:41:33:52:75:43 chr13 50080847 . A G 594.5 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.859;QD=60.9746;RBI=0.0863275;REFB=0;REVB=0.0124043;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000598094;OID=.;OPOS=50080847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr13 50106561 . T G 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0331247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.484;QD=12.8607;RBI=0.0333282;REFB=-0.0122759;REVB=0.00367658;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.561098;STB=0.838983;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0205416;OID=.;OPOS=50106561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:6:1:6:2:6:1:6:2 chr13 50106584 . G A 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00888657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.19;QD=21.0138;RBI=0.00959609;REFB=-0.000668492;REVB=0.00362131;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490817;STB=0.782062;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000261809;OID=.;OPOS=50106584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:2:9:1:6:2:9:1:6 chr13 50123622 . G C 348.1 PASS AF=0.546875;AO=36;DP=65;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.000206137;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6892;QD=21.7563;RBI=0.0353821;REFB=0.00093776;REVB=0.0353815;RO=29;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591029;STB=0.540517;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00336215;OID=.;OPOS=50123622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:29:29:36:35:0.546875:16:20:14:15:15:20:14:15 chr13 50123649 . G A 313.16 PASS AF=0.453333;AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0122538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.019;QD=16.7019;RBI=0.0640349;REFB=-0.0150827;REVB=0.0628515;RO=40;SAF=16;SAR=17;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147654;STB=0.509428;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.025044;OID=.;OPOS=50123649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:40:41:33:34:0.453333:17:16:20:20:18:16:20:21 chr13 50123688 . G T 270.61 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.00721052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.073;QD=14.4325;RBI=0.0133439;REFB=-0.0186548;REVB=0.011228;RO=44;SAF=15;SAR=16;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0068241;STB=0.503873;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0294527;OID=.;OPOS=50123688;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:16:15:21:23:16:15:21:23 chr13 50126382 . G A 239.44 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7534;QD=50.4086;RBI=0.0500315;REFB=0;REVB=0.0479677;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220297;OID=.;OPOS=50126382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr13 50134099 . T C 120.98 PASS AF=0.257143;AO=18;DP=70;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0619839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.821;QD=6.91312;RBI=0.0634968;REFB=-0.0147706;REVB=-0.0137783;RO=52;SAF=8;SAR=10;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160097;STB=0.597378;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0280143;OID=.;OPOS=50134099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:52:52:18:18:0.257143:10:8:30:22:10:8:30:22 chr13 50134150 . A G 116.05 PASS AF=0.265625;AO=17;DP=65;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0163232;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5169;QD=7.25311;RBI=0.0389005;REFB=-0.00528882;REVB=-0.03531;RO=47;SAF=7;SAR=10;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169748;STB=0.60317;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0112212;OID=.;OPOS=50134150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:47:47:17:17:0.265625:10:7:26:21:10:7:26:21 chr13 50141345 . G A 256.44 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0803494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.552;QD=22.7943;RBI=0.083223;REFB=-0.0429562;REVB=0.0216803;RO=21;SAF=7;SAR=17;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411944;STB=0.523057;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.030675;OID=.;OPOS=50141345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:17:7:7:14:17:7:7:14 chr13 50141362 . G A 182.98 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0164866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.91;QD=17.4269;RBI=0.0474602;REFB=-0.022317;REVB=-0.0445047;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675636;STB=0.538422;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0187287;OID=.;OPOS=50141362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:12:7:7:16:12:7:7:16 chr13 50207885 . G A 374.62 PASS AF=0.365854;AO=44;DP=116;FAO=45;FDP=123;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.0195182;FXX=0.00806387;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.6296;QD=12.1826;RBI=0.0424278;REFB=-0.0134098;REVB=-0.0376717;RO=72;SAF=21;SAR=23;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020723;STB=0.511445;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0277681;OID=.;OPOS=50207885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:123:72:78:44:45:0.365854:23:21:33:39:24:21:35:43 chr13 50273831 . T C 175.14 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0341991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6743;QD=20.0161;RBI=0.059084;REFB=-0.00433338;REVB=0.0481804;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123057;STB=0.569543;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0108225;OID=.;OPOS=50273831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:10:8:10:7:10:8:10:7 chr13 50273970 . C T 251.08 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0379827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3893;QD=19.6926;RBI=0.0397495;REFB=-0.0176402;REVB=-0.0117192;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426327;STB=0.531957;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0132505;OID=.;OPOS=50273970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:25:26:26:0.509804:15:11:9:15:15:11:9:16 chr13 50275515 . C T 518.33 PASS AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0138116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.404;QD=22.7835;RBI=0.0225961;REFB=-0.0104622;REVB=-0.0178836;RO=42;SAF=14;SAR=35;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198462;STB=0.609709;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0130132;OID=.;OPOS=50275515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:35:14:21:21:35:14:21:21 chr13 50283819 . T C 442.82 PASS AF=0.453704;AO=48;DP=107;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=0.0108359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.939;QD=16.4006;RBI=0.0108677;REFB=-0.0184439;REVB=0.000831523;RO=59;SAF=16;SAR=32;SRF=20;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00625196;STB=0.504808;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0230956;OID=.;OPOS=50283819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:59:59:48:49:0.453704:32:16:20:39:32:17:20:39 chr13 50296115 . C T 674.56 PASS AF=1;AO=40;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00590691;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2292;QD=62.7501;RBI=0.00714983;REFB=0;REVB=0.00402846;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224218;OID=.;OPOS=50296115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:43:0:0:40:43:1:17:23:0:0:20:23:0:0 chr13 50296116 . G T 32.83 PASS AF=0.130435;AO=6;DP=46;FAO=6;FDP=46;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0161012;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=60.602;QD=2.85496;RBI=0.0544318;REFB=-0.0530865;REVB=0.0519958;RO=40;SAF=1;SAR=5;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470584;STB=0.843957;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0331565;OID=.;OPOS=50296116;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:46:46:40:40:6:6:0.130435:5:1:23:17:5:1:23:17 chr13 50466911 . G A 203.23 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0181016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.04;QD=21.971;RBI=0.0258851;REFB=-0.0115025;REVB=-0.0185032;RO=17;SAF=6;SAR=14;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00574418;STB=0.503223;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.00961552;OID=.;OPOS=50466911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:14:6:5:12:14:6:5:12 chr13 50467031 . TCCCCCCCT TCCCCCCC,TCCCCCCT 103.37 PASS AF=0.245902,0;AO=12,10;DP=60;FAO=15,0;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=1,0;FSAR=14,0;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.0089224,-0.245916;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=1,1;MLLD=189.722,9.44855;QD=6.77811;RBI=0.00916873,0.258261;REFB=-0.000176137,-0.029646;REVB=0.00211099,0.0788931;RO=32;SAF=0,4;SAR=12,6;SRF=7;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.718626,0.248007;STB=0.80604,0.5;STBP=0.054,1;TYPE=del,del;VARB=5.76206e-05,0.0454108;OID=.,.;OPOS=50467039,50467032;OREF=T,C;OALT=-,-;OMAPALT=TCCCCCCC,TCCCCCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.245902,0:12,10:60:15,0:61:46:1,0:14,0:13:33:99:32:0,4:12,6:7:25 chr13 50467044 . G C 183.54 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0227336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=360.611;QD=11.8414;RBI=0.0231663;REFB=-0.00324353;REVB=0.00445635;RO=38;SAF=3;SAR=20;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243112;STB=0.660213;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00309363;OID=.;OPOS=50467044;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:39:23:23:0.370968:20:3:10:28:20:3:11:28 chr13 50588490 . T C 50.48 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00309661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9993;QD=16.8268;RBI=0.143494;REFB=-0.0447063;REVB=-0.143461;RO=5;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.518377;STB=0.809829;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00891771;OID=.;OPOS=50588490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:12:5:5:7:7:0.583333:1:6:1:4:1:6:1:4 chr13 50588492 . T C 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0253425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7168;QD=13.961;RBI=0.132096;REFB=-0.0504503;REVB=-0.129643;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439386;STB=0.768342;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0287069;OID=.;OPOS=50588492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:1:6:3:4:1:6:3:4 chr13 50588494 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00711217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7367;QD=47.8222;RBI=0.00772017;REFB=0;REVB=0.003003;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281154;OID=.;OPOS=50588494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr13 50588496 . T C 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5;QD=49.5977;RBI=0.0294034;REFB=0;REVB=0.0227402;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122573;OID=.;OPOS=50588496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0 chr13 50590423 . G C 183.07 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.0470089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.044;QD=13.314;RBI=0.0477492;REFB=-0.0162792;REVB=0.0083757;RO=33;SAF=12;SAR=10;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196991;STB=0.61215;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0151205;OID=.;OPOS=50590423;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:10:12:24:9:10:12:24:9 chr13 50591480 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.957;QD=53.9112;RBI=0.113207;REFB=0;REVB=0.1122;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000664322;OID=.;OPOS=50591480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr13 50591616 . A G 233.74 PASS AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00646447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.65;QD=24.6037;RBI=0.00648318;REFB=-0.0170728;REVB=-0.000492211;RO=13;SAF=14;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151194;STB=0.559944;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00560472;OID=.;OPOS=50591616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:13:16:22:22:0.578947:8:14:8:5:8:14:8:8 chr13 50656582 . T A 533.14 PASS AF=0.486957;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.024638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.213;QD=18.5439;RBI=0.0284039;REFB=-0.0218039;REVB=0.0141332;RO=59;SAF=28;SAR=28;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392521;STB=0.521731;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0208701;OID=.;OPOS=50656582;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:59:56:56:0.486957:28:28:32:27:28:28:32:27 chr13 50656601 . A T 582.97 PASS AF=0.473684;AO=52;DP=122;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.00150971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.988;QD=17.533;RBI=0.022009;REFB=-0.00921173;REVB=-0.0219571;RO=70;SAF=27;SAR=25;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634203;STB=0.535039;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0104533;OID=.;OPOS=50656601;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:133:70:70:52:63:0.473684:25:27:32:38:30:33:32:38 chr13 51287408 . C G 141.87 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00927534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.627;QD=11.1267;RBI=0.0104231;REFB=-0.0026512;REVB=-0.00475501;RO=32;SAF=2;SAR=15;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343258;STB=0.739094;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00544695;OID=.;OPOS=51287408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:34:17:17:0.333333:15:2:10:22:15:2:12:22 chr13 51387124 . A G 497.81 PASS AF=0.510638;AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0326063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3996;QD=21.1833;RBI=0.0354737;REFB=0.00167478;REVB=-0.0139717;RO=46;SAF=24;SAR=24;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115615;STB=0.563804;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00137087;OID=.;OPOS=51387124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:46:48:48:0.510638:24:24:29:17:24:24:29:17 chr13 51594741 . T G 398.06 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.000867541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5268;QD=18.5143;RBI=0.0011142;REFB=-0.0243941;REVB=0.000699149;RO=40;SAF=14;SAR=27;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566831;STB=0.533317;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0277369;OID=.;OPOS=51594741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:45:41:41:0.476744:27:14:16:24:27:14:18:27 chr13 51603768 . T C 209.01 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0201226;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.094;QD=15.2006;RBI=0.0331169;REFB=-0.0142299;REVB=0.0263023;RO=31;SAF=5;SAR=19;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225225;STB=0.629511;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0203185;OID=.;OPOS=51603768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:19:5:12:19:19:5:12:19 chr13 52440130 . A G 452.11 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00118706;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.124;QD=58.3361;RBI=0.0216437;REFB=0;REVB=0.0216111;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382941;OID=.;OPOS=52440130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr13 52548140 . A C 347.68 PASS AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0160863;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5637;QD=14.3373;RBI=0.0309212;REFB=-0.0084324;REVB=0.0264074;RO=53;SAF=21;SAR=17;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00568804;STB=0.526991;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0271806;OID=.;OPOS=52548140;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:59:38:38:0.391753:17:21:29:24:17:21:30:29 chr13 52603194 . G T 756.78 PASS AF=0.614035;AO=70;DP=114;FAO=70;FDP=114;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0152328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.703;QD=26.5535;RBI=0.0154929;REFB=-0.00115386;REVB=0.00282723;RO=43;SAF=36;SAR=34;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833164;STB=0.540529;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000882879;OID=.;OPOS=52603194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:43:44:70:70:0.614035:34:36:17:26:34:36:18:26 chr13 52603775 . C T 129.01 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0144775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.089;QD=21.5019;RBI=0.019655;REFB=-0.0297926;REVB=-0.0132936;RO=10;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197756;STB=0.611608;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0133459;OID=.;OPOS=52603775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:8:6:7:3:8:6:7:3 chr13 52605675 . A G 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.027049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.958;QD=10.0334;RBI=0.0307985;REFB=-0.0400805;REVB=0.0147276;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231237;STB=0.676751;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0545953;OID=.;OPOS=52605675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:6:7:5:5:0.416667:3:2:4:2:3:2:5:2 chr13 52607169 . T C 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0227957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7571;QD=12.1822;RBI=0.0253846;REFB=-0.00230675;REVB=0.0111684;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308755;STB=0.679686;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00348465;OID=.;OPOS=52607169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:3:12:5:5:3:12 chr13 52730298 . A G 171.23 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0353382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.897;QD=12.4533;RBI=0.0405864;REFB=0.00171567;REVB=0.0199616;RO=34;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169522;STB=0.597846;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00531631;OID=.;OPOS=52730298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:9:12:14:20:9:12:14:20 chr13 52971893 . G A 306.53 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0129253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3095;QD=27.2466;RBI=0.0625847;REFB=-0.0160864;REVB=0.0612354;RO=18;SAF=14;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133708;STB=0.573717;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0127964;OID=.;OPOS=52971893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:13:14:6:12:13:14:6:12 chr13 53035783 . T C 666.61 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4952;QD=62.0104;RBI=0.03044;REFB=0;REVB=-0.0177833;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000653969;OID=.;OPOS=53035783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:18:24:0:0:18:25:0:0 chr13 53035925 . A G 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.614;QD=58.1406;RBI=0.0763289;REFB=0;REVB=0.00392317;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031932;OID=.;OPOS=53035925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0 chr13 53050479 . G A 333.99 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0258495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.331;QD=14.2124;RBI=0.0277986;REFB=-0.0170882;REVB=-0.0102258;RO=56;SAF=20;SAR=17;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430765;STB=0.529938;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0213649;OID=.;OPOS=53050479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:57:37:37:0.393617:17:20:28:28:17:20:28:29 chr13 53608632 . C A,T 793.97 PASS AF=0.0172414,0.965517;AO=4,53;DP=58;FAO=1,56;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=0,26;FSAR=1,30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.11591,-0.046993;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.9747,154.29;QD=54.7563;RBI=0.120388,0.0486161;REFB=-0.0465601,-0.0309756;REVB=-0.0325308,-0.0124572;RO=1;SAF=2,24;SAR=2,29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.166656,-0.0192259;STB=0.989913,0.509431;STBP=0.496,0.317;TYPE=snp,snp;VARB=0.00247513,0.00281187;OID=.,.;OPOS=53608632,53608632;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:58:58:1:1:4,53:1,56:0.0172414,0.965517:2,29:2,24:1:0:1,30:0,26:1:0 chr13 55748673 . T C 1996.33 PASS AF=1;AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140476;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.302;QD=62.3853;RBI=0.107388;REFB=0;REVB=0.106465;RO=0;SAF=62;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634532;OID=.;OPOS=55748673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:128:0:0:128:128:1:66:62:0:0:66:62:0:0 chr13 58458579 . C T 4238.97 PASS AF=0.992701;AO=271;DP=275;FAO=272;FDP=274;FR=.;FRO=2;FSAF=136;FSAR=136;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0462568;FXX=0.00724611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.768;QD=61.8827;RBI=0.0475465;REFB=-0.0829231;REVB=0.010999;RO=2;SAF=136;SAR=135;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.57925e-05;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000479669;OID=.;OPOS=58458579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:275:274:2:2:271:272:0.992701:135:136:1:1:136:136:1:1 chr13 60324979 . G A 391.57 PASS AF=0.370079;AO=45;DP=122;FAO=47;FDP=127;FR=.;FRO=80;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.0431915;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3067;QD=12.3331;RBI=0.0448923;REFB=-0.0177626;REVB=0.0122398;RO=77;SAF=25;SAR=20;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257621;STB=0.511451;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0303571;OID=.;OPOS=60324979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:127:77:80:45:47:0.370079:20:25:41:36:22:25:44:36 chr13 60385058 . C CTAT 34.78 PASS AF=0.153846;AO=5;DP=42;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0160416;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=3;MLLD=201.189;QD=3.56715;RBI=0.0513774;REFB=0.000254903;REVB=-0.0488088;RO=37;SAF=3;SAR=2;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159903;STB=0.538334;STBP=0.859;TYPE=ins;VARB=-0.00178836;OID=.;OPOS=60385059;OREF=-;OALT=TAT;OMAPALT=CTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.153846:5:42:6:39:33:3:3:15:18:34:37:3:2:17:20 chr13 60557958 . C T 357.63 PASS AF=0.354839;AO=44;DP=124;FAO=44;FDP=124;FR=.;FRO=80;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=0.00802063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.433;QD=11.5365;RBI=0.0223313;REFB=-0.0124431;REVB=-0.0208413;RO=80;SAF=18;SAR=26;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252796;STB=0.514475;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0177069;OID=.;OPOS=60557958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:80:80:44:44:0.354839:26:18:31:49:26:18:31:49 chr13 61986918 . C A 727.78 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4986;QD=63.285;RBI=0.089542;REFB=0;REVB=-0.0884902;RO=0;SAF=33;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00094111;OID=.;OPOS=61986918;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:13:33:0:0:13:33:0:0 chr13 61989175 . G T 669.52 PASS AF=0.445122;AO=73;DP=164;FAO=73;FDP=164;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=41;FWDB=0.00602704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.402;QD=16.3298;RBI=0.0310462;REFB=-0.0229241;REVB=-0.0304555;RO=90;SAF=46;SAR=27;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887304;STB=0.54684;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0307929;OID=.;OPOS=61989175;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:90:91:73:73:0.445122:27:46:49:41:27:46:50:41 chr13 64320999 . TG CA 93.29 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00327399;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=149.126;QD=19.6409;RBI=0.0208312;REFB=-0.0237269;REVB=-0.0205723;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28385;STB=0.651838;STBP=0.289;TYPE=mnp;VARB=0.0238437;OID=.;OPOS=64320999;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:19:19:7:8:11:11:0.578947:10:1:2:5:10:1:2:6 chr13 64321002 . T C 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00843413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.173;QD=19.646;RBI=0.0224967;REFB=-0.0271278;REVB=-0.0208558;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258419;STB=0.651838;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0491796;OID=.;OPOS=64321002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:10:1:2:6:10:1:2:6 chr13 64321010 . A G 77.45 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0758088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.943;QD=13.4688;RBI=0.090892;REFB=-0.1812;REVB=-0.0501436;RO=13;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253839;STB=0.654173;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0452829;OID=.;OPOS=64321010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:9:1:3:10:9:1:3:10 chr13 64415161 . T TG 35.93 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.127111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6062;QD=6.84444;RBI=0.12754;REFB=-0.124057;REVB=0.0104561;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46896;STB=0.531844;STBP=0.772;TYPE=ins;VARB=0.172694;OID=.;OPOS=64415162;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:6:20:9:21:12:4:5:6:6:35:14:1:5:8:6 chr13 67800935 . G A 469.23 PASS AF=0.459459;AO=50;DP=110;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00445628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.653;QD=16.9092;RBI=0.005544;REFB=-0.00906346;REVB=-0.0032981;RO=58;SAF=26;SAR=24;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855998;STB=0.551777;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0071632;OID=.;OPOS=67800935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:58:60:50:51:0.459459:24:26:25:33:24:27:26:34 chr13 67802339 . A T 2373.67 PASS AF=0.993333;AO=148;DP=149;FAO=149;FDP=150;FR=.;FRO=1;FSAF=89;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00955698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=322.317;QD=63.298;RBI=0.0107732;REFB=-0.0578305;REVB=0.00497243;RO=1;SAF=89;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799284;STB=0.504132;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-2.31729e-05;OID=.;OPOS=67802339;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:149:150:1:1:148:149:0.993333:59:89:0:1:60:89:0:1 chr13 69267981 . T C 208.77 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00123425;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.685;QD=18.1542;RBI=0.0303423;REFB=-0.0221345;REVB=-0.0303172;RO=25;SAF=14;SAR=7;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587971;STB=0.533302;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0272436;OID=.;OPOS=69267981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:7:14:18:7:7:14:18:7 chr13 70681598 . T C 497.11 PASS AF=0.559524;AO=47;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0191233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6055;QD=23.6721;RBI=0.0210768;REFB=-0.0269913;REVB=-0.00886178;RO=36;SAF=22;SAR=25;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00328259;STB=0.508127;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0173048;OID=.;OPOS=70681598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:37:47:47:0.559524:25:22:17:19:25:22:18:19 chr13 71033601 . T C 82.32 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00438919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.719;QD=19.3687;RBI=0.0201556;REFB=-0.0107477;REVB=0.0196719;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103689;STB=0.559875;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0188642;OID=.;OPOS=71033601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:3:7:4:3:3:7:4:3 chr13 73280182 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.099;QD=56.1915;RBI=0.0275345;REFB=0;REVB=0.0120465;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227101;OID=.;OPOS=73280182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr13 73301655 . A C 727.07 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000311479;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=347.034;QD=57.0253;RBI=0.00762475;REFB=0;REVB=0.00761839;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13887e-05;OID=.;OPOS=73301655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0 chr13 73301728 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.725;QD=45.8068;RBI=0.0234639;REFB=0;REVB=0.0151605;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.22219e-05;OID=.;OPOS=73301728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0 chr13 73329358 . G A 156.99 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0769114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.593;QD=16.1017;RBI=0.0769956;REFB=-0.0336227;REVB=-0.00360008;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131602;STB=0.575668;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0286728;OID=.;OPOS=73329358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:10:7:12:10:10:7:12:10 chr13 73343039 . C T 222.85 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0146193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.37;QD=18.9661;RBI=0.0274039;REFB=-0.0268346;REVB=-0.0231786;RO=24;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118415;STB=0.576854;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0314361;OID=.;OPOS=73343039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:25:22:22:0.468085:10:12:10:14:10:12:10:15 chr13 73350079 . T C 693.39 PASS AF=0.489362;AO=69;DP=141;FAO=69;FDP=141;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.0169055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6588;QD=19.6708;RBI=0.0170024;REFB=-0.0249991;REVB=-0.00181182;RO=72;SAF=31;SAR=38;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110881;STB=0.561213;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0206061;OID=.;OPOS=73350079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:72:72:69:69:0.489362:38:31:41:31:38:31:41:31 chr13 73650112 . C A 497.3 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.349;QD=58.5059;RBI=0.0353929;REFB=0;REVB=0.0321671;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88413e-05;OID=.;OPOS=73650112;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:12:19:0:0:14:20:0:0 chr13 73650117 . G A 571.21 PASS AF=1;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.505;QD=60.1278;RBI=0.0197642;REFB=0;REVB=0.0164215;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.23637e-05;OID=.;OPOS=73650117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:36:38:1:15:21:0:0:15:23:0:0 chr13 74518210 . G A 109.92 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0440698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.762;QD=14.6563;RBI=0.0830112;REFB=-0.033494;REVB=-0.0703471;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112273;STB=0.56561;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0455315;OID=.;OPOS=74518210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:9:4:7:10:9:4:7:10 chr13 74863339 . C A 306.58 PASS AF=0.6;AO=26;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0148115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.989;QD=27.2517;RBI=0.0163574;REFB=-0.0430401;REVB=-0.00694131;RO=18;SAF=8;SAR=18;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262578;STB=0.50894;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0202994;OID=.;OPOS=74863339;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:26:27:0.6:18:8:5:13:19:8:5:13 chr13 74988714 . C T 1594.26 PASS AF=0.442408;AO=169;DP=383;FAO=169;FDP=382;FR=.;FRO=213;FSAF=88;FSAR=81;FSRF=111;FSRR=102;FWDB=-0.0186036;FXX=0.0026109;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.405;QD=16.6938;RBI=0.0385734;REFB=-0.0326636;REVB=-0.0337907;RO=202;SAF=88;SAR=81;SRF=111;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284776;STB=0.500233;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0450487;OID=.;OPOS=74988714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:382:202:213:169:169:0.442408:81:88:111:91:81:88:111:102 chr13 75814017 . C CT 115.48 PASS AF=1;AO=3;DP=27;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499841;FXX=0.370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.856;QD=27.1727;RBI=0.0559874;REFB=0;REVB=-0.0252224;RO=24;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.647813;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00492805;OID=.;OPOS=75814018;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:27:17:17:0:2:15:0:0:3:24:3:0:8:16 chr13 75814018 . C T 347.63 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000567451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.172;QD=51.5011;RBI=0.012148;REFB=-0.0572915;REVB=0.0121348;RO=1;SAF=10;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441872;STB=0.523791;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00233164;OID=.;OPOS=75814018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:16:10:1:0:16:10:1:0 chr13 75814285 . T C 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00877071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.531;QD=16.8983;RBI=0.0462375;REFB=0.00515294;REVB=0.045398;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130908;STB=0.576311;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.0045021;OID=.;OPOS=75814285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:5:4:3:7:5:4 chr13 75814384 . C T 289.72 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.025332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.867;QD=18.9978;RBI=0.0347889;REFB=-0.0068731;REVB=-0.0238445;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763654;STB=0.542492;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00549137;OID=.;OPOS=75814384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:14:17:19:11:14:17:19:11 chr13 75884216 . C T 1277.46 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379185;FXX=0.0459717;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.161;QD=61.5645;RBI=0.0417305;REFB=0;REVB=-0.0174248;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153052;OID=.;OPOS=75884216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:50:31:0:0:51:32:0:0 chr13 75936519 . C G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022877;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.937;QD=57.2025;RBI=0.0269312;REFB=0;REVB=0.0142103;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.62574e-05;OID=.;OPOS=75936519;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0 chr13 76055602 . G A 643.76 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00441738;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.204;QD=59.8843;RBI=0.0249665;REFB=-0.0170347;REVB=0.0245726;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00117315;OID=.;OPOS=76055602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:25:17:0:1:25:17:0:1 chr13 76124151 . C T 1568.42 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7988;QD=64.0169;RBI=0.0776565;REFB=0;REVB=-0.0745132;RO=0;SAF=42;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000351863;OID=.;OPOS=76124151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:56:42:0:0:56:42:0:0 chr13 76378459 . T C 2242.85 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209833;FXX=0.0132442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.799;QD=60.2107;RBI=0.0332883;REFB=-0.0938533;REVB=0.0258421;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.503597;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-4.39966e-05;OID=.;OPOS=76378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:150:149:0:1:148:148:0.993289:79:69:0:0:79:69:1:0 chr13 76709108 . G A 788.57 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313016;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.654;QD=57.3509;RBI=0.0424125;REFB=0;REVB=0.0286187;RO=0;SAF=42;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70796e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.52692e-05;OID=.;OPOS=76709108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:13:42:0:0:13:42:0:0 chr13 76709223 . C A 2147.89 PASS AF=0.985714;AO=91;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=89;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00269823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4921;QD=61.3682;RBI=0.0490032;REFB=0.0138461;REVB=0.0489289;RO=0;SAF=88;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.94432e-08;STB=0.509999;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.000155383;OID=.;OPOS=76709223;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:140:140:0:2:91:138:0.985714:3:88:0:0:49:89:0:2 chr13 77522725 . GACTT G 1269.21 PASS AF=0.92;AO=91;DP=97;FAO=92;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00599916;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=4;MLLD=270.618;QD=50.7685;RBI=0.0140054;REFB=-0.0186213;REVB=0.0126555;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.527601;STBP=0.063;TYPE=del;VARB=0.00288482;OID=.;OPOS=77522726;OREF=ACTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.92:91:97:92:100:8:49:43:7:1:28:0:49:42:0:0 chr13 77574983 . A G 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0113155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.034;QD=16.7316;RBI=0.018387;REFB=-0.00238923;REVB=-0.0144927;RO=36;SAF=10;SAR=21;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116984;STB=0.506575;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00252245;OID=.;OPOS=77574983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:21:10:12:24:21:10:12:24 chr13 77632470 . C T 1006.75 PASS AF=0.644444;AO=86;DP=134;FAO=87;FDP=135;FR=.;FRO=48;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00401426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.43;QD=29.8295;RBI=0.0125953;REFB=-0.00481754;REVB=-0.0119385;RO=47;SAF=45;SAR=41;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777739;STB=0.54308;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00191033;OID=.;OPOS=77632470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:47:48:86:87:0.644444:41:45:19:28:42:45:19:29 chr13 77751892 . C T 1425.41 PASS AF=0.978723;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00377647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.622;QD=60.6557;RBI=0.0173437;REFB=0.0719207;REVB=0.0169276;RO=1;SAF=59;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00796745;STB=0.508195;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=2.65213e-05;OID=.;OPOS=77751892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:93:94:1:2:91:92:0.978723:32:59:1:0:32:60:2:0 chr13 78146301 . C T 1396.34 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8666;QD=62.7567;RBI=0.0644219;REFB=0;REVB=-0.0350719;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126065;OID=.;OPOS=78146301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0 chr13 78178550 . G A 148.07 PASS AF=0.31746;AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0533724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7939;QD=9.40122;RBI=0.054012;REFB=0.0121315;REVB=-0.00828801;RO=43;SAF=7;SAR=13;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164573;STB=0.597601;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.0258533;OID=.;OPOS=78178550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:43:20:20:0.31746:13:7:21:22:13:7:21:22 chr13 78338016 . A G 190.75 PASS AF=0.3125;AO=25;DP=80;FAO=25;FDP=80;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00016739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.461;QD=9.53746;RBI=0.00518993;REFB=-0.00678505;REVB=0.00518723;RO=55;SAF=11;SAR=14;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431038;STB=0.502536;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.013541;OID=.;OPOS=78338016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:55:55:25:25:0.3125:14:11:24:31:14:11:24:31 chr13 78477674 . A G 955.14 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.604;QD=58.7776;RBI=0.0378128;REFB=0;REVB=-0.0354431;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.22062e-05;OID=.;OPOS=78477674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0 chr13 78521890 . C A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.521;QD=53.2772;RBI=0.0820807;REFB=0;REVB=0.0163287;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000852141;OID=.;OPOS=78521890;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0 chr13 79174091 . T A 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.469;QD=58.6005;RBI=0.0245073;REFB=0;REVB=-0.0166989;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.23334e-06;OID=.;OPOS=79174091;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0 chr13 79188534 . T A 1826.93 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.017;QD=60.3942;RBI=0.0241646;REFB=0;REVB=0.0145058;RO=0;SAF=56;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168437;OID=.;OPOS=79188534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:64:56:0:0:65:56:0:0 chr13 79194750 . TGA T 914.07 PASS AF=1;AO=57;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0065679;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=290.541;QD=58.0359;RBI=0.0271162;REFB=0;REVB=0.0263088;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.94847e-05;OID=.;OPOS=79194751;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:57:62:63:63:0:24:39:0:0:5:0:21:36:0:0 chr13 80910786 . C A 834.18 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1104;QD=57.5298;RBI=0.0515427;REFB=0;REVB=-0.0305762;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000619153;OID=.;OPOS=80910786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0 chr13 80910851 . A C 227.15 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00649747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.813;QD=21.1302;RBI=0.00784656;REFB=-0.00557557;REVB=0.00439903;RO=20;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121974;STB=0.559385;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00462427;OID=.;OPOS=80910851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:21:22:22:0.511628:7:15:11:9:7:15:12:9 chr13 80911525 . G A 210.72 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00119071;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.319;QD=14.0479;RBI=0.00667037;REFB=-0.0101886;REVB=0.00656324;RO=35;SAF=11;SAR=14;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105155;STB=0.559952;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0156574;OID=.;OPOS=80911525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:14:11:19:16:14:11:19:16 chr13 86367009 . C A 1146.73 PASS AF=1;AO=68;DP=71;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00837925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.02;QD=59.5706;RBI=0.0515844;REFB=0;REVB=0.0508993;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37049e-05;OID=.;OPOS=86367009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:77:0:0:68:77:1:38:30:0:0:45:32:0:0 chr13 86367973 . CT C,TC 250.69 PASS AF=1,0;AO=18,4;DP=24;FAO=26,0;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00225349,-0.0224102;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=13.9515,4.4276;QD=38.567;RBI=0.00383881,0.156738;REFB=-0.0375424,-0.0608113;REVB=-0.00310778,-0.155127;RO=1;SAF=8,1;SAR=10,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0539582,-0.272709;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00488725,0;OID=.,.;OPOS=86367974,86367973;OREF=T,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:26:1:0:18,4:26,0:1,0:10,3:8,1:1:0:14,0:12,0:0:0 chr13 86369120 . C T 856.66 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00501965;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.434;QD=58.0783;RBI=0.00910975;REFB=0;REVB=0.00760202;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300241;OID=.;OPOS=86369120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0 chr13 88330998 . T C 452.71 PASS AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.00913615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8475;QD=16.3139;RBI=0.0195236;REFB=-0.0125634;REVB=0.0172541;RO=60;SAF=21;SAR=29;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111355;STB=0.557871;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.029394;OID=.;OPOS=88330998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:60:61:50:50:0.45045:29:21:32:28:29:21:32:29 chr13 88331241 . T TTGTA 266.77 PASS AF=0.814815;AO=22;DP=28;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0156881;FXX=0.0999667;HRUN=2;LEN=4;MLLD=317.332;QD=39.522;RBI=0.0156885;REFB=-0.0216145;REVB=-0.000113098;RO=6;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012889;STB=0.533304;STBP=0.559;TYPE=ins;VARB=0.00208921;OID=.;OPOS=88331242;OREF=-;OALT=TGTA;OMAPALT=TTGTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.814815:22:28:22:27:5:14:8:4:1:29:6:14:8:4:2 chr13 95034749 . G A 221.84 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00453241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4077;QD=18.4863;RBI=0.0207474;REFB=-0.0121986;REVB=-0.0202463;RO=26;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110302;STB=0.562444;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.013887;OID=.;OPOS=95034749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:11:11:10:16:11:11:10:16 chr13 95034763 . G A 253.67 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00233613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.291;QD=22.0584;RBI=0.00546821;REFB=-0.0420145;REVB=0.00494407;RO=22;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110138;STB=0.561745;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.041182;OID=.;OPOS=95034763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:15:9:11:11:15:9:11:11 chr13 95264604 . C T 358.26 PASS AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=42;FWDB=-0.00224391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.32;QD=14.6228;RBI=0.0262121;REFB=-0.0142037;REVB=-0.0261159;RO=59;SAF=23;SAR=16;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312145;STB=0.675701;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0274177;OID=.;OPOS=95264604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:16:23:17:42:16:23:17:42 chr13 95273447 . G A 443.37 PASS AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0104108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1133;QD=20.1533;RBI=0.013059;REFB=-0.0125879;REVB=-0.00788374;RO=42;SAF=19;SAR=25;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679132;STB=0.535053;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0155859;OID=.;OPOS=95273447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:44:44:44:0.5:25:19:15:27:25:19:16:28 chr13 95279505 . T A 72.95 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.024373;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.606;QD=18.2372;RBI=0.0254344;REFB=-0.00930326;REVB=-0.00727078;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33014;STB=0.666296;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00333818;OID=.;OPOS=95279505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:17:16:8:7:9:9:0.5625:6:3:6:2:6:3:5:2 chr13 95280923 . A T 754.51 PASS AF=0.5;AO=77;DP=154;FAO=78;FDP=156;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=0.0636919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2939;QD=19.3463;RBI=0.0665772;REFB=-0.0360346;REVB=-0.0193871;RO=77;SAF=35;SAR=42;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478141;STB=0.52589;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0376132;OID=.;OPOS=95280923;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:156:77:78:77:78:0.5:42:35:31:46:42:36:32:46 chr13 95364046 . C G 631.41 PASS AF=0.492308;AO=64;DP=130;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.0197856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.555;QD=19.4279;RBI=0.0215078;REFB=-0.0252823;REVB=-0.00843304;RO=66;SAF=31;SAR=33;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143636;STB=0.507934;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0267606;OID=.;OPOS=95364046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:66:66:64:64:0.492308:33:31:33:33:33:31:33:33 chr13 95364337 . T G 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0235411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.949;QD=10.0339;RBI=0.0287891;REFB=-0.0240251;REVB=-0.0165719;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090044;STB=0.555348;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.04983;OID=.;OPOS=95364337;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:1:6:4:1:1:6 chr13 95673518 . T C 2518.77 PASS AF=0.988024;AO=164;DP=168;FAO=165;FDP=167;FR=.;FRO=2;FSAF=84;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00443769;FXX=0.00595203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.3;QD=60.3298;RBI=0.00952926;REFB=-0.00900181;REVB=0.00843289;RO=1;SAF=83;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583882;STB=0.506097;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-4.79156e-06;OID=.;OPOS=95673518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:168:167:1:2:164:165:0.988024:81:83:0:1:81:84:0:2 chr13 95673938 . TA T,TG 1338.2 PASS AF=0.224719,0.775281;AO=20,70;DP=90;FAO=20,69;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=9,20;FSAR=11,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471469,0.0335737;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=141.271,158.174;QD=60.144;RBI=0.0537748,0.0416069;REFB=0,0;REVB=0.0258632,0.0245752;RO=0;SAF=9,20;SAR=11,50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.0487e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000254214,-0.000899802;OID=.,.;OPOS=95673939,95673939;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.224719,0.775281:20,70:90:20,69:89:0:9,20:11,49:0:0:99:0:9,20:11,50:0:0 chr13 95714976 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00463745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.77;QD=56.9569;RBI=0.0187582;REFB=0;REVB=0.0181759;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64232e-05;OID=.;OPOS=95714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0 chr13 95726541 . A G 1434.4 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.288;QD=63.0504;RBI=0.0666165;REFB=0;REVB=0.0633499;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76766e-05;OID=.;OPOS=95726541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:39:52:0:0:39:52:0:0 chr13 95727780 . T C 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.057;QD=60.7162;RBI=0.0225296;REFB=0;REVB=-0.0222416;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143905;OID=.;OPOS=95727780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:46:30:0:0:46:30:0:0 chr13 95847194 . A G 269.52 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00677951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.929;QD=18.9134;RBI=0.0158906;REFB=-0.0127603;REVB=0.0143718;RO=28;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119322;STB=0.506662;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0132008;OID=.;OPOS=95847194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:19:10:10:18:19:10:10:18 chr13 95861804 . A G 990.33 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.641;QD=59.1242;RBI=0.0567737;REFB=0;REVB=-0.0133587;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013183;OID=.;OPOS=95861804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr13 96540141 . T C 5419.98 PASS AF=1;AO=340;DP=348;FAO=345;FDP=345;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471517;FXX=0.011461;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1094;QD=62.8403;RBI=0.013601;REFB=-0.0163414;REVB=0.0127576;RO=5;SAF=168;SAR=172;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00845597;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.29319e-05;OID=.;OPOS=96540141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:348:345:5:0:340:345:1:172:168:4:1:174:171:0:0 chr13 96540143 . T C 5433.9 PASS AF=1;AO=343;DP=346;FAO=350;FDP=350;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117925;FXX=0.00849834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.441;QD=62.1017;RBI=0.050535;REFB=-0.082772;REVB=0.0505213;RO=2;SAF=171;SAR=172;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-1.61546e-05;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93834e-05;OID=.;OPOS=96540143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:346:350:2:0:343:350:1:172:171:1:1:175:175:0:0 chr13 96601679 . C T 569.98 PASS AF=0.491667;AO=59;DP=120;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0305761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.802;QD=18.9994;RBI=0.0400547;REFB=-0.0205977;REVB=-0.0258743;RO=60;SAF=24;SAR=35;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864528;STB=0.544026;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0257685;OID=.;OPOS=96601679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:60:61:59:59:0.491667:35:24:30:30:35:24:30:31 chr13 96624836 . A G 175.46 PASS AF=0.392157;AO=18;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0212766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.995;QD=13.7617;RBI=0.0336369;REFB=-0.0230977;REVB=-0.0260528;RO=24;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145804;STB=0.520689;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.028767;OID=.;OPOS=96624836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:31:18:20:0.392157:7:11:15:9:9:11:16:15 chr13 96638636 . A C 1861.96 PASS AF=0.99187;AO=121;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0418269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.456;QD=60.5517;RBI=0.0425167;REFB=-0.0406767;REVB=0.00762752;RO=1;SAF=58;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812005;STB=0.504201;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=8.31677e-05;OID=.;OPOS=96638636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:123:1:1:121:122:0.99187:63:58:1:0:63:59:1:0 chr13 96821982 . G T 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.521;QD=57.1062;RBI=0.0120278;REFB=0;REVB=0.0103405;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38146e-05;OID=.;OPOS=96821982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr13 97639414 . C T 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.254;QD=58.4195;RBI=0.00913957;REFB=0;REVB=0.0086643;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6006e-05;OID=.;OPOS=97639414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0 chr13 98045158 . A G 547.97 PASS AF=0.495652;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.0126422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.652;QD=19.0599;RBI=0.0127369;REFB=-0.0136011;REVB=0.00155051;RO=57;SAF=26;SAR=31;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157759;STB=0.582396;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0066218;OID=.;OPOS=98045158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:58:57:57:0.495652:31:26:36:21:31:26:36:22 chr13 98645253 . A G 347.62 PASS AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0219158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.083;QD=19.8641;RBI=0.0228545;REFB=-0.0172866;REVB=0.00648264;RO=34;SAF=22;SAR=14;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209271;STB=0.511621;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0176008;OID=.;OPOS=98645253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:14:22:20:14:14:22:20:14 chr13 98829176 . T C 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.56;QD=57.2374;RBI=0.0285287;REFB=0;REVB=0.000578114;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90668e-05;OID=.;OPOS=98829176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0 chr13 98896776 . C T 256.83 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0151402;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.637;QD=15.8048;RBI=0.034936;REFB=-0.0108814;REVB=-0.0314849;RO=35;SAF=20;SAR=9;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287013;STB=0.655628;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0222299;OID=.;OPOS=98896776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:35:36:29:29:0.446154:9:20:14:21:9:20:15:21 chr13 99088006 . G A 334.24 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0164334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9357;QD=16.7119;RBI=0.0208765;REFB=-0.0100479;REVB=0.0128752;RO=44;SAF=21;SAR=15;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152113;STB=0.508542;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0153101;OID=.;OPOS=99088006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:15:21:25:19:15:21:25:19 chr13 99088113 . C T 166.01 PASS AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0192582;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9444;QD=9.35291;RBI=0.0256176;REFB=-0.00748856;REVB=-0.0168933;RO=49;SAF=10;SAR=12;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135708;STB=0.580081;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.023584;OID=.;OPOS=99088113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:49:49:22:22:0.309859:12:10:28:21:12:10:28:21 chr13 99100547 . T C 1250.01 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0138425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.865;QD=60.2413;RBI=0.0209936;REFB=0.017645;REVB=-0.0157834;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108864;STB=0.505746;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-4.75441e-05;OID=.;OPOS=99100547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:39:43:1:0:39:43:1:0 chr13 99112680 . C T 310.26 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00763782;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0575;QD=53.9582;RBI=0.0290851;REFB=0;REVB=0.0280643;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000517624;OID=.;OPOS=99112680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr13 99324248 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00150464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3625;QD=35.5749;RBI=0.0881086;REFB=0;REVB=0.0880958;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00730799;OID=.;OPOS=99324248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr13 99324524 . T C 160.53 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.1305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1487;QD=18.3459;RBI=0.131175;REFB=-0.00294945;REVB=0.0132912;RO=18;SAF=2;SAR=15;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427439;STB=0.749642;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.000133833;OID=.;OPOS=99324524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:15:2:8:10:15:2:8:10 chr13 99376181 . C T 219.59 PASS AF=0.375;AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.00997524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.995;QD=12.1992;RBI=0.011505;REFB=0.00232149;REVB=0.00573224;RO=43;SAF=17;SAR=9;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248413;STB=0.540511;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.00285973;OID=.;OPOS=99376181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:43:45:26:27:0.375:9:17:29:14:10:17:31:14 chr13 99447005 . T C 1887.51 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6438;QD=61.3825;RBI=0.0360187;REFB=0;REVB=0.0304344;RO=0;SAF=57;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1996e-05;OID=.;OPOS=99447005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:122:123:1:65:57:0:0:66:57:0:0 chr13 99448441 . T A 728.64 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.207;QD=57.1482;RBI=0.0228387;REFB=0;REVB=0.0192406;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.29888e-06;OID=.;OPOS=99448441;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0 chr13 99853119 . T G 56.29 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.01826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.105;QD=11.2571;RBI=0.0206531;REFB=-0.0316051;REVB=0.00964994;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224141;STB=0.617332;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.032386;OID=.;OPOS=99853119;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:11:12:8:8:0.4:2:6:6:5:2:6:7:5 chr13 99853443 . T G 174.97 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0784252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0931;QD=46.6586;RBI=0.0792519;REFB=0;REVB=-0.0114176;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00234063;OID=.;OPOS=99853443;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:14:1:0:0:14:1:0:0 chr13 99948097 . A G 434.76 PASS AF=0.458333;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.00999496;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.839;QD=18.1151;RBI=0.0108609;REFB=0.00397463;REVB=-0.00424969;RO=52;SAF=26;SAR=18;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162685;STB=0.590868;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00508282;OID=.;OPOS=99948097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:52:52:44:44:0.458333:18:26:22:30:18:26:22:30 chr13 99948178 . C A 268.33 PASS AF=0.517857;AO=26;DP=53;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0458485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.92;QD=19.1665;RBI=0.0476215;REFB=-0.017411;REVB=-0.0128733;RO=27;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840598;STB=0.519986;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00820078;OID=.;OPOS=99948178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:56:27:27:26:29:0.517857:13:13:16:11:13:16:16:11 chr13 100004108 . G A 255.68 PASS AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0169954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.217;QD=29.22;RBI=0.04698;REFB=-0.0127816;REVB=0.0437981;RO=12;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068728;STB=0.537783;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00800226;OID=.;OPOS=100004108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:8:15:9:3:8:15:9:3 chr13 100188585 . A T 233.67 PASS AF=0.578947;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00454072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.534;QD=24.5964;RBI=0.0054527;REFB=-0.0219724;REVB=-0.00301891;RO=15;SAF=7;SAR=15;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667244;STB=0.555503;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0146743;OID=.;OPOS=100188585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:15:16:22:22:0.578947:15:7:6:9:15:7:7:9 chr13 100518580 . A G 1885.65 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5656;QD=61.322;RBI=0.0330529;REFB=0;REVB=-0.0255784;RO=0;SAF=68;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10807e-06;OID=.;OPOS=100518580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:54:68:0:0:55:68:0:0 chr13 100537232 . T C 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.938;QD=59.323;RBI=0.0236455;REFB=0;REVB=0.0137079;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84425e-05;OID=.;OPOS=100537232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:29:39:0:0:29:39:0:0 chr13 100945533 . G A 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.268;QD=62.908;RBI=0.0254899;REFB=0;REVB=-0.0118458;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69702e-05;OID=.;OPOS=100945533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:45:45:0:0:45:45:0:0 chr13 101287340 . C T 298.09 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00105195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.324;QD=20.9183;RBI=0.0170928;REFB=-0.00696599;REVB=-0.0170604;RO=26;SAF=8;SAR=23;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194297;STB=0.608391;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00441015;OID=.;OPOS=101287340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:23:8:12:14:23:8:12:14 chr13 101287365 . T C 810.96 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000381105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.846;QD=56.9095;RBI=0.0137081;REFB=0;REVB=-0.0137028;RO=0;SAF=16;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01924e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.80774e-05;OID=.;OPOS=101287365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:40:16:0:0:40:17:0:0 chr13 101289911 . G A 808.1 PASS AF=0.440415;AO=85;DP=193;FAO=85;FDP=193;FR=.;FRO=108;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.0134435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2657;QD=16.7482;RBI=0.0145047;REFB=-0.0216628;REVB=-0.00544615;RO=108;SAF=32;SAR=53;SRF=55;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136665;STB=0.576141;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.020445;OID=.;OPOS=101289911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:108:108:85:85:0.440415:53:32:55:53:53:32:55:53 chr13 101289969 . C T 325.03 PASS AF=0.373832;AO=39;DP=106;FAO=40;FDP=107;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0331888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.875;QD=12.1508;RBI=0.0355199;REFB=0.0012158;REVB=0.0126559;RO=63;SAF=11;SAR=28;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228647;STB=0.620824;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.0016188;OID=.;OPOS=101289969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:63:67:39:40:0.373832:28:11:30:33:29:11:30:37 chr13 101322622 . G C 257.68 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0449885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.19;QD=19.8216;RBI=0.0503552;REFB=-0.0181319;REVB=0.0226205;RO=25;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743954;STB=0.541454;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0223871;OID=.;OPOS=101322622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:15:12:9:16:15:12:9:16 chr13 101735211 . G A 293.61 PASS AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0106482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.61;QD=19.9055;RBI=0.01421;REFB=-0.00288057;REVB=0.00940954;RO=28;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135385;STB=0.575116;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00218271;OID=.;OPOS=101735211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:16:15:18:10:16:15:18:10 chr13 101736075 . A G 477.1 PASS AF=0.424;AO=50;DP=122;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=29;FWDB=0.0267189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1044;QD=15.2671;RBI=0.080304;REFB=-0.0089607;REVB=-0.0757287;RO=72;SAF=29;SAR=21;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185777;STB=0.503936;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0123046;OID=.;OPOS=101736075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:125:72:72:50:53:0.424:21:29:43:29:21:32:43:29 chr13 101795317 . A C 195.41 PASS AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00197624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.265;QD=10.5625;RBI=0.0186543;REFB=0.00325739;REVB=0.0185493;RO=47;SAF=13;SAR=12;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013405;STB=0.507037;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.0145177;OID=.;OPOS=101795317;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:47:49:25:25:0.337838:12:13:25:22:12:13:26:23 chr13 101795422 . A G 307.24 PASS AF=0.345133;AO=39;DP=113;FAO=39;FDP=113;FR=.;FRO=74;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.00579299;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.54;QD=10.8756;RBI=0.0164968;REFB=-0.0119917;REVB=-0.0154462;RO=74;SAF=15;SAR=24;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102959;STB=0.55941;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0158459;OID=.;OPOS=101795422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:74:74:39:39:0.345133:24:15:35:39:24:15:35:39 chr13 102366825 . A G 309.0 PASS AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=-0.0416804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8859;QD=11.8846;RBI=0.0521133;REFB=-0.00613089;REVB=-0.0312815;RO=66;SAF=18;SAR=20;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229636;STB=0.630566;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00971865;OID=.;OPOS=102366825;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:66:66:38:38:0.365385:20:18:45:21:20:18:45:21 chr13 102431351 . G C 542.63 PASS AF=0.478992;AO=57;DP=120;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=-0.00929931;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.274;QD=18.2398;RBI=0.0316697;REFB=-0.00987989;REVB=-0.0302736;RO=62;SAF=28;SAR=29;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159762;STB=0.588326;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0135828;OID=.;OPOS=102431351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:62:62:57:57:0.478992:29:28:41:21:29:28:41:21 chr13 103346806 . C G 554.71 PASS AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0376577;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=328.215;QD=55.471;RBI=0.0385142;REFB=-0.0796107;REVB=0.00807745;RO=1;SAF=6;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718398;STB=0.530789;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.000250331;OID=.;OPOS=103346806;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:32:6:1:0:32:6:1:1 chr13 103384824 . G A 623.61 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00301826;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.702;QD=59.3918;RBI=0.00375687;REFB=-0.106518;REVB=0.00223701;RO=1;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323316;STB=0.517233;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000434347;OID=.;OPOS=103384824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:42:1:1:41:41:0.97619:14:27:0:1:14:27:0:1 chr13 103385015 . A G 1706.5 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204873;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.14;QD=60.407;RBI=0.0570201;REFB=0;REVB=0.0532124;RO=0;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42654e-05;OID=.;OPOS=103385015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:113:0:0:103:113:1:57:46:0:0:67:46:0:0 chr13 103385299 . A C 1067.87 PASS AF=1;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910634;FXX=0.0273935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.793;QD=60.1614;RBI=0.0132223;REFB=0;REVB=0.0095867;RO=0;SAF=24;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164699;OID=.;OPOS=103385299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:71:0:0:71:71:1:47:24:0:0:47:24:0:0 chr13 103385310 . C T 358.76 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00360336;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.979;QD=19.1341;RBI=0.00603699;REFB=-0.00108135;REVB=-0.00484366;RO=38;SAF=13;SAR=24;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169288;STB=0.509429;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00128094;OID=.;OPOS=103385310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:24:13:14:24:24:13:14:24 chr13 103385798 . T C 837.06 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00360509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.824;QD=55.8042;RBI=0.0198695;REFB=-0.046141;REVB=0.0195397;RO=1;SAF=21;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122567;STB=0.506491;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00394647;OID=.;OPOS=103385798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:38:21:0:1:38:21:0:1 chr13 103386116 . C G 490.1 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0403766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.99;QD=56.0117;RBI=0.042138;REFB=0.0215835;REVB=0.0120559;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514277;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.00100497;OID=.;OPOS=103386116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:17:17:0:0:17:17:0:1 chr13 103386283 . A G 2438.89 PASS AF=1;AO=158;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00332266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.364;QD=61.3557;RBI=0.00468126;REFB=0;REVB=0.00329759;RO=0;SAF=84;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.36278e-08;OID=.;OPOS=103386283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:159:159:0:0:158:159:1:74:84:0:0:74:85:0:0 chr13 103388220 . A G 1148.01 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290683;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.975;QD=60.4218;RBI=0.0290991;REFB=0;REVB=-0.00133679;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.01986e-05;OID=.;OPOS=103388220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:38:36:0:0:38:38:0:0 chr13 103388370 . C T 342.07 PASS AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.037262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5567;QD=12.9082;RBI=0.0378868;REFB=-0.0107851;REVB=0.00685199;RO=64;SAF=30;SAR=11;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285083;STB=0.659259;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0112849;OID=.;OPOS=103388370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:65:41:41:0.386792:11:30:31:33:11:30:32:33 chr13 103391634 . C T 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0206125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6367;QD=14.6493;RBI=0.0314293;REFB=-0.00318163;REVB=0.0237261;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150708;STB=0.588103;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0107484;OID=.;OPOS=103391634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:4:10:11:8:4:10:11:8 chr13 103394003 . G A 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0159578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.688;QD=22.6321;RBI=0.0172732;REFB=0.00460796;REVB=0.00661163;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109699;STB=0.561949;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.0022948;OID=.;OPOS=103394003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:7:6:5:3:7:6:5:3 chr13 103394716 . T C 379.9 PASS AF=0.506494;AO=38;DP=78;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0109235;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.823;QD=19.7352;RBI=0.0494865;REFB=-0.00253476;REVB=0.0482658;RO=37;SAF=32;SAR=6;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283449;STB=0.673366;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00153107;OID=.;OPOS=103394716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:37:38:38:39:0.506494:6:32:23:14:6:33:23:15 chr13 103395819 . C T 1456.08 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262748;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.652;QD=62.627;RBI=0.0040126;REFB=0;REVB=0.00303271;RO=1;SAF=39;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119999;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.52665e-06;OID=.;OPOS=103395819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:1:0:92:93:1:53:39:1:0:53:40:0:0 chr13 103396716 . C G 195.61 PASS AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0132732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.857;QD=12.6202;RBI=0.0138913;REFB=-0.0050414;REVB=0.00409768;RO=38;SAF=19;SAR=5;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466303;STB=0.769321;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0280678;OID=.;OPOS=103396716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:5:19:14:24:5:19:14:24 chr13 103397583 . C G 366.19 PASS AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.00855766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0928;QD=16.2751;RBI=0.00907461;REFB=0.0105004;REVB=0.00301909;RO=51;SAF=20;SAR=19;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365192;STB=0.520537;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.0136505;OID=.;OPOS=103397583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:19:20:28:23:19:20:28:23 chr13 103397937 . T G 192.9 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00986225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.592;QD=23.3816;RBI=0.0107536;REFB=-0.00733977;REVB=0.0042866;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199634;STB=0.51117;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00845077;OID=.;OPOS=103397937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:10:9:7:7:10:9:7:7 chr13 103400083 . G A 211.83 PASS AF=0.321429;AO=27;DP=84;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0113475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9413;QD=10.0873;RBI=0.0136678;REFB=-0.0125924;REVB=-0.00761856;RO=57;SAF=9;SAR=18;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129674;STB=0.576213;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0175595;OID=.;OPOS=103400083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:57:57:27:27:0.321429:18:9:25:32:18:9:25:32 chr13 103400729 . G A 156.23 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0182025;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.365;QD=14.8791;RBI=0.0250082;REFB=-0.00626757;REVB=0.0171488;RO=25;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00969463;STB=0.505611;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00620955;OID=.;OPOS=103400729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:25:25:17:17:0.404762:8:9:13:12:8:9:13:12 chr13 103402522 . C T 432.14 PASS AF=0.453608;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.00126318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.1;QD=17.8202;RBI=0.00608743;REFB=-0.0103501;REVB=-0.00595493;RO=53;SAF=15;SAR=29;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309392;STB=0.672776;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0200932;OID=.;OPOS=103402522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:44:44:0.453608:29:15:35:18:29:15:35:18 chr13 103410782 . T C 136.42 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.036186;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2682;QD=16.5362;RBI=0.0557523;REFB=0.00544782;REVB=0.0424134;RO=17;SAF=2;SAR=13;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420017;STB=0.738258;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.011199;OID=.;OPOS=103410782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:18:15:15:0.454545:13:2:8:9:13:2:8:10 chr13 103410914 . A T 206.63 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0237438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.828;QD=13.1196;RBI=0.0291405;REFB=-0.019067;REVB=-0.0168937;RO=38;SAF=7;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138324;STB=0.579728;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0221851;OID=.;OPOS=103410914;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:18:7:15:23:18:7:15:23 chr13 103420671 . T A,TA 37.41 PASS AF=0,0.333333;AO=2,13;DP=45;FAO=0,15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=0,9;FSAR=0,6;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00311368,0.0660909;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=1,1;MLLD=235.71,8.04715;QD=3.32555;RBI=0.00313873,0.066782;REFB=0.00162541,-0.0104461;REVB=0.00039576,0.0095829;RO=26;SAF=0,9;SAR=2,4;SRF=15;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.512492,0.140134;STB=0.5,0.523334;STBP=1,0.83;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.0845259;OID=.,.;OPOS=103420671,103420672;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:39:45:45:26:30:2,13:0,15:0,0.333333:2,4:0,9:15:11:0,6:0,9:19:11 chr13 103420680 . C A 194.9 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00168166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.999;QD=17.3243;RBI=0.025303;REFB=-0.0152159;REVB=-0.025247;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13024;STB=0.57396;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0155587;OID=.;OPOS=103420680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:17:8:9:11:17:8 chr13 103449202 . T C 705.28 PASS AF=0.483444;AO=73;DP=151;FAO=73;FDP=151;FR=.;FRO=78;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=34;FWDB=0.00427282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.35;QD=18.683;RBI=0.00483653;REFB=-0.00480615;REVB=0.00226607;RO=75;SAF=41;SAR=32;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109214;STB=0.50129;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00570415;OID=.;OPOS=103449202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:75:78:73:73:0.483444:32:41:43:32:32:41:44:34 chr13 103493825 . C G 772.96 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928211;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.077;QD=57.2566;RBI=0.0219488;REFB=0;REVB=0.0198896;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304283;OID=.;OPOS=103493825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr13 103504517 . T C 1716.29 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00336956;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.04;QD=60.7535;RBI=0.0147963;REFB=0;REVB=0.0144075;RO=0;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29304e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95155e-06;OID=.;OPOS=103504517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:54:59:0:0:54:59:0:0 chr13 103511301 . T C 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.678;QD=60.5473;RBI=0.0648675;REFB=0;REVB=0.0141307;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6568e-05;OID=.;OPOS=103511301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0 chr13 103527849 . G C 1137.56 PASS AF=0.9625;AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00118529;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.458;QD=56.8782;RBI=0.00767228;REFB=-0.0171066;REVB=0.00758017;RO=3;SAF=32;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182632;STB=0.509658;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0012293;OID=.;OPOS=103527849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:81:80:3:3:77:77:0.9625:45:32:2:1:45:32:2:1 chr13 103527930 . G C 830.44 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00199816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.951;QD=57.2715;RBI=0.0407146;REFB=0;REVB=0.0406655;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.76164e-05;OID=.;OPOS=103527930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:24:34:0:0 chr13 103528002 . G C 187.41 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0306161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7573;QD=14.6988;RBI=0.0312212;REFB=-0.0117606;REVB=-0.00611746;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902056;STB=0.542332;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0140225;OID=.;OPOS=103528002;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:30:21:21:0.411765:9:12:14:15:9:12:15:15 chr13 103528337 . G A 343.9 PASS AF=0.371681;AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0357938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.764;QD=12.1734;RBI=0.0358329;REFB=-0.00522648;REVB=0.00167401;RO=71;SAF=20;SAR=22;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125886;STB=0.507182;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00779342;OID=.;OPOS=103528337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:71:71:42:42:0.371681:22:20:33:38:22:20:33:38 chr13 103705044 . A C 1268.56 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0273241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.597;QD=60.4075;RBI=0.0402133;REFB=0.111592;REVB=0.0295043;RO=1;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106431;STB=0.505617;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000661522;OID=.;OPOS=103705044;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:44:39:0:1:44:39:0:1 chr13 106119446 . G A 1661.47 PASS AF=0.982456;AO=110;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0823154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8099;QD=58.2971;RBI=0.082741;REFB=0.0236787;REVB=-0.00838181;RO=4;SAF=58;SAR=52;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351216;STB=0.509089;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00898594;OID=.;OPOS=106119446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:114:114:4:2:110:112:0.982456:52:58:0:4:54:58:0:2 chr13 107145463 . G C 2403.02 PASS AF=1;AO=154;DP=154;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.218;QD=61.2235;RBI=0.0575037;REFB=0;REVB=0.00785857;RO=0;SAF=75;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79526e-05;OID=.;OPOS=107145463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:157:0:0:154:157:1:79:75:0:0:79:78:0:0 chr13 108518444 . G A 269.55 PASS AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0290117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.11;QD=14.1868;RBI=0.0304368;REFB=-0.010973;REVB=-0.00920419;RO=45;SAF=12;SAR=19;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108385;STB=0.561699;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0160713;OID=.;OPOS=108518444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:19:12:22:23:19:12:22:23 chr13 109438084 . T A 753.57 PASS AF=0.537313;AO=73;DP=135;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.00740851;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.425;QD=22.4947;RBI=0.00947948;REFB=-0.00879225;REVB=0.00591394;RO=59;SAF=32;SAR=41;SRF=19;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980513;STB=0.543848;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00668669;OID=.;OPOS=109438084;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:59:62:73:72:0.537313:41:32:19:40:41:31:21:41 chr13 109472733 . G A 339.52 PASS AF=0.467532;AO=35;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.064987;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2303;QD=17.6374;RBI=0.0676501;REFB=-0.0019825;REVB=-0.0187943;RO=41;SAF=16;SAR=19;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296197;STB=0.508311;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.002158;OID=.;OPOS=109472733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:35:36:0.467532:19:16:20:21:19:17:20:21 chr13 109496813 . T C 334.2 PASS AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0626642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.644;QD=27.2813;RBI=0.0627208;REFB=-0.0188246;REVB=-0.00266577;RO=20;SAF=4;SAR=25;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302304;STB=0.669505;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00584744;OID=.;OPOS=109496813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:20:20:29:29:0.591837:25:4:8:12:25:4:8:12 chr13 109661359 . C G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00293917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.365;QD=62.9825;RBI=0.00510921;REFB=0;REVB=0.00417915;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50611e-06;OID=.;OPOS=109661359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr13 109717928 . A G 245.95 PASS AF=0.952381;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0190301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.831;QD=46.8466;RBI=0.0438719;REFB=-0.0126297;REVB=0.0395297;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.526289;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00013535;OID=.;OPOS=109717928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:21:0:1:19:20:0.952381:10:9:0:0:11:9:1:0 chr13 109793474 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4766;QD=57.6795;RBI=0.0611859;REFB=0;REVB=-0.0460456;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00187215;OID=.;OPOS=109793474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr13 109793720 . A C 2721.98 PASS AF=0.994318;AO=174;DP=176;FAO=175;FDP=176;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035939;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.126;QD=61.8632;RBI=0.0453257;REFB=-0.0846949;REVB=0.0276189;RO=0;SAF=81;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503067;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000494824;OID=.;OPOS=109793720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:176:176:0:1:174:175:0.994318:93:81:0:0:94:81:1:0 chr13 110408608 . C T 376.5 PASS AF=0.381356;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=118;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.0304138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.067;QD=12.7625;RBI=0.0329314;REFB=-0.0112265;REVB=-0.0126285;RO=72;SAF=22;SAR=23;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120373;STB=0.502636;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0166976;OID=.;OPOS=110408608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:72:73:45:45:0.381356:23:22:36:36:23:22:36:37 chr13 110435953 . A G 51.14 PASS AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0345794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.519;QD=7.8684;RBI=0.0881188;REFB=-0.00212899;REVB=-0.0810505;RO=18;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316254;STB=0.693987;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00346087;OID=.;OPOS=110435953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:26:26:18:18:8:8:0.307692:5:3:12:6:5:3:12:6 chr13 110436232 . G A 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0502176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.379;QD=19.1803;RBI=0.051349;REFB=-0.00255392;REVB=-0.0107196;RO=11;SAF=2;SAR=11;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414958;STB=0.523772;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.000969599;OID=.;OPOS=110436232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:11:2:2:9:11:2:2:9 chr13 110819586 . G A 556.03 PASS AF=0.513514;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00407543;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.12;QD=20.0372;RBI=0.00497283;REFB=-0.0137417;REVB=0.00284955;RO=54;SAF=17;SAR=40;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126497;STB=0.569978;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.01456;OID=.;OPOS=110819586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:54:54:57:57:0.513514:40:17:23:31:40:17:23:31 chr13 110822943 . C T 1689.62 PASS AF=0.472826;AO=174;DP=371;FAO=174;FDP=368;FR=.;FRO=194;FSAF=95;FSAR=79;FSRF=105;FSRR=89;FWDB=0.0227774;FXX=0.00808604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8867;QD=18.3654;RBI=0.0270985;REFB=-0.0099451;REVB=-0.0146805;RO=188;SAF=95;SAR=79;SRF=103;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00180644;STB=0.502519;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0158959;OID=.;OPOS=110822943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:371:368:188:194:174:174:0.472826:79:95:103:85:79:95:105:89 chr13 110827574 . T A 544.51 PASS AF=0.467742;AO=57;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0254398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.69;QD=17.5647;RBI=0.047291;REFB=-0.0265919;REVB=0.0398655;RO=64;SAF=22;SAR=35;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510522;STB=0.525079;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0273016;OID=.;OPOS=110827574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:64:66:57:58:0.467742:35:22:28:36:36:22:28:38 chr13 110827580 . C T 562.35 PASS AF=0.472;AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00744082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.6;QD=17.9951;RBI=0.0265034;REFB=-0.0245049;REVB=-0.0254375;RO=63;SAF=22;SAR=37;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545896;STB=0.520223;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0249873;OID=.;OPOS=110827580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:125:63:66:59:59:0.472:37:22:27:36:37:22:27:39 chr13 110833702 . C T 351.85 PASS AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.00509598;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.443;QD=15.6378;RBI=0.0116762;REFB=0.000386277;REVB=0.0105054;RO=51;SAF=18;SAR=20;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083622;STB=0.540615;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.000307712;OID=.;OPOS=110833702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:51:52:38:38:0.422222:20:18:20:31:20:18:21:31 chr13 110839550 . T G 1740.55 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.453;QD=60.5409;RBI=0.045735;REFB=0;REVB=-0.00052441;RO=0;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113941;OID=.;OPOS=110839550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:107:115:0:0:107:115:1:60:47:0:0:60:55:0:0 chr13 110843985 . T C 919.42 PASS AF=0.955882;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0256678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.262;QD=54.0837;RBI=0.026852;REFB=-0.0127868;REVB=0.00788601;RO=2;SAF=27;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337081;STB=0.526308;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.000103251;OID=.;OPOS=110843985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:68:68:2:3:65:65:0.955882:38:27:2:0:38:27:3:0 chr13 110857823 . C A,T 1190.79 PASS AF=0.0361446,0.939759;AO=3,78;DP=83;FAO=3,78;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=3,41;FSAR=0,37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00686389,0.0102846;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=12.932,153.221;QD=57.3877;RBI=0.0142203,0.0108435;REFB=0.0169045,0.0221995;REVB=0.012454,0.00343632;RO=2;SAF=3,41;SAR=0,37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.692188,0.00121612;STB=0.994603,0.500642;STBP=0.221,0.867;TYPE=snp,snp;VARB=0.12437,-0.00289662;OID=.,.;OPOS=110857823,110857823;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:83:83:2:2:3,78:3,78:0.0361446,0.939759:0,37:3,41:1:1:0,37:3,41:1:1 chr13 110857895 . A G 799.01 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00977382;FXX=0.0344768;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.293;QD=57.0724;RBI=0.0168228;REFB=0;REVB=0.0136923;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00066274;OID=.;OPOS=110857895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr13 110861263 . T A 311.74 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0266178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7756;QD=16.6259;RBI=0.0295446;REFB=-0.0209847;REVB=-0.0128208;RO=40;SAF=15;SAR=19;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903075;STB=0.555971;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0299009;OID=.;OPOS=110861263;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:40:41:34:34:0.453333:19:15:14:26:19:15:14:27 chr13 110861785 . C G 377.36 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00445946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0391;QD=16.2303;RBI=0.00558483;REFB=-0.0352499;REVB=0.00336207;RO=52;SAF=24;SAR=16;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438176;STB=0.51999;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0456066;OID=.;OPOS=110861785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:53:40:40:0.430108:16:24:29:23:16:24:30:23 chr13 110864225 . A T 849.69 PASS AF=0.44898;AO=87;DP=196;FAO=88;FDP=196;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.00683046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.822;QD=17.3406;RBI=0.00895324;REFB=-0.00686564;REVB=0.00578837;RO=108;SAF=45;SAR=42;SRF=55;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00796314;STB=0.50743;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00889083;OID=.;OPOS=110864225;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:108:108:87:88:0.44898:42:45:55:53:42:46:55:53 chr13 111077197 . G A 2322.92 PASS AF=0.951807;AO=157;DP=170;FAO=158;FDP=166;FR=.;FRO=8;FSAF=72;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.000696437;FXX=0.0292381;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.675;QD=55.9741;RBI=0.0260817;REFB=-0.100492;REVB=0.0260724;RO=3;SAF=72;SAR=85;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00449999;STB=0.516107;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00401623;OID=.;OPOS=111077197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:170:166:3:8:157:158:0.951807:85:72:1:2:86:72:1:7 chr13 111090909 . T C 285.99 PASS AF=0.492063;AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00488722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5128;QD=18.1581;RBI=0.0276166;REFB=-0.00495845;REVB=-0.0271808;RO=32;SAF=22;SAR=8;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150465;STB=0.589682;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00569759;OID=.;OPOS=111090909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:32:32:30:31:0.492063:8:22:19:13:8:23:19:13 chr13 111090924 . G A 303.75 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00285688;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.612;QD=16.8751;RBI=0.0310036;REFB=-0.0163208;REVB=0.0308717;RO=37;SAF=21;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120317;STB=0.583282;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00683242;OID=.;OPOS=111090924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:39:33:33:0.458333:12:21:19:18:12:21:19:20 chr13 111098226 . C T 373.27 PASS AF=0.550725;AO=37;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00369344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.127;QD=21.6388;RBI=0.00371427;REFB=-0.0295322;REVB=0.000392798;RO=32;SAF=20;SAR=17;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138099;STB=0.562277;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0149327;OID=.;OPOS=111098226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:31:37:38:0.550725:17:20:12:20:18:20:12:19 chr13 111109157 . G A 467.7 PASS AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0159865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.51;QD=22.8146;RBI=0.0458317;REFB=-0.034918;REVB=0.0429532;RO=37;SAF=16;SAR=29;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439175;STB=0.524187;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0327906;OID=.;OPOS=111109157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:29:16:15:22:29:16:15:22 chr13 111109618 . G C 99.5 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.000296237;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2832;QD=13.7246;RBI=0.044398;REFB=-0.0331261;REVB=0.044397;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226981;STB=0.632553;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0486997;OID=.;OPOS=111109618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:11:6:7:5:11:6 chr13 111109670 . A C 270.61 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.02242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.737;QD=14.4325;RBI=0.0236754;REFB=-0.0198719;REVB=-0.0076071;RO=43;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095286;STB=0.560999;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0289705;OID=.;OPOS=111109670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:44:31:31:0.413333:18:13:22:21:18:13:23:21 chr13 111109859 . A G 266.3 PASS AF=0.336842;AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.00737452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6484;QD=11.2124;RBI=0.0169503;REFB=-0.00454478;REVB=0.0152621;RO=63;SAF=12;SAR=20;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32467;STB=0.686912;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00295135;OID=.;OPOS=111109859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:63:63:32:32:0.336842:20:12:42:21:20:12:42:21 chr13 111111173 . G A 446.81 PASS AF=0.457944;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0019583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.864;QD=16.7031;RBI=0.0136678;REFB=-0.00423522;REVB=0.0135268;RO=56;SAF=29;SAR=20;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892647;STB=0.550541;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00487733;OID=.;OPOS=111111173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:56:58:49:49:0.457944:20:29:28:28:20:29:29:29 chr13 111111235 . G A 398.03 PASS AF=0.460674;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00670883;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.925;QD=17.8888;RBI=0.00991653;REFB=-0.0262006;REVB=0.00730268;RO=49;SAF=21;SAR=20;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00193759;STB=0.506576;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0217594;OID=.;OPOS=111111235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:49:48:41:41:0.460674:20:21:25:24:20:21:24:24 chr13 111119396 . G C 262.75 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0180456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.423;QD=15.0143;RBI=0.0189853;REFB=-0.0174747;REVB=-0.00589894;RO=39;SAF=17;SAR=13;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230055;STB=0.635427;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0315704;OID=.;OPOS=111119396;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:40:30:30:0.428571:13:17:13:26:13:17:13:27 chr13 111134858 . T C 138.14 PASS AF=0.285714;AO=19;DP=69;FAO=20;FDP=70;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.001387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.478;QD=7.89352;RBI=0.00599812;REFB=-0.0105198;REVB=-0.00583555;RO=50;SAF=13;SAR=6;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595416;STB=0.507805;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0278483;OID=.;OPOS=111134858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:50:50:19:20:0.285714:6:13:32:18:7:13:32:18 chr13 111134924 . C T 305.3 PASS AF=0.358491;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=68;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=0.00305582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.387;QD=11.5206;RBI=0.0515424;REFB=-0.00181092;REVB=-0.0514518;RO=48;SAF=12;SAR=26;SRF=40;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48311;STB=0.675907;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0046144;OID=.;OPOS=111134924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:48:68:38:38:0.358491:26:12:40:8:26:12:40:28 chr13 111154058 . T A 772.98 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0237889;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4246;QD=55.2125;RBI=0.0399193;REFB=-0.00764625;REVB=-0.0320568;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.506664;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.000313589;OID=.;OPOS=111154058;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:56:0:1:55:55:0.982143:18:37:0:0:18:37:1:0 chr13 111154061 . T C 817.66 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8872;QD=57.3794;RBI=0.0317081;REFB=0;REVB=0.00713328;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143907;OID=.;OPOS=111154061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0 chr13 111155773 . T C 912.13 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0038423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.429;QD=57.9127;RBI=0.0210975;REFB=0;REVB=0.0207447;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67904e-05;OID=.;OPOS=111155773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:31:31:0:0:32:31:0:0 chr13 111156499 . C T 2021.59 PASS AF=0.931973;AO=132;DP=142;FAO=137;FDP=147;FR=.;FRO=10;FSAF=64;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0842926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8126;QD=55.0093;RBI=0.0846446;REFB=-0.0126628;REVB=0.00771137;RO=10;SAF=60;SAR=72;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615775;STB=0.532047;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.015004;OID=.;OPOS=111156499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:142:147:10:10:132:137:0.931973:72:60:0:10:73:64:0:10 chr13 111158874 . A G 122.32 PASS AF=0.293103;AO=16;DP=56;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0144297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9045;QD=8.43607;RBI=0.030139;REFB=0.000826597;REVB=-0.0264603;RO=40;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295439;STB=0.505086;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=-0.00526977;OID=.;OPOS=111158874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:40:41:16:17:0.293103:8:8:21:19:8:9:22:19 chr13 111160304 . G A 180.08 PASS AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0199012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.484;QD=11.0821;RBI=0.0228682;REFB=-0.014836;REVB=0.0112648;RO=42;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174225;STB=0.601569;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0252766;OID=.;OPOS=111160304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:8:15:21:21:8:15:21:21 chr13 111176393 . A G 713.29 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317355;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.872;QD=55.9446;RBI=0.0369382;REFB=0;REVB=-0.0189021;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276821;OID=.;OPOS=111176393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:49:51:1:27:22:0:0:29:22:0:0 chr13 111298392 . A G 371.06 PASS AF=0.569231;AO=32;DP=63;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0102498;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.263;QD=22.8344;RBI=0.0114405;REFB=-0.0239976;REVB=0.00508203;RO=20;SAF=15;SAR=17;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161023;STB=0.575063;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0153813;OID=.;OPOS=111298392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:65:20:28:32:37:0.569231:17:15:14:6:21:16:17:11 chr13 111315405 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0248818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9867;QD=11.0188;RBI=0.0250453;REFB=-0.0318271;REVB=-0.00285744;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12327;STB=0.576643;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0429476;OID=.;OPOS=111315405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:6:2:1:5:6:2 chr13 111319754 . T C 308.35 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0114458;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.673;QD=15.8127;RBI=0.0220181;REFB=-0.000744075;REVB=-0.0188093;RO=44;SAF=21;SAR=13;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977302;STB=0.555177;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00120161;OID=.;OPOS=111319754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:13:21:23:21:13:21:23:21 chr13 111340342 . G A 165.05 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.000209814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9665;QD=14.0471;RBI=0.0123696;REFB=6.60838e-06;REVB=0.0123678;RO=29;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136399;STB=0.507928;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.000110787;OID=.;OPOS=111340342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:12:6:10:19:12:6:10:19 chr13 111350281 . C T 37.38 PASS AF=0.352941;AO=7;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0184719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2572;QD=8.79507;RBI=0.0694386;REFB=-0.00543723;REVB=0.0669366;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108508;STB=0.605667;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0263703;OID=.;OPOS=111350281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:10:11:7:6:0.352941:5:2:2:8:5:1:3:8 chr13 111365104 . A G 1182.52 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00623519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.6;QD=60.642;RBI=0.018892;REFB=0;REVB=0.0178334;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106708;OID=.;OPOS=111365104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:78:0:0:76:78:1:33:43:0:0:35:43:0:0 chr13 111372392 . T A 87.9 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.633;QD=39.0665;RBI=0.0759724;REFB=0;REVB=0.0705467;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143405;OID=.;OPOS=111372392;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:4:4:0:0:5:4:0:0 chr13 111531885 . C A 1101.27 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.995;QD=59.5283;RBI=0.0352204;REFB=0;REVB=-0.00145837;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67552e-05;OID=.;OPOS=111531885;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:74:0:0:68:74:1:37:31:0:0:42:32:0:0 chr13 111806245 . A G 286.79 PASS AF=0.675676;AO=25;DP=37;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0567241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.546;QD=31.0046;RBI=0.0591554;REFB=-0.0338159;REVB=0.0167852;RO=12;SAF=13;SAR=12;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087154;STB=0.547788;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0160531;OID=.;OPOS=111806245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:37:12:12:25:25:0.675676:12:13:8:4:12:13:8:4 chr13 111870037 . T C 114.81 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00488795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.163;QD=10.6799;RBI=0.0491166;REFB=-0.0188002;REVB=0.0488728;RO=28;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289759;STB=0.664092;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0590071;OID=.;OPOS=111870037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:29:14:14:0.325581:10:4:15:13:10:4:15:14 chr13 111980537 . C T 561.63 PASS AF=0.468254;AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.00527538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.041;QD=17.8295;RBI=0.00815569;REFB=-0.00872339;REVB=0.00621978;RO=66;SAF=31;SAR=28;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529915;STB=0.525415;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.012676;OID=.;OPOS=111980537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:66:67:59:59:0.468254:28:31:31:35:28:31:32:35 chr13 112278350 . G A 544.77 PASS AF=0.478992;AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0258276;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.279;QD=18.3117;RBI=0.0292734;REFB=-0.0384925;REVB=0.0137791;RO=58;SAF=27;SAR=30;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00747288;STB=0.503105;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.040347;OID=.;OPOS=112278350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:119:58:62:57:57:0.478992:30:27:27:31:30:27:29:33 chr13 112725172 . C A 74.53 PASS AF=0.333333;AO=5;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=17.9273;QD=9.93719;RBI=0.236474;REFB=-0.0353334;REVB=0.236474;RO=8;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.05587;OID=.;OPOS=112725172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:30:30:8:12:5:10:0.333333:5:0:0:8:10:0:0:12 chr13 112725791 . G A 197.47 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0667361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0956;QD=18.8062;RBI=0.0794131;REFB=-0.00372417;REVB=-0.0430435;RO=22;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839961;STB=0.547572;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0102546;OID=.;OPOS=112725791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:10:10:9:13:10:10:9:13 chr13 113153217 . C A 342.15 PASS AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.00864065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.115;QD=12.9113;RBI=0.00874311;REFB=0.00119155;REVB=-0.00133464;RO=64;SAF=19;SAR=22;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225636;STB=0.508314;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00105667;OID=.;OPOS=113153217;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:65:41:41:0.386792:22:19:31:33:22:19:31:34 chr13 113153271 . G A 411.27 PASS AF=0.466667;AO=36;DP=84;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0137249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=340.121;QD=18.2785;RBI=0.0297588;REFB=-0.0106315;REVB=0.0264048;RO=48;SAF=13;SAR=23;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18623;STB=0.573604;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0122907;OID=.;OPOS=113153271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:90:48:48:36:42:0.466667:23:13:26:22:25:17:26:22 chr13 113479820 . A G 1374.57 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00889486;FXX=0.0326052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5062;QD=61.7785;RBI=0.0100068;REFB=-0.141401;REVB=0.00458439;RO=1;SAF=33;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141424;STB=0.507461;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00148358;OID=.;OPOS=113479820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:91:89:1:1:88:88:0.988764:55:33:1:0:55:33:1:0 chr13 113508839 . G C 538.34 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0676;QD=59.8158;RBI=0.02432;REFB=0;REVB=0.0133244;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326732;OID=.;OPOS=113508839;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0 chr13 113527967 . G A 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0156164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1668;QD=16.1558;RBI=0.0323454;REFB=-0.00679192;REVB=0.0283259;RO=31;SAF=17;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080499;STB=0.53823;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0096869;OID=.;OPOS=113527967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:32:27:27:0.457627:10:17:17:14:10:17:18:14 chr13 113534907 . T C 695.23 PASS AF=0.443787;AO=75;DP=170;FAO=75;FDP=169;FR=.;FRO=94;FSAF=28;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=67;FWDB=-0.0094723;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.387;QD=16.4552;RBI=0.0350705;REFB=-0.0256974;REVB=-0.0337671;RO=92;SAF=28;SAR=47;SRF=27;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868905;STB=0.552522;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0264363;OID=.;OPOS=113534907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:92:94:75:75:0.443787:47:28:27:65:47:28:27:67 chr13 113536132 . T C 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0324502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.033;QD=16.2711;RBI=0.0765693;REFB=-0.0120582;REVB=-0.0693531;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043351;STB=0.524966;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0185468;OID=.;OPOS=113536132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:8:10:9:6:8:10 chr13 113540649 . G T 284.66 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0026386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.735;QD=17.791;RBI=0.00886035;REFB=-0.0135916;REVB=-0.00845834;RO=33;SAF=21;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240536;STB=0.634947;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0169303;OID=.;OPOS=113540649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:10:21:14:19:10:21:14:19 chr13 113656216 . C T 780.08 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.095;QD=63.6799;RBI=0.0271883;REFB=0;REVB=-0.018483;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5307e-06;OID=.;OPOS=113656216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:29:19:0:0:29:20:0:0 chr13 113735608 . G A 638.34 PASS AF=0.93617;AO=41;DP=46;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0605735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.342;QD=54.3264;RBI=0.0613978;REFB=-0.188233;REVB=0.0100267;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.530598;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00193923;OID=.;OPOS=113735608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:46:47:0:3:41:44:0.93617:20:21:0:0:21:23:3:0 chr13 113739226 . T C 2255.69 PASS AF=1;AO=140;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.311;QD=63.5407;RBI=0.0658583;REFB=0;REVB=0.0625353;RO=0;SAF=83;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79311e-05;OID=.;OPOS=113739226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:142:0:0:140:142:1:57:83:0:0:57:85:0:0 chr13 113744441 . C T 1246.0 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1978;QD=61.531;RBI=0.0646809;REFB=0;REVB=0.00914611;RO=0;SAF=28;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50795e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565007;OID=.;OPOS=113744441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:53:28:0:0:53:28:0:0 chr13 113747070 . A C 209.28 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0320756;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.084;QD=17.4403;RBI=0.0336136;REFB=-0.00146701;REVB=-0.0100513;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173577;STB=0.599103;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00124821;OID=.;OPOS=113747070;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:8:13:12:15:8:13:12:15 chr13 113747124 . A G 428.97 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.348;QD=57.1965;RBI=0.00934253;REFB=0;REVB=-0.00493495;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011962;OID=.;OPOS=113747124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr13 113747135 . T C 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00931811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7842;QD=55.6537;RBI=0.126553;REFB=0;REVB=0.126209;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00280707;OID=.;OPOS=113747135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr13 113748872 . G A 354.86 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.00441782;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.976;QD=16.3152;RBI=0.0228538;REFB=0.00545584;REVB=-0.0224227;RO=48;SAF=24;SAR=14;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234091;STB=0.63684;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00498555;OID=.;OPOS=113748872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:48:49:38:38:0.436782:14:24:19:29:14:24:19:30 chr13 113792754 . T C 660.93 PASS AF=0.925926;AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0131458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.337;QD=48.9575;RBI=0.0270308;REFB=-0.068936;REVB=0.023619;RO=4;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647918;STB=0.534469;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.000243011;OID=.;OPOS=113792754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:54:54:4:4:50:50:0.925926:27:23:0:4:27:23:0:4 chr13 113818900 . A G 1677.36 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4302;QD=60.4455;RBI=0.0281446;REFB=0;REVB=-0.0215663;RO=0;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.68556e-05;OID=.;OPOS=113818900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:55:56:0:0:55:56:0:0 chr13 113839788 . CAGA C 195.53 PASS AF=0.328947;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.00465631;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=3;MLLD=251.131;QD=10.2911;RBI=0.00521606;REFB=0.0068567;REVB=0.00235076;RO=48;SAF=7;SAR=18;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327587;STB=0.698114;STBP=0.015;TYPE=del;VARB=-0.0124448;OID=.;OPOS=113839789;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.328947:25:77:25:76:51:7:18:29:22:99:48:7:18:27:21 chr13 113897320 . C T 557.25 PASS AF=0.538462;AO=56;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=-0.0111034;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.858;QD=21.4327;RBI=0.0118515;REFB=-0.0119092;REVB=0.00414421;RO=48;SAF=35;SAR=21;SRF=13;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292531;STB=0.660321;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0186541;OID=.;OPOS=113897320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:48:48:56:56:0.538462:21:35:13:35:21:35:13:35 chr13 113909339 . A G 210.29 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00573635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.567;QD=15.5773;RBI=0.0234813;REFB=-0.0181352;REVB=-0.0227698;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166439;STB=0.518503;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.022993;OID=.;OPOS=113909339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:30:24:24:0.444444:12:12:15:14:12:12:16:14 chr13 113960850 . G C 429.29 PASS AF=0.494253;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0193073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.0448;QD=19.7374;RBI=0.0244592;REFB=0.0163586;REVB=0.0150161;RO=44;SAF=24;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325417;STB=0.51807;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.0131754;OID=.;OPOS=113960850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:44:43:43:0.494253:19:24:23:21:19:24:23:21 chr13 113965176 . C A 270.13 PASS AF=1;AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834859;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.458;QD=49.115;RBI=0.0243953;REFB=-0.172856;REVB=0.0229223;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00293061;OID=.;OPOS=113965176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:23:22:0:0:21:22:1:15:6:0:0:16:6:0:0 chr13 114150107 . C T 227.14 PASS AF=0.511628;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0198917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.896;QD=21.129;RBI=0.0278351;REFB=-0.00596045;REVB=-0.0194707;RO=20;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190715;STB=0.602013;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00610965;OID=.;OPOS=114150107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:20:21:21:22:0.511628:8:13:8:12:9:13:8:13 chr13 114175038 . G A 277.91 PASS AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0248417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.7;QD=13.7238;RBI=0.0304041;REFB=-0.00524996;REVB=-0.0175299;RO=48;SAF=21;SAR=11;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27439;STB=0.661698;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0138766;OID=.;OPOS=114175038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:48:49:32:32:0.395062:11:21:19:29:11:21:19:30 chr13 114303764 . C T 281.9 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.00480501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7378;QD=14.6441;RBI=0.0237566;REFB=-0.0191676;REVB=-0.0232656;RO=45;SAF=16;SAR=16;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149306;STB=0.584364;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0201772;OID=.;OPOS=114303764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:16:16:16:29:16:16:16:29 chr13 114309226 . G A 612.21 PASS AF=0.578431;AO=59;DP=102;FAO=59;FDP=102;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.028788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.698;QD=24.0083;RBI=0.0491413;REFB=-0.0172291;REVB=-0.0398261;RO=43;SAF=35;SAR=24;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643453;STB=0.535156;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0146804;OID=.;OPOS=114309226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:43:43:59:59:0.578431:24:35:22:21:24:35:22:21 chr13 114312354 . T G 540.92 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414132;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.671;QD=60.1026;RBI=0.0176005;REFB=0;REVB=0.0171063;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.05725e-05;OID=.;OPOS=114312354;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:16:20:0:0 chr13 114322288 . TA GT,TG 635.85 PASS AF=0.0714286,0.928571;AO=2,37;DP=43;FAO=3,39;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=1,25;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0044281,-0.00896918;FXX=0.0232504;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=119.909,180.297;QD=60.5574;RBI=0.0580564,0.046489;REFB=0,0;REVB=0.0578873,0.0456156;RO=0;SAF=0,23;SAR=2,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.91909e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0549714,-0.00437188;OID=.,.;OPOS=114322288,114322289;OREF=TA,A;OALT=GT,G;OMAPALT=GT,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:43:42:0:0:2,37:3,39:0.0714286,0.928571:2,14:0,23:0:0:2,14:1,25:0:0 chr13 114469092 . G T 298.01 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0191645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.333;QD=20.9131;RBI=0.0192825;REFB=-0.0228348;REVB=0.00212938;RO=26;SAF=10;SAR=21;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156102;STB=0.586819;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.019679;OID=.;OPOS=114469092;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:21:10:13:13:21:10:13:13 chr13 114524944 . A G 1642.65 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.371;QD=60.2808;RBI=0.0349903;REFB=0;REVB=0.00435186;RO=0;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66603e-05;OID=.;OPOS=114524944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:57:51:0:0:57:52:0:0 chr13 114530114 . G A 902.19 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.744;QD=58.2059;RBI=0.0408853;REFB=0;REVB=-0.00313352;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221868;OID=.;OPOS=114530114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:30:31:0:0:31:31:0:0 chr13 114531565 . C G 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0968;QD=58.9626;RBI=0.020124;REFB=0;REVB=-0.0196434;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151924;OID=.;OPOS=114531565;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr13 114545925 . A G 327.77 PASS AF=0.29932;AO=44;DP=153;FAO=44;FDP=147;FR=.;FRO=103;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=-0.00511237;FXX=0.0392131;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.649;QD=8.91903;RBI=0.0324164;REFB=-0.0212623;REVB=-0.0320108;RO=96;SAF=11;SAR=33;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283918;STB=0.655097;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0529126;OID=.;OPOS=114545925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:147:96:103:44:44:0.29932:33:11:45:51:33:11:46:57 chr13 114623880 . G A 727.48 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.651;QD=63.2595;RBI=0.0623286;REFB=0;REVB=-0.0072813;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287405;OID=.;OPOS=114623880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:26:18:0:0:26:20:0:0 chr13 114747187 . G C 149.88 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0690366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9413;QD=19.339;RBI=0.0866779;REFB=-0.00232723;REVB=0.052412;RO=15;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21392;STB=0.622477;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=8.53189e-05;OID=.;OPOS=114747187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:12:4:7:8:12:4:7:8 chr13 114780764 . A G 273.88 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=-0.0139948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.012;QD=15.2156;RBI=0.0187999;REFB=-0.00667917;REVB=-0.0125532;RO=41;SAF=11;SAR=20;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127909;STB=0.571822;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00406247;OID=.;OPOS=114780764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:20:11:10:31:20:11:10:31 chr14 19378030 . T A 40.61 PASS AF=0.6;AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0064863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.581;QD=16.2437;RBI=0.154244;REFB=-0.0145638;REVB=0.154107;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179553;STB=0.699437;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.029399;OID=.;OPOS=19378030;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:5:4:5:6:0.6:2:3:4:1:3:3:4:0 chr14 19553764 . A G 54.79 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.0953594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2156;QD=12.1758;RBI=0.156447;REFB=-0.00809099;REVB=-0.124026;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403398;STB=0.726902;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00414096;OID=.;OPOS=19553764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:18:18:10:10:8:8:0.444444:6:2:0:10:6:2:0:10 chr14 19687360 . T A 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00140405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.036;QD=19.1342;RBI=0.0542952;REFB=0.000711895;REVB=0.0542771;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00290039;OID=.;OPOS=19687360;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:1:1:3:2:1:1 chr14 20002286 . A G 64.07 PASS AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0208083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.029;QD=9.49165;RBI=0.0208491;REFB=-0.000971518;REVB=0.00130338;RO=18;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131116;STB=0.581615;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00272572;OID=.;OPOS=20002286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:8:1:3:15:8:1:3:15 chr14 20216298 . T C 3155.3 PASS AF=1;AO=197;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251195;FXX=0.00502487;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2078;QD=63.7435;RBI=0.0139066;REFB=-0.0144281;REVB=0.0136778;RO=1;SAF=105;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451446;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000252784;OID=.;OPOS=20216298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:198:198:1:0:197:198:1:92:105:1:0:93:105:0:0 chr14 20248828 . C T 1041.95 PASS AF=0.620915;AO=95;DP=153;FAO=95;FDP=153;FR=.;FRO=58;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.0216321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.688;QD=27.2406;RBI=0.0313448;REFB=-0.0338985;REVB=0.0226836;RO=58;SAF=53;SAR=42;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1249;STB=0.567531;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0174782;OID=.;OPOS=20248828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:58:58:95:95:0.620915:42:53:22:36:42:53:22:36 chr14 20249176 . G A 1481.62 PASS AF=0.661376;AO=125;DP=189;FAO=125;FDP=189;FR=.;FRO=64;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.0123387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.28;QD=31.3569;RBI=0.0146304;REFB=-0.0123267;REVB=-0.00786164;RO=64;SAF=64;SAR=61;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370692;STB=0.519926;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00603387;OID=.;OPOS=20249176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:64:64:125:125:0.661376:61:64:29:35:61:64:29:35 chr14 20249456 . G A 273.51 PASS AF=0.271429;AO=38;DP=140;FAO=38;FDP=140;FR=.;FRO=102;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=0.0390289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4044;QD=7.81458;RBI=0.0391489;REFB=-0.00982677;REVB=0.00306334;RO=102;SAF=20;SAR=18;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766208;STB=0.545431;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0292139;OID=.;OPOS=20249456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:102:102:38:38:0.271429:18:20:60:42:18:20:60:42 chr14 20295627 . C G 190.71 PASS AF=0.262626;AO=26;DP=99;FAO=26;FDP=99;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=-0.029759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8804;QD=7.70534;RBI=0.0350066;REFB=-0.00692818;REVB=-0.0184353;RO=73;SAF=18;SAR=8;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137957;STB=0.583551;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.015332;OID=.;OPOS=20295627;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:73:73:26:26:0.262626:8:18:43:30:8:18:43:30 chr14 20295834 . T C 515.97 PASS AF=0.326531;AO=64;DP=196;FAO=64;FDP=196;FR=.;FRO=132;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=88;FSRR=44;FWDB=0.0118914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.078;QD=10.53;RBI=0.0162879;REFB=-0.00253321;REVB=0.0111307;RO=132;SAF=31;SAR=33;SRF=88;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213191;STB=0.621915;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00411304;OID=.;OPOS=20295834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:132:132:64:64:0.326531:33:31:88:44:33:31:88:44 chr14 20389606 . G A 320.01 PASS AF=0.291391;AO=44;DP=153;FAO=44;FDP=151;FR=.;FRO=107;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=75;FWDB=-0.0254504;FXX=0.0320492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.345;QD=8.47711;RBI=0.0259843;REFB=-0.00640441;REVB=-0.00524021;RO=104;SAF=12;SAR=32;SRF=29;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920078;STB=0.523021;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0129486;OID=.;OPOS=20389606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:151:104:107:44:44:0.291391:32:12:29:75:32:12:32:75 chr14 20389721 . G A 105.29 PASS AF=0.267857;AO=16;DP=57;FAO=15;FDP=56;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0138995;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.096;QD=7.52095;RBI=0.0173628;REFB=-0.00538992;REVB=-0.0104053;RO=41;SAF=7;SAR=9;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00183754;STB=0.529372;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0158918;OID=.;OPOS=20389721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:41:41:16:15:0.267857:9:7:18:23:9:6:18:23 chr14 20403909 . T C 394.64 PASS AF=0.263636;AO=58;DP=219;FAO=58;FDP=220;FR=.;FRO=162;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=68;FSRR=94;FWDB=6.4308e-05;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=206.7;QD=7.17517;RBI=0.00076622;REFB=-0.00595656;REVB=-0.000763517;RO=157;SAF=25;SAR=33;SRF=66;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134445;STB=0.508485;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0197852;OID=.;OPOS=20403909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:157:162:58:58:0.263636:33:25:66:91:33:25:68:94 chr14 20404091 . G A 164.13 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0238453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.054;QD=12.8731;RBI=0.0294938;REFB=0.00473175;REVB=0.0173576;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164237;STB=0.509544;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=-0.00587839;OID=.;OPOS=20404091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:11:8:13:19:11:8:13:19 chr14 20404238 . G A 179.11 PASS AF=0.3;AO=24;DP=80;FAO=24;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00306525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.044;QD=8.95567;RBI=0.00877065;REFB=-0.00130444;REVB=-0.00821758;RO=56;SAF=14;SAR=10;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571428;STB=0.53387;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00552707;OID=.;OPOS=20404238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:56:56:24:24:0.3:10:14:30:26:10:14:30:26 chr14 20404614 . C A 240.99 PASS AF=0.253623;AO=35;DP=138;FAO=35;FDP=138;FR=.;FRO=103;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=-0.0228672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.406;QD=6.98532;RBI=0.0252913;REFB=-0.00318411;REVB=-0.0108045;RO=103;SAF=12;SAR=23;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272384;STB=0.663551;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0126134;OID=.;OPOS=20404614;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:103:103:35:35:0.253623:23:12:58:45:23:12:58:45 chr14 20404735 . C T 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0125582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.347;QD=13.7843;RBI=0.0135893;REFB=-0.00480634;REVB=-0.00519222;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874586;STB=0.549957;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0108293;OID=.;OPOS=20404735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:12:11:13:20:12:11:13:20 chr14 20404736 . G A 356.12 PASS AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00260705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.888;QD=24.56;RBI=0.0243657;REFB=0.0117113;REVB=-0.0242258;RO=22;SAF=15;SAR=20;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186011;STB=0.519989;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.00731282;OID=.;OPOS=20404736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:22:23:35:35:0.603448:20:15:10:12:20:15:11:12 chr14 20404767 . A G 301.13 PASS AF=0.55102;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0417554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.906;QD=24.5822;RBI=0.0418429;REFB=-0.0224528;REVB=0.00270574;RO=21;SAF=12;SAR=14;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881223;STB=0.545421;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0202816;OID=.;OPOS=20404767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:21:22:26:27:0.55102:14:12:12:9:15:12:12:10 chr14 20444490 . C T 820.18 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0101653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.81;QD=55.6054;RBI=0.0248532;REFB=-0.110966;REVB=0.0226792;RO=1;SAF=31;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149748;STB=0.507934;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00242945;OID=.;OPOS=20444490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:27:31:1:0:27:31:1:0 chr14 20470737 . G A 1447.72 PASS AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00612673;FXX=0.0206164;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.889;QD=60.9566;RBI=0.0327013;REFB=-0.112251;REVB=0.0321222;RO=2;SAF=47;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019745;STB=0.510414;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.000307174;OID=.;OPOS=20470737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:46:47:2:0:46:47:2:0 chr14 20470903 . T C 1117.1 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035042;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.289;QD=60.3837;RBI=0.00780758;REFB=0;REVB=-0.00697703;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71776e-07;OID=.;OPOS=20470903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0 chr14 20482471 . C T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.579;QD=44.6898;RBI=0.0439667;REFB=0;REVB=0.0438298;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031531;OID=.;OPOS=20482471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr14 20482694 . G T 518.56 PASS AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0468144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5573;QD=19.3854;RBI=0.0686837;REFB=-0.0168985;REVB=0.0502579;RO=51;SAF=25;SAR=29;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080673;STB=0.533391;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0195975;OID=.;OPOS=20482694;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:51:53:54:54:0.504673:29:25:19:32:29:25:21:32 chr14 20502120 . C T 359.96 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0208084;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.083;QD=22.4977;RBI=0.0260969;REFB=-0.026401;REVB=-0.0157498;RO=27;SAF=17;SAR=19;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138845;STB=0.582557;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0131997;OID=.;OPOS=20502120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:27:28:36:36:0.5625:19:17:8:19:19:17:8:20 chr14 20528207 . G A 264.06 PASS AF=0.581395;AO=24;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0821882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8069;QD=24.5637;RBI=0.0821886;REFB=-0.0681057;REVB=0.000235772;RO=19;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204531;STB=0.588714;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0624985;OID=.;OPOS=20528207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:18:24:25:0.581395:15:9:12:7:15:10:11:7 chr14 20528321 . A G 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0273622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.413;QD=16.4265;RBI=0.0296426;REFB=-0.00511891;REVB=0.0114015;RO=11;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00300253;OID=.;OPOS=20528321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:8:3:3:8:8:3:3:8 chr14 20528359 . G T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4904;QD=50.4126;RBI=0.0851534;REFB=0;REVB=-0.0561521;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268687;OID=.;OPOS=20528359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0 chr14 20528362 . A G 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0173811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.565;QD=14.3342;RBI=0.0201652;REFB=0.00128926;REVB=0.0102242;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033981;STB=0.519956;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.00105541;OID=.;OPOS=20528362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:3:7:6:3:3:7 chr14 20528448 . TCATAGATTTGCTCACTGAC T 36.14 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0023534;FXX=0;HRUN=1;LEN=19;MLLD=530.248;QD=6.57124;RBI=0.0106082;REFB=-0.00103504;REVB=-0.0103439;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331207;STB=0.666111;STBP=0.368;TYPE=del;VARB=0.00227304;OID=.;OPOS=20528449;OREF=CATAGATTTGCTCACTGAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.272727:6:22:6:22:16:2:4:9:7:36:14:2:4:9:5 chr14 20528505 . T A 239.82 PASS AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0119391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.119;QD=18.0994;RBI=0.0424107;REFB=-0.00202483;REVB=0.0406956;RO=26;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166023;STB=0.588167;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00157361;OID=.;OPOS=20528505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:27:25:26:0.490566:9:16:12:14:10:16:12:15 chr14 20528528 . G A 373.05 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00406391;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.799;QD=20.4412;RBI=0.00692486;REFB=-0.00942637;REVB=-0.00560698;RO=35;SAF=20;SAR=18;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843996;STB=0.546738;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00922443;OID=.;OPOS=20528528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:18:20:15:20:18:20:15:20 chr14 20529019 . C T 536.51 PASS AF=0.495575;AO=56;DP=113;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.00978212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.849;QD=18.9916;RBI=0.0117919;REFB=-0.00813519;REVB=0.00658482;RO=56;SAF=24;SAR=32;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145056;STB=0.584353;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00704921;OID=.;OPOS=20529019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:56:57:56:56:0.495575:32:24:33:23:32:24:34:23 chr14 20529043 . C G 410.16 PASS AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0254242;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4042;QD=18.2291;RBI=0.0313648;REFB=-0.0253721;REVB=0.0183673;RO=48;SAF=16;SAR=26;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213215;STB=0.618991;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0278242;OID=.;OPOS=20529043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:26:16:29:19:26:16:29:19 chr14 20586042 . G C 934.28 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.635;QD=58.3925;RBI=0.0044352;REFB=0;REVB=0.000394359;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05821e-06;OID=.;OPOS=20586042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:64:0:0:59:64:1:32:27:0:0:36:28:0:0 chr14 20586432 . C T 1048.09 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.285;QD=58.2274;RBI=0.0614185;REFB=-0.126203;REVB=0.0600475;RO=1;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116761;STB=0.506171;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000623644;OID=.;OPOS=20586432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:40:31:0:1:40:31:0:1 chr14 20692188 . T C 295.76 PASS AF=0.566038;AO=29;DP=48;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0121914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.815;QD=22.3213;RBI=0.0454595;REFB=-0.0622117;REVB=0.0437942;RO=17;SAF=23;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309094;STB=0.608009;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0312712;OID=.;OPOS=20692188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:53:17:23:29:30:0.566038:6:23:7:10:7:23:13:10 chr14 20692291 . C T 586.9 PASS AF=0.588889;AO=53;DP=90;FAO=53;FDP=90;FR=.;FRO=37;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0252768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.189;QD=26.0842;RBI=0.0258365;REFB=-0.0288929;REVB=-0.00534888;RO=37;SAF=34;SAR=19;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161835;STB=0.50884;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0144386;OID=.;OPOS=20692291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:37:37:53:53:0.588889:19:34:23:14:19:34:23:14 chr14 20692453 . G T 241.31 PASS AF=0.5;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0275687;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9953;QD=18.5624;RBI=0.0382435;REFB=-0.000599652;REVB=0.0265053;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269143;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117329;OID=.;OPOS=20692453;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:25:26:0.5:8:17:17:9:9:17:17:9 chr14 20692574 . T C 132.66 PASS AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0266514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.027;QD=9.14902;RBI=0.0267855;REFB=-0.0063309;REVB=0.00267718;RO=40;SAF=11;SAR=7;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130459;STB=0.577734;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0126644;OID=.;OPOS=20692574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:40:40:18:18:0.310345:7:11:20:20:7:11:20:20 chr14 20692643 . T C 276.39 PASS AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0064953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.596;QD=13.649;RBI=0.0215276;REFB=-0.0110606;REVB=0.0205244;RO=49;SAF=12;SAR=20;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370941;STB=0.521159;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.017839;OID=.;OPOS=20692643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:49:32:32:0.395062:20:12:20:29:20:12:20:29 chr14 20698068 . G T 122.8 PASS AF=0.482759;AO=13;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00241006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8441;QD=16.9384;RBI=0.0543881;REFB=0.00246394;REVB=-0.0543347;RO=16;SAF=10;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290727;STB=0.69113;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.00683432;OID=.;OPOS=20698068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:15:13:14:0.482759:3:10:8:8:3:11:7:8 chr14 20698239 . T C 351.2 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00635162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.645;QD=18.0101;RBI=0.0378099;REFB=-0.00951521;REVB=-0.0372726;RO=41;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909668;STB=0.550738;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0110629;OID=.;OPOS=20698239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:19:18:16:25:19:18:16:25 chr14 20698298 . T G 337.86 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.0599665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8226;QD=17.5509;RBI=0.0825118;REFB=-0.0208839;REVB=-0.0566764;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150066;STB=0.58348;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0286221;OID=.;OPOS=20698298;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:21:15:11:30:21:15:11:30 chr14 20764585 . A C 210.81 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00406174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0467;QD=14.0536;RBI=0.0400897;REFB=0.0075614;REVB=-0.0398834;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112036;STB=0.563708;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.0182247;OID=.;OPOS=20764585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:12:13:22:13:12:13:22:13 chr14 20770036 . T C 1606.99 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.587;QD=64.2794;RBI=0.017621;REFB=0;REVB=0.0171651;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87569e-05;OID=.;OPOS=20770036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:51:49:0:0:51:49:0:0 chr14 20781947 . C T 76.66 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.133442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.835;QD=12.776;RBI=0.137829;REFB=-0.0216783;REVB=-0.0344972;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0304391;OID=.;OPOS=20781947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:7:7:5:5:7:7 chr14 20784718 . G T 90.36 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0109792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.051;QD=16.4296;RBI=0.0214826;REFB=-0.0180376;REVB=-0.0184651;RO=10;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122798;STB=0.603574;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0201504;OID=.;OPOS=20784718;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:10:11:11:11:0.5:8:3:4:6:8:3:5:6 chr14 20811466 . G A 783.98 PASS AF=0.510204;AO=75;DP=150;FAO=75;FDP=147;FR=.;FRO=72;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.040224;FXX=0.0199987;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9639;QD=21.3328;RBI=0.0511456;REFB=0.00416069;REVB=0.0315896;RO=73;SAF=36;SAR=39;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608457;STB=0.530171;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.00355647;OID=.;OPOS=20811466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:147:73:72:75:75:0.510204:39:36:40:33:39:36:39:33 chr14 20811813 . C T 102.12 PASS AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0424597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0401;QD=29.1765;RBI=0.0438492;REFB=-0.101406;REVB=0.0109512;RO=3;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125323;STB=0.507029;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0171155;OID=.;OPOS=20811813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:4:7:2:1:4:7:2:1 chr14 20824181 . T C 190.69 PASS AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00417416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.13;QD=15.2552;RBI=0.0117013;REFB=-0.0278246;REVB=0.0109315;RO=30;SAF=4;SAR=16;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261547;STB=0.652891;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.02907;OID=.;OPOS=20824181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:16:4:12:18:16:4:12:18 chr14 20825321 . T TTTCAC 129.8 PASS AF=0.305085;AO=16;DP=60;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0110625;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=284.943;QD=8.80026;RBI=0.0145859;REFB=-0.00399088;REVB=0.00950627;RO=42;SAF=3;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314593;STB=0.589528;STBP=0.385;TYPE=ins;VARB=0.00773758;OID=.;OPOS=20825322;OREF=-;OALT=TTCAC;OMAPALT=TTTCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.305085:16:60:18:59:41:5:13:16:25:99:42:3:13:17:25 chr14 20825323 . T G 131.29 PASS AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00397524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.088;QD=8.90108;RBI=0.0123832;REFB=0.00328113;REVB=0.0117278;RO=40;SAF=5;SAR=13;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129608;STB=0.589528;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.00333192;OID=.;OPOS=20825323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:40:41:18:18:0.305085:13:5:15:25:13:5:16:25 chr14 20852029 . A G 174.07 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0116181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.697;QD=19.341;RBI=0.0163209;REFB=-0.00824761;REVB=-0.0114626;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297709;STB=0.666502;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00869917;OID=.;OPOS=20852029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:3:15:9:9:3:15 chr14 20852817 . G A 320.78 PASS AF=0.515152;AO=33;DP=65;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0598072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.539;QD=19.4411;RBI=0.0659212;REFB=-0.03842;REVB=0.0277255;RO=32;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0359401;OID=.;OPOS=20852817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:32:32:33:34:0.515152:16:17:16:16:17:17:16:16 chr14 20854734 . A G 635.83 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151253;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.905;QD=62.0323;RBI=0.0180817;REFB=0;REVB=0.00990829;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.31905e-05;OID=.;OPOS=20854734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:14:27:0:0 chr14 20859205 . C T 72.73 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00340958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.487;QD=8.81619;RBI=0.0133068;REFB=-0.0131134;REVB=-0.0128626;RO=22;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176947;STB=0.599782;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0303736;OID=.;OPOS=20859205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:32:33:22:23:10:10:0.30303:8:2:7:15:8:2:7:16 chr14 20872881 . G T 241.67 PASS AF=0.5;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0150846;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.891;QD=21.0147;RBI=0.0273057;REFB=-0.00177042;REVB=0.0227609;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234533;STB=0.649224;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00168822;OID=.;OPOS=20872881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:23:22:23:0.5:9:13:8:16:9:14:7:16 chr14 20897064 . C T 117.36 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-2.119e-05;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.022;QD=19.5604;RBI=0.000278903;REFB=-0.0400637;REVB=0.000278096;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232786;STB=0.631394;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0203042;OID=.;OPOS=20897064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:24:24:11:11:13:13:0.541667:6:7:9:2:6:7:9:2 chr14 20897676 . T C 262.91 PASS AF=0.373494;AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0150664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.881;QD=12.6705;RBI=0.0174095;REFB=-0.0113321;REVB=-0.00872323;RO=52;SAF=17;SAR=14;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315762;STB=0.518099;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0191559;OID=.;OPOS=20897676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:52:52:31:31:0.373494:14:17:30:22:14:17:30:22 chr14 20898058 . G C 120.28 PASS AF=0.466667;AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-8.93738e-05;FXX=0.0322477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.6978;QD=16.0366;RBI=0.00860964;REFB=-0.0478074;REVB=0.00860918;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240907;STB=0.686002;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0364782;OID=.;OPOS=20898058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:12:16:13:14:0.466667:4:9:5:7:4:10:6:10 chr14 20916249 . T C 93.72 PASS AF=0.342857;AO=11;DP=34;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00568394;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=154.998;QD=10.7105;RBI=0.0252212;REFB=-0.00626943;REVB=0.0245724;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387176;STB=0.569262;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00897248;OID=.;OPOS=20916249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:34:35:14:23:11:12:0.342857:7:4:11:3:7:5:12:11 chr14 20916958 . T C 244.26 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.014775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.022;QD=23.263;RBI=0.017982;REFB=-0.000182461;REVB=0.0102495;RO=19;SAF=14;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111486;STB=0.562313;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.000423872;OID=.;OPOS=20916958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:9:14:9:10:9:14:9:10 chr14 20920250 . T C 405.4 PASS AF=0.609375;AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0124336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.108;QD=25.3375;RBI=0.0248936;REFB=-0.00700016;REVB=-0.0215661;RO=24;SAF=15;SAR=24;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169142;STB=0.600432;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00719168;OID=.;OPOS=20920250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:24:25:39:39:0.609375:24:15:15:9:24:15:16:9 chr14 21024619 . A G 428.68 PASS AF=0.44;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.0136073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1119;QD=17.1472;RBI=0.037743;REFB=-0.0246628;REVB=-0.0352048;RO=54;SAF=23;SAR=21;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141251;STB=0.507289;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0326941;OID=.;OPOS=21024619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:54:56:44:44:0.44:21:23:29:25:21:23:30:26 chr14 21024786 . A G 778.77 PASS AF=0.506757;AO=75;DP=148;FAO=75;FDP=148;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.00750303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.428;QD=21.0479;RBI=0.00934368;REFB=-0.0058438;REVB=0.00556857;RO=73;SAF=38;SAR=37;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247366;STB=0.513607;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00532026;OID=.;OPOS=21024786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:73:73:75:75:0.506757:37:38:39:34:37:38:39:34 chr14 21052259 . T C 505.55 PASS AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0154838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.446;QD=20.2219;RBI=0.0170827;REFB=-0.0161353;REVB=0.00721604;RO=51;SAF=32;SAR=17;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120038;STB=0.566711;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0196784;OID=.;OPOS=21052259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:17:32:27:24:17:32:27:24 chr14 21081996 . C T 1398.52 PASS AF=0.968421;AO=91;DP=96;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0224567;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.731;QD=58.885;RBI=0.0320766;REFB=-0.0830305;REVB=0.0229042;RO=4;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042072;STB=0.51648;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.000688879;OID=.;OPOS=21081996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:96:95:4:3:91:92:0.968421:43:48:0:4:44:48:0:3 chr14 21099310 . C T 230.58 PASS AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0553754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6862;QD=12.1358;RBI=0.0698748;REFB=-0.00703248;REVB=0.0426153;RO=48;SAF=16;SAR=12;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123986;STB=0.571378;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0105479;OID=.;OPOS=21099310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:48:48:28:28:0.368421:12:16:22:26:12:16:22:26 chr14 21099313 . C T 241.48 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0158282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.212;QD=12.3837;RBI=0.0444278;REFB=-0.0163489;REVB=0.0415127;RO=49;SAF=17;SAR=12;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149911;STB=0.586147;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0234246;OID=.;OPOS=21099313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:12:17:22:27:12:17:22:27 chr14 21099400 . G A 197.63 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0163526;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.65;QD=12.9594;RBI=0.023079;REFB=-0.0202547;REVB=-0.0162859;RO=38;SAF=9;SAR=15;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514675;STB=0.53645;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0316665;OID=.;OPOS=21099400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:38:37:24:24:0.393443:15:9:16:22:15:9:16:21 chr14 21101155 . C T 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0117655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.761;QD=12.9138;RBI=0.012611;REFB=-0.0233455;REVB=-0.0045401;RO=37;SAF=16;SAR=8;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277175;STB=0.659207;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0353233;OID=.;OPOS=21101155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:8:16:15:22:8:16:15:22 chr14 21101236 . CCTTTA C 122.16 PASS AF=0.366667;AO=20;DP=62;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00794415;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=5;MLLD=289.444;QD=8.14408;RBI=0.0196898;REFB=-0.00138528;REVB=0.0180161;RO=37;SAF=14;SAR=6;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275574;STB=0.652033;STBP=0.087;TYPE=del;VARB=0.00568961;OID=.;OPOS=21101237;OREF=CTTTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.366667:20:62:22:60:38:15:7:17:21:99:37:14:6:17:20 chr14 21109141 . C T 316.27 PASS AF=0.596154;AO=30;DP=50;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.010359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.415;QD=24.3284;RBI=0.0105934;REFB=-0.0422656;REVB=-0.00221591;RO=19;SAF=19;SAR=11;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123277;STB=0.55304;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0248032;OID=.;OPOS=21109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:19:21:30:31:0.596154:11:19:15:4:11:20:16:5 chr14 21109170 . T A 999.25 PASS AF=1;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013745;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.092;QD=59.657;RBI=0.021628;REFB=0;REVB=-0.0166986;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197832;OID=.;OPOS=21109170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0 chr14 21109278 . A T 280.24 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00947705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.251;QD=16.7307;RBI=0.0148272;REFB=-0.0184771;REVB=-0.0114032;RO=36;SAF=9;SAR=22;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242563;STB=0.636929;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0269907;OID=.;OPOS=21109278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:22:9:19:17:22:9:19:17 chr14 21109385 . C T 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00136246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.516;QD=22.5809;RBI=0.0300458;REFB=-0.0274154;REVB=0.0300149;RO=7;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101303;STB=0.557426;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0192034;OID=.;OPOS=21109385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:7:5:4:3:7:5:4:3 chr14 21109671 . A G 322.51 PASS AF=0.522388;AO=32;DP=64;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00164675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.35;QD=19.2545;RBI=0.00213356;REFB=0.00045926;REVB=-0.00135657;RO=29;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129439;STB=0.579616;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.000146495;OID=.;OPOS=21109671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:29:32:32:35:0.522388:17:15:18:11:19:16:20:12 chr14 21109726 . G A 358.15 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0316817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.79;QD=22.3842;RBI=0.0319872;REFB=-0.0466472;REVB=-0.00441035;RO=28;SAF=21;SAR=15;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490548;STB=0.527012;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0202571;OID=.;OPOS=21109726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:15:21:18:10:15:21:18:10 chr14 21149930 . T C 313.79 PASS AF=0.5;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0061562;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2506;QD=19.0176;RBI=0.012857;REFB=-0.0178794;REVB=0.0112873;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308285;STB=0.515571;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0247203;OID=.;OPOS=21149930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:66:35:33:33:33:0.5:19:14:16:19:19:14:13:20 chr14 21151483 . T G 1418.54 PASS AF=0.483333;AO=145;DP=301;FAO=145;FDP=300;FR=.;FRO=155;FSAF=76;FSAR=69;FSRF=62;FSRR=93;FWDB=0.0357817;FXX=0.00332215;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3557;QD=18.9139;RBI=0.0390433;REFB=-0.0217796;REVB=-0.015622;RO=155;SAF=76;SAR=69;SRF=63;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110282;STB=0.563882;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0199828;OID=.;OPOS=21151483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:300:155:155:145:145:0.483333:69:76:63:92:69:76:62:93 chr14 21152167 . G C 301.23 PASS AF=0.390805;AO=33;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.0218334;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.864;QD=13.8496;RBI=0.0411415;REFB=0.0031322;REVB=0.0348701;RO=53;SAF=20;SAR=13;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846365;STB=0.558371;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00485631;OID=.;OPOS=21152167;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:53:53:33:34:0.390805:13:20:36:17:14:20:36:17 chr14 21167576 . A T 357.62 PASS AF=0.59322;AO=34;DP=60;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0204872;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7959;QD=24.2457;RBI=0.102401;REFB=-0.00771163;REVB=-0.100331;RO=24;SAF=14;SAR=20;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00379966;STB=0.504948;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00516316;OID=.;OPOS=21167576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:24:24:34:35:0.59322:20:14:10:14:20:15:10:14 chr14 21168055 . T C 500.71 PASS AF=0.482143;AO=53;DP=111;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0134705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.379;QD=17.8824;RBI=0.0191375;REFB=0.00389685;REVB=-0.0135938;RO=56;SAF=20;SAR=33;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836391;STB=0.540968;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=-0.00254044;OID=.;OPOS=21168055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:56:58:53:54:0.482143:33:20:26:30:33:21:27:31 chr14 21168084 . C T 316.74 PASS AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.031726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5806;QD=15.2644;RBI=0.0328056;REFB=-0.00562144;REVB=0.00834692;RO=47;SAF=14;SAR=21;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923832;STB=0.55879;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00993332;OID=.;OPOS=21168084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:48:35:35:0.421687:21:14:23:24:21:14:24:24 chr14 21215997 . C T 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0239533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.667;QD=12.9138;RBI=0.0352198;REFB=-0.0212118;REVB=-0.02582;RO=37;SAF=12;SAR=12;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128775;STB=0.57371;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0203946;OID=.;OPOS=21215997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:12:12:23:14:12:12:23:14 chr14 21216499 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.79;QD=56.9567;RBI=0.0270061;REFB=0;REVB=-0.00552636;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71536e-05;OID=.;OPOS=21216499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr14 21238318 . G A 375.6 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00443313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.395;QD=55.6441;RBI=0.0486209;REFB=0;REVB=0.0484183;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370681;OID=.;OPOS=21238318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr14 21250124 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.568;QD=50.4134;RBI=0.0447502;REFB=0;REVB=0.0187762;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267228;OID=.;OPOS=21250124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr14 21250366 . T C 1038.4 PASS AF=0.972603;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0133191;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.761;QD=56.8987;RBI=0.0435801;REFB=-0.138589;REVB=0.0414949;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.512192;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00116538;OID=.;OPOS=21250366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:73:0:2:71:71:0.972603:40:31:0:0:40:31:0:2 chr14 21360215 . AC A,AG 450.6 PASS AF=0.0909091,0.909091;AO=5,28;DP=33;FAO=3,30;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=3,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256395,0.0196088;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.731,190.807;QD=54.6184;RBI=0.0425719,0.0506274;REFB=0,0;REVB=-0.033985,0.0466758;RO=0;SAF=0,20;SAR=5,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,7.75204e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0726311,0.00233272;OID=.,.;OPOS=21360216,21360216;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0909091,0.909091:5,28:33:3,30:33:0:0,20:3,10:0:0:12:0:0,20:5,8:0:0 chr14 21387994 . A G 1528.25 PASS AF=0.963636;AO=105;DP=109;FAO=106;FDP=110;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.000500833;FXX=0.0090082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.582;QD=55.5727;RBI=0.0153149;REFB=-0.119393;REVB=-0.0153067;RO=4;SAF=47;SAR=58;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368313;STB=0.502084;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000605711;OID=.;OPOS=21387994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:109:110:4:4:105:106:0.963636:58:47:2:2:59:47:2:2 chr14 21388266 . G C 820.17 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00436171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.303;QD=55.6045;RBI=0.00612294;REFB=0.00753695;REVB=-0.0042972;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-9.26507e-05;OID=.;OPOS=21388266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:28:30:0:1:28:30:0:1 chr14 21458320 . CCCCG C 538.21 PASS AF=0.536232;AO=69;DP=147;FAO=74;FDP=138;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.0337102;FXX=0.0349626;HRUN=5;LEN=4;MLLD=259.943;QD=15.6001;RBI=0.0338194;REFB=-0.00697161;REVB=0.00271521;RO=57;SAF=21;SAR=48;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197503;STB=0.622095;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.00507781;OID=.;OPOS=21458321;OREF=CCCG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.536232:69:147:74:138:64:25:49:38:26:99:57:21:48:30:27 chr14 21467913 . T G 1377.5 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00282809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.098;QD=62.6138;RBI=0.0354265;REFB=0;REVB=0.0353134;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102987;OID=.;OPOS=21467913;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:42:46:0:0:42:46:0:0 chr14 21469150 . T TC 482.38 PASS AF=1;AO=4;DP=39;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416738;FXX=0.0512689;HRUN=0;LEN=1;MLLD=200.516;QD=52.1494;RBI=0.0735715;REFB=0;REVB=-0.0606305;RO=34;SAF=3;SAR=1;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22296;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00013884;OID=.;OPOS=21469151;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:4:39:37:37:0:21:16:0:0:4:34:3:1:19:15 chr14 21469151 . T C 486.73 PASS AF=0.897436;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00836585;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=238.057;QD=49.9212;RBI=0.0182046;REFB=-0.219831;REVB=0.0161684;RO=4;SAF=20;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350455;STB=0.518786;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00148958;OID=.;OPOS=21469151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:39:39:4:4:35:35:0.897436:15:20:3:1:15:20:3:1 chr14 21486137 . G C 1144.82 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1984;QD=59.4711;RBI=0.0479577;REFB=0;REVB=-0.0425895;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451782;OID=.;OPOS=21486137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:77:0:0:73:77:1:33:40:0:0:33:44:0:0 chr14 21500121 . G T 300.6 PASS AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00830919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.516;QD=23.1231;RBI=0.0148961;REFB=-0.00055998;REVB=0.0123633;RO=22;SAF=21;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564238;STB=0.531229;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.000638386;OID=.;OPOS=21500121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:9:21:14:8:9:21:14:8 chr14 21500541 . T TA 75.47 PASS AF=0.434783;AO=17;DP=52;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0366618;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.3685;QD=6.56219;RBI=0.0941925;REFB=-0.0585999;REVB=-0.0867648;RO=31;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350383;STB=0.681232;STBP=0.043;TYPE=ins;VARB=0.0277624;OID=.;OPOS=21500542;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.434783:17:52:20:46:26:6:14:16:10:75:31:5:12:19:12 chr14 21501095 . T C 171.26 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.00155318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.13;QD=12.4552;RBI=0.0246874;REFB=-0.0188552;REVB=0.0246385;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297643;STB=0.675619;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0314509;OID=.;OPOS=21501095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:34:21:21:0.381818:11:10:25:8:11:10:26:8 chr14 21501151 . G T 300.23 PASS AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0259378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0783;QD=16.4507;RBI=0.0481969;REFB=-0.0221859;REVB=0.0406223;RO=40;SAF=15;SAR=18;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188837;STB=0.605849;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0270908;OID=.;OPOS=21501151;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:18:15:26:14:18:15:26:14 chr14 21511458 . G C 284.15 PASS AF=0.884615;AO=23;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0218352;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.5786;QD=43.7151;RBI=0.025934;REFB=-0.128255;REVB=0.0139927;RO=3;SAF=15;SAR=8;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728348;STB=0.539533;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0178556;OID=.;OPOS=21511458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:26:26:3:3:23:23:0.884615:8:15:1:2:8:15:1:2 chr14 21511497 . C T 726.89 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00245008;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.651;QD=57.0112;RBI=0.0208564;REFB=0;REVB=-0.020712;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119355;OID=.;OPOS=21511497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0 chr14 21526079 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470997;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.736;QD=55.6561;RBI=0.0305668;REFB=0;REVB=0.0302018;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.47604e-05;OID=.;OPOS=21526079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr14 21549893 . G C 357.98 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.098;QD=55.0745;RBI=0.099657;REFB=0;REVB=0.0627029;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000929966;OID=.;OPOS=21549893;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr14 21551058 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.109;QD=60.2305;RBI=0.0268143;REFB=0;REVB=0.0204592;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216517;OID=.;OPOS=21551058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr14 21551069 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.455;QD=59.0184;RBI=0.0361776;REFB=0;REVB=0.00575741;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165735;OID=.;OPOS=21551069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr14 21556963 . A AT 360.55 PASS AF=1;AO=31;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.4069;QD=45.0681;RBI=0.120036;REFB=0;REVB=0.0488384;RO=1;SAF=14;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321576;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00650903;OID=.;OPOS=21556964;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:31:33:32:32:0:15:17:0:0:7:1:14:17:1:0 chr14 21562560 . T C 720.75 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000223406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6487;QD=61.3402;RBI=0.000224688;REFB=-0.0742176;REVB=2.39692e-05;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113413;OID=.;OPOS=21562560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:47:47:0:0:46:47:1:27:19:0:0:28:19:0:0 chr14 21570273 . T C 715.02 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0179917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.382;QD=60.8526;RBI=0.018111;REFB=-0.0681778;REVB=0.00207558;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184352;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00157802;OID=.;OPOS=21570273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:21:25:1:0:21:25:1:0 chr14 21570614 . A C 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.631;QD=61.695;RBI=0.0266144;REFB=0;REVB=0.0194828;RO=0;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57775e-05;OID=.;OPOS=21570614;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:48:34:0:0:48:34:0:0 chr14 21623290 . T C 1063.11 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1171;QD=59.8935;RBI=0.0454051;REFB=0;REVB=0.0442105;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279753;OID=.;OPOS=21623290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:31:38:0:0:33:38:0:0 chr14 21623489 . C T 317.22 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00374617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.925;QD=25.8958;RBI=0.02219;REFB=-0.00465145;REVB=0.0218715;RO=21;SAF=9;SAR=19;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763854;STB=0.54214;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00221358;OID=.;OPOS=21623489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:19:9:5:16:19:9:5:16 chr14 21623836 . G A 406.42 PASS AF=0.5125;AO=40;DP=77;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0237608;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.996;QD=20.3211;RBI=0.02427;REFB=-0.0553278;REVB=-0.0049459;RO=37;SAF=26;SAR=14;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076453;STB=0.561596;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0526048;OID=.;OPOS=21623836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:80:37:39:40:41:0.5125:14:26:21:16:15:26:20:19 chr14 21624197 . T C 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.016697;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=327.561;QD=13.9591;RBI=0.0204507;REFB=-0.00369633;REVB=0.0118085;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358511;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00430184;OID=.;OPOS=21624197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:5:2:5:2:5:2:5:2 chr14 21770730 . A G 416.67 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00978607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.186;QD=19.608;RBI=0.0165562;REFB=-0.0193777;REVB=-0.0133544;RO=43;SAF=23;SAR=19;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158798;STB=0.588063;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.013833;OID=.;OPOS=21770730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:19:23:16:27:19:23:16:27 chr14 21778717 . AAAT A 135.41 PASS AF=0.7;AO=13;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00687562;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=253.205;QD=27.0827;RBI=0.0233309;REFB=-0.00162404;REVB=0.0222947;RO=6;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0.328205;SSEP=0;SSSB=-0.0216875;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00070996;OID=.;OPOS=21778718;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.7:13:20:14:20:6:7:7:3:3:35:6:6:7:3:3 chr14 21778792 . T C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.311;QD=59.0187;RBI=0.0358291;REFB=0;REVB=0.0267233;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153427;OID=.;OPOS=21778792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0 chr14 21820702 . C A 487.84 PASS AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00153518;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=173.015;QD=21.6819;RBI=0.00664392;REFB=-0.0106306;REVB=-0.00646413;RO=43;SAF=21;SAR=26;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963372;STB=0.553169;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0081775;OID=.;OPOS=21820702;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:26:21:24:19:26:21:24:19 chr14 21829129 . C G 453.88 PASS AF=0.517241;AO=44;DP=86;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.000268182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.588;QD=20.8678;RBI=0.00706638;REFB=0.00359586;REVB=0.00706129;RO=42;SAF=19;SAR=25;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204994;STB=0.606014;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00370856;OID=.;OPOS=21829129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:42:42:44:45:0.517241:25:19:28:14:25:20:28:14 chr14 21831052 . T C 134.79 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0313566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.676;QD=11.4715;RBI=0.0565463;REFB=-0.0146004;REVB=0.0470558;RO=31;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518407;STB=0.530687;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0260783;OID=.;OPOS=21831052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:10:6:13:18:10:6:13:18 chr14 21871653 . C T 393.4 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0104268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2359;QD=22.4801;RBI=0.0187204;REFB=-0.0121184;REVB=-0.0155478;RO=31;SAF=25;SAR=14;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243495;STB=0.513421;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0113418;OID=.;OPOS=21871653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:14:25:19:12:14:25:19:12 chr14 21899631 . C T 390.97 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0460197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.165;QD=16.6369;RBI=0.0463345;REFB=0.00250881;REVB=0.00539191;RO=53;SAF=23;SAR=18;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520942;STB=0.529274;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.00326746;OID=.;OPOS=21899631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:18:23:27:26:18:23:27:26 chr14 21960816 . T C 400.25 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0120274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.856;QD=18.6164;RBI=0.0149995;REFB=-0.0118071;REVB=-0.0089625;RO=44;SAF=12;SAR=29;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122705;STB=0.576613;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0108764;OID=.;OPOS=21960816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:44:45:41:41:0.476744:29:12:18:26:29:12:19:26 chr14 21960969 . G A 140.32 PASS AF=0.277778;AO=18;DP=67;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=0.0119254;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.124;QD=7.79575;RBI=0.0143815;REFB=-0.00765968;REVB=-0.00803831;RO=37;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170068;STB=0.624883;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0133717;OID=.;OPOS=21960969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:72:37:52:18:20:0.277778:9:9:13:24:10:10:17:35 chr14 21967916 . A G 135.39 PASS AF=0.46875;AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00965254;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.222;QD=16.9242;RBI=0.0144663;REFB=-0.0078409;REVB=-0.0107751;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156724;STB=0.53841;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0135585;OID=.;OPOS=21967916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:17:14:15:0.46875:8:6:8:10:9:6:8:9 chr14 21991626 . C G 116.63 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0177574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.946;QD=11.6631;RBI=0.0177608;REFB=-0.0108698;REVB=0.000350843;RO=25;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19955;STB=0.610938;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0215823;OID=.;OPOS=21991626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:26:14:14:0.35:11:3:9:16:11:3:9:17 chr14 21993498 . G A 335.31 PASS AF=0.818182;AO=27;DP=33;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0258793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7362;QD=40.6435;RBI=0.0274158;REFB=-0.110181;REVB=0.00904909;RO=4;SAF=15;SAR=12;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731859;STB=0.510197;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0553028;OID=.;OPOS=21993498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:33:33:4:6:27:27:0.818182:12:15:1:3:12:15:3:3 chr14 22038450 . G A 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.571;QD=62.0217;RBI=0.0355223;REFB=0;REVB=0.0355072;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256623;OID=.;OPOS=22038450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr14 22038525 . G T 181.27 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0137332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.804;QD=16.4788;RBI=0.0183319;REFB=-0.0049958;REVB=-0.0121432;RO=25;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592025;STB=0.533945;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00808801;OID=.;OPOS=22038525;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:8:11:13:12:8:11:13:12 chr14 22038659 . T C 411.9 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.655;QD=56.8139;RBI=0.0726817;REFB=0;REVB=0.0697524;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506064;OID=.;OPOS=22038659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:8:19:0:0:10:19:0:0 chr14 22090594 . C G 1005.38 PASS AF=0.502564;AO=98;DP=195;FAO=98;FDP=195;FR=.;FRO=97;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.00960414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.907;QD=20.6231;RBI=0.01099;REFB=-0.0178792;REVB=-0.00534227;RO=96;SAF=48;SAR=50;SRF=46;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958416;STB=0.507749;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0170681;OID=.;OPOS=22090594;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:96:97:98:98:0.502564:50:48:46:50:50:48:46:51 chr14 22102592 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.721;QD=40.763;RBI=0.0541092;REFB=0;REVB=0.0486419;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348126;OID=.;OPOS=22102592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr14 22102612 . T C 159.96 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.247;QD=45.7025;RBI=0.0333027;REFB=0;REVB=-0.0332412;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000559269;OID=.;OPOS=22102612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr14 22102745 . C A 734.23 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.046547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.018;QD=61.1859;RBI=0.0623054;REFB=0.0362337;REVB=0.0414166;RO=1;SAF=29;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159432;STB=0.508471;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=1.06569e-06;OID=.;OPOS=22102745;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:18:29:1:0:18:29:1:0 chr14 22111660 . C T 1822.49 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.568;QD=61.2603;RBI=0.0370608;REFB=0;REVB=0.0109666;RO=0;SAF=73;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17989e-05;OID=.;OPOS=22111660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:46:73:0:0:46:73:0:0 chr14 22133374 . GT G,TG 70.64 PASS AF=0.608696,0;AO=12,2;DP=27;FAO=14,0;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6,0;FSAR=8,0;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0216372,-0.0664797;FXX=0.148093;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=10.0665,16.4607;QD=12.2857;RBI=0.0933331,0.101227;REFB=-0.105814,-0.00867821;REVB=-0.0907904,-0.0763374;RO=8;SAF=5,1;SAR=7,1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.222221,0.438176;STB=0.63141,0.5;STBP=0.178,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.123315,0;OID=.,.;OPOS=22133375,22133374;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:27:23:8:9:12,2:14,0:0.608696,0:7,1:5,1:1:7:8,0:6,0:1:8 chr14 22133416 . A G 1049.15 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0079908;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.918;QD=59.9514;RBI=0.00953926;REFB=0;REVB=0.00521005;RO=0;SAF=12;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78616e-05;OID=.;OPOS=22133416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:67:70:1:55:12:0:0:56:14:0:0 chr14 22133648 . G A 931.81 PASS AF=1;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142287;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.415;QD=58.2381;RBI=0.0387365;REFB=0;REVB=0.0360287;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494065;OID=.;OPOS=22133648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:63:64:1:29:34:0:0:30:34:0:0 chr14 22133997 . A G 1224.33 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170491;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.013;QD=61.2163;RBI=0.0245561;REFB=0;REVB=-0.0176728;RO=1;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126228;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228972;OID=.;OPOS=22133997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:1:0:79:80:1:37:42:0:1:37:43:0:0 chr14 22236756 . G C 360.39 PASS AF=0.402062;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.00765107;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9741;QD=14.8613;RBI=0.0113899;REFB=-0.000547244;REVB=0.00843743;RO=59;SAF=24;SAR=15;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131993;STB=0.514327;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00102362;OID=.;OPOS=22236756;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:59:58:39:39:0.402062:15:24:37:22:15:24:37:21 chr14 22237070 . C T 420.47 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.00406658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.34;QD=16.4889;RBI=0.00491919;REFB=-0.0191798;REVB=-0.00276792;RO=56;SAF=26;SAR=20;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151018;STB=0.584357;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0238582;OID=.;OPOS=22237070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:20:26:23:33:20:26:23:33 chr14 22237127 . C T 1472.58 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00102284;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.544;QD=63.3368;RBI=0.00871503;REFB=0;REVB=0.0086548;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.67411e-06;OID=.;OPOS=22237127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0 chr14 22314985 . T C 526.3 PASS AF=0.495495;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0191926;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.687;QD=18.9657;RBI=0.0192655;REFB=-0.00568454;REVB=-0.00167436;RO=57;SAF=20;SAR=35;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892283;STB=0.553245;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0054753;OID=.;OPOS=22314985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:57:56:55:55:0.495495:35:20:26:31:35:20:26:30 chr14 22315212 . A G 433.69 PASS AF=0.372263;AO=50;DP=136;FAO=51;FDP=137;FR=.;FRO=86;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=0.0216532;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.462;QD=12.6624;RBI=0.0221258;REFB=-0.0194777;REVB=0.00454867;RO=86;SAF=24;SAR=26;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060834;STB=0.528021;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0308707;OID=.;OPOS=22315212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:86:86:50:51:0.372263:26:24:46:40:26:25:46:40 chr14 22315296 . C T 523.39 PASS AF=0.391892;AO=58;DP=148;FAO=58;FDP=148;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=0.0100133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8934;QD=14.1457;RBI=0.0225327;REFB=-0.00977479;REVB=0.0201855;RO=90;SAF=32;SAR=26;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558854;STB=0.531575;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00916857;OID=.;OPOS=22315296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:90:90:58:58:0.391892:26:32:45:45:26:32:45:45 chr14 22315394 . T C 73.64 PASS AF=0.153846;AO=14;DP=90;FAO=14;FDP=91;FR=.;FRO=77;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.0133905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.814;QD=3.23698;RBI=0.0398298;REFB=-0.00785158;REVB=-0.0375114;RO=76;SAF=6;SAR=8;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00962452;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0394869;OID=.;OPOS=22315394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:90:91:76:77:14:14:0.153846:8:6:32:44:8:6:33:44 chr14 22320728 . T C 449.58 PASS AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0138407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.527;QD=18.9296;RBI=0.0138533;REFB=-0.00576303;REVB=0.000592185;RO=49;SAF=25;SAR=20;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023583;STB=0.51886;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00617061;OID=.;OPOS=22320728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:49:50:45:45:0.473684:20:25:26:23:20:25:26:24 chr14 22321124 . T C 492.57 PASS AF=0.439024;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=123;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=-0.00812774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.877;QD=16.0185;RBI=0.00854287;REFB=-0.00635596;REVB=0.00263068;RO=68;SAF=21;SAR=33;SRF=22;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699267;STB=0.542095;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00803055;OID=.;OPOS=22321124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:68:69:54:54:0.439024:33:21:22:46:33:21:22:47 chr14 22322690 . G A 268.6 PASS AF=0.333333;AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0121583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.299;QD=10.5332;RBI=0.0157793;REFB=-0.00250479;REVB=-0.0100579;RO=67;SAF=13;SAR=21;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07745;STB=0.550625;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00440109;OID=.;OPOS=22322690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:67:68:34:34:0.333333:21:13:30:37:21:13:31:37 chr14 22337393 . G A 1849.62 PASS AF=0.976378;AO=116;DP=121;FAO=124;FDP=127;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0959804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7363;QD=58.2556;RBI=0.0966143;REFB=-0.0595234;REVB=-0.0110491;RO=3;SAF=41;SAR=75;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334814;STB=0.516126;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00226545;OID=.;OPOS=22337393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:121:127:3:3:116:124:0.976378:75:41:3:0:79:45:3:0 chr14 22356491 . G T 744.67 PASS AF=0.964286;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00752054;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2326;QD=53.1906;RBI=0.0449585;REFB=-0.195593;REVB=0.044325;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031395;STB=0.516661;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00999342;OID=.;OPOS=22356491;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:57:56:2:2:54:54:0.964286:29:25:0:2:29:25:0:2 chr14 22356551 . T C 683.13 PASS AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0180004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0553;QD=52.5485;RBI=0.0547858;REFB=-0.0792531;REVB=0.0517443;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184579;STB=0.519223;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00337124;OID=.;OPOS=22356551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:25:25:0:1:25:25:0:2 chr14 22362971 . A G 1761.84 PASS AF=0.924242;AO=121;DP=131;FAO=122;FDP=132;FR=.;FRO=10;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0105841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4166;QD=53.389;RBI=0.0335617;REFB=-0.0349306;REVB=-0.0318491;RO=10;SAF=61;SAR=60;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138637;STB=0.507574;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0202466;OID=.;OPOS=22362971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:131:132:10:10:121:122:0.924242:60:61:6:4:61:61:6:4 chr14 22386449 . C T 872.43 PASS AF=0.437788;AO=95;DP=217;FAO=95;FDP=217;FR=.;FRO=122;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=48;FSRR=74;FWDB=-0.012161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.189;QD=16.0817;RBI=0.0168404;REFB=0.000975648;REVB=-0.0116495;RO=119;SAF=41;SAR=54;SRF=47;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037599;STB=0.521977;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=-0.00164017;OID=.;OPOS=22386449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:119:122:95:95:0.437788:54:41:47:72:54:41:48:74 chr14 22392304 . G A 257.36 PASS AF=0.348315;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.00968737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9749;QD=11.5667;RBI=0.0156592;REFB=0.00769725;REVB=0.012303;RO=57;SAF=18;SAR=13;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120342;STB=0.564098;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=-0.0223786;OID=.;OPOS=22392304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:57:58:31:31:0.348315:13:18:27:30:13:18:28:30 chr14 22392366 . C T 321.2 PASS AF=0.375;AO=39;DP=105;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.00404476;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.506;QD=12.3537;RBI=0.00456693;REFB=-0.00752916;REVB=-0.00212055;RO=65;SAF=21;SAR=18;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682642;STB=0.538902;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0132279;OID=.;OPOS=22392366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:65:65:39:39:0.375:18:21:39:26:18:21:39:26 chr14 22392626 . A C 503.7 PASS AF=0.533333;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00661749;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9869;QD=22.3866;RBI=0.0348159;REFB=-0.00479118;REVB=-0.0341812;RO=40;SAF=27;SAR=21;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104763;STB=0.504236;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00341746;OID=.;OPOS=22392626;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:40:42:48:48:0.533333:21:27:22:18:21:27:24:18 chr14 22392703 . G C 235.44 PASS AF=0.388889;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0208771;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.599;QD=13.0797;RBI=0.0241652;REFB=-0.0189214;REVB=0.0121697;RO=44;SAF=12;SAR=16;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281436;STB=0.516117;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0206499;OID=.;OPOS=22392703;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:44:44:28:28:0.388889:16:12:20:24:16:12:20:24 chr14 22509188 . T C 614.36 PASS AF=0.888889;AO=48;DP=54;FAO=48;FDP=54;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00478885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9099;QD=45.5078;RBI=0.0302011;REFB=-0.00601916;REVB=-0.029819;RO=5;SAF=17;SAR=31;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467919;STB=0.517522;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000610493;OID=.;OPOS=22509188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:54:54:5:6:48:48:0.888889:31:17:3:2:31:17:3:3 chr14 22521051 . G A 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.017992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.242;QD=16.1562;RBI=0.0220481;REFB=-0.00188477;REVB=0.0127438;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178028;STB=0.510043;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00230931;OID=.;OPOS=22521051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:16:16:13:14:16:16 chr14 22600863 . G A 1404.68 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=358.695;QD=62.4301;RBI=0.0132142;REFB=0;REVB=-0.0109277;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.88233e-06;OID=.;OPOS=22600863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:45:44:0:0:45:45:0:0 chr14 22616547 . A G 730.64 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00952613;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.148;QD=57.3051;RBI=0.0113154;REFB=0;REVB=0.00610669;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202182;OID=.;OPOS=22616547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:17:33:0:0:17:34:0:0 chr14 22631678 . C T 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.801;QD=63.2868;RBI=0.0314555;REFB=0;REVB=0.0237026;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14235e-05;OID=.;OPOS=22631678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0 chr14 22636784 . A C 657.71 PASS AF=0.96;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00576169;FXX=0.019604;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.003;QD=52.6165;RBI=0.0376197;REFB=-0.163487;REVB=0.0371759;RO=2;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408602;STB=0.52173;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000575349;OID=.;OPOS=22636784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:51:50:2:2:48:48:0.96:22:26:0:2:22:26:0:2 chr14 22636874 . C T 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.425;QD=51.1814;RBI=0.0618487;REFB=0;REVB=0.00666527;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174042;OID=.;OPOS=22636874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr14 22670458 . C T 1539.93 PASS AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00566502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8718;QD=58.664;RBI=0.00830667;REFB=-0.117797;REVB=-0.00607522;RO=1;SAF=56;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839887;STB=0.504424;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00108253;OID=.;OPOS=22670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:48:56:1:0:48:56:1:0 chr14 22670975 . G A 483.29 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.074;QD=58.58;RBI=0.0571075;REFB=0;REVB=-0.0114822;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000600469;OID=.;OPOS=22670975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0 chr14 22690209 . A C 888.5 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0107759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5837;QD=56.4127;RBI=0.0447061;REFB=0.0611265;REVB=-0.043388;RO=1;SAF=36;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129354;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00140068;OID=.;OPOS=22690209;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:26:36:1:0:26:36:1:0 chr14 22695084 . C T 363.15 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8786;QD=53.7996;RBI=0.0347441;REFB=0;REVB=-0.0247847;RO=1;SAF=15;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029965;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212423;OID=.;OPOS=22695084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:1:0:26:27:1:11:15:1:0:11:16:0:0 chr14 22739862 . A T 395.41 PASS AF=0.455556;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00977051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.755;QD=17.574;RBI=0.0382406;REFB=-0.00977213;REVB=-0.0369713;RO=48;SAF=29;SAR=12;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254485;STB=0.648806;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00763615;OID=.;OPOS=22739862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:49:41:41:0.455556:12:29:22:26:12:29:22:27 chr14 22740245 . A G 302.8 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0525154;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.111;QD=16.8223;RBI=0.0539514;REFB=-0.00835665;REVB=0.012365;RO=39;SAF=17;SAR=16;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516574;STB=0.528998;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00955783;OID=.;OPOS=22740245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:39:39:33:33:0.458333:16:17:18:21:16:17:18:21 chr14 22740270 . G A 328.53 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0153985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.809;QD=17.0665;RBI=0.0168962;REFB=-0.0056888;REVB=-0.00695472;RO=41;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380447;STB=0.521288;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00663912;OID=.;OPOS=22740270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:19:17:21:20:19:17:21:20 chr14 22887459 . CG C 165.4 PASS AF=0.438356;AO=30;DP=74;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0327963;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.1792;QD=9.06307;RBI=0.169843;REFB=-0.00177922;REVB=0.166647;RO=40;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.492754;SSSB=0.0927923;STB=0.56024;STBP=0.387;TYPE=del;VARB=0.0174346;OID=.;OPOS=22887460;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.438356:30:74:32:73:41:19:13:20:21:99:40:17:13:19:21 chr14 22891883 . G C 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0101748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2758;QD=21.0652;RBI=0.0192518;REFB=-0.00987476;REVB=-0.0163433;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037189;STB=0.520888;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0104122;OID=.;OPOS=22891883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:12:12:11:13:12:12 chr14 22942890 . G T 708.01 PASS AF=0.526718;AO=69;DP=131;FAO=69;FDP=131;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=-0.00846036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.352;QD=21.6185;RBI=0.00905402;REFB=-0.0129093;REVB=0.00322453;RO=62;SAF=29;SAR=40;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585567;STB=0.532101;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.012132;OID=.;OPOS=22942890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:62:62:69:69:0.526718:40:29:22:40:40:29:22:40 chr14 22947903 . C T 415.14 PASS AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.000439536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.165;QD=21.8492;RBI=0.0012998;REFB=-0.00657168;REVB=0.00122323;RO=35;SAF=19;SAR=22;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137158;STB=0.575586;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0041563;OID=.;OPOS=22947903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:35:41:41:0.539474:22:19:22:13:22:19:22:13 chr14 22961854 . A G 364.67 PASS AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0517065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.9739;QD=21.4513;RBI=0.0713233;REFB=0.0382253;REVB=-0.0491269;RO=31;SAF=17;SAR=20;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178492;STB=0.598373;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.0307318;OID=.;OPOS=22961854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:20:17:21:10:20:17:21:10 chr14 22964880 . A C 202.01 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0779193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.527;QD=21.2645;RBI=0.0780279;REFB=-0.0351053;REVB=0.00411572;RO=18;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593334;STB=0.533301;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0321874;OID=.;OPOS=22964880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:12:8:6:12:12:8:6:12 chr14 22972742 . G A 331.72 PASS AF=0.380952;AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.0144722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.436;QD=12.637;RBI=0.0197388;REFB=-0.000739524;REVB=-0.013423;RO=65;SAF=23;SAR=17;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156121;STB=0.58886;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00124147;OID=.;OPOS=22972742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:65:40:40:0.380952:17:23:28:37:17:23:28:37 chr14 22972783 . AC A 980.16 PASS AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.6488;QD=46.6741;RBI=0.113208;REFB=0;REVB=-0.103667;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00221236;OID=.;OPOS=22972784;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:82:84:84:84:0:40:44:0:0:18:0:40:42:0:0 chr14 22972815 . C T 218.06 PASS AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0191026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=321.722;QD=11.477;RBI=0.019547;REFB=-0.0102014;REVB=-0.00414423;RO=49;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163052;STB=0.594134;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.018982;OID=.;OPOS=22972815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:12:15:20:29:12:15:20:29 chr14 22975700 . T G 292.42 PASS AF=0.330435;AO=38;DP=115;FAO=38;FDP=115;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.00224509;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.788;QD=10.171;RBI=0.0214886;REFB=-0.00166922;REVB=-0.021371;RO=77;SAF=23;SAR=15;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203214;STB=0.617599;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00291222;OID=.;OPOS=22975700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:77:77:38:38:0.330435:15:23:33:44:15:23:33:44 chr14 22978335 . C T 2430.44 PASS AF=1;AO=156;DP=156;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3671;QD=60.3835;RBI=0.0590921;REFB=0;REVB=0.0441304;RO=0;SAF=65;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000907632;OID=.;OPOS=22978335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:156:161:0:0:156:161:1:91:65:0:0:92:69:0:0 chr14 22979980 . G A 864.04 PASS AF=0.552632;AO=82;DP=150;FAO=84;FDP=152;FR=.;FRO=68;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=-0.0062162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.126;QD=22.738;RBI=0.00814942;REFB=-0.00808449;REVB=-0.0052699;RO=68;SAF=40;SAR=42;SRF=25;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100113;STB=0.554041;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0069334;OID=.;OPOS=22979980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:68:68:82:84:0.552632:42:40:25:43:43:41:25:43 chr14 22984586 . A C 776.21 PASS AF=0.554054;AO=62;DP=147;FAO=82;FDP=148;FR=.;FRO=66;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=-0.0151247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.433;QD=20.9786;RBI=0.0164394;REFB=-0.0114575;REVB=0.00644185;RO=63;SAF=39;SAR=23;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372203;STB=0.591334;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00565951;OID=.;OPOS=22984586;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:63:66:62:82:0.554054:23:39:42:21:43:39:45:21 chr14 22988972 . G C 730.65 PASS AF=0.551181;AO=70;DP=127;FAO=70;FDP=127;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00271988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.421;QD=23.0127;RBI=0.00305876;REFB=0.00130188;REVB=0.00139938;RO=57;SAF=26;SAR=44;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874998;STB=0.547918;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.000944671;OID=.;OPOS=22988972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:57:57:70:70:0.551181:44:26:27:30:44:26:27:30 chr14 22993278 . A AG 703.08 PASS AF=1;AO=58;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.1127;QD=46.8723;RBI=0.0599628;REFB=-0.0486354;REVB=-0.00621487;RO=4;SAF=29;SAR=29;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303643;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00240251;OID=.;OPOS=22993279;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:58:62:60:60:0:30:30:0:0:9:4:29:29:3:1 chr14 22995872 . CAAGT C 332.65 PASS AF=0.394558;AO=58;DP=149;FAO=58;FDP=147;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=0.00256875;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=323.642;QD=9.05166;RBI=0.00317687;REFB=-0.00549333;REVB=0.00186923;RO=87;SAF=17;SAR=41;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21753;STB=0.624479;STBP=0.025;TYPE=del;VARB=0.00755196;OID=.;OPOS=22995873;OREF=AAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.394558:58:149:58:147:89:17:41:43:46:99:87:17:41:42:45 chr14 22997524 . A G 2276.87 PASS AF=0.993464;AO=149;DP=151;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0290993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3096;QD=59.526;RBI=0.0301926;REFB=-0.0494375;REVB=-0.00805116;RO=1;SAF=75;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629973;STB=0.503268;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000237063;OID=.;OPOS=22997524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:151:153:1:1:149:152:0.993464:74:75:1:0:76:76:1:0 chr14 22998590 . AG A 1076.0 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.0682;QD=48.3594;RBI=0.0400406;REFB=0;REVB=0.0115799;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000752106;OID=.;OPOS=22998591;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:88:89:89:89:0:44:45:0:0:19:0:44:44:0:0 chr14 22998619 . AC A 910.88 PASS AF=1;AO=72;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0594382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.5321;QD=47.9411;RBI=0.0627953;REFB=0;REVB=0.0202572;RO=1;SAF=38;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122839;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00057923;OID=.;OPOS=22998620;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:72:76:76:76:0:40:36:0:0:16:1:38:34:1:0 chr14 23000062 . T C 1062.37 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.802;QD=59.8519;RBI=0.0682259;REFB=0;REVB=0.0181929;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318385;OID=.;OPOS=23000062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0 chr14 23009196 . C T 474.83 PASS AF=0.516854;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0108422;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2022;QD=21.3407;RBI=0.0405985;REFB=-0.0202278;REVB=-0.039124;RO=42;SAF=26;SAR=20;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218304;STB=0.614223;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0183977;OID=.;OPOS=23009196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:42:43:46:46:0.516854:20:26:13:29:20:26:14:29 chr14 23013973 . G T 310.68 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0166902;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.931;QD=16.3514;RBI=0.0189982;REFB=-0.019318;REVB=0.00907564;RO=42;SAF=26;SAR=8;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416031;STB=0.734913;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.012632;OID=.;OPOS=23013973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:8:26:15:27:8:26:15:27 chr14 23025932 . A T 873.94 PASS AF=0.567376;AO=80;DP=142;FAO=80;FDP=141;FR=.;FRO=61;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0305599;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.619;QD=24.7926;RBI=0.0358115;REFB=2.50992e-05;REVB=0.0186696;RO=61;SAF=37;SAR=43;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553992;STB=0.530173;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=1.74182e-05;OID=.;OPOS=23025932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:61:61:80:80:0.567376:43:37:24:37:43:37:24:37 chr14 23044002 . G T 349.21 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00630692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.038;QD=20.2437;RBI=0.00817903;REFB=-0.00301681;REVB=-0.00520762;RO=33;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586232;STB=0.532536;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0023424;OID=.;OPOS=23044002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:14:22:18:15:14:22:18:15 chr14 23067042 . A G 235.87 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00775905;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.402;QD=15.4672;RBI=0.00802919;REFB=-0.0214198;REVB=-0.00206521;RO=33;SAF=15;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199556;STB=0.518505;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.015694;OID=.;OPOS=23067042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:33:34:27:27:0.442623:12:15:19:14:12:15:20:14 chr14 23081223 . T C 780.97 PASS AF=0.95;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0425467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9278;QD=52.0646;RBI=0.0712621;REFB=0.00540782;REVB=0.057167;RO=1;SAF=22;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020948;STB=0.503648;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.000265374;OID=.;OPOS=23081223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:59:60:1:3:56:57:0.95:34:22:1:0:34:23:1:2 chr14 23102784 . A G 104.45 PASS AF=0.52;AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0286694;FXX=0.107105;HRUN=5;LEN=1;MLLD=72.358;QD=16.7116;RBI=0.0587944;REFB=0.00451495;REVB=0.0513308;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32335;STB=0.512801;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00380373;OID=.;OPOS=23102784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:9:12:11:13:0.52:8:3:0:9:10:3:3:9 chr14 23102882 . C A 130.64 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00346025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.886;QD=22.7198;RBI=0.00992548;REFB=-0.0075116;REVB=0.00930278;RO=9;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142469;STB=0.580527;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00465659;OID=.;OPOS=23102882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:9:5:5:4:9:5:5:4 chr14 23102896 . A G 141.51 PASS AF=0.681818;AO=14;DP=21;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0174724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.808;QD=25.7282;RBI=0.0263597;REFB=0.0106656;REVB=-0.019737;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132373;STB=0.580534;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.0115638;OID=.;OPOS=23102896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:22:7:7:14:15:0.681818:9:5:4:3:10:5:4:3 chr14 23102969 . G A 150.06 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0218607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4392;QD=19.3623;RBI=0.0235052;REFB=-0.00871291;REVB=-0.00863724;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224986;STB=0.609428;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0115541;OID=.;OPOS=23102969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:15:16:16:0.516129:9:7:10:4:9:7:10:5 chr14 23103040 . C T 226.43 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0103551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1678;QD=17.0888;RBI=0.0208505;REFB=-0.0272508;REVB=-0.0180974;RO=28;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680509;STB=0.53843;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0264211;OID=.;OPOS=23103040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:16:9:12:16:16:9:12:16 chr14 23103282 . T C 178.93 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00706106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5173;QD=15.2283;RBI=0.0083885;REFB=0.00835577;REVB=-0.00452862;RO=28;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173955;STB=0.599898;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.0210003;OID=.;OPOS=23103282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:10:9:18:10:10:9:18:10 chr14 23103347 . T C 216.3 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.011739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4147;QD=22.1847;RBI=0.0230429;REFB=-0.0260513;REVB=0.0198286;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165308;STB=0.591757;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0318521;OID=.;OPOS=23103347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:7:14:15:3:7:14:15:3 chr14 23103354 . ACG AGT,GTG 196.89 PASS AF=0.0555556,0.5;AO=2,18;DP=36;FAO=2,18;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=1,13;FSAR=1,5;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.00253198,0.00042142;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,2;MLLD=165.752,209.74;QD=21.8764;RBI=0.0418121,0.027042;REFB=0.0027435,-0.000240873;REVB=0.0417354,0.0270387;RO=16;SAF=1,13;SAR=1,5;SRF=14;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.464308,-0.174669;STB=0.831478,0.597249;STBP=0.719,0.333;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0343922,0.00319852;OID=.,.;OPOS=23103355,23103354;OREF=CG,AC;OALT=GT,GT;OMAPALT=AGT,GTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:36:36:16:16:2,18:2,18:0.0555556,0.5:1,5:1,13:14:2:1,5:1,13:14:2 chr14 23235808 . G A 1221.86 PASS AF=0.987805;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.99;QD=59.6029;RBI=0.0213904;REFB=-0.0895754;REVB=-0.00281601;RO=1;SAF=47;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00996796;STB=0.505153;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00515231;OID=.;OPOS=23235808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:82:1:1:80:81:0.987805:33:47:1:0:33:48:1:0 chr14 23236524 . C T 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.673;QD=58.7813;RBI=0.0238962;REFB=0;REVB=0.0066891;RO=0;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59089e-05;OID=.;OPOS=23236524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:20:45:0:0:20:45:0:0 chr14 23242828 . T C 382.38 PASS AF=1;AO=26;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.333;QD=52.7418;RBI=0.0666546;REFB=0;REVB=0.0429445;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0234853;OID=.;OPOS=23242828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:26:29:1:14:12:0:0:14:15:0:0 chr14 23248112 . A G 492.07 PASS AF=0.921053;AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0166346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7852;QD=51.7972;RBI=0.0486017;REFB=0.0230776;REVB=0.0456664;RO=3;SAF=21;SAR=14;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622689;STB=0.533315;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00314985;OID=.;OPOS=23248112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:38:38:3:3:35:35:0.921053:14:21:3:0:14:21:3:0 chr14 23282110 . A G 142.72 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.024529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.846;QD=24.82;RBI=0.0314595;REFB=-0.0347941;REVB=0.0196984;RO=8;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188703;STB=0.605915;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0136671;OID=.;OPOS=23282110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:10:5:5:3:10:5:5:3 chr14 23282449 . C T 152.37 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0222486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.071;QD=21.0163;RBI=0.0230417;REFB=-0.0125949;REVB=0.00599319;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633569;STB=0.55166;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00702642;OID=.;OPOS=23282449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:8:8:7:5:8:8:8:5 chr14 23299135 . G T 445.93 PASS AF=0.395349;AO=51;DP=130;FAO=51;FDP=129;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.0203212;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.063;QD=13.8273;RBI=0.0246475;REFB=0.00731744;REVB=0.013948;RO=78;SAF=27;SAR=24;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861254;STB=0.548662;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.0103137;OID=.;OPOS=23299135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:78:78:51:51:0.395349:24:27:35:43:24:27:35:43 chr14 23299286 . T C 708.12 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867362;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.245;QD=56.6499;RBI=0.0396581;REFB=0;REVB=0.038698;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132216;OID=.;OPOS=23299286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:27:22:0:0:28:22:0:0 chr14 23303641 . A C 677.66 PASS AF=1;AO=44;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198945;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.432;QD=51.1443;RBI=0.031913;REFB=0;REVB=0.0249529;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145525;OID=.;OPOS=23303641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:44:53:1:21:23:0:0:25:28:0:0 chr14 23306047 . C CT 184.16 PASS AF=1;AO=2;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123975;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=217.477;QD=46.0404;RBI=0.128548;REFB=0;REVB=-0.0339831;RO=14;SAF=0;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521257;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-3.53033e-05;OID=.;OPOS=23306048;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:16:16:16:0:6:10:0:0:4:14:0:2:6:8 chr14 23306048 . C T 147.72 PASS AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0404419;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=254.213;QD=36.9288;RBI=0.0462733;REFB=-0.170988;REVB=0.0224871;RO=2;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100822;STB=0.555478;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00139163;OID=.;OPOS=23306048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:16:16:2:2:14:14:0.875:8:6:0:2:8:6:0:2 chr14 23312923 . T C 139.07 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0599591;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3548;QD=11.5891;RBI=0.0605767;REFB=-0.0413806;REVB=0.00862801;RO=29;SAF=1;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.602457;STB=0.755467;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0217548;OID=.;OPOS=23312923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:32:11:16:0.333333:10:1:16:13:13:3:17:15 chr14 23321900 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.117;QD=56.7066;RBI=0.0246469;REFB=0;REVB=0.014774;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176052;OID=.;OPOS=23321900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr14 23354151 . C T 157.03 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00369499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.255;QD=16.1054;RBI=0.00394394;REFB=-0.00354262;REVB=0.00137901;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131602;STB=0.575668;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00823336;OID=.;OPOS=23354151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:10:12:7:10:10:12 chr14 23371255 . G GGGC 74.46 PASS AF=0.692308;AO=7;DP=14;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0310906;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=153.959;QD=22.9105;RBI=0.0425278;REFB=-0.0392848;REVB=0.029017;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183473;STB=0.517203;STBP=0.914;TYPE=ins;VARB=0.0133872;OID=.;OPOS=23371256;OREF=-;OALT=GGC;OMAPALT=GGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.692308:7:14:9:13:4:5:4:2:2:21:6:3:4:4:2 chr14 23374435 . G A 818.0 PASS AF=1;AO=51;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.15;QD=57.4033;RBI=0.0388903;REFB=0;REVB=0.0358084;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226773;OID=.;OPOS=23374435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:51:57:1:23:28:0:0:29:28:0:0 chr14 23374862 . C T 358.07 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.119;QD=55.087;RBI=0.0334599;REFB=0;REVB=0.0218157;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170111;OID=.;OPOS=23374862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0 chr14 23398902 . C T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.619;QD=64.1538;RBI=0.108162;REFB=0;REVB=0.100707;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467944;OID=.;OPOS=23398902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0 chr14 23398990 . T G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.261;QD=57.1774;RBI=0.00872113;REFB=0;REVB=-0.00851913;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.49409e-05;OID=.;OPOS=23398990;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0 chr14 23426182 . C A 300.92 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.152185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.672;QD=52.3339;RBI=0.156837;REFB=0;REVB=0.0379169;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000985114;OID=.;OPOS=23426182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:14:7:0:0:14:9:0:0 chr14 23495502 . C G 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0124784;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=339.239;QD=15.6455;RBI=0.0158705;REFB=-0.00452489;REVB=0.00980624;RO=29;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625554;STB=0.535682;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.00588381;OID=.;OPOS=23495502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:12:10:15:14:12:10:15:14 chr14 23511579 . G A 806.94 PASS AF=0.623932;AO=73;DP=120;FAO=73;FDP=117;FR=.;FRO=44;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.016991;FXX=0.0249979;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.692;QD=27.5877;RBI=0.0177118;REFB=-0.0215458;REVB=0.00500136;RO=43;SAF=35;SAR=38;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00983161;STB=0.500821;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00960131;OID=.;OPOS=23511579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:117:43:44:73:73:0.623932:38:35:20:23:38:35:21:23 chr14 23530622 . T C 1120.79 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0752294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.804;QD=58.9887;RBI=0.0757367;REFB=-0.154848;REVB=0.00875095;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507461;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00162455;OID=.;OPOS=23530622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:33:42:0:0:33:42:0:1 chr14 23548783 . A AGAACGT,T 1290.1 PASS AF=0.772277,0.168317;AO=77,17;DP=101;FAO=78,17;FDP=101;FR=.;FRO=6;FSAF=29,9;FSAR=49,8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00963137,-0.0314072;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=6,1;MLLD=268.186,97.7574;QD=51.093;RBI=0.0101301,0.0340717;REFB=-0.0526558,-0.0511805;REVB=0.0031393,0.0132086;RO=6;SAF=28,9;SAR=49,8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0199812,0.0139023;STB=0.50975,0.507683;STBP=0.552,0.93;TYPE=ins,snp;VARB=0.00457402,0.0580901;OID=.,.;OPOS=23548784,23548783;OREF=-,A;OALT=GAACGT,T;OMAPALT=AGAACGT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:101:101:6:6:77,17:78,17:0.772277,0.168317:49,8:28,9:3:3:49,8:29,9:3:3 chr14 23549319 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.115;QD=56.9569;RBI=0.0186976;REFB=0;REVB=0.0105807;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66397e-05;OID=.;OPOS=23549319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr14 23549379 . C G 738.79 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.924;QD=62.8758;RBI=0.0173794;REFB=0;REVB=0.017307;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57909e-05;OID=.;OPOS=23549379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:47:0:0:43:47:1:25:18:0:0:27:20:0:0 chr14 23549785 . T C 1047.35 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0389722;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.543;QD=58.1859;RBI=0.0436286;REFB=-0.0928293;REVB=0.0196117;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000548119;OID=.;OPOS=23549785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:72:0:1:70:71:0.986111:38:32:0:0:38:33:0:1 chr14 23567369 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.138;QD=35.5759;RBI=0.0493644;REFB=0;REVB=0.017402;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104859;OID=.;OPOS=23567369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr14 23569106 . A G 650.02 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.946;QD=61.907;RBI=0.0406401;REFB=0;REVB=-0.0208364;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92646e-05;OID=.;OPOS=23569106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr14 23571671 . A T 1041.87 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.327;QD=59.5356;RBI=0.0317021;REFB=0;REVB=0.00690988;RO=0;SAF=25;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018418;OID=.;OPOS=23571671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:44:25:0:0:45:25:0:0 chr14 23595721 . A G 1044.35 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00418688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5283;QD=59.677;RBI=0.0179772;REFB=0;REVB=-0.0174828;RO=0;SAF=44;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122619;OID=.;OPOS=23595721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:26:44:0:0:26:44:0:0 chr14 23598952 . A G,T 1204.74 PASS AF=0.95122,0.0365854;AO=77,3;DP=80;FAO=78,3;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=35,0;FSAR=43,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00782522,-0.00125107;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.24,124.184;QD=58.7676;RBI=0.036084,0.0330166;REFB=-0.0905281,-0.0612828;REVB=0.0352252,0.0329929;RO=0;SAF=35,0;SAR=42,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.505746,0.5;STBP=0.522,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00169442,0.00396596;OID=.,.;OPOS=23598952,23598952;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:80:82:0:1:77,3:78,3:0.95122,0.0365854:42,3:35,0:0:0:43,3:35,0:0:1 chr14 23744800 . ACATCATCATCATCATCATCATCA ACATCATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCATCT 49.32 PASS AF=0.172414,0.103448;AO=4,3;DP=29;FAO=5,3;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=1,1;FSAR=4,2;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0648874,-0.0426997;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=100.045,187.6;QD=6.80262;RBI=0.0729612,0.0494021;REFB=-0.0269969,0.00371279;REVB=-0.0333611,-0.0248455;RO=19;SAF=1,1;SAR=3,2;SRF=4;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0635908,0.1723;STB=0.545264,0.599401;STBP=0.872,0.805;TYPE=del,snp;VARB=0.15003,0.00330797;OID=.,.;OPOS=23744801,23744823;OREF=CAT,A;OALT=-,T;OMAPALT=ACATCATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCATCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.172414,0.103448:4,3:29:5,3:29:21:1,1:4,2:5:16:29:19:1,1:3,2:4:15 chr14 23745533 . C T 356.14 PASS AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0132046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7678;QD=16.5645;RBI=0.0301213;REFB=-0.0527382;REVB=-0.0270727;RO=47;SAF=17;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833533;STB=0.541083;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.029129;OID=.;OPOS=23745533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:47:48:38:38:0.44186:21:17:25:22:21:17:25:23 chr14 23777099 . G A 1029.91 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939433;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.9;QD=59.7047;RBI=0.0479829;REFB=0;REVB=0.0470543;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110536;OID=.;OPOS=23777099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0 chr14 23777374 . A G 1434.43 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.841;QD=63.052;RBI=0.0246437;REFB=0;REVB=0.00644966;RO=0;SAF=34;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.91714e-05;OID=.;OPOS=23777374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:57:34:0:0:57:34:0:0 chr14 23780569 . TTA T,TT 72.09 PASS AF=0.555556,0;AO=5,3;DP=22;FAO=10,0;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=8,0;FSAR=2,0;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.165474,0.0243501;FXX=0.09995;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=25.1275,13.5437;QD=16.0194;RBI=0.165693,0.0370796;REFB=-0.0119345,-0.0186102;REVB=0.0085053,0.0279637;RO=11;SAF=5,3;SAR=0,0;SRF=6;SRR=5;SSEN=0.391304,0;SSEP=0,0;SSSB=0.712192,0.630413;STB=0.666296,0.5;STBP=0.199,1;TYPE=del,del;VARB=0.0223268,0;OID=.,.;OPOS=23780570,23780571;OREF=TA,A;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.555556,0:5,3:22:10,0:18:8:8,0:2,0:4:4:55:11:5,3:0,0:6:5 chr14 23829041 . TG GT 106.81 PASS AF=0.261905;AO=7;DP=85;FAO=22;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.00386399;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=2;MLLD=68.8203;QD=5.08613;RBI=0.162981;REFB=-0.000807611;REVB=-0.162935;RO=43;SAF=1;SAR=6;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496514;STB=0.924244;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.00336659;OID=.;OPOS=23829041;OREF=TG;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:43:62:7:22:0.261905:6:1:24:19:21:1:30:32 chr14 23902753 . G A 344.68 PASS AF=0.5;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0122313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.07;QD=19.149;RBI=0.0150511;REFB=-0.00806999;REVB=-0.00877113;RO=35;SAF=17;SAR=19;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138073;STB=0.569086;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00896693;OID=.;OPOS=23902753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:36:36:36:0.5:19:17:22:13:19:17:22:14 chr14 23944505 . G A 321.94 PASS AF=0.391304;AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00829163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.905;QD=13.9972;RBI=0.0182019;REFB=0.00304258;REVB=0.0162036;RO=56;SAF=13;SAR=23;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152761;STB=0.587124;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.00386731;OID=.;OPOS=23944505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:56:36:36:0.391304:23:13:28:28:23:13:28:28 chr14 23944514 . C A 262.05 PASS AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0077763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.38;QD=12.4784;RBI=0.0197977;REFB=-0.00586177;REVB=-0.0182065;RO=52;SAF=11;SAR=20;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163192;STB=0.588645;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.010818;OID=.;OPOS=23944514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:52:53:31:31:0.369048:20:11:26:26:20:11:26:27 chr14 23947374 . G A 254.25 PASS AF=0.329787;AO=31;DP=94;FAO=31;FDP=94;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=44;FWDB=-0.0126947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.158;QD=10.819;RBI=0.013073;REFB=-0.00283223;REVB=-0.003122;RO=63;SAF=13;SAR=18;SRF=19;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144057;STB=0.583162;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00700921;OID=.;OPOS=23947374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:63:63:31:31:0.329787:18:13:19:44:18:13:19:44 chr14 24037271 . AT A,TA 80.24 PASS AF=0.4,0.125;AO=13,7;DP=41;FAO=16,5;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11,0;FSAR=5,5;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0654851,0.0118556;FXX=0.0476077;HRUN=8,1;LEN=1,2;MLLD=7.99289,19.3282;QD=8.02403;RBI=0.145102,0.0449491;REFB=-0.0990655,-0.0223368;REVB=-0.129485,-0.0433575;RO=16;SAF=10,1;SAR=3,6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.344161,-0.402921;STB=0.649255,0.997339;STBP=0.153,0.034;TYPE=del,mnp;VARB=0.0903668,0.0410891;OID=.,.;OPOS=24037272,24037271;OREF=T,AT;OALT=-,TA;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:41:40:16:19:13,7:16,5:0.4,0.125:3,6:10,1:7:9:5,5:11,0:8:11 chr14 24261219 . T C 1065.94 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0367113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1854;QD=58.4078;RBI=0.0625412;REFB=-0.066089;REVB=0.0506329;RO=1;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129566;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00136878;OID=.;OPOS=24261219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:36:36:0:1:36:36:0:1 chr14 24261273 . G C 309.46 PASS AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00939387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.528;QD=16.0759;RBI=0.0209689;REFB=-0.0159903;REVB=0.018747;RO=42;SAF=15;SAR=19;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104543;STB=0.565179;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0147344;OID=.;OPOS=24261273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:43:34:34:0.441558:19:15:23:19:19:15:24:19 chr14 24261275 . C T 1116.94 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00243764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.81;QD=60.3751;RBI=0.0504234;REFB=0;REVB=-0.0503644;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118191;OID=.;OPOS=24261275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:36:37:0:0:36:38:0:0 chr14 24261340 . A G 669.75 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0716;QD=62.302;RBI=0.132819;REFB=0;REVB=-0.0216124;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138515;OID=.;OPOS=24261340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0 chr14 24408954 . A G 55.77 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.00213833;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.8039;QD=10.6229;RBI=0.0788945;REFB=-0.0330523;REVB=-0.0788655;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267229;STB=0.657205;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0380609;OID=.;OPOS=24408954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:2:11:5:3:2:11 chr14 24422795 . A G 336.54 PASS AF=0.537313;AO=34;DP=64;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0447186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.4974;QD=20.092;RBI=0.0456324;REFB=-0.0665241;REVB=-0.00908681;RO=30;SAF=20;SAR=14;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213404;STB=0.604881;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0427181;OID=.;OPOS=24422795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:30:31:34:36:0.537313:14:20:10:20:15:21:11:20 chr14 24423090 . A G 263.82 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0264042;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.4351;QD=19.5419;RBI=0.0265384;REFB=-0.0449812;REVB=0.00266533;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622472;STB=0.534734;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0239294;OID=.;OPOS=24423090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:16:12:13:13:16:12:13:13 chr14 24458162 . G C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6258;QD=58.7816;RBI=0.0662212;REFB=0;REVB=-0.0611287;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000306034;OID=.;OPOS=24458162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0 chr14 24458211 . A T 325.8 PASS AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00400238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.494;QD=17.3762;RBI=0.00696842;REFB=-0.0114248;REVB=0.00570437;RO=40;SAF=21;SAR=14;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143851;STB=0.580599;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0169167;OID=.;OPOS=24458211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:14:21:18:22:14:21:18:22 chr14 24464310 . C A 561.09 PASS AF=0.401235;AO=65;DP=162;FAO=65;FDP=162;FR=.;FRO=97;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=-0.00966328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.956;QD=13.8541;RBI=0.00966706;REFB=-0.0139855;REVB=-0.000270078;RO=96;SAF=31;SAR=34;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00868553;STB=0.501618;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0309427;OID=.;OPOS=24464310;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:96:97:65:65:0.401235:34:31:45:51:34:31:46:51 chr14 24470231 . T G 792.39 PASS AF=0.371094;AO=95;DP=257;FAO=95;FDP=256;FR=.;FRO=161;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=56;FSRR=105;FWDB=-0.000451485;FXX=0.0038909;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.272;QD=12.3811;RBI=0.0216482;REFB=-0.00240598;REVB=-0.0216434;RO=160;SAF=53;SAR=42;SRF=56;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22791;STB=0.629855;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00269332;OID=.;OPOS=24470231;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:256:160:161:95:95:0.371094:42:53:56:104:42:53:56:105 chr14 24505722 . C G 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.544;QD=58.6006;RBI=0.0230972;REFB=0;REVB=0.00330958;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83099e-05;OID=.;OPOS=24505722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:31:33:0:0:31:33:0:0 chr14 24507003 . A C 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7628;QD=57.2364;RBI=0.030207;REFB=0;REVB=-0.0301259;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000341027;OID=.;OPOS=24507003;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0 chr14 24507010 . C A 288.86 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0267879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7175;QD=21.0078;RBI=0.0288003;REFB=-0.0108004;REVB=-0.0105766;RO=25;SAF=12;SAR=18;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344163;STB=0.519071;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00814331;OID=.;OPOS=24507010;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:18:12:9:16:18:12:9:16 chr14 24527220 . C T 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.879;QD=59.0186;RBI=0.0314554;REFB=0;REVB=0.0302525;RO=0;SAF=25;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213289;OID=.;OPOS=24527220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:9:25:0:0:9:25:0:0 chr14 24529209 . C T 778.41 PASS AF=0.982759;AO=55;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0975842;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.78;QD=53.6832;RBI=0.0989817;REFB=-0.0905196;REVB=0.0165738;RO=1;SAF=17;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269172;STB=0.512816;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.000398267;OID=.;OPOS=24529209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:58:58:1:1:55:57:0.982759:38:17:1:0:38:19:1:0 chr14 24529260 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.852;QD=61.684;RBI=0.0123197;REFB=0;REVB=0.0121542;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56873e-05;OID=.;OPOS=24529260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr14 24529890 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.518;QD=45.8067;RBI=0.136662;REFB=0;REVB=0.040986;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001337;OID=.;OPOS=24529890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:13:1:0:0:13:1:0:0 chr14 24543808 . G C 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.02;QD=57.1056;RBI=0.0403866;REFB=0;REVB=0.0371614;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104038;OID=.;OPOS=24543808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:21:34:0:0:21:34:0:0 chr14 24545366 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0577985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.362;QD=56.1907;RBI=0.0578088;REFB=0;REVB=-0.0010886;RO=0;SAF=4;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000317001;OID=.;OPOS=24545366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:24:4:0:0:24:4:0:0 chr14 24545835 . C T 535.36 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0971908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.518;QD=59.4847;RBI=0.110268;REFB=0;REVB=0.0520862;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116075;OID=.;OPOS=24545835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:17:18:0:0:18:18:0:0 chr14 24551796 . A AC,C 53.46 PASS AF=0.114286,0.0571429;AO=20,7;DP=112;FAO=12,6;FDP=105;FR=.;FRO=87;FSAF=2,5;FSAR=10,1;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=-0.0366847,-0.0286272;FXX=0.0366939;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=52.4103,61.7011;QD=2.03639;RBI=0.0369014,0.0295022;REFB=-0.0079345,-0.00624054;REVB=0.00399328,-0.00713174;RO=83;SAF=5,5;SAR=15,2;SRF=40;SRR=43;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.309627,0.252079;STB=0.785998,0.840993;STBP=0.048,0.12;TYPE=ins,snp;VARB=0.0541343,0.155323;OID=.,.;OPOS=24551797,24551796;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:112:105:83:87:20,7:12,6:0.114286,0.0571429:15,2:5,5:40:43:10,1:2,5:40:47 chr14 24563339 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.998;QD=33.4285;RBI=0.0480775;REFB=0;REVB=0.0479071;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367086;OID=.;OPOS=24563339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr14 24567498 . A C 1450.46 PASS AF=0.989362;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0326495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9838;QD=61.7217;RBI=0.0608012;REFB=-0.0335142;REVB=-0.0512913;RO=1;SAF=49;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957698;STB=0.504949;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00373845;OID=.;OPOS=24567498;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:1:1:92:93:0.989362:43:49:1:0:43:50:1:0 chr14 24567508 . T C,G 1490.94 PASS AF=0.958333,0.0416667;AO=92,4;DP=96;FAO=92,4;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=50,0;FSAR=42,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000809014,-0.0146949;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=84.1049,43.1983;QD=62.1225;RBI=0.00216785,0.0149817;REFB=0,0;REVB=-0.00201123,-0.00291744;RO=0;SAF=50,0;SAR=42,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000215018,0.0729388;OID=.,.;OPOS=24567508,24567508;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:96:96:0:0:92,4:92,4:0.958333,0.0416667:42,4:50,0:0:0:42,4:50,0:0:0 chr14 24569418 . A G 1266.87 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00506095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.892;QD=60.3274;RBI=0.00507578;REFB=-0.0928424;REVB=0.000387789;RO=1;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116936;STB=0.506171;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-9.29811e-06;OID=.;OPOS=24569418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:40:43:0:1:40:43:0:1 chr14 24614361 . T G 1510.81 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.439;QD=63.6132;RBI=0.0454496;REFB=0;REVB=0.0442337;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64089e-05;OID=.;OPOS=24614361;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:52:43:0:0:52:43:0:0 chr14 24615435 . T C 1472.51 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.716;QD=63.334;RBI=0.0176317;REFB=0;REVB=-0.0034709;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75015e-05;OID=.;OPOS=24615435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:51:42:0:0:51:42:0:0 chr14 24617238 . C T 965.07 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.426;QD=57.6162;RBI=0.0675261;REFB=-0.0557531;REVB=0.0654646;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458963;OID=.;OPOS=24617238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:67:67:0:0:66:67:1:30:36:0:0:31:36:0:0 chr14 24646406 . G GGAA 602.88 PASS AF=0.921569;AO=44;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0173647;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=260.479;QD=47.2848;RBI=0.0462837;REFB=-0.0306369;REVB=0.0429028;RO=6;SAF=21;SAR=23;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424897;STB=0.522129;STBP=0.239;TYPE=ins;VARB=0.00267549;OID=.;OPOS=24646407;OREF=-;OALT=GAA;OMAPALT=GGAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.921569:44:51:47:51:4:22:25:3:1:19:6:21:23:4:2 chr14 24647814 . T C 260.55 PASS AF=0.509091;AO=27;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0395097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.968;QD=18.9492;RBI=0.0401995;REFB=-0.0339116;REVB=-0.00741542;RO=27;SAF=15;SAR=12;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991601;STB=0.562455;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0286462;OID=.;OPOS=24647814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:27:28:0.509091:12:15:12:15:12:16:12:15 chr14 24652882 . A G 389.13 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0486571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6258;QD=21.322;RBI=0.0535951;REFB=-0.0102259;REVB=0.0224706;RO=33;SAF=16;SAR=23;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376734;STB=0.528721;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00666698;OID=.;OPOS=24652882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:34:39:39:0.534247:23:16:15:18:23:16:16:18 chr14 24653954 . G A 75.61 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0749731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.632;QD=11.633;RBI=0.0755992;REFB=-0.0165464;REVB=0.00970933;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03914;STB=0.509073;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0494934;OID=.;OPOS=24653954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:7:3:5:10:7:3:5:11 chr14 24654489 . T C 321.33 PASS AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0209051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.318;QD=18.9019;RBI=0.0216025;REFB=-0.00880617;REVB=-0.00544464;RO=34;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053954;STB=0.530018;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.00801725;OID=.;OPOS=24654489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:15:19:21:13:15:19:21:13 chr14 24657407 . T G 204.84 PASS AF=0.294118;AO=13;DP=63;FAO=20;FDP=68;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=38;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.00232948;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.516;QD=12.0494;RBI=0.0739016;REFB=-0.00479946;REVB=0.0738649;RO=29;SAF=11;SAR=2;SRF=29;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516514;STB=0.645032;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0408682;OID=.;OPOS=24657407;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:68:29:38:13:20:0.294118:2:11:29:0:9:11:29:9 chr14 24679877 . C T 304.11 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00159567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.75;QD=19.9414;RBI=0.0243697;REFB=-0.0248857;REVB=0.0243174;RO=28;SAF=12;SAR=20;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167713;STB=0.58572;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0229685;OID=.;OPOS=24679877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:29:32:32:0.52459:20:12:16:12:20:12:16:13 chr14 24682767 . C T 286.04 PASS AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=0.0122152;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2363;QD=15.4616;RBI=0.0145801;REFB=-0.0199657;REVB=0.00796045;RO=42;SAF=5;SAR=27;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203934;STB=0.616853;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0308433;OID=.;OPOS=24682767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:32:32:0.432432:27:5:12:30:27:5:12:30 chr14 24702789 . C T 420.47 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.020352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.704;QD=16.4889;RBI=0.03158;REFB=-0.00748039;REVB=-0.0241473;RO=56;SAF=24;SAR=22;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563646;STB=0.531502;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0114491;OID=.;OPOS=24702789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:22:24:26:30:22:24:26:30 chr14 24705295 . T C 177.32 PASS AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0334332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9569;QD=12.2287;RBI=0.0410872;REFB=-0.00479206;REVB=0.0238826;RO=36;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388998;STB=0.522487;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0108077;OID=.;OPOS=24705295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:13:9:16:20:13:9:16:20 chr14 24736027 . G A 216.84 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.037317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3317;QD=22.2404;RBI=0.0687268;REFB=-0.0238064;REVB=0.0577132;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081208;STB=0.545412;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0216777;OID=.;OPOS=24736027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:6:12:12:9:6:12 chr14 24736961 . T C 270.1 PASS AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00761833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.126;QD=12.0046;RBI=0.0286718;REFB=-0.00494517;REVB=-0.0276411;RO=58;SAF=12;SAR=20;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161412;STB=0.593161;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0113239;OID=.;OPOS=24736961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:20:12:30:28:20:12:30:28 chr14 24771256 . T C 876.91 PASS AF=0.547297;AO=81;DP=148;FAO=81;FDP=148;FR=.;FRO=67;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.00607482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.8;QD=23.7004;RBI=0.016012;REFB=-0.0105536;REVB=0.0148149;RO=67;SAF=50;SAR=31;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142978;STB=0.578212;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00659262;OID=.;OPOS=24771256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:67:67:81:81:0.547297:31:50:30:37:31:50:30:37 chr14 24784911 . T C 325.12 PASS AF=0.472973;AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0111601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.596;QD=17.574;RBI=0.0211566;REFB=-0.0269297;REVB=0.0179737;RO=39;SAF=15;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0051048;STB=0.511295;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0254702;OID=.;OPOS=24784911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:39:39:34:35:0.472973:19:15:17:22:19:16:17:22 chr14 24785993 . GGGGCGTGGA G 190.73 PASS AF=0.482759;AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00368037;FXX=0.0937354;HRUN=4;LEN=9;MLLD=205.349;QD=13.1537;RBI=0.015787;REFB=-0.0259736;REVB=0.015352;RO=18;SAF=19;SAR=8;SRF=13;SRR=5;SSEN=0.246575;SSEP=0;SSSB=-0.0162015;STB=0.631617;STBP=0.061;TYPE=del;VARB=0.0288791;OID=.;OPOS=24785994;OREF=GGGCGTGGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.482759:27:59:28:58:30:19:9:13:17:99:18:19:8:13:5 chr14 24786293 . T G 397.32 PASS AF=0.882353;AO=30;DP=34;FAO=30;FDP=34;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0110137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.043;QD=46.743;RBI=0.0240487;REFB=0.00186486;REVB=0.0213785;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.706892;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.000486408;OID=.;OPOS=24786293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:34:34:0:4:30:30:0.882353:28:2:0:0:28:2:3:1 chr14 24786976 . T C 784.78 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0056384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.963;QD=57.0749;RBI=0.0473501;REFB=0;REVB=0.0470132;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136303;OID=.;OPOS=24786976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:32:22:0:0:33:22:0:0 chr14 24793600 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.526;QD=59.4353;RBI=0.0315275;REFB=0;REVB=0.00143439;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45784e-05;OID=.;OPOS=24793600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr14 24801960 . G C 286.67 PASS AF=0.492063;AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0240409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1761;QD=18.201;RBI=0.0417958;REFB=-0.0244468;REVB=0.0341895;RO=32;SAF=14;SAR=16;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174719;STB=0.588799;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0146917;OID=.;OPOS=24801960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:32:32:30:31:0.492063:16:14:9:23:17:14:9:23 chr14 24802018 . G A 183.39 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00757202;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.142;QD=22.9233;RBI=0.0179306;REFB=0.0140275;REVB=0.0162533;RO=14;SAF=3;SAR=15;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283339;STB=0.661559;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0202134;OID=.;OPOS=24802018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:14:14:18:18:0.5625:15:3:6:8:15:3:6:8 chr14 24836815 . C G 254.48 PASS AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0148096;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.442;QD=21.2063;RBI=0.0148183;REFB=-0.0336437;REVB=-0.000508416;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111393;STB=0.583266;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.019056;OID=.;OPOS=24836815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:24:24:24:24:0.5:12:12:15:9:12:12:16:8 chr14 24839165 . C T 1107.93 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0497;QD=59.0895;RBI=0.0451668;REFB=-0.0558392;REVB=-0.0159288;RO=0;SAF=48;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16077e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212382;OID=.;OPOS=24839165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:75:75:0:0:74:75:1:26:48:0:0:27:48:0:0 chr14 24846757 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.869;QD=58.587;RBI=0.0287205;REFB=0;REVB=0.0190831;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67577e-05;OID=.;OPOS=24846757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0 chr14 24846961 . G T 117.25 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00222134;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.646;QD=19.541;RBI=0.0165157;REFB=-0.0249418;REVB=-0.0163657;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136262;STB=0.578384;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0275359;OID=.;OPOS=24846961;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:25:24:11:11:13:13:0.541667:10:3:4:7:10:3:4:7 chr14 24877699 . A G 340.04 PASS AF=0.538462;AO=34;DP=64;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0125744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.168;QD=20.9253;RBI=0.0143379;REFB=-0.028604;REVB=0.00688897;RO=28;SAF=12;SAR=22;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961844;STB=0.561496;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.023105;OID=.;OPOS=24877699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:28:30:34:35:0.538462:22:12:13:15:22:13:15:15 chr14 24888335 . T C 257.59 PASS AF=0.320755;AO=34;DP=106;FAO=34;FDP=106;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=61;FWDB=-0.01835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.045;QD=9.7204;RBI=0.0286961;REFB=0.0076736;REVB=-0.0220622;RO=72;SAF=7;SAR=27;SRF=11;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102339;STB=0.558952;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.0168833;OID=.;OPOS=24888335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:72:72:34:34:0.320755:27:7:11:61:27:7:11:61 chr14 24898556 . G C 432.38 PASS AF=0.460784;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0235534;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.67;QD=16.9561;RBI=0.0255677;REFB=-0.0243815;REVB=0.0099471;RO=55;SAF=22;SAR=25;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00450294;STB=0.502512;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0357285;OID=.;OPOS=24898556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:55:55:47:47:0.460784:25:22:26:29:25:22:26:29 chr14 24898558 . C T 500.48 PASS AF=0.509804;AO=51;DP=103;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0400186;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.806;QD=19.6267;RBI=0.0406474;REFB=-0.0109738;REVB=-0.00712192;RO=49;SAF=23;SAR=28;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164512;STB=0.509087;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00505443;OID=.;OPOS=24898558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:49:50:51:52:0.509804:28:23:23:26:28:24:24:26 chr14 24901249 . A C 72.35 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=-0.00886723;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.3;QD=8.51179;RBI=0.016799;REFB=-0.010327;REVB=-0.0142681;RO=24;SAF=3;SAR=7;SRF=20;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559744;STB=0.82939;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.02992;OID=.;OPOS=24901249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:7:3:20:4:7:3:20:4 chr14 24901276 . G T 226.22 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.176148;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.0013;QD=45.2434;RBI=0.197186;REFB=0;REVB=0.088623;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397692;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00732957;OID=.;OPOS=24901276;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:20:1:0:16:20:1:5:11:1:0:7:13:0:0 chr14 24909362 . T C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.713;QD=58.2396;RBI=0.0034488;REFB=0;REVB=0.00271603;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10737e-06;OID=.;OPOS=24909362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0 chr14 24909475 . C G 409.93 PASS AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0225002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.151;QD=51.2418;RBI=0.0241634;REFB=0.0573171;REVB=-0.00880964;RO=2;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774676;STB=0.541638;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.000456736;OID=.;OPOS=24909475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:11:19:0:2:11:19:0:2 chr14 24909731 . C T 834.33 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1269;QD=57.5396;RBI=0.137797;REFB=0;REVB=-0.0113147;RO=0;SAF=10;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36599e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151833;OID=.;OPOS=24909731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:48:10:0:0:48:10:0:0 chr14 24910210 . C A 2252.38 PASS AF=0.979592;AO=144;DP=148;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0101817;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.362;QD=61.2893;RBI=0.0211821;REFB=-0.0645212;REVB=0.0185746;RO=2;SAF=66;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0010929;STB=0.504278;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=8.72153e-05;OID=.;OPOS=24910210;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:148:147:2:3:144:144:0.979592:78:66:1:1:78:66:2:1 chr14 24910973 . TT GA 754.05 PASS AF=0.979592;AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0328586;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=95.2866;QD=61.5548;RBI=0.0978247;REFB=0.08922;REVB=0.0921411;RO=1;SAF=24;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191802;STB=0.5098;STBP=0.508;TYPE=mnp;VARB=-0.00123557;OID=.;OPOS=24910973;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:49:1:1:45:48:0.979592:21:24:1:0:23:25:1:0 chr14 24912008 . T C 211.89 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.00545378;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=340.41;QD=16.6185;RBI=0.00906313;REFB=-0.0077221;REVB=0.00723855;RO=28;SAF=4;SAR=19;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643398;STB=0.53669;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00910305;OID=.;OPOS=24912008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:19:4:6:22:19:4:6:22 chr14 24970942 . A G 306.28 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6412;QD=53.2652;RBI=0.00715324;REFB=0;REVB=0.0053454;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246782;OID=.;OPOS=24970942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:8:14:0:0:8:15:0:0 chr14 24975435 . G T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.987;QD=40.7629;RBI=0.0305023;REFB=0;REVB=0.0213331;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393192;OID=.;OPOS=24975435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr14 25102160 . C T 1132.78 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8371;QD=60.415;RBI=0.0620066;REFB=0;REVB=0.0561075;RO=0;SAF=26;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16077e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194597;OID=.;OPOS=25102160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:48:26:0:0:49:26:0:0 chr14 30045978 . C T 438.1 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=38;FWDB=0.0201505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.138;QD=19.257;RBI=0.0214527;REFB=-0.010861;REVB=0.00736067;RO=46;SAF=18;SAR=26;SRF=9;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213728;STB=0.621309;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00626934;OID=.;OPOS=30045978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:46:47:44:44:0.483516:26:18:9:37:26:18:9:38 chr14 31059969 . G A 754.04 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368885;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3913;QD=56.9086;RBI=0.0370853;REFB=0;REVB=0.00381585;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000953766;OID=.;OPOS=31059969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr14 31099738 . A G 1507.02 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0239463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1497;QD=58.5252;RBI=0.0239672;REFB=0.00706412;REVB=0.000999998;RO=1;SAF=53;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886831;STB=0.504672;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000165896;OID=.;OPOS=31099738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:1:1:102:102:0.990291:49:53:1:0:49:53:1:0 chr14 31108977 . T C 803.53 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0172948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.277;QD=55.4157;RBI=0.0181828;REFB=-0.155273;REVB=0.00561268;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.507934;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000407611;OID=.;OPOS=31108977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:31:26:0:0:31:26:0:1 chr14 31191772 . T C 1444.61 PASS AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0120824;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.741;QD=60.8258;RBI=0.0133277;REFB=-0.134763;REVB=-0.00562536;RO=1;SAF=37;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126406;STB=0.513155;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.000324518;OID=.;OPOS=31191772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:95:1:2:93:93:0.978947:56:37:1:0:56:37:2:0 chr14 31359847 . T A 770.66 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125616;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.058;QD=64.2218;RBI=0.0395593;REFB=0;REVB=0.0375119;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.09676e-05;OID=.;OPOS=31359847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:28:20:0:0 chr14 31420098 . C T 266.47 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0554423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.519;QD=15.9085;RBI=0.0560828;REFB=0.0026316;REVB=-0.00845156;RO=36;SAF=14;SAR=16;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859117;STB=0.555519;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00414953;OID=.;OPOS=31420098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:37:30:30:0.447761:16:14:20:16:16:14:21:16 chr14 31569991 . T C 449.02 PASS AF=0.462264;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0131582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.824;QD=16.9441;RBI=0.0131706;REFB=0.0027429;REVB=0.00057145;RO=57;SAF=21;SAR=28;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00985492;STB=0.505492;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.00356459;OID=.;OPOS=31569991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:57:57:49:49:0.462264:28:21:25:32:28:21:25:32 chr14 31578762 . C T 399.06 PASS AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00336597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.942;QD=23.8245;RBI=0.00343473;REFB=-0.0311371;REVB=-0.000683803;RO=28;SAF=22;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130046;STB=0.571392;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0205495;OID=.;OPOS=31578762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:17:22:11:17:17:22:11:17 chr14 31582380 . A G 791.56 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00945534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.92;QD=53.6653;RBI=0.0120417;REFB=-0.0504186;REVB=0.00745645;RO=2;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376858;STB=0.519993;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0229565;OID=.;OPOS=31582380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:24:33:0:2:24:33:0:2 chr14 31582526 . T C 839.92 PASS AF=0.502959;AO=85;DP=169;FAO=85;FDP=169;FR=.;FRO=84;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=0.0153502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.672;QD=19.8797;RBI=0.0154037;REFB=-0.0122944;REVB=-0.00128295;RO=84;SAF=46;SAR=39;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157778;STB=0.508677;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0124423;OID=.;OPOS=31582526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:84:84:85:85:0.502959:39:46:44:40:39:46:44:40 chr14 31619392 . T C 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0189668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.995;QD=16.1155;RBI=0.0237215;REFB=-0.0189567;REVB=-0.0142468;RO=29;SAF=18;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150984;STB=0.586131;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.018427;OID=.;OPOS=31619392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:6:18:18:11:6:18:18:11 chr14 31647241 . G A 175.28 PASS AF=0.328571;AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00115007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.52;QD=10.0157;RBI=0.00204352;REFB=-0.0104922;REVB=0.00168918;RO=47;SAF=15;SAR=8;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259381;STB=0.652042;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0160088;OID=.;OPOS=31647241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:47:47:23:23:0.328571:8:15:20:27:8:15:20:27 chr14 31790886 . T G 176.24 PASS AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0671044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.348;QD=29.3734;RBI=0.0671095;REFB=-0.00359596;REVB=-0.00082887;RO=7;SAF=4;SAR=13;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129623;STB=0.572237;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000195958;OID=.;OPOS=31790886;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:13:4:3:4:13:4:3:4 chr14 31864485 . G C 442.76 PASS AF=0.420168;AO=50;DP=120;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0284248;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.732;QD=14.8828;RBI=0.031346;REFB=-0.0169061;REVB=0.0132137;RO=68;SAF=22;SAR=28;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136498;STB=0.58057;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0195871;OID=.;OPOS=31864485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:68:69:50:50:0.420168:28:22:39:29:28:22:40:29 chr14 31917203 . T C 260.59 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0299838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.192;QD=24.8178;RBI=0.0375643;REFB=-0.00310648;REVB=0.0226284;RO=18;SAF=6;SAR=18;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265321;STB=0.648516;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00298552;OID=.;OPOS=31917203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:18:6:10:8:18:6:10:8 chr14 31952257 . A G 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00556932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.628;QD=11.3693;RBI=0.00812458;REFB=-0.019099;REVB=-0.00591536;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131313;STB=0.578172;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0249085;OID=.;OPOS=31952257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:6:5:11:8:6:5:11:8 chr14 31952754 . A G 122.22 PASS AF=0.451613;AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0279971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.428;QD=15.7699;RBI=0.0321789;REFB=-0.015581;REVB=0.0158634;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122807;STB=0.548319;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0302068;OID=.;OPOS=31952754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:17:17:13:14:0.451613:6:7:7:10:7:7:7:10 chr14 32047217 . T C 325.74 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=49;FWDB=0.0111812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.421;QD=14.8062;RBI=0.020501;REFB=-0.00409478;REVB=0.0171835;RO=52;SAF=8;SAR=28;SRF=3;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302974;STB=0.666597;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00429787;OID=.;OPOS=32047217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:52:36:36:0.409091:28:8:3:49:28:8:3:49 chr14 32123347 . A C 191.27 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0279;QD=47.8175;RBI=0.131733;REFB=0;REVB=-0.0350224;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00374092;OID=.;OPOS=32123347;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr14 32131273 . G A 232.1 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0181241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1059;QD=14.7365;RBI=0.0392996;REFB=-0.00354342;REVB=0.0348709;RO=33;SAF=13;SAR=14;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915618;STB=0.557988;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00831836;OID=.;OPOS=32131273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:36:27:27:0.428571:14:13:19:14:14:13:21:15 chr14 32414145 . C A 909.06 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.010918;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.319;QD=56.8165;RBI=0.0258657;REFB=-0.077809;REVB=0.0234485;RO=1;SAF=33;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140954;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000181968;OID=.;OPOS=32414145;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:64:1:1:63:63:0.984375:30:33:1:0:30:33:1:0 chr14 32419331 . C T 404.2 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00146534;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.383;QD=18.5837;RBI=0.00503228;REFB=-0.0104781;REVB=0.00481421;RO=46;SAF=16;SAR=25;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126667;STB=0.570741;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00978038;OID=.;OPOS=32419331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:25:16:24:22:25:16:24:22 chr14 32562902 . A G 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00450197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.236;QD=14.6538;RBI=0.0268238;REFB=-0.0230567;REVB=-0.0264433;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0257005;OID=.;OPOS=32562902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:4:4:4:4:4:4 chr14 32960254 . G A 568.81 PASS AF=0.454545;AO=60;DP=132;FAO=60;FDP=132;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0269475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.283;QD=17.2368;RBI=0.0289718;REFB=0.00592394;REVB=-0.0106395;RO=72;SAF=18;SAR=42;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183542;STB=0.602613;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00627524;OID=.;OPOS=32960254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:72:72:60:60:0.454545:42:18:34:38:42:18:34:38 chr14 33014869 . C T 267.2 PASS AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00829514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.221;QD=28.1265;RBI=0.0203534;REFB=-0.0044854;REVB=0.0185864;RO=14;SAF=10;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00815304;STB=0.504501;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00279263;OID=.;OPOS=33014869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:14:10:6:8:14:10:6:8 chr14 33015014 . G A 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00720701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3422;QD=14.0438;RBI=0.0528431;REFB=-0.0399185;REVB=-0.0523493;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744193;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0145799;OID=.;OPOS=33015014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:2:2:3:2:2:2 chr14 33015082 . A G 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00980703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.803;QD=16.4169;RBI=0.0400091;REFB=-0.00290809;REVB=-0.0387885;RO=16;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190475;STB=0.610938;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00554736;OID=.;OPOS=33015082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:3:11:10:6:3:11:10:6 chr14 33046388 . A G 1088.29 PASS AF=0.949367;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00185198;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.626;QD=55.1032;RBI=0.0298965;REFB=-0.0868748;REVB=0.029839;RO=4;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449945;STB=0.523803;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000431483;OID=.;OPOS=33046388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:79:79:4:4:75:75:0.949367:40:35:0:4:40:35:0:4 chr14 33292743 . A C 37.74 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0387899;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=317.137;QD=9.43493;RBI=0.0389139;REFB=-0.0172954;REVB=0.00310357;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271446;STB=0.608323;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0253786;OID=.;OPOS=33292743;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:8:10:6:6:0.375:2:4:3:5:2:4:5:5 chr14 33293022 . A G 217.73 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0290589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7126;QD=16.7486;RBI=0.0332137;REFB=0.0110903;REVB=0.0160851;RO=28;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147263;STB=0.583264;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.00941911;OID=.;OPOS=33293022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:14:10:16:12:14:10:16:12 chr14 33293122 . A G 146.37 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0166915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.738;QD=16.728;RBI=0.0580987;REFB=-0.0210956;REVB=-0.0556494;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345603;STB=0.519831;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0260066;OID=.;OPOS=33293122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:7:9:10:9:7:9:10:9 chr14 34047414 . T C 272.38 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0822032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4408;QD=51.8818;RBI=0.0884147;REFB=0;REVB=0.0325544;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140466;OID=.;OPOS=34047414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr14 34047441 . C T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.352;QD=49.5992;RBI=0.0414884;REFB=0;REVB=-0.0118634;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126219;OID=.;OPOS=34047441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr14 34393602 . A G 208.73 PASS AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-5.50176e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6642;QD=41.7454;RBI=0.048473;REFB=-0.192025;REVB=0.0484729;RO=1;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340316;STB=0.535676;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0203494;OID=.;OPOS=34393602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:20:20:1:2:18:18:0.9:13:5:0:1:13:5:0:2 chr14 34394733 . C T 321.54 PASS AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0076832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.455;QD=14.1339;RBI=0.00769851;REFB=-0.00449492;REVB=0.000485256;RO=55;SAF=16;SAR=20;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496655;STB=0.52824;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00811682;OID=.;OPOS=34394733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:20:16:27:28:20:16:27:28 chr14 34395148 . GA G,GG 481.75 PASS AF=0.56962,0.0126582;AO=43,3;DP=81;FAO=45,1;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=19,0;FSAR=26,1;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00416241,0.00648287;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=304.538,296.534;QD=24.3922;RBI=0.00964803,0.00971875;REFB=-0.0142294,-0.0103832;REVB=0.00870396,0.00724061;RO=35;SAF=19,0;SAR=24,3;SRF=11;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.107099,-0.456245;STB=0.53899,0.986798;STBP=0.463,0.487;TYPE=del,snp;VARB=0.00861998,0.00696194;OID=.,.;OPOS=34395149,34395149;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.56962,0.0126582:43,3:81:45,1:79:33:19,0:26,1:11:22:99:35:19,0:24,3:11:24 chr14 34985645 . G A 171.32 PASS AF=0.384615;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0157215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.378;QD=13.1787;RBI=0.0188015;REFB=-0.0400439;REVB=0.0103116;RO=30;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866919;STB=0.54995;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0696776;OID=.;OPOS=34985645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:30:32:20:20:0.384615:11:9:16:14:11:9:17:15 chr14 34985658 . C T 134.18 PASS AF=0.315789;AO=18;DP=57;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0246742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.307;QD=9.41577;RBI=0.0269338;REFB=0.00112907;REVB=0.0107988;RO=39;SAF=9;SAR=9;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739009;STB=0.543811;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00341868;OID=.;OPOS=34985658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:39:39:18:18:0.315789:9:9:22:17:9:9:22:17 chr14 34993982 . G C 163.19 PASS AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0503469;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.617;QD=19.1987;RBI=0.0511117;REFB=-0.0079378;REVB=-0.008809;RO=17;SAF=4;SAR=13;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383794;STB=0.719285;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00782699;OID=.;OPOS=34993982;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:17:17:17:17:0.5:13:4:11:6:13:4:11:6 chr14 35062312 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.26;QD=56.7065;RBI=0.011767;REFB=0;REVB=0.00399555;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45105e-05;OID=.;OPOS=35062312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr14 35099099 . A G 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0620813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2785;QD=25.2766;RBI=0.0620988;REFB=0.0305193;REVB=-0.0014748;RO=12;SAF=12;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263955;STB=0.514691;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.0385122;OID=.;OPOS=35099099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:7:12:8:4:7:12:8:4 chr14 35242828 . G A 876.95 PASS AF=0.96875;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0389212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.543;QD=54.8096;RBI=0.0393605;REFB=-0.0571135;REVB=0.0058642;RO=2;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294805;STB=0.515147;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00228391;OID=.;OPOS=35242828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:63:64:2:2:61:62:0.96875:31:30:0:2:32:30:0:2 chr14 36004075 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.262;QD=46.8479;RBI=0.0486895;REFB=0;REVB=-0.0460637;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000375016;OID=.;OPOS=36004075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr14 36005659 . T C 203.3 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0739044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0331;QD=21.9788;RBI=0.0807674;REFB=-0.0029335;REVB=0.0325809;RO=17;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264095;STB=0.501482;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00341818;OID=.;OPOS=36005659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:13:7:6:11:13:7:6:11 chr14 36153177 . T C 478.47 PASS AF=0.460177;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.00912858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.409;QD=16.9368;RBI=0.00956872;REFB=-0.0128676;REVB=-0.00286873;RO=60;SAF=28;SAR=24;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371033;STB=0.525229;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0165964;OID=.;OPOS=36153177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:60:61:52:52:0.460177:24:28:30:30:24:28:30:31 chr14 36191031 . A G 470.45 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00117609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.435;QD=20.679;RBI=0.0107125;REFB=-0.00641306;REVB=0.0106477;RO=45;SAF=22;SAR=24;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502846;STB=0.527819;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00541345;OID=.;OPOS=36191031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:24:22:19:26:24:22:19:26 chr14 36207848 . C T 499.72 PASS AF=0.486239;AO=52;DP=108;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0208168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1481;QD=18.3382;RBI=0.0350704;REFB=-0.0104716;REVB=0.028224;RO=56;SAF=22;SAR=30;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391496;STB=0.525785;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0107215;OID=.;OPOS=36207848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:56:56:52:53:0.486239:30:22:26:30:31:22:26:30 chr14 36334905 . CTTT CTTC,C,CT,CTT 523.03 PASS AF=0.128205,0.871795,0,0;AO=7,14,14,14;DP=91;FAO=10,68,0,0;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=3,46,0,0;FSAR=7,22,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063407,0.527811,0.788648,1.54497;FXX=0.161273;HRUN=15,15,15,15;LEN=1,3,2,1;MLLD=180.352,7.80983,5.83591,2.98102;QD=26.8221;RBI=0.138751,0.558283,0.833967,1.63155;REFB=0.0227288,0.0817145,0.0709059,0.0432857;REVB=-0.123415,-0.18192,-0.271175,-0.524417;RO=10;SAF=1,2,12,14;SAR=6,12,2,0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.716008,-0.630548,-0.267316,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=-0.0916618,0.0387133,0.130413,0.132324;OID=.,.,.,.;OPOS=36334908,36334906,36334906,36334906;OREF=T,TTT,TT,T;OALT=C,-,-,-;OMAPALT=CTTC,C,CT,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.128205,0.871795,0,0:7,14,14,14:91:10,68,0,0:78:0:3,46,0,0:7,22,0,0:0:0:48:10:1,2,12,14:6,12,2,0:10:0 chr14 36400983 . T G 259.43 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00986978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.461;QD=14.2152;RBI=0.0185067;REFB=-0.0176587;REVB=-0.0156553;RO=42;SAF=19;SAR=11;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116553;STB=0.560378;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0262496;OID=.;OPOS=36400983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:43:30:30:0.410959:11:19:22:20:11:19:23:20 chr14 36789729 . T G 1116.93 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.162;QD=60.3745;RBI=0.0395015;REFB=0;REVB=0.0115987;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44151e-05;OID=.;OPOS=36789729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:42:32:0:0:42:32:0:0 chr14 36789775 . A T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.179;QD=64.1534;RBI=0.0145864;REFB=0;REVB=0.00240252;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25936e-05;OID=.;OPOS=36789775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr14 36789795 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.313;QD=52.6131;RBI=0.0448448;REFB=0;REVB=-0.000551752;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424136;OID=.;OPOS=36789795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:18:4:0:0:18:4:0:0 chr14 36840650 . A T 1572.99 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.329;QD=59.9234;RBI=0.0228792;REFB=0;REVB=0.0228034;RO=0;SAF=63;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76325e-05;OID=.;OPOS=36840650;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:42:63:0:0:42:63:0:0 chr14 37051517 . C G 114.87 PASS AF=0.411765;AO=13;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.014407;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.277;QD=13.5143;RBI=0.042772;REFB=-0.0298003;REVB=0.0402727;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910385;STB=0.52937;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0386983;OID=.;OPOS=37051517;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:13:14:0.411765:6:7:9:11:7:7:9:11 chr14 37063123 . C T 632.53 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.52;QD=61.71;RBI=0.0177253;REFB=0;REVB=0.0175092;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18197e-05;OID=.;OPOS=37063123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:15:26:0:0 chr14 37063294 . A G 766.41 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00484742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.35;QD=63.8679;RBI=0.0324705;REFB=0;REVB=0.0321066;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.53899e-05;OID=.;OPOS=37063294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr14 37135752 . C T 620.95 PASS AF=0.559633;AO=61;DP=109;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0105299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.404;QD=22.7873;RBI=0.0159239;REFB=-0.0145255;REVB=-0.0119454;RO=47;SAF=21;SAR=40;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518664;STB=0.534539;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0636556;OID=.;OPOS=37135752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:47:48:61:61:0.559633:40:21:19:28:40:21:20:28 chr14 37135753 . G C 428.19 PASS AF=0.440367;AO=47;DP=108;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.00638297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.131;QD=15.7132;RBI=0.0320732;REFB=-0.0168497;REVB=0.0314317;RO=61;SAF=19;SAR=28;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636987;STB=0.542247;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00662783;OID=.;OPOS=37135753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:61:61:47:48:0.440367:28:19:21:40:28:20:21:40 chr14 37344229 . A AG 428.92 PASS AF=1;AO=27;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153561;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=154.975;QD=55.3442;RBI=0.0244895;REFB=0;REVB=0.0190769;RO=4;SAF=7;SAR=20;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140707;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000150686;OID=.;OPOS=37344230;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:34:31:31:0:9:22:0:0:4:4:7:20:3:1 chr14 37641880 . C A 259.85 PASS AF=0.571429;AO=23;DP=41;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0645181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.9092;QD=24.7474;RBI=0.0652988;REFB=-0.0433132;REVB=-0.0100675;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485328;STB=0.519215;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0417334;OID=.;OPOS=37641880;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:18:18:23:24:0.571429:14:9:6:12:15:9:6:12 chr14 38061742 . C T 191.59 PASS AF=0.527778;AO=16;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0128986;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.213;QD=21.288;RBI=0.0445004;REFB=-0.0268199;REVB=0.04259;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810966;STB=0.501465;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0359779;OID=.;OPOS=38061742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:17:16:19:0.527778:6:10:8:5:9:10:9:8 chr14 38218343 . A G 489.35 PASS AF=0.633803;AO=44;DP=70;FAO=45;FDP=71;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00691974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.593;QD=27.5688;RBI=0.0170513;REFB=-0.0179275;REVB=-0.0155841;RO=25;SAF=20;SAR=24;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367271;STB=0.507933;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0106942;OID=.;OPOS=38218343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:25:26:44:45:0.633803:24:20:10:15:25:20:11:15 chr14 38266074 . C T 433.59 PASS AF=0.426087;AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.00527979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.057;QD=15.0813;RBI=0.0568525;REFB=-0.0231172;REVB=-0.0566068;RO=66;SAF=25;SAR=24;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568416;STB=0.531902;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0301916;OID=.;OPOS=38266074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:49:49:0.426087:24:25:30:36:24:25:30:36 chr14 38277999 . C T 272.76 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0124295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0348;QD=24.2453;RBI=0.0218197;REFB=-0.00369626;REVB=-0.0179335;RO=20;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240149;STB=0.513358;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0038049;OID=.;OPOS=38277999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:13:12:9:11:13:12:9:11 chr14 38679473 . C T 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.011096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.952;QD=11.1306;RBI=0.0146956;REFB=-0.0119923;REVB=-0.00963543;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644098;STB=0.518482;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0216319;OID=.;OPOS=38679473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:5:5:9:7:5:5:9:8 chr14 38680080 . T C 149.65 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=30;FWDB=0.00306582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.706;QD=11.9719;RBI=0.0100423;REFB=-0.0284571;REVB=0.00956292;RO=33;SAF=2;SAR=15;SRF=3;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778685;STB=0.545405;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0213398;OID=.;OPOS=38680080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:15:2:3:30:15:2:3:30 chr14 38681226 . G C 203.73 PASS AF=0.321429;AO=26;DP=82;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0292814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1198;QD=9.70151;RBI=0.0385938;REFB=-0.0222114;REVB=0.0251413;RO=56;SAF=16;SAR=10;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156511;STB=0.595615;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0668787;OID=.;OPOS=38681226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:56:57:26:27:0.321429:10:16:27:29:10:17:28:29 chr14 38725285 . G A 108.85 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0138794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.599;QD=24.1899;RBI=0.0314283;REFB=-0.0195729;REVB=0.0281976;RO=6;SAF=1;SAR=11;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322321;STB=0.687107;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0184861;OID=.;OPOS=38725285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:11:1:2:4:11:1:2:4 chr14 39556185 . G C 584.61 PASS AF=0.462121;AO=61;DP=132;FAO=61;FDP=132;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=0.0972109;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9758;QD=17.7155;RBI=0.0972858;REFB=0.00873516;REVB=0.00381502;RO=71;SAF=25;SAR=36;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21469;STB=0.619126;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00605077;OID=.;OPOS=39556185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:71:71:61:61:0.462121:36:25:45:26:36:25:45:26 chr14 39644498 . G A 263.44 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0104157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.816;QD=19.5143;RBI=0.0104528;REFB=-0.0184786;REVB=0.000879632;RO=26;SAF=17;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271321;STB=0.515141;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0251112;OID=.;OPOS=39644498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:11:17:15:11:11:17:15:11 chr14 39651144 . AAG A 147.39 PASS AF=0.478261;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00205127;FXX=0.041658;HRUN=3;LEN=2;MLLD=196.722;QD=12.8165;RBI=0.00395975;REFB=-0.0137386;REVB=-0.00338702;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820088;STB=0.543439;STBP=0.598;TYPE=del;VARB=0.0158859;OID=.;OPOS=39651145;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.478261:21:48:22:46:24:11:11:14:10:99:23:10:11:13:10 chr14 39716808 . T C 517.14 PASS AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0561733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.074;QD=25.2264;RBI=0.0566225;REFB=0.0152866;REVB=-0.00711811;RO=34;SAF=25;SAR=23;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603008;STB=0.532981;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.011982;OID=.;OPOS=39716808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:23:25:15:19:23:25:15:19 chr14 39736680 . T C 105.54 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0430305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.127;QD=12.4165;RBI=0.0430502;REFB=-0.0170553;REVB=-0.00130108;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454102;STB=0.772499;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0215152;OID=.;OPOS=39736680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:11:2:11:10:11:2:11:10 chr14 39777676 . G C 1386.06 PASS AF=0.501805;AO=136;DP=273;FAO=139;FDP=277;FR=.;FRO=138;FSAF=58;FSAR=81;FSRF=70;FSRR=68;FWDB=-0.0536693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.259;QD=20.0154;RBI=0.0556718;REFB=-0.0327446;REVB=0.014797;RO=134;SAF=58;SAR=78;SRF=67;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067276;STB=0.545391;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0318453;OID=.;OPOS=39777676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:277:134:138:136:139:0.501805:78:58:67:67:81:58:70:68 chr14 39784014 . A G 132.46 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.109915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2692;QD=16.0556;RBI=0.123647;REFB=-0.0619133;REVB=0.0566328;RO=16;SAF=2;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329554;STB=0.738258;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0510234;OID=.;OPOS=39784014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:18:15:15:0.454545:13:2:6:10:13:2:8:10 chr14 39818145 . G A 550.55 PASS AF=0.609756;AO=50;DP=80;FAO=50;FDP=82;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.106877;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1996;QD=26.8559;RBI=0.109099;REFB=-0.0102861;REVB=0.021904;RO=30;SAF=23;SAR=27;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185185;STB=0.503433;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00551844;OID=.;OPOS=39818145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:30:32:50:50:0.609756:27:23:13:17:27:23:15:17 chr14 39819734 . T G 325.87 PASS AF=0.37037;AO=40;DP=108;FAO=40;FDP=108;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.0009491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.095;QD=12.0692;RBI=0.00359887;REFB=-0.013327;REVB=-0.00347147;RO=68;SAF=23;SAR=17;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345798;STB=0.519764;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0282858;OID=.;OPOS=39819734;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:68:68:40:40:0.37037:17:23:37:31:17:23:37:31 chr14 39871017 . T C 226.01 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0331199;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.214;QD=20.5461;RBI=0.0357657;REFB=0.0130731;REVB=0.0135004;RO=22;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172067;STB=0.597253;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.0093869;OID=.;OPOS=39871017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:15:7:11:11:15:7:11:11 chr14 42360633 . T C 1514.54 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.411;QD=58.8172;RBI=0.0694753;REFB=-0.0519352;REVB=0.0678593;RO=0;SAF=36;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106669;OID=.;OPOS=42360633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:96:103:0:0:96:103:1:60:36:0:0:66:37:0:0 chr14 42998026 . T C 754.62 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.893;QD=54.8812;RBI=0.0369596;REFB=-0.00233049;REVB=0.0215745;RO=1;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177809;STB=0.50943;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000347025;OID=.;OPOS=42998026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:26:28:0:1:26:28:0:1 chr14 44974966 . G A 239.66 PASS AF=0.309278;AO=30;DP=97;FAO=30;FDP=97;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.00255324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.408;QD=9.88297;RBI=0.0129952;REFB=0.00205339;REVB=-0.0127419;RO=67;SAF=20;SAR=10;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307613;STB=0.680153;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00427833;OID=.;OPOS=44974966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:67:67:30:30:0.309278:10:20:27:40:10:20:27:40 chr14 44975052 . A G 186.71 PASS AF=0.290698;AO=25;DP=86;FAO=25;FDP=86;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0180526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6523;QD=8.68411;RBI=0.0186601;REFB=-0.00602649;REVB=-0.00472242;RO=61;SAF=19;SAR=6;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374958;STB=0.724153;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0172627;OID=.;OPOS=44975052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:61:61:25:25:0.290698:6:19:28:33:6:19:28:33 chr14 44975606 . G T 502.48 PASS AF=0.580247;AO=47;DP=81;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0125908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.5251;QD=24.8136;RBI=0.0465983;REFB=-0.0148122;REVB=0.0448651;RO=34;SAF=34;SAR=13;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301043;STB=0.665474;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0100547;OID=.;OPOS=44975606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:34:34:47:47:0.580247:13:34:12:22:13:34:12:22 chr14 45393715 . T C 93.84 PASS AF=0.307692;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0194487;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.1;QD=9.62477;RBI=0.0417425;REFB=0.000646727;REVB=-0.0369349;RO=27;SAF=8;SAR=4;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998033;STB=0.559905;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=-0.00136551;OID=.;OPOS=45393715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:40:39:27:27:12:12:0.307692:4:8:20:7:4:8:20:7 chr14 47309495 . AG A,AT 1067.26 PASS AF=0.0136986,0.986301;AO=10,47;DP=73;FAO=1,72;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=1,36;FSAR=0,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00961548,-0.00864609;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.723,110.106;QD=58.4802;RBI=0.0101156,0.0534886;REFB=0,0;REVB=-0.00314138,-0.0527852;RO=0;SAF=6,26;SAR=4,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00635561,0.000262896;OID=.,.;OPOS=47309496,47309496;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0136986,0.986301:10,47:73:1,72:73:0:1,36:0,36:0:0:9:0:6,26:4,21:0:0 chr14 47310807 . G A 272.24 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0133113;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.448;QD=16.753;RBI=0.0180093;REFB=-0.00948173;REVB=-0.0121303;RO=29;SAF=20;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139906;STB=0.57138;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00851996;OID=.;OPOS=47310807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:29:35:30:30:0.461538:10:20:15:14:10:20:19:16 chr14 47341131 . C G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00482448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.831;QD=53.9111;RBI=0.0152947;REFB=0;REVB=-0.0145139;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.15306e-05;OID=.;OPOS=47341131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr14 47528470 . T C 1396.7 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0124208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.5551;QD=61.3933;RBI=0.0277285;REFB=-0.0745195;REVB=0.024791;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000695142;OID=.;OPOS=47528470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:0:1:90:90:0.989011:49:41:0:0:49:41:0:1 chr14 47528551 . T A 424.16 PASS AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00970676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.433;QD=15.1485;RBI=0.0152205;REFB=-0.00550594;REVB=0.0117236;RO=63;SAF=20;SAR=28;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123562;STB=0.51219;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00687576;OID=.;OPOS=47528551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:64:48:48:0.428571:28:20:27:36:28:20:28:36 chr14 50044392 . T C 185.59 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.033727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.055;QD=13.7474;RBI=0.0337715;REFB=-0.000640021;REVB=0.00173414;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775949;STB=0.536049;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.000784453;OID=.;OPOS=50044392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:13:9:15:16:13:9:15:17 chr14 50058984 . A G 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0272199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.523;QD=18.7442;RBI=0.0363767;REFB=0.000420181;REVB=0.0241317;RO=4;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.429216;STB=0.749316;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.000467676;OID=.;OPOS=50058984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:5:2:4:0:5:2:4:0 chr14 50065359 . C G 265.13 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.021694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.056;QD=15.5958;RBI=0.0241696;REFB=-0.00795223;REVB=0.0106556;RO=38;SAF=14;SAR=16;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455092;STB=0.525675;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0100948;OID=.;OPOS=50065359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:16:14:16:22:16:14:16:22 chr14 50065717 . G C 411.05 PASS AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0237667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.319;QD=23.8288;RBI=0.0266142;REFB=-0.00539125;REVB=0.0119773;RO=28;SAF=24;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767846;STB=0.55027;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00347907;OID=.;OPOS=50065717;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:28:29:40:40:0.57971:16:24:14:14:16:24:14:15 chr14 50068299 . C G 318.43 PASS AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00149718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6154;QD=23.1582;RBI=0.00269723;REFB=-0.0357884;REVB=0.00224355;RO=23;SAF=14;SAR=18;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642833;STB=0.535447;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0213124;OID=.;OPOS=50068299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:18:14:12:11:18:14:12:11 chr14 50087753 . T C 91.16 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00972933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.944;QD=17.3645;RBI=0.0292876;REFB=-0.0354058;REVB=0.0276243;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200531;STB=0.615182;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0436433;OID=.;OPOS=50087753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:6:5:7:3:6:5:7:3 chr14 50092134 . A T 35.06 PASS AF=0.222222;AO=2;DP=18;FAO=4;FDP=18;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=10;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0182164;FXX=0.0526039;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.22865;QD=7.79165;RBI=0.274225;REFB=-0.0520775;REVB=-0.273619;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306614;STB=0.691294;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0629353;OID=.;OPOS=50092134;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:18:18:5:10:2:4:0.222222:1:1:4:1:1:3:5:5 chr14 50092471 . T C 177.46 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00242562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.846;QD=21.5105;RBI=0.00444496;REFB=-0.0108857;REVB=0.00372478;RO=15;SAF=13;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115188;STB=0.565142;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00611145;OID=.;OPOS=50092471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:5:13:9:6:5:13:9:6 chr14 50101370 . G A 460.54 PASS AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0306505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.142;QD=23.9243;RBI=0.030911;REFB=-0.0345968;REVB=0.00400486;RO=33;SAF=16;SAR=28;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146376;STB=0.580451;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0307445;OID=.;OPOS=50101370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:28:16:18:15:28:16:18:15 chr14 50101682 . C G 289.47 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0126013;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.829;QD=21.0526;RBI=0.0221723;REFB=-0.0223405;REVB=-0.0182433;RO=25;SAF=19;SAR=11;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255512;STB=0.641643;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0282609;OID=.;OPOS=50101682;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:11:19:8:17:11:19:8:17 chr14 50159994 . TGGGGGGGC TGGGGGGC,TGGGGGGCG 122.37 PASS AF=0.909091,0;AO=10,6;DP=22;FAO=20,0;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=16,0;FSAR=4,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.220723,-0.139361;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=9.80159,62.5847;QD=22.249;RBI=0.228259,0.140116;REFB=-0.0747392,-0.00290313;REVB=0.0581715,-0.0145223;RO=4;SAF=8,6;SAR=2,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0381322,0.742782;STB=0.529383,0.5;STBP=0.583,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0547326,0;OID=.,.;OPOS=50159995,50160001;OREF=G,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=TGGGGGGC,TGGGGGGCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.909091,0:10,6:22:20,0:22:2:16,0:4,0:2:0:8:4:8,6:2,0:3:1 chr14 50195679 . A G 1881.16 PASS AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338661;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.02;QD=61.6773;RBI=0.0408905;REFB=0;REVB=0.0229156;RO=0;SAF=49;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.72662e-05;OID=.;OPOS=50195679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:73:49:0:0:73:49:0:0 chr14 50251369 . A G 867.38 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.36;QD=57.825;RBI=0.0130277;REFB=0;REVB=-0.00736497;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11899e-06;OID=.;OPOS=50251369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:33:26:0:0:33:27:0:0 chr14 50298962 . T A 752.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.481;QD=56.7868;RBI=0.0271383;REFB=0;REVB=0.00928839;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427524;OID=.;OPOS=50298962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:28:25:0:0 chr14 50320391 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.605;QD=44.6898;RBI=0.103599;REFB=0;REVB=-0.0987935;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000772287;OID=.;OPOS=50320391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:12:13:1:7:5:0:0:7:6:0:0 chr14 50477643 . G C,T 715.62 PASS AF=0.960784,0.0392157;AO=49,2;DP=52;FAO=49,2;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296795,-0.0192327;FXX=0.0192271;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=89.9818,131.064;QD=56.127;RBI=0.037958,0.0222364;REFB=0,0;REVB=-0.023663,-0.0111607;RO=0;SAF=30,0;SAR=19,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.48867e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00129183,0.109365;OID=.,.;OPOS=50477643,50477643;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:52:51:0:0:49,2:49,2:0.960784,0.0392157:19,2:30,0:0:0:19,2:30,0:0:0 chr14 50575408 . C T 53.69 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0145781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.971;QD=7.95462;RBI=0.0154104;REFB=-0.0118118;REVB=-0.00499589;RO=19;SAF=1;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512194;STB=0.827038;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0230476;OID=.;OPOS=50575408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:7:1:10:9:7:1:10:9 chr14 50575411 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00151083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.152;QD=53.2771;RBI=0.00403788;REFB=0;REVB=0.00374458;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20634e-05;OID=.;OPOS=50575411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr14 50583083 . G T 100.87 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0278206;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3742;QD=14.9443;RBI=0.0303168;REFB=-0.0199781;REVB=0.0120466;RO=15;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464022;STB=0.774143;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0243137;OID=.;OPOS=50583083;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:15:15:12:12:0.444444:2:10:6:9:2:10:6:9 chr14 50585248 . C T 629.8 PASS AF=0.575472;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00566084;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.708;QD=23.766;RBI=0.00566454;REFB=-0.0214125;REVB=0.000204683;RO=45;SAF=31;SAR=30;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150081;STB=0.508194;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0183975;OID=.;OPOS=50585248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:45:45:61:61:0.575472:30:31:22:23:30:31:22:23 chr14 50616878 . G A 258.05 PASS AF=0.344444;AO=30;DP=90;FAO=31;FDP=90;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0217898;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.304;QD=11.4688;RBI=0.0274113;REFB=-0.00243707;REVB=0.0166307;RO=59;SAF=11;SAR=19;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684662;STB=0.547914;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00453696;OID=.;OPOS=50616878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:59:59:30:31:0.344444:19:11:25:34:20:11:25:34 chr14 50623657 . G A 1197.78 PASS AF=0.952941;AO=81;DP=85;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00856092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0689;QD=56.3663;RBI=0.0315314;REFB=-0.0540963;REVB=-0.030347;RO=4;SAF=27;SAR=54;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337903;STB=0.517853;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00173814;OID=.;OPOS=50623657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:85:85:4:4:81:81:0.952941:54:27:0:4:54:27:0:4 chr14 50623679 . G A 466.48 PASS AF=0.777778;AO=41;DP=54;FAO=42;FDP=54;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0272119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7498;QD=34.5537;RBI=0.0319484;REFB=-0.142421;REVB=0.0167395;RO=13;SAF=16;SAR=25;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00263964;STB=0.516567;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0468024;OID=.;OPOS=50623679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:54:54:13:12:41:42:0.777778:25:16:5:8:25:17:4:8 chr14 50623683 . A G 450.14 PASS AF=0.72;AO=35;DP=50;FAO=36;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.000953857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3748;QD=36.011;RBI=0.0298308;REFB=-0.0566705;REVB=0.0298156;RO=15;SAF=16;SAR=19;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693119;STB=0.524873;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0368572;OID=.;OPOS=50623683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:15:14:35:36:0.72:19:16:5:10:20:16:5:9 chr14 50704331 . C T 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.914;QD=59.4341;RBI=0.0287566;REFB=0;REVB=0.0128702;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263239;OID=.;OPOS=50704331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0 chr14 50713679 . T G 604.2 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288334;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.354;QD=61.9697;RBI=0.0288334;REFB=0;REVB=9.22323e-06;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41544e-05;OID=.;OPOS=50713679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr14 50769717 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0490309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8232;QD=14.9783;RBI=0.0512581;REFB=-0.0232559;REVB=0.0149455;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15627;STB=0.576768;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0162247;OID=.;OPOS=50769717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:20:21:10:11:9:10:0.47619:3:6:5:5:4:6:5:6 chr14 50786004 . A G 71.73 PASS AF=0.285714;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.00392463;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.7614;QD=8.19823;RBI=0.094007;REFB=-0.00997665;REVB=-0.093925;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217222;STB=0.65796;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0191777;OID=.;OPOS=50786004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:32:35:22:25:10:10:0.285714:6:4:5:17:6:4:5:20 chr14 50824839 . G A 793.33 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.387;QD=56.6661;RBI=0.0351289;REFB=0;REVB=0.018351;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836565;OID=.;OPOS=50824839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:36:18:0:0:36:20:0:0 chr14 50935150 . A G 1139.12 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00737417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.04;QD=59.1749;RBI=0.00809515;REFB=-0.115817;REVB=0.00333961;RO=0;SAF=23;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.000305124;OID=.;OPOS=50935150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:53:23:0:0:53:23:0:1 chr14 51057727 . G A 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.559;QD=60.7159;RBI=0.0303457;REFB=0;REVB=0.0268276;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102323;OID=.;OPOS=51057727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0 chr14 51202311 . G C 490.1 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0415523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.78;QD=56.0119;RBI=0.042031;REFB=-0.0679323;REVB=-0.00632535;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346006;STB=0.518508;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000441088;OID=.;OPOS=51202311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:21:13:1:0:21:13:1:0 chr14 51219349 . G A 313.84 PASS AF=0.406977;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0200077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.137;QD=14.5973;RBI=0.0373663;REFB=-0.00698158;REVB=0.0315583;RO=50;SAF=16;SAR=19;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102865;STB=0.562888;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0126514;OID=.;OPOS=51219349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:51:35:35:0.406977:19:16:18:32:19:16:18:33 chr14 51223789 . C T 676.78 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00728587;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.238;QD=60.1585;RBI=0.00917816;REFB=-0.0803071;REVB=0.00558164;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.510633;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000331114;OID=.;OPOS=51223789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:21:23:0:0:21:23:1:0 chr14 51224374 . T G 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.74;QD=60.6095;RBI=0.0180632;REFB=0;REVB=-0.015925;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60688e-05;OID=.;OPOS=51224374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr14 51224658 . T A 272.54 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00716893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.171;QD=51.9125;RBI=0.00997594;REFB=0;REVB=0.00693728;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109981;OID=.;OPOS=51224658;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0 chr14 51225132 . G T 808.72 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.788;QD=56.7521;RBI=0.027895;REFB=0;REVB=0.01752;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57009e-05;OID=.;OPOS=51225132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:25:32:0:0 chr14 51237701 . A G 1475.9 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0966995;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.676;QD=63.4797;RBI=0.100671;REFB=0;REVB=0.027997;RO=0;SAF=41;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374691;OID=.;OPOS=51237701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:52:41:0:0:52:41:0:0 chr14 51239067 . C G 1227.44 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9424;QD=61.3718;RBI=0.0516657;REFB=0;REVB=0.0284374;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.72778e-05;OID=.;OPOS=51239067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0 chr14 51324884 . A G 325.23 PASS AF=0.666667;AO=27;DP=41;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00490377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.388;QD=30.9739;RBI=0.023457;REFB=-0.0291209;REVB=0.0229387;RO=14;SAF=15;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123073;STB=0.55928;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0155705;OID=.;OPOS=51324884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:14:14:27:28:0.666667:12:15:5:9:13:15:5:9 chr14 51324894 . AAGAGAGGA AAGAGAGG,AAGAGGA 143.54 PASS AF=0.0833333,0.625;AO=3,9;DP=24;FAO=2,15;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=1,10;FSAR=1,5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.123647,-0.00783822;FXX=0;HRUN=8,1;LEN=1,2;MLLD=4.09873,252.875;QD=23.9224;RBI=0.291153,0.0126624;REFB=-0.0769757,-0.0117991;REVB=-0.263593,0.00994481;RO=5;SAF=2,7;SAR=1,2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.414454,0.38587;STB=0.665187,0.624829;STBP=0.751,0.106;TYPE=del,del;VARB=0.0997466,0.00417159;OID=.,.;OPOS=51324902,51324895;OREF=A,AG;OALT=-,-;OMAPALT=AAGAGAGG,AAGAGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0833333,0.625:3,9:24:2,15:24:7:1,10:1,5:2:5:30:5:2,7:1,2:1:4 chr14 51352608 . T C 598.49 PASS AF=0.572816;AO=57;DP=102;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.00351573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.379;QD=23.2422;RBI=0.00714261;REFB=-0.0165041;REVB=0.00621744;RO=42;SAF=36;SAR=21;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493981;STB=0.516394;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0127015;OID=.;OPOS=51352608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:42:44:57:59:0.572816:21:36:24:18:22:37:26:18 chr14 51368610 . A G 529.99 PASS AF=0.411348;AO=57;DP=141;FAO=58;FDP=141;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=-0.00178326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.336;QD=15.0352;RBI=0.0104785;REFB=-0.0161549;REVB=-0.0103257;RO=82;SAF=36;SAR=21;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227876;STB=0.634602;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0208898;OID=.;OPOS=51368610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:82:83:57:58:0.411348:21:36:34:48:21:37:34:49 chr14 51378590 . CTTT CTT,CTTG 407.49 PASS AF=0.409449,0.0314961;AO=41,5;DP=121;FAO=52,4;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=34,4;FSAR=18,0;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.0401855,-0.0529262;FXX=0.00781189;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=18.5713,23.5757;QD=12.8344;RBI=0.0753016,0.0741079;REFB=-0.0280502,-0.0278008;REVB=0.0636824,-0.0518729;RO=64;SAF=32,4;SAR=9,1;SRF=36;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.277177,0.263404;STB=0.580402,0.997279;STBP=0.136,0.032;TYPE=del,snp;VARB=0.0344591,0.0412509;OID=.,.;OPOS=51378591,51378593;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=CTT,CTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.409449,0.0314961:41,5:121:52,4:127:71:34,4:18,0:37:34:99:64:32,4:9,1:36:28 chr14 51383432 . G A 242.4 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.00910302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.104;QD=12.5922;RBI=0.0243526;REFB=-0.00705814;REVB=-0.0225872;RO=48;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256442;STB=0.646086;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0135496;OID=.;OPOS=51383432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:48:48:29:29:0.376623:13:16:15:33:13:16:15:33 chr14 51411029 . A G 315.46 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0659805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.299;QD=22.533;RBI=0.066608;REFB=-0.0314441;REVB=0.00912158;RO=24;SAF=7;SAR=25;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784023;STB=0.54345;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0247482;OID=.;OPOS=51411029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:25:7:7:17:25:7:7:17 chr14 51446216 . T G 2217.43 PASS AF=0.986755;AO=148;DP=152;FAO=149;FDP=151;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=77;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0361502;FXX=0.00657851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.342;QD=58.7399;RBI=0.0363402;REFB=0.0957191;REVB=0.00371058;RO=3;SAF=72;SAR=76;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00680986;STB=0.506848;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.000199536;OID=.;OPOS=51446216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:152:151:3:2:148:149:0.986755:76:72:2:1:77:72:2:0 chr14 51710912 . T C 314.07 PASS AF=0.344828;AO=39;DP=116;FAO=40;FDP=116;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.00778505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.031;QD=10.8299;RBI=0.00800513;REFB=0.00254137;REVB=-0.00186416;RO=76;SAF=14;SAR=25;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135922;STB=0.584489;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.00503176;OID=.;OPOS=51710912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:76:76:39:40:0.344828:25:14:36:40:26:14:36:40 chr14 51716188 . T G 905.5 PASS AF=0.969697;AO=61;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0166688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.488;QD=54.8788;RBI=0.0174213;REFB=-0.0903063;REVB=0.00506507;RO=2;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314423;STB=0.516661;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000632752;OID=.;OPOS=51716188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:61:64:0.969697:29:32:0:2:29:35:0:2 chr14 51716467 . G A 860.06 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0462318;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.387;QD=56.3972;RBI=0.0471322;REFB=-0.132736;REVB=0.00916866;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154718;STB=0.508194;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000347091;OID=.;OPOS=51716467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:61:1:1:60:60:0.983607:30:30:0:1:30:30:0:1 chr14 51721467 . C T 418.71 PASS AF=0.703704;AO=38;DP=54;FAO=38;FDP=54;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0639948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.779;QD=31.0157;RBI=0.0666617;REFB=-0.00615083;REVB=0.0186667;RO=16;SAF=16;SAR=22;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259056;STB=0.514049;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00209335;OID=.;OPOS=51721467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:16:16:38:38:0.703704:22:16:6:10:22:16:6:10 chr14 51722620 . T C 531.29 PASS AF=0.509259;AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0338035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.34;QD=19.6774;RBI=0.0422524;REFB=-0.0213835;REVB=0.0253492;RO=53;SAF=25;SAR=30;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823426;STB=0.545438;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0288557;OID=.;OPOS=51722620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:53:55:55:0.509259:30:25:29:24:30:25:29:24 chr14 52182081 . T A 353.79 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.00222357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.009;QD=18.6204;RBI=0.00223397;REFB=-0.00925676;REVB=0.000215324;RO=39;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697016;STB=0.538779;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00877744;OID=.;OPOS=52182081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:16:21:25:14:16:21:25:14 chr14 52186966 . G A 576.75 PASS AF=0.540816;AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0785149;FXX=0.019998;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.3293;QD=23.541;RBI=0.0870199;REFB=-0.0129219;REVB=-0.0375217;RO=41;SAF=24;SAR=29;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704435;STB=0.534989;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0155598;OID=.;OPOS=52186966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:98:41:45:53:53:0.540816:29:24:15:26:29:24:17:28 chr14 52384093 . G C 323.0 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00574387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.025;QD=21.8982;RBI=0.0058153;REFB=-0.0124067;REVB=0.000908642;RO=26;SAF=15;SAR=18;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157891;STB=0.587104;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00840652;OID=.;OPOS=52384093;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:18:15:17:9:18:15:17:9 chr14 52418587 . TT CC,CT 757.88 PASS AF=0.037037,0.962963;AO=2,52;DP=54;FAO=2,52;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=2,19;FSAR=0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119952,0.0216072;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=246.165,80.8417;QD=56.1389;RBI=0.015261,0.0720211;REFB=0,0;REVB=-0.0094346,0.0687034;RO=0;SAF=2,19;SAR=0,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.0907e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0226638,-0.000704806;OID=.,.;OPOS=52418587,52418587;OREF=TT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:54:54:0:0:2,52:2,52:0.037037,0.962963:0,33:2,19:0:0:0,33:2,19:0:0 chr14 52418617 . C T 772.73 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0297893;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.047;QD=61.8183;RBI=0.0330319;REFB=-0.125138;REVB=0.0142724;RO=1;SAF=17;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268741;STB=0.51428;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000938144;OID=.;OPOS=52418617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:32:17:1:0:32:17:1:0 chr14 52418636 . G T 745.95 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.81;QD=63.4851;RBI=0.0910991;REFB=0;REVB=0.0256962;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000718838;OID=.;OPOS=52418636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:31:16:0:0:31:16:0:0 chr14 52433339 . C T 312.21 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0152808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0796;QD=14.3542;RBI=0.0294693;REFB=0.00743255;REVB=0.0251979;RO=52;SAF=9;SAR=26;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280221;STB=0.66028;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0102913;OID=.;OPOS=52433339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:26:9:26:26:26:9:26:26 chr14 52478315 . A G 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.018;QD=62.908;RBI=0.0079656;REFB=0;REVB=0.00254716;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.48222e-06;OID=.;OPOS=52478315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:43:47:0:0:43:47:0:0 chr14 52481916 . C CT 626.18 PASS AF=1;AO=9;DP=68;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253221;FXX=0.0161264;HRUN=0;LEN=1;MLLD=134.444;QD=41.0611;RBI=0.115019;REFB=0;REVB=-0.112197;RO=59;SAF=5;SAR=4;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158865;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000577415;OID=.;OPOS=52481917;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:68:61:61:0:27:34:0:0:4:59:5:4:25:34 chr14 52481917 . C T 684.0 PASS AF=0.84375;AO=54;DP=64;FAO=54;FDP=64;FR=.;FRO=10;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.000246375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.521;QD=42.7499;RBI=0.0113112;REFB=-0.00829593;REVB=0.0113085;RO=9;SAF=22;SAR=32;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406975;STB=0.514893;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.000398563;OID=.;OPOS=52481917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:64:64:9:10:54:54:0.84375:32:22:5:4:32:22:5:5 chr14 52481918 . C G 32.51 PASS AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0120318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.058;QD=2.03157;RBI=0.0427188;REFB=-0.00792539;REVB=-0.0409894;RO=52;SAF=3;SAR=4;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00661427;STB=0.50683;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.222814;OID=.;OPOS=52481918;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:64:64:52:57:7:7:0.109375:4:3:22:30:4:3:24:33 chr14 52496387 . C A 1465.03 PASS AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173348;FXX=0.0106372;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.254;QD=63.012;RBI=0.0251002;REFB=0;REVB=0.0181528;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03874e-05;OID=.;OPOS=52496387;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:94:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0 chr14 52496407 . C T 1358.52 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00594309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0173;QD=62.4606;RBI=0.0204042;REFB=0;REVB=-0.0195195;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147376;OID=.;OPOS=52496407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:43:44:0:0:43:44:0:0 chr14 52505517 . G A 237.55 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.00948879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0875;QD=13.7712;RBI=0.0158898;REFB=-0.0232767;REVB=-0.0127455;RO=40;SAF=15;SAR=13;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139523;STB=0.571525;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.030999;OID=.;OPOS=52505517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:13:15:16:24:13:15:17:24 chr14 52507429 . A G 1084.53 PASS AF=0.521739;AO=106;DP=206;FAO=108;FDP=207;FR=.;FRO=99;FSAF=43;FSAR=65;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=-0.00342231;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.542;QD=20.9572;RBI=0.00550505;REFB=-0.0294298;REVB=0.004312;RO=100;SAF=43;SAR=63;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850561;STB=0.552196;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.023414;OID=.;OPOS=52507429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:207:100:99:106:108:0.521739:63:43:50:50:65:43:50:49 chr14 52509501 . T C 396.24 PASS AF=0.345324;AO=48;DP=137;FAO=48;FDP=139;FR=.;FRO=91;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.0325609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9435;QD=11.4024;RBI=0.034084;REFB=-0.0136264;REVB=-0.0100751;RO=89;SAF=17;SAR=31;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163677;STB=0.594822;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0288304;OID=.;OPOS=52509501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:89:91:48:48:0.345324:31:17:44:45:31:17:45:46 chr14 52520368 . C T 390.24 PASS AF=0.431579;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00958509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.547;QD=16.4312;RBI=0.0308992;REFB=-0.0258549;REVB=0.029375;RO=53;SAF=26;SAR=15;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719087;STB=0.536065;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0320651;OID=.;OPOS=52520368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:53:54:41:41:0.431579:15:26:30:23:15:26:31:23 chr14 52520853 . A G 1786.3 PASS AF=0.991597;AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.02464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.946;QD=60.0438;RBI=0.0313417;REFB=-0.0265508;REVB=0.0193694;RO=1;SAF=59;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811835;STB=0.504273;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00014059;OID=.;OPOS=52520853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:119:1:1:117:118:0.991597:58:59:0:1:58:60:0:1 chr14 52535648 . G T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.342;QD=62.3507;RBI=0.0374127;REFB=0;REVB=0.0184252;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023397;OID=.;OPOS=52535648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:27:16:0:0:27:16:0:0 chr14 52536512 . T C 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8219;QD=58.4193;RBI=0.0277585;REFB=0;REVB=0.0107608;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112301;OID=.;OPOS=52536512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0 chr14 53098902 . G A 486.14 PASS AF=0.418605;AO=54;DP=129;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=0.0020261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.314;QD=15.074;RBI=0.00797255;REFB=-0.0126136;REVB=-0.0077108;RO=75;SAF=26;SAR=28;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00153522;STB=0.500862;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0211349;OID=.;OPOS=53098902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:75:75:54:54:0.418605:28:26:36:39:28:26:36:39 chr14 53130507 . T C 310.16 PASS AF=0.388889;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00207807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.274;QD=13.785;RBI=0.0549832;REFB=-0.0104715;REVB=0.0549439;RO=55;SAF=14;SAR=21;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204122;STB=0.511621;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0217834;OID=.;OPOS=53130507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:55:35:35:0.388889:21:14:21:34:21:14:21:34 chr14 53180673 . A G 437.89 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0148724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.936;QD=21.624;RBI=0.0231529;REFB=-0.0184608;REVB=0.0177445;RO=38;SAF=29;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135359;STB=0.574933;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00819739;OID=.;OPOS=53180673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:14:29:20:18:14:29:20:18 chr14 53243981 . CAT C 337.71 PASS AF=0.420455;AO=34;DP=95;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0100848;FXX=0.0434735;HRUN=1;LEN=2;MLLD=231.326;QD=15.3506;RBI=0.0203054;REFB=-0.00132794;REVB=0.017624;RO=47;SAF=14;SAR=20;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807033;STB=0.529215;STBP=0.657;TYPE=del;VARB=0.00378623;OID=.;OPOS=53243982;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.420455:34:95:37:88:51:17:20:26:25:99:47:14:20:23:24 chr14 53394708 . T A 296.81 PASS AF=0.540984;AO=31;DP=58;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00550924;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=143.906;QD=19.4629;RBI=0.0300332;REFB=-0.0143713;REVB=0.0295236;RO=23;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00433031;STB=0.569691;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00284789;OID=.;OPOS=53394708;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:61:23:28:31:33:0.540984:15:16:12:11:18:15:17:11 chr14 53417158 . G C 201.14 PASS AF=0.526316;AO=18;DP=36;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0127514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.742;QD=21.1727;RBI=0.0339873;REFB=-0.0222867;REVB=0.0315046;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156805;STB=0.605163;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0260135;OID=.;OPOS=53417158;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:38:16:18:18:20:0.526316:9:9:11:5:10:10:13:5 chr14 53529669 . A T 799.86 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000291373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.725;QD=57.1326;RBI=0.00261082;REFB=0;REVB=-0.00259451;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.65799e-06;OID=.;OPOS=53529669;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr14 53619463 . G A 183.28 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0171161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.347;QD=43.125;RBI=0.130531;REFB=-0.177876;REVB=0.129403;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.526283;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0083817;OID=.;OPOS=53619463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:17:17:1:1:16:16:0.941176:7:9:1:0:7:9:1:0 chr14 53619480 . T C,TGCCGCC 236.41 PASS AF=0.136364,0.772727;AO=3,17;DP=22;FAO=3,17;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=3,8;FSAR=0,9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0020097,-0.0199901;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=92.4042,207.361;QD=42.9833;RBI=0.0193344,0.029442;REFB=0.000235556,-0.157188;REVB=0.0192297,0.0216154;RO=2;SAF=3,8;SAR=0,9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.101507;STB=0.5,0.55549;STBP=1,0.26;TYPE=snp,ins;VARB=0.034605,0.00944558;OID=.,.;OPOS=53619480,53619481;OREF=T,-;OALT=C,GCCGCC;OMAPALT=C,TGCCGCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:22:22:2:2:3,17:3,17:0.136364,0.772727:0,9:3,8:2:0:0,9:3,8:2:0 chr14 53619544 . G A 691.96 PASS AF=0.962264;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0434082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.51;QD=52.2231;RBI=0.0583973;REFB=-0.130782;REVB=0.0390638;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.520825;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00217355;OID=.;OPOS=53619544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:53:0:2:50:51:0.962264:28:22:0:0:28:23:2:0 chr14 54418838 . CTTTTTTC CTTTTTC,CTTTTTCG 35.36 PASS AF=0.107527,0.016129;AO=26,7;DP=181;FAO=20,3;FDP=186;FR=.;FRO=163;FSAF=4,0;FSAR=16,3;FSRF=54;FSRR=109;FWDB=0.0476178,-0.0138805;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=11.9472,60.1997;QD=0.760433;RBI=0.1315,0.110854;REFB=-0.0398046,-0.00189801;REVB=-0.122576,-0.109982;RO=133;SAF=7,0;SAR=19,7;SRF=45;SRR=88;SSEN=0.458333,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.103913,-0.41807;STB=0.649694,0.995542;STBP=0.192,0.153;TYPE=del,mnp;VARB=0.0426383,0.157177;OID=.,.;OPOS=54418839,54418844;OREF=T,TC;OALT=-,CG;OMAPALT=CTTTTTC,CTTTTTCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.107527,0.016129:26,7:181:20,3:186:163:4,0:16,3:54:109:29:133:7,0:19,7:45:88 chr14 54875276 . C A 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1975;QD=59.018;RBI=0.0290101;REFB=0;REVB=-0.0243874;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000516439;OID=.;OPOS=54875276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr14 54875514 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.013;QD=57.2024;RBI=0.0908836;REFB=0;REVB=-0.00224937;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000757199;OID=.;OPOS=54875514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr14 55221543 . T C 529.86 PASS AF=0.438462;AO=56;DP=128;FAO=57;FDP=130;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.10765;FXX=0.00763301;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.4188;QD=16.3033;RBI=0.142378;REFB=-0.00664854;REVB=0.0931829;RO=72;SAF=27;SAR=29;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661747;STB=0.545144;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00952218;OID=.;OPOS=55221543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:130:72:73:56:57:0.438462:29:27:30:42:29:28:30:43 chr14 55255673 . C T 2064.76 PASS AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.94;QD=62.5684;RBI=0.0679342;REFB=0;REVB=0.0335414;RO=0;SAF=56;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.94421e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126217;OID=.;OPOS=55255673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:76:56:0:0:76:56:0:0 chr14 55308770 . C A 1625.81 PASS AF=0.990909;AO=110;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0633785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4451;QD=59.1205;RBI=0.0659036;REFB=-0.0443584;REVB=-0.0180682;RO=0;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50495;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=7.17226e-05;OID=.;OPOS=55308770;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:110:0:1:110:109:0.990909:59:51:0:0:59:50:1:0 chr14 55344901 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.459;QD=60.2307;RBI=0.036374;REFB=0;REVB=0.00102735;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09615e-05;OID=.;OPOS=55344901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr14 55907172 . C G 2180.55 PASS AF=0.992857;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=84;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000855175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1558;QD=62.3016;RBI=0.0340422;REFB=0.019305;REVB=-0.0340315;RO=1;SAF=84;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056269;STB=0.502958;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000122673;OID=.;OPOS=55907172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:140:140:1:1:139:139:0.992857:55:84:1:0:55:84:1:0 chr14 56113666 . CT C 46.84 PASS AF=0.269663;AO=22;DP=91;FAO=24;FDP=89;FR=.;FRO=65;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.203256;FXX=0.0631512;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.08211;QD=2.1052;RBI=0.20723;REFB=-0.0391193;REVB=-0.040389;RO=52;SAF=9;SAR=13;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10835;STB=0.608974;STBP=0.207;TYPE=del;VARB=-0.0706386;OID=.;OPOS=56113667;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.269663:22:91:24:89:65:9:15:34:31:46:52:9:13:26:26 chr14 56763886 . G A 161.35 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0030837;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.776;QD=17.9272;RBI=0.0336272;REFB=0.0051449;REVB=-0.0334855;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765705;STB=0.529377;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=-0.0045117;OID=.;OPOS=56763886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:18:19:17:17:0.472222:9:8:10:8:9:8:10:9 chr14 57052511 . G T 2307.8 PASS AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000819411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.603;QD=61.1339;RBI=0.0263609;REFB=0;REVB=-0.0263482;RO=0;SAF=78;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.79188e-05;OID=.;OPOS=57052511;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:73:78:0:0:73:78:0:0 chr14 57099859 . G A 1135.45 PASS AF=0.987013;AO=72;DP=73;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0265903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.309;QD=58.9843;RBI=0.0305333;REFB=-0.143362;REVB=0.015008;RO=1;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160282;STB=0.50769;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000346559;OID=.;OPOS=57099859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:73:77:1:1:72:76:0.987013:29:43:0:1:32:44:0:1 chr14 57101682 . A G 1963.99 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702978;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6561;QD=61.858;RBI=0.00901539;REFB=0;REVB=0.00564442;RO=0;SAF=47;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339029;OID=.;OPOS=57101682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:127:0:0:125:127:1:78:47:0:0:79:48:0:0 chr14 57866623 . A G 868.23 PASS AF=0.953846;AO=61;DP=66;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0136749;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.684;QD=53.4295;RBI=0.016298;REFB=-0.0158324;REVB=0.00886687;RO=2;SAF=24;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00667491;STB=0.513509;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00215087;OID=.;OPOS=57866623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:66:65:2:3:61:62:0.953846:37:24:1:1:38:24:2:1 chr14 57876265 . G A 1989.42 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0328;QD=62.1692;RBI=0.0535389;REFB=0;REVB=-0.0213756;RO=0;SAF=58;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000375937;OID=.;OPOS=57876265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:70:58:0:0:70:58:0:0 chr14 57876575 . TTA CTA,T,TAA 1340.19 PASS AF=0.91954,0,0.0804598;AO=42,33,8;DP=89;FAO=80,0,7;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40,0,7;FSAR=40,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650754,-0.0803287,0.0103069;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,2,1;MLLD=40.7767,12.058,15.2453;QD=61.6178;RBI=0.250353,0.47886,0.334945;REFB=0,0,0;REVB=0.241747,-0.472075,0.334787;RO=0;SAF=36,3,8;SAR=6,30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.00529854,0,0.0882449;OID=.,.,.;OPOS=57876575,57876576,57876576;OREF=T,TA,T;OALT=C,-,A;OMAPALT=CTA,T,TAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:20:89:87:0:0:42,33,8:80,0,7:0.91954,0,0.0804598:6,30,0:36,3,8:0:0:40,0,0:40,0,7:0:0 chr14 57938124 . C T 1102.25 PASS AF=0.986667;AO=75;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0258748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9328;QD=58.7869;RBI=0.0606257;REFB=-0.15529;REVB=0.0548268;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00333256;OID=.;OPOS=57938124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:0:1:75:74:0.986667:34:41:0:0:34:40:1:0 chr14 57938260 . T C 1150.52 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000528575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6345;QD=60.5537;RBI=0.0109767;REFB=0;REVB=0.010964;RO=0;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86654e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05226e-05;OID=.;OPOS=57938260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:48:28:0:0:48:28:0:0 chr14 57945689 . G A 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0508026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.205;QD=61.0492;RBI=0.0514506;REFB=0;REVB=0.00813964;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.46482e-05;OID=.;OPOS=57945689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0 chr14 57948380 . T C 834.55 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0705863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.334;QD=57.5553;RBI=0.076107;REFB=0;REVB=0.0284578;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183051;OID=.;OPOS=57948380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:25:31:0:0:26:32:0:0 chr14 57957664 . T A 2438.9 PASS AF=1;AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128606;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=347.614;QD=61.3559;RBI=0.0135515;REFB=0;REVB=-0.00427204;RO=0;SAF=89;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26092e-06;OID=.;OPOS=57957664;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:159:159:0:0:159:159:1:70:89:0:0:70:89:0:0 chr14 58563694 . G C 136.11 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0806496;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.402;QD=16.4977;RBI=0.0807543;REFB=-0.0104277;REVB=-0.00411058;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345563;STB=0.695425;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0317577;OID=.;OPOS=58563694;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:18:18:15:15:0.454545:7:8:3:15:7:8:3:15 chr14 58605790 . G A 1011.78 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00326091;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.794;QD=59.5165;RBI=0.00383218;REFB=0;REVB=0.00201297;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.41033e-06;OID=.;OPOS=58605790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0 chr14 58706609 . C T 806.31 PASS AF=0.48538;AO=83;DP=171;FAO=83;FDP=171;FR=.;FRO=88;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.00764742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.758;QD=18.8611;RBI=0.00835336;REFB=-0.00198816;REVB=0.00336089;RO=88;SAF=50;SAR=33;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221387;STB=0.512217;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00285302;OID=.;OPOS=58706609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:88:88:83:83:0.48538:33:50:51:37:33:50:51:37 chr14 58766617 . A G 1128.06 PASS AF=0.974359;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0716466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5951;QD=57.8492;RBI=0.0848955;REFB=-0.0968426;REVB=-0.0455412;RO=2;SAF=32;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286516;STB=0.514702;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00307658;OID=.;OPOS=58766617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:77:78:2:2:75:76:0.974359:43:32:2:0:43:33:2:0 chr14 58838668 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.73;QD=59.0182;RBI=0.0304088;REFB=0;REVB=-0.0102774;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166386;OID=.;OPOS=58838668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0 chr14 58838701 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.661;QD=55.0987;RBI=0.0374522;REFB=0;REVB=-0.0295227;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.72712e-05;OID=.;OPOS=58838701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr14 58839339 . A C 554.64 PASS AF=0.95;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.014534;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.704;QD=55.464;RBI=0.0189012;REFB=0.0137802;REVB=0.0120839;RO=2;SAF=21;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042533;STB=0.522715;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-2.26311e-05;OID=.;OPOS=58839339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:2:2:37:38:0.95:16:21:2:0:17:21:2:0 chr14 58917454 . G A 1268.08 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272558;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.779;QD=61.8575;RBI=0.0307168;REFB=0;REVB=0.0141648;RO=0;SAF=28;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165052;OID=.;OPOS=58917454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:54:28:0:0:54:28:0:0 chr14 58937416 . T C 986.06 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4603;QD=58.8694;RBI=0.0290841;REFB=0;REVB=-0.0204124;RO=1;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113841;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000419009;OID=.;OPOS=58937416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:1:0:65:67:1:41:24:0:1:43:24:0:0 chr14 58953746 . C G 1116.55 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6516;QD=60.3539;RBI=0.0271663;REFB=0;REVB=-0.0213635;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000352133;OID=.;OPOS=58953746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:43:31:0:0:43:31:0:0 chr14 59010649 . T C 868.25 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.362;QD=57.8831;RBI=0.0356068;REFB=0;REVB=0.0214722;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.83116e-05;OID=.;OPOS=59010649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:36:23:0:0:36:24:0:0 chr14 59112475 . C T 493.85 PASS AF=0.546512;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0144757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.926;QD=22.9696;RBI=0.0151108;REFB=-0.0140236;REVB=0.00433464;RO=39;SAF=26;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966773;STB=0.553169;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0106246;OID=.;OPOS=59112475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:39:39:47:47:0.546512:21:26:17:22:21:26:17:22 chr14 59112732 . C T 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.000413574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.998;QD=21.9446;RBI=0.00516867;REFB=-0.0099463;REVB=0.00515209;RO=12;SAF=14;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180682;STB=0.603301;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00647705;OID=.;OPOS=59112732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:2:14:9:3:2:14:9:3 chr14 59113430 . G A 232.92 PASS AF=0.421875;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0252974;FXX=0.0447694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.322;QD=14.5577;RBI=0.0259263;REFB=-0.0155848;REVB=-0.0056761;RO=35;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107586;STB=0.577358;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0279885;OID=.;OPOS=59113430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:35:37:27:27:0.421875:11:16:17:18:11:16:17:20 chr14 59114770 . C G 563.78 PASS AF=0.53271;AO=57;DP=107;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00510639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5151;QD=21.076;RBI=0.0281556;REFB=-0.0121362;REVB=-0.0276887;RO=50;SAF=29;SAR=28;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026567;STB=0.514599;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0121234;OID=.;OPOS=59114770;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:50:50:57:57:0.53271:28:29:27:23:28:29:27:23 chr14 59789727 . G A 293.86 PASS AF=0.382022;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0312992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9339;QD=13.207;RBI=0.0401652;REFB=-0.000292273;REVB=-0.0251715;RO=55;SAF=18;SAR=16;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117358;STB=0.566807;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000369876;OID=.;OPOS=59789727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:0.382022:16:18:35:20:16:18:35:20 chr14 59797235 . A G 840.12 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00620254;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.863;QD=56.0077;RBI=0.0118551;REFB=-0.100639;REVB=0.010103;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159925;STB=0.508472;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.000210041;OID=.;OPOS=59797235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:60:1:1:59:59:0.983333:29:30:0:1:29:30:0:1 chr14 59835972 . A C,G 275.51 PASS AF=0.333333,0.466667;AO=10,14;DP=30;FAO=10,14;FDP=30;FR=.;FRO=6;FSAF=5,4;FSAR=5,10;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0230385,-0.0274896;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=157.215,192.831;QD=36.7339;RBI=0.0232187,0.0280893;REFB=-0.108952,-0.0405038;REVB=0.00288681,0.00577348;RO=3;SAF=5,4;SAR=5,10;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.205201,-0.244872;STB=0.687177,0.713979;STBP=0.1,0.006;TYPE=snp,snp;VARB=0.0212009,-0.00429421;OID=.,.;OPOS=59835972,59835972;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:84:30:30:3:6:10,14:10,14:0.333333,0.466667:5,10:5,4:3:0:5,10:5,4:6:0 chr14 60004844 . C T 605.0 PASS AF=0.97619;AO=38;DP=41;FAO=41;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0169681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4521;QD=57.6187;RBI=0.0435724;REFB=-0.0381652;REVB=0.0401327;RO=1;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253186;STB=0.512189;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00958692;OID=.;OPOS=60004844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:42:1:1:38:41:0.97619:18:20:0:1:20:21:0:1 chr14 60031996 . G A 1861.97 PASS AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00281159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.962;QD=60.5519;RBI=0.0140705;REFB=-0.0625772;REVB=0.0137867;RO=1;SAF=58;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812055;STB=0.504273;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=7.17519e-05;OID=.;OPOS=60031996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:123:123:1:1:122:122:0.99187:64:58:1:0:64:58:1:0 chr14 60043422 . A G 1135.09 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.333;QD=60.5383;RBI=0.0496999;REFB=0;REVB=-0.0102828;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106331;OID=.;OPOS=60043422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:41:33:0:0:41:34:0:0 chr14 60063472 . A G 2292.76 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.776;QD=63.6878;RBI=0.0408816;REFB=0;REVB=0.024008;RO=0;SAF=62;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.2896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210305;OID=.;OPOS=60063472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:82:62:0:0:82:62:0:0 chr14 60574539 . A G 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00909367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.256;QD=58.4187;RBI=0.00919023;REFB=0;REVB=0.0013287;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6041e-05;OID=.;OPOS=60574539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr14 60575240 . T C 781.63 PASS AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0037494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.909;QD=52.1089;RBI=0.0173469;REFB=-0.0297728;REVB=0.0169369;RO=3;SAF=13;SAR=44;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971428;STB=0.551705;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0129059;OID=.;OPOS=60575240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:60:60:3:3:57:57:0.95:44:13:3:0:44:13:3:0 chr14 60575869 . A G 1573.18 PASS AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0418644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.841;QD=58.8105;RBI=0.04193;REFB=-0.101692;REVB=0.00234518;RO=1;SAF=43;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00747438;STB=0.503936;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000188191;OID=.;OPOS=60575869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:63:43:0:1:63:43:0:1 chr14 60576241 . G C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.306;QD=35.5759;RBI=0.044108;REFB=0;REVB=0.0400271;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00078672;OID=.;OPOS=60576241;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0 chr14 60576637 . A T 1573.01 PASS AF=1;AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.54;QD=59.9242;RBI=0.0291198;REFB=0;REVB=0.0240703;RO=0;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93472e-05;OID=.;OPOS=60576637;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:104:105:1:53:51:0:0:54:51:0:0 chr14 60576951 . A G 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.956;QD=57.2377;RBI=0.0166511;REFB=0;REVB=0.0100795;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.64423e-06;OID=.;OPOS=60576951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0 chr14 60581863 . G A 724.13 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00751532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.566;QD=54.6516;RBI=0.0123854;REFB=-0.0992279;REVB=0.00984466;RO=1;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016526;STB=0.508769;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000167942;OID=.;OPOS=60581863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:28:24:0:1:28:24:0:1 chr14 60581935 . C T 1178.11 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153429;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.295;QD=61.2007;RBI=0.0162353;REFB=0;REVB=-0.00530852;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614131;OID=.;OPOS=60581935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:43:34:0:0:43:34:0:0 chr14 60582053 . G A 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000468719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.884;QD=59.8392;RBI=0.00894847;REFB=0;REVB=0.00893619;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48783e-05;OID=.;OPOS=60582053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0 chr14 60864583 . G T 2354.59 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=82;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0073516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.113;QD=63.2105;RBI=0.0170509;REFB=-0.125239;REVB=0.0153847;RO=1;SAF=66;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00715173;STB=0.503759;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=8.15811e-06;OID=.;OPOS=60864583;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:149:149:1:1:148:148:0.993289:82:66:1:0:82:66:1:0 chr14 60900113 . C T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=311.108;QD=62.1623;RBI=0.0217825;REFB=0;REVB=0.00745391;RO=0;SAF=51;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41516e-05;OID=.;OPOS=60900113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:34:51:0:0:34:51:0:0 chr14 60903757 . G A 801.18 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0435181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.864;QD=55.254;RBI=0.0453234;REFB=-0.0174668;REVB=-0.0126645;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140753;STB=0.50746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000143849;OID=.;OPOS=60903757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:58:1:1:56:57:0.982759:33:23:0:1:33:24:0:1 chr14 60923783 . C T 885.18 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0684475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.268;QD=58.0445;RBI=0.0686538;REFB=0;REVB=0.00531766;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000604039;OID=.;OPOS=60923783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr14 60932752 . G A 754.12 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5936;QD=56.915;RBI=0.0592499;REFB=0;REVB=-0.0529337;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102065;OID=.;OPOS=60932752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr14 61124940 . A G 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0016781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.395;QD=60.2043;RBI=0.00487736;REFB=0;REVB=-0.00457959;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.98241e-06;OID=.;OPOS=61124940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0 chr14 61176485 . T C 445.19 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.449;QD=57.4432;RBI=0.0247943;REFB=0;REVB=0.00914153;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163408;OID=.;OPOS=61176485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr14 61177188 . G A 255.68 PASS AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00456756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.6;QD=29.2201;RBI=0.0186511;REFB=-0.0297402;REVB=-0.0180832;RO=12;SAF=13;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409757;STB=0.522593;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0159043;OID=.;OPOS=61177188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:10:13:6:6:10:13:6:6 chr14 61180657 . T G 381.28 PASS AF=0.394737;AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00286225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.332;QD=13.3782;RBI=0.00591381;REFB=-0.0174274;REVB=-0.005175;RO=69;SAF=22;SAR=23;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735257;STB=0.541599;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0272922;OID=.;OPOS=61180657;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:69:69:45:45:0.394737:23:22:29:40:23:22:29:40 chr14 61445967 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.497;QD=62.0218;RBI=0.0288535;REFB=0;REVB=-0.0112923;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7719e-05;OID=.;OPOS=61445967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr14 61449328 . T A 2428.71 PASS AF=0.964497;AO=163;DP=169;FAO=163;FDP=169;FR=.;FRO=6;FSAF=73;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0206941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.263;QD=57.4843;RBI=0.0209811;REFB=-0.0234969;REVB=0.00345866;RO=3;SAF=73;SAR=90;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759907;STB=0.501871;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.000254457;OID=.;OPOS=61449328;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:169:169:3:6:163:163:0.964497:90:73:2:1:90:73:3:3 chr14 61509924 . T C 789.63 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0318724;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.088;QD=55.4126;RBI=0.0323418;REFB=-0.135735;REVB=-0.00549034;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140753;STB=0.50746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000427734;OID=.;OPOS=61509924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:33:23:0:1:33:23:0:1 chr14 61924239 . G A 341.54 PASS AF=0.45122;AO=38;DP=83;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0239334;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.861;QD=16.6604;RBI=0.0562477;REFB=-0.00245812;REVB=-0.0509018;RO=44;SAF=25;SAR=13;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282115;STB=0.648568;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00232223;OID=.;OPOS=61924239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:44:45:38:37:0.45122:13:25:16:28:13:24:17:28 chr14 61924241 . A C 316.93 PASS AF=0.421687;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.00516042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.299;QD=15.2739;RBI=0.00587596;REFB=-0.0139637;REVB=0.00281016;RO=45;SAF=23;SAR=12;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278873;STB=0.651606;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0254365;OID=.;OPOS=61924241;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:83:45:48:35:35:0.421687:12:23:17:28:12:23:19:29 chr14 61997226 . C T 737.05 PASS AF=0.529851;AO=70;DP=134;FAO=71;FDP=134;FR=.;FRO=63;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0153203;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.841;QD=22.0014;RBI=0.0154601;REFB=0.00673396;REVB=-0.00207401;RO=63;SAF=40;SAR=30;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123379;STB=0.570145;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.00540923;OID=.;OPOS=61997226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:63:63:70:71:0.529851:30:40:27:36:30:41:27:36 chr14 62037421 . C T 370.49 PASS AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00412428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.542;QD=14.8198;RBI=0.00500858;REFB=-0.0117047;REVB=0.00284185;RO=59;SAF=22;SAR=18;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114734;STB=0.569686;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0248101;OID=.;OPOS=62037421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:59:60:40:40:0.4:18:22:26:33:18:22:26:34 chr14 62213848 . T C 216.67 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00998119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.963;QD=13.3333;RBI=0.0132513;REFB=-0.00163706;REVB=0.0087162;RO=39;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134419;STB=0.507686;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0023626;OID=.;OPOS=62213848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:13:13:19:20:13:13:19:20 chr14 62229285 . T G 511.21 PASS AF=0.458333;AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=-0.0206612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.244;QD=17.0404;RBI=0.0211907;REFB=-0.00233802;REVB=0.00470786;RO=65;SAF=32;SAR=23;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651624;STB=0.536219;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00380703;OID=.;OPOS=62229285;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:65:65:55:55:0.458333:23:32:42:23:23:32:42:23 chr14 62244837 . A G 277.41 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.00959398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1453;QD=18.4938;RBI=0.0144103;REFB=-0.0372981;REVB=-0.0107523;RO=30;SAF=18;SAR=12;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291829;STB=0.662234;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0361825;OID=.;OPOS=62244837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:12:18:8:22:12:18:8:22 chr14 62462766 . T C 334.42 PASS AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0120117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.085;QD=19.3866;RBI=0.0124043;REFB=-0.0195029;REVB=-0.00309631;RO=34;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152377;STB=0.50847;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0153161;OID=.;OPOS=62462766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:34:35:35:0.507246:20:15:14:20:20:15:14:20 chr14 62463129 . G T 236.6 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.00795412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.232;QD=15.773;RBI=0.00945591;REFB=-0.0119186;REVB=-0.00511334;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068273;STB=0.538434;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0120959;OID=.;OPOS=62463129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:18:9:9:24:18:9:9:24 chr14 62463214 . C T 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0164584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.483;QD=23.5277;RBI=0.0195848;REFB=-0.00991622;REVB=-0.0106153;RO=15;SAF=6;SAR=14;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956088;STB=0.553141;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00475184;OID=.;OPOS=62463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:14:6:3:12:14:6:3:12 chr14 63174616 . T C 2293.57 PASS AF=0.986486;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00215469;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.7239;QD=61.9883;RBI=0.0420383;REFB=0.0568884;REVB=-0.041983;RO=1;SAF=68;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605839;STB=0.500465;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.00101229;OID=.;OPOS=63174616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:148:148:1:2:146:146:0.986486:78:68:0:1:78:68:1:1 chr14 63784407 . A AG,G 1136.85 PASS AF=0.988372,0.0116279;AO=48,33;DP=90;FAO=85,1;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42,1;FSAR=43,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193843,-0.0352845;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=21.6714,5.1596;QD=52.8768;RBI=0.091286,0.414818;REFB=0,0;REVB=-0.0892042,-0.413315;RO=9;SAF=38,1;SAR=10,32;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0061838,-0.683101;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00199614,0.0565778;OID=.,.;OPOS=63784408,63784407;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:90:86:9:0:48,33:85,1:0.988372,0.0116279:10,32:38,1:7:2:43,0:42,1:0:0 chr14 63841402 . ATTTTG A,AT,ATT 486.21 PASS AF=0,0.97619,0.0238095;AO=10,15,11;DP=42;FAO=0,41,1;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21,1;FSAR=0,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000228851,-0.0020397,-0.00344516;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=5,4,3;MLLD=265.958,268.51,264.117;QD=46.306;RBI=0.0200654,0.0133255,0.00760756;REFB=0,0,0;REVB=0.020064,0.0131685,0.00678277;RO=0;SAF=2,12,5;SAR=8,3,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0147631,-0.00522693,-0.00508946;OID=.,.,.;OPOS=63841403,63841404,63841405;OREF=TTTTG,TTTG,TTG;OALT=-,-,-;OMAPALT=A,AT,ATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.97619,0.0238095:10,15,11:42:0,41,1:42:0:0,21,1:0,20,0:0:0:5:0:2,12,5:8,3,6:0:0 chr14 63841415 . TG GT,TT 56.84 PASS AF=0.240741,0;AO=12,3;DP=54;FAO=13,0;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=5,0;FSAR=8,0;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0610903,0.00469741;FXX=0;HRUN=8,1;LEN=2,1;MLLD=20.2631,153.685;QD=4.21061;RBI=0.0701824,0.00470284;REFB=-0.0667897,0.00137835;REVB=0.0345476,0.000225865;RO=37;SAF=4,2;SAR=8,1;SRF=17;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.158829,0.20346;STB=0.542706,0.5;STBP=0.73,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0115394,-0.0464347;OID=.,.;OPOS=63841415,63841416;OREF=TG,G;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:54:54:37:41:12,3:13,0:0.240741,0:8,1:4,2:17:20:8,0:5,0:18:23 chr14 63842235 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.531;QD=56.9378;RBI=0.0264481;REFB=0;REVB=0.00961476;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58246e-05;OID=.;OPOS=63842235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr14 63842808 . C T 311.11 PASS AF=0.583333;AO=17;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.273349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.8154;QD=25.9255;RBI=0.27464;REFB=-0.0397578;REVB=0.0265992;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518067;STB=0.590847;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0370888;OID=.;OPOS=63842808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:19:20:17:28:0.583333:14:3:4:15:15:13:5:15 chr14 64423187 . C A 260.62 PASS AF=0.467742;AO=28;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00708308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.837;QD=16.8141;RBI=0.00714961;REFB=-0.00897236;REVB=0.000973069;RO=33;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903669;STB=0.557939;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00474396;OID=.;OPOS=64423187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:33:33:28:29:0.467742:17:11:16:17:18:11:16:17 chr14 64491695 . T C 519.84 PASS AF=0.519608;AO=49;DP=98;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=0.00678397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.89;QD=20.3857;RBI=0.0239722;REFB=-0.00572457;REVB=0.0229923;RO=48;SAF=28;SAR=21;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148071;STB=0.600565;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00848862;OID=.;OPOS=64491695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:102:48:49:49:53:0.519608:21:28:35:13:25:28:36:13 chr14 64494278 . C T 1624.22 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00268456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.771;QD=60.1562;RBI=0.0318382;REFB=0;REVB=-0.0317248;RO=0;SAF=59;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.94344e-05;OID=.;OPOS=64494278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:49:59:0:0:49:59:0:0 chr14 64496749 . C T 372.03 PASS AF=0.62069;AO=34;DP=55;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0457864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.839;QD=25.6569;RBI=0.0468305;REFB=-0.0325443;REVB=-0.00983372;RO=21;SAF=7;SAR=27;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275178;STB=0.650779;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00747363;OID=.;OPOS=64496749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:58:21:22:34:36:0.62069:27:7:11:10:29:7:11:11 chr14 64496763 . T C 152.9 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=0.0339727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.2;QD=11.9922;RBI=0.0458634;REFB=-0.00979947;REVB=0.0308108;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360006;STB=0.705692;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.017052;OID=.;OPOS=64496763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:9:9:6:27:9:9:6:27 chr14 64497930 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0154712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.788;QD=19.0179;RBI=0.0157191;REFB=-0.00500892;REVB=-0.00278088;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293275;STB=0.650959;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00307647;OID=.;OPOS=64497930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:14:15:15:0.517241:5:10:4:9:5:10:5:9 chr14 64498037 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.303;QD=55.6559;RBI=0.0446967;REFB=0;REVB=0.0440143;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175976;OID=.;OPOS=64498037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr14 64518321 . A G 167.94 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00811632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.271;QD=11.785;RBI=0.0157624;REFB=-0.000283758;REVB=-0.0135121;RO=36;SAF=15;SAR=6;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303606;STB=0.676909;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0016721;OID=.;OPOS=64518321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:6:15:16:20:6:15:16:20 chr14 64519035 . A G 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3551;QD=53.9099;RBI=0.121358;REFB=0;REVB=0.0805833;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00451014;OID=.;OPOS=64519035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0 chr14 64519455 . A G 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.000543004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.749;QD=10.1726;RBI=0.00606709;REFB=0.0112363;REVB=0.00604274;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129519;STB=0.578703;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.036866;OID=.;OPOS=64519455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:2:7:4:2:2:7 chr14 64519709 . A T 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.00670687;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.162;QD=13.4559;RBI=0.00685848;REFB=0.000915921;REVB=0.00143411;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467471;STB=0.764736;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.000726505;OID=.;OPOS=64519709;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:5:6:1:14:5:6:1:14 chr14 64522674 . G C 261.71 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0184548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.304;QD=17.447;RBI=0.0187686;REFB=-0.0013089;REVB=0.00341789;RO=30;SAF=10;SAR=19;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177236;STB=0.608464;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00137632;OID=.;OPOS=64522674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:30:31:29:29:0.483333:19:10:16:14:19:10:17:14 chr14 64522843 . A G 254.68 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0349205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2645;QD=15.6724;RBI=0.0405058;REFB=-0.0165792;REVB=0.0205251;RO=36;SAF=15;SAR=14;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125617;STB=0.570776;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0291879;OID=.;OPOS=64522843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:14:15:14:22:14:15:14:22 chr14 64551688 . C T 435.61 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0107435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.504;QD=18.5365;RBI=0.0143836;REFB=-0.0235859;REVB=0.00956378;RO=49;SAF=23;SAR=21;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311508;STB=0.522717;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.039103;OID=.;OPOS=64551688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:49:50:44:44:0.468085:21:23:24:25:21:23:24:26 chr14 64554517 . A G 220.56 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0200281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.579;QD=16.0407;RBI=0.0201434;REFB=0.0161451;REVB=-0.0021523;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393535;STB=0.522238;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.0137573;OID=.;OPOS=64554517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:11:14:18:12:11:14:18:12 chr14 64565582 . T C 786.01 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.68;QD=64.1641;RBI=0.0312469;REFB=0;REVB=0.0281241;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.46299e-05;OID=.;OPOS=64565582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:25:23:0:0:26:23:0:0 chr14 64612845 . C T 262.89 PASS AF=0.47541;AO=28;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00853512;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.461;QD=17.2389;RBI=0.0146052;REFB=-0.0129326;REVB=0.0118517;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546039;STB=0.510825;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0149214;OID=.;OPOS=64612845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:32:28:29:0.47541:16:12:16:17:16:13:15:17 chr14 64612858 . C A 258.55 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00207409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.367;QD=16.4156;RBI=0.0178618;REFB=-0.0213874;REVB=-0.0177409;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355327;STB=0.519986;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0183781;OID=.;OPOS=64612858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:16:13:14:20:16:13:14:20 chr14 64637147 . C A 251.07 PASS AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0161871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9503;QD=19.692;RBI=0.0231486;REFB=-0.00943793;REVB=0.016548;RO=25;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134572;STB=0.575696;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00916263;OID=.;OPOS=64637147;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:7:19:15:10:7:19:15:10 chr14 64657684 . C A 534.88 PASS AF=0.456;AO=57;DP=126;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=19;FWDB=-0.0213836;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.468;QD=17.116;RBI=0.0225903;REFB=-0.00943156;REVB=0.00728424;RO=67;SAF=30;SAR=27;SRF=49;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203224;STB=0.607138;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00990057;OID=.;OPOS=64657684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:67:68:57:57:0.456:27:30:49:18:27:30:49:19 chr14 64724051 . C T 401.29 PASS AF=0.644068;AO=38;DP=59;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0451497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.928;QD=27.2058;RBI=0.0502258;REFB=-0.0309883;REVB=-0.022003;RO=21;SAF=21;SAR=17;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012414;STB=0.506772;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.021801;OID=.;OPOS=64724051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:21:21:38:38:0.644068:17:21:12:9:17:21:12:9 chr14 64805001 . A G 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.000338065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.331;QD=14.3343;RBI=0.0182501;REFB=-0.00331885;REVB=0.018247;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040409;STB=0.523757;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00401747;OID=.;OPOS=64805001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:6:4:4:5:6:4 chr14 64882380 . A G 137.9 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00523937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.381;QD=11.4912;RBI=0.00588721;REFB=-0.02226;REVB=-0.00268482;RO=32;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220003;STB=0.630978;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0415835;OID=.;OPOS=64882380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:5:11:16:16:5:11:16:16 chr14 64908845 . G A 560.91 PASS AF=0.543689;AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.00897283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.39;QD=21.7829;RBI=0.00977433;REFB=-0.015312;REVB=-0.00387631;RO=46;SAF=25;SAR=31;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120139;STB=0.559482;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0154759;OID=.;OPOS=64908845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:46:47:56:56:0.543689:31:25:14:32:31:25:15:32 chr14 64935720 . C T 344.56 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00780096;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.019;QD=55.1295;RBI=0.0293974;REFB=0;REVB=-0.0283435;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000233517;OID=.;OPOS=64935720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr14 65008251 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4693;QD=60.9784;RBI=0.0424625;REFB=0;REVB=-0.00616067;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341328;OID=.;OPOS=65008251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr14 65009650 . A C 185.79 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00569113;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.551;QD=19.0551;RBI=0.0255079;REFB=-0.0178311;REVB=0.0248649;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772379;STB=0.543862;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0125868;OID=.;OPOS=65009650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:7:12:11:9:7:12:11:9 chr14 65016702 . T G 393.26 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.608;QD=56.18;RBI=0.0149939;REFB=0;REVB=0.00468754;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71085e-05;OID=.;OPOS=65016702;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0 chr14 65031534 . C T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00240546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.5;QD=63.8718;RBI=0.00308762;REFB=0;REVB=0.00193576;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72699e-06;OID=.;OPOS=65031534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0 chr14 65219006 . C CCTCCT 80.89 PASS AF=0.209677;AO=12;DP=70;FAO=13;FDP=62;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0870047;FXX=0.0312451;HRUN=3;LEN=5;MLLD=197.733;QD=5.21856;RBI=0.0920534;REFB=-0.027865;REVB=-0.0300668;RO=57;SAF=3;SAR=9;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42001;STB=0.718801;STBP=0.107;TYPE=ins;VARB=0.0821495;OID=.;OPOS=65219007;OREF=-;OALT=CTCCT;OMAPALT=CCTCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.209677:12:70:13:62:49:4:9:29:20:80:57:3:9:34:23 chr14 65241228 . A G 1573.02 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9514;QD=59.9247;RBI=0.0281851;REFB=0;REVB=0.00529647;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141525;OID=.;OPOS=65241228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:52:52:0:0:53:52:0:0 chr14 65242044 . C T 454.06 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0905842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.231;QD=55.0375;RBI=0.0910895;REFB=-0.0911127;REVB=0.00958081;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00231194;OID=.;OPOS=65242044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:16:16:0:0:16:16:1:0 chr14 65245956 . C T 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0205004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.933;QD=7.83704;RBI=0.0205447;REFB=-0.00649634;REVB=-0.00134959;RO=16;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248764;STB=0.657425;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.02181;OID=.;OPOS=65245956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:5:2:8:8:5:2:8:8 chr14 65245962 . A G 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.000394479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.521;QD=7.83717;RBI=0.0171449;REFB=-0.00371301;REVB=0.0171404;RO=16;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183097;STB=0.616089;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00532533;OID=.;OPOS=65245962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:5:2:7:9:5:2:7:9 chr14 65246623 . T C 410.83 PASS AF=0.518987;AO=35;DP=80;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.1177;FXX=0.0124984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.231;QD=20.8016;RBI=0.118044;REFB=-0.0057685;REVB=0.0090049;RO=32;SAF=27;SAR=8;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025702;STB=0.544706;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00346656;OID=.;OPOS=65246623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:32:38:35:41:0.518987:8:27:24:8:10:31:26:12 chr14 65253232 . T C 378.99 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00682758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9499;QD=19.1895;RBI=0.0349557;REFB=-0.0578198;REVB=-0.0342824;RO=39;SAF=19;SAR=20;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921568;STB=0.544371;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0383578;OID=.;OPOS=65253232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:40:39:39:0.493671:20:19:23:16:20:19:23:17 chr14 65260227 . T G 171.05 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0213832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.94;QD=17.5433;RBI=0.0227929;REFB=0.00398613;REVB=0.00789138;RO=21;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301757;STB=0.517222;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.00602695;OID=.;OPOS=65260227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:10:8:10:11:10:8:10:11 chr14 65263300 . C T 395.42 PASS AF=0.455556;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00426124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.965;QD=17.5744;RBI=0.0054276;REFB=-0.012405;REVB=0.00336164;RO=49;SAF=19;SAR=22;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455772;STB=0.525503;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0140016;OID=.;OPOS=65263300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:49:49:41:41:0.455556:22:19:25:24:22:19:25:24 chr14 65412748 . G C 94.25 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00988666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.848;QD=10.4723;RBI=0.0293524;REFB=-0.00956307;REVB=-0.0276373;RO=24;SAF=8;SAR=4;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359446;STB=0.713946;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0213414;OID=.;OPOS=65412748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:4:8:8:16:4:8:8:16 chr14 65417070 . C A 264.09 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0630619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.531;QD=12.8822;RBI=0.0650208;REFB=-0.0197806;REVB=0.0158399;RO=51;SAF=16;SAR=15;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00686879;STB=0.503934;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0263162;OID=.;OPOS=65417070;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:51:51:31:31:0.378049:15:16:26:25:15:16:26:25 chr14 65419293 . A G 176.56 PASS AF=0.396226;AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0106838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0855;QD=13.3254;RBI=0.0144427;REFB=0.0249931;REVB=0.0097185;RO=32;SAF=6;SAR=14;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538083;STB=0.541361;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.0380965;OID=.;OPOS=65419293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:32:32:20:21:0.396226:14:6:11:21:15:6:11:21 chr14 65568304 . GAAA GAA,GA,GAAG 323.1 PASS AF=0.835294,0.0352941,0.129412;AO=32,12,7;DP=103;FAO=71,3,11;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44,2,0;FSAR=27,1,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.122452,-0.062983,-0.0234026;FXX=0.212943;HRUN=11,11,11;LEN=1,2,1;MLLD=6.1384,10.9313,146.073;QD=15.2046;RBI=0.134026,0.0634853,0.0399722;REFB=0,0,0;REVB=0.0544859,0.00797008,-0.0324052;RO=15;SAF=22,7,0;SAR=10,5,7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.100321,0.0484683,-0.757216;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0415491,-0.0760707,0.0450061;OID=.,.,.;OPOS=65568305,65568305,65568307;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GAA,GA,GAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.835294,0.0352941,0.129412:32,12,7:103:71,3,11:85:0:44,2,0:27,1,11:0:0:56:15:22,7,0:10,5,7:8:7 chr14 65878807 . C T 412.74 PASS AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00358514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.269;QD=21.441;RBI=0.0156226;REFB=-0.03797;REVB=0.0152057;RO=36;SAF=28;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11811;STB=0.565427;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0341305;OID=.;OPOS=65878807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:36:41:41:0.532468:13:28:20:16:13:28:20:16 chr14 66028446 . A G 261.51 PASS AF=0.360465;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0272911;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.714;QD=12.1632;RBI=0.0278222;REFB=-0.00407991;REVB=0.00541042;RO=49;SAF=4;SAR=27;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434252;STB=0.791645;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0041618;OID=.;OPOS=66028446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:55:31:31:0.360465:27:4:21:28:27:4:27:28 chr14 66136163 . C A 324.19 PASS AF=0.559322;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.00788784;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.084;QD=21.9788;RBI=0.0121825;REFB=-0.0270871;REVB=0.00928416;RO=27;SAF=13;SAR=20;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118329;STB=0.577733;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0187829;OID=.;OPOS=66136163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:27:26:33:33:0.559322:20:13:7:20:20:13:6:20 chr14 66479768 . A C 599.73 PASS AF=0.508333;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00140949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5867;QD=19.991;RBI=0.0081827;REFB=-0.0345391;REVB=-0.00806039;RO=59;SAF=30;SAR=31;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299726;STB=0.51652;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0180845;OID=.;OPOS=66479768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:59:61:61:0.508333:31:30:31:28:31:30:31:28 chr14 66480197 . G A 765.79 PASS AF=0.375527;AO=88;DP=235;FAO=89;FDP=237;FR=.;FRO=148;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=74;FSRR=74;FWDB=0.0200352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.132;QD=12.9247;RBI=0.0222072;REFB=-0.0206062;REVB=-0.00957872;RO=146;SAF=46;SAR=42;SRF=73;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251118;STB=0.517558;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0280395;OID=.;OPOS=66480197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:237:146:148:88:89:0.375527:42:46:73:73:42:47:74:74 chr14 66480247 . CA TC 382.31 PASS AF=0.331707;AO=68;DP=206;FAO=68;FDP=205;FR=.;FRO=137;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=0.0107854;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=2;MLLD=122.842;QD=7.45973;RBI=0.0430258;REFB=-0.0510039;REVB=0.0416521;RO=136;SAF=38;SAR=30;SRF=63;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11087;STB=0.566008;STBP=0.195;TYPE=mnp;VARB=0.140617;OID=.;OPOS=66480247;OREF=CA;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:136:137:68:68:0.331707:30:38:63:73:30:38:63:74 chr14 66974474 . T C 137.37 PASS AF=0.5;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.171654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.542;QD=18.3164;RBI=0.171658;REFB=-0.0229423;REVB=0.00114044;RO=14;SAF=2;SAR=13;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420722;STB=0.76429;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0130567;OID=.;OPOS=66974474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:30:14:15:15:15:0.5:13:2:7:7:13:2:8:7 chr14 67147816 . T C 177.3 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00784584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4181;QD=21.4908;RBI=0.0506077;REFB=-0.00813635;REVB=0.0499958;RO=14;SAF=11;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143909;STB=0.566935;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00953974;OID=.;OPOS=67147816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:15:18:18:0.545455:7:11:6:8:7:11:7:8 chr14 67648289 . G A 64.15 PASS AF=0.310345;AO=8;DP=30;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00237752;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.839;QD=8.84819;RBI=0.0113687;REFB=-0.00203387;REVB=0.0111173;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538376;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00454013;OID=.;OPOS=67648289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:29:20:20:8:9:0.310345:4:4:10:10:4:5:10:10 chr14 67815791 . C A 97.95 PASS AF=0.254545;AO=14;DP=55;FAO=14;FDP=55;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00397225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.13;QD=7.12364;RBI=0.0313274;REFB=-0.0103409;REVB=-0.0310745;RO=41;SAF=8;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719606;STB=0.544439;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0584787;OID=.;OPOS=67815791;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:55:55:41:41:14:14:0.254545:6:8:21:20:6:8:21:20 chr14 67937222 . C T 216.3 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0925188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.4889;QD=22.1848;RBI=0.0971473;REFB=-0.0298457;REVB=0.029629;RO=18;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420569;STB=0.523538;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0291186;OID=.;OPOS=67937222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:13:8:6:12:13:8:6:12 chr14 68024134 . A T 240.49 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0375942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.047;QD=21.3769;RBI=0.0642961;REFB=-0.0162437;REVB=0.05216;RO=22;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584328;STB=0.53279;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0146711;OID=.;OPOS=68024134;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:11:12:10:12:11:12:10:12 chr14 68029313 . G A 234.28 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00576607;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.708;QD=24.0287;RBI=0.0185696;REFB=-0.0258333;REVB=0.0176517;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161305;STB=0.589665;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0162033;OID=.;OPOS=68029313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:11:11:12:5:11:11:12:5 chr14 68035879 . A G 432.02 PASS AF=0.505882;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0187139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.183;QD=20.3305;RBI=0.0606332;REFB=-0.0252346;REVB=-0.057673;RO=42;SAF=25;SAR=18;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124908;STB=0.568935;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0307638;OID=.;OPOS=68035879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:0.505882:18:25:30:12:18:25:30:12 chr14 68042255 . A G 220.57 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00751819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8295;QD=14.2303;RBI=0.0142096;REFB=-0.00317581;REVB=-0.0120578;RO=36;SAF=13;SAR=13;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850411;STB=0.54835;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00330221;OID=.;OPOS=68042255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:13:13:15:21:13:13:15:21 chr14 68042574 . A G 442.13 PASS AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.000579487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4351;QD=20.0968;RBI=0.00207074;REFB=-0.0363635;REVB=0.001988;RO=44;SAF=23;SAR=21;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818151;STB=0.54534;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0428969;OID=.;OPOS=68042574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:21:23:19:25:21:23:19:25 chr14 68045935 . G A 726.85 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0989853;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.521;QD=57.0079;RBI=0.0990475;REFB=0;REVB=0.00350821;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375851;OID=.;OPOS=68045935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0 chr14 68053124 . T A 272.6 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0159437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6891;QD=14.9368;RBI=0.070798;REFB=-0.0324041;REVB=0.0689794;RO=42;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394529;STB=0.522373;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0400541;OID=.;OPOS=68053124;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:21:10:15:27:21:10:15:27 chr14 68053149 . A G 262.79 PASS AF=0.428571;AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0368789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.294;QD=15.0166;RBI=0.0537278;REFB=-0.0139741;REVB=-0.0390721;RO=40;SAF=7;SAR=22;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077578;STB=0.523793;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.02347;OID=.;OPOS=68053149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:29:30:0.428571:22:7:12:28:22:8:12:28 chr14 68053802 . T C 117.19 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0280767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9133;QD=12.0198;RBI=0.03616;REFB=-0.00777719;REVB=-0.0227868;RO=25;SAF=12;SAR=2;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479466;STB=0.789005;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.020172;OID=.;OPOS=68053802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:2:12:12:13:2:12:12:13 chr14 68053977 . A C 1616.37 PASS AF=0.973451;AO=111;DP=113;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0223555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6826;QD=57.2166;RBI=0.0227467;REFB=-0.00862975;REVB=0.00420043;RO=2;SAF=54;SAR=57;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000454345;STB=0.504185;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.000513517;OID=.;OPOS=68053977;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:113:113:2:3:111:110:0.973451:57:54:1:1:56:54:1:2 chr14 68055613 . C G 976.68 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182385;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.677;QD=59.1929;RBI=0.0182714;REFB=0;REVB=0.0010965;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79608e-05;OID=.;OPOS=68055613;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:65:66:1:26:39:0:0:27:39:0:0 chr14 68060574 . G A 286.25 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00611343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.224;QD=18.1745;RBI=0.0119038;REFB=-0.0248109;REVB=-0.010214;RO=32;SAF=20;SAR=11;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219801;STB=0.622973;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0359789;OID=.;OPOS=68060574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:11:20:13:19:11:20:13:19 chr14 68172894 . C T 164.14 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0259064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.674;QD=12.8734;RBI=0.0263269;REFB=0.00355119;REVB=-0.00468639;RO=32;SAF=4;SAR=15;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460536;STB=0.768938;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00933099;OID=.;OPOS=68172894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:15:4:20:12:15:4:20:12 chr14 68213744 . G A 943.75 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00638109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8786;QD=58.0771;RBI=0.0422835;REFB=0;REVB=0.0417993;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186072;OID=.;OPOS=68213744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:63:65:1:34:29:0:0:36:29:0:0 chr14 68213792 . A G 401.01 PASS AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=2.59583e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.041;QD=24.3034;RBI=0.0312892;REFB=-0.0373921;REVB=0.0312892;RO=27;SAF=13;SAR=26;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200928;STB=0.610468;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0290661;OID=.;OPOS=68213792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:27:27:39:39:0.590909:26:13:16:11:26:13:16:11 chr14 68214788 . T C 145.17 PASS AF=0.4;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00217696;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.391;QD=14.5168;RBI=0.0339015;REFB=-0.00672652;REVB=-0.0338315;RO=24;SAF=14;SAR=2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41818;STB=0.749625;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0141973;OID=.;OPOS=68214788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:24:24:16:16:0.4:2:14:14:10:2:14:14:10 chr14 68218165 . G A 168.88 PASS AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.044585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.538;QD=24.1256;RBI=0.0449752;REFB=-0.0122717;REVB=-0.00591174;RO=11;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33169;STB=0.688273;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0117145;OID=.;OPOS=68218165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:3:14:5:6:3:14:5:6 chr14 68234539 . T C 946.04 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187839;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.567;QD=59.1277;RBI=0.0303405;REFB=0;REVB=0.0238267;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.63497e-05;OID=.;OPOS=68234539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr14 68249499 . C T 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00462441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.382;QD=14.1699;RBI=0.014441;REFB=0.0076613;REVB=0.0136805;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243833;STB=0.642579;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.00723704;OID=.;OPOS=68249499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:8:4:6:4:8:4 chr14 68257485 . C T 494.32 PASS AF=0.473214;AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=0.00173811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.928;QD=17.6544;RBI=0.0155828;REFB=0.00136674;REVB=-0.0154855;RO=58;SAF=29;SAR=24;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0871191;STB=0.542822;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00190619;OID=.;OPOS=68257485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:58:59:53:53:0.473214:24:29:37:21:24:29:37:22 chr14 68264867 . A G 107.07 PASS AF=0.55;AO=6;DP=21;FAO=11;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00906993;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.324;QD=21.4131;RBI=0.0116127;REFB=-0.0518248;REVB=-0.00725202;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.571299;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0623119;OID=.;OPOS=68264867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:21:20:9:8:6:11:0.55:3:3:6:3:6:5:5:3 chr14 68265046 . T C 119.53 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.014199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.711;QD=13.6608;RBI=0.0302526;REFB=-0.00513869;REVB=0.0267134;RO=21;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174822;STB=0.602361;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00899487;OID=.;OPOS=68265046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:5:9:10:11:5:9:10:11 chr14 68616597 . G A 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00394299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3425;QD=10.0747;RBI=0.0612487;REFB=0.021836;REVB=0.0611217;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133032;STB=0.581189;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.032142;OID=.;OPOS=68616597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:7:7:5:3:7:7 chr14 68703076 . C T 327.88 PASS AF=0.353448;AO=41;DP=116;FAO=41;FDP=116;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.00332185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.795;QD=11.3062;RBI=0.0203593;REFB=0.0015795;REVB=0.0200865;RO=75;SAF=21;SAR=20;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622727;STB=0.503574;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.00293495;OID=.;OPOS=68703076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:75:75:41:41:0.353448:20:21:38:37:20:21:38:37 chr14 68935789 . T C 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7564;QD=61.213;RBI=0.0263697;REFB=0;REVB=-0.0059813;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129525;OID=.;OPOS=68935789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0 chr14 69012355 . C G 1339.7 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.945;QD=62.3117;RBI=0.0259253;REFB=0;REVB=0.0177718;RO=0;SAF=32;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.24474e-05;OID=.;OPOS=69012355;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:54:32:0:0:54:32:0:0 chr14 69117512 . T C 194.33 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0423862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.3499;QD=12.3381;RBI=0.0423899;REFB=0.00372917;REVB=-0.000560022;RO=38;SAF=20;SAR=4;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262571;STB=0.666508;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00437863;OID=.;OPOS=69117512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:39:24:24:0.380952:4:20:25:13:4:20:25:14 chr14 69257858 . C T 589.76 PASS AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00354001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.988;QD=57.5379;RBI=0.0146546;REFB=-0.144064;REVB=0.0142206;RO=1;SAF=21;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218009;STB=0.511106;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000390624;OID=.;OPOS=69257858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:41:41:1:1:39:40:0.97561:18:21:1:0:18:22:1:0 chr14 69262441 . A G 825.48 PASS AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00389994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.064;QD=54.1297;RBI=0.0489245;REFB=-0.0724299;REVB=-0.0487688;RO=2;SAF=30;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000524089;STB=0.500278;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000614054;OID=.;OPOS=69262441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:61:61:2:2:59:59:0.967213:29:30:1:1:29:30:1:1 chr14 69263074 . G A 567.79 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0416922;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6842;QD=58.2348;RBI=0.0416926;REFB=-0.0450254;REVB=-0.000178456;RO=1;SAF=11;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406887;STB=0.521727;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0173568;OID=.;OPOS=69263074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:39:1:1:38:38:0.974359:27:11:1:0:27:11:1:0 chr14 69341816 . C T 309.88 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0445907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.181;QD=22.1343;RBI=0.0458842;REFB=-0.0227064;REVB=0.0108181;RO=24;SAF=16;SAR=16;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129584;STB=0.571385;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0223108;OID=.;OPOS=69341816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:16:16:8:16:16:16:8:16 chr14 69345647 . C T 48.18 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00626007;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.942;QD=9.17714;RBI=0.00839421;REFB=-0.00731997;REVB=-0.00559234;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162993;STB=0.594327;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0308095;OID=.;OPOS=69345647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:21:21:9:14:6:7:0.333333:3:3:3:6:3:4:6:8 chr14 69352230 . G A 400.1 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0186874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4039;QD=18.6091;RBI=0.0485507;REFB=-0.0064375;REVB=0.0448102;RO=44;SAF=19;SAR=22;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971549;STB=0.559609;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00742296;OID=.;OPOS=69352230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:45:41:41:0.476744:22:19:25:19:22:19:26:19 chr14 69695792 . G A 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7541;QD=62.6701;RBI=0.0524002;REFB=0;REVB=0.0397084;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109603;OID=.;OPOS=69695792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:32:12:0:0:32:12:0:0 chr14 69703158 . A G 2390.67 PASS AF=1;AO=156;DP=158;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00800955;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.574;QD=61.2993;RBI=0.00830369;REFB=0;REVB=0.00219051;RO=0;SAF=81;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33111e-05;OID=.;OPOS=69703158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:158:156:0:0:156:156:1:75:81:0:0:75:81:0:0 chr14 69704553 . G T 1453.49 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00258687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.443;QD=63.1954;RBI=0.0407611;REFB=0;REVB=0.0406789;RO=0;SAF=55;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.22106e-05;OID=.;OPOS=69704553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:37:55:0:0:37:55:0:0 chr14 69799806 . C T 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0630177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2251;QD=18.2502;RBI=0.0706714;REFB=0.00350992;REVB=-0.0319877;RO=15;SAF=2;SAR=13;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112902;STB=0.565123;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=-0.00249166;OID=.;OPOS=69799806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:13:2:3:12:13:2:3:12 chr14 69799892 . A G 128.04 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.0248917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.724;QD=20.4858;RBI=0.0252945;REFB=0.000879546;REVB=-0.00449599;RO=9;SAF=2;SAR=12;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468103;STB=0.549934;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.00117025;OID=.;OPOS=69799892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:9:11:14:14:0.56:12:2:1:8:12:2:1:10 chr14 69820946 . C A 185.4 PASS AF=0.387755;AO=18;DP=50;FAO=19;FDP=49;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=29;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0128288;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.413;QD=15.1343;RBI=0.018111;REFB=-0.0198552;REVB=-0.012784;RO=24;SAF=14;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314539;STB=0.60548;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0437899;OID=.;OPOS=69820946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:24:29:18:19:0.387755:4:14:12:12:5:14:17:12 chr14 70037611 . A T 837.2 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00148918;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.921;QD=55.8135;RBI=0.031809;REFB=-0.124787;REVB=0.0317741;RO=1;SAF=36;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129277;STB=0.506847;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000251407;OID=.;OPOS=70037611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:23:36:1:0:23:36:1:0 chr14 70038786 . A G 289.43 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2475;QD=52.6228;RBI=0.0230432;REFB=0;REVB=0.0122607;RO=0;SAF=2;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0005111;OID=.;OPOS=70038786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:19:2:0:0:20:2:0:0 chr14 70180778 . C G 1264.74 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00154643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.72;QD=61.6946;RBI=0.0218746;REFB=0;REVB=0.0218199;RO=0;SAF=30;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81425e-05;OID=.;OPOS=70180778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:52:30:0:0:52:30:0:0 chr14 70418881 . G A 482.44 PASS AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.0129352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.873;QD=18.5554;RBI=0.0216731;REFB=-0.0189221;REVB=-0.0173897;RO=52;SAF=27;SAR=24;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13293;STB=0.57729;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0214844;OID=.;OPOS=70418881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:53:51:51:0.490385:24:27:35:17:24:27:36:17 chr14 70477508 . C T 2361.08 PASS AF=0.975309;AO=158;DP=162;FAO=158;FDP=162;FR=.;FRO=4;FSAF=106;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0320202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.811;QD=58.2983;RBI=0.0334461;REFB=-0.0858869;REVB=0.0096615;RO=4;SAF=106;SAR=52;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905357;STB=0.504761;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000232845;OID=.;OPOS=70477508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:162:162:4:4:158:158:0.975309:52:106:2:2:52:106:2:2 chr14 70634087 . A G 2262.69 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.327;QD=62.8524;RBI=0.0747842;REFB=-0.0552258;REVB=-0.0726659;RO=0;SAF=69;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.71517e-05;OID=.;OPOS=70634087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:142:144:0:0:141:144:1:72:69:0:0:73:71:0:0 chr14 70712880 . A C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.364;QD=52.6132;RBI=0.0371763;REFB=0;REVB=0.00897425;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028719;OID=.;OPOS=70712880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr14 70713156 . G A 498.05 PASS AF=0.50495;AO=49;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00110085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.922;QD=19.7246;RBI=0.0107738;REFB=-0.0250267;REVB=-0.0107174;RO=50;SAF=23;SAR=26;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269385;STB=0.524874;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0226215;OID=.;OPOS=70713156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:50:50:49:51:0.50495:26:23:22:28:26:25:22:28 chr14 70713858 . T C 577.33 PASS AF=0.576087;AO=50;DP=89;FAO=53;FDP=92;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.023649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.16;QD=25.1013;RBI=0.023894;REFB=-0.0185515;REVB=-0.00341352;RO=39;SAF=17;SAR=33;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185976;STB=0.580858;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0154996;OID=.;OPOS=70713858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:92:39:39:50:53:0.576087:33:17:22:17:33:20:22:17 chr14 70827773 . T C 1453.42 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4398;QD=63.1923;RBI=0.0544642;REFB=0;REVB=0.0196074;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515684;OID=.;OPOS=70827773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0 chr14 70924450 . C T 149.64 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00481701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.083;QD=11.9714;RBI=0.00810898;REFB=-0.00227488;REVB=0.00652319;RO=33;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835601;STB=0.549238;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00673047;OID=.;OPOS=70924450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:8:9:15:18:8:9:15:18 chr14 70924462 . A G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.496;QD=63.5817;RBI=0.0293929;REFB=0;REVB=-0.00516867;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96263e-05;OID=.;OPOS=70924462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0 chr14 70924501 . C G 609.75 PASS AF=0.903846;AO=47;DP=52;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00128382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.841;QD=46.9039;RBI=0.00394549;REFB=0.0228135;REVB=-0.00373078;RO=5;SAF=19;SAR=28;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000796081;STB=0.500425;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=-0.00348482;OID=.;OPOS=70924501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:52:52:5:5:47:47:0.903846:28:19:2:3:28:19:2:3 chr14 70924852 . A C 39.72 PASS AF=0.0961538;AO=10;DP=104;FAO=10;FDP=104;FR=.;FRO=94;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=59;FWDB=-0.0143316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2017;QD=1.52788;RBI=0.0165775;REFB=-0.00182855;REVB=-0.00833182;RO=94;SAF=5;SAR=5;SRF=35;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151378;STB=0.615166;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0343522;OID=.;OPOS=70924852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:104:104:94:94:10:10:0.0961538:5:5:35:59:5:5:35:59 chr14 70925257 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00352834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.637;QD=46.848;RBI=0.00463849;REFB=0;REVB=0.00301105;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.84277e-06;OID=.;OPOS=70925257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr14 70925818 . T C 34.36 PASS AF=0.272727;AO=5;DP=21;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.061115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.138;QD=6.24691;RBI=0.0613282;REFB=-0.00669071;REVB=0.00510948;RO=16;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319494;STB=0.742119;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0903962;OID=.;OPOS=70925818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:21:22:16:16:5:6:0.272727:2:3:5:11:2:4:5:11 chr14 71109153 . C G 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00576701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.245;QD=16.9316;RBI=0.0088265;REFB=-0.01226;REVB=0.00668196;RO=11;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273019;STB=0.642602;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0131814;OID=.;OPOS=71109153;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:9:3:6:5:9:3:6:6 chr14 71139279 . G T 257.99 PASS AF=0.348315;AO=30;DP=88;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0117905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.867;QD=11.5949;RBI=0.0144982;REFB=-0.017588;REVB=-0.0084369;RO=56;SAF=11;SAR=19;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100603;STB=0.506469;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0292896;OID=.;OPOS=71139279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:56:58:30:31:0.348315:19:11:21:35:19:12:23:35 chr14 71374702 . G A 873.52 PASS AF=0.49162;AO=88;DP=181;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=-0.00907198;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6694;QD=19.52;RBI=0.0338394;REFB=-0.0168475;REVB=0.0326007;RO=90;SAF=53;SAR=35;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958036;STB=0.55028;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0139319;OID=.;OPOS=71374702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:179:90:91:88:88:0.49162:35:53:45:45:35:53:46:45 chr14 71444788 . G A 158.05 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00875035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.314;QD=25.2873;RBI=0.00876141;REFB=0.0082949;REVB=0.000440021;RO=9;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144208;STB=0.580215;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.00390705;OID=.;OPOS=71444788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:7:9:7:2:7:9:7:2 chr14 71577898 . C G 358.08 PASS AF=0.652174;AO=30;DP=46;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0338399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.632;QD=31.1377;RBI=0.0347032;REFB=0.00280256;REVB=-0.00769215;RO=15;SAF=21;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701156;STB=0.554418;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.00259294;OID=.;OPOS=71577898;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:15:16:30:30:0.652174:9:21:9:6:9:21:9:7 chr14 71915415 . T G,TGTG 501.14 PASS AF=0.171429,0.828571;AO=7,27;DP=35;FAO=6,29;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,16;FSAR=4,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0870347,-0.0114019;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=59.9774,219.43;QD=57.2728;RBI=0.0873131,0.0119225;REFB=0,0;REVB=-0.00696753,0.00348468;RO=1;SAF=2,16;SAR=5,11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0796435,0.040394;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0265216,0.00131916;OID=.,.;OPOS=71915415,71915416;OREF=T,-;OALT=G,GTG;OMAPALT=G,TGTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:31:35:35:1:0:7,27:6,29:0.171429,0.828571:5,11:2,16:0:1:4,13:2,16:0:0 chr14 72055468 . A C,T 656.9 PASS AF=0.953488,0.0465116;AO=41,2;DP=43;FAO=41,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123171,0.00681554;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=116.847,68.1474;QD=61.1072;RBI=0.0361913,0.0131312;REFB=0,0;REVB=0.0340309,0.0112239;RO=0;SAF=25,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.1719e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0012866,-0.0488225;OID=.,.;OPOS=72055468,72055468;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:43:43:0:0:41,2:41,2:0.953488,0.0465116:16,1:25,1:0:0:16,1:25,1:0:0 chr14 72117156 . T C 489.47 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0557867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8469;QD=55.9397;RBI=0.0713802;REFB=-0.105539;REVB=0.0445307;RO=1;SAF=11;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406014;STB=0.521726;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00536646;OID=.;OPOS=72117156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:23:11:1:0:23:11:1:0 chr14 72457365 . T G 283.13 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00309253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.925;QD=17.4231;RBI=0.00316259;REFB=-0.0183473;REVB=0.000661957;RO=34;SAF=18;SAR=13;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357056;STB=0.519987;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0199599;OID=.;OPOS=72457365;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:13:18:21:13:13:18:21:13 chr14 72457682 . A C 401.55 PASS AF=0.424242;AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0215837;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.528;QD=16.2242;RBI=0.0285396;REFB=-0.00392784;REVB=0.0186722;RO=56;SAF=16;SAR=26;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454763;STB=0.51851;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00512914;OID=.;OPOS=72457682;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:57:42:42:0.424242:26:16:19:37:26:16:20:37 chr14 73079291 . G GA,GAA 390.65 PASS AF=0,1;AO=7,22;DP=35;FAO=0,33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.344415,0.190103;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=15.291,29.1875;QD=47.3513;RBI=0.40132,0.216851;REFB=0,0;REVB=0.206,0.104334;RO=4;SAF=5,6;SAR=2,16;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.250326,-0.228528;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0115978;OID=.,.;OPOS=73079292,73079292;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:7,22:35:0,33:33:0:0,13:0,20:0:0:7:4:5,6:2,16:4:0 chr14 73220020 . A G 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.062406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.657;QD=15.1962;RBI=0.0686183;REFB=0.00746273;REVB=-0.0285299;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218396;STB=0.62176;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.01439;OID=.;OPOS=73220020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:26:18:18:0.409091:8:10:8:16:8:10:9:17 chr14 73240486 . A G 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0588064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7377;QD=10.0339;RBI=0.07722;REFB=0.0369221;REVB=0.0500473;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286688;STB=0.676751;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.0396288;OID=.;OPOS=73240486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:5:2:3:2:5:2 chr14 73358945 . A C 2277.54 PASS AF=0.993421;AO=150;DP=151;FAO=151;FDP=152;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0344108;FXX=0.0440224;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.821;QD=59.9352;RBI=0.0344619;REFB=0.0430939;REVB=0.00187578;RO=1;SAF=76;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621765;STB=0.503268;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=5.78637e-05;OID=.;OPOS=73358945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:151:152:1:1:150:151:0.993421:74:76:1:0:75:76:1:0 chr14 73360819 . T TTGTC 604.74 PASS AF=0.875;AO=41;DP=50;FAO=42;FDP=48;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00922198;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=4;MLLD=288.079;QD=50.3952;RBI=0.0223265;REFB=-0.014511;REVB=0.0203329;RO=7;SAF=13;SAR=28;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118625;STB=0.572333;STBP=0.018;TYPE=ins;VARB=0.00102051;OID=.;OPOS=73360820;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=TTGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.875:41:50:42:48:6:13:29:5:1:32:7:13:28:5:2 chr14 73413830 . G A 332.9 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0029084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.585;QD=19.023;RBI=0.0107126;REFB=-0.0216161;REVB=0.0103103;RO=35;SAF=17;SAR=18;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102449;STB=0.556971;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0279586;OID=.;OPOS=73413830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:18:17:21:14:18:17:21:14 chr14 73422350 . T G 298.47 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00773679;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.807;QD=18.3673;RBI=0.0137955;REFB=-0.014162;REVB=0.0114218;RO=34;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828103;STB=0.554137;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.014784;OID=.;OPOS=73422350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:34:33:32:32:0.492308:17:15:19:15:17:15:19:14 chr14 73429755 . G A 189.83 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=0.000485928;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.853;QD=20.5219;RBI=0.0177455;REFB=-0.0070503;REVB=-0.0177389;RO=18;SAF=6;SAR=13;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226559;STB=0.625785;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00785403;OID=.;OPOS=73429755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:13:6:2:16:13:6:2:16 chr14 73507393 . C A 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0113705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9294;QD=8.24617;RBI=0.0125417;REFB=0.00319707;REVB=0.00529189;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18924;STB=0.616134;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00702157;OID=.;OPOS=73507393;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:4:3:4:11:4:3:4:11 chr14 73719455 . A C 220.9 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00914488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5187;QD=18.0326;RBI=0.0402299;REFB=0.024002;REVB=-0.0391767;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538499;STB=0.530585;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.0291243;OID=.;OPOS=73719455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:11:11:12:15:11:11:12:15 chr14 73727509 . T G 111.43 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.00193257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.989;QD=15.9185;RBI=0.027885;REFB=-0.00694036;REVB=-0.0278179;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355202;STB=0.719735;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0149361;OID=.;OPOS=73727509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:15:13:13:0.464286:7:6:1:12:7:6:1:14 chr14 73957772 . A G 81.11 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0759834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9476;QD=18.0252;RBI=0.10241;REFB=-0.0543854;REVB=-0.0686617;RO=8;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193381;STB=0.6109;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0478799;OID=.;OPOS=73957772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:5:5:6:2:5:5:6:2 chr14 73958375 . T C 208.86 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00269083;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.24;QD=25.3158;RBI=0.0152993;REFB=0.00239185;REVB=-0.0150608;RO=13;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16017;STB=0.5887;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00160044;OID=.;OPOS=73958375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:9:11:10:3:9:11:10:3 chr14 73958812 . T C 237.71 PASS AF=0.457627;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0116766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.634;QD=16.1156;RBI=0.0254511;REFB=-0.0219574;REVB=0.0226145;RO=31;SAF=8;SAR=18;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212589;STB=0.619473;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0361297;OID=.;OPOS=73958812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:31:32:26:27:0.457627:18:8:16:15:19:8:16:16 chr14 73963383 . T C 274.55 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0190488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.973;QD=19.9672;RBI=0.0268292;REFB=-0.0161982;REVB=0.0188932;RO=25;SAF=7;SAR=22;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29748;STB=0.676792;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0132338;OID=.;OPOS=73963383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:26:29:29:0.527273:22:7:14:11:22:7:15:11 chr14 73989859 . C T 101.93 PASS AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.00258049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.833;QD=9.06016;RBI=0.0134757;REFB=-0.0192258;REVB=-0.0132263;RO=32;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299247;STB=0.678683;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0419604;OID=.;OPOS=73989859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:6:7:9:23:6:7:9:23 chr14 74036370 . G T 211.61 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00496157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1885;QD=19.6848;RBI=0.0748401;REFB=-0.0195827;REVB=0.0746754;RO=22;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117528;STB=0.566601;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00935531;OID=.;OPOS=74036370;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:14:7:10:12:14:7:10:12 chr14 74058832 . C T 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00919454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.286;QD=18.7456;RBI=0.0610798;REFB=-0.0586123;REVB=-0.0603838;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448465;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0234035;OID=.;OPOS=74058832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:3:4:2:2:3:4:2:2 chr14 74061968 . T C 141.33 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0271745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2674;QD=21.7436;RBI=0.0334681;REFB=0.00757763;REVB=0.0195361;RO=11;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232282;STB=0.6314;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.0148933;OID=.;OPOS=74061968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:5:10:4:7:5:10:4:7 chr14 74083846 . C T 183.31 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00229578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.873;QD=18.8009;RBI=0.00936154;REFB=-0.0244437;REVB=-0.00907567;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667811;STB=0.537776;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0203823;OID=.;OPOS=74083846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:8:11:13:7:8:11:13:7 chr14 74168625 . G A 241.96 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00396565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.113;QD=14.4454;RBI=0.0131998;REFB=-0.0157519;REVB=-0.01259;RO=38;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300447;STB=0.663043;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0213716;OID=.;OPOS=74168625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:39:28:28:0.41791:10:18:13:25:10:18:14:25 chr14 74181044 . T C 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0385169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.511;QD=16.199;RBI=0.0478742;REFB=-0.0454286;REVB=0.0284321;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116878;STB=0.57112;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0258435;OID=.;OPOS=74181044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:1:2:4:1:1:2 chr14 74196686 . T C 479.28 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0176728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.501;QD=19.9702;RBI=0.0202118;REFB=-0.0217586;REVB=0.00980769;RO=49;SAF=20;SAR=27;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971905;STB=0.553947;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0270025;OID=.;OPOS=74196686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:27:20:26:23:27:20:26:23 chr14 74196844 . T C 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0244264;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.785;QD=10.1407;RBI=0.0257454;REFB=-0.00160776;REVB=0.00813507;RO=28;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300236;STB=0.518106;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0030304;OID=.;OPOS=74196844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:10:3:7:21:10:3:7:21 chr14 74196872 . G C 74.68 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0261261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.311;QD=10.6681;RBI=0.0286018;REFB=-0.00779904;REVB=-0.0116401;RO=18;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104859;STB=0.562383;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0140443;OID=.;OPOS=74196872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:7:3:4:14:7:3:4:14 chr14 74203789 . G A 92.8 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.033404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1252;QD=9.28046;RBI=0.0381049;REFB=0.00895694;REVB=-0.0183347;RO=27;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748206;STB=0.533841;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=-0.02972;OID=.;OPOS=74203789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:27:28:12:12:0.3:5:7:14:13:5:7:15:13 chr14 74203983 . T G 174.33 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.016287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.186;QD=11.622;RBI=0.02067;REFB=-0.00767843;REVB=-0.0127273;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770974;STB=0.544546;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0140397;OID=.;OPOS=74203983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:13:9:13:25:13:9:13:25 chr14 74206481 . T C 197.68 PASS AF=0.47619;AO=19;DP=41;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00376279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9426;QD=18.8262;RBI=0.0582777;REFB=-0.0077395;REVB=-0.0581561;RO=21;SAF=13;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185783;STB=0.538422;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0183935;OID=.;OPOS=74206481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:21:22:19:20:0.47619:6:13:14:7:6:14:14:8 chr14 74206658 . G A 40.31 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0109519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.186;QD=14.6571;RBI=0.0181558;REFB=0.00897189;REVB=0.0144807;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120202;STB=0.571205;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.00471508;OID=.;OPOS=74206658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:4:1:2:4:4:1 chr14 74324807 . G A 239.06 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0165882;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.598;QD=16.2076;RBI=0.0229029;REFB=-0.000508815;REVB=0.0157917;RO=31;SAF=15;SAR=12;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158744;STB=0.596944;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.000410745;OID=.;OPOS=74324807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:32:27:27:0.457627:12:15:12:19:12:15:12:20 chr14 74489735 . G A 317.93 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00473331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.844;QD=15.509;RBI=0.020492;REFB=-0.010967;REVB=-0.0199379;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143856;STB=0.502091;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0133858;OID=.;OPOS=74489735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:46:47:35:35:0.426829:18:17:23:23:18:17:23:24 chr14 74514674 . A T 203.9 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00540208;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.655;QD=12.3577;RBI=0.00651684;REFB=-0.0102057;REVB=-0.0036451;RO=42;SAF=11;SAR=14;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192708;STB=0.618785;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.017375;OID=.;OPOS=74514674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:42:41:25:25:0.378788:14:11:26:16:14:11:26:15 chr14 74539325 . C A 87.91 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=38;FAO=7;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0303046;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.983;QD=15.9837;RBI=0.0332266;REFB=-0.00065608;REVB=-0.0136248;RO=15;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153613;STB=0.624653;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0142058;OID=.;OPOS=74539325;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:38:22:15:11:14:7:0.318182:6:8:6:9:3:4:4:7 chr14 74759006 . C T 165.09 PASS AF=0.355932;AO=20;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.121348;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.241;QD=11.1926;RBI=0.121702;REFB=-0.00277178;REVB=-0.00928038;RO=39;SAF=5;SAR=15;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502534;STB=0.760136;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00202529;OID=.;OPOS=74759006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:38:20:21:0.355932:15:5:28:11:15:6:27:11 chr14 74759301 . G T 106.16 PASS AF=0.6;AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0161368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.513;QD=21.2326;RBI=0.061815;REFB=-0.0186584;REVB=0.0596715;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194374;STB=0.583194;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0206287;OID=.;OPOS=74759301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:20:8:8:11:12:0.6:4:7:3:5:5:7:3:5 chr14 74759477 . C T 292.79 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00268934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.423;QD=17.223;RBI=0.0392417;REFB=0.00587184;REVB=0.0391494;RO=36;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636182;STB=0.535692;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.00398767;OID=.;OPOS=74759477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:19:13:17:19:19:13:17:19 chr14 74766352 . A G 339.73 PASS AF=0.420455;AO=36;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.000348893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4668;QD=15.4424;RBI=0.011624;REFB=0.00675857;REVB=0.0116187;RO=52;SAF=15;SAR=21;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166526;STB=0.605448;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0102702;OID=.;OPOS=74766352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:51:36:37:0.420455:21:15:30:22:22:15:30:21 chr14 74876181 . T G 598.87 PASS AF=0.535714;AO=60;DP=112;FAO=60;FDP=112;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00496683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6883;QD=21.3884;RBI=0.0549893;REFB=-0.0193919;REVB=-0.0547645;RO=52;SAF=28;SAR=32;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011964;STB=0.506569;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0187705;OID=.;OPOS=74876181;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:52:52:60:60:0.535714:32:28:25:27:32:28:25:27 chr14 75159007 . G A 225.84 PASS AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0622627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3833;QD=13.2847;RBI=0.0710986;REFB=-0.0271547;REVB=-0.0343274;RO=40;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11015;STB=0.569981;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0618786;OID=.;OPOS=75159007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:41:27:27:0.397059:12:15:18:22:12:15:18:23 chr14 75179734 . C G 331.0 PASS AF=0.45;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0594884;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3917;QD=16.5502;RBI=0.061875;REFB=-0.017077;REVB=0.0170189;RO=44;SAF=13;SAR=23;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205342;STB=0.615428;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0177994;OID=.;OPOS=75179734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:44:44:36:36:0.45:23:13:25:19:23:13:25:19 chr14 75245368 . C T 260.48 PASS AF=0.509091;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.111209;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.0009;QD=18.9439;RBI=0.112118;REFB=-0.0283546;REVB=0.0142512;RO=27;SAF=8;SAR=19;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826329;STB=0.5581;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0288308;OID=.;OPOS=75245368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:27:27:27:28:0.509091:19:8:6:21:19:9:6:21 chr14 75248669 . G T 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00523869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140;QD=17.8402;RBI=0.0112875;REFB=-0.0208549;REVB=-0.00999817;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12462;STB=0.571326;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0143223;OID=.;OPOS=75248669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:8:6:8:6:8:6 chr14 75279395 . T A 955.19 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.175;QD=58.781;RBI=0.0324235;REFB=0;REVB=0.0321464;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85419e-05;OID=.;OPOS=75279395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0 chr14 75359670 . G A 371.59 PASS AF=0.453488;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=0.00884014;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.972;QD=17.283;RBI=0.00884084;REFB=-0.021302;REVB=0.00011158;RO=48;SAF=12;SAR=27;SRF=13;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434302;STB=0.534466;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0230854;OID=.;OPOS=75359670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:48:47:39:39:0.453488:27:12:13:35:27:12:12:35 chr14 75373245 . A G 236.6 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00486078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.083;QD=15.773;RBI=0.0235798;REFB=-0.00526299;REVB=-0.0230734;RO=33;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00327958;STB=0.501853;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00685621;OID=.;OPOS=75373245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:13:14:17:16:13:14:17:16 chr14 75373475 . T C 241.17 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00621554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.477;QD=14.6161;RBI=0.013204;REFB=-0.0072414;REVB=0.0116496;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193856;STB=0.511005;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00771284;OID=.;OPOS=75373475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:16:12:17:21:16:12:17:21 chr14 75386576 . G A 397.43 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=7;FWDB=-0.00951465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6658;QD=20.6456;RBI=0.0283454;REFB=-0.05496;REVB=0.0267008;RO=37;SAF=23;SAR=17;SRF=30;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218766;STB=0.620042;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0435698;OID=.;OPOS=75386576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:17:23:30:7:17:23:30:7 chr14 75388183 . C T 217.74 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0673398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.634;QD=16.7494;RBI=0.067454;REFB=-0.0141794;REVB=-0.00392412;RO=28;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180224;STB=0.510196;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.025601;OID=.;OPOS=75388183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:15:9:11:17:15:9:11:17 chr14 75412908 . A C,G 1532.96 PASS AF=0.0510204,0.94898;AO=5,93;DP=98;FAO=5,93;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=5,50;FSAR=0,43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720626,0.00769392;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=136.245,97.806;QD=62.57;RBI=0.0568341,0.0242535;REFB=0,0;REVB=-0.0563754,-0.0230008;RO=0;SAF=5,50;SAR=0,43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0810205,0.00235674;OID=.,.;OPOS=75412908,75412908;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:98:98:0:0:5,93:5,93:0.0510204,0.94898:0,43:5,50:0:0:0,43:5,50:0:0 chr14 75482897 . G A 196.26 PASS AF=0.342466;AO=25;DP=73;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00323198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.354;QD=10.7537;RBI=0.0086509;REFB=-0.00253408;REVB=-0.00802449;RO=46;SAF=12;SAR=13;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262782;STB=0.514274;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00818481;OID=.;OPOS=75482897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:48:25:25:0.342466:13:12:21:25:13:12:22:26 chr14 75483812 . T C 1795.55 PASS AF=0.983471;AO=118;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0227447;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.885;QD=59.357;RBI=0.0300813;REFB=0.0288529;REVB=0.0196865;RO=2;SAF=57;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163714;STB=0.508619;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.000902747;OID=.;OPOS=75483812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:121:121:2:2:118:119:0.983471:61:57:2:0:62:57:2:0 chr14 75513883 . T C 748.64 PASS AF=0.948276;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0227111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3103;QD=51.6304;RBI=0.0227182;REFB=-0.00207882;REVB=0.000566557;RO=2;SAF=27;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000601097;STB=0.508153;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=7.54991e-05;OID=.;OPOS=75513883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:58:58:2:3:55:55:0.948276:28:27:1:1:28:27:1:2 chr14 75537381 . C T 802.63 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017412;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.79;QD=57.3306;RBI=0.0216166;REFB=0;REVB=0.0128102;RO=0;SAF=38;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139482;OID=.;OPOS=75537381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:18:38:0:0:18:38:0:0 chr14 75538217 . G T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4641;QD=51.184;RBI=0.0938759;REFB=0;REVB=-0.0815761;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011793;OID=.;OPOS=75538217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr14 75544470 . T A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.941;QD=54.5177;RBI=0.0245426;REFB=0;REVB=-0.0146774;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87451e-05;OID=.;OPOS=75544470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0 chr14 75574087 . C T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.519;QD=63.8719;RBI=0.0177931;REFB=0;REVB=0.0175929;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.99969e-05;OID=.;OPOS=75574087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0 chr14 75590822 . G A 1587.77 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.391;QD=64.1523;RBI=0.046895;REFB=0;REVB=0.0101046;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142878;OID=.;OPOS=75590822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:54:45:0:0:54:45:0:0 chr14 75600697 . C T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.776;QD=49.5991;RBI=0.036509;REFB=0;REVB=0.00283044;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346949;OID=.;OPOS=75600697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0 chr14 75746690 . C T 149.07 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.016048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6501;QD=18.6334;RBI=0.0412941;REFB=-0.00587141;REVB=0.0380482;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054861;STB=0.531211;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00839742;OID=.;OPOS=75746690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:7:9:8:8:7:9 chr14 75758885 . A G 670.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.137;QD=62.3463;RBI=0.0359533;REFB=0;REVB=0.0223336;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037558;OID=.;OPOS=75758885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:13:29:0:0:13:30:0:0 chr14 76045362 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.157;QD=60.9786;RBI=0.0157887;REFB=0;REVB=0.0148369;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.998e-05;OID=.;OPOS=76045362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr14 76045858 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.698;QD=40.7629;RBI=0.0222782;REFB=0;REVB=0.0141378;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049778;OID=.;OPOS=76045858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0 chr14 76045963 . C G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2624;QD=43.4859;RBI=0.0630758;REFB=0;REVB=-0.0497329;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0043706;OID=.;OPOS=76045963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr14 76156609 . C T 199.76 PASS AF=0.421053;AO=23;DP=56;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00382217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.892;QD=14.0183;RBI=0.023936;REFB=-0.00102958;REVB=0.0236289;RO=33;SAF=7;SAR=16;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103337;STB=0.567554;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00193195;OID=.;OPOS=76156609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:33:33:23:24:0.421053:16:7:13:20:17:7:13:20 chr14 76175565 . C A 290.86 PASS AF=0.508197;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0510153;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.973;QD=19.0726;RBI=0.0511682;REFB=0.00911559;REVB=0.00395296;RO=30;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216443;STB=0.620576;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0071777;OID=.;OPOS=76175565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:30:30:31:31:0.508197:19:12:19:11:19:12:19:11 chr14 76175594 . G A 239.1 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00182788;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.576;QD=16.2098;RBI=0.0142968;REFB=-0.0165109;REVB=0.0141794;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240692;STB=0.64357;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0213412;OID=.;OPOS=76175594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:33:32:27:27:0.457627:18:9:19:14:18:9:19:13 chr14 76330181 . G A 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.331;QD=62.6709;RBI=0.0159099;REFB=0;REVB=0.00692475;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26134e-05;OID=.;OPOS=76330181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0 chr14 76368544 . T C 173.73 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0023832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.897;QD=12.8691;RBI=0.0110031;REFB=-0.00339303;REVB=0.0107419;RO=33;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12369;STB=0.571361;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00642201;OID=.;OPOS=76368544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:9:12:15:18:9:12:15:18 chr14 76425616 . GC CG 82.38 PASS AF=0.197183;AO=14;DP=71;FAO=14;FDP=71;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.011185;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=198.544;QD=4.64139;RBI=0.011278;REFB=-0.000937856;REVB=-0.00144487;RO=57;SAF=1;SAR=13;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621709;STB=0.909061;STBP=0.002;TYPE=mnp;VARB=0.0318634;OID=.;OPOS=76425616;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:71:71:57:57:14:14:0.197183:13:1:30:27:13:1:30:27 chr14 76619167 . A C 286.41 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00508837;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.957;QD=18.1845;RBI=0.018839;REFB=-0.00181237;REVB=0.0181388;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088483;STB=0.539558;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00170772;OID=.;OPOS=76619167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:32:31:31:0.492063:14:17:20:11:14:17:20:12 chr14 76662446 . C T 423.77 PASS AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=-0.0737862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9925;QD=21.1887;RBI=0.0737874;REFB=0.0174444;REVB=0.000420946;RO=37;SAF=18;SAR=24;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273159;STB=0.643291;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00486534;OID=.;OPOS=76662446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:38:42:42:0.525:24:18:28:9:24:18:28:10 chr14 76777257 . C T 76.67 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0150172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0386;QD=12.7786;RBI=0.0167399;REFB=0.0165763;REVB=0.00739653;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044472;STB=0.526264;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.0244228;OID=.;OPOS=76777257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:5:9:6:4:5:9 chr14 76957887 . T C 1142.43 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00988152;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1547;QD=59.3472;RBI=0.0104728;REFB=-0.0580925;REVB=0.00346906;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000349201;OID=.;OPOS=76957887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:47:29:0:0:47:29:0:1 chr14 77236380 . C T 140.64 PASS AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0154849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.571;QD=9.37579;RBI=0.0154991;REFB=0.00473594;REVB=-0.000662096;RO=41;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07768;STB=0.54605;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00878329;OID=.;OPOS=77236380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:41:41:19:19:0.316667:11:8:20:21:11:8:20:21 chr14 77245286 . C T 3365.95 PASS AF=1;AO=215;DP=215;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1505;QD=62.3324;RBI=0.0608602;REFB=0;REVB=0.0232723;RO=0;SAF=96;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001393;OID=.;OPOS=77245286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:215:216:0:0:215:216:1:119:96:0:0:119:97:0:0 chr14 77269788 . A C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.582;QD=54.5176;RBI=0.0508039;REFB=0;REVB=0.0420379;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292379;OID=.;OPOS=77269788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0 chr14 77293072 . C A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.197;QD=39.2068;RBI=0.0460029;REFB=0;REVB=0.0109042;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523098;OID=.;OPOS=77293072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr14 77294876 . T C 851.23 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.707;QD=57.7106;RBI=0.0792749;REFB=0;REVB=0.0778628;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195754;OID=.;OPOS=77294876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0 chr14 77332367 . C T 1487.25 PASS AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00046611;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.802;QD=58.3235;RBI=0.0338561;REFB=0.0919128;REVB=0.0338529;RO=0;SAF=35;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53132e-08;STB=0.503759;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.000194802;OID=.;OPOS=77332367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:102:102:0:1:101:101:0.990196:66:35:0:0:66:35:0:1 chr14 77336521 . G A 208.86 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.024977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.928;QD=25.3158;RBI=0.0537804;REFB=0.00621077;REVB=0.0476286;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307847;STB=0.670426;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.00293959;OID=.;OPOS=77336521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:12:8:11:2:12:8:11:2 chr14 77492891 . G A 255.35 PASS AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00628016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.648;QD=13.2652;RBI=0.00690228;REFB=-0.0199426;REVB=0.00286373;RO=47;SAF=8;SAR=22;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215668;STB=0.624178;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.031637;OID=.;OPOS=77492891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:47:47:30:30:0.38961:22:8:21:26:22:8:21:26 chr14 77494682 . G A 343.14 PASS AF=0.546875;AO=34;DP=63;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.134774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8132;QD=21.4462;RBI=0.153315;REFB=-0.0251989;REVB=0.0730849;RO=29;SAF=18;SAR=16;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124288;STB=0.573671;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0255234;OID=.;OPOS=77494682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:29:29:34:35:0.546875:16:18:11:18:16:19:11:18 chr14 77697967 . A G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00258582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.487;QD=56.9379;RBI=0.0110759;REFB=0;REVB=-0.0107698;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.75013e-05;OID=.;OPOS=77697967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0 chr14 77703057 . A G 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.000678301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.431;QD=14.6502;RBI=0.0157033;REFB=-0.0236356;REVB=-0.0156887;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295851;STB=0.683291;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0319222;OID=.;OPOS=77703057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:9:5:12:6:9:5:13:6 chr14 77708804 . C T 304.9 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0108422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.801;QD=26.5128;RBI=0.0205932;REFB=-0.0167082;REVB=0.0175079;RO=19;SAF=10;SAR=17;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196986;STB=0.609039;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0202696;OID=.;OPOS=77708804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:17:10:12:7:17:10:12:7 chr14 77745193 . A C 1030.05 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00356698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.964;QD=58.0307;RBI=0.00356937;REFB=-0.0679752;REVB=0.000130626;RO=1;SAF=29;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160235;STB=0.508472;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=1.16428e-05;OID=.;OPOS=77745193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:41:29:1:0:41:29:1:0 chr14 77746112 . T C 130.2 PASS AF=0.56;AO=10;DP=26;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0378195;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.189;QD=20.8313;RBI=0.038126;REFB=-0.0130566;REVB=-0.00482487;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654152;STB=0.587651;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0339368;OID=.;OPOS=77746112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:26:25:11:11:10:14:0.56:3:7:7:4:3:11:7:4 chr14 77746812 . T C 211.89 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00999827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.72;QD=16.6189;RBI=0.0145925;REFB=-0.00744695;REVB=-0.0106289;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063522;STB=0.536051;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0122685;OID=.;OPOS=77746812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:13:10:14:14:13:10:14:14 chr14 77751925 . C T 1460.12 PASS AF=0.971429;AO=97;DP=101;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0263003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6188;QD=55.6237;RBI=0.043213;REFB=-0.136763;REVB=-0.0342879;RO=4;SAF=41;SAR=56;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250526;STB=0.516126;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00617135;OID=.;OPOS=77751925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:101:105:4:3:97:102:0.971429:56:41:3:1:57:45:3:0 chr14 77787695 . G T 305.0 PASS AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0190919;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.752;QD=32.9726;RBI=0.0197776;REFB=-0.0571341;REVB=0.00516286;RO=11;SAF=15;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174469;STB=0.509547;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0246272;OID=.;OPOS=77787695;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:11:11:26:26:0.702703:11:15:6:5:11:15:6:5 chr14 77793207 . G A 1278.34 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.619;QD=61.607;RBI=0.0276984;REFB=0;REVB=0.0259677;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33706e-05;OID=.;OPOS=77793207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:38:44:0:0:38:45:0:0 chr14 77794283 . T C 1713.16 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6962;QD=60.6429;RBI=0.0442337;REFB=0;REVB=-0.0311276;RO=0;SAF=75;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.36255e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.96399e-07;OID=.;OPOS=77794283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:38:75:0:0:38:75:0:0 chr14 77796641 . G A 1182.25 PASS AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.115075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8665;QD=58.3826;RBI=0.115093;REFB=-0.131718;REVB=-0.00200496;RO=1;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00976132;STB=0.502782;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00404887;OID=.;OPOS=77796641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:81:81:1:2:79:79:0.975309:48:31:0:1:48:31:1:1 chr14 77873117 . G T 387.82 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.00775563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.39;QD=15.9925;RBI=0.0264829;REFB=-0.0145429;REVB=-0.0253218;RO=56;SAF=19;SAR=22;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740028;STB=0.541688;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0219657;OID=.;OPOS=77873117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:22:19:30:26:22:19:30:26 chr14 77926011 . C T 1153.27 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3779;QD=60.6983;RBI=0.108731;REFB=0;REVB=-0.0393544;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00117061;OID=.;OPOS=77926011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0 chr14 77928525 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.157;QD=62.022;RBI=0.0142857;REFB=0;REVB=-0.00261455;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.11867e-05;OID=.;OPOS=77928525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0 chr14 77935520 . G A 1044.15 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.086;QD=59.6658;RBI=0.0312738;REFB=0;REVB=-0.00511961;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.53483e-05;OID=.;OPOS=77935520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0 chr14 77951124 . C T 1345.99 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00365975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.674;QD=61.8846;RBI=0.00482562;REFB=0;REVB=0.00314529;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63142e-05;OID=.;OPOS=77951124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:86:87:1:46:40:0:0:46:41:0:0 chr14 77976325 . T C 323.43 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00940562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.609;QD=53.905;RBI=0.0357325;REFB=0;REVB=0.0344724;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015763;OID=.;OPOS=77976325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr14 77987958 . C A 739.97 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.452;QD=56.9208;RBI=0.0431777;REFB=0;REVB=-0.0402583;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.88566e-05;OID=.;OPOS=77987958;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:50:52:1:30:20:0:0:31:21:0:0 chr14 78014103 . G A 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0133864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.345;QD=17.8403;RBI=0.0162804;REFB=-0.0218071;REVB=-0.00926589;RO=14;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866803;STB=0.549925;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0205405;OID=.;OPOS=78014103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:3:11:10:4:3:11:10:4 chr14 78028803 . A G 347.81 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.996;QD=53.5095;RBI=0.0165059;REFB=0;REVB=0.00871747;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00180567;OID=.;OPOS=78028803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:14:10:0:0:15:11:0:0 chr14 78174473 . A C 940.99 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000489641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6163;QD=57.0299;RBI=0.0492222;REFB=-0.0439871;REVB=-0.0492198;RO=1;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119601;STB=0.506327;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00287906;OID=.;OPOS=78174473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:39:26:0:1:39:26:0:1 chr14 78184566 . C A 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.464;QD=57.0006;RBI=0.0126263;REFB=0;REVB=0.00167433;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12246e-05;OID=.;OPOS=78184566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0 chr14 78197365 . C T 439.86 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.134;QD=56.756;RBI=0.0502567;REFB=0;REVB=0.0212596;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189711;OID=.;OPOS=78197365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0 chr14 78287414 . T C 1008.96 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.101;QD=59.3508;RBI=0.0603992;REFB=0;REVB=0.0469187;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311424;OID=.;OPOS=78287414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:40:28:0:0 chr14 78366933 . G GAAC 101.34 PASS AF=1;AO=6;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210248;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=310.545;QD=40.5368;RBI=0.0464696;REFB=0;REVB=-0.0414413;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119263;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-5.80707e-05;OID=.;OPOS=78366934;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=GAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:11:10:10:0:6:4:0:0:4:4:4:2:2:2 chr14 78366967 . A G 130.27 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.775;QD=43.4221;RBI=0.08871;REFB=0;REVB=-0.0748604;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00720315;OID=.;OPOS=78366967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr14 78392299 . A AGC 78.51 PASS AF=0.2;AO=10;DP=76;FAO=15;FDP=75;FR=.;FRO=60;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.102608;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=55.6466;QD=4.18729;RBI=0.103214;REFB=-0.0307078;REVB=-0.0111636;RO=60;SAF=1;SAR=9;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.593939;STB=0.931073;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.2351;OID=.;OPOS=78392300;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=AGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.2:10:76:15:75:60:1:14:36:24:78:60:1:9:36:24 chr14 78710044 . G A 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.114;QD=57.7123;RBI=0.0376898;REFB=0;REVB=0.0268617;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122493;OID=.;OPOS=78710044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0 chr14 79081400 . T C 833.64 PASS AF=0.441624;AO=86;DP=196;FAO=87;FDP=197;FR=.;FRO=110;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=58;FSRR=52;FWDB=0.0575135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9725;QD=16.9267;RBI=0.0586307;REFB=-0.0129081;REVB=0.0113912;RO=106;SAF=55;SAR=31;SRF=56;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115358;STB=0.560938;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0218645;OID=.;OPOS=79081400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:106:110:86:87:0.441624:31:55:56:50:32:55:58:52 chr14 79270093 . G A 609.53 PASS AF=0.432432;AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=148;FR=.;FRO=84;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=58;FWDB=0.0254618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.835;QD=16.4738;RBI=0.0267679;REFB=-0.0211565;REVB=-0.0082592;RO=82;SAF=30;SAR=34;SRF=25;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168266;STB=0.591739;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0198062;OID=.;OPOS=79270093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:82:84:64:64:0.432432:34:30:25:57:34:30:26:58 chr14 80669580 . T C 305.25 PASS AF=0.414634;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.00567283;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.144;QD=14.8903;RBI=0.0126259;REFB=-0.0241644;REVB=0.0112797;RO=48;SAF=15;SAR=19;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824947;STB=0.546735;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0388163;OID=.;OPOS=80669580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:48:48:34:34:0.414634:19:15:25:23:19:15:25:23 chr14 80963383 . A AGC 346.45 PASS AF=0.440476;AO=35;DP=92;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00218808;FXX=0.0561735;HRUN=0;LEN=2;MLLD=287.883;QD=16.4977;RBI=0.00617717;REFB=-0.00740827;REVB=0.00577665;RO=54;SAF=20;SAR=15;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173632;STB=0.590744;STBP=0.133;TYPE=ins;VARB=0.00861707;OID=.;OPOS=80963384;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=AGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.440476:35:92:37:84:47:21:16:19:28:99:54:20:15:22:32 chr14 81251255 . T C 224.9 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.000978023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.333;QD=19.9909;RBI=0.000981927;REFB=-0.0189842;REVB=8.74737e-05;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581448;STB=0.532757;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0230029;OID=.;OPOS=81251255;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:14:9:10:12:14:9 chr14 81562998 . T C 406.43 PASS AF=0.408696;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=52;FSRR=16;FWDB=0.0177294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2659;QD=14.1368;RBI=0.0178611;REFB=0.00559541;REVB=0.0021655;RO=68;SAF=35;SAR=12;SRF=52;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280711;STB=0.515804;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00495798;OID=.;OPOS=81562998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:68:68:47:47:0.408696:12:35:52:16:12:35:52:16 chr14 81610583 . G C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=6.74549e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9747;QD=58.5877;RBI=0.0260619;REFB=0;REVB=-0.0260618;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000474471;OID=.;OPOS=81610583;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr14 81744736 . A G 466.77 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0198318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6711;QD=20.2942;RBI=0.025405;REFB=-0.0423188;REVB=-0.0158781;RO=46;SAF=29;SAR=17;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619153;STB=0.534347;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0413113;OID=.;OPOS=81744736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:17:29:26:20:17:29:26:20 chr14 86088056 . T C 1121.04 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00566886;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.728;QD=60.5967;RBI=0.00750509;REFB=0;REVB=0.00491837;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227571;OID=.;OPOS=86088056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:44:30:0:0:44:30:0:0 chr14 86091415 . G A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9952;QD=57.1774;RBI=0.0530602;REFB=0;REVB=-0.0301685;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010417;OID=.;OPOS=86091415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0 chr14 86092246 . A G 1320.4 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00246113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2291;QD=62.1362;RBI=0.0629741;REFB=0;REVB=0.062926;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296342;OID=.;OPOS=86092246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:53:32:0:0:53:32:0:0 chr14 86093344 . C T 1496.25 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00419705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.397;QD=62.3438;RBI=0.00430557;REFB=-0.109495;REVB=0.00096059;RO=1;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117069;STB=0.506172;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000229416;OID=.;OPOS=86093344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:40:55:0:1:40:55:0:1 chr14 86093378 . C T 409.18 PASS AF=0.415929;AO=47;DP=113;FAO=47;FDP=113;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0041757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.216;QD=14.4842;RBI=0.00468199;REFB=-0.0106763;REVB=0.00211768;RO=65;SAF=28;SAR=19;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604602;STB=0.539067;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0129775;OID=.;OPOS=86093378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:65:66:47:47:0.415929:19:28:35:30:19:28:35:31 chr14 86094035 . G A 397.44 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0151456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0128;QD=20.6462;RBI=0.0205096;REFB=0.00949579;REVB=0.0138295;RO=37;SAF=18;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392752;STB=0.521728;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00730438;OID=.;OPOS=86094035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:22:18:15:22:22:18:15:22 chr14 88400353 . C T 90.38 PASS AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00907772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2689;QD=7.85883;RBI=0.010978;REFB=-0.00325722;REVB=-0.00617349;RO=34;SAF=2;SAR=10;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292067;STB=0.685919;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0263775;OID=.;OPOS=88400353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:46:46:34:34:12:12:0.26087:10:2:12:22:10:2:12:22 chr14 88400449 . TG CA,CG 712.28 PASS AF=0.468085,0.531915;AO=22,25;DP=47;FAO=22,25;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14,8;FSAR=8,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836068,0.0100703;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=156.775,82.4724;QD=60.6196;RBI=0.0159702,0.0453566;REFB=0,0;REVB=-0.0136069,0.0442245;RO=0;SAF=14,8;SAR=8,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0291283,-0.00325012;OID=.,.;OPOS=88400449,88400449;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:47:47:0:0:22,25:22,25:0.468085,0.531915:8,17:14,8:0:0:8,17:14,8:0:0 chr14 88400486 . A G 195.1 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00587607;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.59;QD=15.3017;RBI=0.0114701;REFB=-0.0135227;REVB=0.00985061;RO=28;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905762;STB=0.562105;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0240497;OID=.;OPOS=88400486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:28:29:22:22:0.431373:13:9:14:14:13:9:15:14 chr14 88401213 . T C 834.08 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3518;QD=57.5228;RBI=0.13948;REFB=0;REVB=0.138674;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134511;OID=.;OPOS=88401213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0 chr14 88407875 . T A 1695.29 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.932;QD=60.5459;RBI=0.0296956;REFB=0;REVB=0.0192858;RO=0;SAF=59;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77494e-05;OID=.;OPOS=88407875;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:53:59:0:0:53:59:0:0 chr14 88407888 . A G 573.13 PASS AF=0.527273;AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0577527;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0018;QD=20.8411;RBI=0.0601593;REFB=-0.0134176;REVB=0.0168453;RO=50;SAF=34;SAR=24;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107331;STB=0.550459;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0378443;OID=.;OPOS=88407888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:50:52:58:58:0.527273:24:34:23:27:24:34:25:27 chr14 88411947 . T C 2809.19 PASS AF=1;AO=179;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.379;QD=62.7751;RBI=0.0343902;REFB=0;REVB=0.0276048;RO=0;SAF=98;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13193e-05;OID=.;OPOS=88411947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:179:179:0:0:179:179:1:81:98:0:0:81:98:0:0 chr14 88414211 . G A 573.17 PASS AF=0.504274;AO=59;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0214478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3307;QD=19.5957;RBI=0.0253501;REFB=-0.00604401;REVB=0.0135137;RO=57;SAF=16;SAR=43;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120888;STB=0.573307;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00521293;OID=.;OPOS=88414211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:57:58:59:59:0.504274:43:16:22:35:43:16:23:35 chr14 88431898 . C T 306.11 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.0337206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6183;QD=15.3053;RBI=0.0384699;REFB=0.00755693;REVB=0.0185165;RO=45;SAF=8;SAR=26;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127162;STB=0.519988;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.0118393;OID=.;OPOS=88431898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:45:46:34:34:0.425:26:8:11:34:26:8:12:34 chr14 88431969 . T C 179.68 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0113468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.543;QD=15.6242;RBI=0.0113491;REFB=-0.0135529;REVB=-0.000228345;RO=27;SAF=2;SAR=17;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23986;STB=0.641333;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0161541;OID=.;OPOS=88431969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:17:2:6:21:17:2:6:21 chr14 88453422 . AGGA AG,AGA,AGAA 250.43 PASS AF=0,1,0;AO=3,8,15;DP=28;FAO=0,21,0;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4,0;FSAR=0,17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.205722,0.0586333,0.186954;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=17.3582,20.4513,15.6833;QD=47.7013;RBI=0.247309,0.157059,0.343828;REFB=0,0,0;REVB=0.137259,-0.145704,-0.288559;RO=0;SAF=1,2,0;SAR=2,6,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0341671,0.00448836,0.0217701;OID=.,.,.;OPOS=88453424,88453423,88453424;OREF=GA,G,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=AG,AGA,AGAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1,0:3,8,15:28:0,21,0:21:0:0,4,0:0,17,0:0:0:3:0:1,2,0:2,6,15:0:0 chr14 88477413 . C T 1586.93 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.449;QD=64.1184;RBI=0.0340571;REFB=0;REVB=-0.0236946;RO=0;SAF=40;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000284703;OID=.;OPOS=88477413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:59:40:0:0:59:40:0:0 chr14 88477882 . A C 606.64 PASS AF=0.561224;AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00498928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.426;QD=24.761;RBI=0.0138223;REFB=-0.0155242;REVB=-0.0128904;RO=43;SAF=35;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14165;STB=0.577706;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.013221;OID=.;OPOS=88477882;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:43:43:55:55:0.561224:20:35:20:23:20:35:20:23 chr14 88651826 . A AAC,C 337.5 PASS AF=0.473684,0;AO=27,5;DP=101;FAO=36,0;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=20,0;FSAR=16,0;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0402355,0.0121244;FXX=0.0256377;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=127.745,100.358;QD=17.763;RBI=0.0437364,0.0386015;REFB=-0.0942756,-0.102744;REVB=0.0171457,0.036648;RO=60;SAF=17,3;SAR=10,2;SRF=20;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.337408,0.281973;STB=0.606878,0.5;STBP=0.086,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0827763,0;OID=.,.;OPOS=88651827,88651826;OREF=-,A;OALT=AC,C;OMAPALT=AAC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:76:60:40:27,5:36,0:0.473684,0:10,2:17,3:20:40:16,0:20,0:14:26 chr14 88652389 . C T 3040.93 PASS AF=1;AO=191;DP=192;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236471;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.178;QD=63.6845;RBI=0.0481259;REFB=0;REVB=0.0419156;RO=0;SAF=100;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45139e-05;OID=.;OPOS=88652389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:192:191:0:0:191:191:1:91:100:0:0:91:100:0:0 chr14 88693725 . G C 729.0 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2302;QD=57.1766;RBI=0.0268093;REFB=0;REVB=0.00252014;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314318;OID=.;OPOS=88693725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:24:26:0:0:25:26:0:0 chr14 88792816 . T G 401.28 PASS AF=0.358209;AO=48;DP=134;FAO=48;FDP=134;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=-0.00411294;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.138;QD=11.9785;RBI=0.0109009;REFB=-0.00793886;REVB=0.0100952;RO=85;SAF=19;SAR=29;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163226;STB=0.589762;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0159258;OID=.;OPOS=88792816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:85:86:48:48:0.358209:29:19:46:39:29:19:46:40 chr14 88852279 . TG T,TT 1087.68 PASS AF=0.922078,0.0779221;AO=66,6;DP=76;FAO=71,6;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41,4;FSAR=30,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182165,0.0213776;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=25.63,7.58304;QD=56.5029;RBI=0.0370966,0.0498498;REFB=0,0;REVB=-0.0323159,0.0450333;RO=0;SAF=40,4;SAR=26,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.289157,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0017128,-0.0140134;OID=.,.;OPOS=88852280,88852280;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.922078,0.0779221:66,6:76:71,6:77:0:41,4:30,2:0:0:17:0:40,4:26,2:0:0 chr14 88862529 . G A 224.91 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.021696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.684;QD=19.9917;RBI=0.0281904;REFB=-0.0093645;REVB=-0.0179996;RO=23;SAF=16;SAR=6;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449781;STB=0.752719;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00746792;OID=.;OPOS=88862529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:6:16:5:18:6:16:5:18 chr14 88935925 . A G 543.9 PASS AF=0.407895;AO=62;DP=152;FAO=62;FDP=152;FR=.;FRO=90;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=-0.00186797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.337;QD=14.3131;RBI=0.0044024;REFB=-0.00241193;REVB=-0.00398646;RO=90;SAF=37;SAR=25;SRF=38;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183391;STB=0.603057;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00442321;OID=.;OPOS=88935925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:90:90:62:62:0.407895:25:37:38:52:25:37:38:52 chr14 88938652 . A G 528.96 PASS AF=0.431818;AO=57;DP=133;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.000490766;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.235;QD=16.0292;RBI=0.0235391;REFB=-0.0132856;REVB=0.0235339;RO=75;SAF=28;SAR=29;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156702;STB=0.508769;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0160256;OID=.;OPOS=88938652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:75:75:57:57:0.431818:29:28:38:37:29:28:38:37 chr14 89037482 . C CA,CAT 243.89 PASS AF=0.22619,0.190476;AO=14,10;DP=99;FAO=19,16;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=7,8;FSAR=12,8;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0172561,-0.125331;FXX=0.0561735;HRUN=0,0;LEN=1,2;MLLD=25.5147,28.3734;QD=11.6138;RBI=0.0592507,0.138491;REFB=-0.0278752,0.00865558;REVB=-0.0566822,0.058924;RO=53;SAF=2,8;SAR=12,2;SRF=29;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.524237,0.340113;STB=0.589445,0.507683;STBP=0.365,0.963;TYPE=ins,ins;VARB=0.027371,0.0323664;OID=.,.;OPOS=89037483,89037483;OREF=-,-;OALT=A,AT;OMAPALT=CA,CAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.22619,0.190476:14,10:99:19,16:84:49:7,8:12,8:24:25:49:53:2,8:12,2:29:24 chr14 89037483 . T A 58.84 PASS AF=0.132653;AO=12;DP=90;FAO=13;FDP=98;FR=.;FRO=85;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=-0.0208974;FXX=0.0101;HRUN=10;LEN=1;MLLD=43.1186;QD=2.40161;RBI=0.0681025;REFB=-0.0192972;REVB=-0.0648171;RO=75;SAF=4;SAR=8;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200403;STB=0.627703;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0581925;OID=.;OPOS=89037483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:90:98:75:85:12:13:0.132653:8:4:37:38:9:4:38:47 chr14 89088266 . C T 66.29 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.020825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.301;QD=12.0525;RBI=0.0244824;REFB=-0.0187237;REVB=-0.0128728;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242158;STB=0.643262;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0230649;OID=.;OPOS=89088266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:4:9:4:5:4:9 chr14 89094243 . G C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9339;QD=60.2307;RBI=0.0591099;REFB=0;REVB=-0.0462141;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00114067;OID=.;OPOS=89094243;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0 chr14 89205265 . T C 457.55 PASS AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0171732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6631;QD=20.5643;RBI=0.0192666;REFB=-0.00395699;REVB=0.00873398;RO=44;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298127;STB=0.516509;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00385798;OID=.;OPOS=89205265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:44:44:45:45:0.505618:21:24:22:22:21:24:22:22 chr14 89306550 . T C 1525.75 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.926;QD=59.8332;RBI=0.0284589;REFB=0;REVB=-0.0067567;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91661e-05;OID=.;OPOS=89306550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:47:55:0:0:47:55:0:0 chr14 89306556 . C T 1530.03 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0244;QD=63.7513;RBI=0.0275082;REFB=0;REVB=-0.0274852;RO=0;SAF=52;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165229;OID=.;OPOS=89306556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:44:52:0:0:44:52:0:0 chr14 89445481 . C T 516.87 PASS AF=0.532609;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0012697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0375;QD=22.4726;RBI=0.0220684;REFB=-0.033027;REVB=-0.0220318;RO=43;SAF=20;SAR=29;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293956;STB=0.516196;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0271356;OID=.;OPOS=89445481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:43:43:49:49:0.532609:29:20:19:24:29:20:19:24 chr14 89627942 . C T 76.96 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0958872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.506;QD=13.3845;RBI=0.11769;REFB=-0.0362309;REVB=-0.0682391;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490172;STB=0.783502;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.03928;OID=.;OPOS=89627942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:2:11:3:7:2:11 chr14 89750819 . A G 250.32 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0194503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.597;QD=20.0257;RBI=0.0203425;REFB=-0.017051;REVB=0.00595854;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142266;STB=0.579935;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.018791;OID=.;OPOS=89750819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:12:12:17:9:12:12:17:9 chr14 89867978 . T C 1589.53 PASS AF=1;AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00820191;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6867;QD=64.2236;RBI=0.0127451;REFB=0;REVB=0.00975532;RO=0;SAF=57;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102117;OID=.;OPOS=89867978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:99:0:0:98:99:1:41:57:0:0:42:57:0:0 chr14 89884022 . A C 274.2 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0181662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.149;QD=24.9271;RBI=0.020281;REFB=0.00125174;REVB=-0.00901702;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170902;STB=0.595252;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.000684879;OID=.;OPOS=89884022;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:8:17:9:10:8:17:9:10 chr14 90095445 . T C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.503;QD=60.609;RBI=0.0292782;REFB=0;REVB=0.0260089;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126023;OID=.;OPOS=90095445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr14 90178913 . T C 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.613;QD=56.705;RBI=0.047395;REFB=0;REVB=-0.00241101;RO=0;SAF=23;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359875;OID=.;OPOS=90178913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:6:23:0:0:6:23:0:0 chr14 90178992 . G A 103.52 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0100329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.84;QD=18.8211;RBI=0.0101047;REFB=-0.0151367;REVB=-0.00120249;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.014461;OID=.;OPOS=90178992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:6:6:5:5:6:6:5:5 chr14 90303383 . A G 956.6 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.822;QD=57.9759;RBI=0.0421912;REFB=0;REVB=0.0396138;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13511e-05;OID=.;OPOS=90303383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:66:0:0:60:66:1:23:37:0:0:28:38:0:0 chr14 90303435 . T A 1096.51 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00295495;FXX=0.0256377;HRUN=5;LEN=1;MLLD=331.57;QD=57.7112;RBI=0.00707442;REFB=-0.0600089;REVB=0.00642773;RO=2;SAF=36;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255553;STB=0.51351;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-1.868e-05;OID=.;OPOS=90303435;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:78:76:2:2:74:74:0.973684:38:36:2:0:38:36:2:0 chr14 90303445 . T C 1193.79 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000962486;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.343;QD=61.2201;RBI=0.0093501;REFB=0;REVB=-0.00930043;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18732e-05;OID=.;OPOS=90303445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr14 90341494 . G A 1029.67 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375396;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.144;QD=59.6908;RBI=0.0400417;REFB=0;REVB=-0.0139326;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200235;OID=.;OPOS=90341494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:37:32:0:0:37:32:0:0 chr14 90398947 . T C 229.29 PASS AF=0.308511;AO=29;DP=94;FAO=29;FDP=94;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.000929555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.104;QD=9.75723;RBI=0.0032516;REFB=0.00211349;REVB=0.0031159;RO=65;SAF=16;SAR=13;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248123;STB=0.64451;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00296412;OID=.;OPOS=90398947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:65:65:29:29:0.308511:13:16:22:43:13:16:22:43 chr14 90730071 . C T 517.25 PASS AF=0.5;AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0180256;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7281;QD=19.1574;RBI=0.0191257;REFB=-0.00604403;REVB=0.00639303;RO=52;SAF=19;SAR=35;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236573;STB=0.622339;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00807746;OID=.;OPOS=90730071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:52:54:54:54:0.5:35:19:32:20:35:19:32:22 chr14 90745422 . T C 486.65 PASS AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.00558279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.291;QD=16.6378;RBI=0.00587775;REFB=-0.0233268;REVB=0.00183859;RO=62;SAF=16;SAR=37;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143078;STB=0.573305;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0211551;OID=.;OPOS=90745422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:64:53:53:0.452991:37:16:27:35:37:16:27:37 chr14 90767607 . C T 1365.11 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.651;QD=62.0503;RBI=0.046661;REFB=0;REVB=0.0432852;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94306e-05;OID=.;OPOS=90767607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:88:0:0:85:88:1:42:43:0:0:45:43:0:0 chr14 90865462 . C G 803.94 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180033;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.707;QD=57.4239;RBI=0.0199024;REFB=0;REVB=0.0084844;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55306e-05;OID=.;OPOS=90865462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0 chr14 90871478 . T C 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.509;QD=63.2868;RBI=0.0125465;REFB=0;REVB=0.00184006;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12802e-05;OID=.;OPOS=90871478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0 chr14 91007797 . G A 93.36 PASS AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00793673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7658;QD=9.82708;RBI=0.0605652;REFB=-0.0233531;REVB=0.0600429;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180068;STB=0.608517;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0452484;OID=.;OPOS=91007797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:7:5:15:11:7:5:15:11 chr14 91084338 . C T 172.67 PASS AF=0.315068;AO=23;DP=73;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0284828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.062;QD=9.46156;RBI=0.0328736;REFB=-0.00697442;REVB=0.0164135;RO=50;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655437;STB=0.538523;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0192767;OID=.;OPOS=91084338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:50:50:23:23:0.315068:13:10:19:31:13:10:19:31 chr14 91084344 . C T 201.1 PASS AF=0.367647;AO=24;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00344575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.632;QD=11.8292;RBI=0.0186823;REFB=-0.00719156;REVB=0.0183618;RO=42;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134129;STB=0.512185;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0118359;OID=.;OPOS=91084344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:43:24:25:0.367647:14:10:18:24:15:10:18:25 chr14 91123575 . T C 248.48 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.482;QD=49.6967;RBI=0.0578011;REFB=0;REVB=-0.0464801;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000815502;OID=.;OPOS=91123575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:8:11:0:0:8:12:0:0 chr14 91161862 . C T 2842.95 PASS AF=0.456522;AO=294;DP=645;FAO=294;FDP=644;FR=.;FRO=350;FSAF=159;FSAR=135;FSRF=222;FSRR=128;FWDB=-0.0174729;FXX=0.00155036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.33;QD=17.6581;RBI=0.0174811;REFB=-0.0133525;REVB=0.000535744;RO=349;SAF=159;SAR=135;SRF=223;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983608;STB=0.551566;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.013488;OID=.;OPOS=91161862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:645:644:349:350:294:294:0.456522:135:159:223:126:135:159:222:128 chr14 91165572 . G A 1377.51 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.059;QD=62.6142;RBI=0.0515936;REFB=0;REVB=-0.00571183;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151358;OID=.;OPOS=91165572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:43:44:0:0:44:44:0:0 chr14 91413794 . G A 673.9 PASS AF=0.519084;AO=65;DP=129;FAO=68;FDP=131;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.0278629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8221;QD=20.5772;RBI=0.0596662;REFB=-0.0102345;REVB=0.0527609;RO=63;SAF=25;SAR=40;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263037;STB=0.523008;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0142665;OID=.;OPOS=91413794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:63:63:65:68:0.519084:40:25:26:37:43:25:26:37 chr14 91666162 . G A 221.96 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0101848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.838;QD=14.5545;RBI=0.0120506;REFB=-0.00856793;REVB=0.00644103;RO=35;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819476;STB=0.546564;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0151533;OID=.;OPOS=91666162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:12:14:16:19:12:14:16:19 chr14 91681888 . G A 158.05 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0296552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.771;QD=25.2873;RBI=0.0362621;REFB=-0.00556543;REVB=-0.0208689;RO=9;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356494;STB=0.519974;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00235672;OID=.;OPOS=91681888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:13:3:2:7:13:3:2:7 chr14 91700846 . G A 474.82 PASS AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0131952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.506;QD=24.3499;RBI=0.10439;REFB=-0.0255391;REVB=0.103552;RO=33;SAF=22;SAR=23;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970276;STB=0.55312;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0148641;OID=.;OPOS=91700846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:33:33:45:45:0.576923:23:22:12:21:23:22:12:21 chr14 91701281 . G A 371.59 PASS AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00662001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.156;QD=22.8672;RBI=0.0194671;REFB=-0.0319143;REVB=0.0183069;RO=28;SAF=11;SAR=26;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255816;STB=0.64133;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0183553;OID=.;OPOS=91701281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:26:11:17:11:26:11:17:11 chr14 91717214 . C T 441.13 PASS AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.00621727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.464;QD=17.4705;RBI=0.0220369;REFB=-0.0111163;REVB=0.0211417;RO=54;SAF=28;SAR=19;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145863;STB=0.581321;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0109244;OID=.;OPOS=91717214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:47:47:0.465347:19:28:24:30:19:28:24:30 chr14 91739081 . A G 970.51 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.247;QD=58.8185;RBI=0.114527;REFB=0;REVB=0.113981;RO=0;SAF=52;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13709e-05;OID=.;OPOS=91739081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:9:52:0:0:14:52:0:0 chr14 91751788 . TC T 66.0 PASS AF=0.375;AO=16;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0459869;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.5454;QD=5.49969;RBI=0.139472;REFB=-0.0349134;REVB=-0.131673;RO=28;SAF=10;SAR=6;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204977;STB=0.523051;STBP=0.801;TYPE=del;VARB=0.0498403;OID=.;OPOS=91751789;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:16:48:18:48:30:12:6:19:11:65:28:10:6:17:11 chr14 91760522 . C T 399.98 PASS AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00817526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8923;QD=18.6035;RBI=0.0231566;REFB=-0.0194879;REVB=0.0216655;RO=44;SAF=17;SAR=24;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163533;STB=0.585324;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0233058;OID=.;OPOS=91760522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:45:41:41:0.476744:24:17:26:18:24:17:26:19 chr14 91773568 . T C 218.99 PASS AF=0.307692;AO=28;DP=91;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.0293512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.542;QD=9.62611;RBI=0.0307124;REFB=-0.0146745;REVB=-0.00904199;RO=63;SAF=14;SAR=14;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102956;STB=0.560397;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0289455;OID=.;OPOS=91773568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:63:63:28:28:0.307692:14:14:37:26:14:14:37:26 chr14 91883499 . G A 544.98 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0343485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.047;QD=57.3662;RBI=0.0405245;REFB=-0.0423439;REVB=-0.0215039;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521727;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00407338;OID=.;OPOS=91883499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:26:11:0:0:26:11:1:0 chr14 91883967 . G T 673.37 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145283;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.773;QD=62.6386;RBI=0.152211;REFB=0;REVB=0.151516;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796483;OID=.;OPOS=91883967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr14 91925027 . G T 503.51 PASS AF=0.972222;AO=30;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00514891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.772;QD=55.9458;RBI=0.0132659;REFB=-0.156544;REVB=0.0122259;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282472;STB=0.512813;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00136466;OID=.;OPOS=91925027;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:30:35:0.972222:14:16:1:0:16:19:1:0 chr14 92084004 . C A,G 751.64 PASS AF=0.0416667,0.958333;AO=2,46;DP=48;FAO=2,46;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=2,30;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172692,0.0254574;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.487,99.985;QD=62.6363;RBI=0.0172772,0.0267051;REFB=0,0;REVB=0.000525115,0.00806725;RO=0;SAF=2,30;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.31553e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0537867,-0.00172487;OID=.,.;OPOS=92084004,92084004;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:48:48:0:0:2,46:2,46:0.0416667,0.958333:0,16:2,30:0:0:0,16:2,30:0:0 chr14 92088016 . G A 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00719365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.921;QD=57.2367;RBI=0.0370575;REFB=0;REVB=-0.0363526;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.91364e-05;OID=.;OPOS=92088016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0 chr14 92159558 . A G 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0177329;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.534;QD=19.018;RBI=0.0196555;REFB=-0.00175025;REVB=0.00847838;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208276;STB=0.618885;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00166722;OID=.;OPOS=92159558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:10:5:8:6:10:5:8:6 chr14 92181337 . G A 200.96 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00656644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.459;QD=15.1664;RBI=0.0750692;REFB=-0.0419177;REVB=-0.0747815;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286246;STB=0.661137;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0347087;OID=.;OPOS=92181337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:11:12:7:23:11:12:7:23 chr14 92181405 . G A 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.383;QD=57.8846;RBI=0.0280365;REFB=0;REVB=-0.00415491;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113944;OID=.;OPOS=92181405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:41:19:0:0:41:19:0:0 chr14 92249101 . T C 598.01 PASS AF=0.484375;AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00184934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.49;QD=18.6879;RBI=0.00530618;REFB=-0.0149804;REVB=0.00497348;RO=65;SAF=22;SAR=40;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146848;STB=0.578009;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0185403;OID=.;OPOS=92249101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:65:66:62:62:0.484375:40:22:33:32:40:22:33:33 chr14 92249126 . G A 1508.52 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.847;QD=63.5166;RBI=0.0377291;REFB=0;REVB=-0.032603;RO=0;SAF=40;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92821e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15626e-05;OID=.;OPOS=92249126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:95:0:0:93:95:1:53:40:0:0:54:41:0:0 chr14 92268615 . T G 1105.69 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0438182;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.273;QD=58.9703;RBI=0.0486096;REFB=-0.119523;REVB=0.0210443;RO=1;SAF=47;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00996047;STB=0.505262;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00337107;OID=.;OPOS=92268615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:27:47:1:0:27:47:1:0 chr14 92347680 . A G 451.96 PASS AF=0.636364;AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0118604;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.884;QD=27.3914;RBI=0.0175408;REFB=0.0401664;REVB=-0.0129233;RO=24;SAF=16;SAR=26;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110227;STB=0.560149;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0225284;OID=.;OPOS=92347680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:24:24:42:42:0.636364:26:16:13:11:26:16:13:11 chr14 92441066 . C T 296.77 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00111742;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.916;QD=17.9863;RBI=0.0210468;REFB=-0.0125579;REVB=-0.0210171;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122612;STB=0.513505;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0131318;OID=.;OPOS=92441066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:33:34:32:32:0.484848:14:18:19:14:14:18:20:14 chr14 92530513 . C T 303.06 PASS AF=0.409639;AO=32;DP=81;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0234223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.361;QD=14.6053;RBI=0.0353562;REFB=-0.00781789;REVB=-0.026485;RO=49;SAF=20;SAR=12;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229447;STB=0.605572;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0120655;OID=.;OPOS=92530513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:49:49:32:34:0.409639:12:20:20:29:14:20:20:29 chr14 92537223 . G T 228.46 PASS AF=0.428571;AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0152842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0832;QD=14.5052;RBI=0.0202257;REFB=-0.0302228;REVB=0.0132466;RO=36;SAF=17;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770551;STB=0.527929;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0371564;OID=.;OPOS=92537223;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:36:36:26:27:0.428571:9:17:21:15:10:17:21:15 chr14 92537354 . C G 52.52 PASS AF=0.190476;AO=7;DP=42;FAO=8;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0378106;FXX=0.0232504;HRUN=5;LEN=1;MLLD=206.633;QD=5.00162;RBI=0.0506526;REFB=-0.0191032;REVB=-0.0337052;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209277;STB=0.52375;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0504419;OID=.;OPOS=92537354;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:42:42:23:34:7:8:0.190476:4:3:14:9:4:4:18:16 chr14 92548785 . C T 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.100803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7222;QD=14.6981;RBI=0.102644;REFB=-0.00710181;REVB=-0.0193546;RO=23;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151826;STB=0.588123;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.00516872;OID=.;OPOS=92548785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:10:6:12:11:10:6:12:11 chr14 92549586 . G A 199.85 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00757714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.763;QD=13.5489;RBI=0.0131941;REFB=-0.000176181;REVB=-0.0108015;RO=35;SAF=7;SAR=17;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187641;STB=0.607993;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.000194204;OID=.;OPOS=92549586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:17:7:16:19:17:7:16:19 chr14 92559678 . G C 141.31 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0165956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.307;QD=13.4583;RBI=0.0165972;REFB=-0.0170312;REVB=0.00023392;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363932;STB=0.709985;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00952024;OID=.;OPOS=92559678;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:10:6:19:7:10:6:19:7 chr14 92792255 . G A 790.29 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0517678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8501;QD=55.4586;RBI=0.0543833;REFB=-0.150864;REVB=0.0166623;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140753;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00554088;OID=.;OPOS=92792255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:57:57:1:0:56:57:1:33:23:0:1:34:23:0:0 chr14 92909073 . T C,G 756.7 PASS AF=0.945455,0.0545455;AO=50,3;DP=53;FAO=52,3;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33,1;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150206,0.0065644;FXX=0.017854;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.824,129.787;QD=55.0329;RBI=0.109647,0.00658123;REFB=0,0;REVB=0.108614,-0.000470316;RO=0;SAF=33,1;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.56458e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000750651,0.0519233;OID=.,.;OPOS=92909073,92909073;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:53:55:0:0:50,3:52,3:0.945455,0.0545455:17,2:33,1:0:0:19,2:33,1:0:0 chr14 92922900 . G A 348.45 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0162904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9345;QD=22.8491;RBI=0.0277149;REFB=-0.0348576;REVB=0.0224219;RO=26;SAF=14;SAR=21;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490079;STB=0.527011;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0125747;OID=.;OPOS=92922900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:21:14:12:14:21:14:12:14 chr14 92958522 . A C 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.489;QD=60.5471;RBI=0.0191022;REFB=0;REVB=0.00601148;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56555e-05;OID=.;OPOS=92958522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:32:43:0:0:32:43:0:0 chr14 93118669 . G A 333.44 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139135;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0769;QD=53.35;RBI=0.0728252;REFB=0;REVB=0.0714837;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161568;OID=.;OPOS=93118669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:16:8:0:0:17:8:0:0 chr14 93178191 . A G 1457.29 PASS AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0111889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9235;QD=62.0122;RBI=0.0123748;REFB=-0.0392256;REVB=-0.00528642;RO=0;SAF=36;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09153e-08;STB=0.506848;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00167772;OID=.;OPOS=93178191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:94:0:1:93:93:0.989362:57:36:0:0:57:36:1:0 chr14 93199080 . C T 207.64 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.021558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.267;QD=15.101;RBI=0.0305077;REFB=-0.00604268;REVB=-0.0215864;RO=31;SAF=7;SAR=17;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406281;STB=0.730183;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0159637;OID=.;OPOS=93199080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:17:7:22:9:17:7:22:9 chr14 93276654 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112268;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=328.659;QD=53.9112;RBI=0.0232121;REFB=0;REVB=-0.0203165;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92772e-05;OID=.;OPOS=93276654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chr14 93399101 . C T 432.03 PASS AF=0.56;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00216132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.713;QD=23.0416;RBI=0.0215806;REFB=-0.0169676;REVB=-0.0214721;RO=31;SAF=30;SAR=12;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584734;STB=0.507039;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0120111;OID=.;OPOS=93399101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:31:33:42:42:0.56:12:30:24:7:12:30:24:9 chr14 93401178 . A G 175.66 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0934703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4949;QD=46.8436;RBI=0.0970718;REFB=0;REVB=-0.0261959;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00501349;OID=.;OPOS=93401178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr14 93407062 . A G 1079.56 PASS AF=0.961039;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=77;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0217916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.425;QD=56.0809;RBI=0.0377848;REFB=-0.0743672;REVB=0.0308677;RO=3;SAF=38;SAR=36;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132722;STB=0.507021;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00466482;OID=.;OPOS=93407062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:77:77:3:3:74:74:0.961039:36:38:1:2:36:38:1:2 chr14 93703854 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0431;QD=44.6898;RBI=0.0564421;REFB=0;REVB=-0.0383763;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00387299;OID=.;OPOS=93703854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr14 93705687 . C T 400.01 PASS AF=0.391667;AO=47;DP=120;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.0153587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8008;QD=13.3335;RBI=0.0320616;REFB=-0.0219478;REVB=-0.0281435;RO=73;SAF=24;SAR=23;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114199;STB=0.564541;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0335315;OID=.;OPOS=93705687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:73:73:47:47:0.391667:23:24:45:28:23:24:45:28 chr14 93708759 . A C 230.78 PASS AF=0.55;AO=23;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00152806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.562;QD=23.0775;RBI=0.0555889;REFB=-0.0117367;REVB=-0.0555679;RO=17;SAF=13;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179283;STB=0.51634;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0163162;OID=.;OPOS=93708759;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:17:18:23:22:0.55:10:13:10:7:9:13:10:8 chr14 93943998 . G A 513.99 PASS AF=0.466102;AO=55;DP=118;FAO=55;FDP=118;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.0276126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6165;QD=17.4235;RBI=0.0327954;REFB=-9.30592e-05;REVB=-0.0176943;RO=61;SAF=34;SAR=21;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183132;STB=0.610108;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00023605;OID=.;OPOS=93943998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:61:63:55:55:0.466102:21:34:26:35:21:34:26:37 chr14 94103602 . G A 131.31 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00154784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.763;QD=14.1959;RBI=0.0231477;REFB=-0.0119208;REVB=0.0230959;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232835;STB=0.625838;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0154985;OID=.;OPOS=94103602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:22:15:15:0.405405:4:11:11:10:4:11:12:10 chr14 94109922 . A G 626.34 PASS AF=0.512195;AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.00624448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.806;QD=20.3686;RBI=0.00652068;REFB=-0.00509147;REVB=0.0018777;RO=60;SAF=31;SAR=32;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225073;STB=0.512393;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00442949;OID=.;OPOS=94109922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:60:60:63:63:0.512195:32:31:28:32:32:31:28:32 chr14 94187832 . C T 754.41 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00959462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7384;QD=56.9362;RBI=0.047486;REFB=0;REVB=0.0465066;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325979;OID=.;OPOS=94187832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr14 94410275 . CA C 436.67 PASS AF=0.602041;AO=58;DP=98;FAO=59;FDP=98;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0113734;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.4983;QD=17.8233;RBI=0.0245353;REFB=0.00598817;REVB=-0.02174;RO=39;SAF=25;SAR=33;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419418;STB=0.525641;STBP=0.522;TYPE=del;VARB=-0.00395167;OID=.;OPOS=94410276;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.602041:58:98:59:98:39:25:34:19:20:99:39:25:33:19:20 chr14 94417421 . G A 764.13 PASS AF=0.473373;AO=80;DP=169;FAO=80;FDP=169;FR=.;FRO=89;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=0.0120546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6017;QD=18.086;RBI=0.0264374;REFB=-0.027034;REVB=-0.0235292;RO=88;SAF=48;SAR=32;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421922;STB=0.526823;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0330765;OID=.;OPOS=94417421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:88:89:80:80:0.473373:32:48:49:39:32:48:49:40 chr14 94417541 . A G 579.81 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141636;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.104;QD=61.0328;RBI=0.0155344;REFB=0;REVB=-0.00638032;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235396;OID=.;OPOS=94417541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr14 94417586 . G A 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0836639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5934;QD=12.1822;RBI=0.0937564;REFB=-0.00708969;REVB=0.0423155;RO=15;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430131;STB=0.758071;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0188463;OID=.;OPOS=94417586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:8:2:9:6:8:2:9:6 chr14 94467549 . C T 732.35 PASS AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123519;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.827;QD=63.6826;RBI=0.00806247;REFB=0;REVB=0.00796729;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169781;OID=.;OPOS=94467549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr14 94510964 . T C 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0304459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4328;QD=15.2624;RBI=0.0514087;REFB=0.00386199;REVB=0.0414234;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208073;STB=0.619395;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00520337;OID=.;OPOS=94510964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:7:6:4:12:7:6:4:12 chr14 94546047 . G C 179.02 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0183005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.784;QD=12.5627;RBI=0.0278441;REFB=-0.0123038;REVB=-0.0209853;RO=34;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310048;STB=0.526292;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0182795;OID=.;OPOS=94546047;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:35:22:22:0.385965:11:11:18:16:11:11:19:16 chr14 94564035 . A G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.992;QD=56.9566;RBI=0.0443646;REFB=0;REVB=0.0139766;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188375;OID=.;OPOS=94564035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr14 94564039 . A G 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9859;QD=64.4141;RBI=0.0210274;REFB=0;REVB=0.000836338;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304075;OID=.;OPOS=94564039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0 chr14 94564058 . G A 608.39 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5505;QD=60.8388;RBI=0.164396;REFB=0;REVB=0.152788;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00373152;OID=.;OPOS=94564058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:40:0:0:37:40:1:20:17:0:0:23:17:0:0 chr14 94756450 . T A 939.95 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200289;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.744;QD=58.7467;RBI=0.0511322;REFB=0;REVB=0.0470462;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000814482;OID=.;OPOS=94756450;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0 chr14 94756458 . A T 148.08 PASS AF=0.31746;AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0286256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.805;QD=9.40175;RBI=0.0312563;REFB=-0.00491176;REVB=-0.0125511;RO=43;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367772;STB=0.521717;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00818164;OID=.;OPOS=94756458;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:43:20:20:0.31746:11:9:18:25:11:9:18:25 chr14 94756750 . T C 1472.52 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.954;QD=63.3344;RBI=0.0356527;REFB=0;REVB=0.0188751;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55276e-05;OID=.;OPOS=94756750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:51:42:0:0:51:42:0:0 chr14 94756794 . T C 1218.17 PASS AF=0.975904;AO=78;DP=80;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0456822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2;QD=58.707;RBI=0.0485246;REFB=-0.149277;REVB=-0.0163638;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.512192;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0112292;OID=.;OPOS=94756794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:80:83:0:2:78:81:0.975904:41:37:0:0:41:40:2:0 chr14 94776216 . C T 618.94 PASS AF=0.492188;AO=63;DP=128;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.00222779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.881;QD=19.3419;RBI=0.00923238;REFB=-0.0149044;REVB=-0.00895956;RO=63;SAF=34;SAR=29;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861825;STB=0.53967;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0175961;OID=.;OPOS=94776216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:63:65:63:63:0.492188:29:34:28:35:29:34:30:35 chr14 94776221 . A C 1737.76 PASS AF=1;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.991;QD=60.4439;RBI=0.0259653;REFB=0;REVB=-0.0041768;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002161;OID=.;OPOS=94776221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:114:115:1:59:55:0:0:59:56:0:0 chr14 94844843 . T G 663.94 PASS AF=0.571429;AO=64;DP=112;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0444614;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6378;QD=23.712;RBI=0.0472177;REFB=-0.0145469;REVB=-0.0158962;RO=48;SAF=42;SAR=22;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145997;STB=0.57988;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0107938;OID=.;OPOS=94844843;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:48:48:64:64:0.571429:22:42:23:25:22:42:23:25 chr14 94849201 . C T 210.64 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0391752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2069;QD=19.1493;RBI=0.0579919;REFB=-0.0158881;REVB=-0.0427595;RO=23;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100971;STB=0.557321;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0194736;OID=.;OPOS=94849201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:14:7:10:13:14:7:10:13 chr14 94929541 . G A 746.69 PASS AF=0.525547;AO=72;DP=137;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=-0.0042135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.054;QD=21.8013;RBI=0.00812871;REFB=-0.014389;REVB=-0.00695143;RO=65;SAF=40;SAR=32;SRF=44;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107867;STB=0.559052;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0129182;OID=.;OPOS=94929541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:65:65:72:72:0.525547:32:40:44:21:32:40:44:21 chr14 94931105 . A G 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00195076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.964;QD=20.0175;RBI=0.0172474;REFB=0.00806164;REVB=0.0171367;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028511;STB=0.516111;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.00708511;OID=.;OPOS=94931105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:10:8:7:10:10:8:7:10 chr14 94933473 . C A 375.48 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00322364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.754;QD=18.316;RBI=0.0182827;REFB=-0.000710961;REVB=0.0179963;RO=43;SAF=21;SAR=18;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00338033;STB=0.501886;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.00149743;OID=.;OPOS=94933473;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:18:21:23:20:18:21:23:20 chr14 94933640 . A T 267.89 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0415481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.478;QD=16.2357;RBI=0.0446235;REFB=-0.00472703;REVB=-0.0162792;RO=36;SAF=12;SAR=18;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167381;STB=0.509428;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00438981;OID=.;OPOS=94933640;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:18:12:15:21:18:12:15:21 chr14 94933695 . G A 242.15 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00607448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1474;QD=16.9928;RBI=0.0178008;REFB=0.00886125;REVB=0.0167323;RO=30;SAF=9;SAR=18;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13283;STB=0.574943;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.0093111;OID=.;OPOS=94933695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:18:9:14:16:18:9:14:16 chr14 94935566 . G A 165.95 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0178023;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.504;QD=9.62002;RBI=0.0361566;REFB=-0.00369275;REVB=-0.0314702;RO=46;SAF=14;SAR=8;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00734237;STB=0.514111;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.010623;OID=.;OPOS=94935566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:46:47:22:22:0.318841:8:14:29:17:8:14:29:18 chr14 94935901 . G C 1165.12 PASS AF=0.515695;AO=115;DP=223;FAO=115;FDP=223;FR=.;FRO=108;FSAF=48;FSAR=67;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.0168725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.5541;QD=20.8991;RBI=0.0385888;REFB=-0.00516269;REVB=0.0347046;RO=108;SAF=48;SAR=67;SRF=59;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114713;STB=0.562837;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00471518;OID=.;OPOS=94935901;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:108:108:115:115:0.515695:67:48:59:49:67:48:59:49 chr14 95080803 . G A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4608;QD=42.181;RBI=0.095631;REFB=0;REVB=0.0934352;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250135;OID=.;OPOS=95080803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr14 95107973 . C T 224.89 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0696331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1618;QD=19.9901;RBI=0.0953192;REFB=0.010641;REVB=0.0650921;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215978;STB=0.512184;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=-0.00499269;OID=.;OPOS=95107973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:12:10:11:12:12:10:11:12 chr14 95110017 . G T 341.29 PASS AF=0.622642;AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00140417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.851;QD=25.7579;RBI=0.00737524;REFB=0.00564672;REVB=0.00724034;RO=20;SAF=9;SAR=24;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178528;STB=0.598362;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00388076;OID=.;OPOS=95110017;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:20:20:33:33:0.622642:24:9:10:10:24:9:10:10 chr14 95555205 . C T 1396.42 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2812;QD=62.7605;RBI=0.0279935;REFB=0;REVB=0.0218515;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97741e-05;OID=.;OPOS=95555205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0 chr14 95660242 . A G 306.26 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00586528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.737;QD=17.7543;RBI=0.0246567;REFB=-0.00856933;REVB=0.0239489;RO=36;SAF=15;SAR=18;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621747;STB=0.534738;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00809016;OID=.;OPOS=95660242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:18:15:14:22:18:15:14:22 chr14 95786115 . C T 689.29 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.344;QD=62.6625;RBI=0.049014;REFB=0;REVB=0.0137119;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316286;OID=.;OPOS=95786115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr14 95884323 . G A 736.52 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0893988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7937;QD=62.6823;RBI=0.0928857;REFB=0;REVB=0.0252114;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142392;OID=.;OPOS=95884323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:19:27:0:0:20:27:0:0 chr14 95903307 . TAGA T 358.09 PASS AF=0.673469;AO=32;DP=50;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00862562;FXX=0.0754575;HRUN=1;LEN=3;MLLD=187.004;QD=29.2319;RBI=0.0346928;REFB=-0.020546;REVB=-0.0336034;RO=16;SAF=13;SAR=19;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196684;STB=0.514791;STBP=0.77;TYPE=del;VARB=0.0105397;OID=.;OPOS=95903308;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.673469:32:50:33:49:16:13:20:7:9:99:16:13:19:7:9 chr14 95906321 . G A 3046.4 PASS AF=1;AO=191;DP=192;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236602;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.981;QD=63.4666;RBI=0.0373251;REFB=-0.0480563;REVB=0.0288679;RO=1;SAF=43;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109439;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59112e-05;OID=.;OPOS=95906321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:192:192:1:0:191:192:1:148:43:1:0:148:44:0:0 chr14 95910933 . T C 239.96 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.00278821;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1641;QD=20.422;RBI=0.00375494;REFB=-0.00446383;REVB=-0.00251504;RO=25;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123154;STB=0.50819;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.00531223;OID=.;OPOS=95910933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:25:24:23:23:0.489362:15:8:9:16:15:8:8:16 chr14 95918625 . T C 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3736;QD=62.0214;RBI=0.045125;REFB=0;REVB=0.0168363;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000291808;OID=.;OPOS=95918625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chr14 95921741 . C T 756.93 PASS AF=1;AO=45;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.131;QD=57.1264;RBI=0.0516038;REFB=0;REVB=0.0177778;RO=0;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223392;OID=.;OPOS=95921741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:45:53:1:13:32:0:0:14:39:0:0 chr14 95923670 . A C 483.65 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.307;QD=58.6245;RBI=0.0540074;REFB=0;REVB=0.0139387;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256973;OID=.;OPOS=95923670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:17:15:0:0:17:16:0:0 chr14 95999820 . T C 306.7 PASS AF=0.345133;AO=39;DP=113;FAO=39;FDP=113;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0152683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.157;QD=10.8565;RBI=0.0280017;REFB=0.00103306;REVB=-0.0234729;RO=73;SAF=18;SAR=21;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579736;STB=0.537171;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.00205756;OID=.;OPOS=95999820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:73:74:39:39:0.345133:21:18:30:43:21:18:30:44 chr14 96129955 . A C 125.93 PASS AF=0.619048;AO=11;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0396067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0911;QD=23.9872;RBI=0.0413476;REFB=0.00774468;REVB=0.0118717;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407764;STB=0.58809;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.00430874;OID=.;OPOS=96129955;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:21:21:7:7:11:13:0.619048:10:1:3:4:10:3:3:4 chr14 96131432 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0445;QD=59.8394;RBI=0.0316154;REFB=0;REVB=-0.00718495;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000600431;OID=.;OPOS=96131432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0 chr14 96136794 . A G 182.02 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0180971;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6552;QD=16.1799;RBI=0.0473026;REFB=3.85547e-05;REVB=0.0437039;RO=26;SAF=11;SAR=8;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205789;STB=0.616803;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00183709;OID=.;OPOS=96136794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:26:26:19:19:0.422222:8:11:20:6:8:11:20:6 chr14 96157187 . G A 255.69 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00616073;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.74;QD=15.7346;RBI=0.00630021;REFB=0.00493032;REVB=0.00131835;RO=36;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144548;STB=0.58119;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00758193;OID=.;OPOS=96157187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:36:36:29:29:0.446154:16:13:11:25:16:13:11:25 chr14 96178688 . C T 646.32 PASS AF=0.464789;AO=66;DP=142;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.0100686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.157;QD=18.2061;RBI=0.010101;REFB=0.00876008;REVB=-0.000808352;RO=76;SAF=18;SAR=48;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177583;STB=0.599087;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.0111743;OID=.;OPOS=96178688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:76:76:66:66:0.464789:48:18:33:43:48:18:33:43 chr14 96556914 . T C 1237.25 PASS AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00928518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.668;QD=58.9165;RBI=0.0454579;REFB=-0.0752056;REVB=0.0444995;RO=1;SAF=48;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976474;STB=0.502092;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.000961608;OID=.;OPOS=96556914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:1:2:82:82:0.97619:34:48:1:0:34:48:1:1 chr14 96557121 . T C 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.051;QD=55.0956;RBI=0.0173268;REFB=0;REVB=0.0160755;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57249e-05;OID=.;OPOS=96557121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr14 96557873 . G T 195.87 PASS AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.000288454;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.63;QD=16.3228;RBI=0.00769342;REFB=0.0018831;REVB=0.00768801;RO=28;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870393;STB=0.54995;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.00232586;OID=.;OPOS=96557873;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:11:9:15:13:11:9:15:13 chr14 96558235 . T C 137.74 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=53;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0114656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1944;QD=10.203;RBI=0.0124458;REFB=-0.016925;REVB=-0.00484117;RO=36;SAF=11;SAR=6;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109682;STB=0.578857;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0324675;OID=.;OPOS=96558235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:36:36:17:18:0.333333:6:11:20:16:6:12:20:16 chr14 96558595 . C T 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=5.41513e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.88;QD=19.6681;RBI=0.0595981;REFB=-0.0196457;REVB=-0.0595981;RO=17;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233393;STB=0.606628;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0153578;OID=.;OPOS=96558595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:19:19:19:0.5:7:12:6:11:7:12:8:11 chr14 96558694 . C T 199.76 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0280891;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.659;QD=19.976;RBI=0.0379542;REFB=-0.0170846;REVB=-0.025525;RO=20;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.021363;OID=.;OPOS=96558694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:13:7:7:13:13:7:7:13 chr14 96558881 . C G 911.06 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00241937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.429;QD=55.2157;RBI=0.0203415;REFB=-0.00746248;REVB=0.0201971;RO=2;SAF=21;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428711;STB=0.52272;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=3.62224e-05;OID=.;OPOS=96558881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:43:21:2:0:43:21:2:0 chr14 96559250 . C T 125.23 PASS AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00247298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.377;QD=10.4362;RBI=0.00842968;REFB=-0.00642405;REVB=0.00805877;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340152;STB=0.702442;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0177011;OID=.;OPOS=96559250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:5:10:12:21:5:10:12:21 chr14 96559459 . C A 150.31 PASS AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.020105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.656;QD=9.85668;RBI=0.0294256;REFB=-0.00603991;REVB=0.0214862;RO=41;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419827;STB=0.524656;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0123269;OID=.;OPOS=96559459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:13:7:13:28:13:7:13:28 chr14 96559723 . G A 538.12 PASS AF=0.561798;AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00222481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.749;QD=24.185;RBI=0.00244619;REFB=-0.0309655;REVB=0.00101689;RO=38;SAF=21;SAR=29;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000850967;STB=0.504386;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0162599;OID=.;OPOS=96559723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:38:39:50:50:0.561798:29:21:16:22:29:21:16:23 chr14 96559732 . G C 240.66 PASS AF=0.3625;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.00494884;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.145;QD=12.0333;RBI=0.0201359;REFB=-0.00906785;REVB=0.0195183;RO=51;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1922;STB=0.611569;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.015872;OID=.;OPOS=96559732;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:51:51:29:29:0.3625:21:8:22:29:21:8:22:29 chr14 96559791 . C T 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.010751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.075;QD=19.3432;RBI=0.0203653;REFB=-0.00455897;REVB=0.0172963;RO=17;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172565;STB=0.609637;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00518583;OID=.;OPOS=96559791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:18:18:18:0.5:8:10:6:11:8:10:6:12 chr14 96560083 . A T 482.6 PASS AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.000469173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.626;QD=23.2578;RBI=0.00199967;REFB=-0.0107991;REVB=-0.00194385;RO=37;SAF=22;SAR=24;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285972;STB=0.515716;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00974688;OID=.;OPOS=96560083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:37:46:46:0.554217:24:22:19:18:24:22:19:18 chr14 96560092 . G A 309.69 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00710953;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9497;QD=15.6806;RBI=0.02548;REFB=0.00805656;REVB=-0.024468;RO=45;SAF=17;SAR=17;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112084;STB=0.506325;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0154351;OID=.;OPOS=96560092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:45:45:34:34:0.43038:17:17:22:23:17:17:22:23 chr14 96671207 . GGGTGGGGAC G 579.95 PASS AF=0.735632;AO=56;DP=73;FAO=64;FDP=87;FR=.;FRO=23;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0345578;FXX=0.112233;HRUN=4;LEN=9;MLLD=247.949;QD=26.6645;RBI=0.0421146;REFB=-0.0351748;REVB=0.0240707;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.580235;STBP=0.015;TYPE=del;VARB=0.0115103;OID=.;OPOS=96671208;OREF=GGTGGGGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.735632:56:73:64:87:23:41:23:8:15:93:0:34:22:0:0 chr14 96707457 . A G 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6605;QD=57.2011;RBI=0.0290986;REFB=0;REVB=-0.00314279;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374879;OID=.;OPOS=96707457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr14 96708667 . T C 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.172;QD=54.5157;RBI=0.0602145;REFB=0;REVB=-0.0378416;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000958071;OID=.;OPOS=96708667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:6:19:0:0:6:19:0:0 chr14 96709230 . G A 651.02 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.267;QD=62.0021;RBI=0.0456914;REFB=0;REVB=0.0164772;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000699958;OID=.;OPOS=96709230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0 chr14 96709359 . A AC 517.28 PASS AF=1;AO=45;DP=48;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437914;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.5143;QD=47.0254;RBI=0.0709615;REFB=0;REVB=0.0558378;RO=2;SAF=13;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669533;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00229668;OID=.;OPOS=96709360;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:45:48:44:44:0:12:32:0:0:9:2:13:32:2:0 chr14 96730142 . A G 792.09 PASS AF=0.506667;AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=150;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00359151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.337;QD=21.1223;RBI=0.0092637;REFB=-0.00133781;REVB=-0.00853915;RO=74;SAF=39;SAR=37;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239135;STB=0.513154;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.000793935;OID=.;OPOS=96730142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:74:74:76:76:0.506667:37:39:36:38:37:39:36:38 chr14 96734831 . G T 449.02 PASS AF=0.462264;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.0038608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.535;QD=16.944;RBI=0.0214525;REFB=-0.00977604;REVB=-0.0211022;RO=56;SAF=27;SAR=22;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133794;STB=0.569592;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0150484;OID=.;OPOS=96734831;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:57:49:49:0.462264:22:27:23:33:22:27:24:33 chr14 96742496 . GC AT 291.42 PASS AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0256452;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=175.553;QD=14.3909;RBI=0.0554997;REFB=-0.0157611;REVB=-0.0492193;RO=48;SAF=15;SAR=18;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908;STB=0.551538;STBP=0.438;TYPE=mnp;VARB=0.0266124;OID=.;OPOS=96742496;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:18:15:26:22:18:15:26:22 chr14 96742594 . G A 312.57 PASS AF=0.366972;AO=39;DP=108;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=0.00429715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.935;QD=11.4706;RBI=0.0113135;REFB=-0.0130185;REVB=-0.0104656;RO=67;SAF=14;SAR=25;SRF=17;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132722;STB=0.553564;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0238476;OID=.;OPOS=96742594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:67:69:39:40:0.366972:25:14:17:50:26:14:19:50 chr14 96751010 . T C 199.67 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0112027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.219;QD=11.5749;RBI=0.0343091;REFB=-0.0189879;REVB=-0.0324286;RO=40;SAF=14;SAR=11;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091092;STB=0.58125;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0320488;OID=.;OPOS=96751010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:44:25:25:0.362319:11:14:19:21:11:14:19:25 chr14 96768425 . G A 334.88 PASS AF=0.397849;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.00618783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.947;QD=14.4036;RBI=0.00623409;REFB=-0.00950793;REVB=0.000758017;RO=56;SAF=24;SAR=13;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181286;STB=0.603175;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0156945;OID=.;OPOS=96768425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:56:56:37:37:0.397849:13:24:27:29:13:24:27:29 chr14 96771959 . A G 1463.78 PASS AF=0.971154;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00332804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.544;QD=56.2992;RBI=0.0229351;REFB=0.0334312;REVB=0.0226923;RO=3;SAF=52;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00831281;STB=0.504383;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.000659488;OID=.;OPOS=96771959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:104:104:3:3:101:101:0.971154:49:52:2:1:49:52:2:1 chr14 96773164 . A G 445.62 PASS AF=0.48913;AO=42;DP=89;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0165663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.005;QD=19.3747;RBI=0.0338995;REFB=-0.00891575;REVB=0.0295759;RO=47;SAF=17;SAR=25;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409178;STB=0.536815;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00928589;OID=.;OPOS=96773164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:92:47:47:42:45:0.48913:25:17:21:26:28:17:21:26 chr14 96781912 . T C 1437.71 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0252868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8281;QD=61.8372;RBI=0.0521069;REFB=-0.0311176;REVB=-0.0455599;RO=0;SAF=38;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09023e-08;STB=0.504586;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00150692;OID=.;OPOS=96781912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:54:38:0:0:54:38:0:1 chr14 96797724 . G A 1606.79 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.308;QD=64.2716;RBI=0.0238428;REFB=0;REVB=0.00723085;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.44792e-05;OID=.;OPOS=96797724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:49:50:0:0:50:50:0:0 chr14 96797867 . G C 497.97 PASS AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0109808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.769;QD=19.7216;RBI=0.0144356;REFB=-0.0163509;REVB=0.00937065;RO=50;SAF=19;SAR=32;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816817;STB=0.545215;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0186821;OID=.;OPOS=96797867;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:50:50:51:51:0.50495:32:19:23:27:32:19:23:27 chr14 96811664 . T C 441.37 PASS AF=0.6;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00781421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.522;QD=25.2213;RBI=0.00801113;REFB=-0.0188407;REVB=-0.00176528;RO=28;SAF=23;SAR=19;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708208;STB=0.538709;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0169009;OID=.;OPOS=96811664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:28:42:42:0.6:19:23:18:10:19:23:18:10 chr14 96829290 . G A 1161.87 PASS AF=0.963415;AO=78;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.000658305;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.543;QD=56.6766;RBI=0.0091094;REFB=0.0429795;REVB=-0.00908558;RO=2;SAF=24;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172084;STB=0.501276;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.000111278;OID=.;OPOS=96829290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:82:82:2:3:78:79:0.963415:54:24:0:2:55:24:1:2 chr14 96851111 . C T 266.71 PASS AF=0.461538;AO=29;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0255824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5259;QD=16.413;RBI=0.0339049;REFB=0.0152541;REVB=0.0222504;RO=35;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108768;STB=0.551833;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=-0.00805226;OID=.;OPOS=96851111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:35:35:29:30:0.461538:15:14:13:22:16:14:13:22 chr14 96871104 . G A 164.49 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00978886;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.255;QD=19.938;RBI=0.034055;REFB=-0.0214451;REVB=-0.0326178;RO=17;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205145;STB=0.602717;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0196731;OID=.;OPOS=96871104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:17:16:17:17:0.515152:7:10:6:11:7:10:6:10 chr14 96922752 . C G 302.22 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.0138274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.872;QD=19.4981;RBI=0.0205733;REFB=-0.0218394;REVB=0.0152336;RO=30;SAF=13;SAR=19;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332732;STB=0.683745;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0349005;OID=.;OPOS=96922752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:19:13:24:6:19:13:24:6 chr14 96922766 . A G 389.96 PASS AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=0.0343824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.98;QD=21.6642;RBI=0.0344009;REFB=-0.0219564;REVB=0.00112895;RO=33;SAF=17;SAR=22;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262564;STB=0.644281;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0124056;OID=.;OPOS=96922766;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:22:17:25:8:22:17:25:8 chr14 96944878 . G A 521.65 PASS AF=0.509434;AO=52;DP=104;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00754952;FXX=0.00934492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.981;QD=19.6849;RBI=0.0122365;REFB=-0.014761;REVB=0.00962997;RO=51;SAF=24;SAR=28;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608332;STB=0.536828;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0213612;OID=.;OPOS=96944878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:51:52:52:54:0.509434:28:24:27:24:30:24:27:25 chr14 96987303 . A T 262.26 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0166158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2678;QD=25.5858;RBI=0.0186592;REFB=-0.00426587;REVB=0.00848993;RO=17;SAF=8;SAR=16;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197862;STB=0.610075;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00148747;OID=.;OPOS=96987303;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:16:8:10:7:16:8:10:7 chr14 97104758 . A G 1534.33 PASS AF=1;AO=91;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.339;QD=59.5855;RBI=0.0797463;REFB=0;REVB=0.0797181;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568974;OID=.;OPOS=97104758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:91:103:1:38:53:0:0:48:55:0:0 chr14 97321689 . C T 1556.47 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2568;QD=59.8641;RBI=0.0229235;REFB=0;REVB=-0.0190747;RO=0;SAF=54;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133274;OID=.;OPOS=97321689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:50:54:0:0:50:54:0:0 chr14 98435696 . T C 3049.75 PASS AF=1;AO=191;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915984;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.994;QD=63.2072;RBI=0.0414973;REFB=-0.0146695;REVB=0.0404737;RO=1;SAF=98;SAR=93;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00483457;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128639;OID=.;OPOS=98435696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:193:193:1:0:191:193:1:93:98:1:0:93:100:0:0 chr14 98444369 . T C 1381.92 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00445375;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.256;QD=62.8147;RBI=0.0119149;REFB=0;REVB=0.0110511;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144462;OID=.;OPOS=98444369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:41:47:0:0:41:47:0:0 chr14 98817896 . T C 1321.12 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6113;QD=62.1705;RBI=0.0325742;REFB=0;REVB=-0.0304604;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314031;OID=.;OPOS=98817896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:38:45:0:0:39:46:0:0 chr14 99638736 . ATTTTTTTTTTTTTTAC ATTTTTTTTTTTATTCT,ATTTTTTTTTTTATTTC,ATTTTTTTTTTTTAC 202.42 PASS AF=0.52,0,0.48;AO=2,2,7;DP=27;FAO=13,0,12;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0,3;FSAR=0,0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0542318,-0.0720747,-0.300999;FXX=0.137883;HRUN=14,14,14;LEN=5,4,2;MLLD=74.8513,66.811,6.20631;QD=32.3874;RBI=0.0614591,0.0776776,0.417899;REFB=0,0,0;REVB=-0.028916,-0.0289662,-0.289896;RO=0;SAF=2,2,2;SAR=0,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0.0480322,0,-0.0291593;OID=.,.,.;OPOS=99638748,99638748,99638737;OREF=TTTAC,TTTA,TT;OALT=ATTCT,ATTT,-;OMAPALT=ATTTTTTTTTTTATTCT,ATTTTTTTTTTTATTTC,ATTTTTTTTTTTTAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.52,0,0.48:2,2,7:27:13,0,12:25:0:13,0,3:0,0,9:0:0:80:0:2,2,2:0,0,5:0:0 chr14 99876505 . A G 84.57 PASS AF=0.407407;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00167618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.991;QD=12.5283;RBI=0.0229892;REFB=-0.0216488;REVB=0.0229281;RO=16;SAF=8;SAR=2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294572;STB=0.691913;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0295581;OID=.;OPOS=99876505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:26:27:16:16:10:11:0.407407:2:8:9:7:2:9:9:7 chr14 100039109 . C G 312.88 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0108034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.666;QD=14.3854;RBI=0.0126139;REFB=-0.00802406;REVB=-0.00651125;RO=52;SAF=15;SAR=20;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590805;STB=0.503354;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0121618;OID=.;OPOS=100039109;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:20:15:22:30:20:15:22:30 chr14 100046373 . A T 103.62 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.016223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.258;QD=13.8157;RBI=0.0167298;REFB=-0.0178507;REVB=-0.00408658;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09589;STB=0.555473;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0226616;OID=.;OPOS=100046373;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:5:12:8:5:5:12 chr14 100049440 . A G 152.34 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0644598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.075;QD=21.0125;RBI=0.0645721;REFB=-0.0282669;REVB=0.00380667;RO=13;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782386;STB=0.543988;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0182063;OID=.;OPOS=100049440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:11:5:3:10:11:5:3:10 chr14 100070030 . G A 76.13 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.036774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.765;QD=12.1808;RBI=0.0457306;REFB=-0.0149595;REVB=0.0271838;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11281;STB=0.567427;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0241517;OID=.;OPOS=100070030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:7:3:6:9:7:3:6:9 chr14 100141689 . T C 231.73 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00394408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.323;QD=48.7862;RBI=0.00675403;REFB=0;REVB=-0.00548281;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00287589;OID=.;OPOS=100141689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:5:13:0:0:6:13:0:0 chr14 100331876 . T C 1282.98 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9672;QD=61.8302;RBI=0.00796479;REFB=0;REVB=-0.00208549;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33436e-05;OID=.;OPOS=100331876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:38:45:0:0:38:45:0:0 chr14 100380948 . T C 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.431;QD=62.3146;RBI=0.0225579;REFB=0;REVB=-0.000889884;RO=0;SAF=31;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22949e-05;OID=.;OPOS=100380948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:55:31:0:0:55:31:0:0 chr14 100411737 . C A 124.38 PASS AF=0.388889;AO=15;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.015048;FXX=0.0526177;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.7045;QD=13.8194;RBI=0.0248969;REFB=-0.0400106;REVB=-0.0198346;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781561;STB=0.590033;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0494349;OID=.;OPOS=100411737;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:22:15:14:0.388889:6:9:11:10:5:9:11:11 chr14 100411767 . C T 220.41 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0402128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.852;QD=24.4899;RBI=0.0424592;REFB=-0.0114491;REVB=-0.0136277;RO=14;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359042;STB=0.537154;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0266464;OID=.;OPOS=100411767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:15:21:21:0.583333:8:13:8:6:8:13:8:7 chr14 100411771 . T G 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00552372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.924;QD=23.5284;RBI=0.0160198;REFB=-0.00559701;REVB=0.0150373;RO=15;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525291;STB=0.529382;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00342988;OID=.;OPOS=100411771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:8:12:8:7:8:12:8:7 chr14 100411774 . G A 520.02 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.081;QD=59.4314;RBI=0.0242931;REFB=0;REVB=0.0121262;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189098;OID=.;OPOS=100411774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:15:20:0:0 chr14 100607595 . C T 129.16 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0340637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.317;QD=12.9164;RBI=0.0527089;REFB=-0.00807618;REVB=0.0402231;RO=25;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449217;STB=0.526281;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0141954;OID=.;OPOS=100607595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:6:9:16:9:6:9:16:9 chr14 100615665 . T C 1282.01 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.746;QD=61.7836;RBI=0.0314391;REFB=0;REVB=0.0262889;RO=0;SAF=51;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97773e-05;OID=.;OPOS=100615665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:31:51:0:0:31:52:0:0 chr14 100625902 . C T 465.04 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9757;QD=58.1299;RBI=0.0376152;REFB=0;REVB=0.00724377;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665633;OID=.;OPOS=100625902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr14 100758502 . G A 498.23 PASS AF=0.505263;AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.052474;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.359;QD=20.9781;RBI=0.0681133;REFB=-0.0148135;REVB=-0.043427;RO=47;SAF=26;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193719;STB=0.515307;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00447894;OID=.;OPOS=100758502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:47:47:47:48:0.505263:21:26:25:22:21:27:25:22 chr14 100759046 . C A 191.76 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.926;QD=47.9404;RBI=0.101912;REFB=0;REVB=-0.0031232;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144512;OID=.;OPOS=100759046;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:16:0:0:15:16:1:10:5:0:0:9:7:0:0 chr14 100759277 . C T 354.35 PASS AF=0.545455;AO=35;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0282105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.3;QD=21.4755;RBI=0.0282331;REFB=-0.0331602;REVB=0.00112706;RO=30;SAF=10;SAR=25;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16907;STB=0.580808;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0278192;OID=.;OPOS=100759277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:35:36:0.545455:25:10:14:16:25:11:14:16 chr14 100792482 . C A 937.47 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.251;QD=58.5918;RBI=0.0380021;REFB=0;REVB=0.0206055;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113015;OID=.;OPOS=100792482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:28:36:0:0:28:36:0:0 chr14 100808845 . G A 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.645;QD=62.6703;RBI=0.0655112;REFB=0;REVB=0.0444193;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350871;OID=.;OPOS=100808845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0 chr14 100832391 . T C 1194.28 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330839;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.527;QD=61.245;RBI=0.0431784;REFB=0;REVB=0.0277459;RO=0;SAF=52;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453463;OID=.;OPOS=100832391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:26:52:0:0:26:52:0:0 chr14 100847523 . T C 223.18 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0067882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.353;QD=49.5961;RBI=0.0156168;REFB=0;REVB=0.0140643;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297074;OID=.;OPOS=100847523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr14 100996312 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.969;QD=61.3361;RBI=0.0370719;REFB=0;REVB=-0.013018;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05829e-05;OID=.;OPOS=100996312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:27:13:0:0:27:13:0:0 chr14 101005215 . T C 127.3 PASS AF=0.348837;AO=13;DP=41;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00507299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.08;QD=11.8421;RBI=0.0234305;REFB=-0.0256395;REVB=0.0228747;RO=28;SAF=4;SAR=9;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337048;STB=0.723836;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0435281;OID=.;OPOS=101005215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:28:28:13:15:0.348837:9:4:17:11:11:4:17:11 chr14 101005236 . A G 43.16 PASS AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0289646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.589;QD=5.56872;RBI=0.0329512;REFB=-0.00261686;REVB=-0.0157111;RO=24;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181028;STB=0.617852;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00899834;OID=.;OPOS=101005236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:31:31:24:24:7:7:0.225806:4:3:14:10:4:3:14:10 chr14 101138230 . A C 535.69 PASS AF=0.555556;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0282203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9613;QD=23.8083;RBI=0.0848294;REFB=-0.00248102;REVB=0.0799977;RO=40;SAF=21;SAR=29;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145717;STB=0.579968;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00404747;OID=.;OPOS=101138230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:40:40:50:50:0.555556:29:21:24:16:29:21:24:16 chr14 101198417 . A G 1677.4 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.503;QD=60.4468;RBI=0.019663;REFB=0;REVB=0.0149467;RO=0;SAF=67;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73785e-06;OID=.;OPOS=101198417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:44:67:0:0:44:67:0:0 chr14 101200645 . T C 79.28 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.469;QD=39.641;RBI=0.0478438;REFB=0;REVB=0.0478438;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465904;OID=.;OPOS=101200645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0 chr14 101301038 . C G 440.02 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.045664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1211;QD=19.5565;RBI=0.0570333;REFB=-0.0111677;REVB=0.0341701;RO=43;SAF=22;SAR=22;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518732;STB=0.511106;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00881674;OID=.;OPOS=101301038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:46:44:44:0.488889:22:22:24:19:22:22:24:22 chr14 101348584 . C G 153.42 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0117489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8702;QD=13.9476;RBI=0.0239071;REFB=-0.00612942;REVB=0.020821;RO=25;SAF=2;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454403;STB=0.777385;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00957212;OID=.;OPOS=101348584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:27:17:17:0.386364:15:2:11:14:15:2:12:15 chr14 101349017 . A G 507.78 PASS AF=0.407143;AO=56;DP=139;FAO=57;FDP=140;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=55;FWDB=-0.0138907;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.613;QD=14.5081;RBI=0.0139161;REFB=0.00030132;REVB=0.000840912;RO=83;SAF=25;SAR=31;SRF=28;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11899;STB=0.571843;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.00105055;OID=.;OPOS=101349017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:83:83:56:57:0.407143:31:25:28:55:31:26:28:55 chr14 101350298 . T C 258.07 PASS AF=0.467742;AO=27;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0225884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.724;QD=16.6494;RBI=0.0314106;REFB=-0.0119713;REVB=0.0218264;RO=33;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150327;STB=0.563715;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0132075;OID=.;OPOS=101350298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:33:33:27:29:0.467742:13:14:12:21:15:14:12:21 chr14 101507727 . C T 233.49 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0404522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.553;QD=15.064;RBI=0.0414189;REFB=0.00197289;REVB=0.00889627;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217077;STB=0.512306;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.00333126;OID=.;OPOS=101507727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:16:11:15:20:16:11:15:20 chr14 101522556 . T C 477.96 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00597161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.166;QD=19.7098;RBI=0.00819957;REFB=-0.00208991;REVB=0.00561898;RO=50;SAF=28;SAR=19;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717762;STB=0.539893;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00121137;OID=.;OPOS=101522556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:19:28:26:24:19:28:26:24 chr14 101522589 . C T 591.09 PASS AF=0.491935;AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.0139657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.588;QD=19.0673;RBI=0.01397;REFB=-0.0175417;REVB=0.000347086;RO=62;SAF=27;SAR=34;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125611;STB=0.565299;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0141704;OID=.;OPOS=101522589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:63:61:61:0.491935:34:27:36:26:34:27:36:27 chr14 101526181 . G A 491.54 PASS AF=0.435484;AO=54;DP=124;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.0571322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.629;QD=15.856;RBI=0.0571326;REFB=-0.0134633;REVB=-0.000211757;RO=69;SAF=27;SAR=27;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138442;STB=0.580616;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.023493;OID=.;OPOS=101526181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:69:70:54:54:0.435484:27:27:25:44:27:27:25:45 chr14 101531854 . A G 602.01 PASS AF=0.425926;AO=68;DP=160;FAO=69;FDP=162;FR=.;FRO=93;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=-0.0083651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.421;QD=14.8644;RBI=0.0504338;REFB=-0.0147633;REVB=-0.0497353;RO=92;SAF=35;SAR=33;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708944;STB=0.538066;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0232558;OID=.;OPOS=101531854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:162:92:93:68:69:0.425926:33:35:41:51:34:35:41:52 chr14 102360916 . G A 149.68 PASS AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0246677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.908;QD=11.9742;RBI=0.0330278;REFB=-0.0201335;REVB=-0.0219622;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214878;STB=0.626304;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0447618;OID=.;OPOS=102360916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:10:7:20:13:10:7:20:13 chr14 102391577 . G C 465.09 PASS AF=0.5625;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0428214;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.5826;QD=23.2544;RBI=0.0622896;REFB=-0.0598643;REVB=0.0452363;RO=36;SAF=21;SAR=24;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494302;STB=0.533319;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0476977;OID=.;OPOS=102391577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:36:35:45:45:0.5625:24:21:19:17:24:21:19:16 chr14 102446161 . G A 353.36 PASS AF=0.414894;AO=38;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0268572;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5546;QD=15.0367;RBI=0.0389607;REFB=-0.00125619;REVB=-0.0282246;RO=56;SAF=17;SAR=21;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092843;STB=0.548994;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.000820547;OID=.;OPOS=102446161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:55:38:39:0.414894:21:17:30:26:21:18:30:25 chr14 102550803 . G A 487.12 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00908213;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7748;QD=59.0448;RBI=0.0145828;REFB=0;REVB=0.0114093;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140238;OID=.;OPOS=102550803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:20:12:0:0:20:13:0:0 chr14 102568296 . G A 1120.99 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00708982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.976;QD=58.9994;RBI=0.0679821;REFB=-0.152602;REVB=-0.0676114;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.506327;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000873434;OID=.;OPOS=102568296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:39:36:0:0:39:36:0:1 chr14 102568367 . T A 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000614968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.988;QD=59.8557;RBI=0.0277019;REFB=0;REVB=0.0276951;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92291e-05;OID=.;OPOS=102568367;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0 chr14 102792386 . T C 541.78 PASS AF=0.574713;AO=48;DP=85;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0225299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.52;QD=24.9096;RBI=0.0268612;REFB=-0.0308119;REVB=0.0146263;RO=36;SAF=23;SAR=25;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380032;STB=0.525725;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0209245;OID=.;OPOS=102792386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:36:37:48:50:0.574713:25:23:19:17:26:24:20:17 chr14 102792631 . G A 132.15 PASS AF=0.636364;AO=13;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.017072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.681;QD=24.0275;RBI=0.0219462;REFB=-0.0120958;REVB=-0.0137906;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684983;STB=0.519972;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.00460565;OID=.;OPOS=102792631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:13:14:0.636364:8:5:3:5:8:6:3:5 chr14 102798055 . G A 282.28 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00719782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9284;QD=22.5823;RBI=0.00910307;REFB=-0.0117723;REVB=-0.0055729;RO=24;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426327;STB=0.523791;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0114167;OID=.;OPOS=102798055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:11:15:15:9:11:15:15:9 chr14 102808330 . C T 72.93 PASS AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0957857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6009;QD=20.8363;RBI=0.097237;REFB=0.00137468;REVB=0.0167373;RO=5;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202228;STB=0.511602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00519626;OID=.;OPOS=102808330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:2:7:4:1:2:7:4:1 chr14 102808655 . G C 142.59 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0019417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4727;QD=14.2594;RBI=0.0106896;REFB=-0.0180182;REVB=-0.0105118;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28395;STB=0.666444;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0243534;OID=.;OPOS=102808655;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:12:4:12:12:12:4:12:12 chr14 102814945 . G A 253.2 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0162428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.265;QD=19.1095;RBI=0.0163996;REFB=-0.00784062;REVB=0.00226223;RO=25;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675077;STB=0.546688;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00810946;OID=.;OPOS=102814945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:14:13:14:11:14:13:15:11 chr14 102894593 . G A 238.83 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00095503;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6517;QD=18.0249;RBI=0.036646;REFB=-0.000892513;REVB=0.0366336;RO=27;SAF=6;SAR=20;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297978;STB=0.668756;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00263535;OID=.;OPOS=102894593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:27:27:26:26:0.490566:20:6:14:13:20:6:14:13 chr14 102965367 . TCACCACACCACACCACACCA TCACCACACCACACCA,TCACCACACCACACCACACCT 181.65 PASS AF=0.6,0.4;AO=10,3;DP=17;FAO=9,6;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6,6;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068759,0.220892;FXX=0.117578;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=155.83,87.9365;QD=48.4409;RBI=0.118975,0.221324;REFB=0,0;REVB=0.0970935,-0.0138135;RO=0;SAF=8,3;SAR=2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0413886,0.0124064;OID=.,.;OPOS=102965368,102965387;OREF=CACCA,A;OALT=-,T;OMAPALT=TCACCACACCACACCA,TCACCACACCACACCACACCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.6,0.4:10,3:17:9,6:15:0:6,6:3,0:0:0:42:0:8,3:2,0:0:0 chr14 102965435 . A G 490.98 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2424;QD=57.7621;RBI=0.12945;REFB=0;REVB=0.129431;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212435;OID=.;OPOS=102965435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:16:17:0:0:17:17:0:0 chr14 102965437 . A T 520.04 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.846;QD=59.4336;RBI=0.0209602;REFB=0;REVB=0.00247248;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160345;OID=.;OPOS=102965437;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr14 103161736 . A AG,G 1140.66 PASS AF=0.987342,0.0126582;AO=73,5;DP=80;FAO=78,1;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47,0;FSAR=31,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871661,-0.0130634;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=23.9909,5.39275;QD=57.7547;RBI=0.134877,0.163816;REFB=0,0;REVB=-0.134595,-0.163295;RO=1;SAF=47,0;SAR=26,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0178434,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00389734,0.0880265;OID=.,.;OPOS=103161737,103161736;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:79:1:0:73,5:78,1:0.987342,0.0126582:26,5:47,0:0:1:31,1:47,0:0:0 chr14 103193028 . G A 215.95 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0394593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7202;QD=15.1547;RBI=0.0399708;REFB=-0.0245963;REVB=0.00637428;RO=32;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596718;STB=0.533871;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0301484;OID=.;OPOS=103193028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:11:14:16:16:11:14:16:16 chr14 103195365 . G C 321.24 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00405163;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.753;QD=16.2652;RBI=0.0249622;REFB=-0.0355516;REVB=-0.0246312;RO=44;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261182;STB=0.514697;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0393741;OID=.;OPOS=103195365;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:20:15:20:24:20:15:20:24 chr14 103338324 . T A 1494.91 PASS AF=1;AO=82;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363923;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=34.5273;QD=62.288;RBI=0.103201;REFB=0;REVB=0.0965719;RO=1;SAF=39;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119881;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00561799;OID=.;OPOS=103338324;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:96:1:0:82:96:1:43:39:1:0:50:46:0:0 chr14 103342049 . T C,G 920.19 PASS AF=0.953125,0.046875;AO=61,3;DP=64;FAO=61,3;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22,3;FSAR=39,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00174568,-0.0210528;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.685,85.3466;QD=57.5118;RBI=0.0119992,0.0308563;REFB=0,0;REVB=0.0118716,0.0225587;RO=0;SAF=22,3;SAR=39,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=6.01474e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00225929,0.0835952;OID=.,.;OPOS=103342049,103342049;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:64:64:0:0:61,3:61,3:0.953125,0.046875:39,0:22,3:0:0:39,0:22,3:0:0 chr14 103370119 . C T 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.999;QD=63.8695;RBI=0.0750669;REFB=0;REVB=0.045004;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124098;OID=.;OPOS=103370119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0 chr14 103370163 . C T 887.31 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00746773;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.2;QD=56.3374;RBI=0.086586;REFB=-0.0192851;REVB=0.0862634;RO=1;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140901;STB=0.507244;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000336388;OID=.;OPOS=103370163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:63:1:1:61:62:0.984127:33:28:0:1:34:28:0:1 chr14 103440473 . G C 168.67 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0232201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.062;QD=16.0639;RBI=0.0452193;REFB=-0.0406563;REVB=-0.0388022;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966124;STB=0.555494;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0579036;OID=.;OPOS=103440473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:13:11:10:8:13:11 chr14 103566904 . G A 502.6 PASS AF=0.515152;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.00320272;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.113;QD=20.3069;RBI=0.0313204;REFB=-0.012319;REVB=0.0311563;RO=48;SAF=26;SAR=25;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120048;STB=0.566125;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0123128;OID=.;OPOS=103566904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:48:48:51:51:0.515152:25:26:31:17:25:26:31:17 chr14 103576395 . G A 418.59 PASS AF=0.413793;AO=48;DP=116;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=-0.0208534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1974;QD=14.4342;RBI=0.0456175;REFB=-0.028389;REVB=0.040572;RO=68;SAF=28;SAR=20;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207114;STB=0.61643;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0428884;OID=.;OPOS=103576395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:68:48:48:0.413793:20:28:26:42:20:28:26:42 chr14 103576415 . A G 558.43 PASS AF=0.586207;AO=51;DP=87;FAO=51;FDP=87;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0528982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5215;QD=25.675;RBI=0.0618702;REFB=-0.049755;REVB=0.032089;RO=36;SAF=17;SAR=34;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176577;STB=0.596735;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0255378;OID=.;OPOS=103576415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:36:36:51:51:0.586207:34:17:20:16:34:17:20:16 chr14 103576443 . TC CG 163.84 PASS AF=0.314286;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0141207;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=210.311;QD=9.36203;RBI=0.0339454;REFB=-0.00869964;REVB=-0.030869;RO=47;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28327;STB=0.66991;STBP=0.076;TYPE=mnp;VARB=0.0242521;OID=.;OPOS=103576443;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:47:48:22:22:0.314286:10:12:14:33:10:12:14:34 chr14 103576775 . C T 163.17 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0138303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.879;QD=14.5038;RBI=0.030502;REFB=-0.0107858;REVB=-0.0271863;RO=27;SAF=12;SAR=6;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305172;STB=0.676276;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0343168;OID=.;OPOS=103576775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:6:12:10:17:6:12:10:17 chr14 103593950 . C G 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0017214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.518;QD=20.7555;RBI=0.0110231;REFB=-0.0134501;REVB=-0.0108878;RO=12;SAF=11;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27002;STB=0.653837;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00873568;OID=.;OPOS=103593950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:4:11:5:7:4:11:5:7 chr14 103602278 . A G 210.72 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0201989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.665;QD=19.1559;RBI=0.0303632;REFB=-0.0234825;REVB=-0.02267;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285203;STB=0.660868;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0247849;OID=.;OPOS=103602278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:16:7:13:8:16:7 chr14 103852725 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.613;QD=57.8848;RBI=0.0426115;REFB=0;REVB=-9.47981e-05;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123933;OID=.;OPOS=103852725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0 chr14 103934488 . T C 994.23 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0043663;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=276.18;QD=57.6365;RBI=0.0053657;REFB=-0.0539253;REVB=-0.00311868;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145412;STB=0.50769;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=8.23695e-05;OID=.;OPOS=103934488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:32:36:0:1:32:36:0:1 chr14 103969909 . A G 328.77 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0131206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.121;QD=15.4716;RBI=0.0265014;REFB=-0.0177248;REVB=-0.0230256;RO=49;SAF=11;SAR=25;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138263;STB=0.578407;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0197051;OID=.;OPOS=103969909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:25:11:21:28:25:11:21:28 chr14 103986255 . C T 1480.77 PASS AF=0.990099;AO=97;DP=98;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0443228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.416;QD=58.6443;RBI=0.0601115;REFB=-0.0379938;REVB=0.0406065;RO=1;SAF=56;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083945;STB=0.504273;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.000462908;OID=.;OPOS=103986255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:101:1:1:97:100:0.990099:41:56:1:0:42:58:1:0 chr14 103996396 . G A 791.05 PASS AF=0.966102;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0666795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.98;QD=53.6302;RBI=0.0668761;REFB=-0.141323;REVB=0.00512438;RO=1;SAF=24;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192399;STB=0.502111;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00197948;OID=.;OPOS=103996396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:1:2:56:57:0.966102:32:24:1:0:32:25:1:1 chr14 104001517 . G A 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.00277023;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=217.498;QD=20.1601;RBI=0.0411332;REFB=-0.0146335;REVB=-0.0410398;RO=14;SAF=12;SAR=4;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224898;STB=0.624869;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0137856;OID=.;OPOS=104001517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:4:12:13:1:4:12:13:1 chr14 104025893 . T C 418.03 PASS AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0168119;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.917;QD=19.906;RBI=0.0168431;REFB=0.00223862;REVB=-0.00102503;RO=40;SAF=28;SAR=14;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406023;STB=0.526303;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00220238;OID=.;OPOS=104025893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:40:42:42:42:0.5:14:28:25:15:14:28:26:16 chr14 104028270 . T C 377.92 PASS AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00163901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.072;QD=24.3822;RBI=0.0570243;REFB=0.0048558;REVB=0.0570007;RO=25;SAF=22;SAR=15;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262009;STB=0.514381;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.00385174;OID=.;OPOS=104028270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:15:22:14:11:15:22:14:11 chr14 104029449 . G A 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.014896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6043;QD=16.199;RBI=0.0293846;REFB=0.0537791;REVB=0.0253291;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.0276595;OID=.;OPOS=104029449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:2:1:3:2:2:1 chr14 104167075 . C T 409.72 PASS AF=0.47191;AO=41;DP=88;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.078495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6923;QD=18.4145;RBI=0.0809692;REFB=-0.0210603;REVB=-0.0198632;RO=44;SAF=17;SAR=24;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493385;STB=0.500278;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0184977;OID=.;OPOS=104167075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:44:47:41:42:0.47191:24:17:16:28:25:17:19:28 chr14 104167545 . G A 90.72 PASS AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.00509905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4906;QD=8.06432;RBI=0.00812427;REFB=-0.00390229;REVB=-0.00632483;RO=33;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237397;STB=0.644224;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00405473;OID=.;OPOS=104167545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:6:6:10:23:6:6:10:23 chr14 104178186 . A G 179.94 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0149585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9128;QD=14.1128;RBI=0.0179221;REFB=-0.00370086;REVB=0.00987132;RO=30;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925042;STB=0.553022;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00984664;OID=.;OPOS=104178186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:10:11:13:17:10:11:13:17 chr14 104178445 . G GGCCCGGCGTGGA 311.37 PASS AF=1;AO=20;DP=26;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155932;FXX=0;HRUN=2;LEN=12;MLLD=460.347;QD=51.8944;RBI=0.0096288;REFB=0;REVB=0.0095017;RO=2;SAF=7;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11466;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000159236;OID=.;OPOS=104178446;OREF=-;OALT=GCCCGGCGTGGA;OMAPALT=GGCCCGGCGTGGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:26:24:24:0:8:16:0:0:4:2:7:13:2:0 chr14 104194196 . C G 1584.25 PASS AF=0.990741;AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00466654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.56;QD=58.676;RBI=0.0214102;REFB=-0.124964;REVB=0.0208955;RO=2;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193615;STB=0.50505;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000738793;OID=.;OPOS=104194196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:108:108:2:1:106:107:0.990741:48:58:0:2:49:58:0:1 chr14 104199356 . C T 337.08 PASS AF=0.566667;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00774461;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4805;QD=22.4721;RBI=0.0222;REFB=0.0153329;REVB=0.0208053;RO=27;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867016;STB=0.555523;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.0120212;OID=.;OPOS=104199356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:27:26:34:34:0.566667:20:14:14:13:20:14:14:12 chr14 104429453 . A G 1344.8 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.681;QD=61.8301;RBI=0.0307524;REFB=0;REVB=0.0268274;RO=1;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920002;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34615e-05;OID=.;OPOS=104429453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:1:0:86:87:1:51:35:0:1:52:35:0:0 chr14 104465037 . T C 1290.53 PASS AF=0.955556;AO=86;DP=90;FAO=86;FDP=90;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0368935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1333;QD=57.357;RBI=0.0901218;REFB=0.0466829;REVB=0.0822242;RO=4;SAF=37;SAR=49;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02731;STB=0.514432;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0175926;OID=.;OPOS=104465037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:90:90:4:4:86:86:0.955556:49:37:3:1:49:37:3:1 chr14 104480071 . G A 288.82 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.00965031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.59;QD=16.2716;RBI=0.0224796;REFB=-0.00528256;REVB=-0.0203028;RO=39;SAF=8;SAR=24;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254158;STB=0.514277;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00634994;OID=.;OPOS=104480071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:24:8:9:30:24:8:9:30 chr14 104480201 . C A 1370.12 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.116;QD=62.2783;RBI=0.039101;REFB=0;REVB=0.00565004;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119106;OID=.;OPOS=104480201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:53:35:0:0:53:35:0:0 chr14 104481083 . T C 322.66 PASS AF=0.5;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0404987;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.793;QD=18.9797;RBI=0.0776883;REFB=-0.017738;REVB=0.0662973;RO=33;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703244;STB=0.545187;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.020163;OID=.;OPOS=104481083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:33:34:34:34:0.5:15:19:21:12:15:19:22:12 chr14 104497543 . C T 422.94 PASS AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.00153671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1932;QD=18.3888;RBI=0.00799331;REFB=-0.00964136;REVB=0.00784421;RO=49;SAF=15;SAR=28;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402747;STB=0.522492;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.011746;OID=.;OPOS=104497543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:49:43:43:0.467391:28:15:19:30:28:15:19:30 chr14 104559552 . G C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.279;QD=60.2307;RBI=0.0194442;REFB=0;REVB=-0.000677468;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.05563e-05;OID=.;OPOS=104559552;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr14 104559623 . T C 1377.48 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.2;QD=62.6126;RBI=0.0559364;REFB=0;REVB=0.0558431;RO=0;SAF=53;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011555;OID=.;OPOS=104559623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:35:53:0:0:35:53:0:0 chr14 104559852 . T C 709.35 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.058404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3393;QD=54.5652;RBI=0.0739932;REFB=0.00171847;REVB=-0.0454309;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5098;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00155976;OID=.;OPOS=104559852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:25:26:0:0:25:26:0:1 chr14 104559919 . T C 538.34 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0776651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2532;QD=59.8155;RBI=0.0788678;REFB=0;REVB=-0.0137208;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157647;OID=.;OPOS=104559919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr14 104559922 . C G 490.38 PASS AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00178613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.406;QD=56.043;RBI=0.00347411;REFB=-0.168154;REVB=0.00297979;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000692696;OID=.;OPOS=104559922;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:18:16:0:0:18:16:0:1 chr14 104563932 . G C,T 1233.97 PASS AF=0.0361446,0.963855;AO=3,78;DP=82;FAO=3,80;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=3,24;FSAR=0,56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147774,0.018688;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.4636,130.813;QD=59.4685;RBI=0.0161222,0.0310467;REFB=-0.0211262,-0.0491481;REVB=0.00644612,0.0247922;RO=1;SAF=3,22;SAR=0,56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0210255;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00786823,-0.00014552;OID=.,.;OPOS=104563932,104563932;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:82:83:1:0:3,78:3,80:0.0361446,0.963855:0,56:3,22:1:0:0,56:3,24:0:0 chr14 104641792 . C T 343.11 PASS AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00551343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.312;QD=31.192;RBI=0.00685942;REFB=-0.0147609;REVB=-0.0040809;RO=15;SAF=16;SAR=13;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072947;STB=0.539909;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00895024;OID=.;OPOS=104641792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:13:16:10:5:13:16:10:5 chr14 104642341 . A G 346.92 PASS AF=0.394231;AO=40;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=7;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=-0.0377703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.697;QD=13.343;RBI=0.0384724;REFB=-0.0161639;REVB=-0.00731607;RO=62;SAF=6;SAR=34;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295393;STB=0.641431;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0239756;OID=.;OPOS=104642341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:63:40:41:0.394231:34:6:21:41:34:7:21:42 chr14 104643409 . A G 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00903357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.282;QD=18.2487;RBI=0.0152192;REFB=-0.0268746;REVB=0.0122482;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991777;STB=0.556873;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0411324;OID=.;OPOS=104643409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:6:6:5:8:6:6 chr14 104643421 . T C 100.72 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0315654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.556;QD=16.1148;RBI=0.0330903;REFB=-0.0240591;REVB=0.00992931;RO=13;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122788;STB=0.571306;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0224445;OID=.;OPOS=104643421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:4:8:7:6:4:8:7:6 chr14 104643721 . C A 180.07 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0271728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.935;QD=23.2346;RBI=0.0276918;REFB=-0.0247058;REVB=0.00533621;RO=13;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650504;STB=0.536359;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0199785;OID=.;OPOS=104643721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:11:7:4:9:11:7:4:9 chr14 104643859 . A G 142.69 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0104502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.709;QD=22.831;RBI=0.0173108;REFB=-0.0321886;REVB=0.0138007;RO=10;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196568;STB=0.610959;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0238789;OID=.;OPOS=104643859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:5:10:4:6:5:10:4:6 chr14 104646326 . A C 194.51 PASS AF=0.434783;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00734052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.481;QD=16.9135;RBI=0.00898162;REFB=-0.0243632;REVB=-0.00517554;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00208611;STB=0.515403;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.030183;OID=.;OPOS=104646326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:26:26:19:20:0.434783:11:8:11:15:11:9:11:15 chr14 104646330 . G C 206.08 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00256057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.44;QD=16.8229;RBI=0.0299603;REFB=-0.0149138;REVB=-0.0298507;RO=28;SAF=10;SAR=11;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478369;STB=0.527318;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0248079;OID=.;OPOS=104646330;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:11:10:12:16:11:10:12:16 chr14 104646771 . T C 330.6 PASS AF=0.589286;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.016002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9927;QD=23.6146;RBI=0.10477;REFB=0.0221374;REVB=-0.103541;RO=22;SAF=18;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662171;STB=0.527671;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.0176239;OID=.;OPOS=104646771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:22:23:33:33:0.589286:15:18:10:12:15:18:11:12 chr14 104647224 . C T 417.85 PASS AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0324307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3105;QD=19.8976;RBI=0.0325468;REFB=0.010403;REVB=0.00274613;RO=42;SAF=20;SAR=22;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128272;STB=0.571073;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00868425;OID=.;OPOS=104647224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:22:20:26:16:22:20:26:16 chr14 104710651 . C T 234.86 PASS AF=0.869565;AO=21;DP=23;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0131185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8823;QD=40.8443;RBI=0.108559;REFB=-0.0451925;REVB=-0.107764;RO=1;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102024;STB=0.666473;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00814436;OID=.;OPOS=104710651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:23:23:1:3:21:20:0.869565:4:17:0:1:3:17:0:3 chr14 104941016 . G A 206.32 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0386267;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.5623;QD=24.2729;RBI=0.0398596;REFB=-0.0658267;REVB=0.00983685;RO=10;SAF=10;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602408;STB=0.529382;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0478477;OID=.;OPOS=104941016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:10:14:20:20:0.588235:10:10:4:6:10:10:6:8 chr14 105054934 . A G 61.02 PASS AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.149;QD=34.8668;RBI=0.0200934;REFB=0;REVB=0.0151184;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143316;OID=.;OPOS=105054934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0 chr14 105055118 . TGACGGGCAG T 616.42 PASS AF=0.893617;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=47;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0242441;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=9;MLLD=316.355;QD=52.4616;RBI=0.0731537;REFB=-0.0590502;REVB=0.0690194;RO=0;SAF=32;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96961e-08;STB=0.505615;STBP=0.876;TYPE=del;VARB=0.00603228;OID=.;OPOS=105055119;OREF=GACGGGCAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.893617:42:44:42:47:5:32:10:4:1:26:0:32:10:0:0 chr14 105167807 . C T 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127559;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.548;QD=57.2369;RBI=0.0163707;REFB=0;REVB=0.010261;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67175e-05;OID=.;OPOS=105167807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0 chr14 105177351 . CA C,CG 2015.3 PASS AF=0.925373,0.0746269;AO=116,15;DP=134;FAO=124,10;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=55,2;FSAR=69,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188282,0.0180984;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.74,90.2065;QD=60.1581;RBI=0.0246462,0.0274331;REFB=0,0;REVB=0.0159039,0.0206161;RO=0;SAF=52,4;SAR=64,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.15413e-08,3.33019e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000648864,-0.0140203;OID=.,.;OPOS=105177352,105177352;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.925373,0.0746269:116,15:134:124,10:134:0:55,2:69,8:0:0:25:0:52,4:64,11:0:0 chr14 105179194 . T C 1495.92 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00524404;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.032;QD=63.656;RBI=0.0234735;REFB=0;REVB=0.0228802;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166211;OID=.;OPOS=105179194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:47:47:0:0:47:47:0:0 chr14 105180565 . T C 875.4 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6676;QD=57.4035;RBI=0.0589475;REFB=0;REVB=-0.0266364;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184332;OID=.;OPOS=105180565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:61:0:0:57:61:1:37:20:0:0:37:24:0:0 chr14 105180706 . A C 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.561;QD=58.4196;RBI=0.0188238;REFB=0;REVB=0.00833386;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16234e-05;OID=.;OPOS=105180706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0 chr14 105196230 . A C 163.16 PASS AF=0.9375;AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0537052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.685;QD=40.7894;RBI=0.0659546;REFB=-0.145426;REVB=0.0382853;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523778;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0313835;OID=.;OPOS=105196230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:0:1:14:15:0.9375:5:9:0:0:5:10:1:0 chr14 105196235 . G A 340.09 PASS AF=0.928571;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0237216;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.8879;QD=48.5845;RBI=0.0536742;REFB=-0.122277;REVB=0.0481478;RO=2;SAF=11;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771382;STB=0.538432;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00371493;OID=.;OPOS=105196235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:27:28:2:2:25:26:0.928571:14:11:2:0:14:12:2:0 chr14 105196365 . T C 1704.26 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.269;QD=59.7986;RBI=0.012276;REFB=0;REVB=0.00558207;RO=0;SAF=47;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.8673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.11282e-06;OID=.;OPOS=105196365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:114:0:0:112:114:1:65:47:0:0:65:49:0:0 chr14 105211221 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.302;QD=56.9383;RBI=0.0178349;REFB=0;REVB=0.0131955;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5993e-05;OID=.;OPOS=105211221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0 chr14 105213343 . A G 768.34 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0826737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9904;QD=54.8817;RBI=0.0829192;REFB=-0.021036;REVB=-0.00637571;RO=1;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149647;STB=0.507934;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00145592;OID=.;OPOS=105213343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:31:24:0:1:31:24:0:1 chr14 105220209 . G GA 1585.85 PASS AF=0.991525;AO=38;DP=140;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0686458;FXX=0.112773;HRUN=0;LEN=1;MLLD=190.075;QD=53.7576;RBI=0.0775358;REFB=0.125036;REVB=-0.0360493;RO=102;SAF=25;SAR=13;SRF=44;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276582;STB=0.504131;STBP=0.495;TYPE=ins;VARB=-0.0076896;OID=.;OPOS=105220210;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.991525:38:140:117:118:1:60:57:1:0:5:102:25:13:44:58 chr14 105220210 . G A 1067.73 PASS AF=0.669173;AO=89;DP=134;FAO=89;FDP=133;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0333362;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.899;QD=32.1121;RBI=0.0512205;REFB=-0.0948318;REVB=0.0388875;RO=40;SAF=36;SAR=53;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142621;STB=0.562464;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00534672;OID=.;OPOS=105220210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:40:44:89:89:0.669173:53:36:26:14:53:36:26:18 chr14 105222037 . C T 3114.54 PASS AF=0.990291;AO=204;DP=206;FAO=204;FDP=206;FR=.;FRO=2;FSAF=91;FSAR=113;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0446714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.397;QD=60.4765;RBI=0.0460129;REFB=-0.0571884;REVB=0.0110298;RO=0;SAF=91;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11724e-08;STB=0.50053;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000681957;OID=.;OPOS=105222037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:206:206:0:2:204:204:0.990291:113:91:0:0:113:91:1:1 chr14 105223668 . G A 348.13 PASS AF=0.39604;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.000589492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.499;QD=13.7871;RBI=0.00877717;REFB=-0.0121883;REVB=0.00875736;RO=59;SAF=16;SAR=24;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133198;STB=0.566232;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0163322;OID=.;OPOS=105223668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:59:61:40:40:0.39604:24:16:31:28:24:16:31:30 chr14 105235923 . TC T 76.72 PASS AF=0.526316;AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0240336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.814;QD=16.1515;RBI=0.0355968;REFB=-0.0126995;REVB=0.0262587;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283852;STB=0.624753;STBP=0.307;TYPE=del;VARB=0.0159926;OID=.;OPOS=105235924;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.526316:9:18:10:19:9:6:4:3:6:67:9:6:3:3:6 chr14 105239894 . C T 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.267;QD=40.76;RBI=0.0838261;REFB=0;REVB=0.0662348;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127647;OID=.;OPOS=105239894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr14 105309608 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0969351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.111;QD=33.4284;RBI=0.0970289;REFB=0;REVB=-0.00426491;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00893447;OID=.;OPOS=105309608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr14 105309965 . C CA 127.43 PASS AF=1;AO=2;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112659;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=83.7821;QD=39.2094;RBI=0.115397;REFB=0;REVB=0.024989;RO=11;SAF=0;SAR=2;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496917;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00130008;OID=.;OPOS=105309966;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:13:13:13:0:3:10:0:0:4:11:0:2:3:8 chr14 105309966 . G A 105.15 PASS AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0388085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.74;QD=32.3545;RBI=0.0431341;REFB=-0.0944257;REVB=0.0188269;RO=2;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998761;STB=0.55546;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00612904;OID=.;OPOS=105309966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:8:3:0:2:8:3:0:2 chr14 105310163 . G A 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0811892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1076;QD=45.8017;RBI=0.0877105;REFB=0;REVB=0.033188;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00557355;OID=.;OPOS=105310163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0 chr14 105310258 . GCCTCCCCTCCCCTC GCCTCCCCT,GCCTCCCCTC 225.82 PASS AF=0,1;AO=5,12;DP=22;FAO=0,20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316168,0.0474901;FXX=0.0908678;HRUN=4,4;LEN=6,5;MLLD=122.957,139.085;QD=45.1641;RBI=0.0326365,0.0506902;REFB=0,0;REVB=0.00809451,0.0177252;RO=0;SAF=5,5;SAR=0,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000403022;OID=.,.;OPOS=105310267,105310259;OREF=CCCCTC,CCTCC;OALT=-,-;OMAPALT=GCCTCCCCT,GCCTCCCCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:5,12:22:0,20:20:0:0,12:0,8:0:0:4:0:5,5:0,7:0:0 chr14 105310498 . T C 767.67 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0540333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1947;QD=56.8641;RBI=0.140892;REFB=0;REVB=-0.130119;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00232243;OID=.;OPOS=105310498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chr14 105310677 . T G 306.71 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.375;QD=53.3399;RBI=0.108742;REFB=0;REVB=0.0266607;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240011;OID=.;OPOS=105310677;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:17:5:0:0:17:6:0:0 chr14 105312054 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.354;QD=57.2026;RBI=0.0141516;REFB=0;REVB=0.01118;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12216e-06;OID=.;OPOS=105312054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr14 105312067 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.82;QD=58.5877;RBI=0.027306;REFB=0;REVB=0.0243962;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173848;OID=.;OPOS=105312067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0 chr14 105353460 . G A 111.41 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00696464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.029;QD=15.916;RBI=0.0131496;REFB=-0.0192201;REVB=0.0111537;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057665;STB=0.533283;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0306823;OID=.;OPOS=105353460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:9:6:6:7:9:6 chr14 105393556 . G C 828.95 PASS AF=0.983607;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0704849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6451;QD=54.3575;RBI=0.0732012;REFB=-0.124794;REVB=0.0197559;RO=2;SAF=32;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285773;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0020641;OID=.;OPOS=105393556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:61:2:1:59:60:0.983607:27:32:2:0:27:33:1:0 chr14 105404585 . CA C,TA 33.96 PASS AF=0.153846,0.0384615;AO=13,2;DP=55;FAO=8,2;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=2,0;FSAR=6,2;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.200391,-0.0180134;FXX=0.0545355;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=12.5031,117.312;QD=2.61262;RBI=0.22374,0.018807;REFB=-0.0312374,-0.00637967;REVB=0.0995147,-0.00540541;RO=35;SAF=7,0;SAR=6,2;SRF=9;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.333739,-0.348565;STB=0.606857,0.993484;STBP=0.579,0.197;TYPE=del,snp;VARB=0.047817,0.0998074;OID=.,.;OPOS=105404586,105404585;OREF=A,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:55:52:35:42:13,2:8,2:0.153846,0.0384615:6,2:7,0:9:26:6,2:2,0:15:27 chr14 105410913 . G A 217.82 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00584853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.759;QD=16.755;RBI=0.00691544;REFB=-0.0168372;REVB=0.00369026;RO=28;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339897;STB=0.519215;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0162565;OID=.;OPOS=105410913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:12:12:15:13:12:12:15:13 chr14 105411163 . A G 176.31 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00114598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.866;QD=20.7417;RBI=0.00686269;REFB=-0.0404608;REVB=-0.00676633;RO=15;SAF=6;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16938;STB=0.612117;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0205955;OID=.;OPOS=105411163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:12:6:8:7:12:6:9:7 chr14 105412779 . C G 287.44 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0125384;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.514;QD=18.2499;RBI=0.0300388;REFB=-0.0265731;REVB=0.0272969;RO=32;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996544;STB=0.555633;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0284932;OID=.;OPOS=105412779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:32:32:31:31:0.492063:16:15:19:13:16:15:19:13 chr14 105414280 . T G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00272618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.511;QD=57.1772;RBI=0.0206941;REFB=0;REVB=-0.0205138;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125448;OID=.;OPOS=105414280;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0 chr14 105414804 . A G 1139.07 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0228653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.888;QD=59.1723;RBI=0.0322895;REFB=-0.0990738;REVB=-0.0227989;RO=1;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155115;STB=0.508195;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000418843;OID=.;OPOS=105414804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:30:46:0:1:30:46:0:1 chr14 105415352 . G C 1600.15 PASS AF=0.981818;AO=105;DP=109;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0363224;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.43;QD=58.1872;RBI=0.0594518;REFB=-0.0178112;REVB=0.0470659;RO=2;SAF=56;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166453;STB=0.508619;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000203588;OID=.;OPOS=105415352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:109:110:2:2:105:108:0.981818:49:56:2:0:51:57:2:0 chr14 105415928 . T C 158.67 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0391649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.344;QD=17.1531;RBI=0.0475079;REFB=-0.0260862;REVB=-0.0268906;RO=20;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168577;STB=0.596104;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0259253;OID=.;OPOS=105415928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:8:9:7:13:8:9:7:13 chr14 105416220 . T A 961.94 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.012342;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.651;QD=57.4293;RBI=0.0877924;REFB=-0.150582;REVB=0.0869205;RO=1;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133089;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00132389;OID=.;OPOS=105416220;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:67:1:1:66:66:0.985075:35:31:0:1:35:31:0:1 chr14 105416230 . A C,G 987.28 PASS AF=0.0294118,0.970588;AO=3,64;DP=68;FAO=2,66;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=1,30;FSAR=1,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137303,0.104846;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=135.191,76.3383;QD=58.0754;RBI=0.0181234,0.105022;REFB=0,0;REVB=0.0118295,-0.00608036;RO=0;SAF=2,29;SAR=1,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0752443,0.000160913;OID=.,.;OPOS=105416230,105416230;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:68:68:0:0:3,64:2,66:0.0294118,0.970588:1,35:2,29:0:0:1,36:1,30:0:0 chr14 105416675 . C G 747.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.404;QD=63.6425;RBI=0.052386;REFB=0;REVB=0.0507491;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414544;OID=.;OPOS=105416675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:17:29:0:0:18:29:0:0 chr14 105416875 . G A 453.53 PASS AF=0.589041;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=7.1889e-05;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.902;QD=24.8507;RBI=0.0171215;REFB=-0.0201886;REVB=0.0171213;RO=29;SAF=26;SAR=17;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392606;STB=0.526942;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0170822;OID=.;OPOS=105416875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:29:30:43:43:0.589041:17:26:19:10:17:26:20:10 chr14 105417208 . A C 373.61 PASS AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00411433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.289;QD=23.3504;RBI=0.00443512;REFB=-0.0317416;REVB=0.00165608;RO=27;SAF=21;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936804;STB=0.505152;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0239852;OID=.;OPOS=105417208;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:16:21:15:12:16:21:15:12 chr14 105417894 . C G 323.47 PASS AF=1;AO=22;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.169;QD=53.9112;RBI=0.0407566;REFB=0;REVB=0.0153431;RO=1;SAF=13;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342405;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268908;OID=.;OPOS=105417894;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:1:0:22:24:1:9:13:1:0:9:15:0:0 chr14 105418275 . T C 673.89 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0586007;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.417;QD=62.6877;RBI=0.0699197;REFB=0;REVB=0.0381408;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103885;OID=.;OPOS=105418275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr14 105461067 . C T 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00393659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.841;QD=57.2376;RBI=0.00445327;REFB=0;REVB=-0.00208205;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10482e-06;OID=.;OPOS=105461067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0 chr14 105477180 . A G 187.84 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.013758;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.6793;QD=10.8892;RBI=0.0171932;REFB=-0.0195835;REVB=0.0103114;RO=44;SAF=9;SAR=15;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041049;STB=0.513607;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0253771;OID=.;OPOS=105477180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:44:45:24:24:0.347826:15:9:15:29:15:9:16:29 chr14 105477613 . T C 96.17 PASS AF=0.5;AO=8;DP=22;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00489898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.381;QD=16.0283;RBI=0.0187948;REFB=-0.0312045;REVB=0.0181451;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192383;STB=0.599822;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0241118;OID=.;OPOS=105477613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:22:24:12:12:8:12:0.5:6:2:5:7:9:3:5:7 chr14 105478102 . G A 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0180892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.387;QD=25.6506;RBI=0.0320555;REFB=-0.00626819;REVB=0.0264638;RO=18;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192718;STB=0.605983;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00655182;OID=.;OPOS=105478102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:10:15:15:3:10:15:15:3 chr14 105518336 . G T 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00657725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.942;QD=11.6336;RBI=0.0110717;REFB=-0.0218412;REVB=0.00890633;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336027;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0301178;OID=.;OPOS=105518336;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:5:5:8:7:5:5:8:8 chr14 105608921 . G GT 35.4 PASS AF=0.382353;AO=12;DP=35;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0160292;FXX=0.0555401;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.1032;QD=4.16504;RBI=0.0216816;REFB=-0.0578098;REVB=0.0145999;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153067;STB=0.558049;STBP=0.677;TYPE=ins;VARB=0.0395737;OID=.;OPOS=105608922;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.382353:12:35:13:34:21:8:5:11:10:35:19:8:4:10:9 chr14 105609335 . A G 187.92 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0067727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.373;QD=20.3152;RBI=0.0607985;REFB=-0.00808838;REVB=-0.0604201;RO=18;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173386;STB=0.509794;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00779014;OID=.;OPOS=105609335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:13:6:6:12:13:6:6:12 chr14 105611282 . A G 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0100008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.776;QD=17.6173;RBI=0.0141828;REFB=-0.00942345;REVB=-0.0100567;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137635;STB=0.577824;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0101725;OID=.;OPOS=105611282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:9:15:13:14:9:15:13:14 chr14 105615648 . C T 227.02 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0253543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.853;QD=13.5533;RBI=0.0254792;REFB=0.0125008;REVB=-0.00252046;RO=40;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593056;STB=0.533826;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.0155528;OID=.;OPOS=105615648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:14:13:17:23:14:13:17:23 chr14 105643619 . G A 105.85 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00732066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.816;QD=21.1705;RBI=0.00768417;REFB=-0.0202064;REVB=-0.00233549;RO=8;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303028;STB=0.517213;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0248747;OID=.;OPOS=105643619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:7:5:3:5:7:5:3:5 chr14 105643652 . A C 83.56 PASS AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00534831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.391;QD=20.8895;RBI=0.0314012;REFB=-0.0776964;REVB=0.0309424;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584143;STB=0.562377;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0489559;OID=.;OPOS=105643652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:5:6:10:10:0.625:5:5:2:3:5:5:2:4 chr14 105916420 . C T 860.22 PASS AF=0.968254;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0132806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.549;QD=54.6168;RBI=0.0265326;REFB=-0.0711609;REVB=0.0229696;RO=2;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50026;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000932443;OID=.;OPOS=105916420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:62:63:2:2:60:61:0.968254:30:30:1:1:30:31:1:1 chr14 105930406 . G A 260.55 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.000298818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.555;QD=14.4747;RBI=0.00760849;REFB=-0.0127188;REVB=0.00760262;RO=41;SAF=7;SAR=23;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339284;STB=0.688914;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.022183;OID=.;OPOS=105930406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:42:30:30:0.416667:23:7:22:19:23:7:22:20 chr14 105935824 . G A 499.69 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0145184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.336;QD=54.02;RBI=0.0395223;REFB=-0.149054;REVB=0.036759;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520822;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00514237;OID=.;OPOS=105935824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:37:37:0:2:35:35:0.945946:23:12:0:0:23:12:0:2 chr14 105962234 . T C 890.45 PASS AF=1;AO=60;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.523;QD=57.4485;RBI=0.0149429;REFB=0;REVB=-0.00730349;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147853;OID=.;OPOS=105962234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:60:62:1:25:35:0:0:27:35:0:0 chr14 105962369 . A G 1208.94 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.403;QD=61.212;RBI=0.0175051;REFB=0;REVB=-0.0165643;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44482e-05;OID=.;OPOS=105962369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:51:28:0:0:51:28:0:0 chr14 105995534 . G A 147.66 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00448302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.337;QD=26.8477;RBI=0.133563;REFB=-0.0576313;REVB=0.133488;RO=7;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993172;STB=0.555481;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0167646;OID=.;OPOS=105995534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:6:9:3:4:6:9:3:4 chr14 106053491 . C T 756.88 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0163497;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.118;QD=55.046;RBI=0.0464207;REFB=0.0736408;REVB=0.0434462;RO=1;SAF=33;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140687;STB=0.50746;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.000889359;OID=.;OPOS=106053491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:55:1:1:54:54:0.981818:21:33:1:0:21:33:1:0 chr14 106053559 . A G 160.25 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00187123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.882;QD=45.7844;RBI=0.00337407;REFB=0;REVB=-0.00280764;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.94108e-05;OID=.;OPOS=106053559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr14 106053577 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1576;QD=40.7628;RBI=0.0389064;REFB=0;REVB=0.0358445;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836243;OID=.;OPOS=106053577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr14 106053975 . G A 1155.18 PASS AF=0.695652;AO=95;DP=139;FAO=96;FDP=138;FR=.;FRO=42;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00108042;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1492;QD=33.4833;RBI=0.0360864;REFB=-0.060096;REVB=0.0360702;RO=41;SAF=47;SAR=48;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00980417;STB=0.503171;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0279487;OID=.;OPOS=106053975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:41:42:95:96:0.695652:48:47:21:20:49:47:21:21 chr14 106054456 . A G 36.61 PASS AF=0.111111;AO=8;DP=72;FAO=8;FDP=72;FR=.;FRO=64;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=46;FWDB=-0.0517361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0504;QD=2.03372;RBI=0.0600309;REFB=0.0044118;REVB=-0.0304482;RO=64;SAF=3;SAR=5;SRF=18;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126534;STB=0.592809;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.0493737;OID=.;OPOS=106054456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:72:72:64:64:8:8:0.111111:5:3:18:46:5:3:18:46 chr14 106054568 . A G 1765.86 PASS AF=0.701422;AO=147;DP=211;FAO=148;FDP=211;FR=.;FRO=63;FSAF=56;FSAR=92;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0129287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.822;QD=33.476;RBI=0.0138147;REFB=-0.0514523;REVB=0.00486764;RO=63;SAF=56;SAR=91;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920125;STB=0.54994;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0193111;OID=.;OPOS=106054568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:63:63:147:148:0.701422:91:56:34:29:92:56:34:29 chr14 106066454 . T C 1472.53 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00563079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.162;QD=63.3346;RBI=0.0301126;REFB=0;REVB=0.0295814;RO=0;SAF=50;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43026e-05;OID=.;OPOS=106066454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:43:50:0:0:43:50:0:0 chr14 106066690 . A C 82.22 PASS AF=0.9;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.916;QD=32.8891;RBI=0.0304382;REFB=-0.0388516;REVB=0.021937;RO=1;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599759;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00281909;OID=.;OPOS=106066690;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:10:1:1:8:9:0.9:6:2:1:0:7:2:1:0 chr14 106067298 . T C 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00144532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.498;QD=58.0606;RBI=0.0119192;REFB=0;REVB=0.0118312;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48488e-05;OID=.;OPOS=106067298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0 chr14 106067958 . C G,T 4528.36 PASS AF=0.0369128,0.949664;AO=11,282;DP=297;FAO=11,283;FDP=298;FR=.;FRO=4;FSAF=0,114;FSAR=11,169;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0512121,0.0198212;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=13.3006,257.31;QD=60.7834;RBI=0.062686,0.0205456;REFB=-0.0593575,-0.0992737;REVB=-0.0361505,0.00540748;RO=2;SAF=0,113;SAR=11,169;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.831607,-0.00836397;STB=0.998538,0.505018;STBP=0.003,0.176;TYPE=snp,snp;VARB=0.248242,-1.75645e-05;OID=.,.;OPOS=106067958,106067958;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:297:298:2:4:11,282:11,283:0.0369128,0.949664:11,169:0,113:2:0:11,169:0,114:3:1 chr14 106090823 . A G 49.04 PASS AF=0.16;AO=8;DP=51;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.039475;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.766;QD=3.92312;RBI=0.0397236;REFB=-0.00154907;REVB=-0.00443719;RO=43;SAF=1;SAR=7;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46065;STB=0.834301;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00459056;OID=.;OPOS=106090823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:51:50:43:42:8:8:0.16:7:1:20:23:7:1:20:22 chr14 106090846 . T C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00363693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.082;QD=57.5451;RBI=0.00877982;REFB=0;REVB=0.00799112;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32121e-05;OID=.;OPOS=106090846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0 chr14 106090927 . G T 1587.67 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.774;QD=64.1484;RBI=0.0367653;REFB=0;REVB=0.00528997;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.43915e-05;OID=.;OPOS=106090927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:43:55:0:0:44:55:0:0 chr14 106091329 . G C 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5521;QD=58.6003;RBI=0.0642293;REFB=0;REVB=0.0374703;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000872961;OID=.;OPOS=106091329;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0 chr14 106091504 . A G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.668;QD=51.9167;RBI=0.0249197;REFB=0;REVB=-0.0201997;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.52195e-05;OID=.;OPOS=106091504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr14 106091697 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4161;QD=47.8222;RBI=0.0662457;REFB=0;REVB=0.0155086;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00292876;OID=.;OPOS=106091697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0 chr14 106091743 . CA C 120.19 PASS AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206739;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.326;QD=43.7059;RBI=0.0216215;REFB=0;REVB=0.00633091;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000267464;OID=.;OPOS=106091744;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:11:12:11:11:0:9:2:0:0:4:0:9:2:0:0 chr14 106092152 . G A 802.41 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000687366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.874;QD=57.3147;RBI=0.0330815;REFB=0;REVB=0.0330744;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122685;OID=.;OPOS=106092152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:21:33:0:0:22:34:0:0 chr14 106109752 . A C 2002.39 PASS AF=0.984848;AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=92;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0492606;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1924;QD=60.6784;RBI=0.0495791;REFB=-0.0310804;REVB=0.00561077;RO=2;SAF=92;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102194;STB=0.505376;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00106913;OID=.;OPOS=106109752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:132:2:2:130:130:0.984848:38:92:2:0:38:92:2:0 chr14 106110137 . C T 3058.84 PASS AF=1;AO=193;DP=194;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183017;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.525;QD=63.3957;RBI=0.0286497;REFB=0.0211695;REVB=0.022042;RO=0;SAF=91;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29097e-05;OID=.;OPOS=106110137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:194:193:0:0:193:193:1:102:91:0:0:102:91:0:0 chr14 106110914 . G T 3204.67 PASS AF=0.972477;AO=212;DP=218;FAO=212;FDP=218;FR=.;FRO=6;FSAF=99;FSAR=113;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0114759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.637;QD=58.8013;RBI=0.0406342;REFB=-0.152078;REVB=0.0389801;RO=1;SAF=99;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419743;STB=0.503696;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000784056;OID=.;OPOS=106110914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:218:218:1:6:212:212:0.972477:113:99:0:1:113:99:2:4 chr14 106173722 . C T 33.29 PASS AF=0.0813008;AO=10;DP=121;FAO=10;FDP=123;FR=.;FRO=113;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=62;FSRR=51;FWDB=-0.00217057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.605;QD=1.08275;RBI=0.0359659;REFB=-0.00127942;REVB=-0.0359004;RO=110;SAF=2;SAR=8;SRF=61;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392678;STB=0.81209;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0258835;OID=.;OPOS=106173722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:121:123:110:113:10:10:0.0813008:8:2:61:49:8:2:62:51 chr14 106173790 . A G 640.92 PASS AF=0.768116;AO=53;DP=69;FAO=53;FDP=69;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0430701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0617;QD=37.1548;RBI=0.0433942;REFB=-0.0314937;REVB=0.00529338;RO=16;SAF=19;SAR=34;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517763;STB=0.527767;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00924978;OID=.;OPOS=106173790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:16:16:53:53:0.768116:34:19:4:12:34:19:4:12 chr14 106188230 . C T 594.87 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.41;QD=61.0119;RBI=0.124362;REFB=0;REVB=0.000915166;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399641;OID=.;OPOS=106188230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:23:15:0:0:23:16:0:0 chr14 106204113 . C T 1700.36 PASS AF=0.991228;AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0222767;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.266;QD=59.6616;RBI=0.0236808;REFB=-0.0587463;REVB=0.00803308;RO=0;SAF=50;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33068e-08;STB=0.503936;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=1.39799e-05;OID=.;OPOS=106204113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:114:0:1:113:113:0.991228:63:50:0:0:63:50:0:1 chr14 106207843 . T C 859.23 PASS AF=0.913043;AO=63;DP=69;FAO=63;FDP=69;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0142547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.881;QD=49.8104;RBI=0.0147171;REFB=0.00980908;REVB=0.00366019;RO=6;SAF=38;SAR=25;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733767;STB=0.538995;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.001263;OID=.;OPOS=106207843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:69:69:6:6:63:63:0.913043:25:38:1:5:25:38:1:5 chr14 106209119 . T C 1083.92 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270925;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.746;QD=60.2179;RBI=0.0308121;REFB=0;REVB=0.0146758;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81044e-05;OID=.;OPOS=106209119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:25:47:0:0:25:47:0:0 chr14 106209340 . T C 1209.02 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.898;QD=61.2164;RBI=0.0219512;REFB=0;REVB=0.0188048;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70665e-05;OID=.;OPOS=106209340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:41:37:0:0:42:37:0:0 chr14 106237624 . C T 421.11 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00201595;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.502;QD=54.3366;RBI=0.00396265;REFB=-0.132369;REVB=0.00341153;RO=1;SAF=14;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321345;STB=0.51723;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=-0.000173783;OID=.;OPOS=106237624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:31:1:1:30:30:0.967742:16:14:1:0:16:14:1:0 chr14 106237642 . T G 410.67 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.914;QD=56.6434;RBI=0.0213168;REFB=0;REVB=0.000469175;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63182e-05;OID=.;OPOS=106237642;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:13:15:0:0:14:15:0:0 chr14 106303846 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.255;QD=62.022;RBI=0.0228179;REFB=0;REVB=0.0226982;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32356e-05;OID=.;OPOS=106303846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr14 106304746 . G A 679.72 PASS AF=0.608247;AO=59;DP=96;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0158784;FXX=0.010203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.33;QD=28.0298;RBI=0.0162938;REFB=-0.00911983;REVB=0.00365597;RO=37;SAF=30;SAR=29;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227423;STB=0.506991;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00551603;OID=.;OPOS=106304746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:37:38:59:59:0.608247:29:30:20:17:29:30:20:18 chr14 106321330 . G A 203.96 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=-0.00987862;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.644;QD=12.3609;RBI=0.01016;REFB=-0.0203191;REVB=-0.00237463;RO=41;SAF=7;SAR=18;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496624;STB=0.528483;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0183792;OID=.;OPOS=106321330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:41:41:25:25:0.378788:18:7:10:31:18:7:10:31 chr14 106321590 . C A 1678.61 PASS AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00949314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.308;QD=59.4197;RBI=0.049971;REFB=-0.0749743;REVB=0.0490609;RO=1;SAF=69;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010913;STB=0.505746;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=6.70406e-05;OID=.;OPOS=106321590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:113:1:1:112:112:0.99115:43:69:0:1:43:69:0:1 chr14 106321663 . T C 293.43 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.0250569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.663;QD=14.8571;RBI=0.0277826;REFB=-0.0167282;REVB=-0.0120008;RO=46;SAF=22;SAR=11;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840685;STB=0.504759;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0194242;OID=.;OPOS=106321663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:11:22:31:15:11:22:31:15 chr14 106321913 . G A 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0232478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.778;QD=12.3289;RBI=0.0303708;REFB=-0.0415489;REVB=0.019543;RO=17;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113573;STB=0.567442;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0581101;OID=.;OPOS=106321913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:7:4:8:9:7:4:8:9 chr14 106329435 . T G 732.58 PASS AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0176907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1121;QD=51.4093;RBI=0.022778;REFB=-0.0661483;REVB=0.0143483;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362146;STB=0.528291;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00363422;OID=.;OPOS=106329435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:57:57:2:3:54:54:0.947368:29:25:2:0:29:25:3:0 chr14 106329451 . GTA ACC 721.74 PASS AF=0.979167;AO=46;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206847;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=194.19;QD=60.1447;RBI=0.023822;REFB=-0.0914506;REVB=0.0118167;RO=1;SAF=19;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240991;STB=0.51219;STBP=0.311;TYPE=mnp;VARB=0.00165551;OID=.;OPOS=106329451;OREF=GTA;OALT=ACC;OMAPALT=ACC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:46:47:0.979167:27:19:1:0:27:20:1:0 chr14 106347371 . T A 4732.69 PASS AF=0.488301;AO=469;DP=918;FAO=480;FDP=983;FR=.;FRO=503;FSAF=204;FSAR=276;FSRF=220;FSRR=283;FWDB=-0.0263659;FXX=0.00707064;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.943;QD=19.2581;RBI=0.0281599;REFB=-0.0398223;REVB=0.00989046;RO=442;SAF=194;SAR=275;SRF=160;SRR=282;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478698;STB=0.506466;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0333194;OID=.;OPOS=106347371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:918:983:442:503:469:480:0.488301:275:194:160:282:276:204:220:283 chr14 106347420 . T C 3521.4 PASS AF=0.47619;AO=360;DP=756;FAO=360;FDP=756;FR=.;FRO=396;FSAF=161;FSAR=199;FSRF=173;FSRR=223;FWDB=-0.0117098;FXX=0.00263849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4632;QD=18.6318;RBI=0.0345838;REFB=-0.034081;REVB=0.032541;RO=396;SAF=161;SAR=199;SRF=173;SRR=223;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100048;STB=0.50549;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0377282;OID=.;OPOS=106347420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:756:756:396:396:360:360:0.47619:199:161:173:223:199:161:173:223 chr14 106354418 . G A 1128.56 PASS AF=0.441606;AO=121;DP=273;FAO=121;FDP=274;FR=.;FRO=153;FSAF=67;FSAR=54;FSRF=68;FSRR=85;FWDB=0.00340608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.786;QD=16.4754;RBI=0.016768;REFB=-0.0279013;REVB=0.0164184;RO=151;SAF=67;SAR=54;SRF=67;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109988;STB=0.560913;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0163604;OID=.;OPOS=106354418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:274:151:153:121:121:0.441606:54:67:67:84:54:67:68:85 chr14 106354450 . A G 637.15 PASS AF=0.361502;AO=76;DP=218;FAO=77;FDP=213;FR=.;FRO=136;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=69;FSRR=67;FWDB=-0.00841941;FXX=0.027396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.533;QD=11.9652;RBI=0.0185781;REFB=-0.0144301;REVB=-0.0165607;RO=118;SAF=41;SAR=35;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00315058;STB=0.516066;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0233035;OID=.;OPOS=106354450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:213:118:136:76:77:0.361502:35:41:64:54:36:41:69:67 chr14 106366544 . G A 426.67 PASS AF=0.585714;AO=41;DP=70;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00343645;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.307;QD=24.3814;RBI=0.00463849;REFB=-0.0282264;REVB=0.00311552;RO=28;SAF=20;SAR=21;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167469;STB=0.583294;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0245906;OID=.;OPOS=106366544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:29:41:41:0.585714:21:20:20:8:21:20:20:9 chr14 106370603 . G C 832.4 PASS AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.116567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.603;QD=52.8506;RBI=0.119318;REFB=-0.021118;REVB=0.0254749;RO=1;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116542;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0115065;OID=.;OPOS=106370603;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:63:63:1:3:60:60:0.952381:40:20:0:1:40:20:1:2 chr14 106382664 . G A 90.18 PASS AF=0.208333;AO=15;DP=71;FAO=15;FDP=72;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.0554182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.747;QD=5.01007;RBI=0.145489;REFB=-0.0232091;REVB=0.134521;RO=53;SAF=8;SAR=7;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529216;STB=0.547072;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0894721;OID=.;OPOS=106382664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:71:72:53:57:15:15:0.208333:7:8:26:27:7:8:27:30 chr14 106382687 . C T 145.61 PASS AF=0.30303;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00591;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9311;QD=8.82455;RBI=0.00773341;REFB=2.87616e-05;REVB=-0.00498774;RO=45;SAF=8;SAR=12;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105066;STB=0.555499;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.000183069;OID=.;OPOS=106382687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:45:46:20:20:0.30303:12:8:22:23:12:8:22:24 chr14 106385332 . G C 1976.93 PASS AF=0.992248;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0716946;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0208;QD=61.3002;RBI=0.081221;REFB=-0.156217;REVB=-0.0381672;RO=1;SAF=54;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871838;STB=0.504586;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00146644;OID=.;OPOS=106385332;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:129:1:1:127:128:0.992248:73:54:1:0:74:54:1:0 chr14 106436780 . A G 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00144413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3961;QD=56.189;RBI=0.0482726;REFB=0;REVB=-0.048251;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00043086;OID=.;OPOS=106436780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0 chr14 106437036 . TCATGGTTTCGTTATACACAGGAGCAAGTGTTTCAAAAA T 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00659003;FXX=0;HRUN=1;LEN=38;MLLD=1241.52;QD=39.2068;RBI=0.0163379;REFB=0;REVB=0.0149499;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=1.22804e-05;OID=.;OPOS=106437037;OREF=CATGGTTTCGTTATACACAGGAGCAAGTGTTTCAAAAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:9:9:9:0:3:6:0:0:4:0:3:6:0:0 chr14 106452690 . G A 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.019704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.535;QD=16.8843;RBI=0.0309393;REFB=-0.00564398;REVB=-0.0238536;RO=16;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348757;STB=0.506485;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00654777;OID=.;OPOS=106452690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:6:9:9:7:6:9:10:7 chr14 106452817 . A G 1271.55 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606251;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2735;QD=61.2796;RBI=0.0661523;REFB=-0.058863;REVB=-0.0264712;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000671062;OID=.;OPOS=106452817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:84:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0 chr14 106471268 . A G 538.53 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00500173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.501;QD=59.8364;RBI=0.0336191;REFB=0;REVB=0.0332449;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227208;OID=.;OPOS=106471268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0 chr14 106471273 . C T 646.53 PASS AF=1;AO=36;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7317;QD=61.5743;RBI=0.158847;REFB=0;REVB=0.0609748;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00911295;OID=.;OPOS=106471273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:36:42:1:18:18:0:0:20:22:0:0 chr14 106471353 . C T 1495.65 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0220238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.318;QD=62.3187;RBI=0.0221516;REFB=0.0209084;REVB=0.002376;RO=1;SAF=49;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957941;STB=0.505049;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000388927;OID=.;OPOS=106471353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:46:49:1:0:46:49:1:0 chr14 106471388 . C A 1526.69 PASS AF=1;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708498;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.448;QD=59.87;RBI=0.0274534;REFB=0;REVB=0.0265234;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0076e-05;OID=.;OPOS=106471388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:104:102:0:0:102:102:1:54:48:0:0:54:48:0:0 chr14 106471528 . C A 379.9 PASS AF=0.878788;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0192184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1499;QD=46.0488;RBI=0.0296032;REFB=0.00564956;REVB=0.0225168;RO=4;SAF=13;SAR=16;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452925;STB=0.524399;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00140689;OID=.;OPOS=106471528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:33:33:4:4:29:29:0.878788:16:13:1:3:16:13:1:3 chr14 106471534 . A C,G 391.36 PASS AF=0.0666667,0.9;AO=2,27;DP=30;FAO=2,27;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=0,14;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00631891,-0.0262896;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=184.028,50.7997;QD=52.1811;RBI=0.0310478,0.0978645;REFB=-0.0149876,-0.0569578;REVB=-0.0303979,-0.0942672;RO=0;SAF=0,14;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.39874e-08;STB=0.5,0.518505;STBP=1,0.56;TYPE=snp,snp;VARB=0.0166448,-0.000656073;OID=.,.;OPOS=106471534,106471534;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:30:30:0:1:2,27:2,27:0.0666667,0.9:2,13:0,14:0:0:2,13:0,14:0:1 chr14 106471547 . A G 282.26 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.28;QD=51.3199;RBI=0.130888;REFB=0;REVB=0.130729;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00457684;OID=.;OPOS=106471547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:19:22:1:6:13:0:0:9:13:0:0 chr14 106471685 . G A 885.79 PASS AF=0.984375;AO=61;DP=63;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00373381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.037;QD=55.3618;RBI=0.0272127;REFB=-0.128281;REVB=0.0269553;RO=2;SAF=26;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349287;STB=0.509088;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.003208;OID=.;OPOS=106471685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:64:2:1:61:63:0.984375:35:26:2:0:36:27:1:0 chr14 106478401 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.575;QD=45.8068;RBI=0.0253106;REFB=0;REVB=0.000388694;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013068;OID=.;OPOS=106478401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr14 106478513 . C G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.184;QD=60.2305;RBI=0.0711567;REFB=0;REVB=0.0251498;RO=0;SAF=8;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227925;OID=.;OPOS=106478513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:29:8:0:0:29:8:0:0 chr14 106478556 . T C 251.87 PASS AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0217787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7435;QD=27.2294;RBI=0.0334342;REFB=-0.0317971;REVB=0.0253679;RO=14;SAF=4;SAR=19;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186331;STB=0.60414;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0120544;OID=.;OPOS=106478556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:19:4:5:9:19:4:5:9 chr14 106478560 . T G 106.31 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.0126371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.501;QD=11.8126;RBI=0.0191942;REFB=-0.0101586;REVB=-0.0144472;RO=22;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171974;STB=0.608548;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0267574;OID=.;OPOS=106478560;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:23:13:13:0.361111:9:4:4:18:9:4:4:19 chr14 106478563 . G C 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0952259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9851;QD=11.8141;RBI=0.095995;REFB=-0.0263894;REVB=0.0121267;RO=23;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186781;STB=0.608548;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0505795;OID=.;OPOS=106478563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:9:4:4:19:9:4:4:19 chr14 106494269 . T C 1340.33 PASS AF=0.91;AO=91;DP=100;FAO=91;FDP=100;FR=.;FRO=9;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0445695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7491;QD=53.6133;RBI=0.0530541;REFB=-0.0281344;REVB=-0.0287802;RO=9;SAF=29;SAR=62;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126633;STB=0.567149;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0161161;OID=.;OPOS=106494269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:100:100:9:9:91:91:0.91:62:29:9:0:62:29:9:0 chr14 106573251 . G A 185.57 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00728331;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.767;QD=18.1046;RBI=0.0170853;REFB=-0.0111088;REVB=-0.0154551;RO=22;SAF=12;SAR=7;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00484832;STB=0.50276;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0199698;OID=.;OPOS=106573251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:7:12:14:8:7:12:14:8 chr14 106573311 . C T 37.85 PASS AF=0.115942;AO=8;DP=69;FAO=8;FDP=69;FR=.;FRO=61;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.0344182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.27;QD=2.19411;RBI=0.0519596;REFB=-0.00356643;REVB=-0.0389255;RO=61;SAF=5;SAR=3;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431299;STB=0.532238;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.038901;OID=.;OPOS=106573311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:69:69:61:61:8:8:0.115942:3:5:36:25:3:5:36:25 chr14 106725240 . G T 213.28 PASS AF=0.283019;AO=30;DP=106;FAO=30;FDP=106;FR=.;FRO=76;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0453707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.435;QD=8.0481;RBI=0.047248;REFB=-0.00584728;REVB=0.0131862;RO=76;SAF=12;SAR=18;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074651;STB=0.544372;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0204382;OID=.;OPOS=106725240;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:76:76:30:30:0.283019:18:12:35:41:18:12:35:41 chr14 106780634 . G A 600.27 PASS AF=0.440559;AO=63;DP=143;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.0133023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.531;QD=16.7906;RBI=0.0133242;REFB=-0.0166179;REVB=0.00076307;RO=78;SAF=27;SAR=36;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00741335;STB=0.50509;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0191728;OID=.;OPOS=106780634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:78:80:63:63:0.440559:36:27:34:44:36:27:35:45 chr14 106780647 . A G 34.11 PASS AF=0.0774648;AO=11;DP=140;FAO=11;FDP=142;FR=.;FRO=131;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=55;FSRR=76;FWDB=-0.0472286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.845;QD=0.960887;RBI=0.0580524;REFB=-0.000289124;REVB=-0.033757;RO=129;SAF=4;SAR=7;SRF=54;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638405;STB=0.554262;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.00241668;OID=.;OPOS=106780647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:140:142:129:131:11:11:0.0774648:7:4:54:75:7:4:55:76 chr14 106780803 . C G 51.04 PASS AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00401126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0766;QD=5.37262;RBI=0.0183835;REFB=-0.0184659;REVB=0.0179405;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151767;STB=0.599748;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0505407;OID=.;OPOS=106780803;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:38:38:30:30:8:8:0.210526:3:5:15:15:3:5:15:15 chr14 106780816 . CA C,CC 631.78 PASS AF=1,0;AO=6,35;DP=41;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445787,-0.0993686;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=176.977,168.495;QD=63.178;RBI=0.0848769,0.137828;REFB=0,0;REVB=-0.0722276,-0.0955111;RO=0;SAF=5,18;SAR=1,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,4.11116e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000669022,0;OID=.,.;OPOS=106780817,106780817;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:6,35:41:40,0:40:0:23,0:17,0:0:0:4:0:5,18:1,17:0:0 chr14 106780956 . AG A 184.3 PASS AF=0.453125;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0282346;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.5476;QD=11.5186;RBI=0.0342881;REFB=0.0362737;REVB=0.0194546;RO=35;SAF=9;SAR=20;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235776;STB=0.633389;STBP=0.067;TYPE=del;VARB=-0.0403328;OID=.;OPOS=106780957;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.453125:29:66:29:64:35:9:20:19:16:99:35:9:20:19:16 chr14 106791006 . C T 671.73 PASS AF=0.678571;AO=56;DP=83;FAO=57;FDP=84;FR=.;FRO=27;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.000473416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.224;QD=31.9869;RBI=0.0111023;REFB=-0.0370828;REVB=-0.0110922;RO=27;SAF=30;SAR=26;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054934;STB=0.526307;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0171654;OID=.;OPOS=106791006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:27:27:56:57:0.678571:26:30:12:15:27:30:12:15 chr14 106791119 . A G 300.99 PASS AF=0.296296;AO=40;DP=135;FAO=40;FDP=135;FR=.;FRO=95;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=49;FWDB=0.00141484;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.673;QD=8.91819;RBI=0.00528485;REFB=-0.00644412;REVB=-0.00509194;RO=93;SAF=18;SAR=22;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277764;STB=0.524187;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.018279;OID=.;OPOS=106791119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:93:95:40:40:0.296296:22:18:44:49:22:18:46:49 chr14 106791131 . A G 313.98 PASS AF=0.310606;AO=39;DP=132;FAO=41;FDP=132;FR=.;FRO=91;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=0.0117128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.598;QD=9.51443;RBI=0.0117739;REFB=-0.00507783;REVB=0.00119865;RO=91;SAF=18;SAR=21;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394517;STB=0.504619;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.011838;OID=.;OPOS=106791131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:91:91:39:41:0.310606:21:18:45:46:21:20:45:46 chr14 106791200 . GC AG 138.32 PASS AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0204465;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=245.965;QD=8.92388;RBI=0.0205807;REFB=-0.020262;REVB=-0.00234566;RO=43;SAF=10;SAR=9;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442065;STB=0.526288;STBP=0.817;TYPE=mnp;VARB=0.0454799;OID=.;OPOS=106791200;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:43:43:19:19:0.306452:9:10:21:22:9:10:21:22 chr14 106805212 . C G 256.22 PASS AF=0.460317;AO=25;DP=59;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.062401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2203;QD=16.268;RBI=0.0676119;REFB=-0.0360218;REVB=0.0260285;RO=33;SAF=19;SAR=6;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152843;STB=0.575702;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0330746;OID=.;OPOS=106805212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:63:33:34:25:29:0.460317:6:19:21:12:7:22:22:12 chr14 106805236 . C T 457.27 PASS AF=0.432203;AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.00614031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.581;QD=15.5006;RBI=0.0267211;REFB=-0.0266167;REVB=-0.026006;RO=66;SAF=28;SAR=23;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799474;STB=0.549;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0299267;OID=.;OPOS=106805236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:66:67:51:51:0.432203:23:28:31:35:23:28:31:36 chr14 106805278 . A G 722.9 PASS AF=0.445714;AO=77;DP=173;FAO=78;FDP=175;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=0.0068557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.62;QD=16.5233;RBI=0.010074;REFB=-0.00980035;REVB=-0.00738139;RO=94;SAF=32;SAR=45;SRF=36;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334291;STB=0.525031;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00791404;OID=.;OPOS=106805278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:175:94:97:77:78:0.445714:45:32:36:58:44:34:38:59 chr14 106805341 . G A 68.42 PASS AF=0.0894309;AO=22;DP=246;FAO=22;FDP=246;FR=.;FRO=224;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=89;FSRR=135;FWDB=-0.0527344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.281;QD=1.11248;RBI=0.0527355;REFB=0.000132261;REVB=-0.000339928;RO=221;SAF=11;SAR=11;SRF=87;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127316;STB=0.593414;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=-0.00233032;OID=.;OPOS=106805341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:246:246:221:224:22:22:0.0894309:11:11:87:134:11:11:89:135 chr14 106805343 . A G 69.07 PASS AF=0.0890688;AO=21;DP=246;FAO=22;FDP=247;FR=.;FRO=225;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=89;FSRR=136;FWDB=-0.0201625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.94;QD=1.11861;RBI=0.0223819;REFB=-0.000663121;REVB=-0.00971716;RO=225;SAF=11;SAR=10;SRF=89;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150348;STB=0.595058;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0114959;OID=.;OPOS=106805343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:246:247:225:225:21:22:0.0890688:10:11:89:136:11:11:89:136 chr14 106805380 . GT GG,TG 1044.25 PASS AF=0.430052,0.119171;AO=77,23;DP=193;FAO=83,23;FDP=193;FR=.;FRO=87;FSAF=26,13;FSAR=57,10;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=0.0501863,-0.11141;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,2;MLLD=284.975,43.2512;QD=21.6424;RBI=0.051095,0.114071;REFB=-0.0167947,-0.0195207;REVB=0.00959373,0.0244956;RO=86;SAF=23,13;SAR=54,10;SRF=29;SRR=57;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0429032,0.283864;STB=0.511834,0.677772;STBP=0.771,0.08;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0213697,0.0420879;OID=.,.;OPOS=106805381,106805380;OREF=T,GT;OALT=G,TG;OMAPALT=GG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:86:87:77,23:83,23:0.430052,0.119171:54,10:23,13:29:57:57,10:26,13:29:58 chr14 106805386 . G C 98.08 PASS AF=0.127072;AO=23;DP=181;FAO=23;FDP=181;FR=.;FRO=158;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=53;FSRR=105;FWDB=-0.0281563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5261;QD=2.16756;RBI=0.0578998;REFB=0.00163655;REVB=0.0505925;RO=158;SAF=13;SAR=10;SRF=53;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286585;STB=0.693585;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.012204;OID=.;OPOS=106805386;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:181:181:158:158:23:23:0.127072:10:13:53:105:10:13:53:105 chr14 106805395 . G A 628.64 PASS AF=0.422619;AO=69;DP=167;FAO=71;FDP=168;FR=.;FRO=97;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=-0.0382328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.082;QD=14.9675;RBI=0.0384742;REFB=-0.00923985;REVB=-0.0043036;RO=97;SAF=19;SAR=50;SRF=41;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174364;STB=0.582026;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0216722;OID=.;OPOS=106805395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:97:97:69:71:0.422619:50:19:41:56:50:21:41:56 chr14 106805402 . T G 123.89 PASS AF=0.15528;AO=25;DP=162;FAO=25;FDP=161;FR=.;FRO=136;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=89;FWDB=-0.00928373;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.416;QD=3.07791;RBI=0.0136026;REFB=0.0045779;REVB=-0.00994198;RO=137;SAF=15;SAR=10;SRF=48;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311483;STB=0.705315;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.0177407;OID=.;OPOS=106805402;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:137:136:25:25:0.15528:10:15:48:89:10:15:47:89 chr14 106805408 . C T 546.85 PASS AF=0.406452;AO=63;DP=156;FAO=63;FDP=155;FR=.;FRO=92;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=0.0117181;FXX=0.012738;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.023;QD=14.1123;RBI=0.017254;REFB=0.00144999;REVB=0.0126645;RO=91;SAF=18;SAR=45;SRF=44;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225669;STB=0.624958;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00120535;OID=.;OPOS=106805408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:91:92:63:63:0.406452:45:18:44:47:45:18:44:48 chr14 106805439 . TA CG,TG 1871.81 PASS AF=0.198413,0.801587;AO=25,100;DP=127;FAO=25,101;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=17,43;FSAR=8,58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00692009,0.0161573;FXX=0.0078734;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=71.0728,145.322;QD=59.4225;RBI=0.00733579,0.0184958;REFB=0,0;REVB=0.00243438,0.00900206;RO=0;SAF=17,41;SAR=8,59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.3262e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00246416,0.00342981;OID=.,.;OPOS=106805439,106805440;OREF=TA,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:127:126:0:0:25,100:25,101:0.198413,0.801587:8,59:17,41:0:0:8,58:17,43:0:0 chr14 106805481 . G A 38.42 PASS AF=0.12963;AO=7;DP=54;FAO=7;FDP=54;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00471374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.698;QD=2.84589;RBI=0.00473623;REFB=-0.00511573;REVB=-0.000461009;RO=47;SAF=5;SAR=2;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128023;STB=0.594953;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.047272;OID=.;OPOS=106805481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:54:54:47:47:7:7:0.12963:2:5:29:18:2:5:29:18 chr14 106805485 . C G 32.15 PASS AF=0.117647;AO=6;DP=53;FAO=6;FDP=51;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0416209;FXX=0.0377287;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.135;QD=2.52143;RBI=0.0486946;REFB=0.00715724;REVB=-0.0252758;RO=47;SAF=5;SAR=1;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294392;STB=0.713471;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0593346;OID=.;OPOS=106805485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:53:51:47:45:6:6:0.117647:1:5:29:18:1:5:29:16 chr14 106805508 . G A 628.0 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275886;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.2868;QD=61.2685;RBI=0.0392432;REFB=0;REVB=0.0279088;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000464449;OID=.;OPOS=106805508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0 chr14 106866565 . C A 511.48 PASS AF=0.494949;AO=49;DP=93;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.0294582;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.529;QD=20.6658;RBI=0.0345528;REFB=-0.0404946;REVB=0.0180585;RO=44;SAF=25;SAR=24;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223389;STB=0.585663;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0255904;OID=.;OPOS=106866565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:99:44:50:49:49:0.494949:24:25:11:33:24:25:17:33 chr14 106877445 . C T 765.05 PASS AF=0.408451;AO=87;DP=212;FAO=87;FDP=213;FR=.;FRO=126;FSAF=57;FSAR=30;FSRF=57;FSRR=69;FWDB=0.00505613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.163;QD=14.3672;RBI=0.0350107;REFB=-0.0170927;REVB=-0.0346437;RO=125;SAF=57;SAR=30;SRF=57;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214286;STB=0.622613;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0260615;OID=.;OPOS=106877445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:125:126:87:87:0.408451:30:57:57:68:30:57:57:69 chr14 106877447 . A ATGATCT 695.37 PASS AF=0.393204;AO=78;DP=209;FAO=81;FDP=206;FR=.;FRO=125;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=57;FSRR=68;FWDB=0.0138714;FXX=0.0236956;HRUN=0;LEN=6;MLLD=280.768;QD=13.5024;RBI=0.0234208;REFB=-0.0130309;REVB=0.018871;RO=123;SAF=52;SAR=26;SRF=55;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243009;STB=0.631196;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.0199328;OID=.;OPOS=106877448;OREF=-;OALT=TGATCT;OMAPALT=ATGATCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.393204:78:209:81:206:125:54:27:57:68:99:123:52:26:55:68 chr14 106877551 . A C 497.56 PASS AF=1;AO=24;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655545;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5108;QD=58.5363;RBI=0.205949;REFB=0;REVB=0.195237;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00244483;OID=.;OPOS=106877551;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:24:34:1:6:18:0:0:12:22:0:0 chr14 106926328 . A C 200.27 PASS AF=0.346667;AO=24;DP=74;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.01434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4673;QD=10.6809;RBI=0.0305953;REFB=-0.0035901;REVB=0.0270266;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819382;STB=0.546631;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00506579;OID=.;OPOS=106926328;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:49:49:24:26:0.346667:12:12:21:28:13:13:21:28 chr14 106926362 . C T 173.02 PASS AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00865338;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.576;QD=11.3457;RBI=0.0127537;REFB=-0.00819753;REVB=0.00936882;RO=39;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1479;STB=0.585722;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0131724;OID=.;OPOS=106926362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:39:39:22:22:0.360656:10:12:16:23:10:12:16:23 chr14 106926388 . T C 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0232936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5688;QD=12.1429;RBI=0.0235722;REFB=-0.00878924;REVB=-0.00361365;RO=33;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167503;STB=0.597484;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0099198;OID=.;OPOS=106926388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:8:11:14:19:8:11:14:19 chr14 106926649 . C A 309.87 PASS AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0766108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.733;QD=28.8248;RBI=0.0766127;REFB=0.0144106;REVB=-0.000531453;RO=16;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125188;STB=0.506891;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0086218;OID=.;OPOS=106926649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:13:14:8:8:13:14:8:8 chr14 106963101 . C T 397.21 PASS AF=0.450549;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0117378;FXX=0.0215031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.717;QD=17.4599;RBI=0.0193692;REFB=-0.00010971;REVB=0.0154074;RO=46;SAF=19;SAR=22;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0065693;STB=0.501886;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=9.70338e-05;OID=.;OPOS=106963101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:91:46:50:41:41:0.450549:22:19:21:25:22:19:23:27 chr14 106967052 . C A 94.7 PASS AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0312262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0834;QD=10.8224;RBI=0.0438253;REFB=-0.0181488;REVB=-0.0307503;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684697;STB=0.540994;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0355076;OID=.;OPOS=106967052;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:5:7:12:11:5:7:12:11 chr14 106993945 . T C 43.84 PASS AF=0.137931;AO=8;DP=58;FAO=8;FDP=58;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.00733577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.484;QD=3.02357;RBI=0.0235308;REFB=-0.00621525;REVB=0.0223581;RO=50;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.564549;STB=0.868901;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0424773;OID=.;OPOS=106993945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:58:58:50:50:8:8:0.137931:2:6:12:38:2:6:12:38 chr14 106994009 . GCT TTC 92.03 PASS AF=0.245283;AO=9;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=0.040484;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=255.113;QD=6.94585;RBI=0.0404904;REFB=-0.0144991;REVB=0.000721032;RO=38;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.583104;STB=0.865905;STBP=0.011;TYPE=mnp;VARB=0.0536112;OID=.;OPOS=106994009;OREF=GCT;OALT=TTC;OMAPALT=TTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:53:53:38:40:9:13:0.245283:3:6:6:32:3:10:8:32 chr14 106994015 . G A 92.9 PASS AF=0.245283;AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=0.0540805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.405;QD=7.01148;RBI=0.0568424;REFB=-0.0169539;REVB=-0.017503;RO=39;SAF=10;SAR=3;SRF=8;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.610546;STB=0.865905;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0275118;OID=.;OPOS=106994015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:52:53:39:40:13:13:0.245283:3:10:8:31:3:10:8:32 chr14 106994063 . C T 150.38 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0115855;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=301.824;QD=12.2757;RBI=0.0178833;REFB=-0.00310353;REVB=0.0136231;RO=32;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359272;STB=0.709445;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00757878;OID=.;OPOS=106994063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:6:11:10:22:6:11:10:22 chr14 107013129 . A C 272.3 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0200753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6215;QD=17.2886;RBI=0.0320858;REFB=-0.0148389;REVB=-0.0250297;RO=31;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431898;STB=0.503309;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0111007;OID=.;OPOS=107013129;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:33:30:30:0.47619:18:12:11:20:18:12:13:20 chr14 107013201 . G T 202.0 PASS AF=0.540541;AO=18;DP=35;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00243232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.989;QD=21.838;RBI=0.033233;REFB=-0.0184567;REVB=-0.0331439;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731248;STB=0.5135;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.012218;OID=.;OPOS=107013201;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:37:17:17:18:20:0.540541:10:8:9:8:10:10:9:8 chr14 107013408 . CTG C 356.35 PASS AF=0.436782;AO=37;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00185624;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=2;MLLD=273.572;QD=16.3839;RBI=0.00922048;REFB=-0.0129954;REVB=-0.0090317;RO=50;SAF=20;SAR=17;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617008;STB=0.546916;STBP=0.47;TYPE=del;VARB=0.0163682;OID=.;OPOS=107013409;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.436782:37:87:38:87:49:21:17:23:26:99:50:20:17:24:26 chr14 107048690 . G A 35.43 PASS AF=0.106667;AO=8;DP=74;FAO=8;FDP=75;FR=.;FRO=67;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0103614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.329;QD=1.88956;RBI=0.0361821;REFB=-0.00280643;REVB=-0.0346668;RO=66;SAF=3;SAR=5;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164335;STB=0.618432;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0138493;OID=.;OPOS=107048690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:74:75:66:67:8:8:0.106667:5:3:34:32:5:3:34:33 chr14 107048702 . G A 155.98 PASS AF=0.271605;AO=22;DP=81;FAO=22;FDP=81;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.00174471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.642;QD=7.70272;RBI=0.0334509;REFB=-0.0110235;REVB=-0.0334054;RO=59;SAF=14;SAR=8;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216858;STB=0.630512;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.030611;OID=.;OPOS=107048702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:59:59:22:22:0.271605:8:14:27:32:8:14:27:32 chr14 107048749 . C G 229.77 PASS AF=0.29703;AO=30;DP=101;FAO=30;FDP=101;FR=.;FRO=71;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0439275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.631;QD=9.10001;RBI=0.0500839;REFB=-0.0109707;REVB=-0.0240575;RO=71;SAF=21;SAR=9;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271991;STB=0.66108;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.031878;OID=.;OPOS=107048749;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:71:71:30:30:0.29703:9:21:34:37:9:21:34:37 chr14 107048767 . G T 136.41 PASS AF=0.205357;AO=23;DP=112;FAO=23;FDP=112;FR=.;FRO=89;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=44;FWDB=-0.0108221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.78;QD=4.87178;RBI=0.0210947;REFB=-0.0067012;REVB=-0.0181071;RO=89;SAF=13;SAR=10;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756725;STB=0.54754;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0273803;OID=.;OPOS=107048767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:89:89:23:23:0.205357:10:13:45:44:10:13:45:44 chr14 107048885 . C T 73.46 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.06521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.825;QD=9.47925;RBI=0.0655834;REFB=0.00137667;REVB=-0.00698795;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861957;STB=0.552525;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00260341;OID=.;OPOS=107048885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:4:6:11:10:4:6:11:10 chr14 107078567 . T C 495.46 PASS AF=0.552941;AO=46;DP=85;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0156562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.894;QD=23.3156;RBI=0.01608;REFB=-0.0279106;REVB=-0.00366732;RO=38;SAF=20;SAR=26;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118513;STB=0.558975;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0154984;OID=.;OPOS=107078567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:38:38:46:47:0.552941:26:20:22:16:26:21:22:16 chr14 107078790 . C T 1611.83 PASS AF=0.981982;AO=108;DP=110;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0400509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.192;QD=58.0838;RBI=0.0480335;REFB=-0.0637528;REVB=0.0265167;RO=2;SAF=60;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155578;STB=0.508195;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.000185093;OID=.;OPOS=107078790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:110:111:2:2:108:109:0.981982:48:60:2:0:49:60:2:0 chr14 107083283 . C T 33.05 PASS AF=0.107692;AO=7;DP=65;FAO=7;FDP=65;FR=.;FRO=58;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0128463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.547;QD=2.03369;RBI=0.0386818;REFB=-0.000811246;REVB=0.0364864;RO=58;SAF=2;SAR=5;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270019;STB=0.707368;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00959498;OID=.;OPOS=107083283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:65:65:58:58:7:7:0.107692:5:2:30:28:5:2:30:28 chr14 107083286 . A G 32.21 PASS AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.0180526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.9;QD=1.923;RBI=0.0556372;REFB=0.000145519;REVB=-0.0526269;RO=60;SAF=2;SAR=5;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284971;STB=0.719715;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.00474549;OID=.;OPOS=107083286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:67:67:60:60:7:7:0.104478:5:2:32:28:5:2:32:28 chr14 107083633 . T C 903.5 PASS AF=0.577465;AO=82;DP=142;FAO=82;FDP=142;FR=.;FRO=60;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.00824151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1192;QD=25.4507;RBI=0.0325592;REFB=-0.0131269;REVB=-0.0314988;RO=58;SAF=39;SAR=43;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110224;STB=0.566354;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0120066;OID=.;OPOS=107083633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:58:60:82:82:0.577465:43:39:36:22:43:39:38:22 chr14 107095326 . C T 1694.11 PASS AF=0.966387;AO=115;DP=119;FAO=115;FDP=119;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0525876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.08;QD=56.9449;RBI=0.0527893;REFB=-0.00637895;REVB=0.00461021;RO=4;SAF=45;SAR=70;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00726335;STB=0.503828;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.000261646;OID=.;OPOS=107095326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:119:119:4:4:115:115:0.966387:70:45:2:2:70:45:2:2 chr14 107113851 . C T 269.55 PASS AF=0.402597;AO=27;DP=73;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0120329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.445;QD=14.0025;RBI=0.0155938;REFB=-0.0174733;REVB=-0.0099185;RO=46;SAF=16;SAR=11;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078771;STB=0.576872;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0328957;OID=.;OPOS=107113851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:77:46:46:27:31:0.402597:11:16:24:22:11:20:24:22 chr14 107114009 . T C 48.07 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0332059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3232;QD=12.8199;RBI=0.0383057;REFB=-0.0554394;REVB=0.019097;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206125;STB=0.624625;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0263713;OID=.;OPOS=107114009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:2:5:4:4:2:5:4:4 chr14 107114193 . A G 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00801016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.245;QD=14.7347;RBI=0.0197653;REFB=-0.0248354;REVB=0.0180694;RO=36;SAF=9;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175486;STB=0.599924;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0174946;OID=.;OPOS=107114193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:18:9:18:18:18:9:18:18 chr14 107131063 . A G 48.32 PASS AF=0.156863;AO=8;DP=51;FAO=8;FDP=51;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0229324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.964;QD=3.78995;RBI=0.0293683;REFB=0.00187015;REVB=-0.0183468;RO=43;SAF=7;SAR=1;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333348;STB=0.743947;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.0102657;OID=.;OPOS=107131063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:51:51:43:43:8:8:0.156863:1:7:29:14:1:7:29:14 chr14 107131410 . A G 62.39 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00345277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3486;QD=7.79844;RBI=0.0080296;REFB=0.0069917;REVB=-0.00724933;RO=23;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231342;STB=0.646702;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.018339;OID=.;OPOS=107131410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:7:2:9:14:7:2:9:14 chr14 107170005 . T C 489.63 PASS AF=0.582278;AO=45;DP=79;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00311955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.811;QD=24.7915;RBI=0.0161073;REFB=-0.0182636;REVB=-0.0158023;RO=33;SAF=22;SAR=23;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137002;STB=0.569591;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0164908;OID=.;OPOS=107170005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:33:33:45:46:0.582278:23:22:22:11:23:23:22:11 chr14 107170055 . G A 288.52 PASS AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0191997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.738;QD=13.7389;RBI=0.0212972;REFB=-0.0246929;REVB=-0.00921642;RO=51;SAF=22;SAR=11;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112061;STB=0.564063;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0395168;OID=.;OPOS=107170055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:11:22:29:22:11:22:29:22 chr14 107170062 . A G 237.71 PASS AF=0.353659;AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0114553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8128;QD=11.5954;RBI=0.0642039;REFB=-0.0283762;REVB=-0.0631738;RO=51;SAF=19;SAR=10;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101695;STB=0.548702;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0498283;OID=.;OPOS=107170062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:51:53:29:29:0.353659:10:19:29:22:10:19:31:22 chr14 107170077 . C T 289.99 PASS AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.0396161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1331;QD=14.1459;RBI=0.0588758;REFB=-0.0280784;REVB=-0.0435536;RO=49;SAF=23;SAR=10;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122958;STB=0.570204;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.04127;OID=.;OPOS=107170077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:10:23:29:20:10:23:29:20 chr14 107170219 . C G 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.000955934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.116;QD=18.6371;RBI=0.00490542;REFB=-0.00965362;REVB=-0.00481137;RO=16;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596367;STB=0.533857;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00732632;OID=.;OPOS=107170219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:6:10:11:5:6:10:11:5 chr14 107178832 . A G 2427.9 PASS AF=0.981707;AO=161;DP=164;FAO=161;FDP=164;FR=.;FRO=3;FSAF=93;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00162727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1629;QD=59.217;RBI=0.0507716;REFB=-0.0931661;REVB=-0.0507455;RO=3;SAF=93;SAR=68;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00317616;STB=0.501669;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0010414;OID=.;OPOS=107178832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:164:164:3:3:161:161:0.981707:68:93:2:1:68:93:2:1 chr14 107178965 . A C 317.4 PASS AF=0.371134;AO=35;DP=97;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.0218976;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.334;QD=13.0886;RBI=0.0219753;REFB=-0.0124222;REVB=-0.00184603;RO=59;SAF=19;SAR=16;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748437;STB=0.522624;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0210018;OID=.;OPOS=107178965;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:59:61:35:36:0.371134:16:19:28:31:17:19:30:31 chr14 107179268 . A G 478.08 PASS AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0121284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.949;QD=19.7145;RBI=0.0137234;REFB=-0.00874888;REVB=-0.00642142;RO=49;SAF=25;SAR=22;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948224;STB=0.547265;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00930735;OID=.;OPOS=107179268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:49:50:47:47:0.484536:22:25:21:28:22:25:22:28 chr14 107211211 . G A 73.81 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0125872;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.796;QD=8.94643;RBI=0.0146592;REFB=-0.00239731;REVB=0.00751362;RO=23;SAF=4;SAR=6;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902872;STB=0.555443;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00608135;OID=.;OPOS=107211211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:34:33:23:23:10:10:0.30303:6:4:11:12:6:4:11:12 chr14 107282926 . A T 30.47 PASS AF=0.0631068;AO=13;DP=206;FAO=13;FDP=206;FR=.;FRO=193;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=103;FSRR=90;FWDB=-0.00949533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.303;QD=0.591585;RBI=0.0290212;REFB=-0.000777544;REVB=-0.0274239;RO=192;SAF=8;SAR=5;SRF=103;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842264;STB=0.577826;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0169647;OID=.;OPOS=107282926;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:206:206:192:193:13:13:0.0631068:5:8:103:89:5:8:103:90 chr14 107282935 . A T 42.3 PASS AF=0.0765306;AO=15;DP=196;FAO=15;FDP=196;FR=.;FRO=181;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=98;FSRR=83;FWDB=-0.04564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5135;QD=0.863205;RBI=0.0456407;REFB=0.00127147;REVB=0.000253947;RO=176;SAF=8;SAR=7;SRF=93;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0055763;STB=0.507514;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.0306534;OID=.;OPOS=107282935;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:196:196:176:181:15:15:0.0765306:7:8:93:83:7:8:98:83 chr15 20462585 . A G 56.17 PASS AF=0.146667;AO=11;DP=75;FAO=11;FDP=75;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.00686974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.896;QD=2.99587;RBI=0.0141067;REFB=-0.0105875;REVB=-0.0123209;RO=64;SAF=8;SAR=3;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142375;STB=0.599808;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0743228;OID=.;OPOS=20462585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:75:75:64:64:11:11:0.146667:3:8:40:24:3:8:40:24 chr15 20462603 . G T 171.93 PASS AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=0.02627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.029;QD=9.29366;RBI=0.0279847;REFB=-0.00774549;REVB=0.00964547;RO=51;SAF=12;SAR=11;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148472;STB=0.587116;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0346832;OID=.;OPOS=20462603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:11:12:33:18:11:12:33:18 chr15 20462623 . G A 81.47 PASS AF=0.191781;AO=14;DP=73;FAO=14;FDP=73;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00299925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.072;QD=4.46436;RBI=0.011812;REFB=-0.00782737;REVB=-0.0114248;RO=59;SAF=10;SAR=4;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246735;STB=0.660918;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0298739;OID=.;OPOS=20462623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:73:73:59:59:14:14:0.191781:4:10:31:28:4:10:31:28 chr15 20476942 . C T 58.05 PASS AF=0.08867;AO=18;DP=202;FAO=18;FDP=203;FR=.;FRO=185;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=103;FSRR=82;FWDB=-0.0244782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.343;QD=1.14376;RBI=0.0539173;REFB=0.000811954;REVB=-0.0480406;RO=183;SAF=8;SAR=10;SRF=102;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131935;STB=0.60119;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.0212858;OID=.;OPOS=20476942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:202:203:183:185:18:18:0.08867:10:8:102:81:10:8:103:82 chr15 20588705 . C A 143.33 PASS AF=0.216981;AO=23;DP=106;FAO=23;FDP=106;FR=.;FRO=83;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=54;FWDB=-0.0235839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9428;QD=5.40873;RBI=0.0316163;REFB=-0.00883491;REVB=-0.0210568;RO=82;SAF=11;SAR=12;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159691;STB=0.601906;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0256576;OID=.;OPOS=20588705;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:82:83:23:23:0.216981:12:11:29:53:12:11:29:54 chr15 20645751 . G A 70.39 PASS AF=0.322581;AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.00309638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.209;QD=9.08303;RBI=0.0030964;REFB=-0.0135336;REVB=-1.2866e-05;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302029;STB=0.644895;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0228877;OID=.;OPOS=20645751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:31:21:21:9:10:0.322581:4:5:6:15:5:5:6:15 chr15 20645827 . A G 96.08 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.151626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.231;QD=12.0096;RBI=0.157197;REFB=-0.00138853;REVB=-0.0414769;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438677;STB=0.749687;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00589227;OID=.;OPOS=20645827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:6:6:2:18:6:6:2:18 chr15 20874897 . A G 3689.19 PASS AF=0.536474;AO=351;DP=657;FAO=353;FDP=658;FR=.;FRO=305;FSAF=171;FSAR=182;FSRF=148;FSRR=157;FWDB=0.0220085;FXX=0.00151743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.821;QD=22.4267;RBI=0.0238587;REFB=-0.024205;REVB=-0.009212;RO=304;SAF=171;SAR=180;SRF=148;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000288283;STB=0.500383;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0189678;OID=.;OPOS=20874897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:657:658:304:305:351:353:0.536474:180:171:148:156:182:171:148:157 chr15 20874927 . T A 2029.67 PASS AF=0.384117;AO=221;DP=601;FAO=237;FDP=617;FR=.;FRO=380;FSAF=119;FSAR=118;FSRF=160;FSRR=220;FWDB=-0.00154114;FXX=0.0016181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.162;QD=13.1583;RBI=0.0165135;REFB=0.000887975;REVB=0.0164414;RO=372;SAF=112;SAR=109;SRF=158;SRR=214;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914383;STB=0.549897;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00137632;OID=.;OPOS=20874927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:601:617:372:380:221:237:0.384117:109:112:158:214:118:119:160:220 chr15 20876452 . G A 43.44 PASS AF=0.0690909;AO=19;DP=275;FAO=19;FDP=275;FR=.;FRO=256;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=111;FSRR=145;FWDB=0.00740944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.12;QD=0.631875;RBI=0.0325944;REFB=-0.00199317;REVB=-0.0317411;RO=255;SAF=6;SAR=13;SRF=110;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132325;STB=0.615912;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0497193;OID=.;OPOS=20876452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:275:275:255:256:19:19:0.0690909:13:6:110:145:13:6:111:145 chr15 20876515 . A G 2296.58 PASS AF=0.584488;AO=209;DP=360;FAO=211;FDP=361;FR=.;FRO=150;FSAF=94;FSAR=117;FSRF=66;FSRR=84;FWDB=0.0213295;FXX=0.00276235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.339;QD=25.4469;RBI=0.0288142;REFB=-0.0290605;REVB=0.0193729;RO=150;SAF=94;SAR=115;SRF=66;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00762212;STB=0.502313;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0182207;OID=.;OPOS=20876515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:360:361:150:150:209:211:0.584488:115:94:66:84:117:94:66:84 chr15 22016194 . G A 115.58 PASS AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0122939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.848;QD=30.8214;RBI=0.0173844;REFB=-0.0116839;REVB=0.0122914;RO=3;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596449;STB=0.533278;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0026652;OID=.;OPOS=22016194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:6:6:1:2:6:6:1:2 chr15 22368634 . C T 88.87 PASS AF=0.15;AO=17;DP=119;FAO=18;FDP=120;FR=.;FRO=102;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=73;FWDB=-0.0196449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.765;QD=2.96236;RBI=0.0198066;REFB=-0.00487693;REVB=-0.0025259;RO=102;SAF=7;SAR=10;SRF=29;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176304;STB=0.597461;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0401032;OID=.;OPOS=22368634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:119:120:102:102:17:18:0.15:10:7:29:73:11:7:29:73 chr15 22368738 . C T 536.12 PASS AF=0.231608;AO=85;DP=370;FAO=85;FDP=367;FR=.;FRO=282;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=128;FSRR=154;FWDB=0.00274992;FXX=0.00810789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.142;QD=5.84326;RBI=0.0257342;REFB=-0.00562512;REVB=-0.0255869;RO=283;SAF=46;SAR=39;SRF=128;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112945;STB=0.566762;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0204802;OID=.;OPOS=22368738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:367:283:282:85:85:0.231608:39:46:128:155:39:46:128:154 chr15 22368855 . T C 469.78 PASS AF=0.238411;AO=72;DP=301;FAO=72;FDP=302;FR=.;FRO=230;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=115;FSRR=115;FWDB=-0.00652498;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.624;QD=6.2222;RBI=0.00705283;REFB=-0.000336456;REVB=-0.00267713;RO=228;SAF=22;SAR=50;SRF=115;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259287;STB=0.653582;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00105235;OID=.;OPOS=22368855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:302:228:230:72:72:0.238411:50:22:115:113:50:22:115:115 chr15 22368862 . G A 3893.83 PASS AF=1;AO=252;DP=253;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548628;FXX=0.00395241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6175;QD=61.8068;RBI=0.0623751;REFB=-0.076138;REVB=-0.0296771;RO=1;SAF=105;SAR=147;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00323191;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539949;OID=.;OPOS=22368862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:253:252:1:0:252:252:1:147:105:0:1:147:105:0:0 chr15 22368905 . G A 621.82 PASS AF=0.416667;AO=70;DP=168;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=52;FWDB=-0.00345389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.503;QD=14.8053;RBI=0.00358636;REFB=-0.010616;REVB=0.000965698;RO=98;SAF=33;SAR=37;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00213166;STB=0.501194;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0150553;OID=.;OPOS=22368905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:98:98:70:70:0.416667:37:33:46:52:37:33:46:52 chr15 22368957 . C T 255.66 PASS AF=0.272727;AO=36;DP=132;FAO=36;FDP=132;FR=.;FRO=96;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=58;FSRR=38;FWDB=-0.0163152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.283;QD=7.74732;RBI=0.0164522;REFB=-0.00383619;REVB=0.00211868;RO=96;SAF=18;SAR=18;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127865;STB=0.575716;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0121041;OID=.;OPOS=22368957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:96:96:36:36:0.272727:18:18:58:38:18:18:58:38 chr15 22369132 . G A 261.65 PASS AF=0.232955;AO=40;DP=175;FAO=41;FDP=176;FR=.;FRO=135;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=58;FSRR=77;FWDB=0.0241841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.736;QD=5.94648;RBI=0.0261782;REFB=-0.000262795;REVB=-0.0100215;RO=135;SAF=23;SAR=17;SRF=58;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182458;STB=0.599733;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00127581;OID=.;OPOS=22369132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:135:135:40:41:0.232955:17:23:58:77:18:23:58:77 chr15 22369179 . A T 57.59 PASS AF=0.152778;AO=11;DP=71;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0140672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.114;QD=3.19943;RBI=0.0227595;REFB=-0.00774733;REVB=-0.0178916;RO=60;SAF=7;SAR=4;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267141;STB=0.68595;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0424961;OID=.;OPOS=22369179;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:71:72:60:61:11:11:0.152778:4:7:25:35:4:7:25:36 chr15 22369248 . T C 1029.97 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0165753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.442;QD=58.0262;RBI=0.022191;REFB=-0.0247716;REVB=0.0147546;RO=1;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145457;STB=0.50769;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.000184805;OID=.;OPOS=22369248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:32:38:0:1:32:38:0:1 chr15 22369373 . G A 253.33 PASS AF=0.180769;AO=47;DP=259;FAO=47;FDP=260;FR=.;FRO=213;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=92;FSRR=121;FWDB=0.00433276;FXX=0.0188672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.394;QD=3.89741;RBI=0.00433307;REFB=-0.00372753;REVB=-5.14115e-05;RO=198;SAF=28;SAR=19;SRF=90;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180974;STB=0.632203;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0136732;OID=.;OPOS=22369373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:260:198:213:47:47:0.180769:19:28:90:108:19:28:92:121 chr15 22382655 . A C 120.14 PASS AF=0.152866;AO=24;DP=159;FAO=24;FDP=157;FR=.;FRO=133;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=82;FWDB=-0.021896;FXX=0.0187488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.989;QD=3.06088;RBI=0.0248033;REFB=-0.00650847;REVB=-0.0116521;RO=130;SAF=12;SAR=12;SRF=49;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158422;STB=0.598647;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0393479;OID=.;OPOS=22382655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:157:130:133:24:24:0.152866:12:12:49:81:12:12:51:82 chr15 22382728 . C T 97.15 PASS AF=0.166667;AO=18;DP=108;FAO=18;FDP=108;FR=.;FRO=90;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=0.0567623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5982;QD=3.5981;RBI=0.0590607;REFB=-0.0010742;REVB=-0.0163159;RO=90;SAF=7;SAR=11;SRF=38;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436752;STB=0.528814;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00676409;OID=.;OPOS=22382728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:108:108:90:90:18:18:0.166667:11:7:38:52:11:7:38:52 chr15 22382739 . A G 1444.41 PASS AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0131305;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.549;QD=60.8172;RBI=0.0133666;REFB=0.0160565;REVB=0.00250117;RO=2;SAF=39;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172344;STB=0.509089;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-2.43829e-05;OID=.;OPOS=22382739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:54:39:0:2:54:39:0:2 chr15 22382821 . G C 392.72 PASS AF=0.256637;AO=58;DP=226;FAO=58;FDP=226;FR=.;FRO=168;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=94;FSRR=74;FWDB=-0.00755468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.137;QD=6.95071;RBI=0.0153869;REFB=-0.00881352;REVB=-0.0134047;RO=168;SAF=31;SAR=27;SRF=94;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315029;STB=0.518745;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0131315;OID=.;OPOS=22382821;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:168:168:58:58:0.256637:27:31:94:74:27:31:94:74 chr15 22382828 . C A 421.64 PASS AF=0.260684;AO=60;DP=232;FAO=61;FDP=234;FR=.;FRO=173;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=96;FSRR=77;FWDB=0.00929708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.255;QD=7.20752;RBI=0.0335137;REFB=0.00742739;REVB=0.0321983;RO=172;SAF=31;SAR=29;SRF=95;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446137;STB=0.522515;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.0283402;OID=.;OPOS=22382828;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:234:172:173:60:61:0.260684:29:31:95:77:29:32:96:77 chr15 22383064 . C A 313.35 PASS AF=0.229358;AO=50;DP=218;FAO=50;FDP=218;FR=.;FRO=168;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=72;FSRR=96;FWDB=0.0148598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5479;QD=5.7495;RBI=0.0208714;REFB=-0.00355597;REVB=0.0146562;RO=167;SAF=23;SAR=27;SRF=71;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447318;STB=0.524462;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0119386;OID=.;OPOS=22383064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:167:168:50:50:0.229358:27:23:71:96:27:23:72:96 chr15 22383066 . A G 1036.84 PASS AF=0.490741;AO=106;DP=216;FAO=106;FDP=216;FR=.;FRO=110;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=50;FSRR=60;FWDB=0.0135033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.09;QD=19.2007;RBI=0.0135083;REFB=-0.00610067;REVB=-0.00036891;RO=110;SAF=44;SAR=62;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373208;STB=0.520539;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00563444;OID=.;OPOS=22383066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:110:110:106:106:0.490741:62:44:50:60:62:44:50:60 chr15 22383189 . G A 373.8 PASS AF=0.26601;AO=54;DP=204;FAO=54;FDP=203;FR=.;FRO=149;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=78;FSRR=71;FWDB=-0.00180113;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.2;QD=7.36555;RBI=0.00416004;REFB=-0.00123857;REVB=-0.00374991;RO=149;SAF=29;SAR=25;SRF=78;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168321;STB=0.50998;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00305852;OID=.;OPOS=22383189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:149:149:54:54:0.26601:25:29:78:71:25:29:78:71 chr15 22383263 . C T 391.7 PASS AF=0.294444;AO=53;DP=177;FAO=53;FDP=180;FR=.;FRO=127;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=57;FSRR=70;FWDB=0.0082655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.571;QD=8.70437;RBI=0.0107695;REFB=-0.0111947;REVB=-0.00690382;RO=123;SAF=28;SAR=25;SRF=54;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106703;STB=0.555883;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0355606;OID=.;OPOS=22383263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:180:123:127:53:53:0.294444:25:28:54:69:25:28:57:70 chr15 22383482 . GA G 118.32 PASS AF=0.243243;AO=18;DP=77;FAO=18;FDP=74;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.0105768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.598;QD=6.39589;RBI=0.0112086;REFB=-0.00352268;REVB=0.00371003;RO=59;SAF=10;SAR=8;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223732;STB=0.634076;STBP=0.218;TYPE=del;VARB=0.0101357;OID=.;OPOS=22383483;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.243243:18:77:18:74:56:10:8:21:35:99:59:10:8:22:37 chr15 22413700 . A G 1946.02 PASS AF=0.977099;AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0121964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0035;QD=59.4203;RBI=0.0152145;REFB=-0.0550298;REVB=-0.00909552;RO=2;SAF=58;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161022;STB=0.504928;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00109998;OID=.;OPOS=22413700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:130:131:2:3:128:128:0.977099:70:58:2:0:70:58:2:1 chr15 22413954 . C T 1731.13 PASS AF=0.504451;AO=170;DP=337;FAO=170;FDP=337;FR=.;FRO=167;FSAF=84;FSAR=86;FSRF=90;FSRR=77;FWDB=-0.00324281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.603;QD=20.5476;RBI=0.01634;REFB=-0.023841;REVB=0.0160149;RO=166;SAF=84;SAR=86;SRF=90;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433608;STB=0.522192;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0241156;OID=.;OPOS=22413954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:337:166:167:170:170:0.504451:86:84:90:76:86:84:90:77 chr15 22414005 . C T 1579.49 PASS AF=0.504792;AO=158;DP=313;FAO=158;FDP=313;FR=.;FRO=155;FSAF=85;FSAR=73;FSRF=73;FSRR=82;FWDB=-0.00622613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.969;QD=20.1852;RBI=0.0075243;REFB=-0.0163198;REVB=0.00422496;RO=155;SAF=85;SAR=73;SRF=73;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606342;STB=0.533202;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0222383;OID=.;OPOS=22414005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:313:155:155:158:158:0.504792:73:85:73:82:73:85:73:82 chr15 22414132 . G A 422.9 PASS AF=0.278539;AO=61;DP=219;FAO=61;FDP=219;FR=.;FRO=158;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=93;FSRR=65;FWDB=-0.00257719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.692;QD=7.72421;RBI=0.0247613;REFB=-0.0154701;REVB=-0.0246268;RO=157;SAF=21;SAR=40;SRF=92;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293303;STB=0.674001;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0553935;OID=.;OPOS=22414132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:157:158:61:61:0.278539:40:21:92:65:40:21:93:65 chr15 22414190 . T C 698.24 PASS AF=0.457317;AO=75;DP=164;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.00117879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5715;QD=17.0303;RBI=0.0414202;REFB=-0.0107471;REVB=0.0414034;RO=89;SAF=39;SAR=36;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360265;STB=0.519995;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0160976;OID=.;OPOS=22414190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:89:89:75:75:0.457317:36:39:43:46:36:39:43:46 chr15 22440297 . A G 784.17 PASS AF=0.982759;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.027256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.355;QD=54.0806;RBI=0.0524979;REFB=-0.0706957;REVB=0.044868;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.509088;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00209345;OID=.;OPOS=22440297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:58:0:1:55:57:0.982759:27:28:0:0:27:30:0:1 chr15 22440322 . A G 608.98 PASS AF=0.712329;AO=52;DP=73;FAO=52;FDP=73;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.0199977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.631;QD=33.3688;RBI=0.0203043;REFB=-0.013888;REVB=-0.00351534;RO=21;SAF=22;SAR=30;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204078;STB=0.609969;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00797163;OID=.;OPOS=22440322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:21:21:52:52:0.712329:30:22:17:4:30:22:17:4 chr15 22440611 . A G 153.14 PASS AF=0.252874;AO=22;DP=88;FAO=22;FDP=87;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.000695923;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.851;QD=7.04087;RBI=0.00356774;REFB=0.0017119;REVB=-0.00349921;RO=64;SAF=12;SAR=10;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748547;STB=0.539713;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.0108139;OID=.;OPOS=22440611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:64:65:22:22:0.252874:10:12:31:33:10:12:32:33 chr15 22440816 . A G 800.01 PASS AF=0.491018;AO=82;DP=169;FAO=82;FDP=167;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.00157948;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.572;QD=19.1618;RBI=0.0314951;REFB=-0.0259206;REVB=-0.0314555;RO=84;SAF=35;SAR=47;SRF=37;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127788;STB=0.504396;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.027924;OID=.;OPOS=22440816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:167:84:85:82:82:0.491018:47:35:37:47:47:35:37:48 chr15 22448406 . G A 44.68 PASS AF=0.116279;AO=10;DP=86;FAO=10;FDP=86;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0244089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2215;QD=2.07835;RBI=0.0355452;REFB=-0.0167408;REVB=-0.0258392;RO=76;SAF=7;SAR=3;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285812;STB=0.709263;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.052702;OID=.;OPOS=22448406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:86:86:76:76:10:10:0.116279:3:7:35:41:3:7:35:41 chr15 22448436 . G A 157.75 PASS AF=0.214876;AO=26;DP=120;FAO=26;FDP=121;FR=.;FRO=95;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=47;FWDB=-0.00295342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.801;QD=5.21485;RBI=0.0398498;REFB=-0.0104828;REVB=0.0397402;RO=93;SAF=13;SAR=13;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00678053;STB=0.504129;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0488384;OID=.;OPOS=22448436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:93:95:26:26:0.214876:13:13:47:46:13:13:48:47 chr15 22448456 . C T 418.29 PASS AF=0.347222;AO=50;DP=144;FAO=50;FDP=144;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=-0.00909822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0054;QD=11.6192;RBI=0.0106553;REFB=0.000719425;REVB=-0.00554596;RO=93;SAF=22;SAR=28;SRF=49;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986551;STB=0.559976;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.00139538;OID=.;OPOS=22448456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:93:94:50:50:0.347222:28:22:49:44:28:22:50:44 chr15 22448752 . C T 264.57 PASS AF=0.21393;AO=43;DP=202;FAO=43;FDP=201;FR=.;FRO=158;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=92;FSRR=66;FWDB=0.00640236;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.706;QD=5.26513;RBI=0.0189906;REFB=0.000477042;REVB=0.0178789;RO=159;SAF=28;SAR=15;SRF=92;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978237;STB=0.557495;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00154029;OID=.;OPOS=22448752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:159:158:43:43:0.21393:15:28:92:67:15:28:92:66 chr15 22840279 . G T 272.78 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.292;QD=51.9587;RBI=0.0381847;REFB=0;REVB=0.00958225;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244141;OID=.;OPOS=22840279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:7:13:0:0:8:13:0:0 chr15 22873784 . C T 1250.18 PASS AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00795978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.556;QD=60.2497;RBI=0.0188784;REFB=-0.0256176;REVB=0.0171183;RO=1;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00976474;STB=0.505153;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=8.23641e-05;OID=.;OPOS=22873784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:48:34:0:1:48:34:0:1 chr15 22921574 . AG CC 156.33 PASS AF=0.414634;AO=12;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00142603;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=330.587;QD=15.2516;RBI=0.0218354;REFB=-0.0193894;REVB=0.0217888;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517221;STBP=0.848;TYPE=mnp;VARB=0.0290238;OID=.;OPOS=22921574;OREF=AG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:12:17:0.414634:6:6:12:12:9:8:12:12 chr15 22926229 . G A 708.52 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.12;QD=62.9794;RBI=0.0152511;REFB=0;REVB=-0.0127087;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19726e-05;OID=.;OPOS=22926229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0 chr15 22960868 . G C 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.566;QD=49.5981;RBI=0.0388549;REFB=0;REVB=0.0023685;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000415125;OID=.;OPOS=22960868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr15 23006358 . CT C 38.92 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0945572;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.2106;QD=4.71749;RBI=0.115632;REFB=-0.0687788;REVB=-0.0665551;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0.301724;SSSB=0.447868;STB=0.593059;STBP=0.479;TYPE=del;VARB=0.0692951;OID=.;OPOS=23006359;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:12:33:11:33:22:5:6:7:15:38:19:8:4:4:15 chr15 23052632 . T C 854.11 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0102578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.725;QD=56.0072;RBI=0.0110739;REFB=0.0051873;REVB=0.00417243;RO=1;SAF=26;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178047;STB=0.509431;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=3.39718e-05;OID=.;OPOS=23052632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:34:26:1:0:34:26:1:0 chr15 23059394 . C T 472.85 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00687952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.202;QD=57.3153;RBI=0.0135171;REFB=0;REVB=0.0116355;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017449;OID=.;OPOS=23059394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:13:19:0:0:13:20:0:0 chr15 23098401 . C T 519.81 PASS AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0361241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.165;QD=56.1952;RBI=0.0704575;REFB=-0.141868;REVB=0.0604922;RO=1;SAF=23;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199081;STB=0.510198;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00339514;OID=.;OPOS=23098401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:12:23:1:0:12:24:1:0 chr15 23098449 . C T 727.9 PASS AF=0.875;AO=56;DP=64;FAO=56;FDP=64;FR=.;FRO=8;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00628475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.904;QD=45.4939;RBI=0.0394469;REFB=-0.0105225;REVB=0.038943;RO=8;SAF=36;SAR=20;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604381;STB=0.532167;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00218685;OID=.;OPOS=23098449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:64:64:8:8:56:56:0.875:20:36:7:1:20:36:7:1 chr15 23158339 . G C 932.5 PASS AF=0.956522;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00376346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9256;QD=54.0577;RBI=0.0860456;REFB=-0.0385523;REVB=-0.0859633;RO=3;SAF=24;SAR=42;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554686;STB=0.529403;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.000953625;OID=.;OPOS=23158339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:69:69:3:3:66:66:0.956522:42:24:3:0:42:24:3:0 chr15 23259835 . C T 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0165854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.977;QD=19.8494;RBI=0.0660556;REFB=0.0018385;REVB=0.0639396;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058655;STB=0.533289;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.000788165;OID=.;OPOS=23259835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:8:7:7:6:8:7:7:6 chr15 23261950 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8155;QD=60.61;RBI=0.0571424;REFB=0;REVB=-0.0571203;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000821995;OID=.;OPOS=23261950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:17:20:0:0:17:21:0:0 chr15 23686598 . T C 175.55 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9256;QD=46.8132;RBI=0.0907082;REFB=0;REVB=-0.0884328;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00212877;OID=.;OPOS=23686598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:2:13:0:0:2:13:0:0 chr15 23686673 . G A,C 218.92 PASS AF=0.888889,0.111111;AO=15,2;DP=18;FAO=16,2;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13,2;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642063,-0.00685466;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=51.6156,127.148;QD=48.6489;RBI=0.124581,0.0177708;REFB=0,0;REVB=0.106761,-0.0163955;RO=0;SAF=13,2;SAR=2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00484884,0.144565;OID=.,.;OPOS=23686673,23686673;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:18:18:0:0:15,2:16,2:0.888889,0.111111:2,0:13,2:0:0:3,0:13,2:0:0 chr15 23687214 . C G 1784.96 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000132137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8372;QD=59.9985;RBI=0.0228827;REFB=0;REVB=-0.0228823;RO=0;SAF=48;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00301117;OID=.;OPOS=23687214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:70:48:0:0:71:48:0:0 chr15 23688944 . A G 1153.6 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00785037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4478;QD=60.7156;RBI=0.0100321;REFB=0;REVB=0.00624619;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.63044e-06;OID=.;OPOS=23688944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chr15 23690543 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0045802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.427;QD=37.4885;RBI=0.00471986;REFB=0;REVB=-0.00113969;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.76027e-05;OID=.;OPOS=23690543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr15 23889033 . G T 207.77 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264339;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.195;QD=48.8874;RBI=0.0332515;REFB=0;REVB=-0.020172;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055194;OID=.;OPOS=23889033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr15 24921771 . G C 247.35 PASS AF=0.39726;AO=28;DP=71;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0170787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9967;QD=13.5532;RBI=0.0343386;REFB=-0.0058696;REVB=-0.0297902;RO=43;SAF=14;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615945;STB=0.53771;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00999211;OID=.;OPOS=24921771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:43:44:28:29:0.39726:14:14:19:24:14:15:20:24 chr15 24922230 . C G 100.17 PASS AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.000780854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7352;QD=10.8296;RBI=0.0107813;REFB=-0.0309712;REVB=-0.010753;RO=24;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181957;STB=0.61155;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0874913;OID=.;OPOS=24922230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:37:37:24:24:11:11:0.297297:8:3:10:14:8:3:10:14 chr15 24923390 . C T 240.16 PASS AF=0.473684;AO=25;DP=55;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0105873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.3233;QD=16.8534;RBI=0.11716;REFB=0.00628265;REVB=0.116681;RO=30;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16114;STB=0.584031;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.00336249;OID=.;OPOS=24923390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:30:30:25:27:0.473684:10:15:13:17:11:16:13:17 chr15 24925133 . T G 120.37 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00586182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.4968;QD=24.0731;RBI=0.0315039;REFB=-0.00189148;REVB=0.0309538;RO=7;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681814;STB=0.538402;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0026615;OID=.;OPOS=24925133;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:6:7:3:4:6:7:3:4 chr15 25307562 . A G 732.92 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.878;QD=56.3788;RBI=0.0517509;REFB=0;REVB=0.0435469;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214048;OID=.;OPOS=25307562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:21:30:0:0:22:30:0:0 chr15 25328802 . C T 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0115564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.818;QD=17.1565;RBI=0.014662;REFB=-0.0207419;REVB=0.00902347;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369472;STB=0.521148;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0172885;OID=.;OPOS=25328802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:7:10:11:9:7:10:11:9 chr15 25330550 . T A 286.49 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0160878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.356;QD=15.6978;RBI=0.0168654;REFB=-0.0178055;REVB=0.00506226;RO=40;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00639344;STB=0.509344;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0226531;OID=.;OPOS=25330550;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:40:41:32:32:0.438356:19:13:16:24:19:13:16:25 chr15 25925094 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=338.615;QD=46.848;RBI=0.0300272;REFB=0;REVB=0.0136515;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.6802e-05;OID=.;OPOS=25925094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr15 25926186 . G A 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00079312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.769;QD=62.162;RBI=0.0191261;REFB=0;REVB=0.0191097;RO=0;SAF=38;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37412e-05;OID=.;OPOS=25926186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:47:38:0:0:47:38:0:0 chr15 25926198 . C G 1084.29 PASS AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0271321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.243;QD=58.6102;RBI=0.0301919;REFB=0.0439422;REVB=0.0132439;RO=1;SAF=34;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013709;STB=0.507244;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-2.42842e-05;OID=.;OPOS=25926198;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:39:34:1:0:39:34:1:0 chr15 25926204 . C G 1062.42 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0309;QD=59.8547;RBI=0.0146017;REFB=0;REVB=0.00178763;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.91331e-05;OID=.;OPOS=25926204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0 chr15 25961964 . A G 1339.76 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00283014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.194;QD=62.3142;RBI=0.0403868;REFB=0;REVB=0.0402876;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87124e-05;OID=.;OPOS=25961964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0 chr15 26327466 . C T 291.85 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.00182109;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.85;QD=16.4422;RBI=0.00905224;REFB=-0.0046782;REVB=-0.00886717;RO=39;SAF=15;SAR=17;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134363;STB=0.575333;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00419453;OID=.;OPOS=26327466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:39:39:32:32:0.450704:17:15:13:26:17:15:13:26 chr15 27017536 . G A 1958.56 PASS AF=0.992188;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233705;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.073;QD=61.2049;RBI=0.030099;REFB=-0.0697774;REVB=0.0189675;RO=1;SAF=71;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856097;STB=0.504504;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=2.94717e-05;OID=.;OPOS=27017536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:128:1:1:126:127:0.992188:55:71:0:1:55:72:0:1 chr15 27018797 . G A 753.51 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0292256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.484;QD=61.5112;RBI=0.0365536;REFB=-0.083473;REVB=0.0219552;RO=1;SAF=29;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159482;STB=0.508471;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00117566;OID=.;OPOS=27018797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:19:29:1:0:19:29:1:0 chr15 27184435 . C T 1230.99 PASS AF=0.987952;AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0442569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.371;QD=59.325;RBI=0.0446204;REFB=-0.0753903;REVB=-0.00568372;RO=1;SAF=38;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122965;STB=0.506328;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00065057;OID=.;OPOS=27184435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:83:1:1:80:82:0.987952:42:38:1:0:43:39:1:0 chr15 27184482 . C T 1084.18 PASS AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00865339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.161;QD=58.6041;RBI=0.0138737;REFB=-0.040483;REVB=0.0108442;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000144122;OID=.;OPOS=27184482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:0:1:72:73:0.986486:31:41:0:0:32:41:0:1 chr15 27184517 . G A 1153.58 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.7;QD=60.7149;RBI=0.00917831;REFB=0;REVB=0.00568435;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29542e-05;OID=.;OPOS=27184517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0 chr15 27188459 . C T 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.102;QD=57.5452;RBI=0.0474173;REFB=0;REVB=0.0332162;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169843;OID=.;OPOS=27188459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0 chr15 27574019 . G A 337.18 PASS AF=0.611111;AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0150953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.07;QD=24.9759;RBI=0.0454194;REFB=-0.00973472;REVB=0.0428375;RO=21;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373919;STB=0.520535;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00604955;OID=.;OPOS=27574019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:21:21:33:33:0.611111:19:14:10:11:19:14:10:11 chr15 27772676 . C T 2460.81 PASS AF=0.987805;AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=164;FR=.;FRO=2;FSAF=89;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.018396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.297;QD=60.0199;RBI=0.0193582;REFB=-0.156502;REVB=0.00602728;RO=1;SAF=89;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531677;STB=0.500608;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000308073;OID=.;OPOS=27772676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:164:164:1:2:162:162:0.987805:73:89:1:0:73:89:1:1 chr15 28090173 . C T 503.88 PASS AF=0.402878;AO=56;DP=139;FAO=56;FDP=139;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.0143267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.928;QD=14.5001;RBI=0.0193618;REFB=-0.00747444;REVB=-0.013024;RO=83;SAF=29;SAR=27;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125439;STB=0.507069;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0108276;OID=.;OPOS=28090173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:83:83:56:56:0.402878:27:29:42:41:27:29:42:41 chr15 28197037 . T C 368.05 PASS AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0150188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.491;QD=29.4439;RBI=0.0224653;REFB=-0.011571;REVB=0.0167071;RO=19;SAF=11;SAR=20;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491596;STB=0.527028;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.00506957;OID=.;OPOS=28197037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:20:11:8:11:20:11:8:11 chr15 28231793 . T C 1553.34 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0184366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.823;QD=62.7614;RBI=0.0437953;REFB=-0.00670595;REVB=0.0397256;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.504504;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=2.30648e-05;OID=.;OPOS=28231793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:0:1:98:98:0.989899:55:43:0:0:55:43:0:1 chr15 28235773 . C T 150.95 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00810926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.784;QD=12.5788;RBI=0.0158089;REFB=-0.01871;REVB=-0.0135706;RO=31;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775411;STB=0.545637;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0309844;OID=.;OPOS=28235773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:11:6:13:18:11:6:13:18 chr15 28362459 . G A 561.26 PASS AF=0.974359;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.147;QD=57.5648;RBI=0.0384157;REFB=-0.11347;REVB=0.0330661;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.513506;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00198659;OID=.;OPOS=28362459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:39:0:1:37:38:0.974359:17:20:0:0:18:20:0:1 chr15 28412872 . G A 1216.15 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00393888;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.951;QD=60.0569;RBI=0.00442389;REFB=0.036303;REVB=0.00201396;RO=1;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116896;STB=0.506171;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000549366;OID=.;OPOS=28412872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:40:40:0:1:40:40:0:1 chr15 28414665 . T C 1283.3 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9876;QD=61.8456;RBI=0.0650235;REFB=0;REVB=0.0508563;RO=0;SAF=27;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470661;OID=.;OPOS=28414665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:56:27:0:0:56:27:0:0 chr15 28419746 . G A 302.85 PASS AF=0.357143;AO=35;DP=98;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.0483421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.171;QD=12.3612;RBI=0.0487368;REFB=-0.00660538;REVB=-0.00619061;RO=62;SAF=18;SAR=17;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00205239;STB=0.506126;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0132778;OID=.;OPOS=28419746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:62:63:35:35:0.357143:17:18:32:30:17:18:33:30 chr15 28517436 . T C 581.03 PASS AF=0.46875;AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=128;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0025327;FXX=0.0375912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.903;QD=18.1571;RBI=0.00363262;REFB=-0.0184731;REVB=-0.0026041;RO=66;SAF=36;SAR=24;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892594;STB=0.514558;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0127334;OID=.;OPOS=28517436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:128:66:68:60:60:0.46875:24:36:39:27:24:36:39:29 chr15 29034188 . G T 332.2 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0113931;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.132;QD=26.5761;RBI=0.015975;REFB=-0.0316732;REVB=-0.0111982;RO=20;SAF=12;SAR=17;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274302;STB=0.506379;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0253999;OID=.;OPOS=29034188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:21:29:29:0.58:17:12:9:11:17:12:9:12 chr15 29410238 . A G 668.06 PASS AF=0.605769;AO=63;DP=104;FAO=63;FDP=104;FR=.;FRO=41;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.000412801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.436;QD=25.6945;RBI=0.0121836;REFB=-0.00821966;REVB=-0.0121766;RO=41;SAF=36;SAR=27;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103293;STB=0.505616;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00370322;OID=.;OPOS=29410238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:41:41:63:63:0.605769:27:36:24:17:27:36:24:17 chr15 29415560 . G A 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.989;QD=60.9782;RBI=0.0379062;REFB=0;REVB=0.0223097;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284091;OID=.;OPOS=29415560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0 chr15 29415698 . A G 1437.92 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379749;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.14;QD=63.2054;RBI=0.0385181;REFB=0;REVB=0.00644618;RO=0;SAF=38;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165828;OID=.;OPOS=29415698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:53:38:0:0:53:38:0:0 chr15 29418520 . C T 870.34 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0596122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0244;QD=56.1509;RBI=0.0614965;REFB=-0.0490413;REVB=-0.0151067;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.511107;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00118521;OID=.;OPOS=29418520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:0:1:61:61:0.983871:22:39:0:0:22:39:0:1 chr15 29418573 . AT CG,GC 728.0 PASS AF=0.0638298,0.93617;AO=4,43;DP=47;FAO=3,44;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=3,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156114,0.00430647;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=74.2225,205.252;QD=61.9573;RBI=0.0423675,0.0306581;REFB=0,0;REVB=0.0393864,0.0303542;RO=0;SAF=0,32;SAR=4,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.61286e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.065026,0.00184262;OID=.,.;OPOS=29418573,29418573;OREF=AT,AT;OALT=CG,GC;OMAPALT=CG,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:47:47:0:0:4,43:3,44:0.0638298,0.93617:4,11:0,32:0:0:3,12:0,32:0:0 chr15 29544656 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.447;QD=63.8719;RBI=0.0319921;REFB=0;REVB=0.00407292;RO=1;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200087;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140442;OID=.;OPOS=29544656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:1:0:47:48:1:23:24:0:1:24:24:0:0 chr15 30008856 . C A 941.09 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0272443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.747;QD=57.0356;RBI=0.0363209;REFB=-0.141957;REVB=0.0240199;RO=1;SAF=41;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192744;STB=0.510201;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00140462;OID=.;OPOS=30008856;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:24:41:0:1:24:41:0:1 chr15 30008889 . G A 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.789;QD=60.8829;RBI=0.0122053;REFB=0;REVB=0.0117183;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11459e-05;OID=.;OPOS=30008889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0 chr15 30018627 . T C 351.22 PASS AF=0.388889;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.00233741;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.868;QD=13.0082;RBI=0.0108866;REFB=-0.00658922;REVB=-0.0106327;RO=66;SAF=21;SAR=21;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326016;STB=0.51851;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0112402;OID=.;OPOS=30018627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:66:66:42:42:0.388889:21:21:35:31:21:21:35:31 chr15 30516531 . A G 49.91 PASS AF=0.181818;AO=8;DP=44;FAO=8;FDP=44;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00612662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.395;QD=4.53682;RBI=0.00663151;REFB=0.00256322;REVB=0.00253801;RO=36;SAF=4;SAR=4;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101558;STB=0.568015;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0178995;OID=.;OPOS=30516531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:44:44:36:36:8:8:0.181818:4:4:15:21:4:4:15:21 chr15 30664453 . C T 398.27 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0161;QD=54.9337;RBI=0.0962575;REFB=0;REVB=0.0875829;RO=1;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206934;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00267997;OID=.;OPOS=30664453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:1:0:28:29:1:22:6:0:1:23:6:0:0 chr15 30665280 . TCA T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00462447;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=379.321;QD=42.1827;RBI=0.00624189;REFB=0;REVB=0.00419231;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.17557e-05;OID=.;OPOS=30665281;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:11:11:11:11:0:4:7:0:0:4:0:4:7:0:0 chr15 31197564 . G A 1135.16 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4249;QD=60.5417;RBI=0.0602048;REFB=0;REVB=-0.0053333;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000547374;OID=.;OPOS=31197564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:40:35:0:0:40:35:0:0 chr15 31229420 . T C 1702.05 PASS AF=0.982759;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00890255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2208;QD=58.6913;RBI=0.0395102;REFB=-0.175115;REVB=0.0384942;RO=2;SAF=55;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000574984;STB=0.500303;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00246192;OID=.;OPOS=31229420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:116:116:2:2:114:114:0.982759:59:55:1:1:59:55:1:1 chr15 31231190 . T C 450.83 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165754;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.323;QD=58.1711;RBI=0.0168096;REFB=0;REVB=0.00279623;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149326;OID=.;OPOS=31231190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:32:31:1:12:20:0:0:12:19:0:0 chr15 31267147 . C T 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00299623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.034;QD=64.1539;RBI=0.00774519;REFB=0;REVB=0.00714217;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39767e-06;OID=.;OPOS=31267147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0 chr15 31330280 . A G 1744.81 PASS AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000853574;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.228;QD=60.166;RBI=0.0173297;REFB=-0.114484;REVB=0.0173087;RO=1;SAF=56;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798107;STB=0.504201;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-2.59316e-05;OID=.;OPOS=31330280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:116:116:1:1:115:115:0.991379:59:56:0:1:59:56:0:1 chr15 31342744 . C T 1510.02 PASS AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.761;QD=59.8026;RBI=0.0409156;REFB=0;REVB=-0.0301214;RO=0;SAF=44;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.03486e-06;OID=.;OPOS=31342744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:56:44:0:0:57:44:0:0 chr15 31362352 . C T 727.18 PASS AF=1;AO=38;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.032;QD=63.2333;RBI=0.0626595;REFB=0;REVB=0.0450278;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407465;OID=.;OPOS=31362352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:38:46:1:18:20:0:0:19:27:0:0 chr15 31369123 . A G 1346.56 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0420265;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4567;QD=61.2072;RBI=0.0541068;REFB=-0.100328;REVB=0.0340781;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00153289;OID=.;OPOS=31369123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:88:88:0:1:86:87:0.988636:50:36:0:0:50:37:0:1 chr15 31669122 . G A 277.18 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0326877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.378;QD=16.3049;RBI=0.0330011;REFB=-0.00683406;REVB=0.00453725;RO=35;SAF=10;SAR=21;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136974;STB=0.580294;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0132826;OID=.;OPOS=31669122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:35:37:31:31:0.455882:21:10:16:19:21:10:17:20 chr15 31793930 . A G 345.22 PASS AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0089301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.118;QD=14.2357;RBI=0.0243155;REFB=-0.0121388;REVB=-0.0226163;RO=59;SAF=20;SAR=18;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721626;STB=0.540962;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0184008;OID=.;OPOS=31793930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:59:59:38:38:0.391753:18:20:35:24:18:20:35:24 chr15 33010412 . G A 517.72 PASS AF=0.948718;AO=36;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0344742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.6576;QD=53.0998;RBI=0.0581241;REFB=-0.196138;REVB=0.0467968;RO=3;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103552;STB=0.535695;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00753961;OID=.;OPOS=33010412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:39:39:3:2:36:37:0.948718:12:24:0:3:13:24:0:2 chr15 33010736 . G A 88.15 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.988;QD=39.1794;RBI=0.0301721;REFB=0;REVB=-0.0128707;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181673;OID=.;OPOS=33010736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:2:7:0:0 chr15 33023098 . C G 209.19 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=-0.000345401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3186;QD=18.5943;RBI=0.116002;REFB=-0.00712078;REVB=-0.116001;RO=23;SAF=19;SAR=2;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859616;STB=0.542813;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00248136;OID=.;OPOS=33023098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:24:21:21:0.466667:2:19:20:3:2:19:21:3 chr15 33023670 . C T 696.31 PASS AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0345006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.697;QD=56.8413;RBI=0.0345887;REFB=-0.118198;REVB=0.00246775;RO=3;SAF=20;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269969;STB=0.514382;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00957171;OID=.;OPOS=33023670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:49:49:3:3:46:46:0.938776:26:20:2:1:26:20:2:1 chr15 33023685 . A C 853.7 PASS AF=0.983607;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0428474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3416;QD=55.9803;RBI=0.0430587;REFB=-0.0282295;REVB=-0.00426083;RO=1;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149779;STB=0.507934;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.003502;OID=.;OPOS=33023685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:61:1:1:59:60:0.983607:31:28:0:1:31:29:0:1 chr15 33023689 . C A 316.27 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0209325;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.366;QD=20.0806;RBI=0.0259835;REFB=-0.00962584;REVB=-0.0153938;RO=29;SAF=8;SAR=25;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418791;STB=0.727039;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00468135;OID=.;OPOS=33023689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:30:33:33:0.52381:25:8:21:8:25:8:21:9 chr15 33023951 . T C 817.69 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.713;QD=57.3818;RBI=0.0822495;REFB=0;REVB=0.0729956;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701772;OID=.;OPOS=33023951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0 chr15 33023985 . A G 113.68 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0329427;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2949;QD=9.67463;RBI=0.077967;REFB=-0.0121238;REVB=0.0706657;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229751;STB=0.642662;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0457277;OID=.;OPOS=33023985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:30:33:14:14:0.297872:8:6:19:11:8:6:21:12 chr15 33024567 . C T 252.74 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0287193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3373;QD=21.062;RBI=0.0546168;REFB=0.00665322;REVB=-0.0464564;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183948;STB=0.603009;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0090253;OID=.;OPOS=33024567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:8:16:11:13:8:16 chr15 33024767 . A G 404.58 PASS AF=0.442105;AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0173755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.6;QD=17.0349;RBI=0.0189522;REFB=-0.0293836;REVB=-0.00756827;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381515;STB=0.5214;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0397853;OID=.;OPOS=33024767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:53:42:42:0.442105:19:23:27:26:19:23:27:26 chr15 33025627 . C T 152.36 PASS AF=0.5;AO=16;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00124117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.034;QD=17.9249;RBI=0.0213685;REFB=-0.00116825;REVB=-0.0213324;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23871;STB=0.643904;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00115928;OID=.;OPOS=33025627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:17:17:16:17:0.5:7:9:5:12:7:10:5:12 chr15 33025979 . C T 73.89 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.083604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.785;QD=9.85196;RBI=0.084639;REFB=-0.00102705;REVB=0.0131959;RO=20;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466664;STB=0.777284;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.0025774;OID=.;OPOS=33025979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:3:7:5:15:3:7:5:15 chr15 33026667 . A T 241.51 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00595038;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.4406;QD=22.4662;RBI=0.0508617;REFB=-0.0224469;REVB=0.0505124;RO=20;SAF=14;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133753;STB=0.574883;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0188911;OID=.;OPOS=33026667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:9:14:9:11:9:14:9:11 chr15 33091079 . A G 419.38 PASS AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0154271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.8903;QD=20.2109;RBI=0.0419291;REFB=-0.0182865;REVB=-0.0389879;RO=41;SAF=22;SAR=20;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165952;STB=0.591605;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0275175;OID=.;OPOS=33091079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:41:42:42:0.506024:20:22:29:12:20:22:29:12 chr15 33103170 . G A 1084.08 PASS AF=0.449799;AO=110;DP=247;FAO=112;FDP=249;FR=.;FRO=137;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=66;FSRR=71;FWDB=-0.000793649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4279;QD=17.4149;RBI=0.0112368;REFB=0.0115204;REVB=-0.0112087;RO=134;SAF=48;SAR=62;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487134;STB=0.529611;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.0111094;OID=.;OPOS=33103170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:249:134:137:110:112:0.449799:62:48:65:69:64:48:66:71 chr15 33191023 . A G 360.94 PASS AF=0.457831;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0162303;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.843;QD=17.3946;RBI=0.0199265;REFB=-0.0072586;REVB=-0.0115605;RO=45;SAF=19;SAR=19;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753209;STB=0.542147;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00681741;OID=.;OPOS=33191023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:45:45:38:38:0.457831:19:19:19:26:19:19:19:26 chr15 33261232 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611575;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.18;QD=37.4882;RBI=0.0627823;REFB=0;REVB=-0.014191;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001161;OID=.;OPOS=33261232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0 chr15 33261288 . G A 300.86 PASS AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0829773;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5831;QD=19.1024;RBI=0.162207;REFB=-0.0236546;REVB=0.139377;RO=31;SAF=17;SAR=15;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131152;STB=0.57282;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0256165;OID=.;OPOS=33261288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:15:17:21:10:15:17:21:10 chr15 33359574 . C A 772.91 PASS AF=0.98;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0685094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0114;QD=61.8326;RBI=0.0690267;REFB=-0.0963952;REVB=0.00843502;RO=1;SAF=23;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020015;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00266702;OID=.;OPOS=33359574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:49:50:1:1:48:49:0.98:25:23:1:0:25:24:1:0 chr15 33445983 . G A 149.6 PASS AF=0.516129;AO=15;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0214966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.765;QD=19.3029;RBI=0.0275817;REFB=-0.0257354;REVB=0.0172814;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116279;STB=0.548327;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0265248;OID=.;OPOS=33445983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:15:15:15:16:0.516129:8:7:9:6:8:8:9:6 chr15 33446258 . G A 486.95 PASS AF=0.481481;AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=41;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=-0.0168677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3084;QD=18.0351;RBI=0.0240193;REFB=-0.0171861;REVB=0.0170999;RO=56;SAF=11;SAR=41;SRF=15;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747524;STB=0.54165;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0214731;OID=.;OPOS=33446258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:56:52:52:0.481481:41:11:15:41:41:11:15:41 chr15 33446311 . G C 446.1 PASS AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.00670381;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=240.303;QD=18.2083;RBI=0.00780132;REFB=-0.00762328;REVB=-0.00398994;RO=53;SAF=12;SAR=33;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644986;STB=0.536118;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00830545;OID=.;OPOS=33446311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:33:12:17:36:33:12:17:36 chr15 33954652 . C T 874.26 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0311586;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.62;QD=56.4042;RBI=0.0761291;REFB=-0.117626;REVB=0.0694607;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.508472;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00152781;OID=.;OPOS=33954652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:62:1:1:61:61:0.983871:32:29:1:0:32:29:1:0 chr15 34014753 . T C 746.93 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4639;QD=63.5685;RBI=0.0655154;REFB=0;REVB=0.065455;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000863416;OID=.;OPOS=34014753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr15 34014913 . C T 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.135;QD=59.8394;RBI=0.0327886;REFB=0;REVB=0.0315313;RO=0;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140087;OID=.;OPOS=34014913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:9:27:0:0:9:27:0:0 chr15 34016274 . G A 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148644;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=278.037;QD=64.1539;RBI=0.0224096;REFB=0;REVB=0.0167702;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02231e-06;OID=.;OPOS=34016274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr15 34113536 . A G 1472.52 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.208;QD=63.334;RBI=0.0104287;REFB=0;REVB=0.0080359;RO=0;SAF=34;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.20828e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63256e-05;OID=.;OPOS=34113536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:59:34:0:0:59:34:0:0 chr15 34130991 . G T 170.98 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.00618332;FXX=0.0192271;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.607;QD=13.4098;RBI=0.0073023;REFB=-0.0119599;REVB=-0.00388462;RO=31;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977955;STB=0.556045;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0199876;OID=.;OPOS=34130991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:31:31:20:20:0.392157:14:6:7:24:14:6:7:24 chr15 34158266 . A G 426.36 PASS AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00200636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1237;QD=16.3985;RBI=0.0244481;REFB=-0.0143653;REVB=0.0243656;RO=57;SAF=25;SAR=22;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399421;STB=0.522317;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0211385;OID=.;OPOS=34158266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:57:57:47:47:0.451923:22:25:28:29:22:25:28:29 chr15 34158529 . G C 238.22 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00353871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.605;QD=20.2743;RBI=0.0146291;REFB=-0.00665188;REVB=0.0141946;RO=24;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062672;STB=0.535342;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00802626;OID=.;OPOS=34158529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:9:14:13:11:9:14:13:11 chr15 34168116 . C G 473.91 PASS AF=0.49;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0727863;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6421;QD=18.9564;RBI=0.0872219;REFB=-0.00710904;REVB=0.0480605;RO=50;SAF=33;SAR=16;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220707;STB=0.627853;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00951797;OID=.;OPOS=34168116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:50:51:49:49:0.49:16:33:22:28:16:33:22:29 chr15 34356988 . G A 1320.94 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00731626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.758;QD=62.1617;RBI=0.0245795;REFB=0;REVB=0.0234654;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26488e-05;OID=.;OPOS=34356988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr15 34357259 . T A 583.75 PASS AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0285546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.007;QD=54.3021;RBI=0.0285829;REFB=-0.0463248;REVB=-0.00127197;RO=3;SAF=17;SAR=23;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758422;STB=0.54052;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000734501;OID=.;OPOS=34357259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:43:43:3:3:40:40:0.930233:23:17:3:0:23:17:3:0 chr15 34517929 . T C 1630.09 PASS AF=0.990909;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253545;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.826;QD=59.2759;RBI=0.0394016;REFB=-0.133136;REVB=0.0301602;RO=1;SAF=69;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117188;STB=0.506172;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.000686025;OID=.;OPOS=34517929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:111:110:1:1:109:109:0.990909:40:69:0:1:40:69:0:1 chr15 34522108 . ACTC AC,ACTT 716.98 PASS AF=0.884615,0.115385;AO=42,5;DP=53;FAO=46,6;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18,1;FSAR=28,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871373,0.00495625;FXX=0.0370302;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=253.629,232.942;QD=55.1523;RBI=0.0271269,0.0344097;REFB=0,0;REVB=0.0256893,0.0340509;RO=0;SAF=15,0;SAR=27,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.13648e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00186194,-0.0092959;OID=.,.;OPOS=34522109,34522111;OREF=CT,C;OALT=-,T;OMAPALT=AC,ACTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.884615,0.115385:42,5:53:46,6:52:0:18,1:28,5:0:0:27:0:15,0:27,5:0:0 chr15 34522935 . GAGAC G 880.7 PASS AF=0.954545;AO=60;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0293079;FXX=0.0704126;HRUN=1;LEN=4;MLLD=271.519;QD=53.3756;RBI=0.029308;REFB=-0.00591628;REVB=-4.77242e-05;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.507216;STBP=0.735;TYPE=del;VARB=0.000148798;OID=.;OPOS=34522936;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.954545:60:66:63:66:3:31:32:1:2:10:0:29:31:0:0 chr15 34522985 . C G 1212.29 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183565;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.767;QD=61.3815;RBI=0.0280846;REFB=0;REVB=0.0212553;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181808;OID=.;OPOS=34522985;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0 chr15 34524995 . G T 1190.56 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.817;QD=61.0543;RBI=0.0108915;REFB=0;REVB=0.00881221;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30889e-05;OID=.;OPOS=34524995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:30:46:0:0:32:46:0:0 chr15 34537966 . T G 358.93 PASS AF=0.5;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0161449;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7736;QD=19.4014;RBI=0.042748;REFB=-0.0112755;REVB=-0.0395819;RO=35;SAF=13;SAR=24;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981174;STB=0.570951;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00283876;OID=.;OPOS=34537966;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:35:37:37:37:0.5:24:13:16:19:24:13:18:19 chr15 34542872 . C G 632.26 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.735;QD=61.6835;RBI=0.00570913;REFB=0;REVB=-0.00180791;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7507e-05;OID=.;OPOS=34542872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:20:20:0:0:21:20:0:0 chr15 34544468 . C T 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4953;QD=64.4116;RBI=0.0319054;REFB=0;REVB=-0.010637;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000427168;OID=.;OPOS=34544468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr15 34551082 . G A 1151.65 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.161;QD=60.6129;RBI=0.0163798;REFB=0;REVB=0.00619944;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20423e-05;OID=.;OPOS=34551082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:36:39:0:0:37:39:0:0 chr15 34635863 . G C 834.91 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9915;QD=57.5798;RBI=0.025774;REFB=0;REVB=0.0116515;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225786;OID=.;OPOS=34635863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:30:27:0:0:30:28:0:0 chr15 34638198 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.606;QD=57.5458;RBI=0.0317817;REFB=0;REVB=0.00911788;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21058e-05;OID=.;OPOS=34638198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:31:26:0:0:32:26:0:0 chr15 34640218 . C T 1623.73 PASS AF=0.991304;AO=110;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0822185;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.2655;QD=56.4774;RBI=0.0845525;REFB=-0.161306;REVB=0.0197291;RO=3;SAF=71;SAR=39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196345;STB=0.503311;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00278867;OID=.;OPOS=34640218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:115:115:3:1:110:114:0.991304:39:71:3:0:39:75:1:0 chr15 34640378 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00975696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.59;QD=50.4134;RBI=0.0109624;REFB=0;REVB=0.00499765;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.18603e-05;OID=.;OPOS=34640378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0 chr15 34647837 . AG A,GA 52.69 PASS AF=0.5,0;AO=9,2;DP=22;FAO=11,0;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6,0;FSAR=5,0;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0389662,-0.00312022;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=12.3552,128.437;QD=9.58053;RBI=0.169581,0.00312755;REFB=-0.0858656,-0.0259342;REVB=0.165044,-0.000213911;RO=11;SAF=6,0;SAR=3,2;SRF=1;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0.461538,0;SSSB=0.499266,-0.451439;STB=0.719663,0.5;STBP=0.069,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.111138,0;OID=.,.;OPOS=34647838,34647837;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:9,2:11,0:0.5,0:3,2:6,0:1:10:5,0:6,0:1:10 chr15 34673722 . C T 74.27 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.000739361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.448;QD=10.2438;RBI=0.0159336;REFB=0.00757057;REVB=0.0159165;RO=19;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200623;STB=0.621967;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.0105447;OID=.;OPOS=34673722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:3:7:10:9:3:7:10:9 chr15 35045057 . G A 550.41 PASS AF=0.539216;AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00183456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.555;QD=21.5847;RBI=0.0209701;REFB=-0.0180631;REVB=0.0208897;RO=47;SAF=30;SAR=25;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11803;STB=0.564808;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0127926;OID=.;OPOS=35045057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:47:47:55:55:0.539216:25:30:19:28:25:30:19:28 chr15 35045312 . T A 223.86 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0099397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.461;QD=19.4663;RBI=0.0100093;REFB=-0.012616;REVB=0.00117875;RO=24;SAF=6;SAR=16;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677659;STB=0.538426;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0199598;OID=.;OPOS=35045312;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:16:6:8:16:16:6:8:16 chr15 35080931 . T C 590.92 PASS AF=0.65;AO=51;DP=81;FAO=52;FDP=80;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00716861;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.443;QD=29.5459;RBI=0.0117448;REFB=-0.0103051;REVB=0.00930335;RO=26;SAF=22;SAR=29;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545751;STB=0.5238;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00515937;OID=.;OPOS=35080931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:26:28:51:52:0.65:29:22:9:17:30:22:10:18 chr15 35149008 . C T 2025.57 PASS AF=0.957143;AO=134;DP=140;FAO=134;FDP=140;FR=.;FRO=6;FSAF=62;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0070996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.24;QD=57.8734;RBI=0.0144953;REFB=-0.00458774;REVB=-0.0126377;RO=5;SAF=62;SAR=72;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180708;STB=0.505579;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000260185;OID=.;OPOS=35149008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:140:140:5:6:134:134:0.957143:72:62:1:4:72:62:2:4 chr15 35230934 . A ATAGT,T 316.61 PASS AF=0.916667,0.0833333;AO=21,2;DP=24;FAO=22,2;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13,2;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122824,0.00172608;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=191.261,78.5907;QD=52.7681;RBI=0.0256685,0.00321555;REFB=0,0;REVB=0.0225392,0.00271301;RO=0;SAF=13,2;SAR=8,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000133277,-0.0413431;OID=.,.;OPOS=35230935,35230934;OREF=-,A;OALT=TAGT,T;OMAPALT=ATAGT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:24:24:0:0:21,2:22,2:0.916667,0.0833333:8,0:13,2:0:0:9,0:13,2:0:0 chr15 35256624 . C G 1135.07 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.686;QD=60.5372;RBI=0.0388105;REFB=0;REVB=-0.0105114;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.37365e-05;OID=.;OPOS=35256624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:42:33:0:0:42:33:0:0 chr15 35665765 . G C 370.87 PASS AF=0.392857;AO=44;DP=112;FAO=44;FDP=112;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0368305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9348;QD=13.2453;RBI=0.0389896;REFB=-0.000511379;REVB=-0.0127945;RO=68;SAF=27;SAR=17;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18531;STB=0.605087;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000362492;OID=.;OPOS=35665765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:68:68:44:44:0.392857:17:27:30:38:17:27:30:38 chr15 36946303 . C G 2514.34 PASS AF=1;AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171407;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.755;QD=61.7016;RBI=0.0396065;REFB=0;REVB=0.0357053;RO=0;SAF=79;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.36235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3523e-06;OID=.;OPOS=36946303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:164:163:0:0:163:163:1:84:79:0:0:84:79:0:0 chr15 36983962 . T C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.908;QD=58.9627;RBI=0.0257756;REFB=0;REVB=0.0144788;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07593e-05;OID=.;OPOS=36983962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0 chr15 37343040 . C G 1193.65 PASS AF=1;AO=76;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150599;FXX=0.0609682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.606;QD=62.0076;RBI=0.0196922;REFB=0;REVB=-0.0126879;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.00717e-07;OID=.;OPOS=37343040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:77:0:0:76:77:1:37:39:0:0:38:39:0:0 chr15 38233869 . T C 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00874612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.145;QD=58.6006;RBI=0.0108957;REFB=0;REVB=0.00649784;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05712e-05;OID=.;OPOS=38233869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr15 38235521 . T A 538.5 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000923213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.522;QD=59.8332;RBI=0.0337572;REFB=0;REVB=0.0337446;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030149;OID=.;OPOS=38235521;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr15 38614525 . G A 1490.73 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.017;QD=63.4355;RBI=0.0151747;REFB=0;REVB=0.00611891;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.71884e-06;OID=.;OPOS=38614525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:94:0:0:92:94:1:41:51:0:0:43:51:0:0 chr15 38643574 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.925;QD=59.3225;RBI=0.0332899;REFB=0;REVB=0.0329728;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105512;OID=.;OPOS=38643574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0 chr15 39545032 . T G 2301.17 PASS AF=0.986486;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.025123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.322;QD=62.1937;RBI=0.0356371;REFB=-0.122222;REVB=0.0252752;RO=2;SAF=85;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153348;STB=0.508063;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.000253431;OID=.;OPOS=39545032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:148:148:2:2:146:146:0.986486:61:85:0:2:61:85:0:2 chr15 39545268 . G A 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0029024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.52;QD=57.0006;RBI=0.0221238;REFB=0;REVB=0.0219326;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.00843e-05;OID=.;OPOS=39545268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0 chr15 39546114 . A G 220.38 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00482222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4842;QD=16.0276;RBI=0.0253621;REFB=0.0121173;REVB=0.0248994;RO=30;SAF=13;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128786;STB=0.507283;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0161002;OID=.;OPOS=39546114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:12:13:16:14:12:13:16:14 chr15 39879717 . G A 495.63 PASS AF=0.5;AO=51;DP=105;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00196932;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.839;QD=19.0628;RBI=0.00828084;REFB=0.000899684;REVB=0.00804326;RO=53;SAF=22;SAR=29;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140824;STB=0.576893;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.000737353;OID=.;OPOS=39879717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:53:52:51:52:0.5:29:22:31:22:30:22:30:22 chr15 39880358 . C T 431.62 PASS AF=0.418803;AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.00263524;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.679;QD=14.7561;RBI=0.00618861;REFB=-0.0109688;REVB=-0.0055995;RO=67;SAF=18;SAR=31;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707396;STB=0.536238;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0123366;OID=.;OPOS=39880358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:67:68:49:49:0.418803:31:18:29:38:31:18:29:39 chr15 39880822 . A G 747.45 PASS AF=0.437158;AO=80;DP=184;FAO=80;FDP=183;FR=.;FRO=103;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=47;FWDB=-0.00586288;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5577;QD=16.3376;RBI=0.00766805;REFB=-0.0117143;REVB=-0.00494222;RO=102;SAF=31;SAR=49;SRF=55;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154465;STB=0.588871;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0128286;OID=.;OPOS=39880822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:102:103:80:80:0.437158:49:31:55:47:49:31:56:47 chr15 39910052 . C G 388.79 PASS AF=0.386555;AO=46;DP=117;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.0538875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1666;QD=13.0686;RBI=0.0619447;REFB=0.0229776;REVB=-0.0305497;RO=71;SAF=24;SAR=22;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166059;STB=0.600828;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0377988;OID=.;OPOS=39910052;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:119:71:73:46:46:0.386555:22:24:26:45:22:24:26:47 chr15 39910404 . G A 238.62 PASS AF=0.465517;AO=26;DP=57;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00244789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.963;QD=16.4562;RBI=0.00797275;REFB=-0.00269485;REVB=-0.00758766;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00961627;STB=0.503873;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00319262;OID=.;OPOS=39910404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:31:31:26:27:0.465517:12:14:17:14:12:15:17:14 chr15 39910431 . A G 188.7 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0117895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.615;QD=14.2416;RBI=0.0166786;REFB=0.00186407;REVB=0.0117977;RO=31;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300867;STB=0.517226;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.00529437;OID=.;OPOS=39910431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:12:10:15:16:12:10:15:16 chr15 40226414 . GGCCCCCG GCCCCG,GGCCCC,GGCCCCG 114.31 PASS AF=0,0,1;AO=2,2,7;DP=19;FAO=0,0,16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,12;FSAR=0,0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0937031,-0.0104913,0.217133;FXX=0.111049;HRUN=4,5,5;LEN=2,2,1;MLLD=11.5682,10.9495,12.7105;QD=28.5782;RBI=0.328303,0.0350111,0.263397;REFB=0.0155886,0.0173914,-0.0932663;REVB=-0.314646,-0.0334022,0.149102;RO=5;SAF=0,2,6;SAR=2,0,1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.611111,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.64233,0.589598,0.275355;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0,0.0521203;OID=.,.,.;OPOS=40226415,40226420,40226416;OREF=GC,CG,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCCCCG,GGCCCC,GGCCCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:0,0,1:2,2,7:19:0,0,16:16:0:0,0,12:0,0,4:0:0:5:5:0,2,6:2,0,1:3:2 chr15 40226495 . T C 1229.28 PASS AF=0.965116;AO=82;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00341305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.449;QD=57.1756;RBI=0.00699215;REFB=-0.0138766;REVB=0.00610257;RO=3;SAF=47;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029269;STB=0.51546;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=2.26633e-05;OID=.;OPOS=40226495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:86:86:3:3:82:83:0.965116:35:47:3:0:36:47:3:0 chr15 40259848 . A C 1062.43 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00779736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.363;QD=59.8551;RBI=0.0104196;REFB=0;REVB=0.00691157;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.87659e-06;OID=.;OPOS=40259848;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:33:38:0:0:33:38:0:0 chr15 40265799 . A G 1261.39 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6323;QD=60.7898;RBI=0.0625704;REFB=0;REVB=-0.0480589;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003262;OID=.;OPOS=40265799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:47:34:0:0:47:36:0:0 chr15 40327290 . A G 1468.92 PASS AF=0.493377;AO=149;DP=301;FAO=149;FDP=302;FR=.;FRO=153;FSAF=82;FSAR=67;FSRF=81;FSRR=72;FWDB=0.00478661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.054;QD=19.4559;RBI=0.00556256;REFB=-0.0108289;REVB=-0.00283381;RO=152;SAF=82;SAR=67;SRF=81;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161854;STB=0.510685;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0117639;OID=.;OPOS=40327290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:302:152:153:149:149:0.493377:67:82:81:71:67:82:81:72 chr15 40327301 . G A 1362.43 PASS AF=0.474227;AO=138;DP=291;FAO=138;FDP=291;FR=.;FRO=153;FSAF=74;FSAR=64;FSRF=79;FSRR=74;FWDB=-0.0326993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9643;QD=18.7275;RBI=0.0496528;REFB=-0.00245536;REVB=-0.0373652;RO=150;SAF=74;SAR=64;SRF=78;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154205;STB=0.510496;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00223023;OID=.;OPOS=40327301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:291:150:153:138:138:0.474227:64:74:78:72:64:74:79:74 chr15 40328575 . G C 248.37 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0308267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.079;QD=11.6882;RBI=0.0330428;REFB=-0.0318866;REVB=0.011897;RO=55;SAF=12;SAR=18;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143409;STB=0.582883;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0682819;OID=.;OPOS=40328575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:18:12:29:26:18:12:29:26 chr15 40330564 . C T 103.92 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.010502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9133;QD=10.1382;RBI=0.0665174;REFB=0.00219305;REVB=-0.0656831;RO=28;SAF=10;SAR=3;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258518;STB=0.657631;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.00922807;OID=.;OPOS=40330564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:3:10:16:12:3:10:16:12 chr15 40383347 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.499;QD=57.7124;RBI=0.0363293;REFB=0;REVB=0.0229234;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74972e-05;OID=.;OPOS=40383347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:22:37:0:0:22:37:0:0 chr15 40383779 . A C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0062256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=326.957;QD=12.4823;RBI=0.00627363;REFB=0.00529778;REVB=-0.000774871;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851185;STB=0.54992;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.00940899;OID=.;OPOS=40383779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:5:14:8:4:5:14 chr15 40426913 . C A 976.55 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00842804;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.029;QD=59.1849;RBI=0.0135652;REFB=0;REVB=0.0106293;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162119;OID=.;OPOS=40426913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0 chr15 40477831 . G A 972.85 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.616;QD=58.9608;RBI=0.0411147;REFB=0;REVB=-0.00673463;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277711;OID=.;OPOS=40477831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0 chr15 40488851 . G A 220.74 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0468548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.492;QD=16.0538;RBI=0.0498392;REFB=-0.0221449;REVB=-0.0169875;RO=28;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108765;STB=0.522238;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0227016;OID=.;OPOS=40488851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:28:30:25:25:0.454545:14:11:12:16:14:11:12:18 chr15 40558087 . G A 739.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378496;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.92;QD=60.3711;RBI=0.0464221;REFB=0;REVB=0.0268778;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215272;OID=.;OPOS=40558087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:29:16:0:0:31:18:0:0 chr15 40568823 . C A 284.58 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0931452;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6109;QD=17.7865;RBI=0.10723;REFB=0.000885261;REVB=0.0531238;RO=33;SAF=10;SAR=21;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26646;STB=0.649386;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00217454;OID=.;OPOS=40568823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:21:10:20:13:21:10:20:13 chr15 40573675 . G T 315.76 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0207851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.19;QD=19.7348;RBI=0.0226918;REFB=-0.0400863;REVB=-0.00910475;RO=31;SAF=20;SAR=13;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19067;STB=0.605996;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0472021;OID=.;OPOS=40573675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:13:20:12:19:13:20:12:19 chr15 40573716 . A G 1062.29 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.072;QD=59.8473;RBI=0.0199351;REFB=0;REVB=-0.0180878;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.25154e-05;OID=.;OPOS=40573716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0 chr15 40581543 . T C 487.35 PASS AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.000879984;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.158;QD=21.422;RBI=0.0107791;REFB=-0.0202923;REVB=0.0107431;RO=44;SAF=22;SAR=25;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067652;STB=0.537367;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0201684;OID=.;OPOS=40581543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:25:22:24:20:25:22:24:20 chr15 40583876 . T G 393.27 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1741;QD=56.1808;RBI=0.128256;REFB=0;REVB=0.125157;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119841;OID=.;OPOS=40583876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr15 40589002 . A G 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.178;QD=58.4194;RBI=0.00897088;REFB=0;REVB=-0.00884953;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28848e-05;OID=.;OPOS=40589002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0 chr15 40590134 . G A 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.995;QD=60.2042;RBI=0.016807;REFB=0;REVB=-0.00459681;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2797e-05;OID=.;OPOS=40590134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:44:29:0:0:44:29:0:0 chr15 40633138 . A T 801.31 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5068;QD=57.2362;RBI=0.0385974;REFB=0;REVB=0.0293634;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418607;OID=.;OPOS=40633138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0 chr15 40655845 . C G 145.23 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109802;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.0747;QD=44.6869;RBI=0.112331;REFB=0;REVB=-0.0237039;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00480641;OID=.;OPOS=40655845;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:11:2:0:0:11:2:0:0 chr15 40655873 . G C 175.58 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7616;QD=46.8204;RBI=0.0455559;REFB=0;REVB=-0.00918789;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604375;OID=.;OPOS=40655873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:13:2:0:0:13:2:0:0 chr15 40656141 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00279013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.655;QD=45.8068;RBI=0.0105523;REFB=0;REVB=0.0101768;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112845;OID=.;OPOS=40656141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr15 40662501 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.501;QD=64.1531;RBI=0.0596971;REFB=0;REVB=0.0485724;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328917;OID=.;OPOS=40662501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:33:16:0:0:33:16:0:0 chr15 40710723 . G A 905.35 PASS AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0597017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3136;QD=56.5846;RBI=0.0949293;REFB=-0.105567;REVB=0.0738057;RO=1;SAF=39;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119536;STB=0.506327;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00317753;OID=.;OPOS=40710723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:62:63:0.984375:23:39:1:0:24:39:1:0 chr15 40751555 . C A 375.56 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5645;QD=55.6391;RBI=0.0464345;REFB=0;REVB=0.0261968;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758867;OID=.;OPOS=40751555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:7:19:0:0:8:19:0:0 chr15 40849408 . C T 1343.6 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0308449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1706;QD=61.0726;RBI=0.0353117;REFB=-0.0349231;REVB=0.0171903;RO=0;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00045452;OID=.;OPOS=40849408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:0:1:87:87:0.988636:40:47:0:0:40:47:1:0 chr15 40856989 . C T 336.84 PASS AF=0.818182;AO=27;DP=33;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0213612;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.861;QD=40.8293;RBI=0.0214558;REFB=-0.0854993;REVB=0.00201286;RO=2;SAF=10;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842653;STB=0.615298;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00589523;OID=.;OPOS=40856989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:33:33:2:6:27:27:0.818182:17:10:2:0:17:10:6:0 chr15 40914038 . A C 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0238469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.462;QD=19.646;RBI=0.033254;REFB=-0.00495181;REVB=0.0231766;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932099;STB=0.553098;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00498404;OID=.;OPOS=40914038;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:4:7:6:2:4:7:6:2 chr15 41105926 . T G 119.51 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00520602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.799;QD=13.6578;RBI=0.0463097;REFB=-0.00665316;REVB=-0.0460161;RO=18;SAF=12;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478053;STB=0.79952;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00461161;OID=.;OPOS=41105926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:21:14:14:0.4:2:12:8:10:2:12:9:12 chr15 41148199 . C T 469.16 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203317;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.427;QD=58.6454;RBI=0.0270626;REFB=0;REVB=0.0178607;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122837;OID=.;OPOS=41148199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr15 41149161 . G C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00791584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.182;QD=51.1846;RBI=0.0326656;REFB=0;REVB=0.031692;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160317;OID=.;OPOS=41149161;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0 chr15 41271718 . C T 1851.09 PASS AF=0.97619;AO=120;DP=120;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0107319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.689;QD=58.7647;RBI=0.0298773;REFB=-0.0249719;REVB=0.0278833;RO=0;SAF=62;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84183e-08;STB=0.511626;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=6.8018e-05;OID=.;OPOS=41271718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:120:126:0:3:120:123:0.97619:58:62:0:0:60:63:3:0 chr15 41476209 . T C 192.65 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00504935;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.68;QD=21.4051;RBI=0.0235765;REFB=-0.00829641;REVB=0.0230294;RO=17;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354222;STB=0.519979;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0132431;OID=.;OPOS=41476209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:13:6:6:11:13:6:6:11 chr15 41476465 . G A 251.69 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0148428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.867;QD=17.064;RBI=0.0151336;REFB=-0.0128667;REVB=0.00295208;RO=31;SAF=13;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423766;STB=0.523793;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0166793;OID=.;OPOS=41476465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:15:13:13:18:15:13:13:18 chr15 41484287 . C A 162.55 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0452278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=354.9;QD=19.7024;RBI=0.0454198;REFB=-0.0199853;REVB=0.00417153;RO=16;SAF=1;SAR=16;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474492;STB=0.780039;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0185214;OID=.;OPOS=41484287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:16:1:5:11:16:1:5:11 chr15 41509288 . T A 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0128518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.514;QD=9.19973;RBI=0.0187068;REFB=-0.0103584;REVB=0.0135932;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191487;STB=0.6151;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0238878;OID=.;OPOS=41509288;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:11:2:2:5:11:2 chr15 41611874 . G A 133.78 PASS AF=0.482759;AO=12;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0217272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1444;QD=18.4517;RBI=0.0918124;REFB=0.021155;REVB=0.0892046;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103751;STB=0.571326;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.018551;OID=.;OPOS=41611874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:14:12:14:0.482759:6:6:8:5:8:6:8:6 chr15 41634587 . AC GA 165.06 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.00641891;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=240.877;QD=14.0472;RBI=0.00647679;REFB=0.00252129;REVB=-0.000863942;RO=29;SAF=5;SAR=13;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.455858;STB=0.762704;STBP=0.012;TYPE=mnp;VARB=-0.00218205;OID=.;OPOS=41634587;OREF=AC;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:13:5:21:8:13:5:21:8 chr15 41663884 . TAAAAAAAAAAAA TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAC 133.77 PASS AF=0,0.125,0.4375,0.4375;AO=2,3,3,4;DP=17;FAO=0,2,7,7;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,1,1;FSAR=0,2,6,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.809155,-0.578229,-0.418771,-0.150489;FXX=0.0587889;HRUN=15,15,15,15;LEN=1,2,3,1;MLLD=3.19085,5.86636,7.62342,210.263;QD=33.4434;RBI=0.855987,0.597161,0.430714,0.150962;REFB=0,0,0,0;REVB=0.279252,0.149174,0.100725,0.0119338;RO=0;SAF=0,0,0,0;SAR=2,3,3,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=-0.0334484,0.0277285,0.0871789,-0.00132535;OID=.,.,.,.;OPOS=41663885,41663885,41663885,41663896;OREF=A,AA,AAA,A;OALT=-,-,-,C;OMAPALT=TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/4:0,0.125,0.4375,0.4375:2,3,3,4:17:0,2,7,7:16:0:0,0,1,1:0,2,6,6:0:0:29:0:0,0,0,0:2,3,3,4:0:0 chr15 41672384 . A G 92.86 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.000940625;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.332;QD=8.84412;RBI=0.00950224;REFB=-0.000503484;REVB=0.00945557;RO=29;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295406;STB=0.646855;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00337191;OID=.;OPOS=41672384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:43:42:29:30:12:12:0.285714:8:4:4:25:8:4:5:25 chr15 41813279 . C T 105.49 PASS AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00598513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.799;QD=8.1143;RBI=0.00630535;REFB=-0.00549229;REVB=0.00198384;RO=38;SAF=5;SAR=9;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112078;STB=0.568865;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0138053;OID=.;OPOS=41813279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:9:5:17:21:9:5:17:21 chr15 41815516 . G C 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.435;QD=60.7162;RBI=0.0505878;REFB=0;REVB=0.00931772;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108425;OID=.;OPOS=41815516;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:46:30:0:0:46:30:0:0 chr15 41819716 . C T 558.86 PASS AF=0.522936;AO=57;DP=109;FAO=57;FDP=109;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0245112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7427;QD=20.5084;RBI=0.0349412;REFB=-0.0133749;REVB=0.0249015;RO=52;SAF=19;SAR=38;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152904;STB=0.584385;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00726879;OID=.;OPOS=41819716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:52:52:57:57:0.522936:38:19:26:26:38:19:26:26 chr15 41821752 . T C 137.89 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0151595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5284;QD=11.491;RBI=0.0157067;REFB=0.016916;REVB=0.00410953;RO=32;SAF=3;SAR=13;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502974;STB=0.799082;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0264394;OID=.;OPOS=41821752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:13:3:20:12:13:3:20:12 chr15 41829230 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.415;QD=62.0218;RBI=0.0728834;REFB=0;REVB=0.029655;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292599;OID=.;OPOS=41829230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0 chr15 41991315 . A T 468.91 PASS AF=1;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0073844;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8539;QD=58.6133;RBI=0.0091358;REFB=0;REVB=0.00537899;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100451;OID=.;OPOS=41991315;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:34:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr15 42026764 . C T 1097.81 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.15;QD=60.1541;RBI=0.0191142;REFB=0;REVB=-0.00126242;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28444e-05;OID=.;OPOS=42026764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:28:44:0:0:28:45:0:0 chr15 42041712 . G A 160.55 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.043;QD=45.8711;RBI=0.0428371;REFB=0;REVB=0.0385321;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000349298;OID=.;OPOS=42041712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:5:8:0:0:6:8:0:0 chr15 42134097 . C T 358.09 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.762;QD=55.0905;RBI=0.0360947;REFB=0;REVB=0.0262302;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534758;OID=.;OPOS=42134097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:21:5:0:0:21:5:0:0 chr15 42135988 . C T 2740.71 PASS AF=0.98895;AO=176;DP=181;FAO=179;FDP=181;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0271459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.882;QD=60.5682;RBI=0.0452963;REFB=-0.166215;REVB=0.036261;RO=1;SAF=90;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526001;STB=0.505746;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.000403026;OID=.;OPOS=42135988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:181:181:1:2:176:179:0.98895:86:90:1:0:86:93:0:2 chr15 42138321 . A G 94.89 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.765;QD=37.9547;RBI=0.0902203;REFB=0;REVB=0.0887226;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195858;OID=.;OPOS=42138321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:3:6:0:0:3:7:0:0 chr15 42139642 . C T 666.77 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0920301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.825;QD=57.9804;RBI=0.102694;REFB=0.163408;REVB=0.0455682;RO=2;SAF=5;SAR=39;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732577;STB=0.539152;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00972503;OID=.;OPOS=42139642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:39:5:1:1:39:5:1:1 chr15 42143533 . T G 271.6 PASS AF=0.538462;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0958771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9254;QD=20.8925;RBI=0.0966798;REFB=-0.00872857;REVB=0.012433;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104946;STB=0.545423;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00558813;OID=.;OPOS=42143533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:23:24:28:28:0.538462:16:12:7:16:16:12:8:16 chr15 42149472 . T C 1680.33 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133863;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.291;QD=60.5524;RBI=0.0279016;REFB=0;REVB=0.0244807;RO=0;SAF=43;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9744e-05;OID=.;OPOS=42149472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:111:0:0:111:111:1:68:43:0:0:68:43:0:0 chr15 42149506 . G C 1157.44 PASS AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0195531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.097;QD=59.3558;RBI=0.0210381;REFB=-0.106653;REVB=0.00776413;RO=1;SAF=21;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852763;STB=0.504503;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.000439806;OID=.;OPOS=42149506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:55:21:0:1:55:22:0:1 chr15 42170578 . G A 1504.12 PASS AF=0.971698;AO=103;DP=109;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0149591;FXX=0.0275204;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.186;QD=56.7593;RBI=0.033445;REFB=-0.104108;REVB=0.0299131;RO=2;SAF=35;SAR=68;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00643621;STB=0.500204;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.000708145;OID=.;OPOS=42170578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:109:106:2:3:103:103:0.971698:68:35:1:1:68:35:1:2 chr15 42171483 . G A 2061.43 PASS AF=0.992647;AO=133;DP=137;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00296713;FXX=0.0144917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.748;QD=60.6302;RBI=0.0290192;REFB=-0.115889;REVB=0.0288671;RO=1;SAF=60;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785622;STB=0.504132;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000877383;OID=.;OPOS=42171483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:137:136:1:1:133:135:0.992647:73:60:1:0:75:60:1:0 chr15 42171537 . A G 1934.06 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.653;QD=61.89;RBI=0.0536662;REFB=0;REVB=0.031184;RO=0;SAF=61;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110664;OID=.;OPOS=42171537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:63:61:0:0:63:62:0:0 chr15 42178122 . T C 1264.5 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00783097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.41;QD=61.683;RBI=0.00875032;REFB=0;REVB=0.00390438;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.09791e-06;OID=.;OPOS=42178122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0 chr15 42178155 . T C 1382.35 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00260143;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.884;QD=62.8341;RBI=0.0189005;REFB=0;REVB=0.0187206;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483486;OID=.;OPOS=42178155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0 chr15 42187492 . T C 657.52 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0642999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.652;QD=59.7742;RBI=0.0647759;REFB=0.000500919;REVB=0.00783802;RO=1;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218371;STB=0.511622;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000192479;OID=.;OPOS=42187492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:22:21:1:0:22:21:1:0 chr15 42284974 . G A 187.84 PASS AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0178329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.426;QD=10.889;RBI=0.0179682;REFB=-0.0149693;REVB=-0.00220053;RO=45;SAF=11;SAR=13;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839416;STB=0.548813;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0193868;OID=.;OPOS=42284974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:13:11:24:21:13:11:24:21 chr15 42287578 . G A 585.49 PASS AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0222293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8081;QD=28.2166;RBI=0.0480662;REFB=0.00227426;REVB=0.0426171;RO=31;SAF=17;SAR=35;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139451;STB=0.57603;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.000704783;OID=.;OPOS=42287578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:35:17:16:15:35:17:16:15 chr15 42297112 . GC G 318.26 PASS AF=0.541667;AO=48;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.11332;FXX=0.0103082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.2085;QD=13.2608;RBI=0.120856;REFB=-0.0314565;REVB=-0.0420068;RO=42;SAF=23;SAR=25;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430234;STB=0.515479;STBP=0.78;TYPE=del;VARB=0.0299196;OID=.;OPOS=42297113;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.541667:48:96:52:96:44:23:29:18:26:99:42:23:25:18:24 chr15 42302433 . A G 89.09 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0194227;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.205;QD=13.7054;RBI=0.0197752;REFB=-0.00869489;REVB=-0.00371702;RO=15;SAF=1;SAR=10;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407996;STB=0.749422;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00502874;OID=.;OPOS=42302433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:26:26:15:15:11:11:0.423077:10:1:5:10:10:1:5:10 chr15 42302437 . G C 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0402286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.861;QD=12.182;RBI=0.0426992;REFB=-0.0172157;REVB=-0.0143136;RO=15;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449007;STB=0.777086;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0107382;OID=.;OPOS=42302437;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:9:1:6:9:9:1:6:9 chr15 42371752 . A T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00457627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.794;QD=53.2772;RBI=0.00737367;REFB=0;REVB=0.00578176;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96218e-06;OID=.;OPOS=42371752;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr15 42373810 . G C 3134.45 PASS AF=0.985646;AO=203;DP=206;FAO=206;FDP=209;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=123;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0145013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.303;QD=59.9895;RBI=0.045059;REFB=-0.0747964;REVB=0.0426618;RO=2;SAF=82;SAR=121;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114739;STB=0.508875;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.000271458;OID=.;OPOS=42373810;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:206:209:2:3:203:206:0.985646:121:82:2:0:123:83:3:0 chr15 42377744 . C G 606.25 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.379;QD=59.1463;RBI=0.0366447;REFB=-0.0704532;REVB=0.0263295;RO=1;SAF=15;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302369;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000507504;OID=.;OPOS=42377744;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:41:41:1:0:40:41:1:25:15:1:0:25:16:0:0 chr15 42433802 . A G 383.69 PASS AF=0.470588;AO=38;DP=84;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00375094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.6;QD=18.056;RBI=0.0272647;REFB=-0.0219998;REVB=-0.0270054;RO=43;SAF=17;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391777;STB=0.508892;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0257953;OID=.;OPOS=42433802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:43:45:38:40:0.470588:21:17:21:22:22:18:21:24 chr15 42434254 . G A 220.96 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0170981;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.595;QD=16.0695;RBI=0.034118;REFB=-0.00313332;REVB=0.0295244;RO=30;SAF=17;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118934;STB=0.567512;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00455754;OID=.;OPOS=42434254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:30:30:25:25:0.454545:8:17:17:13:8:17:17:13 chr15 42434837 . T C 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0194262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.291;QD=18.2511;RBI=0.0290037;REFB=-0.00731172;REVB=0.0215368;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118644;STB=0.56748;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0132398;OID=.;OPOS=42434837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:8:7:5:10:8:7:5:10 chr15 42444918 . C G 91.02 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.121603;FXX=0.039208;HRUN=4;LEN=1;MLLD=24.884;QD=7.43035;RBI=0.141792;REFB=-0.0550973;REVB=0.0729223;RO=26;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331209;STB=0.700568;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0659784;OID=.;OPOS=42444918;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:51:49:26:31:10:10:0.204082:4:6:8:18:4:6:10:21 chr15 42444920 . GA AC 70.45 PASS AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0290466;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=2;MLLD=47.6455;QD=5.63562;RBI=0.079162;REFB=-0.0127841;REVB=-0.0736404;RO=34;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897825;STB=0.604132;STBP=0.491;TYPE=mnp;VARB=0.0850454;OID=.;OPOS=42444920;OREF=GA;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:50:50:34:39:11:11:0.22:5:6:16:18:5:6:16:23 chr15 42553217 . AAT A,AA,AAA 410.79 PASS AF=0,1,0;AO=13,12,2;DP=31;FAO=0,29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18,0;FSAR=0,11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0775009,0.10852,0.119833;FXX=0;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=258.302,264.083,258.745;QD=56.661;RBI=0.0801986,0.110056,0.120892;REFB=0,0,0;REVB=0.0206259,0.0183221,0.0159631;RO=3;SAF=12,3,0;SAR=1,9,2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.10082,-0.295997,-0.74993;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0320678,0.000268334,0;OID=.,.,.;OPOS=42553218,42553219,42553219;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1,0:13,12,2:31:0,29,0:29:0:0,18,0:0,11,0:0:0:4:3:12,3,0:1,9,2:3:0 chr15 42565588 . C A 259.13 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0214653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.372;QD=24.1054;RBI=0.0222664;REFB=-0.000654032;REVB=-0.00591894;RO=18;SAF=10;SAR=14;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112762;STB=0.546521;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000575432;OID=.;OPOS=42565588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:19:24:24:0.55814:14:10:5:13:14:10:6:13 chr15 42568547 . C G 655.94 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00613542;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.687;QD=62.4704;RBI=0.0152113;REFB=0;REVB=0.0139191;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442437;OID=.;OPOS=42568547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr15 42570718 . A G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.911;QD=59.0187;RBI=0.0470483;REFB=0;REVB=-0.00304482;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016144;OID=.;OPOS=42570718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr15 42575963 . A G 545.38 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0314145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.559;QD=57.408;RBI=0.080947;REFB=-0.0425057;REVB=0.0746027;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.514278;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000732904;OID=.;OPOS=42575963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:17:20:0:0:17:20:0:1 chr15 42579948 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.781;QD=57.7123;RBI=0.0183762;REFB=0;REVB=0.00352487;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.02687e-05;OID=.;OPOS=42579948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:39:20:0:0:39:20:0:0 chr15 42834962 . C T 185.82 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0249999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.436;QD=19.0584;RBI=0.025048;REFB=-0.0190753;REVB=-0.00155129;RO=20;SAF=6;SAR=13;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45787;STB=0.756716;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0198078;OID=.;OPOS=42834962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:13:6:17:3:13:6:17:3 chr15 43016796 . C T 480.96 PASS AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0026745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.451;QD=22.9027;RBI=0.00599572;REFB=-0.00549557;REVB=-0.00536616;RO=38;SAF=26;SAR=20;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223813;STB=0.622782;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0039431;OID=.;OPOS=43016796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:20:26:11:27:20:26:11:27 chr15 43045026 . T C 484.63 PASS AF=0.716667;AO=42;DP=60;FAO=43;FDP=60;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.020355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.059;QD=32.3083;RBI=0.0203603;REFB=-0.0314104;REVB=0.000462356;RO=17;SAF=20;SAR=22;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283426;STB=0.511622;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0106578;OID=.;OPOS=43045026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:17:17:42:43:0.716667:22:20:9:8:22:21:9:8 chr15 43170793 . A G 145.83 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00208304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8036;QD=25.3612;RBI=0.0773727;REFB=0.0125723;REVB=0.0773447;RO=8;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980432;STB=0.55484;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.00594445;OID=.;OPOS=43170793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:8:7:5:3:8:7:5:3 chr15 43170823 . C T 164.05 PASS AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00955924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9534;QD=29.8271;RBI=0.0398436;REFB=-0.0205628;REVB=0.0386799;RO=6;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310499;STB=0.51722;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00628481;OID=.;OPOS=43170823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:9:7:3:3:9:7:3:3 chr15 43237572 . T C 234.94 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0312483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5409;QD=18.7954;RBI=0.0452763;REFB=0.00698631;REVB=0.0327641;RO=27;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168347;STB=0.595583;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00636612;OID=.;OPOS=43237572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:8:15:13:14:8:15:13:14 chr15 43531411 . G C 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.456;QD=58.5866;RBI=0.0310973;REFB=0;REVB=0.0301418;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65042e-05;OID=.;OPOS=43531411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0 chr15 43545728 . G A 808.85 PASS AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00291704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.552;QD=53.9234;RBI=0.0467812;REFB=-0.145846;REVB=0.0466902;RO=2;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362473;STB=0.519224;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00144886;OID=.;OPOS=43545728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:60:2:2:58:58:0.966667:25:33:0:2:25:33:0:2 chr15 43552372 . C T 206.93 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0330843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.672;QD=17.2442;RBI=0.0331284;REFB=-0.0124298;REVB=-0.00170975;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105357;STB=0.559944;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.022285;OID=.;OPOS=43552372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:11:10:10:17:11:10:10:17 chr15 43571390 . C G 1011.16 PASS AF=0.911392;AO=72;DP=79;FAO=72;FDP=79;FR=.;FRO=7;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0665915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9327;QD=51.1979;RBI=0.069373;REFB=-0.213447;REVB=-0.0194468;RO=7;SAF=31;SAR=41;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955869;STB=0.55071;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0183725;OID=.;OPOS=43571390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:79:79:7:7:72:72:0.911392:41:31:7:0:41:31:7:0 chr15 43574114 . T C 606.74 PASS AF=0.459854;AO=64;DP=137;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=56;FWDB=-0.060405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.837;QD=17.715;RBI=0.0733416;REFB=-0.00235327;REVB=-0.041596;RO=72;SAF=27;SAR=37;SRF=17;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189023;STB=0.597598;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0017899;OID=.;OPOS=43574114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:72:74:64:63:0.459854:37:27:17:55:37:26:18:56 chr15 43579566 . A G 362.16 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133171;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0864;QD=55.7171;RBI=0.0196852;REFB=0;REVB=0.0144969;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000412242;OID=.;OPOS=43579566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0 chr15 43621839 . T C 41.92 PASS AF=0.155556;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=45;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0135169;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.989;QD=3.72596;RBI=0.0427367;REFB=-0.00174006;REVB=-0.0405428;RO=36;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272356;STB=0.729663;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0104038;OID=.;OPOS=43621839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:44:45:36:38:7:7:0.155556:6:1:11:25:6:1:13:25 chr15 43621947 . A G 1508.16 PASS AF=0.980952;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0234329;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.882;QD=57.4539;RBI=0.0362782;REFB=0.172123;REVB=0.0276949;RO=2;SAF=39;SAR=63;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00453795;STB=0.502453;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=-0.00030302;OID=.;OPOS=43621947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:104:105:2:2:102:103:0.980952:63:39:1:1:64:39:1:1 chr15 43622265 . C A 190.77 PASS AF=0.42;AO=19;DP=51;FAO=21;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0476222;FXX=0.019604;HRUN=6;LEN=1;MLLD=221.087;QD=15.2618;RBI=0.0507199;REFB=-0.0233483;REVB=0.0174537;RO=18;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116263;STB=0.594507;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0354269;OID=.;OPOS=43622265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:18:28:19:21:0.42:11:8:10:8:11:10:18:10 chr15 43632549 . T C 776.46 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186184;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.074;QD=55.4617;RBI=0.0188965;REFB=-0.0170913;REVB=-0.00323002;RO=1;SAF=31;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149647;STB=0.507934;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000561845;OID=.;OPOS=43632549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:56:56:1:1:55:55:0.982143:24:31:1:0:24:31:1:0 chr15 43650384 . G A 392.16 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271537;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.786;QD=56.0225;RBI=0.032156;REFB=0;REVB=0.0172245;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119176;OID=.;OPOS=43650384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:11:16:0:0:11:17:0:0 chr15 43661802 . T C 483.76 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00811262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.857;QD=58.6369;RBI=0.0167179;REFB=0;REVB=0.0146175;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08148e-05;OID=.;OPOS=43661802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:13:19:0:0:14:19:0:0 chr15 43724624 . A G 417.17 PASS AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00824112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.467;QD=17.2029;RBI=0.0175326;REFB=-0.00613897;REVB=-0.015475;RO=54;SAF=31;SAR=12;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126342;STB=0.571155;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0111638;OID=.;OPOS=43724624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:0.443299:12:31:33:21:12:31:33:21 chr15 43724646 . T G 1368.07 PASS AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.944;QD=62.1851;RBI=0.0283186;REFB=0;REVB=0.0282855;RO=1;SAF=58;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160567;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81615e-05;OID=.;OPOS=43724646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:1:0:87:88:1:29:58:0:1:30:58:0:0 chr15 43748304 . A G 710.28 PASS AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0184254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.908;QD=54.6365;RBI=0.0295264;REFB=0.0327846;REVB=0.023072;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184579;STB=0.50943;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000155124;OID=.;OPOS=43748304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:51:52:1:1:50:51:0.980769:25:25:0:1:26:25:0:1 chr15 43762196 . C T 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.648;QD=56.9376;RBI=0.0130949;REFB=0;REVB=0.00411271;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74332e-05;OID=.;OPOS=43762196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chr15 43767774 . G C 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3663;QD=63.8708;RBI=0.0442388;REFB=0;REVB=0.0401865;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811449;OID=.;OPOS=43767774;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0 chr15 43815953 . A G 39.4 PASS AF=0.179487;AO=6;DP=41;FAO=7;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0444567;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.042;QD=4.04116;RBI=0.045459;REFB=-0.00388271;REVB=0.00949337;RO=27;SAF=1;SAR=5;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437238;STB=0.873991;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0233761;OID=.;OPOS=43815953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:41:39:27:32:6:7:0.179487:5:1:14:13:6:1:20:12 chr15 43816917 . G A 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.186;QD=51.9148;RBI=0.0281055;REFB=0;REVB=0.0237076;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288129;OID=.;OPOS=43816917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr15 43817406 . T C 660.25 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00688525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0262;QD=61.419;RBI=0.0219335;REFB=0;REVB=-0.0208247;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140534;OID=.;OPOS=43817406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:18:24:0:0:19:24:0:0 chr15 43818052 . G A 57.07 PASS AF=0.875;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0295172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9135;QD=28.5347;RBI=0.0686737;REFB=0.00705463;REVB=0.0620066;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00886005;OID=.;OPOS=43818052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:8:0:1:7:7:0.875:4:3:0:0:4:3:0:1 chr15 43892847 . G C 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00788769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.347;QD=56.956;RBI=0.011054;REFB=0;REVB=-0.00774439;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.21742e-05;OID=.;OPOS=43892847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr15 43893072 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0072099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.463;QD=37.4885;RBI=0.026995;REFB=0;REVB=0.0260143;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373832;OID=.;OPOS=43893072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr15 43897499 . T C,G 333.67 PASS AF=0.92,0.08;AO=23,2;DP=25;FAO=23,2;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=11,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360984,-0.0108272;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.5614,223.522;QD=53.3879;RBI=0.0526912,0.0237514;REFB=0,0;REVB=0.0383832,-0.02114;RO=0;SAF=12,0;SAR=11,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00274527,0.0262249;OID=.,.;OPOS=43897499,43897499;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:25:25:0:0:23,2:23,2:0.92,0.08:11,2:12,0:0:0:11,2:12,0:0:0 chr15 43925134 . TT AG 106.2 PASS AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278679;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=2;MLLD=187.684;QD=42.4779;RBI=0.0294136;REFB=0;REVB=0.00940953;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000327566;OID=.;OPOS=43925134;OREF=TT;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr15 43939642 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00820795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.346;QD=60.978;RBI=0.0115519;REFB=0;REVB=0.0081287;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24802e-07;OID=.;OPOS=43939642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0 chr15 43988604 . G A 1589.32 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1212;QD=59.9744;RBI=0.0844215;REFB=0;REVB=-0.0610833;RO=0;SAF=42;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.79622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67313e-05;OID=.;OPOS=43988604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:64:42:0:0:64:42:0:0 chr15 44043793 . C G 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.733;QD=61.3756;RBI=0.0305852;REFB=0;REVB=-0.000763583;RO=0;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55968e-05;OID=.;OPOS=44043793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:40:40:0:0:40:40:0:0 chr15 44069069 . G C 1434.37 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9669;QD=63.0494;RBI=0.0262164;REFB=0;REVB=0.0226119;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158483;OID=.;OPOS=44069069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:48:43:0:0:48:43:0:0 chr15 44093927 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.507;QD=61.6836;RBI=0.0563156;REFB=0;REVB=0.0549837;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286691;OID=.;OPOS=44093927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr15 44102010 . A C 1933.55 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.696;QD=61.8736;RBI=0.0198073;REFB=0;REVB=0.00904369;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51317e-05;OID=.;OPOS=44102010;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:71:54:0:0:71:54:0:0 chr15 44120559 . T G 704.17 PASS AF=1;AO=33;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325161;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.046;QD=55.2289;RBI=0.0422916;REFB=0;REVB=0.0270422;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209985;OID=.;OPOS=44120559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:33:51:1:11:22:0:0:26:25:0:0 chr15 44120560 . C G 135.98 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0586241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.3898;QD=10.4599;RBI=0.0658378;REFB=-0.078511;REVB=0.0299638;RO=35;SAF=2;SAR=15;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.644771;STB=0.881903;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0473055;OID=.;OPOS=44120560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:15:2:24:11:15:2:24:11 chr15 44198049 . A G 1530.72 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.74;QD=63.7798;RBI=0.0547078;REFB=0;REVB=0.0186659;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91945e-05;OID=.;OPOS=44198049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:96:0:0:94:96:1:45:49:0:0:46:50:0:0 chr15 44751350 . C T 235.0 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0242916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.414;QD=15.4098;RBI=0.0304963;REFB=-0.00313892;REVB=-0.0184376;RO=34;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200087;STB=0.61355;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00513893;OID=.;OPOS=44751350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:9:18:16:18:9:18:16:18 chr15 44854264 . A AAATC 81.11 PASS AF=0.244444;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0227226;FXX=0.0217344;HRUN=4;LEN=4;MLLD=262.335;QD=7.20978;RBI=0.0231103;REFB=-0.00474381;REVB=-0.00421502;RO=34;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15969;STB=0.599822;STBP=0.454;TYPE=ins;VARB=0.0147939;OID=.;OPOS=44854265;OREF=-;OALT=AATC;OMAPALT=AAATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.244444:11:46:11:45:34:6:5:14:20:81:34:6:5:14:20 chr15 44944341 . G A 187.48 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0450398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7509;QD=12.7108;RBI=0.0651103;REFB=-0.00146315;REVB=0.0470188;RO=35;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677458;STB=0.547018;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00336094;OID=.;OPOS=44944341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:12:11:19:16:12:11:20:16 chr15 44949329 . T C 592.16 PASS AF=0.602273;AO=53;DP=89;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0039419;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.647;QD=26.9162;RBI=0.0193915;REFB=-0.0120929;REVB=-0.0189866;RO=35;SAF=28;SAR=25;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102476;STB=0.505587;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00763242;OID=.;OPOS=44949329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:35:35:53:53:0.602273:25:28:18:17:25:28:18:17 chr15 44966389 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00589342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0092;QD=50.4133;RBI=0.0724153;REFB=0;REVB=-0.072175;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105976;OID=.;OPOS=44966389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr15 44967847 . A G 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.149;QD=23.2183;RBI=0.00705117;REFB=0.019543;REVB=0.00705117;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00400242;OID=.;OPOS=44967847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:5:0:0:1:5:0:0:1 chr15 45047134 . G A 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00624811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.02;QD=14.6983;RBI=0.00671419;REFB=-0.00561856;REVB=0.00245793;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110759;STB=0.564024;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00954817;OID=.;OPOS=45047134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:8:8:14:9:8:8:14:9 chr15 45047573 . C T 738.22 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0636582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.239;QD=56.7864;RBI=0.0654253;REFB=0;REVB=0.0151029;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013804;OID=.;OPOS=45047573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0 chr15 45392075 . G A 1097.77 PASS AF=0.986842;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.112606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4244;QD=57.7775;RBI=0.119776;REFB=-0.109952;REVB=0.0408203;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0131133;OID=.;OPOS=45392075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:76:0:1:72:75:0.986842:36:36:0:0:37:38:0:1 chr15 45396158 . C A 65.78 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.072026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.729;QD=11.4393;RBI=0.0724487;REFB=0.0016696;REVB=0.0078152;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270169;STB=0.660046;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0032958;OID=.;OPOS=45396158;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:4:10:4:5:4:10 chr15 45400358 . C G 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733308;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=209.376;QD=56.9383;RBI=0.0227521;REFB=0;REVB=0.021538;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53845e-05;OID=.;OPOS=45400358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0 chr15 45404066 . G A 1343.67 PASS AF=0.92381;AO=97;DP=105;FAO=97;FDP=105;FR=.;FRO=8;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0247212;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.74;QD=51.1875;RBI=0.0271351;REFB=-0.0901487;REVB=0.0111882;RO=4;SAF=56;SAR=41;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326747;STB=0.503725;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.000761636;OID=.;OPOS=45404066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:105:105:4:8:97:97:0.92381:41:56:4:0:41:56:5:3 chr15 45408414 . C G 774.4 PASS AF=1;AO=36;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6997;QD=64.5331;RBI=0.183539;REFB=0;REVB=0.182682;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00230571;OID=.;OPOS=45408414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:36:48:1:10:26:0:0:22:26:0:0 chr15 45408933 . T C 803.82 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218887;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.76;QD=57.4157;RBI=0.0352481;REFB=0;REVB=0.0276281;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55338e-05;OID=.;OPOS=45408933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr15 45412946 . C A 162.33 PASS AF=0.313433;AO=21;DP=67;FAO=21;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00829962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.266;QD=9.69107;RBI=0.0146378;REFB=-0.0044315;REVB=0.0120574;RO=38;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142202;STB=0.523787;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0129562;OID=.;OPOS=45412946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:45:21:21:0.313433:10:11:15:23:10:11:22:23 chr15 45457458 . G T 2210.51 PASS AF=0.97931;AO=142;DP=145;FAO=142;FDP=145;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0178646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9385;QD=60.9796;RBI=0.0307887;REFB=-0.0787895;REVB=0.0250759;RO=2;SAF=73;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135815;STB=0.503741;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0015978;OID=.;OPOS=45457458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:145:145:2:3:142:142:0.97931:69:73:0:2:69:73:1:2 chr15 45467540 . C G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.577;QD=56.7066;RBI=0.0648395;REFB=0;REVB=0.0258552;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150731;OID=.;OPOS=45467540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr15 45491082 . G A 237.97 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0209618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.403;QD=15.8646;RBI=0.0710638;REFB=-0.0206269;REVB=0.0679018;RO=32;SAF=18;SAR=9;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22602;STB=0.636261;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0260631;OID=.;OPOS=45491082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:33:27:27:0.45:9:18:14:18:9:18:14:19 chr15 45545478 . C T 313.34 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0128395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.799;QD=50.1341;RBI=0.0218319;REFB=0.0339462;REVB=0.0176573;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280951;STB=0.515139;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=1.79691e-05;OID=.;OPOS=45545478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:16:8:0:1:16:8:0:1 chr15 45554267 . C A 1928.93 PASS AF=0.992126;AO=124;DP=126;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0177534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.325;QD=60.7538;RBI=0.0192247;REFB=-0.0838678;REVB=0.00737586;RO=1;SAF=54;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673944;STB=0.503546;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=1.25872e-05;OID=.;OPOS=45554267;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:126:127:1:1:124:126:0.992126:70:54:0:1:70:56:0:1 chr15 45779810 . G A 204.99 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00331291;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.122;QD=16.399;RBI=0.00650589;REFB=0.00189383;REVB=0.00559921;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052726;STB=0.551675;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00237043;OID=.;OPOS=45779810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:29:21:21:0.42:12:9:13:14:12:9:15:14 chr15 45781192 . G A 229.41 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0432638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0124;QD=14.1175;RBI=0.0438308;REFB=-0.0224969;REVB=0.0070268;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144698;STB=0.582031;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0255524;OID=.;OPOS=45781192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:13:14:25:13:13:14:25:13 chr15 48053229 . C A 926.74 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1521;QD=57.0304;RBI=0.0683294;REFB=-0.0989304;REVB=-0.0638435;RO=1;SAF=34;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136897;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00260702;OID=.;OPOS=48053229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:65:1:0:64:65:1:30:34:1:0:30:35:0:0 chr15 48056958 . C T 367.59 PASS AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.00315458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.642;QD=16.5209;RBI=0.00715902;REFB=-0.0194665;REVB=0.00642652;RO=49;SAF=10;SAR=29;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864398;STB=0.558059;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0197027;OID=.;OPOS=48056958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:50:39:39:0.438202:29:10:16:33:29:10:17:33 chr15 48058071 . G A 300.65 PASS AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0244059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.968;QD=16.4737;RBI=0.0296164;REFB=-0.0324373;REVB=-0.0167774;RO=40;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111998;STB=0.562876;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0375452;OID=.;OPOS=48058071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:17:16:24:16:17:16:24:16 chr15 48063076 . T C 1933.61 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00323173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.012;QD=61.8754;RBI=0.0211496;REFB=0;REVB=0.0209012;RO=0;SAF=62;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44326e-05;OID=.;OPOS=48063076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:63:62:0:0:63:62:0:0 chr15 48065487 . C T 684.16 PASS AF=0.531746;AO=67;DP=126;FAO=67;FDP=126;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0178131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2552;QD=21.7195;RBI=0.0179486;REFB=-0.00801269;REVB=0.00220128;RO=59;SAF=33;SAR=34;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135977;STB=0.50746;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00516104;OID=.;OPOS=48065487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:59:59:67:67:0.531746:34:33:30:29:34:33:30:29 chr15 48426484 . A C,G 1054.62 PASS AF=0.0694444,0.930556;AO=5,67;DP=72;FAO=5,67;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=5,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763111,-0.00146058;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.7453,108.739;QD=58.5901;RBI=0.00765217,0.00960697;REFB=0,0;REVB=-0.000567316,0.00949529;RO=0;SAF=0,27;SAR=5,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.157978,-0.000296678;OID=.,.;OPOS=48426484,48426484;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:18:72:72:0:0:5,67:5,67:0.0694444,0.930556:5,40:0,27:0:0:5,40:0,27:0:0 chr15 48443699 . T C 1067.98 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.02131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8848;QD=58.5195;RBI=0.0342344;REFB=-0.151803;REVB=-0.0267932;RO=1;SAF=38;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122839;STB=0.506492;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00306061;OID=.;OPOS=48443699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:34:38:1:0:34:38:1:0 chr15 48460927 . C T 1989.66 PASS AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0479644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.779;QD=62.1769;RBI=0.0544093;REFB=0;REVB=-0.0256864;RO=0;SAF=67;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14595e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015888;OID=.;OPOS=48460927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:61:67:0:0:61:67:0:0 chr15 48495508 . C T 235.29 PASS AF=0.394366;AO=26;DP=69;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00945523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.377;QD=13.2557;RBI=0.01007;REFB=-0.0101314;REVB=0.00346453;RO=43;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629679;STB=0.513668;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0163102;OID=.;OPOS=48495508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:43:43:26:28:0.394366:13:13:24:19:13:15:24:19 chr15 48527142 . ATTTTTTT ATTTTTT,ATTTTTTC 606.99 PASS AF=0.863636,0.136364;AO=33,14;DP=114;FAO=95,15;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=37,14;FSAR=58,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479982,0.108915;FXX=0.0350846;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.4635,12.3661;QD=22.0723;RBI=0.644793,0.287224;REFB=0.0318458,0.0332087;REVB=0.643004,0.265773;RO=43;SAF=17,13;SAR=16,1;SRF=6;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.379167,0.793085;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00850512,-0.104383;OID=.,.;OPOS=48527143,48527149;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.863636,0.136364:33,14:114:95,15:110:0:37,14:58,1:0:0:60:43:17,13:16,1:6:37 chr15 48539587 . T C 1466.62 PASS AF=1;AO=92;DP=96;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410732;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.417;QD=63.7661;RBI=0.00421521;REFB=0;REVB=-0.000947581;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48947e-05;OID=.;OPOS=48539587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0 chr15 48580713 . T A,C 588.41 PASS AF=0.05,0.95;AO=3,36;DP=40;FAO=2,38;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15;FSAR=2,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00388485,0.0460763;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=69.7181,136.658;QD=58.8405;RBI=0.0278214,0.0477275;REFB=0,0;REVB=0.0275489,0.0124452;RO=1;SAF=0,14;SAR=3,22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.727144,-0.0322556;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0944589,0.000225657;OID=.,.;OPOS=48580713,48580713;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:40:40:1:0:3,36:2,38:0.05,0.95:3,22:0,14:1:0:2,23:0,15:0:0 chr15 48701029 . C T 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258128;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.207;QD=56.9478;RBI=0.0264506;REFB=-0.0274093;REVB=0.00577368;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346393;STB=0.518508;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000676983;OID=.;OPOS=48701029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:23:13:1:0:23:13:1:0 chr15 48702457 . C A 976.3 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00910603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.887;QD=57.4293;RBI=0.0286583;REFB=0.0364192;REVB=0.0271731;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.50769;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.000280623;OID=.;OPOS=48702457;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:0:1:67:67:0.985294:35:32:0:0:35:32:1:0 chr15 48807637 . C T 2027.13 PASS AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0609;QD=62.3733;RBI=0.0127618;REFB=0;REVB=0.0127147;RO=0;SAF=56;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.07652e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52904e-05;OID=.;OPOS=48807637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:74:56:0:0:74:56:0:0 chr15 49090175 . G A 399.21 PASS AF=0.58209;AO=37;DP=65;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0235907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5635;QD=23.8332;RBI=0.0435085;REFB=-0.0118366;REVB=0.0365577;RO=27;SAF=22;SAR=15;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144324;STB=0.582459;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0108109;OID=.;OPOS=49090175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:27:28:37:39:0.58209:15:22:11:16:16:23:11:17 chr15 49118087 . C T 204.1 PASS AF=0.436364;AO=23;DP=54;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00888772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.436;QD=14.8439;RBI=0.0799966;REFB=-0.0162883;REVB=-0.0795013;RO=31;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146121;STB=0.568571;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0181223;OID=.;OPOS=49118087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:31:31:23:24:0.436364:10:13:13:18:11:13:13:18 chr15 49168841 . G A 6208.41 PASS AF=1;AO=397;DP=398;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=220;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193573;FXX=0.0268286;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0167;QD=62.2397;RBI=0.0347478;REFB=0.0136874;REVB=0.0288566;RO=1;SAF=220;SAR=177;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00268877;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122055;OID=.;OPOS=49168841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:398:399:1:0:397:399:1:177:220:0:1:179:220:0:0 chr15 49170977 . G A 766.36 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6411;QD=63.8629;RBI=0.0410681;REFB=0;REVB=-0.00171632;RO=0;SAF=11;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000517694;OID=.;OPOS=49170977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:37:11:0:0:37:11:0:0 chr15 49285001 . G C 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0181428;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=286.369;QD=17.6439;RBI=0.0186226;REFB=0.0176991;REVB=-0.00419995;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301282;STB=0.676989;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0103507;OID=.;OPOS=49285001;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:3:4:2:7:3:4 chr15 49288160 . A G 230.89 PASS AF=0.300971;AO=31;DP=103;FAO=31;FDP=103;FR=.;FRO=72;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.00982382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1677;QD=8.96662;RBI=0.06255;REFB=-0.000954389;REVB=0.0617737;RO=71;SAF=11;SAR=20;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118537;STB=0.57549;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00312713;OID=.;OPOS=49288160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:71:72:31:31:0.300971:20:11:32:39:20:11:33:39 chr15 49325289 . A C 1514.83 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0281173;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.234;QD=62.4674;RBI=0.0292709;REFB=-0.0394071;REVB=-0.0081364;RO=1;SAF=46;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010198;STB=0.505375;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=7.37944e-05;OID=.;OPOS=49325289;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:50:46:1:0:50:46:1:0 chr15 49620200 . C T 679.5 PASS AF=0.51938;AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=129;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.0074424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.448;QD=21.0698;RBI=0.0142251;REFB=-0.00193823;REVB=0.0121229;RO=62;SAF=31;SAR=36;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102852;STB=0.556513;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00182473;OID=.;OPOS=49620200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:62:62:67:67:0.51938:36:31:36:26:36:31:36:26 chr15 49627607 . T C 364.68 PASS AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00160115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.916;QD=18.4649;RBI=0.0119511;REFB=-0.0129336;REVB=0.0118434;RO=40;SAF=17;SAR=21;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486818;STB=0.521116;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0226723;OID=.;OPOS=49627607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:41:38:38:0.481013:21:17:20:20:21:17:20:21 chr15 50152583 . G T 1525.74 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00866656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.085;QD=59.833;RBI=0.00996613;REFB=0;REVB=0.00492081;RO=0;SAF=65;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89872e-06;OID=.;OPOS=50152583;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:37:65:0:0:37:65:0:0 chr15 50226313 . G T 200.52 PASS AF=0.413793;AO=22;DP=56;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.118666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3058;QD=13.829;RBI=0.147932;REFB=-0.0180806;REVB=0.0883307;RO=34;SAF=6;SAR=16;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134425;STB=0.593667;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0264972;OID=.;OPOS=50226313;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:34:34:22:24:0.413793:16:6:13:21:18:6:13:21 chr15 50279662 . T C 197.11 PASS AF=0.295455;AO=26;DP=88;FAO=26;FDP=88;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=0.00541682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.175;QD=8.95969;RBI=0.00682648;REFB=0.0146242;REVB=-0.00415438;RO=62;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178926;STB=0.605457;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0273034;OID=.;OPOS=50279662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:62:62:26:26:0.295455:12:14:24:38:12:14:24:38 chr15 50288937 . G A 307.24 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0208122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.823;QD=15.5564;RBI=0.0210737;REFB=-0.0128092;REVB=0.00330997;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161207;STB=0.514961;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0148938;OID=.;OPOS=50288937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:45:34:34:0.43038:18:16:20:24:18:16:20:25 chr15 50311135 . C A 766.27 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6171;QD=63.8556;RBI=0.0595781;REFB=0;REVB=-0.00352652;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00066485;OID=.;OPOS=50311135;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:15:33:0:0:15:33:0:0 chr15 50311148 . A G 728.99 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.914;QD=57.1759;RBI=0.0209918;REFB=0;REVB=-0.0179285;RO=0;SAF=36;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.14989e-05;OID=.;OPOS=50311148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:15:36:0:0:15:36:0:0 chr15 50474766 . A C 232.64 PASS AF=0.909091;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0102779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.165;QD=42.2986;RBI=0.0111691;REFB=-0.117686;REVB=0.00437189;RO=2;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707039;STB=0.535679;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0032194;OID=.;OPOS=50474766;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:22:2:2:19:20:0.909091:12:7:0:2:13:7:0:2 chr15 50773755 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.932;QD=56.9567;RBI=0.00656142;REFB=0;REVB=0.00167728;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38398e-05;OID=.;OPOS=50773755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0 chr15 50867082 . G A 74.68 PASS AF=0.357143;AO=8;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0401552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5223;QD=10.6683;RBI=0.0704155;REFB=-0.00496878;REVB=-0.0578438;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228754;STB=0.565086;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.013489;OID=.;OPOS=50867082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:16:18:8:10:0.357143:6:2:7:9:6:4:9:9 chr15 50981098 . T C 240.36 PASS AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00966163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.256;QD=28.2777;RBI=0.0145953;REFB=-0.0181501;REVB=-0.0109397;RO=12;SAF=16;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220776;STB=0.622636;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00826054;OID=.;OPOS=50981098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:34:34:12:12:22:22:0.647059:6:16:5:7:6:16:5:7 chr15 51217361 . T C 415.2 PASS AF=0.403361;AO=47;DP=118;FAO=48;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0151922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.454;QD=13.9563;RBI=0.0152122;REFB=0.00109875;REVB=-0.000779436;RO=71;SAF=18;SAR=29;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178167;STB=0.592007;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00140669;OID=.;OPOS=51217361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:71:71:47:48:0.403361:29:18:39:32:29:19:39:32 chr15 51294832 . G A 398.91 PASS AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00683537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7904;QD=20.9953;RBI=0.0275778;REFB=-0.00414832;REVB=-0.0267172;RO=36;SAF=14;SAR=26;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181356;STB=0.600492;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00778663;OID=.;OPOS=51294832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:26:14:20:16:26:14:20:16 chr15 51502844 . A C 714.1 PASS AF=0.466258;AO=76;DP=162;FAO=76;FDP=163;FR=.;FRO=87;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=-0.0244459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3431;QD=17.5238;RBI=0.0578939;REFB=-0.0247897;REVB=0.0524795;RO=86;SAF=39;SAR=37;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00146752;STB=0.503956;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0248216;OID=.;OPOS=51502844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:86:87:76:76:0.466258:37:39:44:42:37:39:44:43 chr15 51502986 . G A 664.97 PASS AF=0.434524;AO=73;DP=168;FAO=73;FDP=168;FR=.;FRO=95;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=-0.00215379;FXX=0.00591681;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.931;QD=15.8327;RBI=0.00549544;REFB=-0.00249472;REVB=0.0050558;RO=95;SAF=44;SAR=29;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469071;STB=0.526184;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00339615;OID=.;OPOS=51502986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:95:95:73:73:0.434524:29:44:53:42:29:44:53:42 chr15 51503881 . T A 235.87 PASS AF=0.482143;AO=25;DP=54;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.00546023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.411;QD=16.8475;RBI=0.00745218;REFB=-0.0311962;REVB=-0.00507158;RO=29;SAF=15;SAR=10;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331274;STB=0.658805;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0178487;OID=.;OPOS=51503881;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:29:29:25:27:0.482143:10:15:7:22:12:15:7:22 chr15 51503897 . G A 211.88 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.015228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.507;QD=16.6176;RBI=0.0229967;REFB=-0.00748303;REVB=-0.0172324;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299072;STB=0.668189;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0154032;OID=.;OPOS=51503897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:10:13:7:21:10:13:7:21 chr15 51675625 . C T 580.63 PASS AF=0.487805;AO=60;DP=123;FAO=60;FDP=123;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.00556051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.179;QD=18.8823;RBI=0.01052;REFB=0.00209433;REVB=-0.00893032;RO=63;SAF=30;SAR=30;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220388;STB=0.512191;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00214262;OID=.;OPOS=51675625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:63:63:60:60:0.487805:30:30:30:33:30:30:30:33 chr15 51689772 . G A 3775.71 PASS AF=0.983673;AO=240;DP=244;FAO=241;FDP=245;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=160;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0489131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.712;QD=61.6443;RBI=0.0492177;REFB=-0.026018;REVB=0.00546703;RO=4;SAF=81;SAR=159;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00305933;STB=0.501576;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.000342521;OID=.;OPOS=51689772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:244:245:4:4:240:241:0.983673:159:81:1:3:160:81:1:3 chr15 51698867 . T C 411.09 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.312;QD=56.7025;RBI=0.0918407;REFB=0;REVB=0.081125;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111639;OID=.;OPOS=51698867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:7:22:0:0:7:22:0:0 chr15 51698922 . C T 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.529;QD=58.2392;RBI=0.0104352;REFB=0;REVB=-0.000578861;RO=0;SAF=11;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8409e-05;OID=.;OPOS=51698922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:51:11:0:0:51:11:0:0 chr15 51783820 . T C 2869.85 PASS AF=1;AO=175;DP=175;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.503;QD=62.729;RBI=0.0758549;REFB=0;REVB=0.0207559;RO=0;SAF=54;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173235;OID=.;OPOS=51783820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:175:183:0:0:175:183:1:121:54:0:0:121:62:0:0 chr15 51791559 . A G 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6208;QD=62.3501;RBI=0.0547355;REFB=0;REVB=-0.0521204;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000521547;OID=.;OPOS=51791559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr15 51795172 . G A 1029.78 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00762961;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.2;QD=59.6976;RBI=0.0078668;REFB=0;REVB=0.00191721;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.90672e-05;OID=.;OPOS=51795172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0 chr15 51868373 . A G 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.8;QD=49.5984;RBI=0.0121694;REFB=0;REVB=0.0121152;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017617;OID=.;OPOS=51868373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0 chr15 51914662 . G A 987.69 PASS AF=0.449438;AO=107;DP=242;FAO=120;FDP=267;FR=.;FRO=147;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=68;FSRR=79;FWDB=0.0365054;FXX=0.0037312;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.701;QD=14.7968;RBI=0.0508007;REFB=-0.0461236;REVB=0.0353279;RO=133;SAF=59;SAR=48;SRF=68;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403085;STB=0.534325;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0650605;OID=.;OPOS=51914662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:267:133:147:107:120:0.449438:48:59:68:65:57:63:68:79 chr15 51914716 . T C 1192.84 PASS AF=0.502128;AO=112;DP=231;FAO=118;FDP=235;FR=.;FRO=117;FSAF=52;FSAR=66;FSRF=50;FSRR=67;FWDB=0.0239907;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.321;QD=20.3036;RBI=0.0249302;REFB=-0.0256741;REVB=-0.00677934;RO=119;SAF=46;SAR=66;SRF=52;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252463;STB=0.50674;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0242939;OID=.;OPOS=51914716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:235:119:117:112:118:0.502128:66:46:52:67:66:52:50:67 chr15 52350879 . T C 235.44 PASS AF=0.394366;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0101342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.726;QD=13.2642;RBI=0.0169626;REFB=-0.00206218;REVB=0.0136025;RO=43;SAF=10;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119295;STB=0.568371;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00221206;OID=.;OPOS=52350879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:43:43:28:28:0.394366:18:10:20:23:18:10:20:23 chr15 52357589 . A G 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.00980812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.593;QD=14.9787;RBI=0.0145517;REFB=-0.00568431;REVB=0.0107496;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507618;STB=0.790802;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0142139;OID=.;OPOS=52357589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:3:7:1:10:3:7:1:10 chr15 52404798 . G A 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.026218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.526;QD=14.0438;RBI=0.0295548;REFB=-0.0684934;REVB=0.0136419;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.571155;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0380844;OID=.;OPOS=52404798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:1:3:3:2:1:3 chr15 52432040 . GCCCCG CGCCCG,GCCC,GCCCG,GGCCCC 225.62 PASS AF=0,0.511111,0.0888889,0;AO=5,11,10,2;DP=47;FAO=0,23,4,0;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=0,21,4,0;FSAR=0,2,0,0;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0420555,0.0071378,0.111772,0.113247;FXX=0.0217344;HRUN=1,4,4,4;LEN=2,2,1,5;MLLD=59.5806,25.1611,13.3395,15.443;QD=20.0546;RBI=0.0753213,0.210226,0.140778,0.340759;REFB=-0.00907592,-0.112397,-0.129009,-0.0663181;REVB=-0.062487,-0.210105,-0.0855893,-0.32139;RO=16;SAF=5,9,10,0;SAR=0,2,0,2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.656709,0.185847,0.76005,-0.621068;STB=0.5,0.793489,0.997054,0.5;STBP=1,0.003,0.039,1;TYPE=mnp,del,del,mnp;VARB=0,0.0923994,0.0704376,0;OID=.,.,.,.;OPOS=52432040,52432044,52432041,52432041;OREF=GC,CG,C,CCCCG;OALT=CG,-,-,GCCCC;OMAPALT=CGCCCG,GCCC,GCCCG,GGCCCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:47:45:16:18:5,11,10,2:0,23,4,0:0,0.511111,0.0888889,0:0,2,0,2:5,9,10,0:11:5:0,2,0,0:0,21,4,0:9:9 chr15 52517714 . C T 236.17 PASS AF=0.547619;AO=19;DP=37;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0487017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8624;QD=22.4924;RBI=0.0534788;REFB=-0.0283192;REVB=-0.0220935;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915077;STB=0.545415;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0423658;OID=.;OPOS=52517714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:42:17:19:19:23:0.547619:11:8:9:8:12:11:11:8 chr15 52531941 . A G 664.21 PASS AF=0.464052;AO=71;DP=153;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0112601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.624;QD=17.3649;RBI=0.0113361;REFB=-0.0117948;REVB=0.00131018;RO=82;SAF=36;SAR=35;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167694;STB=0.509299;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00971982;OID=.;OPOS=52531941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:82:82:71:71:0.464052:35:36:43:39:35:36:43:39 chr15 52539673 . C T 1187.4 PASS AF=0.9875;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0535882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.203;QD=59.3701;RBI=0.0576209;REFB=-0.0392624;REVB=0.0211772;RO=1;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133317;STB=0.50704;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000454871;OID=.;OPOS=52539673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:80:1:1:78:79:0.9875:35:43:0:1:35:44:0:1 chr15 52556429 . A G 785.17 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3162;QD=57.1034;RBI=0.0384285;REFB=0;REVB=-0.0281039;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.84208e-06;OID=.;OPOS=52556429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0 chr15 52601033 . T C 422.43 PASS AF=0.455446;AO=42;DP=97;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.00543195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.528;QD=16.7297;RBI=0.0158261;REFB=-0.0170643;REVB=-0.0148647;RO=53;SAF=25;SAR=17;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679941;STB=0.54838;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0228002;OID=.;OPOS=52601033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:53:55:42:46:0.455446:17:25:28:25:17:29:30:25 chr15 52604136 . A ATTTGTCATT 457.8 PASS AF=1;AO=26;DP=39;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173715;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=9;MLLD=297.108;QD=57.2254;RBI=0.0188262;REFB=0;REVB=0.00725649;RO=8;SAF=13;SAR=13;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.52805e-05;OID=.;OPOS=52604137;OREF=-;OALT=TTTGTCATT;OMAPALT=ATTTGTCATT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:26:39:32:32:0:18:14:0:0:4:8:13:13:7:1 chr15 52611451 . A G 945.14 PASS AF=0.443478;AO=101;DP=231;FAO=102;FDP=230;FR=.;FRO=128;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=65;FWDB=-0.0164712;FXX=0.012875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.942;QD=16.4372;RBI=0.0178816;REFB=-0.026152;REVB=-0.00696079;RO=126;SAF=59;SAR=42;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851617;STB=0.54845;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0307983;OID=.;OPOS=52611451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:230:126:128:101:102:0.443478:42:59:63:63:43:59:63:65 chr15 52667552 . G A 1529.89 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.486;QD=63.7456;RBI=0.0200277;REFB=0;REVB=0.000445484;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21747e-05;OID=.;OPOS=52667552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:51:45:0:0:51:45:0:0 chr15 52689526 . T C 1208.94 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.9164;QD=61.2124;RBI=0.0517874;REFB=0;REVB=-0.00183038;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198554;OID=.;OPOS=52689526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0 chr15 52689631 . T G 1044.28 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3637;QD=59.6734;RBI=0.0752036;REFB=0;REVB=-0.0661986;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100059;OID=.;OPOS=52689631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0 chr15 52874488 . A T 277.79 PASS AF=0.5;AO=29;DP=59;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0235169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.621;QD=18.5196;RBI=0.0241501;REFB=-0.00379268;REVB=0.00549396;RO=29;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517034;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00457963;OID=.;OPOS=52874488;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:29:30:29:30:0.5:17:12:12:17:17:13:12:18 chr15 52901283 . TT CC 950.35 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380181;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=86.2613;QD=58.4827;RBI=0.0608985;REFB=0;REVB=0.0475736;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000226003;OID=.;OPOS=52901283;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:37:27:0:0:37:28:0:0 chr15 52901914 . T C 53.13 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0330963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6763;QD=7.32785;RBI=0.0407776;REFB=-0.00381735;REVB=0.0238211;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273308;STB=0.517198;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.014221;OID=.;OPOS=52901914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:11:10:4:4:11:10 chr15 53081221 . C A 346.13 PASS AF=0.468354;AO=36;DP=73;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00670686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.3978;QD=17.5254;RBI=0.0144447;REFB=-0.0496798;REVB=0.0127932;RO=37;SAF=20;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138011;STB=0.515037;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.048304;OID=.;OPOS=53081221;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:79:37:42:36:37:0.468354:16:20:20:17:16:21:25:17 chr15 53809958 . A C 232.92 PASS AF=0.55;AO=20;DP=41;FAO=22;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00175649;FXX=0.0243843;HRUN=6;LEN=1;MLLD=269.267;QD=23.2917;RBI=0.0163808;REFB=-0.0350285;REVB=-0.0162864;RO=13;SAF=17;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37293;STB=0.658374;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0176534;OID=.;OPOS=53809958;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:13:18:20:22:0.55:3:17:6:7:4:18:10:8 chr15 53994493 . A G 1446.72 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.858;QD=62.901;RBI=0.0518349;REFB=0;REVB=0.039886;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140315;OID=.;OPOS=53994493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:47:44:0:0:48:44:0:0 chr15 54008795 . T C 668.72 PASS AF=0.613861;AO=62;DP=101;FAO=62;FDP=101;FR=.;FRO=39;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.0292027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5485;QD=26.4838;RBI=0.0557896;REFB=-0.0106063;REVB=0.0475361;RO=39;SAF=32;SAR=30;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1477;STB=0.580127;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00742058;OID=.;OPOS=54008795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:39:39:62:62:0.613861:30:32:12:27:30:32:12:27 chr15 54008845 . T C 1476.46 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00730116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.885;QD=62.1668;RBI=0.00818506;REFB=-0.0204097;REVB=0.00369978;RO=1;SAF=40;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870024;STB=0.504586;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000458216;OID=.;OPOS=54008845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:54:40:0:1:54:40:0:1 chr15 54306925 . G A 1734.77 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277394;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7059;QD=60.869;RBI=0.0320003;REFB=0;REVB=-0.0159546;RO=1;SAF=52;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0090437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.05026e-05;OID=.;OPOS=54306925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:1:0:113:114:1:61:52:1:0:61:53:0:0 chr15 54528602 . T C 399.33 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0200444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.549;QD=18.3598;RBI=0.023594;REFB=-0.0158969;REVB=0.0124457;RO=43;SAF=15;SAR=26;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116986;STB=0.584733;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0188943;OID=.;OPOS=54528602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:87:43:46:41:41:0.471264:26:15:21:22:26:15:24:22 chr15 54624313 . T A 229.95 PASS AF=0.311828;AO=29;DP=93;FAO=29;FDP=93;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.0030789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.691;QD=9.89055;RBI=0.0138404;REFB=-0.00327558;REVB=0.0134936;RO=64;SAF=22;SAR=7;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260757;STB=0.654647;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00546113;OID=.;OPOS=54624313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:64:64:29:29:0.311828:7:22:36:28:7:22:36:28 chr15 54841874 . A G 283.75 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0157136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.216;QD=23.1636;RBI=0.0190826;REFB=-0.0151995;REVB=0.0108273;RO=23;SAF=17;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189767;STB=0.606075;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00919979;OID=.;OPOS=54841874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:9:17:10:13:9:17:10:13 chr15 55497811 . C T 566.33 PASS AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=40;FWDB=-0.0109149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.06;QD=20.0471;RBI=0.0293951;REFB=-0.0140877;REVB=-0.0272935;RO=54;SAF=26;SAR=32;SRF=14;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171314;STB=0.587911;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0110298;OID=.;OPOS=55497811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:54:55:58:58:0.513274:32:26:14:40:32:26:15:40 chr15 55619796 . T C 302.77 PASS AF=0.52459;AO=31;DP=60;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0546893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.433;QD=19.8539;RBI=0.0547269;REFB=-0.0112033;REVB=0.0020289;RO=29;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289608;STB=0.523062;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0113163;OID=.;OPOS=55619796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:29:29:31:32:0.52459:16:15:15:14:17:15:15:14 chr15 55632859 . G T 487.74 PASS AF=0.575;AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0542112;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.3699;QD=24.387;RBI=0.0589886;REFB=-0.00113187;REVB=-0.0232553;RO=34;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912698;STB=0.549978;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00133221;OID=.;OPOS=55632859;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:0.575:23:23:21:13:23:23:21:13 chr15 55759193 . T C 546.68 PASS AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0167446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3037;QD=53.3349;RBI=0.0171315;REFB=-0.126595;REVB=-0.00361993;RO=2;SAF=15;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584497;STB=0.54543;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00666387;OID=.;OPOS=55759193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:41:41:2:3:38:38:0.926829:23:15:2:0:23:15:3:0 chr15 55970041 . A G 267.33 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0109067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1258;QD=18.4364;RBI=0.0228915;REFB=-0.0102263;REVB=0.0201263;RO=29;SAF=20;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197116;STB=0.610608;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00785298;OID=.;OPOS=55970041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:9:20:14:15:9:20:14:15 chr15 56122741 . A C 478.79 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00236685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.549;QD=25.1997;RBI=0.0111623;REFB=-0.0120751;REVB=-0.0109085;RO=31;SAF=23;SAR=22;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683215;STB=0.537367;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0100844;OID=.;OPOS=56122741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:31:31:45:45:0.592105:22:23:13:18:22:23:13:18 chr15 56139153 . T C 785.14 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.622;QD=57.1009;RBI=0.139381;REFB=0;REVB=0.137583;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417966;OID=.;OPOS=56139153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:19:36:0:0:19:36:0:0 chr15 56140995 . T A 218.03 PASS AF=0.355263;AO=25;DP=74;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00852153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.923;QD=11.4751;RBI=0.0090595;REFB=-0.0190273;REVB=0.00307542;RO=48;SAF=12;SAR=13;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460735;STB=0.555514;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0339869;OID=.;OPOS=56140995;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:76:48:49:25:27:0.355263:13:12:25:23:15:12:26:23 chr15 56152729 . T C 937.55 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.87;QD=58.5968;RBI=0.0386478;REFB=0;REVB=0.0351252;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161717;OID=.;OPOS=56152729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr15 56152872 . C T 1514.57 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183105;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.891;QD=63.7716;RBI=0.0197429;REFB=0;REVB=-0.00738285;RO=0;SAF=53;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017408;OID=.;OPOS=56152872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:42:53:0:0:42:53:0:0 chr15 56207983 . C T 607.81 PASS AF=0.555556;AO=60;DP=108;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0176442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.946;QD=22.5114;RBI=0.0190928;REFB=-0.0162796;REVB=0.00729499;RO=47;SAF=30;SAR=30;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597885;STB=0.527769;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0110249;OID=.;OPOS=56207983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:47:48:60:60:0.555556:30:30:27:20:30:30:27:21 chr15 56322148 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.283;QD=53.2771;RBI=0.0409502;REFB=0;REVB=-0.0247928;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00118962;OID=.;OPOS=56322148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr15 56322156 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0017058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.842;QD=51.9167;RBI=0.00192681;REFB=0;REVB=0.000896009;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45058e-05;OID=.;OPOS=56322156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr15 56386577 . T G 1571.95 PASS AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0210326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.796;QD=62.8782;RBI=0.0211126;REFB=-0.0474242;REVB=0.00183611;RO=1;SAF=45;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104245;STB=0.505493;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000405156;OID=.;OPOS=56386577;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:54:45:1:0:54:45:1:0 chr15 56387606 . C G 328.76 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00884534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5269;QD=15.4712;RBI=0.0466252;REFB=-0.00131261;REVB=0.0457784;RO=49;SAF=22;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125938;STB=0.571198;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00206194;OID=.;OPOS=56387606;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:14:22:24:25:14:22:24:25 chr15 56387859 . T C 412.04 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=10;FSRR=35;FWDB=0.0303679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.256;QD=18.9442;RBI=0.0321967;REFB=-0.0196549;REVB=-0.0106969;RO=45;SAF=10;SAR=32;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205937;STB=0.511445;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0206252;OID=.;OPOS=56387859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:45:42:42:0.482759:32:10:10:35:32:10:10:35 chr15 56387931 . C T 769.32 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2483;QD=56.9868;RBI=0.0151444;REFB=0;REVB=-0.00752883;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50465e-05;OID=.;OPOS=56387931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:35:19:0:0:35:19:0:0 chr15 56388033 . T C 455.08 PASS AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-2.54994e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.591;QD=22.4729;RBI=0.00323373;REFB=0.0039168;REVB=0.00323363;RO=37;SAF=21;SAR=23;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148098;STB=0.508156;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.00268699;OID=.;OPOS=56388033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:44:44:0.54321:23:21:17:20:23:21:17:20 chr15 56471449 . T G 240.99 PASS AF=0.299145;AO=33;DP=108;FAO=35;FDP=117;FR=.;FRO=82;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.0431856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6149;QD=8.23885;RBI=0.0539879;REFB=-0.0242139;REVB=0.0323989;RO=75;SAF=27;SAR=6;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477267;STB=0.762107;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0129652;OID=.;OPOS=56471449;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:117:75:82:33:35:0.299145:6:27:33:42:8:27:33:49 chr15 56721264 . G A 613.35 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4203;QD=61.3354;RBI=0.0299112;REFB=0;REVB=0.0229018;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7105e-05;OID=.;OPOS=56721264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:18:22:0:0 chr15 56756285 . T G 564.42 PASS AF=0.537736;AO=58;DP=106;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0227873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0114;QD=21.299;RBI=0.0261589;REFB=-0.0117854;REVB=-0.0128462;RO=47;SAF=28;SAR=30;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120028;STB=0.50746;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0111174;OID=.;OPOS=56756285;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:47:49:58:57:0.537736:30:28:22:25:30:27:24:25 chr15 56923714 . G A 1271.93 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00258181;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.324;QD=62.0452;RBI=0.00263001;REFB=0;REVB=-0.000501225;RO=0;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.47217e-05;OID=.;OPOS=56923714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:37:45:0:0:37:45:0:0 chr15 56946980 . T G 1120.54 PASS AF=0.987013;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.007351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1742;QD=58.2101;RBI=0.0461559;REFB=-0.0996691;REVB=0.0455667;RO=2;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024887;STB=0.506492;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00399791;OID=.;OPOS=56946980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:2:1:75:76:0.987013:37:38:0:2:38:38:0:1 chr15 56968865 . C T 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00577341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2993;QD=14.9199;RBI=0.00608018;REFB=-0.0455478;REVB=-0.00190692;RO=37;SAF=8;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164895;STB=0.593989;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0627279;OID=.;OPOS=56968865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:20:8:16:21:20:8:16:21 chr15 57213283 . A G 177.78 PASS AF=0.5625;AO=16;DP=30;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0196555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.722;QD=22.2227;RBI=0.0206206;REFB=-0.0040255;REVB=0.00623475;RO=14;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235435;STB=0.64688;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00254965;OID=.;OPOS=57213283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:32:14:14:16:18:0.5625:12:4:7:7:14:4:7:7 chr15 57731335 . A C 519.93 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.056;QD=59.4203;RBI=0.0256244;REFB=0;REVB=0.0216597;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77079e-05;OID=.;OPOS=57731335;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr15 57731573 . C T 526.35 PASS AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0476675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2811;QD=56.9023;RBI=0.0759923;REFB=-0.0474583;REVB=0.0591832;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283378;STB=0.514278;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00299764;OID=.;OPOS=57731573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:16:19:0:1:17:19:0:1 chr15 57731728 . A G 1011.76 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200078;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.694;QD=59.5152;RBI=0.0200218;REFB=0;REVB=0.000749251;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55765e-05;OID=.;OPOS=57731728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0 chr15 57918090 . A G 1190.42 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3918;QD=61.0471;RBI=0.0447494;REFB=0;REVB=0.0409832;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185591;OID=.;OPOS=57918090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0 chr15 57925836 . C T 1025.98 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0959;QD=59.4768;RBI=0.0233606;REFB=0;REVB=-0.0171459;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.14948e-05;OID=.;OPOS=57925836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:38:29:0:0:40:29:0:0 chr15 57967219 . T C 1659.62 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.138;QD=60.3497;RBI=0.0227013;REFB=0;REVB=-0.000806084;RO=0;SAF=70;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59532e-05;OID=.;OPOS=57967219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:40:70:0:0:40:70:0:0 chr15 58256127 . C T 597.08 PASS AF=0.530973;AO=60;DP=113;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00998441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.876;QD=21.1357;RBI=0.0182952;REFB=-0.00621405;REVB=-0.0153306;RO=53;SAF=26;SAR=34;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168951;STB=0.509284;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00459236;OID=.;OPOS=58256127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:53:53:60:60:0.530973:34:26:24:29:34:26:24:29 chr15 58444720 . A T 462.03 PASS AF=0.46729;AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0104961;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.187;QD=17.272;RBI=0.0151518;REFB=-0.00128126;REVB=-0.0109274;RO=59;SAF=28;SAR=22;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173152;STB=0.508702;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00128914;OID=.;OPOS=58444720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:59:57:50:50:0.46729:22:28:32:27:22:28:31:26 chr15 58471368 . C T 482.85 PASS AF=0.441667;AO=49;DP=116;FAO=53;FDP=120;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.0100166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.306;QD=16.0948;RBI=0.0243499;REFB=-0.0116309;REVB=0.0221943;RO=67;SAF=24;SAR=25;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278904;STB=0.505049;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0140871;OID=.;OPOS=58471368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:120:67:67:49:53:0.441667:25:24:31:36:28:25:31:36 chr15 58476281 . A G 820.48 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248727;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.72;QD=57.5775;RBI=0.0259152;REFB=0;REVB=0.00727628;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.26521e-05;OID=.;OPOS=58476281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0 chr15 58834741 . G T 1283.25 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.119;QD=61.8434;RBI=0.0591647;REFB=0;REVB=0.0321711;RO=0;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149637;OID=.;OPOS=58834741;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:35:48:0:0:35:48:0:0 chr15 58838010 . A G 2105.99 PASS AF=0.925466;AO=148;DP=160;FAO=149;FDP=161;FR=.;FRO=12;FSAF=70;FSAR=79;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0129654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.302;QD=52.3227;RBI=0.016196;REFB=-0.0379012;REVB=0.00970616;RO=12;SAF=70;SAR=78;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080356;STB=0.503976;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00958579;OID=.;OPOS=58838010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:160:161:12:12:148:149:0.925466:78:70:5:7:79:70:5:7 chr15 58838011 . T G 30.29 PASS AF=0.068323;AO=11;DP=160;FAO=11;FDP=161;FR=.;FRO=150;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=71;FSRR=79;FWDB=0.0338156;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3622;QD=0.752537;RBI=0.0381465;REFB=-0.0165486;REVB=0.0176538;RO=149;SAF=4;SAR=7;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122544;STB=0.603951;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0544917;OID=.;OPOS=58838011;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:160:161:149:150:11:11:0.068323:7:4:71:78:7:4:71:79 chr15 58853079 . C A 722.59 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.917;QD=62.8342;RBI=0.0831875;REFB=0;REVB=0.0779278;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029939;OID=.;OPOS=58853079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:46:0:0:42:46:1:12:30:0:0:15:31:0:0 chr15 58853109 . A G 773.56 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0197463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.717;QD=61.8847;RBI=0.120261;REFB=-0.100223;REVB=0.118629;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00103194;OID=.;OPOS=58853109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:50:0:1:49:49:0.98:25:24:0:0:25:24:0:1 chr15 58860963 . C A 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.000905091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.046;QD=21.7465;RBI=0.00951408;REFB=-0.00956739;REVB=-0.00947093;RO=20;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783987;STB=0.544012;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00910418;OID=.;OPOS=58860963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:13:9:10:10:13:9:10:10 chr15 58892410 . T C 120.07 PASS AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00786177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5977;QD=9.417;RBI=0.0172938;REFB=-0.00540497;REVB=0.0154036;RO=36;SAF=2;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.560295;STB=0.841767;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0114916;OID=.;OPOS=58892410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:13:2:21:15:13:2:21:15 chr15 58902529 . T C 348.18 PASS AF=0.4;AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0208397;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.775;QD=14.6602;RBI=0.0232481;REFB=0.00187631;REVB=0.0103043;RO=57;SAF=23;SAR=15;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247192;STB=0.64957;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00382362;OID=.;OPOS=58902529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:57:57:38:38:0.4:15:23:21:36:15:23:20:37 chr15 58947625 . A G 49.42 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.116694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.9741;QD=15.2065;RBI=0.126602;REFB=0.0501598;REVB=0.0490975;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304739;STB=0.681283;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.046111;OID=.;OPOS=58947625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:5:2:4:2:5:2:4:2 chr15 58983425 . G C 257.76 PASS AF=0.428571;AO=29;DP=71;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0261656;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.111;QD=14.7291;RBI=0.0261716;REFB=-0.00816564;REVB=0.000562076;RO=40;SAF=17;SAR=12;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164185;STB=0.599933;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0138058;OID=.;OPOS=58983425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:40:40:29:30:0.428571:12:17:17:23:12:18:17:23 chr15 58983588 . T A 382.98 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0111451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9662;QD=17.4083;RBI=0.033016;REFB=-0.00411705;REVB=-0.031078;RO=48;SAF=20;SAR=20;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405846;STB=0.522716;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00413101;OID=.;OPOS=58983588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:20:20:22:26:20:20:22:26 chr15 58985164 . T G 352.88 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00437012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.9255;QD=21.3868;RBI=0.245901;REFB=-0.0396409;REVB=0.245862;RO=18;SAF=14;SAR=5;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114595;STB=0.560943;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0564882;OID=.;OPOS=58985164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:18:28:19:38:0.575758:5:14:15:3:23:15:15:13 chr15 59147037 . A T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.495;QD=55.6561;RBI=0.0451329;REFB=0;REVB=0.0426978;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382977;OID=.;OPOS=59147037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr15 59147413 . T A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140892;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.379;QD=56.1913;RBI=0.0384852;REFB=0;REVB=0.0358135;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173846;OID=.;OPOS=59147413;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0 chr15 59147800 . C T 100.75 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0139121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.635;QD=16.1192;RBI=0.0143204;REFB=-0.0173554;REVB=-0.00339479;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259131;STB=0.647268;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0279136;OID=.;OPOS=59147800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:2:11:7:5:2:11 chr15 59347929 . C A 1434.33 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4318;QD=63.0476;RBI=0.0313011;REFB=0;REVB=-0.0165698;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000310615;OID=.;OPOS=59347929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:54:37:0:0:54:37:0:0 chr15 59368167 . G A 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.869;QD=60.2042;RBI=0.0943035;REFB=0;REVB=0.090384;RO=0;SAF=50;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.51353e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308925;OID=.;OPOS=59368167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:23:50:0:0:23:50:0:0 chr15 59399753 . T C 145.58 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00580946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3988;QD=16.1758;RBI=0.0388821;REFB=-0.00740533;REVB=-0.0384457;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792681;STB=0.545399;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00912276;OID=.;OPOS=59399753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:14:6:6:10:14:6 chr15 59453384 . T C 407.6 PASS AF=0.471264;AO=30;DP=88;FAO=41;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0119001;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.675;QD=18.7402;RBI=0.0120772;REFB=-0.0174957;REVB=-0.00206073;RO=45;SAF=6;SAR=24;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24037;STB=0.506696;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0267929;OID=.;OPOS=59453384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:45:45:30:41:0.471264:24:6:17:28:26:15:17:28 chr15 59499179 . G A 1190.41 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.217;QD=61.0464;RBI=0.0686612;REFB=0;REVB=0.0255823;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217189;OID=.;OPOS=59499179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0 chr15 59499228 . C T 1302.17 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.44;QD=62.0081;RBI=0.0397283;REFB=0;REVB=-0.00544662;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39245e-05;OID=.;OPOS=59499228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:37:46:0:0:37:47:0:0 chr15 59499274 . C A 1072.24 PASS AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00876391;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=282.318;QD=57.1864;RBI=0.0200758;REFB=-0.0336284;REVB=0.0180619;RO=2;SAF=43;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00463235;STB=0.502449;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000123934;OID=.;OPOS=59499274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:30:43:1:1:30:43:1:1 chr15 59500116 . T C 700.09 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00662147;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3225;QD=60.8774;RBI=0.0553793;REFB=0.0323494;REVB=0.054982;RO=1;SAF=19;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240908;STB=0.512815;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=7.75287e-05;OID=.;OPOS=59500116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:26:19:1:0:26:19:1:0 chr15 59500543 . G C 536.5 PASS AF=0.495575;AO=56;DP=113;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00911877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.615;QD=18.9911;RBI=0.0105396;REFB=-0.00966203;REVB=-0.00528501;RO=57;SAF=25;SAR=31;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08893;STB=0.549176;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0122283;OID=.;OPOS=59500543;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:57:57:56:56:0.495575:31:25:31:26:31:25:31:26 chr15 59510189 . G A 334.89 PASS AF=0.397849;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0028527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=324.464;QD=14.4037;RBI=0.0123901;REFB=0.00192613;REVB=0.0120572;RO=56;SAF=24;SAR=13;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235292;STB=0.63373;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00338671;OID=.;OPOS=59510189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:56:56:37:37:0.397849:13:24:24:32:13:24:24:32 chr15 59682428 . G A 263.8 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.00829239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.376;QD=12.8683;RBI=0.0161702;REFB=0.00181262;REVB=-0.013882;RO=51;SAF=13;SAR=18;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07522;STB=0.54297;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.0033588;OID=.;OPOS=59682428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:51:51:31:31:0.378049:18:13:18:33:18:13:18:33 chr15 59682486 . G GT 135.32 PASS AF=0.376812;AO=25;DP=74;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0201542;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.5239;QD=7.8445;RBI=0.0214018;REFB=0.00670511;REVB=-0.00720024;RO=48;SAF=8;SAR=17;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434045;STB=0.514275;STBP=0.895;TYPE=ins;VARB=-0.0161826;OID=.;OPOS=59682487;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.376812:25:74:26:69:43:9:17:14:29:99:48:8:17:17:31 chr15 59784493 . C T 1237.49 PASS AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0271421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.107;QD=58.9279;RBI=0.0274303;REFB=0.0139032;REVB=0.00396582;RO=2;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210376;STB=0.511108;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000244117;OID=.;OPOS=59784493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:44:38:0:2:44:38:0:2 chr15 59911808 . T C 175.14 PASS AF=0.486486;AO=14;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0055103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.43;QD=18.9337;RBI=0.0567184;REFB=-0.020831;REVB=0.0564501;RO=19;SAF=14;SAR=0;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.808256;STB=0.654488;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.018828;OID=.;OPOS=59911808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:14:18:0.486486:0:14:10:9:4:14:10:9 chr15 59911892 . G T 1858.57 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.641;QD=61.4405;RBI=0.0361668;REFB=0;REVB=0.0349707;RO=0;SAF=59;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6849e-05;OID=.;OPOS=59911892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:62:59:0:0:62:59:0:0 chr15 59912253 . A C 689.29 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6657;QD=62.6627;RBI=0.0730573;REFB=0;REVB=0.0548128;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131648;OID=.;OPOS=59912253;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr15 59912625 . G A 270.75 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1943;QD=51.5706;RBI=0.173717;REFB=0;REVB=0.173471;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162937;OID=.;OPOS=59912625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:8:11:0:0:10:11:0:0 chr15 59963488 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.536;QD=60.61;RBI=0.0490303;REFB=0;REVB=0.00821613;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377443;OID=.;OPOS=59963488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr15 60298221 . C A 172.11 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0104552;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=65.3229;QD=18.1166;RBI=0.05133;REFB=0.0347024;REVB=0.050254;RO=20;SAF=2;SAR=16;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246626;STB=0.643489;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.0191755;OID=.;OPOS=60298221;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:16:2:5:15:16:2:5:15 chr15 60666686 . C T 539.84 PASS AF=0.568182;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00908989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1055;QD=24.538;RBI=0.0254467;REFB=0.00457349;REVB=-0.0237678;RO=37;SAF=22;SAR=28;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489045;STB=0.531586;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00625283;OID=.;OPOS=60666686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:37:38:50:50:0.568182:28:22:14:23:28:22:14:24 chr15 60678298 . T A 179.79 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195916;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.106;QD=47.9427;RBI=0.0198223;REFB=0;REVB=0.00301522;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.32932e-05;OID=.;OPOS=60678298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr15 60715800 . T G 540.01 PASS AF=0.909091;AO=31;DP=41;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0360215;FXX=0.0222173;HRUN=7;LEN=1;MLLD=66.7179;QD=49.0916;RBI=0.0952956;REFB=-0.0423266;REVB=0.0882253;RO=3;SAF=13;SAR=18;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145355;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150559;OID=.;OPOS=60715800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:41:44:3:4:31:40:0.909091:18:13:1:2:20:20:2:2 chr15 60724118 . C G 711.48 PASS AF=0.962963;AO=51;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0154638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.06;QD=52.7023;RBI=0.017203;REFB=-0.0585909;REVB=-0.00753742;RO=1;SAF=13;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122334;STB=0.512495;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000297032;OID=.;OPOS=60724118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:1:2:51:52:0.962963:38:13:0:1:39:13:0:2 chr15 60734697 . A G 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0330606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.916;QD=19.6459;RBI=0.0346578;REFB=0.00440546;REVB=-0.0104001;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362939;STB=0.706071;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00439304;OID=.;OPOS=60734697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:4:7:1:7:4:7:1:7 chr15 60789798 . G T 820.15 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0151483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.253;QD=55.6036;RBI=0.0248864;REFB=-0.125062;REVB=-0.0197449;RO=1;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171508;STB=0.509088;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00572598;OID=.;OPOS=60789798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:27:31:0:1:27:31:0:1 chr15 62144563 . A G 102.43 PASS AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0182972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.329;QD=7.7306;RBI=0.0438162;REFB=0.00772171;REVB=0.039813;RO=39;SAF=7;SAR=7;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460785;STB=0.528262;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.0146235;OID=.;OPOS=62144563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:39:39:14:14:0.264151:7:7:18:21:7:7:18:21 chr15 62199580 . T A 85.35 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0506076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9723;QD=11.3806;RBI=0.0522665;REFB=-0.0221008;REVB=0.0130635;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359763;STB=0.521434;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0255767;OID=.;OPOS=62199580;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:11:8:5:6:11:8 chr15 62202482 . C T 2596.44 PASS AF=0.625683;AO=228;DP=364;FAO=229;FDP=366;FR=.;FRO=137;FSAF=101;FSAR=128;FSRF=85;FSRR=52;FWDB=0.0116549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.894;QD=28.3764;RBI=0.0123436;REFB=0.00877864;REVB=-0.00406533;RO=131;SAF=101;SAR=127;SRF=80;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113734;STB=0.567013;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00381789;OID=.;OPOS=62202482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:364:366:131:137:228:229:0.625683:127:101:80:51:128:101:85:52 chr15 62242588 . G C 89.59 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0102467;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.478;QD=13.2724;RBI=0.0269206;REFB=0.0195863;REVB=-0.0248942;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771943;STB=0.526978;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=-0.0278259;OID=.;OPOS=62242588;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:26:27:15:16:11:11:0.407407:6:5:8:7:6:5:8:8 chr15 62244117 . G A 238.4 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00149166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7131;QD=15.8933;RBI=0.00506304;REFB=0.0147186;REVB=0.00483832;RO=33;SAF=15;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199556;STB=0.51127;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=-0.0245843;OID=.;OPOS=62244117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:12:15:19:14:12:15:19:14 chr15 62259637 . C T 851.02 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3022;QD=57.6963;RBI=0.0258191;REFB=0;REVB=-0.0228781;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119889;OID=.;OPOS=62259637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0 chr15 62539781 . A G 175.54 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00579306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.434;QD=13.7679;RBI=0.0549564;REFB=-0.00264032;REVB=-0.0546502;RO=30;SAF=16;SAR=4;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444733;STB=0.751867;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00877575;OID=.;OPOS=62539781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:31:20:20:0.392157:4:16:12:18:4:16:13:18 chr15 62990971 . C T 257.14 PASS AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0583714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3335;QD=13.7141;RBI=0.0609772;REFB=-0.0169692;REVB=-0.0176351;RO=44;SAF=9;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199187;STB=0.621692;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0275568;OID=.;OPOS=62990971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:45:30:30:0.4:21:9:21:23:21:9:22:23 chr15 63009804 . C T 672.46 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.54;QD=61.1327;RBI=0.0642727;REFB=0;REVB=0.0388633;RO=1;SAF=30;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418546;OID=.;OPOS=63009804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:1:0:43:44:1:13:30:1:0:13:31:0:0 chr15 63047778 . C T 1554.38 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458898;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.524;QD=64.0983;RBI=0.0762682;REFB=0;REVB=0.0609177;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332305;OID=.;OPOS=63047778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:44:53:0:0:44:53:0:0 chr15 63351840 . C A 296.38 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0371852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2232;QD=49.3959;RBI=0.0603913;REFB=-0.0970054;REVB=-0.0475854;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486633;STB=0.526293;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00310841;OID=.;OPOS=63351840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:9:14:0:1:9:14:0:1 chr15 63363421 . T TGTTTT 50.0 PASS AO=43;DP=97;LEN=5;RO=54;SAF=29;SAR=25;SRF=22;SRR=21;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=63363421;OREF=-;OALT=TGTTT;OMAPALT=TGTTTT GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:97:54:43:25:29:22:21 chr15 63433766 . G A 1117.43 PASS AF=0.986842;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0529941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1293;QD=58.8123;RBI=0.053312;REFB=0.0708273;REVB=0.00581294;RO=1;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122856;STB=0.506327;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.0204678;OID=.;OPOS=63433766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:76:1:1:73:75:0.986842:38:35:0:1:39:36:0:1 chr15 63446199 . CAAAATT C 45.91 PASS AF=0.32;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00183364;FXX=0.0740466;HRUN=4;LEN=6;MLLD=299.043;QD=7.34564;RBI=0.0237923;REFB=0.00506595;REVB=0.0237216;RO=15;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237275;STB=0.64321;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=-0.0086613;OID=.;OPOS=63446200;OREF=AAAATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.32:8:26:8:25:17:5:3:7:10:45:15:5:3:6:9 chr15 63548787 . G A 164.14 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0046597;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.176;QD=12.8738;RBI=0.0345297;REFB=-0.0218617;REVB=-0.0342138;RO=32;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663241;STB=0.538422;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.032982;OID=.;OPOS=63548787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:12:7:10:22:12:7:10:22 chr15 63986898 . T C 162.0 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.027265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3014;QD=11.9996;RBI=0.0344331;REFB=-0.00995145;REVB=0.0210299;RO=34;SAF=8;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202615;STB=0.61753;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0180501;OID=.;OPOS=63986898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:12:8:20:14:12:8:20:14 chr15 64215375 . G C 785.12 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9926;QD=57.0995;RBI=0.00805427;REFB=0;REVB=0.00209854;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.62573e-05;OID=.;OPOS=64215375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0 chr15 64367745 . T C 49.51 PASS AF=0.538462;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.16605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1405;QD=15.2339;RBI=0.168493;REFB=-0.000375353;REVB=0.0285872;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168138;STB=0.627576;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0173915;OID=.;OPOS=64367745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:6:7:0.538462:4:2:1:5:4:3:1:5 chr15 64385851 . T C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.867;QD=60.609;RBI=0.0478791;REFB=0;REVB=-0.0415403;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314822;OID=.;OPOS=64385851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0 chr15 64385894 . C T 147.15 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0420515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0304;QD=17.3113;RBI=0.0759328;REFB=0.0114468;REVB=0.0632255;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00875906;OID=.;OPOS=64385894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:8:8:9:9:8:8:9:9 chr15 64418397 . G A 50.47 PASS AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0901409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.735;QD=4.92381;RBI=0.0920927;REFB=-0.00695628;REVB=-0.0188594;RO=28;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151162;STB=0.633445;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0200002;OID=.;OPOS=64418397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:41:41:28:33:8:8:0.195122:6:2:10:18:6:2:13:20 chr15 64430607 . T C 130.94 PASS AF=0.608696;AO=5;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0607271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.73;QD=22.7713;RBI=0.0609673;REFB=-0.0386531;REVB=-0.0054065;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275355;STB=0.584301;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0380281;OID=.;OPOS=64430607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:7:9:5:14:0.608696:3:2:1:6:8:6:2:7 chr15 64455123 . G T 245.22 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0156902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.249;QD=15.5698;RBI=0.0317727;REFB=-0.0169866;REVB=-0.0276282;RO=34;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044504;STB=0.508679;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0395604;OID=.;OPOS=64455123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:18:10:12:22:18:10:12:23 chr15 64508763 . G A 191.63 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00410754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.221;QD=15.643;RBI=0.0160565;REFB=0.00141177;REVB=-0.0155222;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692642;STB=0.539837;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.0021593;OID=.;OPOS=64508763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:9:11:14:15:9:11:14:15 chr15 64634884 . C A 636.47 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227866;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.495;QD=62.095;RBI=0.0510396;REFB=0;REVB=-0.0456707;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000199591;OID=.;OPOS=64634884;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0 chr15 64737225 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.714;QD=56.706;RBI=0.0304886;REFB=0;REVB=0.00624242;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135084;OID=.;OPOS=64737225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr15 64792896 . G A 1116.68 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.405;QD=60.3612;RBI=0.0171071;REFB=0;REVB=0.0130734;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13485e-05;OID=.;OPOS=64792896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:31:43:0:0:31:43:0:0 chr15 64793617 . A G 755.82 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343701;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.941;QD=57.043;RBI=0.0359987;REFB=0;REVB=0.0107054;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156131;OID=.;OPOS=64793617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr15 64915106 . C T 834.38 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00751628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.6701;QD=57.5437;RBI=0.0423097;REFB=0;REVB=0.0416368;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556864;OID=.;OPOS=64915106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0 chr15 65041622 . C A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.659;QD=35.5758;RBI=0.0398463;REFB=0;REVB=0.0280707;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.87556e-06;OID=.;OPOS=65041622;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr15 65108479 . T C 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0644085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5079;QD=18.4833;RBI=0.0654524;REFB=-0.00488961;REVB=0.0116429;RO=21;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159169;STB=0.59081;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00363558;OID=.;OPOS=65108479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:6:13:11:10:6:13:11:10 chr15 65153690 . G A 329.42 PASS AF=0.682927;AO=26;DP=39;FAO=28;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00638663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.043;QD=32.1386;RBI=0.0105259;REFB=-0.0270362;REVB=0.00836699;RO=13;SAF=16;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960925;STB=0.547372;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0101798;OID=.;OPOS=65153690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:13:13:26:28:0.682927:10:16:6:7:11:17:6:7 chr15 65157482 . C T 205.85 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0170368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.194;QD=23.5258;RBI=0.0242521;REFB=-0.0300125;REVB=0.0172602;RO=15;SAF=13;SAR=7;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196506;STB=0.608598;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0133056;OID=.;OPOS=65157482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:7:13:13:2:7:13:13:2 chr15 65235776 . A G 149.87 PASS AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0463714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.41;QD=28.5458;RBI=0.057314;REFB=-0.0468439;REVB=-0.0336836;RO=6;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527419;STB=0.529372;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0122101;OID=.;OPOS=65235776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:21:21:6:6:15:15:0.714286:9:6:3:3:9:6:3:3 chr15 65236875 . T C 332.0 PASS AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0253722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.414;QD=16.1951;RBI=0.0271479;REFB=-0.0158368;REVB=0.00965715;RO=45;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00550742;STB=0.503395;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0210996;OID=.;OPOS=65236875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:19:17:21:24:19:17:22:24 chr15 65294903 . A G 160.28 PASS AF=0.517241;AO=13;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0308858;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=313.972;QD=22.1076;RBI=0.0308953;REFB=0.00278186;REVB=-0.000767987;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985854;STB=0.543983;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00194612;OID=.;OPOS=65294903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:8:11:13:15:0.517241:8:5:2:6:8:7:4:7 chr15 65347405 . G A 279.02 PASS AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0233504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.756;QD=27.2211;RBI=0.0250756;REFB=-0.014267;REVB=0.00914026;RO=16;SAF=12;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745185;STB=0.541144;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0127752;OID=.;OPOS=65347405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:13:12:6:10:13:12:6:10 chr15 65369951 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2675;QD=35.5756;RBI=0.0480409;REFB=0;REVB=0.0139562;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00274149;OID=.;OPOS=65369951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr15 65370353 . T C 1563.77 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6977;QD=63.8274;RBI=0.0366011;REFB=0;REVB=0.0209788;RO=0;SAF=60;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58789e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217219;OID=.;OPOS=65370353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:38:60:0:0:38:60:0:0 chr15 65449169 . C T 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.658;QD=57.7116;RBI=0.0347223;REFB=0;REVB=0.028841;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99479e-05;OID=.;OPOS=65449169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr15 65489128 . C T 573.16 PASS AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0460025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.962;QD=55.9177;RBI=0.0528397;REFB=-0.101887;REVB=0.0259963;RO=2;SAF=27;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020432;STB=0.510911;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00552259;OID=.;OPOS=65489128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:12:27:1:1:12:27:1:1 chr15 65489688 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.055;QD=57.3856;RBI=0.0521708;REFB=0;REVB=-0.0502704;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.52215e-05;OID=.;OPOS=65489688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0 chr15 65490901 . T C 1217.53 PASS AF=0.932584;AO=83;DP=89;FAO=83;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0108383;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.802;QD=54.7203;RBI=0.0243702;REFB=0.043821;REVB=-0.0218275;RO=5;SAF=53;SAR=30;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188937;STB=0.502055;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.00132639;OID=.;OPOS=65490901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:89:89:5:6:83:83:0.932584:30:53:4:1:30:53:4:2 chr15 65619427 . T A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.694;QD=33.4285;RBI=0.0482463;REFB=0;REVB=0.0482463;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351004;OID=.;OPOS=65619427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr15 65620156 . C T 347.53 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.097808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5058;QD=51.4862;RBI=0.120176;REFB=-0.114126;REVB=0.0698271;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.512186;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00446206;OID=.;OPOS=65620156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:0:1:26:26:0.962963:20:6:0:0:20:6:0:1 chr15 65621441 . C A 376.05 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.129;QD=55.7104;RBI=0.0464511;REFB=0;REVB=0.0253319;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317167;OID=.;OPOS=65621441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:7:19:0:0:8:19:0:0 chr15 65621857 . T C 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0640054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2789;QD=61.6833;RBI=0.0846387;REFB=0;REVB=0.0553806;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.72432e-05;OID=.;OPOS=65621857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr15 65667724 . A G 556.92 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.385;QD=60.2076;RBI=0.0141297;REFB=0;REVB=0.00982844;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121703;OID=.;OPOS=65667724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr15 65676617 . T C 58.79 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0245311;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.655;QD=11.1984;RBI=0.067784;REFB=0.00702741;REVB=0.0631893;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020009;STB=0.506313;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=-0.00837303;OID=.;OPOS=65676617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:23:21:14:13:8:8:0.380952:3:5:9:5:3:5:8:5 chr15 65676726 . C T 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00434883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.357;QD=20.1601;RBI=0.00881134;REFB=-0.0172402;REVB=0.00766339;RO=14;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166101;STB=0.594472;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0156397;OID=.;OPOS=65676726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:11:5:7:7:11:5:7:7 chr15 65703625 . C G 162.54 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0447789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6088;QD=19.7023;RBI=0.0458056;REFB=0.0345332;REVB=-0.00964388;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284482;STB=0.51611;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.0301345;OID=.;OPOS=65703625;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:7:9:9:8:7:9 chr15 65856653 . G A 63.01 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.060257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.96;QD=8.40086;RBI=0.0625765;REFB=-0.0309757;REVB=-0.0168792;RO=21;SAF=4;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24873;STB=0.651856;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0363664;OID=.;OPOS=65856653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:5:4:14:7:5:4:14:7 chr15 65916527 . A T 421.3 PASS AF=0.421053;AO=48;DP=114;FAO=48;FDP=114;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=-0.0179754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.266;QD=14.7824;RBI=0.0197327;REFB=0.000109067;REVB=-0.00814015;RO=66;SAF=24;SAR=24;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140753;STB=0.578915;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.000285996;OID=.;OPOS=65916527;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:66:66:48:48:0.421053:24:24:42:24:24:24:42:24 chr15 65994733 . C T 593.24 PASS AF=0.517241;AO=59;DP=116;FAO=60;FDP=116;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00445012;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.121;QD=20.4566;RBI=0.0207121;REFB=-0.0254565;REVB=-0.0202284;RO=55;SAF=31;SAR=28;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981137;STB=0.544701;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0284068;OID=.;OPOS=65994733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:55:56:59:60:0.517241:28:31:35:20:28:32:35:21 chr15 66011630 . A G 370.06 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00283709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.049;QD=19.7364;RBI=0.0122714;REFB=-0.0222367;REVB=0.0119389;RO=36;SAF=20;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0012855;STB=0.507039;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0208823;OID=.;OPOS=66011630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:37:38:38:0.506667:18:20:19:17:18:20:20:17 chr15 66023799 . G T 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00792596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.982;QD=9.49513;RBI=0.0162278;REFB=-0.000922205;REVB=-0.0141605;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141068;STB=0.584958;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0094421;OID=.;OPOS=66023799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:5:6:16:8:5:6:16:8 chr15 66181143 . T G 74.25 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00883364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.416;QD=10.2408;RBI=0.0111708;REFB=-0.0110383;REVB=-0.00683761;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03601;STB=0.521696;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0265189;OID=.;OPOS=66181143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:6:4:7:12:6:4:7:12 chr15 66206204 . G A 255.68 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0248574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9182;QD=17.9421;RBI=0.0377698;REFB=0.00330678;REVB=0.028437;RO=28;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657451;STB=0.529162;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=-0.00289607;OID=.;OPOS=66206204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:28:29:28:28:0.491228:17:11:13:15:17:11:13:16 chr15 66214811 . C CG 31.11 PASS AF=0.25;AO=8;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.271926;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=76.8716;QD=5.18581;RBI=0.272772;REFB=-0.0117087;REVB=-0.0214685;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748347;STB=0.624531;STBP=0.573;TYPE=ins;VARB=0.192352;OID=.;OPOS=66214812;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25:8:24:6:24:18:1:5:5:13:31:15:2:6:3:12 chr15 66257408 . T C 635.72 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549217;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3965;QD=62.0214;RBI=0.0819506;REFB=0;REVB=0.0608236;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.72111e-05;OID=.;OPOS=66257408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0 chr15 66274690 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3165;QD=44.6896;RBI=0.0275096;REFB=0;REVB=0.0155565;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101773;OID=.;OPOS=66274690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0 chr15 66411441 . C T 1588.48 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.513;QD=59.9426;RBI=0.0397241;REFB=0;REVB=0.0382225;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89479e-05;OID=.;OPOS=66411441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:106:0:0:104:106:1:49:55:0:0:51:55:0:0 chr15 66612965 . T C 442.72 PASS AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00322877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.171;QD=22.7035;RBI=0.00526697;REFB=-0.00229422;REVB=0.00416125;RO=35;SAF=25;SAR=18;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102056;STB=0.556197;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00249028;OID=.;OPOS=66612965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:18:25:16:19:18:25:16:19 chr15 66640619 . C A 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.772;QD=59.8394;RBI=0.0167716;REFB=0;REVB=0.0119515;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32677e-07;OID=.;OPOS=66640619;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chr15 66644521 . C G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.621;QD=58.1421;RBI=0.0597481;REFB=0;REVB=0.059542;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280416;OID=.;OPOS=66644521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0 chr15 66821250 . A G 236.6 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0319964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.14;QD=15.7732;RBI=0.0325596;REFB=-0.00480002;REVB=-0.00602956;RO=33;SAF=19;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360308;STB=0.703553;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00811803;OID=.;OPOS=66821250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:8:19:11:22:8:19:11:22 chr15 67073549 . C T 410.3 PASS AF=0.702128;AO=32;DP=46;FAO=33;FDP=47;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0747406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.492;QD=34.9188;RBI=0.0826419;REFB=-0.00404366;REVB=0.0352636;RO=14;SAF=16;SAR=16;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398877;STB=0.525758;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00101066;OID=.;OPOS=67073549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:14:14:32:33:0.702128:16:16:6:8:16:17:6:8 chr15 67234251 . A G 1358.62 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.589;QD=62.4654;RBI=0.0366376;REFB=0;REVB=0.0224946;RO=0;SAF=36;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74222e-05;OID=.;OPOS=67234251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:51:36:0:0:51:36:0:0 chr15 67435419 . C CTTT 57.48 PASS AF=0.444444;AO=7;DP=19;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.023311;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=44.0382;QD=12.7741;RBI=0.0594165;REFB=-0.000895111;REVB=-0.0546526;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508907;STB=0.777296;STBP=0.109;TYPE=ins;VARB=-0.000469591;OID=.;OPOS=67435420;OREF=-;OALT=TTT;OMAPALT=CTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.444444:7:19:8:18:10:4:4:10:0:57:11:4:3:11:0 chr15 67457335 . A G 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00959242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.958;QD=59.1432;RBI=0.0120549;REFB=0;REVB=0.00730118;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83689e-05;OID=.;OPOS=67457335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr15 67484297 . C T 389.89 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00239851;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.367;QD=21.3641;RBI=0.00465352;REFB=-0.00542393;REVB=-0.00398778;RO=35;SAF=24;SAR=15;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089062;STB=0.541463;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00449508;OID=.;OPOS=67484297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:35:34:39:39:0.534247:15:24:18:17:15:24:18:16 chr15 67486775 . T C 72.69 PASS AF=0.27027;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0118488;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6892;QD=7.85886;RBI=0.044605;REFB=0.00926264;REVB=0.0430024;RO=27;SAF=8;SAR=2;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.583878;STB=0.853755;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0140343;OID=.;OPOS=67486775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:38:37:27:27:10:10:0.27027:2:8:7:20:2:8:7:20 chr15 67486847 . T C 84.8 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00173764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.474;QD=10.9415;RBI=0.00450858;REFB=0.0040489;REVB=-0.00416027;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31541;STB=0.685413;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.011201;OID=.;OPOS=67486847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:5:6:5:15:5:6:5:15 chr15 67494304 . T G 167.33 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0185169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.541;QD=11.7421;RBI=0.019389;REFB=-0.00344678;REVB=0.00574966;RO=35;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272452;STB=0.646925;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00641433;OID=.;OPOS=67494304;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:36:21:21:0.368421:9:12:11:24:9:12:12:24 chr15 67528374 . T G 299.02 PASS AF=0.54;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00868727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.857;QD=23.9218;RBI=0.0655232;REFB=0.00587699;REVB=0.0649447;RO=23;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597796;STB=0.541636;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=-0.00281214;OID=.;OPOS=67528374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:23:23:26:27:0.54:12:14:14:9:13:14:14:9 chr15 67547301 . C A 720.63 PASS AF=0.522059;AO=70;DP=133;FAO=71;FDP=136;FR=.;FRO=65;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.0364489;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.665;QD=21.1951;RBI=0.0374577;REFB=-0.0209704;REVB=0.0086348;RO=63;SAF=40;SAR=30;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554113;STB=0.526408;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0207106;OID=.;OPOS=67547301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:63:65:70:71:0.522059:30:40:32:31:30:41:34:31 chr15 67574440 . C G 80.01 PASS AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0311549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.647;QD=7.27373;RBI=0.0322844;REFB=-0.00979544;REVB=-0.0084647;RO=33;SAF=2;SAR=9;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156327;STB=0.5998;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0252953;OID=.;OPOS=67574440;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:44:44:33:33:11:11:0.25:9:2:9:24:9:2:9:24 chr15 67692502 . T C 2354.01 PASS AF=0.993289;AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0124064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.867;QD=63.1949;RBI=0.0124185;REFB=-0.100012;REVB=-0.000546791;RO=0;SAF=65;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502994;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=1.36947e-05;OID=.;OPOS=67692502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:149:149:0:1:148:148:0.993289:83:65:0:0:83:65:0:1 chr15 67768151 . G C 1485.71 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175526;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.6;QD=60.0288;RBI=0.0366835;REFB=0;REVB=0.0322116;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98841e-05;OID=.;OPOS=67768151;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:56:43:0:0:56:43:0:0 chr15 67951150 . G T 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00790712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.622;QD=14.2704;RBI=0.0153539;REFB=-0.0007021;REVB=-0.0131613;RO=32;SAF=6;SAR=18;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307386;STB=0.669752;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00137959;OID=.;OPOS=67951150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:33:24:24:0.421053:18:6:17:15:18:6:17:16 chr15 68117300 . T A 1195.67 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392326;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.368;QD=61.3163;RBI=0.0401052;REFB=0;REVB=0.0083203;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019251;OID=.;OPOS=68117300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0 chr15 68583175 . T C 1587.79 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.405;QD=64.1531;RBI=0.043233;REFB=0;REVB=0.0373073;RO=0;SAF=49;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.07135e-05;OID=.;OPOS=68583175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:49:49:0:0:49:50:0:0 chr15 68603625 . C T 1767.61 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.439;QD=60.952;RBI=0.0499275;REFB=0;REVB=0.0418219;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35694e-05;OID=.;OPOS=68603625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:63:53:0:0:63:53:0:0 chr15 68605169 . G A 831.52 PASS AF=0.952381;AO=59;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0312982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.317;QD=52.7948;RBI=0.032979;REFB=-0.0512047;REVB=0.0103942;RO=3;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553977;STB=0.529402;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.000760961;OID=.;OPOS=68605169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:63:63:3:3:59:60:0.952381:24:35:0:3:24:36:0:3 chr15 68609647 . G T 942.65 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.279;QD=58.0093;RBI=0.0545854;REFB=0;REVB=0.0505755;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01847e-05;OID=.;OPOS=68609647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:65:0:0:62:65:1:38:24:0:0:41:24:0:0 chr15 68612556 . T C 1449.53 PASS AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000123589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.486;QD=63.0231;RBI=0.0166594;REFB=0;REVB=0.0166589;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03826e-05;OID=.;OPOS=68612556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:48:44:0:0:48:44:0:0 chr15 68624290 . G A 1322.65 PASS AF=1;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453085;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.538;QD=61.5187;RBI=0.0485771;REFB=0;REVB=0.0175178;RO=0;SAF=22;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52024e-05;OID=.;OPOS=68624290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:85:86:1:63:22:0:0:63:23:0:0 chr15 68624396 . A C 393.23 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.566;QD=56.1761;RBI=0.020514;REFB=0;REVB=0.0203294;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.17043e-05;OID=.;OPOS=68624396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0 chr15 68628143 . C T 1412.68 PASS AF=0.94898;AO=93;DP=98;FAO=93;FDP=98;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.059941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.299;QD=57.6605;RBI=0.0626117;REFB=-0.0339202;REVB=0.0180914;RO=5;SAF=36;SAR=57;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415825;STB=0.521973;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000859099;OID=.;OPOS=68628143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:98:98:5:5:93:93:0.94898:57:36:4:1:57:36:4:1 chr15 68649587 . G A 1047.28 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415754;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.665;QD=59.8444;RBI=0.0432848;REFB=0;REVB=-0.0120441;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71263e-05;OID=.;OPOS=68649587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:33:37:0:0:33:37:0:0 chr15 69019582 . G C 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0138986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.051;QD=13.7531;RBI=0.0178623;REFB=-0.0203337;REVB=-0.0112201;RO=23;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157214;STB=0.590796;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0248073;OID=.;OPOS=69019582;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:9:6:6:17:9:6:6:17 chr15 69238272 . G T 238.36 PASS AF=0.534884;AO=21;DP=41;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0133753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.809;QD=22.1734;RBI=0.0159054;REFB=-0.00269572;REVB=0.00860714;RO=20;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150015;STB=0.579409;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00169401;OID=.;OPOS=69238272;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:43:20:20:21:23:0.534884:11:10:13:7:12:11:13:7 chr15 69238445 . G A 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0226745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.098;QD=9.19977;RBI=0.0238104;REFB=-0.00577999;REVB=0.00726675;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351603;STB=0.711799;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00950236;OID=.;OPOS=69238445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:10:3:4:3:10:3 chr15 69325581 . C T 505.82 PASS AF=0.602564;AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0322138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5039;QD=25.9397;RBI=0.0419363;REFB=-0.0605603;REVB=0.02685;RO=31;SAF=24;SAR=23;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113218;STB=0.56176;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0402476;OID=.;OPOS=69325581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:31:31:47:47:0.602564:23:24:11:20:23:24:11:20 chr15 69327825 . C T 197.12 PASS AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0198124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.415;QD=10.9513;RBI=0.0491485;REFB=-0.0215488;REVB=-0.0449783;RO=47;SAF=15;SAR=10;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200083;STB=0.511619;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0431097;OID=.;OPOS=69327825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:10:15:29:18:10:15:29:18 chr15 69542968 . G A 52.6 PASS AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0130655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0536;QD=6.78734;RBI=0.0134271;REFB=0.00254297;REVB=0.00309517;RO=22;SAF=1;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496771;STB=0.833935;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00621704;OID=.;OPOS=69542968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:22:23:8:8:0.258065:7:1:11:11:7:1:12:11 chr15 69561518 . G A 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00880899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.161;QD=8.24622;RBI=0.00881033;REFB=0.00486711;REVB=-0.00015324;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108749;STB=0.567382;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.00760977;OID=.;OPOS=69561518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:10:5:3:4:10:5 chr15 69564343 . C T 223.12 PASS AF=0.35443;AO=27;DP=74;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.057507;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.4995;QD=11.2974;RBI=0.072096;REFB=-0.0368749;REVB=-0.0434832;RO=47;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692239;STB=0.501844;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0748161;OID=.;OPOS=69564343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:79:47:51:27:28:0.35443:15:12:18:29:16:12:22:29 chr15 69652451 . G A 574.74 PASS AF=0.504274;AO=59;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.000687137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.849;QD=19.6491;RBI=0.00405162;REFB=-0.000931885;REVB=-0.00399293;RO=58;SAF=24;SAR=35;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00953715;STB=0.505261;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00109823;OID=.;OPOS=69652451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:58:58:59:59:0.504274:35:24:23:35:35:24:23:35 chr15 69683945 . C G 590.72 PASS AF=0.602273;AO=53;DP=88;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0226467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6258;QD=26.851;RBI=0.0234641;REFB=-0.0106089;REVB=0.00613943;RO=35;SAF=15;SAR=38;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269637;STB=0.64757;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0093952;OID=.;OPOS=69683945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:35:35:53:53:0.602273:38:15:22:13:38:15:22:13 chr15 69684050 . C T 248.96 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=43;FWDB=-0.0501562;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7722;QD=11.7157;RBI=0.051257;REFB=-0.00928251;REVB=-0.0105656;RO=55;SAF=18;SAR=12;SRF=12;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411384;STB=0.733199;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00964727;OID=.;OPOS=69684050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:12:18:12:43:12:18:12:43 chr15 69697756 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.406;QD=64.4151;RBI=0.0163412;REFB=0;REVB=0.0163033;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85669e-05;OID=.;OPOS=69697756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr15 69709748 . C A 258.6 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.000720318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.935;QD=16.4189;RBI=0.00723236;REFB=-0.0148538;REVB=-0.0071964;RO=34;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193969;STB=0.609046;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.010452;OID=.;OPOS=69709748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:17:12:21:13:17:12:21:13 chr15 69728949 . A G 765.44 PASS AF=0.470588;AO=80;DP=170;FAO=80;FDP=170;FR=.;FRO=90;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.00349374;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.877;QD=18.0104;RBI=0.0067701;REFB=-0.00613485;REVB=0.00579897;RO=90;SAF=47;SAR=33;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313188;STB=0.517336;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00649792;OID=.;OPOS=69728949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:90:90:80:80:0.470588:33:47:50:40:33:47:50:40 chr15 69732736 . C T 471.48 PASS AF=0.5625;AO=45;DP=80;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0041518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.696;QD=23.5739;RBI=0.0312694;REFB=-5.08933e-05;REVB=0.0309925;RO=35;SAF=29;SAR=16;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110756;STB=0.50608;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.000228517;OID=.;OPOS=69732736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:35:35:45:45:0.5625:16:29:23:12:16:29:23:12 chr15 69740350 . A G 291.52 PASS AF=0.516667;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0210242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9051;QD=19.4343;RBI=0.0210319;REFB=-0.0298139;REVB=0.000569376;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133701;STB=0.514276;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0312463;OID=.;OPOS=69740350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:30:31:0.516667:17:13:13:16:18:13:13:16 chr15 70345626 . C T 432.14 PASS AF=0.453608;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00428798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.571;QD=17.8204;RBI=0.0092922;REFB=-0.00431035;REVB=-0.00824368;RO=53;SAF=18;SAR=26;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437648;STB=0.524484;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00386276;OID=.;OPOS=70345626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:44:44:0.453608:26:18:24:29:26:18:24:29 chr15 70346923 . C T 202.07 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0157207;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0098;QD=19.7143;RBI=0.0178534;REFB=-0.0441182;REVB=-0.00846192;RO=20;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219277;STB=0.611539;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0448814;OID=.;OPOS=70346923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:20:21:20:20:0.487805:8:12:7:13:8:12:8:13 chr15 70347362 . C A 74.96 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2931;QD=37.4824;RBI=0.214006;REFB=0;REVB=0.209248;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0141026;OID=.;OPOS=70347362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr15 70347816 . A AG 322.23 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555097;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=211.132;QD=53.7041;RBI=0.058609;REFB=0;REVB=0.0188066;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000429029;OID=.;OPOS=70347817;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:24:24:24:0:7:17:0:0:4:0:7:16:0:0 chr15 70347920 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.414;QD=58.0607;RBI=0.0599962;REFB=0;REVB=-0.0590866;RO=0;SAF=20;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.99326e-05;OID=.;OPOS=70347920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:41:20:0:0:41:20:0:0 chr15 70351788 . T C 519.57 PASS AF=0.531915;AO=47;DP=91;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0129014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.657;QD=22.1095;RBI=0.0129524;REFB=-0.0204752;REVB=-0.00114851;RO=43;SAF=28;SAR=19;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335214;STB=0.515412;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.018795;OID=.;OPOS=70351788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:94:43:44:47:50:0.531915:19:28:24:19:20:30:25:19 chr15 70368432 . T C 257.73 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.000857426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.726;QD=19.8255;RBI=0.0685974;REFB=0.00423689;REVB=-0.068592;RO=25;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136111;STB=0.575831;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00984032;OID=.;OPOS=70368432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:14:13:16:9:14:13:16:9 chr15 70960068 . G A 501.65 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.209;QD=59.0171;RBI=0.0200358;REFB=0;REVB=-0.00930003;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72098e-05;OID=.;OPOS=70960068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:14:19:0:0:15:19:0:0 chr15 70991925 . G C 2632.94 PASS AF=0.994253;AO=169;DP=173;FAO=173;FDP=174;FR=.;FRO=1;FSAF=96;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0120691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.57;QD=60.5273;RBI=0.0137288;REFB=0.0180003;REVB=0.00654354;RO=1;SAF=93;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622116;STB=0.503225;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=1.9124e-05;OID=.;OPOS=70991925;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:173:174:1:1:169:173:0.994253:76:93:0:1:77:96:0:1 chr15 71184278 . G T 255.69 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00508941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8061;QD=17.9428;RBI=0.0325267;REFB=-0.0197981;REVB=0.0321261;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109717;STB=0.56136;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0183432;OID=.;OPOS=71184278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:14:14:11:18:14:14:11:18 chr15 71184495 . A G 245.99 PASS AF=0.340909;AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.0206027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.048;QD=11.1811;RBI=0.0253533;REFB=-0.0249236;REVB=-0.0147756;RO=41;SAF=7;SAR=23;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339284;STB=0.77452;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.058563;OID=.;OPOS=71184495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:58:30:30:0.340909:23:7:22:19:23:7:38:20 chr15 71403406 . T C 275.12 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.00534783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.027;QD=15.4996;RBI=0.0318076;REFB=-0.0309561;REVB=-0.0313548;RO=40;SAF=15;SAR=16;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160882;STB=0.509085;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0392205;OID=.;OPOS=71403406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:16:15:20:20:16:15:20:20 chr15 71953045 . G A 331.01 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.00692584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.972;QD=15.9522;RBI=0.0130368;REFB=-0.0118478;REVB=0.0110449;RO=46;SAF=16;SAR=20;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121671;STB=0.572964;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0152213;OID=.;OPOS=71953045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:46:47:36:36:0.433735:20:16:15:31:20:16:15:32 chr15 72040774 . C T 846.56 PASS AF=0.541096;AO=79;DP=146;FAO=79;FDP=146;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0336695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.521;QD=23.1935;RBI=0.0350782;REFB=-0.0464943;REVB=-0.00984099;RO=66;SAF=38;SAR=41;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787406;STB=0.539464;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0335541;OID=.;OPOS=72040774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:66:67:79:79:0.541096:41:38:38:28:41:38:38:29 chr15 72070067 . A G 83.93 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0375587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6195;QD=10.173;RBI=0.0689874;REFB=-0.0195785;REVB=-0.0578671;RO=22;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199266;STB=0.619356;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0559152;OID=.;OPOS=72070067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:5:6:8:14:5:6:8:14 chr15 72105928 . AC A 804.81 PASS AF=1;AO=69;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024594;FXX=0.013887;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.7878;QD=45.3411;RBI=0.0343291;REFB=-0.0230076;REVB=0.0239504;RO=1;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108681;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00187745;OID=.;OPOS=72105929;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:69:72:71:71:0:27:44:0:0:13:1:26:43:0:1 chr15 72191266 . C T 1437.82 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0551333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4915;QD=61.8416;RBI=0.077399;REFB=0.0117249;REVB=0.0543224;RO=1;SAF=50;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938747;STB=0.504949;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00055075;OID=.;OPOS=72191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:42:50:1:0:42:50:1:0 chr15 72260385 . G A 136.7 PASS AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0280841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=319.724;QD=10.9363;RBI=0.0340032;REFB=-0.00911202;REVB=-0.0191702;RO=34;SAF=4;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336544;STB=0.701863;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0209178;OID=.;OPOS=72260385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:12:4:18:16:12:4:18:16 chr15 72432583 . A G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.077848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.435;QD=60.2298;RBI=0.077859;REFB=0;REVB=-0.00130881;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000478753;OID=.;OPOS=72432583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0 chr15 72433182 . C T 170.35 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0110938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.445;QD=17.0354;RBI=0.0289723;REFB=-0.00258616;REVB=-0.0267641;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970462;STB=0.555494;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00273454;OID=.;OPOS=72433182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:10:12:8:10:10:12 chr15 72462255 . C T 455.07 PASS AF=0.454545;AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0114939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.296;QD=16.548;RBI=0.0178402;REFB=-0.0124316;REVB=-0.0136442;RO=59;SAF=26;SAR=24;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383068;STB=0.516405;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0167042;OID=.;OPOS=72462255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:59:60:50:50:0.454545:24:26:33:26:24:26:33:27 chr15 72511415 . G A 42.83 PASS AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0185022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.115;QD=5.1921;RBI=0.0194983;REFB=-0.0019374;REVB=-0.00615236;RO=26;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26455;STB=0.671813;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00179296;OID=.;OPOS=72511415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:3:4:9:17:3:4:9:17 chr15 72637795 . T C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.135;QD=63.5829;RBI=0.0105521;REFB=0;REVB=-0.00935263;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.10902e-05;OID=.;OPOS=72637795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr15 72638892 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.56;QD=56.9383;RBI=0.0325383;REFB=0;REVB=0.0192687;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75437e-05;OID=.;OPOS=72638892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0 chr15 72638961 . G A 502.23 PASS AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00580259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.138;QD=22.0761;RBI=0.00624969;REFB=-0.00975927;REVB=-0.00232133;RO=43;SAF=30;SAR=18;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100581;STB=0.555532;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00726784;OID=.;OPOS=72638961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:18:30:22:21:18:30:22:21 chr15 72700069 . G A 133.85 PASS AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.057125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5827;QD=25.4946;RBI=0.0824556;REFB=-0.0226212;REVB=-0.0594615;RO=7;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179477;STB=0.599866;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00732062;OID=.;OPOS=72700069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:6:8:6:1:6:8:6:1 chr15 72879653 . A ATTG 432.34 PASS AF=0.888889;AO=32;DP=36;FAO=32;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0121453;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=285.792;QD=48.0381;RBI=0.0153707;REFB=0.0299817;REVB=0.00942073;RO=4;SAF=10;SAR=22;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154532;STB=0.583279;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=-0.00254224;OID=.;OPOS=72879654;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=ATTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.888889:32:36:32:36:4:10:22:4:0:19:4:10:22:4:0 chr15 72904223 . C T 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0014474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.61;QD=21.0076;RBI=0.00255783;REFB=-0.0121508;REVB=-0.00210891;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235247;STB=0.632049;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0143561;OID=.;OPOS=72904223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:12:5:11:8:12:5 chr15 72987588 . G T 742.59 PASS AF=0.964286;AO=55;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.123661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7022;QD=53.0419;RBI=0.125798;REFB=0.117805;REVB=-0.023088;RO=1;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159783;STB=0.501329;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.0434721;OID=.;OPOS=72987588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:1:2:55:54:0.964286:29:26:0:1:29:25:1:1 chr15 73002035 . G A 885.35 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.985;QD=58.0558;RBI=0.00622549;REFB=0;REVB=0.00344435;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76583e-05;OID=.;OPOS=73002035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:28:32:0:0:28:33:0:0 chr15 73023937 . T C 1501.02 PASS AF=0.979592;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.016676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7451;QD=61.2659;RBI=0.0255324;REFB=-0.158872;REVB=0.0193343;RO=0;SAF=35;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508063;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00226519;OID=.;OPOS=73023937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:98:0:2:96:96:0.979592:61:35:0:0:61:35:0:2 chr15 73044594 . C A 361.46 PASS AF=0.487179;AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.00701297;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6017;QD=18.5363;RBI=0.018487;REFB=-0.00308372;REVB=0.0171052;RO=39;SAF=16;SAR=21;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744785;STB=0.540962;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00324195;OID=.;OPOS=73044594;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:39:40:37:38:0.487179:21:16:20:19:22:16:20:20 chr15 73052840 . T C 77.92 PASS AF=0.214286;AO=12;DP=56;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.00378017;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5961;QD=5.5654;RBI=0.0317764;REFB=-0.0030876;REVB=0.0315507;RO=44;SAF=6;SAR=6;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559169;STB=0.535655;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0130525;OID=.;OPOS=73052840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:44:44:12:12:0.214286:6:6:24:20:6:6:24:20 chr15 73052845 . A G 82.59 PASS AF=0.226415;AO=12;DP=54;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0402452;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.856;QD=6.23309;RBI=0.0402924;REFB=-0.00751363;REVB=0.00194957;RO=42;SAF=6;SAR=6;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583404;STB=0.528255;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0226014;OID=.;OPOS=73052845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:54:53:42:41:12:12:0.226415:6:6:23:19:6:6:22:19 chr15 73067234 . T C,G 917.88 PASS AF=0.953125,0.046875;AO=61,3;DP=64;FAO=61,3;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0;FSAR=25,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104902,-0.00648247;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=169.214,127.854;QD=57.3675;RBI=0.0106949,0.0292283;REFB=0,0;REVB=-0.00208258,-0.0285004;RO=0;SAF=36,0;SAR=25,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000133472,0.244589;OID=.,.;OPOS=73067234,73067234;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:64:64:0:0:61,3:61,3:0.953125,0.046875:25,3:36,0:0:0:25,3:36,0:0:0 chr15 73541513 . A G 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00275641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.2321;QD=13.6197;RBI=0.0176426;REFB=0.00127034;REVB=0.017426;RO=37;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066033;STB=0.530464;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00246432;OID=.;OPOS=73541513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:37:38:26:26:0.40625:11:15:19:18:11:15:20:18 chr15 73545732 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00315685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.928;QD=51.1834;RBI=0.0213745;REFB=0;REVB=0.0211401;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17341e-05;OID=.;OPOS=73545732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:15:4:0:0:15:5:0:0 chr15 73564881 . C T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.221;QD=64.1535;RBI=0.0303374;REFB=0;REVB=0.0230126;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.55543e-05;OID=.;OPOS=73564881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0 chr15 73575430 . C T 566.37 PASS AF=0.447761;AO=60;DP=134;FAO=60;FDP=134;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=47;FWDB=-0.0288218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7193;QD=16.9067;RBI=0.0294777;REFB=-0.005959;REVB=-0.00618385;RO=74;SAF=28;SAR=32;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102265;STB=0.55688;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0101987;OID=.;OPOS=73575430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:74:74:60:60:0.447761:32:28:27:47:32:28:27:47 chr15 73614114 . T C 618.07 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00658033;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.831;QD=61.8072;RBI=0.0526772;REFB=0;REVB=0.0522646;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178292;OID=.;OPOS=73614114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:29:11:0:0:29:11:0:0 chr15 73614834 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0426776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.881;QD=35.5759;RBI=0.0564894;REFB=0;REVB=0.0370091;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163161;OID=.;OPOS=73614834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr15 73615393 . GC AG,G 83.76 PASS AF=0,0.85;AO=2,11;DP=20;FAO=0,17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=0,13;FSAR=0,4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.101069,0.151761;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=21.8518,8.08303;QD=16.7514;RBI=0.116617,0.211685;REFB=-0.0739786,-0.113667;REVB=0.0581768,0.147577;RO=7;SAF=2,8;SAR=0,3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.577625,0.124286;STB=0.5,0.581986;STBP=1,0.174;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.117634;OID=.,.;OPOS=73615393,73615394;OREF=GC,C;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:8:20:20:7:3:2,11:0,17:0,0.85:0,3:2,8:4:3:0,4:0,13:1:2 chr15 73617435 . G A 547.3 PASS AF=0.491379;AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0234067;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4561;QD=18.8724;RBI=0.0234076;REFB=0.00215802;REVB=0.000207646;RO=59;SAF=26;SAR=31;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143439;STB=0.507934;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00201892;OID=.;OPOS=73617435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:59:59:57:57:0.491379:31:26:26:33:31:26:26:33 chr15 73995180 . C G 264.81 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00019829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=333.174;QD=20.7691;RBI=0.00387557;REFB=0.00775086;REVB=0.00387049;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238106;STB=0.513265;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.00743908;OID=.;OPOS=73995180;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:15:12:10:14:15:12:10:14 chr15 74032783 . A G 177.0 PASS AF=0.396226;AO=22;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0279378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.843;QD=13.3587;RBI=0.0279446;REFB=-0.0190224;REVB=-0.000615936;RO=29;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130599;STB=0.533182;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0109979;OID=.;OPOS=74032783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:29:32:22:21:0.396226:12:10:17:12:11:10:17:15 chr15 74177199 . C T 187.63 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=0.00190812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3688;QD=12.7205;RBI=0.0102748;REFB=-0.0299556;REVB=0.0100961;RO=36;SAF=11;SAR=12;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288006;STB=0.663626;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0494273;OID=.;OPOS=74177199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:12:11:27:9:12:11:27:9 chr15 74244278 . C G 339.64 PASS AF=0.538462;AO=32;DP=62;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00648173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.794;QD=20.9007;RBI=0.0319157;REFB=-0.0398872;REVB=0.0312506;RO=30;SAF=7;SAR=25;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230911;STB=0.639911;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0342781;OID=.;OPOS=74244278;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:30:30:32:35:0.538462:25:7:13:17:28:7:13:17 chr15 74244344 . C T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.858;QD=58.5876;RBI=0.0112656;REFB=0;REVB=0.00497909;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.23051e-05;OID=.;OPOS=74244344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr15 74275676 . A G 74.48 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.069376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.893;QD=22.9154;RBI=0.0693761;REFB=-0.0308665;REVB=-0.000148178;RO=4;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17833;STB=0.599811;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0155808;OID=.;OPOS=74275676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:8:1:0:4:8:1:0:4 chr15 74277795 . T C 1693.42 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.645;QD=60.4791;RBI=0.0336899;REFB=0;REVB=0.000393691;RO=0;SAF=57;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.42528e-05;OID=.;OPOS=74277795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:54:57:0:0:55:57:0:0 chr15 74328116 . A G 632.1 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00154089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.9928;QD=61.6681;RBI=0.0277078;REFB=0;REVB=-0.0276649;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000289285;OID=.;OPOS=74328116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0 chr15 74328141 . G T 575.78 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00887829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.137;QD=60.6085;RBI=0.0477974;REFB=0;REVB=0.0469656;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00064172;OID=.;OPOS=74328141;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr15 74368293 . A G 244.67 PASS AF=0.261194;AO=35;DP=135;FAO=35;FDP=134;FR=.;FRO=99;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.00558122;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.772;QD=7.30357;RBI=0.0474368;REFB=0.00566068;REVB=-0.0471073;RO=94;SAF=18;SAR=17;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056503;STB=0.55146;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00958292;OID=.;OPOS=74368293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:94:99:35:35:0.261194:17:18:44:50:17:18:44:55 chr15 74368297 . C G 263.23 PASS AF=0.268116;AO=36;DP=137;FAO=37;FDP=138;FR=.;FRO=101;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=57;FWDB=0.0201197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3663;QD=7.62986;RBI=0.0342564;REFB=0.00376537;REVB=0.0277255;RO=100;SAF=18;SAR=18;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863375;STB=0.556828;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.0164444;OID=.;OPOS=74368297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:100:101:36:37:0.268116:18:18:43:57:18:19:44:57 chr15 74427791 . AC A 46.74 PASS AF=0.421053;AO=6;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00497967;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.369;QD=9.8391;RBI=0.0353675;REFB=-0.0647964;REVB=-0.0350152;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=10;SSEN=0.5375;SSEP=0;SSSB=0.673096;STB=0.836515;STBP=0.03;TYPE=del;VARB=0.0974294;OID=.;OPOS=74427792;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421053:6:18:8:19:11:6:2:1:10:46:11:5:1:1:10 chr15 74467856 . G A 160.57 PASS AF=0.64;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0255372;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.459;QD=25.6916;RBI=0.0387779;REFB=-0.0395662;REVB=0.0291818;RO=8;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111987;STB=0.54266;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0192641;OID=.;OPOS=74467856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:26:25:8:9:16:16:0.64:7:9:3:5:7:9:4:5 chr15 74473739 . C T 371.97 PASS AF=0.62069;AO=36;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0107116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.143;QD=25.653;RBI=0.018962;REFB=-0.0497017;REVB=-0.0156467;RO=22;SAF=17;SAR=19;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122891;STB=0.506727;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0346314;OID=.;OPOS=74473739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:22:22:36:36:0.62069:19:17:10:12:19:17:10:12 chr15 74500053 . C T 516.47 PASS AF=0.5;AO=52;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.014419;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.964;QD=19.1286;RBI=0.0146821;REFB=-0.0299347;REVB=0.00276687;RO=54;SAF=25;SAR=27;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516962;STB=0.537023;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0291737;OID=.;OPOS=74500053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:52:54:0.5:27:25:29:25:29:25:29:25 chr15 74572326 . CAG AGC 32.59 PASS AF=0.111111;AO=4;DP=37;FAO=4;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0024238;FXX=0.0270197;HRUN=5;LEN=3;MLLD=101.662;QD=3.62096;RBI=0.0192263;REFB=-0.00191341;REVB=-0.0190729;RO=28;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599029;STB=0.887633;STBP=0.329;TYPE=mnp;VARB=0.0825347;OID=.;OPOS=74572326;OREF=CAG;OALT=AGC;OMAPALT=AGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:37:36:28:29:4:4:0.111111:1:3:5:23:1:3:6:23 chr15 74703929 . T C 419.46 PASS AF=0.488636;AO=42;DP=87;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0198646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0683;QD=19.0664;RBI=0.0204074;REFB=-0.00622102;REVB=0.00467571;RO=45;SAF=21;SAR=21;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103234;STB=0.511622;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0127735;OID=.;OPOS=74703929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:45:45:42:43:0.488636:21:21:23:22:22:21:23:22 chr15 74710593 . C T 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0055143;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.603;QD=22.1886;RBI=0.00799893;REFB=-0.0202589;REVB=0.00579442;RO=18;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262197;STB=0.514692;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0149145;OID=.;OPOS=74710593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:11:10:8:10:11:10:8:10 chr15 74749015 . A G 203.72 PASS AF=0.442308;AO=17;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.033038;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=80.4459;QD=15.6705;RBI=0.0822521;REFB=0.00273642;REVB=-0.0753252;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267568;STB=0.571864;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00128997;OID=.;OPOS=74749015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:29:17:23:0.442308:8:9:14:3:10:13:20:9 chr15 74783370 . C T 224.82 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0347753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9945;QD=27.2504;RBI=0.0348411;REFB=-0.0127206;REVB=-0.00213998;RO=12;SAF=11;SAR=10;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287659;STB=0.657982;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00618801;OID=.;OPOS=74783370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:10:11:1:11:10:11:1:11 chr15 74836316 . A G 38.12 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0390795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.747;QD=10.1643;RBI=0.0503621;REFB=-0.0261911;REVB=-0.0317669;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114905;STB=0.571184;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0518521;OID=.;OPOS=74836316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:5:4:2:4:5:4 chr15 74888196 . A G 32.49 PASS AF=0.125;AO=6;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.00235115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8069;QD=2.70734;RBI=0.0023605;REFB=-0.00176027;REVB=0.000209862;RO=42;SAF=1;SAR=5;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247898;STB=0.693703;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0193712;OID=.;OPOS=74888196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:48:48:42:42:6:6:0.125:5:1:14:28:5:1:14:28 chr15 74889163 . C T 462.56 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0176718;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1232;QD=20.3324;RBI=0.0177965;REFB=0.000508799;REVB=-0.00210355;RO=45;SAF=28;SAR=18;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012721;STB=0.507039;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.00073591;OID=.;OPOS=74889163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:45:45:46:46:0.505495:18:28:28:17:18:28:28:17 chr15 75015215 . T G 338.12 PASS AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00489208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7257;QD=22.923;RBI=0.028448;REFB=-0.00440201;REVB=-0.0280243;RO=25;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114911;STB=0.563343;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00293207;OID=.;OPOS=75015215;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:25:34:34:0.576271:20:14:14:11:20:14:14:11 chr15 75091247 . C T 265.27 PASS AF=0.441176;AO=29;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0494973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.379;QD=15.6038;RBI=0.0495065;REFB=-0.0152028;REVB=0.00095739;RO=36;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165866;STB=0.595268;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0243303;OID=.;OPOS=75091247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:36:38:29:30:0.441176:12:17:15:21:13:17:15:23 chr15 75091664 . G A 365.12 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0252829;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.94;QD=18.2562;RBI=0.0308545;REFB=-0.0182899;REVB=0.0176855;RO=42;SAF=14;SAR=24;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082597;STB=0.546182;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0299893;OID=.;OPOS=75091664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:24:14:19:23:24:14:19:23 chr15 75093389 . C T 235.22 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00882787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.952;QD=25.4293;RBI=0.00932692;REFB=-0.0218606;REVB=-0.00301001;RO=15;SAF=15;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167828;STB=0.593579;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0204385;OID=.;OPOS=75093389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:7:15:7:8:7:15:7:8 chr15 75108636 . G A 127.67 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0227963;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.955;QD=11.8762;RBI=0.022879;REFB=-0.00213311;REVB=0.00194324;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082336;STB=0.548526;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00515583;OID=.;OPOS=75108636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:8:7:11:17:8:7:11:17 chr15 75113083 . A G 186.86 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0522909;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.2378;QD=19.6694;RBI=0.0592595;REFB=-0.000818215;REVB=-0.0278811;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507971;STB=0.528671;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.000745034;OID=.;OPOS=75113083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:12:7:6:13:12:7:6:13 chr15 75130093 . T C 92.72 PASS AF=0.309524;AO=11;DP=39;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.106971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.096;QD=8.83008;RBI=0.16688;REFB=-0.0165378;REVB=-0.128086;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306342;STB=0.561949;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0323579;OID=.;OPOS=75130093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:39:42:28:29:11:13:0.309524:6:5:12:16:6:7:13:16 chr15 75131661 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.722;QD=57.2023;RBI=0.0293689;REFB=0;REVB=0.0192675;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44577e-05;OID=.;OPOS=75131661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0 chr15 75131959 . A G 710.28 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00420713;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=295.767;QD=54.6368;RBI=0.00938618;REFB=0.133426;REVB=-0.0083905;RO=1;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200325;STB=0.510634;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000227021;OID=.;OPOS=75131959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:23:28:0:1:23:28:0:1 chr15 75189930 . A G 474.51 PASS AF=0.628571;AO=44;DP=69;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0314952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.597;QD=27.1147;RBI=0.0330803;REFB=0.00386009;REVB=-0.0101172;RO=25;SAF=26;SAR=18;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101636;STB=0.54879;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00295469;OID=.;OPOS=75189930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:25:26:44:44:0.628571:18:26:11:14:18:26:12:14 chr15 75305040 . A G 888.35 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.124;QD=57.3131;RBI=0.032686;REFB=0;REVB=0.010515;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23808e-05;OID=.;OPOS=75305040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:34:27:0:0:34:28:0:0 chr15 75312715 . C G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.342;QD=53.911;RBI=0.0189193;REFB=0;REVB=-0.0147783;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.70858e-05;OID=.;OPOS=75312715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr15 75336729 . A G 1026.39 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.573;QD=59.5011;RBI=0.0265614;REFB=0;REVB=-0.0168328;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66337e-06;OID=.;OPOS=75336729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr15 75498548 . A G 1135.93 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.058;QD=60.583;RBI=0.0352779;REFB=0;REVB=0.0132859;RO=0;SAF=28;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74586e-05;OID=.;OPOS=75498548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:46:28:0:0:46:29:0:0 chr15 75499602 . C A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.785;QD=59.4351;RBI=0.0526587;REFB=0;REVB=0.0300014;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377836;OID=.;OPOS=75499602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr15 75499619 . T C 464.78 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00282368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.918;QD=58.097;RBI=0.00891593;REFB=0;REVB=-0.00845699;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74701e-05;OID=.;OPOS=75499619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr15 75499861 . G A 632.21 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00605123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.1881;QD=61.6792;RBI=0.0168436;REFB=0;REVB=0.015719;RO=0;SAF=33;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8059e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250474;OID=.;OPOS=75499861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:8:33:0:0:8:33:0:0 chr15 75499995 . T G 634.75 PASS AF=0.460993;AO=65;DP=143;FAO=65;FDP=141;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=25;FWDB=-0.0107316;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.202;QD=18.0071;RBI=0.0144675;REFB=-0.0265882;REVB=0.00970275;RO=72;SAF=34;SAR=31;SRF=50;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164894;STB=0.5805;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0251764;OID=.;OPOS=75499995;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:72:76:65:65:0.460993:31:34:50:22:31:34:51:25 chr15 75501158 . C T 117.42 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0864907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8243;QD=21.349;RBI=0.0938371;REFB=-0.00281391;REVB=-0.0363973;RO=8;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163432;STB=0.615207;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00510037;OID=.;OPOS=75501158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:21:22:8:9:13:13:0.590909:5:8:3:5:5:8:3:6 chr15 75503147 . G A 1157.44 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0488291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.257;QD=59.3557;RBI=0.0589533;REFB=-0.0309206;REVB=0.0330334;RO=1;SAF=30;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155135;STB=0.508195;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000559676;OID=.;OPOS=75503147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:47:30:1:0:47:30:1:0 chr15 75913321 . TGG TG,TGT 563.99 PASS AF=0.913043,0.0869565;AO=20,7;DP=69;FAO=63,6;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=33,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.06602,0.182439;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=10.5465,202.62;QD=32.6949;RBI=1.11759,0.182571;REFB=0,0;REVB=0.335573,0.006928;RO=40;SAF=0,0;SAR=20,7;SRF=28;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.841583,-0.747016;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.019726,0.0247233;OID=.,.;OPOS=75913322,75913323;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=TG,TGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.913043,0.0869565:20,7:69:63,6:69:0:30,0:33,6:0:0:24:40:0,0:20,7:28:12 chr15 75932129 . G T 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.287;QD=58.5874;RBI=0.0248748;REFB=0;REVB=0.0217671;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69196e-05;OID=.;OPOS=75932129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr15 75950602 . T C 257.98 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0323448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.679;QD=18.4268;RBI=0.0387829;REFB=-0.0270578;REVB=0.0213993;RO=28;SAF=20;SAR=8;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750935;STB=0.542138;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0168571;OID=.;OPOS=75950602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:8:20:18:10:8:20:18:10 chr15 75982072 . G A 210.32 PASS AF=0.185;AO=37;DP=201;FAO=37;FDP=200;FR=.;FRO=163;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=91;FSRR=72;FWDB=-0.0166329;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.933;QD=4.20637;RBI=0.0468329;REFB=-0.00593022;REVB=0.0437798;RO=162;SAF=6;SAR=31;SRF=90;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515489;STB=0.829336;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00907003;OID=.;OPOS=75982072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:162:163:37:37:0.185:31:6:90:72:31:6:91:72 chr15 75982085 . C T 175.12 PASS AF=0.167513;AO=32;DP=198;FAO=33;FDP=197;FR=.;FRO=164;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=92;FSRR=72;FWDB=0.00114243;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.352;QD=3.55574;RBI=0.00526397;REFB=-0.00396403;REVB=-0.0051385;RO=166;SAF=6;SAR=26;SRF=94;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483657;STB=0.816474;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0111448;OID=.;OPOS=75982085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:166:164:32:33:0.167513:26:6:94:72:27:6:92:72 chr15 76031200 . C T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00334264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.015;QD=39.206;RBI=0.00731834;REFB=0;REVB=-0.00651037;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97545e-05;OID=.;OPOS=76031200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr15 76136768 . C T 2582.1 PASS AF=0.960894;AO=150;DP=180;FAO=172;FDP=179;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=113;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0409979;FXX=0.00555525;HRUN=5;LEN=1;MLLD=261.159;QD=57.7006;RBI=0.0415516;REFB=-0.0309374;REVB=0.00676111;RO=1;SAF=40;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430492;STB=0.515943;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.000323972;OID=.;OPOS=76136768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:180:179:1:7:150:172:0.960894:110:40:0:1:113:59:5:2 chr15 76191802 . G A 1190.41 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.118;QD=61.0469;RBI=0.0376639;REFB=0;REVB=-0.00926185;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167362;OID=.;OPOS=76191802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0 chr15 76298132 . A G,T 266.51 PASS AF=0.904762,0.0952381;AO=19,2;DP=21;FAO=19,2;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=14,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520932,-0.0688498;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=59.4881,19.3786;QD=50.764;RBI=0.0683141,0.0899303;REFB=0,0;REVB=0.0441941,0.0578547;RO=0;SAF=5,0;SAR=14,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00347414,0.18481;OID=.,.;OPOS=76298132,76298132;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:21:21:0:0:19,2:19,2:0.904762,0.0952381:14,2:5,0:0:0:14,2:5,0:0:0 chr15 76496977 . G C 1877.88 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.171;QD=61.5697;RBI=0.020088;REFB=0;REVB=-0.0163398;RO=0;SAF=73;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97649e-06;OID=.;OPOS=76496977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:49:73:0:0:49:73:0:0 chr15 76497328 . T TTTGA 186.97 PASS AF=0.72;AO=17;DP=26;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.010066;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=259.644;QD=29.9157;RBI=0.0193172;REFB=-0.0377326;REVB=0.0164873;RO=8;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160005;STB=0.559934;STBP=0.376;TYPE=ins;VARB=0.0151574;OID=.;OPOS=76497329;OREF=-;OALT=TTGA;OMAPALT=TTTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.72:17:26:18:25:7:9:9:5:2:44:8:8:9:6:2 chr15 76630303 . T C 238.74 PASS AF=0.267717;AO=34;DP=130;FAO=34;FDP=127;FR=.;FRO=93;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=58;FWDB=-0.0775625;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.539;QD=7.51921;RBI=0.0778107;REFB=-0.00391406;REVB=-0.00621041;RO=92;SAF=12;SAR=22;SRF=34;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220888;STB=0.518545;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0223888;OID=.;OPOS=76630303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:127:92:93:34:34:0.267717:22:12:34:58:22:12:35:58 chr15 77404160 . G C 93.65 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0276876;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1535;QD=17.0266;RBI=0.0602805;REFB=-0.0197251;REVB=-0.0535457;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.020571;OID=.;OPOS=77404160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:22:22:11:11:11:11:0.5:5:6:6:5:5:6:6:5 chr15 77407114 . C G 75.53 PASS AF=0.6;AO=7;DP=16;FAO=9;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0308687;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.82;QD=20.1422;RBI=0.0347619;REFB=-0.00105392;REVB=0.0159847;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374419;STB=0.666369;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00329484;OID=.;OPOS=77407114;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:16:15:6:6:7:9:0.6:4:3:0:6:6:3:0:6 chr15 77907145 . G A 291.43 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0183825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.362;QD=16.8944;RBI=0.0186107;REFB=-0.013615;REVB=-0.00290558;RO=37;SAF=15;SAR=17;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167115;STB=0.593321;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0203469;OID=.;OPOS=77907145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:17:15:11:26:17:15:11:26 chr15 77907535 . C G 488.18 PASS AF=0.534091;AO=47;DP=88;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.016517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.8;QD=22.1899;RBI=0.035068;REFB=-0.0206064;REVB=-0.0309347;RO=41;SAF=11;SAR=36;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252562;STB=0.640211;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.016585;OID=.;OPOS=77907535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:41:47:47:0.534091:36:11:20:21:36:11:20:21 chr15 77907775 . T C 324.8 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0124034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.924;QD=17.0947;RBI=0.0155143;REFB=0.0048385;REVB=0.0093193;RO=41;SAF=24;SAR=11;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289322;STB=0.662482;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00723341;OID=.;OPOS=77907775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:11:24:16:25:11:24:16:25 chr15 77907784 . G A 336.61 PASS AF=0.461538;AO=35;DP=77;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0078803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.499;QD=17.2621;RBI=0.0290675;REFB=-0.023127;REVB=0.0279789;RO=42;SAF=23;SAR=12;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269265;STB=0.655085;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0245999;OID=.;OPOS=77907784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:42:42:35:36:0.461538:12:23:16:26:12:24:16:26 chr15 78207558 . C T 165.06 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00149362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.54;QD=14.0472;RBI=0.00579653;REFB=-0.0134809;REVB=-0.00560079;RO=29;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409314;STB=0.523783;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0210739;OID=.;OPOS=78207558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:8:10:15:14:8:10:15:14 chr15 78207601 . G A 378.86 PASS AF=0.673077;AO=35;DP=52;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0187484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1687;QD=29.143;RBI=0.0188442;REFB=-0.0335335;REVB=-0.001897;RO=17;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786118;STB=0.542833;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0298701;OID=.;OPOS=78207601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:17:35:35:0.673077:19:16:10:7:19:16:10:7 chr15 78207625 . A G 124.69 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0460682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2699;QD=9.97552;RBI=0.0517016;REFB=0.010656;REVB=0.0234685;RO=33;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200299;STB=0.599867;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.0329056;OID=.;OPOS=78207625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:33:35:15:15:0.3:6:9:14:19:6:9:16:19 chr15 78208021 . T C 265.17 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0021921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.597;QD=15.598;RBI=0.0858756;REFB=-0.00922669;REVB=-0.0858476;RO=38;SAF=14;SAR=16;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590043;STB=0.533311;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.017089;OID=.;OPOS=78208021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:16:14:20:18:16:14:20:18 chr15 78208236 . A G 38.3 PASS AF=0.117647;AO=8;DP=68;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0172668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.913;QD=2.25287;RBI=0.0246763;REFB=-0.00956708;REVB=-0.0176289;RO=59;SAF=6;SAR=2;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379068;STB=0.781022;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0696029;OID=.;OPOS=78208236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:68:68:59:60:8:8:0.117647:2:6:25:34:2:6:25:35 chr15 78208239 . T C 38.12 PASS AF=0.117647;AO=8;DP=68;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0322343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.354;QD=2.24208;RBI=0.0361662;REFB=-0.00107488;REVB=-0.0163994;RO=59;SAF=6;SAR=2;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395537;STB=0.781022;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0230623;OID=.;OPOS=78208239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:68:68:59:60:8:8:0.117647:2:6:24:35:2:6:25:35 chr15 78208833 . C T 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0219429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.928;QD=14.7942;RBI=0.0251408;REFB=0.0046618;REVB=-0.0122706;RO=27;SAF=15;SAR=3;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363101;STB=0.714014;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00726933;OID=.;OPOS=78208833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:3:15:15:12:3:15:15:12 chr15 78208880 . G A 766.41 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.8983;QD=63.8678;RBI=0.0462044;REFB=0;REVB=0.0335473;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489279;OID=.;OPOS=78208880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0 chr15 78209436 . C G,T 767.18 PASS AF=0.0408163,0.959184;AO=2,47;DP=49;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,27;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00534068,0.00386311;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=125.183,252.138;QD=62.6273;RBI=0.0425129,0.00541027;REFB=0,0;REVB=-0.0421761,-0.0037878;RO=0;SAF=2,27;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.166341,-5.33394e-05;OID=.,.;OPOS=78209436,78209436;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:49:49:0:0:2,47:2,47:0.0408163,0.959184:0,20:2,27:0:0:0,20:2,27:0:0 chr15 78211339 . T C 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0366629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.854;QD=10.3903;RBI=0.0399162;REFB=-0.0357267;REVB=-0.0157841;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671836;STB=0.540869;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0395916;OID=.;OPOS=78211339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:4:7:4:3:4:7 chr15 78211344 . CA CG,TG 205.82 PASS AF=0.647059,0.352941;AO=11,6;DP=18;FAO=11,6;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4,2;FSAR=7,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241632,0.00127896;FXX=0.0555247;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=93.139,117.026;QD=48.4271;RBI=0.0256398,0.00390438;REFB=0,0;REVB=-0.00857547,0.00368896;RO=0;SAF=4,2;SAR=7,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000517603,0.0243529;OID=.,.;OPOS=78211345,78211344;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:38:18:17:0:0:11,6:11,6:0.647059,0.352941:7,4:4,2:0:0:7,4:4,2:0:0 chr15 78211393 . A T 270.03 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00818725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.909;QD=22.9811;RBI=0.0518715;REFB=-0.023732;REVB=-0.0512213;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422618;STB=0.533307;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0219426;OID=.;OPOS=78211393;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:22:25:25:0.531915:12:13:12:9:12:13:13:9 chr15 78211411 . GCCTCCTGCTCTCGGAGCATCT G,GCCTCCTGCTCTCGGATCATCT 94.17 PASS AF=0.142857,0.125;AO=8,8;DP=63;FAO=8,7;FDP=56;FR=.;FRO=41;FSAF=3,7;FSAR=5,0;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0238578,-0.0304782;FXX=0.0819538;HRUN=2,1;LEN=21,1;MLLD=349.734,185.068;QD=6.72649;RBI=0.0547703,0.0487886;REFB=-0.0240469,-0.0143323;REVB=-0.049301,-0.0380973;RO=33;SAF=3,6;SAR=5,2;SRF=20;SRR=13;SSEN=0.319864,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.274011,0.197392;STB=0.652891,0.998218;STBP=0.37,0.006;TYPE=del,snp;VARB=0.062951,0.0439799;OID=.,.;OPOS=78211412,78211427;OREF=CCTCCTGCTCTCGGAGCATCT,G;OALT=-,T;OMAPALT=G,GCCTCCTGCTCTCGGATCATCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.142857,0.125:8,8:63:8,7:56:41:3,7:5,0:23:18:48:33:3,6:5,2:20:13 chr15 78211471 . C T 234.83 PASS AF=0.315789;AO=25;DP=90;FAO=30;FDP=95;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.0144318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.675;QD=9.88763;RBI=0.0215321;REFB=-0.0185733;REVB=0.0159798;RO=65;SAF=13;SAR=12;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13557;STB=0.545162;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0471099;OID=.;OPOS=78211471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:95:65:65:25:30:0.315789:12:13:41:24:13:17:41:24 chr15 78211598 . C T 214.1 PASS AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0057447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.15;QD=14.7656;RBI=0.00917548;REFB=-0.02132;REVB=0.00715458;RO=33;SAF=16;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991445;STB=0.556476;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0244015;OID=.;OPOS=78211598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:9:16:18:15:9:16:18:15 chr15 78233843 . C T 272.76 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.038644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8502;QD=24.2449;RBI=0.0394687;REFB=0.0124579;REVB=0.0080262;RO=20;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558334;STB=0.531059;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.00899091;OID=.;OPOS=78233843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:12:13:9:11:12:13:9:11 chr15 78234455 . T C 44.29 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0202036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.823;QD=6.8134;RBI=0.020408;REFB=-0.00821825;REVB=-0.00288134;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407997;STB=0.749423;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00819626;OID=.;OPOS=78234455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:4:15:3:4:4:15 chr15 78234461 . G A 53.69 PASS AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0447354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4782;QD=7.95458;RBI=0.0491382;REFB=-0.00970497;REVB=-0.0203299;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.446746;STB=0.768678;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0176519;OID=.;OPOS=78234461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:3:5:4:15:3:5:4:15 chr15 78234477 . A G 72.61 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0181713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4017;QD=8.80169;RBI=0.0770359;REFB=-0.00220534;REVB=-0.0748621;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370495;STB=0.696637;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0370797;OID=.;OPOS=78234477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:5:5:4:18:5:5:5:18 chr15 78276660 . A G 821.07 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0452822;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.041;QD=57.6188;RBI=0.046256;REFB=0;REVB=0.00944154;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.11183e-05;OID=.;OPOS=78276660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0 chr15 78403004 . A G 501.57 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.78;QD=59.0079;RBI=0.0496672;REFB=0;REVB=0.0311815;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041437;OID=.;OPOS=78403004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0 chr15 78461278 . T C 267.89 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0130845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.157;QD=16.236;RBI=0.0384785;REFB=-0.00323219;REVB=0.0361855;RO=36;SAF=8;SAR=22;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299235;STB=0.669446;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00662926;OID=.;OPOS=78461278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:22:8:20:16:22:8:20:16 chr15 78587910 . A G 1991.65 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425202;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.159;QD=62.2391;RBI=0.0474829;REFB=0;REVB=0.0211344;RO=0;SAF=74;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89916e-05;OID=.;OPOS=78587910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:128:0:0:125:128:1:51:74:0:0:54:74:0:0 chr15 78758677 . G C 828.87 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00953156;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.629;QD=57.1636;RBI=0.0214949;REFB=0;REVB=0.019266;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120167;OID=.;OPOS=78758677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:27:30:0:0:27:31:0:0 chr15 78780104 . T C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.842;QD=58.9627;RBI=0.0144719;REFB=0;REVB=0.00141303;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78014e-05;OID=.;OPOS=78780104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:39:27:0:0:39:27:0:0 chr15 78789488 . C T 109.99 PASS AF=0.266667;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.00290342;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.637;QD=7.33283;RBI=0.00781179;REFB=-0.00434978;REVB=0.00725219;RO=43;SAF=11;SAR=5;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180452;STB=0.504825;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0133719;OID=.;OPOS=78789488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:43:44:16:16:0.266667:5:11:29:14:5:11:30:14 chr15 78789676 . T C 58.49 PASS AF=0.4;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0286942;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.219;QD=11.699;RBI=0.0288248;REFB=-0.00780355;REVB=0.00274087;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477608;STB=0.78504;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00379433;OID=.;OPOS=78789676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:21:20:12:12:8:8:0.4:6:2:9:3:6:2:9:3 chr15 78873119 . C T 105.48 PASS AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.031769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8248;QD=8.11399;RBI=0.101182;REFB=0.000247146;REVB=-0.096065;RO=38;SAF=7;SAR=7;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313834;STB=0.519203;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.00691867;OID=.;OPOS=78873119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:7:7:18:20:7:7:18:20 chr15 78887709 . G GTCTC 277.14 PASS AF=0.426667;AO=31;DP=79;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.022106;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.428;QD=14.7808;RBI=0.0241678;REFB=-0.0187371;REVB=0.00976777;RO=47;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028286;STB=0.524588;STBP=0.717;TYPE=ins;VARB=0.0259032;OID=.;OPOS=78887710;OREF=-;OALT=TCTC;OMAPALT=GTCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.426667:31:79:32:75:43:17:15:21:22:99:47:16:15:23:24 chr15 78917399 . A G 385.36 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.00668742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.545;QD=17.9237;RBI=0.00844042;REFB=-0.0178875;REVB=0.00514966;RO=46;SAF=16;SAR=24;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238449;STB=0.632962;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.020935;OID=.;OPOS=78917399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:24:16:30:16:24:16:30:16 chr15 79054889 . CA TG 134.31 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00604259;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=2;MLLD=190.294;QD=15.3495;RBI=0.00618788;REFB=-0.0265544;REVB=-0.00133303;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117085;STB=0.56748;STBP=0.552;TYPE=mnp;VARB=0.0278825;OID=.;OPOS=79054889;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:20:20:15:15:0.428571:8:7:7:13:8:7:7:13 chr15 79054900 . C G 118.99 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0464954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1761;QD=13.9988;RBI=0.0473059;REFB=-0.0187764;REVB=0.00871926;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203328;STB=0.617488;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0282861;OID=.;OPOS=79054900;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:7:7:6:14:7:7:6:14 chr15 79058572 . T G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5367;QD=43.4858;RBI=0.102242;REFB=0;REVB=-0.00900226;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00544437;OID=.;OPOS=79058572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr15 79058923 . G A 680.46 PASS AF=0.9375;AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0167877;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.931;QD=56.705;RBI=0.0594827;REFB=-0.0357064;REVB=0.0570645;RO=3;SAF=28;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00555036;STB=0.502957;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.000835672;OID=.;OPOS=79058923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:48:3:3:45:45:0.9375:17:28:2:1:17:28:2:1 chr15 79059013 . G A 581.63 PASS AF=0.540541;AO=47;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=51;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.00898442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.105;QD=20.9595;RBI=0.0697297;REFB=-0.0973061;REVB=0.0691484;RO=43;SAF=27;SAR=20;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115099;STB=0.557034;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0862341;OID=.;OPOS=79059013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:43:51:47:60:0.540541:20:27:19:24:29:31:20:31 chr15 79066581 . G A 429.42 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0236593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.452;QD=19.5191;RBI=0.0246182;REFB=-0.015681;REVB=0.00680415;RO=44;SAF=18;SAR=25;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123298;STB=0.501898;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0145428;OID=.;OPOS=79066581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:44:45:43:43:0.488636:25:18:19:25:25:18:19:26 chr15 79082108 . C T 199.47 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0129522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.408;QD=15.6448;RBI=0.0230413;REFB=-0.0134298;REVB=-0.0190563;RO=28;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554061;STB=0.542611;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0205463;OID=.;OPOS=79082108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:29:22:22:0.431373:9:13:15:13:9:13:15:14 chr15 79083120 . G A 78.63 PASS AF=0.47619;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0808313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4858;QD=14.9773;RBI=0.0816205;REFB=-0.00920619;REVB=-0.0113228;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255081;STB=0.666296;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00405982;OID=.;OPOS=79083120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:20:21:11:11:9:10:0.47619:7:2:5:6:8:2:5:6 chr15 79089007 . T C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6833;QD=57.5449;RBI=0.0488828;REFB=0;REVB=0.0480763;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394909;OID=.;OPOS=79089007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:21:37:0:0:21:37:0:0 chr15 79185877 . A G 109.14 PASS AF=0.40625;AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00244425;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.042;QD=13.6422;RBI=0.0158962;REFB=0.00138604;REVB=-0.0157072;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114204;STB=0.538402;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.00210727;OID=.;OPOS=79185877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:19:19:12:13:0.40625:5:7:9:10:6:7:9:10 chr15 79185898 . C A 163.59 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00218296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7877;QD=20.4491;RBI=0.0197245;REFB=-0.0134125;REVB=-0.0196033;RO=15;SAF=11;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259921;STB=0.646886;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0111236;OID=.;OPOS=79185898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:6:11:5:10:6:11:5:10 chr15 79189580 . C CTT,T 416.42 PASS AF=0.896552,0.103448;AO=15,12;DP=37;FAO=26,3;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19,2;FSAR=7,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0835226,-0.00139178;FXX=0.23678;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=32.9656,282.095;QD=57.4377;RBI=0.0839444,0.0084032;REFB=0,0;REVB=-0.00840475,-0.00828714;RO=10;SAF=11,9;SAR=4,3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.189223,0.22735;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00890798,0.00451673;OID=.,.;OPOS=79189581,79189580;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:17:37:29:10:0:15,12:26,3:0.896552,0.103448:4,3:11,9:5:5:7,1:19,2:0:0 chr15 79191209 . C T 253.2 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0205366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.613;QD=19.1094;RBI=0.0205594;REFB=-0.0176923;REVB=0.000966734;RO=26;SAF=17;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215813;STB=0.620697;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0212078;OID=.;OPOS=79191209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:10:17:10:16:10:17:10:16 chr15 79217690 . G C 500.39 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.159;QD=58.8694;RBI=0.0749068;REFB=0;REVB=-0.0336163;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824453;OID=.;OPOS=79217690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:20:13:0:0:20:14:0:0 chr15 79224747 . C T 487.83 PASS AF=0.575;AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0251775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.77;QD=24.3913;RBI=0.0297529;REFB=-0.0231142;REVB=-0.0158533;RO=33;SAF=22;SAR=24;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742412;STB=0.534187;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.014289;OID=.;OPOS=79224747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:33:34:46:46:0.575:24:22:19:14:24:22:19:15 chr15 79231518 . A G 112.93 PASS AF=0.291667;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.0073676;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=246.502;QD=9.41099;RBI=0.00749106;REFB=-0.00419519;REVB=0.00135442;RO=32;SAF=3;SAR=11;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583284;STB=0.52152;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0157504;OID=.;OPOS=79231518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:32:34:14:14:0.291667:11:3:8:24:11:3:8:26 chr15 79231526 . A AG 86.43 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0246648;FXX=0.0312402;HRUN=0;LEN=1;MLLD=250.287;QD=11.1521;RBI=0.0268221;REFB=-0.00787049;REVB=-0.0105392;RO=33;SAF=1;SAR=10;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333332;STB=0.776061;STBP=0.076;TYPE=ins;VARB=0.0239141;OID=.;OPOS=79231527;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.354839:11:45:11:31:20:1:10:7:13:86:33:1:10:8:25 chr15 79277247 . A C 2126.98 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272001;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.136;QD=63.0215;RBI=0.0276193;REFB=0;REVB=0.00479391;RO=0;SAF=70;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62647e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.51149e-05;OID=.;OPOS=79277247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:65:70:0:0:66:69:0:0 chr15 79296172 . G A 218.03 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0245874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.579;QD=15.5738;RBI=0.0374394;REFB=-0.0182372;REVB=-0.0282342;RO=31;SAF=16;SAR=9;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00547917;STB=0.503103;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0257506;OID=.;OPOS=79296172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:9:16:20:11:9:16:20:11 chr15 79298523 . G A 455.16 PASS AF=0.54321;AO=43;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0183514;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.338;QD=22.4769;RBI=0.024289;REFB=-0.00823373;REVB=0.0159116;RO=37;SAF=20;SAR=23;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632318;STB=0.528871;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00679773;OID=.;OPOS=79298523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:43:44:0.54321:23:20:20:17:23:21:20:17 chr15 79586361 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00868833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.359;QD=43.4862;RBI=0.01611;REFB=0;REVB=0.0135663;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.24006e-05;OID=.;OPOS=79586361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr15 79588710 . C T 188.1 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0168439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.817;QD=14.1965;RBI=0.0534137;REFB=-0.0263275;REVB=-0.0506884;RO=28;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911027;STB=0.553298;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0350946;OID=.;OPOS=79588710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:28:31:22:22:0.415094:13:9:9:19:13:9:10:21 chr15 79589174 . C G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00268177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.826;QD=53.9112;RBI=0.0428235;REFB=0;REVB=0.0427394;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156393;OID=.;OPOS=79589174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr15 79590208 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.665;QD=54.5176;RBI=0.0414701;REFB=0;REVB=-0.0151688;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8016e-05;OID=.;OPOS=79590208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr15 79606137 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00282129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.975;QD=58.2396;RBI=0.026317;REFB=0;REVB=0.0261653;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73346e-05;OID=.;OPOS=79606137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr15 79614418 . A G 1624.36 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000992815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.066;QD=60.1614;RBI=0.0120236;REFB=0;REVB=0.0119826;RO=0;SAF=54;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07384e-05;OID=.;OPOS=79614418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:54:54:0:0:54:54:0:0 chr15 79675301 . T C 268.13 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0140601;FXX=0.0144907;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.3495;QD=15.772;RBI=0.100893;REFB=0.018211;REVB=-0.0999085;RO=38;SAF=20;SAR=10;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498457;STB=0.528072;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.0175507;OID=.;OPOS=79675301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:10:20:27:11:10:20:27:11 chr15 79750127 . A G 330.5 PASS AF=0.666667;AO=26;DP=40;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00533601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.222;QD=31.4757;RBI=0.065431;REFB=-0.0180188;REVB=0.065213;RO=14;SAF=8;SAR=18;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134897;STB=0.581334;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00900098;OID=.;OPOS=79750127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:14:14:26:28:0.666667:18:8:7:7:20:8:7:7 chr15 79750307 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.146;QD=56.7061;RBI=0.0189871;REFB=0;REVB=-0.00367775;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014759;OID=.;OPOS=79750307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr15 79762525 . A C 276.56 PASS AF=0.4;AO=20;DP=77;FAO=30;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0243656;FXX=0.0259707;HRUN=7;LEN=1;MLLD=104.385;QD=14.7499;RBI=0.0269214;REFB=-0.04089;REVB=0.0114489;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258145;STB=0.525264;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0290657;OID=.;OPOS=79762525;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:29:42:20:30:0.4:8:12:10:19:13:17:22:20 chr15 80191343 . G A 354.2 PASS AF=0.401961;AO=41;DP=102;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.00365336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.782;QD=13.8904;RBI=0.0177955;REFB=-6.18758e-05;REVB=-0.0174165;RO=61;SAF=24;SAR=17;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125757;STB=0.507122;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=3.96966e-05;OID=.;OPOS=80191343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:61:61:41:41:0.401961:17:24:35:26:17:24:35:26 chr15 80215300 . T C 260.55 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0307231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.194;QD=18.9489;RBI=0.0308939;REFB=-0.0167451;REVB=0.00324488;RO=27;SAF=8;SAR=20;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869659;STB=0.548744;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0141139;OID=.;OPOS=80215300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:20:8:10:17:20:8:10:17 chr15 80216015 . C A 408.18 PASS AF=0.451613;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=15;FWDB=0.00549081;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7537;QD=17.5563;RBI=0.00549084;REFB=-0.00979334;REVB=1.98614e-05;RO=51;SAF=26;SAR=16;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927111;STB=0.5517;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0122929;OID=.;OPOS=80216015;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:51:51:42:42:0.451613:16:26:36:15:16:26:36:15 chr15 80216325 . A G 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0498149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8006;QD=18.2511;RBI=0.0505919;REFB=0.033384;REVB=0.0088324;RO=15;SAF=13;SAR=2;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403224;STB=0.735475;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0352191;OID=.;OPOS=80216325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:2:13:8:7:2:13:8:7 chr15 80216532 . A T 387.82 PASS AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0112768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.003;QD=18.4674;RBI=0.0184658;REFB=-0.0213796;REVB=0.0146225;RO=43;SAF=16;SAR=24;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120789;STB=0.558347;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0179395;OID=.;OPOS=80216532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:44:40:40:0.47619:24:16:12:31:24:16:13:31 chr15 80217100 . A G 477.77 PASS AF=0.427419;AO=53;DP=124;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0265901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4411;QD=15.4119;RBI=0.0316074;REFB=-0.00146885;REVB=0.0170878;RO=71;SAF=30;SAR=23;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893358;STB=0.550103;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00210317;OID=.;OPOS=80217100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:71:71:53:53:0.427419:23:30:34:37:23:30:34:37 chr15 80259964 . C T 118.64 PASS AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0408304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5109;QD=7.77948;RBI=0.0824835;REFB=0.00802688;REVB=-0.0716687;RO=44;SAF=5;SAR=12;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123307;STB=0.575071;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.0220139;OID=.;OPOS=80259964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:44:44:17:17:0.278689:12:5:17:27:12:5:17:27 chr15 80260014 . T C 132.66 PASS AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0606807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0617;QD=9.14879;RBI=0.0608351;REFB=0.0100617;REVB=-0.00433139;RO=40;SAF=5;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981428;STB=0.558756;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.0174308;OID=.;OPOS=80260014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:40:40:18:18:0.310345:13:5:14:26:13:5:14:26 chr15 80263217 . C T 323.57 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0284988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.756;QD=16.809;RBI=0.0285855;REFB=-0.0168993;REVB=0.0022243;RO=42;SAF=17;SAR=18;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831608;STB=0.54664;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0220485;OID=.;OPOS=80263217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:18:17:24:18:18:17:24:18 chr15 80263345 . A C 136.73 PASS AF=0.339623;AO=17;DP=54;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0156569;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.998;QD=10.3194;RBI=0.0195324;REFB=0.0065798;REVB=0.0116779;RO=34;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673668;STB=0.508465;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=-0.0102555;OID=.;OPOS=80263345;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:34:35:17:18:0.339623:7:10:18:16:8:10:19:16 chr15 80263406 . C T 108.84 PASS AF=0.40625;AO=12;DP=31;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0266641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2587;QD=13.605;RBI=0.0436423;REFB=0.00703631;REVB=-0.0345496;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857139;STB=0.538402;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.012749;OID=.;OPOS=80263406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:18:19:12:13:0.40625:7:5:9:9:7:6:10:9 chr15 80454707 . G A 380.79 PASS AF=0.558824;AO=37;DP=67;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0634725;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5656;QD=22.3992;RBI=0.0635335;REFB=-0.0166327;REVB=0.00278256;RO=30;SAF=14;SAR=23;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128784;STB=0.56227;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0162341;OID=.;OPOS=80454707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:30:30:37:38:0.558824:23:14:16:14:23:15:16:14 chr15 80873642 . C G 340.54 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0575118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.668;QD=23.4856;RBI=0.0583909;REFB=-0.0130905;REVB=0.0100943;RO=22;SAF=13;SAR=21;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151573;STB=0.584486;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00799492;OID=.;OPOS=80873642;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:22:24:34:34:0.586207:21:13:13:9:21:13:14:10 chr15 80889548 . G A 130.03 PASS AF=0.3;AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.01559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.914;QD=8.66873;RBI=0.0155908;REFB=-0.00807753;REVB=0.000156799;RO=42;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30379;STB=0.68112;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.022042;OID=.;OPOS=80889548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:42:42:18:18:0.3:6:12:17:25:6:12:17:25 chr15 80890101 . T C 545.32 PASS AF=0.421429;AO=59;DP=140;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.021328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7698;QD=15.5804;RBI=0.0363208;REFB=-0.00594263;REVB=0.0293992;RO=81;SAF=27;SAR=32;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247239;STB=0.513864;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.00763655;OID=.;OPOS=80890101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:81:81:59:59:0.421429:32:27:39:42:32:27:39:42 chr15 81047404 . T C 281.4 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0470151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8528;QD=17.0545;RBI=0.05283;REFB=0.00305891;REVB=0.0240955;RO=35;SAF=17;SAR=14;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271502;STB=0.65125;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.0026692;OID=.;OPOS=81047404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:14:17:9:26:14:17:9:26 chr15 81047829 . C A 264.41 PASS AF=0.323232;AO=32;DP=100;FAO=32;FDP=99;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.00535713;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.629;QD=10.6832;RBI=0.00546032;REFB=-0.000527388;REVB=0.00105654;RO=65;SAF=16;SAR=16;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620888;STB=0.535332;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00107016;OID=.;OPOS=81047829;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:65:67:32:32:0.323232:16:16:29:36:16:16:30:37 chr15 81212608 . G A 680.65 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894631;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.861;QD=61.8774;RBI=0.00981457;REFB=0;REVB=-0.00403601;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791633;OID=.;OPOS=81212608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:23:21:0:0 chr15 81440818 . C T 548.03 PASS AF=0.548387;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00906877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.456;QD=23.5712;RBI=0.0135253;REFB=-0.0204246;REVB=0.0100345;RO=41;SAF=16;SAR=35;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09133;STB=0.546081;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0147154;OID=.;OPOS=81440818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:41:42:51:51:0.548387:35:16:17:24:35:16:17:25 chr15 81582868 . G A 491.12 PASS AF=0.484848;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00185213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.293;QD=19.8433;RBI=0.00844433;REFB=-0.0206017;REVB=0.00823871;RO=51;SAF=21;SAR=27;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126793;STB=0.507039;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0204377;OID=.;OPOS=81582868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:51:51:48:48:0.484848:27:21:23:28:27:21:23:28 chr15 81600995 . A G 348.83 PASS AF=0.5;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0282074;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.905;QD=19.3794;RBI=0.0283299;REFB=-0.00236695;REVB=-0.00263191;RO=35;SAF=16;SAR=20;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172685;STB=0.585942;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00327455;OID=.;OPOS=81600995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:36:36:36:0.5:20:16:9:26:20:16:10:26 chr15 81624768 . C T 709.06 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.558;QD=63.0275;RBI=0.0396931;REFB=0;REVB=0.0193653;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117487;OID=.;OPOS=81624768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:19:26:0:0 chr15 81625385 . C T 688.81 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.855;QD=62.6191;RBI=0.0623504;REFB=0;REVB=0.0563186;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450911;OID=.;OPOS=81625385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr15 81636267 . C T 784.23 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.171;QD=64.0191;RBI=0.0282507;REFB=0;REVB=0.0118283;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82012e-05;OID=.;OPOS=81636267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:27:21:0:0:27:22:0:0 chr15 81637284 . G A 2971.61 PASS AF=0.984456;AO=190;DP=193;FAO=190;FDP=193;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=103;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00124015;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.786;QD=61.5879;RBI=0.00598243;REFB=0.0200943;REVB=0.00585248;RO=2;SAF=87;SAR=103;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108196;STB=0.503266;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-6.69725e-05;OID=.;OPOS=81637284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:193:193:2:3:190:190:0.984456:103:87:2:0:103:87:2:1 chr15 82443939 . G A 294.18 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00820491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.545;QD=17.5632;RBI=0.0167597;REFB=-0.00168279;REVB=-0.0146139;RO=35;SAF=25;SAR=7;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267185;STB=0.651086;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00138352;OID=.;OPOS=82443939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:7:25:19:16:7:25:19:16 chr15 82444437 . A G 1053.66 PASS AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046412;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.976;QD=60.2094;RBI=0.048308;REFB=0;REVB=0.0134012;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.03614e-06;OID=.;OPOS=82444437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0 chr15 82444663 . T C 354.05 PASS AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.020455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.794;QD=29.5045;RBI=0.0237853;REFB=-0.0115967;REVB=0.0121381;RO=18;SAF=14;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152482;STB=0.508374;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00570825;OID=.;OPOS=82444663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:16:14:8:10:16:14:8:10 chr15 82456227 . T C 582.49 PASS AF=0.455224;AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0313627;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1593;QD=17.3879;RBI=0.0371199;REFB=-0.0105223;REVB=0.0198562;RO=73;SAF=37;SAR=24;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19144;STB=0.606522;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0132587;OID=.;OPOS=82456227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:73:73:61:61:0.455224:24:37:30:43:24:37:30:43 chr15 82512429 . C G 902.85 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0116565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2128;QD=56.4278;RBI=0.0592862;REFB=0.00446258;REVB=-0.058129;RO=1;SAF=28;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165659;STB=0.508769;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000328858;OID=.;OPOS=82512429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:35:28:1:0:35:28:1:0 chr15 82558034 . G C 360.76 PASS AF=0.463415;AO=37;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00182818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.751;QD=17.5981;RBI=0.00355092;REFB=-0.00843495;REVB=-0.00304414;RO=42;SAF=12;SAR=25;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198669;STB=0.605422;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00914644;OID=.;OPOS=82558034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:42:44:37:38:0.463415:25:12:22:20:26:12:22:22 chr15 82637060 . C CT 133.3 PASS AF=0.866667;AO=3;DP=20;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.112197;FXX=0.249875;HRUN=0;LEN=1;MLLD=149.767;QD=35.5457;RBI=0.134745;REFB=0.0243333;REVB=-0.0746195;RO=17;SAF=3;SAR=0;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599987;STB=0.749497;STBP=0.021;TYPE=ins;VARB=-0.00600174;OID=.;OPOS=82637061;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.866667:3:20:13:15:2:12:1:0:2:12:17:3:0:9:8 chr15 82637061 . C T 152.37 PASS AF=0.75;AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0876458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.436;QD=30.4744;RBI=0.0882253;REFB=-0.0951778;REVB=0.0100953;RO=5;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0279253;OID=.;OPOS=82637061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:20:20:5:5:15:15:0.75:6:9:3:2:6:9:3:2 chr15 82637078 . C CT 163.46 PASS AF=0.888889;AO=2;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0316474;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=156.024;QD=36.3248;RBI=0.0977023;REFB=0.0423423;REVB=-0.0924347;RO=16;SAF=2;SAR=0;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510523;STB=0.583225;STBP=0.103;TYPE=ins;VARB=-0.014146;OID=.;OPOS=82637079;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.888889:2:18:16:18:2:11:5:0:2:10:16:2:0:9:7 chr15 82637079 . C T 158.04 PASS AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0819877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.179;QD=35.1194;RBI=0.0838556;REFB=-0.0631756;REVB=0.0176006;RO=3;SAF=10;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108364;STB=0.559918;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00995153;OID=.;OPOS=82637079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:5:10:1:2:5:10:1:2 chr15 83014106 . T C 37.66 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00206233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.428;QD=9.41458;RBI=0.0115484;REFB=-0.00986573;REVB=-0.0113628;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303121;STB=0.794397;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0120718;OID=.;OPOS=83014106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:7:10:6:6:0.375:1:5:4:3:1:5:4:6 chr15 83215251 . T C 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00415559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.475;QD=12.7288;RBI=0.0294938;REFB=-0.0147509;REVB=0.0291995;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138165;STB=0.578773;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0228998;OID=.;OPOS=83215251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:10:12:9:9:0.428571:5:4:6:4:5:4:7:5 chr15 83224696 . C T 1524.67 PASS AF=1;AO=101;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106105;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.533;QD=59.7911;RBI=0.048971;REFB=0;REVB=0.0478077;RO=0;SAF=54;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07391e-05;OID=.;OPOS=83224696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:103:102:0:0:101:102:1:47:54:0:0:47:55:0:0 chr15 83297138 . C T 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0021837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.416;QD=16.1155;RBI=0.0153528;REFB=-0.0161723;REVB=0.0151967;RO=29;SAF=11;SAR=13;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569455;STB=0.532257;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0182199;OID=.;OPOS=83297138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:13:11:15:14:13:11:15:14 chr15 83428193 . G A 115.52 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00946618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.42;QD=8.88622;RBI=0.024334;REFB=-0.00651418;REVB=-0.0224173;RO=37;SAF=6;SAR=9;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226069;STB=0.636186;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0188728;OID=.;OPOS=83428193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:37:37:15:15:0.288462:9:6:22:15:9:6:22:15 chr15 83447631 . T G 386.95 PASS AF=0.425743;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00452807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.514;QD=15.3247;RBI=0.0127359;REFB=-0.00815248;REVB=-0.0119038;RO=58;SAF=26;SAR=17;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556768;STB=0.531354;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0103936;OID=.;OPOS=83447631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:58:58:43:43:0.425743:17:26:32:26:17:26:32:26 chr15 83499766 . G A 209.67 PASS AF=0.310345;AO=27;DP=87;FAO=27;FDP=87;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.00112785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.286;QD=9.64014;RBI=0.0276862;REFB=-0.00762323;REVB=0.0276632;RO=60;SAF=16;SAR=11;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241794;STB=0.641502;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0139081;OID=.;OPOS=83499766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:60:60:27:27:0.310345:11:16:23:37:11:16:23:37 chr15 83680287 . A G 293.55 PASS AF=0.302326;AO=39;DP=126;FAO=39;FDP=129;FR=.;FRO=90;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.00454474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.729;QD=9.10221;RBI=0.042476;REFB=-0.0158389;REVB=-0.0422321;RO=87;SAF=21;SAR=18;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433328;STB=0.512013;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0385657;OID=.;OPOS=83680287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:129:87:90:39:39:0.302326:18:21:50:37:18:21:50:40 chr15 84488636 . A G 1264.18 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.27;QD=61.6672;RBI=0.0263899;REFB=0;REVB=-0.00641201;RO=0;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45759e-05;OID=.;OPOS=84488636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:37:45:0:0:37:45:0:0 chr15 84493651 . T C 2093.65 PASS AF=0.985401;AO=135;DP=138;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0265321;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9979;QD=61.1284;RBI=0.0322162;REFB=-0.0535062;REVB=-0.0182738;RO=2;SAF=79;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00243339;STB=0.50128;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0052336;OID=.;OPOS=84493651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:138:137:2:2:135:135:0.985401:56:79:1:1:56:79:1:1 chr15 84539619 . C G 950.04 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.021215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.78;QD=55.8845;RBI=0.0493086;REFB=-0.20431;REVB=0.0445114;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.519225;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00423945;OID=.;OPOS=84539619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:0:2:66:66:0.970588:25:41:0:0:25:41:0:2 chr15 84581889 . G A 123.08 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0433163;FXX=0.0526177;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.07;QD=13.6755;RBI=0.0558433;REFB=-0.0151666;REVB=0.0352444;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168078;STB=0.598286;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0242042;OID=.;OPOS=84581889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:22:22:14:14:0.388889:8:6:13:9:8:6:13:9 chr15 84581904 . T C 575.65 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00781181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3563;QD=60.5942;RBI=0.116418;REFB=0;REVB=0.116156;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156371;OID=.;OPOS=84581904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr15 84582124 . G T 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00906358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.069;QD=64.4149;RBI=0.0214337;REFB=0;REVB=0.019423;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.87149e-05;OID=.;OPOS=84582124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr15 84639350 . C T 397.37 PASS AF=0.455556;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0151422;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.43;QD=17.6607;RBI=0.0164007;REFB=-0.0143863;REVB=0.00630045;RO=36;SAF=18;SAR=23;SRF=5;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270129;STB=0.528518;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0183697;OID=.;OPOS=84639350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:36:49:41:41:0.455556:23:18:5:31:23:18:19:30 chr15 84651185 . C A 238.75 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0249433;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.764;QD=14.0443;RBI=0.0263416;REFB=-0.0026228;REVB=0.00846833;RO=40;SAF=21;SAR=7;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261106;STB=0.649885;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00303763;OID=.;OPOS=84651185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:7:21:21:19:7:21:21:19 chr15 84651290 . T C 374.65 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.004;QD=55.5032;RBI=0.0673735;REFB=0;REVB=0.0352867;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.63786e-05;OID=.;OPOS=84651290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr15 84708186 . TG CG,T 1282.91 PASS AF=0.0784314,0.921569;AO=6,50;DP=157;FAO=12,141;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=0,83;FSAR=12,58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0735071,0.805611;FXX=0.0670691;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=151.896,10.1025;QD=33.5402;RBI=0.0735347,0.8443;REFB=0,0;REVB=-0.00201587,0.252653;RO=86;SAF=0,12;SAR=6,38;SRF=70;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.715341,-0.584882;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.109088,0.0450705;OID=.,.;OPOS=84708186,84708187;OREF=T,G;OALT=C,-;OMAPALT=CG,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:29:157:153:86:0:6,50:12,141:0.0784314,0.921569:6,38:0,12:70:16:12,58:0,83:0:0 chr15 84909385 . G A 110.57 PASS AF=0.705882;AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0568754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8527;QD=26.0167;RBI=0.0587704;REFB=-0.0616683;REVB=-0.0148035;RO=4;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164015;STB=0.608539;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0521377;OID=.;OPOS=84909385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:17:4:5:12:12:0.705882:3:9:4:0:3:9:5:0 chr15 84911245 . A G 82.95 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0130841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0351;QD=9.47951;RBI=0.0365086;REFB=-0.0232954;REVB=-0.0340835;RO=23;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831883;STB=0.538391;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0459178;OID=.;OPOS=84911245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:35:35:23:24:11:11:0.314286:7:4:10:13:7:4:10:14 chr15 85149771 . G T 1014.93 PASS AF=1;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176822;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.591;QD=59.7017;RBI=0.0279478;REFB=0;REVB=0.0216429;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45735e-06;OID=.;OPOS=85149771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:67:68:1:36:31:0:0:37:31:0:0 chr15 85163998 . G C 356.4 PASS AF=0.964286;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0178248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.649;QD=50.9136;RBI=0.0956827;REFB=-0.120269;REVB=0.0940077;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00198291;OID=.;OPOS=85163998;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:28:0:1:26:27:0.964286:15:11:0:0:16:11:0:1 chr15 85188994 . T C 655.14 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143713;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.851;QD=62.3945;RBI=0.0193177;REFB=0;REVB=0.012909;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34237e-05;OID=.;OPOS=85188994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0 chr15 85198362 . G T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.238;QD=46.848;RBI=0.0240121;REFB=0;REVB=-0.00837296;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86504e-05;OID=.;OPOS=85198362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr15 85198599 . T C 385.35 PASS AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00144173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.138;QD=17.9232;RBI=0.00308263;REFB=0.00627895;REVB=-0.0027247;RO=45;SAF=24;SAR=16;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168904;STB=0.59995;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.00504397;OID=.;OPOS=85198599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:46:40:40:0.465116:16:24:19:26:16:24:19:27 chr15 85333953 . A G 1047.68 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035847;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.726;QD=59.8677;RBI=0.0220608;REFB=0;REVB=0.0217676;RO=0;SAF=51;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.34984e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82795e-05;OID=.;OPOS=85333953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:19:51:0:0:19:51:0:0 chr15 85333957 . C T 282.0 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.00628168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.117;QD=14.6491;RBI=0.0167954;REFB=-0.00523703;REVB=-0.0155764;RO=44;SAF=22;SAR=10;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770893;STB=0.531896;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00720863;OID=.;OPOS=85333957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:44:45:32:32:0.415584:10:22:33:11:10:22:33:12 chr15 85341859 . G A 903.73 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.343;QD=58.3052;RBI=0.0571172;REFB=0;REVB=0.0310015;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104766;OID=.;OPOS=85341859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:30:29:0:0:32:30:0:0 chr15 85360101 . T C 1589.88 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.078;QD=59.9956;RBI=0.0304708;REFB=0;REVB=0.02151;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52735e-05;OID=.;OPOS=85360101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:52:54:0:0:52:54:0:0 chr15 85383839 . G A 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165729;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.294;QD=62.762;RBI=0.0214076;REFB=0;REVB=0.0135508;RO=0;SAF=31;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92704e-05;OID=.;OPOS=85383839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:58:31:0:0:58:31:0:0 chr15 85401259 . C T 1271.31 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0583046;FXX=0.0117633;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.4148;QD=60.5385;RBI=0.0684785;REFB=-0.167766;REVB=0.0359148;RO=1;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997129;STB=0.507041;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0015387;OID=.;OPOS=85401259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:84:1:1:83:83:0.988095:47:36:0:1:48:35:1:0 chr15 85401419 . T C 1583.24 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.327;QD=63.9694;RBI=0.0146887;REFB=0;REVB=0.0142905;RO=0;SAF=45;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47152e-05;OID=.;OPOS=85401419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:99:0:0:95:99:1:50:45:0:0:53:46:0:0 chr15 85402610 . G A 475.47 PASS AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00527672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3795;QD=19.2111;RBI=0.0578864;REFB=0.00346641;REVB=0.0576454;RO=52;SAF=18;SAR=29;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184244;STB=0.602553;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00309657;OID=.;OPOS=85402610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:29:18:30:22:29:18:30:22 chr15 85405994 . CT CC,C 584.27 PASS AF=0.432836,0.432836;AO=25,26;DP=66;FAO=29,29;FDP=67;FR=.;FRO=9;FSAF=13,29;FSAR=16,0;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0302918,0.0137331;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.0158,18.1952;QD=34.882;RBI=0.0639859,0.0705713;REFB=-0.0477992,-0.0557025;REVB=0.0563613,-0.0692222;RO=9;SAF=13,23;SAR=12,3;SRF=1;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0.59901;SSSB=0.197265,0.50159;STB=0.582035,0.999455;STBP=0.091,0;TYPE=snp,del;VARB=0.00608385,0.0963863;OID=.,.;OPOS=85405995,85405995;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.432836,0.432836:25,26:66:29,29:67:9:13,29:16,0:1:8:99:9:13,23:12,3:1:8 chr15 85411941 . A G 837.06 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0452328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.69;QD=55.8039;RBI=0.0572571;REFB=-0.142762;REVB=-0.0351051;RO=1;SAF=21;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219355;STB=0.511624;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00245274;OID=.;OPOS=85411941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:38:21:1:0:38:21:1:0 chr15 85447431 . G A 735.45 PASS AF=0.594828;AO=69;DP=116;FAO=69;FDP=116;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00783117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.206;QD=25.3604;RBI=0.0230378;REFB=-0.033509;REVB=0.021666;RO=47;SAF=27;SAR=42;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138354;STB=0.57532;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0241955;OID=.;OPOS=85447431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:47:47:69:69:0.594828:42:27:27:20:42:27:27:20 chr15 85467275 . C T 337.9 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00105675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.462;QD=17.5532;RBI=0.0109535;REFB=0.00844305;REVB=-0.0109024;RO=38;SAF=19;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00134965;STB=0.504704;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=-0.00857082;OID=.;OPOS=85467275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:41:36:36:0.467532:17:19:20:18:17:19:22:19 chr15 85476441 . G A 831.08 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.079;QD=57.3156;RBI=0.0923498;REFB=0;REVB=0.0401183;RO=0;SAF=2;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037509;OID=.;OPOS=85476441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:56:58:1:54:2:0:0:54:4:0:0 chr15 85478410 . A G 772.55 PASS AF=0.934426;AO=57;DP=61;FAO=57;FDP=61;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00179221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2038;QD=50.6588;RBI=0.0119513;REFB=-0.022837;REVB=-0.0118162;RO=4;SAF=24;SAR=33;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413312;STB=0.521961;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00908616;OID=.;OPOS=85478410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:61:61:4:4:57:57:0.934426:33:24:3:1:33:24:3:1 chr15 85478696 . C T 364.45 PASS AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00338494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8113;QD=23.8981;RBI=0.0195811;REFB=-0.0190085;REVB=-0.0192863;RO=25;SAF=11;SAR=25;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232116;STB=0.627945;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0109995;OID=.;OPOS=85478696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:25:11:15:10:25:11:15:10 chr15 86087092 . C T 219.83 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.000858493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3632;QD=17.5868;RBI=0.00652879;REFB=-0.0176326;REVB=0.0064721;RO=28;SAF=5;SAR=17;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715779;STB=0.540505;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0189014;OID=.;OPOS=86087092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:17:5:5:23:17:5:5:23 chr15 86087309 . T C 1066.16 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0236531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.004;QD=58.4197;RBI=0.0289755;REFB=-0.0564963;REVB=0.0167365;RO=1;SAF=22;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936655;STB=0.504949;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.000608374;OID=.;OPOS=86087309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:50:22:0:1:50:22:0:1 chr15 86122779 . T C 209.3 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0669426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.121;QD=11.6279;RBI=0.0681494;REFB=-0.0180475;REVB=-0.0127687;RO=46;SAF=7;SAR=19;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296077;STB=0.672235;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0250835;OID=.;OPOS=86122779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:46:46:26:26:0.361111:19:7:24:22:19:7:24:22 chr15 86122916 . T C 198.9 PASS AF=0.352113;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.00245517;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.497;QD=11.2058;RBI=0.00245993;REFB=-0.0121477;REVB=0.000152948;RO=47;SAF=10;SAR=15;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307618;STB=0.672001;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0239386;OID=.;OPOS=86122916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:47:46:25:25:0.352113:15:10:32:15:15:10:31:15 chr15 86123019 . C T 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0357367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.678;QD=8.69797;RBI=0.0359785;REFB=-0.00430254;REVB=-0.00416443;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00947068;OID=.;OPOS=86123019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:13:14:7:7:0.333333:4:3:6:7:4:3:6:8 chr15 86123170 . G T 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00833162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.639;QD=18.0506;RBI=0.0153544;REFB=-0.0175563;REVB=-0.0128973;RO=8;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0147601;OID=.;OPOS=86123170;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:5:5:4:4:5:5:4:4 chr15 86123833 . T C 241.7 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0164841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.471;QD=21.9722;RBI=0.0197452;REFB=-0.00280934;REVB=0.0108697;RO=21;SAF=10;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892066;STB=0.549856;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00275671;OID=.;OPOS=86123833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:13:10:7:14:13:10:7:14 chr15 86123924 . C T 191.6 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00495569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.867;QD=15.6408;RBI=0.0224027;REFB=-0.0113724;REVB=0.0218477;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158565;STB=0.599902;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0142306;OID=.;OPOS=86123924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:9:11:11:17:9:11:11:18 chr15 86123988 . G A 208.71 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00434343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3189;QD=18.1487;RBI=0.0276569;REFB=-0.00862773;REVB=0.0273137;RO=25;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125597;STB=0.571361;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00548919;OID=.;OPOS=86123988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:9:12:11:14:9:12:11:14 chr15 86124419 . C T 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0208878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5401;QD=17.5599;RBI=0.0313218;REFB=-0.0581751;REVB=-0.02334;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494516;STB=0.52827;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0284713;OID=.;OPOS=86124419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:6:12:13:8:6:12:13:8 chr15 86124483 . C G 207.94 PASS AF=0.403226;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0549303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4917;QD=13.4154;RBI=0.0567621;REFB=0.0202991;REVB=-0.0143038;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119891;STB=0.503353;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=-0.0277979;OID=.;OPOS=86124483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:36:37:25:25:0.403226:10:15:22:14:10:15:22:15 chr15 86124555 . G A 285.09 PASS AF=0.450704;AO=29;DP=68;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.025299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.729;QD=16.0613;RBI=0.0297386;REFB=-0.0308515;REVB=-0.0156316;RO=39;SAF=18;SAR=11;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112068;STB=0.527514;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.038148;OID=.;OPOS=86124555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:39:39:29:32:0.450704:11:18:20:19:14:18:20:19 chr15 86124946 . T C 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00632257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.58;QD=21.1725;RBI=0.0227623;REFB=-0.0475;REVB=-0.0218666;RO=8;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0242245;OID=.;OPOS=86124946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:6:6:4:4:6:6:4:4 chr15 86124968 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00255819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.596;QD=19.0179;RBI=0.0124578;REFB=-0.0194303;REVB=-0.0121923;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381971;STB=0.52171;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0240483;OID=.;OPOS=86124968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:6:9:9:5:6:9:9:5 chr15 86125031 . G A 318.76 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00989113;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=279.753;QD=20.9025;RBI=0.0100293;REFB=-0.0268975;REVB=0.00165917;RO=28;SAF=21;SAR=12;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382553;STB=0.52116;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0199635;OID=.;OPOS=86125031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:12:21:19:9:12:21:19:9 chr15 86278309 . G A 359.28 PASS AF=0.387387;AO=43;DP=111;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0163136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.906;QD=12.9471;RBI=0.0206081;REFB=-0.00856035;REVB=0.012592;RO=68;SAF=16;SAR=27;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172165;STB=0.59791;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00919034;OID=.;OPOS=86278309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:68:68:43:43:0.387387:27:16:36:32:27:16:36:32 chr15 86288518 . G C 246.24 PASS AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0321361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3741;QD=24.6235;RBI=0.0872571;REFB=0.00641144;REVB=-0.0811239;RO=17;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15186;STB=0.584541;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00817877;OID=.;OPOS=86288518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:14:9:10:7:14:9:10:7 chr15 86290779 . G GT 344.47 PASS AF=0.527473;AO=47;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0239495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.6906;QD=15.1414;RBI=0.0279256;REFB=0.0372645;REVB=-0.0143618;RO=43;SAF=22;SAR=25;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176033;STB=0.504354;STBP=0.97;TYPE=ins;VARB=-0.0337052;OID=.;OPOS=86290780;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.527473:47:91:48:91:43:23:25:21:22:99:43:22:25:21:22 chr15 86290940 . A C 177.5 PASS AF=0.292683;AO=24;DP=78;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0119159;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.31;QD=8.6586;RBI=0.0239735;REFB=-0.00700316;REVB=-0.0208023;RO=54;SAF=7;SAR=17;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27632;STB=0.655112;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0202219;OID=.;OPOS=86290940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:82:54:58:24:24:0.292683:17:7:28:26:17:7:29:29 chr15 86292324 . G C 452.4 PASS AF=0.523256;AO=44;DP=85;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00520122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.658;QD=21.0417;RBI=0.00875081;REFB=-0.00923694;REVB=0.00703734;RO=41;SAF=16;SAR=28;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473088;STB=0.53018;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0123225;OID=.;OPOS=86292324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:41:41:44:45:0.523256:28:16:17:24:29:16:17:24 chr15 86311695 . G A 348.98 PASS AF=0.408602;AO=37;DP=92;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=-0.00288142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.242;QD=15.0098;RBI=0.00892629;REFB=-0.00682013;REVB=-0.00844844;RO=51;SAF=20;SAR=17;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132318;STB=0.598574;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0129842;OID=.;OPOS=86311695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:51:55:37:38:0.408602:17:20:34:17:18:20:38:17 chr15 86312681 . G A 426.08 PASS AF=0.525;AO=43;DP=81;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0225348;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.257;QD=21.3038;RBI=0.0225387;REFB=-0.0204455;REVB=0.000415921;RO=37;SAF=19;SAR=24;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105386;STB=0.559948;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.014943;OID=.;OPOS=86312681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:37:38:43:42:0.525:24:19:21:16:23:19:22:16 chr15 86313048 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.05;QD=61.3362;RBI=0.0302491;REFB=0;REVB=-0.0230328;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.88702e-05;OID=.;OPOS=86313048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:30:10:0:0:30:10:0:0 chr15 86368898 . G A 316.96 PASS AF=0.56;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00796216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.727;QD=25.3571;RBI=0.0236616;REFB=-0.00876088;REVB=-0.0222817;RO=21;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00924929;STB=0.515748;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00410134;OID=.;OPOS=86368898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:21:22:28:28:0.56:13:15:11:10:13:15:11:11 chr15 86368922 . C T 446.22 PASS AF=0.608696;AO=42;DP=69;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00584015;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.029;QD=25.8677;RBI=0.0156307;REFB=0.00365797;REVB=-0.0144987;RO=25;SAF=18;SAR=24;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903899;STB=0.535548;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00222295;OID=.;OPOS=86368922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:25:27:42:42:0.608696:24:18:14:11:24:18:14:13 chr15 86368959 . A T 611.58 PASS AF=0.566038;AO=60;DP=106;FAO=60;FDP=106;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0429177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2683;QD=23.0786;RBI=0.0429626;REFB=-0.0124925;REVB=0.00196442;RO=45;SAF=31;SAR=29;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391964;STB=0.516661;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0246807;OID=.;OPOS=86368959;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:45:46:60:60:0.566038:29:31:21:24:29:31:22:24 chr15 86940622 . T C 1939.69 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196293;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.99;QD=62.0701;RBI=0.0406374;REFB=0;REVB=0.0405899;RO=0;SAF=59;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1894e-05;OID=.;OPOS=86940622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:125:125:0:0:125:125:1:66:59:0:0:66:59:0:0 chr15 87217613 . A G 772.66 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0442746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.11;QD=61.8129;RBI=0.0449608;REFB=-0.109224;REVB=-0.00782519;RO=1;SAF=29;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015953;STB=0.508471;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00151067;OID=.;OPOS=87217613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:20:29:1:0:20:29:1:0 chr15 87531281 . A C 1657.05 PASS AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0371992;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2464;QD=59.1803;RBI=0.0676359;REFB=-0.103899;REVB=0.0564875;RO=1;SAF=46;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102088;STB=0.505375;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0014763;OID=.;OPOS=87531281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:65:46:1:0:65:46:1:0 chr15 88476365 . G A 319.71 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0211822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.335;QD=15.5956;RBI=0.0211916;REFB=-0.0111044;REVB=0.000633969;RO=46;SAF=16;SAR=19;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044951;STB=0.518299;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0111291;OID=.;OPOS=88476365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:46:47:35:35:0.426829:19:16:19:27:19:16:20:27 chr15 88576185 . G C 1151.96 PASS AF=0.538462;AO=109;DP=209;FAO=112;FDP=208;FR=.;FRO=96;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=0.0725332;FXX=0.0234731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9116;QD=22.1531;RBI=0.092873;REFB=-0.00591548;REVB=0.0580028;RO=95;SAF=51;SAR=58;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00405176;STB=0.506892;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00635473;OID=.;OPOS=88576185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:95:96:109:112:0.538462:58:51:44:51:59:53:44:52 chr15 88679785 . G A 1485.4 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00028655;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.514;QD=60.0162;RBI=0.0479285;REFB=0;REVB=0.0479277;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113872;OID=.;OPOS=88679785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:60:39:0:0:60:39:0:0 chr15 88799324 . C A 324.79 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00540938;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.738;QD=16.8723;RBI=0.00796384;REFB=-0.018639;REVB=0.00584477;RO=43;SAF=11;SAR=24;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136293;STB=0.568587;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0230008;OID=.;OPOS=88799324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:43:42:35:35:0.454545:24:11:19:24:24:11:18:24 chr15 89169858 . A G 133.44 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.000146633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.126;QD=15.6988;RBI=0.00765451;REFB=-0.00825309;REVB=0.0076531;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221869;STB=0.627739;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00801381;OID=.;OPOS=89169858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:6:9:7:12:6:9:7:12 chr15 89172558 . G C 348.93 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0114815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.183;QD=22.8808;RBI=0.0223084;REFB=-0.00648076;REVB=-0.019127;RO=26;SAF=17;SAR=18;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785244;STB=0.543209;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00471479;OID=.;OPOS=89172558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:18:17:10:16:18:17:10:16 chr15 89173657 . A T 207.53 PASS AF=0.4375;AO=20;DP=47;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0116638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.751;QD=17.2944;RBI=0.0134242;REFB=-0.00227807;REVB=-0.00664566;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105214;STB=0.555504;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0033471;OID=.;OPOS=89173657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:26:27:20:21:0.4375:11:9:9:17:12:9:9:18 chr15 89173732 . T C 448.37 PASS AF=0.46875;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=38;FWDB=0.0375683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6146;QD=18.6822;RBI=0.0382822;REFB=0.00150781;REVB=0.00735846;RO=50;SAF=16;SAR=29;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124606;STB=0.560351;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.00105005;OID=.;OPOS=89173732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:51:45:45:0.46875:29:16:12:38:29:16:13:38 chr15 89174748 . G C 246.87 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0421652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3109;QD=17.954;RBI=0.0442083;REFB=0.00544481;REVB=-0.0132842;RO=28;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146113;STB=0.508191;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=-0.00471449;OID=.;OPOS=89174748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:12:15:16:12:12:15:16:12 chr15 89193497 . A T 179.51 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0186722;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0043;QD=14.6537;RBI=0.0295022;REFB=-0.0297103;REVB=0.0228414;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327;STB=0.518828;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0498846;OID=.;OPOS=89193497;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:49:29:29:20:20:0.408163:13:7:11:18:13:7:11:18 chr15 89195178 . G C 271.7 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0158537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.658;QD=14.6864;RBI=0.0158572;REFB=-0.013463;REVB=0.000333132;RO=43;SAF=14;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10888;STB=0.561699;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0207046;OID=.;OPOS=89195178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:17:14:24:19:17:14:24:19 chr15 89195245 . C T 240.85 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=0.0245543;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3811;QD=16.6106;RBI=0.025044;REFB=-0.0119867;REVB=-0.00492806;RO=31;SAF=17;SAR=10;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154806;STB=0.586493;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0131989;OID=.;OPOS=89195245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:31:31:27:27:0.465517:10:17:24:7:10:17:24:7 chr15 89195526 . A G 315.45 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0052233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.722;QD=22.5322;RBI=0.0055359;REFB=-0.0343242;REVB=-0.00183396;RO=23;SAF=22;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265957;STB=0.639445;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0188187;OID=.;OPOS=89195526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:23:24:32:32:0.571429:10:22:8:15:10:22:9:15 chr15 89391160 . C A 278.8 PASS AF=0.449275;AO=32;DP=70;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0198452;FXX=0.0142837;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.91;QD=16.1622;RBI=0.0231107;REFB=-0.01411;REVB=-0.0118437;RO=38;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136136;STB=0.569788;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0143516;OID=.;OPOS=89391160;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:38:38:32:31:0.449275:18:14:22:16:17:14:22:16 chr15 89392745 . T C 2834.16 PASS AF=1;AO=179;DP=181;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226996;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8905;QD=62.6333;RBI=0.0238871;REFB=0;REVB=0.00743792;RO=0;SAF=88;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.27878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000626376;OID=.;OPOS=89392745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:181:181:0:0:179:181:1:91:88:0:0:91:90:0:0 chr15 89393080 . C G 176.23 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.00166533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.4557;QD=20.7333;RBI=0.0230384;REFB=-0.022697;REVB=-0.0229782;RO=16;SAF=4;SAR=14;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127839;STB=0.571356;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0256794;OID=.;OPOS=89393080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:14:4:2:14:14:4:2:14 chr15 89398330 . G A 92.12 PASS AF=0.255319;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.000907761;FXX=0.040808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.862;QD=7.83991;RBI=0.0178683;REFB=-0.000832651;REVB=0.0178452;RO=35;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.544551;STB=0.828108;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00185687;OID=.;OPOS=89398330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:49:47:35:35:12:12:0.255319:3:9:9:26:3:9:9:26 chr15 89398412 . G A 135.05 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.022384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.898;QD=16.8814;RBI=0.0223982;REFB=-0.0136954;REVB=0.000797793;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328175;STB=0.685495;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0290103;OID=.;OPOS=89398412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:7:8:3:14:7:8:3:14 chr15 89398553 . C A 368.52 PASS AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00846382;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.922;QD=24.5681;RBI=0.0433016;REFB=0.0193089;REVB=-0.0424664;RO=24;SAF=17;SAR=19;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141079;STB=0.577306;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.0152986;OID=.;OPOS=89398553;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:24:24:36:36:0.6:19:17:16:8:19:17:16:8 chr15 89401109 . A G 995.71 PASS AF=0.651515;AO=86;DP=132;FAO=86;FDP=132;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0052884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.545;QD=30.1729;RBI=0.00680491;REFB=0.00835028;REVB=-0.00428248;RO=46;SAF=35;SAR=51;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755565;STB=0.540788;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00364226;OID=.;OPOS=89401109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:46:46:86:86:0.651515:51:35:24:22:51:35:24:22 chr15 89401615 . T G 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0199289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.747;QD=12.1821;RBI=0.0316091;REFB=-0.00143932;REVB=-0.0245352;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364728;STB=0.71611;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00207524;OID=.;OPOS=89401615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:5:10:3:7:5:10 chr15 89402051 . A G 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00796574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.324;QD=11.9197;RBI=0.0201505;REFB=0.0168963;REVB=-0.0185092;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263271;STB=0.6599;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.0107775;OID=.;OPOS=89402051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:5:4:5:2:5:4 chr15 89402239 . T C 271.13 PASS AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.011127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.825;QD=30.1256;RBI=0.0133995;REFB=-0.0247409;REVB=0.00746578;RO=12;SAF=9;SAR=15;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178921;STB=0.598508;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0104803;OID=.;OPOS=89402239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:15:9:8:4:15:9:8:4 chr15 89436244 . T C 424.85 PASS AF=0.583333;AO=40;DP=70;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0308787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.142;QD=23.6028;RBI=0.0327299;REFB=-0.0428844;REVB=-0.0108512;RO=30;SAF=19;SAR=21;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713616;STB=0.547596;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0307605;OID=.;OPOS=89436244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:30:30:40:42:0.583333:21:19:17:13:23:19:17:13 chr15 89436295 . G A 400.53 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0160421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.804;QD=21.3617;RBI=0.028588;REFB=-0.00741865;REVB=0.0236627;RO=35;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132955;STB=0.573297;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00615399;OID=.;OPOS=89436295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:20:20:23:12:20:20:23:12 chr15 89450546 . C T 185.6 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00428327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.109;QD=13.7478;RBI=0.0151601;REFB=-0.0204605;REVB=0.0145424;RO=32;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950431;STB=0.554557;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0313155;OID=.;OPOS=89450546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:13:9:16:16:13:9:16:16 chr15 89450587 . G T 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0188247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.926;QD=17.2464;RBI=0.0218363;REFB=-0.0114463;REVB=0.011066;RO=27;SAF=7;SAR=14;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18975;STB=0.608589;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0325639;OID=.;OPOS=89450587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:14:7:14:13:14:7:14:13 chr15 89453152 . T C 514.08 PASS AF=0.515789;AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0115851;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.166;QD=21.6456;RBI=0.0116803;REFB=-0.0120274;REVB=0.00148765;RO=46;SAF=25;SAR=24;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292061;STB=0.516122;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00873669;OID=.;OPOS=89453152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:46:46:49:49:0.515789:24:25:25:21:24:25:25:21 chr15 89740373 . G C 542.14 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281458;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.245;QD=60.2374;RBI=0.041887;REFB=0;REVB=0.0417923;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66517e-05;OID=.;OPOS=89740373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:36:0:0:33:36:1:20:13:0:0:23:13:0:0 chr15 89740384 . T G 604.52 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00582306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.76;QD=60.452;RBI=0.0165857;REFB=0;REVB=0.0155299;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106277;OID=.;OPOS=89740384;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:38:40:1:23:15:0:0:25:15:0:0 chr15 89740469 . T C 990.62 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00133069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.378;QD=59.1416;RBI=0.00699111;REFB=0;REVB=0.0068633;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80827e-05;OID=.;OPOS=89740469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr15 89740616 . G A 1389.13 PASS AF=1;AO=88;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112891;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8723;QD=62.4329;RBI=0.0130609;REFB=0;REVB=0.00656828;RO=0;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000848264;OID=.;OPOS=89740616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:89:0:0:88:89:1:40:48:0:0:41:48:0:0 chr15 89744476 . G T 1943.52 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.279;QD=61.699;RBI=0.0454983;REFB=0;REVB=0.00728379;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97697e-05;OID=.;OPOS=89744476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:120:126:0:0:120:126:1:56:64:0:0:56:70:0:0 chr15 89804043 . C T 1062.4 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1149;QD=59.8535;RBI=0.0370423;REFB=0;REVB=-0.0246214;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000374135;OID=.;OPOS=89804043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0 chr15 89806710 . C T 796.93 PASS AF=0.951613;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0178136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4171;QD=51.4147;RBI=0.0367919;REFB=-0.185811;REVB=-0.032192;RO=4;SAF=29;SAR=29;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303643;STB=0.507656;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00861696;OID=.;OPOS=89806710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:62:62:4:3:58:59:0.951613:29:29:3:1:29:30:2:1 chr15 89836228 . G C 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1022;QD=58.6003;RBI=0.0158512;REFB=0;REVB=0.0121255;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137244;OID=.;OPOS=89836228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr15 89838236 . G A 1501.99 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0719119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1037;QD=63.2416;RBI=0.0722649;REFB=0;REVB=0.00713416;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344347;OID=.;OPOS=89838236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:95:0:0:91:95:1:39:52:0:0:43:52:0:0 chr15 89858602 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.51;QD=56.9382;RBI=0.0298703;REFB=0;REVB=0.0114498;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172935;OID=.;OPOS=89858602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0 chr15 89878377 . A T 1813.92 PASS AF=0.983607;AO=119;DP=123;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0350723;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.901;QD=59.4728;RBI=0.0526061;REFB=0.0561145;REVB=-0.0392088;RO=2;SAF=50;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135676;STB=0.507142;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.000432674;OID=.;OPOS=89878377;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:123:122:2:2:119:120:0.983607:69:50:0:2:69:51:0:2 chr15 89999101 . G T 236.83 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0554265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3173;QD=26.3143;RBI=0.073023;REFB=0.0139405;REVB=0.0475423;RO=11;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37322e-08;STB=0.510195;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.00912051;OID=.;OPOS=89999101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:11:14:22:22:0.611111:12:10:5:6:12:10:6:8 chr15 90138670 . C T 982.39 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00260148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.62;QD=56.1364;RBI=0.00284129;REFB=-0.0413074;REVB=0.00114247;RO=2;SAF=34;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000514051;OID=.;OPOS=90138670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:70:70:2:2:68:68:0.971429:34:34:1:1:34:34:1:1 chr15 90168108 . C T 1194.39 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345677;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.628;QD=60.4756;RBI=0.0382085;REFB=0;REVB=0.0162777;RO=1;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129667;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184303;OID=.;OPOS=90168108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:1:0:78:79:1:36:42:0:1:37:42:0:0 chr15 90168693 . T A 357.98 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.33;QD=55.0731;RBI=0.0523722;REFB=0;REVB=0.0420959;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000627214;OID=.;OPOS=90168693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr15 90170237 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00880519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.225;QD=57.0007;RBI=0.0211608;REFB=0;REVB=0.0192419;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78447e-05;OID=.;OPOS=90170237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr15 90176432 . T G 961.14 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114402;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.148;QD=59.1469;RBI=0.011952;REFB=0;REVB=-0.00346032;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23905e-05;OID=.;OPOS=90176432;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:38:26:0:0:38:27:0:0 chr15 90191827 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.491;QD=44.6897;RBI=0.0640914;REFB=0;REVB=-0.0310149;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0017274;OID=.;OPOS=90191827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0 chr15 90195967 . C G 1551.88 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00703024;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.4382;QD=62.7023;RBI=0.0519248;REFB=-0.08338;REVB=-0.0514467;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000736991;OID=.;OPOS=90195967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:0:1:98:98:0.989899:51:47:0:0:51:47:1:0 chr15 90196008 . C T 1190.43 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.475;QD=61.0477;RBI=0.0179066;REFB=0;REVB=0.000132472;RO=0;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69416e-05;OID=.;OPOS=90196008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:45:33:0:0:45:33:0:0 chr15 90210257 . G A 679.3 PASS AF=0.479167;AO=67;DP=143;FAO=69;FDP=144;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.00675198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.383;QD=18.8694;RBI=0.0208996;REFB=-0.0222802;REVB=0.0197789;RO=75;SAF=28;SAR=39;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110702;STB=0.559253;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0150249;OID=.;OPOS=90210257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:75:75:67:69:0.479167:39:28:40:35:40:29:40:35 chr15 90210263 . A G 724.1 PASS AF=0.5;AO=63;DP=136;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=0.00105439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.983;QD=20.1138;RBI=0.0283573;REFB=-0.0480477;REVB=0.0283376;RO=69;SAF=29;SAR=34;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716176;STB=0.54888;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0117369;OID=.;OPOS=90210263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:144:69:72:63:72:0.5:34:29:37:32:41:31:38:34 chr15 90213229 . G C 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00126041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.796;QD=60.9775;RBI=0.0214327;REFB=0;REVB=-0.0213956;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103861;OID=.;OPOS=90213229;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0 chr15 90344352 . T C 150.06 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0254728;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7454;QD=18.1886;RBI=0.0435308;REFB=-0.0117181;REVB=-0.0352997;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142198;STB=0.581292;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0116637;OID=.;OPOS=90344352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:17:17:16:16:0.484848:6:10:8:9:6:10:8:9 chr15 90346861 . C T 638.5 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0426863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.851;QD=59.3949;RBI=0.0427362;REFB=-0.0635673;REVB=-0.00206464;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000364404;OID=.;OPOS=90346861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:17:25:0:0:17:25:1:0 chr15 90349558 . C T 1556.48 PASS AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000876421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.553;QD=59.8646;RBI=0.00995067;REFB=0;REVB=-0.00991199;RO=0;SAF=43;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99311e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09112e-05;OID=.;OPOS=90349558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:61:43:0:0:61:43:0:0 chr15 90617539 . C T 121.67 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00858557;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.673;QD=23.1748;RBI=0.0183893;REFB=-0.0342602;REVB=0.0162621;RO=8;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518484;STB=0.529366;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00962802;OID=.;OPOS=90617539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:21:21:8:8:13:13:0.619048:4:9:5:3:4:9:5:3 chr15 90623052 . T C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.782;QD=53.277;RBI=0.0350605;REFB=0;REVB=0.0317693;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168552;OID=.;OPOS=90623052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0 chr15 90623559 . G A 73.43 PASS AF=0.322581;AO=9;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0147954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.998;QD=9.4754;RBI=0.0154765;REFB=-0.00278935;REVB=-0.00454092;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216493;STB=0.655392;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00513399;OID=.;OPOS=90623559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:9:10:0.322581:7:2:8:13:8:2:8:13 chr15 90628537 . G A 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00678224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0675;QD=21.7438;RBI=0.0648222;REFB=0.0327673;REVB=0.0644664;RO=11;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880825;STB=0.549931;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.00787625;OID=.;OPOS=90628537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:11:4:4:7:11:4:4:7 chr15 90673809 . G C 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00119671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.109;QD=16.9413;RBI=0.0167088;REFB=-0.00327275;REVB=-0.0166659;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827652;STB=0.547122;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00417507;OID=.;OPOS=90673809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:7:12:17:7:7:12:17:7 chr15 90709545 . G A 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00362518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4812;QD=21.7443;RBI=0.0631196;REFB=0.0211775;REVB=0.0630154;RO=11;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980137;STB=0.555479;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0152516;OID=.;OPOS=90709545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:5:10:6:5:5:10:6:5 chr15 90764219 . G A 212.4 PASS AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00386518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.835;QD=14.3998;RBI=0.0160567;REFB=-0.00536756;REVB=0.0155845;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029113;STB=0.516561;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00887152;OID=.;OPOS=90764219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:11:14:20:14:11:14:20:14 chr15 90768320 . C T 290.05 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=31;FWDB=-0.00598462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.557;QD=16.5741;RBI=0.0353871;REFB=-0.00940537;REVB=0.0348774;RO=38;SAF=10;SAR=22;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15497;STB=0.586234;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00982941;OID=.;OPOS=90768320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:22:10:7:31:22:10:7:31 chr15 90771257 . G A 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00399024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.736;QD=21.7442;RBI=0.00995912;REFB=-0.00223148;REVB=-0.0091248;RO=11;SAF=12;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313185;STB=0.67898;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00342941;OID=.;OPOS=90771257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:3:12:5:6:3:12:5:6 chr15 90771750 . T G 771.42 PASS AF=1;AO=26;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0697121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.028;QD=64.2848;RBI=0.0832391;REFB=0;REVB=0.0454861;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146284;OID=.;OPOS=90771750;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:26:48:1:10:16:0:0:21:27:0:0 chr15 90771840 . C T 116.94 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.0555764;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.708;QD=11.1374;RBI=0.0573936;REFB=-0.0124355;REVB=0.0143278;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283866;STB=0.639829;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00752162;OID=.;OPOS=90771840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:27:28:14:14:0.333333:9:5:4:23:9:5:5:23 chr15 90772200 . G A 727.8 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.05;QD=63.2868;RBI=0.0375827;REFB=0;REVB=0.0374344;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65723e-05;OID=.;OPOS=90772200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:27:18:0:0:27:19:0:0 chr15 90772831 . C T 542.24 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0755643;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0218;QD=60.2491;RBI=0.0761038;REFB=0;REVB=0.00904613;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000820498;OID=.;OPOS=90772831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr15 90774259 . G C 582.43 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.03502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.593;QD=58.2425;RBI=0.0443028;REFB=-0.172829;REVB=0.0271355;RO=1;SAF=21;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218009;STB=0.511622;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00301342;OID=.;OPOS=90774259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:18:21:1:0:18:21:1:0 chr15 90774447 . TAGAG T 255.84 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365557;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=279.652;QD=51.1681;RBI=0.0472414;REFB=0;REVB=0.0299239;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000350066;OID=.;OPOS=90774448;OREF=AGAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:20:20:20:0:11:9:0:0:4:0:10:9:0:0 chr15 90784207 . A G 1529.47 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.498;QD=63.0711;RBI=0.0474929;REFB=0;REVB=0.0408183;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.91649e-05;OID=.;OPOS=90784207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:97:0:0:90:97:1:50:40:0:0:55:42:0:0 chr15 90784250 . T C 1384.91 PASS AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102099;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.074;QD=62.9505;RBI=0.032484;REFB=0;REVB=0.0308378;RO=0;SAF=34;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92055e-05;OID=.;OPOS=90784250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:54:34:0:0:54:34:0:0 chr15 90794102 . G A 490.51 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.601;QD=57.7065;RBI=0.0650221;REFB=0;REVB=0.0426947;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281204;OID=.;OPOS=90794102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:16:15:0:0:18:16:0:0 chr15 90794757 . T G 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.611;QD=62.0212;RBI=0.0323911;REFB=0;REVB=0.0318092;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211745;OID=.;OPOS=90794757;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:29:13:0:0:29:13:0:0 chr15 90794845 . G A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0881674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.327;QD=57.2025;RBI=0.088204;REFB=0;REVB=-0.0025399;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000728205;OID=.;OPOS=90794845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr15 90796558 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6169;QD=63.8718;RBI=0.0209902;REFB=0;REVB=-0.016862;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000277071;OID=.;OPOS=90796558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0 chr15 90800408 . C G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9699;QD=57.8847;RBI=0.0128941;REFB=0;REVB=-0.0061668;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171353;OID=.;OPOS=90800408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0 chr15 90800449 . C T 955.02 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0093;QD=58.7707;RBI=0.038896;REFB=0;REVB=-0.0307758;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40139e-05;OID=.;OPOS=90800449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:25:39:0:0:25:40:0:0 chr15 90806375 . C T 127.81 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0275456;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.777;QD=18.2582;RBI=0.0275681;REFB=-0.010327;REVB=-0.00111189;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629108;STB=0.536031;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0110738;OID=.;OPOS=90806375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:7:7:8:6:7:7 chr15 90809633 . G A 465.11 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3238;QD=58.139;RBI=0.0513461;REFB=0;REVB=0.0182621;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000804155;OID=.;OPOS=90809633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0 chr15 90818400 . A T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.66;QD=43.4862;RBI=0.0684982;REFB=0;REVB=0.0509306;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185161;OID=.;OPOS=90818400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0 chr15 90818469 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0248699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.013;QD=14.0961;RBI=0.0476554;REFB=-0.0359673;REVB=0.0406512;RO=14;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146265;STB=0.586784;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0637673;OID=.;OPOS=90818469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:9:2:4:10:9:2:4:10 chr15 90818641 . G C 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0207128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.211;QD=19.0178;RBI=0.0240595;REFB=-0.00720709;REVB=0.0122409;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318287;STB=0.679775;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0134195;OID=.;OPOS=90818641;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:9:6:11:3:9:6:11:3 chr15 90818827 . G A 358.29 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229884;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.288;QD=55.121;RBI=0.064522;REFB=0;REVB=0.0602878;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418721;OID=.;OPOS=90818827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:10:15:0:0:10:16:0:0 chr15 90819132 . C T 356.1 PASS AF=1;AO=22;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.893;QD=54.7844;RBI=0.0518755;REFB=0;REVB=0.0361439;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00275784;OID=.;OPOS=90819132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:22:26:1:13:9:0:0:13:13:0:0 chr15 90819641 . A C 885.37 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00141134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8681;QD=58.0572;RBI=0.015241;REFB=0;REVB=0.0151755;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103305;OID=.;OPOS=90819641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0 chr15 90819876 . T C 190.82 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7642;QD=47.7037;RBI=0.0653606;REFB=0;REVB=0.0493857;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0036669;OID=.;OPOS=90819876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr15 90820063 . T C 104.89 PASS AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118068;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.041;QD=41.9551;RBI=0.0201686;REFB=0;REVB=-0.0163514;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407615;OID=.;OPOS=90820063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:11:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr15 90820721 . C T 357.48 PASS AF=0.931034;AO=26;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0169945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.169;QD=49.308;RBI=0.0216452;REFB=-0.137833;REVB=-0.0134053;RO=2;SAF=10;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841887;STB=0.541636;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00345675;OID=.;OPOS=90820721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:26:27:0.931034:16:10:2:0:16:11:2:0 chr15 90892293 . C T 427.46 PASS AF=0.37594;AO=50;DP=133;FAO=50;FDP=133;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.0319046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1643;QD=12.8558;RBI=0.0322131;REFB=0.00569264;REVB=0.00444785;RO=82;SAF=23;SAR=27;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366459;STB=0.516534;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.0118707;OID=.;OPOS=90892293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:82:83:50:50:0.37594:27:23:35:47:27:23:36:47 chr15 90903311 . A G 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.015136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.755;QD=16.6262;RBI=0.0172374;REFB=-0.00643948;REVB=0.00824794;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225385;STB=0.629024;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00717293;OID=.;OPOS=90903311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:10:4:7:6:10:4 chr15 91010776 . T C 225.44 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=53;FAO=24;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0254489;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.179;QD=17.3415;RBI=0.0326865;REFB=-0.0183618;REVB=0.0205125;RO=27;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147965;STB=0.567514;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0201156;OID=.;OPOS=91010776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:27:27:18:24:0.461538:11:7:7:20:15:9:7:20 chr15 91019924 . CA C 36.72 PASS AF=0.470588;AO=14;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0992659;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.02686;QD=4.32042;RBI=0.217567;REFB=-0.0671664;REVB=0.193602;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666664;STB=0.529375;STBP=0.771;TYPE=del;VARB=0.108808;OID=.;OPOS=91019925;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.470588:14:34:16:34:18:8:8:10:8:36:16:8:6:8:8 chr15 91045408 . G A 250.19 PASS AF=0.414286;AO=28;DP=68;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00225464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.278;QD=14.2964;RBI=0.00454283;REFB=-0.053241;REVB=-0.00394384;RO=40;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111111;STB=0.502957;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0399457;OID=.;OPOS=91045408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:40:41:28:29:0.414286:15:13:19:21:15:14:20:21 chr15 91172611 . C T 312.82 PASS AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0125896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.586;QD=21.9524;RBI=0.0168911;REFB=-0.0422047;REVB=0.0112611;RO=25;SAF=16;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476002;STB=0.526299;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0208621;OID=.;OPOS=91172611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:25:25:32:32:0.561404:16:16:14:11:16:16:14:11 chr15 91185994 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.000813332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.262;QD=11.9535;RBI=0.0512912;REFB=-0.00250863;REVB=-0.0512848;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515529;STB=0.804188;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00688317;OID=.;OPOS=91185994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:9:2:6:2:9:2 chr15 91426323 . GCCCCCCC GCCCCCC,GCCCCCCA 41.65 PASS AF=0.130435,0.057971;AO=21,4;DP=69;FAO=9,4;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=4,1;FSAR=5,3;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0216264,0.094986;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.11131,26.9244;QD=2.41446;RBI=0.0218689,0.113068;REFB=-0.125038,-0.0594977;REVB=-0.00324739,0.061335;RO=35;SAF=8,1;SAR=13,3;SRF=18;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.146005,-0.29149;STB=0.513858,0.680858;STBP=0.948,0.556;TYPE=del,snp;VARB=0.140912,0.169846;OID=.,.;OPOS=91426324,91426330;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=GCCCCCC,GCCCCCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.130435,0.057971:21,4:69:9,4:69:56:4,1:5,3:24:32:26:35:8,1:13,3:18:17 chr15 91428290 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.233;QD=56.1916;RBI=0.0566022;REFB=0;REVB=0.0344085;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034894;OID=.;OPOS=91428290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chr15 91428589 . T G 712.12 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012269;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.172;QD=63.2991;RBI=0.0271288;REFB=0;REVB=0.0241959;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141323;OID=.;OPOS=91428589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr15 91428636 . G A 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.977;QD=60.977;RBI=0.0746568;REFB=0;REVB=0.0730661;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392347;OID=.;OPOS=91428636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0 chr15 91430436 . T C 785.82 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.881;QD=64.1485;RBI=0.0280709;REFB=0;REVB=0.0248395;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19608e-05;OID=.;OPOS=91430436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr15 91449654 . T C 1540.55 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00489947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.676;QD=59.8271;RBI=0.00811332;REFB=0;REVB=0.00646693;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50326e-06;OID=.;OPOS=91449654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:44:59:0:0:44:59:0:0 chr15 91449702 . A T 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00194973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.694;QD=62.614;RBI=0.0304927;REFB=0;REVB=0.0304303;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99604e-05;OID=.;OPOS=91449702;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:42:46:0:0:42:46:0:0 chr15 91452595 . A G 1194.02 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0331347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.189;QD=59.7008;RBI=0.0355417;REFB=-0.0365656;REVB=-0.0128572;RO=1;SAF=39;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011984;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.000520913;OID=.;OPOS=91452595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:40:39:1:0:40:39:1:0 chr15 91492877 . C T 666.95 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.027206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.767;QD=57.9954;RBI=0.0321979;REFB=-0.0176303;REVB=0.0172203;RO=2;SAF=24;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03755;STB=0.519991;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.000162285;OID=.;OPOS=91492877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:20:24:2:0:20:24:2:0 chr15 91499986 . G T 370.34 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394857;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=139.092;QD=54.8649;RBI=0.0434838;REFB=0;REVB=0.0182133;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284276;OID=.;OPOS=91499986;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:9:17:0:0:10:17:0:0 chr15 91509592 . T C 742.71 PASS AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0820132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4844;QD=53.0505;RBI=0.0829268;REFB=0.00744099;REVB=-0.0122757;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362146;STB=0.519224;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.00159442;OID=.;OPOS=91509592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:29:25:2:0:29:25:2:0 chr15 91517479 . G A 747.08 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1277;QD=63.5811;RBI=0.0251667;REFB=0;REVB=0.0154118;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299695;OID=.;OPOS=91517479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr15 91524841 . G T 1023.21 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.144;QD=59.3167;RBI=0.00452056;REFB=0;REVB=0.00200071;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95446e-05;OID=.;OPOS=91524841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:35:33:0:0:36:33:0:0 chr15 91543761 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.551;QD=53.2771;RBI=0.0499057;REFB=0;REVB=0.0165904;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000420728;OID=.;OPOS=91543761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr15 91795203 . C G 323.56 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0222611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0476;QD=16.8086;RBI=0.0235613;REFB=-0.0157816;REVB=0.00771879;RO=41;SAF=14;SAR=21;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03873;STB=0.529395;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0261294;OID=.;OPOS=91795203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:42:35:35:0.454545:21:14:18:23:21:14:19:23 chr15 91811749 . G A 524.64 PASS AF=0.469565;AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0292327;FXX=0.0944807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7939;QD=18.2482;RBI=0.0330667;REFB=-0.0149358;REVB=0.0154549;RO=55;SAF=22;SAR=32;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159272;STB=0.571402;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0229671;OID=.;OPOS=91811749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:115:55:61:54:54:0.469565:32:22:32:23:32:22:33:28 chr15 91825027 . C T 344.81 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00165471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.718;QD=21.8927;RBI=0.00380309;REFB=-0.00974669;REVB=0.00342424;RO=27;SAF=19;SAR=16;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164288;STB=0.59743;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00933271;OID=.;OPOS=91825027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:28:35:35:0.555556:16:19:9:18:16:19:9:19 chr15 91836627 . A G 564.21 PASS AF=0.504348;AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.0204424;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.14;QD=19.6245;RBI=0.023709;REFB=2.8504e-05;REVB=-0.0120094;RO=56;SAF=40;SAR=18;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18155;STB=0.605632;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-1.15438e-05;OID=.;OPOS=91836627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:56:57:58:58:0.504348:18:40:28:28:18:40:28:29 chr15 91836683 . T C 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00206338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.36;QD=60.2043;RBI=0.0455076;REFB=0;REVB=0.0454608;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.62558e-05;OID=.;OPOS=91836683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:29:44:0:0:29:44:0:0 chr15 92647645 . G C 668.8 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.444;QD=62.2138;RBI=0.0397213;REFB=0;REVB=-0.00467575;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.35505e-05;OID=.;OPOS=92647645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:26:17:0:0 chr15 93015427 . G A 292.79 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0161987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4975;QD=17.2232;RBI=0.0219664;REFB=0.0211268;REVB=-0.0148366;RO=36;SAF=19;SAR=13;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446304;STB=0.524985;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.0259878;OID=.;OPOS=93015427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:13:19:23:13:13:19:23:13 chr15 93198671 . A G 817.61 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0865548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2452;QD=57.3763;RBI=0.0877525;REFB=0;REVB=0.0144487;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000815609;OID=.;OPOS=93198671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:32:25:0:0:32:25:0:0 chr15 93198678 . TTGGAGCTGGA TTGGA,TTGGAGCTGCC 560.94 PASS AF=0.769231,0.230769;AO=23,9;DP=36;FAO=30,9;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13,5;FSAR=17,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129012,-0.0304376;FXX=0.0249938;HRUN=1,2;LEN=6,2;MLLD=239.879,97.2345;QD=57.5321;RBI=0.0333047,0.0332217;REFB=0,0;REVB=0.0307045,-0.0133129;RO=0;SAF=7,6;SAR=16,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00263234,0.0276109;OID=.,.;OPOS=93198679,93198687;OREF=TGGAGC,GA;OALT=-,CC;OMAPALT=TTGGA,TTGGAGCTGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.769231,0.230769:23,9:36:30,9:39:0:13,5:17,4:0:0:58:0:7,6:16,3:0:0 chr15 93447631 . T G 320.87 PASS AF=0.591837;AO=25;DP=45;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00605308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.362;QD=26.1935;RBI=0.00611932;REFB=-0.0156251;REVB=-0.000897942;RO=14;SAF=8;SAR=17;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259417;STB=0.50581;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.00958143;OID=.;OPOS=93447631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:14:20:25:29:0.591837:17:8:4:10:17:12:8:12 chr15 93510603 . A G 1119.46 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213334;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.362;QD=60.5116;RBI=0.0223723;REFB=0;REVB=0.00673834;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02778e-05;OID=.;OPOS=93510603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:44:29:0:0:44:30:0:0 chr15 93521604 . A G 1417.32 PASS AF=0.968421;AO=92;DP=96;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0158358;FXX=0.0104156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.747;QD=59.6768;RBI=0.0158405;REFB=-0.0813664;REVB=-0.00038855;RO=3;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031926;STB=0.51685;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.000177271;OID=.;OPOS=93521604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:96:95:3:3:92:92:0.968421:43:49:0:3:43:49:0:3 chr15 93570241 . T C 2678.8 PASS AF=1;AO=173;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000700045;FXX=0.0114279;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.066;QD=61.9376;RBI=0.0130348;REFB=-0.00779649;REVB=0.013016;RO=0;SAF=74;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70627e-07;OID=.;OPOS=93570241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:175:173:0:0:173:173:1:99:74:0:0:99:74:0:0 chr15 93588336 . A C 747.02 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00750717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.722;QD=63.576;RBI=0.0436759;REFB=0;REVB=0.0430259;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278548;OID=.;OPOS=93588336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0 chr15 93609460 . A T 1850.66 PASS AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00508799;FXX=0.0161277;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.465;QD=60.6774;RBI=0.056215;REFB=-0.0682238;REVB=-0.0559843;RO=1;SAF=73;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00646343;STB=0.503401;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.000195591;OID=.;OPOS=93609460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:122:1:1:121:121:0.991803:48:73:1:0:48:73:1:0 chr15 93616933 . C G 2297.41 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285261;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.016;QD=63.8171;RBI=0.0410081;REFB=0;REVB=0.0294606;RO=0;SAF=64;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02514e-06;OID=.;OPOS=93616933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:144:0:0:142:144:1:78:64:0:0:80:64:0:0 chr15 93616975 . A G 1166.75 PASS AF=1;AO=73;DP=79;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137364;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.463;QD=60.6106;RBI=0.0159045;REFB=0;REVB=0.0080164;RO=0;SAF=19;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.32309e-05;OID=.;OPOS=93616975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:77:0:0:73:77:1:54:19:0:0:54:23:0:0 chr15 93632123 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0043892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4892;QD=35.5757;RBI=0.0215387;REFB=0;REVB=-0.0210867;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000954249;OID=.;OPOS=93632123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr15 93750256 . G T 670.22 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.463;QD=62.3461;RBI=0.0249382;REFB=0;REVB=0.0237029;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012559;OID=.;OPOS=93750256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr15 94884108 . G C 663.68 PASS AF=0.471831;AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=142;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.000653068;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5312;QD=18.6951;RBI=0.00220739;REFB=-0.0100027;REVB=0.00210857;RO=74;SAF=28;SAR=39;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659293;STB=0.540384;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0128213;OID=.;OPOS=94884108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:74:75:67:67:0.471831:39:28:36:38:39:28:37:38 chr15 94945704 . A G 355.16 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0413298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.447;QD=18.9416;RBI=0.0467134;REFB=-0.0225109;REVB=0.0217713;RO=36;SAF=20;SAR=17;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134304;STB=0.507242;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.020631;OID=.;OPOS=94945704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:38:37:37:0.493333:17:20:20:16:17:20:20:18 chr15 94945719 . G T 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.50815e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.773;QD=60.7162;RBI=0.0214268;REFB=0;REVB=-0.0214268;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.03692e-05;OID=.;OPOS=94945719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0 chr15 94986217 . CA AC,C 68.03 PASS AF=0.192308,0.346154;AO=6,7;DP=26;FAO=5,9;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=4,4;FSAR=1,5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0425219,0.124982;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=19.6256,9.46159;QD=10.4661;RBI=0.0443872,0.150787;REFB=-0.104157,-0.129991;REVB=0.0127321,0.0843581;RO=13;SAF=4,4;SAR=2,3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.30002,0.194284;STB=0.77933,0.516093;STBP=0.162,0.934;TYPE=mnp,del;VARB=0.17255,0.119064;OID=.,.;OPOS=94986217,94986218;OREF=CA,A;OALT=AC,-;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:35:26:26:13:12:6,7:5,9:0.192308,0.346154:2,3:4,4:5:8:1,5:4,4:5:7 chr15 95019926 . C T 231.5 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0318477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.306;QD=12.3465;RBI=0.0426197;REFB=-0.00339668;REVB=-0.0283226;RO=47;SAF=15;SAR=13;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273894;STB=0.515748;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00687759;OID=.;OPOS=95019926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:13:15:24:23:13:15:24:23 chr15 98015489 . A G 209.08 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0245192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5695;QD=13.71;RBI=0.0261782;REFB=-0.0160092;REVB=0.009171;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823529;STB=0.53752;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.019911;OID=.;OPOS=98015489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:12:13:21:14:12:13:21:15 chr15 98301844 . GC G,GG,GT,TG 419.1 PASS AF=0,0.1,0.9,0;AO=8,3,15,2;DP=29;FAO=0,3,27,0;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,20,0;FSAR=0,0,7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00314229,-0.0105902,-0.00157614,-0.00407601;FXX=0.0908816;HRUN=1,1,1,1;LEN=1,1,1,2;MLLD=107.731,94.7122,114.477,97.0947;QD=55.8797;RBI=0.0237182,0.0387241,0.0937282,0.00747253;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0235092,0.0372479,0.093715,-0.00626297;RO=0;SAF=4,3,15,0;SAR=4,0,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,snp,snp,mnp;VARB=-0.018677,-0.0278173,0.0141828,0;OID=.,.,.,.;OPOS=98301845,98301845,98301845,98301844;OREF=C,C,C,GC;OALT=-,G,T,TG;OMAPALT=G,GG,GT,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:15:29:30:0:0:8,3,15,2:0,3,27,0:0,0.1,0.9,0:4,0,0,2:4,3,15,0:0:0:0,0,7,0:0,3,20,0:0:0 chr15 98504100 . G C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451191;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.564;QD=33.4285;RBI=0.0865836;REFB=0;REVB=0.0738985;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137054;OID=.;OPOS=98504100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr15 98513845 . T C 1155.57 PASS AF=0.987179;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.903;QD=59.2598;RBI=0.0297739;REFB=-0.0944736;REVB=0.0184613;RO=1;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150175;STB=0.507934;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000347769;OID=.;OPOS=98513845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:78:1:1:75:77:0.987179:31:44:0:1:31:46:0:1 chr15 98995081 . A G 1246.79 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.117;QD=61.5701;RBI=0.0586453;REFB=0;REVB=0.0291888;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184195;OID=.;OPOS=98995081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:37:43:0:0:38:43:0:0 chr15 99023968 . T G 796.45 PASS AF=1;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132609;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.45;QD=55.8912;RBI=0.0146326;REFB=-0.0419361;REVB=0.0061858;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200576;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190977;OID=.;OPOS=99023968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:58:57:1:0:56:57:1:33:23:1:0:33:24:0:0 chr15 99465473 . C T 1521.06 PASS AF=0.979798;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-1.1912e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.497;QD=61.457;RBI=0.0505133;REFB=-0.0997151;REVB=0.0505133;RO=2;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017559;STB=0.509257;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000467189;OID=.;OPOS=99465473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:99:99:2:2:97:97:0.979798:53:44:0:2:53:44:0:2 chr15 99478225 . G A 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00988401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.942;QD=61.2132;RBI=0.0298047;REFB=0;REVB=0.0281181;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85017e-05;OID=.;OPOS=99478225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:40:39:0:0:40:39:0:0 chr15 99501758 . A G 236.57 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00174243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.682;QD=15.7716;RBI=0.00691161;REFB=-0.00792217;REVB=-0.00668837;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956183;STB=0.554176;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0149567;OID=.;OPOS=99501758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:18:9:14:19:18:9:14:19 chr15 99503199 . GGT G 295.27 PASS AF=0.931034;AO=23;DP=25;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0520698;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=2;MLLD=172.037;QD=40.7274;RBI=0.103511;REFB=-0.046297;REVB=0.0894613;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.549962;STBP=0.073;TYPE=del;VARB=0.00370614;OID=.;OPOS=99503200;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.931034:23:25:27:29:2:18:9:0:2:6:0:17:6:0:0 chr15 99503277 . CCCAAA C,CC 112.54 PASS AF=0.0217391,0.391304;AO=6,11;DP=52;FAO=1,18;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=1,10;FSAR=0,8;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00726284,-0.00804319;FXX=0.115362;HRUN=5,5;LEN=5,4;MLLD=269.885,273.572;QD=9.78596;RBI=0.011322,0.0119768;REFB=0.00474432,0.00491364;REVB=0.00868549,0.0088741;RO=25;SAF=5,5;SAR=1,6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.368667,-0.119597;STB=0.988118,0.522588;STBP=0.492,0.852;TYPE=del,del;VARB=0.0659848,-0.00748774;OID=.,.;OPOS=99503278,99503279;OREF=CCAAA,CAAA;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0217391,0.391304:6,11:52:1,18:46:27:1,10:0,8:16:11:99:25:5,5:1,6:14:11 chr15 99504437 . C T 543.53 PASS AF=0.385542;AO=64;DP=166;FAO=64;FDP=166;FR=.;FRO=102;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=0.0171742;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.068;QD=13.0971;RBI=0.0175254;REFB=-0.000128517;REVB=0.00349087;RO=100;SAF=35;SAR=29;SRF=44;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115086;STB=0.57063;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000349423;OID=.;OPOS=99504437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:100:102:64:64:0.385542:29:35:44:56:29:35:44:58 chr15 99504671 . C T 266.71 PASS AF=0.355556;AO=31;DP=89;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0461778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1338;QD=11.8538;RBI=0.069694;REFB=-0.0166054;REVB=0.0522003;RO=58;SAF=15;SAR=16;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00125487;STB=0.509047;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0181641;OID=.;OPOS=99504671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:58:58:31:32:0.355556:16:15:28:30:17:15:28:30 chr15 99511793 . C G 283.42 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00798475;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.14;QD=14.7233;RBI=0.00820614;REFB=-0.00965253;REVB=-0.00189329;RO=43;SAF=10;SAR=22;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361959;STB=0.703874;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0172354;OID=.;OPOS=99511793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:45:32:32:0.415584:22:10:29:14:22:10:30:15 chr15 99511804 . A AC 185.91 PASS AF=0.43662;AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.0782451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.6187;QD=10.4738;RBI=0.0879498;REFB=-0.00945399;REVB=0.0401606;RO=41;SAF=10;SAR=20;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348894;STB=0.676647;STBP=0.011;TYPE=ins;VARB=0.017407;OID=.;OPOS=99511805;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.43662:30:71:31:71:40:11:20:27:13:99:41:10:20:28:13 chr15 99653800 . T C 1359.65 PASS AF=1;AO=85;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2492;QD=62.5126;RBI=0.22214;REFB=0;REVB=0.221684;RO=2;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205873;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132256;OID=.;OPOS=99653800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:2:0:85:87:1:45:40:0:2:47:40:0:0 chr15 99669628 . A T 211.88 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00629519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.333;QD=16.6181;RBI=0.00998251;REFB=-0.0101209;REVB=-0.00774733;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978278;STB=0.555507;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0173869;OID=.;OPOS=99669628;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:13:10:15:13:13:10:15:13 chr15 99670161 . C T 333.12 PASS AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00154095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.325;QD=16.4505;RBI=0.0170106;REFB=-0.0200697;REVB=-0.0169406;RO=45;SAF=17;SAR=19;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275821;STB=0.515498;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0267626;OID=.;OPOS=99670161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:19:17:20:25:19:17:20:25 chr15 99670278 . C T 277.42 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0224705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.168;QD=18.4947;RBI=0.0389948;REFB=-0.0325487;REVB=0.0318695;RO=30;SAF=9;SAR=21;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101311;STB=0.556779;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0172697;OID=.;OPOS=99670278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:21:9:12:18:21:9:12:18 chr15 99670989 . T C 539.15 PASS AF=1;AO=33;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.842;QD=59.9053;RBI=0.0590318;REFB=0;REVB=0.0368228;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000801667;OID=.;OPOS=99670989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:33:36:1:14:19:0:0:13:23:0:0 chr15 99671760 . T C 1636.49 PASS AF=0.991071;AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00220267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.19;QD=58.4462;RBI=0.0414923;REFB=-0.0658539;REVB=-0.0414338;RO=2;SAF=61;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189795;STB=0.50495;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00049174;OID=.;OPOS=99671760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:112:112:2:1:110:111:0.991071:49:61:0:2:50:61:0:1 chr15 99672722 . A G 750.68 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.363;QD=56.6553;RBI=0.0910432;REFB=0;REVB=0.0901321;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169259;OID=.;OPOS=99672722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:25:28:0:0 chr15 99677707 . G A 115.04 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0229015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.885;QD=19.1734;RBI=0.0394107;REFB=0.00203725;REVB=0.0320737;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201895;STB=0.615207;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.000395902;OID=.;OPOS=99677707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:7:4:8:5:7:4 chr15 99715352 . A G 1216.91 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0222781;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.393;QD=60.0943;RBI=0.0235086;REFB=-0.0608399;REVB=-0.00750594;RO=1;SAF=20;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230796;STB=0.512192;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00231374;OID=.;OPOS=99715352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:60:20:1:0:60:20:1:0 chr15 100230790 . A G 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0830891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.27;QD=9.19975;RBI=0.0845782;REFB=-0.00625848;REVB=-0.0158009;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194284;STB=0.619384;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0177196;OID=.;OPOS=100230790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:5:8:3:4:5:8 chr15 100246936 . T C 210.76 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0163763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.405;QD=14.0506;RBI=0.0187913;REFB=-0.0122738;REVB=-0.00921572;RO=35;SAF=9;SAR=16;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217964;STB=0.624395;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0117926;OID=.;OPOS=100246936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:16:9:20:15:16:9:20:15 chr15 100246942 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.007806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.463;QD=58.2396;RBI=0.00914116;REFB=0;REVB=-0.00475681;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92339e-06;OID=.;OPOS=100246942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0 chr15 100252805 . G T 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0510321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.607;QD=10.0754;RBI=0.0535974;REFB=0.00554689;REVB=0.0163832;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410879;STB=0.74415;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.00325319;OID=.;OPOS=100252805;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:11:3:5:3:11:3 chr15 100256618 . A C 322.26 PASS AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0303249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.715;QD=28.0227;RBI=0.047835;REFB=-0.0451266;REVB=-0.0369945;RO=18;SAF=16;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168008;STB=0.592527;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0177448;OID=.;OPOS=100256618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:12:16:6:12:12:16:6:12 chr15 100257173 . T C 386.56 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.0113985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.586;QD=18.1913;RBI=0.0217102;REFB=-0.0174305;REVB=0.0184772;RO=45;SAF=16;SAR=24;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669623;STB=0.537295;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0175464;OID=.;OPOS=100257173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:24:16:15:30:24:16:15:30 chr15 100257713 . T C,TCAGATTGGGGCTAAAACAC,TCAGATTGGGGCTTAAAACAC 117.36 PASS AF=0.0816327,0.122449,0.122449;AO=3,6,6;DP=48;FAO=4,6,6;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=4,6,1;FSAR=0,0,5;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.050387,0.00183047,0.00266918;FXX=0;HRUN=3,1,1;LEN=1,19,20;MLLD=52.514,548.934,560.102;QD=9.58043;RBI=0.06556,0.00594568,0.00659175;REFB=-0.021472,-0.00483346,-0.00419516;REVB=-0.0419436,0.0056569,0.00602716;RO=33;SAF=3,6,1;SAR=0,0,5;SRF=19;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.503221,0.646194,-0.479477;STB=0.996906,0.997869,0.839223;STBP=0.053,0.018,0.1;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0.0489269,0.0216104,0.00878778;OID=.,.,.;OPOS=100257713,100257714,100257714;OREF=T,-,-;OALT=C,CAGATTGGGGCTAAAACAC,CAGATTGGGGCTTAAAACAC;OMAPALT=C,TCAGATTGGGGCTAAAACAC,TCAGATTGGGGCTTAAAACAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:39:48:49:33:33:3,6,6:4,6,6:0.0816327,0.122449,0.122449:0,0,5:3,6,1:19:14:0,0,5:4,6,1:19:14 chr15 100257796 . C CCAGCTGTTG 196.53 PASS AF=0.428571;AO=22;DP=58;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00238495;FXX=0.0344768;HRUN=3;LEN=9;MLLD=345.228;QD=14.0382;RBI=0.0258463;REFB=-0.00730248;REVB=-0.025736;RO=33;SAF=18;SAR=4;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287571;STB=0.642726;STBP=0.082;TYPE=ins;VARB=0.00854373;OID=.;OPOS=100257797;OREF=-;OALT=CAGCTGTTG;OMAPALT=CCAGCTGTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:22:58:24:56:32:19:5:19:13:99:33:18:4:20:13 chr15 100269635 . G C 565.72 PASS AF=0.54902;AO=55;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00342317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.306;QD=22.1852;RBI=0.0448818;REFB=-0.0144902;REVB=0.044751;RO=44;SAF=24;SAR=31;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00374736;STB=0.504598;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0109198;OID=.;OPOS=100269635;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:44:46:55:56:0.54902:31:24:19:25:31:25:21:25 chr15 100269680 . G C 250.82 PASS AF=0.365854;AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.0049827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.331;QD=12.2349;RBI=0.0268587;REFB=-0.0134466;REVB=-0.0263924;RO=52;SAF=13;SAR=17;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177999;STB=0.602187;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0297759;OID=.;OPOS=100269680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:52:52:30:30:0.365854:17:13:31:21:17:13:31:21 chr15 100269737 . G A 411.53 PASS AF=0.716981;AO=37;DP=53;FAO=38;FDP=53;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.016758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5168;QD=31.0591;RBI=0.0167613;REFB=-0.0506451;REVB=0.000334189;RO=16;SAF=21;SAR=16;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00286664;STB=0.513588;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0149462;OID=.;OPOS=100269737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:16:15:37:38:0.716981:16:21:9:7:17:21:9:6 chr15 100269749 . G A 376.71 PASS AF=0.660377;AO=28;DP=53;FAO=35;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0421701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2343;QD=28.431;RBI=0.0422356;REFB=-0.0432672;REVB=-0.00234996;RO=12;SAF=11;SAR=17;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106728;STB=0.504852;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0283106;OID=.;OPOS=100269749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:12:18:28:35:0.660377:17:11:7:5:17:18:9:9 chr15 100269796 . A G 785.86 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00262851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.787;QD=64.152;RBI=0.00578202;REFB=0;REVB=0.00515002;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25381e-05;OID=.;OPOS=100269796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr15 100272052 . CCG CCC,CC,C 96.15 PASS AF=0,0.527778,0;AO=6,8,5;DP=37;FAO=0,19,0;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=0,7,0;FSAR=0,12,0;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.178045,0.0688222,-0.097822;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,2;MLLD=14.5364,12.5485,20.1309;QD=10.6828;RBI=0.193751,0.124272,0.205347;REFB=-0.122544,-0.107892,0.00693309;REVB=0.076417,-0.103475,-0.18055;RO=18;SAF=1,2,3;SAR=5,6,2;SRF=4;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.102181,0.0425351,0.426911;STB=0.5,0.602551,0.5;STBP=1,0.267,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0.128495,0;OID=.,.,.;OPOS=100272054,100272054,100272053;OREF=G,G,CG;OALT=C,-,-;OMAPALT=CCC,CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.527778,0:6,8,5:37:0,19,0:36:17:0,7,0:0,12,0:3:14:93:18:1,2,3:5,6,2:4:14 chr15 100332799 . A C 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.00418746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.295;QD=15.1966;RBI=0.0173945;REFB=-0.0150062;REVB=0.0168829;RO=26;SAF=12;SAR=6;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124752;STB=0.571354;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0241532;OID=.;OPOS=100332799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:6:12:20:6:6:12:20:6 chr15 100332807 . C T 211.94 PASS AF=0.45098;AO=24;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=-0.0094123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.457;QD=16.6224;RBI=0.0926573;REFB=-0.0459198;REVB=-0.092178;RO=27;SAF=17;SAR=7;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822114;STB=0.507788;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0387693;OID=.;OPOS=100332807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:28:24:23:0.45098:7:17:21:6:6:17:21:7 chr15 100332919 . T C 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.000727666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.448;QD=7.76229;RBI=0.0239805;REFB=-0.0169055;REVB=-0.0239695;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210359;STB=0.631171;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0673675;OID=.;OPOS=100332919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:4:9:3:3:4:9 chr15 100339897 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.935;QD=62.6711;RBI=0.05733;REFB=0;REVB=0.0303311;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238332;OID=.;OPOS=100339897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr15 100339938 . C T 429.0 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.06811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.335;QD=57.2006;RBI=0.0681101;REFB=0;REVB=-7.72441e-05;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000884063;OID=.;OPOS=100339938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr15 100339960 . G A 88.06 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0484439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1056;QD=14.0902;RBI=0.0517522;REFB=-0.0462813;REVB=0.0182063;RO=13;SAF=2;SAR=9;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496073;STB=0.778985;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0411315;OID=.;OPOS=100339960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:13:14:11:11:0.44:9:2:9:4:9:2:9:5 chr15 100339996 . C T 33.49 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0149508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.197;QD=19.1367;RBI=0.0238638;REFB=-0.0366667;REVB=-0.0185999;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413629;STB=0.748924;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00322427;OID=.;OPOS=100339996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:2:0:4:1:2:0 chr15 100636586 . G A 229.83 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0235508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0095;QD=15.3219;RBI=0.0262049;REFB=-0.0187539;REVB=0.0114916;RO=33;SAF=18;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125926;STB=0.571374;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0215152;OID=.;OPOS=100636586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:9:18:18:15:9:18:18:15 chr15 100649248 . G A 355.04 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0350959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.961;QD=16.3235;RBI=0.0370031;REFB=-0.00169745;REVB=0.0117265;RO=49;SAF=21;SAR=17;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1839;STB=0.603178;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0014178;OID=.;OPOS=100649248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:49:38:38:0.436782:17:21:18:31:17:21:18:31 chr15 100672237 . T G 562.87 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137087;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.023;QD=60.8506;RBI=0.029452;REFB=0;REVB=0.0260671;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328054;OID=.;OPOS=100672237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr15 100794363 . C T 621.9 PASS AF=0.921569;AO=47;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0496746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5658;QD=48.7762;RBI=0.0502216;REFB=-0.0463103;REVB=0.007392;RO=4;SAF=20;SAR=27;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484242;STB=0.525815;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0208448;OID=.;OPOS=100794363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:51:51:4:4:47:47:0.921569:27:20:3:1:27:20:3:1 chr15 100801698 . G A 494.92 PASS AF=0.54023;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00228241;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.528;QD=22.7551;RBI=0.00364845;REFB=-0.0105896;REVB=0.00284636;RO=40;SAF=24;SAR=23;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538521;STB=0.52963;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00962149;OID=.;OPOS=100801698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:40:40:47:47:0.54023:23:24:23:17:23:24:23:17 chr15 100821467 . G A 665.15 PASS AF=0.387435;AO=74;DP=186;FAO=74;FDP=191;FR=.;FRO=117;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=-0.0402606;FXX=0.0205118;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.187;QD=13.9297;RBI=0.0465058;REFB=-0.0352857;REVB=0.0232781;RO=106;SAF=35;SAR=39;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00858785;STB=0.534841;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0556656;OID=.;OPOS=100821467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:191:106:117:74:74:0.387435:39:35:51:55:39:35:62:55 chr15 100821576 . G A 366.25 PASS AF=0.493506;AO=36;DP=76;FAO=38;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.000254436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.608;QD=19.0258;RBI=0.117696;REFB=-0.0244107;REVB=0.117696;RO=28;SAF=21;SAR=15;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12335;STB=0.634831;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0204465;OID=.;OPOS=100821576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:28:39:36:38:0.493506:15:21:12:16:16:22:12:27 chr15 100942962 . T C 592.88 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.436;QD=60.8083;RBI=0.061279;REFB=0;REVB=0.0145818;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231204;OID=.;OPOS=100942962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:18:18:0:0:19:20:0:0 chr15 101041896 . T C 1045.9 PASS AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00158241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.457;QD=58.1055;RBI=0.0455059;REFB=0.00118562;REVB=0.0454784;RO=1;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106256;STB=0.505493;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000213213;OID=.;OPOS=101041896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:72:1:1:70:71:0.986111:44:26:0:1:45:26:0:1 chr15 101109818 . G A 146.38 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0141428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.803;QD=16.7292;RBI=0.0205483;REFB=-0.0162982;REVB=-0.0149068;RO=19;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287212;STB=0.664136;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0199193;OID=.;OPOS=101109818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:10:6:13:6:10:6:13:6 chr15 101113862 . C T 540.77 PASS AF=0.433824;AO=58;DP=135;FAO=59;FDP=136;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.0164522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.339;QD=15.905;RBI=0.0164711;REFB=-0.0112843;REVB=-0.000789011;RO=75;SAF=30;SAR=28;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106729;STB=0.508472;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0133595;OID=.;OPOS=101113862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:75:77:58:59:0.433824:28:30:38:37:29:30:38:39 chr15 101114357 . C A 238.21 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00584428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.091;QD=20.2732;RBI=0.0236621;REFB=-0.0047469;REVB=-0.0229291;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057389;STB=0.532319;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00526524;OID=.;OPOS=101114357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:11:12:11:13:11:12:11:13 chr15 101324497 . A T 143.57 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0123715;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4371;QD=22.0876;RBI=0.0148009;REFB=-0.00148617;REVB=0.00812484;RO=10;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627389;STB=0.547884;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0016514;OID=.;OPOS=101324497;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:27:26:10:11:15:15:0.576923:4:11:8:2:4:11:9:2 chr15 101421673 . G A 250.23 PASS AF=0.519231;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00780655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.048;QD=19.2487;RBI=0.00982694;REFB=-0.0132159;REVB=-0.0059688;RO=25;SAF=7;SAR=19;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134572;STB=0.55696;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0221814;OID=.;OPOS=101421673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:26:27:0.519231:19:7:10:15:19:8:10:15 chr15 101445766 . C A 117.22 PASS AF=0.290909;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.000316636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.028;QD=8.52492;RBI=0.050575;REFB=-0.0110592;REVB=-0.050574;RO=39;SAF=9;SAR=7;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00191467;STB=0.501153;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.027544;OID=.;OPOS=101445766;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:39:39:16:16:0.290909:7:9:22:17:7:9:22:17 chr15 101464915 . T C 621.81 PASS AF=0.416667;AO=70;DP=168;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=51;FWDB=-0.00127405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3848;QD=14.805;RBI=0.0373065;REFB=-0.0107857;REVB=0.0372847;RO=98;SAF=35;SAR=35;SRF=47;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212452;STB=0.511901;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0161742;OID=.;OPOS=101464915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:98:98:70:70:0.416667:35:35:47:51:35:35:47:51 chr15 101562793 . G A 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000518972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.755;QD=60.6096;RBI=0.0115705;REFB=0;REVB=-0.0115589;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.37806e-05;OID=.;OPOS=101562793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr15 101591923 . A G 1298.07 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.224;QD=61.813;RBI=0.0207349;REFB=0;REVB=0.017434;RO=0;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66464e-06;OID=.;OPOS=101591923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:35:48:0:0:35:49:0:0 chr15 101606145 . C T 368.93 PASS AF=0.610169;AO=33;DP=56;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0984785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.597;QD=25.0123;RBI=0.0986017;REFB=-0.0279981;REVB=0.00492858;RO=23;SAF=19;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734704;STB=0.553162;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0353592;OID=.;OPOS=101606145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:59:23:23:33:36:0.610169:14:19:11:12:14:22:11:12 chr15 101606848 . C T 444.43 PASS AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0159759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.187;QD=23.0873;RBI=0.0172633;REFB=-0.0265291;REVB=-0.00654148;RO=33;SAF=27;SAR=16;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435098;STB=0.532089;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0260443;OID=.;OPOS=101606848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:34:43:43:0.558442:16:27:19:14:16:27:19:15 chr15 101606889 . GC AA 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210411;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=340.103;QD=62.0083;RBI=0.0325352;REFB=0;REVB=0.0248156;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.86342e-05;OID=.;OPOS=101606889;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:40:44:0:0:40:44:0:0 chr15 101607513 . T C 729.55 PASS AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0135309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.665;QD=53.0583;RBI=0.0480987;REFB=-0.0660797;REVB=0.0461563;RO=2;SAF=18;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121857;STB=0.50704;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00116528;OID=.;OPOS=101607513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:55:55:2:1:53:54:0.981818:35:18:1:1:35:19:0:1 chr15 101717680 . G T 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018235;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.098;QD=58.9627;RBI=0.0310261;REFB=0;REVB=0.0251018;RO=0;SAF=46;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.04606e-05;OID=.;OPOS=101717680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:20:46:0:0:20:46:0:0 chr15 101718106 . G A 85.26 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0737586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9654;QD=11.368;RBI=0.0740708;REFB=-0.00515624;REVB=-0.00679301;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933329;STB=0.555457;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0055041;OID=.;OPOS=101718106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:12:7:5:6:12:7 chr15 101718190 . C T 128.27 PASS AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.013301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.836;QD=12.2165;RBI=0.0134294;REFB=-0.0214265;REVB=-0.00185251;RO=26;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00555343;STB=0.514358;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.024953;OID=.;OPOS=101718190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:27:15:15:0.357143:7:8:14:12:7:8:15:12 chr15 101718529 . T C 647.49 PASS AF=0.572727;AO=61;DP=109;FAO=63;FDP=110;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0120648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5693;QD=23.5449;RBI=0.0153666;REFB=-0.0132849;REVB=-0.00951702;RO=47;SAF=21;SAR=40;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156205;STB=0.581621;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00873491;OID=.;OPOS=101718529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:47:47:61:63:0.572727:40:21:25:22:41:22:25:22 chr15 101718927 . G A 163.62 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.000168932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.467;QD=20.453;RBI=0.00130997;REFB=-0.0049527;REVB=-0.00129903;RO=15;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266006;STB=0.650978;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00416216;OID=.;OPOS=101718927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:12:5:9:6:12:5:9:6 chr15 101718950 . T C 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00575168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.319;QD=16.0638;RBI=0.0239559;REFB=-0.0115348;REVB=0.0232552;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199529;STB=0.612949;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0134339;OID=.;OPOS=101718950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:9:17:14:17:9:17:14:17 chr15 101910550 . G A 760.43 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.337;QD=56.328;RBI=0.0350937;REFB=0;REVB=-0.0257515;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50503e-05;OID=.;OPOS=101910550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:54:0:0:51:54:1:17:34:0:0:18:36:0:0 chr15 102192540 . T G 59.4 PASS AF=0.533333;AO=6;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0206472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6438;QD=15.8387;RBI=0.0221131;REFB=-0.0564717;REVB=-0.00791726;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526249;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0105544;OID=.;OPOS=102192540;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:6:7:6:8:0.533333:3:3:3:3:3:5:4:3 chr15 102192548 . A C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.289;QD=46.8479;RBI=0.0703691;REFB=0;REVB=0.0144676;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062656;OID=.;OPOS=102192548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr15 102196186 . C T 467.19 PASS AF=0.651515;AO=43;DP=66;FAO=43;FDP=66;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00688517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.923;QD=28.3148;RBI=0.0112154;REFB=-0.00976808;REVB=0.00885323;RO=23;SAF=17;SAR=26;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110781;STB=0.560316;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0041196;OID=.;OPOS=102196186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:23:23:43:43:0.651515:26:17:13:10:26:17:13:10 chr15 102223771 . G A 343.07 PASS AF=0.430233;AO=36;DP=87;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0282658;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.22;QD=15.9566;RBI=0.0283956;REFB=-0.00933196;REVB=0.00271161;RO=48;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133133;STB=0.586354;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0137904;OID=.;OPOS=102223771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:48:49:36:37:0.430233:17:19:19:29:17:20:19:30 chr15 102224341 . G A 606.03 PASS AF=0.525862;AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.0313644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.104;QD=20.8974;RBI=0.0315179;REFB=-0.0195877;REVB=0.00310594;RO=55;SAF=24;SAR=37;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105284;STB=0.505786;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0156595;OID=.;OPOS=102224341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:55:55:61:61:0.525862:37:24:21:34:37:24:21:34 chr15 102284675 . A G 257.35 PASS AF=0.248322;AO=37;DP=148;FAO=37;FDP=149;FR=.;FRO=112;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=57;FSRR=55;FWDB=-0.0123796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.791;QD=6.90861;RBI=0.0225125;REFB=-0.010482;REVB=-0.0188031;RO=111;SAF=20;SAR=17;SRF=56;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449871;STB=0.523814;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0340252;OID=.;OPOS=102284675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:111:112:37:37:0.248322:17:20:56:55:17:20:57:55 chr15 102346343 . T G 237.85 PASS AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0495317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.009;QD=18.6551;RBI=0.0505799;REFB=-0.0068644;REVB=0.0102442;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778135;STB=0.530781;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0066982;OID=.;OPOS=102346343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:14:10:13:13:14:11:13:13 chr16 103517 . A C 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.717;QD=57.5449;RBI=0.0378165;REFB=0;REVB=-0.0373628;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.17301e-05;OID=.;OPOS=103517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0 chr16 113883 . G GCC 330.54 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0436806;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=2;MLLD=46.0244;QD=47.2197;RBI=0.0621419;REFB=0;REVB=0.0441997;RO=1;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054642;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.18331e-06;OID=.;OPOS=113884;OREF=-;OALT=CC;OMAPALT=GCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:28:29:28:28:0:20:8:0:0:6:1:20:8:0:1 chr16 113886 . GC G 317.53 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701515;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=24.8887;QD=45.361;RBI=0.0702069;REFB=0;REVB=0.00278655;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00335705;OID=.;OPOS=113887;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:27:28:28:28:0:21:7:0:0:6:0:21:6:0:0 chr16 129266 . G GT,T 262.63 PASS AF=0.444444,0.0138889;AO=26,5;DP=73;FAO=32,1;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=18,1;FSAR=14,0;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.106478,0.00392702;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=21.6878,286.263;QD=14.5905;RBI=0.120449,0.00404813;REFB=0.00994311,0.00280993;REVB=-0.0563049,-0.000982815;RO=39;SAF=16,1;SAR=10,4;SRF=27;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0875026,-0.519228;STB=0.558948,0.986832;STBP=0.402,0.491;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0206569,0.0398966;OID=.,.;OPOS=129267,129266;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:39:39:26,5:32,1:0.444444,0.0138889:10,4:16,1:27:12:14,0:18,1:26:13 chr16 129277 . A G 300.26 PASS AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00447322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.634;QD=16.4527;RBI=0.0185405;REFB=-0.00720179;REVB=-0.0179928;RO=40;SAF=19;SAR=14;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100975;STB=0.556579;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00855596;OID=.;OPOS=129277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:14:19:27:13:14:19:27:13 chr16 129654 . C T 46.04 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00176046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.343;QD=11.5107;RBI=0.00574539;REFB=-0.00715886;REVB=-0.00546903;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404365;STB=0.730929;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0103401;OID=.;OPOS=129654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:16:16:8:9:7:7:0.4375:6:1:4:4:6:1:4:5 chr16 180529 . G A 82.06 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00827551;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.52;QD=18.2352;RBI=0.00973296;REFB=-0.0154505;REVB=0.00512313;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260141;STB=0.65085;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00650842;OID=.;OPOS=180529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:3:5:3:7:3:5 chr16 315839 . G A 379.8 PASS AF=0.606557;AO=37;DP=60;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0165216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3055;QD=24.9049;RBI=0.0472648;REFB=-0.0401097;REVB=0.0442831;RO=23;SAF=8;SAR=29;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261538;STB=0.655451;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0196993;OID=.;OPOS=315839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:23:24:37:37:0.606557:29:8:12:11:29:8:13:11 chr16 324052 . A G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.000673775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.226;QD=15.2589;RBI=0.0129268;REFB=-0.0142429;REVB=-0.0129093;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364235;STB=0.521675;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.012162;OID=.;OPOS=324052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:1:6:5:1:1:6:5:1 chr16 336660 . G A 100.75 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00741901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.435;QD=16.1191;RBI=0.0233453;REFB=-0.015928;REVB=-0.0221351;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410576;STB=0.52377;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.015807;OID=.;OPOS=336660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:5:7:7:6:5:7:7:6 chr16 419092 . A G 175.61 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0130846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.302;QD=13.7736;RBI=0.0231599;REFB=0.00358535;REVB=-0.0191095;RO=31;SAF=13;SAR=7;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179536;STB=0.603934;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.00657603;OID=.;OPOS=419092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:7:13:15:16:7:13:15:16 chr16 449345 . G C 274.54 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0871949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5819;QD=19.9664;RBI=0.0877312;REFB=-0.0164511;REVB=-0.00968623;RO=26;SAF=10;SAR=19;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263658;STB=0.646809;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0154588;OID=.;OPOS=449345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:19:10:17:9:19:10:17:9 chr16 449659 . G A 62.67 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0361455;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5401;QD=17.9044;RBI=0.0410184;REFB=-0.0237744;REVB=-0.0193911;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446316;STB=0.519183;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0198782;OID=.;OPOS=449659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:15:14:7:6:8:8:0.571429:3:5:4:3:3:5:4:2 chr16 450165 . T C 44.53 PASS AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0353217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6343;QD=7.12531;RBI=0.040858;REFB=0.00178753;REVB=-0.0205366;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633268;STB=0.540421;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.0140422;OID=.;OPOS=450165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:2:5:12:6:2:5:12:6 chr16 450309 . C T 31.42 PASS AF=0.384615;AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0233824;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.198;QD=9.66726;RBI=0.025448;REFB=-0.0167615;REVB=0.0100432;RO=8;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430337;STB=0.77305;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0610859;OID=.;OPOS=450309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:13:13:8:8:5:5:0.384615:1:4:3:5:1:4:3:5 chr16 456416 . T G 154.71 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0147842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.818;QD=14.7342;RBI=0.0392237;REFB=0.000377476;REVB=0.0363308;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212681;STB=0.576838;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.000199372;OID=.;OPOS=456416;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:25:17:17:0.404762:6:11:19:4:6:11:19:6 chr16 547297 . T C 220.41 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.000380058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.373;QD=24.4904;RBI=0.0192406;REFB=-0.00265362;REVB=-0.0192369;RO=15;SAF=14;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547944;STB=0.530583;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00212221;OID=.;OPOS=547297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:7:14:9:6:7:14:9:6 chr16 570557 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.926;QD=52.6132;RBI=0.0395853;REFB=0;REVB=0.0127529;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020726;OID=.;OPOS=570557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr16 601632 . T C 445.81 PASS AF=0.398438;AO=51;DP=128;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=48;FSRR=29;FWDB=-0.0142358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.375;QD=13.9315;RBI=0.0326686;REFB=-0.0078607;REVB=-0.0294037;RO=74;SAF=30;SAR=21;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216463;STB=0.52198;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0134895;OID=.;OPOS=601632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:74:77:51:51:0.398438:21:30:45:29:21:30:48:29 chr16 602313 . C A 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.875;QD=54.5166;RBI=0.0260236;REFB=0;REVB=0.0228146;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442144;OID=.;OPOS=602313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr16 602672 . C T 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0138341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.312;QD=13.4417;RBI=0.022094;REFB=-0.00997658;REVB=-0.0172269;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917417;STB=0.554343;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0167088;OID=.;OPOS=602672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:8:5:3:7:8:5 chr16 679814 . T C 2314.15 PASS AF=0.987342;AO=151;DP=156;FAO=156;FDP=158;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.014177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5355;QD=58.586;RBI=0.0147802;REFB=-0.0442242;REVB=0.00417919;RO=4;SAF=53;SAR=98;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0080014;STB=0.504999;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0111748;OID=.;OPOS=679814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:156:158:4:2:151:156:0.987342:98:53:2:2:99:57:0:2 chr16 700644 . G C 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.39;QD=60.3766;RBI=0.0270848;REFB=0;REVB=0.0141155;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87477e-05;OID=.;OPOS=700644;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:42:32:0:0:42:32:0:0 chr16 705360 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.875;QD=35.5759;RBI=0.0189355;REFB=0;REVB=-0.00778031;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367829;OID=.;OPOS=705360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr16 705795 . C T 369.23 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.042;QD=52.7466;RBI=0.0659523;REFB=-0.124571;REVB=0.0132857;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545937;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00203216;OID=.;OPOS=705795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:28:28:1:0:27:28:1:19:8:1:0:19:9:0:0 chr16 705844 . T C 347.61 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0458808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5597;QD=51.4974;RBI=0.0496743;REFB=-0.00827846;REVB=-0.019039;RO=1;SAF=3;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131699;STB=0.571368;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00296731;OID=.;OPOS=705844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:23:3:1:0:23:3:1:0 chr16 709001 . C A 456.77 PASS AF=0.969697;AO=28;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.106644;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.266;QD=55.3665;RBI=0.107566;REFB=-0.194909;REVB=0.0140526;RO=1;SAF=15;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300185;STB=0.512812;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00307893;OID=.;OPOS=709001;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:33:33:1:1:28:32:0.969697:13:15:1:0:13:19:1:0 chr16 709152 . G A 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.786;QD=55.6552;RBI=0.106166;REFB=0;REVB=0.0266928;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391223;OID=.;OPOS=709152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0 chr16 711712 . C T 1779.57 PASS AF=1;AO=118;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.174;QD=58.8289;RBI=0.162934;REFB=-0.11833;REVB=0.114184;RO=3;SAF=69;SAR=49;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281883;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179344;OID=.;OPOS=711712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:121:3:0:118:121:1:49:69:0:3:52:69:0:0 chr16 711905 . A G 804.15 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.594;QD=64.3318;RBI=0.0534067;REFB=0;REVB=-0.0470948;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.50231e-05;OID=.;OPOS=711905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:22:27:0:0:22:28:0:0 chr16 712867 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.63;QD=58.5877;RBI=0.0567276;REFB=0;REVB=0.0428985;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196165;OID=.;OPOS=712867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0 chr16 715990 . G A,C 650.92 PASS AF=0.930233,0.0697674;AO=40,3;DP=43;FAO=40,3;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15,3;FSAR=25,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0826906,0.00758191;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=50.2794,204.533;QD=60.5508;RBI=0.139514,0.00970439;REFB=0,0;REVB=0.112367,-0.00605721;RO=0;SAF=15,3;SAR=25,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00217484,0.164622;OID=.,.;OPOS=715990,715990;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:43:43:0:0:40,3:40,3:0.930233,0.0697674:25,0:15,3:0:0:25,0:15,3:0:0 chr16 716273 . T C 702.75 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.802;QD=62.4667;RBI=0.0166066;REFB=0;REVB=0.002776;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1459e-05;OID=.;OPOS=716273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:45:0:0:42:45:1:13:29:0:0:13:32:0:0 chr16 716287 . C A 689.28 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.517;QD=62.6615;RBI=0.0219814;REFB=0;REVB=0.0096465;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.87985e-05;OID=.;OPOS=716287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0 chr16 717523 . G T 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.095;QD=58.6001;RBI=0.0443775;REFB=0;REVB=0.0300327;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.09624e-05;OID=.;OPOS=717523;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr16 717544 . G C 877.9 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0822706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9211;QD=57.5674;RBI=0.0823566;REFB=0;REVB=-0.00376242;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00077187;OID=.;OPOS=717544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:37:23:0:0:38:23:0:0 chr16 718514 . C G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.137;QD=51.1843;RBI=0.0742676;REFB=0;REVB=0.0721876;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000462626;OID=.;OPOS=718514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr16 719592 . G A 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.337;QD=61.0482;RBI=0.0275614;REFB=0;REVB=0.0265132;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45518e-05;OID=.;OPOS=719592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:41:37:0:0:41:37:0:0 chr16 720152 . T C 338.58 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152764;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.894;QD=54.1726;RBI=0.0397678;REFB=0;REVB=0.0367166;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316641;OID=.;OPOS=720152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:13:11:0:0:13:12:0:0 chr16 720960 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.347;QD=51.9167;RBI=0.0565015;REFB=0;REVB=0.0119869;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365965;OID=.;OPOS=720960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr16 722331 . C G,T 402.25 PASS AF=0.0689655,0.931034;AO=2,27;DP=29;FAO=2,27;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=2,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282313,0.0406293;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.4598,172.507;QD=55.4824;RBI=0.0548368,0.0408307;REFB=0,0;REVB=-0.0470113,0.00405097;RO=0;SAF=0,16;SAR=2,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.5146e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.119769,0.000846539;OID=.,.;OPOS=722331,722331;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:29:29:0:0:2,27:2,27:0.0689655,0.931034:2,11:0,16:0:0:2,11:0,16:0:0 chr16 722548 . A G 238.84 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.378;QD=50.2813;RBI=0.0663071;REFB=0;REVB=0.0207545;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000698086;OID=.;OPOS=722548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:12:7:0:0 chr16 772061 . C T 1147.67 PASS AF=0.880435;AO=81;DP=93;FAO=81;FDP=92;FR=.;FRO=11;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0147884;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.163;QD=49.8986;RBI=0.014829;REFB=0.0421197;REVB=0.00109688;RO=10;SAF=46;SAR=35;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560616;STB=0.524709;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00195536;OID=.;OPOS=772061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:93:92:10:11:81:81:0.880435:35:46:3:7:35:46:4:7 chr16 772062 . G T 42.5 PASS AF=0.106383;AO=10;DP=94;FAO=10;FDP=94;FR=.;FRO=84;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.000756448;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.9604;QD=1.80842;RBI=0.029353;REFB=0.00333528;REVB=0.0293433;RO=84;SAF=3;SAR=7;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302798;STB=0.725702;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00294942;OID=.;OPOS=772062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:94:94:84:84:10:10:0.106383:7:3:47:37:7:3:47:37 chr16 772141 . G C 1123.75 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.972;QD=59.9333;RBI=0.0217221;REFB=0;REVB=0.00376843;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174765;OID=.;OPOS=772141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:39:35:0:0:39:36:0:0 chr16 773291 . GCC GC,G 94.32 PASS AF=1,0;AO=12,2;DP=18;FAO=17,0;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.238753,0.128733;FXX=0.0555247;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=6.86647,8.14538;QD=22.1919;RBI=0.238791,0.128738;REFB=-0.0380465,-0.0571728;REVB=-0.00425929,0.0010548;RO=3;SAF=4,0;SAR=8,2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.127365,-0.666583;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0195024,0.0174066;OID=.,.;OPOS=773292,773292;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1,0:12,2:18:17,0:17:0:6,0:11,0:0:0:3:3:4,0:8,2:2:1 chr16 773341 . G A 207.08 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.189;QD=48.7236;RBI=0.0106245;REFB=0;REVB=0.0102232;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133068;OID=.;OPOS=773341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0 chr16 774520 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.314;QD=35.5759;RBI=0.0588539;REFB=0;REVB=0.0439137;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131567;OID=.;OPOS=774520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr16 774692 . A G 990.44 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7982;QD=59.1308;RBI=0.0509734;REFB=0;REVB=-0.0470804;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217637;OID=.;OPOS=774692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0 chr16 774760 . T C 40.61 PASS AF=0.123457;AO=10;DP=77;FAO=10;FDP=81;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=53;FWDB=-0.0117948;FXX=0.0240935;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.6759;QD=2.00552;RBI=0.0715401;REFB=-0.0160772;REVB=-0.0705611;RO=65;SAF=9;SAR=1;SRF=16;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.690458;STB=0.946741;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.129039;OID=.;OPOS=774760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:77:81:65:71:10:10:0.123457:1:9:16:49:1:9:18:53 chr16 778024 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00623387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.628;QD=61.6839;RBI=0.0124256;REFB=0;REVB=0.0107486;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96076e-05;OID=.;OPOS=778024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0 chr16 778820 . G A 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00472031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0205;QD=56.9375;RBI=0.00672516;REFB=0;REVB=0.00479024;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.59736e-05;OID=.;OPOS=778820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0 chr16 781633 . G A 318.26 PASS AF=0.96;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206752;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.921;QD=50.9211;RBI=0.0583944;REFB=-0.0876498;REVB=0.0546117;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487199;STB=0.526294;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00218753;OID=.;OPOS=781633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:26:25:1:1:24:24:0.96:15:9:1:0:15:9:1:0 chr16 784765 . C T 222.75 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.192442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4611;QD=49.4996;RBI=0.206603;REFB=0;REVB=-0.0751727;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00418233;OID=.;OPOS=784765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr16 815549 . T C 591.66 PASS AF=0.546296;AO=56;DP=104;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0207168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.717;QD=21.9133;RBI=0.0265134;REFB=-0.0100036;REVB=0.0165461;RO=48;SAF=21;SAR=35;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14325;STB=0.582299;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00870191;OID=.;OPOS=815549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:48:49:56:59:0.546296:35:21:26:22:38:21:26:23 chr16 815565 . T C 553.65 PASS AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0222679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.36;QD=22.1459;RBI=0.0242684;REFB=-0.0388734;REVB=0.00964845;RO=47;SAF=19;SAR=33;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147642;STB=0.586922;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0301616;OID=.;OPOS=815565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:47:48:52:52:0.52:33:19:25:22:33:19:26:22 chr16 816072 . T C 356.39 PASS AF=0.62;AO=30;DP=49;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0211289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3309;QD=28.5108;RBI=0.0583172;REFB=0.0112852;REVB=-0.054355;RO=19;SAF=16;SAR=14;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790063;STB=0.536059;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00799098;OID=.;OPOS=816072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:19:19:30:31:0.62:14:16:8:11:15:16:8:11 chr16 839262 . A G 1886.09 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.393;QD=61.3363;RBI=0.118049;REFB=0;REVB=-0.0153131;RO=0;SAF=46;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309682;OID=.;OPOS=839262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:123:0:0:119:123:1:73:46:0:0:73:50:0:0 chr16 841872 . CCG C 44.65 PASS AF=0.231884;AO=12;DP=78;FAO=16;FDP=69;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0127851;FXX=0.0416609;HRUN=5;LEN=2;MLLD=25.0561;QD=2.58823;RBI=0.013375;REFB=-0.0512892;REVB=-0.00392829;RO=61;SAF=2;SAR=10;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542946;STB=0.795577;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=0.183304;OID=.;OPOS=841873;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.231884:12:78:16:69:53:4:12:35:18:44:61:2:10:38:23 chr16 845742 . G A 330.07 PASS AF=0.666667;AO=28;DP=42;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.209873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0554;QD=31.4354;RBI=0.211992;REFB=-0.000416876;REVB=0.0298983;RO=14;SAF=7;SAR=21;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158734;STB=0.586152;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00611825;OID=.;OPOS=845742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:14:14:28:28:0.666667:21:7:1:13:21:7:1:13 chr16 845819 . A G 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0182165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2139;QD=27.2217;RBI=0.0182288;REFB=-0.0110018;REVB=0.000667749;RO=15;SAF=7;SAR=17;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184986;STB=0.602747;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00646739;OID=.;OPOS=845819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:17:7:8:7:17:7:8:7 chr16 846768 . C T 94.7 PASS AF=0.27907;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=29;FWDB=0.0436084;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.67;QD=8.80955;RBI=0.0463839;REFB=-0.0156821;REVB=-0.0158042;RO=31;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501524;STB=0.785733;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0464664;OID=.;OPOS=846768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:44:43:31:31:12:12:0.27907:7:5:2:29:7:5:2:29 chr16 846804 . C T 211.87 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.0056102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9939;QD=16.6174;RBI=0.0139644;REFB=-0.00474913;REVB=0.0127879;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364278;STB=0.707679;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00816433;OID=.;OPOS=846804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:28:23:23:0.45098:12:11:3:24:12:11:3:25 chr16 848755 . G A 108.6 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0866598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.55;QD=13.5747;RBI=0.0868631;REFB=0.00501848;REVB=0.00594008;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960223;STB=0.556013;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.00314152;OID=.;OPOS=848755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:6:7:12:7:6:7:12:7 chr16 855517 . GGCAGCT G 105.01 PASS AF=0.432432;AO=15;DP=40;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0104127;FXX=0;HRUN=4;LEN=6;MLLD=344.982;QD=11.3525;RBI=0.0170105;REFB=-0.0146204;REVB=-0.0134511;RO=23;SAF=12;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376672;STB=0.645958;STBP=0.147;TYPE=del;VARB=0.0216699;OID=.;OPOS=855518;OREF=GCAGCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.432432:15:40:16:37:21:12:4:11:10:99:23:12:3:11:12 chr16 855676 . A G 401.73 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.012374;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.755;QD=21.4257;RBI=0.0250789;REFB=-0.0221136;REVB=-0.0218137;RO=34;SAF=22;SAR=18;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00742347;STB=0.503363;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.014291;OID=.;OPOS=855676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:34:35:40:40:0.533333:18:22:19:15:18:22:19:16 chr16 855717 . C G 298.09 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.018587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.318;QD=20.9185;RBI=0.0224765;REFB=-0.0133953;REVB=0.0126378;RO=26;SAF=18;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353721;STB=0.519618;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0159167;OID=.;OPOS=855717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:13:18:14:12:13:18:14:12 chr16 1034834 . T C 1026.36 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00180487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4383;QD=59.499;RBI=0.0148265;REFB=0;REVB=-0.0147162;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121714;OID=.;OPOS=1034834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr16 1116169 . A G 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.741;QD=61.3345;RBI=0.0354888;REFB=0;REVB=0.0339755;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001366;OID=.;OPOS=1116169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr16 1116445 . A G 256.22 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.236;QD=51.2443;RBI=0.100086;REFB=0;REVB=0.0967625;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456204;OID=.;OPOS=1116445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:1:18:0:0:2:18:0:0 chr16 1129872 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.509;QD=37.4885;RBI=0.064527;REFB=0;REVB=0.0495826;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017853;OID=.;OPOS=1129872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr16 1131181 . C T 1515.5 PASS AF=0.979798;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0428135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.838;QD=61.2325;RBI=0.0435072;REFB=0.0164074;REVB=0.00773813;RO=2;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215433;STB=0.511361;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.000714479;OID=.;OPOS=1131181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:98:99:2:2:96:97:0.979798:43:53:0:2:43:54:0:2 chr16 1131373 . G A 96.19 PASS AF=0.375;AO=11;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0325384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1894;QD=12.0238;RBI=0.0536297;REFB=0.00438213;REVB=0.042631;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559997;STB=0.576801;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.00280073;OID=.;OPOS=1131373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:19:20:11:12:0.375:7:4:6:13:7:5:6:14 chr16 1131393 . A G 397.18 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201725;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7082;QD=56.7395;RBI=0.0344056;REFB=0;REVB=-0.0278713;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00108432;OID=.;OPOS=1131393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:29:28:1:19:10:0:0:19:9:0:0 chr16 1250559 . T C 35.95 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00529766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.404;QD=6.25134;RBI=0.046775;REFB=0.0106784;REVB=-0.046474;RO=17;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100585;STB=0.565004;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.0352722;OID=.;OPOS=1250559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:3:3:7:10:3:3:7:10 chr16 1251803 . C T 213.98 PASS AF=0.512195;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00821363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.79;QD=20.8758;RBI=0.0125786;REFB=-0.0237955;REVB=-0.00952673;RO=20;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477426;STB=0.53568;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0318303;OID=.;OPOS=1251803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:20:20:20:21:0.512195:7:13:12:8:7:14:12:8 chr16 1252118 . C T 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0340779;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=194.45;QD=18.767;RBI=0.0452327;REFB=-0.025865;REVB=-0.0297438;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354507;STB=0.713466;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00880485;OID=.;OPOS=1252118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:1:2:1:5:1:2 chr16 1252259 . A G 199.37 PASS AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0255314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.969;QD=27.4996;RBI=0.025535;REFB=-0.0146683;REVB=0.000430727;RO=10;SAF=1;SAR=18;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.649817;STB=0.872203;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00755314;OID=.;OPOS=1252259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:18:1:7:3:18:1:7:3 chr16 1252369 . C T 187.63 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0128973;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.998;QD=19.2441;RBI=0.021657;REFB=-0.0154202;REVB=0.0173978;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721724;STB=0.54094;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0254751;OID=.;OPOS=1252369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:20:20:19:19:0.487179:8:11:10:10:8:11:10:10 chr16 1260481 . T C 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.117;QD=55.095;RBI=0.0281825;REFB=0;REVB=-0.0230931;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187689;OID=.;OPOS=1260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr16 1261219 . A G 895.79 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.528;QD=57.7926;RBI=0.0606532;REFB=0;REVB=0.000850927;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000813246;OID=.;OPOS=1261219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:27:34:0:0:28:34:0:0 chr16 1261222 . A G 902.67 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8533;QD=58.2367;RBI=0.0525709;REFB=0;REVB=-0.0379117;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.6552e-05;OID=.;OPOS=1261222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0 chr16 1261282 . T C 696.7 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0094775;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.029;QD=52.5811;RBI=0.0125591;REFB=-0.0144906;REVB=0.00824059;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361869;STB=0.519223;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=6.07273e-05;OID=.;OPOS=1261282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:25:26:0:2:25:26:0:2 chr16 1268494 . C T 279.85 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0559527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.519;QD=48.6693;RBI=0.0566368;REFB=-0.0902452;REVB=-0.00877598;RO=1;SAF=10;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439896;STB=0.523788;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00134092;OID=.;OPOS=1268494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:12:10:1:0:12:10:1:0 chr16 1269029 . T C 368.05 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0122058;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.06;QD=52.5782;RBI=0.0141802;REFB=-0.0431577;REVB=-0.00721784;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545937;STB=0.52939;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00396036;OID=.;OPOS=1269029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:29:28:1:1:27:27:0.964286:19:8:1:0:19:8:1:0 chr16 1270162 . G A 801.24 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0571277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4119;QD=57.2311;RBI=0.0660542;REFB=0;REVB=0.03316;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287649;OID=.;OPOS=1270162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:22:34:0:0:22:34:0:0 chr16 1271890 . G T 589.67 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041823;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0561;QD=58.9665;RBI=0.200303;REFB=-0.0906973;REVB=0.195888;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00364202;OID=.;OPOS=1271890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:40:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:18:22:0:0 chr16 1272038 . G A 404.99 PASS AF=1;AO=26;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8296;QD=55.8608;RBI=0.132976;REFB=0;REVB=-0.00366762;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00320817;OID=.;OPOS=1272038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:26:29:1:11:15:0:0:11:18:0:0 chr16 1272684 . C G 144.76 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00876459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.397;QD=15.6499;RBI=0.0792128;REFB=-0.0128239;REVB=0.0787264;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108559;STB=0.575663;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0254044;OID=.;OPOS=1272684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:21:16:16:0.432432:9:7:11:9:9:7:12:9 chr16 1272865 . G A 2896.57 PASS AF=1;AO=181;DP=181;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.088;QD=62.9689;RBI=0.0187807;REFB=0;REVB=0.0133317;RO=0;SAF=103;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106684;OID=.;OPOS=1272865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:181:184:0:0:181:184:1:78:103:0:0:79:105:0:0 chr16 1273490 . C T 149.09 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00446317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.269;QD=18.6368;RBI=0.0463988;REFB=-0.035457;REVB=-0.0461837;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552398;STB=0.531457;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0382979;OID=.;OPOS=1273490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:7:9:8:8:7:9:8:8 chr16 1278744 . C T 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0239835;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.536;QD=21.0138;RBI=0.0612303;REFB=-0.0487817;REVB=0.0563378;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.599822;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.018189;OID=.;OPOS=1278744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:2:5:5:6:2:5 chr16 1279574 . C G 48.23 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00154059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.999;QD=12.8606;RBI=0.0372034;REFB=-0.0116371;REVB=-0.0371714;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172968;STB=0.603481;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00990877;OID=.;OPOS=1279574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:3:5:3:4:3:5 chr16 1279584 . T C 57.03 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0555123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0339;QD=12.6722;RBI=0.0557209;REFB=-0.0176886;REVB=0.00481768;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930819;STB=0.555418;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0517605;OID=.;OPOS=1279584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:4:6:4:4:4:6 chr16 1279623 . G A 128.91 PASS AF=0.5;AO=13;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0040362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.207;QD=17.1877;RBI=0.0061566;REFB=-0.0177237;REVB=0.00464895;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991777;STB=0.5342;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0598187;OID=.;OPOS=1279623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:12:15:13:15:0.5:8:5:6:6:9:6:7:8 chr16 1279704 . A G 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0556442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9352;QD=11.1043;RBI=0.0610422;REFB=-0.0342628;REVB=-0.0250975;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092698;STB=0.555409;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0113941;OID=.;OPOS=1279704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:6:1:1:9:6:1:1:9 chr16 1291188 . C T 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0100008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0561;QD=13.631;RBI=0.0380924;REFB=0.0172824;REVB=-0.0367562;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186888;STB=0.608461;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.0148718;OID=.;OPOS=1291188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:2:6:8:1:2:6:8:1 chr16 1291591 . G C 142.56 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0402212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0179;QD=14.2564;RBI=0.0423186;REFB=0.00832238;REVB=0.0131574;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203965;STB=0.619051;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0177362;OID=.;OPOS=1291591;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:11:5:12:12:11:5:12:12 chr16 1291597 . C G 92.58 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0208954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.771;QD=9.25819;RBI=0.0238136;REFB=-0.0166316;REVB=0.0114224;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123711;STB=0.574878;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0178214;OID=.;OPOS=1291597;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:6:6:11:17:6:6:11:17 chr16 1291598 . G A 141.96 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0162216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.567;QD=13.8493;RBI=0.0183416;REFB=-0.00933722;REVB=-0.00856001;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226393;STB=0.632417;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0318182;OID=.;OPOS=1291598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:13:12:11:5:13:12 chr16 1291622 . A G 101.9 PASS AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00146777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.549;QD=8.86091;RBI=0.0719418;REFB=-0.00400836;REVB=-0.0719269;RO=31;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211774;STB=0.62358;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.013028;OID=.;OPOS=1291622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:31:33:13:13:0.282609:6:7:11:20:6:7:12:21 chr16 1306671 . G A 594.25 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0747681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2059;QD=60.9484;RBI=0.0750637;REFB=0;REVB=0.00665447;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000801086;OID=.;OPOS=1306671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0 chr16 1306681 . G A 575.66 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.323;QD=60.5961;RBI=0.0272802;REFB=0;REVB=0.0248531;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234335;OID=.;OPOS=1306681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr16 1306918 . C T 140.86 PASS AF=0.28169;AO=20;DP=71;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.000678227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.242;QD=7.93556;RBI=0.0151222;REFB=-0.00255822;REVB=-0.015107;RO=49;SAF=5;SAR=15;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215076;STB=0.647842;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0194611;OID=.;OPOS=1306918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:49:51:20:20:0.28169:15:5:20:29:15:5:22:29 chr16 1306921 . G A 139.61 PASS AF=0.273973;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00251791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.969;QD=7.6501;RBI=0.00997523;REFB=-0.000665687;REVB=-0.00965222;RO=53;SAF=6;SAR=14;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196656;STB=0.619344;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00234144;OID=.;OPOS=1306921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:53:53:20:20:0.273973:14:6:24:29:14:6:24:29 chr16 1306927 . C T 120.41 PASS AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0195905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8243;QD=6.78391;RBI=0.0298139;REFB=-0.00450537;REVB=0.022474;RO=51;SAF=6;SAR=12;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14989;STB=0.593952;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00859546;OID=.;OPOS=1306927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:51:53:18:18:0.253521:12:6:23:28:12:6:24:29 chr16 1306971 . A G 116.48 PASS AF=0.233766;AO=18;DP=77;FAO=18;FDP=77;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0121685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.126;QD=6.05081;RBI=0.0141615;REFB=-0.00614025;REVB=-0.00724391;RO=59;SAF=7;SAR=11;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128517;STB=0.579705;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0371401;OID=.;OPOS=1306971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:59:59:18:18:0.233766:11:7:29:30:11:7:29:30 chr16 1306973 . A G 107.77 PASS AF=0.223684;AO=17;DP=77;FAO=17;FDP=76;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0231089;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.869;QD=5.6719;RBI=0.0240829;REFB=-0.00170004;REVB=-0.00677997;RO=59;SAF=7;SAR=10;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998134;STB=0.562426;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00517584;OID=.;OPOS=1306973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:59:59:17:17:0.223684:10:7:29:30:10:7:29:30 chr16 1306986 . C T 90.95 PASS AF=0.208333;AO=15;DP=71;FAO=15;FDP=72;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00167446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.071;QD=5.05286;RBI=0.00623521;REFB=0.00158129;REVB=0.00600617;RO=56;SAF=7;SAR=8;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635956;STB=0.533289;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00497173;OID=.;OPOS=1306986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:71:72:56:57:15:15:0.208333:8:7:29:27:8:7:29:28 chr16 1307050 . C T 51.53 PASS AF=0.155172;AO=9;DP=58;FAO=9;FDP=58;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00428589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.539;QD=3.55393;RBI=0.0132088;REFB=0.000246308;REVB=0.0124942;RO=49;SAF=4;SAR=5;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556212;STB=0.538376;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.000632025;OID=.;OPOS=1307050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:58:58:49:49:9:9:0.155172:5:4:24:25:5:4:24:25 chr16 1311333 . A G 1104.65 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0901909;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.909;QD=59.7108;RBI=0.097546;REFB=0;REVB=0.0371594;RO=0;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299591;OID=.;OPOS=1311333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:74:0:0:67:74:1:28:39:0:0:34:40:0:0 chr16 1312546 . T A 753.49 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0240437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.673;QD=61.5096;RBI=0.0281087;REFB=-0.147048;REVB=0.0145602;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177516;STB=0.50943;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00289993;OID=.;OPOS=1312546;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:26:22:0:1:26:22:0:1 chr16 1312826 . A G 925.49 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102736;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.32;QD=58.7611;RBI=0.0167839;REFB=0;REVB=0.0132722;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000695046;OID=.;OPOS=1312826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:24:38:0:0:25:38:0:0 chr16 1370597 . G C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.182;QD=52.6132;RBI=0.0315916;REFB=0;REVB=0.010915;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164406;OID=.;OPOS=1370597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr16 1370614 . C G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.682;QD=48.7367;RBI=0.126217;REFB=0;REVB=0.123835;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819058;OID=.;OPOS=1370614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0 chr16 1370630 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0548155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3588;QD=39.2067;RBI=0.077715;REFB=0;REVB=-0.0550898;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00791648;OID=.;OPOS=1370630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0 chr16 1374818 . A G 481.47 PASS AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00567363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.159;QD=53.4965;RBI=0.00583094;REFB=-0.0755881;REVB=0.00134528;RO=1;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346006;STB=0.535693;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.000866771;OID=.;OPOS=1374818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:1:2:34:34:0.944444:13:21:0:1:13:21:0:2 chr16 1374951 . C G 218.06 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0118137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.064;QD=15.5756;RBI=0.0265805;REFB=-0.0058399;REVB=0.023811;RO=31;SAF=21;SAR=4;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307435;STB=0.677256;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00806993;OID=.;OPOS=1374951;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:4:21:19:12:4:21:19:12 chr16 1389153 . C A 750.72 PASS AF=0.890625;AO=56;DP=63;FAO=57;FDP=64;FR=.;FRO=7;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0363439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.3733;QD=46.9197;RBI=0.129331;REFB=-0.131356;REVB=0.124119;RO=7;SAF=38;SAR=18;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00856735;STB=0.50588;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0175667;OID=.;OPOS=1389153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:63:64:7:7:56:57:0.890625:18:38:5:2:19:38:5:2 chr16 1391871 . C G 179.01 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.023996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.259;QD=12.5623;RBI=0.0241567;REFB=-0.00975004;REVB=0.00278204;RO=35;SAF=8;SAR=14;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134054;STB=0.577486;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0244162;OID=.;OPOS=1391871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:14:8:17:18:14:8:17:18 chr16 1393020 . G A 213.16 PASS AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0219045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.46;QD=20.3007;RBI=0.0497796;REFB=-0.00996715;REVB=0.0447013;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155711;STB=0.596238;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00743595;OID=.;OPOS=1393020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:21:21:20:21:0.5:12:8:12:9:13:8:12:9 chr16 1394507 . A C 950.79 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00779509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.66;QD=57.6237;RBI=0.0191111;REFB=0;REVB=0.017449;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480111;OID=.;OPOS=1394507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:33:28:0:0:37:29:0:0 chr16 1419947 . A G 520.04 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000672004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.028;QD=59.4331;RBI=0.00283052;REFB=0;REVB=-0.00274959;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.94791e-06;OID=.;OPOS=1419947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr16 1433766 . T C 1190.22 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.729;QD=61.0371;RBI=0.0369589;REFB=0;REVB=0.0293395;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.1712e-05;OID=.;OPOS=1433766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:35:43:0:0:35:43:0:0 chr16 1447278 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.45;QD=60.9783;RBI=0.0426439;REFB=0;REVB=0.0141781;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131377;OID=.;OPOS=1447278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0 chr16 1479250 . C T 1715.36 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0139341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.521;QD=59.6648;RBI=0.0205328;REFB=0.00039643;REVB=0.015081;RO=0;SAF=45;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505494;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=1.48604e-06;OID=.;OPOS=1479250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:115:0:1:114:114:0.991304:69:45:0:0:69:45:1:0 chr16 1484391 . AG AC,GC 758.12 PASS AF=0.962963,0.037037;AO=51,2;DP=53;FAO=52,2;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22,2;FSAR=30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452571,-0.0032889;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=80.211,64.1469;QD=56.1567;RBI=0.112443,0.0466645;REFB=0,0;REVB=0.112352,0.0465485;RO=0;SAF=21,2;SAR=30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00130575,0.0444155;OID=.,.;OPOS=1484392,1484391;OREF=G,AG;OALT=C,GC;OMAPALT=AC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:53:54:0:0:51,2:52,2:0.962963,0.037037:30,0:21,2:0:0:30,0:22,2:0:0 chr16 1484473 . A G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.952;QD=62.9829;RBI=0.0126579;REFB=0;REVB=-0.00935613;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.93143e-07;OID=.;OPOS=1484473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0 chr16 1503879 . T A 1840.91 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.679;QD=61.3638;RBI=0.0268022;REFB=0;REVB=-0.0038182;RO=0;SAF=55;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.42654e-05;OID=.;OPOS=1503879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:65:55:0:0:65:55:0:0 chr16 1545448 . A G 267.31 PASS AF=0.327103;AO=35;DP=107;FAO=35;FDP=107;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=-0.0110374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9731;QD=9.99283;RBI=0.0118032;REFB=-0.0367107;REVB=-0.00418222;RO=72;SAF=25;SAR=10;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101;STB=0.558971;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0283085;OID=.;OPOS=1545448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:72:72:35:35:0.327103:10:25:46:26:10:25:46:26 chr16 1547477 . T C 160.42 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0135969;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.709;QD=14.5836;RBI=0.0285873;REFB=-0.0140247;REVB=-0.0251467;RO=26;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265885;STB=0.653888;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0246211;OID=.;OPOS=1547477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:26:26:16:16:0.363636:7:9:8:18:7:9:8:18 chr16 1555589 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.086;QD=57.6802;RBI=0.0250992;REFB=0;REVB=0.0172254;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18916e-06;OID=.;OPOS=1555589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr16 1556295 . C T 272.81 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0076421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.045;QD=24.2496;RBI=0.00899016;REFB=-0.0137415;REVB=0.00473511;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158156;STB=0.575162;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0139457;OID=.;OPOS=1556295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:19:20:25:25:0.555556:12:13:6:13:12:13:7:13 chr16 1559838 . T C 1302.74 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.791;QD=62.0351;RBI=0.0391128;REFB=0;REVB=0.0376937;RO=0;SAF=57;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51495e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49738e-05;OID=.;OPOS=1559838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:26:57:0:0:27:57:0:0 chr16 1574863 . G A 346.14 PASS AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0692565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8527;QD=19.5006;RBI=0.0748507;REFB=-0.00575001;REVB=-0.028393;RO=35;SAF=23;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115209;STB=0.56415;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00573015;OID=.;OPOS=1574863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:13:23:18:17:13:23:18:17 chr16 1584446 . G C 97.31 PASS AF=0.4;AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.015936;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.941;QD=12.9742;RBI=0.0177648;REFB=-0.00215549;REVB=-0.00785064;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256069;STB=0.615195;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00318126;OID=.;OPOS=1584446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:11:12:0.4:7:4:11:7:7:5:11:7 chr16 1591962 . G A 502.49 PASS AF=0.5875;AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0056468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.232;QD=25.1242;RBI=0.00741858;REFB=-0.0199836;REVB=0.00481135;RO=33;SAF=22;SAR=25;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102888;STB=0.55619;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0167504;OID=.;OPOS=1591962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:33:33:47:47:0.5875:25:22:11:22:25:22:11:22 chr16 1608082 . A G 410.28 PASS AF=0.482759;AO=40;DP=85;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.00107579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.742;QD=18.8632;RBI=0.00533451;REFB=-0.0124364;REVB=-0.00522491;RO=45;SAF=15;SAR=25;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250882;STB=0.523798;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0141265;OID=.;OPOS=1608082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:45:45:40:42:0.482759:25:15:18:27:27:15:18:27 chr16 1614097 . A G 1004.63 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00560551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.556;QD=59.0959;RBI=0.00607799;REFB=0;REVB=0.00234953;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63536e-05;OID=.;OPOS=1614097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:40:28:0:0 chr16 1634385 . C T 329.49 PASS AF=0.5;AO=34;DP=69;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.02651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5757;QD=18.8281;RBI=0.0374892;REFB=0.00182909;REVB=0.0265078;RO=34;SAF=16;SAR=18;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157574;STB=0.585041;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.00130888;OID=.;OPOS=1634385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:34:35:34:35:0.5:18:16:22:12:19:16:22:13 chr16 1682281 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.011;QD=53.911;RBI=0.0846586;REFB=0;REVB=0.0446141;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0026929;OID=.;OPOS=1682281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr16 1697025 . C T 176.91 PASS AF=0.338235;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0103399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.619;QD=10.4063;RBI=0.0156051;REFB=-0.0108939;REVB=-0.0116879;RO=45;SAF=13;SAR=10;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866851;STB=0.550662;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0216957;OID=.;OPOS=1697025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:45:45:23:23:0.338235:10:13:22:23:10:13:22:23 chr16 1730470 . A G 382.83 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0287444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9;QD=17.4012;RBI=0.0855088;REFB=-0.0144645;REVB=-0.0805327;RO=48;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202889;STB=0.511358;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0153631;OID=.;OPOS=1730470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:20:20:23:25:20:20:23:25 chr16 1797050 . C T 203.51 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0185581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=322;QD=30.1499;RBI=0.0266693;REFB=-0.00376433;REVB=0.0191534;RO=8;SAF=17;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368817;STB=0.708063;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00246146;OID=.;OPOS=1797050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:2:17:4:4:2:17:4:4 chr16 1812972 . G C 216.13 PASS AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.101942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3128;QD=29.8114;RBI=0.105363;REFB=-0.0379137;REVB=0.0266326;RO=9;SAF=7;SAR=13;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121516;STB=0.567204;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0143656;OID=.;OPOS=1812972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:13:7:5:4:13:7:5:4 chr16 1814391 . T C 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0172137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9726;QD=13.5763;RBI=0.0179517;REFB=-0.0286615;REVB=-0.0050943;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118539;STB=0.569272;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0337783;OID=.;OPOS=1814391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:11:8:7:6:11:8 chr16 1827836 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.348;QD=60.9786;RBI=0.0517844;REFB=0;REVB=0.0485098;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207618;OID=.;OPOS=1827836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:12:27:0:0:12:27:0:0 chr16 1828147 . G A 304.91 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00990875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.642;QD=26.5139;RBI=0.0367141;REFB=-0.0267778;REVB=-0.0353516;RO=19;SAF=11;SAR=16;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09012;STB=0.549881;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0461858;OID=.;OPOS=1828147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:16:11:10:9:16:11:10:9 chr16 1838640 . T C 1634.26 PASS AF=1;AO=106;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.242;QD=59.4277;RBI=0.0282557;REFB=0;REVB=0.0204629;RO=0;SAF=53;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79262e-05;OID=.;OPOS=1838640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:110:0:0:106:110:1:53:53:0:0:57:53:0:0 chr16 1841033 . G A 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.38;QD=62.671;RBI=0.0685932;REFB=0;REVB=0.0682727;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161919;OID=.;OPOS=1841033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0 chr16 1842209 . A G 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00436275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.422;QD=61.6829;RBI=0.0203552;REFB=0;REVB=-0.0198822;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.98786e-05;OID=.;OPOS=1842209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0 chr16 1843672 . T C 1862.28 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305629;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6293;QD=61.5631;RBI=0.0407085;REFB=0;REVB=0.0405936;RO=0;SAF=50;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91843e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.07948e-05;OID=.;OPOS=1843672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:71:50:0:0:71:50:0:0 chr16 1918125 . T G 1413.24 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.476;QD=62.8107;RBI=0.0213472;REFB=0;REVB=-0.00163913;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.65693e-05;OID=.;OPOS=1918125;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:41:48:0:0:41:49:0:0 chr16 1961674 . G C 230.87 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0440079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.549;QD=23.0874;RBI=0.0573878;REFB=-0.00249581;REVB=0.0368329;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243816;STB=0.63624;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00317656;OID=.;OPOS=1961674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:14:8:12:6:14:8:12:6 chr16 1962132 . G A 41.23 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0993471;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=96.7051;QD=16.4907;RBI=0.102244;REFB=-0.00422023;REVB=-0.0241649;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365022;STB=0.749247;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00722968;OID=.;OPOS=1962132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:3:4:6:6:0.6:2:4:0:3:2:4:0:4 chr16 1990994 . T C 236.12 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0103842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.093;QD=19.2749;RBI=0.0106823;REFB=-0.00252868;REVB=0.00250597;RO=26;SAF=12;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204062;STB=0.511535;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00296687;OID=.;OPOS=1990994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:11:12:13:13:11:12:13:13 chr16 2009697 . C T 639.32 PASS AF=0.520325;AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0705872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2851;QD=20.7908;RBI=0.133708;REFB=0.00537138;REVB=0.113557;RO=59;SAF=27;SAR=37;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615669;STB=0.533872;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.00260537;OID=.;OPOS=2009697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:59:59:64:64:0.520325:37:27:29:30:37:27:29:30 chr16 2014283 . A G 371.63 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.974;QD=55.0558;RBI=0.0554454;REFB=0;REVB=0.054491;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257634;OID=.;OPOS=2014283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:6:19:0:0:7:20:0:0 chr16 2028402 . A C 186.2 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0329121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5958;QD=12.4134;RBI=0.0360599;REFB=-0.0177072;REVB=-0.0147347;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201661;STB=0.511618;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0340385;OID=.;OPOS=2028402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:37:37:23:23:0.383333:11:12:20:17:11:12:20:17 chr16 2035868 . C T 1174.06 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626578;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.606;QD=60.9901;RBI=0.0634455;REFB=0;REVB=0.0099662;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157323;OID=.;OPOS=2035868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:29:47:0:0:29:48:0:0 chr16 2048826 . C G 449.41 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.064;QD=54.4741;RBI=0.095583;REFB=-0.0474926;REVB=0.0373569;RO=1;SAF=16;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282674;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215646;OID=.;OPOS=2048826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:32:33:1:0:31:33:1:15:16:1:0:15:18:0:0 chr16 2049640 . A G 805.1 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000977549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1934;QD=64.408;RBI=0.0789517;REFB=0;REVB=-0.0789456;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00058678;OID=.;OPOS=2049640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr16 2070164 . C T 104.62 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00352393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1315;QD=19.9274;RBI=0.0123235;REFB=0.0202563;REVB=0.0118089;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265953;STB=0.650921;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.0149519;OID=.;OPOS=2070164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:7:5:7:2:7:5:7:2 chr16 2070568 . A C 185.32 PASS AF=0.373134;AO=22;DP=64;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0982527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5061;QD=11.0637;RBI=0.0984068;REFB=-0.0221204;REVB=-0.00550377;RO=41;SAF=2;SAR=20;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474157;STB=0.690613;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0292527;OID=.;OPOS=2070568;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:41:42:22:25:0.373134:20:2:15:26:21:4:16:26 chr16 2134692 . A G 68.52 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0123963;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.008;QD=10.9632;RBI=0.0155732;REFB=-0.0129945;REVB=-0.00942645;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920876;STB=0.535635;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.02234;OID=.;OPOS=2134692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:25:25:15:16:9:9:0.36:5:4:8:7:5:4:8:8 chr16 2153308 . G A 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00718726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.917;QD=18.7441;RBI=0.0472111;REFB=-0.0162649;REVB=0.0466608;RO=4;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219787;STB=0.62471;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0110091;OID=.;OPOS=2153308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:1:6:4:0:1:6:4:0 chr16 2160494 . C T 305.03 PASS AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0278883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.491;QD=32.9764;RBI=0.0279133;REFB=-0.0127284;REVB=-0.0011816;RO=10;SAF=6;SAR=20;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112532;STB=0.585036;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00283869;OID=.;OPOS=2160494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:10:11:26:26:0.702703:20:6:4:6:20:6:5:6 chr16 2160895 . G A 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0353041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.417;QD=16.4266;RBI=0.0353811;REFB=-0.0154957;REVB=-0.00233307;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200531;STB=0.633914;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0139139;OID=.;OPOS=2160895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:10:11:11:11:0.5:5:6:3:7:5:6:3:8 chr16 2257105 . C G 864.94 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139151;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.059;QD=54.9168;RBI=0.0168716;REFB=-0.193869;REVB=-0.00954039;RO=1;SAF=25;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185059;STB=0.509431;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00179219;OID=.;OPOS=2257105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:1:1:61:62:0.984127:36:25:1:0:36:26:1:0 chr16 2260567 . C T 1395.79 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336713;FXX=0.0326052;HRUN=5;LEN=1;MLLD=101.197;QD=62.7319;RBI=0.0486472;REFB=0;REVB=0.0351111;RO=0;SAF=32;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000939982;OID=.;OPOS=2260567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:89:0:0:84:89:1:52:32:0:0:53:36:0:0 chr16 2260612 . T C 729.68 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00912705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.901;QD=57.2299;RBI=0.0280887;REFB=0;REVB=0.0265644;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2999e-05;OID=.;OPOS=2260612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:30:19:0:0:31:20:0:0 chr16 2263146 . A G 551.67 PASS AF=0.886364;AO=40;DP=44;FAO=39;FDP=44;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00740645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8181;QD=50.1517;RBI=0.0141176;REFB=-0.0562225;REVB=-0.0120187;RO=4;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143345;STB=0.599945;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0263857;OID=.;OPOS=2263146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:44:44:4:5:40:39:0.886364:11:29:0:4:10:29:0:5 chr16 2278509 . G A 190.95 PASS AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0184476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.476;QD=30.5522;RBI=0.0382309;REFB=-0.0554933;REVB=0.0334856;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814684;STB=0.504499;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0212174;OID=.;OPOS=2278509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:10:8:3:4:10:8:3:4 chr16 2282255 . CG AC,CA,CGA 311.49 PASS AF=0.0416667,0.958333,0;AO=2,9,3;DP=24;FAO=1,23,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13,0;FSAR=1,10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317588,0.0505693,0.0204984;FXX=0;HRUN=5,1,0;LEN=2,1,1;MLLD=67.9025,93.6626,81.5836;QD=51.9143;RBI=0.073091,0.182737,0.108231;REFB=0,0,0;REVB=0.0658307,0.1756,0.106272;RO=1;SAF=0,5,0;SAR=2,4,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.0984833,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,ins;VARB=0.105844,0.00182217,0;OID=.,.,.;OPOS=2282255,2282256,2282257;OREF=CG,G,-;OALT=AC,A,A;OMAPALT=AC,CA,CGA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:24:24:1:0:2,9,3:1,23,0:0.0416667,0.958333,0:2,4,3:0,5,0:0:1:1,10,0:0,13,0:0:0 chr16 2303353 . T C 66.69 PASS AF=0.8;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00573968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.459;QD=26.674;RBI=0.0507312;REFB=0.000139752;REVB=0.0504055;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28674;STB=0.666221;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000623614;OID=.;OPOS=2303353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:10:2:2:7:8:0.8:5:2:2:0:6:2:2:0 chr16 2331430 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.722;QD=60.9786;RBI=0.0145082;REFB=0;REVB=-0.00641632;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01089e-05;OID=.;OPOS=2331430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0 chr16 2367336 . G A 176.73 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0424538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7238;QD=20.7916;RBI=0.0468174;REFB=-0.0667556;REVB=0.0197367;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421209;STB=0.523783;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0390739;OID=.;OPOS=2367336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:9:7:7:11:9:7 chr16 2546812 . C T 324.81 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00052531;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.166;QD=17.0953;RBI=0.00458625;REFB=-0.0268701;REVB=0.00455607;RO=41;SAF=14;SAR=21;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109529;STB=0.561462;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.028294;OID=.;OPOS=2546812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:21:14:21:20:21:14:21:20 chr16 2766483 . AGGGC ACGGC,AGG,AGGC 238.48 PASS AF=0,0,0.96;AO=8,3,6;DP=27;FAO=0,0,24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0,11;FSAR=0,0,13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0703094,-0.121925,0.0807386;FXX=0.0384468;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=35.7356,6.45691,14.912;QD=38.1572;RBI=0.174326,0.377007,0.0871098;REFB=0.0167412,-0.092052,-0.0781836;REVB=-0.159519,-0.356748,0.0327017;RO=1;SAF=2,1,6;SAR=6,2,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.174483,-0.266641,0;STB=0.5,0.5,0.521721;STBP=1,1,0.313;TYPE=snp,del,del;VARB=0.015892,0,0.0219344;OID=.,.,.;OPOS=2766484,2766486,2766484;OREF=G,GC,G;OALT=C,-,-;OMAPALT=ACGGC,AGG,AGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:0,0,0.96:8,3,6:27:0,0,24:25:1:0,0,11:0,0,13:1:0:5:1:2,1,6:6,2,0:1:0 chr16 2812890 . A G 1026.37 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.916;QD=59.4999;RBI=0.0238218;REFB=0;REVB=0.00794717;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86855e-05;OID=.;OPOS=2812890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr16 2812939 . C A 723.29 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4765;QD=62.8945;RBI=0.0728545;REFB=0;REVB=0.0237365;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268199;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136875;OID=.;OPOS=2812939;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:1:0:43:46:1:26:17:1:0:28:18:0:0 chr16 2814162 . G A 466.97 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00893077;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.154;QD=53.3678;RBI=0.00893115;REFB=-0.00606854;REVB=8.25559e-05;RO=2;SAF=17;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05184;STB=0.527761;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00060812;OID=.;OPOS=2814162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:2:2:33:33:0.942857:16:17:2:0:16:17:2:0 chr16 2815237 . A C 619.74 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0032541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.068;QD=59.0232;RBI=0.0239622;REFB=-0.048814;REVB=0.0237403;RO=1;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240543;STB=0.512814;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00316008;OID=.;OPOS=2815237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:19:22:0:1:19:22:0:1 chr16 2818161 . T C 1377.79 PASS AF=0.988889;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0433584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3322;QD=61.2352;RBI=0.0739274;REFB=-0.0785636;REVB=-0.0598775;RO=1;SAF=49;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119955;STB=0.506328;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000266194;OID=.;OPOS=2818161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:90:1:1:88:89:0.988889:39:49:0:1:39:50:0:1 chr16 2818704 . T G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.83;QD=57.1771;RBI=0.060549;REFB=0;REVB=0.0583594;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161643;OID=.;OPOS=2818704;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0 chr16 2821573 . C T 574.72 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.943;QD=60.4967;RBI=0.0323266;REFB=0;REVB=-0.0021615;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115451;OID=.;OPOS=2821573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:15:21:0:0:16:22:0:0 chr16 2821988 . TC T 280.77 PASS AF=1;AO=23;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0525674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.1437;QD=44.9236;RBI=0.0759126;REFB=0;REVB=-0.0547667;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.228917;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0054476;OID=.;OPOS=2821989;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:25:25:25:0:13:12:0:0:5:0:13:10:0:0 chr16 2871555 . G A 280.75 PASS AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00536621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.658;QD=28.0745;RBI=0.089448;REFB=-0.02994;REVB=0.0892869;RO=15;SAF=7;SAR=18;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145385;STB=0.580577;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.018605;OID=.;OPOS=2871555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:18:7:7:8:18:7:7:8 chr16 2891212 . G A 171.2 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-1.74453e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3775;QD=17.5585;RBI=0.00517718;REFB=-0.0168606;REVB=0.00517715;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105572;STB=0.559936;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0190264;OID=.;OPOS=2891212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:15:6:7:11:15:6 chr16 2983459 . C T 197.71 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0151306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2143;QD=18.8299;RBI=0.0183352;REFB=0.00194736;REVB=0.0103558;RO=22;SAF=7;SAR=13;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4131;STB=0.73177;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00130665;OID=.;OPOS=2983459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:13:7:18:4:13:7:18:4 chr16 2983483 . C G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5005;QD=60.2301;RBI=0.0243332;REFB=0;REVB=0.0206964;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335976;OID=.;OPOS=2983483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0 chr16 2986840 . G C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.357;QD=51.1838;RBI=0.110768;REFB=0;REVB=0.00178044;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602596;OID=.;OPOS=2986840;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0 chr16 3065924 . G A 318.42 PASS AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0156941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.916;QD=23.1579;RBI=0.0159647;REFB=-0.0357545;REVB=0.00292681;RO=23;SAF=15;SAR=17;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259067;STB=0.514277;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0200429;OID=.;OPOS=3065924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:17:15:10:13:17:15:10:13 chr16 3075999 . C G 625.78 PASS AF=0.477612;AO=64;DP=134;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.00446837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.7;QD=18.6799;RBI=0.0117928;REFB=0.00340113;REVB=-0.0109135;RO=70;SAF=22;SAR=42;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113563;STB=0.563038;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.00405297;OID=.;OPOS=3075999;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:70:70:64:64:0.477612:42:22:32:38:42:22:32:38 chr16 3099998 . T C 563.02 PASS AF=0.437956;AO=60;DP=137;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=-0.0276239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.402;QD=16.4386;RBI=0.0284417;REFB=-0.00181186;REVB=-0.00677156;RO=77;SAF=22;SAR=38;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923811;STB=0.551689;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00168368;OID=.;OPOS=3099998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:77:77:60:60:0.437956:38:22:35:42:38:22:35:42 chr16 3119167 . T C 132.7 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0203268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5547;QD=15.1661;RBI=0.020969;REFB=-0.017637;REVB=0.00514991;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158751;STB=0.603639;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0219365;OID=.;OPOS=3119167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:7:8:7:12:7:8:7:13 chr16 3119304 . A G 71.64 PASS AF=0.215686;AO=10;DP=51;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0215238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.648;QD=5.61862;RBI=0.02178;REFB=-0.00209094;REVB=0.00333043;RO=39;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235909;STB=0.666405;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00840943;OID=.;OPOS=3119304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:51:51:39:40:10:11:0.215686:6:4:9:30:6:5:10:30 chr16 3132197 . A G 1135.96 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0605823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4864;QD=58.2543;RBI=0.082845;REFB=-0.0118938;REVB=-0.0565073;RO=1;SAF=41;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114041;STB=0.506023;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000906945;OID=.;OPOS=3132197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:36:41:1:0:36:41:1:0 chr16 3140616 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.359;QD=40.7626;RBI=0.0167843;REFB=0;REVB=-0.0113823;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63389e-05;OID=.;OPOS=3140616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0 chr16 3202980 . G T 211.53 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.012061;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.458;QD=14.1022;RBI=0.0120616;REFB=0.00443595;REVB=0.000122308;RO=35;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301953;STB=0.517228;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=-0.00731344;OID=.;OPOS=3202980;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:35:35:25:25:0.416667:15:10:15:20:15:10:15:20 chr16 3207446 . G A 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.938;QD=61.0493;RBI=0.0279694;REFB=0;REVB=0.0169121;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10602e-05;OID=.;OPOS=3207446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0 chr16 3234217 . C T 375.57 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.502;QD=55.64;RBI=0.0449817;REFB=0;REVB=0.0134152;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121628;OID=.;OPOS=3234217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:16:10:0:0:16:11:0:0 chr16 3241975 . G T 913.01 PASS AF=0.955224;AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00365124;FXX=0.042851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.136;QD=54.5078;RBI=0.0187033;REFB=0.0176561;REVB=-0.0183435;RO=2;SAF=43;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111022;STB=0.516984;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000248731;OID=.;OPOS=3241975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:68:67:2:3:64:64:0.955224:21:43:1:1:21:43:1:2 chr16 3243904 . G A 386.58 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00953412;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.263;QD=53.3214;RBI=0.0195535;REFB=-0.0445671;REVB=-0.0170716;RO=1;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713682;STB=0.538433;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00180065;OID=.;OPOS=3243904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:29:1:1:28:28:0.965517:6:22:0:1:6:22:0:1 chr16 3243922 . C A 553.87 PASS AF=1;AO=19;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203107;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.2298;QD=59.8774;RBI=0.0634744;REFB=0;REVB=0.0601371;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102881;OID=.;OPOS=3243922;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:19:37:1:7:12:0:0:7:30:0:0 chr16 3243942 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.976;QD=62.3506;RBI=0.0951187;REFB=0;REVB=-0.0879516;RO=0;SAF=32;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204149;OID=.;OPOS=3243942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:11:32:0:0:11:32:0:0 chr16 3243951 . C T 728.43 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6911;QD=63.3415;RBI=0.110652;REFB=0;REVB=-0.0417467;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00082604;OID=.;OPOS=3243951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:14:30:0:0:14:32:0:0 chr16 3265990 . G A 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00382729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.833;QD=15.784;RBI=0.0149424;REFB=-0.0180151;REVB=-0.014444;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167604;STB=0.597015;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0322614;OID=.;OPOS=3265990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:9:5:9:8:9:5:9:8 chr16 3293888 . C T 673.87 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103848;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.166;QD=62.6858;RBI=0.0292936;REFB=0;REVB=0.027391;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82403e-05;OID=.;OPOS=3293888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:12:31:0:0:12:31:0:0 chr16 3293922 . A T 349.09 PASS AF=0.57377;AO=26;DP=62;FAO=35;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.0143994;FXX=0.0161264;HRUN=7;LEN=1;MLLD=37.9619;QD=22.8908;RBI=0.059262;REFB=0.0281392;REVB=0.057486;RO=15;SAF=17;SAR=9;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059599;STB=0.550871;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.0247117;OID=.;OPOS=3293922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:15:26:26:35:0.57377:9:17:11:4:10:25:21:5 chr16 3297073 . A G 131.31 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.000172431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.027;QD=14.1954;RBI=0.0122767;REFB=-0.014404;REVB=-0.0122755;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155071;STB=0.589629;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0213372;OID=.;OPOS=3297073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:7:15:8:7:7:15 chr16 3297100 . G A 231.05 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00415918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.134;QD=16.5037;RBI=0.00842732;REFB=-0.00467212;REVB=0.00732945;RO=30;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316469;STB=0.517843;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00413927;OID=.;OPOS=3297100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:13:13:14:16:13:13:14:16 chr16 3297175 . T C 356.17 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0298456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1954;QD=21.9183;RBI=0.0526353;REFB=-0.00875457;REVB=-0.0433556;RO=29;SAF=20;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868134;STB=0.547918;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0147688;OID=.;OPOS=3297175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:16:20:13:16:16:20:13:16 chr16 3299749 . G A 325.28 PASS AF=0.568966;AO=32;DP=57;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0186836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1645;QD=22.4332;RBI=0.0406544;REFB=-0.0245413;REVB=0.0361068;RO=25;SAF=17;SAR=15;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872393;STB=0.554008;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0198966;OID=.;OPOS=3299749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:25:25:32:33:0.568966:15:17:16:9:16:17:16:9 chr16 3304626 . C G 169.71 PASS AF=0.607143;AO=15;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.157669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3365;QD=24.2443;RBI=0.177425;REFB=-0.0172108;REVB=0.0813652;RO=10;SAF=12;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337141;STB=0.721355;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.018551;OID=.;OPOS=3304626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:28:28:10:11:15:17:0.607143:3:12:4:6:3:14:4:7 chr16 3405994 . A G 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00062924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.521;QD=64.1539;RBI=0.00892975;REFB=0;REVB=0.00890756;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27668e-05;OID=.;OPOS=3405994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr16 3406387 . C G 359.47 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3126;QD=53.2546;RBI=0.266693;REFB=0;REVB=0.265992;RO=0;SAF=23;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.66402e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0052137;OID=.;OPOS=3406387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:27:0:0:24:27:1:1:23:0:0:4:23:0:0 chr16 3419934 . G T 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.745;QD=59.8394;RBI=0.025625;REFB=0;REVB=0.00676698;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.30871e-05;OID=.;OPOS=3419934;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0 chr16 3452193 . T G 598.2 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255427;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6941;QD=61.3535;RBI=0.0321497;REFB=0;REVB=0.0195237;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.92785e-05;OID=.;OPOS=3452193;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:11:28:0:0:11:28:0:0 chr16 3486285 . C A 358.8 PASS AF=0.452381;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0082777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.107;QD=17.0859;RBI=0.0118138;REFB=-0.01932;REVB=-0.00842886;RO=44;SAF=13;SAR=25;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046291;STB=0.529356;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0226384;OID=.;OPOS=3486285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:44:46:38:38:0.452381:25:13:17:27:25:13:18:28 chr16 3490922 . G C 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.024453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.467;QD=27.2216;RBI=0.0272332;REFB=-0.00665529;REVB=-0.0119875;RO=15;SAF=8;SAR=16;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237308;STB=0.631467;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00343662;OID=.;OPOS=3490922;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:16:8:10:5:16:8:10:5 chr16 3533577 . C G 661.09 PASS AF=1;AO=31;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.6015;QD=58.7634;RBI=0.24374;REFB=-0.0594186;REVB=0.197701;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282674;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00905653;OID=.;OPOS=3533577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:45:45:1:0:31:45:1:16:15:0:1:26:19:0:0 chr16 3534997 . C T 266.29 PASS AF=0.581395;AO=24;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.002194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.203;QD=24.7711;RBI=0.0233082;REFB=0.014185;REVB=0.0232047;RO=18;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021915;STB=0.519215;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=-0.00857168;OID=.;OPOS=3534997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:24:25:0.581395:14:10:8:10:15:10:8:10 chr16 3535116 . T C 1641.84 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4287;QD=60.251;RBI=0.0362223;REFB=0;REVB=0.0039625;RO=0;SAF=63;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91976e-05;OID=.;OPOS=3535116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:46:63:0:0:46:63:0:0 chr16 3535540 . G A 188.08 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.000202511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.776;QD=20.3324;RBI=0.0430874;REFB=-0.00202608;REVB=0.0430869;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957355;STB=0.566503;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00256699;OID=.;OPOS=3535540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:10:9:10:7:10:9:11:7 chr16 3536872 . G A 393.32 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.013;QD=56.1878;RBI=0.0443104;REFB=0;REVB=0.0374488;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365652;OID=.;OPOS=3536872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:19:8:0:0:20:8:0:0 chr16 3551067 . T C 128.45 PASS AF=0.365854;AO=14;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00967937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.432;QD=12.532;RBI=0.0249775;REFB=-0.0217265;REVB=-0.0230258;RO=26;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787773;STB=0.56427;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0226975;OID=.;OPOS=3551067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:26:26:14:15:0.365854:8:6:13:13:9:6:13:13 chr16 3554799 . T C 358.25 PASS AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0320445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.657;QD=14.6225;RBI=0.0322112;REFB=-0.00306945;REVB=-0.00327238;RO=59;SAF=21;SAR=18;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223116;STB=0.512652;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00520413;OID=.;OPOS=3554799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:18:21:33:26:18:21:33:26 chr16 3580565 . T C 259.42 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.00851941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.389;QD=14.2149;RBI=0.043838;REFB=-0.0130771;REVB=0.0430022;RO=43;SAF=22;SAR=8;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400478;STB=0.727788;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0102068;OID=.;OPOS=3580565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:0.410959:8:22:15:28:8:22:15:28 chr16 3586230 . C T 186.2 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0199858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.784;QD=12.4136;RBI=0.0200475;REFB=-0.00706099;REVB=-0.00157185;RO=36;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987513;STB=0.54872;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0104396;OID=.;OPOS=3586230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:10:13:17:19:10:13:18:19 chr16 3594296 . C T 356.1 PASS AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.030098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.97;QD=16.5628;RBI=0.0301355;REFB=-0.0226458;REVB=0.00150333;RO=48;SAF=21;SAR=17;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215408;STB=0.620566;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0508859;OID=.;OPOS=3594296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:17:21:16:32:17:21:16:32 chr16 3602227 . AG A 467.29 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0955333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.3599;QD=44.5035;RBI=0.220204;REFB=0;REVB=-0.198402;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00920328;OID=.;OPOS=3602228;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:42:42:42:42:0:20:22:0:0:9:0:20:22:0:0 chr16 3602242 . C T 292.73 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0701574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.661;QD=27.2305;RBI=0.0712872;REFB=0.0160448;REVB=-0.0126411;RO=17;SAF=14;SAR=12;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132091;STB=0.572898;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.0394997;OID=.;OPOS=3602242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:12:14:6:11:12:14:6:11 chr16 3605853 . G C 1036.13 PASS AF=0.507614;AO=100;DP=197;FAO=100;FDP=197;FR=.;FRO=97;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=40;FSRR=57;FWDB=-0.00619094;FXX=0.00505025;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.348;QD=21.0383;RBI=0.00923554;REFB=-0.0147959;REVB=-0.00685327;RO=95;SAF=46;SAR=54;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349422;STB=0.523688;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0155428;OID=.;OPOS=3605853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:95:97:100:100:0.507614:54:46:40:55:54:46:40:57 chr16 3613150 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.379;QD=40.7629;RBI=0.0208313;REFB=0;REVB=-0.0127902;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022026;OID=.;OPOS=3613150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr16 3613207 . G T 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0612092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.857;QD=14.7986;RBI=0.0614698;REFB=-0.0335743;REVB=0.00565439;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0065293;STB=0.50381;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.041299;OID=.;OPOS=3613207;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:7:6:5:6:7:6 chr16 3613904 . C G 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00616201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.723;QD=21.613;RBI=0.00616731;REFB=5.55872e-05;REVB=0.000255682;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949181;STB=0.553148;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-1.07636e-05;OID=.;OPOS=3613904;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:12:12:14:9:12:12:14:9 chr16 3613928 . A G 251.65 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00896626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7731;QD=20.5426;RBI=0.0114402;REFB=-0.0217485;REVB=0.00710531;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128213;STB=0.571866;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0157294;OID=.;OPOS=3613928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:11:13:17:8:11:13:17:8 chr16 3639139 . A G 2115.28 PASS AF=1;AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00209518;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.341;QD=62.6751;RBI=0.00210086;REFB=0;REVB=-0.000154348;RO=0;SAF=53;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140287;OID=.;OPOS=3639139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:135:0:0:134:135:1:81:53:0:0:81:54:0:0 chr16 3640274 . G A 363.26 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.0175433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.618;QD=18.1631;RBI=0.0253693;REFB=-0.00356459;REVB=0.0183258;RO=40;SAF=27;SAR=11;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654388;STB=0.527329;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00435604;OID=.;OPOS=3640274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:42:38:38:0.475:11:27:26:14:11:27:28:14 chr16 3640784 . GC AT 249.35 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=86;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0725375;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=2;MLLD=174.169;QD=11.7341;RBI=0.0731573;REFB=-0.0129594;REVB=0.00950256;RO=55;SAF=19;SAR=11;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817104;STB=0.547293;STBP=0.536;TYPE=mnp;VARB=0.021109;OID=.;OPOS=3640784;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:55:55:30:30:0.352941:11:19:31:24:11:19:31:24 chr16 3641011 . G A 292.0 PASS AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0238806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2452;QD=21.6298;RBI=0.0238808;REFB=-0.0160077;REVB=-0.000109903;RO=24;SAF=15;SAR=15;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334173;STB=0.518506;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0150595;OID=.;OPOS=3641011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:15:15:13:11:15:15:13:11 chr16 3645607 . A G 264.05 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00523294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3582;QD=19.5595;RBI=0.100314;REFB=-0.0242164;REVB=-0.100178;RO=24;SAF=15;SAR=13;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132722;STB=0.590488;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0135955;OID=.;OPOS=3645607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:24:26:28:28:0.518519:13:15:9:15:13:15:9:17 chr16 3647692 . A C 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0663681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.107;QD=22.9576;RBI=0.0663687;REFB=-0.0119057;REVB=-0.000263314;RO=11;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180541;STB=0.601858;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.004052;OID=.;OPOS=3647692;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:11:5:6:5:11:5:6:5 chr16 3650987 . T C 148.12 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00353361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.25;QD=17.9545;RBI=0.0402128;REFB=-0.00629768;REVB=-0.0400572;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228247;STB=0.631402;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00918189;OID=.;OPOS=3650987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:4:12:9:8:4:12:9:8 chr16 3650991 . T C 159.18 PASS AF=0.485714;AO=16;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0230277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.701;QD=18.1923;RBI=0.0248655;REFB=-0.0221282;REVB=-0.00938178;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173577;STB=0.628868;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0280117;OID=.;OPOS=3650991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:18:16:17:0.485714:4:12:10:7:4:13:10:8 chr16 3656625 . G A 104.3 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0363198;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.298;QD=19.8665;RBI=0.0372984;REFB=0.000175968;REVB=0.00848785;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416756;STB=0.52377;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.000343189;OID=.;OPOS=3656625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:4:5:6:6:4:5 chr16 3724352 . G A 506.27 PASS AF=0.5;AO=53;DP=106;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.00914437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.134;QD=19.1043;RBI=0.0141276;REFB=-0.0312463;REVB=-0.0107689;RO=53;SAF=35;SAR=18;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242843;STB=0.634466;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0463843;OID=.;OPOS=3724352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:53:53:53:53:0.5:18:35:21:32:18:35:21:32 chr16 3724465 . G C 453.5 PASS AF=0.421488;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.030483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7966;QD=14.9916;RBI=0.0304845;REFB=0.0165436;REVB=0.000309118;RO=69;SAF=30;SAR=21;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988687;STB=0.551704;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.0277878;OID=.;OPOS=3724465;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:69:70:51:51:0.421488:21:30:34:35:21:30:35:35 chr16 3726074 . GG CA 169.29 PASS AF=0.422222;AO=17;DP=44;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0283404;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=95.6761;QD=15.0481;RBI=0.0370513;REFB=-0.0221805;REVB=0.0238668;RO=26;SAF=5;SAR=12;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228353;STB=0.650994;STBP=0.112;TYPE=mnp;VARB=0.029558;OID=.;OPOS=3726074;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:26:26:17:19:0.422222:12:5:13:13:14:5:13:13 chr16 3729714 . G A 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0141504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.94;QD=17.4015;RBI=0.0328265;REFB=-0.0445242;REVB=0.02962;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991777;STB=0.578191;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0309662;OID=.;OPOS=3729714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:13:13:13:0.5:8:5:6:6:8:5:7:6 chr16 4015313 . A G 200.0 PASS AF=0.5;AO=17;DP=38;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0253011;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.102;QD=19.9995;RBI=0.0320304;REFB=-0.0313667;REVB=0.0196419;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230532;STB=0.629416;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0213027;OID=.;OPOS=4015313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:21:20:17:20:0.5:9:8:5:16:11:9:4:16 chr16 4015316 . A G 199.63 PASS AF=0.512821;AO=17;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.00806028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5908;QD=20.4744;RBI=0.0611524;REFB=-0.0161918;REVB=-0.0606189;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218064;STB=0.620579;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.013226;OID=.;OPOS=4015316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:19:17:20:0.512821:10:7:4:16:11:9:4:15 chr16 4016463 . G A 181.18 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=0.0115524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.045;QD=11.3237;RBI=0.0116084;REFB=-0.0113666;REVB=-0.00113879;RO=40;SAF=22;SAR=1;SRF=33;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428742;STB=0.758308;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0245532;OID=.;OPOS=4016463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:40:41:23:23:0.359375:1:22:33:7:1:22:34:7 chr16 4016676 . A G 370.09 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0216912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.658;QD=19.738;RBI=0.0321214;REFB=-0.0158172;REVB=0.0236913;RO=36;SAF=23;SAR=15;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310985;STB=0.522598;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0183825;OID=.;OPOS=4016676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:37:38:38:0.506667:15:23:23:13:15:23:24:13 chr16 4027605 . C T 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0393468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.281;QD=17.6172;RBI=0.0393482;REFB=-0.00916264;REVB=0.000330663;RO=27;SAF=16;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2793;STB=0.657762;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0147432;OID=.;OPOS=4027605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:8:16:10:17:8:16:10:17 chr16 4165432 . T C 216.31 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.857;QD=48.069;RBI=0.105503;REFB=0;REVB=0.0856964;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00587693;OID=.;OPOS=4165432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:11:6:0:0:12:6:0:0 chr16 4257628 . T C 84.33 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0134713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.585;QD=10.5417;RBI=0.0138623;REFB=0.00767494;REVB=-0.0032692;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280966;STB=0.666389;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0163465;OID=.;OPOS=4257628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:6:5:15:6:6:5:15:6 chr16 4307646 . A G 325.43 PASS AF=0.347458;AO=41;DP=118;FAO=41;FDP=118;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=52;FWDB=0.0129681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6566;QD=11.0316;RBI=0.0540858;REFB=0.00472101;REVB=0.0525081;RO=77;SAF=23;SAR=18;SRF=25;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263995;STB=0.650699;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00814957;OID=.;OPOS=4307646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:77:77:41:41:0.347458:18:23:25:52:18:23:25:52 chr16 4310468 . C G 353.49 PASS AF=0.377193;AO=42;DP=113;FAO=43;FDP=114;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=0.0216014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.567;QD=12.4032;RBI=0.0327508;REFB=-0.00716626;REVB=0.0246169;RO=71;SAF=17;SAR=25;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113811;STB=0.55553;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0103701;OID=.;OPOS=4310468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:71:71:42:43:0.377193:25:17:36:35:25:18:36:35 chr16 4386814 . T C 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.273;QD=61.048;RBI=0.013795;REFB=0;REVB=0.0125672;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33873e-05;OID=.;OPOS=4386814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0 chr16 4386961 . G A 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.817;QD=12.3961;RBI=0.0300739;REFB=-0.00879735;REVB=0.0300739;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00808393;OID=.;OPOS=4386961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:5:0:0:5:5:0:0:5 chr16 4414631 . GTCGGTG GTCGGGTG,GTCGGT,TCGGGTG 33.7 PASS AF=0.2,0,0;AO=7,7,2;DP=40;FAO=8,0,0;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=7,0,0;FSAR=1,0,0;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0954695,-0.00374402,0.0380653;FXX=0;HRUN=2,2,5;LEN=1,1,3;MLLD=17.0602,22.1211,28.6694;QD=3.37031;RBI=0.180182,0.29177,0.0751171;REFB=-0.0456901,-0.0240321,-0.0135882;REVB=-0.152811,-0.291746,-0.0647581;RO=24;SAF=5,0,2;SAR=2,7,0;SRF=13;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.216323,-0.733522,0.470037;STB=0.874063,0.5,0.5;STBP=0.035,1,1;TYPE=ins,del,mnp;VARB=0.143306,0,0;OID=.,.,.;OPOS=4414634,4414637,4414631;OREF=-,G,GTC;OALT=G,-,TCG;OMAPALT=GTCGGGTG,GTCGGT,TCGGGTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:40:40:24:32:7,7,2:8,0,0:0.2,0,0:2,7,0:5,0,2:13:11:1,0,0:7,0,0:13:19 chr16 4414987 . G A 171.2 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00981568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.575;QD=17.5589;RBI=0.0145907;REFB=-0.0205249;REVB=-0.0107954;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479068;STB=0.527243;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0369359;OID=.;OPOS=4414987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:5:13:16:5:5:13:16:5 chr16 4431202 . A G 2387.24 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.874;QD=64.0871;RBI=0.0713295;REFB=0;REVB=0.00340078;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109637;OID=.;OPOS=4431202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:149:0:0:148:149:1:79:69:0:0:79:70:0:0 chr16 4432029 . A C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.203;QD=61.3363;RBI=0.0314041;REFB=0;REVB=0.00330412;RO=0;SAF=4;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81748e-05;OID=.;OPOS=4432029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:36:4:0:0:36:4:0:0 chr16 4445327 . C G,T 655.71 PASS AF=0.0465116,0.953488;AO=2,41;DP=43;FAO=2,41;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=2,14;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00778415,0.000854705;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=8.69765,151.342;QD=60.996;RBI=0.0201456,0.0112506;REFB=0,0;REVB=-0.0185809,0.0112181;RO=0;SAF=2,14;SAR=0,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.159719,-0.00047433;OID=.,.;OPOS=4445327,4445327;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:43:43:0:0:2,41:2,41:0.0465116,0.953488:0,27:2,14:0:0:0,27:2,14:0:0 chr16 4476089 . T C 930.01 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011548;FXX=0.0307645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.492;QD=59.0484;RBI=0.0280308;REFB=0;REVB=0.0255416;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903352;OID=.;OPOS=4476089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0 chr16 4484396 . A T 357.78 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0544;QD=55.0429;RBI=0.0276261;REFB=0;REVB=-0.0164074;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000920128;OID=.;OPOS=4484396;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr16 4496973 . T A 769.48 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.068;QD=56.9989;RBI=0.0257041;REFB=0;REVB=0.0117259;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03832e-05;OID=.;OPOS=4496973;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0 chr16 4625470 . C G 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0087095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8031;QD=14.6651;RBI=0.0193005;REFB=-0.0227522;REVB=-0.0172236;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199743;STB=0.615237;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0407876;OID=.;OPOS=4625470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:8:7:14:7:8:7:14:7 chr16 4625812 . G A 75.54 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.048196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.033;QD=11.6222;RBI=0.0482915;REFB=-0.033129;REVB=-0.00303573;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181314;STB=0.630875;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0470737;OID=.;OPOS=4625812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:7:3:7:8:7:3:8:8 chr16 4708959 . G C 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0744405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.874;QD=14.6521;RBI=0.0747523;REFB=-0.0189118;REVB=0.00682056;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505365;STB=0.805371;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0223593;OID=.;OPOS=4708959;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:1:4:1:5:1:4 chr16 4709131 . C A 221.08 PASS AF=0.740741;AO=20;DP=27;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0241493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0798;QD=32.7521;RBI=0.0465744;REFB=0.0299669;REVB=-0.0398245;RO=7;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124167;STB=0.568198;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.0124567;OID=.;OPOS=4709131;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:7:7:20:20:0.740741:11:9:5:2:11:9:5:2 chr16 4721468 . T C 138.41 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00667286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.754;QD=11.7795;RBI=0.0145976;REFB=-0.0105258;REVB=0.0129831;RO=30;SAF=10;SAR=6;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02918;STB=0.530687;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0156187;OID=.;OPOS=4721468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:30:31:16:16:0.340426:6:10:18:12:6:10:18:13 chr16 4736316 . C T 293.31 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0165067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.737;QD=14.8511;RBI=0.0202917;REFB=-0.00530314;REVB=0.0118018;RO=46;SAF=18;SAR=15;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205269;STB=0.511621;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00775508;OID=.;OPOS=4736316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:15:18:26:20:15:18:26:20 chr16 4748825 . C T 33.46 PASS AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0811895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1757;QD=5.14708;RBI=0.08792;REFB=-0.00696736;REVB=-0.0337372;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367368;STB=0.730163;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0562275;OID=.;OPOS=4748825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:26:26:20:20:6:6:0.230769:3:3:4:16:3:3:4:16 chr16 4752134 . A G 157.74 PASS AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.00733341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.165;QD=11.2668;RBI=0.0417808;REFB=-0.00638272;REVB=-0.0411322;RO=36;SAF=8;SAR=12;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287522;STB=0.666508;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0111307;OID=.;OPOS=4752134;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:12:8:24:12:12:8:24:12 chr16 4790273 . G A 289.47 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0661767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.064;QD=25.7303;RBI=0.0955565;REFB=0.0163979;REVB=0.0689324;RO=19;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192935;STB=0.605986;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00874413;OID=.;OPOS=4790273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:10:16:16:3:10:16:16:3 chr16 4794873 . C T 374.23 PASS AF=0.46988;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.000732214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.656;QD=18.0352;RBI=0.00606711;REFB=-0.0169178;REVB=0.00602277;RO=44;SAF=19;SAR=20;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11983;STB=0.566818;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0229824;OID=.;OPOS=4794873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:44:44:39:39:0.46988:20:19:27:17:20:19:27:17 chr16 4796393 . A G 173.63 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0176768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.185;QD=13.6181;RBI=0.0226928;REFB=-0.00861179;REVB=0.01423;RO=29;SAF=18;SAR=2;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5038;STB=0.817796;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0119368;OID=.;OPOS=4796393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:31:20:20:0.392157:2:18:16:13:2:18:16:15 chr16 4797457 . C T 720.9 PASS AF=0.565574;AO=69;DP=122;FAO=69;FDP=122;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.000505369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.7048;QD=23.6361;RBI=0.0387563;REFB=-0.0111581;REVB=-0.038753;RO=52;SAF=32;SAR=37;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07392;STB=0.536221;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0103301;OID=.;OPOS=4797457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:52:53:69:69:0.565574:37:32:29:23:37:32:29:24 chr16 4802386 . G T 321.82 PASS AF=0.423529;AO=34;DP=84;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.112603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8963;QD=15.1445;RBI=0.112952;REFB=0.00446076;REVB=-0.00886628;RO=50;SAF=18;SAR=16;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176647;STB=0.618493;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00725681;OID=.;OPOS=4802386;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:50:49:34:36:0.423529:16:18:18:32:16:20:17:32 chr16 4815602 . T C 66.72 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00977559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.831;QD=12.7087;RBI=0.0188393;REFB=-0.0266699;REVB=0.0161046;RO=12;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347481;STB=0.713701;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0340485;OID=.;OPOS=4815602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:1:8:8:4:1:8:8:4 chr16 4815608 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2968;QD=53.277;RBI=0.0701991;REFB=0;REVB=-0.0684684;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00108562;OID=.;OPOS=4815608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0 chr16 4861709 . G C 785.89 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.048;QD=64.1539;RBI=0.0408954;REFB=0;REVB=0.036912;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.12232e-05;OID=.;OPOS=4861709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:26:22:0:0:26:23:0:0 chr16 4930100 . C T 495.08 PASS AF=0.5;AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0252593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2139;QD=20.6281;RBI=0.0252825;REFB=0.000596027;REVB=-0.00108271;RO=45;SAF=25;SAR=23;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305134;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00029351;OID=.;OPOS=4930100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:45:48:48:48:0.5:23:25:25:20:23:25:25:23 chr16 4933939 . G C 65.63 PASS AF=0.375;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.017652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.017;QD=10.9385;RBI=0.0205644;REFB=-0.0149348;REVB=0.01055;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170594;STB=0.52824;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0170425;OID=.;OPOS=4933939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:24:13:15:9:9:0.375:4:5:7:6:4:5:9:6 chr16 4935146 . C T 223.51 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.028636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.494;QD=14.9008;RBI=0.029651;REFB=-0.0172708;REVB=0.00769159;RO=34;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00907633;STB=0.505151;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0166432;OID=.;OPOS=4935146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:12:14:18:16:12:14:18:16 chr16 4935636 . G A 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0263939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.885;QD=18.2488;RBI=0.0491824;REFB=0.00371834;REVB=0.0415002;RO=12;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191108;STB=0.610503;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.0028023;OID=.;OPOS=4935636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:10:3:5:7:10:3:5:7 chr16 4935823 . C G 722.34 PASS AF=0.551181;AO=68;DP=125;FAO=70;FDP=127;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0194278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.834;QD=22.7509;RBI=0.0301091;REFB=-0.0202326;REVB=-0.0230025;RO=57;SAF=33;SAR=35;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195489;STB=0.516778;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0213144;OID=.;OPOS=4935823;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:57:57:68:70:0.551181:35:33:29:28:37:33:29:28 chr16 4938160 . T G 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.71;QD=57.8837;RBI=0.0221153;REFB=0;REVB=0.00862156;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.04006e-05;OID=.;OPOS=4938160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0 chr16 4940809 . A G 1372.89 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4642;QD=62.4041;RBI=0.0581414;REFB=0;REVB=-0.0581081;RO=0;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404614;OID=.;OPOS=4940809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:53:34:0:0:54:34:0:0 chr16 4942099 . C T 404.26 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0100096;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.577;QD=21.8518;RBI=0.0233547;REFB=-0.0073255;REVB=-0.021101;RO=33;SAF=26;SAR=14;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11651;STB=0.558709;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.006915;OID=.;OPOS=4942099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:33:34:40:40:0.540541:14:26:17:16:14:26:18:16 chr16 4944518 . C G 520.06 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.77;QD=59.4353;RBI=0.0116138;REFB=0;REVB=-0.000986854;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94751e-05;OID=.;OPOS=4944518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:18:16:0:0:18:17:0:0 chr16 5050897 . G C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00842106;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.16;QD=12.051;RBI=0.046827;REFB=-0.0107574;REVB=-0.0460636;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242158;STB=0.643262;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0288102;OID=.;OPOS=5050897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:4:9:4:5:4:9 chr16 5068152 . C T 253.72 PASS AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0328758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9893;QD=28.1908;RBI=0.0464857;REFB=0.00959393;REVB=0.0328648;RO=13;SAF=13;SAR=10;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335267;STB=0.518502;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00677744;OID=.;OPOS=5068152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:10:13:8:5:10:13:8:5 chr16 5074952 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.598;QD=60.9786;RBI=0.00972289;REFB=0;REVB=0.00376798;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44472e-05;OID=.;OPOS=5074952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr16 5075542 . G A 1066.64 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289656;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.148;QD=60.0922;RBI=0.0309821;REFB=0;REVB=-0.0109949;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36558e-05;OID=.;OPOS=5075542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0 chr16 5128817 . G A 200.92 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0168148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.666;QD=15.1638;RBI=0.0168151;REFB=-0.0282552;REVB=0.000109207;RO=29;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577269;STB=0.52468;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0374686;OID=.;OPOS=5128817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:29:30:23:23:0.433962:9:14:16:13:9:14:17:13 chr16 5132636 . C T 154.09 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0288759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.24;QD=14.3343;RBI=0.0409757;REFB=-0.0142106;REVB=-0.0290721;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905827;STB=0.552425;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0281311;OID=.;OPOS=5132636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:9:8:10:16:9:8:10:16 chr16 5139186 . G C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00951621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.636;QD=49.5992;RBI=0.0319472;REFB=0;REVB=0.0304969;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91515e-05;OID=.;OPOS=5139186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr16 5139217 . C G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011976;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.865;QD=44.6898;RBI=0.0243257;REFB=0;REVB=0.0211734;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78121e-05;OID=.;OPOS=5139217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr16 5140561 . C T 199.65 PASS AF=0.47619;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.00257733;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.713;QD=19.0138;RBI=0.0107198;REFB=-0.00827524;REVB=0.0104054;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110866;STB=0.57136;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00772123;OID=.;OPOS=5140561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:21:22:20:20:0.47619:12:8:6:15:12:8:6:16 chr16 5649140 . T TTAGGAAA 725.77 PASS AF=1;AO=49;DP=62;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345373;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=7;MLLD=336.418;QD=56.9228;RBI=0.0389018;REFB=0;REVB=0.0179032;RO=11;SAF=22;SAR=27;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156426;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=5.24557e-05;OID=.;OPOS=5649141;OREF=-;OALT=TAGGAAA;OMAPALT=TTAGGAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:49:62:51:51:0:23:28:0:0:4:11:22:27:10:1 chr16 6923966 . A G 1208.93 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.084;QD=61.2115;RBI=0.0498313;REFB=0;REVB=0.0433807;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357367;OID=.;OPOS=6923966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0 chr16 7102036 . CT C 846.31 PASS AF=1;AO=76;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00914126;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.9028;QD=35.6341;RBI=0.19294;REFB=-4.0183e-05;REVB=0.192723;RO=8;SAF=46;SAR=30;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883888;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00483358;OID=.;OPOS=7102037;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:76:94:95:95:0:51:44:0:0:11:8:46:30:1:7 chr16 7760884 . T G 672.08 PASS AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00271432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.45;QD=52.7123;RBI=0.00282764;REFB=-0.0898576;REVB=-0.000792462;RO=2;SAF=23;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00156907;STB=0.5004;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.000419262;OID=.;OPOS=7760884;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:51:2:2:48:49:0.960784:25:23:1:1:25:24:1:1 chr16 7761529 . C T 538.28 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.435;QD=59.8089;RBI=0.0420073;REFB=0;REVB=0.0414697;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020792;OID=.;OPOS=7761529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:19:16:0:0:20:16:0:0 chr16 8728953 . C T 1785.86 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.177;QD=61.0549;RBI=0.0337526;REFB=0;REVB=0.0189473;RO=0;SAF=56;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.13058e-05;OID=.;OPOS=8728953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:61:56:0:0:61:56:0:0 chr16 8729124 . G A 415.03 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0057533;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1519;QD=57.2459;RBI=0.0481288;REFB=0;REVB=0.0477837;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000633147;OID=.;OPOS=8729124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr16 8736028 . T C 2049.86 PASS AF=1;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0644902;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2533;QD=62.5912;RBI=0.0864211;REFB=0;REVB=-0.0575293;RO=0;SAF=55;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000521591;OID=.;OPOS=8736028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:132:131:0:0:131:131:1:76:55:0:0:76:55:0:0 chr16 8738427 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.306;QD=62.0219;RBI=0.0496966;REFB=0;REVB=0.0410261;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216685;OID=.;OPOS=8738427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr16 8738499 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.961;QD=63.2864;RBI=0.0206951;REFB=0;REVB=-0.000928033;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014259;OID=.;OPOS=8738499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0 chr16 8738579 . A G 306.32 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.972;QD=53.2735;RBI=0.0671392;REFB=0;REVB=0.0359878;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000479298;OID=.;OPOS=8738579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr16 8739954 . G A 1102.56 PASS AF=1;AO=67;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3962;QD=60.4142;RBI=0.0665024;REFB=0;REVB=0.0594249;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498874;OID=.;OPOS=8739954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:67:73:1:33:34:0:0:39:34:0:0 chr16 8740015 . A C 1017.09 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443283;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4024;QD=59.829;RBI=0.0475362;REFB=0;REVB=-0.0171668;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000910784;OID=.;OPOS=8740015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0 chr16 8740418 . T C 1153.59 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.762;QD=60.7151;RBI=0.013391;REFB=0;REVB=-0.000245876;RO=0;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86654e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.13135e-05;OID=.;OPOS=8740418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:48:28:0:0:48:28:0:0 chr16 8740503 . G A 806.5 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250651;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.078;QD=57.6068;RBI=0.0380064;REFB=0;REVB=0.0285696;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110804;OID=.;OPOS=8740503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:54:56:1:32:22:0:0:34:22:0:0 chr16 8839954 . A G 162.55 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0354331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.541;QD=19.7024;RBI=0.0401108;REFB=-0.017459;REVB=-0.0187982;RO=16;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204867;STB=0.511614;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0139365;OID=.;OPOS=8839954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:11:6:6:10:11:6:6:10 chr16 8841960 . T C 395.06 PASS AF=0.460674;AO=40;DP=88;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.00824325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.792;QD=17.7553;RBI=0.0142256;REFB=-0.0170301;REVB=0.0115938;RO=48;SAF=20;SAR=20;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16288;STB=0.596025;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0315557;OID=.;OPOS=8841960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:48:48:40:41:0.460674:20:20:16:32:20:21:16:32 chr16 8875763 . T C 355.77 PASS AF=1;AO=23;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.06;QD=54.7344;RBI=0.0513928;REFB=0;REVB=0.0274097;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000972647;OID=.;OPOS=8875763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:23:26:1:13:10:0:0:14:12:0:0 chr16 8948433 . C T 104.63 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0995498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0923;QD=19.929;RBI=0.101029;REFB=-0.0158224;REVB=0.0172264;RO=8;SAF=7;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314284;STB=0.650921;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0594573;OID=.;OPOS=8948433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:8:9:12:12:0.571429:5:7:1:7:5:7:2:7 chr16 8948437 . C T 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0710086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.829;QD=22.6315;RBI=0.072754;REFB=-0.0113574;REVB=0.0158408;RO=8;SAF=8;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321478;STB=0.680587;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0141868;OID=.;OPOS=8948437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:5:8:1:7:5:8:1:7 chr16 8952248 . A G 501.06 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0063024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.768;QD=58.9481;RBI=0.00944975;REFB=0;REVB=0.00704113;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76879e-05;OID=.;OPOS=8952248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:22:10:0:0:23:11:0:0 chr16 8979046 . A G 1026.28 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.153;QD=59.4946;RBI=0.0274404;REFB=0;REVB=-0.017011;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31847e-05;OID=.;OPOS=8979046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr16 9030444 . C G 901.69 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7288;QD=58.1733;RBI=0.0733645;REFB=0;REVB=0.0732534;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000756257;OID=.;OPOS=9030444;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr16 9211117 . CTTTTTTTTTTTTT CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTG 185.25 PASS AF=0.5625,0.1875,0.25;AO=10,7,6;DP=34;FAO=18,6,8;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12,6,8;FSAR=6,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123799,0.237955,0.14729;FXX=0.0856898;HRUN=13,13,13;LEN=2,1,1;MLLD=7.8904,4.56742,13.1547;QD=23.1559;RBI=0.135388,0.289987,0.192147;REFB=-0.0678649,-0.0687984,-0.0943864;REVB=-0.0548069,-0.165741,-0.123394;RO=5;SAF=5,7,6;SAR=5,0,0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.295997,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.119609,0.0951491,-0.110311;OID=.,.,.;OPOS=9211118,9211118,9211130;OREF=TT,T,T;OALT=-,-,G;OMAPALT=CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.5625,0.1875,0.25:10,7,6:34:18,6,8:32:0:12,6,8:6,0,0:0:0:37:5:5,7,6:5,0,0:5:0 chr16 9693953 . C G 58.7 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0182504;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.799;QD=14.6762;RBI=0.0240816;REFB=-0.0362618;REVB=-0.0157113;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213494;STB=0.624687;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0251349;OID=.;OPOS=9693953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:16:16:6:8:8:8:0.5:3:5:2:4:3:5:3:5 chr16 9693997 . C G 48.24 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0173442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4176;QD=12.8628;RBI=0.0451636;REFB=-0.0310958;REVB=0.0417005;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308464;STB=0.685728;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0208227;OID=.;OPOS=9693997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:2:5:3:5:2:5:3:5 chr16 10315838 . T C 52.35 PASS AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0165698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4609;QD=6.54426;RBI=0.0364238;REFB=-0.0149367;REVB=-0.0324367;RO=24;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391027;STB=0.76009;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0259916;OID=.;OPOS=10315838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:7:1:9:15:7:1:9:15 chr16 10524957 . G T 1156.95 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121133;FXX=0.0129853;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.919;QD=60.8919;RBI=0.0202501;REFB=0;REVB=0.0162275;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57505e-06;OID=.;OPOS=10524957;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0 chr16 10525230 . T C 716.43 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.962;QD=62.2984;RBI=0.0411947;REFB=0;REVB=0.0225418;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115746;OID=.;OPOS=10525230;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr16 10631912 . C T 344.06 PASS AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0186157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.148;QD=31.2784;RBI=0.0235928;REFB=-0.0240549;REVB=0.014494;RO=15;SAF=12;SAR=17;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754768;STB=0.541372;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0118664;OID=.;OPOS=10631912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:17:12:8:7:17:12:8:7 chr16 10769958 . T C 868.49 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.031;QD=57.8994;RBI=0.0242493;REFB=0;REVB=0.0173613;RO=0;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49224e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45683e-07;OID=.;OPOS=10769958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:18:41:0:0:18:42:0:0 chr16 10775855 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.319;QD=51.1845;RBI=0.0244098;REFB=0;REVB=0.0103018;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102301;OID=.;OPOS=10775855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0 chr16 10788406 . G T 347.65 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0401026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.526;QD=51.503;RBI=0.0401091;REFB=0.151314;REVB=-0.000720877;RO=1;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617811;STB=0.533307;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.000904341;OID=.;OPOS=10788406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:7:19:0:1:7:19:0:1 chr16 10813648 . C T 205.36 PASS AF=0.428571;AO=23;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00262749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.122;QD=14.6688;RBI=0.0110891;REFB=-0.0101197;REVB=-0.0107733;RO=32;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301204;STB=0.526294;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.021801;OID=.;OPOS=10813648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:23:24:0.428571:15:8:12:20:16:8:12:20 chr16 10989219 . C G 270.58 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.000726384;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=62.4392;QD=16.9114;RBI=0.00246709;REFB=-0.0214801;REVB=-0.00235773;RO=34;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282214;STB=0.658982;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0094533;OID=.;OPOS=10989219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:21:9:20:14:21:9:20:14 chr16 10995933 . A G 490.73 PASS AF=0.971429;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0226337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.832;QD=56.0837;RBI=0.0653535;REFB=-0.0476748;REVB=0.061309;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.514277;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000663148;OID=.;OPOS=10995933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:35:0:1:33:34:0.971429:16:17:0:0:17:17:0:1 chr16 11001743 . G A 272.09 PASS AF=0.641026;AO=24;DP=38;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00341486;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.9823;QD=27.9069;RBI=0.0521148;REFB=-0.0421541;REVB=0.0520028;RO=14;SAF=14;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565342;STB=0.521722;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0196435;OID=.;OPOS=11001743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:14:14:24:25:0.641026:10:14:7:7:11:14:7:7 chr16 11002133 . C G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2071;QD=57.2025;RBI=0.0179213;REFB=0;REVB=0.00645147;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114329;OID=.;OPOS=11002133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:24:6:0:0:24:6:0:0 chr16 11002904 . G A 1030.44 PASS AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.032306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.212;QD=58.0528;RBI=0.106189;REFB=-0.121317;REVB=0.101156;RO=1;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171851;STB=0.508769;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00201743;OID=.;OPOS=11002904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:27:42:0:1:28:42:0:1 chr16 11002927 . A G 1044.37 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00141349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.555;QD=59.678;RBI=0.033089;REFB=0;REVB=0.0330588;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13288e-05;OID=.;OPOS=11002927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0 chr16 11023208 . T C 249.95 PASS AF=0.361446;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=83;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0526401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.184;QD=12.0455;RBI=0.0527509;REFB=0.000687686;REVB=0.00341787;RO=53;SAF=11;SAR=19;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566528;STB=0.532688;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=-0.00152652;OID=.;OPOS=11023208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:53:53:30:30:0.361446:19:11:22:31:19:11:22:31 chr16 11361895 . C G 311.85 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00841297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.582;QD=16.6319;RBI=0.0103001;REFB=-0.0110388;REVB=-0.0059426;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355935;STB=0.519988;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.012846;OID=.;OPOS=11361895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:17:17:19:22:17:17:19:22 chr16 11362729 . G A 177.31 PASS AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00642168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.361;QD=12.2284;RBI=0.0176408;REFB=-0.012424;REVB=0.0164304;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210415;STB=0.620586;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0283828;OID=.;OPOS=11362729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:11:11:25:11:11:11:25:11 chr16 11367143 . G A 699.0 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0429745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.7;QD=54.8239;RBI=0.0508256;REFB=-0.0678243;REVB=0.0271373;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000232184;OID=.;OPOS=11367143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:27:23:0:0:27:23:1:0 chr16 11367154 . C T 199.49 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0184474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1731;QD=15.646;RBI=0.0340017;REFB=-0.0295931;REVB=-0.0285624;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179427;STB=0.529385;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0332872;OID=.;OPOS=11367154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:29:22:22:0.431373:11:11:13:14:11:11:13:16 chr16 11374866 . G T 299.2 PASS AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00360612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9505;QD=13.7563;RBI=0.0147856;REFB=-0.0091073;REVB=-0.0143391;RO=53;SAF=14;SAR=20;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184072;STB=0.604777;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0171686;OID=.;OPOS=11374866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:53:53:34:34:0.390805:20:14:31:22:20:14:31:22 chr16 11387117 . A G 1540.36 PASS AF=0.990476;AO=103;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0128635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.88;QD=58.6802;RBI=0.0134411;REFB=-0.158371;REVB=-0.00389771;RO=1;SAF=32;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00663701;STB=0.503496;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=3.14916e-05;OID=.;OPOS=11387117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:1:1:103:104:0.990476:71:32:0:1:71:33:0:1 chr16 11387164 . T C 1171.99 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.219;QD=60.8827;RBI=0.0392536;REFB=0;REVB=0.0388773;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.55212e-05;OID=.;OPOS=11387164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:50:27:0:0:50:27:0:0 chr16 11444572 . A C 362.54 PASS AF=0.369748;AO=44;DP=119;FAO=44;FDP=119;FR=.;FRO=75;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.00830778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.618;QD=12.1861;RBI=0.0157574;REFB=-0.01989;REVB=-0.0133894;RO=75;SAF=14;SAR=30;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174455;STB=0.599953;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0258181;OID=.;OPOS=11444572;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:75:75:44:44:0.369748:30:14:35:40:30:14:35:40 chr16 11540712 . T C 236.58 PASS AF=0.560976;AO=21;DP=39;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0679411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.779;QD=23.0812;RBI=0.0691169;REFB=-0.0285504;REVB=0.012695;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203967;STB=0.568658;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0229786;OID=.;OPOS=11540712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:18:18:21:23:0.560976:16:5:8:10:16:7:8:10 chr16 11541896 . G A 310.53 PASS AF=0.613636;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0585357;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0921;QD=28.2296;RBI=0.0622567;REFB=-0.0122423;REVB=0.0212007;RO=16;SAF=10;SAR=17;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912786;STB=0.540605;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00888226;OID=.;OPOS=11541896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:16:17:27:27:0.613636:17:10:8:8:17:10:8:9 chr16 11650325 . G A 96.19 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0229948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5181;QD=12.0231;RBI=0.0373759;REFB=-0.0406137;REVB=0.0294652;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18246;STB=0.608509;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0686509;OID=.;OPOS=11650325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:8:4:10:10:8:4:10:10 chr16 11658459 . A AT 124.76 PASS AF=0.306122;AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.000523144;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=217.146;QD=10.1847;RBI=0.032685;REFB=-0.0084693;REVB=-0.0326808;RO=34;SAF=11;SAR=4;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189318;STB=0.614744;STBP=0.305;TYPE=ins;VARB=0.014918;OID=.;OPOS=11658460;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.306122:15:49:15:49:34:11:4:20:14:99:34:11:4:20:14 chr16 11852354 . A C 670.11 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00443957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2274;QD=62.3356;RBI=0.0686915;REFB=0;REVB=-0.0685478;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00109348;OID=.;OPOS=11852354;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr16 11969724 . G C 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.653;QD=57.1056;RBI=0.0192892;REFB=0;REVB=0.0149673;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35359e-05;OID=.;OPOS=11969724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0 chr16 12027474 . CAT C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598486;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=279.68;QD=33.4285;RBI=0.0599088;REFB=0;REVB=0.00268489;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000578554;OID=.;OPOS=12027475;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:6:6:6:0:1:5:0:0:4:0:1:5:0:0 chr16 12060163 . A G 699.32 PASS AF=0.913793;AO=53;DP=58;FAO=53;FDP=58;FR=.;FRO=5;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.015523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.893;QD=48.2292;RBI=0.039373;REFB=-0.071603;REVB=0.0361839;RO=3;SAF=18;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722727;STB=0.543002;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00117209;OID=.;OPOS=12060163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:58:58:3:5:53:53:0.913793:35:18:3:0:35:18:4:1 chr16 12162969 . A G 393.11 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.00403144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.408;QD=19.6554;RBI=0.0139738;REFB=-0.00397693;REVB=-0.0133796;RO=39;SAF=19;SAR=21;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10426;STB=0.550353;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00479675;OID=.;OPOS=12162969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:40:40:40:0.5:21:19:14:25:21:19:15:25 chr16 12183686 . C T 235.54 PASS AF=0.341176;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.0120036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.938;QD=11.0841;RBI=0.0390052;REFB=-0.0145586;REVB=0.0371122;RO=55;SAF=13;SAR=16;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483676;STB=0.522433;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0381174;OID=.;OPOS=12183686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:56:29:29:0.341176:16:13:27:28:16:13:27:29 chr16 12621176 . C G 837.29 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0806169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.416;QD=55.8191;RBI=0.0821102;REFB=-0.101527;REVB=-0.0155881;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00151786;OID=.;OPOS=12621176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:29:30:0:0:29:30:1:0 chr16 12666984 . T A 582.41 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00166202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.252;QD=58.241;RBI=0.017152;REFB=-0.0418522;REVB=0.0170713;RO=1;SAF=16;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028395;STB=0.515144;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00256746;OID=.;OPOS=12666984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:23:16:1:0:23:16:1:0 chr16 12667393 . G A 331.7 PASS AF=0.336;AO=42;DP=125;FAO=42;FDP=125;FR=.;FRO=83;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=-0.0163205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.052;QD=10.6144;RBI=0.0169223;REFB=-0.0110136;REVB=-0.00447278;RO=82;SAF=27;SAR=15;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168021;STB=0.593594;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0163543;OID=.;OPOS=12667393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:82:83:42:42:0.336:15:27:41:41:15:27:42:41 chr16 12667409 . C A 363.59 PASS AF=0.372881;AO=44;DP=118;FAO=44;FDP=118;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.0222605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.199;QD=12.3249;RBI=0.0244439;REFB=-0.00770493;REVB=-0.0100982;RO=74;SAF=28;SAR=16;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139307;STB=0.579581;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0206611;OID=.;OPOS=12667409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:74:74:44:44:0.372881:16:28:38:36:16:28:38:36 chr16 12667945 . C T 565.28 PASS AF=0.444444;AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=-0.00571046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.261;QD=16.7491;RBI=0.0132676;REFB=0.00218176;REVB=0.0119758;RO=75;SAF=27;SAR=33;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105428;STB=0.558649;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00370497;OID=.;OPOS=12667945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:75:75:60:60:0.444444:33:27:26:49:33:27:26:49 chr16 12758966 . T C 381.5 PASS AF=0.704545;AO=31;DP=44;FAO=31;FDP=44;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00768492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.467;QD=34.6814;RBI=0.00989064;REFB=-0.00641278;REVB=-0.0062263;RO=13;SAF=16;SAR=15;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295913;STB=0.516119;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00286585;OID=.;OPOS=12758966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:13:13:31:31:0.704545:15:16:6:7:15:16:6:7 chr16 12897578 . G T 902.55 PASS AF=0.526627;AO=89;DP=168;FAO=89;FDP=169;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=-0.0109759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.693;QD=21.3622;RBI=0.0169519;REFB=-0.00168527;REVB=0.0129189;RO=77;SAF=38;SAR=51;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791154;STB=0.54676;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00123533;OID=.;OPOS=12897578;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:77:80:89:89:0.526627:51:38:40:37:51:38:42:38 chr16 13002359 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.497;QD=59.143;RBI=0.0149359;REFB=0;REVB=0.000127533;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.21539e-05;OID=.;OPOS=13002359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0 chr16 14041958 . T C 300.05 PASS AF=0.684211;AO=25;DP=37;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.024332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4391;QD=31.5839;RBI=0.0267936;REFB=-0.0157168;REVB=0.0112184;RO=12;SAF=18;SAR=7;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868144;STB=0.542749;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00504046;OID=.;OPOS=14041958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:38:12:12:25:26:0.684211:7:18:10:2:7:19:10:2 chr16 14046149 . AT A 78.62 PASS AF=0.477778;AO=36;DP=92;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0029317;FXX=0.0217368;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.88232;QD=3.49433;RBI=0.0802019;REFB=-0.0640697;REVB=0.0801483;RO=37;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130022;STB=0.556903;STBP=0.322;TYPE=del;VARB=0.0332915;OID=.;OPOS=14046150;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477778:36:92:43:90:47:23:20:20:27:78:37:19:17:19:18 chr16 14969016 . T A 98.96 PASS AF=0.216216;AO=16;DP=74;FAO=16;FDP=74;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.00313947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.64;QD=5.34935;RBI=0.0121543;REFB=-0.00632181;REVB=-0.0117418;RO=58;SAF=10;SAR=6;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028285;STB=0.517835;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0194125;OID=.;OPOS=14969016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:74:74:58:58:16:16:0.216216:6:10:35:23:6:10:35:23 chr16 15082865 . C T 204.97 PASS AF=0.555556;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0440782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.0363;QD=22.7742;RBI=0.0708992;REFB=-0.0239107;REVB=0.0555321;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132818;STB=0.562439;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0214157;OID=.;OPOS=15082865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:16:16:19:20:0.555556:10:9:5:11:11:9:5:11 chr16 15083131 . A T 59.16 PASS AF=0.2;AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0118514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.264;QD=5.25874;RBI=0.0137905;REFB=-0.0101498;REVB=-0.0070514;RO=36;SAF=3;SAR=6;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174346;STB=0.615122;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0231558;OID=.;OPOS=15083131;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:45:45:36:36:9:9:0.2:6:3:17:19:6:3:17:19 chr16 15091601 . G C 93.26 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00251849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.552;QD=19.6339;RBI=0.00252987;REFB=-0.0257447;REVB=0.000239765;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335209;STB=0.519196;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.015347;OID=.;OPOS=15091601;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:6:5:4:4:6:5:4:4 chr16 15092213 . A G 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0224991;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.731;QD=13.7531;RBI=0.02703;REFB=-0.0240192;REVB=0.0149804;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264628;STB=0.636506;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0265441;OID=.;OPOS=15092213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:8:7:16:6:8:7:16:7 chr16 15095675 . C A 77.91 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0365161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1976;QD=14.1661;RBI=0.0392392;REFB=-0.042974;REVB=-0.014363;RO=12;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120736;STB=0.57128;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.046277;OID=.;OPOS=15095675;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:3:7:7:5:3:7:7:5 chr16 15098047 . C G 255.69 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.000249368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.118;QD=17.9428;RBI=0.0178729;REFB=-0.0135378;REVB=-0.0178712;RO=29;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210789;STB=0.618235;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0175435;OID=.;OPOS=15098047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:10:18:12:17:10:18:12:17 chr16 15111218 . C T 147.2 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00611789;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.7921;QD=16.355;RBI=0.108254;REFB=-0.00418982;REVB=-0.10808;RO=20;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369908;STB=0.52125;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00428343;OID=.;OPOS=15111218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:20:20:16:16:0.444444:7:9:12:8:7:9:12:8 chr16 15116625 . G T 122.39 PASS AF=0.555556;AO=12;DP=25;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0120834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.308;QD=18.1324;RBI=0.0261393;REFB=-0.0551852;REVB=0.0231788;RO=11;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116603;STB=0.536535;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0270021;OID=.;OPOS=15116625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:27:11:12:12:15:0.555556:3:9:7:4:4:11:8:4 chr16 15129970 . A G 226.27 PASS AF=0.489362;AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0142912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.415;QD=19.2571;RBI=0.0142997;REFB=-0.0271962;REVB=0.000492964;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232452;STB=0.617882;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0153908;OID=.;OPOS=15129970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:22:23:0.489362:11:11:6:18:12:11:6:18 chr16 15131962 . A G 140.21 PASS AF=0.276316;AO=19;DP=73;FAO=21;FDP=76;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0030813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.7611;QD=7.37962;RBI=0.052936;REFB=-0.00280037;REVB=-0.0528462;RO=54;SAF=6;SAR=13;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272413;STB=0.606455;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00429424;OID=.;OPOS=15131962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:76:54:55:19:21:0.276316:13:6:29:25:13:8:29:26 chr16 15131974 . G T 138.9 PASS AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0179246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7822;QD=7.50808;RBI=0.0197271;REFB=-0.00331082;REVB=0.00823807;RO=54;SAF=8;SAR=12;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14379;STB=0.586869;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0132192;OID=.;OPOS=15131974;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:12:8:28:26:12:8:28:26 chr16 15133889 . T G 486.68 PASS AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0128957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.778;QD=16.6388;RBI=0.0129141;REFB=-0.0160809;REVB=0.000688849;RO=64;SAF=24;SAR=29;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000291679;STB=0.500163;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0207939;OID=.;OPOS=15133889;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:64:53:53:0.452991:29:24:29:35:29:24:29:35 chr16 15689721 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.882;QD=58.5871;RBI=0.0815766;REFB=0;REVB=0.0156074;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000633951;OID=.;OPOS=15689721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0 chr16 15696479 . GA AG,GAAGGAAAGAAGGAGGCAGAG 65.78 PASS AF=0.272727,0.454545;AO=3,5;DP=12;FAO=3,5;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=3,4;FSAR=0,1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0100765,0.00197845;FXX=0.0832639;HRUN=2,2;LEN=2,19;MLLD=248.621,236.293;QD=23.9191;RBI=0.019515,0.00730147;REFB=-0.0153759,-0.0140039;REVB=-0.0167123,-0.00702831;RO=4;SAF=3,4;SAR=0,1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.729277,0.425125;STB=0.996656,0.798796;STBP=0.041,0.078;TYPE=mnp,ins;VARB=0.00728836,0.0138012;OID=.,.;OPOS=15696479,15696481;OREF=GA,-;OALT=AG,AGGAAAGAAGGAGGCAGAG;OMAPALT=AG,GAAGGAAAGAAGGAGGCAGAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:21:12:11:4:3:3,5:3,5:0.272727,0.454545:0,1:3,4:1:3:0,1:3,4:0:3 chr16 15781054 . A G 805.31 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.889;QD=64.4247;RBI=0.0512063;REFB=0;REVB=0.0511371;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183862;OID=.;OPOS=15781054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:25:23:0:0:26:24:0:0 chr16 15843899 . G A 182.89 PASS AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123873;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=332.375;QD=43.0329;RBI=0.0146931;REFB=-0.11403;REVB=0.00790188;RO=1;SAF=12;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036598;STB=0.519975;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.000358385;OID=.;OPOS=15843899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:4:12:1:0:4:12:1:0 chr16 15917197 . G A 433.57 PASS AF=0.621212;AO=41;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.010947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6941;QD=26.2771;RBI=0.0381779;REFB=-0.0059574;REVB=0.0365748;RO=25;SAF=10;SAR=31;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196175;STB=0.607787;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0052796;OID=.;OPOS=15917197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:25:25:41:41:0.621212:31:10:12:13:31:10:12:13 chr16 15971028 . C G 538.53 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9151;QD=59.8366;RBI=0.0185813;REFB=0;REVB=-0.0119701;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177352;OID=.;OPOS=15971028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0 chr16 15973654 . G T 190.27 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0104323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.71;QD=21.7452;RBI=0.0104534;REFB=-0.00572546;REVB=0.000664277;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115419;STB=0.564886;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00367026;OID=.;OPOS=15973654;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:11:8:9:7:11:8:9:7 chr16 16138322 . T C 449.92 PASS AF=0.46875;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0104296;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.163;QD=18.7466;RBI=0.014272;REFB=-0.0210189;REVB=0.00974237;RO=51;SAF=23;SAR=22;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199303;STB=0.511106;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0249834;OID=.;OPOS=16138322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:51:51:45:45:0.46875:22:23:25:26:22:23:25:26 chr16 16139714 . T C 186.2 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0028063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.559;QD=12.4135;RBI=0.00796544;REFB=-0.00965908;REVB=-0.00745472;RO=36;SAF=16;SAR=7;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100541;STB=0.551678;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0145226;OID=.;OPOS=16139714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:7:16:22:14:7:16:23:14 chr16 16162019 . T C 1026.39 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4421;QD=59.5009;RBI=0.0753523;REFB=0;REVB=0.0748341;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000455259;OID=.;OPOS=16162019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr16 16177275 . G A 107.35 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0404701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.507;QD=12.6292;RBI=0.0437622;REFB=-0.0055727;REVB=-0.0166524;RO=21;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326158;STB=0.692012;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00424504;OID=.;OPOS=16177275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:9:4:13:8:9:4:13:8 chr16 16236650 . T C 654.07 PASS AF=0.481752;AO=66;DP=138;FAO=66;FDP=137;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.0125727;FXX=0.00724585;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.153;QD=19.097;RBI=0.0148472;REFB=-0.00301606;REVB=0.00789734;RO=70;SAF=30;SAR=36;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291606;STB=0.519994;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00359523;OID=.;OPOS=16236650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:70:71:66:66:0.481752:36:30:34:36:36:30:35:36 chr16 16236789 . A G 270.03 PASS AF=0.444444;AO=23;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0649217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.412;QD=17.1448;RBI=0.0651781;REFB=-0.010273;REVB=0.00577599;RO=32;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301204;STB=0.531977;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00827391;OID=.;OPOS=16236789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:23:28:0.444444:15:8:12:20:19:9:12:20 chr16 16248895 . G A 271.68 PASS AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00291791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.562;QD=14.6854;RBI=0.0398826;REFB=-0.0140611;REVB=-0.0397757;RO=43;SAF=15;SAR=16;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522198;STB=0.529598;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0195427;OID=.;OPOS=16248895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:16:15:23:20:16:15:23:20 chr16 16263663 . G A 436.43 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.0205208;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=191.119;QD=21.2891;RBI=0.0214956;REFB=-0.034061;REVB=-0.00640003;RO=38;SAF=15;SAR=28;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109015;STB=0.549817;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0205053;OID=.;OPOS=16263663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:39:43:43:0.52439:28:15:9:29:28:15:10:29 chr16 16271357 . T C 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.456;QD=59.1431;RBI=0.0102662;REFB=0;REVB=0.00423429;RO=0;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97393e-05;OID=.;OPOS=16271357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:42:25:0:0:42:25:0:0 chr16 16272670 . T C 1238.44 PASS AF=1;AO=69;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5026;QD=61.1574;RBI=0.0828292;REFB=0;REVB=0.081189;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0237165;OID=.;OPOS=16272670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:69:81:1:30:39:0:0:42:39:0:0 chr16 16468294 . C T 35.75 PASS AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00147026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.28;QD=5.95821;RBI=0.00428583;REFB=-0.00539377;REVB=-0.00402575;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46586;STB=0.807742;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0233571;OID=.;OPOS=16468294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:5:1:10:8:5:1:10:8 chr16 17196433 . G C 207.31 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0193197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0526;QD=24.3894;RBI=0.0200061;REFB=0.0160799;REVB=0.00519559;RO=14;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159973;STB=0.50892;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0118178;OID=.;OPOS=17196433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:9:11:8:6:9:11:8:6 chr16 17196622 . T TTC 38.05 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.019278;FXX=0;HRUN=8;LEN=2;MLLD=285.454;QD=8.95262;RBI=0.0213159;REFB=-0.0107145;REVB=0.00909534;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403885;STB=0.776761;STBP=0.149;TYPE=ins;VARB=0.0118628;OID=.;OPOS=17196623;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=TTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.352941:6:18:6:17:11:5:1:5:6:38:12:5:1:6:6 chr16 18823379 . T C 1407.46 PASS AF=0.887931;AO=103;DP=116;FAO=103;FDP=116;FR=.;FRO=13;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00373827;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=193.26;QD=48.533;RBI=0.0103988;REFB=-0.0216359;REVB=0.00970367;RO=7;SAF=46;SAR=57;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037182;STB=0.515797;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000412475;OID=.;OPOS=18823379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:116:116:7:13:103:103:0.887931:57:46:1:6:57:46:4:9 chr16 18847416 . G A 385.85 PASS AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0225695;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.409;QD=20.3078;RBI=0.0255453;REFB=-0.0325474;REVB=-0.0119657;RO=37;SAF=19;SAR=20;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720325;STB=0.539899;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0224487;OID=.;OPOS=18847416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:20:19:15:22:20:19:15:22 chr16 18861335 . A G 300.48 PASS AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0192974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8511;QD=19.0782;RBI=0.0251498;REFB=-0.0137155;REVB=0.0161283;RO=30;SAF=15;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309879;STB=0.508469;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0134212;OID=.;OPOS=18861335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:31:32:32:0.507937:17:15:13:17:17:15:14:17 chr16 19041595 . G A 436.4 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00375319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.779;QD=21.2879;RBI=0.0198293;REFB=-0.0108421;REVB=0.0194709;RO=39;SAF=22;SAR=21;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179181;STB=0.598588;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00848486;OID=.;OPOS=19041595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:39:39:43:43:0.52439:21:22:28:11:21:22:28:11 chr16 19047030 . G A 313.26 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00107782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.362;QD=19.5788;RBI=0.00983283;REFB=-0.00659614;REVB=-0.00977358;RO=30;SAF=19;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178103;STB=0.60594;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00487855;OID=.;OPOS=19047030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:30:31:33:33:0.515625:14:19:11:19:14:19:11:20 chr16 19067933 . G A 452.79 PASS AF=0.646154;AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=65;FR=.;FRO=23;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0220905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5176;QD=27.8637;RBI=0.0237316;REFB=0.00273003;REVB=-0.00867157;RO=22;SAF=31;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14486;STB=0.573531;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00222199;OID=.;OPOS=19067933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:22:23:42:42:0.646154:11:31:12:10:11:31:13:10 chr16 19079037 . G A 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0228099;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.17;QD=14.0446;RBI=0.079223;REFB=-0.0213522;REVB=0.0758682;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118169;STB=0.571155;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00737872;OID=.;OPOS=19079037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:2:3:3:1:2:3:3:1 chr16 19080184 . C T 204.18 PASS AF=0.384615;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0532736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0478;QD=12.5649;RBI=0.0569371;REFB=-0.0292681;REVB=-0.0200939;RO=39;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321898;STB=0.525106;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0463724;OID=.;OPOS=19080184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:39:40:25:25:0.384615:14:11:16:23:14:11:16:24 chr16 19080227 . C CTG 683.13 PASS AF=1;AO=45;DP=51;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149719;FXX=0.058812;HRUN=0;LEN=2;MLLD=305.754;QD=56.9274;RBI=0.0151763;REFB=0;REVB=0.00248242;RO=1;SAF=19;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240908;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=1.71307e-07;OID=.;OPOS=19080228;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:45:51:48:48:0:22:26:0:0:4:1:19:26:1:0 chr16 19085298 . C T 403.38 PASS AF=0.4375;AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00658663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.437;QD=16.8075;RBI=0.0203669;REFB=0.00290906;REVB=-0.0192724;RO=54;SAF=17;SAR=25;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187477;STB=0.605187;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00450856;OID=.;OPOS=19085298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:54:54:42:42:0.4375:25:17:32:22:25:17:32:22 chr16 19089562 . C G 200.25 PASS AF=0.309524;AO=26;DP=83;FAO=26;FDP=84;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0209412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.755;QD=9.53587;RBI=0.0218507;REFB=0.00390383;REVB=-0.00623855;RO=57;SAF=13;SAR=13;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051244;STB=0.535687;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.0145941;OID=.;OPOS=19089562;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:57:58:26:26:0.309524:13:13:26:31:13:13:26:32 chr16 19131105 . G A 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0214716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.696;QD=21.9714;RBI=0.0277514;REFB=0.00715291;REVB=0.0175815;RO=20;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505139;STB=0.541715;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0103306;OID=.;OPOS=19131105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:9:14:11:9:9:14:11:10 chr16 19297219 . T G 721.36 PASS AF=1;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764502;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8042;QD=56.5775;RBI=0.0765475;REFB=0;REVB=0.00385779;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000757368;OID=.;OPOS=19297219;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:50:51:1:27:23:0:0:27:24:0:0 chr16 19310092 . T C 274.05 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.00375881;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.332;QD=15.0166;RBI=0.00787189;REFB=-0.0230844;REVB=-0.0069165;RO=40;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165364;STB=0.604504;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0297872;OID=.;OPOS=19310092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:42:31:31:0.424658:15:16:14:26:15:16:14:28 chr16 19547747 . C G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2779;QD=39.2068;RBI=0.0589492;REFB=0;REVB=0.0546598;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0048299;OID=.;OPOS=19547747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0 chr16 19548116 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000473677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.264;QD=53.9109;RBI=0.00986351;REFB=0;REVB=-0.00985213;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93778e-05;OID=.;OPOS=19548116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:13:10:0:0:13:11:0:0 chr16 19548290 . G A 2200.68 PASS AF=0.992908;AO=140;DP=141;FAO=140;FDP=141;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0240277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.132;QD=62.4307;RBI=0.0336222;REFB=-0.112442;REVB=0.0235185;RO=1;SAF=68;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694102;STB=0.503649;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000189948;OID=.;OPOS=19548290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:141:141:1:1:140:140:0.992908:72:68:1:0:72:68:1:0 chr16 19680546 . T C 302.09 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0110718;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.695;QD=15.8995;RBI=0.0152551;REFB=-0.0145586;REVB=0.0104945;RO=41;SAF=18;SAR=15;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128182;STB=0.571386;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0180506;OID=.;OPOS=19680546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:41:43:33:33:0.434211:15:18:17:24:15:18:18:25 chr16 19800213 . T C 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0195486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.603;QD=14.6983;RBI=0.0196568;REFB=-0.0154247;REVB=-0.0020603;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858883;STB=0.549777;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0310429;OID=.;OPOS=19800213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:7:9:11:12:7:9:11:12 chr16 19868687 . G C 1390.8 PASS AF=0.969697;AO=96;DP=101;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.011508;FXX=0.0198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.133;QD=56.1938;RBI=0.0120108;REFB=-0.0268384;REVB=-0.00343877;RO=3;SAF=53;SAR=43;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126818;STB=0.506691;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.000578409;OID=.;OPOS=19868687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:101:99:3:3:96:96:0.969697:43:53:1:2:43:53:1:2 chr16 20043330 . T C 1153.57 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.854;QD=60.7141;RBI=0.0571556;REFB=0;REVB=0.0469352;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406364;OID=.;OPOS=20043330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0 chr16 20328685 . T C 581.83 PASS AF=0.455224;AO=61;DP=134;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=0.0140008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.835;QD=17.3682;RBI=0.0183386;REFB=-0.0133499;REVB=-0.011844;RO=71;SAF=25;SAR=36;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138598;STB=0.507097;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0150587;OID=.;OPOS=20328685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:71:73:61:61:0.455224:36:25:29:42:36:25:29:44 chr16 20334679 . C T 1688.26 PASS AF=0.991379;AO=111;DP=113;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0378029;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.217;QD=58.2159;RBI=0.0406946;REFB=0.0260092;REVB=0.0150662;RO=1;SAF=54;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871089;STB=0.504273;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000573697;OID=.;OPOS=20334679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:116:1:1:111:115:0.991379:57:54:1:0:57:58:1:0 chr16 20441053 . C G 1665.94 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380599;FXX=0.0178555;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.836;QD=60.5797;RBI=0.0381148;REFB=0;REVB=0.00204566;RO=0;SAF=47;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34717e-05;OID=.;OPOS=20441053;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:63:47:0:0:63:47:0:0 chr16 20441084 . T C 1212.28 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143729;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.887;QD=61.3812;RBI=0.0538073;REFB=0;REVB=0.0518521;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64324e-05;OID=.;OPOS=20441084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:51:28:0:0:51:28:0:0 chr16 20471450 . G A 535.91 PASS AF=0.948718;AO=36;DP=38;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0100316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.209;QD=54.9655;RBI=0.0374811;REFB=-0.145746;REVB=0.0361137;RO=1;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283532;STB=0.527763;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.000651815;OID=.;OPOS=20471450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:38:39:1:2:36:37:0.948718:16:20:0:1:17:20:0:2 chr16 20476852 . T C 800.38 PASS AF=0.982759;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00960961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.923;QD=55.1984;RBI=0.0190255;REFB=-0.00373173;REVB=0.0164203;RO=1;SAF=30;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154549;STB=0.507934;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00011026;OID=.;OPOS=20476852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:58:1:1:55:57:0.982759:25:30:1:0:26:31:1:0 chr16 20488696 . A G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000723379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.16;QD=42.1826;RBI=0.014161;REFB=0;REVB=-0.0141426;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144212;OID=.;OPOS=20488696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr16 20494408 . C T 912.74 PASS AF=0.511364;AO=90;DP=179;FAO=90;FDP=176;FR=.;FRO=86;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=0.0171845;FXX=0.022221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.094;QD=20.744;RBI=0.017204;REFB=0.000196133;REVB=-0.000817887;RO=88;SAF=43;SAR=47;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978381;STB=0.500506;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=-0.000159272;OID=.;OPOS=20494408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:176:88:86:90:90:0.511364:47:43:43:45:47:43:41:45 chr16 20570661 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000432671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.08;QD=37.4885;RBI=0.00672973;REFB=0;REVB=-0.00671581;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124172;OID=.;OPOS=20570661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr16 20576048 . C A 461.65 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0269;QD=57.7065;RBI=0.026394;REFB=0;REVB=0.019876;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79645e-05;OID=.;OPOS=20576048;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:10:22:0:0 chr16 20635418 . C T 1238.84 PASS AF=0.975904;AO=67;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0702927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6913;QD=59.7029;RBI=0.22684;REFB=-0.131562;REVB=0.215674;RO=1;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171796;STB=0.507041;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00544043;OID=.;OPOS=20635418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:83:83:1:1:67:81:0.975904:27:40:0:1:35:46:0:1 chr16 20636814 . G A 1008.18 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.876;QD=59.3044;RBI=0.0701157;REFB=0;REVB=0.0682741;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122278;OID=.;OPOS=20636814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0 chr16 20638576 . A T 1292.09 PASS AF=0.988372;AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0870148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8206;QD=60.0973;RBI=0.0964296;REFB=-0.124623;REVB=0.0415583;RO=1;SAF=34;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956859;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00214979;OID=.;OPOS=20638576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:84:86:1:1:83:85:0.988372:49:34:0:1:49:36:0:1 chr16 20753123 . T C 2293.41 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.875;QD=63.7058;RBI=0.033499;REFB=0;REVB=0.0192824;RO=0;SAF=60;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.45616e-05;OID=.;OPOS=20753123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:84:60:0:0:84:60:0:0 chr16 20855309 . A G 1791.28 PASS AF=0.983471;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00301383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.183;QD=59.216;RBI=0.00698373;REFB=-0.0289875;REVB=-0.00629995;RO=2;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155678;STB=0.508195;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00189115;OID=.;OPOS=20855309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:121:121:2:2:119:119:0.983471:60:59:0:2:60:59:0:2 chr16 21008690 . T C 343.24 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.014445;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=244.811;QD=18.8078;RBI=0.0183688;REFB=-0.00685646;REVB=-0.011347;RO=37;SAF=15;SAR=21;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147046;STB=0.508192;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00656002;OID=.;OPOS=21008690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:21:15:16:21:21:15:16:21 chr16 21190853 . A C 795.6 PASS AF=0.935484;AO=56;DP=62;FAO=58;FDP=62;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0122811;FXX=0.0312451;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.836;QD=51.3287;RBI=0.0128529;REFB=-0.0184006;REVB=-0.00379073;RO=4;SAF=18;SAR=38;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939226;STB=0.549982;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00428164;OID=.;OPOS=21190853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:62:62:4:4:56:58:0.935484:38:18:4:0:40:18:4:0 chr16 21217061 . G A 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5588;QD=63.8718;RBI=0.0431545;REFB=0;REVB=0.0101917;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305906;OID=.;OPOS=21217061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:33:15:0:0:33:15:0:0 chr16 21222672 . C A 1008.49 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456858;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.275;QD=59.323;RBI=0.00889126;REFB=0;REVB=0.00762775;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.45868e-06;OID=.;OPOS=21222672;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0 chr16 21531111 . T C 50.64 PASS AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0158821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.653;QD=5.06415;RBI=0.0557318;REFB=-0.00179001;REVB=-0.0534209;RO=32;SAF=4;SAR=4;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00523608;OID=.;OPOS=21531111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:4:4:16:16:4:4:16:16 chr16 21531133 . C G 92.11 PASS AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0343701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.842;QD=8.9867;RBI=0.0443253;REFB=-0.00309114;REVB=0.0279898;RO=28;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096537;STB=0.547246;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0134076;OID=.;OPOS=21531133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:41:41:28:29:12:12:0.292683:7:5:14:14:7:5:14:15 chr16 21531154 . G C 87.73 PASS AF=0.235294;AO=12;DP=51;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0480089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.641;QD=6.8808;RBI=0.0502159;REFB=-0.0172147;REVB=-0.0147235;RO=39;SAF=5;SAR=7;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553069;STB=0.534825;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0476324;OID=.;OPOS=21531154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:51:51:39:39:12:12:0.235294:7:5:18:21:7:5:18:21 chr16 21531457 . T C 51.73 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0767708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6928;QD=6.27009;RBI=0.134943;REFB=-0.016224;REVB=-0.110977;RO=25;SAF=6;SAR=2;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289654;STB=0.688027;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0407965;OID=.;OPOS=21531457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:33:33:25:25:8:8:0.242424:2:6:13:12:2:6:13:12 chr16 21531473 . G A 76.0 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0491364;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.3329;QD=9.21175;RBI=0.0491792;REFB=-0.00900682;REVB=0.00205284;RO=23;SAF=7;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259722;STB=0.660047;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0395908;OID=.;OPOS=21531473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:34:33:23:23:10:10:0.30303:3:7:11:12:3:7:11:12 chr16 21531494 . T C 682.25 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.206;QD=62.0223;RBI=0.0626659;REFB=0;REVB=0.0236241;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319172;OID=.;OPOS=21531494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:19:25:0:0 chr16 21531609 . C T 80.26 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.00538434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.116;QD=16.8958;RBI=0.0183724;REFB=-0.022035;REVB=0.0175657;RO=9;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245151;STB=0.514256;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0116081;OID=.;OPOS=21531609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:9:1:1:8:9:1:1:8 chr16 21666714 . C T 309.95 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00316833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.111;QD=18.7848;RBI=0.00533598;REFB=-0.0106295;REVB=-0.00429353;RO=33;SAF=10;SAR=23;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121301;STB=0.567859;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0119083;OID=.;OPOS=21666714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:23:10:14:19:23:10:14:19 chr16 21690225 . C A 110.89 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00616698;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.364;QD=14.308;RBI=0.00881427;REFB=-0.00901307;REVB=-0.0062976;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294597;STB=0.517215;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0116721;OID=.;OPOS=21690225;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:31:18:18:13:13:0.419355:4:9:12:6:4:9:12:6 chr16 21730449 . C T 257.55 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00558579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.431;QD=24.5288;RBI=0.00713653;REFB=-0.0201139;REVB=-0.00444173;RO=18;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651923;STB=0.53626;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.012153;OID=.;OPOS=21730449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:14:10:9:9:14:10:9:9 chr16 21742188 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.773;QD=33.4281;RBI=0.0793269;REFB=0;REVB=-0.0650887;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000628748;OID=.;OPOS=21742188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr16 21747633 . A C 55.97 PASS AF=0.16129;AO=10;DP=64;FAO=10;FDP=62;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.00478284;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.041;QD=3.61119;RBI=0.00941446;REFB=-0.00367658;REVB=-0.00810904;RO=53;SAF=3;SAR=7;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298012;STB=0.526262;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0216479;OID=.;OPOS=21747633;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:64:62:53:52:10:10:0.16129:7:3:17:36:7:3:17:35 chr16 21747639 . G T 47.65 PASS AF=0.136364;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=66;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=38;FWDB=0.00865829;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5989;QD=2.88791;RBI=0.0425503;REFB=-0.0145444;REVB=-0.0416601;RO=56;SAF=3;SAR=6;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0080993;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0203881;OID=.;OPOS=21747639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:67:66:56:57:9:9:0.136364:6:3:19:37:6:3:19:38 chr16 21747662 . G A 62.52 PASS AF=0.153846;AO=12;DP=78;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=-0.0466743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.2;QD=3.20609;RBI=0.0532978;REFB=-0.00625681;REVB=-0.0257325;RO=64;SAF=5;SAR=7;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139618;STB=0.574206;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0464957;OID=.;OPOS=21747662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:78:78:64:66:12:12:0.153846:7:5:20:44:7:5:22:44 chr16 22111704 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.301;QD=56.1914;RBI=0.0420586;REFB=0;REVB=-0.00185786;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.49907e-05;OID=.;OPOS=22111704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:21:7:0:0:21:7:0:0 chr16 22144318 . C T 347.68 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0376;QD=51.5076;RBI=0.0653973;REFB=-0.0727776;REVB=0.0599017;RO=1;SAF=15;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029965;STB=0.516117;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0065878;OID=.;OPOS=22144318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:11:15:1:0:11:15:1:0 chr16 22155629 . A G 771.32 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0370977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.186;QD=55.0946;RBI=0.0401214;REFB=-0.129068;REVB=0.0152803;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000833114;OID=.;OPOS=22155629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:56:56:0:1:55:55:0.982143:22:33:0:0:22:33:0:1 chr16 22161136 . T C 747.3 PASS AF=1;AO=31;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.217876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.41;QD=63.6003;RBI=0.220871;REFB=0;REVB=0.0362485;RO=0;SAF=2;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170029;OID=.;OPOS=22161136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:31:47:1:29:2:0:0:29:18:0:0 chr16 22178256 . G A 758.86 PASS AF=0.904762;AO=57;DP=63;FAO=57;FDP=63;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.00742857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8961;QD=48.1817;RBI=0.0949892;REFB=-0.178598;REVB=0.0946983;RO=6;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112656;STB=0.559979;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00749289;OID=.;OPOS=22178256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:63:63:6:6:57:57:0.904762:22:35:0:6:22:35:0:6 chr16 22262514 . C A 542.29 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254272;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.674;QD=60.2548;RBI=0.0269678;REFB=0;REVB=-0.00898462;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92407e-05;OID=.;OPOS=22262514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0 chr16 22269867 . A G 708.46 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.307;QD=62.9742;RBI=0.0518228;REFB=0;REVB=0.0383583;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229819;OID=.;OPOS=22269867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0 chr16 22357850 . C CAG,G 898.66 PASS AF=0.920635,0.0793651;AO=57,5;DP=66;FAO=58,5;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29,4;FSAR=29,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129123,-0.0102689;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=245.97,59.3362;QD=57.0578;RBI=0.0129177,0.0377928;REFB=0,0;REVB=0.000372631,-0.0363709;RO=3;SAF=29,4;SAR=28,1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0463215,-0.23409;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000324995,0.0211165;OID=.,.;OPOS=22357851,22357850;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:21:66:63:3:0:57,5:58,5:0.920635,0.0793651:28,1:29,4:3:0:29,1:29,4:0:0 chr16 23072833 . C T 328.23 PASS AF=0.45679;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0124011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.436;QD=16.2086;RBI=0.0156899;REFB=-0.00277271;REVB=0.00961178;RO=44;SAF=14;SAR=22;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133101;STB=0.580052;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00365826;OID=.;OPOS=23072833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:44:36:37:0.45679:22:14:23:21:23:14:23:21 chr16 23073531 . C G 111.59 PASS AF=0.278689;AO=15;DP=59;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0159009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4371;QD=7.31737;RBI=0.034311;REFB=-0.00762903;REVB=0.0304041;RO=44;SAF=9;SAR=6;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949672;STB=0.547888;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0149276;OID=.;OPOS=23073531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:44:44:15:17:0.278689:6:9:23:21:7:10:23:21 chr16 23098422 . A G 643.41 PASS AF=0.418605;AO=72;DP=172;FAO=72;FDP=172;FR=.;FRO=100;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=64;FWDB=0.000965674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5887;QD=14.963;RBI=0.0161603;REFB=0.00549813;REVB=-0.0161315;RO=97;SAF=38;SAR=34;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181087;STB=0.596769;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00506454;OID=.;OPOS=23098422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:97:100:72:72:0.418605:34:38:34:63:34:38:36:64 chr16 23200761 . T C 219.22 PASS AF=0.412698;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00889978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.512;QD=13.9185;RBI=0.0125662;REFB=-0.0241454;REVB=-0.00887154;RO=36;SAF=16;SAR=10;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341666;STB=0.512811;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0225761;OID=.;OPOS=23200761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:36:37:26:26:0.412698:10:16:21:15:10:16:22:15 chr16 23200848 . T C 424.64 PASS AF=0.432432;AO=45;DP=108;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00353024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8797;QD=15.3025;RBI=0.0552383;REFB=-0.0194408;REVB=-0.0551253;RO=61;SAF=22;SAR=23;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811639;STB=0.570065;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0244281;OID=.;OPOS=23200848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:61:63:45:48:0.432432:23:22:25:36:23:25:25:38 chr16 23360199 . T C 289.68 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.454;QD=52.6683;RBI=0.0647631;REFB=0;REVB=0.0386322;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332876;OID=.;OPOS=23360199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:11:9:0:0:13:9:0:0 chr16 23477997 . CCA C 149.19 PASS AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00972993;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=301.011;QD=14.9186;RBI=0.0226256;REFB=-0.0105462;REVB=0.0204266;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180859;STB=0.598913;STBP=0.243;TYPE=del;VARB=0.0131775;OID=.;OPOS=23477998;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:20:40:20:40:20:9:11:13:7:99:18:9:11:12:6 chr16 23489711 . C G 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0174524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.952;QD=16.8839;RBI=0.029446;REFB=-0.00439453;REVB=-0.0237167;RO=17;SAF=3;SAR=12;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483787;STB=0.778835;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00844019;OID=.;OPOS=23489711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:12:3:12:5:12:3:12:5 chr16 23490353 . T G 76.29 PASS AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.014305;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.881;QD=20.3449;RBI=0.0523252;REFB=-0.0348289;REVB=0.0503319;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179483;OID=.;OPOS=23490353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:4:2:3:6:4:2 chr16 23536684 . T C 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00746283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.787;QD=18.4834;RBI=0.00854063;REFB=-0.0228705;REVB=0.00415312;RO=21;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133747;STB=0.575837;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0275834;OID=.;OPOS=23536684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:9:10:8:13:9:10:8:13 chr16 23546561 . G C 265.08 PASS AF=0.741935;AO=23;DP=31;FAO=23;FDP=31;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0246511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5371;QD=34.2035;RBI=0.0329758;REFB=-0.00762494;REVB=-0.0219027;RO=8;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287914;STB=0.515746;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00335422;OID=.;OPOS=23546561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:31:8:8:23:23:0.741935:13:10:3:5:13:10:3:5 chr16 23563501 . C T 966.35 PASS AF=0.457399;AO=102;DP=223;FAO=102;FDP=223;FR=.;FRO=121;FSAF=39;FSAR=63;FSRF=56;FSRR=65;FWDB=-0.00212889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.755;QD=17.3336;RBI=0.00406488;REFB=-0.019611;REVB=0.00346282;RO=121;SAF=39;SAR=63;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815816;STB=0.545222;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0241679;OID=.;OPOS=23563501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:121:121:102:102:0.457399:63:39:56:65:63:39:56:65 chr16 23582153 . G A 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00300052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7545;QD=21.7464;RBI=0.0351587;REFB=-0.0249244;REVB=0.0350304;RO=20;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125498;STB=0.507036;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0139075;OID=.;OPOS=23582153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:8:14:13:7:8:14:13:7 chr16 23585061 . T C 727.74 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.704;QD=63.2817;RBI=0.0234889;REFB=0;REVB=-0.0160442;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141296;OID=.;OPOS=23585061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0 chr16 23607504 . G C 99.72 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0258668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.506;QD=15.3422;RBI=0.0310527;REFB=-0.000794714;REVB=-0.0171807;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245398;STB=0.514262;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00605136;OID=.;OPOS=23607504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:8:4:5:9:8:4:5:9 chr16 23646191 . T C 491.58 PASS AF=0.642857;AO=45;DP=70;FAO=45;FDP=70;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0180731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2767;QD=28.0901;RBI=0.0209916;REFB=-0.0438417;REVB=0.0106775;RO=24;SAF=23;SAR=22;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462833;STB=0.531793;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0224812;OID=.;OPOS=23646191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:24:25:45:45:0.642857:22:23:14:10:22:23:15:10 chr16 24564879 . GTATATATATATATATAT GTATATATATATATAT,GTATATATATATATATTC 437.46 PASS AF=1,0;AO=25,3;DP=30;FAO=31,0;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106951,0.134853;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=206.913,88.1018;QD=56.4458;RBI=0.15774,0.135368;REFB=0,0;REVB=0.115946,-0.0117965;RO=0;SAF=8,0;SAR=17,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.000413345,0;OID=.,.;OPOS=24564880,24564895;OREF=TA,AT;OALT=-,TC;OMAPALT=GTATATATATATATAT,GTATATATATATATATTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:25,3:30:31,0:31:0:11,0:20,0:0:0:4:0:8,0:17,3:0:0 chr16 24583406 . A G 705.52 PASS AF=0.978723;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286431;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.0519;QD=60.0441;RBI=0.0518992;REFB=-0.0709521;REVB=-0.0432793;RO=1;SAF=25;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018429;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000742147;OID=.;OPOS=24583406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:47:1:1:45:46:0.978723:20:25:1:0:21:25:1:0 chr16 24902194 . T C 2148.21 PASS AF=0.985816;AO=138;DP=142;FAO=139;FDP=141;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0458356;FXX=0.00704176;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.281;QD=60.9422;RBI=0.0485963;REFB=-0.0586789;REVB=0.0161461;RO=3;SAF=82;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109121;STB=0.501317;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.000503902;OID=.;OPOS=24902194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:142:141:3:2:138:139:0.985816:56:82:1:2:57:82:1:1 chr16 24920302 . G A 280.0 PASS AF=0.390244;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00987978;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8689;QD=13.6587;RBI=0.0101007;REFB=-0.0114443;REVB=-0.00210076;RO=48;SAF=22;SAR=10;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25;STB=0.655073;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0190539;OID=.;OPOS=24920302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:48:50:32:32:0.390244:10:22:22:26:10:22:22:28 chr16 25043277 . G A 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0273242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6206;QD=13.2126;RBI=0.0513562;REFB=-0.00397004;REVB=0.0434839;RO=22;SAF=12;SAR=2;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328501;STB=0.697342;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0114333;OID=.;OPOS=25043277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:2:12:14:8:2:12:14:8 chr16 25137289 . G C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.861;QD=50.4134;RBI=0.0543243;REFB=0;REVB=0.0104344;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415301;OID=.;OPOS=25137289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr16 25137385 . G A 237.82 PASS AF=0.353659;AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=0.03019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.541;QD=11.6008;RBI=0.0402063;REFB=-0.000501702;REVB=-0.0265539;RO=53;SAF=16;SAR=13;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103061;STB=0.55934;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00132333;OID=.;OPOS=25137385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:53:53:29:29:0.353659:13:16:34:19:13:16:34:19 chr16 25137449 . A T 260.93 PASS AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.00337602;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.18;QD=11.9968;RBI=0.0215861;REFB=-0.0145671;REVB=0.0213204;RO=55;SAF=23;SAR=8;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26293;STB=0.648323;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0195733;OID=.;OPOS=25137449;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:8:23:29:26:8:23:30:26 chr16 25176004 . A G 243.68 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0125247;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.583;QD=21.6608;RBI=0.012943;REFB=-0.0185436;REVB=0.00326391;RO=22;SAF=5;SAR=18;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328012;STB=0.685922;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0138129;OID=.;OPOS=25176004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:18:5:12:10:18:5:12:10 chr16 25239805 . G C 213.67 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0511083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9041;QD=20.8463;RBI=0.0791153;REFB=0.00923941;REVB=0.0603918;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632754;STB=0.53568;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00863093;OID=.;OPOS=25239805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:12:8:7:14:12:8 chr16 25248360 . G A 388.47 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0214997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.219;QD=21.2858;RBI=0.021909;REFB=-0.0253413;REVB=-0.00421531;RO=34;SAF=13;SAR=26;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456112;STB=0.525239;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0150952;OID=.;OPOS=25248360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:26:13:13:21:26:13:13:21 chr16 27226106 . G A 304.18 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0104892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.561;QD=24.3345;RBI=0.0120528;REFB=-0.0133083;REVB=-0.00593695;RO=22;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373912;STB=0.520817;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0107954;OID=.;OPOS=27226106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:22:22:26:26:0.52:13:13:12:10:13:13:12:10 chr16 27238110 . C T 380.72 PASS AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0103515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.1;QD=16.9208;RBI=0.0104221;REFB=0.00139167;REVB=-0.00121107;RO=49;SAF=16;SAR=24;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290166;STB=0.522924;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=-0.00175415;OID=.;OPOS=27238110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:49:50:40:40:0.444444:24:16:21:28:24:16:22:28 chr16 27246617 . T C 376.46 PASS AF=0.673913;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0243383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7627;QD=32.7354;RBI=0.0260429;REFB=-0.00416148;REVB=0.00926717;RO=15;SAF=18;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288242;STB=0.515749;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00359855;OID=.;OPOS=27246617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:15:15:31:31:0.673913:13:18:8:7:13:18:8:7 chr16 27356203 . A G 175.58 PASS AF=0.37931;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0312998;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.323;QD=12.1091;RBI=0.0325189;REFB=-0.0153413;REVB=0.00882061;RO=36;SAF=5;SAR=17;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378018;STB=0.720127;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0403725;OID=.;OPOS=27356203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:36:36:22:22:0.37931:17:5:20:16:17:5:20:16 chr16 27371158 . C T 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5682;QD=60.2288;RBI=0.0503762;REFB=0;REVB=-0.0182443;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000506966;OID=.;OPOS=27371158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr16 27772901 . G A 669.85 PASS AF=0.918367;AO=45;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0284369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.548;QD=54.6814;RBI=0.0285447;REFB=0.01819;REVB=-0.00247866;RO=4;SAF=24;SAR=21;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721289;STB=0.538445;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.000133968;OID=.;OPOS=27772901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:49:49:4:4:45:45:0.918367:21:24:4:0:21:24:4:0 chr16 27974487 . T C 531.41 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0684017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0702;QD=59.0459;RBI=0.0697374;REFB=0;REVB=-0.0135833;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000665805;OID=.;OPOS=27974487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:21:14:0:0:22:14:0:0 chr16 28354090 . C G 234.9 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0431441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0063;QD=18.7923;RBI=0.0473521;REFB=-0.00925288;REVB=-0.0195144;RO=27;SAF=20;SAR=3;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163644;STB=0.593968;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0204153;OID=.;OPOS=28354090;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:3:20:21:6:3:20:21:6 chr16 28508716 . T C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.536;QD=53.2756;RBI=0.0831444;REFB=0;REVB=0.0410095;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440876;OID=.;OPOS=28508716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0 chr16 28603393 . T C 239.39 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.737;QD=50.3975;RBI=0.0708874;REFB=0;REVB=-0.053663;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270322;OID=.;OPOS=28603393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0 chr16 28617485 . C T 732.76 PASS AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00914279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.365;QD=51.4217;RBI=0.0266354;REFB=-0.178494;REVB=-0.0250171;RO=3;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600297;STB=0.531903;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00378834;OID=.;OPOS=28617485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:57:57:3:3:54:54:0.947368:22:32:0:3:22:32:0:3 chr16 28842311 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00678979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.754;QD=54.5177;RBI=0.00748402;REFB=0;REVB=-0.00314793;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.55264e-05;OID=.;OPOS=28842311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr16 28915527 . G A 530.61 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0211704;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.6;QD=57.3634;RBI=0.0312598;REFB=0.0279761;REVB=0.0229997;RO=1;SAF=12;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374036;STB=0.519989;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00049767;OID=.;OPOS=28915527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:37:1:1:36:36:0.972973:24:12:1:0:24:12:1:0 chr16 28944396 . CT GT,TG 436.52 PASS AF=0.935484,0.0645161;AO=27,2;DP=30;FAO=29,2;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10,2;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236781,-0.0126954;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=60.8059,33.25;QD=56.3254;RBI=0.0597953,0.0385455;REFB=0,0;REVB=0.0549074,0.0363948;RO=0;SAF=8,2;SAR=19,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.06954e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0144279,-0.0320285;OID=.,.;OPOS=28944396,28944396;OREF=C,CT;OALT=G,TG;OMAPALT=GT,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:30:31:0:0:27,2:29,2:0.935484,0.0645161:19,0:8,2:0:0:19,0:10,2:0:0 chr16 28962429 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000848614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0358;QD=33.4285;RBI=0.0388326;REFB=0;REVB=-0.0388233;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00363906;OID=.;OPOS=28962429;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr16 28993369 . C T 382.49 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0384217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9055;QD=52.7566;RBI=0.0661384;REFB=-0.21323;REVB=0.0538337;RO=1;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032084;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0264249;OID=.;OPOS=28993369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:14:14:1:0:14:14:1:0 chr16 28995757 . C A 772.89 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.825;QD=61.8312;RBI=0.014555;REFB=-0.153777;REVB=0.00539012;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.51428;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00082065;OID=.;OPOS=28995757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:50:0:1:49:49:0.98:32:17:0:0:32:17:1:0 chr16 28996171 . C T 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.032073;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.075;QD=15.8391;RBI=0.0323191;REFB=-0.0418999;REVB=-0.00398022;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368767;STB=0.713795;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0197933;OID=.;OPOS=28996171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:3:5:1:6:3:5:1:6 chr16 29063626 . C A 302.98 PASS AF=0.958333;AO=16;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.201647;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8506;QD=50.4959;RBI=0.207513;REFB=-0.041212;REVB=0.0489917;RO=1;SAF=13;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338952;STB=0.512185;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00702584;OID=.;OPOS=29063626;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:25:24:1:1:16:23:0.958333:3:13:1:0:3:20:1:0 chr16 29580611 . G A 261.25 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036821;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0984;QD=52.2498;RBI=0.0419388;REFB=0;REVB=-0.0200768;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000805461;OID=.;OPOS=29580611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr16 29675928 . C T 57.33 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0228585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.212;QD=12.739;RBI=0.0398702;REFB=-0.0169798;REVB=0.0326669;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00781588;OID=.;OPOS=29675928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:5:5:4:4:5:5 chr16 29679989 . A G 195.9 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487504;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5621;QD=46.0938;RBI=0.0815916;REFB=0;REVB=0.0654262;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.011238;OID=.;OPOS=29679989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:15:17:1:4:11:0:0:6:11:0:0 chr16 29680036 . T A,TGGGATTATAGGTGTGAGCCA 280.13 PASS AF=0.155556,0.666667;AO=8,18;DP=46;FAO=7,30;FDP=45;FR=.;FRO=8;FSAF=6,22;FSAR=1,8;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00197991,-0.00949824;FXX=0.0217344;HRUN=1,3;LEN=1,20;MLLD=290.562,222.016;QD=24.9007;RBI=0.0177529,0.0199981;REFB=-0.00858068,-0.0216957;REVB=0.0176422,0.0175986;RO=15;SAF=6,14;SAR=2,4;SRF=15;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.494917,-0.319059;STB=0.699618,0.576876;STBP=0.778,0.151;TYPE=snp,ins;VARB=0.0178119,0.00296453;OID=.,.;OPOS=29680036,29680037;OREF=T,-;OALT=A,GGGATTATAGGTGTGAGCCA;OMAPALT=A,TGGGATTATAGGTGTGAGCCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:53:46:45:15:8:8,18:7,30:0.155556,0.666667:2,4:6,14:15:0:1,8:6,22:8:0 chr16 29680389 . A C 871.33 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00115923;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.295;QD=58.0887;RBI=0.0157088;REFB=0;REVB=0.0156659;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67538e-05;OID=.;OPOS=29680389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0 chr16 29680524 . CTTTTT CTTTTC,CTT,CTTT,CTTTT 579.95 PASS AF=0.1125,0.6875,0.1875,0.0125;AO=5,16,18,12;DP=83;FAO=9,55,15,1;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31,9,1;FSAR=9,24,6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489408,0.277767,0.426781,0.833368;FXX=0.111099;HRUN=14,14,14,14;LEN=1,3,2,1;MLLD=161.138,11.3687,8.06055,3.87418;QD=28.9974;RBI=0.0811134,0.291017,0.457036,0.892578;REFB=0.0155731,0.0112028,0.0107211,0.00725672;REVB=-0.0646853,-0.0868145,-0.163523,-0.319677;RO=8;SAF=0,6,13,11;SAR=5,10,5,1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.831618,-0.360863,-0.215302,-0.2412;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=0.0920628,0.112542,0.0392533,0.144976;OID=.,.,.,.;OPOS=29680529,29680525,29680525,29680525;OREF=T,TTT,TT,T;OALT=C,-,-,-;OMAPALT=CTTTTC,CTT,CTTT,CTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.1125,0.6875,0.1875,0.0125:5,16,18,12:83:9,55,15,1:80:0:0,31,9,1:9,24,6,0:0:0:46:8:0,6,13,11:5,10,5,1:8:0 chr16 29708350 . A G 327.3 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154758;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2259;QD=54.5499;RBI=0.0596932;REFB=0;REVB=-0.0576522;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00201139;OID=.;OPOS=29708350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr16 29790864 . G A 221.53 PASS AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0116724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8882;QD=12.3071;RBI=0.0763;REFB=-0.00833825;REVB=0.0754019;RO=45;SAF=16;SAR=11;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160881;STB=0.592524;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0174903;OID=.;OPOS=29790864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:11:16:20:25:11:16:20:25 chr16 29791561 . T G 1175.78 PASS AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0101414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5593;QD=59.5329;RBI=0.0283884;REFB=-0.0683073;REVB=-0.0265152;RO=1;SAF=41;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114055;STB=0.506023;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00365869;OID=.;OPOS=29791561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:37:41:1:0:37:41:1:0 chr16 29791721 . G C 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0244861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3353;QD=12.73;RBI=0.0312685;REFB=0.00783709;REVB=-0.019446;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385795;STB=0.7268;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0103922;OID=.;OPOS=29791721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:3:9:3:6:3:9 chr16 29814234 . G A 344.01 PASS AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00268456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.945;QD=16.3815;RBI=0.0291144;REFB=-0.0317942;REVB=-0.0289904;RO=47;SAF=20;SAR=17;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176646;STB=0.599055;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0411993;OID=.;OPOS=29814234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:17:20:17:30:17:20:17:30 chr16 29818676 . C T 426.4 PASS AF=0.483146;AO=42;DP=88;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0144177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.478;QD=19.1638;RBI=0.0166313;REFB=-0.00558834;REVB=-0.00829031;RO=46;SAF=25;SAR=17;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111076;STB=0.553772;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00491742;OID=.;OPOS=29818676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:46:46:42:43:0.483146:17:25:22:24:18:25:22:24 chr16 29821744 . G A 1083.68 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646947;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.315;QD=60.2047;RBI=0.00648067;REFB=0;REVB=-0.000380796;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38125e-06;OID=.;OPOS=29821744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0 chr16 29825126 . T C 662.43 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6057;QD=60.2207;RBI=0.0133153;REFB=-0.0099657;REVB=0.00661578;RO=1;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268199;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153181;OID=.;OPOS=29825126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:44:44:1:0:43:44:1:17:26:0:1:18:26:0:0 chr16 29826538 . T C 98.65 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.011976;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.573;QD=23.2115;RBI=0.0179657;REFB=-0.0218176;REVB=0.0133919;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.440891;STB=0.749558;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0264161;OID=.;OPOS=29826538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:18:17:6:6:11:11:0.647059:3:8:0:6:3:8:0:6 chr16 29851738 . C T 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0684597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.667;QD=16.1989;RBI=0.103391;REFB=-0.0134101;REVB=-0.0774793;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.666107;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0222234;OID=.;OPOS=29851738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:0:3:3:2:0:3 chr16 29882490 . C T 428.2 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1976;QD=57.094;RBI=0.0367022;REFB=0;REVB=-0.033746;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100435;OID=.;OPOS=29882490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr16 29899123 . G T 594.52 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7296;QD=60.9767;RBI=0.0553195;REFB=0;REVB=0.0485887;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118877;OID=.;OPOS=29899123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:24:14:0:0:25:14:0:0 chr16 29908433 . C G 686.35 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8991;QD=62.3955;RBI=0.0418494;REFB=0;REVB=-0.0245005;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000803497;OID=.;OPOS=29908433;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr16 29918034 . T C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00817496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.612;QD=48.737;RBI=0.118992;REFB=0;REVB=0.118711;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104706;OID=.;OPOS=29918034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:1:16:0:0:1:16:0:0 chr16 29994922 . C T 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.87;QD=55.6554;RBI=0.030826;REFB=0;REVB=0.0236977;RO=0;SAF=4;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186712;OID=.;OPOS=29994922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:23:4:0:0:23:4:0:0 chr16 29998200 . A G 1026.33 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.082;QD=59.4974;RBI=0.027594;REFB=0;REVB=-0.0273822;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.34085e-05;OID=.;OPOS=29998200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0 chr16 30018500 . C T 206.74 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.069;QD=48.6444;RBI=0.0828488;REFB=0;REVB=0.0396999;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00476072;OID=.;OPOS=30018500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:17:0:0:14:17:1:10:4:0:0:12:5:0:0 chr16 30021402 . C T 485.01 PASS AF=0.944444;AO=35;DP=37;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000504836;FXX=0.0270197;HRUN=5;LEN=1;MLLD=302.746;QD=53.8902;RBI=0.0316051;REFB=-0.0482041;REVB=0.0316011;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217573;STB=0.505048;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.000344039;OID=.;OPOS=30021402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:37:36:1:2:35:34:0.944444:14:21:1:0:14:20:1:1 chr16 30034986 . G A 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0265204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.27;QD=13.4417;RBI=0.0274804;REFB=-0.0250126;REVB=-0.00719983;RO=13;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168206;STB=0.599791;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0273513;OID=.;OPOS=30034986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:7:3:6:7:7:3:6:7 chr16 30037128 . A C 103.67 PASS AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0170466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.188;QD=18.8482;RBI=0.0214053;REFB=-0.0130692;REVB=0.0129462;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320029;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0243773;OID=.;OPOS=30037128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:21:22:10:10:11:12:0.545455:7:4:4:6:7:5:4:6 chr16 30081476 . C T 355.9 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0347738;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3151;QD=18.7318;RBI=0.034863;REFB=-0.0292815;REVB=-0.00249265;RO=39;SAF=17;SAR=20;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00192565;STB=0.501073;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.03582;OID=.;OPOS=30081476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:20:17:18:21:20:17:18:21 chr16 30119525 . C A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.904;QD=56.9383;RBI=0.0269894;REFB=0;REVB=0.000323095;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11123e-05;OID=.;OPOS=30119525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr16 30198151 . A G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.836;QD=42.1826;RBI=0.0141862;REFB=0;REVB=0.00931877;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82832e-05;OID=.;OPOS=30198151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr16 30370510 . T A,TA 33.47 PASS AF=0,0.123288;AO=5,9;DP=69;FAO=0,9;FDP=73;FR=.;FRO=64;FSAF=0,8;FSAR=0,1;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=-0.117382,-0.0252446;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=50.2421,44.5154;QD=1.83397;RBI=0.182772,0.0991511;REFB=-0.00273638,-0.00682678;REVB=-0.140098,-0.0958835;RO=53;SAF=3,5;SAR=2,4;SRF=36;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0942381,-0.159643;STB=0.5,0.80564;STBP=1,0.083;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.132003;OID=.,.;OPOS=30370510,30370511;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:33:69:73:53:64:5,9:0,9:0,0.123288:2,4:3,5:36:17:0,1:0,8:40:24 chr16 30393660 . G A 179.69 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134934;FXX=0.062461;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.805;QD=47.9183;RBI=0.0230756;REFB=0;REVB=0.0187194;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13025e-06;OID=.;OPOS=30393660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0 chr16 30393855 . G A 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0377007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5075;QD=15.8397;RBI=0.0569029;REFB=-0.0494852;REVB=-0.0426216;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45905;STB=0.776953;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0383406;OID=.;OPOS=30393855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:1:7:3:4:1:7:3:4 chr16 30408765 . C T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.482;QD=64.1534;RBI=0.0296901;REFB=0;REVB=-0.0164304;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65768e-05;OID=.;OPOS=30408765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0 chr16 30566640 . C CA 96.76 PASS AF=0.441176;AO=4;DP=38;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0704653;FXX=0.0285633;HRUN=0;LEN=1;MLLD=155.032;QD=11.3841;RBI=0.0736926;REFB=-0.00653383;REVB=-0.0215691;RO=34;SAF=4;SAR=0;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.578595;STB=0.712017;STBP=0.042;TYPE=ins;VARB=0.0319914;OID=.;OPOS=30566641;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.441176:4:38:15:34:19:12:3:9:10:96:34:4:0:18:16 chr16 30566641 . G A 94.24 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0344965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.125;QD=10.4713;RBI=0.0362127;REFB=-0.00455802;REVB=-0.0110161;RO=24;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993944;STB=0.559897;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.013636;OID=.;OPOS=30566641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:4:8:14:10:4:8:14:10 chr16 30671670 . C G 48.51 PASS AF=0.0869565;AO=18;DP=184;FAO=16;FDP=184;FR=.;FRO=168;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=97;FSRR=71;FWDB=0.00585715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.53;QD=1.05463;RBI=0.045043;REFB=-0.00105122;REVB=-0.0446605;RO=155;SAF=3;SAR=15;SRF=91;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490322;STB=0.890287;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0959023;OID=.;OPOS=30671670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:184:184:155:168:18:16:0.0869565:15:3:91:64:14:2:97:71 chr16 30724070 . G T 885.35 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7569;QD=58.0558;RBI=0.0285474;REFB=0;REVB=-0.00642437;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000342138;OID=.;OPOS=30724070;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0 chr16 30734963 . C A 403.36 PASS AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0262351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.568;QD=48.8926;RBI=0.0314736;REFB=-0.152948;REVB=0.017387;RO=3;SAF=17;SAR=13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075438;STB=0.540514;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00145624;OID=.;OPOS=30734963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:33:33:3:3:30:30:0.909091:13:17:3:0:13:17:3:0 chr16 30760162 . G A 251.86 PASS AF=0.426471;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00782157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.445;QD=14.8152;RBI=0.0149438;REFB=-0.0140648;REVB=0.0127334;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782566;STB=0.537106;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0229708;OID=.;OPOS=30760162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:38:39:29:29:0.426471:13:16:18:20:13:16:19:20 chr16 30762640 . C T 343.19 PASS AF=0.964286;AO=26;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0475432;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=154.796;QD=49.0277;RBI=0.0475482;REFB=-0.16448;REVB=-0.000696085;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.512186;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00200013;OID=.;OPOS=30762640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:28:28:0:1:26:27:0.964286:20:6:0:0:20:7:0:1 chr16 30779716 . A G 2169.73 PASS AF=1;AO=130;DP=131;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.785;QD=62.8907;RBI=0.0625633;REFB=0;REVB=0.0420908;RO=0;SAF=53;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15489e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27581e-05;OID=.;OPOS=30779716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:131:138:0:0:130:138:1:77:53:0:0:82:56:0:0 chr16 30780828 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.129;QD=53.9108;RBI=0.0102455;REFB=0;REVB=-0.00864734;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69495e-05;OID=.;OPOS=30780828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chr16 30886643 . T C 322.34 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6736;QD=53.7231;RBI=0.0890344;REFB=0;REVB=0.0241318;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255255;OID=.;OPOS=30886643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr16 30964940 . A G 696.02 PASS AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.052574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9645;QD=56.8184;RBI=0.0526787;REFB=-0.00800494;REVB=-0.00331994;RO=2;SAF=18;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494049;STB=0.517552;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00231616;OID=.;OPOS=30964940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:49:49:2:3:46:46:0.938776:28:18:2:0:28:18:2:1 chr16 30975492 . C T 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0526265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8342;QD=18.6369;RBI=0.0606207;REFB=0.00925522;REVB=0.0300886;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166872;STB=0.595118;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.00579466;OID=.;OPOS=30975492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:9:7:10:6:9:7 chr16 30977316 . GCCC GCC,GCCT 182.09 PASS AF=0.842105,0.157895;AO=7,6;DP=37;FAO=32,6;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12,6;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0659929,-0.0267806;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=4.52582,181.505;QD=19.1675;RBI=0.921302,0.120521;REFB=0.0104915,-0.00568413;REVB=0.918936,0.117508;RO=18;SAF=6,6;SAR=1,0;SRF=2;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.718948,0.828788;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0659709,0.0151461;OID=.,.;OPOS=30977317,30977319;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=GCC,GCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.842105,0.157895:7,6:37:32,6:38:0:12,6:20,0:0:0:34:18:6,6:1,0:2:16 chr16 30980744 . C T 212.77 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0300229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.341;QD=20.2641;RBI=0.0311111;REFB=-0.00849039;REVB=-0.00815663;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105504;STB=0.571361;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0112226;OID=.;OPOS=30980744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:21:21:21:0.5:12:9:11:9:12:9:12:9 chr16 30999142 . A G 300.4 PASS AF=0.666667;AO=26;DP=39;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.022407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9634;QD=30.8103;RBI=0.0459548;REFB=-0.0285105;REVB=-0.0401219;RO=0;SAF=23;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.84181;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0111102;OID=.;OPOS=30999142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:0:13:26:26:0.666667:3:23:0:0:3:23:0:13 chr16 30999462 . T C 850.8 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3475;QD=57.6816;RBI=0.0402729;REFB=0;REVB=-0.0234294;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000635263;OID=.;OPOS=30999462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr16 31075175 . G A 99.71 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00496171;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.026;QD=12.0866;RBI=0.0195326;REFB=0.00933677;REVB=0.0188918;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938032;STB=0.555466;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.0171319;OID=.;OPOS=31075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:33:21:21:12:12:0.363636:5:7:14:7:5:7:14:7 chr16 31075708 . C G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.3;QD=44.6897;RBI=0.0835363;REFB=0;REVB=0.043261;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00271972;OID=.;OPOS=31075708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr16 31088347 . G A 489.52 PASS AF=0.522222;AO=46;DP=91;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0443194;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0005;QD=21.7565;RBI=0.0468294;REFB=-0.0112618;REVB=0.0151255;RO=43;SAF=21;SAR=25;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138069;STB=0.580303;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0116226;OID=.;OPOS=31088347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:43:43:46:47:0.522222:25:21:13:30:25:22:13:30 chr16 31088625 . A G 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00239843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.916;QD=13.4559;RBI=0.0338772;REFB=-0.00930425;REVB=-0.0337922;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154773;STB=0.542293;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0110199;OID=.;OPOS=31088625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:14:15:11:11:0.423077:3:8:10:4:3:8:10:5 chr16 31090407 . G C 383.32 PASS AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.000529107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.881;QD=22.8849;RBI=0.00115801;REFB=-0.0254687;REVB=0.00103006;RO=28;SAF=17;SAR=21;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128342;STB=0.576233;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0241402;OID=.;OPOS=31090407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:29:38:38:0.567164:21:17:8:20:21:17:8:21 chr16 31092075 . G A 91.07 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00830886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.246;QD=17.346;RBI=0.0194118;REFB=-0.00790363;REVB=-0.0175437;RO=10;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246583;STB=0.514259;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0051995;OID=.;OPOS=31092075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:2:9:8:2:2:9:8:2 chr16 31093892 . A G 681.59 PASS AF=0.978261;AO=42;DP=43;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0242154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.447;QD=59.2683;RBI=0.0566813;REFB=-0.0444519;REVB=0.0512482;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218287;STB=0.5102;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00152061;OID=.;OPOS=31093892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:46:1:1:42:45:0.978261:21:21:0:1:24:21:0:1 chr16 31093954 . C T 397.19 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0134487;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.372;QD=23.3644;RBI=0.0168827;REFB=-0.013889;REVB=-0.0102057;RO=29;SAF=26;SAR=13;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25419;STB=0.639927;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0100632;OID=.;OPOS=31093954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:13:26:10:19:13:26:10:19 chr16 31096164 . G C 57.43 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0735465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.329;QD=12.7618;RBI=0.0748068;REFB=0.00888956;REVB=0.0136739;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295251;STB=0.655832;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.00631492;OID=.;OPOS=31096164;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:9:10:8:8:0.444444:6:2:5:4:6:2:5:5 chr16 31099011 . T C 253.2 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0202479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.894;QD=19.1093;RBI=0.0313535;REFB=-0.0045745;REVB=-0.0239388;RO=26;SAF=19;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510882;STB=0.52862;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.00395734;OID=.;OPOS=31099011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:8:19:17:9:8:19:17:9 chr16 31102321 . C T 266.07 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0142962;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2711;QD=12.9792;RBI=0.0496627;REFB=-0.00824243;REVB=-0.0475606;RO=50;SAF=11;SAR=20;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968015;STB=0.550426;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0130733;OID=.;OPOS=31102321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:82:50:51:31:31:0.378049:20:11:22:28:20:11:22:29 chr16 31121793 . G A 81.2 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00685486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.824;QD=18.0455;RBI=0.0192008;REFB=-0.034406;REVB=-0.0179355;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468762;STB=0.526974;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0370269;OID=.;OPOS=31121793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:6:2:3:7:6:2 chr16 31141826 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1062;QD=46.8478;RBI=0.0410002;REFB=0;REVB=0.0199355;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192588;OID=.;OPOS=31141826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr16 31141880 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00947036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.728;QD=48.7363;RBI=0.0122111;REFB=0;REVB=0.00770867;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35621e-05;OID=.;OPOS=31141880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr16 31153105 . A G 638.59 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2475;QD=59.4037;RBI=0.02609;REFB=0.00824929;REVB=-0.0161036;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208598;STB=0.511106;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.000108233;OID=.;OPOS=31153105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:22:20:0:1:22:20:0:1 chr16 31193942 . C A 737.97 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.837;QD=56.7671;RBI=0.0323016;REFB=0;REVB=-0.0129556;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51988e-05;OID=.;OPOS=31193942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0 chr16 31336361 . C T 768.94 PASS AF=0.451087;AO=79;DP=180;FAO=83;FDP=184;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.0554728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6943;QD=16.7161;RBI=0.0574955;REFB=-0.00653172;REVB=0.0151163;RO=101;SAF=31;SAR=48;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755687;STB=0.524375;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.016947;OID=.;OPOS=31336361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:184:101:101:79:83:0.451087:48:31:47:54:48:35:47:54 chr16 31422429 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.3;QD=58.5875;RBI=0.0184778;REFB=0;REVB=0.0107537;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172687;OID=.;OPOS=31422429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr16 31476458 . C T 385.18 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0269879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.362;QD=20.5428;RBI=0.027211;REFB=0.002878;REVB=-0.00347667;RO=36;SAF=19;SAR=20;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155297;STB=0.585788;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00178049;OID=.;OPOS=31476458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:20:19:24:12:20:19:24:12 chr16 31477460 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00742225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.284;QD=19.0182;RBI=0.00809679;REFB=-0.0206882;REVB=-0.00323545;RO=14;SAF=4;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333241;STB=0.690557;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0169889;OID=.;OPOS=31477460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:11:4:9:5:11:4:9:5 chr16 31539934 . G T 97.63 PASS AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00995072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6258;QD=24.4065;RBI=0.0146958;REFB=-0.000750332;REVB=-0.0108143;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235801;STB=0.63137;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.000372301;OID=.;OPOS=31539934;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:7:4:0:5:7:4:0:5 chr16 31724836 . T C 41.92 PASS AF=0.189189;AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0610785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2081;QD=4.53225;RBI=0.0653831;REFB=-0.00684787;REVB=-0.0233317;RO=30;SAF=4;SAR=3;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165596;STB=0.609467;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0257342;OID=.;OPOS=31724836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:37:37:30:30:7:7:0.189189:3:4:21:9:3:4:21:9 chr16 31926617 . CTGTA CTATA,TAACT 400.15 PASS AF=0.965517,0.0344828;AO=23,2;DP=29;FAO=28,1;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10,1;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301016,-0.0223019;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,5;MLLD=221.846,171.047;QD=55.1934;RBI=0.0301982,0.0224968;REFB=0,0;REVB=0.00241446,-0.00295521;RO=0;SAF=6,2;SAR=17,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=2.9951e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00208197,0.0216425;OID=.,.;OPOS=31926619,31926617;OREF=G,CTGTA;OALT=A,TAACT;OMAPALT=CTATA,TAACT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:29:29:0:0:23,2:28,1:0.965517,0.0344828:17,0:6,2:0:0:18,0:10,1:0:0 chr16 32077537 . G T 526.51 PASS AF=0.372781;AO=63;DP=168;FAO=63;FDP=169;FR=.;FRO=106;FSAF=44;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=0.00370887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.957;QD=12.4618;RBI=0.0145353;REFB=-0.0096294;REVB=0.0140541;RO=105;SAF=44;SAR=19;SRF=61;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143022;STB=0.585297;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0120585;OID=.;OPOS=32077537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:105:106:63:63:0.372781:19:44:61:44:19:44:61:45 chr16 32077580 . A G 541.09 PASS AF=0.383234;AO=64;DP=167;FAO=64;FDP=167;FR=.;FRO=103;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=0.0146584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7656;QD=12.9602;RBI=0.021518;REFB=-0.0112369;REVB=-0.015753;RO=103;SAF=40;SAR=24;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123704;STB=0.570086;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0131481;OID=.;OPOS=32077580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:103:103:64:64:0.383234:24:40:53:50:24:40:53:50 chr16 33629700 . G A 356.09 PASS AF=0.316901;AO=45;DP=137;FAO=45;FDP=142;FR=.;FRO=97;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=-0.00564838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.468;QD=10.0306;RBI=0.0193754;REFB=-0.00888774;REVB=-0.0185338;RO=92;SAF=29;SAR=16;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232144;STB=0.650806;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0197053;OID=.;OPOS=33629700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:142:92:97:45:45:0.316901:16:29:41:51:16:29:41:56 chr16 33629846 . T A 184.53 PASS AF=0.277778;AO=25;DP=90;FAO=25;FDP=90;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.0176578;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.39;QD=8.2013;RBI=0.0176594;REFB=-0.0141755;REVB=0.00023264;RO=65;SAF=12;SAR=13;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0037227;STB=0.502224;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0448889;OID=.;OPOS=33629846;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:65:65:25:25:0.277778:13:12:31:34:13:12:31:34 chr16 33629950 . G T 357.25 PASS AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=5;FWDB=-0.00810308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.506;QD=16.8119;RBI=0.0327016;REFB=-0.00105363;REVB=0.0316817;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=42;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413241;STB=0.727175;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00183319;OID=.;OPOS=33629950;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:38:38:0.447059:20:18:42:5:20:18:42:5 chr16 33629973 . G A 348.89 PASS AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=-0.0301809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.509;QD=15.0061;RBI=0.0483339;REFB=-0.0342016;REVB=-0.0377528;RO=55;SAF=21;SAR=17;SRF=42;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231403;STB=0.629568;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0429595;OID=.;OPOS=33629973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:17:21:42:13:17:21:42:13 chr16 33630022 . A T 362.41 PASS AF=0.369748;AO=43;DP=118;FAO=44;FDP=119;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.00089565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.064;QD=12.1817;RBI=0.0226501;REFB=-0.0103783;REVB=-0.0226324;RO=74;SAF=19;SAR=24;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795399;STB=0.53291;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0179635;OID=.;OPOS=33630022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:74:75:43:44:0.369748:24:19:38:36:24:20:38:37 chr16 33961317 . G A 36.63 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00589372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5309;QD=7.32536;RBI=0.0410783;REFB=0.0345702;REVB=0.0406533;RO=14;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.521733;STB=0.832223;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.035432;OID=.;OPOS=33961317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:1:5:5:9:1:5:5:9 chr16 33961327 . G T 37.76 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.00827672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.173;QD=9.44086;RBI=0.0294729;REFB=-0.0186929;REVB=-0.0282869;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656508;STB=0.891803;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0393681;OID=.;OPOS=33961327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:1:5:1:9:1:5:1:9 chr16 33961370 . A C 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.022326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.151;QD=24.3278;RBI=0.0284039;REFB=0.00492389;REVB=-0.0175594;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223089;STB=0.631145;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00371818;OID=.;OPOS=33961370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:1:6:1:1:1:6:1:1 chr16 33961658 . AG AA,GA 34.24 PASS AF=0.136364,0.136364;AO=3,3;DP=22;FAO=3,3;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1,2;FSAR=2,1;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0303903,-0.0675826;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=39.8243,126.781;QD=6.22493;RBI=0.0309408,0.0756791;REFB=-0.0188261,-0.0135039;REVB=-0.0058104,-0.0340577;RO=14;SAF=1,2;SAR=2,1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.257265,0.10955;STB=0.68842,0.591959;STBP=0.526,0.68;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0194951,0.0477365;OID=.,.;OPOS=33961659,33961658;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:22:22:14:16:3,3:3,3:0.136364,0.136364:2,1:1,2:8:6:2,1:1,2:9:7 chr16 33962422 . C A 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00163061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.686;QD=12.396;RBI=0.100394;REFB=0.0016303;REVB=0.100381;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471002;STB=0.776909;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00294255;OID=.;OPOS=33962422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:0:5:2:3:0:5 chr16 33962434 . CG C,CA 99.47 PASS AF=0.230769,0.615385;AO=3,9;DP=14;FAO=3,8;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=0,4;FSAR=3,4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0339504,0.0633284;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.972,59.8536;QD=30.6067;RBI=0.0496687,0.0900918;REFB=-0.0436162,0.0812547;REVB=-0.036254,0.0640784;RO=2;SAF=0,5;SAR=3,4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.176689;STB=0.5,0.599759;STBP=1,0.284;TYPE=del,snp;VARB=0.0669489,0.0101078;OID=.,.;OPOS=33962435,33962435;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.230769,0.615385:3,9:14:3,8:13:2:0,4:3,4:0:2:17:2:0,5:3,4:0:2 chr16 33962500 . T G 46.55 PASS AF=0.148148;AO=8;DP=53;FAO=8;FDP=54;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0222048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.97;QD=3.44851;RBI=0.0235347;REFB=-0.00124303;REVB=0.00779944;RO=45;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176783;STB=0.637928;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00483806;OID=.;OPOS=33962500;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:53:54:45:46:8:8:0.148148:6:2:17:28:6:2:18:28 chr16 33962542 . T A 74.63 PASS AF=0.185714;AO=13;DP=70;FAO=13;FDP=70;FR=.;FRO=57;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.00339424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2929;QD=4.26432;RBI=0.00403496;REFB=-0.00501919;REVB=0.00218174;RO=57;SAF=4;SAR=9;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107342;STB=0.570619;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0139854;OID=.;OPOS=33962542;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:70:70:57:57:13:13:0.185714:9:4:22:35:9:4:22:35 chr16 33962561 . GG CA 548.74 PASS AF=0.695652;AO=48;DP=65;FAO=48;FDP=69;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0322091;FXX=0.0416609;HRUN=2;LEN=2;MLLD=204.476;QD=31.8109;RBI=0.0340567;REFB=-0.0665625;REVB=0.0110648;RO=15;SAF=17;SAR=31;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076493;STB=0.50886;STBP=0.855;TYPE=mnp;VARB=0.0168756;OID=.;OPOS=33962561;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:69:15:21:48:48:0.695652:31:17:3:12:31:17:8:13 chr16 33962570 . G A 380.79 PASS AF=0.493671;AO=38;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0181777;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.941;QD=19.2806;RBI=0.0182294;REFB=0.00303781;REVB=-0.00137236;RO=39;SAF=15;SAR=23;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343545;STB=0.505152;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.00256659;OID=.;OPOS=33962570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:40:38:39:0.493671:23:15:14:25:24:15:15:25 chr16 33962582 . C T 60.9 PASS AF=0.146341;AO=12;DP=82;FAO=12;FDP=82;FR=.;FRO=70;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0174138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.575;QD=2.97059;RBI=0.0186005;REFB=-0.00661147;REVB=-0.00653753;RO=70;SAF=4;SAR=8;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070186;STB=0.54859;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0133344;OID=.;OPOS=33962582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:82:82:70:70:12:12:0.146341:8:4:27:43:8:4:27:43 chr16 33962619 . G A 320.37 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0396681;FXX=0.0596926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.931;QD=20.341;RBI=0.0397182;REFB=-0.0111415;REVB=0.00199367;RO=29;SAF=11;SAR=22;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740542;STB=0.551692;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0132049;OID=.;OPOS=33962619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:63:29:30:33:33:0.52381:22:11:12:17:22:11:13:17 chr16 33962641 . G T 271.34 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00618532;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0562;QD=16.698;RBI=0.00696899;REFB=0.00249168;REVB=0.00321071;RO=35;SAF=12;SAR=18;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282844;STB=0.515913;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.00522831;OID=.;OPOS=33962641;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:18:12:15:20:18:12:15:20 chr16 33962682 . T C 111.95 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.110186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.384;QD=11.4818;RBI=0.110292;REFB=-0.00719916;REVB=0.00481235;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131227;STB=0.517215;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0154282;OID=.;OPOS=33962682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:25:13:13:0.333333:8:5:6:16:8:5:9:16 chr16 33962697 . C T 62.38 PASS AF=0.28125;AO=8;DP=31;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00572912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.336;QD=7.79763;RBI=0.00714277;REFB=0.00786592;REVB=0.00426571;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232136;STB=0.6041;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.0167204;OID=.;OPOS=33962697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:32:23:23:8:9:0.28125:4:4:7:16:5:4:7:16 chr16 33962709 . C G 64.06 PASS AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0132362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.015;QD=9.49064;RBI=0.0144262;REFB=-0.00361766;REVB=-0.00573747;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125693;STB=0.576108;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.00984508;OID=.;OPOS=33962709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:5:4:6:12:5:4:6:12 chr16 33962891 . A T 175.18 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0112243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.895;QD=20.0208;RBI=0.0219659;REFB=-0.00968648;REVB=0.0188817;RO=17;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757821;STB=0.54281;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00652189;OID=.;OPOS=33962891;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:9:9:10:7:9:9:10:7 chr16 33962904 . T A 33.4 PASS AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00342132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0396;QD=3.42585;RBI=0.0583653;REFB=-0.00642847;REVB=-0.0582649;RO=33;SAF=4;SAR=2;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148934;STB=0.606777;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0541167;OID=.;OPOS=33962904;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:2:4:18:15:2:4:18:15 chr16 33962907 . AGGA CAAG,CGGG,TGGG 135.28 PASS AF=0.0833333,0.0555556,0.305556;AO=3,2,11;DP=39;FAO=3,2,11;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=1,1,6;FSAR=2,1,5;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0167153,0.00933506,0.0155937;FXX=0.0769034;HRUN=2,2,2;LEN=4,4,4;MLLD=129.03,151.478,176.537;QD=15.0309;RBI=0.0178307,0.0107275,0.0202741;REFB=-0.0132768,-0.0170843,-0.0107196;REVB=0.00620736,-0.00528534,-0.0129568;RO=20;SAF=1,1,6;SAR=2,1,5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.33423,-0.150169,-0.115455;STB=0.755241,0.635109,0.568741;STBP=0.468,0.723,0.589;TYPE=mnp,mnp,mnp;VARB=0.0417585,0.026653,0.0244763;OID=.,.,.;OPOS=33962907,33962907,33962907;OREF=AGGA,AGGA,AGGA;OALT=CAAG,CGGG,TGGG;OMAPALT=CAAG,CGGG,TGGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:93:39:36:20:20:3,2,11:3,2,11:0.0833333,0.0555556,0.305556:2,1,5:1,1,6:13:7:2,1,5:1,1,6:13:7 chr16 33962918 . G A 49.73 PASS AF=0.177778;AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00256732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.92;QD=4.42039;RBI=0.0471463;REFB=-0.00703666;REVB=-0.0470764;RO=37;SAF=4;SAR=4;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164025;STB=0.511083;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0275319;OID=.;OPOS=33962918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:45:45:37:37:8:8:0.177778:4:4:18:19:4:4:18:19 chr16 33962923 . G A 79.23 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0118148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.501;QD=6.88975;RBI=0.0184562;REFB=0.0025811;REVB=0.014179;RO=35;SAF=4;SAR=7;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116411;STB=0.573634;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00802956;OID=.;OPOS=33962923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:7:4:16:19:7:4:16:19 chr16 33962930 . G T 105.47 PASS AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00255297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.644;QD=8.11334;RBI=0.0277752;REFB=-0.00387478;REVB=0.0276576;RO=38;SAF=6;SAR=8;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227727;STB=0.513946;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.013176;OID=.;OPOS=33962930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:8:6:17:21:8:6:17:21 chr16 33962996 . T C 299.85 PASS AF=0.557692;AO=31;DP=58;FAO=29;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.011688;FXX=0.118624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.15;QD=23.0655;RBI=0.0141318;REFB=-0.00993779;REVB=0.00794346;RO=22;SAF=6;SAR=25;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325968;STB=0.676336;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00886405;OID=.;OPOS=33962996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:52:22:22:31:29:0.557692:25:6:12:10:23:6:12:10 chr16 33963000 . T C 309.39 PASS AF=0.551724;AO=29;DP=55;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0187825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.788;QD=21.3375;RBI=0.0392532;REFB=0.00112503;REVB=0.0344678;RO=26;SAF=5;SAR=24;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384358;STB=0.69505;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.000585146;OID=.;OPOS=33963000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:58:26:26:29:32:0.551724:24:5:14:12:26:6:14:12 chr16 33963002 . G A 112.26 PASS AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0232423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1755;QD=7.74184;RBI=0.0432948;REFB=0.00161154;REVB=-0.0365271;RO=37;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23899;STB=0.612095;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=-0.0150888;OID=.;OPOS=33963002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:42:16:16:0.275862:12:4:16:21:12:4:16:26 chr16 33963003 . A G 60.05 PASS AF=0.192982;AO=6;DP=52;FAO=11;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00430015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.005;QD=4.21411;RBI=0.0503168;REFB=-0.0150639;REVB=0.0501327;RO=45;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559961;STB=0.708235;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0301177;OID=.;OPOS=33963003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:52:57:45:46:6:11:0.192982:4:2:17:28:9:2:18:28 chr16 33963004 . G A 31.29 PASS AF=0.101449;AO=7;DP=69;FAO=7;FDP=69;FR=.;FRO=62;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.0140321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.785;QD=1.81398;RBI=0.0434069;REFB=-0.0014524;REVB=-0.0410762;RO=62;SAF=1;SAR=6;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2527;STB=0.709354;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0536514;OID=.;OPOS=33963004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:69:69:62:62:7:7:0.101449:6:1:19:43:6:1:19:43 chr16 33963015 . T C 731.35 PASS AF=0.638095;AO=67;DP=105;FAO=67;FDP=105;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00954783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.834;QD=27.8608;RBI=0.0364464;REFB=-0.0145209;REVB=0.0351736;RO=38;SAF=19;SAR=48;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145099;STB=0.578854;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00473096;OID=.;OPOS=33963015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:38:38:67:67:0.638095:48:19:18:20:48:19:18:20 chr16 33963020 . C A 1580.72 PASS AF=0.782609;AO=116;DP=151;FAO=126;FDP=161;FR=.;FRO=35;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0300082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.923;QD=39.2725;RBI=0.0330652;REFB=-0.0210098;REVB=0.0138857;RO=34;SAF=41;SAR=75;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053549;STB=0.525841;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00630664;OID=.;OPOS=33963020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:161:34:35:116:126:0.782609:75:41:16:18:79:47:17:18 chr16 33963046 . T C 6167.87 PASS AF=0.899371;AO=416;DP=465;FAO=429;FDP=477;FR=.;FRO=48;FSAF=199;FSAR=230;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00996216;FXX=0.00209201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.936;QD=51.7222;RBI=0.0502778;REFB=-0.0149258;REVB=0.049281;RO=48;SAF=199;SAR=217;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00394531;STB=0.50056;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00331153;OID=.;OPOS=33963046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:465:477:48:48:416:429:0.899371:217:199:22:26:230:199:22:26 chr16 33963086 . A G 7868.55 PASS AF=0.962617;AO=516;DP=535;FAO=515;FDP=535;FR=.;FRO=20;FSAF=222;FSAR=293;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0194178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4206;QD=58.8303;RBI=0.0265012;REFB=-0.0414502;REVB=0.018035;RO=17;SAF=222;SAR=294;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00479904;STB=0.503092;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00499387;OID=.;OPOS=33963086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:535:535:17:20:516:515:0.962617:294:222:6:11:293:222:7:13 chr16 33963106 . T C 8055.63 PASS AF=0.979284;AO=518;DP=529;FAO=520;FDP=531;FR=.;FRO=11;FSAF=229;FSAR=291;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0150789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.375;QD=60.6827;RBI=0.0166509;REFB=-0.0665002;REVB=0.00706253;RO=9;SAF=228;SAR=290;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00721388;STB=0.503526;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.000503955;OID=.;OPOS=33963106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:529:531:9:11:518:520:0.979284:290:228:2:7:291:229:3:8 chr16 33963108 . A G 7681.59 PASS AF=0.958333;AO=503;DP=525;FAO=506;FDP=528;FR=.;FRO=22;FSAF=224;FSAR=282;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.000919387;FXX=0.00189032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.321;QD=58.1939;RBI=0.00486081;REFB=-0.00235005;REVB=-0.00477307;RO=22;SAF=223;SAR=280;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00645541;STB=0.50334;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000194481;OID=.;OPOS=33963108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:525:528:22:22:503:506:0.958333:280:223:8:14:282:224:8:14 chr16 33963175 . C G 7259.5 PASS AF=0.987261;AO=464;DP=473;FAO=465;FDP=471;FR=.;FRO=6;FSAF=201;FSAR=264;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0252769;FXX=0.00632898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.343;QD=61.6518;RBI=0.0346093;REFB=0.0162268;REVB=-0.0236408;RO=5;SAF=201;SAR=263;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000687779;STB=0.501284;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=-0.000446189;OID=.;OPOS=33963175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:473:471:5:6:464:465:0.987261:263:201:2:3:264:201:2:4 chr16 33963202 . A G 5119.35 PASS AF=1;AO=324;DP=325;FAO=325;FDP=325;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00826902;FXX=0.00306739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.86;QD=63.0074;RBI=0.00866562;REFB=-0.0395993;REVB=0.00259155;RO=1;SAF=135;SAR=189;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00251737;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169328;OID=.;OPOS=33963202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:325:325:1:0:324:325:1:189:135:0:1:189:136:0:0 chr16 33963210 . AT GC 3777.22 PASS AF=1;AO=236;DP=246;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455318;FXX=0.032519;HRUN=1;LEN=2;MLLD=179.189;QD=63.4827;RBI=0.00531199;REFB=-0.0913006;REVB=0.00273602;RO=1;SAF=98;SAR=138;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00483829;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000276292;OID=.;OPOS=33963210;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:246:238:1:0:236:238:1:138:98:1:0:139:99:0:0 chr16 33963224 . T C 2974.72 PASS AF=0.974619;AO=190;DP=194;FAO=192;FDP=197;FR=.;FRO=5;FSAF=82;FSAR=110;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00603648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7396;QD=60.4003;RBI=0.00681789;REFB=-0.0512539;REVB=-0.00316932;RO=4;SAF=81;SAR=109;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708152;STB=0.505898;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000604536;OID=.;OPOS=33963224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:194:197:4:5:190:192:0.974619:109:81:1:3:110:82:1:4 chr16 33963248 . T C 2163.51 PASS AF=0.932099;AO=151;DP=162;FAO=151;FDP=162;FR=.;FRO=11;FSAF=59;FSAR=92;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00265275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.389;QD=53.42;RBI=0.0204337;REFB=-0.0186513;REVB=0.0202607;RO=9;SAF=59;SAR=92;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644606;STB=0.501933;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00175507;OID=.;OPOS=33963248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:162:162:9:11:151:151:0.932099:92:59:3:6:92:59:4:7 chr16 33963279 . T C 2508.89 PASS AF=0.910526;AO=176;DP=190;FAO=173;FDP=190;FR=.;FRO=17;FSAF=67;FSAR=106;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0190142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.525;QD=52.8188;RBI=0.0354518;REFB=0.0233118;REVB=0.0299214;RO=12;SAF=70;SAR=106;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337639;STB=0.524217;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.0065827;OID=.;OPOS=33963279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:190:190:12:17:176:173:0.910526:106:70:8:4:106:67:11:6 chr16 33963283 . C CGG 1865.6 PASS AF=0.959064;AO=138;DP=188;FAO=164;FDP=171;FR=.;FRO=7;FSAF=60;FSAR=104;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0987084;FXX=0.0552456;HRUN=2;LEN=2;MLLD=33.2915;QD=43.6398;RBI=0.104784;REFB=-0.0640572;REVB=0.0351602;RO=27;SAF=43;SAR=95;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156844;STB=0.502762;STBP=0.785;TYPE=ins;VARB=0.00458772;OID=.;OPOS=33963284;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=CGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.959064:138:188:164:171:7:60:104:3:4:6:27:43:95:21:6 chr16 33963289 . A G 2546.53 PASS AF=0.934783;AO=168;DP=183;FAO=172;FDP=184;FR=.;FRO=12;FSAF=64;FSAR=108;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00538378;FXX=0.0107521;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.601;QD=55.3594;RBI=0.0125549;REFB=0.00384767;REVB=0.011342;RO=12;SAF=60;SAR=108;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420894;STB=0.52034;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.000209734;OID=.;OPOS=33963289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:183:184:12:12:168:172:0.934783:108:60:8:4:108:64:8:4 chr16 33963329 . T C 2541.31 PASS AF=0.893401;AO=174;DP=197;FAO=176;FDP=197;FR=.;FRO=21;FSAF=80;FSAR=96;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.011439;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.243;QD=51.6002;RBI=0.0253083;REFB=-0.0122806;REVB=0.0225757;RO=19;SAF=79;SAR=95;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431344;STB=0.517623;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000720069;OID=.;OPOS=33963329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:197:197:19:21:174:176:0.893401:95:79:13:6:96:80:13:8 chr16 33963332 . A G 2719.3 PASS AF=0.938462;AO=182;DP=194;FAO=183;FDP=195;FR=.;FRO=12;FSAF=87;FSAR=96;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0165734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.532;QD=55.7806;RBI=0.0169785;REFB=0.00470601;REVB=0.00368646;RO=12;SAF=86;SAR=96;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228474;STB=0.511783;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.000191907;OID=.;OPOS=33963332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:194:195:12:12:182:183:0.938462:96:86:8:4:96:87:8:4 chr16 33963395 . AT TC 1725.72 PASS AF=0.865772;AO=118;DP=141;FAO=129;FDP=149;FR=.;FRO=20;FSAF=61;FSAR=68;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0217802;FXX=0.0324654;HRUN=1;LEN=2;MLLD=291.273;QD=46.328;RBI=0.039547;REFB=-0.0366098;REVB=0.0330089;RO=20;SAF=59;SAR=59;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273442;STB=0.517081;STBP=0.324;TYPE=mnp;VARB=0.00511051;OID=.;OPOS=33963395;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:141:149:20:20:118:129:0.865772:59:59:12:8:68:61:12:8 chr16 33963424 . A G 755.02 PASS AF=0.666667;AO=61;DP=95;FAO=68;FDP=102;FR=.;FRO=34;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0172313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.285;QD=29.6086;RBI=0.0182048;REFB=-0.0134294;REVB=-0.00587331;RO=34;SAF=31;SAR=30;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140154;STB=0.509915;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00312269;OID=.;OPOS=33963424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:102:34:34:61:68:0.666667:30:31:18:16:30:38:18:16 chr16 33963427 . T C 720.05 PASS AF=0.653061;AO=55;DP=90;FAO=64;FDP=98;FR=.;FRO=34;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00887701;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.469;QD=29.3896;RBI=0.0182701;REFB=-0.0277798;REVB=0.0159685;RO=31;SAF=35;SAR=20;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394695;STB=0.522929;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00579004;OID=.;OPOS=33963427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:98:31:34:55:64:0.653061:20:35:18:13:26:38:18:16 chr16 33963437 . T C 988.09 PASS AF=0.741071;AO=82;DP=112;FAO=83;FDP=112;FR=.;FRO=29;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0441661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.0584;QD=35.289;RBI=0.0442087;REFB=0.000909949;REVB=-0.0019405;RO=29;SAF=37;SAR=45;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323921;STB=0.506492;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.000939509;OID=.;OPOS=33963437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:29:29:82:83:0.741071:45:37:15:14:45:38:14:15 chr16 33963445 . A G 1110.38 PASS AF=0.756303;AO=89;DP=118;FAO=90;FDP=119;FR=.;FRO=29;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.03547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7208;QD=37.3238;RBI=0.0578478;REFB=0.0335919;REVB=-0.0456973;RO=29;SAF=44;SAR=45;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105067;STB=0.506909;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.0103172;OID=.;OPOS=33963445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:29:29:89:90:0.756303:45:44:15:14:46:44:15:14 chr16 33963447 . C T 32.35 PASS AF=0.0787402;AO=10;DP=127;FAO=10;FDP=127;FR=.;FRO=117;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=56;FSRR=61;FWDB=0.00566969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.654;QD=1.01895;RBI=0.0269712;REFB=-0.000941918;REVB=-0.0263686;RO=116;SAF=6;SAR=4;SRF=55;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139615;STB=0.611064;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0104113;OID=.;OPOS=33963447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:127:127:116:117:10:10:0.0787402:4:6:55:61:4:6:56:61 chr16 33963477 . GTTT AGAC,GTTC 723.98 PASS AF=0.510204,0.142857;AO=50,14;DP=98;FAO=50,14;FDP=98;FR=.;FRO=34;FSAF=13,7;FSAR=37,7;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00439036,0.00810193;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=4,1;MLLD=215.51,118.06;QD=29.5501;RBI=0.020918,0.0218372;REFB=0.00161968,-0.00604454;REVB=0.0204521,0.0202786;RO=33;SAF=13,7;SAR=37,7;SRF=19;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.257009,-0.0881337;STB=0.636501,0.541608;STBP=0.007,0.744;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00373601,0.00161048;OID=.,.;OPOS=33963477,33963480;OREF=GTTT,T;OALT=AGAC,C;OMAPALT=AGAC,GTTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:33:34:50,14:50,14:0.510204,0.142857:37,7:13,7:19:14:37,7:13,7:19:15 chr16 33963490 . T C 479.6 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0187296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4531;QD=19.9833;RBI=0.0693859;REFB=0.0218366;REVB=0.0668103;RO=49;SAF=13;SAR=34;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253614;STB=0.641446;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0141735;OID=.;OPOS=33963490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:34:13:26:23:34:13:26:23 chr16 33963528 . T C 394.93 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00128373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.957;QD=22.5672;RBI=0.0520501;REFB=-0.0104205;REVB=0.0520343;RO=30;SAF=15;SAR=24;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146063;STB=0.573953;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00802717;OID=.;OPOS=33963528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:30:31:39:39:0.557143:24:15:17:13:24:15:17:14 chr16 33963560 . C A 34.89 PASS AF=0.114754;AO=7;DP=61;FAO=7;FDP=61;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0103832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.136;QD=2.28765;RBI=0.0136149;REFB=-0.00124932;REVB=-0.00880639;RO=53;SAF=3;SAR=4;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288624;STB=0.514245;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00866252;OID=.;OPOS=33963560;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:61:61:53:54:7:7:0.114754:4:3:24:29:4:3:24:30 chr16 33963563 . G C 293.61 PASS AF=0.525424;AO=30;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00963869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.966;QD=19.9054;RBI=0.0101143;REFB=-0.0048891;REVB=-0.00306515;RO=28;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180441;STB=0.605312;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00488708;OID=.;OPOS=33963563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:30:31:0.525424:19:11:16:12:20:11:16:12 chr16 33963571 . T C 313.17 PASS AF=0.561404;AO=31;DP=56;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00182386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.725;QD=21.9769;RBI=0.0222262;REFB=-0.000695655;REVB=0.0221512;RO=25;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934377;STB=0.557341;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.000808697;OID=.;OPOS=33963571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:25:25:31:32:0.561404:16:15:15:10:17:15:15:10 chr16 33963591 . T C 176.64 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00711763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.728;QD=14.1314;RBI=0.0229231;REFB=-0.0054391;REVB=-0.0217901;RO=30;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170097;STB=0.59081;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0107066;OID=.;OPOS=33963591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:30:31:19:19:0.38:6:13:16:14:6:13:17:14 chr16 33963595 . A G 170.23 PASS AF=0.45;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=2.15034e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6923;QD=17.0234;RBI=0.0196606;REFB=-0.0117732;REVB=-0.0196606;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151842;STB=0.519752;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0218076;OID=.;OPOS=33963595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:21:22:18:18:0.45:8:10:12:9:8:10:13:9 chr16 33963597 . C T 168.68 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0105979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.332;QD=16.0652;RBI=0.0105999;REFB=-0.0351784;REVB=-0.000203596;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280656;STB=0.516111;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.029684;OID=.;OPOS=33963597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:8:10:14:10:8:10:14:10 chr16 33963599 . T C 70.78 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0479888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4099;QD=7.25964;RBI=0.0556589;REFB=0.00186511;REVB=-0.0281956;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16387;STB=0.593026;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00791986;OID=.;OPOS=33963599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:28:29:10:10:0.25641:3:7:16:12:3:7:17:12 chr16 33963605 . T C 198.54 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0335989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.199;QD=19.3699;RBI=0.0336091;REFB=0.00348867;REVB=0.000827475;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108214;STB=0.561038;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00391183;OID=.;OPOS=33963605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:14:7:9:11:14:7 chr16 33963624 . T C 104.8 PASS AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0103179;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.599;QD=9.98068;RBI=0.0166052;REFB=-0.0108522;REVB=-0.0130106;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695362;STB=0.56918;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00906963;OID=.;OPOS=33963624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:29:13:13:0.309524:5:8:15:12:5:8:15:14 chr16 33963636 . AA GG 127.2 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0132673;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=269.557;QD=11.5637;RBI=0.0141203;REFB=-0.0123919;REVB=0.00483333;RO=29;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280998;STB=0.666444;STBP=0.129;TYPE=mnp;VARB=0.0179148;OID=.;OPOS=33963636;OREF=AA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:5:10:12:17:5:10:12:17 chr16 33963678 . C T 301.79 PASS AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.000722824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.529;QD=25.1492;RBI=0.0175026;REFB=-0.0149417;REVB=-0.0174877;RO=20;SAF=8;SAR=19;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199186;STB=0.586081;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0088662;OID=.;OPOS=33963678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:21:27:27:0.5625:19:8:2:18:19:8:3:18 chr16 33963722 . C G 135.87 PASS AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0115469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.754;QD=9.70524;RBI=0.0165998;REFB=-0.00378514;REVB=-0.0119257;RO=38;SAF=4;SAR=14;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205873;STB=0.623613;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00983198;OID=.;OPOS=33963722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:14:4:14:24:14:4:14:24 chr16 33963732 . A C 118.36 PASS AF=0.263158;AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0267701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.592;QD=8.30583;RBI=0.0302249;REFB=-0.00638116;REVB=-0.0140325;RO=40;SAF=4;SAR=11;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149397;STB=0.591938;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0129517;OID=.;OPOS=33963732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:40:40:15:15:0.263158:11:4:15:25:11:4:15:25 chr16 33963737 . GC AT 222.51 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00362328;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=2;MLLD=180.129;QD=17.4518;RBI=0.00871347;REFB=-0.0082237;REVB=-0.00792442;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104275;STB=0.527642;STBP=0.837;TYPE=mnp;VARB=0.0120496;OID=.;OPOS=33963737;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:51:29:26:17:17:0.333333:13:4:9:20:13:4:7:19 chr16 33963758 . T C 38.3 PASS AF=0.117647;AO=8;DP=68;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=0.0100774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.773;QD=2.2528;RBI=0.0103919;REFB=0.0021798;REVB=-0.0025372;RO=59;SAF=6;SAR=2;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494576;STB=0.83697;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0130097;OID=.;OPOS=33963758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:68:68:59:60:8:8:0.117647:2:6:18:41:2:6:19:41 chr16 33963769 . C A 356.13 PASS AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=-0.00273967;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=344.734;QD=24.5608;RBI=0.00460776;REFB=0.00428597;REVB=0.00370482;RO=23;SAF=16;SAR=19;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245144;STB=0.633433;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0032932;OID=.;OPOS=33963769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:23:23:35:35:0.603448:19:16:3:20:19:16:3:20 chr16 33963772 . CGGG CGG,CGGC 446.5 PASS AF=0.355932,0.423729;AO=18,25;DP=63;FAO=21,25;FDP=59;FR=.;FRO=13;FSAF=12,8;FSAR=9,17;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0219919,-0.0123115;FXX=0.119385;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=19.878,29.0007;QD=30.2714;RBI=0.086835,0.0442598;REFB=-0.00265401,-0.0271992;REVB=0.084004,0.042513;RO=12;SAF=9,8;SAR=9,17;SRF=1;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.301435,0.172901;STB=0.682767,0.602524;STBP=0.02,0.143;TYPE=del,snp;VARB=0.0298664,-0.00498581;OID=.,.;OPOS=33963773,33963775;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGG,CGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.355932,0.423729:18,25:63:21,25:59:13:12,8:9,17:1:12:99:12:9,8:9,17:1:11 chr16 33963778 . G A 30.08 PASS AF=0.0860215;AO=8;DP=93;FAO=8;FDP=93;FR=.;FRO=85;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=54;FWDB=-0.0127811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.605;QD=1.2936;RBI=0.0139046;REFB=0.000464198;REVB=0.00547533;RO=85;SAF=3;SAR=5;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012404;STB=0.510061;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=-0.00818279;OID=.;OPOS=33963778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:93:93:85:85:8:8:0.0860215:5:3:31:54:5:3:31:54 chr16 33963783 . G C,T 1131.46 PASS AF=0.46875,0.40625;AO=45,39;DP=96;FAO=45,39;FDP=96;FR=.;FRO=12;FSAF=12,19;FSAR=33,20;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0101778,-0.00380237;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=121.675,146.267;QD=47.1443;RBI=0.0265671,0.0131569;REFB=-0.00443594,0.001775;REVB=0.0245402,0.0125955;RO=12;SAF=12,19;SAR=33,20;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0721971,0.0307782;STB=0.538887,0.516608;STBP=0.345,0.699;TYPE=snp,snp;VARB=0.0043706,0.000515843;OID=.,.;OPOS=33963783,33963783;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:96:96:12:12:45,39:45,39:0.46875,0.40625:33,20:12,19:5:7:33,20:12,19:5:7 chr16 33963788 . A C 32.36 PASS AF=0.0787402;AO=10;DP=127;FAO=10;FDP=127;FR=.;FRO=117;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=84;FWDB=0.000172129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.533;QD=1.01926;RBI=0.0129092;REFB=-0.0013691;REVB=-0.012908;RO=117;SAF=4;SAR=6;SRF=33;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148794;STB=0.618343;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0245629;OID=.;OPOS=33963788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:127:127:117:117:10:10:0.0787402:6:4:33:84:6:4:33:84 chr16 33963809 . G C 2354.33 PASS AF=0.887701;AO=165;DP=187;FAO=166;FDP=187;FR=.;FRO=21;FSAF=38;FSAR=128;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00187335;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.77;QD=50.36;RBI=0.10017;REFB=-0.0742247;REVB=0.100152;RO=21;SAF=38;SAR=127;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442218;STB=0.523561;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00768422;OID=.;OPOS=33963809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:187:187:21:21:165:166:0.887701:127:38:8:13:128:38:8:13 chr16 33963816 . TG GA 1988.16 PASS AF=0.757143;AO=158;DP=211;FAO=159;FDP=210;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=127;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00441348;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=2;MLLD=125.319;QD=37.8698;RBI=0.0106437;REFB=-0.0251071;REVB=0.00968551;RO=51;SAF=32;SAR=126;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179668;STB=0.596526;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0126326;OID=.;OPOS=33963816;OREF=TG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:51:51:158:159:0.757143:126:32:25:26:127:32:25:26 chr16 33963822 . A G 2726.98 PASS AF=0.8125;AO=208;DP=256;FAO=208;FDP=256;FR=.;FRO=48;FSAF=47;FSAR=161;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.00550682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.157;QD=42.6091;RBI=0.0225006;REFB=-0.00976917;REVB=-0.0218163;RO=48;SAF=47;SAR=161;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136744;STB=0.57272;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00260154;OID=.;OPOS=33963822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:48:48:208:208:0.8125:161:47:25:23:161:47:25:23 chr16 33963840 . C CCGTT 4109.74 PASS AF=0.866279;AO=289;DP=354;FAO=298;FDP=344;FR=.;FRO=46;FSAF=100;FSAR=198;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00184568;FXX=0.0497224;HRUN=2;LEN=4;MLLD=232.343;QD=47.7877;RBI=0.00966935;REFB=-0.0138055;REVB=-0.00949157;RO=54;SAF=94;SAR=195;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639738;STB=0.533668;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.0022107;OID=.;OPOS=33963841;OREF=-;OALT=CGTT;OMAPALT=CCGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.866279:289:354:298:344:46:100:198:26:20:99:54:94:195:28:26 chr16 33963855 . T C 7719.46 PASS AF=0.909091;AO=530;DP=586;FAO=530;FDP=583;FR=.;FRO=53;FSAF=176;FSAR=354;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0160175;FXX=0.00511937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.683;QD=52.9637;RBI=0.0460244;REFB=-0.0201631;REVB=0.0431472;RO=51;SAF=176;SAR=354;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330424;STB=0.516064;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00135931;OID=.;OPOS=33963855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:586:583:51:53:530:530:0.909091:354:176:26:25:354:176:26:27 chr16 33963875 . A G 11712.5 PASS AF=0.984314;AO=741;DP=754;FAO=753;FDP=765;FR=.;FRO=12;FSAF=305;FSAR=448;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0057316;FXX=0.0039062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9898;QD=61.2419;RBI=0.0826568;REFB=0.0214642;REVB=-0.0824578;RO=12;SAF=301;SAR=440;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00820183;STB=0.50425;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.000302131;OID=.;OPOS=33963875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:754:765:12:12:741:753:0.984314:440:301:8:4:448:305:8:4 chr16 33963881 . C G 11345.6 PASS AF=0.931873;AO=765;DP=823;FAO=766;FDP=822;FR=.;FRO=56;FSAF=312;FSAR=454;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.000870508;FXX=0.00242715;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.688;QD=55.2095;RBI=0.0462687;REFB=0.0183888;REVB=-0.0462605;RO=56;SAF=312;SAR=453;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171404;STB=0.509028;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00116607;OID=.;OPOS=33963881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:823:822:56:56:765:766:0.931873:453:312:30:26:454:312:30:26 chr16 33963912 . T C 14462.7 PASS AF=0.970072;AO=940;DP=969;FAO=940;FDP=969;FR=.;FRO=29;FSAF=401;FSAR=539;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0101038;FXX=0.00308639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.277;QD=59.7015;RBI=0.0229501;REFB=-0.062507;REVB=0.0206063;RO=27;SAF=401;SAR=539;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00701748;STB=0.504875;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00114757;OID=.;OPOS=33963912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:969:969:27:29:940:940:0.970072:539:401:15:12:539:401:17:12 chr16 33963961 . C G 16097.5 PASS AF=0.960109;AO=1058;DP=1104;FAO=1059;FDP=1103;FR=.;FRO=44;FSAF=432;FSAR=627;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0437515;FXX=0.00180994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.221;QD=58.3773;RBI=0.0444887;REFB=-0.0461164;REVB=-0.00806542;RO=38;SAF=432;SAR=626;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011657;STB=0.506601;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00132365;OID=.;OPOS=33963961;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:1104:1103:38:44:1058:1059:0.960109:626:432:22:16:627:432:25:19 chr16 33963975 . A G 14392.4 PASS AF=0.931599;AO=967;DP=1038;FAO=967;FDP=1038;FR=.;FRO=71;FSAF=409;FSAR=558;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.00731478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=341.648;QD=55.462;RBI=0.0120755;REFB=-0.00737604;REVB=0.00960786;RO=71;SAF=409;SAR=558;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112041;STB=0.505881;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.000384895;OID=.;OPOS=33963975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1038:1038:71:71:967:967:0.931599:558:409:36:35:558:409:36:35 chr16 33963991 . A G 14300.0 PASS AF=0.964912;AO=934;DP=969;FAO=935;FDP=969;FR=.;FRO=34;FSAF=402;FSAR=533;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0294954;FXX=0.00103092;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.602;QD=59.03;RBI=0.0295235;REFB=-0.014279;REVB=0.00128947;RO=33;SAF=402;SAR=532;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00963954;STB=0.505656;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.000512794;OID=.;OPOS=33963991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:969:969:33:34:934:935:0.964912:532:402:19:14:533:402:20:14 chr16 33964017 . A G 11443.3 PASS AF=0.951128;AO=738;DP=778;FAO=759;FDP=798;FR=.;FRO=39;FSAF=334;FSAR=425;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0136509;FXX=0.00125155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8361;QD=57.3597;RBI=0.013899;REFB=-0.0265811;REVB=-0.0026143;RO=37;SAF=327;SAR=411;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139494;STB=0.507409;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.000698417;OID=.;OPOS=33964017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:778:798:37:39:738:759:0.951128:411:327:22:15:425:334:23:16 chr16 33964025 . C T 36.95 PASS AF=0.0466045;AO=27;DP=743;FAO=35;FDP=751;FR=.;FRO=716;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=327;FSRR=389;FWDB=0.0360971;FXX=0.00265601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.638;QD=0.196787;RBI=0.0422961;REFB=-8.02488e-05;REVB=-0.0220445;RO=716;SAF=12;SAR=15;SRF=327;SRR=389;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104463;STB=0.608144;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00485428;OID=.;OPOS=33964025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:743:751:716:716:27:35:0.0466045:15:12:327:389:15:20:327:389 chr16 33964048 . G A 49.23 PASS AF=0.0559441;AO=32;DP=572;FAO=32;FDP=572;FR=.;FRO=540;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=249;FSRR=291;FWDB=-0.000385923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6589;QD=0.344297;RBI=0.012737;REFB=-0.000493731;REVB=0.0127311;RO=538;SAF=13;SAR=19;SRF=249;SRR=289;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588475;STB=0.552587;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00459952;OID=.;OPOS=33964048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:572:572:538:540:32:32:0.0559441:19:13:249:289:19:13:249:291 chr16 33964050 . G A 44.07 PASS AF=0.0540541;AO=30;DP=555;FAO=30;FDP=555;FR=.;FRO=525;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=234;FSRR=291;FWDB=0.00334787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.582;QD=0.31759;RBI=0.0109055;REFB=-2.7405e-05;REVB=-0.0103789;RO=524;SAF=14;SAR=16;SRF=234;SRR=290;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205508;STB=0.519948;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00139123;OID=.;OPOS=33964050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:555:555:524:525:30:30:0.0540541:16:14:234:290:16:14:234:291 chr16 33964062 . C T 124.9 PASS AF=0.0975;AO=39;DP=400;FAO=39;FDP=400;FR=.;FRO=361;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=96;FSRR=265;FWDB=-0.0689725;FXX=0.0024937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.858;QD=1.24904;RBI=0.0726192;REFB=-0.0178454;REVB=0.0227234;RO=358;SAF=22;SAR=17;SRF=96;SRR=262;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366528;STB=0.75556;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0693844;OID=.;OPOS=33964062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:400:358:361:39:39:0.0975:17:22:96:262:17:22:96:265 chr16 33964064 . TG CC,CG 3735.59 PASS AF=0.04,0.744;AO=15,278;DP=382;FAO=15,279;FDP=375;FR=.;FRO=81;FSAF=1,61;FSAR=14,218;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.024611,0.0408544;FXX=0.0183241;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=62.6085,86.2491;QD=39.8463;RBI=0.0259572,0.041803;REFB=-0.0369528,-0.0534017;REVB=0.00825096,0.00885473;RO=80;SAF=1,60;SAR=14,218;SRF=42;SRR=38;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.614219,-0.171515;STB=0.918477,0.588858;STBP=0.001,0;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0209955,0.0105634;OID=.,.;OPOS=33964064,33964064;OREF=TG,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:382:375:80:81:15,278:15,279:0.04,0.744:14,218:1,60:42:38:14,218:1,61:42:39 chr16 33964070 . AG GC 3382.22 PASS AF=0.764368;AO=264;DP=354;FAO=266;FDP=348;FR=.;FRO=82;FSAF=66;FSAR=200;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=0.00667101;FXX=0.0224713;HRUN=1;LEN=2;MLLD=152.426;QD=38.8761;RBI=0.0172138;REFB=-0.0610374;REVB=0.0158686;RO=81;SAF=65;SAR=199;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142346;STB=0.576917;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0164507;OID=.;OPOS=33964070;OREF=AG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:348:81:82:264:266:0.764368:199:65:41:40:200:66:42:40 chr16 33964082 . T C 3075.89 PASS AF=0.75625;AO=242;DP=322;FAO=242;FDP=320;FR=.;FRO=78;FSAF=68;FSAR=174;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.00434125;FXX=0.00621099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.045;QD=38.4486;RBI=0.0199839;REFB=-0.0141406;REVB=0.0195067;RO=76;SAF=68;SAR=174;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108473;STB=0.562438;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00615289;OID=.;OPOS=33964082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:320:76:78:242:242:0.75625:174:68:37:39:174:68:39:39 chr16 33964091 . T C 4164.74 PASS AF=0.943522;AO=236;DP=300;FAO=284;FDP=301;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=96;FSAR=188;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.087259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.476;QD=55.3453;RBI=0.0872826;REFB=-0.0499253;REVB=0.00203096;RO=16;SAF=48;SAR=188;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533199;STB=0.509591;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00489474;OID=.;OPOS=33964091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:300:301:16:16:236:284:0.943522:188:48:8:8:188:96:8:8 chr16 33964108 . G C 1918.35 PASS AF=0.662551;AO=161;DP=239;FAO=161;FDP=243;FR=.;FRO=82;FSAF=61;FSAR=100;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=0.0354625;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.989;QD=31.5778;RBI=0.0416575;REFB=-0.01471;REVB=0.0218577;RO=78;SAF=61;SAR=100;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526671;STB=0.534098;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00244161;OID=.;OPOS=33964108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:243:78:82:161:161:0.662551:100:61:36:42:100:61:39:43 chr16 33964119 . A G 74.7 PASS AF=0.100478;AO=21;DP=209;FAO=21;FDP=209;FR=.;FRO=188;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=91;FSRR=97;FWDB=-0.00471728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.301;QD=1.42975;RBI=0.0132649;REFB=-0.0032933;REVB=0.0123978;RO=184;SAF=10;SAR=11;SRF=90;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156815;STB=0.507068;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0182182;OID=.;OPOS=33964119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:209:209:184:188:21:21:0.100478:11:10:90:94:11:10:91:97 chr16 33964134 . G C 623.15 PASS AF=0.470588;AO=63;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=-0.0460975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6228;QD=18.328;RBI=0.047026;REFB=-0.00103462;REVB=0.00929833;RO=72;SAF=36;SAR=27;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530396;STB=0.525633;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00283436;OID=.;OPOS=33964134;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:72:72:63:64:0.470588:27:36:45:27:27:37:45:27 chr16 33964143 . T C 459.61 PASS AF=0.412698;AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=126;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=25;FWDB=-0.0761305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7289;QD=14.5906;RBI=0.0819077;REFB=-0.0331723;REVB=-0.0302161;RO=74;SAF=32;SAR=20;SRF=49;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523484;STB=0.529401;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0323544;OID=.;OPOS=33964143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:74:74:52:52:0.412698:20:32:49:25:20:32:49:25 chr16 33964153 . G T 102.48 PASS AF=0.16129;AO=20;DP=124;FAO=20;FDP=124;FR=.;FRO=104;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=68;FSRR=36;FWDB=-0.0028467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.525;QD=3.30574;RBI=0.00872034;REFB=-0.00454156;REVB=-0.00824262;RO=104;SAF=12;SAR=8;SRF=68;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730001;STB=0.547899;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0224065;OID=.;OPOS=33964153;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:104:104:20:20:0.16129:8:12:68:36:8:12:68:36 chr16 33964154 . C T 156.52 PASS AF=0.211382;AO=26;DP=123;FAO=26;FDP=123;FR=.;FRO=97;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=61;FSRR=36;FWDB=0.027323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.883;QD=5.08997;RBI=0.0306849;REFB=-0.00780278;REVB=-0.013965;RO=93;SAF=19;SAR=7;SRF=59;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140405;STB=0.593243;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0334742;OID=.;OPOS=33964154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:93:97:26:26:0.211382:7:19:59:34:7:19:61:36 chr16 33964168 . G A 128.43 PASS AF=0.198198;AO=22;DP=111;FAO=22;FDP=111;FR=.;FRO=89;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=56;FSRR=33;FWDB=-0.0297858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.134;QD=4.62816;RBI=0.0298294;REFB=-0.0038607;REVB=-0.00161176;RO=89;SAF=18;SAR=4;SRF=56;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295758;STB=0.692111;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0262037;OID=.;OPOS=33964168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:89:89:22:22:0.198198:4:18:56:33:4:18:56:33 chr16 33964196 . T C 113.73 PASS AF=0.280702;AO=16;DP=57;FAO=16;FDP=57;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.00599252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.751;QD=7.98122;RBI=0.00787076;REFB=-0.00556228;REVB=-0.00510279;RO=41;SAF=9;SAR=7;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18167;STB=0.60857;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0359222;OID=.;OPOS=33964196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:41:41:16:16:0.280702:7:9:29:12:7:9:29:12 chr16 33964202 . C T 236.18 PASS AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.000843083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.108;QD=18.5238;RBI=0.0329717;REFB=-0.00651614;REVB=-0.0329609;RO=26;SAF=19;SAR=5;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247777;STB=0.612806;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00696913;OID=.;OPOS=33964202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:5:19:15:11:6:19:15:11 chr16 33964204 . T G 75.84 PASS AF=0.211538;AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0406546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.237;QD=5.83372;RBI=0.0407221;REFB=-0.00502054;REVB=0.00234283;RO=41;SAF=9;SAR=2;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30877;STB=0.70393;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.048067;OID=.;OPOS=33964204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:52:52:41:41:11:11:0.211538:2:9:25:16:2:9:25:16 chr16 33964233 . C T 59.16 PASS AF=0.2;AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00406539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.682;QD=5.25865;RBI=0.00715504;REFB=-0.00181046;REVB=-0.00588789;RO=36;SAF=8;SAR=1;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381951;STB=0.763987;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00237321;OID=.;OPOS=33964233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:45:45:36:36:9:9:0.2:1:8:24:12:1:8:24:12 chr16 33965449 . G C 50.73 PASS AF=0.127907;AO=11;DP=86;FAO=11;FDP=86;FR=.;FRO=75;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=-0.0113393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8963;QD=2.35944;RBI=0.0123466;REFB=-0.0137694;REVB=0.00488452;RO=75;SAF=3;SAR=8;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201949;STB=0.64637;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0976739;OID=.;OPOS=33965449;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:86:86:75:75:11:11:0.127907:8:3:32:43:8:3:32:43 chr16 33965456 . T C 286.3 PASS AF=0.383721;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00845488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1971;QD=13.3164;RBI=0.0160669;REFB=-0.0043893;REVB=0.0136624;RO=53;SAF=10;SAR=23;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175133;STB=0.600551;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00491269;OID=.;OPOS=33965456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:53:33:33:0.383721:23:10:24:29:23:10:24:29 chr16 33965459 . C T 111.92 PASS AF=0.209302;AO=18;DP=86;FAO=18;FDP=86;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.011372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0125;QD=5.20539;RBI=0.0411111;REFB=-0.00573717;REVB=-0.039507;RO=68;SAF=5;SAR=13;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220782;STB=0.64068;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0199436;OID=.;OPOS=33965459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:68:68:18:18:0.209302:13:5:30:38:13:5:30:38 chr16 33965460 . G A 66.93 PASS AF=0.149425;AO=13;DP=87;FAO=13;FDP=87;FR=.;FRO=74;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.00679838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0514;QD=3.07714;RBI=0.00682544;REFB=0.000812479;REVB=0.000607118;RO=73;SAF=3;SAR=10;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266665;STB=0.691383;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00476841;OID=.;OPOS=33965460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:87:87:73:74:13:13:0.149425:10:3:31:42:10:3:32:42 chr16 33965470 . G A 30.31 PASS AF=0.0869565;AO=8;DP=92;FAO=8;FDP=92;FR=.;FRO=84;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.0371311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1975;QD=1.31779;RBI=0.0371537;REFB=-0.0025375;REVB=-0.00129551;RO=84;SAF=1;SAR=7;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399763;STB=0.836495;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0251995;OID=.;OPOS=33965470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:92:92:84:84:8:8:0.0869565:7:1:38:46:7:1:38:46 chr16 33965481 . T C 38.15 PASS AF=0.104651;AO=9;DP=86;FAO=9;FDP=86;FR=.;FRO=77;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0593828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.947;QD=1.77464;RBI=0.0624462;REFB=-0.00467379;REVB=-0.0193189;RO=76;SAF=6;SAR=3;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297845;STB=0.715962;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0769152;OID=.;OPOS=33965481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:86:86:76:77:9:9:0.104651:3:6:31:45:3:6:32:45 chr16 33965482 . GA G 67.66 PASS AF=0.152941;AO=12;DP=86;FAO=13;FDP=85;FR=.;FRO=72;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.0142286;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.378;QD=3.18381;RBI=0.0153916;REFB=-0.00595089;REVB=0.00586924;RO=71;SAF=1;SAR=11;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544895;STB=0.801113;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=0.0365383;OID=.;OPOS=33965483;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.152941:12:86:13:85:72:2:11:34:38:67:71:1:11:34:37 chr16 33965487 . C T 53.23 PASS AF=0.130952;AO=10;DP=83;FAO=11;FDP=84;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.0286938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.072;QD=2.53457;RBI=0.0379977;REFB=-0.00767613;REVB=0.0249097;RO=73;SAF=7;SAR=3;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354285;STB=0.699657;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0482637;OID=.;OPOS=33965487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:83:84:73:73:10:11:0.130952:3:7:29:44:4:7:29:44 chr16 33965489 . A T 67.88 PASS AF=0.152941;AO=13;DP=84;FAO=13;FDP=85;FR=.;FRO=72;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.0551084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6962;QD=3.19413;RBI=0.0894703;REFB=0.00875455;REVB=0.070484;RO=71;SAF=2;SAR=11;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439642;STB=0.808632;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.0382757;OID=.;OPOS=33965489;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:84:85:71:72:13:13:0.152941:11:2:34:37:11:2:35:37 chr16 33965493 . T C 66.57 PASS AF=0.147727;AO=13;DP=88;FAO=13;FDP=88;FR=.;FRO=75;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.016452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2973;QD=3.02577;RBI=0.020001;REFB=-0.00605526;REVB=-0.0113743;RO=74;SAF=2;SAR=11;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456152;STB=0.820373;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0365378;OID=.;OPOS=33965493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:88:88:74:75:13:13:0.147727:11:2:37:37:11:2:38:37 chr16 33965496 . A T 48.19 PASS AF=0.127907;AO=11;DP=86;FAO=11;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=74;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.0121642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.1245;QD=2.2412;RBI=0.174337;REFB=-0.0277874;REVB=-0.173912;RO=60;SAF=2;SAR=9;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.501394;STB=0.799436;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.146301;OID=.;OPOS=33965496;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:86:86:60:74:11:11:0.127907:9:2:36:24:9:2:38:36 chr16 33965505 . C T 61.29 PASS AF=0.148148;AO=12;DP=81;FAO=12;FDP=81;FR=.;FRO=69;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.00439111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.433;QD=3.0266;RBI=0.0107665;REFB=-0.00608771;REVB=-0.00983033;RO=69;SAF=2;SAR=10;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466747;STB=0.822234;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0205949;OID=.;OPOS=33965505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:81:81:69:69:12:12:0.148148:10:2:37:32:10:2:37:32 chr16 33965507 . G C 217.21 PASS AF=0.350649;AO=27;DP=77;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.016505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.759;QD=11.2834;RBI=0.0242842;REFB=-0.0127291;REVB=-0.0178132;RO=49;SAF=17;SAR=10;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223916;STB=0.62346;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0347675;OID=.;OPOS=33965507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:49:50:27:27:0.350649:10:17:21:28:10:17:22:28 chr16 33965533 . A C 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.000823917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.537;QD=17.4542;RBI=0.00818589;REFB=0.00352178;REVB=0.00814432;RO=29;SAF=19;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278319;STB=0.656865;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.00234706;OID=.;OPOS=33965533;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:8:19:12:17:8:19:12:17 chr16 33965537 . CA CG,TG 251.42 PASS AF=0.436364,0.0727273;AO=24,4;DP=52;FAO=24,4;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=19,1;FSAR=5,3;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0232607,0.0217078;FXX=0.017854;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=142.311,139.342;QD=18.2849;RBI=0.0301922,0.0241249;REFB=-0.00893266,-0.0108749;REVB=-0.0192486,-0.0105254;RO=22;SAF=19,1;SAR=5,3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.335938,-0.247236;STB=0.726572,0.653721;STBP=0.009,0.593;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00196824,0.0489448;OID=.,.;OPOS=33965538,33965537;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:55:22:27:24,4:24,4:0.436364,0.0727273:5,3:19,1:10:12:5,3:19,1:11:16 chr16 33965554 . A G 383.13 PASS AF=0.297872;AO=10;DP=48;FAO=14;FDP=47;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00562963;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.835;QD=32.6065;RBI=0.00562991;REFB=-0.0170755;REVB=-5.58845e-05;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555479;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0727974;OID=.;OPOS=33965554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:47:10:12:10:14:0.297872:8:2:2:8:9:5:3:9 chr16 33965560 . TT AC,AT 377.64 PASS AF=0.586957,0.108696;AO=27,5;DP=46;FAO=27,5;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=18,2;FSAR=9,3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0165938,-0.00139254;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=197.884,222.034;QD=32.8385;RBI=0.0216276,0.0127796;REFB=-0.0207848,-0.0229733;REVB=0.0138708,0.0127035;RO=14;SAF=18,2;SAR=9,3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0649221,-0.189489;STB=0.535687,0.624507;STBP=0.582,0.595;TYPE=mnp,snp;VARB=0.014881,-0.00394027;OID=.,.;OPOS=33965560,33965560;OREF=TT,T;OALT=AC,A;OMAPALT=AC,AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:14:14:27,5:27,5:0.586957,0.108696:9,3:18,2:8:6:9,3:18,2:8:6 chr16 34970274 . C G 89.3 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0403123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.327;QD=15.5302;RBI=0.044657;REFB=-0.0181626;REVB=0.0192135;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293955;STB=0.671941;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0197767;OID=.;OPOS=34970274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:3:8:5:7:3:8:5:7 chr16 46565019 . T G 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148459;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.101;QD=58.0611;RBI=0.0156881;REFB=0;REVB=0.005071;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08948e-05;OID=.;OPOS=46565019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0 chr16 46590024 . T C 875.12 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136045;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6191;QD=58.3416;RBI=0.0718589;REFB=0;REVB=-0.0705593;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000298403;OID=.;OPOS=46590024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0 chr16 46642286 . G A 84.88 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.129372;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.4832;QD=10.6097;RBI=0.130568;REFB=-0.00226167;REVB=0.0176364;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.607117;STB=0.800699;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0220926;OID=.;OPOS=46642286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:33:32:17:20:10:10:0.3125:7:3:16:1:7:3:16:4 chr16 46655210 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.213;QD=60.9775;RBI=0.0320476;REFB=0;REVB=0.0278685;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013851;OID=.;OPOS=46655210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr16 46696284 . G A 854.53 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000178473;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.306;QD=57.9341;RBI=0.0400038;REFB=0;REVB=-0.0400034;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173317;OID=.;OPOS=46696284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chr16 46761268 . G A 235.19 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0246951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7906;QD=25.4258;RBI=0.0683959;REFB=-0.00749377;REVB=0.063782;RO=14;SAF=13;SAR=9;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259463;STB=0.654541;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00813444;OID=.;OPOS=46761268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:15:22:22:0.594595:9:13:3:11:9:13:3:12 chr16 46773999 . C A 157.48 PASS AF=0.367347;AO=17;DP=48;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00200768;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.4394;QD=12.8554;RBI=0.0123523;REFB=0.00905436;REVB=0.012188;RO=31;SAF=8;SAR=9;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297672;STB=0.652907;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.0128289;OID=.;OPOS=46773999;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:31:31:17:18:0.367347:9:8:23:8:9:9:23:8 chr16 48201497 . TTCACGGATTGTGCGCTGGATCAGGGTG T 67.44 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0109977;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=27;MLLD=892.146;QD=6.27368;RBI=0.0122238;REFB=-0.00335426;REVB=-0.00533588;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222182;STB=0.618199;STBP=0.299;TYPE=del;VARB=0.00676397;OID=.;OPOS=48201498;OREF=TCACGGATTGTGCGCTGGATCAGGGTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.302326:13:44:13:43:30:6:7:19:11:67:24:6:7:16:8 chr16 49525238 . C T 804.29 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9975;QD=64.343;RBI=0.0626798;REFB=0;REVB=0.00315811;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000560879;OID=.;OPOS=49525238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0 chr16 49672520 . A G 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0528402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9336;QD=21.7441;RBI=0.091203;REFB=-0.00667735;REVB=-0.0743364;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420945;STB=0.523778;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=-0.00122247;OID=.;OPOS=49672520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:9:6:5:6:9:6:5:6 chr16 50059279 . C A 95.35 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0794406;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.022;QD=34.6717;RBI=0.0795827;REFB=-0.0648028;REVB=0.00475444;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529355;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00109248;OID=.;OPOS=50059279;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:0:1:10:10:0.909091:8:2:0:0:8:2:0:1 chr16 50069312 . C G 589.75 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00519567;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.458;QD=62.0785;RBI=0.0304276;REFB=0;REVB=0.0299807;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172391;OID=.;OPOS=50069312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0 chr16 50069772 . A G 816.33 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000483059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.115;QD=57.286;RBI=0.00304419;REFB=0;REVB=0.00300561;RO=1;SAF=25;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184862;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.32294e-06;OID=.;OPOS=50069772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:1:0:56:57:1:31:25:1:0:31:26:0:0 chr16 50071011 . C CTTTAG 117.44 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0012963;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=324.282;QD=21.3533;RBI=0.00283674;REFB=0.000351108;REVB=-0.00252324;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394853;STB=0.522354;STBP=0.856;TYPE=ins;VARB=-0.000213268;OID=.;OPOS=50071012;OREF=-;OALT=TTTAG;OMAPALT=CTTTAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.590909:13:22:13:22:9:5:8:3:6:66:9:5:8:3:6 chr16 50106594 . T C 1723.29 PASS AF=0.975;AO=116;DP=120;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0741687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2721;QD=57.443;RBI=0.0751261;REFB=-0.122322;REVB=0.0119549;RO=2;SAF=38;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00628273;STB=0.518984;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00453088;OID=.;OPOS=50106594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:120:120:2:3:116:117:0.975:78:38:1:1:79:38:3:0 chr16 50263762 . G A 351.13 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.155;QD=54.0198;RBI=0.0476617;REFB=0;REVB=0.0342522;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00210945;OID=.;OPOS=50263762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:8:16:0:0:9:17:0:0 chr16 50265818 . C T 628.33 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4867;QD=61.3003;RBI=0.0720396;REFB=0;REVB=-0.0665332;RO=0;SAF=5;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52432e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00059084;OID=.;OPOS=50265818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:36:5:0:0:36:5:0:0 chr16 50326661 . A G 1659.54 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.063;QD=60.347;RBI=0.0489865;REFB=0;REVB=0.0282123;RO=0;SAF=46;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.91294e-05;OID=.;OPOS=50326661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:64:46:0:0:64:46:0:0 chr16 50368663 . G A 98.55 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0368186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.235;QD=14.0792;RBI=0.0426022;REFB=-0.0109436;REVB=0.0214322;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211339;STB=0.624777;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.012028;OID=.;OPOS=50368663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:9:3:7:9:9:3:7:9 chr16 50642201 . G C 966.9 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00194556;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.117;QD=55.2513;RBI=0.00784189;REFB=-0.120094;REVB=-0.00759671;RO=1;SAF=21;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219715;STB=0.506364;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00266826;OID=.;OPOS=50642201;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:71:70:1:2:68:68:0.971429:47:21:1:0:47:21:1:1 chr16 51171175 . C T 2028.31 PASS AF=1;AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142072;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.238;QD=62.4097;RBI=0.0323388;REFB=0;REVB=-0.0290508;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.04293e-05;OID=.;OPOS=51171175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:130:0:0:130:130:1:70:60:0:0:70:60:0:0 chr16 51172677 . G A 331.3 PASS AF=0.359649;AO=41;DP=114;FAO=41;FDP=114;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0130034;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.637;QD=11.6245;RBI=0.0134257;REFB=-0.00739918;REVB=-0.00334102;RO=73;SAF=18;SAR=23;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301762;STB=0.517293;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0179339;OID=.;OPOS=51172677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:73:73:41:41:0.359649:23:18:34:39:23:18:34:39 chr16 51173559 . G A 117.47 PASS AF=0.3;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0159177;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8343;QD=9.39741;RBI=0.0636777;REFB=-0.00344722;REVB=0.0616561;RO=37;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060639;STB=0.520981;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0126391;OID=.;OPOS=51173559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:50:37:35:15:15:0.3:9:6:13:24:9:6:13:22 chr16 51705448 . C T 691.97 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0177187;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.073;QD=54.2717;RBI=0.0177209;REFB=-0.0707035;REVB=-0.000283653;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.508471;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000252417;OID=.;OPOS=51705448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:52:51:0:1:50:50:0.980392:29:21:0:0:29:21:0:1 chr16 53283966 . G A 211.83 PASS AF=0.38806;AO=20;DP=61;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.00679706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.557;QD=12.6465;RBI=0.0214899;REFB=-0.0166853;REVB=0.0203867;RO=40;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140962;STB=0.505296;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0262178;OID=.;OPOS=53283966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:67:40:41:20:26:0.38806:9:11:17:23:15:11:17:24 chr16 53325691 . G A 124.19 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0191572;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.813;QD=16.0244;RBI=0.0264031;REFB=-0.00875988;REVB=-0.0181694;RO=17;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171008;STB=0.599845;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00962101;OID=.;OPOS=53325691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:31:17:17:14:14:0.451613:11:3:6:11:11:3:6:11 chr16 53326860 . G A 152.9 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0528346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.182;QD=11.9919;RBI=0.0612394;REFB=-0.031431;REVB=-0.0309639;RO=33;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112634;STB=0.506601;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0448218;OID=.;OPOS=53326860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:10:8:15:18:10:8:15:18 chr16 53341748 . T G 272.3 PASS AF=0.395062;AO=30;DP=80;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0146243;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1574;QD=13.4468;RBI=0.0149574;REFB=-0.0141863;REVB=-0.003139;RO=47;SAF=8;SAR=22;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145344;STB=0.564061;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0206702;OID=.;OPOS=53341748;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:47:49:30:32:0.395062:22:8:18:29:22:10:20:29 chr16 53358439 . A G 393.05 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.0344525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5255;QD=19.6524;RBI=0.0347313;REFB=-0.023517;REVB=0.00439194;RO=40;SAF=20;SAR=20;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180723;STB=0.599952;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0201277;OID=.;OPOS=53358439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:20:20:12:28:20:20:12:28 chr16 53371463 . A G 191.45 PASS AF=0.444444;AO=18;DP=43;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0865582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2254;QD=17.0175;RBI=0.107707;REFB=-0.0306348;REVB=-0.0640978;RO=25;SAF=3;SAR=15;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422641;STB=0.708104;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0348164;OID=.;OPOS=53371463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:45:25:25:18:20:0.444444:15:3:13:12:16:4:13:12 chr16 53396356 . T C 220.08 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0381929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6603;QD=12.059;RBI=0.038466;REFB=-0.0130345;REVB=0.00457585;RO=45;SAF=10;SAR=17;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179285;STB=0.597035;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0218337;OID=.;OPOS=53396356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:45:46:27:27:0.369863:17:10:24:21:17:10:24:22 chr16 53404203 . C A 365.17 PASS AF=0.636364;AO=35;DP=55;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00593882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0683;QD=26.5581;RBI=0.0570347;REFB=0.0247388;REVB=-0.0567246;RO=20;SAF=6;SAR=29;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364113;STB=0.701482;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0147203;OID=.;OPOS=53404203;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:20:20:35:35:0.636364:29:6:12:8:29:6:12:8 chr16 53503934 . G A 416.63 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.0133947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5989;QD=19.6059;RBI=0.0361745;REFB=-0.0281471;REVB=0.0336032;RO=43;SAF=29;SAR=13;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00769385;STB=0.504271;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0314319;OID=.;OPOS=53503934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:13:29:30:13:13:29:30:13 chr16 53504721 . T C 375.63 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00342559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.619;QD=23.8497;RBI=0.010263;REFB=-0.00789981;REVB=0.0096744;RO=26;SAF=18;SAR=19;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018761;STB=0.510304;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00645201;OID=.;OPOS=53504721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:26:37:37:0.587302:19:18:12:14:19:18:12:14 chr16 53513055 . T C 259.12 PASS AF=0.55814;AO=23;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0289532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6797;QD=24.1042;RBI=0.0455651;REFB=-0.0104946;REVB=0.0351837;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389085;STB=0.530072;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0155882;OID=.;OPOS=53513055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:23:24:0.55814:12:11:10:9:13:11:10:9 chr16 53639438 . C T 674.31 PASS AF=0.472222;AO=68;DP=144;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=49;FWDB=0.0570641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9397;QD=18.7308;RBI=0.057905;REFB=0.00402181;REVB=0.00983213;RO=74;SAF=40;SAR=28;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232794;STB=0.621434;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00429585;OID=.;OPOS=53639438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:74:76:68:68:0.472222:28:40:25:49:28:40:27:49 chr16 53671754 . C T 231.37 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00392058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1103;QD=23.7301;RBI=0.0520806;REFB=-0.0110805;REVB=-0.0519328;RO=17;SAF=6;SAR=16;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756476;STB=0.542333;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0171331;OID=.;OPOS=53671754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:16:6:6:11:16:6:6:11 chr16 54147723 . CTTTTT CTTTTC,CTT,CTTT 131.34 PASS AF=0.375,0.625,0;AO=4,5,3;DP=17;FAO=6,10,0;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4,0;FSAR=6,6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00487909,0.0248253,0.0356656;FXX=0.111049;HRUN=15,15,15;LEN=1,3,2;MLLD=143.759,16.3402,9.53493;QD=32.8358;RBI=0.0150902,0.0255641,0.0359071;REFB=0,0,0;REVB=-0.0142797,0.00610143,-0.00415771;RO=0;SAF=0,2,2;SAR=4,3,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0825711,-0.0895127,-0.0116197;OID=.,.,.;OPOS=54147728,54147724,54147724;OREF=T,TTT,TT;OALT=C,-,-;OMAPALT=CTTTTC,CTT,CTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.375,0.625,0:4,5,3:17:6,10,0:16:0:0,4,0:6,6,0:0:0:39:0:0,2,2:4,3,1:0:0 chr16 54967096 . C A 753.52 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0602209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.34;QD=61.5115;RBI=0.0603124;REFB=-0.052888;REVB=-0.00332024;RO=1;SAF=9;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494209;STB=0.526304;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.000164048;OID=.;OPOS=54967096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:39:9:1:0:39:9:1:0 chr16 55325460 . T C 696.68 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00358958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.381;QD=52.5798;RBI=0.00738883;REFB=-0.00612044;REVB=-0.00645831;RO=2;SAF=7;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209273;STB=0.511107;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.000638952;OID=.;OPOS=55325460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:44:7:0:2:44:7:0:2 chr16 55362645 . G A 292.69 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0212185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.81;QD=17.217;RBI=0.0269226;REFB=0.00119246;REVB=-0.0165711;RO=36;SAF=23;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173243;STB=0.597649;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.000752725;OID=.;OPOS=55362645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:9:23:20:16:9:23:20:16 chr16 55519607 . C T 531.29 PASS AF=0.509259;AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0093713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.658;QD=19.6774;RBI=0.0200206;REFB=0.00373464;REVB=0.0176919;RO=52;SAF=32;SAR=23;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00442755;STB=0.501557;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=-0.00289016;OID=.;OPOS=55519607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:52:53:55:55:0.509259:23:32:30:22:23:32:31:22 chr16 55523705 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00939899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.043;QD=58.7816;RBI=0.0132413;REFB=0;REVB=0.00932696;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.57946e-07;OID=.;OPOS=55523705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0 chr16 55527113 . G A 195.21 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.010903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.822;QD=14.1969;RBI=0.0428405;REFB=-0.00649432;REVB=0.0414299;RO=31;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293751;STB=0.527844;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.011334;OID=.;OPOS=55527113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:32:23:23:0.418182:9:14:18:13:9:14:18:14 chr16 55562466 . G A 1279.94 PASS AF=0.525641;AO=123;DP=234;FAO=123;FDP=234;FR=.;FRO=111;FSAF=61;FSAR=62;FSRF=68;FSRR=43;FWDB=-0.0166736;FXX=0.00847422;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.22;QD=21.8793;RBI=0.0179675;REFB=-0.0195339;REVB=-0.00669486;RO=110;SAF=61;SAR=62;SRF=67;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977811;STB=0.555292;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0153943;OID=.;OPOS=55562466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:110:111:123:123:0.525641:62:61:67:43:62:61:68:43 chr16 55571563 . G A 478.07 PASS AF=0.528736;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00221945;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.86;QD=21.9802;RBI=0.0103784;REFB=-0.0121529;REVB=0.0101383;RO=41;SAF=25;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476841;STB=0.526304;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0136224;OID=.;OPOS=55571563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:41:41:46:46:0.528736:21:25:20:21:21:25:20:21 chr16 55608587 . G A 639.25 PASS AF=0.427711;AO=71;DP=167;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=52;FSRR=43;FWDB=0.0442912;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.16;QD=15.4037;RBI=0.0463931;REFB=-0.0103061;REVB=0.0138061;RO=95;SAF=36;SAR=35;SRF=52;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413398;STB=0.523091;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0133801;OID=.;OPOS=55608587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:95:95:71:71:0.427711:35:36:52:43:35:36:52:43 chr16 55806311 . G T 304.16 PASS AF=0.360825;AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.00403678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.461;QD=12.5427;RBI=0.00913687;REFB=-0.0069915;REVB=-0.00819675;RO=62;SAF=19;SAR=16;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116394;STB=0.56659;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0112979;OID=.;OPOS=55806311;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:62:62:35:35:0.360825:16:19:40:22:16:19:40:22 chr16 55806409 . T C 473.73 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0481334;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3666;QD=17.5457;RBI=0.0481567;REFB=-0.00157487;REVB=0.00149846;RO=56;SAF=19;SAR=32;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156821;STB=0.583083;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00217648;OID=.;OPOS=55806409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:56:57:51:51:0.472222:32:19:30:26:32:19:30:27 chr16 55844927 . A C 443.75 PASS AF=0.969697;AO=8;DP=34;FAO=32;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0483805;FXX=0.0294031;HRUN=14;LEN=1;MLLD=203.224;QD=53.7883;RBI=0.0494163;REFB=0.0715892;REVB=-0.0100647;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.512812;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00115238;OID=.;OPOS=55844927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:33:0:1:8:32:0.969697:7:1:0:0:19:13:0:1 chr16 55862691 . G A 136.73 PASS AF=0.212121;AO=21;DP=100;FAO=21;FDP=99;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=-0.0171752;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.864;QD=5.52437;RBI=0.051737;REFB=-0.00548242;REVB=-0.048803;RO=79;SAF=11;SAR=10;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00989419;STB=0.511572;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0245469;OID=.;OPOS=55862691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:79:78:21:21:0.212121:10:11:42:37:10:11:42:36 chr16 55862717 . T C 94.31 PASS AF=0.165049;AO=17;DP=103;FAO=17;FDP=103;FR=.;FRO=86;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=-0.00114487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.812;QD=3.66259;RBI=0.0246927;REFB=0.00133816;REVB=-0.0246661;RO=85;SAF=7;SAR=10;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898754;STB=0.554848;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.012993;OID=.;OPOS=55862717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:103:103:85:86:17:17:0.165049:10:7:41:44:10:7:41:45 chr16 55862720 . T C 84.83 PASS AF=0.153846;AO=16;DP=104;FAO=16;FDP=104;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=0.00254527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.058;QD=3.26281;RBI=0.00463494;REFB=-0.00536633;REVB=0.00387353;RO=88;SAF=7;SAR=9;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360246;STB=0.524241;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0244518;OID=.;OPOS=55862720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:104:104:88:88:16:16:0.153846:9:7:41:47:9:7:41:47 chr16 55862762 . C G 109.99 PASS AF=0.178571;AO=20;DP=114;FAO=20;FDP=112;FR=.;FRO=92;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.00238838;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.519;QD=3.92817;RBI=0.00934972;REFB=-0.00375611;REVB=-0.00903952;RO=93;SAF=9;SAR=11;SRF=41;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117345;STB=0.521718;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0207529;OID=.;OPOS=55862762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:93:92:20:20:0.178571:11:9:41:52:11:9:39:53 chr16 55862791 . T C 85.53 PASS AF=0.151786;AO=17;DP=113;FAO=17;FDP=112;FR=.;FRO=95;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=0.000986284;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.093;QD=3.05477;RBI=0.0313816;REFB=-0.00386311;REVB=-0.0313661;RO=94;SAF=7;SAR=10;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718268;STB=0.544238;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0262297;OID=.;OPOS=55862791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:113:112:94:95:17:17:0.151786:10:7:44:50:10:7:44:51 chr16 55862824 . C T 69.91 PASS AF=0.137255;AO=14;DP=102;FAO=14;FDP=102;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.00388051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1095;QD=2.74154;RBI=0.010282;REFB=0.0026556;REVB=-0.00952159;RO=88;SAF=7;SAR=7;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565567;STB=0.53916;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.0216141;OID=.;OPOS=55862824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:102:102:88:88:14:14:0.137255:7:7:40:48:7:7:40:48 chr16 55862836 . G A 64.26 PASS AF=0.150538;AO=7;DP=86;FAO=14;FDP=93;FR=.;FRO=79;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.000501817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.629;QD=2.7638;RBI=0.00515607;REFB=-0.0113259;REVB=-0.00513159;RO=78;SAF=0;SAR=7;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550431;STB=0.559057;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0650874;OID=.;OPOS=55862836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:86:93:78:79:7:14:0.150538:7:0:33:45:7:7:34:45 chr16 55862883 . C A 55.33 PASS AF=0.15873;AO=10;DP=63;FAO=10;FDP=63;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00338999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.436;QD=3.51291;RBI=0.019108;REFB=-0.00549941;REVB=-0.0188049;RO=53;SAF=7;SAR=3;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323212;STB=0.719196;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0266763;OID=.;OPOS=55862883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:63:63:53:53:10:10:0.15873:3:7:23:30:3:7:23:30 chr16 55880480 . A C 288.52 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=3;FWDB=0.0797788;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.7366;QD=19.2349;RBI=0.0800708;REFB=-0.0160524;REVB=0.00683128;RO=29;SAF=25;SAR=6;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138461;STB=0.576227;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0148869;OID=.;OPOS=55880480;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:6:25:26:3:6:25:26:3 chr16 55880534 . G C 288.86 PASS AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.015331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.155;QD=21.0082;RBI=0.0153601;REFB=-0.0122588;REVB=-0.000944279;RO=25;SAF=22;SAR=8;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072725;STB=0.540167;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0110313;OID=.;OPOS=55880534;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:8:22:20:5:8:22:20:5 chr16 55883618 . T C 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00864933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.081;QD=61.048;RBI=0.0238773;REFB=0;REVB=0.0222556;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57267e-05;OID=.;OPOS=55883618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0 chr16 55905636 . A G 1439.91 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0403909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.86;QD=61.9316;RBI=0.0404156;REFB=-0.158351;REVB=0.00141021;RO=1;SAF=47;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099791;STB=0.505153;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00125877;OID=.;OPOS=55905636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:93:93:1:1:91:92:0.989247:44:47:1:0:44:48:1:0 chr16 56228066 . A G 536.41 PASS AF=0.555556;AO=39;DP=88;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0196836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.728;QD=23.8406;RBI=0.0227416;REFB=0.00478065;REVB=-0.0113902;RO=33;SAF=16;SAR=23;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162493;STB=0.598792;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.00241622;OID=.;OPOS=56228066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:33:40:39:50:0.555556:23:16:20:13:31:19:24:16 chr16 56368689 . C T 987.23 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0215849;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.693;QD=56.413;RBI=0.033227;REFB=-0.0526996;REVB=0.0252612;RO=2;SAF=31;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295161;STB=0.51562;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0012048;OID=.;OPOS=56368689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:71:70:2:2:68:68:0.971429:37:31:2:0:37:31:2:0 chr16 56377724 . G A 367.26 PASS AF=0.493506;AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00103366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.12;QD=19.0782;RBI=0.00321548;REFB=-0.027263;REVB=0.00304481;RO=39;SAF=19;SAR=18;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478062;STB=0.51947;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0269225;OID=.;OPOS=56377724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:39:39:37:38:0.493506:18:19:18:21:19:19:18:21 chr16 56395610 . G A 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.801;QD=56.9563;RBI=0.0501437;REFB=0;REVB=0.0463618;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205881;OID=.;OPOS=56395610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0 chr16 56396486 . C T 227.22 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0140669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.18;QD=28.4027;RBI=0.021888;REFB=-0.00268968;REVB=-0.0167693;RO=11;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127881;STB=0.570505;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0015792;OID=.;OPOS=56396486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:10:11:8:3:10:11:8:3 chr16 56485554 . C G 280.11 PASS AF=0.517241;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0613662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2372;QD=19.3176;RBI=0.101423;REFB=-0.0156705;REVB=-0.0807514;RO=28;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111322;STB=0.56892;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0121601;OID=.;OPOS=56485554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:28:28:29:30:0.517241:14:15:18:10:15:15:18:10 chr16 56510299 . A C 172.94 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.065545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.623;QD=18.6965;RBI=0.0668926;REFB=0.0255197;REVB=-0.0133593;RO=19;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214181;STB=0.621171;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.0328054;OID=.;OPOS=56510299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:8:10:6:13:8:10:6:13 chr16 56548501 . C T 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00685201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.636;QD=59.0187;RBI=0.0293615;REFB=0;REVB=0.0285508;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.29252e-05;OID=.;OPOS=56548501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0 chr16 56601720 . A G 1324.85 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0416833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.247;QD=60.9127;RBI=0.0443938;REFB=-0.0283189;REVB=0.0152743;RO=1;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111471;STB=0.505881;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=6.41178e-05;OID=.;OPOS=56601720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:42:44:0:1:42:44:0:1 chr16 56601722 . T C 1326.71 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174075;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.599;QD=62.4335;RBI=0.0176939;REFB=0;REVB=-0.00317082;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.08391e-05;OID=.;OPOS=56601722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0 chr16 56667282 . C A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.358;QD=62.3509;RBI=0.0425718;REFB=0;REVB=0.0314156;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014087;OID=.;OPOS=56667282;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0 chr16 56686470 . C T 782.64 PASS AF=1;AO=38;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.2771;QD=63.8891;RBI=0.189767;REFB=0;REVB=0.189727;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00374431;OID=.;OPOS=56686470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:38:49:1:13:25:0:0:24:25:0:0 chr16 56701294 . T A 96.55 PASS AF=0.521739;AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.000485351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.848;QD=16.7917;RBI=0.0505746;REFB=-0.0313675;REVB=0.0505723;RO=11;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533279;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0179304;OID=.;OPOS=56701294;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:22:23:11:11:11:12:0.521739:3:8:8:3:4:8:8:3 chr16 56855496 . C G 263.52 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0200087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.588;QD=17.5681;RBI=0.021348;REFB=-0.025221;REVB=0.00744235;RO=30;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201103;STB=0.620606;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0290093;OID=.;OPOS=56855496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:31:29:29:0.483333:18:11:18:12:18:11:19:12 chr16 56868700 . A G 785.04 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.997;QD=57.0936;RBI=0.0356694;REFB=0;REVB=0.00197112;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.55577e-05;OID=.;OPOS=56868700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0 chr16 56873495 . C T 677.96 PASS AF=0.48227;AO=68;DP=141;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.0066477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2853;QD=19.2329;RBI=0.0433031;REFB=-0.0017575;REVB=-0.0427898;RO=70;SAF=19;SAR=49;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285372;STB=0.669259;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0015179;OID=.;OPOS=56873495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:70:73:68:68:0.48227:49:19:40:30:49:19:43:30 chr16 56901065 . A G 248.2 PASS AF=0.48;AO=23;DP=49;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00743565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.198;QD=19.8559;RBI=0.0218496;REFB=-0.0273883;REVB=0.0205455;RO=26;SAF=9;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104113;STB=0.566954;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0422285;OID=.;OPOS=56901065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:26:26:23:24:0.48:14:9:13:13:15:9:13:13 chr16 56904587 . C G 707.85 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5583;QD=62.9203;RBI=0.0222371;REFB=0;REVB=0.00297341;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346353;OID=.;OPOS=56904587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0 chr16 56966011 . G A 818.34 PASS AF=0.923077;AO=60;DP=66;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0156956;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.464;QD=50.3596;RBI=0.0398356;REFB=-0.0317973;REVB=0.0366132;RO=3;SAF=38;SAR=22;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358111;STB=0.502755;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00195599;OID=.;OPOS=56966011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:66:65:3:5:60:60:0.923077:22:38:3:0:22:38:3:2 chr16 57005301 . C T 85.27 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0184942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.635;QD=11.3691;RBI=0.0312992;REFB=-0.0208276;REVB=-0.0252509;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359763;STB=0.521434;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.040925;OID=.;OPOS=57005301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:11:8:5:6:11:8 chr16 57016092 . G A 339.4 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0408794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1578;QD=17.863;RBI=0.0545507;REFB=-0.0196715;REVB=0.03612;RO=40;SAF=23;SAR=13;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158586;STB=0.588805;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0250926;OID=.;OPOS=57016092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:13:23:19:21:13:23:19:21 chr16 57060340 . T C 223.17 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0590409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2675;QD=49.5938;RBI=0.059041;REFB=0;REVB=0.000130384;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00188448;OID=.;OPOS=57060340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr16 57060353 . T C 206.8 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.808;QD=48.6594;RBI=0.0464462;REFB=0;REVB=0.0134587;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903044;OID=.;OPOS=57060353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:6:10:0:0:6:11:0:0 chr16 57068106 . AC GT 787.47 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119568;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=123.687;QD=57.2707;RBI=0.0254886;REFB=0;REVB=0.0225101;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000193222;OID=.;OPOS=57068106;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0 chr16 57071114 . A G 739.25 PASS AF=0.979167;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0378568;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.864;QD=61.6042;RBI=0.0394522;REFB=-0.0811726;REVB=-0.0111059;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218604;STB=0.511106;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000716673;OID=.;OPOS=57071114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:48:1:1:46:47:0.979167:21:25:0:1:22:25:0:1 chr16 57073683 . G C 885.41 PASS AF=1;AO=43;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.935;QD=58.0597;RBI=0.0480531;REFB=0;REVB=-0.00979346;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145083;OID=.;OPOS=57073683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:43:61:1:25:18:0:0:32:29:0:0 chr16 57085465 . C T 329.5 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0611228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3851;QD=20.9204;RBI=0.0644585;REFB=-0.0308199;REVB=-0.0204671;RO=29;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601332;STB=0.533314;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0245206;OID=.;OPOS=57085465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:20:14:14:15:20:14:14:15 chr16 57392733 . A C 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00559025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.428;QD=17.2281;RBI=0.0316124;REFB=0.0196861;REVB=-0.0311142;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175135;STB=0.555414;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=-0.0116773;OID=.;OPOS=57392733;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:5:6:8:8:0.571429:3:5:3:2:3:5:3:3 chr16 57499902 . T C 260.67 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.033825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3499;QD=18.9581;RBI=0.0385583;REFB=-0.00807026;REVB=0.0185098;RO=27;SAF=6;SAR=22;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475803;STB=0.76656;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00696819;OID=.;OPOS=57499902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:22:6:20:7:22:6:20:7 chr16 57503213 . C T 461.32 PASS AF=0.458716;AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0576272;FXX=0.0353951;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5052;QD=16.929;RBI=0.0582832;REFB=-0.0290842;REVB=0.00871988;RO=58;SAF=17;SAR=33;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161436;STB=0.586291;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0226883;OID=.;OPOS=57503213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:58:59:50:50:0.458716:33:17:29:29:33:17:29:30 chr16 57507061 . CATT C 256.15 PASS AF=0.519231;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0113252;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=3;MLLD=189.373;QD=19.7041;RBI=0.0152154;REFB=-0.0126346;REVB=0.0101612;RO=24;SAF=18;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389279;STB=0.514275;STBP=0.875;TYPE=del;VARB=0.0140904;OID=.;OPOS=57507062;OREF=ATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.519231:27:53:27:52:25:18:9:16:9:99:24:18:9:15:9 chr16 57595999 . A G 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0181039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.029;QD=11.9164;RBI=0.0731715;REFB=-0.0107973;REVB=-0.0708966;RO=37;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073233;STB=0.542335;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.016725;OID=.;OPOS=57595999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:11:11:16:21:11:11:16:21 chr16 57601792 . C T 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0074654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.114;QD=20.8979;RBI=0.00746568;REFB=-0.0214779;REVB=6.56866e-05;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171168;STB=0.599732;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00807506;OID=.;OPOS=57601792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:6:2:2:2:6:2:2:2 chr16 57689385 . C G 1114.18 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.044;QD=60.226;RBI=0.0260279;REFB=0;REVB=0.0252602;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05259e-05;OID=.;OPOS=57689385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:74:0:0:66:74:1:39:27:0:0:46:28:0:0 chr16 57689883 . T C 737.29 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.116392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.1035;QD=54.6143;RBI=0.118124;REFB=0.0580557;REVB=-0.0201586;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192259;STB=0.5102;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00259695;OID=.;OPOS=57689883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:29:24:1:0:29:24:1:0 chr16 57698931 . A G 446.96 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9065;QD=57.6724;RBI=0.0581841;REFB=0;REVB=0.0359038;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170281;OID=.;OPOS=57698931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr16 57752380 . A G 45.23 PASS AF=0.163265;AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.126294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.3042;QD=3.69246;RBI=0.145788;REFB=-0.0360819;REVB=-0.0728285;RO=33;SAF=1;SAR=7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.674719;STB=0.909443;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.146944;OID=.;OPOS=57752380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:48:49:33:41:8:8:0.163265:7:1:25:8:7:1:28:13 chr16 57786517 . C G,T 768.26 PASS AF=0.0363636,0.963636;AO=2,52;DP=55;FAO=2,53;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=2,27;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314621,0.0333053;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.4135,225.072;QD=55.8735;RBI=0.0324855,0.0423216;REFB=0,0;REVB=0.00808982,0.0261128;RO=1;SAF=2,27;SAR=0,25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.697199,0.018468;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.13433,0.000460512;OID=.,.;OPOS=57786517,57786517;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:55:55:1:0:2,52:2,53:0.0363636,0.963636:0,25:2,27:0:1:0,26:2,27:0:0 chr16 57795394 . G A 296.01 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.000347165;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.595;QD=27.5353;RBI=0.0315882;REFB=-0.0235166;REVB=0.0315863;RO=17;SAF=13;SAR=13;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147606;STB=0.581334;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0234844;OID=.;OPOS=57795394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:17:17:26:26:0.604651:13:13:5:12:13:13:5:12 chr16 57805176 . A G 239.72 PASS AF=0.3625;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0595195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.047;QD=11.9862;RBI=0.0624899;REFB=-0.0174454;REVB=0.0190374;RO=51;SAF=15;SAR=14;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789473;STB=0.545424;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0287988;OID=.;OPOS=57805176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:51:51:29:29:0.3625:14:15:30:21:14:15:30:21 chr16 57937856 . G C 1279.13 PASS AF=0.967391;AO=85;DP=93;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.120667;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7963;QD=55.6142;RBI=0.128047;REFB=-0.139091;REVB=0.0428429;RO=8;SAF=34;SAR=51;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993167;STB=0.518983;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00604055;OID=.;OPOS=57937856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:93:92:8:3:85:89:0.967391:51:34:8:0:51:38:3:0 chr16 57950057 . G A 294.71 PASS AF=0.352381;AO=37;DP=105;FAO=37;FDP=105;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.00413432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5451;QD=11.2272;RBI=0.0119891;REFB=-0.00563874;REVB=0.0112537;RO=65;SAF=19;SAR=18;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277661;STB=0.529396;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0105501;OID=.;OPOS=57950057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:68:37:37:0.352381:18:19:35:30:18:19:38:30 chr16 57996932 . G A 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00538527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.945;QD=16.2716;RBI=0.0253438;REFB=0.000758965;REVB=0.0247651;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043351;STB=0.524966;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.000605468;OID=.;OPOS=57996932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:8:10:9:6:8:10 chr16 57996960 . C T 451.04 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273117;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7092;QD=58.1989;RBI=0.0273953;REFB=0;REVB=0.00213769;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000912335;OID=.;OPOS=57996960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr16 58030634 . C T 279.35 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.013031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.569;QD=18.9387;RBI=0.0134161;REFB=-0.0254902;REVB=-0.00319137;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804786;STB=0.54479;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0215771;OID=.;OPOS=58030634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:17:13:10:19:17:13:10:19 chr16 58079165 . G A 68.42 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0107719;FXX=0.0434594;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.705;QD=12.4401;RBI=0.0108091;REFB=-0.0172795;REVB=-0.000895479;RO=12;SAF=8;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249549;STB=0.639632;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.025629;OID=.;OPOS=58079165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:21:22:12:13:9:9:0.409091:1:8:9:3:1:8:10:3 chr16 58080009 . C T 160.51 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0919466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9027;QD=18.3437;RBI=0.117253;REFB=-0.013599;REVB=0.0727605;RO=18;SAF=5;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150899;STB=0.58636;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0215033;OID=.;OPOS=58080009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:12:5:8:10:12:5:8:10 chr16 58191966 . C T 632.23 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5855;QD=61.6809;RBI=0.0861158;REFB=0;REVB=0.0851201;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000895769;OID=.;OPOS=58191966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr16 58327646 . A G 219.66 PASS AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.0145178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5697;QD=11.8737;RBI=0.0147559;REFB=0.00114571;REVB=-0.00264034;RO=47;SAF=17;SAR=10;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881857;STB=0.550625;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.00216909;OID=.;OPOS=58327646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:47:47:27:27:0.364865:10:17:33:14:10:17:33:14 chr16 58540531 . A G 872.89 PASS AF=0.983871;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0285096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.737;QD=56.3153;RBI=0.0286603;REFB=-0.0887525;REVB=0.00293516;RO=1;SAF=20;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230041;STB=0.511107;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00011469;OID=.;OPOS=58540531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:60:62:1:1:59:61:0.983871:39:20:1:0:39:22:1:0 chr16 58542901 . G A 1227.9 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8297;QD=61.3952;RBI=0.0823102;REFB=0;REVB=0.0362043;RO=0;SAF=52;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437735;OID=.;OPOS=58542901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:27:52:0:0:27:53:0:0 chr16 58545426 . A G 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.408;QD=62.1623;RBI=0.0320894;REFB=0;REVB=0.0124067;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.75613e-05;OID=.;OPOS=58545426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0 chr16 58549932 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8584;QD=37.4885;RBI=0.0839203;REFB=0;REVB=0.0810676;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049954;OID=.;OPOS=58549932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0 chr16 58552921 . G A 726.77 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0419119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.693;QD=52.8558;RBI=0.0472314;REFB=-0.0137387;REVB=0.0217761;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165303;STB=0.501032;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000528718;OID=.;OPOS=58552921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:1:2:53:53:0.963636:28:25:0:1:28:25:1:1 chr16 58573807 . C T 548.6 PASS AF=0.523364;AO=56;DP=107;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.000930352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236;QD=20.5086;RBI=0.00510299;REFB=-0.0317563;REVB=-0.00501746;RO=51;SAF=36;SAR=20;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120405;STB=0.566409;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0267378;OID=.;OPOS=58573807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:51:51:56:56:0.523364:20:36:26:25:20:36:26:25 chr16 58575489 . G A 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.82;QD=56.9563;RBI=0.030966;REFB=0;REVB=0.0108415;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.09357e-05;OID=.;OPOS=58575489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr16 58577421 . C T 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.168;QD=60.2307;RBI=0.0384013;REFB=0;REVB=0.0269408;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128092;OID=.;OPOS=58577421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr16 58587737 . C T 785.8 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.185;QD=64.1471;RBI=0.0148293;REFB=0;REVB=0.00783207;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.53442e-05;OID=.;OPOS=58587737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0 chr16 58743454 . A C 249.64 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0337691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.283;QD=18.4916;RBI=0.0353135;REFB=-0.0125812;REVB=0.0103292;RO=27;SAF=17;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102931;STB=0.557731;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0113136;OID=.;OPOS=58743454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:10:17:14:13:10:17:14:13 chr16 58750604 . G A 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00306865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.124;QD=9.76009;RBI=0.0150387;REFB=0.00565856;REVB=-0.0147222;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407194;STB=0.737211;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.0345782;OID=.;OPOS=58750604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:3:4:11:1:3:4:11:1 chr16 58757668 . A C 223.56 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00672233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.815;QD=14.9039;RBI=0.0187635;REFB=-0.00174221;REVB=0.017518;RO=34;SAF=9;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216238;STB=0.62294;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00241127;OID=.;OPOS=58757668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:17:9:19:15:17:9:19:15 chr16 58757683 . A G 262.81 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0026352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=365.415;QD=15.0178;RBI=0.002681;REFB=0.000203057;REVB=0.000493439;RO=40;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518713;STB=0.529392;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.000187586;OID=.;OPOS=58757683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:18:12:18:22:18:12:18:22 chr16 58804449 . T C 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0727321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6165;QD=21.0136;RBI=0.0809845;REFB=0.00489345;REVB=0.0356164;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331304;STB=0.691912;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00600965;OID=.;OPOS=58804449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:2:9:3:4:2:9:3:4 chr16 64980818 . C T 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.916;QD=57.1062;RBI=0.0170621;REFB=0;REVB=0.0148182;RO=0;SAF=19;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.63728e-05;OID=.;OPOS=64980818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:36:19:0:0:36:19:0:0 chr16 65016087 . A C 1552.38 PASS AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643915;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5874;QD=64.0155;RBI=0.0648831;REFB=0;REVB=0.00797178;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460347;OID=.;OPOS=65016087;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:53:44:0:0:53:44:0:0 chr16 65022234 . C T 357.34 PASS AF=0.393939;AO=39;DP=99;FAO=39;FDP=99;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.022972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0512;QD=14.4378;RBI=0.0471599;REFB=-0.0124424;REVB=-0.0411867;RO=60;SAF=13;SAR=26;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774518;STB=0.544095;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0181772;OID=.;OPOS=65022234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:60:60:39:39:0.393939:26:13:24:36:26:13:24:36 chr16 66420885 . C T 317.6 PASS AF=0.371134;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=47;FWDB=0.0114359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1945;QD=13.097;RBI=0.0181227;REFB=-0.0113195;REVB=0.014059;RO=60;SAF=15;SAR=21;SRF=14;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217169;STB=0.626088;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00641478;OID=.;OPOS=66420885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:60:61:36:36:0.371134:21:15:14:46:21:15:14:47 chr16 66432423 . TC CT 171.82 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00825777;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=2;MLLD=111.962;QD=12.4957;RBI=0.00831122;REFB=-0.0144879;REVB=0.000941119;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00917798;STB=0.514717;STBP=0.843;TYPE=mnp;VARB=0.0210798;OID=.;OPOS=66432423;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:55:33:34:21:21:0.381818:11:10:16:17:11:10:17:17 chr16 66519419 . G A 367.82 PASS AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0133493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.559;QD=21.9591;RBI=0.0193519;REFB=-0.0200371;REVB=0.0140104;RO=30;SAF=20;SAR=17;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140337;STB=0.577344;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.019654;OID=.;OPOS=66519419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:17:20:11:19:17:20:11:19 chr16 66583994 . G C 78.37 PASS AF=0.214286;AO=12;DP=56;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00300232;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.371;QD=5.59791;RBI=0.0108739;REFB=-0.00555998;REVB=-0.0104512;RO=41;SAF=5;SAR=7;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00255383;STB=0.512175;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0169308;OID=.;OPOS=66583994;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:56:56:41:44:12:12:0.214286:7:5:17:24:7:5:19:25 chr16 66584002 . T C 189.83 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.108366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6523;QD=11.3331;RBI=0.117208;REFB=-0.00488554;REVB=-0.0446601;RO=42;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785593;STB=0.537282;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.00640884;OID=.;OPOS=66584002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:42:43:24:24:0.358209:12:12:18:24:12:12:19:24 chr16 66600479 . G A 133.46 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.103142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.574;QD=15.7008;RBI=0.106301;REFB=-0.0105187;REVB=-0.0257196;RO=19;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317787;STB=0.68439;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0194768;OID=.;OPOS=66600479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:4:11:8:11:4:11:8:11 chr16 66614008 . T C 234.93 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0426814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.582;QD=18.7947;RBI=0.0427979;REFB=-0.0218131;REVB=-0.00315493;RO=27;SAF=14;SAR=9;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097699;STB=0.555094;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0265612;OID=.;OPOS=66614008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:9:14:19:8:9:14:19:8 chr16 66654738 . TTA T,TAA 31.37 PASS AF=0.214286,0;AO=7,3;DP=36;FAO=6,0;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=2,0;FSAR=4,0;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.01703,0.0274114;FXX=0.176419;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=20.2692,14.8417;QD=4.48121;RBI=0.0418534,0.0766699;REFB=-0.0343877,0.0103183;REVB=-0.038232,0.0716023;RO=20;SAF=2,3;SAR=5,0;SRF=5;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0.431373,0;SSSB=0.052215,0.704204;STB=0.646651,0.5;STBP=0.558,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0763333,0;OID=.,.;OPOS=66654739,66654739;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.214286,0:7,3:36:6,0:28:22:2,0:4,0:4:18:32:20:2,3:5,0:5:15 chr16 66765067 . G A 269.31 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0155864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.941;QD=16.5729;RBI=0.0185427;REFB=-0.0339947;REVB=0.0100447;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20821;STB=0.616558;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.035265;OID=.;OPOS=66765067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:16:14:24:11:16:14:24:11 chr16 66792714 . T C 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0388578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8968;QD=14.6576;RBI=0.0459902;REFB=0.0120051;REVB=0.0246002;RO=17;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162921;STB=0.593419;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.0130036;OID=.;OPOS=66792714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:4:9:14:3:4:9:14:3 chr16 66812797 . C T 293.25 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0489015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.904;QD=23.0003;RBI=0.0492224;REFB=-2.157e-05;REVB=0.00561084;RO=22;SAF=10;SAR=19;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542831;STB=0.530082;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.000201381;OID=.;OPOS=66812797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:19:10:9:13:19:10:9:13 chr16 66919929 . G C 44.29 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.000336307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.454;QD=6.8134;RBI=0.0201234;REFB=-0.000826529;REVB=-0.0201206;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.008787;STB=0.505602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00247934;OID=.;OPOS=66919929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:11:8:3:4:11:8 chr16 66920510 . A G 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0586467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.683;QD=13.5054;RBI=0.062437;REFB=-0.00811859;REVB=0.021423;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144712;STB=0.585219;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.017102;OID=.;OPOS=66920510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:4:8:9:8:4:8:9:8 chr16 66920949 . G A 183.28 PASS AF=0.324324;AO=23;DP=73;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.00142765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0085;QD=9.90688;RBI=0.0120236;REFB=-0.00323911;REVB=-0.0119386;RO=49;SAF=15;SAR=8;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301502;STB=0.66212;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00921409;OID=.;OPOS=66920949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:49:50:23:24:0.324324:8:15:19:30:9:15:19:31 chr16 66948130 . G A 361.98 PASS AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0142216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.81;QD=17.8754;RBI=0.049786;REFB=-0.00916795;REVB=-0.0477116;RO=43;SAF=23;SAR=15;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909304;STB=0.550871;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00847062;OID=.;OPOS=66948130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:15:23:22:21:15:23:22:21 chr16 67006838 . G A 129.28 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0153014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.975;QD=21.5459;RBI=0.0154905;REFB=-0.0179612;REVB=0.00241312;RO=10;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252219;STB=0.642653;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0161166;OID=.;OPOS=67006838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:9:5:7:3:9:5:7:3 chr16 67236285 . GCCCCCCCA GCACCCCCA,GCCCCCCAC 107.9 PASS AF=0.4,0;AO=7,3;DP=30;FAO=12,0;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=8,0;FSAR=4,0;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0304958,-0.170165;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=239.23,15.2019;QD=14.3861;RBI=0.0382045,0.170473;REFB=-0.0315652,-0.126537;REVB=0.0230128,0.0102462;RO=8;SAF=5,3;SAR=2,0;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.206125,0.660908;STB=0.515126,0.5;STBP=0.905,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0132,0;OID=.,.;OPOS=67236287,67236292;OREF=C,CA;OALT=A,AC;OMAPALT=GCACCCCCA,GCCCCCCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4,0:7,3:30:12,0:30:13:8,0:4,0:9:4:92:8:5,3:2,0:4:4 chr16 67691668 . A G 96.73 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0751153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.42;QD=12.4809;RBI=0.0786911;REFB=-0.00498982;REVB=-0.0234517;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256991;STB=0.651918;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0119287;OID=.;OPOS=67691668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:4:8:8:11:4:8:8:11 chr16 67964836 . G A 57.91 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0111856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.068;QD=13.6262;RBI=0.0552542;REFB=-0.0349951;REVB=-0.0541101;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295251;STB=0.676948;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0692203;OID=.;OPOS=67964836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:5:4:6:2:5:4 chr16 68025801 . G C 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4048;QD=58.5866;RBI=0.0735192;REFB=0;REVB=0.0391794;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00209063;OID=.;OPOS=68025801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chr16 68057096 . T C 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0850386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7906;QD=61.683;RBI=0.0873277;REFB=0;REVB=0.0198637;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000582312;OID=.;OPOS=68057096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr16 68112787 . TG CT,T 56.95 PASS AF=0,0.301587;AO=3,15;DP=61;FAO=0,19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=0,5;FSAR=0,14;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0755656,-0.0895418;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=20.0675,11.3029;QD=3.61564;RBI=0.111855,0.253737;REFB=-0.0468498,-0.0877717;REVB=-0.082471,-0.237413;RO=35;SAF=0,7;SAR=3,8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0.323529;SSSB=-0.58608,-0.187311;STB=0.5,0.75464;STBP=1,0.009;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0422018;OID=.,.;OPOS=68112787,68112788;OREF=TG,G;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:57:61:63:35:44:3,15:0,19:0,0.301587:3,8:0,7:22:13:0,14:0,5:28:16 chr16 68344363 . A C 337.57 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0595613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.829;QD=15.0033;RBI=0.0597296;REFB=-0.0142983;REVB=-0.00448093;RO=52;SAF=24;SAR=13;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119509;STB=0.56306;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0200469;OID=.;OPOS=68344363;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:52:53:37:37:0.411111:13:24:28:24:13:24:29:24 chr16 68344696 . C T 167.32 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.021377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.9646;QD=11.7418;RBI=0.0306673;REFB=-0.0424872;REVB=-0.0219888;RO=36;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346859;STB=0.520115;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0305106;OID=.;OPOS=68344696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:11:10:16:20:11:10:16:20 chr16 68381516 . G A 260.52 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00154057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.177;QD=14.4735;RBI=0.0150612;REFB=-0.00713567;REVB=-0.0149822;RO=42;SAF=12;SAR=18;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12846;STB=0.572985;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0108464;OID=.;OPOS=68381516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:18:12:22:20:18:12:22:20 chr16 68387457 . C T 295.65 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00219303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.728;QD=17.9181;RBI=0.0417131;REFB=-0.0182089;REVB=-0.0416554;RO=33;SAF=21;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135006;STB=0.584439;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0114971;OID=.;OPOS=68387457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:33:34:32:32:0.484848:11:21:17:16:11:21:17:17 chr16 68398924 . C T 228.98 PASS AF=0.511628;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0239655;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.335;QD=21.3002;RBI=0.0290283;REFB=-0.0361041;REVB=-0.0163798;RO=20;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173986;STB=0.509083;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0417589;OID=.;OPOS=68398924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:20:21:21:22:0.511628:13:8:8:12:14:8:8:13 chr16 68569440 . T G 548.03 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0201069;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.269;QD=57.6875;RBI=0.0396234;REFB=-0.0468122;REVB=0.0341428;RO=1;SAF=20;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00356122;OID=.;OPOS=68569440;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:38:1:1:37:37:0.973684:17:20:1:0:17:20:1:0 chr16 68569459 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.112;QD=62.3509;RBI=0.0249036;REFB=0;REVB=0.0213206;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99836e-05;OID=.;OPOS=68569459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0 chr16 68598007 . A G 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2252;QD=55.6546;RBI=0.0259242;REFB=0;REVB=0.00907969;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000383888;OID=.;OPOS=68598007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr16 68599072 . A G 140.63 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0271048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.735;QD=13.0821;RBI=0.0882526;REFB=-0.0179879;REVB=0.0839872;RO=26;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574909;STB=0.54323;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0629047;OID=.;OPOS=68599072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:26:27:16:16:0.372093:7:9:16:10:7:9:17:10 chr16 68713730 . G A 328.68 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0230937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.444;QD=18.0096;RBI=0.0321451;REFB=-0.0124184;REVB=0.0223604;RO=38;SAF=9;SAR=26;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321532;STB=0.680634;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0109246;OID=.;OPOS=68713730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:26:9:22:16:26:9:22:16 chr16 68713823 . C A 304.02 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.0474281;FXX=0.0270234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5182;QD=16.8901;RBI=0.0551392;REFB=0.00485036;REVB=-0.0281232;RO=41;SAF=12;SAR=21;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308288;STB=0.686166;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00769806;OID=.;OPOS=68713823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:41:39:33:33:0.458333:21:12:28:13:21:12:28:11 chr16 68732049 . A C 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0262807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.435;QD=18.2489;RBI=0.0270957;REFB=-0.0424004;REVB=0.00659546;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234295;STB=0.633942;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0224148;OID=.;OPOS=68732049;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:8:4:8:5:8:4 chr16 68857441 . T C 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00135737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.872;QD=56.9569;RBI=0.050229;REFB=0;REVB=0.0502107;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185577;OID=.;OPOS=68857441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0 chr16 68862165 . C T 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.000379036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.56;QD=16.8738;RBI=0.00603987;REFB=0.00717884;REVB=-0.00602797;RO=26;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190708;STB=0.609264;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00857208;OID=.;OPOS=68862165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:13:7:14:12:13:7:14:12 chr16 68868522 . T C 1478.4 PASS AF=0.971429;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.06529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.3739;QD=56.3199;RBI=0.0679931;REFB=-0.16972;REVB=0.0189811;RO=0;SAF=49;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03142e-08;STB=0.504209;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00224638;OID=.;OPOS=68868522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:105:105:0:3:102:102:0.971429:53:49:0:0:53:49:1:2 chr16 68869449 . A G 267.4 PASS AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0408179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.751;QD=42.7834;RBI=0.0410455;REFB=0.012791;REVB=-0.0043169;RO=3;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954175;STB=0.551678;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.000349313;OID=.;OPOS=68869449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:25:25:3:3:22:22:0.88:13:9:0:3:13:9:0:3 chr16 68919559 . T C 298.96 PASS AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0202944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.01;QD=16.1601;RBI=0.0256572;REFB=0.00851535;REVB=0.0156981;RO=41;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237593;STB=0.513361;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=-0.00488579;OID=.;OPOS=68919559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:21:12:14:27:21:12:14:27 chr16 69008037 . C T 338.48 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.00522028;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8767;QD=14.7166;RBI=0.0227248;REFB=0.0026409;REVB=-0.0221171;RO=52;SAF=12;SAR=25;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283804;STB=0.656239;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00396834;OID=.;OPOS=69008037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:55:37:37:0.402174:25:12:31:21:25:12:32:23 chr16 69143577 . A G 148.15 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00543985;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4591;QD=16.9312;RBI=0.00851218;REFB=-0.00801026;REVB=-0.00654715;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212598;STB=0.622483;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0127711;OID=.;OPOS=69143577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:5:11:9:10:5:11:9:10 chr16 69355040 . A G 308.31 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0187842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1926;QD=18.4065;RBI=0.0264789;REFB=-0.00898492;REVB=0.0186624;RO=33;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190195;STB=0.613097;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0117976;OID=.;OPOS=69355040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:34:33:33:0.492537:20:13:20:13:20:13:21:13 chr16 69499731 . T C 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00149076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.426;QD=16.8837;RBI=0.0126648;REFB=0.00531531;REVB=-0.0125768;RO=17;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313904;STB=0.681163;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00551666;OID=.;OPOS=69499731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:4:11:7:10:4:11:7:10 chr16 69704122 . C CTG 307.14 PASS AF=1;AO=20;DP=28;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519768;FXX=0.079968;HRUN=5;LEN=2;MLLD=261.986;QD=53.4156;RBI=0.0532838;REFB=0;REVB=0.0117291;RO=7;SAF=11;SAR=9;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102149;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000415659;OID=.;OPOS=69704123;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:20:28:23:23:0:14:9:0:0:4:7:11:9:4:3 chr16 69733267 . G A 417.39 PASS AF=0.410256;AO=47;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=0.00179808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.244;QD=14.2698;RBI=0.0151146;REFB=-0.0138973;REVB=-0.0150073;RO=67;SAF=23;SAR=24;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169362;STB=0.586742;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0257133;OID=.;OPOS=69733267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:67:69:47:48:0.410256:24:23:22:45:25:23:23:46 chr16 69733460 . G A 919.99 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0266;QD=58.4123;RBI=0.0193131;REFB=0;REVB=-0.00244632;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121679;OID=.;OPOS=69733460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0 chr16 69733665 . T G 187.34 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0228918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.7685;QD=14.6935;RBI=0.0401296;REFB=-0.00810813;REVB=0.0329599;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737477;STB=0.542332;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0154296;OID=.;OPOS=69733665;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:9:12:15:15:9:12:15:15 chr16 69735271 . T A 1838.14 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.671;QD=61.2712;RBI=0.0497222;REFB=0;REVB=0.0309167;RO=0;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106931;OID=.;OPOS=69735271;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:120:0:0:116:120:1:51:65:0:0:52:68:0:0 chr16 69736851 . G A 88.38 PASS AF=0.478261;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0509157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4596;QD=15.3702;RBI=0.0966771;REFB=0.0369792;REVB=-0.0821831;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943118;STB=0.523766;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=-0.0497736;OID=.;OPOS=69736851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:22:23:12:12:10:11:0.478261:4:6:6:6:5:6:6:6 chr16 69745145 . G A 135.08 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0192436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.995;QD=16.8844;RBI=0.0318732;REFB=-0.0085117;REVB=-0.0254084;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163235;STB=0.593102;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.00725783;OID=.;OPOS=69745145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:8:7:5:12:8:7:5:12 chr16 69814950 . G A 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00688842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.542;QD=9.44486;RBI=0.0414384;REFB=-0.00743707;REVB=-0.0408619;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383856;STB=0.523731;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00748338;OID=.;OPOS=69814950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:7:3:2:4:7:3 chr16 69814953 . G A 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0107521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=331.248;QD=9.44488;RBI=0.0263493;REFB=0.000869918;REVB=-0.0240558;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383856;STB=0.523731;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00167247;OID=.;OPOS=69814953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:7:3:2:4:7:3 chr16 69963355 . G A 253.17 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.57;QD=50.6333;RBI=0.026503;REFB=0;REVB=-0.00635635;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55037e-05;OID=.;OPOS=69963355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:5:14:0:0:5:15:0:0 chr16 69963403 . G A 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00973246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.837;QD=12.0517;RBI=0.0159455;REFB=0.00399833;REVB=-0.0126309;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111869;STB=0.567408;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00174;OID=.;OPOS=69963403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:2:7:9:4:2:7:9:4 chr16 69967897 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.921;QD=60.9785;RBI=0.0111752;REFB=0;REVB=0.00556381;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23373e-05;OID=.;OPOS=69967897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0 chr16 69970329 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.264;QD=53.2768;RBI=0.0247608;REFB=0;REVB=0.0245167;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162852;OID=.;OPOS=69970329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr16 69973297 . C T 638.7 PASS AF=0.512;AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.0261708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.525;QD=20.4383;RBI=0.0261807;REFB=-0.0174901;REVB=-0.00071934;RO=61;SAF=24;SAR=40;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164361;STB=0.590603;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0155125;OID=.;OPOS=69973297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:61:61:64:64:0.512:40:24:34:27:40:24:34:27 chr16 69988373 . T C 239.4 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0491571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6642;QD=50.4;RBI=0.0755833;REFB=0;REVB=0.0574144;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285669;OID=.;OPOS=69988373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0 chr16 70010589 . T C 133.6 PASS AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00840402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.369;QD=7.97597;RBI=0.0301088;REFB=-0.0118966;REVB=0.0289121;RO=48;SAF=10;SAR=9;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105571;STB=0.563314;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.02354;OID=.;OPOS=70010589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:9:10:21:27:9:10:21:27 chr16 70010610 . C T 169.78 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0352155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.955;QD=8.81985;RBI=0.0379308;REFB=-0.00507012;REVB=-0.014093;RO=54;SAF=11;SAR=12;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10672;STB=0.563086;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0137992;OID=.;OPOS=70010610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:54:54:23:23:0.298701:12:11:21:33:12:11:21:33 chr16 70016573 . G A 1655.86 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00648987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.888;QD=60.2132;RBI=0.0392462;REFB=0;REVB=0.0387059;RO=0;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.15193e-05;OID=.;OPOS=70016573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:110:0:0:109:110:1:55:54:0:0:55:55:0:0 chr16 70064261 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8789;QD=46.8478;RBI=0.0381178;REFB=0;REVB=-0.021702;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384536;OID=.;OPOS=70064261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr16 70161263 . T C 234.36 PASS AF=0.578947;AO=21;DP=37;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0249401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.852;QD=24.6693;RBI=0.0249407;REFB=-0.010588;REVB=-0.000164856;RO=16;SAF=15;SAR=6;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363082;STB=0.681653;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00471619;OID=.;OPOS=70161263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:16:16:21:22:0.578947:6:15:4:12:7:15:4:12 chr16 70164334 . A G 115.45 PASS AF=0.112319;AO=31;DP=276;FAO=31;FDP=276;FR=.;FRO=245;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=133;FSRR=112;FWDB=-0.00599989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.777;QD=1.67317;RBI=0.0142151;REFB=-0.00175275;REVB=-0.0128868;RO=245;SAF=11;SAR=20;SRF=133;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231327;STB=0.664715;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0180991;OID=.;OPOS=70164334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:245:245:31:31:0.112319:20:11:133:112:20:11:133:112 chr16 70165914 . T C 455.66 PASS AF=0.605634;AO=43;DP=71;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0350388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.037;QD=25.671;RBI=0.0358841;REFB=-0.0265018;REVB=0.00774293;RO=28;SAF=15;SAR=28;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219247;STB=0.511977;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0139925;OID=.;OPOS=70165914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:28:28:43:43:0.605634:28:15:9:19:28:15:9:19 chr16 70170222 . G T 202.55 PASS AF=0.16;AO=40;DP=250;FAO=40;FDP=250;FR=.;FRO=210;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=108;FSRR=102;FWDB=-0.0372492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.957;QD=3.24079;RBI=0.0377632;REFB=-0.00460642;REVB=0.00620924;RO=210;SAF=17;SAR=23;SRF=108;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114978;STB=0.574963;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0270915;OID=.;OPOS=70170222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:210:210:40:40:0.16:23:17:108:102:23:17:108:102 chr16 70172890 . C T 32.11 PASS AF=0.12;AO=6;DP=50;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0122445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.115;QD=2.56872;RBI=0.0123786;REFB=0.000480887;REVB=0.001817;RO=44;SAF=2;SAR=4;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386964;STB=0.529312;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.00336325;OID=.;OPOS=70172890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:50:50:44:44:6:6:0.12:4:2:16:28:4:2:16:28 chr16 70182375 . T C 269.32 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00724489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.737;QD=16.5734;RBI=0.0197096;REFB=-0.0356486;REVB=-0.0183298;RO=35;SAF=6;SAR=24;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27433;STB=0.656134;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0168905;OID=.;OPOS=70182375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:24:6:15:20:24:6:15:20 chr16 70182390 . T G 324.96 PASS AF=0.5;AO=21;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0122679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.96;QD=18.569;RBI=0.036989;REFB=-0.0151893;REVB=0.0348953;RO=30;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133188;STB=0.661768;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0190479;OID=.;OPOS=70182390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:35:21:35:0.5:15:6:12:18:28:7:16:19 chr16 70190401 . C T 172.21 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0192175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.116;QD=26.4934;RBI=0.0223293;REFB=0.000794158;REVB=-0.0113703;RO=9;SAF=10;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904398;STB=0.550399;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.000373747;OID=.;OPOS=70190401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:7:10:4:5:7:10:4:5 chr16 70191029 . T G 1873.92 PASS AF=0.648221;AO=164;DP=253;FAO=164;FDP=253;FR=.;FRO=89;FSAF=87;FSAR=77;FSRF=53;FSRR=36;FWDB=-0.00752818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.049;QD=29.6272;RBI=0.0133189;REFB=-0.0342242;REVB=-0.0109872;RO=86;SAF=87;SAR=77;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403172;STB=0.523019;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.021588;OID=.;OPOS=70191029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:86:89:164:164:0.648221:77:87:51:35:77:87:53:36 chr16 70191161 . C T 1769.54 PASS AF=0.717073;AO=146;DP=204;FAO=147;FDP=205;FR=.;FRO=58;FSAF=68;FSAR=79;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0115394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2783;QD=34.5275;RBI=0.0133458;REFB=-0.00345163;REVB=0.00670471;RO=58;SAF=67;SAR=79;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569431;STB=0.504073;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00168412;OID=.;OPOS=70191161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:58:58:146:147:0.717073:79:67:26:32:79:68:26:32 chr16 70191333 . T C 1384.37 PASS AF=0.83871;AO=104;DP=124;FAO=104;FDP=124;FR=.;FRO=20;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0272816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.026;QD=44.6572;RBI=0.0440896;REFB=-0.0230338;REVB=0.0346353;RO=20;SAF=48;SAR=56;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573112;STB=0.530429;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0032518;OID=.;OPOS=70191333;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:20:20:104:104:0.83871:56:48:13:7:56:48:13:7 chr16 70191556 . G A 152.45 PASS AF=0.147321;AO=32;DP=223;FAO=33;FDP=224;FR=.;FRO=191;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=84;FSRR=107;FWDB=-0.0104828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.6159;QD=2.7224;RBI=0.0343601;REFB=-0.00580037;REVB=0.032722;RO=174;SAF=17;SAR=15;SRF=71;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157607;STB=0.589319;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0269904;OID=.;OPOS=70191556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:174:191:32:33:0.147321:15:17:71:103:15:18:84:107 chr16 70191566 . A G 2261.71 PASS AF=0.798165;AO=174;DP=218;FAO=174;FDP=218;FR=.;FRO=44;FSAF=76;FSAR=98;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0393685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6642;QD=41.4992;RBI=0.0397748;REFB=-0.0205954;REVB=-0.00567043;RO=38;SAF=76;SAR=98;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00363641;STB=0.512923;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00672517;OID=.;OPOS=70191566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:38:44:174:174:0.798165:98:76:17:21:98:76:22:22 chr16 70287177 . A G 544.29 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0337609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6956;QD=57.2933;RBI=0.0671066;REFB=-0.0471646;REVB=-0.0579956;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000528632;OID=.;OPOS=70287177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:18:19:1:0:18:19:1:0 chr16 70287594 . G C 367.01 PASS AF=1;AO=11;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=29.2975;QD=52.4303;RBI=0.21706;REFB=0;REVB=0.21706;RO=1;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00254281;OID=.;OPOS=70287594;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:1:0:11:28:1:11:0:0:1:28:0:0:0 chr16 70303580 . G A 213.93 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0300798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.778;QD=20.8714;RBI=0.0327297;REFB=-0.0255347;REVB=0.0129012;RO=20;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206443;STB=0.511617;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0351509;OID=.;OPOS=70303580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:11:10:10:10:11:10:10:10 chr16 70395387 . C T 72.72 PASS AF=0.277778;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.020712;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.541;QD=8.08044;RBI=0.0207537;REFB=-0.0126378;REVB=0.001315;RO=26;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113413;STB=0.571275;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0232893;OID=.;OPOS=70395387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:37:36:26:26:10:10:0.277778:8:2:7:19:8:2:7:19 chr16 70506907 . T C 221.8 PASS AF=0.448276;AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0273845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.915;QD=15.2967;RBI=0.0284542;REFB=-0.019181;REVB=-0.00772854;RO=32;SAF=11;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287168;STB=0.525587;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0223233;OID=.;OPOS=70506907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:32:32:25:26:0.448276:14:11:15:17:15:11:15:17 chr16 70546234 . G A 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0144271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.489;QD=16.5359;RBI=0.0146196;REFB=-0.024012;REVB=0.00236434;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283849;STB=0.661209;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0211426;OID=.;OPOS=70546234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:10:8:17:6:10:8:17:6 chr16 70548297 . G A 865.78 PASS AF=1;AO=53;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000594748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2604;QD=57.7188;RBI=0.0872397;REFB=0;REVB=0.0872376;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0033559;OID=.;OPOS=70548297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:53:60:1:18:35:0:0:25:35:0:0 chr16 70569215 . A T 413.02 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.000546487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.864;QD=18.9896;RBI=0.0181149;REFB=-0.0179174;REVB=-0.0181067;RO=44;SAF=22;SAR=20;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18835;STB=0.597781;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0145006;OID=.;OPOS=70569215;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:45:42:42:0.482759:20:22:14:30:20:22:15:30 chr16 70602221 . C T 216.6 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0012767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0515;QD=13.3293;RBI=0.0326599;REFB=0.00706193;REVB=-0.032635;RO=38;SAF=10;SAR=16;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304229;STB=0.678768;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.0147887;OID=.;OPOS=70602221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:39:26:26:0.4:16:10:26:12:16:10:27:12 chr16 70726795 . C A 745.96 PASS AF=0.521739;AO=72;DP=139;FAO=72;FDP=138;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.0165985;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.132;QD=21.622;RBI=0.0356295;REFB=-0.016342;REVB=0.0315269;RO=65;SAF=29;SAR=43;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144828;STB=0.583175;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.018802;OID=.;OPOS=70726795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:65:66:72:72:0.521739:43:29:37:28:43:29:38:28 chr16 70796515 . G A 1539.56 PASS AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0312812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.884;QD=58.65;RBI=0.0341155;REFB=-0.0751985;REVB=0.0136145;RO=1;SAF=44;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0078438;STB=0.504131;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000435606;OID=.;OPOS=70796515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:60:44:0:1:60:44:0:1 chr16 70818759 . A G 1615.93 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.247;QD=59.8494;RBI=0.0436294;REFB=0;REVB=0.0345588;RO=0;SAF=39;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11502e-05;OID=.;OPOS=70818759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:101:108:0:0:101:108:1:62:39:0:0:65:43:0:0 chr16 70884524 . C G 445.89 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0132603;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.425;QD=16.5145;RBI=0.0269969;REFB=-0.02089;REVB=-0.0235159;RO=58;SAF=24;SAR=25;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572205;STB=0.526863;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0193196;OID=.;OPOS=70884524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:58:59:49:49:0.453704:25:24:25:33:25:24:26:33 chr16 70884534 . T A 458.95 PASS AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0111054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.801;QD=18.3578;RBI=0.0114912;REFB=-0.00228608;REVB=-0.00295264;RO=54;SAF=22;SAR=24;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328363;STB=0.518317;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0019772;OID=.;OPOS=70884534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:0.46:24:22:24:30:24:22:24:30 chr16 70886630 . C T 317.08 PASS AF=0.371134;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0171275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.269;QD=13.0756;RBI=0.0204168;REFB=-0.0181047;REVB=0.0111127;RO=61;SAF=18;SAR=18;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117314;STB=0.566974;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0415403;OID=.;OPOS=70886630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:61:61:36:36:0.371134:18:18:24:37:18:18:24:37 chr16 70889147 . A G 863.01 PASS AF=0.475676;AO=88;DP=185;FAO=88;FDP=185;FR=.;FRO=97;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=-0.00726414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.213;QD=18.6598;RBI=0.00906064;REFB=-0.00184925;REVB=0.00541548;RO=97;SAF=39;SAR=49;SRF=42;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981347;STB=0.505419;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.00172339;OID=.;OPOS=70889147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:97:97:88:88:0.475676:49:39:42:55:49:39:42:55 chr16 70894087 . T C 937.9 PASS AF=0.368771;AO=111;DP=301;FAO=111;FDP=301;FR=.;FRO=190;FSAF=40;FSAR=71;FSRF=99;FSRR=91;FWDB=0.0110449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.238;QD=12.4638;RBI=0.0340909;REFB=-0.00179126;REVB=0.0322521;RO=189;SAF=40;SAR=71;SRF=98;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180005;STB=0.603626;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00436389;OID=.;OPOS=70894087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:189:190:111:111:0.368771:71:40:98:91:71:40:99:91 chr16 70896015 . GA G 427.15 PASS AF=0.477419;AO=67;DP=155;FAO=74;FDP=155;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=-0.127158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.4318;QD=11.0232;RBI=0.131514;REFB=-0.0226517;REVB=-0.0335675;RO=78;SAF=32;SAR=35;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046516;STB=0.529609;STBP=0.499;TYPE=del;VARB=0.0187591;OID=.;OPOS=70896016;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477419:67:155:74:155:81:36:38:44:37:99:78:32:35:41:37 chr16 70896118 . A G 463.87 PASS AF=0.369128;AO=55;DP=150;FAO=55;FDP=149;FR=.;FRO=94;FSAF=15;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=50;FWDB=-0.015836;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9367;QD=12.4529;RBI=0.0208091;REFB=-0.0236604;REVB=0.0134995;RO=94;SAF=15;SAR=40;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237595;STB=0.636066;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0180398;OID=.;OPOS=70896118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:94:94:55:55:0.369128:40:15:44:50:40:15:44:50 chr16 70896122 . A C 472.16 PASS AF=0.375;AO=50;DP=143;FAO=54;FDP=144;FR=.;FRO=90;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=0.00180512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3111;QD=13.1157;RBI=0.0214759;REFB=-0.0219873;REVB=0.0213999;RO=90;SAF=15;SAR=35;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20133;STB=0.630051;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.014617;OID=.;OPOS=70896122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:90:90:50:54:0.375:35:15:42:48:39:15:42:48 chr16 70897039 . C G 487.39 PASS AF=0.418605;AO=54;DP=129;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.0042254;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.188;QD=15.1128;RBI=0.0192693;REFB=-0.00989708;REVB=0.0188003;RO=75;SAF=31;SAR=23;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288466;STB=0.516208;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.013924;OID=.;OPOS=70897039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:75:75:54:54:0.418605:23:31:41:34:23:31:41:34 chr16 70902559 . C T 1139.5 PASS AF=0.440433;AO=122;DP=277;FAO=122;FDP=277;FR=.;FRO=155;FSAF=46;FSAR=76;FSRF=76;FSRR=79;FWDB=0.00373535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.511;QD=16.4549;RBI=0.00407985;REFB=-0.0108644;REVB=-0.00164083;RO=155;SAF=46;SAR=76;SRF=76;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117478;STB=0.565286;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0154981;OID=.;OPOS=70902559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:155:155:122:122:0.440433:76:46:76:79:76:46:76:79 chr16 70902568 . C T 1025.53 PASS AF=0.435484;AO=108;DP=248;FAO=108;FDP=248;FR=.;FRO=140;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=68;FSRR=72;FWDB=0.0120278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.096;QD=16.5409;RBI=0.0162447;REFB=0.000474142;REVB=-0.0109189;RO=139;SAF=40;SAR=68;SRF=67;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116898;STB=0.567354;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.000905658;OID=.;OPOS=70902568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:139:140:108:108:0.435484:68:40:67:72:68:40:68:72 chr16 70902683 . G A 207.24 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.000439943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.253;QD=24.381;RBI=0.0159405;REFB=-0.00497502;REVB=-0.0159345;RO=14;SAF=10;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527047;STB=0.529382;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00466975;OID=.;OPOS=70902683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:10:10:6:8:10:10:6:8 chr16 70908736 . A G 229.34 PASS AF=0.285714;AO=32;DP=113;FAO=32;FDP=112;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=0.000874702;FXX=0.0344798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.641;QD=8.19065;RBI=0.000929104;REFB=-0.00182882;REVB=-0.000313258;RO=79;SAF=21;SAR=11;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790954;STB=0.552598;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00572214;OID=.;OPOS=70908736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:79:80:32:32:0.285714:11:21:47:32:11:21:47:33 chr16 70913386 . G A 600.95 PASS AF=0.476923;AO=62;DP=130;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.000771869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.046;QD=18.4906;RBI=0.00976206;REFB=-0.0194383;REVB=-0.0097315;RO=68;SAF=36;SAR=26;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159036;STB=0.58809;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0229114;OID=.;OPOS=70913386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:68:68:62:62:0.476923:26:36:28:40:26:36:28:40 chr16 70917855 . A G 891.41 PASS AF=0.483871;AO=91;DP=186;FAO=90;FDP=186;FR=.;FRO=96;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=0.000548206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1678;QD=19.17;RBI=0.0160268;REFB=-0.0123804;REVB=0.0160174;RO=92;SAF=48;SAR=43;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746645;STB=0.549345;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.016677;OID=.;OPOS=70917855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:92:96:91:90:0.483871:43:48:41:51:42:48:42:54 chr16 70917931 . C G 851.27 PASS AF=0.549669;AO=82;DP=151;FAO=83;FDP=151;FR=.;FRO=68;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.025266;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.955;QD=22.5501;RBI=0.0266135;REFB=-0.00594932;REVB=0.00836112;RO=69;SAF=50;SAR=32;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880031;STB=0.55306;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00605334;OID=.;OPOS=70917931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:69:68:82:83:0.549669:32:50:35:34:32:51:34:34 chr16 70926362 . C G 595.08 PASS AF=0.274194;AO=85;DP=310;FAO=85;FDP=310;FR=.;FRO=225;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=121;FSRR=104;FWDB=-0.00872956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.782;QD=7.67842;RBI=0.0291351;REFB=-0.00799122;REVB=-0.0277966;RO=220;SAF=41;SAR=44;SRF=120;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775269;STB=0.540154;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0220979;OID=.;OPOS=70926362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:310:220:225:85:85:0.274194:44:41:120:100:44:41:121:104 chr16 70942688 . A C 638.72 PASS AF=0.422619;AO=71;DP=169;FAO=71;FDP=168;FR=.;FRO=97;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=50;FSRR=47;FWDB=-0.0174911;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.678;QD=15.2076;RBI=0.0230523;REFB=-0.0211187;REVB=-0.0150156;RO=96;SAF=36;SAR=35;SRF=49;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00346968;STB=0.504863;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0254459;OID=.;OPOS=70942688;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:96:97:71:71:0.422619:35:36:49:47:35:36:50:47 chr16 70954513 . T C 143.4 PASS AF=0.25;AO=21;DP=82;FAO=21;FDP=84;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0161907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0503;QD=6.82874;RBI=0.0923659;REFB=-0.0155797;REVB=-0.0909358;RO=61;SAF=12;SAR=9;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578607;STB=0.547899;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0427113;OID=.;OPOS=70954513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:61:63:21:21:0.25:9:12:32:29:9:12:32:31 chr16 70954571 . CT TA 121.92 PASS AF=0.215909;AO=19;DP=88;FAO=19;FDP=88;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.00149696;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.15;QD=5.54175;RBI=0.012766;REFB=-0.00555007;REVB=0.0126779;RO=69;SAF=13;SAR=6;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158435;STB=0.599891;STBP=0.339;TYPE=mnp;VARB=0.0166776;OID=.;OPOS=70954571;OREF=CT;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:69:69:19:19:0.215909:6:13:39:30:6:13:39:30 chr16 70954606 . C T 94.4 PASS AF=0.192771;AO=16;DP=83;FAO=16;FDP=83;FR=.;FRO=67;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0315346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.402;QD=4.54943;RBI=0.0329851;REFB=-0.0110243;REVB=-0.00967399;RO=67;SAF=8;SAR=8;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656677;STB=0.542116;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0547036;OID=.;OPOS=70954606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:83:83:67:67:16:16:0.192771:8:8:37:30:8:8:37:30 chr16 70954774 . A G 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00290045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.123;QD=9.56936;RBI=0.11769;REFB=-0.00659451;REVB=-0.117654;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10912;STB=0.56739;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0256234;OID=.;OPOS=70954774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:6:2:5:10:6:2:5:10 chr16 70954809 . C A 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0064094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.012;QD=12.3948;RBI=0.0126773;REFB=-0.0116151;REVB=0.0109377;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206544;STB=0.512178;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0163492;OID=.;OPOS=70954809;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:9:15:9:5:9:15 chr16 70954915 . G T 1608.97 PASS AF=0.990826;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.016922;FXX=0.00909008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=347.667;QD=59.0449;RBI=0.0175787;REFB=0.0377808;REVB=0.00476024;RO=1;SAF=44;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735954;STB=0.503875;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=2.24248e-06;OID=.;OPOS=70954915;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:109:1:1:108:108:0.990826:64:44:0:1:64:44:0:1 chr16 70954945 . T A 377.06 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=0.00865457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.751;QD=13.9653;RBI=0.00893221;REFB=-0.00622057;REVB=-0.00220972;RO=64;SAF=18;SAR=26;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546219;STB=0.530796;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00759359;OID=.;OPOS=70954945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:26:18:23:41:26:18:23:41 chr16 70972595 . T C 73.99 PASS AF=0.153846;AO=14;DP=92;FAO=14;FDP=91;FR=.;FRO=77;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.00360302;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0396;QD=3.25212;RBI=0.00385197;REFB=0.0040701;REVB=-0.00136234;RO=77;SAF=4;SAR=10;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160084;STB=0.609591;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.0224682;OID=.;OPOS=70972595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:92:91:77:77:14:14:0.153846:10:4:31:46:10:4:31:46 chr16 70972620 . G C 460.41 PASS AF=0.517241;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0187527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.568;QD=21.168;RBI=0.0199347;REFB=-0.0254364;REVB=-0.00676248;RO=42;SAF=16;SAR=29;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00151121;STB=0.500835;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0233061;OID=.;OPOS=70972620;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:42:42:45:45:0.517241:29:16:15:27:29:16:15:27 chr16 70975667 . T C 745.19 PASS AF=0.554688;AO=71;DP=128;FAO=71;FDP=128;FR=.;FRO=57;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.0154865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.637;QD=23.2873;RBI=0.0162856;REFB=-0.0162452;REVB=0.00503886;RO=57;SAF=39;SAR=32;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132503;STB=0.572378;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0137651;OID=.;OPOS=70975667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:57:57:71:71:0.554688:32:39:22:35:32:39:22:35 chr16 70986480 . G A 1049.04 PASS AF=0.510101;AO=101;DP=198;FAO=101;FDP=198;FR=.;FRO=97;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=0.026291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.507;QD=21.1928;RBI=0.029481;REFB=0.0232364;REVB=-0.0133385;RO=97;SAF=52;SAR=49;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638347;STB=0.535005;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.0224595;OID=.;OPOS=70986480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:97:97:101:101:0.510101:49:52:43:54:49:52:43:54 chr16 70989299 . C T 595.67 PASS AF=0.424051;AO=67;DP=157;FAO=67;FDP=158;FR=.;FRO=91;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=0.0201738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.252;QD=15.0804;RBI=0.0406651;REFB=-0.0211408;REVB=0.0353083;RO=85;SAF=39;SAR=28;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100825;STB=0.538332;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0244451;OID=.;OPOS=70989299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:85:91:67:67:0.424051:28:39:41:44:28:39:47:44 chr16 70989335 . G A 808.25 PASS AF=0.464088;AO=84;DP=177;FAO=84;FDP=181;FR=.;FRO=97;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=53;FSRR=44;FWDB=-0.0130953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.28;QD=17.8619;RBI=0.025038;REFB=-0.0138797;REVB=-0.0213404;RO=93;SAF=46;SAR=38;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110655;STB=0.500664;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.01765;OID=.;OPOS=70989335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:181:93:97:84:84:0.464088:38:46:52:41:38:46:53:44 chr16 70993566 . A G 1977.4 PASS AF=0.737327;AO=160;DP=217;FAO=160;FDP=217;FR=.;FRO=57;FSAF=69;FSAR=91;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.00152319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1755;QD=36.4498;RBI=0.00821953;REFB=-0.00899006;REVB=0.00807717;RO=56;SAF=69;SAR=91;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687464;STB=0.534512;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00250387;OID=.;OPOS=70993566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:56:57:160:160:0.737327:91:69:32:24:91:69:32:25 chr16 71008169 . T C 513.24 PASS AF=0.393103;AO=57;DP=145;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=-0.0117132;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.484;QD=14.1582;RBI=0.0152689;REFB=-0.00434145;REVB=0.00979498;RO=87;SAF=28;SAR=29;SRF=51;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101596;STB=0.553497;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00749894;OID=.;OPOS=71008169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:87:88:57:57:0.393103:29:28:51:36:29:28:51:37 chr16 71012855 . T C 1002.3 PASS AF=0.545455;AO=95;DP=175;FAO=96;FDP=176;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=-0.00379792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.559;QD=22.7796;RBI=0.0258038;REFB=-0.0190204;REVB=0.0255228;RO=80;SAF=39;SAR=56;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.001706;STB=0.501949;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0170618;OID=.;OPOS=71012855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:80:80:95:96:0.545455:56:39:33:47:56:40:33:47 chr16 71015329 . G T 535.68 PASS AF=0.258389;AO=77;DP=298;FAO=77;FDP=298;FR=.;FRO=221;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=118;FSRR=103;FWDB=0.000956364;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.776;QD=7.19032;RBI=0.00816775;REFB=0.00116216;REVB=0.00811156;RO=219;SAF=38;SAR=39;SRF=118;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565479;STB=0.529957;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00387411;OID=.;OPOS=71015329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:219:221:77:77:0.258389:39:38:118:101:39:38:118:103 chr16 71025245 . CG GT,TG 211.09 PASS AF=0.0352941,0.294118;AO=3,24;DP=85;FAO=3,25;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=1,12;FSAR=2,13;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00345512,0.00831002;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=187.447,202.231;QD=9.93365;RBI=0.0158099,0.0162449;REFB=0.000860234,0.0026151;REVB=-0.0154278,-0.0139585;RO=53;SAF=1,12;SAR=2,12;SRF=25;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.125565,0.0330402;STB=0.665562,0.519984;STBP=0.666,0.829;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0445614,-0.0133671;OID=.,.;OPOS=71025245,71025245;OREF=CG,C;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:85:85:53:57:3,24:3,25:0.0352941,0.294118:2,12:1,12:25:28:2,13:1,12:29:28 chr16 71026076 . C G 265.99 PASS AF=0.329897;AO=30;DP=94;FAO=32;FDP=97;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.0377526;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.6367;QD=10.9687;RBI=0.037789;REFB=-0.0130327;REVB=-0.00166004;RO=64;SAF=16;SAR=14;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931925;STB=0.577615;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0281761;OID=.;OPOS=71026076;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:97:64:65:30:32:0.329897:14:16:29:35:14:18:29:36 chr16 71026098 . C T 134.9 PASS AF=0.287879;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0057148;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.681;QD=8.17591;RBI=0.00744807;REFB=-0.000242142;REVB=0.00477649;RO=42;SAF=5;SAR=14;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983244;STB=0.599516;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000490177;OID=.;OPOS=71026098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:42:47:19:19:0.287879:14:5:14:28:14:5:18:29 chr16 71054178 . T C 785.53 PASS AF=0.44385;AO=83;DP=187;FAO=83;FDP=187;FR=.;FRO=104;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=0.0101315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.015;QD=16.8028;RBI=0.0167532;REFB=-0.00725388;REVB=0.0133425;RO=103;SAF=36;SAR=47;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00320096;STB=0.50059;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.00879378;OID=.;OPOS=71054178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:103:104:83:83:0.44385:47:36:45:58:47:36:45:59 chr16 71061495 . A G 944.17 PASS AF=0.406844;AO=107;DP=263;FAO=107;FDP=263;FR=.;FRO=156;FSAF=63;FSAR=44;FSRF=91;FSRR=65;FWDB=-0.000294555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.176;QD=14.36;RBI=0.00328032;REFB=-0.0200726;REVB=0.00326707;RO=154;SAF=63;SAR=44;SRF=89;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118032;STB=0.503334;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0257445;OID=.;OPOS=71061495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:154:156:107:107:0.406844:44:63:89:65:44:63:91:65 chr16 71096112 . G A 283.01 PASS AF=0.244318;AO=43;DP=177;FAO=43;FDP=176;FR=.;FRO=133;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=53;FSRR=80;FWDB=-0.0231845;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.178;QD=6.43206;RBI=0.0256508;REFB=0.00179052;REVB=-0.0109746;RO=133;SAF=21;SAR=22;SRF=53;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113557;STB=0.568139;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00935853;OID=.;OPOS=71096112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:133:133:43:43:0.244318:22:21:53:80:22:21:53:80 chr16 71098649 . T C 851.05 PASS AF=0.438679;AO=93;DP=212;FAO=93;FDP=212;FR=.;FRO=119;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=61;FSRR=58;FWDB=0.0219341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3704;QD=16.0576;RBI=0.0224465;REFB=-0.00709774;REVB=-0.00476877;RO=119;SAF=39;SAR=54;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949161;STB=0.552814;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0162194;OID=.;OPOS=71098649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:119:119:93:93:0.438679:54:39:61:58:54:39:61:58 chr16 71100830 . T C 55.31 PASS AF=0.142857;AO=11;DP=77;FAO=11;FDP=77;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=-0.0242516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.931;QD=2.87305;RBI=0.0242721;REFB=-0.00707561;REVB=-0.000997358;RO=65;SAF=6;SAR=5;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687286;STB=0.552791;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0366537;OID=.;OPOS=71100830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:77:77:65:66:11:11:0.142857:5:6:39:26:5:6:40:26 chr16 71100838 . T C 160.7 PASS AF=0.297297;AO=22;DP=74;FAO=22;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0143451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.88;QD=8.68633;RBI=0.0197795;REFB=-0.0045881;REVB=0.0136179;RO=51;SAF=10;SAR=12;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224585;STB=0.637563;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0140618;OID=.;OPOS=71100838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:51:52:22:22:0.297297:12:10:33:18:12:10:34:18 chr16 71101200 . T C 323.11 PASS AF=0.376238;AO=38;DP=101;FAO=38;FDP=101;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.00828854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.67;QD=12.7964;RBI=0.0149279;REFB=-0.00301527;REVB=-0.0124154;RO=63;SAF=14;SAR=24;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318238;STB=0.68076;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00732521;OID=.;OPOS=71101200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:63:63:38:38:0.376238:24:14:42:21:24:14:42:21 chr16 71101270 . C T 311.35 PASS AF=0.368932;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=103;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=0.0224215;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.207;QD=12.0911;RBI=0.022907;REFB=-0.00592056;REVB=-0.00469114;RO=65;SAF=20;SAR=18;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134108;STB=0.576407;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00930888;OID=.;OPOS=71101270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:65:65:38:38:0.368932:18:20:42:23:18:20:42:23 chr16 71103269 . T C 1525.02 PASS AF=0.444142;AO=163;DP=368;FAO=163;FDP=367;FR=.;FRO=204;FSAF=62;FSAR=101;FSRF=96;FSRR=108;FWDB=0.00925509;FXX=0.00271732;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.174;QD=16.6214;RBI=0.0102006;REFB=-0.0126103;REVB=-0.00428911;RO=202;SAF=62;SAR=101;SRF=95;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092912;STB=0.551868;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0171475;OID=.;OPOS=71103269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:368:367:202:204:163:163:0.444142:101:62:95:107:101:62:96:108 chr16 71109904 . C A 592.7 PASS AF=0.446043;AO=62;DP=141;FAO=62;FDP=139;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.0121801;FXX=0.0141834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.871;QD=17.0562;RBI=0.01403;REFB=-0.0174699;REVB=0.00696334;RO=77;SAF=35;SAR=27;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147383;STB=0.582094;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0204128;OID=.;OPOS=71109904;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:139:77:77:62:62:0.446043:27:35:32:45:27:35:32:45 chr16 71113780 . C T 234.92 PASS AF=0.46;AO=20;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0122893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.982;QD=18.7932;RBI=0.0176025;REFB=-0.0106933;REVB=-0.0126024;RO=23;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166923;STB=0.614871;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0165912;OID=.;OPOS=71113780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:23:27:20:23:0.46:7:13:11:12:8:15:12:15 chr16 71122408 . C T 164.69 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0395562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8755;QD=9.54719;RBI=0.0686733;REFB=0.0135583;REVB=-0.0561367;RO=47;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574624;STB=0.533763;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.0325206;OID=.;OPOS=71122408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:47:47:22:22:0.318841:13:9:17:30:13:9:17:30 chr16 71127814 . C G 296.91 PASS AF=0.200803;AO=50;DP=248;FAO=50;FDP=249;FR=.;FRO=199;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=81;FSRR=118;FWDB=0.00524269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.817;QD=4.7696;RBI=0.00663992;REFB=-0.0115121;REVB=0.00407465;RO=197;SAF=20;SAR=30;SRF=81;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014888;STB=0.510666;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0296781;OID=.;OPOS=71127814;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:197:199:50:50:0.200803:30:20:81:116:29:21:81:118 chr16 71149660 . G A 684.57 PASS AF=0.266846;AO=99;DP=371;FAO=99;FDP=371;FR=.;FRO=272;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=117;FSRR=155;FWDB=0.00696466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.157;QD=7.3808;RBI=0.00813492;REFB=-0.00263463;REVB=0.00420363;RO=271;SAF=40;SAR=59;SRF=117;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354286;STB=0.519718;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00911978;OID=.;OPOS=71149660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:371:371:271:272:99:99:0.266846:59:40:117:154:59:40:117:155 chr16 71163579 . C T 767.61 PASS AF=0.544776;AO=73;DP=134;FAO=73;FDP=134;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0165701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.938;QD=22.9138;RBI=0.0648036;REFB=-0.0166201;REVB=0.0626493;RO=60;SAF=35;SAR=38;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658787;STB=0.531819;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.011196;OID=.;OPOS=71163579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:60:61:73:73:0.544776:38:35:24:36:38:35:25:36 chr16 71163693 . A G 100.23 PASS AF=0.186813;AO=17;DP=91;FAO=17;FDP=91;FR=.;FRO=74;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=0.0208624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.896;QD=4.40564;RBI=0.0279419;REFB=-0.00588095;REVB=-0.0185879;RO=74;SAF=6;SAR=11;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875327;STB=0.556703;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0262417;OID=.;OPOS=71163693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:74:74:17:17:0.186813:11:6:31:43:11:6:31:43 chr16 71237702 . C T 98.99 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=-0.00770587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.545;QD=14.6656;RBI=0.0501861;REFB=-0.00214608;REVB=0.049591;RO=15;SAF=11;SAR=1;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132987;STB=0.578799;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00669345;OID=.;OPOS=71237702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:27:27:15:15:12:12:0.444444:1:11:13:2:1:11:13:2 chr16 71264523 . T A 148.24 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.0286454;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6133;QD=11.6264;RBI=0.0343813;REFB=-0.0150661;REVB=-0.0190136;RO=31;SAF=2;SAR=16;SRF=5;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120539;STB=0.631408;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0644476;OID=.;OPOS=71264523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:33:18:18:0.352941:16:2:5:26:16:2:7:26 chr16 71318577 . T C 306.15 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0135081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.465;QD=15.3076;RBI=0.021323;REFB=-0.00415086;REVB=0.0164985;RO=46;SAF=18;SAR=16;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074042;STB=0.541826;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0055619;OID=.;OPOS=71318577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:16:18:21:25:16:18:21:25 chr16 71319539 . C T 116.25 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00669283;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.902;QD=20.2165;RBI=0.00724488;REFB=-0.0213303;REVB=-0.00277386;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177266;STB=0.571322;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0108569;OID=.;OPOS=71319539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:23:23:9:10:13:13:0.565217:6:7:7:2:6:7:7:3 chr16 71319646 . G A 278.88 PASS AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=-0.00882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2374;QD=13.9439;RBI=0.0122498;REFB=0.0194977;REVB=-0.00850093;RO=48;SAF=23;SAR=9;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416787;STB=0.523654;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.0215015;OID=.;OPOS=71319646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:9:23:36:12:9:23:36:12 chr16 71482794 . T A 205.46 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00139989;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.865;QD=15.8045;RBI=0.00189128;REFB=-0.0204906;REVB=0.00127171;RO=27;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200444;STB=0.599908;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.015521;OID=.;OPOS=71482794;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:27:29:23:23:0.442308:6:17:15:12:6:17:17:12 chr16 71487206 . T C 318.98 PASS AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0546704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.138;QD=15.7519;RBI=0.0810446;REFB=-0.00480076;REVB=-0.0598279;RO=46;SAF=28;SAR=7;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312991;STB=0.678674;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00379221;OID=.;OPOS=71487206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:35:35:0.432099:7:28:25:21:7:28:25:21 chr16 71509588 . G A 229.4 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0320813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.8275;QD=22.3807;RBI=0.0353349;REFB=-0.0407246;REVB=0.0148104;RO=17;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807896;STB=0.565553;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0242133;OID=.;OPOS=71509588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:17:19:22:22:0.536585:10:12:11:6:10:12:13:6 chr16 71509634 . G C 122.19 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0169102;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.058;QD=14.8114;RBI=0.103809;REFB=-0.0124562;REVB=-0.102422;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548562;STB=0.520803;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0406641;OID=.;OPOS=71509634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:18:19:14:14:0.424242:10:4:6:12:10:4:6:13 chr16 71509685 . C G 132.13 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00152607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.609;QD=24.024;RBI=0.0029552;REFB=-0.0215231;REVB=0.00253067;RO=8;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681046;STB=0.538405;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0185462;OID=.;OPOS=71509685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:10:4:3:5:10:4:3:5 chr16 71570704 . C T 268.05 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0323765;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9903;QD=21.4438;RBI=0.0339488;REFB=-0.0138854;REVB=0.0102118;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198756;STB=0.610696;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0150055;OID=.;OPOS=71570704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:17:10:14:9:17:10:14:9 chr16 71603771 . C A 195.73 PASS AF=0.487805;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00869678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.522;QD=19.0956;RBI=0.00871358;REFB=-0.0244669;REVB=0.000540813;RO=21;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123789;STB=0.510194;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0306505;OID=.;OPOS=71603771;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:21:21:19:20:0.487805:7:12:13:8:8:12:13:8 chr16 71660310 . G A 214.68 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.094922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6794;QD=21.4678;RBI=0.102824;REFB=-0.0188342;REVB=-0.0395301;RO=19;SAF=18;SAR=3;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236794;STB=0.635146;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0170893;OID=.;OPOS=71660310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:3:18:13:6:3:18:13:6 chr16 71668552 . G A 130.66 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0141635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.96;QD=13.7531;RBI=0.0237331;REFB=-0.0100304;REVB=0.0190436;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00960055;STB=0.507033;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0118766;OID=.;OPOS=71668552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:23:15:15:0.394737:8:7:10:11:8:7:11:12 chr16 71668634 . T G 49.71 PASS AF=0.3125;AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0110548;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.05;QD=12.4282;RBI=0.013076;REFB=-0.00582278;REVB=0.00698385;RO=9;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.548753;STB=0.822299;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00419814;OID=.;OPOS=71668634;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:17:16:9:8:5:5:0.3125:1:4:2:7:1:4:2:6 chr16 71674882 . C G 83.48 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0354698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.015;QD=9.8216;RBI=0.053157;REFB=-0.0112148;REVB=-0.0395924;RO=23;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171006;STB=0.602992;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.021424;OID=.;OPOS=71674882;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:6:5:14:9:6:5:14:9 chr16 71678932 . T C 123.1 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.000879202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.604;QD=16.4139;RBI=0.00481724;REFB=-0.00301116;REVB=-0.00473633;RO=16;SAF=11;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307902;STB=0.679494;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.000316067;OID=.;OPOS=71678932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:3:11:8:8:3:11:8:8 chr16 71679057 . C T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.57;QD=46.848;RBI=0.0227743;REFB=0;REVB=-0.0205726;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.52455e-05;OID=.;OPOS=71679057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr16 71682796 . T C 236.07 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0359083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2813;QD=19.2707;RBI=0.0395774;REFB=-0.0290654;REVB=0.0166422;RO=26;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616294;STB=0.534853;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0301767;OID=.;OPOS=71682796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:10:13:13:13:10:13:13:13 chr16 71710428 . G A 518.9 PASS AF=0.448;AO=56;DP=125;FAO=56;FDP=125;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.0146039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.12;QD=16.6049;RBI=0.0494383;REFB=0.00722423;REVB=-0.0472321;RO=69;SAF=32;SAR=24;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378919;STB=0.521119;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.0104989;OID=.;OPOS=71710428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:69:69:56:56:0.448:24:32:42:27:24:32:42:27 chr16 71712786 . A G 343.0 PASS AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.000853702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.121;QD=24.0704;RBI=0.00157441;REFB=-0.0115387;REVB=-0.00132286;RO=23;SAF=21;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168027;STB=0.592422;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0176386;OID=.;OPOS=71712786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:13:21:9:14:13:21:9:14 chr16 71762977 . ACAG A 54.18 PASS AF=0.275862;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00047396;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=3;MLLD=234.621;QD=7.47377;RBI=0.0347598;REFB=-0.0078455;REVB=-0.0347566;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375982;STB=0.708546;STBP=0.221;TYPE=del;VARB=0.025942;OID=.;OPOS=71762978;OREF=CAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.275862:8:32:8:29:21:2:6:11:10:54:19:2:6:11:8 chr16 71773190 . G T 90.09 PASS AF=0.478261;AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0032389;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=225.089;QD=15.6682;RBI=0.0327719;REFB=-0.000957301;REVB=-0.0326115;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468762;STB=0.586989;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.0014724;OID=.;OPOS=71773190;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:23:23:8:12:10:11:0.478261:3:7:6:2:3:8:7:5 chr16 71800384 . T A 115.67 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0100225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.717;QD=11.0158;RBI=0.012825;REFB=-0.00506807;REVB=-0.00800192;RO=28;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239502;STB=0.642653;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0086745;OID=.;OPOS=71800384;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:9:5:16:12:9:5:16:12 chr16 71886530 . T A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.501;QD=55.656;RBI=0.0232191;REFB=0;REVB=-0.0129435;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12044e-05;OID=.;OPOS=71886530;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:19:8:0:0:19:8:0:0 chr16 71887381 . A G 248.6 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.000757062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.638;QD=25.4971;RBI=0.0656409;REFB=-0.00452005;REVB=-0.0656365;RO=16;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486154;STB=0.527003;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00379131;OID=.;OPOS=71887381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:13:10:8:8:13:10:8:8 chr16 71889173 . C T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00120013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=373.32;QD=62.1623;RBI=0.0117428;REFB=0;REVB=0.0116813;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97003e-06;OID=.;OPOS=71889173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:52:33:0:0:52:33:0:0 chr16 71890489 . C G 306.98 PASS AF=0.361905;AO=38;DP=105;FAO=38;FDP=105;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.0143633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.256;QD=11.6946;RBI=0.0165121;REFB=-0.0120853;REVB=-0.00814519;RO=65;SAF=20;SAR=18;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151623;STB=0.57443;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0215449;OID=.;OPOS=71890489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:67:38:38:0.361905:18:20:43:22:18:20:43:24 chr16 71950450 . C T 748.06 PASS AF=0.5;AO=73;DP=146;FAO=73;FDP=146;FR=.;FRO=73;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=-0.00544163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2054;QD=20.4948;RBI=0.020659;REFB=0.00180079;REVB=-0.0199295;RO=73;SAF=41;SAR=32;SRF=27;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172767;STB=0.595062;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00146552;OID=.;OPOS=71950450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:73:73:73:0.5:32:41:27:46:32:41:27:46 chr16 71956511 . AATGCCC A 90.27 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0194498;FXX=0.0555401;HRUN=2;LEN=6;MLLD=261.368;QD=10.6198;RBI=0.0217226;REFB=-0.0110093;REVB=-0.00967364;RO=17;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32343;STB=0.694856;STBP=0.073;TYPE=del;VARB=0.0200062;OID=.;OPOS=71956512;OREF=ATGCCC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.411765:14:35:14:34:20:9:5:6:14:90:17:9:5:5:12 chr16 71976919 . G A 203.66 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0372921;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.994;QD=12.1589;RBI=0.0409366;REFB=-0.0320689;REVB=0.0168852;RO=44;SAF=6;SAR=19;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358334;STB=0.694351;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0809438;OID=.;OPOS=71976919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:44:42:25:25:0.373134:19:6:24:20:19:6:22:20 chr16 71981414 . C CTTTG 1146.09 PASS AF=0.854369;AO=83;DP=105;FAO=88;FDP=103;FR=.;FRO=15;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00170262;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=4;MLLD=280.033;QD=44.5085;RBI=0.00746474;REFB=-0.0157331;REVB=-0.00726797;RO=15;SAF=41;SAR=42;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496925;STB=0.522647;STBP=0.274;TYPE=ins;VARB=0.00197476;OID=.;OPOS=71981415;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.854369:83:105:88:103:15:45:43:10:5:76:15:41:42:10:5 chr16 71983772 . G C 175.35 PASS AF=0.392157;AO=22;DP=53;FAO=20;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00345625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.505;QD=13.7526;RBI=0.0053217;REFB=-4.01773e-05;REVB=0.00404657;RO=22;SAF=11;SAR=11;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285588;STB=0.578869;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=5.83984e-05;OID=.;OPOS=71983772;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:51:22:31:22:20:0.392157:11:11:4:18:9:11:13:18 chr16 71986946 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.106;QD=57.0003;RBI=0.027255;REFB=0;REVB=0.0113279;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012324;OID=.;OPOS=71986946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0 chr16 71986995 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.012;QD=56.7066;RBI=0.0302365;REFB=0;REVB=0.0299936;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108598;OID=.;OPOS=71986995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:21:8:0:0:21:8:0:0 chr16 71988106 . C T 958.67 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00906003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.849;QD=57.2339;RBI=0.0339948;REFB=-0.0518672;REVB=0.0327652;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145365;STB=0.50769;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000170497;OID=.;OPOS=71988106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:34:32:1:0:34:32:1:0 chr16 72001110 . G A 300.33 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00851402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.22;QD=24.5165;RBI=0.0160133;REFB=-0.0367959;REVB=0.0135624;RO=22;SAF=15;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451551;STB=0.525095;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0327494;OID=.;OPOS=72001110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:12:15:11:11:12:15:11:11 chr16 72001136 . G A 205.1 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0066995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.055;QD=16.4078;RBI=0.0147839;REFB=0.0012127;REVB=0.0131788;RO=29;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763318;STB=0.543685;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.00160158;OID=.;OPOS=72001136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:11:10:16:13:11:10:16:13 chr16 72003952 . G C 284.66 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00136815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.982;QD=17.791;RBI=0.011887;REFB=-0.00687733;REVB=0.011808;RO=33;SAF=12;SAR=19;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229143;STB=0.512812;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00740589;OID=.;OPOS=72003952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:19:12:12:21:19:12:12:21 chr16 72007399 . C T 105.4 PASS AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0383197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.275;QD=11.0943;RBI=0.0384042;REFB=-0.00490952;REVB=0.00254675;RO=25;SAF=4;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360394;STB=0.713963;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0105211;OID=.;OPOS=72007399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:9:4:16:9:9:4:16:9 chr16 72011181 . G T 772.67 PASS AF=0.98;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00928694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.768;QD=61.8137;RBI=0.0198174;REFB=0.0258133;REVB=0.0175067;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51219;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000127982;OID=.;OPOS=72011181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:50:0:1:49:49:0.98:20:29:0:0:20:29:0:1 chr16 72011193 . A C 740.82 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0806;QD=56.9861;RBI=0.0385712;REFB=0;REVB=0.0224399;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573688;OID=.;OPOS=72011193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:22:29:0:0:23:29:0:0 chr16 72011261 . A G 1255.5 PASS AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0172902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6223;QD=59.0823;RBI=0.0304707;REFB=-0.0253659;REVB=-0.02509;RO=2;SAF=36;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255827;STB=0.51351;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00685365;OID=.;OPOS=72011261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:47:36:2:0:47:36:2:0 chr16 72013797 . G C 727.78 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.029;QD=63.285;RBI=0.0267554;REFB=0;REVB=-0.00281133;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38065e-05;OID=.;OPOS=72013797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr16 72020134 . T C 253.6 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.023766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4236;QD=17.4897;RBI=0.0237673;REFB=0.0113882;REVB=-0.000248695;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066429;STB=0.537287;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=-0.0126536;OID=.;OPOS=72020134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:16:12:15:15:16:12:15:15 chr16 72020218 . G A 390.77 PASS AF=0.666667;AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00604421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.47;QD=32.5643;RBI=0.0184193;REFB=-0.0339648;REVB=0.0173994;RO=16;SAF=20;SAR=12;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401822;STB=0.521964;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0254923;OID=.;OPOS=72020218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:16:16:32:32:0.666667:12:20:9:7:12:20:9:7 chr16 72020293 . C CA 583.55 PASS AF=0.982456;AO=6;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.150039;FXX=0.0172384;HRUN=0;LEN=1;MLLD=99.3469;QD=40.9509;RBI=0.151895;REFB=-0.0750278;REVB=0.0236749;RO=52;SAF=5;SAR=1;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35966;STB=0.50769;STBP=0.517;TYPE=ins;VARB=0.016531;OID=.;OPOS=72020294;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.982456:6:58:56:57:1:32:24:1:0:4:52:5:1:28:24 chr16 72020294 . G A 653.27 PASS AF=0.87931;AO=51;DP=58;FAO=51;FDP=58;FR=.;FRO=7;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0259308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.469;QD=45.0532;RBI=0.0348895;REFB=-0.146156;REVB=-0.0233425;RO=6;SAF=27;SAR=24;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604599;STB=0.539862;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00604438;OID=.;OPOS=72020294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:58:58:6:7:51:51:0.87931:24:27:5:1:24:27:6:1 chr16 72020323 . A G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.129;QD=57.1775;RBI=0.0499755;REFB=0;REVB=0.0242542;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115871;OID=.;OPOS=72020323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0 chr16 72032231 . T A 632.51 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.638;QD=61.7086;RBI=0.0162405;REFB=0;REVB=0.009164;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56096e-05;OID=.;OPOS=72032231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:22:19:0:0 chr16 72042682 . A C 670.25 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.497;QD=62.3492;RBI=0.0446615;REFB=0;REVB=0.0257931;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192172;OID=.;OPOS=72042682;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:25:17:0:0:26:17:0:0 chr16 72198358 . T C 280.41 PASS AF=0.517241;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00653394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.452;QD=19.3388;RBI=0.0157171;REFB=-0.00389287;REVB=0.0142946;RO=28;SAF=17;SAR=12;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15377;STB=0.592268;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0036885;OID=.;OPOS=72198358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:28:28:29:30:0.517241:12:17:21:7:13:17:21:7 chr16 72818965 . T TA 291.62 PASS AF=0.494845;AO=46;DP=98;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00937766;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.6126;QD=12.0255;RBI=0.0675396;REFB=0.0215325;REVB=0.0668854;RO=48;SAF=30;SAR=16;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202288;STB=0.592142;STBP=0.096;TYPE=ins;VARB=-0.0105611;OID=.;OPOS=72818966;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.494845:46:98:48:97:49:31:17:23:26:99:48:30:16:21:27 chr16 72827758 . T C 868.34 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.792;QD=57.8891;RBI=0.028976;REFB=0;REVB=0.00518391;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61023e-05;OID=.;OPOS=72827758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:31:28:0:0:31:29:0:0 chr16 72828403 . A G 160.23 PASS AF=0.472222;AO=16;DP=35;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0168457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8901;QD=17.8037;RBI=0.0238719;REFB=0.00972172;REVB=0.0169142;RO=19;SAF=12;SAR=4;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.492072;STB=0.749722;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0104376;OID=.;OPOS=72828403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:19:19:16:17:0.472222:4:12:4:15:5:12:4:15 chr16 72829630 . A G 170.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00128442;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5313;QD=15.1494;RBI=0.00719155;REFB=-0.0264701;REVB=0.00707592;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457137;STB=0.545405;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.027452;OID=.;OPOS=72829630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:27:18:18:0.4:8:10:15:10:8:10:17:10 chr16 72831652 . G A 305.0 PASS AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0365149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.155;QD=32.9725;RBI=0.0841455;REFB=0.03377;REVB=0.0758098;RO=11;SAF=10;SAR=16;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396784;STB=0.521722;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0123228;OID=.;OPOS=72831652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:11:11:26:26:0.702703:16:10:5:6:16:10:5:6 chr16 72832135 . T A 1175.48 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137511;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.195;QD=61.0638;RBI=0.0169985;REFB=0;REVB=0.00999275;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13012e-05;OID=.;OPOS=72832135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0 chr16 72991660 . C G 669.83 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8073;QD=62.3098;RBI=0.00821391;REFB=0;REVB=-0.000198106;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.13731e-05;OID=.;OPOS=72991660;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:25:17:0:0:25:18:0:0 chr16 72991715 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6968;QD=33.4283;RBI=0.0197596;REFB=0;REVB=0.0197596;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115567;OID=.;OPOS=72991715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chr16 72993831 . A C 96.52 PASS AF=0.352941;AO=5;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.110827;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4414;QD=11.3555;RBI=0.129488;REFB=-0.0520619;REVB=-0.0669673;RO=12;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180994;STB=0.588093;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0733401;OID=.;OPOS=72993831;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:35:34:12:22:5:12:0.352941:2:3:9:3:6:6:14:8 chr16 73143402 . C CAGA 456.99 PASS AF=0.85;AO=31;DP=41;FAO=34;FDP=40;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0170997;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=3;MLLD=219.155;QD=45.6988;RBI=0.0188496;REFB=-0.0211043;REVB=-0.00793159;RO=7;SAF=21;SAR=10;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192495;STB=0.575339;STBP=0.03;TYPE=ins;VARB=0.00384951;OID=.;OPOS=73143403;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.85:31:41:34:40:6:22:12:1:5:33:7:21:10:1:6 chr16 73512204 . AGC GTA 722.39 PASS AF=1;AO=3;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.17895;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=3;MLLD=74.1208;QD=58.9707;RBI=0.276378;REFB=0;REVB=0.210622;RO=0;SAF=3;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00715174;OID=.;OPOS=73512204;OREF=AGC;OALT=GTA;OMAPALT=GTA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:3:49:1:0:3:0:0:23:26:0:0 chr16 74366531 . A C 662.39 PASS AF=0.703704;AO=54;DP=78;FAO=57;FDP=81;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0371156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.31;QD=32.7105;RBI=0.0405377;REFB=-0.0160012;REVB=-0.0163016;RO=24;SAF=15;SAR=39;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120314;STB=0.547153;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00525594;OID=.;OPOS=74366531;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:24:24:54:57:0.703704:39:15:11:13:39:18:11:13 chr16 74394671 . T C 491.8 PASS AF=0.490566;AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0174058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.708;QD=18.5583;RBI=0.018141;REFB=-0.0261996;REVB=-0.00511192;RO=54;SAF=29;SAR=23;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363189;STB=0.520124;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0265641;OID=.;OPOS=74394671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:54:54:52:52:0.490566:23:29:28:26:23:29:28:26 chr16 74394745 . A G 79.87 PASS AF=0.218182;AO=12;DP=55;FAO=12;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0251115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.936;QD=5.80897;RBI=0.0265236;REFB=-0.0069248;REVB=0.00853917;RO=42;SAF=6;SAR=6;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509076;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0236055;OID=.;OPOS=74394745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:42:43:12:12:0.218182:6:6:21:21:6:6:22:21 chr16 74425358 . G A 120.13 PASS AF=0.103858;AO=36;DP=335;FAO=35;FDP=337;FR=.;FRO=302;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=204;FSRR=98;FWDB=-0.00290693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.915;QD=1.42592;RBI=0.0297683;REFB=-0.00160115;REVB=-0.029626;RO=297;SAF=26;SAR=10;SRF=201;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662826;STB=0.573328;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0115384;OID=.;OPOS=74425358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:335:337:297:302:36:35:0.103858:10:26:201:96:9:26:204:98 chr16 74425548 . A G 660.06 PASS AF=0.328185;AO=84;DP=260;FAO=85;FDP=259;FR=.;FRO=174;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=84;FSRR=90;FWDB=-0.00238437;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.061;QD=10.194;RBI=0.0124952;REFB=-0.0143717;REVB=0.0122656;RO=174;SAF=43;SAR=41;SRF=84;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341941;STB=0.523423;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0163521;OID=.;OPOS=74425548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:174:174:84:85:0.328185:41:43:84:90:41:44:84:90 chr16 74425569 . C T 90.61 PASS AF=0.111111;AO=24;DP=216;FAO=24;FDP=216;FR=.;FRO=192;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=91;FSRR=101;FWDB=0.006532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.51;QD=1.67799;RBI=0.0437931;REFB=-0.00862003;REVB=-0.0433033;RO=191;SAF=12;SAR=12;SRF=90;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355251;STB=0.523129;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0742269;OID=.;OPOS=74425569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:216:216:191:192:24:24:0.111111:12:12:90:101:12:12:91:101 chr16 74425702 . GG AA 154.13 PASS AF=0.137255;AO=25;DP=291;FAO=42;FDP=306;FR=.;FRO=264;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=131;FSRR=133;FWDB=-0.00506352;FXX=0.0129028;HRUN=2;LEN=2;MLLD=177.803;QD=2.01471;RBI=0.0152676;REFB=-0.00742896;REVB=0.0144035;RO=261;SAF=21;SAR=4;SRF=130;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.412442;STB=0.544358;STBP=0.547;TYPE=mnp;VARB=0.0403149;OID=.;OPOS=74425702;OREF=GG;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:306:261:264:25:42:0.137255:4:21:130:131:19:23:131:133 chr16 74425732 . G T 301.22 PASS AF=0.188811;AO=54;DP=287;FAO=54;FDP=286;FR=.,HEALED;FRO=232;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=121;FSRR=111;FWDB=-0.0162492;FXX=0.0034842;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.263;QD=4.21284;RBI=0.0760502;REFB=-0.018164;REVB=-0.0742939;RO=190;SAF=27;SAR=27;SRF=117;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148613;STB=0.517476;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0745735;OID=.;OPOS=74425732;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:286:190:232:54:54:0.188811:27:27:117:73:27:27:121:111 chr16 74425769 . C T 267.97 PASS AF=0.189922;AO=49;DP=259;FAO=49;FDP=258;FR=.;FRO=209;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=121;FSRR=88;FWDB=-0.00814917;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8462;QD=4.1546;RBI=0.0207644;REFB=-0.0182937;REVB=-0.0190984;RO=209;SAF=23;SAR=26;SRF=121;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140905;STB=0.588089;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0951628;OID=.;OPOS=74425769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:209:209:49:49:0.189922:26:23:121:88:26:23:121:88 chr16 74425787 . G T 272.67 PASS AF=0.211982;AO=45;DP=217;FAO=46;FDP=217;FR=.;FRO=171;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=99;FSRR=72;FWDB=0.0135589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.349;QD=5.02608;RBI=0.013755;REFB=-0.00853583;REVB=-0.00231469;RO=170;SAF=19;SAR=26;SRF=98;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195566;STB=0.612141;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0254208;OID=.;OPOS=74425787;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:170:171:45:46:0.211982:26:19:98:72:26:20:99:72 chr16 74425793 . T C 291.95 PASS AF=0.226601;AO=46;DP=203;FAO=46;FDP=203;FR=.;FRO=157;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=89;FSRR=68;FWDB=-0.00232768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.874;QD=5.75274;RBI=0.0170241;REFB=-0.0178262;REVB=-0.0168642;RO=157;SAF=20;SAR=26;SRF=89;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166546;STB=0.601145;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0448015;OID=.;OPOS=74425793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:157:157:46:46:0.226601:26:20:89:68:26:20:89:68 chr16 74425795 . G A 304.29 PASS AF=0.239583;AO=46;DP=192;FAO=46;FDP=192;FR=.;FRO=146;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=84;FSRR=62;FWDB=0.0253934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8766;QD=6.33932;RBI=0.0391277;REFB=-0.0545267;REVB=-0.0297684;RO=141;SAF=20;SAR=26;SRF=81;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173841;STB=0.60569;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0278958;OID=.;OPOS=74425795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:141:146:46:46:0.239583:26:20:81:60:26:20:84:62 chr16 74425826 . G A 156.28 PASS AF=0.275;AO=22;DP=80;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0360852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.532;QD=7.81407;RBI=0.0365727;REFB=-0.00479581;REVB=-0.00595173;RO=58;SAF=12;SAR=10;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071268;STB=0.542687;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.020753;OID=.;OPOS=74425826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:58:58:22:22:0.275:10:12:35:23:10:12:35:23 chr16 74443789 . T G,TG 58.47 PASS AF=0.0555556,0.444444;AO=2,7;DP=18;FAO=1,8;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=0,1;FSAR=1,7;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0185439,0.124661;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=267.134,15.7506;QD=12.9934;RBI=0.0250905,0.130692;REFB=-0.00759697,-0.116633;REVB=-0.0169014,-0.039246;RO=9;SAF=0,1;SAR=2,6;SRF=1;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.476258,0.0642184;STB=0.982229,0.517199;STBP=0.599,0.902;TYPE=snp,ins;VARB=0.0462837,0.0871691;OID=.,.;OPOS=74443789,74443790;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:49:18:18:9:9:2,7:1,8:0.0555556,0.444444:2,6:0,1:1:8:1,7:0,1:1:8 chr16 74537591 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.12;QD=62.022;RBI=0.0194878;REFB=0;REVB=0.00689822;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16082e-05;OID=.;OPOS=74537591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0 chr16 74664743 . T C 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0244438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.505;QD=14.9202;RBI=0.0252154;REFB=-0.0203869;REVB=0.00619003;RO=37;SAF=13;SAR=15;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487122;STB=0.50276;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0275188;OID=.;OPOS=74664743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:15:13:17:20:15:13:17:20 chr16 74664810 . A T 914.52 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132642;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.36;QD=58.065;RBI=0.133454;REFB=0;REVB=0.0146947;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00203703;OID=.;OPOS=74664810;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:32:30:0:0:32:31:0:0 chr16 74670458 . C T 410.44 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.512;QD=56.6124;RBI=0.0178128;REFB=0;REVB=-0.0121568;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106938;OID=.;OPOS=74670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr16 74695079 . G T 1301.86 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.8;QD=61.9931;RBI=0.0344205;REFB=0;REVB=-0.00957308;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131454;OID=.;OPOS=74695079;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:50:33:0:0:51:33:0:0 chr16 74750405 . G A 153.47 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0344611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.927;QD=13.9521;RBI=0.0345355;REFB=-0.0330638;REVB=-0.00226535;RO=24;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836578;STB=0.526432;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0393496;OID=.;OPOS=74750405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:44:24:27:17:17:0.386364:10:7:8:16:10:7:10:17 chr16 75238103 . C T 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.783;QD=57.2346;RBI=0.0712421;REFB=0;REVB=0.0468789;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101678;OID=.;OPOS=75238103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr16 75269267 . A G 358.33 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.509;QD=55.1283;RBI=0.00988302;REFB=0;REVB=-0.0028252;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21626e-05;OID=.;OPOS=75269267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:12:13:0:0:13:13:0:0 chr16 75269534 . C T 326.88 PASS AF=0.925926;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0453234;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.61;QD=48.4272;RBI=0.071187;REFB=-0.166006;REVB=0.0548943;RO=1;SAF=12;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370998;STB=0.501482;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0028425;OID=.;OPOS=75269534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:28:27:1:2:25:25:0.925926:13:12:1:0:13:12:1:1 chr16 75271146 . CCG CC,C 124.02 PASS AF=0.222222,0.188889;AO=20,13;DP=96;FAO=20,17;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=0,10;FSAR=20,7;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.00810096,-0.0612922;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.7918,21.299;QD=5.51219;RBI=0.0309346,0.0818247;REFB=-0.101688,-0.0480386;REVB=-0.029855,-0.0542083;RO=55;SAF=2,6;SAR=18,7;SRF=26;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.549632,-0.013986;STB=0.99937,0.5602;STBP=0,0.602;TYPE=del,del;VARB=0.140571,0.161449;OID=.,.;OPOS=75271148,75271147;OREF=G,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.222222,0.188889:20,13:96:20,17:90:53:0,10:20,7:27:26:45:55:2,6:18,7:26:29 chr16 75281964 . A C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.192;QD=56.1909;RBI=0.060599;REFB=0;REVB=0.0552662;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473956;OID=.;OPOS=75281964;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr16 75327916 . A G 1135.1 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.326;QD=60.5386;RBI=0.0425836;REFB=0;REVB=0.0020878;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148447;OID=.;OPOS=75327916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:39:35:0:0:39:36:0:0 chr16 75565242 . A C 95.24 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0075554;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=211.358;QD=25.3975;RBI=0.00877511;REFB=-0.000808819;REVB=0.00446302;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138896;STB=0.578172;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.000572937;OID=.;OPOS=75565242;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:5:6:1:3:5:6:1:3 chr16 75565284 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00593761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.693;QD=56.7066;RBI=0.033917;REFB=0;REVB=0.0333932;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143742;OID=.;OPOS=75565284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0 chr16 75565420 . A G 708.82 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.253;QD=63.0061;RBI=0.0318984;REFB=0;REVB=0.0134705;RO=0;SAF=34;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137689;OID=.;OPOS=75565420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:10:34:0:0:11:34:0:0 chr16 75574030 . C T 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.294;QD=63.583;RBI=0.0198778;REFB=0;REVB=-0.00811445;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60077e-05;OID=.;OPOS=75574030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr16 75590092 . G C 1153.38 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7455;QD=60.7044;RBI=0.163855;REFB=0;REVB=0.162574;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153004;OID=.;OPOS=75590092;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:76:0:0:70:76:1:33:37:0:0:39:37:0:0 chr16 75590113 . C G 374.45 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0250403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.361;QD=20.8028;RBI=0.0250462;REFB=-0.0214419;REVB=0.000546816;RO=34;SAF=17;SAR=21;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070165;STB=0.538836;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0187833;OID=.;OPOS=75590113;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:21:17:18:16:21:17:18:16 chr16 75646576 . G T 2408.85 PASS AF=1;AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.046;QD=64.2361;RBI=0.00626946;REFB=0;REVB=-0.00580105;RO=0;SAF=70;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.82518e-06;OID=.;OPOS=75646576;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:150:0:0:149:150:1:79:70:0:0:79:71:0:0 chr16 75646685 . G T 582.41 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0458626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3352;QD=58.2411;RBI=0.0536635;REFB=0.010409;REVB=-0.0278639;RO=1;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00166002;OID=.;OPOS=75646685;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:22:17:0:1:22:17:0:1 chr16 75669878 . A G 525.26 PASS AF=0.495495;AO=55;DP=111;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.012013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.041;QD=18.9284;RBI=0.0151568;REFB=0.00512224;REVB=0.0092421;RO=56;SAF=27;SAR=28;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897023;STB=0.549555;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00724079;OID=.;OPOS=75669878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:56:56:55:55:0.495495:28:27:22:34:28:27:22:34 chr16 75728368 . A G 339.14 PASS AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.000451692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4332;QD=17.8496;RBI=0.0142093;REFB=-0.00654105;REVB=0.0142021;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06855;STB=0.538271;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00963992;OID=.;OPOS=75728368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:17:19:24:16:17:19:24:16 chr16 76311602 . G GT 597.58 PASS AF=1;AO=50;DP=55;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364794;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.8253;QD=46.8689;RBI=0.0926936;REFB=0;REVB=0.0926218;RO=4;SAF=17;SAR=33;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140176;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0022906;OID=.;OPOS=76311603;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:50:55:51:51:0:18:33:0:0:11:4:17:33:1:3 chr16 76532583 . A G 446.54 PASS AF=0.462264;AO=47;DP=105;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.0143481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.856;QD=16.8507;RBI=0.0388947;REFB=-0.0120226;REVB=-0.0361515;RO=53;SAF=20;SAR=27;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101761;STB=0.524824;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.011787;OID=.;OPOS=76532583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:53:57:47:49:0.462264:27:20:22:31:27:22:23:34 chr16 76587750 . G A 330.79 PASS AF=0.433735;AO=34;DP=81;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00532908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.334;QD=15.9415;RBI=0.00870148;REFB=-0.0122156;REVB=0.00687871;RO=47;SAF=15;SAR=19;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178811;STB=0.596764;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0155523;OID=.;OPOS=76587750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:47:47:34:36:0.433735:19:15:29:18:20:16:29:18 chr16 76902847 . T C 169.77 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0106153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.904;QD=8.81917;RBI=0.0169501;REFB=-0.00733328;REVB=0.0132145;RO=52;SAF=10;SAR=13;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991098;STB=0.571527;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0263658;OID=.;OPOS=76902847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:52:54:23:23:0.298701:13:10:27:25:13:10:29:25 chr16 76902850 . G A 169.79 PASS AF=0.298701;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0402931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.278;QD=8.82;RBI=0.040426;REFB=-0.00120803;REVB=-0.00327521;RO=53;SAF=10;SAR=13;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110044;STB=0.571527;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00300773;OID=.;OPOS=76902850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:53:54:23:23:0.298701:13:10:28:25:13:10:29:25 chr16 77228629 . A G 306.52 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0039765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8407;QD=53.3074;RBI=0.0157489;REFB=0;REVB=-0.0152386;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000318437;OID=.;OPOS=77228629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:9:13:0:0:9:14:0:0 chr16 77228866 . T C 834.39 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0965474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.153;QD=57.5443;RBI=0.0994021;REFB=0;REVB=0.0236512;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167697;OID=.;OPOS=77228866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:36:22:0:0:36:22:0:0 chr16 77228971 . C T 120.62 PASS AF=0.466667;AO=13;DP=29;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0935532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.495;QD=16.0821;RBI=0.104876;REFB=-0.0335297;REVB=0.0473997;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249568;STB=0.635327;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0322029;OID=.;OPOS=77228971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:30:15:16:13:14:0.466667:7:6:11:4:8:6:11:5 chr16 77233338 . C T 1780.65 PASS AF=0.443662;AO=189;DP=427;FAO=189;FDP=426;FR=.;FRO=237;FSAF=79;FSAR=110;FSRF=119;FSRR=118;FWDB=0.0023689;FXX=0.00467279;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.566;QD=16.7197;RBI=0.00513803;REFB=-0.0132983;REVB=0.00455935;RO=235;SAF=79;SAR=110;SRF=119;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08948;STB=0.547341;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.016273;OID=.;OPOS=77233338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:427:426:235:237:189:189:0.443662:110:79:119:116:110:79:119:118 chr16 77233394 . A G 4856.04 PASS AF=1;AO=310;DP=310;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=191;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.883;QD=62.6586;RBI=0.0478036;REFB=0;REVB=0.0455358;RO=0;SAF=119;SAR=191;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73957e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76796e-05;OID=.;OPOS=77233394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:310:310:0:0:310:310:1:191:119:0:0:191:119:0:0 chr16 77246795 . C G 117.18 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0631031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.0088;QD=12.0182;RBI=0.0724659;REFB=-0.00257044;REVB=-0.0356274;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336707;STB=0.501989;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103289;OID=.;OPOS=77246795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:9:5:9:16:9:5:9:16 chr16 77316150 . G T 291.6 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0225796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.839;QD=19.44;RBI=0.0281763;REFB=-0.0350818;REVB=0.0168542;RO=29;SAF=13;SAR=18;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359408;STB=0.519987;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0376728;OID=.;OPOS=77316150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:18:13:11:18:18:13:11:18 chr16 77327018 . G A 509.47 PASS AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0318097;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5853;QD=21.0091;RBI=0.0597717;REFB=-0.0198118;REVB=0.0506043;RO=47;SAF=31;SAR=18;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676593;STB=0.541149;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0182312;OID=.;OPOS=77327018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:47:48:49:49:0.505155:18:31:33:14:18:31:34:14 chr16 77328895 . C T 462.57 PASS AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0136843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.862;QD=19.075;RBI=0.043182;REFB=-0.00569997;REVB=0.0409564;RO=51;SAF=25;SAR=21;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133665;STB=0.507439;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00582522;OID=.;OPOS=77328895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:21:25:27:24:21:25:27:24 chr16 77328990 . C A 229.42 PASS AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0136529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4997;QD=14.1181;RBI=0.0184705;REFB=-0.00399039;REVB=-0.0124402;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998573;STB=0.556776;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00627929;OID=.;OPOS=77328990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:13:14:16:22:13:14:16:22 chr16 77353973 . G T 1208.94 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.968;QD=61.2122;RBI=0.0330258;REFB=0;REVB=0.0294733;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163898;OID=.;OPOS=77353973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:41:38:0:0:41:38:0:0 chr16 77359919 . A T 937.59 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.378;QD=58.5992;RBI=0.0202273;REFB=0;REVB=0.017686;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36566e-05;OID=.;OPOS=77359919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0 chr16 77389956 . A G 1135.19 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.725;QD=60.5433;RBI=0.0175692;REFB=0;REVB=0.00449362;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02813e-05;OID=.;OPOS=77389956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chr16 77769369 . C T 1130.75 PASS AF=0.403785;AO=128;DP=317;FAO=128;FDP=317;FR=.;FRO=189;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=91;FSRR=98;FWDB=0.0225225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.215;QD=14.2682;RBI=0.0225814;REFB=-0.015446;REVB=0.00163069;RO=187;SAF=65;SAR=63;SRF=90;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028161;STB=0.515693;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0218686;OID=.;OPOS=77769369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:187:189:128:128:0.403785:63:65:90:97:63:65:91:98 chr16 77775672 . A G 463.96 PASS AF=0.479167;AO=45;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00808523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2695;QD=19.3316;RBI=0.00994773;REFB=-0.000342488;REVB=0.00579539;RO=49;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07892;STB=0.553774;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.000143263;OID=.;OPOS=77775672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:50:45:46:0.479167:21:24:22:27:21:25:22:28 chr16 78013112 . T A 284.1 PASS AF=0.484375;AO=30;DP=63;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00778974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7762;QD=17.7563;RBI=0.0434404;REFB=-0.0468535;REVB=0.0427363;RO=33;SAF=13;SAR=17;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376816;STB=0.513505;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0348066;OID=.;OPOS=78013112;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:33:33:30:31:0.484375:17:13:13:20:18:13:13:20 chr16 78013123 . C T 767.66 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00233791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.805;QD=56.8633;RBI=0.0192813;REFB=0;REVB=-0.019139;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.84462e-05;OID=.;OPOS=78013123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:34:18:0:0:35:19:0:0 chr16 78013882 . A T 1302.17 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.109;QD=62.008;RBI=0.026456;REFB=0;REVB=-0.0173932;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78545e-06;OID=.;OPOS=78013882;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:51:33:0:0:51:33:0:0 chr16 78063000 . T C 216.56 PASS AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0288638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0765;QD=13.3264;RBI=0.0356806;REFB=-0.030596;REVB=-0.0209758;RO=39;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137303;STB=0.507854;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0496911;OID=.;OPOS=78063000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:15:11:17:22:15:11:17:22 chr16 78063064 . G T 117.74 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0723137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7203;QD=12.3941;RBI=0.0826347;REFB=-0.0257621;REVB=-0.0399902;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592718;STB=0.534835;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0403656;OID=.;OPOS=78063064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:8:6:9:15:8:6:9:15 chr16 78064351 . C G 163.65 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00589534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.264;QD=20.4561;RBI=0.00763425;REFB=-0.0245228;REVB=-0.00485043;RO=15;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099476;STB=0.556352;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.02013;OID=.;OPOS=78064351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:6:11:8:7:6:11:8:7 chr16 78065139 . A G 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000462228;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=273.196;QD=57.1061;RBI=0.00189588;REFB=0;REVB=0.00183867;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39251e-06;OID=.;OPOS=78065139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr16 78065972 . A G 664.03 PASS AF=0.478571;AO=67;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0177274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.393;QD=18.9721;RBI=0.0460044;REFB=0.00525304;REVB=0.0424517;RO=73;SAF=29;SAR=38;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314175;STB=0.517393;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00636871;OID=.;OPOS=78065972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:73:73:67:67:0.478571:38:29:34:39:38:29:34:39 chr16 78066018 . A C 549.26 PASS AF=0.467742;AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.00353057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.864;QD=17.7179;RBI=0.0137113;REFB=-0.0111567;REVB=0.013249;RO=66;SAF=25;SAR=33;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954884;STB=0.553054;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0123786;OID=.;OPOS=78066018;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:66:66:58:58:0.467742:33:25:35:31:33:25:35:31 chr16 78142308 . G T 136.18 PASS AF=0.326531;AO=8;DP=40;FAO=16;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0180256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.057;QD=11.1167;RBI=0.018507;REFB=-0.0133345;REVB=-0.00419353;RO=26;SAF=6;SAR=2;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311262;STB=0.689405;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.030407;OID=.;OPOS=78142308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:49:26:31:8:16:0.326531:2:6:13:13:4:12:15:16 chr16 78148943 . C G 458.61 PASS AF=0.564103;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00857414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1089;QD=23.5185;RBI=0.0745071;REFB=0.0333242;REVB=-0.0740121;RO=34;SAF=20;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595219;STB=0.532695;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.0270759;OID=.;OPOS=78148943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:44:44:0.564103:24:20:18:16:24:20:18:16 chr16 78149000 . C T 333.03 PASS AF=0.548387;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0112013;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.288;QD=21.4861;RBI=0.0273157;REFB=-0.00993244;REVB=-0.0249135;RO=28;SAF=16;SAR=18;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00516447;STB=0.502855;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00838082;OID=.;OPOS=78149000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:28:28:34:34:0.548387:18:16:13:15:18:16:13:15 chr16 78312489 . G T 144.77 PASS AF=0.354167;AO=14;DP=45;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00626419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.525;QD=12.0638;RBI=0.00983125;REFB=-0.0134823;REVB=0.00757717;RO=31;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315998;STB=0.618324;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0336083;OID=.;OPOS=78312489;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:48:31:31:14:17:0.354167:6:8:9:22:9:8:9:22 chr16 78312497 . C A 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00977592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.458;QD=64.1539;RBI=0.0139907;REFB=0;REVB=0.0100086;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39156e-05;OID=.;OPOS=78312497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:31:18:0:0:31:18:0:0 chr16 78586531 . T C 1866.58 PASS AF=0.99187;AO=123;DP=124;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0408941;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7846;QD=60.7016;RBI=0.0419602;REFB=-0.0712234;REVB=0.00939866;RO=0;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00107665;OID=.;OPOS=78586531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:124:123:0:1:123:122:0.99187:63:60:0:0:63:59:0:1 chr16 78790846 . G A 337.59 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0268396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.278;QD=20.1543;RBI=0.0268876;REFB=-0.0109409;REVB=0.00160575;RO=32;SAF=10;SAR=25;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280112;STB=0.656016;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0139106;OID=.;OPOS=78790846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:25:10:19:13:25:10:19:13 chr16 78790883 . A G 206.41 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0128346;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.296;QD=12.5095;RBI=0.018104;REFB=-0.00574111;REVB=0.0127683;RO=41;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205963;STB=0.617559;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00987572;OID=.;OPOS=78790883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:13:12:12:29:13:12:12:29 chr16 79633805 . TGCC T 291.07 PASS AF=1;AO=19;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0900912;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=3;MLLD=267.151;QD=52.921;RBI=0.0962423;REFB=0;REVB=0.033855;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000589693;OID=.;OPOS=79633806;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:23:22:22:0:8:14:0:0:4:0:6:13:0:0 chr16 81050965 . A T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0068292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.318;QD=63.8713;RBI=0.0088961;REFB=0;REVB=-0.00570111;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56168e-06;OID=.;OPOS=81050965;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr16 81061827 . G A 1525.63 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3182;QD=59.8286;RBI=0.0188932;REFB=0;REVB=0.00566882;RO=0;SAF=44;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.30896e-05;OID=.;OPOS=81061827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:58:44:0:0:58:44:0:0 chr16 81062171 . C T 766.34 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0623688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.159;QD=63.8616;RBI=0.0641321;REFB=0;REVB=0.0149353;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.23244e-05;OID=.;OPOS=81062171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0 chr16 81077915 . T C 240.42 PASS AF=1;AO=16;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.429;QD=50.614;RBI=0.0876184;REFB=0;REVB=0.0178901;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104417;OID=.;OPOS=81077915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:16:19:1:3:13:0:0:3:16:0:0 chr16 81095363 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.193;QD=48.7373;RBI=0.0447445;REFB=0;REVB=0.0444655;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242951;OID=.;OPOS=81095363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr16 81142257 . T C 595.43 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6014;QD=61.0699;RBI=0.137169;REFB=0;REVB=0.017017;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014589;OID=.;OPOS=81142257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:17:19:0:0:18:21:0:0 chr16 81145807 . C G 1608.87 PASS AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0203873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1107;QD=59.0412;RBI=0.0238733;REFB=-0.012651;REVB=-0.0124215;RO=0;SAF=40;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85373e-08;STB=0.503649;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-3.77613e-07;OID=.;OPOS=81145807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:0:1:108:108:0.990826:68:40:0:0:68:40:0:1 chr16 81151122 . A C 902.6 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00467021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8379;QD=58.2324;RBI=0.0189214;REFB=0;REVB=-0.018336;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109025;OID=.;OPOS=81151122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:25:37:0:0:25:37:0:0 chr16 81157324 . G A 274.19 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0161299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8488;QD=24.9262;RBI=0.0173005;REFB=-0.0245138;REVB=0.00625579;RO=19;SAF=7;SAR=18;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815005;STB=0.545417;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.018586;OID=.;OPOS=81157324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:18:7:7:12:18:7:7:12 chr16 81173136 . T C 801.28 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00208159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9442;QD=57.2345;RBI=0.00494073;REFB=0;REVB=0.00448083;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16436e-05;OID=.;OPOS=81173136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:24:32:0:0:24:32:0:0 chr16 81174978 . A G 722.6 PASS AF=0.591304;AO=68;DP=116;FAO=68;FDP=115;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0100191;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.532;QD=25.134;RBI=0.010335;REFB=-0.0278461;REVB=0.00253591;RO=48;SAF=23;SAR=45;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162327;STB=0.592236;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.012875;OID=.;OPOS=81174978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:48:47:68:68:0.591304:45:23:26:22:45:23:26:21 chr16 81174992 . G T 722.48 PASS AF=0.560976;AO=69;DP=124;FAO=69;FDP=123;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0166865;FXX=0.00806387;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.548;QD=23.4952;RBI=0.023021;REFB=-0.00378022;REVB=0.0158596;RO=52;SAF=21;SAR=48;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256661;STB=0.641383;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00255582;OID=.;OPOS=81174992;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:52:54:69:69:0.560976:48:21:32:20:48:21:33:21 chr16 81174999 . A G 791.25 PASS AF=0.592;AO=72;DP=125;FAO=74;FDP=125;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=51;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0161167;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.626;QD=25.32;RBI=0.0163655;REFB=-0.00780892;REVB=0.00284276;RO=53;SAF=23;SAR=49;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230597;STB=0.635296;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00613878;OID=.;OPOS=81174999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:53:51:72:74:0.592:49:23:32:21:51:23:32:19 chr16 81181097 . G T 375.33 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0371176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.902;QD=18.309;RBI=0.03836;REFB=-0.0173519;REVB=-0.0096839;RO=43;SAF=17;SAR=22;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497464;STB=0.527763;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0234315;OID=.;OPOS=81181097;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:22:17:21:22:22:17:21:22 chr16 81183325 . T A 230.29 PASS AF=0.337209;AO=27;DP=87;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.00727418;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.114;QD=10.7109;RBI=0.0103323;REFB=-0.00499556;REVB=-0.00733778;RO=55;SAF=12;SAR=15;SRF=40;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31998;STB=0.655184;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.012868;OID=.;OPOS=81183325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:55:57:27:29:0.337209:15:12:40:15:15:14:41:16 chr16 81185416 . A G 591.72 PASS AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0744865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0814;QD=56.3546;RBI=0.0765695;REFB=-0.096248;REVB=0.0177383;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51999;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0032046;OID=.;OPOS=81185416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:42:0:2:40:40:0.952381:24:16:0:0:24:16:0:2 chr16 81187568 . C T 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0232127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.777;QD=13.4418;RBI=0.0467678;REFB=-0.0227215;REVB=0.0406005;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731962;STB=0.542776;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0277864;OID=.;OPOS=81187568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:2:8:11:2:2:8:11:2 chr16 81187571 . T A 73.19 PASS AF=0.434783;AO=8;DP=21;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0252442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.426;QD=12.7293;RBI=0.069644;REFB=-0.0186529;REVB=0.0649078;RO=13;SAF=8;SAR=0;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.72046;STB=0.542776;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0210172;OID=.;OPOS=81187571;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:21:23:13:13:8:10:0.434783:0:8:11:2:2:8:11:2 chr16 81187634 . GG CT 129.28 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0232032;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=231.134;QD=21.5459;RBI=0.0355373;REFB=-0.0231728;REVB=0.0269168;RO=10;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247621;STB=0.640814;STBP=0.142;TYPE=mnp;VARB=0.0170242;OID=.;OPOS=81187634;OREF=GG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:4:10:4:6:4:10:4:6 chr16 81187665 . C T 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0324608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.754;QD=18.2488;RBI=0.0403979;REFB=0.00365922;REVB=-0.0240475;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304683;STB=0.674727;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00358993;OID=.;OPOS=81187665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:4:9:4:8:4:9:4:8 chr16 81187709 . T A 154.09 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00332435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7805;QD=14.3338;RBI=0.0263113;REFB=-0.0172273;REVB=0.0261005;RO=25;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284533;STB=0.679772;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0215304;OID=.;OPOS=81187709;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:4:13:13:12:4:13:13:13 chr16 81190601 . T C 1029.83 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202462;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.51;QD=59.7;RBI=0.0294409;REFB=0;REVB=0.0293712;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69347e-05;OID=.;OPOS=81190601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr16 81190613 . A G 1117.24 PASS AF=1;AO=70;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161776;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1959;QD=60.3914;RBI=0.0507274;REFB=0;REVB=0.0480786;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000588045;OID=.;OPOS=81190613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:70:74:1:33:37:0:0:37:37:0:0 chr16 81193322 . G A 292.89 PASS AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00282435;FXX=0.0238067;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.227;QD=14.2875;RBI=0.040431;REFB=7.587e-05;REVB=-0.0403322;RO=48;SAF=17;SAR=16;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137577;STB=0.570538;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-2.53219e-05;OID=.;OPOS=81193322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:49:33:33:0.402439:16:17:31:17:16:17:31:18 chr16 81193358 . C G 652.88 PASS AF=0.556522;AO=63;DP=114;FAO=64;FDP=115;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0190907;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.329;QD=22.7089;RBI=0.041925;REFB=-0.0225778;REVB=0.0373263;RO=50;SAF=38;SAR=25;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526796;STB=0.536635;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0113795;OID=.;OPOS=81193358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:50:51:63:64:0.556522:25:38:27:23:25:39:27:24 chr16 81194382 . T C 565.69 PASS AF=0.54902;AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=0.00172999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.017;QD=22.1838;RBI=0.02216;REFB=-0.00694674;REVB=-0.0220923;RO=46;SAF=30;SAR=26;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171029;STB=0.593406;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0072543;OID=.;OPOS=81194382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:46:46:56:56:0.54902:26:30:34:12:26:30:34:12 chr16 81198306 . C A 283.44 PASS AF=0.476923;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0139426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.335;QD=17.4426;RBI=0.0286147;REFB=-0.0162589;REVB=-0.0249881;RO=33;SAF=20;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919343;STB=0.551388;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0189803;OID=.;OPOS=81198306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:33:34:30:31:0.476923:10:20:19:14:10:21:20:14 chr16 81199520 . T C 111.03 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0427494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1856;QD=9.44929;RBI=0.0600307;REFB=-0.0304528;REVB=-0.0421446;RO=33;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115902;STB=0.569525;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0709552;OID=.;OPOS=81199520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:8:6:11:22:8:6:11:22 chr16 81199538 . T C 115.17 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.00361706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6578;QD=10.7131;RBI=0.00965516;REFB=-0.00410506;REVB=-0.00895203;RO=29;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183495;STB=0.608248;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0149588;OID=.;OPOS=81199538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:8:6:8:21:8:6:8:21 chr16 81199544 . G A 103.47 PASS AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0130022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.796;QD=9.85443;RBI=0.0254121;REFB=-0.0188411;REVB=0.0218339;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251516;STB=0.631394;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0337685;OID=.;OPOS=81199544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:29:13:13:0.309524:7:6:7:21:7:6:8:21 chr16 81199554 . CA TG 106.86 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0373274;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=162.61;QD=12.2129;RBI=0.0374418;REFB=-0.0215707;REVB=-0.00292421;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156584;STB=0.591793;STBP=0.455;TYPE=mnp;VARB=0.0312269;OID=.;OPOS=81199554;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:7:6:7:15:7:6:7:15 chr16 81208175 . C T 346.09 PASS AF=0.607143;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00445476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.78;QD=24.7206;RBI=0.0238281;REFB=-0.0111213;REVB=0.023408;RO=22;SAF=20;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642892;STB=0.535311;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00827102;OID=.;OPOS=81208175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:22:22:34:34:0.607143:14:20:11:11:14:20:11:11 chr16 81208515 . G A 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0111653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.828;QD=22.5856;RBI=0.0396514;REFB=-0.0143701;REVB=0.0380469;RO=6;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184829;STB=0.604217;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0034811;OID=.;OPOS=81208515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:5:6:5:1:5:6:5:1 chr16 81209207 . T C 319.38 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.059;QD=53.2305;RBI=0.0169699;REFB=0;REVB=0.0168531;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86499e-05;OID=.;OPOS=81209207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:13:10:0:0:13:11:0:0 chr16 81211496 . C A 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0583101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.815;QD=17.8403;RBI=0.0617654;REFB=-0.0221057;REVB=0.0203692;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629108;STB=0.536031;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0342452;OID=.;OPOS=81211496;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:6:8:7:7:6:8:7:7 chr16 81211548 . G A 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0111847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8785;QD=16.6272;RBI=0.0154833;REFB=0.016787;REVB=0.0107068;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298971;STB=0.517215;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.0344608;OID=.;OPOS=81211548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:6:8:7:6:6:8 chr16 81213378 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.177;QD=60.6101;RBI=0.0299592;REFB=0;REVB=0.0271719;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26227e-05;OID=.;OPOS=81213378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0 chr16 81219213 . C T 177.57 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0695092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.402;QD=14.4955;RBI=0.069512;REFB=-0.0234819;REVB=-0.000623694;RO=30;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229186;STB=0.51326;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.032181;OID=.;OPOS=81219213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:11:8:12:18:11:8:12:18 chr16 81232275 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.943;QD=47.8223;RBI=0.0165139;REFB=0;REVB=0.00217588;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123213;OID=.;OPOS=81232275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chr16 81232564 . T G 2358.77 PASS AF=0.98125;AO=156;DP=161;FAO=157;FDP=160;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=105;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00403209;FXX=0.00621079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.167;QD=58.9692;RBI=0.0387061;REFB=0.0154953;REVB=-0.0384956;RO=2;SAF=52;SAR=104;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179424;STB=0.514017;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0108279;OID=.;OPOS=81232564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:161:160:2:3:156:157:0.98125:104:52:2:0:105:52:3:0 chr16 81241098 . C T 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.329;QD=58.2395;RBI=0.0348345;REFB=0;REVB=0.0274839;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106429;OID=.;OPOS=81241098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0 chr16 81241100 . G C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=334.792;QD=58.2396;RBI=0.0315141;REFB=0;REVB=0.0250629;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85103e-05;OID=.;OPOS=81241100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0 chr16 81242102 . G A 742.08 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737107;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.827;QD=56.0062;RBI=0.0590934;REFB=0;REVB=-0.0586319;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.41167e-05;OID=.;OPOS=81242102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:26:26:0:0:27:26:0:0 chr16 81242194 . T C 1043.92 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.402;QD=59.6528;RBI=0.0594093;REFB=0;REVB=0.0306029;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101742;OID=.;OPOS=81242194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:70:0:0:67:70:1:41:26:0:0:41:29:0:0 chr16 81248745 . A G 1494.91 PASS AF=0.945946;AO=103;DP=109;FAO=105;FDP=111;FR=.;FRO=6;FSAF=73;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0341261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.256;QD=53.8708;RBI=0.0376156;REFB=-0.0219131;REVB=0.0158224;RO=2;SAF=71;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00795961;STB=0.508867;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00113685;OID=.;OPOS=81248745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:109:111:2:6:103:105:0.945946:32:71:1:1:32:73:5:1 chr16 81249954 . T A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.312;QD=63.2863;RBI=0.0457621;REFB=0;REVB=0.0224452;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137594;OID=.;OPOS=81249954;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr16 81253745 . C G 1428.53 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210052;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.688;QD=62.7926;RBI=0.0382668;REFB=0;REVB=0.0319864;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11083e-05;OID=.;OPOS=81253745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:89:91:0:0:89:91:1:46:43:0:0:47:44:0:0 chr16 81253759 . A G 1322.4 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177839;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3483;QD=62.2304;RBI=0.0279858;REFB=0;REVB=0.0216087;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000598497;OID=.;OPOS=81253759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:44:40:0:0:45:40:0:0 chr16 81253917 . A G 545.39 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.595;QD=58.9606;RBI=0.0101362;REFB=0;REVB=0.00124845;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193972;OID=.;OPOS=81253917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:21:15:0:0:21:16:0:0 chr16 81279120 . T C 230.65 PASS AF=0.472727;AO=25;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00768318;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5578;QD=16.7743;RBI=0.0502166;REFB=-0.0106308;REVB=-0.0496254;RO=29;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247752;STB=0.645457;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0112896;OID=.;OPOS=81279120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:25:26:0.472727:9:16:11:18:9:17:11:18 chr16 81301694 . A T 384.15 PASS AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.00360842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.535;QD=17.6622;RBI=0.0194143;REFB=-0.00982402;REVB=-0.019076;RO=47;SAF=20;SAR=20;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13384;STB=0.574676;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0114554;OID=.;OPOS=81301694;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:20:20:30:17:20:20:30:17 chr16 81388181 . C G 401.87 PASS AF=0.422018;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0112939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2103;QD=14.7475;RBI=0.0221373;REFB=-0.0029714;REVB=0.0190397;RO=63;SAF=22;SAR=24;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144177;STB=0.580918;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00562874;OID=.;OPOS=81388181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:63:63:46:46:0.422018:24:22:39:24:24:22:39:24 chr16 81497952 . A G 834.41 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000518676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.116;QD=57.5452;RBI=0.0228758;REFB=0;REVB=0.02287;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33258e-05;OID=.;OPOS=81497952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0 chr16 81679151 . A G 1166.17 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.249;QD=59.8038;RBI=0.0387587;REFB=0;REVB=-0.0101697;RO=1;SAF=34;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137161;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28725e-05;OID=.;OPOS=81679151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:1:0:77:78:1:43:34:1:0:43:35:0:0 chr16 81730192 . G A 279.54 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00529329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.4819;QD=21.9246;RBI=0.0168606;REFB=-0.00611239;REVB=0.0160082;RO=23;SAF=16;SAR=12;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180183;STB=0.599929;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00588739;OID=.;OPOS=81730192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:12:16:8:15:12:16:8:15 chr16 81819768 . T C 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.669;QD=61.6833;RBI=0.026563;REFB=0;REVB=0.0116198;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127346;OID=.;OPOS=81819768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr16 81902079 . T C 982.17 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0207;QD=58.6372;RBI=0.0813964;REFB=0;REVB=0.0783125;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000645969;OID=.;OPOS=81902079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:33:32:0:0:34:33:0:0 chr16 81902283 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.282;QD=45.8067;RBI=0.0321912;REFB=0;REVB=0.0117018;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340197;OID=.;OPOS=81902283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0 chr16 81929488 . C T 733.04 PASS AF=0.489796;AO=72;DP=148;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.00576927;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.292;QD=19.9467;RBI=0.00582275;REFB=-0.0269881;REVB=-0.000787382;RO=75;SAF=35;SAR=37;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799141;STB=0.544064;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0266949;OID=.;OPOS=81929488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:75:75:72:72:0.489796:37:35:30:45:37:35:30:45 chr16 81941319 . C T 376.17 PASS AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00322543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.951;QD=50.1554;RBI=0.0448352;REFB=-0.147828;REVB=0.0447191;RO=1;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489106;STB=0.549963;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00441815;OID=.;OPOS=81941319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:30:30:1:2:28:28:0.933333:9:19:0:1:9:19:0:2 chr16 81971403 . T C 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00422219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.994;QD=19.3433;RBI=0.0189333;REFB=-0.0202026;REVB=0.0184565;RO=16;SAF=12;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29513;STB=0.690701;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0427067;OID=.;OPOS=81971403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:18:18:18:0.5:6:12:5:11:6:12:5:13 chr16 81995543 . G T 37.15 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.00376242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.874;QD=8.2546;RBI=0.00726228;REFB=-0.0140722;REVB=0.00621168;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470497;STB=0.777135;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0295009;OID=.;OPOS=81995543;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:11:1:3:3:11:1 chr16 82203705 . A C 148.07 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0277463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.842;QD=17.9483;RBI=0.0278976;REFB=-0.046381;REVB=-0.00290115;RO=17;SAF=4;SAR=12;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279432;STB=0.660802;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0353104;OID=.;OPOS=82203705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:12:4:9:8:12:4:9:8 chr16 82203711 . G T 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0521685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9899;QD=19.3431;RBI=0.0672171;REFB=0.0258147;REVB=0.0423861;RO=18;SAF=5;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215916;STB=0.623143;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.0138382;OID=.;OPOS=82203711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:13:5:9:9:13:5:9:9 chr16 82203742 . T C 150.12 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0598378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.235;QD=19.3696;RBI=0.0705466;REFB=-0.0276291;REVB=0.0373665;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811631;STB=0.54616;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0260617;OID=.;OPOS=82203742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:10:6:7:8:10:6:7:8 chr16 82203758 . C T 125.82 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0305323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3695;QD=18.6403;RBI=0.0346389;REFB=0.0425925;REVB=0.0163595;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967639;STB=0.555473;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.0241282;OID=.;OPOS=82203758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:10:4:5:8:10:4:5:8 chr16 82203768 . G T 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0256884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.32;QD=16.9315;RBI=0.027397;REFB=-0.00885031;REVB=0.00952367;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784743;STB=0.545377;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0059619;OID=.;OPOS=82203768;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:5:7:8:4:5:7 chr16 82673047 . C T 1324.3 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00175422;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.922;QD=62.3201;RBI=0.0342206;REFB=0;REVB=0.0341756;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69569e-05;OID=.;OPOS=82673047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:45:40:0:0:45:40:0:0 chr16 82903030 . A C 259.85 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.07612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.725;QD=47.2446;RBI=0.0927829;REFB=-0.128187;REVB=0.053051;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519981;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00663533;OID=.;OPOS=82903030;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:22:0:1:21:21:0.954545:12:9:0:0:12:9:0:1 chr16 83065664 . G A 2458.9 PASS AF=0.993827;AO=161;DP=162;FAO=161;FDP=162;FR=.;FRO=1;FSAF=89;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.7;QD=60.7136;RBI=0.049238;REFB=0.0524906;REVB=0.0435937;RO=1;SAF=89;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531658;STB=0.502793;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-1.36192e-05;OID=.;OPOS=83065664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:162:162:1:1:161:161:0.993827:72:89:1:0:72:89:1:0 chr16 83205106 . T A 156.43 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00337988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.856;QD=24.0668;RBI=0.00373004;REFB=-0.0198281;REVB=0.00157785;RO=10;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15703;STB=0.588123;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00848775;OID=.;OPOS=83205106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:6:10:4:6:6:10:4:6 chr16 83205185 . G T 270.93 PASS AF=0.766667;AO=23;DP=31;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0115821;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280;QD=36.1238;RBI=0.0181805;REFB=0.00235973;REVB=-0.0140138;RO=7;SAF=14;SAR=9;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198863;STB=0.608601;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.000297181;OID=.;OPOS=83205185;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:31:30:7:7:23:23:0.766667:9:14:1:6:9:14:1:6 chr16 83214480 . C A 108.86 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0100108;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.615;QD=12.8064;RBI=0.0258959;REFB=-0.00565354;REVB=0.0238826;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114735;STB=0.567464;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.00910347;OID=.;OPOS=83214480;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:21:21:13:13:0.382353:6:7:9:12:6:7:9:12 chr16 83817019 . A G 537.01 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00555499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.854;QD=58.0547;RBI=0.0263666;REFB=0;REVB=-0.0257748;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.57416e-06;OID=.;OPOS=83817019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:37:0:0:32:37:1:14:18:0:0:16:21:0:0 chr16 83941865 . G C 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0435038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.139;QD=16.9415;RBI=0.0450441;REFB=-0.0148377;REVB=0.0116785;RO=23;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124548;STB=0.562095;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0167703;OID=.;OPOS=83941865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:13:6:10:13:13:6:10:14 chr16 83983071 . C T 789.38 PASS AF=1;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103018;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.069;QD=64.4388;RBI=0.0709668;REFB=0;REVB=0.0702151;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157426;OID=.;OPOS=83983071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:48:49:1:22:26:0:0:22:27:0:0 chr16 83984776 . A C 735.05 PASS AF=0.947368;AO=54;DP=58;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=47;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0257685;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2469;QD=51.5821;RBI=0.0289425;REFB=-0.0111775;REVB=-0.0131777;RO=4;SAF=7;SAR=47;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207211;STB=0.588199;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00202761;OID=.;OPOS=83984776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:58:57:4:3:54:54:0.947368:47:7:4:0:47:7:3:0 chr16 83984844 . A C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.876;QD=58.7812;RBI=0.0227204;REFB=0;REVB=0.00602687;RO=0;SAF=19;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14385e-05;OID=.;OPOS=83984844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:46:19:0:0:46:19:0:0 chr16 83984850 . C G 972.87 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.073;QD=58.9616;RBI=0.0151807;REFB=0;REVB=0.0117196;RO=0;SAF=20;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16658e-05;OID=.;OPOS=83984850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:46:20:0:0:46:20:0:0 chr16 84035446 . C G 640.53 PASS AF=0.516129;AO=64;DP=124;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.00768127;FXX=0.00799936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.191;QD=20.6622;RBI=0.0128479;REFB=-0.0105823;REVB=0.0102989;RO=59;SAF=38;SAR=26;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148897;STB=0.578069;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00987563;OID=.;OPOS=84035446;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:59:60:64:64:0.516129:26:38:25:34:26:38:26:34 chr16 84067004 . C T 56.85 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.04178;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.322;QD=10.3368;RBI=0.0437963;REFB=-0.0074291;REVB=-0.0131358;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343095;STB=0.706044;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0386436;OID=.;OPOS=84067004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:23:22:14:14:8:8:0.363636:3:5:4:10:3:5:4:10 chr16 84070500 . C G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.358;QD=59.8393;RBI=0.0744043;REFB=0;REVB=-0.0589345;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82948e-05;OID=.;OPOS=84070500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr16 84073559 . T C 356.48 PASS AF=0.528571;AO=34;DP=68;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0214028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.196;QD=20.3702;RBI=0.0248228;REFB=-0.0205751;REVB=-0.0125734;RO=33;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146722;STB=0.553459;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0223556;OID=.;OPOS=84073559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:33:33:34:37:0.528571:21:13:18:15:21:16:18:15 chr16 84115483 . G A 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.25;QD=62.1622;RBI=0.0203896;REFB=0;REVB=0.0177247;RO=0;SAF=53;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22889e-05;OID=.;OPOS=84115483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:32:53:0:0:32:53:0:0 chr16 84203612 . A G 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0599345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.7947;QD=14.7985;RBI=0.0685334;REFB=-0.00569925;REVB=-0.0332367;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323019;STB=0.691913;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.000546624;OID=.;OPOS=84203612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:2:9:7:6:2:9:7:6 chr16 84203729 . A AC 69.83 PASS AF=0.541667;AO=3;DP=25;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.173829;FXX=0.039984;HRUN=0;LEN=1;MLLD=14.4217;QD=11.6388;RBI=0.188464;REFB=-0.114344;REVB=0.0728162;RO=20;SAF=3;SAR=0;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500593;STB=0.559915;STBP=0.751;TYPE=ins;VARB=0.141141;OID=.;OPOS=84203730;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.541667:3:25:13:24:11:11:2:10:1:64:20:3:0:16:4 chr16 84203730 . G C 51.97 PASS AF=0.32;AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.0374805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5436;QD=8.31505;RBI=0.0549946;REFB=-0.0448578;REVB=0.0402445;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.497764;STB=0.758615;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0449923;OID=.;OPOS=84203730;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:24:25:17:17:7:8:0.32:3:4:16:1:3:5:16:1 chr16 84203939 . C T 102.51 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00180227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.417;QD=17.8275;RBI=0.0173866;REFB=-0.0232579;REVB=0.0172929;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301131;STB=0.533279;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0251517;OID=.;OPOS=84203939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:10:11:12:12:0.521739:8:4:3:7:8:4:3:8 chr16 84208335 . G T 278.58 PASS AF=0.316239;AO=37;DP=117;FAO=37;FDP=117;FR=.;FRO=80;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.0199529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1244;QD=9.52425;RBI=0.0209606;REFB=0.0269308;REVB=0.0064209;RO=80;SAF=19;SAR=18;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451577;STB=0.526302;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0565476;OID=.;OPOS=84208335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:80:80:37:37:0.316239:18:19:38:42:18:19:38:42 chr16 84209634 . C G 181.12 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0341408;FXX=0.0377287;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.072;QD=14.2057;RBI=0.0349349;REFB=-0.00437802;REVB=0.00740667;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978491;STB=0.505613;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00516385;OID=.;OPOS=84209634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:30:30:21:21:0.411765:11:10:14:16:11:10:14:16 chr16 84209738 . T C 102.52 PASS AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0105002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.854;QD=17.8287;RBI=0.0113557;REFB=0.0107858;REVB=-0.00432405;RO=11;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198673;STB=0.615179;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.0121193;OID=.;OPOS=84209738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:9:3:5:6:9:3:5:6 chr16 84212571 . C A 175.11 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.024486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.705;QD=20.012;RBI=0.0246112;REFB=-0.0213944;REVB=0.00247887;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133395;STB=0.575083;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.027625;OID=.;OPOS=84212571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:10:8:5:12:10:8:5:12 chr16 84213114 . C T 99.99 PASS AF=0.259259;AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0121594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.645;QD=7.40661;RBI=0.0152074;REFB=-0.00369715;REVB=-0.0091331;RO=39;SAF=4;SAR=10;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253729;STB=0.66642;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0119729;OID=.;OPOS=84213114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:39:40:14:14:0.259259:10:4:19:20:10:4:20:20 chr16 84213434 . A T 55.19 PASS AF=0.307692;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00313727;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.512;QD=8.49101;RBI=0.0128824;REFB=-0.0109432;REVB=-0.0124945;RO=17;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416015;STB=0.755988;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0459838;OID=.;OPOS=84213434;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:27:26:17:18:8:8:0.307692:7:1:7:10:7:1:7:11 chr16 84215390 . T C 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0176205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.584;QD=15.2625;RBI=0.0324785;REFB=-0.0128379;REVB=0.0272832;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127637;STB=0.55547;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0155775;OID=.;OPOS=84215390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:6:7:6:9:6:7:7:9 chr16 84217062 . C T 564.05 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9713;QD=59.3738;RBI=0.0759562;REFB=0;REVB=0.0455952;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156888;OID=.;OPOS=84217062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:24:13:0:0:24:14:0:0 chr16 84218565 . T C 220.79 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00579699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.698;QD=24.5318;RBI=0.0105934;REFB=-0.0158781;REVB=0.00886653;RO=14;SAF=9;SAR=12;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103053;STB=0.543958;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00945925;OID=.;OPOS=84218565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:15:21:21:0.583333:12:9:8:6:12:9:8:7 chr16 84225184 . C T 318.81 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0137594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.833;QD=20.9054;RBI=0.0211479;REFB=-0.0331031;REVB=-0.0160597;RO=27;SAF=18;SAR=15;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200723;STB=0.60171;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0212231;OID=.;OPOS=84225184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:28:33:33:0.540984:15:18:8:19:15:18:9:19 chr16 84228199 . G T 193.2 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0011641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.326;QD=16.4427;RBI=0.0192512;REFB=-0.0162394;REVB=0.0192159;RO=27;SAF=15;SAR=5;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360537;STB=0.707648;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0401961;OID=.;OPOS=84228199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:5:15:11:16:5:15:11:16 chr16 84228237 . A C 358.58 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00598803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.82;QD=55.1668;RBI=0.0182411;REFB=0;REVB=0.0172302;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74398e-05;OID=.;OPOS=84228237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:15:11:0:0 chr16 84228279 . G A 76.4 PASS AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.228;QD=25.4668;RBI=0.0278425;REFB=0.0584175;REVB=0.0278425;RO=3;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00438109;OID=.;OPOS=84228279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:9:0:0:3:9:0:0:3 chr16 84228305 . C G 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.803;QD=13.2053;RBI=0.018206;REFB=-0.0224411;REVB=-0.018206;RO=6;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216071;OID=.;OPOS=84228305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:6:0:0:6:6:0:0:6 chr16 84228770 . G C 136.28 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.00837685;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.597;QD=17.5849;RBI=0.0251337;REFB=-0.00433865;REVB=0.0236967;RO=16;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965766;STB=0.554844;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.00576819;OID=.;OPOS=84228770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:11:4:3:13:11:4:3:13 chr16 84229436 . G A 89.78 PASS AF=0.714286;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00303698;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=308.211;QD=25.6505;RBI=0.0155027;REFB=-0.023288;REVB=0.0152023;RO=4;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175933;STB=0.5998;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00868595;OID=.;OPOS=84229436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:15:14:4:4:10:10:0.714286:6:4:3:1:6:4:3:1 chr16 84229559 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.912;QD=54.5175;RBI=0.0342874;REFB=0;REVB=0.0303249;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170348;OID=.;OPOS=84229559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr16 84229580 . C T 164.05 PASS AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0158678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.999;QD=29.8273;RBI=0.0161058;REFB=-0.0158953;REVB=0.00275879;RO=6;SAF=9;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524228;STB=0.529034;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00846087;OID=.;OPOS=84229580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:7:9:4:2:7:9:4:2 chr16 84230376 . T C 47.32 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.132022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.0568;QD=11.8306;RBI=0.13491;REFB=-0.0422968;REVB=-0.0277639;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267754;STB=0.66611;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0383895;OID=.;OPOS=84230376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:6:1:3:6:6:1:3:6 chr16 84230500 . A C 449.07 PASS AF=0.408;AO=51;DP=125;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.0235352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.798;QD=14.3704;RBI=0.0277081;REFB=-0.021493;REVB=-0.0146231;RO=74;SAF=22;SAR=29;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867041;STB=0.548877;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0274599;OID=.;OPOS=84230500;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:74:74:51:51:0.408:29:22:38:36:29:22:38:36 chr16 84256605 . A G 477.31 PASS AF=0.49505;AO=49;DP=100;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00587651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.726;QD=18.9032;RBI=0.0103468;REFB=-0.0056563;REVB=0.00851599;RO=50;SAF=16;SAR=33;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167576;STB=0.580126;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00664279;OID=.;OPOS=84256605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:50:51:49:50:0.49505:33:16:25:25:33:17:25:26 chr16 84270381 . G A 674.9 PASS AF=0.540984;AO=66;DP=122;FAO=66;FDP=122;FR=.;FRO=56;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0353975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4633;QD=22.1279;RBI=0.0648564;REFB=0.0194446;REVB=0.0543449;RO=56;SAF=42;SAR=24;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1485;STB=0.581513;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.0173975;OID=.;OPOS=84270381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:56:56:66:66:0.540984:24:42:26:30:24:42:26:30 chr16 84270476 . G A 391.25 PASS AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.026549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.174;QD=22.0423;RBI=0.0266596;REFB=-0.0284828;REVB=0.00242626;RO=31;SAF=18;SAR=21;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605364;STB=0.539454;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0205124;OID=.;OPOS=84270476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:31:32:39:39:0.549296:21:18:12:19:21:18:12:20 chr16 84360533 . A G 195.77 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0901998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9759;QD=17.7973;RBI=0.0914742;REFB=0.00465;REVB=0.0152165;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22611;STB=0.628902;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.00231432;OID=.;OPOS=84360533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:13:7:14:10:13:7:14:10 chr16 84402275 . G C 536.95 PASS AF=0.789474;AO=21;DP=57;FAO=45;FDP=57;FR=.;FRO=12;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0173897;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=165.34;QD=37.6807;RBI=0.0240086;REFB=-0.0352556;REVB=-0.0165533;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.578915;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00457934;OID=.;OPOS=84402275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:57:57:0:12:21:45:0.789474:11:10:0:0:13:32:12:0 chr16 84438505 . C T 332.26 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0123004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3256;QD=24.1643;RBI=0.0669643;REFB=0.01489;REVB=-0.0658249;RO=22;SAF=12;SAR=21;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10363;STB=0.557058;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.0149197;OID=.;OPOS=84438505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:21:12:11:11:21:12:11:11 chr16 84438512 . G A 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8033;QD=57.7122;RBI=0.0238713;REFB=0;REVB=-0.0229489;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154184;OID=.;OPOS=84438512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:36:23:0:0:36:23:0:0 chr16 84444349 . A C 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00301198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.18;QD=60.5473;RBI=0.0211541;REFB=0;REVB=0.0209386;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08443e-05;OID=.;OPOS=84444349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0 chr16 84476200 . A T 134.31 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.026794;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.944;QD=15.3495;RBI=0.0269473;REFB=-0.0234449;REVB=0.00287058;RO=21;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104278;STB=0.550956;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0267664;OID=.;OPOS=84476200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:21:20:15:15:0.428571:11:4:4:17:11:4:4:16 chr16 84485573 . C A 923.55 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0231396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.941;QD=56.8336;RBI=0.0683107;REFB=-0.151901;REVB=0.0642722;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.509088;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00177338;OID=.;OPOS=84485573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:27:37:0:0:27:37:0:1 chr16 84485600 . G A 344.97 PASS AF=0.555556;AO=29;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00282339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.507;QD=21.9029;RBI=0.0728289;REFB=0.00317414;REVB=0.0727741;RO=18;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267157;STB=0.534948;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.00115568;OID=.;OPOS=84485600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:18:28:29:35:0.555556:14:15:10:8:16:19:13:15 chr16 84493144 . C G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00944905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.294;QD=58.2396;RBI=0.0438661;REFB=0;REVB=0.0428363;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100109;OID=.;OPOS=84493144;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0 chr16 84494020 . G T 734.23 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0040901;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.27;QD=61.1854;RBI=0.013348;REFB=0.0320216;REVB=0.0127059;RO=1;SAF=13;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347981;STB=0.518511;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.000166741;OID=.;OPOS=84494020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:34:13:1:0:34:13:1:0 chr16 84494275 . C T 766.74 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.035;QD=63.8946;RBI=0.0406956;REFB=0;REVB=0.038761;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146972;OID=.;OPOS=84494275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:28:19:0:0:29:19:0:0 chr16 84516309 . G A 424.5 PASS AF=0.478723;AO=36;DP=85;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0496562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7267;QD=18.0636;RBI=0.0531559;REFB=0.0164196;REVB=0.0189688;RO=47;SAF=17;SAR=19;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112453;STB=0.618707;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00291083;OID=.;OPOS=84516309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:94:47:49:36:45:0.478723:19:17:17:30:19:26:17:32 chr16 84520325 . T C 175.67 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00301661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3085;QD=46.8442;RBI=0.0433621;REFB=0;REVB=-0.0432571;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000260498;OID=.;OPOS=84520325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr16 84520396 . A G 582.14 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318745;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.544;QD=61.278;RBI=0.0335879;REFB=0;REVB=-0.0105907;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000891852;OID=.;OPOS=84520396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr16 84520537 . T C 1175.17 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457481;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.454;QD=61.048;RBI=0.00598679;REFB=0;REVB=0.0038617;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25981e-05;OID=.;OPOS=84520537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:50:27:0:0:50:27:0:0 chr16 84522897 . G C 751.67 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178933;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9158;QD=63.9718;RBI=0.0374146;REFB=0;REVB=-0.0373718;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.345e-05;OID=.;OPOS=84522897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:13:34:0:0:13:34:0:0 chr16 84531071 . C T 167.32 PASS AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0100164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.776;QD=11.7419;RBI=0.0103008;REFB=-0.0104833;REVB=-0.00240382;RO=36;SAF=14;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245471;STB=0.642719;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0156323;OID=.;OPOS=84531071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:7:14:16:20:7:14:16:20 chr16 84600347 . T C 251.92 PASS AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00947343;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.079;QD=27.235;RBI=0.0296643;REFB=-0.0026096;REVB=0.0281109;RO=14;SAF=16;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151447;STB=0.508373;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00162156;OID=.;OPOS=84600347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:7:16:10:4:7:16:10:4 chr16 84691044 . C T 200.47 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0470949;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4843;QD=19.5585;RBI=0.053306;REFB=-0.00814367;REVB=0.024972;RO=21;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155711;STB=0.588147;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0112316;OID=.;OPOS=84691044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:21:21:20:20:0.487805:8:12:9:12:8:12:9:12 chr16 84778690 . C T 366.32 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.048697;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.693;QD=52.3316;RBI=0.049861;REFB=-0.149156;REVB=0.0107108;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.518505;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0012203;OID=.;OPOS=84778690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:28:28:0:1:27:27:0.964286:14:13:0:0:14:13:1:0 chr16 84778694 . T C 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.272;QD=54.5166;RBI=0.0382515;REFB=0;REVB=-0.00184784;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210201;OID=.;OPOS=84778694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr16 84778697 . G C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5671;QD=54.5176;RBI=0.0491308;REFB=0;REVB=-0.0360162;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.30822e-05;OID=.;OPOS=84778697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr16 84879464 . A G 436.41 PASS AF=0.403226;AO=50;DP=124;FAO=50;FDP=124;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=-0.0350941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.12;QD=14.0776;RBI=0.0354336;REFB=-0.0164641;REVB=-0.0048933;RO=74;SAF=22;SAR=28;SRF=46;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190249;STB=0.607101;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0161549;OID=.;OPOS=84879464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:74:74:50:50:0.403226:28:22:46:28:28:22:46:28 chr16 84883102 . C T 253.88 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00619211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.623;QD=21.6068;RBI=0.0182277;REFB=-0.0025207;REVB=0.0171437;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721459;STB=0.551928;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00296693;OID=.;OPOS=84883102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:23:24:24:0.510638:14:10:11:11:14:10:12:11 chr16 84906098 . C G 2621.77 PASS AF=1;AO=169;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00280707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.992;QD=62.0537;RBI=0.00294019;REFB=0;REVB=0.000874684;RO=0;SAF=81;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92609e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89425e-06;OID=.;OPOS=84906098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:169:169:0:0:169:169:1:88:81:0:0:88:81:0:0 chr16 84922859 . C T 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.061;QD=57.8846;RBI=0.0569885;REFB=0;REVB=0.0497496;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465055;OID=.;OPOS=84922859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:35:25:0:0:35:25:0:0 chr16 84942638 . T G 206.1 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.00156167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.117;QD=16.8248;RBI=0.0146285;REFB=-0.00971428;REVB=0.0145449;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194149;STB=0.610137;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00819387;OID=.;OPOS=84942638;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:10:11:20:8:10:11:20:8 chr16 85009463 . T C 185.57 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.00921336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.739;QD=13.7459;RBI=0.0414758;REFB=0.0130881;REVB=-0.0404396;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709926;STB=0.5406;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.0180375;OID=.;OPOS=85009463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:9:13:21:11:9:13:21:11 chr16 85009970 . A G 348.63 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.000468436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.468;QD=17.4316;RBI=0.00935928;REFB=0.00557743;REVB=-0.00934755;RO=43;SAF=24;SAR=13;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921501;STB=0.551696;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=-0.00475144;OID=.;OPOS=85009970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:13:24:24:19:13:24:24:19 chr16 85100976 . G A 565.7 PASS AF=0.537736;AO=57;DP=106;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00489033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.21;QD=21.3471;RBI=0.0696217;REFB=-0.0119533;REVB=0.0694498;RO=49;SAF=27;SAR=30;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650148;STB=0.535702;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00993869;OID=.;OPOS=85100976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:49:49:57:57:0.537736:30:27:27:22:30:27:27:22 chr16 85682289 . ACCCCCCCCG ACCCCCCCGC,ACCCCCCCG 34.01 PASS AF=0.025,0.325;AO=3,8;DP=42;FAO=1,13;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=1,8;FSAR=0,5;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0861113,-0.149017;FXX=0.0476077;HRUN=8,8;LEN=2,1;MLLD=147.914,7.03742;QD=3.40104;RBI=0.0890299,0.297261;REFB=-0.00782204,-0.135045;REVB=0.0226091,0.257212;RO=22;SAF=3,5;SAR=0,3;SRF=5;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.710835,0.441439;STB=0.994851,0.740421;STBP=0.111,0.047;TYPE=mnp,del;VARB=0.0181442,0.17911;OID=.,.;OPOS=85682297,85682290;OREF=CG,C;OALT=GC,-;OMAPALT=ACCCCCCCGC,ACCCCCCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.025,0.325:3,8:42:1,13:40:26:1,8:0,5:6:20:27:22:3,5:0,3:5:17 chr16 85706047 . A C 476.69 PASS AF=0.576923;AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0739577;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.4264;QD=24.4455;RBI=0.0742148;REFB=-0.00820074;REVB=-0.00617132;RO=33;SAF=20;SAR=25;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636841;STB=0.534868;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00729934;OID=.;OPOS=85706047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:33:33:45:45:0.576923:25:20:12:21:25:20:12:21 chr16 85706285 . C A 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00512969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.173;QD=16.1562;RBI=0.00677985;REFB=-0.0291151;REVB=-0.00443314;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149431;STB=0.58432;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0452131;OID=.;OPOS=85706285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:11:16:14:18:11:16:14:18 chr16 85711860 . C T 389.62 PASS AF=0.389831;AO=45;DP=117;FAO=46;FDP=118;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=-0.0073318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.603;QD=13.2073;RBI=0.00827496;REFB=-0.0177248;REVB=-0.00383661;RO=71;SAF=13;SAR=32;SRF=23;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449037;STB=0.520539;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0259268;OID=.;OPOS=85711860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:71:72:45:46:0.389831:32:13:23:48:32:14:24:48 chr16 85812955 . T A 31.84 PASS AF=0.212121;AO=6;DP=31;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0129647;FXX=0;HRUN=16;LEN=1;MLLD=57.2399;QD=3.8595;RBI=0.0204137;REFB=-0.00097351;REVB=-0.0157682;RO=25;SAF=6;SAR=0;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.702329;STB=0.814547;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00439743;OID=.;OPOS=85812955;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:31:33:25:26:6:7:0.212121:0:6:12:13:1:6:13:13 chr16 85813019 . CT CTA,TA 36.23 PASS AF=0.169811,0;AO=9,2;DP=57;FAO=9,0;FDP=53;FR=.;FRO=44;FSAF=8,0;FSAR=1,0;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0410528,-0.0627623;FXX=0.0701631;HRUN=0,1;LEN=1,2;MLLD=123.288,122.795;QD=2.73455;RBI=0.0428018,0.0645159;REFB=-0.000809344,0.00160541;REVB=-0.0121103,-0.0149396;RO=44;SAF=7,2;SAR=2,0;SRF=17;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.462328,0.456198;STB=0.898751,0.5;STBP=0.018,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.14935,0;OID=.,.;OPOS=85813021,85813019;OREF=-,CT;OALT=A,TA;OMAPALT=CTA,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:57:53:44:44:9,2:9,0:0.169811,0:2,0:7,2:17:27:1,0:8,0:17:27 chr16 85813231 . A C 249.91 PASS AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0224572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3752;QD=16.6607;RBI=0.0238353;REFB=0.0291166;REVB=0.00798725;RO=32;SAF=6;SAR=22;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315911;STB=0.679635;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0329725;OID=.;OPOS=85813231;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:22:6:16:16:22:6:16:16 chr16 85814899 . T TAGTC 482.19 PASS AF=0.944444;AO=32;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00725368;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=4;MLLD=254.55;QD=53.5761;RBI=0.0145568;REFB=0.00612794;REVB=0.0126209;RO=2;SAF=16;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054844;STB=0.527761;STBP=0.222;TYPE=ins;VARB=-0.000128082;OID=.;OPOS=85814900;OREF=-;OALT=AGTC;OMAPALT=TAGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.944444:32:36:34:36:2:17:17:2:0:9:2:16:16:2:0 chr16 85838653 . T C 1472.56 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.125;QD=63.3358;RBI=0.0424886;REFB=0;REVB=0.0410329;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131079;OID=.;OPOS=85838653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0 chr16 85839211 . G C 404.37 PASS AF=0.438776;AO=35;DP=99;FAO=43;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=42;FWDB=-0.00245718;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.423;QD=16.5048;RBI=0.00246292;REFB=-0.0470392;REVB=-0.000168125;RO=49;SAF=17;SAR=18;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230984;STB=0.597066;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.036805;OID=.;OPOS=85839211;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:49:55:35:43:0.438776:18:17:13:36:26:17:13:42 chr16 85948098 . G A 473.38 PASS AF=0.56962;AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.00449795;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.475;QD=23.9688;RBI=0.0375603;REFB=-0.0155894;REVB=0.03729;RO=31;SAF=15;SAR=30;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260658;STB=0.649505;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0054989;OID=.;OPOS=85948098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:31:34:45:45:0.56962:30:15:21:10:30:15:23:11 chr16 85954801 . G A 1038.05 PASS AF=0.526596;AO=99;DP=192;FAO=99;FDP=188;FR=.;FRO=89;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=0.0216462;FXX=0.0208322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.814;QD=22.0861;RBI=0.0249476;REFB=-0.0119706;REVB=0.0124027;RO=82;SAF=47;SAR=52;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501975;STB=0.506683;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0108614;OID=.;OPOS=85954801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:188:82:89:99:99:0.526596:52:47:34:48:52:47:41:48 chr16 86069722 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.103;QD=53.9111;RBI=0.0402496;REFB=0;REVB=-0.00945107;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00057978;OID=.;OPOS=86069722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr16 86069738 . C G 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0374534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.57;QD=8.69139;RBI=0.0375124;REFB=-0.00426707;REVB=0.00210419;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292508;STB=0.679182;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00534535;OID=.;OPOS=86069738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:5:3:11:6:5:3:11:6 chr16 86069788 . GT TG 83.9 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00942876;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=117.151;QD=10.1695;RBI=0.0242454;REFB=-0.0154112;REVB=-0.0223369;RO=22;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220022;STB=0.633889;STBP=0.313;TYPE=mnp;VARB=0.048756;OID=.;OPOS=86069788;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:8:3:10:12:8:3:10:12 chr16 86069827 . A G 93.81 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.014509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.273;QD=10.1418;RBI=0.0146449;REFB=-0.00453391;REVB=0.00199111;RO=25;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160057;STB=0.596253;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00630272;OID=.;OPOS=86069827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:5:7:11:14:5:7:11:14 chr16 86547496 . C T 1150.52 PASS AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.02596;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5599;QD=58.2541;RBI=0.0408013;REFB=0.0679781;REVB=0.0314775;RO=2;SAF=48;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628164;STB=0.50332;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00247572;OID=.;OPOS=86547496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:29:48:1:1:29:48:1:1 chr16 86564671 . G T 285.83 PASS AF=0.530612;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0012872;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7596;QD=23.333;RBI=0.00753943;REFB=0.00676307;REVB=-0.00742874;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059747;STB=0.545419;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00659029;OID=.;OPOS=86564671;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:22:23:26:26:0.530612:10:16:12:10:10:16:12:11 chr16 86565826 . C G 508.71 PASS AF=0.551724;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.0379895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.6592;QD=23.3889;RBI=0.0428223;REFB=0.0207442;REVB=-0.0197622;RO=36;SAF=30;SAR=18;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589472;STB=0.532697;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.0114625;OID=.;OPOS=86565826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:36:39:48:48:0.551724:18:30:25:11:18:30:27:12 chr16 86565882 . G C 642.73 PASS AF=0.581633;AO=57;DP=99;FAO=57;FDP=98;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.00482429;FXX=0.0101;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.81;QD=26.2337;RBI=0.0160054;REFB=-0.0179323;REVB=-0.015261;RO=40;SAF=38;SAR=19;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00710314;STB=0.503815;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0105056;OID=.;OPOS=86565882;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:40:41:57:57:0.581633:19:38:27:13:19:38:27:14 chr16 86588993 . T C 673.87 PASS AF=0.59596;AO=59;DP=99;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0203757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0479;QD=27.227;RBI=0.0247844;REFB=-0.0139671;REVB=-0.0141101;RO=40;SAF=29;SAR=30;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248124;STB=0.513518;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.00922539;OID=.;OPOS=86588993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:40:40:59:59:0.59596:30:29:21:19:30:29:21:19 chr16 86614217 . G C 466.09 PASS AF=0.576923;AO=44;DP=77;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00335356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.101;QD=23.9019;RBI=0.0212145;REFB=-0.00241891;REVB=-0.0209478;RO=33;SAF=16;SAR=28;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253495;STB=0.517531;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00182879;OID=.;OPOS=86614217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:33:33:44:45:0.576923:28:16:13:20:29:16:13:20 chr16 86614222 . A C 489.28 PASS AF=0.575;AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0609581;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9708;QD=24.4642;RBI=0.0611994;REFB=0.0521986;REVB=-0.00542993;RO=34;SAF=16;SAR=30;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291839;STB=0.516007;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.0406569;OID=.;OPOS=86614222;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:0.575:30:16:13:21:30:16:13:21 chr16 86614599 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.000809112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.655;QD=14.9785;RBI=0.00433447;REFB=-0.0139037;REVB=-0.00425829;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150146;STB=0.666296;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0375536;OID=.;OPOS=86614599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:9:11:10:10:0.47619:8:2:3:6:8:2:5:6 chr16 87350773 . C A 984.86 PASS AF=0.8875;AO=71;DP=81;FAO=71;FDP=80;FR=.;FRO=9;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0732567;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.038;QD=49.2431;RBI=0.0866377;REFB=-0.168784;REVB=0.0462552;RO=5;SAF=27;SAR=44;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05447;STB=0.558967;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00564344;OID=.;OPOS=87350773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:81:80:5:9:71:71:0.8875:44:27:4:1:44:27:8:1 chr16 87417621 . G A 420.45 PASS AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00521907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.525;QD=16.4883;RBI=0.00649257;REFB=0.00471707;REVB=0.00386196;RO=53;SAF=24;SAR=22;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00631348;STB=0.507689;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.00559095;OID=.;OPOS=87417621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:56:46:46:0.45098:22:24:28:25:22:24:30:26 chr16 87436720 . G T 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.322;QD=61.3352;RBI=0.0761121;REFB=0;REVB=-0.0668407;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248803;OID=.;OPOS=87436720;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr16 87436764 . A G 786.89 PASS AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0406513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.367;QD=55.2202;RBI=0.0406923;REFB=-0.101612;REVB=-0.0018265;RO=1;SAF=25;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184819;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000130444;OID=.;OPOS=87436764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:57:1:1:55:56:0.982456:30:25:1:0:30:26:1:0 chr16 87446368 . C T 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0128767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.267;QD=18.6372;RBI=0.0137422;REFB=-0.0012124;REVB=-0.00479981;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253096;STB=0.630978;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00127201;OID=.;OPOS=87446368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:5:11:6:9:5:11:7:9 chr16 87493737 . T C 310.37 PASS AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0160236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.791;QD=21.4047;RBI=0.0369346;REFB=0.00274232;REVB=0.0332778;RO=26;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199308;STB=0.61021;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00130187;OID=.;OPOS=87493737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:19:13:17:9:19:13:17:9 chr16 87678144 . T C 211.1 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013456;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.056;QD=49.6701;RBI=0.0188261;REFB=0;REVB=-0.0131665;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190431;OID=.;OPOS=87678144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr16 87678165 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0492109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.738;QD=11.0195;RBI=0.0710217;REFB=0.00809973;REVB=0.0512091;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12327;STB=0.576643;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.0306362;OID=.;OPOS=87678165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:6:2:1:5:6:2 chr16 87738853 . T C 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0825206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.435;QD=14.6497;RBI=0.0828515;REFB=-0.0287079;REVB=0.0073975;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971452;STB=0.556441;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0218123;OID=.;OPOS=87738853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:10:9:8:6:10:9 chr16 87866138 . G C 249.71 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0261046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5797;QD=20.3844;RBI=0.0545539;REFB=-0.00722668;REVB=-0.0479028;RO=25;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166181;STB=0.59297;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0116369;OID=.;OPOS=87866138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:13:11:7:18:13:11:7:18 chr16 88052161 . C A 1589.83 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.492;QD=59.9936;RBI=0.0211858;REFB=0;REVB=0.016998;RO=0;SAF=60;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78268e-05;OID=.;OPOS=88052161;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:46:60:0:0:46:60:0:0 chr16 88105053 . T A 812.95 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.257;QD=57.0493;RBI=0.0303302;REFB=0;REVB=0.00817862;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75542e-05;OID=.;OPOS=88105053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:28:27:0:0:29:28:0:0 chr16 88123598 . C G 688.37 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0515709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1738;QD=59.8578;RBI=0.0521268;REFB=-0.108179;REVB=0.00759285;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.50943;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00240107;OID=.;OPOS=88123598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:46:46:0:1:45:45:0.978261:19:26:0:0:19:26:1:0 chr16 88123697 . C A 563.67 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00730875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3909;QD=57.8118;RBI=0.0825889;REFB=0.0141487;REVB=0.0822649;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253186;STB=0.513506;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000773416;OID=.;OPOS=88123697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:20:18:1:0:20:18:1:0 chr16 88134285 . A G 690.04 PASS AF=0.978261;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0138154;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.665;QD=60.0039;RBI=0.0870043;REFB=-0.0660905;REVB=-0.0859005;RO=1;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164792;STB=0.508768;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000296473;OID=.;OPOS=88134285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:46:1:1:43:45:0.978261:28:15:0:1:28:17:0:1 chr16 88494824 . G A 693.79 PASS AF=0.613208;AO=65;DP=106;FAO=65;FDP=106;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.051989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3326;QD=26.1807;RBI=0.0787248;REFB=-0.0173458;REVB=0.0591163;RO=41;SAF=29;SAR=36;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761712;STB=0.541321;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0122623;OID=.;OPOS=88494824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:41:41:65:65:0.613208:36:29:14:27:36:29:14:27 chr16 88494947 . T C 831.79 PASS AF=1;AO=47;DP=60;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204929;FXX=0.0333278;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9736;QD=57.3646;RBI=0.150549;REFB=0;REVB=-0.149148;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194673;OID=.;OPOS=88494947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:58:0:0:47:58:1:25:22:0:0:29:29:0:0 chr16 88494976 . A C 1294.64 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.461;QD=60.9241;RBI=0.0407072;REFB=0;REVB=0.0283812;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54101e-05;OID=.;OPOS=88494976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:85:0:0:80:85:1:36:44:0:0:40:45:0:0 chr16 88495654 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9963;QD=45.8065;RBI=0.0178146;REFB=0;REVB=0.00570474;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103475;OID=.;OPOS=88495654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr16 88496008 . T C 712.52 PASS AF=1;AO=36;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.207571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.809;QD=63.3349;RBI=0.208951;REFB=0;REVB=0.0239715;RO=0;SAF=1;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.00013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00365079;OID=.;OPOS=88496008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:45:0:0:36:45:1:35:1:0:0:37:8:0:0 chr16 88497446 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.505;QD=49.5992;RBI=0.077267;REFB=0;REVB=-0.0761756;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000640778;OID=.;OPOS=88497446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:3:15:0:0:3:15:0:0 chr16 88498221 . C T 202.01 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.014877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.406;QD=21.2647;RBI=0.0161132;REFB=-0.0164832;REVB=-0.00618958;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317187;STB=0.502657;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0109679;OID=.;OPOS=88498221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:9:11:10:7:9:11:10:8 chr16 88498297 . T G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.64;QD=48.7373;RBI=0.0476558;REFB=0;REVB=-0.0405733;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.89684e-05;OID=.;OPOS=88498297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr16 88499539 . C G 825.22 PASS AF=0.553957;AO=77;DP=139;FAO=77;FDP=139;FR=.;FRO=62;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.00798075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.71;QD=23.7475;RBI=0.00803479;REFB=-0.0200718;REVB=-0.000930323;RO=61;SAF=42;SAR=35;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832457;STB=0.541874;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0131805;OID=.;OPOS=88499539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:61:62:77:77:0.553957:35:42:27:34:35:42:28:34 chr16 88500430 . G T 181.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0028417;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.246;QD=15.1018;RBI=0.00758535;REFB=-0.0118665;REVB=-0.00703294;RO=27;SAF=15;SAR=4;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400266;STB=0.527127;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.02421;OID=.;OPOS=88500430;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:27:29:19:19:0.395833:4:15:22:5:4:15:22:7 chr16 88501034 . G C 33.46 PASS AF=0.25;AO=5;DP=23;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0168115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.256;QD=5.5768;RBI=0.0366757;REFB=-0.0355299;REVB=-0.0325957;RO=18;SAF=4;SAR=1;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194673;STB=0.672417;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.108083;OID=.;OPOS=88501034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:23:24:18:18:5:6:0.25:1:4:12:6:1:5:12:6 chr16 88501386 . C A 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.066898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4268;QD=16.8219;RBI=0.111707;REFB=-0.0641227;REVB=0.0894597;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206743;STB=0.51216;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.030207;OID=.;OPOS=88501386;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:3:2:3:4:3:2 chr16 88501971 . T A 272.47 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0150095;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.842;QD=21.3699;RBI=0.0174615;REFB=-0.0244268;REVB=0.00892287;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883058;STB=0.548985;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00961712;OID=.;OPOS=88501971;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:23:23:28:28:0.54902:14:14:14:9:14:14:14:9 chr16 88502505 . A G 358.11 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0628095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5967;QD=55.0945;RBI=0.0628768;REFB=0;REVB=0.00290881;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106018;OID=.;OPOS=88502505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr16 88504850 . G C 268.42 PASS AF=0.359551;AO=28;DP=80;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.0234589;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4893;QD=12.0638;RBI=0.0803925;REFB=-0.0318128;REVB=-0.0768936;RO=48;SAF=21;SAR=7;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298632;STB=0.529393;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0798851;OID=.;OPOS=88504850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:89:48:57:28:32:0.359551:7:21:35:13:11:21:35:22 chr16 88504868 . A G 1302.12 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.861;QD=62.0058;RBI=0.0438107;REFB=0;REVB=-0.0272244;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.08422e-05;OID=.;OPOS=88504868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:45:38:0:0:46:38:0:0 chr16 88505635 . A G 116.09 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00460021;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8833;QD=11.0562;RBI=0.0249376;REFB=-0.00826771;REVB=-0.0245096;RO=27;SAF=9;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592259;STB=0.550286;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0112056;OID=.;OPOS=88505635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:27:28:14:14:0.333333:5:9:16:11:5:9:16:12 chr16 88505734 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0644073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.054;QD=51.9167;RBI=0.0644291;REFB=0;REVB=0.00167621;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000753505;OID=.;OPOS=88505734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr16 88620383 . G A 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0117304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.459;QD=17.9407;RBI=0.0144699;REFB=-0.00839587;REVB=0.00847206;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193321;STB=0.609267;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00952504;OID=.;OPOS=88620383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:16:6:9:10:16:6 chr16 88633052 . G C 367.81 PASS AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0537965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.679;QD=21.959;RBI=0.0541485;REFB=-0.0100325;REVB=-0.00616397;RO=30;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649768;STB=0.535839;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00525054;OID=.;OPOS=88633052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:19:18:17:13:19:18:17:13 chr16 88644005 . A G 340.47 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.2452;QD=54.4753;RBI=0.0433115;REFB=0;REVB=-0.0399874;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00144751;OID=.;OPOS=88644005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0 chr16 88664722 . C T 162.27 PASS AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0194663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.7338;QD=9.01495;RBI=0.019799;REFB=-0.022413;REVB=0.00361451;RO=49;SAF=10;SAR=12;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412631;STB=0.51775;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0367731;OID=.;OPOS=88664722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:49:50:22:22:0.305556:12:10:24:25:12:10:24:26 chr16 88709828 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0063;QD=33.4285;RBI=0.0569955;REFB=0;REVB=-0.0195114;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00702813;OID=.;OPOS=88709828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr16 88713236 . A G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00417603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.937;QD=60.9786;RBI=0.0115571;REFB=0;REVB=0.0107762;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31026e-05;OID=.;OPOS=88713236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr16 88713248 . TG T 33.61 PASS AF=0.25;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0761641;FXX=0.0302939;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.4501;QD=4.2008;RBI=0.0930073;REFB=-0.038029;REVB=0.0533797;RO=20;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=13;SSEN=0.362069;SSEP=0;SSSB=0.597084;STB=0.887137;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=0.0675367;OID=.;OPOS=88713249;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25:8:31:8:32:24:7:1:8:16:33:20:7:1:7:13 chr16 88717386 . T C 1008.48 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.725;QD=59.3225;RBI=0.0331482;REFB=0;REVB=-0.00842268;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05971e-05;OID=.;OPOS=88717386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:35:32:0:0:36:32:0:0 chr16 88724347 . G T 242.95 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00691529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.775;QD=22.5999;RBI=0.00744199;REFB=-0.0402371;REVB=0.00274991;RO=20;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295472;STB=0.516515;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0413887;OID=.;OPOS=88724347;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:10:13:12:8:10:13:12:8 chr16 88778615 . G A 399.01 PASS AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0118078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.243;QD=21.0007;RBI=0.0118763;REFB=-0.0207016;REVB=-0.00127417;RO=35;SAF=23;SAR=17;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216806;STB=0.504041;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0175011;OID=.;OPOS=88778615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:36:40:40:0.526316:17:23:21:14:17:23:21:15 chr16 88779739 . A G 375.61 PASS AF=0.4;AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=46;FWDB=-0.0019803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.968;QD=13.6585;RBI=0.016633;REFB=-0.00657742;REVB=-0.0165147;RO=64;SAF=26;SAR=18;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285902;STB=0.667665;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00442708;OID=.;OPOS=88779739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:64:66:44:44:0.4:18:26:20:44:18:26:20:46 chr16 88780634 . AGGTGTGGGTGT AGGTGT,AGGTGTGTGTGG 323.69 PASS AF=0.916667,0.0833333;AO=20,3;DP=26;FAO=22,2;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5,2;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313325,0.0502422;FXX=0.0768935;HRUN=3,3;LEN=6,5;MLLD=220.867,50.2105;QD=53.9479;RBI=0.07245,0.0538123;REFB=0,0;REVB=0.0653244,0.0192738;RO=0;SAF=4,3;SAR=16,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.000558197,0.0825944;OID=.,.;OPOS=88780635,88780641;OREF=GGTGTG,GGTGT;OALT=-,TGTGG;OMAPALT=AGGTGT,AGGTGTGTGTGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.916667,0.0833333:20,3:26:22,2:24:0:5,2:17,0:0:0:8:0:4,3:16,0:0:0 chr16 88781040 . A G 332.87 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00401288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.43;QD=19.0209;RBI=0.0229983;REFB=-0.0192194;REVB=-0.0226455;RO=35;SAF=23;SAR=12;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281539;STB=0.515686;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0175025;OID=.;OPOS=88781040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:12:23:22:13:12:23:22:13 chr16 88781125 . T C 403.4 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.7248;QD=55.6409;RBI=0.0345409;REFB=0;REVB=-0.00620607;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000379619;OID=.;OPOS=88781125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:17:11:0:0:17:12:0:0 chr16 88781339 . G A 87.46 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0335306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.588;QD=13.4555;RBI=0.0335314;REFB=-0.0348819;REVB=0.000224074;RO=15;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379619;STB=0.522347;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0219954;OID=.;OPOS=88781339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:7:4:6:9:7:4:6:9 chr16 88781614 . G C 413.7 PASS AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0140052;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.845;QD=16.3841;RBI=0.0242751;REFB=-0.0131105;REVB=-0.0198277;RO=56;SAF=29;SAR=16;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949347;STB=0.553256;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0164669;OID=.;OPOS=88781614;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:56:56:45:45:0.445545:16:29:31:25:16:29:31:25 chr16 88782676 . A G 313.09 PASS AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.000319691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194;QD=16.9235;RBI=0.013406;REFB=-0.0140683;REVB=-0.0134022;RO=39;SAF=18;SAR=16;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16163;STB=0.58289;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0136032;OID=.;OPOS=88782676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:40:34:34:0.459459:16:18:14:25:16:18:15:25 chr16 88783100 . T C 157.84 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0103033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.582;QD=16.6149;RBI=0.0117058;REFB=-0.0256192;REVB=0.00555598;RO=21;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15372;STB=0.588131;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0285751;OID=.;OPOS=88783100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:7:10:9:12:7:10:9:12 chr16 88783521 . T C 186.2 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0410849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5461;QD=12.4135;RBI=0.0426789;REFB=-0.00711664;REVB=0.011555;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784809;STB=0.545151;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0102533;OID=.;OPOS=88783521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:37:37:23:23:0.383333:11:12:22:15:11:12:22:15 chr16 88786904 . G A 251.61 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.103582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2275;QD=17.0582;RBI=0.103895;REFB=-0.00915481;REVB=-0.00805273;RO=31;SAF=17;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257792;STB=0.514491;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0168247;OID=.;OPOS=88786904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:11:17:18:13:11:17:18:13 chr16 88787704 . G C 410.29 PASS AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0146943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.009;QD=18.2353;RBI=0.0148592;REFB=-0.0302773;REVB=-0.00220779;RO=48;SAF=17;SAR=25;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170572;STB=0.595193;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0518886;OID=.;OPOS=88787704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:25:17:28:20:25:17:28:20 chr16 88791458 . G A 186.85 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0976075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6919;QD=14.655;RBI=0.0986412;REFB=-0.019494;REVB=-0.0142431;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497535;STB=0.502854;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0394516;OID=.;OPOS=88791458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:9:12:17:13:9:12:17:13 chr16 88792047 . A G 725.07 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00645837;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7038;QD=54.7225;RBI=0.0848016;REFB=0.00248473;REVB=-0.0845553;RO=1;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125628;STB=0.506664;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-0.00143053;OID=.;OPOS=88792047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:53:1:1:52:52:0.981132:37:15:0:1:37:15:0:1 chr16 88792097 . A G 501.4 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.918;QD=58.9876;RBI=0.0347733;REFB=0;REVB=0.01949;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106404;OID=.;OPOS=88792097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:25:9:0:0:25:9:0:0 chr16 88803124 . T C 1422.03 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00821277;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4778;QD=61.8274;RBI=0.00945529;REFB=-0.0333893;REVB=0.0046854;RO=1;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977343;STB=0.505154;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000191757;OID=.;OPOS=88803124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:92:1:1:91:91:0.98913:48:43:0:1:48:43:0:1 chr16 88803982 . C G 204.4 PASS AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.047148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3962;QD=22.7114;RBI=0.0707411;REFB=-0.00295776;REVB=0.0527388;RO=16;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495686;STB=0.52775;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00592389;OID=.;OPOS=88803982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:10:10:9:7:10:10:9:7 chr16 88804734 . A G 632.21 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.119;QD=61.6794;RBI=0.0588355;REFB=0;REVB=-0.0111627;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383068;OID=.;OPOS=88804734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr16 88804924 . TCCC TCC,TCCA 227.67 PASS AF=0.952381,0.047619;AO=16,3;DP=21;FAO=20,1;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.266394,0.0631607;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=18.6137,5.48178;QD=43.3662;RBI=0.266571,0.0652341;REFB=0,0;REVB=0.00970063,-0.0163158;RO=1;SAF=9,1;SAR=7,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0481057,-0.266641;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0118016,0.00818944;OID=.,.;OPOS=88804925,88804927;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=TCC,TCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.952381,0.047619:16,3:21:20,1:21:0:12,0:8,1:0:0:4:1:9,1:7,2:1:0 chr16 88808743 . A G 351.45 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00620171;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.113;QD=52.0659;RBI=0.0323593;REFB=0.110485;REVB=0.0317595;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343929;STB=0.518504;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000679636;OID=.;OPOS=88808743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:27:27:1:1:26:26:0.962963:13:13:1:0:13:13:1:0 chr16 88809368 . G T 276.39 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0173271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.062;QD=15.7936;RBI=0.0173911;REFB=0.00507446;REVB=-0.00149114;RO=38;SAF=17;SAR=14;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109642;STB=0.552598;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.00598369;OID=.;OPOS=88809368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:39:31:31:0.442857:14:17:25:13:14:17:25:14 chr16 88809434 . A G 1301.93 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.218;QD=61.9968;RBI=0.0586339;REFB=0;REVB=-0.0208576;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74279e-05;OID=.;OPOS=88809434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:46:38:0:0:46:38:0:0 chr16 88809480 . A G 961.37 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308151;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.595;QD=59.1613;RBI=0.0312482;REFB=0;REVB=-0.00518449;RO=0;SAF=17;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.33797e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392886;OID=.;OPOS=88809480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:65:0:0:65:65:1:48:17:0:0:48:17:0:0 chr16 88809686 . T C 1413.49 PASS AF=0.968421;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0348506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8566;QD=59.5152;RBI=0.0480677;REFB=0.0638312;REVB=-0.033105;RO=3;SAF=59;SAR=33;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198981;STB=0.510504;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.0198117;OID=.;OPOS=88809686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:95:95:3:3:92:92:0.968421:33:59:1:2:33:59:1:2 chr16 88809773 . G C 1492.36 PASS AF=0.990196;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0375172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.255;QD=58.5239;RBI=0.0630731;REFB=-0.0561652;REVB=0.0507019;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.505154;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000901365;OID=.;OPOS=88809773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:102:0:1:100:101:0.990196:48:52:0:0:48:53:0:1 chr16 88809893 . GG AC 434.41 PASS AF=0.723404;AO=34;DP=48;FAO=34;FDP=47;FR=.;FRO=13;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00495669;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=2;MLLD=341.825;QD=36.9708;RBI=0.0207698;REFB=-0.00298024;REVB=-0.0201697;RO=13;SAF=22;SAR=12;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059323;STB=0.532239;STBP=0.5;TYPE=mnp;VARB=0.00100601;OID=.;OPOS=88809893;OREF=GG;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:13:13:34:34:0.723404:12:22:7:6:12:22:7:6 chr16 88872145 . T C 1319.34 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1016;QD=62.0865;RBI=0.0264108;REFB=0;REVB=0.0254277;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260644;OID=.;OPOS=88872145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:38:47:0:0:38:47:0:0 chr16 88872229 . A G 1437.99 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00670028;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.493;QD=63.2085;RBI=0.00849264;REFB=0;REVB=-0.00521836;RO=0;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.30185e-05;OID=.;OPOS=88872229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:91:0:0:91:91:1:49:42:0:0:49:42:0:0 chr16 88872511 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.87;QD=57.6799;RBI=0.0790651;REFB=0;REVB=0.0455829;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697155;OID=.;OPOS=88872511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0 chr16 88874632 . C G 2182.58 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108127;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.943;QD=63.2633;RBI=0.015153;REFB=0;REVB=0.010616;RO=0;SAF=56;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64187e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38785e-05;OID=.;OPOS=88874632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:138:0:0:137:138:1:81:56:0:0:81:57:0:0 chr16 88884466 . C T 718.03 PASS AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0686445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0501;QD=57.4425;RBI=0.0790592;REFB=-0.216217;REVB=0.0392211;RO=3;SAF=27;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106402;STB=0.505665;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0196446;OID=.;OPOS=88884466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:50:50:3:3:47:47:0.94:20:27:2:1:20:27:2:1 chr16 88902183 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.067;QD=58.2396;RBI=0.0610362;REFB=0;REVB=0.0536316;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206357;OID=.;OPOS=88902183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0 chr16 88921634 . C G 129.58 PASS AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.000413819;FXX=0.0161264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.661;QD=8.49701;RBI=0.00057035;REFB=-0.00458056;REVB=0.000392496;RO=43;SAF=10;SAR=8;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145437;STB=0.586375;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0216405;OID=.;OPOS=88921634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:43:43:18:18:0.295082:8:10:29:14:8:10:29:14 chr16 89167140 . G C 93.75 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0227261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.694;QD=10.1353;RBI=0.0806894;REFB=-0.0335472;REVB=0.0774229;RO=25;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267325;STB=0.516102;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0531607;OID=.;OPOS=89167140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:5:7:14:11:5:7:14:11 chr16 89235184 . T G 722.33 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.114;QD=56.653;RBI=0.0578622;REFB=0;REVB=0.0161691;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015544;OID=.;OPOS=89235184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:31:20:0:0 chr16 89238215 . C T 358.87 PASS AF=0.614035;AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0148185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.516;QD=25.184;RBI=0.0160215;REFB=-0.0316902;REVB=0.00609095;RO=22;SAF=21;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039613;STB=0.521727;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0186778;OID=.;OPOS=89238215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:22:22:35:35:0.614035:14:21:12:10:14:21:12:10 chr16 89245890 . G C,T 715.5 PASS AF=0.0576923,0.942308;AO=3,49;DP=52;FAO=3,49;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=3,19;FSAR=0,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.100009,0.0588731;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=6.21995,56.7825;QD=55.0385;RBI=0.103632,0.0772035;REFB=0,0;REVB=-0.0271627,0.0499433;RO=0;SAF=3,19;SAR=0,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.48867e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.250993,-0.00141108;OID=.,.;OPOS=89245890,89245890;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:52:52:0:0:3,49:3,49:0.0576923,0.942308:0,30:3,19:0:0:0,30:3,19:0:0 chr16 89246670 . T C 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.966;QD=64.1538;RBI=0.0309136;REFB=0;REVB=-0.0250736;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.07768e-05;OID=.;OPOS=89246670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chr16 89251776 . G A 174.12 PASS AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0124043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.268;QD=27.8591;RBI=0.054568;REFB=-0.0156357;REVB=0.0531395;RO=8;SAF=1;SAR=16;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520584;STB=0.799519;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00784758;OID=.;OPOS=89251776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:16:1:4:4:16:1:4:4 chr16 89251798 . C T 118.92 PASS AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0124905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.831;QD=33.9782;RBI=0.016461;REFB=-0.0264406;REVB=-0.0107216;RO=2;SAF=1;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258461;STB=0.646759;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00425644;OID=.;OPOS=89251798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:11:1:1:1:11:1:1:1 chr16 89251851 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0744;QD=45.8067;RBI=0.0308434;REFB=0;REVB=-0.0287992;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00174963;OID=.;OPOS=89251851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0 chr16 89256695 . G A 230.88 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0240542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.888;QD=23.0883;RBI=0.035296;REFB=-0.0154111;REVB=-0.0258303;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17956;STB=0.599913;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0113123;OID=.;OPOS=89256695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:11:11:13:5:11:11:13:5 chr16 89259993 . A G 937.49 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0099678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2322;QD=58.5929;RBI=0.0602375;REFB=0;REVB=-0.059407;RO=0;SAF=23;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000607256;OID=.;OPOS=89259993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:41:23:0:0:41:23:0:0 chr16 89265087 . A G 1058.86 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0321;QD=59.6542;RBI=0.114161;REFB=0;REVB=-0.00678251;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124992;OID=.;OPOS=89265087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:65:71:0:0:65:71:1:32:33:0:0:32:39:0:0 chr16 89265100 . GC AT,GT 958.0 PASS AF=0.521739,0.463768;AO=36,32;DP=70;FAO=36,32;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=13,24;FSAR=23,8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00249024,0.0128511;FXX=0.0142837;HRUN=4,3;LEN=2,1;MLLD=159.479,143.455;QD=55.5364;RBI=0.0174961,0.0266158;REFB=0.0249142,-0.10415;REVB=0.017318,0.0233077;RO=0;SAF=13,24;SAR=23,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.21415e-08,0;STB=0.510632,0.529393;STBP=0.511,0.151;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00383479,0.000447008;OID=.,.;OPOS=89265100,89265101;OREF=GC,C;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:70:69:0:1:36,32:36,32:0.521739,0.463768:23,8:13,24:0:0:23,8:13,24:0:1 chr16 89265466 . AC CG,GC 563.31 PASS AF=0.105263,0.894737;AO=4,33;DP=38;FAO=4,34;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=4,12;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405027,0.0279791;FXX=0.0256345;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=80.6583,95.3118;QD=59.2955;RBI=0.0443047,0.0295821;REFB=0,0;REVB=0.0179564,-0.00960593;RO=0;SAF=4,12;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0235381,0.0245785;OID=.,.;OPOS=89265466,89265466;OREF=AC,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:38:38:0:0:4,33:4,34:0.105263,0.894737:0,21:4,12:0:0:0,22:4,12:0:0 chr16 89289624 . G A 352.91 PASS AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00414589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.982;QD=15.8613;RBI=0.0107207;REFB=-0.00159667;REVB=0.00988661;RO=51;SAF=24;SAR=14;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107758;STB=0.560853;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00216801;OID=.;OPOS=89289624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:51:51:38:38:0.426966:14:24:27:24:14:24:27:24 chr16 89291210 . G GGTGA 111.65 PASS AF=0.285714;AO=13;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0100767;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=301.253;QD=9.11448;RBI=0.01482;REFB=-0.0104712;REVB=-0.010867;RO=35;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109225;STB=0.59171;STBP=0.419;TYPE=ins;VARB=0.0292863;OID=.;OPOS=89291211;OREF=-;OALT=GTGA;OMAPALT=GGTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:13:49:14:49:35:7:7:13:22:99:35:6:7:13:22 chr16 89291951 . C T 267.36 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00841631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.199;QD=18.4388;RBI=0.0147376;REFB=0.00644398;REVB=-0.0120981;RO=29;SAF=23;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201494;STB=0.613729;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00449625;OID=.;OPOS=89291951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:6:23:18:11:6:23:18:11 chr16 89293271 . A C 367.23 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0100455;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.579;QD=19.0768;RBI=0.0100577;REFB=-0.0049796;REVB=0.000496504;RO=39;SAF=23;SAR=15;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109412;STB=0.560943;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00505445;OID=.;OPOS=89293271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:15:23:19:20:15:23:19:20 chr16 89293291 . G A 456.18 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00430817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.649;QD=20.2749;RBI=0.0178691;REFB=0.00745508;REVB=-0.017342;RO=45;SAF=20;SAR=25;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803415;STB=0.544535;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=-0.0123347;OID=.;OPOS=89293291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:45:45:45:45:0.5:25:20:24:21:25:20:24:21 chr16 89293614 . A G 161.53 PASS AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0142123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=330.292;QD=10.5918;RBI=0.0142937;REFB=-0.0017842;REVB=0.00152312;RO=40;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708767;STB=0.504142;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00326554;OID=.;OPOS=89293614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:40:40:21:21:0.344262:13:8:15:25:13:8:15:25 chr16 89294184 . G A 279.02 PASS AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0152186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.114;QD=27.2219;RBI=0.0212715;REFB=-0.0203958;REVB=-0.0148617;RO=16;SAF=13;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581605;STB=0.532138;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0111921;OID=.;OPOS=89294184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:12:13:7:9:12:13:7:9 chr16 89294381 . T C 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.027961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0805;QD=16.8227;RBI=0.0662798;REFB=-0.0196667;REVB=0.0600932;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935942;STB=0.55539;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0217048;OID=.;OPOS=89294381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:2:3:5:2:2:3 chr16 89294511 . C T 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00767558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.811;QD=14.3342;RBI=0.0109165;REFB=-0.00417834;REVB=-0.00776249;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400047;STB=0.732852;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00223671;OID=.;OPOS=89294511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:8:2:6:3:8:2 chr16 89294697 . C T 103.36 PASS AF=0.448276;AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0306933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6816;QD=14.2561;RBI=0.0316372;REFB=-0.00543672;REVB=0.00767031;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284721;STB=0.631378;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0108985;OID=.;OPOS=89294697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:12:13:0.448276:8:4:10:6:8:5:10:6 chr16 89294798 . A G 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0627342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9817;QD=22.6313;RBI=0.0712792;REFB=-0.0165279;REVB=-0.0338401;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204544;STB=0.637472;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0302099;OID=.;OPOS=89294798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:7:8:13:13:0.619048:5:8:2:5:5:8:2:6 chr16 89299200 . C A 47.54 PASS AF=0.5;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00691931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.09;QD=13.5822;RBI=0.0102716;REFB=-0.0270957;REVB=0.00759135;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191087;STB=0.639615;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0409172;OID=.;OPOS=89299200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:6:7:0.5:3:3:5:2:4:3:5:2 chr16 89299227 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0306301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.118;QD=11.9533;RBI=0.0313419;REFB=-0.0146333;REVB=-0.00664168;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043798;STB=0.52625;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0110249;OID=.;OPOS=89299227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:6:5:4:4:6:5 chr16 89299280 . T A 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0174267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.845;QD=12.7292;RBI=0.0439243;REFB=-0.0183107;REVB=-0.0403194;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0271484;OID=.;OPOS=89299280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:6:6:4:5:6:6 chr16 89300015 . A G 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.869;QD=35.5741;RBI=0.0716072;REFB=0;REVB=-0.000294876;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002824;OID=.;OPOS=89300015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr16 89300138 . TCG T 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0098681;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=226.886;QD=10.1734;RBI=0.0890859;REFB=-0.0442379;REVB=0.0885377;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726992;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0596971;OID=.;OPOS=89300139;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:6:16:6:15:9:4:2:6:3:38:10:4:2:6:4 chr16 89300147 . A G 167.45 PASS AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.678;QD=41.8618;RBI=0.0622651;REFB=0.123542;REVB=-0.0570553;RO=1;SAF=10;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434393;STB=0.523778;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.0041653;OID=.;OPOS=89300147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:5:10:1:0:5:10:1:0 chr16 89350178 . G A 669.6 PASS AF=0.960784;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0305953;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.893;QD=52.5174;RBI=0.0318245;REFB=-0.0627663;REVB=0.00875949;RO=2;SAF=24;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0007528;STB=0.5004;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00298593;OID=.;OPOS=89350178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:51:2:2:49:49:0.960784:25:24:1:1:25:24:1:1 chr16 89590168 . T C,TATCTC 1357.52 PASS AF=0.0957447,0.87234;AO=11,80;DP=96;FAO=9,82;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=3,42;FSAR=6,40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00264625,-0.00564953;FXX=0.0208312;HRUN=2,1;LEN=1,5;MLLD=78.5764,243.198;QD=57.7668;RBI=0.0253745,0.00817593;REFB=0.0277129,0.022871;REVB=-0.0252361,0.00591005;RO=3;SAF=3,42;SAR=8,38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.294912,-0.0326201;STB=0.666295,0.517237;STBP=0.084,0.108;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00395486,-1.45437e-05;OID=.,.;OPOS=89590168,89590169;OREF=T,-;OALT=C,ATCTC;OMAPALT=C,TATCTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:37:96:94:3:3:11,80:9,82:0.0957447,0.87234:8,38:3,42:3:0:6,40:3,42:3:0 chr16 89590243 . G A 1153.61 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00132779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.589;QD=60.7161;RBI=0.00534044;REFB=0;REVB=0.00517275;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90046e-06;OID=.;OPOS=89590243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0 chr16 89662990 . T C 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.586;QD=63.8693;RBI=0.0422961;REFB=0;REVB=-0.00613655;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000434318;OID=.;OPOS=89662990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr16 89663025 . C T 81.28 PASS AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0264235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.518;QD=8.12763;RBI=0.0459435;REFB=-0.0132325;REVB=-0.0375847;RO=29;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00741697;STB=0.504579;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0385648;OID=.;OPOS=89663025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:6:5:13:16:6:5:13:16 chr16 89704365 . G C 142.69 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00464419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.684;QD=22.8309;RBI=0.026763;REFB=-0.0157287;REVB=0.026357;RO=10;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234872;STB=0.631413;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00848336;OID=.;OPOS=89704365;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:8:7:8:2:8:7:8:2 chr16 89713563 . C G 204.2 PASS AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0153911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.961;QD=12.5658;RBI=0.0217532;REFB=-0.0326454;REVB=-0.0153726;RO=40;SAF=7;SAR=18;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348625;STB=0.700841;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0357077;OID=.;OPOS=89713563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:18:7:24:16:18:7:24:16 chr16 89762432 . C G 309.82 PASS AF=0.364583;AO=21;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=59;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=0.00589672;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=183.903;QD=12.9092;RBI=0.0397159;REFB=-0.0209006;REVB=-0.0392758;RO=41;SAF=9;SAR=12;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33471;STB=0.63629;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0391378;OID=.;OPOS=89762432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:41:59:21:35:0.364583:12:9:30:11:19:16:40:19 chr16 89764549 . G A 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.023496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.539;QD=15.2589;RBI=0.0284682;REFB=-0.00980183;REVB=0.0160741;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394184;STB=0.680376;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.011517;OID=.;OPOS=89764549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:5:6:7:7:0.538462:4:3:5:0:4:3:5:1 chr16 89777761 . C T 321.8 PASS AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00618212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.355;QD=23.8368;RBI=0.0103583;REFB=-0.0193842;REVB=0.00831122;RO=22;SAF=19;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367198;STB=0.520225;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0144846;OID=.;OPOS=89777761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:13:19:12:10:13:19:12:10 chr16 89782989 . A G 141.05 PASS AF=0.369565;AO=15;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0266953;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1087;QD=12.2652;RBI=0.0314712;REFB=-0.0172521;REVB=0.0166671;RO=30;SAF=12;SAR=3;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311052;STB=0.584423;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0345307;OID=.;OPOS=89782989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:30:29:15:17:0.369565:3:12:17:13:5:12:17:12 chr16 89783187 . C T 696.66 PASS AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00524046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4385;QD=54.6398;RBI=0.0437621;REFB=-0.133252;REVB=0.0434472;RO=0;SAF=12;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519992;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00238109;OID=.;OPOS=89783187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:51:0:1:49:50:0.980392:37:12:0:0:38:12:1:0 chr16 89784065 . C T 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00813647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.81;QD=18.7442;RBI=0.00813647;REFB=-0.00166219;REVB=0;RO=4;SAF=7;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000941288;OID=.;OPOS=89784065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:0:7:4:0:0:7:4:0 chr16 89785603 . A C 162.51 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0306289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3049;QD=19.6982;RBI=0.093941;REFB=-0.0228793;REVB=-0.0888075;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129484;STB=0.57339;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.019938;OID=.;OPOS=89785603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:10:7:9:7:10:7:9:7 chr16 89789898 . T C 248.98 PASS AF=0.340909;AO=30;DP=90;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0418381;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6851;QD=11.3171;RBI=0.0491454;REFB=-0.00691258;REVB=-0.0257845;RO=57;SAF=20;SAR=10;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860114;STB=0.557338;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0183027;OID=.;OPOS=89789898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:88:57:58:30:30:0.340909:10:20:34:23:10:20:34:24 chr16 89799950 . C T 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0567598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9982;QD=19.1799;RBI=0.0584144;REFB=-0.0117026;REVB=0.0138048;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155247;STB=0.588105;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.013787;OID=.;OPOS=89799950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:6:7:8:3:6:7:8:3 chr16 89805914 . T C 346.8 PASS AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.052594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7779;QD=22.3739;RBI=0.0594254;REFB=-0.0308923;REVB=-0.0276631;RO=27;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695308;STB=0.538296;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0174648;OID=.;OPOS=89805914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:19:16:10:17:19:16:10:17 chr16 89806343 . C A 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00374274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.73;QD=13.4591;RBI=0.00843182;REFB=-0.00755016;REVB=-0.00755563;RO=26;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0122713;OID=.;OPOS=89806343;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:8:8:13:13:8:8:13:13 chr16 89806347 . A T 619.95 PASS AF=0.97619;AO=42;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0275671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.609;QD=59.0424;RBI=0.0419203;REFB=0.0908248;REVB=0.0315811;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000519636;OID=.;OPOS=89806347;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:0:1:42:41:0.97619:22:20:0:0:21:20:0:1 chr16 89807233 . C G 197.78 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0436843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.017;QD=14.6504;RBI=0.0526734;REFB=-0.0268444;REVB=-0.0294307;RO=30;SAF=15;SAR=8;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204658;STB=0.504421;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.034314;OID=.;OPOS=89807233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:31:23:23:0.425926:8:15:19:11:8:15:20:11 chr16 89809319 . T C 45.19 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.0365637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1814;QD=8.21705;RBI=0.0365637;REFB=-0.00284834;REVB=0;RO=15;SAF=7;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00589987;OID=.;OPOS=89809319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:0:7:15:0:0:7:15:0 chr16 89825065 . G A 92.97 PASS AF=0.3125;AO=8;DP=33;FAO=10;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0514128;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0134;QD=11.6209;RBI=0.0699978;REFB=-0.0338549;REVB=0.0475017;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401836;STB=0.5998;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.109799;OID=.;OPOS=89825065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:32:18:20:8:10:0.3125:2:6:7:11:4:6:9:11 chr16 89828437 . A G 226.97 PASS AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0149095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.946;QD=15.6532;RBI=0.0211163;REFB=-0.0484899;REVB=-0.0149534;RO=32;SAF=6;SAR=20;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269715;STB=0.654077;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0582669;OID=.;OPOS=89828437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:20:6:15:17:20:6:15:17 chr16 89836323 . C T 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.312;QD=62.6707;RBI=0.0637481;REFB=0;REVB=0.0626924;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239995;OID=.;OPOS=89836323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr16 89839766 . G C 35.56 PASS AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0152296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.845;QD=5.68927;RBI=0.016224;REFB=-0.00526305;REVB=0.00559241;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167553;STB=0.610731;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0182937;OID=.;OPOS=89839766;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:9:10:4:2:9:10 chr16 89845194 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.62;QD=59.0176;RBI=0.0147109;REFB=0;REVB=0.0019602;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.21708e-05;OID=.;OPOS=89845194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0 chr16 89849480 . C T 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0197597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9591;QD=48.6255;RBI=0.0207863;REFB=-0.0748747;REVB=0.00645192;RO=1;SAF=15;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298327;STB=0.516115;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00187708;OID=.;OPOS=89849480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:7:15:1:0:7:15:1:0 chr16 89857935 . G A 95.68 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0577709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.71;QD=11.5972;RBI=0.0647273;REFB=0.00700659;REVB=-0.0291916;RO=21;SAF=1;SAR=11;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490545;STB=0.804229;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.0037657;OID=.;OPOS=89857935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:11:1:8:13:11:1:8:13 chr16 89858417 . C A 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0110552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.921;QD=13.4417;RBI=0.0193509;REFB=-0.016304;REVB=0.015882;RO=13;SAF=9;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424961;STB=0.759911;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0292279;OID=.;OPOS=89858417;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:1:9:8:5:1:9:8:5 chr16 89866043 . T C 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0556802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4519;QD=58.5864;RBI=0.0588264;REFB=0;REVB=0.0189806;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000728949;OID=.;OPOS=89866043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr16 89916879 . C CGAG 72.94 PASS AF=0.529412;AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.039997;FXX=0.149925;HRUN=1;LEN=3;MLLD=237.083;QD=17.1635;RBI=0.0416538;REFB=-0.0128611;REVB=0.0116307;RO=20;SAF=1;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494369;STB=0.65587;STBP=0.205;TYPE=ins;VARB=0.00850302;OID=.;OPOS=89916880;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=CGAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.529412:8:28:9:17:8:2:7:4:4:60:20:1:7:10:10 chr16 89920957 . A G 194.34 PASS AF=0.59375;AO=18;DP=31;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0095844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6502;QD=24.2927;RBI=0.0205933;REFB=0.000258599;REVB=-0.018227;RO=13;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455938;STB=0.515238;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.000934757;OID=.;OPOS=89920957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:13:13:18:19:0.59375:8:10:8:5:8:11:8:5 chr16 89954138 . G C 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0252388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.963;QD=14.0974;RBI=0.0424354;REFB=-0.00115474;REVB=-0.034114;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223717;STB=0.630343;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00111602;OID=.;OPOS=89954138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:11:7:8:5:11:7 chr16 89965055 . G A 193.21 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0185963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.13;QD=16.4433;RBI=0.0231285;REFB=0.00147747;REVB=-0.0137516;RO=27;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192282;STB=0.61006;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=-0.00260828;OID=.;OPOS=89965055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:12:8:16:11:12:8:16:11 chr16 89985940 . G A 360.13 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.000859888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.834;QD=22.8652;RBI=0.00563178;REFB=-0.0364879;REVB=-0.00556575;RO=27;SAF=25;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578154;STB=0.531897;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0234903;OID=.;OPOS=89985940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:11:25:17:10:11:25:17:10 chr16 89986154 . G A 79.38 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0274807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.234;QD=15.8768;RBI=0.0355978;REFB=-0.0284388;REVB=0.0226277;RO=10;SAF=8;SAR=2;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0301709;OID=.;OPOS=89986154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:2:8:8:2:2:8:8:2 chr16 89986608 . A G 243.79 PASS AF=0.313725;AO=32;DP=103;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.0148199;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.512;QD=9.56046;RBI=0.0222665;REFB=-0.00382367;REVB=-0.0166183;RO=70;SAF=10;SAR=22;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216965;STB=0.512704;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0127355;OID=.;OPOS=89986608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:70:70:32:32:0.313725:22:10:23:47:22:10:23:47 chr16 89986760 . A G 378.77 PASS AF=0.394737;AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.0327617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8507;QD=13.2901;RBI=0.0657695;REFB=0.0204873;REVB=-0.057029;RO=69;SAF=17;SAR=28;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152952;STB=0.508667;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0287166;OID=.;OPOS=89986760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:69:69:45:45:0.394737:28:17:27:42:28:17:27:42 chr16 89987201 . A G 334.84 PASS AF=0.45;AO=35;DP=81;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0493084;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6487;QD=16.7418;RBI=0.0517028;REFB=0.0028725;REVB=0.0155521;RO=44;SAF=15;SAR=20;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159897;STB=0.595383;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.0017769;OID=.;OPOS=89987201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:44:44:35:36:0.45:20:15:26:18:21:15:26:18 chr16 90025640 . G C 180.05 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.015889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.083;QD=23.232;RBI=0.0159047;REFB=-0.00413303;REVB=-0.0007053;RO=13;SAF=3;SAR=15;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45689;STB=0.759171;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00766648;OID=.;OPOS=90025640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:15:3:9:4:15:3:9:4 chr16 90030355 . T C 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0298808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7675;QD=12.3961;RBI=0.0298808;REFB=-0.0118871;REVB=0;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00778872;OID=.;OPOS=90030355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:0:5:5:0:0:5:5:0 chr16 90037828 . G A 244.13 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0218634;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.557;QD=21.7;RBI=0.0223284;REFB=-0.0177019;REVB=0.004533;RO=22;SAF=12;SAR=11;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215997;STB=0.62059;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00832902;OID=.;OPOS=90037828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:22:22:23:23:0.511111:11:12:6:16:11:12:6:16 chr16 90038369 . A G 188.57 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0252313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7772;QD=14.2317;RBI=0.0252322;REFB=-0.0192922;REVB=-0.000212768;RO=31;SAF=10;SAR=12;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193012;STB=0.610072;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0148718;OID=.;OPOS=90038369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:12:10:20:11:12:10:20:11 chr16 90038647 . A G 207.5 PASS AF=0.351351;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.00394911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.136;QD=11.216;RBI=0.0141764;REFB=-0.0112306;REVB=-0.0136153;RO=48;SAF=10;SAR=16;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220997;STB=0.628001;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0171237;OID=.;OPOS=90038647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:48:48:26:26:0.351351:16:10:28:20:16:10:28:20 chr16 90038786 . C A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.48;QD=58.4194;RBI=0.0249174;REFB=0;REVB=0.00785139;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.87549e-05;OID=.;OPOS=90038786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0 chr16 90048327 . G A 313.07 PASS AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0569598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.564;QD=16.9229;RBI=0.0608854;REFB=-0.0213114;REVB=-0.0215083;RO=40;SAF=13;SAR=21;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163341;STB=0.591733;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0228037;OID=.;OPOS=90048327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:21:13:22:18:21:13:22:18 chr16 90095484 . C T 1609.04 PASS AF=0.973684;AO=110;DP=114;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0104156;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.35;QD=56.4574;RBI=0.0367355;REFB=-0.119021;REVB=0.035228;RO=0;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514016;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.000532332;OID=.;OPOS=90095484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:114:114:0:3:110:111:0.973684:59:51:0:0:59:52:3:0 chr16 90096052 . CCTT C,GCTC 944.64 PASS AF=0.863636,0.136364;AO=56,9;DP=69;FAO=57,9;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=14,7;FSAR=43,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274577,-0.000444054;FXX=0.043472;HRUN=2,2;LEN=3,4;MLLD=205.625,124.81;QD=57.2509;RBI=0.0325045,0.00200467;REFB=0,0;REVB=0.017396,-0.00195487;RO=0;SAF=14,7;SAR=42,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00207273,0.0502389;OID=.,.;OPOS=90096053,90096052;OREF=CTT,CCTT;OALT=-,GCTC;OMAPALT=C,GCTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:46:69:66:0:0:56,9:57,9:0.863636,0.136364:42,2:14,7:0:0:43,2:14,7:0:0 chr16 90097748 . C T 170.88 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0491043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.151;QD=42.719;RBI=0.109672;REFB=-0.108634;REVB=0.0980646;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434393;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00430755;OID=.;OPOS=90097748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:16:16:1:0:15:16:1:10:5:0:1:11:5:0:0 chr16 90109711 . A G 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4776;QD=45.8034;RBI=0.147542;REFB=0;REVB=-0.143551;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00517467;OID=.;OPOS=90109711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr16 90110027 . G A,C 557.82 PASS AF=0.973684,0.0263158;AO=36,2;DP=38;FAO=37,1;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594748,-0.00773971;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=131.422,9.17599;QD=58.7174;RBI=0.0684863,0.0551971;REFB=0,0;REVB=0.0339576,-0.0546518;RO=0;SAF=21,0;SAR=15,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00188958,0.175324;OID=.,.;OPOS=90110027,90110027;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:38:38:0:0:36,2:37,1:0.973684,0.0263158:15,2:21,0:0:0:16,1:21,0:0:0 chr16 90110284 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.565;QD=58.5877;RBI=0.0428286;REFB=0;REVB=0.0415509;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146212;OID=.;OPOS=90110284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr16 90110289 . C A 459.44 PASS AF=1;AO=24;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8111;QD=57.4304;RBI=0.07665;REFB=0;REVB=0.0476191;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00378081;OID=.;OPOS=90110289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:24:32:1:11:13:0:0:18:14:0:0 chr16 90130136 . C T 576.4 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.76833e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.733;QD=60.674;RBI=0.00583948;REFB=0;REVB=0.00583929;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17559e-05;OID=.;OPOS=90130136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:18:19:0:0:18:20:0:0 chr16 90160238 . C T 214.21 PASS AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0230315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.258;QD=45.0966;RBI=0.0456008;REFB=-0.0314082;REVB=0.0393571;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704612;STB=0.538418;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00544887;OID=.;OPOS=90160238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:6:12:0:1:6:12:0:1 chr16 90160246 . G A 230.28 PASS AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0124904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.596;QD=46.0565;RBI=0.0146832;REFB=-0.00819183;REVB=-0.00771936;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705879;STB=0.53842;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000377894;OID=.;OPOS=90160246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:6:13:0:1:6:13:0:1 chr16 90160793 . G C 162.37 PASS AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0579206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7957;QD=38.2047;RBI=0.0606071;REFB=0.121512;REVB=0.0178444;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826301;STB=0.583219;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.0207123;OID=.;OPOS=90160793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:17:17:1:2:15:15:0.882353:10:5:1:0:10:5:2:0 chr16 90160953 . T C 43.73 PASS AF=0.75;AO=4;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0318595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.545;QD=21.8663;RBI=0.0326723;REFB=-0.0453607;REVB=0.0072426;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.767801;STB=0.749058;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0246528;OID=.;OPOS=90160953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:4:6:0.75:0:4:0:2:1:5:0:2 chr16 90161033 . AC A,AA 548.63 PASS AF=0.027027,0.972973;AO=6,31;DP=37;FAO=1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=1,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531244,0.0519171;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=201.788,220.664;QD=59.3113;RBI=0.0534463,0.0526993;REFB=0,0;REVB=0.00585708,0.00904589;RO=0;SAF=3,16;SAR=3,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0213588,0.00328843;OID=.,.;OPOS=90161034,90161034;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.027027,0.972973:6,31:37:1,36:37:0:0,19:1,17:0:0:5:0:3,16:3,15:0:0 chr16 90161065 . A T 765.73 PASS AF=1;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00590356;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.365;QD=56.7211;RBI=0.0132656;REFB=0;REVB=-0.0118795;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.38571e-05;OID=.;OPOS=90161065;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:53:54:1:28:25:0:0:29:25:0:0 chr16 90161231 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1764;QD=56.1907;RBI=0.0391084;REFB=0;REVB=-0.0350413;RO=1;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344248;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404274;OID=.;OPOS=90161231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:1:0:27:28:1:13:14:0:1:14:14:0:0 chr16 90161578 . G A 120.36 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0409517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5696;QD=24.0725;RBI=0.0414952;REFB=-0.0449598;REVB=-0.00669425;RO=7;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206184;STB=0.51161;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0232042;OID=.;OPOS=90161578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:7:6:3:4:7:6:3:4 chr16 90161585 . C A 108.86 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0573544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.552;QD=24.1899;RBI=0.0687645;REFB=-0.0115436;REVB=-0.0379345;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500226;STB=0.528254;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0128464;OID=.;OPOS=90161585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:3:3:7:5:3:3 chr16 90161590 . G A 62.67 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0291993;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.16;QD=17.9048;RBI=0.0510027;REFB=0.00572071;REVB=0.0418172;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946669;STB=0.555414;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.00469818;OID=.;OPOS=90161590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:15:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:3:3:5:3:3:3 chr16 90161592 . G A 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0292893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.732;QD=15.8391;RBI=0.0316389;REFB=-0.00443675;REVB=-0.0119649;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446316;STB=0.526249;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00596643;OID=.;OPOS=90161592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:3:4:5:3:3:4 chr16 90232832 . A C 376.23 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0236802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.325;QD=21.196;RBI=0.0317844;REFB=-0.0287878;REVB=-0.0212014;RO=33;SAF=17;SAR=21;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182751;STB=0.600828;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0264999;OID=.;OPOS=90232832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:21:17:22:11:21:17:22:11 chr16 90232893 . C A 261.73 PASS AF=0.467742;AO=28;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.177922;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5794;QD=16.8858;RBI=0.193336;REFB=-0.0315928;REVB=0.0756467;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217008;STB=0.635669;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.042461;OID=.;OPOS=90232893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:33:28:29:0.467742:11:17:13:21:11:18:12:21 chr17 6115 . G C 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.271;QD=61.2132;RBI=0.0512026;REFB=0;REVB=0.0403192;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010488;OID=.;OPOS=6115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0 chr17 6157 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.93;QD=57.0006;RBI=0.0258011;REFB=0;REVB=0.0256426;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70997e-05;OID=.;OPOS=6157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0 chr17 181474 . T C 1560.92 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.207;QD=63.711;RBI=0.0460357;REFB=0;REVB=-0.000807396;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.53726e-05;OID=.;OPOS=181474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:49:48:0:0:50:48:0:0 chr17 181479 . C A 1540.03 PASS AF=0.98;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.051611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.31;QD=61.6012;RBI=0.0530704;REFB=-0.135898;REVB=0.0123599;RO=1;SAF=49;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958098;STB=0.509998;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.000899107;OID=.;OPOS=181479;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:99:100:1:2:97:98:0.98:48:49:1:0:49:49:2:0 chr17 292759 . C T 138.95 PASS AF=0.535714;AO=14;DP=27;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0688454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.755;QD=19.8494;RBI=0.0690472;REFB=0.0117712;REVB=0.00527594;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185034;STB=0.615215;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.0119042;OID=.;OPOS=292759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:28:13:13:14:15:0.535714:11:3:5:8:12:3:5:8 chr17 505105 . T C 311.95 PASS AF=0.357798;AO=39;DP=108;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.00654479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.747;QD=11.4478;RBI=0.0423409;REFB=-0.023754;REVB=0.0418321;RO=69;SAF=15;SAR=24;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154586;STB=0.59339;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.049001;OID=.;OPOS=505105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:69:70:39:39:0.357798:24:15:36:33:24:15:37:33 chr17 505139 . G A 297.31 PASS AF=0.382022;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00990569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8376;QD=13.3623;RBI=0.010365;REFB=0.00373284;REVB=-0.00305142;RO=55;SAF=11;SAR=23;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151311;STB=0.586765;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.0022099;OID=.;OPOS=505139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:0.382022:23:11:25:30:23:11:25:30 chr17 526907 . G T 143.35 PASS AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.000313953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.208;QD=9.88627;RBI=0.0132843;REFB=-0.00550009;REVB=-0.0132806;RO=38;SAF=5;SAR=14;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389813;STB=0.736593;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00932913;OID=.;OPOS=526907;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:38:39:19:19:0.327586:14:5:23:15:14:5:24:15 chr17 648186 . G A 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00286378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.097;QD=14.6492;RBI=0.0370917;REFB=-0.0121737;REVB=0.0369809;RO=19;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012103;STB=0.507032;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0125249;OID=.;OPOS=648186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:5:9:12:7:5:9:12:7 chr17 648498 . C T 74.19 PASS AF=0.344828;AO=9;DP=28;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0124381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.149;QD=10.2328;RBI=0.0325693;REFB=-0.00367374;REVB=0.0301007;RO=19;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355283;STB=0.603547;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00850672;OID=.;OPOS=648498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:29:19:19:9:10:0.344828:8:1:6:13:8:2:6:13 chr17 649547 . G C 85.02 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0291845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9991;QD=22.671;RBI=0.136933;REFB=-0.0077999;REVB=0.133786;RO=5;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721239;STB=0.540904;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0104696;OID=.;OPOS=649547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:7:3:1:4:7:3:1:4 chr17 649935 . G C 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0185229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.599;QD=25.3676;RBI=0.037615;REFB=-0.00719638;REVB=0.0327382;RO=13;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955196;STB=0.541626;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00634266;OID=.;OPOS=649935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:13:14:21:21:0.6:7:14:7:6:7:14:8:6 chr17 704017 . A G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0447312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.248;QD=60.2305;RBI=0.0507393;REFB=0;REVB=0.0239497;RO=0;SAF=30;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000355169;OID=.;OPOS=704017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:7:30:0:0:7:30:0:0 chr17 800106 . C T 93.37 PASS AF=0.307692;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=25;FWDB=-0.0596568;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.497;QD=9.57665;RBI=0.0596605;REFB=-0.00702846;REVB=0.000666508;RO=22;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453386;STB=0.521704;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0145409;OID=.;OPOS=800106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:39:22:27:12:12:0.307692:11:1:0:22:11:1:2:25 chr17 908529 . A G 92.58 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0165813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.559;QD=9.25818;RBI=0.0166364;REFB=-0.0212424;REVB=0.00135238;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822896;STB=0.549917;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0514762;OID=.;OPOS=908529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:6:6:12:16:6:6:12:16 chr17 925764 . A G 328.46 PASS AF=0.413793;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00956685;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.588;QD=15.1015;RBI=0.0145836;REFB=-0.0129424;REVB=-0.0110071;RO=51;SAF=15;SAR=21;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254586;STB=0.64345;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.01007;OID=.;OPOS=925764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:51:51:36:36:0.413793:21:15:34:17:21:15:34:17 chr17 970413 . C T 222.68 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.903;QD=49.4847;RBI=0.0448993;REFB=0;REVB=0.0250159;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340335;OID=.;OPOS=970413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0 chr17 982039 . GA AG 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00998234;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.722;QD=18.767;RBI=0.0126306;REFB=-0.0352939;REVB=-0.0077386;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354507;STB=0.713466;STBP=0.136;TYPE=mnp;VARB=0.0344665;OID=.;OPOS=982039;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:1:2:1:5:1:2 chr17 1183338 . C T 137.99 PASS AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0391254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3821;QD=29.0497;RBI=0.0434254;REFB=-0.0242404;REVB=0.0188406;RO=5;SAF=10;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166281;STB=0.59308;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0112496;OID=.;OPOS=1183338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:4:10:2:3:4:10:2:3 chr17 1183354 . T C 358.12 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8814;QD=55.0957;RBI=0.0218339;REFB=0;REVB=-0.00798179;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000479671;OID=.;OPOS=1183354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr17 1183464 . A G 747.08 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0046788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.831;QD=63.5812;RBI=0.0313548;REFB=0;REVB=-0.0310038;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108155;OID=.;OPOS=1183464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0 chr17 1201721 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0218938;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=297.785;QD=11.9536;RBI=0.0273677;REFB=-0.00409351;REVB=0.016421;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313604;STB=0.683812;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00509513;OID=.;OPOS=1201721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:2:9:4:4:2:9 chr17 1359363 . T G 112.27 PASS AF=0.275862;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.00358343;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.738;QD=7.74254;RBI=0.0224878;REFB=-0.0155658;REVB=-0.0222005;RO=42;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358124;STB=0.716124;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0143933;OID=.;OPOS=1359363;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:42:42:16:16:0.275862:5:11:16:26:5:11:16:26 chr17 1371123 . T C 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00753444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5186;QD=12.9744;RBI=0.025231;REFB=-0.00517767;REVB=-0.0240798;RO=18;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378639;STB=0.723753;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0022538;OID=.;OPOS=1371123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:3:9:7:11:3:9:7:11 chr17 1373518 . T C 251.1 PASS AF=0.595238;AO=22;DP=40;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00330346;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.854;QD=23.9139;RBI=0.00479867;REFB=-0.0391319;REVB=0.00348057;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128295;STB=0.519984;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0348898;OID=.;OPOS=1373518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:42:16:17:22:25:0.595238:12:10:10:6:13:12:9:8 chr17 1384066 . A G 527.85 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233298;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.173;QD=58.6496;RBI=0.0404814;REFB=0;REVB=-0.0330828;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24037e-06;OID=.;OPOS=1384066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:12:22:0:0:13:23:0:0 chr17 1424948 . A G 900.47 PASS AF=0.969231;AO=65;DP=67;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00107931;FXX=0.0298463;HRUN=7;LEN=1;MLLD=282.234;QD=55.4135;RBI=0.00933079;REFB=0.0533344;REVB=0.00926816;RO=2;SAF=36;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255209;STB=0.514281;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=-0.00044097;OID=.;OPOS=1424948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:67:65:2:2:65:63:0.969231:29:36:2:0:29:34:2:0 chr17 1489088 . C G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.273;QD=59.4355;RBI=0.0412781;REFB=0;REVB=-0.0382737;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171929;OID=.;OPOS=1489088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr17 1516480 . T C 962.79 PASS AF=0.985075;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0786707;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.174;QD=57.4797;RBI=0.0786971;REFB=0.0191133;REVB=-0.00203495;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000144009;OID=.;OPOS=1516480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:67:0:1:64:66:0.985075:38:26:0:0:38:28:0:1 chr17 1538302 . C A 844.5 PASS AF=0.542484;AO=83;DP=152;FAO=83;FDP=153;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.0182283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0545;QD=22.0783;RBI=0.0564623;REFB=-0.025781;REVB=0.0534389;RO=69;SAF=34;SAR=49;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165333;STB=0.593496;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0197476;OID=.;OPOS=1538302;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:69:70:83:83:0.542484:49:34:42:27:49:34:43:27 chr17 1538546 . C T 562.02 PASS AF=0.554455;AO=55;DP=102;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.00296506;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.067;QD=22.2581;RBI=0.0314835;REFB=-0.0142204;REVB=0.0313436;RO=45;SAF=37;SAR=18;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461467;STB=0.528187;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00640025;OID=.;OPOS=1538546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:45:45:55:56:0.554455:18:37:28:17:18:38:28:17 chr17 1538628 . C G 415.28 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.000528283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.609;QD=19.3151;RBI=0.0111487;REFB=-0.022813;REVB=0.0111361;RO=44;SAF=29;SAR=13;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00927642;STB=0.505159;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0230869;OID=.;OPOS=1538628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:13:29:30:14:13:29:30:14 chr17 1542153 . G A 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0371357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5482;QD=25.2765;RBI=0.0405651;REFB=-0.013834;REVB=-0.0163236;RO=8;SAF=6;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361417;STB=0.530089;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0101239;OID=.;OPOS=1542153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:8:12:19:19:0.612903:13:6:3:5:13:6:3:9 chr17 1542190 . G A 169.87 PASS AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0276087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.761;QD=25.1653;RBI=0.0491342;REFB=-0.0251867;REVB=0.0406439;RO=9;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028895;STB=0.502615;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0275931;OID=.;OPOS=1542190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:9:10:17:17:0.62963:12:5:3:6:12:5:3:7 chr17 1611370 . G A 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0226999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.654;QD=18.767;RBI=0.0499873;REFB=-0.0109086;REVB=0.0445359;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0102972;OID=.;OPOS=1611370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:4:2:1:2:4:2:1:2 chr17 1629969 . C T 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0153583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.166;QD=22.5809;RBI=0.0153627;REFB=-0.00235287;REVB=-0.00036681;RO=7;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285;STB=0.516103;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00240428;OID=.;OPOS=1629969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:10:2:1:6:10:2:1:6 chr17 1629975 . C T 107.26 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0347745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.634;QD=22.5808;RBI=0.0463954;REFB=-0.00752699;REVB=-0.0307127;RO=7;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285;STB=0.516103;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00348369;OID=.;OPOS=1629975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:10:2:1:6:10:2:1:6 chr17 1630208 . C T 205.36 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00361301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.132;QD=14.6687;RBI=0.0267095;REFB=-0.0199959;REVB=0.026464;RO=32;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941656;STB=0.553527;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0224169;OID=.;OPOS=1630208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:12:12:13:19:12:12:13:19 chr17 1630395 . T C 277.28 PASS AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.056452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0044;QD=26.4076;RBI=0.0567999;REFB=-0.0213916;REVB=0.00627718;RO=16;SAF=15;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201968;STB=0.59992;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0151568;OID=.;OPOS=1630395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:16:17:25:25:0.595238:10:15:5:11:10:15:6:11 chr17 1630584 . A G 92.17 PASS AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0141714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.622;QD=8.99186;RBI=0.0304201;REFB=-0.00537121;REVB=-0.0269175;RO=29;SAF=5;SAR=7;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116902;STB=0.571309;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0161687;OID=.;OPOS=1630584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:7:5:15:14:7:5:15:14 chr17 1636934 . A G 248.31 PASS AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0177349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.113;QD=11.685;RBI=0.030593;REFB=-0.020724;REVB=-0.024928;RO=55;SAF=20;SAR=10;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279184;STB=0.661309;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0386627;OID=.;OPOS=1636934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:10:20:23:32:10:20:23:32 chr17 1637074 . A G 848.27 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4744;QD=57.5096;RBI=0.0350809;REFB=0;REVB=-0.0231272;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11583e-05;OID=.;OPOS=1637074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0 chr17 1637302 . A G 1044.24 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00463872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1393;QD=59.6706;RBI=0.0124112;REFB=0;REVB=-0.0115117;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.26629e-05;OID=.;OPOS=1637302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0 chr17 1639454 . G A 218.99 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0120583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.817;QD=23.6746;RBI=0.0173596;REFB=-0.0250308;REVB=0.0124881;RO=16;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704467;STB=0.503933;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0174518;OID=.;OPOS=1639454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:12:9:7:9:12:9:7:9 chr17 1639458 . A G 557.07 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6467;QD=60.2233;RBI=0.027156;REFB=0;REVB=0.00475777;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219741;OID=.;OPOS=1639458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0 chr17 1640709 . C T 175.48 PASS AF=0.708333;AO=16;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0237547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.36;QD=29.2472;RBI=0.0656564;REFB=0.0142065;REVB=0.0612084;RO=7;SAF=14;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447028;STB=0.699733;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00243258;OID=.;OPOS=1640709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:7:7:16:17:0.708333:2:14:2:5:3:14:2:5 chr17 1648294 . C T 239.31 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0318178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.94;QD=20.8099;RBI=0.0340397;REFB=-0.00675552;REVB=-0.0120966;RO=23;SAF=17;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13818;STB=0.57816;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0131341;OID=.;OPOS=1648294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:6:17:14:9:6:17:14:9 chr17 1658361 . T TC 63.94 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.014276;FXX=0.0270197;HRUN=0;LEN=1;MLLD=69.0061;QD=7.10418;RBI=0.0198805;REFB=-0.00862304;REVB=0.0138358;RO=24;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45341e-08;STB=0.553121;STBP=0.68;TYPE=ins;VARB=0.156244;OID=.;OPOS=1658362;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.444444:12:36:16:36:20:3:13:5:15:63:24:3:9:6:18 chr17 1673276 . C T 346.1 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0106214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9512;QD=16.8831;RBI=0.022738;REFB=-0.0488964;REVB=0.0201048;RO=45;SAF=19;SAR=18;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197783;STB=0.610435;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0370279;OID=.;OPOS=1673276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:18:19:14:31:18:19:14:31 chr17 1674429 . T C 164.95 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00310511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.075;QD=14.0385;RBI=0.016948;REFB=0.00348678;REVB=-0.0166611;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132711;STB=0.565965;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00309124;OID=.;OPOS=1674429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:8:10:12:16:8:10:13:16 chr17 1680002 . T C 362.09 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215103;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.987;QD=55.706;RBI=0.021676;REFB=0;REVB=0.00267498;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.31593e-05;OID=.;OPOS=1680002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr17 1686410 . T C 689.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.54;QD=62.6606;RBI=0.0307626;REFB=0;REVB=-0.0108896;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137534;OID=.;OPOS=1686410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:23:21:0:0 chr17 1690752 . G A 412.76 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0419731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.14;QD=18.762;RBI=0.0656145;REFB=0.0105966;REVB=0.0504334;RO=46;SAF=25;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908247;STB=0.550636;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.0112715;OID=.;OPOS=1690752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:17:25:23:23:17:25:23:23 chr17 1703543 . G C 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0171255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.648;QD=13.6309;RBI=0.0224719;REFB=-0.00133212;REVB=0.01455;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256503;STB=0.6518;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00209535;OID=.;OPOS=1703543;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:3:5:3:6:3:5:3:6 chr17 1731268 . T C 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.000464785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=304.961;QD=16.1155;RBI=0.00281138;REFB=-0.013851;REVB=0.0027727;RO=29;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16746;STB=0.595363;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0150691;OID=.;OPOS=1731268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:17:7:13:16:17:7:13:16 chr17 1795180 . T C 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00349577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.361;QD=17.247;RBI=0.0213664;REFB=-0.012886;REVB=0.0210785;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052726;STB=0.530092;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0109913;OID=.;OPOS=1795180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:14:13:9:12:14:13 chr17 1801065 . G C 437.41 PASS AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00425925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.015;QD=24.3006;RBI=0.00476962;REFB=-0.0286184;REVB=0.00214662;RO=30;SAF=22;SAR=20;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582162;STB=0.5319;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0136952;OID=.;OPOS=1801065;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:30:30:42:42:0.583333:20:22:18:12:20:22:18:12 chr17 1801144 . C T 330.13 PASS AF=0.359649;AO=41;DP=114;FAO=41;FDP=114;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.00111505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.752;QD=11.5835;RBI=0.0199772;REFB=0.00116246;REVB=-0.019946;RO=72;SAF=24;SAR=17;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959316;STB=0.559556;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.00144067;OID=.;OPOS=1801144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:72:73:41:41:0.359649:17:24:36:36:17:24:36:37 chr17 1839674 . G C 286.37 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0455864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7867;QD=15.6916;RBI=0.0537342;REFB=0.0142721;REVB=-0.0284472;RO=41;SAF=12;SAR=20;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139626;STB=0.578897;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.0196266;OID=.;OPOS=1839674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:20:12:21:20:20:12:21:20 chr17 1840468 . C T 598.75 PASS AF=0.504132;AO=61;DP=121;FAO=61;FDP=121;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.00575954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.387;QD=19.7934;RBI=0.00981042;REFB=-0.0192251;REVB=0.00794179;RO=60;SAF=30;SAR=31;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022608;STB=0.512469;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0170884;OID=.;OPOS=1840468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:60:60:61:61:0.504132:31:30:28:32:31:30:28:32 chr17 1943888 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.267;QD=59.4356;RBI=0.0473066;REFB=0;REVB=0.0430596;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192013;OID=.;OPOS=1943888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0 chr17 1962394 . C T 497.96 PASS AF=0.878049;AO=35;DP=40;FAO=36;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0131965;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.747;QD=48.5811;RBI=0.035648;REFB=-0.131273;REVB=0.0331154;RO=4;SAF=21;SAR=14;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01982;STB=0.501424;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0050257;OID=.;OPOS=1962394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:40:41:4:5:35:36:0.878049:14:21:2:2:14:22:3:2 chr17 2202943 . T C 737.97 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.799;QD=62.8062;RBI=0.0534135;REFB=0;REVB=0.000667359;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026957;OID=.;OPOS=2202943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:21:23:0:0:21:26:0:0 chr17 2203167 . T G 651.19 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.471;QD=62.0184;RBI=0.0461986;REFB=0;REVB=0.00809272;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000600124;OID=.;OPOS=2203167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0 chr17 2203348 . T C 220.29 PASS AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00802916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.216;QD=48.9524;RBI=0.0208426;REFB=0;REVB=0.019234;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194229;OID=.;OPOS=2203348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:7:9:0:0:9:9:0:0 chr17 2203453 . A G 603.34 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0794038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.796;QD=60.3337;RBI=0.0802827;REFB=0;REVB=-0.0118469;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181536;OID=.;OPOS=2203453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:20:18:0:0:20:20:0:0 chr17 2236404 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2164;QD=50.4117;RBI=0.0271788;REFB=0;REVB=0.0260587;RO=1;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340316;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631744;OID=.;OPOS=2236404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:1:0:18:19:1:13:5:0:1:14:5:0:0 chr17 2266799 . G A 976.48 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0776866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.959;QD=57.4402;RBI=0.13263;REFB=-0.111201;REVB=0.107497;RO=1;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129467;STB=0.506847;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00405512;OID=.;OPOS=2266799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:36:31:0:1:36:31:0:1 chr17 2266812 . T C 1135.25 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.362;QD=60.5465;RBI=0.0286297;REFB=0;REVB=0.0150395;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.26912e-05;OID=.;OPOS=2266812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0 chr17 2268311 . G A 1310.14 PASS AF=0.913462;AO=95;DP=105;FAO=95;FDP=104;FR=.;FRO=9;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0179338;FXX=0.0280348;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.097;QD=50.3898;RBI=0.0301562;REFB=-0.181434;REVB=0.024244;RO=2;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215415;STB=0.547358;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00418957;OID=.;OPOS=2268311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:105:104:2:9:95:95:0.913462:43:52:0:2:43:52:0:9 chr17 2559056 . C T 289.48 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00043784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.695;QD=25.7314;RBI=0.00135176;REFB=0.0097174;REVB=-0.00127889;RO=19;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391783;STB=0.521722;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=-0.00624244;OID=.;OPOS=2559056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:15:11:9:10:15:11:9:10 chr17 2588722 . TAA T 56.39 PASS AF=0.344828;AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0143099;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=2;MLLD=141.975;QD=7.77801;RBI=0.0338691;REFB=-0.00157122;REVB=-0.0306976;RO=19;SAF=5;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325653;STB=0.517207;STBP=0.947;TYPE=del;VARB=0.00118517;OID=.;OPOS=2588723;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.344828:9:30:10:29:19:5:5:10:9:56:19:5:4:10:9 chr17 2600186 . G A 589.81 PASS AF=0.431373;AO=66;DP=153;FAO=66;FDP=153;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=0.0563585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2173;QD=15.42;RBI=0.0657124;REFB=-0.0043718;REVB=0.0337911;RO=87;SAF=25;SAR=41;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108895;STB=0.560937;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.007457;OID=.;OPOS=2600186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:87:87:66:66:0.431373:41:25:42:45:41:25:42:45 chr17 2606715 . G A 524.87 PASS AF=0.39726;AO=58;DP=146;FAO=58;FDP=146;FR=.;FRO=88;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.0247619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.884;QD=14.3801;RBI=0.0316633;REFB=-0.0221418;REVB=0.0197335;RO=87;SAF=25;SAR=33;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624088;STB=0.50651;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0322725;OID=.;OPOS=2606715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:87:88:58:58:0.39726:33:25:37:50:33:25:37:51 chr17 2868935 . T C 786.92 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.783;QD=55.2224;RBI=0.026984;REFB=-0.0206691;REVB=-0.00702739;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177894;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000531913;OID=.;OPOS=2868935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:30:26:1:0:30:26:1:0 chr17 2883588 . C A 818.82 PASS AF=0.676768;AO=66;DP=98;FAO=67;FDP=99;FR=.;FRO=32;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00123641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7266;QD=33.0836;RBI=0.0382053;REFB=-0.000965891;REVB=-0.0381853;RO=32;SAF=33;SAR=33;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567162;STB=0.532681;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.000120581;OID=.;OPOS=2883588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:32:32:66:67:0.676768:33:33:13:19:33:34:13:19 chr17 2884545 . A G 419.43 PASS AF=0.615385;AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0115408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.31;QD=25.8111;RBI=0.0189717;REFB=0.0017972;REVB=0.0150577;RO=25;SAF=22;SAR=18;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133063;STB=0.572705;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.00457064;OID=.;OPOS=2884545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:25:25:40:40:0.615385:18:22:9:16:18:22:9:16 chr17 2937663 . T TA 417.27 PASS AF=0.608247;AO=54;DP=97;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.0749586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.1799;QD=17.2068;RBI=0.0934742;REFB=0.0138378;REVB=-0.0558449;RO=40;SAF=27;SAR=27;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11684;STB=0.581627;STBP=0.063;TYPE=ins;VARB=-0.00797989;OID=.;OPOS=2937664;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.608247:54:97:59:97:38:28:31:26:12:99:40:27:27:26:14 chr17 2940720 . C A 208.73 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.00932887;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.472;QD=18.9758;RBI=0.011906;REFB=-0.0226594;REVB=0.0073977;RO=23;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178614;STB=0.599914;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0430403;OID=.;OPOS=2940720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:14:7:4:19:14:7:4:19 chr17 2940759 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.901;QD=62.7621;RBI=0.0103938;REFB=0;REVB=-0.0083861;RO=0;SAF=28;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.04351e-06;OID=.;OPOS=2940759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:61:28:0:0:61:28:0:0 chr17 2966032 . C G 95.32 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0305577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3167;QD=34.6635;RBI=0.057608;REFB=-0.01676;REVB=-0.0488355;RO=1;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176689;STB=0.599781;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.00249327;OID=.;OPOS=2966032;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:8:2:1:0:8:2:1:0 chr17 2966173 . G C 283.87 PASS AF=0.330357;AO=37;DP=112;FAO=37;FDP=112;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=-0.00229146;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.999;QD=10.1381;RBI=0.0283224;REFB=-0.0181996;REVB=-0.0282296;RO=75;SAF=25;SAR=12;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111471;STB=0.564861;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0419783;OID=.;OPOS=2966173;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:75:75:37:37:0.330357:12:25:44:31:12:25:44:31 chr17 2966191 . G A 294.84 PASS AF=0.307692;AO=39;DP=129;FAO=40;FDP=130;FR=.;FRO=90;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=0.0259485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9047;QD=9.07191;RBI=0.0784578;REFB=-0.000538081;REVB=0.0740426;RO=90;SAF=28;SAR=11;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224095;STB=0.63729;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00365531;OID=.;OPOS=2966191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:90:90:39:40:0.307692:11:28:49:41:11:29:49:41 chr17 2966273 . G A 218.79 PASS AF=0.287129;AO=29;DP=101;FAO=29;FDP=101;FR=.;FRO=72;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.015603;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.307;QD=8.66512;RBI=0.0159721;REFB=-0.0110105;REVB=-0.00341386;RO=71;SAF=11;SAR=18;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883622;STB=0.558099;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0268283;OID=.;OPOS=2966273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:71:72:29:29:0.287129:18:11:32:39:18:11:33:39 chr17 2966308 . C T 189.33 PASS AF=0.304878;AO=25;DP=82;FAO=25;FDP=82;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0150576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3463;QD=9.2357;RBI=0.0416347;REFB=-0.00272902;REVB=-0.0388164;RO=57;SAF=10;SAR=15;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108789;STB=0.564304;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00748597;OID=.;OPOS=2966308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:57:57:25:25:0.304878:15:10:28:29:15:10:28:29 chr17 3101076 . G C 982.53 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0027648;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.708;QD=56.1444;RBI=0.0254946;REFB=-0.115873;REVB=0.0253443;RO=2;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230456;STB=0.512192;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00038288;OID=.;OPOS=3101076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:70:70:2:2:68:68:0.971429:40:28:0:2:40:28:0:2 chr17 3119008 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3372;QD=56.9381;RBI=0.0343252;REFB=0;REVB=-0.0342154;RO=0;SAF=39;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000301493;OID=.;OPOS=3119008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:14:39:0:0:14:39:0:0 chr17 3119397 . G T 292.0 PASS AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0354695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.159;QD=21.6295;RBI=0.0437845;REFB=-0.00785037;REVB=-0.0256709;RO=24;SAF=14;SAR=16;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404142;STB=0.522373;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00469098;OID=.;OPOS=3119397;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:16:14:10:14:16:14:10:14 chr17 3119611 . G A 439.45 PASS AF=0.441441;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=-0.0137684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3609;QD=15.8361;RBI=0.0262552;REFB=-0.00291182;REVB=0.0223554;RO=62;SAF=23;SAR=26;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174441;STB=0.597335;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00590476;OID=.;OPOS=3119611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:62:62:49:49:0.441441:26:23:40:22:26:23:40:22 chr17 3119767 . C T 269.18 PASS AF=0.351648;AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0426372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6037;QD=11.8321;RBI=0.0460276;REFB=0.0135152;REVB=-0.0173383;RO=58;SAF=18;SAR=14;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165115;STB=0.599938;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.0415649;OID=.;OPOS=3119767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:58:59:32:32:0.351648:14:18:24:34:14:18:24:35 chr17 3181384 . C T 215.5 PASS AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00141942;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.76;QD=13.0607;RBI=0.00151768;REFB=-0.00742975;REVB=0.000537207;RO=40;SAF=12;SAR=14;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040757;STB=0.523346;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0103678;OID=.;OPOS=3181384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:14:12:20:20:14:12:20:20 chr17 3195503 . C T 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.139;QD=61.0482;RBI=0.0219742;REFB=0;REVB=0.0116062;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81093e-05;OID=.;OPOS=3195503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:44:34:0:0:44:34:0:0 chr17 3213690 . T C 91.84 PASS AF=0.285714;AO=11;DP=41;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=5;FWDB=-0.0296979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.367;QD=8.74638;RBI=0.029846;REFB=-0.0170996;REVB=0.00297022;RO=30;SAF=3;SAR=8;SRF=25;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596499;STB=0.8165;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0393104;OID=.;OPOS=3213690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:42:30:30:11:12:0.285714:8:3:25:5:8:4:25:5 chr17 3214181 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.939;QD=51.9167;RBI=0.0698354;REFB=0;REVB=0.0594556;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868411;OID=.;OPOS=3214181;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr17 3301549 . G A 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.454;QD=56.705;RBI=0.0351116;REFB=0;REVB=0.0215875;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276815;OID=.;OPOS=3301549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr17 3324004 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2812;QD=35.5758;RBI=0.0934768;REFB=0;REVB=-0.088499;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00967169;OID=.;OPOS=3324004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr17 3324810 . A G 359.9 PASS AF=0.903226;AO=25;DP=28;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0392747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4064;QD=46.4387;RBI=0.0394974;REFB=0.00649342;REVB=-0.00418857;RO=2;SAF=10;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084107;STB=0.527426;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.00520896;OID=.;OPOS=3324810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:28:31:2:3:25:28:0.903226:15:10:2:0:17:11:2:1 chr17 3337057 . A G 805.18 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9964;QD=64.4143;RBI=0.0377635;REFB=0;REVB=0.0225861;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04589e-05;OID=.;OPOS=3337057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:16:34:0:0:16:34:0:0 chr17 3343519 . T C 269.5 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0194681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.12;QD=18.9121;RBI=0.0226923;REFB=-0.00659355;REVB=-0.0116591;RO=27;SAF=16;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358835;STB=0.527656;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0150455;OID=.;OPOS=3343519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:27:28:29:29:0.508772:13:16:16:11:13:16:17:11 chr17 3352294 . A G 486.48 PASS AF=0.666667;AO=44;DP=67;FAO=44;FDP=66;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00910131;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.032;QD=29.4835;RBI=0.0139768;REFB=-0.0167958;REVB=0.0106074;RO=22;SAF=22;SAR=22;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278935;STB=0.515145;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00896181;OID=.;OPOS=3352294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:22:22:44:44:0.666667:22:22:12:10:22:22:12:10 chr17 3352331 . C T 405.42 PASS AF=0.609375;AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0206427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.439;QD=25.3389;RBI=0.0270019;REFB=0.00495772;REVB=-0.0174063;RO=25;SAF=21;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013232;STB=0.507243;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.00459674;OID=.;OPOS=3352331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:25:25:39:39:0.609375:18:21:13:12:18:21:13:12 chr17 3397702 . C T 403.6 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00279624;FXX=0.0410903;HRUN=5;LEN=1;MLLD=122.155;QD=23.0629;RBI=0.0101447;REFB=-0.0018666;REVB=-0.00975173;RO=27;SAF=17;SAR=22;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787233;STB=0.536824;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0029619;OID=.;OPOS=3397702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:27:31:39:39:0.557143:22:17:9:18:22:17:11:20 chr17 3416555 . C A 197.54 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.096622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2839;QD=26.3384;RBI=0.0972478;REFB=-0.0703093;REVB=-0.0110148;RO=11;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120689;STB=0.567201;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0190779;OID=.;OPOS=3416555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:12:7:6:5:12:7:6:5 chr17 3422032 . G A 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.3;QD=60.3767;RBI=0.0265854;REFB=0;REVB=0.0246415;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19969e-05;OID=.;OPOS=3422032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:41:33:0:0:41:33:0:0 chr17 3422077 . G A 1062.43 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.238;QD=59.8554;RBI=0.054296;REFB=0;REVB=0.0403094;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470489;OID=.;OPOS=3422077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0 chr17 3445901 . T G 713.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807353;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.168;QD=63.4265;RBI=0.0275854;REFB=0;REVB=0.0263775;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00057737;OID=.;OPOS=3445901;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr17 3447914 . C T 160.28 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00107055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0138;QD=45.7947;RBI=0.00620109;REFB=0;REVB=0.00610798;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023804;OID=.;OPOS=3447914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr17 3458072 . T C 674.15 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792828;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.875;QD=62.7116;RBI=0.0142365;REFB=0;REVB=0.0118246;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41181e-05;OID=.;OPOS=3458072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0 chr17 3486702 . G A 85.67 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.00389824;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.767;QD=10.0784;RBI=0.0175935;REFB=0.00184508;REVB=-0.0171562;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291707;STB=0.666405;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00313929;OID=.;OPOS=3486702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:35:34:20:23:11:11:0.323529:6:5:4:16:6:5:5:18 chr17 3493200 . C G 265.18 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00195673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7812;QD=15.5987;RBI=0.0128808;REFB=0.0129247;REVB=0.0127313;RO=38;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118009;STB=0.566622;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=-0.0181336;OID=.;OPOS=3493200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:13:17:17:21:13:17:17:21 chr17 3495465 . C T 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.004818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.061;QD=18.6372;RBI=0.0293968;REFB=0.00313161;REVB=0.0289992;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113657;STB=0.564438;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.0040554;OID=.;OPOS=3495465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:7:9:11:5:7:9:11:5 chr17 3514028 . G C 575.74 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.586;QD=60.6041;RBI=0.0271917;REFB=0;REVB=-0.0214735;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279786;OID=.;OPOS=3514028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chr17 3553526 . A G 499.24 PASS AF=0.945946;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00350838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5318;QD=53.9718;RBI=0.010207;REFB=-0.02506;REVB=0.00958515;RO=2;SAF=21;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128728;STB=0.505615;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00745219;OID=.;OPOS=3553526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:37:2:2:34:35:0.945946:13:21:1:1:14:21:1:1 chr17 3561396 . C T 1098.42 PASS AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00326358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.454;QD=56.3293;RBI=0.0257208;REFB=-0.146342;REVB=0.0255129;RO=3;SAF=36;SAR=39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378057;STB=0.519995;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00134998;OID=.;OPOS=3561396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:78:78:3:3:75:75:0.961538:39:36:3:0:39:36:3:0 chr17 3563963 . C G 229.64 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0132583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.842;QD=22.4038;RBI=0.0173082;REFB=-0.0372273;REVB=-0.0111261;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089494;STB=0.536552;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0269022;OID=.;OPOS=3563963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:18:19:22:22:0.536585:11:11:7:11:11:11:8:11 chr17 3564400 . TT AG,TG 569.91 PASS AF=0.410256,0.589744;AO=16,23;DP=39;FAO=16,23;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8,8;FSAR=8,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00863568,-0.0295425;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=80.8581,107.781;QD=58.4527;RBI=0.0427173,0.043302;REFB=0,0;REVB=0.0418354,0.0316591;RO=0;SAF=8,8;SAR=8,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0255227,0.0309997;OID=.,.;OPOS=3564400,3564401;OREF=TT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:39:39:0:0:16,23:16,23:0.410256,0.589744:8,15:8,8:0:0:8,15:8,8:0:0 chr17 3568012 . A G 563.44 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0771865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.636;QD=57.7891;RBI=0.0785778;REFB=0.0123712;REVB=0.0147213;RO=1;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164445;STB=0.508767;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000151204;OID=.;OPOS=3568012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:28:10:0:1:28:10:0:1 chr17 3594276 . TGGGGGTC TGGGATCG,TGGGGTC 488.83 PASS AF=0.0714286,0.928571;AO=3,34;DP=43;FAO=3,39;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=3,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0571143,-0.0596648;FXX=0.0454442;HRUN=5,5;LEN=4,1;MLLD=223.886,15.1256;QD=46.5556;RBI=0.0595356,0.181934;REFB=0,0;REVB=-0.0168062,-0.171872;RO=0;SAF=0,8;SAR=3,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.0147632,-0.0150073;OID=.,.;OPOS=3594280,3594277;OREF=GGTC,G;OALT=ATCG,-;OMAPALT=TGGGATCG,TGGGGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0714286,0.928571:3,34:43:3,39:42:0:0,11:3,28:0:0:14:0:0,8:3,26:0:0 chr17 3627473 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.083;QD=35.5754;RBI=0.181546;REFB=0;REVB=0.104186;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00636431;OID=.;OPOS=3627473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr17 3627840 . G A 446.95 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.001;QD=57.6714;RBI=0.0402028;REFB=0;REVB=0.0181074;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217594;OID=.;OPOS=3627840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr17 3628067 . G A 141.33 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00932487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.922;QD=21.7422;RBI=0.00934263;REFB=-0.0181293;REVB=-0.000575787;RO=11;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163157;STB=0.592683;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00670963;OID=.;OPOS=3628067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:11:4:5:6:11:4:5:6 chr17 3628212 . T C 340.72 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0703187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.659;QD=54.5158;RBI=0.0711517;REFB=0;REVB=0.010855;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102979;OID=.;OPOS=3628212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0 chr17 3629698 . A G 1098.72 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.496;QD=60.2037;RBI=0.042643;REFB=0;REVB=0.0370871;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38692e-05;OID=.;OPOS=3629698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:27:46:0:0:27:46:0:0 chr17 3629848 . A G 255.84 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.758;QD=51.1684;RBI=0.0466626;REFB=0;REVB=-0.0347878;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112112;OID=.;OPOS=3629848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr17 3629867 . G A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.79;QD=42.1826;RBI=0.0627174;REFB=0;REVB=0.0586614;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000906391;OID=.;OPOS=3629867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0 chr17 3632836 . G A 397.6 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637739;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.234;QD=56.7995;RBI=0.0665944;REFB=0;REVB=0.0191757;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492746;OID=.;OPOS=3632836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0 chr17 3715351 . G A 236.5 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0766321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.36;QD=15.7665;RBI=0.0843187;REFB=-0.025132;REVB=-0.0351733;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297355;STB=0.526562;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0299248;OID=.;OPOS=3715351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:33:27:27:0.45:11:16:18:14:11:16:18:15 chr17 3749411 . T G 140.09 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0242475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8774;QD=20.7541;RBI=0.0343636;REFB=-0.0251754;REVB=0.0243499;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138827;STB=0.578839;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0279379;OID=.;OPOS=3749411;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:5:10:6:6:5:10:6:6 chr17 3818788 . G A 669.05 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0311731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.786;QD=58.1782;RBI=0.0330466;REFB=-0.131459;REVB=0.010969;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521729;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.000959592;OID=.;OPOS=3818788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:46:46:0:2:44:44:0.956522:22:22:0:0:22:22:2:0 chr17 3818830 . A G 689.37 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0804;QD=62.6701;RBI=0.0413562;REFB=0;REVB=-0.0385358;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194061;OID=.;OPOS=3818830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr17 3819002 . T C 575.7 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000736026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.685;QD=60.6004;RBI=0.0248082;REFB=0;REVB=0.0247973;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85683e-05;OID=.;OPOS=3819002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0 chr17 3828083 . ACCC ACC,ACCG 956.92 PASS AF=0.0447761,0.955224;AO=9,54;DP=67;FAO=3,64;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=1,29;FSAR=2,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0735214,0.195584;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=21.933,38.097;QD=57.1293;RBI=0.123467,0.202743;REFB=0,0;REVB=0.0991908,0.0533995;RO=0;SAF=9,20;SAR=0,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.77753e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00797507,0.00360451;OID=.,.;OPOS=3828084,3828086;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=ACC,ACCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0447761,0.955224:9,54:67:3,64:67:0:1,29:2,35:0:0:8:0:9,20:0,34:0:0 chr17 3828702 . T C 766.39 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.888;QD=56.7698;RBI=0.0391601;REFB=0;REVB=0.0156276;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.27623e-05;OID=.;OPOS=3828702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:54:0:0:51:54:1:22:29:0:0:22:32:0:0 chr17 3909404 . C A 251.64 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0252422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3699;QD=20.5421;RBI=0.0427761;REFB=-0.00858031;REVB=-0.0345344;RO=25;SAF=17;SAR=7;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584059;STB=0.532743;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0113475;OID=.;OPOS=3909404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:7:17:19:6:7:17:19:6 chr17 3947644 . T C 396.65 PASS AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0796758;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.8397;QD=17.2457;RBI=0.0804171;REFB=-0.0205861;REVB=0.0108943;RO=51;SAF=18;SAR=23;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274656;STB=0.51539;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0275968;OID=.;OPOS=3947644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:23:18:21:30:23:18:21:30 chr17 3953083 . T C 483.65 PASS AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00362009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.632;QD=23.0311;RBI=0.0178305;REFB=-0.00429827;REVB=-0.0174592;RO=37;SAF=29;SAR=17;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163928;STB=0.596476;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00324993;OID=.;OPOS=3953083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:37:38:46:46:0.547619:17:29:16:21:17:29:16:22 chr17 3953102 . A G 436.34 PASS AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0135488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.733;QD=21.285;RBI=0.0163436;REFB=-0.0200988;REVB=0.0091403;RO=38;SAF=28;SAR=15;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200374;STB=0.617114;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0119305;OID=.;OPOS=3953102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:39:43:43:0.52439:15:28:16:22:15:28:16:23 chr17 3966064 . A G 429.22 PASS AF=0.655738;AO=40;DP=61;FAO=40;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.013335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.472;QD=28.1458;RBI=0.014799;REFB=-0.0147656;REVB=0.00641764;RO=21;SAF=22;SAR=18;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016688;STB=0.509086;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00770401;OID=.;OPOS=3966064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:21:21:40:40:0.655738:18:22:11:10:18:22:11:10 chr17 3968064 . A C 269.24 PASS AF=0.648649;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00486501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.55;QD=29.1071;RBI=0.0439661;REFB=-0.00828996;REVB=-0.0436961;RO=12;SAF=14;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151383;STB=0.596333;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0132628;OID=.;OPOS=3968064;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:12:13:24:24:0.648649:10:14:4:8:10:14:4:9 chr17 3977532 . G A 320.14 PASS AF=0.559322;AO=32;DP=58;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00899616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.577;QD=21.7046;RBI=0.024245;REFB=-0.00960285;REVB=-0.0225142;RO=26;SAF=13;SAR=19;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459175;STB=0.516726;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00547385;OID=.;OPOS=3977532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:26:26:32:33:0.559322:19:13:12:14:19:14:12:14 chr17 3979949 . G A 175.86 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00425272;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.65;QD=13.793;RBI=0.0194944;REFB=-0.0156336;REVB=-0.0190249;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139375;STB=0.578869;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0246252;OID=.;OPOS=3979949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:29:31:20:20:0.392157:11:9:17:12:11:9:18:13 chr17 3999199 . C T 375.72 PASS AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.00460936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.758;QD=14.5911;RBI=0.0132176;REFB=-0.000509312;REVB=-0.0123878;RO=60;SAF=18;SAR=25;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135931;STB=0.576626;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00159597;OID=.;OPOS=3999199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:25:18:33:27:25:18:33:27 chr17 4015997 . A G 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0247994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.597;QD=14.1699;RBI=0.0338938;REFB=-0.0182697;REVB=0.0231037;RO=12;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198747;STB=0.617401;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00947754;OID=.;OPOS=4015997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:3:7:6:6:3:7:6:6 chr17 4067552 . C T 264.79 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0568248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1055;QD=20.7678;RBI=0.0576395;REFB=-0.00193912;REVB=-0.00965681;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238106;STB=0.513265;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00142336;OID=.;OPOS=4067552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:15:12:10:14:15:12:10:14 chr17 4069735 . C A 480.19 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=102;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0200841;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.953;QD=19.0173;RBI=0.0205462;REFB=-0.0161235;REVB=0.00433279;RO=50;SAF=26;SAR=24;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544429;STB=0.534592;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0163903;OID=.;OPOS=4069735;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:50:51:50:50:0.49505:24:26:29:21:24:26:30:21 chr17 4084608 . C T 260.11 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00691535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5527;QD=16.7813;RBI=0.00778677;REFB=-0.0308304;REVB=-0.00357936;RO=33;SAF=15;SAR=14;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878763;STB=0.549356;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0270945;OID=.;OPOS=4084608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:14:15:14:19:14:15:14:19 chr17 4088291 . C T 306.31 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.253;QD=53.271;RBI=0.0157386;REFB=0;REVB=0.00275468;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175594;OID=.;OPOS=4088291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr17 4337412 . C G 152.9 PASS AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0268594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.646;QD=10.3659;RBI=0.0281867;REFB=-0.017082;REVB=0.00854763;RO=39;SAF=7;SAR=13;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159625;STB=0.593928;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0229057;OID=.;OPOS=4337412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:13:7:19:20:13:7:19:20 chr17 4440907 . A G 310.03 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0253462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8468;QD=18.7898;RBI=0.0424568;REFB=-0.0191521;REVB=-0.034061;RO=33;SAF=19;SAR=14;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562232;STB=0.531291;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0148173;OID=.;OPOS=4440907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:14:19:21:12:14:19:21:12 chr17 4446457 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0238639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.891;QD=19.0179;RBI=0.0289652;REFB=-0.0220963;REVB=0.0164164;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285692;STB=0.660189;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0192003;OID=.;OPOS=4446457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:7:8:12:2:7:8:12:2 chr17 4453620 . T C 139.47 PASS AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.00418094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.406;QD=9.14564;RBI=0.00424997;REFB=-0.0095807;REVB=0.000762884;RO=41;SAF=8;SAR=11;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214967;STB=0.633762;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0236797;OID=.;OPOS=4453620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:41:42:19:19:0.311475:11:8:25:16:11:8:26:16 chr17 4455500 . T C 787.47 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132392;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.61;QD=57.2709;RBI=0.0135256;REFB=0;REVB=-0.00276859;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.81405e-05;OID=.;OPOS=4455500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0 chr17 4461748 . G A 58.79 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0239254;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.175;QD=13.0635;RBI=0.0248256;REFB=-0.0162084;REVB=0.0066246;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108737;STB=0.571247;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0169764;OID=.;OPOS=4461748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:18:18:8:10:8:8:0.444444:3:5:4:4:3:5:5:5 chr17 4463023 . G A 1572.76 PASS AF=0.964286;AO=108;DP=113;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0271603;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.352;QD=56.17;RBI=0.0409268;REFB=-0.121554;REVB=0.0306157;RO=3;SAF=59;SAR=49;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235212;STB=0.507347;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.000566025;OID=.;OPOS=4463023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:113:112:3:4:108:108:0.964286:49:59:3:0:49:59:3:1 chr17 4497160 . T C,G 350.38 PASS AF=0.923077,0.0769231;AO=24,2;DP=27;FAO=24,2;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=15,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233296,0.00383655;FXX=0.0370233;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=95.9342,86.4947;QD=53.904;RBI=0.0410688,0.0163371;REFB=0,0;REVB=0.0337991,0.0158802;RO=0;SAF=9,0;SAR=15,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00695073,-0.0225324;OID=.,.;OPOS=4497160,4497160;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:27:26:0:0:24,2:24,2:0.923077,0.0769231:15,2:9,0:0:0:15,2:9,0:0:0 chr17 4545581 . C T 420.45 PASS AF=0.911765;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=34;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.167733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.466;QD=49.4647;RBI=0.168106;REFB=-0.164211;REVB=0.0111891;RO=3;SAF=12;SAR=19;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103249;STB=0.555519;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00348537;OID=.;OPOS=4545581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:34:34:3:3:31:31:0.911765:19:12:3:0:19:12:3:0 chr17 4575283 . A G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.534;QD=58.1419;RBI=0.0212936;REFB=0;REVB=0.0181744;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02147e-05;OID=.;OPOS=4575283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr17 4620497 . C T 402.25 PASS AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0999106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6551;QD=48.7578;RBI=0.104202;REFB=-0.052884;REVB=-0.0295957;RO=3;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075438;STB=0.540514;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0278003;OID=.;OPOS=4620497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:33:33:3:3:30:30:0.909091:17:13:0:3:17:13:0:3 chr17 4622638 . C T 363.75 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071217;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9921;QD=55.9619;RBI=0.0350049;REFB=0;REVB=0.0342728;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124553;OID=.;OPOS=4622638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:22:4:0:0:22:4:0:0 chr17 4622686 . C T 78.65 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0203379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.99;QD=14.9809;RBI=0.0217641;REFB=-0.0129735;REVB=0.00774899;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174364;STB=0.599828;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0084965;OID=.;OPOS=4622686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:8:2:1:10:8:2:1:10 chr17 4637886 . G A 1282.49 PASS AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.887;QD=61.071;RBI=0.0373554;REFB=0;REVB=0.02637;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94795e-05;OID=.;OPOS=4637886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:82:84:1:39:43:0:0:39:45:0:0 chr17 4638484 . T C 780.12 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137218;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.777;QD=56.7363;RBI=0.0592576;REFB=0;REVB=0.057647;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095159;OID=.;OPOS=4638484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:21:33:0:0:22:33:0:0 chr17 4638563 . G A 1097.6 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.019;QD=60.1426;RBI=0.0182185;REFB=0;REVB=-0.000992221;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.81737e-05;OID=.;OPOS=4638563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:25:47:0:0:25:48:0:0 chr17 4638737 . A G 501.61 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.514;QD=59.0134;RBI=0.0167715;REFB=0;REVB=-0.00313528;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95731e-05;OID=.;OPOS=4638737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:20:13:0:0:21:13:0:0 chr17 4641755 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154131;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.364;QD=60.9786;RBI=0.0157221;REFB=0;REVB=0.0031019;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97905e-05;OID=.;OPOS=4641755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0 chr17 4645324 . T C 255.35 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0109113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8468;QD=17.9196;RBI=0.0155034;REFB=-0.00104686;REVB=-0.0110136;RO=29;SAF=6;SAR=22;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320324;STB=0.681274;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.000561874;OID=.;OPOS=4645324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:22:6:15:14:22:6:15:14 chr17 4649378 . T C 211.74 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0317184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0856;QD=19.6968;RBI=0.0322911;REFB=-0.0129278;REVB=0.0060546;RO=22;SAF=3;SAR=18;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385193;STB=0.721973;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0149957;OID=.;OPOS=4649378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:18:3:10:12:18:3:10:12 chr17 4684095 . G A 344.05 PASS AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0162641;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.668;QD=31.2776;RBI=0.0300948;REFB=-0.00549918;REVB=0.0253215;RO=15;SAF=25;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209876;STB=0.616347;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00248361;OID=.;OPOS=4684095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:4:25:10:5:4:25:10:5 chr17 4684133 . G C 323.93 PASS AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0803977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5769;QD=28.7939;RBI=0.156432;REFB=-0.0387974;REVB=0.134191;RO=17;SAF=25;SAR=3;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189104;STB=0.60545;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0391486;OID=.;OPOS=4684133;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:3:25:13:4:3:25:13:4 chr17 4686414 . A C 439.49 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0238105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.384;QD=21.9743;RBI=0.0243271;REFB=-0.0304911;REVB=0.00498671;RO=35;SAF=18;SAR=25;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555866;STB=0.520811;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.023202;OID=.;OPOS=4686414;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:35:37:43:43:0.5375:25:18:17:18:24:19:18:19 chr17 4686463 . A ACGCCTACCTGGCT 73.76 PASS AF=0.206897;AO=11;DP=60;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0200035;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=13;MLLD=327.312;QD=5.08656;RBI=0.0205946;REFB=-0.0134113;REVB=-0.00489863;RO=47;SAF=1;SAR=10;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510163;STB=0.861217;STBP=0.02;TYPE=ins;VARB=0.0412803;OID=.;OPOS=4686464;OREF=-;OALT=CGCCTACCTGGCT;OMAPALT=ACGCCTACCTGGCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.206897:11:60:12:58:46:1:11:20:26:73:47:1:10:20:27 chr17 4689572 . T C 98.54 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0802097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.813;QD=14.0766;RBI=0.0914886;REFB=-0.035856;REVB=-0.0440064;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147216;STB=0.586802;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0334478;OID=.;OPOS=4689572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:9:3:6:10:9:3:6:10 chr17 4693054 . G A 113.84 PASS AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0110511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.894;QD=9.89897;RBI=0.0178368;REFB=-0.0178992;REVB=-0.0140009;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438412;STB=0.549928;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0456494;OID=.;OPOS=4693054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:32:14:14:0.304348:6:8:16:14:6:8:16:16 chr17 4693170 . T C 170.21 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.142;QD=45.3891;RBI=0.151097;REFB=0;REVB=0.0186152;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00496619;OID=.;OPOS=4693170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:12:2:0:0:12:3:0:0 chr17 4712395 . A T 213.34 PASS AF=1;AO=14;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0730379;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.341;QD=50.197;RBI=0.0730693;REFB=0;REVB=0.00214163;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000948466;OID=.;OPOS=4712395;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:17:0:0:14:17:1:5:9:0:0:5:12:0:0 chr17 4721376 . A G 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00100513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.612;QD=19.0179;RBI=0.00148295;REFB=-0.00489132;REVB=-0.00109035;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156623;STB=0.588672;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00398795;OID=.;OPOS=4721376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:7:8:10:4:7:8:10:4 chr17 4722133 . C T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.54;QD=44.6898;RBI=0.0375167;REFB=0;REVB=-0.00479948;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.7304e-05;OID=.;OPOS=4722133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0 chr17 4796271 . C T 184.71 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.000571095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.984;QD=12.1121;RBI=0.0318251;REFB=-0.0283091;REVB=-0.03182;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037694;STB=0.529889;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0513134;OID=.;OPOS=4796271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:38:23:23:0.377049:11:12:18:19:11:12:18:20 chr17 4796274 . T C 885.35 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.777;QD=58.0556;RBI=0.00989993;REFB=0;REVB=-0.00555537;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3286e-05;OID=.;OPOS=4796274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0 chr17 4796286 . C T 815.6 PASS AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0280695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.993;QD=52.6193;RBI=0.0455696;REFB=-0.168457;REVB=0.0358984;RO=2;SAF=27;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336704;STB=0.526307;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00103396;OID=.;OPOS=4796286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:62:62:2:3:59:59:0.951613:32:27:2:0:32:27:3:0 chr17 4801125 . C G 38.14 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0865741;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.477;QD=10.1709;RBI=0.0866282;REFB=0.00167378;REVB=-0.00306211;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129519;STB=0.578703;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.0043615;OID=.;OPOS=4801125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:2:7:4:2:2:7 chr17 4801163 . C A 64.59 PASS AF=0.642857;AO=8;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=246.833;QD=18.454;RBI=0.00470528;REFB=0.0019282;REVB=-0.00470528;RO=5;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000318484;OID=.;OPOS=4801163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:14:14:5:5:8:9:0.642857:8:0:0:5:9:0:0:5 chr17 4801286 . C T 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=-0.0559025;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=296.009;QD=8.69143;RBI=0.0571195;REFB=-0.00492373;REVB=-0.0117281;RO=17;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490452;STB=0.773846;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00912766;OID=.;OPOS=4801286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:7:1:0:17:7:1:0:17 chr17 4801288 . A C 53.66 PASS AF=0.36;AO=10;DP=26;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0.0975303;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.752;QD=8.58601;RBI=0.0991112;REFB=-0.0122863;REVB=0.0176317;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42374;STB=0.749693;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0659755;OID=.;OPOS=4801288;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:25:16:16:10:9:0.36:9:1:0:16:8:1:0:16 chr17 4836973 . A G 154.78 PASS AF=0.592593;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0272174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.074;QD=22.9302;RBI=0.0273012;REFB=-0.0112379;REVB=0.00213753;RO=11;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252524;STB=0.523779;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00703583;OID=.;OPOS=4836973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:26:27:11:11:15:16:0.592593:5:10:7:4:5:11:7:4 chr17 4837660 . A C 203.51 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0233142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.482;QD=30.1499;RBI=0.0244001;REFB=-0.00974026;REVB=-0.00719835;RO=8;SAF=11;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430588;STB=0.523784;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0040142;OID=.;OPOS=4837660;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:8:11:4:4:8:11:4:4 chr17 4849284 . G A 276.22 PASS AF=0.537037;AO=26;DP=51;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0405796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6548;QD=20.4604;RBI=0.067249;REFB=-0.033508;REVB=0.0536258;RO=25;SAF=7;SAR=19;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368689;STB=0.655065;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0406373;OID=.;OPOS=4849284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:25:25:26:29:0.537037:19:7:17:8:19:10:17:8 chr17 4856376 . A G 193.19 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0204442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.715;QD=16.4421;RBI=0.026514;REFB=-0.0202262;REVB=-0.0168826;RO=26;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211223;STB=0.612785;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0346011;OID=.;OPOS=4856376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:27:20:20:0.425532:6:14:13:13:6:14:14:13 chr17 4862645 . CAT C,CAC 140.25 PASS AF=0.538462,0.0384615;AO=13,2;DP=27;FAO=14,1;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=8,1;FSAR=6,0;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0258343,-0.0703077;FXX=0.0370233;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=177.508,96.502;QD=21.5769;RBI=0.0264774,0.0822102;REFB=-0.0824544,-0.0240148;REVB=0.00580017,0.0426068;RO=10;SAF=8,1;SAR=5,1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0696635,-0.213474;STB=0.57133,0.985328;STBP=0.484,0.563;TYPE=del,snp;VARB=0.0415193,0.0974249;OID=.,.;OPOS=4862646,4862647;OREF=AT,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.538462,0.0384615:13,2:27:14,1:26:11:8,1:6,0:8:3:91:10:8,1:5,1:7:3 chr17 4863410 . A G 344.0 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0415829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3653;QD=52.9234;RBI=0.0651638;REFB=0;REVB=-0.0501715;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157392;OID=.;OPOS=4863410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0 chr17 4875566 . T C 79.55 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0115166;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.86;QD=13.8343;RBI=0.0156084;REFB=-0.0213023;REVB=-0.0105352;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154027;STB=0.509073;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0279563;OID=.;OPOS=4875566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:24:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:8:5:4:6:8:5 chr17 4883045 . C T 129.27 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.00487929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.38;QD=21.5448;RBI=0.00508633;REFB=-0.00349185;REVB=0.00143642;RO=8;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282875;STB=0.689409;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.000471178;OID=.;OPOS=4883045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:8:10:14:14:0.583333:8:6:7:1:8:6:9:1 chr17 4883450 . T C 37.63 PASS AF=0.6;AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0270861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.547;QD=15.0534;RBI=0.0447792;REFB=-0.00558969;REVB=0.0356583;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268008;STB=0.571183;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0118143;OID=.;OPOS=4883450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:5:6:0.6:1:4:2:2:2:4:2:2 chr17 4890932 . C A 56.22 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0403971;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.514;QD=11.2434;RBI=0.0923053;REFB=0.000413807;REVB=0.082996;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448594;STB=0.52696;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00227982;OID=.;OPOS=4890932;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:8:4:3:5:8:4 chr17 4892176 . C G 205.08 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0216771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.8378;QD=16.406;RBI=0.030716;REFB=-0.020803;REVB=-0.0217617;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180526;STB=0.60293;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0456503;OID=.;OPOS=4892176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:10:19:10:11:10:19 chr17 4904564 . T C 195.78 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0383276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0499;QD=17.7978;RBI=0.0390945;REFB=-0.0255577;REVB=-0.0077055;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176508;STB=0.51004;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0261914;OID=.;OPOS=4904564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:13:7:8:16:13:7:8:16 chr17 4936336 . A T 187.38 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.00873891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.321;QD=14.6966;RBI=0.0148086;REFB=-0.0129453;REVB=-0.0119552;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259893;STB=0.655598;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.018608;OID=.;OPOS=4936336;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:29:30:21:21:0.411765:9:12:9:20:9:12:9:21 chr17 4937575 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.993;QD=43.4849;RBI=0.0316279;REFB=0;REVB=0.0191641;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697668;OID=.;OPOS=4937575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:1:11:0:0:1:11:0:0 chr17 4996915 . AC A 88.11 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.241;QD=39.1599;RBI=0.117735;REFB=0;REVB=-0.0248474;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00197646;OID=.;OPOS=4996916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:9:9:9:9:0:4:5:0:0:4:0:4:5:0:0 chr17 4997039 . G C 417.97 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0773673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6199;QD=53.932;RBI=0.0818589;REFB=0.0408791;REVB=0.0267429;RO=1;SAF=20;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227444;STB=0.512187;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.0028971;OID=.;OPOS=4997039;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:10:20:1:0:10:20:1:0 chr17 4997433 . G A 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9207;QD=56.7049;RBI=0.0626131;REFB=0;REVB=0.0614599;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134469;OID=.;OPOS=4997433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr17 4997787 . A G 651.17 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.29;QD=62.016;RBI=0.0219336;REFB=0;REVB=0.0184051;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13081e-05;OID=.;OPOS=4997787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr17 4998030 . G C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8695;QD=48.7367;RBI=0.0358927;REFB=0;REVB=-0.0335212;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000526627;OID=.;OPOS=4998030;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr17 4998586 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00234493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.246;QD=44.6898;RBI=0.00241839;REFB=0;REVB=-0.000591546;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92466e-05;OID=.;OPOS=4998586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr17 4998852 . G C 410.96 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.033;QD=56.6837;RBI=0.0226599;REFB=0;REVB=-0.00547107;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65552e-05;OID=.;OPOS=4998852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr17 5036210 . TC GT 33.34 PASS AF=0.109375;AO=7;DP=65;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0248086;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=2;MLLD=138.631;QD=2.08394;RBI=0.0363873;REFB=-0.00682806;REVB=-0.0266189;RO=56;SAF=3;SAR=4;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628279;STB=0.555893;STBP=0.787;TYPE=mnp;VARB=0.0342428;OID=.;OPOS=5036210;OREF=TC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:65:64:56:57:7:7:0.109375:4:3:27:29:4:3:28:29 chr17 5036214 . C T 33.49 PASS AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0302969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.818;QD=2.09323;RBI=0.0331713;REFB=-0.00197323;REVB=-0.0135069;RO=55;SAF=3;SAR=4;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07314;STB=0.540424;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0300261;OID=.;OPOS=5036214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:64:64:55:57:7:7:0.109375:4:3:27:28:4:3:27:30 chr17 5036224 . C G 34.41 PASS AF=0.112903;AO=7;DP=62;FAO=7;FDP=62;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0322063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.863;QD=2.21991;RBI=0.0372854;REFB=-0.00544499;REVB=-0.0187871;RO=54;SAF=3;SAR=4;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623475;STB=0.539422;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0449789;OID=.;OPOS=5036224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:62:62:54:55:7:7:0.112903:4:3:26:28:4:3:26:29 chr17 5036249 . G T 38.42 PASS AF=0.12963;AO=6;DP=53;FAO=7;FDP=54;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0140868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.161;QD=2.84582;RBI=0.0237679;REFB=-0.00321262;REVB=-0.0191435;RO=47;SAF=3;SAR=3;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036924;STB=0.53466;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0329968;OID=.;OPOS=5036249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:53:54:47:47:6:7:0.12963:3:3:22:25:4:3:22:25 chr17 5036274 . C A 66.21 PASS AF=0.192308;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.000434173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.751;QD=5.09326;RBI=0.0115616;REFB=0.0022415;REVB=-0.0115534;RO=41;SAF=4;SAR=6;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790995;STB=0.562374;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00734807;OID=.;OPOS=5036274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:52:52:41:42:10:10:0.192308:6:4:19:22:6:4:20:22 chr17 5036281 . G C 68.2 PASS AF=0.204082;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00840344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.928;QD=5.56747;RBI=0.0162555;REFB=-0.00234506;REVB=-0.0139149;RO=39;SAF=4;SAR=6;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107658;STB=0.570106;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00735244;OID=.;OPOS=5036281;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:39:39:10:10:0.204082:6:4:19:20:6:4:19:20 chr17 5042422 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.868;QD=55.6561;RBI=0.0343257;REFB=0;REVB=-0.0268298;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000382329;OID=.;OPOS=5042422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr17 5042699 . CGTTTTT CGTTTTC,TCGTTTT 35.19 PASS AF=0.132075,0;AO=5,2;DP=54;FAO=7,0;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=6,0;FSAR=1,0;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0195655,0.0540916;FXX=0.0185151;HRUN=5,1;LEN=1,3;MLLD=26.9261,32.361;QD=2.65617;RBI=0.220553,0.203026;REFB=-0.0461788,-0.0383632;REVB=-0.219683,-0.195688;RO=34;SAF=4,0;SAR=1,2;SRF=23;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.178609,-0.533328;STB=0.78339,0.5;STBP=0.158,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.236321,0;OID=.,.;OPOS=5042705,5042699;OREF=T,CGT;OALT=C,TCG;OMAPALT=CGTTTTC,TCGTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:54:53:34:46:5,2:7,0:0.132075,0:1,2:4,0:23:11:1,0:6,0:27:19 chr17 5042894 . T C 1877.87 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00741166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.131;QD=61.5694;RBI=0.0169954;REFB=0;REVB=0.0152942;RO=0;SAF=52;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37489e-05;OID=.;OPOS=5042894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:70:52:0:0:70:52:0:0 chr17 5071236 . A G 158.06 PASS AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00496566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.459;QD=9.87901;RBI=0.0248856;REFB=-0.0306877;REVB=-0.0243852;RO=42;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187552;STB=0.601674;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0702224;OID=.;OPOS=5071236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:43:21:21:0.328125:9:12:17:25:9:12:18:25 chr17 5084763 . G A 542.26 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440835;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2055;QD=60.2513;RBI=0.0501552;REFB=0;REVB=-0.0239205;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97813e-05;OID=.;OPOS=5084763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:24:11:0:0:25:11:0:0 chr17 5085161 . A C 285.29 PASS AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.000180587;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.817;QD=15.2153;RBI=0.0285518;REFB=-0.00703588;REVB=0.0285512;RO=43;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680902;STB=0.538438;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00542692;OID=.;OPOS=5085161;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:18:14:16:27:18:14:16:27 chr17 5085857 . C T 1083.73 PASS AF=1;AO=66;DP=68;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.559;QD=59.3825;RBI=0.0375581;REFB=0;REVB=0.0045079;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75267e-05;OID=.;OPOS=5085857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:73:0:0:66:73:1:31:35:0:0:32:41:0:0 chr17 5280440 . T C 771.69 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00334846;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6829;QD=64.3071;RBI=0.0358467;REFB=0;REVB=0.0356899;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000656658;OID=.;OPOS=5280440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:15:33:0:0:15:33:0:0 chr17 5284698 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=324.828;QD=61.3364;RBI=0.018836;REFB=0;REVB=0.0128806;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49631e-05;OID=.;OPOS=5284698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr17 5284719 . T C 668.5 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.633;QD=62.1859;RBI=0.0569491;REFB=0;REVB=0.056719;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148088;OID=.;OPOS=5284719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr17 5284770 . G A,T 653.91 PASS AF=0.976744,0.0232558;AO=41,2;DP=43;FAO=42,1;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23,1;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372463,0.0375815;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=229.282,140.989;QD=60.8287;RBI=0.0375614,0.0412273;REFB=0,0;REVB=0.00485521,-0.0169507;RO=0;SAF=22,2;SAR=19,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000153266,0.0928331;OID=.,.;OPOS=5284770,5284770;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:43:43:0:0:41,2:42,1:0.976744,0.0232558:19,0:22,2:0:0:19,0:23,1:0:0 chr17 5287297 . AG A 725.86 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105654;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.9594;QD=50.0591;RBI=0.141601;REFB=0;REVB=-0.0942765;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.537815;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00440941;OID=.;OPOS=5287298;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:58:59:58:58:0:21:37:0:0:13:0:21:37:0:0 chr17 5288760 . A G 692.39 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.638;QD=61.5456;RBI=0.105097;REFB=0;REVB=0.0249188;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103568;OID=.;OPOS=5288760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:45:0:0:41:45:1:14:27:0:0:15:30:0:0 chr17 5288769 . CA C 628.4 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00385788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4524;QD=57.1269;RBI=0.0117671;REFB=0;REVB=0.0111167;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000326804;OID=.;OPOS=5288770;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:43:44:44:44:0:29:15:0:0:4:0:28:15:0:0 chr17 5288794 . G C 557.1 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.117;QD=60.2274;RBI=0.0464956;REFB=0;REVB=-0.0359976;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120345;OID=.;OPOS=5288794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0 chr17 5289580 . A G 651.06 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.505;QD=62.0053;RBI=0.0343578;REFB=0;REVB=-9.32053e-05;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259251;OID=.;OPOS=5289580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr17 5290033 . T C 776.4 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7399;QD=55.4573;RBI=0.0532496;REFB=-0.0753421;REVB=0.011669;RO=1;SAF=28;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165384;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00402431;OID=.;OPOS=5290033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:56:56:1:0:55:56:1:27:28:1:0:27:29:0:0 chr17 5290703 . G A 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00960465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.266;QD=61.6949;RBI=0.00961725;REFB=0;REVB=-0.000492072;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30193e-05;OID=.;OPOS=5290703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0 chr17 5294976 . T A 804.53 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014042;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.066;QD=57.4665;RBI=0.0147266;REFB=0;REVB=0.00443815;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89637e-05;OID=.;OPOS=5294976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr17 5308377 . C T 872.84 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124868;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.392;QD=57.2352;RBI=0.028256;REFB=-0.139458;REVB=0.0253472;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34051e-05;OID=.;OPOS=5308377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0 chr17 5326089 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.289;QD=55.6561;RBI=0.027389;REFB=0;REVB=0.0197588;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176938;OID=.;OPOS=5326089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr17 5326145 . C G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.794;QD=56.7066;RBI=0.0235722;REFB=0;REVB=-0.00814183;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255832;OID=.;OPOS=5326145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr17 5326162 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.601;QD=54.5176;RBI=0.04087;REFB=0;REVB=-0.0108116;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000570413;OID=.;OPOS=5326162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr17 5328633 . G A 250.85 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.86;QD=50.1697;RBI=0.0671563;REFB=0;REVB=0.0654147;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570832;OID=.;OPOS=5328633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:7:12:0:0:8:12:0:0 chr17 5328662 . T C 45.77 PASS AF=0.333333;AO=2;DP=16;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00497863;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=155.611;QD=8.71811;RBI=0.0241731;REFB=-0.00179163;REVB=0.0236548;RO=0;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000945582;OID=.;OPOS=5328662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:16:21:0:14:2:7:0.333333:0:2:0:0:3:4:8:6 chr17 5334850 . G A 575.78 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00842965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1021;QD=60.6088;RBI=0.0255449;REFB=0;REVB=-0.024114;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204008;OID=.;OPOS=5334850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr17 5334873 . GA G,GG 726.82 PASS AF=0.924528,0.0754717;AO=49,4;DP=54;FAO=49,4;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17,2;FSAR=32,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127404,-0.00194234;FXX=0.0185151;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=27.536,8.47304;QD=54.854;RBI=0.0143942,0.00520369;REFB=0,0;REVB=-0.00669884,0.00482759;RO=0;SAF=17,2;SAR=32,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.70321e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00995975,0.0391281;OID=.,.;OPOS=5334874,5334874;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.924528,0.0754717:49,4:54:49,4:53:0:17,2:32,2:0:0:16:0:17,2:32,2:0:0 chr17 5347576 . G A 1084.21 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296121;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.473;QD=60.2338;RBI=0.0479448;REFB=0;REVB=0.0377072;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033301;OID=.;OPOS=5347576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0 chr17 5356913 . C T 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0152527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=354.722;QD=10.3792;RBI=0.0183032;REFB=-0.0128684;REVB=-0.0101175;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484;STB=0.529345;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.01953;OID=.;OPOS=5356913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:6:10:6:3:6:10 chr17 5393461 . T C 463.68 PASS AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0544759;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1523;QD=18.0071;RBI=0.0544981;REFB=0.00207401;REVB=0.0015526;RO=53;SAF=17;SAR=33;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198431;STB=0.610329;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0019839;OID=.;OPOS=5393461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:33:17:29:24:33:17:29:24 chr17 5393603 . C T 203.31 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.018701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.812;QD=21.979;RBI=0.019775;REFB=-0.0110238;REVB=0.00642839;RO=16;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173878;STB=0.612074;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00604309;OID=.;OPOS=5393603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:16:17:20:20:0.540541:13:7:9:7:13:7:10:7 chr17 5393784 . T TTTAA 77.47 PASS AF=0.297297;AO=9;DP=41;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0177042;FXX=0.0512689;HRUN=3;LEN=4;MLLD=245.503;QD=8.37553;RBI=0.0229457;REFB=-0.0179531;REVB=-0.0145969;RO=32;SAF=6;SAR=3;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549173;STB=0.543402;STBP=0.787;TYPE=ins;VARB=0.0518036;OID=.;OPOS=5393785;OREF=-;OALT=TTAA;OMAPALT=TTTAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.297297:9:41:11:37:26:7:4:18:8:77:32:6:3:20:12 chr17 5404011 . T C 279.95 PASS AF=0.450704;AO=27;DP=66;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00849418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.059;QD=15.772;RBI=0.0148505;REFB=-0.0226559;REVB=0.0121814;RO=38;SAF=9;SAR=18;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517788;STB=0.500544;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0215738;OID=.;OPOS=5404011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:71:38:39:27:32:0.450704:18:9:11:27:23:9:11:28 chr17 5418107 . G A 282.5 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0205525;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.577;QD=16.6177;RBI=0.0210246;REFB=-0.0203543;REVB=0.00443009;RO=37;SAF=14;SAR=17;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338983;STB=0.519072;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0271096;OID=.;OPOS=5418107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:37:37:31:31:0.455882:17:14:18:19:17:14:18:19 chr17 5418799 . G A 413.84 PASS AF=0.525641;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0111955;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.485;QD=21.2226;RBI=0.0297854;REFB=-0.0363411;REVB=-0.0276013;RO=37;SAF=9;SAR=32;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148642;STB=0.582738;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0402933;OID=.;OPOS=5418799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:37:37:41:41:0.525641:32:9:13:24:32:9:13:24 chr17 5424886 . G A 297.83 PASS AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.01796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3738;QD=15.884;RBI=0.0220756;REFB=0.0301366;REVB=0.0128362;RO=42;SAF=15;SAR=18;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216232;STB=0.512188;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=-0.0371808;OID=.;OPOS=5424886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:18:15:20:22:18:15:20:22 chr17 5424982 . C CG,G 34.84 PASS AF=0.0909091,0;AO=12,6;DP=84;FAO=7,0;FDP=77;FR=.;FRO=70;FSAF=1,0;FSAR=6,0;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.0276215,-0.0269741;FXX=0.0833234;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=32.8205,45.9641;QD=1.80976;RBI=0.0832533,0.0990165;REFB=-0.00171672,0.000472774;REVB=-0.0785377,-0.0952715;RO=64;SAF=3,0;SAR=9,6;SRF=34;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.353038,-0.593983;STB=0.846311,0.5;STBP=0.065,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0863348,0.112304;OID=.,.;OPOS=5424983,5424982;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:84:77:64:70:12,6:7,0:0.0909091,0:9,6:3,0:34:30:6,0:1,0:36:34 chr17 5425077 . T C 236.59 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0087432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.687;QD=15.7729;RBI=0.0219178;REFB=-0.0170823;REVB=-0.0200985;RO=33;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016893;STB=0.509547;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0219626;OID=.;OPOS=5425077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:16:11:14:19:16:11:14:19 chr17 5440197 . T C 365.85 PASS AF=0.401869;AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.000398933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.536;QD=13.6766;RBI=0.0200332;REFB=-0.0123402;REVB=-0.0200292;RO=63;SAF=26;SAR=17;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869184;STB=0.545028;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0204109;OID=.;OPOS=5440197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:63:64:43:43:0.401869:17:26:33:30:17:26:34:30 chr17 5487164 . C G 659.16 PASS AF=0.5;AO=66;DP=132;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0216075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3337;QD=19.9746;RBI=0.050182;REFB=-0.00664479;REVB=0.0452918;RO=65;SAF=35;SAR=31;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737414;STB=0.507608;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00693406;OID=.;OPOS=5487164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:65:66:66:66:0.5:31:35:35:30:31:35:36:30 chr17 5991344 . C T 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.865;QD=61.2131;RBI=0.0299254;REFB=0;REVB=0.0260561;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34327e-05;OID=.;OPOS=5991344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:51:28:0:0:51:28:0:0 chr17 6014176 . A G 769.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.734;QD=56.9998;RBI=0.0471189;REFB=0;REVB=-0.0086847;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129375;OID=.;OPOS=6014176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0 chr17 6023792 . C T 397.09 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0329971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.995;QD=23.3585;RBI=0.0331103;REFB=-0.0175864;REVB=-0.00273492;RO=29;SAF=22;SAR=17;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367436;STB=0.520203;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0169232;OID=.;OPOS=6023792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:17:22:15:14:17:22:15:14 chr17 6328930 . G A 118.67 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00290114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.003;QD=13.1861;RBI=0.0248536;REFB=-0.0457025;REVB=-0.0246837;RO=22;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198983;STB=0.616766;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0576615;OID=.;OPOS=6328930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:9:5:12:10:9:5:12:10 chr17 6329917 . C T 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00502348;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.042;QD=10.0752;RBI=0.00804458;REFB=-0.00553702;REVB=-0.0062833;RO=14;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.527668;STB=0.828027;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00662965;OID=.;OPOS=6329917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:1:7:6:8:1:7:6:8 chr17 6330068 . T C 443.46 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.744;QD=57.2201;RBI=0.0483773;REFB=0;REVB=0.0261891;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263092;OID=.;OPOS=6330068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:19:11:0:0:19:12:0:0 chr17 6331803 . T C 681.31 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0542506;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7765;QD=60.5609;RBI=0.0768;REFB=-0.0840303;REVB=0.0543609;RO=1;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184224;STB=0.509799;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00506345;OID=.;OPOS=6331803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:45:1:1:44:44:0.977778:25:19:0:1:25:19:0:1 chr17 6337247 . C G 281.25 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.011447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.027;QD=21.2262;RBI=0.0750151;REFB=-0.0107401;REVB=0.0741366;RO=24;SAF=11;SAR=18;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320452;STB=0.517796;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00926398;OID=.;OPOS=6337247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:18:11:10:14:18:11:10:14 chr17 6353679 . A C 704.99 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0330989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=342.112;QD=58.7495;RBI=0.0338804;REFB=-0.0281721;REVB=0.00723482;RO=1;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229252;STB=0.502761;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.000488001;OID=.;OPOS=6353679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:48:48:1:2:46:46:0.958333:20:26:0:1:20:26:1:1 chr17 6364753 . A G 1414.92 PASS AF=1;AO=74;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.917;QD=62.8854;RBI=0.0488607;REFB=0;REVB=-0.0127947;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.59093e-05;OID=.;OPOS=6364753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:74:90:1:35:39:0:0:36:54:0:0 chr17 6381939 . G A 333.06 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00770269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.964;QD=26.6448;RBI=0.00781304;REFB=-0.0398183;REVB=-0.00130851;RO=20;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104723;STB=0.564912;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0186214;OID=.;OPOS=6381939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:20:21:29:29:0.58:11:18:15:5:11:18:16:5 chr17 6483046 . T C 889.57 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159971;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.857;QD=58.3322;RBI=0.0161323;REFB=0;REVB=-0.00208438;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419719;OID=.;OPOS=6483046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr17 6493198 . T C 2861.11 PASS AF=1;AO=180;DP=180;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00968417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0903;QD=62.8816;RBI=0.014945;REFB=0;REVB=-0.0113829;RO=0;SAF=86;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51944e-05;OID=.;OPOS=6493198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:180:182:0:0:180:182:1:94:86:0:0:94:88:0:0 chr17 6511781 . A G 973.5 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.525;QD=59.0002;RBI=0.00947296;REFB=0;REVB=0.00012855;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15004e-05;OID=.;OPOS=6511781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:33:32:0:0:33:33:0:0 chr17 6515387 . A G 1230.57 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191098;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.994;QD=61.5283;RBI=0.0212934;REFB=0;REVB=0.00939268;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16793e-05;OID=.;OPOS=6515387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:45:35:0:0:45:35:0:0 chr17 6515454 . C T 767.22 PASS AF=1;AO=47;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00280616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.211;QD=56.8315;RBI=0.0161841;REFB=0;REVB=0.015939;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80831e-05;OID=.;OPOS=6515454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:47:54:1:26:21:0:0:33:21:0:0 chr17 6531648 . A G 2768.27 PASS AF=1;AO=173;DP=174;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.958;QD=62.5597;RBI=0.0398063;REFB=0;REVB=0.0242114;RO=1;SAF=103;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675119;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.03302e-06;OID=.;OPOS=6531648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:174:177:1:0:173:177:1:70:103:0:1:74:103:0:0 chr17 6546259 . T C 842.55 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0114948;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=297.336;QD=54.358;RBI=0.014107;REFB=-0.0441179;REVB=0.00817785;RO=1;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171579;STB=0.501628;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000186016;OID=.;OPOS=6546259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:62:1:2:60:60:0.967742:27:33:0:1:27:33:1:1 chr17 6556022 . A G 722.8 PASS AF=0.632075;AO=64;DP=103;FAO=67;FDP=106;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0185474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.306;QD=27.2755;RBI=0.0186202;REFB=-0.0186131;REVB=0.00164499;RO=39;SAF=33;SAR=31;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733966;STB=0.535724;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00972428;OID=.;OPOS=6556022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:106:39:39:64:67:0.632075:31:33:16:23:33:34:16:23 chr17 6556194 . T TAGAAG 103.27 PASS AF=0.197674;AO=17;DP=86;FAO=17;FDP=86;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=26;FWDB=-0.0191488;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=5;MLLD=296.931;QD=4.8031;RBI=0.021071;REFB=0.000665418;REVB=0.00879267;RO=69;SAF=9;SAR=8;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120087;STB=0.576091;STBP=0.527;TYPE=ins;VARB=-0.00265186;OID=.;OPOS=6556195;OREF=-;OALT=AGAAG;OMAPALT=TAGAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.197674:17:86:17:86:69:9:8:43:26:99:69:9:8:43:26 chr17 6556326 . G A 293.46 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0103965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.521;QD=14.8589;RBI=0.0224341;REFB=-0.00924596;REVB=-0.0198797;RO=45;SAF=18;SAR=15;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198619;STB=0.602778;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0124177;OID=.;OPOS=6556326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:46:33:33:0.417722:15:18:33:12:15:18:33:13 chr17 6556538 . G C 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.557;QD=61.0483;RBI=0.0391615;REFB=0;REVB=0.0211468;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272673;OID=.;OPOS=6556538;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0 chr17 6556541 . A T 1112.14 PASS AF=0.974026;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0277256;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.596;QD=57.7734;RBI=0.0313305;REFB=-0.179465;REVB=0.0145909;RO=2;SAF=46;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00586059;STB=0.503098;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.000641706;OID=.;OPOS=6556541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:78:77:2:2:75:75:0.974026:29:46:1:1:29:46:1:1 chr17 6558768 . C T 516.7 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000223252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.5965;QD=59.0519;RBI=0.023651;REFB=0;REVB=-0.0236499;RO=0;SAF=27;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000448301;OID=.;OPOS=6558768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:6:27:0:0:6:29:0:0 chr17 6663894 . GC AG,GG 499.64 PASS AF=0.485714,0.514286;AO=17,18;DP=35;FAO=17,18;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=6,8;FSAR=11,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704512,0.0360446;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=93.7219,141.112;QD=57.1021;RBI=0.0496236,0.0362436;REFB=0,0;REVB=0.0491209,0.00379282;RO=0;SAF=6,8;SAR=11,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0209305,0.0113426;OID=.,.;OPOS=6663894,6663895;OREF=GC,C;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:35:35:0:0:17,18:17,18:0.485714,0.514286:11,10:6,8:0:0:11,10:6,8:0:0 chr17 6683215 . C T 520.01 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.0529;QD=59.4301;RBI=0.0345643;REFB=0;REVB=0.0302599;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379673;OID=.;OPOS=6683215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0 chr17 6690161 . C T 1208.8 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1716;QD=61.2049;RBI=0.0235707;REFB=0;REVB=-0.0067486;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.35276e-05;OID=.;OPOS=6690161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0 chr17 6716242 . G A 297.56 PASS AF=0.434211;AO=31;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.017785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.745;QD=15.6613;RBI=0.0300381;REFB=-0.0171893;REVB=0.0242071;RO=42;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973885;STB=0.575712;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0218215;OID=.;OPOS=6716242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:43:31:33:0.434211:17:14:23:19:19:14:24:19 chr17 6733672 . T C 1606.66 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2473;QD=60.062;RBI=0.0562436;REFB=0;REVB=0.052892;RO=0;SAF=43;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000457762;OID=.;OPOS=6733672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:64:43:0:0:64:43:0:0 chr17 6902743 . G A 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0257861;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.473;QD=48.6263;RBI=0.0550857;REFB=-0.0894286;REVB=0.0486776;RO=1;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401764;STB=0.521719;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000829198;OID=.;OPOS=6902743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:11:11:1:0:11:11:1:0 chr17 6902760 . A G 190.74 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.851;QD=47.6858;RBI=0.0852654;REFB=0;REVB=0.079628;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000789317;OID=.;OPOS=6902760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:16:0:0:14:16:1:8:6:0:0:9:7:0:0 chr17 6905061 . T G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.348;QD=60.2307;RBI=0.0301403;REFB=0;REVB=0.014915;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115276;OID=.;OPOS=6905061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0 chr17 6909838 . A G 140.64 PASS AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00216925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.165;QD=9.37592;RBI=0.0153119;REFB=-0.0189181;REVB=-0.0151575;RO=39;SAF=9;SAR=10;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102687;STB=0.574392;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0382327;OID=.;OPOS=6909838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:39:41:19:19:0.316667:10:9:15:24:10:9:15:26 chr17 6919093 . T C 148.7 PASS AF=0.625;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0371296;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.857;QD=24.7828;RBI=0.0395837;REFB=-0.0271778;REVB=0.0137209;RO=9;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593147;STB=0.533289;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0160953;OID=.;OPOS=6919093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:26:24:9:9:15:15:0.625:8:7:5:4:8:7:5:4 chr17 6920257 . C T 469.9 PASS AF=0.555556;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.0101394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.423;QD=23.2049;RBI=0.0112222;REFB=-0.0151974;REVB=-0.00480945;RO=35;SAF=16;SAR=29;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304492;STB=0.672162;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00859886;OID=.;OPOS=6920257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:35:36:45:45:0.555556:29:16:26:9:29:16:27:9 chr17 6929924 . T C 740.44 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.249;QD=56.9567;RBI=0.0388231;REFB=0;REVB=-0.0200284;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140894;OID=.;OPOS=6929924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:29:22:0:0:29:23:0:0 chr17 6930139 . C T 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0197047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.247;QD=15.293;RBI=0.0266266;REFB=-0.0409995;REVB=0.0179081;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946172;STB=0.555432;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0312256;OID=.;OPOS=6930139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:4:5:4:5:4:5 chr17 6942108 . C T 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00909351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.567;QD=19.6972;RBI=0.00959882;REFB=-0.016467;REVB=-0.00307336;RO=22;SAF=7;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199077;STB=0.612793;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0196578;OID=.;OPOS=6942108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:14:7:12:10:14:7:12:10 chr17 6942111 . G T 225.55 PASS AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00808276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.688;QD=20.5046;RBI=0.00841669;REFB=-0.0239631;REVB=0.00234728;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226186;STB=0.612146;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.038893;OID=.;OPOS=6942111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:22:22:21:22:0.5:9:12:7:15:10:12:7:15 chr17 6943266 . G A 210.69 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.136322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.185;QD=19.154;RBI=0.136433;REFB=0.00119984;REVB=-0.00550478;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267774;STB=0.529383;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.00240312;OID=.;OPOS=6943266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:23:21:21:0.477273:8:13:13:9:8:13:13:10 chr17 6979179 . A G 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.000696964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.84;QD=21.0155;RBI=0.0157405;REFB=-0.0215532;REVB=-0.015725;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810966;STB=0.504581;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0168457;OID=.;OPOS=6979179;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:6:10:8:5:6:10:8:5 chr17 6981353 . G C 337.64 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=28;FWDB=-0.00866369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5929;QD=20.1577;RBI=0.0178783;REFB=-0.0360784;REVB=-0.0156389;RO=32;SAF=14;SAR=21;SRF=4;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264294;STB=0.644665;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0262316;OID=.;OPOS=6981353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:21:14:4:28:21:14:4:28 chr17 6981397 . A G 431.91 PASS AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=-0.000847975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.172;QD=23.0353;RBI=0.0138251;REFB=-0.0383793;REVB=-0.0137991;RO=33;SAF=13;SAR=29;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158886;STB=0.586661;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0261658;OID=.;OPOS=6981397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:29:13:5:28:29:13:5:28 chr17 7011144 . G A 93.94 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00779159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1105;QD=10.4377;RBI=0.0569379;REFB=-0.0111063;REVB=0.0564023;RO=23;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16234;STB=0.60991;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0252755;OID=.;OPOS=7011144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:35:36:23:24:12:12:0.333333:7:5:13:10:7:5:14:10 chr17 7106623 . G A 261.46 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.000434622;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.045;QD=23.769;RBI=0.0210801;REFB=-0.00131628;REVB=0.0210756;RO=20;SAF=14;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149289;STB=0.583264;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00110832;OID=.;OPOS=7106623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:10:14:8:12:10:14:8:12 chr17 7147350 . T TC 831.51 PASS AF=1;AO=83;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.3902;QD=36.1527;RBI=0.0563511;REFB=0;REVB=-0.0271356;RO=8;SAF=38;SAR=45;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278657;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00136239;OID=.;OPOS=7147351;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:83:95:92:92:0:39:53:0:0:15:8:38:45:5:3 chr17 7185788 . T C 651.43 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.81;QD=62.0411;RBI=0.0634982;REFB=0;REVB=0.00943496;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27789e-05;OID=.;OPOS=7185788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:28:12:0:0:29:13:0:0 chr17 7213694 . C A 731.35 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194518;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.297;QD=63.5957;RBI=0.0247304;REFB=0;REVB=0.0152717;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117105;OID=.;OPOS=7213694;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:32:13:0:0:32:14:0:0 chr17 7217463 . T C 785.18 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.414;QD=57.1042;RBI=0.0102148;REFB=0;REVB=0.00826025;RO=0;SAF=19;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78241e-05;OID=.;OPOS=7217463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:36:19:0:0:36:19:0:0 chr17 7219230 . A G 526.89 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5952;QD=58.5432;RBI=0.0665414;REFB=0;REVB=-0.0252298;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211723;OID=.;OPOS=7219230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:24:11:0:0:24:12:0:0 chr17 7221385 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.019;QD=56.9383;RBI=0.0432763;REFB=0;REVB=0.0397287;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124565;OID=.;OPOS=7221385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr17 7224921 . C G 501.58 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.058;QD=59.0093;RBI=0.0451605;REFB=0;REVB=0.0289799;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000591274;OID=.;OPOS=7224921;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr17 7286266 . C T 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0108572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.135;QD=15.2625;RBI=0.0110441;REFB=-0.0535069;REVB=-0.00202289;RO=16;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23035;STB=0.636124;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0552361;OID=.;OPOS=7286266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:2:11:11:5:2:11:11:5 chr17 7286326 . T A 168.72 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00558839;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.29;QD=22.4961;RBI=0.0158511;REFB=-0.0224156;REVB=0.0148333;RO=13;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886073;STB=0.54994;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0190648;OID=.;OPOS=7286326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:13:13:17:17:0.566667:6:11:7:6:6:11:7:6 chr17 7290695 . A G 149.75 PASS AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0283711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.986;QD=28.5238;RBI=0.0314052;REFB=-0.0358301;REVB=-0.0134673;RO=6;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102291;STB=0.556886;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00795341;OID=.;OPOS=7290695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:8:7:4:2:8:7:4:2 chr17 7292107 . G A 278.55 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00132334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.943;QD=21.8471;RBI=0.0683956;REFB=-0.00912875;REVB=0.0683828;RO=23;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762207;STB=0.542342;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00820363;OID=.;OPOS=7292107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:12:16:11:12:12:16:11:12 chr17 7307018 . AAAG A 112.6 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.015825;FXX=0.0999667;HRUN=4;LEN=3;MLLD=354.941;QD=16.6816;RBI=0.0221465;REFB=-0.0105734;REVB=-0.0154931;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.33858;SSSB=-0.0395277;STB=0.522358;STBP=0.83;TYPE=del;VARB=0.00858521;OID=.;OPOS=7307019;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.555556:15:29:15:27:12:8:7:7:5:80:12:8:7:7:5 chr17 7318396 . C T 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.754;QD=62.3508;RBI=0.0254831;REFB=0;REVB=0.0160567;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75598e-05;OID=.;OPOS=7318396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0 chr17 7322245 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.968;QD=60.9776;RBI=0.0257075;REFB=0;REVB=0.013921;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49206e-05;OID=.;OPOS=7322245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0 chr17 7322741 . AT A 73.44 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.124018;FXX=0.039208;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.9142;QD=5.99537;RBI=0.127121;REFB=-0.00924818;REVB=-0.0279131;RO=28;SAF=16;SAR=3;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.527778;SSSB=0.484179;STB=0.842925;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.00793986;OID=.;OPOS=7322742;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.387755:19:51:19:49:30:17:2:13:17:73:28:16:3:12:16 chr17 7386055 . C T 1463.17 PASS AF=0.969388;AO=94;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0318409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.726;QD=59.7213;RBI=0.0390825;REFB=-0.180393;REVB=0.0226627;RO=1;SAF=30;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155407;STB=0.523072;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00064794;OID=.;OPOS=7386055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:98:98:1:3:94:95:0.969388:64:30:1:0:64:31:3:0 chr17 7386279 . TG CA 735.38 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174847;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=181.454;QD=56.5674;RBI=0.0249443;REFB=0;REVB=0.0177906;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000118684;OID=.;OPOS=7386279;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:31:20:0:0:31:21:0:0 chr17 7400137 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7357;QD=60.9786;RBI=0.0400948;REFB=0;REVB=0.0385802;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294061;OID=.;OPOS=7400137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:26:13:0:0:26:13:0:0 chr17 7402600 . T C 411.02 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.193;QD=56.6923;RBI=0.0629567;REFB=0;REVB=0.0489075;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000869017;OID=.;OPOS=7402600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:10:19:0:0 chr17 7404107 . T C 801.05 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5452;QD=57.2176;RBI=0.0415562;REFB=0;REVB=0.0261065;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283807;OID=.;OPOS=7404107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0 chr17 7404991 . T C 926.69 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1303;QD=57.9181;RBI=0.0321693;REFB=0;REVB=0.0069551;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697066;OID=.;OPOS=7404991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:34:29:0:0:34:30:0:0 chr17 7412403 . T C 604.13 PASS AF=0.488189;AO=62;DP=127;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.0205546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.9795;QD=19.0277;RBI=0.0993777;REFB=0.0214881;REVB=-0.0972288;RO=65;SAF=24;SAR=38;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998946;STB=0.555305;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.0202117;OID=.;OPOS=7412403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:65:65:62:62:0.488189:38:24:32:33:38:24:32:33 chr17 7416683 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.918;QD=40.7628;RBI=0.0694097;REFB=0;REVB=0.0517347;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145541;OID=.;OPOS=7416683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr17 7460516 . CG CC,TC 600.05 PASS AF=0.95,0.05;AO=38,2;DP=40;FAO=38,2;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=23,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0827889,0.0923915;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=61.1913,13.3935;QD=60.0046;RBI=0.0871269,0.0951836;REFB=0,0;REVB=-0.0271495,-0.0228854;RO=0;SAF=15,0;SAR=23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00165128,0.0801319;OID=.,.;OPOS=7460517,7460516;OREF=G,CG;OALT=C,TC;OMAPALT=CC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:40:40:0:0:38,2:38,2:0.95,0.05:23,2:15,0:0:0:23,2:15,0:0:0 chr17 7460559 . T C,G 402.1 PASS AF=0.0689655,0.931034;AO=2,27;DP=29;FAO=2,27;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=2,14;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213944,0.0372029;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=79.0395,126.165;QD=55.4624;RBI=0.0296146,0.0464379;REFB=0,0;REVB=0.0204769,0.0277924;RO=0;SAF=2,14;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.39874e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.140026,-0.000769766;OID=.,.;OPOS=7460559,7460559;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:29:29:0:0:2,27:2,27:0.0689655,0.931034:0,13:2,14:0:0:0,13:2,14:0:0 chr17 7462969 . A G 754.34 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.196;QD=56.931;RBI=0.0391727;REFB=0;REVB=0.0166272;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143358;OID=.;OPOS=7462969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:25:28:0:0 chr17 7470285 . CA C 1183.52 PASS AF=1;AO=95;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521665;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.0627;QD=47.8192;RBI=0.0574721;REFB=0;REVB=-0.0241183;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000486994;OID=.;OPOS=7470286;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:95:101:99:99:0:46:53:0:0:22:0:46:49:0:0 chr17 7475159 . A T 589.27 PASS AF=0.857143;AO=40;DP=47;FAO=42;FDP=49;FR=.;FRO=7;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0493739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.672;QD=48.1035;RBI=0.0498867;REFB=-0.00373814;REVB=-0.00713458;RO=7;SAF=23;SAR=17;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810306;STB=0.53747;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00208502;OID=.;OPOS=7475159;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:47:49:7:7:40:42:0.857143:17:23:2:5:19:23:2:5 chr17 7475161 . A T 45.67 PASS AF=0.179487;AO=7;DP=45;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.041259;FXX=0.133304;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.369;QD=4.68439;RBI=0.043624;REFB=-0.00305112;REVB=0.0141684;RO=38;SAF=2;SAR=5;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372631;STB=0.703116;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00707819;OID=.;OPOS=7475161;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:45:39:38:32:7:7:0.179487:5:2:23:15:5:2:17:15 chr17 7477938 . G C 805.15 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.746;QD=64.4121;RBI=0.0432303;REFB=0;REVB=0.042217;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165434;OID=.;OPOS=7477938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0 chr17 7490379 . G C 38.14 PASS AF=0.75;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.039008;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=63.4993;QD=19.0713;RBI=0.0752574;REFB=-0.150343;REVB=0.0643587;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161039;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.019467;OID=.;OPOS=7490379;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:8:2:2:4:6:0.75:1:3:1:1:3:3:1:1 chr17 7530271 . C T 198.42 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0136605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.703;QD=44.0922;RBI=0.0148118;REFB=-0.0175144;REVB=-0.00572536;RO=1;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398535;STB=0.521714;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00207925;OID=.;OPOS=7530271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:11:6:0:1:11:6:0:1 chr17 7557419 . A G 789.57 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100801;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4653;QD=57.4236;RBI=0.101539;REFB=0;REVB=0.0122229;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000508792;OID=.;OPOS=7557419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:17:36:0:0:18:37:0:0 chr17 7578115 . T C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.406;QD=53.9086;RBI=0.0624781;REFB=0;REVB=-0.0624385;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00042694;OID=.;OPOS=7578115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr17 7579472 . G C 178.64 PASS AF=0.73913;AO=16;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00553568;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=185.692;QD=31.0687;RBI=0.0120909;REFB=-0.0471983;REVB=-0.0107492;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.593653;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0112696;OID=.;OPOS=7579472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:23:0:6:16:17:0.73913:12:4:0:0:13:4:0:6 chr17 7613765 . G A 1030.06 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.619;QD=58.0316;RBI=0.0308816;REFB=-0.0016292;REVB=0.0238765;RO=1;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145457;STB=0.50769;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.000314985;OID=.;OPOS=7613765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:32:38:0:1:32:38:0:1 chr17 7614601 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218157;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.59;QD=63.2858;RBI=0.0255282;REFB=0;REVB=0.0132576;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.25138e-05;OID=.;OPOS=7614601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0 chr17 7667308 . C T 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0511928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.5263;QD=22.5857;RBI=0.0590803;REFB=-0.0224235;REVB=-0.0294919;RO=6;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26877;STB=0.64977;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0182458;OID=.;OPOS=7667308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:7:4:0:6:7:4:0:6 chr17 7674784 . C T 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0487805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.185;QD=16.8228;RBI=0.0502581;REFB=0.00443837;REVB=0.0120969;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292301;STB=0.666293;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.0031205;OID=.;OPOS=7674784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:0:5:5:2:0:5 chr17 7681412 . C G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9224;QD=62.9823;RBI=0.0662731;REFB=0;REVB=-0.0169735;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000625126;OID=.;OPOS=7681412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0 chr17 7690345 . C T 132.17 PASS AF=0.636364;AO=4;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0414836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.956;QD=24.0304;RBI=0.0670278;REFB=-0.0501693;REVB=0.0526482;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.554715;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0268116;OID=.;OPOS=7690345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:4:14:0.636364:2:2:4:4:9:5:4:4 chr17 7722365 . C T 295.76 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.017551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.882;QD=20.3971;RBI=0.0178208;REFB=-0.018523;REVB=0.00308943;RO=27;SAF=16;SAR=15;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331252;STB=0.518383;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0168829;OID=.;OPOS=7722365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:15:16:15:12:15:16:15:12 chr17 7750232 . T C 105.14 PASS AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0196588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.129;QD=32.3519;RBI=0.0441298;REFB=0.00149792;REVB=0.0395091;RO=2;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221917;STB=0.624759;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.000211794;OID=.;OPOS=7750232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:3:8:0:2:3:8:0:2 chr17 7751388 . C A 226.43 PASS AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=27;FWDB=-0.0325853;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=293.491;QD=17.0893;RBI=0.0336655;REFB=-0.00254213;REVB=0.00845979;RO=27;SAF=3;SAR=22;SRF=1;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219305;STB=0.625452;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00243704;OID=.;OPOS=7751388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:28:25:25:0.471698:22:3:1:26:22:3:1:27 chr17 7751751 . C T 37.17 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.000220532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.238;QD=8.2592;RBI=0.062574;REFB=-0.0227797;REVB=0.0625736;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264239;STB=0.666111;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0364629;OID=.;OPOS=7751751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:7:5:4:2:7:5 chr17 7760704 . A G 334.25 PASS AF=0.384615;AO=41;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=7;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00314657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.627;QD=12.8559;RBI=0.00314661;REFB=-0.00145004;REVB=-1.5272e-05;RO=63;SAF=7;SAR=34;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42466;STB=0.738672;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00158044;OID=.;OPOS=7760704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:63:64:41:40:0.384615:34:7:32:31:33:7:32:32 chr17 7761926 . C T 186.79 PASS AF=0.5;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.046059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6624;QD=19.6626;RBI=0.0461279;REFB=0.00142501;REVB=0.00251991;RO=18;SAF=6;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169787;STB=0.611643;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.000112303;OID=.;OPOS=7761926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:18:19:19:19:0.5:13:6:9:9:13:6:10:9 chr17 7802454 . A C 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0348266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.129;QD=16.236;RBI=0.036188;REFB=-0.0322041;REVB=0.0098327;RO=36;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917739;STB=0.55169;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0248329;OID=.;OPOS=7802454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:13:17:17:19:13:17:17:19 chr17 7843053 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.763;QD=45.8066;RBI=0.0804908;REFB=0;REVB=0.07306;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171017;OID=.;OPOS=7843053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0 chr17 7847955 . C A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8616;QD=51.9158;RBI=0.0466104;REFB=0;REVB=0.0466104;RO=0;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139547;OID=.;OPOS=7847955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:21:0:0:0:21:0:0:0 chr17 7849087 . C G 1320.4 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.4615;QD=62.1365;RBI=0.0250445;REFB=0;REVB=0.00657484;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128246;OID=.;OPOS=7849087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0 chr17 7907189 . C T 232.14 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=0.00895761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8404;QD=14.7387;RBI=0.0188791;REFB=-0.0169749;REVB=-0.0166187;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178947;STB=0.615309;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0269907;OID=.;OPOS=7907189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:36:27:27:0.428571:18:9:6:27:18:9:6:30 chr17 7915912 . C T 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0232905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3848;QD=9.76045;RBI=0.06769;REFB=0.00809847;REVB=0.063557;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157904;STB=0.59674;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=-0.00588047;OID=.;OPOS=7915912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:7:5:4:3:7:5 chr17 7960625 . C T 217.81 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0273141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.866;QD=16.7545;RBI=0.0317282;REFB=-0.012395;REVB=-0.0161437;RO=27;SAF=11;SAR=13;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26189;STB=0.63554;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00804299;OID=.;OPOS=7960625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:13:11:20:7:13:11:20:8 chr17 7983799 . A G 286.4 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00206381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.601;QD=15.6929;RBI=0.00985443;REFB=-0.0123278;REVB=-0.0096359;RO=41;SAF=17;SAR=15;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11566;STB=0.565177;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0132337;OID=.;OPOS=7983799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:15:17:17:24:15:17:17:24 chr17 7984157 . A C 235.03 PASS AF=0.75;AO=18;DP=26;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00930001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.895;QD=33.5763;RBI=0.0723082;REFB=-0.0247809;REVB=0.0717076;RO=7;SAF=15;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022089;STB=0.545413;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.012626;OID=.;OPOS=7984157;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:26:28:7:7:18:21:0.75:3:15:6:1:6:15:6:1 chr17 7999957 . G A 471.33 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416695;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2161;QD=58.9159;RBI=0.047794;REFB=0;REVB=0.0234077;RO=0;SAF=28;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162099;OID=.;OPOS=7999957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:4:28:0:0:4:28:0:0 chr17 8023057 . A C 706.6 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0918778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.591;QD=58.8833;RBI=0.255716;REFB=0;REVB=0.238641;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00926464;OID=.;OPOS=8023057;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr17 8023059 . A C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00351017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.954;QD=63.872;RBI=0.00628656;REFB=0;REVB=0.00521531;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2364e-06;OID=.;OPOS=8023059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr17 8023061 . C T 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.937;QD=63.8704;RBI=0.0343959;REFB=0;REVB=0.0222301;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60616e-05;OID=.;OPOS=8023061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr17 8023143 . G A 746.96 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00258507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8374;QD=63.5706;RBI=0.0171726;REFB=0;REVB=0.0169769;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105353;OID=.;OPOS=8023143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0 chr17 8024237 . T C 728.25 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3644;QD=57.1179;RBI=0.073117;REFB=0;REVB=-0.0696168;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000731526;OID=.;OPOS=8024237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0 chr17 8029071 . T G 237.51 PASS AF=0.522727;AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00267832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.245;QD=21.5922;RBI=0.00295343;REFB=-0.0012792;REVB=0.00124474;RO=21;SAF=18;SAR=4;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282291;STB=0.665604;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0013047;OID=.;OPOS=8029071;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:21:21:22:23:0.522727:4:18:12:9:4:19:12:9 chr17 8048169 . T C 167.16 PASS AF=0.428571;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0101415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.057;QD=15.9202;RBI=0.0385259;REFB=-0.0621078;REVB=-0.0371672;RO=22;SAF=11;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234869;STB=0.610988;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0609648;OID=.;OPOS=8048169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:22:24:17:18:0.428571:6:11:9:13:7:11:10:14 chr17 8062583 . A G 240.29 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0074834;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.243;QD=14.5632;RBI=0.00796874;REFB=-0.000469033;REVB=-0.00273851;RO=38;SAF=21;SAR=7;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229708;STB=0.631478;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.000867898;OID=.;OPOS=8062583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:7:21:21:17:7:21:21:17 chr17 8064083 . T G 118.63 PASS AF=0.211111;AO=14;DP=87;FAO=19;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=57;FSRR=14;FWDB=0.00223683;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.029;QD=5.27257;RBI=0.0103213;REFB=-0.00683862;REVB=0.010076;RO=55;SAF=13;SAR=1;SRF=51;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00604009;STB=0.647434;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0252877;OID=.;OPOS=8064083;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:55:71:14:19:0.211111:1:13:51:4:2:17:57:14 chr17 8076778 . C T 140.07 PASS AF=0.273973;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00917853;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.316;QD=7.67496;RBI=0.0138738;REFB=-0.00413251;REVB=0.0104036;RO=53;SAF=12;SAR=8;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188285;STB=0.511352;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0117211;OID=.;OPOS=8076778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:53:53:20:20:0.273973:8:12:31:22:8:12:31:22 chr17 8076802 . T A 212.1 PASS AF=0.329268;AO=27;DP=82;FAO=27;FDP=82;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0111585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0079;QD=10.3464;RBI=0.0112141;REFB=-0.0148711;REVB=-0.00111519;RO=55;SAF=16;SAR=11;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341545;STB=0.519948;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0352789;OID=.;OPOS=8076802;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:55:55:27:27:0.329268:11:16:31:24:11:16:31:24 chr17 8079029 . G C 117.44 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0668749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3071;QD=21.3523;RBI=0.0916911;REFB=-0.00414149;REVB=0.0627295;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203205;STB=0.615207;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00753993;OID=.;OPOS=8079029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:8:5:6:3:8:5:6:3 chr17 8090908 . A G 242.95 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0370972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2944;QD=22.5999;RBI=0.0697632;REFB=0.013032;REVB=-0.0590822;RO=20;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213713;STB=0.619729;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.01301;OID=.;OPOS=8090908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:8:15:8:12:8:15:8:12 chr17 8092694 . T G 119.48 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0204276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2147;QD=14.0559;RBI=0.0293283;REFB=0.0223232;REVB=-0.0210442;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299292;STB=0.682688;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=-0.0382658;OID=.;OPOS=8092694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:8:6:14:5:8:6:15:5 chr17 8108331 . A G 158.62 PASS AF=0.45;AO=13;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0127185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.093;QD=15.8615;RBI=0.0383075;REFB=-0.0218202;REVB=-0.0361346;RO=19;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11174;STB=0.583236;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0443211;OID=.;OPOS=8108331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:22:13:18:0.45:10:3:6:13:13:5:9:13 chr17 8108339 . G A 153.97 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0111778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9239;QD=14.3229;RBI=0.0117153;REFB=-0.0133614;REVB=-0.00350774;RO=26;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630339;STB=0.536697;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0129768;OID=.;OPOS=8108339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:12:5:9:17:12:5:9:17 chr17 8132763 . T C 132.09 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0249943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.701;QD=24.016;RBI=0.0287431;REFB=0.0205018;REVB=-0.0141933;RO=8;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214091;STB=0.617512;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=-0.00384097;OID=.;OPOS=8132763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:13:1:0:8:13:1:0:8 chr17 8135058 . C A 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00473885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.211;QD=12.9748;RBI=0.00626046;REFB=0.00376355;REVB=-0.00409105;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113436;STB=0.566558;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=-0.00790998;OID=.;OPOS=8135058;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:7:11:6:6:7:11 chr17 8135061 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.071;QD=57.2023;RBI=0.0237982;REFB=0;REVB=0.0111842;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.51821e-05;OID=.;OPOS=8135061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr17 8141707 . T C 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00517349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8317;QD=59.8392;RBI=0.043783;REFB=0;REVB=-0.0434763;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000615982;OID=.;OPOS=8141707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr17 8157310 . C T 228.92 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=0.0102717;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.191;QD=16.0643;RBI=0.01088;REFB=-0.0117543;REVB=0.00358713;RO=31;SAF=15;SAR=11;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203183;STB=0.613654;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0120529;OID=.;OPOS=8157310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:11:15:24:7:11:15:24:7 chr17 8161149 . C T 198.71 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0164366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.533;QD=19.3862;RBI=0.0175919;REFB=-0.0151638;REVB=-0.00626998;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15199;STB=0.585871;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0129009;OID=.;OPOS=8161149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:8:13:9:11:8:13 chr17 8167600 . T C 222.72 PASS AF=0.471698;AO=19;DP=48;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.0477969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.627;QD=16.8093;RBI=0.0499275;REFB=-0.0192439;REVB=0.0144295;RO=27;SAF=3;SAR=16;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018993;STB=0.517794;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0144422;OID=.;OPOS=8167600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:53:27:28:19:25:0.471698:16:3:4:23:21:4:5:23 chr17 8168224 . T C 161.84 PASS AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00210075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.939;QD=28.1453;RBI=0.0152202;REFB=-0.00118495;REVB=0.0150745;RO=7;SAF=10;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261132;STB=0.644982;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.000268232;OID=.;OPOS=8168224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:7:7:16:16:0.695652:6:10:1:6:6:10:1:6 chr17 8172732 . A G 252.94 PASS AF=0.5;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0482795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.402;QD=21.0785;RBI=0.0490947;REFB=-0.0194581;REVB=0.00890968;RO=23;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933852;STB=0.564461;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0204698;OID=.;OPOS=8172732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:23:24:24:24:0.5:15:9:11:12:15:9:12:12 chr17 8216468 . T C 149.1 PASS AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00891576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.2;QD=18.6371;RBI=0.0144235;REFB=-0.0206654;REVB=-0.0113379;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166872;STB=0.595118;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0206485;OID=.;OPOS=8216468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:9:7:10:6:9:7 chr17 8249116 . C T 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00984863;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.123;QD=15.6455;RBI=0.019471;REFB=-0.0213801;REVB=0.0167965;RO=29;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175894;STB=0.600264;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0288299;OID=.;OPOS=8249116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:13:9:17:12:13:9:17:12 chr17 8339283 . C T 400.22 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0469547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.248;QD=53.3624;RBI=0.0537196;REFB=-0.176869;REVB=0.026097;RO=1;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227272;STB=0.512187;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.010624;OID=.;OPOS=8339283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:20:9:0:1:20:9:0:1 chr17 8339307 . G A 502.0 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.262;QD=59.0582;RBI=0.105276;REFB=0;REVB=0.0723163;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870342;OID=.;OPOS=8339307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:23:10:0:0:24:10:0:0 chr17 8378932 . A G 1339.61 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2146;QD=62.3073;RBI=0.0477206;REFB=0;REVB=0.0386628;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249724;OID=.;OPOS=8378932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:31:55:0:0:31:55:0:0 chr17 8383894 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.49724e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.043;QD=57.6802;RBI=0.0216938;REFB=0;REVB=0.0216936;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234775;OID=.;OPOS=8383894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0 chr17 8402669 . C T 200.85 PASS AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.161058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7835;QD=20.5999;RBI=0.161089;REFB=-0.0193337;REVB=-0.00317503;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155872;STB=0.5877;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0147613;OID=.;OPOS=8402669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:11:9:12:7:11:9:12:7 chr17 8416901 . C T 1245.97 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0798881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2429;QD=61.5296;RBI=0.116804;REFB=0;REVB=0.0852112;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143557;OID=.;OPOS=8416901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:38:43:0:0:38:43:0:0 chr17 8424270 . G A 964.67 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0121188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.954;QD=55.9231;RBI=0.0181459;REFB=-0.176461;REVB=0.0135059;RO=1;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145389;STB=0.50065;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00167902;OID=.;OPOS=8424270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:1:2:67:67:0.971014:32:35:0:1:32:35:1:1 chr17 8450357 . C A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.574;QD=58.4196;RBI=0.0240629;REFB=0;REVB=0.0209899;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04518e-05;OID=.;OPOS=8450357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0 chr17 8647931 . G C 207.12 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.086527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0695;QD=48.7339;RBI=0.088304;REFB=0;REVB=0.017626;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00159555;OID=.;OPOS=8647931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0 chr17 8700778 . G A 196.74 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0160735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.487;QD=18.3009;RBI=0.020244;REFB=0.000230111;REVB=0.012307;RO=23;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221978;STB=0.626734;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.000619934;OID=.;OPOS=8700778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:6:14:11:12:6:14:11:12 chr17 8700982 . C T 135.84 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0727576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5721;QD=17.5271;RBI=0.0945906;REFB=0.0035087;REVB=0.060446;RO=16;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158066;STB=0.590784;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00184851;OID=.;OPOS=8700982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:10:5:8:8:10:5:8:8 chr17 8701799 . G T 249.37 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00864615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8718;QD=19.9499;RBI=0.0328471;REFB=-0.0494413;REVB=-0.0316888;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385395;STB=0.521721;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0161245;OID=.;OPOS=8701799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:13:11:13:13:13:11:13:13 chr17 8701800 . A T 32.07 PASS AF=0.12;AO=6;DP=50;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0252701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7708;QD=2.56558;RBI=0.0565962;REFB=-0.0248681;REVB=-0.0506414;RO=44;SAF=5;SAR=1;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459606;STB=0.843042;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0476837;OID=.;OPOS=8701800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:50:50:44:44:6:6:0.12:1:5:19:25:1:5:19:25 chr17 8725214 . A AG 416.92 PASS AF=1;AO=37;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.1721;QD=36.2539;RBI=0.104685;REFB=0;REVB=-0.0685702;RO=8;SAF=15;SAR=22;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00266343;OID=.;OPOS=8725215;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:37:47:46:46:0:19:27:0:0:8:8:15:22:5:3 chr17 8725973 . A G 102.62 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0174009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.965;QD=9.32949;RBI=0.0177993;REFB=-0.00908976;REVB=-0.0037449;RO=31;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.412379;STB=0.747153;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0197653;OID=.;OPOS=8725973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:4:9:10:21:4:9:10:21 chr17 8792029 . A G 47.19 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0273232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.624;QD=11.1033;RBI=0.0327767;REFB=-0.0325372;REVB=0.018104;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258458;STB=0.655317;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0112975;OID=.;OPOS=8792029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:7:3:4:3:7:3 chr17 8792514 . G A 112.0 PASS AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0483482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1364;QD=8.96016;RBI=0.0483596;REFB=0.0104687;REVB=0.00104992;RO=36;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170837;STB=0.604938;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=-0.0440357;OID=.;OPOS=8792514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:10:4:15:21:10:4:15:21 chr17 9066248 . C T 287.94 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.000524819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.508;QD=18.5765;RBI=0.0496452;REFB=-0.0157328;REVB=0.0496424;RO=31;SAF=13;SAR=18;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600466;STB=0.533456;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0135615;OID=.;OPOS=9066248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:18:13:11:20:18:13:11:20 chr17 9066254 . T C 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.544;QD=57.8848;RBI=0.00874656;REFB=0;REVB=0.00840983;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41388e-05;OID=.;OPOS=9066254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0 chr17 9086712 . C T 141.0 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0513447;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.339;QD=20.143;RBI=0.0570815;REFB=-0.0315198;REVB=-0.0249404;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121067;STB=0.56863;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0210978;OID=.;OPOS=9086712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:5:8:7:8:5:8 chr17 9395231 . G A 158.05 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0122841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.737;QD=25.2873;RBI=0.0126833;REFB=-0.0234563;REVB=-0.00315683;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119544;STB=0.566925;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0115569;OID=.;OPOS=9395231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:6:10:4:5:6:10:4:5 chr17 9471711 . T G 499.94 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0426431;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.237;QD=54.048;RBI=0.0429104;REFB=-0.123128;REVB=0.00478268;RO=2;SAF=28;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322556;STB=0.517232;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00138187;OID=.;OPOS=9471711;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:37:37:2:2:35:35:0.945946:7:28:2:0:7:28:2:0 chr17 9479098 . C A 358.0 PASS AF=0.848485;AO=28;DP=33;FAO=28;FDP=33;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.000838399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.439;QD=43.3944;RBI=0.0469188;REFB=-0.0575387;REVB=0.0469113;RO=4;SAF=7;SAR=21;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52939;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00506096;OID=.;OPOS=9479098;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:33:33:4:5:28:28:0.848485:21:7:1:3:21:7:2:3 chr17 9515777 . G A 192.28 PASS AF=0.575758;AO=18;DP=32;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.045605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2635;QD=23.3064;RBI=0.0654426;REFB=-0.028524;REVB=0.0469352;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088825;STB=0.533945;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0171242;OID=.;OPOS=9515777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:14:14:18:19:0.575758:11:7:7:7:11:8:7:7 chr17 9549381 . C T 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0309722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.172;QD=22.9576;RBI=0.0509176;REFB=-0.038202;REVB=0.0404144;RO=11;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810739;STB=0.545399;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0179825;OID=.;OPOS=9549381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:10:6:3:8:10:6:3:8 chr17 9549441 . C T 124.16 PASS AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0105082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.587;QD=27.5907;RBI=0.0181921;REFB=-0.0113475;REVB=-0.0148503;RO=5;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214904;STB=0.618883;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00191709;OID=.;OPOS=9549441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:8:5:0:5:8:5:0:5 chr17 9586165 . C T 289.49 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00124903;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.722;QD=25.7322;RBI=0.0232985;REFB=-0.0135472;REVB=0.023265;RO=19;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031099;STB=0.517228;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00927975;OID=.;OPOS=9586165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:12:14:11:8:12:14:11:8 chr17 9632247 . A G 390.4 PASS AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.011051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.701;QD=19.0439;RBI=0.011068;REFB=-0.0161726;REVB=0.000614123;RO=42;SAF=22;SAR=18;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680624;STB=0.537878;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.015295;OID=.;OPOS=9632247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:18:22:20:22:18:22:20:22 chr17 9712255 . G A 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00282717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.142;QD=57.7124;RBI=0.0247803;REFB=0;REVB=0.0246185;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08325e-05;OID=.;OPOS=9712255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr17 9725101 . G A 281.2 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00417701;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.426;QD=21.2223;RBI=0.0168684;REFB=-0.0403617;REVB=0.0163431;RO=24;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480101;STB=0.52664;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0239813;OID=.;OPOS=9725101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:24:24:29:29:0.54717:15:14:13:11:15:14:13:11 chr17 9725338 . G A 382.98 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0164782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.828;QD=17.4083;RBI=0.0307725;REFB=-0.0176701;REVB=0.0259887;RO=48;SAF=26;SAR=14;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695389;STB=0.539005;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0144272;OID=.;OPOS=9725338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:14:26:28:20:14:26:28:20 chr17 9725347 . A G 252.57 PASS AF=0.375;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0297287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.131;QD=12.6284;RBI=0.0543665;REFB=-0.00592326;REVB=-0.0455184;RO=48;SAF=22;SAR=8;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160942;STB=0.596831;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0264682;OID=.;OPOS=9725347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:50:30:30:0.375:8:22:29:19:8:22:30:20 chr17 9764531 . A G 362.07 PASS AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0124713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.197;QD=15.4074;RBI=0.0124713;REFB=0.00259027;REVB=3.70401e-05;RO=55;SAF=20;SAR=19;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978693;STB=0.555225;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.00540995;OID=.;OPOS=9764531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:19:20:23:32:19:20:23:32 chr17 9769199 . T C 305.63 PASS AF=0.574074;AO=30;DP=53;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0445783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4239;QD=22.6393;RBI=0.096473;REFB=0.0100101;REVB=0.0855559;RO=23;SAF=10;SAR=20;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222415;STB=0.626781;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00700182;OID=.;OPOS=9769199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:23:23:30:31:0.574074:20:10:14:9:21:10:14:9 chr17 9943064 . C T 238.89 PASS AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00590038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.524;QD=11.7969;RBI=0.0367936;REFB=-0.0113145;REVB=-0.0363174;RO=52;SAF=23;SAR=6;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348569;STB=0.703696;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0241011;OID=.;OPOS=9943064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:6:23:27:25:6:23:27:25 chr17 9943073 . C T 237.24 PASS AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0409579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5042;QD=11.4334;RBI=0.0709307;REFB=-0.00201442;REVB=-0.0579105;RO=54;SAF=23;SAR=6;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351834;STB=0.706178;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00425868;OID=.;OPOS=9943073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:54:54:29:29:0.349398:6:23:28:26:6:23:28:26 chr17 10205015 . C T 138.94 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00556949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.743;QD=19.8481;RBI=0.0815126;REFB=-0.0362001;REVB=0.0813221;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517022;STB=0.529372;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0206714;OID=.;OPOS=10205015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:6:7:9:6:6:7 chr17 10216510 . G A 2260.64 PASS AF=1;AO=143;DP=145;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394839;FXX=0.0273954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.039;QD=63.6799;RBI=0.0595747;REFB=0;REVB=0.0446114;RO=0;SAF=81;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19551e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155173;OID=.;OPOS=10216510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:142:0:0:143:142:1:62:81:0:0:62:80:0:0 chr17 10223714 . T C 796.66 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0270865;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.986;QD=54.0108;RBI=0.0818238;REFB=-0.155719;REVB=0.0772104;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512816;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00168698;OID=.;OPOS=10223714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:60:59:0:2:57:57:0.966102:38:19:0:0:38:19:0:2 chr17 10236465 . G A 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.29;QD=61.0491;RBI=0.0329967;REFB=0;REVB=-0.00795837;RO=0;SAF=27;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29402e-05;OID=.;OPOS=10236465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:51:27:0:0:51:27:0:0 chr17 10243717 . G A 958.2 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449849;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9863;QD=58.9659;RBI=0.045219;REFB=0;REVB=0.00459523;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317928;OID=.;OPOS=10243717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0 chr17 10297658 . A G 355.64 PASS AF=0.4;AO=41;DP=106;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=-0.00291137;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0518;QD=13.5481;RBI=0.00921249;REFB=-0.0172004;REVB=-0.00874036;RO=63;SAF=22;SAR=19;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141849;STB=0.573052;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0368795;OID=.;OPOS=10297658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:63:63:41:42:0.4:19:22:42:21:19:23:42:21 chr17 10304261 . G A 161.07 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0135204;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1693;QD=12.6327;RBI=0.038952;REFB=-0.00562165;REVB=-0.0365302;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067857;STB=0.530366;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0131623;OID=.;OPOS=10304261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:32:19:19:0.372549:11:8:15:16:11:8:15:17 chr17 10318636 . A G 1884.99 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102045;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.069;QD=60.3195;RBI=0.108883;REFB=0;REVB=0.0379782;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000834612;OID=.;OPOS=10318636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:125:0:0:115:125:1:67:48:0:0:67:58:0:0 chr17 10346781 . T C 598.31 PASS AF=0.508333;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.0194903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.479;QD=19.9436;RBI=0.0289988;REFB=-0.00122741;REVB=0.0214723;RO=57;SAF=21;SAR=40;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563624;STB=0.533322;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00141244;OID=.;OPOS=10346781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:57:59:61:61:0.508333:40:21:23:34:40:21:24:35 chr17 10348354 . T C 404.1 PASS AF=0.493976;AO=40;DP=82;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00638551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.789;QD=19.4749;RBI=0.00703586;REFB=-0.0124957;REVB=0.00295442;RO=42;SAF=16;SAR=24;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158428;STB=0.579466;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0141749;OID=.;OPOS=10348354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:42:42:40:41:0.493976:24:16:24:18:24:17:24:18 chr17 10355371 . C T 157.64 PASS AF=0.357143;AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0127436;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5623;QD=11.2598;RBI=0.0949201;REFB=-0.02227;REVB=0.0940607;RO=34;SAF=15;SAR=4;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383924;STB=0.692105;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0375429;OID=.;OPOS=10355371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:56:34:36:19:20:0.357143:4:15:16:18:5:15:17:19 chr17 10355763 . T C 766.83 PASS AF=0.455056;AO=81;DP=178;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=-0.0105852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.126;QD=17.2321;RBI=0.0256808;REFB=-0.00758119;REVB=0.0233978;RO=97;SAF=33;SAR=48;SRF=46;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669481;STB=0.537177;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0132063;OID=.;OPOS=10355763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:97:97:81:81:0.455056:48:33:46:51:48:33:46:51 chr17 10357915 . G A 552.01 PASS AF=0.6;AO=49;DP=85;FAO=51;FDP=85;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0177621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.449;QD=25.977;RBI=0.0199763;REFB=-0.0245463;REVB=0.0091413;RO=34;SAF=33;SAR=16;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161729;STB=0.593182;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0102934;OID=.;OPOS=10357915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:34:34:49:51:0.6:16:33:16:18:16:35:16:18 chr17 10363410 . A G 951.55 PASS AF=0.452915;AO=100;DP=223;FAO=101;FDP=223;FR=.;FRO=122;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=62;FSRR=60;FWDB=0.00789374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.293;QD=17.0681;RBI=0.032289;REFB=-0.0106166;REVB=0.0313092;RO=121;SAF=49;SAR=51;SRF=61;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139597;STB=0.512609;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0122297;OID=.;OPOS=10363410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:121:122:100:101:0.452915:51:49:61:60:52:49:62:60 chr17 10412808 . G A 909.59 PASS AF=0.556962;AO=88;DP=159;FAO=88;FDP=158;FR=.;FRO=70;FSAF=55;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0593484;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9794;QD=23.0277;RBI=0.0624223;REFB=0.0111961;REVB=-0.0193469;RO=71;SAF=55;SAR=33;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766384;STB=0.538071;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00846992;OID=.;OPOS=10412808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:71:70:88:88:0.556962:33:55:38:33:33:55:38:32 chr17 10415840 . A G 953.57 PASS AF=0.985507;AO=66;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0229323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.36;QD=55.2793;RBI=0.0240959;REFB=-0.0276474;REVB=0.00739748;RO=2;SAF=22;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103745;STB=0.505493;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.000720616;OID=.;OPOS=10415840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:69:2:1:66:68:0.985507:44:22:1:1:45:23:0:1 chr17 10427924 . G A 206.31 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=77;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.00323408;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.819;QD=10.5799;RBI=0.00776479;REFB=-0.0153061;REVB=0.00705922;RO=50;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982954;STB=0.539847;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0357482;OID=.;OPOS=10427924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:50:52:26:26:0.333333:15:11:17:33:15:11:19:33 chr17 10448769 . A T 883.28 PASS AF=0.533742;AO=87;DP=163;FAO=87;FDP=163;FR=.;FRO=76;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.011035;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.37;QD=21.6755;RBI=0.0176334;REFB=0.000822128;REVB=-0.0137537;RO=76;SAF=39;SAR=48;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105362;STB=0.505765;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00078345;OID=.;OPOS=10448769;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:76:76:87:87:0.533742:48:39:35:41:48:39:35:41 chr17 10450816 . T C 533.59 PASS AF=0.456;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.00207101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.759;QD=17.0749;RBI=0.0238591;REFB=-0.00512899;REVB=-0.023769;RO=68;SAF=34;SAR=23;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814358;STB=0.545386;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00586606;OID=.;OPOS=10450816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:68:68:57:57:0.456:23:34:35:33:23:34:35:33 chr17 10536018 . G A 290.93 PASS AF=0.336283;AO=34;DP=110;FAO=38;FDP=113;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0217005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.164;QD=10.2982;RBI=0.0277404;REFB=-0.0295398;REVB=0.0172806;RO=75;SAF=12;SAR=22;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154443;STB=0.539602;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.062291;OID=.;OPOS=10536018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:75:75:34:38:0.336283:22:12:36:39:22:16:36:39 chr17 10541515 . C T 418.17 PASS AF=0.546667;AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0325615;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.134;QD=22.3023;RBI=0.040111;REFB=-0.0116516;REVB=0.023423;RO=33;SAF=21;SAR=20;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100993;STB=0.547922;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00986615;OID=.;OPOS=10541515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:34:41:41:0.546667:20:21:21:12:20:21:21:13 chr17 10542471 . T G 447.88 PASS AF=0.573333;AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0144715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.925;QD=23.887;RBI=0.0316042;REFB=-0.0173736;REVB=0.0280963;RO=31;SAF=21;SAR=22;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950044;STB=0.558142;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0128293;OID=.;OPOS=10542471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:31:32:43:43:0.573333:22:21:19:12:22:21:20:12 chr17 10542765 . A G 308.42 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00980853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.163;QD=18.413;RBI=0.00983377;REFB=-0.00549548;REVB=0.000704014;RO=34;SAF=16;SAR=17;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147982;STB=0.582299;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00712857;OID=.;OPOS=10542765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:17:16:11:23:17:16:11:23 chr17 10542886 . T C 221.96 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00423346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2395;QD=14.5545;RBI=0.00950535;REFB=-0.0199983;REVB=0.00851055;RO=35;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819476;STB=0.546564;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0271604;OID=.;OPOS=10542886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:12:14:16:19:12:14:16:19 chr17 10543463 . T C 877.0 PASS AF=0.540373;AO=82;DP=162;FAO=87;FDP=161;FR=.;FRO=74;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.0397575;FXX=0.0182916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.714;QD=21.7887;RBI=0.0397685;REFB=-0.0387244;REVB=-0.000935693;RO=73;SAF=47;SAR=35;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101067;STB=0.520684;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.036161;OID=.;OPOS=10543463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:73:74:82:87:0.540373:35:47:41:32:35:52:41:33 chr17 10544416 . G T 103.33 PASS AF=0.288889;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0294247;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1158;QD=9.18498;RBI=0.0319945;REFB=-0.0192165;REVB=-0.0125632;RO=32;SAF=5;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100544;STB=0.561308;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0313168;OID=.;OPOS=10544416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:32:32:13:13:0.288889:8:5:15:17:8:5:15:17 chr17 11523082 . A G 832.3 PASS AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00230274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.097;QD=55.4867;RBI=0.0178968;REFB=0.0886551;REVB=0.017748;RO=1;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145145;STB=0.50769;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00148257;OID=.;OPOS=11523082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:60:1:1:58:59:0.983333:32:26:0:1:32:27:0:1 chr17 11583089 . T C 1498.7 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234372;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.839;QD=59.948;RBI=0.046573;REFB=0;REVB=0.040246;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21394e-05;OID=.;OPOS=11583089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:51:49:0:0:51:49:0:0 chr17 11648332 . C T 881.16 PASS AF=0.96875;AO=59;DP=60;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.135204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1595;QD=55.0723;RBI=0.13522;REFB=-0.0537688;REVB=-0.00208192;RO=0;SAF=18;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49224e-08;STB=0.505604;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00144945;OID=.;OPOS=11648332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:64:0:2:59:62:0.96875:41:18:0:0:41:21:1:1 chr17 11650903 . C T 327.7 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0129047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2382;QD=15.2417;RBI=0.0226142;REFB=-0.0192958;REVB=-0.0185707;RO=50;SAF=20;SAR=16;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158919;STB=0.589694;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0368892;OID=.;OPOS=11650903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:16:20:20:30:16:20:20:30 chr17 11757355 . G A 139.0 PASS AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0389191;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6234;QD=18.533;RBI=0.0389301;REFB=-0.0221574;REVB=-0.000926939;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289734;STB=0.663556;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0237315;OID=.;OPOS=11757355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:15:15:15:15:0.5:8:7:12:3:8:7:12:3 chr17 11786951 . T C 191.03 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.00300357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.414;QD=13.4056;RBI=0.00639276;REFB=0.00211354;REVB=-0.00564322;RO=34;SAF=12;SAR=11;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163372;STB=0.593143;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.00396006;OID=.;OPOS=11786951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:11:12:23:11:11:12:23:11 chr17 11787936 . A G 367.13 PASS AF=0.62;AO=30;DP=49;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.00631703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.071;QD=29.37;RBI=0.00950996;REFB=-0.019106;REVB=0.00710877;RO=19;SAF=15;SAR=15;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242574;STB=0.624925;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00806004;OID=.;OPOS=11787936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:19:19:30:31:0.62:15:15:3:16:16:15:3:16 chr17 11865462 . G A 900.6 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=67;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00194293;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.835;QD=55.4216;RBI=0.00730307;REFB=0.00263751;REVB=0.00703988;RO=2;SAF=26;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349417;STB=0.518513;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-1.24597e-05;OID=.;OPOS=11865462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:67:65:2:2:63:63:0.969231:37:26:2:0:37:26:2:0 chr17 12656111 . T C 351.23 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00657945;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.201;QD=23.0316;RBI=0.00664395;REFB=-0.00648638;REVB=0.000923513;RO=24;SAF=12;SAR=23;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916152;STB=0.537034;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00440683;OID=.;OPOS=12656111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:24:26:35:35:0.57377:23:12:11:13:23:12:11:15 chr17 12820646 . G C 1320.93 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7509;QD=62.1615;RBI=0.0567223;REFB=0;REVB=-0.0169653;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274493;OID=.;OPOS=12820646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr17 13399616 . A T 696.82 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.829;QD=61.9398;RBI=0.0390748;REFB=0;REVB=-0.00755152;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254426;OID=.;OPOS=13399616;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:26:18:0:0:26:19:0:0 chr17 14005439 . G A 514.39 PASS AF=0.434109;AO=56;DP=129;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.0038866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1821;QD=15.9501;RBI=0.0459365;REFB=-0.00908348;REVB=0.0457717;RO=73;SAF=21;SAR=35;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354824;STB=0.519826;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0111958;OID=.;OPOS=14005439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:73:73:56:56:0.434109:35:21:25:48:35:21:25:48 chr17 14095309 . A G 343.09 PASS AF=0.333333;AO=43;DP=129;FAO=43;FDP=129;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.00670965;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.572;QD=10.6384;RBI=0.0278693;REFB=-0.00247636;REVB=-0.0270495;RO=79;SAF=24;SAR=19;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240943;STB=0.622104;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00553459;OID=.;OPOS=14095309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:79:86:43:43:0.333333:19:24:27:52:19:24:32:54 chr17 14111176 . C A 220.57 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.00571748;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.76;QD=16.0414;RBI=0.00668936;REFB=-0.000692721;REVB=0.00347245;RO=29;SAF=3;SAR=22;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306161;STB=0.671592;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.000562051;OID=.;OPOS=14111176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:22:3:9:20:22:3:9:21 chr17 14139891 . A C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.803;QD=42.1826;RBI=0.0137106;REFB=0;REVB=0.00574196;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284692;OID=.;OPOS=14139891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0 chr17 14140080 . C T 236.12 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0176913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.999;QD=19.2749;RBI=0.0243286;REFB=-0.00885262;REVB=-0.0167002;RO=25;SAF=10;SAR=13;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421408;STB=0.514376;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00828241;OID=.;OPOS=14140080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:13:10:12:13:13:10:12:14 chr17 14140103 . A G 664.6 PASS AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0469012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0993;QD=57.7916;RBI=0.0524477;REFB=-0.0763106;REVB=0.0234743;RO=2;SAF=18;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493711;STB=0.526304;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00222669;OID=.;OPOS=14140103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:46:46:2:2:44:44:0.956522:26:18:2:0:26:18:2:0 chr17 14248423 . T C 93.84 PASS AF=0.352941;AO=11;DP=33;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0106256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.109;QD=11.0402;RBI=0.0241463;REFB=-0.00714678;REVB=0.0216827;RO=22;SAF=2;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262172;STB=0.589127;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0189776;OID=.;OPOS=14248423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:33:34:22:22:11:12:0.352941:9:2:8:14:9:3:8:14 chr17 14249167 . C T 141.79 PASS AF=0.339623;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00522318;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.813;QD=10.7012;RBI=0.0110695;REFB=-0.0170555;REVB=0.00975972;RO=36;SAF=10;SAR=8;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129974;STB=0.588651;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0348099;OID=.;OPOS=14249167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:36:35:18:18:0.339623:8:10:24:12:8:10:24:11 chr17 14673567 . C CA 81.15 PASS AF=0.5;AO=27;DP=70;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0995492;FXX=0.0149231;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.38164;QD=4.91839;RBI=0.173444;REFB=-0.000695072;REVB=-0.142031;RO=33;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115124;STB=0.56176;STBP=0.334;TYPE=ins;VARB=-0.0357331;OID=.;OPOS=14673568;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:27:70:33:66:33:13:20:17:16:81:33:10:17:16:17 chr17 15207364 . T G 112.0 PASS AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00362158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.248;QD=8.96034;RBI=0.00464074;REFB=-0.00843506;REVB=0.00290184;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328152;STB=0.519971;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.02186;OID=.;OPOS=15207364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:7:7:19:17:7:7:19:17 chr17 15215660 . T C 322.93 PASS AF=0.387097;AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=42;FWDB=0.0174592;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.029;QD=13.8896;RBI=0.026512;REFB=-0.00939963;REVB=0.0199516;RO=56;SAF=18;SAR=18;SRF=14;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270332;STB=0.645087;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.01685;OID=.;OPOS=15215660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:56:57:36:36:0.387097:18:18:14:42:18:18:15:42 chr17 15234895 . C T 117.74 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0131273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.345;QD=12.394;RBI=0.0161698;REFB=0.00162728;REVB=-0.00944111;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676393;STB=0.539942;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-0.00269956;OID=.;OPOS=15234895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:10:14:9:5:10:14 chr17 15311975 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8767;QD=54.5177;RBI=0.0567931;REFB=0;REVB=-0.0527034;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00190958;OID=.;OPOS=15311975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0 chr17 15341183 . A C 544.01 PASS AF=0.409722;AO=59;DP=145;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.0141742;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.295;QD=15.1115;RBI=0.0142437;REFB=-0.00630535;REVB=0.00140505;RO=85;SAF=32;SAR=27;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260701;STB=0.514659;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00607941;OID=.;OPOS=15341183;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:85:85:59:59:0.409722:27:32:44:41:27:32:44:41 chr17 15343524 . C CCTT 498.61 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151514;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=217.762;QD=58.6604;RBI=0.0165369;REFB=0;REVB=0.00662623;RO=0;SAF=4;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.73257e-05;OID=.;OPOS=15343525;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:33:34:34:34:0:4:30:0:0:4:0:4:29:0:0 chr17 15492409 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00350953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.249;QD=33.4285;RBI=0.00865629;REFB=0;REVB=0.00791293;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210397;OID=.;OPOS=15492409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr17 15620481 . C T 55.11 PASS AF=0.141026;AO=11;DP=79;FAO=11;FDP=78;FR=.;FRO=67;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0298869;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0239;QD=2.82639;RBI=0.0298918;REFB=0.00381121;REVB=-0.000544399;RO=67;SAF=5;SAR=6;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010088;STB=0.507029;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.0374222;OID=.;OPOS=15620481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:79:78:67:67:11:11:0.141026:6:5:31:36:6:5:31:36 chr17 15975463 . C G 131.07 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0554788;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1427;QD=13.1071;RBI=0.0591044;REFB=0.000758452;REVB=0.0203821;RO=25;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285998;STB=0.516756;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.00060559;OID=.;OPOS=15975463;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:7:8:14:11:7:8:14:11 chr17 16068340 . C T 388.96 PASS AF=0.302857;AO=45;DP=169;FAO=53;FDP=175;FR=.;FRO=122;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=71;FSRR=51;FWDB=-0.00213829;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.298;QD=8.89039;RBI=0.00282401;REFB=-0.0172764;REVB=0.00184466;RO=122;SAF=25;SAR=20;SRF=71;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330947;STB=0.576425;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0309282;OID=.;OPOS=16068340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:175:122:122:45:53:0.302857:20:25:71:51:28:25:71:51 chr17 16068343 . G A 392.9 PASS AF=0.294444;AO=53;DP=181;FAO=53;FDP=180;FR=.;FRO=127;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=75;FSRR=52;FWDB=-0.0295797;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6542;QD=8.73108;RBI=0.0415015;REFB=-0.0098174;REVB=-0.0291104;RO=128;SAF=25;SAR=28;SRF=75;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137543;STB=0.583302;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0187925;OID=.;OPOS=16068343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:128:127:53:53:0.294444:28:25:75:53:28:25:75:52 chr17 16068362 . C T 493.82 PASS AF=0.321244;AO=62;DP=194;FAO=62;FDP=193;FR=.;FRO=131;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=72;FSRR=59;FWDB=-0.00493971;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.953;QD=10.2346;RBI=0.0244667;REFB=-0.00805688;REVB=-0.0239628;RO=132;SAF=28;SAR=34;SRF=73;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119061;STB=0.566268;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0150288;OID=.;OPOS=16068362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:132:131:62:62:0.321244:34:28:73:59:34:28:72:59 chr17 16068377 . C G 511.3 PASS AF=0.335106;AO=62;DP=189;FAO=63;FDP=188;FR=.;FRO=125;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=75;FSRR=50;FWDB=0.00254432;FXX=0.0105258;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.585;QD=10.8788;RBI=0.00413373;REFB=0.000549915;REVB=-0.00325794;RO=123;SAF=29;SAR=33;SRF=74;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15424;STB=0.581838;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000849212;OID=.;OPOS=16068377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:123:125:62:63:0.335106:33:29:74:49:33:30:75:50 chr17 16068383 . G A 574.77 PASS AF=0.356021;AO=67;DP=193;FAO=68;FDP=191;FR=.;FRO=123;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=70;FSRR=53;FWDB=-0.0143924;FXX=0.0154631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.203;QD=12.037;RBI=0.0148184;REFB=-0.00387416;REVB=0.00352777;RO=126;SAF=33;SAR=34;SRF=70;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719563;STB=0.553833;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00745734;OID=.;OPOS=16068383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:191:126:123:67:68:0.356021:34:33:70:56:35:33:70:53 chr17 16068396 . G A 690.38 PASS AF=0.392857;AO=76;DP=195;FAO=77;FDP=196;FR=.;FRO=119;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=-0.0130548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.575;QD=14.0894;RBI=0.0232534;REFB=-0.00137151;REVB=0.019243;RO=111;SAF=35;SAR=41;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112843;STB=0.550497;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00441798;OID=.;OPOS=16068396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:111:119:76:77:0.392857:41:35:63:48:42:35:64:55 chr17 16068463 . C T 288.0 PASS AF=0.237838;AO=44;DP=185;FAO=44;FDP=185;FR=.;FRO=141;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=60;FSRR=81;FWDB=-0.0204162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.84;QD=6.22711;RBI=0.0206727;REFB=-0.00816654;REVB=0.00324661;RO=141;SAF=20;SAR=24;SRF=60;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370526;STB=0.522378;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0236499;OID=.;OPOS=16068463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:141:141:44:44:0.237838:24:20:60:81:24:20:60:81 chr17 16321032 . G C 298.09 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0064071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.677;QD=20.9184;RBI=0.00656439;REFB=-0.0249506;REVB=-0.00142838;RO=26;SAF=17;SAR=14;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196116;STB=0.608433;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0242193;OID=.;OPOS=16321032;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:14:17:8:18:14:17:8:18 chr17 16325968 . A G 173.58 PASS AF=0.461538;AO=16;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0124112;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.233;QD=17.8036;RBI=0.019056;REFB=-0.00600945;REVB=0.0144601;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760933;STB=0.504499;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00708856;OID=.;OPOS=16325968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:22:21:16:18:0.461538:9:7:8:14:11:7:8:13 chr17 16326005 . A C 299.32 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0135826;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.098;QD=20.6428;RBI=0.0136181;REFB=-0.0194783;REVB=-0.000981869;RO=26;SAF=14;SAR=17;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154578;STB=0.573986;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.013044;OID=.;OPOS=16326005;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:27:31:31:0.534483:17:14:7:19:17:14:8:19 chr17 16336992 . C G 187.75 PASS AF=0.5;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00964926;FXX=0.0270197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.1739;QD=20.8609;RBI=0.0910189;REFB=-0.0546137;REVB=-0.090506;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169801;STB=0.555494;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0450313;OID=.;OPOS=16336992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:13:16:17:18:0.5:9:8:9:4:10:8:9:7 chr17 16346932 . G T 182.53 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.000631616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.111;QD=17.3842;RBI=0.00355316;REFB=-0.00680527;REVB=0.00349657;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15049;STB=0.586026;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0103375;OID=.;OPOS=16346932;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:12:7:12:11:12:7:12:11 chr17 16350239 . A G 176.24 PASS AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0365477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7094;QD=29.3734;RBI=0.0390968;REFB=-0.0120623;REVB=0.0138862;RO=7;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151063;STB=0.583241;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00602591;OID=.;OPOS=16350239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:7:10:6:1:7:10:6:1 chr17 16524929 . C A 386.16 PASS AF=0.487805;AO=39;DP=81;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0179784;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.773;QD=18.8369;RBI=0.0199762;REFB=-0.00813091;REVB=-0.00870762;RO=42;SAF=18;SAR=21;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358647;STB=0.525722;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00713973;OID=.;OPOS=16524929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:42:42:39:40:0.487805:21:18:21:21:22:18:21:21 chr17 16537207 . C T 637.28 PASS AF=0.57;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00291555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.188;QD=25.4913;RBI=0.00610748;REFB=-0.0314071;REVB=-0.00536665;RO=43;SAF=31;SAR=26;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254683;STB=0.513928;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.024185;OID=.;OPOS=16537207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:43:43:57:57:0.57:26:31:22:21:26:31:22:21 chr17 16635980 . G A 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0214939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9092;QD=19.0177;RBI=0.0228386;REFB=0.0219079;REVB=0.00772104;RO=14;SAF=2;SAR=13;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298867;STB=0.6738;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.0412357;OID=.;OPOS=16635980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:13:2:5:9:13:2:5:9 chr17 16692262 . C T 178.73 PASS AF=0.5625;AO=17;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0439444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1193;QD=22.3411;RBI=0.0537924;REFB=3.00903e-06;REVB=-0.0310243;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184004;STB=0.610988;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.000433196;OID=.;OPOS=16692262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:17:18:0.5625:7:10:5:9:7:11:5:9 chr17 16735618 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.964;QD=49.5991;RBI=0.0519635;REFB=0;REVB=0.0459175;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259315;OID=.;OPOS=16735618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr17 16746358 . G A 175.65 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0525989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.174;QD=46.8394;RBI=0.0538826;REFB=0;REVB=0.0116914;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000797927;OID=.;OPOS=16746358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0 chr17 16828713 . A T 426.7 PASS AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00576661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2586;QD=19.1774;RBI=0.00614253;REFB=-0.00135691;REVB=0.00211585;RO=46;SAF=23;SAR=20;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132789;STB=0.573771;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00133639;OID=.;OPOS=16828713;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:46:43:43:0.483146:20:23:18:28:20:23:18:28 chr17 16828790 . TG CA 152.9 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0269978;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=192.986;QD=11.9922;RBI=0.0272625;REFB=-0.0145381;REVB=0.00378997;RO=33;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022643;STB=0.51326;STBP=0.897;TYPE=mnp;VARB=0.0346225;OID=.;OPOS=16828790;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:10:8:14:19:10:8:14:19 chr17 16829159 . C T 180.8 PASS AF=0.463415;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0183548;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.683;QD=17.6387;RBI=0.0214632;REFB=-0.00738198;REVB=-0.0111252;RO=19;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195539;STB=0.518305;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0115131;OID=.;OPOS=16829159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:41:19:22:18:19:0.463415:11:7:7:12:11:8:10:12 chr17 16836425 . G A 274.25 PASS AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0161198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.557;QD=12.9056;RBI=0.0215391;REFB=-0.004827;REVB=0.0142858;RO=53;SAF=17;SAR=15;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647616;STB=0.537082;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00555849;OID=.;OPOS=16836425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:53:53:32:32:0.376471:15:17:25:28:15:17:25:28 chr17 16842912 . A G 851.15 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.473;QD=57.7051;RBI=0.00479934;REFB=0;REVB=-0.00321354;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08252e-05;OID=.;OPOS=16842912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0 chr17 16842991 . G A 1220.93 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000766664;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=269.834;QD=58.8399;RBI=0.00801834;REFB=-0.0747282;REVB=-0.00798161;RO=2;SAF=30;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182065;STB=0.509613;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-1.71866e-05;OID=.;OPOS=16842991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:83:83:2:2:81:81:0.975904:51:30:0:2:51:30:0:2 chr17 16855878 . C T 482.95 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298673;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.4168;QD=58.5397;RBI=0.0343956;REFB=0;REVB=0.0170588;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244636;OID=.;OPOS=16855878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr17 16892265 . G A 340.57 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0670118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5824;QD=23.4879;RBI=0.067421;REFB=0.00480197;REVB=-0.00741658;RO=24;SAF=16;SAR=18;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221488;STB=0.512188;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.00487229;OID=.;OPOS=16892265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:18:16:12:12:18:16:12:12 chr17 16892273 . A G 333.67 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0331398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.83;QD=24.2666;RBI=0.0352826;REFB=-0.0033997;REVB=0.0121086;RO=22;SAF=17;SAR=16;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110251;STB=0.50606;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00186979;OID=.;OPOS=16892273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:16:17:11:11:16:17:11:11 chr17 17039561 . CCAGCAGCA CCAGCA,CCAG 331.62 PASS AF=0.88,0.12;AO=9,3;DP=25;FAO=22,3;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15,3;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579154,-0.0486467;FXX=0.0740466;HRUN=1,1;LEN=3,5;MLLD=77.1282,112.629;QD=53.0597;RBI=0.122394,0.0824215;REFB=0,0;REVB=0.107824,-0.0665342;RO=0;SAF=7,3;SAR=2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0207404,0.101646;OID=.,.;OPOS=17039562,17039565;OREF=CAG,CAGCA;OALT=-,-;OMAPALT=CCAGCA,CCAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.88,0.12:9,3:25:22,3:25:0:15,3:7,0:0:0:15:0:7,3:2,0:0:0 chr17 17046024 . C A 698.97 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0854449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2834;QD=54.8215;RBI=0.10519;REFB=-0.0438808;REVB=-0.0613527;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5098;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00599946;OID=.;OPOS=17046024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:25:25:1:0:25:25:1:0 chr17 17062241 . C G 4136.41 PASS AF=0.961131;AO=273;DP=285;FAO=272;FDP=283;FR=.;FRO=11;FSAF=130;FSAR=142;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00105898;FXX=0.0070173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=232.526;QD=58.4651;RBI=0.00570364;REFB=-0.111868;REVB=0.00560447;RO=6;SAF=131;SAR=142;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145013;STB=0.502629;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.000484745;OID=.;OPOS=17062241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:285:283:6:11:273:272:0.961131:142:131:5:1:142:130:6:5 chr17 17069105 . G A 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.14;QD=63.8705;RBI=0.0267889;REFB=0;REVB=0.0196644;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010164;OID=.;OPOS=17069105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0 chr17 17070424 . A G 361.11 PASS AF=0.410526;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.00729797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.44;QD=15.2045;RBI=0.0107419;REFB=-0.00696022;REVB=0.00788216;RO=56;SAF=25;SAR=14;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114567;STB=0.564938;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00928438;OID=.;OPOS=17070424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:56:56:39:39:0.410526:14:25:30:26:14:25:30:26 chr17 17168164 . G A 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.209;QD=64.1539;RBI=0.060988;REFB=0;REVB=0.00104775;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93307e-05;OID=.;OPOS=17168164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr17 17179481 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0736181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.981;QD=61.6839;RBI=0.0736289;REFB=0;REVB=0.00126312;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000239215;OID=.;OPOS=17179481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0 chr17 17397818 . G C 313.07 PASS AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0154266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.937;QD=16.9228;RBI=0.0239796;REFB=-0.0298215;REVB=-0.0183586;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481638;STB=0.527011;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.027815;OID=.;OPOS=17397818;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:17:17:18:22:17:17:18:22 chr17 17397982 . T C 1576.48 PASS AF=0.981651;AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0857919;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.412;QD=57.8525;RBI=0.0858723;REFB=-0.0160037;REVB=0.00371544;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.509089;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.000183455;OID=.;OPOS=17397982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:109:109:0:2:107:107:0.981651:53:54:0:0:53:54:2:0 chr17 17398043 . C T 241.49 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0160556;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.328;QD=12.3841;RBI=0.0162613;REFB=-0.00941353;REVB=0.00257849;RO=49;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594602;STB=0.534138;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0148697;OID=.;OPOS=17398043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:15:14:21:28:15:14:21:28 chr17 17409560 . C T 208.53 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0263636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8051;QD=18.133;RBI=0.0410981;REFB=-0.0168652;REVB=-0.031528;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14936;STB=0.584339;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0145158;OID=.;OPOS=17409560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:12:9:7:18:12:9:7:18 chr17 17682484 . G A 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.127;QD=56.188;RBI=0.0448809;REFB=0;REVB=0.0050589;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186796;OID=.;OPOS=17682484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0 chr17 17696531 . G C 446.95 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0656567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2983;QD=57.6704;RBI=0.0946796;REFB=0;REVB=-0.0682161;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00270921;OID=.;OPOS=17696531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0 chr17 17696755 . C A 1142.29 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434899;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.6735;QD=59.3396;RBI=0.049274;REFB=-0.0236493;REVB=-0.0231637;RO=1;SAF=33;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141217;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197695;OID=.;OPOS=17696755;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:76:77:1:0:75:77:1:42:33:1:0:42:35:0:0 chr17 17715101 . G A 538.45 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.839;QD=59.8276;RBI=0.0298206;REFB=0;REVB=0.0246551;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122855;OID=.;OPOS=17715101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0 chr17 17896205 . C T 1160.76 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0146034;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.315;QD=59.5259;RBI=0.0184878;REFB=0.0761891;REVB=0.0113375;RO=1;SAF=24;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884746;STB=0.504672;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=6.6335e-05;OID=.;OPOS=17896205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:79:78:1:1:77:77:0.987179:53:24:0:1:53:24:0:1 chr17 17910419 . C T 674.29 PASS AF=0.472222;AO=68;DP=144;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.0241142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9707;QD=18.7304;RBI=0.0249602;REFB=-0.00135017;REVB=0.00644359;RO=76;SAF=35;SAR=33;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362059;STB=0.520051;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00137893;OID=.;OPOS=17910419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:76:76:68:68:0.472222:33:35:42:34:33:35:42:34 chr17 17969797 . TG T 49.0 PASS AF=0.583333;AO=3;DP=23;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0378558;FXX=0.199867;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.107;QD=16.3326;RBI=0.127319;REFB=-0.0704635;REVB=0.121561;RO=19;SAF=0;SAR=3;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.555072;STB=0.809829;STBP=0.035;TYPE=del;VARB=0.0623768;OID=.;OPOS=17969798;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:3:23:7:12:5:1:6:4:1:33:19:0:3:7:12 chr17 18003671 . T G 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.375;QD=62.0207;RBI=0.0187278;REFB=0;REVB=0.0151135;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80932e-05;OID=.;OPOS=18003671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0 chr17 18023897 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.337;QD=33.427;RBI=0.0483566;REFB=0;REVB=0.0439595;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107282;OID=.;OPOS=18023897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0 chr17 18041507 . C T 249.67 PASS AF=0.5;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0170071;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0091;QD=18.4943;RBI=0.0320003;REFB=-0.00648988;REVB=0.0271068;RO=28;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935452;STB=0.54051;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00790196;OID=.;OPOS=18041507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:28:27:27:27:0.5:9:18:16:12:9:18:16:11 chr17 18046898 . T C 70.63 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0147015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5638;QD=17.6566;RBI=0.0738236;REFB=-0.0199217;REVB=0.0723449;RO=7;SAF=8;SAR=1;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271782;STB=0.65192;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0294446;OID=.;OPOS=18046898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:16:16:7:7:9:9:0.5625:1:8:7:0:1:8:7:0 chr17 18047189 . G A 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0024501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.047;QD=16.1562;RBI=0.00523996;REFB=-0.0190642;REVB=0.00463186;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966714;STB=0.554338;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0155153;OID=.;OPOS=18047189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:11:16:22:10:11:16:22:10 chr17 18052867 . T C 929.82 PASS AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0429705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.5987;QD=55.5118;RBI=0.0452507;REFB=0.0108909;REVB=0.0141829;RO=1;SAF=43;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010861;STB=0.505364;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.000949648;OID=.;OPOS=18052867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:67:67:1:2:65:65:0.970149:22:43:1:0:22:43:1:1 chr17 18077175 . T C 280.81 PASS AF=0.354839;AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.00421015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.046;QD=12.0777;RBI=0.0137218;REFB=-0.00797877;REVB=-0.01306;RO=60;SAF=15;SAR=18;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429877;STB=0.524738;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0164683;OID=.;OPOS=18077175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:60:60:33:33:0.354839:18:15:25:35:18:15:25:35 chr17 18087299 . C T 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0389233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.297;QD=14.6525;RBI=0.0636775;REFB=-0.0417663;REVB=-0.0503964;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344857;STB=0.70522;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0197588;OID=.;OPOS=18087299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:1:4:2:4:1:4 chr17 18137141 . A G 1952.26 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.989;QD=61.9764;RBI=0.0499755;REFB=0;REVB=0.0175328;RO=0;SAF=56;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8016e-05;OID=.;OPOS=18137141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:70:56:0:0:70:56:0:0 chr17 18148045 . G C 33.53 PASS AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.000275845;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=141.09;QD=5.15866;RBI=0.023425;REFB=-0.0050642;REVB=-0.0234234;RO=20;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116287;STB=0.575523;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0124697;OID=.;OPOS=18148045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:26:26:20:20:6:6:0.230769:2:4:15:5:2:4:15:5 chr17 18390993 . C T 146.3 PASS AF=0.339286;AO=18;DP=55;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=0.0045814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1212;QD=10.4498;RBI=0.0395857;REFB=-0.0215032;REVB=0.0393197;RO=37;SAF=4;SAR=14;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00995223;STB=0.505612;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0315637;OID=.;OPOS=18390993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:37:37:18:19:0.339286:14:4:8:29:15:4:8:29 chr17 18391003 . G A 175.27 PASS AF=0.328571;AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=38;FWDB=0.00247111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3675;QD=10.0153;RBI=0.00869709;REFB=-0.00123846;REVB=-0.00833864;RO=46;SAF=5;SAR=18;SRF=9;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374001;STB=0.526294;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00117424;OID=.;OPOS=18391003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:46:47:23:23:0.328571:18:5:9:37:18:5:9:38 chr17 18528623 . A G 1475.01 PASS AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0643352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9524;QD=62.1056;RBI=0.0735188;REFB=-0.0146946;REVB=-0.0355809;RO=1;SAF=48;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.009776;STB=0.505154;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000989065;OID=.;OPOS=18528623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:46:48:1:0:46:48:1:0 chr17 18542519 . T G 151.13 PASS AF=0.75;AO=14;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0187752;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3954;QD=30.2268;RBI=0.0878343;REFB=0.00266678;REVB=0.0858041;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471926;STB=0.516756;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0193038;OID=.;OPOS=18542519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:20:20:5:5:14:15:0.75:7:7:2:3:8:7:2:3 chr17 18565350 . G C 583.4 PASS AF=0.420382;AO=66;DP=157;FAO=66;FDP=157;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=0.00595277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.027;QD=14.8636;RBI=0.0145574;REFB=-0.00929417;REVB=-0.0132847;RO=91;SAF=42;SAR=24;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216678;STB=0.621458;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0119332;OID=.;OPOS=18565350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:91:91:66:66:0.420382:24:42:39:52:24:42:39:52 chr17 18610134 . T G 374.15 PASS AF=0.46988;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0650323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.364;QD=18.0315;RBI=0.076199;REFB=-0.00654864;REVB=-0.0397125;RO=44;SAF=22;SAR=17;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396697;STB=0.522162;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00859199;OID=.;OPOS=18610134;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:44:44:39:39:0.46988:17:22:23:21:17:22:23:21 chr17 18630995 . G A 376.72 PASS AF=0.5;AO=37;DP=77;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0210254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4544;QD=19.3191;RBI=0.0401328;REFB=-0.0269736;REVB=0.0341844;RO=39;SAF=12;SAR=25;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250665;STB=0.63151;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0283947;OID=.;OPOS=18630995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:39:39:37:39:0.5:25:12:23:16:26:13:23:16 chr17 18647625 . T A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-8.86957e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.583;QD=14.7986;RBI=0.00739856;REFB=0.00329602;REVB=-0.00739802;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288616;STB=0.666389;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.00443669;OID=.;OPOS=18647625;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:6:5:10:3:6:5:10:3 chr17 18653070 . G A 473.58 PASS AF=0.516854;AO=45;DP=87;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0042069;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1886;QD=21.2844;RBI=0.0134012;REFB=0.00945679;REVB=0.0127237;RO=42;SAF=25;SAR=20;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110741;STB=0.559661;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00752592;OID=.;OPOS=18653070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:42:43:45:46:0.516854:20:25:18:24:20:26:19:24 chr17 18694277 . G A 770.63 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0253585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.947;QD=55.0448;RBI=0.0256649;REFB=0.053024;REVB=0.00395374;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000185695;OID=.;OPOS=18694277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:25:30:0:0:25:30:1:0 chr17 18702220 . T C 2420.85 PASS AF=0.976048;AO=162;DP=166;FAO=163;FDP=167;FR=.;FRO=4;FSAF=72;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00330273;FXX=0.00595203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.139;QD=57.9845;RBI=0.0272232;REFB=-0.0801752;REVB=0.0270221;RO=4;SAF=70;SAR=92;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00316872;STB=0.501415;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00650464;OID=.;OPOS=18702220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:166:167:4:4:162:163:0.976048:92:70:2:2:91:72:2:2 chr17 18880986 . C T 620.93 PASS AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0102281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.17;QD=55.1939;RBI=0.0115056;REFB=-0.0321606;REVB=0.00526926;RO=1;SAF=24;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019159;STB=0.50649;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.00167378;OID=.;OPOS=18880986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:45:45:1:3:42:42:0.933333:18:24:1:0:18:24:2:1 chr17 18907029 . A C,G 483.17 PASS AF=0.0588235,0.941176;AO=3,31;DP=34;FAO=2,32;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=2,15;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00846289,0.00494732;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=35.429,66.5362;QD=56.8438;RBI=0.0398693,0.0404653;REFB=0,0;REVB=-0.0389608,-0.0401617;RO=0;SAF=3,14;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.242426,-0.00369087;OID=.,.;OPOS=18907029,18907029;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:34:34:0:0:3,31:2,32:0.0588235,0.941176:0,17:3,14:0:0:0,17:2,15:0:0 chr17 18918396 . G C 481.82 PASS AF=0.944444;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.03539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2341;QD=53.5358;RBI=0.0650698;REFB=-0.00941192;REVB=0.0546043;RO=2;SAF=10;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245816;STB=0.513611;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.00249711;OID=.;OPOS=18918396;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:36:2:2:33:34:0.944444:23:10:1:1:24:10:1:1 chr17 18923124 . G A 468.55 PASS AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.00330584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.835;QD=18.0211;RBI=0.0267556;REFB=-0.00242548;REVB=0.0265506;RO=54;SAF=32;SAR=18;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00828914;STB=0.504601;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0026479;OID=.;OPOS=18923124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:0.480769:18:32:35:19:18:32:35:19 chr17 18923180 . C T 505.57 PASS AF=0.509804;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0269627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.248;QD=19.8261;RBI=0.0276118;REFB=-0.0236682;REVB=0.0059521;RO=50;SAF=32;SAR=20;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014363;STB=0.507933;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0198986;OID=.;OPOS=18923180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:50:50:52:52:0.509804:20:32:30:20:20:32:30:20 chr17 19411482 . C T 100.75 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00361399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=333.574;QD=16.1192;RBI=0.0125365;REFB=-0.00512065;REVB=-0.0120043;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243637;STB=0.640296;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00489414;OID=.;OPOS=19411482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:5:7:4:9:5:7:4:9 chr17 19578873 . A T 1190.45 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00909753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.878;QD=61.0489;RBI=0.0173578;REFB=0;REVB=0.0147827;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4262e-05;OID=.;OPOS=19578873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0 chr17 19608773 . G A 1030.3 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0309753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.473;QD=58.0453;RBI=0.065863;REFB=-0.0916516;REVB=0.0581246;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505745;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000493558;OID=.;OPOS=19608773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:71:0:1:70:70:0.985915:27:43:0:0:27:43:1:0 chr17 19617236 . G T 629.06 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259413;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.92;QD=62.9062;RBI=0.0605438;REFB=0;REVB=0.0547047;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356072;OID=.;OPOS=19617236;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr17 19642952 . G C 450.82 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166299;FXX=0.0312402;HRUN=4;LEN=1;MLLD=320.877;QD=58.171;RBI=0.0237551;REFB=0;REVB=0.0169632;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84418e-05;OID=.;OPOS=19642952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0 chr17 19645938 . A C 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.216;QD=57.7116;RBI=0.0342333;REFB=0;REVB=-0.0236046;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68245e-06;OID=.;OPOS=19645938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chr17 19679697 . G A 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0213885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.185;QD=21.7443;RBI=0.0404574;REFB=-0.0208752;REVB=-0.0343414;RO=11;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176946;STB=0.599867;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0174838;OID=.;OPOS=19679697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:6:9:4:7:6:9:4:7 chr17 19827800 . G A 720.17 PASS AF=0.396226;AO=83;DP=214;FAO=84;FDP=212;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=70;FSRR=58;FWDB=-0.0223263;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.964;QD=13.5882;RBI=0.041218;REFB=0.00332419;REVB=-0.0346476;RO=124;SAF=38;SAR=45;SRF=69;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104937;STB=0.549753;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00395599;OID=.;OPOS=19827800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:212:124:128:83:84:0.396226:45:38:69:55:45:39:70:58 chr17 20107773 . T C 1263.15 PASS AF=1;AO=80;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.06082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6816;QD=60.8746;RBI=0.0682886;REFB=0;REVB=-0.0310525;RO=0;SAF=55;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439277;OID=.;OPOS=20107773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:80:83:1:25:55:0:0:27:56:0:0 chr17 20108239 . A T 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.987;QD=59.8394;RBI=0.0230288;REFB=0;REVB=0.0140635;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.68733e-05;OID=.;OPOS=20108239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr17 20109189 . C T 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0239;QD=59.1431;RBI=0.0237791;REFB=0;REVB=0.0237257;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.99267e-05;OID=.;OPOS=20109189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0 chr17 20163528 . CA C,CG 638.22 PASS AF=0.0697674,0.930233;AO=6,39;DP=45;FAO=3,40;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=3,14;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512796,0.142646;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=200.068,222.244;QD=59.3694;RBI=0.0531287,0.14297;REFB=0,0;REVB=0.013895,0.00962387;RO=0;SAF=6,11;SAR=0,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00376729,4.42144e-05;OID=.,.;OPOS=20163529,20163529;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0697674,0.930233:6,39:45:3,40:43:0:3,14:0,26:0:0:12:0:6,11:0,28:0:0 chr17 20244264 . G C 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00855467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.861;QD=59.0186;RBI=0.0500616;REFB=0;REVB=0.0493253;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221465;OID=.;OPOS=20244264;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0 chr17 20268754 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.473;QD=37.4885;RBI=0.025329;REFB=0;REVB=0.0149567;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000326788;OID=.;OPOS=20268754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr17 20361493 . T C 36.61 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.000125711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.001;QD=7.32281;RBI=0.0625334;REFB=0.00894034;REVB=-0.0625333;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784305;STB=0.549835;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.0159686;OID=.;OPOS=20361493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:3:3:6:8:3:3:6:8 chr17 20769862 . T A 178.22 PASS AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00516052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.961;QD=14.8514;RBI=0.0101083;REFB=-0.00294201;REVB=-0.00869171;RO=26;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512182;STB=0.557463;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00727423;OID=.;OPOS=20769862;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:29:19:19:0.395833:9:10:15:11:9:10:18:11 chr17 20769866 . G A 165.05 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0129267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.819;QD=14.0471;RBI=0.0172966;REFB=0.011193;REVB=-0.0114923;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552757;STB=0.51921;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=-0.0236268;OID=.;OPOS=20769866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:28:29:18:18:0.382979:8:10:17:11:8:10:17:12 chr17 20769896 . G T 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00800336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.912;QD=13.5518;RBI=0.0164713;REFB=-0.000444831;REVB=0.0143962;RO=35;SAF=16;SAR=8;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110481;STB=0.506324;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00060023;OID=.;OPOS=20769896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:8:16:23:12:8:16:23:12 chr17 20769899 . G T 199.89 PASS AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0023864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.35;QD=13.5518;RBI=0.0127441;REFB=-0.00805042;REVB=-0.0125187;RO=35;SAF=16;SAR=8;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110481;STB=0.506324;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0150218;OID=.;OPOS=20769899;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:8:16:23:12:8:16:23:12 chr17 20769904 . G A 306.88 PASS AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0149348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1629;QD=18.0516;RBI=0.0170687;REFB=-0.0302809;REVB=-0.00826398;RO=35;SAF=20;SAR=13;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499079;STB=0.52784;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0159073;OID=.;OPOS=20769904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:13:20:23:12:13:20:23:12 chr17 20769954 . T G 357.63 PASS AF=0.506849;AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0168932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.652;QD=19.5963;RBI=0.0176421;REFB=-0.0275023;REVB=0.00508569;RO=34;SAF=22;SAR=14;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11809;STB=0.538873;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0280069;OID=.;OPOS=20769954;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:34:36:36:37:0.506849:14:22:25:9:14:23:25:11 chr17 20769964 . C A 281.49 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0928428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.947;QD=17.0597;RBI=0.0958867;REFB=-0.0284303;REVB=-0.0239683;RO=35;SAF=20;SAR=11;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424877;STB=0.523794;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.029072;OID=.;OPOS=20769964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:11:20:24:11:11:20:24:11 chr17 20769968 . G A 283.31 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0291132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.453;QD=17.4342;RBI=0.0302916;REFB=-0.0340609;REVB=-0.00836662;RO=33;SAF=21;SAR=10;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112732;STB=0.500567;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0238994;OID=.;OPOS=20769968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:33:34:31:31:0.476923:10:21:22:11:10:21:23:11 chr17 20769995 . C T 236.07 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.137114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0035;QD=19.2713;RBI=0.151991;REFB=-0.01257;REVB=0.0655831;RO=26;SAF=16;SAR=7;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396613;STB=0.522369;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0193212;OID=.;OPOS=20769995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:7:16:19:7:7:16:19:7 chr17 20770002 . CC AG 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00867282;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=245.193;QD=19.4668;RBI=0.0102753;REFB=-0.0279835;REVB=0.00551038;RO=24;SAF=15;SAR=7;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750266;STB=0.542216;STBP=0.614;TYPE=mnp;VARB=0.0328195;OID=.;OPOS=20770002;OREF=CC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:7:15:18:6:7:15:18:6 chr17 20770017 . C T 32.81 PASS AF=0.133333;AO=6;DP=45;FAO=6;FDP=45;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=9;FWDB=-0.0163049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.677;QD=2.91668;RBI=0.0172624;REFB=-5.54585e-06;REVB=0.00566914;RO=39;SAF=2;SAR=4;SRF=30;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493933;STB=0.830374;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.000844829;OID=.;OPOS=20770017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:45:45:39:39:6:6:0.133333:4:2:30:9:4:2:30:9 chr17 20797873 . G GCAT 74.41 PASS AF=0.152174;AO=13;DP=93;FAO=14;FDP=92;FR=.;FRO=78;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=0.0152394;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=3;MLLD=314.076;QD=3.23514;RBI=0.0164336;REFB=-0.00141908;REVB=-0.00614995;RO=78;SAF=5;SAR=8;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656169;STB=0.569703;STBP=0.621;TYPE=ins;VARB=0.00962376;OID=.;OPOS=20797874;OREF=-;OALT=CAT;OMAPALT=GCAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.152174:13:93:14:92:78:5:9:34:44:74:78:5:8:34:44 chr17 20797920 . C G 826.88 PASS AF=0.733333;AO=66;DP=89;FAO=66;FDP=90;FR=.;FRO=24;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00402077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.298;QD=36.7503;RBI=0.00969347;REFB=-0.0166485;REVB=-0.00882025;RO=23;SAF=31;SAR=35;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379845;STB=0.525416;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00577488;OID=.;OPOS=20797920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:23:24:66:66:0.733333:35:31:9:14:35:31:9:15 chr17 20799119 . A G 280.96 PASS AF=0.342857;AO=34;DP=103;FAO=36;FDP=105;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.000477273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.746;QD=10.7033;RBI=0.000481364;REFB=-0.0207872;REVB=6.26245e-05;RO=69;SAF=20;SAR=14;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272323;STB=0.512188;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0419771;OID=.;OPOS=20799119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:69:69:34:36:0.342857:14:20:39:30:15:21:39:30 chr17 21117589 . C A 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0092327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.025;QD=10.0339;RBI=0.0176317;REFB=-0.00494753;REVB=0.0150212;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00541246;OID=.;OPOS=21117589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:4:3:2:3:4:3 chr17 21132915 . C T 223.08 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5968;QD=49.5726;RBI=0.0667687;REFB=0;REVB=0.053631;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00154299;OID=.;OPOS=21132915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0 chr17 21144074 . G A 842.55 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0130541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.624;QD=54.3579;RBI=0.0142714;REFB=0.0313354;REVB=0.0057673;RO=2;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269523;STB=0.514281;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.000718279;OID=.;OPOS=21144074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:34:26:0:2:34:26:0:2 chr17 21144125 . C CG,G 32.09 PASS AF=0.166667,0.166667;AO=3,4;DP=18;FAO=3,3;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2,2;FSAR=1,1;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00105697,-0.0148554;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=54.9678,58.9696;QD=7.1302;RBI=0.0345947,0.0344221;REFB=-0.0153715,-0.011844;REVB=-0.0345786,-0.0310515;RO=10;SAF=1,3;SAR=2,1;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.359808,0.621758;STB=0.8875,0.8875;STBP=0.544,0.544;TYPE=ins,snp;VARB=0.170023,0.207929;OID=.,.;OPOS=21144126,21144125;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:18:18:10:12:3,4:3,3:0.166667,0.166667:2,1:1,3:1:9:1,1:2,2:1:11 chr17 21144155 . C G 271.79 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8066;QD=51.7685;RBI=0.0264633;REFB=0;REVB=-0.000352683;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000561504;OID=.;OPOS=21144155;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:16:5:0:0:16:5:0:0 chr17 21144352 . G A 672.22 PASS AF=0.957447;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00173595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.629;QD=57.2106;RBI=0.0215703;REFB=-0.0862927;REVB=0.0215004;RO=2;SAF=36;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116714;STB=0.549977;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00824031;OID=.;OPOS=21144352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:45:47:2:2:43:45:0.957447:7:36:0:2:9:36:0:2 chr17 21194769 . C T 128.88 PASS AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.015257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1437;QD=8.4511;RBI=0.0152918;REFB=-0.00324578;REVB=0.001031;RO=43;SAF=6;SAR=12;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339128;STB=0.701911;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00254417;OID=.;OPOS=21194769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:43:43:18:18:0.295082:12:6:27:16:12:6:27:16 chr17 21194771 . A T 120.27 PASS AF=0.283333;AO=16;DP=58;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0140949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3999;QD=8.01814;RBI=0.0172946;REFB=-0.0172404;REVB=-0.0100218;RO=42;SAF=6;SAR=10;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259095;STB=0.67672;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0390116;OID=.;OPOS=21194771;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:42:43:16:17:0.283333:10:6:25:17:11:6:26:17 chr17 21194785 . T C 112.32 PASS AF=0.275862;AO=16;DP=57;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00940075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.835;QD=7.74619;RBI=0.0244022;REFB=-0.00434211;REVB=-0.0225188;RO=40;SAF=7;SAR=9;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219068;STB=0.645397;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0198841;OID=.;OPOS=21194785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:40:42:16:16:0.275862:9:7:25:15:9:7:27:15 chr17 21194820 . G A 133.66 PASS AF=0.283582;AO=19;DP=66;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0234784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.043;QD=7.97941;RBI=0.0272113;REFB=-0.0176784;REVB=-0.0137558;RO=46;SAF=11;SAR=8;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633226;STB=0.534167;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0304164;OID=.;OPOS=21194820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:46:48:19:19:0.283582:8:11:29:17:8:11:30:18 chr17 21194843 . T C 190.88 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0545982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.286;QD=11.5687;RBI=0.061475;REFB=-0.00403417;REVB=-0.0282527;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197135;STB=0.511412;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0161618;OID=.;OPOS=21194843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:11:13:22:20:11:13:22:20 chr17 21194852 . G A 193.14 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00345058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.919;QD=12.0714;RBI=0.0161162;REFB=-0.011352;REVB=0.0157425;RO=40;SAF=13;SAR=11;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181335;STB=0.510462;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00930453;OID=.;OPOS=21194852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:40:40:24:24:0.375:11:13:21:19:11:13:21:19 chr17 21194859 . G A 239.72 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.034187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7483;QD=14.3119;RBI=0.0358613;REFB=0.00118795;REVB=0.0108296;RO=38;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095687;STB=0.513359;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.00110561;OID=.;OPOS=21194859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:39:28:28:0.41791:15:13:18:20:15:13:19:20 chr17 21199022 . A T 83.47 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0374493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.344;QD=9.82036;RBI=0.0401703;REFB=-0.00724333;REVB=-0.0145328;RO=23;SAF=2;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340093;STB=0.710096;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0374818;OID=.;OPOS=21199022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:9:2:10:13:9:2:10:13 chr17 21199037 . G A 72.42 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0509577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8978;QD=8.51991;RBI=0.0561061;REFB=0.0193099;REVB=-0.0234778;RO=22;SAF=1;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544725;STB=0.847017;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0298158;OID=.;OPOS=21199037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:22:24:10:10:0.294118:9:1:11:11:9:1:12:12 chr17 21199390 . C T 286.68 PASS AF=0.383721;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.022787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.307;QD=13.3339;RBI=0.0230501;REFB=-0.000285392;REVB=0.00347235;RO=53;SAF=13;SAR=20;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858505;STB=0.549103;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=6.37528e-05;OID=.;OPOS=21199390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:53:33:33:0.383721:20:13:25:28:20:13:25:28 chr17 21199403 . C T 340.76 PASS AF=0.425287;AO=36;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00317058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.525;QD=15.6673;RBI=0.0463978;REFB=-0.00934583;REVB=-0.0462893;RO=50;SAF=14;SAR=22;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960103;STB=0.560223;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0158179;OID=.;OPOS=21199403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:50:36:37:0.425287:22:14:24:26:23:14:24:26 chr17 21201719 . T C 717.93 PASS AF=0.547619;AO=69;DP=127;FAO=69;FDP=126;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0519286;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8965;QD=22.7914;RBI=0.0575652;REFB=-0.0412796;REVB=-0.0248431;RO=57;SAF=33;SAR=36;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329007;STB=0.518;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0400169;OID=.;OPOS=21201719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:57:57:69:69:0.547619:36:33:25:32:36:33:25:32 chr17 21202191 . C A 505.38 PASS AF=0.519231;AO=49;DP=104;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.0345254;FXX=0.0188661;HRUN=7;LEN=1;MLLD=45.507;QD=19.4376;RBI=0.0472042;REFB=-0.0622047;REVB=0.0321906;RO=37;SAF=15;SAR=34;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033638;STB=0.526306;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0458355;OID=.;OPOS=21202191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:37:50:49:54:0.519231:34:15:10:27:34:20:16:34 chr17 21202237 . G C 533.11 PASS AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.0272894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.646;QD=23.1788;RBI=0.0278917;REFB=-0.018019;REVB=-0.00576535;RO=42;SAF=17;SAR=33;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743265;STB=0.54074;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00623412;OID=.;OPOS=21202237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:42:42:50:50:0.543478:33:17:11:31:33:17:11:31 chr17 21203893 . T C 553.78 PASS AF=0.579545;AO=46;DP=83;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00509218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.211;QD=25.1717;RBI=0.0177715;REFB=-0.0185309;REVB=0.0170263;RO=37;SAF=17;SAR=29;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142445;STB=0.54617;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0138697;OID=.;OPOS=21203893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:88:37:37:46:51:0.579545:29:17:20:17:29:22:20:17 chr17 21203934 . G A 295.68 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0117308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.605;QD=17.9199;RBI=0.0118683;REFB=-0.0139798;REVB=-0.00180117;RO=33;SAF=10;SAR=22;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168633;STB=0.58842;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.012212;OID=.;OPOS=21203934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:34:32:32:0.484848:22:10:16:17:22:10:16:18 chr17 21203949 . C T 276.54 PASS AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00602944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.016;QD=18.7485;RBI=0.0635825;REFB=-0.0568138;REVB=0.063296;RO=28;SAF=9;SAR=21;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124696;STB=0.563175;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.057104;OID=.;OPOS=21203949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:29:30:30:0.508475:21:9:12:16:21:9:12:17 chr17 21204187 . G T 188.89 PASS AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00906374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.501;QD=11.1109;RBI=0.0125844;REFB=-0.0146444;REVB=-0.00873017;RO=44;SAF=13;SAR=11;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00424879;STB=0.502467;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0208376;OID=.;OPOS=21204187;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:11:13:24:20:11:13:24:20 chr17 21204192 . C T 199.94 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0117405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.111;QD=11.5909;RBI=0.0150238;REFB=-0.00260384;REVB=-0.00937428;RO=43;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00206474;STB=0.509382;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00460006;OID=.;OPOS=21204192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:43:44:25:25:0.362319:11:14:24:19:11:14:24:20 chr17 21204210 . C T 231.49 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0137485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1374;QD=12.3459;RBI=0.0525557;REFB=0.0139963;REVB=0.0507255;RO=47;SAF=15;SAR=13;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191711;STB=0.511018;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0238757;OID=.;OPOS=21204210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:13:15:26:21:13:15:26:21 chr17 21204257 . G A 228.34 PASS AF=0.298077;AO=31;DP=104;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0158655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.252;QD=8.78224;RBI=0.0252615;REFB=-0.014073;REVB=0.0196579;RO=73;SAF=15;SAR=16;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110588;STB=0.506513;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0267368;OID=.;OPOS=21204257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:73:73:31:31:0.298077:16:15:36:37:16:15:36:37 chr17 21204266 . T C 226.06 PASS AF=0.295238;AO=31;DP=105;FAO=31;FDP=105;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.00168883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.085;QD=8.61164;RBI=0.0339609;REFB=-0.00854153;REVB=-0.0339189;RO=74;SAF=14;SAR=17;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579338;STB=0.534174;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.022267;OID=.;OPOS=21204266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:74:74:31:31:0.295238:17:14:37:37:17:14:37:37 chr17 21204308 . G T 135.2 PASS AF=0.246914;AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=81;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.0468498;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.468;QD=6.67639;RBI=0.0474869;REFB=-0.000911191;REVB=0.00775273;RO=60;SAF=11;SAR=9;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818181;STB=0.543837;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0026812;OID=.;OPOS=21204308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:60:61:20:20:0.246914:9:11:29:31:9:11:30:31 chr17 21205460 . C T 253.9 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0153966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.73;QD=21.6081;RBI=0.0159462;REFB=-0.0342591;REVB=0.00415067;RO=22;SAF=18;SAR=6;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119949;STB=0.559948;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0277755;OID=.;OPOS=21205460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:23:24:24:0.510638:6:18:14:8:6:18:15:8 chr17 21206556 . C T 407.46 PASS AF=0.525641;AO=40;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0135021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.216;QD=20.8954;RBI=0.0142311;REFB=-0.0134555;REVB=0.00449639;RO=37;SAF=14;SAR=26;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076453;STB=0.51999;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0133819;OID=.;OPOS=21206556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:37:37:40:41:0.525641:26:14:16:21:26:15:15:22 chr17 21207813 . T G 113.97 PASS AF=0.146341;AO=24;DP=164;FAO=24;FDP=164;FR=.;FRO=140;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=83;FWDB=-0.0204062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4911;QD=2.77983;RBI=0.0312388;REFB=0.00481066;REVB=-0.0236526;RO=139;SAF=8;SAR=16;SRF=56;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944802;STB=0.567628;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.0314594;OID=.;OPOS=21207813;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:139:140:24:24:0.146341:16:8:56:83:16:8:57:83 chr17 21207835 . G A 128.7 PASS AF=0.160256;AO=25;DP=156;FAO=25;FDP=156;FR=.;FRO=131;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=52;FSRR=79;FWDB=0.0600749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1761;QD=3.2999;RBI=0.0629682;REFB=0.000758084;REVB=-0.0188678;RO=131;SAF=8;SAR=17;SRF=52;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106241;STB=0.570412;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-0.00260837;OID=.;OPOS=21207835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:131:131:25:25:0.160256:17:8:52:79:17:8:52:79 chr17 21207844 . C T 824.36 PASS AF=0.52;AO=78;DP=150;FAO=78;FDP=150;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.00142124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.64;QD=21.983;RBI=0.0082584;REFB=-0.0187306;REVB=-0.00813518;RO=72;SAF=28;SAR=50;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538279;STB=0.529576;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0181322;OID=.;OPOS=21207844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:72:72:78:78:0.52:50:28:30:42:50:28:30:42 chr17 21208413 . C T 132.0 PASS AF=0.275362;AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00222104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.446;QD=7.65203;RBI=0.0154999;REFB=-0.00874366;REVB=-0.0153399;RO=50;SAF=12;SAR=7;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25165;STB=0.651426;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0227969;OID=.;OPOS=21208413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:50:50:19:19:0.275362:7:12:21:29:7:12:21:29 chr17 21208449 . G T 70.52 PASS AF=0.232558;AO=11;DP=44;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00374037;FXX=0.0227221;HRUN=6;LEN=1;MLLD=209.487;QD=6.56001;RBI=0.0213915;REFB=2.59486e-05;REVB=-0.0210619;RO=33;SAF=8;SAR=3;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331843;STB=0.689757;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.000133264;OID=.;OPOS=21208449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:44:43:33:33:11:10:0.232558:3:8:15:18:3:7:15:18 chr17 21215483 . C T 1105.64 PASS AF=0.582857;AO=102;DP=176;FAO=102;FDP=175;FR=.;FRO=73;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.00224687;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.028;QD=25.2718;RBI=0.00477757;REFB=-0.013417;REVB=0.00421625;RO=72;SAF=60;SAR=42;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385413;STB=0.505539;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00987058;OID=.;OPOS=21215483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:72:73:102:102:0.582857:42:60:42:30:42:60:42:31 chr17 21215537 . C A 664.2 PASS AF=0.464052;AO=71;DP=153;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.00215497;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=256.148;QD=17.3647;RBI=0.00337817;REFB=-0.0167056;REVB=0.00260156;RO=81;SAF=40;SAR=31;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00763498;STB=0.507934;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0178087;OID=.;OPOS=21215537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:81:82:71:71:0.464052:31:40:45:36:31:40:45:37 chr17 21215552 . C T 607.3 PASS AF=0.440789;AO=67;DP=152;FAO=67;FDP=152;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.00431527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.451;QD=15.9816;RBI=0.010764;REFB=-0.00576646;REVB=0.00986113;RO=83;SAF=37;SAR=30;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198734;STB=0.507057;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0102126;OID=.;OPOS=21215552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:83:85:67:67:0.440789:30:37:46:37:30:37:48:37 chr17 21215557 . G A 653.46 PASS AF=0.458904;AO=65;DP=148;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=0.00560469;FXX=0.0266649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.829;QD=17.9029;RBI=0.0160831;REFB=-0.00418826;REVB=-0.0150749;RO=75;SAF=38;SAR=27;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111808;STB=0.529292;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00483593;OID=.;OPOS=21215557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:146:75:79:65:67:0.458904:27:38:43:32:27:40:43:36 chr17 21216788 . C T 206.1 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00967836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.774;QD=16.8247;RBI=0.0474334;REFB=-0.00728046;REVB=0.0464355;RO=28;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594165;STB=0.533948;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00857867;OID=.;OPOS=21216788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:11:10:15:13:11:10:15:13 chr17 21216846 . G C 224.88 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0593328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8165;QD=19.9897;RBI=0.0636612;REFB=0.00123595;REVB=0.0230733;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986588;STB=0.555506;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00096443;OID=.;OPOS=21216846;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:15:8:10:12:15:8 chr17 21217513 . G A 406.64 PASS AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=0.0209538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9648;QD=14.268;RBI=0.0211304;REFB=9.11111e-05;REVB=-0.00272561;RO=67;SAF=25;SAR=22;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164659;STB=0.592554;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.000202755;OID=.;OPOS=21217513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:67:67:47:47:0.412281:22:25:25:42:22:25:25:42 chr17 21217547 . T C 393.32 PASS AF=0.4;AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=-0.000289383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.506;QD=13.6808;RBI=0.010765;REFB=-0.00629421;REVB=-0.0107612;RO=68;SAF=24;SAR=22;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177586;STB=0.595001;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0102315;OID=.;OPOS=21217547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:68:69:46:46:0.4:22:24:24:44:22:24:25:44 chr17 21217586 . G T 564.71 PASS AF=0.487395;AO=56;DP=120;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0111854;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.647;QD=18.9817;RBI=0.0145704;REFB=-0.00760937;REVB=-0.00933727;RO=60;SAF=28;SAR=28;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466658;STB=0.52981;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00485882;OID=.;OPOS=21217586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:60:61:56:58:0.487395:28:28:27:33:28:30:28:33 chr17 21217596 . C G 551.57 PASS AF=0.409836;AO=41;DP=123;FAO=50;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00198351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.972;QD=18.0841;RBI=0.0245991;REFB=-0.0305766;REVB=-0.024519;RO=58;SAF=14;SAR=27;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135684;STB=0.533226;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0586539;OID=.;OPOS=21217596;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:58:63:41:50:0.409836:27:14:27:31:24:26:29:34 chr17 21217660 . C T 448.17 PASS AF=0.470588;AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0022132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.639;QD=17.5754;RBI=0.00453241;REFB=-0.00897721;REVB=0.00395532;RO=54;SAF=29;SAR=19;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153025;STB=0.58522;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0109113;OID=.;OPOS=21217660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:54:54:48:48:0.470588:19:29:24:30:19:29:24:30 chr17 21217690 . C T 292.45 PASS AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0448323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.697;QD=13.2932;RBI=0.0530401;REFB=-0.0350883;REVB=-0.0283428;RO=53;SAF=19;SAR=15;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732147;STB=0.547559;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0662839;OID=.;OPOS=21217690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:53:54:34:34:0.386364:15:19:26:27:15:19:26:28 chr17 21217727 . T C 89.82 PASS AF=0.232143;AO=13;DP=58;FAO=13;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.058827;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.721;QD=6.41567;RBI=0.0607553;REFB=-0.0188864;REVB=-0.0151851;RO=32;SAF=3;SAR=10;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273817;STB=0.768817;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0652433;OID=.;OPOS=21217727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:58:56:32:43:13:13:0.232143:10:3:14:18:10:3:25:18 chr17 21217748 . TG GC,TC 73.37 PASS AF=0,0.255814;AO=2,10;DP=43;FAO=0,11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=0,4;FSAR=0,7;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0817833,-0.0305915;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=190.071,72.3015;QD=6.82519;RBI=0.0853368,0.0456736;REFB=-0.000669235,-0.029241;REVB=-0.0243692,-0.0339152;RO=30;SAF=2,3;SAR=0,7;SRF=16;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.442851,-0.282208;STB=0.5,0.646793;STBP=1,0.268;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0769326;OID=.,.;OPOS=21217748,21217749;OREF=TG,G;OALT=GC,C;OMAPALT=GC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:73:43:43:30:32:2,10:0,11:0,0.255814:0,7:2,3:16:14:0,7:0,4:18:14 chr17 21318663 . G A 81.72 PASS AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0136547;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.833;QD=8.17152;RBI=0.0147824;REFB=-0.00876369;REVB=-0.00566304;RO=29;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734822;STB=0.545372;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0205712;OID=.;OPOS=21318663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:6:5:15:14:6:5:15:14 chr17 21318671 . G A 32.7 PASS AF=0.130435;AO=6;DP=46;FAO=6;FDP=46;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0136502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.7779;QD=2.84357;RBI=0.0215401;REFB=0.000573874;REVB=0.0166628;RO=40;SAF=3;SAR=3;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588595;STB=0.543335;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=-0.00489482;OID=.;OPOS=21318671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:46:46:40:40:6:6:0.130435:3:3:22:18:3:3:22:18 chr17 21318698 . C T 220.16 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0874083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4435;QD=16.0119;RBI=0.0930145;REFB=0.00124585;REVB=0.0318038;RO=27;SAF=13;SAR=12;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672963;STB=0.543825;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.000836113;OID=.;OPOS=21318698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:30:25:25:0.454545:12:13:16:11:12:13:18:12 chr17 21318770 . G A 221.69 PASS AF=0.375;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0043217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.131;QD=12.3159;RBI=0.00712534;REFB=-0.01469;REVB=0.0056651;RO=44;SAF=13;SAR=14;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199792;STB=0.504631;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0213181;OID=.;OPOS=21318770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:44:45:27:27:0.375:14:13:22:22:14:13:22:23 chr17 21318773 . G A 234.4 PASS AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0249329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.297;QD=13.022;RBI=0.0250528;REFB=-0.0363358;REVB=0.00244764;RO=44;SAF=13;SAR=15;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623464;STB=0.535689;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0459801;OID=.;OPOS=21318773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:15:13:23:21:15:13:23:21 chr17 21318782 . G A 160.21 PASS AF=0.247312;AO=23;DP=93;FAO=23;FDP=93;FR=.;FRO=70;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.00690161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.789;QD=6.89062;RBI=0.010604;REFB=-0.00505004;REVB=0.00805062;RO=70;SAF=9;SAR=14;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100855;STB=0.56155;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0123008;OID=.;OPOS=21318782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:70:70:23:23:0.247312:14:9:33:37:14:9:33:37 chr17 21318867 . G A 193.92 PASS AF=0.23622;AO=30;DP=127;FAO=30;FDP=127;FR=.;FRO=97;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.0274432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.052;QD=6.1078;RBI=0.0291517;REFB=0.00629772;REVB=0.00983305;RO=97;SAF=14;SAR=16;SRF=39;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820648;STB=0.549861;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.0254114;OID=.;OPOS=21318867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:97:97:30:30:0.23622:16:14:39:58:16:14:39:58 chr17 21318897 . G C 434.39 PASS AF=0.361702;AO=51;DP=142;FAO=51;FDP=141;FR=.;FRO=90;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=-0.0304616;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.533;QD=12.3231;RBI=0.0415809;REFB=-0.0170305;REVB=-0.0283031;RO=90;SAF=19;SAR=32;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962835;STB=0.555052;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0258128;OID=.;OPOS=21318897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:90:90:51:51:0.361702:32:19:41:49:32:19:41:49 chr17 21318912 . C A 272.32 PASS AF=0.267606;AO=38;DP=142;FAO=38;FDP=142;FR=.;FRO=104;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=63;FWDB=0.0408504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3327;QD=7.67108;RBI=0.0410488;REFB=-0.00337771;REVB=0.00403118;RO=103;SAF=19;SAR=19;SRF=40;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137646;STB=0.577425;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0129631;OID=.;OPOS=21318912;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:103:104:38:38:0.267606:19:19:40:63:19:19:41:63 chr17 21318918 . G A 274.86 PASS AF=0.281481;AO=38;DP=135;FAO=38;FDP=135;FR=.;FRO=97;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=60;FWDB=0.04821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3839;QD=8.14385;RBI=0.0487419;REFB=-0.010073;REVB=0.00718127;RO=97;SAF=19;SAR=19;SRF=37;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144672;STB=0.585142;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0286421;OID=.;OPOS=21318918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:97:97:38:38:0.281481:19:19:37:60:19:19:37:60 chr17 21318948 . C T 224.13 PASS AF=0.275862;AO=32;DP=115;FAO=32;FDP=116;FR=.;FRO=84;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=0.0551667;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6538;QD=7.72849;RBI=0.0585582;REFB=-0.0101895;REVB=-0.0196392;RO=83;SAF=15;SAR=17;SRF=33;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875459;STB=0.555521;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0451714;OID=.;OPOS=21318948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:83:84:32:32:0.275862:17:15:33:50:17:15:33:51 chr17 21318951 . CA CG,TG 673.27 PASS AF=0.306306,0.297297;AO=34,33;DP=111;FAO=34,33;FDP=111;FR=.;FRO=44;FSAF=11,16;FSAR=23,17;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0745465,-0.0324801;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=88.1442,209.553;QD=24.2619;RBI=0.0754223,0.0343098;REFB=-0.0300995,-0.0183146;REVB=-0.0114603,-0.0110547;RO=43;SAF=11,16;SAR=23,17;SRF=19;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.126763,0.0432031;STB=0.566462,0.530368;STBP=0.349,0.625;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0208428,0.0156303;OID=.,.;OPOS=21318952,21318951;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:43:44:34,33:34,33:0.306306,0.297297:23,17:11,16:19:24:23,17:11,16:19:25 chr17 21318969 . C T 196.42 PASS AF=0.269231;AO=28;DP=104;FAO=28;FDP=104;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=0.00524824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6233;QD=7.55476;RBI=0.00689611;REFB=-0.00224529;REVB=-0.00447351;RO=75;SAF=14;SAR=14;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138595;STB=0.576869;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0114365;OID=.;OPOS=21318969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:75:76:28:28:0.269231:14:14:29:46:14:14:30:46 chr17 21318981 . C T 149.44 PASS AF=0.236559;AO=22;DP=93;FAO=22;FDP=93;FR=.;FRO=71;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.00333745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.868;QD=6.42736;RBI=0.042713;REFB=-0.0123029;REVB=-0.0425824;RO=70;SAF=12;SAR=10;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144241;STB=0.58245;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0356643;OID=.;OPOS=21318981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:70:71:22:22:0.236559:10:12:30:40:10:12:31:40 chr17 21319007 . GG AC,GC 454.64 PASS AF=0.268293,0.292683;AO=22,24;DP=82;FAO=22,24;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=9,12;FSAR=13,12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0231691,-0.0264478;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=225.501,218.706;QD=22.1773;RBI=0.0257185,0.0275636;REFB=-0.00287345,-0.00943802;REVB=0.0111641,0.00776313;RO=36;SAF=9,12;SAR=13,12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0388998,0.0581527;STB=0.522487,0.533306;STBP=0.812,0.698;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0215647,-0.0109569;OID=.,.;OPOS=21319007,21319008;OREF=GG,G;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:82:82:36:36:22,24:22,24:0.268293,0.292683:13,12:9,12:16:20:13,12:9,12:16:20 chr17 21319069 . G A 163.11 PASS AF=0.240385;AO=24;DP=104;FAO=25;FDP=104;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0211675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.509;QD=6.27359;RBI=0.0233019;REFB=-0.00758825;REVB=0.00974243;RO=79;SAF=11;SAR=13;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125775;STB=0.50886;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0263598;OID=.;OPOS=21319069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:79:79:24:25:0.240385:13:11:37:42:13:12:37:42 chr17 21319079 . C A 163.93 PASS AF=0.238095;AO=25;DP=105;FAO=25;FDP=105;FR=.;FRO=80;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.024589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5782;QD=6.24481;RBI=0.0247212;REFB=-0.00408033;REVB=0.00255281;RO=80;SAF=12;SAR=13;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624005;STB=0.503814;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0119532;OID=.;OPOS=21319079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:80:80:25:25:0.238095:13:12:38:42:13:12:38:42 chr17 21319087 . G A 146.98 PASS AF=0.221154;AO=23;DP=104;FAO=23;FDP=104;FR=.;FRO=81;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.0056485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.925;QD=5.65301;RBI=0.00749096;REFB=-0.00213138;REVB=-0.00492025;RO=81;SAF=11;SAR=12;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00404959;STB=0.50251;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.00751468;OID=.;OPOS=21319087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:81:81:23:23:0.221154:12:11:39:42:12:11:39:42 chr17 21319110 . G A 162.37 PASS AF=0.235849;AO=25;DP=106;FAO=25;FDP=106;FR=.;FRO=81;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.0194235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9398;QD=6.12719;RBI=0.0197969;REFB=-0.00824904;REVB=0.00382726;RO=81;SAF=12;SAR=13;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185074;STB=0.501133;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0194372;OID=.;OPOS=21319110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:81:81:25:25:0.235849:13:12:39:42:13:12:39:42 chr17 21319121 . C T 282.94 PASS AF=0.342857;AO=36;DP=105;FAO=36;FDP=105;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.00282974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.645;QD=10.7785;RBI=0.0499715;REFB=0.00111513;REVB=-0.0498913;RO=67;SAF=20;SAR=16;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121342;STB=0.578904;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00248133;OID=.;OPOS=21319121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:67:69:36:36:0.342857:16:20:30:37:16:20:30:39 chr17 21319171 . G A 152.78 PASS AF=0.226415;AO=24;DP=106;FAO=24;FDP=106;FR=.;FRO=82;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0262112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2647;QD=5.76528;RBI=0.0268571;REFB=-0.00638589;REVB=-0.00585482;RO=82;SAF=16;SAR=8;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256029;STB=0.658095;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0175128;OID=.;OPOS=21319171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:82:82:24:24:0.226415:8:16:38:44:8:16:38:44 chr17 21319208 . C T 145.91 PASS AF=0.259259;AO=21;DP=80;FAO=21;FDP=81;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.0256191;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.23;QD=7.20519;RBI=0.0265062;REFB=-0.0138317;REVB=0.00679986;RO=59;SAF=15;SAR=6;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318212;STB=0.698733;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0268227;OID=.;OPOS=21319208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:59:60:21:21:0.259259:6:15:27:32:6:15:27:33 chr17 21319230 . G C 193.0 PASS AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0132992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.694;QD=10.0257;RBI=0.026405;REFB=-0.0137846;REVB=-0.0228113;RO=52;SAF=11;SAR=14;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113294;STB=0.566337;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0363278;OID=.;OPOS=21319230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:52:52:25:25:0.324675:14:11:28:24:14:11:28:24 chr17 21319251 . C T 144.0 PASS AF=0.294118;AO=21;DP=69;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0218617;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.895;QD=8.47082;RBI=0.0231571;REFB=-0.0135993;REVB=-0.00763675;RO=47;SAF=14;SAR=7;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235577;STB=0.67452;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0207277;OID=.;OPOS=21319251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:47:48:21:20:0.294118:7:14:22:25:6:14:22:26 chr17 21319272 . C T 204.09 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0181709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.991;QD=10.4662;RBI=0.0244831;REFB=-0.00919352;REVB=-0.0164084;RO=51;SAF=15;SAR=11;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769806;STB=0.538892;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0401244;OID=.;OPOS=21319272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:51:52:26:26:0.333333:11:15:26:25:11:15:27:25 chr17 21319285 . C T 197.44 PASS AF=0.295455;AO=26;DP=90;FAO=26;FDP=88;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0580595;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0469;QD=8.97431;RBI=0.0589318;REFB=-0.0209508;REVB=0.0101025;RO=64;SAF=15;SAR=11;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092612;STB=0.543253;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0572977;OID=.;OPOS=21319285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:88:64:62:26:26:0.295455:11:15:32:32:11:15:32:30 chr17 21319302 . T C 722.77 PASS AF=0.640777;AO=66;DP=103;FAO=66;FDP=103;FR=.;FRO=37;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.000253031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7465;QD=28.0688;RBI=0.0190738;REFB=-0.0287948;REVB=0.0190721;RO=35;SAF=38;SAR=28;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214913;STB=0.512893;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0157319;OID=.;OPOS=21319302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:35:37:66:66:0.640777:28:38:19:16:28:38:20:17 chr17 21319311 . C T 232.81 PASS AF=0.279661;AO=33;DP=118;FAO=33;FDP=118;FR=.;FRO=85;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.0171049;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.827;QD=7.89177;RBI=0.0212486;REFB=-0.00714024;REVB=-0.0126066;RO=84;SAF=19;SAR=14;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200372;STB=0.508123;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0234586;OID=.;OPOS=21319311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:84:85:33:33:0.279661:14:19:47:37:14:19:48:37 chr17 21319369 . G A 236.93 PASS AF=0.238095;AO=35;DP=148;FAO=35;FDP=147;FR=.;FRO=112;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=68;FSRR=44;FWDB=-0.00339775;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.664;QD=6.44711;RBI=0.00587959;REFB=-0.0111821;REVB=-0.00479843;RO=113;SAF=17;SAR=18;SRF=68;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145858;STB=0.592054;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0399691;OID=.;OPOS=21319369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:113:112:35:35:0.238095:18:17:68:45:18:17:68:44 chr17 21319392 . G A 235.83 PASS AF=0.236486;AO=35;DP=147;FAO=35;FDP=148;FR=.;FRO=113;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=66;FSRR=47;FWDB=-0.0220428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.822;QD=6.37366;RBI=0.028783;REFB=-0.0103481;REVB=0.0185089;RO=112;SAF=17;SAR=18;SRF=65;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11873;STB=0.574795;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0557525;OID=.;OPOS=21319392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:112:113:35:35:0.236486:18:17:65:47:18:17:66:47 chr17 21319399 . A G 514.03 PASS AF=0.398601;AO=57;DP=143;FAO=57;FDP=143;FR=.;FRO=86;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.00939876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.619;QD=14.3784;RBI=0.0150577;REFB=-0.00799554;REVB=-0.0117643;RO=86;SAF=36;SAR=21;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143962;STB=0.581349;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00862439;OID=.;OPOS=21319399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:86:86:57:57:0.398601:21:36:43:43:21:36:43:43 chr17 21319407 . C T 216.31 PASS AF=0.229167;AO=33;DP=144;FAO=33;FDP=144;FR=.;FRO=111;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=64;FSRR=47;FWDB=0.0515903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8068;QD=6.00869;RBI=0.0604709;REFB=0.00676715;REVB=-0.0315464;RO=111;SAF=16;SAR=17;SRF=64;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115564;STB=0.570428;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=-0.00723844;OID=.;OPOS=21319407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:111:111:33:33:0.229167:17:16:64:47:17:16:64:47 chr17 21319436 . G A 111.88 PASS AF=0.172131;AO=21;DP=122;FAO=21;FDP=122;FR=.;FRO=101;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=-0.00105526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.665;QD=3.66814;RBI=0.0162242;REFB=-0.00483704;REVB=-0.0161899;RO=99;SAF=12;SAR=9;SRF=54;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334498;STB=0.522544;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0163699;OID=.;OPOS=21319436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:99:101:21:21:0.172131:9:12:54:45:9:12:55:46 chr17 21319439 . T G 97.26 PASS AF=0.159664;AO=19;DP=121;FAO=19;FDP=119;FR=.;FRO=100;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0118066;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.529;QD=3.26921;RBI=0.0120662;REFB=-0.00424162;REVB=0.00248962;RO=100;SAF=10;SAR=9;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301586;STB=0.519979;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.012055;OID=.;OPOS=21319439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:121:119:100:100:19:19:0.159664:9:10:55:45:9:10:55:45 chr17 21319452 . G A 109.21 PASS AF=0.176991;AO=20;DP=113;FAO=20;FDP=113;FR=.;FRO=93;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=53;FSRR=40;FWDB=-0.0260589;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.832;QD=3.86566;RBI=0.0412486;REFB=-0.0023739;REVB=-0.0319746;RO=91;SAF=11;SAR=9;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134021;STB=0.516575;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00929164;OID=.;OPOS=21319452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:91:93:20:20:0.176991:9:11:51:40:9:11:53:40 chr17 21319465 . T C 103.29 PASS AF=0.176471;AO=18;DP=102;FAO=18;FDP=102;FR=.;FRO=84;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.0455896;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2031;QD=4.05079;RBI=0.0801591;REFB=-0.00331521;REVB=-0.0659323;RO=84;SAF=9;SAR=9;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0114887;OID=.;OPOS=21319465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:84:84:18:18:0.176471:9:9:42:42:9:9:42:42 chr17 21319470 . T C 96.83 PASS AF=0.17;AO=17;DP=100;FAO=17;FDP=100;FR=.;FRO=83;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.014345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1409;QD=3.87322;RBI=0.015368;REFB=-0.0124815;REVB=0.00551339;RO=82;SAF=9;SAR=8;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371412;STB=0.529377;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0288021;OID=.;OPOS=21319470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:100:100:82:83:17:17:0.17:8:9:41:41:8:9:41:42 chr17 21319473 . G A 385.08 PASS AF=0.427083;AO=39;DP=95;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0170503;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.11;QD=16.0451;RBI=0.0185021;REFB=-0.00886897;REVB=-0.00718428;RO=55;SAF=20;SAR=19;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414895;STB=0.546908;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0116455;OID=.;OPOS=21319473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:55:55:39:41:0.427083:19:20:26:29:19:22:25:30 chr17 21319488 . C T 77.17 PASS AF=0.170732;AO=14;DP=82;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.00924836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.774;QD=3.76418;RBI=0.00927498;REFB=-0.00091493;REVB=-0.000702275;RO=68;SAF=7;SAR=7;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00590506;OID=.;OPOS=21319488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:82:82:68:68:14:14:0.170732:7:7:34:34:7:7:34:34 chr17 21319519 . G C 76.33 PASS AF=0.166667;AO=14;DP=84;FAO=14;FDP=84;FR=.;FRO=70;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.00734878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.85;QD=3.63477;RBI=0.0201228;REFB=-0.0078348;REVB=0.018733;RO=70;SAF=6;SAR=8;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541692;STB=0.536031;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.047246;OID=.;OPOS=21319519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:84:84:70:70:14:14:0.166667:8:6:33:37:8:6:33:37 chr17 21319523 . C T 86.72 PASS AF=0.1875;AO=15;DP=80;FAO=15;FDP=80;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0155277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.078;QD=4.33601;RBI=0.0164006;REFB=-0.00317637;REVB=-0.00527917;RO=64;SAF=8;SAR=7;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807816;STB=0.558062;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0311725;OID=.;OPOS=21319523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:80:80:64:65:15:15:0.1875:7:8:30:34:7:8:30:35 chr17 21319527 . C T 86.75 PASS AF=0.1875;AO=15;DP=80;FAO=15;FDP=80;FR=.;FRO=65;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.00270679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.757;QD=4.33731;RBI=0.0144323;REFB=-0.00362122;REVB=-0.0141762;RO=65;SAF=7;SAR=8;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128976;STB=0.50835;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0211584;OID=.;OPOS=21319527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:80:80:65:65:15:15:0.1875:8:7:31:34:8:7:31:34 chr17 21319543 . G A 109.28 PASS AF=0.195652;AO=18;DP=92;FAO=18;FDP=92;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.00415583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.081;QD=4.75136;RBI=0.0190503;REFB=-0.0103338;REVB=-0.0185914;RO=73;SAF=8;SAR=10;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270338;STB=0.523089;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0531996;OID=.;OPOS=21319543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:73:74:18:18:0.195652:10:8:34:39:10:8:35:39 chr17 21319560 . G T 147.04 PASS AF=0.22449;AO=22;DP=98;FAO=22;FDP=98;FR=.;FRO=76;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-0.0147207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4688;QD=6.00149;RBI=0.060866;REFB=0.00827431;REVB=0.059059;RO=76;SAF=10;SAR=12;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00906788;STB=0.505613;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=-0.03041;OID=.;OPOS=21319560;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:76:76:22:22:0.22449:12:10:34:42:12:10:34:42 chr17 21319650 . CGAG C 290.84 PASS AF=0.27451;AO=40;DP=153;FAO=42;FDP=153;FR=.;FRO=111;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=56;FSRR=55;FWDB=-0.00375292;FXX=0.0254761;HRUN=1;LEN=3;MLLD=215.257;QD=7.60363;RBI=0.00967707;REFB=-0.00953414;REVB=0.00891971;RO=110;SAF=20;SAR=20;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111966;STB=0.514012;STBP=0.825;TYPE=del;VARB=0.0233639;OID=.;OPOS=21319651;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.27451:40:153:42:153:111:22:20:56:55:99:110:20:20:56:54 chr17 21319682 . C T 309.95 PASS AF=0.267857;AO=45;DP=168;FAO=45;FDP=168;FR=.;FRO=123;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=65;FSRR=58;FWDB=0.0263228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1141;QD=7.3797;RBI=0.0378664;REFB=-0.0115715;REVB=-0.0272208;RO=123;SAF=24;SAR=21;SRF=65;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603672;STB=0.503584;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0146298;OID=.;OPOS=21319682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:123:123:45:45:0.267857:21:24:65:58:21:24:65:58 chr17 21319716 . G A 173.6 PASS AF=0.21875;AO=28;DP=129;FAO=28;FDP=128;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.00338832;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.286;QD=5.42509;RBI=0.0098633;REFB=-0.0041932;REVB=0.00926304;RO=98;SAF=16;SAR=12;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130994;STB=0.516995;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00508271;OID=.;OPOS=21319716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:98:100:28:28:0.21875:12:16:55:43:12:16:55:45 chr17 21319728 . T C 147.07 PASS AF=0.211864;AO=25;DP=118;FAO=25;FDP=118;FR=.;FRO=93;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=38;FWDB=-0.0621575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.44;QD=4.98537;RBI=0.0627031;REFB=-0.0208922;REVB=-0.00825374;RO=93;SAF=16;SAR=9;SRF=55;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649277;STB=0.540585;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.066063;OID=.;OPOS=21319728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:93:93:25:25:0.211864:9:16:55:38:9:16:55:38 chr17 21319743 . A G 159.7 PASS AF=0.218487;AO=26;DP=120;FAO=26;FDP=119;FR=.;FRO=93;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=57;FSRR=36;FWDB=-0.0264237;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.033;QD=5.36797;RBI=0.0497987;REFB=-0.00813247;REVB=-0.0422102;RO=94;SAF=17;SAR=9;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643143;STB=0.534564;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0180174;OID=.;OPOS=21319743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:94:93:26:26:0.218487:9:17:57:37:9:17:57:36 chr17 21319767 . C T 458.53 PASS AF=0.505376;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0269738;FXX=0.162148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.984;QD=19.7215;RBI=0.0285113;REFB=-0.0107546;REVB=0.00923607;RO=46;SAF=30;SAR=17;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488703;STB=0.527075;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0124049;OID=.;OPOS=21319767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:93:46:46:47:47:0.505376:17:30:27:19:17:30:27:19 chr17 21319785 . C T 379.29 PASS AF=0.411215;AO=45;DP=108;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.0147089;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.739;QD=14.1792;RBI=0.0201391;REFB=-0.0146755;REVB=-0.0137562;RO=63;SAF=28;SAR=17;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380015;STB=0.530672;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0184673;OID=.;OPOS=21319785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:63:63:45:44:0.411215:17:28:37:26:16:28:37:26 chr17 21319786 . G A 105.21 PASS AF=0.175926;AO=19;DP=108;FAO=19;FDP=108;FR=.;FRO=89;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=0.0186627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8591;QD=3.89683;RBI=0.019103;REFB=0.00424528;REVB=-0.0040777;RO=89;SAF=14;SAR=5;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226463;STB=0.64924;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.0227969;OID=.;OPOS=21319786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:89:89:19:19:0.175926:5:14:51:38:5:14:51:38 chr17 21319845 . C T 132.13 PASS AF=0.238095;AO=19;DP=83;FAO=20;FDP=84;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=0.00898351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.48;QD=6.29189;RBI=0.0178652;REFB=-0.0186093;REVB=0.0154422;RO=64;SAF=10;SAR=9;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104672;STB=0.546071;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0455951;OID=.;OPOS=21319845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:64:64:19:20:0.238095:9:10:39:25:9:11:39:25 chr17 21319860 . C T 276.18 PASS AF=0.5625;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0511218;FXX=0.261498;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1883;QD=23.0152;RBI=0.0722769;REFB=-0.00840152;REVB=0.0510932;RO=21;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108186;STB=0.559956;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0130696;OID=.;OPOS=21319860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:48:21:21:27:27:0.5625:14:13:13:8:14:13:13:8 chr17 21319868 . G T 98.14 PASS AF=0.238806;AO=15;DP=66;FAO=16;FDP=67;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00701268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.057;QD=5.85885;RBI=0.00715334;REFB=-0.00853323;REVB=-0.00141158;RO=45;SAF=7;SAR=8;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134451;STB=0.552174;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0308125;OID=.;OPOS=21319868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:66:67:45:51:15:16:0.238806:8:7:26:19:8:8:29:22 chr17 21319908 . C T 151.48 PASS AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0411226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.2;QD=10.0983;RBI=0.0411308;REFB=-0.00186087;REVB=-0.000821197;RO=39;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130999;STB=0.516762;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00929201;OID=.;OPOS=21319908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:39:40:20:20:0.333333:11:9:18:21:11:9:19:21 chr17 21319943 . A G 58.95 PASS AF=0.195652;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0238738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.847;QD=5.12633;RBI=0.0306014;REFB=-0.00217912;REVB=-0.0191438;RO=36;SAF=5;SAR=4;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101175;STB=0.555432;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00940053;OID=.;OPOS=21319943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:46:46:36:37:9:9:0.195652:4:5:17:19:4:5:18:19 chr17 21319955 . G A 103.23 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0401962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2136;QD=10.0707;RBI=0.0401963;REFB=-0.0217598;REVB=3.14709e-05;RO=28;SAF=4;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26506;STB=0.659979;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0708762;OID=.;OPOS=21319955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:9:4:15:13:9:4:15:13 chr17 21319989 . C A 99.64 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00263284;FXX=0.0605877;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.619;QD=12.8562;RBI=0.0245704;REFB=-0.00941758;REVB=0.024429;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153067;STB=0.590753;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00793649;OID=.;OPOS=21319989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:9:10:8:4:9:10 chr17 21319993 . T C 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0131293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.584;QD=15.1969;RBI=0.0161917;REFB=-0.00959845;REVB=0.00947593;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698633;STB=0.540482;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0149288;OID=.;OPOS=21319993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:9:9:8:6:9:9 chr17 21320008 . C T 93.99 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0129425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.578;QD=10.4434;RBI=0.019351;REFB=-0.00544247;REVB=-0.0143859;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139316;STB=0.583198;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0597209;OID=.;OPOS=21320008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:36:36:24:24:12:12:0.333333:6:6:15:9:6:6:15:9 chr17 21320012 . C T 95.06 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0129612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.461;QD=11.184;RBI=0.0143238;REFB=-0.00984359;REVB=0.00609758;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492868;STB=0.529363;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0088932;OID=.;OPOS=21320012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:12:10:6:6:12:10 chr17 21320041 . G A 164.21 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00133653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.069;QD=12.8795;RBI=0.00925346;REFB=-0.00561579;REVB=-0.00915643;RO=32;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733497;STB=0.542575;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00809116;OID=.;OPOS=21320041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:10:9:13:19:10:9:13:19 chr17 21320102 . C A 43.15 PASS AF=0.135593;AO=9;DP=60;FAO=8;FDP=59;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.00576741;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.485;QD=2.92528;RBI=0.00577933;REFB=-0.00472502;REVB=-0.000370982;RO=49;SAF=4;SAR=5;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804006;STB=0.508453;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0323711;OID=.;OPOS=21320102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:60:59:49:51:9:8:0.135593:5:4:25:24:4:4:26:25 chr17 21320114 . T G 43.84 PASS AF=0.137931;AO=8;DP=58;FAO=8;FDP=58;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0067434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7351;QD=3.02315;RBI=0.0384249;REFB=0.00764543;REVB=-0.0378285;RO=50;SAF=3;SAR=5;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17486;STB=0.624688;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.0519052;OID=.;OPOS=21320114;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:58:58:50:50:8:8:0.137931:5:3:26:24:5:3:26:24 chr17 21320197 . G C 173.74 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.00122399;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=260.148;QD=12.8697;RBI=0.0234035;REFB=-0.00667703;REVB=0.0233715;RO=33;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317345;STB=0.682755;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00631787;OID=.;OPOS=21320197;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:7:14:12:21:7:14:12:21 chr17 21320210 . C T 209.34 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0151597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.708;QD=13.7269;RBI=0.0264532;REFB=-0.0086419;REVB=-0.0216784;RO=35;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161905;STB=0.585296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00443212;OID=.;OPOS=21320210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:9:16:17:18:9:16:18:18 chr17 21320212 . A G 453.63 PASS AF=0.666667;AO=39;DP=61;FAO=42;FDP=63;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00383822;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.865;QD=28.8018;RBI=0.0100883;REFB=-0.0199817;REVB=-0.0093296;RO=22;SAF=23;SAR=16;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605056;STB=0.524464;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0104568;OID=.;OPOS=21320212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:22:21:39:42:0.666667:16:23:11:11:17:25:11:10 chr17 21320252 . G T 298.69 PASS AF=0.386364;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00612641;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.576;QD=13.5766;RBI=0.0062343;REFB=-0.0129037;REVB=-0.00115481;RO=53;SAF=21;SAR=13;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13821;STB=0.584868;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0181475;OID=.;OPOS=21320252;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:53:54:34:34:0.386364:13:21:26:27:13:21:26:28 chr17 21320263 . T C 237.75 PASS AF=0.3;AO=30;DP=100;FAO=30;FDP=100;FR=.;FRO=70;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.00192491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.347;QD=9.50991;RBI=0.0357732;REFB=-0.0185875;REVB=-0.0357213;RO=70;SAF=13;SAR=17;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212528;STB=0.624591;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0403012;OID=.;OPOS=21320263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:70:70:30:30:0.3:17:13:43:27:17:13:43:27 chr17 21320279 . C T 272.03 PASS AF=0.321429;AO=36;DP=110;FAO=36;FDP=112;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.0289522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.623;QD=9.71546;RBI=0.0591632;REFB=-0.00471415;REVB=-0.0515951;RO=74;SAF=24;SAR=12;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199648;STB=0.625695;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0122282;OID=.;OPOS=21320279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:74:76:36:36:0.321429:12:24:37:37:12:24:37:39 chr17 21320350 . G A 245.48 PASS AF=0.293103;AO=34;DP=116;FAO=34;FDP=116;FR=.;FRO=82;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-2.18257e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.831;QD=8.46496;RBI=0.0071402;REFB=0.00365562;REVB=-0.00714017;RO=81;SAF=19;SAR=15;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10719;STB=0.558789;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.00917273;OID=.;OPOS=21320350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:81:82:34:34:0.293103:15:19:38:43:15:19:39:43 chr17 21320365 . T C 254.48 PASS AF=0.314815;AO=34;DP=109;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.000170488;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4434;QD=9.42524;RBI=0.00350254;REFB=-0.000183897;REVB=-0.00349839;RO=74;SAF=13;SAR=21;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155658;STB=0.591006;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.000828846;OID=.;OPOS=21320365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:74:74:34:34:0.314815:21:13:38:36:21:13:38:36 chr17 21320392 . CAAAAAAAAAAAAT CAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAT 225.18 PASS AF=0,0.368421,0.631579;AO=3,6,9;DP=56;FAO=0,21,36;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,13;FSAR=0,13,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.878814,-0.0261606,-1.03037;FXX=0;HRUN=2,2,12;LEN=1,1,1;MLLD=17.338,16.2837,2.25829;QD=15.8022;RBI=0.933272,0.0261621,1.17409;REFB=-0.393928,0.0148184,0.501225;REVB=-0.314138,0.000277132,0.562861;RO=4;SAF=0,0,1;SAR=3,6,8;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.642277,-0.742782,-0.158958;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,-0.00407989,0.315392;OID=.,.,.;OPOS=21320405,21320405,21320393;OREF=T,T,A;OALT=A,-,-;OMAPALT=CAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.368421,0.631579:3,6,9:56:0,21,36:57:0:0,8,13:0,13,23:0:0:99:4:0,0,1:3,6,8:1:3 chr17 21320787 . G A 376.12 PASS AF=0.264423;AO=55;DP=208;FAO=55;FDP=208;FR=.;FRO=153;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=123;FWDB=-0.0315901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.438;QD=7.23297;RBI=0.0368674;REFB=-0.0094871;REVB=-0.0190071;RO=152;SAF=18;SAR=37;SRF=29;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212787;STB=0.618519;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0259369;OID=.;OPOS=21320787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:152:153:55:55:0.264423:37:18:29:123:37:18:30:123 chr17 21320796 . C T 1114.21 PASS AF=0.530303;AO=105;DP=198;FAO=105;FDP=198;FR=.;FRO=93;FSAF=24;FSAR=81;FSRF=23;FSRR=70;FWDB=-0.0125076;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.39;QD=22.5092;RBI=0.0157578;REFB=-0.00529257;REVB=-0.00958483;RO=92;SAF=24;SAR=81;SRF=22;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126878;STB=0.512311;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00497388;OID=.;OPOS=21320796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:92:93:105:105:0.530303:81:24:22:70:81:24:23:70 chr17 21320798 . G C 758.94 PASS AF=0.548718;AO=107;DP=195;FAO=107;FDP=195;FR=.;FRO=88;FSAF=26;FSAR=81;FSRF=21;FSRR=67;FWDB=0.0368641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.184;QD=15.568;RBI=0.0464641;REFB=-0.0417353;REVB=0.0282835;RO=86;SAF=26;SAR=81;SRF=20;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116787;STB=0.502678;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.118386;OID=.;OPOS=21320798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:86:88:107:107:0.548718:81:26:20:66:81:26:21:67 chr17 21320980 . C G 701.77 PASS AF=0.511111;AO=69;DP=135;FAO=69;FDP=135;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=49;FWDB=0.00645588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.952;QD=20.7933;RBI=0.0230553;REFB=-0.0147843;REVB=-0.022133;RO=65;SAF=31;SAR=38;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171294;STB=0.596523;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0150393;OID=.;OPOS=21320980;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:65:66:69:69:0.511111:38:31:17:48:38:31:17:49 chr17 21320991 . C T 217.45 PASS AF=0.258065;AO=32;DP=124;FAO=32;FDP=124;FR=.;FRO=92;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=-0.000202989;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.642;QD=7.01462;RBI=0.00818332;REFB=-0.0082185;REVB=-0.0081808;RO=91;SAF=10;SAR=22;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693823;STB=0.5387;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0341018;OID=.;OPOS=21320991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:91:92:32:32:0.258065:22:10:33:58:22:10:33:59 chr17 21320993 . G T 641.84 PASS AF=0.520325;AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=44;FWDB=0.0356181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.715;QD=20.8728;RBI=0.0363828;REFB=-0.0124019;REVB=-0.00742023;RO=59;SAF=26;SAR=38;SRF=15;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142074;STB=0.577755;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0175997;OID=.;OPOS=21320993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:59:59:64:64:0.520325:38:26:15:44:38:26:15:44 chr17 21321005 . C A 173.9 PASS AF=0.247619;AO=26;DP=105;FAO=26;FDP=105;FR=.;FRO=79;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.0336181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8485;QD=6.6249;RBI=0.0467769;REFB=-0.0227163;REVB=0.0325255;RO=79;SAF=7;SAR=19;SRF=26;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888878;STB=0.554333;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0701749;OID=.;OPOS=21321005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:79:79:26:26:0.247619:19:7:26:53:19:7:26:53 chr17 21321016 . T C 453.74 PASS AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=32;FWDB=0.0512025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.309;QD=22.4071;RBI=0.0512026;REFB=-0.0140374;REVB=9.36029e-05;RO=37;SAF=14;SAR=30;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189978;STB=0.603574;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0175546;OID=.;OPOS=21321016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:44:44:0.54321:30:14:5:32:30:14:5:32 chr17 21321028 . CC TG 234.34 PASS AF=0.25;AO=14;DP=57;FAO=14;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=26;FWDB=0.0176554;FXX=0.0175408;HRUN=6;LEN=2;MLLD=209.536;QD=16.7385;RBI=0.0177595;REFB=-0.00750435;REVB=0.00191985;RO=29;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219117;STB=0.62697;STBP=0.441;TYPE=mnp;VARB=0.0122622;OID=.;OPOS=21321028;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:29:29:14:14:0.25:11:3:3:26:11:3:3:26 chr17 21322972 . GT CC 121.57 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00286336;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=221.739;QD=14.7354;RBI=0.00816927;REFB=0.00286134;REVB=-0.00765103;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143297;STB=0.599854;STBP=0.344;TYPE=mnp;VARB=-0.0055508;OID=.;OPOS=21322972;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:5:9:9:9:5:9:9:10 chr17 21322975 . G A 72.35 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00325131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.642;QD=8.5118;RBI=0.0321933;REFB=0.000227627;REVB=-0.0320287;RO=24;SAF=9;SAR=1;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.600844;STB=0.875804;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.000424744;OID=.;OPOS=21322975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:1:9:10:14:1:9:10:14 chr17 21323001 . C T 174.77 PASS AF=0.486486;AO=15;DP=38;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0100972;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.866;QD=18.8942;RBI=0.0165554;REFB=-0.00987113;REVB=-0.0131198;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512395;STB=0.515135;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0152166;OID=.;OPOS=21323001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:17:19:15:18:0.486486:7:8:10:7:8:10:10:9 chr17 21323049 . C T 227.1 PASS AF=0.35;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.017432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.412;QD=11.3552;RBI=0.0175684;REFB=-0.00853479;REVB=0.00218517;RO=52;SAF=17;SAR=11;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226069;STB=0.63065;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0279271;OID=.;OPOS=21323049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:52:28:28:0.35:11:17:21:31:11:17:21:31 chr17 21323056 . G T 43.9 PASS AF=0.11236;AO=10;DP=89;FAO=10;FDP=89;FR=.;FRO=79;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=-0.0107771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.258;QD=1.97303;RBI=0.0119929;REFB=-0.00343007;REVB=-0.0052615;RO=79;SAF=3;SAR=7;SRF=39;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235246;STB=0.675504;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0243491;OID=.;OPOS=21323056;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:89:89:79:79:10:10:0.11236:7:3:39:40:7:3:39:40 chr17 21323074 . T C 45.68 PASS AF=0.103774;AO=11;DP=105;FAO=11;FDP=106;FR=.;FRO=95;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=50;FSRR=45;FWDB=-0.0130601;FXX=0.00934492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.424;QD=1.72387;RBI=0.0131262;REFB=-0.00246068;REVB=-0.00131524;RO=94;SAF=5;SAR=6;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791304;STB=0.563987;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0168885;OID=.;OPOS=21323074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:105:106:94:95:11:11:0.103774:6:5:49:45:6:5:50:45 chr17 21323096 . G A 421.06 PASS AF=0.404959;AO=48;DP=120;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.011247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.206;QD=13.9193;RBI=0.0112471;REFB=-0.0126713;REVB=-4.15636e-05;RO=71;SAF=24;SAR=24;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520931;STB=0.539068;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0185504;OID=.;OPOS=21323096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:71:72:48:49:0.404959:24:24:39:32:25:24:40:32 chr17 21323107 . A G 276.15 PASS AF=0.305785;AO=37;DP=121;FAO=37;FDP=121;FR=.;FRO=84;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.00643841;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.405;QD=9.12905;RBI=0.015781;REFB=-0.0116321;REVB=0.0144079;RO=82;SAF=17;SAR=20;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133557;STB=0.569105;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0290862;OID=.;OPOS=21323107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:82:84:37:37:0.305785:20:17:47:35:20:17:47:37 chr17 21323119 . T C 44.18 PASS AF=0.0952381;AO=12;DP=126;FAO=12;FDP=126;FR=.;FRO=114;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=57;FSRR=57;FWDB=0.0126626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.788;QD=1.40257;RBI=0.0194611;REFB=-0.0062839;REVB=-0.0147781;RO=113;SAF=7;SAR=5;SRF=56;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10303;STB=0.575471;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.049539;OID=.;OPOS=21323119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:126:126:113:114:12:12:0.0952381:5:7:56:57:5:7:57:57 chr17 21323136 . G A 46.3 PASS AF=0.1;AO=12;DP=120;FAO=12;FDP=120;FR=.;FRO=108;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=52;FSRR=56;FWDB=-0.0138713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.796;QD=1.54333;RBI=0.0207271;REFB=-0.00423368;REVB=-0.0154013;RO=108;SAF=7;SAR=5;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120217;STB=0.591261;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.051594;OID=.;OPOS=21323136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:120:120:108:108:12:12:0.1:5:7:52:56:5:7:52:56 chr17 21825565 . G T 3091.76 PASS AF=0.98995;AO=196;DP=199;FAO=197;FDP=199;FR=.;FRO=2;FSAF=101;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0136772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.8;QD=62.1458;RBI=0.01591;REFB=-0.0988465;REVB=0.00812797;RO=1;SAF=101;SAR=95;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0049869;STB=0.505154;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.000132579;OID=.;OPOS=21825565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:199:199:1:2:196:197:0.98995:95:101:0:1:96:101:0:2 chr17 21826256 . A G 1272.93 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.611;QD=61.3459;RBI=0.024947;REFB=0;REVB=0.0232458;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8837e-05;OID=.;OPOS=21826256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:49:33:0:0:50:33:0:0 chr17 22023528 . G C 311.05 PASS AF=0.492537;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0190048;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.985;QD=18.57;RBI=0.0197125;REFB=0.00033611;REVB=0.00523457;RO=36;SAF=12;SAR=21;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157057;STB=0.601046;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000285866;OID=.;OPOS=22023528;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:36:34:33:33:0.492537:21:12:19:17:21:12:19:15 chr17 22023591 . T C 510.19 PASS AF=0.55814;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0100362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.459;QD=23.7299;RBI=0.0193416;REFB=-0.00616313;REVB=0.016534;RO=38;SAF=14;SAR=34;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246993;STB=0.636115;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00480184;OID=.;OPOS=22023591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:38:38:48:48:0.55814:34:14:22:16:34:14:22:16 chr17 22024047 . C T 37.15 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0949329;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=414.393;QD=8.25463;RBI=0.0949334;REFB=0.00420892;REVB=0.000291525;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480689;STB=0.772248;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00902071;OID=.;OPOS=22024047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:5:1:0:12:5:1:0:12 chr17 25932609 . C T 748.89 PASS AF=0.5;AO=72;DP=144;FAO=73;FDP=146;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.0962321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.052;QD=20.5174;RBI=0.0982203;REFB=-0.0125358;REVB=0.0196625;RO=72;SAF=34;SAR=38;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138051;STB=0.574984;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0105215;OID=.;OPOS=25932609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:72:73:72:73:0.5:38:34:45:27:38:35:46:27 chr17 25958304 . G A 451.49 PASS AF=0.466667;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0210219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.338;QD=17.1995;RBI=0.0221482;REFB=-0.021942;REVB=0.00697299;RO=56;SAF=19;SAR=30;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126863;STB=0.57072;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0203504;OID=.;OPOS=25958304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:56:56:49:49:0.466667:30:19:29:27:30:19:29:27 chr17 25970633 . G A 321.24 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.000235551;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=286.351;QD=16.2652;RBI=0.00681575;REFB=-0.01689;REVB=-0.00681168;RO=43;SAF=12;SAR=23;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079903;STB=0.553111;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0195895;OID=.;OPOS=25970633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:44:35:35:0.443038:23:12:18:25:23:12:19:25 chr17 26668350 . A G 40.1 PASS AF=0.1125;AO=9;DP=80;FAO=9;FDP=80;FR=.;FRO=71;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=50;FSRR=21;FWDB=-0.0322445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.312;QD=2.00501;RBI=0.0435969;REFB=-0.00625825;REVB=-0.0293425;RO=71;SAF=7;SAR=2;SRF=50;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111727;STB=0.585251;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.04363;OID=.;OPOS=26668350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:80:80:71:71:9:9:0.1125:2:7:50:21:2:7:50:21 chr17 26671945 . A AG 1261.3 PASS AF=1;AO=101;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.197785;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.4135;QD=45.4524;RBI=0.272195;REFB=0;REVB=0.187006;RO=12;SAF=57;SAR=44;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802063;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00472502;OID=.;OPOS=26671946;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:101:113:111:111:0:59:52:0:0:23:12:57:44:2:10 chr17 26672360 . G GC 187.81 PASS AF=1;AO=14;DP=19;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.5056;QD=46.9534;RBI=0.0643958;REFB=0;REVB=-0.0381096;RO=4;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298628;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00608885;OID=.;OPOS=26672361;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:14:19:16:16:0:10:6:0:0:4:4:10:4:0:4 chr17 26676135 . C T 972.86 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8293;QD=58.9611;RBI=0.0402821;REFB=0;REVB=-0.00406962;RO=0;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360593;OID=.;OPOS=26676135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:44:22:0:0:44:22:0:0 chr17 26694861 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0082571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.771;QD=56.9379;RBI=0.0449015;REFB=0;REVB=0.0441358;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273425;OID=.;OPOS=26694861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0 chr17 26708300 . T C 837.3 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00484325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.937;QD=55.8197;RBI=0.0190566;REFB=-0.124952;REVB=0.0184308;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145176;STB=0.50769;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=3.08022e-05;OID=.;OPOS=26708300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:0:1:32:27:0:1 chr17 26708302 . G T 837.18 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0322111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.681;QD=55.8117;RBI=0.0403441;REFB=0.00782665;REVB=0.0242918;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145176;STB=0.50769;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=2.41306e-05;OID=.;OPOS=26708302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:0:1:32:27:0:1 chr17 26708547 . CTTTC CTTCG 782.44 PASS AF=1;AO=36;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.254926;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=2;MLLD=46.6083;QD=56.9046;RBI=0.286757;REFB=0;REVB=-0.131311;RO=0;SAF=7;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00107968;OID=.;OPOS=26708550;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CTTCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:36:56:55:55:0:22:33:0:0:4:0:7:29:0:0 chr17 26727721 . GA G 1016.68 PASS AF=1;AO=81;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0767851;FXX=0.0232531;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.8258;QD=48.4133;RBI=0.105336;REFB=0;REVB=-0.0721097;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00219023;OID=.;OPOS=26727722;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:81:86:84:84:0:40:44:0:0:18:0:38:43:0:0 chr17 26851602 . C T 358.84 PASS AF=0.614035;AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0162839;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.493;QD=25.1817;RBI=0.0236617;REFB=-0.029158;REVB=-0.0171672;RO=22;SAF=26;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129633;STB=0.571386;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0224198;OID=.;OPOS=26851602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:22:22:35:35:0.614035:9:26:13:9:9:26:13:9 chr17 26857788 . T C 246.85 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0144878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.524;QD=17.9528;RBI=0.0148613;REFB=-0.0076608;REVB=-0.00331091;RO=28;SAF=13;SAR=14;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113757;STB=0.563639;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00802676;OID=.;OPOS=26857788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:14:13:10:18:14:13:10:18 chr17 26864302 . G C 85.24 PASS AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00695544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.971;QD=11.3653;RBI=0.0108004;REFB=-0.0245158;REVB=0.00826254;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813642;STB=0.512173;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0304964;OID=.;OPOS=26864302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:30:19:19:10:11:0.366667:6:4:9:10:6:5:9:10 chr17 27009749 . C T 204.15 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.00217329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.279;QD=10.4694;RBI=0.0102426;REFB=0.00212279;REVB=0.0100094;RO=52;SAF=9;SAR=17;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240237;STB=0.514028;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.0038653;OID=.;OPOS=27009749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:52:52:26:26:0.333333:17:9:19:33:17:9:19:33 chr17 27030690 . C T 507.31 PASS AF=0.647887;AO=46;DP=71;FAO=46;FDP=71;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.054064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9036;QD=28.5811;RBI=0.0552709;REFB=-0.0785629;REVB=-0.0114869;RO=24;SAF=18;SAR=28;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200051;STB=0.615335;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0407541;OID=.;OPOS=27030690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:24:25:46:46:0.647887:28:18:17:7:28:18:18:7 chr17 27068133 . C T 255.27 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00500815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.084;QD=22.1972;RBI=0.0132846;REFB=-0.00549237;REVB=-0.0123044;RO=21;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139454;STB=0.586886;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00623229;OID=.;OPOS=27068133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:21:22:24:24:0.521739:12:12:14:7:12:12:15:7 chr17 27185827 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.878;QD=61.684;RBI=0.0315554;REFB=0;REVB=-0.00968296;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137084;OID=.;OPOS=27185827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0 chr17 27207453 . G A 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.017584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.045;QD=19.9925;RBI=0.0335356;REFB=-0.00666216;REVB=0.0285559;RO=23;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108138;STB=0.561125;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00838509;OID=.;OPOS=27207453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:14:8:11:12:14:8:11:12 chr17 27207571 . C T 322.88 PASS AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00600476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.017;QD=19.2764;RBI=0.00927958;REFB=-0.0164268;REVB=0.00707485;RO=33;SAF=15;SAR=19;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183795;STB=0.601585;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0121423;OID=.;OPOS=27207571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:19:15:8:25:19:15:8:25 chr17 27284443 . A G 575.68 PASS AF=0.590909;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00702971;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.407;QD=26.1675;RBI=0.00992333;REFB=-0.026287;REVB=0.00700397;RO=36;SAF=20;SAR=32;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410276;STB=0.52238;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0143923;OID=.;OPOS=27284443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:36:36:52:52:0.590909:32:20:12:24:32:20:12:24 chr17 27286851 . T C 510.29 PASS AF=0.486486;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.00139154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2705;QD=18.3888;RBI=0.00201999;REFB=-0.0080229;REVB=0.00146423;RO=57;SAF=29;SAR=25;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997927;STB=0.505529;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00861752;OID=.;OPOS=27286851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:57:57:54:54:0.486486:25:29:30:27:25:29:30:27 chr17 27290969 . T TG 151.59 PASS AF=0.5;AO=29;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.128366;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9975;QD=9.47457;RBI=0.133366;REFB=0.0190462;REVB=0.0361754;RO=27;SAF=15;SAR=14;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190592;STB=0.546846;STBP=0.493;TYPE=ins;VARB=0.00113395;OID=.;OPOS=27290970;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:29:64:32:64:32:16:16:13:19:99:27:15:14:8:19 chr17 27422053 . C T 512.03 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.504;QD=58.5172;RBI=0.202367;REFB=0;REVB=-0.00929064;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107813;OID=.;OPOS=27422053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0 chr17 27424316 . G A 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00379934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.103;QD=17.3205;RBI=0.0114819;REFB=-0.011025;REVB=0.0108351;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109111;STB=0.562422;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0118689;OID=.;OPOS=27424316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:9:7:10:8:9:7:10:8 chr17 27425172 . G A 165.18 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0482846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.404;QD=12.4664;RBI=0.0482936;REFB=-0.0165416;REVB=0.00093052;RO=33;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946778;STB=0.554552;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0336146;OID=.;OPOS=27425172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:13:7:9:24:13:7:9:24 chr17 27438469 . G A,T 447.77 PASS AF=0.939394,0.030303;AO=30,2;DP=33;FAO=31,1;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16,0;FSAR=15,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147048,0.0056775;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=122.004,52.196;QD=54.2754;RBI=0.0347937,0.0117018;REFB=0.0388868,-0.0683408;REVB=0.0315337,0.0102323;RO=0;SAF=16,0;SAR=14,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.56309e-08,0;STB=0.516119,0.5;STBP=0.553,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000668342,0.0794767;OID=.,.;OPOS=27438469,27438469;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:33:33:0:1:30,2:31,1:0.939394,0.030303:14,2:16,0:0:0:15,1:16,0:0:1 chr17 27441077 . C G 611.11 PASS AF=1;AO=34;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.261;QD=61.1109;RBI=0.044571;REFB=0;REVB=0.0368359;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824945;OID=.;OPOS=27441077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:34:40:1:17:17:0:0:20:20:0:0 chr17 27580756 . C T 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00916726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.245;QD=17.6896;RBI=0.0113813;REFB=-0.0240486;REVB=0.00674503;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00545082;STB=0.503103;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0249046;OID=.;OPOS=27580756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:9:12:15:11:9:12:15:11 chr17 27588806 . C A 206.36 PASS AF=0.4375;AO=20;DP=44;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0715978;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.3865;QD=17.1969;RBI=0.0718581;REFB=-0.0399399;REVB=-0.00611079;RO=24;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573397;STB=0.512184;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0380803;OID=.;OPOS=27588806;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:48:24:27:20:21:0.4375:8:12:13:11:9:12:16:11 chr17 27835138 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.884;QD=47.8224;RBI=0.020409;REFB=0;REVB=0.0117441;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165219;OID=.;OPOS=27835138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr17 27889578 . T C 1641.95 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.732;QD=60.255;RBI=0.0363373;REFB=0;REVB=0.0340151;RO=0;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43649e-05;OID=.;OPOS=27889578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:56:53:0:0:56:53:0:0 chr17 27889986 . T C 937.22 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00509419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.796;QD=58.5763;RBI=0.0670404;REFB=0;REVB=0.0668466;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122969;OID=.;OPOS=27889986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0 chr17 27901975 . A G 712.12 PASS AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00800345;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.619;QD=63.2992;RBI=0.08205;REFB=0;REVB=-0.0816587;RO=0;SAF=37;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000361881;OID=.;OPOS=27901975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:8:37:0:0:8:37:0:0 chr17 27904711 . G A 342.77 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0165123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.177;QD=21.4228;RBI=0.0173643;REFB=-0.0335597;REVB=0.00537235;RO=29;SAF=20;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04498;STB=0.524873;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.033129;OID=.;OPOS=27904711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:15:20:15:14:15:20:15:14 chr17 28268800 . A C 316.82 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00628941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7048;QD=20.4397;RBI=0.0616189;REFB=0.0210046;REVB=0.0612971;RO=29;SAF=12;SAR=21;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752055;STB=0.54177;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.0181843;OID=.;OPOS=28268800;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:21:12:13:16:21:12:13:16 chr17 28296327 . T G 154.83 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0660431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9792;QD=22.9379;RBI=0.0835181;REFB=-0.0139351;REVB=-0.0511233;RO=11;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06032;STB=0.533938;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0118291;OID=.;OPOS=28296327;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:10:6:5:6:10:6:5:6 chr17 28320248 . T A 920.35 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.565;QD=58.435;RBI=0.0224088;REFB=0;REVB=0.00522144;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43698e-05;OID=.;OPOS=28320248;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:28:35:0:0 chr17 28381141 . C G 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0035243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.357;QD=19.6682;RBI=0.00471402;REFB=0.00528381;REVB=-0.0031307;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275581;STB=0.655576;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.00943066;OID=.;OPOS=28381141;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:12:7:13:6:12:7:13:6 chr17 28407876 . T G 776.23 PASS AF=0.63964;AO=68;DP=108;FAO=71;FDP=111;FR=.;FRO=40;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00564575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9152;QD=27.9724;RBI=0.0732958;REFB=-0.00607376;REVB=0.073078;RO=40;SAF=35;SAR=33;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241569;STB=0.520542;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00385352;OID=.;OPOS=28407876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:40:40:68:71:0.63964:33:35:22:18:36:35:22:18 chr17 28444183 . A C 747.04 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8125;QD=63.5782;RBI=0.046285;REFB=0;REVB=-0.0417769;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230717;OID=.;OPOS=28444183;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0 chr17 28511978 . G A 362.06 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000365996;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.896;QD=55.7009;RBI=0.0114869;REFB=0;REVB=0.011481;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.42703e-05;OID=.;OPOS=28511978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:7:19:0:0:7:19:0:0 chr17 28576076 . T C 403.68 PASS AF=0.518519;AO=39;DP=78;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0261053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2837;QD=19.9348;RBI=0.0278987;REFB=-0.0364949;REVB=-0.00984121;RO=38;SAF=14;SAR=25;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130344;STB=0.540521;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0512412;OID=.;OPOS=28576076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:38:39:39:42:0.518519:25:14:19:19:25:17:19:20 chr17 28612448 . G C 418.75 PASS AF=0.413793;AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=49;FSRR=19;FWDB=0.000155622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8953;QD=14.4397;RBI=0.00723091;REFB=0.00863095;REVB=-0.00722924;RO=67;SAF=30;SAR=18;SRF=48;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104359;STB=0.561587;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.00760775;OID=.;OPOS=28612448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:67:68:48:48:0.413793:18:30:48:19:18:30:49:19 chr17 28794020 . A G 1529.97 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00673477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3935;QD=63.7486;RBI=0.0167736;REFB=0;REVB=0.0153622;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131137;OID=.;OPOS=28794020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:51:45:0:0:51:45:0:0 chr17 28853530 . A C 497.28 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.066;QD=58.5034;RBI=0.0703782;REFB=0;REVB=0.0388197;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298519;OID=.;OPOS=28853530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:20:13:0:0:20:14:0:0 chr17 28900708 . G T 435.86 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0105757;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=259.616;QD=54.4819;RBI=0.0261229;REFB=-0.118057;REVB=0.0238864;RO=1;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321576;STB=0.51723;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00065734;OID=.;OPOS=28900708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:14:17:0:1:14:17:0:1 chr17 29029728 . A C 233.24 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0207289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.401;QD=15.0478;RBI=0.0260258;REFB=-0.0110945;REVB=-0.015737;RO=35;SAF=19;SAR=8;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116557;STB=0.566345;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0158265;OID=.;OPOS=29029728;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:8:19:21:14:8:19:21:14 chr17 29111368 . A G 152.15 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0275492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.086;QD=13.2301;RBI=0.0275522;REFB=-0.0154429;REVB=0.000402331;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872883;STB=0.550961;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0388309;OID=.;OPOS=29111368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:9:8:16:13:9:8:16:13 chr17 29486152 . G A 233.4 PASS AF=0.383562;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0135572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.52;QD=12.7889;RBI=0.0135589;REFB=-0.00923668;REVB=-0.000215996;RO=44;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170541;STB=0.602669;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0133261;OID=.;OPOS=29486152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:44:45:28:28:0.383562:14:14:15:29:14:14:15:30 chr17 29496819 . C T 112.22 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00172773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0264;QD=16.6247;RBI=0.0584962;REFB=-0.0240408;REVB=-0.0584707;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412168;STB=0.523773;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0130832;OID=.;OPOS=29496819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:6:8:8:5:6:8 chr17 29508775 . G A 303.32 PASS AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00838183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.885;QD=25.8143;RBI=0.00841091;REFB=-0.0103205;REVB=-0.000698857;RO=20;SAF=16;SAR=11;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258696;STB=0.642865;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0159912;OID=.;OPOS=29508775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:11:16:5:15:11:16:5:15 chr17 29553485 . G A 219.94 PASS AF=0.40625;AO=18;DP=65;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0259619;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4599;QD=13.7465;RBI=0.0335612;REFB=-0.0104309;REVB=-0.0212681;RO=27;SAF=4;SAR=14;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148963;STB=0.531226;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0316615;OID=.;OPOS=29553485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:27:38:18:26:0.40625:14:4:9:18:17:9:15:23 chr17 29646032 . G A 654.04 PASS AF=0.551724;AO=63;DP=116;FAO=64;FDP=116;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0202067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.059;QD=22.5531;RBI=0.0209336;REFB=-0.00184268;REVB=-0.00546847;RO=52;SAF=24;SAR=39;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691485;STB=0.540528;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00101563;OID=.;OPOS=29646032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:52:52:63:64:0.551724:39:24:24:28:40:24:24:28 chr17 29705947 . T C 231.05 PASS AF=0.464286;AO=27;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0133509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.528;QD=16.5036;RBI=0.0255641;REFB=-0.011899;REVB=-0.0218009;RO=29;SAF=10;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042321;STB=0.508664;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0118361;OID=.;OPOS=29705947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:30:27:26:0.464286:17:10:12:17:16:10:12:18 chr17 29857460 . G A 365.87 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0128557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.283;QD=18.7625;RBI=0.026009;REFB=-0.0213377;REVB=0.0226097;RO=40;SAF=18;SAR=20;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242474;STB=0.513506;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0212482;OID=.;OPOS=29857460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:20:18:20:20:20:18:20:20 chr17 29890808 . C T 238.31 PASS AF=0.457627;AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0361669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.591;QD=16.1566;RBI=0.0376079;REFB=-0.0141929;REVB=-0.0103107;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155198;STB=0.510043;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0177718;OID=.;OPOS=29890808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:32:26:27:0.457627:13:13:16:15:13:14:16:16 chr17 30183857 . T C 468.92 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352722;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.256;QD=58.6149;RBI=0.0353022;REFB=0;REVB=0.00145696;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171371;OID=.;OPOS=30183857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:22:10:0:0:22:10:0:0 chr17 30222002 . T C 435.85 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0244981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.241;QD=54.481;RBI=0.0264087;REFB=0.00444023;REVB=0.0098623;RO=1;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227606;STB=0.512187;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-3.65778e-06;OID=.;OPOS=30222002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:20:11:0:1:20:11:0:1 chr17 30348160 . T C 566.48 PASS AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0423223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.106;QD=20.0525;RBI=0.0435799;REFB=-0.0175468;REVB=-0.0103937;RO=54;SAF=19;SAR=39;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176396;STB=0.602474;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0169231;OID=.;OPOS=30348160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:54:55:58:58:0.513274:39:19:28:26:39:19:29:26 chr17 30470028 . G GC 92.82 PASS AF=0.472222;AO=14;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0396085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.8538;QD=10.3136;RBI=0.105508;REFB=-0.0375917;REVB=-0.0977907;RO=21;SAF=0;SAR=14;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.768804;STB=0.666419;STBP=0.267;TYPE=ins;VARB=0.0311443;OID=.;OPOS=30470029;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.472222:14:36:17:36:19:1:16:3:16:92:21:0:14:4:17 chr17 30533970 . A G 338.07 PASS AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0356154;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.241;QD=28.7723;RBI=0.0357195;REFB=-0.0191109;REVB=0.00272513;RO=18;SAF=13;SAR=16;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419841;STB=0.523084;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0116992;OID=.;OPOS=30533970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:16:13:7:11:16:13:7:11 chr17 31320023 . G A 391.94 PASS AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0326639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6284;QD=16.8578;RBI=0.0704462;REFB=-0.0112767;REVB=0.0624158;RO=52;SAF=13;SAR=28;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075058;STB=0.542232;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0165476;OID=.;OPOS=31320023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:28:13:20:32:28:13:20:32 chr17 31340682 . C T 447.68 PASS AF=0.454545;AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.01835;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3557;QD=18.088;RBI=0.0183678;REFB=-0.016709;REVB=-0.0008093;RO=54;SAF=25;SAR=20;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231969;STB=0.629084;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0129761;OID=.;OPOS=31340682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:54:54:45:45:0.454545:20:25:17:37:20:25:17:37 chr17 32483237 . A G 437.83 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00961758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.366;QD=21.6212;RBI=0.00972453;REFB=-0.0205249;REVB=0.00143824;RO=37;SAF=17;SAR=26;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038961;STB=0.513279;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0157815;OID=.;OPOS=32483237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:38:43:43:0.530864:26:17:13:24:26:17:14:24 chr17 32483270 . C G 389.07 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0706614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4727;QD=18.7504;RBI=0.0708457;REFB=0.00566286;REVB=0.00510713;RO=43;SAF=19;SAR=21;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309483;STB=0.517233;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.00649314;OID=.;OPOS=32483270;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:21:19:19:24:21:19:19:24 chr17 32583269 . T C 279.07 PASS AF=0.5;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0112523;FXX=0.0322529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.605;QD=18.6046;RBI=0.0145599;REFB=-0.0275135;REVB=0.00923992;RO=30;SAF=19;SAR=11;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293711;STB=0.663649;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0231648;OID=.;OPOS=32583269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:30:30:30:30:0.5:11:19:9:21:11:19:9:21 chr17 32583911 . C T 593.66 PASS AF=0.556701;AO=54;DP=95;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0152158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6745;QD=24.4809;RBI=0.0179462;REFB=-0.0353683;REVB=-0.00951565;RO=40;SAF=29;SAR=25;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183051;STB=0.582829;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0125681;OID=.;OPOS=32583911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:40:43:54:54:0.556701:25:29:12:28:25:29:15:28 chr17 32904586 . C T 457.53 PASS AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0379239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9323;QD=20.5632;RBI=0.0434775;REFB=-0.010016;REVB=-0.021262;RO=44;SAF=14;SAR=31;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22059;STB=0.622565;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0100547;OID=.;OPOS=32904586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:44:44:45:45:0.505618:31:14:24:20:31:14:24:20 chr17 32953258 . G A 299.26 PASS AF=0.586957;AO=23;DP=42;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0417045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0011;QD=26.023;RBI=0.148126;REFB=-0.0368836;REVB=0.142134;RO=19;SAF=15;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27236;STB=0.598015;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0295687;OID=.;OPOS=32953258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:46:19:19:23:27:0.586957:8:15:6:13:12:15:6:13 chr17 32964868 . G A 310.0 PASS AF=0.402299;AO=34;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=0.102705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6124;QD=14.2529;RBI=0.11477;REFB=-0.0290107;REVB=0.0512232;RO=52;SAF=18;SAR=16;SRF=37;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198143;STB=0.618732;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0469942;OID=.;OPOS=32964868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:34:35:0.402299:16:18:37:15:17:18:37:15 chr17 33286664 . A G 286.3 PASS AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0372276;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.248;QD=20.4501;RBI=0.0376335;REFB=-0.0263235;REVB=-0.00551205;RO=26;SAF=18;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179932;STB=0.599933;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0205411;OID=.;OPOS=33286664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:12:18:10:16:12:18:10:16 chr17 33288363 . C T 1141.07 PASS AF=0.479167;AO=115;DP=239;FAO=115;FDP=240;FR=.;FRO=125;FSAF=39;FSAR=76;FSRF=55;FSRR=70;FWDB=-0.0143696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.387;QD=19.0178;RBI=0.0149977;REFB=-0.0151475;REVB=-0.00429472;RO=121;SAF=39;SAR=76;SRF=54;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106909;STB=0.556463;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0158793;OID=.;OPOS=33288363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:240:121:125:115:115:0.479167:76:39:54:67:76:39:55:70 chr17 33288882 . T G 578.79 PASS AF=0.557692;AO=57;DP=102;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0490994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.396;QD=22.2611;RBI=0.0509509;REFB=-0.0227437;REVB=-0.0136104;RO=45;SAF=25;SAR=32;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686171;STB=0.535437;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0179596;OID=.;OPOS=33288882;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:45:46:57:58:0.557692:32:25:16:29:32:26:17:29 chr17 33289937 . A T 272.76 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00870357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.619;QD=14.9456;RBI=0.0113073;REFB=-0.00588408;REVB=0.00721829;RO=42;SAF=17;SAR=14;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251209;STB=0.514226;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0112756;OID=.;OPOS=33289937;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:14:17:22:20:14:17:22:20 chr17 33319639 . G A 290.0 PASS AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.00316574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.02;QD=16.5713;RBI=0.0231881;REFB=-0.00960202;REVB=0.022971;RO=38;SAF=8;SAR=24;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404204;STB=0.727795;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0175466;OID=.;OPOS=33319639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:24:8:25:13:24:8:25:13 chr17 33348541 . C T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00706929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.402;QD=12.724;RBI=0.0161028;REFB=-0.011824;REVB=0.0144681;RO=35;SAF=5;SAR=18;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349197;STB=0.711498;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.016727;OID=.;OPOS=33348541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:18:5:18:17:18:5:19:17 chr17 33445549 . G A 885.37 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.68;QD=58.0573;RBI=0.0370909;REFB=0;REVB=0.0107284;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127855;OID=.;OPOS=33445549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0 chr17 33448818 . T C 837.01 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000834133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.1829;QD=55.8006;RBI=0.0567336;REFB=0.165018;REVB=-0.0567274;RO=1;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149779;STB=0.507934;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.00497356;OID=.;OPOS=33448818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:31:28:0:1:31:28:0:1 chr17 33457562 . T C 44.53 PASS AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0692988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.325;QD=7.12504;RBI=0.0693139;REFB=-0.0289299;REVB=-0.00144794;RO=18;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327529;STB=0.702782;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0392635;OID=.;OPOS=33457562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:4:3:13:5:4:3:13:5 chr17 33457697 . T C 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0370412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.144;QD=24.3281;RBI=0.0410502;REFB=-0.0225121;REVB=0.0176937;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216951;STB=0.624651;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00530482;OID=.;OPOS=33457697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:0:2:3:4:0:2 chr17 33459096 . C T 124.25 PASS AF=0.307692;AO=15;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0248196;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9746;QD=9.55788;RBI=0.0249146;REFB=-0.00329901;REVB=0.0021742;RO=35;SAF=10;SAR=5;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183634;STB=0.588124;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0176333;OID=.;OPOS=33459096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:36:15:16:0.307692:5:10:18:17:6:10:18:18 chr17 33459419 . G A 194.05 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00019973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7149;QD=16.8736;RBI=0.0262629;REFB=-0.00376653;REVB=0.0262621;RO=26;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226813;STB=0.629824;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0180319;OID=.;OPOS=33459419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:13:7:15:11:13:7:15:11 chr17 33460175 . T C 110.4 PASS AF=0.318182;AO=13;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0746024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6247;QD=10.036;RBI=0.0853889;REFB=-0.026246;REVB=-0.041542;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172087;STB=0.621535;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0370241;OID=.;OPOS=33460175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:30:30:13:14:0.318182:5:8:14:16:5:9:14:16 chr17 33460367 . G A 178.76 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0076814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.559;QD=22.3447;RBI=0.0453879;REFB=-0.0506227;REVB=0.0447332;RO=13;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455938;STB=0.538964;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0303197;OID=.;OPOS=33460367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:13:14:18:18:0.5625:10:8:5:8:10:8:5:9 chr17 33460431 . C T 364.28 PASS AF=0.536232;AO=35;DP=67;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0783843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3711;QD=21.1178;RBI=0.0886941;REFB=-0.0421008;REVB=0.0415036;RO=30;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482389;STB=0.522751;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0392929;OID=.;OPOS=33460431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:30:32:35:37:0.536232:19:16:12:18:19:18:14:18 chr17 33460516 . A G 281.57 PASS AF=0.54717;AO=28;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0220557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6677;QD=21.2503;RBI=0.0226025;REFB=-0.0468666;REVB=0.00494164;RO=23;SAF=10;SAR=18;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047444;STB=0.505776;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0520077;OID=.;OPOS=33460516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:23:24:28:29:0.54717:18:10:7:16:19:10:8:16 chr17 33464864 . C T 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0621;QD=58.0609;RBI=0.038073;REFB=0;REVB=0.0353656;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226124;OID=.;OPOS=33464864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0 chr17 33469279 . G C 130.25 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0727517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.664;QD=43.418;RBI=0.134573;REFB=0;REVB=-0.113212;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0102236;OID=.;OPOS=33469279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr17 33586365 . T C 34.05 PASS AF=0.0826446;AO=10;DP=121;FAO=10;FDP=121;FR=.;FRO=111;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=52;FSRR=59;FWDB=-0.00874117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.722;QD=1.12569;RBI=0.0374266;REFB=-0.0031914;REVB=-0.0363915;RO=111;SAF=9;SAR=1;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487292;STB=0.897701;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0270513;OID=.;OPOS=33586365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:121:121:111:111:10:10:0.0826446:1:9:52:59:1:9:52:59 chr17 33680807 . G A 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000135217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5215;QD=44.6896;RBI=0.0886182;REFB=0;REVB=-0.0886181;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00447291;OID=.;OPOS=33680807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0 chr17 33680811 . C A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6866;QD=45.8053;RBI=0.0457694;REFB=0;REVB=0.0432282;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139285;OID=.;OPOS=33680811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr17 33680840 . T C 427.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6463;QD=56.9775;RBI=0.0840907;REFB=0;REVB=0.0810773;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136427;OID=.;OPOS=33680840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:17:11:0:0:19:11:0:0 chr17 33689926 . T C 2254.84 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0888575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2233;QD=63.5167;RBI=0.0889234;REFB=0;REVB=-0.00342183;RO=0;SAF=80;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24749e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000410013;OID=.;OPOS=33689926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:62:80:0:0:62:80:0:0 chr17 33749546 . A G 219.88 PASS AF=0.564103;AO=19;DP=36;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0504048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.428;QD=22.5517;RBI=0.0504863;REFB=-0.0155307;REVB=-0.00286697;RO=17;SAF=13;SAR=6;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369444;STB=0.692667;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0113373;OID=.;OPOS=33749546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:39:17:17:19:22:0.564103:6:13:4:13:7:15:4:13 chr17 33749919 . A C 118.91 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00304779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.316;QD=13.2126;RBI=0.0269831;REFB=-0.00391923;REVB=-0.0268105;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282608;STB=0.66642;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00695812;OID=.;OPOS=33749919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:10:4:12:10:10:4:12:10 chr17 33768334 . T G 876.33 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0251393;FXX=0.0158705;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.091;QD=56.5375;RBI=0.0252067;REFB=-0.14672;REVB=0.00184271;RO=1;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165597;STB=0.508769;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.000300139;OID=.;OPOS=33768334;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:28:33:0:1:28:33:0:1 chr17 33768354 . C T 791.09 PASS AF=1;AO=53;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0091;QD=55.5151;RBI=0.0704858;REFB=-0.10745;REVB=0.0637253;RO=2;SAF=28;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00194369;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00625171;OID=.;OPOS=33768354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:55:57:2:0:53:57:1:25:28:1:1:27:30:0:0 chr17 33769034 . G A 150.25 PASS AF=0.22549;AO=23;DP=102;FAO=23;FDP=102;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=32;FWDB=-0.00111472;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8612;QD=5.89208;RBI=0.00286083;REFB=-0.00226685;REVB=0.00263472;RO=78;SAF=18;SAR=5;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26403;STB=0.671885;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00507666;OID=.;OPOS=33769034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:78:79:23:23:0.22549:5:18:47:31:5:18:47:32 chr17 33769038 . C A 147.38 PASS AF=0.218182;AO=23;DP=110;FAO=24;FDP=110;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=35;FWDB=-0.00898128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.3;QD=5.35933;RBI=0.0302419;REFB=-0.0137857;REVB=-0.0288775;RO=85;SAF=18;SAR=5;SRF=51;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26799;STB=0.684515;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0288324;OID=.;OPOS=33769038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:85:86:23:24:0.218182:5:18:51:34:5:19:51:35 chr17 33771996 . G A 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.321;QD=63.583;RBI=0.0248004;REFB=0;REVB=0.0213623;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76713e-05;OID=.;OPOS=33771996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr17 33805150 . T C 1511.27 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169914;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.615;QD=59.8523;RBI=0.073423;REFB=0;REVB=0.0714299;RO=0;SAF=47;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158805;OID=.;OPOS=33805150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:54:47:0:0:54:47:0:0 chr17 33806546 . G A 1572.91 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.835;QD=59.9204;RBI=0.0247339;REFB=0;REVB=-0.0200562;RO=0;SAF=61;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.74448e-05;OID=.;OPOS=33806546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:44:61:0:0:44:61:0:0 chr17 33806863 . G A 1472.57 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.773;QD=63.3362;RBI=0.0344926;REFB=0;REVB=-0.0233218;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.28919e-06;OID=.;OPOS=33806863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:41:52:0:0:41:52:0:0 chr17 33880003 . C G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000707933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.679;QD=56.1914;RBI=0.0500268;REFB=0;REVB=0.0500218;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319203;OID=.;OPOS=33880003;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chr17 33881631 . T C 1452.53 PASS AF=1;AO=79;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.475;QD=63.1533;RBI=0.0232936;REFB=0;REVB=0.00100752;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82022e-05;OID=.;OPOS=33881631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:79:92:1:46:33:0:0:46:46:0:0 chr17 33881718 . G A 1010.84 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059087;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1157;QD=59.4609;RBI=0.0600712;REFB=0;REVB=-0.0108294;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542651;OID=.;OPOS=33881718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0 chr17 33884804 . T C 763.49 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.822;QD=63.624;RBI=0.0317218;REFB=0;REVB=0.0235192;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46505e-05;OID=.;OPOS=33884804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:33:14:0:0:34:14:0:0 chr17 33901965 . C G 432.89 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975958;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.483;QD=57.7185;RBI=0.0199608;REFB=0;REVB=-0.0174121;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.72556e-06;OID=.;OPOS=33901965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:16:13:0:0:16:14:0:0 chr17 34069578 . C T 244.12 PASS AF=0.482143;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=27;FWDB=0.0401549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.928;QD=17.4372;RBI=0.0417288;REFB=-0.0126879;REVB=0.0113523;RO=29;SAF=7;SAR=19;SRF=2;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278248;STB=0.659404;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0170432;OID=.;OPOS=34069578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:29:26:27:0.482143:19:7:2:27:19:8:2:27 chr17 34073301 . C T 682.37 PASS AF=0.46;AO=69;DP=150;FAO=69;FDP=150;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.0161788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.039;QD=18.1964;RBI=0.0174509;REFB=-0.00634308;REVB=-0.00654049;RO=75;SAF=36;SAR=33;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392867;STB=0.501742;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00670087;OID=.;OPOS=34073301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:75:81:69:69:0.46:33:36:36:39:33:36:42:39 chr17 34100350 . G C,GC 739.67 PASS AF=0.0377358,0.962264;AO=2,50;DP=55;FAO=2,51;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=1,20;FSAR=1,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306399,0.021941;FXX=0;HRUN=2,0;LEN=1,1;MLLD=211.146,238.484;QD=55.8243;RBI=0.0409176,0.0415163;REFB=0,0;REVB=0.0271192,0.0352448;RO=2;SAF=1,20;SAR=1,30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.390188,-0.0447671;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0304167,-0.000987036;OID=.,.;OPOS=34100350,34100351;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:55:53:2:0:2,50:2,51:0.0377358,0.962264:1,30:1,20:2:0:1,31:1,20:0:0 chr17 34182099 . G GT 320.46 PASS AF=0.446154;AO=56;DP=133;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=0.0592601;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.8899;QD=9.86022;RBI=0.063865;REFB=-0.00142619;REVB=0.0238114;RO=75;SAF=12;SAR=44;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22172;STB=0.573886;STBP=0.202;TYPE=ins;VARB=0.000345024;OID=.;OPOS=34182100;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.446154:56:133:58:130:72:14:44:25:47:99:75:12:44:29:46 chr17 34303693 . T C 54.08 PASS AF=0.161765;AO=10;DP=57;FAO=11;FDP=68;FR=.;FRO=57;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0065174;FXX=0.0144907;HRUN=14;LEN=1;MLLD=91.338;QD=3.18143;RBI=0.0835598;REFB=0.000445878;REVB=-0.0833052;RO=45;SAF=3;SAR=7;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406482;STB=0.701455;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.00304198;OID=.;OPOS=34303693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:57:68:45:57:10:11:0.161765:7:3:29:16:7:4:35:22 chr17 34416537 . G A 572.03 PASS AF=0.508621;AO=58;DP=113;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.00338889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.253;QD=19.725;RBI=0.0140094;REFB=-0.0103677;REVB=0.0135933;RO=55;SAF=30;SAR=28;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135295;STB=0.577234;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00609926;OID=.;OPOS=34416537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:55:57:58:59:0.508621:28:30:20:35:29:30:20:37 chr17 34431287 . G T 1691.8 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00567702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.613;QD=59.8867;RBI=0.0268694;REFB=0;REVB=0.0262628;RO=0;SAF=53;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7761e-05;OID=.;OPOS=34431287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:113:0:0:110:113:1:57:53:0:0:58:55:0:0 chr17 34431961 . T C 115.99 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.554;QD=42.179;RBI=0.0306366;REFB=0;REVB=0.0282125;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109885;OID=.;OPOS=34431961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0 chr17 34432663 . AT GA 387.83 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00164367;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=212.324;QD=15.993;RBI=0.00842976;REFB=-0.00298168;REVB=0.00826796;RO=56;SAF=19;SAR=22;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545625;STB=0.530711;STBP=0.62;TYPE=mnp;VARB=0.00372242;OID=.;OPOS=34432663;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:22:19:23:33:22:19:23:33 chr17 34437572 . C T 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0289753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.107;QD=8.81111;RBI=0.0543165;REFB=-0.0169506;REVB=-0.0459425;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273912;STB=0.517182;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0341494;OID=.;OPOS=34437572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:2:9:5:1:2:9 chr17 34437713 . T C 205.87 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00652332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.767;QD=23.5284;RBI=0.00688017;REFB=-0.0126912;REVB=-0.00218701;RO=14;SAF=14;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214461;STB=0.636222;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00702106;OID=.;OPOS=34437713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:6:14:6:8:6:14:6:9 chr17 34539815 . G C 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00103761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5679;QD=60.6097;RBI=0.0240348;REFB=0;REVB=-0.0240124;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000233551;OID=.;OPOS=34539815;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0 chr17 34854280 . G A 461.87 PASS AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0115198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0367;QD=21.4825;RBI=0.0752914;REFB=0.00826403;REVB=0.0744049;RO=41;SAF=18;SAR=27;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533171;STB=0.529399;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.00616658;OID=.;OPOS=34854280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:27:18:14:27:27:18:14:27 chr17 34871721 . T C 263.34 PASS AF=0.6;AO=23;DP=39;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=5.46486e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.901;QD=26.3337;RBI=0.00641762;REFB=-0.0270603;REVB=0.00641739;RO=16;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185012;STB=0.590835;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0168407;OID=.;OPOS=34871721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:16:16:23:24:0.6:13:10:11:5:13:11:11:5 chr17 34893326 . A G 205.16 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.007778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.423;QD=15.7818;RBI=0.00876825;REFB=-0.00585233;REVB=0.00404785;RO=29;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012387;STB=0.507036;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00922183;OID=.;OPOS=34893326;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:9:14:18:11:9:14:18:11 chr17 34942595 . G A 105.01 PASS AF=0.6;AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00239475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.036;QD=21.0025;RBI=0.00405644;REFB=0.000264537;REVB=0.00327413;RO=8;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204038;STB=0.59985;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.000212827;OID=.;OPOS=34942595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:20:8:8:11:12:0.6:7:4:1:7:8:4:1:7 chr17 34956585 . CCA C 235.77 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00597029;FXX=0.0365809;HRUN=2;LEN=2;MLLD=227.957;QD=11.9376;RBI=0.00718159;REFB=-0.0140029;REVB=-0.00399134;RO=40;SAF=15;SAR=21;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.303681;SSSB=-0.0558455;STB=0.539592;STBP=0.542;TYPE=del;VARB=0.0143484;OID=.;OPOS=34956586;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.455696:36:81:36:79:43:15:21:21:22:99:40:15:21:19:21 chr17 34958598 . G C 317.15 PASS AF=0.492754;AO=32;DP=67;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00508238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.405;QD=18.3853;RBI=0.00961176;REFB=-0.0222447;REVB=0.00815814;RO=34;SAF=13;SAR=19;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525676;STB=0.509428;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0224762;OID=.;OPOS=34958598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:34:35:32:34:0.492754:19:13:14:20:21:13:14:21 chr17 35478362 . T C 766.38 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.061;QD=63.865;RBI=0.0428324;REFB=0;REVB=0.0315842;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293551;OID=.;OPOS=35478362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0 chr17 35609866 . C T 679.9 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.975;QD=61.809;RBI=0.0237141;REFB=0;REVB=0.0134745;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236937;OID=.;OPOS=35609866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:26:17:0:0:26:18:0:0 chr17 35696804 . G A 296.41 PASS AF=0.958333;AO=20;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00768799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.488;QD=49.4013;RBI=0.0221822;REFB=0.100101;REVB=0.0208073;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484648;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.00111556;OID=.;OPOS=35696804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:20:23:0.958333:9:11:0:1:11:12:0:1 chr17 35872988 . G A 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0265832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.988;QD=13.4591;RBI=0.0304404;REFB=-0.0195418;REVB=-0.0148307;RO=25;SAF=9;SAR=7;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173098;STB=0.60857;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0389128;OID=.;OPOS=35872988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:7:9:18:7:7:9:19:7 chr17 35873324 . T C 954.85 PASS AF=0.985294;AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0237648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.223;QD=56.1676;RBI=0.0250899;REFB=-0.0423646;REVB=0.00804584;RO=1;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160106;STB=0.508472;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000104664;OID=.;OPOS=35873324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:68:1:1:65:67:0.985294:29:36:0:1:29:38:0:1 chr17 35873399 . TA T 1153.68 PASS AF=1;AO=92;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00326111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.2516;QD=48.5759;RBI=0.00388756;REFB=0;REVB=-0.0021162;RO=0;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000462621;OID=.;OPOS=35873400;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:92:95:95:95:0:49:46:0:0:21:0:49:43:0:0 chr17 35902225 . C G 404.44 PASS AF=0.577465;AO=37;DP=68;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.106812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.662;QD=22.7851;RBI=0.106858;REFB=-0.0171054;REVB=-0.00313112;RO=28;SAF=14;SAR=23;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110295;STB=0.575249;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0173488;OID=.;OPOS=35902225;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:28:30:37:41:0.577465:23:14:7:21:23:18:8:22 chr17 35937637 . T C 388.32 PASS AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00228085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.023;QD=21.2775;RBI=0.00972674;REFB=-0.00143852;REVB=0.00945554;RO=34;SAF=22;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295789;STB=0.51635;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00120489;OID=.;OPOS=35937637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:17:22:18:16:17:22:18:16 chr17 35984410 . T C 287.89 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0120362;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.234;QD=23.9912;RBI=0.0257046;REFB=-0.018066;REVB=0.0227125;RO=22;SAF=5;SAR=21;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148268;STB=0.583264;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0136576;OID=.;OPOS=35984410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:21:5:7:15:21:5:7:15 chr17 35988672 . C T 201.1 PASS AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0175684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7431;QD=11.8294;RBI=0.0275895;REFB=-0.0037421;REVB=0.0212728;RO=43;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265833;STB=0.653321;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00485822;OID=.;OPOS=35988672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:43:43:25:25:0.367647:9:16:17:26:9:16:17:26 chr17 35995638 . T A 249.97 PASS AF=0.361446;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=83;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00472083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.499;QD=12.0467;RBI=0.00860438;REFB=-0.00720506;REVB=0.00719369;RO=53;SAF=17;SAR=13;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206484;STB=0.511887;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00998721;OID=.;OPOS=35995638;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:53:53:30:30:0.361446:13:17:31:22:13:17:31:22 chr17 36003359 . A G 196.9 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0341091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.57;QD=12.9112;RBI=0.0692633;REFB=-0.00475311;REVB=-0.0602825;RO=36;SAF=17;SAR=7;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338333;STB=0.701344;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0161605;OID=.;OPOS=36003359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:7:17:14:22:7:17:14:23 chr17 36358847 . T A 2623.75 PASS AF=0.994152;AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=96;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.015266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5281;QD=61.3742;RBI=0.0516134;REFB=-0.105899;REVB=0.0493041;RO=1;SAF=96;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00493231;STB=0.50259;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00108622;OID=.;OPOS=36358847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:171:171:1:1:170:170:0.994152:74:96:1:0:74:96:1:0 chr17 36365176 . C T 80.62 PASS AF=0.261905;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0632573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.707;QD=7.6781;RBI=0.0636173;REFB=-0.0056847;REVB=-0.00675798;RO=30;SAF=8;SAR=3;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169007;STB=0.596829;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0231249;OID=.;OPOS=36365176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:42:30:31:11:11:0.261905:3:8:18:12:3:8:19:12 chr17 36474601 . A G 160.51 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0340084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.448;QD=18.3443;RBI=0.0347463;REFB=-0.0100696;REVB=-0.00712261;RO=18;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08752;STB=0.54994;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00841996;OID=.;OPOS=36474601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:6:11:10:8:6:11:10:8 chr17 36478388 . G T 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0198211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.792;QD=12.9747;RBI=0.0203027;REFB=-0.031178;REVB=-0.00439611;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289056;STB=0.517017;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0405618;OID=.;OPOS=36478388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:7:5:8:10:7:5:8:10 chr17 36485362 . C T 35.9 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.10182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5152;QD=8.44674;RBI=0.119492;REFB=0.0199026;REVB=0.0625389;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308307;STB=0.691681;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.0115347;OID=.;OPOS=36485362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:17:17:11:11:6:6:0.352941:2:4:4:7:2:4:4:7 chr17 36485753 . G C 70.78 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0301381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.601;QD=7.25903;RBI=0.0624172;REFB=-0.0141192;REVB=0.0546589;RO=29;SAF=3;SAR=7;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18748;STB=0.618537;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0444137;OID=.;OPOS=36485753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:7:3:13:16:7:3:13:16 chr17 36493598 . A G 305.77 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.022256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1478;QD=27.1797;RBI=0.0768749;REFB=-0.0640066;REVB=-0.0735828;RO=18;SAF=9;SAR=18;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208299;STB=0.615297;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0450857;OID=.;OPOS=36493598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:18:9:11:7:18:9:11:7 chr17 36617210 . A G 1817.21 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191843;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.894;QD=61.0826;RBI=0.0207869;REFB=0;REVB=0.00800353;RO=0;SAF=69;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10569e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173532;OID=.;OPOS=36617210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:49:69:0:0:50:69:0:0 chr17 36635721 . C T 347.89 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00677206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.788;QD=17.3945;RBI=0.0109556;REFB=-0.0062176;REVB=-0.00861185;RO=43;SAF=17;SAR=20;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396341;STB=0.522172;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00838239;OID=.;OPOS=36635721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:20:17:18:25:20:17:18:25 chr17 36646386 . A G 2280.24 PASS AF=0.993103;AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00944443;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.715;QD=62.9033;RBI=0.0403118;REFB=-0.00697482;REVB=0.0391899;RO=0;SAF=61;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502994;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=5.54254e-05;OID=.;OPOS=36646386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:145:0:1:144:144:0.993103:83:61:0:0:83:61:0:1 chr17 36699322 . A G 135.95 PASS AF=0.483871;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.00179728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0295;QD=17.5421;RBI=0.129147;REFB=-0.0127839;REVB=0.129135;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416766;STB=0.736149;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0152196;OID=.;OPOS=36699322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:31:16:16:14:15:0.483871:7:7:15:1:8:7:15:1 chr17 36704829 . G A 270.03 PASS AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00905175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.766;QD=22.9815;RBI=0.0110524;REFB=-0.0383839;REVB=0.00634197;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319934;STB=0.517843;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0218396;OID=.;OPOS=36704829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:10:15:14:8:10:15:14:8 chr17 36861983 . T C 594.52 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8081;QD=60.9759;RBI=0.0545205;REFB=0;REVB=-0.0154589;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102359;OID=.;OPOS=36861983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr17 36873149 . C T 386.57 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00126928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.881;QD=18.1914;RBI=0.0202114;REFB=-0.0135504;REVB=-0.0201715;RO=45;SAF=18;SAR=22;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266913;STB=0.514891;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0132968;OID=.;OPOS=36873149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:22:18:19:26:22:18:19:26 chr17 36881872 . ACCCCCCC ACCCCCC,ACCCCCCA 52.08 PASS AF=0.451613,0.0322581;AO=12,2;DP=30;FAO=14,1;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=3,1;FSAR=11,0;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0912818,-0.00769664;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.14815,25.0666;QD=6.71963;RBI=0.0913803,0.0132017;REFB=-0.0722641,-0.0319544;REVB=0.00424227,0.010726;RO=14;SAF=2,2;SAR=10,0;SRF=2;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0411397,0.731324;STB=0.521709,0.995311;STBP=0.88,0.102;TYPE=del,snp;VARB=0.0826291,-0.0226696;OID=.,.;OPOS=36881873,36881879;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=ACCCCCC,ACCCCCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.451613,0.0322581:12,2:30:14,1:31:16:3,1:11,0:3:13:47:14:2,2:10,0:2:12 chr17 36882595 . T A 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.018639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5164;QD=8.81126;RBI=0.0344951;REFB=-0.0112328;REVB=0.0290258;RO=10;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568762;STB=0.517182;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0100356;OID=.;OPOS=36882595;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:10:11:6:6:0.352941:5:1:2:8:5:1:2:9 chr17 36890949 . T C 370.98 PASS AF=1;AO=19;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.381;QD=54.9595;RBI=0.0557815;REFB=0;REVB=0.0557181;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221877;OID=.;OPOS=36890949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:19:27:1:12:7:0:0:16:11:0:0 chr17 36894839 . G A 497.04 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00816447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.08;QD=58.4751;RBI=0.0276573;REFB=0;REVB=0.0264247;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15442e-05;OID=.;OPOS=36894839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr17 36906873 . A G 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.014548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.328;QD=12.0158;RBI=0.0269282;REFB=-0.0164416;REVB=-0.0226603;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247547;STB=0.688929;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0197977;OID=.;OPOS=36906873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:5:7:6:6:0.461538:1:5:3:2:1:5:4:3 chr17 36909061 . A G 339.21 PASS AF=0.5;AO=35;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0415762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.241;QD=18.8453;RBI=0.0430904;REFB=-0.00930122;REVB=-0.0113229;RO=36;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012284;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0151617;OID=.;OPOS=36909061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:36:36:35:36:0.5:17:18:19:17:17:19:19:17 chr17 36922196 . A G 257.95 PASS AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0365228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.979;QD=18.425;RBI=0.0367091;REFB=-0.00579686;REVB=-0.00369358;RO=28;SAF=16;SAR=12;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189786;STB=0.605986;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.016226;OID=.;OPOS=36922196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:12:16:10:18:12:16:10:18 chr17 36922839 . C G 195.43 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.000169076;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.963;QD=15.3274;RBI=0.0591291;REFB=-0.0188848;REVB=-0.0591289;RO=29;SAF=13;SAR=9;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104376;STB=0.55927;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0223774;OID=.;OPOS=36922839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:9:13:20:9:9:13:20:9 chr17 36926731 . T G 179.02 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0243678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1339;QD=10.8497;RBI=0.0390193;REFB=-0.00377723;REVB=0.0304748;RO=40;SAF=13;SAR=10;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206105;STB=0.638128;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00866507;OID=.;OPOS=36926731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:40:43:23:23:0.348485:10:13:15:25:10:13:15:28 chr17 36926767 . G A 207.45 PASS AF=0.416667;AO=24;DP=59;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.048557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.926;QD=13.8297;RBI=0.0498028;REFB=-0.00693409;REVB=0.0110695;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18861;STB=0.592519;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00807848;OID=.;OPOS=36926767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:35:35:24:25:0.416667:10:14:14:21:11:14:14:21 chr17 37017969 . T G 240.86 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0336568;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7212;QD=16.6108;RBI=0.049403;REFB=-0.00239693;REVB=0.0361645;RO=32;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835435;STB=0.538433;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00439437;OID=.;OPOS=37017969;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:32:31:27:27:0.465517:12:15:15:17:12:15:15:16 chr17 37023896 . G A 76.38 PASS AF=0.5;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00170101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.814;QD=15.2753;RBI=0.0278812;REFB=-0.00184219;REVB=0.0278293;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498364;STB=0.550917;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00343822;OID=.;OPOS=37023896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:19:20:10:10:9:10:0.5:5:4:5:5:6:4:5:5 chr17 37070658 . A G 106.38 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00557959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3334;QD=11.8205;RBI=0.0198874;REFB=-0.00136686;REVB=-0.0190886;RO=23;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560947;STB=0.533282;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00184158;OID=.;OPOS=37070658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:8:5:10:13:8:5:10:13 chr17 37076331 . G A 253.46 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0103204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.477;QD=19.1294;RBI=0.0103579;REFB=-0.0376029;REVB=-0.000880168;RO=24;SAF=14;SAR=13;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120826;STB=0.546688;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0319565;OID=.;OPOS=37076331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:26:27:27:0.509434:13:14:9:15:13:14:11:15 chr17 37101380 . T C 279.6 PASS AF=0.956522;AO=19;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0053507;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.025;QD=48.6264;RBI=0.0277202;REFB=0.0450267;REVB=0.0271989;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.519982;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000223359;OID=.;OPOS=37101380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:0:1:19:22:0.956522:9:10:0:0:12:10:0:1 chr17 37213317 . C A 212.27 PASS AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0244799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.964;QD=27.3903;RBI=0.0487831;REFB=-0.000941333;REVB=0.0421963;RO=11;SAF=5;SAR=15;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603052;STB=0.533301;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.00173273;OID=.;OPOS=37213317;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:15:5:2:9:15:5:2:9 chr17 37228765 . A G 251.46 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0247074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5516;QD=20.5275;RBI=0.0248656;REFB=-0.0115367;REVB=-0.00280041;RO=25;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166181;STB=0.59297;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00944763;OID=.;OPOS=37228765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:13:11:7:18:13:11:7:18 chr17 37243927 . A G 250.3 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0170312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.272;QD=20.0236;RBI=0.0292853;REFB=-0.0168467;REVB=-0.0238237;RO=26;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105797;STB=0.559393;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.015222;OID=.;OPOS=37243927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:10:14:18:8:10:14:18:8 chr17 37316988 . T C 131.24 PASS AF=0.271429;AO=19;DP=70;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0193285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.385;QD=7.49961;RBI=0.0229663;REFB=-0.00364886;REVB=-0.0124041;RO=51;SAF=9;SAR=10;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208443;STB=0.624875;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0131215;OID=.;OPOS=37316988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:51:51:19:19:0.271429:10:9:33:18:10:9:33:18 chr17 37319029 . T G 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0338222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.187;QD=14.6575;RBI=0.0341921;REFB=-0.0167967;REVB=-0.00501601;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861396;STB=0.550186;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0304557;OID=.;OPOS=37319029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:8:9:8:5:8:9 chr17 37319065 . C T 99.23 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0381484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.451;QD=14.7013;RBI=0.0382574;REFB=0.00416366;REVB=0.00288606;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484683;STB=0.528254;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-0.00327675;OID=.;OPOS=37319065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:7:5:7:8:7:5:7:8 chr17 37319103 . T C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00548292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.267;QD=12.0517;RBI=0.02015;REFB=-0.00714998;REVB=0.0193897;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278721;STB=0.666296;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00791235;OID=.;OPOS=37319103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:5:8:3:6:5:8 chr17 37334243 . G A 213.59 PASS AF=0.431034;AO=21;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00503096;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=71.2876;QD=14.7306;RBI=0.11285;REFB=-0.0181577;REVB=0.112738;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00522327;STB=0.542902;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0480544;OID=.;OPOS=37334243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:33:21:25:0.431034:11:10:13:14:14:11:17:16 chr17 37410892 . C G 820.46 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193832;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.654;QD=57.5761;RBI=0.019782;REFB=0;REVB=0.00395214;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51491e-05;OID=.;OPOS=37410892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0 chr17 37420535 . G A 365.17 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0236518;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.514;QD=32.4596;RBI=0.0366258;REFB=-0.0358902;REVB=0.027965;RO=15;SAF=5;SAR=25;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386733;STB=0.714122;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0116703;OID=.;OPOS=37420535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:25:5:10:5:25:5:10:5 chr17 37898543 . T C 789.17 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0608284;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.048;QD=64.4222;RBI=0.0815381;REFB=0;REVB=0.0542989;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.25492e-05;OID=.;OPOS=37898543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0 chr17 38068621 . T C 404.43 PASS AF=0.540541;AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00421808;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.947;QD=21.8609;RBI=0.00444726;REFB=0.00583451;REVB=0.00140923;RO=35;SAF=17;SAR=22;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163674;STB=0.576575;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-0.00496828;OID=.;OPOS=38068621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:34:39:40:0.540541:22:17:22:13:22:18:21:13 chr17 38121993 . G A 344.28 PASS AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=40;FWDB=-0.00355491;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5567;QD=15.8288;RBI=0.0709878;REFB=0.0125398;REVB=0.0708987;RO=50;SAF=18;SAR=19;SRF=10;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298604;STB=0.666169;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00749325;OID=.;OPOS=38121993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:50:37:37:0.425287:19:18:10:40:19:18:10:40 chr17 38122680 . G T 234.18 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0278642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.541;QD=18.3668;RBI=0.0288544;REFB=-0.0183854;REVB=-0.00749425;RO=26;SAF=7;SAR=18;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306127;STB=0.517227;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.02306;OID=.;OPOS=38122680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:18:7:8:18:18:7:8:18 chr17 38122686 . G A 240.56 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0874622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.978;QD=21.3828;RBI=0.120068;REFB=0.0443152;REVB=0.0822592;RO=22;SAF=6;SAR=17;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387947;STB=0.521721;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0326841;OID=.;OPOS=38122686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:17:6:5:17:17:6:5:17 chr17 38137364 . G A 319.63 PASS AF=0.962963;AO=24;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.13116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8014;QD=47.3527;RBI=0.140781;REFB=-0.126864;REVB=0.0511487;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487199;STB=0.521722;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0141811;OID=.;OPOS=38137364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:24:26:0.962963:15:9:1:0:15:11:1:0 chr17 38173143 . G A 673.64 PASS AF=1;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141236;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.281;QD=62.6644;RBI=0.0442069;REFB=0;REVB=0.0418901;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33321e-05;OID=.;OPOS=38173143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:27:16:0:0 chr17 38173537 . TCCC TCC,TCCG 747.27 PASS AF=0.906667,0.0933333;AO=38,6;DP=76;FAO=68,7;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40,0;FSAR=28,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174327,0.00885897;FXX=0.0131562;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.6001,22.2318;QD=39.8544;RBI=0.631213,0.270354;REFB=-0.0960781,-0.0201;REVB=0.606663,0.270209;RO=28;SAF=32,0;SAR=6,6;SRF=6;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0.494048,0;SSSB=0.535832,-0.609898;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0586613,-0.169282;OID=.,.;OPOS=38173538,38173540;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TCC,TCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.906667,0.0933333:38,6:76:68,7:75:0:40,0:28,7:0:0:24:28:32,0:6,6:6:22 chr17 38176256 . A T 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.121;QD=51.9145;RBI=0.0687805;REFB=0;REVB=0.0437072;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119185;OID=.;OPOS=38176256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0 chr17 38179492 . A G 707.42 PASS AF=0.929825;AO=52;DP=56;FAO=53;FDP=57;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00705554;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.158;QD=49.6433;RBI=0.00892095;REFB=-0.11842;REVB=-0.00545918;RO=4;SAF=27;SAR=25;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648251;STB=0.533321;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00138558;OID=.;OPOS=38179492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:56:57:4:4:52:53:0.929825:25:27:4:0:25:28:4:0 chr17 38246286 . A G 186.87 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0155631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.132;QD=19.67;RBI=0.0189796;REFB=-0.0146748;REVB=0.0108635;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175082;STB=0.597845;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00675716;OID=.;OPOS=38246286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:13:6:3:16:13:6:3:16 chr17 38253407 . A AAGG 93.78 PASS AF=0.342857;AO=10;DP=37;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00864517;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=3;MLLD=175.102;QD=10.7179;RBI=0.0233736;REFB=-0.00705846;REVB=-0.021716;RO=26;SAF=7;SAR=3;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199615;STB=0.627234;STBP=0.298;TYPE=ins;VARB=0.0344373;OID=.;OPOS=38253408;OREF=-;OALT=AGG;OMAPALT=AAGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.342857:10:37:12:35:23:8:4:11:12:93:26:7:3:14:12 chr17 38273561 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488575;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.768;QD=50.4135;RBI=0.00911143;REFB=0;REVB=0.00769075;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01792e-05;OID=.;OPOS=38273561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0 chr17 38350209 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0116109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.09;QD=14.9783;RBI=0.0226706;REFB=-0.0182397;REVB=0.0194716;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376093;STB=0.719196;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0429689;OID=.;OPOS=38350209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:8:3:7:3:8:3 chr17 38350583 . G A 306.32 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.679;QD=53.2724;RBI=0.0977042;REFB=0;REVB=0.0801066;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000682574;OID=.;OPOS=38350583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0 chr17 38457151 . G A 937.03 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.634;QD=58.5644;RBI=0.0381761;REFB=0;REVB=0.0174949;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173179;OID=.;OPOS=38457151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:64:0:0:61:64:1:22:39:0:0:23:41:0:0 chr17 38513802 . G C 1024.97 PASS AF=0.987179;AO=20;DP=84;FAO=77;FDP=78;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=1;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.210603;FXX=0.0370325;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.7238;QD=52.5628;RBI=0.214755;REFB=0.0733813;REVB=0.0420231;RO=38;SAF=0;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.812244;STB=0.509801;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.0309421;OID=.;OPOS=38513802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:84:78:38:1:20:77:0.987179:20:0:19:19:52:25:1:0 chr17 38600092 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.526;QD=33.4285;RBI=0.0404641;REFB=0;REVB=0.00439674;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062591;OID=.;OPOS=38600092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr17 38911212 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.346;QD=57.3858;RBI=0.0480579;REFB=0;REVB=-0.0476171;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000357232;OID=.;OPOS=38911212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0 chr17 38911327 . C G 315.1 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0184218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8801;QD=20.0064;RBI=0.0567563;REFB=0.0210494;REVB=0.0536834;RO=30;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676215;STB=0.537549;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.0185356;OID=.;OPOS=38911327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:15:18:14:16:15:18:14:16 chr17 38911363 . G A 261.83 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00480048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1628;QD=17.1694;RBI=0.00487531;REFB=-0.0102917;REVB=-0.000850885;RO=30;SAF=16;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445683;STB=0.522373;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00738088;OID=.;OPOS=38911363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:32:29:29:0.47541:13:16:18:12:13:16:19:13 chr17 38928014 . A G 454.11 PASS AF=0.471154;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0150826;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.857;QD=17.4659;RBI=0.0180881;REFB=-0.00660535;REVB=0.00998462;RO=55;SAF=25;SAR=24;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183353;STB=0.5102;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00677513;OID=.;OPOS=38928014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:55:55:49:49:0.471154:24:25:27:28:24:25:27:28 chr17 38935812 . A G 769.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.552;QD=56.9998;RBI=0.0343793;REFB=0;REVB=-0.0210194;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38055e-05;OID=.;OPOS=38935812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr17 38936659 . C T 487.23 PASS AF=0.481481;AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0379369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.657;QD=18.0456;RBI=0.0389151;REFB=0.00485025;REVB=0.00867049;RO=56;SAF=27;SAR=25;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489638;STB=0.527152;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.00501616;OID=.;OPOS=38936659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:56:52:52:0.481481:25:27:32:24:25:27:32:24 chr17 38938591 . C G 260.5 PASS AF=0.571429;AO=23;DP=41;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0116251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.271;QD=24.8097;RBI=0.0396365;REFB=-0.0270051;REVB=0.0378934;RO=18;SAF=8;SAR=15;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167508;STB=0.599924;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0133844;OID=.;OPOS=38938591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:18:18:23:24:0.571429:15:8:3:15:15:9:3:15 chr17 38950239 . C T 340.38 PASS AF=0.362069;AO=42;DP=116;FAO=42;FDP=116;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.00362092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.528;QD=11.7371;RBI=0.0122297;REFB=-0.0131778;REVB=-0.0116814;RO=74;SAF=20;SAR=22;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415918;STB=0.523798;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0199957;OID=.;OPOS=38950239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:74:74:42:42:0.362069:22:20:38:36:22:20:38:36 chr17 38950251 . A G 336.51 PASS AF=0.372727;AO=41;DP=111;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.00439088;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.947;QD=12.2367;RBI=0.0289224;REFB=-0.0244431;REVB=-0.0285872;RO=68;SAF=20;SAR=21;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294199;STB=0.512189;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0369962;OID=.;OPOS=38950251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:68:69:41:41:0.372727:21:20:35:33:21:20:35:34 chr17 38955961 . G A 172.2 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00295933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.895;QD=26.4926;RBI=0.00967166;REFB=-0.0048706;REVB=-0.00920779;RO=9;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198959;STB=0.610978;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00205769;OID=.;OPOS=38955961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:11:6:6:3:11:6:6:3 chr17 38978536 . A C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00359537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.417;QD=45.8065;RBI=0.00997051;REFB=0;REVB=0.0092997;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12402e-05;OID=.;OPOS=38978536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr17 38990834 . G C 620.48 PASS AF=0.517544;AO=55;DP=113;FAO=59;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00935544;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.158;QD=21.7713;RBI=0.027102;REFB=-0.044316;REVB=0.025436;RO=30;SAF=25;SAR=30;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580244;STB=0.544552;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0251374;OID=.;OPOS=38990834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:30:45:55:59:0.517544:30:25:11:19:31:28:26:19 chr17 38991003 . T C 660.14 PASS AF=0.468531;AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=143;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.00771995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.608;QD=18.4653;RBI=0.0105222;REFB=-0.0104042;REVB=0.00714973;RO=76;SAF=31;SAR=36;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035846;STB=0.519877;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0156548;OID=.;OPOS=38991003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:76:76:67:67:0.468531:36:31:38:38:36:31:38:38 chr17 38991032 . T A 735.5 PASS AF=0.496689;AO=73;DP=149;FAO=75;FDP=151;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.0195146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9427;QD=19.4834;RBI=0.0406076;REFB=-0.0222088;REVB=0.0356112;RO=76;SAF=34;SAR=39;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195484;STB=0.516955;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0234655;OID=.;OPOS=38991032;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:76:76:73:75:0.496689:39:34:37:39:41:34:37:39 chr17 39081713 . A G 1914.93 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.897;QD=61.7718;RBI=0.0136629;REFB=0;REVB=-0.0136112;RO=0;SAF=70;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.20778e-05;OID=.;OPOS=39081713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:54:70:0:0:54:70:0:0 chr17 39084504 . T C 1434.28 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.021;QD=63.0452;RBI=0.0692341;REFB=0;REVB=0.0566017;RO=0;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204266;OID=.;OPOS=39084504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:53:37:0:0:53:38:0:0 chr17 39150167 . G A 205.84 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0275377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.042;QD=23.525;RBI=0.0425367;REFB=-0.0260083;REVB=0.0324198;RO=15;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720767;STB=0.540154;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0167094;OID=.;OPOS=39150167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:7:13:11:4:7:13:11:4 chr17 39150284 . A G 312.94 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00671636;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.009;QD=14.2246;RBI=0.034921;REFB=-0.0227339;REVB=-0.0342691;RO=54;SAF=24;SAR=11;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245788;STB=0.634497;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0334318;OID=.;OPOS=39150284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:54:53:35:35:0.397727:11:24:25:29:11:24:25:28 chr17 39150357 . A G 311.85 PASS AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0421139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.433;QD=16.6319;RBI=0.0455058;REFB=-0.0093004;REVB=-0.0172393;RO=39;SAF=25;SAR=9;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236495;STB=0.623253;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0172586;OID=.;OPOS=39150357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:41:34:34:0.453333:9:25:20:19:9:25:22:19 chr17 39156027 . G A 339.07 PASS AF=0.45122;AO=36;DP=81;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.014506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.153;QD=16.5402;RBI=0.0161996;REFB=-0.0330701;REVB=0.00721136;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191121;STB=0.598374;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.028618;OID=.;OPOS=39156027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:45:45:36:37:0.45122:17:19:15:30:18:19:15:30 chr17 39186031 . C T 271.89 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0240472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.517;QD=19.4206;RBI=0.0503251;REFB=-0.024934;REVB=-0.0442081;RO=27;SAF=12;SAR=17;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185599;STB=0.603356;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0259297;OID=.;OPOS=39186031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:17:12:17:10:17:12:17:10 chr17 39186168 . A C 160.52 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0296679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.473;QD=18.3452;RBI=0.072816;REFB=0.000698656;REVB=-0.0664981;RO=18;SAF=4;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320338;STB=0.683978;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00575682;OID=.;OPOS=39186168;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:13:4:10:8:13:4:10:8 chr17 39186220 . G A 225.99 PASS AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00356257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.003;QD=20.5445;RBI=0.0093532;REFB=0.00289005;REVB=0.00864814;RO=22;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131399;STB=0.574254;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.00387009;OID=.;OPOS=39186220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:15:7:10:12:15:7:10:12 chr17 39190758 . T C 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00794432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.502;QD=8.81108;RBI=0.0378202;REFB=-0.0196099;REVB=-0.0369764;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132203;STB=0.583047;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0367179;OID=.;OPOS=39190758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:4:2:5:6:4:2:5:6 chr17 39197176 . G A 37.39 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0465442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.716;QD=8.79848;RBI=0.0509169;REFB=-0.0276273;REVB=0.0206439;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359862;STB=0.730829;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.026162;OID=.;OPOS=39197176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:5:6:5:1:5:6 chr17 39197499 . G A 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0511529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.802;QD=8.24625;RBI=0.0582427;REFB=-0.0113448;REVB=-0.0278494;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403073;STB=0.749318;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.030739;OID=.;OPOS=39197499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:5:10:2:5:5:10 chr17 39203455 . G C 43.73 PASS AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0448798;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.246;QD=21.8652;RBI=0.0449194;REFB=-0.187448;REVB=0.00188711;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173071;STB=0.599697;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0216164;OID=.;OPOS=39203455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:0:2:4:2:0:2 chr17 39203490 . G C 159.75 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.11015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7943;QD=26.6255;RBI=0.110581;REFB=-0.0825466;REVB=0.0097531;RO=8;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259834;STB=0.642704;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0242075;OID=.;OPOS=39203490;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:10:6:0:8:10:6:0:8 chr17 39203521 . GTGGTGTCTGAGGC G,GTGGTGT 56.84 PASS AF=0.333333,0;AO=7,4;DP=31;FAO=7,0;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3,0;FSAR=4,0;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.00762054,-0.0190126;FXX=0.322477;HRUN=1,1;LEN=13,7;MLLD=249.882,218.125;QD=10.8274;RBI=0.0393455,0.0570443;REFB=-0.0194807,-0.0103786;REVB=-0.0386005,-0.0537826;RO=9;SAF=3,1;SAR=4,3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.206013,0.0398812;STB=0.70542,0.5;STBP=0.274,1;TYPE=del,del;VARB=0.0373973,0;OID=.,.;OPOS=39203522,39203528;OREF=TGGTGTCTGAGGC,CTGAGGC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GTGGTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333,0:7,4:31:7,0:21:14:3,0:4,0:2:12:56:9:3,1:4,3:2:7 chr17 39216302 . T G,TG 225.71 PASS AF=0.0204082,0.489796;AO=2,23;DP=49;FAO=1,24;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=1,14;FSAR=0,10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0160543,-0.0979795;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=146.835,25.5189;QD=18.4251;RBI=0.0498201,0.10041;REFB=-0.0119142,-0.0284508;REVB=-0.0471625,-0.0219583;RO=24;SAF=1,14;SAR=1,9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0787327,0.0239571;STB=0.988251,0.5;STBP=0.467,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0632263,0.0258084;OID=.,.;OPOS=39216302,39216303;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:49:49:24:24:2,23:1,24:0.0204082,0.489796:1,9:1,14:14:10:0,10:1,14:14:10 chr17 39305956 . G A 179.68 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.017637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9337;QD=15.6242;RBI=0.0567452;REFB=-0.0169893;REVB=0.0539347;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512182;STB=0.517223;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0447063;OID=.;OPOS=39305956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:26:27:19:19:0.413043:10:9:11:15:10:9:12:15 chr17 39334456 . G A 771.66 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0899276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2386;QD=55.1188;RBI=0.104606;REFB=-0.130022;REVB=0.0534363;RO=1;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140721;STB=0.50746;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00323862;OID=.;OPOS=39334456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:56:56:1:1:55:55:0.982143:33:22:0:1:33:22:0:1 chr17 39340707 . C T 545.24 PASS AF=0.973684;AO=36;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0542608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.089;QD=57.3931;RBI=0.0857846;REFB=-0.103718;REVB=-0.0664436;RO=0;SAF=29;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529395;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.000935772;OID=.;OPOS=39340707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:0:1:36:37:0.973684:7:29:0:0:8:29:0:1 chr17 39340910 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.147;QD=35.5759;RBI=0.0289365;REFB=0;REVB=0.0189578;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431698;OID=.;OPOS=39340910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr17 39341158 . G A 651.19 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0956;QD=62.0183;RBI=0.023863;REFB=0;REVB=-0.0188413;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190457;OID=.;OPOS=39341158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr17 39341266 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.852;QD=45.8068;RBI=0.0246091;REFB=0;REVB=-0.00421289;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000365824;OID=.;OPOS=39341266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr17 39341294 . T A 130.87 PASS AF=1;AO=9;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0817102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.028;QD=43.6235;RBI=0.0817113;REFB=0;REVB=0.000421933;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000609572;OID=.;OPOS=39341294;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:9:12:1:6:3:0:0:6:6:0:0 chr17 39341473 . G C 304.87 PASS AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0366064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.622;QD=26.5108;RBI=0.040489;REFB=-0.000843982;REVB=-0.0173012;RO=19;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726478;STB=0.540163;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00108812;OID=.;OPOS=39341473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:13:14:8:11:13:14:8:11 chr17 39346518 . T C 223.44 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.677;QD=49.6524;RBI=0.0538784;REFB=0;REVB=0.016476;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408964;OID=.;OPOS=39346518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:18:0:0:16:18:1:11:5:0:0:12:6:0:0 chr17 39382942 . C A 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4907;QD=13.9591;RBI=0.00068211;REFB=0.026239;REVB=-0.00068211;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0264042;OID=.;OPOS=39382942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:6:7:7:7:0.5:7:0:0:6:7:0:0:7 chr17 39383335 . C G 519.82 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0843219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.211;QD=59.4077;RBI=0.0844847;REFB=0;REVB=0.00524284;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000409935;OID=.;OPOS=39383335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr17 39388852 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3409;QD=37.4885;RBI=0.0373786;REFB=0;REVB=0.00703392;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324889;OID=.;OPOS=39388852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr17 39394674 . A G 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.083;QD=63.8711;RBI=0.0215851;REFB=0;REVB=0.0138741;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38097e-05;OID=.;OPOS=39394674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0 chr17 39394729 . C A 198.31 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.133548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5547;QD=44.0685;RBI=0.133847;REFB=-0.0997268;REVB=-0.00894754;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523782;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0265068;OID=.;OPOS=39394729;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:7:10:0:0:7:10:1:0 chr17 39394755 . C A 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5163;QD=35.5753;RBI=0.0360332;REFB=0;REVB=0.0135244;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00399566;OID=.;OPOS=39394755;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr17 39406409 . C A 1769.59 PASS AF=0.96748;AO=119;DP=123;FAO=119;FDP=123;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0201796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5662;QD=57.5476;RBI=0.0705516;REFB=-0.0871676;REVB=0.0676041;RO=4;SAF=56;SAR=63;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013674;STB=0.507203;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00484095;OID=.;OPOS=39406409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:123:123:4:4:119:119:0.96748:63:56:1:3:63:56:1:3 chr17 39406447 . A G 2334.77 PASS AF=0.993243;AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.653;QD=63.1019;RBI=0.0253171;REFB=0.0202199;REVB=0.00549764;RO=1;SAF=77;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674592;STB=0.503546;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=2.62928e-05;OID=.;OPOS=39406447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:148:148:1:1:147:147:0.993243:70:77:0:1:70:77:0:1 chr17 39406567 . C A 1933.55 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.715;QD=61.8737;RBI=0.0152249;REFB=0;REVB=0.00894948;RO=0;SAF=65;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.14414e-06;OID=.;OPOS=39406567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:60:65:0:0:60:65:0:0 chr17 39406589 . A G 2239.32 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366829;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.867;QD=63.5269;RBI=0.0154685;REFB=0;REVB=0.0150272;RO=0;SAF=67;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.30239e-06;OID=.;OPOS=39406589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:141:0:0:141:141:1:74:67:0:0:74:67:0:0 chr17 39412372 . G C 1171.79 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.765;QD=60.8722;RBI=0.0166011;REFB=0;REVB=0.0140888;RO=0;SAF=50;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15601e-05;OID=.;OPOS=39412372;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:27:50:0:0:27:50:0:0 chr17 39432562 . A T 365.26 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00454465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.77;QD=52.1796;RBI=0.0200787;REFB=-0.192654;REVB=0.0195576;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.533308;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00142769;OID=.;OPOS=39432562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:7:20:0:0:7:20:0:1 chr17 39458765 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00943236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.035;QD=56.7066;RBI=0.0237992;REFB=0;REVB=-0.0218503;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147173;OID=.;OPOS=39458765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr17 39535859 . A G 2361.07 PASS AF=0.975309;AO=158;DP=162;FAO=158;FDP=162;FR=.;FRO=4;FSAF=82;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0165599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.121;QD=58.2979;RBI=0.0174268;REFB=-0.000154595;REVB=0.00542801;RO=3;SAF=82;SAR=76;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00524286;STB=0.500469;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=8.71663e-06;OID=.;OPOS=39535859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:162:162:3:4:158:158:0.975309:76:82:2:1:76:82:2:2 chr17 39580454 . T C 764.36 PASS AF=0.576;AO=72;DP=125;FAO=72;FDP=125;FR=.;FRO=53;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00800215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.92;QD=24.4596;RBI=0.0324791;REFB=-0.00355241;REVB=0.0314779;RO=50;SAF=45;SAR=27;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120934;STB=0.501066;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.00294782;OID=.;OPOS=39580454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:50:53:72:72:0.576:27:45:32:18:27:45:33:20 chr17 39593768 . A G 1024.01 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.122;QD=59.3632;RBI=0.0360084;REFB=0;REVB=-0.0106332;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96071e-05;OID=.;OPOS=39593768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:27:41:0:0:28:41:0:0 chr17 39616430 . G T 304.08 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0363497;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.808;QD=20.2722;RBI=0.0960512;REFB=-0.0223064;REVB=0.0889075;RO=27;SAF=26;SAR=6;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209204;STB=0.631337;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0167831;OID=.;OPOS=39616430;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:6:26:17:10:6:26:17:11 chr17 39619093 . GT AC 156.46 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0153672;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.734;QD=14.2235;RBI=0.0252685;REFB=-0.0179817;REVB=-0.0200586;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092905;STB=0.543427;STBP=0.712;TYPE=mnp;VARB=0.0345972;OID=.;OPOS=39619093;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:44:26:27:17:17:0.386364:10:7:13:13:10:7:13:14 chr17 39619115 . G A 220.94 PASS AF=0.44898;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0107248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.49;QD=18.0355;RBI=0.0108327;REFB=-0.0118896;REVB=-0.00152504;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052726;STB=0.514912;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0122796;OID=.;OPOS=39619115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:21:22:0.44898:12:9:13:14:12:10:13:14 chr17 39619193 . C T 309.06 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00790119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.079;QD=18.7309;RBI=0.0170947;REFB=-0.0086474;REVB=0.0151592;RO=33;SAF=23;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177119;STB=0.599136;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0103357;OID=.;OPOS=39619193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:10:23:17:16:10:23:17:16 chr17 39619219 . G A 370.03 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.00805424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.569;QD=19.7349;RBI=0.00844609;REFB=-0.014506;REVB=-0.00254276;RO=36;SAF=22;SAR=16;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801511;STB=0.549682;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0135663;OID=.;OPOS=39619219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:37:38:38:0.506667:16:22:24:12:16:22:25:12 chr17 39620399 . C T 525.49 PASS AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0333296;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.493;QD=23.6174;RBI=0.0474106;REFB=-0.0207958;REVB=0.033718;RO=40;SAF=27;SAR=22;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102958;STB=0.55655;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0174487;OID=.;OPOS=39620399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:40:40:49:49:0.550562:22:27:17:23:22:27:17:23 chr17 39622068 . G T 612.41 PASS AF=0.470149;AO=63;DP=135;FAO=63;FDP=134;FR=.;FRO=71;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=-0.0175537;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.5431;QD=18.2809;RBI=0.0200885;REFB=-0.00497647;REVB=-0.00976809;RO=69;SAF=40;SAR=23;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281459;STB=0.662109;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00542279;OID=.;OPOS=39622068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:69:71:63:63:0.470149:23:40:23:46:23:40:23:48 chr17 39622385 . A G 112.98 PASS AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.00306238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.964;QD=9.41457;RBI=0.00721594;REFB=0.00331439;REVB=0.00653388;RO=33;SAF=12;SAR=2;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191535;STB=0.612063;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.00718058;OID=.;OPOS=39622385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:33:34:14:14:0.291667:2:12:25:8:2:12:26:8 chr17 39623363 . T C 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0155968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.95;QD=17.4541;RBI=0.0230985;REFB=-0.0299517;REVB=0.0170376;RO=29;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170017;STB=0.595615;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0291956;OID=.;OPOS=39623363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:10:17:13:16:10:17:13:16 chr17 39624240 . G C 269.56 PASS AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.000953991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.732;QD=14.1875;RBI=0.02899;REFB=0.000550299;REVB=-0.0289743;RO=45;SAF=23;SAR=8;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19718;STB=0.612953;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.000947917;OID=.;OPOS=39624240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:8:23:26:19:8:23:26:19 chr17 39624326 . G C 335.46 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0157684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.288;QD=16.9851;RBI=0.0208331;REFB=-0.0134623;REVB=0.0136154;RO=43;SAF=23;SAR=13;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236999;STB=0.632953;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0147301;OID=.;OPOS=39624326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:13:23:17:26:13:23:17:26 chr17 39633317 . A G 109.18 PASS AF=0.448276;AO=11;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00397189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8761;QD=15.0591;RBI=0.00679041;REFB=-0.00761711;REVB=-0.00550761;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312947;STB=0.688862;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0146333;OID=.;OPOS=39633317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:14:16:11:13:0.448276:6:5:11:3:7:6:13:3 chr17 39633349 . G C 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.000994639;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.132;QD=12.9748;RBI=0.0228736;REFB=-0.000970975;REVB=-0.022852;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891716;STB=0.552241;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00143707;OID=.;OPOS=39633349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:5:7:12:6:5:7:12:6 chr17 39634625 . A G 275.43 PASS AF=0.54717;AO=27;DP=51;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.000248007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.293;QD=20.787;RBI=0.00713356;REFB=-0.0338575;REVB=-0.00712924;RO=24;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148059;STB=0.57518;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0261836;OID=.;OPOS=39634625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:24:24:27:29:0.54717:10:17:11:13:11:18:11:13 chr17 39637244 . A G 362.53 PASS AF=0.411765;AO=38;DP=98;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00533071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.705;QD=14.2168;RBI=0.0325721;REFB=-0.0343373;REVB=0.032133;RO=60;SAF=20;SAR=18;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283296;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0477172;OID=.;OPOS=39637244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:102:60:60:38:42:0.411765:18:20:30:30:21:21:30:30 chr17 39643646 . G A 150.09 PASS AF=0.34;AO=16;DP=49;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00760792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.035;QD=12.0072;RBI=0.0217942;REFB=-0.0180835;REVB=-0.0204232;RO=33;SAF=7;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12204;STB=0.549238;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0307764;OID=.;OPOS=39643646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:33:33:16:17:0.34:9:7:18:15:9:8:18:15 chr17 39646021 . A G 958.67 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.069278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.117;QD=57.2338;RBI=0.0718951;REFB=-0.109421;REVB=0.0192216;RO=1;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129446;STB=0.506847;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00209539;OID=.;OPOS=39646021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:36:30:0:1:36:30:0:1 chr17 39648609 . G A 287.59 PASS AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.00164483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.259;QD=13.5338;RBI=0.00717163;REFB=-0.0148387;REVB=-0.00698046;RO=52;SAF=21;SAR=12;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458268;STB=0.52618;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0190499;OID=.;OPOS=39648609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:52:52:33:33:0.388235:12:21:31:21:12:21:31:21 chr17 39659194 . T C 1018.14 PASS AF=1;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110834;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4216;QD=59.8909;RBI=0.0350956;REFB=0;REVB=0.0332996;RO=0;SAF=60;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.76879e-05;OID=.;OPOS=39659194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:70:68:0:0:68:68:1:8:60:0:0:8:60:0:0 chr17 39659913 . G A 1055.32 PASS AF=1;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793826;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.257;QD=60.3041;RBI=0.0208746;REFB=0;REVB=0.0193063;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255985;OID=.;OPOS=39659913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0 chr17 39661689 . G A 170.75 PASS AF=1;AO=9;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140745;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.578;QD=45.532;RBI=0.0507103;REFB=0;REVB=0.048718;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132301;OID=.;OPOS=39661689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:9:15:1:4:5:0:0:7:8:0:0 chr17 39670912 . G C 785.35 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0524319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4926;QD=64.1105;RBI=0.0530544;REFB=0;REVB=-0.00810355;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00079249;OID=.;OPOS=39670912;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:34:15:0:0:34:15:0:0 chr17 39674641 . T C 1563.81 PASS AF=0.972727;AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00462471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.41;QD=56.8659;RBI=0.0161215;REFB=-0.0955286;REVB=0.0154439;RO=3;SAF=53;SAR=54;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00838224;STB=0.504418;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=9.53452e-06;OID=.;OPOS=39674641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:110:110:3:3:107:107:0.972727:54:53:1:2:54:53:1:2 chr17 39681475 . A G 660.92 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00578017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.205;QD=61.4808;RBI=0.0211754;REFB=0;REVB=0.0203712;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107743;OID=.;OPOS=39681475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:27:15:0:0:28:15:0:0 chr17 39723990 . T A 48.21 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0697108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.162;QD=12.8563;RBI=0.0697162;REFB=-0.00891156;REVB=0.000870816;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280299;STB=0.666221;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0158982;OID=.;OPOS=39723990;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:2:6:3:4:2:6 chr17 39727816 . T G 169.09 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0713519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6864;QD=16.4963;RBI=0.0787161;REFB=-0.0341574;REVB=0.0332436;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512182;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0517829;OID=.;OPOS=39727816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:23:18:18:0.439024:9:9:11:11:9:9:12:11 chr17 39728050 . G A 239.43 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4004;QD=50.4057;RBI=0.0407558;REFB=0;REVB=0.0407558;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557994;OID=.;OPOS=39728050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:18:0:0:0:19:0:0:0 chr17 39742718 . A G 290.41 PASS AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00405934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.034;QD=14.1663;RBI=0.0105887;REFB=-0.0103899;REVB=0.00977965;RO=49;SAF=13;SAR=20;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993512;STB=0.556227;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0233432;OID=.;OPOS=39742718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:20:13:15:34:20:13:15:34 chr17 39742807 . C T 94.25 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0516389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.999;QD=10.4723;RBI=0.0538987;REFB=-0.00152348;REVB=0.0154432;RO=24;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077256;STB=0.546792;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00271876;OID=.;OPOS=39742807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:10:2:5:19:10:2:5:19 chr17 39742894 . G A 42.92 PASS AF=0.75;AO=5;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0412773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.486;QD=21.4609;RBI=0.0413836;REFB=-0.0149189;REVB=0.00296346;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.545299;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00814343;OID=.;OPOS=39742894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:5:6:0.75:3:2:1:1:4:2:1:1 chr17 39742898 . GC AT 51.28 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125246;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=2;MLLD=119.739;QD=29.3019;RBI=0.104659;REFB=-0.0280488;REVB=0.103907;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599655;STBP=0.252;TYPE=mnp;VARB=0.0112758;OID=.;OPOS=39742898;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:8:7:0:1:6:6:0.857143:4:2:0:0:4:2:1:0 chr17 39743081 . G A 70.49 PASS AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0102302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.291;QD=7.04894;RBI=0.0118906;REFB=-0.0140003;REVB=0.00606052;RO=30;SAF=2;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31976;STB=0.705428;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0366053;OID=.;OPOS=39743081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:8:2:13:17:8:2:13:17 chr17 39766504 . A G 139.3 PASS AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00474617;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.9417;QD=30.9546;RBI=0.098733;REFB=0.026464;REVB=-0.0986189;RO=3;SAF=4;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138172;STB=0.613864;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.018484;OID=.;OPOS=39766504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:18:18:3:4:14:14:0.777778:10:4:2:1:10:4:3:1 chr17 39766755 . T C 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00203038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.891;QD=18.0506;RBI=0.0296233;REFB=0.00558779;REVB=0.0295536;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172877;STB=0.5998;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00124098;OID=.;OPOS=39766755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:5:3:6:4:5:3 chr17 39767744 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.067;QD=51.1845;RBI=0.0134588;REFB=0;REVB=-0.0131989;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000179338;OID=.;OPOS=39767744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chr17 39786865 . G A 195.04 PASS AF=0.209677;AO=14;DP=62;FAO=13;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00863546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.974;QD=12.5833;RBI=0.0191609;REFB=-0.010734;REVB=0.0171046;RO=35;SAF=2;SAR=12;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.577583;STB=0.916534;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000500935;OID=.;OPOS=39786865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:62:62:35:37:14:13:0.209677:12:2:22:13:12:1:23:14 chr17 39871700 . G A 171.2 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=0.00801668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.233;QD=17.5592;RBI=0.0365712;REFB=-0.0265768;REVB=0.0356817;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304428;STB=0.670497;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.058459;OID=.;OPOS=39871700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:18:3:8:10:18:3 chr17 39874267 . T A 135.32 PASS AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0105298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.432;QD=8.32765;RBI=0.0119532;REFB=-0.00749455;REVB=-0.00565715;RO=45;SAF=8;SAR=11;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544112;STB=0.525508;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0217195;OID=.;OPOS=39874267;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:45:46:19:19:0.292308:11:8:21:24:11:8:21:25 chr17 39874283 . T A 144.25 PASS AF=0.298507;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0260252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3012;QD=8.61196;RBI=0.027514;REFB=0.0244892;REVB=-0.00892786;RO=47;SAF=8;SAR=12;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056508;STB=0.533708;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.0524336;OID=.;OPOS=39874283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:47:47:20:20:0.298507:12:8:21:26:12:8:21:26 chr17 39879729 . CAGA C,CAGC 52.27 PASS AF=0.25,0.0833333;AO=6,2;DP=24;FAO=6,2;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3,0;FSAR=3,2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0266648,-0.00139028;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=232.057,101.304;QD=8.71245;RBI=0.0553372,0.0398223;REFB=0.00466322,0.0083018;REVB=-0.0484891,-0.039798;RO=14;SAF=3,0;SAR=3,2;SRF=10;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.239465,-0.644719;STB=0.681292,0.996675;STBP=0.374,0.049;TYPE=del,snp;VARB=-0.000779252,-0.08074;OID=.,.;OPOS=39879730,39879732;OREF=AGA,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CAGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25,0.0833333:6,2:24:6,2:24:16:3,0:3,2:12:4:38:14:3,0:3,2:10:4 chr17 39880340 . A C 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.010958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.349;QD=9.44487;RBI=0.032059;REFB=-0.0135055;REVB=-0.0301281;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267756;STB=0.666111;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0230388;OID=.;OPOS=39880340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:4:6:2:4:4:6 chr17 39880545 . C T 364.97 PASS AF=0.697674;AO=30;DP=43;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0337148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.449;QD=33.951;RBI=0.0337173;REFB=-0.0248071;REVB=0.000410461;RO=13;SAF=7;SAR=23;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555575;STB=0.530377;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0132092;OID=.;OPOS=39880545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:13:13:30:30:0.697674:23:7:4:9:23:7:4:9 chr17 39880572 . CG CA,C 251.15 PASS AF=0.68,0.32;AO=17,5;DP=25;FAO=17,8;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1,1;FSAR=16,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265868,-0.0608603;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=169.7,20.2298;QD=40.1841;RBI=0.0294588,0.0997616;REFB=-0.083782,-0.104839;REVB=0.0126873,0.0790468;RO=3;SAF=1,1;SAR=16,4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0.338776;SSSB=0.0786008,0.23409;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.00286945,0.233354;OID=.,.;OPOS=39880573,39880573;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=CA,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.68,0.32:17,5:25:17,8:25:0:1,1:16,7:0:0:43:3:1,1:16,4:0:3 chr17 39881289 . G C 337.53 PASS AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0020784;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.072;QD=22.5019;RBI=0.0535189;REFB=-0.0353184;REVB=0.0534785;RO=26;SAF=16;SAR=18;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833507;STB=0.545961;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0384824;OID=.;OPOS=39881289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:18:16:15:11:18:16:15:11 chr17 39883350 . G A 227.0 PASS AF=0.442623;AO=26;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0156604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.288;QD=14.8854;RBI=0.0240698;REFB=-0.0085551;REVB=0.0182787;RO=32;SAF=8;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169743;STB=0.589674;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00675756;OID=.;OPOS=39883350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:34:26:27:0.442623:18:8:15:17:19:8:15:19 chr17 39883559 . G A 66.8 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0338364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.251;QD=12.7244;RBI=0.0640507;REFB=-0.00938041;REVB=-0.0543838;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243311;STB=0.644834;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00986785;OID=.;OPOS=39883559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:5:7:3:6:5:7 chr17 39883595 . T C 118.08 PASS AF=0.4375;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0144769;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.516;QD=14.7598;RBI=0.0152741;REFB=0.0022329;REVB=0.00486981;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142857;STB=0.613472;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.000894284;OID=.;OPOS=39883595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:17:18:13:14:0.4375:5:8:8:9:5:9:8:10 chr17 39883672 . G A 247.09 PASS AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0128884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.001;QD=24.7086;RBI=0.0210019;REFB=-0.0323943;REVB=0.0165822;RO=17;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838134;STB=0.546597;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0229274;OID=.;OPOS=39883672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:12:11:10:7:12:11:10:7 chr17 39884091 . G C 670.27 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=320.106;QD=62.3509;RBI=0.0154565;REFB=0;REVB=0.0139949;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01514e-05;OID=.;OPOS=39884091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:27:16:0:0 chr17 39884583 . G A 582.51 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0469769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3717;QD=58.2505;RBI=0.112892;REFB=-0.117294;REVB=0.102653;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509429;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00658146;OID=.;OPOS=39884583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:26:13:0:0:26:13:0:1 chr17 39890715 . A T 960.15 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385012;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.416;QD=59.0864;RBI=0.0477902;REFB=0;REVB=0.0283117;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120346;OID=.;OPOS=39890715;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0 chr17 39959189 . C G 566.29 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00783282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.372;QD=59.609;RBI=0.0230434;REFB=0;REVB=0.0216713;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05883e-05;OID=.;OPOS=39959189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:21:15:0:0:21:17:0:0 chr17 39967442 . T C 84.79 PASS AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.023891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.992;QD=10.9409;RBI=0.0248281;REFB=0.0112324;REVB=0.00675656;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493524;STB=0.502953;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0219012;OID=.;OPOS=39967442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:6:5:9:11:6:5:9:11 chr17 39983808 . G C 1030.1 PASS AF=0.985915;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0175004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9083;QD=58.0338;RBI=0.0319551;REFB=-0.0689927;REVB=-0.026737;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141097;STB=0.507461;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.000608267;OID=.;OPOS=39983808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:69:70:0.985915:33:36:0:1:33:37:0:1 chr17 39983820 . G A 941.44 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352511;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.857;QD=58.8401;RBI=0.0382341;REFB=0;REVB=0.0148055;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376892;OID=.;OPOS=39983820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0 chr17 39983849 . G C 689.1 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5031;QD=62.6457;RBI=0.0762966;REFB=0;REVB=0.039177;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151878;OID=.;OPOS=39983849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr17 39987130 . T C 1098.69 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4933;QD=60.2023;RBI=0.0342428;REFB=0;REVB=0.0252649;RO=0;SAF=22;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76821e-05;OID=.;OPOS=39987130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:50:22:0:0:50:23:0:0 chr17 39991867 . A ATATC 905.39 PASS AF=1;AO=61;DP=69;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435675;FXX=0.0461467;HRUN=0;LEN=4;MLLD=317.632;QD=58.4125;RBI=0.00573016;REFB=0;REVB=0.00372202;RO=4;SAF=32;SAR=29;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554299;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.13221e-05;OID=.;OPOS=39991868;OREF=-;OALT=TATC;OMAPALT=ATATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:61:69:62:62:0:33:29:0:0:5:4:32:29:4:0 chr17 39998141 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.665;QD=62.0219;RBI=0.0164901;REFB=0;REVB=0.0111207;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08309e-05;OID=.;OPOS=39998141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:29:13:0:0:29:13:0:0 chr17 40010979 . G A 706.62 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00108656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.839;QD=62.8104;RBI=0.00713959;REFB=0;REVB=0.00705643;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10494e-05;OID=.;OPOS=40010979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0 chr17 40028068 . AC A,GC 33.78 PASS AF=0.25,0.1;AO=3,2;DP=20;FAO=5,2;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1,2;FSAR=4,0;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00762777,-0.041063;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=16.4168,67.5331;QD=6.75506;RBI=0.141586,0.0646562;REFB=-0.03763,-0.0114933;REVB=-0.141381,-0.0499424;RO=13;SAF=0,2;SAR=3,0;SRF=3;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.556789,0.67888;STB=0.533195,0.996673;STBP=0.991,0.041;TYPE=del,snp;VARB=0.0658293,0.111765;OID=.,.;OPOS=40028069,40028068;OREF=C,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:20:20:13:13:3,2:5,2:0.25,0.1:3,0:0,2:3:10:4,0:1,2:3:10 chr17 40048613 . A G 1164.3 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.767;QD=60.4832;RBI=0.0238436;REFB=0;REVB=0.0211504;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55063e-05;OID=.;OPOS=40048613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:47:29:0:0:48:29:0:0 chr17 40125864 . G A 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0346684;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.573;QD=14.6546;RBI=0.0376546;REFB=-0.00976058;REVB=-0.0146959;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246937;STB=0.624707;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0115577;OID=.;OPOS=40125864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:6:8:8:8:0.5:4:4:1:5:4:4:2:6 chr17 40126133 . G A 444.75 PASS AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.020828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.523;QD=16.4722;RBI=0.0349697;REFB=-0.0174114;REVB=-0.0280904;RO=59;SAF=25;SAR=24;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814894;STB=0.545436;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0224286;OID=.;OPOS=40126133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:24:25:35:24:24:25:35:24 chr17 40126187 . G A 434.94 PASS AF=0.429825;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.0367035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.578;QD=15.2612;RBI=0.0385915;REFB=-0.0259013;REVB=0.011923;RO=65;SAF=22;SAR=27;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754083;STB=0.542307;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0316061;OID=.;OPOS=40126187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:65:65:49:49:0.429825:27:22:34:31:27:22:34:31 chr17 40146970 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00990385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.014;QD=47.8222;RBI=0.0352175;REFB=0;REVB=-0.0337962;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000462171;OID=.;OPOS=40146970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chr17 40173851 . A C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.755;QD=55.6557;RBI=0.0457901;REFB=0;REVB=0.044258;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108981;OID=.;OPOS=40173851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0 chr17 40322252 . T C 753.78 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.09;QD=56.8893;RBI=0.0542228;REFB=0;REVB=-0.0495943;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00029088;OID=.;OPOS=40322252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr17 40475056 . G A 238.27 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0199893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3282;QD=16.1538;RBI=0.0201958;REFB=-0.00605023;REVB=0.00288074;RO=31;SAF=13;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938681;STB=0.560656;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00510184;OID=.;OPOS=40475056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:32:27:27:0.457627:14:13:18:13:14:13:19:13 chr17 40689455 . T C 841.8 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0585718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6103;QD=57.0713;RBI=0.0597592;REFB=0;REVB=0.0118535;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131702;OID=.;OPOS=40689455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:24:34:0:0:24:35:0:0 chr17 40696233 . C G 379.33 PASS AF=0.878788;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0574285;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.8404;QD=45.9798;RBI=0.0725467;REFB=-0.0841045;REVB=0.0443282;RO=3;SAF=9;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13229;STB=0.590844;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0207844;OID=.;OPOS=40696233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:33:33:3:4:29:29:0.878788:20:9:3:0:20:9:4:0 chr17 40699291 . G A 551.82 PASS AF=1;AO=33;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.15;QD=59.6564;RBI=0.152088;REFB=0;REVB=0.151678;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253324;OID=.;OPOS=40699291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:33:37:1:11:22:0:0:13:24:0:0 chr17 40699332 . T C 661.85 PASS AF=0.977273;AO=44;DP=45;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00140261;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.333;QD=60.168;RBI=0.00820367;REFB=0.00598011;REVB=0.00808287;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000202722;OID=.;OPOS=40699332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:44:0:1:44:43:0.977273:18:26:0:0:18:25:1:0 chr17 40705100 . C T 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.465;QD=60.6102;RBI=0.0491119;REFB=0;REVB=0.0356346;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258097;OID=.;OPOS=40705100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr17 40706906 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.649;QD=47.8223;RBI=0.0584827;REFB=0;REVB=0.0425799;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000545761;OID=.;OPOS=40706906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0 chr17 40714804 . C A 375.42 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0581527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8708;QD=55.6179;RBI=0.0913928;REFB=0;REVB=0.0705047;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297931;OID=.;OPOS=40714804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:19:8:0:0:19:8:0:0 chr17 40716520 . A G 1062.44 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.31;QD=59.8559;RBI=0.0390237;REFB=0;REVB=0.00171527;RO=0;SAF=20;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108611;OID=.;OPOS=40716520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:51:20:0:0:51:20:0:0 chr17 40722029 . A G 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00652738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.257;QD=63.8719;RBI=0.0111175;REFB=0;REVB=0.00899955;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36193e-06;OID=.;OPOS=40722029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0 chr17 40725379 . A T 309.64 PASS AF=0.515625;AO=31;DP=62;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.029347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5039;QD=19.3525;RBI=0.029347;REFB=-0.0229032;REVB=1.06495e-05;RO=31;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.024578;OID=.;OPOS=40725379;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:31:31:31:33:0.515625:16:15:15:16:16:17:15:16 chr17 40731597 . T A 1325.94 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00979253;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.33;QD=62.3974;RBI=0.0200129;REFB=0;REVB=-0.0174534;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413916;OID=.;OPOS=40731597;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:56:29:0:0:56:29:0:0 chr17 40765986 . C T 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.0312203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.83;QD=18.4834;RBI=0.0312206;REFB=-0.00570164;REVB=0.000140615;RO=20;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350127;STB=0.667548;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00457894;OID=.;OPOS=40765986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:21:19:19:0.475:12:7:1:19:12:7:2:19 chr17 40766546 . C G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.74;QD=43.4862;RBI=0.0428206;REFB=0;REVB=0.0373739;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281086;OID=.;OPOS=40766546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr17 40811919 . A G 246.52 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00405927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9991;QD=46.9552;RBI=0.0530298;REFB=-0.0705289;REVB=-0.0528743;RO=1;SAF=14;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317962;STB=0.517224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0204831;OID=.;OPOS=40811919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:6:14:1:0:6:14:1:0 chr17 40818450 . C CA 221.49 PASS AF=1;AO=3;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100969;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=73.3032;QD=44.2969;RBI=0.130164;REFB=0;REVB=0.0821462;RO=17;SAF=0;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.580631;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0020544;OID=.;OPOS=40818451;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:20:20:20:0:7:13:0:0:4:17:0:3:7:10 chr17 40818451 . G A,C 214.0 PASS AF=0.85,0.1;AO=17,2;DP=20;FAO=17,2;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=7,0;FSAR=10,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0248205,-0.100299;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=92.785,11.2401;QD=42.799;RBI=0.0479106,0.105042;REFB=-0.181115,-0.136443;REVB=0.0409801,-0.031211;RO=1;SAF=7,0;SAR=10,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0436347,0;STB=0.523782,0.5;STBP=0.522,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00256153,0.210826;OID=.,.;OPOS=40818451,40818451;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:20:20:1:1:17,2:17,2:0.85,0.1:10,2:7,0:0:1:10,2:7,0:0:1 chr17 40818699 . A G 885.37 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.851;QD=58.0573;RBI=0.0284248;REFB=0;REVB=-0.0246227;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09002e-05;OID=.;OPOS=40818699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:40:21:0:0:40:21:0:0 chr17 40835922 . A C 2784.01 PASS AF=1;AO=177;DP=177;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00473203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8893;QD=62.562;RBI=0.0319269;REFB=0;REVB=-0.0315742;RO=0;SAF=80;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.6568e-05;OID=.;OPOS=40835922;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:177:178:0:0:177:178:1:97:80:0:0:97:81:0:0 chr17 40854534 . G GT 597.06 PASS AF=1;AO=41;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394051;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.9674;QD=45.9273;RBI=0.123341;REFB=0;REVB=0.116877;RO=12;SAF=16;SAR=25;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101264;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00405588;OID=.;OPOS=40854535;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:41:53:52:52:0:18:34:0:0:11:12:16:25:2:10 chr17 40926695 . A T 1786.62 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.434;QD=60.5635;RBI=0.0586092;REFB=0;REVB=0.0560791;RO=0;SAF=60;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.75567e-05;OID=.;OPOS=40926695;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:118:0:0:114:118:1:54:60:0:0:56:62:0:0 chr17 40947916 . GCCCCCA GCCCC,GCCCCA 170.84 PASS AF=0,1;AO=2,14;DP=19;FAO=0,19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.160757,-0.00536391;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=8.41921,13.0082;QD=35.9653;RBI=0.164726,0.0891407;REFB=0,0;REVB=-0.0359396,0.0889791;RO=1;SAF=1,2;SAR=1,12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.25849,0.0364168;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.008122;OID=.,.;OPOS=40947921,40947917;OREF=CA,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCC,GCCCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:2,14:19:0,19:19:0:0,4:0,15:0:0:3:1:1,2:1,12:0:1 chr17 40996751 . C T 153.47 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0361038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0716;QD=13.9517;RBI=0.0389813;REFB=0.0149676;REVB=-0.014699;RO=26;SAF=4;SAR=13;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408974;STB=0.747647;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00931281;OID=.;OPOS=40996751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:27:17:17:0.386364:13:4:16:10:13:4:17:10 chr17 41116234 . G A 740.4 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8033;QD=56.9536;RBI=0.0296751;REFB=0;REVB=-0.0247735;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000511648;OID=.;OPOS=41116234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0 chr17 41121208 . GGGC G,GG,GGGG 516.11 PASS AF=0.888889,0.0833333,0.0277778;AO=12,16,6;DP=35;FAO=32,3,1;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7,2,0;FSAR=25,1,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309624,-0.0393274,-0.0487343;FXX=0;HRUN=5,5,1;LEN=3,2,1;MLLD=233.517,231.135,219.157;QD=57.345;RBI=0.044813,0.0457026,0.0497726;REFB=0,0,0;REVB=0.0323965,0.0232828,0.0101136;RO=0;SAF=0,4,4;SAR=12,12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.07465e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0126879,0.00113892,-0.0065927;OID=.,.,.;OPOS=41121209,41121210,41121211;OREF=GGC,GC,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.888889,0.0833333,0.0277778:12,16,6:35:32,3,1:36:0:7,2,0:25,1,1:0:0:9:0:0,4,4:12,12,2:0:0 chr17 41121217 . G A 273.36 PASS AF=0.685714;AO=24;DP=35;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00590576;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=225.264;QD=31.2415;RBI=0.00761201;REFB=-0.00280237;REVB=0.00480258;RO=11;SAF=2;SAR=22;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518137;STB=0.791687;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000133886;OID=.;OPOS=41121217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:35:35:11:11:24:24:0.685714:22:2:7:4:22:2:7:4 chr17 41121218 . GA AG 43.39 PASS AF=0.205882;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=-0.00272123;FXX=0.0285633;HRUN=7;LEN=2;MLLD=92.4035;QD=5.10438;RBI=0.00492768;REFB=0.00492457;REVB=0.00410816;RO=27;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.615514;STB=0.873433;STBP=0.113;TYPE=mnp;VARB=-0.0039702;OID=.;OPOS=41121218;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:35:34:27:27:7:7:0.205882:2:5:4:23:2:5:4:23 chr17 41133071 . T C 212.45 PASS AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189046;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.124;QD=49.9876;RBI=0.042862;REFB=0;REVB=0.0384678;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000593798;OID=.;OPOS=41133071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr17 41165493 . A G 763.05 PASS AF=1;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.314;QD=63.5879;RBI=0.0360167;REFB=0;REVB=0.0186301;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473314;OID=.;OPOS=41165493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:46:48:1:17:29:0:0:19:29:0:0 chr17 41165878 . C T 473.44 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027964;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5073;QD=59.1796;RBI=0.0524926;REFB=0;REVB=0.0444239;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00182037;OID=.;OPOS=41165878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr17 41174025 . A C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.759;QD=33.4284;RBI=0.0503345;REFB=0;REVB=0.0134087;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00160159;OID=.;OPOS=41174025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr17 41196408 . G A 554.26 PASS AF=0.909091;AO=38;DP=43;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0147017;FXX=0.0434688;HRUN=7;LEN=1;MLLD=114.491;QD=50.3874;RBI=0.0367429;REFB=-0.208309;REVB=0.0336735;RO=5;SAF=21;SAR=17;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333416;STB=0.504585;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00768609;OID=.;OPOS=41196408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:43:44:5:4:38:40:0.909091:17:21:2:3:18:22:2:2 chr17 41223094 . T C 1098.43 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.212;QD=60.188;RBI=0.0409538;REFB=0;REVB=0.0224328;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09368e-05;OID=.;OPOS=41223094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:44:28:0:0:44:29:0:0 chr17 41234470 . A G 1135.03 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2445;QD=60.535;RBI=0.0236623;REFB=0;REVB=0.0154224;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180336;OID=.;OPOS=41234470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:37:38:0:0:37:38:0:0 chr17 41244000 . T C 699.0 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0178326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.716;QD=54.8238;RBI=0.0409149;REFB=-0.0769023;REVB=0.0368243;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192104;STB=0.5102;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000343974;OID=.;OPOS=41244000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:26:24:1:0:26:24:1:0 chr17 41244435 . T C 638.43 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1926;QD=59.3886;RBI=0.0517825;REFB=0.019413;REVB=0.0161302;RO=1;SAF=13;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347354;STB=0.51851;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.00221522;OID=.;OPOS=41244435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:29:13:1:0:29:13:1:0 chr17 41244936 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.069;QD=58.5877;RBI=0.03822;REFB=0;REVB=0.00782661;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.1558e-05;OID=.;OPOS=41244936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr17 41245237 . A G 786.88 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00297225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5311;QD=55.2196;RBI=0.0330732;REFB=-0.0528845;REVB=0.0329394;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154585;STB=0.508194;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00316724;OID=.;OPOS=41245237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:30:26:0:1:30:26:0:1 chr17 41245466 . G A 1167.12 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.582;QD=60.6294;RBI=0.0522436;REFB=0;REVB=-0.0521745;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00043786;OID=.;OPOS=41245466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:34:42:0:0:34:43:0:0 chr17 41277187 . G C 74.58 PASS AF=1;AO=5;DP=6;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.922;QD=37.2924;RBI=0.113585;REFB=0;REVB=0.0399065;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000618572;OID=.;OPOS=41277187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:8:0:0:5:8:1:4:1:0:0:6:2:0:0 chr17 41291953 . C G 656.14 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029237;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7811;QD=62.4897;RBI=0.0318016;REFB=0;REVB=0.0125115;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000913399;OID=.;OPOS=41291953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr17 41330024 . T C 937.6 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9806;QD=58.6;RBI=0.0419328;REFB=0;REVB=0.0361548;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387132;OID=.;OPOS=41330024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:28:35:0:0:29:35:0:0 chr17 41331460 . G A 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.99;QD=54.5165;RBI=0.0170219;REFB=0;REVB=-0.00651092;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16582e-05;OID=.;OPOS=41331460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0 chr17 41332804 . T C 184.46 PASS AF=0.809524;AO=18;DP=20;FAO=17;FDP=21;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.110489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8669;QD=35.1355;RBI=0.11049;REFB=0.0647432;REVB=-0.000527298;RO=1;SAF=6;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704612;STB=0.596155;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.0144308;OID=.;OPOS=41332804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:20:21:1:4:18:17:0.809524:12:6:1:0:12:5:3:1 chr17 41361960 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.594;QD=62.022;RBI=0.0157124;REFB=0;REVB=0.0110656;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50486e-05;OID=.;OPOS=41361960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0 chr17 41362272 . C G 830.14 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0198256;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.849;QD=56.2804;RBI=0.0203613;REFB=-0.0744323;REVB=0.00463986;RO=1;SAF=18;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254817;STB=0.513509;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000873676;OID=.;OPOS=41362272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:59:1:1:58:58:0.983051:40:18:1:0:40:18:1:0 chr17 41445410 . A T 383.27 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227107;FXX=0.0689417;HRUN=7;LEN=1;MLLD=278.746;QD=56.7806;RBI=0.0233937;REFB=0;REVB=0.00561159;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11612e-05;OID=.;OPOS=41445410;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:27:0:0:29:27:1:20:9:0:0:20:7:0:0 chr17 41454935 . T C 575.74 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.895;QD=60.6045;RBI=0.0475128;REFB=0;REVB=0.0251991;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.37912e-05;OID=.;OPOS=41454935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0 chr17 41522213 . T A 242.14 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00119497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7069;QD=14.9008;RBI=0.028262;REFB=-0.00869896;REVB=0.0282367;RO=37;SAF=19;SAR=9;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636657;STB=0.53617;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0120027;OID=.;OPOS=41522213;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:9:19:23:14:9:19:23:14 chr17 41603882 . T C 286.45 PASS AF=0.525424;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0164584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.761;QD=19.4205;RBI=0.0164585;REFB=-0.0145671;REVB=-4.43902e-05;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218367;STB=0.626249;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0149493;OID=.;OPOS=41603882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:28:28:30:31:0.525424:9:21:13:15:9:22:13:15 chr17 41610114 . C T 206.38 PASS AF=0.428571;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00589174;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.268;QD=16.847;RBI=0.00994889;REFB=-0.0269866;REVB=0.00801672;RO=26;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106976;STB=0.581318;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.060304;OID=.;OPOS=41610114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:49:26:28:21:21:0.428571:12:9:14:12:12:9:16:12 chr17 41843979 . C G 1198.45 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282386;FXX=0.0249969;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8272;QD=61.4589;RBI=0.0489443;REFB=0;REVB=-0.0399765;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118966;OID=.;OPOS=41843979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0 chr17 41846508 . A G 831.81 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.107;QD=57.3663;RBI=0.0913738;REFB=0;REVB=0.090528;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164116;OID=.;OPOS=41846508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:26:30:0:0:28:30:0:0 chr17 41907079 . C T 208.57 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0212718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3588;QD=18.1367;RBI=0.0345364;REFB=-0.0165994;REVB=-0.0272079;RO=25;SAF=13;SAR=8;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172714;STB=0.598232;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0182629;OID=.;OPOS=41907079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:8:13:11:14:8:13:11:14 chr17 41959808 . T C 3765.71 PASS AF=0.991701;AO=238;DP=241;FAO=239;FDP=241;FR=.;FRO=2;FSAF=97;FSAR=142;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00476387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.481;QD=62.5015;RBI=0.0131584;REFB=-0.0822269;REVB=-0.0122658;RO=2;SAF=96;SAR=142;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00982421;STB=0.505102;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.000567361;OID=.;OPOS=41959808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:241:241:2:2:238:239:0.991701:142:96:2:0:142:97:2:0 chr17 41960343 . T C 276.91 PASS AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00371868;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.316;QD=52.7449;RBI=0.0390573;REFB=0;REVB=0.0388798;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145166;OID=.;OPOS=41960343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr17 41960633 . CG GC 1959.45 PASS AF=1;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237036;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=2;MLLD=209.551;QD=62.2047;RBI=0.0266825;REFB=0;REVB=0.0122514;RO=0;SAF=65;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.88412e-05;OID=.;OPOS=41960633;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:126:0:0:126:126:1:61:65:0:0:61:65:0:0 chr17 41961451 . T C 520.25 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000311448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.011;QD=59.4573;RBI=0.025081;REFB=0;REVB=0.025079;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53512e-05;OID=.;OPOS=41961451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:13:20:0:0:15:20:0:0 chr17 41994794 . C T 740.39 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.801;QD=56.9531;RBI=0.0426226;REFB=0;REVB=0.0316128;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220395;OID=.;OPOS=41994794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0 chr17 42030531 . G C 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00636327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.946;QD=15.3789;RBI=0.0444384;REFB=-0.0235736;REVB=-0.0439804;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113119;STB=0.506568;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.032175;OID=.;OPOS=42030531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:7:5:6:8:7:5:6:8 chr17 42030743 . G C 875.74 PASS AF=0.96875;AO=60;DP=62;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0437392;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.2369;QD=54.7336;RBI=0.10141;REFB=-0.104743;REVB=0.0914924;RO=2;SAF=35;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262048;STB=0.513884;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00367396;OID=.;OPOS=42030743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:62:64:2:2:60:62:0.96875:25:35:2:0:27:35:2:0 chr17 42085972 . C T 176.26 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0818536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7184;QD=20.7361;RBI=0.120648;REFB=-0.0110743;REVB=0.0886337;RO=15;SAF=12;SAR=6;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366958;STB=0.716752;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0153765;OID=.;OPOS=42085972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:6:12:3:12:6:12:3:13 chr17 42152103 . G A 205.15 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0273912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.636;QD=15.7804;RBI=0.0274031;REFB=-0.0046153;REVB=-0.000804212;RO=29;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167204;STB=0.594516;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00558177;OID=.;OPOS=42152103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:12:11:9:20:12:11:9:20 chr17 42154470 . A G 103.51 PASS AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.00866576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.543;QD=18.8207;RBI=0.0104912;REFB=-0.0328537;REVB=-0.00591356;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240072;STB=0.636153;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0329617;OID=.;OPOS=42154470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:6:6:2:8:6:6:2:8 chr17 42155403 . CGGGGG CGGGGA,CGGGG 357.98 PASS AF=0.568182,0.409091;AO=21,10;DP=47;FAO=25,18;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=13,10;FSAR=12,8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00170986,0.0277492;FXX=0.0638162;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=212.384,5.95035;QD=32.5434;RBI=0.026703,0.214023;REFB=-0.0877788,-0.315681;REVB=-0.0266482,-0.212216;RO=3;SAF=10,6;SAR=11,4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0.611111;SSEP=0,0.408163;SSSB=-0.119932,-0.178335;STB=0.518504,0.523783;STBP=0.502,0.517;TYPE=snp,del;VARB=0.0364379,-0.0655066;OID=.,.;OPOS=42155408,42155404;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=CGGGGA,CGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.568182,0.409091:21,10:47:25,18:44:1:13,10:12,8:1:0:99:3:10,6:11,4:3:0 chr17 42164885 . G C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2462;QD=47.8216;RBI=0.046664;REFB=0;REVB=-0.0101098;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144107;OID=.;OPOS=42164885;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:15:1:0:0:15:1:0:0 chr17 42213347 . G A 472.47 PASS AF=0.671875;AO=43;DP=64;FAO=43;FDP=64;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00540383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.691;QD=29.5293;RBI=0.00582451;REFB=-0.0342818;REVB=-0.00217336;RO=21;SAF=14;SAR=29;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1585;STB=0.586273;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0207956;OID=.;OPOS=42213347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:21:21:43:43:0.671875:29:14:12:9:29:14:12:9 chr17 42225547 . A C 147.91 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0491644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.29;QD=25.7241;RBI=0.0812426;REFB=-0.0169078;REVB=0.0646778;RO=8;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508496;STB=0.785323;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000614058;OID=.;OPOS=42225547;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:23:23:8:8:15:15:0.652174:12:3:8:0:12:3:8:0 chr17 42248346 . A T 375.53 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9707;QD=55.6341;RBI=0.0500572;REFB=0;REVB=-0.0356068;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00165972;OID=.;OPOS=42248346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr17 42249670 . C T 335.82 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0323935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.5;QD=14.6009;RBI=0.0323972;REFB=0.000407887;REVB=-0.000484663;RO=54;SAF=12;SAR=25;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192912;STB=0.615699;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.000385517;OID=.;OPOS=42249670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:55:37:37:0.402174:25:12:27:27:25:12:28:27 chr17 42254527 . T G 100.2 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.000952185;FXX=0.105235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.973;QD=11.7883;RBI=0.0185212;REFB=-0.00217007;REVB=-0.0184968;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339383;STB=0.705597;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00678327;OID=.;OPOS=42254527;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:34:21:22:12:12:0.352941:6:6:17:4:6:6:18:4 chr17 42255097 . T C 113.4 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0332111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.431;QD=9.65116;RBI=0.0350225;REFB=-0.00906172;REVB=-0.0111173;RO=33;SAF=3;SAR=11;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177052;STB=0.608527;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0217021;OID=.;OPOS=42255097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:11:3:11:22:11:3:11:22 chr17 42266880 . G A 113.78 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.130294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0914;QD=18.2046;RBI=0.130385;REFB=-0.00464052;REVB=-0.00488788;RO=12;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379419;STB=0.521706;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0015774;OID=.;OPOS=42266880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:7:6:5:7:7:6:5:7 chr17 42270291 . A G 258.62 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00620467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.491;QD=16.4202;RBI=0.0323574;REFB=-6.62068e-05;REVB=0.031757;RO=34;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165292;STB=0.509304;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000251004;OID=.;OPOS=42270291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:15:14:17:17:15:14:17:17 chr17 42287519 . C T 254.21 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00296558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6528;QD=15.4065;RBI=0.0733754;REFB=-0.030238;REVB=-0.0733154;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941007;STB=0.546605;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0376878;OID=.;OPOS=42287519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:37:29:29:0.439394:11:18:19:17:11:18:20:17 chr17 42392622 . T C 1571.5 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.39;QD=59.8667;RBI=0.0305438;REFB=0;REVB=0.0296018;RO=0;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82417e-05;OID=.;OPOS=42392622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:50:55:0:0:50:55:0:0 chr17 42398052 . A G 109.05 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0211141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.841;QD=36.3484;RBI=0.0211424;REFB=-0.0140639;REVB=0.00109307;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815441;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00172031;OID=.;OPOS=42398052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:5:6:0:1:5:6:0:1 chr17 42398757 . C A 347.89 PASS AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000867089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.969;QD=51.539;RBI=0.0441513;REFB=0;REVB=0.0441428;RO=1;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370998;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470856;OID=.;OPOS=42398757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:1:0:25:27:1:12:13:0:1:13:14:0:0 chr17 42427630 . T C 169.16 PASS AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00552964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9056;QD=12.083;RBI=0.0218524;REFB=-0.00156017;REVB=-0.0211412;RO=35;SAF=13;SAR=8;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848775;STB=0.549248;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00155931;OID=.;OPOS=42427630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:8:13:19:16:8:13:19:16 chr17 42433359 . AC A 37.54 PASS AF=0.411765;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.143322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.5027;QD=8.8339;RBI=0.201765;REFB=-0.0138658;REVB=0.142013;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474505;STB=0.780525;STBP=0.089;TYPE=del;VARB=0.0260895;OID=.;OPOS=42433360;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.411765:6:17:7:17:10:5:2:2:8:37:8:4:2:1:7 chr17 42449789 . G A 483.33 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.785;QD=58.5852;RBI=0.00543857;REFB=0;REVB=-0.00487507;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09288e-06;OID=.;OPOS=42449789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr17 42453065 . A C 367.56 PASS AF=1;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223164;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.231;QD=56.5481;RBI=0.0321805;REFB=0;REVB=0.0231854;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295297;OID=.;OPOS=42453065;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:26:0:0:26:26:1:4:22:0:0:4:22:0:0 chr17 42454463 . G C 899.95 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2425;QD=56.2469;RBI=0.0971491;REFB=0;REVB=0.0968118;RO=2;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235969;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115204;OID=.;OPOS=42454463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:2:0:62:64:1:39:23:0:2:41:23:0:0 chr17 42745385 . A G 259.15 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00570691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4979;QD=24.1065;RBI=0.0250412;REFB=0.00960619;REVB=0.0243823;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177809;STB=0.598768;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.0069036;OID=.;OPOS=42745385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:11:13:6:13:11:13:6:13 chr17 42786213 . G C 228.34 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0130996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.966;QD=21.7465;RBI=0.0131644;REFB=-0.016913;REVB=-0.00130502;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243248;STB=0.63605;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0201309;OID=.;OPOS=42786213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:9:13:6:14:9:13:6:14 chr17 42851729 . C T 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.602;QD=47.8207;RBI=0.0648237;REFB=0;REVB=0.00404865;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394005;OID=.;OPOS=42851729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr17 42852604 . G T 769.49 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5092;QD=56.9992;RBI=0.0208855;REFB=0;REVB=-0.0113848;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000271868;OID=.;OPOS=42852604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0 chr17 42852610 . T C 698.94 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00158001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.28;QD=54.8189;RBI=0.0226852;REFB=-0.0159169;REVB=-0.0226301;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.511623;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=5.85203e-05;OID=.;OPOS=42852610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:21:29:0:0:21:29:0:1 chr17 42854610 . T C,G 728.28 PASS AF=0.961538,0.0384615;AO=50,2;DP=52;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24,1;FSAR=26,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106957,-0.037773;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=62.7807,17.5473;QD=56.0215;RBI=0.0268845,0.0829329;REFB=0,0;REVB=0.0246653,-0.0738313;RO=0;SAF=24,1;SAR=26,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.10374e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000339794,0.179237;OID=.,.;OPOS=42854610,42854610;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:52:52:0:0:50,2:50,2:0.961538,0.0384615:26,1:24,1:0:0:26,1:24,1:0:0 chr17 42855554 . T C 642.4 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00410148;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.139;QD=59.7579;RBI=0.0524004;REFB=-0.0868855;REVB=0.0522397;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00130448;OID=.;OPOS=42855554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:43:0:1:42:42:0.976744:17:25:0:0:17:25:1:0 chr17 42857430 . G A 1002.32 PASS AF=1;AO=68;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125523;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5648;QD=55.6846;RBI=0.0704456;REFB=-0.0897444;REVB=0.0693183;RO=1;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011966;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00199147;OID=.;OPOS=42857430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:72:1:0:68:72:1:39:29:0:1:42:30:0:0 chr17 42857517 . C T 726.41 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.049086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.735;QD=52.8301;RBI=0.0522657;REFB=-0.0243896;REVB=0.0179519;RO=2;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303767;STB=0.516123;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000497433;OID=.;OPOS=42857517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:30:23:0:2:30:23:0:2 chr17 42880753 . C T 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0103717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5392;QD=12.7299;RBI=0.0444685;REFB=0.0169587;REVB=-0.0432421;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211189;STB=0.624732;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.0263864;OID=.;OPOS=42880753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:8:4:5:4:8:4 chr17 42925559 . C T 92.58 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00599415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.987;QD=9.25821;RBI=0.013217;REFB=-0.0102523;REVB=-0.0117796;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239462;STB=0.630935;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.019722;OID=.;OPOS=42925559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:27:28:12:12:0.3:7:5:17:10:7:5:17:11 chr17 42961009 . C T 183.89 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0105111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.098;QD=17.9408;RBI=0.0111926;REFB=-0.00199805;REVB=-0.00384589;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117542;STB=0.566939;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00180824;OID=.;OPOS=42961009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:11:8:12:10:11:8:12:10 chr17 42979670 . C A 125.72 PASS AF=0.307692;AO=15;DP=51;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00661084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.121;QD=9.67077;RBI=0.00997571;REFB=-0.000351986;REVB=0.00747071;RO=36;SAF=11;SAR=4;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228698;STB=0.65197;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00094958;OID=.;OPOS=42979670;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:36:36:15:16:0.307692:4:11:20:16:4:12:20:16 chr17 42981239 . G GAGT,T 294.81 PASS AF=0.433333,0.1;AO=23,6;DP=73;FAO=26,6;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=19,0;FSAR=7,6;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0117634,0.0283442;FXX=0.0322529;HRUN=0,5;LEN=3,1;MLLD=242.775,81.7899;QD=19.6542;RBI=0.0126964,0.0305113;REFB=-0.0157192,0.00770622;REVB=0.00477732,-0.0112937;RO=40;SAF=16,0;SAR=7,6;SRF=28;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00563921,-0.726516;STB=0.554939,0.998433;STBP=0.469,0;TYPE=ins,snp;VARB=0.0232803,-0.0199512;OID=.,.;OPOS=42981240,42981239;OREF=-,G;OALT=AGT,T;OMAPALT=GAGT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:60:40:28:23,6:26,6:0.433333,0.1:7,6:16,0:28:12:7,6:19,0:18:10 chr17 42981499 . C T 83.43 PASS AF=0.44;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.017379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.482;QD=13.349;RBI=0.0260604;REFB=-0.00181684;REVB=-0.0194194;RO=14;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119127;STB=0.509074;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00589327;OID=.;OPOS=42981499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:24:25:14:14:10:11:0.44:8:2:4:10:8:3:4:10 chr17 42981654 . A G 155.51 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00615965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=346.206;QD=15.172;RBI=0.00626892;REFB=-0.00970678;REVB=-0.00116538;RO=24;SAF=13;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173705;STB=0.601295;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00994567;OID=.;OPOS=42981654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:4:13:15:9:4:13:15:9 chr17 42982288 . A G 227.49 PASS AF=0.48;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0348815;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.812;QD=18.1994;RBI=0.0366909;REFB=-0.0236031;REVB=-0.01138;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112989;STB=0.563705;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0371953;OID=.;OPOS=42982288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:26:26:24:24:0.48:14:10:14:12:14:10:14:12 chr17 42982729 . G A 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00694409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.724;QD=21.9715;RBI=0.020142;REFB=-0.0144021;REVB=0.0189071;RO=21;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742616;STB=0.541723;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0144751;OID=.;OPOS=42982729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:16:7:8:13:16:7:8:13 chr17 42984687 . G C 369.67 PASS AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00596853;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.905;QD=22.404;RBI=0.0348228;REFB=-0.0179883;REVB=-0.0343075;RO=29;SAF=20;SAR=17;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647269;STB=0.535636;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0145738;OID=.;OPOS=42984687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:17:20:18:11:17:20:18:11 chr17 42987524 . T C 430.88 PASS AF=0.444444;AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=-0.0152266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.719;QD=15.9583;RBI=0.0153799;REFB=-0.0248268;REVB=-0.0021664;RO=59;SAF=29;SAR=19;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776608;STB=0.53684;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0282993;OID=.;OPOS=42987524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:59:60:48:48:0.444444:19:29:40:19:19:29:40:20 chr17 43159051 . GAAAAAGA GAAAAAAG,GAAAAGA 35.74 PASS AF=0,0.27027;AO=2,11;DP=42;FAO=0,10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=0,1;FSAR=0,9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.367305,0.264475;FXX=0.0263089;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=30.5353,13.1796;QD=3.86327;RBI=0.36913,0.26921;REFB=0.0064034,-0.0527135;REVB=0.0366608,-0.0502644;RO=23;SAF=2,1;SAR=0,10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.450372,-0.629621;STB=0.5,0.894221;STBP=1,0.007;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.129913;OID=.,.;OPOS=43159057,43159052;OREF=GA,A;OALT=AG,-;OMAPALT=GAAAAAAG,GAAAAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.27027:2,11:42:0,10:37:27:0,1:0,9:17:10:37:23:2,1:0,10:14:9 chr17 43171154 . C T 245.19 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0188263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2465;QD=15.5675;RBI=0.0188293;REFB=-0.00323265;REVB=0.000336467;RO=35;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491731;STB=0.527789;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00124669;OID=.;OPOS=43171154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:15:13:18:17:15:13:18:17 chr17 43181287 . A G 735.53 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.703;QD=56.5794;RBI=0.013593;REFB=0;REVB=0.0135259;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.89393e-05;OID=.;OPOS=43181287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:22:29:0:0:23:29:0:0 chr17 43183420 . C T 375.37 PASS AF=0.40367;AO=44;DP=109;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.00416604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.435;QD=13.775;RBI=0.0290627;REFB=-0.0215276;REVB=0.0287626;RO=65;SAF=18;SAR=26;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261608;STB=0.647282;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0262437;OID=.;OPOS=43183420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:65:65:44:44:0.40367:26:18:43:22:26:18:43:22 chr17 43192821 . A G 92.27 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.020029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1604;QD=14.1956;RBI=0.0216596;REFB=0.000995766;REVB=0.0082449;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662048;STB=0.538398;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00472302;OID=.;OPOS=43192821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:6:8:6:6:6:8 chr17 43198430 . AC A 33.04 PASS AF=0.6;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.158953;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.1082;QD=8.81085;RBI=0.21959;REFB=-0.159279;REVB=0.151504;RO=7;SAF=8;SAR=0;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.793549;STB=0.743518;STBP=0.074;TYPE=del;VARB=0.120009;OID=.;OPOS=43198431;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.6:8:15:9:15:6:8:1:3:3:30:7:8:0:3:4 chr17 43227766 . T TTTGG 642.39 PASS AF=0.976744;AO=37;DP=45;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00152612;FXX=0.0444346;HRUN=3;LEN=4;MLLD=290.422;QD=59.7573;RBI=0.0250271;REFB=0.0151955;REVB=-0.0249805;RO=5;SAF=14;SAR=23;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515289;STB=0.509429;STBP=0.519;TYPE=ins;VARB=-0.000198219;OID=.;OPOS=43227767;OREF=-;OALT=TTGG;OMAPALT=TTTGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.976744:37:45:42:43:1:16:26:0:1:4:5:14:23:3:2 chr17 43229299 . A C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.632;QD=40.7629;RBI=0.0210732;REFB=0;REVB=-0.000395814;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217418;OID=.;OPOS=43229299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr17 43318778 . GC CG 152.4 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0244825;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=211.345;QD=40.6406;RBI=0.0277935;REFB=-0.0857522;REVB=0.0131562;RO=1;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128919;STB=0.571319;STBP=0.151;TYPE=mnp;VARB=0.0013039;OID=.;OPOS=43318778;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:3:11:0:1:3:11:0:1 chr17 43333125 . C T 154.34 PASS AF=0.344828;AO=19;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.016336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.324;QD=10.6444;RBI=0.0271258;REFB=-0.00822059;REVB=-0.0216551;RO=37;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338623;STB=0.666513;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0270272;OID=.;OPOS=43333125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:38:19:20:0.344828:8:11:10:27:9:11:11:27 chr17 43333785 . AAGAC A 143.1 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0255077;FXX=0.111093;HRUN=2;LEN=4;MLLD=235.067;QD=10.2215;RBI=0.0323767;REFB=-0.0235205;REVB=0.0199401;RO=33;SAF=5;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316776;STB=0.68337;STBP=0.043;TYPE=del;VARB=0.0304809;OID=.;OPOS=43333786;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.410714:23:62:23:56:33:5:18:16:17:99:33:5:18:16:17 chr17 43340936 . G A 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0159754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.088;QD=19.5225;RBI=0.0874635;REFB=-0.0294534;REVB=0.0859921;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186957;STB=0.606586;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0410111;OID=.;OPOS=43340936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:9:5:7:5:9:5:7:5 chr17 43342141 . G C 155.51 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00568511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.305;QD=15.1716;RBI=0.0157104;REFB=-0.0187035;REVB=-0.0146457;RO=24;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098029;STB=0.556457;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0115049;OID=.;OPOS=43342141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:8:9:15:9:8:9:15:9 chr17 43351039 . C G 303.89 PASS AF=0.574468;AO=26;DP=45;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00172138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.278;QD=25.8633;RBI=0.00744844;REFB=-0.0300117;REVB=0.0072468;RO=19;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18309;STB=0.617558;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0178989;OID=.;OPOS=43351039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:47:19:20:26:27:0.574468:17:9:11:8:18:9:12:8 chr17 43364293 . C CG 245.55 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.6311;QD=40.9245;RBI=0.0912981;REFB=0;REVB=-0.0908808;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0177974;OID=.;OPOS=43364294;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:24:24:24:0:12:12:0:0:5:0:12:11:0:0 chr17 43923180 . G A 670.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.821;QD=62.3499;RBI=0.0636677;REFB=0;REVB=0.0440783;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279644;OID=.;OPOS=43923180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0 chr17 43923898 . A G 306.26 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3216;QD=53.2632;RBI=0.0355967;REFB=0;REVB=-0.0150298;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018325;OID=.;OPOS=43923898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0 chr17 43924412 . T C 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.634;QD=62.9079;RBI=0.0385975;REFB=0;REVB=0.00112445;RO=0;SAF=30;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.67707e-05;OID=.;OPOS=43924412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:60:30:0:0:60:30:0:0 chr17 44067382 . T C 370.02 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000506223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7251;QD=54.817;RBI=0.0103415;REFB=0;REVB=-0.0103291;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000704047;OID=.;OPOS=44067382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:18:8:0:0:18:9:0:0 chr17 44077044 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.878;QD=33.4285;RBI=0.0501464;REFB=0;REVB=0.0423115;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522553;OID=.;OPOS=44077044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr17 44117135 . C T 999.18 PASS AF=0.797872;AO=68;DP=89;FAO=75;FDP=94;FR=.;FRO=19;FSAF=63;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=0.00794382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.357;QD=42.5181;RBI=0.028088;REFB=-0.0552097;REVB=-0.0269412;RO=0;SAF=59;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87695e-08;STB=0.710996;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00148631;OID=.;OPOS=44117135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:94:0:19:68:75:0.797872:9:59:0:0:12:63:1:18 chr17 44144993 . C G 417.98 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00476784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.079;QD=53.9323;RBI=0.0366295;REFB=-0.126683;REVB=0.0363179;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513505;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00171642;OID=.;OPOS=44144993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:31:0:1:30:30:0.967742:18:12:0:0:18:12:0:1 chr17 44248499 . G C 708.51 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.288;QD=62.9789;RBI=0.0309518;REFB=0;REVB=-0.0236579;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.14918e-05;OID=.;OPOS=44248499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0 chr17 44408406 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0696938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.225;QD=46.848;RBI=0.0711415;REFB=0;REVB=0.0142791;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00068432;OID=.;OPOS=44408406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr17 44950122 . T C 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.043382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.666;QD=9.75998;RBI=0.0474029;REFB=-0.0092195;REVB=-0.019106;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439197;STB=0.776868;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.011597;OID=.;OPOS=44950122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:6:1:6:6:6:1:6:6 chr17 44998563 . G A 644.16 PASS AF=0.524194;AO=64;DP=124;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0120366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1774;QD=20.7794;RBI=0.0525986;REFB=0.00289959;REVB=-0.0512029;RO=60;SAF=37;SAR=27;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548301;STB=0.52112;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00303899;OID=.;OPOS=44998563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:60:59:64:65:0.524194:27:37:31:29:28:37:31:28 chr17 45000529 . G C 228.22 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0301287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.081;QD=13.8315;RBI=0.0406979;REFB=-0.0225626;REVB=-0.0273602;RO=39;SAF=15;SAR=12;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178837;STB=0.510197;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0285419;OID=.;OPOS=45000529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:12:15:21:18:12:15:21:18 chr17 45000547 . G C 858.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441575;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.4426;QD=57.2172;RBI=0.049419;REFB=0;REVB=-0.0221891;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.13042e-05;OID=.;OPOS=45000547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:27:33:0:0 chr17 45008570 . G A 72.7 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00243712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.714;QD=8.81185;RBI=0.0142874;REFB=-0.00989514;REVB=-0.014078;RO=23;SAF=7;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259722;STB=0.660047;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0259355;OID=.;OPOS=45008570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:3:7:11:12:3:7:11:12 chr17 45234298 . G C 82.3 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0356456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7991;QD=19.3655;RBI=0.0379667;REFB=-0.0061585;REVB=0.0130715;RO=6;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459658;STB=0.512171;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0015174;OID=.;OPOS=45234298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:6:7:10:10:0.588235:6:4:2:4:6:4:3:4 chr17 45234343 . T G 80.27 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0143689;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.286;QD=16.8984;RBI=0.0153113;REFB=-0.000470774;REVB=0.00528858;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373874;STB=0.521695;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.000356901;OID=.;OPOS=45234343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:6:4:4:5:6:4:4:5 chr17 45234360 . A C 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0276801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.758;QD=12.8688;RBI=0.0284156;REFB=-0.00484809;REVB=-0.00642328;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813502;STB=0.54786;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0054476;OID=.;OPOS=45234360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:6:5:6:10:6:5:6:10 chr17 45234403 . TT GG 45.06 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0262449;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=148.465;QD=7.83717;RBI=0.0471484;REFB=-0.00132168;REVB=-0.0391685;RO=16;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183097;STB=0.616089;STBP=0.454;TYPE=mnp;VARB=0.00165077;OID=.;OPOS=45234403;OREF=TT;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:5:2:7:9:5:2:7:9 chr17 45234406 . CA C 44.8 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0105187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.27;QD=7.46636;RBI=0.0263622;REFB=-0.0220808;REVB=-0.0241728;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156386;STB=0.5997;STBP=0.608;TYPE=del;VARB=0.0294258;OID=.;OPOS=45234407;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.291667:7:24:7:24:17:2:5:7:10:44:17:2:5:7:10 chr17 45234417 . A G 40.41 PASS AF=0.368421;AO=6;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0368574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7669;QD=8.50677;RBI=0.0371235;REFB=-0.0203477;REVB=-0.00443702;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439476;STB=0.644727;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0730011;OID=.;OPOS=45234417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:19:19:13:12:6:7:0.368421:5:1:7:6:5:2:6:6 chr17 45234420 . T G 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0307212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4662;QD=12.7386;RBI=0.0489701;REFB=-0.0126234;REVB=0.0381349;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119124;STB=0.571247;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0279311;OID=.;OPOS=45234420;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:5:3:5:5:5:3:5:5 chr17 45266522 . T C 118.16 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00863285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8018;QD=12.7737;RBI=0.0631618;REFB=-0.0156428;REVB=-0.062569;RO=23;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383547;STB=0.724873;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0211649;OID=.;OPOS=45266522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:10:4:15:8:10:4:15:8 chr17 45266535 . T C 185.81 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0131012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.196;QD=19.0574;RBI=0.0549436;REFB=-0.00274449;REVB=-0.0533587;RO=20;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294619;STB=0.666496;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00684663;OID=.;OPOS=45266535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:12:7:14:6:12:7:14:6 chr17 45266571 . T A 159.3 PASS AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=15;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0118747;FXX=0.107105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.7;QD=25.4872;RBI=0.0141174;REFB=-0.00458229;REVB=0.007635;RO=7;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645688;STB=0.562414;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00505322;OID=.;OPOS=45266571;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:30:25:7:8:18:15:0.6:8:10:3:4:5:10:4:4 chr17 45266573 . AGG AGGCAC,AGGCACC,CCC 114.33 PASS AF=0.347826,0.173913,0.0434783;AO=3,3,2;DP=30;FAO=8,4,1;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=6,3,1;FSAR=2,1,0;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0942145,0.0935395,0.00131628;FXX=0.206825;HRUN=7,7,1;LEN=3,4,3;MLLD=107.266,107.054,114.998;QD=19.8836;RBI=0.0946004,0.0936528,0.00398218;REFB=-0.0890746,-0.0868397,-0.0303983;REVB=-0.00853526,-0.00460533,-0.00375835;RO=13;SAF=3,2,2;SAR=0,1,0;SRF=10;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.556789,-0.138806,0.468324;STB=0.535622,0.545218,0.985759;STBP=0.828,0.973,0.514;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=0.040691,0.0377383,0.0693512;OID=.,.,.;OPOS=45266576,45266576,45266573;OREF=-,-,AGG;OALT=CAC,CACC,CCC;OMAPALT=AGGCAC,AGGCACC,CCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:30:23:13:10:3,3,2:8,4,1:0.347826,0.173913,0.0434783:0,1,0:3,2,2:10:3:2,1,0:6,3,1:7:3 chr17 45364540 . T C 206.65 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.000382988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.481;QD=13.1206;RBI=0.0253311;REFB=-0.0257465;REVB=0.0253282;RO=38;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214228;STB=0.622545;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0219663;OID=.;OPOS=45364540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:10:15:15:23:10:15:15:23 chr17 45368337 . A C 1694.96 PASS AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0802;QD=60.5344;RBI=0.0527199;REFB=0;REVB=0.0250188;RO=0;SAF=55;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34603e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246729;OID=.;OPOS=45368337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:57:55:0:0:57:55:0:0 chr17 45369662 . G A 231.25 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0145035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9415;QD=12.3334;RBI=0.0752396;REFB=-0.0271069;REVB=-0.0738285;RO=47;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171372;STB=0.598754;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0296464;OID=.;OPOS=45369662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:10:18:23:24:10:18:23:24 chr17 45369777 . A G 252.75 PASS AF=0.5;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0101728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.958;QD=21.0621;RBI=0.0162571;REFB=-0.00735104;REVB=-0.012681;RO=24;SAF=6;SAR=17;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165421;STB=0.571084;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0175012;OID=.;OPOS=45369777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:23:24:0.5:17:6:10:14:17:7:10:14 chr17 45369789 . G A 146.14 PASS AF=0.457143;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0124623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.131;QD=16.7021;RBI=0.0171889;REFB=-0.0120706;REVB=0.0118385;RO=19;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267316;STB=0.610022;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0113329;OID=.;OPOS=45369789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:15:16:0.457143:12:3:8:11:12:4:8:11 chr17 45388586 . T A 1414.43 PASS AF=0.971154;AO=98;DP=103;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0139342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8691;QD=54.4012;RBI=0.0841991;REFB=-0.19109;REVB=0.0830381;RO=5;SAF=57;SAR=41;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544027;STB=0.51648;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.007615;OID=.;OPOS=45388586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:103:104:5:3:98:101:0.971154:41:57:0:5:44:57:0:3 chr17 45421563 . G A 355.03 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00473527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5392;QD=18.9348;RBI=0.0739591;REFB=0.000167102;REVB=-0.0738073;RO=38;SAF=23;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16093;STB=0.589694;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.0013488;OID=.;OPOS=45421563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:14:23:17:21:14:23:17:21 chr17 45425287 . C T 387.83 PASS AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=-0.0660579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1572;QD=15.9928;RBI=0.0679129;REFB=-0.00984697;REVB=-0.0157645;RO=56;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124863;STB=0.57006;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0100315;OID=.;OPOS=45425287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:23:18:18:38:23:18:18:38 chr17 45451894 . G A 559.05 PASS AF=0.460938;AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0722585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0697;QD=17.4703;RBI=0.0722899;REFB=-0.000961229;REVB=0.00212771;RO=66;SAF=31;SAR=28;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191274;STB=0.521547;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.000465234;OID=.;OPOS=45451894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:66:69:59:59:0.460938:28:31:36:30:28:31:39:30 chr17 45468842 . A T 229.77 PASS AF=0.45614;AO=25;DP=56;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00226925;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.321;QD=16.1244;RBI=0.00794918;REFB=-0.00795845;REVB=0.0076184;RO=31;SAF=14;SAR=11;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167666;STB=0.581707;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0096668;OID=.;OPOS=45468842;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:31:31:25:26:0.45614:11:14:12:19:12:14:12:19 chr17 45468871 . A G 218.01 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00432315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1645;QD=14.0654;RBI=0.0293191;REFB=-0.0151156;REVB=0.0289987;RO=35;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149334;STB=0.576864;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0241333;OID=.;OPOS=45468871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:36:26:26:0.419355:11:15:15:20:11:15:16:20 chr17 45490251 . C T 412.01 PASS AF=0.488372;AO=41;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0442868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3831;QD=19.163;RBI=0.0578271;REFB=-0.00392611;REVB=-0.037184;RO=44;SAF=19;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340848;STB=0.512189;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00347277;OID=.;OPOS=45490251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:41:42:0.488372:22:19:22:22:22:20:22:22 chr17 45567593 . ATC A 179.01 PASS AF=0.431818;AO=18;DP=43;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0187922;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.342;QD=16.2737;RBI=0.0196406;REFB=-0.0365787;REVB=-0.00571004;RO=25;SAF=7;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534255;STB=0.542668;STBP=0.627;TYPE=del;VARB=0.0497736;OID=.;OPOS=45567594;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.431818:18:43:19:44:25:7:12:11:14:99:25:7:11:11:14 chr17 45569815 . A G 128.99 PASS AF=0.5;AO=9;DP=25;FAO=14;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.027716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.779;QD=18.4264;RBI=0.0292822;REFB=-0.0344829;REVB=0.00944807;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473086;STB=0.782147;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0178534;OID=.;OPOS=45569815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:25:28:9:10:9:14:0.5:2:7:2:7:2:12:3:7 chr17 45700384 . C CCTA 259.88 PASS AF=0.509091;AO=27;DP=57;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00183128;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=220.217;QD=18.9005;RBI=0.0168415;REFB=-0.00793622;REVB=-0.0167417;RO=29;SAF=11;SAR=16;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129559;STB=0.586898;STBP=0.228;TYPE=ins;VARB=0.0237712;OID=.;OPOS=45700385;OREF=-;OALT=CTA;OMAPALT=CCTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.509091:27:57:28:55:27:12:16:7:20:99:29:11:16:8:21 chr17 45759767 . C T 495.88 PASS AF=0.490741;AO=49;DP=104;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0240704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9668;QD=18.3659;RBI=0.024095;REFB=-0.00108669;REVB=0.00108972;RO=55;SAF=26;SAR=23;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665519;STB=0.536769;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.000583156;OID=.;OPOS=45759767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:55:55:49:53:0.490741:23:26:33:22:25:28:33:22 chr17 45760349 . T C 961.92 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0302013;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=317.471;QD=57.4279;RBI=0.0306691;REFB=-0.091976;REVB=0.00533575;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=2.22623e-05;OID=.;OPOS=45760349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:67:0:1:66:66:0.985075:36:30:0:0:36:30:1:0 chr17 45760429 . T C 649.19 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.791;QD=60.3898;RBI=0.0532687;REFB=0;REVB=0.0230289;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212722;OID=.;OPOS=45760429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:1:0:42:43:1:22:20:1:0:22:21:0:0 chr17 45760433 . T C 619.95 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00559721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.584;QD=59.0424;RBI=0.0304966;REFB=-0.0338686;REVB=0.0299785;RO=1;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218198;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000947264;OID=.;OPOS=45760433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:21:20:0:1:21:20:0:1 chr17 45885687 . A G 428.06 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00830011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.011;QD=19.4574;RBI=0.0180866;REFB=-0.0135328;REVB=0.0160696;RO=45;SAF=19;SAR=24;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144805;STB=0.580405;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0119614;OID=.;OPOS=45885687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:24:19:27:18:24:19:27:18 chr17 45887951 . G T 65.86 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0368658;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.801;QD=10.1322;RBI=0.0386735;REFB=-0.0120012;REVB=0.0116856;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215431;STB=0.631281;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.035529;OID=.;OPOS=45887951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:26:26:17:17:9:9:0.346154:6:3:9:8:6:3:9:8 chr17 45915788 . T C 610.42 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0778905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.391;QD=61.0419;RBI=0.0791051;REFB=0;REVB=0.013809;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000352441;OID=.;OPOS=45915788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:25:14:0:0:26:14:0:0 chr17 45959620 . T C 577.46 PASS AF=0.604651;AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00382913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.962;QD=26.8585;RBI=0.0148422;REFB=-0.00165597;REVB=0.0143398;RO=34;SAF=24;SAR=28;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916986;STB=0.549981;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00139083;OID=.;OPOS=45959620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:34:34:52:52:0.604651:28:24:20:14:28:24:20:14 chr17 45994044 . C T 139.42 PASS AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.041573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5134;QD=9.14247;RBI=0.0695907;REFB=0.00203899;REVB=0.0558082;RO=42;SAF=11;SAR=8;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230746;STB=0.63456;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00174542;OID=.;OPOS=45994044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:8:11:32:10:8:11:32:10 chr17 45994094 . T C 310.64 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=-0.0205845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3853;QD=16.3496;RBI=0.0205968;REFB=0.0021421;REVB=0.000712226;RO=41;SAF=26;SAR=8;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926703;STB=0.535694;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=-0.00332769;OID=.;OPOS=45994094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:42:34:34:0.447368:8:26:34:7:8:26:34:8 chr17 45994154 . G A 255.79 PASS AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0722104;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2353;QD=15.5026;RBI=0.0740287;REFB=-0.0266754;REVB=-0.0163067;RO=36;SAF=8;SAR=21;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128905;STB=0.567519;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0823503;OID=.;OPOS=45994154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:37:29:29:0.439394:21:8:14:22:21:8:14:23 chr17 46002744 . G T 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00211044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.702;QD=23.8999;RBI=0.0111441;REFB=-0.0126418;REVB=-0.0109424;RO=23;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266441;STB=0.501483;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0120932;OID=.;OPOS=46002744;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:13:14:12:11:13:14:12:11 chr17 46005792 . A ACT 164.69 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0128683;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=260.32;QD=9.54714;RBI=0.0183672;REFB=-0.00620381;REVB=-0.0131057;RO=47;SAF=11;SAR=11;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615026;STB=0.536199;STBP=0.691;TYPE=ins;VARB=0.0131162;OID=.;OPOS=46005793;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.318841:22:69:22:69:47:11:11:21:26:99:47:11:11:21:26 chr17 46020698 . C T 328.74 PASS AF=0.37;AO=37;DP=100;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.00866088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.689;QD=13.1497;RBI=0.0181347;REFB=-0.0143535;REVB=0.0159328;RO=63;SAF=19;SAR=18;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116976;STB=0.56674;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0229288;OID=.;OPOS=46020698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:63:63:37:37:0.37:18:19:39:24:18:19:39:24 chr17 46026156 . A G 421.4 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0140436;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.365;QD=54.3741;RBI=0.0517537;REFB=-0.0152981;REVB=-0.0498119;RO=1;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372625;STB=0.519987;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00091955;OID=.;OPOS=46026156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:12:18:0:1:12:18:0:1 chr17 46029962 . ACTCT A 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0025826;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=291.292;QD=20.8719;RBI=0.00481421;REFB=-0.0273644;REVB=0.00406286;RO=21;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295343;STB=0.677252;STBP=0.035;TYPE=del;VARB=0.0203648;OID=.;OPOS=46029963;OREF=CTCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.512195:21:42:21:41:20:14:7:6:14:99:21:14:7:7:14 chr17 46059071 . T C 92.58 PASS AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00952696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.36;QD=9.25846;RBI=0.00962219;REFB=-0.0119245;REVB=-0.00135039;RO=27;SAF=4;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216083;STB=0.620484;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0272933;OID=.;OPOS=46059071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:40:40:27:28:12:12:0.3:8:4:14:13:8:4:14:14 chr17 46147945 . G A 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0136257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.918;QD=20.7548;RBI=0.0162364;REFB=0.00150752;REVB=-0.00882948;RO=12;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323297;STB=0.682686;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.00212041;OID=.;OPOS=46147945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:10:5:9:3:10:5:9:3 chr17 46262171 . C T 1426.19 PASS AF=0.98913;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0234761;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.173;QD=62.0083;RBI=0.0276801;REFB=-0.0140634;REVB=0.0146649;RO=1;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101937;STB=0.505375;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=1.26828e-05;OID=.;OPOS=46262171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:92:1:1:91:91:0.98913:46:45:0:1:46:45:0:1 chr17 46507417 . G A 798.07 PASS AF=0.444444;AO=84;DP=189;FAO=84;FDP=189;FR=.;FRO=105;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=51;FSRR=54;FWDB=-0.0235852;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.387;QD=16.8904;RBI=0.0237545;REFB=-0.00455227;REVB=0.00283127;RO=103;SAF=39;SAR=45;SRF=50;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210435;STB=0.511943;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00546091;OID=.;OPOS=46507417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:103:105:84:84:0.444444:45:39:50:53:45:39:51:54 chr17 46607021 . T C 1822.07 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0028;QD=61.2461;RBI=0.0481837;REFB=0;REVB=0.00707139;RO=0;SAF=57;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9434e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186178;OID=.;OPOS=46607021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:62:57:0:0:62:57:0:0 chr17 46626811 . G GGACA 116.35 PASS AF=0.722222;AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0199312;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=363.321;QD=25.8555;RBI=0.0199766;REFB=-0.00115267;REVB=-0.0013469;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273921;STB=0.608548;STBP=0.286;TYPE=ins;VARB=0.000752033;OID=.;OPOS=46626812;OREF=-;OALT=GACA;OMAPALT=GGACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.722222:12:20:13:18:5:4:9:0:5:29:7:4:8:0:7 chr17 46629593 . G T 653.07 PASS AF=0.909091;AO=50;DP=56;FAO=50;FDP=55;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.000986708;FXX=0.017854;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.066;QD=47.496;RBI=0.0306506;REFB=-0.0669356;REVB=0.0306347;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200269;STB=0.549;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00085219;OID=.;OPOS=46629593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:56:55:1:5:50:50:0.909091:27:23:1:0:27:23:5:0 chr17 46651177 . GCCCG CGCCG,GCC,GCCG 119.74 PASS AF=0,0.625,0;AO=3,6,5;DP=28;FAO=0,15,0;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=0,11,0;FSAR=0,4,0;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00670674,0.249486,0.123321;FXX=0.0768935;HRUN=1,3,3;LEN=2,2,1;MLLD=112.095,21.9877,11.8898;QD=19.9574;RBI=0.113735,0.252743,0.147833;REFB=-0.0286144,-0.187196,-0.172989;REVB=-0.113537,-0.0404428,0.0815268;RO=11;SAF=0,5,5;SAR=3,1,0;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.630413,0.434685,0.731328;STB=0.5,0.662422,0.5;STBP=1,0.051,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0,0.121529,0.0297529;OID=.,.,.;OPOS=46651177,46651180,46651178;OREF=GC,CG,C;OALT=CG,-,-;OMAPALT=CGCCG,GCC,GCCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:57:28:24:11:9:3,6,5:0,15,0:0,0.625,0:3,1,0:0,5,5:5:6:0,4,0:0,11,0:3:6 chr17 46653037 . AT A,AA 619.8 PASS AF=0.477273,0.0227273;AO=36,16;DP=124;FAO=63,3;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=21,0;FSAR=42,3;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.0465067,0.0589039;FXX=0.0222206;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=239.286,238.285;QD=18.7818;RBI=0.0468364,0.0591279;REFB=0.00102949,0.000422835;REVB=-0.00554738,-0.00514196;RO=68;SAF=7,2;SAR=29,14;SRF=25;SRR=43;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.252766,-0.399062;STB=0.542359,0.99597;STBP=0.384,0.121;TYPE=del,snp;VARB=-0.0061443,-0.00157393;OID=.,.;OPOS=46653038,46653038;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.477273,0.0227273:36,16:124:63,3:132:66:21,0:42,3:27:39:99:68:7,2:29,14:25:43 chr17 46670520 . T C 610.46 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00204991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.447;QD=56.7867;RBI=0.00275858;REFB=0.00886851;REVB=0.00184597;RO=1;SAF=27;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170644;STB=0.517849;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-8.87236e-05;OID=.;OPOS=46670520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:43:43:1:2:41:41:0.953488:14:27:1:0:14:27:2:0 chr17 46684929 . A G 349.94 PASS AF=0.4625;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.041901;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.6;QD=17.4969;RBI=0.0419039;REFB=0.013876;REVB=0.00049344;RO=42;SAF=17;SAR=20;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10613;STB=0.552905;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.0143082;OID=.;OPOS=46684929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:42:43:37:37:0.4625:20:17:24:18:20:17:24:19 chr17 46688135 . G A 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00373194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.471;QD=11.0197;RBI=0.00618529;REFB=-0.00125192;REVB=0.00493259;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169784;OID=.;OPOS=46688135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:4:4:3:3:4:4 chr17 46688256 . T C 483.3 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5674;QD=58.5815;RBI=0.113413;REFB=0;REVB=0.110767;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00197652;OID=.;OPOS=46688256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr17 46689680 . C A 64.19 PASS AF=0.409091;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00218383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.886;QD=11.6705;RBI=0.0133014;REFB=-0.0199664;REVB=0.0131209;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434779;STB=0.536003;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.038911;OID=.;OPOS=46689680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:21:22:12:13:8:9:0.409091:3:5:7:5:4:5:8:5 chr17 46805443 . A G 543.23 PASS AF=0.581395;AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.000781912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4739;QD=25.2666;RBI=0.0299541;REFB=-0.0246888;REVB=-0.0299439;RO=35;SAF=20;SAR=30;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130554;STB=0.577434;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0206977;OID=.;OPOS=46805443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:35:36:50:50:0.581395:30:20:20:15:30:20:21:15 chr17 46842983 . T C 357.47 PASS AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0204375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.445;QD=49.3065;RBI=0.0204397;REFB=0.00373683;REVB=-0.000299635;RO=2;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489106;STB=0.526297;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00128819;OID=.;OPOS=46842983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:18:9:0:2:18:9:0:2 chr17 46847364 . C A 246.84 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00545468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.141;QD=17.9519;RBI=0.0397993;REFB=-0.028354;REVB=0.0394237;RO=28;SAF=20;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144508;STB=0.581519;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0304441;OID=.;OPOS=46847364;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:7:20:17:11:7:20:17:11 chr17 46867302 . C T 402.83 PASS AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00612976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.037;QD=19.1821;RBI=0.0179993;REFB=-0.0133251;REVB=0.0169234;RO=42;SAF=23;SAR=18;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989887;STB=0.54919;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0151955;OID=.;OPOS=46867302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:43:41:41:0.488095:18:23:19:23:18:23:20:23 chr17 46881748 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.03;QD=56.1916;RBI=0.0151461;REFB=0;REVB=-0.00424922;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55049e-05;OID=.;OPOS=46881748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr17 46894377 . A C 266.15 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0156668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.931;QD=21.2917;RBI=0.0158219;REFB=-0.0231621;REVB=-0.00221029;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0222216;OID=.;OPOS=46894377;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:11:14:14:11:11:14:14:11 chr17 46923384 . G A 551.33 PASS AF=0.56044;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00156889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.271;QD=24.2342;RBI=0.00634502;REFB=-0.00521103;REVB=0.006148;RO=39;SAF=22;SAR=29;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446536;STB=0.519433;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.00441538;OID=.;OPOS=46923384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:39:40:51:51:0.56044:29:22:19:20:29:22:19:21 chr17 46926615 . G A 184.09 PASS AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0040184;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1537;QD=17.9603;RBI=0.0788397;REFB=0.000461671;REVB=0.0787372;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971332;STB=0.555495;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.000334069;OID=.;OPOS=46926615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:6:13:13:9:6:13:13:9 chr17 46934007 . A C 375.64 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.449;QD=55.6508;RBI=0.0481709;REFB=0;REVB=0.0433681;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382329;OID=.;OPOS=46934007;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0 chr17 46939658 . C G 63.35 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0224149;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=296.697;QD=8.73785;RBI=0.0250863;REFB=-0.00981477;REVB=-0.0112647;RO=20;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192227;STB=0.618777;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0233232;OID=.;OPOS=46939658;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:3:6:10:10:3:6:10:10 chr17 46970836 . A G 1099.03 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.222;QD=60.2207;RBI=0.0331219;REFB=0;REVB=0.0325079;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.72741e-05;OID=.;OPOS=46970836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:27:44:0:0:29:44:0:0 chr17 46971140 . G A 94.62 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0292905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2813;QD=21.026;RBI=0.0324228;REFB=0.0355276;REVB=0.0139035;RO=6;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263404;STB=0.691912;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.0188048;OID=.;OPOS=46971140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:17:18:6:7:11:11:0.611111:9:2:3:3:9:2:4:3 chr17 46972479 . ATCTC A 124.93 PASS AF=0.5;AO=12;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0168743;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=260.536;QD=17.8472;RBI=0.0191985;REFB=-0.0263106;REVB=-0.00915641;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199941;STB=0.639808;STBP=0.158;TYPE=del;VARB=0.0314744;OID=.;OPOS=46972480;OREF=TCTC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:12:28:14:28:14:8:6:4:10:99:14:6:6:4:10 chr17 47000251 . C T 577.99 PASS AF=0.552083;AO=53;DP=97;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00774204;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.811;QD=24.083;RBI=0.0236915;REFB=-0.0126969;REVB=-0.0223908;RO=43;SAF=25;SAR=28;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436085;STB=0.523914;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00962638;OID=.;OPOS=47000251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:43:43:53:53:0.552083:28:25:18:25:28:25:18:25 chr17 47007963 . C T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00388341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.028;QD=13.4859;RBI=0.0222029;REFB=-0.0234968;REVB=0.0218607;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119999;STB=0.571265;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0159213;OID=.;OPOS=47007963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:6:3:5:6:6:3:5:6 chr17 47014632 . A G 76.14 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.018952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.612;QD=12.1821;RBI=0.045913;REFB=-0.000745197;REVB=0.041819;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381359;STB=0.719645;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00153379;OID=.;OPOS=47014632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:2:13:5:5:2:13 chr17 47014651 . CT C 187.13 PASS AF=0.633333;AO=18;DP=29;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0259022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4958;QD=24.9509;RBI=0.0625011;REFB=-0.0242758;REVB=-0.0568811;RO=10;SAF=2;SAR=16;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459733;STB=0.755222;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.0274048;OID=.;OPOS=47014652;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.633333:18:29:19:30:11:2:17:6:5:79:10:2:16:6:4 chr17 47014675 . C T 481.03 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.592;QD=58.307;RBI=0.020909;REFB=0;REVB=0.0208785;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134434;OID=.;OPOS=47014675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0 chr17 47026836 . G C 158.7 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00415017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.444;QD=17.1565;RBI=0.0525189;REFB=-0.00622518;REVB=0.0523546;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479907;STB=0.773977;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00437324;OID=.;OPOS=47026836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:4:13:5:15:4:13:5:15 chr17 47036042 . C A 238.92 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00530121;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.733;QD=18.0314;RBI=0.0451202;REFB=-0.0112817;REVB=0.0448077;RO=26;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242636;STB=0.645143;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0150472;OID=.;OPOS=47036042;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:17:9:16:10:17:9:17:10 chr17 47039132 . T C 216.34 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00251866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.117;QD=21.6335;RBI=0.00774555;REFB=-0.0224782;REVB=0.00732461;RO=19;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00649354;STB=0.503646;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.023049;OID=.;OPOS=47039132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:9:12:11:8:9:12:11:8 chr17 47210429 . A G 766.38 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0541376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1408;QD=63.8646;RBI=0.126006;REFB=0;REVB=-0.113783;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00240057;OID=.;OPOS=47210429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0 chr17 47241604 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.246;QD=56.9383;RBI=0.0185367;REFB=0;REVB=0.00269538;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7702e-05;OID=.;OPOS=47241604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr17 47243559 . C T 549.58 PASS AF=0.5;AO=57;DP=114;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0348452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.328;QD=19.2833;RBI=0.0421829;REFB=-0.011649;REVB=-0.0237741;RO=56;SAF=32;SAR=25;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394547;STB=0.517729;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00882359;OID=.;OPOS=47243559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:56:57:57:57:0.5:25:32:29:27:25:32:30:27 chr17 47293906 . G A 1231.35 PASS AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0255743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.848;QD=60.0659;RBI=0.030129;REFB=-0.0815878;REVB=0.0159284;RO=1;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137227;STB=0.507245;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000394701;OID=.;OPOS=47293906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:34:47:0:1:34:47:0:1 chr17 47297297 . T C 1208.91 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177753;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.796;QD=61.2106;RBI=0.0201207;REFB=0;REVB=0.00942765;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5454e-05;OID=.;OPOS=47297297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:33:45:0:0:33:46:0:0 chr17 47300823 . G A 59.95 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0138261;FXX=0.0951928;HRUN=6;LEN=1;MLLD=198.685;QD=12.6215;RBI=0.112911;REFB=-0.00206467;REVB=0.112062;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109376;STB=0.565062;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00316363;OID=.;OPOS=47300823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:8:3:3:5:8:3 chr17 47373417 . T C 150.11 PASS AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00862415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.907;QD=19.3696;RBI=0.107363;REFB=-0.00889056;REVB=0.107016;RO=14;SAF=11;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330708;STB=0.700947;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00450692;OID=.;OPOS=47373417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:15:16:16:0.516129:5:11:4:10:5:11:4:11 chr17 47588000 . C T 230.87 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00342439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.508;QD=23.0872;RBI=0.01212;REFB=-0.0167779;REVB=-0.0116262;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447114;STB=0.524977;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00880466;OID=.;OPOS=47588000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:11:11:8:10:11:11:8:10 chr17 47677008 . GTTAT GTTA,GT 224.33 PASS AF=0,0.636364;AO=5,22;DP=45;FAO=0,28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=0,15;FSAR=0,13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.045101,0.00297345;FXX=0.0434688;HRUN=6,2;LEN=1,3;MLLD=11.9998,259.172;QD=20.3932;RBI=0.207969,0.00821195;REFB=-0.123913,-0.0287775;REVB=-0.20302,-0.00765472;RO=10;SAF=2,12;SAR=3,10;SRF=7;SRR=3;SSEN=0.538462,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.304772,-0.0893496;STB=0.5,0.532764;STBP=1,0.543;TYPE=del,del;VARB=0.0443223,0.0192605;OID=.,.;OPOS=47677012,47677009;OREF=T,TTA;OALT=-,-;OMAPALT=GTTA,GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.636364:5,22:45:0,28:44:16:0,15:0,13:10:6:83:10:2,12:3,10:7:3 chr17 47888852 . A G 289.36 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.907;QD=52.6103;RBI=0.028833;REFB=0;REVB=0.00495405;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329395;OID=.;OPOS=47888852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr17 47903381 . C T 222.03 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-3.83408e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.121;QD=14.559;RBI=0.000677557;REFB=-0.00752262;REVB=-0.000676472;RO=35;SAF=17;SAR=9;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586509;STB=0.533398;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0106042;OID=.;OPOS=47903381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:9:17:21:14:9:17:21:14 chr17 48067439 . G A 346.22 PASS AF=0.777778;AO=28;DP=36;FAO=28;FDP=36;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0453308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.601;QD=38.4687;RBI=0.0516119;REFB=-0.0521848;REVB=0.0246761;RO=8;SAF=13;SAR=15;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146659;STB=0.507962;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0122376;OID=.;OPOS=48067439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:36:36:8:8:28:28:0.777778:15:13:4:4:15:13:4:4 chr17 48067953 . T C 168.98 PASS AF=0.282353;AO=23;DP=85;FAO=24;FDP=85;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.00783224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.854;QD=7.95182;RBI=0.103966;REFB=-0.0120432;REVB=0.103671;RO=62;SAF=13;SAR=10;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000864881;STB=0.523271;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0334662;OID=.;OPOS=48067953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:62:61:23:24:0.282353:10:13:35:27:11:13:35:26 chr17 48070878 . C T 502.24 PASS AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.00970379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.932;QD=22.0763;RBI=0.0115386;REFB=-0.00362324;REVB=-0.00624314;RO=43;SAF=26;SAR=22;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343991;STB=0.518956;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00310587;OID=.;OPOS=48070878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:22:26:25:18:22:26:25:18 chr17 48072225 . G A 341.84 PASS AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00119335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.337;QD=15.8995;RBI=0.0101774;REFB=0.000418281;REVB=0.0101072;RO=49;SAF=11;SAR=26;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147312;STB=0.583403;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.000501896;OID=.;OPOS=48072225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:26:11:21:28:26:11:21:28 chr17 48149386 . C T 373.01 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0504181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6849;QD=20.439;RBI=0.0603456;REFB=0.0119857;REVB=0.0331602;RO=35;SAF=23;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00475802;STB=0.502636;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=-0.00760641;OID=.;OPOS=48149386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:15:23:21:14:15:23:21:14 chr17 48151353 . T C 282.81 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00789766;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.318;QD=17.1398;RBI=0.00878798;REFB=-0.0159228;REVB=-0.00385429;RO=35;SAF=14;SAR=17;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00527004;STB=0.502957;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0246401;OID=.;OPOS=48151353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:35:35:31:31:0.469697:17:14:16:19:17:14:16:19 chr17 48155425 . G A 367.22 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0107302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4336;QD=19.0765;RBI=0.0162136;REFB=-0.0278543;REVB=0.0121549;RO=38;SAF=22;SAR=16;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243832;STB=0.505615;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0192151;OID=.;OPOS=48155425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:39:38:38:0.493506:16:22:23:15:16:22:23:16 chr17 48166980 . C T 87.31 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00222938;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.804;QD=12.0433;RBI=0.0227368;REFB=-0.00300863;REVB=-0.0226272;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813502;STB=0.506318;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00779797;OID=.;OPOS=48166980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:30:29:16:18:11:11:0.37931:6:5:6:10:6:5:8:10 chr17 48174908 . C T 605.25 PASS AF=0.521368;AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.000629438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.458;QD=20.6924;RBI=0.0109272;REFB=-0.0275784;REVB=0.0109091;RO=55;SAF=27;SAR=34;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104025;STB=0.501844;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0270266;OID=.;OPOS=48174908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:56:61:61:0.521368:34:27:25:30:34:27:25:31 chr17 48183471 . G A 130.64 PASS AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0133413;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=220.83;QD=22.7199;RBI=0.0136499;REFB=0.00310909;REVB=0.0028863;RO=8;SAF=12;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125598;STB=0.55805;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00146163;OID=.;OPOS=48183471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:8:9:14:14:0.608696:2:12:6:2:2:12:7:2 chr17 48211533 . T G 45.36 PASS AF=0.318182;AO=6;DP=21;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0134116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.801;QD=8.24666;RBI=0.0134116;REFB=-0.00415135;REVB=0;RO=15;SAF=6;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00954206;OID=.;OPOS=48211533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:22:15:15:6:7:0.318182:0:6:15:0:0:7:15:0 chr17 48226811 . C T 151.19 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0128385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0918;QD=20.1589;RBI=0.0128416;REFB=-0.00752301;REVB=0.000284646;RO=14;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041916;STB=0.523779;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00684058;OID=.;OPOS=48226811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:11:5:5:9:11:5:5:9 chr17 48258140 . T C 837.07 PASS AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0285831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.446;QD=55.8049;RBI=0.0546135;REFB=0.073941;REVB=0.0465364;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184944;STB=0.509801;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000508787;OID=.;OPOS=48258140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:60:1:1:58:59:0.983333:25:33:0:1:25:34:0:1 chr17 48258321 . C T 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.657;QD=55.6544;RBI=0.0165906;REFB=0;REVB=0.0151928;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010932;OID=.;OPOS=48258321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr17 48265495 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.506;QD=56.1915;RBI=0.0371709;REFB=0;REVB=0.0278691;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177504;OID=.;OPOS=48265495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0 chr17 48267290 . A AC 137.36 PASS AF=1;AO=2;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106795;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=87.3431;QD=39.2446;RBI=0.109459;REFB=0;REVB=0.0240012;RO=12;SAF=2;SAR=0;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.671794;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0101828;OID=.;OPOS=48267291;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:14:14:14:0:5:9:0:0:4:12:2:0:3:9 chr17 48267291 . G C 118.92 PASS AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0652494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.456;QD=33.9783;RBI=0.0652503;REFB=-0.0517191;REVB=-0.000352879;RO=2;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222789;STB=0.624776;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0156072;OID=.;OPOS=48267291;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:9:3:2:0:9:3:2:0 chr17 48268223 . A G 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.278;QD=61.3363;RBI=0.0221207;REFB=0;REVB=0.00173604;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30435e-05;OID=.;OPOS=48268223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr17 48356260 . G C 784.94 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.092;QD=57.0864;RBI=0.0247075;REFB=0;REVB=-0.000587285;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55007e-05;OID=.;OPOS=48356260;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0 chr17 48435746 . C T 264.65 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0191097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.715;QD=17.6434;RBI=0.0193208;REFB=-0.0387388;REVB=-0.00284805;RO=30;SAF=19;SAR=10;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217582;STB=0.523793;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0414997;OID=.;OPOS=48435746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:30:31:29:29:0.483333:10:19:19:11:10:19:19:12 chr17 48452776 . A C 325.79 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0525376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.635;QD=24.5876;RBI=0.0534535;REFB=-0.0165227;REVB=0.00985245;RO=21;SAF=9;SAR=23;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392369;STB=0.521532;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0111984;OID=.;OPOS=48452776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:23:9:5:16:23:9:5:16 chr17 48456002 . G A 345.66 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0255646;FXX=0.0266631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.062;QD=18.9404;RBI=0.0273505;REFB=-0.0188354;REVB=-0.0097212;RO=37;SAF=17;SAR=19;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036397;STB=0.520264;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0201127;OID=.;OPOS=48456002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:73:37:37:36:36:0.493151:19:17:16:21:19:17:16:21 chr17 48472270 . C T 313.98 PASS AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00623809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2917;QD=30.6325;RBI=0.0198373;REFB=-0.000159928;REVB=0.0188309;RO=13;SAF=10;SAR=17;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103509;STB=0.570842;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.000594496;OID=.;OPOS=48472270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:13:14:27:27:0.658537:17:10:7:6:17:10:8:6 chr17 48598785 . G A 558.13 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.0573932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.281;QD=23.0158;RBI=0.0573939;REFB=-0.0219004;REVB=0.000286683;RO=45;SAF=24;SAR=28;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190228;STB=0.604357;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00638566;OID=.;OPOS=48598785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:28:24:31:14:28:24:31:14 chr17 48599450 . A T 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.000816153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.865;QD=15.1969;RBI=0.0295277;REFB=-0.00370469;REVB=-0.0295164;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961734;STB=0.555478;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00619775;OID=.;OPOS=48599450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:6:12:8:6:6:12 chr17 48603503 . C T 71.7 PASS AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0570597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.505;QD=7.96626;RBI=0.0574503;REFB=-0.00224132;REVB=0.00668758;RO=26;SAF=4;SAR=6;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331209;STB=0.70176;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00339111;OID=.;OPOS=48603503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:36:36:26:26:10:10:0.277778:6:4:18:8:6:4:18:8 chr17 48606537 . C G 225.32 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0257491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8875;QD=27.3112;RBI=0.0261944;REFB=0.00757729;REVB=-0.00480934;RO=12;SAF=7;SAR=14;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17222;STB=0.595651;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.00517802;OID=.;OPOS=48606537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:14:7:7:5:14:7:7:5 chr17 48607614 . G A 57.33 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.014497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.889;QD=12.7393;RBI=0.0145806;REFB=-0.0178872;REVB=0.00155917;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930819;STB=0.555418;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0223134;OID=.;OPOS=48607614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:6:4:4:4:6:4 chr17 48608717 . T C 442.77 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00110934;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.768;QD=19.6785;RBI=0.00238362;REFB=-0.00780918;REVB=0.00210974;RO=46;SAF=17;SAR=27;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146573;STB=0.581501;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00814941;OID=.;OPOS=48608717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:27:17:25:21:27:17:25:21 chr17 48610272 . G C 485.12 PASS AF=0.5;AO=39;DP=86;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.0210546;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.98;QD=20.6435;RBI=0.0298044;REFB=-0.0309843;REVB=0.0210952;RO=47;SAF=21;SAR=18;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212079;STB=0.585419;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0308065;OID=.;OPOS=48610272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:94:47:47:39:47:0.5:18:21:15:32:24:23:15:32 chr17 48613837 . A G 287.59 PASS AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.00615446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.578;QD=13.5338;RBI=0.00618245;REFB=-0.0087362;REVB=-0.00058762;RO=52;SAF=11;SAR=22;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380251;STB=0.521726;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0139298;OID=.;OPOS=48613837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:52:52:33:33:0.388235:22:11:19:33:22:11:19:33 chr17 48625677 . G A 176.76 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0194731;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.538;QD=11.9836;RBI=0.0259301;REFB=-0.00722649;REVB=-0.0171221;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770974;STB=0.520046;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0165565;OID=.;OPOS=48625677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:59:38:37:22:22:0.372881:13:9:13:25:13:9:14:23 chr17 48625928 . C G 273.91 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00615583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.455;QD=17.6718;RBI=0.0095827;REFB=0.0107003;REVB=-0.00734397;RO=32;SAF=11;SAR=19;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183274;STB=0.602775;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.02314;OID=.;OPOS=48625928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:19:11:18:14:19:11:18:14 chr17 48626389 . C T 255.82 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0375914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.2374;QD=15.7425;RBI=0.0390264;REFB=-0.031685;REVB=-0.0104857;RO=35;SAF=7;SAR=22;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155276;STB=0.599926;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0370666;OID=.;OPOS=48626389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:22:7:13:22:22:7:14:22 chr17 48626398 . C T 272.3 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.000201569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.529;QD=17.2887;RBI=0.00400082;REFB=-0.0148708;REVB=-0.00399574;RO=33;SAF=7;SAR=23;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153149;STB=0.586515;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0284373;OID=.;OPOS=48626398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:23:7:12:21:23:7:12:21 chr17 48628092 . A G 54.73 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.038493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.179;QD=24.3259;RBI=0.0599687;REFB=-0.0107223;REVB=0.0459841;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0108909;OID=.;OPOS=48628092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:0:2:4:3:0:2 chr17 48628470 . T A 479.28 PASS AF=0.460177;AO=52;DP=114;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.0131591;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4752;QD=16.9656;RBI=0.0131721;REFB=-0.0193574;REVB=-0.000585871;RO=61;SAF=28;SAR=24;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345283;STB=0.519223;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0184299;OID=.;OPOS=48628470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:61:61:52:52:0.460177:24:28:35:26:24:28:35:26 chr17 48629458 . A G 1362.62 PASS AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0212149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6941;QD=59.8953;RBI=0.0545008;REFB=-0.0141858;REVB=-0.0502023;RO=1;SAF=54;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869637;STB=0.509257;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000145225;OID=.;OPOS=48629458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:91:91:1:2:89:89:0.978022:35:54:1:0:36:53:2:0 chr17 48653354 . C A 333.68 PASS AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0227128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.673;QD=24.268;RBI=0.0297647;REFB=-0.0111125;REVB=0.0192371;RO=20;SAF=16;SAR=17;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240148;STB=0.512134;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00671083;OID=.;OPOS=48653354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:20:22:33:33:0.6:17:16:9:11:17:16:10:12 chr17 48703752 . T C 527.52 PASS AF=0.524752;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.015443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.555;QD=20.8921;RBI=0.0162992;REFB=-0.0178921;REVB=0.00521322;RO=48;SAF=24;SAR=29;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105371;STB=0.557905;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0117536;OID=.;OPOS=48703752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:48:48:53:53:0.524752:29:24:16:32:29:24:16:32 chr17 48712705 . G A 676.79 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0175992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.693;QD=60.1589;RBI=0.0374362;REFB=-0.111301;REVB=0.0330414;RO=1;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170841;STB=0.509087;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00136355;OID=.;OPOS=48712705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:27:17:0:1:27:17:0:1 chr17 48712711 . C G 714.63 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0119219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.536;QD=60.8196;RBI=0.0358145;REFB=-0.0961254;REVB=0.033772;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00107956;OID=.;OPOS=48712711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:27:19:0:0:27:19:0:1 chr17 48761105 . C T 59.18 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0112568;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.563;QD=13.1521;RBI=0.0388864;REFB=-0.0241585;REVB=0.0372214;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295637;STB=0.675253;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.015443;OID=.;OPOS=48761105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:19:18:10:10:8:8:0.444444:5:3:7:3:5:3:7:3 chr17 48768486 . A G 378.06 PASS AF=0.407407;AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.00837551;FXX=0.0181802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.494;QD=14.0021;RBI=0.0214149;REFB=-0.0100656;REVB=-0.0197091;RO=64;SAF=14;SAR=30;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24747;STB=0.640179;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0137387;OID=.;OPOS=48768486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:108:64:64:44:44:0.407407:30:14:35:29:30:14:35:29 chr17 48784934 . T C 158.32 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0981718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1797;QD=18.0934;RBI=0.0983549;REFB=-0.0192614;REVB=0.00599884;RO=17;SAF=2;SAR=15;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339138;STB=0.689386;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0104372;OID=.;OPOS=48784934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:18:17:17:0.485714:15:2:6:11:15:2:6:12 chr17 48815465 . C G 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00221892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.428;QD=10.3792;RBI=0.0172696;REFB=-0.0132662;REVB=0.0171264;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198652;STB=0.621926;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0150806;OID=.;OPOS=48815465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:7:2:6:10:7:2:6:10 chr17 48834023 . A G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00353718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.964;QD=15.2577;RBI=0.0535623;REFB=-0.00745193;REVB=-0.0534454;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767769;STB=0.545327;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0173942;OID=.;OPOS=48834023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:4:2:3:4:4:2 chr17 48834032 . G A 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00304873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.235;QD=15.2589;RBI=0.00459977;REFB=0.0199181;REVB=-0.0034443;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767769;STB=0.545327;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=-0.00361272;OID=.;OPOS=48834032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:4:2:3:4:4:2 chr17 48917333 . C T 274.42 PASS AF=0.430556;AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00392518;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.252;QD=15.2457;RBI=0.015721;REFB=-0.00836476;REVB=0.0152231;RO=41;SAF=21;SAR=9;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18079;STB=0.586083;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0147634;OID=.;OPOS=48917333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:30:31:0.430556:9:21:22:19:10:21:22:19 chr17 48940422 . T C 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0199865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.821;QD=15.1603;RBI=0.0337778;REFB=-0.00482664;REVB=0.0272301;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136903;STB=0.578851;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00383657;OID=.;OPOS=48940422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:8:8:8:14:8:8:8:14 chr17 49098590 . G A 752.31 PASS AF=0.503268;AO=76;DP=153;FAO=77;FDP=153;FR=.;FRO=76;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.0157511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1381;QD=19.6682;RBI=0.0239536;REFB=-0.025085;REVB=0.0180466;RO=76;SAF=36;SAR=40;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119057;STB=0.561744;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0250734;OID=.;OPOS=49098590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:76:76:76:77:0.503268:40:36:46:30:40:37:46:30 chr17 49350802 . A C 205.17 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.000233266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.007;QD=15.782;RBI=0.00435896;REFB=-0.016307;REVB=0.00435271;RO=29;SAF=11;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00441764;STB=0.50251;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0211;OID=.;OPOS=49350802;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:12:11:14:15:12:11:14:15 chr17 49713300 . G A 2404.0 PASS AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203644;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.638;QD=61.2485;RBI=0.0286281;REFB=0;REVB=0.0201211;RO=0;SAF=80;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75874e-05;OID=.;OPOS=49713300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:77:80:0:0:77:80:0:0 chr17 51063068 . A G 181.23 PASS AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.029837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4867;QD=11.3268;RBI=0.0302989;REFB=0.00997496;REVB=0.00527021;RO=41;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268086;STB=0.515567;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.0180028;OID=.;OPOS=51063068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:41:41:23:23:0.359375:14:9:17:24:14:9:17:24 chr17 51901084 . A G 716.54 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384043;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.063;QD=57.3231;RBI=0.0167296;REFB=0;REVB=-0.0162828;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64099e-05;OID=.;OPOS=51901084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0 chr17 51901385 . C T 1641.95 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.761;QD=60.255;RBI=0.0204109;REFB=0;REVB=0.0112838;RO=0;SAF=40;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79859e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36611e-05;OID=.;OPOS=51901385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:69:40:0:0:69:40:0:0 chr17 51901643 . C T 1200.36 PASS AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0102622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.222;QD=58.554;RBI=0.0119007;REFB=0.112671;REVB=-0.00602606;RO=2;SAF=29;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182044;STB=0.509613;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.0017329;OID=.;OPOS=51901643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:51:29:0:2:51:29:0:2 chr17 51901703 . C G 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00271009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.224;QD=59.8381;RBI=0.0275604;REFB=0;REVB=-0.0274268;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.15254e-05;OID=.;OPOS=51901703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0 chr17 51902252 . C T 1757.52 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.962;QD=60.6043;RBI=0.0433373;REFB=0;REVB=0.0420121;RO=0;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.94371e-05;OID=.;OPOS=51902252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:116:0:0:114:116:1:55:59:0:0:56:60:0:0 chr17 51902492 . A AAAT 66.52 PASS AF=1;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=3;LEN=3;MLLD=182.539;QD=38.0126;RBI=0.014204;REFB=0;REVB=-0.014204;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.793444;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000129147;OID=.;OPOS=51902493;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:13:7:7:0:0:7:0:0:4:6:0:7:4:2 chr17 53076799 . G A 955.19 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00807038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.896;QD=58.7807;RBI=0.00866436;REFB=0;REVB=-0.0031528;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.06596e-05;OID=.;OPOS=53076799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:40:25:0:0:40:25:0:0 chr17 53076986 . G A 358.11 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000263611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0029;QD=55.0944;RBI=0.060609;REFB=0;REVB=0.0606084;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142965;OID=.;OPOS=53076986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr17 53400110 . T C 668.66 PASS AF=0.467105;AO=71;DP=152;FAO=71;FDP=152;FR=.;FRO=81;FSAF=51;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.000714471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.19;QD=17.5962;RBI=0.00844274;REFB=-0.013295;REVB=0.00841246;RO=81;SAF=51;SAR=20;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268738;STB=0.649637;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0136041;OID=.;OPOS=53400110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:81:81:71:71:0.467105:20:51:37:44:20:51:37:44 chr17 53400918 . GT G 204.38 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.11681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.6229;QD=10.4812;RBI=0.148103;REFB=-0.0477553;REVB=-0.0910494;RO=38;SAF=19;SAR=18;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181167;STB=0.576231;STBP=0.219;TYPE=del;VARB=0.0446724;OID=.;OPOS=53400919;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.474359:37:78:37:78:41:20:17:28:13:99:38:19:18:27:11 chr17 53485186 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3094;QD=47.8215;RBI=0.0361364;REFB=0;REVB=0.0121429;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000641728;OID=.;OPOS=53485186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr17 53851228 . C T 1939.35 PASS AF=0.992126;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0344079;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7908;QD=61.082;RBI=0.0437494;REFB=-0.115156;REVB=0.0270205;RO=1;SAF=58;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693679;STB=0.503649;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000607221;OID=.;OPOS=53851228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:128:127:1:1:126:126:0.992126:68:58:0:1:68:58:0:1 chr17 54450038 . C A 375.41 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.333;QD=55.6167;RBI=0.0284921;REFB=0;REVB=0.0200651;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.07713e-06;OID=.;OPOS=54450038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0 chr17 54450134 . G A 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.572;QD=63.2857;RBI=0.0280132;REFB=0;REVB=0.00513912;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54893e-05;OID=.;OPOS=54450134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0 chr17 54534634 . G A 585.86 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00442557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.731;QD=60.0877;RBI=0.0219554;REFB=0;REVB=-0.0215048;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166809;OID=.;OPOS=54534634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:16:22:0:0:17:22:0:0 chr17 54921494 . A C 972.87 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.003;QD=58.962;RBI=0.0136918;REFB=0;REVB=6.45029e-05;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.19587e-05;OID=.;OPOS=54921494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0 chr17 54978794 . G A 981.65 PASS AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0235262;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.722;QD=56.0942;RBI=0.0436864;REFB=-0.376837;REVB=0.0368106;RO=1;SAF=44;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192841;STB=0.519994;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00159371;OID=.;OPOS=54978794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:70:70:1:2:68:68:0.971429:24:44:0:1:24:44:0:2 chr17 55027850 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.602;QD=57.6806;RBI=0.0401746;REFB=0;REVB=0.00483565;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471128;OID=.;OPOS=55027850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0 chr17 55182811 . CT C 472.57 PASS AF=1;AO=40;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128325;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.9226;QD=42.9609;RBI=0.164203;REFB=0;REVB=0.102446;RO=2;SAF=18;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492943;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00709784;OID=.;OPOS=55182812;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:40:45:44:44:0:22:22:0:0:9:2:18:22:2:0 chr17 55183203 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.794;QD=55.656;RBI=0.0429791;REFB=0;REVB=0.0239489;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000578924;OID=.;OPOS=55183203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr17 55183716 . T C 857.36 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226003;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.865;QD=58.1258;RBI=0.0398885;REFB=0;REVB=0.0328682;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.03435e-05;OID=.;OPOS=55183716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0 chr17 55198420 . C T 157.29 PASS AF=0.435897;AO=15;DP=37;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00823031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.495;QD=16.1328;RBI=0.0144644;REFB=-0.00396917;REVB=0.0118946;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243281;STB=0.681208;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0055299;OID=.;OPOS=55198420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:39:20:22:15:17:0.435897:9:6:13:7:11:6:15:7 chr17 55334495 . A AG 52.73 PASS AF=0.244898;AO=18;DP=56;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.216178;FXX=0.0576812;HRUN=0;LEN=1;MLLD=56.9935;QD=4.30467;RBI=0.216184;REFB=-0.0162977;REVB=0.00157737;RO=37;SAF=16;SAR=2;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.584255;STB=0.873748;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.100814;OID=.;OPOS=55334496;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.244898:18:56:12:49:37:11:1:19:18:52:37:16:2:16:21 chr17 55607022 . A G 394.99 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0292127;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0508;QD=22.5709;RBI=0.0298434;REFB=-0.015852;REVB=-0.00610291;RO=30;SAF=16;SAR=23;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175763;STB=0.603446;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0105314;OID=.;OPOS=55607022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:30:31:39:39:0.557143:23:16:19:11:23:16:20:11 chr17 55822171 . T C 189.88 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0106911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.542;QD=11.336;RBI=0.0129063;REFB=-0.0269477;REVB=-0.00722995;RO=42;SAF=10;SAR=14;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194578;STB=0.604852;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0448557;OID=.;OPOS=55822171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:42:43:24:24:0.358209:14:10:25:17:14:10:25:18 chr17 55822214 . T A 194.14 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00910033;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6802;QD=11.5903;RBI=0.0279458;REFB=-0.0214421;REVB=0.0264226;RO=40;SAF=8;SAR=16;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187584;STB=0.618455;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0180524;OID=.;OPOS=55822214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:40:43:24:24:0.358209:16:8:20:20:16:8:22:21 chr17 55822467 . G A 372.28 PASS AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0216805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0701;QD=15.195;RBI=0.0221615;REFB=0.00168817;REVB=-0.00459213;RO=58;SAF=28;SAR=12;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169539;STB=0.596362;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00138612;OID=.;OPOS=55822467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:58:58:40:40:0.408163:12:28:32:26:12:28:32:26 chr17 55822568 . CATTTTTTT CATTTTTTC,CCATTTTTC,TCATTTTTT,TCCATTTTT 491.01 PASS AF=0.5,0,0,0;AO=32,4,4,5;DP=106;FAO=53,0,0,0;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=28,0,0,0;FSAR=25,0,0,0;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0357801,0.00319242,0.0537357,0.00932283;FXX=0;HRUN=7,1,1,1;LEN=1,8,3,4;MLLD=21.0035,31.8109,27.9737,55.6464;QD=18.5288;RBI=0.149123,0.121191,0.192373,0.160099;REFB=-0.0352337,-0.023616,-0.0193684,-0.019772;REVB=-0.144767,-0.121149,-0.184716,-0.159828;RO=23;SAF=25,0,0,0;SAR=7,4,4,5;SRF=14;SRR=9;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.169813,-0.67482,-0.67482,-0.709336;STB=0.567969,0.5,0.5,0.5;STBP=0.162,1,1,1;TYPE=snp,mnp,mnp,mnp;VARB=-0.00760181,0,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=55822576,55822569,55822568,55822568;OREF=T,ATTTTTTT,CAT,CATT;OALT=C,CATTTTTC,TCA,TCCA;OMAPALT=CATTTTTTC,CCATTTTTC,TCATTTTTT,TCCATTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:23:47:32,4,4,5:53,0,0,0:0.5,0,0,0:7,4,4,5:25,0,0,0:14:9:25,0,0,0:28,0,0,0:18:29 chr17 56396587 . T C 211.87 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0140235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.868;QD=16.6174;RBI=0.0352858;REFB=-0.00462819;REVB=-0.0323794;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103749;STB=0.547129;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00680701;OID=.;OPOS=56396587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:27:28:23:23:0.45098:11:12:17:10:11:12:17:11 chr17 56432362 . C G 557.73 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.006;QD=60.2952;RBI=0.0419151;REFB=0;REVB=0.0254146;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90901e-05;OID=.;OPOS=56432362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0 chr17 56540267 . C T 1838.92 PASS AF=1;AO=117;DP=117;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00209159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.539;QD=61.2973;RBI=0.0158886;REFB=0;REVB=0.0157503;RO=0;SAF=50;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36992e-05;OID=.;OPOS=56540267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:120:0:0:117:120:1:67:50:0:0:67:53:0:0 chr17 56544280 . T G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.154;QD=58.5876;RBI=0.0541151;REFB=0;REVB=-0.0541;RO=0;SAF=25;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00045616;OID=.;OPOS=56544280;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:8:25:0:0:8:25:0:0 chr17 56568680 . C T 673.65 PASS AF=0.918367;AO=45;DP=50;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00512618;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.865;QD=54.9919;RBI=0.00679568;REFB=0.0304944;REVB=-0.00446135;RO=4;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089208;STB=0.547598;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0109344;OID=.;OPOS=56568680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:50:49:4:4:45:45:0.918367:19:26:0:4:19:26:0:4 chr17 56620167 . C T 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.52;QD=49.5992;RBI=0.0274925;REFB=0;REVB=0.0212045;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167713;OID=.;OPOS=56620167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr17 56620501 . A G 1472.56 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.392;QD=63.3361;RBI=0.0152155;REFB=0;REVB=0.00708104;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90948e-05;OID=.;OPOS=56620501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0 chr17 56621286 . G T 1008.16 PASS AF=0.879518;AO=73;DP=83;FAO=73;FDP=83;FR=.;FRO=10;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0292436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3362;QD=48.5861;RBI=0.0542848;REFB=3.91538e-06;REVB=0.0457346;RO=9;SAF=33;SAR=40;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00158773;STB=0.505822;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.000499923;OID=.;OPOS=56621286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:83:83:9:10:73:73:0.879518:40:33:4:5:40:33:5:5 chr17 56621288 . C T 35.01 PASS AF=0.111111;AO=9;DP=81;FAO=9;FDP=81;FR=.;FRO=72;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0286322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.7681;QD=1.72891;RBI=0.0347151;REFB=-0.0306221;REVB=0.01963;RO=72;SAF=4;SAR=5;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331396;STB=0.524806;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.248976;OID=.;OPOS=56621288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:81:81:72:72:9:9:0.111111:5:4:34:38:5:4:34:38 chr17 56621359 . T C,G 1494.3 PASS AF=0.96875,0.03125;AO=86,5;DP=91;FAO=93,3;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45,3;FSAR=48,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00609056,-0.0105814;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=165.404,123.752;QD=62.2624;RBI=0.109435,0.0875183;REFB=0,0;REVB=0.109266,0.0868762;RO=0;SAF=44,4;SAR=42,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000395696,0.0443719;OID=.,.;OPOS=56621359,56621359;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:91:96:0:0:86,5:93,3:0.96875,0.03125:42,1:44,4:0:0:48,0:45,3:0:0 chr17 56636854 . T C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.511;QD=58.9627;RBI=0.0273031;REFB=0;REVB=0.0141321;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14771e-05;OID=.;OPOS=56636854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0 chr17 56643109 . A G,T 803.41 PASS AF=0.947368,0.0526316;AO=53,3;DP=56;FAO=54,3;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=34,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397156,0.0126498;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=92.1395,176.67;QD=56.3793;RBI=0.0454056,0.0142559;REFB=0,0;REVB=0.0220077,0.00657376;RO=0;SAF=19,1;SAR=34,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.97342e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000648375,0.0553464;OID=.,.;OPOS=56643109,56643109;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:56:57:0:0:53,3:54,3:0.947368,0.0526316:34,2:19,1:0:0:34,2:20,1:0:0 chr17 56659018 . C T 669.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.751;QD=62.2538;RBI=0.0475271;REFB=0;REVB=-0.0046344;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000290516;OID=.;OPOS=56659018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:27:16:0:0 chr17 56709034 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.076;QD=43.4862;RBI=0.0940854;REFB=0;REVB=-0.0937774;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011414;OID=.;OPOS=56709034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr17 56709058 . G C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.267;QD=49.599;RBI=0.0581341;REFB=0;REVB=0.0557965;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346517;OID=.;OPOS=56709058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0 chr17 56709077 . A G 244.1 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.104;QD=48.8192;RBI=0.159445;REFB=0;REVB=0.154238;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0036182;OID=.;OPOS=56709077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:9:10:0:0:10:10:0:0 chr17 56709103 . CAAAT C 209.92 PASS AF=1;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00478237;FXX=0.142789;HRUN=3;LEN=4;MLLD=223.764;QD=46.6496;RBI=0.0100053;REFB=0;REVB=-0.00878838;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-7.25614e-05;OID=.;OPOS=56709104;OREF=AAAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:18:21:18:18:0:10:8:0:0:4:0:10:8:0:0 chr17 56709159 . G C 45.99 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0574309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0767;QD=9.19703;RBI=0.0603006;REFB=-0.00454237;REVB=0.0183806;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311223;STB=0.713673;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00302352;OID=.;OPOS=56709159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:12:13:7:7:0.35:5:2:7:5:5:2:8:5 chr17 56736547 . G A 293.34 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00301907;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.12;QD=53.3338;RBI=0.00414288;REFB=0;REVB=-0.00283701;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7785e-07;OID=.;OPOS=56736547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:5:17:0:0:5:17:0:0 chr17 56736596 . T TCCCAAACACAA 88.22 PASS AF=1;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161282;FXX=0;HRUN=0;LEN=11;MLLD=402.841;QD=39.2068;RBI=0.021133;REFB=0;REVB=0.013656;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529407;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-8.86844e-06;OID=.;OPOS=56736597;OREF=-;OALT=CCCAAACACAA;OMAPALT=TCCCAAACACAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:8:21:9:9:0:4:5:0:0:4:12:4:4:12:0 chr17 56736640 . A T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.905;QD=35.5757;RBI=0.113549;REFB=0;REVB=0.000356753;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253567;OID=.;OPOS=56736640;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0 chr17 56755092 . TA T 527.45 PASS AF=1;AO=44;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.141125;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.8603;QD=45.8651;RBI=0.14221;REFB=0;REVB=-0.0175385;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00488652;OID=.;OPOS=56755093;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:44:46:46:46:0:21:25:0:0:10:0:19:25:0:0 chr17 56756977 . A G 584.71 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.353;QD=59.9703;RBI=0.0760152;REFB=0;REVB=0.0420939;RO=1;SAF=28;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164445;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001579;OID=.;OPOS=56756977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:1:0:38:39:1:10:28:1:0:10:29:0:0 chr17 56771096 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.608;QD=42.1826;RBI=0.0066942;REFB=0;REVB=0.0066942;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72342e-05;OID=.;OPOS=56771096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0 chr17 57059119 . GAAA GAA,GAAT 1117.19 PASS AF=1,0;AO=60,15;DP=76;FAO=76,0;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0994254,-0.0432809;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=28.0962,15.8207;QD=58.7992;RBI=0.0997312,0.208389;REFB=0,0;REVB=0.00780472,-0.203845;RO=1;SAF=42,1;SAR=18,14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0254925,0.0314901;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00173276,0;OID=.,.;OPOS=57059120,57059122;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=GAA,GAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:60,15:76:76,0:76:0:43,0:33,0:0:0:6:1:42,1:18,14:0:1 chr17 57287454 . A G 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.144;QD=59.5016;RBI=0.0437579;REFB=0;REVB=0.0253333;RO=0;SAF=46;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012597;OID=.;OPOS=57287454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:23:46:0:0:23:46:0:0 chr17 57290383 . G A 616.95 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000304132;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.714;QD=61.6953;RBI=0.00297206;REFB=0;REVB=0.00295646;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00094e-05;OID=.;OPOS=57290383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0 chr17 57477235 . T G 184.84 PASS AF=0.396552;AO=22;DP=57;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0292132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.145;QD=12.7475;RBI=0.0295521;REFB=-0.000425947;REVB=-0.00446238;RO=35;SAF=11;SAR=11;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198987;STB=0.599917;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.000104461;OID=.;OPOS=57477235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:35:35:22:23:0.396552:11:11:24:11:11:12:24:11 chr17 57477616 . G A 431.85 PASS AF=0.453608;AO=43;DP=96;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00693413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.176;QD=17.8084;RBI=0.0153428;REFB=-0.0178183;REVB=-0.0136864;RO=52;SAF=21;SAR=22;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113756;STB=0.505152;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0131239;OID=.;OPOS=57477616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:52:53:43:44:0.453608:22:21:26:26:22:22:26:27 chr17 57478276 . T A 626.8 PASS AF=0.48855;AO=63;DP=130;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0174546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.003;QD=19.1389;RBI=0.018294;REFB=-0.00976341;REVB=0.00547811;RO=67;SAF=27;SAR=36;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602076;STB=0.528384;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0104865;OID=.;OPOS=57478276;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:67:67:63:64:0.48855:36:27:33:34:36:28:33:34 chr17 57951973 . G A 95.55 PASS AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0687782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.336;QD=11.5814;RBI=0.0778196;REFB=-0.00936357;REVB=-0.0364066;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394925;STB=0.726972;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0350125;OID=.;OPOS=57951973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:6:6:3:18:6:6:3:18 chr17 57963537 . A G 107.43 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0166535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1584;QD=12.6393;RBI=0.0235292;REFB=-0.0090112;REVB=0.0166218;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910385;STB=0.538402;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0152924;OID=.;OPOS=57963537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:7:6:11:9:7:6:11:10 chr17 58024275 . A G 64.84 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.008352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.147;QD=10.3749;RBI=0.00836586;REFB=-0.0143997;REVB=-0.000481349;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189101;STB=0.613789;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0307558;OID=.;OPOS=58024275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:10:6:5:4:10:6 chr17 58024324 . A G 203.05 PASS AF=0.44186;AO=15;DP=46;FAO=19;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00981158;FXX=0.0652032;HRUN=9;LEN=1;MLLD=239.555;QD=18.8886;RBI=0.024576;REFB=-0.00550053;REVB=0.0225324;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156055;STB=0.565645;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.000801233;OID=.;OPOS=58024324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:43:12:18:15:19:0.44186:7:8:4:8:8:11:8:10 chr17 58031412 . A G 124.16 PASS AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0203752;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.156;QD=27.592;RBI=0.0203971;REFB=-0.0371359;REVB=0.000944427;RO=5;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995427;STB=0.555473;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0112894;OID=.;OPOS=58031412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:8:5:1:4:8:5:1:4 chr17 58256327 . A T 722.15 PASS AF=0.530303;AO=70;DP=132;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00853805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2196;QD=21.8833;RBI=0.032092;REFB=-0.00532858;REVB=-0.0309354;RO=62;SAF=27;SAR=43;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155071;STB=0.585138;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00396612;OID=.;OPOS=58256327;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:62:62:70:70:0.530303:43:27:35:27:43:27:35:27 chr17 58786625 . A G 1438.38 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00401517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5841;QD=61.8658;RBI=0.0147369;REFB=-0.0324054;REVB=0.0141794;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000492778;OID=.;OPOS=58786625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:49:43:0:0:49:43:1:0 chr17 58824567 . T C 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1131;QD=57.711;RBI=0.0731497;REFB=0;REVB=0.0478593;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121261;OID=.;OPOS=58824567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0 chr17 59482169 . C G 80.99 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.0148263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.869;QD=7.71357;RBI=0.0586649;REFB=-0.0180952;REVB=0.0567604;RO=27;SAF=11;SAR=1;SRF=23;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188612;STB=0.687109;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.100566;OID=.;OPOS=59482169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:27:30:12:12:0.285714:1:11:23:4:1:11:24:6 chr17 59482173 . G A 79.42 PASS AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.00451017;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=308.474;QD=6.90642;RBI=0.048035;REFB=-0.00360019;REVB=-0.0478228;RO=35;SAF=10;SAR=1;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31401;STB=0.708186;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00718027;OID=.;OPOS=59482173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:1:10:27:8:1:10:27:8 chr17 59485555 . C T 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0161914;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.981;QD=14.1699;RBI=0.0233102;REFB=-0.0114979;REVB=0.0167691;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655979;STB=0.538386;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0130074;OID=.;OPOS=59485555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:4:8:6:4:4:8 chr17 59533868 . G C 559.76 PASS AF=0.398773;AO=65;DP=162;FAO=65;FDP=163;FR=.;FRO=98;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.0426219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2006;QD=13.7365;RBI=0.0497808;REFB=0.00154233;REVB=0.0257197;RO=94;SAF=27;SAR=38;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900153;STB=0.557528;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.00287072;OID=.;OPOS=59533868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:94:98:65:65:0.398773:38:27:47:47:38:27:50:48 chr17 59534987 . T G 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0120738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.64;QD=27.2211;RBI=0.0345846;REFB=-0.0399255;REVB=0.0324086;RO=15;SAF=11;SAR=13;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982784;STB=0.554326;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0225038;OID=.;OPOS=59534987;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:13:11:9:6:13:11:9:6 chr17 59667953 . G A 518.71 PASS AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=14;FWDB=0.00570221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.139;QD=19.3912;RBI=0.0142131;REFB=-0.00335754;REVB=0.0130191;RO=53;SAF=15;SAR=39;SRF=39;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409092;STB=0.725873;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00492976;OID=.;OPOS=59667953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:53:53:54:54:0.504673:39:15:39:14:39:15:39:14 chr17 59668021 . G C 379.42 PASS AF=0.493671;AO=38;DP=78;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0180705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.044;QD=19.2112;RBI=0.0183027;REFB=-0.0184078;REVB=0.00290638;RO=39;SAF=11;SAR=27;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286253;STB=0.669309;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0141033;OID=.;OPOS=59668021;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:39:40:38:39:0.493671:27:11:23:16:28:11:24:16 chr17 59668352 . C T 738.39 PASS AF=0.454545;AO=78;DP=175;FAO=80;FDP=176;FR=.;FRO=96;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.00722415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1102;QD=16.7817;RBI=0.00810589;REFB=-0.00906351;REVB=-0.00367656;RO=96;SAF=36;SAR=42;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00719462;STB=0.503418;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0161807;OID=.;OPOS=59668352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:96:96:78:80:0.454545:42:36:45:51:42:38:45:51 chr17 59760174 . G A 127.2 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0208903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.192;QD=11.5634;RBI=0.0210209;REFB=-0.00628361;REVB=-0.00233964;RO=27;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128693;STB=0.603033;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0161621;OID=.;OPOS=59760174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:29:15:15:0.340909:10:5:12:15:10:5:14:15 chr17 59760996 . A G 170.24 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=0.0171621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.201;QD=17.0243;RBI=0.0424899;REFB=-0.0181458;REVB=0.0388697;RO=22;SAF=12;SAR=6;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236083;STB=0.632527;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0194403;OID=.;OPOS=59760996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:6:12:19:3:6:12:19:3 chr17 59763347 . A G 294.2 PASS AF=0.470588;AO=31;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00809481;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.833;QD=17.3057;RBI=0.00849268;REFB=-0.0101872;REVB=0.00256899;RO=37;SAF=14;SAR=17;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859701;STB=0.54794;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0103892;OID=.;OPOS=59763347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:36:31:32:0.470588:17:14:20:17:18:14:19:17 chr17 59763465 . T C 920.09 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000827554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.855;QD=58.4186;RBI=0.0333297;REFB=0;REVB=0.0333194;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104612;OID=.;OPOS=59763465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0 chr17 59924502 . T C 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00659896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.867;QD=13.5806;RBI=0.00768167;REFB=-0.00213456;REVB=0.00393215;RO=28;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693722;STB=0.540422;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00450656;OID=.;OPOS=59924502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:8:9:13:15:8:9:13:15 chr17 59955426 . T G 1190.46 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.12;QD=61.0492;RBI=0.018373;REFB=0;REVB=0.00172293;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24077e-05;OID=.;OPOS=59955426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0 chr17 59969000 . T C 265.36 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0755097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3112;QD=17.9903;RBI=0.0774008;REFB=0.00051426;REVB=0.0170048;RO=30;SAF=9;SAR=20;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29846;STB=0.667344;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.000581253;OID=.;OPOS=59969000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:20:9:19:11:20:9:19:11 chr17 60020136 . AAAAG A,AA 174.89 PASS AF=0,0.560976;AO=6,15;DP=41;FAO=0,23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=0,13;FSAR=0,10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0040702,-0.00271465;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=4,3;MLLD=262.589,270.77;QD=17.0629;RBI=0.0177402,0.0195766;REFB=-0.00739912,-0.00729095;REVB=0.0172669,0.0193875;RO=18;SAF=2,10;SAR=4,5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0690318,0.265355;STB=0.5,0.5771;STBP=1,0.316;TYPE=del,del;VARB=0.00393255,0.00669869;OID=.,.;OPOS=60020137,60020138;OREF=AAAG,AAG;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.560976:6,15:41:0,23:41:18:0,13:0,10:7:11:99:18:2,10:4,5:7:11 chr17 60040329 . C T 248.61 PASS AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=0.0302452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.874;QD=25.4982;RBI=0.0306035;REFB=-0.00287562;REVB=-0.00466924;RO=16;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295594;STB=0.661817;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00238012;OID=.;OPOS=60040329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:13:10:1:15:13:10:1:15 chr17 60043884 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.312;QD=58.2396;RBI=0.0127517;REFB=0;REVB=0.00482677;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88319e-05;OID=.;OPOS=60043884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0 chr17 60043929 . T C 184.82 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.010701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.386;QD=12.1191;RBI=0.0322466;REFB=-0.00412241;REVB=0.0304193;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201661;STB=0.502855;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.00615828;OID=.;OPOS=60043929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:37:38:23:23:0.377049:11:12:20:17:11:12:20:18 chr17 60083208 . G T 173.89 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.098418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.155;QD=19.3211;RBI=0.0988055;REFB=0.033767;REVB=0.00874246;RO=18;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115755;STB=0.565149;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.0384576;OID=.;OPOS=60083208;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:12:6:4:14:12:6:4:14 chr17 60345508 . A G 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0873873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.281;QD=23.2196;RBI=0.0899101;REFB=-0.0830059;REVB=-0.0211495;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.571154;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0030577;OID=.;OPOS=60345508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:1:0:2:3:1:0 chr17 60348325 . G A 2483.75 PASS AF=0.993865;AO=162;DP=165;FAO=162;FDP=163;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122113;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3587;QD=60.9509;RBI=0.0156567;REFB=-0.102524;REVB=0.00979891;RO=1;SAF=82;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.005911;STB=0.503105;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000393664;OID=.;OPOS=60348325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:165:163:1:1:162:162:0.993865:80:82:0:1:80:82:0:1 chr17 60351457 . G A 3085.82 PASS AF=1;AO=193;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.044;QD=63.6252;RBI=0.0708533;REFB=0;REVB=-0.060806;RO=0;SAF=96;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5437e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41335e-05;OID=.;OPOS=60351457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:194:194:0:0:193:194:1:97:96:0:0:97:97:0:0 chr17 60503892 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237938;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.621;QD=37.4885;RBI=0.0295241;REFB=0;REVB=0.0174795;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00097869;OID=.;OPOS=60503892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0 chr17 60525047 . C T 470.79 PASS AF=0.647059;AO=43;DP=68;FAO=44;FDP=68;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00506169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.926;QD=27.6932;RBI=0.0617254;REFB=-0.00205801;REVB=-0.0615175;RO=24;SAF=22;SAR=21;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035033;STB=0.522717;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.000519527;OID=.;OPOS=60525047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:24:24:43:44:0.647059:21:22:11:13:21:23:11:13 chr17 60683503 . A G 437.59 PASS AF=0.457143;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.00558942;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.652;QD=16.6702;RBI=0.0262766;REFB=-0.0174575;REVB=0.0256752;RO=58;SAF=24;SAR=24;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845138;STB=0.542839;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0204661;OID=.;OPOS=60683503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:58:57:48:48:0.457143:24:24:24:34:24:24:24:33 chr17 60690271 . C G 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0136481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.328;QD=17.3212;RBI=0.0179446;REFB=-0.0220131;REVB=-0.0116506;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221667;STB=0.512696;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0187885;OID=.;OPOS=60690271;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:11:5:6:12:11:5:6:12 chr17 60742279 . C T 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00268008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.796;QD=18.4438;RBI=0.0118918;REFB=0.00866261;REVB=-0.0115858;RO=9;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967735;STB=0.555457;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=-0.0079743;OID=.;OPOS=60742279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:5:6:6:3:5:6:6:3 chr17 60753904 . A C 754.28 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9888;QD=56.9267;RBI=0.0157103;REFB=0;REVB=0.0040668;RO=0;SAF=14;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.35559e-05;OID=.;OPOS=60753904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:39:14:0:0:39:14:0:0 chr17 60758273 . G C 947.84 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3223;QD=58.3284;RBI=0.0304408;REFB=0;REVB=-0.0271755;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000377223;OID=.;OPOS=60758273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:39:25:0:0:40:25:0:0 chr17 60766224 . A G 1115.75 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0252;QD=60.3107;RBI=0.00974352;REFB=0;REVB=0.00822321;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34795e-05;OID=.;OPOS=60766224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:32:42:0:0:32:42:0:0 chr17 60767015 . G A 820.19 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0269937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.451;QD=55.6064;RBI=0.0701647;REFB=-0.0825003;REVB=0.0647644;RO=0;SAF=13;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00113601;OID=.;OPOS=60767015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:0:1:58:58:0.983051:45:13:0:0:45:13:0:1 chr17 60769803 . A G 126.84 PASS AF=0.319149;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00371158;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.208;QD=10.7948;RBI=0.0187619;REFB=-0.0128485;REVB=-0.0183911;RO=32;SAF=4;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143692;STB=0.586545;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0215265;OID=.;OPOS=60769803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:32:32:15:15:0.319149:11:4:12:20:11:4:12:20 chr17 60813627 . G A 192.68 PASS AF=0.316456;AO=25;DP=79;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0140086;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7784;QD=9.75605;RBI=0.0147386;REFB=-0.00807601;REVB=0.00458122;RO=54;SAF=9;SAR=16;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102606;STB=0.56046;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0162944;OID=.;OPOS=60813627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:54:54:25:25:0.316456:16:9:24:30:16:9:24:30 chr17 60814273 . A G 184.39 PASS AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.016908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.197;QD=10.1034;RBI=0.0179294;REFB=-0.0112403;REVB=0.00596509;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129016;STB=0.575281;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0126963;OID=.;OPOS=60814273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:49:49:24:24:0.328767:12:12:19:30:12:12:19:30 chr17 61559923 . C T 908.52 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.239;QD=57.6837;RBI=0.0275591;REFB=0;REVB=0.0242354;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71956e-05;OID=.;OPOS=61559923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:31:31:0:0:31:32:0:0 chr17 61562309 . C T 206.97 PASS AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602166;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.163;QD=48.6997;RBI=0.0614647;REFB=0;REVB=0.0123233;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267535;OID=.;OPOS=61562309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:6:10:0:0:6:11:0:0 chr17 61562774 . T C 293.37 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472655;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.222;QD=53.3401;RBI=0.0488962;REFB=0;REVB=-0.0125223;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264254;OID=.;OPOS=61562774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr17 61564052 . A G 563.7 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00215873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7564;QD=57.8149;RBI=0.00614523;REFB=-0.0432627;REVB=0.00575359;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176841;STB=0.509429;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00139326;OID=.;OPOS=61564052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:26:12:0:1:26:12:0:1 chr17 61566031 . G A 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0039985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.709;QD=57.7119;RBI=0.0395182;REFB=0;REVB=0.0393154;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105263;OID=.;OPOS=61566031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0 chr17 61573761 . T C 323.19 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313804;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5454;QD=53.8643;RBI=0.0626126;REFB=0;REVB=-0.0625339;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00198248;OID=.;OPOS=61573761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr17 61805747 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.5456e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.993;QD=53.2771;RBI=0.0130823;REFB=0;REVB=0.013082;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90319e-05;OID=.;OPOS=61805747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr17 61838259 . G A 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.0195;QD=59.018;RBI=0.0895405;REFB=0;REVB=-0.0867101;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00207089;OID=.;OPOS=61838259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr17 61901197 . T A 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00197284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.27;QD=58.0608;RBI=0.0205077;REFB=0;REVB=0.0204125;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91032e-05;OID=.;OPOS=61901197;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0 chr17 61903445 . G C 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.886;QD=61.2132;RBI=0.0322622;REFB=0;REVB=-0.0297128;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.46549e-05;OID=.;OPOS=61903445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0 chr17 61906846 . T C 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00744455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.336;QD=56.9558;RBI=0.0128885;REFB=0;REVB=0.010521;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14835e-05;OID=.;OPOS=61906846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr17 61908271 . C T 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00392469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.503;QD=57.0005;RBI=0.00423212;REFB=0;REVB=0.00158354;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77684e-05;OID=.;OPOS=61908271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0 chr17 61908556 . C T 851.19 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.564;QD=57.7078;RBI=0.0318037;REFB=0;REVB=0.0203004;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011498;OID=.;OPOS=61908556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0 chr17 61910167 . G A 973.01 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.631;QD=58.97;RBI=0.0311276;REFB=0;REVB=0.0248941;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.58357e-05;OID=.;OPOS=61910167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:30:34:0:0:31:35:0:0 chr17 62019103 . G T 269.78 PASS AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0111538;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.445;QD=14.0143;RBI=0.0111677;REFB=-0.00175548;REVB=-0.000556768;RO=46;SAF=8;SAR=23;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18856;STB=0.608153;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00224123;OID=.;OPOS=62019103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:23:8:19:27:23:8:19:27 chr17 62020348 . T C 350.88 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00560835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.07;QD=20.6397;RBI=0.0162232;REFB=-0.0293607;REVB=-0.015223;RO=32;SAF=14;SAR=22;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967771;STB=0.553661;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0329389;OID=.;OPOS=62020348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:22:14:16:16:22:14:16:16 chr17 62041068 . T C 1607.13 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.314;QD=64.2851;RBI=0.0791961;REFB=0;REVB=0.0783083;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234003;OID=.;OPOS=62041068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:45:54:0:0:45:55:0:0 chr17 62121480 . T C 416.1 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011386;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.022;QD=57.3928;RBI=0.0506586;REFB=0;REVB=0.0493625;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00068476;OID=.;OPOS=62121480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr17 62125272 . A G 1499.72 PASS AF=1;AO=99;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00461613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.57;QD=59.395;RBI=0.0219573;REFB=0;REVB=0.0214666;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174866;OID=.;OPOS=62125272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:99:101:1:51:48:0:0:53:48:0:0 chr17 62141455 . A G 1357.16 PASS AF=0.967391;AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0692291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0278;QD=59.0071;RBI=0.0698362;REFB=-0.0443558;REVB=-0.00918871;RO=3;SAF=44;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106392;STB=0.505617;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00198783;OID=.;OPOS=62141455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:92:92:3:3:89:89:0.967391:45:44:2:1:45:44:2:1 chr17 62568057 . T C 400.53 PASS AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0372132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.148;QD=21.3618;RBI=0.0383267;REFB=-0.00103353;REVB=0.00917117;RO=35;SAF=17;SAR=23;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466773;STB=0.52576;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00106608;OID=.;OPOS=62568057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:23:17:13:22:23:17:13:22 chr17 62782689 . T C 1542.4 PASS AF=0.98;AO=94;DP=96;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00577289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9778;QD=61.696;RBI=0.0333742;REFB=-0.047689;REVB=0.0328711;RO=2;SAF=38;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392189;STB=0.502127;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.00302453;OID=.;OPOS=62782689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:96:100:2:2:94:98:0.98:56:38:1:1:59:39:1:1 chr17 62796759 . A C 563.79 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0291145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.834;QD=57.8246;RBI=0.0291312;REFB=0.0483009;REVB=-0.000986603;RO=1;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164445;STB=0.508767;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.000318674;OID=.;OPOS=62796759;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:28:10:0:1:28:10:0:1 chr17 62820746 . G T 892.52 PASS AF=0.941176;AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=68;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0119547;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.07;QD=52.5009;RBI=0.0477881;REFB=-0.128394;REVB=0.0462687;RO=4;SAF=28;SAR=36;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703414;STB=0.50373;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00125347;OID=.;OPOS=62820746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:68:68:4:4:64:64:0.941176:36:28:2:2:36:28:2:2 chr17 63533768 . G A 365.07 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0224335;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.613;QD=52.1523;RBI=0.022836;REFB=-0.0327427;REVB=0.00426875;RO=1;SAF=20;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226895;STB=0.512186;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.000181335;OID=.;OPOS=63533768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:7:20:1:0:7:20:1:0 chr17 63533789 . T C 525.11 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.402;QD=58.3453;RBI=0.073862;REFB=0;REVB=0.0641415;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000945309;OID=.;OPOS=63533789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:36:0:0:33:36:1:12:21:0:0:14:22:0:0 chr17 63534250 . T C 958.32 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162866;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.188;QD=58.9738;RBI=0.0731835;REFB=0;REVB=0.0713482;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200324;OID=.;OPOS=63534250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:24:40:0:0:25:40:0:0 chr17 63554591 . G A 88.03 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.0382189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9932;QD=14.0852;RBI=0.0421639;REFB=-0.0212677;REVB=-0.0178076;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173528;STB=0.59984;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0426474;OID=.;OPOS=63554591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:8:3:2:12:8:3:2:12 chr17 64023642 . A G,T 1593.21 PASS AF=0.962963,0.037037;AO=104,4;DP=108;FAO=104,4;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59,4;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387503,0.0300375;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=241.603,186.344;QD=59.0077;RBI=0.038802,0.0301517;REFB=0,0;REVB=0.00200229,0.00262157;RO=0;SAF=59,4;SAR=45,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000151217,0.156649;OID=.,.;OPOS=64023642,64023642;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:108:108:0:0:104,4:104,4:0.962963,0.037037:45,0:59,4:0:0:45,0:59,4:0:0 chr17 64208230 . G A 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00430157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.195;QD=58.419;RBI=0.00744438;REFB=0;REVB=-0.0060758;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51641e-06;OID=.;OPOS=64208230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:37:26:0:0:37:26:0:0 chr17 64210757 . C A 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0621887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7327;QD=16.172;RBI=0.0662854;REFB=-0.00609905;REVB=0.0229415;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27835;STB=0.668724;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00831954;OID=.;OPOS=64210757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:7:9:5:14:7:9:5:15 chr17 64783081 . G A 1541.81 PASS AF=0.990566;AO=103;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00102964;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6155;QD=58.1817;RBI=0.00111584;REFB=-0.0376821;REVB=-0.000430053;RO=1;SAF=47;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099887;STB=0.50505;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00232709;OID=.;OPOS=64783081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:1:1:103:105:0.990566:56:47:1:0:56:49:1:0 chr17 64800898 . G A 330.42 PASS AF=0.377551;AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0193548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.77;QD=13.4866;RBI=0.0298373;REFB=-0.00325264;REVB=-0.0227081;RO=60;SAF=21;SAR=16;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737277;STB=0.537243;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00419081;OID=.;OPOS=64800898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:60:61:37:37:0.377551:16:21:30:30:16:21:31:30 chr17 64801021 . A G 786.19 PASS AF=1;AO=47;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812363;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8518;QD=64.1788;RBI=0.0834965;REFB=0;REVB=0.0192957;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168626;OID=.;OPOS=64801021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:47:49:1:24:23:0:0:25:24:0:0 chr17 64880788 . G A 183.72 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0039354;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.844;QD=17.09;RBI=0.0107971;REFB=0.00516329;REVB=-0.0100544;RO=24;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210735;STB=0.620562;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0041366;OID=.;OPOS=64880788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:24:24:19:19:0.44186:12:7:14:10:12:7:14:10 chr17 64881075 . A G 366.02 PASS AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.00651998;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0999;QD=15.914;RBI=0.0263935;REFB=-0.0171027;REVB=-0.0255755;RO=52;SAF=24;SAR=15;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214067;STB=0.615325;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0383881;OID=.;OPOS=64881075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:53:39:39:0.423913:15:24:21:31:15:24:22:31 chr17 65027740 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00969339;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.925;QD=44.6898;RBI=0.0213168;REFB=0;REVB=-0.0189854;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122895;OID=.;OPOS=65027740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0 chr17 65066879 . A G 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00517143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.944;QD=57.7124;RBI=0.0188704;REFB=0;REVB=0.0181479;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78754e-05;OID=.;OPOS=65066879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0 chr17 65104666 . T G 1587.65 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.119;QD=64.1474;RBI=0.0317286;REFB=0;REVB=0.0224569;RO=0;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82802e-05;OID=.;OPOS=65104666;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:57:41:0:0:58:41:0:0 chr17 65104743 . G A 1752.53 PASS AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363434;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.657;QD=60.9575;RBI=0.0561649;REFB=0;REVB=0.0428211;RO=0;SAF=38;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58688e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.88682e-05;OID=.;OPOS=65104743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:77:38:0:0:77:38:0:0 chr17 65116109 . CT TC 85.95 PASS AF=0.294118;AO=7;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0318134;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=68.6744;QD=20.2238;RBI=0.0469257;REFB=-0.0559441;REVB=0.0344954;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.52454;STB=0.798799;STBP=0.145;TYPE=mnp;VARB=0.00755698;OID=.;OPOS=65116109;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:17:17:7:7:7:5:0.294118:1:6:2:5:1:4:2:5 chr17 65404916 . AAG A 44.23 PASS AF=0.307692;AO=7;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0121911;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=38.8716;QD=6.80492;RBI=0.0547554;REFB=-0.0113368;REVB=-0.053381;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248764;STB=0.719432;STBP=0.161;TYPE=del;VARB=0.0195179;OID=.;OPOS=65404917;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.307692:7:26:8:26:18:6:2:8:10:44:16:5:2:8:8 chr17 65574283 . A G 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277499;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.073;QD=57.8836;RBI=0.0357526;REFB=0;REVB=0.022543;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144559;OID=.;OPOS=65574283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0 chr17 65717525 . T C 179.62 PASS AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.029365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.129;QD=15.619;RBI=0.0296232;REFB=0.0005931;REVB=-0.00390328;RO=26;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135953;STB=0.568647;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=-0.000779218;OID=.;OPOS=65717525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:26:27:19:19:0.413043:7:12:13:13:7:12:14:13 chr17 65734425 . A G 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0176259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.522;QD=21.0076;RBI=0.0176276;REFB=-0.00973277;REVB=-0.000244882;RO=17;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466785;STB=0.526288;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0101467;OID=.;OPOS=65734425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:9:10:8:9:9:10:8:9 chr17 65739627 . A G 233.98 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0019621;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.182;QD=18.3515;RBI=0.00560898;REFB=0.000386705;REVB=-0.0052546;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30459;STB=0.671268;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.000129967;OID=.;OPOS=65739627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:8:17:9:17:8:17:9:17 chr17 65978851 . T G 683.02 PASS AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0347531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9988;QD=52.5397;RBI=0.0537617;REFB=-0.165245;REVB=0.0410188;RO=2;SAF=32;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109524;STB=0.505821;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00746477;OID=.;OPOS=65978851;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:52:52:2:2:50:50:0.961538:18:32:1:1:18:32:1:1 chr17 65989048 . T C 616.88 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319358;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1266;QD=61.6883;RBI=0.0443418;REFB=0;REVB=-0.0307619;RO=1;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199568;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45457e-05;OID=.;OPOS=65989048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:1:0:40:40:1:23:17:0:1:23:17:0:0 chr17 66016006 . T C 455.98 PASS AF=1;AO=30;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016402;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.854;QD=58.8362;RBI=0.0166551;REFB=0;REVB=-0.00289268;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018026;OID=.;OPOS=66016006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:16:15:0:0 chr17 66016096 . C T 365.01 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.104116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2562;QD=52.1446;RBI=0.105986;REFB=0.116823;REVB=-0.0198239;RO=1;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299926;STB=0.516117;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00477236;OID=.;OPOS=66016096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:15:12:0:1:15:12:0:1 chr17 66195838 . A T 250.39 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00814229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.992;QD=20.0308;RBI=0.0229498;REFB=-0.0156347;REVB=-0.0214569;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147764;STB=0.583264;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0174304;OID=.;OPOS=66195838;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:14:10:15:11:14:10:15:11 chr17 66246416 . A G 193.14 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0106257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.927;QD=12.0714;RBI=0.0108962;REFB=-0.0031396;REVB=-0.00241276;RO=40;SAF=9;SAR=15;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190759;STB=0.610144;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00412254;OID=.;OPOS=66246416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:40:40:24:24:0.375:15:9:22:18:15:9:22:18 chr17 66253095 . T A 97.3 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0266027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8187;QD=12.9734;RBI=0.0266113;REFB=-0.0234406;REVB=-0.000676668;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0162707;OID=.;OPOS=66253095;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:9:9:6:6:9:9 chr17 66264542 . A T 344.18 PASS AF=0.349593;AO=43;DP=123;FAO=43;FDP=123;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=-0.0301551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2774;QD=11.1929;RBI=0.0740045;REFB=0.0056185;REVB=0.0675821;RO=80;SAF=21;SAR=22;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000987893;STB=0.500567;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.0105388;OID=.;OPOS=66264542;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:80:80:43:43:0.349593:22:21:39:41:22:21:39:41 chr17 66264567 . TTA T 146.75 PASS AF=0.361111;AO=23;DP=33;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0191598;FXX=0.234018;HRUN=2;LEN=2;MLLD=141.683;QD=8.15252;RBI=0.0258229;REFB=-0.0415846;REVB=0.0173126;RO=4;SAF=8;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115953;STB=0.559761;STBP=0.472;TYPE=del;VARB=0.0898978;OID=.;OPOS=66264568;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.361111:23:33:26:72:46:8:18:18:28:99:4:8:15:3:1 chr17 66267650 . T G 140.7 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00931247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.622;QD=13.0888;RBI=0.00936247;REFB=-0.0060939;REVB=0.000966362;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740772;STB=0.54323;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0115723;OID=.;OPOS=66267650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:7:9:17:10:7:9:17:10 chr17 66270082 . A G 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0155317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.092;QD=14.0977;RBI=0.0190302;REFB=-0.00332123;REVB=-0.010996;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399795;STB=0.731716;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00599828;OID=.;OPOS=66270082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:4:9:5:13:4:9:5:13 chr17 66364749 . T C 108.38 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.028499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4256;QD=13.5478;RBI=0.028977;REFB=-0.0378808;REVB=0.00524162;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414547;STB=0.524235;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0675628;OID=.;OPOS=66364749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:8:11:7:6:8:11 chr17 66364804 . T C 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00378816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.405;QD=18.4834;RBI=0.00643221;REFB=-0.00184428;REVB=-0.00519839;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418943;STB=0.523785;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00143743;OID=.;OPOS=66364804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:10:9:9:12:10:9:9:12 chr17 66391016 . G A 387.26 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00844429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.178;QD=23.8315;RBI=0.0306391;REFB=-0.0033185;REVB=-0.0294525;RO=25;SAF=22;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724872;STB=0.540962;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00345674;OID=.;OPOS=66391016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:25:27:38:38:0.584615:16:22:12:13:16:22:13:14 chr17 66391276 . G A 390.97 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0168218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.439;QD=16.6371;RBI=0.0278399;REFB=-0.00369474;REVB=0.022183;RO=53;SAF=23;SAR=18;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831311;STB=0.546595;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00562477;OID=.;OPOS=66391276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:18:23:34:19:18:23:34:19 chr17 66422292 . A G 52.94 PASS AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0241743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9458;QD=7.05806;RBI=0.026383;REFB=0.00326553;REVB=0.0105671;RO=22;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394364;STB=0.749375;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0169199;OID=.;OPOS=66422292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:6:2:13:9:6:2:13:9 chr17 66449122 . G A 255.74 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00584185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.535;QD=15.7379;RBI=0.00588242;REFB=-0.00566974;REVB=-0.000689699;RO=35;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429289;STB=0.53295;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0099309;OID=.;OPOS=66449122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:17:12:16:19:17:12:17:19 chr17 66533655 . A G 557.08 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.163;QD=60.2246;RBI=0.0306133;REFB=0;REVB=-0.00777584;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.12802e-05;OID=.;OPOS=66533655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0 chr17 66536749 . C T 269.13 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0421202;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.3351;QD=21.9697;RBI=0.0425566;REFB=-0.00192795;REVB=-0.00607907;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167808;STB=0.594327;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00243695;OID=.;OPOS=66536749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:24:24:25:25:0.510204:17:8:12:12:17:8:12:12 chr17 66538239 . G T 318.69 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.016444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1587;QD=20.8977;RBI=0.0549808;REFB=-0.0200099;REVB=0.0524641;RO=28;SAF=15;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378112;STB=0.520945;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0184229;OID=.;OPOS=66538239;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:18:15:14:14:18:15:14:14 chr17 66539847 . C T 329.76 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0118212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9045;QD=20.9373;RBI=0.0306584;REFB=0.0126078;REVB=0.0282877;RO=29;SAF=13;SAR=21;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171174;STB=0.594845;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00947237;OID=.;OPOS=66539847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:21:13:17:12:21:13:17:12 chr17 66596463 . C T 632.31 PASS AF=0.558559;AO=62;DP=111;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00014774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.656;QD=22.7858;RBI=0.0428415;REFB=-0.0174144;REVB=0.0428412;RO=49;SAF=39;SAR=23;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318341;STB=0.517427;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0127795;OID=.;OPOS=66596463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:49:49:62:62:0.558559:23:39:29:20:23:39:29:20 chr17 66872802 . G C 1606.77 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0796246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4597;QD=64.2706;RBI=0.0803235;REFB=0;REVB=-0.0105731;RO=0;SAF=43;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000581717;OID=.;OPOS=66872802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:57:43:0:0:57:43:0:0 chr17 66918363 . T C 61.49 PASS AF=0.36;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00651383;FXX=0;HRUN=45;LEN=1;MLLD=158.93;QD=9.83823;RBI=0.0147727;REFB=-0.00268976;REVB=-0.013259;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442988;STB=0.789344;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00162477;OID=.;OPOS=66918363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:21:25:13:16:8:9:0.36:1:7:7:6:1:8:9:7 chr17 66928434 . C T 153.92 PASS AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0227106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.948;QD=11.6168;RBI=0.0227454;REFB=-0.00210613;REVB=0.00125796;RO=34;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2752;STB=0.659416;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00456824;OID=.;OPOS=66928434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:8:11:11:23:8:11:11:23 chr17 66985992 . T G 397.45 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0178603;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=278.826;QD=20.6465;RBI=0.0222808;REFB=-0.0052045;REVB=0.0133209;RO=36;SAF=17;SAR=23;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410591;STB=0.529939;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00426924;OID=.;OPOS=66985992;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:37:40:40:0.519481:23:17:17:19:23:17:18:19 chr17 67017930 . T C 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0116078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.073;QD=22.1439;RBI=0.0125673;REFB=-0.00159745;REVB=0.00481606;RO=13;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291666;STB=0.666444;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00302651;OID=.;OPOS=67017930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:14:3:6:7:14:3:6:7 chr17 67028260 . T C 431.43 PASS AF=0.473118;AO=43;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.0237363;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3539;QD=18.5563;RBI=0.0371534;REFB=0.00256233;REVB=-0.0285826;RO=48;SAF=18;SAR=25;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383216;STB=0.532453;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.002672;OID=.;OPOS=67028260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:49:43:44:0.473118:25:18:22:26:26:18:23:26 chr17 67031457 . C T 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.299;QD=60.8833;RBI=0.0173037;REFB=0;REVB=-0.0130901;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.55616e-06;OID=.;OPOS=67031457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0 chr17 67081830 . T C 354.89 PASS AF=0.396226;AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0111728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.46;QD=13.392;RBI=0.0251426;REFB=-0.00158753;REVB=0.0225238;RO=64;SAF=15;SAR=27;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558109;STB=0.531685;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00385239;OID=.;OPOS=67081830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:0.396226:27:15:26:38:27:15:26:38 chr17 67101718 . C T 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.115;QD=59.5016;RBI=0.0262394;REFB=0;REVB=0.00214792;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141939;OID=.;OPOS=67101718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:41:28:0:0:41:28:0:0 chr17 67125840 . C T 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00178838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.988;QD=18.0506;RBI=0.0195748;REFB=-0.0104618;REVB=-0.019493;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368125;STB=0.719451;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00788051;OID=.;OPOS=67125840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:1:9:5:3:1:9:5:3 chr17 67178316 . A G 472.68 PASS AF=0.555556;AO=44;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0203466;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.1;QD=23.3423;RBI=0.0248968;REFB=-0.020802;REVB=0.0143481;RO=36;SAF=15;SAR=29;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182463;STB=0.502689;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0141971;OID=.;OPOS=67178316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:36:36:44:45:0.555556:29:15:13:23:29:16:13:23 chr17 67212031 . A G 234.96 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0223139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.904;QD=15.4074;RBI=0.0252765;REFB=-0.0306894;REVB=0.0118739;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549698;STB=0.531112;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0399231;OID=.;OPOS=67212031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:12:15:17:17:12:15:17:17 chr17 67212423 . G A 315.66 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0121703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=315.466;QD=17.5365;RBI=0.0122043;REFB=-0.0104495;REVB=0.000910806;RO=38;SAF=20;SAR=14;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157568;STB=0.588183;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0108929;OID=.;OPOS=67212423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:14:20:16:22:14:20:16:22 chr17 67215712 . C T 348.85 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00457796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.862;QD=22.8752;RBI=0.0218136;REFB=-0.019704;REVB=-0.0213278;RO=26;SAF=21;SAR=14;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438497;STB=0.524124;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0201595;OID=.;OPOS=67215712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:14:21:17:9:14:21:17:9 chr17 67219768 . C T 373.75 PASS AF=0.4;AO=44;DP=109;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=0.00225257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.201;QD=13.591;RBI=0.00238026;REFB=-0.00639369;REVB=-0.000769107;RO=65;SAF=26;SAR=18;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235145;STB=0.518667;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0138827;OID=.;OPOS=67219768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:65:66:44:44:0.4:18:26:37:28:18:26:37:29 chr17 67257281 . C T 367.22 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0395636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.808;QD=19.0764;RBI=0.0422065;REFB=-0.0149643;REVB=-0.0147007;RO=39;SAF=18;SAR=20;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151629;STB=0.584196;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0191093;OID=.;OPOS=67257281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:20:18:25:14:20:18:25:14 chr17 67260926 . A G 581.02 PASS AF=0.455224;AO=61;DP=134;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.00262662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.325;QD=17.344;RBI=0.0499841;REFB=-0.0230591;REVB=0.0499151;RO=73;SAF=38;SAR=23;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143402;STB=0.579908;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0286378;OID=.;OPOS=67260926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:73:73:61:61:0.455224:23:38:35:38:23:38:35:38 chr17 67267317 . T C 105.32 PASS AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00247277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.289;QD=11.0859;RBI=0.00471491;REFB=0.000341799;REVB=-0.00401445;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207719;STB=0.622233;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.000682925;OID=.;OPOS=67267317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:6:7:18:7:6:7:18:7 chr17 67273882 . C A 566.46 PASS AF=0.513274;AO=58;DP=112;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.0161664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.771;QD=20.0517;RBI=0.0192632;REFB=-0.0129385;REVB=-0.0104746;RO=54;SAF=31;SAR=27;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15894;STB=0.582573;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0149638;OID=.;OPOS=67273882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:54:55:58:58:0.513274:27:31:19:35:27:31:20:35 chr17 67290840 . T C 635.13 PASS AF=0.440252;AO=70;DP=159;FAO=70;FDP=159;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0282903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.161;QD=15.978;RBI=0.0288836;REFB=-0.0280408;REVB=0.00582461;RO=89;SAF=29;SAR=41;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126176;STB=0.57035;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0387567;OID=.;OPOS=67290840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:89:89:70:70:0.440252:41:29:48:41:41:29:48:41 chr17 67304447 . C T 276.98 PASS AF=0.390244;AO=31;DP=81;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0144856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.456;QD=13.5111;RBI=0.0153933;REFB=-0.00663258;REVB=-0.00520784;RO=50;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604754;STB=0.524375;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0106846;OID=.;OPOS=67304447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:50:50:31:32:0.390244:15:16:23:27:16:16:23:27 chr17 67513003 . C A 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.806;QD=59.5014;RBI=0.0167821;REFB=0;REVB=0.00825787;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3981e-05;OID=.;OPOS=67513003;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:40:29:0:0:40:29:0:0 chr17 67513055 . A G 791.7 PASS AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.042256;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=246.134;QD=53.6748;RBI=0.0439154;REFB=-0.104649;REVB=0.0119579;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.516123;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00045395;OID=.;OPOS=67513055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:59:59:1:2:57:57:0.966102:30:27:0:1:30:27:0:2 chr17 67982157 . C T 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.46;QD=64.1539;RBI=0.0146284;REFB=0;REVB=0.00987571;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.58928e-06;OID=.;OPOS=67982157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr17 70643565 . A G 584.96 PASS AF=0.68;AO=51;DP=75;FAO=51;FDP=75;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00392614;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.41;QD=31.1978;RBI=0.00637984;REFB=-0.0132179;REVB=0.00502869;RO=24;SAF=22;SAR=29;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341525;STB=0.518472;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00535781;OID=.;OPOS=70643565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:24:24:51:51:0.68:29:22:9:15:29:22:9:15 chr17 70643798 . A G 145.09 PASS AF=0.333333;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0150647;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.748;QD=10.1815;RBI=0.016034;REFB=-0.0207724;REVB=-0.00549044;RO=38;SAF=4;SAR=15;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157653;STB=0.593952;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0381938;OID=.;OPOS=70643798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:38:38:19:19:0.333333:15:4:12:26:15:4:12:26 chr17 70645013 . G A 313.61 PASS AF=0.507463;AO=33;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0433226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.784;QD=18.7229;RBI=0.0469212;REFB=-0.0232233;REVB=-0.0180209;RO=31;SAF=28;SAR=5;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156626;STB=0.604998;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0261356;OID=.;OPOS=70645013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:33:33:34:0.507463:5:28:23:8:5:29:24:9 chr17 70660158 . T C 670.07 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.408;QD=62.3321;RBI=0.0271474;REFB=0;REVB=0.021787;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.99435e-05;OID=.;OPOS=70660158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:28:15:0:0:28:15:0:0 chr17 70943990 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5928;QD=57.202;RBI=0.0789003;REFB=0;REVB=0.0786942;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796271;OID=.;OPOS=70943990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr17 71027797 . C A 160.51 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0218896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.161;QD=18.3434;RBI=0.0227964;REFB=-0.0118655;REVB=-0.0063656;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23473;STB=0.633739;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0141091;OID=.;OPOS=71027797;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:11:6:11:7:11:6:11:7 chr17 71027833 . A G 125.85 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0368527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.277;QD=18.6449;RBI=0.0369584;REFB=0.000486437;REVB=-0.00279313;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165626;STB=0.595095;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.000167077;OID=.;OPOS=71027833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:10:4:6:7:10:4:6:7 chr17 71166701 . A G 343.19 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0434128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.444;QD=18.805;RBI=0.0434404;REFB=0.0133025;REVB=0.00154663;RO=37;SAF=20;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138011;STB=0.507688;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.0125398;OID=.;OPOS=71166701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:16:20:20:17:16:20:20:17 chr17 71167102 . T C 104.63 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0553355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2644;QD=19.9291;RBI=0.0602692;REFB=0.00750681;REVB=-0.0238821;RO=9;SAF=9;SAR=3;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469487;STB=0.767007;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0167128;OID=.;OPOS=71167102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:3:9:1:8:3:9:1:8 chr17 71167537 . G GA 68.23 PASS AF=0.666667;AO=2;DP=20;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0523499;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6489;QD=15.1629;RBI=0.104702;REFB=0.0659786;REVB=0.0906747;RO=17;SAF=1;SAR=1;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882671;STB=0.528799;STBP=0.754;TYPE=ins;VARB=-0.0186186;OID=.;OPOS=71167538;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.666667:2:20:12:18:6:5:7:2:4:34:17:1:1:7:10 chr17 71167541 . G A 107.19 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.102829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7992;QD=22.5667;RBI=0.102829;REFB=-0.0157768;REVB=-4.51963e-05;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510973;STB=0.550377;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.035291;OID=.;OPOS=71167541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:19:6:7:12:12:0.631579:7:5:2:4:7:5:2:5 chr17 71192663 . G A 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0265911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0957;QD=14.0957;RBI=0.0290458;REFB=0.0039201;REVB=0.0116865;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250796;STB=0.514679;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.00574117;OID=.;OPOS=71192663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:6:5:6:8:6:5:6:8 chr17 71192873 . A G 158.17 PASS AF=0.64;AO=15;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0116215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.88;QD=25.3071;RBI=0.0206635;REFB=-0.0529245;REVB=-0.0170857;RO=9;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306606;STB=0.502535;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00945646;OID=.;OPOS=71192873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:24:25:9:9:15:16:0.64:9:6:4:5:9:7:4:5 chr17 71196809 . A G 609.43 PASS AF=0.5;AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0279427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6041;QD=19.6592;RBI=0.0491464;REFB=0.0134661;REVB=-0.0404299;RO=62;SAF=28;SAR=34;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293958;STB=0.516225;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.0148408;OID=.;OPOS=71196809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:62:62:62:0.5:34:28:30:32:34:28:30:32 chr17 71197748 . G A 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0424551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6707;QD=15.8819;RBI=0.0688636;REFB=0.00115698;REVB=0.0542195;RO=10;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22222;STB=0.631288;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00479069;OID=.;OPOS=71197748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:2:8:6:4:2:8:6:4 chr17 71232687 . T C 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00883354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.121;QD=11.0198;RBI=0.00948773;REFB=-0.0372833;REVB=0.00346201;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162008;STB=0.599657;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0474815;OID=.;OPOS=71232687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:4:4:2:4:4:4 chr17 71232804 . C A 753.46 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00860176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.955;QD=61.5073;RBI=0.020327;REFB=0.107636;REVB=-0.0184173;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.00343653;OID=.;OPOS=71232804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:49:0:1:48:48:0.979592:19:29:0:0:19:29:0:1 chr17 71232807 . T C 175.27 PASS AF=0.392157;AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0177663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.886;QD=13.747;RBI=0.0535777;REFB=-0.00463048;REVB=-0.0505463;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736774;STB=0.559061;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00864648;OID=.;OPOS=71232807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:31:19:20:0.392157:8:11:20:11:9:11:20:11 chr17 71232881 . G C 307.19 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00431351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1819;QD=15.5541;RBI=0.0187304;REFB=-0.0175268;REVB=0.0182269;RO=44;SAF=17;SAR=17;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910317;STB=0.544278;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0221401;OID=.;OPOS=71232881;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:45:34:34:0.43038:17:17:26:18:17:17:26:19 chr17 71233130 . A G 105.82 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0117258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.225;QD=11.4396;RBI=0.0289043;REFB=-0.0343587;REVB=0.0264191;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219086;STB=0.627733;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0329663;OID=.;OPOS=71233130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:8:5:5:19:8:5:5:19 chr17 71238433 . G A 648.23 PASS AF=0.503876;AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.00775769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.069;QD=20.1;RBI=0.00782271;REFB=-0.0113901;REVB=0.0010065;RO=64;SAF=31;SAR=34;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737287;STB=0.504064;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0222292;OID=.;OPOS=71238433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:64:64:65:65:0.503876:34:31:30:34:34:31:30:34 chr17 71239087 . G T 377.65 PASS AF=0.384615;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.000110288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.27;QD=12.911;RBI=0.0165819;REFB=-0.00328346;REVB=0.0165816;RO=72;SAF=29;SAR=16;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175893;STB=0.600111;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00529762;OID=.;OPOS=71239087;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:72:72:45:45:0.384615:16:29:35:37:16:29:35:37 chr17 71239215 . AA GA,TT 168.08 PASS AF=0,0.413793;AO=2,21;DP=56;FAO=0,24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=0,16;FSAR=0,8;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.0442154,0.0244143;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=25.8483,153.937;QD=11.5916;RBI=0.100699,0.10286;REFB=-0.0144784,-0.0238634;REVB=-0.090473,0.0999202;RO=32;SAF=1,16;SAR=1,5;SRF=24;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.246767,0.0169869;STB=0.5,0.546629;STBP=1,0.622;TYPE=snp,mnp;VARB=0,0.108401;OID=.,.;OPOS=71239215,71239215;OREF=A,AA;OALT=G,TT;OMAPALT=GA,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:56:58:32:34:2,21:0,24:0,0.413793:1,5:1,16:24:8:0,8:0,16:25:9 chr17 71239225 . T G 43.6 PASS AF=0.159091;AO=10;DP=47;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=-0.00930456;FXX=0.0638162;HRUN=24;LEN=1;MLLD=142.735;QD=3.96333;RBI=0.0120632;REFB=-0.00382687;REVB=-0.00767758;RO=36;SAF=5;SAR=5;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352324;STB=0.855632;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0151076;OID=.;OPOS=71239225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:47:44:36:37:10:7:0.159091:5:5:28:8:5:2:29:8 chr17 71239234 . T G 64.46 PASS AF=0.257143;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0152007;FXX=0.0540395;HRUN=24;LEN=1;MLLD=125.463;QD=7.36735;RBI=0.0282728;REFB=-0.0116782;REVB=-0.0238388;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101922;STB=0.575003;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0153305;OID=.;OPOS=71239234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:37:35:25:26:9:9:0.257143:4:5:16:9:4:5:17:9 chr17 71244630 . C T 830.52 PASS AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.064;QD=55.3677;RBI=0.0240948;REFB=-0.126083;REVB=0.016564;RO=1;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122541;STB=0.506491;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00284393;OID=.;OPOS=71244630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:60:1:1:58:59:0.983333:38:20:0:1:38:21:0:1 chr17 71354114 . C T 151.19 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0385322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.156;QD=20.1587;RBI=0.059681;REFB=0.0141713;REVB=0.0455751;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281733;STB=0.658351;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00875829;OID=.;OPOS=71354114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:9:7:11:3:9:7:11:3 chr17 71365314 . A G 1302.09 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.36;QD=62.0042;RBI=0.0276312;REFB=0;REVB=0.00744229;RO=0;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35614e-05;OID=.;OPOS=71365314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:50:34:0:0:50:34:0:0 chr17 71384016 . C T 504.36 PASS AF=0.5875;AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00561917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.867;QD=25.2181;RBI=0.00608639;REFB=-0.0355211;REVB=0.0023386;RO=32;SAF=17;SAR=30;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130409;STB=0.566009;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0176974;OID=.;OPOS=71384016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:32:33:47:47:0.5875:30:17:17:15:30:17:17:16 chr17 71410891 . C T 693.78 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313243;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.114;QD=63.071;RBI=0.0313275;REFB=0;REVB=0.000444473;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152593;OID=.;OPOS=71410891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0 chr17 71426656 . G T 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0100653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.306;QD=12.0163;RBI=0.014164;REFB=-0.00236133;REVB=0.00996535;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484388;STB=0.529316;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.00327061;OID=.;OPOS=71426656;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:2:5:4:2:2:5 chr17 71426670 . G A 38.51 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0279143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.513;QD=10.2682;RBI=0.0279235;REFB=-0.0210174;REVB=0.000717721;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912889;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0191757;OID=.;OPOS=71426670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:8:9:6:6:0.4:4:2:2:6:4:2:3:6 chr17 71429908 . G C 142.65 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0415021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0229;QD=14.2654;RBI=0.0647511;REFB=0.00583967;REVB=0.0497019;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200326;STB=0.61749;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00548636;OID=.;OPOS=71429908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:12:4:10:14:12:4:10:14 chr17 71468267 . G A 78.65 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00209873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.973;QD=14.9808;RBI=0.0145602;REFB=0.0059483;REVB=0.0144082;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131181;STB=0.576768;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.00431727;OID=.;OPOS=71468267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:4:6:5:6:4:6:5:6 chr17 71503636 . T C 361.74 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00922189;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.081;QD=20.0966;RBI=0.0296331;REFB=-0.0122285;REVB=0.0281616;RO=34;SAF=15;SAR=22;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108449;STB=0.56749;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00904452;OID=.;OPOS=71503636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:35:37:37:0.513889:22:15:18:16:22:15:19:16 chr17 71746427 . G A 181.36 PASS AF=0.392857;AO=21;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0428303;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.439;QD=12.954;RBI=0.0437468;REFB=0.0104745;REVB=0.00890796;RO=35;SAF=11;SAR=10;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114294;STB=0.562858;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00397043;OID=.;OPOS=71746427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:35:34:21:22:0.392857:10:11:22:13:10:12:22:12 chr17 71746435 . C T 206.05 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.022231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.098;QD=12.8779;RBI=0.043632;REFB=-0.0195168;REVB=-0.0375437;RO=38;SAF=12;SAR=13;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103893;STB=0.566572;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0164659;OID=.;OPOS=71746435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:38:39:25:25:0.390625:13:12:22:16:13:12:23:16 chr17 71746479 . C G 251.68 PASS AF=0.37037;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00553212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2052;QD=12.4287;RBI=0.0223889;REFB=-0.00909537;REVB=-0.0216947;RO=51;SAF=15;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752423;STB=0.543181;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0184433;OID=.;OPOS=71746479;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:51:51:30:30:0.37037:15:15:29:22:15:15:29:22 chr17 71746508 . T C 357.2 PASS AF=0.423913;AO=36;DP=89;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00170761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.468;QD=15.5306;RBI=0.00360082;REFB=-0.0170935;REVB=-0.00317017;RO=53;SAF=15;SAR=21;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156504;STB=0.559969;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0192656;OID=.;OPOS=71746508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:92:53:53:36:39:0.423913:21:15:30:23:21:18:30:23 chr17 71746796 . A G 426.9 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.052455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9622;QD=21.8922;RBI=0.0525045;REFB=-0.0264977;REVB=0.00227946;RO=36;SAF=21;SAR=21;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0172214;OID=.;OPOS=71746796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:21:21:18:18:21:21:18:18 chr17 71747278 . G C 838.5 PASS AF=0.553191;AO=78;DP=141;FAO=78;FDP=141;FR=.;FRO=63;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=20;FWDB=-0.00725404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.021;QD=23.7871;RBI=0.0134729;REFB=-0.0158957;REVB=-0.0113533;RO=63;SAF=47;SAR=31;SRF=43;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694666;STB=0.537874;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0126474;OID=.;OPOS=71747278;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:63:63:78:78:0.553191:31:47:43:20:31:47:43:20 chr17 71747323 . T C 316.47 PASS AF=0.455696;AO=30;DP=76;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0275512;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.507;QD=16.0239;RBI=0.0292816;REFB=-0.0244585;REVB=-0.00991668;RO=44;SAF=15;SAR=15;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950497;STB=0.544279;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0264564;OID=.;OPOS=71747323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:44:43:30:36:0.455696:15:15:26:18:18:18:25:18 chr17 71747336 . G A 256.48 PASS AF=0.405405;AO=29;DP=73;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0224566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9719;QD=13.8637;RBI=0.0225649;REFB=-0.0137108;REVB=0.00220781;RO=43;SAF=14;SAR=15;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545428;STB=0.546731;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0321422;OID=.;OPOS=71747336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:43:44:29:30:0.405405:15:14:23:20:16:14:24:20 chr17 71747394 . C T 169.48 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0209106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7691;QD=10.5927;RBI=0.0209529;REFB=0.00423285;REVB=-0.00133073;RO=41;SAF=5;SAR=17;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347773;STB=0.699172;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00758593;OID=.;OPOS=71747394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:41:42:22:22:0.34375:17:5:21:20:17:5:21:21 chr17 71747397 . G A 161.46 PASS AF=0.344262;AO=20;DP=60;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0587934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5541;QD=10.5873;RBI=0.0588314;REFB=-0.00108838;REVB=-0.00211324;RO=40;SAF=5;SAR=15;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280528;STB=0.634383;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00185906;OID=.;OPOS=71747397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:40:40:20:21:0.344262:15:5:19:21:15:6:19:21 chr17 71752500 . C CT 1506.71 PASS AF=1;AO=100;DP=106;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282018;FXX=0.00980296;HRUN=0;LEN=1;MLLD=208.13;QD=59.6716;RBI=0.0284846;REFB=0;REVB=-0.0040036;RO=4;SAF=55;SAR=45;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147487;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=6.6854e-05;OID=.;OPOS=71752501;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:100:106:101:101:0:56:45:0:0:8:4:55:45:3:1 chr17 72209858 . A G 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.2;QD=57.1772;RBI=0.0168263;REFB=0;REVB=-0.0167802;RO=0;SAF=11;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.03413e-05;OID=.;OPOS=72209858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:40:11:0:0:40:11:0:0 chr17 72308319 . G A 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3212;QD=56.9377;RBI=0.0728612;REFB=0;REVB=0.0586099;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000960175;OID=.;OPOS=72308319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0 chr17 72346855 . T C 117.43 PASS AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0289122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.55;QD=21.3499;RBI=0.0300135;REFB=-0.0395879;REVB=0.00805578;RO=9;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304962;STB=0.670994;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0133203;OID=.;OPOS=72346855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:7:6:8:1:7:6:8:1 chr17 72349067 . C T 181.24 PASS AF=0.408163;AO=19;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00324469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9303;QD=14.7952;RBI=0.0104459;REFB=-0.0392022;REVB=0.00992921;RO=29;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500627;STB=0.508466;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0504839;OID=.;OPOS=72349067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:29:29:19:20:0.408163:12:7:12:17:12:8:12:17 chr17 72350412 . G A 275.68 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.012268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.475;QD=25.6449;RBI=0.0241138;REFB=-0.0381651;REVB=0.0207599;RO=18;SAF=19;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091;STB=0.550682;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0308227;OID=.;OPOS=72350412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:6:19:12:6:6:19:12:6 chr17 72351406 . C T 341.55 PASS AF=0.413043;AO=32;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0305158;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7781;QD=14.85;RBI=0.0597007;REFB=-0.0162013;REVB=0.0513124;RO=43;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114787;STB=0.565236;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0221824;OID=.;OPOS=72351406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:43:54:32:38:0.413043:19:13:17:26:22:16:17:37 chr17 72351761 . A G 875.79 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.56;QD=57.4286;RBI=0.0309398;REFB=0;REVB=0.0115693;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42216e-05;OID=.;OPOS=72351761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:61:0:0:56:61:1:33:23:0:0:36:25:0:0 chr17 72366695 . C A 575.11 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178592;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.8058;QD=60.5375;RBI=0.0544858;REFB=0;REVB=-0.0514757;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000562215;OID=.;OPOS=72366695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr17 72368550 . T C 804.41 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00124647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9808;QD=64.3524;RBI=0.0240553;REFB=0;REVB=0.024023;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143545;OID=.;OPOS=72368550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:38:12:0:0:38:12:0:0 chr17 72429927 . G A 339.93 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0428526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9456;QD=18.1299;RBI=0.0645386;REFB=-0.0425247;REVB=0.0482585;RO=38;SAF=12;SAR=24;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112791;STB=0.557659;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0323001;OID=.;OPOS=72429927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:39:36:36:0.48:24:12:17:21:24:12:17:22 chr17 72439700 . T G 304.7 PASS AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.269;QD=52.9921;RBI=0.0486203;REFB=0;REVB=0.0485598;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331404;OID=.;OPOS=72439700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:3:16:0:0:5:18:0:0 chr17 72439773 . AGGGGG AGGG,AGGGG,AGGGGC 506.5 PASS AF=0.358491,0.509434,0.113208;AO=17,18,6;DP=52;FAO=19,27,6;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=14,14,3;FSAR=5,13,3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0982613,-0.194779,-0.00890556;FXX=0.0185151;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=15.6282,14.0604,7.6675;QD=38.2261;RBI=0.0987235,0.195785,0.0175796;REFB=0.0351338,0.0428381,-0.00635802;REVB=0.00954226,0.0198196,-0.015157;RO=3;SAF=11,10,3;SAR=6,8,3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0.414179,0.414179,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0909087,0.0582612,0.0941184;STB=0.517223,0.517229,0.571194;STBP=0.636,0.532,0.516;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0680757,-0.0620613,-0.0871478;OID=.,.,.;OPOS=72439774,72439774,72439778;OREF=GG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=AGGG,AGGGG,AGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.358491,0.509434,0.113208:17,18,6:52:19,27,6:53:1:14,14,3:5,13,3:1:0:78:3:11,10,3:6,8,3:1:2 chr17 72439808 . TG T 179.83 PASS AF=0.384615;AO=33;DP=93;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.213443;FXX=0.0215031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.6195;QD=7.90448;RBI=0.217437;REFB=-0.017696;REVB=-0.0414853;RO=55;SAF=11;SAR=22;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236248;STB=0.612981;STBP=0.09;TYPE=del;VARB=0.0156394;OID=.;OPOS=72439809;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.384615:33:93:35:91:56:13:22:31:25:99:55:11:22:30:25 chr17 72469958 . A G 736.85 PASS AF=0.533835;AO=71;DP=133;FAO=71;FDP=133;FR=.;FRO=62;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.00258139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2577;QD=22.1608;RBI=0.0201422;REFB=-0.021667;REVB=-0.0199761;RO=62;SAF=42;SAR=29;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146956;STB=0.580581;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0226084;OID=.;OPOS=72469958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:62:71:71:0.533835:29:42:26:36:29:42:26:36 chr17 72537878 . G A 330.44 PASS AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0934325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8135;QD=50.8367;RBI=0.0979954;REFB=-0.105379;REVB=0.0295546;RO=1;SAF=15;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299354;STB=0.516116;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00204702;OID=.;OPOS=72537878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:10:15:1:0:10:15:1:0 chr17 72584764 . C T 452.16 PASS AF=0.5;AO=44;DP=89;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0212344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3864;QD=20.0959;RBI=0.0214074;REFB=-0.00892648;REVB=-0.00271616;RO=44;SAF=24;SAR=20;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125912;STB=0.578914;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0156971;OID=.;OPOS=72584764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:44:45:44:45:0.5:20:24:30:14:21:24:31:14 chr17 72588326 . A C 167.16 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0157588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.598;QD=15.1962;RBI=0.0160544;REFB=-0.00852892;REVB=0.00306646;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625797;STB=0.536043;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00989697;OID=.;OPOS=72588326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:10:16:10:8:10:16 chr17 72588778 . C T 75.22 PASS AF=0.384615;AO=9;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00606631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.655;QD=11.5726;RBI=0.0210483;REFB=-0.0114236;REVB=-0.0201552;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244812;STB=0.5998;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0360947;OID=.;OPOS=72588778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:9:10:0.384615:6:3:9:7:6:4:9:7 chr17 72589114 . C G 259.28 PASS AF=0.5;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0399681;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.096;QD=18.52;RBI=0.0402423;REFB=-0.00394925;REVB=0.00468946;RO=27;SAF=15;SAR=13;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176617;STB=0.605987;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00342794;OID=.;OPOS=72589114;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:56:27:28:28:28:0.5:13:15:9:18:13:15:9:19 chr17 72589435 . T C 440.73 PASS AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.00946723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.522;QD=19.588;RBI=0.026897;REFB=-0.0116702;REVB=-0.0251758;RO=44;SAF=23;SAR=21;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18365;STB=0.588816;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0120477;OID=.;OPOS=72589435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:46:44:44:0.488889:21:23:14:30:21:23:16:30 chr17 72590267 . T C 274.53 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0220968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.541;QD=19.966;RBI=0.0222271;REFB=-0.00936393;REVB=-0.00240316;RO=26;SAF=5;SAR=24;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173611;STB=0.597627;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00916152;OID=.;OPOS=72590267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:24:5:8:18:24:5:8:18 chr17 72691928 . T C 464.96 PASS AF=0.484211;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0175875;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.7602;QD=19.5774;RBI=0.0293094;REFB=-0.0179189;REVB=-0.0234461;RO=47;SAF=9;SAR=37;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.428215;STB=0.741026;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0178561;OID=.;OPOS=72691928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:47:49:46:46:0.484211:37:9:29:18:37:9:30:19 chr17 72700943 . A G 110.71 PASS AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0342626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0164;QD=26.0487;RBI=0.0385984;REFB=-0.0546775;REVB=0.0177739;RO=5;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522328;STB=0.529363;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0201014;OID=.;OPOS=72700943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:6:6:3:2:6:6:3:2 chr17 72744798 . G C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.757;QD=46.848;RBI=0.0747142;REFB=0;REVB=0.0451466;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000802888;OID=.;OPOS=72744798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr17 72773794 . C A 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00106336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.092;QD=16.5359;RBI=0.0111173;REFB=-0.00325997;REVB=0.0110663;RO=23;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33269;STB=0.689098;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00317934;OID=.;OPOS=72773794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:11:7:17:6:11:7:17:6 chr17 72784932 . G A 143.32 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0113024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.91;QD=14.6995;RBI=0.015975;REFB=-0.0370091;REVB=-0.0112897;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124079;STB=0.554389;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0436288;OID=.;OPOS=72784932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:7:9:15:7:7:9:15:8 chr17 72838649 . C A 1002.52 PASS AF=0.521505;AO=97;DP=186;FAO=97;FDP=186;FR=.;FRO=89;FSAF=31;FSAR=66;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.0099664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.232;QD=21.5595;RBI=0.0106722;REFB=-0.018242;REVB=0.00381649;RO=89;SAF=31;SAR=66;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133781;STB=0.573482;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0150888;OID=.;OPOS=72838649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:89:89:97:97:0.521505:66:31:41:48:66:31:41:48 chr17 72838739 . G A 386.71 PASS AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0379142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.436;QD=20.9032;RBI=0.0401742;REFB=-0.00979709;REVB=-0.0132845;RO=35;SAF=4;SAR=35;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393685;STB=0.722823;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0063296;OID=.;OPOS=72838739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:35:4:13:22:35:4:13:22 chr17 72851133 . A G 246.54 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.838;QD=46.9596;RBI=0.0228561;REFB=-0.111995;REVB=0.000764079;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523786;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00333428;OID=.;OPOS=72851133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:10:10:0:0:10:10:1:0 chr17 72860076 . G T 144.18 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0130885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.377;QD=24.0304;RBI=0.0348181;REFB=-0.0107782;REVB=-0.0322643;RO=9;SAF=10;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806815;STB=0.545393;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00406808;OID=.;OPOS=72860076;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:5:10:5:4:5:10:5:4 chr17 72860253 . A G 417.99 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00916562;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.698;QD=19.218;RBI=0.00926267;REFB=-0.0152476;REVB=0.00133732;RO=46;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128178;STB=0.577013;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.016007;OID=.;OPOS=72860253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:46:45:42:42:0.482759:18:24:20:26:18:24:19:26 chr17 72862593 . C T 601.61 PASS AF=0.512605;AO=61;DP=119;FAO=61;FDP=119;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.0142898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.948;QD=20.2222;RBI=0.0305296;REFB=-0.0219412;REVB=0.0269789;RO=58;SAF=29;SAR=32;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00651362;STB=0.503588;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0183884;OID=.;OPOS=72862593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:58:58:61:61:0.512605:32:29:28:30:32:29:28:30 chr17 72863030 . T C 79.23 PASS AF=0.588235;AO=9;DP=16;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00714463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1613;QD=18.6424;RBI=0.0463065;REFB=-0.0232181;REVB=-0.045752;RO=7;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955156;STB=0.571284;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0489967;OID=.;OPOS=72863030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:17:7:7:9:10:0.588235:5:4:4:3:6:4:4:3 chr17 72889685 . G A 287.89 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0609738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.54;QD=15.9939;RBI=0.0654528;REFB=-0.0169778;REVB=-0.0237964;RO=32;SAF=23;SAR=9;SRF=2;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.544076;STB=0.751106;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0039234;OID=.;OPOS=72889685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:40:32:32:0.444444:9:23:2:30:9:23:10:30 chr17 72889696 . A G 310.35 PASS AF=0.551724;AO=33;DP=59;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=-0.0422694;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1484;QD=21.4032;RBI=0.0443822;REFB=-0.0193989;REVB=-0.0135306;RO=26;SAF=27;SAR=6;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.622325;STB=0.860897;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0380787;OID=.;OPOS=72889696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:26:26:33:32:0.551724:6:27:0:26:5:27:0:26 chr17 72926420 . G A 211.89 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.020996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.467;QD=16.6187;RBI=0.0295294;REFB=-0.0125386;REVB=-0.0207643;RO=28;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174848;STB=0.599228;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.033499;OID=.;OPOS=72926420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:9:14:12:16:9:14:12:16 chr17 72927123 . G T 854.72 PASS AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255538;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.722;QD=56.9811;RBI=0.0364541;REFB=0;REVB=0.0259982;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193727;OID=.;OPOS=72927123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:36:23:0:0:36:24:0:0 chr17 72937605 . G A 249.61 PASS AF=0.5;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00876611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.388;QD=18.4893;RBI=0.0244108;REFB=-0.00304777;REVB=-0.0227825;RO=26;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119713;STB=0.555821;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00421353;OID=.;OPOS=72937605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:26:27:27:27:0.5:13:14:17:9:13:14:17:10 chr17 72937851 . G A 165.16 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0435077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9275;QD=12.4651;RBI=0.0436372;REFB=-0.0248206;REVB=-0.00336012;RO=32;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472756;STB=0.535474;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0281442;OID=.;OPOS=72937851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:33:20:20:0.377358:9:11:19:13:9:11:20:13 chr17 72938100 . T C 447.63 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0091121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.651;QD=57.7585;RBI=0.0217132;REFB=0;REVB=0.0197087;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011117;OID=.;OPOS=72938100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:13:17:0:0:13:18:0:0 chr17 72939446 . C T 116.2 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00926839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.671;QD=20.2077;RBI=0.0311772;REFB=-0.0268156;REVB=0.0297677;RO=10;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162192;STB=0.593066;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0361896;OID=.;OPOS=72939446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:10:3:4:6:10:3:4:6 chr17 72948369 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.128;QD=62.6708;RBI=0.028196;REFB=0;REVB=-0.0271904;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130654;OID=.;OPOS=72948369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chr17 72949167 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.704;QD=47.8217;RBI=0.0435176;REFB=0;REVB=0.0192457;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553879;OID=.;OPOS=72949167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr17 72949649 . C T 1021.52 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0279879;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.404;QD=56.7512;RBI=0.0545704;REFB=-0.0378314;REVB=0.0468466;RO=2;SAF=36;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025541;STB=0.51351;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00146013;OID=.;OPOS=72949649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:72:2:2:70:70:0.972222:34:36:2:0:34:36:2:0 chr17 72952017 . A G 1026.24 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00464241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.413;QD=59.4921;RBI=0.0108689;REFB=0;REVB=-0.00982753;RO=0;SAF=21;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63118e-05;OID=.;OPOS=72952017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:48:21:0:0:48:21:0:0 chr17 73000061 . A G 551.14 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.00383881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.836;QD=20.7977;RBI=0.00810686;REFB=-0.00715373;REVB=-0.00714035;RO=50;SAF=32;SAR=24;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789765;STB=0.543463;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00651101;OID=.;OPOS=73000061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:24:32:24:26:24:32:24:26 chr17 73016621 . C T 102.73 PASS AF=0.393939;AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0114757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.78;QD=12.4516;RBI=0.0168789;REFB=-0.0105193;REVB=0.0123775;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181383;STB=0.509789;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0116464;OID=.;OPOS=73016621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:12:13:0.393939:5:7:12:8:5:8:12:8 chr17 73037868 . C G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0080043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.23;QD=45.8068;RBI=0.0341888;REFB=0;REVB=0.0332386;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195727;OID=.;OPOS=73037868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr17 73038746 . T C 515.44 PASS AF=0.578313;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0116715;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.061;QD=24.8405;RBI=0.0166806;REFB=-0.00740942;REVB=-0.0119172;RO=35;SAF=21;SAR=27;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153282;STB=0.508393;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00462055;OID=.;OPOS=73038746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:35:35:48:48:0.578313:27:21:16:19:27:21:16:19 chr17 73059820 . C G 1272.54 PASS AF=0.945055;AO=85;DP=91;FAO=86;FDP=91;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0484624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.986;QD=55.9356;RBI=0.0590565;REFB=-0.0666897;REVB=0.0337502;RO=5;SAF=39;SAR=46;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622543;STB=0.503596;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00109845;OID=.;OPOS=73059820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:91:91:5:5:85:86:0.945055:46:39:2:3:46:40:2:3 chr17 73060073 . T C 686.09 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.798;QD=62.372;RBI=0.0545247;REFB=0;REVB=0.0503775;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339097;OID=.;OPOS=73060073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:28:15:0:0:29:15:0:0 chr17 73060111 . G A 347.7 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0308622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6856;QD=51.5104;RBI=0.0398757;REFB=-0.0736288;REVB=0.0252507;RO=1;SAF=6;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712358;STB=0.538431;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00259033;OID=.;OPOS=73060111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:20:6:1:0:20:6:1:0 chr17 73085975 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.062;QD=55.6561;RBI=0.0293428;REFB=0;REVB=0.0281179;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227925;OID=.;OPOS=73085975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr17 73089852 . T C 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0261268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.68;QD=10.0752;RBI=0.0278709;REFB=-0.00718981;REVB=0.00970439;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020009;STB=0.512165;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0189055;OID=.;OPOS=73089852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:5:9:5:3:5:9 chr17 73110279 . C T 520.1 PASS AF=0.585366;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0270806;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.555;QD=25.3706;RBI=0.0337218;REFB=-0.0204606;REVB=0.0200948;RO=33;SAF=26;SAR=22;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715934;STB=0.53188;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0140474;OID=.;OPOS=73110279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:33:34:48:48:0.585366:22:26:21:12:22:26:21:13 chr17 73127217 . G C 128.05 PASS AF=0.7;AO=13;DP=19;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0561137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9487;QD=25.6093;RBI=0.0716636;REFB=0.0726194;REVB=0.044575;RO=6;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114837;STB=0.571326;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.0245089;OID=.;OPOS=73127217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:19:20:6:6:13:14:0.7:6:7:2:4:6:8:2:4 chr17 73221439 . C T 842.57 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00187442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.546;QD=54.3593;RBI=0.0222865;REFB=-0.0141021;REVB=0.0222075;RO=2;SAF=19;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128196;STB=0.506796;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=9.72838e-05;OID=.;OPOS=73221439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:41:19:1:1:41:19:1:1 chr17 73222847 . C T 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00169938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.889;QD=61.3364;RBI=0.00660292;REFB=0;REVB=0.00638049;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47258e-05;OID=.;OPOS=73222847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0 chr17 73222865 . G A 435.85 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0045726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.409;QD=54.481;RBI=0.0116804;REFB=-0.00327157;REVB=0.0107481;RO=1;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=5.09292e-05;OID=.;OPOS=73222865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:13:18:1:0:13:18:1:0 chr17 73230856 . C T 1603.99 PASS AF=0.990909;AO=106;DP=109;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0190919;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6325;QD=58.3269;RBI=0.0298432;REFB=-0.110338;REVB=0.0229372;RO=2;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179016;STB=0.504672;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00219621;OID=.;OPOS=73230856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:110:2:1:106:109:0.990909:52:54:0:2:53:56:0:1 chr17 73257986 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.434;QD=33.4285;RBI=0.0281771;REFB=0;REVB=-0.00283426;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447815;OID=.;OPOS=73257986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr17 73258479 . C T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060466;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.638;QD=63.872;RBI=0.0290468;REFB=0;REVB=0.0284104;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3228e-05;OID=.;OPOS=73258479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0 chr17 73269530 . A G 471.95 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2686;QD=55.5238;RBI=0.0518621;REFB=-0.0414837;REVB=-0.0454674;RO=1;SAF=17;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266901;STB=0.514277;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00116177;OID=.;OPOS=73269530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:16:17:1:0:16:17:1:0 chr17 73269676 . C T 785.87 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6773;QD=64.1529;RBI=0.0334575;REFB=0;REVB=0.0048099;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484535;OID=.;OPOS=73269676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chr17 73279624 . A G 758.41 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.065;QD=63.2007;RBI=0.0587558;REFB=0;REVB=-0.00676749;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220075;OID=.;OPOS=73279624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:21:25:0:0:21:27:0:0 chr17 73315368 . C T 647.94 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.017108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.954;QD=57.5944;RBI=0.0171275;REFB=-0.0189205;REVB=0.000816841;RO=2;SAF=23;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0029222;STB=0.501557;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00272678;OID=.;OPOS=73315368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:20:23:1:1:20:23:1:1 chr17 73488794 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.477;QD=56.7056;RBI=0.0505194;REFB=0;REVB=-0.0130667;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256419;OID=.;OPOS=73488794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr17 73495692 . C G 959.27 PASS AF=1;AO=46;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.237814;FXX=0.028165;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.3996;QD=55.6097;RBI=0.239536;REFB=0;REVB=-0.0286693;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00539809;OID=.;OPOS=73495692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:69:0:0:46:69:1:33:13:0:0:33:36:0:0 chr17 73498483 . T C 102.09 PASS AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.226859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.433;QD=40.8367;RBI=0.22852;REFB=0;REVB=0.0275026;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168362;OID=.;OPOS=73498483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:9:10:1:9:0:0:0:9:1:0:0 chr17 73498623 . A G 101.15 PASS AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00752078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.68;QD=8.42908;RBI=0.139736;REFB=-0.0121248;REVB=-0.139533;RO=34;SAF=12;SAR=1;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471039;STB=0.816125;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0303271;OID=.;OPOS=73498623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:34:35:13:13:0.270833:1:12:23:11:1:12:23:12 chr17 73509823 . T C 288.71 PASS AF=0.675676;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00782247;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.46;QD=31.2116;RBI=0.0273306;REFB=-0.0164462;REVB=0.0261873;RO=12;SAF=10;SAR=15;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414093;STB=0.522709;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00847708;OID=.;OPOS=73509823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:38:37:12:12:25:25:0.675676:15:10:4:8:15:10:4:8 chr17 73518203 . G C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.057;QD=57.2023;RBI=0.030542;REFB=0;REVB=0.0179398;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012408;OID=.;OPOS=73518203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chr17 73518284 . G C 191.28 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.344;QD=47.8189;RBI=0.0425186;REFB=0;REVB=0.0254601;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108067;OID=.;OPOS=73518284;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr17 73519413 . C T 699.27 PASS AF=0.978261;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189037;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.8836;QD=60.8062;RBI=0.0838928;REFB=-0.130635;REVB=0.0817352;RO=1;SAF=19;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240823;STB=0.51219;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00302384;OID=.;OPOS=73519413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:46:46:1:1:44:45:0.978261:25:19:1:0:25:20:1:0 chr17 73552185 . G A 175.66 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.636;QD=46.8434;RBI=0.0603359;REFB=0;REVB=0.0571929;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171612;OID=.;OPOS=73552185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0 chr17 73565171 . T C 166.61 PASS AF=0.761905;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0805413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4888;QD=31.7344;RBI=0.105878;REFB=0.00238657;REVB=-0.0687259;RO=5;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702821;STB=0.538873;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.00638288;OID=.;OPOS=73565171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:21:21:5:5:16:16:0.761905:9:7:3:2:9:7:3:2 chr17 73571030 . A G 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.020053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.09;QD=15.3788;RBI=0.0222692;REFB=-0.00370898;REVB=-0.00968469;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244233;STB=0.653614;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0138671;OID=.;OPOS=73571030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:14:12:12:0.461538:6:6:3:10:6:6:3:11 chr17 73571155 . T C 202.69 PASS AF=0.320988;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.0595522;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5748;QD=10.0092;RBI=0.0897226;REFB=-0.009966;REVB=0.0671095;RO=56;SAF=5;SAR=21;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.565062;STB=0.832941;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0175499;OID=.;OPOS=73571155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:56:55:26:26:0.320988:21:5:39:17:21:5:39:16 chr17 73586233 . C G 304.08 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0284555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3257;QD=15.0164;RBI=0.0325777;REFB=-0.022056;REVB=0.0158616;RO=47;SAF=14;SAR=20;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166472;STB=0.594148;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0238529;OID=.;OPOS=73586233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:20:14:27:20:20:14:27:20 chr17 73587784 . A G 553.06 PASS AF=0.566667;AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0183103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.972;QD=24.5804;RBI=0.0183531;REFB=-0.0115109;REVB=0.00125211;RO=39;SAF=18;SAR=33;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00521252;STB=0.502856;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00832214;OID=.;OPOS=73587784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:39:51:51:0.566667:33:18:14:25:33:18:14:25 chr17 73590830 . T G 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.561;QD=57.3857;RBI=0.0634437;REFB=0;REVB=0.0120781;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03787e-05;OID=.;OPOS=73590830;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0 chr17 73602081 . G A 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0318492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8284;QD=9.76025;RBI=0.0502811;REFB=0.00963168;REVB=-0.0389079;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425288;STB=0.773931;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.0151904;OID=.;OPOS=73602081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:11:12:7:7:0.368421:5:2:8:3:5:2:9:3 chr17 73609139 . C T 138.59 PASS AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00726544;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.084;QD=27.7184;RBI=0.0478195;REFB=-0.0279298;REVB=0.0472643;RO=6;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0200103;OID=.;OPOS=73609139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:20:20:6:6:14:14:0.7:7:7:3:3:7:7:3:3 chr17 73612642 . A AT 244.23 PASS AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.6741;QD=48.8455;RBI=0.191785;REFB=0;REVB=0.187506;RO=1;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540538;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0141929;OID=.;OPOS=73612643;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:19:20:20:20:0:11:9:0:0:4:1:11:8:0:1 chr17 73616920 . A G 68.61 PASS AF=0.192982;AO=11;DP=57;FAO=11;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0168957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.456;QD=4.81439;RBI=0.025512;REFB=-0.00144467;REVB=-0.0191153;RO=46;SAF=7;SAR=4;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00787459;STB=0.505145;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00579968;OID=.;OPOS=73616920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:57:57:46:46:11:11:0.192982:4:7:29:17:4:7:29:17 chr17 73617104 . A C 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0134298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.678;QD=14.6571;RBI=0.0343274;REFB=-0.0181397;REVB=-0.0315913;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884949;STB=0.505147;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0252727;OID=.;OPOS=73617104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:7:6:8:9:7:6:8:9 chr17 73619920 . G A 47.62 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00315222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.887;QD=10.5823;RBI=0.00324784;REFB=-0.0153727;REVB=0.000782318;RO=10;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496025;STB=0.826582;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0140405;OID=.;OPOS=73619920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:18:18:10:11:7:7:0.388889:1:6:4:6:1:6:4:7 chr17 73625286 . G A 650.84 PASS AF=0.47482;AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.00136439;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.253;QD=18.7293;RBI=0.00206539;REFB=-0.0233164;REVB=0.00155058;RO=74;SAF=38;SAR=28;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471517;STB=0.529403;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0327043;OID=.;OPOS=73625286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:74:73:66:66:0.47482:28:38:39:35:28:38:38:35 chr17 73625430 . G A 218.48 PASS AF=0.471698;AO=24;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0286676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4609;QD=16.4891;RBI=0.0664546;REFB=-0.0338207;REVB=0.0599532;RO=29;SAF=16;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152367;STB=0.557797;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0307431;OID=.;OPOS=73625430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:28:24:25:0.471698:8:16:15:14:9:16:15:13 chr17 73625478 . T C 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.598;QD=58.7815;RBI=0.0297979;REFB=0;REVB=-0.00231747;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34421e-05;OID=.;OPOS=73625478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0 chr17 73627565 . A G 902.69 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0400403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.673;QD=58.238;RBI=0.0407035;REFB=0;REVB=0.00731771;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142342;OID=.;OPOS=73627565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0 chr17 73687495 . G A 403.23 PASS AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.01306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.656;QD=24.8141;RBI=0.0134426;REFB=-0.0296866;REVB=-0.00318399;RO=25;SAF=29;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1565;STB=0.597325;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0180259;OID=.;OPOS=73687495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:25:26:39:39:0.6:10:29:14:11:10:29:14:12 chr17 73698557 . C T 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.953;QD=57.2376;RBI=0.0246737;REFB=0;REVB=0.0156247;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141774;OID=.;OPOS=73698557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr17 73753503 . T C 53.44 PASS AF=0.258065;AO=10;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.015663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.823;QD=6.89518;RBI=0.0794469;REFB=-0.0195247;REVB=-0.0778876;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861957;STB=0.548267;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0395389;OID=.;OPOS=73753503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:31:31:21:23:10:8:0.258065:6:4:10:11:4:4:10:13 chr17 73760820 . G A 75.64 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0404249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.5119;QD=11.6363;RBI=0.0664947;REFB=-0.0304352;REVB=0.0527957;RO=16;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406149;STB=0.745234;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.032462;OID=.;OPOS=73760820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:8:2:9:7:8:2:9:7 chr17 73812909 . A G 966.48 PASS AF=0.522222;AO=91;DP=178;FAO=94;FDP=180;FR=.;FRO=86;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.0190667;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5835;QD=21.4772;RBI=0.0249876;REFB=-0.0294808;REVB=0.0161505;RO=83;SAF=49;SAR=42;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00729955;STB=0.519996;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0268167;OID=.;OPOS=73812909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:83:86:91:94:0.522222:42:49:44:39:42:52:44:42 chr17 73816026 . A G 45.96 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=5.78527e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5449;QD=9.19258;RBI=0.077343;REFB=-0.0249455;REVB=-0.077343;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474209;STB=0.514244;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0644933;OID=.;OPOS=73816026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:12:13:7:7:0.35:6:1:2:10:6:1:2:11 chr17 73819525 . C T 408.33 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0360531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.805;QD=20.4165;RBI=0.0373616;REFB=-0.00599783;REVB=0.00980112;RO=39;SAF=24;SAR=17;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648769;STB=0.535962;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00561658;OID=.;OPOS=73819525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:17:24:20:19:17:24:20:19 chr17 73824121 . T C 580.3 PASS AF=0.472441;AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.0919608;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9717;QD=18.2773;RBI=0.100262;REFB=-0.0137437;REVB=-0.0399454;RO=66;SAF=33;SAR=27;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246526;STB=0.50916;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0103846;OID=.;OPOS=73824121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:66:67:60:60:0.472441:27:33:38:28:27:33:38:29 chr17 73827205 . T C 611.79 PASS AF=0.418182;AO=67;DP=165;FAO=69;FDP=165;FR=.;FRO=96;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.0363347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.098;QD=14.8312;RBI=0.0365791;REFB=-0.0121543;REVB=-0.00422095;RO=95;SAF=35;SAR=32;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508818;STB=0.539234;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0174398;OID=.;OPOS=73827205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:95:96:67:69:0.418182:32:35:45:50:32:37:45:51 chr17 73831594 . G A 95.95 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.109869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.2391;QD=22.5761;RBI=0.119876;REFB=-0.0939173;REVB=0.0479496;RO=6;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140261;STB=0.580485;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0611866;OID=.;OPOS=73831594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:9:2:2:4:9:2:2:4 chr17 73836162 . C G 48.03 PASS AF=0.466667;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0350062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2763;QD=12.8075;RBI=0.0476285;REFB=-0.049138;REVB=0.0322963;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247224;STB=0.673053;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0226035;OID=.;OPOS=73836162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:14:15:8:8:6:7:0.466667:2:4:7:1:3:4:7:1 chr17 73843040 . G A 337.6 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0199071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.858;QD=20.1555;RBI=0.0204332;REFB=-0.0160124;REVB=0.00460657;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146512;STB=0.581093;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0162098;OID=.;OPOS=73843040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:17:18:11:21:17:18:11:21 chr17 73886888 . A G 99.33 PASS AF=0.444444;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00703508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.85;QD=14.715;RBI=0.0220318;REFB=-0.0159492;REVB=-0.0208784;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00751908;STB=0.542788;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0100841;OID=.;OPOS=73886888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:15:15:11:12:0.444444:3:8:11:4:4:8:11:4 chr17 73888354 . G A 38.14 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0516396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9594;QD=10.1716;RBI=0.0598135;REFB=-0.00294369;REVB=0.0301829;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114905;STB=0.571184;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00210584;OID=.;OPOS=73888354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:4:5:4:2:4:5 chr17 73888423 . A G 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0234876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.359;QD=13.5765;RBI=0.0271692;REFB=-0.00593404;REVB=-0.0136565;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547742;STB=0.543976;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00883166;OID=.;OPOS=73888423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:8:5:6:12:8:5:6:13 chr17 73888427 . A C 121.51 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0277961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3903;QD=15.1887;RBI=0.0277988;REFB=-0.00618042;REVB=0.000391419;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457514;STB=0.514685;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0244741;OID=.;OPOS=73888427;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:16:18:14:14:0.4375:9:5:5:11:9:5:6:12 chr17 73897344 . G A 90.37 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0214909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7611;QD=16.4309;RBI=0.0806232;REFB=-0.0099602;REVB=0.0777062;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119431;STB=0.545372;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0152891;OID=.;OPOS=73897344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:22:22:10:11:11:11:0.5:6:5:6:4:6:5:6:5 chr17 73900688 . T C 774.12 PASS AF=0.47093;AO=74;DP=165;FAO=81;FDP=172;FR=.;FRO=91;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=0.0196525;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.455;QD=18.0029;RBI=0.0346419;REFB=-0.0347439;REVB=0.0285279;RO=90;SAF=35;SAR=39;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595538;STB=0.530113;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0483932;OID=.;OPOS=73900688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:172:90:91:74:81:0.47093:39:35:48:42:42:39:49:42 chr17 73917372 . A G 154.1 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00468974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.315;QD=14.3345;RBI=0.0240345;REFB=-0.0179111;REVB=-0.0235726;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115094;STB=0.566399;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0208155;OID=.;OPOS=73917372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:10:7:8:18:10:7:8:18 chr17 73922941 . T C 152.27 PASS AF=0.571429;AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0171121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.334;QD=21.7531;RBI=0.0262467;REFB=-0.026642;REVB=0.0199013;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211639;STB=0.519207;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0187933;OID=.;OPOS=73922941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:27:28:12:12:14:16:0.571429:9:5:4:8:10:6:4:8 chr17 73949540 . G C 339.04 PASS AF=0.596491;AO=25;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0125031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4373;QD=23.7924;RBI=0.0143409;REFB=-0.00362266;REVB=0.00702388;RO=22;SAF=18;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31204;STB=0.692183;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00259066;OID=.;OPOS=73949540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:22:23:25:34:0.596491:7:18:8:14:7:27:9:14 chr17 73997474 . G A 126.58 PASS AF=0.608696;AO=13;DP=22;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0243494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.508;QD=22.0142;RBI=0.0261754;REFB=-0.0214196;REVB=0.00960497;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147025;STB=0.592461;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0214651;OID=.;OPOS=73997474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:23:9:9:13:14:0.608696:6:7:3:6:6:8:3:6 chr17 74003981 . C T 229.58 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0158402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.059;QD=22.3978;RBI=0.0171058;REFB=0.00591324;REVB=0.00645712;RO=19;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653289;STB=0.536552;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.00584433;OID=.;OPOS=74003981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:11:11:8:11:11:11:8:11 chr17 74014628 . G A 120.99 PASS AF=0.288136;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0173209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3503;QD=8.20265;RBI=0.0214481;REFB=-0.00187032;REVB=0.0126494;RO=41;SAF=9;SAR=8;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774964;STB=0.554608;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00461596;OID=.;OPOS=74014628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:41:42:17:17:0.288136:8:9:19:22:8:9:19:23 chr17 74014668 . T C 60.57 PASS AF=0.2;AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0101466;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.973;QD=5.38422;RBI=0.0128697;REFB=-0.02143;REVB=-0.00791681;RO=38;SAF=5;SAR=4;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996894;STB=0.588042;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0424211;OID=.;OPOS=74014668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:47:45:38:36:9:9:0.2:4:5:18:20:4:5:16:20 chr17 74017554 . G T 99.51 PASS AF=0.219178;AO=16;DP=73;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0150019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.295;QD=5.45242;RBI=0.0289583;REFB=-0.00210584;REVB=0.0247695;RO=57;SAF=13;SAR=3;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375082;STB=0.740337;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00903704;OID=.;OPOS=74017554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:57:57:16:16:0.219178:3:13:31:26:3:13:31:26 chr17 74017573 . C G 79.42 PASS AF=0.181818;AO=14;DP=77;FAO=14;FDP=77;FR=.;FRO=63;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.0247787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.528;QD=4.12596;RBI=0.0333329;REFB=-0.00816916;REVB=-0.0222957;RO=63;SAF=11;SAR=3;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317912;STB=0.711572;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0390564;OID=.;OPOS=74017573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:77:77:63:63:14:14:0.181818:3:11:35:28:3:11:35:28 chr17 74017594 . A G 30.28 PASS AF=0.0972222;AO=7;DP=72;FAO=7;FDP=72;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0599239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.104;QD=1.68249;RBI=0.0656545;REFB=-0.00527329;REVB=-0.0268263;RO=65;SAF=4;SAR=3;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379921;STB=0.530034;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0363669;OID=.;OPOS=74017594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:72:72:65:65:7:7:0.0972222:3:4:35:30:3:4:35:30 chr17 74056413 . C T 472.73 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0397823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2143;QD=55.6147;RBI=0.044422;REFB=-0.167186;REVB=-0.0197657;RO=1;SAF=18;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252499;STB=0.513505;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00680679;OID=.;OPOS=74056413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:34:34:1:1:33:33:0.970588:15:18:1:0:15:18:1:0 chr17 74066447 . T A 805.17 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.456;QD=64.4137;RBI=0.0486141;REFB=0;REVB=0.0445619;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022624;OID=.;OPOS=74066447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0 chr17 74077797 . C T 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00808239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.108;QD=56.9372;RBI=0.0140372;REFB=0;REVB=0.0114769;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.83329e-05;OID=.;OPOS=74077797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr17 74080443 . C T 905.77 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0542294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.344;QD=56.6105;RBI=0.0564856;REFB=-0.103295;REVB=0.0158049;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00490134;OID=.;OPOS=74080443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:37:26:0:0:37:26:1:0 chr17 74152366 . A G 307.53 PASS AF=0.722222;AO=26;DP=36;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0307263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.032;QD=34.1702;RBI=0.0312247;REFB=0.00758746;REVB=0.00555687;RO=10;SAF=15;SAR=11;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140731;STB=0.576864;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00343566;OID=.;OPOS=74152366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:36:36:10:10:26:26:0.722222:11:15:3:7:11:15:3:7 chr17 74286082 . C T 125.59 PASS AF=0.307692;AO=14;DP=50;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0111237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.173;QD=9.66046;RBI=0.0120643;REFB=-0.0121948;REVB=0.00467023;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13183;STB=0.618339;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0368972;OID=.;OPOS=74286082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:36:36:14:16:0.307692:7:7:14:22:7:9:14:22 chr17 74286106 . C T 137.82 PASS AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0245321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5337;QD=10.0231;RBI=0.0332451;REFB=0.00113809;REVB=-0.0224368;RO=37;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199567;STB=0.617403;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.00476506;OID=.;OPOS=74286106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:8:10:14:23:8:10:14:23 chr17 74287204 . C G 182.98 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00983714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3617;QD=17.4269;RBI=0.0156879;REFB=-0.0332972;REVB=0.0122205;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00439952;STB=0.50251;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0393243;OID=.;OPOS=74287204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:10:9:11:12:10:9:11:12 chr17 74287389 . T C 123.78 PASS AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00156091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.985;QD=9.90206;RBI=0.0105707;REFB=-0.00838659;REVB=0.0104548;RO=35;SAF=12;SAR=3;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214608;STB=0.631385;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0205009;OID=.;OPOS=74287389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:3:12:23:12:3:12:23:12 chr17 74287594 . G A 125.85 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0427053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3707;QD=18.6448;RBI=0.0431159;REFB=0.0221716;REVB=-0.00593607;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290292;STB=0.66642;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0210344;OID=.;OPOS=74287594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:4:10:5:8:4:10:5:8 chr17 74289500 . G A 108.85 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00244035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.235;QD=24.1896;RBI=0.0447495;REFB=0.00617572;REVB=-0.0446829;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500226;STB=0.528254;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.00341274;OID=.;OPOS=74289500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:3:3:7:5:3:3 chr17 74289839 . G A 162.54 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-7.55232e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.666;QD=19.7023;RBI=0.00511461;REFB=-0.00256564;REVB=-0.00511405;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137389;STB=0.577529;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00316651;OID=.;OPOS=74289839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:8:9:11:5:8:9:11:5 chr17 74289875 . C T 224.57 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0957703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2127;QD=17.6133;RBI=0.114535;REFB=-0.0167512;REVB=0.0628198;RO=27;SAF=10;SAR=14;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297034;STB=0.666536;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0248612;OID=.;OPOS=74289875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:14:10:20:7:14:10:20:7 chr17 74289908 . A G 269.52 PASS AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0165584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.271;QD=18.9137;RBI=0.0306442;REFB=0.00372252;REVB=-0.0257854;RO=28;SAF=10;SAR=19;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320376;STB=0.678451;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00394019;OID=.;OPOS=74289908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:19:10:20:8:19:10:20:8 chr17 74290097 . T A 75.13 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00287589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.632;QD=11.131;RBI=0.0280232;REFB=-0.0207987;REVB=-0.0278752;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128126;STB=0.507677;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0426032;OID=.;OPOS=74290097;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:6:4:7:10:6:4:7:10 chr17 74307737 . T C 163.65 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00180853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.536;QD=20.456;RBI=0.00628604;REFB=0.00720228;REVB=0.00602026;RO=15;SAF=12;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213639;STB=0.621364;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.0100508;OID=.;OPOS=74307737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:5:12:7:8:5:12:7:8 chr17 74382988 . CG C 169.9 PASS AF=0.884615;AO=19;DP=27;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0387322;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8704;QD=26.1389;RBI=0.231941;REFB=-0.160778;REVB=0.228684;RO=5;SAF=15;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.428571;SSSB=-0.00603431;STB=0.519214;STBP=0.705;TYPE=del;VARB=0.072661;OID=.;OPOS=74382989;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.884615:19:27:23:26:3:18:5:2:1:9:5:15:4:4:1 chr17 74387284 . C T 1362.69 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0276449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.269;QD=61.2447;RBI=0.0451383;REFB=-0.149727;REVB=0.0356822;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.505746;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000272784;OID=.;OPOS=74387284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:0:1:88:88:0.988764:45:43:0:0:45:43:1:0 chr17 74467017 . G C 141.32 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0162153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.136;QD=13.4586;RBI=0.0185029;REFB=-0.0104994;REVB=-0.008912;RO=26;SAF=4;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25178;STB=0.64845;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0133459;OID=.;OPOS=74467017;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:12:4:12:14:12:4:12:14 chr17 74470522 . C T 210.7 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.017437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.987;QD=19.1548;RBI=0.0179237;REFB=-0.022142;REVB=-0.00414858;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196547;STB=0.501084;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0245561;OID=.;OPOS=74470522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:22:23:21:21:0.477273:11:10:10:12:11:10:11:12 chr17 74475024 . GG AG,CA 250.79 PASS AF=0.9,0.1;AO=18,2;DP=20;FAO=18,2;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12,2;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108896,0.0174998;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=122.361,87.4495;QD=50.1575;RBI=0.0562132,0.0345908;REFB=0,0;REVB=0.0551484,0.0298376;RO=0;SAF=12,2;SAR=6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00538619,-0.00827768;OID=.,.;OPOS=74475024,74475024;OREF=G,GG;OALT=A,CA;OMAPALT=AG,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:20:20:0:0:18,2:18,2:0.9,0.1:6,0:12,2:0:0:6,0:12,2:0:0 chr17 74475975 . C A 332.39 PASS AF=0.591837;AO=25;DP=45;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0255539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.64;QD=27.1342;RBI=0.0657686;REFB=-0.046676;REVB=0.0606013;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127416;STB=0.561755;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0344884;OID=.;OPOS=74475975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:20:20:25:29:0.591837:11:14:8:12:13:16:8:12 chr17 74541129 . A G 227.21 PASS AF=1;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142563;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9615;QD=50.4903;RBI=0.0142563;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000473683;OID=.;OPOS=74541129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:18:0:0:16:18:1:0:16:0:0:0:18:0:0 chr17 74652491 . T C 482.89 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00151712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.714;QD=58.5315;RBI=0.0132259;REFB=0;REVB=0.0131386;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69402e-05;OID=.;OPOS=74652491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr17 74652501 . AT TA 345.93 PASS AF=0.931034;AO=29;DP=30;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0878033;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=2;MLLD=222.028;QD=47.7149;RBI=0.154411;REFB=-0.0602627;REVB=0.127018;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.506591;STBP=0.859;TYPE=mnp;VARB=0.00202193;OID=.;OPOS=74652501;OREF=AT;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:29:0:2:29:27:0.931034:17:12:0:0:16:11:1:1 chr17 74732507 . A G 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00850316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.804;QD=60.2292;RBI=0.0258397;REFB=0;REVB=-0.0244005;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013665;OID=.;OPOS=74732507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0 chr17 74733099 . G A 2686.87 PASS AF=1;AO=173;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340785;FXX=0.00571396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.228;QD=61.7672;RBI=0.040798;REFB=-0.0681627;REVB=0.0224306;RO=1;SAF=102;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47287e-05;OID=.;OPOS=74733099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:175:174:1:0:173:174:1:71:102:1:0:71:103:0:0 chr17 74846671 . C A 194.89 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0539769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.329;QD=17.3236;RBI=0.0545052;REFB=-0.0106352;REVB=-0.00757083;RO=25;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401324;STB=0.522913;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0168172;OID=.;OPOS=74846671;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:12:8:11:14:12:8:11:14 chr17 74857676 . A G 977.35 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195551;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.126;QD=59.2335;RBI=0.0196509;REFB=0;REVB=0.00193819;RO=0;SAF=21;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47552e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112624;OID=.;OPOS=74857676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:45:21:0:0:45:21:0:0 chr17 74878259 . G A 361.88 PASS AF=0.407767;AO=42;DP=103;FAO=42;FDP=103;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.00142802;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.24;QD=14.0536;RBI=0.027117;REFB=-0.0114006;REVB=0.0270794;RO=60;SAF=22;SAR=20;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623955;STB=0.529726;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0179937;OID=.;OPOS=74878259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:60:61:42:42:0.407767:20:22:35:25:20:22:35:26 chr17 74899373 . C T 506.82 PASS AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0710025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6995;QD=20.4775;RBI=0.0759672;REFB=-0.0230838;REVB=0.0270122;RO=49;SAF=25;SAR=24;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552506;STB=0.52533;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0330169;OID=.;OPOS=74899373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:49:50:49:49:0.494949:24:25:22:27:24:25:23:27 chr17 74928758 . C T 257.19 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0107326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.845;QD=23.3813;RBI=0.0159808;REFB=-0.00583685;REVB=0.0118405;RO=20;SAF=18;SAR=6;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116505;STB=0.564466;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00264641;OID=.;OPOS=74928758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:6:18:17:3:6:18:17:3 chr17 74936576 . G A 256.6 PASS AF=0.519231;AO=20;DP=54;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0189097;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6105;QD=19.7384;RBI=0.0667923;REFB=-0.0515114;REVB=0.0640596;RO=24;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973723;STB=0.517229;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0146108;OID=.;OPOS=74936576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:52:24:25:20:27:0.519231:12:8:12:12:12:15:13:12 chr17 74942478 . C T 1410.4 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0499908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.639;QD=60.6625;RBI=0.0513472;REFB=-0.102889;REVB=0.011724;RO=1;SAF=47;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099791;STB=0.505153;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000307818;OID=.;OPOS=74942478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:93:93:1:1:91:92:0.989247:44:47:1:0:44:48:1:0 chr17 75085434 . G A 1847.34 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.384;QD=61.0692;RBI=0.0292495;REFB=0;REVB=0.0242241;RO=0;SAF=66;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10813e-05;OID=.;OPOS=75085434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:54:66:0:0:55:66:0:0 chr17 75158213 . T G 346.99 PASS AF=0.4;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.0094209;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.358;QD=14.61;RBI=0.0110283;REFB=-0.0172305;REVB=-0.00573328;RO=57;SAF=15;SAR=23;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00967961;STB=0.505492;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0236576;OID=.;OPOS=75158213;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:57:57:38:38:0.4:23:15:23:34:23:15:23:34 chr17 75158256 . C T 178.86 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0188877;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.067;QD=13.7581;RBI=0.0200988;REFB=-0.00140283;REVB=0.00687158;RO=30;SAF=4;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308695;STB=0.692103;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00522682;OID=.;OPOS=75158256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:30:31:21:21:0.403846:17:4:13:17:17:4:14:17 chr17 75158261 . C G 117.2 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.015497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.716;QD=12.0206;RBI=0.0331034;REFB=-0.0286299;REVB=-0.029252;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179997;STB=0.606587;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0521736;OID=.;OPOS=75158261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:9:5:13:12:9:5:13:12 chr17 75190846 . A C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.989;QD=61.3362;RBI=0.0378686;REFB=0;REVB=0.0309918;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228736;OID=.;OPOS=75190846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0 chr17 75190962 . C T 73.39 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0995433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7608;QD=9.17316;RBI=0.101189;REFB=-0.016242;REVB=-0.0181754;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102445;STB=0.562377;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0259468;OID=.;OPOS=75190962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:9:13:5:5:9:13 chr17 75209816 . G C 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0162974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.43;QD=16.2717;RBI=0.0224832;REFB=-0.0421733;REVB=0.0154884;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11279;STB=0.565128;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0460855;OID=.;OPOS=75209816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:10:5:8:10:10:5:8:10 chr17 75303298 . T C 762.2 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.969;QD=56.4593;RBI=0.035221;REFB=0;REVB=0.0128517;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130769;OID=.;OPOS=75303298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:35:18:0:0:35:19:0:0 chr17 75401191 . C T 478.79 PASS AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00413348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.172;QD=25.1995;RBI=0.00843232;REFB=-0.0200793;REVB=0.00734971;RO=31;SAF=19;SAR=26;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118509;STB=0.564857;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0189655;OID=.;OPOS=75401191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:31:31:45:45:0.592105:26:19:18:13:26:19:18:13 chr17 75425078 . G C 238.08 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0182456;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.617;QD=16.1408;RBI=0.0189844;REFB=-0.0148868;REVB=0.00524467;RO=32;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00676195;STB=0.503814;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0194978;OID=.;OPOS=75425078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:15:12:14:18:15:12:14:18 chr17 75425206 . A G 177.64 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0436458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6904;QD=14.5015;RBI=0.061564;REFB=0.00100446;REVB=-0.0434185;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453538;STB=0.507684;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=-0.00431017;OID=.;OPOS=75425206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:28:30:19:19:0.387755:11:8:13:15:11:8:13:17 chr17 75425456 . A G 203.99 PASS AF=0.545455;AO=15;DP=34;FAO=18;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0176845;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.859;QD=24.7255;RBI=0.0341093;REFB=-0.0448479;REVB=0.0291668;RO=9;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593147;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0234453;OID=.;OPOS=75425456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:34:33:9:12:15:18:0.545455:8:7:5:4:9:9:6:6 chr17 75426849 . A G 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0805967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.084;QD=22.5854;RBI=0.0858629;REFB=0.0348567;REVB=-0.0296073;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.440891;STB=0.749558;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0302662;OID=.;OPOS=75426849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:3:8:0:6:3:8:0:6 chr17 75478481 . C T 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00956626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.509;QD=21.6129;RBI=0.0109173;REFB=-0.00687768;REVB=0.00526071;RO=23;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207296;STB=0.511618;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00629257;OID=.;OPOS=75478481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:13:11:10:13:13:11:10:13 chr17 75494705 . A G 1153.39 PASS AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.492;QD=60.7047;RBI=0.0512064;REFB=0;REVB=0.0357928;RO=0;SAF=15;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181141;OID=.;OPOS=75494705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:60:15:0:0:60:16:0:0 chr17 75495065 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.036;QD=58.5878;RBI=0.0302988;REFB=0;REVB=0.0217659;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102083;OID=.;OPOS=75495065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr17 75495397 . T C 95.32 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0326094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.404;QD=34.6628;RBI=0.0377032;REFB=0.0130949;REVB=0.0189252;RO=1;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126911;STB=0.57128;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.00371;OID=.;OPOS=75495397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:7:3:1:0:7:3:1:0 chr17 75495480 . C T 105.87 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00460767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.451;QD=21.174;RBI=0.0584217;REFB=-0.0295233;REVB=0.0582397;RO=7;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892086;STB=0.570063;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0241299;OID=.;OPOS=75495480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:7:8:12:12:0.6:5:7:5:2:5:7:6:2 chr17 75495504 . C G 132.15 PASS AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0328179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.283;QD=24.0277;RBI=0.0580556;REFB=-0.0333185;REVB=0.0478898;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971129;STB=0.554715;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0137317;OID=.;OPOS=75495504;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:5:9:4:4:5:9:4:4 chr17 75496342 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7424;QD=42.1824;RBI=0.0202349;REFB=0;REVB=-0.013782;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37021e-05;OID=.;OPOS=75496342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0 chr17 75496361 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.567;QD=40.763;RBI=0.0313573;REFB=0;REVB=-0.0261946;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193557;OID=.;OPOS=75496361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0 chr17 75558676 . A T 85.97 PASS AF=0.9;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0505301;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.619;QD=34.3886;RBI=0.13205;REFB=-0.0788483;REVB=0.122;RO=1;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593592;STB=0.533262;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.018272;OID=.;OPOS=75558676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:11:10:1:1:9:9:0.9:7:2:0:1:7:2:0:1 chr17 75559019 . C T 580.21 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238481;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.222;QD=61.0744;RBI=0.0138156;REFB=0;REVB=-0.0136082;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47757e-05;OID=.;OPOS=75559019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0 chr17 76060866 . C G 409.61 PASS AF=0.438095;AO=45;DP=104;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.0192376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.995;QD=15.6041;RBI=0.0211317;REFB=0.000811276;REVB=0.00874437;RO=58;SAF=29;SAR=16;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24943;STB=0.647776;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00128865;OID=.;OPOS=76060866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:58:59:45:46:0.438095:16:29:23:35:16:30:23:36 chr17 76060954 . A C 319.65 PASS AF=0.375;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00641942;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2922;QD=13.3188;RBI=0.0105796;REFB=-0.00254206;REVB=0.00840944;RO=60;SAF=18;SAR=18;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00745689;OID=.;OPOS=76060954;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:60:60:36:36:0.375:18:18:30:30:18:18:30:30 chr17 76063047 . A G 93.8 PASS AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.010243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.72;QD=10.1411;RBI=0.0107876;REFB=0.00292938;REVB=-0.00338431;RO=24;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183569;STB=0.622023;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=-0.00468906;OID=.;OPOS=76063047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:37:37:24:25:12:12:0.324324:7:5:14:10:7:5:15:10 chr17 76093866 . T C 171.41 PASS AF=0.354839;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0136136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4428;QD=11.059;RBI=0.0498188;REFB=-0.00332505;REVB=-0.0479227;RO=39;SAF=9;SAR=13;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115019;STB=0.575153;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00362263;OID=.;OPOS=76093866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:39:40:22:22:0.354839:13:9:20:19:13:9:21:19 chr17 76105731 . C T 358.1 PASS AF=0.534247;AO=36;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00348522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.384;QD=19.6221;RBI=0.00835953;REFB=-0.00436294;REVB=0.00759836;RO=34;SAF=16;SAR=20;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125406;STB=0.583056;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00324395;OID=.;OPOS=76105731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:36:39:0.534247:20:16:20:14:23:16:20:14 chr17 76105754 . G A 540.22 PASS AF=0.53125;AO=50;DP=95;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00198771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.933;QD=22.509;RBI=0.0165088;REFB=-0.00727563;REVB=0.0163887;RO=45;SAF=22;SAR=28;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155718;STB=0.588917;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00618205;OID=.;OPOS=76105754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:45:45:50:51:0.53125:28:22:28:17:29:22:28:17 chr17 76121004 . G A 326.15 PASS AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.022971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8013;QD=20.0709;RBI=0.0271838;REFB=0.00712615;REVB=0.014536;RO=30;SAF=20;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187408;STB=0.503729;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00573287;OID=.;OPOS=76121004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:31:34:34:0.523077:14:20:17:13:14:20:18:13 chr17 76121864 . A G 120.86 PASS AF=0.424242;AO=13;DP=32;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00231413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.686;QD=14.6497;RBI=0.0126674;REFB=-0.00693396;REVB=0.0124543;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118539;STB=0.54539;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00735208;OID=.;OPOS=76121864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:19:19:13:14:0.424242:7:6:11:8:7:7:11:8 chr17 76157266 . T C 505.41 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101936;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.859;QD=59.4599;RBI=0.0291781;REFB=0;REVB=0.0273395;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13553e-05;OID=.;OPOS=76157266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr17 76178748 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.409;QD=61.684;RBI=0.049719;REFB=0;REVB=0.0292957;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.82973e-05;OID=.;OPOS=76178748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0 chr17 76183043 . A G 223.13 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.475;QD=49.5848;RBI=0.0421206;REFB=0;REVB=0.0224509;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361769;OID=.;OPOS=76183043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0 chr17 76188753 . C A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.8;QD=56.7061;RBI=0.00843434;REFB=0;REVB=0.00784002;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31467e-05;OID=.;OPOS=76188753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr17 76188773 . C CT 336.52 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.112863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.0368;QD=46.4165;RBI=0.115656;REFB=0;REVB=0.0252609;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00395519;OID=.;OPOS=76188774;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:28:29:29:29:0:15:14:0:0:6:0:14:14:0:0 chr17 76210367 . G C 422.26 PASS AF=0.518519;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0224031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.8814;QD=20.8522;RBI=0.024974;REFB=0.00470459;REVB=-0.0110365;RO=39;SAF=22;SAR=20;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14856;STB=0.58191;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.00680171;OID=.;OPOS=76210367;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:39:42:42:0.518519:20:22:27:12:20:22:27:12 chr17 76219591 . G A 167.05 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0646473;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4099;QD=14.5263;RBI=0.101335;REFB=0.0179264;REVB=0.0780351;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173515;STB=0.610988;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.0218236;OID=.;OPOS=76219591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:29:28:18:18:0.391304:11:7:16:13:11:7:16:12 chr17 76267843 . G A 148.13 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0148286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.026;QD=17.9556;RBI=0.0160044;REFB=-0.00359309;REVB=-0.00602118;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349675;STB=0.519975;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00299046;OID=.;OPOS=76267843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:6:10:10:7:6:10:10:7 chr17 76367052 . A G 249.99 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0102222;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6557;QD=13.8884;RBI=0.043211;REFB=-0.0592005;REVB=-0.0419845;RO=43;SAF=18;SAR=11;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017737;STB=0.510114;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0836617;OID=.;OPOS=76367052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:11:18:26:17:11:18:26:17 chr17 76395430 . C T 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000272416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.401;QD=57.2347;RBI=0.0046842;REFB=0;REVB=-0.00467628;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19613e-05;OID=.;OPOS=76395430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:24:32:0:0:24:32:0:0 chr17 76415702 . C T 143.31 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00250421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.452;QD=14.6982;RBI=0.0102;REFB=-0.00609279;REVB=-0.00988779;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1295;STB=0.574986;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00995289;OID=.;OPOS=76415702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:7:9:10:13:7:9:10:13 chr17 76423097 . G A 1080.53 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.815;QD=60.0297;RBI=0.0113897;REFB=0;REVB=-0.0108284;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.13725e-05;OID=.;OPOS=76423097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0 chr17 76433898 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.473;QD=62.0215;RBI=0.0268438;REFB=0;REVB=0.0136003;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195013;OID=.;OPOS=76433898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0 chr17 76449505 . G C 424.19 PASS AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00269905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=313.839;QD=26.9329;RBI=0.00328401;REFB=-0.0117808;REVB=0.00187079;RO=23;SAF=27;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141452;STB=0.577377;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00513327;OID=.;OPOS=76449505;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:23:23:40:40:0.634921:13:27:11:12:13:27:11:12 chr17 76451921 . A G 782.03 PASS AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0352872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.737;QD=52.1355;RBI=0.0396547;REFB=-0.097735;REVB=0.0180918;RO=3;SAF=33;SAR=24;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409639;STB=0.521732;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00101942;OID=.;OPOS=76451921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:60:60:3:3:57:57:0.95:24:33:3:0:24:33:3:0 chr17 76462770 . G A 303.14 PASS AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0165815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.273;QD=14.97;RBI=0.0166034;REFB=-0.0255411;REVB=0.000851791;RO=47;SAF=18;SAR=16;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149463;STB=0.584367;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.045449;OID=.;OPOS=76462770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:16:18:18:29:16:18:18:29 chr17 76464916 . G A 167.43 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0159399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.845;QD=23.0939;RBI=0.0213554;REFB=-0.0128859;REVB=0.0142117;RO=12;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245494;STB=0.637293;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0120117;OID=.;OPOS=76464916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:10:7:9:3:10:7:9:3 chr17 76468750 . G T 46.54 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0324802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2084;QD=12.4115;RBI=0.0616766;REFB=-0.0363801;REVB=0.0524313;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296554;STB=0.673053;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0459992;OID=.;OPOS=76468750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:7:1:3:4:7:1 chr17 76468817 . G A 176.68 PASS AF=0.68;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0326327;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3788;QD=28.2681;RBI=0.0577369;REFB=-0.0345753;REVB=0.0476303;RO=8;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193442;STB=0.607351;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0267145;OID=.;OPOS=76468817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:26:25:8:8:17:17:0.68:10:7:6:2:10:7:6:2 chr17 76468839 . C T 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0297469;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.225;QD=9.11039;RBI=0.0321701;REFB=-0.0168907;REVB=-0.012249;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390509;STB=0.734775;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0605659;OID=.;OPOS=76468839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:3:5:4:12:3:5:4:12 chr17 76468843 . C T 35.75 PASS AF=0.25;AO=5;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0286055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.109;QD=5.95898;RBI=0.0302496;REFB=-0.0146285;REVB=-0.00983683;RO=18;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823023;STB=0.62461;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0906091;OID=.;OPOS=76468843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:18:18:5:6:0.25:3:2:6:12:3:3:6:12 chr17 76471366 . G A 185.66 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0119317;FXX=0.0454442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.077;QD=17.6815;RBI=0.0146486;REFB=-0.0053007;REVB=0.00849786;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03751;STB=0.521388;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00481949;OID=.;OPOS=76471366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:42:23:23:19:19:0.452381:9:10:13:10:9:10:13:10 chr17 76472768 . G A 817.72 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.349;QD=57.3837;RBI=0.0560541;REFB=0;REVB=-0.0480971;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.57172e-05;OID=.;OPOS=76472768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0 chr17 76482432 . A G 142.14 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0665183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1084;QD=13.8677;RBI=0.0676532;REFB=-0.00480978;REVB=-0.0123397;RO=23;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19448;STB=0.613354;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00251391;OID=.;OPOS=76482432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:23:25:16:16:0.390244:6:10:10:13:6:10:11:14 chr17 76491127 . TG CC 1026.41 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00653304;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=283.451;QD=59.5018;RBI=0.0173015;REFB=0;REVB=-0.0160207;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-1.26675e-05;OID=.;OPOS=76491127;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0 chr17 76496492 . A G 2216.11 PASS AF=1;AO=127;DP=128;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.382;QD=62.4258;RBI=0.0566291;REFB=0;REVB=0.0512537;RO=0;SAF=49;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19009e-05;OID=.;OPOS=76496492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:128:142:0:0:127:142:1:78:49:0:0:89:53:0:0 chr17 76497920 . C A 618.58 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0374161;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.3744;QD=58.9124;RBI=0.0379554;REFB=-0.0832657;REVB=-0.00637504;RO=1;SAF=11;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407439;STB=0.521728;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00223036;OID=.;OPOS=76497920;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:30:11:1:0:30:11:1:0 chr17 76498692 . C T 688.77 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.06;QD=62.6154;RBI=0.0309931;REFB=0;REVB=0.00897001;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.80824e-05;OID=.;OPOS=76498692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:23:19:0:0:23:21:0:0 chr17 76503560 . C A 569.17 PASS AF=0.542857;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=105;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00256471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2199;QD=21.6828;RBI=0.00486947;REFB=-0.0161032;REVB=0.00413933;RO=48;SAF=31;SAR=26;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539967;STB=0.529638;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0132804;OID=.;OPOS=76503560;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:48:48:57:57:0.542857:26:31:23:25:26:31:23:25 chr17 76503593 . T C 483.43 PASS AF=0.472727;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.020178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6494;QD=17.5794;RBI=0.0216495;REFB=-0.00490874;REVB=-0.00784535;RO=56;SAF=21;SAR=31;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107957;STB=0.569584;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00414282;OID=.;OPOS=76503593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:58:52:52:0.472727:31:21:29:27:31:21:31:27 chr17 76525565 . A G 110.59 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.031287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.859;QD=15.2542;RBI=0.0340536;REFB=0.0129779;REVB=-0.013445;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366376;STB=0.521244;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.0233426;OID=.;OPOS=76525565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:7:6:8:8:7:6:8:8 chr17 76528591 . C T 43.62 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00460271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.348;QD=6.01694;RBI=0.0309129;REFB=-0.00450073;REVB=-0.0305683;RO=22;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464184;STB=0.808013;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0142601;OID=.;OPOS=76528591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:1:6:11:11:1:6:11:11 chr17 76528790 . A G 458.97 PASS AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00147115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.03;QD=20.8621;RBI=0.0223973;REFB=-0.0185199;REVB=0.0223489;RO=43;SAF=29;SAR=16;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059492;STB=0.532958;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.012343;OID=.;OPOS=76528790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:43:43:45:45:0.511364:16:29:25:18:16:29:25:18 chr17 76535948 . T C 805.1 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.091;QD=64.4083;RBI=0.0272476;REFB=0;REVB=0.0192843;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262763;OID=.;OPOS=76535948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr17 76557862 . T C 1346.7 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00277314;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.471;QD=61.9172;RBI=0.0203406;REFB=0;REVB=-0.0201507;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204989;OID=.;OPOS=76557862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:45:41:0:0:46:41:0:0 chr17 76567707 . T C 707.83 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0256;QD=62.9182;RBI=0.0673001;REFB=0;REVB=-0.0406792;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000952239;OID=.;OPOS=76567707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0 chr17 76571044 . G A 171.15 PASS AF=0.395833;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.019639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.369;QD=14.2625;RBI=0.0252001;REFB=-0.00911585;REVB=0.015791;RO=27;SAF=6;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198628;STB=0.611854;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0138402;OID=.;OPOS=76571044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:27:29:18:19:0.395833:12:6:14:13:12:7:16:13 chr17 76672002 . T C 63.06 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0241929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.776;QD=12.0105;RBI=0.0273035;REFB=0.00262586;REVB=0.0126564;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202897;STB=0.644834;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00371595;OID=.;OPOS=76672002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:21:21:11:12:9:9:0.428571:6:3:6:5:6:3:7:5 chr17 76799795 . G A 366.76 PASS AF=0.351562;AO=45;DP=128;FAO=45;FDP=128;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=-0.0149994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.559;QD=11.4612;RBI=0.0352127;REFB=-0.0217334;REVB=0.0318583;RO=83;SAF=23;SAR=22;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101004;STB=0.55784;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0442341;OID=.;OPOS=76799795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:83:83:45:45:0.351562:22:23:35:48:22:23:35:48 chr17 76799860 . T C 357.85 PASS AF=0.356522;AO=28;DP=112;FAO=41;FDP=115;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=70;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.00718249;FXX=0.0573723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.584;QD=12.4469;RBI=0.0144357;REFB=-0.0248316;REVB=-0.012522;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00257103;STB=0.600925;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.015106;OID=.;OPOS=76799860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:45:70:28:41:0.356522:15:13:21:24:21:20:23:47 chr17 76799898 . A G 360.49 PASS AF=0.363636;AO=44;DP=121;FAO=44;FDP=121;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=51;FWDB=0.00388254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.529;QD=11.9172;RBI=0.0176422;REFB=-0.00853255;REVB=-0.0172097;RO=77;SAF=22;SAR=22;SRF=26;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181656;STB=0.603261;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0160295;OID=.;OPOS=76799898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:77:77:44:44:0.363636:22:22:26:51:22:22:26:51 chr17 76823227 . T G 129.28 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0705841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.418;QD=21.5458;RBI=0.0711412;REFB=-0.00518681;REVB=0.00888611;RO=10;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157829;STB=0.508916;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00261525;OID=.;OPOS=76823227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:11:3:2:8:11:3:2:8 chr17 76823260 . A C 101.58 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0212904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6292;QD=16.9302;RBI=0.0334058;REFB=-0.00604534;REVB=0.0257423;RO=11;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795217;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.008892;OID=.;OPOS=76823260;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:9:3:2:9:9:3:3:9 chr17 76849777 . TTA T,TTT 83.22 PASS AF=0.464286,0;AO=6,3;DP=26;FAO=13,0;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=1,0;FSAR=12,0;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0193925,0.160566;FXX=0.0666445;HRUN=7,6;LEN=2,1;MLLD=21.4373,11.8216;QD=11.8883;RBI=0.151624,0.181586;REFB=-0.00647381,-0.0834048;REVB=-0.150378,0.0848059;RO=16;SAF=0,0;SAR=6,3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.713886,-0.594791;STB=0.82694,0.5;STBP=0.01,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00153998,0;OID=.,.;OPOS=76849778,76849779;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.464286,0:6,3:26:13,0:28:15:1,0:12,0:7:8:83:16:0,0:6,3:7:9 chr17 76887360 . G C 191.7 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0736107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2686;QD=23.2366;RBI=0.076675;REFB=-0.130221;REVB=-0.0214599;RO=7;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202028;STB=0.512181;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.076206;OID=.;OPOS=76887360;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:33:33:7:12:17:17:0.515152:9:8:6:1:9:8:6:6 chr17 76887658 . G A 284.67 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00983197;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.036;QD=21.8975;RBI=0.0242783;REFB=-0.020779;REVB=0.0221984;RO=22;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672487;STB=0.525589;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0185616;OID=.;OPOS=76887658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:22:23:29:29:0.557692:13:16:14:8:13:16:14:9 chr17 76887854 . C A 255.68 PASS AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.01055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.52;QD=29.2208;RBI=0.0129141;REFB=-0.0252579;REVB=0.00744799;RO=11;SAF=9;SAR=14;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386122;STB=0.509083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0143891;OID=.;OPOS=76887854;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:35:35:11:12:23:23:0.657143:14:9:5:6:14:9:5:7 chr17 76970879 . A G 1510.43 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.361;QD=63.597;RBI=0.0068102;REFB=0;REVB=-0.00469556;RO=0;SAF=41;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.63311e-07;OID=.;OPOS=76970879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:54:41:0:0:54:41:0:0 chr17 76988785 . G A 73.05 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0509199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.885;QD=9.13177;RBI=0.0512084;REFB=0.00306566;REVB=0.00542783;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511128;STB=0.531188;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=-0.00558691;OID=.;OPOS=76988785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:10:12:5:5:10:12 chr17 76993546 . A G 82.32 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0507511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.526;QD=19.3688;RBI=0.0532294;REFB=-0.0179407;REVB=-0.0160529;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25827;STB=0.64679;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00865681;OID=.;OPOS=76993546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:5:5:1:6:5:5:1:6 chr17 77039835 . G A 785.2 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00702358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.872;QD=57.1053;RBI=0.0865348;REFB=0;REVB=0.0862493;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000914922;OID=.;OPOS=77039835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0 chr17 77039852 . G A 989.34 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.584;QD=58.1967;RBI=0.0794588;REFB=0;REVB=0.0720457;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262336;OID=.;OPOS=77039852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:66:68:1:34:32:0:0:34:34:0:0 chr17 77040128 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.385;QD=50.4134;RBI=0.0648561;REFB=0;REVB=0.0304838;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000288722;OID=.;OPOS=77040128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr17 77040185 . G C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.443;QD=37.4885;RBI=0.0575486;REFB=0;REVB=0.0552881;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000823882;OID=.;OPOS=77040185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr17 77042718 . C T 710.24 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00742132;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.339;QD=54.634;RBI=0.0189856;REFB=-0.0568043;REVB=0.017475;RO=1;SAF=16;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285164;STB=0.515146;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=8.54854e-05;OID=.;OPOS=77042718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:35:16:1:0:35:16:1:0 chr17 77073566 . G A 428.31 PASS AF=0.378788;AO=50;DP=132;FAO=50;FDP=132;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=0.00552127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.291;QD=12.9789;RBI=0.00715494;REFB=-0.0101109;REVB=-0.00455069;RO=82;SAF=23;SAR=27;SRF=50;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162746;STB=0.592211;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0147978;OID=.;OPOS=77073566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:82:82:50:50:0.378788:27:23:50:32:27:23:50:32 chr17 77075670 . C T 165.68 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0114111;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.062;QD=11.426;RBI=0.0132945;REFB=0.000145865;REVB=0.00682145;RO=36;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116225;STB=0.558047;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.000106327;OID=.;OPOS=77075670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:37:21:21:0.362069:10:11:15:21:10:11:16:21 chr17 77075673 . A G 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00957259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.694;QD=12.724;RBI=0.0102161;REFB=-0.00159585;REVB=-0.00356861;RO=34;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188425;STB=0.606323;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00881394;OID=.;OPOS=77075673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:34:36:23:23:0.389831:10:13:13:21:10:13:14:22 chr17 77704912 . T C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00751823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.954;QD=60.2301;RBI=0.00912918;REFB=0;REVB=-0.00517862;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.31973e-06;OID=.;OPOS=77704912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0 chr17 77705045 . T C 1306.09 PASS AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0231565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.064;QD=60.7483;RBI=0.0234261;REFB=-0.0108859;REVB=0.00354364;RO=1;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108899;STB=0.505746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000179098;OID=.;OPOS=77705045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:43:42:0:1:43:42:0:1 chr17 77758691 . G A 367.23 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0129098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.256;QD=19.0766;RBI=0.0163538;REFB=0.0163541;REVB=0.010039;RO=39;SAF=14;SAR=24;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346889;STB=0.519278;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=-0.0155943;OID=.;OPOS=77758691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:24:14:13:26:24:14:13:26 chr17 77768654 . C A 303.58 PASS AF=0.37;AO=37;DP=106;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=-0.00377108;FXX=0.0825612;HRUN=8;LEN=1;MLLD=286.972;QD=12.143;RBI=0.011782;REFB=-0.0104234;REVB=-0.0111622;RO=58;SAF=28;SAR=9;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155909;STB=0.571388;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0154364;OID=.;OPOS=77768654;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:100:58:63:37:37:0.37:9:28:37:21:9:28:42:21 chr17 77772068 . G A 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0332993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.1;QD=12.7823;RBI=0.0334016;REFB=-0.0143384;REVB=-0.00261218;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168865;STB=0.50998;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0194364;OID=.;OPOS=77772068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:7:3:4:10:7:3:4:10 chr17 77808957 . AG A,GA 40.35 PASS AF=0.218182,0;AO=13,3;DP=55;FAO=12,0;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=6,0;FSAR=6,0;FSRF=36;FSRR=7;FWDB=-0.0828629,-0.0594711;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=16.9501,74.973;QD=2.93451;RBI=0.255039,0.128996;REFB=-0.0787739,-0.00693695;REVB=-0.241203,-0.114469;RO=37;SAF=7,0;SAR=6,3;SRF=35;SRR=2;SSEN=0.344136,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.56118,-0.821423;STB=0.763319,0.5;STBP=0.081,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.10015,0.0203256;OID=.,.;OPOS=77808958,77808957;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:55:55:37:43:13,3:12,0:0.218182,0:6,3:7,0:35:2:6,0:6,0:36:7 chr17 77917849 . C T 260.58 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00421592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.382;QD=24.8173;RBI=0.00422446;REFB=-0.0105535;REVB=0.000268416;RO=18;SAF=14;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221129;STB=0.512285;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00617468;OID=.;OPOS=77917849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:10:14:11:7:10:14:11:7 chr17 77925393 . G A 990.59 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0741995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.39;QD=59.1395;RBI=0.0814744;REFB=0;REVB=0.0336528;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465985;OID=.;OPOS=77925393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0 chr17 77984141 . C T 606.86 PASS AF=0.571429;AO=60;DP=105;FAO=60;FDP=105;FR=.;FRO=45;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.00222271;FXX=0.00943307;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.692;QD=23.1183;RBI=0.0225582;REFB=-0.0242995;REVB=-0.0224484;RO=45;SAF=36;SAR=24;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257506;STB=0.640404;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0286417;OID=.;OPOS=77984141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:45:45:60:60:0.571429:24:36:12:33:24:36:12:33 chr17 78013724 . G C 438.42 PASS AF=0.914286;AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.037689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.095;QD=50.1056;RBI=0.0706715;REFB=-0.0711334;REVB=0.059783;RO=3;SAF=17;SAR=15;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316373;STB=0.516984;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00175955;OID=.;OPOS=78013724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:35:35:3:3:32:32:0.914286:15:17:1:2:15:17:1:2 chr17 78023722 . C T 236.82 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0549231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7586;QD=19.7352;RBI=0.0780703;REFB=0.0134339;REVB=0.0554836;RO=25;SAF=6;SAR=17;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110803;STB=0.562857;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=-0.0108853;OID=.;OPOS=78023722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:17:6:9:16:17:6:9:16 chr17 78032695 . A C 148.08 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00950994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3485;QD=17.9491;RBI=0.0124553;REFB=-0.0132108;REVB=0.00804339;RO=17;SAF=14;SAR=2;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.514553;STB=0.799563;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0135977;OID=.;OPOS=78032695;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:2:14:7:10:2:14:7:10 chr17 78055758 . T G 528.03 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.921;QD=58.6701;RBI=0.0198062;REFB=0;REVB=0.019626;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122033;OID=.;OPOS=78055758;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:16:18:0:0:18:18:0:0 chr17 78063957 . A G 154.36 PASS AF=0.25;AO=21;DP=87;FAO=22;FDP=88;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=0.0717309;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.274;QD=7.01627;RBI=0.071745;REFB=-0.0155368;REVB=-0.00141963;RO=64;SAF=10;SAR=11;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241401;STB=0.644906;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.038032;OID=.;OPOS=78063957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:64:66:21:22:0.25:11:10:43:21:12:10:43:23 chr17 78063964 . A G 116.41 PASS AF=0.227848;AO=18;DP=81;FAO=18;FDP=79;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=0.0267613;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3925;QD=5.89405;RBI=0.0283648;REFB=-0.0115155;REVB=-0.00940179;RO=61;SAF=6;SAR=12;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367461;STB=0.725571;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0361065;OID=.;OPOS=78063964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:79:61:61:18:18:0.227848:12:6:39:22:12:6:39:22 chr17 78063966 . A G 114.36 PASS AF=0.222222;AO=18;DP=81;FAO=18;FDP=81;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=-0.0664513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.783;QD=5.64762;RBI=0.0727816;REFB=-0.0120704;REVB=-0.0296882;RO=63;SAF=6;SAR=12;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380885;STB=0.734134;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0731692;OID=.;OPOS=78063966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:63:63:18:18:0.222222:12:6:41:22:12:6:41:22 chr17 78063996 . A G 56.77 PASS AF=0.173077;AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.00554026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4178;QD=4.36669;RBI=0.0100248;REFB=-0.0114746;REVB=-0.00835473;RO=43;SAF=2;SAR=7;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496603;STB=0.826119;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0528297;OID=.;OPOS=78063996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:52:43:43:9:9:0.173077:7:2:28:15:7:2:28:15 chr17 78064015 . G C 500.21 PASS AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.071013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5056;QD=54.0767;RBI=0.0879265;REFB=-0.0900771;REVB=0.0518481;RO=2;SAF=17;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00144371;STB=0.500772;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0064521;OID=.;OPOS=78064015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:37:37:2:2:35:35:0.945946:18:17:1:1:18:17:1:1 chr17 78069097 . G A 395.94 PASS AF=0.533333;AO=36;DP=71;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0123451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.773;QD=21.117;RBI=0.013924;REFB=-0.0207022;REVB=0.00644022;RO=35;SAF=21;SAR=15;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416124;STB=0.51396;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0199781;OID=.;OPOS=78069097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:75:35:35:36:40:0.533333:15:21:22:13:16:24:22:13 chr17 78071052 . T C 736.45 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00374496;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.596;QD=56.6499;RBI=0.0048273;REFB=0;REVB=0.003046;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348391;OID=.;OPOS=78071052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr17 78073355 . A G 172.7 PASS AF=0.315068;AO=23;DP=73;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0411735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2582;QD=9.46283;RBI=0.0569821;REFB=-0.00693383;REVB=-0.0393916;RO=50;SAF=5;SAR=18;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25436;STB=0.652029;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0153518;OID=.;OPOS=78073355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:50:50:23:23:0.315068:18:5:20:30:18:5:20:30 chr17 78073562 . A G 133.09 PASS AF=0.347826;AO=15;DP=45;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.018566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.259;QD=11.5732;RBI=0.0204701;REFB=-0.009802;REVB=0.00862141;RO=28;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11147;STB=0.604264;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0195048;OID=.;OPOS=78073562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:28:30:15:16:0.347826:9:6:14:14:10:6:16:14 chr17 78078709 . T C 1502.14 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0050076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.87;QD=62.5893;RBI=0.0103259;REFB=-0.0524048;REVB=0.0090304;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08529e-05;OID=.;OPOS=78078709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:96:96:0:0:95:96:1:48:47:0:0:49:47:0:0 chr17 78079597 . A G 915.48 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00515046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3582;QD=57.2175;RBI=0.0275269;REFB=0;REVB=0.0270408;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407688;OID=.;OPOS=78079597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:26:37:0:0:27:37:0:0 chr17 78079669 . G A 601.21 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0185143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.706;QD=58.6541;RBI=0.0503175;REFB=-0.105389;REVB=0.0467876;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208425;STB=0.511106;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127359;OID=.;OPOS=78079669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:18:22:1:0:18:22:1:0 chr17 78082504 . G A 1558.83 PASS AF=1;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275901;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.954;QD=64.2818;RBI=0.0184757;REFB=0;REVB=0.0182685;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101129;OID=.;OPOS=78082504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:97:0:0:97:97:1:45:52:0:0:45:52:0:0 chr17 78084769 . G A 576.71 PASS AF=0.537037;AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.000168291;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.158;QD=21.3597;RBI=0.040133;REFB=-0.0392497;REVB=-0.0401327;RO=50;SAF=39;SAR=19;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22067;STB=0.621471;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.031888;OID=.;OPOS=78084769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:50:50:58:58:0.537037:19:39:21:29:19:39:21:29 chr17 78087109 . A G 76.69 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0315699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.474;QD=12.7815;RBI=0.0335382;REFB=-4.49627e-06;REVB=0.0113202;RO=14;SAF=1;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519327;STB=0.81741;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.000818055;OID=.;OPOS=78087109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:9:1:7:7:9:1:7:7 chr17 78091405 . G A 1086.16 PASS AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.28;QD=58.7113;RBI=0.0244224;REFB=-0.132484;REVB=0.0194379;RO=1;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126112;STB=0.506665;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000265528;OID=.;OPOS=78091405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:74:1:1:72:73:0.986486:37:35:0:1:37:36:0:1 chr17 78092063 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318413;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=329.457;QD=55.6561;RBI=0.0477947;REFB=0;REVB=0.0356436;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105212;OID=.;OPOS=78092063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr17 78113832 . G A 249.18 PASS AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0497839;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.503;QD=24.9181;RBI=0.0498632;REFB=-0.0118756;REVB=-0.0028113;RO=16;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933018;STB=0.561746;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00687507;OID=.;OPOS=78113832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:16:17:23:23:0.575:10:13:11:5:10:13:12:5 chr17 78162170 . G A,C 1297.43 PASS AF=0.964706,0.0352941;AO=82,3;DP=85;FAO=82,3;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46,3;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649256,-0.00564355;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=61.095,146.633;QD=61.0555;RBI=0.0675908,0.00630863;REFB=0,0;REVB=0.0187932,-0.00281942;RO=0;SAF=46,3;SAR=36,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.14462e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00160863,0.0494137;OID=.,.;OPOS=78162170,78162170;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:85:85:0:0:82,3:82,3:0.964706,0.0352941:36,0:46,3:0:0:36,0:46,3:0:0 chr17 78171944 . G C 234.23 PASS AF=0.463415;AO=13;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0317229;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.598;QD=22.8516;RBI=0.034347;REFB=-0.000872895;REVB=0.0131671;RO=17;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339284;STB=0.738818;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0890476;OID=.;OPOS=78171944;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:13:19:0.463415:11:2:7:10:17:2:7:10 chr17 78178916 . C T 239.64 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0114695;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=366.737;QD=20.8385;RBI=0.0115323;REFB=-0.0128364;REVB=0.00120216;RO=22;SAF=2;SAR=21;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107124;STB=0.561439;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0134092;OID=.;OPOS=78178916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:23:23:23:0.5:21:2:2:20:21:2:3:20 chr17 78219065 . C A 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.537;QD=58.1418;RBI=0.0373127;REFB=0;REVB=0.031707;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373335;OID=.;OPOS=78219065;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:22:10:0:0:22:10:0:0 chr17 78293189 . A T 1106.6 PASS AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0157615;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.149;QD=59.0186;RBI=0.0166427;REFB=-0.0100616;REVB=0.00534361;RO=1;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113997;STB=0.506023;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000185959;OID=.;OPOS=78293189;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:75:1:1:74:74:0.986667:41:33:0:1:41:33:0:1 chr17 78298938 . A G 1030.07 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000754038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.913;QD=58.0321;RBI=0.0331409;REFB=-0.0699102;REVB=-0.0331323;RO=1;SAF=7;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00744765;STB=0.503936;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.000590341;OID=.;OPOS=78298938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:63:7:0:1:63:7:0:1 chr17 78327358 . G A 163.25 PASS AF=0.35;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0110204;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.348;QD=10.8836;RBI=0.0306752;REFB=-0.0245837;REVB=-0.0286273;RO=40;SAF=15;SAR=6;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114772;STB=0.555501;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0415405;OID=.;OPOS=78327358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:40:39:21:21:0.35:6:15:25:15:6:15:25:14 chr17 78354661 . C T 146.85 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0127937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.919;QD=11.2962;RBI=0.0534089;REFB=-0.0153987;REVB=-0.051854;RO=34;SAF=16;SAR=2;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487492;STB=0.794926;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0278267;OID=.;OPOS=78354661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:2:16:19:15:2:16:19:15 chr17 78360160 . G A 391.7 PASS AF=0.43617;AO=40;DP=93;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0142995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.701;QD=16.6683;RBI=0.0146923;REFB=-0.0186941;REVB=0.00337502;RO=52;SAF=21;SAR=19;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444521;STB=0.525975;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0242508;OID=.;OPOS=78360160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:52:53:40:41:0.43617:19:21:25:27:19:22:26:27 chr17 78396004 . A G 247.33 PASS AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0101425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.257;QD=13.7407;RBI=0.0105881;REFB=-0.0110544;REVB=0.0030395;RO=41;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303147;STB=0.503353;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0159967;OID=.;OPOS=78396004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:43:29:29:0.402778:14:15:20:21:14:15:22:21 chr17 78401588 . G T 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.015869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9492;QD=11.1977;RBI=0.0761242;REFB=0.013033;REVB=0.0744518;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139567;STB=0.583194;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.0282732;OID=.;OPOS=78401588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:5:7:10:12:5:7:10:12 chr17 78444658 . T G 524.24 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0428796;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9342;QD=59.913;RBI=0.0518625;REFB=0;REVB=0.0291729;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108954;OID=.;OPOS=78444658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chr17 78445702 . A G 837.11 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00953961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.886;QD=55.8075;RBI=0.0173955;REFB=-0.117312;REVB=-0.0145464;RO=1;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125832;STB=0.506664;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-4.03097e-05;OID=.;OPOS=78445702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:37:22:0:1:37:22:0:1 chr17 78854223 . A G 772.58 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0157977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6372;QD=61.8062;RBI=0.0794422;REFB=-0.126284;REVB=-0.0778557;RO=1;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184525;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00262783;OID=.;OPOS=78854223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:25:24:0:1:25:24:0:1 chr17 78896529 . C T 702.93 PASS AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0860863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.766;QD=51.1221;RBI=0.0889179;REFB=-0.229158;REVB=0.022261;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171263;STB=0.508056;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00371373;OID=.;OPOS=78896529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:55:55:1:3:52:52:0.945455:27:25:0:1:27:25:1:2 chr17 78921117 . C T 1312.72 PASS AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0155423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1183;QD=59.6689;RBI=0.0161708;REFB=-0.131947;REVB=-0.00446473;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511625;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00191622;OID=.;OPOS=78921117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:88:88:0:2:86:86:0.977273:44:42:0:0:44:42:2:0 chr17 79059230 . C T 2547.82 PASS AF=1;AO=165;DP=165;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.876;QD=61.7653;RBI=0.0147228;REFB=0;REVB=0.00628645;RO=0;SAF=62;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30626e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.21594e-06;OID=.;OPOS=79059230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:165:165:0:0:165:165:1:103:62:0:0:103:62:0:0 chr17 79082862 . G A 692.03 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238559;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.526;QD=57.6692;RBI=0.0342361;REFB=0;REVB=0.0341529;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103156;OID=.;OPOS=79082862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:29:18:0:0:29:19:0:0 chr17 79091103 . G T 576.45 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.166;QD=60.6788;RBI=0.0172134;REFB=0;REVB=-0.00551634;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20898e-05;OID=.;OPOS=79091103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:26:10:0:0:28:10:0:0 chr17 79093822 . A G 296.28 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0288584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.388;QD=49.3805;RBI=0.109085;REFB=0.0597828;REVB=-0.105199;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370176;STB=0.519983;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.0202957;OID=.;OPOS=79093822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:11:12:1:0:11:12:1:0 chr17 79095144 . G A 658.26 PASS AF=0.93617;AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0241295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.955;QD=56.0222;RBI=0.0487965;REFB=-0.0284485;REVB=0.042413;RO=3;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625072;STB=0.533318;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00516721;OID=.;OPOS=79095144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:47:47:3:3:44:44:0.93617:21:23:0:3:21:23:0:3 chr17 79095629 . C A 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0414857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.128;QD=8.69805;RBI=0.044467;REFB=-0.0261432;REVB=-0.0160078;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162774;STB=0.599733;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0264657;OID=.;OPOS=79095629;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:10:4:3:4:10:4 chr17 79140505 . C G 644.01 PASS AF=1;AO=27;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368553;FXX=0.0454442;HRUN=7;LEN=1;MLLD=168.342;QD=61.3339;RBI=0.0412303;REFB=0;REVB=0.0184831;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00734828;OID=.;OPOS=79140505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:42:0:0:27:42:1:5:22:0:0:10:32:0:0 chr17 79171967 . A G 393.31 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00957513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.211;QD=56.1867;RBI=0.052831;REFB=0;REVB=-0.051956;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00027303;OID=.;OPOS=79171967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0 chr17 79173184 . T C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0085;QD=53.9089;RBI=0.032774;REFB=0;REVB=-0.0309943;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350015;OID=.;OPOS=79173184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr17 79173224 . T C,G 415.32 PASS AF=0.866667,0.133333;AO=26,4;DP=30;FAO=26,4;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=11,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000119731,-0.0246063;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.2439,138.503;QD=55.3764;RBI=0.0168152,0.0246066;REFB=0,0;REVB=0.0168148,-0.000110054;RO=0;SAF=15,0;SAR=11,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00469378,0.184231;OID=.,.;OPOS=79173224,79173224;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:30:30:0:0:26,4:26,4:0.866667,0.133333:11,4:15,0:0:0:11,4:15,0:0:0 chr17 79174221 . T C 1480.89 PASS AF=1;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237636;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.243;QD=59.8341;RBI=0.0251685;REFB=0;REVB=0.00829129;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374795;OID=.;OPOS=79174221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:99:0:0:99:99:1:60:39:0:0:60:39:0:0 chr17 79182778 . T C 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6535;QD=56.9563;RBI=0.0220101;REFB=0;REVB=-0.00493893;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189315;OID=.;OPOS=79182778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0 chr17 79202864 . CG C 54.64 PASS AF=0.434783;AO=5;DP=21;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0694901;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.3087;QD=9.50274;RBI=0.140727;REFB=-0.0766553;REVB=0.122373;RO=13;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456697;STB=0.754173;STBP=0.059;TYPE=del;VARB=0.12601;OID=.;OPOS=79202865;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.434783:5:21:10:23:13:8:2:5:8:54:13:4:1:5:8 chr17 79202956 . T C 304.94 PASS AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.112;QD=53.0336;RBI=0.0289246;REFB=0;REVB=0.0223911;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00081314;OID=.;OPOS=79202956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:13:6:0:0:16:7:0:0 chr17 79219500 . AATG A 854.85 PASS AF=0.841584;AO=80;DP=96;FAO=85;FDP=101;FR=.;FRO=16;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0086872;FXX=0.0560695;HRUN=2;LEN=3;MLLD=275.612;QD=33.8556;RBI=0.0109564;REFB=0.014164;REVB=-0.00667647;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.540201;STBP=0.064;TYPE=del;VARB=-0.00244645;OID=.;OPOS=79219501;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.841584:80:96:85:101:16:37:48:11:5:42:0:33:47:0:0 chr17 79220224 . G C 615.27 PASS AF=1;AO=31;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9739;QD=61.5269;RBI=0.186999;REFB=0;REVB=0.173236;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00398637;OID=.;OPOS=79220224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:31:40:1:10:21:0:0:15:25:0:0 chr17 79410256 . G A 181.28 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0164643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.833;QD=16.4804;RBI=0.0189694;REFB=-0.0176791;REVB=-0.00942158;RO=25;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191767;STB=0.510991;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0210165;OID=.;OPOS=79410256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:8:11:14:11:8:11:14:11 chr17 79414307 . A G 136.63 PASS AF=0.666667;AO=13;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0453631;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.434;QD=26.0249;RBI=0.0470881;REFB=-0.0238717;REVB=-0.0126287;RO=7;SAF=9;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176469;STB=0.605901;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0139713;OID=.;OPOS=79414307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:21:21:7:7:13:14:0.666667:4:9:3:4:4:10:3:4 chr17 79424516 . A G 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0166871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0341;QD=9.76061;RBI=0.0319981;REFB=-0.013846;REVB=-0.0273025;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073775;STB=0.545324;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0131201;OID=.;OPOS=79424516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:6:6:4:3:6:6 chr17 79424537 . C T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00734017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.009;QD=13.486;RBI=0.0659187;REFB=0.00389802;REVB=0.0655088;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937493;STB=0.555432;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.00556342;OID=.;OPOS=79424537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:5:6:4:5:5:6 chr17 79478019 . G A 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.707;QD=57.711;RBI=0.0206946;REFB=0;REVB=0.0101688;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23685e-05;OID=.;OPOS=79478019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:22:37:0:0:22:37:0:0 chr17 79496190 . G A 346.53 PASS AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.0232605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.572;QD=14.7461;RBI=0.0337189;REFB=-0.0223492;REVB=0.0244114;RO=54;SAF=25;SAR=13;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731236;STB=0.555192;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0432713;OID=.;OPOS=79496190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:56:38:38:0.404255:13:25:32:22:13:25:32:24 chr17 79496289 . G A 307.54 PASS AF=0.722222;AO=26;DP=36;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0413349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.876;QD=34.171;RBI=0.0430474;REFB=-0.0414476;REVB=0.012021;RO=10;SAF=11;SAR=15;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120384;STB=0.506574;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0148163;OID=.;OPOS=79496289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:36:36:10:10:26:26:0.722222:15:11:4:6:15:11:4:6 chr17 79507170 . T C 592.38 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134042;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.685;QD=60.7569;RBI=0.072102;REFB=0;REVB=0.0708451;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133669;OID=.;OPOS=79507170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0 chr17 79507272 . G A 197.22 PASS AF=0.42623;AO=21;DP=58;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0128611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.302;QD=12.9326;RBI=0.09313;REFB=-0.00938005;REVB=0.0922377;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105122;STB=0.607512;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0182562;OID=.;OPOS=79507272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:61:33:35:21:26:0.42623:11:10:19:14:16:10:20:15 chr17 79508400 . T C 730.35 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.589;QD=56.181;RBI=0.0342231;REFB=0;REVB=0.0222789;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106821;OID=.;OPOS=79508400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:27:24:0:0:28:24:0:0 chr17 79511135 . A G 227.15 PASS AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0195006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.897;QD=21.1301;RBI=0.0196427;REFB=-0.0274047;REVB=0.00235853;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221279;STB=0.624106;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0147313;OID=.;OPOS=79511135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:9:13:7:14:9:13:7:14 chr17 79514028 . C G 104.85 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0193786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.23;QD=10.7536;RBI=0.0291365;REFB=-0.0130957;REVB=0.0217579;RO=25;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204309;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0289452;OID=.;OPOS=79514028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:26:13:13:0.333333:7:6:12:13:7:6:12:14 chr17 79514832 . G A 109.55 PASS AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00917087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.443;QD=8.11465;RBI=0.0146068;REFB=-0.00459429;REVB=0.0113689;RO=38;SAF=5;SAR=10;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110778;STB=0.559918;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0152804;OID=.;OPOS=79514832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:38:39:15:15:0.277778:10:5:16:22:10:5:16:23 chr17 79525118 . T G 141.12 PASS AF=0.484848;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00447236;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.316;QD=17.1055;RBI=0.00447237;REFB=-0.0123103;REVB=1.19985e-05;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21177;STB=0.588363;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.00814862;OID=.;OPOS=79525118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:15:16:0.484848:11:4:8:9:11:5:8:9 chr17 79532583 . G A 204.2 PASS AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0244594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.437;QD=12.5664;RBI=0.0389253;REFB=-0.026774;REVB=0.0302806;RO=39;SAF=17;SAR=8;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151114;STB=0.503523;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0422215;OID=.;OPOS=79532583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:39:40:25:25:0.384615:8:17:27:12:8:17:27:13 chr17 79589242 . G A 1135.26 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.725;QD=60.5473;RBI=0.0223868;REFB=0;REVB=0.0160418;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05836e-05;OID=.;OPOS=79589242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:39:36:0:0:39:36:0:0 chr17 79596811 . C T 715.02 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00545461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.443;QD=60.8526;RBI=0.0229933;REFB=0.0375768;REVB=0.0223369;RO=1;SAF=29;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159381;STB=0.508471;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000146173;OID=.;OPOS=79596811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:17:29:1:0:17:29:1:0 chr17 79609410 . G T 340.23 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.14;QD=54.4363;RBI=0.0762726;REFB=0;REVB=0.0288539;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272002;OID=.;OPOS=79609410;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:12:13:0:0 chr17 79612161 . C T 1240.77 PASS AF=0.97619;AO=83;DP=85;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00429128;FXX=0.0117633;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.873;QD=59.0843;RBI=0.0139751;REFB=-0.046174;REVB=0.0133;RO=2;SAF=39;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236664;STB=0.512817;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.000110576;OID=.;OPOS=79612161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:85:84:2:2:83:82:0.97619:44:39:2:0:44:38:2:0 chr17 79612333 . G A 152.38 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0094389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.585;QD=40.6333;RBI=0.0314541;REFB=-0.166713;REVB=0.0300045;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571319;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00560956;OID=.;OPOS=79612333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:11:3:0:0:11:3:1:0 chr17 79612382 . T C 145.19 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1366;QD=44.6736;RBI=0.0993177;REFB=0;REVB=0.0985595;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0057446;OID=.;OPOS=79612382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr17 79612397 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.005997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.769;QD=46.848;RBI=0.0146758;REFB=0;REVB=-0.0133945;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000271609;OID=.;OPOS=79612397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr17 79612413 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.438;QD=51.9166;RBI=0.0343396;REFB=0;REVB=0.0343155;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515068;OID=.;OPOS=79612413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr17 79612443 . T C 578.99 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.644;QD=59.3837;RBI=0.0859587;REFB=0;REVB=0.0818007;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573603;OID=.;OPOS=79612443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:35:39:1:13:22:0:0:17:22:0:0 chr17 79614481 . A G 174.25 PASS AF=1;AO=12;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.775;QD=46.4666;RBI=0.033859;REFB=0;REVB=0.0264503;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00286389;OID=.;OPOS=79614481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:12:15:1:5:7:0:0:5:10:0:0 chr17 79614932 . TTAAC T 250.7 PASS AF=0.923077;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00803573;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=330.506;QD=38.5699;RBI=0.0114093;REFB=-0.0190405;REVB=0.00809938;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555508;STBP=0.083;TYPE=del;VARB=0.00257355;OID=.;OPOS=79614933;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.923077:24:24:24:26:2:8:16:2:0:7:0:8:16:0:0 chr17 79637349 . T C 1483.45 PASS AF=1;AO=92;DP=96;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138047;FXX=0.0312467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.856;QD=63.8042;RBI=0.0155676;REFB=0;REVB=0.00719589;RO=0;SAF=38;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09023e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.47152e-05;OID=.;OPOS=79637349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:93:0:0:92:93:1:54:38:0:0:54:39:0:0 chr17 79801977 . C T 113.31 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.000345617;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.819;QD=16.7872;RBI=0.0283381;REFB=-0.0171185;REVB=-0.028336;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101817;STB=0.529366;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.023966;OID=.;OPOS=79801977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:12:14:13:13:0.481481:9:4:5:7:9:4:5:9 chr17 79803101 . A G 239.33 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0396557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.462;QD=20.8116;RBI=0.040845;REFB=-0.0062181;REVB=-0.0097847;RO=23;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197977;STB=0.611551;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00592722;OID=.;OPOS=79803101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:8:15:10:13:8:15:10:13 chr17 79825897 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.072;QD=45.8068;RBI=0.0500799;REFB=0;REVB=0.0365598;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408592;OID=.;OPOS=79825897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0 chr17 79872241 . A G 697.92 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0348237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.805;QD=52.6735;RBI=0.0349017;REFB=-0.128776;REVB=0.0023319;RO=2;SAF=25;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361869;STB=0.519223;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000510279;OID=.;OPOS=79872241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:53:53:2:2:51:51:0.962264:26:25:2:0:26:25:2:0 chr17 79880994 . CA AC,CAC 61.09 PASS AF=0.108696,0.130435;AO=6,6;DP=51;FAO=5,6;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=5,2;FSAR=0,4;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0400132,-0.0400046;FXX=0.061212;HRUN=4,0;LEN=2,1;MLLD=61.5074,50.106;QD=5.31249;RBI=0.0452753,0.0521481;REFB=-0.00372872,-0.00474453;REVB=-0.0211849,-0.0334523;RO=38;SAF=6,1;SAR=0,5;SRF=23;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.619668,-0.497628;STB=0.997707,0.655216;STBP=0.028,0.473;TYPE=mnp,ins;VARB=0.106818,0.0515886;OID=.,.;OPOS=79880994,79880996;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:22:51:46:38:35:6,6:5,6:0.108696,0.130435:0,5:6,1:23:15:0,4:5,2:18:17 chr17 79891147 . T C 761.15 PASS AF=1;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451319;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0193;QD=64.7784;RBI=0.0519964;REFB=0;REVB=0.0258213;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0024025;OID=.;OPOS=79891147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:47:0:0:47:47:1:30:17:0:0:30:17:0:0 chr17 79899172 . G A 166.06 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0109484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.967;QD=22.1413;RBI=0.0270242;REFB=-0.0244684;REVB=0.0247071;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26923;STB=0.652773;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0273922;OID=.;OPOS=79899172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:4:13:6:7:4:13:6:7 chr17 80013235 . A G 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.721;QD=59.1424;RBI=0.028368;REFB=0;REVB=-0.0129019;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000181503;OID=.;OPOS=80013235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:40:27:0:0:40:27:0:0 chr17 80039481 . G A 871.19 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0634364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.405;QD=56.2058;RBI=0.0634369;REFB=-0.0776192;REVB=0.000246807;RO=1;SAF=35;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132969;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00921439;OID=.;OPOS=80039481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:26:35:1:0:26:35:1:0 chr17 80051183 . A G 606.58 PASS AF=0.572816;AO=58;DP=103;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.00829106;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.005;QD=23.5563;RBI=0.0424832;REFB=0.00493531;REVB=-0.0416663;RO=43;SAF=23;SAR=35;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127591;STB=0.569554;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.0034378;OID=.;OPOS=80051183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:43:44:58:59:0.572816:35:23:24:19:35:24:25:19 chr17 80099639 . C A 689.27 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00707011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0406;QD=62.6607;RBI=0.0583438;REFB=0;REVB=-0.0579138;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000788981;OID=.;OPOS=80099639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr17 80103737 . T C 950.4 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.438;QD=57.6001;RBI=0.0352003;REFB=0;REVB=0.00449974;RO=1;SAF=21;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219605;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172145;OID=.;OPOS=80103737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:1:0:65:66:1:44:21:1:0:44:22:0:0 chr17 80136418 . C T 765.83 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0381;QD=63.819;RBI=0.0490335;REFB=0;REVB=0.0182813;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394399;OID=.;OPOS=80136418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chr17 80151881 . G A 1546.63 PASS AF=0.989899;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0026176;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.899;QD=62.49;RBI=0.049607;REFB=-0.0947418;REVB=0.0495379;RO=1;SAF=56;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114268;STB=0.506023;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00153147;OID=.;OPOS=80151881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:99:1:1:97:98:0.989899:41:56:0:1:41:57:0:1 chr17 80159566 . T C 923.36 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0703489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2753;QD=56.8221;RBI=0.0912676;REFB=0.0314788;REVB=-0.0581447;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00217256;OID=.;OPOS=80159566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:0:1:64:64:0.984615:31:33:0:0:31:33:0:1 chr17 80195582 . T C 463.39 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000314622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.398;QD=52.9587;RBI=0.0123571;REFB=-0.0113149;REVB=0.0123531;RO=2;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930498;STB=0.549969;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.000157735;OID=.;OPOS=80195582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:2:2:33:33:0.942857:9:24:0:2:9:24:0:2 chr17 80280865 . G A 243.52 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00333298;FXX=0.0151492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=172.874;QD=14.9855;RBI=0.0320313;REFB=-0.00777576;REVB=0.0318574;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192849;STB=0.588814;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0117787;OID=.;OPOS=80280865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:33:37:28:28:0.430769:15:13:22:11:15:13:23:14 chr17 80320561 . G A 484.43 PASS AF=0.666667;AO=44;DP=66;FAO=44;FDP=66;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00089007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.911;QD=29.3595;RBI=0.00379199;REFB=-0.0298375;REVB=-0.00368605;RO=22;SAF=20;SAR=24;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851947;STB=0.546198;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00642394;OID=.;OPOS=80320561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:22:22:44:44:0.666667:24:20:7:15:24:20:7:15 chr17 80350331 . G A 562.3 PASS AF=0.437956;AO=58;DP=135;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=31;FWDB=0.00383807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2862;QD=16.4174;RBI=0.0236805;REFB=-0.00514789;REVB=0.0233674;RO=77;SAF=38;SAR=20;SRF=46;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635592;STB=0.531854;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00807387;OID=.;OPOS=80350331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:77:77:58:60:0.437956:20:38:46:31:21:39:46:31 chr17 80373452 . C T 188.66 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0763737;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.2341;QD=19.8589;RBI=0.0775714;REFB=-0.073514;REVB=-0.0135787;RO=18;SAF=13;SAR=6;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387837;STB=0.706309;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0745304;OID=.;OPOS=80373452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:18:19:19:19:0.5:6:13:4:14:6:13:5:14 chr17 80377690 . T G 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00581162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.143;QD=13.486;RBI=0.0439214;REFB=-0.00165116;REVB=0.0435352;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33333;STB=0.69952;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00278906;OID=.;OPOS=80377690;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:2:7:5:6:2:7:5:6 chr17 80391684 . A G 1298.72 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000390554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.555;QD=61.1161;RBI=0.0231821;REFB=0;REVB=-0.0231788;RO=0;SAF=26;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51495e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533874;OID=.;OPOS=80391684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:57:26:0:0:57:28:0:0 chr17 80394530 . G T 510.66 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0477903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9172;QD=56.7402;RBI=0.102454;REFB=-0.111509;REVB=0.0906247;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283378;STB=0.515143;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00532497;OID=.;OPOS=80394530;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:36:36:1:1:35:35:0.972222:16:19:0:1:16:19:0:1 chr17 80401541 . T G 295.86 PASS AF=0.373626;AO=35;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0182443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.794;QD=13.005;RBI=0.0237607;REFB=-0.00158394;REVB=-0.0152223;RO=54;SAF=20;SAR=15;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371672;STB=0.550429;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00245058;OID=.;OPOS=80401541;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:54:57:35:34:0.373626:15:20:29:25:14:20:29:28 chr17 80401945 . C CG 37.71 PASS AF=0.380952;AO=3;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.166349;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=14.2047;QD=7.18371;RBI=0.166537;REFB=-0.0687182;REVB=-0.00791857;RO=18;SAF=3;SAR=0;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567432;STB=0.545344;STBP=0.805;TYPE=ins;VARB=0.0909713;OID=.;OPOS=80401946;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.380952:3:21:8:21:13:5:3:9:4:37:18:3:0:11:7 chr17 80401946 . A G 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0413275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9251;QD=10.6348;RBI=0.081864;REFB=0.0220067;REVB=-0.0706664;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752617;STB=0.545344;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0408294;OID=.;OPOS=80401946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:3:5:9:4:3:5:9:4 chr17 80439733 . C T 369.37 PASS AF=0.40566;AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=47;FWDB=-0.0057468;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.633;QD=13.9386;RBI=0.00705099;REFB=-0.00735096;REVB=0.00408544;RO=62;SAF=15;SAR=28;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108909;STB=0.564447;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00818237;OID=.;OPOS=80439733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:62:63:43:43:0.40566:28:15:16:46:28:15:16:47 chr17 80452592 . G C 105.13 PASS AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0191659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.386;QD=32.3464;RBI=0.0503233;REFB=0.0359096;REVB=0.0465307;RO=2;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178335;STB=0.599815;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.00236943;OID=.;OPOS=80452592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:7:4:2:0:7:4:2:0 chr17 80481088 . T C 275.74 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00214819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.702;QD=25.6503;RBI=0.0229364;REFB=-0.000268428;REVB=-0.0228355;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339979;STB=0.501885;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=6.06993e-05;OID=.;OPOS=80481088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:14:11:8:10:14:11:8:10 chr17 80585094 . C T 162.98 PASS AF=0.515152;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0264356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.189;QD=19.7547;RBI=0.0286556;REFB=-0.00398545;REVB=0.0110591;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199204;STB=0.638613;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00335575;OID=.;OPOS=80585094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:15:16:16:17:0.515152:5:11:7:8:5:12:7:9 chr17 80614933 . T C 411.06 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0638454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.809;QD=56.6984;RBI=0.0641822;REFB=0;REVB=-0.00656702;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00103284;OID=.;OPOS=80614933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr17 80615040 . A C 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.336;QD=57.2377;RBI=0.037237;REFB=0;REVB=-0.0177562;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118767;OID=.;OPOS=80615040;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0 chr17 80626104 . T C 168.54 PASS AF=0.391304;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0170752;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8739;QD=14.6558;RBI=0.0187033;REFB=-0.00949514;REVB=0.00763204;RO=28;SAF=14;SAR=4;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900914;STB=0.55257;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0177502;OID=.;OPOS=80626104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:46:28:28:18:18:0.391304:4:14:20:8:4:14:20:8 chr17 80674643 . C G 289.35 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.791;QD=52.6098;RBI=0.0562808;REFB=0;REVB=-0.0554977;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000313812;OID=.;OPOS=80674643;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:5:17:0:0:5:17:0:0 chr17 80696410 . A C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.648;QD=52.6127;RBI=0.0327975;REFB=0;REVB=0.0300089;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109165;OID=.;OPOS=80696410;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr17 80700592 . T C 1135.1 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.549;QD=60.5387;RBI=0.0610682;REFB=0;REVB=0.0243072;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15607e-05;OID=.;OPOS=80700592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:36:38:0:0:37:38:0:0 chr17 80706928 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.137;QD=52.6131;RBI=0.0372846;REFB=0;REVB=0.00984616;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000523842;OID=.;OPOS=80706928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr17 80708601 . C G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=336.807;QD=39.2068;RBI=0.0211835;REFB=0;REVB=0.00348675;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154493;OID=.;OPOS=80708601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr17 80887451 . A G 817.69 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6444;QD=57.3819;RBI=0.0151164;REFB=0;REVB=-0.0069874;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80364e-05;OID=.;OPOS=80887451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0 chr17 80895745 . T C 948.0 PASS AF=0.984848;AO=66;DP=68;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0245652;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.172;QD=57.4547;RBI=0.0391729;REFB=-0.044125;REVB=0.0305133;RO=1;SAF=36;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129446;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000416005;OID=.;OPOS=80895745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:66:1:1:66:65:0.984848:30:36:1:0:30:35:1:0 chr17 80895769 . A G 851.04 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00705479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2465;QD=57.6975;RBI=0.00728347;REFB=0;REVB=-0.0018108;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.12572e-05;OID=.;OPOS=80895769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:20:39:0:0:20:39:0:0 chr17 80895933 . A G 189.88 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.024;QD=47.4702;RBI=0.100866;REFB=0;REVB=0.100365;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00365192;OID=.;OPOS=80895933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:14:16:1:4:10:0:0:5:11:0:0 chr17 80899281 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.455;QD=49.5992;RBI=0.0386956;REFB=0;REVB=0.0256982;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301097;OID=.;OPOS=80899281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:15:3:0:0:15:3:0:0 chr17 80992932 . A C 250.64 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00707476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.817;QD=14.5299;RBI=0.0194863;REFB=-0.00500393;REVB=-0.0181566;RO=40;SAF=15;SAR=14;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13687;STB=0.577413;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00875189;OID=.;OPOS=80992932;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:14:15:26:14:14:15:26:14 chr17 81006629 . C T 146.85 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0115895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.191;QD=11.2962;RBI=0.0121028;REFB=-0.000208508;REVB=-0.00348735;RO=34;SAF=7;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189016;STB=0.610988;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000451449;OID=.;OPOS=81006629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:11:7:19:15:11:7:19:15 chr17 81009595 . C T 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0775758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7111;QD=24.3276;RBI=0.0869964;REFB=0.00182965;REVB=-0.0393747;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216951;STB=0.624651;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00249815;OID=.;OPOS=81009595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:0:2:3:4:0:2 chr17 81043039 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.142;QD=48.7369;RBI=0.0780224;REFB=0;REVB=0.0105245;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405843;OID=.;OPOS=81043039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0 chr17 81050982 . G C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.526;QD=59.4355;RBI=0.0404841;REFB=0;REVB=0.00255445;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223898;OID=.;OPOS=81050982;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0 chr18 47492 . G A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00732171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.894;QD=14.7986;RBI=0.0125259;REFB=-0.00491915;REVB=0.0101632;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251218;STB=0.649179;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00529469;OID=.;OPOS=47492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:2:9:8:5:2:9:8:5 chr18 47649 . C T 1069.17 PASS AF=0.482301;AO=109;DP=224;FAO=109;FDP=226;FR=.;FRO=117;FSAF=57;FSAR=52;FSRF=65;FSRR=52;FWDB=-0.00741793;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.318;QD=18.9233;RBI=0.00813689;REFB=-0.00550818;REVB=-0.00334415;RO=114;SAF=57;SAR=52;SRF=62;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195018;STB=0.516946;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00677171;OID=.;OPOS=47649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:226:114:117:109:109:0.482301:52:57:62:52:52:57:65:52 chr18 48104 . T C 131.34 PASS AF=0.21978;AO=20;DP=91;FAO=20;FDP=91;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.00638795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9628;QD=5.77319;RBI=0.0445072;REFB=-0.0204755;REVB=0.0440464;RO=70;SAF=15;SAR=5;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387235;STB=0.745609;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0687154;OID=.;OPOS=48104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:70:71:20:20:0.21978:5:15:31:39:5:15:31:40 chr18 49034 . G A 140.59 PASS AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0146489;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.714;QD=31.2417;RBI=0.0173637;REFB=0.0138042;REVB=0.00932253;RO=4;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00361955;OID=.;OPOS=49034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:18:18:4:4:14:14:0.777778:7:7:2:2:7:7:2:2 chr18 49169 . C T 130.13 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0110589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.132;QD=13.3462;RBI=0.0187526;REFB=-0.0136022;REVB=-0.0151446;RO=24;SAF=4;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223804;STB=0.631997;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.022636;OID=.;OPOS=49169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:11:4:11:13:11:4:11:13 chr18 49208 . G A 50.08 PASS AF=0.186047;AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0345738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.306;QD=4.65899;RBI=0.0382265;REFB=-0.0150201;REVB=-0.0163068;RO=35;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230423;STB=0.65082;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0427269;OID=.;OPOS=49208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:43:43:35:35:8:8:0.186047:4:4:11:24:4:4:11:24 chr18 224131 . G A 381.02 PASS AF=0.415094;AO=43;DP=104;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.00526273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.917;QD=14.3783;RBI=0.00625199;REFB=-0.0105882;REVB=-0.00337507;RO=60;SAF=17;SAR=26;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928535;STB=0.553888;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0151134;OID=.;OPOS=224131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:60:62:43:44:0.415094:26:17:29:31:26:18:31:31 chr18 252559 . G A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.83;QD=57.3857;RBI=0.0245949;REFB=0;REVB=-0.0015619;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33222e-05;OID=.;OPOS=252559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0 chr18 319512 . CAAAAAAAAAAAAA CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAG,CAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 658.92 PASS AF=0,0.130435,0.869565,0;AO=27,11,32,12;DP=119;FAO=0,15,100,0;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,25,0;FSAR=0,15,75,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.113021,0.117822,-0.0331727,-0.0280466;FXX=0.0495827;HRUN=13,13,13,13;LEN=1,1,2,3;MLLD=4.24566,11.1026,8.7019,9.40518;QD=22.919;RBI=0.499805,0.249093,0.232863,0.156385;REFB=0,0,0,0;REVB=0.486858,0.219466,0.230488,0.153849;RO=14;SAF=6,0,7,4;SAR=21,11,25,8;SRF=0;SRR=14;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.231279,0,0.203212,0.420327;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,snp,del,del;VARB=0,-0.22716,0.0286691,-0.0754005;OID=.,.,.,.;OPOS=319513,319525,319513,319513;OREF=A,A,AA,AAA;OALT=-,G,-,-;OMAPALT=CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAG,CAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.130435,0.869565,0:27,11,32,12:119:0,15,100,0:115:0:0,0,25,0:0,15,75,0:0:0:35:14:6,0,7,4:21,11,25,8:0:14 chr18 334742 . C T 471.31 PASS AF=0.407692;AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=130;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=48;FSRR=29;FWDB=0.0240699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.214;QD=14.5019;RBI=0.0317962;REFB=-0.00611562;REVB=0.020776;RO=76;SAF=20;SAR=33;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250185;STB=0.644034;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00752972;OID=.;OPOS=334742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:76:77:53:53:0.407692:33:20:47:29:33:20:48:29 chr18 334758 . T C 1785.67 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0025928;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.621;QD=61.0486;RBI=0.0830189;REFB=0;REVB=0.0829784;RO=0;SAF=64;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.58386e-05;OID=.;OPOS=334758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:52:64:0:0:53:64:0:0 chr18 334994 . A G 1156.54 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011129;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.006;QD=60.8707;RBI=0.0132112;REFB=0;REVB=0.00711916;RO=0;SAF=56;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.42054e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06976e-05;OID=.;OPOS=334994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:77:76:1:21:56:0:0:20:56:0:0 chr18 580623 . T C 242.92 PASS AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.011123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.075;QD=22.5968;RBI=0.0132926;REFB=-0.00388437;REVB=0.00727821;RO=20;SAF=8;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469479;STB=0.526293;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0022816;OID=.;OPOS=580623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:15:8:8:12:15:8:8:12 chr18 581201 . T A 775.39 PASS AF=0.42029;AO=87;DP=207;FAO=87;FDP=207;FR=.;FRO=120;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=66;FSRR=54;FWDB=0.059863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.407;QD=14.9834;RBI=0.065858;REFB=0.00534338;REVB=0.0274534;RO=120;SAF=38;SAR=49;SRF=66;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117395;STB=0.565579;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.00596288;OID=.;OPOS=581201;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:120:120:87:87:0.42029:49:38:66:54:49:38:66:54 chr18 581203 . TT GA 742.93 PASS AF=0.413793;AO=84;DP=205;FAO=84;FDP=203;FR=.;FRO=119;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=66;FSRR=53;FWDB=0.0132587;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=2;MLLD=192.32;QD=14.6391;RBI=0.0133039;REFB=-0.0022754;REVB=0.00109622;RO=119;SAF=38;SAR=46;SRF=66;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106847;STB=0.55978;STBP=0.146;TYPE=mnp;VARB=0.00279671;OID=.;OPOS=581203;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:119:119:84:84:0.413793:46:38:66:53:46:38:66:53 chr18 586700 . T C 270.76 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.071286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6624;QD=16.9225;RBI=0.074099;REFB=0.00367776;REVB=-0.020223;RO=33;SAF=23;SAR=7;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271805;STB=0.663344;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00683554;OID=.;OPOS=586700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:33:34:30:30:0.46875:7:23:17:16:7:23:17:17 chr18 586714 . A G 270.77 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0139663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.201;QD=16.9229;RBI=0.01644;REFB=-0.0267192;REVB=-0.00867267;RO=34;SAF=23;SAR=7;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314216;STB=0.677938;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0225007;OID=.;OPOS=586714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:7:23:16:18:7:23:16:18 chr18 586736 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00462309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.043;QD=56.9568;RBI=0.00642625;REFB=0;REVB=0.00446361;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.49142e-07;OID=.;OPOS=586736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr18 658064 . G C 1232.14 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.154;QD=60.8466;RBI=0.031328;REFB=0;REVB=0.00084016;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15883e-05;OID=.;OPOS=658064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:45:35:0:0:46:35:0:0 chr18 691266 . A G 135.95 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0126043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.997;QD=17.542;RBI=0.0401417;REFB=-0.00977984;REVB=-0.0381115;RO=16;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414798;STB=0.523777;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0112755;OID=.;OPOS=691266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:10:5:6:10:10:5:6:10 chr18 706558 . C T 220.93 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0554324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.307;QD=18.0352;RBI=0.0560243;REFB=-0.00662439;REVB=-0.00812207;RO=27;SAF=16;SAR=6;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414198;STB=0.735082;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.012093;OID=.;OPOS=706558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:6:16:8:19:6:16:8:19 chr18 722009 . TAA T 91.58 PASS AF=0.346939;AO=16;DP=50;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00173559;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=2;MLLD=134.728;QD=7.47624;RBI=0.00978697;REFB=-0.00987232;REVB=0.00963185;RO=29;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264837;STB=0.524971;STBP=0.815;TYPE=del;VARB=0.0156282;OID=.;OPOS=722010;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.346939:16:50:17:49:32:10:7:20:12:91:29:9:7:17:12 chr18 722366 . T TG 86.14 PASS AF=0.354839;AO=12;DP=32;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0231429;FXX=0.0312402;HRUN=0;LEN=1;MLLD=265.46;QD=11.115;RBI=0.0529194;REFB=-0.00682587;REVB=-0.0475906;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18246;STB=0.657925;STBP=0.229;TYPE=ins;VARB=0.0175393;OID=.;OPOS=722367;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.354839:12:32:11:31:20:3:8:10:10:86:20:4:8:10:10 chr18 722402 . T C 247.08 PASS AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0469318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.678;QD=24.7084;RBI=0.0656824;REFB=-0.042645;REVB=0.0459521;RO=17;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309972;STB=0.517227;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0289406;OID=.;OPOS=722402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:14:9:6:11:14:9:6:11 chr18 724612 . A G 393.3 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8282;QD=56.1857;RBI=0.0407164;REFB=0;REVB=0.0370784;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127816;OID=.;OPOS=724612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr18 907675 . G A 897.47 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0450812;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2938;QD=55.2291;RBI=0.0528059;REFB=-0.125502;REVB=0.0274982;RO=2;SAF=17;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168132;STB=0.508909;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0024889;OID=.;OPOS=907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:65:2:2:63:63:0.969231:46:17:1:1:46:17:1:1 chr18 2538644 . G A 201.82 PASS AF=0.44;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0535054;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8591;QD=16.1458;RBI=0.0540231;REFB=-0.0387105;REVB=0.00746122;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222769;STB=0.63624;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0321362;OID=.;OPOS=2538644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:29:28:22:22:0.44:8:14:12:17:8:14:11:17 chr18 2539016 . C G 955.18 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0844;QD=58.7805;RBI=0.0664063;REFB=0;REVB=0.0662323;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000598801;OID=.;OPOS=2539016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:25:40:0:0:25:40:0:0 chr18 2547500 . G T 302.59 PASS AF=0.4;AO=33;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00101879;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.512;QD=14.2397;RBI=0.0194863;REFB=-0.00473401;REVB=0.0194596;RO=51;SAF=22;SAR=11;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174791;STB=0.617043;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00613696;OID=.;OPOS=2547500;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:51:51:33:34:0.4:11:22:26:25:11:23:25:26 chr18 2595443 . G T 339.05 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00246323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0381;QD=18.0828;RBI=0.00409276;REFB=-0.0119126;REVB=0.00326851;RO=38;SAF=16;SAR=20;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995761;STB=0.562096;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0164668;OID=.;OPOS=2595443;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:39:36:36:0.48:20:16:21:17:20:16:22:17 chr18 2616457 . G C 1129.55 PASS AF=0.466667;AO=117;DP=253;FAO=119;FDP=255;FR=.;FRO=136;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=-0.00162689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.36;QD=17.7185;RBI=0.00164487;REFB=-0.0102219;REVB=0.000242579;RO=133;SAF=51;SAR=66;SRF=77;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137474;STB=0.584807;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0149376;OID=.;OPOS=2616457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:255:133:136:117:119:0.466667:66:51:77:56:68:51:80:56 chr18 2705700 . A G 575.79 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00269577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.622;QD=60.6099;RBI=0.039304;REFB=0;REVB=0.0392114;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250947;OID=.;OPOS=2705700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:22:15:0:0:22:16:0:0 chr18 2707619 . G A 512.17 PASS AF=0.393103;AO=57;DP=145;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.0191835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.512;QD=14.1287;RBI=0.0254845;REFB=-0.00120584;REVB=-0.0167765;RO=88;SAF=29;SAR=28;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942388;STB=0.505322;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00170532;OID=.;OPOS=2707619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:88:88:57:57:0.393103:28:29:44:44:28:29:44:44 chr18 2724930 . A T 242.45 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0195029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.543;QD=14.9203;RBI=0.0291068;REFB=-0.0166399;REVB=-0.0216065;RO=37;SAF=9;SAR=19;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339019;STB=0.519241;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0194718;OID=.;OPOS=2724930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:19:9:13:24:19:9:13:24 chr18 2740714 . A G 447.31 PASS AF=0.517647;AO=43;DP=84;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0227317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.069;QD=21.0499;RBI=0.0273327;REFB=-0.00738817;REVB=0.0151773;RO=40;SAF=29;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094739;STB=0.538578;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0054419;OID=.;OPOS=2740714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:40:41:43:44:0.517647:14:29:23:17:15:29:24:17 chr18 2750444 . C T 278.9 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00212106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.052;QD=16.4061;RBI=0.00258205;REFB=-0.00771389;REVB=-0.00147244;RO=36;SAF=11;SAR=20;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905697;STB=0.55996;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.00706963;OID=.;OPOS=2750444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:37:31:31:0.455882:20:11:16:20:20:11:17:20 chr18 2750477 . A G 200.83 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0266291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2827;QD=15.1566;RBI=0.0266929;REFB=-0.0127299;REVB=0.00184472;RO=29;SAF=7;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188239;STB=0.618522;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0223892;OID=.;OPOS=2750477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:30:23:23:0.433962:16:7:14:15:16:7:15:15 chr18 2763697 . C T 624.61 PASS AF=0.448052;AO=64;DP=150;FAO=69;FDP=154;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.00270763;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.584;QD=16.2237;RBI=0.0115688;REFB=-0.0135514;REVB=-0.0112475;RO=85;SAF=36;SAR=28;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046157;STB=0.502262;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0146438;OID=.;OPOS=2763697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:154:85:85:64:69:0.448052:28:36:44:41:33:36:44:41 chr18 2778962 . G C 241.49 PASS AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0509609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.237;QD=12.3841;RBI=0.0548729;REFB=-0.00386073;REVB=0.0203477;RO=49;SAF=19;SAR=10;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974111;STB=0.556145;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00701879;OID=.;OPOS=2778962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:10:19:28:21:10:19:28:21 chr18 2778979 . G T 1207.97 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.117766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0068;QD=61.1631;RBI=0.117797;REFB=0;REVB=-0.00273731;RO=0;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00101559;OID=.;OPOS=2778979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:31:46:0:0:33:46:0:0 chr18 2891478 . T C 180.08 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0265894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3328;QD=23.2362;RBI=0.03129;REFB=-0.0285612;REVB=0.0164945;RO=13;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455938;STB=0.525519;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0214799;OID=.;OPOS=2891478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:10:8:5:8:10:8:5:8 chr18 2913431 . T C 1160.8 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4694;QD=60.3015;RBI=0.0062736;REFB=0;REVB=7.74736e-05;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125642;OID=.;OPOS=2913431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:77:0:0:74:77:1:44:30:0:0:47:30:0:0 chr18 2914073 . TA T 457.47 PASS AF=1;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0885096;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.4907;QD=48.1547;RBI=0.0949913;REFB=0;REVB=0.0344876;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00379878;OID=.;OPOS=2914074;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:37:39:38:38:0:15:23:0:0:8:0:14:23:0:0 chr18 2920288 . G A 820.49 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043454;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.172;QD=57.5785;RBI=0.0598858;REFB=0;REVB=0.0412076;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184442;OID=.;OPOS=2920288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0 chr18 2946163 . G A 727.42 PASS AF=0.42246;AO=79;DP=187;FAO=79;FDP=187;FR=.;FRO=108;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=-0.00218804;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.174;QD=15.5597;RBI=0.00829822;REFB=-0.0120324;REVB=0.00800456;RO=108;SAF=47;SAR=32;SRF=54;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995126;STB=0.555664;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0158683;OID=.;OPOS=2946163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:108:108:79:79:0.42246:32:47:54:54:32:47:54:54 chr18 2946291 . C T 2941.71 PASS AF=1;AO=186;DP=186;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8798;QD=63.2627;RBI=0.029731;REFB=0;REVB=-0.027596;RO=0;SAF=82;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142869;OID=.;OPOS=2946291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:186:186:0:0:186:186:1:104:82:0:0:104:82:0:0 chr18 3067278 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.734;QD=62.671;RBI=0.0249834;REFB=0;REVB=-0.00805853;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46267e-05;OID=.;OPOS=3067278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0 chr18 3075503 . C CAAA 900.69 PASS AF=1;AO=58;DP=67;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00860941;FXX=0.0895389;HRUN=0;LEN=3;MLLD=272.754;QD=59.0616;RBI=0.0116422;REFB=0;REVB=0.00783699;RO=6;SAF=35;SAR=23;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-1.04796e-05;OID=.;OPOS=3075504;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:58:67:61:61:0:38:23:0:0:5:6:35:23:2:4 chr18 3075712 . C A 1181.66 PASS AF=0.975309;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.027196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4186;QD=58.3538;RBI=0.0464094;REFB=-0.0414512;REVB=-0.0376061;RO=1;SAF=36;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129683;STB=0.51351;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00526041;OID=.;OPOS=3075712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:80:81:1:2:79:79:0.975309:43:36:1:0:43:36:2:0 chr18 3168816 . G A 312.86 PASS AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00234147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.549;QD=14.3842;RBI=0.0113612;REFB=-0.0164575;REVB=-0.0111173;RO=52;SAF=11;SAR=24;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281748;STB=0.660309;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0311222;OID=.;OPOS=3168816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:24:11:30:22:24:11:30:22 chr18 3176040 . C G 305.51 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00645805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.004;QD=17.7107;RBI=0.00853588;REFB=-0.00477541;REVB=0.00558165;RO=36;SAF=12;SAR=21;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303177;STB=0.669151;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00436685;OID=.;OPOS=3176040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:21:12:25:11:21:12:25:11 chr18 3188976 . A G 848.92 PASS AF=0.5;AO=85;DP=171;FAO=86;FDP=172;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=67;FSRF=30;FSRR=56;FWDB=-0.0106741;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.456;QD=19.7423;RBI=0.0132437;REFB=-0.0185189;REVB=-0.00783956;RO=84;SAF=18;SAR=67;SRF=28;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147994;STB=0.584143;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0159059;OID=.;OPOS=3188976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:84:86:85:86:0.5:67:18:28:56:67:19:30:56 chr18 3256112 . A G 351.16 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0270102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.767;QD=18.0083;RBI=0.0283728;REFB=-0.0173091;REVB=0.00868692;RO=41;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829714;STB=0.546411;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.014903;OID=.;OPOS=3256112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:23:14:19:22:23:14:19:22 chr18 3571217 . T C 817.69 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.21;QD=57.3815;RBI=0.0842066;REFB=0;REVB=0.0826438;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000572499;OID=.;OPOS=3571217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:16:41:0:0:16:41:0:0 chr18 3598067 . G A 74.69 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00530398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.262;QD=10.6701;RBI=0.00665789;REFB=-0.0170919;REVB=0.00402433;RO=18;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286912;STB=0.517207;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.030279;OID=.;OPOS=3598067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:7:3:5:13:7:3:5:13 chr18 3729175 . C T 551.51 PASS AF=0.554348;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00203732;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.049;QD=23.9785;RBI=0.0299291;REFB=-0.0188212;REVB=0.0298597;RO=40;SAF=34;SAR=17;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00753565;STB=0.508193;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0162991;OID=.;OPOS=3729175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:40:41:51:51:0.554348:17:34:27:13:17:34:28:13 chr18 5292030 . A G 1677.35 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000783968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3905;QD=60.445;RBI=0.00627667;REFB=0;REVB=-0.00622752;RO=0;SAF=47;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43031e-05;OID=.;OPOS=5292030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:64:47:0:0:64:47:0:0 chr18 5410574 . A G 969.65 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.774;QD=58.7664;RBI=0.0271024;REFB=0;REVB=0.000609488;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39547e-05;OID=.;OPOS=5410574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:35:29:0:0:36:30:0:0 chr18 5630531 . G A 2152.26 PASS AF=0.972222;AO=140;DP=148;FAO=140;FDP=144;FR=.;FRO=4;FSAF=62;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0343505;FXX=0.0270252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.267;QD=59.785;RBI=0.0480116;REFB=-0.0739465;REVB=0.0335433;RO=4;SAF=62;SAR=78;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00305476;STB=0.501607;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00117736;OID=.;OPOS=5630531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:148:144:4:4:140:140:0.972222:78:62:2:2:78:62:2:2 chr18 5955911 . C T 772.11 PASS AF=0.982759;AO=53;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0416701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.974;QD=53.2492;RBI=0.0416972;REFB=-0.10439;REVB=-0.00150175;RO=1;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154473;STB=0.507934;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00298301;OID=.;OPOS=5955911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:58:1:1:53:57:0.982759:30:23:0:1:31:26:0:1 chr18 5955932 . G A 688.77 PASS AF=0.980392;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00651754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8983;QD=54.0215;RBI=0.157457;REFB=-0.00135119;REVB=0.157322;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.511107;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0016833;OID=.;OPOS=5955932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:49:50:0.980392:27:22:0:0:28:22:1:0 chr18 5956145 . T C 1050.96 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.269;QD=58.3868;RBI=0.0335923;REFB=-0.0313514;REVB=0.0290418;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411987;OID=.;OPOS=5956145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:72:72:0:0:71:72:1:24:47:0:0:25:47:0:0 chr18 5956238 . C T 1573.0 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00576345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7365;QD=59.9238;RBI=0.00762946;REFB=0;REVB=-0.00499912;RO=0;SAF=68;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16377e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49948e-05;OID=.;OPOS=5956238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:37:68:0:0:37:68:0:0 chr18 5960165 . G A 2715.51 PASS AF=1;AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.098;QD=62.4254;RBI=0.0236402;REFB=0;REVB=-0.0164558;RO=0;SAF=97;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66407e-07;OID=.;OPOS=5960165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:173:174:0:0:173:174:1:76:97:0:0:77:97:0:0 chr18 5969537 . T C 466.48 PASS AF=0.542169;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00655911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0874;QD=22.4809;RBI=0.0125443;REFB=-0.0180198;REVB=-0.0106929;RO=37;SAF=13;SAR=32;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854709;STB=0.542694;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.018961;OID=.;OPOS=5969537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:37:38:45:45:0.542169:32:13:14:23:32:13:14:24 chr18 6046717 . T C 743.87 PASS AF=0.390909;AO=86;DP=221;FAO=86;FDP=220;FR=.;FRO=134;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=70;FSRR=64;FWDB=-0.00411112;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9283;QD=13.525;RBI=0.0157413;REFB=0.00344711;REVB=0.0151949;RO=132;SAF=37;SAR=49;SRF=69;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999377;STB=0.556332;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.00454906;OID=.;OPOS=6046717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:220:132:134:86:86:0.390909:49:37:69:63:49:37:70:64 chr18 6455000 . C T 1308.46 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4748;QD=61.5745;RBI=0.0197776;REFB=0;REVB=0.0035322;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520623;OID=.;OPOS=6455000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:40:44:0:0:41:44:0:0 chr18 6455037 . T C 1396.45 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.152;QD=62.7619;RBI=0.035584;REFB=0;REVB=0.0257781;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81056e-05;OID=.;OPOS=6455037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:46:43:0:0:46:43:0:0 chr18 6889973 . A G 294.51 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00643998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.205;QD=15.103;RBI=0.0313723;REFB=-0.00873954;REVB=0.0307042;RO=45;SAF=21;SAR=12;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198147;STB=0.612224;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0089837;OID=.;OPOS=6889973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:12:21:20:25:12:21:20:25 chr18 6890434 . A G 492.49 PASS AF=0.490566;AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0241754;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.065;QD=18.5846;RBI=0.0296181;REFB=-0.00840057;REVB=0.017111;RO=54;SAF=30;SAR=22;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323908;STB=0.51793;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00773188;OID=.;OPOS=6890434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:54:54:52:52:0.490566:22:30:33:21:22:30:33:21 chr18 6912143 . A C 295.1 PASS AF=0.54386;AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00721372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5946;QD=20.7088;RBI=0.0188328;REFB=-0.0303874;REVB=-0.0173965;RO=27;SAF=13;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10425;STB=0.572031;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0230919;OID=.;OPOS=6912143;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:26:30:31:0.54386:17:13:15:12:18:13:15:11 chr18 6928180 . G T 53.4 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00642535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4771;QD=7.62902;RBI=0.0275004;REFB=-0.0107014;REVB=0.0267392;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291917;STB=0.678182;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0190748;OID=.;OPOS=6928180;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:4:4:5:15:4:4:5:15 chr18 6980523 . T C 1135.25 PASS AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.05;QD=60.5469;RBI=0.0138795;REFB=0;REVB=0.00483871;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12988e-05;OID=.;OPOS=6980523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:38:36:0:0:39:36:0:0 chr18 6985631 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.057;QD=59.4356;RBI=0.0252046;REFB=0;REVB=0.0167255;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223941;OID=.;OPOS=6985631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0 chr18 7567803 . C G 66.5 PASS AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0129053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.871;QD=26.6017;RBI=0.0603349;REFB=-0.0946211;REVB=0.0589386;RO=2;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218484;STB=0.624686;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0177065;OID=.;OPOS=7567803;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:3:5:0:2:3:5:0:2 chr18 8387195 . G A 2008.27 PASS AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.36;QD=62.272;RBI=0.0511569;REFB=0;REVB=0.0416324;RO=0;SAF=71;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1079e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108571;OID=.;OPOS=8387195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:58:71:0:0:58:71:0:0 chr18 8387219 . G C 1523.53 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0466842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.639;QD=58.5974;RBI=0.0467433;REFB=-0.106693;REVB=0.00235013;RO=1;SAF=57;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102034;STB=0.505375;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00100791;OID=.;OPOS=8387219;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:46:57:0:1:46:57:0:1 chr18 8471976 . A G 224.91 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0134663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6399;QD=19.9916;RBI=0.0165156;REFB=-0.00460683;REVB=-0.00956159;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100024;STB=0.5564;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00454476;OID=.;OPOS=8471976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:10:13:10:12:10:13 chr18 8783835 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000859685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.766;QD=56.7066;RBI=0.00340917;REFB=0;REVB=0.003299;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90131e-05;OID=.;OPOS=8783835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr18 8784370 . A G 1432.62 PASS AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0135608;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.842;QD=59.6925;RBI=0.0219311;REFB=0.0104229;REVB=-0.017236;RO=3;SAF=47;SAR=46;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00955155;STB=0.50504;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.000149786;OID=.;OPOS=8784370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:96:96:3:3:93:93:0.96875:46:47:2:1:46:47:2:1 chr18 8809445 . G C 421.77 PASS AF=0.401639;AO=48;DP=122;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=41;FWDB=-0.00344778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4227;QD=13.8284;RBI=0.00363717;REFB=-0.0137947;REVB=-0.00115838;RO=73;SAF=16;SAR=32;SRF=32;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119881;STB=0.572224;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.030284;OID=.;OPOS=8809445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:73:73:48:49:0.401639:32:16:32:41:33:16:32:41 chr18 8826083 . G C 310.29 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167076;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.759;QD=53.9628;RBI=0.0274979;REFB=0;REVB=0.0218401;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102442;OID=.;OPOS=8826083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr18 9117867 . T C 306.02 PASS AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00295141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.667;QD=15.6935;RBI=0.00429969;REFB=-0.0106039;REVB=0.00312674;RO=44;SAF=15;SAR=19;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327031;STB=0.518422;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0136275;OID=.;OPOS=9117867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:19:15:18:26:19:15:18:26 chr18 9255982 . A G 450.41 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.0571545;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.8982;QD=20.018;RBI=0.0571808;REFB=-0.00142172;REVB=0.00173449;RO=45;SAF=15;SAR=30;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223414;STB=0.512391;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00107834;OID=.;OPOS=9255982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:45:45:45:45:0.5:30:15:16:29:30:15:16:29 chr18 9278070 . G C 434.91 PASS AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0197152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.206;QD=20.9595;RBI=0.0200616;REFB=-0.00166802;REVB=0.00371204;RO=40;SAF=17;SAR=26;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931727;STB=0.551581;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00078858;OID=.;OPOS=9278070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:26:17:20:20:26:17:20:20 chr18 9283697 . T C 467.16 PASS AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0150145;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.493;QD=21.984;RBI=0.0187415;REFB=-0.0132269;REVB=0.0112164;RO=40;SAF=26;SAR=19;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883938;STB=0.548791;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00865198;OID=.;OPOS=9283697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:19:26:19:21:19:26:19:21 chr18 9402174 . A G 122.25 PASS AF=0.293103;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0115126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.079;QD=8.43118;RBI=0.0131338;REFB=-0.00648672;REVB=-0.00632112;RO=40;SAF=5;SAR=12;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380453;STB=0.733462;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0116328;OID=.;OPOS=9402174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:40:41:17:17:0.293103:12:5:25:15:12:5:26:15 chr18 9518126 . G A 416.17 PASS AF=0.40678;AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0103004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7642;QD=14.1076;RBI=0.0289923;REFB=-0.0128873;REVB=0.0271009;RO=70;SAF=25;SAR=23;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668738;STB=0.537714;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.015798;OID=.;OPOS=9518126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:70:70:48:48:0.40678:23:25:32:38:23:25:32:38 chr18 9562042 . C T 177.37 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0182954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.214;QD=14.4791;RBI=0.0200584;REFB=-0.0131222;REVB=0.00822281;RO=30;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134712;STB=0.578369;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0201122;OID=.;OPOS=9562042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:13:6:13:17:13:6:13:17 chr18 9618005 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9777;QD=54.5172;RBI=0.0286177;REFB=0;REVB=0.0282848;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829342;OID=.;OPOS=9618005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr18 9618049 . C T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.975;QD=55.656;RBI=0.0197464;REFB=0;REVB=-0.0196721;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101094;OID=.;OPOS=9618049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr18 9887497 . G A 56.96 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.085583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8876;QD=28.4819;RBI=0.0857935;REFB=-0.041496;REVB=-0.00600669;RO=1;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674964;STB=0.538356;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0833315;OID=.;OPOS=9887497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:6:1:0:1:6:1:0:1 chr18 9887857 . G A 246.81 PASS AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.00174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.805;QD=17.9498;RBI=0.033628;REFB=-0.0155392;REVB=0.0335829;RO=28;SAF=18;SAR=9;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340232;STB=0.690338;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0150361;OID=.;OPOS=9887857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:9:18:8:20:9:18:8:20 chr18 9888069 . A G 426.62 PASS AF=0.373134;AO=50;DP=134;FAO=50;FDP=134;FR=.;FRO=84;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=50;FWDB=-0.00218779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9233;QD=12.735;RBI=0.00471714;REFB=0.00710098;REVB=0.00417911;RO=84;SAF=20;SAR=30;SRF=34;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00545656;STB=0.503104;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.0231337;OID=.;OPOS=9888069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:84:84:50:50:0.373134:30:20:34:50:30:20:34:50 chr18 9955960 . A G 557.51 PASS AF=0.530612;AO=51;DP=98;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0286726;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.373;QD=22.7554;RBI=0.0291618;REFB=0.00479158;REVB=-0.0053194;RO=46;SAF=16;SAR=35;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749417;STB=0.544466;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.00385304;OID=.;OPOS=9955960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:46:46:51:52:0.530612:35:16:18:28:36:16:18:28 chr18 10454960 . C G 433.14 PASS AF=0.970588;AO=29;DP=32;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.151239;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.3911;QD=50.9574;RBI=0.152947;REFB=-0.108262;REVB=-0.0227931;RO=3;SAF=12;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044969;STB=0.514277;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0142533;OID=.;OPOS=10454960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:32:34:3:1:29:33:0.970588:17:12:2:1:17:16:0:1 chr18 10539819 . GA G 79.18 PASS AF=0.313433;AO=19;DP=68;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0479116;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.5289;QD=4.727;RBI=0.122627;REFB=-0.0217852;REVB=-0.112879;RO=40;SAF=3;SAR=16;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.586798;STB=0.8375;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.0411028;OID=.;OPOS=10539820;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.313433:19:68:21:67:46:3:18:28:18:79:40:3:16:27:13 chr18 10681711 . C T 730.2 PASS AF=0.518248;AO=69;DP=135;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.000207961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.32;QD=21.3199;RBI=0.00390763;REFB=-0.0141428;REVB=0.00390209;RO=61;SAF=36;SAR=33;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675778;STB=0.52527;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0136563;OID=.;OPOS=10681711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:61:66:69:71:0.518248:33:36:27:34:35:36:30:36 chr18 10741011 . G A 1601.55 PASS AF=0.973214;AO=109;DP=113;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0083588;FXX=0.00884877;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.748;QD=57.1983;RBI=0.0169571;REFB=0.0368696;REVB=0.0147538;RO=3;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251857;STB=0.513272;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=-0.000144844;OID=.;OPOS=10741011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:113:112:3:3:109:109:0.973214:55:54:0:3:55:54:0:3 chr18 10748603 . A T 236.12 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0174398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.24;QD=19.2749;RBI=0.0182718;REFB=0.00301814;REVB=-0.00545107;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616294;STB=0.534853;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=-0.0029444;OID=.;OPOS=10748603;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:13:10:13:13:13:10:13:13 chr18 10752666 . C T 111.03 PASS AF=0.271186;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00605821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.244;QD=7.52756;RBI=0.0278976;REFB=0.00145141;REVB=-0.0272318;RO=41;SAF=6;SAR=10;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300773;STB=0.663701;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00901873;OID=.;OPOS=10752666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:41:43:16:16:0.271186:10:6:26:15:10:6:26:17 chr18 10758023 . G A 2125.05 PASS AF=1;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345488;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.462;QD=62.9646;RBI=0.00414336;REFB=0;REVB=-0.00228718;RO=0;SAF=73;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.44095e-06;OID=.;OPOS=10758023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:135:0:0:135:135:1:62:73:0:0:62:73:0:0 chr18 10762962 . G A 1042.52 PASS AF=0.96;AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0080944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.43;QD=55.6009;RBI=0.0189701;REFB=-0.0106721;REVB=0.0171565;RO=3;SAF=37;SAR=35;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136503;STB=0.507223;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00504052;OID=.;OPOS=10762962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:75:75:3:3:72:72:0.96:35:37:1:2:35:37:1:2 chr18 10763007 . T C 937.56 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0028755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1365;QD=58.5977;RBI=0.00879296;REFB=0;REVB=0.00830949;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93015e-05;OID=.;OPOS=10763007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0 chr18 10787047 . G A 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.359;QD=59.8391;RBI=0.021217;REFB=0;REVB=-0.00738205;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20241e-05;OID=.;OPOS=10787047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr18 11609754 . G A 217.17 PASS AF=0.364865;AO=26;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0112276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.05;QD=11.7388;RBI=0.0118775;REFB=-0.00520523;REVB=-0.0038749;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854634;STB=0.522072;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0134693;OID=.;OPOS=11609754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:47:26:27:0.364865:13:13:19:26:14:13:21:26 chr18 11609863 . G A 311.96 PASS AF=0.357798;AO=39;DP=109;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.0078178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.337;QD=11.448;RBI=0.0106736;REFB=-0.0124589;REVB=0.00726686;RO=70;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197636;STB=0.613041;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0155122;OID=.;OPOS=11609863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:70:70:39:39:0.357798:17:22:27:43:17:22:27:43 chr18 11609903 . CA GG 1580.58 PASS AF=1;AO=106;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291027;FXX=0.0277752;HRUN=1;LEN=2;MLLD=315.997;QD=60.2125;RBI=0.0292037;REFB=0;REVB=-0.002426;RO=0;SAF=49;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.4705e-06;OID=.;OPOS=11609903;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:105:0:0:106:105:1:57:49:0:0:56:49:0:0 chr18 11610052 . T C 260.12 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0527632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.565;QD=14.4514;RBI=0.0534198;REFB=-0.0312288;REVB=0.00835031;RO=41;SAF=17;SAR=13;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17696;STB=0.604586;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0486367;OID=.;OPOS=11610052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:41:42:30:30:0.416667:13:17:30:11:13:17:31:11 chr18 11610073 . G A 323.53 PASS AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.0208792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.157;QD=16.8067;RBI=0.0231378;REFB=0.00331294;REVB=-0.00997078;RO=42;SAF=17;SAR=18;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221965;STB=0.623827;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00355746;OID=.;OPOS=11610073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:18:17:30:12:18:17:30:12 chr18 11610163 . G C 930.2 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5573;QD=58.1372;RBI=0.0896407;REFB=0;REVB=0.0707879;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012593;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122723;OID=.;OPOS=11610163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:1:0:63:64:1:37:26:0:1:38:26:0:0 chr18 11610332 . G T 239.89 PASS AF=0.290598;AO=32;DP=114;FAO=34;FDP=117;FR=.;FRO=83;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=0.00192228;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.298;QD=8.20126;RBI=0.00504307;REFB=-0.01492;REVB=0.00466234;RO=77;SAF=14;SAR=18;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206578;STB=0.520536;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0428788;OID=.;OPOS=11610332;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:117:77:83:32:34:0.290598:18:14:35:42:19:15:39:44 chr18 11610349 . G A 730.07 PASS AF=0.653465;AO=59;DP=95;FAO=66;FDP=101;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0487725;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5197;QD=28.9136;RBI=0.0982668;REFB=-0.0477055;REVB=0.0853089;RO=35;SAF=24;SAR=35;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354994;STB=0.534341;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0177191;OID=.;OPOS=11610349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:101:35:35:59:66:0.653465:35:24:16:19:42:24:16:19 chr18 11610362 . G C 195.98 PASS AF=0.288889;AO=26;DP=87;FAO=26;FDP=90;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=0.00459197;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=195.281;QD=8.71026;RBI=0.0166451;REFB=-0.0124576;REVB=-0.0159991;RO=61;SAF=12;SAR=14;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162982;STB=0.596788;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0235729;OID=.;OPOS=11610362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:61:64:26:26:0.288889:14:12:20:41:14:12:21:43 chr18 11610382 . C A 400.45 PASS AF=0.633333;AO=38;DP=61;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0578855;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7083;QD=26.6969;RBI=0.0593913;REFB=-0.00162656;REVB=0.013289;RO=23;SAF=13;SAR=25;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371466;STB=0.508716;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0037539;OID=.;OPOS=11610382;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:23:22:38:38:0.633333:25:13:9:14:25:13:8:14 chr18 11610443 . T C 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0606824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.724;QD=10.0752;RBI=0.0616436;REFB=-0.0401278;REVB=0.0108432;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226511;STB=0.636048;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0161916;OID=.;OPOS=11610443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:4:10:4:4:4:10 chr18 11619523 . C A 42.22 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0574905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.416;QD=18.7642;RBI=0.0666981;REFB=-0.0509373;REVB=0.0338153;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.615062;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.027387;OID=.;OPOS=11619523;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:3:0:1:5:3:0 chr18 11619552 . C T 392.42 PASS AF=1;AO=20;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.609;QD=56.0604;RBI=0.0711735;REFB=0;REVB=0.021657;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013834;OID=.;OPOS=11619552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:20:28:1:9:11:0:0:12:16:0:0 chr18 11619799 . ATGT A 1657.11 PASS AF=1;AO=102;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220852;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=3;MLLD=186.186;QD=60.2584;RBI=0.0485287;REFB=0;REVB=0.043212;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.90349e-05;OID=.;OPOS=11619800;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:102:112:110:110:0:51:59:0:0:9:0:48:54:0:0 chr18 11619908 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3873;QD=33.4285;RBI=0.0528432;REFB=0;REVB=0.0154318;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00197244;OID=.;OPOS=11619908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr18 11625886 . T C 1738.51 PASS AF=0.991379;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0231806;FXX=0.00854628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2634;QD=59.9488;RBI=0.0632228;REFB=-0.131909;REVB=-0.0588199;RO=1;SAF=75;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00628987;STB=0.503267;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000846649;OID=.;OPOS=11625886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:115:116:1:1:114:115:0.991379:39:75:1:0:39:76:1:0 chr18 11639356 . G C 2648.15 PASS AF=0.994186;AO=169;DP=172;FAO=171;FDP=172;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0165826;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.368;QD=61.5849;RBI=0.05917;REFB=-0.0341333;REVB=0.0567989;RO=1;SAF=80;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531778;STB=0.502793;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000150573;OID=.;OPOS=11639356;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:172:172:1:1:169:171:0.994186:89:80:0:1:89:82:0:1 chr18 11853053 . A G 801.7 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.61;QD=57.2642;RBI=0.0348304;REFB=0;REVB=0.0285879;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1043e-05;OID=.;OPOS=11853053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:31:24:0:0:32:24:0:0 chr18 11853731 . A G 879.67 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164409;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.104;QD=57.6831;RBI=0.00175787;REFB=0;REVB=0.000622177;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.49578e-05;OID=.;OPOS=11853731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:28:32:0:0:29:32:0:0 chr18 11999115 . T C 191.63 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0543763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.337;QD=15.6429;RBI=0.0544106;REFB=-0.000750935;REVB=0.00193247;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741956;STB=0.542578;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.000524426;OID=.;OPOS=11999115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:11:9:11:18:11:9:11:18 chr18 12094031 . G T 620.3 PASS AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0593287;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.6801;QD=55.1374;RBI=0.0595802;REFB=0.00253968;REVB=-0.00546868;RO=2;SAF=11;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258812;STB=0.533758;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.000432289;OID=.;OPOS=12094031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:45:45:2:3:42:42:0.933333:31:11:1:1:31:11:2:1 chr18 12658600 . A G 531.58 PASS AF=0.482759;AO=55;DP=115;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.00593666;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.548;QD=18.3302;RBI=0.0184805;REFB=-0.0187667;REVB=-0.017501;RO=60;SAF=30;SAR=25;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136129;STB=0.569828;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0164633;OID=.;OPOS=12658600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:60:60:55:56:0.482759:25:30:24:36:26:30:24:36 chr18 12662148 . G A 330.01 PASS AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0344869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.643;QD=18.334;RBI=0.0386156;REFB=-0.0272345;REVB=-0.0173727;RO=36;SAF=15;SAR=20;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171344;STB=0.599947;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0205596;OID=.;OPOS=12662148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:37:35:35:0.486111:20:15:9:27:20:15:9:28 chr18 12718593 . A G 220.52 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0320884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3954;QD=14.2268;RBI=0.0323121;REFB=0.00146871;REVB=-0.00379519;RO=36;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170669;STB=0.596703;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.00147907;OID=.;OPOS=12718593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:13:13:12:24:13:13:12:24 chr18 12760740 . T A 336.83 PASS AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.028759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.406;QD=28.0691;RBI=0.0786555;REFB=0.0148491;REVB=-0.0732093;RO=18;SAF=11;SAR=18;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237441;STB=0.620606;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.0107305;OID=.;OPOS=12760740;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:19:29:29:0.604167:18:11:13:5:18:11:13:6 chr18 12984144 . C A 501.4 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1305;QD=58.9885;RBI=0.0316435;REFB=0;REVB=-0.0261375;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.03995e-05;OID=.;OPOS=12984144;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0 chr18 13001512 . G C 994.28 PASS AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0275678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.302;QD=57.6395;RBI=0.0302797;REFB=-0.118863;REVB=-0.012525;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145389;STB=0.50769;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000333953;OID=.;OPOS=13001512;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:35:32:1:0:36:32:1:0 chr18 13001523 . G A 1018.13 PASS AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0248261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.813;QD=56.5628;RBI=0.0261186;REFB=-0.059241;REVB=0.00811458;RO=2;SAF=34;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000750534;STB=0.500397;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00181563;OID=.;OPOS=13001523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:36:34:1:1:36:34:1:1 chr18 13056333 . C T 779.77 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.168;QD=55.698;RBI=0.0606439;REFB=0;REVB=0.0275458;RO=1;SAF=30;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154549;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000672754;OID=.;OPOS=13056333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:1:0:55:56:1:25:30:1:0:25:31:0:0 chr18 13068132 . T C 1577.83 PASS AF=1;AO=95;DP=97;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683568;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.215;QD=60.108;RBI=0.0730661;REFB=0;REVB=0.025807;RO=0;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28013e-05;OID=.;OPOS=13068132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:97:105:0:0:95:105:1:40:55:0:0:40:65:0:0 chr18 13069782 . C T 801.76 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186655;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.579;QD=57.2683;RBI=0.0418865;REFB=0;REVB=0.0374977;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000466163;OID=.;OPOS=13069782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:28:27:0:0:28:28:0:0 chr18 13095609 . T C 1822.51 PASS AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.934;QD=61.2607;RBI=0.0387411;REFB=0;REVB=0.0261632;RO=0;SAF=56;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90387e-06;OID=.;OPOS=13095609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:63:56:0:0:63:56:0:0 chr18 13116432 . G T 2834.24 PASS AF=0.98913;AO=182;DP=184;FAO=182;FDP=184;FR=.;FRO=2;FSAF=109;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00353221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.044;QD=61.6139;RBI=0.00376345;REFB=-0.160782;REVB=-0.00129886;RO=2;SAF=109;SAR=73;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00212916;STB=0.501118;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.000290088;OID=.;OPOS=13116432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:184:184:2:2:182:182:0.98913:73:109:1:1:73:109:1:1 chr18 14105016 . C A 218.42 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0225065;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.049;QD=22.402;RBI=0.0259934;REFB=-0.0258192;REVB=-0.0130045;RO=18;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190399;STB=0.606777;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0231072;OID=.;OPOS=14105016;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:18:18:21:21:0.538462:13:8:11:7:13:8:11:7 chr18 14105923 . T C 989.8 PASS AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0157195;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=299.384;QD=54.9891;RBI=0.0157407;REFB=0.0402295;REVB=0.000816125;RO=2;SAF=44;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00791034;STB=0.513615;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.000117334;OID=.;OPOS=14105923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:72:72:2:3:69:69:0.958333:25:44:1:1:25:44:1:2 chr18 14106039 . T C 108.53 PASS AF=0.393939;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.033367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.752;QD=13.1553;RBI=0.0335515;REFB=-0.0240964;REVB=-0.00351349;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292438;STB=0.684416;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0336715;OID=.;OPOS=14106039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:20:20:12:13:0.393939:5:7:6:14:5:8:6:14 chr18 14184006 . G C 50.26 PASS AF=0.190476;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00413126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9688;QD=4.78671;RBI=0.0203001;REFB=0.0191241;REVB=0.0198753;RO=34;SAF=4;SAR=4;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0836447;OID=.;OPOS=14184006;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:42:42:34:34:8:8:0.190476:4:4:17:17:4:4:17:17 chr18 14184067 . T A 32.38 PASS AF=0.122449;AO=6;DP=49;FAO=6;FDP=49;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00162081;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.962;QD=2.64356;RBI=0.00219906;REFB=-0.000289694;REVB=-0.00148622;RO=43;SAF=2;SAR=4;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157904;STB=0.61931;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00218361;OID=.;OPOS=14184067;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:49:49:43:43:6:6:0.122449:4:2:20:23:4:2:20:23 chr18 14186473 . T C 96.28 PASS AF=0.234375;AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.0116455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8825;QD=6.01722;RBI=0.0473482;REFB=0.00220589;REVB=-0.0458937;RO=49;SAF=7;SAR=8;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124547;STB=0.577068;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.00906517;OID=.;OPOS=14186473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:64:64:49:49:15:15:0.234375:8:7:18:31:8:7:18:31 chr18 14186497 . G C 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.233;QD=57.3855;RBI=0.0158445;REFB=0;REVB=-0.0145693;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72041e-05;OID=.;OPOS=14186497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:38:19:0:0:38:19:0:0 chr18 14187255 . A T 118.49 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0556569;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3777;QD=12.1531;RBI=0.0570265;REFB=-0.00916504;REVB=-0.0124231;RO=25;SAF=2;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509853;STB=0.806236;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0142101;OID=.;OPOS=14187255;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:39:25:25:14:14:0.358974:12:2:14:11:12:2:14:11 chr18 14187273 . C G 138.97 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0064991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.51;QD=12.0843;RBI=0.00852089;REFB=-0.000851323;REVB=0.00551065;RO=30;SAF=3;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393452;STB=0.735524;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00399234;OID=.;OPOS=14187273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:13:3:15:15:13:3:15:15 chr18 14187304 . G A 115.7 PASS AF=0.265625;AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0283007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.044;QD=7.23155;RBI=0.0314583;REFB=-0.000974203;REVB=-0.0137366;RO=47;SAF=3;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460328;STB=0.783642;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00510174;OID=.;OPOS=14187304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:47:47:17:17:0.265625:14:3:25:22:14:3:25:22 chr18 14187327 . T G 104.27 PASS AF=0.242424;AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0258199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.859;QD=6.31952;RBI=0.031593;REFB=-0.00157045;REVB=0.0182057;RO=50;SAF=3;SAR=13;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453009;STB=0.782761;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00298465;OID=.;OPOS=14187327;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:50:50:16:16:0.242424:13:3:27:23:13:3:27:23 chr18 14524966 . T C 327.52 PASS AF=0.270115;AO=47;DP=174;FAO=47;FDP=174;FR=.;FRO=127;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=64;FSRR=63;FWDB=0.00966541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3729;QD=7.52921;RBI=0.0140229;REFB=0.00452163;REVB=0.0101598;RO=127;SAF=27;SAR=20;SRF=64;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087369;STB=0.551812;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.010573;OID=.;OPOS=14524966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:127:127:47:47:0.270115:20:27:64:63:20:27:64:63 chr18 14533105 . G C 267.53 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0154663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.698;QD=21.839;RBI=0.0175926;REFB=0.00321278;REVB=-0.00838399;RO=24;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134466;STB=0.574984;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-0.00222468;OID=.;OPOS=14533105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:11:14:17:7:11:14:17:7 chr18 14537949 . A G 310.86 PASS AF=0.366337;AO=36;DP=100;FAO=37;FDP=101;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00923303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.811;QD=12.3113;RBI=0.00997452;REFB=-0.00454267;REVB=-0.00377388;RO=57;SAF=16;SAR=20;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143374;STB=0.527168;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00888982;OID=.;OPOS=14537949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:57:64:36:37:0.366337:20:16:18:39:21:16:25:39 chr18 14542648 . C A 264.59 PASS AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0109697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.511;QD=21.167;RBI=0.0825582;REFB=-0.021286;REVB=0.0818262;RO=25;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216524;STB=0.520644;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0223057;OID=.;OPOS=14542648;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:25:25:24:25:0.5:10:14:14:11:10:15:14:11 chr18 14542890 . G C 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.114949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1265;QD=11.0196;RBI=0.115598;REFB=0.0149705;REVB=-0.0122344;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374671;STB=0.726563;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0177843;OID=.;OPOS=14542890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:2:6:2:4:2:6 chr18 14543057 . T G 238.2 PASS AF=0.3625;AO=25;DP=77;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00378252;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.269;QD=11.9099;RBI=0.00758993;REFB=-0.0201832;REVB=-0.00658024;RO=51;SAF=17;SAR=8;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910233;STB=0.508654;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.033909;OID=.;OPOS=14543057;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:80:51:51:25:29:0.3625:8:17:31:20:11:18:31:20 chr18 14543098 . C T 229.91 PASS AF=0.363636;AO=27;DP=76;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.00953414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.34;QD=11.9433;RBI=0.0131335;REFB=-0.00901879;REVB=-0.00903259;RO=49;SAF=17;SAR=10;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00361426;STB=0.507037;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0150439;OID=.;OPOS=14543098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:49:49:27:28:0.363636:10:17:31:18:10:18:31:18 chr18 14543139 . T C 881.3 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.1284;QD=56.8582;RBI=0.0533354;REFB=0;REVB=-0.0365289;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120078;OID=.;OPOS=14543139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:20:40:0:0:20:42:0:0 chr18 14752957 . G A 1149.94 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.321;QD=60.5231;RBI=0.0249995;REFB=0;REVB=-0.00656859;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.18566e-05;OID=.;OPOS=14752957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0 chr18 14759244 . G C 1120.41 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00505142;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.726;QD=60.5627;RBI=0.0298074;REFB=0;REVB=-0.0293762;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.40805e-05;OID=.;OPOS=14759244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:72:74:1:36:36:0:0:38:36:0:0 chr18 14779969 . C G 559.94 PASS AF=0.530612;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.000957713;FXX=0.019998;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.795;QD=22.8546;RBI=0.00909856;REFB=-0.0121385;REVB=0.00904802;RO=46;SAF=23;SAR=29;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309318;STB=0.51703;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0105283;OID=.;OPOS=14779969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:46:46:52:52:0.530612:29:23:22:24:29:23:22:24 chr18 14779986 . G A 59.22 PASS AF=0.121495;AO=13;DP=107;FAO=13;FDP=107;FR=.;FRO=94;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=-0.0120964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.947;QD=2.21373;RBI=0.0197096;REFB=8.51388e-05;REVB=-0.015561;RO=92;SAF=4;SAR=9;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189619;STB=0.63779;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00439818;OID=.;OPOS=14779986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:107:107:92:94:13:13:0.121495:9:4:42:50:9:4:43:51 chr18 14780019 . G T 60.38 PASS AF=0.12381;AO=13;DP=105;FAO=13;FDP=105;FR=.;FRO=92;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.00836439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.03;QD=2.3002;RBI=0.0207075;REFB=-0.00177938;REVB=-0.018943;RO=92;SAF=4;SAR=9;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202116;STB=0.645571;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0152818;OID=.;OPOS=14780019;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:105:105:92:92:13:13:0.12381:9:4:43:49:9:4:43:49 chr18 14780024 . T C 60.93 PASS AF=0.125;AO=13;DP=103;FAO=13;FDP=104;FR=.;FRO=91;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.0474697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.335;QD=2.34347;RBI=0.0526324;REFB=0.00209325;REVB=0.0227331;RO=90;SAF=4;SAR=9;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201799;STB=0.640643;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.0139896;OID=.;OPOS=14780024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:103:104:90:91:13:13:0.125:9:4:42:48:9:4:42:49 chr18 14780037 . C A 62.72 PASS AF=0.13;AO=13;DP=100;FAO=13;FDP=100;FR=.;FRO=87;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0354007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.578;QD=2.50874;RBI=0.0404093;REFB=-0.00275772;REVB=-0.0194859;RO=87;SAF=4;SAR=9;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181174;STB=0.629062;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0287205;OID=.;OPOS=14780037;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:100:100:87:87:13:13:0.13:9:4:39:48:9:4:39:48 chr18 14796214 . G T 270.61 PASS AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00212401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.546;QD=14.4326;RBI=0.00537478;REFB=-0.0104496;REVB=0.00493729;RO=44;SAF=19;SAR=12;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023776;STB=0.513505;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0116039;OID=.;OPOS=14796214;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:12:19:26:18:12:19:26:18 chr18 14848820 . C T 694.17 PASS AF=0.74026;AO=57;DP=78;FAO=57;FDP=77;FR=.;FRO=20;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.01324;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.325;QD=36.0608;RBI=0.0165228;REFB=-0.0213725;REVB=0.00988465;RO=13;SAF=32;SAR=25;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190775;STB=0.503004;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00582118;OID=.;OPOS=14848820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:13:20:57:57:0.74026:25:32:8:5:25:32:11:9 chr18 14848821 . G A 143.91 PASS AF=0.265823;AO=17;DP=75;FAO=21;FDP=79;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00770653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.49;QD=7.28666;RBI=0.0191257;REFB=-0.0167946;REVB=-0.0175044;RO=56;SAF=10;SAR=7;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658621;STB=0.514692;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.026693;OID=.;OPOS=14848821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:79:56:58:17:21:0.265823:7:10:30:26:9:12:32:26 chr18 14850375 . G A 191.54 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00563989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.874;QD=22.5343;RBI=0.00625978;REFB=-0.00825953;REVB=-0.00271597;RO=15;SAF=4;SAR=15;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193622;STB=0.60963;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00662872;OID=.;OPOS=14850375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:15:4:6:9:15:4:6:9 chr18 18529872 . A G 69.17 PASS AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0307118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.567;QD=6.14842;RBI=0.0307166;REFB=-0.00167093;REVB=-0.000543419;RO=35;SAF=8;SAR=2;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.527865;STB=0.832716;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00992892;OID=.;OPOS=18529872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:2:8:12:23:2:8:12:23 chr18 18529880 . G A 90.08 PASS AF=0.255319;AO=12;DP=47;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0319163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.616;QD=7.66678;RBI=0.0523717;REFB=-0.0069335;REVB=-0.0415228;RO=35;SAF=8;SAR=4;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374269;STB=0.729373;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0217189;OID=.;OPOS=18529880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:47:47:35:35:12:12:0.255319:4:8:12:23:4:8:12:23 chr18 19034556 . T C 2364.07 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.38;QD=63.8939;RBI=0.058105;REFB=0;REVB=0.00290004;RO=0;SAF=81;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94291e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74686e-05;OID=.;OPOS=19034556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:148:0:0:147:148:1:66:81:0:0:66:82:0:0 chr18 19048751 . T G 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0370403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.383;QD=15.6259;RBI=0.0370464;REFB=-0.0222892;REVB=0.000673532;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00559472;STB=0.503222;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0194505;OID=.;OPOS=19048751;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:15:8:6:11:15:8 chr18 19079853 . A G 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.821;QD=60.0306;RBI=0.00896405;REFB=0;REVB=0.00496696;RO=0;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21422e-05;OID=.;OPOS=19079853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:43:29:0:0:43:29:0:0 chr18 19100758 . A ATCT 178.42 PASS AF=0.403846;AO=20;DP=55;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=-0.0205767;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=3;MLLD=159.97;QD=13.7246;RBI=0.0319239;REFB=-0.0222778;REVB=-0.0244077;RO=34;SAF=6;SAR=14;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475297;STB=0.799754;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.038836;OID=.;OPOS=19100759;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.403846:20:55:21:52:31:6:15:26:5:99:34:6:14:26:8 chr18 19119974 . GATATATATATATATATAT GATATATATATATATAT,GATATATATATATATATAC 302.24 PASS AF=0.522727,0.113636;AO=16,5;DP=43;FAO=23,5;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=11,1;FSAR=12,4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.158877,-0.0447441;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=59.4295,77.8269;QD=27.4765;RBI=0.158877,0.0478415;REFB=-0.109744,-0.0511419;REVB=-0.000357068,0.0169343;RO=17;SAF=8,1;SAR=8,4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0796379,-0.443561;STB=0.534491,0.783147;STBP=0.632,0.164;TYPE=del,snp;VARB=0.16187,-0.00131402;OID=.,.;OPOS=19119975,19119992;OREF=AT,T;OALT=-,C;OMAPALT=GATATATATATATATAT,GATATATATATATATATAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.522727,0.113636:16,5:43:23,5:44:16:11,1:12,4:9:7:99:17:8,1:8,4:10:7 chr18 19120652 . T C 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0361825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.281;QD=13.631;RBI=0.0364235;REFB=0.00779688;REVB=-0.00418282;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645053;STB=0.538364;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.0105862;OID=.;OPOS=19120652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:4:5:5:3:4:5 chr18 19153494 . C T 885.42 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2653;QD=58.0604;RBI=0.0410527;REFB=0;REVB=-0.0173776;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000355141;OID=.;OPOS=19153494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0 chr18 19154143 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.004;QD=48.7373;RBI=0.023819;REFB=0;REVB=-0.0188732;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000388682;OID=.;OPOS=19154143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0 chr18 19373962 . T TATG 1076.11 PASS AF=1;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00941191;FXX=0.0657808;HRUN=0;LEN=3;MLLD=234.343;QD=60.6257;RBI=0.01106;REFB=0;REVB=-0.00580851;RO=2;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210088;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=5.71472e-06;OID=.;OPOS=19373963;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=TATG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:71:76:71:71:0:27:44:0:0:6:2:27:44:0:2 chr18 19450386 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179835;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=75.3305;QD=51.1832;RBI=0.0183696;REFB=0;REVB=0.0037468;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552771;OID=.;OPOS=19450386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr18 19508949 . G A 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.833;QD=56.7066;RBI=0.028068;REFB=0;REVB=0.00738357;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144077;OID=.;OPOS=19508949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr18 19710668 . A C 354.02 PASS AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.00343147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1225;QD=29.5017;RBI=0.0482407;REFB=0.0393881;REVB=0.0481185;RO=18;SAF=12;SAR=18;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289476;STB=0.658435;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.023739;OID=.;OPOS=19710668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:18:12:15:3:18:12:15:3 chr18 19840623 . A G 972.62 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0924713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7725;QD=58.9465;RBI=0.0933669;REFB=0;REVB=-0.0129013;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474131;OID=.;OPOS=19840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:43:22:0:0:44:22:0:0 chr18 19995753 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.363;QD=61.684;RBI=0.014679;REFB=0;REVB=-0.00613127;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.2222e-05;OID=.;OPOS=19995753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr18 20838286 . G T 176.6 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.106867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.941;QD=14.1281;RBI=0.108172;REFB=-0.00263899;REVB=-0.0167501;RO=31;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00835411;STB=0.504849;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.000275446;OID=.;OPOS=20838286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:13:6:10:21:13:6:10:21 chr18 20953720 . G A 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0871494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1635;QD=14.665;RBI=0.102976;REFB=-0.0214531;REVB=0.0548555;RO=21;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125611;STB=0.572936;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0371881;OID=.;OPOS=20953720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:9:6:11:10:9:6:11:10 chr18 20965034 . G A 55.49 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.03115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.622;QD=10.0886;RBI=0.0368562;REFB=-0.0204417;REVB=-0.0196992;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274631;STB=0.666263;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0241548;OID=.;OPOS=20965034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:9:5:5:3:9:5 chr18 21017836 . T C 655.47 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.595;QD=60.9736;RBI=0.0201692;REFB=0;REVB=0.00920681;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217925;OID=.;OPOS=21017836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:28:13:0:0:28:15:0:0 chr18 21100240 . C T 1599.36 PASS AF=0.981818;AO=108;DP=111;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0256467;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.389;QD=58.1586;RBI=0.025802;REFB=-0.0566497;REVB=-0.00282704;RO=1;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797772;STB=0.500849;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000273616;OID=.;OPOS=21100240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:111:110:1:2:108:108:0.981818:59:49:0:1:59:49:1:1 chr18 21109250 . T C 598.15 PASS AF=1;AO=15;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122546;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.839;QD=61.3491;RBI=0.125546;REFB=0;REVB=0.0272816;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391964;OID=.;OPOS=21109250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:39:0:0:15:39:1:11:4:0:0:17:22:0:0 chr18 21111853 . T C 395.96 PASS AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0171769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.682;QD=20.3055;RBI=0.0255445;REFB=-0.0069101;REVB=0.0189071;RO=38;SAF=17;SAR=23;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200356;STB=0.511106;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00684517;OID=.;OPOS=21111853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:23:17:17:21:23:17:17:21 chr18 21119777 . G A 391.65 PASS AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00111003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.608;QD=22.0646;RBI=0.00678837;REFB=0.00675173;REVB=0.006697;RO=32;SAF=19;SAR=20;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150729;STB=0.508311;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=-0.00535646;OID=.;OPOS=21119777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:20:19:15:17:20:19:15:17 chr18 21120444 . T C 186.56 PASS AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0329235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.039;QD=27.6383;RBI=0.0339816;REFB=-0.053275;REVB=0.00841402;RO=8;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302969;STB=0.645008;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0195892;OID=.;OPOS=21120444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:8:9:18:18:0.666667:10:8:8:0:10:8:8:1 chr18 21124945 . C G 747.06 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.395;QD=63.5797;RBI=0.019443;REFB=0;REVB=0.00109864;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202614;OID=.;OPOS=21124945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0 chr18 21140432 . T C 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0214615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.543;QD=15.8391;RBI=0.0259718;REFB=-0.0184716;REVB=-0.0146266;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566609;STB=0.53325;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0115496;OID=.;OPOS=21140432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:4:4:3:4:4:4:3:4 chr18 21413869 . T C 878.04 PASS AF=0.459184;AO=82;DP=189;FAO=90;FDP=196;FR=.;FRO=106;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=-0.00698246;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.062;QD=17.9192;RBI=0.0128024;REFB=-0.0314093;REVB=0.0107306;RO=107;SAF=48;SAR=34;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148531;STB=0.554537;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0365171;OID=.;OPOS=21413869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:196:107:106:82:90:0.459184:34:48:47:60:41:49:47:59 chr18 21437931 . G C 729.26 PASS AF=0.514493;AO=71;DP=138;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=0.00466071;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.642;QD=21.1378;RBI=0.0049129;REFB=-0.0183346;REVB=-0.00155381;RO=67;SAF=41;SAR=30;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242617;STB=0.63301;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0180978;OID=.;OPOS=21437931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:67:67:71:71:0.514493:30:41:20:47:30:41:20:47 chr18 21441717 . C T 163.64 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0398471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.4707;QD=20.4553;RBI=0.0449652;REFB=-0.020314;REVB=-0.0208345;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806589;STB=0.545403;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00927196;OID=.;OPOS=21441717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:4:11:11:6:4:11 chr18 21481233 . C G 196.93 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0159871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.08;QD=12.9137;RBI=0.0255116;REFB=-0.0343796;REVB=0.019881;RO=37;SAF=11;SAR=13;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866966;STB=0.549754;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0520645;OID=.;OPOS=21481233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:13:11:20:17:13:11:20:17 chr18 21511034 . C A 442.89 PASS AF=0.45;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=0.0181202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9372;QD=17.7155;RBI=0.0181336;REFB=0.0222591;REVB=-0.000699264;RO=55;SAF=29;SAR=16;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108755;STB=0.50608;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0272296;OID=.;OPOS=21511034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:55:55:45:45:0.45:16:29:36:19:16:29:36:19 chr18 21511089 . A G 1343.15 PASS AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608418;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.409;QD=62.4721;RBI=0.0610844;REFB=0;REVB=-0.00543848;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82572e-05;OID=.;OPOS=21511089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:32:54:0:0:32:54:0:0 chr18 21513768 . C T 536.44 PASS AF=0.426471;AO=58;DP=137;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.0178258;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4719;QD=15.7778;RBI=0.0197546;REFB=-0.000289692;REVB=0.00851383;RO=79;SAF=22;SAR=36;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146275;STB=0.585412;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.000281631;OID=.;OPOS=21513768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:79:78:58:58:0.426471:36:22:41:38:36:22:41:37 chr18 21710321 . C T 2140.89 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000562631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.938;QD=62.9675;RBI=0.0255509;REFB=0;REVB=-0.0255447;RO=0;SAF=55;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78419e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.48858e-05;OID=.;OPOS=21710321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:80:55:0:0:80:56:0:0 chr18 21736933 . T G 369.5 PASS AF=0.448276;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0135694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.755;QD=16.9884;RBI=0.0137402;REFB=0.000620735;REVB=-0.00215987;RO=48;SAF=26;SAR=13;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672509;STB=0.537795;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.00087935;OID=.;OPOS=21736933;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:48:39:39:0.448276:13:26:29:19:13:26:29:19 chr18 21739725 . T C 244.36 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0154308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.02;QD=17.4545;RBI=0.0156791;REFB=0.0032449;REVB=0.00277938;RO=29;SAF=17;SAR=10;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260342;STB=0.646027;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00567093;OID=.;OPOS=21739725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:10:17:10:19:10:17:10:19 chr18 21759055 . G C 1513.12 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.304;QD=59.9257;RBI=0.0385953;REFB=0;REVB=0.0164106;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.561e-05;OID=.;OPOS=21759055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:49:52:0:0:49:52:0:0 chr18 21759190 . G C 255.8 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0751342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.789;QD=51.1604;RBI=0.0959199;REFB=0;REVB=0.0596279;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000455299;OID=.;OPOS=21759190;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr18 21776167 . GA AG,G 66.87 PASS AF=0,0.619048;AO=3,9;DP=22;FAO=0,13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=0,5;FSAR=0,8;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00913128,0.142601;FXX=0.0454339;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=71.3982,14.387;QD=12.7374;RBI=0.248237,0.18149;REFB=-0.0188422,-0.117233;REVB=-0.248069,-0.112266;RO=7;SAF=0,5;SAR=3,4;SRF=7;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0.339901;SSSB=-0.812474,-0.364502;STB=0.5,0.721916;STBP=1,0.019;TYPE=mnp,del;VARB=0.109799,0.0402517;OID=.,.;OPOS=21776167,21776168;OREF=GA,A;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:50:22:21:7:8:3,9:0,13:0,0.619048:3,4:0,5:7:0:0,8:0,5:8:0 chr18 22008810 . A G 340.79 PASS AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.00630254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.195;QD=15.6684;RBI=0.00639392;REFB=0.00166378;REVB=0.00107711;RO=49;SAF=27;SAR=10;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160839;STB=0.599084;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00172988;OID=.;OPOS=22008810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:49:50:37:37:0.425287:10:27:29:20:10:27:29:21 chr18 22020543 . C G 1453.48 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.168;QD=63.1946;RBI=0.0137729;REFB=0;REVB=0.000873022;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.61929e-06;OID=.;OPOS=22020543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:51:40:0:0:51:41:0:0 chr18 22775185 . C T 253.11 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0168206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.762;QD=15.1111;RBI=0.0332897;REFB=0.000230065;REVB=-0.0287276;RO=37;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126227;STB=0.578893;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00091628;OID=.;OPOS=22775185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:38:29:29:0.432836:17:12:20:17:17:12:21:17 chr18 22805996 . C T 141.96 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00652286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.956;QD=13.8494;RBI=0.0129847;REFB=-0.01431;REVB=-0.0112274;RO=25;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276392;STB=0.516109;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0355837;OID=.;OPOS=22805996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:6:10:15:10:6:10:15:10 chr18 23597811 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.816;QD=57.7124;RBI=0.0436742;REFB=0;REVB=0.0429926;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130189;OID=.;OPOS=23597811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0 chr18 23873463 . T C 2835.11 PASS AF=1;AO=180;DP=182;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191336;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.11;QD=63.0024;RBI=0.0543336;REFB=0;REVB=0.0508532;RO=0;SAF=81;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.27191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173407;OID=.;OPOS=23873463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:182:180:0:0:180:180:1:99:81:0:0:99:81:0:0 chr18 23879134 . T C 270.86 PASS AF=0.88;AO=23;DP=26;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00381933;FXX=0.0384468;HRUN=10;LEN=1;MLLD=377.858;QD=43.3372;RBI=0.00392618;REFB=0.0350715;REVB=-0.000909721;RO=2;SAF=18;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589862;STB=0.529384;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.00142362;OID=.;OPOS=23879134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:26:25:2:3:23:22:0.88:5:18:1:1:4:18:2:1 chr18 24035399 . A G 555.04 PASS AF=1;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00412464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1827;QD=60.0038;RBI=0.039554;REFB=0;REVB=-0.0393384;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000563334;OID=.;OPOS=24035399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:35:37:1:18:17:0:0:20:17:0:0 chr18 24269386 . G A 605.15 PASS AF=0.488189;AO=62;DP=126;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=-0.0184602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.155;QD=19.0597;RBI=0.0450051;REFB=-0.0287272;REVB=-0.0410448;RO=63;SAF=18;SAR=44;SRF=20;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295954;STB=0.519993;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0304612;OID=.;OPOS=24269386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:63:65:62:62:0.488189:44:18:20:43:44:18:21:44 chr18 24445692 . C T 741.72 PASS AF=0.537879;AO=70;DP=133;FAO=71;FDP=132;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.0324709;FXX=0.0149243;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.101;QD=22.4765;RBI=0.0345379;REFB=-0.0136566;REVB=0.0117689;RO=60;SAF=22;SAR=48;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223408;STB=0.613283;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00960559;OID=.;OPOS=24445692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:60:61:70:71:0.537879:48:22:34:26:48:23:34:27 chr18 25531125 . CTTTTTT CTTTTCT,CTTTTTC,CTT 220.78 PASS AF=0.304348,0.173913,0.521739;AO=2,3,4;DP=21;FAO=7,4,12;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,5;FSAR=7,4,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026003,0.0280731,0.16532;FXX=0.0416493;HRUN=15,15,15;LEN=1,1,4;MLLD=118.95,121.162,20.6619;QD=38.397;RBI=0.041969,0.0365584,0.170097;REFB=0,0,0;REVB=-0.032943,-0.0234184,-0.0400287;RO=0;SAF=0,0,0;SAR=2,3,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,del;VARB=0.0261889,-0.00694915,0.0220424;OID=.,.,.;OPOS=25531130,25531131,25531126;OREF=T,T,TTTT;OALT=C,C,-;OMAPALT=CTTTTCT,CTTTTTC,CTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.304348,0.173913,0.521739:2,3,4:21:7,4,12:23:0:0,0,5:7,4,7:0:0:42:0:0,0,0:2,3,4:0:0 chr18 25543387 . G A 421.84 PASS AF=0.443396;AO=46;DP=105;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0138954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.332;QD=15.9184;RBI=0.0138976;REFB=-0.021265;REVB=-0.000246372;RO=59;SAF=23;SAR=23;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594773;STB=0.538877;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0223534;OID=.;OPOS=25543387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:59:59:46:47:0.443396:23:23:33:26:24:23:33:26 chr18 25565082 . A G 2392.0 PASS AF=1;AO=155;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.688;QD=60.9427;RBI=0.0336301;REFB=0;REVB=0.0112389;RO=1;SAF=90;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525694;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56167e-05;OID=.;OPOS=25565082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:156:157:1:0:155:157:1:65:90:1:0:65:92:0:0 chr18 25570228 . G C 2668.87 PASS AF=0.983051;AO=174;DP=177;FAO=174;FDP=177;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00313116;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=271.971;QD=60.3134;RBI=0.0158519;REFB=-0.0302521;REVB=0.0155396;RO=2;SAF=87;SAR=87;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108156;STB=0.502825;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=4.16403e-05;OID=.;OPOS=25570228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:177:177:2:3:174:174:0.983051:87:87:2:0:87:87:2:1 chr18 25616451 . A T 156.0 PASS AF=0.271605;AO=22;DP=81;FAO=22;FDP=81;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.0106939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.017;QD=7.70351;RBI=0.0116741;REFB=-0.00442092;REVB=-0.00468243;RO=59;SAF=12;SAR=10;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856752;STB=0.551523;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0128003;OID=.;OPOS=25616451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:59:59:22:22:0.271605:10:12:28:31:10:12:28:31 chr18 28570025 . G T 1531.98 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6165;QD=63.1743;RBI=0.0180484;REFB=0;REVB=0.00702663;RO=0;SAF=61;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20571e-05;OID=.;OPOS=28570025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:35:61:0:0:35:62:0:0 chr18 28586964 . A G 2235.49 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00389343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.338;QD=63.4181;RBI=0.0207366;REFB=0;REVB=0.0203678;RO=0;SAF=76;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.52843e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75921e-05;OID=.;OPOS=28586964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:65:76:0:0:65:76:0:0 chr18 28610988 . C T 1399.22 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0112589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.679;QD=61.5042;RBI=0.036522;REFB=0.0166712;REVB=-0.0347433;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.506328;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.00153772;OID=.;OPOS=28610988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:0:1:90:90:0.989011:39:51:0:0:39:51:0:1 chr18 28611061 . A T 1545.19 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213645;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.704;QD=64.3828;RBI=0.0402659;REFB=0;REVB=0.0341306;RO=0;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00201376;OID=.;OPOS=28611061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:36:60:0:0:36:60:0:0 chr18 28611139 . A C 775.28 PASS AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.021448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.103;QD=53.4672;RBI=0.026997;REFB=-0.17304;REVB=0.0163957;RO=1;SAF=25;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184862;STB=0.501867;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00256753;OID=.;OPOS=28611139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:58:58:1:2:56:56:0.965517:31:25:1:0:31:25:1:1 chr18 28720072 . G A 1093.68 PASS AF=0.609756;AO=100;DP=164;FAO=100;FDP=164;FR=.;FRO=64;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.00266346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.922;QD=26.675;RBI=0.0136289;REFB=-0.0149359;REVB=0.0133661;RO=64;SAF=42;SAR=58;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129155;STB=0.506992;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00961407;OID=.;OPOS=28720072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:64:64:100:100:0.609756:58:42:28:36:58:42:28:36 chr18 28722039 . G A 489.18 PASS AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.04555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9614;QD=18.2871;RBI=0.0500109;REFB=0.00944958;REVB=0.0206469;RO=55;SAF=28;SAR=24;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00652414;STB=0.503617;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0127216;OID=.;OPOS=28722039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:55:55:52:52:0.485981:24:28:30:25:24:28:30:25 chr18 28722103 . T C 477.48 PASS AF=0.472222;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.00786165;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.796;QD=17.6844;RBI=0.0265153;REFB=-0.0164661;REVB=0.025323;RO=54;SAF=17;SAR=34;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229248;STB=0.624154;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0236577;OID=.;OPOS=28722103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:54:57:51:51:0.472222:34:17:31:23:34:17:32:25 chr18 28734749 . A G 531.05 PASS AF=0.504587;AO=55;DP=111;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0057847;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.268;QD=19.4879;RBI=0.00999735;REFB=-0.0181703;REVB=-0.00815379;RO=53;SAF=36;SAR=19;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490032;STB=0.533225;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0184448;OID=.;OPOS=28734749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:109:53:54:55:55:0.504587:19:36:32:21:19:36:32:22 chr18 28968371 . G A 706.65 PASS AF=0.452381;AO=76;DP=168;FAO=76;FDP=168;FR=.;FRO=92;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=52;FWDB=-0.0150972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0043;QD=16.8249;RBI=0.0678344;REFB=0.0129486;REVB=0.0661331;RO=91;SAF=38;SAR=38;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701321;STB=0.535705;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0153717;OID=.;OPOS=28968371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:91:92:76:76:0.452381:38:38:39:52:38:38:40:52 chr18 28968959 . C T 1400.66 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0290688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.528;QD=61.5675;RBI=0.0437341;REFB=-0.158225;REVB=0.0326753;RO=1;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977254;STB=0.505153;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000920234;OID=.;OPOS=28968959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:48:42:0:1:48:42:0:1 chr18 28986333 . A C 773.79 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449389;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.428;QD=57.3181;RBI=0.0474154;REFB=0;REVB=-0.0151233;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.21204e-05;OID=.;OPOS=28986333;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0 chr18 28993183 . A G 135.95 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0216494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.444;QD=17.5418;RBI=0.0414958;REFB=0.013087;REVB=0.0354006;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174999;STB=0.584302;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.0113849;OID=.;OPOS=28993183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:16:15:15:0.483871:9:6:9:6:9:6:9:7 chr18 28993501 . C A 162.33 PASS AF=0.882353;AO=16;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0596781;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.9225;QD=38.1948;RBI=0.0863298;REFB=-0.140509;REVB=-0.0623807;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.545396;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0240988;OID=.;OPOS=28993501;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:17:17:0:2:16:15:0.882353:11:5:0:0:10:5:0:2 chr18 29055957 . A G 1828.98 PASS AF=0.991736;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0170184;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8538;QD=60.4622;RBI=0.0452998;REFB=-0.093398;REVB=0.0419815;RO=0;SAF=63;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000959023;OID=.;OPOS=29055957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:121:0:1:120:120:0.991736:57:63:0:0:57:63:0:1 chr18 29104698 . C T 154.22 PASS AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0116906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.278;QD=10.6361;RBI=0.013;REFB=-0.000750795;REVB=0.00568613;RO=38;SAF=13;SAR=7;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200833;STB=0.617838;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00173093;OID=.;OPOS=29104698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:38:38:20:20:0.344828:7:13:18:20:7:13:18:20 chr18 29126670 . T C 137.81 PASS AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0256864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.073;QD=10.0228;RBI=0.0271612;REFB=-0.00906042;REVB=0.00882826;RO=37;SAF=7;SAR=11;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289162;STB=0.66976;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0224416;OID=.;OPOS=29126670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:11:7:24:13:11:7:24:13 chr18 29339910 . G T 357.53 PASS AF=0.875;AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0285135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.071;QD=44.6912;RBI=0.0285191;REFB=-0.104636;REVB=-0.000564643;RO=1;SAF=6;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713682;STB=0.624902;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00381389;OID=.;OPOS=29339910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:32:32:1:4:28:28:0.875:22:6:1:0:22:6:4:0 chr18 29410479 . T A 185.23 PASS AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0162728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.521;QD=10.2904;RBI=0.0389481;REFB=-0.00466033;REVB=0.0353858;RO=48;SAF=10;SAR=14;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957716;STB=0.556028;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.011403;OID=.;OPOS=29410479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:48:48:24:24:0.333333:14:10:24:24:14:10:24:24 chr18 29497573 . A G 1400.28 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0165175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.187;QD=61.5509;RBI=0.0283821;REFB=-0.0913592;REVB=0.0230806;RO=1;SAF=59;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00796664;STB=0.504201;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00125348;OID=.;OPOS=29497573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:31:59:1:0:31:59:1:0 chr18 29598847 . C T 243.25 PASS AF=0.376623;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.00965467;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.931;QD=12.6363;RBI=0.00966618;REFB=-0.0137342;REVB=-0.000471568;RO=48;SAF=12;SAR=17;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247971;STB=0.641696;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0259687;OID=.;OPOS=29598847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:48:48:29:29:0.376623:17:12:31:17:17:12:31:17 chr18 29710880 . A AAG,G 879.01 PASS AF=0.88,0;AO=62,3;DP=77;FAO=66,0;FDP=75;FR=.;FRO=9;FSAF=27,0;FSAR=39,0;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0207898,0.0213815;FXX=0.0384566;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=334.938,198.925;QD=46.8806;RBI=0.0208269,0.02192;REFB=0.00962335,0.0102981;REVB=0.0012425,0.0048288;RO=10;SAF=26,0;SAR=36,3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.032128,-0.597037;STB=0.509431,0.5;STBP=0.664,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00107033,0;OID=.,.;OPOS=29710881,29710880;OREF=-,A;OALT=AG,G;OMAPALT=AAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:77:75:10:9:62,3:66,0:0.88,0:36,3:26,0:3:7:39,0:27,0:3:6 chr18 29795076 . T C 1741.6 PASS AF=1;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000713256;FXX=0.0256388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.791;QD=61.1087;RBI=0.0227179;REFB=0;REVB=0.0227067;RO=0;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63462e-05;OID=.;OPOS=29795076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:114:0:0:114:114:1:55:59:0:0:55:59:0:0 chr18 29795101 . T C 1732.42 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.09;QD=60.7866;RBI=0.0765677;REFB=0;REVB=0.0758198;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06784e-05;OID=.;OPOS=29795101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:114:0:0:107:114:1:53:54:0:0:60:54:0:0 chr18 30349691 . C T 318.64 PASS AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00999202;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.819;QD=15.3563;RBI=0.0284843;REFB=-0.000533062;REVB=-0.0266742;RO=45;SAF=25;SAR=10;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17647;STB=0.610621;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.000121288;OID=.;OPOS=30349691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:45:48:35:35:0.421687:10:25:25:20:10:25:26:22 chr18 30804756 . C T 1314.56 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0683462;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8782;QD=61.8616;RBI=0.0931055;REFB=0;REVB=-0.0632253;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00106177;OID=.;OPOS=30804756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:37:47:0:0:37:48:0:0 chr18 30846895 . A T 1501.57 PASS AF=1;AO=93;DP=95;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00901207;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.421;QD=59.4682;RBI=0.0171589;REFB=0;REVB=-0.0146017;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12691e-05;OID=.;OPOS=30846895;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:101:0:0:93:101:1:46:47:0:0:48:53:0:0 chr18 30908047 . A T 74.2 PASS AF=0.434783;AO=5;DP=19;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0027424;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.193;QD=12.9041;RBI=0.0222467;REFB=0.0065601;REVB=0.022077;RO=10;SAF=4;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.69532;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.00564192;OID=.;OPOS=30908047;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:19:23:10:13:5:10:0.434783:1:4:8:2:5:5:11:2 chr18 31320229 . A G 982.0 PASS AF=0.985294;AO=65;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0528882;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.137;QD=57.7644;RBI=0.0782732;REFB=-0.042897;REVB=0.0577022;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.506022;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00133607;OID=.;OPOS=31320229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:69:68:0:1:65:67:0.985294:41:24:0:0:41:26:0:1 chr18 31324934 . A G 785.0 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.247;QD=57.0912;RBI=0.0246431;REFB=0;REVB=0.00867989;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102121;OID=.;OPOS=31324934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:35:20:0:0:35:20:0:0 chr18 32721078 . C T 406.15 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=-0.00280611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6979;QD=17.6588;RBI=0.0215635;REFB=-0.00940764;REVB=0.0213801;RO=50;SAF=18;SAR=24;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172917;STB=0.596048;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0143362;OID=.;OPOS=32721078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:24:18:13:37:24:18:13:37 chr18 33647254 . A C 690.45 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.363;QD=62.7678;RBI=0.0474707;REFB=0;REVB=-0.0235604;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107769;OID=.;OPOS=33647254;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:28:14:0:0:28:16:0:0 chr18 33694120 . G A 620.36 PASS AF=0.477612;AO=63;DP=133;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.0183955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.744;QD=18.5181;RBI=0.024722;REFB=-0.0126521;REVB=-0.0165161;RO=69;SAF=36;SAR=27;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611812;STB=0.525416;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.013578;OID=.;OPOS=33694120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:69:70:63:64:0.477612:27:36:35:34:28:36:36:34 chr18 33702162 . G A 381.7 PASS AF=0.513158;AO=38;DP=75;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0197664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.642;QD=20.0892;RBI=0.0200326;REFB=-0.0129574;REVB=-0.00325541;RO=34;SAF=23;SAR=15;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190119;STB=0.602365;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00802428;OID=.;OPOS=33702162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:34:37:38:39:0.513158:15:23:13:21:16:23:14:23 chr18 33706614 . C G 1669.53 PASS AF=1;AO=107;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113056;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.898;QD=60.7102;RBI=0.0504816;REFB=0;REVB=0.0491994;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459065;OID=.;OPOS=33706614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:110:0:0:107:110:1:45:62:0:0:48:62:0:0 chr18 33713287 . T A 389.71 PASS AF=0.460674;AO=40;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.00398296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3575;QD=17.5151;RBI=0.0289798;REFB=-0.0294401;REVB=-0.0287048;RO=48;SAF=31;SAR=9;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268721;STB=0.635012;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0485787;OID=.;OPOS=33713287;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:48:48:40:41:0.460674:9:31:26:22:10:31:26:22 chr18 33718326 . A C 313.23 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0119421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.561;QD=19.5769;RBI=0.0131406;REFB=-0.0101508;REVB=-0.00548285;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552866;STB=0.530729;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0100954;OID=.;OPOS=33718326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:16:17:14:17:16:17:14:17 chr18 33719434 . C T 378.05 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0181158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9476;QD=19.1418;RBI=0.0196005;REFB=-0.0203695;REVB=0.00748306;RO=40;SAF=16;SAR=23;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334;STB=0.518559;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0275115;OID=.;OPOS=33719434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:23:16:15:25:23:16:15:25 chr18 33725931 . G A 349.81 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00308475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.853;QD=17.7121;RBI=0.0130233;REFB=-0.012248;REVB=-0.0126527;RO=41;SAF=23;SAR=14;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151442;STB=0.591333;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0184216;OID=.;OPOS=33725931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:42:37:37:0.468354:14:23:19:22:14:23:19:23 chr18 33750046 . C T 552.93 PASS AF=0.413793;AO=60;DP=145;FAO=60;FDP=145;FR=.;FRO=85;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=24;FWDB=-0.00180471;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2052;QD=15.2532;RBI=0.0661653;REFB=-0.0313926;REVB=-0.0661407;RO=85;SAF=41;SAR=19;SRF=61;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421777;STB=0.523635;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0434652;OID=.;OPOS=33750046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:85:85:60:60:0.413793:19:41:61:24:19:41:61:24 chr18 33754507 . A G 354.28 PASS AF=0.647059;AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.000737987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9481;QD=27.7866;RBI=0.022855;REFB=0.0350119;REVB=0.0228431;RO=18;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10082;STB=0.555127;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0201246;OID=.;OPOS=33754507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:18:18:33:33:0.647059:18:15:11:7:18:15:11:7 chr18 33779821 . C A 1156.93 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101714;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.247;QD=60.8911;RBI=0.010192;REFB=0;REVB=0.000647822;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60961e-05;OID=.;OPOS=33779821;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0 chr18 33779855 . C T 296.71 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00639636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.623;QD=15.6161;RBI=0.0415143;REFB=0.00290875;REVB=0.0410186;RO=43;SAF=23;SAR=10;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287077;STB=0.66245;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00309928;OID=.;OPOS=33779855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:10:23:18:25:10:23:18:25 chr18 33779896 . A G 990.65 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.278;QD=59.1432;RBI=0.0287386;REFB=0;REVB=-0.00617583;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34606e-05;OID=.;OPOS=33779896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0 chr18 33780020 . A G 653.77 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160369;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0599;QD=62.2636;RBI=0.0167435;REFB=0;REVB=0.00481252;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00857323;OID=.;OPOS=33780020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:22:20:0:0 chr18 33785093 . G A 382.6 PASS AF=0.506494;AO=38;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00851883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.04;QD=19.8755;RBI=0.00882166;REFB=-0.00994095;REVB=-0.00229157;RO=37;SAF=20;SAR=18;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593407;STB=0.532252;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0113703;OID=.;OPOS=33785093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:37:38:38:39:0.506494:18:20:17:20:19:20:17:21 chr18 33785185 . A G 704.95 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00423521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.468;QD=58.7454;RBI=0.00478676;REFB=0.00023217;REVB=0.00223071;RO=2;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375754;STB=0.519991;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-3.3937e-05;OID=.;OPOS=33785185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:48:48:2:2:46:46:0.958333:24:22:0:2:24:22:0:2 chr18 33831189 . C A 737.64 PASS AF=0.57377;AO=69;DP=119;FAO=70;FDP=122;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.000991938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3152;QD=24.1849;RBI=0.0345062;REFB=-0.0165749;REVB=-0.034492;RO=50;SAF=26;SAR=43;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00261449;STB=0.509179;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0175327;OID=.;OPOS=33831189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:122:50:52:69:70:0.57377:43:26:19:31:43:27:19:33 chr18 34398914 . C T 251.64 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00116708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3943;QD=20.5416;RBI=0.00994666;REFB=-0.00317593;REVB=-0.00987795;RO=25;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216524;STB=0.512185;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00250246;OID=.;OPOS=34398914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:10:14:14:11:10:14:14:11 chr18 34824547 . T G 228.58 PASS AF=0.320388;AO=30;DP=95;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.0207339;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=46.8604;QD=8.87679;RBI=0.0667944;REFB=-0.0117305;REVB=-0.0634948;RO=65;SAF=21;SAR=9;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148382;STB=0.563164;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0431194;OID=.;OPOS=34824547;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:103:65:70:30:33:0.320388:9:21:38:27:10:23:43:27 chr18 34850846 . G A 159.58 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0348787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.375;QD=17.7313;RBI=0.0382114;REFB=-0.0134336;REVB=0.0156074;RO=19;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792681;STB=0.545399;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0168956;OID=.;OPOS=34850846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:5:12:12:7:5:12:12:7 chr18 39761310 . A G 800.95 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0067;QD=57.2104;RBI=0.0451974;REFB=0;REVB=0.023331;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361016;OID=.;OPOS=39761310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:37:18:0:0:37:19:0:0 chr18 39761342 . C T 620.37 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0180586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.23;QD=59.0832;RBI=0.0182091;REFB=-0.13963;REVB=0.00233638;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509086;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.000389361;OID=.;OPOS=39761342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:42:42:0:1:41:41:0.97619:27:14:0:0:27:14:0:1 chr18 40323497 . G T 213.91 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.6;QD=47.5346;RBI=0.0179839;REFB=0;REVB=-0.0177093;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.2666e-05;OID=.;OPOS=40323497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:4:13:0:0:4:14:0:0 chr18 42456653 . G A 266.13 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.194761;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.271;QD=15.2074;RBI=0.194776;REFB=6.36078e-05;REVB=0.00241059;RO=40;SAF=1;SAR=29;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.597578;STB=0.856793;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000620433;OID=.;OPOS=42456653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:40:40:30:30:0.428571:29:1:11:29:29:1:11:29 chr18 42456670 . C CTCTT,T 317.83 PASS AF=0.446154,0.0769231;AO=29,5;DP=68;FAO=29,5;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=4,0;FSAR=25,5;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00649907,-0.00449923;FXX=0.0714184;HRUN=0,1;LEN=4,1;MLLD=231.816,104.558;QD=19.5584;RBI=0.00769542,0.00989461;REFB=-0.0225591,-0.0100308;REVB=0.00412086,-0.00881251;RO=34;SAF=4,0;SAR=25,5;SRF=9;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.208102,-0.559147;STB=0.633422,0.99701;STBP=0.112,0.085;TYPE=ins,snp;VARB=0.0214731,0.0239309;OID=.,.;OPOS=42456671,42456670;OREF=-,C;OALT=TCTT,T;OMAPALT=CTCTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:65:34:31:29,5:29,5:0.446154,0.0769231:25,5:4,0:9:25:25,5:4,0:9:22 chr18 42532606 . G A 492.66 PASS AF=0.457627;AO=53;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0099646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.049;QD=16.7004;RBI=0.0114411;REFB=-0.00817764;REVB=-0.00562196;RO=63;SAF=21;SAR=32;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798237;STB=0.54253;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.010895;OID=.;OPOS=42532606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:63:64:53:54:0.457627:32:21:30:33:32:22:31:33 chr18 42532693 . C A 364.32 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.000774884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.336;QD=21.1199;RBI=0.0149474;REFB=0.00887586;REVB=-0.0149273;RO=32;SAF=13;SAR=24;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182138;STB=0.600914;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.0134801;OID=.;OPOS=42532693;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:24:13:18:14:24:13:18:14 chr18 42533130 . A G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00731994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.981;QD=58.2391;RBI=0.011572;REFB=0;REVB=0.00896268;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.5752e-05;OID=.;OPOS=42533130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0 chr18 43206985 . A G 2336.92 PASS AF=1;AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107863;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.809;QD=61.0958;RBI=0.0115109;REFB=0;REVB=-0.00401941;RO=0;SAF=82;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6227e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.36973e-05;OID=.;OPOS=43206985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:153:0:0:153:153:1:71:82:0:0:71:82:0:0 chr18 43252883 . G A 407.77 PASS AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.00823848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8107;QD=14.3078;RBI=0.00861052;REFB=-0.00713033;REVB=0.00250368;RO=65;SAF=26;SAR=21;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630037;STB=0.527016;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0116989;OID=.;OPOS=43252883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:65:67:47:47:0.412281:21:26:32:33:21:26:34:33 chr18 43262359 . G A 220.78 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.000409488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7629;QD=12.0974;RBI=0.0423446;REFB=-0.047857;REVB=-0.0423426;RO=45;SAF=9;SAR=18;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787431;STB=0.554414;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0668829;OID=.;OPOS=43262359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:45:46:27:27:0.369863:18:9:18:27:18:9:19:27 chr18 43307246 . C T 504.41 PASS AF=0.580247;AO=47;DP=82;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0114335;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.115;QD=24.9092;RBI=0.0719992;REFB=-0.0376912;REVB=-0.0710856;RO=34;SAF=23;SAR=24;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531965;STB=0.529121;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0281637;OID=.;OPOS=43307246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:34:34:47:47:0.580247:24:23:19:15:24:23:19:15 chr18 43307338 . C A 419.55 PASS AF=0.561644;AO=40;DP=72;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00031457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.954;QD=22.9891;RBI=0.00648972;REFB=-0.0358225;REVB=0.0064821;RO=31;SAF=18;SAR=22;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781477;STB=0.529751;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0289763;OID=.;OPOS=43307338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:31:32:40:41:0.561644:22:18:17:14:22:19:17:15 chr18 43310401 . CCG CC,C 46.27 PASS AF=0.333333,0;AO=5,8;DP=34;FAO=12,0;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=10,0;FSAR=2,0;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0486192,-0.196693;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=13.6974,22.7999;QD=5.14079;RBI=0.0503031,0.208522;REFB=-0.0558802,0.0235302;REVB=-0.0129065,-0.0692333;RO=19;SAF=4,7;SAR=1,1;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.343502,0.472346;STB=0.760384,0.5;STBP=0.049,1;TYPE=del,del;VARB=0.090111,0.0431713;OID=.,.;OPOS=43310403,43310402;OREF=G,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333,0:5,8:34:12,0:36:24:10,0:2,0:12:12:44:19:4,7:1,1:10:9 chr18 43310415 . G A 57.46 PASS AF=0.272727;AO=5;DP=34;FAO=9;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0244223;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.894;QD=6.96539;RBI=0.0678385;REFB=-0.0181381;REVB=-0.0632899;RO=19;SAF=5;SAR=0;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.66854;STB=0.837849;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0483169;OID=.;OPOS=43310415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:34:33:19:24:5:9:0.272727:0:5:11:8:1:8:12:12 chr18 43316538 . A G 1212.3 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459308;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.096;QD=61.3822;RBI=0.0512398;REFB=0;REVB=0.022713;RO=0;SAF=27;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99965e-05;OID=.;OPOS=43316538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:51:27:0:0:51:28:0:0 chr18 43319519 . G A 272.76 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0261454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4177;QD=14.9455;RBI=0.0283318;REFB=0.0120489;REVB=0.0109137;RO=42;SAF=14;SAR=17;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734077;STB=0.541566;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.0160795;OID=.;OPOS=43319519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:17:14:22:20:17:14:22:20 chr18 43416974 . T A 224.62 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.007808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.662;QD=17.617;RBI=0.00836814;REFB=-0.0145763;REVB=-0.00301012;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144062;STB=0.570673;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0158623;OID=.;OPOS=43416974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:27:24:24:0.470588:13:11:16:10:13:11:16:11 chr18 43420177 . G A 242.38 PASS AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0180673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.361;QD=29.3791;RBI=0.0251041;REFB=-0.0736636;REVB=0.0174295;RO=9;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206317;STB=0.605968;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0218648;OID=.;OPOS=43420177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:9:11:22:22:0.666667:11:11:8:1:11:11:9:2 chr18 43464657 . G A 210.45 PASS AF=0.438596;AO=23;DP=55;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00937667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.763;QD=14.7686;RBI=0.0262385;REFB=-0.038061;REVB=0.0245059;RO=32;SAF=9;SAR=14;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205313;STB=0.608305;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0321964;OID=.;OPOS=43464657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:32:32:23:25:0.438596:14:9:19:13:15:10:19:13 chr18 43481075 . G A 151.74 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00817283;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.695;QD=18.3927;RBI=0.0131056;REFB=-0.0213051;REVB=0.010245;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345603;STB=0.547469;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0221954;OID=.;OPOS=43481075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:33:19:17:16:16:0.484848:7:9:10:9:7:9:8:9 chr18 43490602 . G A 192.84 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00905818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.256;QD=14.8339;RBI=0.00942737;REFB=-0.00799862;REVB=0.0026124;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125424;STB=0.571366;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00988854;OID=.;OPOS=43490602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:12:10:10:20:12:10:10:20 chr18 43497710 . A G 236.84 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00411042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.366;QD=26.3153;RBI=0.0114292;REFB=-0.00826815;REVB=0.0106645;RO=13;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077413;STB=0.555506;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.00669735;OID=.;OPOS=43497710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:13:14:22:22:0.611111:11:11:8:5:11:11:9:5 chr18 43547127 . TGG GTG,T,TG 348.54 PASS AF=0,0.027027,0.972973;AO=3,6,27;DP=38;FAO=0,1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,25;FSAR=0,0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00871163,-0.0303033,-0.0580336;FXX=0.0263089;HRUN=1,5,5;LEN=2,2,1;MLLD=7.41898,11.5884,11.4267;QD=37.6802;RBI=0.0730933,0.130082,0.242712;REFB=0,0,0;REVB=-0.0725722,-0.126503,-0.235671;RO=0;SAF=3,2,21;SAR=0,4,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0.47619,0.47619;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.0252508,-0.0166989,-0.0104064;OID=.,.,.;OPOS=43547127,43547128,43547128;OREF=TG,GG,G;OALT=GT,-,-;OMAPALT=GTG,T,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:4:38:37:0:0:3,6,27:0,1,36:0,0.027027,0.972973:0,4,6:3,2,21:0:0:0,0,11:0,1,25:0:0 chr18 43563677 . T C 215.98 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0415643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.238;QD=15.1566;RBI=0.0417924;REFB=0.00571394;REVB=0.00436128;RO=32;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506399;STB=0.528729;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-0.0118539;OID=.;OPOS=43563677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:13:12:17:15:13:12:17:15 chr18 43565380 . A G 201.54 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0204239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.307;QD=13.8996;RBI=0.0204907;REFB=-0.0114735;REVB=-0.00165329;RO=34;SAF=17;SAR=7;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462942;STB=0.762025;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0133467;OID=.;OPOS=43565380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:7:17:8:26:7:17:8:26 chr18 43565399 . C A 165.66 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.00181022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.58;QD=11.4249;RBI=0.00214394;REFB=0.00531765;REVB=-0.00114874;RO=37;SAF=17;SAR=4;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.570674;STB=0.829621;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00355379;OID=.;OPOS=43565399;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:37:21:21:0.362069:4:17:10:27:4:17:10:27 chr18 43568717 . T C 187.93 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00501982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.165;QD=20.3167;RBI=0.0339558;REFB=0.00417269;REVB=0.0335827;RO=18;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226898;STB=0.512807;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00211987;OID=.;OPOS=43568717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:10:9:9:9:10:9:9:9 chr18 43595850 . TAAAAAAAAAAT TAAAAAAAAATA 40.71 PASS AF=0.105882;AO=3;DP=82;FAO=9;FDP=85;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=68;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=47;FSRR=21;FWDB=-0.0674178;FXX=0.0116266;HRUN=10;LEN=2;MLLD=38.2339;QD=1.91568;RBI=0.283945;REFB=-0.0245779;REVB=-0.275825;RO=35;SAF=0;SAR=3;SRF=31;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.763948;STB=0.92903;STBP=0.032;TYPE=mnp;VARB=0.275701;OID=.;OPOS=43595860;OREF=AT;OALT=TA;OMAPALT=TAAAAAAAAATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.105882:3:82:9:85:68:1:8:47:21:25:35:0:3:31:4 chr18 43701587 . G A 195.78 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00604781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.717;QD=17.7977;RBI=0.0370806;REFB=-0.0191467;REVB=-0.0365841;RO=24;SAF=16;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219221;STB=0.626366;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0280381;OID=.;OPOS=43701587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:4:16:15:9:4:16:15:9 chr18 43833701 . T TCTG 470.09 PASS AF=0.485437;AO=49;DP=105;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0262993;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=3;MLLD=271.556;QD=18.256;RBI=0.0274447;REFB=0.0101324;REVB=0.00784611;RO=54;SAF=20;SAR=29;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188877;STB=0.5126;STBP=0.811;TYPE=ins;VARB=-0.00997481;OID=.;OPOS=43833702;OREF=-;OALT=CTG;OMAPALT=TCTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.485437:49:105:50:103:53:21:29:21:32:99:54:20:29:21:33 chr18 43843736 . T G 289.32 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2683;QD=52.6033;RBI=0.050331;REFB=0;REVB=0.0457532;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223374;OID=.;OPOS=43843736;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0 chr18 44040660 . T C 1116.84 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0047;QD=60.37;RBI=0.0842193;REFB=0;REVB=0.0828997;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355302;OID=.;OPOS=44040660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:37:36:0:0:38:36:0:0 chr18 44087535 . G A 689.62 PASS AF=0.476821;AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=0.00391845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7108;QD=18.268;RBI=0.0248711;REFB=-0.00043913;REVB=0.0245605;RO=79;SAF=35;SAR=37;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043033;STB=0.523803;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.000743499;OID=.;OPOS=44087535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:79:79:72:72:0.476821:37:35:42:37:37:35:42:37 chr18 44104691 . C T 317.91 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00929008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.417;QD=15.508;RBI=0.0520763;REFB=-0.0207316;REVB=0.051241;RO=45;SAF=25;SAR=10;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17647;STB=0.590497;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0435315;OID=.;OPOS=44104691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:47:35:35:0.426829:10:25:25:20:10:25:27:20 chr18 44555312 . G C 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00818354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.161;QD=21.0134;RBI=0.0319051;REFB=-0.0215448;REVB=0.0308378;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175522;STB=0.599822;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0209936;OID=.;OPOS=44555312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:5:2:6:5:5:2 chr18 44561955 . C G 332.7 PASS AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0117234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.387;QD=26.6164;RBI=0.0122047;REFB=-0.0151778;REVB=0.00339343;RO=21;SAF=15;SAR=14;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777283;STB=0.542907;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00974019;OID=.;OPOS=44561955;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:14:15:13:8:14:15:13:8 chr18 44610718 . T C 576.32 PASS AF=0.552083;AO=53;DP=96;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.00152374;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=291.835;QD=24.0131;RBI=0.00805615;REFB=-0.0110819;REVB=-0.00791074;RO=43;SAF=26;SAR=27;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187993;STB=0.602783;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0089891;OID=.;OPOS=44610718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:43:43:53:53:0.552083:27:26:31:12:27:26:31:12 chr18 44682459 . CAGCT C 123.64 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00129732;FXX=0.0975372;HRUN=1;LEN=4;MLLD=270.639;QD=13.3663;RBI=0.0143547;REFB=-0.00519582;REVB=0.0142959;RO=22;SAF=12;SAR=2;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328501;STB=0.717026;STBP=0.081;TYPE=del;VARB=0.00834471;OID=.;OPOS=44682460;OREF=AGCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.378378:14:41:14:37:23:12:2:14:9:99:22:12:2:14:8 chr18 44682490 . A G 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00667511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.112;QD=21.6129;RBI=0.0150369;REFB=-0.0194886;REVB=0.0134741;RO=23;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254828;STB=0.514274;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0203729;OID=.;OPOS=44682490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:9:15:15:8:9:15:15:8 chr18 44760901 . G A 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0471317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8147;QD=11.1978;RBI=0.0549115;REFB=0.0133732;REVB=-0.0281759;RO=22;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45063;STB=0.763251;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.0214601;OID=.;OPOS=44760901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:8:4:17:5:8:4:17:5 chr18 45359459 . C A 194.9 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0150931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.982;QD=17.3241;RBI=0.0209539;REFB=-0.0273062;REVB=-0.014535;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984044;STB=0.505612;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0275895;OID=.;OPOS=45359459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:11:9:11:14:11:9:11:14 chr18 45555829 . T C 307.78 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0609098;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0806;QD=20.5185;RBI=0.0760692;REFB=-0.0521643;REVB=-0.0455688;RO=27;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458672;STB=0.516656;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0394693;OID=.;OPOS=45555829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:16:16:12:15:16:16:13:15 chr18 45566276 . G A 182.87 PASS AF=0.463415;AO=17;DP=39;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00401888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.728;QD=17.841;RBI=0.00521144;REFB=-0.0179248;REVB=0.00331778;RO=21;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298132;STB=0.63714;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0232011;OID=.;OPOS=45566276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:21:22:17:19:0.463415:11:6:14:7:11:8:15:7 chr18 45696158 . G A 130.89 PASS AF=0.384615;AO=13;DP=37;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0220911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.136;QD=13.4245;RBI=0.0270329;REFB=-0.00847542;REVB=0.0155808;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172139;STB=0.587511;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0256341;OID=.;OPOS=45696158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:39:24:24:13:15:0.384615:8:5:13:11:9:6:13:11 chr18 45696204 . T C 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00437255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.927;QD=16.6157;RBI=0.0325436;REFB=-0.0207914;REVB=0.0322485;RO=21;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020831;STB=0.511931;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0331301;OID=.;OPOS=45696204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:11:6:7:14:11:6:7:14 chr18 45696256 . A G 121.57 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0171034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.896;QD=15.1968;RBI=0.0197477;REFB=0.000995403;REVB=0.00987135;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331196;STB=0.519203;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=-0.00103342;OID=.;OPOS=45696256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:9:5:7:11:9:5:7:11 chr18 46001932 . A G 1212.84 PASS AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0029215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=354.231;QD=59.8935;RBI=0.0227944;REFB=-0.0259645;REVB=-0.0226064;RO=1;SAF=67;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00701563;STB=0.503703;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=7.57829e-05;OID=.;OPOS=46001932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:13:67:1:0:13:67:1:0 chr18 46284587 . T C 242.99 PASS AF=0.451613;AO=26;DP=60;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0105301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.005;QD=15.6766;RBI=0.0107928;REFB=-0.0401199;REVB=-0.00236692;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00907633;STB=0.523348;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0347093;OID=.;OPOS=46284587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:34:34:26:28:0.451613:14:12:16:18:16:12:16:18 chr18 46343666 . C T 172.19 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0439417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8871;QD=26.4901;RBI=0.0454189;REFB=-0.0542175;REVB=-0.0114895;RO=9;SAF=8;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15699;STB=0.587057;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0332363;OID=.;OPOS=46343666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:9:8:2:7:9:8:2:7 chr18 46385948 . A G 127.39 PASS AF=0.538462;AO=10;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0285758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.223;QD=19.5978;RBI=0.0299992;REFB=-0.0572651;REVB=-0.009131;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170018;STB=0.538407;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0494941;OID=.;OPOS=46385948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:10:14:0.538462:6:4:7:5:7:7:7:5 chr18 46446589 . T C 600.88 PASS AF=0.540541;AO=59;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00198781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.558;QD=21.6532;RBI=0.0125448;REFB=-0.0186029;REVB=-0.0123863;RO=51;SAF=30;SAR=29;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485097;STB=0.530143;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0167136;OID=.;OPOS=46446589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:59:60:0.540541:29:30:23:28:29:31:23:28 chr18 46545924 . A G 2221.28 PASS AF=0.980263;AO=149;DP=152;FAO=149;FDP=152;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=133;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0575137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.115;QD=58.4547;RBI=0.0575179;REFB=-0.107301;REVB=0.000690497;RO=3;SAF=16;SAR=133;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522664;STB=0.527541;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.000358256;OID=.;OPOS=46545924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:152:152:3:3:149:149:0.980263:133:16:2:1:133:16:2:1 chr18 46545973 . C A 963.46 PASS AF=0.497382;AO=95;DP=191;FAO=95;FDP=191;FR=.;FRO=96;FSAF=5;FSAR=90;FSRF=8;FSRR=88;FWDB=-0.0287728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.549;QD=20.1772;RBI=0.028845;REFB=-0.0437797;REVB=-0.00203828;RO=95;SAF=5;SAR=90;SRF=7;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870526;STB=0.567945;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0381679;OID=.;OPOS=46545973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:95:96:95:95:0.497382:90:5:7:88:90:5:8:88 chr18 46545979 . A C 2816.8 PASS AF=0.994475;AO=177;DP=184;FAO=180;FDP=181;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0757553;FXX=0.0216205;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.983;QD=62.2498;RBI=0.0938368;REFB=-0.0743009;REVB=0.0553758;RO=1;SAF=11;SAR=166;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0028595;STB=0.501484;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.000217418;OID=.;OPOS=46545979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:184:181:1:1:177:180:0.994475:166:11:0:1:168:12:0:1 chr18 46576058 . T C 289.48 PASS AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.011969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.869;QD=25.7315;RBI=0.0164549;REFB=-0.0216707;REVB=-0.0112918;RO=18;SAF=23;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231304;STB=0.623618;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.013514;OID=.;OPOS=46576058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:19:26:26:0.577778:3:23:13:5:3:23:14:5 chr18 47013723 . A T 200.95 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0123403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.486;QD=15.1662;RBI=0.0186378;REFB=-0.0212721;REVB=0.0139673;RO=29;SAF=8;SAR=15;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236222;STB=0.625932;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0311766;OID=.;OPOS=47013723;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:30:23:23:0.433962:15:8:17:12:15:8:17:13 chr18 47014953 . G GTGT 44.75 PASS AF=0.269231;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0242742;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=3;MLLD=199.321;QD=6.88412;RBI=0.0246487;REFB=0.0013552;REVB=-0.00428041;RO=20;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308427;STB=0.715255;STBP=0.253;TYPE=ins;VARB=-0.0223787;OID=.;OPOS=47014954;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=GTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.269231:7:27:7:26:19:3:4:14:5:44:20:3:4:14:6 chr18 47017820 . A G 387.22 PASS AF=0.383333;AO=46;DP=120;FAO=46;FDP=120;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.00431115;FXX=0.00826378;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5586;QD=12.9073;RBI=0.00628091;REFB=-0.00246179;REVB=0.0045677;RO=74;SAF=27;SAR=19;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209699;STB=0.61886;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00428969;OID=.;OPOS=47017820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:74:74:46:46:0.383333:19:27:29:45:19:27:29:45 chr18 47093864 . C T 317.32 PASS AF=0.371429;AO=39;DP=105;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.00834568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.98;QD=12.0884;RBI=0.00853834;REFB=-0.0185732;REVB=-0.00180353;RO=63;SAF=23;SAR=16;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00273322;STB=0.500757;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0313191;OID=.;OPOS=47093864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:63:66:39:39:0.371429:16:23:37:26:16:23:39:27 chr18 47369758 . C T 1604.57 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.256;QD=64.1828;RBI=0.0469044;REFB=0;REVB=0.0157195;RO=0;SAF=27;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.69335e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.805e-05;OID=.;OPOS=47369758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:100:0:0:95:100:1:68:27:0:0:68:32:0:0 chr18 47383243 . C T 1029.33 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.029361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6854;QD=57.9903;RBI=0.0534984;REFB=0.045759;REVB=0.0447215;RO=1;SAF=30;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154986;STB=0.508194;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.000670553;OID=.;OPOS=47383243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:40:30:1:0:40:30:1:0 chr18 47421391 . G A 409.91 PASS AF=0.5;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00262731;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.553;QD=19.9958;RBI=0.0732986;REFB=-0.0335877;REVB=0.0732515;RO=41;SAF=25;SAR=16;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679939;STB=0.537781;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0256455;OID=.;OPOS=47421391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:82:41:41:41:41:0.5:16:25:22:19:16:25:22:19 chr18 47563299 . T C 785.82 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2663;QD=64.1487;RBI=0.0249898;REFB=0;REVB=1.58091e-05;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296511;OID=.;OPOS=47563299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0 chr18 47733498 . G T 203.88 PASS AF=0.42;AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0123641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.061;QD=16.3104;RBI=0.0138285;REFB=-0.00932775;REVB=0.00619338;RO=27;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317387;STB=0.523787;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0150772;OID=.;OPOS=47733498;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:27:29:20:21:0.42:11:9:13:14:11:10:15:14 chr18 47777244 . C T 500.06 PASS AF=0.388158;AO=57;DP=151;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=0.00515078;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.502;QD=13.1594;RBI=0.0104299;REFB=-0.0217501;REVB=-0.00906926;RO=93;SAF=26;SAR=31;SRF=40;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287839;STB=0.510348;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.033969;OID=.;OPOS=47777244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:93:93:57:59:0.388158:31:26:40:53:32:27:41:52 chr18 47777937 . G A 236.11 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0663953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.51;QD=19.2746;RBI=0.0713107;REFB=0.0216004;REVB=0.0260168;RO=26;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184073;STB=0.604303;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0190912;OID=.;OPOS=47777937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:15:8:14:12:15:8:14:12 chr18 47795629 . C A 1787.44 PASS AF=0.991597;AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.013962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0149;QD=60.0821;RBI=0.0287133;REFB=-0.0388699;REVB=-0.0250901;RO=2;SAF=63;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00123475;STB=0.504586;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000466645;OID=.;OPOS=47795629;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:119:2:1:117:118:0.991597:54:63:1:1:54:64:0:1 chr18 47801800 . G A 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.00969187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2975;QD=12.7297;RBI=0.0261417;REFB=-0.00466994;REVB=0.0242787;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453824;STB=0.764191;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0121554;OID=.;OPOS=47801800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:2:10:3:6:2:10 chr18 47803354 . C T 433.67 PASS AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00145176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.204;QD=20.6508;RBI=0.0316132;REFB=-0.0194244;REVB=-0.0315798;RO=41;SAF=26;SAR=17;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834791;STB=0.546259;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0117612;OID=.;OPOS=47803354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:17:26:21:20:17:26:21:20 chr18 47809871 . G T 64.88 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0557834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7723;QD=10.3807;RBI=0.114684;REFB=-0.0086898;REVB=-0.100203;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244812;STB=0.648314;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0113495;OID=.;OPOS=47809871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:9:7:6:3:9:7 chr18 47810251 . C G 220.41 PASS AF=0.314607;AO=28;DP=89;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.00646931;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.908;QD=9.90611;RBI=0.00753436;REFB=-0.0162834;REVB=-0.00386196;RO=61;SAF=14;SAR=14;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670898;STB=0.539298;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0319055;OID=.;OPOS=47810251;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:61:61:28:28:0.314607:14:14:34:27:14:14:34:27 chr18 47810351 . A G 885.65 PASS AF=1;AO=54;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.207;QD=58.0752;RBI=0.0943946;REFB=0;REVB=0.0939699;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146767;OID=.;OPOS=47810351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:54:61:1:17:37:0:0:24:37:0:0 chr18 47811374 . G A 64.44 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=-0.0321155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.693;QD=9.91423;RBI=0.0663704;REFB=0.00597724;REVB=0.0580829;RO=17;SAF=5;SAR=4;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390503;STB=0.72689;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0177518;OID=.;OPOS=47811374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:4:5:15:2:4:5:15:2 chr18 47908556 . G A 856.93 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.599;QD=57.1286;RBI=0.0304468;REFB=0;REVB=-0.0123585;RO=0;SAF=16;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83285e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.36689e-05;OID=.;OPOS=47908556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:42:16:0:0:42:18:0:0 chr18 48190440 . G A 906.67 PASS AF=0.479167;AO=91;DP=192;FAO=92;FDP=192;FR=.;FRO=100;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=56;FWDB=0.0159848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6527;QD=18.889;RBI=0.0593079;REFB=-0.0381187;REVB=0.0571132;RO=101;SAF=48;SAR=43;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872728;STB=0.542486;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0410631;OID=.;OPOS=48190440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:101:100:91:92:0.479167:43:48:44:57:44:48:44:56 chr18 48325430 . T G 311.85 PASS AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0090703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6854;QD=14.175;RBI=0.0873721;REFB=-0.0138923;REVB=0.0869001;RO=53;SAF=11;SAR=24;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158078;STB=0.590249;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0234592;OID=.;OPOS=48325430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:53:53:35:35:0.397727:24:11:24:29:24:11:24:29 chr18 48331524 . G A 140.32 PASS AF=0.277778;AO=20;DP=72;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0131573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5047;QD=7.79545;RBI=0.0229838;REFB=-0.00593598;REVB=-0.0188451;RO=52;SAF=9;SAR=11;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174107;STB=0.604294;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0153076;OID=.;OPOS=48331524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:52:52:20:20:0.277778:11:9:31:21:11:9:31:21 chr18 48331553 . T C 190.01 PASS AF=0.308642;AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0517533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7829;QD=9.38318;RBI=0.0526152;REFB=-0.00976885;REVB=-0.00948419;RO=56;SAF=11;SAR=14;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153186;STB=0.590125;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0224251;OID=.;OPOS=48331553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:56:56:25:25:0.308642:14:11:32:24:14:11:32:24 chr18 48333203 . C G 239.68 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00279372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.524;QD=18.089;RBI=0.0133166;REFB=-0.00830033;REVB=0.0130202;RO=27;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120468;STB=0.567633;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00947441;OID=.;OPOS=48333203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:15:11:15:12:15:11:15:12 chr18 48577782 . G C 316.38 PASS AF=0.622222;AO=26;DP=43;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00211881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.013;QD=28.1226;RBI=0.0119215;REFB=-0.0281824;REVB=-0.0117317;RO=17;SAF=17;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949121;STB=0.530356;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0150727;OID=.;OPOS=48577782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:45:17:17:26:28:0.622222:9:17:9:8:11:17:9:8 chr18 48578991 . ATTTTTTTG ATTTTTTG,ATTTTTTGA,ATTTTTTGT 57.52 PASS AF=0.314815,0.037037,0;AO=18,2,2;DP=53;FAO=17,2,0;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=8,1,0;FSAR=9,1,0;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0472851,0.0581811,-0.0486954;FXX=0.0181785;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,2;MLLD=7.28914,22.7305,150.462;QD=4.26049;RBI=0.131757,0.0717693,0.0498002;REFB=-0.223717,-0.134753,-0.0261932;REVB=-0.12298,0.0420214,-0.0104318;RO=24;SAF=7,1,2;SAR=11,1,0;SRF=16;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.271363,-0.163262,0.42499;STB=0.567489,0.56691,0.5;STBP=0.5,0.836,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.154037,0.186413,0.0291291;OID=.,.,.;OPOS=48578992,48578998,48578998;OREF=T,TG,TG;OALT=-,GA,GT;OMAPALT=ATTTTTTG,ATTTTTTGA,ATTTTTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.314815,0.037037,0:18,2,2:53:17,2,0:54:35:8,1,0:9,1,0:20:15:52:24:7,1,2:11,1,0:16:8 chr18 48633216 . G T 267.97 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.000534144;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.641;QD=21.4376;RBI=0.00813005;REFB=-0.0270503;REVB=-0.00811249;RO=23;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690909;STB=0.538433;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0186023;OID=.;OPOS=48633216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:14:13:13:10:14:13:13:10 chr18 48723217 . C T 358.11 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.716;QD=55.093;RBI=0.0480781;REFB=0;REVB=0.0443342;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200444;OID=.;OPOS=48723217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr18 49072801 . C T 579.18 PASS AF=0.483871;AO=60;DP=124;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0384886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.563;QD=18.6831;RBI=0.0402502;REFB=0.00679378;REVB=-0.0117774;RO=63;SAF=22;SAR=38;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756532;STB=0.538536;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.0049043;OID=.;OPOS=49072801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:64:60:60:0.483871:38:22:28:35:38:22:28:36 chr18 49867224 . T C 3784.17 PASS AF=1;AO=239;DP=240;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333481;FXX=0.00416649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.548;QD=63.3335;RBI=0.0334568;REFB=0.00538733;REVB=-0.00269524;RO=0;SAF=95;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09987e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106922;OID=.;OPOS=49867224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:240:239:0:0:239:239:1:144:95:0:0:144:95:0:0 chr18 50432602 . C G 1156.91 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0425566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6307;QD=59.3289;RBI=0.042558;REFB=0.0468896;REVB=-0.000347397;RO=1;SAF=30;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155135;STB=0.508195;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.00124269;OID=.;OPOS=50432602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:47:30:1:0:47:30:1:0 chr18 50936994 . T C 507.83 PASS AF=0.414815;AO=55;DP=135;FAO=56;FDP=135;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.00471617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.973;QD=15.0469;RBI=0.00594827;REFB=-0.0105815;REVB=-0.00362486;RO=79;SAF=21;SAR=34;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117063;STB=0.510802;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0111199;OID=.;OPOS=50936994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:79:79:55:56:0.414815:34:21:31:48:35:21:31:48 chr18 50942653 . C T 846.7 PASS AF=0.541096;AO=79;DP=146;FAO=79;FDP=146;FR=.;FRO=67;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.0169427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.526;QD=23.1972;RBI=0.0351338;REFB=-0.0239158;REVB=-0.0307787;RO=67;SAF=40;SAR=39;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134736;STB=0.50737;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0167245;OID=.;OPOS=50942653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:67:67:79:79:0.541096:39:40:35:32:39:40:35:32 chr18 51681244 . T C 283.51 PASS AF=0.52;AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00552375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.363;QD=22.6809;RBI=0.0397598;REFB=-0.0320111;REVB=0.0393742;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556107;STB=0.539969;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0242916;OID=.;OPOS=51681244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:24:24:25:26:0.52:12:13:14:10:13:13:14:10 chr18 51795957 . GCGACGAC GCGAC,GCGA,GCGGCGAC 743.54 PASS AF=0.895833,0,0.104167;AO=24,11,5;DP=50;FAO=43,0,5;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0,1;FSAR=26,0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486847,-0.00967636,0.0264656;FXX=0.020404;HRUN=1,1,1;LEN=3,4,1;MLLD=168.328,172.387,68.0862;QD=61.962;RBI=0.0602003,0.010272,0.029927;REFB=0,0,0;REVB=0.0354101,0.00344691,0.0139714;RO=0;SAF=15,0,1;SAR=9,11,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00548256,0,0.0335248;OID=.,.,.;OPOS=51795958,51795961,51795960;OREF=CGA,CGAC,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GCGAC,GCGA,GCGGCGAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.895833,0,0.104167:24,11,5:50:43,0,5:48:0:17,0,1:26,0,4:0:0:26:0:15,0,1:9,11,4:0:0 chr18 51820805 . G A 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.243;QD=51.9167;RBI=0.0537945;REFB=0;REVB=-0.00206041;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000613292;OID=.;OPOS=51820805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0 chr18 52265308 . A C 801.12 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1267;QD=57.223;RBI=0.027402;REFB=0;REVB=-0.0216771;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.10313e-05;OID=.;OPOS=52265308;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr18 52570281 . G A 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00459031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.32;QD=59.0187;RBI=0.0263603;REFB=0;REVB=0.0259576;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12228e-05;OID=.;OPOS=52570281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chr18 53177774 . G C 542.35 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454438;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.502;QD=60.2609;RBI=0.0461217;REFB=0;REVB=-0.00787858;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339574;OID=.;OPOS=53177774;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0 chr18 53303101 . C G 1716.58 PASS AF=1;AO=56;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00837953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.175;QD=61.8586;RBI=0.13427;REFB=0;REVB=0.134008;RO=0;SAF=46;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180546;OID=.;OPOS=53303101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:111:0:0:56:111:1:10:46:0:0:65:46:0:0 chr18 54281802 . AAT A 34.88 PASS AF=0.185185;AO=15;DP=98;FAO=15;FDP=81;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=-0.157533;FXX=0.0470533;HRUN=5;LEN=2;MLLD=29.0262;QD=1.72266;RBI=0.159132;REFB=-0.0318863;REVB=0.0225027;RO=73;SAF=13;SAR=2;SRF=21;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.653139;STB=0.823429;STBP=0.017;TYPE=del;VARB=0.127193;OID=.;OPOS=54281803;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.185185:15:98:15:81:66:11:4:19:47:34:73:13:2:21:52 chr18 54293658 . T C 131.13 PASS AF=0.320755;AO=16;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00781047;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.262;QD=9.89669;RBI=0.0313253;REFB=-0.0114221;REVB=-0.030336;RO=36;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227523;STB=0.61387;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0264488;OID=.;OPOS=54293658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:36:36:16:17:0.320755:8:8:11:25:9:8:11:25 chr18 54339818 . C G 1522.61 PASS AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0271593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5882;QD=58.5618;RBI=0.0292771;REFB=0.0206426;REVB=-0.0109325;RO=1;SAF=46;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102034;STB=0.505375;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.0010431;OID=.;OPOS=54339818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:57:46:1:0:57:46:1:0 chr18 54448778 . G A 612.39 PASS AF=0.578431;AO=59;DP=102;FAO=59;FDP=102;FR=.;FRO=43;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00333861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.936;QD=24.0153;RBI=0.0688298;REFB=-0.023013;REVB=0.0687488;RO=43;SAF=33;SAR=26;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000925619;STB=0.500505;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.014723;OID=.;OPOS=54448778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:43:43:59:59:0.578431:26:33:24:19:26:33:24:19 chr18 54624667 . G A 211.53 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00228238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.012;QD=19.6774;RBI=0.00992257;REFB=-0.024539;REVB=0.0096565;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14499;STB=0.58158;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0265315;OID=.;OPOS=54624667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:7:15:11:10:7:15 chr18 55021725 . A C 268.54 PASS AF=0.402597;AO=30;DP=76;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0177621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.781;QD=13.9502;RBI=0.0233018;REFB=-0.00237431;REVB=0.0150825;RO=46;SAF=17;SAR=13;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940029;STB=0.541919;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00347964;OID=.;OPOS=55021725;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:46:46:30:31:0.402597:13:17:22:24:14:17:22:24 chr18 55027334 . G T 279.9 PASS AF=0.526316;AO=29;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0222771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4588;QD=19.6422;RBI=0.0352254;REFB=-0.00459958;REVB=0.0272866;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974348;STB=0.526298;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.00442634;OID=.;OPOS=55027334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:25:27:29:30:0.526316:15:14:15:10:15:15:15:12 chr18 55034359 . T C 535.42 PASS AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00213887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.868;QD=23.2791;RBI=0.00947193;REFB=-0.0112672;REVB=0.00922728;RO=41;SAF=30;SAR=20;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330721;STB=0.524654;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0100958;OID=.;OPOS=55034359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:41:42:50:50:0.543478:20:30:23:18:20:30:23:19 chr18 55145377 . G A 525.59 PASS AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00676569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.065;QD=58.3993;RBI=0.0087562;REFB=0;REVB=0.00555847;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83281e-05;OID=.;OPOS=55145377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:18:17:0:0:18:18:0:0 chr18 55145575 . C G 1087.63 PASS AF=1;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772934;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1461;QD=60.4239;RBI=0.0330701;REFB=0;REVB=0.0321541;RO=0;SAF=20;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380586;OID=.;OPOS=55145575;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:72:0:0:72:72:1:52:20:0:0:52:20:0:0 chr18 55145764 . GG CA,GC 549.7 PASS AF=0.0540541,0.945946;AO=2,32;DP=40;FAO=2,35;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843536,-0.00263363;FXX=0.0749813;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=110.22,212.385;QD=59.427;RBI=0.0131568,0.0223508;REFB=0,0;REVB=0.0100968,0.0221951;RO=0;SAF=0,20;SAR=2,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0319799,0.00215209;OID=.,.;OPOS=55145764,55145765;OREF=GG,G;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:40:37:0:0:2,32:2,35:0.0540541,0.945946:2,12:0,20:0:0:2,14:0,21:0:0 chr18 55145906 . C T 754.6 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.040813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9156;QD=54.88;RBI=0.0494054;REFB=-0.0391567;REVB=0.0278422;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.508769;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00048191;OID=.;OPOS=55145906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:28:26:0:0:28:26:0:1 chr18 55146453 . T C 1051.49 PASS AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00458807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.896;QD=56.8374;RBI=0.0105596;REFB=-0.0770536;REVB=-0.00951079;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515621;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00269547;OID=.;OPOS=55146453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:74:74:0:2:72:72:0.972973:31:41:0:0:31:41:0:2 chr18 55150557 . G T 1472.43 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7397;QD=63.3301;RBI=0.0339655;REFB=0;REVB=-0.0272237;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000250361;OID=.;OPOS=55150557;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:51:42:0:0:51:42:0:0 chr18 55154066 . A G 1756.44 PASS AF=1;AO=114;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.008756;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.251;QD=60.5669;RBI=0.0398118;REFB=0;REVB=0.038837;RO=0;SAF=61;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.24572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49199e-05;OID=.;OPOS=55154066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:114:116:1:53:61:0:0:53:63:0:0 chr18 55155489 . A G 1608.25 PASS AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.02018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.611;QD=59.0185;RBI=0.0209843;REFB=-0.0732823;REVB=0.00575414;RO=1;SAF=51;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00921638;STB=0.504853;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000313033;OID=.;OPOS=55155489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:109:109:1:1:108:108:0.990826:57:51:1:0:57:51:1:0 chr18 55158489 . A AATTCTGC 559.46 PASS AF=0.783333;AO=46;DP=60;FAO=47;FDP=60;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.00813912;FXX=0;HRUN=3;LEN=7;MLLD=289.768;QD=37.2974;RBI=0.0123221;REFB=-0.025089;REVB=0.00925138;RO=13;SAF=13;SAR=33;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250335;STB=0.635453;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.00661006;OID=.;OPOS=55158490;OREF=-;OALT=ATTCTGC;OMAPALT=AATTCTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.783333:46:60:47:60:13:13:34:11:2:82:13:13:33:11:2 chr18 55221648 . T C 711.36 PASS AF=0.530769;AO=69;DP=131;FAO=69;FDP=130;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.00638988;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.693;QD=21.8881;RBI=0.00639293;REFB=-0.00901112;REVB=-0.000197665;RO=61;SAF=27;SAR=42;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157502;STB=0.586461;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00860298;OID=.;OPOS=55221648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:61:61:69:69:0.530769:42:27:35:26:42:27:35:26 chr18 55226383 . G C 317.06 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.029508;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.2693;QD=17.6147;RBI=0.0497435;REFB=-0.0137352;REVB=0.0400462;RO=36;SAF=17;SAR=17;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205707;STB=0.638813;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.010871;OID=.;OPOS=55226383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:36:38:34:34:0.472222:17:17:26:10:17:17:29:9 chr18 55313783 . A T 239.34 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.013814;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.128;QD=20.8117;RBI=0.014206;REFB=-0.00695949;REVB=-0.00331386;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161907;STB=0.590477;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00515831;OID=.;OPOS=55313783;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:10:13:17:6:10:13:17:6 chr18 55314820 . C A 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.252;QD=60.6097;RBI=0.0245935;REFB=0;REVB=0.013939;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06117e-05;OID=.;OPOS=55314820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0 chr18 55317676 . C T 654.74 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435972;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2263;QD=62.3564;RBI=0.0883978;REFB=0;REVB=-0.076899;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00195554;OID=.;OPOS=55317676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0 chr18 55346232 . A G 358.13 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8801;QD=55.0964;RBI=0.0610352;REFB=0;REVB=-0.039896;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153436;OID=.;OPOS=55346232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr18 55362532 . T G 1194.07 PASS AF=0.9875;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0488885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.494;QD=59.7037;RBI=0.0617934;REFB=-0.0817477;REVB=0.0377934;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.506665;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00094916;OID=.;OPOS=55362532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:80:0:1:78:79:0.9875:37:41:0:0:37:42:0:1 chr18 55364852 . A G 348.18 PASS AF=0.4;AO=37;DP=96;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=0.00471874;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.114;QD=14.6601;RBI=0.00761813;REFB=-0.00786563;REVB=-0.00598075;RO=57;SAF=21;SAR=16;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09006;STB=0.543756;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00932504;OID=.;OPOS=55364852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:57:57:37:38:0.4:16:21:37:20:16:22:37:20 chr18 56148796 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.497;QD=55.656;RBI=0.00680298;REFB=0;REVB=-0.00463032;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26751e-06;OID=.;OPOS=56148796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr18 56149099 . T C 1715.4 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0431811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.765;QD=59.666;RBI=0.0439275;REFB=-0.0809485;REVB=0.00806319;RO=1;SAF=49;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095921;STB=0.50505;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000216323;OID=.;OPOS=56149099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:115:115:1:1:114:114:0.991304:65:49:1:0:65:49:1:0 chr18 56196450 . TC T,TT 96.3 PASS AF=0.366667,0.0333333;AO=9,3;DP=31;FAO=11,1;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6,0;FSAR=5,1;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0175578,-0.0160401;FXX=0.0322477;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=266.121,267.142;QD=12.8397;RBI=0.0175701,0.0185884;REFB=-0.0135531,-0.00923724;REVB=0.000657623,-0.00939373;RO=17;SAF=6,0;SAR=3,3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.154634,-0.620678;STB=0.52825,0.989658;STBP=0.811,0.463;TYPE=del,snp;VARB=0.0142413,-0.0434003;OID=.,.;OPOS=56196451,56196451;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.366667,0.0333333:9,3:31:11,1:30:18:6,0:5,1:9:9:71:17:6,0:3,3:9:8 chr18 56202418 . T C 145.16 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.083;QD=44.6655;RBI=0.0323863;REFB=0;REVB=0.0298734;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837268;OID=.;OPOS=56202418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr18 56202768 . C A 433.6 PASS AF=0.505882;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0385188;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2077;QD=20.4045;RBI=0.0421396;REFB=0.00709832;REVB=-0.0170894;RO=41;SAF=32;SAR=11;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937015;STB=0.547922;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=-0.01276;OID=.;OPOS=56202768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:41:42:43:43:0.505882:11:32:27:14:11:32:28:14 chr18 56202982 . A T 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.97;QD=59.6795;RBI=0.00859021;REFB=0;REVB=-0.00782267;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.19264e-06;OID=.;OPOS=56202982;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0 chr18 56203074 . G A 372.48 PASS AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0144761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.073;QD=15.2034;RBI=0.0209994;REFB=-0.0203383;REVB=-0.0152124;RO=58;SAF=26;SAR=14;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214574;STB=0.62156;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0238096;OID=.;OPOS=56203074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:58:58:40:40:0.408163:14:26:26:32:14:26:26:32 chr18 56203120 . C T 400.52 PASS AF=0.391667;AO=47;DP=120;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.00113422;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.216;QD=13.3507;RBI=0.0144818;REFB=-0.00284188;REVB=-0.0144374;RO=73;SAF=31;SAR=16;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281591;STB=0.659507;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00388516;OID=.;OPOS=56203120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:73:73:47:47:0.391667:16:31:29:44:16:31:29:44 chr18 56203411 . G C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.754;QD=55.0985;RBI=0.0343708;REFB=0;REVB=0.0340954;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186076;OID=.;OPOS=56203411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0 chr18 56203447 . A G 727.73 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.966;QD=63.2805;RBI=0.0636874;REFB=0;REVB=0.0478827;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000664566;OID=.;OPOS=56203447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0 chr18 56203891 . G T 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.026;QD=54.517;RBI=0.0865037;REFB=0;REVB=0.0859164;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246355;OID=.;OPOS=56203891;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr18 56203898 . T G 320.62 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.515;QD=53.4368;RBI=0.0186174;REFB=0;REVB=-0.00430848;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92994e-05;OID=.;OPOS=56203898;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0 chr18 56204250 . A C 868.25 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4143;QD=57.8832;RBI=0.0412625;REFB=0;REVB=0.0134144;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248125;OID=.;OPOS=56204250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0 chr18 56204387 . ACAGTTGATGTGTCCT A 157.6 PASS AF=0.318182;AO=21;DP=69;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.00824101;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=15;MLLD=491.884;QD=9.55162;RBI=0.00839852;REFB=-0.00826395;REVB=-0.00161891;RO=44;SAF=8;SAR=13;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214342;STB=0.604551;STBP=0.249;TYPE=del;VARB=0.0184202;OID=.;OPOS=56204388;OREF=CAGTTGATGTGTCCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.318182:21:69:21:66:45:8:13:24:21:99:44:8:13:25:19 chr18 56204410 . C T 249.97 PASS AF=0.361446;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=83;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0069272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.824;QD=12.0467;RBI=0.014645;REFB=-0.0150112;REVB=-0.0129031;RO=53;SAF=14;SAR=16;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130485;STB=0.57503;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0270044;OID=.;OPOS=56204410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:53:53:30:30:0.361446:16:14:31:22:16:14:31:22 chr18 56204644 . T G 271.04 PASS AF=0.418919;AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0221394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.084;QD=14.6507;RBI=0.0221917;REFB=-0.0345703;REVB=0.00152192;RO=42;SAF=7;SAR=23;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237193;STB=0.649895;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0359701;OID=.;OPOS=56204644;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:42:43:30:31:0.418919:23:7:18:24:24:7:19:24 chr18 56204671 . A T 384.61 PASS AF=0.575758;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.000784715;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8579;QD=23.3094;RBI=0.0505914;REFB=0.00326649;REVB=-0.0505853;RO=29;SAF=16;SAR=22;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209317;STB=0.609084;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00229697;OID=.;OPOS=56204671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:29:28:38:38:0.575758:22:16:5:24:22:16:5:23 chr18 56204747 . G A 1441.83 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.001884;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.575;QD=62.0142;RBI=0.00630281;REFB=-0.0289724;REVB=0.00601464;RO=1;SAF=28;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166273;STB=0.50877;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=2.70119e-06;OID=.;OPOS=56204747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:93:1:1:92:92:0.989247:64:28:1:0:64:28:1:0 chr18 56204932 . T G 201.99 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0138488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.191;QD=12.059;RBI=0.0297163;REFB=-0.00421631;REVB=0.026292;RO=42;SAF=13;SAR=12;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561582;STB=0.532348;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0059191;OID=.;OPOS=56204932;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:12:13:24:18:12:13:24:18 chr18 56204945 . C G 168.46 PASS AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0151077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7962;QD=10.3665;RBI=0.0151868;REFB=-0.0178273;REVB=-0.00154806;RO=43;SAF=13;SAR=9;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644977;STB=0.537768;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0211147;OID=.;OPOS=56204945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:9:13:23:20:9:13:23:20 chr18 56204977 . C T 112.32 PASS AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0099662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.337;QD=7.74647;RBI=0.00997748;REFB=-0.000688363;REVB=-0.00047431;RO=42;SAF=8;SAR=8;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853141;STB=0.55166;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00147362;OID=.;OPOS=56204977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:42:42:16:16:0.275862:8:8:24:18:8:8:24:18 chr18 56204991 . C T 120.99 PASS AF=0.288136;AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0237301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.991;QD=8.20275;RBI=0.0286482;REFB=-0.0164171;REVB=-0.0160499;RO=42;SAF=9;SAR=8;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216296;STB=0.513011;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0319612;OID=.;OPOS=56204991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:42:42:17:17:0.288136:8:9:23:19:8:9:23:19 chr18 56205262 . A C 122.33 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00544837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.349;QD=15.7844;RBI=0.0062699;REFB=-0.0265506;REVB=-0.00310273;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743153;STB=0.542797;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0233336;OID=.;OPOS=56205262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:6:8:11:6:6:8:11:6 chr18 56246442 . T C 947.85 PASS AF=1;AO=33;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.269456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.601;QD=58.3292;RBI=0.271698;REFB=0;REVB=-0.0348379;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0157053;OID=.;OPOS=56246442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:33:65:1:23:10:0:0:29:36:0:0 chr18 56247180 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.525;QD=57.68;RBI=0.0485926;REFB=0;REVB=0.0334168;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594584;OID=.;OPOS=56247180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:19:12:0:0 chr18 56247567 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00037994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.49;QD=59.8393;RBI=0.00644134;REFB=0;REVB=-0.00643013;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.52797e-05;OID=.;OPOS=56247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:26:10:0:0:26:10:0:0 chr18 56247599 . C CA 252.46 PASS AF=1;AO=7;DP=31;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813374;FXX=0.128991;HRUN=0;LEN=1;MLLD=107.594;QD=37.4011;RBI=0.106708;REFB=0;REVB=-0.0690715;RO=23;SAF=0;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.720582;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000303904;OID=.;OPOS=56247600;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:7:31:27:27:0:11:16:0:0:3:23:0:7:11:12 chr18 56247600 . C A 283.56 PASS AF=0.821429;AO=23;DP=31;FAO=23;FDP=28;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00847503;FXX=0.096743;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.979;QD=40.5078;RBI=0.0108029;REFB=-0.00432855;REVB=0.00669898;RO=5;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158791;STB=0.586135;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00107095;OID=.;OPOS=56247600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:31:28:5:5:23:23:0.821429:12:11:0:5:12:11:0:5 chr18 56279025 . T G 803.47 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00981414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.118;QD=55.4114;RBI=0.0422681;REFB=-0.0274925;REVB=0.0411129;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.000162236;OID=.;OPOS=56279025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:27:30:0:0:27:30:0:1 chr18 56470255 . G C 339.42 PASS AF=1;AO=19;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0499742;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.4625;QD=54.3073;RBI=0.0508448;REFB=0;REVB=0.00936885;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000834494;OID=.;OPOS=56470255;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:19:25:1:6:13:0:0:11:14:0:0 chr18 56470264 . T TGG 148.82 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=28;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0238427;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=2;MLLD=39.0718;QD=22.0475;RBI=0.0689297;REFB=-0.057686;REVB=0.0646748;RO=9;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045353;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0255612;OID=.;OPOS=56470265;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=TGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.666667:16:28:18:27:9:10:8:5:4:50:9:9:7:5:4 chr18 56587802 . A C 269.24 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00365992;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.736;QD=16.3174;RBI=0.0205185;REFB=-0.0191366;REVB=-0.0201894;RO=36;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0215655;OID=.;OPOS=56587802;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:36:36:30:30:0.454545:15:15:18:18:15:15:18:18 chr18 56593521 . T G 727.73 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553049;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6207;QD=61.9345;RBI=0.0775623;REFB=0;REVB=0.0543809;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00448795;OID=.;OPOS=56593521;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:25:20:0:0:27:20:0:0 chr18 56887507 . C A 358.0 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.248;QD=55.0768;RBI=0.0548837;REFB=0;REVB=0.0190353;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520597;OID=.;OPOS=56887507;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0 chr18 57640352 . C CAA 798.77 PASS AF=1;AO=59;DP=70;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187219;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=33.4549;QD=47.6876;RBI=0.0342996;REFB=0;REVB=-0.0287394;RO=3;SAF=22;SAR=37;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028407;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-4.34433e-05;OID=.;OPOS=57640353;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:59:70:67:67:0:24:43:0:0:14:3:22:37:2:1 chr18 59166541 . C T 685.53 PASS AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00735688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.313;QD=50.7801;RBI=0.01943;REFB=0.0565669;REVB=0.0179834;RO=3;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462558;STB=0.524581;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.00140726;OID=.;OPOS=59166541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:54:54:3:3:51:51:0.944444:29:22:0:3:29:22:0:3 chr18 59170304 . C G 1377.52 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.005;QD=62.6144;RBI=0.0269747;REFB=0;REVB=0.0222431;RO=0;SAF=42;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49352e-05;OID=.;OPOS=59170304;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:46:42:0:0:46:42:0:0 chr18 59780393 . T A 165.38 PASS AF=0.387755;AO=18;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0303053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.393;QD=13.5003;RBI=0.0437627;REFB=-0.0240676;REVB=0.0315715;RO=30;SAF=12;SAR=6;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395261;STB=0.501154;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0324895;OID=.;OPOS=59780393;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:18:19:0.387755:6:12:19:11:7:12:19:11 chr18 59805532 . T C 1396.28 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8629;QD=62.754;RBI=0.0340942;REFB=0;REVB=0.0313358;RO=0;SAF=32;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013562;OID=.;OPOS=59805532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:57:32:0:0:57:32:0:0 chr18 59807635 . T C 122.49 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00896744;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.515;QD=14.8477;RBI=0.00900734;REFB=-0.0160972;REVB=-0.000846818;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291666;STB=0.643871;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.024675;OID=.;OPOS=59807635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:16:19:14:14:0.424242:8:6:12:4:8:6:13:6 chr18 59814268 . G A 475.43 PASS AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00720895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.432;QD=19.2094;RBI=0.0164548;REFB=-0.0171074;REVB=0.0147916;RO=52;SAF=28;SAR=19;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018362;STB=0.510218;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0215251;OID=.;OPOS=59814268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:19:28:30:22:19:28:30:22 chr18 59814324 . G C 1116.96 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.443;QD=60.3763;RBI=0.0237563;REFB=0;REVB=-0.0108401;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57475e-05;OID=.;OPOS=59814324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0 chr18 60027241 . C T 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.11;QD=62.9079;RBI=0.0108435;REFB=0;REVB=0.00609446;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59547e-05;OID=.;OPOS=60027241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:43:47:0:0:43:47:0:0 chr18 60036083 . A G 747.08 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4713;QD=63.581;RBI=0.0354384;REFB=0;REVB=-0.0180771;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000502225;OID=.;OPOS=60036083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0 chr18 60111488 . G A 263.71 PASS AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.056126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9762;QD=26.3713;RBI=0.0585437;REFB=0.0169931;REVB=0.0166504;RO=16;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474226;STB=0.526294;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.0128068;OID=.;OPOS=60111488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:15:9:7:9:15:9:7:9 chr18 60191428 . G A 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3446;QD=39.2062;RBI=0.0980849;REFB=0;REVB=0.0830848;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00968699;OID=.;OPOS=60191428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr18 60237388 . A G 972.8 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7164;QD=58.9576;RBI=0.0437997;REFB=0;REVB=0.0410878;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405185;OID=.;OPOS=60237388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:34:31:0:0:34:32:0:0 chr18 60241732 . C T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.49;QD=53.9112;RBI=0.053664;REFB=0;REVB=-0.0073568;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153367;OID=.;OPOS=60241732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:4:20:0:0:4:20:0:0 chr18 60244856 . A G 2963.54 PASS AF=1;AO=184;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156771;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.153;QD=63.3912;RBI=0.0447626;REFB=0;REVB=0.0419276;RO=0;SAF=101;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98134e-05;OID=.;OPOS=60244856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:185:187:0:0:184:187:1:83:101:0:0:86:101:0:0 chr18 60562298 . A T 512.42 PASS AF=0.515789;AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0171565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3783;QD=21.5757;RBI=0.0257365;REFB=-0.0201045;REVB=-0.0191838;RO=46;SAF=25;SAR=24;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00894733;STB=0.50494;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.013836;OID=.;OPOS=60562298;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:46:49:49:0.515789:24:25:23:23:24:25:23:23 chr18 60995261 . G C 115.52 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0107955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.657;QD=8.88629;RBI=0.0126937;REFB=-0.0068583;REVB=-0.00667728;RO=37;SAF=3;SAR=12;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290495;STB=0.67898;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0157885;OID=.;OPOS=60995261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:37:37:15:15:0.288462:12:3:15:22:12:3:15:22 chr18 60998678 . G C 419.63 PASS AF=0.506024;AO=37;DP=87;FAO=42;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.00164638;FXX=0.0459717;HRUN=6;LEN=1;MLLD=239.554;QD=20.2232;RBI=0.0431089;REFB=-0.00262582;REVB=-0.0430775;RO=23;SAF=16;SAR=21;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933294;STB=0.5319;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.00129045;OID=.;OPOS=60998678;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:83:23:41:37:42:0.506024:21:16:13:10:24:18:15:26 chr18 61022791 . C T 299.1 PASS AF=0.58;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00793924;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.577;QD=23.9279;RBI=0.00962524;REFB=0.00424012;REVB=-0.00544185;RO=21;SAF=7;SAR=22;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284166;STB=0.65815;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00355549;OID=.;OPOS=61022791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:21:21:29:29:0.58:22:7:12:9:22:7:12:9 chr18 61156606 . G C 445.73 PASS AF=0.52381;AO=43;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00638124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4761;QD=21.2251;RBI=0.0132019;REFB=-0.0212322;REVB=0.0115572;RO=40;SAF=33;SAR=10;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312685;STB=0.67653;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0199808;OID=.;OPOS=61156606;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:40:40:43:44:0.52381:10:33:18:22:10:34:18:22 chr18 61160287 . T C 422.21 PASS AF=0.447619;AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0233179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.6163;QD=16.0841;RBI=0.0398643;REFB=0.0315405;REVB=-0.0323333;RO=57;SAF=20;SAR=27;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941651;STB=0.546199;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.0420234;OID=.;OPOS=61160287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:57:58:47:47:0.447619:27:20:19:38:27:20:20:38 chr18 61160385 . T C 193.14 PASS AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00904954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.026;QD=12.0713;RBI=0.0103577;REFB=-0.0220444;REVB=-0.00503853;RO=39;SAF=17;SAR=7;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325841;STB=0.681663;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0259848;OID=.;OPOS=61160385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:40:24:24:0.375:7:17:16:23:7:17:17:23 chr18 61170721 . T C 738.8 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9468;QD=54.7262;RBI=0.0351415;REFB=-0.071595;REVB=0.0334019;RO=1;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177765;STB=0.50943;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00207644;OID=.;OPOS=61170721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:26:27:0:1:26:27:0:1 chr18 61170782 . A G 178.15 PASS AF=0.377049;AO=22;DP=60;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00401184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.721;QD=11.6817;RBI=0.00666359;REFB=-0.0181766;REVB=-0.00532058;RO=38;SAF=10;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163461;STB=0.578656;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.017025;OID=.;OPOS=61170782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:38:38:22:23:0.377049:12:10:23:15:12:11:23:15 chr18 61170925 . T C 1383.85 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0017363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.513;QD=61.5044;RBI=0.0289032;REFB=-0.129639;REVB=0.028851;RO=0;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000642326;OID=.;OPOS=61170925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:90:90:0:0:89:90:1:38:51:0:0:38:52:0:0 chr18 61233907 . C T 446.95 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1524;QD=57.6706;RBI=0.0368239;REFB=0;REVB=0.000390959;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000476784;OID=.;OPOS=61233907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:8:22:0:0:9:22:0:0 chr18 61234004 . G C 1083.89 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101511;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.58;QD=60.216;RBI=0.044992;REFB=0;REVB=0.0438319;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223151;OID=.;OPOS=61234004;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0 chr18 61264298 . G A 2507.24 PASS AF=0.976471;AO=166;DP=170;FAO=166;FDP=170;FR=.;FRO=4;FSAF=80;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0225986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.063;QD=58.9939;RBI=0.0276678;REFB=-0.201778;REVB=0.0159628;RO=2;SAF=80;SAR=86;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109376;STB=0.511362;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-9.36273e-05;OID=.;OPOS=61264298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:170:170:2:4:166:166:0.976471:86:80:0:2:86:80:0:4 chr18 61264468 . C T 1396.43 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.733;QD=62.7607;RBI=0.0517222;REFB=0;REVB=0.0115284;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124576;OID=.;OPOS=61264468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0 chr18 61322995 . T C 2370.28 PASS AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.553;QD=64.0616;RBI=0.0637397;REFB=0;REVB=-0.0072576;RO=0;SAF=59;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24828e-05;OID=.;OPOS=61322995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:89:59:0:0:89:59:0:0 chr18 61326597 . A C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.516;QD=60.6102;RBI=0.0401684;REFB=0;REVB=0.0272199;RO=0;SAF=37;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26946e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298268;OID=.;OPOS=61326597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:1:37:0:0:1:37:0:0 chr18 61326602 . A G 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.862;QD=61.684;RBI=0.0594038;REFB=0;REVB=0.0593759;RO=0;SAF=40;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131146;OID=.;OPOS=61326602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:1:40:0:0:1:40:0:0 chr18 61326609 . T G 727.77 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.507;QD=63.2843;RBI=0.100193;REFB=0;REVB=0.098892;RO=0;SAF=45;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54366e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375071;OID=.;OPOS=61326609;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:1:45:0:0:1:45:0:0 chr18 61377579 . A C 1441.95 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0438288;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.485;QD=62.0195;RBI=0.0466532;REFB=-0.117103;REVB=0.0159864;RO=1;SAF=45;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104184;STB=0.505493;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.000299137;OID=.;OPOS=61377579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:94:93:1:1:92:92:0.989247:47:45:1:0:47:45:1:0 chr18 61379838 . T G 993.96 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322994;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0629;QD=59.341;RBI=0.0480165;REFB=0;REVB=0.0355294;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248394;OID=.;OPOS=61379838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:32:34:0:0:33:34:0:0 chr18 61379914 . T C 68.92 PASS AF=0.217391;AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0274443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.432;QD=5.99325;RBI=0.028152;REFB=-0.00319876;REVB=0.00627275;RO=36;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101609;STB=0.565089;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00988386;OID=.;OPOS=61379914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:46:46:36:36:10:10:0.217391:5:5:15:21:5:5:15:21 chr18 61383354 . C T 606.95 PASS AF=0.525862;AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0101373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.4;QD=20.9291;RBI=0.0149013;REFB=-0.0104018;REVB=-0.0109217;RO=55;SAF=24;SAR=37;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544414;STB=0.529952;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0110886;OID=.;OPOS=61383354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:55:55:61:61:0.525862:37:24:25:30:37:24:25:30 chr18 61387312 . G A 1541.9 PASS AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000758215;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.991;QD=59.8796;RBI=0.0325245;REFB=0;REVB=-0.0325157;RO=0;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.60721e-05;OID=.;OPOS=61387312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:52:51:0:0:52:51:0:0 chr18 61387333 . T A 1507.89 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.612;QD=63.4902;RBI=0.0261453;REFB=0;REVB=0.019983;RO=0;SAF=46;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.45505e-05;OID=.;OPOS=61387333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:48:46:0:0:49:46:0:0 chr18 61387389 . G A 972.82 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6955;QD=58.9586;RBI=0.0532497;REFB=0;REVB=0.0121109;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576494;OID=.;OPOS=61387389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0 chr18 61390316 . C A 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629076;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.791;QD=59.5017;RBI=0.00818752;REFB=0;REVB=0.0052404;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07498e-05;OID=.;OPOS=61390316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr18 61390332 . C T 1012.02 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0293497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.678;QD=57.8297;RBI=0.0298332;REFB=-0.10195;REVB=0.00534939;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000374801;OID=.;OPOS=61390332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:0:1:69:69:0.985714:29:40:0:0:29:40:1:0 chr18 61390361 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.602;QD=58.0611;RBI=0.0221817;REFB=0;REVB=0.00874418;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58696e-05;OID=.;OPOS=61390361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:26:35:0:0:26:35:0:0 chr18 61390570 . T G 704.98 PASS AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0176667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.207;QD=58.7487;RBI=0.0230557;REFB=-0.0505473;REVB=0.0148139;RO=2;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0034276;STB=0.501824;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000319419;OID=.;OPOS=61390570;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:48:48:2:2:46:46:0.958333:25:21:1:1:25:21:1:1 chr18 61647069 . G A 583.2 PASS AF=0.557895;AO=53;DP=97;FAO=53;FDP=95;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.00550926;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.856;QD=24.5559;RBI=0.0575527;REFB=-0.0203847;REVB=-0.0572884;RO=44;SAF=26;SAR=27;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120314;STB=0.577626;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0163921;OID=.;OPOS=61647069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:95:44:42:53:53:0.557895:27:26:28:16:27:26:28:14 chr18 62036875 . G A 1933.61 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.949;QD=61.8756;RBI=0.024861;REFB=0;REVB=-0.0088343;RO=0;SAF=52;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69581e-06;OID=.;OPOS=62036875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:73:52:0:0:73:52:0:0 chr18 63489378 . C T 2098.08 PASS AF=1;AO=133;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00505462;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1038;QD=62.6291;RBI=0.00506616;REFB=0;REVB=-0.000341738;RO=0;SAF=59;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.98246e-06;OID=.;OPOS=63489378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:134:0:0:133:134:1:74:59:0:0:75:59:0:0 chr18 63530016 . A G 1713.25 PASS AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.318;QD=60.6461;RBI=0.0446226;REFB=0;REVB=-0.0171676;RO=0;SAF=49;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34554e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.55584e-05;OID=.;OPOS=63530016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:64:49:0:0:64:49:0:0 chr18 65178280 . T C 138.18 PASS AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00268272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.727;QD=8.91478;RBI=0.0316207;REFB=-0.00982203;REVB=0.0315067;RO=43;SAF=13;SAR=6;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333269;STB=0.697781;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0193242;OID=.;OPOS=65178280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:43:43:19:19:0.306452:6:13:17:26:6:13:17:26 chr18 65182392 . T C 854.99 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00150194;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.628;QD=56.065;RBI=0.00224606;REFB=-0.189581;REVB=0.00167002;RO=1;SAF=31;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014981;STB=0.507934;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000530282;OID=.;OPOS=65182392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:29:31:1:0:29:31:1:0 chr18 66358514 . TAA T 338.62 PASS AF=0.411765;AO=56;DP=137;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=0.0128055;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=2;MLLD=51.1306;QD=9.95938;RBI=0.0188868;REFB=0.0249334;REVB=0.0138828;RO=79;SAF=22;SAR=34;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17159;STB=0.60007;STBP=0.07;TYPE=del;VARB=-0.0364723;OID=.;OPOS=66358515;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.411765:56:137:56:136:80:22:34:45:35:99:79:22:34:44:35 chr18 66504093 . A C 1804.67 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.879;QD=61.1754;RBI=0.0378208;REFB=0;REVB=0.0179086;RO=0;SAF=55;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53064e-05;OID=.;OPOS=66504093;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:118:0:0:116:118:1:61:55:0:0:61:57:0:0 chr18 66504459 . A T 1274.98 PASS AF=0.976744;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00759573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.147;QD=59.3013;RBI=0.0539104;REFB=-0.129719;REVB=0.0533726;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.510636;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.000533645;OID=.;OPOS=66504459;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:86:86:0:2:84:84:0.976744:46:38:0:0:46:38:0:2 chr18 66513615 . A G 315.65 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00058771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8896;QD=17.5362;RBI=0.0218947;REFB=-0.0041;REVB=-0.0218868;RO=38;SAF=18;SAR=16;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470234;STB=0.5263;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00541991;OID=.;OPOS=66513615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:16:18:22:16:16:18:22:16 chr18 66513641 . C A 62.08 PASS AF=0.179487;AO=13;DP=71;FAO=14;FDP=78;FR=.;FRO=64;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.0104217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.647;QD=3.18339;RBI=0.0787349;REFB=-0.00270377;REVB=-0.0780422;RO=55;SAF=0;SAR=13;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.785398;STB=0.920828;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0928083;OID=.;OPOS=66513641;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:71:78:55:64:13:14:0.179487:13:0:37:18:13:1:36:28 chr18 66513662 . T C 372.62 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.000190194;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.269;QD=19.357;RBI=0.0346162;REFB=-0.00016776;REVB=0.0346157;RO=34;SAF=18;SAR=20;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531552;STB=0.545431;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.000192514;OID=.;OPOS=66513662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:34:39:38:38:0.493506:20:18:14:20:20:18:15:24 chr18 66526176 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.751;QD=44.6898;RBI=0.0246557;REFB=0;REVB=0.0218649;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200569;OID=.;OPOS=66526176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0 chr18 66542006 . G T 187.2 PASS AF=0.411765;AO=19;DP=49;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.011005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.314;QD=14.6826;RBI=0.0127937;REFB=-0.0123259;REVB=-0.00652453;RO=30;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153402;STB=0.609651;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0184852;OID=.;OPOS=66542006;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:30:30:19:21:0.411765:8:11:13:17:8:13:13:17 chr18 66678326 . T C 321.33 PASS AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0110047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.288;QD=18.9019;RBI=0.0146319;REFB=-0.00729562;REVB=0.00964309;RO=34;SAF=15;SAR=19;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00803486;OID=.;OPOS=66678326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:19:15:15:19:19:15:15:19 chr18 67345034 . T C 2288.6 PASS AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.148;QD=63.5722;RBI=0.0505623;REFB=0;REVB=0.041228;RO=0;SAF=71;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26772e-05;OID=.;OPOS=67345034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:73:71:0:0:73:71:0:0 chr18 67365668 . A G 355.04 PASS AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.00153157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.307;QD=16.3235;RBI=0.0103404;REFB=-0.00860236;REVB=-0.0102263;RO=48;SAF=16;SAR=22;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258156;STB=0.519341;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0143532;OID=.;OPOS=67365668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:22:16:19:29:22:16:19:30 chr18 67531642 . T C 1529.5 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.261;QD=63.7293;RBI=0.0525731;REFB=0;REVB=0.0336383;RO=0;SAF=36;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150488;OID=.;OPOS=67531642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:59:36:0:0:59:37:0:0 chr18 67563041 . A AG 32.85 PASS AF=0.179104;AO=10;DP=71;FAO=12;FDP=67;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0686552;FXX=0.0694348;HRUN=0;LEN=1;MLLD=104.472;QD=1.96139;RBI=0.0686753;REFB=0.00197023;REVB=0.00166277;RO=54;SAF=9;SAR=1;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533397;STB=0.88688;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=-0.120131;OID=.;OPOS=67563042;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.179104:10:71:12:67:55:11:1:28:27:32:54:9:1:27:27 chr18 67718688 . A G 997.59 PASS AF=0.985507;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0238173;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.649;QD=57.8314;RBI=0.0241311;REFB=-0.0691787;REVB=0.00387913;RO=1;SAF=30;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154939;STB=0.508194;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-9.25945e-05;OID=.;OPOS=67718688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:69:1:1:68:68:0.985507:38:30:1:0:38:30:1:0 chr18 67806833 . A C 374.63 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0194096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.688;QD=20.8125;RBI=0.0246509;REFB=-0.00218997;REVB=0.0151965;RO=33;SAF=23;SAR=15;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519125;STB=0.522715;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00174817;OID=.;OPOS=67806833;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:34:38:38:0.527778:15:23:18:15:15:23:19:15 chr18 67863850 . T TCTC 471.92 PASS AF=0.734694;AO=33;DP=50;FAO=36;FDP=49;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0150284;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=3;MLLD=204.552;QD=38.5238;RBI=0.0226329;REFB=-0.0315495;REVB=0.0169232;RO=17;SAF=8;SAR=25;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285415;STB=0.56886;STBP=0.117;TYPE=ins;VARB=0.0130666;OID=.;OPOS=67863851;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.734694:33:50:36:49:13:11:25:7:6:94:17:8:25:11:6 chr18 67871343 . A C 1080.55 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5131;QD=60.0304;RBI=0.0627351;REFB=0;REVB=0.0391558;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621624;OID=.;OPOS=67871343;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:25:47:0:0:25:47:0:0 chr18 67992104 . G A,GA 33.01 PASS AF=0,0.142857;AO=3,9;DP=56;FAO=0,8;FDP=56;FR=.;FRO=48;FSAF=0,3;FSAR=0,5;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0153984,-0.130582;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=291.642,16.3793;QD=2.35764;RBI=0.0154647,0.146836;REFB=-0.00151239,-0.0405619;REVB=-0.00143107,-0.0671492;RO=44;SAF=3,3;SAR=0,6;SRF=17;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.545913,-0.0702573;STB=0.5,0.537289;STBP=1,0.841;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0780947;OID=.,.;OPOS=67992104,67992105;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:33:56:56:44:48:3,9:0,8:0,0.142857:0,6:3,3:17:27:0,5:0,3:20:28 chr18 70209177 . C T 1139.58 PASS AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0649539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.748;QD=59.1989;RBI=0.0740635;REFB=-0.105108;REVB=0.0355863;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00046483;OID=.;OPOS=70209177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:41:35:0:0:41:35:0:1 chr18 70417396 . C T 1556.73 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.115;QD=63.5402;RBI=0.0433213;REFB=0;REVB=-0.0114316;RO=0;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81934e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.90215e-05;OID=.;OPOS=70417396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:35:62:0:0:36:62:0:0 chr18 70532840 . T G 2054.34 PASS AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.004098;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.385;QD=61.7848;RBI=0.00765256;REFB=-0.088928;REVB=-0.00646282;RO=0;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84852e-08;STB=0.503546;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000196372;OID=.;OPOS=70532840;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:133:133:0:1:132:132:0.992481:70:62:0:0:70:62:0:1 chr18 71927987 . T C 244.17 PASS AF=0.6875;AO=23;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0123922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5141;QD=30.5217;RBI=0.0351619;REFB=0.00443279;REVB=-0.0329058;RO=9;SAF=10;SAR=13;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503491;STB=0.517226;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.00366171;OID=.;OPOS=71927987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:32:32:9:10:23:22:0.6875:13:10:4:5:12:10:4:6 chr18 72009309 . C T 497.16 PASS AF=0.383117;AO=59;DP=154;FAO=59;FDP=154;FR=.;FRO=95;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=-0.024269;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.597;QD=12.9132;RBI=0.0281268;REFB=-0.00979102;REVB=0.0142173;RO=95;SAF=34;SAR=25;SRF=55;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298669;STB=0.501691;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0149099;OID=.;OPOS=72009309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:95:95:59:59:0.383117:25:34:55:40:25:34:55:40 chr18 72009544 . C T 321.8 PASS AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.000200644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.612;QD=23.8368;RBI=0.000285519;REFB=-0.0231774;REVB=0.000203132;RO=22;SAF=13;SAR=19;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104324;STB=0.557475;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0118902;OID=.;OPOS=72009544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:19:13:12:10:19:13:12:10 chr18 72020983 . A G 496.03 PASS AF=0.477477;AO=53;DP=111;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0264413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.335;QD=17.8749;RBI=0.0301855;REFB=0.00288134;REVB=0.0145609;RO=58;SAF=26;SAR=27;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887903;STB=0.504928;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00314439;OID=.;OPOS=72020983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:58:53:53:0.477477:27:26:29:29:27:26:29:29 chr18 72021717 . T C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9856;QD=58.5876;RBI=0.0184535;REFB=0;REVB=-0.0184113;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000347922;OID=.;OPOS=72021717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0 chr18 72103782 . T C 608.5 PASS AF=0.42953;AO=64;DP=149;FAO=64;FDP=149;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.0286416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7745;QD=16.3355;RBI=0.0294858;REFB=-0.0134602;REVB=0.007005;RO=85;SAF=36;SAR=28;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152981;STB=0.585461;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0139069;OID=.;OPOS=72103782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:85:85:64:64:0.42953:28:36:35:50:28:36:35:50 chr18 72114181 . C T 37.51 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.11812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.29;QD=8.82506;RBI=0.120267;REFB=-0.0236094;REVB=0.0226206;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434685;STB=0.776761;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0296663;OID=.;OPOS=72114181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:6:5:5:1:6:5 chr18 72114455 . C T 1069.38 PASS AF=1;AO=59;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.419;QD=60.247;RBI=0.132218;REFB=0;REVB=0.120147;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321073;OID=.;OPOS=72114455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:59:71:1:22:37:0:0:31:40:0:0 chr18 72114490 . G A 253.16 PASS AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0582348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8572;QD=19.1065;RBI=0.0841663;REFB=0.0035131;REVB=0.0607674;RO=26;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207967;STB=0.511619;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.00314732;OID=.;OPOS=72114490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:11:16:16:10:11:16:16:10 chr18 72223591 . G GTGC 909.77 PASS AF=0.942029;AO=63;DP=71;FAO=65;FDP=69;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0759517;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=254.638;QD=52.7406;RBI=0.110073;REFB=-0.12757;REVB=0.0796708;RO=8;SAF=38;SAR=25;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00483348;STB=0.5099;STBP=0.536;TYPE=ins;VARB=0.00731863;OID=.;OPOS=72223592;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=GTGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.942029:63:71:65:69:4:38:27:3:1:14:8:38:25:5:3 chr18 72228124 . A G 1959.49 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.357;QD=61.7162;RBI=0.0479085;REFB=0;REVB=-0.00714093;RO=0;SAF=56;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98589e-05;OID=.;OPOS=72228124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:127:0:0:126:127:1:70:56:0:0:71:56:0:0 chr18 72234635 . C T 389.94 PASS AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0210247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.73;QD=21.6634;RBI=0.0306274;REFB=-0.0153897;REVB=-0.022271;RO=33;SAF=11;SAR=28;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187951;STB=0.60426;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0274057;OID=.;OPOS=72234635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:28:11:16:17:28:11:16:17 chr18 72343008 . T C 815.97 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.957;QD=57.2611;RBI=0.0360582;REFB=0;REVB=0.0264032;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281247;OID=.;OPOS=72343008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:27:29:0:0:28:29:0:0 chr18 72344223 . T C 609.46 PASS AF=0.5;AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.0120017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.204;QD=19.66;RBI=0.0120048;REFB=-0.0116956;REVB=-0.000270717;RO=61;SAF=26;SAR=36;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213883;STB=0.516466;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.011688;OID=.;OPOS=72344223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:61:62:62:62:0.5:36:26:27:34:36:26:28:34 chr18 72345890 . A C 238.87 PASS AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0368896;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.3441;QD=11.7962;RBI=0.0472167;REFB=0.000686795;REVB=0.0294715;RO=52;SAF=13;SAR=16;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284325;STB=0.516396;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=-0.000791137;OID=.;OPOS=72345890;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:16:13:22:30:16:13:22:30 chr18 72346494 . C G 179.51 PASS AF=0.5625;AO=13;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0215757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.009;QD=22.4388;RBI=0.0250027;REFB=-0.0138604;REVB=0.0126343;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225385;STB=0.548455;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0105418;OID=.;OPOS=72346494;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:13:18:0.5625:6:7:4:10:11:7:4:10 chr18 72347482 . T C 313.86 PASS AF=0.406977;AO=34;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00902981;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.726;QD=14.5979;RBI=0.0112712;REFB=-0.0167178;REVB=-0.00674561;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00125032;STB=0.515427;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0207716;OID=.;OPOS=72347482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:51:34:35:0.406977:19:15:22:28:19:16:22:29 chr18 72775887 . G A 404.35 PASS AF=0.609375;AO=37;DP=62;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0146544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.004;QD=25.2719;RBI=0.0214763;REFB=-0.038909;REVB=0.0156997;RO=25;SAF=20;SAR=17;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044163;STB=0.514302;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0221233;OID=.;OPOS=72775887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:25:25:37:39:0.609375:17:20:15:10:17:22:15:10 chr18 72776121 . G A 1219.03 PASS AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0186269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.107;QD=58.7485;RBI=0.0530507;REFB=-0.0886994;REVB=0.0496731;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.511361;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00125219;OID=.;OPOS=72776121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:83:83:0:2:81:81:0.975904:43:38:0:0:43:38:0:2 chr18 72914280 . G A 37.78 PASS AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0291422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.381;QD=9.44487;RBI=0.0291422;REFB=-0.0165625;REVB=4.75682e-05;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203317;STB=0.624609;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0213088;OID=.;OPOS=72914280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:3:7:3:3:3:7 chr18 72920909 . C A 593.65 PASS AF=0.556701;AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00315593;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.868;QD=24.4804;RBI=0.00509084;REFB=-0.0130763;REVB=-0.0039946;RO=42;SAF=22;SAR=32;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753311;STB=0.546991;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00974214;OID=.;OPOS=72920909;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:42:43:54:54:0.556701:32:22:21:21:32:22:22:21 chr18 74090957 . CG C 599.37 PASS AF=1;AO=59;DP=77;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064798;FXX=0.0632831;HRUN=7;LEN=1;MLLD=11.6179;QD=32.3981;RBI=0.21108;REFB=-0.014059;REVB=0.21098;RO=10;SAF=30;SAR=29;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837447;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00602765;OID=.;OPOS=74090958;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:59:77:74:74:0:32:42:0:0:9:10:30:29:2:8 chr18 74208284 . G A 912.66 PASS AF=0.494565;AO=90;DP=184;FAO=91;FDP=184;FR=.;FRO=93;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=58;FSRR=35;FWDB=0.0303511;FXX=0.00540511;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.531;QD=19.8405;RBI=0.104396;REFB=0.00415008;REVB=0.0998864;RO=93;SAF=56;SAR=34;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00140755;STB=0.504424;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=-0.0034924;OID=.;OPOS=74208284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:93:93:90:91:0.494565:34:56:58:35:35:56:58:35 chr18 74208573 . G A 58.59 PASS AF=0.5;AO=7;DP=15;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0344531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3334;QD=14.6487;RBI=0.124165;REFB=0.0120158;REVB=0.119289;RO=8;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334227;STB=0.590707;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.0057023;OID=.;OPOS=74208573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:15:16:8:8:7:8:0.5:1:6:7:1:2:6:7:1 chr18 74611127 . A G 1510.25 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.643;QD=63.5894;RBI=0.0689694;REFB=0;REVB=0.0193774;RO=0;SAF=38;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226243;OID=.;OPOS=74611127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:57:38:0:0:57:38:0:0 chr18 74671768 . T C 236.14 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00462106;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.706;QD=17.4921;RBI=0.0166687;REFB=0.00798426;REVB=-0.0160153;RO=28;SAF=9;SAR=17;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630546;STB=0.535343;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.00931757;OID=.;OPOS=74671768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:28:28:26:26:0.481481:17:9:8:20:17:9:8:20 chr18 74680259 . C T 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.188;QD=57.3858;RBI=0.0203877;REFB=0;REVB=0.0151488;RO=0;SAF=12;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157293;OID=.;OPOS=74680259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:45:12:0:0:45:12:0:0 chr18 74692336 . A G 429.9 PASS AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0115806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.213;QD=17.3695;RBI=0.0172839;REFB=-0.0233224;REVB=0.0128305;RO=55;SAF=17;SAR=27;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329589;STB=0.518475;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0391637;OID=.;OPOS=74692336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:27:17:23:32:27:17:23:32 chr18 74701984 . G A 1196.88 PASS AF=0.555556;AO=114;DP=207;FAO=115;FDP=207;FR=.;FRO=92;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=53;FSRR=39;FWDB=0.0224729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9693;QD=23.1281;RBI=0.0249036;REFB=-0.0134688;REVB=0.0107312;RO=91;SAF=63;SAR=51;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246332;STB=0.508824;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00939018;OID=.;OPOS=74701984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:91:92:114:115:0.555556:51:63:53:38:51:64:53:39 chr18 74702864 . G A 154.1 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00432371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2971;QD=14.3348;RBI=0.0223483;REFB=-0.0113912;REVB=0.0219261;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150139;STB=0.586856;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0155094;OID=.;OPOS=74702864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:9:8:16:10:9:8:16:10 chr18 74962645 . T C 344.12 PASS AF=0.344;AO=43;DP=125;FAO=43;FDP=125;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=55;FSRR=27;FWDB=0.00469124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.391;QD=11.012;RBI=0.0152694;REFB=-0.0222301;REVB=-0.0145309;RO=81;SAF=22;SAR=21;SRF=54;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178126;STB=0.604892;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0209794;OID=.;OPOS=74962645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:81:82:43:43:0.344:21:22:54:27:21:22:55:27 chr18 74980809 . G A 630.68 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.652;QD=61.5301;RBI=0.0274673;REFB=0;REVB=0.00951574;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.01663e-05;OID=.;OPOS=74980809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chr18 75796809 . G A 36.31 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0182731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9497;QD=6.91568;RBI=0.0245618;REFB=0.00913038;REVB=0.0164127;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0218636;OID=.;OPOS=75796809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:5:10:4:2:5:10 chr18 76753768 . C G 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394472;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.9151;QD=37.4864;RBI=0.0397729;REFB=0;REVB=-0.00507954;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00232284;OID=.;OPOS=76753768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr18 76754466 . C T 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.907;QD=56.9557;RBI=0.0441514;REFB=0;REVB=0.030644;RO=0;SAF=14;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180411;OID=.;OPOS=76754466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:38:14:0:0:38:14:0:0 chr18 76829525 . A G 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0177593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.41;QD=16.1989;RBI=0.0328029;REFB=-4.70867e-05;REVB=0.0275796;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.000581389;OID=.;OPOS=76829525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1 chr18 77067000 . T G 309.95 PASS AF=0.453333;AO=33;DP=73;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.00254374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.617;QD=16.5305;RBI=0.00670724;REFB=-0.0204716;REVB=-0.00620616;RO=40;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246384;STB=0.636284;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0175137;OID=.;OPOS=77067000;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:40:41:33:34:0.453333:13:20:14:26:13:21:15:26 chr18 77246406 . T G 244.7 PASS AF=0.32967;AO=30;DP=92;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0213392;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.134;QD=10.7561;RBI=0.0225932;REFB=-0.0139219;REVB=-0.00742241;RO=61;SAF=11;SAR=19;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719844;STB=0.541992;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.024294;OID=.;OPOS=77246406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:61:61:30:30:0.32967:19:11:26:35:19:11:26:35 chr18 77420703 . C G 118.39 PASS AF=0.25;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=72;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0248011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2221;QD=6.5772;RBI=0.12628;REFB=-0.0170035;REVB=-0.123821;RO=49;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194836;STB=0.597717;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0200046;OID=.;OPOS=77420703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:49:54:18:18:0.25:7:11:22:27:7:11:26:28 chr18 77439532 . T C 63.02 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0498194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.305;QD=8.40201;RBI=0.0499927;REFB=-0.00572031;REVB=0.00415968;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254235;STB=0.515754;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0116527;OID=.;OPOS=77439532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:7:2:5:16:7:2:5:16 chr18 77513721 . T C 1401.1 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139204;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.871;QD=62.9708;RBI=0.0150439;REFB=0;REVB=0.00570458;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57755e-05;OID=.;OPOS=77513721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:52:37:0:0:52:37:0:0 chr18 77728135 . G T 485.47 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.241;QD=57.1143;RBI=0.0193585;REFB=0;REVB=-0.013169;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55558e-05;OID=.;OPOS=77728135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0 chr18 77736735 . T C 657.73 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0607825;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.4751;QD=59.7938;RBI=0.0610903;REFB=-0.116458;REVB=-0.00612461;RO=1;SAF=13;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034749;STB=0.51851;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0026025;OID=.;OPOS=77736735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:30:13:1:0:30:13:1:0 chr18 77773006 . A G 48.7 PASS AF=0.147059;AO=9;DP=67;FAO=10;FDP=68;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=-0.00605001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.178;QD=2.86485;RBI=0.0279784;REFB=-0.00332389;REVB=-0.0273164;RO=57;SAF=3;SAR=6;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494424;STB=0.510396;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0284699;OID=.;OPOS=77773006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:67:68:57:58:9:10:0.147059:6:3:17:40:7:3:18:40 chr18 77773035 . G A 62.57 PASS AF=0.181818;AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00783821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.68;QD=4.55074;RBI=0.0382565;REFB=-0.00117436;REVB=-0.0374449;RO=45;SAF=3;SAR=7;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473304;STB=0.531581;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00541843;OID=.;OPOS=77773035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:55:55:45:45:10:10:0.181818:7:3:15:30:7:3:15:30 chr18 77805856 . A C 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00269532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.783;QD=14.9786;RBI=0.068218;REFB=0.00389605;REVB=-0.0681647;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406606;STB=0.523762;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.00845505;OID=.;OPOS=77805856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:5:5:6:5:5:5:6:5 chr18 77894844 . G A 100.95 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0426348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.136;QD=16.152;RBI=0.0454353;REFB=-0.0112359;REVB=0.0157048;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103751;STB=0.559901;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00513566;OID=.;OPOS=77894844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:8:5:6:6:8:5 chr18 77895078 . A G 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00309014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.683;QD=27.2218;RBI=0.00561907;REFB=-0.0161501;REVB=-0.00469308;RO=15;SAF=11;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052231;STB=0.528884;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0116435;OID=.;OPOS=77895078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:13:11:8:7:13:11:8:7 chr18 77896242 . C T 304.99 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0163537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5271;QD=20.3324;RBI=0.0190442;REFB=-0.0276567;REVB=0.00975894;RO=27;SAF=12;SAR=20;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152043;STB=0.593161;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0449329;OID=.;OPOS=77896242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:20:12:15:12:20:12:16:12 chr18 77918221 . C T 159.41 PASS AF=0.485714;AO=16;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0104509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.674;QD=18.2179;RBI=0.0179433;REFB=-0.008646;REVB=0.0145856;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790844;STB=0.555916;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0105067;OID=.;OPOS=77918221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:18:18:16:17:0.485714:11:5:7:11:12:5:7:11 chr19 282753 . G A 35.75 PASS AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0123189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.359;QD=5.95777;RBI=0.0216157;REFB=-0.0193298;REVB=-0.0177619;RO=18;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156386;STB=0.5997;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0504178;OID=.;OPOS=282753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:4:2:4:14:4:2:4:14 chr19 362283 . C T 482.88 PASS AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0188232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.01;QD=18.5723;RBI=0.0188827;REFB=0.0054955;REVB=0.00149728;RO=53;SAF=26;SAR=25;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104173;STB=0.557634;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00518949;OID=.;OPOS=362283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:53:53:51:51:0.490385:25:26:33:20:25:26:33:20 chr19 367089 . G A 420.85 PASS AF=0.512195;AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00446747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.492;QD=20.5293;RBI=0.0383383;REFB=-0.0035593;REVB=0.0380771;RO=40;SAF=26;SAR=16;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129675;STB=0.571903;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00471242;OID=.;OPOS=367089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:40:40:42:42:0.512195:16:26:19:21:16:26:19:21 chr19 371213 . T C 85.69 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.096274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.922;QD=12.2408;RBI=0.0966469;REFB=-0.00828239;REVB=0.00848184;RO=16;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517487;STB=0.795357;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0166038;OID=.;OPOS=371213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:28:28:16:17:11:11:0.392857:2:9:5:11:2:9:6:11 chr19 372661 . C A 201.04 PASS AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0163238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5742;QD=19.1467;RBI=0.018471;REFB=-0.0171742;REVB=-0.00864359;RO=21;SAF=2;SAR=18;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185187;STB=0.612778;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0130312;OID=.;OPOS=372661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:21:21:20:21:0.5:18:2:4:17:19:2:4:17 chr19 407900 . A G 184.32 PASS AF=0.4;AO=18;DP=48;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0258196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.761;QD=14.7456;RBI=0.02582;REFB=-0.0273791;REVB=0.000127571;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169044;STB=0.510111;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0342386;OID=.;OPOS=407900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:28:30:18:20:0.4:8:10:16:12:9:11:17:13 chr19 453160 . A G 1026.36 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.783;QD=59.4994;RBI=0.0155859;REFB=0;REVB=0.00565225;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54123e-05;OID=.;OPOS=453160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0 chr19 463528 . G A 634.76 PASS AF=0.467626;AO=65;DP=139;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.0653878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9673;QD=18.2665;RBI=0.0685255;REFB=-0.0130449;REVB=0.0204984;RO=74;SAF=27;SAR=38;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167809;STB=0.509311;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0154924;OID=.;OPOS=463528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:74:74:65:65:0.467626:38:27:32:42:38:27:32:42 chr19 498524 . A G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.507;QD=59.0184;RBI=0.0291083;REFB=0;REVB=0.00169212;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6994e-05;OID=.;OPOS=498524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0 chr19 549678 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.954;QD=59.4357;RBI=0.0176644;REFB=0;REVB=-0.000248988;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56321e-05;OID=.;OPOS=549678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0 chr19 579100 . C T 84.73 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0236546;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5866;QD=9.96799;RBI=0.0262207;REFB=-0.0111014;REVB=-0.0113131;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266107;STB=0.5161;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0244023;OID=.;OPOS=579100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:35:34:23:23:11:11:0.323529:5:6:12:11:5:6:12:11 chr19 579157 . T C 70.53 PASS AF=0.37037;AO=9;DP=26;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0433632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.129;QD=10.4493;RBI=0.0434626;REFB=-0.0295074;REVB=-0.00293777;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3728;STB=0.703363;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0253266;OID=.;OPOS=579157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:26:27:16:17:9:10:0.37037:5:4:2:14:5:5:3:14 chr19 579450 . G A 112.01 PASS AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0172606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.641;QD=8.96068;RBI=0.0564428;REFB=-0.0117338;REVB=0.0537389;RO=36;SAF=13;SAR=1;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616554;STB=0.887831;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0143022;OID=.;OPOS=579450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:1:13:18:18:1:13:18:18 chr19 579627 . C T 193.2 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0102455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1479;QD=16.4428;RBI=0.0102506;REFB=-0.00784009;REVB=-0.000323895;RO=27;SAF=15;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224056;STB=0.629491;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0194044;OID=.;OPOS=579627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:5:15:15:12:5:15:15:12 chr19 580388 . C G 470.35 PASS AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0640097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3742;QD=20.6749;RBI=0.066489;REFB=-0.00724964;REVB=0.0179874;RO=45;SAF=23;SAR=23;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694942;STB=0.538445;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00653199;OID=.;OPOS=580388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:23:23:26:19:23:23:26:19 chr19 582775 . A G 136.88 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0289804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.741;QD=18.2511;RBI=0.0307759;REFB=-0.0205596;REVB=-0.0103582;RO=15;SAF=11;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0331031;OID=.;OPOS=582775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:4:11:11:4:4:11:11:4 chr19 582927 . T A 227.95 PASS AF=0.419355;AO=23;DP=64;FAO=26;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00270087;FXX=0.0312451;HRUN=7;LEN=1;MLLD=278.101;QD=14.7063;RBI=0.0154538;REFB=-0.0281616;REVB=-0.015216;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10065;STB=0.592522;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.01717;OID=.;OPOS=582927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:24:36:23:26:0.419355:14:9:12:12:15:11:21:15 chr19 605171 . T C 1608.89 PASS AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.09275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.215;QD=59.5885;RBI=0.0931453;REFB=0;REVB=0.00857134;RO=0;SAF=43;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230387;OID=.;OPOS=605171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:64:43:0:0:64:44:0:0 chr19 613898 . T C 123.97 PASS AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0117526;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1578;QD=9.53613;RBI=0.0120736;REFB=-0.0170667;REVB=0.00276528;RO=36;SAF=9;SAR=7;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057711;STB=0.53444;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0420552;OID=.;OPOS=613898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:7:9:22:14:7:9:22:14 chr19 620392 . G A 208.86 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0729121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3385;QD=25.3162;RBI=0.0750438;REFB=0.0304987;REVB=0.0177594;RO=13;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840629;STB=0.546878;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.012514;OID=.;OPOS=620392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:13:7:6:7:13:7:6:7 chr19 621063 . A G 240.22 PASS AF=0.405797;AO=29;DP=70;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0295648;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7238;QD=13.926;RBI=0.0305684;REFB=-0.00781814;REVB=0.00776835;RO=41;SAF=15;SAR=14;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0052018;STB=0.514009;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0136054;OID=.;OPOS=621063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:41:41:29:28:0.405797:14:15:21:20:13:15:21:20 chr19 621070 . G A 320.72 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00598648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.281;QD=16.2391;RBI=0.0069816;REFB=-0.035385;REVB=0.00359231;RO=42;SAF=18;SAR=17;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556858;STB=0.517381;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0366457;OID=.;OPOS=621070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:44:35:35:0.443038:17:18:24:18:17:18:24:20 chr19 625198 . A G 215.26 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0288397;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.295;QD=16.5581;RBI=0.0290409;REFB=-0.0139053;REVB=-0.00341323;RO=30;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178441;STB=0.583264;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0151984;OID=.;OPOS=625198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:52:30:28:24:24:0.461538:14:10:18:12:14:10:16:12 chr19 641215 . T C 116.47 PASS AF=0.358974;AO=13;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0196421;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.448;QD=11.9458;RBI=0.0715207;REFB=-0.0125287;REVB=0.0687706;RO=25;SAF=3;SAR=10;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265113;STB=0.672219;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0350865;OID=.;OPOS=641215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:13:14:0.358974:10:3:11:14:11:3:11:14 chr19 651852 . C T 267.01 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0162081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3869;QD=20.1516;RBI=0.0168719;REFB=-0.0131675;REVB=0.0046862;RO=25;SAF=6;SAR=22;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201341;STB=0.613152;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0243321;OID=.;OPOS=651852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:22:6:10:15:22:6:10:15 chr19 687142 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.508;QD=37.4885;RBI=0.0538898;REFB=0;REVB=0.00566883;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000827098;OID=.;OPOS=687142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr19 691909 . T C 318.75 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0138788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.593;QD=20.9017;RBI=0.0227145;REFB=-0.020144;REVB=0.0179813;RO=28;SAF=15;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378112;STB=0.520945;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0108665;OID=.;OPOS=691909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:18:15:14:14:18:15:14:14 chr19 731144 . A G 505.58 PASS AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0107666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4654;QD=20.223;RBI=0.0125611;REFB=-0.0357942;REVB=-0.0064702;RO=51;SAF=22;SAR=27;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200286;STB=0.511107;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0367527;OID=.;OPOS=731144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:27:22:24:27:27:22:24:27 chr19 756985 . T G 133.08 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0648295;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1053;QD=14.0082;RBI=0.0748792;REFB=-0.00314963;REVB=-0.0374704;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120601;STB=0.507033;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00165997;OID=.;OPOS=756985;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:23:23:15:15:0.394737:7:8:12:11:7:8:12:11 chr19 757399 . A C 187.93 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0100405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.483;QD=20.3167;RBI=0.0124499;REFB=-0.0142849;REVB=0.00736118;RO=18;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226898;STB=0.512807;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0157067;OID=.;OPOS=757399;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:9:10:9:9:9:10:9:9 chr19 757412 . AG GG,GT 177.49 PASS AF=0.461538,0;AO=18,2;DP=41;FAO=18,0;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10,0;FSAR=8,0;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0096167,-0.00821606;FXX=0.0487686;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=127.574,223.356;QD=18.2044;RBI=0.0249501,0.0162397;REFB=-0.0245592,-0.0137825;REVB=-0.0230223,-0.014008;RO=20;SAF=10,0;SAR=8,2;SRF=9;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0974848,-0.489708;STB=0.568106,0.5;STBP=0.456,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0386421,0;OID=.,.;OPOS=757412,757412;OREF=A,AG;OALT=G,GT;OMAPALT=GG,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:39:20:21:18,2:18,0:0.461538,0:8,2:10,0:9:11:8,0:10,0:9:12 chr19 757606 . T C 58.84 PASS AF=0.290323;AO=6;DP=27;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0231965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.244;QD=7.59235;RBI=0.0249683;REFB=-0.0121217;REVB=0.0092377;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523756;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0481148;OID=.;OPOS=757606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:27:31:21:22:6:9:0.290323:2:4:14:7:3:6:14:8 chr19 856014 . C T 104.38 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0469454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4882;QD=10.4375;RBI=0.049927;REFB=-0.00205447;REVB=0.0169954;RO=27;SAF=4;SAR=9;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320333;STB=0.692012;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00420652;OID=.;OPOS=856014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:9:4:16:11:9:4:16:11 chr19 880066 . G A 206.96 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00722684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.825;QD=17.247;RBI=0.0185906;REFB=-0.0182378;REVB=-0.0171284;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052726;STB=0.530092;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0151053;OID=.;OPOS=880066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:14:13:9:12:14:13 chr19 885818 . A G 116.66 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0862952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5951;QD=11.6655;RBI=0.0863085;REFB=-0.00203835;REVB=-0.00151915;RO=26;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787773;STB=0.546695;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=6.31508e-05;OID=.;OPOS=885818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:6:8:13:13:6:8:13:13 chr19 900951 . A G 303.44 PASS AF=0.5;AO=31;DP=64;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0761794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.759;QD=18.3905;RBI=0.0765905;REFB=-0.0306036;REVB=0.00792506;RO=32;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100596;STB=0.560403;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0253939;OID=.;OPOS=900951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:32:33:31:33:0.5:14:17:14:18:15:18:14:19 chr19 901507 . A G 510.55 PASS AF=0.556818;AO=46;DP=83;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0125463;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.714;QD=23.2068;RBI=0.0235992;REFB=-0.0305365;REVB=0.0199878;RO=35;SAF=27;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103253;STB=0.562214;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0193824;OID=.;OPOS=901507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:88:35:39:46:49:0.556818:19:27:16:19:22:27:16:23 chr19 965043 . T C 333.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.409;QD=53.3549;RBI=0.0315309;REFB=0;REVB=0.0231714;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218126;OID=.;OPOS=965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:13:11:0:0:13:12:0:0 chr19 966646 . GC G 77.51 PASS AF=0.428571;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.00648902;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.0467;QD=8.85844;RBI=0.14823;REFB=-0.0120827;REVB=-0.148088;RO=20;SAF=2;SAR=12;SRF=17;SRR=3;SSEN=0.29899;SSEP=0;SSSB=-0.666528;STB=0.884825;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.0113982;OID=.;OPOS=966647;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:14:35:15:35:20:2:13:17:3:77:20:2:12:17:3 chr19 984533 . T C 66.28 PASS AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.014744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.359;QD=12.0517;RBI=0.0181811;REFB=-0.00725768;REVB=0.010638;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288925;STB=0.517204;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0112568;OID=.;OPOS=984533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:9:4:3:6:9:4 chr19 990281 . G A 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00328796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.583;QD=12.4824;RBI=0.0145281;REFB=-0.0234939;REVB=0.0141511;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289056;STB=0.502758;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0189926;OID=.;OPOS=990281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:5:7:10:8:5:7:11:8 chr19 994099 . C CG 30.21 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0185862;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=36.9556;QD=5.03493;RBI=0.0368845;REFB=-0.0355186;REVB=-0.0318594;RO=20;SAF=6;SAR=1;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198197;STB=0.666111;STBP=0.445;TYPE=ins;VARB=0.171304;OID=.;OPOS=994100;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.291667:7:28:7:24:17:6:1:12:5:30:20:6:1:15:5 chr19 1003172 . C T 666.23 PASS AF=0.617021;AO=57;DP=94;FAO=58;FDP=94;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00516828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.448;QD=28.3502;RBI=0.0122765;REFB=-0.0234087;REVB=-0.0111356;RO=36;SAF=32;SAR=25;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835068;STB=0.547954;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0243242;OID=.;OPOS=1003172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:36:36:57:58:0.617021:25:32:16:20:25:33:16:20 chr19 1004740 . T C 334.28 PASS AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.000353344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.491;QD=16.7138;RBI=0.00282784;REFB=-0.0135279;REVB=0.00280568;RO=44;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173829;STB=0.509757;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0176526;OID=.;OPOS=1004740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:17:19:24:20:17:19:24:20 chr19 1008683 . G A 205.39 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.016508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6356;QD=23.4732;RBI=0.0655518;REFB=-0.0124879;REVB=0.0634391;RO=14;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141557;STB=0.564039;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0113863;OID=.;OPOS=1008683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:11:9:9:5:11:9:9:6 chr19 1008879 . G C 132.65 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0407749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9976;QD=15.1603;RBI=0.0429678;REFB=0.014978;REVB=-0.0135515;RO=20;SAF=12;SAR=3;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250154;STB=0.646841;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.0212679;OID=.;OPOS=1008879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:3:12:12:8:3:12:12:8 chr19 1009585 . C G 359.78 PASS AF=0.411765;AO=43;DP=103;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.00522143;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6371;QD=14.109;RBI=0.0236639;REFB=-0.00852834;REVB=-0.0230807;RO=58;SAF=25;SAR=18;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129934;STB=0.507243;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00882454;OID=.;OPOS=1009585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:58:60:43:42:0.411765:18:25:33:25:17:25:35:25 chr19 1009883 . A G 112.21 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0091226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6347;QD=16.6233;RBI=0.0825158;REFB=-0.0525324;REVB=-0.08201;RO=13;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237804;STB=0.624791;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00794071;OID=.;OPOS=1009883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:14:13:13:0.481481:10:3:6:7:10:3:6:8 chr19 1014398 . A G 392.59 PASS AF=0.58209;AO=38;DP=66;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00264398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.73;QD=23.4381;RBI=0.0132234;REFB=-0.0426585;REVB=-0.0129564;RO=28;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510552;STB=0.533735;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0475151;OID=.;OPOS=1014398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:28:28:38:39:0.58209:16:22:18:10:17:22:18:10 chr19 1032689 . G T 96.68 PASS AF=0.387097;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0456453;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.5262;QD=12.4752;RBI=0.0458981;REFB=-0.00981628;REVB=-0.00481076;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21212;STB=0.64494;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00738763;OID=.;OPOS=1032689;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:11:12:0.387097:5:6:14:5:6:6:14:5 chr19 1036552 . T C 375.31 PASS AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0544028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.829;QD=18.3075;RBI=0.0549674;REFB=-0.00402327;REVB=-0.00785778;RO=43;SAF=27;SAR=12;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115774;STB=0.564819;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00523815;OID=.;OPOS=1036552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:12:27:25:18:12:27:25:18 chr19 1036574 . C T 275.0 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.00831107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.818;QD=15.4932;RBI=0.00858963;REFB=-0.0175712;REVB=0.00216978;RO=38;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139847;STB=0.575821;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0239013;OID=.;OPOS=1036574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:40:31:31:0.43662:15:16:25:13:15:16:26:14 chr19 1038995 . A C 1049.51 PASS AF=0.534759;AO=101;DP=186;FAO=100;FDP=187;FR=.;FRO=87;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=-0.00832458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.9;QD=22.4495;RBI=0.00914943;REFB=-0.0048902;REVB=-0.00379649;RO=84;SAF=43;SAR=58;SRF=27;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902321;STB=0.541927;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00436912;OID=.;OPOS=1038995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:84:87:101:100:0.534759:58:43:27:57:58:42:29:58 chr19 1042809 . A G 90.32 PASS AF=0.428571;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0243107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.952;QD=12.9026;RBI=0.0290938;REFB=-0.00288535;REVB=0.0159824;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410147;STB=0.697354;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00585022;OID=.;OPOS=1042809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:27:28:16:16:11:12:0.428571:8:3:11:5:8:4:11:5 chr19 1045173 . G A 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0122746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9783;QD=12.9746;RBI=0.0122801;REFB=-0.0301611;REVB=0.000365563;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0318098;OID=.;OPOS=1045173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:8:4:6:12:8:4:6:12 chr19 1047002 . A G 75.57 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0324986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9969;QD=11.6262;RBI=0.0835679;REFB=-0.00985478;REVB=-0.0769898;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217976;STB=0.630875;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0163759;OID=.;OPOS=1047002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:7:3:8:8:7:3:8:8 chr19 1047161 . A G 270.39 PASS AF=0.430556;AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00640984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.307;QD=15.0219;RBI=0.0138303;REFB=-0.00644913;REVB=-0.0122552;RO=37;SAF=8;SAR=22;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185745;STB=0.622356;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00791274;OID=.;OPOS=1047161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:37:41:30:31:0.430556:22:8:16:21:22:9:20:21 chr19 1047537 . A C 141.93 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0817476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9279;QD=13.8468;RBI=0.0852132;REFB=-0.0184055;REVB=-0.0240547;RO=25;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209509;STB=0.621474;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0254106;OID=.;OPOS=1047537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:7:9:9:16:7:9:9:16 chr19 1049305 . C A 707.08 PASS AF=0.423913;AO=77;DP=184;FAO=78;FDP=184;FR=.;FRO=106;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=62;FSRR=44;FWDB=0.0270612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0183;QD=15.3713;RBI=0.0588307;REFB=0.000502857;REVB=0.0522374;RO=103;SAF=36;SAR=41;SRF=59;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107568;STB=0.563421;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.000505848;OID=.;OPOS=1049305;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:103:106:77:78:0.423913:41:36:59:44:41:37:62:44 chr19 1052005 . C T 224.04 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00010043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.436;QD=14.936;RBI=0.00243946;REFB=-0.0254652;REVB=-0.00243739;RO=34;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775006;STB=0.544007;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0444736;OID=.;OPOS=1052005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:15:11:17:17:15:11:17:17 chr19 1053524 . C G 114.01 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.050294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.462;QD=19.0016;RBI=0.11463;REFB=-0.00358062;REVB=-0.103008;RO=10;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256042;STB=0.620075;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00202685;OID=.;OPOS=1053524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:10:11:13:13:0.541667:7:6:8:2:7:6:8:3 chr19 1054060 . A G 271.11 PASS AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0145237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.15;QD=30.1229;RBI=0.0205372;REFB=-0.0244254;REVB=-0.0145202;RO=12;SAF=20;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283185;STB=0.657744;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0277211;OID=.;OPOS=1054060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:4:20:6:6:4:20:6:6 chr19 1055191 . G A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0242133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.662;QD=14.7986;RBI=0.0278989;REFB=-0.0215387;REVB=0.0138587;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208455;STB=0.512173;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0211808;OID=.;OPOS=1055191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:7:4:5:8:7:4:5:8 chr19 1056065 . A G 120.36 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00921068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.371;QD=24.0719;RBI=0.0183333;REFB=-0.0520752;REVB=-0.0158516;RO=6;SAF=4;SAR=9;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974122;STB=0.509077;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0149452;OID=.;OPOS=1056065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:6:7:13:13:0.65:9:4:1:5:9:4:2:5 chr19 1056492 . G C 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5107;QD=37.4854;RBI=0.0896198;REFB=0;REVB=0.0817768;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00943073;OID=.;OPOS=1056492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr19 1058176 . A G 300.71 PASS AF=0.576923;AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0197099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7364;QD=23.1318;RBI=0.0228951;REFB=-0.00607881;REVB=0.0116492;RO=22;SAF=15;SAR=14;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084127;STB=0.538436;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00307743;OID=.;OPOS=1058176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:22:22:29:30:0.576923:14:15:9:13:15:15:9:13 chr19 1059004 . A G 76.11 PASS AF=0.323529;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=-0.0177592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.31;QD=8.95451;RBI=0.0291508;REFB=-0.0116727;REVB=-0.0231167;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405356;STB=0.761973;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0310891;OID=.;OPOS=1059004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:33:34:22:23:10:11:0.323529:6:4:17:5:7:4:18:5 chr19 1062192 . T C 239.33 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0240577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.655;QD=20.8114;RBI=0.0322747;REFB=-0.0180647;REVB=-0.0215148;RO=23;SAF=5;SAR=18;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196491;STB=0.611545;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0267051;OID=.;OPOS=1062192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:18:5:9:14:18:5:9:14 chr19 1064193 . G A 594.6 PASS AF=0.551402;AO=59;DP=107;FAO=59;FDP=107;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.00141957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.246;QD=22.2282;RBI=0.00722806;REFB=-0.035492;REVB=0.00708729;RO=48;SAF=30;SAR=29;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112861;STB=0.561745;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0203122;OID=.;OPOS=1064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:48:48:59:59:0.551402:29:30:31:17:29:30:31:17 chr19 1068734 . T C 565.31 PASS AF=0.444444;AO=60;DP=134;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=-0.0132849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.949;QD=16.7499;RBI=0.0301712;REFB=-0.0253989;REVB=-0.027089;RO=74;SAF=20;SAR=40;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635802;STB=0.532598;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0378534;OID=.;OPOS=1068734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:74:75:60:60:0.444444:40:20:29:45:40:20:29:46 chr19 1068738 . G A 565.28 PASS AF=0.444444;AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.0440204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.261;QD=16.7489;RBI=0.0499473;REFB=-0.018239;REVB=0.0235994;RO=75;SAF=20;SAR=40;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583374;STB=0.532598;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0128629;OID=.;OPOS=1068738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:75:75:60:60:0.444444:40:20:29:46:40:20:29:46 chr19 1074000 . A C,T 1224.54 PASS AF=0.037037,0.962963;AO=4,77;DP=81;FAO=3,78;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=3,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055472,0.0341122;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=10.4279,137.77;QD=60.4711;RBI=0.0605169,0.0363133;REFB=0,0;REVB=-0.0241899,0.0124506;RO=0;SAF=1,31;SAR=3,46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,3.64555e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.035631,0.00038009;OID=.,.;OPOS=1074000,1074000;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:81:81:0:0:4,77:3,78:0.037037,0.962963:3,46:1,31:0:0:3,46:0,32:0:0 chr19 1080311 . G C 237.12 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0910088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5539;QD=49.9194;RBI=0.151436;REFB=0;REVB=0.121038;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00746846;OID=.;OPOS=1080311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:4:15:0:0:4:15:0:0 chr19 1081617 . A G 75.14 PASS AF=1;AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2277;QD=37.5707;RBI=0.147653;REFB=0;REVB=0.135276;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0152304;OID=.;OPOS=1081617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:6:8:1:2:4:0:0:4:4:0:0 chr19 1085966 . A G 92.98 PASS AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00629251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.512;QD=9.53617;RBI=0.0415043;REFB=-0.00308397;REVB=-0.0410245;RO=27;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634537;STB=0.538398;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00469926;OID=.;OPOS=1085966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:6:6:15:12:6:6:15:12 chr19 1094004 . G A 1272.08 PASS AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.736;QD=61.3052;RBI=0.0280579;REFB=0;REVB=0.00799894;RO=1;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126271;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41079e-05;OID=.;OPOS=1094004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:1:0:82:83:1:37:45:0:1:38:45:0:0 chr19 1105213 . C T 229.55 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0377307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.506;QD=22.395;RBI=0.0393618;REFB=-0.0186547;REVB=0.0112136;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724577;STB=0.540504;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.019291;OID=.;OPOS=1105213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:12:10:7:12:12:10:7:12 chr19 1231142 . T C 327.06 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400523;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.673;QD=54.5106;RBI=0.0634409;REFB=0;REVB=0.0491992;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345076;OID=.;OPOS=1231142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr19 1235487 . G A 144.15 PASS AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0339388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0494;QD=24.025;RBI=0.0491954;REFB=-0.055798;REVB=0.0356138;RO=9;SAF=2;SAR=13;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321265;STB=0.683919;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.034109;OID=.;OPOS=1235487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:13:2:4:5:13:2:4:5 chr19 1256998 . C T 531.25 PASS AF=0.478632;AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=-0.00791315;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.579;QD=18.1624;RBI=0.0113775;REFB=-0.00694277;REVB=0.00817491;RO=61;SAF=24;SAR=32;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11476;STB=0.56343;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00885513;OID=.;OPOS=1256998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:61:61:56:56:0.478632:32:24:19:42:32:24:19:42 chr19 1258801 . AG AA,GA 40.87 PASS AF=0.173913,0.130435;AO=3,3;DP=22;FAO=4,3;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4,3;FSAR=0,0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.00248502,-0.0122018;FXX=0.079968;HRUN=1,10;LEN=1,2;MLLD=212.99,34.8764;QD=7.10736;RBI=0.00248502,0.0122018;REFB=0.00360619,0.00225681;REVB=0,0;RO=13;SAF=3,3;SAR=0,0;SRF=13;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.024809,-0.088613;OID=.,.;OPOS=1258802,1258801;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:22:23:13:16:3,3:4,3:0.173913,0.130435:0,0:3,3:13:0:0,0:4,3:16:0 chr19 1271584 . C T 69.61 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0130807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4858;QD=16.38;RBI=0.0142171;REFB=-0.0153604;REVB=0.00556963;RO=8;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263859;STB=0.65587;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00868723;OID=.;OPOS=1271584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:7:2:4:4:7:2:4:4 chr19 1272040 . T C 1916.56 PASS AF=0.992063;AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0115033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.861;QD=60.8432;RBI=0.0147075;REFB=0.0279396;REVB=0.00916432;RO=1;SAF=59;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725375;STB=0.503816;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-5.13467e-05;OID=.;OPOS=1272040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:126:126:1:1:124:125:0.992063:65:59:0:1:65:60:0:1 chr19 1277275 . G C 413.72 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114432;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2738;QD=55.1624;RBI=0.020656;REFB=-0.132737;REVB=0.0171966;RO=1;SAF=14;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03211;STB=0.517229;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00214928;OID=.;OPOS=1277275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:31:30:1:1:29:29:0.966667:15:14:1:0:15:14:1:0 chr19 1321754 . G A 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.000188496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=319.051;QD=19.3436;RBI=0.000584243;REFB=-0.0181954;REVB=0.000553;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507894;STB=0.528814;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0183215;OID=.;OPOS=1321754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:11:7:8:10:11:7:8:10 chr19 1357082 . T C 618.61 PASS AF=0.457143;AO=64;DP=140;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=0.000259144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.704;QD=17.6745;RBI=0.00438026;REFB=-0.0133728;REVB=0.00437259;RO=76;SAF=40;SAR=24;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200398;STB=0.611476;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0168999;OID=.;OPOS=1357082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:76:76:64:64:0.457143:24:40:32:44:24:40:32:44 chr19 1358726 . C T 772.68 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0141527;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.364;QD=61.8144;RBI=0.0161333;REFB=0.0393107;REVB=0.00774506;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.00014241;OID=.;OPOS=1358726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:0:1:49:49:0.98:21:28:0:0:21:28:0:1 chr19 1360575 . G A 165.61 PASS AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0208062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3811;QD=11.4213;RBI=0.0633593;REFB=-0.00371173;REVB=0.0598456;RO=37;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176243;STB=0.602551;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0113739;OID=.;OPOS=1360575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:37:21:21:0.362069:8:13:17:20:8:13:17:20 chr19 1370675 . C G 193.34 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0171489;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7813;QD=13.8101;RBI=0.0181814;REFB=-0.00441258;REVB=0.00603978;RO=33;SAF=7;SAR=16;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228645;STB=0.63146;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00257666;OID=.;OPOS=1370675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:33:33:23:23:0.410714:16:7:17:16:16:7:17:16 chr19 1388538 . C T 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0238758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.373;QD=17.8402;RBI=0.0413601;REFB=-0.0125772;REVB=0.0337728;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251864;STB=0.642669;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0129574;OID=.;OPOS=1388538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:11:3:7:7:11:3 chr19 1389517 . C A 417.81 PASS AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00531424;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.342;QD=22.5842;RBI=0.00531739;REFB=-0.0120408;REVB=-0.000183017;RO=33;SAF=21;SAR=20;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956202;STB=0.552606;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00996601;OID=.;OPOS=1389517;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:20:21:13:20:20:21:13:20 chr19 1495634 . G A 145.72 PASS AF=0.470588;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0480379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3474;QD=17.1433;RBI=0.0598003;REFB=-0.0233636;REVB=0.0356151;RO=18;SAF=12;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380983;STB=0.728132;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0415047;OID=.;OPOS=1495634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:18:18:15:16:0.470588:3:12:8:10:3:13:8:10 chr19 1497543 . A G 148.37 PASS AF=0.615385;AO=15;DP=25;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.037228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.938;QD=22.8261;RBI=0.0385603;REFB=-0.0141187;REVB=-0.0100483;RO=10;SAF=5;SAR=10;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111594;STB=0.57438;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00741338;OID=.;OPOS=1497543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:26:10:10:15:16:0.615385:10:5:2:8:10:6:2:8 chr19 1510661 . A G 101.9 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.943;QD=40.7616;RBI=0.0763946;REFB=0;REVB=0.0578992;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255068;OID=.;OPOS=1510661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0 chr19 1533972 . C G 215.62 PASS AF=0.438596;AO=24;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0169284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2282;QD=15.1312;RBI=0.0176625;REFB=-0.0287228;REVB=-0.00503932;RO=32;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073137;STB=0.551295;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0469747;OID=.;OPOS=1533972;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:24:25:0.438596:11:13:15:17:11:14:15:17 chr19 1534042 . T C 212.44 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0383922;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1239;QD=19.3129;RBI=0.0853824;REFB=-0.0442183;REVB=-0.076264;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105504;STB=0.526291;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0429574;OID=.;OPOS=1534042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:20:23:21:21:0.477273:12:9:11:9:12:9:11:12 chr19 1535084 . G A 446.1 PASS AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.00518986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.945;QD=18.2082;RBI=0.0101981;REFB=-0.0211612;REVB=-0.00877871;RO=53;SAF=23;SAR=22;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746431;STB=0.541648;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0235499;OID=.;OPOS=1535084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:22:23:23:30:22:23:23:30 chr19 1535193 . GCCC G,GCCA 169.52 PASS AF=0.354167,0.0416667;AO=16,3;DP=48;FAO=17,2;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=9,1;FSAR=8,1;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0312594,-0.0444959;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=3,1;MLLD=55.3195,281.645;QD=14.1263;RBI=0.0346823,0.0444991;REFB=-0.00684625,-0.00096767;REVB=0.0150237,0.000539998;RO=26;SAF=8,2;SAR=8,1;SRF=9;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.163822,0.330599;STB=0.572435,0.579866;STBP=0.476,0.843;TYPE=del,snp;VARB=0.0127267,0.0115365;OID=.,.;OPOS=1535194,1535196;OREF=CCC,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GCCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.354167,0.0416667:16,3:48:17,2:48:29:9,1:8,1:12:17:99:26:8,2:8,1:9:17 chr19 1535205 . G C 149.11 PASS AF=0.369565;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0389744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9428;QD=12.9664;RBI=0.0739492;REFB=-0.0164174;REVB=-0.0628449;RO=29;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566555;STB=0.550961;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0241468;OID=.;OPOS=1535205;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:29:29:16:17:0.369565:8:8:13:16:8:9:13:16 chr19 1609267 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00501929;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.169;QD=58.5878;RBI=0.00539345;REFB=0;REVB=0.00197383;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34748e-06;OID=.;OPOS=1609267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chr19 1624007 . A G 854.36 PASS AF=0.409483;AO=95;DP=231;FAO=95;FDP=232;FR=.;FRO=137;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=69;FSRR=68;FWDB=-0.0305617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1108;QD=14.7303;RBI=0.0517865;REFB=-0.00799769;REVB=-0.041807;RO=136;SAF=46;SAR=49;SRF=69;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243516;STB=0.51148;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0111004;OID=.;OPOS=1624007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:232:136:137:95:95:0.409483:49:46:69:67:49:46:69:68 chr19 1782798 . A G 414.94 PASS AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300583;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.834;QD=57.2327;RBI=0.030192;REFB=0;REVB=0.00283832;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261477;OID=.;OPOS=1782798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr19 1789556 . C T 417.9 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6527;QD=53.9219;RBI=0.0197297;REFB=-0.020982;REVB=0.0137231;RO=1;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443379;STB=0.523793;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00558301;OID=.;OPOS=1789556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:10:20:0:1:10:20:0:1 chr19 1789960 . T C 135.04 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00443225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.916;QD=16.8804;RBI=0.0227494;REFB=-0.00495868;REVB=-0.0223134;RO=17;SAF=12;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399955;STB=0.732057;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00444102;OID=.;OPOS=1789960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:3:12:7:10:3:12:7:10 chr19 1796166 . C T 769.48 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.039;QD=56.9989;RBI=0.0151564;REFB=0;REVB=0.0108523;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70282e-05;OID=.;OPOS=1796166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0 chr19 1799762 . TCAA AATC,TCA,TC 107.59 PASS AF=0.2,0.12,0.6;AO=3,6,6;DP=28;FAO=5,3,15;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=0,0,0;FSAR=5,3,15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-9.748e-12,-5.76974e-12,-1.15395e-11;FXX=0.166611;HRUN=1,15,15;LEN=4,1,2;MLLD=36.1359,3.30751,5.42274;QD=17.2146;RBI=0.108881,0.0363157,0.0189366;REFB=-0.0232084,-0.124788,-0.0940006;REVB=0.108881,-0.0363157,-0.0189366;RO=3;SAF=0,0,0;SAR=3,6,6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=-0.16494,0.0479804,0.128537;OID=.,.,.;OPOS=1799762,1799764,1799764;OREF=TCAA,A,AA;OALT=AATC,-,-;OMAPALT=AATC,TCA,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:33:28:25:3:2:3,6,6:5,3,15:0.2,0.12,0.6:3,6,6:0,0,0:0:3:5,3,15:0,0,0:0:2 chr19 1810605 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.435;QD=51.1846;RBI=0.0283585;REFB=0;REVB=0.0178172;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126496;OID=.;OPOS=1810605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:3:17:0:0:3:17:0:0 chr19 1811546 . CA CG,TG 650.8 PASS AF=0.930233,0.0697674;AO=39,3;DP=43;FAO=40,3;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21,3;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155738,0.0207283;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=165.481,107.314;QD=60.5391;RBI=0.0212399,0.0246165;REFB=0,0;REVB=0.0144426,-0.0132782;RO=0;SAF=21,3;SAR=18,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.34792e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000464345,0.00565099;OID=.,.;OPOS=1811547,1811546;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:43:43:0:0:39,3:40,3:0.930233,0.0697674:18,0:21,3:0:0:19,0:21,3:0:0 chr19 1811603 . C T 153.39 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0482257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.598;QD=13.9442;RBI=0.0484532;REFB=-0.0199007;REVB=-0.00468986;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166926;STB=0.596706;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0210452;OID=.;OPOS=1811603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:9:8:17:10:9:8:17:10 chr19 1819125 . T C 466.15 PASS AF=0.688525;AO=42;DP=62;FAO=42;FDP=61;FR=.;FRO=19;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00297839;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.756;QD=30.5671;RBI=0.00553721;REFB=-0.0199173;REVB=0.00466797;RO=19;SAF=28;SAR=14;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011381;STB=0.50617;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.008974;OID=.;OPOS=1819125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:19:19:42:42:0.688525:14:28:13:6:14:28:13:6 chr19 1821637 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.35;QD=57.202;RBI=0.0305427;REFB=0;REVB=0.00248079;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100744;OID=.;OPOS=1821637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:24:6:0:0:24:6:0:0 chr19 1825927 . TCTC T,TCTT 383.51 PASS AF=0.569231,0.0153846;AO=33,3;DP=72;FAO=37,1;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=7,0;FSAR=30,1;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.00268366,-0.0149644;FXX=0.133316;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=161.636,80.3175;QD=23.6004;RBI=0.016503,0.0152336;REFB=-0.0175667,-0.00728058;REVB=0.0162833,-0.00285118;RO=30;SAF=5,1;SAR=28,2;SRF=14;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.367353,-0.140575;STB=0.588183,0.986753;STBP=0.177,0.516;TYPE=del,snp;VARB=0.0109938,0.0376913;OID=.,.;OPOS=1825928,1825930;OREF=CTC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.569231,0.0153846:33,3:72:37,1:65:27:7,0:30,1:9:18:99:30:5,1:28,2:14:16 chr19 1827565 . A G 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0164852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8091;QD=19.1803;RBI=0.0976051;REFB=-0.0323804;REVB=-0.0962029;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131312;STB=0.575046;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.013957;OID=.;OPOS=1827565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:5:8:5:6:5:8:5:6 chr19 1854557 . A G 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0222027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.931;QD=12.0148;RBI=0.025853;REFB=-0.0221799;REVB=0.0132446;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202122;STB=0.599629;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0189848;OID=.;OPOS=1854557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:1:5:4:2:1:5:5:2 chr19 1880950 . T C 242.14 PASS AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.069956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.274;QD=16.9921;RBI=0.0711769;REFB=-0.0382475;REVB=-0.0131262;RO=30;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00371759;STB=0.502091;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0528179;OID=.;OPOS=1880950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:17:10:11:19:17:10:11:19 chr19 1925970 . T C 54.36 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0275769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.29;QD=8.69776;RBI=0.035946;REFB=-0.00272489;REVB=-0.0230571;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377676;STB=0.734096;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0140962;OID=.;OPOS=1925970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:6:2:10:7:6:2:10:7 chr19 1986520 . G A 213.53 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0114956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.497;QD=16.1154;RBI=0.0172162;REFB=0.00904711;REVB=0.0128159;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116742;STB=0.565984;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.010371;OID=.;OPOS=1986520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:18:11:12:12:18:11 chr19 1997363 . A G 274.22 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00774199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2015;QD=24.9293;RBI=0.00789703;REFB=-0.0236296;REVB=-0.00155716;RO=19;SAF=15;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998414;STB=0.555511;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0155843;OID=.;OPOS=1997363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:10:15:9:10:10:15:9:10 chr19 2041032 . T C 203.05 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0158328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.241;QD=30.0814;RBI=0.07462;REFB=0.00673522;REVB=-0.0729209;RO=8;SAF=6;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361417;STB=0.519979;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-0.00341994;OID=.;OPOS=2041032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:13:6:3:5:13:6:3:5 chr19 2110746 . G A 586.93 PASS AF=0.54;AO=54;DP=100;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00203889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.473;QD=23.477;RBI=0.0509617;REFB=-0.0292891;REVB=0.0509209;RO=44;SAF=33;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111919;STB=0.572371;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.024711;OID=.;OPOS=2110746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:44:46:54:54:0.54:21:33:21:23:21:33:21:25 chr19 2116281 . T C 252.9 PASS AF=0.543478;AO=22;DP=44;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0168519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.517;QD=21.9911;RBI=0.0333651;REFB=-0.00807982;REVB=-0.0287965;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101306;STB=0.523541;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00589329;OID=.;OPOS=2116281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:46:21:21:22:25:0.543478:12:10:12:9:12:13:12:9 chr19 2116649 . A G 761.24 PASS AF=0.513158;AO=70;DP=143;FAO=78;FDP=152;FR=.;FRO=74;FSAF=50;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.0304197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.828;QD=20.0326;RBI=0.0332329;REFB=-0.0191863;REVB=-0.0133816;RO=72;SAF=45;SAR=25;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583658;STB=0.524216;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0263208;OID=.;OPOS=2116649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:152:72:74:70:78:0.513158:25:45:42:30:28:50:44:30 chr19 2138654 . T G 323.46 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.137;QD=53.9106;RBI=0.014696;REFB=0;REVB=0.014198;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264304;OID=.;OPOS=2138654;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr19 2249477 . G T 382.88 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0028893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.521;QD=17.4035;RBI=0.0392108;REFB=-0.0135285;REVB=0.0391042;RO=46;SAF=23;SAR=17;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120975;STB=0.576064;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0202499;OID=.;OPOS=2249477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:48:40:40:0.454545:17:23:32:14:17:23:34:14 chr19 2249583 . G A 168.99 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.0261858;FXX=0.0322477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=126.774;QD=22.5314;RBI=0.0319479;REFB=-0.00200348;REVB=0.0183022;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406249;STB=0.723921;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00143339;OID=.;OPOS=2249583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:13:0:9:8:13:0 chr19 2249634 . G A 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0370574;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.467;QD=18.8866;RBI=0.038248;REFB=-0.0301997;REVB=-0.00946878;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47997;STB=0.777112;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0128045;OID=.;OPOS=2249634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:6:2:5:0:6:2:5:0 chr19 2251817 . T C 353.55 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.344;QD=54.3919;RBI=0.0143505;REFB=0;REVB=0.0142873;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000426953;OID=.;OPOS=2251817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:17:8:0:0:18:8:0:0 chr19 2255311 . C G 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0270722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.209;QD=14.6578;RBI=0.0285994;REFB=-0.00462053;REVB=0.00922058;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198112;STB=0.615207;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0147822;OID=.;OPOS=2255311;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:10:7:8:5:10:7 chr19 2278755 . C T 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0408316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.741;QD=10.0327;RBI=0.0516952;REFB=-0.0196138;REVB=-0.0317045;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378245;STB=0.7397;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0407492;OID=.;OPOS=2278755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:4:3:4:1:4:3 chr19 2278936 . G A 194.76 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.088583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0164;QD=17.3119;RBI=0.0986445;REFB=-0.00909197;REVB=0.0434025;RO=25;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170646;STB=0.597601;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.015949;OID=.;OPOS=2278936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:7:13:12:13:7:13:12:13 chr19 2339958 . T C 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.92;QD=57.6807;RBI=0.035027;REFB=0;REVB=0.0302763;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200439;OID=.;OPOS=2339958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr19 2340154 . G GC 953.75 PASS AF=1;AO=79;DP=97;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.6582;QD=41.0213;RBI=0.249982;REFB=0;REVB=0.221788;RO=18;SAF=39;SAR=40;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408719;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00540324;OID=.;OPOS=2340155;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:79:97:93:93:0:46:47:0:0:19:18:39:40:11:7 chr19 2341059 . GT AC,GC 142.19 PASS AF=0.538462,0.461538;AO=7,6;DP=13;FAO=7,6;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2,4;FSAR=5,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229624,0.0256879;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=178.428,151.104;QD=43.7494;RBI=0.0231458,0.0681701;REFB=0,0;REVB=-0.00290828,-0.063145;RO=0;SAF=2,4;SAR=5,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00169024,0.00616888;OID=.,.;OPOS=2341059,2341060;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:38:13:13:0:0:7,6:7,6:0.538462,0.461538:5,2:2,4:0:0:5,2:2,4:0:0 chr19 2344022 . G A 77.64 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.022913;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3685;QD=23.8905;RBI=0.0302386;REFB=-0.0464019;REVB=-0.0197323;RO=4;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34935;STB=0.705321;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0195249;OID=.;OPOS=2344022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:13:13:4:4:9:9:0.692308:1:8:2:2:1:8:2:2 chr19 2353149 . C CA 48.06 PASS AF=1;AO=2;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-3.01743e-11;FXX=0.142653;HRUN=0;LEN=1;MLLD=156.81;QD=32.0418;RBI=0.0100475;REFB=0;REVB=-0.0100475;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544828;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00552064;OID=.;OPOS=2353150;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:7:6:6:0:0:6:0:0:3:5:0:2:1:4 chr19 2353150 . C A 33.5 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0192715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.317;QD=19.142;RBI=0.0368861;REFB=-0.119146;REVB=0.0314515;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171367;STB=0.59965;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0106011;OID=.;OPOS=2353150;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:0:2:4:1:0:2 chr19 2389866 . C T 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00487082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.674;QD=17.1001;RBI=0.006514;REFB=-0.0340664;REVB=0.00432519;RO=15;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211805;STB=0.62119;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0217183;OID=.;OPOS=2389866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:6:8:5:10:6:8:5:10 chr19 2396556 . C T 88.33 PASS AF=1;AO=5;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.305;QD=39.2566;RBI=0.0449218;REFB=0;REVB=0.0443175;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073002;OID=.;OPOS=2396556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:5:9:1:3:2:0:0:6:3:0:0 chr19 2396611 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.912;QD=43.4861;RBI=0.0190341;REFB=0;REVB=-0.0109375;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74005e-05;OID=.;OPOS=2396611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0 chr19 2398849 . A G 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00837022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.515;QD=61.0485;RBI=0.0166902;REFB=0;REVB=0.0144396;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83936e-05;OID=.;OPOS=2398849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:46:32:0:0:46:32:0:0 chr19 2433890 . A G 201.67 PASS AF=0.588235;AO=19;DP=33;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0153158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.371;QD=23.7264;RBI=0.019226;REFB=-0.0350344;REVB=0.0116217;RO=13;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337889;STB=0.681648;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0201039;OID=.;OPOS=2433890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:13:14:19:20:0.588235:12:7:11:2:12:8:12:2 chr19 2714720 . A G 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.015;QD=56.1885;RBI=0.0319985;REFB=0;REVB=0.0287554;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25227e-05;OID=.;OPOS=2714720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr19 2714771 . T C 442.58 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000578132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6225;QD=57.1071;RBI=0.000660584;REFB=0;REVB=-0.000319585;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17395e-05;OID=.;OPOS=2714771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:14:17:0:0 chr19 2717256 . C G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.014;QD=55.656;RBI=0.0445149;REFB=0;REVB=0.0376164;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438505;OID=.;OPOS=2717256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr19 2732986 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.48;QD=35.5759;RBI=0.0219349;REFB=0;REVB=0.0163246;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63391e-05;OID=.;OPOS=2732986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr19 2761512 . G A 192.5 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00866199;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.7;QD=22.0003;RBI=0.016639;REFB=-0.0253247;REVB=0.0142066;RO=15;SAF=12;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299237;STB=0.52784;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0264108;OID=.;OPOS=2761512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:15:16:19:19:0.542857:7:12:10:5:7:12:11:5 chr19 2762585 . A C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.614;QD=61.6839;RBI=0.0253304;REFB=0;REVB=0.00240009;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179912;OID=.;OPOS=2762585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr19 2767192 . G T 411.47 PASS AF=0.56338;AO=36;DP=73;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0217048;FXX=0.0657808;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.126;QD=23.1812;RBI=0.022812;REFB=-0.0579097;REVB=0.0070206;RO=25;SAF=13;SAR=23;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182001;STB=0.603721;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.033948;OID=.;OPOS=2767192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:25:31:36:40:0.56338:23:13:15:10:26:14:18:13 chr19 2853566 . A G 191.24 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.597;QD=47.8091;RBI=0.0680809;REFB=0;REVB=-0.024561;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000884333;OID=.;OPOS=2853566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr19 2896818 . C T 196.93 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0209451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2884;QD=12.9134;RBI=0.0296548;REFB=0.00852927;REVB=-0.0209931;RO=36;SAF=20;SAR=4;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24878;STB=0.658764;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0145603;OID=.;OPOS=2896818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:4:20:24:12:4:20:24:13 chr19 2896948 . T C 362.36 PASS AF=0.394495;AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=0.0467606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.335;QD=13.2976;RBI=0.0471315;REFB=-0.0145074;REVB=0.00590125;RO=66;SAF=26;SAR=17;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706005;STB=0.539909;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0272921;OID=.;OPOS=2896948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:66:66:43:43:0.394495:17:26:44:22:17:26:44:22 chr19 2896953 . A G 375.9 PASS AF=0.40367;AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=0.00874818;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.471;QD=13.7943;RBI=0.00879325;REFB=-0.00916017;REVB=-0.000889148;RO=66;SAF=27;SAR=17;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603293;STB=0.54051;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0158043;OID=.;OPOS=2896953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:66:65:44:44:0.40367:17:27:44:22:17:27:44:21 chr19 2915738 . T A 315.8 PASS AF=0.485714;AO=33;DP=69;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00739233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1075;QD=18.0456;RBI=0.0213415;REFB=-0.00835839;REVB=0.0200203;RO=35;SAF=11;SAR=22;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148607;STB=0.596542;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0134091;OID=.;OPOS=2915738;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:35:36:33:34:0.485714:22:11:17:18:23:11:18:18 chr19 2917186 . T C 171.14 PASS AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0217924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.945;QD=14.882;RBI=0.0242581;REFB=0.000777154;REVB=-0.0106557;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089381;STB=0.551939;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00180628;OID=.;OPOS=2917186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:17:17:0.369565:9:8:15:12:9:8:15:12 chr19 2917287 . C A 94.91 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0594726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1387;QD=11.8637;RBI=0.0673153;REFB=0.0102783;REVB=0.0315334;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130663;STB=0.576801;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.0236051;OID=.;OPOS=2917287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:6:14:7:5:6:14 chr19 2917612 . T C 372.63 PASS AF=0.631579;AO=35;DP=58;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00195326;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.277;QD=26.1494;RBI=0.00459078;REFB=0.00149183;REVB=0.00415452;RO=21;SAF=15;SAR=20;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982625;STB=0.546849;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.00108194;OID=.;OPOS=2917612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:21:21:35:36:0.631579:20:15:12:9:20:16:12:9 chr19 2994903 . T C 532.33 PASS AF=0.452381;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=0.00889134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.648;QD=16.8995;RBI=0.0093954;REFB=-0.00881409;REVB=0.00303607;RO=65;SAF=12;SAR=45;SRF=18;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897236;STB=0.550277;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00943009;OID=.;OPOS=2994903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:65:69:57:57:0.452381:45:12:18:47:45:12:19:50 chr19 2994921 . G A 670.85 PASS AF=0.459459;AO=68;DP=149;FAO=68;FDP=148;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=21;FSRR=59;FWDB=-0.0170131;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.109;QD=18.1311;RBI=0.0346751;REFB=-0.0185963;REVB=0.0302145;RO=79;SAF=14;SAR=54;SRF=21;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083465;STB=0.544341;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0225788;OID=.;OPOS=2994921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:79:80:68:68:0.459459:54:14:21:58:54:14:21:59 chr19 2997897 . G A 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00042294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.242;QD=17.1001;RBI=0.0170528;REFB=-0.0218117;REVB=0.0170475;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644073;STB=0.51513;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0175714;OID=.;OPOS=2997897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:8:6:5:9:8:6:6:9 chr19 3014639 . A G 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00982212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.832;QD=20.2683;RBI=0.0162214;REFB=0.00308076;REVB=-0.0129097;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289559;STB=0.662107;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00274327;OID=.;OPOS=3014639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:9:12:5:16:9:12:5:16 chr19 3028852 . GGCC GC,GGC,GG 141.84 PASS AF=0,0.826087,0.0869565;AO=3,10,4;DP=25;FAO=0,19,2;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=0,13,2;FSAR=0,6,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0600375,0.139479,0.0720527;FXX=0.0416493;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,2;MLLD=8.86128,12.4154,14.5536;QD=24.6671;RBI=0.4566,0.216945,0.120688;REFB=0.0103303,-0.0058537,-0.00430859;REVB=-0.452636,-0.166164,-0.0968197;RO=7;SAF=0,10,2;SAR=3,0,2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0.382979,0,0;SSSB=-0.722194,0.788545,-0.213092;STB=0.5,0.535678,0.5;STBP=1,0.414,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.0159458,0.000362837;OID=.,.,.;OPOS=3028853,3028854,3028854;OREF=GC,C,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,GGC,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.826087,0.0869565:3,10,4:25:0,19,2:23:2:0,13,2:0,6,0:2:0:9:7:0,10,2:3,0,2:5:2 chr19 3028871 . G C 134.53 PASS AF=0.454545;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.000978193;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.313;QD=16.3068;RBI=0.00318459;REFB=-0.0233539;REVB=-0.00303064;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078252;STB=0.542801;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0255839;OID=.;OPOS=3028871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:19:18:14:15:0.454545:7:7:11:8:7:8:11:7 chr19 3062857 . T C 1539.46 PASS AF=0.946903;AO=107;DP=114;FAO=107;FDP=113;FR=.;FRO=6;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0258225;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.529;QD=54.4942;RBI=0.0545884;REFB=-0.0790451;REVB=0.0480947;RO=6;SAF=53;SAR=54;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330799;STB=0.517455;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00341947;OID=.;OPOS=3062857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:114:113:6:6:107:107:0.946903:54:53:1:5:54:53:1:5 chr19 3119239 . C T 483.27 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.479;QD=58.5786;RBI=0.0192321;REFB=0;REVB=0.00177917;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15626e-05;OID=.;OPOS=3119239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0 chr19 3122243 . C T 325.79 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0338946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.848;QD=24.5876;RBI=0.0342884;REFB=-0.0210153;REVB=0.00518183;RO=21;SAF=15;SAR=17;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133935;STB=0.573432;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0144308;OID=.;OPOS=3122243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:17:15:6:15:17:15:6:15 chr19 3150238 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00432291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.339;QD=54.5165;RBI=0.0154535;REFB=0;REVB=-0.0148366;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102682;OID=.;OPOS=3150238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr19 3155902 . G A 198.25 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0292204;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.713;QD=14.6853;RBI=0.0313695;REFB=-0.0137057;REVB=0.0114111;RO=31;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00565179;STB=0.503223;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0167386;OID=.;OPOS=3155902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:11:12:16:15:11:12:16:15 chr19 3186085 . G T 234.98 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=5;FWDB=0.00552687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.853;QD=15.4087;RBI=0.0290518;REFB=-0.0195247;REVB=0.0285212;RO=33;SAF=13;SAR=14;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358298;STB=0.704064;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0229734;OID=.;OPOS=3186085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:34:27:27:0.442623:14:13:28:5:14:13:29:5 chr19 3207422 . T C 38.47 PASS AF=0.428571;AO=5;DP=13;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0651098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.998;QD=10.9907;RBI=0.0702648;REFB=-0.0216725;REVB=0.026417;RO=8;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430337;STB=0.788428;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0609554;OID=.;OPOS=3207422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:14:8:8:5:6:0.428571:4:1:5:3:5:1:5:3 chr19 3534463 . C T 690.35 PASS AF=0.4625;AO=74;DP=160;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=59;FSRR=27;FWDB=-0.00077924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.416;QD=17.2588;RBI=0.00445385;REFB=-0.0083268;REVB=-0.00438515;RO=86;SAF=43;SAR=31;SRF=59;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106807;STB=0.559037;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00693131;OID=.;OPOS=3534463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:86:86:74:74:0.4625:31:43:59:27:31:43:59:27 chr19 3534842 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.284;QD=43.4862;RBI=0.0240526;REFB=0;REVB=0.00370906;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100904;OID=.;OPOS=3534842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr19 3543397 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.107;QD=48.7373;RBI=0.0159764;REFB=0;REVB=0.00529152;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10804e-05;OID=.;OPOS=3543397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr19 3548231 . A G 456.47 PASS AF=0.523256;AO=44;DP=85;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0166991;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3361;QD=21.2312;RBI=0.0535328;REFB=-0.0224664;REVB=-0.0508615;RO=40;SAF=21;SAR=23;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626153;STB=0.522717;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0192492;OID=.;OPOS=3548231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:40:41:44:45:0.523256:23:21:22:18:23:22:22:19 chr19 3576314 . CCTTCT CCT,CCTTCC 828.65 PASS AF=0.915254,0.0847458;AO=51,4;DP=61;FAO=54,5;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22,2;FSAR=32,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00424067,0.00376195;FXX=0.0483793;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=238.249,31.4012;QD=56.1798;RBI=0.0192572,0.0400658;REFB=0,0;REVB=0.0187845,-0.0398888;RO=0;SAF=22,1;SAR=29,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00195351,0.0216923;OID=.,.;OPOS=3576315,3576319;OREF=CTT,T;OALT=-,C;OMAPALT=CCT,CCTTCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.915254,0.0847458:51,4:61:54,5:59:0:22,2:32,3:0:0:20:0:22,1:29,3:0:0 chr19 3590131 . C T 133.33 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0130901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1112;QD=15.6859;RBI=0.0390706;REFB=-0.0116218;REVB=-0.0368125;RO=19;SAF=4;SAR=11;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483669;STB=0.776606;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0196353;OID=.;OPOS=3590131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:11:4:15:4:11:4:15:4 chr19 3592171 . T C 152.34 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0145416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6469;QD=21.0119;RBI=0.0174986;REFB=-0.0447077;REVB=-0.00973373;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633569;STB=0.51722;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0117302;OID=.;OPOS=3592171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:29:12:13:16:16:0.551724:8:8:5:7:8:8:6:7 chr19 3593004 . A G 224.91 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0328141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3453;QD=19.9922;RBI=0.0883217;REFB=-0.037179;REVB=-0.0819998;RO=22;SAF=11;SAR=11;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285588;STB=0.644324;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0219808;OID=.;OPOS=3593004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:23:22:22:0.488889:11:11:4:18:11:11:5:18 chr19 3600390 . G A 423.71 PASS AF=0.447619;AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0157808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.772;QD=16.1414;RBI=0.0164555;REFB=-0.0218128;REVB=0.0046639;RO=58;SAF=20;SAR=27;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742253;STB=0.541529;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0270063;OID=.;OPOS=3600390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:58:58:47:47:0.447619:27:20:29:29:27:20:29:29 chr19 3610887 . C T 167.91 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0179276;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.916;QD=15.6194;RBI=0.0253892;REFB=-0.0183605;REVB=-0.0179782;RO=25;SAF=13;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334268;STB=0.693113;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0206008;OID=.;OPOS=3610887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:5:13:10:15:5:13:10:15 chr19 3611765 . A G 256.09 PASS AF=1;AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.007;QD=51.2176;RBI=0.0133392;REFB=0;REVB=0.00876593;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237774;OID=.;OPOS=3611765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:18:20:1:9:9:0:0:11:9:0:0 chr19 3611972 . G A 1212.25 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0497209;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.552;QD=61.3796;RBI=0.055678;REFB=0;REVB=0.0250575;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125575;OID=.;OPOS=3611972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:35:44:0:0:35:44:0:0 chr19 3614403 . T C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00349459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.806;QD=62.0219;RBI=0.0443837;REFB=0;REVB=0.0442459;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105643;OID=.;OPOS=3614403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr19 3633115 . C A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.187;QD=43.4861;RBI=0.0445954;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536167;OID=.;OPOS=3633115;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:0:12:0:0:0:12:0:0 chr19 3653525 . C T 744.83 PASS AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0365672;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=225.44;QD=54.1697;RBI=0.0372117;REFB=0.177674;REVB=0.00689577;RO=1;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000272795;OID=.;OPOS=3653525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:53:54:0.981818:24:29:1:0:24:30:1:0 chr19 3730041 . C T 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0152692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.015;QD=14.6656;RBI=0.0251471;REFB=-0.00774037;REVB=-0.0199808;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401765;STB=0.733022;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0171336;OID=.;OPOS=3730041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:4:11:7:14:4:11:7:14 chr19 3738649 . A C 130.03 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00822017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8552;QD=13.3363;RBI=0.0497933;REFB=0.00564507;REVB=-0.0491101;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787323;STB=0.546014;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.010468;OID=.;OPOS=3738649;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:8:7:13:11:8:7:13:11 chr19 3738971 . A G 140.77 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0117212;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2882;QD=12.513;RBI=0.030994;REFB=0.00718441;REVB=-0.0286922;RO=29;SAF=2;SAR=14;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359178;STB=0.717621;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0127451;OID=.;OPOS=3738971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:14:2:10:19:14:2:10:19 chr19 3746087 . G A 244.15 PASS AF=0.5;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00206802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.182;QD=18.7808;RBI=0.00207341;REFB=-0.00746788;REVB=-0.000149411;RO=24;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753359;STB=0.519388;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00958928;OID=.;OPOS=3746087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:24:26:26:26:0.5:12:14:15:9:12:14:15:11 chr19 3750205 . T TG,TGG 526.31 PASS AF=0,1;AO=9,34;DP=49;FAO=0,47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442982,0.0251445;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=14.5409,24.2289;QD=44.7927;RBI=0.056944,0.0335579;REFB=0,0;REVB=0.035781,0.0222236;RO=2;SAF=4,11;SAR=5,23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.176689,-0.0776698;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00409403;OID=.,.;OPOS=3750206,3750206;OREF=-,-;OALT=G,GG;OMAPALT=TG,TGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1:9,34:49:0,47:47:0:0,18:0,29:0:0:10:2:4,11:5,23:2:0 chr19 3750615 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0078081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.194;QD=56.7066;RBI=0.00864076;REFB=0;REVB=-0.00370085;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46052e-05;OID=.;OPOS=3750615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0 chr19 3750622 . A C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00531162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.672;QD=57.68;RBI=0.0135794;REFB=0;REVB=0.0124975;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96546e-05;OID=.;OPOS=3750622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chr19 3752563 . G A 83.9 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00842397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.833;QD=10.1699;RBI=0.00915687;REFB=-0.0140249;REVB=-0.00358956;RO=22;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503109;STB=0.530331;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0270085;OID=.;OPOS=3752563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:5:6:11:11:5:6:11:11 chr19 3752874 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00444896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.931;QD=60.6102;RBI=0.0446945;REFB=0;REVB=0.0444725;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153627;OID=.;OPOS=3752874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0 chr19 3753769 . C T 754.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.608;QD=56.9382;RBI=0.0534438;REFB=0;REVB=0.0226243;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194294;OID=.;OPOS=3753769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:25:28:0:0 chr19 3762698 . C T 405.69 PASS AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0253063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.458;QD=17.2632;RBI=0.0264116;REFB=-0.0202187;REVB=0.00756083;RO=52;SAF=26;SAR=16;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157657;STB=0.588435;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0229371;OID=.;OPOS=3762698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:16:26:24:28:16:26:24:28 chr19 3767265 . C T 428.49 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.194;QD=57.1316;RBI=0.0293799;REFB=0;REVB=0.0197261;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026164;OID=.;OPOS=3767265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:10:19:0:0:11:19:0:0 chr19 3778241 . TGGGG GTGGG,TGGGA,TGGG 100.04 PASS AF=0.0833333,0,0.458333;AO=3,2,5;DP=25;FAO=2,0,11;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=1,0,3;FSAR=1,0,8;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.020385,-0.0721857,0.0529785;FXX=0.039984;HRUN=1,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=51.3278,50.7739,19.4103;QD=16.6738;RBI=0.137816,0.0922782,0.160479;REFB=-0.0376869,0.025168,-0.0315011;REVB=-0.1363,-0.0574847,-0.151482;RO=10;SAF=0,2,0;SAR=3,0,5;SRF=10;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.410714;SSSB=-0.831614,0,-0.840897;STB=0.92185,0.5,0.823044;STBP=0.796,1,0.01;TYPE=mnp,snp,del;VARB=0.0831625,0,0.0263899;OID=.,.,.;OPOS=3778241,3778245,3778242;OREF=TG,G,G;OALT=GT,A,-;OMAPALT=GTGGG,TGGGA,TGGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:72:25:24:10:11:3,2,5:2,0,11:0.0833333,0,0.458333:3,0,5:0,2,0:10:0:1,0,8:1,0,3:11:0 chr19 3820191 . C T 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0077007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0743;QD=16.4541;RBI=0.028279;REFB=-0.0225248;REVB=-0.0272103;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.681121;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.013501;OID=.;OPOS=3820191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:1:5:2:2:1:5:2:2 chr19 3831525 . C A 203.14 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00134005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8441;QD=21.9611;RBI=0.0592637;REFB=-0.0167157;REVB=0.0592486;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317187;STB=0.51779;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0157451;OID=.;OPOS=3831525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:9:11:10:7:9:11:10:7 chr19 3831709 . C T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0014037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.485;QD=13.4856;RBI=0.0699784;REFB=-0.0151291;REVB=-0.0699643;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202897;STB=0.620415;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0124456;OID=.;OPOS=3831709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:5:6:3:6:5:6 chr19 3831765 . G A 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0154321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.971;QD=13.5765;RBI=0.018575;REFB=-0.00182959;REVB=-0.0103382;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385393;STB=0.522578;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00365105;OID=.;OPOS=3831765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:5:8:11:8:5:8:11:8 chr19 3963621 . GGCCCC GCCC,GGCCC,GGCCCT 39.06 PASS AF=0.127273,0,0.0363636;AO=9,7,2;DP=55;FAO=7,0,2;FDP=55;FR=.;FRO=46;FSAF=4,0,0;FSAR=3,0,2;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.24812,-0.313199,-0.0681155;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=20.1667,9.96548,252.254;QD=2.84045;RBI=0.291358,0.334903,0.0748433;REFB=-0.0563108,-0.0684387,-0.0050504;REVB=-0.152727,0.118602,-0.031013;RO=32;SAF=8,7,0;SAR=1,0,2;SRF=14;SRR=18;SSEN=0.311111,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.569834,0.717249,-0.421836;STB=0.513773,0.5,0.995657;STBP=0.991,1,0.1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.118082,0.0194283,0.0310524;OID=.,.,.;OPOS=3963622,3963623,3963626;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=GCCC,GGCCC,GGCCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.127273,0,0.0363636:9,7,2:55:7,0,2:55:46:4,0,0:3,0,2:27:19:29:32:8,7,0:1,0,2:14:18 chr19 3977486 . A G 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.015;QD=59.0177;RBI=0.0525592;REFB=0;REVB=0.0524044;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324391;OID=.;OPOS=3977486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr19 3979408 . A G 358.11 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.867;QD=55.0939;RBI=0.0320431;REFB=0;REVB=0.0111046;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000238518;OID=.;OPOS=3979408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0 chr19 4028783 . C T 365.73 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0147955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.615;QD=52.2473;RBI=0.0149971;REFB=-0.0832887;REVB=0.00245092;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.533308;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000559446;OID=.;OPOS=4028783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:20:7:0:0:20:7:1:0 chr19 4033462 . T C 1766.1 PASS AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0648956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.857;QD=60.8998;RBI=0.0673848;REFB=0;REVB=0.0181458;RO=0;SAF=75;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105653;OID=.;OPOS=4033462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:41:75:0:0:41:75:0:0 chr19 4042858 . G A 635.89 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00370522;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.374;QD=62.038;RBI=0.00370523;REFB=0;REVB=1.09138e-05;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60888e-05;OID=.;OPOS=4042858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr19 4042923 . A G 868.23 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00654011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.081;QD=57.8824;RBI=0.0299859;REFB=0;REVB=-0.029264;RO=0;SAF=42;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41114e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35372e-05;OID=.;OPOS=4042923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:18:42:0:0:18:42:0:0 chr19 4043024 . T C 849.82 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.312;QD=57.615;RBI=0.0434129;REFB=0;REVB=-0.0180369;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.58042e-05;OID=.;OPOS=4043024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:24:34:0:0:24:35:0:0 chr19 4046430 . CTTTTTTTTTTTTTTTTTG CTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTGTC 260.71 PASS AF=0,0.833333,0,0.166667;AO=5,12,5,4;DP=38;FAO=0,30,0,6;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21,0,6;FSAR=0,9,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581352,0.00965692,0.0143921,-0.000652276;FXX=0.099975;HRUN=17,17,17,17;LEN=5,3,2,3;MLLD=7.66125,7.76523,5.8429,207.178;QD=28.9676;RBI=0.482167,0.793519,1.16178,0.0928455;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.482132,-0.793461,-1.16169,-0.0928432;RO=0;SAF=2,12,5,4;SAR=3,0,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,mnp;VARB=0.0346917,0.0523832,0.116478,-0.0508737;OID=.,.,.,.;OPOS=4046431,4046431,4046431,4046446;OREF=TTTTT,TTT,TT,TTG;OALT=-,-,-,GTC;OMAPALT=CTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/4:0,0.833333,0,0.166667:5,12,5,4:38:0,30,0,6:36:0:0,21,0,6:0,9,0,0:0:0:33:0:2,12,5,4:3,0,0,0:0:0 chr19 4101062 . G T 300.41 PASS AF=0.888889;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0624148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.368;QD=44.5054;RBI=0.0624979;REFB=-0.0385848;REVB=-0.00322234;RO=3;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894972;STB=0.548348;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00494579;OID=.;OPOS=4101062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:27:27:3:3:24:24:0.888889:14:10:0:3:14:10:0:3 chr19 4180836 . C T 328.17 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344417;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.254;QD=54.6957;RBI=0.0807398;REFB=0;REVB=0.0730252;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418626;OID=.;OPOS=4180836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0 chr19 4186395 . T G 133.54 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0275059;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.304;QD=14.838;RBI=0.0295178;REFB=-0.0123525;REVB=-0.0107111;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.412334;STB=0.736551;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0189883;OID=.;OPOS=4186395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:21:21:15:15:0.416667:5:10:5:16:5:10:5:16 chr19 4217207 . T G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00431311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.709;QD=57.202;RBI=0.00432762;REFB=0;REVB=-0.000354077;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.44331e-05;OID=.;OPOS=4217207;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr19 4236996 . G A 133.6 PASS AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.018445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.64;QD=7.97598;RBI=0.0219596;REFB=0.00234427;REVB=-0.0119166;RO=48;SAF=14;SAR=5;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403923;STB=0.742336;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00300448;OID=.;OPOS=4236996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:5:14:19:29:5:14:19:29 chr19 4237067 . A G 72.35 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0156099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.015;QD=8.5118;RBI=0.0189261;REFB=-0.0462868;REVB=-0.0107018;RO=24;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5217;STB=0.810018;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0537834;OID=.;OPOS=4237067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:3:7:5:19:3:7:5:19 chr19 4251069 . T C 97.94 PASS AF=0.254545;AO=14;DP=55;FAO=14;FDP=55;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0298495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9589;QD=7.12311;RBI=0.0308805;REFB=-0.0180724;REVB=-0.00791263;RO=40;SAF=5;SAR=9;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231829;STB=0.634272;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0553386;OID=.;OPOS=4251069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:55:55:40:41:14:14:0.254545:9:5:22:18:9:5:22:19 chr19 4254375 . C T 70.57 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0326855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.085;QD=17.6436;RBI=0.0429088;REFB=-0.0342418;REVB=-0.0277997;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174375;STB=0.599799;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0189028;OID=.;OPOS=4254375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:6:3:1:6:6:3:1:6 chr19 4280186 . C T 346.88 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0222597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6709;QD=22.7459;RBI=0.0563508;REFB=-0.00723036;REVB=0.051768;RO=26;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349192;STB=0.51922;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00530118;OID=.;OPOS=4280186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:15:20:16:10:15:20:16:10 chr19 4306311 . T C 58.61 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0265641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.742;QD=14.6537;RBI=0.0341471;REFB=0.0066128;REVB=-0.0214563;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0119014;OID=.;OPOS=4306311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:4:4:4:4:4:4 chr19 4325433 . G A 181.54 PASS AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00690919;FXX=0.0416493;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.808;QD=31.572;RBI=0.0148682;REFB=0.00886904;REVB=0.0131653;RO=6;SAF=7;SAR=10;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384898;STB=0.521252;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00308433;OID=.;OPOS=4325433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:23:23:6:6:17:17:0.73913:10:7:2:4:10:7:2:4 chr19 4333711 . C T 266.54 PASS AF=0.340426;AO=32;DP=94;FAO=32;FDP=94;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.0424454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1462;QD=11.3419;RBI=0.0502123;REFB=-0.000439468;REVB=0.0268265;RO=62;SAF=14;SAR=18;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107865;STB=0.562461;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00232895;OID=.;OPOS=4333711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:62:62:32:32:0.340426:18:14:33:29:18:14:33:29 chr19 4357555 . A G 841.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6374;QD=57.0441;RBI=0.0749049;REFB=0;REVB=0.0271037;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000989771;OID=.;OPOS=4357555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:29:29:0:0:30:29:0:0 chr19 4442336 . C T 349.05 PASS AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.016137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.068;QD=17.9;RBI=0.0188812;REFB=-0.0219966;REVB=0.009803;RO=39;SAF=16;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00324645;STB=0.503524;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0285648;OID=.;OPOS=4442336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:41:37:37:0.474359:21:16:17:22:21:16:18:23 chr19 4442999 . T G 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116;QD=63.8694;RBI=0.0209362;REFB=0;REVB=-0.0202472;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134449;OID=.;OPOS=4442999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0 chr19 4454000 . G A 105.6 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00552193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.78;QD=20.1137;RBI=0.0166201;REFB=-0.0154728;REVB=0.0156759;RO=8;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324761;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326171;OID=.;OPOS=4454000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:20:21:8:9:12:12:0.571429:4:8:5:3:4:8:6:3 chr19 4493708 . A G 366.6 PASS AF=0.37931;AO=44;DP=116;FAO=44;FDP=116;FR=.;FRO=72;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.0274943;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.454;QD=12.6414;RBI=0.0297471;REFB=-0.0283062;REVB=-0.0113556;RO=71;SAF=23;SAR=21;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135933;STB=0.503141;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0423959;OID=.;OPOS=4493708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:71:72:44:44:0.37931:21:23:38:33:21:23:38:34 chr19 4508945 . A G 768.81 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193229;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.799;QD=64.0678;RBI=0.0604166;REFB=0;REVB=0.0572433;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36318e-05;OID=.;OPOS=4508945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chr19 4510560 . C T 313.17 PASS AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.00415993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.324;QD=19.573;RBI=0.0107323;REFB=-0.0248929;REVB=0.00989326;RO=31;SAF=13;SAR=20;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160134;STB=0.588427;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0201878;OID=.;OPOS=4510560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:20:13:7:24:20:13:7:24 chr19 4511043 . C CT 121.66 PASS AF=0.655172;AO=18;DP=30;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00845492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.2504;QD=16.7803;RBI=0.0297452;REFB=-0.0198073;REVB=0.0285183;RO=11;SAF=12;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212716;STB=0.615262;STBP=0.115;TYPE=ins;VARB=0.020444;OID=.;OPOS=4511044;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.655172:18:30:19:29:10:12:7:3:7:42:11:12:6:4:7 chr19 4511281 . G A 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00100063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.983;QD=17.3212;RBI=0.0191048;REFB=-0.0332179;REVB=0.0190786;RO=18;SAF=2;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.49963;STB=0.792024;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0168556;OID=.;OPOS=4511281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:14:2:10:8:14:2:10:8 chr19 4511350 . T A 544.68 PASS AF=0.847826;AO=39;DP=46;FAO=39;FDP=46;FR=.;FRO=7;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00557744;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.135;QD=47.3638;RBI=0.00793996;REFB=0.029808;REVB=0.00565111;RO=7;SAF=17;SAR=22;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435536;STB=0.523363;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.00505415;OID=.;OPOS=4511350;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:46:46:7:7:39:39:0.847826:22:17:2:5:22:17:2:5 chr19 4511453 . G A 480.74 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2576;QD=58.2713;RBI=0.103309;REFB=0;REVB=0.102097;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174613;OID=.;OPOS=4511453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0 chr19 4511479 . A T 30.52 PASS AF=0.208333;AO=6;DP=24;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00956479;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.367;QD=5.08731;RBI=0.00980176;REFB=-0.00794408;REVB=-0.00214224;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161893;STB=0.770795;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00504122;OID=.;OPOS=4511479;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:24:24:17:19:6:5:0.208333:4:2:8:9:4:1:10:9 chr19 4511491 . A G 45.07 PASS AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0736366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4746;QD=7.83744;RBI=0.0876896;REFB=-0.0259684;REVB=-0.0476142;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388841;STB=0.761037;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0246315;OID=.;OPOS=4511491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:23:14:16:7:7:0.304348:6:1:6:8:6:1:7:9 chr19 4511525 . AT GC,GT 350.69 PASS AF=0.0769231,0.923077;AO=2,24;DP=26;FAO=2,24;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=2,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188353,0.0367629;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=110.577,106.008;QD=53.952;RBI=0.0230045,0.0387008;REFB=0,0;REVB=-0.0132075,-0.0120931;RO=0;SAF=0,12;SAR=2,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00691527,0.00272054;OID=.,.;OPOS=4511525,4511525;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:26:26:0:0:2,24:2,24:0.0769231,0.923077:2,12:0,12:0:0:2,12:0,12:0:0 chr19 4511647 . C G 548.56 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3598;QD=57.7434;RBI=0.0269293;REFB=-0.102128;REVB=0.0221455;RO=1;SAF=20;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228411;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00631886;OID=.;OPOS=4511647;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:38:38:1:0:37:38:1:17:20:1:0:17:21:0:0 chr19 4511725 . T C 282.62 PASS AF=0.884615;AO=21;DP=23;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0468811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.49;QD=43.4805;RBI=0.0555965;REFB=0.0131402;REVB=0.0298854;RO=2;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709089;STB=0.507036;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.0388662;OID=.;OPOS=4511725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:23:26:2:3:21:23:0.884615:12:9:0:2:14:9:1:2 chr19 4511730 . T C 410.68 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.432;QD=56.6458;RBI=0.0273362;REFB=0;REVB=-0.0185799;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25235e-06;OID=.;OPOS=4511730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr19 4511737 . T C 144.97 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0234116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.0956;QD=17.5718;RBI=0.0349998;REFB=0.00548284;REVB=0.026017;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349675;STB=0.519975;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=-0.00573133;OID=.;OPOS=4511737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:7:10:10:6:7:10 chr19 4511746 . A T 107.42 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00635646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.535;QD=12.6374;RBI=0.00646503;REFB=-0.0118912;REVB=0.00117982;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00405815;STB=0.502389;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0063768;OID=.;OPOS=4511746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:8:5:8:13:8:5:8:13 chr19 4511791 . A C 129.61 PASS AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.0276757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.881;QD=9.60044;RBI=0.0286229;REFB=-0.0135579;REVB=-0.00730245;RO=37;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141149;STB=0.583241;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0230487;OID=.;OPOS=4511791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:10:7:11:26:10:7:11:26 chr19 4511830 . A G 234.86 PASS AF=0.472727;AO=25;DP=56;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00616938;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.343;QD=17.0805;RBI=0.0287376;REFB=-0.0145115;REVB=-0.0280676;RO=31;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205188;STB=0.507037;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0303039;OID=.;OPOS=4511830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:31:29:25:26:0.472727:14:11:13:18:14:12:13:16 chr19 4511908 . C T 235.0 PASS AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.045216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.761;QD=15.4097;RBI=0.0453287;REFB=-0.0158286;REVB=-0.00319469;RO=34;SAF=8;SAR=19;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09664;STB=0.554895;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0173294;OID=.;OPOS=4511908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:19:8:13:21:19:8:13:21 chr19 4511920 . T C 33.49 PASS AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0206732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.729;QD=2.09328;RBI=0.0331092;REFB=-0.00514906;REVB=-0.0258619;RO=56;SAF=3;SAR=4;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877474;STB=0.555401;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0450962;OID=.;OPOS=4511920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:64:64:56:57:7:7:0.109375:4:3:20:36:4:3:21:36 chr19 4511927 . G A 344.8 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0084986;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.7339;QD=21.8917;RBI=0.0130262;REFB=-0.0107297;REVB=0.00987197;RO=27;SAF=12;SAR=23;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238797;STB=0.50701;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00775321;OID=.;OPOS=4511927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:28:35:35:0.555556:23:12:10:17:23:12:10:18 chr19 4511929 . A G 300.66 PASS AF=0.516129;AO=31;DP=61;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0140551;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8203;QD=19.3974;RBI=0.0265218;REFB=-0.00455741;REVB=-0.0224913;RO=30;SAF=11;SAR=20;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428374;STB=0.512812;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0183991;OID=.;OPOS=4511929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:30:31:32:0.516129:20:11:12:18:20:12:12:18 chr19 4511955 . T C 1080.53 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.168;QD=60.0292;RBI=0.0408599;REFB=0;REVB=-0.0396795;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.24447e-05;OID=.;OPOS=4511955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0 chr19 4512669 . T C 1357.95 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.229;QD=62.4343;RBI=0.0489025;REFB=0;REVB=0.0325787;RO=0;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16151e-05;OID=.;OPOS=4512669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:47:40:0:0:47:40:0:0 chr19 4513143 . CA TG 137.08 PASS AF=0.928571;AO=12;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0216077;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=175.826;QD=39.1669;RBI=0.0649392;REFB=-0.227044;REVB=0.061239;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998765;STB=0.545384;STBP=0.296;TYPE=mnp;VARB=0.00767531;OID=.;OPOS=4513143;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:1:1:12:13:0.928571:4:8:0:1:5:8:0:1 chr19 4513559 . A G 571.06 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.116;QD=60.112;RBI=0.0217933;REFB=0;REVB=-0.00179223;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010946;OID=.;OPOS=4513559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0 chr19 4534017 . C G 122.71 PASS AF=0.371429;AO=10;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0170872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.34;QD=14.0234;RBI=0.0277736;REFB=-0.0166897;REVB=0.0218953;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162481;STB=0.641996;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0336171;OID=.;OPOS=4534017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:35:35:19:20:10:13:0.371429:4:6:14:5:7:6:14:6 chr19 4542981 . C A 97.54 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0889871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2524;QD=13.4541;RBI=0.0956845;REFB=-0.0335491;REVB=0.0351683;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113103;STB=0.566363;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.062023;OID=.;OPOS=4542981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:9:8:7:5:9:8 chr19 4558431 . C G 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0614156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5529;QD=12.7387;RBI=0.066548;REFB=-0.0343003;REVB=0.0256274;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926992;STB=0.599733;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0502717;OID=.;OPOS=4558431;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:9:10:8:8:0.444444:2:6:6:3:2:6:6:4 chr19 4694639 . G A 160.52 PASS AF=0.485714;AO=16;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0409071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7724;QD=18.3452;RBI=0.0452827;REFB=-0.014766;REVB=0.01942;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234065;STB=0.606768;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0163921;OID=.;OPOS=4694639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:18:18:16:17:0.485714:5:11:8:10:6:11:8:10 chr19 4769740 . C A 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.63;QD=60.3766;RBI=0.0621273;REFB=0;REVB=0.0107378;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244021;OID=.;OPOS=4769740;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0 chr19 4794257 . T G 96.21 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00857747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.673;QD=12.0258;RBI=0.0233017;REFB=-0.0126525;REVB=-0.0216656;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140483;STB=0.583194;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.019545;OID=.;OPOS=4794257;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:11:9:7:5:11:9 chr19 4818378 . T C 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.683;QD=60.6101;RBI=0.0323044;REFB=0;REVB=0.012029;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34271e-05;OID=.;OPOS=4818378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chr19 4847713 . A G 434.91 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210795;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.603;QD=57.9879;RBI=0.00420167;REFB=0;REVB=0.00363464;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61215e-05;OID=.;OPOS=4847713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0 chr19 4847874 . A G 723.89 PASS AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.103035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.498;QD=59.0933;RBI=0.103057;REFB=-0.0122925;REVB=0.00210186;RO=2;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293801;STB=0.515618;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.000666517;OID=.;OPOS=4847874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:49:49:2:2:47:47:0.959184:31:16:0:2:31:16:0:2 chr19 4852106 . A G 560.83 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159727;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.004;QD=60.63;RBI=0.0159968;REFB=0;REVB=0.000877672;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46903e-05;OID=.;OPOS=4852106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chr19 4852137 . C T 134.24 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00461403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.446;QD=16.2717;RBI=0.00580997;REFB=-0.0217363;REVB=0.00353079;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668581;STB=0.524966;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0211487;OID=.;OPOS=4852137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:18:15:15:0.454545:6:9:9:8:6:9:10:8 chr19 4859937 . T C 153.3 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0256235;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.329;QD=20.44;RBI=0.0263984;REFB=-0.00711257;REVB=0.00634922;RO=14;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330708;STB=0.687265;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00513522;OID=.;OPOS=4859937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:30:14:14:16:16:0.533333:11:5:10:4:11:5:10:4 chr19 4932725 . G A 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0212025;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.777;QD=19.4668;RBI=0.0358826;REFB=-0.0138865;REVB=-0.0289485;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115537;STB=0.565159;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0131327;OID=.;OPOS=4932725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:11:11:9:15:11:11:9:15 chr19 4945914 . A C 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00139455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.168;QD=12.3947;RBI=0.0219527;REFB=-0.000771328;REVB=-0.0219084;RO=24;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285454;STB=0.669041;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00210772;OID=.;OPOS=4945914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:10:4:13:11:10:4:13:11 chr19 4945917 . C T 117.74 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00828641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.895;QD=12.3937;RBI=0.0194738;REFB=-0.0020094;REVB=-0.0176229;RO=24;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285454;STB=0.669041;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00561759;OID=.;OPOS=4945917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:10:4:13:11:10:4:13:11 chr19 4945974 . T C 340.18 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.444;QD=54.4287;RBI=0.0871029;REFB=0;REVB=0.0848027;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001247;OID=.;OPOS=4945974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:12:11:0:0:14:11:0:0 chr19 4950770 . C T 287.63 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00532212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.27;QD=25.0111;RBI=0.023414;REFB=-0.0220745;REVB=0.0228011;RO=19;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100292;STB=0.565168;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0218624;OID=.;OPOS=4950770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:20:26:26:0.565217:13:13:12:7:13:13:13:7 chr19 4954454 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.686;QD=62.0219;RBI=0.0203082;REFB=0;REVB=0.00186402;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11846e-05;OID=.;OPOS=4954454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chr19 4954679 . G GC 207.61 PASS AF=1;AO=12;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795042;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8708;QD=41.5211;RBI=0.0871784;REFB=0;REVB=-0.0357653;RO=9;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.712389;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00298716;OID=.;OPOS=4954680;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:12:21:20:20:0:11:9:0:0:4:9:11:1:0:9 chr19 5041178 . T C 976.23 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135021;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.522;QD=59.1654;RBI=0.0696608;REFB=0;REVB=0.0683398;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147622;OID=.;OPOS=5041178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0 chr19 5110794 . A G 180.45 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0680574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.193;QD=16.0404;RBI=0.0698436;REFB=-0.00642293;REVB=-0.0156947;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181591;STB=0.54605;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0194998;OID=.;OPOS=5110794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:26:19:19:0.422222:8:11:8:13:8:11:13:13 chr19 5114112 . G A 427.48 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0415789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0138;QD=19.4308;RBI=0.0790086;REFB=-0.0190295;REVB=0.067183;RO=45;SAF=25;SAR=18;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00341588;STB=0.501898;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0174271;OID=.;OPOS=5114112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:18:25:26:19:18:25:26:19 chr19 5114116 . T G 440.28 PASS AF=0.494382;AO=42;DP=87;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00857174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.007;QD=19.7878;RBI=0.0197649;REFB=-0.019776;REVB=0.0178095;RO=45;SAF=26;SAR=16;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401787;STB=0.506846;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.020673;OID=.;OPOS=5114116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:45:45:42:44:0.494382:16:26:26:19:18:26:26:19 chr19 5135392 . A G 1081.82 PASS AF=0.915663;AO=76;DP=83;FAO=76;FDP=83;FR=.;FRO=7;FSAF=55;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00424392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.115;QD=52.1357;RBI=0.00748649;REFB=-0.0235406;REVB=-0.00616738;RO=7;SAF=55;SAR=21;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834943;STB=0.544335;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00212554;OID=.;OPOS=5135392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:83:83:7:7:76:76:0.915663:21:55:2:5:21:55:2:5 chr19 5206775 . A G 538.79 PASS AF=1;AO=32;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9484;QD=59.8656;RBI=0.0890559;REFB=0;REVB=0.0731094;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0027029;OID=.;OPOS=5206775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:32:36:1:10:22:0:0:13:23:0:0 chr19 5214697 . A G 972.25 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.5;QD=58.9242;RBI=0.0294513;REFB=0;REVB=-0.0291481;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.85587e-05;OID=.;OPOS=5214697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0 chr19 5273494 . A G 421.35 PASS AF=0.569444;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.036075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.311;QD=23.4082;RBI=0.0382683;REFB=-0.00938141;REVB=0.0127694;RO=31;SAF=21;SAR=20;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537429;STB=0.529517;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00784497;OID=.;OPOS=5273494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:31:31:41:41:0.569444:20:21:18:13:20:21:18:13 chr19 5455611 . C T 223.84 PASS AF=0.471698;AO=22;DP=50;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.108012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9422;QD=16.8936;RBI=0.170128;REFB=-0.0236104;REVB=0.131441;RO=28;SAF=9;SAR=13;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293388;STB=0.641904;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0328285;OID=.;OPOS=5455611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:28:28:22:25:0.471698:13:9:20:8:14:11:20:8 chr19 5455735 . G A 175.61 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0344656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.484;QD=13.7736;RBI=0.0373147;REFB=-0.0191003;REVB=0.0143007;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317361;STB=0.681648;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0184021;OID=.;OPOS=5455735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:12:8:22:9:12:8:22:9 chr19 5455796 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0786237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.622;QD=54.5173;RBI=0.0800844;REFB=0;REVB=-0.0152259;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002507;OID=.;OPOS=5455796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr19 5455971 . G T 200.3 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0271524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.182;QD=18.6329;RBI=0.0317131;REFB=-0.0150652;REVB=-0.0163849;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158925;STB=0.590075;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0405504;OID=.;OPOS=5455971;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:7:14:11:11:7:14:11:11 chr19 5455978 . T C 223.75 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000803299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.016;QD=19.4567;RBI=0.00786738;REFB=-0.0303674;REVB=0.00782626;RO=23;SAF=15;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155667;STB=0.579324;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0336459;OID=.;OPOS=5455978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:7:15:12:11:7:15:13:11 chr19 5455990 . G A 252.32 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.021623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.685;QD=21.0269;RBI=0.0418394;REFB=-0.0467922;REVB=0.0358187;RO=24;SAF=16;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119132;STB=0.567107;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.042969;OID=.;OPOS=5455990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:8:16:13:11:8:16:13:11 chr19 5456450 . T C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.512;QD=57.6805;RBI=0.0254538;REFB=0;REVB=0.00414277;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.69798e-05;OID=.;OPOS=5456450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr19 5649943 . C T 189.07 PASS AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.031522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.047;QD=21.0076;RBI=0.0347652;REFB=-0.0137686;REVB=0.0146622;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592254;STB=0.533299;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0120959;OID=.;OPOS=5649943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:6:11:11:8:6:11 chr19 5766090 . T C 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.388;QD=52.6124;RBI=0.0155698;REFB=0;REVB=-0.0146533;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.58255e-05;OID=.;OPOS=5766090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0 chr19 5772897 . C T 375.43 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0537026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.409;QD=23.837;RBI=0.0549013;REFB=-0.00647021;REVB=0.0114097;RO=25;SAF=18;SAR=19;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933472;STB=0.558109;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00539434;OID=.;OPOS=5772897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:25:26:37:37:0.587302:19:18:9:16:19:18:9:17 chr19 5772950 . G A 260.22 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.000219588;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=120.18;QD=16.7886;RBI=0.00852358;REFB=-0.00270779;REVB=-0.00852075;RO=30;SAF=11;SAR=18;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783104;STB=0.562003;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00220123;OID=.;OPOS=5772950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:62:30:33:29:29:0.467742:18:11:9:21:18:11:9:24 chr19 5778517 . A T 173.46 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00385482;FXX=0.083316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.258;QD=15.7692;RBI=0.0307793;REFB=-0.0092398;REVB=-0.030537;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788358;STB=0.566935;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0194699;OID=.;OPOS=5778517;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:44:19:26:18:18:0.409091:7:11:10:9:7:11:13:13 chr19 5783634 . T C 35.47 PASS AF=0.5;AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000516213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.665;QD=17.7339;RBI=0.0400842;REFB=0.000241596;REVB=-0.0400809;RO=2;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0202951;OID=.;OPOS=5783634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:8:8:2:2:4:4:0.5:2:2:0:2:2:2:0:2 chr19 5783905 . G A 110.71 PASS AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0546557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.164;QD=26.0484;RBI=0.104154;REFB=-0.0137579;REVB=0.0886616;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00896755;STB=0.505042;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0129784;OID=.;OPOS=5783905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:5:7:3:2:5:7:3:2 chr19 5784370 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0140231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.859;QD=14.0966;RBI=0.0384675;REFB=-0.0224145;REVB=0.0358204;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250796;STB=0.514679;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0153255;OID=.;OPOS=5784370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:6:5:6:8:6:5:6:8 chr19 5786815 . G A 64.07 PASS AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0145221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.042;QD=9.49165;RBI=0.0176605;REFB=-0.00448209;REVB=-0.01005;RO=18;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476868;STB=0.789691;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00880845;OID=.;OPOS=5786815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:2:7:6:12:2:7:6:12 chr19 5789565 . T C 89.11 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0312016;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.916;QD=13.7093;RBI=0.0325439;REFB=-0.014297;REVB=0.00925024;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119984;STB=0.585202;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0155923;OID=.;OPOS=5789565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:27:26:16:15:11:11:0.423077:3:8:10:6:3:8:9:6 chr19 5831672 . G C 74.5 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0250642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.4982;QD=22.9223;RBI=0.0259088;REFB=0.00440243;REVB=0.00656125;RO=3;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671366;STB=0.512168;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=-0.00631078;OID=.;OPOS=5831672;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:13:3:4:9:9:0.692308:2:7:2:1:2:7:3:1 chr19 5832209 . G A 338.86 PASS AF=0.604167;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0138529;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.648;QD=28.2383;RBI=0.0158433;REFB=-0.0183622;REVB=-0.00768821;RO=18;SAF=21;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935188;STB=0.567519;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0111966;OID=.;OPOS=5832209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:18:19:29:29:0.604167:8:21:11:7:8:21:11:8 chr19 5844537 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.426;QD=56.1915;RBI=0.0193725;REFB=0;REVB=0.0155805;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177688;OID=.;OPOS=5844537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0 chr19 5844649 . G A 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.324;QD=46.8479;RBI=0.0121749;REFB=0;REVB=0.00459829;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.91743e-05;OID=.;OPOS=5844649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr19 5866654 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.735;QD=53.2769;RBI=0.0116435;REFB=0;REVB=-0.00319627;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94676e-05;OID=.;OPOS=5866654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr19 5866724 . G A 66.38 PASS AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0697221;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.883;QD=37.9328;RBI=0.0744331;REFB=0;REVB=0.0260599;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00351116;OID=.;OPOS=5866724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:8:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr19 5866736 . T C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0823039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.172;QD=35.5759;RBI=0.0856727;REFB=0;REVB=0.023788;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00246521;OID=.;OPOS=5866736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr19 5867748 . G T 70.16 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0544817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.89;QD=31.1825;RBI=0.0850924;REFB=-0.11597;REVB=0.0653641;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.599732;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00982056;OID=.;OPOS=5867748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:9:9:0:1:8:8:0.888889:6:2:0:0:6:2:1:0 chr19 5892954 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00549593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.688;QD=55.6559;RBI=0.0174341;REFB=0;REVB=-0.0165452;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109162;OID=.;OPOS=5892954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr19 6156483 . T C 1244.16 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.638;QD=61.4402;RBI=0.148835;REFB=0;REVB=0.145742;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365276;OID=.;OPOS=6156483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:43:36:0:0:45:36:0:0 chr19 6375831 . G A 173.09 PASS AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0622086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.275;QD=18.7119;RBI=0.0624909;REFB=-0.0107375;REVB=-0.00593364;RO=19;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702603;STB=0.539834;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0161899;OID=.;OPOS=6375831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:10:8:7:12:10:8:7:12 chr19 6376722 . A G 536.27 PASS AF=0.555556;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0440518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2093;QD=23.8344;RBI=0.0613105;REFB=0.00194952;REVB=-0.0426429;RO=40;SAF=27;SAR=23;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172842;STB=0.594677;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00140138;OID=.;OPOS=6376722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:40:40:50:50:0.555556:23:27:13:27:23:27:13:27 chr19 6411830 . C G 1171.96 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.613;QD=60.8808;RBI=0.034229;REFB=0;REVB=0.0261393;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162254;OID=.;OPOS=6411830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr19 6415442 . GTGC CGCG,GCGC 366.73 PASS AF=0.037037,0.962963;AO=2,16;DP=27;FAO=1,26;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209367,-0.0180445;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=4,1;MLLD=58.171,70.3915;QD=54.3301;RBI=0.0213376,0.0284765;REFB=0,0;REVB=0.00411653,0.0220296;RO=0;SAF=0,9;SAR=2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.164609,-0.00143055;OID=.,.;OPOS=6415442,6415443;OREF=GTGC,T;OALT=CGCG,C;OMAPALT=CGCG,GCGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:27:27:0:0:2,16:1,26:0.037037,0.962963:2,7:0,9:0:0:1,15:0,11:0:0 chr19 6427408 . G A 156.2 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0177346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.683;QD=16.0207;RBI=0.0749469;REFB=-0.00139624;REVB=0.0728185;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174965;STB=0.600483;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00235667;OID=.;OPOS=6427408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:10:7:13:9:10:7:13:9 chr19 6468935 . GC CG 45.41 PASS AF=0.4375;AO=2;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0733115;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=31.5888;QD=11.353;RBI=0.112058;REFB=-0.0661667;REVB=-0.0847488;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524163;STB=0.788741;STBP=0.068;TYPE=mnp;VARB=0.12483;OID=.;OPOS=6468935;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:16:16:6:8:2:7:0.4375:2:0:1:5:2:5:1:7 chr19 6477256 . G T 112.57 PASS AF=0.52381;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00353957;FXX=0.0454339;HRUN=9;LEN=1;MLLD=254.619;QD=21.4415;RBI=0.0184354;REFB=-0.0439573;REVB=-0.0180925;RO=3;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157689;STB=0.63137;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0145286;OID=.;OPOS=6477256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:22:21:3:5:10:11:0.52381:3:7:3:0:4:7:5:0 chr19 6495736 . A G 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0357172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9833;QD=12.3961;RBI=0.0357861;REFB=0.00681978;REVB=-0.00221944;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363118;STB=0.726279;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-0.0127059;OID=.;OPOS=6495736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:3:2:4:1:3:2 chr19 6535080 . T C 691.24 PASS AF=0.5;AO=67;DP=136;FAO=69;FDP=138;FR=.;FRO=69;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=26;FWDB=-0.00480494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.666;QD=20.0359;RBI=0.0319219;REFB=-0.0230077;REVB=-0.0315582;RO=69;SAF=37;SAR=30;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664909;STB=0.529707;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0150921;OID=.;OPOS=6535080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:69:69:67:69:0.5:30:37:43:26:30:39:43:26 chr19 6586268 . G A 671.05 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00559784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.035;QD=62.4231;RBI=0.0513931;REFB=0;REVB=0.0510873;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148629;OID=.;OPOS=6586268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:22:21:0:0 chr19 6665020 . T C 769.41 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0533637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3931;QD=56.9933;RBI=0.061623;REFB=0;REVB=-0.0308173;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000756106;OID=.;OPOS=6665020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0 chr19 6669934 . G A 229.27 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0473397;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.808;QD=13.8953;RBI=0.0486187;REFB=-0.00702416;REVB=-0.0110784;RO=37;SAF=5;SAR=22;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128734;STB=0.604115;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0110319;OID=.;OPOS=6669934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:39:27:27:0.409091:22:5:10:27:22:5:12:27 chr19 6677989 . G A 240.27 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00507904;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.619;QD=14.1333;RBI=0.0110152;REFB=-0.0205347;REVB=-0.00977435;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225009;STB=0.512811;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0293914;OID=.;OPOS=6677989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:12:16:22:18:12:16:22:18 chr19 6679511 . C T 408.32 PASS AF=0.506173;AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0904746;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1691;QD=20.1641;RBI=0.0905491;REFB=-0.0664311;REVB=-0.0036731;RO=38;SAF=21;SAR=19;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219951;STB=0.530425;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0496546;OID=.;OPOS=6679511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:40:40:41:0.506173:19:21:19:19:19:22:19:21 chr19 6696597 . G A 174.7 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.157;QD=46.5854;RBI=0.0348674;REFB=0;REVB=0.00292296;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360095;OID=.;OPOS=6696597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:7:7:0:0:8:7:0:0 chr19 6697406 . A G 1049.75 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00105554;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.746;QD=59.9856;RBI=0.00923696;REFB=0;REVB=-0.00917645;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.07664e-05;OID=.;OPOS=6697406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0 chr19 6702157 . C G 787.7 PASS AF=1;AO=49;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00723467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1723;QD=57.2873;RBI=0.162427;REFB=0;REVB=0.162266;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012002;OID=.;OPOS=6702157;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:49:55:1:23:26:0:0:29:26:0:0 chr19 6709704 . C T 188.69 PASS AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0344304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.252;QD=29.0294;RBI=0.0356066;REFB=-0.0243129;REVB=0.00907606;RO=8;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637946;STB=0.535358;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00673991;OID=.;OPOS=6709704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:11:7:4:4:11:7:4:4 chr19 6709848 . C T 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0201076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9554;QD=12.8687;RBI=0.032689;REFB=0.0169421;REVB=-0.0257732;RO=16;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37532;STB=0.725348;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.031734;OID=.;OPOS=6709848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:2:9:8:8:2:9:8:8 chr19 6713291 . C T 346.74 PASS AF=0.777778;AO=26;DP=34;FAO=28;FDP=36;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.113574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0941;QD=38.5269;RBI=0.116544;REFB=0.0126675;REVB=0.0261433;RO=8;SAF=10;SAR=16;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159841;STB=0.571377;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.000375096;OID=.;OPOS=6713291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:36:8:8:26:28:0.777778:16:10:6:2:16:12:6:2 chr19 6731057 . T C 83.87 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00639615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1436;QD=10.1656;RBI=0.013344;REFB=0.00058142;REVB=0.0117111;RO=22;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295482;STB=0.677107;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.000134305;OID=.;OPOS=6731057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:4:7:8:14:4:7:8:14 chr19 6731078 . GC G 183.74 PASS AF=0.657143;AO=22;DP=34;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0427557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=28.3301;QD=20.9983;RBI=0.0532211;REFB=-0.0260997;REVB=0.031693;RO=12;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=5;SSEN=0.249497;SSEP=0;SSSB=-0.144616;STB=0.58434;STBP=0.168;TYPE=del;VARB=0.0202971;OID=.;OPOS=6731079;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.657143:22:34:23:35:12:8:15:7:5:67:12:8:14:7:5 chr19 6737481 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00874416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.147;QD=57.2025;RBI=0.0170555;REFB=0;REVB=-0.0146434;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02915e-05;OID=.;OPOS=6737481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0 chr19 6737509 . G A,C 333.92 PASS AF=0.92,0.08;AO=22,2;DP=24;FAO=23,2;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=12,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0951168,0.0539768;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.369,111.192;QD=53.428;RBI=0.0951379,0.0542723;REFB=0,0;REVB=0.00200436,0.00565505;RO=0;SAF=10,0;SAR=12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0016527,0.158413;OID=.,.;OPOS=6737509,6737509;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:24:25:0:0:22,2:23,2:0.92,0.08:12,2:10,0:0:0:12,2:11,0:0:0 chr19 6833777 . A G 1098.71 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.079;QD=60.2035;RBI=0.0244326;REFB=0;REVB=-0.00127133;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52779e-05;OID=.;OPOS=6833777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:27:45:0:0:28:45:0:0 chr19 6833989 . G T 650.15 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140473;FXX=0.0227221;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.3777;QD=60.4788;RBI=0.054628;REFB=0;REVB=0.0546099;RO=0;SAF=8;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8059e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00224457;OID=.;OPOS=6833989;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:33:8:0:0:35:8:0:0 chr19 6896483 . G A 612.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5667;QD=61.2359;RBI=0.0289787;REFB=0;REVB=-0.0182802;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000331974;OID=.;OPOS=6896483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0 chr19 6897464 . C G 767.87 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.97;QD=63.9894;RBI=0.0656277;REFB=0;REVB=0.0173825;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201412;OID=.;OPOS=6897464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:27:19:0:0:27:21:0:0 chr19 6901891 . G A 976.9 PASS AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0542637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5046;QD=57.4646;RBI=0.0714265;REFB=-0.0503027;REVB=-0.0464456;RO=1;SAF=36;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129467;STB=0.506847;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00110886;OID=.;OPOS=6901891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:31:36:1:0:31:36:1:0 chr19 6903920 . A G 763.96 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8314;QD=63.6637;RBI=0.0258562;REFB=0;REVB=-0.0226858;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103122;OID=.;OPOS=6903920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr19 6904137 . C T 740.43 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.081;QD=56.9558;RBI=0.00522334;REFB=0;REVB=0.00351503;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81179e-05;OID=.;OPOS=6904137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0 chr19 6913811 . A G 726.69 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0905973;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0842;QD=56.9951;RBI=0.0905983;REFB=0;REVB=0.000421689;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000445969;OID=.;OPOS=6913811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0 chr19 6919624 . A C 999.55 PASS AF=0.971831;AO=70;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0425577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0764;QD=56.3128;RBI=0.0540863;REFB=-0.0375628;REVB=-0.0333792;RO=1;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133173;STB=0.514282;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000390847;OID=.;OPOS=6919624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:71:71:1:2:70:69:0.971831:35:35:0:1:34:35:0:2 chr19 6919753 . A G 571.38 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.343;QD=58.6031;RBI=0.0664411;REFB=0;REVB=0.00809228;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00298627;OID=.;OPOS=6919753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:24:12:0:0:24:15:0:0 chr19 6974556 . C A 298.58 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00639137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.347;QD=23.8864;RBI=0.016347;REFB=-0.00890947;REVB=0.0150457;RO=22;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124776;STB=0.578114;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0116937;OID=.;OPOS=6974556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:22:23:27:27:0.54:14:13:14:8:14:13:15:8 chr19 7005905 . T A 337.96 PASS AF=1;AO=21;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259947;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.404;QD=54.0742;RBI=0.0312466;REFB=0;REVB=-0.0173386;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00304991;OID=.;OPOS=7005905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:21:25:1:9:12:0:0:12:13:0:0 chr19 7076418 . C A 292.77 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00210892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5566;QD=17.2219;RBI=0.0481335;REFB=0.000509487;REVB=-0.0480873;RO=35;SAF=18;SAR=14;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176218;STB=0.587734;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0016597;OID=.;OPOS=7076418;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:36:32:32:0.470588:14:18:26:9:14:18:26:10 chr19 7083629 . A G 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00567383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.763;QD=14.0438;RBI=0.0576936;REFB=-0.00577738;REVB=0.0574139;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28673;STB=0.666163;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0168202;OID=.;OPOS=7083629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:1:4:4:0:1:4:4:0 chr19 7125297 . G A 313.4 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4719;QD=52.2334;RBI=0.0415184;REFB=0;REVB=-0.0158423;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00314981;OID=.;OPOS=7125297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:11:12:0:0:11:13:0:0 chr19 7504982 . C T 36.82 PASS AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0243875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.861;QD=6.40384;RBI=0.0249053;REFB=-0.0117258;REVB=-0.0050521;RO=17;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334106;STB=0.521667;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0467417;OID=.;OPOS=7504982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:23:23:17:17:6:6:0.26087:3:3:9:8:3:3:9:8 chr19 7524855 . C T 555.06 PASS AF=0.513514;AO=57;DP=111;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0169769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0108;QD=20.0023;RBI=0.0738507;REFB=-0.0107648;REVB=0.0718729;RO=54;SAF=25;SAR=32;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00523453;STB=0.502885;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0132721;OID=.;OPOS=7524855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:54:54:57:57:0.513514:32:25:24:30:32:25:24:30 chr19 7528734 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9868;QD=55.0985;RBI=0.0232706;REFB=0;REVB=-0.0181363;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69965e-05;OID=.;OPOS=7528734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr19 7532011 . G C 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.014394;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.565;QD=12.7388;RBI=0.0149313;REFB=-0.0072869;REVB=-0.00396955;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306568;STB=0.677062;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00800505;OID=.;OPOS=7532011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:5:3:1:9:5:3:1:9 chr19 7533767 . T G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000101248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.645;QD=62.6711;RBI=0.0383397;REFB=0;REVB=0.0383396;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38752e-05;OID=.;OPOS=7533767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr19 7533850 . A G 601.12 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.618;QD=58.6462;RBI=0.0308499;REFB=-0.129422;REVB=0.0289113;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00314437;OID=.;OPOS=7533850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:15:25:0:0:15:25:0:1 chr19 7538039 . A G 1377.51 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.08;QD=62.6141;RBI=0.0375386;REFB=0;REVB=0.0175438;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36077e-05;OID=.;OPOS=7538039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:50:38:0:0:50:38:0:0 chr19 7538117 . A G 1062.14 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6969;QD=59.8388;RBI=0.0160495;REFB=0;REVB=0.00625212;RO=0;SAF=25;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.80702e-05;OID=.;OPOS=7538117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:46:25:0:0:46:25:0:0 chr19 7547074 . A C 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.000490379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.705;QD=16.9316;RBI=0.00730927;REFB=-0.0200707;REVB=-0.0072928;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0159087;OID=.;OPOS=7547074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:6:6:6:6:6:6 chr19 7569282 . A G 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.031209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7873;QD=18.7668;RBI=0.0456217;REFB=0.0207209;REVB=-0.0332766;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236104;STB=0.635975;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.0118579;OID=.;OPOS=7569282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:2:4:3:0:2:4:3:0 chr19 7570978 . T C 473.01 PASS AF=0.944444;AO=31;DP=33;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.126027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6125;QD=52.5565;RBI=0.12628;REFB=0.0122292;REVB=0.00798039;RO=2;SAF=5;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067003;STB=0.529712;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.0110257;OID=.;OPOS=7570978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:33:36:2:2:31:34:0.944444:26:5:1:1:28:6:1:1 chr19 7570990 . A G 108.62 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0337322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7668;QD=13.577;RBI=0.033769;REFB=-0.00194906;REVB=-0.00157657;RO=18;SAF=1;SAR=12;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397658;STB=0.770098;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000716775;OID=.;OPOS=7570990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:12:1:5:13:12:1:6:13 chr19 7571030 . T A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.19;QD=50.4133;RBI=0.0494664;REFB=0;REVB=0.0381456;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414925;OID=.;OPOS=7571030;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0 chr19 7573098 . T A 269.0 PASS AF=0.483871;AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0236558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2018;QD=17.3549;RBI=0.0258142;REFB=-0.00714803;REVB=0.010333;RO=30;SAF=15;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106162;STB=0.548355;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0116083;OID=.;OPOS=7573098;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:32:29:30:0.483871:14:15:19:11:15:15:19:13 chr19 7573287 . C T 152.68 PASS AF=0.3;AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00281206;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.594;QD=8.72455;RBI=0.00363127;REFB=-0.00722126;REVB=0.00229749;RO=49;SAF=6;SAR=15;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254019;STB=0.652023;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0166386;OID=.;OPOS=7573287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:49:49:21:21:0.3:15:6:24:25:15:6:24:25 chr19 7573297 . T C 96.57 PASS AF=0.242424;AO=15;DP=64;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00758161;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.422;QD=5.85244;RBI=0.0323474;REFB=-0.00150656;REVB=-0.0314464;RO=46;SAF=0;SAR=15;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.771032;STB=0.725134;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00559935;OID=.;OPOS=7573297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:64:66:46:50:15:16:0.242424:15:0:23:23:13:3:22:28 chr19 7573301 . C T 130.57 PASS AF=0.275362;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0634414;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.6042;QD=7.56915;RBI=0.0715713;REFB=-0.0426242;REVB=-0.0331306;RO=48;SAF=3;SAR=16;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382926;STB=0.751578;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.105397;OID=.;OPOS=7573301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:48:50:19:19:0.275362:16:3:20:28:16:3:22:28 chr19 7593589 . C T 515.37 PASS AF=0.4375;AO=56;DP=128;FAO=56;FDP=128;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.0121948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.914;QD=16.1054;RBI=0.0172378;REFB=-0.00772078;REVB=0.0121831;RO=72;SAF=24;SAR=32;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555698;STB=0.531024;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.00987632;OID=.;OPOS=7593589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:72:72:56:56:0.4375:32:24:27:45:32:24:27:45 chr19 7687428 . G A 208.75 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0415522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.584;QD=18.1521;RBI=0.0424351;REFB=-0.0157867;REVB=0.00861121;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497351;STB=0.528275;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0202543;OID=.;OPOS=7687428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:12:9:12:13:12:9:12:13 chr19 7688614 . T C 75.46 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00674539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.927;QD=11.6099;RBI=0.0102221;REFB=0.00765309;REVB=0.00768057;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0116493;OID=.;OPOS=7688614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:8:8:5:5:8:8 chr19 7705452 . G A 89.53 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.00693709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7363;QD=15.57;RBI=0.0351495;REFB=-0.00158399;REVB=0.0344581;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335791;STB=0.691998;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00222772;OID=.;OPOS=7705452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:6:5:10:2:6:5:10:2 chr19 7711221 . T C 557.5 PASS AF=0.632911;AO=50;DP=79;FAO=50;FDP=79;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.000819495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.867;QD=28.228;RBI=0.0137941;REFB=-0.0234488;REVB=0.0137697;RO=29;SAF=16;SAR=34;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167373;STB=0.591267;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0128896;OID=.;OPOS=7711221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:29:29:50:50:0.632911:34:16:16:13:34:16:16:13 chr19 7712277 . A G 443.48 PASS AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0108638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.374;QD=20.1584;RBI=0.0209334;REFB=-0.0171017;REVB=-0.0178937;RO=44;SAF=30;SAR=14;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272557;STB=0.651413;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0134866;OID=.;OPOS=7712277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:14:30:17:27:14:30:17:27 chr19 7743879 . C T 160.43 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0631084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0331;QD=18.3349;RBI=0.0641005;REFB=-0.0167991;REVB=0.011234;RO=18;SAF=15;SAR=2;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186447;STB=0.607962;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0195535;OID=.;OPOS=7743879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:2:15:14:4:2:15:14:4 chr19 7747445 . G A 449.69 PASS AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00573849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.24;QD=18.9343;RBI=0.0164315;REFB=-0.0125491;REVB=0.0153968;RO=50;SAF=21;SAR=24;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126424;STB=0.507039;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0149379;OID=.;OPOS=7747445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:50:45:45:0.473684:24:21:24:26:24:21:24:26 chr19 7755056 . G A 132.7 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0300996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9364;QD=15.1661;RBI=0.0306025;REFB=-0.00518295;REVB=-0.00552523;RO=20;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820866;STB=0.547465;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00941468;OID=.;OPOS=7755056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:7:8:9:11:7:8:9:11 chr19 7755153 . T TG 41.6 PASS AF=0.37037;AO=5;DP=34;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.11685;FXX=0.205822;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.6634;QD=6.16311;RBI=0.124711;REFB=-0.0326701;REVB=0.0435778;RO=28;SAF=1;SAR=4;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458333;STB=0.666296;STBP=0.262;TYPE=ins;VARB=0.092155;OID=.;OPOS=7755154;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.37037:5:34:10:27:17:8:2:10:7:41:28:1:4:17:11 chr19 7761667 . A G 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0272008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6966;QD=17.3781;RBI=0.0325443;REFB=-0.0184262;REVB=0.0178676;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116602;STB=0.567442;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0209445;OID=.;OPOS=7761667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:4:7:5:5:4:7:5:5 chr19 7763248 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00617472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.552;QD=14.9787;RBI=0.00639624;REFB=-0.0246188;REVB=0.00166875;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19417;STB=0.615131;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0226212;OID=.;OPOS=7763248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:8:2:4:7:8:2:4:7 chr19 7913974 . T C 284.32 PASS AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00577181;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.868;QD=17.4964;RBI=0.00649709;REFB=0.00577943;REVB=-0.00298302;RO=34;SAF=15;SAR=16;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124125;STB=0.506954;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=-0.00374745;OID=.;OPOS=7913974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:16:15:16:18:16:15:16:18 chr19 7916620 . A G 152.36 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0506894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.024;QD=21.0154;RBI=0.0578535;REFB=-0.0135223;REVB=-0.0278857;RO=13;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00444403;STB=0.502509;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0101338;OID=.;OPOS=7916620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:11:5:4:9:11:5:4:9 chr19 7928462 . T C 613.13 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.308;QD=61.3132;RBI=0.0445584;REFB=0;REVB=0.0359517;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210467;OID=.;OPOS=7928462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:23:16:0:0:23:17:0:0 chr19 7928788 . A C 375.31 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3205;QD=55.6007;RBI=0.0334956;REFB=0;REVB=-0.0241004;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039774;OID=.;OPOS=7928788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0 chr19 7935157 . C A 36.23 PASS AF=0.666667;AO=5;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1549;QD=16.1033;RBI=0.18523;REFB=-0.19122;REVB=0.18523;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.126911;OID=.;OPOS=7935157;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:9:4:3:5:6:0.666667:5:0:0:4:6:0:0:3 chr19 7938306 . A AG 697.42 PASS AF=1;AO=56;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0574919;FXX=0.0454477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.5387;QD=44.2806;RBI=0.0577034;REFB=0;REVB=-0.00493637;RO=4;SAF=51;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265625;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000652696;OID=.;OPOS=7938307;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:56:64:63:63:0:51:12:0:0:13:4:51:5:0:4 chr19 7944348 . TC T 309.52 PASS AF=1;AO=29;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0805775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.2807;QD=38.6897;RBI=0.0896263;REFB=0;REVB=-0.0392445;RO=1;SAF=19;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238907;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00316375;OID=.;OPOS=7944349;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:29:32:32:32:0:21:11:0:0:6:1:19:10:1:0 chr19 7944700 . A G 245.16 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0157631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6231;QD=15.5659;RBI=0.0442067;REFB=-0.00349626;REVB=-0.0413009;RO=35;SAF=21;SAR=7;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474345;STB=0.767256;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00354107;OID=.;OPOS=7944700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:7:21:9:26:7:21:9:26 chr19 7963914 . A C 578.27 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149396;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8701;QD=60.8701;RBI=0.0155311;REFB=0;REVB=-0.00424539;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135517;OID=.;OPOS=7963914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr19 7963949 . A G 124.76 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0254749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2748;QD=17.8223;RBI=0.0407351;REFB=-0.0377453;REVB=-0.0317864;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644073;STB=0.53679;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0380953;OID=.;OPOS=7963949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:5:9:8:6:5:9 chr19 7963976 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00141924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.371;QD=53.9112;RBI=0.00483997;REFB=0;REVB=0.0046272;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.00984e-05;OID=.;OPOS=7963976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0 chr19 7964727 . G A 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0271107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.859;QD=14.6525;RBI=0.0394891;REFB=-0.000202835;REVB=-0.0287123;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757641;STB=0.545304;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=7.6979e-05;OID=.;OPOS=7964727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:3:2:3:3:3:2 chr19 7965339 . C T 740.18 PASS AF=0.537879;AO=71;DP=133;FAO=71;FDP=132;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.00572553;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.48;QD=22.4298;RBI=0.0174545;REFB=-0.0054852;REVB=0.0164887;RO=61;SAF=36;SAR=35;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012851;STB=0.50704;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00658591;OID=.;OPOS=7965339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:61:61:71:71:0.537879:35:36:30:31:35:36:30:31 chr19 7967812 . G T 237.65 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00585524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.157;QD=18.6394;RBI=0.00636423;REFB=-0.00899344;REVB=0.00249392;RO=26;SAF=8;SAR=17;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269143;STB=0.515139;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0144044;OID=.;OPOS=7967812;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:17:8:9:17:17:8:9:17 chr19 7986638 . C G 126.69 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0162123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.208;QD=11.2612;RBI=0.0162255;REFB=-0.0190481;REVB=0.000652817;RO=30;SAF=9;SAR=6;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121034;STB=0.571338;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0366305;OID=.;OPOS=7986638;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:6:9:21:9:6:9:21:9 chr19 8138054 . C A 313.44 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00415099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2465;QD=50.1501;RBI=0.0132968;REFB=-0.12204;REVB=0.0126323;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280951;STB=0.515139;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00264587;OID=.;OPOS=8138054;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:16:8:0:1:16:8:0:1 chr19 8145921 . C T 147.67 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0413846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.644;QD=26.8493;RBI=0.0431257;REFB=-0.0204809;REVB=0.01213;RO=7;SAF=12;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722156;STB=0.540484;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00808349;OID=.;OPOS=8145921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:3:12:5:2:3:12:5:2 chr19 8152725 . A G 339.29 PASS AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0387038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.282;QD=20.563;RBI=0.0392919;REFB=0.0157933;REVB=-0.00677291;RO=31;SAF=14;SAR=21;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402575;STB=0.52228;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.0125421;OID=.;OPOS=8152725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:21:14:11:20:21:14:11:20 chr19 8159362 . G T 124.85 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0114615;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.226;QD=17.8358;RBI=0.0301984;REFB=-0.00667828;REVB=0.0279388;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00468732;OID=.;OPOS=8159362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:4:10:10:4:4:10:10:4 chr19 8159409 . G T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.226;QD=54.5177;RBI=0.0296838;REFB=0;REVB=0.0275051;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179938;OID=.;OPOS=8159409;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0 chr19 8160334 . G A 130.61 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.022933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3993;QD=13.748;RBI=0.0410569;REFB=-0.00969763;REVB=0.034055;RO=23;SAF=4;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241174;STB=0.641823;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.015949;OID=.;OPOS=8160334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:11:4:11:12:11:4:11:12 chr19 8161450 . C T 182.12 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0253781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.082;QD=16.941;RBI=0.0255957;REFB=0.00227522;REVB=-0.00333004;RO=24;SAF=7;SAR=12;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248915;STB=0.642187;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00179533;OID=.;OPOS=8161450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:12:7:15:9:12:7:15:9 chr19 8165868 . G A 274.92 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0104973;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.813;QD=17.7371;RBI=0.0331465;REFB=-0.0314442;REVB=-0.0314404;RO=32;SAF=17;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619083;STB=0.534684;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0339043;OID=.;OPOS=8165868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:32:32:30:30:0.483871:13:17:16:16:13:17:16:16 chr19 8176009 . C T 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0369002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.534;QD=18.2489;RBI=0.0372282;REFB=-0.0514023;REVB=-0.00493094;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101817;STB=0.558527;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0237636;OID=.;OPOS=8176009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:5:7:9:4:5:7 chr19 8176569 . G A 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00953748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.916;QD=10.3789;RBI=0.0274573;REFB=-0.00382887;REVB=0.0257477;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752546;STB=0.545355;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00812499;OID=.;OPOS=8176569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:6:10:5:4:6:10 chr19 8176640 . C T 120.18 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0137141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5165;QD=14.1387;RBI=0.0392513;REFB=0.00585272;REVB=-0.0367775;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260571;STB=0.52937;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.00522986;OID=.;OPOS=8176640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:7:7:9:10:7:7:9:11 chr19 8176919 . C T 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0123085;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.421;QD=16.4168;RBI=0.013079;REFB=-0.010246;REVB=0.0044228;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112676;STB=0.564429;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0120031;OID=.;OPOS=8176919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:9:5:4:12:9:5:4:12 chr19 8191238 . C T 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5692;QD=57.2015;RBI=0.0146313;REFB=0;REVB=-0.00275493;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236825;OID=.;OPOS=8191238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr19 8191248 . A G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.253;QD=56.7065;RBI=0.0225063;REFB=0;REVB=0.00411753;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.22428e-05;OID=.;OPOS=8191248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr19 8191401 . G A 59.4 PASS AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0408008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.757;QD=15.8391;RBI=0.117126;REFB=0.00811562;REVB=0.109789;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539065;STB=0.822615;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.000450388;OID=.;OPOS=8191401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:1:7:2:5:1:7:2:5 chr19 8196444 . C T 841.61 PASS AF=1;AO=41;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.388;QD=58.0419;RBI=0.0892914;REFB=0;REVB=0.0868322;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313276;OID=.;OPOS=8196444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:41:58:1:14:27:0:0:24:34:0:0 chr19 8196499 . G A 400.73 PASS AF=0.526316;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00477316;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.481;QD=21.0909;RBI=0.00565523;REFB=-0.0276645;REVB=-0.00303291;RO=34;SAF=18;SAR=22;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06625;STB=0.536921;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0202262;OID=.;OPOS=8196499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:34:36:40:40:0.526316:22:18:18:16:22:18:19:17 chr19 8203188 . G A 141.96 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.455;QD=13.8496;RBI=0.0474317;REFB=-0.0140724;REVB=0.044242;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445449;STB=0.756154;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0271551;OID=.;OPOS=8203188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:19:6:11:5:19:6 chr19 8203328 . G A 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.169;QD=57.7121;RBI=0.0230587;REFB=0;REVB=0.000700919;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.52725e-05;OID=.;OPOS=8203328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0 chr19 8319455 . C T 202.02 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0376055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.272;QD=21.2648;RBI=0.0439246;REFB=-0.0163643;REVB=0.0226979;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467648;STB=0.52629;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0126732;OID=.;OPOS=8319455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:8:10:10:10:8:10 chr19 8320555 . G A 110.71 PASS AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0311391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.739;QD=26.0485;RBI=0.0387116;REFB=-0.0119252;REVB=0.0229988;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198498;STB=0.611467;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00844283;OID=.;OPOS=8320555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:5:7:1:4:5:7:1:4 chr19 8321937 . C T 235.22 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00885116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4222;QD=25.4289;RBI=0.0532768;REFB=-0.0142151;REVB=-0.0525364;RO=15;SAF=9;SAR=13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110161;STB=0.560985;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0117388;OID=.;OPOS=8321937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:13:9:4:11:13:9:4:11 chr19 8326904 . G A 96.66 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.00958393;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.6295;QD=12.4729;RBI=0.0161915;REFB=-0.0328098;REVB=-0.0130504;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409469;STB=0.709389;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.032962;OID=.;OPOS=8326904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:6:6:2:16:6:6:3:16 chr19 8367033 . T C 428.92 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3274;QD=57.1896;RBI=0.026384;REFB=0;REVB=0.00441744;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417886;OID=.;OPOS=8367033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0 chr19 8376431 . G A 313.3 PASS AF=0.764706;AO=26;DP=34;FAO=26;FDP=34;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0359216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.941;QD=36.8585;RBI=0.04977;REFB=-0.0133051;REVB=0.0344484;RO=8;SAF=13;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054001;STB=0.529389;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0050051;OID=.;OPOS=8376431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:34:8:8:26:26:0.764706:13:13:3:5:13:13:3:5 chr19 8387207 . G A 217.2 PASS AF=0.297872;AO=28;DP=94;FAO=28;FDP=94;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.000870314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.546;QD=9.24233;RBI=0.00252651;REFB=-0.0143949;REVB=-0.00237188;RO=63;SAF=25;SAR=3;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606003;STB=0.8603;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0377167;OID=.;OPOS=8387207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:63:66:28:28:0.297872:3:25:27:36:3:25:29:37 chr19 8398714 . A G 203.14 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0154045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.551;QD=21.9605;RBI=0.0354304;REFB=-0.0172126;REVB=0.0319064;RO=17;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592807;STB=0.5333;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0150271;OID=.;OPOS=8398714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:8:12:9:8:8:12:9:8 chr19 8454236 . A G 885.41 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.109;QD=58.0593;RBI=0.00704315;REFB=0;REVB=-0.00179546;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31548e-05;OID=.;OPOS=8454236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr19 8486884 . G A 230.58 PASS AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0263315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.056;QD=12.1358;RBI=0.0284828;REFB=-0.0180797;REVB=0.0108592;RO=42;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250124;STB=0.552594;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.035624;OID=.;OPOS=8486884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:48:28:28:0.368421:14:14:22:20:14:14:28:20 chr19 8503864 . AC A,CA 173.89 PASS AF=0.714286,0;AO=12,2;DP=25;FAO=20,0;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=12,0;FSAR=8,0;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.036739,0.0230686;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=21.5879,18.7508;QD=24.8412;RBI=0.0482444,0.062479;REFB=-0.0440318,-0.00781161;REVB=0.0312692,0.0580643;RO=10;SAF=4,2;SAR=8,0;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.308176,0;SSSB=-0.0579899,0.612877;STB=0.5999,0.5;STBP=0.111,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0302909,0;OID=.,.;OPOS=8503865,8503864;OREF=C,AC;OALT=-,CA;OMAPALT=A,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:28:10:8:12,2:20,0:0.714286,0:8,0:4,2:4:6:8,0:12,0:2:6 chr19 8553630 . C T 1294.36 PASS AF=0.988235;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0138806;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.643;QD=60.9112;RBI=0.0230038;REFB=-0.062163;REVB=0.018344;RO=1;SAF=37;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126298;STB=0.506665;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=6.12253e-05;OID=.;OPOS=8553630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:87:85:1:1:84:84:0.988235:47:37:1:0:47:37:1:0 chr19 8563456 . C G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7739;QD=33.4248;RBI=0.0833491;REFB=0;REVB=-0.0824801;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00717502;OID=.;OPOS=8563456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chr19 8564523 . T G 52.11 PASS AF=0.242424;AO=7;DP=32;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00468779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.085;QD=6.31639;RBI=0.0194659;REFB=-0.0359596;REVB=-0.018893;RO=24;SAF=5;SAR=2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168956;STB=0.660587;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0221842;OID=.;OPOS=8564523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:33:24:25:7:8:0.242424:2:5:14:10:2:6:14:11 chr19 8567475 . T C 179.8 PASS AF=0.303797;AO=24;DP=79;FAO=24;FDP=79;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00487152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.086;QD=9.10383;RBI=0.0229634;REFB=-0.00302288;REVB=0.0224407;RO=54;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530609;STB=0.536053;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00468764;OID=.;OPOS=8567475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:54:55:24:24:0.303797:15:9:18:36:15:9:18:37 chr19 8567500 . G A 159.93 PASS AF=0.293333;AO=22;DP=75;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0280948;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.6672;QD=8.52958;RBI=0.0280951;REFB=-0.0196179;REVB=0.00014547;RO=52;SAF=8;SAR=14;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734574;STB=0.533304;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0466369;OID=.;OPOS=8567500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:52:53:22:22:0.293333:14:8:16:36:14:8:17:36 chr19 8578000 . G A 358.87 PASS AF=0.614035;AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0185272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.745;QD=25.1839;RBI=0.0233952;REFB=-0.0229919;REVB=0.0142857;RO=22;SAF=16;SAR=19;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125637;STB=0.568823;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0142624;OID=.;OPOS=8578000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:22:22:35:35:0.614035:19:16:14:8:19:16:14:8 chr19 8578035 . T C 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.010983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.513;QD=19.4667;RBI=0.0139531;REFB=-0.0100856;REVB=-0.00860593;RO=19;SAF=15;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305148;STB=0.70021;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0104225;OID=.;OPOS=8578035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:19:24:22:22:0.478261:7:15:6:13:7:15:7:17 chr19 8578118 . A G 305.18 PASS AF=0.362745;AO=37;DP=101;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=-0.0163236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9019;QD=11.9677;RBI=0.0406918;REFB=-0.019522;REVB=-0.0372741;RO=62;SAF=20;SAR=17;SRF=43;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172535;STB=0.588699;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0274048;OID=.;OPOS=8578118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:62:65:37:37:0.362745:17:20:43:19:17:20:44:21 chr19 8578199 . T C 421.07 PASS AF=0.392;AO=48;DP=124;FAO=49;FDP=125;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=25;FWDB=0.00121067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.862;QD=13.4744;RBI=0.00203035;REFB=-0.00885999;REVB=-0.00162991;RO=74;SAF=28;SAR=20;SRF=50;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104133;STB=0.562921;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0105299;OID=.;OPOS=8578199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:74:76:48:49:0.392:20:28:50:24:21:28:51:25 chr19 8645786 . A C 538.21 PASS AF=1;AO=31;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.084;QD=59.8015;RBI=0.0720125;REFB=0;REVB=0.0107963;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155722;OID=.;OPOS=8645786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:31:36:1:21:10:0:0:21:15:0:0 chr19 8669931 . G C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.469;QD=62.9828;RBI=0.0534209;REFB=0;REVB=0.010648;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117236;OID=.;OPOS=8669931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0 chr19 8808373 . G T 1514.23 PASS AF=0.989691;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0342073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2909;QD=62.4424;RBI=0.0981755;REFB=0.0222397;REVB=0.0920233;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.504672;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000895545;OID=.;OPOS=8808373;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:95:97:0:1:95:96:0.989691:52:43:0:0:53:43:0:1 chr19 8808900 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.403;QD=45.8068;RBI=0.0562109;REFB=0;REVB=-0.0415817;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.97057e-05;OID=.;OPOS=8808900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0 chr19 8808942 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.11035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3598;QD=46.8466;RBI=0.131908;REFB=0;REVB=-0.0722685;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00734189;OID=.;OPOS=8808942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0 chr19 8841558 . T C 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.09;QD=58.0609;RBI=0.042049;REFB=0;REVB=0.00597678;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001042;OID=.;OPOS=8841558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chr19 8953801 . T C 718.81 PASS AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00618173;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5278;QD=61.1749;RBI=0.0171588;REFB=-0.0323869;REVB=-0.0160066;RO=1;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199954;STB=0.5102;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000618609;OID=.;OPOS=8953801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:45:46:0.978723:23:22:0:1:24:22:0:1 chr19 8953922 . C T 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.165;QD=63.8692;RBI=0.0035745;REFB=0;REVB=0.00337946;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95299e-05;OID=.;OPOS=8953922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0 chr19 8961981 . C G 2299.65 PASS AF=0.993151;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0143062;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8135;QD=63.0041;RBI=0.050884;REFB=-0.0383441;REVB=0.0488314;RO=1;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694226;STB=0.503649;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000286078;OID=.;OPOS=8961981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:146:146:1:1:145:145:0.993151:68:77:0:1:68:77:0:1 chr19 8979212 . C T 430.17 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00255835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7241;QD=22.6404;RBI=0.04915;REFB=-0.0010608;REVB=-0.0490833;RO=34;SAF=16;SAR=26;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193382;STB=0.606506;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.000389228;OID=.;OPOS=8979212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:26:16:21:13:26:16:21:13 chr19 8982271 . G A 255.53 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.050754;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.9835;QD=15.7251;RBI=0.107051;REFB=-0.0155843;REVB=0.0942542;RO=36;SAF=14;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169154;STB=0.509548;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0255915;OID=.;OPOS=8982271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:15:14:18:18:15:14:18:18 chr19 8987218 . G T 369.53 PASS AF=0.389381;AO=44;DP=113;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0105159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.022;QD=13.0809;RBI=0.0287167;REFB=-0.0230104;REVB=0.026722;RO=68;SAF=20;SAR=24;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144569;STB=0.503245;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0343155;OID=.;OPOS=8987218;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:68:69:44:44:0.389381:24:20:30:38:24:20:31:38 chr19 8996019 . A T 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00806945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.379;QD=21.9444;RBI=0.0198123;REFB=-0.00645563;REVB=0.0180945;RO=12;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43923;STB=0.745477;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0241918;OID=.;OPOS=8996019;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:11:5:11:1:11:5:11:1 chr19 8999421 . G C 34.93 PASS AF=0.0918367;AO=9;DP=98;FAO=9;FDP=98;FR=.;FRO=89;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.00646982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.725;QD=1.42571;RBI=0.0219804;REFB=-0.000572777;REVB=-0.0210067;RO=89;SAF=1;SAR=8;SRF=46;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474728;STB=0.879691;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0156179;OID=.;OPOS=8999421;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:98:98:89:89:9:9:0.0918367:8:1:46:43:8:1:46:43 chr19 8999438 . A T 51.53 PASS AF=0.116505;AO=12;DP=104;FAO=12;FDP=103;FR=.;FRO=91;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=41;FSRR=50;FWDB=-0.0604158;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.22;QD=2.00108;RBI=0.0616557;REFB=-0.00315583;REVB=-0.0123026;RO=91;SAF=8;SAR=4;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259263;STB=0.687591;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0255253;OID=.;OPOS=8999438;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:104:103:91:91:12:12:0.116505:4:8:41:50:4:8:41:50 chr19 8999445 . C T 288.35 PASS AF=0.349515;AO=36;DP=103;FAO=36;FDP=103;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=-0.0160978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.056;QD=11.1981;RBI=0.0167914;REFB=-0.0175487;REVB=0.00477612;RO=64;SAF=12;SAR=24;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274352;STB=0.662247;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0295059;OID=.;OPOS=8999445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:64:67:36:36:0.349515:24:12:37:27:24:12:39:28 chr19 8999449 . G T 46.39 PASS AF=0.104762;AO=11;DP=105;FAO=11;FDP=105;FR=.;FRO=94;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=-0.0447436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4013;QD=1.76718;RBI=0.0612621;REFB=0.000719777;REVB=-0.0418457;RO=93;SAF=7;SAR=4;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217718;STB=0.657837;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=-0.0151706;OID=.;OPOS=8999449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:105:105:93:94:11:11:0.104762:4:7:42:51:4:7:43:51 chr19 8999453 . C T 448.13 PASS AF=0.470588;AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.02119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.595;QD=17.5736;RBI=0.0264447;REFB=-0.00564495;REVB=0.015821;RO=53;SAF=23;SAR=25;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428198;STB=0.52829;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00753365;OID=.;OPOS=8999453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:54:48:48:0.470588:25:23:23:30:25:23:23:31 chr19 8999474 . T C 39.06 PASS AF=0.0943396;AO=10;DP=106;FAO=10;FDP=106;FR=.;FRO=96;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=50;FWDB=-0.0356557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.029;QD=1.47381;RBI=0.0358245;REFB=-0.00545644;REVB=0.00347364;RO=96;SAF=4;SAR=6;SRF=46;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092517;STB=0.572373;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0501742;OID=.;OPOS=8999474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:106:106:96:96:10:10:0.0943396:6:4:46:50:6:4:46:50 chr19 8999478 . T C 53.06 PASS AF=0.114286;AO=12;DP=105;FAO=12;FDP=105;FR=.;FRO=93;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=-0.0317021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.388;QD=2.02133;RBI=0.0360497;REFB=-0.00446175;REVB=-0.0171626;RO=93;SAF=7;SAR=5;SRF=41;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170956;STB=0.62421;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0307052;OID=.;OPOS=8999478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:105:105:93:93:12:12:0.114286:5:7:41:52:5:7:41:52 chr19 9001822 . A G 207.64 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0162063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.22;QD=15.101;RBI=0.0166397;REFB=-0.027577;REVB=0.00377281;RO=31;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174825;STB=0.599913;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0343167;OID=.;OPOS=9001822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:17:7:14:17:17:7:14:17 chr19 9001833 . A G 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00382867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.41;QD=14.7348;RBI=0.0212397;REFB=0.0175774;REVB=0.0208917;RO=36;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779232;STB=0.544302;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.00919812;OID=.;OPOS=9001833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:17:10:16:20:17:10:16:20 chr19 9001835 . G A 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0161817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.601;QD=14.7347;RBI=0.0463778;REFB=-0.0179616;REVB=-0.0434632;RO=36;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779232;STB=0.544302;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0356914;OID=.;OPOS=9001835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:17:10:16:20:17:10:16:20 chr19 9002504 . T C 190.83 PASS AF=0.241935;AO=30;DP=125;FAO=30;FDP=124;FR=.;FRO=94;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=-0.0141861;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.134;QD=6.15579;RBI=0.0388853;REFB=-0.0145851;REVB=-0.0362053;RO=93;SAF=13;SAR=17;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10177;STB=0.556075;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0324796;OID=.;OPOS=9002504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:93:94:30:30:0.241935:17:13:33:60:17:13:34:60 chr19 9002519 . G C 186.71 PASS AF=0.215827;AO=27;DP=134;FAO=30;FDP=139;FR=.;FRO=109;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=68;FWDB=0.0120193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.515;QD=5.37302;RBI=0.0545532;REFB=-0.022842;REVB=0.0532127;RO=101;SAF=10;SAR=17;SRF=35;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327935;STB=0.546188;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0765832;OID=.;OPOS=9002519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:139:101:109:27:30:0.215827:17:10:35:66:17:13:41:68 chr19 9002576 . T C 85.16 PASS AF=0.134752;AO=20;DP=141;FAO=19;FDP=141;FR=.;FRO=122;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=79;FWDB=-0.0848763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7179;QD=2.41602;RBI=0.0986658;REFB=-0.00615739;REVB=-0.0503085;RO=120;SAF=9;SAR=11;SRF=42;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131324;STB=0.561998;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0423508;OID=.;OPOS=9002576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:141:141:120:122:20:19:0.134752:11:9:42:78:11:8:43:79 chr19 9002587 . C T 59.25 PASS AF=0.107914;AO=15;DP=139;FAO=15;FDP=139;FR=.;FRO=124;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=80;FWDB=-0.00911052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4744;QD=1.70516;RBI=0.0166156;REFB=-0.00654729;REVB=-0.0138952;RO=124;SAF=7;SAR=8;SRF=44;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140098;STB=0.601435;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0415616;OID=.;OPOS=9002587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:139:139:124:124:15:15:0.107914:8:7:44:80:8:7:44:80 chr19 9002597 . C T 33.16 PASS AF=0.0806452;AO=10;DP=124;FAO=10;FDP=124;FR=.;FRO=114;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=42;FSRR=72;FWDB=0.0616562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0155;QD=1.06962;RBI=0.0657056;REFB=0.00237326;REVB=-0.0227099;RO=114;SAF=7;SAR=3;SRF=42;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358508;STB=0.780754;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.0255804;OID=.;OPOS=9002597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:124:124:114:114:10:10:0.0806452:3:7:42:72:3:7:42:72 chr19 9003615 . C T 488.69 PASS AF=0.392857;AO=55;DP=140;FAO=55;FDP=140;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=-0.0182162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9554;QD=13.9627;RBI=0.0324676;REFB=-0.0244114;REVB=-0.0268759;RO=85;SAF=31;SAR=24;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19902;STB=0.612168;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0415914;OID=.;OPOS=9003615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:85:85:55:55:0.392857:24:31:32:53:24:31:32:53 chr19 9003618 . C T 898.41 PASS AF=0.595588;AO=81;DP=136;FAO=81;FDP=136;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.00958777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.577;QD=26.4238;RBI=0.0242381;REFB=-0.0016467;REVB=-0.0222612;RO=55;SAF=29;SAR=52;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171371;STB=0.593206;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000988494;OID=.;OPOS=9003618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:55:55:81:81:0.595588:52:29:32:23:52:29:32:23 chr19 9003640 . G T 481.86 PASS AF=0.406015;AO=54;DP=133;FAO=54;FDP=133;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=0.00460589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.754;QD=14.492;RBI=0.00983794;REFB=-0.00205931;REVB=-0.00869314;RO=78;SAF=29;SAR=25;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185577;STB=0.607291;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00230435;OID=.;OPOS=9003640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:78:79:54:54:0.406015:25:29:28:50:25:29:28:51 chr19 9003645 . G A 854.0 PASS AF=0.590909;AO=78;DP=132;FAO=78;FDP=132;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0267986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.288;QD=25.8788;RBI=0.0271304;REFB=-0.0118151;REVB=0.00423002;RO=54;SAF=27;SAR=51;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122381;STB=0.566649;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0215844;OID=.;OPOS=9003645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:54:54:78:78:0.590909:51:27:27:27:51:27:27:27 chr19 9005719 . A G 651.18 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.155;QD=62.0171;RBI=0.0443305;REFB=0;REVB=0.0298431;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.53808e-05;OID=.;OPOS=9005719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr19 9006370 . A G 59.72 PASS AF=0.141176;AO=12;DP=85;FAO=12;FDP=85;FR=.;FRO=73;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.0425874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.142;QD=2.81023;RBI=0.0575352;REFB=-0.0031064;REVB=-0.0386861;RO=72;SAF=3;SAR=9;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360856;STB=0.745151;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0178152;OID=.;OPOS=9006370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:85:85:72:73:12:12:0.141176:9:3:39:33:9:3:39:34 chr19 9006415 . TT CA 60.42 PASS AF=0.164179;AO=11;DP=68;FAO=11;FDP=67;FR=.;FRO=56;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00352567;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=2;MLLD=229.929;QD=3.60711;RBI=0.00706395;REFB=-0.00506578;REVB=0.0061212;RO=56;SAF=4;SAR=7;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149205;STB=0.600922;STBP=0.499;TYPE=mnp;VARB=0.0390043;OID=.;OPOS=9006415;OREF=TT;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:68:67:56:56:11:11:0.164179:7:4:27:29:7:4:27:29 chr19 9006418 . G A 68.88 PASS AF=0.181818;AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.00164267;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.161;QD=4.1747;RBI=0.00165196;REFB=-0.00736413;REVB=-0.0001749;RO=54;SAF=5;SAR=7;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103961;STB=0.568413;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0362789;OID=.;OPOS=9006418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:66:66:54:54:12:12:0.181818:7:5:27:27:7:5:27:27 chr19 9014551 . T C 207.66 PASS AF=0.3;AO=27;DP=90;FAO=27;FDP=90;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.00373603;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2288;QD=9.22946;RBI=0.00374047;REFB=-0.00207213;REVB=-0.000182164;RO=63;SAF=16;SAR=11;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648144;STB=0.503827;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00508782;OID=.;OPOS=9014551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:63:63:27:27:0.3:11:16:37:26:11:16:37:26 chr19 9014569 . A G 199.08 PASS AF=0.305882;AO=25;DP=85;FAO=26;FDP=85;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.00795229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.093;QD=9.36852;RBI=0.00978351;REFB=-0.0114511;REVB=-0.00569897;RO=56;SAF=14;SAR=11;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136229;STB=0.511619;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0286798;OID=.;OPOS=9014569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:56:59:25:26:0.305882:11:14:32:24:11:15:35:24 chr19 9019605 . C G 859.51 PASS AF=0.51497;AO=87;DP=166;FAO=86;FDP=167;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.00242182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.545;QD=20.587;RBI=0.00245799;REFB=-0.0338357;REVB=0.000420161;RO=79;SAF=38;SAR=49;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608328;STB=0.543136;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0307061;OID=.;OPOS=9019605;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:79:81:87:86:0.51497:49:38:40:39:49:37:42:39 chr19 9020154 . A G 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0064372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.939;QD=17.56;RBI=0.0160599;REFB=-0.0179168;REVB=-0.0147134;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163499;STB=0.593118;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0174931;OID=.;OPOS=9020154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:8:13:8:10:8:13 chr19 9024871 . C T 279.7 PASS AF=0.484375;AO=29;DP=62;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00187331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.525;QD=17.4809;RBI=0.0121426;REFB=-0.00978692;REVB=-0.0119973;RO=32;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223811;STB=0.625541;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0100723;OID=.;OPOS=9024871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:32:33:29:31:0.484375:17:12:21:11:18:13:22:11 chr19 9024994 . C T 233.7 PASS AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00604371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.977;QD=24.5995;RBI=0.00609064;REFB=-0.0168864;REVB=0.000754657;RO=16;SAF=15;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195183;STB=0.609034;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0098806;OID=.;OPOS=9024994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:7:15:7:9:7:15:7:9 chr19 9026257 . G A 742.55 PASS AF=0.454023;AO=79;DP=173;FAO=79;FDP=174;FR=.;FRO=95;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=-0.00733281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.821;QD=17.07;RBI=0.0323983;REFB=-0.0201082;REVB=0.0315576;RO=94;SAF=37;SAR=42;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107317;STB=0.502849;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0199451;OID=.;OPOS=9026257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:94:95:79:79:0.454023:42:37:43:51:42:37:44:51 chr19 9026318 . A G 742.25 PASS AF=0.514286;AO=72;DP=140;FAO=72;FDP=140;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=0.0133245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.369;QD=21.2072;RBI=0.0164352;REFB=-0.0148038;REVB=0.00962152;RO=68;SAF=24;SAR=48;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193356;STB=0.510635;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.013561;OID=.;OPOS=9026318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:68:68:72:72:0.514286:48:24:24:44:48:24:24:44 chr19 9028373 . G A 458.89 PASS AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0224951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3418;QD=20.8588;RBI=0.0314299;REFB=-0.0144784;REVB=0.0219501;RO=42;SAF=21;SAR=24;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118236;STB=0.569862;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00984996;OID=.;OPOS=9028373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:43:45:45:0.511364:24:21:14:28:24:21:14:29 chr19 9033314 . G A 192.76 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0729367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.759;QD=23.3645;RBI=0.0730761;REFB=-0.0348736;REVB=0.00451198;RO=14;SAF=13;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946752;STB=0.553134;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0297346;OID=.;OPOS=9033314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:6:13:8:6:6:13:8:6 chr19 9048342 . C T 726.46 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.405;QD=63.1703;RBI=0.0429999;REFB=0;REVB=0.0371533;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026988;OID=.;OPOS=9048342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0 chr19 9048895 . A C 180.04 PASS AF=0.353846;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0109003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3972;QD=11.0795;RBI=0.0158756;REFB=-0.0124534;REVB=0.011542;RO=41;SAF=11;SAR=12;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910849;STB=0.544688;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0526292;OID=.;OPOS=9048895;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:41:42:23:23:0.353846:12:11:23:18:12:11:23:19 chr19 9049726 . G A 566.34 PASS AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0320466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.301;QD=20.0473;RBI=0.0328124;REFB=-0.0240947;REVB=-0.0070478;RO=55;SAF=29;SAR=29;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401384;STB=0.522116;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0328038;OID=.;OPOS=9049726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:55:55:58:58:0.513274:29:29:30:25:29:29:30:25 chr19 9056982 . G A 493.55 PASS AF=0.652174;AO=45;DP=69;FAO=45;FDP=69;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.102252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1798;QD=28.6113;RBI=0.103896;REFB=0.0219121;REVB=-0.0184087;RO=24;SAF=10;SAR=35;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161295;STB=0.588193;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0217991;OID=.;OPOS=9056982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:24:24:45:45:0.652174:35:10:10:14:35:10:10:14 chr19 9057408 . A G 1859.38 PASS AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.725;QD=61.467;RBI=0.0383241;REFB=0;REVB=0.0260614;RO=0;SAF=55;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80061e-05;OID=.;OPOS=9057408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:66:55:0:0:66:55:0:0 chr19 9057687 . A G 1209.79 PASS AF=0.987654;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0381447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.168;QD=59.7427;RBI=0.0386103;REFB=-0.121441;REVB=-0.00597847;RO=1;SAF=37;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126228;STB=0.506665;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000756579;OID=.;OPOS=9057687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:81:1:1:79:80:0.987654:42:37:1:0:43:37:1:0 chr19 9057721 . C T 125.44 PASS AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0187515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1615;QD=8.96017;RBI=0.0362749;REFB=-0.0267757;REVB=-0.0310524;RO=39;SAF=7;SAR=10;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176399;STB=0.605305;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0307221;OID=.;OPOS=9057721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:10:7:22:17:10:7:22:17 chr19 9058907 . G C 726.85 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315011;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.15;QD=57.0078;RBI=0.0479084;REFB=0;REVB=0.0360956;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275427;OID=.;OPOS=9058907;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0 chr19 9058942 . C T 519.07 PASS AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00265154;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.775;QD=25.3203;RBI=0.00302493;REFB=-0.00736806;REVB=-0.00145586;RO=34;SAF=20;SAR=28;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268858;STB=0.5147;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00551154;OID=.;OPOS=9058942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:28:20:13:21:28:20:13:21 chr19 9059159 . T G 370.97 PASS AF=0.453333;AO=33;DP=76;FAO=34;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0216809;FXX=0.0259707;HRUN=7;LEN=1;MLLD=241.15;QD=19.785;RBI=0.0369688;REFB=-0.0329301;REVB=-0.0299438;RO=20;SAF=7;SAR=26;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210267;STB=0.698148;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0203677;OID=.;OPOS=9059159;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:20:30:33:34:0.453333:26:7:9:11:27:7:17:13 chr19 9059307 . C T 506.71 PASS AF=0.594937;AO=47;DP=76;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0150363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.648;QD=25.656;RBI=0.0185634;REFB=-0.0220982;REVB=0.0108862;RO=29;SAF=18;SAR=29;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168268;STB=0.610974;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0142894;OID=.;OPOS=9059307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:29:32:47:47:0.594937:29:18:18:11:29:18:21:11 chr19 9059808 . A G 1609.59 PASS AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00838143;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.75;QD=60.1715;RBI=0.00876166;REFB=0;REVB=0.0025531;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47078e-05;OID=.;OPOS=9059808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:53:54:0:0:53:54:0:0 chr19 9060541 . C T 402.14 PASS AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00567084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.582;QD=21.7371;RBI=0.00872352;REFB=-0.0305978;REVB=-0.00662883;RO=34;SAF=13;SAR=27;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105392;STB=0.558316;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0228318;OID=.;OPOS=9060541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:34:40:40:0.540541:27:13:15:19:27:13:15:19 chr19 9060605 . G A 1335.64 PASS AF=1;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601551;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.735;QD=61.4089;RBI=0.0472842;REFB=-0.0592515;REVB=0.0469;RO=1;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114156;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114916;OID=.;OPOS=9060605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:88:87:1:0:86:87:1:41:45:0:1:42:45:0:0 chr19 9060656 . C T 476.41 PASS AF=0.452174;AO=52;DP=116;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.0156517;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7549;QD=16.5706;RBI=0.051499;REFB=-0.0258867;REVB=-0.0490629;RO=64;SAF=24;SAR=28;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552503;STB=0.527017;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0207231;OID=.;OPOS=9060656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:64:63:52:52:0.452174:28:24:26:38:28:24:26:37 chr19 9060812 . T C 1029.81 PASS AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214763;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.246;QD=59.699;RBI=0.0217423;REFB=0;REVB=0.0033903;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75523e-05;OID=.;OPOS=9060812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:45:24:0:0:45:24:0:0 chr19 9061559 . C G 430.21 PASS AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00533908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.966;QD=22.6424;RBI=0.01152;REFB=-0.0134059;REVB=-0.0102081;RO=33;SAF=25;SAR=17;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161358;STB=0.595193;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0039695;OID=.;OPOS=9061559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:34:42:42:0.552632:17:25:13:20:17:25:13:21 chr19 9062415 . T G 359.52 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0214304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0547;QD=19.9733;RBI=0.0251355;REFB=-0.0143053;REVB=-0.0131351;RO=35;SAF=15;SAR=22;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575832;STB=0.531898;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0275962;OID=.;OPOS=9062415;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:22:15:12:23:22:15:12:23 chr19 9062544 . T G 688.68 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0686;QD=62.6075;RBI=0.112908;REFB=0;REVB=-0.0998122;RO=0;SAF=12;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00217598;OID=.;OPOS=9062544;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:31:12:0:0:31:13:0:0 chr19 9063678 . T G 686.84 PASS AF=0.523438;AO=66;DP=127;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.00682845;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.814;QD=21.4639;RBI=0.0168767;REFB=-0.0103338;REVB=0.0154336;RO=60;SAF=35;SAR=31;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838844;STB=0.545716;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00619098;OID=.;OPOS=9063678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:60:61:66:67:0.523438:31:35:26:34:32:35:26:35 chr19 9063935 . G A 551.94 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.0106674;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.81;QD=20.8278;RBI=0.0115979;REFB=-0.0285905;REVB=0.00455162;RO=50;SAF=17;SAR=39;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280933;STB=0.654946;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0259255;OID=.;OPOS=9063935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:39:17:31:19:39:17:31:19 chr19 9065203 . T C 161.48 PASS AF=0.515152;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0292761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.277;QD=19.5738;RBI=0.0357237;REFB=-0.0283731;REVB=0.0204718;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510626;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0248141;OID=.;OPOS=9065203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:16:16:16:17:0.515152:11:5:5:11:12:5:5:11 chr19 9065510 . G A 586.22 PASS AF=0.473282;AO=61;DP=131;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=0.0450751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8216;QD=17.8999;RBI=0.0674659;REFB=-0.00770765;REVB=0.0501985;RO=69;SAF=31;SAR=30;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167252;STB=0.603298;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00949922;OID=.;OPOS=9065510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:69:61:62:0.473282:30:31:23:46:30:32:22:47 chr19 9065632 . T C 276.68 PASS AF=0.376471;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00649801;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.936;QD=13.0204;RBI=0.00932669;REFB=-0.0167454;REVB=-0.00669051;RO=51;SAF=10;SAR=22;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300023;STB=0.661551;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0163974;OID=.;OPOS=9065632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:51:53:32:32:0.376471:22:10:30:21:22:10:30:23 chr19 9066259 . T C 480.72 PASS AF=0.374194;AO=56;DP=155;FAO=58;FDP=155;FR=.;FRO=97;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.00496392;FXX=0.0189861;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.635;QD=12.4058;RBI=0.0972742;REFB=-0.00695427;REVB=0.0971475;RO=96;SAF=36;SAR=20;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820909;STB=0.535055;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0107286;OID=.;OPOS=9066259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:96:97:56:58:0.374194:20:36:55:41:22:36:55:42 chr19 9068530 . C T 787.57 PASS AF=0.528169;AO=74;DP=141;FAO=75;FDP=142;FR=.;FRO=67;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=0.00290354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.235;QD=22.1851;RBI=0.0093977;REFB=-0.00368852;REVB=-0.00893791;RO=67;SAF=37;SAR=37;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109985;STB=0.562894;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00480279;OID=.;OPOS=9068530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:67:67:74:75:0.528169:37:37:42:25:38:37:42:25 chr19 9070079 . C G 287.9 PASS AF=0.565217;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00749727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.398;QD=25.0349;RBI=0.0726082;REFB=-0.0330648;REVB=-0.0722201;RO=19;SAF=17;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103221;STB=0.570616;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0152684;OID=.;OPOS=9070079;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:19:20:26:26:0.565217:9:17:10:9:9:17:10:10 chr19 9070194 . A G 740.41 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.456;QD=56.9546;RBI=0.0237108;REFB=0;REVB=0.0166547;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15146e-05;OID=.;OPOS=9070194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0 chr19 9070225 . G C 920.08 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1832;QD=58.4179;RBI=0.0291856;REFB=0;REVB=0.00646969;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269488;OID=.;OPOS=9070225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:38:24:0:0:39:24:0:0 chr19 9070837 . G A 1508.65 PASS AF=0.963303;AO=103;DP=109;FAO=105;FDP=109;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0139204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.361;QD=55.3634;RBI=0.0144257;REFB=-0.0542681;REVB=0.00378462;RO=4;SAF=64;SAR=39;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277543;STB=0.513772;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.000825526;OID=.;OPOS=9070837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:109:109:4:4:103:105:0.963303:39:64:1:3:41:64:1:3 chr19 9071763 . T A 1423.27 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269522;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.847;QD=63.2567;RBI=0.0301761;REFB=0;REVB=0.0135713;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.87794e-05;OID=.;OPOS=9071763;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:50:40:0:0:50:40:0:0 chr19 9072313 . A G 78.16 PASS AF=0.5;AO=8;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0822998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6512;QD=15.6322;RBI=0.0872266;REFB=-0.0520988;REVB=0.0289004;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547459;STB=0.749624;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0718527;OID=.;OPOS=9072313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:20:20:10:10:8:10:0.5:3:5:0:10:5:5:0:10 chr19 9072742 . T C 349.86 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00606707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4787;QD=17.7144;RBI=0.0229211;REFB=-0.0188713;REVB=0.0221036;RO=42;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192487;STB=0.510766;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0249336;OID=.;OPOS=9072742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:21:16:19:23:21:16:19:23 chr19 9074950 . G T 509.74 PASS AF=0.521277;AO=49;DP=93;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0426564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.334;QD=21.691;RBI=0.0475055;REFB=-0.0122448;REVB=-0.0209094;RO=44;SAF=26;SAR=23;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161917;STB=0.593672;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0113086;OID=.;OPOS=9074950;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:44:45:49:49:0.521277:23:26:15:29:23:26:15:30 chr19 9075217 . T A 139.19 PASS AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0255487;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4588;QD=10.9168;RBI=0.0325893;REFB=-0.0226969;REVB=0.0202318;RO=34;SAF=5;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24437;STB=0.645299;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0223204;OID=.;OPOS=9075217;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:12:5:17:17:12:5:17:17 chr19 9075346 . T A 615.43 PASS AF=0.544643;AO=57;DP=112;FAO=61;FDP=112;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.00246644;FXX=0.0344798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.342;QD=21.9795;RBI=0.010106;REFB=-0.0106591;REVB=0.00980041;RO=55;SAF=24;SAR=33;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00262153;STB=0.511478;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00864682;OID=.;OPOS=9075346;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:55:51:57:61:0.544643:33:24:23:32:35:26:23:28 chr19 9075565 . C T 749.69 PASS AF=0.549618;AO=71;DP=130;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=51;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0157886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5056;QD=22.8913;RBI=0.0178246;REFB=-0.00219664;REVB=-0.00827266;RO=58;SAF=20;SAR=51;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199561;STB=0.59983;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00263189;OID=.;OPOS=9075565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:58:59:71:72:0.549618:51:20:29:29:51:21:29:30 chr19 9075584 . T A 481.4 PASS AF=0.438017;AO=53;DP=121;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=49;FWDB=0.014131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.391;QD=15.914;RBI=0.0148079;REFB=-0.0153318;REVB=0.00442589;RO=68;SAF=25;SAR=28;SRF=19;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197402;STB=0.609717;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0175658;OID=.;OPOS=9075584;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:68:68:53:53:0.438017:28:25:19:49:28:25:19:49 chr19 9075635 . G A 384.82 PASS AF=0.41;AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=-0.00392976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.969;QD=15.3928;RBI=0.0137245;REFB=-0.0113403;REVB=0.0131499;RO=59;SAF=21;SAR=20;SRF=16;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252081;STB=0.641235;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0160112;OID=.;OPOS=9075635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:59:59:41:41:0.41:20:21:16:43:20:21:16:43 chr19 9075737 . T C 872.02 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201026;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2816;QD=58.1349;RBI=0.041448;REFB=0;REVB=0.0362466;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345454;OID=.;OPOS=9075737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0 chr19 9075969 . C T 230.22 PASS AF=0.409091;AO=23;DP=70;FAO=27;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.130792;FXX=0.0571347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.5527;QD=13.953;RBI=0.172541;REFB=-0.0244224;REVB=-0.112534;RO=25;SAF=16;SAR=7;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346445;STB=0.57782;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0346431;OID=.;OPOS=9075969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:66:25:39:23:27:0.409091:7:16:8:17:11:16:18:21 chr19 9076083 . G A 277.92 PASS AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00490686;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.623;QD=13.3939;RBI=0.00958859;REFB=-0.0184414;REVB=0.00823795;RO=51;SAF=16;SAR=16;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031623;STB=0.518061;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0174783;OID=.;OPOS=9076083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:16:16:27:24:16:16:27:24 chr19 9076163 . C T 464.07 PASS AF=0.386861;AO=53;DP=137;FAO=53;FDP=137;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=53;FWDB=-0.0461112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6552;QD=13.5496;RBI=0.0479646;REFB=0.0116927;REVB=-0.0132044;RO=84;SAF=25;SAR=28;SRF=31;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112579;STB=0.563572;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.0277885;OID=.;OPOS=9076163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:84:84:53:53:0.386861:28:25:31:53:28:25:31:53 chr19 9076278 . G A 164.13 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=-0.00304237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.298;QD=12.8726;RBI=0.00421551;REFB=-0.00972263;REVB=0.00291796;RO=32;SAF=7;SAR=12;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272042;STB=0.65454;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0219975;OID=.;OPOS=9076278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:12:7:5:27:12:7:5:27 chr19 9076728 . C T 120.15 PASS AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0876508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4665;QD=14.1355;RBI=0.0960749;REFB=-0.0234758;REVB=-0.0393412;RO=20;SAF=2;SAR=12;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.446063;STB=0.765518;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0195292;OID=.;OPOS=9076728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:12:2:10:10:12:2:10:10 chr19 9076858 . C T 174.35 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00444621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.332;QD=11.6232;RBI=0.00860689;REFB=-0.0137597;REVB=0.00736952;RO=37;SAF=9;SAR=13;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171147;STB=0.590826;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0202817;OID=.;OPOS=9076858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:37:38:22:22:0.366667:13:9:21:16:13:9:21:17 chr19 9076929 . T G 255.2 PASS AF=0.333333;AO=31;DP=93;FAO=31;FDP=93;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0218223;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.555;QD=10.9764;RBI=0.0231506;REFB=-0.0119715;REVB=-0.00772907;RO=61;SAF=12;SAR=19;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844858;STB=0.544384;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0230618;OID=.;OPOS=9076929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:61:62:31:31:0.333333:19:12:28:33:19:12:28:34 chr19 9076950 . C A 296.23 PASS AF=0.382022;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0257123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.242;QD=13.3136;RBI=0.0397996;REFB=-0.00282108;REVB=-0.030379;RO=55;SAF=12;SAR=22;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095344;STB=0.554589;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00816668;OID=.;OPOS=9076950;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:0.382022:22:12:24:31:22:12:24:31 chr19 9076991 . C T 238.89 PASS AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0202019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.456;QD=11.797;RBI=0.0241899;REFB=0.00178208;REVB=-0.0133054;RO=51;SAF=9;SAR=20;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123288;STB=0.579382;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.0051129;OID=.;OPOS=9076991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:51:52:29:29:0.358025:20:9:21:30:20:9:22:30 chr19 9077060 . C T 331.68 PASS AF=0.548387;AO=32;DP=60;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0504189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.663;QD=21.3986;RBI=0.0504603;REFB=-0.0120585;REVB=-0.00204325;RO=28;SAF=11;SAR=21;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124178;STB=0.51712;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0089505;OID=.;OPOS=9077060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:28:28:32:34:0.548387:21:11:10:18:23:11:10:18 chr19 9077196 . C T 364.97 PASS AF=0.481013;AO=37;DP=78;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.024252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.575;QD=18.4795;RBI=0.0548785;REFB=-0.00511943;REVB=-0.0492289;RO=41;SAF=21;SAR=16;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982795;STB=0.56029;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00495382;OID=.;OPOS=9077196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:41:41:37:38:0.481013:16:21:19:22:16:22:19:22 chr19 9077264 . T G 414.48 PASS AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0049837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.721;QD=21.8145;RBI=0.0187296;REFB=-0.0172203;REVB=-0.0180544;RO=35;SAF=17;SAR=24;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131361;STB=0.572498;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.019112;OID=.;OPOS=9077264;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:35:41:41:0.539474:24:17:20:15:24:17:20:15 chr19 9077436 . G A 488.61 PASS AF=0.559524;AO=46;DP=83;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.00345323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.03;QD=23.267;RBI=0.0158745;REFB=-0.0153535;REVB=0.0154944;RO=37;SAF=28;SAR=18;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228962;STB=0.618424;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00846907;OID=.;OPOS=9077436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:37:37:46:47:0.559524:18:28:12:25:19:28:12:25 chr19 9077803 . T C 324.96 PASS AF=0.53125;AO=27;DP=65;FAO=34;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00417322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.488;QD=20.3099;RBI=0.0949603;REFB=-0.0111697;REVB=0.0948686;RO=29;SAF=13;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329533;STB=0.556784;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0125103;OID=.;OPOS=9077803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:29:30:27:34:0.53125:14:13:15:14:21:13:15:15 chr19 9080462 . C G 2178.19 PASS AF=1;AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.602;QD=63.136;RBI=0.0399674;REFB=0;REVB=0.0398369;RO=0;SAF=50;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84035e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.021e-05;OID=.;OPOS=9080462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:137:138:0:0:137:138:1:87:50:0:0:88:50:0:0 chr19 9082514 . C A 457.22 PASS AF=0.432203;AO=50;DP=117;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=-0.00877087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.75;QD=15.499;RBI=0.00997028;REFB=-0.0220748;REVB=0.00474113;RO=67;SAF=15;SAR=35;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851331;STB=0.538042;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0267574;OID=.;OPOS=9082514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:67:67:50:51:0.432203:35:15:25:42:35:16:25:42 chr19 9087615 . T A 827.5 PASS AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0301714;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.4007;QD=55.1669;RBI=0.0350306;REFB=-0.112366;REVB=0.0177998;RO=1;SAF=28;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00332097;OID=.;OPOS=9087615;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:59:60:1:1:58:59:0.983333:30:28:1:0:31:28:1:0 chr19 9088017 . T G 327.3 PASS AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0307447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9706;QD=17.6921;RBI=0.0442226;REFB=-0.00935729;REVB=0.0317869;RO=39;SAF=11;SAR=24;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206144;STB=0.511539;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0108455;OID=.;OPOS=9088017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:24:11:13:26:24:11:13:26 chr19 9088722 . G A 275.13 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00434525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.107;QD=15.5;RBI=0.0075631;REFB=-0.0178055;REVB=0.00619026;RO=40;SAF=12;SAR=19;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139539;STB=0.578896;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0201901;OID=.;OPOS=9088722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:19:12:21:19:19:12:21:19 chr19 9204307 . A G 379.45 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0088234;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.582;QD=56.2149;RBI=0.0169768;REFB=0;REVB=-0.0145038;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.41274e-05;OID=.;OPOS=9204307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr19 9213026 . T C 118.28 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0607164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.716;QD=12.7866;RBI=0.08823;REFB=-0.0154871;REVB=-0.064016;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987965;STB=0.558056;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0197887;OID=.;OPOS=9213026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:8:6:12:11:8:6:12:11 chr19 9213079 . A C 62.39 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00758092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3182;QD=7.79834;RBI=0.016259;REFB=-0.0116244;REVB=0.0143835;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22078;STB=0.637985;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0285031;OID=.;OPOS=9213079;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:6:3:12:11:6:3:12:11 chr19 9213132 . A G 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00485697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6143;QD=12.868;RBI=0.00501836;REFB=-0.00967686;REVB=-0.00126244;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777998;STB=0.546014;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.00932503;OID=.;OPOS=9213132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:4:7:9:7:4:7:9:7 chr19 9251220 . C T 318.35 PASS AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0274812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.261;QD=18.1914;RBI=0.0275116;REFB=-0.00147006;REVB=-0.0012921;RO=36;SAF=25;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153199;STB=0.50856;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00242132;OID=.;OPOS=9251220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:9:25:26:10:9:25:26:10 chr19 9251258 . T C 161.37 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0351049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3383;QD=11.9531;RBI=0.0404364;REFB=-0.0103373;REVB=-0.0200686;RO=34;SAF=14;SAR=6;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298614;STB=0.517374;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0395878;OID=.;OPOS=9251258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:6:14:23:11:6:14:23:11 chr19 9267292 . G A 210.69 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00739562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3194;QD=19.1534;RBI=0.0089094;REFB=0.00736661;REVB=-0.00496813;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121916;STB=0.568901;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=-0.00906778;OID=.;OPOS=9267292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:9:14:10:11:9:14 chr19 9271707 . C T 300.6 PASS AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.85;QD=23.1231;RBI=0.0310431;REFB=-0.0289695;REVB=0.0275533;RO=22;SAF=9;SAR=21;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13208;STB=0.573225;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0199111;OID=.;OPOS=9271707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:21:9:10:12:21:9:10:12 chr19 9271969 . C A 257.74 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00538983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1847;QD=23.4312;RBI=0.0259447;REFB=-0.0183389;REVB=0.0253787;RO=20;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114994;STB=0.564098;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.014694;OID=.;OPOS=9271969;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:13:11:12:8:13:11:12:8 chr19 9273800 . A G 620.1 PASS AF=0.584158;AO=59;DP=101;FAO=59;FDP=101;FR=.;FRO=42;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00485804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.441;QD=24.5585;RBI=0.038185;REFB=-0.0494437;REVB=-0.0378747;RO=42;SAF=34;SAR=25;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148354;STB=0.508092;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.03847;OID=.;OPOS=9273800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:42:42:59:59:0.584158:25:34:25:17:25:34:25:17 chr19 9296664 . T C 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00524761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.077;QD=17.4007;RBI=0.00980656;REFB=-0.00998541;REVB=0.0082844;RO=13;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237804;STB=0.638067;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00704312;OID=.;OPOS=9296664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:10:3:6:7:10:3:6:7 chr19 9297274 . G A 172.19 PASS AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0128025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.938;QD=26.4907;RBI=0.0175369;REFB=0.00855147;REVB=-0.0119849;RO=9;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263792;STB=0.646886;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.0225913;OID=.;OPOS=9297274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:11:6:7:2:11:6:7:2 chr19 9297381 . A C 379.01 PASS AF=0.673913;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0260582;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8817;QD=32.9572;RBI=0.0755667;REFB=-0.0071793;REVB=0.0709317;RO=16;SAF=14;SAR=17;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00887061;STB=0.517034;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.00737744;OID=.;OPOS=9297381;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:16:15:31:31:0.673913:17:14:7:9:17:14:6:9 chr19 9297605 . TC T,TT 202.28 PASS AF=0.567568,0;AO=7,6;DP=30;FAO=21,0;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=16,0;FSAR=5,0;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00297241,-0.00199699;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.423,181.811;QD=21.8677;RBI=0.0109002,0.00997;REFB=-0.0126524,-0.012353;REVB=0.0104871,0.00976796;RO=15;SAF=4,5;SAR=3,1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.18924,0.166455;STB=0.542331,0.5;STBP=0.584,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0146686,-0.03961;OID=.,.;OPOS=9297606,9297606;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.567568,0:7,6:30:21,0:37:16:16,0:5,0:11:5:99:15:4,5:3,1:11:4 chr19 9297874 . G A 254.83 PASS AF=0.520833;AO=23;DP=45;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0289583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.829;QD=21.2361;RBI=0.030246;REFB=-0.0295022;REVB=0.00873144;RO=22;SAF=10;SAR=13;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022833;STB=0.521722;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0380159;OID=.;OPOS=9297874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:48:22:23:23:25:0.520833:13:10:9:13:13:12:10:13 chr19 9298364 . C T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0347995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6202;QD=11.9535;RBI=0.0562175;REFB=0.0436286;REVB=0.0441521;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09343;STB=0.555425;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0547629;OID=.;OPOS=9298364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:2:6:9:2:2:6:9:2 chr19 9325116 . G A 538.82 PASS AF=0.52381;AO=54;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0133535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.513;QD=20.5264;RBI=0.0133656;REFB=-0.0134549;REVB=0.000567508;RO=50;SAF=21;SAR=33;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818136;STB=0.548369;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0110522;OID=.;OPOS=9325116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:50:50:54:55:0.52381:33:21:24:26:34:21:24:26 chr19 9325252 . G A 262.81 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.000445437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.118;QD=15.0176;RBI=0.0133612;REFB=-0.000554002;REVB=-0.0133538;RO=39;SAF=15;SAR=15;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01281;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000544207;OID=.;OPOS=9325252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:40:30:30:0.428571:15:15:20:19:15:15:20:20 chr19 9346427 . T C 238.22 PASS AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0269176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.086;QD=20.2744;RBI=0.0279478;REFB=-0.0404923;REVB=0.00751812;RO=24;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062672;STB=0.535342;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0375164;OID=.;OPOS=9346427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:9:14:13:11:9:14:13:11 chr19 9346599 . C G 396.36 PASS AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0411003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3358;QD=20.5902;RBI=0.0467734;REFB=-0.00518242;REVB=-0.0223274;RO=36;SAF=17;SAR=23;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169785;STB=0.516845;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00490317;OID=.;OPOS=9346599;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:37:40:40:0.519481:23:17:16:20:23:17:17:20 chr19 9346762 . T G 102.28 PASS AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.143117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0495;QD=9.09156;RBI=0.147248;REFB=-0.0172302;REVB=0.0346339;RO=32;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179938;STB=0.608235;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0678801;OID=.;OPOS=9346762;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:7:6:10:22:7:6:10:22 chr19 9362138 . G A 100.16 PASS AF=0.4;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0133422;FXX=0.0624805;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.347;QD=13.3551;RBI=0.0207139;REFB=-0.0111478;REVB=-0.0158446;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141414;STB=0.583194;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0166365;OID=.;OPOS=9362138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:30:18:18:12:12:0.4:5:7:8:10:5:7:8:10 chr19 9362297 . C T 141.02 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00701935;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.844;QD=20.1452;RBI=0.0145344;REFB=0.0118466;REVB=-0.0127271;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940743;STB=0.538411;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00891855;OID=.;OPOS=9362297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:28:14:13:15:15:0.535714:7:8:9:5:7:8:8:5 chr19 9362343 . C T 122.32 PASS AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0223265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.758;QD=15.7831;RBI=0.0231436;REFB=-0.0194587;REVB=0.00609562;RO=17;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552695;STB=0.531973;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0209572;OID=.;OPOS=9362343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:5:9:10:7:5:9:10:7 chr19 9362443 . C T 91.11 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00884977;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.401;QD=8.28232;RBI=0.0115013;REFB=-1.39572e-05;REVB=-0.00734592;RO=32;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201923;STB=0.624787;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=4.664e-05;OID=.;OPOS=9362443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:4:8:16:16:4:8:16:16 chr19 9434872 . C T 414.51 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0195113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.874;QD=19.2793;RBI=0.0238298;REFB=-0.00385489;REVB=-0.0136809;RO=44;SAF=27;SAR=15;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648967;STB=0.503608;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00501336;OID=.;OPOS=9434872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:15:27:28:16:15:27:28:16 chr19 9449888 . A G 905.77 PASS AF=0.577465;AO=82;DP=143;FAO=82;FDP=142;FR=.;FRO=60;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.0307918;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.192;QD=25.5147;RBI=0.0348619;REFB=-0.0278256;REVB=0.0163466;RO=60;SAF=45;SAR=37;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127962;STB=0.569603;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0185973;OID=.;OPOS=9449888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:60:60:82:82:0.577465:37:45:23:37:37:45:23:37 chr19 9452026 . ACT A 211.4 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0104689;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.002;QD=18.7909;RBI=0.0113489;REFB=-0.00897972;REVB=-0.00438162;RO=24;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481383;STB=0.527247;STBP=0.727;TYPE=del;VARB=0.00905953;OID=.;OPOS=9452027;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:21:46:21:45:24:8:13:8:16:99:24:8:13:8:16 chr19 9489745 . T C 486.68 PASS AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.913;QD=16.6387;RBI=0.0324512;REFB=-0.00175794;REVB=-0.0292279;RO=64;SAF=26;SAR=27;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367643;STB=0.520496;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00199818;OID=.;OPOS=9489745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:64:53:53:0.452991:27:26:29:35:27:26:29:35 chr19 9490814 . C T 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0206059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.396;QD=16.5359;RBI=0.0250723;REFB=-0.0064131;REVB=0.0142834;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981228;STB=0.505488;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00930302;OID=.;OPOS=9490814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:22:23:18:18:0.439024:8:10:12:10:8:10:13:10 chr19 9492141 . C T 158.1 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.000343971;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.413;QD=15.8099;RBI=0.0340715;REFB=0.00425783;REVB=-0.0340697;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541645;STB=0.531112;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=-0.00551999;OID=.;OPOS=9492141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:16:7:6:11:16:7 chr19 9492370 . A T 114.43 PASS AF=0.565217;AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0138466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.271;QD=19.9013;RBI=0.0317738;REFB=-0.0213272;REVB=0.028598;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972526;STB=0.571322;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0141254;OID=.;OPOS=9492370;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:23:10:10:12:13:0.565217:5:7:7:3:6:7:7:3 chr19 9524185 . A G 373.78 PASS AF=0.407407;AO=43;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=0.0715434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.8338;QD=13.8436;RBI=0.0718036;REFB=-0.033159;REVB=0.00610695;RO=62;SAF=20;SAR=23;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117249;STB=0.557436;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0659145;OID=.;OPOS=9524185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:62:64:43:44:0.407407:23:20:22:40:24:20:23:41 chr19 10071063 . T C 81.04 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.098189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.903;QD=18.0085;RBI=0.101752;REFB=-0.0383455;REVB=0.0266896;RO=8;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.461553;STB=0.775174;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.015962;OID=.;OPOS=10071063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:9:1:4:4:9:1:4:4 chr19 10071347 . C T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0353154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.007;QD=13.486;RBI=0.0364224;REFB=0.00686483;REVB=-0.00891134;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166665;STB=0.59976;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00335254;OID=.;OPOS=10071347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:7:2:4:7:7:2:4:7 chr19 10071414 . G A 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00679909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.916;QD=11.8306;RBI=0.0178064;REFB=-0.0169743;REVB=-0.0164572;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129996;STB=0.576788;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0396589;OID=.;OPOS=10071414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:6:12:6:5:6:12 chr19 10077419 . C G 88.12 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.934;QD=39.1639;RBI=0.0361446;REFB=0;REVB=0.012572;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202295;OID=.;OPOS=10077419;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:4:4:0:0:5:4:0:0 chr19 10078589 . T C 206.27 PASS AF=0.371429;AO=24;DP=67;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0468104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.7089;QD=11.7867;RBI=0.0767587;REFB=-0.0064284;REVB=0.0608332;RO=43;SAF=15;SAR=9;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178626;STB=0.587905;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0092965;OID=.;OPOS=10078589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:43:44:24:26:0.371429:9:15:20:23:10:16:21:23 chr19 10079093 . C T 306.58 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0134594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.597;QD=27.2513;RBI=0.0141725;REFB=-0.0449796;REVB=-0.00443903;RO=18;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128911;STB=0.571374;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.020163;OID=.;OPOS=10079093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:18:9:9:9:18:9:9:9 chr19 10081276 . C G 154.69 PASS AF=0.36;AO=17;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0190974;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.928;QD=12.3751;RBI=0.0232716;REFB=-0.011282;REVB=0.0132988;RO=31;SAF=12;SAR=5;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503693;STB=0.53842;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0148623;OID=.;OPOS=10081276;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:31:32:17:18:0.36:5:12:22:9:6:12:23:9 chr19 10084292 . C G 469.38 PASS AF=0.971429;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0931305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.596;QD=53.6435;RBI=0.0931321;REFB=-0.0498554;REVB=0.000556384;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.515143;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00468339;OID=.;OPOS=10084292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:33:35:0:1:33:34:0.971429:16:17:0:0:16:18:0:1 chr19 10085054 . G A 55.93 PASS AF=0.333333;AO=4;DP=23;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00896314;FXX=0.039984;HRUN=5;LEN=1;MLLD=160.405;QD=9.32221;RBI=0.0201336;REFB=-0.00892965;REVB=0.0180284;RO=9;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579645;STB=0.599733;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0234587;OID=.;OPOS=10085054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:24:9:16:4:8:0.333333:2:2:4:5:6:2:6:10 chr19 10088271 . C G 397.09 PASS AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0186634;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5149;QD=49.6364;RBI=0.0206106;REFB=-0.101222;REVB=0.0087448;RO=1;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372625;STB=0.538436;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00687305;OID=.;OPOS=10088271;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:32:32:1:2:30:30:0.9375:12:18:0:1:12:18:0:2 chr19 10089262 . G A 438.79 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00779871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.609;QD=56.6184;RBI=0.0085474;REFB=0;REVB=-0.00349832;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157671;OID=.;OPOS=10089262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:18:13:0:0 chr19 10090070 . C T 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00182243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.129;QD=12.483;RBI=0.0319263;REFB=-0.0243146;REVB=-0.0318743;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891716;STB=0.530676;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0254257;OID=.;OPOS=10090070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:5:7:12:6:5:7:12:7 chr19 10100061 . C A 207.79 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00596267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.181;QD=17.6838;RBI=0.00684679;REFB=-0.000610746;REVB=-0.00336528;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205219;STB=0.615913;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.000722331;OID=.;OPOS=10100061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:11:10:7:19:11:10:7:19 chr19 10102676 . A G 77.29 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0247873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.445;QD=13.4417;RBI=0.0249256;REFB=-0.0250746;REVB=0.00262245;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825183;STB=0.548295;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0251476;OID=.;OPOS=10102676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:10:3:3:7:10:3 chr19 10112346 . T C 1151.49 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00639466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.352;QD=60.6045;RBI=0.0209668;REFB=0;REVB=0.0199679;RO=0;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65389e-05;OID=.;OPOS=10112346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:29:46:0:0:29:47:0:0 chr19 10131999 . T C 252.85 PASS AF=0.5;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00575735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.072;QD=21.0709;RBI=0.0163184;REFB=-0.0293817;REVB=-0.0152691;RO=22;SAF=14;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110704;STB=0.583264;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0244914;OID=.;OPOS=10131999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:22:24:24:24:0.5:10:14:10:12:10:14:10:14 chr19 10132290 . C T 197.12 PASS AF=0.542857;AO=8;DP=36;FAO=19;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0398474;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.555;QD=22.5282;RBI=0.045034;REFB=-0.0325966;REVB=0.0209821;RO=16;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132461;STB=0.59313;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0240061;OID=.;OPOS=10132290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:16:16:8:19:0.542857:7:1:3:13:12:7:3:13 chr19 10218524 . C G 252.79 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.026188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.158;QD=21.0657;RBI=0.0337106;REFB=-0.00866035;REVB=-0.0212271;RO=24;SAF=17;SAR=7;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941903;STB=0.55259;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00919265;OID=.;OPOS=10218524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:7:17:19:5:7:17:19:5 chr19 10221218 . G A 67.33 PASS AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0451023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.54;QD=26.9335;RBI=0.116297;REFB=-0.0591468;REVB=0.107195;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679981;STB=0.571264;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0232427;OID=.;OPOS=10221218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:10:10:1:2:8:8:0.8:2:6:1:0:2:6:2:0 chr19 10225777 . A G 164.83 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00859682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.172;QD=21.2691;RBI=0.0326501;REFB=-0.0497941;REVB=0.031498;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179543;STB=0.601441;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0321143;OID=.;OPOS=10225777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:11:6:8:6:11:6:8:6 chr19 10229297 . C A 173.73 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00359027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.342;QD=12.869;RBI=0.00815346;REFB=-0.000686339;REVB=-0.00732044;RO=33;SAF=6;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163835;STB=0.595143;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00226441;OID=.;OPOS=10229297;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:15:6:14:19:15:6:14:19 chr19 10265312 . T C 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.102;QD=55.6558;RBI=0.0191909;REFB=0;REVB=0.0167869;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09923e-05;OID=.;OPOS=10265312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chr19 10267077 . T C 210.29 PASS AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00132709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.783;QD=15.5771;RBI=0.048951;REFB=0.000308119;REVB=0.048933;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733835;STB=0.541632;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.000131634;OID=.;OPOS=10267077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:13:11:16:14:13:11:16:14 chr19 10271034 . C G 274.88 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0706287;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6524;QD=21.5588;RBI=0.0792344;REFB=-0.0188488;REVB=-0.0359121;RO=24;SAF=16;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100975;STB=0.517229;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0107066;OID=.;OPOS=10271034;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:24:23:28:28:0.54902:12:16:14:10:12:16:14:9 chr19 10273372 . T C 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0165619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2441;QD=14.6652;RBI=0.0198144;REFB=-0.00376111;REVB=0.0108772;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136602;STB=0.578846;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00707325;OID=.;OPOS=10273372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:8:7:7:14:8:7:7:14 chr19 10402938 . G A 211.75 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0470532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.741;QD=19.6973;RBI=0.050293;REFB=-0.0410255;REVB=0.0177589;RO=20;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124959;STB=0.58672;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0378448;OID=.;OPOS=10402938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:20:22:21:21:0.488372:8:13:15:5:8:13:17:5 chr19 10403368 . G A 201.99 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0286518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.826;QD=21.2623;RBI=0.0341833;REFB=0.00708965;REVB=0.0186432;RO=17;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154719;STB=0.5999;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.00650887;OID=.;OPOS=10403368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:12:8:10:7:12:8:11:7 chr19 10415781 . T C 99.94 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.015312;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.218;QD=14.2776;RBI=0.0242181;REFB=-0.00288731;REVB=-0.0187632;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143325;STB=0.617454;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000957697;OID=.;OPOS=10415781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:16:12:12:0.428571:5:7:6:8:5:7:6:10 chr19 10426422 . A C 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00907344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.967;QD=18.7441;RBI=0.0166262;REFB=-0.0653524;REVB=0.0139321;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149414;STB=0.58797;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0308297;OID=.;OPOS=10426422;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:2:5:2:2:2:5:2:2 chr19 10426628 . T C 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0196949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.079;QD=13.2053;RBI=0.0697977;REFB=0.00611555;REVB=-0.0669614;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280783;STB=0.666171;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.0157477;OID=.;OPOS=10426628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:5:1:3:3:5:1 chr19 10433819 . A AC 45.44 PASS AF=0.625;AO=8;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.053082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.099;QD=11.3605;RBI=0.0821541;REFB=-0.0921571;REVB=0.0627024;RO=7;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.539065;STB=0.842943;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.0776491;OID=.;OPOS=10433820;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.625:8:16:10:16:6:1:9:5:1:40:7:1:7:5:2 chr19 10449392 . A G 86.86 PASS AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0109295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.722;QD=12.8689;RBI=0.0175177;REFB=-0.0190373;REVB=-0.0136901;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459799;STB=0.76877;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0213962;OID=.;OPOS=10449392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:3:8:4:12:3:8:4:12 chr19 10475652 . C A 353.68 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.100138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.153;QD=18.6149;RBI=0.100412;REFB=-0.0206413;REVB=0.00740572;RO=39;SAF=14;SAR=23;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190901;STB=0.510633;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0230955;OID=.;OPOS=10475652;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:23:14:14:25:23:14:14:25 chr19 10488969 . G T 362.22 PASS AF=0.578125;AO=36;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0133064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.023;QD=22.6389;RBI=0.0176186;REFB=-0.0414621;REVB=0.0115479;RO=28;SAF=17;SAR=19;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106722;STB=0.544664;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0187396;OID=.;OPOS=10488969;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:27:36:37:0.578125:19:17:17:11:19:18:16:11 chr19 10577843 . C A 111.55 PASS AF=0.378378;AO=13;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0429392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.613;QD=12.0598;RBI=0.064048;REFB=-0.0312599;REVB=-0.0475223;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174558;STB=0.621458;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0673978;OID=.;OPOS=10577843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:13:14:0.378378:7:6:7:16:7:7:7:16 chr19 10579474 . T G 162.3 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0111378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.812;QD=19.6726;RBI=0.0264598;REFB=-0.0625667;REVB=0.0240014;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464767;STB=0.512805;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0595444;OID=.;OPOS=10579474;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:16:17:17:0.515152:7:10:8:7:7:10:9:7 chr19 10665944 . GC CT 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=223.877;QD=10.0339;RBI=0.00575552;REFB=-0.0137361;REVB=0.00575552;RO=7;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.029974;OID=.;OPOS=10665944;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:5:0:0:7:5:0:0:7 chr19 10668452 . A G 123.17 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00842092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.0244;QD=37.8969;RBI=0.0204287;REFB=-0.122733;REVB=-0.0186123;RO=1;SAF=9;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475628;STB=0.526273;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00635399;OID=.;OPOS=10668452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:3:9:1:0:3:9:1:0 chr19 10668673 . A G 201.68 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00899008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.724;QD=21.2294;RBI=0.0127103;REFB=-0.0390985;REVB=0.00898502;RO=18;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385902;STB=0.521717;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0340342;OID=.;OPOS=10668673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:12:8:8:10:12:8:8:10 chr19 10670184 . C G 473.36 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00331592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.223;QD=57.3773;RBI=0.0341781;REFB=0;REVB=0.0340169;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105454;OID=.;OPOS=10670184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:24:8:0:0:24:9:0:0 chr19 10676429 . G A 67.89 PASS AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0519671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9953;QD=15.0867;RBI=0.0825849;REFB=-0.0106596;REVB=0.0641848;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380371;STB=0.736288;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0138541;OID=.;OPOS=10676429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:17:18:9:9:8:9:0.5:2:6:3:6:2:7:3:6 chr19 10683477 . A G 744.81 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.955;QD=63.3882;RBI=0.0202337;REFB=0;REVB=0.0199353;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150427;OID=.;OPOS=10683477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:30:16:0:0:31:16:0:0 chr19 10692000 . T C 726.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00761344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.601;QD=63.1792;RBI=0.00766523;REFB=0;REVB=0.000889465;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.32406e-05;OID=.;OPOS=10692000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:22:23:0:0:22:24:0:0 chr19 10738639 . C T 557.11 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2101;QD=60.2277;RBI=0.0551115;REFB=0;REVB=0.0208637;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114699;OID=.;OPOS=10738639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:27:10:0:0:27:10:0:0 chr19 10742170 . A G 279.6 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0221021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.877;QD=48.626;RBI=0.0530331;REFB=0.00649201;REVB=-0.0482079;RO=1;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401764;STB=0.521719;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00183144;OID=.;OPOS=10742170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:11:11:0:1:11:11:0:1 chr19 10794630 . G T 1440.44 PASS AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0419327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.448;QD=61.9544;RBI=0.0480199;REFB=-0.0958384;REVB=0.0233999;RO=1;SAF=55;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126395;STB=0.506665;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000340016;OID=.;OPOS=10794630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:93:93:1:1:92:92:0.989247:37:55:0:1:37:55:0:1 chr19 10891015 . C G 145.5 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0234885;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.931;QD=16.1663;RBI=0.0456874;REFB=-0.0210763;REVB=0.0391871;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154651;STB=0.610979;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0284531;OID=.;OPOS=10891015;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:20:16:16:0.444444:8:8:6:12:8:8:6:14 chr19 10939792 . T C 341.81 PASS AF=0.430233;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=0.00374835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.827;QD=15.8981;RBI=0.00622811;REFB=-0.0107243;REVB=0.00497386;RO=48;SAF=12;SAR=25;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884147;STB=0.539405;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0100457;OID=.;OPOS=10939792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:48:49:37:37:0.430233:25:12:12:36:25:12:13:36 chr19 10941991 . A T 39.61 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0240247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.851;QD=13.2044;RBI=0.0363244;REFB=-0.0152828;REVB=0.0272447;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207272;STB=0.66611;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0291535;OID=.;OPOS=10941991;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:5:6:6:6:0.5:4:2:3:2:4:2:4:2 chr19 11144157 . C T 145.47 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.057838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4157;QD=16.1628;RBI=0.0579599;REFB=0.0200498;REVB=0.0037574;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313311;STB=0.681577;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.0230894;OID=.;OPOS=11144157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:12:4:11:9:12:4:11:9 chr19 11224265 . A G 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0128615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.207;QD=13.5055;RBI=0.0275611;REFB=-0.0108542;REVB=-0.0243761;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310145;STB=0.681519;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0256321;OID=.;OPOS=11224265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:8:4:11:6:8:4:11:6 chr19 11227602 . C T 294.61 PASS AF=0.533333;AO=23;DP=58;FAO=32;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00902848;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.372;QD=19.6405;RBI=0.0388927;REFB=-0.0304812;REVB=-0.0378303;RO=26;SAF=9;SAR=14;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450092;STB=0.506489;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0202337;OID=.;OPOS=11227602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:26:28:23:32:0.533333:14:9:9:17:19:13:11:17 chr19 11227603 . G T 49.53 PASS AF=0.15;AO=9;DP=57;FAO=9;FDP=60;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0396454;FXX=0.0322529;HRUN=5;LEN=1;MLLD=121.484;QD=3.30228;RBI=0.0644234;REFB=-0.00923606;REVB=-0.0507801;RO=46;SAF=4;SAR=5;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392369;STB=0.545355;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0440879;OID=.;OPOS=11227603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:57:60:46:51:9:9:0.15:5:4:19:27:5:4:20:31 chr19 11230881 . T C 209.33 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0362461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5007;QD=13.7268;RBI=0.0448147;REFB=0.0291824;REVB=-0.0263547;RO=36;SAF=10;SAR=15;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762365;STB=0.543589;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0452285;OID=.;OPOS=11230881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:15:10:17:19:15:10:17:19 chr19 11233941 . A G 180.81 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105585;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.391;QD=48.2161;RBI=0.038713;REFB=0;REVB=-0.0372453;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172182;OID=.;OPOS=11233941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0 chr19 11242044 . G A 320.82 PASS AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0346594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.745;QD=21.3877;RBI=0.0402601;REFB=-0.0104261;REVB=0.0204842;RO=27;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189342;STB=0.604874;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00482762;OID=.;OPOS=11242044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:21:12:16:11:21:12:16:11 chr19 11242765 . A G 108.11 PASS AF=0.52;AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.034568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1286;QD=17.2975;RBI=0.0345947;REFB=-0.0367311;REVB=-0.00136038;RO=12;SAF=1;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.53363;STB=0.720916;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0194027;OID=.;OPOS=11242765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:12:13:0.52:11:1:6:6:11:2:6:6 chr19 11244187 . TTATATATATATATATAC TTATATATATATATAC,TTATATATATATATACAC,TTATATATATATATATAT 216.37 PASS AF=0.611111,0.222222,0.166667;AO=11,4,3;DP=19;FAO=11,4,3;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,0;FSAR=10,4,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671861,0.103521,0.0388024;FXX=0.0526039;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=118.38,69.4171,71.7802;QD=48.0818;RBI=0.106031,0.118335,0.0486849;REFB=0,0,0;REVB=0.0820283,0.0573298,-0.0294039;RO=0;SAF=1,0,0;SAR=10,4,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0370226,0.0512239,0.079138;OID=.,.,.;OPOS=11244188,11244202,11244204;OREF=TA,T,C;OALT=-,C,T;OMAPALT=TTATATATATATATAC,TTATATATATATATACAC,TTATATATATATATATAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.611111,0.222222,0.166667:11,4,3:19:11,4,3:18:0:1,0,0:10,4,3:0:0:25:0:1,0,0:10,4,3:0:0 chr19 11303943 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7414;QD=50.4134;RBI=0.084237;REFB=0;REVB=-0.0842273;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00304023;OID=.;OPOS=11303943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0 chr19 11319491 . G A 88.9 PASS AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.000103472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6595;QD=27.3539;RBI=0.0124189;REFB=-0.0277265;REVB=0.0124184;RO=3;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394666;STB=0.729154;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0325047;OID=.;OPOS=11319491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:9:1:2:1:9:1:2:1 chr19 11319636 . G A 176.27 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0212802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.194;QD=20.7375;RBI=0.080222;REFB=-0.0175674;REVB=0.077348;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342335;STB=0.691625;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0176053;OID=.;OPOS=11319636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:3:13:7:11:3:13 chr19 11326119 . A G 139.53 PASS AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0128989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.302;QD=12.4027;RBI=0.0135326;REFB=-0.013721;REVB=-0.00409258;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499272;STB=0.529375;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0182612;OID=.;OPOS=11326119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:9:7:14:15:9:7:14:15 chr19 11326125 . C T 116.15 PASS AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00137088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.775;QD=11.332;RBI=0.022032;REFB=-0.0171759;REVB=0.0219893;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142158;STB=0.584714;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0437779;OID=.;OPOS=11326125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:9:5:13:14:9:5:13:14 chr19 11327608 . T C 176.74 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0200059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.926;QD=18.1269;RBI=0.0276312;REFB=-0.0176527;REVB=-0.0190591;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229316;STB=0.640069;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0258063;OID=.;OPOS=11327608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:19:20:19:19:0.487179:11:8:13:6:11:8:14:6 chr19 11327626 . A G 241.67 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00862032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.588;QD=21.9698;RBI=0.0294125;REFB=-0.000293717;REVB=-0.0281209;RO=20;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217751;STB=0.630958;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.000199615;OID=.;OPOS=11327626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:13:10:14:6:13:10:15:6 chr19 11358799 . G A 98.61 PASS AF=0.529412;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0299291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.163;QD=23.2023;RBI=0.0444013;REFB=-0.0685499;REVB=0.0327983;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788369;STB=0.529348;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0244736;OID=.;OPOS=11358799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:17:17:4:4:8:9:0.529412:3:5:3:1:3:6:3:1 chr19 11363146 . A T 400.09 PASS AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0107046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5879;QD=53.3452;RBI=0.0117602;REFB=-0.0426813;REVB=0.00486969;RO=1;SAF=6;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713682;STB=0.53331;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00729527;OID=.;OPOS=11363146;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:30:1:1:28:29:0.966667:22:6:1:0:22:7:1:0 chr19 11459665 . G GA 78.39 PASS AF=0.588235;AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00266518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.5785;QD=18.4444;RBI=0.0169284;REFB=-0.0820131;REVB=0.0167173;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394541;STB=0.674342;STBP=0.113;TYPE=ins;VARB=0.0589193;OID=.;OPOS=11459666;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.588235:9:17:10:17:7:3:7:5:2:39:7:2:7:5:2 chr19 11473296 . C T 205.16 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.000439615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.848;QD=15.7819;RBI=0.00412766;REFB=-0.0146734;REVB=0.00410419;RO=29;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213625;STB=0.620985;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.033162;OID=.;OPOS=11473296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:13:10:19:10:13:10:19:10 chr19 11508177 . G A 220.96 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00258701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.302;QD=18.0378;RBI=0.0403978;REFB=-0.0113894;REVB=0.0403149;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179427;STB=0.510195;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0178674;OID=.;OPOS=11508177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:11:11:13:14:11:11:13:14 chr19 11516007 . T G 144.06 PASS AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0101131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.588;QD=18.0076;RBI=0.0124573;REFB=-0.00414485;REVB=-0.00727382;RO=11;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980137;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288784;OID=.;OPOS=11516007;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:11:16:15:16:0.5:5:10:6:5:6:10:10:6 chr19 11526759 . G A 883.32 PASS AF=0.902778;AO=65;DP=72;FAO=65;FDP=72;FR=.;FRO=7;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.00713621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.194;QD=49.0735;RBI=0.0680157;REFB=-0.198079;REVB=0.0676403;RO=4;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673089;STB=0.559304;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00345799;OID=.;OPOS=11526759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:72:72:4:7:65:65:0.902778:26:39:0:4:26:39:0:7 chr19 11529958 . C T 389.62 PASS AF=0.527027;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.0320506;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5198;QD=21.0605;RBI=0.0321876;REFB=-0.0190882;REVB=0.00296613;RO=33;SAF=16;SAR=23;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121222;STB=0.576857;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0121589;OID=.;OPOS=11529958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:33:35:39:39:0.527027:23:16:9:24:23:16:9:26 chr19 11534547 . T A 69.63 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.036639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.579;QD=16.3839;RBI=0.0390136;REFB=-0.0156718;REVB=-0.0134032;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782009;STB=0.545357;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0184581;OID=.;OPOS=11534547;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:6:2:3:6:6:2 chr19 11708464 . G C 266.0 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0467335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3814;QD=21.2799;RBI=0.0570075;REFB=0.0356783;REVB=0.0326471;RO=25;SAF=8;SAR=17;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320625;STB=0.679856;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.0345624;OID=.;OPOS=11708464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:17:8:17:8:17:8:17:8 chr19 11833654 . TA AT,T 39.39 PASS AF=0.04,0.16;AO=4,8;DP=51;FAO=2,8;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=2,1;FSAR=0,7;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0280423,0.011438;FXX=0.019604;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=75.6578,17.1394;QD=3.1511;RBI=0.0498861,0.0116392;REFB=0.000995429,-0.0159125;REVB=-0.0412583,-0.00215478;RO=37;SAF=2,1;SAR=2,7;SRF=13;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.166025,-0.364571;STB=0.996448,0.741697;STBP=0.06,0.218;TYPE=mnp,del;VARB=0.0652838,0.0390544;OID=.,.;OPOS=11833654,11833655;OREF=TA,A;OALT=AT,-;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:26:51:50:37:40:4,8:2,8:0.04,0.16:2,7:2,1:13:24:0,7:2,1:13:27 chr19 11891003 . G A 617.12 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150418;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.924;QD=61.7121;RBI=0.0165308;REFB=0;REVB=0.0068564;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.87623e-05;OID=.;OPOS=11891003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0 chr19 11892935 . G C 321.16 PASS AF=0.710526;AO=27;DP=38;FAO=27;FDP=38;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0209966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3102;QD=33.8066;RBI=0.0215266;REFB=-0.0317843;REVB=-0.00474769;RO=11;SAF=20;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550816;STB=0.530005;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0108181;OID=.;OPOS=11892935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:11:11:27:27:0.710526:7:20:9:2:7:20:9:2 chr19 11941221 . T A 581.56 PASS AF=0.424658;AO=62;DP=146;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=-0.00306967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.359;QD=15.9332;RBI=0.00384587;REFB=-0.00869901;REVB=0.00231687;RO=84;SAF=34;SAR=28;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620843;STB=0.534769;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0125796;OID=.;OPOS=11941221;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:84:84:62:62:0.424658:28:34:41:43:28:34:41:43 chr19 11942362 . A G 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0216477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.569;QD=16.1065;RBI=0.0238972;REFB=-0.0102824;REVB=-0.0101218;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00270738;STB=0.501556;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0154006;OID=.;OPOS=11942362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:10:7:9:13:10:7:9:13 chr19 11942615 . A C 199.71 PASS AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00916444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.946;QD=36.3117;RBI=0.021861;REFB=0.00393507;REVB=0.0198473;RO=4;SAF=9;SAR=9;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166085;STB=0.590811;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00392592;OID=.;OPOS=11942615;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:22:22:4:4:18:18:0.818182:9:9:4:0:9:9:4:0 chr19 11942771 . G A 77.92 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00724774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9929;QD=14.1676;RBI=0.0146885;REFB=0.00709656;REVB=0.0127759;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.454407;STB=0.768666;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00827701;OID=.;OPOS=11942771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:2:8:4:8:2:8:4:8 chr19 11943697 . G A 218.98 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.16;QD=48.662;RBI=0.034035;REFB=0;REVB=0.0266495;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000963438;OID=.;OPOS=11943697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:13:4:0:0:13:5:0:0 chr19 12016269 . A G 292.44 PASS AF=0.590909;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0245859;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7696;QD=26.5853;RBI=0.030757;REFB=0.011344;REVB=0.0184804;RO=18;SAF=11;SAR=15;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156866;STB=0.586334;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.00624468;OID=.;OPOS=12016269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:18:18:26:26:0.590909:15:11:4:14:15:11:4:14 chr19 12222381 . C G 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00375467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.873;QD=62.9829;RBI=0.0190151;REFB=0;REVB=0.0186408;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92713e-05;OID=.;OPOS=12222381;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0 chr19 12222785 . G A 220.78 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0458955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7494;QD=12.0974;RBI=0.0478921;REFB=-0.00329966;REVB=-0.0136842;RO=46;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349423;STB=0.520109;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00511346;OID=.;OPOS=12222785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:15:12:19:27:15:12:19:27 chr19 12222861 . T C 170.33 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00326522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.494;QD=17.0333;RBI=0.0171377;REFB=0.00184198;REVB=0.0168238;RO=22;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167939;STB=0.596381;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.00140337;OID=.;OPOS=12222861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:6:12:11:11:6:12:11:11 chr19 12253327 . C T 556.16 PASS AF=0.450382;AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0397505;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0847;QD=16.9821;RBI=0.10107;REFB=-0.0419685;REVB=-0.0929251;RO=68;SAF=35;SAR=24;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188229;STB=0.604191;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0489609;OID=.;OPOS=12253327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:131:68:72:59:59:0.450382:24:35:27:41:24:35:29:43 chr19 12256358 . T G 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00220763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.93;QD=17.1;RBI=0.0151274;REFB=-0.0305719;REVB=-0.0149654;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263751;STB=0.51513;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0286544;OID=.;OPOS=12256358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:8:6:6:9:8:6:6:9 chr19 12256912 . C T 103.98 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.12534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.417;QD=10.1441;RBI=0.125584;REFB=-0.0113695;REVB=-0.00782023;RO=28;SAF=3;SAR=10;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366798;STB=0.72253;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00548048;OID=.;OPOS=12256912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:10:3:15:13:10:3:15:13 chr19 12383540 . G C 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0109585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.875;QD=19.5231;RBI=0.0187707;REFB=0.00377856;REVB=-0.0152398;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211639;STB=0.512031;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.00360422;OID=.;OPOS=12383540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:9:5:4:8:9:5:4:8 chr19 12384580 . T C 267.53 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0286256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0753;QD=21.839;RBI=0.0286963;REFB=-0.0129582;REVB=0.00201279;RO=24;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527657;STB=0.529593;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0202984;OID=.;OPOS=12384580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:9:16:14:10:9:16:14:10 chr19 12405552 . T C 800.86 PASS AF=0.422535;AO=84;DP=206;FAO=90;FDP=213;FR=.;FRO=123;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=-0.0740074;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8015;QD=15.0395;RBI=0.0740127;REFB=-0.0252193;REVB=-0.00089138;RO=120;SAF=44;SAR=40;SRF=64;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100315;STB=0.518144;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.036721;OID=.;OPOS=12405552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:213:120:123:84:90:0.422535:40:44:64:56:46:44:64:59 chr19 12502457 . A G 209.33 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0287645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.663;QD=13.7268;RBI=0.0297311;REFB=-0.00853258;REVB=-0.00751948;RO=34;SAF=10;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102778;STB=0.543589;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0121;OID=.;OPOS=12502457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:36:25:25:0.409836:15:10:17:17:15:10:17:19 chr19 12541214 . G T 101.52 PASS AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0173508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1716;QD=8.64032;RBI=0.078574;REFB=0.0108373;REVB=-0.0766343;RO=34;SAF=6;SAR=7;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107347;STB=0.506569;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.0293048;OID=.;OPOS=12541214;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:34:34:13:13:0.276596:7:6:16:18:7:6:16:18 chr19 12541532 . C A 246.72 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00228001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.056;QD=15.9172;RBI=0.00862418;REFB=-0.0116915;REVB=-0.00831733;RO=34;SAF=8;SAR=20;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439328;STB=0.524844;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0142287;OID=.;OPOS=12541532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:20:8:11:23:20:8:11:23 chr19 12541542 . C T 191.04 PASS AF=0.403509;AO=24;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0102572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.825;QD=13.4063;RBI=0.0112735;REFB=-0.0141608;REVB=-0.00467769;RO=33;SAF=7;SAR=17;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498078;STB=0.513357;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0180224;OID=.;OPOS=12541542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:34:24:23:0.403509:17:7:11:22:16:7:11:23 chr19 12541544 . A C 202.07 PASS AF=0.413793;AO=22;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00473153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.988;QD=13.9361;RBI=0.00482504;REFB=-0.00745851;REVB=-0.000945334;RO=35;SAF=7;SAR=15;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298307;STB=0.54191;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00872527;OID=.;OPOS=12541544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:35:34:22:24:0.413793:15:7:12:23:17:7:12:22 chr19 12541795 . C A 218.33 PASS AF=0.433333;AO=25;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0183906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.022;QD=14.5555;RBI=0.0251018;REFB=-0.0135784;REVB=0.0170846;RO=34;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042925;STB=0.533307;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00832178;OID=.;OPOS=12541795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:25:26:0.433333:10:15:19:15:10:16:19:15 chr19 12542355 . A G 72.35 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00952588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.334;QD=8.5118;RBI=0.0137971;REFB=-0.00348935;REVB=0.0099809;RO=24;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193506;STB=0.620003;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00851774;OID=.;OPOS=12542355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:3:7:13:11:3:7:13:11 chr19 12542653 . TT GA 271.89 PASS AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0118787;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=318.724;QD=19.4209;RBI=0.0118856;REFB=-0.0129388;REVB=-0.000405606;RO=27;SAF=10;SAR=19;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218663;STB=0.622081;STBP=0.079;TYPE=mnp;VARB=0.0135199;OID=.;OPOS=12542653;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:19:10:16:11:19:10:16:11 chr19 12551715 . A C 182.53 PASS AF=0.403509;AO=21;DP=55;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0180706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.198;QD=12.8092;RBI=0.0194312;REFB=-0.0186101;REVB=-0.0071431;RO=33;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805773;STB=0.503873;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0279103;OID=.;OPOS=12551715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:33:34:21:23:0.403509:13:8:15:18:13:10:15:19 chr19 12707978 . G A 296.94 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0207288;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.198;QD=17.9963;RBI=0.0280279;REFB=-0.000795959;REVB=0.0188648;RO=34;SAF=19;SAR=13;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141225;STB=0.578998;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.000873949;OID=.;OPOS=12707978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:34:34:32:32:0.484848:13:19:15:19:13:19:15:19 chr19 12800805 . G A 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.000267442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.034;QD=14.654;RBI=0.0311752;REFB=-0.022686;REVB=0.031174;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502688;STB=0.793435;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0129559;OID=.;OPOS=12800805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:6:2:7:1:6:2:7:1 chr19 12876964 . G C 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00983415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.811;QD=10.1733;RBI=0.00983425;REFB=0.00311159;REVB=-4.36598e-05;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.59968;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00848312;OID=.;OPOS=12876964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:3:3:6:3:3:3:6:3 chr19 12958697 . T C 144.58 PASS AF=0.615385;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0145133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.5587;QD=22.2427;RBI=0.102981;REFB=0.0183573;REVB=-0.101954;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00912176;STB=0.538414;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.0242555;OID=.;OPOS=12958697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:26:26:11:10:15:16:0.615385:7:8:6:5:8:8:6:4 chr19 12963143 . T C 173.13 PASS AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0339221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6125;QD=18.7164;RBI=0.0516959;REFB=-0.0531815;REVB=0.0390097;RO=18;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321907;STB=0.697203;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0497248;OID=.;OPOS=12963143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:18:19:17:18:0.486486:10:7:14:4:11:7:15:4 chr19 12985576 . A G 104.69 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0210155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.463;QD=10.7373;RBI=0.0210634;REFB=-0.0165582;REVB=0.0014189;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172223;STB=0.603015;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0310756;OID=.;OPOS=12985576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:14:12:8:5:14:12 chr19 12989560 . G A 236.58 PASS AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.030167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.661;QD=15.7722;RBI=0.0311583;REFB=-0.00232985;REVB=0.00779705;RO=33;SAF=19;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360308;STB=0.703553;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00590436;OID=.;OPOS=12989560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:8:19:11:22:8:19:11:22 chr19 13008171 . A G 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00699433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.839;QD=15.2931;RBI=0.00897241;REFB=-0.0113142;REVB=-0.00561993;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400241;STB=0.736288;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00933255;OID=.;OPOS=13008171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:2:7:3:6:2:7:3:6 chr19 13010520 . A G 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0180282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.231;QD=21.9446;RBI=0.0225994;REFB=-0.0145417;REVB=-0.0136278;RO=12;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341381;STB=0.519207;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0128029;OID=.;OPOS=13010520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:10:6:4:8:10:6:4:8 chr19 13215846 . G A 412.99 PASS AF=0.588235;AO=39;DP=67;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0406281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.694;QD=24.2933;RBI=0.0424397;REFB=-0.0177113;REVB=0.0122673;RO=28;SAF=15;SAR=24;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222112;STB=0.518509;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0054136;OID=.;OPOS=13215846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:28:28:39:40:0.588235:24:15:10:18:24:16:10:18 chr19 13317457 . T C 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0301793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.627;QD=18.0506;RBI=0.0302673;REFB=0.0181903;REVB=0.00230583;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264286;STB=0.651879;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0104553;OID=.;OPOS=13317457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:6:2:6:4:6:2 chr19 13319693 . AT GG,GT 73.6 PASS AF=0.25,0.75;AO=2,5;DP=7;FAO=2,6;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2,6;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373845,0.0747432;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=82.9985,76.6978;QD=36.7986;RBI=0.0373845,0.0747432;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.016175,-0.00994785;OID=.,.;OPOS=13319693,13319693;OREF=AT,A;OALT=GG,G;OMAPALT=GG,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:7:8:0:0:2,5:2,6:0.25,0.75:0,0:2,5:0:0:0,0:2,6:0:0 chr19 13319766 . C T 154.32 PASS AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0190624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.621;QD=10.643;RBI=0.0229135;REFB=-0.00292504;REVB=-0.0127142;RO=37;SAF=12;SAR=8;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122992;STB=0.558767;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00515517;OID=.;OPOS=13319766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:37:38:20:20:0.344828:8:12:26:11:8:12:26:12 chr19 13387904 . A G 220.89 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00610781;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.653;QD=23.2517;RBI=0.065049;REFB=0.0271432;REVB=0.0647616;RO=17;SAF=13;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167545;STB=0.593818;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.0111934;OID=.;OPOS=13387904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:8:13:7:10:8:13:7:10 chr19 13414594 . C T 192.51 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0101125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.715;QD=16.3841;RBI=0.0135577;REFB=-0.0146711;REVB=-0.00903047;RO=27;SAF=15;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186042;STB=0.60748;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0216383;OID=.;OPOS=13414594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:5:15:16:11:5:15:16:11 chr19 13445208 . C T 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00633329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9359;QD=61.3359;RBI=0.0167942;REFB=0;REVB=0.0155543;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190924;OID=.;OPOS=13445208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0 chr19 13885484 . A G 85.0 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00592921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6777;QD=22.666;RBI=0.00703601;REFB=0.04728;REVB=0.00378814;RO=5;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671499;STB=0.538382;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.0282016;OID=.;OPOS=13885484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:7:3:2:3:7:3:2:3 chr19 13988416 . A G 171.26 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.0396899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.162;QD=12.4552;RBI=0.0695306;REFB=-0.0263935;REVB=-0.0570896;RO=34;SAF=11;SAR=10;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198777;STB=0.613933;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0511921;OID=.;OPOS=13988416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:10:11:24:10:10:11:24:10 chr19 14000170 . T C 300.85 PASS AF=0.525424;AO=25;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.017631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4698;QD=20.3964;RBI=0.0355826;REFB=-0.0213318;REVB=0.0309074;RO=27;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10189;STB=0.567584;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0397206;OID=.;OPOS=14000170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:27:27:25:31:0.525424:12:13:17:10:16:15:17:10 chr19 14000400 . A G 263.53 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0226828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.724;QD=17.5684;RBI=0.0308082;REFB=-0.00882872;REVB=-0.020848;RO=31;SAF=23;SAR=6;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333993;STB=0.689229;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0135291;OID=.;OPOS=14000400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:6:23:15:16:6:23:15:16 chr19 14000870 . C T 273.91 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0249558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.642;QD=17.6717;RBI=0.0257393;REFB=-0.0190441;REVB=0.00630254;RO=32;SAF=22;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266234;STB=0.650012;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0240056;OID=.;OPOS=14000870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:8:22:15:17:8:22:15:17 chr19 14015711 . C A 84.34 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.118599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.155;QD=10.542;RBI=0.119702;REFB=0.0192598;REVB=-0.0162114;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028677;STB=0.51721;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.0328886;OID=.;OPOS=14015711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:6:5:9:12:6:5:9:12 chr19 14017281 . ACCCCCG ACCCC,ACCCCG 38.48 PASS AF=0,0.411765;AO=3,5;DP=19;FAO=0,7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=0,1;FSAR=0,6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0645883,0.0198032;FXX=0.0555247;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=23.858,12.9609;QD=9.05369;RBI=0.173201,0.0346861;REFB=-0.0284147,-0.076345;REVB=-0.160708,0.0284774;RO=9;SAF=0,2;SAR=3,3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.670564,-0.157037;STB=0.5,0.765078;STBP=1,0.124;TYPE=del,del;VARB=0,0.117114;OID=.,.;OPOS=14017286,14017282;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=ACCCC,ACCCCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.411765:3,5:19:0,7:17:10:0,1:0,6:5:5:38:9:0,2:3,3:5:4 chr19 14030689 . T C 104.34 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0247787;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.495;QD=9.48553;RBI=0.0520744;REFB=0.00380004;REVB=-0.0458013;RO=31;SAF=8;SAR=5;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780667;STB=0.547099;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=-0.0186235;OID=.;OPOS=14030689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:5:8:21:10:5:8:21:10 chr19 14034576 . TC T 38.63 PASS AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.021855;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.8889;QD=3.96244;RBI=0.0999648;REFB=-0.00857753;REVB=0.0975465;RO=29;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.626727;STB=0.894482;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.0514399;OID=.;OPOS=14034577;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25641:10:39:10:39:29:9:1:11:18:38:29:9:1:11:18 chr19 14038791 . C T 190.65 PASS AF=0.542857;AO=18;DP=34;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0444057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.162;QD=21.7881;RBI=0.0495889;REFB=-0.0319985;REVB=0.0220724;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146424;STB=0.590672;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0306289;OID=.;OPOS=14038791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:16:16:18:19:0.542857:7:11:7:9:7:12:7:9 chr19 14083761 . T C 65.29 PASS AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00413529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7937;QD=10.8809;RBI=0.00937949;REFB=-0.0365755;REVB=0.00841868;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.06323;OID=.;OPOS=14083761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:10:5:3:6:10:5 chr19 14141666 . G T 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0336846;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.911;QD=25.3678;RBI=0.0350679;REFB=-0.0205725;REVB=-0.00975245;RO=14;SAF=9;SAR=12;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103053;STB=0.557322;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0121518;OID=.;OPOS=14141666;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:12:9:8:6:12:9:8:6 chr19 14185226 . T C 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0269439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.657;QD=11.9529;RBI=0.0318869;REFB=-0.00652915;REVB=-0.0170528;RO=11;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109376;STB=0.565062;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0104619;OID=.;OPOS=14185226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:5:3:3:8:5:3:3:8 chr19 14200109 . T A 227.22 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.016275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2146;QD=28.4028;RBI=0.0227033;REFB=-0.0404945;REVB=0.0158292;RO=11;SAF=11;SAR=10;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155402;STB=0.585719;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0183766;OID=.;OPOS=14200109;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:10:11:3:8:10:11:3:8 chr19 14231325 . C G 192.83 PASS AF=0.428571;AO=20;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00898157;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.4196;QD=13.7739;RBI=0.072137;REFB=-0.0960706;REVB=-0.0715757;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299605;STB=0.6766;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0831859;OID=.;OPOS=14231325;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:24:30:20:24:0.428571:7:13:8:16:7:17:12:18 chr19 14231330 . A G 177.31 PASS AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0167617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9146;QD=12.2284;RBI=0.0348213;REFB=-0.00499939;REVB=-0.0305216;RO=36;SAF=15;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260669;STB=0.650985;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00906269;OID=.;OPOS=14231330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:7:15:16:20:7:15:16:20 chr19 14512489 . G A 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0338114;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=103.555;QD=10.1738;RBI=0.0350123;REFB=-0.012997;REVB=0.00909099;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33738;STB=0.713469;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0341474;OID=.;OPOS=14512489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:1:5:5:4:1:5:5:4 chr19 14517594 . C T 155.27 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00208494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6629;QD=15.1485;RBI=0.0235926;REFB=-0.000498102;REVB=0.0235003;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312091;STB=0.679569;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00166589;OID=.;OPOS=14517594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:11:6:16:8:11:6:16:8 chr19 14561722 . A G 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00564914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.82;QD=23.2181;RBI=0.00564937;REFB=-0.0470847;REVB=-5.07264e-05;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00716414;OID=.;OPOS=14561722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0 chr19 14582468 . G A 155.83 PASS AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.299;QD=44.5239;RBI=0.055311;REFB=0;REVB=0.0377322;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157776;OID=.;OPOS=14582468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:8:5:0:0:8:6:0:0 chr19 14590236 . C T 543.92 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573449;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.438;QD=60.4351;RBI=0.0432266;REFB=0;REVB=0.0428446;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334269;OID=.;OPOS=14590236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0 chr19 14590262 . G A 253.62 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0163791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.622;QD=17.7979;RBI=0.0164301;REFB=-0.0344931;REVB=-0.00129273;RO=29;SAF=8;SAR=20;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110182;STB=0.506168;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.030758;OID=.;OPOS=14590262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:20:8:8:21:20:8:8:21 chr19 14682804 . G C 145.59 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00656536;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.816;QD=15.3255;RBI=0.00656561;REFB=-0.0123373;REVB=-5.67216e-05;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124079;STB=0.571343;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0160527;OID=.;OPOS=14682804;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:22:22:16:16:0.421053:9:7:7:15:9:7:7:15 chr19 14736316 . T C 226.14 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0175711;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.4903;QD=28.2677;RBI=0.0632436;REFB=0.0416755;REVB=0.0607537;RO=11;SAF=5;SAR=16;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334787;STB=0.686278;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0167685;OID=.;OPOS=14736316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:16:5:8:3:16:5:8:3 chr19 14752325 . C T 992.31 PASS AF=1;AO=64;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.495;QD=59.2425;RBI=0.013141;REFB=0;REVB=0.0120132;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69454e-05;OID=.;OPOS=14752325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:64:67:1:29:35:0:0:29:38:0:0 chr19 14769339 . C G 2759.24 PASS AF=0.988889;AO=176;DP=178;FAO=178;FDP=180;FR=.;FRO=2;FSAF=132;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0499084;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9041;QD=61.3165;RBI=0.059568;REFB=-0.0911777;REVB=0.0325193;RO=0;SAF=130;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503489;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.000537284;OID=.;OPOS=14769339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:178:180:0:2:176:178:0.988889:46:130:0:0:46:132:1:1 chr19 14817548 . T A 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1065;QD=57.2021;RBI=0.0366786;REFB=0;REVB=0.0341004;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000729893;OID=.;OPOS=14817548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0 chr19 14829749 . C T 1044.33 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.78;QD=59.6763;RBI=0.0265655;REFB=0;REVB=0.0217183;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192859;OID=.;OPOS=14829749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0 chr19 14847013 . G C 164.81 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.032133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.222;QD=21.2663;RBI=0.0486538;REFB=0.0168397;REVB=0.0365331;RO=14;SAF=13;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188781;STB=0.60734;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.011236;OID=.;OPOS=14847013;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:4:13:8:6:4:13:8:6 chr19 14862430 . C G 712.39 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170623;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.277;QD=63.3236;RBI=0.0279193;REFB=0;REVB=-0.022099;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000369762;OID=.;OPOS=14862430;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0 chr19 14876125 . T C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00160524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.647;QD=12.4824;RBI=0.0305766;REFB=-0.0187711;REVB=0.0305344;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292886;STB=0.502758;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216698;OID=.;OPOS=14876125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:7:5:7:11:7:5:8:11 chr19 14877043 . C T 603.56 PASS AF=0.516949;AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=0.0348864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.649;QD=20.4595;RBI=0.0353725;REFB=-0.00605974;REVB=-0.00584421;RO=56;SAF=27;SAR=34;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172876;STB=0.598757;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00471694;OID=.;OPOS=14877043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:56:57:61:61:0.516949:34:27:36:20:34:27:37:20 chr19 14910438 . C T 382.89 PASS AF=0.965517;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.109043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.314;QD=52.8124;RBI=0.115978;REFB=-0.0653778;REVB=0.0395035;RO=1;SAF=1;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303701;STB=0.666512;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.000576443;OID=.;OPOS=14910438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:29:1:1:27:28:0.965517:26:1:1:0:27:1:1:0 chr19 14910573 . C T 62.7 PASS AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0060517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.654;QD=8.08971;RBI=0.00606785;REFB=-0.00882747;REVB=-0.000442483;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145403;STB=0.590701;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0118448;OID=.;OPOS=14910573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:6:3:10:12:6:3:10:12 chr19 14938616 . T C 274.22 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0200178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.925;QD=24.9293;RBI=0.0232389;REFB=0.00350348;REVB=-0.0118039;RO=19;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868166;STB=0.548347;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.0016944;OID=.;OPOS=14938616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:17:8:8:11:17:8:8:11 chr19 14974930 . G A 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.216;QD=57.3854;RBI=0.0278898;REFB=0;REVB=0.0232916;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11e-05;OID=.;OPOS=14974930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0 chr19 14991643 . G A 172.12 PASS AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00201529;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.891;QD=18.1182;RBI=0.0115241;REFB=-0.00583451;REVB=0.0113465;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188164;STB=0.60682;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00579985;OID=.;OPOS=14991643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:7:13:8:10:7:13 chr19 14991963 . C A 168.98 PASS AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-4.99813e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.67;QD=18.7753;RBI=0.0102289;REFB=-0.0102583;REVB=0.0102287;RO=18;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321907;STB=0.662483;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0149383;OID=.;OPOS=14991963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:18:18:17:18:0.5:10:7:14:4:10:8:14:4 chr19 14992031 . A G 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00880612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.185;QD=9.13261;RBI=0.0605106;REFB=-0.0143101;REVB=0.0598664;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113609;STB=0.56948;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0263835;OID=.;OPOS=14992031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:4:6:11:11:4:6:11:11 chr19 14992042 . A G 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0130367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.852;QD=9.13237;RBI=0.0382078;REFB=-0.00374172;REVB=-0.0359149;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00867632;OID=.;OPOS=14992042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:11:11:5:5:11:11 chr19 14992045 . C T 73.2 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0251584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7489;QD=9.14966;RBI=0.0893562;REFB=-0.010568;REVB=0.0857414;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0296479;OID=.;OPOS=14992045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:11:11:5:5:11:11 chr19 15052983 . T TATC 749.88 PASS AF=0.876923;AO=57;DP=68;FAO=57;FDP=65;FR=.;FRO=8;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0174628;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=3;MLLD=253.782;QD=46.1467;RBI=0.0174864;REFB=-0.0777453;REVB=0.000908709;RO=10;SAF=24;SAR=33;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106681;STB=0.556261;STBP=0.016;TYPE=ins;VARB=0.009381;OID=.;OPOS=15052984;OREF=-;OALT=ATC;OMAPALT=TATC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.876923:57:68:57:65:8:24:33:7:1:39:10:24:33:8:2 chr19 15083693 . C A 106.41 PASS AF=0.571429;AO=7;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0209833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.146;QD=20.2676;RBI=0.0361832;REFB=-0.0174232;REVB=0.0294776;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757329;STB=0.650921;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0178249;OID=.;OPOS=15083693;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:7:12:0.571429:2:5:7:2:7:5:7:2 chr19 15131330 . G A 303.49 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00174844;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4467;QD=23.8028;RBI=0.00809544;REFB=-0.0210281;REVB=0.00790437;RO=21;SAF=13;SAR=17;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400491;STB=0.522074;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0185401;OID=.;OPOS=15131330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:17:13:8:13:17:13:8:13 chr19 15133762 . G C 780.76 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0074725;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5068;QD=55.7685;RBI=0.0139254;REFB=-0.0560621;REVB=-0.0117507;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00339153;OID=.;OPOS=15133762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:31:24:0:0:32:24:0:0 chr19 15133787 . C A 769.92 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136204;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.693;QD=64.1599;RBI=0.0226281;REFB=0;REVB=0.0180697;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90182e-05;OID=.;OPOS=15133787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0 chr19 15198263 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.06368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4593;QD=40.7628;RBI=0.0905845;REFB=0;REVB=0.0644237;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00769722;OID=.;OPOS=15198263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr19 15198363 . A C 134.2 PASS AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00396338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.839;QD=16.2661;RBI=0.00632833;REFB=-0.0185811;REVB=-0.00493349;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148075;STB=0.585251;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0197681;OID=.;OPOS=15198363;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:6:9:8:10:6:9:8:10 chr19 15198507 . T C 201.92 PASS AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0379362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4348;QD=21.2544;RBI=0.0492416;REFB=-0.0395797;REVB=-0.0313938;RO=18;SAF=4;SAR=16;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30766;STB=0.67513;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0483748;OID=.;OPOS=15198507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:16:4:9:9:16:4:9:9 chr19 15198631 . A C 317.25 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.000529929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.819;QD=25.8983;RBI=0.000603224;REFB=-0.0123676;REVB=-0.000288193;RO=21;SAF=10;SAR=18;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970076;STB=0.553807;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00671059;OID=.;OPOS=15198631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:18:10:10:11:18:10:10:11 chr19 15198720 . A T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00217972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.184;QD=12.724;RBI=0.00670123;REFB=0.00375324;REVB=-0.00633682;RO=36;SAF=11;SAR=12;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817891;STB=0.547018;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.00635902;OID=.;OPOS=15198720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:12:11:20:16:12:11:20:16 chr19 15198764 . T C 920.1 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.265;QD=58.419;RBI=0.0172465;REFB=0;REVB=-0.00345451;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1693e-05;OID=.;OPOS=15198764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr19 15224592 . G C 411.37 PASS AF=0.47191;AO=41;DP=88;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=5;FWDB=0.00406829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.261;QD=18.4884;RBI=0.0188465;REFB=-0.0113736;REVB=0.0184022;RO=47;SAF=31;SAR=10;SRF=42;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201567;STB=0.61812;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0136159;OID=.;OPOS=15224592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:47:47:41:42:0.47191:10:31:42:5:11:31:42:5 chr19 15225348 . T C 296.3 PASS AF=0.958333;AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.118571;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.0276;QD=49.3825;RBI=0.14795;REFB=0.0454512;REVB=-0.0884882;RO=2;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615783;STB=0.516115;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.0088335;OID=.;OPOS=15225348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:2:1:22:23:0.958333:14:8:0:2:15:8:0:1 chr19 15225358 . T A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.659;QD=50.4134;RBI=0.0334806;REFB=0;REVB=0.00644142;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131166;OID=.;OPOS=15225358;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0 chr19 15226970 . G A 455.09 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2076;QD=56.8861;RBI=0.0596975;REFB=0;REVB=-0.0109078;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00301842;OID=.;OPOS=15226970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:21:10:0:0:22:10:0:0 chr19 15227030 . G A 130.42 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7294;QD=43.4717;RBI=0.0893668;REFB=0;REVB=0.0848008;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00572276;OID=.;OPOS=15227030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0 chr19 15233581 . C A 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0174315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.458;QD=22.1886;RBI=0.021704;REFB=-0.022991;REVB=-0.0129308;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149696;STB=0.583862;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0166106;OID=.;OPOS=15233581;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:11:7:12:9:11:7 chr19 15271135 . T G 45.44 PASS AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5394;QD=30.2953;RBI=0.0587754;REFB=0;REVB=0.0587754;RO=0;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0288831;OID=.;OPOS=15271135;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:1:5:0:0:0:6:0:0:0 chr19 15271771 . G A 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0164671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.605;QD=11.0924;RBI=0.0233877;REFB=-0.0187779;REVB=0.0166077;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231237;STB=0.6423;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.029004;OID=.;OPOS=15271771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:4:2:3:2:4:2 chr19 15278057 . A G 441.15 PASS AF=0.650794;AO=41;DP=57;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0383672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7466;QD=28.0096;RBI=0.0433006;REFB=-0.07723;REVB=-0.0200725;RO=15;SAF=23;SAR=18;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471082;STB=0.526886;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0302728;OID=.;OPOS=15278057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:63:15:22:41:41:0.650794:18:23:7:8:18:23:14:8 chr19 15285052 . T C 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0213318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.227;QD=10.3792;RBI=0.0288754;REFB=-0.0191939;REVB=-0.0194613;RO=16;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509244;STB=0.817349;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0223543;OID=.;OPOS=15285052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:1:8:8:8:1:8:8:8 chr19 15292437 . T C 298.48 PASS AF=0.52459;AO=28;DP=57;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0521715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.233;QD=19.5722;RBI=0.0526027;REFB=-0.0328467;REVB=-0.00672144;RO=28;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127098;STB=0.601571;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0330965;OID=.;OPOS=15292437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:61:28:29:28:32:0.52459:13:15:11:17:13:19:11:18 chr19 15295134 . G A 848.0 PASS AF=0.983871;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0497985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4709;QD=54.7096;RBI=0.0789283;REFB=-0.0643753;REVB=0.0612355;RO=1;SAF=40;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116542;STB=0.512191;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00583522;OID=.;OPOS=15295134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:62:62:1:1:60:61:0.983871:20:40:1:0:20:41:0:1 chr19 15302844 . T C 68.08 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0170133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4439;QD=14.3333;RBI=0.0193647;REFB=-0.0195927;REVB=-0.00924872;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498364;STB=0.529346;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0208154;OID=.;OPOS=15302844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:5:5:5:4:5:5 chr19 15338370 . G A 90.34 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.021194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.679;QD=16.4262;RBI=0.0234857;REFB=-0.0236962;REVB=-0.0101189;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235046;STB=0.636115;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0192615;OID=.;OPOS=15338370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:7:4:7:4:7:4:7:4 chr19 15338401 . C A 93.29 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.049882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0611;QD=19.6406;RBI=0.0710535;REFB=-0.0133797;REVB=0.0506002;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335209;STB=0.519196;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0149549;OID=.;OPOS=15338401;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:5:6:4:4:5:6:4:4 chr19 15484618 . TC T 46.27 PASS AF=0.276596;AO=16;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.22591;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.4453;QD=3.93792;RBI=0.226049;REFB=-0.0606702;REVB=0.00790409;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24463;STB=0.653589;STBP=0.21;TYPE=del;VARB=0.106172;OID=.;OPOS=15484619;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.276596:16:47:13:47:34:3:10:14:20:46:29:4:12:13:16 chr19 15490485 . C T 324.66 PASS AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0198221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.2;QD=17.0872;RBI=0.0437248;REFB=-0.0298807;REVB=0.0389736;RO=41;SAF=18;SAR=17;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139917;STB=0.578188;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.038734;OID=.;OPOS=15490485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:17:18:27:14:17:18:27:14 chr19 15508362 . G C 1914.94 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.397;QD=61.7722;RBI=0.0207526;REFB=0;REVB=-0.0171102;RO=0;SAF=47;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.56212e-05;OID=.;OPOS=15508362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:77:47:0:0:77:47:0:0 chr19 15511787 . T C 33.16 PASS AF=0.0857143;AO=9;DP=106;FAO=9;FDP=105;FR=.;FRO=96;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=48;FWDB=0.00219283;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.064;QD=1.2632;RBI=0.0450554;REFB=-0.00586004;REVB=-0.045002;RO=97;SAF=1;SAR=8;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449226;STB=0.874126;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0724328;OID=.;OPOS=15511787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:106:105:97:96:9:9:0.0857143:8:1:48:49:8:1:48:48 chr19 15533821 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.342;QD=58.5874;RBI=0.0461644;REFB=0;REVB=0.0423686;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026793;OID=.;OPOS=15533821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chr19 15538230 . G A 173.0 PASS AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00416429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.736;QD=11.3439;RBI=0.017304;REFB=-0.0171935;REVB=0.0167955;RO=38;SAF=10;SAR=12;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276443;STB=0.664585;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0351514;OID=.;OPOS=15538230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:39:22:22:0.360656:12:10:27:11:12:10:28:11 chr19 15540461 . GC CG,GCG 173.66 PASS AF=0.0183486,0.33945;AO=8,34;DP=113;FAO=2,37;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=0,11;FSAR=2,26;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0364743,-0.0724422;FXX=0;HRUN=5,0;LEN=2,1;MLLD=55.5946,52.0323;QD=6.37285;RBI=0.0440485,0.0744662;REFB=-0.00865902,-0.0102037;REVB=-0.0246961,-0.0172436;RO=69;SAF=0,12;SAR=8,22;SRF=33;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.619063,-0.149662;STB=0.994499,0.613547;STBP=0.19,0.088;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0372405,0.171146;OID=.,.;OPOS=15540461,15540463;OREF=GC,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:113:109:69:70:8,34:2,37:0.0183486,0.33945:8,22:0,12:33:36:2,26:0,11:32:38 chr19 15549939 . C T 296.17 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0816609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3809;QD=49.3622;RBI=0.152575;REFB=-0.19032;REVB=0.128883;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402265;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0545102;OID=.;OPOS=15549939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:12:11:1:0:12:11:1:0 chr19 15559079 . G A 414.2 PASS AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0432355;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.071;QD=18.6158;RBI=0.0435559;REFB=-0.00397727;REVB=-0.00527328;RO=46;SAF=12;SAR=30;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688214;STB=0.534334;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00442669;OID=.;OPOS=15559079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:47:42:42:0.47191:30:12:16:30:30:12:16:31 chr19 15565549 . G A 123.13 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.02811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2613;QD=16.417;RBI=0.0294326;REFB=-0.0166973;REVB=-0.00872387;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193277;STB=0.611489;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.016674;OID=.;OPOS=15565549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:5:9:7:9:5:9:7:9 chr19 15586982 . C T 160.52 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00297375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.659;QD=18.3452;RBI=0.0129225;REFB=-0.000464459;REVB=-0.0125757;RO=18;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743401;STB=0.542205;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.000312133;OID=.;OPOS=15586982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:7:10:12:6:7:10:12:6 chr19 15726487 . G T 211.95 PASS AF=0.645161;AO=19;DP=30;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00940682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.433;QD=27.3481;RBI=0.0534251;REFB=-0.0419626;REVB=0.0525905;RO=11;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179487;STB=0.604544;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0202783;OID=.;OPOS=15726487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:30:31:11:11:19:20:0.645161:12:7:7:4:13:7:7:4 chr19 15729052 . GCCCC CGCCC,GCCCG 349.97 PASS AF=0,0.545455;AO=5,28;DP=67;FAO=0,36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=0,20;FSAR=0,16;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.112779,-0.0624754;FXX=0.0149231;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=51.1406,73.2953;QD=21.2101;RBI=0.11282,0.0630806;REFB=-0.0187944,-0.0402393;REVB=-0.00300636,0.00871747;RO=20;SAF=5,12;SAR=0,16;SRF=8;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.716012,0.0220541;STB=0.5,0.520537;STBP=1,0.726;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0503465,0.0339925;OID=.,.;OPOS=15729052,15729056;OREF=GC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CGCCC,GCCCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:67:66:20:30:5,28:0,36:0,0.545455:0,16:5,12:8:12:0,16:0,20:18:12 chr19 15730498 . G GC 1851.99 PASS AF=1;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0741384;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=47.5258;QD=60.721;RBI=0.079955;REFB=0;REVB=-0.0299384;RO=0;SAF=46;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04499e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000332892;OID=.;OPOS=15730499;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:121:122:122:122:0:47:75:0:0:10:0:46:75:0:0 chr19 15739597 . A C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.441;QD=58.5878;RBI=0.0294151;REFB=0;REVB=0.0255994;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82292e-05;OID=.;OPOS=15739597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr19 15757927 . T C 597.36 PASS AF=0.666667;AO=52;DP=79;FAO=52;FDP=78;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00536532;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.473;QD=30.6337;RBI=0.0142702;REFB=-0.0334005;REVB=0.0132231;RO=25;SAF=26;SAR=26;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359848;STB=0.525631;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.016772;OID=.;OPOS=15757927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:25:26:52:52:0.666667:26:26:11:14:26:26:11:15 chr19 15760895 . C T 258.66 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0606408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.178;QD=16.6879;RBI=0.0609631;REFB=-0.0162123;REVB=0.00626029;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190859;STB=0.59728;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0327308;OID=.;OPOS=15760895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:33:29:29:0.467742:14:15:10:22:14:15:11:22 chr19 15763721 . G A 288.52 PASS AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0161062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.616;QD=13.739;RBI=0.0297012;REFB=-0.0177731;REVB=-0.024955;RO=51;SAF=20;SAR=13;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225861;STB=0.628494;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0247736;OID=.;OPOS=15763721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:13:20:20:31:13:20:20:31 chr19 15769378 . CG CC,GC 129.2 PASS AF=0.378378,0;AO=10,2;DP=37;FAO=14,0;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=7,0;FSAR=7,0;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0061442,-0.0805743;FXX=0;HRUN=1,6;LEN=1,2;MLLD=157.186,102.262;QD=13.968;RBI=0.00861237,0.0805802;REFB=-0.00806104,-0.00392874;REVB=0.00603503,0.000969897;RO=19;SAF=4,2;SAR=6,0;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0813642,0.526746;STB=0.527738,0.5;STBP=0.805,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0179527,0;OID=.,.;OPOS=15769379,15769378;OREF=G,CG;OALT=C,GC;OMAPALT=CC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:37:37:19:22:10,2:14,0:0.378378,0:6,0:4,2:9:10:7,0:7,0:12:10 chr19 15769529 . GC TT 255.69 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0129472;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=300.451;QD=17.9428;RBI=0.0131851;REFB=-0.0199181;REVB=-0.00249286;RO=29;SAF=19;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217895;STB=0.622452;STBP=0.091;TYPE=mnp;VARB=0.0209581;OID=.;OPOS=15769529;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:9:19:13:16:9:19:13:16 chr19 15769625 . A G 239.32 PASS AF=0.490566;AO=27;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0365344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.219;QD=18.0621;RBI=0.0365507;REFB=-0.00854772;REVB=0.00109152;RO=26;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149125;STB=0.606332;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00980891;OID=.;OPOS=15769625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:27:26:0.490566:11:16:11:15:10:16:11:16 chr19 15784061 . C A 716.53 PASS AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019687;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4193;QD=57.3221;RBI=0.0197015;REFB=0;REVB=-0.000754649;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013576;OID=.;OPOS=15784061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0 chr19 15784386 . C T 868.26 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.63;QD=57.8841;RBI=0.034867;REFB=0;REVB=0.0180002;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.43583e-05;OID=.;OPOS=15784386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:35:25:0:0:35:25:0:0 chr19 15789098 . A G 869.76 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4928;QD=57.9839;RBI=0.101914;REFB=0;REVB=-0.00766817;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001109;OID=.;OPOS=15789098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:60:0:0:56:60:1:24:32:0:0:24:36:0:0 chr19 15789140 . A G 1008.48 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.433;QD=59.3226;RBI=0.0257221;REFB=0;REVB=0.00861198;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14074e-05;OID=.;OPOS=15789140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:29:39:0:0:29:39:0:0 chr19 15791180 . C T 1309.81 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137265;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.344;QD=61.6381;RBI=0.0429569;REFB=0;REVB=0.0407047;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145103;OID=.;OPOS=15791180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:83:85:1:42:41:0:0:43:42:0:0 chr19 15793235 . T C 351.74 PASS AF=0.364407;AO=43;DP=119;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=-0.0474798;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.162;QD=11.9232;RBI=0.0480477;REFB=-0.0100769;REVB=0.00736521;RO=74;SAF=16;SAR=27;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247731;STB=0.508255;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0160108;OID=.;OPOS=15793235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:74:75:43:43:0.364407:27:16:26:48:27:16:27:48 chr19 15807884 . A G 305.0 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0188835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3777;QD=27.1113;RBI=0.0567429;REFB=-0.00936481;REVB=-0.0535086;RO=18;SAF=11;SAR=16;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139246;STB=0.507687;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.00959331;OID=.;OPOS=15807884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:16:11:7:11:16:11:7:11 chr19 15838967 . G A 400.21 PASS AF=0.391667;AO=47;DP=120;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0228131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.017;QD=13.3403;RBI=0.0352793;REFB=-0.0267878;REVB=0.0269108;RO=72;SAF=23;SAR=24;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480989;STB=0.522718;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0371034;OID=.;OPOS=15838967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:72:73:47:47:0.391667:24:23:32:40:24:23:33:40 chr19 15839174 . C T 92.53 PASS AF=0.55;AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0552735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.638;QD=18.5054;RBI=0.0578401;REFB=-0.0096977;REVB=-0.0170388;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318185;STB=0.514825;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00643256;OID=.;OPOS=15839174;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:20:9:9:10:11:0.55:7:3:3:6:7:4:3:6 chr19 15839365 . C T 40.31 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0419005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5447;QD=14.6565;RBI=0.0455548;REFB=0.0313609;REVB=0.017877;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757641;STB=0.545304;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=-0.0187272;OID=.;OPOS=15839365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:3:2:3:3:3:2 chr19 15852223 . A C 187.38 PASS AF=0.415094;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0245006;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.08;QD=14.1415;RBI=0.0246141;REFB=0.0145273;REVB=0.00236109;RO=31;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268907;STB=0.653133;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0222079;OID=.;OPOS=15852223;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:53:31:31:22:22:0.415094:9:13:10:21:9:13:10:21 chr19 15852242 . C A 304.08 PASS AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0148596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.204;QD=19.9398;RBI=0.0399108;REFB=-0.012422;REVB=0.0370414;RO=27;SAF=12;SAR=20;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152043;STB=0.569576;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0194914;OID=.;OPOS=15852242;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:29:32:32:0.52459:20:12:15:12:20:12:15:14 chr19 15852872 . G A 700.42 PASS AF=0.47619;AO=70;DP=147;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.00707322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6745;QD=19.0592;RBI=0.0250029;REFB=-0.00578121;REVB=0.0239816;RO=75;SAF=35;SAR=35;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686406;STB=0.530604;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00489959;OID=.;OPOS=15852872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:75:77:70:70:0.47619:35:35:43:32:35:35:43:34 chr19 15881953 . A G 367.23 PASS AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00183015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.446;QD=19.0768;RBI=0.00187294;REFB=-0.0162707;REVB=0.000398062;RO=38;SAF=14;SAR=24;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168896;STB=0.600781;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0166507;OID=.;OPOS=15881953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:39:38:38:0.493506:24:14:21:17:24:14:22:17 chr19 15905002 . T C 435.65 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00215642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.711;QD=18.5384;RBI=0.00278075;REFB=-0.0177329;REVB=0.00175569;RO=48;SAF=15;SAR=29;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136787;STB=0.588791;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0255938;OID=.;OPOS=15905002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:48:50:44:44:0.468085:29:15:23:25:29:15:25:25 chr19 15905431 . T C 217.92 PASS AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0366516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.306;QD=13.6197;RBI=0.0370632;REFB=-0.0254772;REVB=-0.00550856;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951402;STB=0.554413;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0262744;OID=.;OPOS=15905431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:10:16:20:18:10:16:20:18 chr19 15905529 . C A 65.77 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0251272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.199;QD=11.4382;RBI=0.0343235;REFB=-0.0103457;REVB=-0.0233822;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206442;STB=0.62712;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00916173;OID=.;OPOS=15905529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:1:8:11:3:1:8:11:3 chr19 15918455 . G A 240.48 PASS AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0168851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.365;QD=21.376;RBI=0.0193439;REFB=-0.0183549;REVB=0.00943808;RO=22;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605424;STB=0.533951;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0135492;OID=.;OPOS=15918455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:12:11:9:13:12:11:9:13 chr19 15989730 . T C 49.56 PASS AF=0.11828;AO=11;DP=93;FAO=11;FDP=93;FR=.;FRO=82;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=-0.0310813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.128;QD=2.13165;RBI=0.0312885;REFB=-0.00474236;REVB=-0.00359488;RO=80;SAF=6;SAR=5;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995611;STB=0.57986;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0700346;OID=.;OPOS=15989730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:93:93:80:82:11:11:0.11828:5:6:50:30:5:6:52:30 chr19 16034714 . A G 801.17 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0172;QD=57.2266;RBI=0.0343414;REFB=0;REVB=0.00444279;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020763;OID=.;OPOS=16034714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr19 16045141 . T C 608.61 PASS AF=1;AO=33;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0805913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.932;QD=60.8607;RBI=0.081365;REFB=0;REVB=0.0111941;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000891506;OID=.;OPOS=16045141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:33:40:1:21:12:0:0:22:18:0:0 chr19 16136528 . G GCAGCACCTGGC 279.7 PASS AF=0.233696;AO=41;DP=201;FAO=43;FDP=184;FR=.;FRO=141;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=72;FSRR=69;FWDB=-0.0234618;FXX=0.0264536;HRUN=1;LEN=11;MLLD=337.002;QD=6.08042;RBI=0.0235483;REFB=-0.014019;REVB=-0.00201679;RO=153;SAF=16;SAR=25;SRF=77;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14546;STB=0.570743;STBP=0.295;TYPE=ins;VARB=0.0401438;OID=.;OPOS=16136529;OREF=-;OALT=CAGCACCTGGC;OMAPALT=GCAGCACCTGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.233696:41:201:43:184:141:18:25:72:69:99:153:16:25:77:76 chr19 16136923 . T C 651.22 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.28;QD=62.0214;RBI=0.0087582;REFB=0;REVB=-0.0055272;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31689e-05;OID=.;OPOS=16136923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr19 16145533 . A G 196.71 PASS AF=0.308642;AO=25;DP=88;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0155356;FXX=0.0795364;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4391;QD=9.71426;RBI=0.0461492;REFB=-0.0132156;REVB=0.0434556;RO=51;SAF=11;SAR=14;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102523;STB=0.553864;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0395386;OID=.;OPOS=16145533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:81:51:56:25:25:0.308642:14:11:27:24:14:11:29:27 chr19 16145539 . G A 268.54 PASS AF=0.347826;AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00479434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.997;QD=11.6758;RBI=0.00735311;REFB=-0.000438999;REVB=0.00557518;RO=60;SAF=13;SAR=19;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125502;STB=0.572557;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00119032;OID=.;OPOS=16145539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:60:60:32:32:0.347826:19:13:31:29:19:13:31:29 chr19 16145653 . G A 227.13 PASS AF=0.35;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0143965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.027;QD=11.3565;RBI=0.0145985;REFB=-0.00221038;REVB=0.00241966;RO=52;SAF=13;SAR=15;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185567;STB=0.510745;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00365616;OID=.;OPOS=16145653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:52:28:28:0.35:15:13:25:27:15:13:25:27 chr19 16145731 . C A 224.88 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0309807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.0663;QD=19.9894;RBI=0.048925;REFB=0.00723264;REVB=-0.0378662;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806656;STB=0.534382;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00559229;OID=.;OPOS=16145731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:22:23:22:22:0.488889:10:12:10:12:10:12:11:12 chr19 16146400 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00242009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.05;QD=62.7621;RBI=0.0174426;REFB=0;REVB=-0.0172739;RO=0;SAF=41;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08119e-05;OID=.;OPOS=16146400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:48:41:0:0:48:41:0:0 chr19 16238279 . C T 293.35 PASS AF=1;AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105661;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2137;QD=53.3362;RBI=0.0321034;REFB=0;REVB=-0.0303147;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00119882;OID=.;OPOS=16238279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:14:8:0:0 chr19 16268207 . TAA TA,T 212.84 PASS AF=1,0;AO=20,3;DP=23;FAO=23,0;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109721,-0.0620021;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=13.5837,8.31413;QD=37.0153;RBI=0.131085,0.0732214;REFB=0,0;REVB=-0.0717255,-0.03895;RO=0;SAF=7,2;SAR=13,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0123109,0.0468645;OID=.,.;OPOS=16268208,16268208;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:20,3:23:23,0:23:0:9,0:14,0:0:0:4:0:7,2:13,1:0:0 chr19 16275655 . C T 236.49 PASS AF=0.611111;AO=16;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00344186;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=181.063;QD=26.2769;RBI=0.0328923;REFB=-0.051324;REVB=0.0327117;RO=7;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117373;STB=0.545413;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0174833;OID=.;OPOS=16275655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:7:14:16:22:0.611111:8:8:2:5:10:12:6:8 chr19 16284288 . G T 250.34 PASS AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0178243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7142;QD=20.0271;RBI=0.0266675;REFB=0.010949;REVB=0.0198356;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163737;STB=0.579935;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.0123951;OID=.;OPOS=16284288;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:12:12:8:17:12:12:9:17 chr19 16301312 . A G 137.87 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.016538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.218;QD=19.0165;RBI=0.0201706;REFB=-0.0040544;REVB=0.0115476;RO=14;SAF=12;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104493;STB=0.559915;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00435426;OID=.;OPOS=16301312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:3:12:10:4:3:12:10:4 chr19 16593573 . G A 156.26 PASS AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0118695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.993;QD=15.626;RBI=0.018584;REFB=-0.00562384;REVB=0.0142996;RO=23;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180203;STB=0.603381;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00550338;OID=.;OPOS=16593573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:8:9:8:15:8:9:8:15 chr19 16611978 . T C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0100858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.352;QD=12.4824;RBI=0.0165844;REFB=-0.00309107;REVB=-0.013165;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272843;STB=0.516102;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00431277;OID=.;OPOS=16611978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:6:6:10:9:6:6:10:9 chr19 16612011 . T C 134.16 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=32;FAO=15;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0191718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.059;QD=15.3326;RBI=0.0192743;REFB=-0.0118681;REVB=-0.00198497;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519058;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0190136;OID=.;OPOS=16612011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:35:16:20:12:15:0.428571:6:6:8:8:8:7:10:10 chr19 16628850 . G A 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0354727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.742;QD=8.69139;RBI=0.0355376;REFB=-0.0111396;REVB=0.00214656;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097172;STB=0.559852;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0251408;OID=.;OPOS=16628850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:10:7:4:4:10:7 chr19 16860105 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.129;QD=58.5878;RBI=0.0428758;REFB=0;REVB=0.0370686;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266298;OID=.;OPOS=16860105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr19 16899838 . A T 1507.59 PASS AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.772;QD=58.5471;RBI=0.0434538;REFB=-0.0558746;REVB=-0.0292701;RO=0;SAF=63;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=5.93754e-05;OID=.;OPOS=16899838;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:103:0:1:102:102:0.990291:39:63:0:0:39:63:1:0 chr19 16976286 . A G 990.53 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227775;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3803;QD=59.1362;RBI=0.0290688;REFB=0;REVB=-0.0180605;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000934288;OID=.;OPOS=16976286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:31:35:0:0:31:36:0:0 chr19 16976289 . T C 275.12 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.010157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.789;QD=15.4997;RBI=0.0132071;REFB=-0.0130708;REVB=-0.00844183;RO=40;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484293;STB=0.527355;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0166058;OID=.;OPOS=16976289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:14:17:20:20:14:17:20:20 chr19 17025292 . G A 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.743;QD=54.5176;RBI=0.00328773;REFB=0;REVB=0.00267503;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44168e-05;OID=.;OPOS=17025292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr19 17088299 . T C 83.09 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0270247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.642;QD=9.4956;RBI=0.0336747;REFB=-0.0282176;REVB=-0.0200911;RO=23;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270184;STB=0.649215;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0320365;OID=.;OPOS=17088299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:23:24:11:11:0.314286:4:7:9:14:4:7:10:14 chr19 17088319 . G T 35.12 PASS AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0201417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.047;QD=5.20279;RBI=0.0265221;REFB=-0.0127474;REVB=0.017255;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835743;STB=0.555373;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.131016;OID=.;OPOS=17088319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:9:12:3:3:9:12 chr19 17091368 . T G 263.72 PASS AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0025447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.376;QD=26.3717;RBI=0.00277157;REFB=-0.0423263;REVB=-0.00109821;RO=15;SAF=4;SAR=20;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113712;STB=0.555506;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0297846;OID=.;OPOS=17091368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:15:16:24:24:0.6:20:4:4:11:20:4:4:12 chr19 17170885 . C T 168.89 PASS AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00145676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.79;QD=24.1271;RBI=0.0119559;REFB=-0.020621;REVB=-0.0118669;RO=11;SAF=12;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253869;STB=0.642682;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0129534;OID=.;OPOS=17170885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:5:12:4:7:5:12:4:7 chr19 17213217 . C T 317.25 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00918579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.403;QD=25.8981;RBI=0.0139466;REFB=-0.0327445;REVB=0.0104943;RO=21;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287438;STB=0.515922;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0201184;OID=.;OPOS=17213217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:11:17:12:9:11:17:12:9 chr19 17273893 . G T 56.78 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0262752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.172;QD=11.9536;RBI=0.0375481;REFB=-0.0167994;REVB=0.0268231;RO=11;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424693;STB=0.762848;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0245106;OID=.;OPOS=17273893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:7:1:5:6:7:1:5:6 chr19 17303774 . T G 155.99 PASS AF=0.271605;AO=22;DP=81;FAO=22;FDP=81;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.00683125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.688;QD=7.70307;RBI=0.0247568;REFB=-0.00696122;REVB=-0.0237957;RO=59;SAF=12;SAR=10;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653093;STB=0.53929;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0181993;OID=.;OPOS=17303774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:59:59:22:22:0.271605:10:12:29:30:10:12:29:30 chr19 17305440 . T C 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0373188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.729;QD=19.0175;RBI=0.0394328;REFB=-0.0231116;REVB=0.0127381;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119455;STB=0.567483;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0247891;OID=.;OPOS=17305440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:11:3:5:10:11:3 chr19 17306031 . T C 47.52 PASS AF=0.4375;AO=5;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0323111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.154;QD=11.8795;RBI=0.0647682;REFB=-0.000988517;REVB=0.056133;RO=9;SAF=1;SAR=4;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.694754;STB=0.908159;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00305068;OID=.;OPOS=17306031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:16:9:9:5:7:0.4375:4:1:9:0:6:1:9:0 chr19 17312992 . C T 74.68 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0195436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.598;QD=10.6681;RBI=0.0207449;REFB=0.00149007;REVB=0.006957;RO=18;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535944;STB=0.83254;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0020446;OID=.;OPOS=17312992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:1:9:9:9:1:9:9:9 chr19 17316782 . T C 281.32 PASS AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00382299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.462;QD=28.1316;RBI=0.0279689;REFB=-0.0133394;REVB=-0.0277064;RO=15;SAF=22;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459386;STB=0.758371;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0069607;OID=.;OPOS=17316782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:3:22:6:9:3:22:6:9 chr19 17317955 . A G 388.87 PASS AF=0.43;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.0627454;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1662;QD=15.555;RBI=0.0642755;REFB=-0.02943;REVB=-0.0139414;RO=55;SAF=26;SAR=17;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115584;STB=0.565721;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0518225;OID=.;OPOS=17317955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:55:57:43:43:0.43:17:26:27:28:17:26:28:29 chr19 17330060 . T C 758.76 PASS AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0565633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8598;QD=53.2462;RBI=0.0586373;REFB=0.0193344;REVB=-0.015457;RO=2;SAF=27;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033641;STB=0.517851;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.00178025;OID=.;OPOS=17330060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:28:27:2:0:28:27:2:0 chr19 17338099 . G C 78.63 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0316963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.112;QD=14.9777;RBI=0.0336791;REFB=-0.00625015;REVB=-0.0113852;RO=11;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422378;STB=0.749464;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0281212;OID=.;OPOS=17338099;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:2:8:4:7:2:8:4:7 chr19 17339112 . G A 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.0189164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.559;QD=16.1724;RBI=0.0253747;REFB=-0.00527239;REVB=0.016913;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316371;STB=0.677241;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0050131;OID=.;OPOS=17339112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:18:2:6:10:18:2 chr19 17351535 . G A 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0231679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1191;QD=12.4832;RBI=0.0293736;REFB=-0.0182208;REVB=0.018057;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520805;STB=0.530676;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0281372;OID=.;OPOS=17351535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:12:7:5:7:12:7 chr19 17366278 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.025;QD=55.0984;RBI=0.021967;REFB=0;REVB=0.0148141;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129893;OID=.;OPOS=17366278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0 chr19 17366313 . C T 96.0 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0239583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.343;QD=22.5877;RBI=0.0464735;REFB=-0.0235793;REVB=-0.0398219;RO=6;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765456;STB=0.5434;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0312267;OID=.;OPOS=17366313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:5:6:4:2:5:6:4:2 chr19 17367435 . T C 92.2 PASS AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00489322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0716;QD=8.99506;RBI=0.0173909;REFB=-0.00679539;REVB=-0.0166883;RO=29;SAF=4;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254695;STB=0.655476;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0183521;OID=.;OPOS=17367435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:8:4:16:13:8:4:16:13 chr19 17370190 . T G 133.88 PASS AF=0.390244;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00620114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7283;QD=13.061;RBI=0.0443216;REFB=-0.0146935;REVB=0.0438857;RO=24;SAF=2;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474834;STB=0.734658;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0248742;OID=.;OPOS=17370190;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:25:15:16:0.390244:13:2:12:12:13:3:13:12 chr19 17392572 . G C 52.97 PASS AF=0.121212;AO=11;DP=98;FAO=12;FDP=99;FR=.;FRO=87;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=0.00170643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9241;QD=2.14023;RBI=0.00649415;REFB=0.00105665;REVB=-0.00626594;RO=87;SAF=10;SAR=1;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.583415;STB=0.9262;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0119618;OID=.;OPOS=17392572;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:98:99:87:87:11:12:0.121212:1:10:35:52:1:11:35:52 chr19 17451981 . G A 510.98 PASS AF=0.510417;AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00141484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.714;QD=21.2909;RBI=0.0287337;REFB=-0.0206001;REVB=0.0286988;RO=47;SAF=30;SAR=19;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924716;STB=0.55116;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0187417;OID=.;OPOS=17451981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:47:47:49:49:0.510417:19:30:24:23:19:30:24:23 chr19 17463214 . C T 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6764;QD=51.1827;RBI=0.0741142;REFB=0;REVB=0.0376944;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0023468;OID=.;OPOS=17463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0 chr19 17547292 . A G 834.33 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.297;QD=57.54;RBI=0.0163675;REFB=0;REVB=0.0048596;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98528e-05;OID=.;OPOS=17547292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0 chr19 17556054 . A G 84.34 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0155709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8028;QD=10.5424;RBI=0.0378553;REFB=-0.0172847;REVB=0.0345046;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301978;STB=0.664511;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0301595;OID=.;OPOS=17556054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:20:21:11:11:0.34375:4:7:7:13:4:7:8:13 chr19 17611490 . T G 251.92 PASS AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0265538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.65;QD=27.235;RBI=0.0266024;REFB=-0.0146591;REVB=-0.00160715;RO=13;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109533;STB=0.508228;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00798188;OID=.;OPOS=17611490;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:13:14:23:23:0.621622:11:12:7:6:11:12:7:7 chr19 17616171 . G A 391.48 PASS AF=0.549296;AO=33;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0404483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6357;QD=22.0553;RBI=0.0701454;REFB=-0.0307539;REVB=0.057309;RO=27;SAF=13;SAR=20;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731707;STB=0.545431;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0264109;OID=.;OPOS=17616171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:27:32:33:39:0.549296:20:13:13:14:21:18:18:14 chr19 17628587 . A G 155.51 PASS AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0183695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3034;QD=15.1719;RBI=0.0199983;REFB=0.0146033;REVB=-0.00790514;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688185;STB=0.53983;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.018606;OID=.;OPOS=17628587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:11:6:10:14:11:6:10:14 chr19 17648350 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.531;QD=43.4862;RBI=0.024636;REFB=0;REVB=0.0240849;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273155;OID=.;OPOS=17648350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr19 17691655 . G A 101.47 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0310542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.896;QD=16.9123;RBI=0.0524448;REFB=-0.0305667;REVB=0.0422622;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784743;STB=0.545377;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0409916;OID=.;OPOS=17691655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:5:7:8:4:5:7 chr19 17692324 . T G 85.62 PASS AF=0.366667;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0522193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.978;QD=11.4155;RBI=0.0523196;REFB=-0.00917801;REVB=0.0032391;RO=18;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.535944;STB=0.832592;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0126884;OID=.;OPOS=17692324;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:28:30:18:19:10:11:0.366667:9:1:9:9:10:1:9:10 chr19 17746947 . A G 1180.91 PASS AF=0.987179;AO=53;DP=80;FAO=77;FDP=78;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.181;QD=60.5593;RBI=0.0610707;REFB=0;REVB=0.0177951;RO=0;SAF=13;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241182;OID=.;OPOS=17746947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:80:78:0:0:53:77:0.987179:40:13:0:0:43:34:0:0 chr19 17777508 . C G 575.47 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0634;QD=60.5757;RBI=0.0797926;REFB=0;REVB=-0.0773677;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133096;OID=.;OPOS=17777508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0 chr19 17845333 . C A 218.96 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00709661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9595;QD=23.671;RBI=0.035273;REFB=-0.0404887;REVB=0.0345517;RO=15;SAF=7;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10729;STB=0.548972;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0325606;OID=.;OPOS=17845333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:15:16:21:21:0.567568:14:7:7:8:14:7:7:9 chr19 17885270 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.564;QD=54.5172;RBI=0.060524;REFB=0;REVB=0.0458015;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236966;OID=.;OPOS=17885270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0 chr19 17886940 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.064;QD=53.9112;RBI=0.0237488;REFB=0;REVB=-0.0035916;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27221e-05;OID=.;OPOS=17886940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0 chr19 17887024 . T C 463.42 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0279482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.63;QD=52.9618;RBI=0.0585948;REFB=-0.0572449;REVB=0.0515;RO=2;SAF=9;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030063;STB=0.516119;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00365089;OID=.;OPOS=17887024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:35:35:2:2:33:33:0.942857:24:9:1:1:24:9:1:1 chr19 17892591 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.186;QD=44.6897;RBI=0.0534934;REFB=0;REVB=0.0532991;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669147;OID=.;OPOS=17892591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr19 17932138 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0724274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8223;QD=45.8068;RBI=0.104249;REFB=0;REVB=0.0749812;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11636e-05;OID=.;OPOS=17932138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr19 18047283 . T G 366.45 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0134298;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7989;QD=21.2434;RBI=0.0175097;REFB=-0.0372106;REVB=-0.0112352;RO=32;SAF=20;SAR=17;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138099;STB=0.576283;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0294402;OID=.;OPOS=18047283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:69:32:32:37:37:0.536232:17:20:12:20:17:20:12:20 chr19 18179214 . G A 572.36 PASS AF=0.522222;AO=46;DP=92;FAO=47;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00759728;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.387;QD=25.4384;RBI=0.0162817;REFB=-0.0349912;REVB=-0.0144006;RO=25;SAF=17;SAR=29;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299646;STB=0.629013;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0218916;OID=.;OPOS=18179214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:25:31:46:47:0.522222:29:17:21:4:29:18:22:9 chr19 18191664 . C G 147.67 PASS AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0448886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.677;QD=26.8492;RBI=0.0453654;REFB=0.00792803;REVB=-0.00655998;RO=7;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267429;STB=0.650939;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.00316378;OID=.;OPOS=18191664;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:12:3:4:3:12:3:4:3 chr19 18234441 . C T 106.86 PASS AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00661993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.204;QD=12.2128;RBI=0.0071252;REFB=-0.0250387;REVB=-0.00263534;RO=22;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260252;STB=0.654301;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0180804;OID=.;OPOS=18234441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:4:9:10:12:4:9:10:12 chr19 18245512 . C T 112.03 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00917788;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.217;QD=24.8946;RBI=0.101788;REFB=-0.0223311;REVB=0.101373;RO=6;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116132;STB=0.565115;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0114512;OID=.;OPOS=18245512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:18:18:6:6:12:12:0.666667:4:8:5:1:4:8:5:1 chr19 18248146 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.323;QD=56.7064;RBI=0.0474732;REFB=0;REVB=0.00647347;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314735;OID=.;OPOS=18248146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr19 18255359 . G A 282.28 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00848528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.526;QD=22.5827;RBI=0.00850087;REFB=-0.0163346;REVB=-0.000514612;RO=24;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715993;STB=0.539969;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0208634;OID=.;OPOS=18255359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:13:13:14:10:13:13:14:10 chr19 18257750 . C T 560.48 PASS AF=0.541667;AO=51;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.013895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.704;QD=23.3533;RBI=0.0140971;REFB=-0.00563517;REVB=0.00237809;RO=43;SAF=23;SAR=28;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668211;STB=0.534833;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00371838;OID=.;OPOS=18257750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:43:44:51:52:0.541667:28:23:16:27:28:24:17:27 chr19 18273047 . T C 289.77 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.519;QD=52.6855;RBI=0.0531412;REFB=0;REVB=0.0214253;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196815;OID=.;OPOS=18273047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:14:6:0:0:14:8:0:0 chr19 18279638 . T C 805.02 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7657;QD=64.4017;RBI=0.0266806;REFB=0;REVB=-0.00252707;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187777;OID=.;OPOS=18279638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0 chr19 18284651 . G T 47.68 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00199785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.748;QD=11.9196;RBI=0.0166657;REFB=-0.0143473;REVB=0.0165455;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118071;STB=0.571224;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0217284;OID=.;OPOS=18284651;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:4:5:3:4:4:5 chr19 18288069 . A G 377.87 PASS AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00248623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.226;QD=24.3789;RBI=0.00830789;REFB=-0.0445247;REVB=0.00792715;RO=25;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141907;STB=0.577717;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0334232;OID=.;OPOS=18288069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:19:18:17:8:19:18:17:8 chr19 18288898 . T C 329.75 PASS AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.013727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.983;QD=20.9363;RBI=0.015208;REFB=-0.014811;REVB=-0.0065462;RO=29;SAF=16;SAR=18;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186318;STB=0.510313;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0117255;OID=.;OPOS=18288898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:18:16:13:16:18:16:13:16 chr19 18288947 . A C 245.66 PASS AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00289229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.392;QD=17.5475;RBI=0.0501152;REFB=-0.00943227;REVB=0.0500316;RO=28;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853658;STB=0.557598;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.01239;OID=.;OPOS=18288947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:29:27:27:0.482143:16:11:14:14:16:11:15:14 chr19 18305578 . G C 556.53 PASS AF=0.632911;AO=49;DP=79;FAO=50;FDP=79;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0643249;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9484;QD=28.1786;RBI=0.0727127;REFB=-0.0365911;REVB=0.0339036;RO=29;SAF=24;SAR=25;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042274;STB=0.538913;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.027694;OID=.;OPOS=18305578;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:29:29:49:50:0.632911:25:24:16:13:26:24:17:12 chr19 18306990 . G C 580.5 PASS AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.024946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8954;QD=27.9759;RBI=0.0283829;REFB=-0.000135654;REVB=0.0135384;RO=31;SAF=20;SAR=32;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137106;STB=0.57464;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00027116;OID=.;OPOS=18306990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:32:20:18:13:32:20:18:13 chr19 18311199 . A G 870.97 PASS AF=0.71875;AO=69;DP=95;FAO=69;FDP=96;FR=.;FRO=27;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00138767;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.449;QD=36.2905;RBI=0.0262299;REFB=0.0175504;REVB=0.0261931;RO=26;SAF=41;SAR=28;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112164;STB=0.500469;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=-0.0124497;OID=.;OPOS=18311199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:26:27:69:69:0.71875:28:41:16:10:28:41:16:11 chr19 18329240 . T C 221.67 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0521299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3088;QD=18.4722;RBI=0.0532491;REFB=-0.0110448;REVB=0.0108599;RO=26;SAF=15;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183911;STB=0.60474;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0116189;OID=.;OPOS=18329240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:7:15:13:13:7:15:13:13 chr19 18329784 . C T 298.73 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00326958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.776;QD=23.8986;RBI=0.0113836;REFB=0.00710955;REVB=0.010904;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928247;STB=0.551738;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.00505322;OID=.;OPOS=18329784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:17:10:11:12:17:10:11:12 chr19 18359037 . G A 211.89 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.00923869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.142;QD=16.6186;RBI=0.0164601;REFB=-0.016121;REVB=-0.0136229;RO=28;SAF=5;SAR=18;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908398;STB=0.551839;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0221386;OID=.;OPOS=18359037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:18:5:8:20:18:5:8:20 chr19 18368810 . G T 363.17 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.000301086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.105;QD=18.1585;RBI=0.0163167;REFB=-0.0144398;REVB=0.0163139;RO=41;SAF=19;SAR=19;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794795;STB=0.549974;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0259544;OID=.;OPOS=18368810;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:42:38:38:0.475:19:19:24:17:19:19:25:17 chr19 18368969 . G A 766.92 PASS AF=0.455056;AO=81;DP=178;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.0213954;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=162.24;QD=17.2342;RBI=0.0216962;REFB=-0.00272884;REVB=0.00359977;RO=95;SAF=26;SAR=55;SRF=55;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257924;STB=0.638492;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00685332;OID=.;OPOS=18368969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:95:97:81:81:0.455056:55:26:55:40:55:26:55:42 chr19 18368988 . G A 784.33 PASS AF=0.487952;AO=81;DP=166;FAO=81;FDP=166;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=0.035216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.242;QD=18.8995;RBI=0.0386715;REFB=-0.0291663;REVB=0.0159787;RO=82;SAF=27;SAR=54;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236034;STB=0.633711;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.017716;OID=.;OPOS=18368988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:82:85:81:81:0.487952:54:27:48:34:54:27:50:35 chr19 18369120 . G A 162.92 PASS AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00869938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4941;QD=13.0335;RBI=0.0243298;REFB=-0.00930359;REVB=-0.0227214;RO=32;SAF=16;SAR=2;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506272;STB=0.804329;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0190581;OID=.;OPOS=18369120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:2:16:17:15:2:16:17:15 chr19 18369211 . T G 95.67 PASS AF=0.363636;AO=11;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.015506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5602;QD=11.5969;RBI=0.0571631;REFB=0.00387376;REVB=0.0550198;RO=21;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362148;STB=0.555466;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.00381404;OID=.;OPOS=18369211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:21:21:11:12:0.363636:7:4:7:14:7:5:7:14 chr19 18369270 . C T 99.24 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0088719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.333;QD=14.7023;RBI=0.0160195;REFB=-0.0026299;REVB=-0.0133384;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153102;STB=0.5881;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00249442;OID=.;OPOS=18369270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:3:12:8:4:3:12 chr19 18369581 . G T 36.58 PASS AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0161143;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.9914;QD=7.31542;RBI=0.103156;REFB=0.00457823;REVB=0.101889;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606052;STB=0.538337;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.0128646;OID=.;OPOS=18369581;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:2:4:10:4:2:4:10:4 chr19 18370160 . A AG,G 189.3 PASS AF=1,0;AO=14,2;DP=18;FAO=18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0698328,0.0039837;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=17.2677,249.896;QD=42.0675;RBI=0.104936,0.021809;REFB=0,0;REVB=0.0783256,-0.0214421;RO=2;SAF=10,2;SAR=4,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.180146,0.727176;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00254982,0;OID=.,.;OPOS=18370161,18370160;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:2:0:14,2:18,0:1,0:4,0:10,2:0:2:6,0:12,0:0:0 chr19 18371394 . C T 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00969093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.249;QD=16.199;RBI=0.0119167;REFB=-0.0380904;REVB=0.00693497;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0258019;OID=.;OPOS=18371394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1 chr19 18375563 . G A 105.58 PASS AF=0.325;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0110308;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.444;QD=10.5575;RBI=0.0139502;REFB=-0.0174153;REVB=0.00853996;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695362;STB=0.541767;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0292722;OID=.;OPOS=18375563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:40:27:27:13:13:0.325:5:8:15:12:5:8:15:12 chr19 18375659 . C T 257.96 PASS AF=0.348315;AO=31;DP=89;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.00786971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6383;QD=11.5939;RBI=0.0260796;REFB=0.00425427;REVB=-0.0248639;RO=56;SAF=21;SAR=10;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649478;STB=0.553037;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.00903568;OID=.;OPOS=18375659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:58:31:31:0.348315:10:21:35:21:10:21:35:23 chr19 18376407 . T A 78.36 PASS AF=0.416667;AO=9;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0156118;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.634;QD=13.0604;RBI=0.0348577;REFB=-0.0169219;REVB=0.0311663;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168206;STB=0.526264;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0284584;OID=.;OPOS=18376407;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:24:24:14:14:9:10:0.416667:5:4:4:10:6:4:5:9 chr19 18376522 . T G 280.53 PASS AF=0.625;AO=23;DP=39;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0135313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.464;QD=28.053;RBI=0.0145119;REFB=-0.005533;REVB=0.00524401;RO=15;SAF=9;SAR=14;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103316;STB=0.567794;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00268728;OID=.;OPOS=18376522;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:15:15:23:25:0.625:14:9:8:7:16:9:8:7 chr19 18377274 . A G 268.98 PASS AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0219884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1006;QD=23.3895;RBI=0.158016;REFB=-0.00730412;REVB=-0.156479;RO=21;SAF=21;SAR=4;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217024;STB=0.622531;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00402935;OID=.;OPOS=18377274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:4:21:14:7:4:21:14:7 chr19 18377496 . C G 372.71 PASS AF=0.610169;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0355849;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0867;QD=25.2684;RBI=0.0437292;REFB=-0.00271363;REVB=-0.0254158;RO=23;SAF=14;SAR=22;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656975;STB=0.536042;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0015668;OID=.;OPOS=18377496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:59:23:23:36:36:0.610169:22:14:11:12:22:14:11:12 chr19 18377647 . G C 72.44 PASS AF=0.642857;AO=8;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00159407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.635;QD=20.6961;RBI=0.17068;REFB=0.00846475;REVB=0.170673;RO=4;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141787;STB=0.511602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0028638;OID=.;OPOS=18377647;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:14:14:4:5:8:9:0.642857:1:7:3:1:2:7:4:1 chr19 18378219 . A G 327.92 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0179893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.119;QD=20.4951;RBI=0.0270443;REFB=-0.0182321;REVB=-0.0201936;RO=29;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145334;STB=0.57297;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0136262;OID=.;OPOS=18378219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:30:34:34:0.53125:14:20:12:17:14:20:13:17 chr19 18392894 . C T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1414;QD=39.2058;RBI=0.0454109;REFB=0;REVB=0.0453903;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00339658;OID=.;OPOS=18392894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr19 18392913 . A G 88.21 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.679;QD=39.2039;RBI=0.0377828;REFB=0;REVB=0.0362395;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725836;OID=.;OPOS=18392913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:5:3:0:0:6:3:0:0 chr19 18444360 . T G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0625164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.381;QD=42.1826;RBI=0.0715848;REFB=0;REVB=-0.0348725;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00242122;OID=.;OPOS=18444360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr19 18497024 . G C 86.34 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0297325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.952;QD=12.3339;RBI=0.0349985;REFB=-0.0294609;REVB=-0.0184628;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283924;STB=0.637358;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0315041;OID=.;OPOS=18497024;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:16:17:11:11:0.392857:6:5:3:13:6:5:4:13 chr19 18499154 . G C 39.27 PASS AF=0.104762;AO=10;DP=95;FAO=11;FDP=105;FR=.;FRO=94;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=0.0397092;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.6774;QD=1.49604;RBI=0.0752123;REFB=-0.00190965;REVB=-0.0638755;RO=84;SAF=10;SAR=0;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.649014;STB=0.91594;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0375424;OID=.;OPOS=18499154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:95:105:84:94:10:11:0.104762:0:10:40:44:1:10:40:54 chr19 18502835 . G A 244.1 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0166151;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.567;QD=18.7769;RBI=0.0198695;REFB=-0.00465732;REVB=-0.0108966;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366546;STB=0.702986;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.005182;OID=.;OPOS=18502835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:4:22:11:15:4:22 chr19 18538742 . A C 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0256545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.045;QD=10.0746;RBI=0.028581;REFB=-0.0124886;REVB=-0.0125984;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103271;STB=0.562351;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0142412;OID=.;OPOS=18538742;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:3:5:10:4:3:5:10:4 chr19 18546678 . T C 284.6 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00996305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.588;QD=17.7877;RBI=0.0153397;REFB=0.00929441;REVB=0.0116638;RO=32;SAF=20;SAR=11;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426537;STB=0.512187;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.00406145;OID=.;OPOS=18546678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:33:31:31:0.484375:11:20:22:10:11:20:22:11 chr19 18547305 . T A 287.93 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0261806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4807;QD=18.5764;RBI=0.0282623;REFB=-0.0389246;REVB=0.010646;RO=30;SAF=11;SAR=20;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246663;STB=0.645068;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0216672;OID=.;OPOS=18547305;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:31:31:31:0.5:20:11:19:11:20:11:20:11 chr19 18553580 . CAGAT C 77.04 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00499106;FXX=0.0908816;HRUN=1;LEN=4;MLLD=335.468;QD=10.2715;RBI=0.0123528;REFB=-0.00814309;REVB=0.0112997;RO=20;SAF=2;SAR=8;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454543;STB=0.777202;STBP=0.037;TYPE=del;VARB=0.017611;OID=.;OPOS=18553581;OREF=AGAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:10:33:10:30:20:2:8:12:8:77:20:2:8:12:8 chr19 18562438 . C T 240.22 PASS AF=0.522727;AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0124165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.824;QD=21.838;RBI=0.0341844;REFB=-0.0575995;REVB=0.0318497;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228018;STB=0.523789;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0316578;OID=.;OPOS=18562438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:21:21:22:23:0.522727:12:10:9:12:12:11:9:12 chr19 18572472 . G A 83.12 PASS AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0194037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.438;QD=10.0746;RBI=0.0327377;REFB=-0.0116942;REVB=0.0263677;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237364;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.021183;OID=.;OPOS=18572472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:33:33:21:22:11:11:0.333333:5:6:11:10:5:6:12:10 chr19 18679379 . C G 64.87 PASS AF=0.36;AO=10;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0126649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4186;QD=10.3789;RBI=0.0615352;REFB=-0.000475382;REVB=0.0602177;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101015;STB=0.613789;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00566705;OID=.;OPOS=18679379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:15:16:10:9:0.36:5:5:6:9:4:5:6:10 chr19 18684563 . C T 58.48 PASS AF=0.421053;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0143027;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.452;QD=12.3107;RBI=0.0277124;REFB=-0.0143251;REVB=0.0237363;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1654;STB=0.580431;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0137953;OID=.;OPOS=18684563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:20:19:10:11:8:8:0.421053:2:6:6:4:2:6:7:4 chr19 18700047 . A G 57.54 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0205358;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.469;QD=9.20574;RBI=0.0250611;REFB=-0.0225189;REVB=0.0143645;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166665;STB=0.583131;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0326398;OID=.;OPOS=18700047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:16:8:8:0.32:4:4:4:8:4:4:6:10 chr19 18710535 . G A 260.53 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00966214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.369;QD=18.9477;RBI=0.0185988;REFB=-0.00791373;REVB=-0.0158921;RO=27;SAF=19;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119218;STB=0.506662;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.00439774;OID=.;OPOS=18710535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:9:19:18:9:9:19:18:9 chr19 18726856 . T C 341.05 PASS AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.00540693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.386;QD=20.9875;RBI=0.0283246;REFB=-0.0164546;REVB=-0.0278038;RO=30;SAF=19;SAR=16;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134076;STB=0.57395;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0126881;OID=.;OPOS=18726856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:16:19:21:9:16:19:21:9 chr19 18775077 . C T 984.44 PASS AF=0.559524;AO=94;DP=168;FAO=94;FDP=168;FR=.;FRO=74;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.024945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1448;QD=23.439;RBI=0.0304428;REFB=-0.0291778;REVB=0.0174502;RO=74;SAF=47;SAR=47;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327707;STB=0.517853;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0256899;OID=.;OPOS=18775077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:74:74:94:94:0.559524:47:47:40:34:47:47:40:34 chr19 18977937 . G C 222.47 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.00550392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.833;QD=12.5333;RBI=0.0315103;REFB=-0.0150905;REVB=0.0310259;RO=44;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388263;STB=0.522277;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.020061;OID=.;OPOS=18977937;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:12:15:26:18:12:15:26:18 chr19 19017862 . G A 370.45 PASS AF=0.666667;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00257961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.753;QD=29.0551;RBI=0.0122277;REFB=-0.0338239;REVB=0.0119525;RO=17;SAF=17;SAR=17;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898806;STB=0.548991;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.023676;OID=.;OPOS=19017862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:17:17:34:34:0.666667:17:17:6:11:17:17:6:11 chr19 19033089 . G A 252.17 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.000379007;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.956;QD=17.0965;RBI=0.00209353;REFB=-0.00343241;REVB=0.00205894;RO=31;SAF=18;SAR=10;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301581;STB=0.516959;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00343738;OID=.;OPOS=19033089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:10:18:19:12:10:18:19:12 chr19 19035428 . G T 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0505251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.558;QD=11.257;RBI=0.0505609;REFB=-0.0127385;REVB=-0.00190125;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448594;STB=0.52696;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.020769;OID=.;OPOS=19035428;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:8:4:3:5:8:4 chr19 19136541 . C T 772.66 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00337082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.17;QD=61.8127;RBI=0.0417761;REFB=-0.0726387;REVB=0.0416398;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00015629;OID=.;OPOS=19136541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:0:1:49:49:0.98:23:26:0:0:23:26:0:1 chr19 19230868 . A G 1783.31 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410222;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.811;QD=60.4513;RBI=0.0512463;REFB=0;REVB=0.0307141;RO=0;SAF=59;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12461e-05;OID=.;OPOS=19230868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:118:0:0:115:118:1:56:59:0:0:57:61:0:0 chr19 19243175 . C T 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.033713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.162;QD=8.81104;RBI=0.0337932;REFB=-0.0134921;REVB=-0.00232686;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469701;STB=0.529314;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0356524;OID=.;OPOS=19243175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:3:3:5:6:3:3:5:6 chr19 19267910 . G A 54.66 PASS AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0404827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3606;QD=9.11023;RBI=0.0413806;REFB=-0.00719442;REVB=-0.00857388;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354635;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0178561;OID=.;OPOS=19267910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:15:16:8:8:0.333333:4:4:8:7:4:4:8:8 chr19 19312496 . C G 38.14 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.122697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0133;QD=10.1715;RBI=0.124121;REFB=0.01085;REVB=-0.0187457;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.59968;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00589155;OID=.;OPOS=19312496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:3:3:6:3:3:3:6:3 chr19 19344692 . C T 424.2 PASS AF=0.634921;AO=39;DP=61;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0589479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.72;QD=26.9331;RBI=0.0618657;REFB=-0.024275;REVB=-0.0187753;RO=22;SAF=11;SAR=28;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290336;STB=0.513268;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0145486;OID=.;OPOS=19344692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:22:23:39:40:0.634921:28:11:7:15:29:11:7:16 chr19 19446936 . G A 1249.46 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00258467;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9848;QD=61.7016;RBI=0.00512325;REFB=0;REVB=-0.00442348;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74361e-05;OID=.;OPOS=19446936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:34:47:0:0:34:47:0:0 chr19 19449686 . G T 1175.35 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229392;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.056;QD=61.0572;RBI=0.0233135;REFB=0;REVB=-0.00416058;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10722e-05;OID=.;OPOS=19449686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0 chr19 19467085 . G C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.093;QD=53.9112;RBI=0.0237239;REFB=0;REVB=-0.0167231;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26793e-07;OID=.;OPOS=19467085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr19 19467937 . T C 296.5 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0254305;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.06;QD=49.4162;RBI=0.0400399;REFB=-0.00824903;REVB=0.0309271;RO=1;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298695;STB=0.516115;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000448785;OID=.;OPOS=19467937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:25:24:1:1:23:23:0.958333:15:8:0:1:15:8:0:1 chr19 19468709 . GC G,GG 534.57 PASS AF=0.0277778,0.972222;AO=6,30;DP=36;FAO=1,35;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=1,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908296,0.0959325;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=193.398,218.83;QD=59.3964;RBI=0.0930666,0.0979922;REFB=0,0;REVB=0.0202825,0.0199857;RO=0;SAF=5,13;SAR=1,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,-5.63861e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00646415,4.1315e-05;OID=.,.;OPOS=19468710,19468710;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0277778,0.972222:6,30:36:1,35:36:0:0,18:1,17:0:0:5:0:5,13:1,17:0:0 chr19 19468734 . G A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.987;QD=55.6561;RBI=0.0145369;REFB=0;REVB=0.0074426;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.35839e-05;OID=.;OPOS=19468734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0 chr19 19735257 . G T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.931;QD=53.2772;RBI=0.0145461;REFB=0;REVB=-0.00629335;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32035e-05;OID=.;OPOS=19735257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0 chr19 19855654 . C T 96.2 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.00379764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.496;QD=12.0248;RBI=0.0257963;REFB=-0.0183124;REVB=-0.0255153;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251285;STB=0.645855;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0171725;OID=.;OPOS=19855654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:4:16:7:5:4:16 chr19 20002439 . G T 194.89 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0289014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9379;QD=17.3238;RBI=0.0397149;REFB=0.0733603;REVB=0.0272393;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398935;STB=0.5111;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.0406586;OID=.;OPOS=20002439;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:10:10:13:11:10:10:13:12 chr19 20003109 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.64;QD=50.413;RBI=0.0156756;REFB=0;REVB=0.0071296;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304942;OID=.;OPOS=20003109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr19 20044041 . G T 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0116543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0998;QD=16.931;RBI=0.0939214;REFB=-0.0303705;REVB=-0.0931956;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312315;STB=0.681497;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0196511;OID=.;OPOS=20044041;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:7:5:9:3:7:5 chr19 20044332 . A G 40.3 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0156831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.77;QD=14.6527;RBI=0.0223825;REFB=0.011902;REVB=0.0159693;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247547;STB=0.651594;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.00187363;OID=.;OPOS=20044332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:2:3:5:1:2:3 chr19 20117685 . G A 359.5 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0101888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.862;QD=19.9722;RBI=0.0106886;REFB=-0.00700482;REVB=-0.00323017;RO=35;SAF=15;SAR=22;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967862;STB=0.553746;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00705802;OID=.;OPOS=20117685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:22:15:18:17:22:15:18:17 chr19 20135066 . G T 120.8 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0126516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.795;QD=14.642;RBI=0.0126587;REFB=-0.00986475;REVB=-0.000422912;RO=19;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300166;STB=0.676646;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.01698;OID=.;OPOS=20135066;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:3:11:10:9:3:11:10:9 chr19 20150125 . T C 131.67 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0276519;FXX=0.0999667;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.304;QD=19.5064;RBI=0.0299664;REFB=-0.017907;REVB=-0.0115479;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298506;STB=0.555473;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0178695;OID=.;OPOS=20150125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:27:16:13:14:14:0.518519:10:4:5:11:10:4:5:8 chr19 20150175 . G C 121.02 PASS AF=0.424242;AO=13;DP=32;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0191706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.913;QD=14.6695;RBI=0.023369;REFB=-0.0217155;REVB=0.0133641;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126383;STB=0.588103;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0336785;OID=.;OPOS=20150175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:19:19:13:14:0.424242:9:4:8:11:10:4:8:11 chr19 20229486 . G A 72.95 PASS AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0199711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.195;QD=20.8422;RBI=0.0199713;REFB=-0.0129338;REVB=9.78866e-05;RO=5;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12236;STB=0.571252;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00988411;OID=.;OPOS=20229486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:1:8:4:1:1:8:4:1 chr19 20369503 . C G 861.32 PASS AF=0.494318;AO=87;DP=177;FAO=87;FDP=176;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.00254548;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.904;QD=19.5754;RBI=0.0140792;REFB=-0.00797685;REVB=-0.0138472;RO=90;SAF=45;SAR=42;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364155;STB=0.522909;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00698403;OID=.;OPOS=20369503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:90:89:87:87:0.494318:42:45:43:47:42:45:42:47 chr19 20727463 . T C 105.86 PASS AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0212417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.903;QD=21.1729;RBI=0.024998;REFB=0.00298314;REVB=-0.0131792;RO=7;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162618;STB=0.620483;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.00300233;OID=.;OPOS=20727463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:7:8:12:12:0.6:4:8:3:4:4:8:3:5 chr19 20727932 . G A 123.19 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0673683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9919;QD=37.9044;RBI=0.0810748;REFB=-0.113308;REVB=0.0451069;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998765;STB=0.55546;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00965542;OID=.;OPOS=20727932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:4:8:0:1:4:8:0:1 chr19 20808149 . A G 380.8 PASS AF=0.5;AO=38;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0122289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.692;QD=19.5283;RBI=0.0334479;REFB=-0.00531269;REVB=0.0311322;RO=39;SAF=23;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388014;STB=0.526735;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00528703;OID=.;OPOS=20808149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:39:38:39:0.5:15:23:22:17:15:24:22:17 chr19 21299774 . T A,TATA 144.71 PASS AF=0.0588235,0.764706;AO=3,11;DP=19;FAO=1,13;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=1,8;FSAR=0,5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00561431,0.0507825;FXX=0.105208;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=65.0834,163.595;QD=34.05;RBI=0.15821,0.0538198;REFB=0.0398805,0.0695849;REVB=-0.15811,-0.0178244;RO=4;SAF=3,7;SAR=0,4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.642277,-0.0591994;STB=0.5,0.578833;STBP=1,0.256;TYPE=snp,ins;VARB=-0.046812,0.000669859;OID=.,.;OPOS=21299774,21299775;OREF=T,-;OALT=A,ATA;OMAPALT=A,TATA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:17:19:17:4:3:3,11:1,13:0.0588235,0.764706:0,4:3,7:3:1:0,5:1,8:3:0 chr19 21300462 . A G 198.53 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0277462;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.143;QD=44.1169;RBI=0.0372377;REFB=-0.0563276;REVB=0.0248354;RO=1;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830155;STB=0.545399;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000510886;OID=.;OPOS=21300462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:5:12:0:1:5:12:0:1 chr19 21477431 . T C 1358.61 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00799597;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.292;QD=62.4647;RBI=0.0204493;REFB=0;REVB=0.0188212;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42157e-05;OID=.;OPOS=21477431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:48:39:0:0:48:39:0:0 chr19 21492062 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00547386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.424;QD=60.2299;RBI=0.0307778;REFB=0;REVB=0.0302871;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120128;OID=.;OPOS=21492062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:19:18:0:0 chr19 21544571 . G A 979.44 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.073;QD=58.474;RBI=0.0587039;REFB=0;REVB=0.0427649;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028196;OID=.;OPOS=21544571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:38:27:0:0:38:29:0:0 chr19 21606429 . G T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00961833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.891;QD=56.7066;RBI=0.0113821;REFB=0;REVB=0.00608603;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57191e-05;OID=.;OPOS=21606429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0 chr19 21609743 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.764;QD=47.8224;RBI=0.0282233;REFB=0;REVB=0.0151113;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392138;OID=.;OPOS=21609743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr19 21688602 . C G 753.45 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0811966;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.033;QD=61.5061;RBI=0.0857393;REFB=-0.108115;REVB=0.0275382;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516122;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00041072;OID=.;OPOS=21688602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:33:15:0:0:33:15:1:0 chr19 21719401 . T C 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139482;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.408;QD=50.4135;RBI=0.0272158;REFB=0;REVB=-0.0233698;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49509e-05;OID=.;OPOS=21719401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr19 22115982 . A G 68.53 PASS AF=0.888889;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0405437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4978;QD=30.4589;RBI=0.0611234;REFB=-0.0398174;REVB=-0.0457414;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.538369;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0395051;OID=.;OPOS=22115982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:2:1:7:8:0.888889:5:2:0:2:6:2:0:1 chr19 22156585 . G T 238.85 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0775256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2708;QD=50.2842;RBI=0.0780338;REFB=0;REVB=0.00889158;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148133;OID=.;OPOS=22156585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0 chr19 22375868 . C T 1364.75 PASS AF=1;AO=74;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694145;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2211;QD=62.0342;RBI=0.0791999;REFB=0;REVB=-0.0381347;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000685145;OID=.;OPOS=22375868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:88:0:0:74:88:1:34:40:0:0:35:53:0:0 chr19 23328940 . G A 648.03 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0256582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.805;QD=57.603;RBI=0.033744;REFB=-0.058452;REVB=0.0219161;RO=2;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036096;STB=0.519222;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00286208;OID=.;OPOS=23328940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:25:18:0:2:25:18:0:2 chr19 23406165 . T C 340.59 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.872;QD=54.4947;RBI=0.0657842;REFB=0;REVB=0.0657737;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393284;OID=.;OPOS=23406165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0 chr19 23406801 . G C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.253;QD=42.1826;RBI=0.0352882;REFB=0;REVB=-0.0295274;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000372372;OID=.;OPOS=23406801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr19 23542697 . G C 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00125801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.829;QD=11.6341;RBI=0.0107516;REFB=0.000875172;REVB=-0.0106777;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644098;STB=0.538385;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.000936595;OID=.;OPOS=23542697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:9:7:5:5:9:7 chr19 23545250 . A G 426.49 PASS AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.00661201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.781;QD=16.4035;RBI=0.0122002;REFB=-0.00459556;REVB=0.0102531;RO=56;SAF=35;SAR=12;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21427;STB=0.62671;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00778829;OID=.;OPOS=23545250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:57:47:47:0.451923:12:35:31:25:12:35:31:26 chr19 23837365 . A C 207.12 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3002;QD=48.7335;RBI=0.0510141;REFB=0;REVB=0.00969165;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00130699;OID=.;OPOS=23837365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr19 23869823 . T G 157.82 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.01055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7094;QD=16.6127;RBI=0.0110071;REFB=0.0226689;REVB=-0.00313901;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872856;STB=0.549942;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=-0.0613574;OID=.;OPOS=23869823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:9:8:8:13:9:8:8:13 chr19 23927468 . A G 928.91 PASS AF=1;AO=62;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893048;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.181;QD=58.0567;RBI=0.018774;REFB=0;REVB=0.0165139;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218384;OID=.;OPOS=23927468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:64:0:0:62:64:1:31:31:0:0:33:31:0:0 chr19 24184114 . A G 32.89 PASS AF=0.133333;AO=6;DP=44;FAO=6;FDP=45;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00760595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.868;QD=2.9232;RBI=0.0494898;REFB=0.000323396;REVB=0.0489018;RO=38;SAF=2;SAR=4;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227436;STB=0.675888;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.00365203;OID=.;OPOS=24184114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:44:45:38:39:6:6:0.133333:4:2:20:18:4:2:21:18 chr19 24184261 . C T 753.87 PASS AF=0.51049;AO=73;DP=143;FAO=73;FDP=143;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0134773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4106;QD=21.0873;RBI=0.0215136;REFB=-0.0223268;REVB=0.0167689;RO=70;SAF=40;SAR=33;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682151;STB=0.537521;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.018576;OID=.;OPOS=24184261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:70:70:73:73:0.51049:33:40:33:37:33:40:33:37 chr19 29724086 . A C 612.86 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9695;QD=61.2864;RBI=0.0485857;REFB=0;REVB=0.00314258;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000233719;OID=.;OPOS=29724086;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:22:17:0:0:23:17:0:0 chr19 29724111 . T G 711.67 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0597674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0599;QD=52.7163;RBI=0.069432;REFB=-0.169048;REVB=-0.0353363;RO=1;SAF=18;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254452;STB=0.526306;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00630192;OID=.;OPOS=29724111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:54:54:1:2:52:52:0.962963:34:18:1:0:34:18:2:0 chr19 30097268 . C G 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.608;QD=42.1826;RBI=0.0771049;REFB=0;REVB=-0.0700389;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000548877;OID=.;OPOS=30097268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0 chr19 30101339 . G A 362.72 PASS AF=0.493506;AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0116326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.739;QD=18.8427;RBI=0.0272096;REFB=-0.0174635;REVB=0.0245976;RO=38;SAF=26;SAR=11;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311796;STB=0.66704;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0231195;OID=.;OPOS=30101339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:38:39:37:38:0.493506:11:26:14:24:12:26:14:25 chr19 30102856 . A G 707.96 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247023;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.995;QD=56.6371;RBI=0.0248388;REFB=0;REVB=0.00260002;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879741;OID=.;OPOS=30102856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:22:27:0:0:23:27:0:0 chr19 30156601 . G C 254.82 PASS AF=0.916667;AO=20;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.174194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9344;QD=42.4702;RBI=0.177009;REFB=-0.0445414;REVB=0.0314438;RO=4;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914945;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0562514;OID=.;OPOS=30156601;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:24:24:4:2:20:22:0.916667:11:9:3:1:11:11:1:1 chr19 30165639 . C T 429.01 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550593;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=173.437;QD=57.2019;RBI=0.0579403;REFB=0;REVB=0.0180431;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117871;OID=.;OPOS=30165639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0 chr19 30193721 . G A 928.53 PASS AF=0.630769;AO=82;DP=130;FAO=82;FDP=130;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.00754024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.257;QD=28.5701;RBI=0.0111105;REFB=-0.0229591;REVB=0.00816017;RO=48;SAF=36;SAR=46;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845709;STB=0.545752;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0117666;OID=.;OPOS=30193721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:48:48:82:82:0.630769:46:36:27:21:46:36:27:21 chr19 30500118 . GTGATGATGATGATGATGATGATGAT GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC 1551.83 PASS AF=0.90566,0.0943396;AO=83,10;DP=109;FAO=96,10;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=48,4;FSAR=48,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163139,-0.00176368;FXX=0.045041;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=125.459,96.4088;QD=58.5594;RBI=0.053289,0.00749337;REFB=0,0;REVB=0.0507304,-0.00728286;RO=0;SAF=40,5;SAR=43,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00742752,0.0288358;OID=.,.;OPOS=30500119,30500143;OREF=TGA,T;OALT=-,C;OMAPALT=GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.90566,0.0943396:83,10:109:96,10:106:0:48,4:48,6:0:0:36:0:40,5:43,5:0:0 chr19 31039631 . C T 85.4 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0190786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4485;QD=10.0473;RBI=0.0205073;REFB=-0.0253582;REVB=-0.00752023;RO=22;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202168;STB=0.608495;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0159679;OID=.;OPOS=31039631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:33:34:22:23:11:11:0.323529:7:4:12:10:7:4:12:11 chr19 31768416 . A G 118.92 PASS AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00189133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.151;QD=13.2128;RBI=0.00282004;REFB=-0.0207746;REVB=-0.00209177;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10623;STB=0.562409;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0316288;OID=.;OPOS=31768416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:5:9:12:10:5:9:12:10 chr19 31769763 . G A 286.62 PASS AF=0.39759;AO=31;DP=81;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.00432365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.423;QD=13.813;RBI=0.0617788;REFB=-0.00490551;REVB=0.0616273;RO=49;SAF=16;SAR=15;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125949;STB=0.581043;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0113341;OID=.;OPOS=31769763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:49:50:31:33:0.39759:15:16:31:18:17:16:31:19 chr19 31770009 . C T 614.52 PASS AF=0.635294;AO=54;DP=85;FAO=54;FDP=85;FR=.;FRO=31;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00767864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.066;QD=28.9186;RBI=0.0330771;REFB=-0.0385224;REVB=0.0321735;RO=30;SAF=32;SAR=22;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510351;STB=0.519993;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0229449;OID=.;OPOS=31770009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:30:31:54:54:0.635294:22:32:20:10:22:32:20:11 chr19 32083696 . T C 1641.92 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.971;QD=60.2539;RBI=0.0158115;REFB=0;REVB=0.000988515;RO=0;SAF=48;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46781e-05;OID=.;OPOS=32083696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:61:48:0:0:61:48:0:0 chr19 32873698 . A G 598.8 PASS AF=1;AO=37;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000677738;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.778;QD=59.8795;RBI=0.0216319;REFB=0;REVB=0.0216213;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136022;OID=.;OPOS=32873698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:40:0:0:37:40:1:22:15:0:0:23:17:0:0 chr19 32930069 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4746;QD=58.5872;RBI=0.0845867;REFB=0;REVB=-0.0831889;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00168223;OID=.;OPOS=32930069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr19 33088126 . TAG T,TCT 287.24 PASS AF=0.909091,0.0909091;AO=20,2;DP=23;FAO=20,2;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10,2;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303625,0.00771743;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=164.681,114.051;QD=52.2245;RBI=0.0558795,0.0483395;REFB=0,0;REVB=0.0469109,0.0477194;RO=0;SAF=10,2;SAR=10,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00054136,-0.000883306;OID=.,.;OPOS=33088127,33088127;OREF=AG,AG;OALT=-,CT;OMAPALT=T,TCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.909091,0.0909091:20,2:23:20,2:22:0:10,2:10,0:0:0:10:0:10,2:10,0:0:0 chr19 33110204 . T C 43.04 PASS AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0091127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5618;QD=5.38019;RBI=0.0318759;REFB=-0.00222582;REVB=0.0305456;RO=25;SAF=1;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480956;STB=0.822531;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0120193;OID=.;OPOS=33110204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:32:32:25:25:7:7:0.21875:6:1:13:12:6:1:13:12 chr19 33117666 . T C 270.8 PASS AF=0.527273;AO=25;DP=51;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00115002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.92;QD=19.6944;RBI=0.010683;REFB=-0.0432708;REVB=0.0106209;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894563;STB=0.542684;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0357066;OID=.;OPOS=33117666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:55:26:26:25:29:0.527273:11:14:12:14:13:16:12:14 chr19 33167879 . G A 124.16 PASS AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00682474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.415;QD=27.5919;RBI=0.0133112;REFB=-0.0222197;REVB=0.0114285;RO=5;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686393;STB=0.538402;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00851853;OID=.;OPOS=33167879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:6:7:2:3:6:7:2:3 chr19 33168383 . T G 105.07 PASS AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00213523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.034;QD=6.46604;RBI=0.0311285;REFB=-0.00226845;REVB=0.0310552;RO=49;SAF=7;SAR=9;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641736;STB=0.539602;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00762067;OID=.;OPOS=33168383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:49:49:16:16:0.246154:9:7:24:25:9:7:24:25 chr19 33168412 . C T 137.89 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0120848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.34;QD=11.4909;RBI=0.0285074;REFB=-0.0102078;REVB=-0.0258191;RO=32;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141128;STB=0.583232;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0275784;OID=.;OPOS=33168412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:8:8:12:20:8:8:12:20 chr19 33168605 . G A 189.28 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0388853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.277;QD=13.0535;RBI=0.0389331;REFB=-0.0161084;REVB=0.00192882;RO=35;SAF=12;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222449;STB=0.512771;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0286767;OID=.;OPOS=33168605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:11:12:19:16:11:12:19:16 chr19 33168641 . C T 179.01 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0253786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.909;QD=12.562;RBI=0.0318369;REFB=-0.013;REVB=-0.0192227;RO=35;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112908;STB=0.565158;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0218356;OID=.;OPOS=33168641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:13:9:18:17:13:9:18:17 chr19 33169003 . A C 167.87 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0213303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.058;QD=15.6156;RBI=0.0287449;REFB=-0.00974512;REVB=0.0192688;RO=25;SAF=6;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195225;STB=0.612774;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0181312;OID=.;OPOS=33169003;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:12:6:13:12:12:6:13:12 chr19 33169097 . G T 323.88 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=-0.0142836;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.877;QD=16.6093;RBI=0.0644083;REFB=-0.017732;REVB=-0.0628045;RO=43;SAF=11;SAR=24;SRF=10;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972634;STB=0.554347;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.021021;OID=.;OPOS=33169097;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:24:11:10:33:24:11:10:33 chr19 33239450 . C G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00167769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.543;QD=62.3507;RBI=0.0059494;REFB=0;REVB=0.00570795;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11121e-05;OID=.;OPOS=33239450;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr19 33246948 . A G 275.06 PASS AF=0.483871;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0353931;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1874;QD=17.7457;RBI=0.0357771;REFB=-0.00967182;REVB=0.005228;RO=32;SAF=20;SAR=10;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323152;STB=0.680732;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00715273;OID=.;OPOS=33246948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:32:32:30:30:0.483871:10:20:10:22:10:20:10:22 chr19 33281924 . A G 1557.61 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0333329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8295;QD=58.7777;RBI=0.0365216;REFB=-0.11791;REVB=-0.0149245;RO=1;SAF=64;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735807;STB=0.503875;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00157605;OID=.;OPOS=33281924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:106:106:1:1:105:105:0.990566:41:64:1:0:41:64:1:0 chr19 33333155 . G A 854.14 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00388567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.987;QD=56.0094;RBI=0.0241253;REFB=-0.0610662;REVB=0.0238104;RO=1;SAF=32;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145205;STB=0.50769;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000394107;OID=.;OPOS=33333155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:28:32:1:0:28:32:1:0 chr19 33353041 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00190774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.465;QD=53.2772;RBI=0.0341467;REFB=0;REVB=0.0340934;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34743e-05;OID=.;OPOS=33353041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr19 33353061 . G T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.922;QD=55.0986;RBI=0.0431303;REFB=0;REVB=-0.0166503;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135911;OID=.;OPOS=33353061;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr19 33353464 . G A 698.0 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.13337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6676;QD=54.7453;RBI=0.134273;REFB=-0.0959923;REVB=-0.0155486;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.508768;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00484787;OID=.;OPOS=33353464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:28:22:0:0:28:22:0:1 chr19 33353854 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.088;QD=58.1421;RBI=0.0399529;REFB=0;REVB=-0.0329323;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.32827e-05;OID=.;OPOS=33353854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr19 33355055 . A G 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.341;QD=57.1748;RBI=0.0456745;REFB=0;REVB=0.0341838;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168424;OID=.;OPOS=33355055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0 chr19 33355081 . G A 739.08 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0549827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.132;QD=54.7464;RBI=0.0905113;REFB=-0.0405412;REVB=0.0718972;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.511107;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000897454;OID=.;OPOS=33355081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:22:31:0:0:22:31:0:1 chr19 33390796 . G A 1175.55 PASS AF=0.9875;AO=76;DP=78;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00324349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9925;QD=58.7774;RBI=0.0586178;REFB=-0.090015;REVB=-0.058528;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133285;STB=0.506492;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000853498;OID=.;OPOS=33390796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:80:1:1:76:79:0.9875:41:35:1:0:41:38:1:0 chr19 33430816 . T G 1870.81 PASS AF=1;AO=119;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103934;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1838;QD=60.8395;RBI=0.10457;REFB=0;REVB=0.0115203;RO=0;SAF=40;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000617008;OID=.;OPOS=33430816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:119:123:1:79:40:0:0:79:44:0:0 chr19 33439187 . G A 410.85 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3493;QD=56.6687;RBI=0.020448;REFB=0;REVB=-0.00634093;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184233;OID=.;OPOS=33439187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0 chr19 33444556 . T C 479.37 PASS AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=-0.0337017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5459;QD=19.9738;RBI=0.0424911;REFB=-0.00909967;REVB=-0.0258784;RO=49;SAF=33;SAR=14;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395758;STB=0.719176;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0125225;OID=.;OPOS=33444556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:14:33:13:36:14:33:13:36 chr19 33444576 . C T 363.49 PASS AF=0.414894;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=0.00732846;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.129;QD=15.4676;RBI=0.00903234;REFB=-0.00863308;REVB=-0.00527984;RO=49;SAF=29;SAR=10;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417601;STB=0.751492;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00745436;OID=.;OPOS=33444576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:49:55:39:39:0.414894:10:29:16:33:10:29:17:38 chr19 33444588 . T G 350.29 PASS AF=0.408602;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.000892653;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.579;QD=15.0661;RBI=0.00609804;REFB=0.00273461;REVB=-0.00603236;RO=51;SAF=30;SAR=8;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506319;STB=0.792873;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0052348;OID=.;OPOS=33444588;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:51:55:38:38:0.408602:8:30:15:36:8:30:16:39 chr19 33467515 . T C 183.27 PASS AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0494592;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.259;QD=13.3284;RBI=0.0494756;REFB=-0.0181278;REVB=-0.00127374;RO=33;SAF=10;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125988;STB=0.572303;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0163482;OID=.;OPOS=33467515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:12:10:19:14:12:10:19:14 chr19 33470874 . A G 170.66 PASS AF=0.381818;AO=20;DP=54;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.00876292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.275;QD=12.4117;RBI=0.00968611;REFB=-0.00961132;REVB=-0.004127;RO=34;SAF=11;SAR=9;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245045;STB=0.651279;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0206276;OID=.;OPOS=33470874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:34:34:20:21:0.381818:9:11:26:8:10:11:26:8 chr19 33487071 . G C,T 286.04 PASS AF=0.458333,0.5;AO=11,11;DP=23;FAO=11,12;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=2,5;FSAR=9,7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0353196,0.0347109;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=141.466,29.7538;QD=47.6731;RBI=0.0359424,0.0347801;REFB=0.0152928,-0.0346441;REVB=0.00666198,-0.0021931;RO=1;SAF=2,4;SAR=9,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0473806,0.0599362;STB=0.526269,0.533278;STBP=0.669,0.541;TYPE=snp,snp;VARB=0.0122312,0.0116067;OID=.,.;OPOS=33487071,33487071;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:90:23:24:1:1:11,11:11,12:0.458333,0.5:9,7:2,4:0:1:9,7:2,5:0:1 chr19 33490500 . C T 85.84 PASS AF=0.182927;AO=15;DP=82;FAO=15;FDP=82;FR=.;FRO=67;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.0587908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0712;QD=4.18731;RBI=0.0731213;REFB=-0.00325677;REVB=-0.0434785;RO=67;SAF=6;SAR=9;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243482;STB=0.656941;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0236348;OID=.;OPOS=33490500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:82:82:67:67:15:15:0.182927:9:6:40:27:9:6:40:27 chr19 33490566 . T C 50.92 PASS AF=0.123596;AO=11;DP=89;FAO=11;FDP=89;FR=.;FRO=78;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=34;FWDB=-0.0187564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.274;QD=2.28834;RBI=0.0469006;REFB=-0.00622506;REVB=-0.0429868;RO=74;SAF=4;SAR=7;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261306;STB=0.671696;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.038507;OID=.;OPOS=33490566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:89:89:74:78:11:11:0.123596:7:4:43:31:7:4:44:34 chr19 33490585 . G A 101.7 PASS AF=0.195402;AO=17;DP=87;FAO=17;FDP=87;FR=.;FRO=70;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.0231553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.636;QD=4.67575;RBI=0.0265281;REFB=-0.00253598;REVB=0.012945;RO=70;SAF=11;SAR=6;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187456;STB=0.620214;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0147808;OID=.;OPOS=33490585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:70:70:17:17:0.195402:6:11:35:35:6:11:35:35 chr19 33498978 . A G 557.12 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9473;QD=60.2292;RBI=0.0297352;REFB=0;REVB=0.0276063;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338838;OID=.;OPOS=33498978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0 chr19 33499071 . G A 162.55 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0194874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.397;QD=19.7028;RBI=0.0224292;REFB=-0.01765;REVB=0.0111046;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283242;STB=0.659543;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00481471;OID=.;OPOS=33499071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:10:7:12:4:10:7:12:4 chr19 33572089 . G C 60.89 PASS AF=0.285714;AO=9;DP=34;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.056138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1418;QD=6.9589;RBI=0.1049;REFB=-0.0490903;REVB=0.088614;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417813;STB=0.558022;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.133409;OID=.;OPOS=33572089;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:34:35:25:25:9:10:0.285714:4:5:13:12:4:6:13:12 chr19 33579128 . T C 267.35 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0202883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.974;QD=18.4378;RBI=0.0564376;REFB=-0.0148278;REVB=0.0526648;RO=29;SAF=21;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206189;STB=0.615915;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0164034;OID=.;OPOS=33579128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:8:21:15:14:8:21:15:14 chr19 33586739 . G C 230.79 PASS AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00652256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7009;QD=17.7529;RBI=0.00652995;REFB=-0.0151783;REVB=0.000310706;RO=27;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110845;STB=0.56245;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0161634;OID=.;OPOS=33586739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:10:15:13:14:10:15:13:14 chr19 33600764 . T C 256.44 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.000601781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.352;QD=22.7947;RBI=0.0126766;REFB=-0.0169791;REVB=-0.0126623;RO=21;SAF=13;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655076;STB=0.536555;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0209046;OID=.;OPOS=33600764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:11:13:13:8:11:13:13:8 chr19 33602757 . C T 347.19 PASS AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.026637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.914;QD=17.1454;RBI=0.0266559;REFB=-0.0199801;REVB=0.0010054;RO=44;SAF=16;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878871;STB=0.549269;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0255356;OID=.;OPOS=33602757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:44:44:37:37:0.45679:21:16:23:21:21:16:23:21 chr19 33605300 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.416;QD=46.8479;RBI=0.137237;REFB=0;REVB=0.0271321;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00481571;OID=.;OPOS=33605300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr19 33605312 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.689;QD=45.8068;RBI=0.0344976;REFB=0;REVB=-0.0318929;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000511078;OID=.;OPOS=33605312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chr19 33608733 . C A 104.39 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.026744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.733;QD=10.4389;RBI=0.0337925;REFB=-0.013222;REVB=-0.0206565;RO=26;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429136;STB=0.538402;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0201098;OID=.;OPOS=33608733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:26:27:13:13:0.325:7:6:13:13:7:6:14:13 chr19 33635761 . C T 144.02 PASS AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00603903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.857;QD=15.1604;RBI=0.015248;REFB=-0.01733;REVB=-0.0140012;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260625;STB=0.657717;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0197142;OID=.;OPOS=33635761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:22:16:16:0.421053:8:8:5:16:8:8:5:17 chr19 33647379 . T C 107.11 PASS AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0162721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.639;QD=12.6014;RBI=0.0164242;REFB=-0.00133801;REVB=0.00223057;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190337;STB=0.610951;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00403371;OID=.;OPOS=33647379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:6:15:7:6:6:15 chr19 33668046 . G A 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.954;QD=56.1915;RBI=0.0435646;REFB=0;REVB=0.0202077;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00051114;OID=.;OPOS=33668046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0 chr19 33697380 . C T 146.48 PASS AF=0.352941;AO=17;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00715455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.816;QD=11.4885;RBI=0.0314303;REFB=-0.0159198;REVB=-0.0306052;RO=33;SAF=14;SAR=3;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276698;STB=0.615245;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.031444;OID=.;OPOS=33697380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:33:33:17:18:0.352941:3:14:21:12:4:14:21:12 chr19 33698291 . T C 82.32 PASS AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0263284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.48;QD=8.89994;RBI=0.0335246;REFB=-0.00140799;REVB=-0.0207535;RO=26;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128107;STB=0.577753;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00283165;OID=.;OPOS=33698291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:6:5:9:17:6:5:9:17 chr19 33698448 . G A 158.02 PASS AF=0.387755;AO=15;DP=46;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0301536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1308;QD=12.8994;RBI=0.0940752;REFB=-0.0412967;REVB=0.0891117;RO=29;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179334;STB=0.504306;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0754624;OID=.;OPOS=33698448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:29:30:15:19:0.387755:8:7:14:15:10:9:14:16 chr19 33878837 . G A 515.1 PASS AF=0.46281;AO=51;DP=118;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.108809;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.974;QD=17.028;RBI=0.13247;REFB=-0.00277757;REVB=0.0755576;RO=66;SAF=29;SAR=22;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236917;STB=0.517979;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00595083;OID=.;OPOS=33878837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:121:66:65:51:56:0.46281:22:29:36:30:24:32:35:30 chr19 34842488 . T C 789.36 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350981;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.178;QD=64.4379;RBI=0.0351077;REFB=0;REVB=-0.000822627;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209412;OID=.;OPOS=34842488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0 chr19 34843761 . C A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436292;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=401.836;QD=33.4285;RBI=0.043635;REFB=0;REVB=0.0007089;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235706;OID=.;OPOS=34843761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0 chr19 34868642 . A G 153.52 PASS AF=0.372549;AO=13;DP=45;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0448463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.35;QD=12.0408;RBI=0.0464472;REFB=-0.0153737;REVB=-0.0120896;RO=32;SAF=9;SAR=4;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162974;STB=0.624274;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0337448;OID=.;OPOS=34868642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:51:32:32:13:19:0.372549:4:9:18:14:5:14:18:14 chr19 34959979 . A G 222.02 PASS AF=0.552632;AO=20;DP=39;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00179418;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.084;QD=23.3706;RBI=0.0225477;REFB=-0.0406312;REVB=0.0224762;RO=19;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173701;STB=0.514498;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.03003;OID=.;OPOS=34959979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:19:17:20:21:0.552632:13:7:7:12:13:8:7:10 chr19 34972146 . G C 96.26 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0605023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2891;QD=12.4207;RBI=0.0632857;REFB=0.0292269;REVB=0.0185621;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110534;STB=0.564867;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.0378818;OID=.;OPOS=34972146;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:13:6:5:7:13:6 chr19 34972365 . C T 49.94 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0480274;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1391;QD=12.4845;RBI=0.050301;REFB=-0.0254748;REVB=-0.0149519;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218747;STB=0.631215;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0462806;OID=.;OPOS=34972365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:16:16:9:9:7:7:0.4375:4:3:6:3:4:3:6:3 chr19 35175775 . C T 332.91 PASS AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0024198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.284;QD=14.1665;RBI=0.00245586;REFB=-0.0128377;REVB=-0.000419304;RO=57;SAF=23;SAR=14;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282349;STB=0.516062;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0191905;OID=.;OPOS=35175775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:57:57:37:37:0.393617:14:23:34:23:14:23:34:23 chr19 35250304 . G A 352.02 PASS AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00336161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.641;QD=28.7364;RBI=0.0194929;REFB=0.00261934;REVB=-0.0192008;RO=18;SAF=17;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158421;STB=0.576611;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.00105796;OID=.;OPOS=35250304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:18:19:30:30:0.612245:13:17:6:12:13:17:7:12 chr19 35270362 . G C 757.06 PASS AF=0.481707;AO=79;DP=164;FAO=79;FDP=164;FR=.;FRO=85;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=-0.00248242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0015;QD=18.4648;RBI=0.00341066;REFB=-0.00882522;REVB=0.00233885;RO=85;SAF=48;SAR=31;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754626;STB=0.541716;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.010272;OID=.;OPOS=35270362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:85:85:79:79:0.481707:31:48:45:40:31:48:45:40 chr19 35434238 . A G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.787;QD=57.8849;RBI=0.0104092;REFB=0;REVB=0.00405897;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40555e-05;OID=.;OPOS=35434238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:26:34:0:0:26:34:0:0 chr19 35434512 . T C 699.99 PASS AF=1;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516196;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.877;QD=54.9012;RBI=0.0269381;REFB=-0.121585;REVB=0.0264389;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165471;OID=.;OPOS=35434512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:52:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:26:25:0:0 chr19 35435006 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.497;QD=53.9112;RBI=0.0303673;REFB=0;REVB=-0.030265;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.75927e-05;OID=.;OPOS=35435006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0 chr19 35435069 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.529;QD=58.5874;RBI=0.0575583;REFB=0;REVB=0.0198785;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341628;OID=.;OPOS=35435069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr19 35435589 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0091;QD=51.9165;RBI=0.0704218;REFB=0;REVB=-0.0602037;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000711781;OID=.;OPOS=35435589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr19 35449082 . G A 1901.36 PASS AF=1;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013585;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4797;QD=61.3341;RBI=0.0135941;REFB=0;REVB=-0.000495894;RO=0;SAF=65;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48103e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316581;OID=.;OPOS=35449082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:125:124:0:0:124:124:1:59:65:0:0:59:65:0:0 chr19 35450229 . C T 662.68 PASS AF=0.895833;AO=43;DP=48;FAO=43;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0114793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.236;QD=55.2234;RBI=0.0131999;REFB=-0.000208518;REVB=-0.00651642;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229007;STB=0.508643;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=-7.51939e-05;OID=.;OPOS=35450229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:48:48:1:3:43:43:0.895833:23:20:1:0:23:20:1:2 chr19 35577870 . G A 286.12 PASS AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0245329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2781;QD=18.1666;RBI=0.0253244;REFB=-0.0194301;REVB=-0.00628175;RO=32;SAF=12;SAR=19;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729062;STB=0.540634;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0231941;OID=.;OPOS=35577870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:19:12:10:22:19:12:10:22 chr19 35590180 . T A 156.24 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00114095;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.778;QD=14.2032;RBI=0.0247079;REFB=-0.0163987;REVB=0.0246816;RO=27;SAF=4;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360897;STB=0.711552;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0198551;OID=.;OPOS=35590180;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:44:27:27:17:17:0.386364:13:4:15:12:13:4:15:12 chr19 35597352 . T C 446.98 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000838957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.759;QD=57.6743;RBI=0.0680966;REFB=0;REVB=0.0680915;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016461;OID=.;OPOS=35597352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0 chr19 35597462 . A G 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00480159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.371;QD=16.1066;RBI=0.0199232;REFB=-0.0140856;REVB=-0.0193359;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117594;STB=0.567489;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0162469;OID=.;OPOS=35597462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:13:9:9:8:13:9 chr19 35597620 . C T 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00332042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.277;QD=22.1446;RBI=0.0123829;REFB=0.000277166;REVB=-0.0119295;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667668;STB=0.537506;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.000325206;OID=.;OPOS=35597620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:5:8:9:8:5:8 chr19 35610245 . A G 168.34 PASS AF=0.473684;AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0205754;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1838;QD=17.72;RBI=0.0253032;REFB=-0.018558;REVB=0.0147277;RO=22;SAF=13;SAR=4;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292634;STB=0.602529;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0114441;OID=.;OPOS=35610245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:22:20:17:18:0.473684:4:13:11:11:5:13:11:9 chr19 35612168 . T A 68.58 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0430539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.712;QD=13.0623;RBI=0.043164;REFB=-0.0111457;REVB=-0.00308148;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112036;STB=0.555438;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.00935583;OID=.;OPOS=35612168;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:19:21:9:12:9:9:0.428571:6:3:2:7:6:3:3:9 chr19 35614336 . T C 152.76 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0706391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8777;QD=13.579;RBI=0.0822783;REFB=-4.16173e-05;REVB=-0.042188;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489516;STB=0.502854;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.00401574;OID=.;OPOS=35614336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:11:6:10:18:11:6:10:18 chr19 35614534 . A T 196.16 PASS AF=0.318182;AO=11;DP=41;FAO=14;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0282099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.6993;QD=17.8323;RBI=0.0446554;REFB=-0.0411222;REVB=-0.0346165;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266107;STB=0.578199;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0643458;OID=.;OPOS=35614534;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:41:44:23:23:11:14:0.318182:5:6:12:11:5:9:12:11 chr19 35616663 . A G 263.52 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00654572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.132;QD=17.5681;RBI=0.00663219;REFB=-0.0345418;REVB=0.00106744;RO=30;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226798;STB=0.633808;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0505525;OID=.;OPOS=35616663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:31:29:29:0.483333:17:12:20:10:17:12:21:10 chr19 35616692 . C T 265.59 PASS AF=0.483871;AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0427859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.566;QD=17.135;RBI=0.0519104;REFB=-0.014132;REVB=0.0293948;RO=32;SAF=13;SAR=16;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163949;STB=0.581143;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0155841;OID=.;OPOS=35616692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:32:32:29:30:0.483871:16:13:20:12:16:14:20:12 chr19 35617122 . A G 51.89 PASS AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0458378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7986;QD=6.10489;RBI=0.0833849;REFB=-0.000328084;REVB=-0.0696558;RO=26;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193611;STB=0.624688;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=-0.00835761;OID=.;OPOS=35617122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:3:5:12:14:3:5:12:14 chr19 35617270 . T C 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.053097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9082;QD=12.7298;RBI=0.0562215;REFB=-0.00897937;REVB=0.0184815;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243311;STB=0.644834;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.018225;OID=.;OPOS=35617270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:7:5:6:3:7:5 chr19 35622695 . A G 834.26 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.713;QD=57.5349;RBI=0.0351141;REFB=0;REVB=-0.0266284;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.91698e-05;OID=.;OPOS=35622695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:22:35:0:0:22:36:0:0 chr19 35648365 . T G 416.49 PASS AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0141477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.657;QD=19.5995;RBI=0.0143382;REFB=-0.0262062;REVB=0.00232932;RO=43;SAF=19;SAR=23;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116855;STB=0.50649;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0311845;OID=.;OPOS=35648365;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:23:19:20:23:23:19:20:23 chr19 35649324 . C G 613.79 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.434;QD=61.3792;RBI=0.0217895;REFB=0;REVB=-0.00253101;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49089e-05;OID=.;OPOS=35649324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:26:13:0:0:26:14:0:0 chr19 35655151 . T C 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0534361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.657;QD=21.0125;RBI=0.0551833;REFB=-0.00128823;REVB=0.0137759;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172885;STB=0.597538;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.000643095;OID=.;OPOS=35655151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:7:4:1:6:7:4:1:6 chr19 35660450 . T C 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0157803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.625;QD=13.5055;RBI=0.0335584;REFB=-0.00410739;REVB=-0.0296167;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503811;STB=0.502954;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.00751081;OID=.;OPOS=35660450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:7:10:7:5:7:10 chr19 35660508 . G A 120.86 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0458173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3847;QD=14.6494;RBI=0.0508626;REFB=0.00159317;REVB=0.0220857;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067199;STB=0.539114;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=-0.000633239;OID=.;OPOS=35660508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:8:11:9:5:8:11 chr19 35741375 . C T 353.11 PASS AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00234299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.19;QD=18.5849;RBI=0.0137504;REFB=-0.00654452;REVB=0.0135494;RO=36;SAF=22;SAR=15;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356377;STB=0.542792;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00558314;OID=.;OPOS=35741375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:39:37:37:0.486842:15:22:20:16:15:22:20:19 chr19 35741456 . T C 674.44 PASS AF=0.51145;AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0666677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1175;QD=20.5937;RBI=0.09734;REFB=0.0150489;REVB=-0.070926;RO=59;SAF=31;SAR=36;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776336;STB=0.53558;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.015061;OID=.;OPOS=35741456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:59:64:67:67:0.51145:36:31:22:37:36:31:25:39 chr19 35770056 . G A 138.42 PASS AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00895537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.267;QD=11.7808;RBI=0.00902354;REFB=0.00897922;REVB=-0.00110712;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363738;STB=0.714025;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.0115371;OID=.;OPOS=35770056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:11:5:20:11:11:5:20:11 chr19 35790503 . G A 253.9 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0177248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0591;QD=21.6087;RBI=0.0729219;REFB=0.00598757;REVB=0.0707349;RO=23;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137512;STB=0.576792;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.00353157;OID=.;OPOS=35790503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:11:13:16:7:11:13:16:7 chr19 35836530 . G A 356.6 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00574565;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.294;QD=19.0189;RBI=0.0335901;REFB=-0.00242835;REVB=0.033095;RO=37;SAF=21;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507688;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00170089;OID=.;OPOS=35836530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:37:38:37:37:0.493333:16:21:21:16:16:21:21:17 chr19 35843086 . G A 67.86 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0225707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.998;QD=14.2866;RBI=0.0482618;REFB=-0.0356829;REVB=0.0426587;RO=10;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196839;STB=0.617362;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0365904;OID=.;OPOS=35843086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:2:7:6:4:2:7:6:4 chr19 35849811 . C A 69.39 PASS AF=0.227273;AO=10;DP=44;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0350809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1335;QD=6.30838;RBI=0.0844534;REFB=-0.00723499;REVB=0.0768226;RO=34;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312654;STB=0.6996;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0297709;OID=.;OPOS=35849811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:44:44:34:34:10:10:0.227273:3:7:15:19:3:7:15:19 chr19 35850672 . T C 31.6 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0413025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.783;QD=14.0438;RBI=0.0519785;REFB=-0.0653702;REVB=0.0315575;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543107;STB=0.533194;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.022874;OID=.;OPOS=35850672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:1:3:4:1:1:3 chr19 35863707 . G A 99.15 PASS AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00429876;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.427;QD=24.7867;RBI=0.0597133;REFB=-0.163613;REVB=0.0595583;RO=4;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295997;STB=0.691974;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00576113;OID=.;OPOS=35863707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:16:16:4:5:11:11:0.6875:4:7:0:4:4:7:0:5 chr19 35898796 . T TC 122.68 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00520543;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1;QD=9.62154;RBI=0.0383615;REFB=0.0178299;REVB=-0.0380067;RO=32;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252796;STB=0.646272;STBP=0.088;TYPE=ins;VARB=-0.0271205;OID=.;OPOS=35898797;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.411765:21:53:21:51:30:13:8:11:19:99:32:13:8:12:20 chr19 35898899 . A G 212.8 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00096814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.035;QD=20.267;RBI=0.0640809;REFB=0.00068071;REVB=-0.0640736;RO=21;SAF=18;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530219;STB=0.802827;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00332283;OID=.;OPOS=35898899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:3:18:7:14:3:18:7:14 chr19 35899969 . GC G 267.23 PASS AF=0.513158;AO=37;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.021125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.9687;QD=14.0647;RBI=0.135695;REFB=0.00592117;REVB=-0.13404;RO=31;SAF=20;SAR=17;SRF=14;SRR=17;SSEN=0.347542;SSEP=0;SSSB=0.0733571;STB=0.576961;STBP=0.171;TYPE=del;VARB=-0.00833327;OID=.;OPOS=35899970;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.513158:37:76:39:76:37:22:17:15:22:99:31:20:17:14:17 chr19 35991442 . T G 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.319;QD=56.9568;RBI=0.0408184;REFB=0;REVB=-0.00186881;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166481;OID=.;OPOS=35991442;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0 chr19 36002381 . C T 108.86 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0266808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.266;QD=24.1901;RBI=0.0272771;REFB=-0.00940885;REVB=0.0056723;RO=6;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00309609;OID=.;OPOS=36002381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:2:10:5:1:2:10:5:1 chr19 36002710 . C A 538.11 PASS AF=0.561798;AO=49;DP=88;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0108334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.404;QD=24.1845;RBI=0.0189449;REFB=-0.0198967;REVB=0.0155417;RO=36;SAF=14;SAR=35;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931672;STB=0.554964;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0129629;OID=.;OPOS=36002710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:36:39:49:50:0.561798:35:14:14:22:35:15:16:23 chr19 36004106 . A G 306.28 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9665;QD=53.2656;RBI=0.0412138;REFB=0;REVB=-0.0396233;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000575382;OID=.;OPOS=36004106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr19 36004171 . C A 99.64 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0243314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.76;QD=26.5702;RBI=0.0257133;REFB=-0.0233288;REVB=0.00831599;RO=4;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19919;STB=0.610929;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0106685;OID=.;OPOS=36004171;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:7:4:0:4:7:4:0:4 chr19 36017928 . G C 240.16 PASS AF=1;AO=13;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.863;QD=50.5598;RBI=0.239137;REFB=0;REVB=0.0422276;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104075;OID=.;OPOS=36017928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:19:0:0:13:19:1:12:1:0:0:14:5:0:0 chr19 36017950 . C T 60.31 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0205428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4016;QD=17.2302;RBI=0.0399634;REFB=-0.037095;REVB=-0.0342792;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651668;STB=0.538359;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.013911;OID=.;OPOS=36017950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:7:1:1:5:7:1:1:5 chr19 36033460 . C T 299.93 PASS AF=0.359223;AO=36;DP=102;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0156591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.49;QD=11.6477;RBI=0.0161846;REFB=-0.0125959;REVB=0.00409068;RO=65;SAF=19;SAR=17;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293316;STB=0.530231;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.016807;OID=.;OPOS=36033460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:65:66:36:37:0.359223:17:19:36:29:18:19:37:29 chr19 36066570 . A G 3044.95 PASS AF=0.883817;AO=213;DP=241;FAO=213;FDP=241;FR=.;FRO=28;FSAF=67;FSAR=146;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00614672;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.726;QD=50.5386;RBI=0.0126098;REFB=-0.0139874;REVB=0.0110102;RO=28;SAF=67;SAR=146;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895496;STB=0.547312;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00159367;OID=.;OPOS=36066570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:28:28:213:213:0.883817:146:67:19:9:146:67:19:9 chr19 36066577 . A G 3078.83 PASS AF=0.88843;AO=215;DP=242;FAO=215;FDP=242;FR=.;FRO=27;FSAF=69;FSAR=146;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00628801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.372;QD=50.8897;RBI=0.0527882;REFB=-0.00179525;REVB=0.0524124;RO=27;SAF=69;SAR=146;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727551;STB=0.538418;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00031821;OID=.;OPOS=36066577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:27:27:215:215:0.88843:146:69:17:10:146:69:17:10 chr19 36066634 . A G 2589.52 PASS AF=0.912371;AO=177;DP=194;FAO=177;FDP=194;FR=.;FRO=17;FSAF=66;FSAR=111;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00818402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.505;QD=53.3922;RBI=0.0127518;REFB=0.0222897;REVB=-0.0097791;RO=17;SAF=66;SAR=111;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378616;STB=0.519968;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.00296854;OID=.;OPOS=36066634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:194:194:17:17:177:177:0.912371:111:66:10:7:111:66:10:7 chr19 36066642 . A G 2246.32 PASS AF=0.893258;AO=159;DP=178;FAO=159;FDP=178;FR=.;FRO=19;FSAF=62;FSAR=97;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0134388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.818;QD=50.4791;RBI=0.0150608;REFB=0.0121897;REVB=0.0067991;RO=19;SAF=62;SAR=97;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507072;STB=0.526784;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00123325;OID=.;OPOS=36066642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:178:178:19:19:159:159:0.893258:97:62:12:7:97:62:12:7 chr19 36066645 . A G 2103.4 PASS AF=0.888235;AO=151;DP=170;FAO=151;FDP=170;FR=.;FRO=19;FSAF=62;FSAR=89;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0134874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.216;QD=49.4917;RBI=0.0182682;REFB=-0.0327872;REVB=0.0123213;RO=19;SAF=62;SAR=89;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478413;STB=0.52528;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00535113;OID=.;OPOS=36066645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:170:170:19:19:151:151:0.888235:89:62:12:7:89:62:12:7 chr19 36066661 . A G 1411.74 PASS AF=0.828125;AO=106;DP=129;FAO=106;FDP=128;FR=.;FRO=22;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0221441;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.91;QD=44.1168;RBI=0.0225132;REFB=-0.00628423;REVB=0.00406009;RO=21;SAF=53;SAR=53;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00741331;STB=0.507811;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00102499;OID=.;OPOS=36066661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:21:22:106:106:0.828125:53:53:11:10:53:53:12:10 chr19 36066667 . A G 1130.49 PASS AF=0.764706;AO=91;DP=119;FAO=91;FDP=119;FR=.;FRO=28;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0156227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.613;QD=37.9997;RBI=0.0161869;REFB=-0.0425123;REVB=-0.00423652;RO=28;SAF=51;SAR=40;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00491539;STB=0.502625;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00947127;OID=.;OPOS=36066667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:28:28:91:91:0.764706:40:51:16:12:40:51:16:12 chr19 36066744 . C T 59.07 PASS AF=0.137931;AO=12;DP=87;FAO=12;FDP=87;FR=.;FRO=75;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=50;FSRR=25;FWDB=-0.000684986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.951;QD=2.71575;RBI=0.0149103;REFB=-0.00508808;REVB=-0.0148946;RO=75;SAF=1;SAR=11;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.657831;STB=0.939077;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0111984;OID=.;OPOS=36066744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:87:87:75:75:12:12:0.137931:11:1:50:25:11:1:50:25 chr19 36159524 . G A 199.68 PASS AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0901209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1111;QD=36.3061;RBI=0.0910343;REFB=-0.0203767;REVB=-0.0128635;RO=4;SAF=12;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606198;STB=0.533296;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0357714;OID=.;OPOS=36159524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:22:22:4:4:18:18:0.818182:6:12:2:2:6:12:2:2 chr19 36168914 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.804;QD=42.1817;RBI=0.0367839;REFB=0;REVB=0.000520569;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00180742;OID=.;OPOS=36168914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0 chr19 36214632 . A AG 1340.8 PASS AF=1;AO=114;DP=124;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112855;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.1299;QD=45.8393;RBI=0.115288;REFB=0;REVB=-0.0235614;RO=8;SAF=39;SAR=75;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127655;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000511297;OID=.;OPOS=36214633;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:114:124:117:117:0:40:77:0:0:25:8:39:75:2:6 chr19 36224705 . A G 1058.83 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.311;QD=59.6524;RBI=0.0303122;REFB=0;REVB=0.0232841;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47648e-05;OID=.;OPOS=36224705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:41:29:0:0:42:29:0:0 chr19 36235431 . A G 445.92 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0361;QD=57.5378;RBI=0.0343974;REFB=0;REVB=0.0160695;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614037;OID=.;OPOS=36235431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0 chr19 36236909 . G C 1590.78 PASS AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00909001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.94;QD=58.9179;RBI=0.0271597;REFB=-0.0531496;REVB=0.0255934;RO=1;SAF=50;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082545;STB=0.504347;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000106123;OID=.;OPOS=36236909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:108:108:1:1:107:107:0.990741:57:50:0:1:57:50:0:1 chr19 36243089 . T C 1042.34 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176852;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0943;QD=59.5621;RBI=0.0255541;REFB=0;REVB=-0.0184457;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39008e-06;OID=.;OPOS=36243089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:70:0:0:67:70:1:32:35:0:0:32:38:0:0 chr19 36243813 . G A 1556.51 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00246042;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.155;QD=62.8893;RBI=0.0232926;REFB=0.0298833;REVB=0.0231623;RO=1;SAF=51;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920984;STB=0.504853;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=2.20643e-05;OID=.;OPOS=36243813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:100:99:1:1:98:98:0.989899:47:51:1:0:47:51:1:0 chr19 36246574 . C T 109.63 PASS AF=0.538462;AO=12;DP=24;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.108635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3758;QD=16.8661;RBI=0.115293;REFB=-0.0102925;REVB=-0.0386133;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175524;STB=0.627742;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0242334;OID=.;OPOS=36246574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:24:26:12:12:12:14:0.538462:8:4:2:10:8:6:2:10 chr19 36258937 . AGGG AGG,AGGC 499.12 PASS AF=0.942857,0.0571429;AO=30,2;DP=33;FAO=33,2;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.21089,-0.149454;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=28.5742,6.33126;QD=57.0422;RBI=0.216436,0.16663;REFB=0,0;REVB=-0.048679,0.0736831;RO=0;SAF=15,1;SAR=15,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0140702,0.0326861;OID=.,.;OPOS=36258938,36258940;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=AGG,AGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.942857,0.0571429:30,2:33:33,2:35:0:17,1:16,1:0:0:9:0:15,1:15,1:0:0 chr19 36273534 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.089;QD=45.8068;RBI=0.0961171;REFB=0;REVB=0.0743908;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161113;OID=.;OPOS=36273534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr19 36275074 . G A 382.56 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0158599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.996;QD=52.7669;RBI=0.041151;REFB=-0.0423142;REVB=0.037972;RO=1;SAF=13;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344547;STB=0.518505;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00324682;OID=.;OPOS=36275074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:15:13:1:0:15:13:1:0 chr19 36302921 . T C 1535.06 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.626;QD=59.6139;RBI=0.0345944;REFB=0;REVB=-0.00365729;RO=0;SAF=59;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3262e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57735e-05;OID=.;OPOS=36302921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:100:103:0:0:100:103:1:41:59:0:0:41:62:0:0 chr19 36322270 . C T 871.19 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365651;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.183;QD=58.0794;RBI=0.037858;REFB=0;REVB=0.00980918;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.34717e-05;OID=.;OPOS=36322270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0 chr19 36334419 . G A 137.87 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.028882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.415;QD=19.0171;RBI=0.0418904;REFB=0.00424058;REVB=-0.030342;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119455;STB=0.567483;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00446431;OID=.;OPOS=36334419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:11:3:5:10:11:3 chr19 36342267 . G A 192.93 PASS AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00711735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7939;QD=24.1165;RBI=0.034312;REFB=-0.0123997;REVB=0.0335657;RO=13;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860085;STB=0.547896;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.021092;OID=.;OPOS=36342267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:8:11:9:4:8:11:9:4 chr19 36355595 . A G 740.3 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459829;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5359;QD=56.9463;RBI=0.0831262;REFB=0;REVB=-0.0692499;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00152345;OID=.;OPOS=36355595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr19 36365684 . G T 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0251126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.628;QD=14.0974;RBI=0.033089;REFB=-0.0195199;REVB=0.0215463;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275431;STB=0.659955;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0268002;OID=.;OPOS=36365684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:6:12:5:8:6:12 chr19 36370011 . G A 151.75 PASS AF=0.447368;AO=16;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0296553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2287;QD=15.9738;RBI=0.0704337;REFB=0.0105283;REVB=0.0638864;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851303;STB=0.562426;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=-0.0102886;OID=.;OPOS=36370011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:16:17:0.447368:9:7:11:10:10:7:11:10 chr19 36387881 . A G 84.8 PASS AF=0.354839;AO=10;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0170812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.343;QD=10.9415;RBI=0.0171343;REFB=-0.0146887;REVB=-0.001348;RO=19;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084162;STB=0.559328;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0217552;OID=.;OPOS=36387881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:19:20:10:11:0.354839:7:3:7:12:8:3:7:13 chr19 36393186 . T C 97.84 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0452542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5609;QD=13.4956;RBI=0.0582046;REFB=-0.00697203;REVB=-0.0366037;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147216;STB=0.612045;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0148823;OID=.;OPOS=36393186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:16:17:12:12:0.413793:9:3:6:10:9:3:7:10 chr19 36394272 . T C 158.68 PASS AF=0.459459;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.012419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.187;QD=17.1545;RBI=0.0255349;REFB=-0.0224578;REVB=-0.0223114;RO=20;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515905;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0212075;OID=.;OPOS=36394272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:20:20:16:17:0.459459:8:8:10:10:8:9:10:10 chr19 36394678 . T C 692.02 PASS AF=0.519084;AO=68;DP=131;FAO=68;FDP=131;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=-0.0153345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9119;QD=21.1305;RBI=0.0263773;REFB=-0.00546676;REVB=-0.0214619;RO=63;SAF=31;SAR=37;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100947;STB=0.505548;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00549172;OID=.;OPOS=36394678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:63:63:68:68:0.519084:37:31:28:35:37:31:28:35 chr19 36398414 . C A 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0208542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2871;QD=11.0923;RBI=0.0570304;REFB=-0.0324896;REVB=0.0530808;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308675;STB=0.694785;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0519449;OID=.;OPOS=36398414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:3:3:1:4:3:3 chr19 36486445 . G C 376.17 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.084;QD=55.7295;RBI=0.0635533;REFB=0;REVB=0.012971;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244756;OID=.;OPOS=36486445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:14:13:0:0 chr19 36497351 . GCCCCCT GCCCCTC 37.29 PASS AF=0.151515;AO=6;DP=59;FAO=5;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0137646;FXX=0.449925;HRUN=5;LEN=2;MLLD=23.3678;QD=4.51996;RBI=0.0881959;REFB=-0.145492;REVB=-0.0871151;RO=41;SAF=5;SAR=1;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307895;STB=0.620159;STBP=0.629;TYPE=mnp;VARB=0.263757;OID=.;OPOS=36497356;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=GCCCCTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.151515:6:59:5:33:26:4:1:18:8:24:41:5:1:25:16 chr19 36497358 . C G 267.88 PASS AF=0.454545;AO=29;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=0.015801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.145;QD=16.2353;RBI=0.015941;REFB=-0.0448639;REVB=0.00210749;RO=34;SAF=18;SAR=11;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1211;STB=0.571061;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.056962;OID=.;OPOS=36497358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:36:29:30:0.454545:11:18:25:9:11:19:27:9 chr19 36497373 . A G 310.48 PASS AF=0.5;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0408852;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2254;QD=18.8172;RBI=0.0456075;REFB=-0.0133844;REVB=-0.0202102;RO=33;SAF=21;SAR=12;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599132;STB=0.533314;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0163815;OID=.;OPOS=36497373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:33:33:33:33:0.5:12:21:23:10:12:21:23:10 chr19 36499173 . C T 135.33 PASS AF=0.428571;AO=14;DP=37;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0729771;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.384;QD=15.4667;RBI=0.0769933;REFB=-0.00159194;REVB=0.0245422;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137003;STB=0.599863;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0044065;OID=.;OPOS=36499173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:35:16:20:14:15:0.428571:5:9:8:8:5:10:10:10 chr19 36530562 . T C 74.2 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00110801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5731;QD=10.234;RBI=0.0367255;REFB=-0.00827097;REVB=-0.0367088;RO=19;SAF=9;SAR=1;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.434842;STB=0.77351;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0217277;OID=.;OPOS=36530562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:1:9:12:7:1:9:12:7 chr19 36530913 . C T 204.23 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0422164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.246;QD=15.71;RBI=0.0422168;REFB=-0.0189824;REVB=0.000184225;RO=29;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125424;STB=0.571366;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0186671;OID=.;OPOS=36530913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:9:14:14:15:9:14:14:15 chr19 36549684 . G A 171.16 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00677649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4388;QD=17.5548;RBI=0.0275288;REFB=-0.0291207;REVB=0.0266817;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258194;STB=0.646899;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.068576;OID=.;OPOS=36549684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:7:14:7:11:7:14 chr19 36590329 . T C 76.12 PASS AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0212411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.854;QD=12.1798;RBI=0.0213844;REFB=-0.00504132;REVB=0.00247194;RO=15;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146256;STB=0.586045;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00697686;OID=.;OPOS=36590329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:6:4:4:11:6:4:4:11 chr19 36592627 . G A 984.36 PASS AF=0.556213;AO=94;DP=172;FAO=94;FDP=169;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=69;FSRF=12;FSRR=63;FWDB=0.0481243;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8511;QD=23.2985;RBI=0.0591696;REFB=-0.0250625;REVB=0.0344252;RO=73;SAF=25;SAR=69;SRF=11;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126887;STB=0.563801;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0208651;OID=.;OPOS=36592627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:169:73:75:94:94:0.556213:69:25:11:62:69:25:12:63 chr19 36594659 . A T 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00693776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.324;QD=59.0182;RBI=0.00693801;REFB=0;REVB=5.90785e-05;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40793e-05;OID=.;OPOS=36594659;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr19 36595436 . A C 210.81 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0159934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.926;QD=14.0542;RBI=0.0641314;REFB=-0.0166719;REVB=-0.0621051;RO=35;SAF=18;SAR=7;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424363;STB=0.524252;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0232802;OID=.;OPOS=36595436;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:7:18:24:11:7:18:24:11 chr19 36602729 . G C 154.1 PASS AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0147213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6428;QD=14.3352;RBI=0.0188352;REFB=0.0138458;REVB=0.0117494;RO=26;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196745;STB=0.614388;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.0199618;OID=.;OPOS=36602729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:11:6:14:12:11:6:14:12 chr19 36603703 . T A 181.36 PASS AF=0.434783;AO=18;DP=44;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00137552;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.788;QD=15.7701;RBI=0.00635815;REFB=-0.0128717;REVB=-0.00620758;RO=25;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152329;STB=0.505149;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0172904;OID=.;OPOS=36603703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:46:25:26:18:20:0.434783:6:12:17:8:6:14:18:8 chr19 36604735 . CA C 240.2 PASS AF=0.522727;AO=22;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0317208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.405;QD=21.8362;RBI=0.0386394;REFB=-0.00185374;REVB=-0.0220634;RO=21;SAF=17;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334396;STB=0.693694;STBP=0.013;TYPE=del;VARB=0.00260584;OID=.;OPOS=36604736;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.522727:22:44:23:44:21:18:5:9:12:99:21:17:5:9:12 chr19 36642884 . T C 382.53 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.605;QD=52.7625;RBI=0.0145945;REFB=-0.0297021;REVB=0.00850508;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.523792;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000778372;OID=.;OPOS=36642884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:1:0:18:10:1:0 chr19 36674305 . A G 224.22 PASS AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0168726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.399;QD=42.7086;RBI=0.0203449;REFB=0.0376639;REVB=0.011368;RO=2;SAF=6;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366475;STB=0.519979;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.00323062;OID=.;OPOS=36674305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:13:6:1:1:13:6:1:1 chr19 36728219 . TAAAAAC TAAAA,TAAAAC 56.35 PASS AF=0.4375,0.0625;AO=6,3;DP=21;FAO=7,1;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5,1;FSAR=2,0;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.101444,-0.0717502;FXX=0.0587889;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=24.9876,14.9688;QD=14.0878;RBI=0.138921,0.0985951;REFB=-0.0787018,-0.0831623;REVB=0.0949104,0.0676232;RO=11;SAF=4,3;SAR=2,0;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.308307,0.686823;STB=0.624625,0.989059;STBP=0.406,0.496;TYPE=del,del;VARB=0.129199,-0.111914;OID=.,.;OPOS=36728224,36728220;OREF=AC,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAA,TAAAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4375,0.0625:6,3:21:7,1:16:8:5,1:2,0:4:4:39:11:4,3:2,0:4:7 chr19 36728290 . A G 39.01 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00866451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.994;QD=12.0044;RBI=0.00902178;REFB=-0.0337437;REVB=-0.00251373;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275357;STB=0.699353;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0187448;OID=.;OPOS=36728290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:4:2:4:2:4:2:5:2 chr19 36885067 . A T 60.39 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0181949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.233;QD=17.2538;RBI=0.0189674;REFB=-0.0012956;REVB=-0.00535808;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661115;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139828;OID=.;OPOS=36885067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:14:14:5:6:8:8:0.571429:4:4:2:3:4:4:3:3 chr19 36939572 . C T 335.85 PASS AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.00689177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.191;QD=22.3902;RBI=0.0115342;REFB=-0.0064928;REVB=-0.00924886;RO=26;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181875;STB=0.599944;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00462054;OID=.;OPOS=36939572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:17:17:19:7:17:17:19:7 chr19 36940760 . G T 143.44 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0308905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3744;QD=14.7115;RBI=0.0408617;REFB=-0.0178316;REVB=-0.0267481;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942034;STB=0.554389;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0107297;OID=.;OPOS=36940760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:9:7:8:15:9:7:8:15 chr19 37004938 . T C 113.03 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00774247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.114;QD=17.3892;RBI=0.0835283;REFB=-0.00937959;REVB=0.0831687;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668703;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0349375;OID=.;OPOS=37004938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:7:6:7:6:7:6:7:6 chr19 37039069 . A C 214.24 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0315629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6388;QD=12.7903;RBI=0.0383666;REFB=-0.00629449;REVB=-0.0218123;RO=41;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13144;STB=0.575285;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00967267;OID=.;OPOS=37039069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:12:14:17:24:12:14:17:24 chr19 37068081 . G C 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00511458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.606;QD=58.1417;RBI=0.0193644;REFB=0;REVB=0.0186768;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121566;OID=.;OPOS=37068081;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr19 37117302 . A G 195.68 PASS AF=0.558824;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.011024;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.768;QD=23.0213;RBI=0.0132461;REFB=-0.0227047;REVB=-0.00734367;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102254;STB=0.532676;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0158015;OID=.;OPOS=37117302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:34:17:15:19:19:0.558824:10:9:6:11:10:9:6:9 chr19 37210805 . C T 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0360775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2393;QD=16.6162;RBI=0.0376229;REFB=-0.00585814;REVB=-0.0106723;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278502;STB=0.670534;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00599684;OID=.;OPOS=37210805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:20:21:17:17:0.447368:6:11:7:13:6:11:7:14 chr19 37239278 . C A 88.08 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0309707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8095;QD=14.0928;RBI=0.0794553;REFB=-0.00853159;REVB=-0.0731707;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570728;STB=0.825321;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0140937;OID=.;OPOS=37239278;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:8:3:13:1:8:3:13:1 chr19 37241141 . A G 160.52 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00724385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.64;QD=18.3452;RBI=0.0113949;REFB=0.0129965;REVB=-0.00879606;RO=18;SAF=13;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113657;STB=0.565136;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.0133666;OID=.;OPOS=37241141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:4:13:12:6:4:13:12:6 chr19 37310344 . T C 147.19 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0241811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.013;QD=17.3165;RBI=0.02462;REFB=-0.0261691;REVB=0.00462834;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796379;STB=0.529375;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0323249;OID=.;OPOS=37310344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:18:16:16:0.470588:8:8:7:10:8:8:8:10 chr19 37382927 . T TA 33.29 PASS AF=0.315789;AO=5;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.20645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.9497;QD=7.00781;RBI=0.219155;REFB=-0.00363384;REVB=0.0735328;RO=13;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.741485;STB=0.817086;STBP=0.086;TYPE=ins;VARB=0.031731;OID=.;OPOS=37382928;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.315789:5:19:6:19:13:5:1:5:8:33:13:5:0:5:8 chr19 37441111 . C T 127.9 PASS AF=0.310345;AO=17;DP=57;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0043976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.706;QD=8.82098;RBI=0.0393822;REFB=-0.00779018;REVB=-0.0391359;RO=40;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760907;STB=0.566857;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0192674;OID=.;OPOS=37441111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:40:40:17:18:0.310345:10:7:14:26:10:8:14:26 chr19 37441462 . T C 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0135985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.255;QD=16.4543;RBI=0.0620807;REFB=-0.00431173;REVB=0.0605731;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443891;STB=0.768234;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00564935;OID=.;OPOS=37441462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:5:1:3:1:5:1:3:1 chr19 37441980 . A G 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0235567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6592;QD=13.0906;RBI=0.0236723;REFB=-0.00337085;REVB=-0.00233654;RO=20;SAF=2;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340736;STB=0.704761;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00790808;OID=.;OPOS=37441980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:11:2:8:12:11:2:8:12 chr19 37690375 . C T 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=-0.00159498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.154;QD=9.56923;RBI=0.0106139;REFB=-0.00972337;REVB=-0.0104933;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.592465;STB=0.848369;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0109925;OID=.;OPOS=37690375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:6:2:13:2:6:2:13:2 chr19 37690420 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.561;QD=57.2025;RBI=0.051695;REFB=0;REVB=0.0493302;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102273;OID=.;OPOS=37690420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0 chr19 37825633 . A T 324.49 PASS AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00572185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.567;QD=19.6659;RBI=0.019875;REFB=-0.0157904;REVB=-0.0190335;RO=32;SAF=16;SAR=18;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161123;STB=0.589329;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0301872;OID=.;OPOS=37825633;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:18:16:21:11:18:16:21:11 chr19 37854235 . G T 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00626981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.775;QD=16.199;RBI=0.0155047;REFB=-0.0263068;REVB=-0.0141804;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0231068;OID=.;OPOS=37854235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:1:2:3:2:1:2 chr19 38030265 . G A 193.22 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00806493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.033;QD=16.4438;RBI=0.0195076;REFB=-0.00774692;REVB=-0.0177624;RO=27;SAF=13;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137497;STB=0.578984;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0124298;OID=.;OPOS=38030265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:7:13:14:13:7:13:14:13 chr19 38033251 . C T 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00978357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3403;QD=10.2402;RBI=0.0707651;REFB=-0.00519361;REVB=-0.0700855;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143277;STB=0.58604;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00339265;OID=.;OPOS=38033251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:5:5:12:7:5:5:12:7 chr19 38034016 . TTA T,TAA,TTT 92.89 PASS AF=0.517241,0,0;AO=7,6,6;DP=42;FAO=15,0,0;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5,0,0;FSAR=10,0,0;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0568245,0.0333007,-0.0378644;FXX=0.0937207;HRUN=5,5,7;LEN=2,1,1;MLLD=18.4929,15.1205,13.7374;QD=12.8121;RBI=0.0835037,0.0417302,0.045016;REFB=-0.0804469,-0.00941544,0.00354678;REVB=-0.0611869,-0.025149,0.024346;RO=21;SAF=3,6,0;SAR=4,0,6;SRF=7;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.116335,0.756858,-0.669238;STB=0.512803,0.5,0.5;STBP=0.919,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0774042,0,0;OID=.,.,.;OPOS=38034017,38034017,38034018;OREF=TA,T,A;OALT=-,A,T;OMAPALT=T,TAA,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.517241,0,0:7,6,6:42:15,0,0:29:14:5,0,0:10,0,0:5:9:93:21:3,6,0:4,0,6:7:14 chr19 38046967 . G A 80.51 PASS AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.00368836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.698;QD=7.66748;RBI=0.00926582;REFB=-0.00223922;REVB=0.00850008;RO=31;SAF=5;SAR=6;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262511;STB=0.660747;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00773724;OID=.;OPOS=38046967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:6:5:21:10:6:5:21:10 chr19 38055612 . A T 376.46 PASS AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.000491667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.491;QD=18.5905;RBI=0.0477699;REFB=0.000631074;REVB=-0.0477674;RO=41;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000575833;STB=0.506646;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.000870313;OID=.;OPOS=38055612;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:41:42:39:39:0.481481:20:19:20:21:20:19:21:21 chr19 38056574 . T A 458.77 PASS AF=0.564103;AO=42;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0180255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.8981;QD=23.5269;RBI=0.036205;REFB=-0.00289632;REVB=-0.0313988;RO=34;SAF=28;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948942;STB=0.535786;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00210442;OID=.;OPOS=38056574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:42:44:0.564103:14:28:19:15:16:28:19:15 chr19 38091932 . A T 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0283991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.075;QD=18.4831;RBI=0.0397391;REFB=0.00665712;REVB=-0.0277973;RO=21;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09006;STB=0.551127;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.0146227;OID=.;OPOS=38091932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:9:10:9:12:9:10:9:12 chr19 38189440 . T C 267.07 PASS AF=0.528302;AO=27;DP=52;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.000871875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=319.377;QD=20.156;RBI=0.000928888;REFB=-0.0142541;REVB=0.000320417;RO=25;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426759;STB=0.53331;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0120828;OID=.;OPOS=38189440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:25:25:27:28:0.528302:11:16:16:9:12:16:16:9 chr19 38189616 . T C 252.62 PASS AF=0.509434;AO=26;DP=51;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0151578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.074;QD=19.0655;RBI=0.0304085;REFB=-0.00600135;REVB=-0.0263613;RO=25;SAF=16;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121095;STB=0.584464;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0103598;OID=.;OPOS=38189616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:25:26:26:27:0.509434:10:16:12:13:10:17:12:14 chr19 38202516 . A C 191.7 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.69474e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.196;QD=47.924;RBI=0.118977;REFB=0;REVB=0.118977;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174523;OID=.;OPOS=38202516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:16:0:0:14:16:1:12:2:0:0:13:3:0:0 chr19 38230720 . C G 272.77 PASS AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00999439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.06;QD=24.2461;RBI=0.0212893;REFB=-0.00655911;REVB=0.0187975;RO=20;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411624;STB=0.522917;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00724277;OID=.;OPOS=38230720;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:15:10:9:11:15:10:9:11 chr19 38314767 . A G 184.83 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00115152;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.351;QD=12.12;RBI=0.00251576;REFB=-0.00661155;REVB=0.00223676;RO=38;SAF=15;SAR=8;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169511;STB=0.59814;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0099182;OID=.;OPOS=38314767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:8:15:19:19:8:15:19:19 chr19 38376485 . T A 108.03 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0154586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.117;QD=13.0949;RBI=0.0282028;REFB=-0.000570028;REVB=0.0235888;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121279;STB=0.571317;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00204471;OID=.;OPOS=38376485;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:5:8:10:10:5:8:10:10 chr19 38377564 . T C 165.07 PASS AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.023389;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.1558;QD=14.0483;RBI=0.0574086;REFB=-0.023773;REVB=0.0524281;RO=29;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409314;STB=0.523783;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0155872;OID=.;OPOS=38377564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:8:10:15:14:8:10:15:14 chr19 38377773 . G A 225.34 PASS AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0546065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4299;QD=27.3137;RBI=0.0586886;REFB=0.00215323;REVB=-0.0215053;RO=12;SAF=14;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275851;STB=0.652914;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00073407;OID=.;OPOS=38377773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:7:14:3:9:7:14:3:9 chr19 38378107 . G A 115.67 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0148526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0322;QD=11.0157;RBI=0.0165481;REFB=-0.010792;REVB=0.00729661;RO=28;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803216;STB=0.547876;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0206827;OID=.;OPOS=38378107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:6:8:14:14:6:8:14:14 chr19 38378539 . G C 246.69 PASS AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0143389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.024;QD=15.9153;RBI=0.0234476;REFB=-0.00895077;REVB=-0.0185522;RO=33;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777995;STB=0.535689;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0150411;OID=.;OPOS=38378539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:13:15:15:18:13:15:16:18 chr19 38379446 . C T 174.65 PASS AF=0.431818;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0111304;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.922;QD=15.8774;RBI=0.0111309;REFB=-0.0129595;REVB=0.000106361;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159573;STB=0.556567;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0139059;OID=.;OPOS=38379446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:25:18:19:0.431818:10:8:14:9:11:8:13:12 chr19 38382328 . C T 272.85 PASS AF=0.321429;AO=36;DP=111;FAO=36;FDP=112;FR=.;FRO=76;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0108562;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3615;QD=9.74458;RBI=0.0260465;REFB=-0.00348821;REVB=-0.0236762;RO=74;SAF=12;SAR=24;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153906;STB=0.591143;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00688993;OID=.;OPOS=38382328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:74:76:36:36:0.321429:24:12:34:40:24:12:35:41 chr19 38600988 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0544634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1672;QD=14.9786;RBI=0.0751003;REFB=-0.0189033;REVB=-0.0517088;RO=11;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167219;STB=0.59977;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0111872;OID=.;OPOS=38600988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:9:1:2:9:9:1:2:9 chr19 38652993 . C T 296.39 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00163546;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=309.825;QD=49.3981;RBI=0.0425002;REFB=0.0058247;REVB=0.0424687;RO=1;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319244;STB=0.517226;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=5.50125e-05;OID=.;OPOS=38652993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:14:9:0:1:14:9:0:1 chr19 38698997 . G T 109.04 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.407;QD=36.3476;RBI=0.0421609;REFB=0.218288;REVB=0.030044;RO=1;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690901;STB=0.538392;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.0102468;OID=.;OPOS=38698997;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:6:5:0:1:6:5:0:1 chr19 38706989 . G A 127.16 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0131621;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.189;QD=39.1276;RBI=0.0157138;REFB=-0.0638617;REVB=0.00858382;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.000674526;OID=.;OPOS=38706989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:13:1:1:12:12:0.923077:8:4:0:1:8:4:0:1 chr19 38709568 . C T 557.01 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.246;QD=60.2177;RBI=0.0373962;REFB=0;REVB=-0.00367958;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265541;OID=.;OPOS=38709568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chr19 38794895 . T C 269.95 PASS AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.0297248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.663;QD=11.9978;RBI=0.0303709;REFB=-0.00884819;REVB=-0.006231;RO=58;SAF=18;SAR=14;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221346;STB=0.626972;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0177329;OID=.;OPOS=38794895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:14:18:21:37:14:18:21:37 chr19 38795550 . G GAAGAAGGAGAAGGGC 103.15 PASS AF=0.375;AO=11;DP=38;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.017358;FXX=0.135099;HRUN=2;LEN=15;MLLD=303.725;QD=12.8935;RBI=0.0176385;REFB=-0.0235394;REVB=0.00313272;RO=25;SAF=9;SAR=2;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337091;STB=0.539931;STBP=0.771;TYPE=ins;VARB=0.0318837;OID=.;OPOS=38795551;OREF=-;OALT=AAGAAGGAGAAGGGC;OMAPALT=GAAGAAGGAGAAGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:11:38:12:32:20:9:3:14:6:99:25:9:2:20:5 chr19 38798086 . T C 137.93 PASS AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0198871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.477;QD=29.0369;RBI=0.0218315;REFB=-0.0166053;REVB=0.00900651;RO=5;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112433;STB=0.562413;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00665022;OID=.;OPOS=38798086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:6:8:4:1:6:8:4:1 chr19 38800176 . G A 73.05 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0425374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.952;QD=9.13165;RBI=0.0429329;REFB=-0.00202264;REVB=-0.00581381;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15422;STB=0.593569;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00451305;OID=.;OPOS=38800176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:8:14:5:5:8:14 chr19 38847431 . T C 192.98 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00298851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.811;QD=13.7844;RBI=0.0167248;REFB=-0.00248585;REVB=0.0164556;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119227;STB=0.568017;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00373375;OID=.;OPOS=38847431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:12:11:12:21:12:11:12:21 chr19 38852453 . C T 103.82 PASS AF=0.393939;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0124424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.468;QD=12.5848;RBI=0.0126107;REFB=-0.019159;REVB=0.00205327;RO=20;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238155;STB=0.655478;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0375188;OID=.;OPOS=38852453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:33:20:20:12:13:0.393939:9:3:9:11:10:3:9:11 chr19 38853442 . C G 152.89 PASS AF=0.352941;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00525436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8125;QD=11.9912;RBI=0.0803442;REFB=0.000965519;REVB=-0.0801722;RO=32;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171859;STB=0.58814;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=-0.0035827;OID=.;OPOS=38853442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:32:33:18:18:0.352941:9:9:21:11:9:9:21:12 chr19 38876352 . G A 192.92 PASS AF=0.59375;AO=17;DP=31;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00553098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2863;QD=24.1153;RBI=0.07697;REFB=-0.0540075;REVB=0.076771;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064699;STB=0.565146;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0380935;OID=.;OPOS=38876352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:14:13:17:19:0.59375:11:6:6:8:13:6:6:7 chr19 38886225 . C T 49.54 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.114736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.151;QD=15.2416;RBI=0.11478;REFB=-0.0251249;REVB=0.00317488;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414385;STB=0.744007;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0294556;OID=.;OPOS=38886225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:2:5:1:5:2:5:1:5 chr19 38893856 . G C 115.16 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00267656;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.972;QD=10.7126;RBI=0.0302361;REFB=-0.00784031;REVB=-0.0301174;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225815;STB=0.513494;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0257072;OID=.;OPOS=38893856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:6:8:16:13:6:8:16:13 chr19 38912764 . A G 118.32 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=47;FAO=15;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=3.82102e-05;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7732;QD=9.2801;RBI=0.0155821;REFB=-0.00234179;REVB=-0.015582;RO=25;SAF=6;SAR=4;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515768;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0117836;OID=.;OPOS=38912764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:51:25:36:10:15:0.294118:4:6:15:10:8:7:16:20 chr19 38935280 . A G 268.55 PASS AF=0.347826;AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0074271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8399;QD=11.6759;RBI=0.00884888;REFB=-0.0205735;REVB=-0.00481049;RO=60;SAF=16;SAR=16;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564484;STB=0.532588;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0289852;OID=.;OPOS=38935280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:60:60:32:32:0.347826:16:16:33:27:16:16:33:27 chr19 38939408 . T C 727.58 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.869;QD=63.2678;RBI=0.0848135;REFB=0;REVB=0.0840222;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00065012;OID=.;OPOS=38939408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:16:28:0:0:17:29:0:0 chr19 38946182 . G A 937.56 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.837;QD=58.5976;RBI=0.0456199;REFB=0;REVB=0.0429322;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250168;OID=.;OPOS=38946182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:37:27:0:0:37:27:0:0 chr19 38949904 . C T 386.51 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00199815;FXX=0.0333222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.231;QD=53.3113;RBI=0.0156188;REFB=-0.138942;REVB=-0.0154905;RO=1;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216544;STB=0.51162;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.00125417;OID=.;OPOS=38949904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:29:1:1:28:28:0.965517:21:7:0:1:21:7:0:1 chr19 38956803 . G A 1766.74 PASS AF=0.991525;AO=108;DP=110;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0201471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.839;QD=59.8895;RBI=0.0634633;REFB=-0.0614076;REVB=0.0601804;RO=1;SAF=45;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00747538;STB=0.503703;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000645369;OID=.;OPOS=38956803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:110:118:1:1:108:117:0.991525:63:45:0:1:67:50:0:1 chr19 38990456 . C T 45.52 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0950085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2087;QD=26.0086;RBI=0.0952612;REFB=-0.0624193;REVB=-0.00693404;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171372;STB=0.599655;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0263082;OID=.;OPOS=38990456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:4:2:1:0:4:2:1:0 chr19 39367111 . T C 141.01 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0508349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.449;QD=13.4294;RBI=0.109214;REFB=-0.0241575;REVB=-0.0966614;RO=26;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252144;STB=0.646878;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0397601;OID=.;OPOS=39367111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:6:10:10:16:6:10:10:16 chr19 39385531 . CT C,CC 451.82 PASS AF=1,0;AO=11,20;DP=32;FAO=31,0;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217857,3.61719e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.471,174.263;QD=58.2988;RBI=0.12585,0.125223;REFB=0,0;REVB=-0.12395,-0.125223;RO=1;SAF=10,4;SAR=1,16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0428878,-0.101866;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000528411,0;OID=.,.;OPOS=39385532,39385532;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:11,20:32:31,0:31:0:14,0:17,0:0:0:4:1:10,4:1,16:1:0 chr19 39432783 . T C 1070.92 PASS AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000666802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.391;QD=59.4957;RBI=0.00183103;REFB=0;REVB=-0.0017053;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202825;OID=.;OPOS=39432783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:35:36:0:0:35:37:0:0 chr19 39433299 . A G 545.57 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202134;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.917;QD=60.6192;RBI=0.0213534;REFB=0;REVB=-0.00688365;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819781;OID=.;OPOS=39433299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0 chr19 39589189 . C T 518.72 PASS AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0186499;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.828;QD=19.3913;RBI=0.0203834;REFB=-0.0173214;REVB=-0.00822574;RO=53;SAF=32;SAR=22;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109619;STB=0.560594;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0209147;OID=.;OPOS=39589189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:53:53:54:54:0.504673:22:32:25:28:22:32:25:28 chr19 39590955 . G A 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0286672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.854;QD=12.3289;RBI=0.0512612;REFB=-0.0240929;REVB=-0.0424959;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162153;STB=0.596829;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.041778;OID=.;OPOS=39590955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:3:8:10:7:3:8:10:7 chr19 39591919 . C G 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.013848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9224;QD=12.7386;RBI=0.0292056;REFB=-0.0284152;REVB=-0.0257138;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3708;STB=0.728476;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0457056;OID=.;OPOS=39591919;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:7:1:4:6:7:1:4:6 chr19 39592138 . C T 146.85 PASS AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00982722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.816;QD=11.2959;RBI=0.018385;REFB=-0.00830516;REVB=-0.0155381;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140927;STB=0.57383;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0311664;OID=.;OPOS=39592138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:7:11:16:17:7:11:17:17 chr19 39688901 . G T 145.95 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0239891;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.303;QD=23.3523;RBI=0.080983;REFB=-0.0575128;REVB=0.0773484;RO=10;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944299;STB=0.553121;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0182094;OID=.;OPOS=39688901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:25:25:10:10:15:15:0.6:8:7:6:4:8:7:6:4 chr19 39734325 . G A 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0284148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.334;QD=13.5807;RBI=0.0289402;REFB=-0.00831271;REVB=-0.00548944;RO=27;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327102;STB=0.703449;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00843374;OID=.;OPOS=39734325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:28:17:17:0.377778:4:13:13:14:4:13:13:15 chr19 39735106 . T C 61.75 PASS AF=0.272727;AO=8;DP=32;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0151428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8688;QD=7.48446;RBI=0.0324672;REFB=0.00135606;REVB=0.0287196;RO=24;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05323;STB=0.583157;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00313657;OID=.;OPOS=39735106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:32:33:24:24:8:9:0.272727:3:5:16:8:4:5:16:8 chr19 39874383 . TGGGGGC GGGGGCG,TGGGGC,TGGGGCG,TTGGGGC 293.33 PASS AF=0,1,0,0;AO=2,26,3,3;DP=46;FAO=0,47,0,0;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13,0,0;FSAR=0,34,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00718322,0.1981,-0.115972,0.153981;FXX=0;HRUN=2,5,5,5;LEN=7,1,2,1;MLLD=65.8117,8.92427,22.6946,16.8502;QD=24.9639;RBI=0.0630675,0.25356,0.123191,0.218156;REFB=-0.0197325,-0.189841,-0.114049,-0.138508;REVB=-0.0626571,0.158268,0.041552,0.154537;RO=12;SAF=2,0,3,1;SAR=0,26,0,2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.561268,-0.859857,0.637912,-0.184075;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp,snp;VARB=0,0.110039,-0.052151,0;OID=.,.,.,.;OPOS=39874383,39874384,39874388,39874384;OREF=TGGGGGC,G,GC,G;OALT=GGGGGCG,-,CG,T;OMAPALT=GGGGGCG,TGGGGC,TGGGGCG,TTGGGGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:5:46:47:12:0:2,26,3,3:0,47,0,0:0,1,0,0:0,26,0,2:2,0,3,1:6:6:0,34,0,0:0,13,0,0:0:0 chr19 39888511 . G A 82.57 PASS AF=0.423077;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00189607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.647;QD=12.7032;RBI=0.0426672;REFB=-0.031705;REVB=-0.0426251;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306446;STB=0.661345;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0570128;OID=.;OPOS=39888511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:26:26:13:15:10:11:0.423077:3:7:5:8:3:8:7:8 chr19 39891161 . T C 335.53 PASS AF=0.386139;AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=-0.00151882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.094;QD=13.2882;RBI=0.0421526;REFB=-0.0010445;REVB=0.0421252;RO=62;SAF=14;SAR=25;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00485354;STB=0.502761;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00185194;OID=.;OPOS=39891161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:62:62:39:39:0.386139:25:14:22:40:25:14:22:40 chr19 39891219 . C T 315.2 PASS AF=0.364486;AO=39;DP=106;FAO=39;FDP=107;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.00469239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.009;QD=11.7831;RBI=0.00776609;REFB=-0.0116794;REVB=0.00618819;RO=67;SAF=13;SAR=26;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066124;STB=0.534229;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0163609;OID=.;OPOS=39891219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:67:68:39:39:0.364486:26:13:26:41:26:13:26:42 chr19 39913634 . G A 151.2 PASS AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0237545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6641;QD=20.1601;RBI=0.0483293;REFB=-0.0431118;REVB=-0.0420886;RO=13;SAF=2;SAR=14;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392632;STB=0.749625;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0525858;OID=.;OPOS=39913634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:14:16:16:0.533333:14:2:6:7:14:2:7:7 chr19 39914748 . G A 306.44 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.332;QD=53.2944;RBI=0.0540077;REFB=0;REVB=0.00230829;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249616;OID=.;OPOS=39914748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:13:10:0:0 chr19 39915637 . G A 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.039;QD=42.1826;RBI=0.0357063;REFB=0;REVB=0.00404748;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262612;OID=.;OPOS=39915637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr19 39915758 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180185;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.522;QD=46.848;RBI=0.0616465;REFB=0;REVB=0.0589544;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177622;OID=.;OPOS=39915758;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr19 39916110 . GGGA G 513.46 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309632;FXX=0.0850883;HRUN=3;LEN=3;MLLD=179.589;QD=47.7636;RBI=0.0322611;REFB=0;REVB=-0.00905869;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.318824;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.1628e-05;OID=.;OPOS=39916111;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:43:44:43:43:0:21:22:0:0:9:0:21:22:0:0 chr19 39926509 . A C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.895;QD=49.599;RBI=0.0115757;REFB=0;REVB=7.07681e-05;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124091;OID=.;OPOS=39926509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr19 39926521 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.8242;QD=50.412;RBI=0.0105535;REFB=0;REVB=0.00738062;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54201e-06;OID=.;OPOS=39926521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr19 39932023 . T C 611.98 PASS AF=0.508197;AO=62;DP=122;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0111298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.006;QD=20.065;RBI=0.0256167;REFB=-0.0230768;REVB=0.0230726;RO=60;SAF=30;SAR=32;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751656;STB=0.541388;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0141859;OID=.;OPOS=39932023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:60:60:62:62:0.508197:32:30:24:36:32:30:24:36 chr19 39932066 . T C 1376.04 PASS AF=0.967742;AO=91;DP=91;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0240256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.271;QD=59.1847;RBI=0.0417456;REFB=-0.0149577;REVB=0.0341389;RO=0;SAF=38;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519476;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000996376;OID=.;OPOS=39932066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:91:93:0:3:91:90:0.967742:53:38:0:0:53:37:3:0 chr19 39944082 . C T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.872;QD=61.6835;RBI=0.0744952;REFB=0;REVB=0.066552;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634616;OID=.;OPOS=39944082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0 chr19 39948981 . T G 136.15 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0666637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.197;QD=10.4728;RBI=0.0679714;REFB=-0.00662891;REVB=0.0132684;RO=35;SAF=5;SAR=12;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115607;STB=0.506841;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0145513;OID=.;OPOS=39948981;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:12:5:10:25:12:5:10:25 chr19 39955533 . G A 228.74 PASS AF=0.55;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0438988;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.7751;QD=22.8744;RBI=0.050834;REFB=-0.00171278;REVB=0.0256319;RO=15;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381435;STB=0.514838;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00130305;OID=.;OPOS=39955533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:15:18:21:22:0.55:13:8:5:10:14:8:6:12 chr19 39967318 . T C 118.39 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.106192;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.287;QD=20.5893;RBI=0.107342;REFB=-0.0238013;REVB=-0.0156657;RO=10;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283221;STB=0.65607;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0308395;OID=.;OPOS=39967318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:23:23:10:10:13:13:0.565217:11:2:0:10:11:2:0:10 chr19 39967320 . T C 116.2 PASS AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0892882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.824;QD=20.2093;RBI=0.0965927;REFB=-0.0151779;REVB=0.0368477;RO=10;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283221;STB=0.65607;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00663074;OID=.;OPOS=39967320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:11:2:0:10:11:2:0:10 chr19 39967322 . T C 123.0 PASS AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0572596;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0234;QD=24.599;RBI=0.100831;REFB=-0.0612566;REVB=0.0829948;RO=7;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218747;STB=0.620538;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0300564;OID=.;OPOS=39967322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:20:20:7:7:13:13:0.65:11:2:0:7:11:2:0:7 chr19 39991237 . C G 114.35 PASS AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.0146688;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.7743;QD=10.395;RBI=0.0404778;REFB=-0.0249279;REVB=0.0377263;RO=28;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284533;STB=0.658887;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0289857;OID=.;OPOS=39991237;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:30:14:14:0.318182:7:7:7:21:7:7:8:22 chr19 39994711 . T C 728.39 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6348;QD=57.1286;RBI=0.029786;REFB=0;REVB=0.000152741;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103404;OID=.;OPOS=39994711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr19 39996027 . C T 513.65 PASS AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00481327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.589;QD=24.4595;RBI=0.00827162;REFB=-0.00582354;REVB=0.00672697;RO=36;SAF=13;SAR=35;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266366;STB=0.646675;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00184209;OID=.;OPOS=39996027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:35:13:21:15:35:13:21:15 chr19 40009396 . A G 239.41 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0982355;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=68.5958;QD=50.4021;RBI=0.0985549;REFB=0;REVB=-0.00792746;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00173643;OID=.;OPOS=40009396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0 chr19 40023308 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.851;QD=39.2068;RBI=0.0157497;REFB=0;REVB=0.00866651;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015721;OID=.;OPOS=40023308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0 chr19 40030654 . G C 171.21 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0123152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.752;QD=17.5598;RBI=0.0264809;REFB=-0.0163041;REVB=0.0234429;RO=20;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185717;STB=0.589647;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0206572;OID=.;OPOS=40030654;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:21:18:18:0.461538:9:9:6:14:9:9:7:14 chr19 40149297 . T A 941.01 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000852977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8858;QD=57.0307;RBI=0.0362604;REFB=-0.0525708;REVB=0.0362504;RO=1;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119601;STB=0.506327;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00254845;OID=.;OPOS=40149297;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:39:26:0:1:39:26:0:1 chr19 40170053 . G A 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00633893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.049;QD=10.0339;RBI=0.0404933;REFB=-0.0299296;REVB=-0.0399941;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090044;STB=0.555348;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0442042;OID=.;OPOS=40170053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:1:4:6:1:1:4:6:1 chr19 40170103 . A C 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00358138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.4679;QD=14.6525;RBI=0.0302358;REFB=-0.00278507;REVB=0.0300229;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435573;STB=0.526224;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0057205;OID=.;OPOS=40170103;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:4:1:1:5:4:1 chr19 40357683 . T G 377.47 PASS AF=0.541667;AO=36;DP=69;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=-0.00175931;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.221;QD=20.9704;RBI=0.00488938;REFB=-0.0278619;REVB=0.00456189;RO=32;SAF=23;SAR=13;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137353;STB=0.59706;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0236205;OID=.;OPOS=40357683;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:72:32:33:36:39:0.541667:13:23:25:7:16:23:26:7 chr19 40363020 . G A 933.74 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00257449;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.637;QD=58.3587;RBI=0.0812664;REFB=0;REVB=0.0812257;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257948;OID=.;OPOS=40363020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:29:34:0:0:30:34:0:0 chr19 40363926 . C G 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6079;QD=60.9784;RBI=0.0284409;REFB=0;REVB=0.0164249;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441163;OID=.;OPOS=40363926;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0 chr19 40366362 . G C 483.35 PASS AF=1;AO=28;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.784;QD=58.5876;RBI=0.0268676;REFB=0;REVB=0.0230478;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53658e-05;OID=.;OPOS=40366362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:28:33:1:18:10:0:0:18:15:0:0 chr19 40367862 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.715;QD=33.4285;RBI=0.0085;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103064;OID=.;OPOS=40367862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0 chr19 40368395 . C T 756.42 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080831;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.886;QD=57.0882;RBI=0.0313628;REFB=0;REVB=0.0303033;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010227;OID=.;OPOS=40368395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0 chr19 40368498 . AA CC 310.29 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181466;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=2;MLLD=229.877;QD=53.9632;RBI=0.0207227;REFB=0;REVB=0.0100067;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.92149e-05;OID=.;OPOS=40368498;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr19 40368520 . G C 191.27 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0850381;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.301;QD=47.8173;RBI=0.0850618;REFB=0;REVB=-0.00201054;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0030951;OID=.;OPOS=40368520;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0 chr19 40376880 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00574832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0597;QD=45.805;RBI=0.0299483;REFB=0;REVB=-0.0293915;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00137164;OID=.;OPOS=40376880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr19 40582039 . T A 76.67 PASS AF=0.416667;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00157031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.915;QD=12.7781;RBI=0.0177796;REFB=-0.0126325;REVB=0.0177102;RO=14;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206442;STB=0.642516;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0196237;OID=.;OPOS=40582039;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:23:24:14:14:9:10:0.416667:8:1:3:11:9:1:3:11 chr19 40719076 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.188;QD=46.8477;RBI=0.0439483;REFB=0;REVB=-0.0438992;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000589223;OID=.;OPOS=40719076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0 chr19 40739513 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.658;QD=51.1845;RBI=0.0298587;REFB=0;REVB=-0.00394568;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000437557;OID=.;OPOS=40739513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0 chr19 40886756 . G A 162.55 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0211302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.99;QD=19.7024;RBI=0.0241468;REFB=-0.00183703;REVB=-0.0116867;RO=16;SAF=13;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207948;STB=0.618896;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00192002;OID=.;OPOS=40886756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:4:13:9:7:4:13:9:7 chr19 40886993 . C T 83.08 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0169075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.977;QD=9.49535;RBI=0.0176709;REFB=-0.0278494;REVB=0.00513792;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123092;STB=0.559478;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0502672;OID=.;OPOS=40886993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:35:35:23:24:11:11:0.314286:5:6:10:13:5:6:11:13 chr19 40900865 . C T 1116.42 PASS AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0374606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.557;QD=56.5276;RBI=0.043365;REFB=-0.0150625;REVB=0.0218456;RO=2;SAF=32;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392447;STB=0.503419;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.000165831;OID=.;OPOS=40900865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:79:79:2:3:76:76:0.962025:44:32:1:1:44:32:1:2 chr19 41078220 . G C 236.84 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00453299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.273;QD=26.3156;RBI=0.0114504;REFB=-0.0285799;REVB=-0.0105149;RO=14;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999037;STB=0.555504;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0110462;OID=.;OPOS=41078220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:8:14:7:7:8:14:7:7 chr19 41123093 . A AG 237.95 PASS AF=1;AO=22;DP=31;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0722109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.9557;QD=33.9933;RBI=0.107313;REFB=0;REVB=-0.0793836;RO=9;SAF=11;SAR=11;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147036;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00501381;OID=.;OPOS=41123094;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:22:31:28:28:0:12:16:0:0:5:9:11:11:2:7 chr19 41211056 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.76;QD=47.8222;RBI=0.0330773;REFB=0;REVB=-0.00563602;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000486927;OID=.;OPOS=41211056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr19 41289756 . G A 67.08 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.00691813;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.421;QD=12.7763;RBI=0.047464;REFB=-0.0121675;REVB=0.0469571;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204722;STB=0.63134;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0166663;OID=.;OPOS=41289756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:21:21:11:12:9:9:0.428571:2:7:10:1:2:7:11:1 chr19 41350664 . A T 1193.78 PASS AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.130112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.999;QD=59.689;RBI=0.130151;REFB=-0.0904755;REVB=0.00319043;RO=1;SAF=34;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137195;STB=0.507245;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000370935;OID=.;OPOS=41350664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:80:1:1:79:79:0.9875:45:34:1:0:45:34:1:0 chr19 41356281 . T C 1190.16 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.864;QD=61.034;RBI=0.0434273;REFB=0;REVB=-0.00963264;RO=0;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000297237;OID=.;OPOS=41356281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:45:33:0:0:45:33:0:0 chr19 41381647 . A C 83.58 PASS AF=0.26087;AO=8;DP=42;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00229755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.841;QD=7.26762;RBI=0.0261007;REFB=-0.00591673;REVB=0.0259994;RO=32;SAF=6;SAR=2;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34608;STB=0.521703;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0958896;OID=.;OPOS=41381647;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:42:46:32:34:8:12:0.26087:2:6:15:17:6:6:16:18 chr19 41383215 . G C 404.12 PASS AF=0.493976;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0202111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.746;QD=19.4758;RBI=0.0459301;REFB=0.0165506;REVB=-0.0412442;RO=42;SAF=19;SAR=22;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981073;STB=0.554487;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.0181349;OID=.;OPOS=41383215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:42:41:41:0.493976:22:19:24:18:22:19:24:18 chr19 41383799 . G A 622.47 PASS AF=0.534483;AO=62;DP=116;FAO=62;FDP=116;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.00036461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8983;QD=21.4643;RBI=0.0173488;REFB=-0.0189305;REVB=0.017345;RO=53;SAF=30;SAR=32;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531274;STB=0.524728;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0150561;OID=.;OPOS=41383799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:53:54:62:62:0.534483:32:30:29:24:32:30:29:25 chr19 41384675 . T C 660.81 PASS AF=0.503817;AO=66;DP=131;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.0466852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5039;QD=20.1774;RBI=0.0467791;REFB=-0.0133377;REVB=0.00296242;RO=63;SAF=26;SAR=40;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607204;STB=0.534596;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0141505;OID=.;OPOS=41384675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:63:65:66:66:0.503817:40:26:29:34:40:26:30:35 chr19 41386136 . A C 181.28 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0400634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.482;QD=16.4801;RBI=0.0436645;REFB=-0.0256525;REVB=-0.0173639;RO=25;SAF=15;SAR=4;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145755;STB=0.58432;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0432701;OID=.;OPOS=41386136;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:4:15:17:8:4:15:17:8 chr19 41386420 . A C 292.0 PASS AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0360902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5832;QD=21.6297;RBI=0.0650593;REFB=-0.0328351;REVB=-0.0541314;RO=24;SAF=16;SAR=14;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258414;STB=0.642247;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0184187;OID=.;OPOS=41386420;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:14:16:5:19:14:16:5:19 chr19 41386486 . CA AG 242.54 PASS AF=0.430769;AO=27;DP=64;FAO=28;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00430307;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=198.022;QD=14.9255;RBI=0.0296015;REFB=-0.0254782;REVB=-0.0292871;RO=26;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149125;STB=0.502241;STBP=0.993;TYPE=mnp;VARB=0.0319812;OID=.;OPOS=41386486;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:26:37:27:28:0.430769:16:11:15:11:16:12:16:21 chr19 41386494 . A C 253.12 PASS AF=0.432836;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0325377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.964;QD=15.1115;RBI=0.0370481;REFB=-0.0145717;REVB=-0.0177161;RO=37;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189635;STB=0.519481;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0231271;OID=.;OPOS=41386494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:37:38:29:29:0.432836:17:12:16:21:17:12:17:21 chr19 41386527 . G A 263.52 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00157409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.332;QD=17.5676;RBI=0.0115541;REFB=-0.0163522;REVB=-0.0114464;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065637;STB=0.536817;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0216101;OID=.;OPOS=41386527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:17:12:15:16:17:12:15:16 chr19 41387620 . A G 124.92 PASS AF=0.276923;AO=18;DP=65;FAO=18;FDP=65;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00558401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7621;QD=7.68716;RBI=0.0646123;REFB=-0.018913;REVB=-0.0643705;RO=47;SAF=3;SAR=15;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306076;STB=0.689414;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0186293;OID=.;OPOS=41387620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:47:47:18:18:0.276923:15:3:17:30:15:3:17:30 chr19 41387647 . A G 99.23 PASS AF=0.245902;AO=15;DP=61;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.0073294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0936;QD=6.50661;RBI=0.0263734;REFB=-0.000969984;REVB=-0.0253345;RO=46;SAF=4;SAR=11;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116637;STB=0.572815;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00118232;OID=.;OPOS=41387647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:46:46:15:15:0.245902:11:4:16:30:11:4:16:30 chr19 41387656 . A T 101.41 PASS AF=0.254237;AO=15;DP=59;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0128136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.923;QD=6.87495;RBI=0.0208646;REFB=-0.00361444;REVB=-0.0164664;RO=43;SAF=4;SAR=11;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117039;STB=0.584987;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0246822;OID=.;OPOS=41387656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:43:44:15:15:0.254237:11:4:15:28:11:4:16:28 chr19 41404196 . A G 200.94 PASS AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.014552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.666;QD=11.8197;RBI=0.0147986;REFB=-0.00813956;REVB=0.00269016;RO=40;SAF=9;SAR=16;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376423;STB=0.717328;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0149657;OID=.;OPOS=41404196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:43:25:25:0.367647:16:9:29:11:16:9:31:12 chr19 41405962 . T G 286.7 PASS AF=0.577778;AO=22;DP=41;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0448347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.736;QD=25.484;RBI=0.0473251;REFB=-0.0652068;REVB=0.0151497;RO=19;SAF=6;SAR=16;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188126;STB=0.538977;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0420682;OID=.;OPOS=41405962;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:45:19:19:22:26:0.577778:16:6:9:10:16:10:9:10 chr19 41414481 . G A 509.87 PASS AF=0.454545;AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=46;FWDB=-0.00480293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.986;QD=16.8553;RBI=0.00872558;REFB=-0.0216298;REVB=-0.00728475;RO=66;SAF=32;SAR=23;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267833;STB=0.648597;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.038773;OID=.;OPOS=41414481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:66:66:55:55:0.454545:23:32:20:46:23:32:20:46 chr19 41442300 . T C 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0103516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.072;QD=18.2897;RBI=0.015343;REFB=-0.0185765;REVB=-0.0113248;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179268;STB=0.599938;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0263335;OID=.;OPOS=41442300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:14:18:12:21:14:18:12:21 chr19 41512841 . G T 422.32 PASS AF=0.518519;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00114997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.023;QD=20.8553;RBI=0.00807248;REFB=-0.0124148;REVB=-0.00799015;RO=39;SAF=18;SAR=24;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247844;STB=0.636616;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0119251;OID=.;OPOS=41512841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:39:42:42:0.518519:24:18:28:11:24:18:28:11 chr19 41531522 . G T 312.62 PASS AF=0.361111;AO=39;DP=109;FAO=39;FDP=108;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.00962347;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.119;QD=11.5785;RBI=0.0146306;REFB=-0.0161316;REVB=0.0110201;RO=69;SAF=28;SAR=11;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25162;STB=0.645083;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.028254;OID=.;OPOS=41531522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:69:69:39:39:0.361111:11:28:35:34:11:28:35:34 chr19 41531656 . A C 320.08 PASS AF=0.4375;AO=34;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.0142677;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.797;QD=16.0038;RBI=0.018908;REFB=-0.00684724;REVB=-0.0124075;RO=44;SAF=24;SAR=10;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00160878;STB=0.502182;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00969425;OID=.;OPOS=41531656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:44:45:34:35:0.4375:10:24:31:13:10:25:32:13 chr19 41531705 . G A 291.07 PASS AF=0.590909;AO=25;DP=43;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=-0.012224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.709;QD=26.4612;RBI=0.0350716;REFB=-0.0234215;REVB=0.0328724;RO=18;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274455;STB=0.642764;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00422377;OID=.;OPOS=41531705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:18:18:25:26:0.590909:9:16:17:1:9:17:17:1 chr19 41532005 . G A 1026.39 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.912;QD=59.5008;RBI=0.0498212;REFB=0;REVB=0.0271285;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015909;OID=.;OPOS=41532005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:45:24:0:0:45:24:0:0 chr19 41622107 . G GC 92.72 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0481907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.6584;QD=12.3626;RBI=0.0622479;REFB=0.0112313;REVB=-0.0394013;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743153;STB=0.52937;STBP=0.787;TYPE=ins;VARB=-0.0119137;OID=.;OPOS=41622108;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.466667:14:31:14:30:16:8:6:10:6:92:17:8:6:11:6 chr19 41622189 . G A 229.58 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0102461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.932;QD=22.398;RBI=0.0151337;REFB=-0.0249798;REVB=0.0111376;RO=19;SAF=16;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188126;STB=0.605959;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0172397;OID=.;OPOS=41622189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:6:16:10:9:6:16:10:9 chr19 41627868 . G A 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0115991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.016;QD=13.4859;RBI=0.0199007;REFB=-0.0178689;REVB=-0.0161709;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566031;STB=0.533262;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0164991;OID=.;OPOS=41627868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:2:7:9:2:2:7:9:2 chr19 41700493 . G C 411.47 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.843;QD=56.755;RBI=0.0885395;REFB=0;REVB=0.0478936;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329185;OID=.;OPOS=41700493;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:14:14:0:0:14:15:0:0 chr19 41743861 . A G 400.22 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0123642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.566;QD=53.3624;RBI=0.0211252;REFB=-0.00726309;REVB=-0.017129;RO=1;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037234;STB=0.519986;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000241197;OID=.;OPOS=41743861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:12:17:0:1:12:17:0:1 chr19 41748153 . A G 104.61 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00534459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.071;QD=10.461;RBI=0.00881016;REFB=-0.0148889;REVB=-0.00700388;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695362;STB=0.541767;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.028021;OID=.;OPOS=41748153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:5:8:15:12:5:8:15:12 chr19 41869392 . T C 198.05 PASS AF=0.4375;AO=18;DP=45;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=1;FWDB=0.00439323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.096;QD=16.504;RBI=0.019371;REFB=-0.0254405;REVB=0.0188663;RO=27;SAF=16;SAR=2;SRF=26;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243401;STB=0.646953;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0233388;OID=.;OPOS=41869392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:48:27:27:18:21:0.4375:2:16:26:1:3:18:26:1 chr19 41889748 . T C 412.05 PASS AF=0.442308;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=0.0266231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.135;QD=15.8481;RBI=0.0280843;REFB=-0.0151518;REVB=-0.00894111;RO=57;SAF=17;SAR=29;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173019;STB=0.516007;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0247269;OID=.;OPOS=41889748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:57:58:46:46:0.442308:29:17:22:35:29:17:23:35 chr19 41903220 . G A 148.09 PASS AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.000409564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.508;QD=18.5108;RBI=0.0320084;REFB=-0.0303568;REVB=-0.0320058;RO=16;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197718;STB=0.593637;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0217569;OID=.;OPOS=41903220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:16:16:15:16:0.5:7:8:5:11:8:8:5:11 chr19 41930396 . A G 46.67 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0936783;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.763;QD=8.88965;RBI=0.0939761;REFB=-0.00116351;REVB=-0.00747573;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25089;STB=0.651795;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.00468087;OID=.;OPOS=41930396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:21:21:14:14:7:7:0.333333:4:3:3:11:4:3:3:11 chr19 41932084 . G T 37.87 PASS AF=0.4;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00754406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.697;QD=10.0976;RBI=0.00765603;REFB=-0.0286547;REVB=0.00130463;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427406;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0704675;OID=.;OPOS=41932084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:14:15:8:9:6:6:0.4:4:2:3:5:4:2:3:6 chr19 41937095 . G A 293.27 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0164692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.935;QD=23.0011;RBI=0.0219801;REFB=-0.0339183;REVB=-0.0145565;RO=22;SAF=20;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229792;STB=0.627584;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0166684;OID=.;OPOS=41937095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:9:20:9:13:9:20:9:13 chr19 41939297 . C G 151.94 PASS AF=0.369565;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0455593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.423;QD=13.2124;RBI=0.0484431;REFB=-0.0416983;REVB=0.0164647;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194375;STB=0.626792;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.055248;OID=.;OPOS=41939297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:29:29:16:17:0.369565:10:6:16:13:11:6:16:13 chr19 41944237 . T C 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0179927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.489;QD=11.9166;RBI=0.0652484;REFB=-0.00971355;REVB=-0.0627185;RO=37;SAF=6;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222947;STB=0.630012;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0216367;OID=.;OPOS=41944237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:16:6:17:20:16:6:17:20 chr19 41945837 . T A 271.69 PASS AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00494854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.978;QD=20.8995;RBI=0.00506328;REFB=0.0101921;REVB=-0.0010718;RO=24;SAF=10;SAR=18;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604092;STB=0.533513;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.00356046;OID=.;OPOS=41945837;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:18:10:7:17:18:10:7:17 chr19 41949870 . T C 545.71 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00456645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.125;QD=57.4434;RBI=0.00609553;REFB=-0.261829;REVB=0.0040377;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.514278;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00160455;OID=.;OPOS=41949870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:38:0:1:37:37:0.973684:20:17:0:0:20:17:1:0 chr19 42070360 . C T 1080.52 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.691;QD=60.0286;RBI=0.052688;REFB=0;REVB=0.0289209;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289572;OID=.;OPOS=42070360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:27:45:0:0:27:45:0:0 chr19 42070528 . G C 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.516;QD=63.2864;RBI=0.0145859;REFB=0;REVB=0.00761686;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40215e-05;OID=.;OPOS=42070528;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0 chr19 42071289 . T C 1904.96 PASS AF=0.976744;AO=125;DP=131;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00669871;FXX=0.015266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9883;QD=59.0687;RBI=0.0293435;REFB=-0.107651;REVB=0.0285687;RO=2;SAF=75;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186229;STB=0.514283;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00600734;OID=.;OPOS=42071289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:131:129:2:3:125:126:0.976744:50:75:0:2:51:75:0:3 chr19 42083849 . C A 1231.17 PASS AF=0.987805;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.078505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5523;QD=60.0572;RBI=0.0805326;REFB=-0.0951925;REVB=-0.0179574;RO=1;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150268;STB=0.507935;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00190631;OID=.;OPOS=42083849;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:81:82:1:1:80:81:0.987805:31:49:0:1:31:50:0:1 chr19 42085873 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.486;QD=57.0006;RBI=0.0431679;REFB=0;REVB=0.0259859;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113728;OID=.;OPOS=42085873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0 chr19 42132314 . G C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00783217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.639;QD=35.5759;RBI=0.0418917;REFB=0;REVB=0.041153;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376593;OID=.;OPOS=42132314;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr19 42190859 . A T 204.91 PASS AF=0.337662;AO=26;DP=77;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0737741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2513;QD=10.6446;RBI=0.0856427;REFB=-0.0153324;REVB=-0.0434979;RO=51;SAF=13;SAR=13;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557397;STB=0.532443;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0311627;OID=.;OPOS=42190859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:51:51:26:26:0.337662:13:13:28:23:13:13:28:23 chr19 42221607 . A G 761.77 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294893;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.399;QD=56.4271;RBI=0.0309791;REFB=0;REVB=-0.00949145;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213975;OID=.;OPOS=42221607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:25:28:0:0:26:28:0:0 chr19 42260569 . G A 455.53 PASS AF=0.505747;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0573687;FXX=0.0439512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.757;QD=20.9442;RBI=0.0575857;REFB=-0.001005;REVB=0.0049941;RO=42;SAF=19;SAR=25;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00291976;STB=0.505048;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00842124;OID=.;OPOS=42260569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:42:43:44:44:0.505747:25:19:18:24:25:19:19:24 chr19 42265889 . G T 189.18 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00337723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1732;QD=13.047;RBI=0.0190734;REFB=-0.0180903;REVB=-0.018772;RO=33;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983909;STB=0.558231;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0325452;OID=.;OPOS=42265889;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:35:23:23:0.396552:9:14:17:16:9:14:18:17 chr19 42312933 . G A 284.08 PASS AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00468815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.222;QD=15.1507;RBI=0.0853609;REFB=-0.0197442;REVB=0.0852321;RO=43;SAF=13;SAR=19;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845984;STB=0.547892;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0316639;OID=.;OPOS=42312933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:19:13:21:22:19:13:21:22 chr19 42315281 . G T 214.51 PASS AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00528541;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.483;QD=17.1609;RBI=0.0142998;REFB=-0.00305416;REVB=0.0132871;RO=27;SAF=15;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611233;STB=0.534678;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00209845;OID=.;OPOS=42315281;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:27:27:23:23:0.46:8:15:16:11:8:15:16:11 chr19 42342319 . A G 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0123683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.941;QD=11.6342;RBI=0.0268509;REFB=-0.00350267;REVB=0.0238326;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.568998;STB=0.848246;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0166041;OID=.;OPOS=42342319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:9:1:9:7:9:1:9:7 chr19 42354629 . T C 412.62 PASS AF=0.588235;AO=39;DP=67;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0315355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.413;QD=24.2715;RBI=0.031536;REFB=-0.0215397;REVB=-0.000171173;RO=28;SAF=22;SAR=17;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118439;STB=0.569244;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0107596;OID=.;OPOS=42354629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:28:28:39:40:0.588235:17:22:20:8:18:22:20:8 chr19 42392130 . T C 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0123723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.613;QD=19.3436;RBI=0.01584;REFB=-0.0165829;REVB=-0.00989092;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048982;STB=0.527747;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0166974;OID=.;OPOS=42392130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:10:8:9:9:10:8 chr19 42392310 . C T 151.13 PASS AF=0.515152;AO=13;DP=31;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0640006;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.508;QD=18.3187;RBI=0.0682801;REFB=-0.053028;REVB=0.0237926;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00967959;STB=0.521714;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0422805;OID=.;OPOS=42392310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:33:16:16:13:17:0.515152:8:5:6:10:11:6:5:11 chr19 42402680 . CA AC,CAC 31.81 PASS AF=0.0192308,0.0865385;AO=6,15;DP=109;FAO=2,9;FDP=104;FR=.;FRO=93;FSAF=0,6;FSAR=2,3;FSRF=37;FSRR=56;FWDB=-0.0206355,-0.0318207;FXX=0.0095229;HRUN=6,0;LEN=2,1;MLLD=94.8346,85.2623;QD=1.2234;RBI=0.024664,0.0344403;REFB=-0.00540475,-0.00526298;REVB=-0.0135089,-0.0131748;RO=87;SAF=4,9;SAR=2,6;SRF=34;SRR=53;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.275633,0.25754;STB=0.993964,0.73244;STBP=0.218,0.161;TYPE=mnp,ins;VARB=0.118386,0.199615;OID=.,.;OPOS=42402680,42402682;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:23:109:104:87:93:6,15:2,9:0.0192308,0.0865385:2,6:4,9:34:53:2,3:0,6:37:56 chr19 42463447 . C T 125.01 PASS AF=0.348837;AO=14;DP=42;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00434551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.158;QD=11.6292;RBI=0.00532986;REFB=-0.0275971;REVB=0.00308609;RO=28;SAF=3;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318687;STB=0.702997;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0456017;OID=.;OPOS=42463447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:28:28:14:15:0.348837:11:3:13:15:12:3:13:15 chr19 42489516 . A C 972.89 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.733;QD=58.9627;RBI=0.0351278;REFB=0;REVB=0.0259984;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74093e-05;OID=.;OPOS=42489516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0 chr19 42572987 . C T 185.43 PASS AF=0.463415;AO=18;DP=40;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0235603;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.792;QD=18.0905;RBI=0.084601;REFB=-0.0302792;REVB=-0.0812541;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187649;STB=0.5837;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0514496;OID=.;OPOS=42572987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:20:22:18:19:0.463415:8:10:15:5:8:11:16:6 chr19 42736267 . A G 707.89 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.309;QD=62.9238;RBI=0.0518506;REFB=0;REVB=0.00587004;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121509;OID=.;OPOS=42736267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr19 43348671 . C T 397.24 PASS AF=0.410714;AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0356354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5137;QD=14.1871;RBI=0.0438255;REFB=-0.00439395;REVB=0.0255106;RO=66;SAF=21;SAR=25;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927667;STB=0.552303;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00570889;OID=.;OPOS=43348671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:66:66:46:46:0.410714:25:21:36:30:25:21:36:30 chr19 43371292 . A T 99.96 PASS AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.000577395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.133;QD=15.3789;RBI=0.00845731;REFB=-0.0116645;REVB=-0.00843758;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199941;STB=0.615202;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00763608;OID=.;OPOS=43371292;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:4:10:6:6:4:10 chr19 43372386 . T C 914.08 PASS AF=0.476684;AO=92;DP=193;FAO=92;FDP=193;FR=.;FRO=101;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.0192838;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.125;QD=18.9445;RBI=0.0194577;REFB=0.00799328;REVB=0.00259568;RO=101;SAF=51;SAR=41;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844881;STB=0.546644;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.00974762;OID=.;OPOS=43372386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:101:101:92:92:0.476684:41:51:47:54:41:51:47:54 chr19 43372941 . T C 462.2 PASS AF=0.480392;AO=48;DP=101;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=10;FWDB=0.00584324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.187;QD=18.1255;RBI=0.0648659;REFB=-0.00226536;REVB=-0.0646022;RO=53;SAF=37;SAR=11;SRF=43;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560778;STB=0.52752;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00266009;OID=.;OPOS=43372941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:53:53:48:49:0.480392:11:37:43:10:11:38:43:10 chr19 43382174 . C A 480.16 PASS AF=0.434426;AO=53;DP=122;FAO=53;FDP=122;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.00940742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.816;QD=15.743;RBI=0.00967301;REFB=-0.0100434;REVB=-0.00225113;RO=69;SAF=21;SAR=32;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552156;STB=0.530939;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0146492;OID=.;OPOS=43382174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:69:69:53:53:0.434426:32:21:31:38:32:21:31:38 chr19 43382368 . T G 787.45 PASS AF=0.428571;AO=87;DP=203;FAO=87;FDP=203;FR=.;FRO=116;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=69;FWDB=-0.000940476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.888;QD=15.5163;RBI=0.017225;REFB=0.00592301;REVB=-0.0171993;RO=114;SAF=45;SAR=42;SRF=47;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106634;STB=0.563819;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.0142006;OID=.;OPOS=43382368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:114:116:87:87:0.428571:42:45:47:67:42:45:47:69 chr19 43382374 . C G 814.01 PASS AF=0.438424;AO=89;DP=203;FAO=89;FDP=203;FR=.;FRO=114;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=67;FWDB=0.00494958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.064;QD=16.0396;RBI=0.00789897;REFB=-0.0212755;REVB=-0.00615592;RO=114;SAF=43;SAR=46;SRF=47;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718596;STB=0.53994;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0240691;OID=.;OPOS=43382374;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:114:114:89:89:0.438424:46:43:47:67:46:43:47:67 chr19 43383680 . G T 540.1 PASS AF=0.504505;AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0175132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7297;QD=19.4631;RBI=0.0212253;REFB=-0.0160635;REVB=-0.0119917;RO=55;SAF=34;SAR=22;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901306;STB=0.549817;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0166651;OID=.;OPOS=43383680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:55:55:56:56:0.504505:22:34:28:27:22:34:28:27 chr19 43411767 . C T 697.49 PASS AF=0.434286;AO=76;DP=175;FAO=76;FDP=175;FR=.;FRO=99;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=54;FSRR=45;FWDB=0.00521451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.703;QD=15.9426;RBI=0.0544827;REFB=-0.0182849;REVB=-0.0542326;RO=98;SAF=51;SAR=25;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130117;STB=0.576251;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0226006;OID=.;OPOS=43411767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:98:99:76:76:0.434286:25:51:54:44:25:51:54:45 chr19 43420451 . G C 1060.77 PASS AF=0.531579;AO=101;DP=190;FAO=101;FDP=190;FR=.;FRO=89;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=-0.00470448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.672;QD=22.3319;RBI=0.00715137;REFB=-0.0243137;REVB=0.00538609;RO=89;SAF=55;SAR=46;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451279;STB=0.502467;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0211459;OID=.;OPOS=43420451;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:89:89:101:101:0.531579:46:55:48:41:46:55:48:41 chr19 43439793 . G A 2281.68 PASS AF=0.986395;AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=147;FR=.;FRO=2;FSAF=94;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.013176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.733;QD=62.0866;RBI=0.0147945;REFB=0.0423833;REVB=0.00672834;RO=1;SAF=94;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503274;STB=0.502209;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.000275852;OID=.;OPOS=43439793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:147:147:1:2:145:145:0.986395:51:94:1:0:51:94:1:1 chr19 43519362 . C T 2474.88 PASS AF=1;AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.914;QD=61.4876;RBI=0.0114544;REFB=0;REVB=0.00755113;RO=0;SAF=60;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48295e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.86186e-07;OID=.;OPOS=43519362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:161:161:0:0:161:161:1:101:60:0:0:101:60:0:0 chr19 43519442 . T C 1697.33 PASS AF=0.991228;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0160948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.002;QD=59.5555;RBI=0.0375725;REFB=0.0427856;REVB=0.0339507;RO=1;SAF=37;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126587;STB=0.506665;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-2.97441e-05;OID=.;OPOS=43519442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:114:1:1:113:113:0.991228:76:37:1:0:76:37:1:0 chr19 43529026 . CA TG 1227.51 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00841569;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=204.644;QD=61.3756;RBI=0.00846515;REFB=0;REVB=0.000913741;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.36842e-05;OID=.;OPOS=43529026;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0 chr19 43679410 . A G 2622.59 PASS AF=0.994152;AO=169;DP=170;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=93;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00694343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.021;QD=61.3472;RBI=0.0612869;REFB=-0.250626;REVB=0.0608923;RO=1;SAF=93;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622116;STB=0.503225;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000979491;OID=.;OPOS=43679410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:170:171:1:1:169:170:0.994152:76:93:0:1:77:93:0:1 chr19 43680051 . C T 2700.41 PASS AF=0.994286;AO=174;DP=176;FAO=174;FDP=175;FR=.;FRO=1;FSAF=113;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212769;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.868;QD=61.7236;RBI=0.0405796;REFB=0.0341667;REVB=0.0345543;RO=1;SAF=113;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00419412;STB=0.502202;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000116558;OID=.;OPOS=43680051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:176:175:1:1:174:174:0.994286:61:113:1:0:61:113:1:0 chr19 43687589 . G A 557.04 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0128592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6627;QD=57.1325;RBI=0.0645129;REFB=-0.119364;REVB=0.0632183;RO=1;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267628;STB=0.514278;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00424583;OID=.;OPOS=43687589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:17:21:0:1:17:21:0:1 chr19 43687613 . T C,G 644.58 PASS AF=0.931818,0.0454545;AO=40,2;DP=42;FAO=41,2;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22,0;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0213675,0.0157184;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=152.821,108.556;QD=58.5979;RBI=0.056226,0.0190304;REFB=-0.11712,-0.0677077;REVB=0.0520076,0.010728;RO=0;SAF=22,0;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.19993e-08,0;STB=0.512814,0.5;STBP=0.326,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.005137,-0.0376595;OID=.,.;OPOS=43687613,43687613;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:42:44:0:1:40,2:41,2:0.931818,0.0454545:18,2:22,0:0:0:19,2:22,0:0:1 chr19 43690506 . G C 1044.68 PASS AF=0.973333;AO=64;DP=65;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0198909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.389;QD=55.7162;RBI=0.0491078;REFB=-0.0305979;REVB=0.0448991;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502449;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000133256;OID=.;OPOS=43690506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:75:0:2:64:73:0.973333:26:38:0:0:30:43:1:1 chr19 43699336 . T C 2952.43 PASS AF=0.984375;AO=188;DP=191;FAO=189;FDP=192;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0262732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.56;QD=61.5089;RBI=0.0426999;REFB=-0.0721026;REVB=0.03366;RO=2;SAF=65;SAR=123;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00767924;STB=0.505975;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00130465;OID=.;OPOS=43699336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:191:192:2:3:188:189:0.984375:123:65:0:2:124:65:0:3 chr19 43699417 . A G 2963.58 PASS AF=1;AO=182;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00876578;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.365;QD=63.3921;RBI=0.0517751;REFB=0;REVB=0.0510276;RO=0;SAF=62;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186195;OID=.;OPOS=43699417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:185:187:0:0:182:187:1:120:62:0:0:125:62:0:0 chr19 43772270 . G T 2948.99 PASS AF=1;AO=183;DP=188;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402686;FXX=0.00526288;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4329;QD=62.4126;RBI=0.0551425;REFB=-0.0503861;REVB=0.0549953;RO=1;SAF=84;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00563434;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248162;OID=.;OPOS=43772270;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:188:189:1:0:183:189:1:99:84:1:0:105:84:0:0 chr19 43772302 . C T 2445.79 PASS AF=1;AO=156;DP=156;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.725;QD=61.1448;RBI=0.0220268;REFB=0;REVB=0.0217114;RO=0;SAF=55;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109005;OID=.;OPOS=43772302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:156:160:0:0:156:160:1:101:55:0:0:104:56:0:0 chr19 43773599 . T C 1534.04 PASS AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00849543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.07;QD=62.614;RBI=0.0133263;REFB=-0.0961234;REVB=0.0102673;RO=0;SAF=38;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66457e-08;STB=0.506492;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.000598851;OID=.;OPOS=43773599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:98:98:0:1:97:97:0.989796:59:38:0:0:59:38:1:0 chr19 43864548 . C A 503.88 PASS AF=0.509804;AO=52;DP=103;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0286593;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.125;QD=19.7601;RBI=0.0289486;REFB=-0.0194633;REVB=0.00408224;RO=50;SAF=31;SAR=21;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330633;STB=0.518267;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0247384;OID=.;OPOS=43864548;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:50:50:52:52:0.509804:21:31:28:22:21:31:28:22 chr19 43910649 . G T 108.27 PASS AF=0.6;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00410154;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.992;QD=21.6549;RBI=0.0351199;REFB=-0.0101616;REVB=0.0348796;RO=9;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791542;STB=0.56239;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00681044;OID=.;OPOS=43910649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:21:20:9:8:12:12:0.6:9:3:3:6:9:3:3:5 chr19 43910764 . A G 237.41 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.719;QD=49.9816;RBI=0.0199946;REFB=0;REVB=-0.0113672;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584603;OID=.;OPOS=43910764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:4:14:0:0:4:15:0:0 chr19 43922061 . A G 290.64 PASS AF=0.345794;AO=37;DP=107;FAO=37;FDP=107;FR=.;FRO=70;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.00293963;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.724;QD=10.8651;RBI=0.0328912;REFB=0.00482166;REVB=0.0327595;RO=70;SAF=16;SAR=21;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037734;STB=0.521727;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=-0.0121805;OID=.;OPOS=43922061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:70:70:37:37:0.345794:21:16:28:42:21:16:28:42 chr19 43965029 . G A 251.56 PASS AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0228697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5569;QD=20.5356;RBI=0.0235404;REFB=0.0210863;REVB=-0.00557916;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535512;STB=0.530096;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.0215801;OID=.;OPOS=43965029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:11:13:15:10:11:13:15:10 chr19 43979589 . G T 84.34 PASS AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0229809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.129;QD=10.5421;RBI=0.0257583;REFB=-0.02691;REVB=0.0116348;RO=21;SAF=2;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328926;STB=0.701714;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0460449;OID=.;OPOS=43979589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:9:2:9:12:9:2:9:12 chr19 44047550 . T C 375.59 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00292728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1895;QD=55.6433;RBI=0.0529442;REFB=0;REVB=0.0528632;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120423;OID=.;OPOS=44047550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:11:15:0:0:12:15:0:0 chr19 44047826 . T A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.543;QD=58.5878;RBI=0.0500943;REFB=0;REVB=0.0127456;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249402;OID=.;OPOS=44047826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr19 44055726 . T C 306.18 PASS AF=0.551724;AO=26;DP=52;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0403764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.244;QD=21.1159;RBI=0.040468;REFB=-0.0566214;REVB=0.00272148;RO=24;SAF=9;SAR=17;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122157;STB=0.555521;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0384506;OID=.;OPOS=44055726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:58:24:26:26:32:0.551724:17:9:8:16:17:15:9:17 chr19 44081287 . CA C,CG 642.74 PASS AF=0.0232558,0.976744;AO=6,34;DP=43;FAO=1,42;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138653,0.022496;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.993,56.0063;QD=59.7896;RBI=0.0194901,0.0225263;REFB=0,0;REVB=-0.0194407,0.00116812;RO=0;SAF=5,20;SAR=1,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,4.48532e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.150711,-0.000556768;OID=.,.;OPOS=44081288,44081288;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0232558,0.976744:6,34:43:1,42:43:0:1,27:0,15:0:0:5:0:5,20:1,14:0:0 chr19 44082945 . T C 364.81 PASS AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00927284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.159;QD=52.1161;RBI=0.0288231;REFB=0.149924;REVB=0.0272907;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488676;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.00171105;OID=.;OPOS=44082945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:18:9:1:0:18:9:1:0 chr19 44116662 . G A 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.022087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.376;QD=16.3858;RBI=0.0354525;REFB=-0.0287038;REVB=0.0277316;RO=8;SAF=7;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.51159;STB=0.79683;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0106019;OID=.;OPOS=44116662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:2:7:1:7:2:7:1:7 chr19 44118353 . G A 167.79 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00875814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.808;QD=15.6081;RBI=0.032917;REFB=-0.0221788;REVB=-0.0317305;RO=25;SAF=9;SAR=9;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223878;STB=0.627774;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0503876;OID=.;OPOS=44118353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:9:9:18:7:9:9:18:7 chr19 44126738 . G A 444.34 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.072;QD=57.3344;RBI=0.0345456;REFB=0;REVB=0.0197812;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.88484e-05;OID=.;OPOS=44126738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0 chr19 44156472 . T C 161.04 PASS AF=0.485714;AO=14;DP=32;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0456386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.896;QD=18.4044;RBI=0.119935;REFB=-0.0270285;REVB=0.110912;RO=18;SAF=11;SAR=3;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453017;STB=0.659813;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0306365;OID=.;OPOS=44156472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:35:18:18:14:17:0.485714:3:11:6:12:6:11:6:12 chr19 44223113 . G A 839.94 PASS AF=0.518293;AO=84;DP=163;FAO=85;FDP=164;FR=.;FRO=79;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=48;FSRR=31;FWDB=-0.00966672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.11;QD=20.4863;RBI=0.0144473;REFB=-0.0196762;REVB=0.0107369;RO=76;SAF=52;SAR=32;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000575457;STB=0.502112;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0174401;OID=.;OPOS=44223113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:76:79:84:85:0.518293:32:52:47:29:33:52:48:31 chr19 44302624 . T C 147.97 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00359584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.449;QD=17.9362;RBI=0.00673511;REFB=-0.0216198;REVB=0.00569488;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796379;STB=0.545398;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0337648;OID=.;OPOS=44302624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:8:8:7:10:8:8:7:10 chr19 44303066 . C G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.929;QD=49.5992;RBI=0.0729743;REFB=0;REVB=0.0639033;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567393;OID=.;OPOS=44303066;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr19 44351107 . G A 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.000218796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3827;QD=25.7109;RBI=0.0508387;REFB=0.0263192;REVB=-0.0508382;RO=6;SAF=9;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21376;STB=0.620497;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-0.0596608;OID=.;OPOS=44351107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:4:9:2:4:4:9:2:4 chr19 44351166 . GGGAGAT G 82.96 PASS AF=0.35;AO=13;DP=38;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00618861;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=6;MLLD=289.257;QD=8.29557;RBI=0.0212812;REFB=-0.00648653;REVB=-0.0203615;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=13;SSEN=0.621918;SSEP=0;SSSB=0.0644495;STB=0.595609;STBP=0.398;TYPE=del;VARB=0.0163819;OID=.;OPOS=44351167;OREF=GGAGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.35:13:38:14:40:26:8:6:11:15:82:25:7:6:12:13 chr19 44351694 . C T 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00604819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.486;QD=10.6345;RBI=0.0427248;REFB=0.0196749;REVB=-0.0422945;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242792;STB=0.646696;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.0263937;OID=.;OPOS=44351694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:3:5:5:8:3:5:5:8 chr19 44351836 . G A 346.81 PASS AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00903218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.439;QD=22.3751;RBI=0.00932775;REFB=-0.00273902;REVB=0.0023295;RO=27;SAF=11;SAR=24;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173086;STB=0.595772;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0116492;OID=.;OPOS=44351836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:24:11:14:13:24:11:14:13 chr19 44352665 . TG CA 201.54 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00844614;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=311.717;QD=13.8996;RBI=0.0101702;REFB=-0.00743908;REVB=0.00566537;RO=34;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603607;STB=0.534454;STBP=0.674;TYPE=mnp;VARB=0.00973118;OID=.;OPOS=44352665;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:12:12:19:15:12:12:19:15 chr19 44352688 . G A 175.9 PASS AF=0.392157;AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0131239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.789;QD=13.7962;RBI=0.0168494;REFB=-0.00758714;REVB=-0.0105672;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102072;STB=0.540235;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0131496;OID=.;OPOS=44352688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:31:19:20:0.392157:11:8:16:15:11:9:16:15 chr19 44377357 . C T 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00344566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.436;QD=57.6806;RBI=0.0200594;REFB=0;REVB=0.0197613;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37106e-05;OID=.;OPOS=44377357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0 chr19 44417575 . A G 233.47 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0332715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6205;QD=15.0625;RBI=0.0622129;REFB=-0.0157201;REVB=-0.0525685;RO=35;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214936;STB=0.62213;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0188159;OID=.;OPOS=44417575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:9:18:16:19:9:18:16:19 chr19 44418077 . C T 372.73 PASS AF=0.413462;AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=20;FWDB=0.0397481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0755;QD=14.3356;RBI=0.0421758;REFB=-0.0181205;REVB=0.0141027;RO=61;SAF=24;SAR=19;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122488;STB=0.568831;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0218736;OID=.;OPOS=44418077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:61:61:43:43:0.413462:19:24:41:20:19:24:41:20 chr19 44418343 . C T 328.67 PASS AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00203721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.927;QD=18.0095;RBI=0.0023353;REFB=-0.0139624;REVB=-0.00114165;RO=37;SAF=25;SAR=10;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274641;STB=0.661061;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0146038;OID=.;OPOS=44418343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:38:35:35:0.479452:10:25:16:21:10:25:16:22 chr19 44418544 . A G 275.61 PASS AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0163791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1986;QD=18.0728;RBI=0.0164075;REFB=0.0132052;REVB=0.000963854;RO=31;SAF=9;SAR=21;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181704;STB=0.602079;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.0108876;OID=.;OPOS=44418544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:21:9:15:16:21:9:15:16 chr19 44418693 . T C 145.54 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0311262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.453;QD=16.1708;RBI=0.0314094;REFB=-0.00641757;REVB=-0.00420816;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249699;STB=0.642687;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00504426;OID=.;OPOS=44418693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:14:6:9:7:14:6 chr19 44418776 . G A 584.65 PASS AF=0.552381;AO=58;DP=103;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0234582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.626;QD=22.2723;RBI=0.0238981;REFB=-0.0183475;REVB=0.00456428;RO=45;SAF=29;SAR=29;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798708;STB=0.533322;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0175474;OID=.;OPOS=44418776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:45:47:58:58:0.552381:29:29:18:27:29:29:20:27 chr19 44419030 . A G 538.53 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.288;QD=59.8365;RBI=0.00986234;REFB=0;REVB=0.00290921;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01529e-05;OID=.;OPOS=44419030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chr19 44470189 . T A 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.139;QD=61.683;RBI=0.0309597;REFB=0;REVB=0.00777978;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010854;OID=.;OPOS=44470189;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0 chr19 44470420 . T C 656.49 PASS AF=1;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231575;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7558;QD=62.5224;RBI=0.0280702;REFB=0;REVB=0.0158639;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029694;OID=.;OPOS=44470420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0 chr19 44470548 . A G 632.25 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0407;QD=61.6825;RBI=0.0768581;REFB=0;REVB=0.0674638;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000507195;OID=.;OPOS=44470548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0 chr19 44470663 . G C 670.78 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.197;QD=62.3984;RBI=0.0201093;REFB=0;REVB=0.000787468;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81904e-05;OID=.;OPOS=44470663;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:20:22:0:0:20:23:0:0 chr19 44471209 . T A 729.01 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.175;QD=57.1775;RBI=0.00994273;REFB=0;REVB=0.0098223;RO=0;SAF=15;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42809e-05;OID=.;OPOS=44471209;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:36:15:0:0:36:15:0:0 chr19 44471323 . G A 955.79 PASS AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218082;FXX=0.0149231;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.089;QD=57.9268;RBI=0.0315693;REFB=0;REVB=0.0228259;RO=0;SAF=19;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297655;OID=.;OPOS=44471323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:45:19:0:0:47:19:0:0 chr19 44494215 . T C 729.36 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2986;QD=57.205;RBI=0.0652952;REFB=0;REVB=0.0573529;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126826;OID=.;OPOS=44494215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:29:21:0:0:30:21:0:0 chr19 44496070 . A G 893.8 PASS AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0211873;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.295;QD=55.0033;RBI=0.027269;REFB=0.000217693;REVB=0.0171668;RO=2;SAF=27;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423162;STB=0.502241;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=4.77767e-06;OID=.;OPOS=44496070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:36:27:1:1:36:27:1:1 chr19 44500478 . A T 933.8 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.218;QD=58.3626;RBI=0.0412228;REFB=0;REVB=0.0352302;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248346;OID=.;OPOS=44500478;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:37:26:0:0:37:27:0:0 chr19 44500701 . C T 132.41 PASS AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0191693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.932;QD=9.99283;RBI=0.0191744;REFB=-0.0109917;REVB=0.000442953;RO=36;SAF=11;SAR=6;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441854;STB=0.526284;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.018814;OID=.;OPOS=44500701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:6:11:22:14:6:11:22:14 chr19 44500761 . G A 976.14 PASS AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158154;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.484;QD=59.1599;RBI=0.00791315;REFB=0;REVB=-0.0077535;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.99766e-05;OID=.;OPOS=44500761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0 chr19 44501116 . A G 481.47 PASS AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0163922;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=308.82;QD=53.4965;RBI=0.0165296;REFB=-0.044648;REVB=-0.00212669;RO=2;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00231151;OID=.;OPOS=44501116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:17:17:1:1:17:17:1:1 chr19 44501227 . A G 669.98 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2492;QD=62.324;RBI=0.0296359;REFB=0;REVB=-0.0157056;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000683461;OID=.;OPOS=44501227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0 chr19 44501518 . G A 1914.93 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.653;QD=61.7719;RBI=0.0258405;REFB=0;REVB=0.0250114;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22613e-05;OID=.;OPOS=44501518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:74:50:0:0:74:50:0:0 chr19 44511223 . T G 1249.75 PASS AF=0.987952;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.021231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1978;QD=60.2291;RBI=0.0440185;REFB=-0.158745;REVB=0.03856;RO=1;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114095;STB=0.505881;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00113963;OID=.;OPOS=44511223;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:83:1:1:81:82:0.987952:41:40:0:1:42:40:0:1 chr19 44515352 . T G 428.17 PASS AF=0.483146;AO=42;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00797095;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.287;QD=19.2437;RBI=0.0167811;REFB=-0.00535021;REVB=0.0147672;RO=46;SAF=17;SAR=25;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131167;STB=0.575881;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00650292;OID=.;OPOS=44515352;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:46:42:43:0.483146:25:17:25:21:25:18:26:20 chr19 44515514 . C A 258.63 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0467258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0148;QD=14.3682;RBI=0.0529674;REFB=-0.0113218;REVB=0.0249448;RO=41;SAF=12;SAR=18;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103736;STB=0.51162;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0176631;OID=.;OPOS=44515514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:41:42:30:30:0.416667:18:12:16:25:18:12:16:26 chr19 44564981 . G A 579.75 PASS AF=0.56383;AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.014163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.828;QD=24.6701;RBI=0.0198335;REFB=-0.0233795;REVB=-0.0138844;RO=41;SAF=22;SAR=31;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817235;STB=0.544675;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0149079;OID=.;OPOS=44564981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:41:41:53:53:0.56383:31:22:13:28:31:22:13:28 chr19 44570551 . G A 184.22 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0235685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.269;QD=25.4096;RBI=0.0236054;REFB=-0.0447203;REVB=0.0013206;RO=10;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951104;STB=0.566857;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0470765;OID=.;OPOS=44570551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:29:29:10:11:18:18:0.62069:8:10:7:3:8:10:8:3 chr19 44591360 . G A 293.27 PASS AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00217709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.606;QD=23.0013;RBI=0.0285198;REFB=-0.00670625;REVB=0.0284365;RO=22;SAF=10;SAR=19;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542831;STB=0.530082;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00705435;OID=.;OPOS=44591360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:19:10:9:13:19:10:9:13 chr19 44610665 . A G 654.94 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377416;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.487;QD=62.3756;RBI=0.0417029;REFB=0;REVB=0.0177399;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126651;OID=.;OPOS=44610665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0 chr19 44610798 . A T 923.21 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373174;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.892;QD=58.6167;RBI=0.0501412;REFB=0;REVB=0.0334897;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135179;OID=.;OPOS=44610798;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0 chr19 44611066 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.297;QD=62.6709;RBI=0.0479013;REFB=0;REVB=0.0478203;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223137;OID=.;OPOS=44611066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chr19 44611420 . A G 545.23 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00949617;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.163;QD=57.3921;RBI=0.0109144;REFB=-0.0761553;REVB=0.00538034;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000310179;OID=.;OPOS=44611420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:20:17:0:1:20:17:0:1 chr19 44612005 . A G 795.4 PASS AF=0.983051;AO=53;DP=54;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.784;QD=53.9255;RBI=0.0220315;REFB=0.0102579;REVB=0.00575733;RO=1;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149574;STB=0.507934;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000919395;OID=.;OPOS=44612005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:59:1:1:53:58:0.983051:31:22:0:1:31:27:0:1 chr19 44612014 . A T 885.45 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.87;QD=58.0621;RBI=0.0723158;REFB=0;REVB=-0.00143604;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48563e-05;OID=.;OPOS=44612014;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:33:27:0:0:33:28:0:0 chr19 44612231 . A G 727.58 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00860725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.062;QD=63.2682;RBI=0.0440683;REFB=0;REVB=0.0432196;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213494;OID=.;OPOS=44612231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0 chr19 44636575 . A G 284.58 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00386497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1943;QD=17.7864;RBI=0.106086;REFB=-3.62262e-05;REVB=-0.106016;RO=33;SAF=19;SAR=12;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174868;STB=0.597906;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00230928;OID=.;OPOS=44636575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:12:19:14:19:12:19:14:19 chr19 44652954 . G A 594.79 PASS AF=0.459259;AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.00829171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.896;QD=17.6234;RBI=0.0191687;REFB=-0.026844;REVB=0.0172826;RO=73;SAF=30;SAR=32;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903025;STB=0.50502;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.032778;OID=.;OPOS=44652954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:73:73:62:62:0.459259:32:30:36:37:32:30:36:37 chr19 44660967 . A G 76.56 PASS AF=0.434783;AO=9;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0367426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5494;QD=13.3145;RBI=0.0423242;REFB=-0.02787;REVB=-0.0210076;RO=13;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521077;STB=0.8268;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0312047;OID=.;OPOS=44660967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:22:23:13:13:9:10:0.434783:8:1:7:6:9:1:7:6 chr19 44721699 . C T 486.15 PASS AF=0.5;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00449682;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.687;QD=19.4462;RBI=0.00634695;REFB=-0.0144777;REVB=0.00447911;RO=51;SAF=20;SAR=30;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101793;STB=0.551;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0159616;OID=.;OPOS=44721699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:51:50:50:50:0.5:30:20:26:25:30:20:25:25 chr19 44739303 . T C 45.05 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.026518;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.528;QD=20.0242;RBI=0.0272111;REFB=-0.00892087;REVB=0.00610226;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297985;STB=0.713466;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0027708;OID=.;OPOS=44739303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:10:9:4:3:6:6:0.666667:5:1:2:2:5:1:2:1 chr19 44739399 . T C 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0114493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.321;QD=14.6539;RBI=0.0142725;REFB=-0.0139208;REVB=0.00852169;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128818;STB=0.576719;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0138593;OID=.;OPOS=44739399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:6:2:3:5:6:2:3:5 chr19 44764064 . A G 1822.41 PASS AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0793;QD=61.2575;RBI=0.043891;REFB=0;REVB=-0.00354406;RO=0;SAF=63;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000245516;OID=.;OPOS=44764064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:55:63:0:0:55:64:0:0 chr19 44778405 . A C 362.14 PASS AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573607;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.405;QD=55.7134;RBI=0.0683764;REFB=0;REVB=0.0372167;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103393;OID=.;OPOS=44778405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0 chr19 44778797 . T A 43.62 PASS AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0371794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.873;QD=6.01615;RBI=0.0390136;REFB=-0.0031398;REVB=-0.0118216;RO=22;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307537;STB=0.519943;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0214003;OID=.;OPOS=44778797;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:4:3:10:12:4:3:10:12 chr19 44778799 . G A 43.5 PASS AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0305843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7314;QD=6.21414;RBI=0.0309362;REFB=-0.0134023;REVB=-0.0046528;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0587605;OID=.;OPOS=44778799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:4:3:9:12:4:3:9:12 chr19 44792701 . T G 225.54 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0388675;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1614;QD=19.6119;RBI=0.0675712;REFB=0.001994;REVB=0.0552737;RO=24;SAF=17;SAR=5;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171725;STB=0.597894;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.000414978;OID=.;OPOS=44792701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:24:24:22:22:0.478261:5:17:15:9:5:17:15:9 chr19 44792969 . G A 207.1 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8839;QD=48.73;RBI=0.0464724;REFB=0;REVB=-0.0413608;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210638;OID=.;OPOS=44792969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr19 44832684 . T G 1170.94 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.383;QD=60.828;RBI=0.0285916;REFB=0;REVB=-0.0052921;RO=0;SAF=26;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76817e-05;OID=.;OPOS=44832684;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:51:26:0:0:51:26:0:0 chr19 44832875 . A G 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00507481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.389;QD=57.3857;RBI=0.00678667;REFB=0;REVB=0.00450613;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15022e-05;OID=.;OPOS=44832875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0 chr19 44832992 . C G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8119;QD=63.582;RBI=0.0235954;REFB=0;REVB=0.0199387;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000434407;OID=.;OPOS=44832992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0 chr19 44833506 . C T 1340.75 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0322827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0534;QD=60.9432;RBI=0.0323319;REFB=-0.0303283;REVB=-0.00178295;RO=1;SAF=42;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111481;STB=0.505881;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00200922;OID=.;OPOS=44833506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:1:1:87:87:0.988636:45:42:1:0:45:42:1:0 chr19 44833851 . G C 879.44 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0015097;FXX=0.0476115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.142;QD=58.6293;RBI=0.0559628;REFB=0;REVB=0.0559424;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484565;OID=.;OPOS=44833851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0 chr19 44840789 . T C 1607.33 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.662;QD=64.2934;RBI=0.0327702;REFB=0;REVB=0.0280161;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52526e-05;OID=.;OPOS=44840789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:46:53:0:0:47:53:0:0 chr19 44871293 . T C 322.36 PASS AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.00107905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0704;QD=16.5311;RBI=0.00686353;REFB=-0.0184194;REVB=-0.00677818;RO=43;SAF=20;SAR=15;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571379;STB=0.532057;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0269992;OID=.;OPOS=44871293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:15:20:27:16:15:20:27:16 chr19 44890697 . A G 255.17 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0161718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.093;QD=22.1888;RBI=0.0226022;REFB=0.0104773;REVB=0.0157902;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223687;STB=0.624898;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0153529;OID=.;OPOS=44890697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:14:10:15:7:14:10:15:7 chr19 44891784 . T C 771.53 PASS AF=1;AO=47;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.79;QD=62.9817;RBI=0.0228273;REFB=0;REVB=0.0200206;RO=0;SAF=35;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.88699e-05;OID=.;OPOS=44891784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:47:49:1:12:35:0:0:14:35:0:0 chr19 44930880 . G A 740.76 PASS AF=0.356863;AO=89;DP=255;FAO=91;FDP=255;FR=.;FRO=164;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=58;FSRR=106;FWDB=-0.0162861;FXX=0.0039061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9561;QD=11.6198;RBI=0.0188891;REFB=-0.0103291;REVB=-0.00956882;RO=163;SAF=46;SAR=43;SRF=57;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189777;STB=0.610737;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0162431;OID=.;OPOS=44930880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:163:164:89:91:0.356863:43:46:57:106:43:48:58:106 chr19 44934489 . G A 372.51 PASS AF=0.413462;AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.0130574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2663;QD=14.3274;RBI=0.070981;REFB=-0.0186798;REVB=0.0697697;RO=60;SAF=17;SAR=26;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581699;STB=0.528637;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0278181;OID=.;OPOS=44934489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:60:61:43:43:0.413462:26:17:27:33:26:17:27:34 chr19 44981318 . G A 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0560503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.443;QD=8.81111;RBI=0.0562857;REFB=0.00332781;REVB=0.005143;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272391;STB=0.675005;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=-0.00556472;OID=.;OPOS=44981318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:4:7:5:1:4:7 chr19 44981516 . C T 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0335354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3731;QD=19.1795;RBI=0.0343638;REFB=-0.0360676;REVB=-0.00750003;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201895;STB=0.615207;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0235705;OID=.;OPOS=44981516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:5:8:4:7:5:8:4:7 chr19 44981525 . G A 76.55 PASS AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0744418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9217;QD=12.758;RBI=0.108232;REFB=-0.0431117;REVB=0.0785665;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703453;STB=0.541584;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0626962;OID=.;OPOS=44981525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:8:6:5:5:8:6 chr19 44981883 . C G 973.51 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.996;QD=59.0007;RBI=0.0268254;REFB=0;REVB=0.0233998;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71487e-05;OID=.;OPOS=44981883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:36:29:0:0:37:29:0:0 chr19 44983567 . C G 1877.83 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.918;QD=61.5682;RBI=0.00223593;REFB=0;REVB=0.000240892;RO=0;SAF=65;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45572e-06;OID=.;OPOS=44983567;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:57:65:0:0:57:65:0:0 chr19 45001346 . G A 375.46 PASS AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0361612;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2234;QD=20.8586;RBI=0.0667738;REFB=-0.0180992;REVB=-0.0561347;RO=34;SAF=19;SAR=19;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501854;STB=0.527763;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.026799;OID=.;OPOS=45001346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:19:19:19:15:19:19:19:15 chr19 45016990 . CT C 1951.13 PASS AF=1;AO=157;DP=165;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014754;FXX=0.0240949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.8513;QD=48.176;RBI=0.100781;REFB=0;REVB=0.0996957;RO=1;SAF=71;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00550025;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000915485;OID=.;OPOS=45016991;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:157:165:162:162:0:74:88:0:0:35:1:71:86:0:1 chr19 45024581 . C G 373.47 PASS AF=0.542857;AO=39;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=-0.0467587;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6952;QD=21.3409;RBI=0.0468637;REFB=0.00534266;REVB=-0.00313522;RO=30;SAF=27;SAR=12;SRF=27;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212127;STB=0.628514;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.0114434;OID=.;OPOS=45024581;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:32:39:38:0.542857:12:27:27:3:12:26:29:3 chr19 45028169 . C T 374.4 PASS AF=0.416667;AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00326732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9572;QD=15.6;RBI=0.0148321;REFB=0.0129373;REVB=-0.0144678;RO=54;SAF=14;SAR=26;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10189;STB=0.559572;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.0223685;OID=.;OPOS=45028169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:54:56:40:40:0.416667:26:14:24:30:26:14:25:31 chr19 45050756 . T C 310.23 PASS AF=0.542373;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00331155;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.642;QD=21.0325;RBI=0.00396364;REFB=-0.0106315;REVB=0.00217808;RO=27;SAF=20;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18173;STB=0.600795;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0108793;OID=.;OPOS=45050756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:27:27:32:32:0.542373:12:20:11:16:12:20:11:16 chr19 45153329 . G A 183.54 PASS AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0136153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.83;QD=11.8414;RBI=0.0310034;REFB=-0.00516091;REVB=0.0278538;RO=39;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112693;STB=0.565161;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0101705;OID=.;OPOS=45153329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:10:13:18:21:10:13:18:21 chr19 45162038 . A G 841.86 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0145;QD=57.0749;RBI=0.0655845;REFB=0;REVB=0.064084;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184944;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000601679;OID=.;OPOS=45162038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:1:0:58:59:1:25:33:0:1:26:33:0:0 chr19 45296832 . A G 196.74 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00483526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.496;QD=18.3009;RBI=0.00564683;REFB=-0.0201129;REVB=0.00291666;RO=23;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126472;STB=0.572053;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0199378;OID=.;OPOS=45296832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:13:7:11:12:13:7:11:12 chr19 45296846 . A AC 68.63 PASS AF=0.382353;AO=12;DP=37;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0417627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.2129;QD=8.07394;RBI=0.158788;REFB=-0.0159533;REVB=0.153197;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046246;STB=0.538402;STBP=0.769;TYPE=ins;VARB=0.0530489;OID=.;OPOS=45296847;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.382353:12:37:13:34:21:6:7:11:10:68:24:6:6:13:11 chr19 45297454 . A C 35.82 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00115206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.138;QD=7.54182;RBI=0.033365;REFB=-0.025298;REVB=0.0333451;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373394;STB=0.732613;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0722912;OID=.;OPOS=45297454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:19:19:13:13:6:6:0.315789:4:2:9:4:4:2:9:4 chr19 45315539 . G A 91.18 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0251373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.1425;QD=17.3679;RBI=0.0344983;REFB=-0.0191592;REVB=-0.0236273;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236841;STB=0.613825;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0364815;OID=.;OPOS=45315539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:9:10:11:11:0.52381:4:7:3:6:4:7:4:6 chr19 45389224 . A G 340.25 PASS AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0473327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.629;QD=48.6064;RBI=0.047744;REFB=-0.0347692;REVB=-0.00625345;RO=2;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464325;STB=0.524981;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.000785327;OID=.;OPOS=45389224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:19:7:0:2:19:7:0:2 chr19 45395714 . T C 218.04 PASS AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0493518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.928;QD=15.5742;RBI=0.0493817;REFB=0.0204567;REVB=-0.00171813;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221069;STB=0.624185;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.0250568;OID=.;OPOS=45395714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:13:12:8:23:13:12:8:23 chr19 45409167 . C G 57.9 PASS AF=0.4;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0166199;FXX=0.0475964;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.02;QD=11.5805;RBI=0.0166199;REFB=-0.0233928;REVB=0;RO=12;SAF=8;SAR=0;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0389462;OID=.;OPOS=45409167;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:21:20:12:12:8:8:0.4:0:8:12:0:0:8:12:0 chr19 45412079 . C T 62.69 PASS AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0688728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.806;QD=20.8978;RBI=0.0689492;REFB=0.0110515;REVB=-0.00324439;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467971;STB=0.776952;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00179153;OID=.;OPOS=45412079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:7:1:3:1:7:1:3:1 chr19 45448036 . T C 390.15 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00446458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.725;QD=55.7354;RBI=0.0111179;REFB=0;REVB=-0.0101821;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82985e-06;OID=.;OPOS=45448036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:14:13:0:0:15:13:0:0 chr19 45448465 . T G 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0424339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.397;QD=16.3859;RBI=0.0440502;REFB=-0.00486128;REVB=0.0118231;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144653;STB=0.58423;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00587492;OID=.;OPOS=45448465;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:5:3:5:4:5:3 chr19 45476422 . T C 1150.63 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.596;QD=59.7732;RBI=0.0348068;REFB=0;REVB=0.00936347;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012891;OID=.;OPOS=45476422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:77:0:0:71:77:1:32:39:0:0:34:43:0:0 chr19 45488567 . T C 241.46 PASS AF=1;AO=13;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.445;QD=48.2927;RBI=0.0405037;REFB=0;REVB=0.03547;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119914;OID=.;OPOS=45488567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:13:20:1:8:5:0:0:14:6:0:0 chr19 45490636 . T C 247.43 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.253;QD=49.4865;RBI=0.105765;REFB=0;REVB=0.104908;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0054602;OID=.;OPOS=45490636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:10:9:0:0:11:9:0:0 chr19 45561063 . A G 900.87 PASS AF=0.955224;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00169283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.5947;QD=53.7832;RBI=0.0329933;REFB=0.0364277;REVB=-0.0329498;RO=2;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314596;STB=0.509626;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=-0.00545866;OID=.;OPOS=45561063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:67:67:2:3:64:64:0.955224:29:35:0:2:29:35:1:2 chr19 45648408 . CTTCG CAGTC,CTCG 845.9 PASS AF=0.0972222,0.902778;AO=5,14;DP=72;FAO=7,65;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=7,27;FSAR=0,38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.163841,-0.218794;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,1;MLLD=129.547,18.4867;QD=46.9946;RBI=0.16534,0.74259;REFB=-0.0128787,-0.0185656;REVB=0.022214,0.709626;RO=31;SAF=5,10;SAR=0,4;SRF=1;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0.458333;SSSB=0.860923,0.686449;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.126473,0.0429813;OID=.,.;OPOS=45648409,45648409;OREF=TTCG,T;OALT=AGTC,-;OMAPALT=CAGTC,CTCG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0972222,0.902778:5,14:72:7,65:72:0:7,27:0,38:0:0:26:31:5,10:0,4:1:30 chr19 45728059 . T C 56.28 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0714473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8164;QD=11.257;RBI=0.0770706;REFB=0.00665626;REVB=-0.0288992;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340422;STB=0.699579;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.0217714;OID=.;OPOS=45728059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:10:2:4:4:10:2 chr19 45728123 . C T 66.81 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.000139284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.515;QD=12.7263;RBI=0.0214197;REFB=-0.0395831;REVB=-0.0214192;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197653;STB=0.615159;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0386102;OID=.;OPOS=45728123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:10:2:3:6:10:2 chr19 45801018 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7564;QD=42.1826;RBI=0.00724239;REFB=0;REVB=0.00187618;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482711;OID=.;OPOS=45801018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0 chr19 45868309 . T G 95.99 PASS AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0190797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.624;QD=22.5852;RBI=0.0507734;REFB=-0.0293417;REVB=0.0470521;RO=6;SAF=10;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207895;STB=0.615214;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0117418;OID=.;OPOS=45868309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:1:10:6:0:1:10:6:0 chr19 45882962 . T A 175.07 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0321056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3328;QD=20.0075;RBI=0.0376069;REFB=-0.00490654;REVB=-0.0195834;RO=17;SAF=13;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173039;STB=0.509793;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00821728;OID=.;OPOS=45882962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:5:13:12:5:5:13:12:5 chr19 45909934 . G A 108.19 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00411971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.732;QD=13.9594;RBI=0.0121527;REFB=-0.00900755;REVB=0.0114331;RO=15;SAF=11;SAR=2;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763811;STB=0.615799;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.025212;OID=.;OPOS=45909934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:15:18:13:13:0.419355:2:11:12:3:2:11:13:5 chr19 45910003 . G T 183.69 PASS AF=0.44186;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0393714;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0811;QD=17.0877;RBI=0.0437871;REFB=-0.032389;REVB=-0.0191625;RO=23;SAF=13;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806656;STB=0.53715;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0755834;OID=.;OPOS=45910003;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:43:23:24:19:19:0.44186:6:13:14:9:6:13:15:9 chr19 45912002 . A C 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00276047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=421.277;QD=12.0157;RBI=0.00311626;REFB=-0.00989659;REVB=-0.00144599;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215036;STB=0.631131;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0119015;OID=.;OPOS=45912002;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:4:3:4:2:4:3 chr19 45912343 . A G 385.14 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00281225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.236;QD=20.5405;RBI=0.0190341;REFB=-0.00418539;REVB=-0.0188252;RO=36;SAF=24;SAR=15;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196773;STB=0.608997;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00366023;OID=.;OPOS=45912343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:15:24:14:22:15:24:14:22 chr19 45912406 . G A 283.42 PASS AF=0.557692;AO=27;DP=50;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0203032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.149;QD=21.8014;RBI=0.0203783;REFB=-0.0127108;REVB=0.00174779;RO=23;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147912;STB=0.565174;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0124964;OID=.;OPOS=45912406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:23:23:27:29:0.557692:14:13:7:16:16:13:7:16 chr19 45923653 . A G 372.92 PASS AF=0.464286;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0285366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.275;QD=17.7581;RBI=0.0305131;REFB=-0.0321112;REVB=0.0108032;RO=45;SAF=15;SAR=24;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206294;STB=0.615325;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.01992;OID=.;OPOS=45923653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:39:39:0.464286:24:15:27:18:24:15:27:18 chr19 46026970 . T A 728.94 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2847;QD=57.1718;RBI=0.0534897;REFB=0;REVB=-0.00806642;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00053412;OID=.;OPOS=46026970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0 chr19 46029187 . T C 710.57 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00370066;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.55;QD=54.6589;RBI=0.0540186;REFB=-0.084724;REVB=-0.0538917;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=5.81817e-05;OID=.;OPOS=46029187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:27:24:0:0:27:24:0:1 chr19 46029981 . T C 2270.96 PASS AF=1;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00663402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.017;QD=63.5235;RBI=0.00729857;REFB=0;REVB=-0.00304284;RO=0;SAF=71;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12165e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66396e-05;OID=.;OPOS=46029981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:143:0:0:143:143:1:72:71:0:0:72:71:0:0 chr19 46057081 . A G 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.724;QD=54.5176;RBI=0.0253;REFB=0;REVB=0.0189939;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461929;OID=.;OPOS=46057081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr19 46094597 . G A 156.27 PASS AF=0.5;AO=15;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00604558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.302;QD=18.3844;RBI=0.0244173;REFB=-0.014326;REVB=0.023657;RO=17;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202191;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0116124;OID=.;OPOS=46094597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:17:17:15:17:0.5:5:10:11:6:6:11:11:6 chr19 46095651 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.75;QD=53.9109;RBI=0.0193294;REFB=0;REVB=0.00402258;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194427;OID=.;OPOS=46095651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr19 46154806 . T C 68.3 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0158575;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.886;QD=13.0094;RBI=0.0175645;REFB=-0.0216669;REVB=0.00755308;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436487;STB=0.760275;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.068332;OID=.;OPOS=46154806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:22:21:12:12:9:9:0.428571:2:7:4:8:2:7:4:8 chr19 46154820 . G A 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0343504;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.2224;QD=11.8301;RBI=0.05949;REFB=-0.0193851;REVB=-0.0485706;RO=18;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451626;STB=0.766009;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0291577;OID=.;OPOS=46154820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:3:8:5:13:3:8:5:13 chr19 46154902 . G GC 103.76 PASS AF=0.372549;AO=17;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0270529;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=159.872;QD=8.13834;RBI=0.0302202;REFB=-0.0121905;REVB=0.0134685;RO=32;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102053;STB=0.541622;STBP=0.647;TYPE=ins;VARB=0.00781984;OID=.;OPOS=46154903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.372549:17:51:19:51:32:6:13:12:20:99:32:5:12:12:20 chr19 46154906 . C CT 116.98 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00471408;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=331.935;QD=10.398;RBI=0.00565433;REFB=0.00245993;REVB=0.00312231;RO=32;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713451;STB=0.544455;STBP=0.621;TYPE=ins;VARB=-0.00302282;OID=.;OPOS=46154907;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.422222:19:51:19:45:26:6:13:10:16:99:32:6:13:12:20 chr19 46206262 . G A 220.15 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00497264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.768;QD=17.6118;RBI=0.00541916;REFB=-0.0162327;REVB=-0.00215411;RO=28;SAF=7;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154193;STB=0.588152;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0205067;OID=.;OPOS=46206262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:15:7:13:15:15:7:13:15 chr19 46262286 . C A 52.53 PASS AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00446042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9541;QD=7.00375;RBI=0.0305837;REFB=-0.0262017;REVB=-0.0302567;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721645;STB=0.545344;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0663853;OID=.;OPOS=46262286;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:5:3:7:15:5:3:7:15 chr19 46269076 . G A 135.95 PASS AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00539023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.87;QD=17.5415;RBI=0.013781;REFB=-0.0221249;REVB=0.0126832;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254966;STB=0.645381;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0143691;OID=.;OPOS=46269076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:11:5:9:6:11:5 chr19 46269313 . G C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751243;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.221;QD=33.4285;RBI=0.0758469;REFB=0;REVB=0.0104442;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00274461;OID=.;OPOS=46269313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr19 46289392 . G C 340.0 PASS AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00987132;FXX=0.0344709;HRUN=8;LEN=1;MLLD=250.86;QD=48.5713;RBI=0.0104373;REFB=-0.169723;REVB=-0.00339016;RO=1;SAF=20;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226687;STB=0.523792;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000965547;OID=.;OPOS=46289392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:28:28:1:2:26:26:0.928571:6:20:1:0:6:20:2:0 chr19 46289503 . C T 251.17 PASS AF=0.531915;AO=16;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0845843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1211;QD=21.3761;RBI=0.0946201;REFB=-0.0649487;REVB=0.0424084;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324922;STB=0.611677;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0575465;OID=.;OPOS=46289503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:22:16:25:0.531915:10:6:15:6:14:11:15:7 chr19 46289504 . G T 50.46 PASS AF=0.173913;AO=7;DP=44;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.000407596;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=1;MLLD=75.8268;QD=4.38812;RBI=0.00145059;REFB=-0.0603728;REVB=0.00139215;RO=36;SAF=5;SAR=2;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202526;STB=0.561641;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0223541;OID=.;OPOS=46289504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:44:46:36:38:7:8:0.173913:2:5:20:16:3:5:21:17 chr19 46318286 . G A 448.9 PASS AF=0.462264;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0334823;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3915;QD=16.9397;RBI=0.0690114;REFB=-0.0418423;REVB=0.0603449;RO=54;SAF=25;SAR=24;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793981;STB=0.557241;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0739052;OID=.;OPOS=46318286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:54:57:49:49:0.462264:24:25:23:31:24:25:23:34 chr19 46319415 . G C 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.014811;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=338.588;QD=26.0262;RBI=0.0500477;REFB=-0.00839748;REVB=0.047806;RO=1;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789211;STB=0.54531;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00158289;OID=.;OPOS=46319415;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:1:5:1:0:1:5:1:0 chr19 46345670 . G A 221.97 PASS AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00553509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.77;QD=25.3677;RBI=0.00568809;REFB=-0.0261752;REVB=0.0013104;RO=14;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034374;STB=0.519108;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0251542;OID=.;OPOS=46345670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:11:10:6:8:11:10:6:8 chr19 46394187 . C T 137.62 PASS AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.000942345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.557;QD=18.3497;RBI=0.0219003;REFB=0.0015141;REVB=-0.02188;RO=14;SAF=12;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461409;STB=0.777393;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.000912719;OID=.;OPOS=46394187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:14:15:15:15:0.5:3:12:4:10:3:12:4:11 chr19 46404579 . A G 465.9 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.63;QD=58.2371;RBI=0.079199;REFB=0;REVB=0.00030475;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212878;OID=.;OPOS=46404579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:32:0:0:29:32:1:24:5:0:0:25:7:0:0 chr19 46511548 . T C 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2214;QD=43.4861;RBI=0.0273217;REFB=0;REVB=0.00694909;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000633999;OID=.;OPOS=46511548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chr19 46520026 . A G 382.23 PASS AF=0.447917;AO=37;DP=90;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0063033;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.437;QD=15.9263;RBI=0.00812197;REFB=-0.0206779;REVB=-0.005122;RO=44;SAF=15;SAR=22;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658461;STB=0.535861;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.020913;OID=.;OPOS=46520026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:96:44:53:37:43:0.447917:22:15:15:29:27:16:23:30 chr19 46543566 . C T 168.69 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00568965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.107;QD=16.0653;RBI=0.0195298;REFB=-0.00113426;REVB=-0.0186827;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638092;STB=0.547567;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00224783;OID=.;OPOS=46543566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:24:18:18:0.428571:9:9:13:10:9:9:14:10 chr19 46627592 . G A 192.45 PASS AF=0.431373;AO=21;DP=50;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0232322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8982;QD=15.0942;RBI=0.0260273;REFB=-0.0133046;REVB=-0.0117339;RO=28;SAF=6;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264588;STB=0.669041;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0521479;OID=.;OPOS=46627592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:28:29:21:22:0.431373:15:6:15:13:16:6:16:13 chr19 46811984 . A G 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0313594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.012;QD=12.3961;RBI=0.0359069;REFB=-0.000892605;REVB=-0.0174897;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317065;STB=0.691596;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.000711823;OID=.;OPOS=46811984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:1:4:2:3:1:4 chr19 46815310 . G A 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0515624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6106;QD=21.0134;RBI=0.0632011;REFB=-0.0525654;REVB=0.0365472;RO=7;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124286;STB=0.571292;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0311153;OID=.;OPOS=46815310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:8:3:3:4:8:3:3:4 chr19 46815499 . T C 89.24 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00235688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9704;QD=15.5199;RBI=0.105986;REFB=-0.00997785;REVB=-0.10596;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20624;STB=0.617991;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00165186;OID=.;OPOS=46815499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:7:4:2:10:7:4:2:10 chr19 46815703 . ATATT A 71.67 PASS AF=0.45;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00865838;FXX=0.0908678;HRUN=1;LEN=4;MLLD=261.986;QD=14.3343;RBI=0.0224031;REFB=-0.00969166;REVB=-0.0206623;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138165;STB=0.555432;STBP=0.717;TYPE=del;VARB=0.0173381;OID=.;OPOS=46815704;OREF=TATT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45:9:22:9:20:11:4:5:6:5:71:10:4:5:6:4 chr19 46815711 . C T 88.23 PASS AF=0.44;AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00989745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.572;QD=14.1162;RBI=0.0135935;REFB=-0.0100389;REVB=-0.00931785;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036821;STB=0.514679;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0172244;OID=.;OPOS=46815711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:23:25:13:14:10:11:0.44:5:5:6:7:6:5:6:8 chr19 46823702 . A G 287.6 PASS AF=0.415584;AO=30;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0231131;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.469;QD=14.9402;RBI=0.0267501;REFB=-0.0275589;REVB=0.0134667;RO=44;SAF=15;SAR=15;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14283;STB=0.571385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0643653;OID=.;OPOS=46823702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:44:45:30:32:0.415584:15:15:16:28:16:16:17:28 chr19 46823751 . C T 407.96 PASS AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0127102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.647;QD=17.7374;RBI=0.0140318;REFB=-0.00826709;REVB=0.00594497;RO=50;SAF=23;SAR=19;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104362;STB=0.55834;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00626502;OID=.;OPOS=46823751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:19:23:22:28:19:23:22:28 chr19 46971773 . T G 110.65 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0078525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3609;QD=15.2624;RBI=0.0403779;REFB=-0.00567025;REVB=0.039607;RO=16;SAF=2;SAR=11;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.57848;STB=0.836426;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00973314;OID=.;OPOS=46971773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:11:2:12:4:11:2:12:4 chr19 46997522 . C T 208.7 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0342019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.911;QD=18.148;RBI=0.0414363;REFB=-0.0169088;REVB=0.0233922;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347428;STB=0.519732;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0183653;OID=.;OPOS=46997522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:11:10:11:14:11:10:11:14 chr19 47124714 . T G 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0198973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.103;QD=12.9138;RBI=0.02614;REFB=-0.00804847;REVB=-0.0169527;RO=37;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298407;STB=0.517132;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00969867;OID=.;OPOS=47124714;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:13:11:18:19:13:11:18:19 chr19 47126847 . GC AT 291.6 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0457398;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=138.664;QD=19.4401;RBI=0.0602256;REFB=-0.026274;REVB=0.039179;RO=29;SAF=14;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332681;STB=0.518507;STBP=0.794;TYPE=mnp;VARB=0.0223683;OID=.;OPOS=47126847;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:17:14:12:17:17:14:12:17 chr19 47177913 . A G 501.16 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.614;QD=58.9598;RBI=0.0533069;REFB=0;REVB=-0.0264913;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016515;OID=.;OPOS=47177913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0 chr19 47212593 . A G 121.78 PASS AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0911956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3745;QD=16.2376;RBI=0.0962677;REFB=0.025846;REVB=-0.0308357;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359682;STB=0.709353;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0348906;OID=.;OPOS=47212593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:11:3:9:7:11:3:9:7 chr19 47223543 . T C 639.24 PASS AF=0.592233;AO=61;DP=102;FAO=61;FDP=103;FR=.;FRO=42;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00159623;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.803;QD=24.8249;RBI=0.0934686;REFB=-0.0232604;REVB=-0.0934549;RO=41;SAF=39;SAR=22;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801076;STB=0.549648;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00873948;OID=.;OPOS=47223543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:41:42:61:61:0.592233:22:39:22:19:22:39:22:20 chr19 47282162 . G A 144.67 PASS AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0094099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.208;QD=15.64;RBI=0.0360557;REFB=-0.00582496;REVB=0.0348061;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893246;STB=0.505148;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0348467;OID=.;OPOS=47282162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:7:9:12:9:7:9:12:9 chr19 47291174 . G C 65.73 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0460904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1852;QD=11.4311;RBI=0.216482;REFB=-0.033024;REVB=-0.211519;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206442;STB=0.62712;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0285156;OID=.;OPOS=47291174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:1:8:11:3:1:8:11:3 chr19 47424371 . T C 624.75 PASS AF=0.508065;AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.0083598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.101;QD=20.1533;RBI=0.00909637;REFB=-0.00154637;REVB=0.00358575;RO=61;SAF=26;SAR=37;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158385;STB=0.587274;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.001875;OID=.;OPOS=47424371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:61:61:63:63:0.508065:37:26:36:25:37:26:36:25 chr19 47543774 . G A 1489.07 PASS AF=0.980769;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0468979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.14;QD=57.2721;RBI=0.0507561;REFB=-0.15393;REVB=0.0194104;RO=1;SAF=34;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137487;STB=0.503338;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00654713;OID=.;OPOS=47543774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:103:104:1:2:102:102:0.980769:68:34:1:0:67:35:1:1 chr19 47548678 . G A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.755;QD=33.4285;RBI=0.0236995;REFB=0;REVB=0.00722678;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399597;OID=.;OPOS=47548678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr19 47761646 . G C 175.92 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.589;QD=46.9131;RBI=0.0899286;REFB=0;REVB=0.0893966;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494456;OID=.;OPOS=47761646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:4:10:0:0:5:10:0:0 chr19 47768128 . G C 152.43 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00691633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.409;QD=40.6475;RBI=0.0160923;REFB=-0.0929358;REVB=-0.0145302;RO=1;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478651;STB=0.526279;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00696703;OID=.;OPOS=47768128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:5:9:1:0:5:9:1:0 chr19 47770015 . A C 728.87 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.817;QD=57.1664;RBI=0.0567967;REFB=0;REVB=0.0394298;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000673986;OID=.;OPOS=47770015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0 chr19 47774447 . G A 87.7 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.777;QD=38.9774;RBI=0.0939434;REFB=0;REVB=0.0328343;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169342;OID=.;OPOS=47774447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr19 47774572 . C T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.059;QD=48.7368;RBI=0.100861;REFB=0;REVB=0.0959721;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215088;OID=.;OPOS=47774572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0 chr19 47774772 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.809;QD=44.6898;RBI=0.0507989;REFB=0;REVB=-0.0339002;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10543e-05;OID=.;OPOS=47774772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0 chr19 47778857 . C G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.105;QD=51.9163;RBI=0.0776221;REFB=0;REVB=0.0496333;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353681;OID=.;OPOS=47778857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr19 47813165 . G A 239.45 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00407959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.289;QD=50.41;RBI=0.0295772;REFB=0;REVB=0.0292945;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399272;OID=.;OPOS=47813165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0 chr19 47823038 . G A 207.07 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0571956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7298;QD=48.7225;RBI=0.0666518;REFB=0;REVB=0.0342218;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000915391;OID=.;OPOS=47823038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0 chr19 47823484 . T C 727.79 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.534;QD=63.2863;RBI=0.0321689;REFB=0;REVB=0.0309929;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137535;OID=.;OPOS=47823484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0 chr19 47823871 . G T 537.86 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.847;QD=59.7626;RBI=0.0415952;REFB=0;REVB=-0.0344716;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000920695;OID=.;OPOS=47823871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0 chr19 47910763 . CG C 47.55 PASS AF=0.344828;AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.017298;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=18.6629;QD=6.55846;RBI=0.113681;REFB=0.00880205;REVB=0.112358;RO=19;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133986;STB=0.603547;STBP=0.499;TYPE=del;VARB=0.00307732;OID=.;OPOS=47910764;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.344828:9:29:10:29:19:8:2:13:6:47:19:7:2:13:6 chr19 47935352 . T C 188.33 PASS AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0326314;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=117.133;QD=37.6652;RBI=0.0611725;REFB=-0.0496473;REVB=0.0517423;RO=3;SAF=14;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886692;STB=0.548334;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00264865;OID=.;OPOS=47935352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:3:14:3:0:3:14:3:0 chr19 47980153 . G A 284.61 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00119344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.144;QD=17.7884;RBI=0.0207943;REFB=-0.0120449;REVB=0.02076;RO=33;SAF=13;SAR=18;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171194;STB=0.595726;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0175985;OID=.;OPOS=47980153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:18:13:20:13:18:13:20:13 chr19 48049175 . C G 163.22 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.00469944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9055;QD=12.8017;RBI=0.092048;REFB=-0.00980764;REVB=0.091928;RO=32;SAF=14;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657908;STB=0.53842;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0168721;OID=.;OPOS=48049175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:5:14:22:10:5:14:22:10 chr19 48229268 . C G 146.2 PASS AF=0.652174;AO=13;DP=21;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00185099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.332;QD=25.4257;RBI=0.0334519;REFB=-0.0326226;REVB=0.0334006;RO=8;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259793;STB=0.511612;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0191753;OID=.;OPOS=48229268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:23:8:8:13:15:0.652174:6:7:4:4:8:7:4:4 chr19 48244194 . A G 166.08 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.00880362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.062;QD=22.1437;RBI=0.0583241;REFB=-0.000643596;REVB=-0.0576558;RO=13;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367533;STB=0.705432;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00217705;OID=.;OPOS=48244194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:11:6:11:2:11:6:11:2 chr19 48244377 . C T 187.89 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00297173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.059;QD=20.3129;RBI=0.0109638;REFB=-0.00282047;REVB=-0.0105534;RO=18;SAF=13;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169787;STB=0.596225;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.002379;OID=.;OPOS=48244377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:6:13:9:9:6:13:9:9 chr19 48255804 . A G 48.2 PASS AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0343789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9486;QD=12.8543;RBI=0.0507248;REFB=-0.0149026;REVB=-0.0372974;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353209;STB=0.699618;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0193762;OID=.;OPOS=48255804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:6:1:0:8:6:1:0:8 chr19 48351527 . T C 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00352932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.902;QD=12.4821;RBI=0.0415399;REFB=-0.00532056;REVB=0.0413897;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256991;STB=0.651918;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0218852;OID=.;OPOS=48351527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:11:8:8:4:11:8 chr19 48352054 . G C 73.44 PASS AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.0432515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.743;QD=9.47555;RBI=0.05325;REFB=-0.00248606;REVB=-0.0310625;RO=21;SAF=2;SAR=8;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217266;STB=0.627699;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00357814;OID=.;OPOS=48352054;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:8:2:2:19:8:2:2:19 chr19 48389425 . A G 1381.52 PASS AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0144966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.481;QD=61.4008;RBI=0.0194039;REFB=-0.11595;REVB=0.012898;RO=1;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101917;STB=0.505375;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=2.329e-05;OID=.;OPOS=48389425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:46:43:0:1:46:43:0:1 chr19 48525507 . G A 983.03 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.082;QD=58.6884;RBI=0.0148131;REFB=0;REVB=0.0132164;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.45459e-05;OID=.;OPOS=48525507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:29:36:0:0:30:37:0:0 chr19 48543862 . G A 542.25 PASS AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0012641;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.764;QD=60.2502;RBI=0.0225791;REFB=0;REVB=0.0225437;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84804e-05;OID=.;OPOS=48543862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0 chr19 48598823 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.493;QD=53.2772;RBI=0.0266538;REFB=0;REVB=0.0142913;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162399;OID=.;OPOS=48598823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0 chr19 48601454 . T C 239.94 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0151136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.657;QD=14.3247;RBI=0.0151165;REFB=0.00542043;REVB=0.000299414;RO=38;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239379;STB=0.628209;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00764424;OID=.;OPOS=48601454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:39:28:28:0.41791:11:17:14:24:11:17:15:24 chr19 48602948 . T C 318.62 PASS AF=0.692308;AO=27;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00826654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.85;QD=32.6786;RBI=0.0546648;REFB=-0.0383478;REVB=0.0540362;RO=12;SAF=14;SAR=13;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103865;STB=0.556776;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0110177;OID=.;OPOS=48602948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:39:39:12:12:27:27:0.692308:13:14:4:8:13:14:4:8 chr19 48608598 . C G 140.43 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0096831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9198;QD=13.7007;RBI=0.0307839;REFB=-0.0469271;REVB=0.0292213;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303114;STB=0.6767;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0787697;OID=.;OPOS=48608598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:5:11:10:15:5:11:10:15 chr19 48613788 . T G 186.76 PASS AF=0.20979;AO=30;DP=145;FAO=30;FDP=143;FR=.;FRO=113;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=62;FSRR=51;FWDB=-0.0259504;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.679;QD=5.22413;RBI=0.0336904;REFB=-0.0115408;REVB=0.0214854;RO=109;SAF=2;SAR=28;SRF=61;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.669581;STB=0.918671;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0428367;OID=.;OPOS=48613788;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:143:109:113:30:30:0.20979:28:2:61:48:28:2:62:51 chr19 48621036 . C G 300.83 PASS AF=0.666667;AO=26;DP=39;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00486096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.438;QD=30.854;RBI=0.0602799;REFB=-0.10259;REVB=0.0600835;RO=13;SAF=21;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221157;STB=0.622537;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0401842;OID=.;OPOS=48621036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:13:13:26:26:0.666667:5:21:7:6:5:21:7:6 chr19 48622427 . A G 908.84 PASS AF=0.457547;AO=97;DP=212;FAO=97;FDP=212;FR=.;FRO=115;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=56;FSRR=59;FWDB=-0.0101327;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.648;QD=17.1479;RBI=0.0279238;REFB=-0.0132736;REVB=-0.0260205;RO=113;SAF=44;SAR=53;SRF=54;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237384;STB=0.518182;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0332129;OID=.;OPOS=48622427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:113:115:97:97:0.457547:53:44:54:59:53:44:56:59 chr19 48697961 . C T 364.09 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0157503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7655;QD=21.1068;RBI=0.0425246;REFB=-0.00435147;REVB=0.0395003;RO=32;SAF=26;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332439;STB=0.684109;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00492114;OID=.;OPOS=48697961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:11:26:10:22:11:26:10:22 chr19 48821738 . C G 128.02 PASS AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0498658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.694;QD=20.4832;RBI=0.10163;REFB=0.0257093;REVB=-0.0885548;RO=11;SAF=11;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36541;STB=0.709352;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.0283173;OID=.;OPOS=48821738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:3:11:4:7:3:11:4:7 chr19 48823545 . G A 132.0 PASS AF=0.275362;AO=19;DP=68;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00387055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.44;QD=7.65208;RBI=0.02456;REFB=-0.0113765;REVB=-0.0242531;RO=48;SAF=10;SAR=9;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685427;STB=0.53913;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.037927;OID=.;OPOS=48823545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:48:50:19:19:0.275362:9:10:28:20:9:10:29:21 chr19 48835668 . G C 211.87 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0308781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0972;QD=16.6174;RBI=0.0359417;REFB=-0.0226202;REVB=-0.0183942;RO=28;SAF=14;SAR=9;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072395;STB=0.540949;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0623768;OID=.;OPOS=48835668;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:9:14:19:9:9:14:19:9 chr19 48836673 . G T 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.015404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.173;QD=9.76012;RBI=0.0299621;REFB=-0.00127228;REVB=-0.0256991;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196632;STB=0.618737;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00293457;OID=.;OPOS=48836673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:3:9:4:3:3:9 chr19 48863386 . C T 157.86 PASS AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0150549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.199;QD=12.1431;RBI=0.0191899;REFB=-0.0103155;REVB=-0.0118996;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451219;STB=0.526288;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0142455;OID=.;OPOS=48863386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:9:10:16:17:9:10:16:17 chr19 48869178 . C T 197.54 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0047728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7319;QD=26.3381;RBI=0.0498564;REFB=0.00944978;REVB=0.0496274;RO=11;SAF=5;SAR=14;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720336;STB=0.539866;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00411594;OID=.;OPOS=48869178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:14:5:2:9:14:5:2:9 chr19 48918157 . C T 140.09 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00642261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.112;QD=20.7543;RBI=0.0368512;REFB=-0.0204571;REVB=0.0362872;RO=12;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173947;STB=0.597866;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0034864;OID=.;OPOS=48918157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:8:7:3:9:8:7:3:9 chr19 48949286 . G T 108.85 PASS AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0427599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7704;QD=24.1898;RBI=0.0444704;REFB=-0.0555309;REVB=0.0122151;RO=6;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984044;STB=0.555464;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0346808;OID=.;OPOS=48949286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:6:6:2:4:6:6:2:4 chr19 48981760 . G A 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00952182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.341;QD=18.7441;RBI=0.0104236;REFB=-0.0345259;REVB=0.00424114;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448465;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0190959;OID=.;OPOS=48981760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:3:4:2:2:3:4:2:2 chr19 48985178 . TA T 658.97 PASS AF=0.554217;AO=87;DP=165;FAO=92;FDP=166;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=0.0302811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=29.1266;QD=15.8788;RBI=0.0980835;REFB=-0.007085;REVB=-0.0932922;RO=74;SAF=37;SAR=50;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00548118;STB=0.50228;STBP=0.952;TYPE=del;VARB=0.00441341;OID=.;OPOS=48985179;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.554217:87:165:92:166:74:39:53:31:43:99:74:37:50:31:43 chr19 49096065 . C T 93.32 PASS AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0158614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.786;QD=19.6457;RBI=0.0183755;REFB=-0.028046;REVB=-0.00927783;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593282;STB=0.533919;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0274053;OID=.;OPOS=49096065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:6:5:3:5:6:5:3:5 chr19 49102399 . C T 568.08 PASS AF=0.392857;AO=66;DP=169;FAO=66;FDP=168;FR=.;FRO=102;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=65;FWDB=-0.00993326;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.837;QD=13.5256;RBI=0.0103742;REFB=-0.019183;REVB=-0.00299224;RO=102;SAF=33;SAR=33;SRF=37;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14821;STB=0.583309;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0252507;OID=.;OPOS=49102399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:102:102:66:66:0.392857:33:33:37:65:33:33:37:65 chr19 49116359 . T C 70.88 PASS AF=0.322581;AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0490108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.808;QD=9.14582;RBI=0.0999787;REFB=-0.0431169;REVB=-0.0871418;RO=20;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39347;STB=0.75725;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.058951;OID=.;OPOS=49116359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:31:20:21:9:10:0.322581:8:1:7:13:9:1:7:14 chr19 49116438 . A G 217.79 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0780512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3566;QD=16.7533;RBI=0.0800973;REFB=-0.00971672;REVB=-0.0179884;RO=27;SAF=4;SAR=20;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869346;STB=0.572851;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0089975;OID=.;OPOS=49116438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:27:28:24:24:0.461538:20:4:6:21:20:4:7:21 chr19 49116555 . A G 415.87 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.365;QD=53.6607;RBI=0.111489;REFB=-0.0967522;REVB=-0.106112;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00653827;OID=.;OPOS=49116555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:29:31:1:0:28:31:1:18:10:1:0:18:13:0:0 chr19 49183705 . G A 224.8 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00202644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.861;QD=19.9824;RBI=0.0245516;REFB=-0.0117715;REVB=0.0244678;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196827;STB=0.511101;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0129341;OID=.;OPOS=49183705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:11:11:12:11:11:11:12:11 chr19 49206603 . C T 483.34 PASS AF=1;AO=28;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8855;QD=58.587;RBI=0.0693642;REFB=0;REVB=-0.026544;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592732;OID=.;OPOS=49206603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:28:33:1:8:20:0:0:13:20:0:0 chr19 49206631 . A T 428.99 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00183739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.66;QD=57.1985;RBI=0.0208287;REFB=0;REVB=0.0207475;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17463e-05;OID=.;OPOS=49206631;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:7:22:0:0:7:23:0:0 chr19 49217261 . A G 446.83 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.721;QD=57.6556;RBI=0.0444455;REFB=0;REVB=-0.0391231;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013102;OID=.;OPOS=49217261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0 chr19 49217305 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00113828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.326;QD=59.8386;RBI=0.00888425;REFB=0;REVB=0.00881103;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83499e-05;OID=.;OPOS=49217305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0 chr19 49244219 . CG AA,CA 986.85 PASS AF=0.941176,0.0588235;AO=64,4;DP=68;FAO=64,4;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=45,1;FSAR=19,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00917016,0.00758441;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=269.524,210.601;QD=58.05;RBI=0.0233345,0.0222456;REFB=0,0;REVB=0.0214571,0.0209127;RO=0;SAF=45,1;SAR=19,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0037674,-0.0407416;OID=.,.;OPOS=49244219,49244220;OREF=CG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:68:68:0:0:64,4:64,4:0.941176,0.0588235:19,3:45,1:0:0:19,3:45,1:0:0 chr19 49247786 . G A 885.25 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00537072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.151;QD=58.0489;RBI=0.037934;REFB=0;REVB=0.0375519;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28971e-05;OID=.;OPOS=49247786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:32:28:0:0:32:29:0:0 chr19 49254504 . G A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.601;QD=39.2068;RBI=0.0408026;REFB=0;REVB=0.0278932;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000929207;OID=.;OPOS=49254504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr19 49259529 . A G 816.02 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.093;QD=57.2647;RBI=0.0440749;REFB=0;REVB=0.0204609;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172263;OID=.;OPOS=49259529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:19:36:0:0:19:38:0:0 chr19 49261368 . T C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.984;QD=45.8068;RBI=0.0215232;REFB=0;REVB=-0.00201145;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10604e-05;OID=.;OPOS=49261368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0 chr19 49299533 . A G 907.03 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289533;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.427;QD=58.5178;RBI=0.0361283;REFB=0;REVB=0.0216093;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83417e-05;OID=.;OPOS=49299533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0 chr19 49339098 . T C 391.42 PASS AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0771923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9282;QD=22.0515;RBI=0.0789625;REFB=0.00783496;REVB=0.0166259;RO=32;SAF=22;SAR=17;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509938;STB=0.528092;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.00864356;OID=.;OPOS=49339098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:17:22:20:12:17:22:20:12 chr19 49360716 . G A 117.86 PASS AF=0.538462;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00709972;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=195.039;QD=18.1328;RBI=0.0298085;REFB=-0.00238716;REVB=-0.0289506;RO=11;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202754;STB=0.606586;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00124896;OID=.;OPOS=49360716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:26:11:12:13:14:0.538462:4:9:5:6:5:9:5:7 chr19 49416456 . G A 39.62 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00662194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.846;QD=13.2053;RBI=0.00704099;REFB=-0.0351702;REVB=-0.0023928;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138347;STB=0.583063;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00803014;OID=.;OPOS=49416456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:2:4:3:3:2:4 chr19 49421966 . T C 232.07 PASS AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00633825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.376;QD=14.7348;RBI=0.0136817;REFB=-0.0104397;REVB=-0.012125;RO=35;SAF=17;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899779;STB=0.560394;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0116597;OID=.;OPOS=49421966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:36:27:27:0.428571:10:17:19:16:10:17:19:17 chr19 49438363 . G A 145.55 PASS AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00789078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.887;QD=16.1724;RBI=0.0079546;REFB=-0.0251043;REVB=-0.00100563;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122295;STB=0.507033;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.030543;OID=.;OPOS=49438363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:9:11:9:7:9:11 chr19 49442933 . T C 196.64 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0207174;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.856;QD=17.4791;RBI=0.0212889;REFB=0.00169961;REVB=-0.00489965;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22143;STB=0.6257;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00316112;OID=.;OPOS=49442933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:8:17:9:11:8:17 chr19 49442937 . G A 241.7 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00158142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.226;QD=21.9722;RBI=0.039146;REFB=-0.0034276;REVB=0.0391141;RO=21;SAF=6;SAR=17;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287671;STB=0.662188;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00678589;OID=.;OPOS=49442937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:17:6:12:9:17:6:12:9 chr19 49445817 . T C 161.56 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0562523;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.04;QD=17.0062;RBI=0.0564707;REFB=-0.0200389;REVB=-0.00496077;RO=21;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129296;STB=0.573688;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0512359;OID=.;OPOS=49445817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:38:21:21:17:17:0.447368:10:7:6:15:10:7:6:15 chr19 49469087 . T C 106.48 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.062605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7252;QD=11.8307;RBI=0.0821217;REFB=-0.0143867;REVB=-0.0531468;RO=22;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764642;STB=0.555473;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0518944;OID=.;OPOS=49469087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:22:23:13:13:0.361111:5:8:15:7:5:8:16:7 chr19 49485548 . G A 306.72 PASS AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0223461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2238;QD=22.7201;RBI=0.058653;REFB=-0.00128095;REVB=0.0542294;RO=23;SAF=19;SAR=12;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321856;STB=0.517755;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00256596;OID=.;OPOS=49485548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:23:23:31:31:0.574074:12:19:15:8:12:19:15:8 chr19 49513273 . C T 56.29 PASS AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00442388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.276;QD=11.2574;RBI=0.0168725;REFB=-0.00952284;REVB=0.0162822;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345943;STB=0.709978;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0462307;OID=.;OPOS=49513273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:7:5:6:2:7:5 chr19 49513349 . C G 77.25 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.040729;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.6686;QD=13.4344;RBI=0.0418922;REFB=-0.0168432;REVB=0.00980342;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11072;STB=0.565089;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00392233;OID=.;OPOS=49513349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:5:5:8:5:5:5:8:5 chr19 49519058 . T C 1057.35 PASS AF=0.526042;AO=102;DP=189;FAO=101;FDP=192;FR=.;FRO=91;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=39;FWDB=-0.0991915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1801;QD=22.0281;RBI=0.102722;REFB=-0.00806436;REVB=-0.0266974;RO=86;SAF=53;SAR=49;SRF=48;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323899;STB=0.526876;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00985239;OID=.;OPOS=49519058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:192:86:91:102:101:0.526042:49:53:48:38:49:52:52:39 chr19 49519466 . A G 142.7 PASS AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0184339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.417;QD=22.8318;RBI=0.0631244;REFB=-0.00615413;REVB=-0.0603729;RO=10;SAF=11;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324202;STB=0.68336;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00170386;OID=.;OPOS=49519466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:25:25:10:10:15:15:0.6:4:11:3:7:4:11:3:7 chr19 49520315 . T C 226.97 PASS AF=0.448276;AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0153854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.383;QD=15.653;RBI=0.0157287;REFB=-0.0266689;REVB=-0.00326862;RO=32;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136239;STB=0.565988;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0394657;OID=.;OPOS=49520315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:32:32:25:26:0.448276:12:13:21:11:12:14:21:11 chr19 49520372 . A T 246.13 PASS AF=0.451613;AO=26;DP=60;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00650785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.314;QD=15.8793;RBI=0.00777487;REFB=-0.0159113;REVB=0.00425399;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183856;STB=0.580589;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0170535;OID=.;OPOS=49520372;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:34:34:26:28:0.451613:14:12:22:12:14:14:22:12 chr19 49557572 . T C 85.7 PASS AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00394935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.38;QD=11.4268;RBI=0.0137239;REFB=-0.0215609;REVB=-0.0131433;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108084;STB=0.545372;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0297817;OID=.;OPOS=49557572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:30:18:19:10:11:0.366667:4:6:9:9:5:6:9:10 chr19 49559693 . T C 79.28 PASS AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00327796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.212;QD=14.4138;RBI=0.0237038;REFB=-0.00390971;REVB=0.023476;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119999;STB=0.603574;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0108664;OID=.;OPOS=49559693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:20:22:11:11:9:11:0.5:6:3:5:6:8:3:5:6 chr19 49560461 . G A 82.37 PASS AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.029641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.7492;QD=8.90481;RBI=0.123573;REFB=-0.0150531;REVB=0.119966;RO=26;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243363;STB=0.648512;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0389262;OID=.;OPOS=49560461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:4:7:11:15:4:7:11:15 chr19 49621964 . T C,G 637.36 PASS AF=0.952381,0.047619;AO=40,2;DP=42;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22,1;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048476,0.00905403;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=198.516,151.726;QD=60.7012;RBI=0.0772273,0.02789;REFB=0,0;REVB=0.077075,0.0263795;RO=0;SAF=22,1;SAR=18,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.19993e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00132874,0.0837385;OID=.,.;OPOS=49621964,49621964;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:42:42:0:0:40,2:40,2:0.952381,0.047619:18,1:22,1:0:0:18,1:22,1:0:0 chr19 49646066 . GGTG GGT,TGGT 1172.03 PASS AF=0.936364,0.0636364;AO=21,7;DP=114;FAO=103,7;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=57,0;FSAR=46,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.740559,0.0666962;FXX=0.0350846;HRUN=3,3;LEN=1,4;MLLD=14.1647,146.485;QD=42.6194;RBI=0.780851,0.11625;REFB=0,0;REVB=0.247588,-0.0952137;RO=67;SAF=2,0;SAR=19,7;SRF=54;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0.253927,0;SSSB=-0.755351,-0.756412;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0208859,0.256323;OID=.,.;OPOS=49646069,49646066;OREF=G,GGTG;OALT=-,TGGT;OMAPALT=GGT,TGGT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:21:114:110:67:0:21,7:103,7:0.936364,0.0636364:19,7:2,0:54:13:46,7:57,0:0:0 chr19 49658084 . G A 348.75 PASS AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00743337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.437;QD=14.9998;RBI=0.0528251;REFB=-0.0319654;REVB=0.0522995;RO=54;SAF=19;SAR=19;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038438;STB=0.516121;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0518569;OID=.;OPOS=49658084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:54:55:38:38:0.408602:19:19:25:29:19:19:26:29 chr19 49658367 . C T 222.85 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=-0.00837739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.863;QD=18.9663;RBI=0.00971194;REFB=-0.0283319;REVB=0.00491337;RO=25;SAF=5;SAR=17;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959366;STB=0.55389;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0169723;OID=.;OPOS=49658367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:17:5:4:21:17:5:4:21 chr19 49699866 . C T 293.59 PASS AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00956123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3538;QD=19.9044;RBI=0.0123348;REFB=-0.00149902;REVB=0.0077929;RO=28;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246229;STB=0.63667;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00129336;OID=.;OPOS=49699866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:19:12:19:9:19:12:19:9 chr19 49839015 . T C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.534;QD=39.2068;RBI=0.01544;REFB=0;REVB=-0.0110435;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90609e-06;OID=.;OPOS=49839015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr19 49869051 . T G 137.71 PASS AF=0.326531;AO=15;DP=48;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00158784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.513;QD=11.2418;RBI=0.028234;REFB=-0.0112853;REVB=-0.0281893;RO=32;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334829;STB=0.530574;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0185409;OID=.;OPOS=49869051;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:32:33:15:16:0.326531:8:7:14:18:8:8:15:18 chr19 49878115 . G A 277.42 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0576606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.108;QD=18.4943;RBI=0.0592533;REFB=-0.0114258;REVB=0.0136457;RO=30;SAF=10;SAR=20;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330997;STB=0.518506;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.013651;OID=.;OPOS=49878115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:20:10:11:19:20:10:11:19 chr19 49878196 . G A 112.97 PASS AF=0.225806;AO=10;DP=62;FAO=14;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00637327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.847;QD=7.28815;RBI=0.0295272;REFB=-0.0279857;REVB=0.0288312;RO=44;SAF=9;SAR=1;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.589009;STB=0.665638;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0641273;OID=.;OPOS=49878196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:62:62:44:45:10:14:0.225806:1:9:19:25:5:9:19:26 chr19 49894152 . C T 304.3 PASS AF=0.395349;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=0.0157182;FXX=0.0227247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.253;QD=14.1534;RBI=0.0164287;REFB=-0.0197612;REVB=0.00477902;RO=50;SAF=12;SAR=22;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353381;STB=0.708163;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0273003;OID=.;OPOS=49894152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:50:52:34:34:0.395349:22:12:35:15:22:12:37:15 chr19 49899076 . G A 131.99 PASS AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00431136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.056;QD=14.6654;RBI=0.0174702;REFB=0.00251043;REVB=0.0169298;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218022;STB=0.626207;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=-0.00469516;OID=.;OPOS=49899076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:8:13:6:9:8:13 chr19 49901318 . T C 129.31 PASS AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0201863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.371;QD=21.552;RBI=0.0332939;REFB=-0.0526035;REVB=0.0264763;RO=10;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531474;STB=0.530077;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0243765;OID=.;OPOS=49901318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:6:8:5:5:6:8:5:5 chr19 49950298 . C T 1062.34 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.332;QD=59.8504;RBI=0.022455;REFB=0;REVB=0.0191854;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.62259e-05;OID=.;OPOS=49950298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:29:42:0:0:29:42:0:0 chr19 49950356 . C G 312.04 PASS AF=0.507463;AO=33;DP=63;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0265327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.815;QD=18.6293;RBI=0.0288925;REFB=-0.0564589;REVB=-0.0114364;RO=30;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474038;STB=0.522955;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0967883;OID=.;OPOS=49950356;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:67:30:33:33:34:0.507463:15:18:18:12:16:18:19:14 chr19 49954803 . C T 187.68 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0201769;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.252;QD=12.724;RBI=0.021111;REFB=-0.0144846;REVB=0.00620995;RO=36;SAF=6;SAR=17;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379333;STB=0.718839;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0278378;OID=.;OPOS=49954803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:17:6:22:14:17:6:22:14 chr19 49954807 . T G 184.81 PASS AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0443123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6809;QD=12.1184;RBI=0.0443493;REFB=-0.0148295;REVB=0.00181084;RO=38;SAF=6;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355356;STB=0.706046;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0350256;OID=.;OPOS=49954807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:17:6:22:16:17:6:22:16 chr19 49964977 . C G 154.98 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0331511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.832;QD=22.9595;RBI=0.0348075;REFB=-0.0137567;REVB=0.0106096;RO=11;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180541;STB=0.601858;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00950614;OID=.;OPOS=49964977;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:11:5:6:5:11:5:6:5 chr19 49965173 . A T 160.3 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8979;QD=45.8006;RBI=0.03376;REFB=0;REVB=-0.00868827;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000945899;OID=.;OPOS=49965173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr19 49967680 . G A 176.3 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00589624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0131;QD=20.7413;RBI=0.0322991;REFB=0.00311203;REVB=0.0317563;RO=16;SAF=3;SAR=15;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24913;STB=0.642677;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.00123692;OID=.;OPOS=49967680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:15:3:6:10:15:3:6:10 chr19 49983673 . C T 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00733819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8489;QD=10.0337;RBI=0.0115511;REFB=-0.0130944;REVB=0.00892068;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15966;STB=0.5996;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0201593;OID=.;OPOS=49983673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:3:4:2:3:3:4 chr19 49994470 . T A 301.74 PASS AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00088204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4382;QD=25.1453;RBI=0.0433949;REFB=-0.029146;REVB=-0.0433859;RO=21;SAF=10;SAR=17;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161707;STB=0.589838;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0211975;OID=.;OPOS=49994470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:17:10:12:9:17:10:12:9 chr19 49994476 . T C 260.64 PASS AF=0.533333;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0995812;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.571;QD=23.1681;RBI=0.0996807;REFB=-0.0260231;REVB=-0.00445354;RO=21;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205794;STB=0.615286;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0124091;OID=.;OPOS=49994476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:21:21:24:24:0.533333:16:8:12:9:16:8:12:9 chr19 50140092 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.662;QD=45.8068;RBI=0.0107183;REFB=0;REVB=-0.000777947;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.13415e-05;OID=.;OPOS=50140092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0 chr19 50156896 . T C 727.78 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00558848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.086;QD=63.2848;RBI=0.0489524;REFB=0;REVB=-0.0486324;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135384;OID=.;OPOS=50156896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0 chr19 50162909 . C G 226.79 PASS AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.00533856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.748;QD=13.5399;RBI=0.00646411;REFB=-0.00790088;REVB=0.00364479;RO=40;SAF=9;SAR=18;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349677;STB=0.698886;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0220438;OID=.;OPOS=50162909;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:18:9:27:13:18:9:27:13 chr19 50183788 . G A 148.14 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0168703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3451;QD=17.9558;RBI=0.0553246;REFB=-0.00883089;REVB=0.0526897;RO=17;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25653;STB=0.64687;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0104817;OID=.;OPOS=50183788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:5:11:7:10:5:11:7:10 chr19 50310466 . G A 386.54 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00656463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.149;QD=18.1902;RBI=0.0138602;REFB=-0.0178787;REVB=0.012207;RO=45;SAF=22;SAR=18;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113472;STB=0.563146;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.021616;OID=.;OPOS=50310466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:18:22:30:15:18:22:30:15 chr19 50322482 . C G 481.89 PASS AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.241185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.2434;QD=18.1844;RBI=0.243897;REFB=0.0280721;REVB=0.0362723;RO=55;SAF=32;SAR=19;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147932;STB=0.582227;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.10633;OID=.;OPOS=50322482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:55:55:51:51:0.481132:19:32:26:29:19:32:26:29 chr19 50338784 . C T 430.71 PASS AF=0.418803;AO=47;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=-0.00708307;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.7427;QD=14.7252;RBI=0.0590324;REFB=-0.0171758;REVB=0.058606;RO=66;SAF=13;SAR=34;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336065;STB=0.501844;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0227218;OID=.;OPOS=50338784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:68:47:49:0.418803:34:13:20:46:34:15:21:47 chr19 50340130 . CG CC,C 172.58 PASS AF=0.0555556,0.583333;AO=2,14;DP=34;FAO=2,21;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=2,15;FSAR=0,6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.16224,0.21866;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.007,13.3815;QD=19.1752;RBI=0.186375,0.226956;REFB=-0.149223,-0.153977;REVB=0.091727,-0.0608023;RO=17;SAF=2,11;SAR=0,3;SRF=12;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.456158,0.103828;STB=0.99339,0.544511;STBP=0.29,0.538;TYPE=snp,del;VARB=0.0438693,0.104134;OID=.,.;OPOS=50340131,50340131;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0555556,0.583333:2,14:34:2,21:36:13:2,15:0,6:8:5:56:17:2,11:0,3:12:5 chr19 50354211 . C T 727.8 PASS AF=1;AO=50;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.173;QD=53.9112;RBI=0.260624;REFB=0;REVB=0.0207517;RO=3;SAF=9;SAR=41;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133614;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589832;OID=.;OPOS=50354211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:54:3:0:50:54:1:41:9:3:0:42:12:0:0 chr19 50360989 . A G 270.08 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0199618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.815;QD=16.8802;RBI=0.0222534;REFB=-0.00131462;REVB=0.00983563;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494941;STB=0.527759;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00180045;OID=.;OPOS=50360989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:17:13:13:21:17:13:13:21 chr19 50364721 . A C 244.55 PASS AF=0.426471;AO=28;DP=67;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.0612016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.491;QD=14.3854;RBI=0.0621231;REFB=-0.00999432;REVB=0.01066;RO=38;SAF=8;SAR=20;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284494;STB=0.537125;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0160195;OID=.;OPOS=50364721;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:38:39:28:29:0.426471:20:8:10:28:20:9:10:29 chr19 50383591 . A G 775.5 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.381;QD=56.4;RBI=0.0139754;REFB=0;REVB=-0.00801746;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385223;OID=.;OPOS=50383591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:32:22:0:0:32:23:0:0 chr19 50383636 . T C 750.96 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141623;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.212;QD=63.9111;RBI=0.0268697;REFB=0;REVB=0.0228344;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123856;OID=.;OPOS=50383636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0 chr19 50387750 . G C 210.81 PASS AF=0.423729;AO=23;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0136886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.915;QD=14.2924;RBI=0.0230178;REFB=-0.0211942;REVB=-0.0185052;RO=34;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128709;STB=0.591763;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0313923;OID=.;OPOS=50387750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:34:34:23:25:0.423729:13:10:19:15:15:10:19:15 chr19 50393269 . A G 104.15 PASS AF=0.571429;AO=11;DP=20;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0111039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.664;QD=19.8377;RBI=0.0276313;REFB=-0.0266081;REVB=-0.025302;RO=9;SAF=9;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428568;STB=0.691969;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00860751;OID=.;OPOS=50393269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:20:21:9:9:11:12:0.571429:2:9:3:6:3:9:3:6 chr19 50399384 . G GC 617.78 PASS AF=1;AO=45;DP=66;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348804;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.0458;QD=39.224;RBI=0.200554;REFB=0;REVB=0.197497;RO=19;SAF=22;SAR=23;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493687;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00378508;OID=.;OPOS=50399385;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:45:66:63:63:0:32:31:0:0:12:19:22:23:11:8 chr19 50404939 . T G 210.68 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00626453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.523;QD=19.1528;RBI=0.0118475;REFB=-0.0193109;REVB=0.0100558;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241773;STB=0.635853;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0232616;OID=.;OPOS=50404939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:6:17:10:11:6:17 chr19 50411742 . A G 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.662;QD=57.3849;RBI=0.0267505;REFB=0;REVB=0.0123832;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.40929e-05;OID=.;OPOS=50411742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0 chr19 50412417 . G A 223.19 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.452;QD=49.5986;RBI=0.0268613;REFB=0;REVB=0.0210961;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000531026;OID=.;OPOS=50412417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr19 50435747 . T C 115.98 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0911697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7991;QD=42.1729;RBI=0.118317;REFB=0;REVB=0.0754124;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000753964;OID=.;OPOS=50435747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:10:1:0:0:10:1:0:0 chr19 50452750 . T C 78.01 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0433052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5241;QD=14.1839;RBI=0.0486879;REFB=0.00106277;REVB=-0.0222524;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234457;STB=0.636111;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.00708188;OID=.;OPOS=50452750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:5:5:3:9:5:5:3:9 chr19 50453317 . C T 439.41 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0173409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.947;QD=19.3149;RBI=0.0174061;REFB=-0.0235437;REVB=0.0015053;RO=47;SAF=15;SAR=29;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846194;STB=0.547148;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0266822;OID=.;OPOS=50453317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:29:15:20:27:29:15:20:27 chr19 50462298 . G C 161.52 PASS AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0208022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.97;QD=10.5912;RBI=0.0208057;REFB=-0.00365284;REVB=-0.00038598;RO=40;SAF=7;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220152;STB=0.629088;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00813956;OID=.;OPOS=50462298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:40:40:21:21:0.344262:14:7:21:19:14:7:21:19 chr19 50463982 . T G 96.74 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00416999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.212;QD=12.4824;RBI=0.0042714;REFB=-0.00161747;REVB=-0.000925186;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600117;STB=0.535459;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00243533;OID=.;OPOS=50463982;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:10:9:5:7:10:9 chr19 50464023 . C G 109.22 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0215322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7218;QD=14.0933;RBI=0.0525669;REFB=0.00171114;REVB=-0.0479546;RO=18;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46486;STB=0.775992;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00561656;OID=.;OPOS=50464023;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:2:11:8:10:2:11:8:10 chr19 50474571 . A G 41.2 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0414328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7699;QD=16.4793;RBI=0.0910779;REFB=-0.0746347;REVB=-0.081108;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194334;STB=0.571183;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0234029;OID=.;OPOS=50474571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:3:4:6:6:0.6:2:4:1:2:2:4:2:2 chr19 50475114 . G C 173.28 PASS AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.037103;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4202;QD=12.8359;RBI=0.037146;REFB=-0.018077;REVB=-0.001788;RO=31;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442495;STB=0.521719;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0291057;OID=.;OPOS=50475114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:33:21:21:0.388889:12:9:12:19:12:9:13:20 chr19 50485454 . A G 189.28 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0491976;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4711;QD=15.1427;RBI=0.0497834;REFB=-0.0329599;REVB=0.00761421;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554376;STB=0.531761;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0464035;OID=.;OPOS=50485454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:9:12:15:14:9:12:15:14 chr19 50510971 . CCTGGTCTTCTGAGGGCTACAG CCTGGTCTTCTGAGGGCTACCC 258.46 PASS AF=0.261538;AO=15;DP=78;FAO=17;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0215474;FXX=0.155824;HRUN=1;LEN=2;MLLD=272.004;QD=15.9049;RBI=0.0216774;REFB=-0.00629469;REVB=0.00236966;RO=25;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.602617;STBP=0.316;TYPE=mnp;VARB=0.01579;OID=.;OPOS=50510991;OREF=AG;OALT=CC;OMAPALT=CCTGGTCTTCTGAGGGCTACCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.261538:15:78:17:65:36:11:6:18:18:99:25:9:6:15:10 chr19 50510999 . TT AC 64.85 PASS AF=0.16;AO=12;DP=68;FAO=12;FDP=75;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0110891;FXX=0.0506265;HRUN=2;LEN=2;MLLD=210.62;QD=3.45862;RBI=0.036063;REFB=-0.00602187;REVB=-0.0343158;RO=53;SAF=6;SAR=6;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105922;STB=0.59984;STBP=0.494;TYPE=mnp;VARB=0.0487707;OID=.;OPOS=50510999;OREF=TT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:68:75:53:63:12:12:0.16:6:6:31:22:6:6:39:24 chr19 50562372 . T C 234.58 PASS AF=0.46;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00883814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.265;QD=18.7668;RBI=0.0107723;REFB=-0.00597249;REVB=-0.00615865;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272898;STB=0.642131;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0110501;OID=.;OPOS=50562372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:26:27:23:23:0.46:13:10:19:7:13:10:19:8 chr19 50562459 . T G 427.99 PASS AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0150911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8356;QD=19.4539;RBI=0.0254776;REFB=-0.0208131;REVB=0.0205272;RO=45;SAF=21;SAR=22;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000475595;STB=0.500264;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0153561;OID=.;OPOS=50562459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:22:21:22:23:22:21:22:23 chr19 50563402 . T C 30.14 PASS AF=0.1;AO=5;DP=69;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.00539683;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.067;QD=1.72235;RBI=0.011979;REFB=-0.00626308;REVB=-0.0106945;RO=60;SAF=0;SAR=5;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574666;STB=0.862983;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0520473;OID=.;OPOS=50563402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:69:70:60:63:5:7:0.1:5:0:33:27:6:1:35:28 chr19 50665984 . C G 187.35 PASS AF=0.513514;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0443598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5328;QD=20.2539;RBI=0.0542405;REFB=0.00104134;REVB=0.0312128;RO=17;SAF=3;SAR=15;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340843;STB=0.718835;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00212478;OID=.;OPOS=50665984;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:37:17:18:18:19:0.513514:15:3:8:9:16:3:9:9 chr19 50666389 . G A 105.52 PASS AF=0.419355;AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0549256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.579;QD=13.6149;RBI=0.0690569;REFB=-0.0220361;REVB=0.0418573;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506427;STB=0.770305;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0690863;OID=.;OPOS=50666389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:31:17:18:12:13:0.419355:7:5:16:1:8:5:16:2 chr19 50726570 . G A 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00721505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.192;QD=57.6802;RBI=0.0108616;REFB=0;REVB=0.00811893;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1492e-05;OID=.;OPOS=50726570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0 chr19 50762418 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.784;QD=43.4854;RBI=0.0860846;REFB=0;REVB=-0.0816963;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00134768;OID=.;OPOS=50762418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chr19 50771609 . G A 289.14 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.614;QD=52.57;RBI=0.070622;REFB=0;REVB=0.0615588;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958641;OID=.;OPOS=50771609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr19 50796905 . G A 847.69 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396603;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.025;QD=56.5124;RBI=0.0447367;REFB=0;REVB=0.0206985;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031121;OID=.;OPOS=50796905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:60:60:0:0:59:60:1:24:35:0:0:24:36:0:0 chr19 50881820 . A AAAC 54.42 PASS AF=1;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00836668;FXX=0.142653;HRUN=3;LEN=3;MLLD=301.944;QD=36.2816;RBI=0.00836668;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000185657;OID=.;OPOS=50881821;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:6:7:6:6:0:6:0:0:0:3:1:6:0:1:0 chr19 50918737 . G A 367.31 PASS AF=0.411765;AO=42;DP=101;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.0213951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.994;QD=14.4042;RBI=0.0214251;REFB=-0.0119698;REVB=0.00113438;RO=59;SAF=24;SAR=18;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127642;STB=0.502856;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.021481;OID=.;OPOS=50918737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:59:60:42:42:0.411765:18:24:33:26:18:24:34:26 chr19 50967605 . G A 216.47 PASS AF=0.567568;AO=19;DP=36;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0119571;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.558;QD=23.4017;RBI=0.01234;REFB=-0.0146928;REVB=0.00305008;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165088;STB=0.606116;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0182402;OID=.;OPOS=50967605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:16:16:19:21:0.567568:11:8:10:6:13:8:10:6 chr19 51207775 . C T 132.71 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0114948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7404;QD=15.1663;RBI=0.047377;REFB=0.0289449;REVB=-0.0459614;RO=20;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250154;STB=0.646841;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.0374469;OID=.;OPOS=51207775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:12:3:8:12:12:3:8:12 chr19 51297825 . GC AA 325.74 PASS AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.0121179;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=153.358;QD=14.8064;RBI=0.0137546;REFB=-0.00849909;REVB=-0.00650747;RO=50;SAF=19;SAR=17;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00801626;STB=0.50506;STBP=0.964;TYPE=mnp;VARB=0.0090243;OID=.;OPOS=51297825;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:52:36:36:0.409091:17:19:26:24:17:19:27:25 chr19 51301395 . C T 516.47 PASS AF=0.5;AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00843019;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.258;QD=19.1286;RBI=0.0109675;REFB=-0.0161656;REVB=0.00701553;RO=54;SAF=24;SAR=30;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100466;STB=0.555535;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0171714;OID=.;OPOS=51301395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:54:54:0.5:30:24:30:24:30:24:30:24 chr19 51301456 . G A 167.9 PASS AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00215666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.835;QD=15.6189;RBI=0.0114814;REFB=-0.0250759;REVB=0.011277;RO=25;SAF=4;SAR=14;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467078;STB=0.76933;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0313059;OID=.;OPOS=51301456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:14:4:17:8:14:4:17:8 chr19 51302066 . A G 100.75 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0338717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.786;QD=16.1198;RBI=0.0395594;REFB=-0.0284036;REVB=0.0204366;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191053;STB=0.610921;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0240838;OID=.;OPOS=51302066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:8:4:7:6:8:4:7:6 chr19 51321813 . A G 164.18 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0148118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.062;QD=11.1309;RBI=0.0155828;REFB=-0.0191804;REVB=0.00484071;RO=38;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113255;STB=0.565854;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0160628;OID=.;OPOS=51321813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:10:11:16:22:10:11:16:22 chr19 51323232 . T C 178.76 PASS AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.012695;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=133.905;QD=15.2134;RBI=0.013765;REFB=-0.00139646;REVB=-0.00532108;RO=26;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396414;STB=0.744756;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00404527;OID=.;OPOS=51323232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:28:19:19:0.404255:5:14:9:17:5:14:9:19 chr19 51323473 . C G 161.19 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.016426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.61;QD=18.9633;RBI=0.0197307;REFB=-0.0429257;REVB=0.010931;RO=17;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155199;STB=0.588131;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0277134;OID=.;OPOS=51323473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:10:7:10:7:10:7:10:7 chr19 51323501 . A G 284.84 PASS AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00949836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.869;QD=23.7367;RBI=0.00956798;REFB=-0.0272324;REVB=-0.00115218;RO=22;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118083;STB=0.506574;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0278873;OID=.;OPOS=51323501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:15:11:9:13:15:11:9:13 chr19 51326962 . TCCCCCCCA TCCCCCCA,TCCCCCCAC 67.84 PASS AF=0.208696,0.0521739;AO=31,8;DP=117;FAO=24,6;FDP=115;FR=.;FRO=85;FSAF=9,6;FSAR=15,0;FSRF=56;FSRR=29;FWDB=0.0923779,-0.0435666;FXX=0.0495827;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.35024,49.9775;QD=2.35978;RBI=0.216268,0.141892;REFB=-0.136974,-0.0150731;REVB=-0.195545,-0.135038;RO=56;SAF=12,8;SAR=19,0;SRF=35;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.261575,0.615906;STB=0.710998,0.997737;STBP=0.029,0.043;TYPE=del,mnp;VARB=0.159965,0.144534;OID=.,.;OPOS=51326963,51326969;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=TCCCCCCA,TCCCCCCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.208696,0.0521739:31,8:117:24,6:115:85:9,6:15,0:56:29:53:56:12,8:19,0:35:21 chr19 51330932 . G T 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0162528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.056;QD=15.9167;RBI=0.0201401;REFB=-0.0371427;REVB=0.0118941;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00477241;STB=0.502758;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0369581;OID=.;OPOS=51330932;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:8:7:6:7:8:7 chr19 51379893 . C T 345.21 PASS AF=0.431818;AO=36;DP=86;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0314506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9646;QD=15.6912;RBI=0.0641939;REFB=-0.0100585;REVB=0.0559617;RO=50;SAF=21;SAR=15;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167351;STB=0.589941;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0137341;OID=.;OPOS=51379893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:50:50:36:38:0.431818:15:21:21:29:16:22:21:29 chr19 51381777 . C T 1007.01 PASS AF=0.615385;AO=88;DP=143;FAO=88;FDP=143;FR=.;FRO=55;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0143733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.979;QD=28.168;RBI=0.0143751;REFB=-0.0174606;REVB=-0.000229259;RO=54;SAF=49;SAR=39;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271621;STB=0.51148;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0126974;OID=.;OPOS=51381777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:54:55:88:88:0.615385:39:49:28:26:39:49:29:26 chr19 51411636 . G T 727.94 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.435;QD=57.0934;RBI=0.0401584;REFB=0;REVB=0.0175862;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252961;OID=.;OPOS=51411636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0 chr19 51452250 . T C 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00197285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.267;QD=54.7457;RBI=0.0053893;REFB=-0.0330357;REVB=0.00501522;RO=1;SAF=39;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324593;STB=0.517235;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.000429614;OID=.;OPOS=51452250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:14:39:0:1:14:39:0:1 chr19 51485622 . A G 3781.28 PASS AF=1;AO=238;DP=238;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5527;QD=63.5509;RBI=0.0551977;REFB=0;REVB=-0.0541722;RO=0;SAF=122;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125815;OID=.;OPOS=51485622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:238:238:0:0:238:238:1:116:122:0:0:116:122:0:0 chr19 51487175 . T G 301.46 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.316;QD=52.4279;RBI=0.0667021;REFB=0;REVB=-0.0194737;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346162;OID=.;OPOS=51487175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:17:5:0:0:17:6:0:0 chr19 51507053 . C T 293.41 PASS AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0108492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.484;QD=14.8563;RBI=0.0192288;REFB=-0.00480609;REVB=0.0158759;RO=46;SAF=13;SAR=20;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219159;STB=0.623974;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00568053;OID=.;OPOS=51507053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:20:13:28:18:20:13:28:18 chr19 51517731 . A G 754.12 PASS AF=0.677419;AO=62;DP=92;FAO=63;FDP=93;FR=.;FRO=30;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00871047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.508;QD=32.435;RBI=0.0174096;REFB=-0.033691;REVB=-0.0150738;RO=30;SAF=36;SAR=26;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029161;STB=0.512496;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0154383;OID=.;OPOS=51517731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:30:30:62:63:0.677419:26:36:16:14:27:36:16:14 chr19 51519236 . A G 50.47 PASS AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0064038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.974;QD=16.8232;RBI=0.00641622;REFB=-0.0419097;REVB=-0.000398993;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0260957;OID=.;OPOS=51519236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:2:3:3:4:2:3 chr19 51519259 . C T 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.033708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.309;QD=22.6317;RBI=0.035664;REFB=-0.0280343;REVB=0.0116488;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589614;STB=0.533282;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0183037;OID=.;OPOS=51519259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:7:6:3:5:7:6:3:5 chr19 51519364 . T G 174.25 PASS AF=0.708333;AO=16;DP=23;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0440759;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.401;QD=29.0413;RBI=0.0443346;REFB=-0.0851552;REVB=0.00478232;RO=7;SAF=4;SAR=12;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120742;STB=0.572237;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0321103;OID=.;OPOS=51519364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:23:24:7:7:16:17:0.708333:12:4:3:4:13:4:3:4 chr19 51520487 . A C 203.4 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00923811;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.374;QD=15.6458;RBI=0.0237787;REFB=-0.00867439;REVB=0.0219108;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134304;STB=0.507633;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00591364;OID=.;OPOS=51520487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:10:13:16:13:10:13:16:13 chr19 51530693 . G A 1497.58 PASS AF=1;AO=92;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501179;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.501;QD=63.7266;RBI=0.0612088;REFB=0;REVB=0.0351386;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181501;OID=.;OPOS=51530693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:92:94:1:42:50:0:0:42:52:0:0 chr19 51535130 . A G 160.31 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.887;QD=45.8027;RBI=0.0378756;REFB=0;REVB=-0.0355159;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000506393;OID=.;OPOS=51535130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr19 51560017 . GGCCCCCA GCCCCA,GGCCCCA,GGCCCCCAG 69.93 PASS AF=0.407407,0.037037,0;AO=11,5,3;DP=28;FAO=11,1,0;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=3,0,0;FSAR=8,1,0;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.100003,-0.155981,-0.231863;FXX=0;HRUN=5,5,1;LEN=2,1,1;MLLD=23.6373,10.6134,27.722;QD=10.3598;RBI=0.101347,0.155999,0.234203;REFB=-0.0903724,-0.134234,-0.0370153;REVB=0.016455,-0.00235816,0.0330278;RO=9;SAF=3,3,3;SAR=8,2,0;SRF=1;SRR=8;SSEN=0.30137,0.344828,0;SSEP=0,0.305556,0;SSSB=0.176469,0.480172,0.780801;STB=0.624759,0.988956,0.5;STBP=0.29,0.479,1;TYPE=del,del,ins;VARB=0.126102,0.0327626,0;OID=.,.,.;OPOS=51560018,51560019,51560025;OREF=GC,C,-;OALT=-,-,G;OMAPALT=GCCCCA,GGCCCCA,GGCCCCCAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.407407,0.037037,0:11,5,3:28:11,1,0:27:15:3,0,0:8,1,0:7:8:63:9:3,3,3:8,2,0:1:8 chr19 51566943 . G A 635.21 PASS AF=0.602151;AO=56;DP=93;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0160775;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4887;QD=27.3207;RBI=0.0186506;REFB=-0.000673605;REVB=-0.00945285;RO=36;SAF=23;SAR=33;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00441385;STB=0.508894;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000272244;OID=.;OPOS=51566943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:36:37:56:56:0.602151:33:23:15:21:33:23:16:21 chr19 51628529 . A G 972.79 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.599;QD=58.957;RBI=0.0358144;REFB=0;REVB=-0.0262055;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.17024e-06;OID=.;OPOS=51628529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0 chr19 51630482 . C A 632.86 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.589;QD=61.742;RBI=0.0604014;REFB=0;REVB=0.0386269;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248629;OID=.;OPOS=51630482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:22:19:0:0 chr19 51656454 . A T 998.07 PASS AF=1;AO=57;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676704;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.747;QD=58.7098;RBI=0.0676884;REFB=0;REVB=0.0015635;RO=1;SAF=14;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324906;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012743;OID=.;OPOS=51656454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:68:1:0:57:68:1:43:14:1:0:43:25:0:0 chr19 51833081 . G C 31.69 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0385398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5781;QD=14.0842;RBI=0.0700339;REFB=-0.0746603;REVB=0.0584758;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425125;STB=0.760793;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0535774;OID=.;OPOS=51833081;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:3:1:4:1:3:1 chr19 51835892 . T G,TG 684.73 PASS AF=0.0217391,0.978261;AO=2,29;DP=49;FAO=1,45;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00873401,-0.0654615;FXX=0.041658;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=204.335,26.2402;QD=59.5421;RBI=0.0160184,0.0654621;REFB=0,0;REVB=-0.0134278,0.000274497;RO=14;SAF=1,9;SAR=1,20;SRF=2;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.431702,0.12297;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00941993,-0.00224757;OID=.,.;OPOS=51835892,51835893;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:49:46:14:0:2,29:1,45:0.0217391,0.978261:1,20:1,9:2:12:0,32:1,13:0:0 chr19 51837171 . A G 382.88 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0027404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1042;QD=17.4037;RBI=0.0751747;REFB=-0.0432182;REVB=-0.0751248;RO=45;SAF=13;SAR=27;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032553;STB=0.530403;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0319001;OID=.;OPOS=51837171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:48:40:40:0.454545:27:13:16:29:27:13:18:30 chr19 51841417 . C T 296.4 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.235;QD=49.3993;RBI=0.0224995;REFB=-0.147111;REVB=0.0186347;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515138;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00155612;OID=.;OPOS=51841417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:7:16:0:0:7:16:1:0 chr19 51843808 . C T 429.68 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0891557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1562;QD=55.4419;RBI=0.0940475;REFB=0;REVB=0.0299363;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250375;OID=.;OPOS=51843808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:20:10:0:0:20:11:0:0 chr19 51844978 . G T 661.36 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0167527;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.228;QD=60.1236;RBI=0.0175319;REFB=-0.0924802;REVB=0.00516855;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000225849;OID=.;OPOS=51844978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:44:0:1:43:43:0.977273:27:16:0:0:27:16:0:1 chr19 51845371 . T G 1078.37 PASS AF=0.961039;AO=75;DP=77;FAO=74;FDP=77;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0393911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4407;QD=56.0192;RBI=0.0470761;REFB=0.00762375;REVB=0.0257779;RO=2;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286516;STB=0.523071;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.00677945;OID=.;OPOS=51845371;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:77:77:2:3:75:74:0.961039:32:43:0:2:31:43:0:3 chr19 51892683 . T C 130.64 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.014553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.78;QD=13.7514;RBI=0.0392302;REFB=-0.00396401;REVB=-0.0364311;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199743;STB=0.585254;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00640121;OID=.;OPOS=51892683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:38:21:23:15:15:0.394737:8:7:14:7:8:7:14:9 chr19 51920196 . G T 90.76 PASS AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0044606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4914;QD=8.0678;RBI=0.0298271;REFB=-0.00433179;REVB=0.0294917;RO=33;SAF=1;SAR=11;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460505;STB=0.79936;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0158592;OID=.;OPOS=51920196;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:11:1:11:22:11:1:11:22 chr19 51920613 . C T 314.24 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0783753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5517;QD=50.278;RBI=0.11486;REFB=-0.144955;REVB=0.0839651;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521721;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0109633;OID=.;OPOS=51920613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:25:25:0:1:24:24:0.96:13:11:0:0:13:11:1:0 chr19 51957556 . T C 287.92 PASS AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0160827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.915;QD=18.5756;RBI=0.0161997;REFB=-0.00475973;REVB=-0.0019438;RO=31;SAF=16;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865288;STB=0.548256;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00359207;OID=.;OPOS=51957556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:15:16:13:18:15:16:13:18 chr19 51984725 . T A 2258.42 PASS AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100809;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.599;QD=63.6176;RBI=0.0422651;REFB=0;REVB=0.0410453;RO=0;SAF=73;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84831e-05;OID=.;OPOS=51984725;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:69:73:0:0:69:73:0:0 chr19 51984727 . A G 618.07 PASS AF=0.457143;AO=64;DP=140;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.0173313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.348;QD=17.6592;RBI=0.0206942;REFB=0.000426903;REVB=-0.0113083;RO=76;SAF=34;SAR=30;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177075;STB=0.509845;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.000370608;OID=.;OPOS=51984727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:76:76:64:64:0.457143:30:34:39:37:30:34:39:37 chr19 52000624 . T G 385.16 PASS AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00984807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.231;QD=20.5416;RBI=0.0402199;REFB=-0.0195689;REVB=-0.0389956;RO=36;SAF=23;SAR=16;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699503;STB=0.538662;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0216022;OID=.;OPOS=52000624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:16:23:24:12:16:23:24:12 chr19 52000672 . G A 415.36 PASS AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=-0.0104386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.828;QD=19.319;RBI=0.0141445;REFB=-0.0274665;REVB=0.00954473;RO=44;SAF=22;SAR=20;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234174;STB=0.629157;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0338937;OID=.;OPOS=52000672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:20:22:34:10:20:22:34:10 chr19 52001485 . G A 262.76 PASS AF=0.71875;AO=22;DP=31;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0995734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.649;QD=32.8455;RBI=0.0995751;REFB=0.00623608;REVB=0.000580552;RO=9;SAF=2;SAR=20;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174194;STB=0.599899;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00409157;OID=.;OPOS=52001485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:32:9:9:22:23:0.71875:20:2:2:7:21:2:2:7 chr19 52002488 . C A 453.39 PASS AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.00219227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.807;QD=16.3383;RBI=0.0422618;REFB=-0.00723197;REVB=-0.0422049;RO=61;SAF=32;SAR=18;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134483;STB=0.57525;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00708885;OID=.;OPOS=52002488;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:61:50:50:0.45045:18:32:31:30:18:32:31:30 chr19 52002729 . G A 265.77 PASS AF=0.413333;AO=30;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.01891;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.35;QD=14.1742;RBI=0.0664857;REFB=-0.00642584;REVB=0.0637398;RO=42;SAF=12;SAR=18;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152368;STB=0.593689;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0115119;OID=.;OPOS=52002729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:42:44:30:31:0.413333:18:12:23:19:19:12:24:20 chr19 52004743 . G A 296.41 PASS AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=16;FWDB=-0.0336451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.9;QD=13.1736;RBI=0.0372807;REFB=-0.0248581;REVB=0.0160579;RO=56;SAF=15;SAR=19;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292192;STB=0.665515;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0419783;OID=.;OPOS=52004743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:56:56:34:34:0.377778:19:15:40:16:19:15:40:16 chr19 52004759 . C T 280.81 PASS AF=0.354839;AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.0122437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.945;QD=12.0778;RBI=0.0158908;REFB=-0.0121153;REVB=0.0101296;RO=59;SAF=13;SAR=20;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291196;STB=0.661063;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0222176;OID=.;OPOS=52004759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:59:60:33:33:0.354839:20:13:39:20:20:13:39:21 chr19 52004795 . G T 224.8 PASS AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0374747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.562;QD=13.0319;RBI=0.0376033;REFB=-0.00235026;REVB=-0.00310628;RO=42;SAF=10;SAR=17;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238105;STB=0.636263;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00262644;OID=.;OPOS=52004795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:17:10:25:17:17:10:25:17 chr19 52032963 . TC T,TG 403.26 PASS AF=0.32,0.56;AO=11,17;DP=49;FAO=16,28;FDP=50;FR=.;FRO=6;FSAF=10,12;FSAR=6,16;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.108455,0.0208999;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=7.93953,210.181;QD=32.2607;RBI=0.173118,0.0210422;REFB=-0.112876,-0.0562562;REVB=-0.134935,-0.00244302;RO=8;SAF=6,6;SAR=5,11;SRF=5;SRR=3;SSEN=0.5,0;SSEP=0.833333,0;SSSB=-0.0593282,-0.161931;STB=0.535669,0.512811;STBP=0.624,0.734;TYPE=del,snp;VARB=0.0711622,0.0307798;OID=.,.;OPOS=52032964,52032964;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.32,0.56:11,17:49:16,28:50:6:10,12:6,16:3:3:92:8:6,6:5,11:5:3 chr19 52033742 . G A 278.91 PASS AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00136847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.506;QD=16.4066;RBI=0.00647122;REFB=-0.00989397;REVB=0.00632487;RO=37;SAF=16;SAR=15;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00253091;STB=0.501424;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0118299;OID=.;OPOS=52033742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:15:16:19:18:15:16:19:18 chr19 52076960 . T C 159.09 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.745;QD=45.4552;RBI=0.038749;REFB=0;REVB=0.0300359;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292748;OID=.;OPOS=52076960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:3:10:0:0:3:11:0:0 chr19 52076974 . C T 160.24 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.321;QD=45.7833;RBI=0.0448349;REFB=0;REVB=0.022043;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684788;OID=.;OPOS=52076974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0 chr19 52077030 . TGGGGTTTG T 258.66 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553645;FXX=0;HRUN=4;LEN=8;MLLD=307.714;QD=44.9843;RBI=0.016325;REFB=0;REVB=-0.0153575;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.47818e-05;OID=.;OPOS=52077031;OREF=GGGGTTTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:22:22:23:23:0:15:8:0:0:5:0:14:8:0:0 chr19 52077069 . G A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.178;QD=61.3362;RBI=0.0222093;REFB=0;REVB=0.0186252;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27125e-05;OID=.;OPOS=52077069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:11:29:0:0:11:29:0:0 chr19 52090191 . G A 197.18 PASS AF=0.575758;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00358661;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.998;QD=23.9004;RBI=0.0298262;REFB=-0.01281;REVB=0.0296097;RO=15;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184629;STB=0.558077;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00854167;OID=.;OPOS=52090191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:33:15:14:19:19:0.575758:7:12:6:9:7:12:7:7 chr19 52130488 . G A 152.35 PASS AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0463783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6063;QD=21.0142;RBI=0.0562199;REFB=0.0103757;REVB=-0.0317762;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277495;STB=0.654997;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0126961;OID=.;OPOS=52130488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:8:8:11:2:8:8:11:2 chr19 52132325 . A T 135.19 PASS AF=0.25;AO=20;DP=80;FAO=20;FDP=80;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0328825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.563;QD=6.75936;RBI=0.0336712;REFB=-0.00525464;REVB=-0.00724476;RO=60;SAF=11;SAR=9;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142453;STB=0.586763;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0231968;OID=.;OPOS=52132325;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:60:60:20:20:0.25:9:11:26:34:9:11:26:34 chr19 52220351 . G A 267.9 PASS AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0124529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.929;QD=16.2365;RBI=0.02315;REFB=-0.0201711;REVB=0.0195153;RO=36;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323326;STB=0.518206;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0250831;OID=.;OPOS=52220351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:16:14:18:18:16:14:18:18 chr19 52223121 . A G 613.31 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.548;QD=61.3312;RBI=0.0711869;REFB=0;REVB=0.0693775;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265456;OID=.;OPOS=52223121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:13:26:0:0:14:26:0:0 chr19 52223180 . A G 806.71 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00567788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.406;QD=56.6113;RBI=0.00941517;REFB=0;REVB=0.00751047;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.79126e-05;OID=.;OPOS=52223180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:34:22:0:0:34:23:0:0 chr19 52249211 . T G 297.21 PASS AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00545816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.108;QD=18.2899;RBI=0.00783235;REFB=-0.00935438;REVB=-0.00561731;RO=33;SAF=16;SAR=16;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137679;STB=0.507688;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0110725;OID=.;OPOS=52249211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:16:16:16:17:16:16:16:17 chr19 52249702 . G T 45.27 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00218753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.116;QD=20.1204;RBI=0.0550037;REFB=0.0132616;REVB=-0.0549602;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190062;STB=0.614874;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.00224219;OID=.;OPOS=52249702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:9:9:2:2:5:5:0.555556:1:4:1:1:1:4:1:1 chr19 52249947 . C G 153.4 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0178548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4669;QD=13.9456;RBI=0.0194857;REFB=-0.0281741;REVB=-0.00780377;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188284;STB=0.608575;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0211134;OID=.;OPOS=52249947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:9:8:8:19:9:8:8:19 chr19 52250216 . A G 1245.12 PASS AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.918;QD=60.7377;RBI=0.0184259;REFB=0;REVB=-0.00879119;RO=1;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106407;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34956e-05;OID=.;OPOS=52250216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:1:0:81:82:1:44:37:0:1:45:37:0:0 chr19 52506985 . T C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.97;QD=61.336;RBI=0.0640821;REFB=0;REVB=0.0304989;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431956;OID=.;OPOS=52506985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0 chr19 52520607 . C T 298.46 PASS AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.421;QD=51.906;RBI=0.0309836;REFB=0;REVB=-0.00814676;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371877;OID=.;OPOS=52520607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:18:4:0:0:18:5:0:0 chr19 52521296 . G A 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.879;QD=60.2046;RBI=0.0344549;REFB=0;REVB=0.0318549;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.05957e-05;OID=.;OPOS=52521296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:34:39:0:0:34:39:0:0 chr19 52537576 . T G 450.82 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.103;QD=56.3525;RBI=0.0149909;REFB=0;REVB=0.0117158;RO=1;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227606;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47119e-05;OID=.;OPOS=52537576;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:1:0:31:32:1:20:11:0:1:21:11:0:0 chr19 52619065 . T C 211.49 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0276621;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.284;QD=18.7994;RBI=0.0411522;REFB=-0.0195728;REVB=0.0304683;RO=24;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125413;STB=0.571359;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0283251;OID=.;OPOS=52619065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:14:7:11:13:14:7:11:13 chr19 52762384 . C A 126.69 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0682863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5314;QD=11.2611;RBI=0.073912;REFB=0.0136547;REVB=-0.0282836;RO=29;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132331;STB=0.58812;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=-0.038547;OID=.;OPOS=52762384;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:30:15:15:0.333333:7:8:12:17:7:8:12:18 chr19 52803669 . CTG C 260.07 PASS AF=0.416667;AO=28;DP=73;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.00668491;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=2;MLLD=202.721;QD=14.4486;RBI=0.00915271;REFB=-0.0180191;REVB=0.00625172;RO=41;SAF=17;SAR=11;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847631;STB=0.54115;STBP=0.619;TYPE=del;VARB=0.0217011;OID=.;OPOS=52803670;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.416667:28:73:30:72:42:18:12:28:14:99:41:17:11:28:13 chr19 52825032 . C T 195.89 PASS AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00959101;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=299.736;QD=25.2766;RBI=0.0217912;REFB=-0.00173136;REVB=-0.019567;RO=12;SAF=11;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113182;STB=0.563073;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00128992;OID=.;OPOS=52825032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:8:11:5:7:8:11:5:7 chr19 52856955 . C T 195.81 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.011818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.445;QD=17.8005;RBI=0.025507;REFB=0.00780035;REVB=-0.022604;RO=24;SAF=6;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165835;STB=0.594901;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.0139152;OID=.;OPOS=52856955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:14:6:11:13:14:6:11:13 chr19 52917590 . G A 262.17 PASS AF=0.5;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0668766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8676;QD=24.969;RBI=0.0700193;REFB=-0.00322399;REVB=0.0207417;RO=16;SAF=14;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875034;STB=0.565973;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.0317484;OID=.;OPOS=52917590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:16:17:21:21:0.5:7:14:9:7:7:14:9:8 chr19 52937339 . G A 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0309228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1127;QD=9.19974;RBI=0.0560052;REFB=-0.0073108;REVB=0.0466944;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133873;STB=0.581866;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0186758;OID=.;OPOS=52937339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:9:4:3:4:9:4 chr19 52938361 . C A 537.63 PASS AF=0.51;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0156236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1233;QD=21.505;RBI=0.0880857;REFB=0.00175398;REVB=-0.0866891;RO=49;SAF=21;SAR=30;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124311;STB=0.568693;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.00331714;OID=.;OPOS=52938361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:49:49:51:51:0.51:30:21:27:22:30:21:27:22 chr19 52938417 . A G 430.75 PASS AF=0.478261;AO=43;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0294221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1484;QD=18.728;RBI=0.0387112;REFB=-0.0163681;REVB=0.0251574;RO=48;SAF=17;SAR=26;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159146;STB=0.60323;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0326378;OID=.;OPOS=52938417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:48:43:44:0.478261:26:17:27:21:27:17:28:20 chr19 52938459 . A G 345.92 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.00413598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7226;QD=16.8741;RBI=0.0102711;REFB=-0.0199116;REVB=0.00940153;RO=45;SAF=14;SAR=23;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154032;STB=0.58653;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0225185;OID=.;OPOS=52938459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:23:14:24:21:23:14:24:21 chr19 52941171 . T C 182.93 PASS AF=0.4;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0271655;FXX=0.017854;HRUN=6;LEN=1;MLLD=53.1778;QD=13.3041;RBI=0.103112;REFB=0.0116377;REVB=0.099469;RO=32;SAF=17;SAR=5;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373458;STB=0.693688;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.0147799;OID=.;OPOS=52941171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:32:33:22:22:0.4:5:17:14:18:5:17:16:17 chr19 52941847 . A T 177.07 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0209974;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.571;QD=20.2367;RBI=0.0239846;REFB=-0.0170073;REVB=-0.0115917;RO=17;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126496;STB=0.571351;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0135869;OID=.;OPOS=52941847;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:17:17:18:18:0.514286:9:9:6:11:9:9:6:11 chr19 52942159 . A G 39.61 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0329829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.804;QD=13.2047;RBI=0.0544777;REFB=0.0719737;REVB=0.0433584;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396745;STB=0.736113;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.0170565;OID=.;OPOS=52942159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:1:5:2:4:1:5 chr19 52942495 . G A 49.61 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0339774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3737;QD=15.2644;RBI=0.0381684;REFB=-0.0263127;REVB=0.0173886;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304739;STB=0.681283;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0261847;OID=.;OPOS=52942495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:5:2:4:2:5:2:4:2 chr19 52954507 . T C 816.38 PASS AF=0.50303;AO=83;DP=166;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=-0.0200215;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.183;QD=19.791;RBI=0.020132;REFB=-0.0202988;REVB=-0.0021064;RO=82;SAF=39;SAR=44;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712111;STB=0.539159;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0188248;OID=.;OPOS=52954507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:82:82:83:83:0.50303:44:39:45:37:44:39:45:37 chr19 53014346 . G A 322.13 PASS AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00810708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.988;QD=21.4751;RBI=0.0132821;REFB=-0.0296517;REVB=-0.0105208;RO=27;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220302;STB=0.512188;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0106169;OID=.;OPOS=53014346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:15:18:14:13:15:18:14:13 chr19 53015384 . A G 101.59 PASS AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0255908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.712;QD=16.9315;RBI=0.0262532;REFB=-0.0171903;REVB=0.00586011;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312315;STB=0.681497;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0240469;OID=.;OPOS=53015384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:7:5:9:3:7:5 chr19 53015987 . C G 37.15 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0252464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.167;QD=8.25462;RBI=0.0516742;REFB=0.00919432;REVB=0.0450871;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946031;STB=0.559795;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.0125897;OID=.;OPOS=53015987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:5:7:4:2:5:7 chr19 53056465 . G A 175.62 PASS AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0313707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3738;QD=13.7744;RBI=0.0337129;REFB=0.0189538;REVB=0.0123466;RO=31;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509175;STB=0.529382;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.0304313;OID=.;OPOS=53056465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:10:10:14:17:10:10:14:17 chr19 53057925 . C A 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00528852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.765;QD=17.3781;RBI=0.029544;REFB=-0.0274165;REVB=-0.0290668;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154239;STB=0.588087;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0170697;OID=.;OPOS=53057925;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:2:8:7:4:2:8 chr19 53059235 . T G 74.48 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0468553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.619;QD=22.9167;RBI=0.0469171;REFB=-0.00432866;REVB=0.00240618;RO=4;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228994;STB=0.63128;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00315904;OID=.;OPOS=53059235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:3:6:1:3:3:6:1:3 chr19 53075519 . G T 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0388987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.506;QD=12.9748;RBI=0.05054;REFB=0.0019326;REVB=-0.0322673;RO=18;SAF=10;SAR=2;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404817;STB=0.742785;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00649341;OID=.;OPOS=53075519;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:2:10:9:9:2:10:9:9 chr19 53077411 . T C 1301.7 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4387;QD=61.9858;RBI=0.0515336;REFB=0;REVB=0.00951743;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484801;OID=.;OPOS=53077411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:43:40:0:0:43:41:0:0 chr19 53085659 . C T 59.19 PASS AF=0.533333;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00285091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.736;QD=15.7832;RBI=0.00336575;REFB=-0.0502536;REVB=-0.00178902;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161108;STB=0.571264;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0116921;OID=.;OPOS=53085659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:14:15:7:7:7:8:0.533333:2:5:6:1:2:6:6:1 chr19 53085813 . T C 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0330824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.074;QD=16.4264;RBI=0.0393003;REFB=-0.00698633;REVB=-0.0212147;RO=11;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325354;STB=0.689298;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0067999;OID=.;OPOS=53085813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:8:3:7:4:8:3:7:4 chr19 53086124 . C A 110.74 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0233932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.183;QD=15.2741;RBI=0.0384754;REFB=0.00700999;REVB=0.030547;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219892;STB=0.646177;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.00957259;OID=.;OPOS=53086124;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:4:9:7:8:4:9:7:9 chr19 53116643 . T C 246.92 PASS AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0547116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.103;QD=24.692;RBI=0.0584615;REFB=-0.0107008;REVB=0.0206008;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126768;STB=0.509083;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00930189;OID=.;OPOS=53116643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:16:17:23:23:0.575:14:9:6:10:14:9:7:10 chr19 53117531 . C T 86.3 PASS AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0214316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.853;QD=12.3292;RBI=0.0216271;REFB=-0.0108292;REVB=0.00290155;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136212;STB=0.5805;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00937988;OID=.;OPOS=53117531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:6:5:10:7:6:5:10:7 chr19 53117809 . C A 442.03 PASS AF=0.7;AO=34;DP=49;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0180327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.7336;QD=35.3621;RBI=0.0180341;REFB=-0.02391;REVB=-0.000230963;RO=15;SAF=20;SAR=14;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316535;STB=0.511621;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00657502;OID=.;OPOS=53117809;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:15:15:34:35:0.7:14:20:8:7:15:20:8:7 chr19 53209553 . GG AT 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0256669;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=247.852;QD=15.2589;RBI=0.0258673;REFB=-0.00980739;REVB=-0.00321346;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414385;STB=0.744007;STBP=0.111;TYPE=mnp;VARB=0.00240253;OID=.;OPOS=53209553;OREF=GG;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:5:2:5:1:5:2:5:1 chr19 53270384 . A G 205.15 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00282797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.364;QD=16.4116;RBI=0.0212078;REFB=-0.00958925;REVB=-0.0210184;RO=29;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990281;STB=0.556569;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0143885;OID=.;OPOS=53270384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:11:10:11:18:11:10:11:18 chr19 53303527 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.324;QD=50.4134;RBI=0.056779;REFB=0;REVB=0.0476461;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229248;OID=.;OPOS=53303527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:8:10:0:0:8:11:0:0 chr19 53303890 . C G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.786;QD=46.8479;RBI=0.0634368;REFB=0;REVB=0.0232602;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111606;OID=.;OPOS=53303890;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr19 53304563 . T C 805.0 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4101;QD=64.4003;RBI=0.034809;REFB=0;REVB=0.0320693;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00066079;OID=.;OPOS=53304563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0 chr19 53321171 . G A 349.25 PASS AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.000254143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.547;QD=20.2462;RBI=0.0160484;REFB=-0.0191144;REVB=-0.0160464;RO=33;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586232;STB=0.532536;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0167467;OID=.;OPOS=53321171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:14:22:18:15:14:22:18:15 chr19 53344116 . ACC AC,ACG 156.0 PASS AF=0.142857,0.857143;AO=2,12;DP=14;FAO=2,12;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8;FSAR=2,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163441,-0.00896021;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=33.6457,61.9497;QD=44.5703;RBI=0.118635,0.144734;REFB=0,0;REVB=-0.117504,-0.144456;RO=0;SAF=0,8;SAR=2,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0717194,0.0163559;OID=.,.;OPOS=53344117,53344118;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=AC,ACG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.142857,0.857143:2,12:14:2,12:14:0:0,8:2,4:0:0:6:0:0,8:2,4:0:0 chr19 53345321 . T G 1117.59 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.918;QD=60.4102;RBI=0.0875121;REFB=0;REVB=0.0571864;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449818;OID=.;OPOS=53345321;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:41:32:0:0:42:32:0:0 chr19 53384700 . CA C 61.13 PASS AF=0.5;AO=9;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0881775;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.8762;QD=9.40414;RBI=0.128575;REFB=-0.098845;REVB=0.0935747;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244315;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=del;VARB=0.125225;OID=.;OPOS=53384701;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:9:25:13:26:13:6:7:7:6:60:14:3:6:8:6 chr19 53391402 . A G 399.41 PASS AF=0.38843;AO=47;DP=121;FAO=47;FDP=121;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=49;FSRR=25;FWDB=-0.0261014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.85;QD=13.2035;RBI=0.0283117;REFB=-0.00430309;REVB=-0.0109667;RO=74;SAF=34;SAR=13;SRF=49;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788837;STB=0.544898;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00629667;OID=.;OPOS=53391402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:74:74:47:47:0.38843:13:34:49:25:13:34:49:25 chr19 53453777 . C T 135.07 PASS AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00832523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.885;QD=16.884;RBI=0.0292;REFB=-0.0224512;REVB=0.0279881;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961734;STB=0.555478;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0260621;OID=.;OPOS=53453777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:11:4:6:11:11:4:6:11 chr19 53453873 . T C 109.25 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00335009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.867;QD=14.0969;RBI=0.00337022;REFB=-0.0158245;REVB=-0.000367795;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171008;STB=0.599845;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0420206;OID=.;OPOS=53453873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:10:8:8:5:10:8 chr19 53454475 . C CACT 257.54 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0111131;FXX=0.040808;HRUN=0;LEN=3;MLLD=262.039;QD=21.9181;RBI=0.0112889;REFB=-0.00530309;REVB=0.00198464;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184232;STB=0.593562;STBP=0.202;TYPE=ins;VARB=0.00966055;OID=.;OPOS=53454476;OREF=-;OALT=ACT;OMAPALT=CACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.510638:24:49:24:47:23:14:10:9:14:99:24:14:10:9:15 chr19 53454543 . G A 299.16 PASS AF=0.55102;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00348878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5161;QD=24.4216;RBI=0.0449792;REFB=-4.74174e-05;REVB=-0.0448437;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207053;STB=0.619971;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.000301034;OID=.;OPOS=53454543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:22:22:26:27:0.55102:10:16:8:14:10:17:8:14 chr19 53454789 . A T 309.47 PASS AF=0.441558;AO=35;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0346725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0373;QD=16.0761;RBI=0.0360543;REFB=-0.0167063;REVB=-0.00988592;RO=42;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878;STB=0.565179;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.024944;OID=.;OPOS=53454789;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:43:35:34:0.441558:19:16:23:19:19:15:24:19 chr19 53553686 . G A 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00175233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.336;QD=20.2683;RBI=0.00204965;REFB=-0.015413;REVB=0.00106321;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427514;STB=0.524115;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0159958;OID=.;OPOS=53553686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:9:12:11:10:9:12:11:10 chr19 53576589 . C G 262.78 PASS AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0071458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.751;QD=15.0162;RBI=0.00739146;REFB=-0.0106938;REVB=-0.00188977;RO=39;SAF=15;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640877;STB=0.528552;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0121937;OID=.;OPOS=53576589;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:40:30:30:0.428571:15:15:22:17:15:15:22:18 chr19 53577419 . G C 261.26 PASS AF=0.416667;AO=31;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0921621;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1459;QD=14.5146;RBI=0.0925427;REFB=0.00824909;REVB=-0.0083839;RO=41;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881673;STB=0.531348;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=-0.0134201;OID=.;OPOS=53577419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:42:31:30:0.416667:17:14:15:26:17:13:16:26 chr19 53612311 . T C 77.28 PASS AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00994985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.816;QD=13.4407;RBI=0.0350858;REFB=-0.0164184;REVB=0.0336455;RO=13;SAF=2;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426955;STB=0.754173;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.029577;OID=.;OPOS=53612311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:8:2:8:5:8:2:8:5 chr19 53612720 . T C 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0326398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.575;QD=8.69144;RBI=0.089542;REFB=0.0127365;REVB=0.0833811;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429261;STB=0.764058;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.0154185;OID=.;OPOS=53612720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:2:6:6:11:2:6:6:11 chr19 53612745 . T C 144.95 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0116787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181;QD=16.5653;RBI=0.0152741;REFB=-0.0153898;REVB=-0.00984404;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212598;STB=0.622483;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0259021;OID=.;OPOS=53612745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:5:11:9:10:5:11:9:10 chr19 53612757 . T G 259.12 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00542583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.673;QD=24.1046;RBI=0.0155864;REFB=0.00226969;REVB=-0.0146115;RO=19;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208682;STB=0.511618;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.00401126;OID=.;OPOS=53612757;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:12:12:10:9:12:12:10:9 chr19 53612989 . A G 203.8 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00455383;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5803;QD=14.3017;RBI=0.0260213;REFB=-0.0157835;REVB=0.0256197;RO=33;SAF=8;SAR=16;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161669;STB=0.592513;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0174276;OID=.;OPOS=53612989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:16:8:16:17:16:8:16:17 chr19 53645291 . T C 244.1 PASS AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.022975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8711;QD=18.7769;RBI=0.0230094;REFB=-0.0242328;REVB=0.00125784;RO=26;SAF=16;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358533;STB=0.520108;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0222168;OID=.;OPOS=53645291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:10:16:15:11:10:16:15:11 chr19 53667804 . C T 201.54 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00679252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.282;QD=13.8996;RBI=0.032013;REFB=0.0058881;REVB=-0.0312841;RO=34;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906085;STB=0.551682;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.015313;OID=.;OPOS=53667804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:12:12:20:14:12:12:20:14 chr19 53667913 . A G 292.79 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0227817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.903;QD=17.223;RBI=0.0237158;REFB=-0.00175173;REVB=-0.00659025;RO=35;SAF=17;SAR=15;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690545;STB=0.545843;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00227632;OID=.;OPOS=53667913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:36:32:32:0.470588:15:17:16:19:15:17:16:20 chr19 53667940 . A G 300.64 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0263836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.791;QD=21.4745;RBI=0.0270484;REFB=0.0065132;REVB=0.00595988;RO=23;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105557;STB=0.573534;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00675734;OID=.;OPOS=53667940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:25:31:31:0.553571:16:15:8:15:16:15:8:17 chr19 53669273 . T C 566.79 PASS AF=0.95122;AO=37;DP=39;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00721468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.586;QD=55.2962;RBI=0.0123963;REFB=-0.140312;REVB=0.0100805;RO=2;SAF=17;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519525;STB=0.527763;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.000821234;OID=.;OPOS=53669273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:39:41:2:2:37:39:0.95122:20:17:2:0:22:17:2:0 chr19 53669492 . A G 203.23 PASS AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0131567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.268;QD=21.971;RBI=0.0137266;REFB=-0.0185043;REVB=0.00391422;RO=17;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199317;STB=0.612074;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0212244;OID=.;OPOS=53669492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:7:13:7:10:7:13:7:10 chr19 53727097 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=349.461;QD=47.8223;RBI=0.0109557;REFB=0;REVB=0.00420604;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26822e-05;OID=.;OPOS=53727097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0 chr19 53727145 . G GGTTTT 39.01 PASS AF=0.4;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0230044;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=287.714;QD=10.4037;RBI=0.0268903;REFB=-0.00646256;REVB=-0.0139242;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.434685;STB=0.812863;STBP=0.095;TYPE=ins;VARB=0.00809562;OID=.;OPOS=53727146;OREF=-;OALT=GTTTT;OMAPALT=GGTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:6:17:6:15:9:5:1:3:6:39:11:5:1:5:6 chr19 53740822 . T C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.328;QD=39.2068;RBI=0.0265825;REFB=0;REVB=0.0199993;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373461;OID=.;OPOS=53740822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chr19 53741068 . C T 708.52 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9402;QD=62.9799;RBI=0.0296632;REFB=0;REVB=-0.00776318;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000421593;OID=.;OPOS=53741068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0 chr19 53741188 . C T 837.03 PASS AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0118812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.334;QD=55.8023;RBI=0.0119922;REFB=0.0337326;REVB=-0.0016282;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.509801;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=4.1724e-05;OID=.;OPOS=53741188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:60:60:0:1:59:59:0.983333:34:25:0:0:34:25:1:0 chr19 53761740 . T C 305.43 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0535629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5678;QD=17.7063;RBI=0.0540525;REFB=-0.0506842;REVB=-0.00725851;RO=36;SAF=21;SAR=12;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252158;STB=0.514116;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0409351;OID=.;OPOS=53761740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:12:21:22:14:12:21:22:14 chr19 53762537 . C T 336.32 PASS AF=0.6;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0131536;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.378;QD=24.4597;RBI=0.0133698;REFB=0.000145867;REVB=0.00239431;RO=25;SAF=22;SAR=11;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273534;STB=0.641888;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.000109902;OID=.;OPOS=53762537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:55:25:22:33:33:0.6:11:22:8:17:11:22:7:15 chr19 53770261 . T C 41.21 PASS AF=0.162791;AO=7;DP=43;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00439666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.597;QD=3.83351;RBI=0.00517546;REFB=-0.00103569;REVB=0.00273034;RO=35;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354128;STB=0.510175;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0173715;OID=.;OPOS=53770261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:43:43:35:36:7:7:0.162791:4:3:14:21:4:3:15:21 chr19 53784899 . C T 506.38 PASS AF=0.473684;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=114;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.0112373;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.108;QD=17.7679;RBI=0.0135603;REFB=-0.0206361;REVB=0.00758977;RO=59;SAF=23;SAR=31;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624062;STB=0.539381;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0258005;OID=.;OPOS=53784899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:59:60:54:54:0.473684:31:23:29:30:31:23:30:30 chr19 53787375 . C T 148.11 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00939623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.235;QD=17.9527;RBI=0.0326509;REFB=-0.0300124;REVB=0.0312697;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14083;STB=0.579738;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.027499;OID=.;OPOS=53787375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:4:13:10:6:4:13 chr19 53793042 . G A 75.14 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0256583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.916;QD=11.1311;RBI=0.0398197;REFB=-0.00226009;REVB=-0.030451;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191932;STB=0.615758;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0031888;OID=.;OPOS=53793042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:7:3:8:9:7:3:8:9 chr19 53793574 . A G 374.16 PASS AF=0.46988;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00810518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.625;QD=18.0321;RBI=0.00952963;REFB=-0.00173457;REVB=-0.00501198;RO=44;SAF=27;SAR=12;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363539;STB=0.520332;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00176564;OID=.;OPOS=53793574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:44:44:39:39:0.46988:12:27:29:15:12:27:29:15 chr19 53793798 . C T 240.41 PASS AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0193215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.812;QD=28.2831;RBI=0.0208259;REFB=-0.000711661;REVB=0.00777155;RO=12;SAF=12;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787447;STB=0.543439;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000517198;OID=.;OPOS=53793798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:10:12:8:4:10:12:8:4 chr19 53793888 . C A 69.28 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0103718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.66;QD=30.7903;RBI=0.0116034;REFB=0.0365324;REVB=0.0052022;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978599;STB=0.555418;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.00135226;OID=.;OPOS=53793888;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:4:4:0:1:4:4:0:1 chr19 53793911 . T A 89.74 PASS AF=0.714286;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.026655;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0562;QD=25.6387;RBI=0.0638701;REFB=0.0333387;REVB=-0.0580422;RO=5;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125849;STB=0.545366;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.0167458;OID=.;OPOS=53793911;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:15:14:5:4:10:10:0.714286:6:4:1:4:6:4:1:3 chr19 53794858 . G A 236.45 PASS AF=0.345238;AO=29;DP=84;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=0.0013679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.994;QD=11.2596;RBI=0.0367696;REFB=-0.0117376;REVB=-0.0367441;RO=54;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24857;STB=0.635092;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0254027;OID=.;OPOS=53794858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:54:55:29:29:0.345238:14:15:16:38:14:15:17:38 chr19 53854397 . G C 160.51 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0154549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.712;QD=18.3441;RBI=0.0416111;REFB=-0.0167299;REVB=0.0386346;RO=17;SAF=4;SAR=13;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131328;STB=0.598202;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0230946;OID=.;OPOS=53854397;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:18:17:17:0.485714:13:4:6:11:13:4:7:11 chr19 53875494 . A T 670.24 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6466;QD=62.3476;RBI=0.0624986;REFB=0;REVB=0.0609975;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492955;OID=.;OPOS=53875494;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr19 53875523 . G A 690.56 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.093;QD=62.7784;RBI=0.0496319;REFB=0;REVB=0.0358655;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195651;OID=.;OPOS=53875523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:17:25:0:0:17:27:0:0 chr19 53875569 . G A 582.41 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0334896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.135;QD=58.2414;RBI=0.061136;REFB=0.023793;REVB=0.0511475;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000116068;OID=.;OPOS=53875569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:1:0:17:22:1:0 chr19 53911973 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.277;QD=39.2068;RBI=0.0497522;REFB=0;REVB=-0.0473819;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000563599;OID=.;OPOS=53911973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chr19 53912242 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.626;QD=51.1846;RBI=0.0383603;REFB=0;REVB=-0.0212636;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00101798;OID=.;OPOS=53912242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr19 53952885 . TC GT,T 393.16 PASS AF=0.0606061,0.939394;AO=2,29;DP=33;FAO=2,31;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=2,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148372,0.0515034;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=25.4795,18.2263;QD=47.6556;RBI=0.0598766,0.109239;REFB=0,0;REVB=-0.0580092,-0.0963351;RO=1;SAF=0,15;SAR=2,14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0.423503;SSSB=0,0.03211;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=-0.065958,0.0180141;OID=.,.;OPOS=53952885,53952886;OREF=TC,C;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:33:33:1:0:2,29:2,31:0.0606061,0.939394:2,14:0,15:0:1:2,15:0,16:0:0 chr19 53958126 . T G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7669;QD=53.9109;RBI=0.0307377;REFB=0;REVB=0.0305107;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000529767;OID=.;OPOS=53958126;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:5:19:0:0:5:19:0:0 chr19 53958263 . G A 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.899;QD=57.6807;RBI=0.0399678;REFB=0;REVB=-0.000963236;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000497771;OID=.;OPOS=53958263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0 chr19 53959343 . G A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.697;QD=49.5989;RBI=0.0976848;REFB=0;REVB=0.0970242;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181437;OID=.;OPOS=53959343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0 chr19 53959568 . G C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.8;QD=47.8223;RBI=0.0259224;REFB=0;REVB=0.00857731;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361787;OID=.;OPOS=53959568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr19 53990002 . G A 2072.98 PASS AF=0.691057;AO=169;DP=246;FAO=170;FDP=246;FR=.;FRO=76;FSAF=73;FSAR=97;FSRF=24;FSRR=52;FWDB=-0.000586131;FXX=0.00404842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.47;QD=33.707;RBI=0.00816143;REFB=-0.00914802;REVB=0.00814036;RO=75;SAF=72;SAR=97;SRF=23;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709496;STB=0.536178;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0047719;OID=.;OPOS=53990002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:75:76:169:170:0.691057:97:72:23:52:97:73:24:52 chr19 53993764 . A T 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.999;QD=61.6839;RBI=0.0402843;REFB=0;REVB=0.0394596;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172414;OID=.;OPOS=53993764;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chr19 53995004 . G A 295.25 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0486296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.572;QD=49.2081;RBI=0.0653807;REFB=-0.0660015;REVB=0.0437012;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342828;STB=0.518502;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00271019;OID=.;OPOS=53995004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:13:10:0:1:13:10:0:1 chr19 54191743 . A G 191.54 PASS AF=0.558824;AO=18;DP=33;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-8.25269e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.518;QD=22.5343;RBI=0.0154186;REFB=-0.0168248;REVB=0.0154184;RO=15;SAF=4;SAR=14;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342305;STB=0.661982;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0139588;OID=.;OPOS=54191743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:15:15:18:19:0.558824:14:4:9:6:14:5:9:6 chr19 54308554 . C T 62.39 PASS AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.000110709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.965;QD=13.8633;RBI=0.0120195;REFB=-0.0397638;REVB=-0.012019;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645053;STB=0.559863;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0453729;OID=.;OPOS=54308554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:17:18:9:9:8:9:0.5:3:5:5:4:3:6:5:4 chr19 54377665 . G A 218.54 PASS AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0267802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8629;QD=31.2201;RBI=0.0474783;REFB=-0.0409852;REVB=0.0392047;RO=8;SAF=11;SAR=9;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154571;STB=0.585022;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0203526;OID=.;OPOS=54377665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:8:8:20:20:0.714286:9:11:2:6:9:11:2:6 chr19 54378099 . GA AG 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00482773;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=71.8317;QD=40.7629;RBI=0.0174732;REFB=0;REVB=0.016793;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000737;OID=.;OPOS=54378099;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0 chr19 54378627 . T A 2205.71 PASS AF=0.973856;AO=149;DP=153;FAO=149;FDP=153;FR=.;FRO=4;FSAF=107;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00669213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.393;QD=57.6656;RBI=0.0117031;REFB=-0.0351025;REVB=0.00960097;RO=2;SAF=107;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00880716;STB=0.50103;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.000479884;OID=.;OPOS=54378627;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:153:153:2:4:149:149:0.973856:42:107:2:0:42:107:3:1 chr19 54378789 . C G 2271.17 PASS AF=1;AO=144;DP=149;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0780595;FXX=0.0503113;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6989;QD=60.1634;RBI=0.0808067;REFB=0;REVB=0.0208911;RO=0;SAF=54;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122697;OID=.;OPOS=54378789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:149:151:0:0:144:151:1:90:54:0:0:95:56:0:0 chr19 54378795 . G A 35.28 PASS AF=0.109091;AO=10;DP=124;FAO=12;FDP=110;FR=.;FRO=98;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=77;FWDB=0.0112626;FXX=0.153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.159;QD=1.28279;RBI=0.0151952;REFB=-0.00412341;REVB=0.0102003;RO=84;SAF=0;SAR=10;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610447;STB=0.544234;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0565275;OID=.;OPOS=54378795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:124:110:84:98:10:12:0.109091:10:0:35:49:9:3:21:77 chr19 54379573 . C T 175.59 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5143;QD=46.8235;RBI=0.0545006;REFB=0;REVB=-0.0279592;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00372029;OID=.;OPOS=54379573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr19 54385820 . C T 2418.23 PASS AF=0.99375;AO=158;DP=161;FAO=159;FDP=160;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141259;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.169;QD=60.4558;RBI=0.0236713;REFB=-0.0840555;REVB=0.0189945;RO=1;SAF=78;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606085;STB=0.503144;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=2.29702e-05;OID=.;OPOS=54385820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:161:160:1:1:158:159:0.99375:80:78:1:0:80:79:1:0 chr19 54394965 . T C 419.36 PASS AF=0.452632;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0029386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.401;QD=17.6571;RBI=0.0163917;REFB=0.00401582;REVB=-0.0161261;RO=52;SAF=22;SAR=21;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489641;STB=0.527385;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.00496504;OID=.;OPOS=54394965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:52:52:43:43:0.452632:21:22:24:28:21:22:24:28 chr19 54409996 . C T 442.0 PASS AF=0.701754;AO=39;DP=57;FAO=40;FDP=57;FR=.;FRO=17;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0173355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.886;QD=31.0172;RBI=0.0197662;REFB=-0.0256828;REVB=-0.00949648;RO=17;SAF=25;SAR=14;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100204;STB=0.556768;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0132857;OID=.;OPOS=54409996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:17:17:39:40:0.701754:14:25:8:9:14:26:8:9 chr19 54561792 . G A 161.51 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.031034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.415;QD=19.0014;RBI=0.0310343;REFB=-0.0249604;REVB=-0.000129777;RO=17;SAF=4;SAR=13;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189116;STB=0.608373;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0401472;OID=.;OPOS=54561792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:13:4:7:10:13:4:7:10 chr19 54600232 . A C 563.78 PASS AF=0.53271;AO=57;DP=107;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00332011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.7912;QD=21.0761;RBI=0.0342042;REFB=0.00576864;REVB=-0.0340426;RO=49;SAF=33;SAR=24;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758747;STB=0.537375;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.0116132;OID=.;OPOS=54600232;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:49:50:57:57:0.53271:24:33:24:25:24:33:25:25 chr19 54606209 . T G 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0223491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.838;QD=7.76204;RBI=0.0360718;REFB=-0.00662977;REVB=-0.0283141;RO=13;SAF=5;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302036;STB=0.696919;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0144374;OID=.;OPOS=54606209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:1:5:8:5:1:5:8:5 chr19 54649671 . T C 272.95 PASS AF=1;AO=12;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0920806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.658;QD=51.9905;RBI=0.104905;REFB=0;REVB=0.0502615;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126046;OID=.;OPOS=54649671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:12:21:1:8:4:0:0:13:8:0:0 chr19 54652203 . T C 36.87 PASS AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0546936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6282;QD=7.76122;RBI=0.075805;REFB=-0.0297755;REVB=-0.0524882;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210359;STB=0.631171;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0523265;OID=.;OPOS=54652203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:9:4:3:3:9:4 chr19 54664209 . G C 244.23 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0759347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9897;QD=13.0254;RBI=0.0884033;REFB=-0.0148547;REVB=0.0452666;RO=45;SAF=8;SAR=21;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223101;STB=0.636264;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0265079;OID=.;OPOS=54664209;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:46:29:29:0.386667:21:8:21:24:21:8:22:24 chr19 54664752 . A C 190.27 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0138928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.88;QD=21.7452;RBI=0.0141171;REFB=0.00100496;REVB=0.00250665;RO=16;SAF=6;SAR=13;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160953;STB=0.59081;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000805394;OID=.;OPOS=54664752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:13:6:8:8:13:6:8:8 chr19 54665970 . C T 223.82 PASS AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0379371;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0244;QD=20.3474;RBI=0.0687046;REFB=-0.0186072;REVB=0.0572808;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107592;STB=0.546177;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0459458;OID=.;OPOS=54665970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:21:22:22:22:0.5:12:10:7:14:12:10:8:14 chr19 54674742 . C T 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00484225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.463;QD=18.49;RBI=0.01634;REFB=-0.0224112;REVB=-0.015606;RO=26;SAF=8;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205612;STB=0.616751;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0188311;OID=.;OPOS=54674742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:14:8:15:11:14:8:15:11 chr19 54676763 . C T 242.46 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00880978;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.833;QD=14.9204;RBI=0.00882721;REFB=-0.00154584;REVB=0.000554514;RO=37;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322349;STB=0.518259;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00175361;OID=.;OPOS=54676763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:15:13:16:21:15:13:16:21 chr19 54676814 . G GC 204.2 PASS AF=0.491525;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0823015;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=28.497;QD=13.8442;RBI=0.102267;REFB=-0.0228908;REVB=0.0607039;RO=36;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180002;STB=0.592961;STBP=0.183;TYPE=ins;VARB=0.0237071;OID=.;OPOS=54676815;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.491525:29:65:29:59:30:15:14:10:20:99:36:15:14:12:24 chr19 54677189 . C T 411.53 PASS AF=0.506173;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0434615;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.527;QD=20.3224;RBI=0.0434868;REFB=-0.0301089;REVB=0.00148361;RO=40;SAF=22;SAR=19;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797507;STB=0.544159;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0181324;OID=.;OPOS=54677189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:81:40:40:41:41:0.506173:19:22:25:15:19:22:25:15 chr19 54677759 . T C 817.71 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.465;QD=57.3834;RBI=0.0237552;REFB=0;REVB=-0.0195691;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.66924e-06;OID=.;OPOS=54677759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chr19 54697079 . C T 251.69 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0359147;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.043;QD=17.064;RBI=0.036655;REFB=-0.00432856;REVB=0.00732973;RO=31;SAF=19;SAR=9;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131582;STB=0.57419;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00479687;OID=.;OPOS=54697079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:9:19:17:14:9:19:17:14 chr19 54697172 . T C 244.2 PASS AF=0.386667;AO=28;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.026582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.715;QD=13.0238;RBI=0.0491552;REFB=-0.0130478;REVB=-0.0413477;RO=46;SAF=18;SAR=10;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226698;STB=0.636776;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0184166;OID=.;OPOS=54697172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:28:29:0.386667:10:18:20:26:10:19:20:26 chr19 54725156 . T C 74.97 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0792846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3976;QD=37.4872;RBI=0.0792896;REFB=0;REVB=-0.000885936;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00639544;OID=.;OPOS=54725156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr19 54725798 . G T 854.55 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0560405;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.6704;QD=56.0363;RBI=0.133464;REFB=-0.140726;REVB=0.121128;RO=1;SAF=42;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111061;STB=0.50588;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00447984;OID=.;OPOS=54725798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:18:42:1:0:18:42:1:0 chr19 54725930 . C T 666.5 PASS AF=0.515625;AO=66;DP=129;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.0146104;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3618;QD=20.8282;RBI=0.0609309;REFB=0.0129436;REVB=-0.0591533;RO=62;SAF=40;SAR=26;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515915;STB=0.528341;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.0123528;OID=.;OPOS=54725930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:62:62:66:66:0.515625:26:40:41:21:26:40:41:21 chr19 54725995 . G A 690.2 PASS AF=0.531746;AO=67;DP=128;FAO=67;FDP=126;FR=.;FRO=59;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=-0.0421063;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1829;QD=21.9112;RBI=0.0421063;REFB=-0.0221282;REVB=-4.80601e-05;RO=59;SAF=38;SAR=29;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826871;STB=0.545286;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0204989;OID=.;OPOS=54725995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:126:59:59:67:67:0.531746:29:38:39:20:29:38:39:20 chr19 54726816 . A T 336.2 PASS AF=0.402174;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0111101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.418;QD=14.6176;RBI=0.0183287;REFB=-0.0214224;REVB=-0.0145777;RO=54;SAF=19;SAR=18;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335246;STB=0.524356;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.036032;OID=.;OPOS=54726816;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:54:55:37:37:0.402174:18:19:26:28:18:19:26:29 chr19 54726833 . T C 328.78 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.101757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4077;QD=15.4719;RBI=0.101773;REFB=-0.0308678;REVB=0.00177413;RO=49;SAF=19;SAR=17;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00290207;STB=0.501638;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0389627;OID=.;OPOS=54726833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:17:19:26:23:17:19:26:23 chr19 54726839 . C T 342.48 PASS AF=0.430233;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0139259;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4733;QD=15.9294;RBI=0.0144125;REFB=-0.0353475;REVB=-0.00371354;RO=48;SAF=19;SAR=18;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734735;STB=0.501886;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0200258;OID=.;OPOS=54726839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:48:49:37:37:0.430233:18:19:25:23:18:19:25:24 chr19 54726843 . C G 338.55 PASS AF=0.425287;AO=35;DP=86;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.00379522;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.824;QD=15.5654;RBI=0.00402842;REFB=-0.0220206;REVB=-0.00135075;RO=51;SAF=18;SAR=17;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00468719;STB=0.503729;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0226322;OID=.;OPOS=54726843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:51:50:35:37:0.425287:17:18:26:25:18:19:26:24 chr19 54726861 . C T 368.61 PASS AF=0.464286;AO=38;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00626841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.672;QD=17.553;RBI=0.0110232;REFB=-0.00695295;REVB=-0.00906743;RO=44;SAF=17;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288855;STB=0.514698;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0283201;OID=.;OPOS=54726861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:45:38:39:0.464286:21:17:21:23:21:18:22:23 chr19 54726872 . C G 278.92 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0355469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.939;QD=15.4957;RBI=0.0358254;REFB=-0.0361307;REVB=0.00445814;RO=39;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803639;STB=0.552877;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0416456;OID=.;OPOS=54726872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:40:32:32:0.444444:19:13:19:20:19:13:20:20 chr19 54746051 . A C 101.83 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3839;QD=40.7341;RBI=0.102415;REFB=0;REVB=0.000499971;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00656581;OID=.;OPOS=54746051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0 chr19 54746081 . T C 240.4 PASS AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00783438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.59;QD=43.7089;RBI=0.0116428;REFB=-0.13319;REVB=0.00861269;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535679;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.00184521;OID=.;OPOS=54746081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:0:2:20:20:0.909091:13:7:0:0:13:7:0:2 chr19 54754752 . T C 432.19 PASS AF=0.5;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.025283;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.134;QD=20.102;RBI=0.0282303;REFB=-0.0214587;REVB=0.0125587;RO=43;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418944;STB=0.523232;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.021502;OID=.;OPOS=54754752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:43:43:43:43:0.5:22:21:23:20:22:21:23:20 chr19 54767879 . T C 1484.4 PASS AF=0.989583;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0149759;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.531;QD=61.85;RBI=0.0512562;REFB=0.00232724;REVB=0.0490196;RO=1;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886354;STB=0.504672;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000185813;OID=.;OPOS=54767879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:96:1:1:95:95:0.989583:53:42:0:1:53:42:0:1 chr19 54782919 . C T 276.08 PASS AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00776392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.828;QD=15.7762;RBI=0.0152064;REFB=-0.0119408;REVB=-0.013075;RO=39;SAF=23;SAR=8;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252445;STB=0.643425;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0291685;OID=.;OPOS=54782919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:8:23:20:19:8:23:20:19 chr19 54783375 . T A 1877.8 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.08;QD=61.5671;RBI=0.0350722;REFB=0;REVB=-0.00921696;RO=0;SAF=78;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02007e-05;OID=.;OPOS=54783375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:44:78:0:0:44:78:0:0 chr19 54783923 . A G 734.03 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0421031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6064;QD=61.169;RBI=0.0442362;REFB=-0.0550677;REVB=0.0135709;RO=1;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177461;STB=0.50943;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00116384;OID=.;OPOS=54783923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:26:21:0:1:26:21:0:1 chr19 54784130 . T C 127.9 PASS AF=0.307692;AO=11;DP=48;FAO=16;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.083504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6954;QD=9.83839;RBI=0.0836776;REFB=-0.0141292;REVB=-0.0053875;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449958;STB=0.690484;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0275429;OID=.;OPOS=54784130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:52:28:36:11:16:0.307692:4:7:26:2:9:7:26:10 chr19 54786022 . G C 89.54 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0245233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.441;QD=15.5715;RBI=0.043264;REFB=-0.0143267;REVB=-0.0356424;RO=12;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192184;STB=0.613407;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0128269;OID=.;OPOS=54786022;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:2:9:8:4:2:9:8:4 chr19 54803185 . G T 702.62 PASS AF=0.444444;AO=76;DP=171;FAO=76;FDP=171;FR=.;FRO=95;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=-0.00727096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1511;QD=16.4355;RBI=0.0485677;REFB=-0.0131882;REVB=0.0480204;RO=94;SAF=40;SAR=36;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789172;STB=0.546671;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.016597;OID=.;OPOS=54803185;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:94:95:76:76:0.444444:36:40:42:52:36:40:42:53 chr19 54849463 . C T 260.16 PASS AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.038437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.858;QD=16.7847;RBI=0.067341;REFB=-0.0132072;REVB=0.0552939;RO=33;SAF=13;SAR=16;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818968;STB=0.545939;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0151459;OID=.;OPOS=54849463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:16:13:12:21:16:13:12:21 chr19 54849481 . T G 231.06 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0419338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.077;QD=16.504;RBI=0.0451086;REFB=-0.0101954;REVB=-0.0166235;RO=30;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225367;STB=0.512702;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0106248;OID=.;OPOS=54849481;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:15:11:12:18:15:11:12:18 chr19 54867572 . C T 179.04 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0263916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.83;QD=10.8511;RBI=0.037298;REFB=-0.0070586;REVB=-0.0263557;RO=43;SAF=16;SAR=7;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289811;STB=0.669215;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0124272;OID=.;OPOS=54867572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:43:43:23:23:0.348485:7:16:19:24:7:16:19:24 chr19 54871664 . G C 286.11 PASS AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=5;FWDB=0.00485054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5643;QD=15.677;RBI=0.0451295;REFB=-0.00661004;REVB=-0.0448681;RO=41;SAF=19;SAR=13;SRF=36;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319111;STB=0.676352;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00813025;OID=.;OPOS=54871664;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:13:19:36:5:13:19:36:5 chr19 54946784 . A G 190.28 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00305266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.58;QD=21.7467;RBI=0.0127952;REFB=-0.0264298;REVB=0.0124257;RO=16;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386818;STB=0.521716;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0152251;OID=.;OPOS=54946784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:8:11:10:6:8:11:10:6 chr19 54947509 . G A 206.45 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0154607;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5804;QD=12.903;RBI=0.0503416;REFB=-0.0102687;REVB=0.0479087;RO=39;SAF=15;SAR=10;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941553;STB=0.554096;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0166149;OID=.;OPOS=54947509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:39:39:25:25:0.390625:10:15:20:19:10:15:20:19 chr19 55014124 . G A 104.95 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00924432;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.324;QD=10.2392;RBI=0.0308846;REFB=-0.0153519;REVB=-0.0294687;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286919;STB=0.67128;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0274968;OID=.;OPOS=55014124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:28:28:13:13:0.317073:5:8:10:18:5:8:10:18 chr19 55019402 . A G 208.69 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0556078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.714;QD=25.2955;RBI=0.0557057;REFB=-0.000783483;REVB=0.00330149;RO=13;SAF=15;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526517;STB=0.529382;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.000121481;OID=.;OPOS=55019402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:5:15:9:4:5:15:9:4 chr19 55045042 . G A 404.0 PASS AF=0.401709;AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=117;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.0191814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.485;QD=13.8118;RBI=0.0298946;REFB=-0.0298397;REVB=-0.0229295;RO=66;SAF=22;SAR=25;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109884;STB=0.549777;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0327111;OID=.;OPOS=55045042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:70:47:47:0.401709:25:22:24:42:25:22:27:43 chr19 55085399 . G A 580.72 PASS AF=0.39881;AO=67;DP=168;FAO=67;FDP=168;FR=.;FRO=101;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=51;FSRR=50;FWDB=-0.0127516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.706;QD=13.8266;RBI=0.0156134;REFB=-0.0212785;REVB=-0.00900976;RO=97;SAF=42;SAR=25;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109993;STB=0.57532;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.031965;OID=.;OPOS=55085399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:97:101:67:67:0.39881:25:42:51:46:25:42:51:50 chr19 55086775 . C T 350.95 PASS AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.0115838;FXX=0.0210504;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174;QD=15.0945;RBI=0.0125641;REFB=-0.00750841;REVB=-0.00486525;RO=51;SAF=23;SAR=15;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234118;STB=0.640596;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0154714;OID=.;OPOS=55086775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:55:38:38:0.408602:15:23:19:32:15:23:20:35 chr19 55098667 . G A 728.54 PASS AF=0.487179;AO=76;DP=157;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=0.00673113;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0519;QD=18.6806;RBI=0.0152953;REFB=-4.89016e-06;REVB=-0.0137345;RO=81;SAF=47;SAR=29;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142061;STB=0.581422;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-3.92534e-05;OID=.;OPOS=55098667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:81:80:76:76:0.487179:29:47:38:43:29:47:37:43 chr19 55105722 . G C 530.52 PASS AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.0232044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.482;QD=20.6026;RBI=0.0268666;REFB=-0.0147063;REVB=-0.0135414;RO=49;SAF=32;SAR=22;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00067584;STB=0.500372;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0349767;OID=.;OPOS=55105722;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:49:49:54:54:0.524272:22:32:29:20:22:32:29:20 chr19 55105727 . A G 551.13 PASS AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0119821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.982;QD=20.7974;RBI=0.0198163;REFB=-0.0301995;REVB=-0.0157834;RO=50;SAF=33;SAR=23;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257892;STB=0.514192;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.026065;OID=.;OPOS=55105727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:23:33:28:22:23:33:28:22 chr19 55105743 . A G 581.76 PASS AF=0.54717;AO=58;DP=106;FAO=58;FDP=106;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.000863517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.545;QD=21.9531;RBI=0.018493;REFB=-0.0130657;REVB=0.0184728;RO=46;SAF=35;SAR=23;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499807;STB=0.519211;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0111793;OID=.;OPOS=55105743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:46:48:58:58:0.54717:23:35:25:21:23:35:27:21 chr19 55106317 . A G 448.97 PASS AF=0.408;AO=50;DP=125;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.00920961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.786;QD=14.3669;RBI=0.0111356;REFB=-0.00666476;REVB=-0.00625976;RO=73;SAF=26;SAR=24;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730844;STB=0.550295;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0145238;OID=.;OPOS=55106317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:73:74:50:51:0.408:24:26:43:30:25:26:44:30 chr19 55106338 . A C 351.92 PASS AF=0.367521;AO=43;DP=117;FAO=43;FDP=117;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=-0.00208313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.249;QD=12.0314;RBI=0.0186682;REFB=-0.0106373;REVB=-0.0185516;RO=71;SAF=23;SAR=20;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158552;STB=0.503595;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0184933;OID=.;OPOS=55106338;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:71:74:43:43:0.367521:20:23:39:32:20:23:40:34 chr19 55106590 . A G 436.99 PASS AF=0.422414;AO=46;DP=116;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0154877;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.98;QD=15.0685;RBI=0.0245798;REFB=-0.0139763;REVB=-0.0190865;RO=68;SAF=30;SAR=16;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211283;STB=0.626224;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0232389;OID=.;OPOS=55106590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:67:46:49:0.422414:16:30:31:37:16:33:31:36 chr19 55106865 . T C 761.79 PASS AF=0.625;AO=69;DP=112;FAO=70;FDP=112;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00702243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.052;QD=27.2068;RBI=0.00721608;REFB=-0.0311179;REVB=-0.00166052;RO=42;SAF=22;SAR=47;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102654;STB=0.550766;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0158663;OID=.;OPOS=55106865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:42:42:69:70:0.625:47:22:19:23:47:23:19:23 chr19 55107308 . G C 302.1 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0126542;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.558;QD=24.6611;RBI=0.0208112;REFB=-0.0204713;REVB=-0.016522;RO=22;SAF=19;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216503;STB=0.620821;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.015649;OID=.;OPOS=55107308;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:22:22:27:27:0.55102:8:19:10:12:8:19:10:12 chr19 55107313 . T C 287.64 PASS AF=0.5625;AO=23;DP=44;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00159238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.027;QD=23.9696;RBI=0.0106235;REFB=-0.0239297;REVB=-0.0105034;RO=21;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233789;STB=0.648666;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00954335;OID=.;OPOS=55107313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:48:21:21:23:27:0.5625:8:15:8:13:8:19:8:13 chr19 55107336 . C T 259.16 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0177415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8749;QD=24.1077;RBI=0.0680414;REFB=-0.00626819;REVB=0.0656877;RO=17;SAF=15;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16197;STB=0.568804;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00415418;OID=.;OPOS=55107336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:19:24:24:0.55814:9:15:7:10:9:15:9:10 chr19 55107343 . T C 215.11 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00566448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.68;QD=21.5109;RBI=0.0245646;REFB=-0.0252917;REVB=-0.0239025;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190413;STB=0.596397;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0189332;OID=.;OPOS=55107343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:7:14:8:10:7:14:9:10 chr19 55142101 . G A 395.53 PASS AF=0.695652;AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00669412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3616;QD=34.3939;RBI=0.0243241;REFB=0.0146211;REVB=-0.0233848;RO=14;SAF=16;SAR=16;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398877;STB=0.521726;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00808201;OID=.;OPOS=55142101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:14:14:32:32:0.695652:16:16:8:6:16:16:8:6 chr19 55142739 . A C 244.05 PASS AF=0.5;AO=20;DP=44;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00384412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.035;QD=20.3372;RBI=0.0133118;REFB=-0.0323669;REVB=0.0127447;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176508;STB=0.543443;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0298162;OID=.;OPOS=55142739;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:48:24:24:20:24:0.5:7:13:16:8:10:14:16:8 chr19 55143083 . T C 889.46 PASS AF=0.497207;AO=89;DP=181;FAO=89;FDP=179;FR=.;FRO=90;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=51;FWDB=0.0057663;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.972;QD=19.8763;RBI=0.00641386;REFB=-0.00992145;REVB=0.00280846;RO=91;SAF=38;SAR=51;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00150564;STB=0.503267;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00890466;OID=.;OPOS=55143083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:179:91:90:89:89:0.497207:51:38:39:52:51:38:39:51 chr19 55143452 . T C 603.34 PASS AF=0.561224;AO=53;DP=95;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.018842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.06;QD=24.6262;RBI=0.019451;REFB=-0.0134747;REVB=0.00482945;RO=42;SAF=23;SAR=30;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438037;STB=0.526306;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0107178;OID=.;OPOS=55143452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:42:43:53:55:0.561224:30:23:16:26:30:25:17:26 chr19 55143491 . G T 904.56 PASS AF=0.585714;AO=81;DP=139;FAO=82;FDP=140;FR=.;FRO=58;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.011048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.711;QD=25.8445;RBI=0.0170005;REFB=-0.0150097;REVB=0.0129212;RO=57;SAF=35;SAR=46;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359111;STB=0.512863;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0123799;OID=.;OPOS=55143491;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:57:58:81:82:0.585714:46:35:22:35:47:35:23:35 chr19 55148088 . G A 148.04 PASS AF=0.31746;AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0298144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0207;QD=9.3993;RBI=0.0464878;REFB=-0.0071357;REVB=0.0356681;RO=43;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175536;STB=0.603076;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0150199;OID=.;OPOS=55148088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:43:43:20:20:0.31746:10:10:15:28:10:10:15:28 chr19 55174498 . T C 347.5 PASS AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0602262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0242;QD=51.481;RBI=0.0624082;REFB=0.0166631;REVB=-0.0163581;RO=1;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251148;STB=0.513503;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.0196211;OID=.;OPOS=55174498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:18:8:0:1:18:8:0:1 chr19 55178162 . A G 289.35 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5281;QD=52.6084;RBI=0.151528;REFB=0;REVB=-0.151486;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00485341;OID=.;OPOS=55178162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chr19 55179364 . A G 220.4 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.000763594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.838;QD=16.0288;RBI=0.0332628;REFB=-0.0136822;REVB=-0.0332541;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581785;STB=0.532916;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.014176;OID=.;OPOS=55179364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:11:14:15:15:11:14:15:15 chr19 55237616 . C T 905.76 PASS AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118255;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.801;QD=58.4361;RBI=0.0134849;REFB=0;REVB=0.00648084;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94261e-05;OID=.;OPOS=55237616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr19 55237677 . C T 726.87 PASS AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0206424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.107;QD=52.8632;RBI=0.033444;REFB=-0.0278199;REVB=0.0263133;RO=2;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261643;STB=0.513884;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00129157;OID=.;OPOS=55237677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:35:18:0:2:35:18:0:2 chr19 55239223 . G A 1190.41 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.137;QD=61.0466;RBI=0.0596994;REFB=0;REVB=0.0579272;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133248;OID=.;OPOS=55239223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0 chr19 55246731 . C A,T 1493.89 PASS AF=0.489796,0.510204;AO=48,50;DP=98;FAO=48,50;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=28,23;FSAR=20,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208179,0.0170512;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=270.08,67.4991;QD=60.975;RBI=0.0217077,0.0409031;REFB=0,0;REVB=0.00615132,-0.0371796;RO=0;SAF=28,23;SAR=20,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.56477e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0124325,-0.00180715;OID=.,.;OPOS=55246731,55246731;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:98:98:0:0:48,50:48,50:0.489796,0.510204:20,27:28,23:0:0:20,27:28,23:0:0 chr19 55246741 . T C 483.55 PASS AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.00410503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.176;QD=19.1506;RBI=0.0268512;REFB=-0.00111874;REVB=0.0265356;RO=51;SAF=23;SAR=27;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116487;STB=0.564471;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00264672;OID=.;OPOS=55246741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:51:50:50:0.49505:27:23:30:21:27:23:30:21 chr19 55247306 . A G 365.8 PASS AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0335488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3813;QD=18.7589;RBI=0.0433886;REFB=-0.0045827;REVB=-0.0275146;RO=40;SAF=12;SAR=26;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157899;STB=0.588273;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00365458;OID=.;OPOS=55247306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:26:12:19:21:26:12:19:21 chr19 55247353 . C A 327.91 PASS AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0107309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.863;QD=20.4942;RBI=0.0244395;REFB=6.52142e-05;REVB=0.0219576;RO=30;SAF=15;SAR=19;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937669;STB=0.551857;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=5.25255e-05;OID=.;OPOS=55247353;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:19:15:10:20:19:15:10:20 chr19 55247514 . C T 195.8 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0177117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.336;QD=17.7996;RBI=0.0180212;REFB=-0.00119283;REVB=-0.00332548;RO=24;SAF=5;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145161;STB=0.583245;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.000970157;OID=.;OPOS=55247514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:15:5:9:15:15:5:9:15 chr19 55250036 . T C 363.09 PASS AF=0.681818;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=44;FR=.;FRO=14;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0152855;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1497;QD=33.0082;RBI=0.0359614;REFB=-0.0315139;REVB=0.0325511;RO=14;SAF=27;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404648;STB=0.725619;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0205397;OID=.;OPOS=55250036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:14:14:30:30:0.681818:3:27:7:7:3:27:7:7 chr19 55250061 . C A 280.8 PASS AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0187875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.411;QD=28.0797;RBI=0.0190152;REFB=-0.0409484;REVB=0.00293444;RO=14;SAF=21;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310322;STB=0.69213;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.045121;OID=.;OPOS=55250061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:14:15:25:25:0.625:4:21:7:7:4:21:7:8 chr19 55250928 . G C 212.12 PASS AF=0.13649;AO=49;DP=359;FAO=49;FDP=359;FR=.;FRO=310;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=158;FSRR=152;FWDB=-0.0124446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.39;QD=2.36345;RBI=0.0132136;REFB=-0.00487437;REVB=0.00444199;RO=310;SAF=20;SAR=29;SRF=158;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130033;STB=0.587757;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0318793;OID=.;OPOS=55250928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:310:310:49:49:0.13649:29:20:158:152:29:20:158:152 chr19 55250953 . G C 48.89 PASS AF=0.0628141;AO=25;DP=398;FAO=25;FDP=398;FR=.;FRO=373;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=188;FSRR=185;FWDB=-0.0199406;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.668;QD=0.49133;RBI=0.0353626;REFB=-0.00185012;REVB=-0.0292042;RO=373;SAF=8;SAR=17;SRF=188;SRR=185;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196993;STB=0.673264;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0305626;OID=.;OPOS=55250953;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:398:398:373:373:25:25:0.0628141:17:8:188:185:17:8:188:185 chr19 55251010 . C A 234.18 PASS AF=0.144476;AO=44;DP=333;FAO=51;FDP=353;FR=.;FRO=302;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=137;FSRR=165;FWDB=-0.0602617;FXX=0.00282478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.68;QD=2.65364;RBI=0.0603705;REFB=-0.00631285;REVB=-0.00362283;RO=276;SAF=13;SAR=31;SRF=115;SRR=161;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16681;STB=0.625899;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0314786;OID=.;OPOS=55251010;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:353:276:302:44:51:0.144476:31:13:115:161:35:16:137:165 chr19 55251013 . G T 705.6 PASS AF=0.288184;AO=100;DP=345;FAO=100;FDP=347;FR=.;FRO=247;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=112;FSRR=135;FWDB=-0.0073286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8047;QD=8.1337;RBI=0.0235304;REFB=-0.0101135;REVB=0.0223601;RO=241;SAF=39;SAR=61;SRF=109;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778145;STB=0.546475;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.028796;OID=.;OPOS=55251013;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:347:241:247:100:100:0.288184:61:39:109:132:61:39:112:135 chr19 55253465 . C G 196.94 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0197644;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.575;QD=12.9139;RBI=0.0204229;REFB=0.00265801;REVB=0.00514418;RO=37;SAF=8;SAR=16;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11241;STB=0.564052;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00314581;OID=.;OPOS=55253465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:16:8:9:28:16:8:9:28 chr19 55253521 . C G 628.97 PASS AF=0.575472;AO=61;DP=106;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00799317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.465;QD=23.7347;RBI=0.0496144;REFB=-0.00545257;REVB=0.0489663;RO=45;SAF=26;SAR=35;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748211;STB=0.540787;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00189481;OID=.;OPOS=55253521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:45:45:61:61:0.575472:35:26:15:30:35:26:15:30 chr19 55253544 . A G 197.12 PASS AF=0.245902;AO=30;DP=122;FAO=30;FDP=122;FR=.;FRO=92;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=60;FWDB=0.0078816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9267;QD=6.46284;RBI=0.0876288;REFB=-0.00251577;REVB=-0.0872737;RO=92;SAF=15;SAR=15;SRF=32;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191125;STB=0.614682;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00592814;OID=.;OPOS=55253544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:92:92:30:30:0.245902:15:15:32:60:15:15:32:60 chr19 55253552 . T A 242.7 PASS AF=0.259259;AO=35;DP=135;FAO=35;FDP=135;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=-0.0100093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=355.223;QD=7.19102;RBI=0.0129683;REFB=0.00460926;REVB=0.00824561;RO=100;SAF=19;SAR=16;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236553;STB=0.640374;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.011183;OID=.;OPOS=55253552;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:100:100:35:35:0.259259:16:19:35:65:16:19:35:65 chr19 55253601 . G A 346.4 PASS AF=0.296296;AO=46;DP=158;FAO=48;FDP=162;FR=.;FRO=114;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=-0.0439527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9098;QD=8.55315;RBI=0.0629589;REFB=-0.0147919;REVB=0.0450775;RO=112;SAF=19;SAR=27;SRF=47;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00820307;STB=0.524737;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0346106;OID=.;OPOS=55253601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:162:112:114:46:48:0.296296:27:19:47:65:29:19:49:65 chr19 55255377 . C T 195.22 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0126139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.93;QD=14.1977;RBI=0.014217;REFB=-0.0142438;REVB=0.00655834;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486882;STB=0.527844;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0161029;OID=.;OPOS=55255377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:9:14:18:14:9:14:18:14 chr19 55255490 . A C 219.43 PASS AF=0.225166;AO=35;DP=152;FAO=34;FDP=151;FR=.;FRO=117;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=0.0109458;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.475;QD=5.81283;RBI=0.0115535;REFB=-0.00225488;REVB=-0.00369769;RO=116;SAF=11;SAR=24;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199698;STB=0.605946;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00694927;OID=.;OPOS=55255490;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:116:117:35:34:0.225166:24:11:54:62:23:11:53:64 chr19 55255493 . C T 250.83 PASS AF=0.245161;AO=38;DP=155;FAO=38;FDP=155;FR=.;FRO=117;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=66;FWDB=-0.0083127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.051;QD=6.47303;RBI=0.0153475;REFB=-0.00627499;REVB=0.0129013;RO=117;SAF=14;SAR=24;SRF=51;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878869;STB=0.553163;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.013523;OID=.;OPOS=55255493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:117:117:38:38:0.245161:24:14:51:66:24:14:51:66 chr19 55258778 . G A 1361.44 PASS AF=0.908257;AO=99;DP=110;FAO=99;FDP=109;FR=.;FRO=10;FSAF=62;FSAR=37;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00708524;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.066;QD=49.9611;RBI=0.0087856;REFB=-0.0419005;REVB=-0.00519481;RO=10;SAF=62;SAR=37;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00485706;STB=0.50257;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00496205;OID=.;OPOS=55258778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:110:109:10:10:99:99:0.908257:37:62:6:4:37:62:6:4 chr19 55258808 . C T 605.98 PASS AF=0.456522;AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=0.0646163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3876;QD=17.5645;RBI=0.0798114;REFB=0.00167953;REVB=0.0468465;RO=69;SAF=31;SAR=32;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123666;STB=0.580191;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00232263;OID=.;OPOS=55258808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:69:75:63:63:0.456522:32:31:43:26:32:31:48:27 chr19 55258830 . CG TA 622.64 PASS AF=0.433962;AO=69;DP=161;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=46;FWDB=0.00380553;FXX=0.0124216;HRUN=2;LEN=2;MLLD=186.355;QD=15.6638;RBI=0.00437861;REFB=0.00176073;REVB=0.00216568;RO=90;SAF=47;SAR=22;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205009;STB=0.614818;STBP=0.02;TYPE=mnp;VARB=-0.001876;OID=.;OPOS=55258830;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:90:90:69:69:0.433962:22:47:44:46:22:47:44:46 chr19 55263898 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0393019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5261;QD=53.9112;RBI=0.0667188;REFB=0;REVB=-0.0539144;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00258949;OID=.;OPOS=55263898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr19 55266447 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.865;QD=56.1915;RBI=0.0444827;REFB=0;REVB=-0.0431676;RO=0;SAF=24;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188199;OID=.;OPOS=55266447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:3:24:0:0:3:25:0:0 chr19 55266496 . A G 259.12 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.0452653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7595;QD=24.1043;RBI=0.0525685;REFB=0.0118598;REVB=-0.0267301;RO=19;SAF=22;SAR=2;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867757;STB=0.547908;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.0147304;OID=.;OPOS=55266496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:2:22:18:1:2:22:18:1 chr19 55267623 . A C 1343.47 PASS AF=0.970297;AO=62;DP=103;FAO=98;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0523446;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.645;QD=53.2068;RBI=0.054591;REFB=-0.0267937;REVB=0.0154991;RO=3;SAF=15;SAR=47;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291879;STB=0.515461;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00258208;OID=.;OPOS=55267623;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:103:101:3:3:62:98:0.970297:47:15:0:3:47:51:0:3 chr19 55267624 . G C 31.21 PASS AF=0.0882353;AO=9;DP=102;FAO=9;FDP=102;FR=.;FRO=93;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=-0.0653021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.207;QD=1.22397;RBI=0.0653066;REFB=-0.0150995;REVB=-0.000762993;RO=93;SAF=8;SAR=1;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.47687;STB=0.884089;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0975137;OID=.;OPOS=55267624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:102:102:93:93:9:9:0.0882353:1:8:44:49:1:8:44:49 chr19 55275334 . A G 552.07 PASS AF=0.47541;AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=0.0171417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.547;QD=18.1007;RBI=0.0222865;REFB=-0.0189754;REVB=0.0142425;RO=64;SAF=35;SAR=23;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586303;STB=0.503251;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0184856;OID=.;OPOS=55275334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:64:64:58:58:0.47541:23:35:39:25:23:35:39:25 chr19 55275387 . A G 122.05 PASS AF=0.155844;AO=24;DP=155;FAO=24;FDP=154;FR=.;FRO=130;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=77;FSRR=53;FWDB=-0.00552333;FXX=0.0064512;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.0429;QD=3.17017;RBI=0.0228142;REFB=-0.000139713;REVB=-0.0221355;RO=130;SAF=20;SAR=4;SRF=77;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359931;STB=0.745842;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.000794199;OID=.;OPOS=55275387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:130:130:24:24:0.155844:4:20:77:53:4:20:77:53 chr19 55281315 . G T 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9585;QD=46.8469;RBI=0.064825;REFB=0;REVB=-0.0424111;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270293;OID=.;OPOS=55281315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr19 55284824 . G C 147.01 PASS AF=0.457143;AO=15;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0273604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.307;QD=16.801;RBI=0.0276622;REFB=-0.0110402;REVB=0.00407504;RO=19;SAF=3;SAR=12;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888851;STB=0.509422;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0128038;OID=.;OPOS=55284824;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:35:19:19:15:16:0.457143:12:3:5:14:12:4:5:14 chr19 55284858 . G A 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00678747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.586;QD=56.9373;RBI=0.0198622;REFB=0;REVB=0.0186664;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127945;OID=.;OPOS=55284858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr19 55284939 . A G 38.35 PASS AF=0.0925926;AO=10;DP=108;FAO=10;FDP=108;FR=.;FRO=98;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.0217997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.362;QD=1.42052;RBI=0.0219903;REFB=-0.00113061;REVB=0.0028896;RO=98;SAF=7;SAR=3;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222481;STB=0.675778;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.013121;OID=.;OPOS=55284939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:108:108:98:98:10:10:0.0925926:3:7:50:48:3:7:50:48 chr19 55284943 . CA AT 38.37 PASS AF=0.0925926;AO=10;DP=108;FAO=10;FDP=108;FR=.;FRO=98;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=0.0191581;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=64.9041;QD=1.42106;RBI=0.0420639;REFB=-0.000379396;REVB=-0.0374478;RO=96;SAF=7;SAR=3;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234146;STB=0.675778;STBP=0.269;TYPE=mnp;VARB=0.00222434;OID=.;OPOS=55284943;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:108:108:96:98:10:10:0.0925926:3:7:48:48:3:7:50:48 chr19 55284962 . C G 44.69 PASS AF=0.101852;AO=11;DP=108;FAO=11;FDP=108;FR=.;FRO=97;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=0.0701326;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6969;QD=1.65503;RBI=0.0714224;REFB=-0.00283473;REVB=-0.0135121;RO=97;SAF=8;SAR=3;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277853;STB=0.711937;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0292162;OID=.;OPOS=55284962;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:108:108:97:97:11:11:0.101852:3:8:48:49:3:8:48:49 chr19 55284976 . A G 52.57 PASS AF=0.113208;AO=12;DP=106;FAO=12;FDP=106;FR=.;FRO=94;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=-0.0420674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.866;QD=1.98385;RBI=0.0420752;REFB=-0.00419133;REVB=-0.000811027;RO=93;SAF=8;SAR=4;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221452;STB=0.666389;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0441767;OID=.;OPOS=55284976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:106:106:93:94:12:12:0.113208:4:8:45:48:4:8:45:49 chr19 55284986 . C A 278.62 PASS AF=0.346154;AO=35;DP=103;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.0181411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.895;QD=10.716;RBI=0.0272842;REFB=-0.0130542;REVB=0.0203796;RO=68;SAF=19;SAR=16;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990574;STB=0.564996;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0297364;OID=.;OPOS=55284986;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:68:68:35:36:0.346154:16:19:31:37:16:20:31:37 chr19 55284987 . G A 84.83 PASS AF=0.153846;AO=16;DP=104;FAO=16;FDP=104;FR=.;FRO=88;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0125254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.775;QD=3.26278;RBI=0.0129044;REFB=-0.00783513;REVB=0.00310441;RO=88;SAF=8;SAR=8;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142864;STB=0.509603;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0413058;OID=.;OPOS=55284987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:104:104:88:88:16:16:0.153846:8:8:43:45:8:8:43:45 chr19 55285045 . G T 381.46 PASS AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0575481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7082;QD=19.8163;RBI=0.0600216;REFB=-0.0409941;REVB=0.0170533;RO=38;SAF=22;SAR=17;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172708;STB=0.595724;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0399113;OID=.;OPOS=55285045;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:17:22:14:24:17:22:14:24 chr19 55285053 . T G 38.57 PASS AF=0.117647;AO=7;DP=68;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00717749;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.177;QD=2.26887;RBI=0.0226873;REFB=-0.00477994;REVB=-0.0215221;RO=58;SAF=3;SAR=4;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432989;STB=0.582497;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0355908;OID=.;OPOS=55285053;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:68:68:58:60:7:8:0.117647:4:3:27:31:5:3:28:32 chr19 55285082 . T C 40.92 PASS AF=0.155556;AO=7;DP=45;FAO=7;FDP=45;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0343988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8294;QD=3.63758;RBI=0.0354204;REFB=-0.0125279;REVB=0.00844566;RO=38;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754437;STB=0.552485;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0755711;OID=.;OPOS=55285082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:45:45:38:38:7:7:0.155556:4:3:14:24:4:3:14:24 chr19 55286650 . T C 643.32 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220647;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.329;QD=61.269;RBI=0.0276469;REFB=0;REVB=0.0166583;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000545671;OID=.;OPOS=55286650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:22:20:0:0 chr19 55286665 . T A 157.44 PASS AF=0.344262;AO=18;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0125932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8033;QD=10.3236;RBI=0.0348426;REFB=-0.0128042;REVB=0.0324872;RO=39;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310693;STB=0.616984;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0235879;OID=.;OPOS=55286665;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:39:40:18:21:0.344262:8:10:11:28:11:10:12:28 chr19 55286769 . C A 338.14 PASS AF=0.328244;AO=29;DP=131;FAO=43;FDP=131;FR=.;FRO=88;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=-0.00715976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.949;QD=10.325;RBI=0.00718988;REFB=-0.0148749;REVB=0.000657432;RO=63;SAF=12;SAR=17;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128967;STB=0.637002;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0413908;OID=.;OPOS=55286769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:63:88:29:43:0.328244:17:12:33:30:31:12:41:47 chr19 55286770 . C G 90.14 PASS AF=0.141791;AO=19;DP=134;FAO=19;FDP=134;FR=.;FRO=115;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.0379225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.494;QD=2.69084;RBI=0.0565476;REFB=-0.0039851;REVB=-0.0419465;RO=115;SAF=5;SAR=14;SRF=49;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222319;STB=0.653808;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0558971;OID=.;OPOS=55286770;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:134:134:115:115:19:19:0.141791:14:5:49:66:14:5:49:66 chr19 55286773 . AGG GCA 75.68 PASS AF=0.128788;AO=17;DP=132;FAO=17;FDP=132;FR=.;FRO=115;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.0287897;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=257.67;QD=2.29336;RBI=0.0485281;REFB=-0.00330157;REVB=-0.0390658;RO=113;SAF=4;SAR=13;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268466;STB=0.685338;STBP=0.156;TYPE=mnp;VARB=0.0445473;OID=.;OPOS=55286773;OREF=AGG;OALT=GCA;OMAPALT=GCA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:132:132:113:115:17:17:0.128788:13:4:49:64:13:4:49:66 chr19 55286781 . G A 253.65 PASS AF=0.266667;AO=36;DP=134;FAO=36;FDP=135;FR=.;FRO=99;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=65;FWDB=-0.00993502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.022;QD=7.51568;RBI=0.0102006;REFB=-0.00526923;REVB=0.00231253;RO=98;SAF=20;SAR=16;SRF=33;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265245;STB=0.652095;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0149143;OID=.;OPOS=55286781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:98:99:36:36:0.266667:16:20:33:65:16:20:34:65 chr19 55286795 . TG CA,CG 1091.59 PASS AF=0.318519,0.385185;AO=43,52;DP=136;FAO=43,52;FDP=135;FR=.;FRO=40;FSAF=10,25;FSAR=33,27;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.000667785,-0.00238596;FXX=0.0073524;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=221.76,140.432;QD=32.3434;RBI=0.0104657,0.0138744;REFB=-0.0093884,-0.00568577;REVB=0.0104443,0.0136677;RO=40;SAF=10,25;SAR=33,27;SRF=21;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.292279,-0.0350925;STB=0.662912,0.519223;STBP=0.004,0.675;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0119439,-0.00205468;OID=.,.;OPOS=55286795,55286795;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:136:135:40:40:43,52:43,52:0.318519,0.385185:33,27:10,25:21:19:33,27:10,25:21:19 chr19 55286809 . G A 306.57 PASS AF=0.284722;AO=41;DP=144;FAO=41;FDP=144;FR=.;FRO=103;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=68;FWDB=-0.00643543;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.316;QD=8.51574;RBI=0.012404;REFB=-0.00505816;REVB=-0.010604;RO=101;SAF=23;SAR=18;SRF=33;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278802;STB=0.654463;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0256019;OID=.;OPOS=55286809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:101:103:41:41:0.284722:18:23:33:68:18:23:35:68 chr19 55286822 . C T 382.04 PASS AF=0.310976;AO=51;DP=164;FAO=51;FDP=164;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=52;FSRR=61;FWDB=0.00680358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.937;QD=9.31808;RBI=0.0102009;REFB=-0.00929263;REVB=-0.00760066;RO=113;SAF=19;SAR=32;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10733;STB=0.562491;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0215746;OID=.;OPOS=55286822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:113:113:51:51:0.310976:32:19:52:61:32:19:52:61 chr19 55286854 . A G 1327.49 PASS AF=0.649718;AO=115;DP=177;FAO=115;FDP=177;FR=.;FRO=62;FSAF=47;FSAR=68;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.00424441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.47;QD=29.9997;RBI=0.0164621;REFB=-0.00297997;REVB=0.0159056;RO=62;SAF=47;SAR=68;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817544;STB=0.544047;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00129591;OID=.;OPOS=55286854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:62:62:115:115:0.649718:68:47:33:29:68:47:33:29 chr19 55290108 . A G 52.42 PASS AF=0.1;AO=14;DP=143;FAO=14;FDP=140;FR=.;FRO=126;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=75;FSRR=51;FWDB=0.00460889;FXX=0.0209776;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.2546;QD=1.49764;RBI=0.0120471;REFB=-0.000368273;REVB=-0.0111307;RO=126;SAF=6;SAR=8;SRF=75;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19703;STB=0.646507;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00577576;OID=.;OPOS=55290108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:143:140:126:126:14:14:0.1:8:6:75:51:8:6:75:51 chr19 55294927 . A G,T 1518.82 PASS AF=0.944444,0.037037;AO=99,4;DP=105;FAO=102,4;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=47,4;FSAR=55,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00384935,-0.00463345;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=193.567,149.171;QD=56.2527;RBI=0.0376164,0.0333122;REFB=-0.0292831,-0.0593395;REVB=0.0374189,0.0329884;RO=2;SAF=46,4;SAR=53,0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0013342,0.725637;STB=0.500759,0.995773;STBP=0.867,0.168;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00197872,0.130792;OID=.,.;OPOS=55294927,55294927;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:105:108:2:2:99,4:102,4:0.944444,0.037037:53,0:46,4:1:1:55,0:47,4:1:1 chr19 55294931 . T C 621.13 PASS AF=0.559633;AO=61;DP=109;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00590024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8429;QD=22.7936;RBI=0.035233;REFB=0.00147181;REVB=0.0347355;RO=47;SAF=33;SAR=28;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917437;STB=0.554604;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.000841695;OID=.;OPOS=55294931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:47:48:61:61:0.559633:28:33:20:27:28:33:20:28 chr19 55294969 . A G 644.2 PASS AF=0.552632;AO=63;DP=115;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.00182794;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2708;QD=22.6036;RBI=0.0432331;REFB=-0.00145396;REVB=-0.0431945;RO=52;SAF=33;SAR=30;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829835;STB=0.549984;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000735736;OID=.;OPOS=55294969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:52:51:63:63:0.552632:30:33:22:30:30:33:21:30 chr19 55297784 . C T 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0229859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.769;QD=10.3791;RBI=0.0489692;REFB=-0.0106633;REVB=0.0432393;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25384;STB=0.651856;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0232238;OID=.;OPOS=55297784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:11:5:5:4:11:5 chr19 55299773 . A C 912.28 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0147401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1706;QD=56.1403;RBI=0.0413264;REFB=-0.022858;REVB=-0.0386083;RO=1;SAF=33;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140981;STB=0.50746;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00238971;OID=.;OPOS=55299773;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:31:33:1:0:31:33:1:0 chr19 55317456 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.791;QD=47.8222;RBI=0.0141524;REFB=0;REVB=0.00201299;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198506;OID=.;OPOS=55317456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0 chr19 55317669 . C G 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.019036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.627;QD=47.8151;RBI=0.0296686;REFB=-0.0742992;REVB=0.0227566;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533301;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00107019;OID=.;OPOS=55317669;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:7:14:0:0:7:14:0:1 chr19 55320279 . G A 820.2 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00756402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6489;QD=55.6066;RBI=0.026147;REFB=-0.0952489;REVB=0.0250291;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.50769;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00231618;OID=.;OPOS=55320279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:0:1:58:58:0.983051:26:32:0:0:26:32:1:0 chr19 55324635 . T C 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00160734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.901;QD=56.7053;RBI=0.027004;REFB=0;REVB=0.0269562;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154056;OID=.;OPOS=55324635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr19 55325455 . G A 223.16 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.163;QD=49.5908;RBI=0.032354;REFB=0;REVB=-0.030231;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123465;OID=.;OPOS=55325455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr19 55327930 . A G 62.35 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9789;QD=35.6298;RBI=0.119936;REFB=0;REVB=-0.119827;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00488491;OID=.;OPOS=55327930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0 chr19 55327960 . C T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.907;QD=39.2065;RBI=0.0423202;REFB=0;REVB=0.0322763;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144314;OID=.;OPOS=55327960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr19 55328959 . G T 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00718056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.032;QD=56.7049;RBI=0.0185087;REFB=0;REVB=0.0170591;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201738;OID=.;OPOS=55328959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0 chr19 55328993 . G C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000784329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8086;QD=61.3357;RBI=0.00817429;REFB=0;REVB=0.00813658;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19651e-05;OID=.;OPOS=55328993;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chr19 55329021 . A G 689.22 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.437;QD=62.6562;RBI=0.0299773;REFB=0;REVB=-0.0295259;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112131;OID=.;OPOS=55329021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0 chr19 55329783 . A G 246.55 PASS AF=0.952381;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0696155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.2717;QD=46.9611;RBI=0.108845;REFB=-0.0971649;REVB=-0.0836719;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.51998;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00147808;OID=.;OPOS=55329783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:0:1:19:20:0.952381:8:11:0:0:8:12:1:0 chr19 55329901 . A G 311.54 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042135;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.919;QD=54.1809;RBI=0.0431094;REFB=0;REVB=0.00911348;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220342;OID=.;OPOS=55329901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0 chr19 55329922 . A T 255.9 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7316;QD=51.1803;RBI=0.113495;REFB=0;REVB=0.112334;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0031283;OID=.;OPOS=55329922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0 chr19 55333096 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-2.08505e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.707;QD=49.5991;RBI=0.0450886;REFB=0;REVB=0.0450886;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456956;OID=.;OPOS=55333096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr19 55340913 . CA C 39.26 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.125578;FXX=0.0465008;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.44726;QD=3.83071;RBI=0.243963;REFB=-0.0934218;REVB=0.209161;RO=23;SAF=12;SAR=3;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.629967;STB=0.794827;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.118804;OID=.;OPOS=55340914;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.365854:15:43:15:41:26:11:4:6:20:39:23:12:3:3:20 chr19 55344191 . C T 140.1 PASS AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0522615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.42;QD=20.7554;RBI=0.0568358;REFB=-0.013252;REVB=0.0223393;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10615;STB=0.559922;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00751176;OID=.;OPOS=55344191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:7:8:8:4:7:8:8:4 chr19 55344239 . T G 249.55 PASS AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0395829;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9991;QD=32.1994;RBI=0.0399392;REFB=0.00373057;REVB=-0.00532292;RO=9;SAF=16;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171211;STB=0.594504;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00146981;OID=.;OPOS=55344239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:31:31:9:9:22:22:0.709677:6:16:4:5:6:16:4:5 chr19 55346534 . G C 61.47 PASS AF=0.126214;AO=13;DP=103;FAO=13;FDP=103;FR=.;FRO=90;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.00609383;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.736;QD=2.38726;RBI=0.0123928;REFB=-0.00244297;REVB=-0.010791;RO=90;SAF=8;SAR=5;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14245;STB=0.601347;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0220454;OID=.;OPOS=55346534;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:103:103:90:90:13:13:0.126214:5:8:45:45:5:8:45:45 chr19 55346565 . G T 120.92 PASS AF=0.190909;AO=21;DP=110;FAO=21;FDP=110;FR=.,HEALED;FRO=89;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.00962059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.257;QD=4.39698;RBI=0.0370475;REFB=-0.00754587;REVB=-0.0357765;RO=64;SAF=15;SAR=6;SRF=44;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394451;STB=0.683467;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0205528;OID=.;OPOS=55346565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:64:89:21:21:0.190909:6:15:44:20:6:15:44:45 chr19 55346592 . G A 169.74 PASS AF=0.245098;AO=25;DP=102;FAO=25;FDP=102;FR=.;FRO=77;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=0.0127101;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8519;QD=6.65643;RBI=0.013582;REFB=-0.00489437;REVB=0.0047879;RO=77;SAF=18;SAR=7;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319967;STB=0.695492;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0140953;OID=.;OPOS=55346592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:77:77:25:25:0.245098:7:18:36:41:7:18:36:41 chr19 55358655 . A G 535.62 PASS AF=0.393333;AO=59;DP=150;FAO=59;FDP=150;FR=.;FRO=91;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.00587926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.909;QD=14.2831;RBI=0.00683787;REFB=-0.0188462;REVB=-0.00349153;RO=91;SAF=28;SAR=31;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736269;STB=0.541511;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.027979;OID=.;OPOS=55358655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:91:91:59:59:0.393333:31:28:37:54:31:28:37:54 chr19 55358658 . T C 235.34 PASS AF=0.234899;AO=35;DP=149;FAO=35;FDP=149;FR=.;FRO=114;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=68;FWDB=-0.00218181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.463;QD=6.31795;RBI=0.00285083;REFB=-0.0103;REVB=-0.00183493;RO=113;SAF=19;SAR=16;SRF=45;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180553;STB=0.605404;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0198203;OID=.;OPOS=55358658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:113:114:35:35:0.234899:16:19:45:68:16:19:46:68 chr19 55358686 . A C 233.04 PASS AF=0.248175;AO=34;DP=138;FAO=34;FDP=137;FR=.;FRO=103;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=62;FWDB=-0.019514;FXX=0.0143875;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.298;QD=6.80424;RBI=0.0195312;REFB=-0.000594709;REVB=0.000820966;RO=102;SAF=16;SAR=18;SRF=40;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098945;STB=0.555042;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00343035;OID=.;OPOS=55358686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:102:103:34:34:0.248175:18:16:40:62:18:16:41:62 chr19 55358734 . G A 724.0 PASS AF=0.647059;AO=65;DP=101;FAO=66;FDP=102;FR=.;FRO=36;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=35;FWDB=0.0234725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3181;QD=28.392;RBI=0.0268072;REFB=-0.00948169;REVB=-0.0129485;RO=35;SAF=34;SAR=31;SRF=1;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317909;STB=0.674208;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00197729;OID=.;OPOS=55358734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:35:36:65:66:0.647059:31:34:1:34:31:35:1:35 chr19 55359227 . A G 35.84 PASS AF=0.0729167;AO=12;DP=191;FAO=14;FDP=192;FR=.;FRO=178;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=84;FSRR=94;FWDB=-0.034792;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.918;QD=0.746687;RBI=0.0347941;REFB=-0.00204328;REVB=0.000378602;RO=178;SAF=7;SAR=5;SRF=84;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116402;STB=0.526005;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0233147;OID=.;OPOS=55359227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:191:192:178:178:12:14:0.0729167:5:7:84:94:7:7:84:94 chr19 55359234 . A G 47.75 PASS AF=0.0829016;AO=15;DP=192;FAO=16;FDP=193;FR=.;FRO=177;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=86;FSRR=91;FWDB=-0.0152652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.669;QD=0.9897;RBI=0.0327023;REFB=-0.00461388;REVB=-0.0289209;RO=171;SAF=8;SAR=7;SRF=84;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478238;STB=0.512937;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0494868;OID=.;OPOS=55359234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:192:193:171:177:15:16:0.0829016:7:8:84:87:8:8:86:91 chr19 55359255 . C G 54.99 PASS AF=0.0890052;AO=17;DP=191;FAO=17;FDP=191;FR=.;FRO=174;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=85;FSRR=89;FWDB=-0.0189402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.404;QD=1.15155;RBI=0.0456993;REFB=-0.00356209;REVB=-0.0415896;RO=170;SAF=8;SAR=9;SRF=84;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027653;STB=0.516329;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0427606;OID=.;OPOS=55359255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:191:191:170:174:17:17:0.0890052:9:8:84:86:9:8:85:89 chr19 55359272 . C G 2671.1 PASS AF=0.994318;AO=171;DP=175;FAO=175;FDP=176;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.056902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3789;QD=60.7069;RBI=0.0571693;REFB=-0.138797;REVB=0.00552221;RO=1;SAF=82;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0057692;STB=0.50289;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000934595;OID=.;OPOS=55359272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:175:176:1:1:171:175:0.994318:89:82:1:0:89:86:1:0 chr19 55359371 . A G 214.75 PASS AF=0.3375;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0216691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4519;QD=10.7375;RBI=0.0281984;REFB=-0.00546419;REVB=0.0180444;RO=53;SAF=11;SAR=16;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200421;STB=0.616428;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0109497;OID=.;OPOS=55359371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:53:53:27:27:0.3375:16:11:31:22:16:11:31:22 chr19 55359426 . A G 67.81 PASS AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.000672229;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.368;QD=5.42449;RBI=0.0299273;REFB=-0.00332418;REVB=-0.0299197;RO=40;SAF=4;SAR=6;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322233;STB=0.520967;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.017;OID=.;OPOS=55359426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:50:50:40:40:10:10:0.2:6:4:15:25:6:4:15:25 chr19 55361942 . G T 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.979;QD=63.872;RBI=0.0566522;REFB=0;REVB=0.0545957;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214453;OID=.;OPOS=55361942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0 chr19 55362719 . G T 1826.41 PASS AF=0.991803;AO=118;DP=119;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0237304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.986;QD=59.8824;RBI=0.0326415;REFB=-0.0138741;REVB=0.0224128;RO=1;SAF=69;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959426;STB=0.504854;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000101517;OID=.;OPOS=55362719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:119:122:1:1:118:121:0.991803:49:69:0:1:51:70:0:1 chr19 55363704 . G A 99.63 PASS AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0146571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.836;QD=26.5684;RBI=0.0153945;REFB=-0.0634193;REVB=-0.00470744;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138896;STB=0.578172;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.004093;OID=.;OPOS=55363704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:5:6:1:3:5:6:1:3 chr19 55365320 . G T 600.12 PASS AF=0.574257;AO=58;DP=100;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00249294;FXX=0.0194156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.967;QD=23.7673;RBI=0.0101521;REFB=-0.00963306;REVB=0.00984126;RO=42;SAF=30;SAR=28;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315671;STB=0.512291;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00618896;OID=.;OPOS=55365320;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:42:43:58:58:0.574257:28:30:20:22:28:30:21:22 chr19 55396900 . A G 91.82 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.00148867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.089;QD=8.7452;RBI=0.0025882;REFB=0.00243546;REVB=0.00211722;RO=29;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388367;STB=0.515599;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.00574596;OID=.;OPOS=55396900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:29:30:12:12:0.285714:9:3:8:21:9:3:8:22 chr19 55399643 . T C 129.45 PASS AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.019831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0443;QD=9.58911;RBI=0.0312031;REFB=0.00743542;REVB=-0.0240908;RO=37;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139789;STB=0.582688;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.0177907;OID=.;OPOS=55399643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:9:8:13:24:9:8:13:24 chr19 55399684 . C T 70.19 PASS AF=0.243902;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0128959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9413;QD=6.84769;RBI=0.0316891;REFB=-0.0273655;REVB=-0.0289464;RO=31;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286964;STB=0.678909;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0807669;OID=.;OPOS=55399684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:41:41:31:31:10:10:0.243902:4:6:11:20:4:6:11:20 chr19 55418054 . A C 321.03 PASS AF=0.443038;AO=34;DP=78;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0175508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8449;QD=16.2546;RBI=0.0472971;REFB=0.00834964;REVB=-0.0439202;RO=44;SAF=15;SAR=19;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364184;STB=0.511266;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.0116115;OID=.;OPOS=55418054;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:44:44:34:35:0.443038:19:15:21:23:19:16:21:23 chr19 55420801 . C A 382.56 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.038794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.829;QD=52.7675;RBI=0.0455882;REFB=-0.0978791;REVB=0.0239439;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251595;STB=0.513504;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00357123;OID=.;OPOS=55420801;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:0:1:18:10:0:1 chr19 55423530 . C T 193.75 PASS AF=0.444444;AO=19;DP=44;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00821008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0622;QD=17.2222;RBI=0.0291364;REFB=-0.00657172;REVB=0.0279557;RO=25;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736349;STB=0.555501;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00850279;OID=.;OPOS=55423530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:25:25:19:20:0.444444:9:10:15:10:10:10:15:10 chr19 55441902 . T C 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.326;QD=53.9073;RBI=0.0455611;REFB=0;REVB=0.0426879;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023268;OID=.;OPOS=55441902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0 chr19 55441995 . A G 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.478;QD=58.5871;RBI=0.0913394;REFB=0;REVB=0.0493595;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710201;OID=.;OPOS=55441995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0 chr19 55451232 . C T 105.82 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00313975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.753;QD=11.4395;RBI=0.0106123;REFB=-0.00723508;REVB=0.0101372;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420088;STB=0.524961;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0335917;OID=.;OPOS=55451232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:12:12:6:7:12:12 chr19 55451797 . C T 178.73 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.00780826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.919;QD=22.3411;RBI=0.00788327;REFB=-0.0271763;REVB=0.0010849;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21458;STB=0.619112;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00587382;OID=.;OPOS=55451797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:11:7:2:12:11:7:2:12 chr19 55493651 . C T 632.24 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.062;QD=61.6815;RBI=0.0334486;REFB=0;REVB=-0.000541957;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5706e-05;OID=.;OPOS=55493651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0 chr19 55494157 . G A 520.01 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2158;QD=59.4297;RBI=0.0892347;REFB=0;REVB=-0.0146772;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000722814;OID=.;OPOS=55494157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0 chr19 55494632 . A G 447.01 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0600987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2618;QD=57.6789;RBI=0.0601004;REFB=0;REVB=0.000447941;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00127216;OID=.;OPOS=55494632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr19 55494740 . T C 393.31 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00238594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.948;QD=56.1865;RBI=0.0182021;REFB=0;REVB=0.0180451;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133136;OID=.;OPOS=55494740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0 chr19 55525595 . CT C,CC 115.04 PASS AF=0.0909091,0.909091;AO=3,8;DP=11;FAO=1,10;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693764,0.0766446;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=181.292,191.899;QD=41.8317;RBI=0.0694004,0.0766614;REFB=0,0;REVB=0.00182715,0.00160576;RO=0;SAF=2,3;SAR=1,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0123887,0.00145879;OID=.,.;OPOS=55525596,55525596;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0909091,0.909091:3,8:11:1,10:11:0:0,5:1,5:0:0:6:0:2,3:1,5:0:0 chr19 55525894 . G A 280.12 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.1957;QD=50.9312;RBI=0.0503118;REFB=0;REVB=0.0476887;RO=0;SAF=19;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00503579;OID=.;OPOS=55525894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:2:19:0:0:3:19:0:0 chr19 55526345 . T G 123.15 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0130225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.225;QD=37.893;RBI=0.0150505;REFB=0.0251632;REVB=0.00754525;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069361;STB=0.538398;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-9.89982e-05;OID=.;OPOS=55526345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:6:6:0:1:6:6:0:1 chr19 55526368 . G T 31.61 PASS AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.046782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.896;QD=14.0503;RBI=0.0503697;REFB=0.00350381;REVB=-0.0186693;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425125;STB=0.760793;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.00185344;OID=.;OPOS=55526368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:1:4:1:3:1:4:1:3 chr19 55527081 . C T 785.76 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00621473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.936;QD=64.144;RBI=0.0165235;REFB=0;REVB=0.0153102;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39391e-05;OID=.;OPOS=55527081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:26:22:0:0:26:23:0:0 chr19 55530035 . C T 670.25 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0842429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9598;QD=62.3493;RBI=0.086447;REFB=0;REVB=0.0193965;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123517;OID=.;OPOS=55530035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:30:13:0:0:30:13:0:0 chr19 55536595 . G A 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00636877;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.781;QD=56.9569;RBI=0.00641989;REFB=0;REVB=0.000808531;RO=0;SAF=16;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.67401e-06;OID=.;OPOS=55536595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:36:16:0:0:36:16:0:0 chr19 55538980 . T C 749.56 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.897;QD=56.5703;RBI=0.0265629;REFB=0;REVB=0.0261777;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123079;OID=.;OPOS=55538980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:26:27:0:0 chr19 55539061 . A G 1050.83 PASS AF=0.973333;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0400264;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5617;QD=56.0441;RBI=0.0401339;REFB=0.0178068;REVB=-0.00293651;RO=2;SAF=35;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000364693;STB=0.500183;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.000924809;OID=.;OPOS=55539061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:73:75:2:2:71:73:0.973333:36:35:1:1:37:36:1:1 chr19 55539072 . T G 1116.86 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.416;QD=60.3707;RBI=0.0236511;REFB=0;REVB=0.00818444;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.69705e-05;OID=.;OPOS=55539072;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0 chr19 55559715 . G A 357.57 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.582;QD=55.0111;RBI=0.0594804;REFB=0;REVB=0.0403308;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300941;OID=.;OPOS=55559715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:14:10:0:0:15:11:0:0 chr19 55570574 . A G 1298.25 PASS AF=1;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219872;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.158;QD=61.8213;RBI=0.0290118;REFB=0;REVB=0.0189274;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63682e-05;OID=.;OPOS=55570574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:83:84:1:40:43:0:0:40:44:0:0 chr19 55593441 . G C 53.41 PASS AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0114077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.792;QD=7.62973;RBI=0.0126454;REFB=-0.00833075;REVB=-0.00545615;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48975;STB=0.749531;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0279011;OID=.;OPOS=55593441;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:28:15:20:8:8:0.285714:4:4:1:14:4:4:3:17 chr19 55598724 . A G 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0311418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.199;QD=12.7388;RBI=0.0865439;REFB=-0.0121695;REVB=-0.0807467;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930819;STB=0.555418;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00636075;OID=.;OPOS=55598724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:6:4:4:4:6:4 chr19 55614923 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.06228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0982;QD=44.6897;RBI=0.0711896;REFB=0;REVB=-0.0344842;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0028729;OID=.;OPOS=55614923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr19 55644325 . A C 255.91 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2293;QD=51.1829;RBI=0.0297209;REFB=0;REVB=0.0127807;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000428008;OID=.;OPOS=55644325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:4:16:0:0:4:16:0:0 chr19 55653297 . A C 104.62 PASS AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0408075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0678;QD=19.9279;RBI=0.0416516;REFB=-0.00833753;REVB=0.00834293;RO=9;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902331;STB=0.551636;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00549462;OID=.;OPOS=55653297;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:4:8:5:4:4:8:5:4 chr19 55660537 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5584;QD=37.4883;RBI=0.0861449;REFB=0;REVB=0.0760996;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00827377;OID=.;OPOS=55660537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr19 55671337 . C T 239.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.232;QD=50.3575;RBI=0.0393643;REFB=0;REVB=0.0362129;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00056554;OID=.;OPOS=55671337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:10:8:0:0:10:9:0:0 chr19 55699454 . T C 1012.09 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0130706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5141;QD=57.8336;RBI=0.0601646;REFB=-0.0478731;REVB=-0.0587277;RO=1;SAF=41;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113915;STB=0.506022;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000327392;OID=.;OPOS=55699454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:28:41:1:0:28:41:1:0 chr19 55738634 . T C 807.0 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158746;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6475;QD=57.6425;RBI=0.0920127;REFB=0;REVB=0.0906329;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000823923;OID=.;OPOS=55738634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0 chr19 55739689 . G A 309.73 PASS AF=0.365385;AO=38;DP=101;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00229937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.978;QD=11.9128;RBI=0.0723252;REFB=-0.0233447;REVB=-0.0722886;RO=63;SAF=22;SAR=16;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180403;STB=0.61594;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0479005;OID=.;OPOS=55739689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:104:63:66:38:38:0.365385:16:22:26:37:16:22:26:40 chr19 55791091 . C T 697.3 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.715;QD=61.9819;RBI=0.034349;REFB=0;REVB=0.020756;RO=0;SAF=9;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27702e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9442e-05;OID=.;OPOS=55791091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:45:0:0:42:45:1:33:9:0:0:36:9:0:0 chr19 55815035 . AC A 122.3 PASS AF=0.580247;AO=34;DP=83;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.191163;FXX=0.0240935;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.15515;QD=6.0395;RBI=0.194397;REFB=-0.0969161;REVB=-0.0353106;RO=36;SAF=12;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140987;STB=0.550711;STBP=0.296;TYPE=del;VARB=0.128044;OID=.;OPOS=55815036;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.580247:34:83:47:81:34:18:29:17:17:72:36:12:22:18:18 chr19 55856083 . T C 237.68 PASS AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00953978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.969;QD=18.6418;RBI=0.0246087;REFB=-0.0142855;REVB=-0.0226844;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213828;STB=0.626445;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0224496;OID=.;OPOS=55856083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:11:13:8:18:11:14:8:18 chr19 55856211 . C T 259.43 PASS AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00783625;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.827;QD=14.2154;RBI=0.0164041;REFB=-0.000659776;REVB=0.0144114;RO=43;SAF=8;SAR=22;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129168;STB=0.573861;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.000877007;OID=.;OPOS=55856211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:0.410959:22:8:16:27:22:8:16:27 chr19 55859439 . C A 201.55 PASS AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0130163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.064;QD=13.8998;RBI=0.0240443;REFB=-0.0102476;REVB=-0.0202165;RO=33;SAF=11;SAR=13;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349646;STB=0.510136;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0217459;OID=.;OPOS=55859439;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:34:24:24:0.413793:13:11:14:19:13:11:15:19 chr19 55865062 . T C 221.2 PASS AF=0.5;AO=21;DP=47;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00347222;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.002;QD=17.0155;RBI=0.00733669;REFB=-0.0236024;REVB=0.00646303;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14365;STB=0.59694;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0458934;OID=.;OPOS=55865062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:52:26:26:21:26:0.5:9:12:11:15:10:16:11:15 chr19 55870104 . G C 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.698;QD=58.2396;RBI=0.0169379;REFB=0;REVB=0.00990819;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81118e-05;OID=.;OPOS=55870104;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0 chr19 55870289 . C T 649.43 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1934;QD=61.8506;RBI=0.0962648;REFB=0;REVB=0.0633365;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010668;OID=.;OPOS=55870289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr19 55870351 . T C 323.45 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.555;QD=53.9088;RBI=0.0293277;REFB=0;REVB=0.0175108;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60191e-05;OID=.;OPOS=55870351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr19 55870600 . C G 660.75 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00166681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.383;QD=61.4652;RBI=0.0552965;REFB=0;REVB=0.0552714;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311164;OID=.;OPOS=55870600;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:16:25:0:0:18:25:0:0 chr19 55871019 . A G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.707;QD=47.8216;RBI=0.0333313;REFB=0;REVB=-0.027272;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000317805;OID=.;OPOS=55871019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0 chr19 55872397 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.88;QD=37.4885;RBI=0.0828725;REFB=0;REVB=-0.00131447;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002584;OID=.;OPOS=55872397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0 chr19 55872531 . C G 126.87 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0380493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.4841;QD=19.519;RBI=0.0382447;REFB=-0.0272013;REVB=0.00386116;RO=12;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256161;STB=0.644963;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0257809;OID=.;OPOS=55872531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:6:8:3:9:6:8:3:9 chr19 55872566 . A G 388.12 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.852;QD=55.446;RBI=0.0642052;REFB=0;REVB=0.0102761;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109873;OID=.;OPOS=55872566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:13:15:0:0 chr19 55873642 . C T 875.23 PASS AF=1;AO=59;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120945;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.846;QD=58.3483;RBI=0.0250314;REFB=0;REVB=0.0219156;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000152126;OID=.;OPOS=55873642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:60:0:0:59:60:1:27:32:0:0:28:32:0:0 chr19 55877231 . C T 49.54 PASS AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00583725;FXX=0.0587889;HRUN=6;LEN=1;MLLD=99.4293;QD=12.3838;RBI=0.0149686;REFB=-0.0132913;REVB=-0.0137836;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354212;STB=0.713673;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.014337;OID=.;OPOS=55877231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:16:16:9:9:7:7:0.4375:2:5:3:6:2:5:3:6 chr19 55879872 . C T 227.76 PASS AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0204165;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.213;QD=20.7052;RBI=0.0204169;REFB=-0.015104;REVB=0.000137635;RO=22;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429447;STB=0.524207;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0203332;OID=.;OPOS=55879872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:22:22:22:22:0.5:14:8:9:13:14:8:9:13 chr19 55913038 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.495;QD=62.0217;RBI=0.0449677;REFB=0;REVB=0.0357265;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340405;OID=.;OPOS=55913038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:17:24:0:0:18:24:0:0 chr19 55999993 . A G,T 1100.99 PASS AF=0.891892,0.108108;AO=71,3;DP=75;FAO=66,8;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33,8;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366738,0.00719483;FXX=0.0133316;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.602,137.828;QD=59.5127;RBI=0.0372617,0.0161886;REFB=0,0;REVB=-0.00659317,0.0145019;RO=0;SAF=40,1;SAR=31,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.18246e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00201114,0.0316146;OID=.,.;OPOS=55999993,55999993;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:23:75:74:0:0:71,3:66,8:0.891892,0.108108:31,2:40,1:0:0:33,0:33,8:0:0 chr19 56000797 . C T 160.3 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000254858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.267;QD=45.7992;RBI=0.0133071;REFB=0;REVB=0.0133047;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33267e-05;OID=.;OPOS=56000797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr19 56011460 . C T 464.75 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8321;QD=58.0931;RBI=0.210927;REFB=0;REVB=0.0871065;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00537408;OID=.;OPOS=56011460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0 chr19 56024519 . T C 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.472;QD=58.142;RBI=0.026285;REFB=0;REVB=0.00697675;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100416;OID=.;OPOS=56024519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chr19 56030009 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000895195;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.954;QD=42.1826;RBI=0.037245;REFB=0;REVB=0.0372343;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159335;OID=.;OPOS=56030009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr19 56041255 . C G 145.87 PASS AF=1;AO=12;DP=15;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.473;QD=44.8834;RBI=0.0786745;REFB=0;REVB=0.0705246;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000951514;OID=.;OPOS=56041255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:13:0:0:12:13:1:4:8:0:0:6:7:0:0 chr19 56047448 . A G 1163.74 PASS AF=0.987342;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0306502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.175;QD=58.9235;RBI=0.0308622;REFB=0.0665158;REVB=-0.00361163;RO=1;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996436;STB=0.505153;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000266787;OID=.;OPOS=56047448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:79:1:1:77:78:0.987342:47:30:0:1:48:30:0:1 chr19 56052770 . C T 126.9 PASS AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0169914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.125;QD=19.5232;RBI=0.0218907;REFB=-0.0428473;REVB=-0.0138021;RO=12;SAF=12;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323957;STB=0.688208;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0249015;OID=.;OPOS=56052770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:2:12:7:5:2:12:7:5 chr19 56056184 . A G 426.44 PASS AF=0.451923;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=-0.0233967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6336;QD=16.4017;RBI=0.0879807;REFB=-0.0344513;REVB=-0.0848127;RO=56;SAF=26;SAR=21;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162545;STB=0.583791;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0331078;OID=.;OPOS=56056184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:56:57:47:47:0.451923:21:26:40:16:21:26:40:17 chr19 56103984 . C T 501.65 PASS AF=0.486239;AO=52;DP=108;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0208968;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.249;QD=18.4091;RBI=0.0210018;REFB=-0.00363276;REVB=0.00209769;RO=56;SAF=32;SAR=20;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191956;STB=0.609578;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00360062;OID=.;OPOS=56103984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:56:56:52:53:0.486239:20:32:23:33:20:33:23:33 chr19 56114045 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.878;QD=51.9164;RBI=0.046025;REFB=0;REVB=0.0272313;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534561;OID=.;OPOS=56114045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0 chr19 56114237 . G A 911.77 PASS AF=1;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708548;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1234;QD=56.9856;RBI=0.167603;REFB=-0.109947;REVB=0.15189;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012593;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00553355;OID=.;OPOS=56114237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:65:64:1:0:63:64:1:37:26:0:1:38:26:0:0 chr19 56154518 . GTTT G 168.06 PASS AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00104867;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=115.983;QD=18.6736;RBI=0.0150904;REFB=-0.00961155;REVB=-0.0150539;RO=15;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573739;STB=0.531885;STBP=0.653;TYPE=del;VARB=0.00650853;OID=.;OPOS=56154519;OREF=TTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:21:36:21:36:15:7:14:4:11:96:15:7:14:4:11 chr19 56160399 . T C 756.99 PASS AF=1;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404711;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3698;QD=57.1314;RBI=0.0228716;REFB=0;REVB=0.0225107;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140295;OID=.;OPOS=56160399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0 chr19 56162776 . C T 266.05 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.12215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1405;QD=21.2837;RBI=0.12222;REFB=-0.0331705;REVB=-0.00415957;RO=25;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142116;STB=0.579555;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0266588;OID=.;OPOS=56162776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:12:13:9:16:12:13:9:16 chr19 56180968 . C T 740.44 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.12;QD=56.9569;RBI=0.0693722;REFB=0;REVB=0.0433618;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234437;OID=.;OPOS=56180968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0 chr19 56241265 . A G 868.27 PASS AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.941;QD=57.8848;RBI=0.00949427;REFB=0;REVB=0.00908465;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.24359e-05;OID=.;OPOS=56241265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:36:22:0:0:37:23:0:0 chr19 56274086 . G A 98.42 PASS AF=0.254902;AO=13;DP=51;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00257963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.763;QD=7.71942;RBI=0.0142739;REFB=-0.0105836;REVB=0.0140388;RO=38;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378519;STB=0.732217;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0186784;OID=.;OPOS=56274086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:51:51:38:38:13:13:0.254902:4:9:14:24:4:9:14:24 chr19 56274424 . C A 116.38 PASS AF=0.151316;AO=23;DP=152;FAO=23;FDP=152;FR=.;FRO=129;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=62;FSRR=67;FWDB=-0.0171944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.776;QD=3.06265;RBI=0.0193859;REFB=-0.000428401;REVB=0.00895352;RO=127;SAF=2;SAR=21;SRF=61;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559139;STB=0.883836;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00147443;OID=.;OPOS=56274424;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:127:129:23:23:0.151316:21:2:61:66:21:2:62:67 chr19 56274453 . G A 75.39 PASS AF=0.130769;AO=17;DP=130;FAO=17;FDP=130;FR=.;FRO=113;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=-0.0151537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3593;QD=2.31966;RBI=0.0259608;REFB=-0.000293457;REVB=0.0210791;RO=109;SAF=2;SAR=15;SRF=51;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483333;STB=0.837278;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0024143;OID=.;OPOS=56274453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:130:130:109:113:17:17:0.130769:15:2:51:58:15:2:51:62 chr19 56283289 . A G 78.87 PASS AF=0.229167;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0406722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6596;QD=6.57217;RBI=0.0427373;REFB=0.00269314;REVB=-0.0131243;RO=37;SAF=4;SAR=7;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245307;STB=0.655152;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0132933;OID=.;OPOS=56283289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:48:48:37:37:11:11:0.229167:7:4:21:16:7:4:21:16 chr19 56283297 . G A 128.61 PASS AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.01731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.936;QD=12.5475;RBI=0.0290069;REFB=-0.0112102;REVB=0.0232758;RO=26;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772636;STB=0.545394;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0212286;OID=.;OPOS=56283297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:7:8:12:14:7:8:12:14 chr19 56284090 . G A 663.82 PASS AF=0.815385;AO=53;DP=67;FAO=53;FDP=65;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00595903;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.98;QD=40.8503;RBI=0.0498408;REFB=0.000893348;REVB=0.0494833;RO=11;SAF=25;SAR=28;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349076;STB=0.5102;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-4.05507e-05;OID=.;OPOS=56284090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:67:65:11:12:53:53:0.815385:28:25:4:7:28:25:5:7 chr19 56284457 . G A 79.46 PASS AF=0.234043;AO=10;DP=46;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=-0.0557812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.792;QD=6.76232;RBI=0.0566366;REFB=-0.00228304;REVB=-0.0098063;RO=34;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29487;STB=0.702663;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00475468;OID=.;OPOS=56284457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:47:34:36:10:11:0.234043:9:1:8:26:10:1:8:28 chr19 56284507 . T G 84.08 PASS AF=0.202899;AO=14;DP=69;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.000950061;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.168;QD=4.87447;RBI=0.00688718;REFB=-0.00379519;REVB=-0.00682134;RO=54;SAF=1;SAR=13;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521826;STB=0.84983;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0238474;OID=.;OPOS=56284507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:69:69:54:55:14:14:0.202899:13:1:20:34:13:1:20:35 chr19 56284511 . C G 90.33 PASS AF=0.205479;AO=15;DP=73;FAO=15;FDP=73;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.00148111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.452;QD=4.94981;RBI=0.0109255;REFB=-0.00764605;REVB=-0.0108246;RO=58;SAF=1;SAR=14;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529037;STB=0.857326;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0392764;OID=.;OPOS=56284511;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:73:73:58:58:15:15:0.205479:14:1:21:37:14:1:21:37 chr19 56284529 . C A 84.09 PASS AF=0.202899;AO=14;DP=70;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.019433;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6284;QD=4.87493;RBI=0.0236903;REFB=-0.00700376;REVB=-0.0135495;RO=54;SAF=1;SAR=13;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521826;STB=0.858213;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00275611;OID=.;OPOS=56284529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:70:69:54:55:14:14:0.202899:13:1:20:34:13:1:21:34 chr19 56284535 . A G 68.88 PASS AF=0.181818;AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.00231676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.084;QD=4.1747;RBI=0.00464857;REFB=0.000633058;REVB=-0.00403011;RO=54;SAF=1;SAR=11;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.497996;STB=0.845444;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00423208;OID=.;OPOS=56284535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:66:66:54:54:12:12:0.181818:11:1:21:33:11:1:21:33 chr19 56307583 . A G 803.38 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0848884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5085;QD=55.4055;RBI=0.0917312;REFB=-0.0510661;REVB=0.0347647;RO=1;SAF=35;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132859;STB=0.50704;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00157908;OID=.;OPOS=56307583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:22:35:1:0:22:35:1:0 chr19 56320200 . C T 2252.68 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00605807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1333;QD=63.4558;RBI=0.0276253;REFB=0;REVB=-0.0269528;RO=0;SAF=64;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33035e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166456;OID=.;OPOS=56320200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:142:0:0:140:142:1:76:64:0:0:77:65:0:0 chr19 56321295 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0450817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2872;QD=53.9112;RBI=0.0485387;REFB=0;REVB=-0.0179901;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158298;OID=.;OPOS=56321295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr19 56321414 . C A 785.21 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.37;QD=57.1065;RBI=0.0960409;REFB=0;REVB=0.0952554;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000609197;OID=.;OPOS=56321414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:55:0:0:52:55:1:32:20:0:0:35:20:0:0 chr19 56369189 . G A 550.53 PASS AF=1;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.927;QD=59.5168;RBI=0.004441;REFB=0;REVB=0.00294639;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248877;OID=.;OPOS=56369189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:35:37:1:18:17:0:0:20:17:0:0 chr19 56369215 . C T 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.956;QD=58.1415;RBI=0.0832055;REFB=0;REVB=0.083135;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000844223;OID=.;OPOS=56369215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0 chr19 56369593 . T C 375.61 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.45;QD=55.6461;RBI=0.024957;REFB=0;REVB=0.00909846;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163321;OID=.;OPOS=56369593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr19 56373462 . G A 248.42 PASS AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00631663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.234;QD=13.9955;RBI=0.00926134;REFB=-0.0211923;REVB=0.00677293;RO=42;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179158;STB=0.510197;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0280718;OID=.;OPOS=56373462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:15:14:21:21:15:14:21:21 chr19 56392920 . C T 199.86 PASS AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=-0.000868967;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.364;QD=11.5862;RBI=0.0170745;REFB=-0.0136173;REVB=-0.0170524;RO=44;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169268;STB=0.596746;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0218836;OID=.;OPOS=56392920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:16:9:10:34:16:9:10:34 chr19 56419263 . T C 474.3 PASS AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0115934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.189;QD=18.9718;RBI=0.0169917;REFB=-0.00436279;REVB=-0.0124222;RO=53;SAF=23;SAR=24;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162657;STB=0.590293;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00378064;OID=.;OPOS=56419263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:53:53:47:47:0.47:24:23:35:18:24:23:35:18 chr19 56423074 . C G 127.6 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0116004;FXX=0.0644953;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.096;QD=17.5996;RBI=0.0219674;REFB=-0.0424343;REVB=0.0186547;RO=15;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413564;STB=0.523775;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0426058;OID=.;OPOS=56423074;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:29:15:15:14:14:0.482759:9:5:6:9:9:5:6:9 chr19 56423254 . G A 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00329505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.363;QD=7.46507;RBI=0.00473438;REFB=0.00607536;REVB=-0.00339955;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220682;STB=0.640604;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.0162811;OID=.;OPOS=56423254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:2:5:9:8:2:5:9:8 chr19 56423668 . G A 114.05 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0348685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.025;QD=18.2473;RBI=0.0348944;REFB=-0.0045513;REVB=-0.00134258;RO=12;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111715;STB=0.564411;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00980297;OID=.;OPOS=56423668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:10:3:4:8:10:3:4:8 chr19 56423692 . C T 55.83 PASS AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0521214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.513;QD=10.6345;RBI=0.0571123;REFB=-0.00324956;REVB=-0.0233489;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139534;STB=0.545344;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00830139;OID=.;OPOS=56423692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:12:13:8:8:0.380952:5:3:3:9:5:3:4:9 chr19 56423728 . A G 64.87 PASS AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0140971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.019;QD=10.3792;RBI=0.0217682;REFB=-0.0181172;REVB=0.0165869;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752546;STB=0.545355;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.033586;OID=.;OPOS=56423728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:6:10:5:4:6:10 chr19 56423893 . G A 309.96 PASS AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00966107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.128;QD=18.7852;RBI=0.0266009;REFB=-0.0256022;REVB=-0.0247845;RO=33;SAF=19;SAR=14;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109143;STB=0.560849;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0257732;OID=.;OPOS=56423893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:14:19:15:18:14:19:15:18 chr19 56424443 . T C 58.61 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00182382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.604;QD=14.6535;RBI=0.02365;REFB=-0.0201974;REVB=0.0235796;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108737;STB=0.564352;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0143402;OID=.;OPOS=56424443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:4:4:5:3:4:4 chr19 56443519 . C T 736.22 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0576058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7865;QD=61.352;RBI=0.0576287;REFB=-0.0580565;REVB=0.00162376;RO=1;SAF=20;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229327;STB=0.51219;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00150855;OID=.;OPOS=56443519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:48:48:1:1:47:47:0.979167:27:20:1:0:27:20:1:0 chr19 56459342 . C T 574.42 PASS AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0459203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.474;QD=56.0407;RBI=0.0461216;REFB=-0.195032;REVB=-0.00430466;RO=2;SAF=14;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623593;STB=0.533316;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00333438;OID=.;OPOS=56459342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:41:41:2:2:39:39:0.95122:25:14:2:0:25:14:2:0 chr19 56459614 . G C 501.61 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0362;QD=59.0134;RBI=0.0715281;REFB=0;REVB=0.0331727;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173585;OID=.;OPOS=56459614;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0 chr19 56477687 . A G 708.49 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4091;QD=62.9767;RBI=0.0302859;REFB=0;REVB=0.0138736;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566047;OID=.;OPOS=56477687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr19 56477710 . T C 523.78 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041778;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.748;QD=59.8607;RBI=0.0787883;REFB=0;REVB=0.0667997;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274144;OID=.;OPOS=56477710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0 chr19 56487603 . A G 1720.01 PASS AF=0.902985;AO=120;DP=134;FAO=121;FDP=134;FR=.;FRO=13;FSAF=66;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0166044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8909;QD=51.3435;RBI=0.0182372;REFB=-0.054325;REVB=-0.00754258;RO=14;SAF=66;SAR=54;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094558;STB=0.545447;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0350029;OID=.;OPOS=56487603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:134:134:14:13:120:121:0.902985:54:66:1:13:55:66:1:12 chr19 56499279 . G C 417.96 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0705219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.178;QD=53.9306;RBI=0.0705591;REFB=0.017867;REVB=0.00229185;RO=1;SAF=10;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443379;STB=0.523793;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00037942;OID=.;OPOS=56499279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:20:10:1:0:20:10:1:0 chr19 56511082 . C G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=354.676;QD=55.0987;RBI=0.0207866;REFB=0;REVB=0.00406423;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.68402e-05;OID=.;OPOS=56511082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr19 56511090 . T C 465.01 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00486269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.504;QD=58.1266;RBI=0.0169258;REFB=0;REVB=0.0162123;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.11735e-05;OID=.;OPOS=56511090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr19 56515334 . C T 637.04 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243479;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.285;QD=62.1503;RBI=0.0267311;REFB=0;REVB=-0.0110333;RO=0;SAF=11;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101225;OID=.;OPOS=56515334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:30:11:0:0:30:11:0:0 chr19 56527179 . T TC 52.45 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0695278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.1268;QD=6.55642;RBI=0.0877396;REFB=0.027274;REVB=0.0535174;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314542;STB=0.687177;STBP=0.197;TYPE=ins;VARB=-0.0439489;OID=.;OPOS=56527180;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3125:10:32:10:32:22:5:5:5:17:52:22:5:5:5:17 chr19 56538976 . G C 138.95 PASS AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0199685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7883;QD=19.8494;RBI=0.0411178;REFB=0.000462349;REVB=-0.0359434;RO=13;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046223;STB=0.52628;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.000797275;OID=.;OPOS=56538976;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:10:5:5:8:10:5:5:8 chr19 56539240 . C T 174.42 PASS AF=0.323944;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.00913017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.441;QD=9.82625;RBI=0.0107342;REFB=-0.00597725;REVB=0.00564472;RO=48;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121617;STB=0.571007;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0140438;OID=.;OPOS=56539240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:48:48:23:23:0.323944:13:10:16:32:13:10:16:32 chr19 56549510 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.37;QD=62.671;RBI=0.0153392;REFB=0;REVB=-0.0149709;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.18982e-05;OID=.;OPOS=56549510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr19 56549532 . A G 538.35 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.14;QD=59.8166;RBI=0.0470171;REFB=0;REVB=0.030191;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118296;OID=.;OPOS=56549532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0 chr19 56565164 . G A 223.17 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0663223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.703;QD=49.5937;RBI=0.0679997;REFB=0;REVB=0.0150105;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115812;OID=.;OPOS=56565164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0 chr19 56569629 . C G 527.56 PASS AF=0.438462;AO=57;DP=130;FAO=57;FDP=130;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00292158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.306;QD=16.2325;RBI=0.0323804;REFB=-0.0108733;REVB=-0.0322483;RO=73;SAF=29;SAR=28;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039406;STB=0.522013;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0142175;OID=.;OPOS=56569629;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:73:73:57:57:0.438462:28:29:40:33:28:29:40:33 chr19 56572832 . G A 376.24 PASS AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0100351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.723;QD=21.1966;RBI=0.0130598;REFB=-0.0013364;REVB=0.00835797;RO=32;SAF=13;SAR=25;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188768;STB=0.612028;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000941066;OID=.;OPOS=56572832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:33:38:38:0.535211:25:13:18:14:25:13:19:14 chr19 56688570 . G A 446.96 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1383;QD=57.6723;RBI=0.0582357;REFB=0;REVB=0.0551925;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794364;OID=.;OPOS=56688570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0 chr19 56693620 . C G 205.1 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0294426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9398;QD=15.7768;RBI=0.0295047;REFB=-0.00752672;REVB=-0.00191426;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210125;STB=0.511935;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00956295;OID=.;OPOS=56693620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:10:13:17:12:10:13:17:12 chr19 56702323 . C T 390.97 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.00452514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.019;QD=16.6369;RBI=0.00453259;REFB=-0.00701006;REVB=0.000259908;RO=53;SAF=11;SAR=30;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149737;STB=0.584609;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00988745;OID=.;OPOS=56702323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:30:11:21:32:30:11:21:32 chr19 56703248 . G A 180.45 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.123162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.8076;QD=16.0395;RBI=0.126762;REFB=-0.0298123;REVB=0.0299964;RO=26;SAF=14;SAR=5;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974454;STB=0.555501;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0347769;OID=.;OPOS=56703248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:5:14:21:5:5:14:21:5 chr19 56704101 . G A 156.95 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0211999;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.486;QD=16.9678;RBI=0.0212007;REFB=-0.00829683;REVB=-0.000177004;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220726;STB=0.626304;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00997276;OID=.;OPOS=56704101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:37:20:20:15:15:0.405405:8:7:5:15:8:7:5:15 chr19 56704260 . C T 300.4 PASS AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00395744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5361;QD=19.0732;RBI=0.0296354;REFB=0.00332372;REVB=-0.02937;RO=31;SAF=11;SAR=21;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130518;STB=0.572881;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00381866;OID=.;OPOS=56704260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:21:11:15:16:21:11:15:16 chr19 56704399 . G A 267.51 PASS AF=0.510204;AO=26;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0386728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.369;QD=21.8375;RBI=0.0390585;REFB=-0.00723335;REVB=0.00547548;RO=23;SAF=14;SAR=12;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267276;STB=0.630969;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0116297;OID=.;OPOS=56704399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:24:26:25:0.510204:12:14:5:18:12:13:6:18 chr19 56717325 . T G 321.23 PASS AF=0.55;AO=32;DP=59;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00497288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.213;QD=21.415;RBI=0.0348809;REFB=-0.00592733;REVB=0.0345245;RO=26;SAF=23;SAR=9;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121115;STB=0.523737;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00583234;OID=.;OPOS=56717325;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:26:27:32:33:0.55:9:23:19:7:10:23:20:7 chr19 56717353 . A G 419.55 PASS AF=0.561644;AO=41;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.016662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.063;QD=22.9889;RBI=0.042939;REFB=-0.0129413;REVB=0.0395744;RO=32;SAF=28;SAR=13;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242737;STB=0.513362;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0168248;OID=.;OPOS=56717353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:32:32:41:41:0.561644:13:28:21:11:13:28:21:11 chr19 56718585 . A G 213.2 PASS AF=0.329268;AO=27;DP=82;FAO=27;FDP=82;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0247515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.574;QD=10.4002;RBI=0.028734;REFB=-0.01314;REVB=-0.0145946;RO=55;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951299;STB=0.555514;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.022531;OID=.;OPOS=56718585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:55:55:27:27:0.329268:12:15:26:29:12:15:26:29 chr19 56718608 . G A 375.73 PASS AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0139961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.754;QD=23.8556;RBI=0.019366;REFB=-0.0316437;REVB=0.0133848;RO=25;SAF=19;SAR=18;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246178;STB=0.505576;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0162328;OID=.;OPOS=56718608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:25:26:37:37:0.587302:18:19:12:13:18:19:13:13 chr19 56827938 . C A 937.49 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0724227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9147;QD=58.5933;RBI=0.0773453;REFB=0;REVB=-0.0271524;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100951;OID=.;OPOS=56827938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0 chr19 56888454 . A C 220.92 PASS AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0841516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0108;QD=18.0345;RBI=0.0852469;REFB=0.0158885;REVB=0.0136214;RO=27;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154021;STB=0.587705;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.0155626;OID=.;OPOS=56888454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:14:8:14:13:14:8:14:13 chr19 56888526 . A T 121.57 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0108291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.968;QD=15.1968;RBI=0.0128281;REFB=-0.00801511;REVB=0.00687686;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331196;STB=0.519203;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0141596;OID=.;OPOS=56888526;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:9:5:7:11:9:5:7:11 chr19 56895496 . C T 144.48 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0303998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2611;QD=15.6194;RBI=0.0407873;REFB=-0.0598217;REVB=-0.0271929;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960359;STB=0.556441;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.033172;OID=.;OPOS=56895496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:17:19:14:14:0.378378:8:6:9:8:8:6:10:9 chr19 56935527 . A G,T 455.13 PASS AF=0.9375,0.0625;AO=29,3;DP=32;FAO=30,2;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17,2;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651199,0.00342674;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=74.6129,88.7103;QD=56.8912;RBI=0.0773422,0.0218128;REFB=0,0;REVB=0.0417279,-0.021542;RO=0;SAF=16,3;SAR=13,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=1.36179e-05,0.142196;OID=.,.;OPOS=56935527,56935527;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:32:32:0:0:29,3:30,2:0.9375,0.0625:13,0:16,3:0:0:13,0:17,2:0:0 chr19 56952821 . C T 223.56 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0260079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.874;QD=14.904;RBI=0.030012;REFB=-0.0137643;REVB=-0.0149769;RO=34;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419753;STB=0.523791;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0210021;OID=.;OPOS=56952821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:15:11:13:21:15:11:13:21 chr19 56953585 . T C 167.47 PASS AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.029785;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.061;QD=41.8678;RBI=0.0304635;REFB=-0.0643691;REVB=0.0063936;RO=1;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536101;STB=0.529373;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00465887;OID=.;OPOS=56953585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:8:7:0:1:8:7:0:1 chr19 56953863 . T C 1518.73 PASS AF=0.989796;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1549;QD=61.9888;RBI=0.0255433;REFB=-0.13582;REVB=0.0141975;RO=1;SAF=52;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903231;STB=0.504586;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00294635;OID=.;OPOS=56953863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:96:98:1:1:95:97:0.989796:43:52:1:0:43:54:1:0 chr19 56981382 . T C 1731.29 PASS AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.744;QD=60.7469;RBI=0.00786492;REFB=0;REVB=0.00126732;RO=0;SAF=42;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47005e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32082e-05;OID=.;OPOS=56981382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:72:42:0:0:72:42:0:0 chr19 57036653 . G A 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00825687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.604;QD=22.9574;RBI=0.0202185;REFB=-0.00536832;REVB=0.0184557;RO=11;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06032;STB=0.533938;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00320286;OID=.;OPOS=57036653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:6:10:6:5:6:10:6:5 chr19 57036678 . G A 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.000255627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.609;QD=21.9441;RBI=0.0233767;REFB=0.0124961;REVB=-0.0233753;RO=12;SAF=12;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153092;STB=0.586841;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.00345442;OID=.;OPOS=57036678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:4:12:7:5:4:12:7:5 chr19 57058998 . C G 492.26 PASS AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.041057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.061;QD=22.6326;RBI=0.0411153;REFB=-0.0114818;REVB=0.00218909;RO=40;SAF=18;SAR=29;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293734;STB=0.516156;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00575617;OID=.;OPOS=57058998;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:40:40:47:47:0.54023:29:18:14:26:29:18:14:26 chr19 57062073 . T C 1157.14 PASS AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341295;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.681;QD=60.9022;RBI=0.00369005;REFB=0;REVB=-0.00140293;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.42428e-05;OID=.;OPOS=57062073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chr19 57065189 . T C 376.37 PASS AF=0.425532;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.013414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.128;QD=16.0156;RBI=0.0136241;REFB=0.00128269;REVB=-0.00238335;RO=54;SAF=19;SAR=21;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503271;STB=0.528328;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.00139979;OID=.;OPOS=57065189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:54:40:40:0.425532:21:19:23:31:21:19:23:31 chr19 57088850 . T C 169.49 PASS AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0164745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.64;QD=10.5933;RBI=0.0171261;REFB=0.00120312;REVB=-0.00467906;RO=42;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503381;STB=0.502939;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=-0.00184943;OID=.;OPOS=57088850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:13:9:17:25:13:9:17:25 chr19 57089050 . C T 381.53 PASS AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00495651;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3239;QD=22.4432;RBI=0.0194791;REFB=-0.031717;REVB=0.0188379;RO=30;SAF=16;SAR=22;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730393;STB=0.540172;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0263509;OID=.;OPOS=57089050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:30:38:38:0.558824:22:16:10:20:22:16:10:20 chr19 57135023 . T C 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.000629369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.002;QD=20.2687;RBI=0.018144;REFB=-0.0117772;REVB=0.0181331;RO=20;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148804;STB=0.596238;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0116018;OID=.;OPOS=57135023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:21:21:21:0.5:8:13:9:11:8:13:9:12 chr19 57175578 . C T 191.25 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.737;QD=47.8116;RBI=0.0517276;REFB=0;REVB=0.008107;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000847664;OID=.;OPOS=57175578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0 chr19 57293394 . A G 1062.43 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.478;QD=59.8551;RBI=0.0294877;REFB=0;REVB=0.0053203;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.10844e-05;OID=.;OPOS=57293394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0 chr19 57335022 . G A 1677.13 PASS AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.733;QD=60.4371;RBI=0.072181;REFB=0;REVB=0.0704413;RO=0;SAF=57;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129123;OID=.;OPOS=57335022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:54:57:0:0:54:57:0:0 chr19 57433619 . C T 411.15 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.534;QD=56.7107;RBI=0.0108779;REFB=0;REVB=0.0062749;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39151e-05;OID=.;OPOS=57433619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:14:14:0:0:14:15:0:0 chr19 57433712 . T C 113.1 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00505692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.401;QD=17.4002;RBI=0.0111666;REFB=-0.018847;REVB=-0.00995589;RO=13;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200611;STB=0.615207;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0348859;OID=.;OPOS=57433712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:5:8:5:8:5:8:5:8 chr19 57641146 . A G 52.12 PASS AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0068991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.997;QD=6.31789;RBI=0.00933831;REFB=0.00146815;REVB=0.00629337;RO=25;SAF=3;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21683;STB=0.638753;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.00406867;OID=.;OPOS=57641146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:5:3:14:11:5:3:14:11 chr19 57641799 . G A 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0322409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.854;QD=18.0506;RBI=0.0370985;REFB=-0.0337172;REVB=0.0183527;RO=8;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096204;STB=0.555446;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0264726;OID=.;OPOS=57641799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:5:5:3:5:5:5:3:5 chr19 57642782 . C A,G 634.0 PASS AF=0.952381,0.047619;AO=39,3;DP=42;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=24,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014115,0.00337731;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.75,55.3202;QD=60.3813;RBI=0.0147579,0.0526865;REFB=0,0;REVB=-0.00430847,-0.0525781;RO=0;SAF=16,0;SAR=23,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.43889e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000212639,0.123396;OID=.,.;OPOS=57642782,57642782;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:42:42:0:0:39,3:40,2:0.952381,0.047619:23,3:16,0:0:0:24,2:16,0:0:0 chr19 57643051 . G A 300.48 PASS AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0906935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.894;QD=19.0782;RBI=0.0908264;REFB=-0.00690851;REVB=-0.00491193;RO=31;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181983;STB=0.601322;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00284186;OID=.;OPOS=57643051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:19:13:19:12:19:13:19:12 chr19 57643099 . G A 180.48 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0218102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1418;QD=16.0427;RBI=0.0443889;REFB=0.0228648;REVB=0.0386612;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141957;STB=0.581311;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0278072;OID=.;OPOS=57643099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:10:9:16:10:10:9:16:10 chr19 57647015 . A G 184.73 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00295622;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3557;QD=17.5935;RBI=0.00622352;REFB=-0.018088;REVB=-0.00547658;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117542;STB=0.578864;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0289567;OID=.;OPOS=57647015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:22:23:19:19:0.452381:11:8:12:10:11:8:13:10 chr19 57647236 . T C 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0125536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.032;QD=17.3254;RBI=0.0159367;REFB=-0.00256513;REVB=-0.00981761;RO=25;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170646;STB=0.597601;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00418977;OID=.;OPOS=57647236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:7:13:12:13:7:13:12:13 chr19 57649901 . G A 345.88 PASS AF=0.5;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0116308;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.968;QD=19.2153;RBI=0.0117289;REFB=-0.0263727;REVB=-0.00151417;RO=36;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766345;STB=0.542563;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0266365;OID=.;OPOS=57649901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:36:36:36:36:0.5:16:20:23:13:16:20:23:13 chr19 57649940 . A T 232.93 PASS AF=0.465517;AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00420334;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.023;QD=16.0642;RBI=0.00928983;REFB=-0.0103851;REVB=0.0082845;RO=31;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218881;STB=0.609057;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0149616;OID=.;OPOS=57649940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:31:31:26:27:0.465517:16:10:19:12:16:11:19:12 chr19 57742472 . G C 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9527;QD=61.3346;RBI=0.0920753;REFB=0;REVB=0.052752;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014991;OID=.;OPOS=57742472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0 chr19 57742489 . C T 557.45 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.354;QD=60.2646;RBI=0.0446892;REFB=0;REVB=0.0299336;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482739;OID=.;OPOS=57742489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:17:19:0:0:17:20:0:0 chr19 57742493 . AGGACGAGCAGGATT A 199.91 PASS AF=1;AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141418;FXX=0.227169;HRUN=2;LEN=14;MLLD=345.672;QD=47.0373;RBI=0.0153321;REFB=0;REVB=0.005923;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000830445;OID=.;OPOS=57742494;OREF=GGACGAGCAGGATT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:17:22:17:17:0:12:5:0:0:4:0:12:5:0:0 chr19 57773447 . T G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.457;QD=51.1846;RBI=0.0188457;REFB=0;REVB=-8.44484e-05;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49594e-05;OID=.;OPOS=57773447;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0 chr19 57832214 . G T 47.16 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.10644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0448;QD=11.0969;RBI=0.126339;REFB=-0.00372507;REVB=0.068058;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108508;STB=0.565043;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0207001;OID=.;OPOS=57832214;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:2:8:5:2:2:8 chr19 57832257 . T C 235.22 PASS AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.00850664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=335.915;QD=25.4289;RBI=0.00964795;REFB=-0.0130513;REVB=0.00455191;RO=14;SAF=4;SAR=18;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475753;STB=0.534453;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0100036;OID=.;OPOS=57832257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:14:15:22:22:0.594595:18:4:2:12:18:4:2:13 chr19 57838018 . C G 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0178042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.104;QD=8.6914;RBI=0.0185016;REFB=-0.00924894;REVB=-0.00503195;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021884;STB=0.51348;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.019509;OID=.;OPOS=57838018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:6:2:4:13:6:2:4:13 chr19 57839150 . A G 279.61 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0244732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.106;QD=48.6273;RBI=0.0299758;REFB=-0.140863;REVB=0.0173093;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519982;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00220694;OID=.;OPOS=57839150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:0:1:22:22:0.956522:10:12:0:0:10:12:1:0 chr19 57839567 . T A 837.19 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00536207;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.673;QD=57.7369;RBI=0.0104586;REFB=0;REVB=0.00897945;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139046;OID=.;OPOS=57839567;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0 chr19 57840547 . A G 130.02 PASS AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0501421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.165;QD=13.3356;RBI=0.0507138;REFB=0.0136219;REVB=-0.00759328;RO=24;SAF=8;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00880615;STB=0.505148;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-0.0137002;OID=.;OPOS=57840547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:7:8:13:11:7:8:13:11 chr19 57868336 . A G 313.33 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00862093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.972;QD=50.1333;RBI=0.0216348;REFB=-0.00136926;REVB=-0.019843;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299036;STB=0.516116;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-3.67694e-05;OID=.;OPOS=57868336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:15:9:0:1:15:9:0:1 chr19 57909872 . G A 1291.72 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0090812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.919;QD=61.5107;RBI=0.00971419;REFB=0;REVB=0.00344924;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146585;OID=.;OPOS=57909872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:37:46:0:0:37:47:0:0 chr19 57931553 . C T 214.41 PASS AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0171081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.17;QD=12.8009;RBI=0.0177051;REFB=-0.00024438;REVB=-0.00455866;RO=40;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175972;STB=0.593895;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.000214261;OID=.;OPOS=57931553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:10:16:18:22:10:16:19:22 chr19 57956828 . T G 708.53 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8576;QD=62.9801;RBI=0.0589543;REFB=0;REVB=0.0562465;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000818907;OID=.;OPOS=57956828;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0 chr19 57967049 . G T 1044.32 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1009;QD=59.6753;RBI=0.043929;REFB=0;REVB=0.00828534;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494686;OID=.;OPOS=57967049;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0 chr19 57967133 . G A 923.28 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.043182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4657;QD=56.8171;RBI=0.0480946;REFB=0.0321906;REVB=0.0211754;RO=1;SAF=21;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219567;STB=0.511624;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-3.96868e-05;OID=.;OPOS=57967133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:43:21:1:0:43:21:1:0 chr19 57984426 . C A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00264906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.312;QD=64.1536;RBI=0.0028088;REFB=0;REVB=0.000933705;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09242e-06;OID=.;OPOS=57984426;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:31:18:0:0:31:18:0:0 chr19 57984918 . A G 711.48 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00826766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.106;QD=52.7021;RBI=0.0270656;REFB=-0.139271;REVB=0.0257719;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518511;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.000862959;OID=.;OPOS=57984918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:54:54:0:2:52:52:0.962963:26:26:0:0:26:26:0:2 chr19 57985460 . T A 1058.41 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0717117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.842;QD=59.6285;RBI=0.0945953;REFB=0;REVB=-0.0616903;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126624;OID=.;OPOS=57985460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0 chr19 57985566 . G C 1416.3 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116266;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.48;QD=62.9467;RBI=0.0197856;REFB=0;REVB=0.0160091;RO=0;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0093e-06;OID=.;OPOS=57985566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:38:51:0:0:39:51:0:0 chr19 57987905 . G A 1510.85 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.258;QD=63.6149;RBI=0.019696;REFB=0;REVB=0.0146771;RO=0;SAF=45;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79762e-05;OID=.;OPOS=57987905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:50:45:0:0:50:45:0:0 chr19 57988666 . A AGCC 208.4 PASS AF=0.9;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000522685;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=199.144;QD=41.6794;RBI=0.0301275;REFB=-0.0481678;REVB=0.0301229;RO=4;SAF=4;SAR=14;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301148;STB=0.59988;STBP=0.05;TYPE=ins;VARB=0.013057;OID=.;OPOS=57988667;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=AGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.9:18:22:18:20:2:4:14:2:0:9:4:4:14:4:0 chr19 58001512 . T A 791.55 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00507981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.997;QD=56.5394;RBI=0.0374038;REFB=0;REVB=0.0370572;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164716;OID=.;OPOS=58001512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:23:32:0:0:24:32:0:0 chr19 58003141 . A G 123.15 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0437017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9899;QD=37.8923;RBI=0.0536412;REFB=-0.0842509;REVB=-0.0311054;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0219245;OID=.;OPOS=58003141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:8:4:0:1:8:4:0:1 chr19 58003488 . A G 905.9 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0167668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.778;QD=56.6189;RBI=0.0450781;REFB=-0.0951839;REVB=0.0418438;RO=0;SAF=22;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00128751;OID=.;OPOS=58003488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:41:22:0:0:41:22:0:1 chr19 58003580 . A G 1936.3 PASS AF=0.992126;AO=127;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0074333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.993;QD=60.986;RBI=0.0147494;REFB=-0.0974147;REVB=0.0127393;RO=0;SAF=49;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.502e-08;STB=0.505154;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.000216792;OID=.;OPOS=58003580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:127:127:0:1:127:126:0.992126:78:49:0:0:78:48:1:0 chr19 58003613 . C T 1801.73 PASS AF=1;AO=113;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4773;QD=61.0756;RBI=0.0257933;REFB=0;REVB=-0.0049301;RO=0;SAF=40;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59302e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.00696e-05;OID=.;OPOS=58003613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:118:0:0:113:118:1:73:40:0:0:73:45:0:0 chr19 58004346 . G C 694.84 PASS AF=1;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5609;QD=54.4972;RBI=0.0194115;REFB=-0.0640979;REVB=0.00669591;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171119;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166566;OID=.;OPOS=58004346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:51:51:1:0:49:51:1:27:22:0:1:29:22:0:0 chr19 58004931 . A G 45.57 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0470775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9472;QD=26.0414;RBI=0.0639626;REFB=-0.0791142;REVB=0.0433004;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0221536;OID=.;OPOS=58004931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:1:0:3:3:1:0 chr19 58011421 . G T 70.56 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00384759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.265;QD=17.6393;RBI=0.00397233;REFB=-0.025495;REVB=0.000987663;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092312;STB=0.553081;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0236596;OID=.;OPOS=58011421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:1:6:7:2:1:6 chr19 58016048 . C T 207.69 PASS AF=0.3;AO=27;DP=90;FAO=27;FDP=90;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.00733865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.764;QD=9.23045;RBI=0.0103616;REFB=-0.00231727;REVB=0.00731481;RO=63;SAF=16;SAR=11;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648144;STB=0.503827;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00514506;OID=.;OPOS=58016048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:63:63:27:27:0.3:11:16:37:26:11:16:37:26 chr19 58038964 . T A 1113.77 PASS AF=0.986842;AO=68;DP=70;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0343213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8243;QD=58.6193;RBI=0.119805;REFB=-0.0746825;REVB=0.114784;RO=1;SAF=42;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111219;STB=0.505616;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00349043;OID=.;OPOS=58038964;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:70:76:1:1:68:75:0.986842:26:42:1:0:31:44:1:0 chr19 58058536 . A G 1302.14 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0262;QD=62.0069;RBI=0.00895334;REFB=0;REVB=-0.00801557;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.53018e-05;OID=.;OPOS=58058536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:40:44:0:0:40:44:0:0 chr19 58058739 . T C 292.64 PASS AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00967951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.683;QD=27.222;RBI=0.0313861;REFB=0.000532633;REVB=-0.0298562;RO=17;SAF=14;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359317;STB=0.51984;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.000418328;OID=.;OPOS=58058739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:12:14:10:7:12:14:10:7 chr19 58117223 . T A 91.24 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00264039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.575;QD=17.3781;RBI=0.00357523;REFB=-0.0104797;REVB=-0.00241053;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274137;STB=0.657836;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00827243;OID=.;OPOS=58117223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:7:3:7:4:7:3 chr19 58151338 . TG GT,T 366.13 PASS AF=0,0.528571;AO=4,32;DP=73;FAO=0,37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=0,14;FSAR=0,23;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0183052,0.0361224;FXX=0.0410903;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=226.431,246.884;QD=20.9217;RBI=0.021626,0.0387157;REFB=-0.0120627,-0.0143007;REVB=0.0115153,0.0139313;RO=32;SAF=4,10;SAR=0,22;SRF=14;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.62275,-0.12315;STB=0.5,0.537449;STBP=1,0.533;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0103455;OID=.,.;OPOS=58151338,58151339;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:73:70:32:33:4,32:0,37:0,0.528571:0,22:4,10:14:18:0,23:0,14:15:18 chr19 58200099 . T C 212.71 PASS AF=0.479167;AO=19;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0044406;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=60.6039;QD=17.7259;RBI=0.00593722;REFB=-0.028852;REVB=0.00394102;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177504;STB=0.620046;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0137355;OID=.;OPOS=58200099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:20:25:19:23:0.479167:6:13:10:10:7:16:12:13 chr19 58200628 . G T 253.67 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0315378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5423;QD=21.5889;RBI=0.0544568;REFB=-0.0397901;REVB=-0.0443949;RO=23;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981691;STB=0.55491;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0298116;OID=.;OPOS=58200628;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:11:13:15:8:11:13:15:8 chr19 58201360 . C T 92.46 PASS AF=0.27907;AO=13;DP=44;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.012556;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.282;QD=8.60098;RBI=0.0254354;REFB=-0.00118094;REVB=-0.0221202;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268377;STB=0.517212;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00583049;OID=.;OPOS=58201360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:43:27:31:13:12:0.27907:5:8:16:11:4:8:20:11 chr19 58202016 . ATTCAT A 59.37 PASS AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0249799;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=282.809;QD=8.79589;RBI=0.0288409;REFB=-0.0103568;REVB=0.0144154;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308755;STB=0.703363;STBP=0.167;TYPE=del;VARB=0.0237799;OID=.;OPOS=58202017;OREF=TTCAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.37037:10:27:10:27:17:5:5:14:3:59:15:5:5:12:3 chr19 58213952 . C A 261.66 PASS AF=0.360465;AO=30;DP=85;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0503078;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1683;QD=12.1702;RBI=0.0510732;REFB=-0.00701001;REVB=0.00880896;RO=55;SAF=16;SAR=14;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047536;STB=0.536818;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0144491;OID=.;OPOS=58213952;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:55:55:30:31:0.360465:14:16:27:28:14:17:27:28 chr19 58258466 . G T 195.6 PASS AF=0.434783;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00665797;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.624;QD=17.0087;RBI=0.0114801;REFB=-0.00795688;REVB=-0.00935228;RO=27;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556976;STB=0.521717;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0123713;OID=.;OPOS=58258466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:27:26:20:20:0.434783:10:10:15:12:10:10:14:12 chr19 58301766 . TG T 437.03 PASS AF=0.473684;AO=65;DP=152;FAO=72;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.20011;FXX=0.0129862;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.6444;QD=11.5007;RBI=0.202948;REFB=-0.0194957;REVB=-0.0338187;RO=76;SAF=29;SAR=36;SRF=37;SRR=39;SSEN=0.754237;SSEP=0;SSSB=-0.0397367;STB=0.506577;STBP=0.905;TYPE=del;VARB=0.0188042;OID=.;OPOS=58301767;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.473684:65:152:72:152:80:36:36:41:39:99:76:29:36:37:39 chr19 58352522 . G A 433.27 PASS AF=0.458333;AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=43;FWDB=0.0219665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.436;QD=18.053;RBI=0.0266145;REFB=-0.00834675;REVB=0.0150267;RO=50;SAF=15;SAR=29;SRF=9;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183638;STB=0.608064;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.015186;OID=.;OPOS=58352522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:52:44:44:0.458333:29:15:9:41:29:15:9:43 chr19 58374130 . C T 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0141576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.811;QD=13.5807;RBI=0.0232417;REFB=-0.0164066;REVB=-0.018432;RO=27;SAF=13;SAR=4;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084144;STB=0.568938;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0229899;OID=.;OPOS=58374130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:28:17:17:0.377778:4:13:19:8:4:13:19:9 chr19 58378690 . G A 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0058988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=357.069;QD=43.4862;RBI=0.00757897;REFB=0;REVB=0.00475866;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.42221e-06;OID=.;OPOS=58378690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0 chr19 58385748 . G A 67.97 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.032254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.86;QD=14.3088;RBI=0.0325764;REFB=-0.0356945;REVB=-0.00457198;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371297;STB=0.519956;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0357934;OID=.;OPOS=58385748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:18:19:8:10:9:9:0.473684:6:3:3:5:6:3:3:7 chr19 58385762 . C G 70.03 PASS AF=0.5625;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0709451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.9699;QD=17.507;RBI=0.0840275;REFB=-0.127154;REVB=-0.0450269;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775671;STB=0.571275;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0991082;OID=.;OPOS=58385762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:15:16:7:7:8:9:0.5625:5:3:2:5:5:4:2:5 chr19 58385954 . T C 369.82 PASS AF=0.909091;AO=25;DP=34;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00422369;FXX=0.0294031;HRUN=8;LEN=1;MLLD=150.759;QD=44.8262;RBI=0.0294135;REFB=0.043039;REVB=0.0291086;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.540514;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.000853283;OID=.;OPOS=58385954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:34:33:0:3:25:30:0.909091:15:10:0:0:17:13:0:3 chr19 58420152 . C A 143.49 PASS AF=0.294118;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0055714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.585;QD=8.44069;RBI=0.0146726;REFB=-0.000348355;REVB=0.0135736;RO=47;SAF=6;SAR=14;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185953;STB=0.605659;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00087149;OID=.;OPOS=58420152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:47:48:20:20:0.294118:14:6:21:26:14:6:21:27 chr19 58420162 . T C 89.09 PASS AF=0.225806;AO=14;DP=62;FAO=14;FDP=62;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0195024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.575;QD=5.74797;RBI=0.0242009;REFB=-0.00752663;REVB=0.0143297;RO=48;SAF=6;SAR=8;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015;STB=0.509421;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0346553;OID=.;OPOS=58420162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:62:62:48:48:14:14:0.225806:8:6:20:28:8:6:20:28 chr19 58420167 . T C 96.7 PASS AF=0.234375;AO=15;DP=65;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0112273;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5661;QD=6.04345;RBI=0.0135914;REFB=0.000210356;REVB=-0.00765985;RO=49;SAF=7;SAR=8;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472214;STB=0.529373;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.000368947;OID=.;OPOS=58420167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:65:64:49:49:15:15:0.234375:8:7:21:28:8:7:21:28 chr19 58420699 . C A 100.7 PASS AF=0.26;AO=12;DP=49;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00724905;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.994;QD=8.05629;RBI=0.0380331;REFB=-0.011343;REVB=0.0373358;RO=37;SAF=6;SAR=6;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249204;STB=0.624429;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0390748;OID=.;OPOS=58420699;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:37:37:12:13:0.26:6:6:26:11:6:7:26:11 chr19 58421128 . C T 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00446012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6841;QD=37.4884;RBI=0.0166595;REFB=0;REVB=-0.0160513;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000742297;OID=.;OPOS=58421128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0 chr19 58439306 . G A 121.58 PASS AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.053865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.43;QD=15.1969;RBI=0.0546202;REFB=-0.0291465;REVB=-0.00905166;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279744;STB=0.660653;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0303822;OID=.;OPOS=58439306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:13:5:8:6:13:5 chr19 58453342 . T C 298.75 PASS AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00416134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.158;QD=23.8999;RBI=0.0139403;REFB=-0.00677749;REVB=-0.0133047;RO=23;SAF=16;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232943;STB=0.512967;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0145971;OID=.;OPOS=58453342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:11:16:13:10:11:16:13:10 chr19 58455381 . C T 887.77 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0919001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.218;QD=58.2147;RBI=0.0926149;REFB=0;REVB=0.0114843;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103733;OID=.;OPOS=58455381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:56:61:0:0:55:61:1:26:29:0:0:26:35:0:0 chr19 58572959 . G A 172.96 PASS AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0104324;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.738;QD=10.9817;RBI=0.010473;REFB=-0.00402782;REVB=-0.000921271;RO=40;SAF=14;SAR=8;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208085;STB=0.628868;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00621052;OID=.;OPOS=58572959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:40:41:22:22:0.349206:8:14:18:22:8:14:18:23 chr19 58572979 . G A 216.09 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.0341928;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1943;QD=14.4057;RBI=0.0380514;REFB=-0.0551924;REVB=-0.016696;RO=26;SAF=15;SAR=7;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.503882;STB=0.744827;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0264869;OID=.;OPOS=58572979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:60:26:30:22:22:0.366667:7:15:3:23:7:15:7:23 chr19 58581572 . G A 240.41 PASS AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.00185914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.303;QD=28.2832;RBI=0.010891;REFB=0.00563312;REVB=0.0107312;RO=12;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239019;STB=0.631465;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00209473;OID=.;OPOS=58581572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:12:10:10:2:12:10:10:2 chr19 58600048 . C T 143.76 PASS AF=0.5;AO=8;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0565078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.636;QD=17.9706;RBI=0.0663915;REFB=-0.0803106;REVB=0.0348525;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149044;STB=0.533293;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0456879;OID=.;OPOS=58600048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:9:15:8:16:0.5:4:4:3:6:12:4:3:12 chr19 58600080 . C T 170.32 PASS AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.00442945;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.663;QD=17.0321;RBI=0.00983931;REFB=-0.0123514;REVB=0.0087859;RO=22;SAF=5;SAR=13;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626701;STB=0.535676;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0178664;OID=.;OPOS=58600080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:13:5:5:17:13:5:5:17 chr19 58718360 . A AG 284.6 PASS AF=1;AO=23;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148385;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.6112;QD=43.7847;RBI=0.177172;REFB=0;REVB=-0.0968077;RO=3;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12022;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00182347;OID=.;OPOS=58718361;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:23:27:26:26:0:13:13:0:0:5:3:10:13:3:0 chr19 58718412 . C T 115.08 PASS AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0188515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.569;QD=19.1803;RBI=0.0293522;REFB=0.00478413;REVB=0.0224984;RO=11;SAF=11;SAR=2;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561612;STB=0.822605;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00759529;OID=.;OPOS=58718412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:2:11:2:9:2:11:2:9 chr19 58774071 . A G 74.68 PASS AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0118899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.923;QD=10.6679;RBI=0.0400255;REFB=-0.00528561;REVB=-0.0382188;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118978;STB=0.571289;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0135173;OID=.;OPOS=58774071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:5:5:11:7:5:5:11:7 chr19 58790675 . T C 73.83 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0286995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.493;QD=9.84391;RBI=0.0341988;REFB=-0.00384121;REVB=-0.0185983;RO=20;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230451;STB=0.640553;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0101403;OID=.;OPOS=58790675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:7:3:10:10:7:3:10:10 chr19 58790713 . G C 33.05 PASS AF=0.272727;AO=5;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0155878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0319;QD=6.0099;RBI=0.0187534;REFB=0.00408947;REVB=-0.0104265;RO=14;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294624;STB=0.580369;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=-0.0189134;OID=.;OPOS=58790713;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:22:22:14:16:5:6:0.272727:4:1:6:8:4:2:7:9 chr19 58805783 . C T 111.42 PASS AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0403961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.826;QD=15.9166;RBI=0.0403964;REFB=-0.0118367;REVB=0.000160364;RO=15;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783935;STB=0.545384;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0153493;OID=.;OPOS=58805783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:5:8:8:7:5:8:8:7 chr19 58806083 . T C 215.99 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.013942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.47;QD=15.1572;RBI=0.0351505;REFB=-0.00884806;REVB=-0.0322673;RO=31;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07463;STB=0.533871;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00896817;OID=.;OPOS=58806083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:31:32:25:25:0.438596:14:11:16:15:14:11:16:16 chr19 58864479 . T C 805.16 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.099;QD=64.4131;RBI=0.0422028;REFB=0;REVB=0.00516919;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015905;OID=.;OPOS=58864479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0 chr19 58868480 . G T 52.92 PASS AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0548317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.018;QD=21.169;RBI=0.179851;REFB=0.0164431;REVB=0.171289;RO=3;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21311;STB=0.624624;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0114133;OID=.;OPOS=58868480;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:2:5:1:2:2:5:1:2 chr19 58870087 . TG T 379.37 PASS AF=0.60241;AO=47;DP=84;FAO=50;FDP=83;FR=.;FRO=33;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0240733;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.8687;QD=18.2829;RBI=0.0827976;REFB=-0.00907411;REVB=-0.0792207;RO=33;SAF=32;SAR=15;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0.445813;SSSB=0.0877602;STB=0.556141;STBP=0.229;TYPE=del;VARB=0.0023026;OID=.;OPOS=58870088;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.60241:47:84:50:83:33:35:15:19:14:99:33:32:15:19:14 chr19 58879965 . A G 87.82 PASS AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7589;QD=39.0312;RBI=0.125846;REFB=0;REVB=0.125409;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00275806;OID=.;OPOS=58879965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:0:8:0:0:1:8:0:0 chr19 58880016 . G C 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0374766;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.969;QD=12.3961;RBI=0.0636691;REFB=-0.0420181;REVB=-0.0514709;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389209;STB=0.726606;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0293175;OID=.;OPOS=58880016;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:0:5:3:2:0:5 chr19 58880184 . T C 420.69 PASS AF=0.467391;AO=42;DP=91;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00520701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.515;QD=18.2907;RBI=0.00584524;REFB=-0.0361597;REVB=0.00265591;RO=48;SAF=28;SAR=14;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127548;STB=0.582163;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0325601;OID=.;OPOS=58880184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:48:49:42:43:0.467391:14:28:26:22:14:29:26:23 chr19 58880242 . T C 284.63 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0155004;FXX=0.048187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.836;QD=14.4118;RBI=0.0161573;REFB=-0.00107425;REVB=-0.00456024;RO=46;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13224;STB=0.568678;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0014241;OID=.;OPOS=58880242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:79:46:47:32:32:0.405063:14:18:20:26:14:18:21:26 chr19 58904396 . G A 346.52 PASS AF=0.493151;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00189847;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9471;QD=18.9872;RBI=0.00202886;REFB=0.000186318;REVB=0.000715579;RO=37;SAF=18;SAR=18;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110788;STB=0.56161;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000474358;OID=.;OPOS=58904396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:37:37:36:36:0.493151:18:18:23:14:18:18:23:14 chr19 58945962 . C T 566.78 PASS AF=1;AO=27;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301384;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.733;QD=59.6614;RBI=0.0870971;REFB=0;REVB=0.0817165;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0054096;OID=.;OPOS=58945962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:27:38:1:11:16:0:0:20:18:0:0 chr19 58982044 . C T 304.02 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.031958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6863;QD=17.3726;RBI=0.0751302;REFB=0.0155238;REVB=-0.0679943;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0040763;STB=0.518931;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.018106;OID=.;OPOS=58982044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:35:37:33:33:0.471429:19:14:15:20:19:14:17:20 chr19 58982384 . A G 782.62 PASS AF=1;AO=41;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.99;QD=63.8871;RBI=0.0673947;REFB=0;REVB=0.0313121;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18171e-05;OID=.;OPOS=58982384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:41:49:1:29:12:0:0:29:20:0:0 chr19 58983296 . G A 169.1 PASS AF=0.53125;AO=16;DP=33;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00844149;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.376;QD=21.1378;RBI=0.00870892;REFB=-0.00855444;REVB=0.00214162;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283782;STB=0.501843;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00661949;OID=.;OPOS=58983296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:15:15:16:17:0.53125:8:8:7:8:9:8:7:8 chr19 59059729 . G A 1478.52 PASS AF=1;AO=94;DP=95;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209864;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7741;QD=57.9813;RBI=0.099909;REFB=-0.158519;REVB=0.09768;RO=1;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111554;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019175;OID=.;OPOS=59059729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:95:102:1:0:94:102:1:42:52:0:1:50:52:0:0 chr19 59061326 . G A 59.59 PASS AF=0.209302;AO=9;DP=43;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0426671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8184;QD=5.54341;RBI=0.0439982;REFB=-0.00835416;REVB=0.0107404;RO=34;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193372;STB=0.623405;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0213704;OID=.;OPOS=59061326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:43:43:34:34:9:9:0.209302:5:4:10:24:5:4:10:24 chr20 76962 . T C 257.61 PASS AF=0.336842;AO=29;DP=92;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=47;FSRR=16;FWDB=0.0229399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.681;QD=10.8467;RBI=0.0298264;REFB=-0.055638;REVB=0.0190624;RO=63;SAF=20;SAR=9;SRF=47;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801692;STB=0.522808;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0870604;OID=.;OPOS=76962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:63:63:29:32:0.336842:9:20:47:16:9:23:47:16 chr20 126155 . GCAAA G 214.26 PASS AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0106952;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=342.029;QD=16.1708;RBI=0.010753;REFB=0.00353011;REVB=-0.00111355;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127161;STB=0.565984;STBP=0.399;TYPE=del;VARB=-0.00442973;OID=.;OPOS=126156;OREF=CAAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45283:24:53:24:53:29:12:12:18:11:99:25:12:12:16:9 chr20 126310 . ACC A 1288.26 PASS AF=1;AO=100;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260728;FXX=0.00934492;HRUN=5;LEN=2;MLLD=35.5272;QD=48.6135;RBI=0.0541763;REFB=0;REVB=0.0474898;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000111612;OID=.;OPOS=126311;OREF=CC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:100:107:106:106:0:53:53:0:0:23:0:47:53:0:0 chr20 138178 . GCCT GCT,GCTG 415.81 PASS AF=0.527778,0.0555556;AO=32,4;DP=67;FAO=38,4;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=15,4;FSAR=23,0;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0783926,-0.0381125;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=29.4826,28.9543;QD=23.1004;RBI=0.0900128,0.0480419;REFB=0.0161169,0.0175482;REVB=0.0442369,0.0292482;RO=30;SAF=12,4;SAR=20,0;SRF=12;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0230209,0.645896;STB=0.502426,0.997654;STBP=0.996,0.017;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00373294,0.00528723;OID=.,.;OPOS=138179,138180;OREF=C,CT;OALT=-,TG;OMAPALT=GCT,GCTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.527778,0.0555556:32,4:67:38,4:72:30:15,4:23,0:12:18:99:30:12,4:20,0:12:18 chr20 139456 . G A 317.25 PASS AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0116107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0419;QD=25.8975;RBI=0.045241;REFB=0.0360986;REVB=0.0437257;RO=21;SAF=14;SAR=14;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129189;STB=0.571379;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.0248297;OID=.;OPOS=139456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:14:14:7:14:14:14:7:14 chr20 139576 . C A 313.22 PASS AF=0.584906;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0423115;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.458;QD=23.6389;RBI=0.0472458;REFB=-0.03592;REVB=0.0210215;RO=20;SAF=15;SAR=16;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168454;STB=0.569112;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0229756;OID=.;OPOS=139576;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:20:22:31:31:0.584906:16:15:5:15:16:15:7:15 chr20 168728 . T A 558.01 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00834898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.258;QD=23.0108;RBI=0.0103604;REFB=-0.00369974;REVB=-0.00613454;RO=44;SAF=23;SAR=29;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294262;STB=0.511418;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.00351292;OID=.;OPOS=168728;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:44:45:52:52:0.536082:29:23:21:23:29:23:21:24 chr20 170198 . T C 213.28 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.000753006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.226;QD=12.5461;RBI=0.0390044;REFB=0.00106495;REVB=0.0389971;RO=42;SAF=6;SAR=20;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388055;STB=0.724456;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00292722;OID=.;OPOS=170198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:42:26:26:0.382353:20:6:24:18:20:6:24:18 chr20 210144 . G T 231.05 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00797161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.461;QD=16.5038;RBI=0.0178439;REFB=0.00264101;REVB=-0.0159642;RO=29;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525152;STB=0.508664;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.00245509;OID=.;OPOS=210144;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:29:30:26:26:0.464286:10:16:18:11:10:16:18:12 chr20 210306 . C G 77.92 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0309974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.794;QD=14.1676;RBI=0.0320592;REFB=-0.0146884;REVB=-0.00818268;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773769;STB=0.545364;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0184394;OID=.;OPOS=210306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:5:5:7:5:5:5:7:5 chr20 238435 . CTGGTCT C 152.78 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=0.0185464;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=318.601;QD=13.58;RBI=0.0240825;REFB=-0.00749016;REVB=0.0153622;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351045;STB=0.683732;STBP=0.112;TYPE=del;VARB=0.0103222;OID=.;OPOS=238436;OREF=TGGTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.377778:17:45:17:45:28:7:10:4:24:99:26:7:10:3:23 chr20 256727 . T A 196.95 PASS AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00804367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.106;QD=12.915;RBI=0.0121496;REFB=0.00929503;REVB=-0.00910557;RO=34;SAF=17;SAR=7;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285106;STB=0.673119;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0102567;OID=.;OPOS=256727;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:37:24:24:0.393443:7:17:15:19:7:17:16:21 chr20 257733 . A G 209.71 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00858257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.142;QD=18.6405;RBI=0.0085826;REFB=-0.0148421;REVB=2.10009e-05;RO=23;SAF=16;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215792;STB=0.615266;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00937572;OID=.;OPOS=257733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:45:23:24:21:21:0.466667:5:16:13:10:5:16:14:10 chr20 259969 . G C 808.26 PASS AF=0.494048;AO=82;DP=167;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=57;FWDB=0.00602911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.633;QD=19.2442;RBI=0.0102238;REFB=-0.0184859;REVB=0.00825689;RO=85;SAF=37;SAR=45;SRF=28;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115249;STB=0.560345;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0151645;OID=.;OPOS=259969;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:85:85:82:83:0.494048:45:37:28:57:46:37:28:57 chr20 279483 . T C 211.77 PASS AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0538702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.351;QD=19.6993;RBI=0.0566892;REFB=-0.00253911;REVB=-0.017654;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441483;STB=0.539133;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00233219;OID=.;OPOS=279483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:21:22:21:21:0.488372:13:8:9:12:13:8:10:12 chr20 308525 . AG ACG,A 38.98 PASS AF=0,0.428571;AO=2,6;DP=20;FAO=0,9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=0,2;FSAR=0,7;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0622351,-0.10485;FXX=0;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=68.007,14.2686;QD=7.42395;RBI=0.180415,0.205368;REFB=-0.0275578,-0.0978364;REVB=-0.169341,-0.176585;RO=8;SAF=0,2;SAR=2,4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0.286966;SSSB=-0.812466,-0.573303;STB=0.5,0.793179;STBP=1,0.03;TYPE=ins,del;VARB=0,0.115281;OID=.,.;OPOS=308526,308526;OREF=-,G;OALT=C,-;OMAPALT=ACG,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.428571:2,6:20:0,9:21:12:0,2:0,7:9:3:39:8:0,2:2,4:8:0 chr20 368905 . A G 209.34 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0159489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4734;QD=18.608;RBI=0.0187662;REFB=-0.00012841;REVB=0.00988953;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16874;STB=0.602264;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.000767181;OID=.;OPOS=368905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:24:21:21:0.466667:13:8:5:18:13:8:5:19 chr20 371972 . T C 461.28 PASS AF=0.469388;AO=46;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00677301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5662;QD=18.8279;RBI=0.053142;REFB=-0.0415339;REVB=-0.0527086;RO=51;SAF=27;SAR=19;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553976;STB=0.52628;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0347674;OID=.;OPOS=371972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:51:52:46:46:0.469388:19:27:27:24:19:27:28:24 chr20 397928 . C T 1097.39 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7439;QD=60.131;RBI=0.0216853;REFB=0;REVB=-0.00198588;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000212303;OID=.;OPOS=397928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:38:35:0:0:38:35:0:0 chr20 418199 . T A 185.51 PASS AF=0.338028;AO=23;DP=70;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0412966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.157;QD=10.4511;RBI=0.04172;REFB=-0.0122954;REVB=-0.00592863;RO=46;SAF=5;SAR=18;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214915;STB=0.630348;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0387991;OID=.;OPOS=418199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:46:47:23:24:0.338028:18:5:17:29:19:5:17:30 chr20 428553 . T C 288.51 PASS AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0191711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9995;QD=13.7384;RBI=0.0372608;REFB=0.000215587;REVB=0.0319505;RO=51;SAF=22;SAR=11;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112061;STB=0.564063;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.000214498;OID=.;OPOS=428553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:11:22:29:22:11:22:29:22 chr20 590542 . CG GC 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.086235;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=123.229;QD=43.4861;RBI=0.0877548;REFB=0;REVB=-0.0162612;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00203714;OID=.;OPOS=590542;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0 chr20 628890 . T C 187.65 PASS AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0746962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6781;QD=12.7223;RBI=0.0812647;REFB=0.0224415;REVB=-0.0320068;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103988;STB=0.505983;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0450244;OID=.;OPOS=628890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:13:10:16:20:13:10:16:20 chr20 642650 . G C 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00167024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2201;QD=13.6308;RBI=0.0399306;REFB=0.0215493;REVB=0.0398957;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162764;STB=0.596769;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.0207887;OID=.;OPOS=642650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:5:4:5:3:5:4 chr20 744415 . G A 46.36 PASS AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.025358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.402;QD=9.76015;RBI=0.0269119;REFB=-0.00187029;REVB=0.0090123;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439197;STB=0.776868;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00362177;OID=.;OPOS=744415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:1:6:6:6:1:6:6:6 chr20 744570 . G A 1105.0 PASS AF=0.617284;AO=100;DP=162;FAO=100;FDP=162;FR=.;FRO=62;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=50;FSRR=12;FWDB=-0.00985605;FXX=0.0121944;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.798;QD=27.284;RBI=0.00990091;REFB=-0.0489838;REVB=-0.000941448;RO=59;SAF=69;SAR=31;SRF=50;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134042;STB=0.554227;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0284101;OID=.;OPOS=744570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:59:62:100:100:0.617284:31:69:50:9:31:69:50:12 chr20 745963 . G A 164.03 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00771771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.221;QD=12.8647;RBI=0.0408785;REFB=-0.00467317;REVB=-0.0401434;RO=31;SAF=14;SAR=5;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350671;STB=0.713146;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0193254;OID=.;OPOS=745963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:32:19:19:0.372549:5:14:13:18:5:14:13:19 chr20 825678 . T C 411.09 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.635;QD=56.7015;RBI=0.0253006;REFB=0;REVB=-0.0107404;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000277861;OID=.;OPOS=825678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0 chr20 826492 . G C 355.16 PASS AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00711674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.869;QD=18.9416;RBI=0.0195328;REFB=0.00372105;REVB=0.0181902;RO=38;SAF=15;SAR=22;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134867;STB=0.575123;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00629568;OID=.;OPOS=826492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:22:15:21:17:22:15:21:17 chr20 826513 . C G 487.8 PASS AF=0.575;AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0146986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.9999;QD=24.3898;RBI=0.0154189;REFB=-0.00889202;REVB=-0.00465743;RO=34;SAF=26;SAR=20;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118943;STB=0.565189;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00609403;OID=.;OPOS=826513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:0.575:20:26:14:20:20:26:14:20 chr20 826710 . C T 236.38 PASS AF=0.75;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0505099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9889;QD=33.7683;RBI=0.0700196;REFB=-0.0179132;REVB=0.0484923;RO=7;SAF=8;SAR=13;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228484;STB=0.512533;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0187847;OID=.;OPOS=826710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:7:7:21:21:0.75:13:8:3:4:13:8:3:4 chr20 853433 . GTTG GT,GTG,GTGG 486.53 PASS AF=0,1,0;AO=13,9,12;DP=36;FAO=0,36,0;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21,0;FSAR=0,15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.313983,-0.0276036,-0.340884;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=15.1512,22.0102,16.0548;QD=54.0586;RBI=0.528318,0.0471318,0.508099;REFB=0,0,0;REVB=-0.424894,-0.0382026,0.37678;RO=0;SAF=0,7,12;SAR=13,2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0121031,-0.00245663,-0.0187162;OID=.,.,.;OPOS=853435,853434,853435;OREF=TG,T,T;OALT=-,-,G;OMAPALT=GT,GTG,GTGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1,0:13,9,12:36:0,36,0:36:0:0,21,0:0,15,0:0:0:4:0:0,7,12:13,2,0:0:0 chr20 853502 . G A 286.41 PASS AF=0.346154;AO=36;DP=104;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=49;FWDB=0.0361981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0324;QD=11.0158;RBI=0.0592725;REFB=0.00465289;REVB=0.0469354;RO=68;SAF=12;SAR=24;SRF=19;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709267;STB=0.540719;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.00643794;OID=.;OPOS=853502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:68:68:36:36:0.346154:24:12:19:49:24:12:19:49 chr20 854940 . T C 505.54 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0534492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9929;QD=56.1708;RBI=0.0918906;REFB=-0.00652422;REVB=0.0747467;RO=1;SAF=25;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183486;STB=0.509798;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00374847;OID=.;OPOS=854940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:10:25:1:0:10:25:1:0 chr20 860426 . G A 219.91 PASS AF=0.44;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00392161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.425;QD=17.5927;RBI=0.0180717;REFB=-0.00723286;REVB=-0.0176411;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977101;STB=0.545413;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00624785;OID=.;OPOS=860426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:27:28:22:22:0.44:10:12:12:15:10:12:13:15 chr20 939130 . T A 95.41 PASS AF=0.264151;AO=13;DP=52;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0405361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3588;QD=7.20038;RBI=0.0535662;REFB=-0.0212325;REVB=-0.0350167;RO=28;SAF=9;SAR=4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26506;STB=0.656909;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0271748;OID=.;OPOS=939130;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:52:53:28:39:13:14:0.264151:4:9:13:15:4:10:20:19 chr20 939161 . A G 136.13 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0507273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6281;QD=10.4718;RBI=0.0526728;REFB=-0.00115079;REVB=0.0141832;RO=35;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117061;STB=0.569394;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00498634;OID=.;OPOS=939161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:7:10:17:18:7:10:17:18 chr20 948686 . G A 272.8 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.0203579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.624;QD=14.9478;RBI=0.0209897;REFB=-0.0198756;REVB=-0.00511131;RO=42;SAF=18;SAR=13;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270264;STB=0.652193;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0341573;OID=.;OPOS=948686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:13:18:13:29:13:18:13:29 chr20 1099523 . T G 834.03 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.035;QD=57.5191;RBI=0.025288;REFB=0;REVB=0.0218767;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41826e-05;OID=.;OPOS=1099523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:39:19:0:0:39:19:0:0 chr20 1210647 . T C 167.04 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00633245;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.639;QD=23.0397;RBI=0.0137914;REFB=-0.0190207;REVB=0.0122516;RO=12;SAF=12;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228251;STB=0.628663;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0275584;OID=.;OPOS=1210647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:5:12:5:7:5:12:5:7 chr20 1214814 . A C 71.66 PASS AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0543526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7444;QD=7.96226;RBI=0.0546882;REFB=-0.0131133;REVB=0.0060493;RO=26;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450613;STB=0.781029;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0392897;OID=.;OPOS=1214814;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:36:36:26:26:10:10:0.277778:2:8:11:15:2:8:11:15 chr20 1221038 . T C 190.88 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00334378;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.429;QD=20.0921;RBI=0.00433522;REFB=-0.015778;REVB=0.00275921;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179952;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177326;OID=.;OPOS=1221038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:20:19:19:19:0.5:7:12:13:7:7:12:12:7 chr20 1291076 . G C 727.17 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.846;QD=63.232;RBI=0.0418557;REFB=0;REVB=0.0106354;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15401e-05;OID=.;OPOS=1291076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:34:12:0:0:34:12:0:0 chr20 1293008 . C T 1697.32 PASS AF=0.991228;AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0248125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.88;QD=59.5552;RBI=0.0265441;REFB=0.0108798;REVB=0.00943035;RO=0;SAF=37;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78011e-08;STB=0.503267;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=3.11627e-05;OID=.;OPOS=1293008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:113:114:0:1:112:113:0.991228:75:37:0:0:76:37:0:1 chr20 1298794 . G A 670.24 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.493;QD=62.3476;RBI=0.00638351;REFB=0;REVB=0.00189123;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82226e-05;OID=.;OPOS=1298794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr20 1424303 . G A 619.93 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00121692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.509;QD=59.0406;RBI=0.0216935;REFB=-0.0332626;REVB=-0.0216594;RO=1;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302497;STB=0.516121;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00389709;OID=.;OPOS=1424303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:15:26:0:1:15:26:0:1 chr20 1426393 . C T 2664.03 PASS AF=0.988571;AO=173;DP=175;FAO=173;FDP=175;FR=.;FRO=2;FSAF=92;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0714735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.219;QD=60.892;RBI=0.072608;REFB=-0.0597804;REVB=-0.0127851;RO=2;SAF=92;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000694359;STB=0.500365;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.000137856;OID=.;OPOS=1426393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:175:175:2:2:173:173:0.988571:81:92:1:1:81:92:1:1 chr20 1454493 . C T 112.24 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00384475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6657;QD=16.6285;RBI=0.0552178;REFB=0.0146275;REVB=-0.0550838;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185092;STB=0.60719;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.0129899;OID=.;OPOS=1454493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:7:7:9:4:7:7 chr20 1457910 . C A 1888.73 PASS AF=0.992126;AO=120;DP=123;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0620536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.447;QD=59.4876;RBI=0.0621085;REFB=-0.0680775;REVB=-0.00261034;RO=1;SAF=49;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664388;STB=0.503496;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000665982;OID=.;OPOS=1457910;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:123:127:1:1:120:126:0.992126:71:49:0:1:71:55:0:1 chr20 1459060 . T G 970.33 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9827;QD=58.8081;RBI=0.0282005;REFB=0;REVB=0.0265767;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001023;OID=.;OPOS=1459060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr20 1532595 . T C 1856.54 PASS AF=0.97619;AO=123;DP=127;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0125286;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.96;QD=58.9376;RBI=0.018119;REFB=-0.0475692;REVB=0.0130894;RO=2;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155709;STB=0.512193;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.000961246;OID=.;OPOS=1532595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:127:126:2:3:123:123:0.97619:60:63:0:2:60:63:0:3 chr20 1546911 . C G 717.32 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.79;QD=62.3753;RBI=0.0464238;REFB=0;REVB=0.0396851;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000792348;OID=.;OPOS=1546911;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:31:14:0:0:32:14:0:0 chr20 1551485 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00345994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1641;QD=56.1909;RBI=0.0262493;REFB=0;REVB=0.0260203;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320414;OID=.;OPOS=1551485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0 chr20 1552430 . T C 4932.49 PASS AF=1;AO=312;DP=314;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00616018;FXX=0.00316446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.185;QD=62.6348;RBI=0.0189386;REFB=0.00542622;REVB=0.0179088;RO=0;SAF=160;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07716e-05;OID=.;OPOS=1552430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:314:315:0:0:312:315:1:152:160:0:0:155:160:0:0 chr20 1559101 . T G 5445.59 PASS AF=1;AO=350;DP=352;FAO=350;FDP=350;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115028;FXX=0.00568166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.933;QD=62.2353;RBI=0.0207791;REFB=-0.0105835;REVB=0.0173048;RO=2;SAF=162;SAR=188;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00504847;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82558e-05;OID=.;OPOS=1559101;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:352:350:2:0:350:350:1:188:162:0:2:188:162:0:0 chr20 1592175 . T G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.043;QD=33.4285;RBI=0.0326704;REFB=0;REVB=0.0306748;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126239;OID=.;OPOS=1592175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr20 1592193 . C T 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.318;QD=33.4285;RBI=0.0140824;REFB=0;REVB=-0.000471945;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203376;OID=.;OPOS=1592193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chr20 1592215 . C G 101.99 PASS AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1003;QD=40.7958;RBI=0.207325;REFB=0;REVB=0.205859;RO=1;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175672;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0111755;OID=.;OPOS=1592215;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:1:0:9:10:1:2:7:0:1:3:7:0:0 chr20 1592265 . A G 123.15 PASS AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0568214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.119;QD=37.8921;RBI=0.0698296;REFB=0.0169991;REVB=0.0405893;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069361;STB=0.538398;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00265361;OID=.;OPOS=1592265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:6:6:1:0:6:6:1:0 chr20 1592284 . G A 145.19 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.294;QD=44.6751;RBI=0.114502;REFB=0;REVB=0.00812398;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00269206;OID=.;OPOS=1592284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:6:6:0:0:6:7:0:0 chr20 1592312 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.022;QD=40.7629;RBI=0.0556389;REFB=0;REVB=0.0470774;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136213;OID=.;OPOS=1592312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr20 1592343 . T C 62.25 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00700813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7708;QD=35.5724;RBI=0.0145069;REFB=0;REVB=-0.0127018;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000455407;OID=.;OPOS=1592343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0 chr20 1610939 . G A 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.31489e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.078;QD=55.0987;RBI=0.00713939;REFB=0;REVB=-0.00713878;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08246e-05;OID=.;OPOS=1610939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0 chr20 1615959 . T C 1246.79 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.355;QD=61.5701;RBI=0.0288136;REFB=0;REVB=-0.00493467;RO=0;SAF=51;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.12019e-05;OID=.;OPOS=1615959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:81:0:0:79:81:1:28:51:0:0:29:52:0:0 chr20 1616137 . G A 1003.69 PASS AF=0.524324;AO=97;DP=183;FAO=97;FDP=185;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=54;FSRR=34;FWDB=0.0214423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.395;QD=21.7014;RBI=0.0420452;REFB=-0.0110529;REVB=-0.0361666;RO=86;SAF=52;SAR=45;SRF=54;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798832;STB=0.537276;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0111999;OID=.;OPOS=1616137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:185:86:88:97:97:0.524324:45:52:54:32:45:52:54:34 chr20 1616206 . A G 1835.76 PASS AF=1;AO=119;DP=123;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017215;FXX=0.0325177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.706;QD=61.7063;RBI=0.0223297;REFB=0;REVB=-0.0142218;RO=0;SAF=64;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.87762e-05;OID=.;OPOS=1616206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:119:0:0:119:119:1:55:64:0:0:55:64:0:0 chr20 1616892 . A G 1138.94 PASS AF=0.525822;AO=112;DP=215;FAO=112;FDP=213;FR=.;FRO=101;FSAF=65;FSAR=47;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=0.00300376;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.236;QD=21.3885;RBI=0.0262868;REFB=-0.0161593;REVB=-0.0261146;RO=94;SAF=65;SAR=47;SRF=48;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592177;STB=0.550325;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0122685;OID=.;OPOS=1616892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:213:94:101:112:112:0.525822:47:65:48:46:47:65:48:53 chr20 1617069 . A G 1090.32 PASS AF=0.526829;AO=108;DP=205;FAO=108;FDP=205;FR=.;FRO=97;FSAF=63;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=0.0012547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.815;QD=21.2746;RBI=0.0173443;REFB=0.00803159;REVB=-0.0172988;RO=97;SAF=63;SAR=45;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686554;STB=0.537565;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.0103321;OID=.;OPOS=1617069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:97:97:108:108:0.526829:45:63:49:48:45:63:49:48 chr20 1629906 . C T 1103.98 PASS AF=0.536082;AO=104;DP=194;FAO=104;FDP=194;FR=.;FRO=90;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=34;FSRR=56;FWDB=0.00851607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.328;QD=22.7625;RBI=0.00918332;REFB=-0.00545427;REVB=0.00343657;RO=90;SAF=55;SAR=49;SRF=34;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127797;STB=0.569738;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00453774;OID=.;OPOS=1629906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:90:90:104:104:0.536082:49:55:34:56:49:55:34:56 chr20 1895889 . G C 95.32 PASS AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00279948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0979;QD=34.6634;RBI=0.0763587;REFB=0.0370962;REVB=0.0763073;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596689;STB=0.533268;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.00169413;OID=.;OPOS=1895889;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:3:7:1:0:3:7:1:0 chr20 1895950 . CCT GTC 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00789977;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=218.879;QD=45.8068;RBI=0.0162071;REFB=0;REVB=0.0141515;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000180437;OID=.;OPOS=1895950;OREF=CCT;OALT=GTC;OMAPALT=GTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chr20 1895963 . A G 392.32 PASS AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00427351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.381;QD=50.6224;RBI=0.0127525;REFB=-0.113867;REVB=0.0120152;RO=2;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664029;STB=0.53569;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00084117;OID=.;OPOS=1895963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:31:31:2:2:29:29:0.935484:13:16:0:2:13:16:0:2 chr20 1895965 . C A 434.13 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.833;QD=56.0167;RBI=0.195247;REFB=0;REVB=0.117463;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00696679;OID=.;OPOS=1895965;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:15:16:0:0 chr20 1895984 . C A 695.85 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0169086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.178;QD=60.5089;RBI=0.0196772;REFB=0.0534493;REVB=-0.0100644;RO=1;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199954;STB=0.510634;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.000708666;OID=.;OPOS=1895984;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:23:22:0:1:23:22:0:1 chr20 1895990 . G A 739.07 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.013397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.013;QD=54.7462;RBI=0.0134516;REFB=-0.00885228;REVB=-0.00121149;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171308;STB=0.509087;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=2.39169e-05;OID=.;OPOS=1895990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:27:26:0:1:27:26:0:1 chr20 1896051 . CCGA C 694.81 PASS AF=1;AO=52;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00867561;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=3;MLLD=321.163;QD=49.6291;RBI=0.0150597;REFB=0;REVB=0.0123097;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.576471;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.18063e-05;OID=.;OPOS=1896052;OREF=CGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:52:55:56:56:0:25:31:0:0:12:0:23:29:0:0 chr20 1896059 . GT AC 808.0 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108231;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=2;MLLD=210.602;QD=57.7143;RBI=0.0111314;REFB=0;REVB=-0.00260183;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000203578;OID=.;OPOS=1896059;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:29:26:0:0:30:26:0:0 chr20 1896100 . C T 909.73 PASS AF=1;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145228;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.676;QD=58.6924;RBI=0.0341895;REFB=0;REVB=0.0341587;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811938;OID=.;OPOS=1896100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0 chr20 1959939 . G A 549.64 PASS AF=0.554348;AO=50;DP=91;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.00757043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.152;QD=23.8973;RBI=0.0123572;REFB=-0.0044175;REVB=-0.0097667;RO=41;SAF=24;SAR=26;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134938;STB=0.569184;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00442591;OID=.;OPOS=1959939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:41:41:50:51:0.554348:26:24:13:28:27:24:13:28 chr20 2127684 . C T 693.24 PASS AF=0.424581;AO=76;DP=179;FAO=76;FDP=179;FR=.;FRO=103;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=60;FSRR=43;FWDB=-0.0266399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3404;QD=15.4913;RBI=0.0280391;REFB=-0.0267192;REVB=0.0087469;RO=103;SAF=33;SAR=43;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152019;STB=0.584883;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0234857;OID=.;OPOS=2127684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:103:103:76:76:0.424581:43:33:60:43:43:33:60:43 chr20 2127930 . C T 279.85 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0348605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7437;QD=14.1696;RBI=0.0650211;REFB=-0.0151271;REVB=0.0548862;RO=47;SAF=5;SAR=27;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39002;STB=0.725793;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.036652;OID=.;OPOS=2127930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:27:5:21:26:27:5:21:26 chr20 2290333 . C A 571.83 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.627;QD=60.1927;RBI=0.0359351;REFB=0;REVB=0.0213927;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341795;OID=.;OPOS=2290333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:16:21:0:0:16:22:0:0 chr20 2321105 . G C 624.76 PASS AF=0.474074;AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=135;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.00760311;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=316.693;QD=18.5113;RBI=0.0253449;REFB=-0.0033115;REVB=-0.0241776;RO=71;SAF=25;SAR=39;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165138;STB=0.59157;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00414634;OID=.;OPOS=2321105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:71:71:64:64:0.474074:39:25:40:31:39:25:40:31 chr20 2375262 . A G 407.89 PASS AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00286843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.785;QD=20.3942;RBI=0.0297571;REFB=-0.0132929;REVB=-0.0296185;RO=38;SAF=10;SAR=31;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29937;STB=0.673822;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0174398;OID=.;OPOS=2375262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:38:39:41:41:0.5125:31:10:21:17:31:10:22:17 chr20 2539387 . G A 188.21 PASS AF=0.425532;AO=16;DP=44;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0374237;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.8419;QD=16.0182;RBI=0.101417;REFB=-0.0622369;REVB=0.0942598;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116415;STB=0.517839;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0868;OID=.;OPOS=2539387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:47:28:27:16:20:0.425532:8:8:11:17:12:8:10:17 chr20 2591232 . C T 187.39 PASS AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00387074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.041;QD=14.6969;RBI=0.00481175;REFB=-0.0178348;REVB=0.00285836;RO=30;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497535;STB=0.502854;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0244593;OID=.;OPOS=2591232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:9:12:17:13:9:12:17:13 chr20 2593863 . T C 585.57 PASS AF=0.531532;AO=59;DP=111;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=12;FWDB=-0.00846415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.301;QD=21.1017;RBI=0.00847446;REFB=-0.00446725;REVB=0.00041787;RO=51;SAF=30;SAR=29;SRF=39;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218414;STB=0.62266;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00515802;OID=.;OPOS=2593863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:52:59:59:0.531532:29:30:39:12:29:30:40:12 chr20 2618140 . T C 1264.75 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00277709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.385;QD=61.6949;RBI=0.0141814;REFB=0;REVB=0.0139068;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56509e-05;OID=.;OPOS=2618140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:49:33:0:0:49:33:0:0 chr20 2621998 . T C 119.53 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0542164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.376;QD=13.6609;RBI=0.054446;REFB=-0.000899402;REVB=0.00499455;RO=21;SAF=2;SAR=12;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911277;STB=0.553764;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0014953;OID=.;OPOS=2621998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:12:2:4:17:12:2:4:17 chr20 2633936 . T C 959.91 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322327;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.013;QD=59.0713;RBI=0.0415874;REFB=0;REVB=-0.0262787;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13931e-05;OID=.;OPOS=2633936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0 chr20 2637071 . T C 126.95 PASS AF=0.441176;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.000445758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.108;QD=14.9357;RBI=0.003261;REFB=-0.00589015;REVB=-0.00323039;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13069;STB=0.555483;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00773207;OID=.;OPOS=2637071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:34:19:19:14:15:0.441176:7:7:7:12:8:7:7:12 chr20 2644407 . C G 583.15 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00943922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.967;QD=59.8102;RBI=0.0148079;REFB=0;REVB=-0.0114094;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298458;OID=.;OPOS=2644407;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:17:21:0:0:17:22:0:0 chr20 2739583 . T C 393.37 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0378555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.4716;QD=22.4783;RBI=0.0378559;REFB=-0.000993537;REVB=0.000170168;RO=31;SAF=20;SAR=19;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286266;STB=0.515766;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00136212;OID=.;OPOS=2739583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:19:20:17:14:19:20:17:14 chr20 2840773 . C T 156.42 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0408763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2847;QD=24.0646;RBI=0.0643784;REFB=-0.0534174;REVB=0.0497363;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111394;STB=0.562422;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0166106;OID=.;OPOS=2840773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:9:7:6:4:9:7:6:4 chr20 2967430 . G A 553.67 PASS AF=0.479339;AO=58;DP=121;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0355701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.767;QD=18.3031;RBI=0.0379128;REFB=-0.0164375;REVB=-0.0131206;RO=63;SAF=33;SAR=25;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117057;STB=0.564885;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0233936;OID=.;OPOS=2967430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:63:63:58:58:0.479339:25:33:28:35:25:33:28:35 chr20 2996497 . C T 854.11 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.195;QD=56.0069;RBI=0.0197926;REFB=-0.0286065;REVB=0.0130925;RO=1;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024187;STB=0.512816;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000504533;OID=.;OPOS=2996497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:19:41:0:1:19:41:0:1 chr20 3025107 . C T 137.4 PASS AF=0.333333;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0341702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7809;QD=11.4499;RBI=0.065594;REFB=-0.0371088;REVB=-0.0559907;RO=30;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214002;STB=0.602966;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0700915;OID=.;OPOS=3025107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:30:32:16:16:0.333333:9:7:19:11:9:7:19:13 chr20 3026345 . A AGCCCC 88.85 PASS AF=0.222222;AO=13;DP=67;FAO=14;FDP=63;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.117974;FXX=0.0596926;HRUN=1;LEN=5;MLLD=132.185;QD=5.64152;RBI=0.122233;REFB=-0.0116753;REVB=-0.0319849;RO=46;SAF=0;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.753573;STB=0.888231;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.0290549;OID=.;OPOS=3026346;OREF=-;OALT=GCCCC;OMAPALT=AGCCCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.222222:13:67:14:63:49:1:13:23:26:88:46:0:13:23:23 chr20 3074835 . C T 255.95 PASS AF=0.333333;AO=31;DP=94;FAO=31;FDP=93;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0506832;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5253;QD=11.0087;RBI=0.0561309;REFB=-0.0225349;REVB=0.0241224;RO=62;SAF=19;SAR=12;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057508;STB=0.533455;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0167098;OID=.;OPOS=3074835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:62:62:31:31:0.333333:12:19:35:27:12:19:35:27 chr20 3090848 . T G 186.54 PASS AF=0.389831;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0561551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7252;QD=12.6464;RBI=0.0566169;REFB=-0.0198992;REVB=-0.00721657;RO=36;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289903;STB=0.527133;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0515353;OID=.;OPOS=3090848;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:36:36:22:23:0.389831:14:8:14:22:15:8:14:22 chr20 3090942 . A G 357.3 PASS AF=0.697674;AO=29;DP=42;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00658568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.949;QD=33.2368;RBI=0.00791567;REFB=-0.0112496;REVB=0.00439166;RO=13;SAF=11;SAR=18;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487675;STB=0.530357;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00396402;OID=.;OPOS=3090942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:13:13:29:30:0.697674:18:11:6:7:19:11:6:7 chr20 3193893 . A C 175.24 PASS AF=0.319444;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.000327788;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.807;QD=9.73527;RBI=0.0189544;REFB=-0.0109647;REVB=-0.0189515;RO=43;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632463;STB=0.549355;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0564024;OID=.;OPOS=3193893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:43:49:23:23:0.319444:11:12:20:23:11:12:22:27 chr20 3193978 . G A 509.38 PASS AF=0.661972;AO=45;DP=69;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0223487;FXX=0.0273935;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.2787;QD=28.6973;RBI=0.0784776;REFB=0.0127807;REVB=0.0752281;RO=24;SAF=20;SAR=25;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115319;STB=0.552877;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0035648;OID=.;OPOS=3193978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:24:24:45:47:0.661972:25:20:15:9:25:22:15:9 chr20 3204084 . G A 524.79 PASS AF=0.495495;AO=55;DP=111;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0325304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9263;QD=18.9114;RBI=0.0364163;REFB=-0.0364931;REVB=0.0163681;RO=55;SAF=33;SAR=22;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259046;STB=0.638249;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0304003;OID=.;OPOS=3204084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:55:56:55:55:0.495495:22:33:17:38:22:33:18:38 chr20 3214581 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00633924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.982;QD=56.1907;RBI=0.0145066;REFB=0;REVB=0.0130482;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64731e-05;OID=.;OPOS=3214581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0 chr20 3218634 . G C 881.81 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2044;QD=57.8234;RBI=0.0671184;REFB=0;REVB=-0.0647049;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340837;OID=.;OPOS=3218634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:38:22:0:0:38:23:0:0 chr20 3232031 . C T 278.4 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000575495;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.453;QD=53.0285;RBI=0.00619715;REFB=0;REVB=0.00617038;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123503;OID=.;OPOS=3232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0 chr20 3259609 . A G 35.12 PASS AF=0.142857;AO=7;DP=53;FAO=8;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.124222;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=19.5384;QD=2.50865;RBI=0.143775;REFB=-0.026536;REVB=-0.0723887;RO=23;SAF=7;SAR=0;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.76562;STB=0.848577;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0984998;OID=.;OPOS=3259609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:53:56:23:48:7:8:0.142857:0:7:8:15:1:7:24:24 chr20 3285140 . T A,C 790.06 PASS AF=0.0357143,0.964286;AO=2,52;DP=54;FAO=2,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=2,19;FSAR=0,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046967,-0.0129459;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=50.382,101.425;QD=56.4326;RBI=0.0474797,0.0135113;REFB=0,0;REVB=0.00695848,0.00386787;RO=0;SAF=2,19;SAR=0,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.0907e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0461543,-0.000130718;OID=.,.;OPOS=3285140,3285140;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:54:56:0:0:2,52:2,54:0.0357143,0.964286:0,33:2,19:0:0:0,35:2,19:0:0 chr20 3340782 . G A 54.74 PASS AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0196792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4411;QD=24.3281;RBI=0.0237941;REFB=-0.0273541;REVB=-0.0133749;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955799;STB=0.55539;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00605733;OID=.;OPOS=3340782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:2:5:1:1:2:5:1:1 chr20 3362033 . T C 308.91 PASS AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.708;QD=51.4852;RBI=0.140008;REFB=0;REVB=0.139139;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000762176;OID=.;OPOS=3362033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:9:14:0:0:10:14:0:0 chr20 3515924 . G A 729.56 PASS AF=0.427027;AO=79;DP=185;FAO=79;FDP=185;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=-0.00872124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.706;QD=15.7744;RBI=0.0150102;REFB=-0.00520151;REVB=0.0122166;RO=105;SAF=38;SAR=41;SRF=49;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147;STB=0.505346;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00960276;OID=.;OPOS=3515924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:105:106:79:79:0.427027:41:38:49:56:41:38:50:56 chr20 3515951 . C T 694.62 PASS AF=0.39801;AO=80;DP=203;FAO=80;FDP=201;FR=.;FRO=121;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=57;FSRR=64;FWDB=-0.00738478;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.609;QD=13.8233;RBI=0.0080537;REFB=0.00126285;REVB=-0.00321359;RO=118;SAF=36;SAR=44;SRF=54;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00817064;STB=0.512779;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=-0.00192846;OID=.;OPOS=3515951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:201:118:121:80:80:0.39801:44:36:54:64:44:36:57:64 chr20 3564672 . C T 303.47 PASS AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0114157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.608;QD=16.8594;RBI=0.0152839;REFB=-0.0198392;REVB=-0.0101626;RO=38;SAF=11;SAR=22;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11666;STB=0.559963;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0270844;OID=.;OPOS=3564672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:39:33:33:0.458333:22:11:17:21:22:11:17:22 chr20 3624848 . C T 572.3 PASS AF=0.527273;AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.00297594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.093;QD=20.8108;RBI=0.0219257;REFB=-0.0178887;REVB=-0.0217228;RO=52;SAF=30;SAR=28;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118284;STB=0.564921;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0199647;OID=.;OPOS=3624848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:52:52:58:58:0.527273:28:30:34:18:28:30:34:18 chr20 3628918 . T C 164.4 PASS AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0116734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.228;QD=13.6997;RBI=0.0121906;REFB=-0.0129112;REVB=0.00351305;RO=30;SAF=5;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255597;STB=0.649825;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0151992;OID=.;OPOS=3628918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:13:5:15:15:13:5:15:15 chr20 3630100 . A T 233.47 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00146601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.539;QD=16.9796;RBI=0.016691;REFB=0.00351099;REVB=0.0166264;RO=29;SAF=9;SAR=17;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00137158;STB=0.500772;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=-0.00460526;OID=.;OPOS=3630100;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:17:9:10:19:17:9:10:19 chr20 3640823 . C T 137.87 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00710595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.462;QD=19.0171;RBI=0.0112449;REFB=0.00722149;REVB=0.00871508;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238067;STB=0.526281;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.00875565;OID=.;OPOS=3640823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:13:14:15:15:0.517241:5:10:9:4:5:10:10:4 chr20 3649632 . ATCTGGACT A 98.27 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00252449;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=8;MLLD=311.891;QD=12.6794;RBI=0.0029393;REFB=-0.0109037;REVB=-0.00150548;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412202;STB=0.759617;STBP=0.028;TYPE=del;VARB=0.0182972;OID=.;OPOS=3649633;OREF=TCTGGACT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.387097:12:32:12:31:19:4:8:15:4:98:17:4:8:13:4 chr20 3651742 . C G 461.88 PASS AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=-0.0180948;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.21;QD=21.4826;RBI=0.0295239;REFB=-0.0134667;REVB=-0.023329;RO=41;SAF=33;SAR=12;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254777;STB=0.51405;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.011853;OID=.;OPOS=3651742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:12:33:31:10:12:33:31:10 chr20 3655219 . T C 215.11 PASS AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0131829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.919;QD=21.5109;RBI=0.0227752;REFB=-0.0296632;REVB=-0.0185721;RO=19;SAF=15;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130599;STB=0.573697;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0244508;OID=.;OPOS=3655219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:6:15:11:8:6:15:11:8 chr20 3672836 . G A 115.67 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0421516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4124;QD=11.0158;RBI=0.0513971;REFB=-0.00610875;REVB=0.0294093;RO=27;SAF=3;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402347;STB=0.751422;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0162886;OID=.;OPOS=3672836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:27:28:14:14:0.333333:11:3:15:12:11:3:16:12 chr20 3675333 . G A 180.84 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.0141976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0562;QD=13.9111;RBI=0.0289916;REFB=0.0262026;REVB=0.0252773;RO=31;SAF=16;SAR=5;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279773;STB=0.516113;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=-0.0191626;OID=.;OPOS=3675333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:5:16:23:8:5:16:23:8 chr20 3675498 . T G 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.00319809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.929;QD=18.4438;RBI=0.00614686;REFB=-0.011578;REVB=-0.00524939;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32335;STB=0.679754;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00560643;OID=.;OPOS=3675498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:3:8:9:0:3:8:9:0 chr20 3677357 . T C 769.13 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0776289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2205;QD=55.9367;RBI=0.0788049;REFB=0;REVB=-0.0135639;RO=1;SAF=32;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144898;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811699;OID=.;OPOS=3677357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:55:1:0:51:55:1:19:32:1:0:19:36:0:0 chr20 3677736 . T G 85.3 PASS AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0210416;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.763;QD=10.0347;RBI=0.0216412;REFB=-0.0366004;REVB=-0.00505886;RO=23;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130723;STB=0.57818;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0396978;OID=.;OPOS=3677736;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:34:34:23:23:11:11:0.323529:7:4:6:17:7:4:6:17 chr20 3682011 . G A 441.75 PASS AF=0.544304;AO=42;DP=78;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00644715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.394;QD=22.3671;RBI=0.0276828;REFB=-0.00131945;REVB=0.0269216;RO=36;SAF=16;SAR=26;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125709;STB=0.57304;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00108474;OID=.;OPOS=3682011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:36:36:42:43:0.544304:26:16:19:17:27:16:19:17 chr20 3686436 . C T 672.09 PASS AF=0.5;AO=67;DP=134;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=0.00908662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.736;QD=20.0623;RBI=0.0092752;REFB=-0.0165542;REVB=-0.00186085;RO=66;SAF=27;SAR=40;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197953;STB=0.507729;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.014424;OID=.;OPOS=3686436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:66:67:67:67:0.5:40:27:28:38:40:27:28:39 chr20 3784110 . C T 216.34 PASS AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0121555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.055;QD=22.1885;RBI=0.0178895;REFB=-0.0192775;REVB=0.0131255;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081208;STB=0.545412;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0135494;OID=.;OPOS=3784110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:6:12:12:9:6:12 chr20 3838441 . C G 919.91 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9196;QD=54.1124;RBI=0.0609672;REFB=0;REVB=-0.00752849;RO=1;SAF=22;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209782;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00922228;OID=.;OPOS=3838441;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:68:1:0:63:68:1:41:22:1:0:41:27:0:0 chr20 3843027 . C A 315.66 PASS AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00914708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.386;QD=17.5365;RBI=0.0128231;REFB=-0.0242795;REVB=0.00898677;RO=38;SAF=7;SAR=27;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228329;STB=0.629154;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0279079;OID=.;OPOS=3843027;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:27:7:15:23:27:7:15:23 chr20 3846397 . C T 378.18 PASS AF=0.578125;AO=33;DP=60;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0245764;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.039;QD=23.6362;RBI=0.0794205;REFB=-0.0486918;REVB=0.0755223;RO=27;SAF=22;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158968;STB=0.548555;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0306734;OID=.;OPOS=3846397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:64:27:27:33:37:0.578125:11:22:13:14:15:22:13:14 chr20 4053254 . A G 704.94 PASS AF=0.518797;AO=69;DP=133;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=0.00578785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.488;QD=21.2012;RBI=0.0257168;REFB=-0.0272283;REVB=-0.025057;RO=64;SAF=29;SAR=40;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841752;STB=0.546163;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0240142;OID=.;OPOS=4053254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:64:64:69:69:0.518797:40:29:21:43:40:29:21:43 chr20 4124037 . TACACACACACACACACACACACACACACACA TACACACACACACACA,TACACACACACACACACACACACACAC,TACACACACACACACACACACACACACA,TACACACACACACACACACACACACACACA 179.5 PASS AF=0.2,0,0.4,0.4;AO=3,3,2,5;DP=17;FAO=3,0,6,6;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,4,2;FSAR=3,0,2,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161736,-0.0194062,-0.00299429,0.0756862;FXX=0.117578;HRUN=1,1,1,1;LEN=16,5,4,2;MLLD=646.235,126.248,101.538,92.8834;QD=47.8675;RBI=0.0210018,0.0376136,0.0387857,0.0858799;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0133974,-0.0322208,-0.03867,0.0405827;RO=0;SAF=0,3,0,2;SAR=3,0,2,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,del;VARB=0.0113578,0,0.0256412,0.000117052;OID=.,.,.,.;OPOS=4124038,4124064,4124038,4124038;OREF=ACACACACACACACAC,ACACA,ACAC,AC;OALT=-,-,-,-;OMAPALT=TACACACACACACACA,TACACACACACACACACACACACACAC,TACACACACACACACACACACACACACA,TACACACACACACACACACACACACACACA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/4:0.2,0,0.4,0.4:3,3,2,5:17:3,0,6,6:15:0:0,0,4,2:3,0,2,4:0:0:46:0:0,3,0,2:3,0,2,3:0:0 chr20 4163302 . A G 101.92 PASS AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0103476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.962;QD=8.86274;RBI=0.0566345;REFB=-0.0133816;REVB=-0.0556812;RO=33;SAF=9;SAR=4;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11183;STB=0.568664;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0570653;OID=.;OPOS=4163302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:4:9:20:13:4:9:20:13 chr20 4164283 . A G 249.53 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0424283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.951;QD=14.259;RBI=0.0430464;REFB=-0.0215972;REVB=0.00726882;RO=41;SAF=10;SAR=19;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128596;STB=0.573309;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0257103;OID=.;OPOS=4164283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:19:10:19:22:19:10:19:22 chr20 4229218 . G A 330.93 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00199994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.333;QD=15.9483;RBI=0.0612803;REFB=-0.0209246;REVB=0.0612477;RO=46;SAF=20;SAR=16;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012164;STB=0.513506;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0296067;OID=.;OPOS=4229218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:47:36:36:0.433735:16:20:25:21:16:20:25:22 chr20 4706137 . GC G 46.43 PASS AF=0.470588;AO=9;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0156322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.2254;QD=10.9236;RBI=0.256926;REFB=-0.0283912;REVB=-0.25645;RO=7;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.455837;SSEP=0;SSSB=-0.613799;STB=0.860595;STBP=0.018;TYPE=del;VARB=0.00686225;OID=.;OPOS=4706138;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.470588:9:17:8:17:9:1:7:7:2:45:7:1:8:6:1 chr20 4707861 . G A 195.72 PASS AF=0.333333;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0116071;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9192;QD=10.4382;RBI=0.0307564;REFB=-0.0010447;REVB=-0.0284822;RO=50;SAF=5;SAR=20;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420918;STB=0.748325;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00175523;OID=.;OPOS=4707861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:50:50:25:25:0.333333:20:5:27:23:20:5:27:23 chr20 4708130 . T C 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9437;QD=55.6543;RBI=0.0219972;REFB=0;REVB=0.0187869;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000730004;OID=.;OPOS=4708130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0 chr20 4713176 . A G 294.04 PASS AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00747491;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.425;QD=17.2967;RBI=0.0218043;REFB=-0.0324537;REVB=0.020483;RO=36;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495611;STB=0.527761;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0375333;OID=.;OPOS=4713176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:17:15:15:21:17:15:15:21 chr20 4762577 . C G 1302.16 PASS AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.81;QD=62.0078;RBI=0.0176059;REFB=0;REVB=0.0133744;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9201e-06;OID=.;OPOS=4762577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:41:43:0:0:41:43:0:0 chr20 4762869 . G A 415.39 PASS AF=0.431193;AO=46;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00852076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.397;QD=15.2437;RBI=0.0150114;REFB=-0.00749917;REVB=0.0123588;RO=62;SAF=30;SAR=16;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11202;STB=0.567358;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0101165;OID=.;OPOS=4762869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:62:62:46:47:0.431193:16:30:34:28:16:31:34:28 chr20 4764682 . T C 698.85 PASS AF=1;AO=38;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.871;QD=62.1203;RBI=0.258073;REFB=0;REVB=0.0145009;RO=1;SAF=8;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549974;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043571;OID=.;OPOS=4764682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:45:1:0:38:45:1:30:8:1:0:30:15:0:0 chr20 4834338 . C T 174.09 PASS AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0661675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.583;QD=19.3436;RBI=0.0698201;REFB=-0.0133588;REVB=-0.0222869;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162152;STB=0.591122;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0195044;OID=.;OPOS=4834338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:11:7:4:14:11:7:4:14 chr20 4854682 . A G 314.83 PASS AF=0.411765;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0227457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.043;QD=14.8156;RBI=0.0246336;REFB=-0.0131378;REVB=0.00945773;RO=49;SAF=18;SAR=17;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802856;STB=0.550579;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.016035;OID=.;OPOS=4854682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:50:35:35:0.411765:17:18:29:20:17:18:30:20 chr20 4880308 . G A 201.17 PASS AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00324167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.104;QD=9.81308;RBI=0.0129213;REFB=-0.0103179;REVB=0.0125081;RO=56;SAF=11;SAR=15;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276602;STB=0.51624;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0253175;OID=.;OPOS=4880308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:56:56:26:26:0.317073:15:11:25:31:15:11:25:31 chr20 5283256 . C G 580.25 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0318142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9897;QD=58.0251;RBI=0.0517849;REFB=-0.0779066;REVB=-0.0408599;RO=1;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170496;STB=0.509086;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00192033;OID=.;OPOS=5283256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:27:12:0:1:27:12:0:1 chr20 5283376 . G A 458.87 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.841;QD=57.3581;RBI=0.0313462;REFB=0;REVB=0.0029121;RO=0;SAF=3;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150354;OID=.;OPOS=5283376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:28:3:0:0:29:3:0:0 chr20 5296798 . T C 3933.51 PASS AF=0.984674;AO=257;DP=261;FAO=257;FDP=261;FR=.;FRO=4;FSAF=137;FSAR=120;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0356617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2085;QD=60.2837;RBI=0.0383584;REFB=-0.0152061;REVB=-0.0141282;RO=4;SAF=137;SAR=120;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000970204;STB=0.500509;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.000877527;OID=.;OPOS=5296798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:261:261:4:4:257:257:0.984674:120:137:2:2:120:137:2:2 chr20 5454286 . G A 120.27 PASS AF=0.518519;AO=12;DP=26;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00679333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.344;QD=17.8179;RBI=0.0500458;REFB=-0.0567011;REVB=-0.0495826;RO=11;SAF=8;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581219;STB=0.533287;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0597405;OID=.;OPOS=5454286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:27:11:13:12:14:0.518519:4:8:8:3:4:10:10:3 chr20 5454416 . G A 38.77 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0435487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.276;QD=11.0782;RBI=0.0478195;REFB=-0.0372762;REVB=-0.019754;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474505;STB=0.781817;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0349721;OID=.;OPOS=5454416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:1:7:2:4:1:7 chr20 5527176 . T A 66.83 PASS AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.021156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.005;QD=12.7298;RBI=0.021488;REFB=-0.00938762;REVB=-0.00376274;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315875;STB=0.687091;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00808966;OID=.;OPOS=5527176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:8:4:6:3:8:4 chr20 5527291 . A G 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0122748;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.66;QD=10.2403;RBI=0.0122762;REFB=-0.00183938;REVB=0.000181572;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201589;STB=0.620462;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00394023;OID=.;OPOS=5527291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:5:5:13:6:5:5:13:6 chr20 5843812 . T C 261.51 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0118506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0417;QD=17.1484;RBI=0.0176544;REFB=0.0128931;REVB=0.013086;RO=31;SAF=9;SAR=20;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217669;STB=0.501318;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=-0.0287699;OID=.;OPOS=5843812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:32:29:29:0.47541:20:9:9:22:20:9:10:22 chr20 5903388 . A C 46.76 PASS AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.026474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0802;QD=10.3901;RBI=0.0334654;REFB=-0.0197808;REVB=-0.020471;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423661;STB=0.738729;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0330866;OID=.;OPOS=5903388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:1:6:11:0:1:6:11:0 chr20 5903517 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.096;QD=62.762;RBI=0.0301114;REFB=0;REVB=0.0278804;RO=0;SAF=15;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88589e-05;OID=.;OPOS=5903517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:74:15:0:0:74:15:0:0 chr20 5903848 . C G 210.6 PASS AF=0.44;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0299436;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4685;QD=16.8484;RBI=0.0369291;REFB=-0.0322501;REVB=-0.0216134;RO=27;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117237;STB=0.538426;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.039351;OID=.;OPOS=5903848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:27:28:21:22:0.44:7:14:15:12:8:14:16:12 chr20 5903894 . A G 109.85 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.110333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7929;QD=14.647;RBI=0.128954;REFB=-0.0636103;REVB=-0.066751;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09589;STB=0.555473;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0744009;OID=.;OPOS=5903894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:12:5:5:8:12:5 chr20 5904028 . C T 57.32 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0148556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.988;QD=12.7388;RBI=0.0408292;REFB=-0.0155439;REVB=0.0380307;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418021;STB=0.749374;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0103309;OID=.;OPOS=5904028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:6:2:7:3:6:2:7:3 chr20 5923203 . TT CC 1768.07 PASS AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198048;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=154.125;QD=60.968;RBI=0.0278393;REFB=0;REVB=0.0195652;RO=0;SAF=56;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=4.85006e-05;OID=.;OPOS=5923203;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:59:56:0:0:60:56:0:0 chr20 5933108 . C A 1050.93 PASS AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112802;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.383;QD=60.0534;RBI=0.0139604;REFB=0;REVB=-0.00822487;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.28925e-06;OID=.;OPOS=5933108;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0 chr20 5982604 . T C,G 822.43 PASS AF=0.965517,0.0344828;AO=55,2;DP=57;FAO=56,2;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18,2;FSAR=38,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545047,0.000217845;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=202.983,146.783;QD=56.719;RBI=0.0276426,0.025426;REFB=0,0;REVB=-0.0270999,-0.0254251;RO=0;SAF=17,2;SAR=38,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.97918e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00151645,0.047777;OID=.,.;OPOS=5982604,5982604;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:57:58:0:0:55,2:56,2:0.965517,0.0344828:38,0:17,2:0:0:38,0:18,2:0:0 chr20 5988095 . A G 1865.43 PASS AF=0.99187;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321422;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.547;QD=60.6643;RBI=0.0321603;REFB=-0.092621;REVB=-0.00107751;RO=1;SAF=64;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736537;STB=0.503875;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=8.76281e-05;OID=.;OPOS=5988095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:123:1:1:122:122:0.99187:58:64:1:0:58:64:1:0 chr20 6064710 . A G 1708.16 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.058;QD=59.9353;RBI=0.0297019;REFB=0;REVB=0.025051;RO=0;SAF=79;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201561;OID=.;OPOS=6064710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:114:0:0:110:114:1:31:79:0:0:35:79:0:0 chr20 6065729 . C T 748.02 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.11792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.706;QD=51.5878;RBI=0.140098;REFB=-0.112894;REVB=0.0756459;RO=1;SAF=37;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125779;STB=0.506664;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0125485;OID=.;OPOS=6065729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:20:37:1:0:20:37:1:0 chr20 6065731 . T C 685.38 PASS AF=0.883333;AO=53;DP=60;FAO=53;FDP=60;FR=.;FRO=7;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00630409;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.756;QD=45.6921;RBI=0.0069846;REFB=-0.041632;REVB=0.00300718;RO=6;SAF=39;SAR=14;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130146;STB=0.582057;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.000550883;OID=.;OPOS=6065731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:60:60:6:7:53:53:0.883333:14:39:1:5:14:39:1:6 chr20 6751034 . A G 735.94 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00688711;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.241;QD=56.6106;RBI=0.061127;REFB=0;REVB=0.0607378;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198045;OID=.;OPOS=6751034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:24:28:0:0 chr20 6759115 . A T 988.43 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.186;QD=59.011;RBI=0.0143902;REFB=0;REVB=0.00132038;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.60397e-05;OID=.;OPOS=6759115;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:26:41:0:0:26:41:0:0 chr20 7614374 . G A 238.34 PASS AF=0.353659;AO=28;DP=81;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0367576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.198;QD=11.6265;RBI=0.0370281;REFB=-0.0106116;REVB=-0.00446763;RO=53;SAF=20;SAR=8;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715218;STB=0.521724;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0340055;OID=.;OPOS=7614374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:53:53:28:29:0.353659:8:20:35:18:9:20:35:18 chr20 7863999 . C A,T 1876.81 PASS AF=0.935484,0.0645161;AO=115,6;DP=121;FAO=116,8;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=61,4;FSAR=55,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00529834,0.00352944;FXX=0.0236202;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.7839,177.31;QD=60.5423;RBI=0.0175627,0.00592662;REFB=0,0;REVB=-0.0167444,-0.00476108;RO=0;SAF=61,2;SAR=54,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18616e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00681094,0.0341442;OID=.,.;OPOS=7863999,7863999;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:21:121:124:0:0:115,6:116,8:0.935484,0.0645161:54,4:61,2:0:0:55,4:61,4:0:0 chr20 7915210 . C A 766.05 PASS AF=0.540741;AO=73;DP=135;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00180796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.149;QD=22.6979;RBI=0.0218541;REFB=-0.0223711;REVB=-0.0217792;RO=62;SAF=39;SAR=34;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152473;STB=0.508348;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0181541;OID=.;OPOS=7915210;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:62:62:73:73:0.540741:34:39:32:30:34:39:32:30 chr20 7962707 . C A 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.628;QD=58.4197;RBI=0.0312206;REFB=0;REVB=0.028464;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39975e-05;OID=.;OPOS=7962707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0 chr20 7963041 . C T 943.35 PASS AF=1;AO=55;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9782;QD=54.6868;RBI=0.274769;REFB=0;REVB=0.262931;RO=0;SAF=45;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0155;OID=.;OPOS=7963041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:69:69:0:0:55:69:1:10:45:0:0:22:47:0:0 chr20 7999642 . G A 2251.33 PASS AF=1;AO=141;DP=142;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00975768;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.646;QD=62.9743;RBI=0.010646;REFB=0;REVB=0.00425732;RO=0;SAF=74;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003645;OID=.;OPOS=7999642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:142:143:0:0:141:143:1:67:74:0:0:69:74:0:0 chr20 8717758 . G A 305.51 PASS AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0434477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5749;QD=17.7104;RBI=0.043953;REFB=0.0126659;REVB=-0.00664526;RO=36;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749594;STB=0.54198;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.0124645;OID=.;OPOS=8717758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:20:13:17:19:20:13:17:19 chr20 8755243 . T C 1109.1 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.354;QD=59.9515;RBI=0.0662285;REFB=0;REVB=0.0619973;RO=0;SAF=48;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163744;OID=.;OPOS=8755243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:74:0:0:70:74:1:22:48:0:0:26:48:0:0 chr20 8769180 . C T 408.9 PASS AF=1;AO=26;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.154371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3342;QD=56.3993;RBI=0.167639;REFB=0;REVB=-0.065364;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0031002;OID=.;OPOS=8769180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:26:29:1:14:12:0:0:14:15:0:0 chr20 8811896 . C T 194.33 PASS AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.007541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.148;QD=12.3385;RBI=0.00827875;REFB=0.000252532;REVB=0.00341628;RO=39;SAF=14;SAR=10;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157989;STB=0.590953;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000347179;OID=.;OPOS=8811896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:10:14:17:22:10:14:17:22 chr20 8864548 . G A 139.59 PASS AF=0.273973;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0129604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4587;QD=7.649;RBI=0.0142832;REFB=-0.00462342;REVB=-0.00600322;RO=53;SAF=9;SAR=11;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116609;STB=0.570189;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00712544;OID=.;OPOS=8864548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:53:53:20:20:0.273973:11:9:29:24:11:9:29:24 chr20 8865006 . C T 778.73 PASS AF=0.425641;AO=83;DP=196;FAO=83;FDP=195;FR=.;FRO=112;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=61;FSRR=51;FWDB=-0.00438479;FXX=0.00510178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.512;QD=15.9739;RBI=0.0192369;REFB=-0.0129783;REVB=-0.0187305;RO=110;SAF=38;SAR=45;SRF=60;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894319;STB=0.549784;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0151343;OID=.;OPOS=8865006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:195:110:112:83:83:0.425641:45:38:60:50:45:38:61:51 chr20 9288522 . G A 361.02 PASS AF=0.513889;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0104984;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.208;QD=20.0565;RBI=0.031613;REFB=-0.0105446;REVB=0.0298189;RO=35;SAF=11;SAR=26;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276636;STB=0.654002;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00963981;OID=.;OPOS=9288522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:35:35:37:37:0.513889:26:11:21:14:26:11:21:14 chr20 9424810 . A C 332.55 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204556;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2533;QD=55.4254;RBI=0.0224871;REFB=0;REVB=-0.00934015;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000925031;OID=.;OPOS=9424810;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr20 9424904 . C A 268.6 PASS AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00419466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.598;QD=51.1616;RBI=0.00460486;REFB=0;REVB=-0.00189988;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871968;OID=.;OPOS=9424904;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:10:10:0:0:10:11:0:0 chr20 9460659 . A C 370.11 PASS AF=0.632653;AO=31;DP=49;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0219051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7821;QD=30.213;RBI=0.0379965;REFB=-0.0787175;REVB=0.0310467;RO=18;SAF=10;SAR=21;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128679;STB=0.570768;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0298288;OID=.;OPOS=9460659;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:18:18:31:31:0.632653:21:10:9:9:21:10:9:9 chr20 9519735 . CTTTTTTTTTTTTTTTTG CTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTGT,TCTTTCTTTTTTTTTTTG 189.53 PASS AF=0.297297,0.27027,0.189189,0.243243;AO=6,8,3,2;DP=49;FAO=11,10,7,9;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10,9,3,0;FSAR=1,1,4,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061136,0.0908558,0.134328,0.00913208;FXX=0.244848;HRUN=16,16,16,1;LEN=3,2,2,6;MLLD=6.46776,5.70248,19.7613,227.514;QD=20.4897;RBI=0.328513,0.39117,0.140567,0.124488;REFB=-0.227396,-0.288682,-0.209206,-0.0349588;REVB=-0.322774,-0.380473,-0.0414156,-0.124152;RO=1;SAF=4,8,3,0;SAR=2,0,0,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.0962265,0,0,-0.697199;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,mnp;VARB=0.158669,-0.0392525,-0.270635,0.0795142;OID=.,.,.,.;OPOS=9519736,9519736,9519751,9519735;OREF=TTT,TT,TG,CTTTTT;OALT=-,-,GT,TCTTTC;OMAPALT=CTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTG,CTTTTTTTTTTTTTTTGT,TCTTTCTTTTTTTTTTTG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/4:29:49:37:1:0:6,8,3,2:11,10,7,9:0.297297,0.27027,0.189189,0.243243:2,0,0,2:4,8,3,0:1:0:1,1,4,9:10,9,3,0:0:0 chr20 10006682 . T A 329.69 PASS AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0177456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0571;QD=15.6996;RBI=0.0250992;REFB=-0.00185372;REVB=0.01775;RO=48;SAF=13;SAR=23;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815173;STB=0.546063;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00331495;OID=.;OPOS=10006682;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:23:13:21:27:23:13:21:27 chr20 10019093 . A G 281.66 PASS AF=0.407895;AO=22;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.040453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7568;QD=14.824;RBI=0.0412331;REFB=-0.0300221;REVB=-0.00798262;RO=43;SAF=13;SAR=9;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437146;STB=0.583281;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0894994;OID=.;OPOS=10019093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:22:31:0.407895:9:13:27:16:16:15:27:16 chr20 10653469 . C T 393.13 PASS AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.000915105;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=214.193;QD=19.6564;RBI=0.00837719;REFB=-0.0102028;REVB=0.00832706;RO=39;SAF=17;SAR=23;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788237;STB=0.550353;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00899902;OID=.;OPOS=10653469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:40:40:40:0.5:23:17:20:19:23:17:21:19 chr20 11791008 . C T 1437.7 PASS AF=0.989247;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0593415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.49;QD=61.8364;RBI=0.0595389;REFB=-0.0577773;REVB=0.00484392;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00147699;OID=.;OPOS=11791008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:93:0:1:91:92:0.989247:42:49:0:0:42:50:1:0 chr20 11903654 . G A 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0832395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.539;QD=60.9776;RBI=0.0834642;REFB=0;REVB=0.00612094;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00048579;OID=.;OPOS=11903654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr20 11907058 . C T 911.76 PASS AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0158255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.826;QD=55.258;RBI=0.0240171;REFB=0.00509246;REVB=-0.0180658;RO=2;SAF=27;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337022;STB=0.517852;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.000506651;OID=.;OPOS=11907058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:37:27:2:0:37:27:2:0 chr20 13029764 . A C 1152.12 PASS AF=0.987342;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0076429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.101;QD=58.3351;RBI=0.00777408;REFB=0.00892328;REVB=0.0014221;RO=2;SAF=20;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449945;STB=0.511625;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-1.25249e-05;OID=.;OPOS=13029764;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:79:79:2:1:77:78:0.987342:57:20:2:0:57:21:1:0 chr20 13029862 . C T 399.97 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0909351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4959;QD=53.3298;RBI=0.0953637;REFB=-0.076193;REVB=0.0287233;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300429;STB=0.516118;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0103389;OID=.;OPOS=13029862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:14:15:1:0:14:15:1:0 chr20 13029920 . C G 927.71 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00643233;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.725;QD=57.0897;RBI=0.0569509;REFB=0.0197886;REVB=0.0565865;RO=1;SAF=36;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129402;STB=0.506847;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.00041358;OID=.;OPOS=13029920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:65:1:1:64:64:0.984615:28:36:1:0:28:36:1:0 chr20 13053018 . T G 1246.11 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.686;QD=61.5363;RBI=0.00622238;REFB=0;REVB=-0.0047314;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.33669e-07;OID=.;OPOS=13053018;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:50:31:0:0:50:31:0:0 chr20 13053035 . A G 1246.11 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.164;QD=61.5362;RBI=0.0245519;REFB=0;REVB=-0.00664011;RO=0;SAF=29;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45212e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84894e-05;OID=.;OPOS=13053035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:52:29:0:0:52:29:0:0 chr20 13597717 . G A 159.57 PASS AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0328967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.582;QD=17.7295;RBI=0.0370146;REFB=0.0262403;REVB=0.0169672;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247833;STB=0.640865;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.033063;OID=.;OPOS=13597717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:6:13:7:10:6:13 chr20 13605903 . A T 250.22 PASS AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.000801453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.66;QD=26.3387;RBI=0.00743099;REFB=-0.0105205;REVB=-0.00738765;RO=15;SAF=11;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039191;STB=0.52172;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0100295;OID=.;OPOS=13605903;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:12:11:8:7:12:11:8:7 chr20 13747441 . A G 1530.03 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.759;QD=63.7512;RBI=0.0491272;REFB=0;REVB=0.0441284;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95857e-05;OID=.;OPOS=13747441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:47:49:0:0:47:49:0:0 chr20 13756690 . CTCATCTTCATCCTCCTCT C 84.93 PASS AF=0.255814;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.055302;FXX=0.104145;HRUN=1;LEN=18;MLLD=284.927;QD=7.90044;RBI=0.0553714;REFB=-0.0213643;REVB=0.00276967;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00819703;STB=0.541982;STBP=0.778;TYPE=del;VARB=0.0545256;OID=.;OPOS=13756691;OREF=TCATCTTCATCCTCCTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.255814:11:49:11:43:32:7:4:22:10:84:28:7:4:18:10 chr20 13847420 . A G 729.43 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00201751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.903;QD=57.2099;RBI=0.014338;REFB=0;REVB=0.0141953;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70471e-05;OID=.;OPOS=13847420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:26:25:0:0 chr20 13954028 . A G 361.43 PASS AF=0.513514;AO=37;DP=73;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0167733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1406;QD=19.5366;RBI=0.0965442;REFB=-0.0340299;REVB=0.0950759;RO=36;SAF=23;SAR=14;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135544;STB=0.565812;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0352428;OID=.;OPOS=13954028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:36:36:37:38:0.513514:14:23:17:19:15:23:17:19 chr20 14203735 . T C 1511.1 PASS AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165603;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5029;QD=59.8456;RBI=0.103713;REFB=0;REVB=0.102383;RO=0;SAF=41;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352519;OID=.;OPOS=14203735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:60:41:0:0:60:41:0:0 chr20 14306896 . G A 1170.09 PASS AF=0.621302;AO=105;DP=170;FAO=105;FDP=169;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0170587;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.065;QD=27.6944;RBI=0.0172685;REFB=0.00879652;REVB=-0.00268379;RO=65;SAF=45;SAR=60;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456698;STB=0.521437;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.00436947;OID=.;OPOS=14306896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:65:64:105:105:0.621302:60:45:32:33:60:45:31:33 chr20 14306953 . G T 660.38 PASS AF=0.382353;AO=78;DP=204;FAO=78;FDP=204;FR=.;FRO=126;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=60;FSRR=66;FWDB=-0.0394992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1719;QD=12.9487;RBI=0.0420921;REFB=0.00714005;REVB=-0.014545;RO=124;SAF=27;SAR=51;SRF=60;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156106;STB=0.584101;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.01279;OID=.;OPOS=14306953;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:124:126:78:78:0.382353:51:27:60:64:51:27:60:66 chr20 16033620 . T C 602.05 PASS AF=0.446809;AO=63;DP=141;FAO=63;FDP=141;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=0.010907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.39;QD=17.0793;RBI=0.0110178;REFB=-0.00171187;REVB=0.0015586;RO=78;SAF=34;SAR=29;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00121946;STB=0.500679;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00266009;OID=.;OPOS=16033620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:78:78:63:63:0.446809:29:34:42:36:29:34:42:36 chr20 16033818 . ATTTG A 163.51 PASS AF=0.428571;AO=24;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0027723;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=188.985;QD=10.3818;RBI=0.00402264;REFB=-0.00510188;REVB=0.00291478;RO=35;SAF=5;SAR=19;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40919;STB=0.695501;STBP=0.013;TYPE=del;VARB=0.00748238;OID=.;OPOS=16033819;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.428571:24:63:27:63:36:7:20:21:15:99:35:5:19:20:15 chr20 16240427 . T C 32.43 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.262;QD=16.216;RBI=0.00284105;REFB=-0.0105397;REVB=0.00284105;RO=3;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000656274;OID=.;OPOS=16240427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:5:0:0:3:5:0:0:3 chr20 16252981 . C A 277.92 PASS AF=0.395062;AO=31;DP=80;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.00405281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.407;QD=13.7246;RBI=0.00412671;REFB=-0.00380461;REVB=-0.000777512;RO=47;SAF=12;SAR=19;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303335;STB=0.64617;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00725552;OID=.;OPOS=16252981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:47:49:31:32:0.395062:19:12:32:15:19:13:32:17 chr20 16359567 . A G 669.24 PASS AF=1;AO=39;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.416;QD=62.2552;RBI=0.0314568;REFB=0;REVB=-0.00925499;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325897;OID=.;OPOS=16359567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:39:43:1:26:13:0:0:26:17:0:0 chr20 16486698 . G A 654.17 PASS AF=0.478261;AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=138;FR=.;FRO=72;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.00735486;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149;QD=18.9615;RBI=0.0200415;REFB=-0.010534;REVB=-0.0186431;RO=73;SAF=38;SAR=28;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790352;STB=0.5327;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.011937;OID=.;OPOS=16486698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:73:72:66:66:0.478261:28:38:36:37:28:38:37:35 chr20 16493533 . T C 175.77 PASS AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.000663641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.755;QD=11.9167;RBI=0.00233633;REFB=-0.0166181;REVB=0.0022401;RO=37;SAF=11;SAR=11;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13211;STB=0.576203;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0283462;OID=.;OPOS=16493533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:11:11:23:14:11:11:23:14 chr20 16729138 . T C 540.99 PASS AF=0.475806;AO=52;DP=118;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=51;FWDB=0.0476558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.542;QD=17.4514;RBI=0.0484647;REFB=-0.0193031;REVB=0.00881767;RO=65;SAF=19;SAR=33;SRF=14;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170388;STB=0.62325;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0346322;OID=.;OPOS=16729138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:124:65:65:52:59:0.475806:33:19:14:51:33:26:14:51 chr20 16729654 . A AAGATG 50.0 PASS AO=30;DP=53;LEN=5;RO=23;SAF=18;SAR=20;SRF=9;SRR=6;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=16729655;OREF=-;OALT=AGATG;OMAPALT=AAGATG GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:53:23:30:20:18:9:6 chr20 16963522 . G C 696.99 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464987;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1659;QD=61.9549;RBI=0.0535313;REFB=0;REVB=0.026523;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0143333;OID=.;OPOS=16963522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:43:45:1:25:18:0:0:27:18:0:0 chr20 16963542 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.61;QD=57.0008;RBI=0.0444445;REFB=0;REVB=0.0401558;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.84159e-05;OID=.;OPOS=16963542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0 chr20 17189761 . C G 490.61 PASS AF=0.432;AO=53;DP=126;FAO=54;FDP=125;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.0196069;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4575;QD=15.6996;RBI=0.0546005;REFB=-0.0101537;REVB=0.0509586;RO=72;SAF=20;SAR=33;SRF=47;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278416;STB=0.655317;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0150806;OID=.;OPOS=17189761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:72:71:53:54:0.432:33:20:47:25:34:20:46:25 chr20 17464516 . T C 450.24 PASS AF=0.636364;AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0111549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.184;QD=27.2875;RBI=0.0132598;REFB=-0.0162043;REVB=0.00716873;RO=24;SAF=18;SAR=24;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811545;STB=0.504423;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0100723;OID=.;OPOS=17464516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:24:24:42:42:0.636364:24:18:10:14:24:18:10:14 chr20 17469659 . G A 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00730625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.045;QD=14.794;RBI=0.0477758;REFB=-0.0150153;REVB=-0.0472139;RO=27;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173498;STB=0.600384;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.023658;OID=.;OPOS=17469659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:7:11:12:15:7:11:12:15 chr20 17470035 . C G 221.56 PASS AF=0.468085;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00415912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.929;QD=18.856;RBI=0.0204196;REFB=-0.0165601;REVB=0.0199915;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111266;STB=0.516883;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0182302;OID=.;OPOS=17470035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:25:25:21:22:0.468085:12:9:11:14:13:9:11:14 chr20 17594714 . GC G 963.81 PASS AF=0.490196;AO=99;DP=205;FAO=100;FDP=204;FR=.;FRO=104;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=19;FSRR=85;FWDB=-0.0333839;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.199;QD=18.8982;RBI=0.0383935;REFB=-0.0136995;REVB=-0.0189625;RO=105;SAF=44;SAR=55;SRF=20;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249846;STB=0.63746;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0338973;OID=.;OPOS=17594715;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.490196:99:205:100:204:104:44:56:19:85:99:105:44:55:20:85 chr20 17594729 . G A 947.34 PASS AF=0.485149;AO=98;DP=203;FAO=98;FDP=202;FR=.;FRO=104;FSAF=10;FSAR=88;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=-0.00789098;FXX=0.00492587;HRUN=3;LEN=1;MLLD=346.715;QD=18.7592;RBI=0.0102732;REFB=-0.00388601;REVB=-0.00657811;RO=104;SAF=10;SAR=88;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473943;STB=0.766969;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00352863;OID=.;OPOS=17594729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:202:104:104:98:98:0.485149:88:10:45:59:88:10:45:59 chr20 17596155 . C A 590.74 PASS AF=0.602273;AO=53;DP=88;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.00753401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.75;QD=26.8518;RBI=0.0149976;REFB=-0.0186492;REVB=0.0129679;RO=35;SAF=23;SAR=30;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112089;STB=0.560953;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0172906;OID=.;OPOS=17596155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:35:35:53:53:0.602273:30:23:10:25:30:23:10:25 chr20 17597482 . G A 88.79 PASS AF=0.458333;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0306709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.403;QD=14.7984;RBI=0.0315282;REFB=-0.00860255;REVB=0.0073022;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296512;STB=0.512173;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0278224;OID=.;OPOS=17597482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:23:24:12:13:11:11:0.458333:7:4:4:8:7:4:5:8 chr20 17600357 . G A 644.94 PASS AF=0.584906;AO=62;DP=105;FAO=62;FDP=106;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.019296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.726;QD=24.3374;RBI=0.0199614;REFB=-0.00593162;REVB=0.00511117;RO=42;SAF=30;SAR=32;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112345;STB=0.559614;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00482161;OID=.;OPOS=17600357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:42:44:62:62:0.584906:32:30:14:28:32:30:15:29 chr20 17602196 . A G 344.55 PASS AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0142567;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.232;QD=21.203;RBI=0.0164767;REFB=-0.0257433;REVB=0.00826015;RO=28;SAF=12;SAR=23;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13345;STB=0.56094;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0221953;OID=.;OPOS=17602196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:30:35:35:0.538462:23:12:14:14:23:12:14:16 chr20 17605240 . A T 1080.38 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00357845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.924;QD=60.021;RBI=0.0124807;REFB=0;REVB=0.0119567;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65139e-05;OID=.;OPOS=17605240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:41:31:0:0:41:31:0:0 chr20 17608233 . C T 949.41 PASS AF=0.489899;AO=97;DP=201;FAO=97;FDP=198;FR=.;FRO=101;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=0.0189649;FXX=0.0149246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.364;QD=19.1799;RBI=0.0256614;REFB=-0.0196488;REVB=0.017287;RO=100;SAF=50;SAR=47;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327038;STB=0.515461;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0182686;OID=.;OPOS=17608233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:198:100:101:97:97:0.489899:47:50:48:52:47:50:49:52 chr20 17705677 . A G 1437.75 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060339;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.644;QD=63.198;RBI=0.019035;REFB=0;REVB=-0.0180533;RO=0;SAF=52;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175772;OID=.;OPOS=17705677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:90:91:1:38:52:0:0:38:53:0:0 chr20 17716416 . C G 369.96 PASS AF=0.409524;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0115721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9351;QD=14.0937;RBI=0.0173332;REFB=-0.0110653;REVB=0.0129045;RO=61;SAF=19;SAR=24;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103009;STB=0.562803;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0165465;OID=.;OPOS=17716416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:61:62:43:43:0.409524:24:19:33:28:24:19:34:28 chr20 18143117 . T G 556.33 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00908213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.2045;QD=60.1434;RBI=0.0271358;REFB=0;REVB=0.0255708;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285516;OID=.;OPOS=18143117;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:22:12:0:0:25:12:0:0 chr20 18143355 . C T 2073.43 PASS AF=1;AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202499;FXX=0.0149243;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.762;QD=62.8312;RBI=0.0204233;REFB=0;REVB=0.0203226;RO=0;SAF=61;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02225e-06;OID=.;OPOS=18143355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:132:0:0:132:132:1:71:61:0:0:71:61:0:0 chr20 18167977 . T C 1107.8 PASS AF=1;AO=71;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.216542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.58;QD=58.3053;RBI=0.216637;REFB=0;REVB=-0.00643096;RO=2;SAF=32;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028636;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000895673;OID=.;OPOS=18167977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:76:2:0:71:76:1:39:32:2:0:39:37:0:0 chr20 18296072 . T A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3464;QD=53.9111;RBI=0.0358673;REFB=0;REVB=0.0288775;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141794;OID=.;OPOS=18296072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0 chr20 18309650 . GT GG,G 940.78 PASS AF=0.0454545,0.954545;AO=4,62;DP=66;FAO=3,63;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=2,29;FSAR=1,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063928,0.0715811;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=5.93752,29.8095;QD=57.017;RBI=0.0658908,0.0757176;REFB=0,0;REVB=0.0159627,0.0246841;RO=0;SAF=3,28;SAR=1,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.00769736,-0.00504781;OID=.,.;OPOS=18309651,18309651;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=GG,G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0454545,0.954545:4,62:66:3,63:66:0:2,29:1,34:0:0:9:0:3,28:1,34:0:0 chr20 18445963 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.112;QD=57.2022;RBI=0.027058;REFB=0;REVB=0.00386563;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243363;OID=.;OPOS=18445963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0 chr20 18523002 . C G 306.26 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0762778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8282;QD=53.2622;RBI=0.0893533;REFB=0;REVB=0.0465373;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00362831;OID=.;OPOS=18523002;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chr20 18573108 . T G 670.01 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.040559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4169;QD=62.3262;RBI=0.0678547;REFB=0;REVB=0.0543987;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129785;OID=.;OPOS=18573108;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:11:31:0:0:12:31:0:0 chr20 18790456 . G T 793.5 PASS AF=0.435233;AO=84;DP=193;FAO=84;FDP=193;FR=.;FRO=109;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=70;FSRR=39;FWDB=-0.00615203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8589;QD=16.4456;RBI=0.019038;REFB=-0.00178203;REVB=-0.0180166;RO=109;SAF=38;SAR=46;SRF=70;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19077;STB=0.605977;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00209975;OID=.;OPOS=18790456;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:109:109:84:84:0.435233:46:38:70:39:46:38:70:39 chr20 19261623 . G A 586.31 PASS AF=0.504202;AO=60;DP=118;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00397668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3403;QD=19.708;RBI=0.0235076;REFB=-0.0278689;REVB=0.0231688;RO=57;SAF=30;SAR=30;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698288;STB=0.546203;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0293807;OID=.;OPOS=19261623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:57:59:60:60:0.504202:30:30:24:33:30:30:24:35 chr20 19560664 . G A 1629.79 PASS AF=1;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000992762;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.702;QD=60.3627;RBI=0.00386368;REFB=0;REVB=-0.00373396;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.64542e-06;OID=.;OPOS=19560664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:108:0:0:108:108:1:60:48:0:0:60:48:0:0 chr20 19702049 . G A 873.29 PASS AF=0.543624;AO=78;DP=145;FAO=81;FDP=149;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.0108873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.288;QD=23.444;RBI=0.0113065;REFB=-0.00182004;REVB=-0.00305015;RO=66;SAF=33;SAR=45;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647788;STB=0.533082;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00161635;OID=.;OPOS=19702049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:149:66:68:78:81:0.543624:45:33:23:43:48:33:23:45 chr20 19951534 . T A 531.23 PASS AF=0.509259;AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0147971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7509;QD=19.6753;RBI=0.0148075;REFB=0.0236556;REVB=0.000556738;RO=53;SAF=31;SAR=24;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987201;STB=0.554486;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.0245426;OID=.;OPOS=19951534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:53:55:55:0.509259:24:31:24:29:24:31:24:29 chr20 19970705 . C T 399.22 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00617946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0336;QD=15.3547;RBI=0.00655512;REFB=-0.00930178;REVB=0.00218718;RO=59;SAF=17;SAR=28;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128995;STB=0.507243;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00886356;OID=.;OPOS=19970705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:59:45:45:0.432692:28:17:23:36:28:17:23:36 chr20 19983022 . ATTTTTT ATTTTT,ATTTTTA 87.11 PASS AF=0.387755,0.0408163;AO=17,2;DP=49;FAO=19,2;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=6,0;FSAR=13,2;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.101486,-0.0724436;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=11.6603,22.2623;QD=7.11073;RBI=0.180536,0.180065;REFB=0.0273826,-0.00735214;REVB=0.149311,0.16485;RO=28;SAF=6,0;SAR=11,2;SRF=6;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0.4,0;SSSB=0.173693,-0.368411;STB=0.573698,0.992096;STBP=0.495,0.369;TYPE=del,snp;VARB=-0.0214822,0.0100932;OID=.,.;OPOS=19983023,19983028;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.387755,0.0408163:17,2:49:19,2:49:28:6,0:13,2:6:22:78:28:6,0:11,2:6:22 chr20 20006368 . T C 380.47 PASS AF=0.362205;AO=46;DP=127;FAO=46;FDP=127;FR=.;FRO=81;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=-0.0105122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.46;QD=11.9833;RBI=0.011372;REFB=-0.004501;REVB=0.0043376;RO=81;SAF=20;SAR=26;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663243;STB=0.537914;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00957332;OID=.;OPOS=20006368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:81:81:46:46:0.362205:26:20:40:41:26:20:40:41 chr20 20032998 . T C 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0530615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9229;QD=16.6271;RBI=0.0692332;REFB=-0.00192335;REVB=-0.0444715;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103812;STB=0.559354;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.0019881;OID=.;OPOS=20032998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:3:11:9:4:3:11 chr20 20033137 . T A 1591.99 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201658;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.459;QD=64.3229;RBI=0.0297862;REFB=0;REVB=0.0219216;RO=0;SAF=33;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160044;OID=.;OPOS=20033137;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:65:33:0:0:66:33:0:0 chr20 20033242 . A T 205.31 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0623216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4747;QD=12.8319;RBI=0.0656214;REFB=0.0297569;REVB=0.0205469;RO=39;SAF=5;SAR=20;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123246;STB=0.571367;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.0466173;OID=.;OPOS=20033242;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:20:5:11:28:20:5:11:28 chr20 20050397 . G A 1327.8 PASS AF=1;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013173;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.522;QD=62.4847;RBI=0.0190519;REFB=0;REVB=0.013764;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02845e-05;OID=.;OPOS=20050397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0 chr20 20144780 . T C 43.17 PASS AF=0.0982143;AO=11;DP=112;FAO=11;FDP=112;FR=.;FRO=101;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=60;FWDB=-0.0248033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.991;QD=1.54181;RBI=0.0428921;REFB=-0.00469756;REVB=-0.0349933;RO=100;SAF=1;SAR=10;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441557;STB=0.856378;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0293569;OID=.;OPOS=20144780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:112:112:100:101:11:11:0.0982143:10:1:41:59:10:1:41:60 chr20 20152462 . A C 233.59 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00871944;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9284;QD=16.9881;RBI=0.00971457;REFB=0.012291;REVB=-0.00428303;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780541;STB=0.543876;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.0164633;OID=.;OPOS=20152462;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:29:29:26:26:0.472727:12:14:18:11:12:14:18:11 chr20 20341333 . G C 1896.16 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.537;QD=61.6638;RBI=0.0271618;REFB=0;REVB=0.0233567;RO=0;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14503e-05;OID=.;OPOS=20341333;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:60:63:0:0:60:63:0:0 chr20 20350516 . T G 560.29 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.879;QD=58.9783;RBI=0.0359475;REFB=0;REVB=0.0260401;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106757;OID=.;OPOS=20350516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:24:12:0:0:24:14:0:0 chr20 20373813 . C T 524.38 PASS AF=0.46281;AO=55;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.0153376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.944;QD=17.3347;RBI=0.0251634;REFB=-0.0322475;REVB=0.0199488;RO=65;SAF=34;SAR=21;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497091;STB=0.531442;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0376938;OID=.;OPOS=20373813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:65:55:56:0.46281:21:34:37:28:21:35:37:28 chr20 20377421 . A AC 85.69 PASS AF=0.709677;AO=16;DP=33;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0833645;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.87081;QD=11.0564;RBI=0.241254;REFB=-0.0425858;REVB=0.226393;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106233;STB=0.543244;STBP=0.506;TYPE=ins;VARB=0.0809869;OID=.;OPOS=20377422;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.709677:16:33:22:31:9:13:9:4:5:22:14:10:6:7:7 chr20 20484043 . A G 465.67 PASS AF=0.542169;AO=44;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00654557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.928;QD=22.4418;RBI=0.0192445;REFB=-0.00224477;REVB=-0.0180971;RO=39;SAF=22;SAR=22;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164186;STB=0.579536;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00171736;OID=.;OPOS=20484043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:38:44:45:0.542169:22:22:27:12:22:23:26:12 chr20 20512440 . CTTTTTA CTTTT,CTTTTA,CTTTTAA,TACTTTT 135.28 PASS AF=0.526316,0.0526316,0,0.263158;AO=4,6,9,5;DP=35;FAO=10,1,0,5;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=9,1,0,0;FSAR=1,0,0,5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0089072,0.110089,0.114225,0.0272303;FXX=0.208247;HRUN=5,5,5,1;LEN=2,1,1,7;MLLD=25.7026,13.1092,11.1839,64.4971;QD=28.4797;RBI=0.145325,0.137984,0.128185,0.0272528;REFB=-0.127469,-0.16147,-0.0585816,-0.0599784;REVB=0.145052,0.0831867,-0.0581737,0.00110652;RO=5;SAF=3,6,8,0;SAR=1,0,1,5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.320004,0.773282,0.441617,-0.730294;STB=0.799259,0.994936,0.5,0.5;STBP=0.004,0.102,1,1;TYPE=del,del,snp,mnp;VARB=0.0716356,0.0907305,0,0.0479418;OID=.,.,.,.;OPOS=20512445,20512441,20512445,20512440;OREF=TA,T,T,CTTTTTA;OALT=-,-,A,TACTTTT;OMAPALT=CTTTT,CTTTTA,CTTTTAA,TACTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/4:30:35:19:5:3:4,6,9,5:10,1,0,5:0.526316,0.0526316,0,0.263158:1,0,1,5:3,6,8,0:2:3:1,0,0,5:9,1,0,0:0:3 chr20 20693088 . C T 239.99 PASS AF=0.465517;AO=26;DP=57;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0739992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7771;QD=16.5507;RBI=0.080305;REFB=-0.00584472;REVB=0.0311932;RO=30;SAF=17;SAR=9;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152328;STB=0.602332;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00736947;OID=.;OPOS=20693088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:30:31:26:27:0.465517:9:17:15:15:9:18:15:16 chr20 21142523 . C G 1190.44 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.113;QD=61.0481;RBI=0.0282663;REFB=0;REVB=0.0193023;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19475e-06;OID=.;OPOS=21142523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0 chr20 21142813 . T C 754.24 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6931;QD=56.9235;RBI=0.0278882;REFB=0;REVB=0.0254949;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204707;OID=.;OPOS=21142813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0 chr20 21186161 . A AG 592.1 PASS AF=1;AO=50;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.230498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.9135;QD=43.8592;RBI=0.232485;REFB=0;REVB=0.0303321;RO=2;SAF=19;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046999;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00653881;OID=.;OPOS=21186162;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:50:54:54:54:0:21:33:0:0:11:2:19:31:2:0 chr20 21362703 . TA T 1585.03 PASS AF=1;AO=129;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=25.6315;QD=48.0313;RBI=0.0718237;REFB=0;REVB=-0.0595054;RO=0;SAF=62;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000190948;OID=.;OPOS=21362704;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:129:132:132:132:0:63:69:0:0:29:0:62:67:0:0 chr20 22562674 . T C 946.92 PASS AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0272441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.754;QD=55.7009;RBI=0.031621;REFB=-0.0770292;REVB=0.0160514;RO=1;SAF=35;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133089;STB=0.513885;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.000971097;OID=.;OPOS=22562674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:68:68:1:2:66:66:0.970588:31:35:1:0:31:35:2:0 chr20 23016970 . T G 704.93 PASS AF=0.534884;AO=68;DP=128;FAO=69;FDP=129;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0252856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.024;QD=21.8581;RBI=0.0276645;REFB=-0.011272;REVB=-0.0112233;RO=60;SAF=29;SAR=39;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105969;STB=0.553737;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00943412;OID=.;OPOS=23016970;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:60:60:68:69:0.534884:39:29:33:27:39:30:33:27 chr20 23017017 . T C 2255.05 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000477895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.465;QD=63.5226;RBI=0.00593874;REFB=0;REVB=0.00591948;RO=0;SAF=65;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32058e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44858e-06;OID=.;OPOS=23017017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:142:0:0:140:142:1:75:65:0:0:77:65:0:0 chr20 23017044 . C T 745.15 PASS AF=0.521739;AO=72;DP=138;FAO=72;FDP=138;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0118445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.812;QD=21.5986;RBI=0.0128775;REFB=-0.00908158;REVB=-0.00505346;RO=66;SAF=30;SAR=42;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047063;STB=0.525855;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00826525;OID=.;OPOS=23017044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:66:66:72:72:0.521739:42:30:31:35:42:30:31:35 chr20 23017082 . T C 1967.19 PASS AF=0.992308;AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0562989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1309;QD=60.5288;RBI=0.056362;REFB=0.0150005;REVB=-0.00266772;RO=2;SAF=60;SAR=68;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000917027;STB=0.504132;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.000632954;OID=.;OPOS=23017082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:130:130:2:1:128:129:0.992308:68:60:1:1:69:60:1:0 chr20 23064912 . T C 170.7 PASS AF=0.413043;AO=18;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00443227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3255;QD=14.8431;RBI=0.0324676;REFB=-0.0281444;REVB=-0.0321637;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115825;STB=0.557543;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0438583;OID=.;OPOS=23064912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:46:26:27:18:19:0.413043:11:7:13:13:11:8:14:13 chr20 23065342 . A G 510.8 PASS AF=0.490909;AO=53;DP=109;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.00235036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.546;QD=18.5746;RBI=0.0978105;REFB=-0.0205288;REVB=-0.0977823;RO=56;SAF=20;SAR=33;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497601;STB=0.521045;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0282585;OID=.;OPOS=23065342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:56:56:53:54:0.490909:33:20:24:32:33:21:24:32 chr20 23066338 . G C 151.29 PASS AF=0.346939;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00299416;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.485;QD=12.3498;RBI=0.0480977;REFB=-0.00419621;REVB=-0.0480044;RO=28;SAF=12;SAR=5;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108546;STB=0.560366;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00683442;OID=.;OPOS=23066338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:28:32:17:17:0.346939:5:12:20:8:5:12:20:12 chr20 23335120 . CTT C 67.0 PASS AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.0353231;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=50.6676;QD=13.3995;RBI=0.0358662;REFB=0.00862156;REVB=-0.00621786;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358971;STB=0.705518;STBP=0.177;TYPE=del;VARB=-0.0112563;OID=.;OPOS=23335121;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45:9:20:9:20:11:4:5:1:10:66:11:4:5:1:10 chr20 23345844 . A C 419.43 PASS AF=0.615385;AO=39;DP=64;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0520844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.901;QD=25.8109;RBI=0.0526847;REFB=-0.0143214;REVB=0.00793046;RO=24;SAF=13;SAR=26;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322313;STB=0.51517;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00588639;OID=.;OPOS=23345844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:24:25:39:40:0.615385:26:13:9:15:27:13:9:16 chr20 23352480 . A G 237.07 PASS AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0498911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0778;QD=19.7562;RBI=0.0553192;REFB=-0.00764911;REVB=0.0238976;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235256;STB=0.63291;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00766755;OID=.;OPOS=23352480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:8:15:10:15:8:15:10:15 chr20 23355423 . C T 74.48 PASS AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0640171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.435;QD=22.9154;RBI=0.0647132;REFB=-0.0121765;REVB=0.00946656;RO=4;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34935;STB=0.705321;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0037061;OID=.;OPOS=23355423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:8:1:2:2:8:1:2:2 chr20 23421101 . G A 281.95 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0557419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0532;QD=14.6469;RBI=0.056411;REFB=-0.00792791;REVB=0.0086629;RO=45;SAF=19;SAR=13;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104259;STB=0.558864;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0102649;OID=.;OPOS=23421101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:13:19:31:14:13:19:31:14 chr20 23424613 . T C 304.13 PASS AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.00641037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.255;QD=17.3789;RBI=0.00661477;REFB=-0.00803929;REVB=0.00163165;RO=36;SAF=12;SAR=21;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059695;STB=0.538659;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0138724;OID=.;OPOS=23424613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:36:37:33:33:0.471429:21:12:11:25:21:12:11:26 chr20 23424638 . C T 319.84 PASS AF=0.492754;AO=33;DP=68;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.00529261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.97;QD=18.5413;RBI=0.00852264;REFB=-0.0252886;REVB=-0.0066801;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134116;STB=0.581452;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0352456;OID=.;OPOS=23424638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:35:35:33:34:0.492754:19:14:10:25:19:15:10:25 chr20 23432528 . A G 210.14 PASS AF=0.361111;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.000786238;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.463;QD=11.6746;RBI=0.0186777;REFB=0.00136965;REVB=0.0186611;RO=46;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00557715;STB=0.503223;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.00141126;OID=.;OPOS=23432528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:46:46:26:26:0.361111:14:12:21:25:14:12:21:25 chr20 23472391 . A G 2953.7 PASS AF=0.970732;AO=190;DP=194;FAO=199;FDP=205;FR=.;FRO=6;FSAF=93;FSAR=106;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0151743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.345;QD=57.6331;RBI=0.0180404;REFB=-0.154997;REVB=0.00975689;RO=1;SAF=90;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526175;STB=0.515623;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.000554449;OID=.;OPOS=23472391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:194:205:1:6:190:199:0.970732:100:90:1:0:106:93:6:0 chr20 23531276 . G A 39.05 PASS AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00741479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.977;QD=12.0157;RBI=0.0175379;REFB=-0.0157267;REVB=0.0158934;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303121;STB=0.688929;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0123584;OID=.;OPOS=23531276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:5:1:3:4:5:1:3:4 chr20 23546639 . T G 533.62 PASS AF=0.456;AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0098286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.114;QD=17.0758;RBI=0.0115573;REFB=-0.0105835;REVB=-0.00608025;RO=67;SAF=28;SAR=29;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422575;STB=0.527253;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0124674;OID=.;OPOS=23546639;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:67:68:57:57:0.456:29:28:30:37:29:28:30:38 chr20 23586360 . G A 1433.51 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4505;QD=63.0113;RBI=0.0466436;REFB=0;REVB=0.0418172;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177534;OID=.;OPOS=23586360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:42:49:0:0:42:49:0:0 chr20 23618395 . T C 1749.42 PASS AF=1;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.189;QD=60.8494;RBI=0.0137586;REFB=0;REVB=0.0110349;RO=0;SAF=50;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7936e-05;OID=.;OPOS=23618395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:115:115:0:0:114:115:1:64:50:0:0:65:50:0:0 chr20 23729722 . G T 4354.83 PASS AF=0.985866;AO=279;DP=285;FAO=279;FDP=283;FR=.;FRO=4;FSAF=153;FSAR=126;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0262689;FXX=0.0070173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6084;QD=61.5523;RBI=0.0348266;REFB=-0.131626;REVB=-0.0228657;RO=4;SAF=153;SAR=126;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123008;STB=0.506451;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.000638164;OID=.;OPOS=23729722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:285:283:4:4:279:279:0.985866:126:153:4:0:126:153:4:0 chr20 23731494 . A G 924.01 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0892762;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.289;QD=58.6674;RBI=0.0904122;REFB=0;REVB=-0.0142871;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454665;OID=.;OPOS=23731494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0 chr20 23860178 . A G 223.16 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0111277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.696;QD=14.6336;RBI=0.0140686;REFB=-0.0213201;REVB=-0.00860815;RO=35;SAF=16;SAR=10;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141102;STB=0.508015;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0348687;OID=.;OPOS=23860178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:10:16:22:13:10:16:22:13 chr20 24939590 . G C 1013.58 PASS AF=0.959459;AO=69;DP=72;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0138985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.623;QD=54.7881;RBI=0.0201451;REFB=0.000215491;REVB=0.0145829;RO=3;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325738;STB=0.517237;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.000135438;OID=.;OPOS=24939590;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:72:74:3:3:69:71:0.959459:42:27:0:3:42:29:0:3 chr20 24952147 . G A 399.6 PASS AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00256294;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.671;QD=15.3694;RBI=0.021568;REFB=-0.0116373;REVB=0.0214152;RO=59;SAF=31;SAR=14;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227251;STB=0.628037;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0161591;OID=.;OPOS=24952147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:59:45:45:0.432692:14:31:28:31:14:31:28:31 chr20 24954887 . A T 175.66 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00353053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.872;QD=46.8433;RBI=0.0376803;REFB=0;REVB=0.0375145;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379403;OID=.;OPOS=24954887;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chr20 25011423 . T C 181.27 PASS AF=0.431818;AO=18;DP=43;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0231049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.962;QD=16.4793;RBI=0.0377372;REFB=-0.0195539;REVB=-0.0298372;RO=23;SAF=7;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896712;STB=0.565686;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.020161;OID=.;OPOS=25011423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:23:25:18:19:0.431818:11:7:11:12:12:7:12:13 chr20 25027526 . G A 358.11 PASS AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0102085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.762;QD=22.3817;RBI=0.0107902;REFB=-0.00340323;REVB=0.00349512;RO=28;SAF=15;SAR=21;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490548;STB=0.527012;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00301882;OID=.;OPOS=25027526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:21:15:10:18:21:15:10:18 chr20 25059564 . C T 569.99 PASS AF=0.458015;AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=0.0327616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.655;QD=17.4044;RBI=0.0344662;REFB=-0.0107408;REVB=-0.010705;RO=71;SAF=30;SAR=30;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130612;STB=0.572495;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0141757;OID=.;OPOS=25059564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:71:71:60:60:0.458015:30:30:45:26:30:30:45:26 chr20 25187213 . G A 286.2 PASS AF=0.484375;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00512082;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.189;QD=17.8875;RBI=0.0107968;REFB=-0.00793632;REVB=-0.00950515;RO=33;SAF=10;SAR=20;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620413;STB=0.540846;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.00722651;OID=.;OPOS=25187213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:30:31:0.484375:20:10:13:20:21:10:13:20 chr20 25193949 . G A 206.76 PASS AF=0.390625;AO=24;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0103939;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4042;QD=12.9227;RBI=0.0261227;REFB=-0.00309189;REVB=0.0239659;RO=39;SAF=9;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682646;STB=0.548773;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00618472;OID=.;OPOS=25193949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:39:24:25:0.390625:15:9:17:22:16:9:17:22 chr20 25195394 . C T 1135.32 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00232642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1894;QD=58.9774;RBI=0.0132445;REFB=0;REVB=0.0130386;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57827e-05;OID=.;OPOS=25195394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:77:0:0:71:77:1:31:40:0:0:35:42:0:0 chr20 25195509 . A G 1134.53 PASS AF=0.9625;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.012735;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=286.648;QD=56.7267;RBI=0.0151271;REFB=-0.148762;REVB=0.00816383;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.000385296;OID=.;OPOS=25195509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:80:80:0:3:77:77:0.9625:35:42:0:0:35:42:2:1 chr20 25207074 . T C 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0025522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.528;QD=62.1621;RBI=0.0166835;REFB=0;REVB=0.0164872;RO=0;SAF=34;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01988e-05;OID=.;OPOS=25207074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:51:34:0:0:51:34:0:0 chr20 25259006 . G T 277.73 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0160586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.89;QD=16.1003;RBI=0.0165459;REFB=-0.0203728;REVB=0.00398602;RO=38;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796798;STB=0.544909;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0207439;OID=.;OPOS=25259006;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:13:18:19:19:13:18:19:19 chr20 25260931 . A G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00578367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.122;QD=58.2393;RBI=0.00738889;REFB=0;REVB=0.00459834;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69501e-05;OID=.;OPOS=25260931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0 chr20 25262769 . G A 268.74 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00690801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.05;QD=22.3947;RBI=0.0199744;REFB=-0.0132754;REVB=0.0187419;RO=23;SAF=6;SAR=19;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275039;STB=0.655039;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0209848;OID=.;OPOS=25262769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:19:6:12:11:19:6:12:11 chr20 25264814 . T C 713.73 PASS AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0212788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5612;QD=52.8691;RBI=0.0793594;REFB=-0.188445;REVB=0.0764535;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519223;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00687823;OID=.;OPOS=25264814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:54:54:0:2:52:52:0.962963:27:25:0:0:27:25:2:0 chr20 25268920 . T C 784.44 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3779;QD=62.755;RBI=0.0488557;REFB=0;REVB=0.0463936;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110059;OID=.;OPOS=25268920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:28:21:0:0:29:21:0:0 chr20 25276297 . G A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000329255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.312;QD=57.1062;RBI=0.00207512;REFB=0;REVB=-0.00204883;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.06451e-06;OID=.;OPOS=25276297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0 chr20 25282944 . A G 696.85 PASS AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0188881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.908;QD=52.5924;RBI=0.0189987;REFB=-0.116934;REVB=-0.00204688;RO=1;SAF=18;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254383;STB=0.506051;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.000439882;OID=.;OPOS=25282944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:53:53:1:2:51:51:0.962264:33:18:1:0:33:18:1:1 chr20 25456888 . A G 1589.78 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4415;QD=59.9917;RBI=0.0464309;REFB=0;REVB=-0.0331361;RO=0;SAF=24;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17645e-06;OID=.;OPOS=25456888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:82:24:0:0:82:24:0:0 chr20 25457049 . GCTCCCA G 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248297;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=6;MLLD=259.56;QD=57.7115;RBI=0.031267;REFB=0;REVB=0.019003;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.71981e-05;OID=.;OPOS=25457050;OREF=CTCCCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:30:31:30:30:0:12:18:0:0:4:0:12:18:0:0 chr20 25591862 . A T 449.71 PASS AF=0.969697;AO=29;DP=30;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.175137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.6;QD=54.5108;RBI=0.175394;REFB=-0.0757491;REVB=0.00949218;RO=1;SAF=1;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163549;STB=0.508469;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00216548;OID=.;OPOS=25591862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:30:33:1:1:29:32:0.969697:28:1:0:1:29:3:0:1 chr20 25591864 . A T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0789227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.294;QD=55.0987;RBI=0.0792832;REFB=0;REVB=0.00755137;RO=0;SAF=3;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170403;OID=.;OPOS=25591864;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:23:3:0:0:23:3:0:0 chr20 25595829 . C T 209.79 PASS AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00400583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.738;QD=11.4954;RBI=0.0311521;REFB=0.00192065;REVB=-0.0308934;RO=46;SAF=16;SAR=10;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153216;STB=0.59567;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00334836;OID=.;OPOS=25595829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:47:26:26:0.356164:10:16:22:24:10:16:22:25 chr20 25595868 . G A 321.05 PASS AF=0.387097;AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0322524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.36;QD=13.8084;RBI=0.035841;REFB=0.014673;REVB=0.0156319;RO=57;SAF=20;SAR=16;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694;STB=0.539546;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=-0.0232852;OID=.;OPOS=25595868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:57:36:36:0.387097:16:20:28:29:16:20:28:29 chr20 25755672 . G T 379.58 PASS AF=0.359375;AO=46;DP=128;FAO=46;FDP=128;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.00885588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.425;QD=11.8619;RBI=0.0120724;REFB=-0.0136628;REVB=-0.00820472;RO=82;SAF=21;SAR=25;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598663;STB=0.503423;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.03195;OID=.;OPOS=25755672;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:82:82:46:46:0.359375:25:21:37:45:25:21:37:45 chr20 26063560 . G A 519.07 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.095;QD=59.3219;RBI=0.0222826;REFB=0;REVB=-0.0216157;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115873;OID=.;OPOS=26063560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr20 26084111 . A G 32.78 PASS AF=0.0963855;AO=8;DP=83;FAO=8;FDP=83;FR=.;FRO=75;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.0198893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.434;QD=1.57977;RBI=0.0307561;REFB=0.00416242;REVB=0.0234596;RO=74;SAF=2;SAR=6;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332138;STB=0.762669;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0160156;OID=.;OPOS=26084111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:83:83:74:75:8:8:0.0963855:6:2:40:34:6:2:41:34 chr20 26094564 . T G 2375.82 PASS AF=0.508658;AO=235;DP=463;FAO=235;FDP=462;FR=.;FRO=227;FSAF=126;FSAR=109;FSRF=108;FSRR=119;FWDB=-0.0166635;FXX=0.00215978;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2566;QD=20.5699;RBI=0.0177774;REFB=-0.00326169;REVB=-0.00619374;RO=225;SAF=126;SAR=109;SRF=108;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050357;STB=0.529702;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00520531;OID=.;OPOS=26094564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:463:462:225:227:235:235:0.508658:109:126:108:117:109:126:108:119 chr20 26094567 . T C 2916.26 PASS AF=0.578834;AO=268;DP=464;FAO=268;FDP=463;FR=.;FRO=195;FSAF=135;FSAR=133;FSRF=98;FSRR=97;FWDB=0.0076158;FXX=0.00215513;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.716;QD=25.1944;RBI=0.0240657;REFB=-0.0119501;REVB=0.0228289;RO=193;SAF=135;SAR=133;SRF=96;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00489573;STB=0.500492;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0096917;OID=.;OPOS=26094567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:464:463:193:195:268:268:0.578834:133:135:96:97:133:135:98:97 chr20 26094605 . G A 1646.11 PASS AF=0.448187;AO=173;DP=386;FAO=173;FDP=386;FR=.;FRO=213;FSAF=89;FSAR=84;FSRF=95;FSRR=118;FWDB=-0.0103567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.088;QD=17.0582;RBI=0.0264794;REFB=-0.0217973;REVB=-0.02437;RO=211;SAF=89;SAR=84;SRF=94;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684665;STB=0.537712;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0266341;OID=.;OPOS=26094605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:386:386:211:213:173:173:0.448187:84:89:94:117:84:89:95:118 chr20 26094609 . C A 1528.7 PASS AF=0.438503;AO=164;DP=374;FAO=164;FDP=374;FR=.;FRO=210;FSAF=82;FSAR=82;FSRF=96;FSRR=114;FWDB=-0.0151433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3629;QD=16.3497;RBI=0.0193568;REFB=0.0201364;REVB=-0.0120568;RO=210;SAF=82;SAR=82;SRF=96;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434206;STB=0.524061;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.0252355;OID=.;OPOS=26094609;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:374:210:210:164:164:0.438503:82:82:96:114:82:82:96:114 chr20 29623217 . C T 44.39 PASS AF=0.0732759;AO=17;DP=232;FAO=17;FDP=232;FR=.;FRO=215;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=101;FSRR=114;FWDB=-0.0134222;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2291;QD=0.765346;RBI=0.0660882;REFB=-0.00175889;REVB=-0.0647108;RO=214;SAF=4;SAR=13;SRF=100;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267554;STB=0.728497;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0258274;OID=.;OPOS=29623217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:232:232:214:215:17:17:0.0732759:13:4:100:114:13:4:101:114 chr20 29623223 . T C 497.07 PASS AF=0.295154;AO=67;DP=227;FAO=67;FDP=227;FR=.;FRO=160;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=75;FSRR=85;FWDB=0.00106378;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.948;QD=8.75887;RBI=0.00116344;REFB=-0.0032441;REVB=0.000471138;RO=159;SAF=28;SAR=39;SRF=75;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658269;STB=0.536376;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00666484;OID=.;OPOS=29623223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:159:160:67:67:0.295154:39:28:75:84:39:28:75:85 chr20 29623248 . AAAGAAG AAAGAAA,AAAG 703.0 PASS AF=0.0909091,0.315789;AO=19,65;DP=226;FAO=19,66;FDP=209;FR=.;FRO=124;FSAF=10,27;FSAR=9,39;FSRF=56;FSRR=68;FWDB=-0.0180754,-0.00696336;FXX=0.0792917;HRUN=2,2;LEN=1,3;MLLD=37.7672,244.643;QD=13.4545;RBI=0.106687,0.0419825;REFB=0.047414,-0.0002066;REVB=0.105145,0.041401;RO=110;SAF=10,26;SAR=9,39;SRF=54;SRR=56;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0446659,-0.102331;STB=0.564449,0.528395;STBP=0.539,0.594;TYPE=snp,del;VARB=-0.0507613,0.00677636;OID=.,.;OPOS=29623254,29623249;OREF=G,AAG;OALT=A,-;OMAPALT=AAAGAAA,AAAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0909091,0.315789:19,65:226:19,66:209:124:10,27:9,39:56:68:99:110:10,26:9,39:54:56 chr20 29623263 . C T 67.89 PASS AF=0.092511;AO=21;DP=227;FAO=21;FDP=227;FR=.;FRO=206;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=93;FSRR=113;FWDB=-0.0142298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.716;QD=1.19633;RBI=0.0170407;REFB=-0.000304635;REVB=-0.00937547;RO=205;SAF=10;SAR=11;SRF=92;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327452;STB=0.522524;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00285763;OID=.;OPOS=29623263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:227:227:205:206:21:21:0.092511:11:10:92:113:11:10:93:113 chr20 29624020 . G GT 208.31 PASS AF=0.613636;AO=46;DP=84;FAO=54;FDP=88;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0560737;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.8821;QD=9.46871;RBI=0.191542;REFB=0.00783727;REVB=0.183151;RO=33;SAF=20;SAR=26;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556848;STB=0.543;STBP=0.329;TYPE=ins;VARB=0.0352236;OID=.;OPOS=29624021;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.613636:46:84:54:88:34:25:29:12:22:78:33:20:26:12:21 chr20 29624068 . T C 117.8 PASS AF=0.150943;AO=21;DP=156;FAO=24;FDP=159;FR=.;FRO=135;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=59;FSRR=76;FWDB=-0.00676289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.83;QD=2.96351;RBI=0.0135764;REFB=-0.000908013;REVB=0.0117721;RO=134;SAF=8;SAR=13;SRF=59;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768472;STB=0.51767;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00326337;OID=.;OPOS=29624068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:159:134:135:21:24:0.150943:13:8:59:75:14:10:59:76 chr20 29624070 . G A 997.13 PASS AF=0.580247;AO=94;DP=162;FAO=94;FDP=162;FR=.;FRO=68;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=0.00113859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.845;QD=24.6204;RBI=0.0100356;REFB=-0.00240835;REVB=-0.00997075;RO=68;SAF=46;SAR=48;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11726;STB=0.563623;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00194005;OID=.;OPOS=29624070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:68:68:94:94:0.580247:48:46:23:45:48:46:23:45 chr20 29625876 . C T 131.93 PASS AF=0.177778;AO=24;DP=135;FAO=24;FDP=135;FR=.;FRO=111;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=65;FSRR=46;FWDB=-0.00180968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.758;QD=3.90916;RBI=0.036267;REFB=-0.00238511;REVB=-0.0362219;RO=110;SAF=19;SAR=5;SRF=64;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30434;STB=0.697444;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0222853;OID=.;OPOS=29625876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:110:111:24:24:0.177778:5:19:64:46:5:19:65:46 chr20 29625877 . G A 412.53 PASS AF=0.362963;AO=49;DP=135;FAO=49;FDP=135;FR=.;FRO=86;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=0.00398507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.192;QD=12.2231;RBI=0.0211883;REFB=-0.00284464;REVB=-0.0208102;RO=84;SAF=37;SAR=12;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260831;STB=0.651747;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00315123;OID=.;OPOS=29625877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:84:86:49:49:0.362963:12:37:46:38:12:37:47:39 chr20 29625925 . C CTTG 266.07 PASS AF=0.271429;AO=34;DP=143;FAO=38;FDP=140;FR=.;FRO=102;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=-0.00784019;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=3;MLLD=245.342;QD=7.60198;RBI=0.0276705;REFB=-0.00399969;REVB=-0.0265365;RO=104;SAF=25;SAR=9;SRF=53;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297452;STB=0.66105;STBP=0.022;TYPE=ins;VARB=0.00931801;OID=.;OPOS=29625926;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=CTTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.271429:34:143:38:140:102:27:11:51:51:99:104:25:9:53:51 chr20 29625979 . C A 54.78 PASS AF=0.0955414;AO=15;DP=157;FAO=15;FDP=157;FR=.;FRO=142;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=67;FSRR=75;FWDB=-0.00414099;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.269;QD=1.39564;RBI=0.0168618;REFB=-0.0031687;REVB=-0.0163454;RO=137;SAF=9;SAR=6;SRF=66;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140458;STB=0.615038;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0218143;OID=.;OPOS=29625979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:157:157:137:142:15:15:0.0955414:6:9:66:71:6:9:67:75 chr20 29625984 . TG CC,TA 201.47 PASS AF=0.173077,0.0512821;AO=28,8;DP=156;FAO=27,8;FDP=156;FR=.;FRO=121;FSAF=15,3;FSAR=12,5;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=-0.000599981,-0.0797838;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=275.514,57.4351;QD=5.16584;RBI=0.00236856,0.0861694;REFB=-0.000961077,-0.00502865;REVB=0.00229131,-0.0325532;RO=117;SAF=16,3;SAR=12,5;SRF=58;SRR=59;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0968453,-0.125167;STB=0.555514,0.606385;STBP=0.528,0.567;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00246502,0.0606183;OID=.,.;OPOS=29625984,29625985;OREF=TG,G;OALT=CC,A;OMAPALT=CC,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:117:121:28,8:27,8:0.173077,0.0512821:12,5:16,3:58:59:12,5:15,3:59:62 chr20 29628237 . C A 76.85 PASS AF=0.0902527;AO=25;DP=279;FAO=25;FDP=277;FR=.;FRO=252;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=138;FSRR=114;FWDB=-0.0292366;FXX=0.0107139;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.182;QD=1.1098;RBI=0.0297005;REFB=-0.00316097;REVB=-0.00522899;RO=248;SAF=17;SAR=8;SRF=137;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157218;STB=0.625726;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0199197;OID=.;OPOS=29628237;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:279:277:248:252:25:25:0.0902527:8:17:137:111:8:17:138:114 chr20 29628254 . A G 141.74 PASS AF=0.125899;AO=36;DP=280;FAO=35;FDP=278;FR=.;FRO=243;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=132;FSRR=111;FWDB=-0.00986671;FXX=0.0071426;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.973;QD=2.03942;RBI=0.0109468;REFB=-0.00444676;REVB=0.00474127;RO=242;SAF=20;SAR=16;SRF=130;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234643;STB=0.50031;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0281594;OID=.;OPOS=29628254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:278:242:243:36:35:0.125899:16:20:130:112:16:19:132:111 chr20 29628271 . C T 1507.26 PASS AF=0.539033;AO=143;DP=267;FAO=145;FDP=269;FR=.;FRO=124;FSAF=83;FSAR=62;FSRF=59;FSRR=65;FWDB=-0.0134907;FXX=0.0073798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.364;QD=22.4128;RBI=0.0187736;REFB=-0.0223606;REVB=-0.0130556;RO=124;SAF=81;SAR=62;SRF=59;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776603;STB=0.544889;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0153861;OID=.;OPOS=29628271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:269:124:124:143:145:0.539033:62:81:59:65:62:83:59:65 chr20 29628328 . C G 49.97 PASS AF=0.0921053;AO=14;DP=153;FAO=14;FDP=152;FR=.;FRO=138;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=53;FSRR=85;FWDB=-0.050799;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2435;QD=1.31493;RBI=0.0716571;REFB=-0.00943592;REVB=-0.0505391;RO=136;SAF=9;SAR=5;SRF=52;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299038;STB=0.722922;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0510654;OID=.;OPOS=29628328;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:153:152:136:138:14:14:0.0921053:5:9:52:84:5:9:53:85 chr20 29628361 . A C 165.19 PASS AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.00646339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.693;QD=12.4669;RBI=0.0119393;REFB=-0.0294453;REVB=0.0100385;RO=33;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133961;STB=0.576935;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0451514;OID=.;OPOS=29628361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:13:7:8:25:13:7:8:25 chr20 29628415 . T A 51.66 PASS AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0218116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.791;QD=5.90414;RBI=0.0264754;REFB=0.001223;REVB=-0.0150067;RO=27;SAF=3;SAR=5;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129007;STB=0.583729;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.00392964;OID=.;OPOS=29628415;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:5:3:13:14:5:3:13:14 chr20 29628431 . C T 186.65 PASS AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00203167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.897;QD=27.6512;RBI=0.0198795;REFB=-0.0305679;REVB=-0.0197754;RO=9;SAF=9;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167227;STB=0.592493;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0158284;OID=.;OPOS=29628431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:27:9:9:18:18:0.666667:9:9:2:7:9:9:2:7 chr20 29628439 . A G 43.99 PASS AF=0.259259;AO=6;DP=26;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0240716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.236;QD=6.51669;RBI=0.02483;REFB=0.0155117;REVB=0.00608968;RO=20;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42192;STB=0.803909;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0316131;OID=.;OPOS=29628439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:26:27:20:20:6:7:0.259259:5:1:10:10:6:1:10:10 chr20 29630666 . T C 446.34 PASS AF=0.296117;AO=61;DP=206;FAO=61;FDP=206;FR=.;FRO=145;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=69;FSRR=76;FWDB=0.00739181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.4574;QD=8.66688;RBI=0.00773235;REFB=-0.0177715;REVB=0.00226942;RO=145;SAF=36;SAR=25;SRF=69;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138314;STB=0.580711;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.013245;OID=.;OPOS=29630666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:145:145:61:61:0.296117:25:36:69:76:25:36:69:76 chr20 29630674 . A T 531.51 PASS AF=0.323944;AO=69;DP=213;FAO=69;FDP=213;FR=.;FRO=144;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=72;FSRR=72;FWDB=0.00684138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.154;QD=9.98145;RBI=0.0168007;REFB=-0.00356174;REVB=-0.0153447;RO=144;SAF=38;SAR=31;SRF=72;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597073;STB=0.534397;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00495303;OID=.;OPOS=29630674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:144:144:69:69:0.323944:31:38:72:72:31:38:72:72 chr20 29630681 . G A 417.34 PASS AF=0.273148;AO=59;DP=228;FAO=59;FDP=216;FR=.;FRO=157;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=80;FSRR=77;FWDB=-0.00821805;FXX=0.0526293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.312;QD=7.72842;RBI=0.00897304;REFB=-0.003965;REVB=0.00360264;RO=151;SAF=33;SAR=26;SRF=78;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526407;STB=0.536361;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00701324;OID=.;OPOS=29630681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:216:151:157:59:59:0.273148:26:33:78:73:26:33:80:77 chr20 29630695 . C A 217.26 PASS AF=0.168627;AO=42;DP=253;FAO=43;FDP=255;FR=.;FRO=212;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=107;FSRR=105;FWDB=-0.00753941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.783;QD=3.40796;RBI=0.0193775;REFB=-0.00548045;REVB=-0.0178506;RO=209;SAF=24;SAR=18;SRF=107;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771064;STB=0.544536;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0281032;OID=.;OPOS=29630695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:255:209:212:42:43:0.168627:18:24:107:102:19:24:107:105 chr20 29630697 . A G 638.62 PASS AF=0.325397;AO=80;DP=253;FAO=82;FDP=252;FR=.;FRO=170;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=82;FSRR=88;FWDB=0.0173457;FXX=0.00395241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8393;QD=10.1368;RBI=0.0391898;REFB=-0.00505451;REVB=0.0351421;RO=172;SAF=47;SAR=33;SRF=81;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138296;STB=0.561465;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0100512;OID=.;OPOS=29630697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:252:172:170:80:82:0.325397:33:47:81:91:35:47:82:88 chr20 29630725 . T C 965.48 PASS AF=0.392857;AO=110;DP=280;FAO=110;FDP=280;FR=.;FRO=170;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=78;FSRR=92;FWDB=-0.0261654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.403;QD=13.7926;RBI=0.03278;REFB=-0.00713325;REVB=-0.0197459;RO=170;SAF=54;SAR=56;SRF=78;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347331;STB=0.519497;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0106687;OID=.;OPOS=29630725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:280:170:170:110:110:0.392857:56:54:78:92:56:54:78:92 chr20 29632635 . C G 54.3 PASS AF=0.115385;AO=11;DP=103;FAO=12;FDP=104;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.0129788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.038;QD=2.08851;RBI=0.0169014;REFB=-0.0013668;REVB=-0.0108262;RO=92;SAF=6;SAR=5;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144463;STB=0.567198;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00992086;OID=.;OPOS=29632635;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:103:104:92:92:11:12:0.115385:5:6:39:53:6:6:39:53 chr20 29632638 . C A 109.11 PASS AF=0.180952;AO=19;DP=105;FAO=19;FDP=105;FR=.;FRO=86;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.000470455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.266;QD=4.15648;RBI=0.0101044;REFB=-0.00325147;REVB=-0.0100935;RO=79;SAF=8;SAR=11;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120403;STB=0.507684;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0147764;OID=.;OPOS=29632638;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:79:86:19:19:0.180952:11:8:34:45:11:8:37:49 chr20 29632643 . T C 38.0 PASS AF=0.0917431;AO=10;DP=109;FAO=10;FDP=109;FR=.;FRO=99;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.0123969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2581;QD=1.39448;RBI=0.0134637;REFB=0.000213853;REVB=-0.0052523;RO=99;SAF=4;SAR=6;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287536;STB=0.522682;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=-0.00229439;OID=.;OPOS=29632643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:109:109:99:99:10:10:0.0917431:6:4:42:57:6:4:42:57 chr20 29632660 . G T 33.88 PASS AF=0.0769231;AO=11;DP=143;FAO=11;FDP=143;FR=.;FRO=132;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=59;FSRR=73;FWDB=-0.0171967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1301;QD=0.947665;RBI=0.0272478;REFB=-0.00569709;REVB=-0.0211357;RO=132;SAF=6;SAR=5;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109012;STB=0.590003;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0467569;OID=.;OPOS=29632660;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:143:143:132:132:11:11:0.0769231:5:6:59:73:5:6:59:73 chr20 29632662 . G C 393.65 PASS AF=0.356589;AO=46;DP=145;FAO=46;FDP=129;FR=.;FRO=83;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=-0.00648215;FXX=0.110337;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.4;QD=12.2061;RBI=0.0182065;REFB=-0.00814461;REVB=-0.0170135;RO=83;SAF=27;SAR=19;SRF=34;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197693;STB=0.612973;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0153801;OID=.;OPOS=29632662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:129:83:83:46:46:0.356589:19:27:34:49:19:27:34:49 chr20 29632674 . T TA 63.69 PASS AF=0.239726;AO=31;DP=150;FAO=35;FDP=146;FR=.;FRO=111;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=61;FWDB=-0.169524;FXX=0.00680226;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.2884;QD=1.74495;RBI=0.169789;REFB=-0.0435251;REVB=-0.0094777;RO=112;SAF=14;SAR=17;SRF=51;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478688;STB=0.562236;STBP=0.41;TYPE=ins;VARB=0.0407186;OID=.;OPOS=29632675;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.239726:31:150:35:146:111:13:22:50:61:63:112:14:17:51:61 chr20 29632680 . G A 31.84 PASS AF=0.0723684;AO=11;DP=151;FAO=11;FDP=152;FR=.;FRO=141;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=61;FSRR=80;FWDB=-0.0778888;FXX=0.0129862;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9053;QD=0.83784;RBI=0.108125;REFB=-0.00225778;REVB=-0.0749952;RO=140;SAF=4;SAR=7;SRF=60;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733995;STB=0.566502;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0236005;OID=.;OPOS=29632680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:151:152:140:141:11:11:0.0723684:7:4:60:80:7:4:61:80 chr20 29632707 . G A 182.87 PASS AF=0.2;AO=31;DP=155;FAO=31;FDP=155;FR=.;FRO=124;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=53;FSRR=71;FWDB=0.00603709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.839;QD=4.71911;RBI=0.0180161;REFB=-0.00642125;REVB=-0.0169745;RO=124;SAF=16;SAR=15;SRF=53;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113176;STB=0.570673;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0336192;OID=.;OPOS=29632707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:124:124:31:31:0.2:15:16:53:71:15:16:53:71 chr20 29632709 . C T 60.91 PASS AF=0.102564;AO=16;DP=156;FAO=16;FDP=156;FR=.;FRO=140;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=78;FWDB=-0.0295947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.456;QD=1.56176;RBI=0.0313624;REFB=-0.0112856;REVB=-0.0103805;RO=140;SAF=7;SAR=9;SRF=62;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00652675;STB=0.504872;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0344397;OID=.;OPOS=29632709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:156:156:140:140:16:16:0.102564:9:7:62:78:9:7:62:78 chr20 29632714 . CT AG 62.46 PASS AF=0.105263;AO=16;DP=152;FAO=16;FDP=152;FR=.;FRO=136;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=60;FSRR=76;FWDB=-0.00686765;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=295.686;QD=1.64374;RBI=0.0135442;REFB=-0.00294642;REVB=-0.011674;RO=135;SAF=7;SAR=9;SRF=59;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000568233;STB=0.503335;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.037183;OID=.;OPOS=29632714;OREF=CT;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:152:152:135:136:16:16:0.105263:9:7:59:76:9:7:60:76 chr20 29633861 . A T 56.11 PASS AF=0.0986842;AO=16;DP=152;FAO=15;FDP=152;FR=.,HEALED;FRO=137;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=73;FSRR=64;FWDB=0.00545113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.488;QD=1.47646;RBI=0.0491854;REFB=-0.00782728;REVB=-0.0488824;RO=114;SAF=6;SAR=10;SRF=73;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319938;STB=0.618642;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0566188;OID=.;OPOS=29633861;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:152:152:114:137:16:15:0.0986842:10:6:73:41:9:6:73:64 chr20 29633887 . G A 63.28 PASS AF=0.0978261;AO=18;DP=184;FAO=18;FDP=184;FR=.;FRO=166;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=81;FSRR=85;FWDB=-0.0288627;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.489;QD=1.3756;RBI=0.0470975;REFB=-0.00500948;REVB=-0.0372173;RO=159;SAF=6;SAR=12;SRF=76;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177364;STB=0.641906;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0276494;OID=.;OPOS=29633887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:184:184:159:166:18:18:0.0978261:12:6:76:83:12:6:81:85 chr20 29633900 . A G 217.3 PASS AF=0.201087;AO=35;DP=184;FAO=37;FDP=184;FR=.;FRO=147;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=56;FSRR=91;FWDB=0.0723101;FXX=0.00540511;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3635;QD=4.72389;RBI=0.0995394;REFB=0.00380104;REVB=0.0684057;RO=147;SAF=16;SAR=19;SRF=57;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909342;STB=0.563755;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-0.00823699;OID=.;OPOS=29633900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:147:147:35:37:0.201087:19:16:57:90:20:17:56:91 chr20 29633915 . C T 51.2 PASS AF=0.0874317;AO=16;DP=183;FAO=16;FDP=183;FR=.;FRO=167;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=69;FSRR=98;FWDB=-0.0345103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.358;QD=1.11918;RBI=0.0450795;REFB=-0.00417819;REVB=-0.0290034;RO=158;SAF=3;SAR=13;SRF=61;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26871;STB=0.737262;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0445798;OID=.;OPOS=29633915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:183:183:158:167:16:16:0.0874317:13:3:61:97:13:3:69:98 chr20 29633916 . G A 606.95 PASS AF=0.469697;AO=60;DP=182;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=0.00463076;FXX=0.278673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2654;QD=18.3924;RBI=0.0182533;REFB=-0.0127086;REVB=-0.0176561;RO=65;SAF=26;SAR=34;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920817;STB=0.54327;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0131117;OID=.;OPOS=29633916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:132:65:70:60:62:0.469697:34:26:22:43:34:28:26:44 chr20 29633929 . A G 398.18 PASS AF=0.30814;AO=53;DP=172;FAO=53;FDP=172;FR=.;FRO=119;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=73;FWDB=-0.0114864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.981;QD=9.26009;RBI=0.0142781;REFB=-0.0114384;REVB=0.00848089;RO=119;SAF=26;SAR=27;SRF=46;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124549;STB=0.572156;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0154034;OID=.;OPOS=29633929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:119:119:53:53:0.30814:27:26:46:73:27:26:46:73 chr20 29633938 . A G 423.81 PASS AF=0.323529;AO=55;DP=170;FAO=55;FDP=170;FR=.;FRO=115;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.0305355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7724;QD=9.97192;RBI=0.0314082;REFB=0.00842899;REVB=-0.00735224;RO=115;SAF=23;SAR=32;SRF=49;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00949245;STB=0.505483;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.0296666;OID=.;OPOS=29633938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:115:115:55:55:0.323529:32:23:49:66:32:23:49:66 chr20 29633952 . C T 321.26 PASS AF=0.288462;AO=45;DP=154;FAO=45;FDP=156;FR=.;FRO=111;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=66;FWDB=-0.00128048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.737;QD=8.2374;RBI=0.0092206;REFB=-0.00799196;REVB=0.00913125;RO=109;SAF=19;SAR=26;SRF=45;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116198;STB=0.512304;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0127648;OID=.;OPOS=29633952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:156:109:111:45:45:0.288462:26:19:45:64:26:19:45:66 chr20 29652138 . C G 117.17 PASS AF=0.119835;AO=29;DP=258;FAO=29;FDP=242;FR=.;FRO=213;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=92;FSRR=121;FWDB=0.0548076;FXX=0.0656345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0492;QD=1.93664;RBI=0.0551069;REFB=0.00561396;REVB=0.00573502;RO=212;SAF=16;SAR=13;SRF=91;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152551;STB=0.604214;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.0398705;OID=.;OPOS=29652138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:242:212:213:29:29:0.119835:13:16:91:121:13:16:92:121 chr20 29652147 . A G 84.16 PASS AF=0.100806;AO=25;DP=248;FAO=25;FDP=248;FR=.;FRO=223;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=85;FSRR=138;FWDB=-0.0108295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3419;QD=1.35737;RBI=0.0259881;REFB=-0.00265043;REVB=-0.0236243;RO=222;SAF=12;SAR=13;SRF=84;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126058;STB=0.589583;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0384928;OID=.;OPOS=29652147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:248:248:222:223:25:25:0.100806:13:12:84:138:13:12:85:138 chr20 29652164 . GC GT,TT 163.12 PASS AF=0.0813397,0.0909091;AO=18,18;DP=218;FAO=17,19;FDP=209;FR=.;FRO=173;FSAF=9,6;FSAR=8,13;FSRF=52;FSRR=121;FWDB=-0.013098,-0.00166001;FXX=0.0412825;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=70.0424,102.537;QD=3.122;RBI=0.101319,0.0370289;REFB=-0.013273,-0.00926072;REVB=-0.100468,-0.0369917;RO=168;SAF=9,5;SAR=9,13;SRF=50;SRR=118;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.252775,-0.02873;STB=0.703858,0.51603;STBP=0.105,0.906;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0897748,0.0327425;OID=.,.;OPOS=29652165,29652164;OREF=C,GC;OALT=T,TT;OMAPALT=GT,TT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:64:218:209:168:173:18,18:17,19:0.0813397,0.0909091:9,13:9,5:50:118:8,13:9,6:52:121 chr20 29652166 . G A 43.57 PASS AF=0.0747664;AO=13;DP=212;FAO=16;FDP=214;FR=.;FRO=198;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=62;FSRR=136;FWDB=-0.0174041;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.035;QD=0.814433;RBI=0.018649;REFB=-0.00119348;REVB=-0.00669954;RO=196;SAF=3;SAR=10;SRF=61;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102943;STB=0.562907;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0243287;OID=.;OPOS=29652166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:212:214:196:198:13:16:0.0747664:10:3:61:135:10:6:62:136 chr20 29652172 . TG CA,CG 2534.35 PASS AF=0.349282,0.555024;AO=73,116;DP=209;FAO=73,116;FDP=209;FR=.;FRO=20;FSAF=22,36;FSAR=51,80;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0204185,-0.01834;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=158.1,100.454;QD=48.5043;RBI=0.0285688,0.0233894;REFB=0.00973421,0.00442752;REVB=0.0199816,-0.0145157;RO=20;SAF=22,36;SAR=51,80;SRF=5;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0248175,0.0197161;STB=0.513252,0.510446;STBP=0.671,0.616;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00530418,0.00655131;OID=.,.;OPOS=29652172,29652172;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:209:209:20:20:73,116:73,116:0.349282,0.555024:51,80:22,36:5:15:51,80:22,36:5:15 chr20 29652182 . C T 58.8 PASS AF=0.0895522;AO=18;DP=201;FAO=18;FDP=201;FR=.;FRO=183;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=135;FWDB=-0.00345933;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2154;QD=1.17015;RBI=0.0260572;REFB=-0.000572698;REVB=0.0258266;RO=179;SAF=5;SAR=13;SRF=45;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402027;STB=0.517825;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00915961;OID=.;OPOS=29652182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:201:201:179:183:18:18:0.0895522:13:5:45:134:13:5:48:135 chr20 29652183 . G A 188.24 PASS AF=0.172414;AO=35;DP=199;FAO=35;FDP=203;FR=.;FRO=168;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=47;FSRR=121;FWDB=-0.0549072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.106;QD=3.70923;RBI=0.0563327;REFB=-0.011486;REVB=0.0125928;RO=163;SAF=8;SAR=27;SRF=42;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507965;STB=0.556354;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0403105;OID=.;OPOS=29652183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:203:163:168:35:35:0.172414:27:8:42:121:27:8:47:121 chr20 29652190 . T G 47.37 PASS AF=0.080402;AO=16;DP=198;FAO=16;FDP=199;FR=.;FRO=183;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=52;FSRR=131;FWDB=-0.0313136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.795;QD=0.952214;RBI=0.0352454;REFB=-0.00182597;REVB=0.0161771;RO=181;SAF=2;SAR=14;SRF=51;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254019;STB=0.722419;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0239676;OID=.;OPOS=29652190;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:198:199:181:183:16:16:0.080402:14:2:51:130:14:2:52:131 chr20 29652191 . C T 2014.77 PASS AF=0.784615;AO=152;DP=194;FAO=153;FDP=195;FR=.;FRO=42;FSAF=41;FSAR=112;FSRF=9;FSRR=33;FWDB=0.0372245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7557;QD=41.3285;RBI=0.0418316;REFB=-0.0299115;REVB=-0.0190845;RO=42;SAF=41;SAR=111;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290895;STB=0.51494;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00798358;OID=.;OPOS=29652191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:42:42:152:153:0.784615:111:41:9:33:112:41:9:33 chr20 29652194 . C T 248.23 PASS AF=0.20398;AO=41;DP=201;FAO=41;FDP=201;FR=.;FRO=160;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=126;FWDB=0.0293758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.981;QD=4.93986;RBI=0.0314372;REFB=-0.00475692;REVB=0.0111963;RO=160;SAF=16;SAR=25;SRF=34;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264166;STB=0.658964;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0301418;OID=.;OPOS=29652194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:160:160:41:41:0.20398:25:16:34:126:25:16:34:126 chr20 29652196 . T C 288.97 PASS AF=0.223881;AO=45;DP=198;FAO=45;FDP=201;FR=.;FRO=156;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=40;FSRR=116;FWDB=-0.0328775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2928;QD=5.75059;RBI=0.0348227;REFB=-0.0159727;REVB=0.0114756;RO=153;SAF=10;SAR=35;SRF=37;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349841;STB=0.536793;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0421787;OID=.;OPOS=29652196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:201:153:156:45:45:0.223881:35:10:37:116:35:10:40:116 chr20 29652205 . A G 50.15 PASS AF=0.0855615;AO=16;DP=187;FAO=16;FDP=187;FR=.;FRO=171;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=130;FWDB=0.00802483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.03;QD=1.07281;RBI=0.00881973;REFB=-0.00213065;REVB=-0.00365921;RO=171;SAF=6;SAR=10;SRF=41;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18822;STB=0.64107;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0352404;OID=.;OPOS=29652205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:187:187:171:171:16:16:0.0855615:10:6:41:130:10:6:41:130 chr20 29652235 . CG CC,GC 1578.59 PASS AF=0.751825,0.109489;AO=100,15;DP=147;FAO=103,15;FDP=137;FR=.;FRO=19;FSAF=19,4;FSAR=84,11;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.00336033,0.0062399;FXX=0.0866609;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=90.0534,171.134;QD=46.0902;RBI=0.00352468,0.0116151;REFB=-0.0142535,-0.00963192;REVB=-0.00106374,0.00979662;RO=17;SAF=16,4;SAR=84,11;SRF=2;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0219325,0.198115;STB=0.506936,0.583683;STBP=0.797,0.523;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00253663,0.0217323;OID=.,.;OPOS=29652236,29652235;OREF=G,CG;OALT=C,GC;OMAPALT=CC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:147:137:17:19:100,15:103,15:0.751825,0.109489:84,11:16,4:2:15:84,11:19,4:3:16 chr20 29652254 . G A 188.92 PASS AF=0.243697;AO=29;DP=119;FAO=29;FDP=119;FR=.;FRO=90;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=65;FWDB=-0.00190219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.939;QD=6.35038;RBI=0.00746224;REFB=-0.00258474;REVB=0.00721572;RO=90;SAF=5;SAR=24;SRF=25;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190409;STB=0.617935;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0076765;OID=.;OPOS=29652254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:90:90:29:29:0.243697:24:5:25:65:24:5:25:65 chr20 29652260 . C T 30.78 PASS AF=0.079646;AO=9;DP=113;FAO=9;FDP=113;FR=.;FRO=104;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=76;FWDB=-0.0105076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6378;QD=1.08946;RBI=0.0132587;REFB=-0.0033577;REVB=-0.00808605;RO=103;SAF=2;SAR=7;SRF=28;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726283;STB=0.558374;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0484112;OID=.;OPOS=29652260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:113:113:103:104:9:9:0.079646:7:2:28:75:7:2:28:76 chr20 29965014 . T C 571.91 PASS AF=0.548077;AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0293868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5805;QD=21.9963;RBI=0.0337518;REFB=-0.0228181;REVB=0.0166014;RO=47;SAF=26;SAR=31;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275023;STB=0.515085;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0191388;OID=.;OPOS=29965014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:47:47:57:57:0.548077:31:26:23:24:31:26:23:24 chr20 29978216 . T C 273.94 PASS AF=0.424658;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0111734;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.212;QD=15.0102;RBI=0.0126154;REFB=-0.0162482;REVB=0.00585703;RO=42;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130518;STB=0.573911;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0262561;OID=.;OPOS=29978216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:42:42:31:31:0.424658:13:18:19:23:13:18:19:23 chr20 30070239 . C A 364.31 PASS AF=0.536232;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0563157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.149;QD=21.1195;RBI=0.0592042;REFB=-0.0101578;REVB=0.018267;RO=31;SAF=14;SAR=23;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143127;STB=0.586874;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00969617;OID=.;OPOS=30070239;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:31:32:37:37:0.536232:23:14:17:14:23:14:18:14 chr20 30193543 . CCG C,CCC,CGG 49.45 PASS AF=0.257143,0,0;AO=6,4,4;DP=47;FAO=9,0,0;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=1,0,0;FSAR=8,0,0;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.121576,-0.111428,0.101306;FXX=0.0540395;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=29.4111,23.5555,22.4695;QD=5.65181;RBI=0.127092,0.115064,0.104564;REFB=-0.0243235,0.0185221,-0.0212383;REVB=-0.0370381,-0.0286975,0.0258956;RO=31;SAF=0,0,4;SAR=6,4,0;SRF=10;SRR=21;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.62472,-0.540895,0.677819;STB=0.734054,0.5,0.5;STBP=0.196,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0817455,0,0;OID=.,.,.;OPOS=30193544,30193545,30193544;OREF=CG,G,C;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CCC,CGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.257143,0,0:6,4,4:47:9,0,0:35:26:1,0,0:8,0,0:8:18:50:31:0,0,4:6,4,0:10:21 chr20 30452782 . C T 430.41 PASS AF=0.531646;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.004035;FXX=0.048187;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.34;QD=21.793;RBI=0.0239326;REFB=-0.0102684;REVB=0.02359;RO=35;SAF=19;SAR=23;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679182;STB=0.548167;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00824458;OID=.;OPOS=30452782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:79:35:37:42:42:0.531646:23:19:13:22:23:19:13:24 chr20 30467684 . T G 240.93 PASS AF=0.621622;AO=21;DP=34;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0440765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4819;QD=26.0467;RBI=0.0441296;REFB=-0.0434416;REVB=-0.00216412;RO=13;SAF=9;SAR=12;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180237;STB=0.595661;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0244776;OID=.;OPOS=30467684;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:37:13:14:21:23:0.621622:12:9:9:4:14:9:9:5 chr20 30513735 . C T 182.74 PASS AF=0.365079;AO=22;DP=62;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0191597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.326;QD=11.6027;RBI=0.112621;REFB=-0.0135187;REVB=0.110979;RO=40;SAF=7;SAR=15;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360589;STB=0.715264;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0332135;OID=.;OPOS=30513735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:40:40:22:23:0.365079:15:7:26:14:16:7:26:14 chr20 30746248 . T C 1497.89 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487909;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.639;QD=63.7401;RBI=0.0791568;REFB=0;REVB=0.0623317;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811193;OID=.;OPOS=30746248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:45:49:0:0:45:49:0:0 chr20 30777800 . T C 650.84 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.023;QD=61.985;RBI=0.0213864;REFB=0;REVB=0.0130202;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96344e-05;OID=.;OPOS=30777800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0 chr20 30777860 . A G 286.96 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0901514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.245;QD=52.1749;RBI=0.0957348;REFB=0;REVB=-0.0322162;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000683387;OID=.;OPOS=30777860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:13:7:0:0:13:9:0:0 chr20 30795819 . T C 711.29 PASS AF=1;AO=45;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525788;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.35;QD=54.7142;RBI=0.075119;REFB=0;REVB=0.0536501;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333956;OID=.;OPOS=30795819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:52:0:0:45:52:1:9:36:0:0:10:42:0:0 chr20 30922398 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.023;QD=60.9781;RBI=0.0247749;REFB=0;REVB=-0.00695084;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45773e-05;OID=.;OPOS=30922398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:27:12:0:0:27:12:0:0 chr20 31022959 . T C 882.76 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.719;QD=57.8857;RBI=0.0255638;REFB=0;REVB=0.024222;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92155e-05;OID=.;OPOS=31022959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:23:37:0:0:24:37:0:0 chr20 31024274 . T C 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.998;QD=63.5825;RBI=0.0331425;REFB=0;REVB=0.0226836;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.98745e-06;OID=.;OPOS=31024274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr20 31025163 . A G 487.83 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522463;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.853;QD=59.1305;RBI=0.0541623;REFB=0;REVB=0.0142785;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330473;OID=.;OPOS=31025163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0 chr20 31025535 . A G 1333.29 PASS AF=1;AO=72;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102309;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.894;QD=62.0137;RBI=0.0170684;REFB=0;REVB=0.0136623;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94647e-05;OID=.;OPOS=31025535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:86:0:0:72:86:1:28:44:0:0:36:50:0:0 chr20 31025536 . C G 37.29 PASS AF=0.101124;AO=9;DP=89;FAO=9;FDP=89;FR=.;FRO=80;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=29;FWDB=-0.000253087;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=78.0725;QD=1.67581;RBI=0.0233002;REFB=-0.0101358;REVB=0.0232988;RO=80;SAF=2;SAR=7;SRF=51;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459166;STB=0.836819;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0289854;OID=.;OPOS=31025536;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:89:89:80:80:9:9:0.101124:7:2:51:29:7:2:51:29 chr20 31196471 . A G 62.09 PASS AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0134767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.672;QD=7.52624;RBI=0.0163796;REFB=0.00107777;REVB=0.00930965;RO=24;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305426;STB=0.694188;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.00248365;OID=.;OPOS=31196471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:7:2:11:13:7:2:11:13 chr20 31292312 . A G 40.13 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00596951;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=115.009;QD=7.64423;RBI=0.00613845;REFB=-0.00609833;REVB=0.00143023;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.595941;STB=0.867405;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0259466;OID=.;OPOS=31292312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:21:21:14:14:7:7:0.333333:1:6:4:10:1:6:4:10 chr20 31386347 . T C 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0426623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.167;QD=57.2025;RBI=0.0438207;REFB=0;REVB=-0.0100092;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000390385;OID=.;OPOS=31386347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0 chr20 31388636 . T C 596.74 PASS AF=0.953488;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0540435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.2;QD=55.5104;RBI=0.0595661;REFB=-0.123903;REVB=0.0250485;RO=2;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425907;STB=0.522716;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00183021;OID=.;OPOS=31388636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:43:2:2:40:41:0.953488:21:19:0:2:21:20:0:2 chr20 31427635 . C T 250.68 PASS AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0157199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.151;QD=14.5321;RBI=0.0234673;REFB=-0.00933407;REVB=0.017424;RO=39;SAF=13;SAR=16;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119581;STB=0.558243;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0158134;OID=.;OPOS=31427635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:40:29:29:0.42029:16:13:13:26:16:13:14:26 chr20 31436747 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.573;QD=56.7064;RBI=0.0311823;REFB=0;REVB=-0.0292381;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.48694e-05;OID=.;OPOS=31436747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0 chr20 31494382 . G A 416.14 PASS AF=0.532468;AO=40;DP=76;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0187399;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8304;QD=21.6179;RBI=0.0220593;REFB=-0.00148013;REVB=0.0116374;RO=34;SAF=19;SAR=21;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529394;STB=0.533317;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00149;OID=.;OPOS=31494382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:34:36:40:41:0.532468:21:19:14:20:21:20:15:21 chr20 31518340 . A G 372.26 PASS AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.042463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1523;QD=15.1943;RBI=0.0483549;REFB=-0.0245167;REVB=-0.0231322;RO=56;SAF=17;SAR=23;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222253;STB=0.614359;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0270743;OID=.;OPOS=31518340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:56:58:40:40:0.408163:23:17:36:20:23:17:36:22 chr20 31584178 . G A 964.39 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306481;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.429;QD=58.4478;RBI=0.0344967;REFB=-0.176514;REVB=0.015834;RO=0;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386545;OID=.;OPOS=31584178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:66:66:0:0:66:66:1:29:37:0:0:29:37:0:0 chr20 31587752 . G C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000251622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.557;QD=54.5177;RBI=0.0154105;REFB=0;REVB=0.0154085;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103408;OID=.;OPOS=31587752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0 chr20 31587793 . A G 689.5 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6122;QD=62.6817;RBI=0.0592861;REFB=0;REVB=0.0524558;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650496;OID=.;OPOS=31587793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:15:28:0:0:16:28:0:0 chr20 31622083 . G A 317.86 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0145796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4936;QD=15.5055;RBI=0.0148763;REFB=-0.0153714;REVB=-0.00295627;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00751125;STB=0.510113;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0197527;OID=.;OPOS=31622083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:47:35:35:0.426829:18:17:22:24:18:17:22:25 chr20 31627291 . A G 310.35 PASS AF=0.584906;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0249393;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.014;QD=23.4223;RBI=0.0261466;REFB=-0.00551353;REVB=0.00785329;RO=23;SAF=11;SAR=20;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199696;STB=0.600685;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00372858;OID=.;OPOS=31627291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:23:22:31:31:0.584906:20:11:14:9:20:11:13:9 chr20 31652292 . G A 481.07 PASS AF=0.541176;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0496736;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8398;QD=22.6387;RBI=0.0599548;REFB=-0.0354225;REVB=0.0335725;RO=39;SAF=20;SAR=26;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000944594;STB=0.50052;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0310221;OID=.;OPOS=31652292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:39:39:46:46:0.541176:26:20:17:22:26:20:17:22 chr20 31656632 . C G 639.74 PASS AF=0.432927;AO=70;DP=164;FAO=71;FDP=164;FR=.;FRO=93;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=57;FSRR=36;FWDB=-0.0184906;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.247;QD=15.6035;RBI=0.031231;REFB=-0.00479969;REVB=0.0251689;RO=92;SAF=31;SAR=39;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178266;STB=0.599019;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00512604;OID=.;OPOS=31656632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:92:93:70:71:0.432927:39:31:57:35:40:31:57:36 chr20 31671209 . G C 444.21 PASS AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00708735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.257;QD=23.0756;RBI=0.012017;REFB=0.00134604;REVB=0.00970449;RO=34;SAF=21;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037951;STB=0.520861;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.000667886;OID=.;OPOS=31671209;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:34:43:43:0.558442:22:21:15:19:22:21:15:19 chr20 31671599 . A G 43.48 PASS AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0507341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.547;QD=5.79783;RBI=0.0513479;REFB=-0.0104905;REVB=-0.00791575;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116335;STB=0.529329;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0261597;OID=.;OPOS=31671599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:30:30:21:23:7:7:0.233333:3:4:14:7:3:4:14:9 chr20 31671663 . T C 60.97 PASS AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0305645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1692;QD=6.59143;RBI=0.0309657;REFB=-0.00129644;REVB=0.00496828;RO=28;SAF=2;SAR=7;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419739;STB=0.767688;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00350398;OID=.;OPOS=31671663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:37:37:28:28:9:9:0.243243:7:2:16:12:7:2:16:12 chr20 31673846 . A G 268.77 PASS AF=0.333333;AO=33;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.000946946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.837;QD=10.5398;RBI=0.0303481;REFB=-0.016075;REVB=-0.0303333;RO=68;SAF=16;SAR=17;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000516136;STB=0.509821;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0383969;OID=.;OPOS=31673846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:68:68:33:34:0.333333:17:16:33:35:18:16:33:35 chr20 31676804 . A C 263.72 PASS AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0353292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5832;QD=13.0233;RBI=0.03602;REFB=-0.0293419;REVB=0.00702051;RO=49;SAF=25;SAR=6;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266299;STB=0.663148;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0687199;OID=.;OPOS=31676804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:50:31:31:0.382716:6:25:30:19:6:25:30:20 chr20 31678534 . T C 476.25 PASS AF=0.528736;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0138397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.38;QD=21.8964;RBI=0.0245307;REFB=-0.00391603;REVB=0.0202539;RO=41;SAF=20;SAR=26;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457478;STB=0.525241;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00277411;OID=.;OPOS=31678534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:41:46:46:0.528736:26:20:20:21:26:20:20:21 chr20 31688241 . T C 245.96 PASS AF=0.340909;AO=30;DP=87;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0150207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.127;QD=11.1799;RBI=0.0153245;REFB=-0.000549129;REVB=0.00303599;RO=57;SAF=14;SAR=16;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476439;STB=0.521988;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00107385;OID=.;OPOS=31688241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:57:58:30:30:0.340909:16:14:29:28:16:14:29:29 chr20 31688260 . C T 197.72 PASS AF=0.298851;AO=26;DP=87;FAO=26;FDP=87;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.00211895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5956;QD=9.09046;RBI=0.0123441;REFB=-0.00936518;REVB=-0.0121609;RO=61;SAF=13;SAR=13;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291481;STB=0.517228;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0120567;OID=.;OPOS=31688260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:61:61:26:26:0.298851:13:13:29:32:13:13:29:32 chr20 31757102 . C G 266.56 PASS AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00144478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.568;QD=15.9138;RBI=0.00692761;REFB=-0.0194394;REVB=-0.00677528;RO=37;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119295;STB=0.56712;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0234683;OID=.;OPOS=31757102;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:15:15:23:14:15:15:23:14 chr20 31761885 . G A 457.17 PASS AF=0.432203;AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0247558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.188;QD=15.4971;RBI=0.0335852;REFB=-0.00991493;REVB=-0.0226962;RO=67;SAF=26;SAR=25;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430548;STB=0.524117;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0132266;OID=.;OPOS=31761885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:67:67:51:51:0.432203:25:26:37:30:25:26:37:30 chr20 31767470 . G C 255.64 PASS AF=0.491228;AO=27;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0110186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9124;QD=17.9395;RBI=0.018153;REFB=-0.035445;REVB=0.0144264;RO=29;SAF=16;SAR=11;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225789;STB=0.631877;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0586394;OID=.;OPOS=31767470;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:29:29:27:28:0.491228:11:16:10:19:11:17:10:19 chr20 31812206 . A G 568.09 PASS AF=0.565217;AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0181116;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.036;QD=24.6997;RBI=0.0188208;REFB=-0.0110708;REVB=0.00511797;RO=40;SAF=29;SAR=23;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341837;STB=0.518716;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00797845;OID=.;OPOS=31812206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:40:40:52:52:0.565217:23:29:24:16:23:29:24:16 chr20 31812923 . G A 1575.22 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329116;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.328;QD=60.0082;RBI=0.0409282;REFB=0;REVB=0.02433;RO=0;SAF=59;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.81857e-05;OID=.;OPOS=31812923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:46:59:0:0:46:59:0:0 chr20 31814277 . C T 287.59 PASS AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00583118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.138;QD=15.9775;RBI=0.00726345;REFB=0.00390067;REVB=-0.00433072;RO=40;SAF=12;SAR=20;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260674;STB=0.514697;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.00369609;OID=.;OPOS=31814277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:20:12:16:24:20:12:16:24 chr20 31830955 . T C 421.29 PASS AF=0.569444;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0624275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3839;QD=23.4048;RBI=0.0641901;REFB=-0.0413646;REVB=0.014939;RO=31;SAF=15;SAR=26;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122044;STB=0.567173;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.030372;OID=.;OPOS=31830955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:31:31:41:41:0.569444:26:15:16:15:26:15:16:15 chr20 31876681 . A G 306.57 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0365766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.173;QD=27.2507;RBI=0.0387104;REFB=-0.0236949;REVB=-0.0126747;RO=18;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936646;STB=0.551686;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.013905;OID=.;OPOS=31876681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:14:13:11:7:14:13:11:7 chr20 31897554 . G C 340.71 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00302872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.102;QD=54.514;RBI=0.0121302;REFB=0;REVB=-0.011746;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.29134e-05;OID=.;OPOS=31897554;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chr20 32212690 . C T 1342.18 PASS AF=0.906542;AO=95;DP=107;FAO=97;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0114363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.992;QD=50.175;RBI=0.011467;REFB=-0.0136847;REVB=-0.000838971;RO=4;SAF=47;SAR=48;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195332;STB=0.513716;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000625536;OID=.;OPOS=32212690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:107:107:4:9:95:97:0.906542:48:47:3:1:48:49:6:3 chr20 32248163 . C T 1044.1 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.708;QD=59.6627;RBI=0.0465785;REFB=0;REVB=0.0223659;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128689;OID=.;OPOS=32248163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:44:26:0:0:44:26:0:0 chr20 32256195 . AC A,GA 209.08 PASS AF=0.651163,0;AO=24,3;DP=44;FAO=28,0;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=19,0;FSAR=9,0;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0477321,-0.036956;FXX=0.0227221;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=13.5159,14.9337;QD=19.4493;RBI=0.0599714,0.0369582;REFB=-0.168333,-0.0808646;REVB=0.0363073,-0.000407877;RO=15;SAF=16,3;SAR=8,0;SRF=10;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.392857,0;SSSB=0,0.569668;STB=0.50474,0.5;STBP=0.968,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.128062,0;OID=.,.;OPOS=32256196,32256195;OREF=C,AC;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:44:43:15:15:24,3:28,0:0.651163,0:8,0:16,3:10:5:9,0:19,0:10:5 chr20 32295541 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.579;QD=47.8223;RBI=0.0352988;REFB=0;REVB=0.0335379;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194091;OID=.;OPOS=32295541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr20 32379263 . T C 393.32 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.27;QD=56.1892;RBI=0.0615624;REFB=0;REVB=0.0576939;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271524;OID=.;OPOS=32379263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr20 32664864 . C CCAG 217.98 PASS AF=1;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0851465;FXX=0.333194;HRUN=2;LEN=3;MLLD=157.372;QD=54.4943;RBI=0.0862736;REFB=0;REVB=0.0138998;RO=16;SAF=1;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.62412;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000838359;OID=.;OPOS=32664865;OREF=-;OALT=CAG;OMAPALT=CCAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:15:33:16:16:0:1:15:0:0:3:16:1:14:9:7 chr20 32664866 . G A 109.29 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=0.0422788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.763;QD=14.1017;RBI=0.044785;REFB=0.00238458;REVB=-0.0147714;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423808;STB=0.711081;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00231011;OID=.;OPOS=32664866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:7:6:1:16:7:6:2:16 chr20 32664926 . G A 154.96 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0222811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.848;QD=22.9575;RBI=0.122062;REFB=-0.000280971;REVB=0.120011;RO=11;SAF=12;SAR=4;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286381;STB=0.656989;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00181312;OID=.;OPOS=32664926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:4:12:11:0:4:12:11:0 chr20 32665009 . C T 441.7 PASS AF=0.591549;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0374566;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.862;QD=24.8846;RBI=0.0451143;REFB=-0.0441395;REVB=-0.0251456;RO=29;SAF=26;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287785;STB=0.515752;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0329815;OID=.;OPOS=32665009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:29:29:42:42:0.591549:16:26:19:10:16:26:19:10 chr20 32971986 . G C 40.27 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.042601;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.655;QD=8.94832;RBI=0.087519;REFB=-0.0480171;REVB=0.0764509;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883056;STB=0.555373;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0155754;OID=.;OPOS=32971986;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:7:5:3:3:7:5 chr20 32972053 . TGCA T 67.43 PASS AF=0.45;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0106045;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=338.645;QD=13.4862;RBI=0.0206996;REFB=-0.00684212;REVB=-0.0177769;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040409;STB=0.545355;STBP=0.716;TYPE=del;VARB=0.00863682;OID=.;OPOS=32972054;OREF=GCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.45:9:19:9:20:11:5:4:7:4:67:10:5:4:6:4 chr20 33097718 . A AT 58.66 PASS AF=0.415094;AO=19;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.107606;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.75378;QD=4.42746;RBI=0.138462;REFB=-0.0287667;REVB=-0.0871363;RO=28;SAF=14;SAR=5;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294733;STB=0.502956;STBP=0.98;TYPE=ins;VARB=0.0121921;OID=.;OPOS=33097719;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.415094:19:53:22:53:31:15:7:21:10:58:28:14:5:20:8 chr20 33104592 . G C 238.85 PASS AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0313972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7946;QD=13.6483;RBI=0.0896409;REFB=0.000766207;REVB=0.0839625;RO=41;SAF=18;SAR=10;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637336;STB=0.545421;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00162613;OID=.;OPOS=33104592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:42:28:28:0.4:10:18:24:17:10:18:24:18 chr20 33324481 . A G 302.25 PASS AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.000163553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.525;QD=19.4997;RBI=0.00763922;REFB=-0.00875083;REVB=0.00763747;RO=30;SAF=16;SAR=16;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870193;STB=0.548357;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00754957;OID=.;OPOS=33324481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:16:16:18:12:16:16:18:12 chr20 33337751 . T C 391.72 PASS AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0223921;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.938;QD=19.3443;RBI=0.0240421;REFB=-0.00958094;REVB=0.008753;RO=40;SAF=21;SAR=19;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225267;STB=0.50649;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0061873;OID=.;OPOS=33337751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:41:40:40:0.493827:19:21:20:20:19:21:21:20 chr20 33439103 . C T 299.21 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0860113;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.2591;QD=23.4674;RBI=0.086031;REFB=0.0232631;REVB=0.00184108;RO=21;SAF=10;SAR=20;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185651;STB=0.602669;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.0267701;OID=.;OPOS=33439103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:20:10:12:9:20:10:12:9 chr20 33451148 . G A 691.41 PASS AF=0.515152;AO=67;DP=132;FAO=68;FDP=132;FR=.;FRO=64;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.00638346;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9495;QD=20.9518;RBI=0.0685297;REFB=-0.00208488;REVB=0.0682318;RO=62;SAF=36;SAR=31;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812652;STB=0.539789;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00291347;OID=.;OPOS=33451148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:62:64:67:68:0.515152:31:36:39:23:31:37:40:24 chr20 33462951 . G T 102.62 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00308518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7497;QD=9.32921;RBI=0.0401163;REFB=-0.00514585;REVB=-0.0399975;RO=31;SAF=3;SAR=10;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215577;STB=0.63269;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0248537;OID=.;OPOS=33462951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:10:3:12:19:10:3:12:19 chr20 33470694 . C T 451.48 PASS AF=0.48913;AO=44;DP=91;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.00166498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.304;QD=19.6296;RBI=0.00361465;REFB=-0.00258887;REVB=0.00320835;RO=47;SAF=17;SAR=27;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287682;STB=0.662182;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00131472;OID=.;OPOS=33470694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:47:47:44:45:0.48913:27:17:33:14:28:17:33:14 chr20 33572941 . A G 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.017045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.274;QD=16.6272;RBI=0.123249;REFB=-0.00454071;REVB=-0.122064;RO=13;SAF=10;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237804;STB=0.661981;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00253677;OID=.;OPOS=33572941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:14:13:13:0.481481:3:10:7:6:3:10:7:7 chr20 33578899 . T C 494.04 PASS AF=0.494845;AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0224055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.946;QD=20.3727;RBI=0.0224145;REFB=-0.00451077;REVB=0.000635112;RO=48;SAF=20;SAR=27;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00827278;STB=0.515105;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0039875;OID=.;OPOS=33578899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:48:49:47:48:0.494845:27:20:20:28:27:21:20:29 chr20 33581955 . G A 513.64 PASS AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.983;QD=24.4592;RBI=0.0406373;REFB=-0.010169;REVB=0.0377277;RO=36;SAF=21;SAR=27;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016587;STB=0.509087;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00684083;OID=.;OPOS=33581955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:27:21:15:21:27:21:15:21 chr20 33583331 . A G 262.96 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.013271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2802;QD=47.8101;RBI=0.0185179;REFB=0.0707684;REVB=0.0129148;RO=1;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369221;STB=0.519981;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.0366274;OID=.;OPOS=33583331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:12:9:0:1:12:9:0:1 chr20 33584289 . C T 159.83 PASS AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00881665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.518;QD=26.6377;RBI=0.00928611;REFB=-0.0474659;REVB=-0.00291522;RO=8;SAF=13;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3259;STB=0.683952;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0180142;OID=.;OPOS=33584289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:3:13:3:5:3:13:3:5 chr20 33591006 . G A 447.6 PASS AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0338736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0394;QD=21.0637;RBI=0.0538193;REFB=-0.00978141;REVB=0.0418222;RO=41;SAF=19;SAR=25;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195858;STB=0.608096;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0130366;OID=.;OPOS=33591006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:25:19:27:14:25:19:27:14 chr20 33657126 . G A 280.25 PASS AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0406739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0977;QD=16.7311;RBI=0.0410471;REFB=-0.0215834;REVB=0.00552297;RO=36;SAF=13;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104336;STB=0.558643;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0311627;OID=.;OPOS=33657126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:18:13:19:17:18:13:19:17 chr20 33867754 . G C 203.61 PASS AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0104964;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.488;QD=30.1645;RBI=0.0128014;REFB=-0.0326525;REVB=0.00732807;RO=8;SAF=15;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39593;STB=0.720273;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0107206;OID=.;OPOS=33867754;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:8:8:19:19:0.703704:4:15:1:7:4:15:1:7 chr20 33874797 . G C 37.18 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0122336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.53;QD=8.7481;RBI=0.0223489;REFB=-0.00733934;REVB=-0.0187033;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27543;STB=0.646611;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0253389;OID=.;OPOS=33874797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:9:11:6:6:0.352941:3:3:7:2:3:3:8:3 chr20 33969530 . C T 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0261674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.877;QD=18.4439;RBI=0.0264421;REFB=-0.00241205;REVB=0.00380134;RO=9;SAF=9;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428568;STB=0.749499;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0040041;OID=.;OPOS=33969530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:2:9:3:6:2:9:3:6 chr20 33971914 . C T 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0091177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7273;QD=20.5628;RBI=0.00914203;REFB=0.0318152;REVB=0.000666446;RO=25;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158607;STB=0.588026;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.0223238;OID=.;OPOS=33971914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:16:13:16:9:16:13:16:9 chr20 33974163 . T A 61.38 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00961267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.51;QD=18.8865;RBI=0.00972842;REFB=-0.0370486;REVB=-0.00149627;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.57124;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0176364;OID=.;OPOS=33974163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:4:5:8:8:0.615385:6:2:1:3:6:2:2:3 chr20 34062642 . C T 236.14 PASS AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00671859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.784;QD=19.2768;RBI=0.0684982;REFB=-0.00275973;REVB=-0.0681679;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839702;STB=0.558932;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00286616;OID=.;OPOS=34062642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:9:14:13:12:9:14:13:13 chr20 34090519 . G A 252.78 PASS AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.0328342;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.633;QD=21.0651;RBI=0.0407132;REFB=-0.0118499;REVB=-0.0240723;RO=24;SAF=11;SAR=13;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27122;STB=0.650426;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0123788;OID=.;OPOS=34090519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:13:11:4:20:13:11:4:20 chr20 34116282 . T C 164.82 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00999508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.418;QD=21.2675;RBI=0.0548416;REFB=-0.00142702;REVB=-0.053923;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036754;STB=0.502072;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297721;OID=.;OPOS=34116282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:6:11:9:5:6:11:9:5 chr20 34131396 . C T 318.44 PASS AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.00814128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.178;QD=18.1964;RBI=0.00974325;REFB=-0.00766892;REVB=-0.00535261;RO=36;SAF=9;SAR=25;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077546;STB=0.543452;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00736803;OID=.;OPOS=34131396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:25:9:12:24:25:9:12:24 chr20 34144107 . T C 563.96 PASS AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.05518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.906;QD=57.8416;RBI=0.0556387;REFB=-0.162722;REVB=0.00712916;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51612;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000749904;OID=.;OPOS=34144107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:39:0:1:38:38:0.974359:15:23:0:0:15:23:0:1 chr20 34147998 . A G 600.81 PASS AF=0.488189;AO=60;DP=125;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0234282;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.931;QD=18.923;RBI=0.0264681;REFB=-0.02493;REVB=-0.0123158;RO=64;SAF=20;SAR=40;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233985;STB=0.630953;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0178308;OID=.;OPOS=34147998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:64:65:60:62:0.488189:40:20:37:27:42:20:37:28 chr20 34152782 . C T 276.12 PASS AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00719304;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.777;QD=25.6856;RBI=0.0268171;REFB=-0.0326975;REVB=-0.0258344;RO=18;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771509;STB=0.542822;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0143502;OID=.;OPOS=34152782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:15:10:9:9:15:10:9:9 chr20 34164422 . T C 905.91 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0179168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4189;QD=56.6194;RBI=0.0179378;REFB=-0.0804534;REVB=-0.00086802;RO=1;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145288;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00337098;OID=.;OPOS=34164422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:32:31:0:1:32:31:0:1 chr20 34170035 . C G 476.75 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109386;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.312;QD=56.088;RBI=0.0297243;REFB=-0.153217;REVB=0.0276384;RO=1;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252499;STB=0.513505;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0014749;OID=.;OPOS=34170035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:35:34:1:1:33:33:0.970588:18:15:0:1:18:15:0:1 chr20 34170316 . C A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.007;QD=53.911;RBI=0.0618276;REFB=0;REVB=0.0605076;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158463;OID=.;OPOS=34170316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0 chr20 34173046 . C T 255.17 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0152081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.301;QD=22.1888;RBI=0.01706;REFB=-0.03744;REVB=0.00773034;RO=21;SAF=13;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250791;STB=0.52379;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0286422;OID=.;OPOS=34173046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:21:22:24:24:0.521739:11:13:12:9:11:13:13:9 chr20 34173178 . A G 98.64 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0248844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.15;QD=14.091;RBI=0.0563091;REFB=-0.0235181;REVB=-0.0505122;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610571;STB=0.535655;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0238747;OID=.;OPOS=34173178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:6:6:7:9:6:6:7:9 chr20 34179907 . C T 1381.13 PASS AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0155642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7207;QD=61.3836;RBI=0.0180782;REFB=0.0459348;REVB=0.00919674;RO=1;SAF=43;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108942;STB=0.505746;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00223847;OID=.;OPOS=34179907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:46:43:1:0:46:43:1:0 chr20 34183479 . C T 281.24 PASS AF=0.54717;AO=25;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0048775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.104;QD=21.2256;RBI=0.0148327;REFB=-0.0213165;REVB=0.0140078;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1549;STB=0.538018;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0156495;OID=.;OPOS=34183479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:19:24:25:29:0.54717:8:17:16:3:12:17:16:8 chr20 34186953 . T C 266.15 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0662511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0663;QD=21.2918;RBI=0.0662665;REFB=-0.0333612;REVB=-0.00142842;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176737;STB=0.598971;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0367567;OID=.;OPOS=34186953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:11:14:9:16:11:14:9:16 chr20 34187552 . C T 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0278725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.243;QD=13.5051;RBI=0.0695023;REFB=-0.00726045;REVB=0.0636687;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170437;STB=0.599834;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0146204;OID=.;OPOS=34187552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:10:7:7:5:10:7 chr20 34187697 . A G 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0087216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.983;QD=15.8822;RBI=0.0119121;REFB=0.00983214;REVB=-0.00811361;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575228;STB=0.553088;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=-0.00610993;OID=.;OPOS=34187697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:9:10:10:10:0.5:6:4:3:6:6:4:3:7 chr20 34187728 . T G 67.69 PASS AF=0.473684;AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0269904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.485;QD=14.2496;RBI=0.0663877;REFB=-0.0141007;REVB=0.0606535;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645053;STB=0.538374;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0161377;OID=.;OPOS=34187728;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:18:19:9:10:8:9:0.473684:5:3:4:5:6:3:4:6 chr20 34190077 . G A 561.61 PASS AF=0.541667;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0101999;FXX=0.0103082;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.279;QD=23.4003;RBI=0.0102708;REFB=-0.0132924;REVB=-0.00120469;RO=42;SAF=34;SAR=18;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244483;STB=0.634688;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0126677;OID=.;OPOS=34190077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:42:44:52:52:0.541667:18:34:15:27:18:34:16:28 chr20 34190970 . C T 221.51 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0391615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9166;QD=18.4588;RBI=0.0487835;REFB=-0.0283985;REVB=0.0290898;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1344;STB=0.5764;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0423527;OID=.;OPOS=34190970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:8:14:13:13:8:14:13:13 chr20 34194054 . T C 63.14 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0273806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1747;QD=8.70919;RBI=0.045485;REFB=-0.0139403;REVB=-0.0363207;RO=19;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217768;STB=0.650823;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0347292;OID=.;OPOS=34194054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:29:29:19:20:9:9:0.310345:3:6:9:10:3:6:9:11 chr20 34194243 . A G 156.08 PASS AF=0.586207;AO=7;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.16848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.1838;QD=21.5287;RBI=0.17984;REFB=-0.0784077;REVB=0.062905;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143714;STB=0.663731;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0749782;OID=.;OPOS=34194243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:29:29:12:12:7:17:0.586207:6:1:1:11:9:8:1:11 chr20 34215234 . C CA 103.56 PASS AF=0.592593;AO=13;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.130482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.6507;QD=15.3418;RBI=0.214472;REFB=-0.023815;REVB=0.170214;RO=13;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27476;STB=0.544131;STBP=0.641;TYPE=ins;VARB=0.0566709;OID=.;OPOS=34215235;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.592593:13:27:16:27:11:9:7:5:6:50:13:9:4:5:8 chr20 34218673 . G C 211.93 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0108541;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=126.141;QD=16.6222;RBI=0.0569262;REFB=-0.0012708;REVB=-0.0558819;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063522;STB=0.536051;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00419114;OID=.;OPOS=34218673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:13:10:14:14:13:10:14:14 chr20 34219496 . T C 211.3 PASS AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0115348;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.302;QD=18.7821;RBI=0.0210483;REFB=-0.00141295;REVB=0.0176063;RO=24;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677185;STB=0.538425;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00183119;OID=.;OPOS=34219496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:12:9:12:12:12:9:12:12 chr20 34243017 . C T 298.68 PASS AF=0.395349;AO=32;DP=84;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00285548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.839;QD=13.8921;RBI=0.0103015;REFB=-0.000482943;REVB=0.00989783;RO=50;SAF=17;SAR=15;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760072;STB=0.547297;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000608999;OID=.;OPOS=34243017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:50:52:32:34:0.395349:15:17:23:27:15:19:25:27 chr20 34312495 . T C 229.88 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0200758;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6607;QD=21.8937;RBI=0.0208473;REFB=-0.0101638;REVB=0.00561898;RO=20;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595207;STB=0.533304;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0110165;OID=.;OPOS=34312495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:20:20:22:22:0.52381:14:8:6:14:14:8:6:14 chr20 34324456 . A T 143.34 PASS AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0159698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.998;QD=9.88571;RBI=0.0160059;REFB=-0.013679;REVB=0.00107485;RO=39;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105007;STB=0.561978;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0234087;OID=.;OPOS=34324456;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:11:8:20:19:11:8:20:19 chr20 34324484 . A C 164.18 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00588475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.886;QD=11.1305;RBI=0.0199409;REFB=-0.0157744;REVB=0.0190528;RO=37;SAF=9;SAR=12;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043178;STB=0.512303;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0246614;OID=.;OPOS=34324484;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:37:38:21:21:0.355932:12:9:16:21:12:9:17:21 chr20 34502107 . G A 167.67 PASS AF=0.45;AO=16;DP=38;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0600349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2582;QD=16.7668;RBI=0.0666604;REFB=-0.00693584;REVB=-0.0289727;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108015;STB=0.524972;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00930107;OID=.;OPOS=34502107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:40:22:22:16:18:0.45:9:7:12:10:9:9:12:10 chr20 34542365 . C G 512.09 PASS AF=0.509615;AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0328748;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.147;QD=19.6957;RBI=0.0369116;REFB=-0.00421306;REVB=-0.0167844;RO=41;SAF=24;SAR=29;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00849274;STB=0.53018;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00456091;OID=.;OPOS=34542365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:41:51:53:53:0.509615:29:24:19:22:29:24:20:31 chr20 34596371 . C T 251.7 PASS AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00730195;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.345;QD=17.064;RBI=0.019325;REFB=-0.0235894;REVB=0.0178924;RO=31;SAF=12;SAR=16;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171215;STB=0.596086;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0248719;OID=.;OPOS=34596371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:16:12:19:12:16:12:19:12 chr20 34820562 . A T 33.17 PASS AF=0.105263;AO=8;DP=77;FAO=8;FDP=76;FR=.;FRO=68;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.00291691;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.802;QD=1.74574;RBI=0.0134854;REFB=-0.00106338;REVB=0.0131661;RO=61;SAF=1;SAR=7;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508486;STB=0.855703;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0883023;OID=.;OPOS=34820562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:77:76:61:68:8:8:0.105263:7:1:34:27:7:1:34:34 chr20 35125368 . CCAAAA CAAAAC,CAAA,CCAAA 94.55 PASS AF=0.105263,0.526316,0;AO=2,4,6;DP=20;FAO=2,10,0;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=2,2,0;FSAR=0,8,0;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.14159,0.0682062,-0.0933982;FXX=0.049975;HRUN=5,5,4;LEN=5,2,1;MLLD=21.3177,22.2475,14.1441;QD=19.9043;RBI=0.190649,0.129727,0.160431;REFB=-0.147089,-0.127165,-0.0618828;REVB=0.127668,0.110349,-0.130441;RO=8;SAF=2,1,1;SAR=0,3,5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0,0.31875;SSEP=0,0,0;SSSB=0.590874,-0.272394,-0.373885;STB=0.994469,0.624724,0.5;STBP=0.176,0.316,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.15199,0.139264,0;OID=.,.,.;OPOS=35125369,35125369,35125370;OREF=CAAAA,CA,A;OALT=AAAAC,-,-;OMAPALT=CAAAAC,CAAA,CCAAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.105263,0.526316,0:2,4,6:20:2,10,0:19:7:2,2,0:0,8,0:3:4:46:8:2,1,1:0,3,5:4:4 chr20 35236275 . CTTTTTTT CTTTTTT,CTTTTTTC 89.93 PASS AF=0.236364,0.145455;AO=10,8;DP=55;FAO=13,8;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=6,7;FSAR=7,1;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0484277,0.121663;FXX=0.017854;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.95195,28.8157;QD=6.54022;RBI=0.12772,0.137836;REFB=-0.0958367,-0.058341;REVB=0.118183,0.0647847;RO=29;SAF=3,7;SAR=7,1;SRF=12;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.14712,0.561225;STB=0.536368,0.874063;STBP=0.774,0.026;TYPE=del,snp;VARB=0.0811568,0.0491323;OID=.,.;OPOS=35236276,35236282;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.236364,0.145455:10,8:55:13,8:55:34:6,7:7,1:14:20:33:29:3,7:7,1:12:17 chr20 35710453 . T C 153.61 PASS AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0479171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9146;QD=21.9444;RBI=0.0536605;REFB=0.00655789;REVB=-0.0241537;RO=12;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257456;STB=0.642704;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.013875;OID=.;OPOS=35710453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:10:6:1:11:10:6:1:11 chr20 35740794 . T C 362.65 PASS AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00779157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4615;QD=20.723;RBI=0.00879803;REFB=0.0029255;REVB=-0.00408616;RO=33;SAF=15;SAR=22;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120414;STB=0.566708;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00302637;OID=.;OPOS=35740794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:22:15:18:15:22:15:18:15 chr20 35769592 . T C 189.57 PASS AF=0.42;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0453127;FXX=0.019604;HRUN=6;LEN=1;MLLD=56.4976;QD=15.1658;RBI=0.0468713;REFB=0.00233438;REVB=0.0119867;RO=29;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207726;STB=0.618934;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00596727;OID=.;OPOS=35769592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:29:29:21:21:0.42:8:13:12:17:8:13:12:17 chr20 35769647 . G T 170.54 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0765597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.2656;QD=12.4031;RBI=0.0819853;REFB=-0.0370521;REVB=0.0293291;RO=31;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124161;STB=0.580235;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0645125;OID=.;OPOS=35769647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:34:21:21:0.381818:9:12:14:17:9:12:15:19 chr20 35783494 . T C 302.78 PASS AF=0.464789;AO=32;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0142929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5408;QD=17.058;RBI=0.0274381;REFB=-0.0030509;REVB=0.0234214;RO=38;SAF=20;SAR=12;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00678926;STB=0.502761;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00425398;OID=.;OPOS=35783494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:38:32:33:0.464789:12:20:24:14:12:21:24:14 chr20 35807790 . G GCTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT 60.82 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0108378;FXX=0.153787;HRUN=1;LEN=29;MLLD=668.997;QD=11.0582;RBI=0.010846;REFB=-0.0148658;REVB=-0.000421679;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583904;STB=0.535624;STBP=0.869;TYPE=ins;VARB=0.0216594;OID=.;OPOS=35807791;OREF=-;OALT=CTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT;OMAPALT=GCTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.363636:8:26:8:22:14:5:3:8:6:60:14:5:3:8:6 chr20 35865054 . C T 201.61 PASS AF=0.342105;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0132576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9841;QD=10.6113;RBI=0.0233896;REFB=-0.0212224;REVB=0.0192695;RO=50;SAF=11;SAR=15;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109964;STB=0.563975;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0542419;OID=.;OPOS=35865054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:50:50:26:26:0.342105:15:11:26:24:15:11:26:24 chr20 36030939 . G C 1080.74 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3722;QD=60.0412;RBI=0.141571;REFB=0;REVB=0.136056;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000943589;OID=.;OPOS=36030939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:32:39:0:0:33:39:0:0 chr20 36146148 . T C 1899.8 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00129398;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.159;QD=61.782;RBI=0.00856001;REFB=0;REVB=-0.00846164;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.55478e-05;OID=.;OPOS=36146148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:59:64:0:0:59:64:0:0 chr20 36603611 . A C 205.17 PASS AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0204592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.864;QD=15.782;RBI=0.0206443;REFB=-0.0255637;REVB=-0.00275835;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100106;STB=0.55168;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.019584;OID=.;OPOS=36603611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:29:23:23:0.442308:10:13:18:9:10:13:19:10 chr20 36603780 . T C 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.050641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.405;QD=13.0903;RBI=0.0506934;REFB=-0.025402;REVB=-0.00230464;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117418;STB=0.568618;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0292242;OID=.;OPOS=36603780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:7:6:7:13:7:6:7:13 chr20 36603807 . C T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.62;QD=54.5177;RBI=0.0530823;REFB=0;REVB=0.027078;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240912;OID=.;OPOS=36603807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chr20 36761014 . G A 1510.82 PASS AF=0.908333;AO=108;DP=119;FAO=109;FDP=120;FR=.;FRO=11;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0140497;FXX=0.00826378;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.958;QD=50.3608;RBI=0.0294954;REFB=-0.158052;REVB=0.0259343;RO=9;SAF=60;SAR=48;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508865;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00219551;OID=.;OPOS=36761014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:119:120:9:11:108:109:0.908333:48:60:5:4:49:60:5:6 chr20 36761202 . G A 943.03 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.509;QD=58.0328;RBI=0.0347234;REFB=0;REVB=0.0338587;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14434e-05;OID=.;OPOS=36761202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:27:36:0:0:28:37:0:0 chr20 36770588 . C T 905.36 PASS AF=0.955882;AO=63;DP=68;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0210221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.533;QD=53.2567;RBI=0.049582;REFB=-0.0425388;REVB=0.0449048;RO=3;SAF=43;SAR=20;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657153;STB=0.531905;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.000275021;OID=.;OPOS=36770588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:68:68:3:3:63:65:0.955882:20:43:0:3:22:43:0:3 chr20 36932660 . C T 545.22 PASS AF=0.588235;AO=49;DP=85;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0446498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.54;QD=25.6574;RBI=0.0454802;REFB=-0.0148553;REVB=-0.00865156;RO=35;SAF=19;SAR=30;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324481;STB=0.51219;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0392479;OID=.;OPOS=36932660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:35:35:49:50:0.588235:30:19:15:20:30:20:15:20 chr20 36932676 . G C 407.47 PASS AF=0.506173;AO=40;DP=80;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00923307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.023;QD=20.1221;RBI=0.00987264;REFB=-0.0238504;REVB=0.00349565;RO=40;SAF=15;SAR=25;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704914;STB=0.530572;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0208187;OID=.;OPOS=36932676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:40:40:40:41:0.506173:25:15:18:22:25:16:18:22 chr20 36940314 . C T 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=0.00681803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.429;QD=14.7422;RBI=0.00872398;REFB=-0.00491321;REVB=0.00544264;RO=25;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52075;STB=0.795619;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00266369;OID=.;OPOS=36940314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:12:5:21:4:12:5:21:4 chr20 36952425 . A C 354.04 PASS AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00500022;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.511;QD=21.1369;RBI=0.00500027;REFB=-0.0176136;REVB=-2.25226e-05;RO=31;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170685;STB=0.594188;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0173008;OID=.;OPOS=36952425;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:19:17:21:10:19:17:21:10 chr20 36989381 . G A 337.75 PASS AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.00221757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.761;QD=15.0109;RBI=0.0626922;REFB=-2.27452e-06;REVB=-0.062653;RO=53;SAF=16;SAR=21;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195924;STB=0.610624;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00025685;OID=.;OPOS=36989381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:53:53:37:37:0.411111:21:16:33:20:21:16:33:20 chr20 37005536 . T C 1586.12 PASS AF=1;AO=102;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03798;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.173;QD=59.2943;RBI=0.0382052;REFB=0;REVB=0.00414263;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130672;OID=.;OPOS=37005536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:107:0:0:102:107:1:57:45:0:0:60:47:0:0 chr20 37062583 . T C 710.28 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0129332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.684;QD=54.6368;RBI=0.012989;REFB=-0.0894388;REVB=0.00120256;RO=1;SAF=27;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171217;STB=0.509087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00195077;OID=.;OPOS=37062583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:24:27:1:0:24:27:1:0 chr20 37203483 . GTC CGT,GCC 188.51 PASS AF=0,0.320755;AO=2,15;DP=54;FAO=0,17;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=0,7;FSAR=0,10;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0419438,0.0203662;FXX=0.0185151;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=37.5979,74;QD=14.2272;RBI=0.0685271,0.0638631;REFB=-0.00211873,0.00596057;REVB=0.0541911,-0.0605286;RO=21;SAF=2,7;SAR=0,8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.585199,0.136602;STB=0.5,0.507763;STBP=1,0.948;TYPE=mnp,snp;VARB=0,-0.0100489;OID=.,.;OPOS=37203483,37203484;OREF=GTC,T;OALT=CGT,C;OMAPALT=CGT,GCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:99:54:53:21:30:2,15:0,17:0,0.320755:0,8:2,7:7:14:0,10:0,7:12:18 chr20 37203813 . C T 735.84 PASS AF=1;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981467;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7908;QD=55.5354;RBI=0.0316323;REFB=0;REVB=0.0300712;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174066;OID=.;OPOS=37203813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:26:27:0:0 chr20 37501507 . T C 926.8 PASS AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162243;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.145;QD=58.8443;RBI=0.0230955;REFB=0;REVB=-0.016437;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.552e-05;OID=.;OPOS=37501507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0 chr20 37601243 . A G 272.57 PASS AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=40;FWDB=-0.000441807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.648;QD=12.5319;RBI=0.0153965;REFB=-0.00915807;REVB=-0.0153901;RO=55;SAF=14;SAR=18;SRF=15;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191014;STB=0.608633;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0166523;OID=.;OPOS=37601243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:55:32:32:0.367816:18:14:15:40:18:14:15:40 chr20 37977945 . T C 754.43 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00571971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.523;QD=56.9381;RBI=0.0212938;REFB=0;REVB=0.0205112;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98395e-05;OID=.;OPOS=37977945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0 chr20 37981504 . C T 436.39 PASS AF=0.433628;AO=49;DP=113;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0159642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.035;QD=15.4474;RBI=0.0212734;REFB=-0.00267302;REVB=0.0140606;RO=64;SAF=31;SAR=18;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199251;STB=0.611796;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00328944;OID=.;OPOS=37981504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:64:64:49:49:0.433628:18:31:28:36:18:31:28:36 chr20 39609426 . C T 540.44 PASS AF=0.471545;AO=56;DP=124;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.041476;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2576;QD=17.5754;RBI=0.0481085;REFB=0.00185033;REVB=0.0243757;RO=68;SAF=24;SAR=32;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128101;STB=0.572924;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.00157161;OID=.;OPOS=39609426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:68:65:56:58:0.471545:32:24:38:30:33:25:37:28 chr20 39634616 . C T 1298.12 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7375;QD=61.8151;RBI=0.0488029;REFB=0;REVB=0.0289243;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021341;OID=.;OPOS=39634616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:44:39:0:0:45:39:0:0 chr20 39797465 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.539;QD=62.3508;RBI=0.0102762;REFB=0;REVB=0.00146604;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.02475e-05;OID=.;OPOS=39797465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0 chr20 39807769 . G A 1686.43 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1474;QD=60.2297;RBI=0.0647434;REFB=0;REVB=-0.0631394;RO=0;SAF=57;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000296641;OID=.;OPOS=39807769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:112:0:0:111:112:1:54:57:0:0:55:57:0:0 chr20 39832237 . A G 39.12 PASS AF=0.16;AO=7;DP=49;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0567323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.268;QD=3.12945;RBI=0.0594755;REFB=0.000159884;REVB=-0.0178546;RO=42;SAF=7;SAR=0;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.694038;STB=0.874064;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0142748;OID=.;OPOS=39832237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:49:50:42:42:7:8:0.16:0:7:18:24:1:7:18:24 chr20 39986085 . A C 417.78 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0347695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7775;QD=53.9065;RBI=0.0440186;REFB=-0.0642492;REVB=-0.0269947;RO=1;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443379;STB=0.523793;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0159465;OID=.;OPOS=39986085;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:10:20:0:1:10:20:0:1 chr20 39986540 . G A 2270.54 PASS AF=0.993377;AO=150;DP=152;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.033428;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8853;QD=60.1468;RBI=0.0634444;REFB=-0.0860681;REVB=0.0539236;RO=1;SAF=75;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629996;STB=0.503311;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000662157;OID=.;OPOS=39986540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:152:151:1:1:150:150:0.993377:75:75:1:0:75:75:1:0 chr20 39990614 . C T 1204.62 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.908;QD=60.9935;RBI=0.014163;REFB=0;REVB=0.0129667;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94165e-05;OID=.;OPOS=39990614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:79:0:0:75:79:1:37:38:0:0:41:38:0:0 chr20 40034097 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.317;QD=35.5759;RBI=0.0246066;REFB=0;REVB=0.0192752;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338474;OID=.;OPOS=40034097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr20 40043913 . C T 743.69 PASS AF=0.981481;AO=54;DP=55;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0251754;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0698;QD=55.0879;RBI=0.0749586;REFB=-0.113662;REVB=0.0706045;RO=1;SAF=32;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145012;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00357828;OID=.;OPOS=40043913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:54:1:1:54:53:0.981481:22:32:1:0:21:32:1:0 chr20 40179919 . AC A,AT 137.37 PASS AF=0.0769231,0.923077;AO=2,10;DP=13;FAO=1,12;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511785,0.0500911;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=171.901,193.816;QD=42.2684;RBI=0.0520601,0.051495;REFB=0,0;REVB=0.00954019,0.0119425;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0389219,-0.000179693;OID=.,.;OPOS=40179920,40179920;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0769231,0.923077:2,10:13:1,12:13:0:0,7:1,5:0:0:4:0:2,5:0,5:0:0 chr20 40701456 . G A 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00588571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.955;QD=58.9626;RBI=0.00764431;REFB=0;REVB=-0.0048779;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69789e-06;OID=.;OPOS=40701456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0 chr20 40702071 . G A 116.67 PASS AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00939474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.258;QD=11.6669;RBI=0.0101616;REFB=-0.00369799;REVB=-0.00387265;RO=25;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12338;STB=0.555478;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0080038;OID=.;OPOS=40702071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:26:14:14:0.35:8:6:8:17:8:6:9:17 chr20 40714479 . G A 150.25 PASS AF=0.327869;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0272031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.164;QD=9.85263;RBI=0.0272164;REFB=-0.00776838;REVB=-0.00085023;RO=40;SAF=13;SAR=7;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255;STB=0.642361;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.018148;OID=.;OPOS=40714479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:40:41:20:20:0.327869:7:13:17:23:7:13:18:23 chr20 41306600 . A G 819.05 PASS AF=0.567164;AO=76;DP=134;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00836551;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.333;QD=24.4491;RBI=0.0101102;REFB=0.00390936;REVB=-0.00567745;RO=57;SAF=40;SAR=36;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555308;STB=0.52606;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00180563;OID=.;OPOS=41306600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:57:58:76:76:0.567164:36:40:34:23:36:40:34:24 chr20 41419904 . G A 267.07 PASS AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00013869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.391;QD=20.156;RBI=0.0122077;REFB=-0.00870056;REVB=-0.0122069;RO=25;SAF=21;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153713;STB=0.586141;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.012013;OID=.;OPOS=41419904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:7:21:15:10:7:21:15:10 chr20 41692175 . C T 150.35 PASS AF=0.351852;AO=20;DP=55;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00693475;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.452;QD=11.1371;RBI=0.0166187;REFB=-0.0154496;REVB=0.0151026;RO=35;SAF=7;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184;STB=0.596319;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0280909;OID=.;OPOS=41692175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:35:35:20:19:0.351852:13:7:18:17:12:7:18:17 chr20 42089511 . T C 357.09 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.155;QD=54.9364;RBI=0.0131777;REFB=0;REVB=0.0117302;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42414e-05;OID=.;OPOS=42089511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:14:10:0:0:15:11:0:0 chr20 42157405 . C T 164.82 PASS AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00829675;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.23;QD=21.2675;RBI=0.00841072;REFB=-0.00822086;REVB=0.00137993;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287338;STB=0.640295;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00642305;OID=.;OPOS=42157405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:14:17:17:0.548387:8:9:2:11:8:9:3:11 chr20 42164722 . T C 556.97 PASS AF=0.55;AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.00563801;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.351;QD=22.2789;RBI=0.0159311;REFB=0.0132424;REVB=0.0149001;RO=47;SAF=25;SAR=30;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11803;STB=0.575018;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.00927185;OID=.;OPOS=42164722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:47:45:55:55:0.55:30:25:28:19:30:25:28:17 chr20 42196550 . T G 262.11 PASS AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00763567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.016;QD=25.5721;RBI=0.0228778;REFB=-0.0219181;REVB=-0.021566;RO=17;SAF=8;SAR=16;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239639;STB=0.63322;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0188108;OID=.;OPOS=42196550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:16:8:11:6:16:8:11:6 chr20 42225114 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0019097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.762;QD=60.2307;RBI=0.0194139;REFB=0;REVB=0.0193198;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25708e-05;OID=.;OPOS=42225114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0 chr20 42310509 . T C 506.88 PASS AF=1;AO=23;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0682416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.21;QD=59.6329;RBI=0.0886506;REFB=0;REVB=0.0565863;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000671714;OID=.;OPOS=42310509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:23:34:1:12:11:0:0:12:22:0:0 chr20 42328639 . T C 1109.07 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.151;QD=59.1506;RBI=0.023895;REFB=0;REVB=0.0238112;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134142;OID=.;OPOS=42328639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:30:43:0:0:31:44:0:0 chr20 42425127 . G A 206.57 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0199203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.759;QD=13.1158;RBI=0.0245743;REFB=-0.0163304;REVB=-0.0143902;RO=37;SAF=5;SAR=20;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323105;STB=0.696795;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0139081;OID=.;OPOS=42425127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:38:25:25:0.396825:20:5:17:20:20:5:18:20 chr20 42425178 . A G 138.97 PASS AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00974635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.482;QD=12.0843;RBI=0.0215231;REFB=-0.00440913;REVB=0.0191899;RO=30;SAF=3;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294502;STB=0.676835;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0108057;OID=.;OPOS=42425178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:13:3:12:18:13:3:12:18 chr20 42743454 . A G 320.57 PASS AF=0.55;AO=32;DP=58;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0190206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.117;QD=21.3716;RBI=0.0208437;REFB=-0.00868378;REVB=-0.00852503;RO=25;SAF=17;SAR=15;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022933;STB=0.504584;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00692769;OID=.;OPOS=42743454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:25:27:32:33:0.55:15:17:14:11:15:18:15:12 chr20 42815190 . G A 411.11 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.426;QD=56.7042;RBI=0.0410629;REFB=0;REVB=0.0319908;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97182e-05;OID=.;OPOS=42815190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:21:8:0:0:21:8:0:0 chr20 42825929 . C T 89.54 PASS AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00035534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.591;QD=15.5715;RBI=0.0405356;REFB=-0.000209056;REVB=-0.040534;RO=12;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343697;STB=0.519964;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.000446648;OID=.;OPOS=42825929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:5:6:7:5:5:6:7:5 chr20 42826350 . A C 185.82 PASS AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0295512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.986;QD=19.0582;RBI=0.03052;REFB=-0.0083833;REVB=0.00762882;RO=20;SAF=2;SAR=17;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.616884;STB=0.854924;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0101462;OID=.;OPOS=42826350;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:17:2:14:6:17:2:14:6 chr20 42908965 . G C 380.37 PASS AF=0.513158;AO=34;DP=71;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0201313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.213;QD=20.0194;RBI=0.0382366;REFB=-0.0337536;REVB=0.032508;RO=36;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255746;STB=0.538442;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0314649;OID=.;OPOS=42908965;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:76:36:37:34:39:0.513158:17:17:19:17:21:18:20:17 chr20 42939750 . T C 34.82 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0217361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7836;QD=23.2126;RBI=0.127276;REFB=-0.00931601;REVB=-0.125406;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.013846;OID=.;OPOS=42939750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1 chr20 43059211 . A C 240.93 PASS AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.0257119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.658;QD=14.602;RBI=0.0644502;REFB=-0.0187611;REVB=0.0590993;RO=38;SAF=17;SAR=11;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838434;STB=0.547421;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0296256;OID=.;OPOS=43059211;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:11:17:26:12:11:17:26:12 chr20 43089819 . G A 428.88 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2337;QD=57.1839;RBI=0.0869763;REFB=0;REVB=0.0842975;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143509;OID=.;OPOS=43089819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0 chr20 43264927 . C T 404.03 PASS AF=0.966667;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00283189;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.975;QD=53.8706;RBI=0.0100995;REFB=-0.0645868;REVB=0.00969436;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512187;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.000194588;OID=.;OPOS=43264927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:30:0:1:29:29:0.966667:9:20:0:0:9:20:1:0 chr20 43378770 . A G 1246.11 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.269;QD=61.5363;RBI=0.028328;REFB=0;REVB=0.025695;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66493e-05;OID=.;OPOS=43378770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:41:40:0:0:41:40:0:0 chr20 43379263 . CA C,CC 142.69 PASS AF=0.307692,0.692308;AO=5,8;DP=13;FAO=4,9;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=4,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=314.056,318.419;QD=43.9032;RBI=0.0396318,0.0381769;REFB=0,0;REVB=0.0396318,0.0381769;RO=0;SAF=0,0;SAR=5,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0329573,-0.0140676;OID=.,.;OPOS=43379264,43379264;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.307692,0.692308:5,8:13:4,9:13:0:0,0:4,9:0:0:19:0:0,0:5,8:0:0 chr20 43379454 . T C 285.8 PASS AF=1;AO=13;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.5094;QD=51.9631;RBI=0.159537;REFB=0;REVB=0.159081;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00529956;OID=.;OPOS=43379454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:22:0:0:13:22:1:2:11:0:0:10:12:0:0 chr20 43571822 . G A 164.68 PASS AF=0.318841;AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.000855431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.359;QD=9.54681;RBI=0.0164524;REFB=-0.00769692;REVB=0.0164301;RO=47;SAF=14;SAR=8;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148982;STB=0.587994;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0188152;OID=.;OPOS=43571822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:47:47:22:22:0.318841:8:14:24:23:8:14:24:23 chr20 43708297 . T G 648.77 PASS AF=0.471429;AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.00653225;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.358;QD=18.5362;RBI=0.00655107;REFB=-0.00594782;REVB=-0.000496265;RO=74;SAF=33;SAR=33;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257704;STB=0.514281;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00459918;OID=.;OPOS=43708297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:74:74:66:66:0.471429:33:33:39:35:33:33:39:35 chr20 43933021 . G T 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.91;QD=58.1417;RBI=0.0659424;REFB=0;REVB=0.0254043;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292771;OID=.;OPOS=43933021;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0 chr20 43933163 . T C 972.77 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00276677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0353;QD=58.9554;RBI=0.0266534;REFB=0;REVB=0.0265094;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157821;OID=.;OPOS=43933163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0 chr20 43951032 . C T 1688.8 PASS AF=0.974359;AO=114;DP=117;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000333606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7601;QD=57.7368;RBI=0.0344176;REFB=-0.143636;REVB=0.0344159;RO=2;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158226;STB=0.512395;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00701543;OID=.;OPOS=43951032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:117:117:2:3:114:114:0.974359:59:55:0:2:59:55:0:3 chr20 43995880 . T G 1336.3 PASS AF=0.967033;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00607639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.707;QD=58.7384;RBI=0.00752229;REFB=-0.00100548;REVB=-0.00443422;RO=3;SAF=38;SAR=50;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149046;STB=0.50787;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=1.71652e-06;OID=.;OPOS=43995880;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:91:91:3:3:88:88:0.967033:50:38:2:1:50:38:2:1 chr20 43996012 . G T 312.1 PASS AF=0.642857;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0135752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1598;QD=29.7233;RBI=0.0586668;REFB=-0.0033594;REVB=0.0570746;RO=15;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738885;STB=0.540511;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00334619;OID=.;OPOS=43996012;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:15:15:27:27:0.642857:10:17:11:4:10:17:11:4 chr20 43996132 . C T 182.29 PASS AF=0.580645;AO=19;DP=32;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.00625404;FXX=0.0312402;HRUN=6;LEN=1;MLLD=289.781;QD=23.5219;RBI=0.0165992;REFB=-0.0110844;REVB=0.0153759;RO=12;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355522;STB=0.734725;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00909102;OID=.;OPOS=43996132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:31:12:13:19:18:0.580645:13:6:10:2:13:5:11:2 chr20 43996454 . G T 421.81 PASS AF=0.645161;AO=40;DP=62;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0341666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5969;QD=27.2133;RBI=0.0354757;REFB=-0.0146943;REVB=0.00954824;RO=21;SAF=17;SAR=23;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00230829;STB=0.510685;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00978198;OID=.;OPOS=43996454;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:21:22:40:40:0.645161:23:17:9:12:23:17:10:12 chr20 43996466 . C T 151.0 PASS AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00469487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.144;QD=11.1852;RBI=0.00963004;REFB=-0.00848669;REVB=0.00840809;RO=35;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570419;STB=0.533299;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0142307;OID=.;OPOS=43996466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:35:35:19:19:0.351852:11:8:13:22:11:8:13:22 chr20 44005936 . C T 394.53 PASS AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0595817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.613;QD=19.976;RBI=0.0606875;REFB=-0.0108662;REVB=0.0115319;RO=39;SAF=12;SAR=28;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203995;STB=0.613639;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00799318;OID=.;OPOS=44005936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:28:12:20:19:28:12:20:19 chr20 44038574 . A G 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.00319641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.66;QD=13.631;RBI=0.0603466;REFB=-0.00726078;REVB=-0.0602619;RO=9;SAF=7;SAR=1;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291009;STB=0.517199;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00635088;OID=.;OPOS=44038574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:1:7:8:1:1:7:8:1 chr20 44054349 . T C 2789.6 PASS AF=1;AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.083;QD=62.6877;RBI=0.0285291;REFB=0;REVB=0.00638656;RO=0;SAF=101;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49939e-05;OID=.;OPOS=44054349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:178:178:0:0:178:178:1:77:101:0:0:77:101:0:0 chr20 44163825 . G T 500.22 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0217975;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.058;QD=16.9566;RBI=0.0585789;REFB=-0.0102282;REVB=-0.0543723;RO=62;SAF=30;SAR=24;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998561;STB=0.563886;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0120897;OID=.;OPOS=44163825;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:64:54:54:0.457627:24:30:28:34:24:30:28:36 chr20 44174423 . G A 536.6 PASS AF=0.459677;AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=0.000924094;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.287;QD=17.3096;RBI=0.0077043;REFB=-0.00640344;REVB=-0.00764868;RO=66;SAF=26;SAR=31;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143884;STB=0.583562;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00753595;OID=.;OPOS=44174423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:66:67:57:57:0.459677:31:26:40:26:31:26:41:26 chr20 44188489 . A C 453.71 PASS AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0109615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.676;QD=25.206;RBI=0.0113615;REFB=-0.00471052;REVB=0.00298814;RO=29;SAF=22;SAR=21;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719176;STB=0.539337;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00356622;OID=.;OPOS=44188489;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:21:22:12:17:21:22:12:17 chr20 44238741 . T G 454.98 PASS AF=0.5;AO=44;DP=89;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0275639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4509;QD=20.2212;RBI=0.0392166;REFB=0.00327553;REVB=-0.0278957;RO=44;SAF=20;SAR=24;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102253;STB=0.544359;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=-0.00422172;OID=.;OPOS=44238741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:44:45:44:45:0.5:24:20:25:19:24:21:25:20 chr20 44314609 . A G 1090.4 PASS AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0146361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8977;QD=57.3893;RBI=0.0484746;REFB=-0.128375;REVB=-0.0462122;RO=2;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214946;STB=0.511361;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00331918;OID=.;OPOS=44314609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:76:76:2:2:74:74:0.973684:43:31:0:2:43:31:0:2 chr20 44352620 . G A 466.39 PASS AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=0.0128329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.023;QD=19.8465;RBI=0.0154412;REFB=0.00885465;REVB=-0.00858759;RO=48;SAF=33;SAR=13;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377245;STB=0.520897;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.00808322;OID=.;OPOS=44352620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:13:33:36:12:13:33:36:12 chr20 44378577 . T C 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00618442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.068;QD=17.3212;RBI=0.00763446;REFB=0.00192928;REVB=0.00447638;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234065;STB=0.634442;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.00160225;OID=.;OPOS=44378577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:11:5:10:8:11:5:10:8 chr20 44417643 . A G 557.02 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3447;QD=60.2183;RBI=0.138931;REFB=0;REVB=0.0957988;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00360561;OID=.;OPOS=44417643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0 chr20 44417675 . G C 445.44 PASS AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0314739;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.3365;QD=52.405;RBI=0.0318537;REFB=-0.0936594;REVB=0.00490421;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716363;STB=0.538437;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.002644;OID=.;OPOS=44417675;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:12:20:0:2:12:20:0:2 chr20 44418564 . A G 769.67 PASS AF=0.98;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0289414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.73;QD=61.5733;RBI=0.0302709;REFB=-0.0247061;REVB=0.00887261;RO=1;SAF=29;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159432;STB=0.508471;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000503746;OID=.;OPOS=44418564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:50:1:1:47:49:0.98:18:29:1:0:20:29:1:0 chr20 44452697 . C A 884.18 PASS AF=0.954545;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0773273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.328;QD=53.5866;RBI=0.0784179;REFB=9.94339e-05;REVB=0.0130326;RO=1;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122662;STB=0.518981;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000161122;OID=.;OPOS=44452697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:66:66:1:3:63:63:0.954545:38:25:0:1:38:25:0:3 chr20 44462924 . G A 100.74 PASS AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.01821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.206;QD=16.1187;RBI=0.0250992;REFB=-0.0356299;REVB=0.0172734;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173529;STB=0.59984;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0387473;OID=.;OPOS=44462924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:9:4:6:6:9:4 chr20 44469290 . G A 81.23 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0235944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.714;QD=18.0506;RBI=0.0248905;REFB=-0.0136069;REVB=-0.00792723;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23572;STB=0.633909;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0165561;OID=.;OPOS=44469290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:1:7:6:4:1:7 chr20 44470676 . T C 274.55 PASS AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.00124254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.267;QD=19.9671;RBI=0.00987378;REFB=-0.0192858;REVB=-0.00979528;RO=26;SAF=21;SAR=8;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00707213;STB=0.503934;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0170306;OID=.;OPOS=44470676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:8:21:19:7:8:21:19:7 chr20 44501458 . A G 161.47 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0140279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.548;QD=18.9969;RBI=0.0188197;REFB=-0.0336238;REVB=0.0125459;RO=17;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755876;STB=0.542666;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0377186;OID=.;OPOS=44501458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:4:13:14:3:4:13:14:3 chr20 44505973 . T C 70.0 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00357811;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.264;QD=14.7358;RBI=0.0311229;REFB=-0.0120971;REVB=-0.0309165;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650008;STB=0.592381;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0122196;OID=.;OPOS=44505973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:20:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:4:6:6:3:5:5 chr20 44506418 . G A 181.29 PASS AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0159872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.959;QD=16.4805;RBI=0.0159905;REFB=-0.000814026;REVB=0.000324344;RO=25;SAF=7;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229424;STB=0.63144;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00107398;OID=.;OPOS=44506418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:12:7:15:10:12:7:15:10 chr20 44512792 . CTG C 99.49 PASS AF=0.578947;AO=12;DP=21;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0430865;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=2;MLLD=262.406;QD=20.9446;RBI=0.0461416;REFB=-0.00834714;REVB=-0.0165107;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324761;STB=0.505145;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00509641;OID=.;OPOS=44512793;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.578947:12:21:11:19:8:4:7:3:5:57:8:4:8:3:5 chr20 44513289 . T C 727.76 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3441;QD=63.2833;RBI=0.0184948;REFB=0;REVB=0.0183608;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112175;OID=.;OPOS=44513289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0 chr20 44513357 . G A,C 656.71 PASS AF=0.976744,0.0232558;AO=37,2;DP=39;FAO=42,1;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=19,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302736,0.0248685;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=263.925,226.077;QD=61.0893;RBI=0.0312807,0.0263853;REFB=0,0;REVB=0.00787375,0.00881723;RO=0;SAF=21,0;SAR=16,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.7558e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000447314,-0.00276442;OID=.,.;OPOS=44513357,44513357;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:39:43:0:0:37,2:42,1:0.976744,0.0232558:16,2:21,0:0:0:19,1:23,0:0:0 chr20 44515559 . G A 198.73 PASS AF=0.487805;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00258352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.494;QD=19.388;RBI=0.00528221;REFB=-0.015743;REVB=0.0046073;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884614;STB=0.537859;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0149297;OID=.;OPOS=44515559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:20:21:20:20:0.487805:11:9:11:9:11:9:11:10 chr20 44523547 . G A 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.35;QD=53.911;RBI=0.0468739;REFB=0;REVB=0.0179909;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366677;OID=.;OPOS=44523547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chr20 44578674 . T A 175.99 PASS AF=0.392157;AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0355548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.05;QD=13.8027;RBI=0.036028;REFB=-0.0185785;REVB=-0.00581971;RO=31;SAF=6;SAR=13;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254996;STB=0.656981;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0204533;OID=.;OPOS=44578674;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:31:31:19:20:0.392157:13:6:17:14:14:6:17:14 chr20 44578961 . A G 244.29 PASS AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0141941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.736;QD=13.0291;RBI=0.0222622;REFB=0.00265686;REVB=-0.0171504;RO=46;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093314;STB=0.553451;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.00406274;OID=.;OPOS=44578961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:17:12:23:23:17:12:23:23 chr20 44596207 . C G 205.7 PASS AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00880121;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.097;QD=12.4668;RBI=0.0109413;REFB=-0.0168079;REVB=-0.0065;RO=41;SAF=17;SAR=8;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215844;STB=0.624739;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0424649;OID=.;OPOS=44596207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:8:17:20:21:8:17:20:21 chr20 44637624 . C T 562.23 PASS AF=0.495868;AO=57;DP=110;FAO=60;FDP=121;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.0133005;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.3158;QD=18.5862;RBI=0.0512625;REFB=-0.0205203;REVB=-0.049507;RO=52;SAF=37;SAR=20;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049495;STB=0.523132;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0225224;OID=.;OPOS=44637624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:121:52:61:57:60:0.495868:20:37:31:21:22:38:36:25 chr20 44640229 . C T 310.65 PASS AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00328633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.089;QD=16.3499;RBI=0.0133575;REFB=-0.0101493;REVB=-0.012947;RO=42;SAF=19;SAR=15;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196165;STB=0.610028;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.010364;OID=.;OPOS=44640229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:15:19:15:27:15:19:15:27 chr20 44642406 . G C 236.24 PASS AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0419528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0989;QD=17.4992;RBI=0.0420635;REFB=-0.0176893;REVB=0.00304955;RO=28;SAF=6;SAR=20;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245511;STB=0.513823;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0197874;OID=.;OPOS=44642406;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:20:6:7:21:20:6:7:21 chr20 44642833 . A C 82.7 PASS AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00334691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.083;QD=9.18858;RBI=0.0247766;REFB=-0.00893106;REVB=-0.0245495;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439633;STB=0.526832;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0343771;OID=.;OPOS=44642833;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:4:7:15:10:4:7:15:10 chr20 44664491 . C A 304.35 PASS AF=0.465753;AO=33;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0462384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.328;QD=16.6766;RBI=0.0464019;REFB=-0.0151463;REVB=-0.0038914;RO=40;SAF=20;SAR=13;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200218;STB=0.624024;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0207139;OID=.;OPOS=44664491;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:39:33:34:0.465753:13:20:16:24:13:21:15:24 chr20 44665946 . T C 472.86 PASS AF=0.614286;AO=37;DP=69;FAO=43;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00250006;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.063;QD=27.0204;RBI=0.00457969;REFB=-0.026;REVB=0.00383709;RO=13;SAF=18;SAR=19;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119924;STB=0.514161;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0145015;OID=.;OPOS=44665946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:13:25:37:43:0.614286:19:18:6:7:24:19:12:13 chr20 44671880 . C T 574.43 PASS AF=0.53211;AO=58;DP=109;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0240819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.024;QD=21.08;RBI=0.0241832;REFB=-0.00365058;REVB=0.0022111;RO=51;SAF=27;SAR=31;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043352;STB=0.502382;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00409268;OID=.;OPOS=44671880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:51:51:58:58:0.53211:31:27:24:27:31:27:24:27 chr20 44678348 . G A 1157.44 PASS AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00191595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.221;QD=59.3559;RBI=0.019895;REFB=0.00202959;REVB=0.0198026;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111359;STB=0.505881;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=1.74761e-05;OID=.;OPOS=44678348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:42:35:0:1:42:35:0:1 chr20 44688730 . G A 1917.18 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294655;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1392;QD=61.8444;RBI=0.0408843;REFB=0;REVB=0.0283428;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00776e-05;OID=.;OPOS=44688730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:74:50:0:0:74:50:0:0 chr20 44691350 . T G 649.53 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.765;QD=61.8597;RBI=0.0178608;REFB=0;REVB=-0.0165546;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.679e-05;OID=.;OPOS=44691350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0 chr20 44746982 . T C 576.59 PASS AF=1;AO=33;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.214;QD=60.6936;RBI=0.12158;REFB=0;REVB=0.120854;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571029;OID=.;OPOS=44746982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:33:38:1:12:21:0:0:17:21:0:0 chr20 44757407 . G A 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0179078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.621;QD=13.9591;RBI=0.0366898;REFB=-0.0156452;REVB=0.0320227;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135151;STB=0.581152;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00363674;OID=.;OPOS=44757407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:4:3:2:5:4:3 chr20 44869878 . C T 303.27 PASS AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0471845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.514;QD=25.8099;RBI=0.0472196;REFB=-0.00401744;REVB=-0.00181967;RO=20;SAF=15;SAR=12;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305811;STB=0.668088;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00375709;OID=.;OPOS=44869878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:12:15:3:17:12:15:3:17 chr20 44996182 . A G 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.187;QD=57.6801;RBI=0.143511;REFB=0;REVB=0.00941118;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000562439;OID=.;OPOS=44996182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chr20 45003945 . T C 238.68 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0170728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.504;QD=16.1819;RBI=0.0170822;REFB=-0.0311505;REVB=0.000567101;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178028;STB=0.510043;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0197004;OID=.;OPOS=45003945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:16:16:13:14:16:16 chr20 45085437 . C CTTT,T 312.21 PASS AF=0.346939,0.0306122;AO=30,4;DP=100;FAO=34,3;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=18,0;FSAR=16,3;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.00395071,-0.0290789;FXX=0.019998;HRUN=0,1;LEN=3,1;MLLD=229.121,110.722;QD=12.7431;RBI=0.025463,0.0748383;REFB=-0.000249915,0.00150976;REVB=-0.0251547,-0.0689578;RO=62;SAF=16,1;SAR=14,3;SRF=29;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0757042,-0.215565;STB=0.534633,0.996376;STBP=0.638,0.097;TYPE=ins,snp;VARB=0.00207103,0.00838193;OID=.,.;OPOS=45085438,45085437;OREF=-,C;OALT=TTT,T;OMAPALT=CTTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:62:61:30,4:34,3:0.346939,0.0306122:14,3:16,1:29:33:16,3:18,0:29:32 chr20 45204266 . G A 263.66 PASS AF=0.449275;AO=29;DP=64;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0634321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.208;QD=15.2844;RBI=0.0635495;REFB=-0.0654411;REVB=0.00386062;RO=35;SAF=18;SAR=11;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1062;STB=0.563595;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0534516;OID=.;OPOS=45204266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:69:35:38:29:31:0.449275:11:18:18:17:12:19:19:19 chr20 45817255 . A C 263.92 PASS AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0106383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3593;QD=12.8743;RBI=0.0283516;REFB=-0.00151617;REVB=-0.02628;RO=50;SAF=14;SAR=17;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307873;STB=0.524095;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00364726;OID=.;OPOS=45817255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:51:31:31:0.378049:17:14:24:26:17:14:25:26 chr20 45839078 . C T 73.1 PASS AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0731798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9403;QD=16.2438;RBI=0.0966094;REFB=-0.0362457;REVB=0.0630722;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662608;STB=0.538383;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00198114;OID=.;OPOS=45839078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:5:3:3:7:5:3 chr20 45853037 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.038;QD=56.1914;RBI=0.0934412;REFB=0;REVB=0.0648512;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129024;OID=.;OPOS=45853037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0 chr20 45867343 . T A 52.69 PASS AF=0.171875;AO=13;DP=65;FAO=11;FDP=64;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.0524241;FXX=0.0447694;HRUN=5;LEN=1;MLLD=30.5625;QD=3.29285;RBI=0.063829;REFB=-0.00563406;REVB=0.0364123;RO=52;SAF=13;SAR=0;SRF=12;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.818064;STB=0.935298;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0260428;OID=.;OPOS=45867343;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:65:64:52:53:13:11:0.171875:0:13:12:40:1:10:16:37 chr20 46268394 . C T 214.77 PASS AF=0.3375;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00181294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9058;QD=10.7385;RBI=0.00587622;REFB=-0.00971299;REVB=-0.00558956;RO=52;SAF=13;SAR=14;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1329;STB=0.582031;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0184041;OID=.;OPOS=46268394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:53:27:27:0.3375:14:13:19:33:14:13:19:34 chr20 46268493 . A G 115.36 PASS AF=0.285714;AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00521454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.348;QD=8.23998;RBI=0.010854;REFB=-0.0046442;REVB=0.00951937;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103381;STB=0.562422;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0116485;OID=.;OPOS=46268493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:40:40:16:16:0.285714:7:9:19:21:7:9:19:21 chr20 46279827 . G A 96.19 PASS AF=0.375;AO=11;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0116826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.384;QD=12.0235;RBI=0.0235953;REFB=-0.0175826;REVB=-0.0205001;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115455;STB=0.543407;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0408737;OID=.;OPOS=46279827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:11:12:0.375:5:6:13:7:5:7:13:7 chr20 46279866 . A G 82.08 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.05317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.264;QD=8.64014;RBI=0.0662297;REFB=-0.0425848;REVB=-0.0394883;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522814;STB=0.545372;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0899062;OID=.;OPOS=46279866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:38:38:26:27:11:11:0.289474:5:6:13:13:5:6:13:14 chr20 46365571 . A G 486.68 PASS AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.00883548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.617;QD=16.6387;RBI=0.025123;REFB=-0.031437;REVB=-0.0235181;RO=64;SAF=30;SAR=23;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200598;STB=0.611618;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0440928;OID=.;OPOS=46365571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:64:53:53:0.452991:23:30:23:41:23:30:23:41 chr20 47241618 . A G 378.86 PASS AF=0.673077;AO=35;DP=52;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00756299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.812;QD=29.1431;RBI=0.0313127;REFB=-0.010432;REVB=0.0303856;RO=17;SAF=13;SAR=22;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1338;STB=0.573004;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00613261;OID=.;OPOS=47241618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:17:17:35:35:0.673077:22:13:10:7:22:13:10:7 chr20 47253150 . T C 773.89 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.080178;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.467;QD=57.3253;RBI=0.0804232;REFB=0;REVB=0.00627576;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000398097;OID=.;OPOS=47253150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:35:19:0:0:35:19:0:0 chr20 47262549 . C T 257.64 PASS AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0500129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.953;QD=23.9668;RBI=0.0505686;REFB=-0.0343491;REVB=0.00747639;RO=19;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00557402;STB=0.503103;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0330363;OID=.;OPOS=47262549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:9:15:12:7:9:15:12:7 chr20 47307618 . G A 638.89 PASS AF=0.44586;AO=70;DP=157;FAO=70;FDP=157;FR=.;FRO=87;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.00503833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9472;QD=16.2774;RBI=0.00617299;REFB=-0.0179323;REVB=0.00356666;RO=87;SAF=40;SAR=30;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100103;STB=0.555743;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0249184;OID=.;OPOS=47307618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:87:87:70:70:0.44586:30:40:41:46:30:40:41:46 chr20 47630449 . C T 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.687;QD=56.9374;RBI=0.0246202;REFB=0;REVB=0.00732866;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.23317e-05;OID=.;OPOS=47630449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0 chr20 47862485 . T TA 30.12 PASS AF=0.25;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0798199;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.5489;QD=4.30286;RBI=0.129813;REFB=-0.0261627;REVB=0.102373;RO=23;SAF=2;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328123;STB=0.741906;STBP=0.177;TYPE=ins;VARB=0.0482531;OID=.;OPOS=47862486;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25:7:30:7:28:21:2:5:13:8:30:23:2:5:13:10 chr20 48120777 . G A 414.96 PASS AF=0.690909;AO=38;DP=55;FAO=38;FDP=55;FR=.;FRO=17;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0274654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6391;QD=30.1786;RBI=0.0295568;REFB=-0.0407321;REVB=-0.0109205;RO=17;SAF=24;SAR=14;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835016;STB=0.54524;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0118955;OID=.;OPOS=48120777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:17:17:38:38:0.690909:14:24:13:4:14:24:13:4 chr20 48129706 . G T 192.46 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=-0.000530532;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.219;QD=13.747;RBI=0.000588921;REFB=-0.00358556;REVB=0.000255664;RO=30;SAF=16;SAR=7;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130683;STB=0.567513;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00617763;OID=.;OPOS=48129706;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:33:23:23:0.410714:7:16:24:6:7:16:26:7 chr20 48491258 . T G 868.27 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.578;QD=57.8849;RBI=0.0170884;REFB=0;REVB=0.0111319;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66029e-05;OID=.;OPOS=48491258;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0 chr20 48522392 . G A 118.27 PASS AF=0.365854;AO=13;DP=39;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.0861069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2121;QD=11.5383;RBI=0.112956;REFB=-0.0553886;REVB=0.0731071;RO=26;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450514;STB=0.742845;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0921744;OID=.;OPOS=48522392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:41:26:26:13:15:0.365854:5:8:5:21:6:9:5:21 chr20 48522585 . G A 140.71 PASS AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0237721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.433;QD=13.0888;RBI=0.0244839;REFB=-0.0119201;REVB=-0.00586082;RO=27;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337406;STB=0.697162;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0371845;OID=.;OPOS=48522585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:5:11:10:17:5:11:10:17 chr20 48524827 . A G 209.94 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0258441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.847;QD=19.0852;RBI=0.0260071;REFB=-0.0133968;REVB=0.00290692;RO=22;SAF=6;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170602;STB=0.611399;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00937574;OID=.;OPOS=48524827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:22:23:21:21:0.477273:15:6:10:12:15:6:11:12 chr20 48569240 . TG T 248.03 PASS AF=0.393162;AO=44;DP=119;FAO=46;FDP=117;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0194146;FXX=0.0168053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.8301;QD=8.47961;RBI=0.0280229;REFB=-0.0105812;REVB=0.0202078;RO=70;SAF=21;SAR=23;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707949;STB=0.529902;STBP=0.616;TYPE=del;VARB=0.0165361;OID=.;OPOS=48569241;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.393162:44:119:46:117:71:23:23:39:32:99:70:21:23:38:32 chr20 48569278 . T C 393.28 PASS AF=0.4;AO=46;DP=113;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.00257026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.292;QD=13.6794;RBI=0.0136619;REFB=-0.00991345;REVB=0.0134179;RO=67;SAF=23;SAR=23;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102023;STB=0.56519;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0170463;OID=.;OPOS=48569278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:67:69:46:46:0.4:23:23:40:27:23:23:42:27 chr20 48700947 . T C 555.01 PASS AF=0.479339;AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.0120499;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.295;QD=18.3475;RBI=0.0270749;REFB=-0.0061937;REVB=0.0242456;RO=63;SAF=24;SAR=34;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148225;STB=0.582163;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00782296;OID=.;OPOS=48700947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:63:63:58:58:0.479339:34:24:36:27:34:24:36:27 chr20 48713049 . G A 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0074343;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.159;QD=59.4357;RBI=0.0095014;REFB=0;REVB=-0.00591674;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20748e-06;OID=.;OPOS=48713049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chr20 48746189 . C T 329.76 PASS AF=0.439024;AO=35;DP=83;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00946214;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.187;QD=16.0861;RBI=0.0097925;REFB=-0.0169762;REVB=0.0025221;RO=46;SAF=13;SAR=22;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111219;STB=0.556156;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0187064;OID=.;OPOS=48746189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:46:46:35:36:0.439024:22:13:22:24:23:13:21:25 chr20 49196284 . C T 123.75 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0195756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.713;QD=17.0693;RBI=0.0241702;REFB=0.000425446;REVB=0.0141772;RO=14;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866803;STB=0.538404;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.000387364;OID=.;OPOS=49196284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:11:3:4:10:11:3:4:11 chr20 49197898 . C T 382.97 PASS AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00312778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.027;QD=17.4078;RBI=0.00557631;REFB=-0.0231715;REVB=-0.00461652;RO=48;SAF=16;SAR=24;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990774;STB=0.555527;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0214694;OID=.;OPOS=49197898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:24:16:24:24:24:16:24:24 chr20 49214156 . A G 273.94 PASS AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.000516206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.19;QD=15.219;RBI=0.00327386;REFB=-0.013302;REVB=-0.00323291;RO=39;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791125;STB=0.5438;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0159483;OID=.;OPOS=49214156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:41:31:31:0.430556:15:16:17:22:15:16:18:23 chr20 49367076 . T G 1264.04 PASS AF=0.965517;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.03601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.645;QD=58.1168;RBI=0.0698558;REFB=-0.128174;REVB=0.0598591;RO=3;SAF=46;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298905;STB=0.515786;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00146123;OID=.;OPOS=49367076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:87:87:3:3:84:84:0.965517:38:46:3:0:38:46:3:0 chr20 49369006 . A G 1159.41 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3292;QD=59.457;RBI=0.036474;REFB=-0.102369;REVB=0.0184096;RO=1;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119811;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140612;OID=.;OPOS=49369006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:78:78:1:0:77:78:1:39:38:0:1:40:38:0:0 chr20 49369605 . C CCT 91.17 PASS AF=0.254902;AO=10;DP=54;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00599493;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=2;MLLD=199.312;QD=7.15055;RBI=0.0797096;REFB=-0.00236297;REVB=-0.0794838;RO=43;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07158;STB=0.530441;STBP=0.836;TYPE=ins;VARB=0.00466036;OID=.;OPOS=49369606;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.254902:10:54:13:51:38:7:6:22:16:91:43:5:5:24:19 chr20 49369613 . T TC 222.89 PASS AF=0.609756;AO=15;DP=59;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0121919;FXX=0.19604;HRUN=0;LEN=1;MLLD=173.681;QD=21.7449;RBI=0.0835039;REFB=0.0197381;REVB=0.082609;RO=43;SAF=9;SAR=6;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518436;STB=0.532138;STBP=0.64;TYPE=ins;VARB=-0.0113746;OID=.;OPOS=49369614;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.609756:15:59:25:41:16:13:12:7:9:99:43:9:6:24:19 chr20 49369614 . T C 113.68 PASS AF=0.280702;AO=17;DP=58;FAO=16;FDP=57;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0124872;FXX=0.0172384;HRUN=11;LEN=1;MLLD=149.403;QD=7.97736;RBI=0.0475405;REFB=-0.0107577;REVB=-0.0458713;RO=38;SAF=11;SAR=6;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114378;STB=0.582854;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0113557;OID=.;OPOS=49369614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:38:41:17:16:0.280702:6:11:21:17:6:10:21:20 chr20 49369624 . A T 620.54 PASS AF=0.918033;AO=48;DP=58;FAO=56;FDP=61;FR=.;FRO=5;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.066055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.7017;QD=40.6908;RBI=0.20945;REFB=-0.142407;REVB=0.198761;RO=9;SAF=24;SAR=24;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491669;STB=0.524581;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0452805;OID=.;OPOS=49369624;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:58:61:9:5:48:56:0.918033:24:24:6:3:28:28:4:1 chr20 49507344 . G C 114.06 PASS AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0207726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.258;QD=18.249;RBI=0.0289311;REFB=-0.0121406;REVB=0.0201371;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182354;STB=0.603623;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0103801;OID=.;OPOS=49507344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:6:7:9:3:6:7:9:3 chr20 49509184 . G A 593.75 PASS AF=0.55102;AO=54;DP=100;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.0115466;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.785;QD=24.2345;RBI=0.0180928;REFB=-0.000617287;REVB=-0.0139293;RO=40;SAF=20;SAR=34;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273133;STB=0.657681;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000909182;OID=.;OPOS=49509184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:40:44:54:54:0.55102:34:20:29:11:34:20:32:12 chr20 49577558 . C T 124.6 PASS AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0110406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6706;QD=18.4589;RBI=0.0287161;REFB=-0.0205101;REVB=0.0265088;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967639;STB=0.555473;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0210326;OID=.;OPOS=49577558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:4:10:8:5:4:10:8:5 chr20 50092027 . T G 463.81 PASS AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0051461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.777;QD=19.3255;RBI=0.0051461;REFB=-0.000641184;REVB=-1.10062e-06;RO=50;SAF=32;SAR=14;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233108;STB=0.630105;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.000837357;OID=.;OPOS=50092027;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:14:32:23:27:14:32:23:27 chr20 50140627 . G C 205.09 PASS AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0190428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.145;QD=16.4076;RBI=0.0214857;REFB=-0.0261259;REVB=0.0099501;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283682;STB=0.516237;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0396042;OID=.;OPOS=50140627;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:16:13:10:11:16:13 chr20 50217620 . A G 746.43 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4138;QD=63.5255;RBI=0.0301282;REFB=0;REVB=0.0229606;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51299e-05;OID=.;OPOS=50217620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr20 50287736 . C T 1043.48 PASS AF=0.987013;AO=69;DP=75;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00219074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.845;QD=54.207;RBI=0.0355226;REFB=-0.102731;REVB=0.0354549;RO=6;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785499;STB=0.506327;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00158247;OID=.;OPOS=50287736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:77:6:1:69:76:0.987013:33:36:0:6:39:37:0:1 chr20 50287790 . A G 1012.21 PASS AF=0.985714;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00703333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3139;QD=57.8405;RBI=0.0277792;REFB=-0.131059;REVB=0.0268741;RO=1;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116708;STB=0.506022;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0022192;OID=.;OPOS=50287790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:69:70:1:1:68:69:0.985714:40:28:0:1:41:28:0:1 chr20 50407162 . T C 78.02 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0185015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.921;QD=14.1852;RBI=0.0253897;REFB=0.00371199;REVB=0.0173877;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501495;STB=0.509415;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=-0.00453677;OID=.;OPOS=50407162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:21:22:11:12:10:10:0.454545:4:6:6:5:4:6:7:5 chr20 50407502 . A C 325.6 PASS AF=0.603774;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00448449;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.736;QD=24.5734;RBI=0.00553721;REFB=-0.00292041;REVB=-0.00324808;RO=21;SAF=17;SAR=15;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987451;STB=0.554198;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00178727;OID=.;OPOS=50407502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:21:21:32:32:0.603774:15:17:14:7:15:17:14:7 chr20 50408482 . A G 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.398;QD=53.9076;RBI=0.0454335;REFB=0;REVB=0.0288774;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000390483;OID=.;OPOS=50408482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr20 50803444 . C T 544.87 PASS AF=0.536842;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00928953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.162;QD=22.9417;RBI=0.0219668;REFB=0.00645665;REVB=0.0199059;RO=44;SAF=19;SAR=32;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148919;STB=0.582032;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.00425118;OID=.;OPOS=50803444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:44:44:51:51:0.536842:32:19:24:20:32:19:24:20 chr20 50803573 . G A 147.22 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00470995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.437;QD=17.3196;RBI=0.0106055;REFB=-0.00826738;REVB=-0.00950229;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581634;STB=0.533291;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0115615;OID=.;OPOS=50803573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:9:7:9:9:9:7:9:9 chr20 51870849 . T C 1577.11 PASS AF=0.940171;AO=110;DP=117;FAO=110;FDP=117;FR=.;FRO=7;FSAF=58;FSAR=52;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0709736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.201;QD=53.9182;RBI=0.0714356;REFB=-0.117328;REVB=0.00811173;RO=5;SAF=58;SAR=52;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225794;STB=0.511234;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00354543;OID=.;OPOS=51870849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:117:117:5:7:110:110:0.940171:52:58:4:1:52:58:5:2 chr20 52105972 . C T 801.26 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.212;QD=57.2327;RBI=0.0138816;REFB=0;REVB=0.00438754;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.62892e-05;OID=.;OPOS=52105972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0 chr20 52184384 . T A 137.16 PASS AF=0.5;AO=17;DP=39;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0142704;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=23.0155;QD=10.9724;RBI=0.0464981;REFB=-0.107606;REVB=0.0442541;RO=22;SAF=2;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416869;STB=0.598341;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0387779;OID=.;OPOS=52184384;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:50:22:25:17:25:0.5:15:2:9:13:19:6:10:15 chr20 52583505 . C T 722.45 PASS AF=0.490196;AO=75;DP=153;FAO=75;FDP=153;FR=.;FRO=78;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=-0.0274291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.662;QD=18.8876;RBI=0.0274313;REFB=-0.0208086;REVB=0.000345525;RO=78;SAF=46;SAR=29;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351245;STB=0.51939;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0109285;OID=.;OPOS=52583505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:78:78:75:75:0.490196:29:46:45:33:29:46:45:33 chr20 52611540 . C A 148.09 PASS AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0459655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6322;QD=17.9501;RBI=0.0784962;REFB=0.0254877;REVB=0.0636304;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113657;STB=0.544692;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0240823;OID=.;OPOS=52611540;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:9:7:5:11:9:7:6:11 chr20 52645166 . A G 650.3 PASS AF=0.463576;AO=65;DP=147;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0126234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3425;QD=17.2264;RBI=0.0501222;REFB=-0.0293451;REVB=-0.0485065;RO=79;SAF=35;SAR=30;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938764;STB=0.560391;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0276918;OID=.;OPOS=52645166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:151:79:81:65:70:0.463576:30:35:35:44:31:39:36:45 chr20 52674615 . A G 728.95 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.851;QD=57.1728;RBI=0.0644821;REFB=0;REVB=0.0284301;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231418;OID=.;OPOS=52674615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:28:21:0:0:30:21:0:0 chr20 52675188 . G T 593.19 PASS AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0728542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5092;QD=60.8399;RBI=0.0754402;REFB=0;REVB=-0.0195828;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00162893;OID=.;OPOS=52675188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:17:21:0:0:18:21:0:0 chr20 52775528 . C T 565.08 PASS AF=0.535354;AO=52;DP=98;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.000937752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.789;QD=22.8315;RBI=0.022415;REFB=-0.000317782;REVB=-0.0223954;RO=44;SAF=23;SAR=29;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197713;STB=0.619791;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000437194;OID=.;OPOS=52775528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:44:46:52:53:0.535354:29:23:30:14:30:23:32:14 chr20 52786219 . G A 317.01 PASS AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0117508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.411;QD=17.8595;RBI=0.0130231;REFB=-0.0139426;REVB=-0.00561411;RO=37;SAF=19;SAR=15;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117591;STB=0.565718;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.012288;OID=.;OPOS=52786219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:15:19:16:21:15:19:16:21 chr20 54824029 . G A 336.65 PASS AF=0.402174;AO=36;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0109383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.961;QD=14.6369;RBI=0.011845;REFB=-0.00586639;REVB=0.00454506;RO=53;SAF=21;SAR=15;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117756;STB=0.556834;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00974243;OID=.;OPOS=54824029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:55:36:37:0.402174:15:21:25:28:16:21:26:29 chr20 54944791 . C G 213.23 PASS AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00953878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.978;QD=12.5432;RBI=0.0129572;REFB=-0.0093598;REVB=-0.00876925;RO=42;SAF=19;SAR=7;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243838;STB=0.641135;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0239577;OID=.;OPOS=54944791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:42:42:26:26:0.382353:7:19:22:20:7:19:22:20 chr20 54961463 . T C 1514.21 PASS AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224442;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.288;QD=63.7563;RBI=0.0365166;REFB=0;REVB=0.0364476;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24739e-06;OID=.;OPOS=54961463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:55:40:0:0:55:40:0:0 chr20 54961541 . A T 688.98 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4967;QD=62.6348;RBI=0.0300813;REFB=0;REVB=0.0294416;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00040935;OID=.;OPOS=54961541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0 chr20 55028167 . G A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.166;QD=39.2068;RBI=0.0296414;REFB=0;REVB=-0.00808863;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223754;OID=.;OPOS=55028167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr20 55033476 . C G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4781;QD=62.3504;RBI=0.0304801;REFB=0;REVB=-0.00125338;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350863;OID=.;OPOS=55033476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0 chr20 55033635 . C T 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.974;QD=56.7064;RBI=0.0681931;REFB=0;REVB=0.0663539;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000583841;OID=.;OPOS=55033635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr20 55033647 . T C 358.11 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.221;QD=55.0934;RBI=0.059057;REFB=0;REVB=0.0565522;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000635383;OID=.;OPOS=55033647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0 chr20 55033713 . G A,C 100.18 PASS AF=0.8,0.2;AO=8,2;DP=10;FAO=8,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3,2;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205074,0.0510401;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=240.026,70.9598;QD=40.0716;RBI=0.025672,0.05559;REFB=0,0;REVB=0.0154433,-0.0220262;RO=0;SAF=3,2;SAR=5,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00192505,0.122013;OID=.,.;OPOS=55033713,55033713;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:10:10:0:0:8,2:8,2:0.8,0.2:5,0:3,2:0:0:5,0:3,2:0:0 chr20 55066633 . T G 190.86 PASS AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00393136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1367;QD=11.5673;RBI=0.060557;REFB=0.00431368;REVB=0.0604293;RO=42;SAF=11;SAR=13;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123768;STB=0.571549;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.00873691;OID=.;OPOS=55066633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:13:11:24:18:13:11:24:18 chr20 55072471 . TA T,TG,TT 329.2 PASS AF=0,0.88,0.12;AO=3,18,3;DP=25;FAO=0,22,3;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,3;FSAR=0,19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950862,-0.0111118,-0.00745798;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=123.62,131.551,112.697;QD=52.6723;RBI=0.0708932,0.0678116,0.0646118;REFB=0,0,0;REVB=0.0702526,0.066895,0.0641799;RO=0;SAF=0,3,3;SAR=3,15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.32e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0,-0.00520618,0.0220418;OID=.,.,.;OPOS=55072472,55072472,55072472;OREF=A,A,A;OALT=-,G,T;OMAPALT=T,TG,TT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.88,0.12:3,18,3:25:0,22,3:25:0:0,3,3:0,19,0:0:0:13:0:0,3,3:3,15,0:0:0 chr20 55088404 . A G 801.28 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.472;QD=57.2342;RBI=0.0206248;REFB=0;REVB=-0.00712238;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53431e-05;OID=.;OPOS=55088404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0 chr20 55108617 . C A 618.88 PASS AF=0.559633;AO=59;DP=107;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0225183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.056;QD=22.711;RBI=0.0228431;REFB=-0.0430208;REVB=-0.00383838;RO=47;SAF=29;SAR=30;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00175218;STB=0.505565;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0306588;OID=.;OPOS=55108617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:47:48:59:61:0.559633:30:29:23:24:31:30:23:25 chr20 55111273 . C T 205.83 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00738794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.103;QD=23.5238;RBI=0.0274756;REFB=-0.0104681;REVB=-0.0264637;RO=14;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168909;STB=0.609859;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00187481;OID=.;OPOS=55111273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:7:13:6:8:7:13:6:9 chr20 55111364 . A C 305.09 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0105179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.831;QD=22.1882;RBI=0.0122781;REFB=-0.0301741;REVB=-0.00633446;RO=21;SAF=18;SAR=13;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00692624;STB=0.535691;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0230174;OID=.;OPOS=55111364;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:55:21:24:31:31:0.563636:13:18:12:9:13:18:12:12 chr20 55263662 . T G 109.17 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0205465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9097;QD=14.0862;RBI=0.040671;REFB=-0.00165466;REVB=-0.0350994;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275431;STB=0.659955;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.000582654;OID=.;OPOS=55263662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:6:12:5:8:6:12 chr20 55748206 . G A 486.85 PASS AF=1;AO=29;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024372;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4521;QD=59.0125;RBI=0.109672;REFB=0;REVB=0.10693;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00198401;OID=.;OPOS=55748206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:0:0:29:33:1:13:16:0:0:14:19:0:0 chr20 55934834 . T A 465.98 PASS AF=0.523256;AO=44;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.021992;FXX=0.0337041;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7848;QD=21.6737;RBI=0.0348343;REFB=-0.0018162;REVB=0.0270145;RO=42;SAF=19;SAR=25;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184274;STB=0.508184;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00217459;OID=.;OPOS=55934834;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:42:41:44:45:0.523256:25:19:19:23:26:19:18:23 chr20 56090807 . A G 255.1 PASS AF=0.519231;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0232213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.022;QD=19.6233;RBI=0.0234541;REFB=-0.0169107;REVB=-0.0032961;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941937;STB=0.561359;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0194073;OID=.;OPOS=56090807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:26:27:0.519231:11:15:17:8:12:15:17:8 chr20 56098733 . T C 677.08 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0242464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.198;QD=60.1845;RBI=0.0300225;REFB=-0.102075;REVB=0.0177049;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515145;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000866986;OID=.;OPOS=56098733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:45:45:0:1:44:44:0.977778:16:28:0:0:16:28:0:1 chr20 56131216 . A G 447.0 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.0895;QD=57.6777;RBI=0.11029;REFB=0;REVB=-0.100744;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00316318;OID=.;OPOS=56131216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chr20 56137895 . G C 428.14 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9929;QD=57.0851;RBI=0.0595886;REFB=0;REVB=0.0455343;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00190221;OID=.;OPOS=56137895;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chr20 56139403 . T C 1896.41 PASS AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6157;QD=61.6717;RBI=0.0118394;REFB=0;REVB=-0.010985;RO=0;SAF=56;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.60146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.8903e-05;OID=.;OPOS=56139403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:67:56:0:0:67:56:0:0 chr20 56179422 . C A 279.44 PASS AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0242693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.212;QD=48.5974;RBI=0.0475503;REFB=-0.125458;REVB=0.0408905;RO=1;SAF=10;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439896;STB=0.523788;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00165322;OID=.;OPOS=56179422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:12:10:1:0:12:10:1:0 chr20 56182296 . A C 1098.73 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.562;QD=60.2042;RBI=0.0553369;REFB=0;REVB=0.0257058;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161395;OID=.;OPOS=56182296;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0 chr20 56186884 . T C 1279.45 PASS AF=1;AO=79;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0678471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.406;QD=61.6604;RBI=0.0981741;REFB=0;REVB=0.0709572;RO=0;SAF=25;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0008933;OID=.;OPOS=56186884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:83:0:0:79:83:1:54:25:0:0:55:28:0:0 chr20 56190598 . T C 31.82 PASS AF=0.117647;AO=6;DP=51;FAO=6;FDP=51;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00499684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.129;QD=2.49546;RBI=0.0286785;REFB=-0.000628267;REVB=-0.0282398;RO=45;SAF=5;SAR=1;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392423;STB=0.803124;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00309019;OID=.;OPOS=56190598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:51:51:45:45:6:6:0.117647:1:5:23:22:1:5:23:22 chr20 56190634 . C T 170.24 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0187725;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.671;QD=16.2131;RBI=0.023647;REFB=0.000169389;REVB=-0.0143797;RO=25;SAF=12;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115251;STB=0.576184;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.000287436;OID=.;OPOS=56190634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:25:24:18:18:0.428571:6:12:14:11:6:12:13:11 chr20 56227532 . T C 91.18 PASS AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0386301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5814;QD=17.3667;RBI=0.0537045;REFB=0.00199602;REVB=-0.037308;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25877;STB=0.646239;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00434044;OID=.;OPOS=56227532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:1:9:7:4:1:9 chr20 56793706 . G A 203.85 PASS AF=0.444444;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00105118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.9401;QD=15.1002;RBI=0.00831705;REFB=-0.0168888;REVB=-0.00825035;RO=30;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13075;STB=0.55995;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0298253;OID=.;OPOS=56793706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:30:30:23:24:0.444444:10:13:13:17:11:13:13:17 chr20 56793764 . G A 234.95 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00185654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.915;QD=18.7957;RBI=0.00373421;REFB=-0.00412987;REVB=0.00324;RO=26;SAF=11;SAR=12;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162328;STB=0.599215;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00548828;OID=.;OPOS=56793764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:27:23:23:0.46:12:11:8:18:12:11:8:19 chr20 56807969 . A G 361.99 PASS AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0173504;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.946;QD=22.9836;RBI=0.0289508;REFB=-0.00139939;REVB=0.0231757;RO=26;SAF=8;SAR=28;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125357;STB=0.583284;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.000800745;OID=.;OPOS=56807969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:27:36:36:0.571429:28:8:9:17:28:8:10:17 chr20 56814892 . G T 387.72 PASS AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0175249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7554;QD=18.4628;RBI=0.0421628;REFB=0.0126767;REVB=0.0383481;RO=44;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213421;STB=0.511899;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.0130791;OID=.;OPOS=56814892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:44:40:40:0.47619:20:20:23:21:20:20:23:21 chr20 56826020 . A G 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.10841;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.27;QD=15.2585;RBI=0.110583;REFB=0.00486953;REVB=-0.0218163;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363051;STB=0.744007;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00140187;OID=.;OPOS=56826020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:12:13:5:6:7:7:0.538462:2:5:1:4:2:5:1:5 chr20 57020556 . G C 560.85 PASS AF=0.472;AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0404489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.394;QD=17.9473;RBI=0.0404636;REFB=-0.0114646;REVB=0.00108983;RO=65;SAF=31;SAR=28;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103729;STB=0.561179;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.012753;OID=.;OPOS=57020556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:66:59:59:0.472:28:31:27:38:28:31:27:39 chr20 57045667 . T C 2991.85 PASS AF=1;AO=178;DP=181;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017167;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.058;QD=62.9864;RBI=0.035002;REFB=0;REVB=0.030503;RO=0;SAF=77;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03969e-05;OID=.;OPOS=57045667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:181:190:0:0:178:190:1:101:77:0:0:111:79:0:0 chr20 57045765 . A G 1282.02 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.026;QD=61.7841;RBI=0.040603;REFB=0;REVB=0.000196585;RO=0;SAF=24;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92906e-05;OID=.;OPOS=57045765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:59:24:0:0:59:24:0:0 chr20 57244493 . G A 754.35 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.51;QD=56.9318;RBI=0.026591;REFB=0;REVB=0.00258467;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111493;OID=.;OPOS=57244493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0 chr20 57266134 . G A 155.66 PASS AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0406068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.174;QD=9.43367;RBI=0.0406079;REFB=-0.0190547;REVB=-0.000308141;RO=45;SAF=10;SAR=11;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110283;STB=0.506506;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0339023;OID=.;OPOS=57266134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:11:10:21:24:11:10:21:24 chr20 57266506 . G A,GA 33.94 PASS AF=0,0.269231;AO=2,6;DP=26;FAO=0,7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=0,1;FSAR=0,6;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0280658,0.000746288;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=138.269,157.464;QD=5.22211;RBI=0.0280713,0.023353;REFB=-0.00952122,1.68244e-05;REVB=0.000557172,0.0233411;RO=17;SAF=0,0;SAR=2,6;SRF=3;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.423265,-0.655704;STB=0.5,0.521675;STBP=1,0.998;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00722063;OID=.,.;OPOS=57266506,57266507;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:34:26:26:17:19:2,6:0,7:0,0.269231:2,6:0,0:3:14:0,6:0,1:3:16 chr20 57268867 . C A 211.88 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.000643307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.99;QD=16.6181;RBI=0.0055624;REFB=-0.0130664;REVB=-0.00552507;RO=28;SAF=3;SAR=20;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520841;STB=0.529387;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0157157;OID=.;OPOS=57268867;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:20:3:3:25:20:3:3:25 chr20 57269495 . G A 124.88 PASS AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0390188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.684;QD=17.8403;RBI=0.0520284;REFB=-0.010154;REVB=0.0344164;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623504;STB=0.535663;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0102478;OID=.;OPOS=57269495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:8:6:7:7:8:6 chr20 57280575 . T C 1491.98 PASS AF=1;AO=98;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139169;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2504;QD=59.0885;RBI=0.0497222;REFB=0;REVB=0.0477349;RO=0;SAF=36;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407511;OID=.;OPOS=57280575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:101:0:0:98:101:1:62:36:0:0:64:37:0:0 chr20 57290347 . C G 521.25 PASS AF=0.482456;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.0587023;FXX=0.0172399;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0866;QD=18.2895;RBI=0.065211;REFB=-0.0179747;REVB=-0.0283992;RO=52;SAF=27;SAR=28;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07573;STB=0.526608;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00925942;OID=.;OPOS=57290347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:52:59:55:55:0.482456:28:27:30:22:28:27:32:27 chr20 57478807 . C T 1522.61 PASS AF=0.990385;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0508764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9647;QD=58.5621;RBI=0.0509073;REFB=-0.0370322;REVB=0.00177298;RO=1;SAF=50;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939493;STB=0.50495;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00205335;OID=.;OPOS=57478807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:103:104:1:1:102:103:0.990385:52:50:1:0:53:50:1:0 chr20 57571762 . CA C,CG 1044.48 PASS AF=0.175676,0.824324;AO=16,58;DP=76;FAO=13,61;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=11,26;FSAR=2,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232383,0.0336586;FXX=0.0133316;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=139.557,155.338;QD=56.4583;RBI=0.0282592,0.0350669;REFB=-0.0334855,-0.0182534;REVB=0.0160799,0.00983825;RO=2;SAF=14,22;SAR=2,36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0609953,-0.0409638;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0138317,0.0038627;OID=.,.;OPOS=57571763,57571763;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.175676,0.824324:16,58:76:13,61:74:0:11,26:2,35:0:0:47:2:14,22:2,36:2:0 chr20 57572675 . A G 1116.95 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.284;QD=60.3755;RBI=0.0185904;REFB=0;REVB=0.0153521;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20284e-05;OID=.;OPOS=57572675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0 chr20 57599016 . T G 501.6 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1298;QD=59.0123;RBI=0.02601;REFB=0;REVB=0.0119098;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315081;OID=.;OPOS=57599016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0 chr20 57612390 . C G 747.07 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3734;QD=63.5803;RBI=0.0344711;REFB=0;REVB=0.0233199;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.85404e-05;OID=.;OPOS=57612390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:35:12:0:0:35:12:0:0 chr20 57768940 . A C 33.29 PASS AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0221472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.718;QD=3.80478;RBI=0.0728104;REFB=-0.00331239;REVB=-0.0693603;RO=24;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258062;STB=0.675006;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.209946;OID=.;OPOS=57768940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:35:35:24:28:6:6:0.171429:5:1:8:16:5:1:9:19 chr20 57829301 . T C 613.32 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.957;QD=61.3318;RBI=0.0211489;REFB=0;REVB=-0.0154784;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203971;OID=.;OPOS=57829301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chr20 57833518 . G A 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00550297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.03;QD=18.4834;RBI=0.0304556;REFB=-0.00916179;REVB=0.0299543;RO=21;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272284;STB=0.654385;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00941439;OID=.;OPOS=57833518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:12:7:14:7:12:7:14:7 chr20 57833740 . T C 258.47 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00675994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.1397;QD=16.4106;RBI=0.0227463;REFB=0.0307942;REVB=0.0217186;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356394;STB=0.547137;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.0397853;OID=.;OPOS=57833740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:31:34:29:29:0.460317:17:12:14:17:17:12:17:17 chr20 57834150 . A T 351.65 PASS AF=0.529412;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0273894;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.7474;QD=20.6856;RBI=0.0287644;REFB=-0.0900333;REVB=0.00878722;RO=29;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190244;STB=0.60608;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0753703;OID=.;OPOS=57834150;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:29:32:36:36:0.529412:17:19:22:7:17:19:24:8 chr20 58883534 . T C 161.5 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00354543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.359;QD=19.0005;RBI=0.0133429;REFB=-0.0379495;REVB=0.0128632;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060353;STB=0.534371;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.027728;OID=.;OPOS=58883534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:5:12:11:6:5:12:11:6 chr20 60293852 . G C 321.52 PASS AF=0.443038;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0338235;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9811;QD=16.2792;RBI=0.0386263;REFB=-0.025082;REVB=-0.0186537;RO=44;SAF=21;SAR=14;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00934897;STB=0.50526;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0171774;OID=.;OPOS=60293852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:44:44:35:35:0.443038:14:21:26:18:14:21:26:18 chr20 60293919 . C A 1932.41 PASS AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1811;QD=61.8371;RBI=0.0654336;REFB=0;REVB=0.0195597;RO=0;SAF=63;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357627;OID=.;OPOS=60293919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:62:63:0:0:62:63:0:0 chr20 60294279 . A G 85.77 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0192838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3006;QD=11.8305;RBI=0.0255953;REFB=0.00969051;REVB=0.0168302;RO=17;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522142;STB=0.552534;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.0181857;OID=.;OPOS=60294279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:7:4:7:10:7:4:8:10 chr20 60294296 . G A 64.29 PASS AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0298744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3181;QD=9.8911;RBI=0.0344522;REFB=0.0156984;REVB=0.0171604;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908725;STB=0.555429;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=-0.0292313;OID=.;OPOS=60294296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:6:3:7:10:6:3:7:10 chr20 60294388 . C T 52.92 PASS AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.016777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.153;QD=21.1692;RBI=0.0214071;REFB=-0.00296212;REVB=0.0132964;RO=3;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505826;STB=0.529328;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00160543;OID=.;OPOS=60294388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:3:4:2:1:3:4:2:1 chr20 60485627 . C T 348.03 PASS AF=0.39604;AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0123025;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.232;QD=13.7832;RBI=0.0197952;REFB=-0.0279589;REVB=0.015508;RO=59;SAF=21;SAR=19;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106288;STB=0.549605;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0436878;OID=.;OPOS=60485627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:59:61:40:40:0.39604:19:21:25:34:19:21:27:34 chr20 60503350 . A G 707.51 PASS AF=0.45509;AO=76;DP=167;FAO=76;FDP=167;FR=.;FRO=91;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.00687798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9102;QD=16.9464;RBI=0.0188637;REFB=-0.00430742;REVB=-0.0175651;RO=91;SAF=35;SAR=41;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334478;STB=0.518572;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.00439019;OID=.;OPOS=60503350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:91:91:76:76:0.45509:41:35:45:46:41:35:45:46 chr20 60511860 . C T 456.08 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0218604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.255;QD=55.2819;RBI=0.0560901;REFB=-0.147825;REVB=0.0516548;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282865;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00153628;OID=.;OPOS=60511860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:33:33:1:1:32:32:0.969697:16:16:1:0:16:16:1:0 chr20 60572663 . C A 1347.16 PASS AF=0.988764;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0657646;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2179;QD=60.5465;RBI=0.0996265;REFB=-0.137235;REVB=0.0748361;RO=1;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106475;STB=0.505493;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.00334547;OID=.;OPOS=60572663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:89:89:1:1:87:88:0.988764:44:43:0:1:45:43:0:1 chr20 60712511 . A G 291.6 PASS AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0150978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.068;QD=19.44;RBI=0.02338;REFB=-0.0092901;REVB=-0.0178517;RO=29;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713473;STB=0.50397;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00989493;OID=.;OPOS=60712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:19:12:11:18:19:12:11:18 chr20 60713311 . G A 113.39 PASS AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=8.95729e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6018;QD=9.65022;RBI=0.0151145;REFB=-0.00105328;REVB=0.0151143;RO=32;SAF=12;SAR=2;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477269;STB=0.802334;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00332361;OID=.;OPOS=60713311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:32:33:14:14:0.297872:2:12:16:16:2:12:16:17 chr20 60713332 . A G 118.05 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0177785;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.422;QD=11.2425;RBI=0.0192282;REFB=-0.00369445;REVB=0.00732472;RO=30;SAF=11;SAR=2;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510669;STB=0.831612;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0137111;OID=.;OPOS=60713332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:30:28:13:14:0.333333:2:11:13:17:2:12:11:17 chr20 60768497 . C T 225.98 PASS AF=0.478261;AO=18;DP=43;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00940974;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.834;QD=19.6506;RBI=0.0240959;REFB=-0.0264825;REVB=0.0221827;RO=25;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155842;STB=0.526292;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.026083;OID=.;OPOS=60768497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:46:25:24:18:22:0.478261:6:12:13:12:9:13:13:11 chr20 60808026 . C T 415.77 PASS AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0116968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.825;QD=16.1465;RBI=0.0122523;REFB=-0.0226307;REVB=0.00364728;RO=57;SAF=24;SAR=22;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168362;STB=0.59392;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0246074;OID=.;OPOS=60808026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:57:57:46:46:0.446602:22:24:20:37:22:24:20:37 chr20 60831300 . G A 638.0 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226044;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.167;QD=60.7622;RBI=0.0261029;REFB=0;REVB=0.0130539;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445881;OID=.;OPOS=60831300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:16:24:0:0:16:26:0:0 chr20 60881330 . G A 1514.65 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.261;QD=62.4597;RBI=0.0948374;REFB=-0.0582177;REVB=0.0939892;RO=0;SAF=52;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000133771;OID=.;OPOS=60881330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:0:1:96:96:0.989691:44:52:0:0:44:52:0:1 chr20 60881780 . T C 638.46 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00741448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1258;QD=59.3912;RBI=0.0121032;REFB=-0.0505219;REVB=0.00956628;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218287;STB=0.511622;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0087805;OID=.;OPOS=60881780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:21:21:0:1:21:21:0:1 chr20 60887581 . G A 111.98 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.105854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0092;QD=16.5889;RBI=0.105854;REFB=-0.0133494;REVB=0.00015846;RO=12;SAF=11;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491152;STB=0.763427;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.040097;OID=.;OPOS=60887581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:12:14:13:13:0.481481:2:11:4:8:2:11:6:8 chr20 60892526 . A G 955.2 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.348;QD=58.7817;RBI=0.0143536;REFB=0;REVB=0.00484064;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51706e-05;OID=.;OPOS=60892526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0 chr20 60893639 . G C 263.53 PASS AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0052372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.309;QD=17.5685;RBI=0.0126478;REFB=-0.0158325;REVB=-0.0115125;RO=31;SAF=7;SAR=22;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959263;STB=0.554035;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0182196;OID=.;OPOS=60893639;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:22:7:10:21:22:7:10:21 chr20 60895697 . C T 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0569878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4667;QD=25.7116;RBI=0.0607381;REFB=-0.0369633;REVB=0.0210119;RO=5;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132375;STB=0.594902;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.013109;OID=.;OPOS=60895697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:5:6:13:13:0.684211:6:7:4:1:6:7:5:1 chr20 60897487 . CG CA,TG 517.19 PASS AF=0.564103,0.410256;AO=18,16;DP=39;FAO=22,16;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=8,10;FSAR=14,6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0815949,0.049284;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=45.5432,52.6229;QD=53.0447;RBI=0.0897599,0.0515009;REFB=-0.0347948,-0.00195811;REVB=0.0374046,0.0149476;RO=1;SAF=7,10;SAR=11,6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0399301,0.0701691;STB=0.517226,0.538413;STBP=0.519,0.27;TYPE=snp,snp;VARB=0.014984,0.0651645;OID=.,.;OPOS=60897488,60897487;OREF=G,C;OALT=A,T;OMAPALT=CA,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:39:39:1:1:18,16:22,16:0.564103,0.410256:11,6:7,10:0:1:14,6:8,10:0:1 chr20 60897772 . T C 370.92 PASS AF=0.493671;AO=37;DP=77;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0281959;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6498;QD=18.7806;RBI=0.03081;REFB=-0.0491188;REVB=0.0124197;RO=37;SAF=29;SAR=8;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240406;STB=0.620458;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0482211;OID=.;OPOS=60897772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:37:40:37:39:0.493671:8:29:21:16:9:30:23:17 chr20 60898908 . C T 197.75 PASS AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.058872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0807;QD=14.6482;RBI=0.0826618;REFB=-0.0138235;REVB=0.0580264;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15915;STB=0.590829;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0209317;OID=.;OPOS=60898908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:14:9:17:14:14:9:17:14 chr20 60899182 . C T 207.17 PASS AF=0.4375;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00242986;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6367;QD=17.2644;RBI=0.0130774;REFB=-0.037031;REVB=0.0128497;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276933;STB=0.657441;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0409472;OID=.;OPOS=60899182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:27:27:21:21:0.4375:13:8:18:9:13:8:18:9 chr20 60900481 . A G 1339.03 PASS AF=0.947368;AO=85;DP=92;FAO=90;FDP=95;FR=.;FRO=5;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0117514;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.6485;QD=56.38;RBI=0.0344587;REFB=-0.152356;REVB=0.032393;RO=7;SAF=42;SAR=43;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521586;STB=0.516963;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0175124;OID=.;OPOS=60900481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:92:95:7:5:85:90:0.947368:43:42:6:1:47:43:4:1 chr20 60900579 . C A 740.42 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.713;QD=56.9552;RBI=0.0540221;REFB=0;REVB=0.0196323;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524938;OID=.;OPOS=60900579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chr20 60904853 . T C 716.53 PASS AF=0.848485;AO=54;DP=64;FAO=56;FDP=66;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0031244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.095;QD=43.4261;RBI=0.0163498;REFB=-0.00125031;REVB=0.0160485;RO=10;SAF=21;SAR=33;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179867;STB=0.596119;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000389422;OID=.;OPOS=60904853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:64:66:10:10:54:56:0.848485:33:21:10:0:35:21:10:0 chr20 60905878 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.561;QD=37.4878;RBI=0.107927;REFB=0;REVB=-0.103001;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00180013;OID=.;OPOS=60905878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0 chr20 60907446 . T C 1153.59 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.365;QD=60.7154;RBI=0.0593962;REFB=0;REVB=0.0511489;RO=0;SAF=50;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118994;OID=.;OPOS=60907446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:26:50:0:0:26:50:0:0 chr20 60907675 . G A 411.06 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.124;QD=56.6987;RBI=0.0473823;REFB=0;REVB=0.0322461;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.11744e-05;OID=.;OPOS=60907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chr20 60908964 . G A 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1693;QD=39.2023;RBI=0.10186;REFB=0;REVB=0.093476;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00926334;OID=.;OPOS=60908964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr20 60908969 . T C 88.14 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9858;QD=39.1715;RBI=0.0255292;REFB=0;REVB=0.0219619;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148445;OID=.;OPOS=60908969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0 chr20 60909060 . A G 499.21 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0022448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.759;QD=58.7305;RBI=0.0466997;REFB=0;REVB=-0.0466457;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.20085e-05;OID=.;OPOS=60909060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:12:19:0:0:14:20:0:0 chr20 60911958 . G A 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00500336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.446;QD=15.8821;RBI=0.00936321;REFB=-0.027845;REVB=-0.0079143;RO=10;SAF=8;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121211;STB=0.571275;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0286468;OID=.;OPOS=60911958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:2:8:7:3:2:8:7:3 chr20 60912683 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4666;QD=56.7064;RBI=0.0406055;REFB=0;REVB=-0.0309839;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073251;OID=.;OPOS=60912683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr20 60913127 . A G 141.34 PASS AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00650074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.442;QD=21.7443;RBI=0.0367124;REFB=0.0219345;REVB=-0.0361323;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052179;STB=0.529373;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.0198006;OID=.;OPOS=60913127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:10:5:3:8:10:5:3:8 chr20 60917294 . G A 40.29 PASS AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.107328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.474;QD=14.6521;RBI=0.126248;REFB=0.0159525;REVB=-0.0664782;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.545304;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.0307234;OID=.;OPOS=60917294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:2:3:3:3:2:3 chr20 60920624 . A G 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0431838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.863;QD=25.7109;RBI=0.0432043;REFB=0.00104803;REVB=-0.00132924;RO=6;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246058;STB=0.63618;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.00307555;OID=.;OPOS=60920624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:5:8:6:0:5:8:6:0 chr20 60920887 . G A 120.47 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0369966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1115;QD=13.0241;RBI=0.0477807;REFB=0.00716722;REVB=-0.0302365;RO=22;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473803;STB=0.540483;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=-0.0140066;OID=.;OPOS=60920887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:37:22:23:14:14:0.378378:7:7:10:12:7:7:10:13 chr20 60921643 . T C 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.475;QD=46.8478;RBI=0.0656233;REFB=0;REVB=0.0564569;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135168;OID=.;OPOS=60921643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chr20 60927349 . C T 769.49 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.591;QD=56.9995;RBI=0.0231899;REFB=0;REVB=0.0207768;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55616e-05;OID=.;OPOS=60927349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0 chr20 60927412 . G A 193.19 PASS AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0297451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2543;QD=16.4414;RBI=0.0370248;REFB=-0.0144492;REVB=0.0220468;RO=27;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185573;STB=0.510628;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0168985;OID=.;OPOS=60927412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:10:10:14:13:10:10:14:13 chr20 60937597 . A G 390.39 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2805;QD=55.7695;RBI=0.0500463;REFB=0;REVB=0.0489745;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111901;OID=.;OPOS=60937597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:22:6:0:0:22:6:0:0 chr20 60963494 . C T 1268.42 PASS AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0405592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5502;QD=60.4009;RBI=0.111413;REFB=0.0332341;REVB=-0.103769;RO=1;SAF=47;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997129;STB=0.505262;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0165271;OID=.;OPOS=60963494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:36:47:1:0:36:47:1:0 chr20 60966318 . G T 465.7 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0917636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.473;QD=58.2124;RBI=0.104108;REFB=0;REVB=0.0491729;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118311;OID=.;OPOS=60966318;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:14:18:0:0 chr20 60989365 . C T 501.56 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8379;QD=59.0073;RBI=0.0712101;REFB=0;REVB=0.0487248;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188659;OID=.;OPOS=60989365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0 chr20 61039958 . T C 571.63 PASS AF=0.58427;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.032632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.575;QD=25.6912;RBI=0.0330639;REFB=-0.0248267;REVB=-0.00532667;RO=35;SAF=22;SAR=30;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255995;STB=0.503977;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00775377;OID=.;OPOS=61039958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:35:37:52:52:0.58427:30:22:16:19:30:22:16:21 chr20 61040453 . C G 165.85 PASS AF=0.387755;AO=16;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.00541855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3151;QD=13.539;RBI=0.0612414;REFB=-0.0158549;REVB=0.0610013;RO=24;SAF=15;SAR=1;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209089;STB=0.577528;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0178505;OID=.;OPOS=61040453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:30:16:19:0.387755:1:15:21:3:3:16:23:7 chr20 61040951 . C T 419.12 PASS AF=0.352113;AO=51;DP=142;FAO=50;FDP=142;FR=.;FRO=92;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=0.0528466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2804;QD=11.8061;RBI=0.0530265;REFB=0.00113486;REVB=-0.00436457;RO=91;SAF=19;SAR=32;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909132;STB=0.565344;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.00177209;OID=.;OPOS=61040951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:91:92:51:50:0.352113:32:19:41:50:32:18:42:50 chr20 61048549 . G A 260.2 PASS AF=0.467742;AO=28;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0158986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.04;QD=16.7868;RBI=0.0161028;REFB=-0.0142037;REVB=0.00255661;RO=32;SAF=20;SAR=8;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220779;STB=0.623672;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0210338;OID=.;OPOS=61048549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:33:28:29:0.467742:8:20:16:16:8:21:17:16 chr20 61167883 . G A 143.85 PASS AF=0.823529;AO=13;DP=16;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0447913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.234;QD=33.8477;RBI=0.0467124;REFB=-0.00100079;REVB=-0.0132583;RO=3;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436406;STB=0.52937;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.000304878;OID=.;OPOS=61167883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:17:3:3:13:14:0.823529:7:6:1:2:7:7:1:2 chr20 61326380 . C T 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.769;QD=60.9786;RBI=0.0492051;REFB=0;REVB=0.0490838;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149817;OID=.;OPOS=61326380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0 chr20 61448933 . C A 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0198073;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.741;QD=20.8722;RBI=0.0204293;REFB=-0.0123332;REVB=0.00500272;RO=19;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169149;STB=0.607374;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00470905;OID=.;OPOS=61448933;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:19:20:21:21:0.512195:8:13:8:11:8:13:8:12 chr20 61467800 . A G 335.33 PASS AF=0.492958;AO=29;DP=73;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0571773;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7263;QD=18.892;RBI=0.0578056;REFB=-0.0180619;REVB=0.00849984;RO=25;SAF=11;SAR=18;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868084;STB=0.597596;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0288535;OID=.;OPOS=61467800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:25:36:29:35:0.492958:18:11:12:13:23:12:19:17 chr20 61512606 . T C 651.18 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1657;QD=62.0172;RBI=0.027587;REFB=0;REVB=0.012535;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338193;OID=.;OPOS=61512606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:29:13:0:0:29:13:0:0 chr20 61522455 . T C 377.47 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00594209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3765;QD=16.2352;RBI=0.0269948;REFB=-0.00731998;REVB=0.0263327;RO=52;SAF=20;SAR=20;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155137;STB=0.580606;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00969264;OID=.;OPOS=61522455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:53:40:40:0.430108:20:20:18:34:20:20:19:34 chr20 61528074 . T C 436.86 PASS AF=0.429825;AO=49;DP=116;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.00105893;FXX=0.0172399;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.411;QD=15.3284;RBI=0.00305428;REFB=-0.0240762;REVB=-0.00286484;RO=65;SAF=21;SAR=28;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459769;STB=0.525763;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0347747;OID=.;OPOS=61528074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:65:65:49:49:0.429825:28:21:25:40:28:21:25:40 chr20 61576777 . A G 119.5 PASS AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.020531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.272;QD=13.6571;RBI=0.0332019;REFB=-0.0261681;REVB=-0.026093;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40921;STB=0.725488;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0429955;OID=.;OPOS=61576777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:20:21:14:14:0.4:10:4:14:6:10:4:14:7 chr20 61577275 . T C 760.44 PASS AF=1;AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029959;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.996;QD=63.37;RBI=0.0306696;REFB=0;REVB=0.00656358;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320672;OID=.;OPOS=61577275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:48:0:0:45:48:1:27:18:0:0:27:21:0:0 chr20 61588159 . A G 801.26 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0890269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0396;QD=57.2329;RBI=0.0933531;REFB=0;REVB=0.0280895;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000440484;OID=.;OPOS=61588159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0 chr20 61594679 . A G 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00519624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.345;QD=63.5829;RBI=0.0404619;REFB=0;REVB=0.0401269;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76142e-05;OID=.;OPOS=61594679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0 chr20 61597946 . CTTA CTA,CTAC 735.11 PASS AF=1,0;AO=50,4;DP=57;FAO=56,0;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0;FSAR=30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0407399,-0.0253312;FXX=0.0175408;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=23.514,11.5979;QD=52.5076;RBI=0.0469101,0.0563201;REFB=0,0;REVB=0.0232554,-0.0503019;RO=0;SAF=23,2;SAR=27,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.000320862,-0.00866217;OID=.,.;OPOS=61597947,61597948;OREF=T,TA;OALT=-,AC;OMAPALT=CTA,CTAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:50,4:57:56,0:56:0:26,0:30,0:0:0:4:0:23,2:27,2:0:0 chr20 61827841 . CA C 30.91 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0124092;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=8.32314;QD=4.57876;RBI=0.0813853;REFB=-0.0561782;REVB=-0.0804337;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202882;STB=0.636033;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=0.0493352;OID=.;OPOS=61827842;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333:10:27:9:27:18:7:2:11:7:30:14:8:2:9:5 chr20 61834695 . G A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.295;QD=62.3507;RBI=0.0192206;REFB=0;REVB=0.016007;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187639;OID=.;OPOS=61834695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0 chr20 61869826 . C T 390.85 PASS AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=0.0218901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9591;QD=16.632;RBI=0.0557829;REFB=0.0123773;REVB=0.0513085;RO=53;SAF=25;SAR=16;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337847;STB=0.518957;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.0116596;OID=.;OPOS=61869826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:16:25:34:19:16:25:34:19 chr20 61870727 . G C 55.41 PASS AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0359457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.05;QD=10.0752;RBI=0.0374062;REFB=-0.0258329;REVB=0.0103504;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118061;STB=0.590689;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0234573;OID=.;OPOS=61870727;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:4:4:5:8:4:4:5:9 chr20 61880169 . T G 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0116412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.407;QD=9.19977;RBI=0.0117141;REFB=-0.0162968;REVB=-0.00130483;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194284;STB=0.619384;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0327508;OID=.;OPOS=61880169;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:5:8:3:4:5:8 chr20 61881296 . A G 1491.68 PASS AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00389493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.282;QD=63.4758;RBI=0.0164519;REFB=0;REVB=0.0159842;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.28346e-05;OID=.;OPOS=61881296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:51:43:0:0:51:43:0:0 chr20 61918164 . C G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.809;QD=43.4862;RBI=0.061979;REFB=0;REVB=0.0574829;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138496;OID=.;OPOS=61918164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:1:11:0:0:1:11:0:0 chr20 61941747 . A G 603.21 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.952;QD=60.3206;RBI=0.0466377;REFB=0;REVB=0.0426348;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194953;OID=.;OPOS=61941747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:20:18:0:0:21:19:0:0 chr20 61951489 . G C 191.24 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0835239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8929;QD=47.8101;RBI=0.0921078;REFB=0;REVB=-0.0388281;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00485499;OID=.;OPOS=61951489;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0 chr20 61956782 . T C 821.78 PASS AF=1;AO=48;DP=60;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.112216;FXX=0.0499917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8839;QD=57.669;RBI=0.112575;REFB=0;REVB=0.00897838;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130252;OID=.;OPOS=61956782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:57:0:0:48:57:1:34:14:0:0:41:16:0:0 chr20 61981104 . C T 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.093;QD=55.0982;RBI=0.0605218;REFB=0;REVB=0.0344493;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00229389;OID=.;OPOS=61981104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:7:19:0:0:7:19:0:0 chr20 61981134 . G A 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.032922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.43;QD=8.69136;RBI=0.0696776;REFB=-0.0148981;REVB=0.0614094;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238253;STB=0.654846;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0360804;OID=.;OPOS=61981134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:16:17:8:8:0.32:3:5:13:3:3:5:14:3 chr20 61981536 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00671637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.974;QD=55.0984;RBI=0.0623146;REFB=0;REVB=-0.0619516;RO=0;SAF=20;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000978644;OID=.;OPOS=61981536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:6:20:0:0:6:20:0:0 chr20 61981554 . C A 535.72 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357129;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.71;QD=57.9155;RBI=0.0691331;REFB=0;REVB=0.0591943;RO=0;SAF=25;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00377552;OID=.;OPOS=61981554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:37:0:0:34:37:1:9:25:0:0:11:26:0:0 chr20 61981574 . C T 254.06 PASS AF=0.52;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00389407;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.036;QD=20.3247;RBI=0.0144216;REFB=-0.00950821;REVB=-0.0138859;RO=24;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108409;STB=0.560837;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0101997;OID=.;OPOS=61981574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:24:24:26:26:0.52:7:19:15:9:7:19:15:9 chr20 61982085 . A G 960.46 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.273;QD=58.2097;RBI=0.0302749;REFB=0;REVB=-0.0102378;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520862;OID=.;OPOS=61982085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:27:38:0:0:27:39:0:0 chr20 61982124 . A G 1116.93 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.333;QD=60.3748;RBI=0.0148719;REFB=0;REVB=-0.00569956;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9173e-05;OID=.;OPOS=61982124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0 chr20 62038277 . T G 2346.17 PASS AF=0.99375;AO=107;DP=154;FAO=159;FDP=160;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=74;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312287;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7961;QD=58.6542;RBI=0.252502;REFB=0;REVB=0.250563;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0127273;OID=.;OPOS=62038277;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:154:160:0:0:107:159:0.99375:45:62:0:0:85:74:0:0 chr20 62038378 . A T 102.07 PASS AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0152331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.38;QD=29.1641;RBI=0.033584;REFB=0.0246178;REVB=-0.0299305;RO=3;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117458;STB=0.56511;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=-0.00248376;OID=.;OPOS=62038378;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:10:1:0:3:10:1:0:3 chr20 62070966 . G A 473.01 PASS AF=0.505495;AO=41;DP=87;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0059664;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.585;QD=20.7917;RBI=0.0430154;REFB=-0.0242936;REVB=0.0425996;RO=46;SAF=13;SAR=28;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163853;STB=0.586062;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0197184;OID=.;OPOS=62070966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:91:46:45:41:46:0.505495:28:13:22:24:31:15:22:23 chr20 62126185 . A G 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0171351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0529;QD=16.1063;RBI=0.10509;REFB=-0.0167139;REVB=-0.103684;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161818;STB=0.592708;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0160438;OID=.;OPOS=62126185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:14:8:9:8:14:8 chr20 62126299 . C T 322.89 PASS AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0114469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.907;QD=14.1928;RBI=0.0158301;REFB=-0.0191711;REVB=-0.0109344;RO=55;SAF=11;SAR=25;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264201;STB=0.650707;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0125156;OID=.;OPOS=62126299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:25:11:30:25:25:11:30:25 chr20 62172219 . G A 1303.28 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.92;QD=62.0612;RBI=0.108344;REFB=0;REVB=0.108287;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156934;OID=.;OPOS=62172219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:42:40:0:0:44:40:0:0 chr20 62173562 . G T 803.5 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0090982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.127;QD=55.4139;RBI=0.0179476;REFB=-0.0972724;REVB=0.0154706;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00103459;OID=.;OPOS=62173562;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:25:32:0:0:25:32:1:0 chr20 62174724 . G A 728.26 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4191;QD=63.327;RBI=0.151255;REFB=0;REVB=0.149909;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193263;OID=.;OPOS=62174724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:46:0:0:43:46:1:16:27:0:0:19:27:0:0 chr20 62187187 . T C 93.39 PASS AF=0.342857;AO=11;DP=34;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00399821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.103;QD=10.6734;RBI=0.0170172;REFB=-0.016325;REVB=-0.0165409;RO=23;SAF=3;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375094;STB=0.67895;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0451481;OID=.;OPOS=62187187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:34:35:23:23:11:12:0.342857:8:3:14:9:8:4:14:9 chr20 62187439 . T C 37.43 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0150679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3141;QD=8.80606;RBI=0.0747279;REFB=-0.00575035;REVB=-0.073193;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471991;STB=0.784921;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0226303;OID=.;OPOS=62187439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:4:2:9:2:4:2:9:2 chr20 62191321 . A G 682.19 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.105;QD=62.0176;RBI=0.0220109;REFB=0;REVB=-0.0219187;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259603;OID=.;OPOS=62191321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:18:25:0:0:18:26:0:0 chr20 62191937 . G A 147.23 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.000560514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.949;QD=17.3212;RBI=0.01828;REFB=-0.00332817;REVB=-0.0182714;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281531;STB=0.661448;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00719283;OID=.;OPOS=62191937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:5:11:7:11:5:11:7:11 chr20 62193019 . C T 89.17 PASS AF=0.324324;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0107439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.398;QD=9.63994;RBI=0.0138963;REFB=-0.0307906;REVB=-0.00881346;RO=21;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501047;STB=0.76628;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0293196;OID=.;OPOS=62193019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:35:37:21:25:11:12:0.324324:3:8:5:16:4:8:6:19 chr20 62193445 . G A 196.72 PASS AF=0.465116;AO=19;DP=42;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00636311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.601;QD=18.2997;RBI=0.00792885;REFB=0.000836576;REVB=0.00473048;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668713;STB=0.548338;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.000606202;OID=.;OPOS=62193445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:23:23:19:20:0.465116:7:12:13:10:7:13:13:10 chr20 62194030 . G C 1713.62 PASS AF=1;AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.008;QD=60.659;RBI=0.0300302;REFB=0;REVB=0.0194951;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9263e-05;OID=.;OPOS=62194030;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:113:113:0:0:112:113:1:49:63:0:0:49:64:0:0 chr20 62194103 . A G 696.05 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.823;QD=61.8713;RBI=0.054734;REFB=0;REVB=0.0375424;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168713;OID=.;OPOS=62194103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0 chr20 62194128 . G A 215.99 PASS AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0116432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1797;QD=15.1573;RBI=0.046945;REFB=0.0217284;REVB=0.0454782;RO=31;SAF=14;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198351;STB=0.619547;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.0191463;OID=.;OPOS=62194128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:11:14:11:20:11:14:11:21 chr20 62195220 . C T 83.58 PASS AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00137669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.427;QD=20.8957;RBI=0.0129149;REFB=-0.022837;REVB=0.0128413;RO=6;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174376;STB=0.5998;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00480265;OID=.;OPOS=62195220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:6:4:4:2:6:4:4:2 chr20 62195672 . C T 74.24 PASS AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0336214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.824;QD=10.2402;RBI=0.0339489;REFB=-0.0188487;REVB=0.00470421;RO=19;SAF=2;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475763;STB=0.788143;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0390255;OID=.;OPOS=62195672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:8:2:12:7:8:2:12:7 chr20 62196033 . C T 198.54 PASS AF=0.487805;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00511364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3762;QD=19.3699;RBI=0.0237064;REFB=-0.0162784;REVB=-0.0231483;RO=21;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284676;STB=0.638681;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00953979;OID=.;OPOS=62196033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:21:21:19:20:0.487805:13:6:13:8:13:7:13:8 chr20 62196182 . G C 172.43 PASS AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00977768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8146;QD=19.1588;RBI=0.0310127;REFB=-0.0252151;REVB=0.0294311;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210219;STB=0.610988;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0235787;OID=.;OPOS=62196182;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:36:17:18:17:18:0.5:11:6:10:7:11:7:11:7 chr20 62196807 . T C 708.56 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000376421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.94;QD=62.9828;RBI=0.0342376;REFB=0;REVB=0.0342355;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173953;OID=.;OPOS=62196807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0 chr20 62196884 . A G 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.014;QD=58.4197;RBI=0.0153128;REFB=0;REVB=-0.0138363;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.93622e-05;OID=.;OPOS=62196884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0 chr20 62198236 . G A 162.49 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.007409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.85;QD=19.6955;RBI=0.0251534;REFB=-0.0379173;REVB=-0.0240375;RO=16;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191794;STB=0.60924;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0525169;OID=.;OPOS=62198236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:5:12:8:8:5:12:8:8 chr20 62198348 . C T 885.43 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.679;QD=58.0611;RBI=0.0552643;REFB=0;REVB=0.0169897;RO=0;SAF=15;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.29692e-05;OID=.;OPOS=62198348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:45:15:0:0:45:16:0:0 chr20 62198662 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.905;QD=44.6897;RBI=0.0546737;REFB=0;REVB=-0.019978;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107825;OID=.;OPOS=62198662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0 chr20 62200575 . TG CA,CG 517.07 PASS AF=0.5,0.5;AO=18,18;DP=36;FAO=18,18;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7,14;FSAR=11,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160125,-0.065339;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=71.1344,66.0062;QD=57.4518;RBI=0.0860807,0.107144;REFB=0,0;REVB=0.0845783,0.0849159;RO=0;SAF=7,14;SAR=11,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-2.33768e-05,0.0169821;OID=.,.;OPOS=62200575,62200575;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:36:36:0:0:18,18:18,18:0.5,0.5:11,4:7,14:0:0:11,4:7,14:0:0 chr20 62200860 . A G 535.94 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.206;QD=59.5486;RBI=0.0651441;REFB=0;REVB=0.0475092;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047659;OID=.;OPOS=62200860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:10:24:0:0:11:25:0:0 chr20 62221364 . G A 169.49 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.052501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.107;QD=16.5358;RBI=0.0525013;REFB=-0.0306301;REVB=0.00016836;RO=23;SAF=2;SAR=16;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373833;STB=0.72042;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0260159;OID=.;OPOS=62221364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:16:2:8:15:16:2:8:15 chr20 62221610 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.533;QD=57.3857;RBI=0.011202;REFB=0;REVB=0.00458875;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.63626e-05;OID=.;OPOS=62221610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0 chr20 62221766 . C T 84.26 PASS AF=0.314286;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00755436;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.776;QD=9.62938;RBI=0.00969237;REFB=-0.016374;REVB=0.00607237;RO=23;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20057;STB=0.61155;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0247885;OID=.;OPOS=62221766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:36:35:23:24:11:11:0.314286:8:3:10:13:8:3:10:14 chr20 62227081 . A G 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00888428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.519;QD=62.671;RBI=0.0157484;REFB=0;REVB=0.0130031;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.72809e-05;OID=.;OPOS=62227081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0 chr20 62236148 . T C 199.99 PASS AF=0.431373;AO=20;DP=49;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00802937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.606;QD=15.6852;RBI=0.0289496;REFB=-0.0398423;REVB=0.0278138;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224634;STB=0.593556;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0434131;OID=.;OPOS=62236148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:29:29:20:22:0.431373:8:12:11:18:10:12:11:18 chr20 62309554 . C T 243.33 PASS AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0208417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.621;QD=12.807;RBI=0.0222451;REFB=-0.0100789;REVB=-0.0077761;RO=47;SAF=15;SAR=14;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529714;STB=0.530351;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0176245;OID=.;OPOS=62309554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:47:47:29:29:0.381579:14:15:22:25:14:15:22:25 chr20 62319464 . T C 229.71 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0164984;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.765;QD=28.7141;RBI=0.0278067;REFB=-0.0428514;REVB=0.0223833;RO=10;SAF=17;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963411;STB=0.543336;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0212211;OID=.;OPOS=62319464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:32:32:10:11:21:21:0.65625:4:17:7:3:4:17:8:3 chr20 62320968 . T C 157.85 PASS AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0633961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.888;QD=16.6156;RBI=0.0634;REFB=-0.0108636;REVB=0.000709957;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277875;STB=0.659999;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0144623;OID=.;OPOS=62320968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:12:5:12:9:12:5:12:9 chr20 62321655 . G A 239.81 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00406457;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.672;QD=16.2583;RBI=0.0337278;REFB=-0.0254639;REVB=0.0334819;RO=32;SAF=13;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122563;STB=0.506913;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0129009;OID=.;OPOS=62321655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:14:13:15:17:14:13:15:17 chr20 62322288 . T C 423.13 PASS AF=0.506024;AO=34;DP=85;FAO=42;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00584337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.451;QD=20.3918;RBI=0.00926614;REFB=-0.0263707;REVB=0.00719141;RO=42;SAF=11;SAR=23;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112203;STB=0.517474;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0257822;OID=.;OPOS=62322288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:83:42:41:34:42:0.506024:23:11:18:24:24:18:19:22 chr20 62324289 . C T 1406.25 PASS AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0124987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6901;QD=60.4839;RBI=0.0288523;REFB=-0.0717989;REVB=0.0260046;RO=2;SAF=56;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263128;STB=0.513886;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00118454;OID=.;OPOS=62324289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:93:93:2:2:91:91:0.978495:35:56:0:2:35:56:0:2 chr20 62326110 . A C 260.49 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0591082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.744;QD=14.4714;RBI=0.0946012;REFB=0.00742144;REVB=-0.0738622;RO=42;SAF=18;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12846;STB=0.572985;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.0100576;OID=.;OPOS=62326110;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:12:18:20:22:12:18:20:22 chr20 62328267 . C T 239.49 PASS AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.019923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.916;QD=18.075;RBI=0.0380681;REFB=-0.010361;REVB=0.0324384;RO=27;SAF=6;SAR=20;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196797;STB=0.611418;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0200602;OID=.;OPOS=62328267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:20:6:11:16:20:6:11:16 chr20 62328375 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.194;QD=58.5878;RBI=0.0146277;REFB=0;REVB=0.00043061;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77021e-05;OID=.;OPOS=62328375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0 chr20 62328453 . T C 96.2 PASS AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0292946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.178;QD=12.0244;RBI=0.030335;REFB=-0.00821213;REVB=0.00787651;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191599;STB=0.613216;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0124265;OID=.;OPOS=62328453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:12:8:7:5:12:8 chr20 62328742 . C T 217.27 PASS AF=0.552632;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0151428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.548;QD=22.8704;RBI=0.0167809;REFB=-0.0557579;REVB=0.00723137;RO=16;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225777;STB=0.596923;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.036718;OID=.;OPOS=62328742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:16:17:20:21:0.552632:12:8:11:5:12:9:11:6 chr20 62328829 . C G 253.95 PASS AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00998363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.34;QD=21.613;RBI=0.0151707;REFB=-0.00386712;REVB=0.0114227;RO=23;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592592;STB=0.533186;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00372981;OID=.;OPOS=62328829;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:11:13:14:9:11:13:14:9 chr20 62331989 . T G 267.16 PASS AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.066471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7922;QD=18.4247;RBI=0.0735777;REFB=-0.00360537;REVB=-0.0315481;RO=27;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126706;STB=0.568674;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00417448;OID=.;OPOS=62331989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:29:29:29:0.5:14:15:10:17:14:15:11:18 chr20 62332641 . T C 452.09 PASS AF=0.564103;AO=43;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0135755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.164;QD=23.1838;RBI=0.0251404;REFB=-0.0168745;REVB=0.0211599;RO=35;SAF=11;SAR=32;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167213;STB=0.599952;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0122508;OID=.;OPOS=62332641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:34:43:44:0.564103:32:11:15:20:33:11:15:19 chr20 62340115 . C G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.882;QD=57.2025;RBI=0.0640231;REFB=0;REVB=0.0629725;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226714;OID=.;OPOS=62340115;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0 chr20 62372813 . G A 411.78 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010864;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.812;QD=56.7969;RBI=0.0109983;REFB=0;REVB=-0.00171337;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112226;OID=.;OPOS=62372813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:15:13:0:0:16:13:0:0 chr20 62373707 . G T 298.19 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0211882;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.522;QD=15.694;RBI=0.0258943;REFB=-0.028992;REVB=-0.0148854;RO=42;SAF=10;SAR=23;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29727;STB=0.66245;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0293303;OID=.;OPOS=62373707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:43:33:33:0.434211:23:10:25:17:23:10:25:18 chr20 62378349 . C T 227.22 PASS AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0319286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3338;QD=28.4026;RBI=0.105086;REFB=-0.000587792;REVB=0.100118;RO=11;SAF=9;SAR=12;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414906;STB=0.522914;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00440409;OID=.;OPOS=62378349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:12:9:4:7:12:9:4:7 chr20 62378364 . C T 207.32 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.015944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.918;QD=24.3902;RBI=0.0224399;REFB=-0.0101637;REVB=-0.0157904;RO=14;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105524;STB=0.558765;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00635662;OID=.;OPOS=62378364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:10:10:5:9:10:10:5:9 chr20 62522466 . A G 442.84 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.132;QD=57.1412;RBI=0.0534457;REFB=0;REVB=0.046748;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35171e-05;OID=.;OPOS=62522466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:14:17:0:0 chr20 62540460 . A G 239.44 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3172;QD=50.4083;RBI=0.0235295;REFB=0;REVB=-0.022192;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454688;OID=.;OPOS=62540460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr20 62576991 . G A 181.99 PASS AF=0.422222;AO=20;DP=46;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0266971;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.125;QD=16.1767;RBI=0.0334257;REFB=-0.00247747;REVB=0.0201132;RO=26;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515206;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00348239;OID=.;OPOS=62576991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:26:26:20:19:0.422222:10:10:13:13:10:9:13:13 chr20 62698333 . A T 176.16 PASS AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0128765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.697;QD=10.2123;RBI=0.0143949;REFB=-0.000406564;REVB=-0.00643509;RO=46;SAF=10;SAR=13;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123529;STB=0.572264;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00100298;OID=.;OPOS=62698333;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:46:46:23:23:0.333333:13:10:25:21:13:10:25:21 chr20 62714783 . C G 2303.22 PASS AF=0.980892;AO=153;DP=153;FAO=154;FDP=157;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=96;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0781177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.189;QD=58.6808;RBI=0.0948142;REFB=-0.114532;REVB=0.0537343;RO=0;SAF=58;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500881;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00260517;OID=.;OPOS=62714783;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:153:157:0:3:153:154:0.980892:95:58:0:0:96:58:1:2 chr20 62737318 . G A 1043.61 PASS AF=0.96;AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0352213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.155;QD=55.659;RBI=0.0366978;REFB=-0.042071;REVB=0.0103046;RO=3;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349969;STB=0.518513;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.000923067;OID=.;OPOS=62737318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:75:75:3:3:72:72:0.96:39:33:0:3:39:33:0:3 chr20 62863580 . C T 629.91 PASS AF=0.5625;AO=62;DP=112;FAO=63;FDP=112;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.000787464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.972;QD=22.4968;RBI=0.0208877;REFB=-0.0269876;REVB=0.0208728;RO=50;SAF=33;SAR=29;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263559;STB=0.52188;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0193867;OID=.;OPOS=62863580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:50:49:62:63:0.5625:29:33:25:25:29:34:24:25 chr20 62959184 . T C 80.91 PASS AF=0.189189;AO=14;DP=74;FAO=14;FDP=74;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=0.0096062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9004;QD=4.37342;RBI=0.0329569;REFB=-0.00632614;REVB=-0.0315259;RO=60;SAF=4;SAR=10;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114736;STB=0.575109;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.036781;OID=.;OPOS=62959184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:74:74:60:60:14:14:0.189189:10:4:22:38:10:4:22:38 chr21 9907271 . A G 1021.31 PASS AF=0.509901;AO=103;DP=201;FAO=103;FDP=202;FR=.;FRO=99;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.052605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1783;QD=20.2239;RBI=0.153648;REFB=-0.0279125;REVB=-0.144362;RO=98;SAF=43;SAR=60;SRF=40;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852671;STB=0.50168;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0257607;OID=.;OPOS=9907271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:98:99:103:103:0.509901:60:43:40:58:60:43:41:58 chr21 9907324 . G C 487.36 PASS AF=0.281513;AO=67;DP=238;FAO=67;FDP=238;FR=.;FRO=171;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=76;FSRR=95;FWDB=-0.0156187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.917;QD=8.19096;RBI=0.0157248;REFB=-0.0128305;REVB=0.00182306;RO=171;SAF=25;SAR=42;SRF=76;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905737;STB=0.553264;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0270526;OID=.;OPOS=9907324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:171:171:67:67:0.281513:42:25:76:95:42:25:76:95 chr21 9907340 . A G 1635.83 PASS AF=0.62069;AO=144;DP=232;FAO=144;FDP=232;FR=.;FRO=88;FSAF=58;FSAR=86;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.00331928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.538;QD=28.204;RBI=0.00852127;REFB=-0.0131808;REVB=-0.00784821;RO=88;SAF=58;SAR=86;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618873;STB=0.533402;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00496712;OID=.;OPOS=9907340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:88:88:144:144:0.62069:86:58:43:45:86:58:43:45 chr21 9907345 . C T 422.84 PASS AF=0.264069;AO=61;DP=231;FAO=61;FDP=231;FR=.;FRO=170;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=67;FSRR=103;FWDB=0.00939905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.58;QD=7.32192;RBI=0.0215319;REFB=-0.00924628;REVB=-0.0193721;RO=170;SAF=33;SAR=28;SRF=67;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18116;STB=0.606873;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0177738;OID=.;OPOS=9907345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:170:170:61:61:0.264069:28:33:67:103:28:33:67:103 chr21 9907375 . T C 857.1 PASS AF=0.458333;AO=88;DP=194;FAO=88;FDP=192;FR=.;FRO=104;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=0.00568579;FXX=0.0103087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5611;QD=17.8562;RBI=0.0157001;REFB=-0.000859442;REVB=-0.0146344;RO=104;SAF=41;SAR=47;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232199;STB=0.512863;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.000486817;OID=.;OPOS=9907375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:192:104:104:88:88:0.458333:47:41:46:58:47:41:46:58 chr21 9907384 . G A 850.36 PASS AF=0.47541;AO=86;DP=183;FAO=87;FDP=183;FR=.;FRO=96;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=55;FWDB=0.00566636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.751;QD=18.5871;RBI=0.00814329;REFB=-0.0201618;REVB=-0.00584855;RO=96;SAF=37;SAR=49;SRF=41;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00306592;STB=0.505176;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0148037;OID=.;OPOS=9907384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:96:96:86:87:0.47541:49:37:41:55:49:38:41:55 chr21 9907397 . C T 810.77 PASS AF=0.494048;AO=83;DP=168;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=-0.0159168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.234;QD=19.3041;RBI=0.0160962;REFB=-0.0139716;REVB=-0.00239618;RO=85;SAF=36;SAR=47;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00955458;STB=0.505262;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0130361;OID=.;OPOS=9907397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:85:85:83:83:0.494048:47:36:36:49:47:36:36:49 chr21 9907416 . C T 149.23 PASS AF=0.188406;AO=26;DP=138;FAO=26;FDP=138;FR=.;FRO=112;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=72;FWDB=-0.0294047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.213;QD=4.32543;RBI=0.0299855;REFB=-0.0105381;REVB=-0.0058732;RO=112;SAF=13;SAR=13;SRF=40;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184332;STB=0.615858;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0472748;OID=.;OPOS=9907416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:112:112:26:26:0.188406:13:13:40:72:13:13:40:72 chr21 9907419 . A G 250.53 PASS AF=0.28;AO=34;DP=125;FAO=35;FDP=125;FR=.;FRO=90;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=56;FWDB=-0.0129077;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.779;QD=8.01697;RBI=0.0129078;REFB=-0.0176974;REVB=3.07009e-05;RO=88;SAF=14;SAR=20;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466593;STB=0.537715;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0337153;OID=.;OPOS=9907419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:88:90:34:35:0.28:20:14:33:55:20:15:34:56 chr21 9907422 . G A 245.08 PASS AF=0.293103;AO=34;DP=116;FAO=34;FDP=116;FR=.;FRO=82;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.00847544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1104;QD=8.45103;RBI=0.0180521;REFB=-0.00145819;REVB=0.0159388;RO=82;SAF=16;SAR=18;SRF=33;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826621;STB=0.54859;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0021757;OID=.;OPOS=9907422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:82:82:34:34:0.293103:18:16:33:49:18:16:33:49 chr21 9908330 . AC GC,GG 3360.81 PASS AF=0.351111,0.648889;AO=74,146;DP=230;FAO=79,146;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=38,59;FSAR=41,87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00131041,-0.00450346;FXX=0.0217382;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=164.938,114.743;QD=59.7477;RBI=0.0195302,0.0451948;REFB=-0.0695419,-0.047402;REVB=-0.0194862,-0.0449699;RO=1;SAF=38,59;SAR=36,87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0129601,0.00543546;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0235503,-0.00252539;OID=.,.;OPOS=9908330,9908330;OREF=A,AC;OALT=G,GG;OMAPALT=GC,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:230:225:1:0:74,146:79,146:0.351111,0.648889:36,87:38,59:0:1:41,87:38,59:0:0 chr21 9908380 . G A 49.14 PASS AF=0.0719424;AO=20;DP=278;FAO=20;FDP=278;FR=.;FRO=258;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=114;FSRR=144;FWDB=-0.02211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2317;QD=0.707057;RBI=0.0293346;REFB=-0.00280754;REVB=0.0192787;RO=257;SAF=6;SAR=14;SRF=114;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165976;STB=0.639125;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0307366;OID=.;OPOS=9908380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:278:278:257:258:20:20:0.0719424:14:6:114:143:14:6:114:144 chr21 9909078 . G A 1259.37 PASS AF=0.585;AO=117;DP=201;FAO=117;FDP=200;FR=.;FRO=83;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=0.0138544;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.295;QD=25.1874;RBI=0.0399314;REFB=-0.0266076;REVB=0.0374509;RO=83;SAF=58;SAR=59;SRF=33;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751936;STB=0.540751;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0175578;OID=.;OPOS=9909078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:83:83:117:117:0.585:59:58:33:50:59:58:33:50 chr21 9909080 . G A 377.4 PASS AF=0.2657;AO=55;DP=208;FAO=55;FDP=207;FR=.;FRO=152;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=64;FSRR=88;FWDB=0.00778447;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.087;QD=7.29269;RBI=0.0248162;REFB=-0.0198879;REVB=0.0235636;RO=151;SAF=31;SAR=24;SRF=63;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179647;STB=0.603579;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0403354;OID=.;OPOS=9909080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:151:152:55:55:0.2657:24:31:63:88:24:31:64:88 chr21 9909103 . G A 93.35 PASS AF=0.101887;AO=27;DP=265;FAO=27;FDP=265;FR=.;FRO=238;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=111;FSRR=127;FWDB=-0.0104309;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.546;QD=1.40908;RBI=0.0215006;REFB=-0.00670426;REVB=0.0188008;RO=233;SAF=14;SAR=13;SRF=107;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723684;STB=0.546688;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0300342;OID=.;OPOS=9909103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:265:265:233:238:27:27:0.101887:13:14:107:126:13:14:111:127 chr21 9909124 . C T 100.65 PASS AF=0.0990099;AO=30;DP=303;FAO=30;FDP=303;FR=.;FRO=273;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=135;FSRR=138;FWDB=0.00528299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.451;QD=1.32868;RBI=0.00823018;REFB=-0.00195562;REVB=-0.00631078;RO=273;SAF=9;SAR=21;SRF=135;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239167;STB=0.678667;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.020917;OID=.;OPOS=9909124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:303:273:273:30:30:0.0990099:21:9:135:138:21:9:135:138 chr21 9909149 . G A 177.56 PASS AF=0.132492;AO=42;DP=316;FAO=42;FDP=317;FR=.;FRO=275;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=131;FSRR=144;FWDB=0.000158679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.332;QD=2.24047;RBI=0.0161919;REFB=-0.0049911;REVB=0.0161911;RO=273;SAF=20;SAR=22;SRF=130;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500151;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0317045;OID=.;OPOS=9909149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:317:273:275:42:42:0.132492:22:20:130:143:22:20:131:144 chr21 9909176 . C A 2690.67 PASS AF=0.707937;AO=221;DP=315;FAO=223;FDP=315;FR=.;FRO=92;FSAF=110;FSAR=113;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=0.0686215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.42;QD=34.1672;RBI=0.0707839;REFB=0.000960147;REVB=0.0173624;RO=92;SAF=109;SAR=112;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261931;STB=0.513915;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.000177286;OID=.;OPOS=9909176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:315:92:92:221:223:0.707937:112:109:41:51:113:110:41:51 chr21 9909179 . C A 177.53 PASS AF=0.135314;AO=41;DP=302;FAO=41;FDP=303;FR=.;FRO=262;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=126;FSRR=136;FWDB=-0.00767482;FXX=0.0194168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.957;QD=2.34362;RBI=0.0135874;REFB=-0.00569079;REVB=-0.0112123;RO=261;SAF=18;SAR=23;SRF=126;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560603;STB=0.536425;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0393414;OID=.;OPOS=9909179;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:303:261:262:41:41:0.135314:23:18:126:135:23:18:126:136 chr21 9909208 . C T 163.01 PASS AF=0.136691;AO=36;DP=276;FAO=38;FDP=278;FR=.;FRO=240;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=115;FSRR=125;FWDB=0.0107181;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.597;QD=2.34549;RBI=0.026099;REFB=-0.00532892;REVB=-0.0237966;RO=238;SAF=19;SAR=17;SRF=115;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565434;STB=0.563246;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0481852;OID=.;OPOS=9909208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:278:238:240:36:38:0.136691:17:19:115:123:17:21:115:125 chr21 9909218 . GT AC 134.33 PASS AF=0.132479;AO=31;DP=236;FAO=31;FDP=234;FR=.;FRO=203;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=102;FSRR=101;FWDB=-0.0374903;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.274;QD=2.29631;RBI=0.038963;REFB=-0.00904476;REVB=0.0106109;RO=200;SAF=16;SAR=15;SRF=99;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267979;STB=0.511851;STBP=0.873;TYPE=mnp;VARB=0.0427877;OID=.;OPOS=9909218;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:234:200:203:31:31:0.132479:15:16:99:101:15:16:102:101 chr21 9909273 . C T 32.27 PASS AF=0.0833333;AO=9;DP=110;FAO=9;FDP=108;FR=.;FRO=99;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=37;FSRR=62;FWDB=0.0204041;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.017;QD=1.19511;RBI=0.0247632;REFB=-0.00453671;REVB=-0.0140318;RO=94;SAF=7;SAR=2;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417771;STB=0.835168;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0697375;OID=.;OPOS=9909273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:110:108:94:99:9:9:0.0833333:2:7:37:57:2:7:37:62 chr21 9909274 . G A 65.31 PASS AF=0.12844;AO=14;DP=106;FAO=14;FDP=109;FR=.;FRO=95;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=-0.0035273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.105;QD=2.39687;RBI=0.022338;REFB=2.88251e-05;REVB=-0.0220577;RO=92;SAF=4;SAR=10;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233859;STB=0.654366;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00215826;OID=.;OPOS=9909274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:106:109:92:95:14:14:0.12844:10:4:43:49:10:4:43:52 chr21 10181174 . G A 189.59 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00469195;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.804;QD=24.4635;RBI=0.0166578;REFB=-0.0147328;REVB=-0.0159834;RO=9;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545405;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00967836;OID=.;OPOS=10181174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:31:31:9:12:18:18:0.580645:10:8:4:5:10:8:4:8 chr21 10181184 . T C 189.09 PASS AF=0.527778;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0148936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.866;QD=21.0105;RBI=0.0174142;REFB=-0.0427787;REVB=0.00902405;RO=17;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252415;STB=0.501465;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.018673;OID=.;OPOS=10181184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:17:17:18:19:0.527778:9:9:8:9:10:9:8:9 chr21 10862598 . C T 247.41 PASS AF=0.242038;AO=38;DP=156;FAO=38;FDP=157;FR=.;FRO=119;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=67;FWDB=-0.00416017;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.075;QD=6.30348;RBI=0.00507833;REFB=-0.00191687;REVB=-0.00291245;RO=118;SAF=12;SAR=26;SRF=51;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155914;STB=0.598507;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00357202;OID=.;OPOS=10862598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:118:119:38:38:0.242038:26:12:51:67:26:12:52:67 chr21 10862599 . C T 922.42 PASS AF=0.559748;AO=89;DP=159;FAO=89;FDP=159;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.00817784;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.468;QD=23.2056;RBI=0.00925894;REFB=-0.0102102;REVB=0.00434177;RO=69;SAF=37;SAR=52;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202289;STB=0.507143;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00446442;OID=.;OPOS=10862599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:69:70:89:89:0.559748:52:37:27:42:52:37:28:42 chr21 10862618 . T C 1414.9 PASS AF=0.647059;AO=121;DP=188;FAO=121;FDP=187;FR=.;FRO=66;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0157196;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.523;QD=30.2652;RBI=0.0170366;REFB=-0.00775547;REVB=0.0065681;RO=66;SAF=55;SAR=66;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301368;STB=0.516222;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00463194;OID=.;OPOS=10862618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:66:66:121:121:0.647059:66:55:27:39:66:55:27:39 chr21 10862846 . A T 1276.92 PASS AF=0.770992;AO=93;DP=123;FAO=101;FDP=131;FR=.;FRO=30;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0345654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.446;QD=38.99;RBI=0.0371474;REFB=-0.0148506;REVB=-0.0136075;RO=29;SAF=33;SAR=60;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118453;STB=0.501411;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00451042;OID=.;OPOS=10862846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:131:29:30:93:101:0.770992:60:33:11:18:60:41:12:18 chr21 10862853 . G A 506.85 PASS AF=0.411765;AO=56;DP=136;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.00502105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6014;QD=14.9073;RBI=0.0146947;REFB=0.00220844;REVB=-0.0138103;RO=77;SAF=22;SAR=34;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244138;STB=0.527194;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00356171;OID=.;OPOS=10862853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:77:80:56:56:0.411765:34:22:32:45:34:22:35:45 chr21 10862874 . A G 532.67 PASS AF=0.414286;AO=59;DP=140;FAO=58;FDP=140;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=0.0134656;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7303;QD=15.219;RBI=0.025482;REFB=-0.0182272;REVB=-0.0216335;RO=81;SAF=32;SAR=27;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755521;STB=0.551706;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0242416;OID=.;OPOS=10862874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:81:82:59:58:0.414286:27:32:38:43:26:32:38:44 chr21 10862947 . G A 684.9 PASS AF=0.476821;AO=69;DP=148;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=-0.00276826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.334;QD=18.143;RBI=0.00568443;REFB=-0.000451104;REVB=0.00496482;RO=79;SAF=32;SAR=37;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323975;STB=0.507461;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000656343;OID=.;OPOS=10862947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:151:79:79:69:72:0.476821:37:32:34:45:40:32:34:45 chr21 10906989 . C T 145.26 PASS AF=0.159341;AO=32;DP=181;FAO=29;FDP=182;FR=.;FRO=153;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=87;FSRR=66;FWDB=-0.0277394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0989;QD=3.19254;RBI=0.0292039;REFB=0.00528499;REVB=-0.00913222;RO=149;SAF=12;SAR=20;SRF=86;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255771;STB=0.628133;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.0382683;OID=.;OPOS=10906989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:182:149:153:32:29:0.159341:20:12:86:63:17:12:87:66 chr21 10907041 . C A 82.49 PASS AF=0.145299;AO=17;DP=117;FAO=17;FDP=117;FR=.;FRO=100;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=56;FSRR=44;FWDB=-0.00237257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.032;QD=2.82033;RBI=0.0045709;REFB=0.000704635;REVB=0.00390692;RO=99;SAF=9;SAR=8;SRF=55;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331018;STB=0.526285;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-0.00893892;OID=.;OPOS=10907041;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:117:117:99:100:17:17:0.145299:8:9:55:44:8:9:56:44 chr21 10909712 . C T 162.0 PASS AF=0.171271;AO=32;DP=181;FAO=31;FDP=181;FR=.;FRO=150;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=57;FSRR=93;FWDB=-0.0366928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3571;QD=3.58007;RBI=0.0401403;REFB=-0.00911595;REVB=0.0162753;RO=146;SAF=6;SAR=26;SRF=57;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31049;STB=0.689745;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0547085;OID=.;OPOS=10909712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:146:150:32:31:0.171271:26:6:57:89:25:6:57:93 chr21 10910311 . T G 480.7 PASS AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0118901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.596;QD=20.2398;RBI=0.0289885;REFB=-0.00949334;REVB=0.0264378;RO=48;SAF=19;SAR=28;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798021;STB=0.504423;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0102638;OID=.;OPOS=10910311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:48:48:47:47:0.494737:28:19:19:29:28:19:19:29 chr21 10910340 . C G 42.47 PASS AF=0.106383;AO=10;DP=94;FAO=10;FDP=94;FR=.;FRO=84;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=50;FWDB=-0.0111576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.26;QD=1.80706;RBI=0.0432481;REFB=-0.00434064;REVB=-0.0417841;RO=84;SAF=7;SAR=3;SRF=34;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340177;STB=0.750543;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0253604;OID=.;OPOS=10910340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:94:94:84:84:10:10:0.106383:3:7:34:50:3:7:34:50 chr21 10910347 . A G 1437.7 PASS AF=1;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163519;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.401;QD=63.1954;RBI=0.0265161;REFB=0;REVB=0.0208738;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116738;OID=.;OPOS=10910347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:91:0:0:91:91:1:52:39:0:0:52:39:0:0 chr21 10920098 . T C 2025.17 PASS AF=0.977778;AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00937307;FXX=0.0073524;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.11;QD=60.0051;RBI=0.0251644;REFB=-0.0664667;REVB=0.0233536;RO=2;SAF=70;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00086272;STB=0.504568;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.000108064;OID=.;OPOS=10920098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:136:135:2:3:132:132:0.977778:62:70:1:1:61:71:1:2 chr21 10921939 . C T 42.61 PASS AF=0.106383;AO=10;DP=95;FAO=10;FDP=94;FR=.;FRO=84;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=-0.0232576;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.748;QD=1.81329;RBI=0.0244003;REFB=-0.004085;REVB=-0.00737967;RO=84;SAF=5;SAR=5;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028229;STB=0.521234;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0237972;OID=.;OPOS=10921939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:95:94:84:84:10:10:0.106383:5:5:44:40:5:5:44:40 chr21 10933882 . T C 122.9 PASS AF=0.129464;AO=29;DP=224;FAO=29;FDP=224;FR=.;FRO=195;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=125;FSRR=70;FWDB=-0.0146884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.158;QD=2.19467;RBI=0.0147233;REFB=-0.000180588;REVB=0.00101248;RO=195;SAF=20;SAR=9;SRF=125;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068575;STB=0.547627;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00106465;OID=.;OPOS=10933882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:195:195:29:29:0.129464:9:20:125:70:9:20:125:70 chr21 10934956 . A G 194.94 PASS AF=0.12766;AO=49;DP=377;FAO=48;FDP=376;FR=.;FRO=328;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=182;FSRR=146;FWDB=-0.0192109;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.534;QD=2.07386;RBI=0.0199431;REFB=-0.0032444;REVB=-0.00535427;RO=328;SAF=21;SAR=28;SRF=182;SRR=146;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159802;STB=0.619041;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0222794;OID=.;OPOS=10934956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:376:328:328:49:48:0.12766:28:21:182:146:28:20:182:146 chr21 10935004 . A T 131.31 PASS AF=0.116838;AO=34;DP=292;FAO=34;FDP=291;FR=.;FRO=257;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=138;FSRR=119;FWDB=-0.00108859;FXX=0.00342454;HRUN=6;LEN=1;MLLD=284.026;QD=1.80495;RBI=0.00941561;REFB=-0.000400472;REVB=0.00935246;RO=257;SAF=22;SAR=12;SRF=138;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140936;STB=0.600106;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00348793;OID=.;OPOS=10935004;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:291:257:257:34:34:0.116838:12:22:138:119:12:22:138:119 chr21 10942756 . G A 720.43 PASS AF=0.260442;AO=106;DP=407;FAO=106;FDP=407;FR=.;FRO=301;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=145;FSRR=156;FWDB=-4.76389e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3953;QD=7.08037;RBI=0.038437;REFB=-0.000170151;REVB=-0.0384369;RO=296;SAF=60;SAR=46;SRF=143;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1036;STB=0.562401;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.000312429;OID=.;OPOS=10942756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:407:407:296:301:106:106:0.260442:46:60:143:153:46:60:145:156 chr21 10942924 . CCTT C 105.55 PASS AF=0.191257;AO=35;DP=184;FAO=35;FDP=183;FR=.;FRO=148;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=71;FSRR=77;FWDB=0.00352254;FXX=0.0108102;HRUN=2;LEN=3;MLLD=226.4;QD=2.30699;RBI=0.00421057;REFB=-0.00222531;REVB=-0.00230664;RO=143;SAF=20;SAR=15;SRF=68;SRR=75;SSEN=0.256819;SSEP=0;SSSB=0.122674;STB=0.574061;STBP=0.352;TYPE=del;VARB=0.0100853;OID=.;OPOS=10942925;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.191257:35:184:35:183:148:20:15:71:77:99:143:20:15:68:75 chr21 10943003 . C T 150.75 PASS AF=0.192593;AO=26;DP=136;FAO=26;FDP=135;FR=.;FRO=109;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.0113649;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6743;QD=4.46654;RBI=0.0136068;REFB=-0.00490617;REVB=-0.00748214;RO=110;SAF=18;SAR=8;SRF=57;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229622;STB=0.649586;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.01377;OID=.;OPOS=10943003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:110:109:26:26:0.192593:8:18:57:53:8:18:56:53 chr21 10951387 . T G 74.68 PASS AF=0.0737327;AO=32;DP=434;FAO=32;FDP=434;FR=.;FRO=402;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=190;FSRR=212;FWDB=0.00607671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.136;QD=0.688309;RBI=0.0116611;REFB=-0.00221555;REVB=-0.00995266;RO=402;SAF=13;SAR=19;SRF=190;SRR=212;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755696;STB=0.562206;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0250354;OID=.;OPOS=10951387;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:434:434:402:402:32:32:0.0737327:19:13:190:212:19:13:190:212 chr21 10951426 . G T 86.26 PASS AF=0.0826873;AO=32;DP=383;FAO=32;FDP=387;FR=.;FRO=355;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=164;FSRR=191;FWDB=-0.0105954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3068;QD=0.891591;RBI=0.0406245;REFB=-0.00204799;REVB=-0.0392185;RO=348;SAF=13;SAR=19;SRF=162;SRR=186;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070163;STB=0.551912;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0256365;OID=.;OPOS=10951426;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:383:387:348:355:32:32:0.0826873:19:13:162:186:19:13:164:191 chr21 10959806 . G T 54.14 PASS AF=0.163636;AO=9;DP=55;FAO=9;FDP=55;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=8.1527e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.475;QD=3.93718;RBI=0.00901044;REFB=-0.00237624;REVB=-0.00901007;RO=45;SAF=5;SAR=4;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816053;STB=0.564373;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00972565;OID=.;OPOS=10959806;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:55:55:45:46:9:9:0.163636:4:5:22:23:4:5:22:24 chr21 10970003 . G A 174.05 PASS AF=0.19863;AO=29;DP=146;FAO=29;FDP=146;FR=.;FRO=117;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=58;FSRR=59;FWDB=-0.028732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.291;QD=4.76849;RBI=0.0293337;REFB=-0.0094996;REVB=-0.00591075;RO=115;SAF=14;SAR=15;SRF=58;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275015;STB=0.51039;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.034275;OID=.;OPOS=10970003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:115:117:29:29:0.19863:15:14:58:57:15:14:58:59 chr21 10970017 . C T 203.54 PASS AF=0.214765;AO=32;DP=149;FAO=32;FDP=149;FR=.;FRO=117;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=60;FWDB=-0.0238292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6914;QD=5.46424;RBI=0.0404909;REFB=-0.00455766;REVB=0.0327366;RO=117;SAF=16;SAR=16;SRF=57;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162758;STB=0.510061;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0179122;OID=.;OPOS=10970017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:117:117:32:32:0.214765:16:16:57:60:16:16:57:60 chr21 11029616 . G T 392.06 PASS AF=0.315152;AO=52;DP=158;FAO=52;FDP=165;FR=.;FRO=113;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=66;FSRR=47;FWDB=-0.0781032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4406;QD=9.50457;RBI=0.0793801;REFB=0.0092232;REVB=0.0141809;RO=105;SAF=35;SAR=17;SRF=58;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148959;STB=0.566059;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.02233;OID=.;OPOS=11029616;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:165:105:113:52:52:0.315152:17:35:58:47:17:35:66:47 chr21 11029624 . C T 186.21 PASS AF=0.192982;AO=32;DP=171;FAO=33;FDP=171;FR=.;FRO=138;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=81;FSRR=57;FWDB=-0.0139439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.273;QD=4.35583;RBI=0.0763881;REFB=-0.00420434;REVB=-0.0751047;RO=137;SAF=23;SAR=9;SRF=81;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179687;STB=0.596994;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0166695;OID=.;OPOS=11029624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:137:138:32:33:0.192982:9:23:81:56:10:23:81:57 chr21 11029630 . GC G 166.88 PASS AF=0.179191;AO=31;DP=174;FAO=31;FDP=173;FR=.;FRO=142;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=83;FSRR=59;FWDB=-0.0123918;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.38;QD=3.85842;RBI=0.0143668;REFB=0.00126938;REVB=0.00726974;RO=141;SAF=22;SAR=9;SRF=83;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169256;STB=0.612787;STBP=0.19;TYPE=del;VARB=-0.0110859;OID=.;OPOS=11029631;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.179191:31:174:31:173:142:22:9:83:59:99:141:22:9:83:58 chr21 11029653 . C T 68.18 PASS AF=0.101064;AO=19;DP=188;FAO=19;FDP=188;FR=.;FRO=169;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=98;FSRR=71;FWDB=-0.00333879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.005;QD=1.45063;RBI=0.00663526;REFB=0.00231548;REVB=-0.00573403;RO=168;SAF=8;SAR=11;SRF=98;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194029;STB=0.639814;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=-0.0147577;OID=.;OPOS=11029653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:188:188:168:169:19:19:0.101064:11:8:98:70:11:8:98:71 chr21 11029679 . C G 269.63 PASS AF=0.233333;AO=42;DP=180;FAO=42;FDP=180;FR=.;FRO=138;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=75;FSRR=63;FWDB=-0.00323659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.212;QD=5.99187;RBI=0.0996251;REFB=-0.00207852;REVB=-0.0995725;RO=133;SAF=22;SAR=20;SRF=71;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126452;STB=0.515128;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00698876;OID=.;OPOS=11029679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:133:138:42:42:0.233333:20:22:71:62:20:22:75:63 chr21 11038753 . GAAAAT GAAA,GAAAT 145.64 PASS AF=0.25,0;AO=42,27;DP=211;FAO=52,0;FDP=208;FR=.;FRO=156;FSAF=44,0;FSAR=8,0;FSRF=153;FSRR=3;FWDB=-0.063967,-0.110071;FXX=0.0142173;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=22.256,12.0494;QD=2.80081;RBI=0.227427,0.24102;REFB=-0.0783045,-0.0944843;REVB=-0.218246,-0.214418;RO=121;SAF=34,25;SAR=8,2;SRF=121;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.368573,0.368573;SSSB=-0.591267,-0.650944;STB=0.764995,0.5;STBP=0.055,1;TYPE=del,del;VARB=0.194241,0.0114215;OID=.,.;OPOS=11038757,11038754;OREF=AT,A;OALT=-,-;OMAPALT=GAAA,GAAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.25,0:42,27:211:52,0:208:156:44,0:8,0:153:3:99:121:34,25:8,2:121:0 chr21 11038802 . G A 542.88 PASS AF=0.211628;AO=91;DP=432;FAO=91;FDP=430;FR=.;FRO=339;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=189;FSRR=150;FWDB=0.0386314;FXX=0.00462952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4654;QD=5.05008;RBI=0.0396285;REFB=-0.00107586;REVB=-0.00883375;RO=339;SAF=47;SAR=44;SRF=189;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531053;STB=0.532451;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00470916;OID=.;OPOS=11038802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:432:430:339:339:91:91:0.211628:44:47:189:150:44:47:189:150 chr21 11038843 . G C 2726.81 PASS AF=0.65616;AO=227;DP=348;FAO=229;FDP=349;FR=.;FRO=120;FSAF=126;FSAR=103;FSRF=67;FSRR=53;FWDB=0.0544438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4833;QD=31.2528;RBI=0.0573715;REFB=-0.028514;REVB=0.018093;RO=121;SAF=125;SAR=102;SRF=68;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00741856;STB=0.50282;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0175315;OID=.;OPOS=11038843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:349:121:120:227:229:0.65616:102:125:68:53:103:126:67:53 chr21 11049584 . C T 126.35 PASS AF=0.152941;AO=26;DP=170;FAO=26;FDP=170;FR=.;FRO=144;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=66;FSRR=78;FWDB=-0.0044823;FXX=0.00584761;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.448;QD=2.97298;RBI=0.0123243;REFB=-0.00190861;REVB=-0.0114803;RO=142;SAF=19;SAR=7;SRF=64;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355812;STB=0.730592;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0103785;OID=.;OPOS=11049584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:142:144:26:26:0.152941:7:19:64:78:7:19:66:78 chr21 11049592 . C T 120.3 PASS AF=0.142077;AO=26;DP=183;FAO=26;FDP=183;FR=.;FRO=157;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=74;FSRR=83;FWDB=0.0491238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.544;QD=2.62941;RBI=0.0491651;REFB=-0.000972761;REVB=-0.00201551;RO=157;SAF=19;SAR=7;SRF=74;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331272;STB=0.724096;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0116722;OID=.;OPOS=11049592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:157:157:26:26:0.142077:7:19:74:83:7:19:74:83 chr21 11049617 . C G 50.15 PASS AF=0.0809524;AO=17;DP=210;FAO=17;FDP=210;FR=.;FRO=193;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=106;FSRR=87;FWDB=-0.00367564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1964;QD=0.955237;RBI=0.00367567;REFB=0.000983416;REVB=-1.58492e-05;RO=191;SAF=6;SAR=11;SRF=104;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21726;STB=0.67672;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.0123136;OID=.;OPOS=11049617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:210:210:191:193:17:17:0.0809524:11:6:104:87:11:6:106:87 chr21 11057855 . A T 786.84 PASS AF=0.75;AO=63;DP=84;FAO=63;FDP=84;FR=.;FRO=21;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00211724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.263;QD=37.4684;RBI=0.0135015;REFB=-0.0234742;REVB=0.0133345;RO=20;SAF=45;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11157;STB=0.555537;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0074768;OID=.;OPOS=11057855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:20:21:63:63:0.75:18:45:10:10:18:45:11:10 chr21 11057888 . T A 379.12 PASS AF=0.430108;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00898145;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.611;QD=16.3062;RBI=0.0108497;REFB=-0.0186989;REVB=-0.00608691;RO=52;SAF=29;SAR=11;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189335;STB=0.603004;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0192843;OID=.;OPOS=11057888;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:52:53:40:40:0.430108:11:29:29:23:11:29:30:23 chr21 11057929 . T C 98.26 PASS AF=0.175258;AO=17;DP=98;FAO=17;FDP=97;FR=.;FRO=80;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=0.00263128;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6863;QD=4.05181;RBI=0.013611;REFB=-0.00840361;REVB=-0.0133542;RO=80;SAF=10;SAR=7;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332182;STB=0.521713;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0396073;OID=.;OPOS=11057929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:98:97:80:80:17:17:0.175258:7:10:45:35:7:10:45:35 chr21 11057931 . C A 34.94 PASS AF=0.0918367;AO=9;DP=98;FAO=9;FDP=98;FR=.;FRO=89;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=-0.00297139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.609;QD=1.42599;RBI=0.0207434;REFB=-0.000603812;REVB=-0.0205295;RO=88;SAF=6;SAR=3;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143298;STB=0.609679;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00525622;OID=.;OPOS=11057931;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:98:98:88:89:9:9:0.0918367:3:6:48:40:3:6:49:40 chr21 11058226 . G C 475.15 PASS AF=0.292793;AO=65;DP=222;FAO=65;FDP=222;FR=.;FRO=157;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=91;FSRR=66;FWDB=-0.0105689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.301;QD=8.56122;RBI=0.0108498;REFB=-0.00680452;REVB=0.00245268;RO=156;SAF=35;SAR=30;SRF=91;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549386;STB=0.529403;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0157559;OID=.;OPOS=11058226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:156:157:65:65:0.292793:30:35:91:65:30:35:91:66 chr21 11097557 . A G 102.29 PASS AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00790347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.139;QD=9.09236;RBI=0.00850953;REFB=0.00161458;REVB=0.00315395;RO=31;SAF=2;SAR=11;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35162;STB=0.712583;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.00761486;OID=.;OPOS=11097557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:32:13:13:0.288889:11:2:12:19:11:2:12:20 chr21 11097574 . T A 74.2 PASS AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0244852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.641;QD=5.60027;RBI=0.0278643;REFB=-0.0126754;REVB=0.0133001;RO=42;SAF=1;SAR=10;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.497821;STB=0.836464;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0459504;OID=.;OPOS=11097574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:53:53:42:42:11:11:0.207547:10:1:17:25:10:1:17:25 chr21 11098674 . T C 778.74 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.521;QD=56.6358;RBI=0.0534421;REFB=0;REVB=0.0336474;RO=1;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229779;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156073;OID=.;OPOS=11098674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:1:0:54:55:1:20:34:0:1:21:34:0:0 chr21 11098723 . T C 141.32 PASS AF=0.28169;AO=20;DP=72;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0464936;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.65;QD=7.96154;RBI=0.0494801;REFB=-0.00800209;REVB=-0.0169302;RO=51;SAF=4;SAR=16;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474297;STB=0.776183;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0401663;OID=.;OPOS=11098723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:51:51:20:20:0.28169:16:4:30:21:16:4:29:22 chr21 11098732 . C T 109.67 PASS AF=0.236111;AO=17;DP=72;FAO=17;FDP=72;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0159277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.67;QD=6.09288;RBI=0.0197353;REFB=-0.0231432;REVB=-0.0116529;RO=55;SAF=3;SAR=14;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475981;STB=0.79756;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0523038;OID=.;OPOS=11098732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:55:55:17:17:0.236111:14:3:30:25:14:3:30:25 chr21 11098756 . C A 140.52 PASS AF=0.272727;AO=20;DP=76;FAO=21;FDP=77;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.00338767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.198;QD=7.29962;RBI=0.00998495;REFB=-0.00849564;REVB=0.0093927;RO=56;SAF=6;SAR=14;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310779;STB=0.697922;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0221133;OID=.;OPOS=11098756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:56:56:20:21:0.272727:14:6:31:25:15:6:31:25 chr21 11098763 . C T 157.87 PASS AF=0.282051;AO=22;DP=78;FAO=22;FDP=78;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0173539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.81;QD=8.09595;RBI=0.017354;REFB=-0.0117273;REVB=6.38595e-05;RO=56;SAF=7;SAR=15;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264999;STB=0.658998;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0470046;OID=.;OPOS=11098763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:56:56:22:22:0.282051:15:7:30:26:15:7:30:26 chr21 14419915 . A G 429.15 PASS AF=0.214502;AO=71;DP=333;FAO=71;FDP=331;FR=.;FRO=260;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=134;FSRR=126;FWDB=-0.0277364;FXX=0.00600583;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.992;QD=5.18608;RBI=0.0300045;REFB=-0.00605131;REVB=0.0114439;RO=261;SAF=29;SAR=42;SRF=134;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135185;STB=0.584206;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0274415;OID=.;OPOS=14419915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:331:261:260:71:71:0.214502:42:29:134:127:42:29:134:126 chr21 14420005 . A G 1820.1 PASS AF=0.477922;AO=184;DP=388;FAO=184;FDP=385;FR=.;FRO=201;FSAF=87;FSAR=97;FSRF=94;FSRR=107;FWDB=0.00468547;FXX=0.00773176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.746;QD=18.9101;RBI=0.00663037;REFB=-0.0100651;REVB=-0.00469129;RO=197;SAF=87;SAR=97;SRF=94;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00408806;STB=0.502705;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0131718;OID=.;OPOS=14420005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:385:197:201:184:184:0.477922:97:87:94:103:97:87:94:107 chr21 14743819 . G A 54.32 PASS AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0710631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.189;QD=8.69137;RBI=0.0868574;REFB=0.00515943;REVB=-0.0499424;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292508;STB=0.679182;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.0153618;OID=.;OPOS=14743819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:5:3:11:6:5:3:11:6 chr21 14778721 . A T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00850789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5709;QD=48.7372;RBI=0.0142703;REFB=0;REVB=0.0114567;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97391e-05;OID=.;OPOS=14778721;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0 chr21 14982716 . T C 118.29 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=-0.0362943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.829;QD=12.7877;RBI=0.0384028;REFB=-0.00871618;REVB=0.0125499;RO=23;SAF=1;SAR=13;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577255;STB=0.534194;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0226503;OID=.;OPOS=14982716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:13:1:2:21:13:1:2:21 chr21 14982886 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.08;QD=40.7628;RBI=0.0369333;REFB=0;REVB=0.0305695;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000583132;OID=.;OPOS=14982886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chr21 14982952 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00998813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.212;QD=37.4885;RBI=0.0108064;REFB=0;REVB=0.00412502;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302125;OID=.;OPOS=14982952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr21 15013735 . A G 2078.19 PASS AF=0.978261;AO=135;DP=138;FAO=135;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0217438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.579;QD=60.2374;RBI=0.070907;REFB=-0.0321724;REVB=0.0674909;RO=2;SAF=61;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00134838;STB=0.502602;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.000978564;OID=.;OPOS=15013735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:138:138:2:3:135:135:0.978261:74:61:1:1:74:61:1:2 chr21 15457003 . C A 228.91 PASS AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00823573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.933;QD=16.0639;RBI=0.014062;REFB=-0.0120603;REVB=0.0113979;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668104;STB=0.537786;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0121051;OID=.;OPOS=15457003;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:10:16:17:14:10:16:17:14 chr21 15457034 . A T 296.72 PASS AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00610818;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.92;QD=15.617;RBI=0.0143411;REFB=-0.00481599;REVB=0.0129752;RO=43;SAF=19;SAR=14;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416024;STB=0.523486;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.00578759;OID=.;OPOS=15457034;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:14:19:23:20:14:19:23:20 chr21 15457086 . A G 282.06 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0101119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1849;QD=14.6522;RBI=0.0211635;REFB=-0.0081708;REVB=0.0185914;RO=44;SAF=16;SAR=16;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697201;STB=0.545426;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0121317;OID=.;OPOS=15457086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:44:45:32:32:0.415584:16:16:25:19:16:16:26:19 chr21 15457293 . T G 35.38 PASS AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00983652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1521;QD=5.44268;RBI=0.0300852;REFB=0.00963096;REVB=-0.0284317;RO=20;SAF=2;SAR=4;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407207;STB=0.761138;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.0136232;OID=.;OPOS=15457293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:4:2:14:6:4:2:14:6 chr21 15457297 . C G 44.05 PASS AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0250827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7152;QD=6.52522;RBI=0.0378091;REFB=0.00241937;REVB=0.0282912;RO=20;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308427;STB=0.693379;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.00767024;OID=.;OPOS=15457297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:4:3:14:6:4:3:14:6 chr21 15457318 . T G 120.85 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0149471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7407;QD=14.6484;RBI=0.0166414;REFB=0.00341427;REVB=-0.00731565;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236955;STB=0.636183;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.00273957;OID=.;OPOS=15457318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:7:7:14:5:7:7:14:5 chr21 15457339 . T G 146.21 PASS AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0181272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1462;QD=16.7097;RBI=0.0753879;REFB=-0.038049;REVB=0.0731761;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119416;STB=0.568183;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0665201;OID=.;OPOS=15457339;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:7:9:13:6:7:9:13:6 chr21 15457350 . TA CG 157.04 PASS AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00726596;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=342.022;QD=16.1065;RBI=0.0409627;REFB=0.000551477;REVB=-0.0403131;RO=22;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608231;STB=0.534914;STBP=0.744;TYPE=mnp;VARB=-0.000834949;OID=.;OPOS=15457350;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:8:9:13:9:8:9:13:9 chr21 15457374 . G C 195.81 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0284142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.51;QD=17.8005;RBI=0.0304585;REFB=-0.0152842;REVB=0.0109706;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127152;STB=0.572326;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0145996;OID=.;OPOS=15457374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:11:9:14:10:11:9:14:10 chr21 15457399 . G C 184.83 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00603048;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.038;QD=18.4834;RBI=0.0351604;REFB=-0.00875325;REVB=-0.0346394;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231994;STB=0.501318;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.010254;OID=.;OPOS=15457399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:10:9:10:11:10:9:10:11 chr21 15457410 . C G 142.61 PASS AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.010192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6831;QD=14.2614;RBI=0.0104189;REFB=-0.0155238;REVB=-0.00216266;RO=24;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107476;STB=0.562422;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0225519;OID=.;OPOS=15457410;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:7:9:11:13:7:9:11:13 chr21 15457434 . G A 34.83 PASS AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0163111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.528;QD=4.80436;RBI=0.0165722;REFB=-0.00115751;REVB=0.00293026;RO=23;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223454;STB=0.650654;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0439894;OID=.;OPOS=15457434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:2:4:11:12:2:4:11:12 chr21 15457463 . CACACACAGT C 187.25 PASS AF=1;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257774;FXX=0.166574;HRUN=1;LEN=9;MLLD=324.06;QD=49.932;RBI=0.0257775;REFB=0;REVB=-6.2768e-05;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=9.21105e-05;OID=.;OPOS=15457464;OREF=ACACACAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:15:17:15:15:0:7:8:0:0:3:0:7:8:0:0 chr21 15481365 . G T 317.33 PASS AF=0.416667;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.00649839;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.656;QD=15.111;RBI=0.0152332;REFB=-0.0200473;REVB=0.0137776;RO=50;SAF=13;SAR=21;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207108;STB=0.617318;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0218689;OID=.;OPOS=15481365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:49:34:35:0.416667:21:13:29:21:22:13:28:21 chr21 15516976 . T A 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.7338e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0531;QD=57.2349;RBI=0.0107816;REFB=0;REVB=0.0107815;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100899;OID=.;OPOS=15516976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:22:34:0:0:22:34:0:0 chr21 15593495 . T G 283.68 PASS AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0795308;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.106;QD=19.9075;RBI=0.0795924;REFB=-0.0224785;REVB=0.00313078;RO=27;SAF=13;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225501;STB=0.512536;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0125012;OID=.;OPOS=15593495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:17:13:11:16:17:13:11:16 chr21 15596772 . T G 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9438;QD=59.1425;RBI=0.0838809;REFB=0;REVB=-0.0815011;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000583908;OID=.;OPOS=15596772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0 chr21 15646397 . A G 1710.74 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.767;QD=60.5572;RBI=0.0503329;REFB=0;REVB=0.0479058;RO=0;SAF=68;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98822e-05;OID=.;OPOS=15646397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:113:0:0:109:113:1:41:68:0:0:43:70:0:0 chr21 15671835 . G A 900.95 PASS AF=0.56129;AO=87;DP=155;FAO=87;FDP=155;FR=.;FRO=68;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0205428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4403;QD=23.2503;RBI=0.0670213;REFB=0.0225896;REVB=-0.0637954;RO=68;SAF=41;SAR=46;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468072;STB=0.525513;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.0183899;OID=.;OPOS=15671835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:68:68:87:87:0.56129:46:41:36:32:46:41:36:32 chr21 15926544 . G A 1568.47 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.249;QD=64.0193;RBI=0.00657706;REFB=0;REVB=0.00399787;RO=0;SAF=60;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58789e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63827e-06;OID=.;OPOS=15926544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:38:60:0:0:38:60:0:0 chr21 15954593 . G A 549.54 PASS AF=0.47541;AO=54;DP=118;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0356023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7551;QD=18.0176;RBI=0.0444976;REFB=-0.0157705;REVB=-0.0266929;RO=64;SAF=29;SAR=25;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664699;STB=0.543586;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0166674;OID=.;OPOS=15954593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:122:64:64:54:58:0.47541:25:29:30:34:26:32:30:34 chr21 15954660 . T C 680.76 PASS AF=0.489209;AO=68;DP=139;FAO=68;FDP=139;FR=.;FRO=71;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.00950143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.977;QD=19.5902;RBI=0.0119874;REFB=0.00555711;REVB=-0.0073089;RO=70;SAF=40;SAR=28;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134195;STB=0.570678;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00308626;OID=.;OPOS=15954660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:70:71:68:68:0.489209:28:40:31:39:28:40:32:39 chr21 15964920 . C G 335.45 PASS AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0020898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.247;QD=16.9846;RBI=0.0260873;REFB=0.0148379;REVB=-0.0260034;RO=43;SAF=16;SAR=20;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485608;STB=0.527206;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.0163349;OID=.;OPOS=15964920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:20:16:17:26:20:16:17:26 chr21 15974409 . T C 1030.07 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0350243;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.417;QD=58.032;RBI=0.0426953;REFB=-0.0405685;REVB=0.024417;RO=1;SAF=32;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145457;STB=0.50769;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000114478;OID=.;OPOS=15974409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:38:32:1:0:38:32:1:0 chr21 16335469 . T C 1933.29 PASS AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.69;QD=61.8654;RBI=0.0465103;REFB=0;REVB=0.0356016;RO=0;SAF=68;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199926;OID=.;OPOS=16335469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:56:68:0:0:57:68:0:0 chr21 16340289 . C T 791.79 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334272;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.463;QD=56.5565;RBI=0.0344042;REFB=0;REVB=0.00814066;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054001;OID=.;OPOS=16340289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:33:22:0:0:33:23:0:0 chr21 16424469 . C T 464.21 PASS AF=0.451327;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.00411633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.397;QD=16.4324;RBI=0.0121495;REFB=-0.0190621;REVB=-0.011431;RO=62;SAF=36;SAR=15;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170842;STB=0.595804;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0212245;OID=.;OPOS=16424469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:62:62:51:51:0.451327:15:36:34:28:15:36:34:28 chr21 16986637 . G A 212.82 PASS AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0460335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.691;QD=20.2683;RBI=0.0460546;REFB=-0.0142005;REVB=0.00139334;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128135;STB=0.572016;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00767283;OID=.;OPOS=16986637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:10:11:14:7:10:11:14:7 chr21 17205787 . C T 737.08 PASS AF=0.5;AO=75;DP=151;FAO=75;FDP=150;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=53;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=0.00684742;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.339;QD=19.6554;RBI=0.0121058;REFB=-0.0247697;REVB=0.00998311;RO=75;SAF=22;SAR=53;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567494;STB=0.53132;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0189088;OID=.;OPOS=17205787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:75:75:75:75:0.5:53:22:26:49:53:22:26:49 chr21 19161403 . A G 303.77 PASS AF=0.358491;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=106;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.0426774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2922;QD=11.463;RBI=0.0526955;REFB=-0.0217018;REVB=0.0309104;RO=68;SAF=14;SAR=24;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150458;STB=0.586512;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0411259;OID=.;OPOS=19161403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:68:68:38:38:0.358491:24:14:34:34:24:14:34:34 chr21 19163391 . GAACTC G 120.53 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.016382;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=5;MLLD=292.374;QD=8.17127;RBI=0.0291949;REFB=-0.0136565;REVB=-0.0241655;RO=35;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146005;STB=0.578178;STBP=0.417;TYPE=del;VARB=0.0240928;OID=.;OPOS=19163392;OREF=AACTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.355932:21:59:21:59:38:13:8:19:19:99:35:13:8:17:18 chr21 19163707 . C T 463.1 PASS AF=0.469388;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00047911;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.678;QD=18.9019;RBI=0.0262694;REFB=-0.0160075;REVB=-0.0262651;RO=47;SAF=28;SAR=18;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110917;STB=0.589039;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0140094;OID=.;OPOS=19163707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:47:52:46:46:0.469388:18:28:23:24:18:28:23:29 chr21 19165259 . ACT A 333.16 PASS AF=0.423529;AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00992677;FXX=0.0449388;HRUN=1;LEN=2;MLLD=213.435;QD=15.6783;RBI=0.0111303;REFB=-0.0140986;REVB=-0.00503423;RO=49;SAF=21;SAR=15;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756045;STB=0.54272;STBP=0.496;TYPE=del;VARB=0.0228136;OID=.;OPOS=19165260;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.423529:36:89:36:85:49:21:15:25:24:99:49:21:15:25:24 chr21 19165320 . AATTTTTA AAATTTTA,AATTTTA,AATTTTAT,ATTTTA 97.17 PASS AF=0.0625,0,0,0.270833;AO=13,9,3,8;DP=59;FAO=3,0,0,13;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=0,0,0,5;FSAR=3,0,0,8;FSRF=27;FSRR=5;FWDB=-0.0146726,-0.241221,-0.215001,-0.22687;FXX=0.199967;HRUN=5,5,5,4;LEN=1,1,2,2;MLLD=16.4302,9.66023,14.3075,19.2109;QD=8.09748;RBI=0.0474603,0.315232,0.217968,0.286354;REFB=-0.0455478,-0.127641,-0.0633294,-0.0811703;REVB=0.0451353,0.202938,0.0358446,0.174724;RO=23;SAF=0,5,1,7;SAR=13,4,2,1;SRF=16;SRR=7;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.828429,-0.169302,-0.378783,0.3143;STB=0.998476,0.5,0.5,0.797165;STBP=0.002,1,1,0.041;TYPE=snp,del,mnp,del;VARB=0.00763102,0.0535035,0.0766469,0.133672;OID=.,.,.,.;OPOS=19165322,19165322,19165326,19165321;OREF=T,T,TA,AT;OALT=A,-,AT,-;OMAPALT=AAATTTTA,AATTTTA,AATTTTAT,ATTTTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/4:0.0625,0,0,0.270833:13,9,3,8:59:3,0,0,13:48:32:0,0,0,5:3,0,0,8:27:5:78:23:0,5,1,7:13,4,2,1:16:7 chr21 19169155 . G C 179.65 PASS AF=0.413043;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00560814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9904;QD=15.6218;RBI=0.0058118;REFB=-0.00847418;REVB=-0.00152505;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517223;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0201217;OID=.;OPOS=19169155;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:27:27:18:19:0.413043:8:10:15:12:9:10:15:12 chr21 19169218 . G C 349.12 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00352766;FXX=0.0454477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.566;QD=22.166;RBI=0.00604345;REFB=-0.0063384;REVB=0.00490703;RO=24;SAF=23;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592664;STB=0.524267;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00496371;OID=.;OPOS=19169218;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:63:24:28:35:35:0.555556:12:23:14:10:12:23:17:11 chr21 19666910 . A G 101.97 PASS AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00345558;FXX=0.099975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.53;QD=11.33;RBI=0.0034648;REFB=-0.00101941;REVB=0.000252647;RO=24;SAF=11;SAR=1;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491226;STB=0.808167;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00512055;OID=.;OPOS=19666910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:36:24:24:12:12:0.333333:1:11:15:9:1:11:15:9 chr21 19670118 . G A 426.81 PASS AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00698094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.136;QD=21.8875;RBI=0.0149196;REFB=-0.00793125;REVB=-0.0131857;RO=36;SAF=16;SAR=26;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215735;STB=0.618991;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00666605;OID=.;OPOS=19670118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:26:16:23:13:26:16:23:13 chr21 21728991 . C A 477.75 PASS AF=0.534884;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0292007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9248;QD=22.2211;RBI=0.0296899;REFB=-0.00156948;REVB=0.00536759;RO=40;SAF=22;SAR=24;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664161;STB=0.53657;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00149538;OID=.;OPOS=21728991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:40:46:46:0.534884:24:22:16:24:24:22:16:24 chr21 22746187 . T C 235.39 PASS AF=0.394366;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.000944298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.347;QD=13.2612;RBI=0.020607;REFB=-0.01205;REVB=-0.0205853;RO=42;SAF=11;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489128;STB=0.508191;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0205338;OID=.;OPOS=22746187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:42:43:27:28:0.394366:16:11:19:23:16:12:19:24 chr21 24804558 . T C 145.72 PASS AF=0.2625;AO=21;DP=80;FAO=21;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.0345496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.869;QD=7.28596;RBI=0.0358887;REFB=-0.000605723;REVB=0.00971218;RO=58;SAF=12;SAR=9;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25048;STB=0.643226;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0144864;OID=.;OPOS=24804558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:58:59:21:21:0.2625:9:12:21:37:9:12:22:37 chr21 24804562 . G A 145.7 PASS AF=0.2625;AO=21;DP=80;FAO=21;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.00284256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.438;QD=7.28508;RBI=0.0154554;REFB=-0.00340687;REVB=-0.0151918;RO=59;SAF=12;SAR=9;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238423;STB=0.643226;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.020161;OID=.;OPOS=24804562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:59:59:21:21:0.2625:9:12:22:37:9:12:22:37 chr21 26965148 . G A 1175.84 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209174;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.856;QD=61.0828;RBI=0.0556884;REFB=0;REVB=-0.0516106;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.42627e-05;OID=.;OPOS=26965148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0 chr21 26965205 . T C 1227.48 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.269;QD=61.3742;RBI=0.0708135;REFB=0;REVB=0.0668625;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197771;OID=.;OPOS=26965205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:42:38:0:0:42:38:0:0 chr21 26969703 . T C 870.24 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0287508;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5362;QD=55.2535;RBI=0.0649287;REFB=-0.0958642;REVB=0.0582162;RO=2;SAF=28;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00247062;STB=0.508769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00330092;OID=.;OPOS=26969703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:63:63:2:1:61:62:0.984127:33:28:1:1:34:28:1:0 chr21 26978950 . A G 623.12 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.278;QD=60.7917;RBI=0.125297;REFB=0;REVB=-0.0242467;RO=1;SAF=18;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253417;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000668367;OID=.;OPOS=26978950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:1:0:40:41:1:22:18:1:0:22:19:0:0 chr21 27056250 . A G 152.74 PASS AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.000777474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6943;QD=13.5768;RBI=0.0128913;REFB=-0.0118058;REVB=0.0128679;RO=28;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674743;STB=0.503932;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0320066;OID=.;OPOS=27056250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:9:8:13:15:9:8:13:15 chr21 27563105 . G A 477.78 PASS AF=0.534884;AO=45;DP=85;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00186086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.785;QD=22.2223;RBI=0.0212792;REFB=-0.00570144;REVB=-0.0211977;RO=40;SAF=24;SAR=21;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357933;STB=0.524862;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00452438;OID=.;OPOS=27563105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:40:40:45:46:0.534884:21:24:23:17:22:24:23:17 chr21 28212760 . G A 628.78 PASS AF=0.508333;AO=61;DP=119;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0175725;FXX=0.0839631;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.96;QD=20.9592;RBI=0.0186686;REFB=-0.0145875;REVB=-0.00630274;RO=58;SAF=29;SAR=32;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674319;STB=0.532886;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.016574;OID=.;OPOS=28212760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:58:59:61:61:0.508333:32:29:32:26:32:29:32:27 chr21 28326276 . G A 2046.07 PASS AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.6;QD=62.4756;RBI=0.0160976;REFB=0;REVB=0.00728129;RO=0;SAF=72;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95289e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77502e-06;OID=.;OPOS=28326276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:59:72:0:0:59:72:0:0 chr21 30250555 . T C 1116.97 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00500669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.113;QD=60.3767;RBI=0.0128751;REFB=0;REVB=0.0118617;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39789e-05;OID=.;OPOS=30250555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0 chr21 30250615 . T C 775.58 PASS AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0107538;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.978;QD=53.4882;RBI=0.0108968;REFB=-0.14394;REVB=-0.00175958;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514701;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000413034;OID=.;OPOS=30250615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:58:58:0:2:56:56:0.965517:33:23:0:0:33:23:0:2 chr21 30255347 . C A 57.93 PASS AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0210406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.505;QD=13.631;RBI=0.037723;REFB=-0.0157199;REVB=0.0313101;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200579;STB=0.620366;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0155032;OID=.;OPOS=30255347;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:4:5:6:2:4:5 chr21 30257560 . C G 837.58 PASS AF=0.436019;AO=92;DP=212;FAO=92;FDP=211;FR=.;FRO=119;FSAF=27;FSAR=65;FSRF=43;FSRR=76;FWDB=-0.0199958;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4182;QD=15.8783;RBI=0.0487106;REFB=-0.0221557;REVB=0.0444172;RO=116;SAF=27;SAR=65;SRF=43;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892714;STB=0.544444;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0244651;OID=.;OPOS=30257560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:116:119:92:92:0.436019:65:27:43:73:65:27:43:76 chr21 30257566 . GTT GT,GTC 3000.82 PASS AF=0.132353,0.867647;AO=24,167;DP=204;FAO=27,177;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=2,68;FSAR=25,109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.141499,-0.0762726;FXX=0.00487781;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.3778,45.9762;QD=58.8396;RBI=0.161068,0.0955241;REFB=0,0;REVB=-0.0769474,-0.0575095;RO=0;SAF=2,62;SAR=22,105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.48349e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0367896,-0.00231823;OID=.,.;OPOS=30257567,30257568;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=GT,GTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.132353,0.867647:24,167:204:27,177:204:0:2,68:25,109:0:0:99:0:2,62:22,105:0:0 chr21 30257570 . A C 80.31 PASS AF=0.121359;AO=28;DP=206;FAO=25;FDP=206;FR=.;FRO=181;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=69;FSRR=112;FWDB=-0.0369082;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.0218;QD=1.5594;RBI=0.0702469;REFB=-0.0239547;REVB=-0.0597696;RO=178;SAF=2;SAR=26;SRF=69;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.514428;STB=0.857769;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.186416;OID=.;OPOS=30257570;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:206:206:178:181:28:25:0.121359:26:2:69:109:23:2:69:112 chr21 30331935 . G A 186.85 PASS AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0103254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.113;QD=19.6684;RBI=0.0209521;REFB=-0.00131747;REVB=-0.0182312;RO=18;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117976;STB=0.552431;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000634792;OID=.;OPOS=30331935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:18:19:19:19:0.5:10:9:11:7:10:9:11:8 chr21 30339234 . T C 92.19 PASS AF=0.375;AO=10;DP=30;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0105601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.825;QD=11.5233;RBI=0.0131983;REFB=-0.0200407;REVB=-0.00791699;RO=20;SAF=8;SAR=2;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212765;STB=0.576787;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0485152;OID=.;OPOS=30339234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:30:32:20:20:10:12:0.375:2:8:13:7:3:9:13:7 chr21 30341891 . A G 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.702;QD=64.1538;RBI=0.0283677;REFB=0;REVB=0.0162184;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86295e-05;OID=.;OPOS=30341891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0 chr21 30408670 . A T 563.18 PASS AF=0.434783;AO=60;DP=139;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=14;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=0.0111243;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.936;QD=16.324;RBI=0.014205;REFB=-0.0156927;REVB=0.00883362;RO=78;SAF=14;SAR=46;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242344;STB=0.636629;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0167144;OID=.;OPOS=30408670;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:78:78:60:60:0.434783:46:14:34:44:46:14:34:44 chr21 30511691 . G A 220.77 PASS AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0981428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.335;QD=12.0968;RBI=0.0986827;REFB=-0.0141494;REVB=-0.0103081;RO=46;SAF=5;SAR=22;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377457;STB=0.720691;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0400002;OID=.;OPOS=30511691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:22:5:22:24:22:5:22:24 chr21 30552839 . A G 318.76 PASS AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0221507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.628;QD=20.9024;RBI=0.0243297;REFB=0.00245071;REVB=-0.0100639;RO=28;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467495;STB=0.525881;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.00325655;OID=.;OPOS=30552839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:16:17:16:12:16:17:16:12 chr21 30552877 . T C 351.29 PASS AF=0.468354;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00811416;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.439;QD=17.7869;RBI=0.0254017;REFB=-0.0105341;REVB=0.0240709;RO=43;SAF=19;SAR=18;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042932;STB=0.518153;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0111088;OID=.;OPOS=30552877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:43:42:37:37:0.468354:18:19:24:19:18:19:23:19 chr21 30716955 . TTGTGTGTG T 92.32 PASS AF=0.5;AO=10;DP=23;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0191552;FXX=0.190431;HRUN=3;LEN=8;MLLD=127.923;QD=10.861;RBI=0.0320162;REFB=-0.0552243;REVB=0.0256538;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.566855;STBP=0.499;TYPE=del;VARB=0.0950527;OID=.;OPOS=30716956;OREF=TGTGTGTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5:10:23:17:34:17:11:6:13:4:92:0:8:2:0:0 chr21 30717151 . C T 1120.77 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00441857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.384;QD=58.9879;RBI=0.0686217;REFB=-0.0771245;REVB=-0.0684793;RO=1;SAF=41;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114011;STB=0.506022;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000129704;OID=.;OPOS=30717151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:34:41:1:0:34:41:1:0 chr21 30718201 . G A 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.392;QD=63.583;RBI=0.032026;REFB=0;REVB=0.0304117;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.26163e-05;OID=.;OPOS=30718201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:31:16:0:0:31:16:0:0 chr21 30830393 . T G 688.41 PASS AF=0.408602;AO=76;DP=186;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=71;FWDB=-0.0214975;FXX=0.00534731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0363;QD=14.8044;RBI=0.0268613;REFB=-0.00133947;REVB=0.0161054;RO=110;SAF=36;SAR=40;SRF=39;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127267;STB=0.571165;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00239913;OID=.;OPOS=30830393;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:110:110:76:76:0.408602:40:36:39:71:40:36:39:71 chr21 30969901 . T C 331.66 PASS AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0556076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1465;QD=21.3972;RBI=0.0561252;REFB=-0.0231693;REVB=0.00760459;RO=26;SAF=20;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159874;STB=0.588183;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0173763;OID=.;OPOS=30969901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:26:28:34:34:0.548387:14:20:10:16:14:20:11:17 chr21 30971183 . G A 277.42 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0141411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.427;QD=18.4948;RBI=0.0341488;REFB=0.000684257;REVB=-0.0310832;RO=28;SAF=14;SAR=16;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961608;STB=0.550529;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=-0.00142021;OID=.;OPOS=30971183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:30:30:30:0.5:16:14:10:18:16:14:11:19 chr21 30973567 . A T 363.26 PASS AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0001704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.079;QD=18.163;RBI=0.0398887;REFB=-0.00577737;REVB=-0.0398883;RO=42;SAF=17;SAR=21;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273033;STB=0.515244;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00793248;OID=.;OPOS=30973567;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:21:17:20:22:21:17:20:22 chr21 31538692 . C T 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.000666601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.659;QD=15.293;RBI=0.0410545;REFB=-0.000469751;REVB=-0.0410491;RO=9;SAF=8;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419704;STB=0.754021;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.000128059;OID=.;OPOS=31538692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:1:8:5:4:1:8:5:4 chr21 31587793 . A G 186.33 PASS AF=0.487179;AO=18;DP=38;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00590354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.016;QD=19.111;RBI=0.0262854;REFB=-0.0179673;REVB=0.0256139;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115484;STB=0.543862;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0176794;OID=.;OPOS=31587793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:39:20:20:18:19:0.487179:6:12:11:9:7:12:11:9 chr21 31655212 . A C 1530.55 PASS AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00812495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.169;QD=63.7728;RBI=0.0294234;REFB=0;REVB=0.0282793;RO=0;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94779e-05;OID=.;OPOS=31655212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:47:48:0:0:48:48:0:0 chr21 31709691 . G A 399.01 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=0.0184153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.676;QD=18.3453;RBI=0.024721;REFB=-0.0153366;REVB=0.0164925;RO=46;SAF=15;SAR=26;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111272;STB=0.561769;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.017201;OID=.;OPOS=31709691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:26:15:12:34:26:15:12:34 chr21 31744127 . A T 265.17 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00205955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.147;QD=15.5985;RBI=0.0109491;REFB=-0.0175814;REVB=0.0107536;RO=38;SAF=11;SAR=19;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135881;STB=0.576871;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0153686;OID=.;OPOS=31744127;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:19:11:19:19:19:11:19:19 chr21 31768539 . G C 2417.93 PASS AF=1;AO=156;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756291;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.03;QD=61.2135;RBI=0.0757207;REFB=0;REVB=-0.00372171;RO=0;SAF=76;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02513e-05;OID=.;OPOS=31768539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:159:158:0:0:156:158:1:80:76:0:0:80:78:0:0 chr21 31913981 . AG A,TA 1321.02 PASS AF=1,0;AO=80,3;DP=84;FAO=85,0;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43,0;FSAR=42,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229908,0.0213999;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=265.931,238.508;QD=62.1659;RBI=0.0234703,0.0220062;REFB=0,0;REVB=-0.00471998,-0.00512997;RO=0;SAF=42,0;SAR=38,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.26068e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=3.84031e-05,0;OID=.,.;OPOS=31913982,31913981;OREF=G,AG;OALT=-,TA;OMAPALT=A,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:85:0:0:80,3:85,0:1,0:38,3:42,0:0:0:42,0:43,0:0:0 chr21 31914000 . T A 1401.3 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00175112;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.296;QD=62.9797;RBI=0.00175634;REFB=0;REVB=-0.000135384;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7383e-05;OID=.;OPOS=31914000;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0 chr21 32090908 . C T 769.98 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00110907;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.69;QD=64.1648;RBI=0.0153896;REFB=0;REVB=0.0153496;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56521e-05;OID=.;OPOS=32090908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0 chr21 32119495 . C G 461.36 PASS AF=0.469388;AO=45;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.00709079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.823;QD=18.8309;RBI=0.00785254;REFB=-0.0114604;REVB=-0.00337389;RO=52;SAF=19;SAR=26;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760374;STB=0.548425;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00916295;OID=.;OPOS=32119495;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:52:52:45:46:0.469388:26:19:18:34:26:20:18:34 chr21 32201969 . GA G 1874.78 PASS AF=1;AO=154;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104974;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.4665;QD=46.0068;RBI=0.0402776;REFB=0;REVB=-0.0388856;RO=0;SAF=57;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81504e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000311402;OID=.;OPOS=32201970;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:154:164:163:163:0:61:102:0:0:35:0:57:97:0:0 chr21 32410582 . C T 191.03 PASS AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00545497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.881;QD=13.4057;RBI=0.0133151;REFB=-0.00478537;REVB=-0.0121464;RO=34;SAF=14;SAR=9;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423745;STB=0.524251;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.00540226;OID=.;OPOS=32410582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:9:14:22:12:9:14:22:12 chr21 32410619 . A G 330.9 PASS AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00414113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.095;QD=15.947;RBI=0.0102592;REFB=-0.0183267;REVB=0.00938631;RO=47;SAF=17;SAR=19;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144894;STB=0.581459;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0161295;OID=.;OPOS=32410619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:19:17:29:18:19:17:29:18 chr21 32491426 . AAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAC,TAAAAAAAAAAAA,TTAAAAAAAAAAA,TTTAAAAAAAAAA 73.41 PASS AF=0.0645161,0.612903,0.0322581,0.129032;AO=2,4,2,3;DP=35;FAO=2,19,1,4;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=2,9,0,1;FSAR=0,10,1,3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.208903,-0.289116,-0.140233,-0.0878087;FXX=0.13885;HRUN=16,16,16,16;LEN=1,1,2,3;MLLD=120.33,4.70861,7.33245,11.4257;QD=9.47202;RBI=0.213526,0.350549,0.177112,0.111078;REFB=-0.0791305,-0.9133,-0.452156,-0.311428;REVB=-0.0441919,-0.198234,-0.108182,-0.0680296;RO=1;SAF=2,0,0,1;SAR=0,4,2,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.697199,0,0,0.163246;STB=0.99138,0.567615,0.993343,0.788117;STBP=0.427,0.239,0.233,0.185;TYPE=snp,snp,mnp,mnp;VARB=0.149303,-0.207741,0.128655,0.0976538;OID=.,.,.,.;OPOS=32491438,32491426,32491426,32491426;OREF=A,A,AA,AAA;OALT=C,T,TT,TTT;OMAPALT=AAAAAAAAAAAAC,TAAAAAAAAAAAA,TTAAAAAAAAAAA,TTTAAAAAAAAAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/4:13:35:31:1:5:2,4,2,3:2,19,1,4:0.0645161,0.612903,0.0322581,0.129032:0,4,2,2:2,0,0,1:0:1:0,10,1,3:2,9,0,1:4:1 chr21 32493031 . A G 2476.48 PASS AF=1;AO=158;DP=161;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273623;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.892;QD=61.1476;RBI=0.0446283;REFB=0;REVB=-0.035256;RO=0;SAF=84;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155784;OID=.;OPOS=32493031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:161:162:0:0:158:162:1:74:84:0:0:76:86:0:0 chr21 32638549 . CC AT 100.96 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0122266;FXX=0.0357015;HRUN=6;LEN=2;MLLD=257.316;QD=14.9568;RBI=0.0129307;REFB=0.00744452;REVB=0.00420878;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484683;STB=0.528254;STBP=0.778;TYPE=mnp;VARB=-0.0115391;OID=.;OPOS=32638549;OREF=CC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:27:15:15:12:12:0.444444:7:5:7:8:7:5:7:8 chr21 33068535 . CTA ACT,CAT,CT 68.74 PASS AF=0,0.0547945,0.383562;AO=5,5,25;DP=74;FAO=0,4,28;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=0,0,9;FSAR=0,4,19;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.048175,0.00885821,0.211265;FXX=0.0135117;HRUN=1,1,7;LEN=3,2,1;MLLD=19.9431,186.921,6.65032;QD=3.76652;RBI=0.108942,0.0787657,0.291325;REFB=-0.0899944,-0.0113174,-0.167853;REVB=-0.0977113,-0.078266,-0.200592;RO=30;SAF=1,0,7;SAR=4,5,18;SRF=19;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.478851,-0.697069,-0.348006;STB=0.5,0.997454,0.632556;STBP=1,0.03,0.071;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0,0.0293246,0.17513;OID=.,.,.;OPOS=33068535,33068536,33068537;OREF=CTA,TA,A;OALT=ACT,AT,-;OMAPALT=ACT,CAT,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:56:74:73:30:41:5,5,25:0,4,28:0,0.0547945,0.383562:4,5,18:1,0,7:19:11:0,4,19:0,0,9:22:19 chr21 33346936 . C T 1157.83 PASS AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0207117;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.718;QD=59.376;RBI=0.0608623;REFB=-0.045525;REVB=0.0572298;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133285;STB=0.50704;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00175359;OID=.;OPOS=33346936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:41:35:1:0:42:35:1:0 chr21 33368188 . T C 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0374686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.799;QD=58.4195;RBI=0.03748;REFB=0;REVB=-0.000924115;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175247;OID=.;OPOS=33368188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0 chr21 33370900 . T C 1011.11 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00398136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9871;QD=57.7777;RBI=0.0044615;REFB=-0.122554;REVB=-0.00201338;RO=1;SAF=40;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116725;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00350355;OID=.;OPOS=33370900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:29:40:1:0:29:40:1:0 chr21 33372749 . TGT CGT,GTC 3036.85 PASS AF=0.970443,0.0295567;AO=166,7;DP=187;FAO=197,6;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=114,6;FSAR=83,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598136,0.0471894;FXX=0.0193227;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=125.845,77.4089;QD=59.8393;RBI=0.0607017,0.0493956;REFB=0,0;REVB=0.0103459,0.0145975;RO=1;SAF=95,6;SAR=71,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00498333,-0.0674964;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=6.18806e-05,0.141732;OID=.,.;OPOS=33372749,33372749;OREF=T,TGT;OALT=C,GTC;OMAPALT=CGT,GTC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:187:203:1:0:166,7:197,6:0.970443,0.0295567:71,1:95,6:1:0:83,0:114,6:0:0 chr21 33373966 . T TTGTGTGTG,TTGTGTGTGTG 57.1 PASS AF=0,0.8;AO=2,5;DP=10;FAO=0,8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=0,7;FSAR=0,1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0392551,0.0390361;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=8,10;MLLD=180.372,197.933;QD=22.8381;RBI=0.0393177,0.0513637;REFB=-0.144772,-0.146081;REVB=-0.00221863,0.0333828;RO=3;SAF=2,4;SAR=0,1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.23409;STB=0.5,0.562356;STBP=1,0.67;TYPE=ins,ins;VARB=0.0145854,0.00690457;OID=.,.;OPOS=33373967,33373967;OREF=-,-;OALT=TGTGTGTG,TGTGTGTGTG;OMAPALT=TTGTGTGTG,TTGTGTGTGTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0,0.8:2,5:10:0,8:10:2:0,7:0,1:2:0:12:3:2,4:0,1:3:0 chr21 33374318 . C T 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00178967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.26;QD=58.9625;RBI=0.0039928;REFB=0;REVB=0.00356925;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.60908e-06;OID=.;OPOS=33374318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0 chr21 33694224 . C G 688.13 PASS AF=0.915254;AO=51;DP=57;FAO=54;FDP=59;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.157708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7906;QD=46.6529;RBI=0.157852;REFB=-0.0884068;REVB=0.00673576;RO=2;SAF=36;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174612;STB=0.552552;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0060989;OID=.;OPOS=33694224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:57:59:2:5:51:54:0.915254:15:36:1:1:15:39:1:4 chr21 33714962 . C T 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=357.212;QD=19.1341;RBI=0.0145845;REFB=0.0107027;REVB=-0.0145845;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00306631;OID=.;OPOS=33714962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:5:0:0:2:5:0:0:2 chr21 33719695 . C T 535.83 PASS AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6475;QD=54.9567;RBI=0.029353;REFB=0.0152454;REVB=0.0274489;RO=1;SAF=28;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164365;STB=0.517232;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.000344116;OID=.;OPOS=33719695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:39:39:1:2:37:37:0.948718:9:28:1:0:9:28:2:0 chr21 33721642 . C T 137.88 PASS AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0151259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0155;QD=19.0178;RBI=0.0177707;REFB=-0.0186569;REVB=-0.00932766;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149262;STB=0.585249;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0128106;OID=.;OPOS=33721642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:7:7:5:10:7:7 chr21 33749533 . A C 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.829;QD=63.0525;RBI=0.0473482;REFB=0;REVB=0.0254201;RO=0;SAF=58;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.45581e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49386e-05;OID=.;OPOS=33749533;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:33:58:0:0:33:58:0:0 chr21 33785228 . C A 737.45 PASS AF=1;AO=47;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.69;QD=58.996;RBI=0.0877655;REFB=-0.075048;REVB=0.0864345;RO=3;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803571;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025224;OID=.;OPOS=33785228;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:50:50:3:0:47:50:1:16:31:0:3:19:31:0:0 chr21 33840208 . A G 863.88 PASS AF=0.984127;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00158268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.383;QD=54.8497;RBI=0.00494675;REFB=-0.217262;REVB=-0.00468673;RO=0;SAF=20;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14674e-08;STB=0.50588;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.000305272;OID=.;OPOS=33840208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:63:63:0:1:61:62:0.984127:41:20:0:0:42:20:0:1 chr21 33887131 . G A 742.57 PASS AF=1;AO=52;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.243;QD=52.1099;RBI=0.0878364;REFB=-0.0817311;REVB=0.0433267;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106304;OID=.;OPOS=33887131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:55:57:0:0:52:57:1:26:26:0:0:29:28:0:0 chr21 34157235 . GTTTTTTTTTT GTTTTTTT,GTTTTTTTTTA,GTTTTTTTT 191.94 PASS AF=0.588235,0.411765,0;AO=5,2,2;DP=16;FAO=10,7,0;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7,0;FSAR=10,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.213359,-0.0110207,-0.299823;FXX=0.0555247;HRUN=12,12,12;LEN=3,1,2;MLLD=15.6022,138.827,13.5204;QD=45.1618;RBI=0.234912,0.0158598,0.32688;REFB=0,0,0;REVB=0.0982937,0.0114051,0.130218;RO=0;SAF=0,2,0;SAR=5,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0064233,-9.24229e-06,0.0378268;OID=.,.,.;OPOS=34157236,34157245,34157236;OREF=TTT,T,TT;OALT=-,A,-;OMAPALT=GTTTTTTT,GTTTTTTTTTA,GTTTTTTTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.588235,0.411765,0:5,2,2:16:10,7,0:17:0:0,7,0:10,0,0:0:0:51:0:0,2,0:5,0,2:0:0 chr21 34163742 . A G 1377.48 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.229;QD=62.6126;RBI=0.0420745;REFB=0;REVB=0.0266236;RO=0;SAF=31;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138294;OID=.;OPOS=34163742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:57:31:0:0:57:31:0:0 chr21 34166190 . A T 1281.0 PASS AF=0.988372;AO=82;DP=85;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0438053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5124;QD=59.5814;RBI=0.0657523;REFB=0.0868704;REVB=-0.0490354;RO=2;SAF=44;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00165769;STB=0.506328;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00114913;OID=.;OPOS=34166190;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:86:2:1:82:85:0.988372:38:44:1:1:39:46:0:1 chr21 34166343 . C T 1204.41 PASS AF=0.942529;AO=82;DP=87;FAO=82;FDP=87;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0314139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9931;QD=55.3752;RBI=0.0408349;REFB=-0.049575;REVB=0.0260895;RO=5;SAF=36;SAR=46;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430583;STB=0.502277;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.032212;OID=.;OPOS=34166343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:87:87:5:5:82:82:0.942529:46:36:2:3:46:36:2:3 chr21 34169317 . C CT 559.19 PASS AF=1;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016147;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=127.844;QD=47.5908;RBI=0.0205547;REFB=0;REVB=-0.0127189;RO=2;SAF=15;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158556;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=1.83201e-05;OID=.;OPOS=34169318;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:47:49:47:47:0:15:32:0:0:10:2:15:32:1:1 chr21 34400237 . G C 57.0 PASS AF=0.875;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.785;QD=28.4996;RBI=0.0135775;REFB=-0.0687273;REVB=0;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00330386;OID=.;OPOS=34400237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:6:7:0.875:0:6:1:0:0:7:1:0 chr21 34400350 . C G 269.04 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00982931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0296;QD=16.5566;RBI=0.0143039;REFB=0.0164464;REVB=-0.0103916;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11865;STB=0.559056;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.0119206;OID=.;OPOS=34400350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:35:30:30:0.461538:17:13:19:15:17:13:19:16 chr21 34444137 . G A 303.04 PASS AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00661387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.702;QD=14.6044;RBI=0.0111895;REFB=-0.00675652;REVB=0.00902556;RO=49;SAF=14;SAR=20;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103441;STB=0.558704;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0102325;OID=.;OPOS=34444137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:49:49:34:34:0.409639:20:14:25:24:20:14:25:24 chr21 34614255 . T G 708.43 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.049;QD=62.9713;RBI=0.0553094;REFB=0;REVB=0.0412293;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353177;OID=.;OPOS=34614255;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0 chr21 34634991 . C A 56.23 PASS AF=0.4;AO=6;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00617417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.246;QD=11.2469;RBI=0.0266758;REFB=0.00665209;REVB=0.0259515;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137104;STB=0.583139;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00195431;OID=.;OPOS=34634991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:20:20:12:12:6:8:0.4:1:5:9:3:3:5:9:3 chr21 34640788 . A G 918.14 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00946108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.503;QD=56.5009;RBI=0.0136017;REFB=0.0816662;REVB=-0.00977209;RO=1;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116608;STB=0.506022;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00109088;OID=.;OPOS=34640788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:40:23:0:1:41:23:0:1 chr21 34666376 . A G 508.36 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0744446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3074;QD=56.4842;RBI=0.0885523;REFB=0.011826;REVB=-0.0479532;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346204;STB=0.518508;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.00336753;OID=.;OPOS=34666376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:22:13:1:0:22:13:1:0 chr21 34668747 . A G 313.33 PASS AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.107;QD=50.1325;RBI=0.100338;REFB=-0.0349283;REVB=0.0949888;RO=1;SAF=14;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319609;STB=0.517227;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00183606;OID=.;OPOS=34668747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:10:14:1:0:10:14:1:0 chr21 34715699 . G C 280.89 PASS AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0333639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4998;QD=14.4048;RBI=0.0362099;REFB=-0.0213082;REVB=-0.0140713;RO=46;SAF=9;SAR=23;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155167;STB=0.588607;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.024786;OID=.;OPOS=34715699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:23:9:19:27:23:9:19:27 chr21 34821570 . G A 382.5 PASS AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0345777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7384;QD=52.7585;RBI=0.0530643;REFB=0.0171935;REVB=0.0402518;RO=1;SAF=20;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227089;STB=0.512187;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.000358809;OID=.;OPOS=34821570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:8:20:1:0:8:20:1:0 chr21 34821648 . CAA C 302.46 PASS AF=1;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336308;FXX=0.0714031;HRUN=2;LEN=2;MLLD=229.113;QD=46.5329;RBI=0.0704575;REFB=0;REVB=0.061913;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000492892;OID=.;OPOS=34821649;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:26:28:26:26:0:13:13:0:0:5:0:13:13:0:0 chr21 34822150 . T A 670.46 PASS AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0830997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.285;QD=50.6006;RBI=0.0839851;REFB=-0.236503;REVB=-0.0121628;RO=3;SAF=27;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135786;STB=0.507221;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0156551;OID=.;OPOS=34822150;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:53:53:3:3:50:50:0.943396:23:27:2:1:23:27:2:1 chr21 34822452 . T C 520.63 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.741;QD=59.5009;RBI=0.0437534;REFB=0;REVB=0.0403549;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516941;OID=.;OPOS=34822452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:20:15:0:0 chr21 34851060 . TAAAAAAAAAG TAAAAAAAAGT,TAAAAAAAGAT 33.76 PASS AF=0.153846,0;AO=5,2;DP=40;FAO=6,0;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=2,0;FSAR=4,0;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0947326,-0.0111855;FXX=0.0487686;HRUN=9,9;LEN=2,3;MLLD=23.0551,128.273;QD=3.46283;RBI=0.107467,0.0113362;REFB=-0.00737786,-0.000399669;REVB=-0.0507433,-0.0018427;RO=21;SAF=1,2;SAR=4,0;SRF=12;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.431387,0.475599;STB=0.699355,0.5;STBP=0.346,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.017851,0.0581808;OID=.,.;OPOS=34851069,34851068;OREF=AG,AAG;OALT=GT,GAT;OMAPALT=TAAAAAAAAGT,TAAAAAAAGAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.153846,0:5,2:40:6,0:39:33:2,0:4,0:19:14:30:21:1,2:4,0:12:9 chr21 34897113 . C T 1614.44 PASS AF=1;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000684081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.681;QD=59.2457;RBI=0.00873415;REFB=-0.0206904;REVB=0.00870732;RO=1;SAF=58;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939877;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13385e-05;OID=.;OPOS=34897113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:109:109:1:0:108:109:1:50:58:0:1:51:58:0:0 chr21 34925142 . C T 1024.35 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.311;QD=59.3824;RBI=0.039394;REFB=0;REVB=-0.00221393;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164627;OID=.;OPOS=34925142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:40:28:0:0:41:28:0:0 chr21 34926043 . G A 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.192;QD=47.822;RBI=0.0668025;REFB=0;REVB=0.05443;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130066;OID=.;OPOS=34926043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chr21 34945721 . T C 674.98 PASS AF=1;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987168;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.389;QD=61.3614;RBI=0.051443;REFB=0;REVB=0.050487;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117823;OID=.;OPOS=34945721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:44:0:0:43:44:1:25:18:0:0:26:18:0:0 chr21 34948684 . G GA 949.84 PASS AF=1;AO=80;DP=85;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139963;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.1791;QD=46.9059;RBI=0.144194;REFB=0;REVB=0.0346742;RO=3;SAF=37;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368479;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00266366;OID=.;OPOS=34948685;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:80:85:81:81:0:38:43:0:0:17:3:37:43:3:0 chr21 34948696 . GA G 1168.49 PASS AF=1;AO=77;DP=80;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438751;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5786;QD=59.9228;RBI=0.0623299;REFB=0;REVB=-0.0442718;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000134512;OID=.;OPOS=34948697;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:77:80:78:78:0:34:44:0:0:6:0:34:43:0:0 chr21 35201281 . G A 855.37 PASS AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312186;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.352;QD=57.991;RBI=0.0312824;REFB=0;REVB=-0.00199638;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112579;OID=.;OPOS=35201281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0 chr21 35237608 . T C 447.01 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.636;QD=57.6786;RBI=0.037544;REFB=0;REVB=0.00522664;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256331;OID=.;OPOS=35237608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0 chr21 35260481 . T C 209.33 PASS AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0130695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8216;QD=13.7262;RBI=0.0226122;REFB=-0.00473426;REVB=0.0184526;RO=36;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00804803;STB=0.504596;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00749618;OID=.;OPOS=35260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:13:12:17:19:13:12:17:19 chr21 35275955 . G A 375.66 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.207;QD=55.6532;RBI=0.0357254;REFB=0;REVB=0.0210132;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367737;OID=.;OPOS=35275955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0 chr21 35281393 . A G 534.82 PASS AF=0.537634;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0207048;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.864;QD=23.003;RBI=0.0254012;REFB=-0.022543;REVB=-0.014715;RO=42;SAF=23;SAR=27;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727375;STB=0.545319;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0172598;OID=.;OPOS=35281393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:42:43:50:50:0.537634:27:23:23:19:27:23:24:19 chr21 35467645 . A G 2277.18 PASS AF=0.993103;AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000319909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.24;QD=62.8188;RBI=0.00877684;REFB=0.0503052;REVB=-0.008771;RO=1;SAF=78;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605804;STB=0.503184;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000127165;OID=.;OPOS=35467645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:145:145:1:1:144:144:0.993103:66:78:1:0:66:78:1:0 chr21 35469193 . C A 305.99 PASS AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.047411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1754;QD=47.0752;RBI=0.0558821;REFB=-0.0126708;REVB=-0.0295804;RO=2;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617183;STB=0.533306;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00307557;OID=.;OPOS=35469193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:14:10:0:2:14:10:0:2 chr21 35469708 . G A,GA 566.12 PASS AF=0,1;AO=3,50;DP=73;FAO=0,69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=0,40;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624105,0.128773;FXX=0;HRUN=4,6;LEN=1,1;MLLD=7.14097,10.9092;QD=32.8184;RBI=0.0647932,0.128869;REFB=-0.0236342,0.0141209;REVB=0.0174095,0.00499064;RO=15;SAF=1,30;SAR=2,20;SRF=9;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.286083,-3.26176e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00420834;OID=.,.;OPOS=35469708,35469709;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:3:73:69:15:0:3,50:0,69:0,1:2,20:1,30:9:6:0,29:0,40:0:0 chr21 35469726 . G GT 840.92 PASS AF=1;AO=69;DP=78;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103304;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.312;QD=47.3756;RBI=0.106189;REFB=0;REVB=-0.024583;RO=8;SAF=40;SAR=29;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343876;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00234883;OID=.;OPOS=35469727;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:69:78:71:71:0:42:29:0:0:15:8:40:29:6:2 chr21 35469852 . C A 1280.37 PASS AF=1;AO=72;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4344;QD=61.7046;RBI=0.122476;REFB=0;REVB=0.12196;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151487;OID=.;OPOS=35469852;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:72:83:1:38:34:0:0:48:35:0:0 chr21 35470042 . G T 681.26 PASS AF=1;AO=31;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.922;QD=59.2405;RBI=0.039304;REFB=0;REVB=0.0150192;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12837e-06;OID=.;OPOS=35470042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:31:46:1:15:16:0:0:20:26:0:0 chr21 35470210 . T G 716.55 PASS AF=0.963636;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00769997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.583;QD=52.1124;RBI=0.016597;REFB=-0.0381313;REVB=0.0147027;RO=2;SAF=30;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00548722;STB=0.503175;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-3.5211e-06;OID=.;OPOS=35470210;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:55:2:2:52:53:0.963636:22:30:1:1:22:31:1:1 chr21 35470213 . C A 768.24 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209217;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9947;QD=56.907;RBI=0.0213067;REFB=0;REVB=-0.00403217;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158648;OID=.;OPOS=35470213;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0 chr21 35474671 . ATTTCTG A 1386.28 PASS AF=0.975;AO=114;DP=119;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0231978;FXX=0.00826378;HRUN=3;LEN=6;MLLD=300.559;QD=46.2092;RBI=0.0385961;REFB=-0.0748399;REVB=0.0308468;RO=0;SAF=65;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29464e-08;STB=0.502402;STBP=0.796;TYPE=del;VARB=0.00137707;OID=.;OPOS=35474672;OREF=TTTCTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.975:114:119:117:120:3:67:50:2:1:10:0:65:49:0:0 chr21 35497669 . C T 506.85 PASS AF=0.411765;AO=56;DP=136;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=0.00859223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.915;QD=14.9074;RBI=0.0542136;REFB=-0.0235072;REVB=-0.0535284;RO=80;SAF=31;SAR=25;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00945794;STB=0.505317;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0374184;OID=.;OPOS=35497669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:80:80:56:56:0.411765:25:31:45:35:25:31:45:35 chr21 35757862 . T C 251.73 PASS AF=0.42029;AO=30;DP=70;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0138653;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.702;QD=14.5929;RBI=0.0231406;REFB=-0.00697346;REVB=0.0185267;RO=38;SAF=20;SAR=10;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22293;STB=0.607767;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0169127;OID=.;OPOS=35757862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:38:40:30:29:0.42029:10:20:17:21:10:19:19:21 chr21 35773137 . C T 346.27 PASS AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.004512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2461;QD=16.891;RBI=0.0194512;REFB=-0.0201105;REVB=0.0189206;RO=45;SAF=18;SAR=19;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849456;STB=0.547594;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.024463;OID=.;OPOS=35773137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:19:18:18:27:19:18:18:27 chr21 35821821 . T C 478.45 PASS AF=1;AO=30;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00968026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.671;QD=57.9942;RBI=0.0188424;REFB=0;REVB=0.0161656;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000201561;OID=.;OPOS=35821821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:30:33:1:15:15:0:0:15:18:0:0 chr21 35890409 . C T 715.63 PASS AF=0.47973;AO=71;DP=148;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=0.00401284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.189;QD=19.3413;RBI=0.00788334;REFB=-0.0126562;REVB=0.00678559;RO=76;SAF=37;SAR=34;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443591;STB=0.521121;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0131756;OID=.;OPOS=35890409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:76:77:71:71:0.47973:34:37:36:40:34:37:37:40 chr21 35893737 . T C 775.75 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1902;QD=56.4182;RBI=0.0413705;REFB=0;REVB=0.0400338;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208319;OID=.;OPOS=35893737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:28:25:0:0:29:26:0:0 chr21 36042203 . G C 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0942;QD=39.2043;RBI=0.0657881;REFB=0;REVB=0.0559311;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00637844;OID=.;OPOS=36042203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr21 36410954 . G T 69.63 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.069744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0673;QD=16.3825;RBI=0.0944101;REFB=-0.0108408;REVB=0.0636321;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238988;STB=0.639683;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0276417;OID=.;OPOS=36410954;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:6:3:5:3:6:3:5:3 chr21 36411119 . G T 141.96 PASS AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.00405994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.695;QD=13.8493;RBI=0.00518022;REFB=0.00500783;REVB=0.00321739;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924333;STB=0.553442;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.00716845;OID=.;OPOS=36411119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:6:19:11:5:6:19 chr21 37420650 . G A 257.26 PASS AF=0.585366;AO=23;DP=40;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0178336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.863;QD=25.0986;RBI=0.0186162;REFB=-0.0190585;REVB=-0.00534109;RO=17;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510151;STB=0.536555;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0203711;OID=.;OPOS=37420650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:41:17:17:23:24:0.585366:11:12:10:7:12:12:10:7 chr21 37420655 . GCAGGCAACTCT G 100.37 PASS AF=0.4;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0163323;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=11;MLLD=363.384;QD=13.3828;RBI=0.0168884;REFB=-0.000588375;REVB=0.00429784;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953953;STB=0.533278;STBP=0.797;TYPE=del;VARB=0.000517612;OID=.;OPOS=37420656;OREF=CAGGCAACTCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:12:32:12:30:18:6:6:8:10:99:15:6:6:6:9 chr21 37429679 . G C 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2135;QD=45.8047;RBI=0.0307131;REFB=0;REVB=-0.0184924;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153639;OID=.;OPOS=37429679;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr21 37442632 . G C 193.91 PASS AF=0.425926;AO=21;DP=52;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.000149754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.144;QD=14.3637;RBI=0.00999255;REFB=-0.0426433;REVB=0.00999143;RO=31;SAF=14;SAR=7;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610545;STB=0.553686;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0289178;OID=.;OPOS=37442632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:31:31:21:23:0.425926:7:14:19:12:7:16:19:12 chr21 37443480 . T G 195.16 PASS AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.027295;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.367;QD=17.7417;RBI=0.0274524;REFB=-0.0147965;REVB=0.00293564;RO=24;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099707;STB=0.557083;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0192448;OID=.;OPOS=37443480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:15:5:8:16:15:5:8:16 chr21 37444120 . C T 344.35 PASS AF=0.390476;AO=41;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00832842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.493;QD=13.1181;RBI=0.022841;REFB=-0.0100983;REVB=0.0212685;RO=64;SAF=21;SAR=20;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800681;STB=0.545433;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0212461;OID=.;OPOS=37444120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:64:64:41:41:0.390476:20:21:28:36:20:21:28:36 chr21 37444696 . C T 96.48 PASS AF=0.220588;AO=15;DP=68;FAO=15;FDP=68;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.00745823;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.507;QD=5.67501;RBI=0.0139613;REFB=-0.0118883;REVB=-0.0118023;RO=49;SAF=8;SAR=7;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534395;STB=0.518639;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0378573;OID=.;OPOS=37444696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:68:68:49:53:15:15:0.220588:7:8:24:25:7:8:27:26 chr21 37444973 . C T 205.36 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00472904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.059;QD=12.8348;RBI=0.0183996;REFB=-0.0109699;REVB=-0.0177815;RO=38;SAF=10;SAR=15;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214228;STB=0.614816;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0247155;OID=.;OPOS=37444973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:38:39:25:25:0.390625:15:10:23:15:15:10:23:16 chr21 37507745 . C T 243.34 PASS AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.020707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.738;QD=12.8071;RBI=0.0217168;REFB=0.00403944;REVB=0.00654516;RO=47;SAF=18;SAR=11;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986836;STB=0.556661;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=-0.00385168;OID=.;OPOS=37507745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:47:47:29:29:0.381579:11:18:25:22:11:18:25:22 chr21 37518706 . G A 266.18 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0219986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.457;QD=21.2945;RBI=0.0448172;REFB=0.00336498;REVB=0.0390467;RO=24;SAF=2;SAR=23;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529423;STB=0.816934;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00218946;OID=.;OPOS=37518706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:25:25:25:0.5:23:2:11:13:23:2:12:13 chr21 37609571 . T C 277.38 PASS AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.0365067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7869;QD=18.4917;RBI=0.0381744;REFB=0.000114221;REVB=0.0111602;RO=30;SAF=4;SAR=26;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165013;STB=0.593291;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.000366829;OID=.;OPOS=37609571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:26:4:7:23:26:4:7:23 chr21 37617630 . T G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.562;QD=51.9167;RBI=0.0270876;REFB=0;REVB=0.0124544;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.90065e-05;OID=.;OPOS=37617630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chr21 37664501 . G A 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00335051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5467;QD=10.14;RBI=0.0189742;REFB=-0.00938274;REVB=-0.0186761;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207149;STB=0.622902;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0146637;OID=.;OPOS=37664501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:7:6:8:20:7:6:8:20 chr21 37741352 . G A 228.19 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.017102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.098;QD=13.8298;RBI=0.0200079;REFB=-0.0107053;REVB=0.0103845;RO=39;SAF=7;SAR=20;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378757;STB=0.716598;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00917672;OID=.;OPOS=37741352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:20:7:24:15:20:7:24:15 chr21 37781046 . C T 294.01 PASS AF=0.477612;AO=33;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.097168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9396;QD=17.5527;RBI=0.113986;REFB=-0.0278899;REVB=0.0595922;RO=34;SAF=15;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414729;STB=0.508881;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0344594;OID=.;OPOS=37781046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:35:33:32:0.477612:18:15:17:17:17:15:17:18 chr21 38081562 . T G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.36;QD=37.4877;RBI=0.0430484;REFB=0;REVB=0.0400393;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000635905;OID=.;OPOS=38081562;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr21 38081577 . C G 145.64 PASS AF=1;AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.099;QD=44.8114;RBI=0.150208;REFB=0;REVB=0.10314;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137233;OID=.;OPOS=38081577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:11:13:1:7:4:0:0:7:6:0:0 chr21 38117308 . C A 328.89 PASS AF=0.578947;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0203806;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.987;QD=23.0803;RBI=0.0204956;REFB=-0.0195121;REVB=0.00216839;RO=25;SAF=22;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122665;STB=0.574953;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0198614;OID=.;OPOS=38117308;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:25:24:33:33:0.578947:11:22:13:12:11:22:12:12 chr21 38118089 . G C 282.29 PASS AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=-0.00929634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.796;QD=22.5829;RBI=0.0242666;REFB=-0.0296691;REVB=-0.0224153;RO=24;SAF=21;SAR=5;SRF=20;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364202;STB=0.520289;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0230875;OID=.;OPOS=38118089;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:5:21:20:4:5:21:20:4 chr21 38437951 . T G 863.25 PASS AF=0.555556;AO=80;DP=144;FAO=80;FDP=144;FR=.;FRO=64;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.00447247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5349;QD=23.9792;RBI=0.0223408;REFB=-0.0277782;REVB=0.0218885;RO=64;SAF=39;SAR=41;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609997;STB=0.53329;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0241605;OID=.;OPOS=38437951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:64:64:80:80:0.555556:41:39:36:28:41:39:36:28 chr21 38444863 . C T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.331;QD=62.1622;RBI=0.0527299;REFB=0;REVB=0.0177809;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206626;OID=.;OPOS=38444863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0 chr21 38444881 . G A 342.88 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0114988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.041;QD=21.4302;RBI=0.0122527;REFB=-0.00468203;REVB=0.00423144;RO=29;SAF=25;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208311;STB=0.615694;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00370475;OID=.;OPOS=38444881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:10:25:14:15:10:25:14:15 chr21 38444890 . A G 180.91 PASS AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00728709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.209;QD=12.9223;RBI=0.0100856;REFB=-0.0110835;REVB=0.00697263;RO=34;SAF=10;SAR=12;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262063;STB=0.649554;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00665553;OID=.;OPOS=38444890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:12:10:24:10:12:10:24:10 chr21 38468958 . A G 347.86 PASS AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0463686;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.401;QD=14.8024;RBI=0.0507817;REFB=0.0050383;REVB=0.0207059;RO=55;SAF=20;SAR=18;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748496;STB=0.547461;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=-0.00954662;OID=.;OPOS=38468958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:55:56:38:38:0.404255:18:20:25:30:18:20:25:31 chr21 38495269 . GA AT,GAT 748.78 PASS AF=0.0178571,0.982143;AO=2,52;DP=57;FAO=1,55;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=0,33;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0856981,-0.095323;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=132.717,26.6183;QD=53.4839;RBI=0.0941151,0.122356;REFB=0,0;REVB=-0.0389036,0.0767109;RO=1;SAF=0,31;SAR=2,21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697199,-0.0149535;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=-0.00806566,0.000556424;OID=.,.;OPOS=38495269,38495271;OREF=GA,-;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GAT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:57:56:1:0:2,52:1,55:0.0178571,0.982143:2,21:0,31:1:0:1,22:0,33:0:0 chr21 38512956 . A G 364.55 PASS AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0100489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.049;QD=18.458;RBI=0.0104577;REFB=0.00244932;REVB=-0.00289538;RO=41;SAF=19;SAR=19;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113451;STB=0.506326;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=-0.00580368;OID=.;OPOS=38512956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:41:38:38:0.481013:19:19:20:21:19:19:20:21 chr21 38520844 . AG A 45.48 PASS AF=0.409091;AO=7;DP=23;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0472843;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4421;QD=8.26861;RBI=0.279744;REFB=-0.0510537;REVB=-0.275719;RO=11;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=4;SSEN=0.549261;SSEP=0;SSSB=-0.528175;STB=0.707368;STBP=0.135;TYPE=del;VARB=0.0399319;OID=.;OPOS=38520845;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.409091:7:23:9:22:13:2:7:7:6:45:11:1:6:7:4 chr21 38524226 . A G 260.82 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0144543;FXX=0.017854;HRUN=6;LEN=1;MLLD=133.048;QD=18.9687;RBI=0.0162619;REFB=-0.00700962;REVB=0.0074514;RO=24;SAF=8;SAR=20;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471938;STB=0.568811;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0245932;OID=.;OPOS=38524226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:24:27:28:28:0.509091:20:8:8:16:20:8:11:16 chr21 38525356 . T C 515.41 PASS AF=0.394737;AO=60;DP=153;FAO=60;FDP=152;FR=.;FRO=92;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=62;FSRR=30;FWDB=0.0224654;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.529;QD=13.5634;RBI=0.0254075;REFB=0.0042595;REVB=0.0118678;RO=92;SAF=38;SAR=22;SRF=62;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476129;STB=0.526811;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.0067195;OID=.;OPOS=38525356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:92:92:60:60:0.394737:22:38:62:30:22:38:62:30 chr21 38525603 . A G 179.02 PASS AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00522632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.724;QD=12.5628;RBI=0.0259838;REFB=-0.0193456;REVB=0.0254527;RO=34;SAF=14;SAR=8;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349835;STB=0.691192;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0405999;OID=.;OPOS=38525603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:34:35:22:22:0.385965:8:14:10:24:8:14:11:24 chr21 38532058 . TG T 869.34 PASS AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00620397;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.4342;QD=48.977;RBI=0.0168957;REFB=0;REVB=0.0157155;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000424492;OID=.;OPOS=38532059;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:70:72:71:71:0:37:34:0:0:15:0:36:34:0:0 chr21 38532068 . G GA 742.25 PASS AF=0.985075;AO=63;DP=73;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.157624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.9531;QD=44.3133;RBI=0.212648;REFB=-0.00459502;REVB=0.142737;RO=10;SAF=31;SAR=32;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00204119;STB=0.507244;STBP=0.502;TYPE=ins;VARB=0.00649276;OID=.;OPOS=38532069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.985075:63:73:66:67:1:32:34:0:1:9:10:31:32:5:5 chr21 38568009 . G C 540.11 PASS AF=0.504505;AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0106838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.58;QD=19.4635;RBI=0.0201641;REFB=-0.00181833;REVB=0.0171011;RO=55;SAF=27;SAR=29;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404761;STB=0.522346;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00178772;OID=.;OPOS=38568009;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:55:55:56:56:0.504505:29:27:29:26:29:27:29:26 chr21 38568308 . C T 162.54 PASS AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0135855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4672;QD=19.7021;RBI=0.0151183;REFB=0.00356605;REVB=0.00663321;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825894;STB=0.546708;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.00282422;OID=.;OPOS=38568308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:8:9:10:6:8:9:10:6 chr21 38885442 . A G 1238.74 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.14;QD=61.1725;RBI=0.0182574;REFB=0;REVB=-0.00516056;RO=0;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8881e-05;OID=.;OPOS=38885442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:29:50:0:0:31:50:0:0 chr21 38997701 . G A 1497.32 PASS AF=0.990385;AO=102;DP=105;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0122975;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.315;QD=57.5894;RBI=0.0125322;REFB=-0.133633;REVB=-0.00241418;RO=2;SAF=66;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00586155;STB=0.506848;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000401379;OID=.;OPOS=38997701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:105:104:2:1:102:103:0.990385:36:66:1:1:36:67:0:1 chr21 39086965 . T C 670.09 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.55;QD=62.3339;RBI=0.0205171;REFB=0;REVB=0.016557;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8534e-05;OID=.;OPOS=39086965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0 chr21 39213020 . G A 130.65 PASS AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.010652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.651;QD=13.7525;RBI=0.0277918;REFB=-0.0061656;REVB=-0.0256694;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383171;STB=0.71974;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0156152;OID=.;OPOS=39213020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:6:9:5:18:6:9:5:18 chr21 39672624 . C G 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.139;QD=60.2307;RBI=0.0199774;REFB=0;REVB=0.0116218;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123628;OID=.;OPOS=39672624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0 chr21 39870310 . G A 557.1 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00223084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.372;QD=60.2267;RBI=0.00282701;REFB=0;REVB=0.00173648;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.55944e-06;OID=.;OPOS=39870310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0 chr21 40191431 . T G 552.23 PASS AF=0.47541;AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.0164895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6881;QD=18.1058;RBI=0.0205657;REFB=-0.0338418;REVB=-0.01229;RO=63;SAF=33;SAR=25;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329337;STB=0.513298;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0300321;OID=.;OPOS=40191431;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:63:64:58:58:0.47541:25:33:38:25:25:33:38:26 chr21 40191638 . A G 406.75 PASS AF=0.571429;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.000400064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.606;QD=23.2427;RBI=0.00888703;REFB=-0.00145676;REVB=-0.00887802;RO=28;SAF=18;SAR=22;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010815;STB=0.507201;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.000979523;OID=.;OPOS=40191638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:30:40:40:0.571429:22:18:13:15:22:18:14:16 chr21 40195277 . T A 2306.78 PASS AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0717512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5833;QD=61.1067;RBI=0.0743451;REFB=0;REVB=-0.0194669;RO=0;SAF=60;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239434;OID=.;OPOS=40195277;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:91:60:0:0:91:60:0:0 chr21 40552307 . A G 708.2 PASS AF=0.526718;AO=68;DP=130;FAO=69;FDP=131;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.0285722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.642;QD=21.6245;RBI=0.0312549;REFB=-0.0108432;REVB=0.0126688;RO=62;SAF=37;SAR=31;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605842;STB=0.529906;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00781011;OID=.;OPOS=40552307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:62:62:68:69:0.526718:31:37:38:24:31:38:38:24 chr21 40571246 . A G 920.47 PASS AF=0.571429;AO=88;DP=154;FAO=88;FDP=154;FR=.;FRO=66;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.00118467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.038;QD=23.9084;RBI=0.0156745;REFB=-0.0113894;REVB=0.0156296;RO=65;SAF=41;SAR=47;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805696;STB=0.546984;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00722173;OID=.;OPOS=40571246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:65:66:88:88:0.571429:47:41:37:28:47:41:38:28 chr21 40574305 . A G 264.86 PASS AF=0.43662;AO=29;DP=70;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00375954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.112;QD=14.9218;RBI=0.0161349;REFB=-0.0127187;REVB=0.0156908;RO=40;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200361;STB=0.60613;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.025233;OID=.;OPOS=40574305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:40:40:29:31:0.43662:11:18:17:23:12:19:17:23 chr21 40584598 . C T 237.24 PASS AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00934792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.478;QD=11.433;RBI=0.015808;REFB=-0.00589461;REVB=-0.0127479;RO=54;SAF=15;SAR=14;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127543;STB=0.573529;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0108296;OID=.;OPOS=40584598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:54:54:29:29:0.349398:14:15:34:20:14:15:34:20 chr21 40670460 . G C 563.79 PASS AF=0.53271;AO=57;DP=107;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.000939532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.744;QD=21.0761;RBI=0.0101613;REFB=-0.00479019;REVB=-0.0101178;RO=50;SAF=12;SAR=45;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226816;STB=0.625742;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00365832;OID=.;OPOS=40670460;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:50:50:57:57:0.53271:45:12:21:29:45:12:21:29 chr21 40686020 . C T 245.21 PASS AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0140323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.27;QD=15.5688;RBI=0.0153941;REFB=-0.0113934;REVB=0.00633019;RO=35;SAF=9;SAR=19;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00807278;STB=0.50456;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.01588;OID=.;OPOS=40686020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:19:9:11:24:19:9:11:24 chr21 40686078 . G C 220.4 PASS AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0169868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.149;QD=16.0287;RBI=0.0170828;REFB=-0.0157472;REVB=0.00180905;RO=30;SAF=5;SAR=20;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211907;STB=0.621252;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0142081;OID=.;OPOS=40686078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:20:5:11:19:20:5:11:19 chr21 40686327 . T C 195.09 PASS AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0357794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.198;QD=14.1883;RBI=0.0359253;REFB=-0.0258054;REVB=0.00323433;RO=32;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296895;STB=0.516948;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0321146;OID=.;OPOS=40686327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:13:10:13:19:13:10:13:19 chr21 40769290 . A G 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.375;QD=49.5992;RBI=0.0628101;REFB=0;REVB=0.0551253;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124016;OID=.;OPOS=40769290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0 chr21 40823981 . G A 1380.08 PASS AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00376074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.768;QD=61.337;RBI=0.0458454;REFB=-0.146175;REVB=0.0456909;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.505881;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000206631;OID=.;OPOS=40823981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:90:90:0:1:89:89:0.988889:47:42:0:0:47:42:1:0 chr21 40871810 . T C 1461.79 PASS AF=1;AO=77;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3437;QD=62.2038;RBI=0.0900766;REFB=0;REVB=0.076351;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000904163;OID=.;OPOS=40871810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:94:94:0:0:77:94:1:37:40:0:0:54:40:0:0 chr21 40883671 . G GAGA 652.31 PASS AF=0.909091;AO=48;DP=56;FAO=50;FDP=55;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.049467;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=243.767;QD=47.4405;RBI=0.0513291;REFB=-0.0592882;REVB=0.0137001;RO=7;SAF=24;SAR=24;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510464;STB=0.527262;STBP=0.212;TYPE=ins;VARB=0.00511958;OID=.;OPOS=40883672;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.909091:48:56:50:55:5:25:25:1:4:23:7:24:24:2:5 chr21 40969826 . G C 1317.66 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.916;QD=62.0074;RBI=0.0367917;REFB=0;REVB=0.0258895;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92161e-05;OID=.;OPOS=40969826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:47:36:0:0:47:38:0:0 chr21 41032740 . T C 192.83 PASS AF=0.423077;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.00244477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.203;QD=14.8333;RBI=0.0252819;REFB=-0.0279216;REVB=-0.0251634;RO=28;SAF=15;SAR=7;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438496;STB=0.759591;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0232012;OID=.;OPOS=41032740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:28:30:22:22:0.423077:7:15:6:22:7:15:6:24 chr21 41032804 . G A 331.78 PASS AF=0.492958;AO=33;DP=69;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00960905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8056;QD=18.6919;RBI=0.110665;REFB=-0.033563;REVB=0.110247;RO=35;SAF=19;SAR=14;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135517;STB=0.563717;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0183609;OID=.;OPOS=41032804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:35:36:33:35:0.492958:14:19:15:20:16:19:15:21 chr21 41137499 . A G 1066.17 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00240033;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.55;QD=58.42;RBI=0.00500131;REFB=0.0525745;REVB=0.00438765;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116777;STB=0.506171;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-6.39006e-05;OID=.;OPOS=41137499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:40:32:0:1:40:32:0:1 chr21 41137507 . G C 1078.38 PASS AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.019;QD=59.9098;RBI=0.0351042;REFB=0;REVB=0.0198987;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.50156e-05;OID=.;OPOS=41137507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:42:30:0:0:42:30:0:0 chr21 41165462 . C A 1063.03 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.814;QD=59.8892;RBI=0.0308512;REFB=0;REVB=0.0222397;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46005e-05;OID=.;OPOS=41165462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:32:37:0:0:33:38:0:0 chr21 41297992 . C T 544.77 PASS AF=0.536842;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.062556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9751;QD=22.9377;RBI=0.0804721;REFB=-0.000350461;REVB=0.0506213;RO=44;SAF=21;SAR=30;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754733;STB=0.541545;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00177357;OID=.;OPOS=41297992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:44:44:51:51:0.536842:30:21:22:22:30:21:22:22 chr21 41416066 . C T 446.8 PASS AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=51;FSRR=7;FWDB=0.000801363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.226;QD=16.7029;RBI=0.0396276;REFB=-0.00911916;REVB=-0.0396195;RO=58;SAF=30;SAR=19;SRF=51;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298532;STB=0.663593;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0121802;OID=.;OPOS=41416066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:58:58:49:49:0.457944:19:30:51:7:19:30:51:7 chr21 41434841 . T C 401.88 PASS AF=0.422018;AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0129556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2114;QD=14.7479;RBI=0.0136207;REFB=0.0108092;REVB=0.00420423;RO=63;SAF=20;SAR=26;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755614;STB=0.542518;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.0095744;OID=.;OPOS=41434841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:63:63:46:46:0.422018:26:20:32:31:26:20:32:31 chr21 41447058 . G C 407.7 PASS AF=0.433962;AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.0435392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4378;QD=15.3848;RBI=0.0436862;REFB=-0.00282958;REVB=-0.00358114;RO=59;SAF=17;SAR=29;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216399;STB=0.518301;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00199357;OID=.;OPOS=41447058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:59:60:46:46:0.433962:29:17:23:36:29:17:24:36 chr21 41455854 . G A 680.23 PASS AF=0.475524;AO=68;DP=142;FAO=68;FDP=143;FR=.;FRO=75;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.00218191;FXX=0.027209;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.3;QD=19.0275;RBI=0.00331807;REFB=-0.0123172;REVB=0.00249977;RO=74;SAF=42;SAR=26;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151283;STB=0.587448;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0115048;OID=.;OPOS=41455854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:74:75:68:68:0.475524:26:42:34:40:26:42:34:41 chr21 41725630 . G C 221.88 PASS AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0101605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.5;QD=18.4899;RBI=0.0101819;REFB=-0.0195725;REVB=-0.000660883;RO=26;SAF=9;SAR=13;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511632;STB=0.529043;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0248139;OID=.;OPOS=41725630;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:13:9:12:14:13:9:12:14 chr21 42556885 . A G 264.81 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0447911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.616;QD=20.7691;RBI=0.0574821;REFB=0.00965895;REVB=0.036027;RO=24;SAF=15;SAR=12;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13319;STB=0.573938;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00565764;OID=.;OPOS=42556885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:12:15:17:7:12:15:17:7 chr21 42622786 . C T 416.6 PASS AF=0.482759;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0259496;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.487;QD=19.154;RBI=0.0326688;REFB=-0.0114981;REVB=-0.0198461;RO=44;SAF=18;SAR=24;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453826;STB=0.51999;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0101092;OID=.;OPOS=42622786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:44:45:42:42:0.482759:24:18:21:23:24:18:21:24 chr21 42717662 . T C 920.03 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.423;QD=58.4143;RBI=0.055032;REFB=0;REVB=0.0322401;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185452;OID=.;OPOS=42717662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:36:27:0:0:36:27:0:0 chr21 42775555 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9301;QD=48.7373;RBI=0.0837274;REFB=0;REVB=-0.0610951;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00429033;OID=.;OPOS=42775555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chr21 42824661 . A G 354.45 PASS AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0403099;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4159;QD=24.0307;RBI=0.0451437;REFB=-0.0112423;REVB=0.020324;RO=24;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413829;STB=0.522736;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0128301;OID=.;OPOS=42824661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:17:18:11:13:17:18:11:13 chr21 42845374 . G A 685.42 PASS AF=0.476821;AO=72;DP=152;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=0.0173832;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1007;QD=18.1569;RBI=0.0305858;REFB=-0.0554418;REVB=0.0251657;RO=75;SAF=29;SAR=43;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122013;STB=0.568192;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0437401;OID=.;OPOS=42845374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:75:79:72:72:0.476821:43:29:40:35:43:29:42:37 chr21 42848560 . CAG C 68.09 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0141394;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=267.249;QD=14.3343;RBI=0.0177849;REFB=-0.0112288;REVB=-0.0107879;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394404;STB=0.740083;STBP=0.105;TYPE=del;VARB=0.0166197;OID=.;OPOS=42848561;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.473684:9:19:9:19:10:1:8:4:6:67:10:1:8:4:6 chr21 42852497 . C T 340.49 PASS AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0109184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.832;QD=18.1592;RBI=0.0347714;REFB=-0.00208401;REVB=-0.0330128;RO=39;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400696;STB=0.522376;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00239393;OID=.;OPOS=42852497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:20:16:19:20:20:16:19:20 chr21 43161022 . C T 147.01 PASS AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.012838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.774;QD=17.2955;RBI=0.0409982;REFB=-0.0471378;REVB=0.0389363;RO=18;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154267;STB=0.587682;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0354047;OID=.;OPOS=43161022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:7:9:13:5:7:9:13:5 chr21 43161357 . T C 71.08 PASS AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0442774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1441;QD=7.48167;RBI=0.0545214;REFB=-0.00123975;REVB=-0.0318134;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282447;STB=0.677058;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00315517;OID=.;OPOS=43161357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:3:7:13:15:3:7:13:15 chr21 43161805 . G A 397.1 PASS AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.016056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.322;QD=23.359;RBI=0.0427176;REFB=-0.01989;REVB=0.0395853;RO=29;SAF=20;SAR=19;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156785;STB=0.585983;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0102809;OID=.;OPOS=43161805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:19:20:9:20:19:20:9:20 chr21 43161877 . C T 437.41 PASS AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0576779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.011;QD=24.3004;RBI=0.0580144;REFB=-0.0190407;REVB=0.00623936;RO=30;SAF=17;SAR=25;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073845;STB=0.540521;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0119262;OID=.;OPOS=43161877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:30:30:42:42:0.583333:25:17:15:15:25:17:15:15 chr21 43162150 . G A 697.73 PASS AF=0.613208;AO=64;DP=106;FAO=65;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.00120558;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.16;QD=26.3295;RBI=0.0322345;REFB=0.00102407;REVB=0.0322119;RO=27;SAF=23;SAR=41;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113153;STB=0.505062;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.000323469;OID=.;OPOS=43162150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:27:41:64:65:0.613208:41:23:15:12:42:23:15:26 chr21 43164232 . C A 38.15 PASS AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.011042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.007;QD=10.1734;RBI=0.0173215;REFB=-0.0527387;REVB=0.0133457;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.077322;OID=.;OPOS=43164232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:3:6:4:2:3:6 chr21 43218520 . G A 341.84 PASS AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0125653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.561;QD=18.478;RBI=0.0125969;REFB=-0.00440162;REVB=0.00089279;RO=38;SAF=14;SAR=22;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104647;STB=0.558429;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00444315;OID=.;OPOS=43218520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:22:14:19:19:22:14:19:19 chr21 43218807 . C T 262.01 PASS AF=0.491525;AO=28;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0493152;FXX=0.063482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0627;QD=17.7634;RBI=0.0557769;REFB=-0.010195;REVB=0.026059;RO=28;SAF=20;SAR=8;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177703;STB=0.603699;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0117942;OID=.;OPOS=43218807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:30:28:29:0.491525:8:20:15:13:9:20:15:15 chr21 43219728 . A T 260.29 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.0424874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.899;QD=14.4608;RBI=0.0428235;REFB=0.00633085;REVB=0.00535503;RO=42;SAF=20;SAR=10;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358332;STB=0.702572;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0138407;OID=.;OPOS=43219728;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:10:20:13:29:10:20:13:29 chr21 43220380 . C A 631.8 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.562;QD=61.6387;RBI=0.0206164;REFB=0;REVB=0.0179257;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32926e-06;OID=.;OPOS=43220380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0 chr21 43221483 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.577;QD=52.6132;RBI=0.0290691;REFB=0;REVB=0.0226167;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125417;OID=.;OPOS=43221483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chr21 43221797 . G C 91.95 PASS AF=0.26087;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0302847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.7808;QD=7.99574;RBI=0.106129;REFB=-0.0178038;REVB=0.101716;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157706;STB=0.666389;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0526614;OID=.;OPOS=43221797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:46:28:34:12:12:0.26087:8:4:13:15:8:4:19:15 chr21 43221826 . T C 398.72 PASS AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114633;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.99;QD=56.9598;RBI=0.118275;REFB=0;REVB=-0.0291251;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000961261;OID=.;OPOS=43221826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0 chr21 43236176 . G A 180.45 PASS AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0140392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.267;QD=16.0403;RBI=0.0229613;REFB=-0.0193297;REVB=-0.0181692;RO=26;SAF=5;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260962;STB=0.650994;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0270379;OID=.;OPOS=43236176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:14:5:13:13:14:5:13:13 chr21 43239972 . A G 284.73 PASS AF=0.52;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0286087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.114;QD=22.7782;RBI=0.0352389;REFB=-0.0256832;REVB=0.0205748;RO=22;SAF=17;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241507;STB=0.616628;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0174533;OID=.;OPOS=43239972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:22:24:26:26:0.52:9:17:8:14:9:17:10:14 chr21 43243585 . A C,G 2789.47 PASS AF=0.0601093,0.939891;AO=11,171;DP=183;FAO=11,172;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=10,83;FSAR=1,89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112144,0.0180403;FXX=0.0108102;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.472,74.9956;QD=60.9719;RBI=0.0164388,0.0190477;REFB=-0.0213159,-0.0575887;REVB=-0.0120196,-0.00611238;RO=0;SAF=10,82;SAR=1,89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.78894e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.160518,0.00199915;OID=.,.;OPOS=43243585,43243585;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:25:183:183:0:0:11,171:11,172:0.0601093,0.939891:1,89:10,82:0:0:1,89:10,83:0:0 chr21 43256252 . C T 1226.56 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.215;QD=61.328;RBI=0.0230256;REFB=0;REVB=0.0157108;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02035e-05;OID=.;OPOS=43256252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:42:37:0:0:43:37:0:0 chr21 43267260 . C T 1060.59 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.267;QD=59.7516;RBI=0.0352937;REFB=0;REVB=0.027479;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48351e-05;OID=.;OPOS=43267260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:35:35:0:0:36:35:0:0 chr21 43305619 . C T 266.79 PASS AF=0.441176;AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00239059;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.942;QD=15.6934;RBI=0.0140259;REFB=-0.0150399;REVB=-0.0138207;RO=36;SAF=16;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314642;STB=0.510841;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0187296;OID=.;OPOS=43305619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:36:38:29:30:0.441176:13:16:21:15:14:16:21:17 chr21 43306075 . G C 238.3 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00549782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.281;QD=16.1562;RBI=0.0178597;REFB=-0.0133946;REVB=0.0169924;RO=32;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373568;STB=0.521057;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0178667;OID=.;OPOS=43306075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:15:12:13:19:15:12:13:19 chr21 43306101 . A G 211.47 PASS AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0627393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.248;QD=16.586;RBI=0.0639653;REFB=0.0177879;REVB=0.0124633;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415392;STB=0.52354;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.0112986;OID=.;OPOS=43306101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:13:10:11:17:13:10:11:17 chr21 43314868 . G C 261.64 PASS AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0195309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7672;QD=14.7401;RBI=0.0259432;REFB=0.0100139;REVB=-0.0170761;RO=41;SAF=19;SAR=11;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553966;STB=0.531326;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-0.028233;OID=.;OPOS=43314868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:11:19:28:13:11:19:28:13 chr21 43315057 . C T 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.922;QD=39.2053;RBI=0.146988;REFB=0;REVB=0.0316043;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00370765;OID=.;OPOS=43315057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0 chr21 43327117 . C T 136.15 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0124199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.641;QD=10.4727;RBI=0.0154171;REFB=-0.0105828;REVB=-0.00913419;RO=35;SAF=7;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148793;STB=0.588131;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0174847;OID=.;OPOS=43327117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:10:7:19:16:10:7:19:16 chr21 43327793 . C T 281.96 PASS AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00124171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.694;QD=14.6475;RBI=0.00261854;REFB=-0.015311;REVB=0.00230541;RO=45;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631637;STB=0.535752;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0203698;OID=.;OPOS=43327793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:18:14:17:28:18:14:17:28 chr21 43327856 . A G 396.72 PASS AF=0.506329;AO=39;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00203564;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.973;QD=20.0871;RBI=0.0166319;REFB=0.00847166;REVB=-0.0165068;RO=39;SAF=16;SAR=23;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481859;STB=0.521266;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.00633497;OID=.;OPOS=43327856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:39:40:0.506329:23:16:14:25:24:16:14:25 chr21 43408317 . T TAAAGA 105.99 PASS AF=0.48;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00425616;FXX=0.107105;HRUN=3;LEN=5;MLLD=242.06;QD=16.9582;RBI=0.0045091;REFB=-0.00450172;REVB=-0.00148901;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513491;STBP=0.928;TYPE=ins;VARB=0.00507343;OID=.;OPOS=43408318;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=TAAAGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.48:12:29:12:25:13:3:9:3:10:99:16:3:9:4:12 chr21 43413731 . C T 437.92 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.000423674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.742;QD=21.6258;RBI=0.0094318;REFB=-0.00407693;REVB=0.00942228;RO=37;SAF=19;SAR=24;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149254;STB=0.502617;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00363306;OID=.;OPOS=43413731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:38:43:43:0.530864:24:19:17:20:24:19:17:21 chr21 43504228 . T C 950.48 PASS AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00203196;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.607;QD=58.4912;RBI=0.0121666;REFB=0;REVB=0.0119958;RO=0;SAF=19;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7992e-05;OID=.;OPOS=43504228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:45:19:0:0:46:19:0:0 chr21 43510427 . T C 754.62 PASS AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00140144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.925;QD=54.8811;RBI=0.0195832;REFB=0.0265561;REVB=0.019533;RO=1;SAF=34;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136612;STB=0.507244;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.000216762;OID=.;OPOS=43510427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:20:34:1:0:20:34:1:0 chr21 43510437 . A C 848.79 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8658;QD=57.545;RBI=0.0439272;REFB=0;REVB=0.0373874;RO=1;SAF=35;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132888;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000713011;OID=.;OPOS=43510437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:1:0:58:59:1:23:35:1:0:23:36:0:0 chr21 43513989 . C T 190.13 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00219659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9362;QD=21.7294;RBI=0.0567984;REFB=-0.00184516;REVB=0.056756;RO=16;SAF=3;SAR=16;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492465;STB=0.780159;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00380307;OID=.;OPOS=43513989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:16:3:11:5:16:3:11:5 chr21 43531008 . T C 1502.99 PASS AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386084;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.249;QD=63.9568;RBI=0.0557627;REFB=0;REVB=0.0402352;RO=0;SAF=55;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211974;OID=.;OPOS=43531008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:39:55:0:0:39:55:0:0 chr21 43531553 . A C 295.63 PASS AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00365485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.714;QD=17.9169;RBI=0.0211159;REFB=-0.0209776;REVB=-0.0207972;RO=34;SAF=7;SAR=25;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302909;STB=0.671024;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.040655;OID=.;OPOS=43531553;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:25:7:17:17:25:7:17:17 chr21 43531632 . T C 1471.63 PASS AF=0.989474;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.018239;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.039;QD=61.9632;RBI=0.0290835;REFB=-0.110032;REVB=-0.0226537;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000453492;OID=.;OPOS=43531632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:93:95:0:1:92:94:0.989474:42:50:0:0:42:52:0:1 chr21 43531808 . A C 82.39 PASS AF=0.588235;AO=9;DP=16;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0112215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.632;QD=19.3866;RBI=0.011379;REFB=-0.0342841;REVB=0.00188662;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201011;STB=0.588064;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0113525;OID=.;OPOS=43531808;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:17:7:7:9:10:0.588235:4:5:2:5:5:5:2:5 chr21 43547165 . G A 309.6 PASS AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00212253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.588;QD=18.7638;RBI=0.0150535;REFB=-0.00431181;REVB=-0.0149031;RO=32;SAF=23;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158823;STB=0.567859;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0075025;OID=.;OPOS=43547165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:32:33:32:33:0.5:9:23:18:14:10:23:19:14 chr21 43547788 . T C 882.47 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.615;QD=57.8667;RBI=0.0375283;REFB=0;REVB=0.0333863;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06978e-05;OID=.;OPOS=43547788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:21:39:0:0:22:39:0:0 chr21 43547873 . G A 491.05 PASS AF=0.484848;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0332115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.713;QD=19.8403;RBI=0.034523;REFB=-0.00357603;REVB=-0.00942506;RO=49;SAF=31;SAR=17;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110413;STB=0.56311;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00441888;OID=.;OPOS=43547873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:49:51:48:48:0.484848:17:31:26:23:17:31:27:24 chr21 43786512 . C T 135.87 PASS AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00807851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.714;QD=9.70485;RBI=0.0246422;REFB=-0.0226344;REVB=-0.0232803;RO=38;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382809;STB=0.522702;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0667824;OID=.;OPOS=43786512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:7:11:22:16:7:11:22:16 chr21 43786606 . G A 214.42 PASS AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00274387;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2991;QD=17.1534;RBI=0.0234939;REFB=-0.0192767;REVB=-0.0233332;RO=27;SAF=7;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146629;STB=0.583418;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.015224;OID=.;OPOS=43786606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:27:27:23:23:0.46:16:7:12:15:16:7:12:15 chr21 43792869 . C T 1450.43 PASS AF=0.979381;AO=89;DP=92;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0208368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.244;QD=59.8114;RBI=0.0387005;REFB=-0.0564551;REVB=0.0326122;RO=3;SAF=38;SAR=51;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00591389;STB=0.509257;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.000994644;OID=.;OPOS=43792869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:92:97:3:2:89:95:0.979381:51:38:1:2:53:42:0:2 chr21 43805637 . C T 1190.4 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4599;QD=61.0462;RBI=0.0204034;REFB=0;REVB=-0.0128903;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76e-05;OID=.;OPOS=43805637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0 chr21 43824106 . A G 519.67 PASS AF=0.313364;AO=66;DP=221;FAO=68;FDP=217;FR=.;FRO=149;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=72;FSRR=77;FWDB=0.00839765;FXX=0.0269046;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.596;QD=9.57913;RBI=0.00973457;REFB=-0.0169422;REVB=-0.00492356;RO=154;SAF=25;SAR=41;SRF=73;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117419;STB=0.560231;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0434982;OID=.;OPOS=43824106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:217:154:149:66:68:0.313364:41:25:73:81:41:27:72:77 chr21 43824123 . G C 450.89 PASS AF=0.30102;AO=58;DP=195;FAO=59;FDP=196;FR=.;FRO=137;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=77;FWDB=-0.00977388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.103;QD=9.20182;RBI=0.0204337;REFB=-0.0144406;REVB=-0.0179446;RO=134;SAF=19;SAR=39;SRF=58;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134794;STB=0.587003;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0319049;OID=.;OPOS=43824123;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:134:137:58:59:0.30102:39:19:58:76:40:19:60:77 chr21 43824136 . C T 457.67 PASS AF=0.312169;AO=59;DP=189;FAO=59;FDP=189;FR=.;FRO=130;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=58;FSRR=72;FWDB=0.0193415;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.7201;QD=9.68611;RBI=0.0549978;REFB=-0.00174189;REVB=0.0514846;RO=129;SAF=20;SAR=39;SRF=57;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128901;STB=0.57808;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00354415;OID=.;OPOS=43824136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:129:130:59:59:0.312169:39:20:57:72:39:20:58:72 chr21 43855067 . A C 435.67 PASS AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0060861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.87;QD=18.5392;RBI=0.010913;REFB=-0.0126561;REVB=-0.00905828;RO=50;SAF=22;SAR=22;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763493;STB=0.542534;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0146513;OID=.;OPOS=43855067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:22:22:21:29:22:22:21:29 chr21 43863521 . A G 342.2 PASS AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0401477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4806;QD=21.3873;RBI=0.0429575;REFB=-0.0436031;REVB=0.0152809;RO=28;SAF=22;SAR=13;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272894;STB=0.642966;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.042514;OID=.;OPOS=43863521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:29:35:35:0.546875:13:22:8:20:13:22:9:20 chr21 43905887 . C T 506.77 PASS AF=0.411765;AO=56;DP=136;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=0.0102374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.622;QD=14.905;RBI=0.0107627;REFB=-0.0163759;REVB=0.00332109;RO=80;SAF=39;SAR=17;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267651;STB=0.651012;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0302749;OID=.;OPOS=43905887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:80:80:56:56:0.411765:17:39:36:44:17:39:36:44 chr21 43985955 . G A 218.99 PASS AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0484609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.91;QD=23.675;RBI=0.048919;REFB=-0.015189;REVB=0.00667897;RO=16;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300656;STB=0.51678;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00935654;OID=.;OPOS=43985955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:10:11:9:7:10:11:9:7 chr21 44180443 . C T 516.99 PASS AF=0.526882;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0230879;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.329;QD=22.2361;RBI=0.0372661;REFB=-0.0210611;REVB=0.0292525;RO=44;SAF=26;SAR=23;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127952;STB=0.507052;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0152159;OID=.;OPOS=44180443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:44:44:49:49:0.526882:23:26:24:20:23:26:24:20 chr21 44371114 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.895;QD=37.4885;RBI=0.0372824;REFB=0;REVB=-0.0166982;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000603181;OID=.;OPOS=44371114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chr21 44430325 . T C 177.49 PASS AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.00393884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.678;QD=21.5139;RBI=0.0115434;REFB=-0.0166287;REVB=0.0108507;RO=15;SAF=4;SAR=14;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02641;STB=0.514835;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00987136;OID=.;OPOS=44430325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:14:4:3:12:14:4:3:12 chr21 44437142 . A G 141.3 PASS AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.08805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0141;QD=13.4575;RBI=0.0907086;REFB=0.0013204;REVB=0.0218003;RO=25;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140771;STB=0.516109;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.000230909;OID=.;OPOS=44437142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:12:4:6:19:12:4:6:20 chr21 44450392 . TGTGTGTGTGT CGCGTGTGTGC 53.49 PASS AF=0.5;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0736758;FXX=0.3998;HRUN=1;LEN=11;MLLD=181.277;QD=17.8283;RBI=0.0746594;REFB=-0.0290687;REVB=-0.0120792;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.713468;STBP=0.206;TYPE=mnp;VARB=0.03027;OID=.;OPOS=44450392;OREF=TGTGTGTGTGT;OALT=CGCGTGTGTGC;OMAPALT=CGCGTGTGTGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:19:12:3:6:6:6:0.5:1:5:3:0:1:5:3:3 chr21 44450404 . C T 37.16 PASS AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0136904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2363;QD=8.25681;RBI=0.0969963;REFB=-0.0307416;REVB=-0.0960253;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.583773;STB=0.860959;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0132613;OID=.;OPOS=44450404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:3:9:1:5:3:9 chr21 44480616 . G A 276.05 PASS AF=0.530612;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0601923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0094;QD=22.5347;RBI=0.0601969;REFB=-0.0418706;REVB=-0.00074435;RO=19;SAF=7;SAR=18;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694597;STB=0.521722;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.034861;OID=.;OPOS=44480616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:49:19:23:25:26:0.530612:18:7:4:15:18:8:8:15 chr21 44589215 . C T 468.89 PASS AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00931681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.25;QD=20.3867;RBI=0.0116526;REFB=-0.018914;REVB=0.00699852;RO=46;SAF=26;SAR=20;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117665;STB=0.565189;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0261714;OID=.;OPOS=44589215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:20:26:20:26:20:26:20:26 chr21 44748660 . G A 268.59 PASS AF=0.351648;AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.010261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1475;QD=11.8063;RBI=0.0373164;REFB=-0.0107712;REVB=-0.0358779;RO=59;SAF=19;SAR=13;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396952;STB=0.522921;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0153711;OID=.;OPOS=44748660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:59:59:32:32:0.351648:13:19:33:26:13:19:33:26 chr21 44749141 . G A 74.69 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1836;QD=37.3433;RBI=0.100262;REFB=0;REVB=-0.0914531;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00216888;OID=.;OPOS=44749141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0 chr21 44835508 . A G 255.9 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9316;QD=51.1807;RBI=0.0368402;REFB=0;REVB=0.00304258;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000814137;OID=.;OPOS=44835508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0 chr21 44837551 . G A 563.3 PASS AF=0.906977;AO=39;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0309727;FXX=0.0227221;HRUN=5;LEN=1;MLLD=166.504;QD=52.3997;RBI=0.0849524;REFB=-0.152459;REVB=0.079105;RO=2;SAF=30;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339175;STB=0.533963;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00205019;OID=.;OPOS=44837551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:43:43:2:4:39:39:0.906977:9:30:1:1:9:30:2:2 chr21 44837555 . G A 739.86 PASS AF=0.964286;AO=52;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=41;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0312388;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.964;QD=52.8473;RBI=0.070495;REFB=-0.0997779;REVB=0.0631956;RO=1;SAF=41;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113527;STB=0.5119;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000689116;OID=.;OPOS=44837555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:1:2:52:54:0.964286:11:41:1:0:13:41:2:0 chr21 45092257 . T A 620.86 PASS AF=0.97619;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0405915;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.333;QD=59.1297;RBI=0.0671523;REFB=-0.13379;REVB=0.0534954;RO=1;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267986;STB=0.514279;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00181478;OID=.;OPOS=45092257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:43:42:1:1:41:41:0.97619:17:24:0:1:17:24:0:1 chr21 45096206 . G A 742.64 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00991903;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.983;QD=57.1263;RBI=0.0751425;REFB=0;REVB=0.0744849;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126298;OID=.;OPOS=45096206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:53:52:1:20:33:0:0:19:33:0:0 chr21 45107518 . A G 1032.71 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.969;QD=59.0123;RBI=0.00581072;REFB=0;REVB=0.00347141;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.96613e-06;OID=.;OPOS=45107518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:38:31:0:0:39:31:0:0 chr21 45107562 . T C 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.175;QD=57.2376;RBI=0.0322547;REFB=0;REVB=0.0300229;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24648e-05;OID=.;OPOS=45107562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0 chr21 45152500 . G A 557.13 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.254;QD=60.2301;RBI=0.0409544;REFB=0;REVB=0.00677967;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203161;OID=.;OPOS=45152500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:20:16:0:0:21:16:0:0 chr21 45168884 . G A 106.33 PASS AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0277563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.941;QD=11.8143;RBI=0.0287951;REFB=-0.0146812;REVB=0.0076646;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174558;STB=0.602471;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0298831;OID=.;OPOS=45168884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:7:16:7:6:7:16 chr21 45181189 . C G 415.74 PASS AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.00977899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.446;QD=16.7975;RBI=0.0137187;REFB=-0.00540395;REVB=0.00962152;RO=56;SAF=12;SAR=31;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308275;STB=0.673829;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00620666;OID=.;OPOS=45181189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:56:43:43:0.434343:31:12:32:24:31:12:32:24 chr21 45209559 . C T 326.91 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00952426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5664;QD=15.2053;RBI=0.00958617;REFB=-0.0207253;REVB=0.00108772;RO=46;SAF=16;SAR=20;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012164;STB=0.532449;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0331005;OID=.;OPOS=45209559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:50:36:36:0.418605:20:16:21:25:20:16:25:25 chr21 45212626 . T C 370.64 PASS AF=0.453488;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0188924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3452;QD=17.2392;RBI=0.0375978;REFB=-0.00634739;REVB=0.0325064;RO=47;SAF=14;SAR=25;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688485;STB=0.538636;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0106585;OID=.;OPOS=45212626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:47:47:39:39:0.453488:25:14:20:27:25:14:20:27 chr21 45215051 . A G 198.97 PASS AF=0.357143;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0130574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.629;QD=11.3697;RBI=0.0232073;REFB=-0.0203124;REVB=-0.0191855;RO=44;SAF=13;SAR=12;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10409;STB=0.551683;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0286136;OID=.;OPOS=45215051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:44:45:25:25:0.357143:12:13:27:17:12:13:27:18 chr21 45217559 . T C 196.5 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0122505;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.72;QD=17.467;RBI=0.0161122;REFB=-0.0128424;REVB=0.0104656;RO=24;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00804904;STB=0.505612;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0129618;OID=.;OPOS=45217559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:24:25:20:20:0.444444:9:11:13:11:9:11:14:11 chr21 45217929 . T C 311.55 PASS AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0091764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.436;QD=19.1722;RBI=0.0180126;REFB=-0.0264318;REVB=0.0155;RO=31;SAF=13;SAR=20;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163571;STB=0.583753;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0220735;OID=.;OPOS=45217929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:32:33:33:0.507692:20:13:18:13:20:13:18:14 chr21 45219524 . T C 92.22 PASS AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0153805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1787;QD=18.4436;RBI=0.0380124;REFB=0.00306638;REVB=0.0347618;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104359;STB=0.588621;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00143791;OID=.;OPOS=45219524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:20:20:8:9:11:11:0.55:4:7:4:4:4:7:4:5 chr21 45220787 . A G 980.31 PASS AF=1;AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.313;QD=58.526;RBI=0.022519;REFB=0;REVB=0.0221914;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157564;OID=.;OPOS=45220787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:65:67:1:33:32:0:0:34:33:0:0 chr21 45402820 . G A 451.6 PASS AF=0.466667;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.00529573;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.601;QD=17.2039;RBI=0.0355569;REFB=-0.0194791;REVB=0.0351604;RO=56;SAF=29;SAR=20;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254808;STB=0.641439;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0162912;OID=.;OPOS=45402820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:56:56:49:49:0.466667:20:29:18:38:20:29:18:38 chr21 45482950 . C T 419.93 PASS AF=0.417391;AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=22;FWDB=-0.037192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4742;QD=14.6062;RBI=0.0381109;REFB=-0.000482097;REVB=-0.00831826;RO=67;SAF=19;SAR=29;SRF=45;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279995;STB=0.656928;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000339959;OID=.;OPOS=45482950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:67:67:48:48:0.417391:29:19:45:22:29:19:45:22 chr21 45503121 . G A 106.24 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139672;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3527;QD=42.4966;RBI=0.0207918;REFB=0;REVB=-0.0154018;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161458;OID=.;OPOS=45503121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0 chr21 45506819 . T C 1530.04 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.013;QD=63.7519;RBI=0.0286102;REFB=0;REVB=0.00126141;RO=0;SAF=54;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68933e-05;OID=.;OPOS=45506819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:42:54:0:0:42:54:0:0 chr21 45522693 . G A 270.69 PASS AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0328574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9619;QD=16.9184;RBI=0.0486802;REFB=-0.00223664;REVB=0.0359188;RO=34;SAF=17;SAR=13;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11865;STB=0.566622;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00214539;OID=.;OPOS=45522693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:13:17:15:19:13:17:15:19 chr21 45523416 . C T 183.0 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00248715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.239;QD=17.4286;RBI=0.00383047;REFB=-0.00970644;REVB=-0.00291317;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109198;STB=0.562433;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0157801;OID=.;OPOS=45523416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:7:12:12:11:7:12:12:11 chr21 45544594 . T C 301.11 PASS AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00860078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.35;QD=14.1699;RBI=0.0113816;REFB=-0.015687;REVB=0.00745433;RO=51;SAF=27;SAR=7;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288869;STB=0.666275;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0233459;OID=.;OPOS=45544594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:7:27:29:22:7:27:29:22 chr21 45547913 . C A 425.02 PASS AF=0.395161;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=52;FWDB=0.0237871;FXX=0.00799936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.041;QD=13.7103;RBI=0.0239642;REFB=-0.00386561;REVB=-0.00290826;RO=70;SAF=28;SAR=21;SRF=21;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278098;STB=0.65612;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00847585;OID=.;OPOS=45547913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:70:75:49:49:0.395161:21:28:21:49:21:28:23:52 chr21 45561194 . TCGG GTCG,TC,TCG 469.09 PASS AF=0,0.673469,0.22449;AO=4,27,5;DP=49;FAO=0,33,11;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=0,33,4;FSAR=0,0,7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0638627,-0.00182158,-0.00355017;FXX=0.019996;HRUN=1,3,3;LEN=3,2,1;MLLD=49.9995,22.458,12.1836;QD=38.2934;RBI=0.0804356,0.0213975,0.0391718;REFB=-0.0831493,-0.124676,-0.209829;REVB=0.0489023,0.0213198,0.0390106;RO=5;SAF=0,27,4;SAR=4,0,1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0.392405,0.392405;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.672226,0.873385,0.487487;STB=0.5,0.999455,0.556863;STBP=1,0,0.556;TYPE=mnp,del,del;VARB=0,0.0226161,0.134099;OID=.,.,.;OPOS=45561194,45561196,45561196;OREF=TCG,GG,G;OALT=GTC,-,-;OMAPALT=GTCG,TC,TCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:50:49:49:5:5:4,27,5:0,33,11:0,0.673469,0.22449:4,0,1:0,27,4:1:4:0,0,7:0,33,4:1:4 chr21 45561200 . TCC TC,T 66.76 PASS AF=0.235294,0.117647;AO=11,6;DP=51;FAO=12,6;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=9,0;FSAR=3,6;FSRF=29;FSRR=4;FWDB=-0.0225471,-0.0115727;FXX=0.0192271;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=14.893,28.9687;QD=5.23585;RBI=0.0435544,0.0231008;REFB=-0.0475143,-0.0244619;REVB=-0.0372641,-0.019993;RO=29;SAF=8,0;SAR=3,6;SRF=25;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.232268,-0.815432;STB=0.643875,0.999145;STBP=0.462,0;TYPE=del,del;VARB=0.0515595,0.0297842;OID=.,.;OPOS=45561201,45561201;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=TC,T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.235294,0.117647:11,6:51:12,6:51:33:9,0:3,6:29:4:35:29:8,0:3,6:25:4 chr21 45564766 . C G 583.43 PASS AF=0.462121;AO=61;DP=132;FAO=61;FDP=132;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=-0.00500089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.476;QD=17.6797;RBI=0.0088626;REFB=-0.0107821;REVB=0.00731688;RO=71;SAF=31;SAR=30;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122097;STB=0.567707;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0145577;OID=.;OPOS=45564766;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:71:71:61:61:0.462121:30:31:45:26:30:31:45:26 chr21 45565473 . C T 97.31 PASS AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0103369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.714;QD=12.9748;RBI=0.0138634;REFB=-0.0099356;REVB=-0.00923801;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215384;STB=0.624812;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0117738;OID=.;OPOS=45565473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:7:5:4:14:7:5:4:14 chr21 45649494 . A G 340.19 PASS AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0933945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9063;QD=48.599;RBI=0.0937462;REFB=-0.0818653;REVB=-0.00811269;RO=2;SAF=10;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01607;STB=0.508664;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00330671;OID=.;OPOS=45649494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:16:10:1:1:16:10:1:1 chr21 45649499 . G A 256.92 PASS AF=0.916667;AO=21;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0316779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.395;QD=42.8191;RBI=0.0373986;REFB=0.00545299;REVB=0.0198788;RO=2;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411632;STB=0.517226;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-9.32895e-05;OID=.;OPOS=45649499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:24:24:2:2:21:22:0.916667:15:6:1:1:15:7:1:1 chr21 45649778 . A G 1053.43 PASS AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.151;QD=59.3483;RBI=0.047887;REFB=0;REVB=0.0109232;RO=0;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192438;OID=.;OPOS=45649778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:24:46:0:0:24:47:0:0 chr21 45649848 . T C 947.63 PASS AF=0.970588;AO=65;DP=69;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.000833319;FXX=0.0144907;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.337;QD=55.7427;RBI=0.00807662;REFB=-0.121522;REVB=-0.00803351;RO=1;SAF=53;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00883198;STB=0.509257;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-4.10825e-05;OID=.;OPOS=45649848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:68:1:2:65:66:0.970588:12:53:1:0:13:53:2:0 chr21 45708277 . C T 167.39 PASS AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.009959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.249;QD=23.0888;RBI=0.010849;REFB=-0.0363378;REVB=0.00430329;RO=12;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127109;STB=0.571344;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0284135;OID=.;OPOS=45708277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:10:7:7:5:10:7:7:5 chr21 45710700 . T C 173.01 PASS AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0194242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8104;QD=11.3452;RBI=0.032152;REFB=-0.0338027;REVB=-0.0256213;RO=38;SAF=11;SAR=11;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862944;STB=0.557326;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.047524;OID=.;OPOS=45710700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:38:39:22:22:0.360656:11:11:22:16:11:11:23:16 chr21 45712977 . T C 274.56 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0129418;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.625;QD=17.4323;RBI=0.0133428;REFB=-0.0176899;REVB=-0.00324649;RO=34;SAF=19;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102326;STB=0.564313;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0204642;OID=.;OPOS=45712977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:63:34:33:30:30:0.47619:11:19:18:16:11:19:17:16 chr21 45717550 . T C 395.33 PASS AF=0.370079;AO=48;DP=127;FAO=47;FDP=127;FR=.;FRO=80;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=-0.017372;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.105;QD=12.4514;RBI=0.0253898;REFB=-0.0239192;REVB=0.0185163;RO=78;SAF=33;SAR=15;SRF=48;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087705;STB=0.563967;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0385382;OID=.;OPOS=45717550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:78:80:48:47:0.370079:15:33:48:30:14:33:49:31 chr21 45725715 . A G 220.61 PASS AF=0.454545;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0123558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.673;QD=16.0446;RBI=0.0232379;REFB=-0.00606026;REVB=-0.0196808;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652725;STB=0.525527;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00611259;OID=.;OPOS=45725715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:30:30:24:25:0.454545:12:12:17:13:12:13:17:13 chr21 45732116 . C T 232.78 PASS AF=0.464286;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.00102882;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.208;QD=16.6274;RBI=0.00452566;REFB=-0.00474646;REVB=0.00440716;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39007;STB=0.727118;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0158231;OID=.;OPOS=45732116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:31:30:26:26:0.464286:10:16:6:25:10:16:5:25 chr21 45750346 . C A 1278.16 PASS AF=0.977011;AO=83;DP=86;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00609302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8854;QD=58.766;RBI=0.0489901;REFB=-0.21892;REVB=0.0486097;RO=2;SAF=53;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305258;STB=0.515148;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0114736;OID=.;OPOS=45750346;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:86:87:2:2:83:85:0.977011:30:53:0:2:32:53:0:2 chr21 45811343 . T G 38.61 PASS AF=0.428571;AO=4;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00859516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.35;QD=11.0314;RBI=0.00957232;REFB=-0.0369933;REVB=-0.00421338;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127513;STB=0.526227;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0466138;OID=.;OPOS=45811343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:4:6:0.428571:2:2:5:3:2:4:5:3 chr21 45811355 . G C 48.13 PASS AF=0.461538;AO=3;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.13845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.0235;QD=14.8086;RBI=0.141836;REFB=-0.0320413;REVB=-0.0308083;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149914;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.109245;OID=.;OPOS=45811355;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:13:13:4:6:3:6:0.461538:2:1:2:2:2:4:4:2 chr21 45838421 . C T 122.45 PASS AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.054518;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9827;QD=14.843;RBI=0.0546943;REFB=-0.00548584;REVB=0.00438835;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357417;STB=0.555473;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00895153;OID=.;OPOS=45838421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:19:19:14:14:0.424242:4:10:13:6:4:10:12:7 chr21 45844751 . A G 2335.89 PASS AF=0.993548;AO=154;DP=156;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0481744;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.134;QD=60.2811;RBI=0.0481798;REFB=-0.0879631;REVB=-0.000723085;RO=1;SAF=80;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638536;STB=0.503355;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000137127;OID=.;OPOS=45844751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:156:155:1:1:154:154:0.993548:74:80:0:1:74:80:0:1 chr21 45878637 . A G 394.92 PASS AF=1;AO=23;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.771;QD=56.4174;RBI=0.0644462;REFB=0;REVB=0.0462653;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000738804;OID=.;OPOS=45878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:23:28:1:17:6:0:0:22:6:0:0 chr21 45978090 . C T 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.138339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9926;QD=23.2182;RBI=0.156693;REFB=-0.0183585;REVB=0.0735871;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.00155666;OID=.;OPOS=45978090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1 chr21 45993746 . C T 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8262;QD=26.0262;RBI=0.0618152;REFB=-0.0249858;REVB=0.0618152;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120126;OID=.;OPOS=45993746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:6:0:0:1:6:0:0:1 chr21 45999908 . A C 147.57 PASS AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.01252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.012;QD=36.8927;RBI=0.0218335;REFB=-0.053684;REVB=0.0178872;RO=2;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576353;STB=0.531868;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00816199;OID=.;OPOS=45999908;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:10:4:1:1:10:4:1:1 chr21 46012240 . A G 50.92 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00492095;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.4291;QD=14.5477;RBI=0.12411;REFB=-0.0387434;REVB=-0.124012;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0238935;OID=.;OPOS=46012240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:14:14:7:7:7:7:0.5:1:6:6:1:1:6:6:1 chr21 46012285 . A G 107.78 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0288354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.809;QD=13.064;RBI=0.0338009;REFB=0.00675424;REVB=-0.0176358;RO=20;SAF=9;SAR=4;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213335;STB=0.622592;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=-0.013219;OID=.;OPOS=46012285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:4:9:17:3:4:9:17:3 chr21 46020527 . C T 184.81 PASS AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00604566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.327;QD=18.4805;RBI=0.0103174;REFB=-0.0347465;REVB=0.00836059;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119816;STB=0.547777;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0494149;OID=.;OPOS=46020527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:20:21:19:19:0.475:7:12:15:5:7:12:15:6 chr21 46021370 . T C 42.23 PASS AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0680217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.846;QD=18.7689;RBI=0.0733842;REFB=0.042361;REVB=0.0275372;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215133;STB=0.66617;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.0116814;OID=.;OPOS=46021370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:2:3:6:6:0.666667:3:3:0:2:3:3:0:3 chr21 46021390 . G C 32.39 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00217635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9418;QD=16.1957;RBI=0.0499629;REFB=-0.0313272;REVB=-0.0499155;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361596;STB=0.713517;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0145844;OID=.;OPOS=46021390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:0:3:2:3:0:3 chr21 46021607 . A G 112.23 PASS AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00247982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.54;QD=16.6265;RBI=0.0386564;REFB=-0.0171855;REVB=-0.0385768;RO=14;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120083;STB=0.569509;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.022344;OID=.;OPOS=46021607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:4:9:8:6:4:9:8:6 chr21 46021722 . G A 407.94 PASS AF=0.56338;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00104108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.177;QD=22.9823;RBI=0.0269498;REFB=-0.0555204;REVB=0.0269297;RO=30;SAF=26;SAR=14;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122996;STB=0.561816;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0276006;OID=.;OPOS=46021722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:30:31:40:40:0.56338:14:26:15:15:14:26:16:15 chr21 46021759 . A G 274.91 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0409504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.966;QD=15.4876;RBI=0.0414222;REFB=-0.00967197;REVB=-0.00623409;RO=40;SAF=10;SAR=21;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325022;STB=0.683426;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0100141;OID=.;OPOS=46021759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:21:10:26:14:21:10:26:14 chr21 46021934 . C T 135.33 PASS AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0182657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.607;QD=8.32805;RBI=0.0182991;REFB=-0.00884088;REVB=-0.00110577;RO=46;SAF=18;SAR=1;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.66633;STB=0.91279;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0191525;OID=.;OPOS=46021934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:46:46:19:19:0.292308:1:18:23:23:1:18:23:23 chr21 46021946 . C G 154.25 PASS AF=0.308824;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0217179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.721;QD=9.07364;RBI=0.0267233;REFB=-0.00610567;REVB=-0.0155714;RO=46;SAF=19;SAR=2;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.589824;STB=0.854277;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00765264;OID=.;OPOS=46021946;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:46:47:21:21:0.308824:2:19:22:24:2:19:23:24 chr21 46021954 . CTG C 147.49 PASS AF=0.3125;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00118714;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=2;MLLD=258.198;QD=9.21825;RBI=0.0157157;REFB=-0.00908165;REVB=-0.0156708;RO=43;SAF=18;SAR=2;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55565;STB=0.843347;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0140711;OID=.;OPOS=46021955;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.3125:20:65:20:64:44:18:2:22:22:99:43:18:2:22:21 chr21 46032094 . A G 143.3 PASS AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0216248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.452;QD=14.6975;RBI=0.021626;REFB=-0.0303182;REVB=0.000229491;RO=23;SAF=12;SAR=4;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259816;STB=0.65197;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0399638;OID=.;OPOS=46032094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:4:12:12:11:4:12:12:11 chr21 46047633 . A G 375.67 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6036;QD=55.6554;RBI=0.0501548;REFB=0;REVB=-0.0207592;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378283;OID=.;OPOS=46047633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0 chr21 46047710 . T C 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.203;QD=55.0978;RBI=0.02255;REFB=0;REVB=0.0188443;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60817e-05;OID=.;OPOS=46047710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0 chr21 46047857 . C T 45.6 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0895838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.717;QD=26.0577;RBI=0.090028;REFB=-0.167141;REVB=0.00893308;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00722243;OID=.;OPOS=46047857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:1:0:3:3:1:0 chr21 46047925 . G T 138.58 PASS AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258255;FXX=0.142755;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.642;QD=46.1944;RBI=0.0708767;REFB=0;REVB=0.0660042;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00219509;OID=.;OPOS=46047925;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:13:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0 chr21 46047971 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.237027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9051;QD=33.4283;RBI=0.243961;REFB=0;REVB=-0.0577507;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0277944;OID=.;OPOS=46047971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr21 46048265 . C T 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539408;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.703;QD=45.8068;RBI=0.0511478;REFB=0;REVB=0.0508626;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239555;OID=.;OPOS=46048265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0 chr21 46057391 . A G 35.56 PASS AF=0.25;AO=5;DP=23;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0149901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.714;QD=5.92597;RBI=0.0209897;REFB=-0.015768;REVB=0.0146923;RO=18;SAF=3;SAR=2;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823023;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0619091;OID=.;OPOS=46057391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:24:18:18:5:6:0.25:2:3:12:6:2:4:12:6 chr21 46057393 . T A 35.74 PASS AF=0.25;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0226009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7907;QD=5.95741;RBI=0.0227323;REFB=-0.0224779;REVB=-0.00244081;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247213;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0383827;OID=.;OPOS=46057393;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:24:17:18:6:6:0.25:2:4:11:6:2:4:12:6 chr21 46057548 . A C 128.13 PASS AF=0.5;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0967337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.009;QD=23.2959;RBI=0.205962;REFB=-0.0246825;REVB=-0.181832;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123877;STB=0.559889;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.01204;OID=.;OPOS=46057548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:22:22:7:8:10:11:0.5:6:4:4:3:7:4:4:4 chr21 46057590 . A T 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0166391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.266;QD=15.8821;RBI=0.0339557;REFB=-0.0220612;REVB=-0.0295995;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108107;STB=0.562382;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0184152;OID=.;OPOS=46057590;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:7:3:2:8:7:3:2:8 chr21 46057806 . G A 78.88 PASS AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00898556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.234;QD=28.6825;RBI=0.0284565;REFB=-0.0357073;REVB=0.0270006;RO=2;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12691;STB=0.571279;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0171066;OID=.;OPOS=46057806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:6:3:0:2:6:3:0:2 chr21 46057958 . C T 80.21 PASS AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.102874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1193;QD=16.8859;RBI=0.111949;REFB=-0.0626805;REVB=0.0441531;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150146;STB=0.588044;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0648222;OID=.;OPOS=46057958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:8:2:3:6:8:2:3:6 chr21 46074202 . A G 58.62 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0276972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.728;QD=14.6539;RBI=0.0489349;REFB=0.00242375;REVB=0.0403422;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354424;STB=0.699646;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.00293305;OID=.;OPOS=46074202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:8:0:2:6:8:0 chr21 46077946 . A G 158.54 PASS AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00129786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7552;QD=17.1398;RBI=0.0278043;REFB=-0.0413518;REVB=0.027774;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935847;STB=0.563686;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0494911;OID=.;OPOS=46077946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:19:20:17:17:0.459459:7:10:13:6:7:10:14:6 chr21 46086377 . A G 70.58 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0309544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.159;QD=17.6438;RBI=0.0378607;REFB=-0.00923769;REVB=0.0218005;RO=7;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550555;STB=0.826738;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00550942;OID=.;OPOS=46086377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:8:1:5:2:8:1:5:2 chr21 46086718 . GA CG 120.2 PASS AF=0.684211;AO=12;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.045698;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=210.9;QD=25.3043;RBI=0.048966;REFB=9.46087e-05;REVB=-0.0175888;RO=6;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596347;STB=0.846387;STBP=0.002;TYPE=mnp;VARB=-0.000575775;OID=.;OPOS=46086718;OREF=GA;OALT=CG;OMAPALT=CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:12:13:0.684211:11:1:5:1:12:1:5:1 chr21 46086757 . GC AT 115.39 PASS AF=0.5;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0334166;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=2;MLLD=215.446;QD=17.7523;RBI=0.0411942;REFB=-0.0522202;REVB=0.0240892;RO=13;SAF=3;SAR=10;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361503;STB=0.709334;STBP=0.058;TYPE=mnp;VARB=0.0406491;OID=.;OPOS=46086757;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:26:13:13:13:13:0.5:10:3:8:5:10:3:8:5 chr21 46233836 . C A 234.72 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0219984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.793;QD=18.7774;RBI=0.0267533;REFB=-0.0213208;REVB=0.0152253;RO=27;SAF=16;SAR=7;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216686;STB=0.623265;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0291021;OID=.;OPOS=46233836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:7:16:13:14:7:16:13:14 chr21 46271452 . C T 266.6 PASS AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.0154869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.206;QD=13.4987;RBI=0.0221303;REFB=-0.00729541;REVB=-0.0158084;RO=48;SAF=6;SAR=25;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089526;STB=0.551435;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00897076;OID=.;OPOS=46271452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:25:6:12:36:25:6:12:36 chr21 46314907 . T A 1026.39 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.275;QD=59.5006;RBI=0.026883;REFB=0;REVB=0.0159834;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.99021e-05;OID=.;OPOS=46314907;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0 chr21 46320313 . C T 549.01 PASS AF=0.544554;AO=52;DP=97;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0709434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9998;QD=21.743;RBI=0.0900036;REFB=-0.00265826;REVB=0.0553866;RO=45;SAF=18;SAR=34;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291388;STB=0.532362;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00364404;OID=.;OPOS=46320313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:45:46:52:55:0.544554:34:18:17:28:37:18:18:28 chr21 46328026 . G A 1109.63 PASS AF=0.470833;AO=113;DP=239;FAO=113;FDP=240;FR=.;FRO=127;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=52;FSRR=75;FWDB=-0.00957346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.781;QD=18.4938;RBI=0.0150775;REFB=-0.00498441;REVB=0.0116481;RO=126;SAF=56;SAR=57;SRF=52;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793262;STB=0.545608;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00638642;OID=.;OPOS=46328026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:240:126:127:113:113:0.470833:57:56:52:74:57:56:52:75 chr21 46328099 . T C 2356.11 PASS AF=1;AO=143;DP=144;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162163;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.005;QD=63.6786;RBI=0.0195069;REFB=0;REVB=0.0108422;RO=0;SAF=50;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.34106e-06;OID=.;OPOS=46328099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:144:148:0:0:143:148:1:93:50:0:0:93:55:0:0 chr21 46330628 . C T 300.3 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0343157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.363;QD=24.514;RBI=0.0344635;REFB=-0.0326696;REVB=0.00318882;RO=22;SAF=9;SAR=18;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100401;STB=0.555516;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0226615;OID=.;OPOS=46330628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:18:9:5:17:18:9:5:17 chr21 46353637 . T C 683.38 PASS AF=0.4;AO=75;DP=190;FAO=76;FDP=190;FR=.;FRO=114;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=67;FSRR=47;FWDB=-0.0079717;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.545;QD=14.387;RBI=0.0079782;REFB=-0.00159085;REVB=0.000322047;RO=111;SAF=38;SAR=37;SRF=66;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936741;STB=0.552618;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00257432;OID=.;OPOS=46353637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:111:114:75:76:0.4:37:38:66:45:38:38:67:47 chr21 46353678 . G A 540.84 PASS AF=0.406667;AO=61;DP=150;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0095368;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7042;QD=14.4225;RBI=0.0508995;REFB=-0.0226806;REVB=0.0499981;RO=89;SAF=27;SAR=34;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101989;STB=0.557358;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0292414;OID=.;OPOS=46353678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:89:89:61:61:0.406667:34:27:48:41:34:27:48:41 chr21 46353949 . C G 208.78 PASS AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00936469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.96;QD=18.1543;RBI=0.0493271;REFB=-0.0132974;REVB=-0.04843;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696018;STB=0.539644;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0191026;OID=.;OPOS=46353949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:14:7:10:15:14:7:10:15 chr21 46353985 . A G 243.92 PASS AF=0.482143;AO=26;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0346883;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6646;QD=17.4226;RBI=0.0347986;REFB=-0.022992;REVB=0.00276942;RO=30;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366047;STB=0.500662;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0232189;OID=.;OPOS=46353985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:29:26:27:0.482143:12:14:15:15:13:14:15:14 chr21 46354055 . A G 250.5 PASS AF=0.441176;AO=27;DP=65;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0239816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1157;QD=14.7355;RBI=0.0563946;REFB=-0.0132963;REVB=-0.0510415;RO=35;SAF=19;SAR=8;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479051;STB=0.511104;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0775249;OID=.;OPOS=46354055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:35:38:27:30:0.441176:8:19:26:9:10:20:26:12 chr21 46355710 . A G 499.54 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00523677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.156;QD=16.9335;RBI=0.00802553;REFB=-0.013136;REVB=-0.00608156;RO=64;SAF=32;SAR=22;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151396;STB=0.584351;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0215496;OID=.;OPOS=46355710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:64:64:54:54:0.457627:22:32:28:36:22:32:28:36 chr21 46572572 . A G 1391.57 PASS AF=1;AO=87;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347544;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3326;QD=61.8476;RBI=0.0399599;REFB=0;REVB=0.0197211;RO=1;SAF=63;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00746289;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000949084;OID=.;OPOS=46572572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:1:0:87:90:1:24:63:1:0:25:65:0:0 chr21 46641968 . G A 479.45 PASS AF=0.375839;AO=47;DP=140;FAO=56;FDP=149;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=0.0124937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.239;QD=12.8712;RBI=0.0128085;REFB=-0.031378;REVB=0.00282221;RO=88;SAF=16;SAR=31;SRF=54;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307182;STB=0.596262;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.03822;OID=.;OPOS=46641968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:149:88:93:47:56:0.375839:31:16:54:34:31:25:56:37 chr21 46705345 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129178;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=291.13;QD=61.684;RBI=0.0129696;REFB=0;REVB=0.00115745;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05e-05;OID=.;OPOS=46705345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0 chr21 46705621 . G A 308.22 PASS AF=0.43038;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.00565784;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.368;QD=15.6062;RBI=0.00937801;REFB=-0.0193798;REVB=-0.00747903;RO=42;SAF=18;SAR=16;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987996;STB=0.548263;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0196302;OID=.;OPOS=46705621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:42:45:34:34:0.43038:16:18:18:24:16:18:20:25 chr21 46875564 . T C 1116.91 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0666176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.224;QD=60.3735;RBI=0.0670799;REFB=0;REVB=-0.00786194;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149835;OID=.;OPOS=46875564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:34:39:0:0:35:39:0:0 chr21 46898243 . C G 2535.75 PASS AF=1;AO=153;DP=153;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.31;QD=61.4728;RBI=0.0336168;REFB=0;REVB=0.0320028;RO=0;SAF=57;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85442e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03219e-05;OID=.;OPOS=46898243;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:153:165:0:0:153:165:1:96:57:0:0:104:61:0:0 chr21 46911188 . C G 1708.46 PASS AF=0.896296;AO=120;DP=135;FAO=121;FDP=135;FR=.;FRO=14;FSAF=53;FSAR=68;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0228543;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=284.045;QD=50.6211;RBI=0.0257896;REFB=-0.201716;REVB=0.0119491;RO=11;SAF=52;SAR=68;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761567;STB=0.551004;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000925345;OID=.;OPOS=46911188;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:135:135:11:14:120:121:0.896296:68:52:10:1:68:53:13:1 chr21 46950863 . C T 36.15 PASS AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.000823966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.375;QD=6.57354;RBI=0.0235211;REFB=-0.00746522;REVB=-0.0235067;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257618;STB=0.666111;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0368883;OID=.;OPOS=46950863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:2:4:7:9:2:4:7:9 chr21 46951556 . A G 223.34 PASS AF=0.470588;AO=22;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0175113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.353;QD=17.5165;RBI=0.0186265;REFB=-0.0197863;REVB=-0.00634833;RO=25;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563503;STB=0.529387;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0226674;OID=.;OPOS=46951556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:27:22:24:0.470588:11:11:14:11:12:12:15:12 chr21 46957794 . T C 765.92 PASS AF=0.540741;AO=73;DP=135;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.055818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.601;QD=22.6939;RBI=0.0589666;REFB=-0.0404813;REVB=0.0190109;RO=62;SAF=44;SAR=29;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470553;STB=0.525779;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0327249;OID=.;OPOS=46957794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:62:62:73:73:0.540741:29:44:34:28:29:44:34:28 chr21 47329352 . T C 1414.23 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265742;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.314;QD=62.8547;RBI=0.0285099;REFB=0;REVB=-0.0103259;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230464;OID=.;OPOS=47329352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:41:48:0:0:42:48:0:0 chr21 47406556 . TGG TGA,TG 546.09 PASS AF=0.0454545,0.909091;AO=3,23;DP=66;FAO=3,60;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=3,32;FSAR=0,28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.100532,0.329639;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=164.334,12.9418;QD=33.0961;RBI=0.160898,1.15644;REFB=-0.0494565,-0.0563401;REVB=0.125624,1.10846;RO=37;SAF=3,23;SAR=0,0;SRF=11;SRR=26;SSEN=0,0.371429;SSEP=0,0.352273;SSSB=0.621617,0.851851;STB=0.5,0.522381;STBP=1,0.123;TYPE=snp,del;VARB=-0.0128838,0.0487031;OID=.,.;OPOS=47406558,47406557;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=TGA,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0454545,0.909091:3,23:66:3,60:66:3:3,32:0,28:3:0:10:37:3,23:0,0:11:26 chr21 47409503 . A G 576.31 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00174102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.487;QD=60.6639;RBI=0.0281081;REFB=0;REVB=-0.0280542;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.79909e-05;OID=.;OPOS=47409503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:13:24:0:0:13:25:0:0 chr21 47410931 . T C 606.92 PASS AF=0.572816;AO=59;DP=104;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0004201;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.501;QD=23.5697;RBI=0.0165145;REFB=-0.00926221;REVB=0.0165091;RO=44;SAF=21;SAR=38;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135824;STB=0.574347;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00322501;OID=.;OPOS=47410931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:44:44:59:59:0.572816:38:21:23:21:38:21:23:21 chr21 47417415 . C A 642.76 PASS AF=0.941176;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0507004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7883;QD=50.4125;RBI=0.0539056;REFB=-0.0675241;REVB=-0.0183107;RO=3;SAF=5;SAR=42;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214554;STB=0.599953;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00791784;OID=.;OPOS=47417415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:50:51:3:3:47:48:0.941176:42:5:3:0:42:6:3:0 chr21 47420723 . G C 1111.2 PASS AF=0.615854;AO=101;DP=164;FAO=101;FDP=164;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=64;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.0177741;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.447;QD=27.1023;RBI=0.0183186;REFB=-0.00231446;REVB=-0.00443322;RO=52;SAF=37;SAR=64;SRF=40;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253885;STB=0.604864;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000953411;OID=.;OPOS=47420723;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:52:63:101:101:0.615854:64:37:40:12:64:37:40:23 chr21 47420726 . C G 2285.95 PASS AF=1;AO=136;DP=143;FAO=155;FDP=155;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=68;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2665;QD=58.9923;RBI=0.090778;REFB=0;REVB=0.0579187;RO=0;SAF=68;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253195;OID=.;OPOS=47420726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:143:155:0:0:136:155:1:68:68:0:0:87:68:0:0 chr21 47423040 . A G 286.49 PASS AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0174611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.914;QD=24.3822;RBI=0.0388721;REFB=0.00550962;REVB=-0.0347297;RO=21;SAF=21;SAR=5;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566682;STB=0.53162;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.00620453;OID=.;OPOS=47423040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:5:21:16:5:5:21:16:5 chr21 47423507 . G A 61.81 PASS AF=0.264706;AO=8;DP=33;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0336395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.104;QD=7.27119;RBI=0.0393314;REFB=-0.0100481;REVB=0.02038;RO=24;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309225;STB=0.611989;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0250701;OID=.;OPOS=47423507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:33:34:24:25:8:9:0.264706:6:2:12:12:6:3:12:13 chr21 47423636 . C T 386.55 PASS AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00703378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.096;QD=18.1904;RBI=0.0144999;REFB=-0.0079225;REVB=0.0126796;RO=45;SAF=17;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165151;STB=0.592113;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0111167;OID=.;OPOS=47423636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:23:17:27:18:23:17:27:18 chr21 47532440 . C T 239.34 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0162123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.852;QD=20.8117;RBI=0.0319331;REFB=-0.0126333;REVB=0.0275115;RO=23;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419051;STB=0.523593;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0119537;OID=.;OPOS=47532440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:15:8:9:14:15:8:9:14 chr21 47536546 . C T 673.61 PASS AF=0.617021;AO=58;DP=97;FAO=58;FDP=94;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0184601;FXX=0.0309246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2658;QD=28.6644;RBI=0.019011;REFB=-0.0373357;REVB=0.00454356;RO=34;SAF=33;SAR=25;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474876;STB=0.516003;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0232693;OID=.;OPOS=47536546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:94:34:36:58:58:0.617021:25:33:17:17:25:33:19:17 chr21 47538960 . G A 351.03 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.437;QD=54.0041;RBI=0.0724632;REFB=0;REVB=0.0375058;RO=1;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370602;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574502;OID=.;OPOS=47538960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:1:0:24:26:1:12:12:0:1:14:12:0:0 chr21 47542861 . A G 621.07 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.276;QD=60.5917;RBI=0.0222114;REFB=0;REVB=0.00734211;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00430993;OID=.;OPOS=47542861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:23:18:0:0 chr21 47544838 . G A 285.98 PASS AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0407921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.33;QD=21.9985;RBI=0.0467702;REFB=0.0149287;REVB=0.0228791;RO=23;SAF=3;SAR=26;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351405;STB=0.699097;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0100396;OID=.;OPOS=47544838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:26:3:8:15:26:3:8:15 chr21 47545155 . A G 867.19 PASS AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00303502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0523;QD=57.8126;RBI=0.0203479;REFB=0;REVB=-0.0201203;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119068;OID=.;OPOS=47545155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:20:40:0:0:20:40:0:0 chr21 47545346 . C T 163.78 PASS AF=0.761905;AO=15;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0085488;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.985;QD=31.196;RBI=0.0117654;REFB=-0.038537;REVB=-0.00808355;RO=3;SAF=12;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1013;STB=0.580555;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0110348;OID=.;OPOS=47545346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:21:21:3:5:15:16:0.761905:3:12:3:0:3:13:5:0 chr21 47545768 . G A 153.03 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.000605524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2893;QD=13.9116;RBI=0.0378389;REFB=-0.0536191;REVB=-0.037834;RO=27;SAF=13;SAR=4;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254716;STB=0.649809;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0377033;OID=.;OPOS=47545768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:4:13:15:12:4:13:15:12 chr21 47545823 . G A 169.08 PASS AF=0.294872;AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.00172545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.291;QD=8.6707;RBI=0.0414881;REFB=-0.00365361;REVB=0.0414522;RO=55;SAF=15;SAR=8;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204862;STB=0.512184;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00446807;OID=.;OPOS=47545823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:55:55:23:23:0.294872:8:15:35:20:8:15:35:20 chr21 47545826 . C T 189.99 PASS AF=0.308642;AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=0.000982744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.511;QD=9.38215;RBI=0.0720411;REFB=-0.0089362;REVB=-0.0720344;RO=56;SAF=17;SAR=8;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048848;STB=0.528865;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0217802;OID=.;OPOS=47545826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:56:56:25:25:0.308642:8:17:36:20:8:17:36:20 chr21 47545913 . G A 262.91 PASS AF=0.373494;AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.00551653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.662;QD=12.6705;RBI=0.00674421;REFB=-0.00890044;REVB=-0.00387972;RO=52;SAF=17;SAR=14;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162518;STB=0.592595;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0146856;OID=.;OPOS=47545913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:52:52:31:31:0.373494:14:17:36:16:14:17:36:16 chr21 47551909 . G A 267.19 PASS AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0433081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.624;QD=28.1254;RBI=0.0434624;REFB=-0.05175;REVB=0.00365933;RO=14;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143251;STB=0.578883;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0324809;OID=.;OPOS=47551909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:12:12:10:4:12:12:10:4 chr21 47552386 . G A 306.14 PASS AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0247163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.063;QD=15.307;RBI=0.0305074;REFB=-0.0116584;REVB=0.017883;RO=46;SAF=18;SAR=16;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366492;STB=0.520698;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0159035;OID=.;OPOS=47552386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:16:18:26:20:16:18:26:20 chr21 47556792 . AC A,AT 234.9 PASS AF=0.366667,0.466667;AO=8,12;DP=30;FAO=11,14;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=11,7;FSAR=0,7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.172241,-0.013096;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.418,114.611;QD=31.3197;RBI=0.173352,0.0201669;REFB=-0.116194,-0.0439368;REVB=0.0195916,0.0153362;RO=5;SAF=8,5;SAR=0,7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.8,0;SSSB=0.814474,0.119488;STB=0.998632,0.578837;STBP=0,0.284;TYPE=del,snp;VARB=-0.0418877,0.0391929;OID=.,.;OPOS=47556793,47556793;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.366667,0.466667:8,12:30:11,14:30:5:11,7:0,7:1:4:65:5:8,5:0,7:1:4 chr21 47557222 . G A 168.9 PASS AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.023648;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8954;QD=22.5205;RBI=0.0346306;REFB=-0.0430946;REVB=-0.0252993;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522387;STB=0.529377;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0208715;OID=.;OPOS=47557222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:8:9:6:7:8:9:6:7 chr21 47575372 . C T 198.42 PASS AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.121413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3167;QD=44.0927;RBI=0.122965;REFB=-0.129968;REVB=0.0194735;RO=1;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0162175;OID=.;OPOS=47575372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:8:9:1:0:8:9:1:0 chr21 47608580 . G A 206.64 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00367763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.815;QD=13.1202;RBI=0.0102726;REFB=-0.0132904;REVB=-0.00959174;RO=37;SAF=12;SAR=13;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349392;STB=0.512061;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0209397;OID=.;OPOS=47608580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:37:38:25:25:0.396825:13:12:19:18:13:12:19:19 chr21 47609677 . A G 267.55 PASS AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.000449641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.382;QD=21.8408;RBI=0.113872;REFB=-0.0134751;REVB=-0.113871;RO=24;SAF=22;SAR=3;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21521;STB=0.622528;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0104178;OID=.;OPOS=47609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:3:22:18:6:3:22:18:6 chr21 47610066 . T C 176.27 PASS AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0118291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.227;QD=20.738;RBI=0.012021;REFB=-0.0180776;REVB=0.00213912;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719337;STB=0.555494;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0114665;OID=.;OPOS=47610066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:10:8:8:7:10:8:9:7 chr21 47612466 . A G 241.34 PASS AF=0.424242;AO=27;DP=64;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00132835;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.702;QD=14.6264;RBI=0.00707729;REFB=-0.0262157;REVB=-0.00695151;RO=37;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817159;STB=0.547743;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0408457;OID=.;OPOS=47612466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:37:38:27:28:0.424242:11:16:19:18:11:17:20:18 chr21 47612471 . T C 243.26 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00650794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4693;QD=15.2036;RBI=0.0304213;REFB=-0.0272092;REVB=0.0297171;RO=35;SAF=17;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650725;STB=0.545838;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0525335;OID=.;OPOS=47612471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:36:28:28:0.4375:11:17:19:16:11:17:19:17 chr21 47612512 . C CTG 129.5 PASS AF=0.320755;AO=16;DP=57;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0560602;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=128.038;QD=9.77355;RBI=0.0577182;REFB=-0.0251954;REVB=-0.0137347;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107314;STB=0.535921;STBP=0.734;TYPE=ins;VARB=0.0566192;OID=.;OPOS=47612513;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.320755:16:57:17:53:36:10:7:23:13:99:40:9:7:26:14 chr21 47613004 . T C 50.75 PASS AF=0.183673;AO=10;DP=49;FAO=9;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0430838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3328;QD=4.14254;RBI=0.180626;REFB=-0.0347581;REVB=-0.175413;RO=37;SAF=5;SAR=5;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217659;STB=0.515118;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0848571;OID=.;OPOS=47613004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:49:49:37:40:10:9:0.183673:5:5:25:12:3:6:26:14 chr21 47613570 . T C 31.58 PASS AF=0.146341;AO=7;DP=39;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.138513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.144;QD=3.08126;RBI=0.18718;REFB=-0.0226583;REVB=-0.125899;RO=31;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413546;STB=0.863556;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.127428;OID=.;OPOS=47613570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:39:41:31:35:7:6:0.146341:2:5:11:20:1:5:13:22 chr21 47613623 . C T 65.95 PASS AF=0.168831;AO=13;DP=77;FAO=13;FDP=77;FR=.;FRO=64;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0484927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.6458;QD=3.42609;RBI=0.0754229;REFB=-0.0275599;REVB=-0.0577673;RO=61;SAF=4;SAR=9;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197536;STB=0.6152;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.139001;OID=.;OPOS=47613623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:77:77:61:64:13:13:0.168831:9:4:28:33:9:4:28:36 chr21 47613639 . C T 65.58 PASS AF=0.196429;AO=11;DP=56;FAO=11;FDP=56;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0431799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.235;QD=4.6845;RBI=0.129081;REFB=-0.0196887;REVB=-0.121645;RO=44;SAF=3;SAR=8;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212636;STB=0.649889;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.102824;OID=.;OPOS=47613639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:56:56:44:45:11:11:0.196429:8:3:19:25:8:3:20:25 chr21 47614443 . A G 220.38 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.033564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0365;QD=14.2181;RBI=0.0381499;REFB=-0.0031866;REVB=-0.0181348;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956379;STB=0.554414;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.00496886;OID=.;OPOS=47614443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:12:14:16:20:12:14:16:20 chr21 47614469 . A C 192.86 PASS AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0091589;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.924;QD=13.7759;RBI=0.0105856;REFB=-0.011208;REVB=0.00530759;RO=32;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855785;STB=0.539501;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0140487;OID=.;OPOS=47614469;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:11:12:14:18:11:12:15:18 chr21 47635212 . G A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0337242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.986;QD=14.6578;RBI=0.0362806;REFB=-0.00464461;REVB=0.0133776;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142857;STB=0.583204;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.011988;OID=.;OPOS=47635212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:9:8:8:5:9:8 chr21 47660749 . A C 153.94 PASS AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0105806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.59;QD=11.6177;RBI=0.0119078;REFB=-0.0319816;REVB=0.00546326;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10145;STB=0.559057;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0385935;OID=.;OPOS=47660749;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:9:10:21:13:9:10:21:13 chr21 47660867 . G A 277.62 PASS AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.013286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.368;QD=16.0938;RBI=0.0132867;REFB=0.000307897;REVB=-0.000139364;RO=38;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021716;STB=0.512233;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.000471442;OID=.;OPOS=47660867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:14:17:20:18:14:17:20:18 chr21 47676711 . G A 268.73 PASS AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0333291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0908;QD=22.3939;RBI=0.115713;REFB=0.0218041;REVB=0.110809;RO=23;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00453611;STB=0.502536;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=-0.0117745;OID=.;OPOS=47676711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:11:14:13:10:11:14:13:10 chr21 47685939 . A G 300.26 PASS AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0213351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.227;QD=16.4526;RBI=0.029408;REFB=-0.0155627;REVB=0.0202397;RO=38;SAF=22;SAR=11;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018975;STB=0.520821;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.019932;OID=.;OPOS=47685939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:40:33:33:0.452055:11:22:26:12:11:22:28:12 chr21 47734659 . G A 208.42 PASS AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00664064;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.487;QD=22.5314;RBI=0.0324986;REFB=-0.0176803;REVB=0.0318129;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307902;STB=0.679494;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0152169;OID=.;OPOS=47734659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:16:16:14:14:0.378378:11:3:8:8:11:3:8:8 chr21 47773103 . C A 213.94 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0312585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.685;QD=20.8719;RBI=0.0320662;REFB=-0.0388077;REVB=0.00715186;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152558;STB=0.586122;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0320537;OID=.;OPOS=47773103;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:10:10:7:14:10:10 chr21 47777063 . G A 471.92 PASS AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00266895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=342.123;QD=55.5196;RBI=0.0168865;REFB=0.0193015;REVB=0.0166743;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239571;STB=0.512813;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000563764;OID=.;OPOS=47777063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:19:14:0:1:19:14:0:1 chr21 47783796 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.156;QD=54.5176;RBI=0.0582306;REFB=0;REVB=-0.0401368;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000873826;OID=.;OPOS=47783796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0 chr21 47786817 . C G 920.03 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9719;QD=58.4143;RBI=0.0627145;REFB=0;REVB=0.054487;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693066;OID=.;OPOS=47786817;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0 chr21 47787002 . T C 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00796095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.386;QD=57.3857;RBI=0.0210689;REFB=0;REVB=0.0195069;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123723;OID=.;OPOS=47787002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0 chr21 47811272 . C T 49.59 PASS AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.114418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.731;QD=15.2586;RBI=0.115714;REFB=-0.0220003;REVB=0.0172709;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308536;STB=0.680376;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0330157;OID=.;OPOS=47811272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:1:5:3:4:1:5 chr21 47836653 . C T 150.29 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00720054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6074;QD=12.5241;RBI=0.0466195;REFB=-0.00658398;REVB=-0.0460601;RO=29;SAF=11;SAR=6;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513012;STB=0.501339;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00814742;OID=.;OPOS=47836653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:29:31:17:17:0.354167:6:11:20:9:6:11:20:11 chr21 47850484 . G C 378.95 PASS AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0170546;FXX=0.0394685;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.215;QD=20.7641;RBI=0.0496974;REFB=-0.0090961;REVB=-0.0466794;RO=34;SAF=16;SAR=22;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931852;STB=0.545166;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00953322;OID=.;OPOS=47850484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:35:38:38:0.520548:22:16:18:16:22:16:18:17 chr21 47851753 . A G 269.57 PASS AF=0.568182;AO=24;DP=43;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00869985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.024;QD=24.5059;RBI=0.0232982;REFB=-0.0397954;REVB=-0.0216129;RO=19;SAF=16;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241656;STB=0.618688;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0115715;OID=.;OPOS=47851753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:19:19:24:25:0.568182:8:16:7:12:9:16:7:12 chr21 47863757 . A C 229.05 PASS AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00689153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.053;QD=13.8819;RBI=0.0077343;REFB=-0.00638203;REVB=0.00351088;RO=39;SAF=15;SAR=12;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360483;STB=0.520533;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0138958;OID=.;OPOS=47863757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:12:15:23:16:12:15:23:16 chr21 47910523 . A G 105.81 PASS AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00624142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.381;QD=11.4385;RBI=0.0304677;REFB=-0.0078987;REVB=0.0298216;RO=24;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172139;STB=0.602352;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0096597;OID=.;OPOS=47910523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:5:8:11:13:5:8:11:13 chr21 47945533 . GCTC G 109.38 PASS AF=0.283019;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00366212;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=3;MLLD=305.443;QD=8.25539;RBI=0.0158493;REFB=-0.00556909;REVB=-0.0154204;RO=37;SAF=9;SAR=6;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039278;STB=0.534837;STBP=0.741;TYPE=del;VARB=0.0147999;OID=.;OPOS=47945534;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.283019:15:55:15:53:38:9:6:21:17:99:37:9:6:21:16 chr21 47959692 . G A 132.52 PASS AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0128367;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5405;QD=9.46549;RBI=0.0143031;REFB=-0.0123307;REVB=-0.00630842;RO=38;SAF=9;SAR=9;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0292321;OID=.;OPOS=47959692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:9:9:19:19:9:9:19:19 chr21 47959698 . C T 144.89 PASS AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.010176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.091;QD=10.168;RBI=0.0251263;REFB=-0.0220649;REVB=-0.0229735;RO=38;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595016;STB=0.535019;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0323463;OID=.;OPOS=47959698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:38:38:19:19:0.333333:9:10:18:20:9:10:18:20 chr21 47961711 . G A 629.08 PASS AF=0.448276;AO=65;DP=146;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=-0.0218216;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8774;QD=17.3538;RBI=0.0362186;REFB=-0.0153234;REVB=-0.0289068;RO=80;SAF=27;SAR=38;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978565;STB=0.50545;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0139046;OID=.;OPOS=47961711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:80:80:65:65:0.448276:38:27:34:46:38:27:34:46 chr21 47970581 . G A 260.66 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0357653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2919;QD=18.9572;RBI=0.0362421;REFB=-0.00757405;REVB=-0.00585941;RO=27;SAF=14;SAR=14;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162654;STB=0.509084;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00502692;OID=.;OPOS=47970581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:14:14:14:13:14:14:14:13 chr21 47974582 . A G 333.67 PASS AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00309092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9312;QD=21.8798;RBI=0.0200991;REFB=-0.0349501;REVB=-0.01986;RO=27;SAF=12;SAR=22;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224623;STB=0.624192;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0167051;OID=.;OPOS=47974582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:22:12:17:10:22:12:17:10 chr21 47978321 . G C,GC 1358.9 PASS AF=0.0337079,0.966292;AO=5,82;DP=91;FAO=3,86;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=2,34;FSAR=1,52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.059098,-0.00915091;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=14.4559,33.5149;QD=61.074;RBI=0.130259,0.115994;REFB=0,0;REVB=0.116081,0.115633;RO=3;SAF=3,32;SAR=2,50;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.2842,-0.042344;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0768306,0.00599876;OID=.,.;OPOS=47978321,47978322;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:91:89:3:0:5,82:3,86:0.0337079,0.966292:2,50:3,32:3:0:1,52:2,34:0:0 chr21 47985655 . C T 231.53 PASS AF=0.536585;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00674383;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.602;QD=22.5884;RBI=0.00719533;REFB=-0.0167578;REVB=0.00250869;RO=17;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952036;STB=0.578992;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0215134;OID=.;OPOS=47985655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:41:17:19:22:22:0.536585:9:13:8:9:9:13:8:11 chr21 48022230 . C G 203.35 PASS AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0191854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.411;QD=14.2704;RBI=0.0192606;REFB=0.00464969;REVB=0.00170045;RO=33;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039205;STB=0.522369;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.00741985;OID=.;OPOS=48022230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:10:14:18:15:10:14:18:15 chr21 48063476 . C G 1553.06 PASS AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0607246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.189;QD=62.7498;RBI=0.0645824;REFB=-0.0155493;REVB=-0.0219866;RO=1;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903448;STB=0.504761;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00063245;OID=.;OPOS=48063476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:52:46:0:1:52:46:0:1 chr21 48084820 . C G 747.79 PASS AF=0.59322;AO=69;DP=118;FAO=70;FDP=118;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.036412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.098;QD=25.3487;RBI=0.0375669;REFB=-0.00759852;REVB=-0.00924326;RO=48;SAF=33;SAR=36;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150567;STB=0.505346;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00563379;OID=.;OPOS=48084820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:48:48:69:70:0.59322:36:33:22:26:37:33:22:26 chr22 17072483 . A G 842.81 PASS AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0313125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.654;QD=54.3749;RBI=0.0335832;REFB=-0.183128;REVB=0.012139;RO=2;SAF=17;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523295;STB=0.527768;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0035389;OID=.;OPOS=17072483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:62:62:2:2:60:60:0.967742:43:17:2:0:43:17:2:0 chr22 17073066 . A G 111.3 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.135;QD=40.4715;RBI=0.117868;REFB=0;REVB=0.0962079;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00384291;OID=.;OPOS=17073066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:3:7:0:0:4:7:0:0 chr22 17073475 . C T 785.67 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.202;QD=64.136;RBI=0.0103787;REFB=0;REVB=0.00859151;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14042e-05;OID=.;OPOS=17073475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr22 17264565 . G T 1119.89 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0536398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.636;QD=58.9414;RBI=0.0536416;REFB=0.0750535;REVB=0.000437813;RO=0;SAF=47;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94731e-08;STB=0.505262;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000145593;OID=.;OPOS=17264565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:75:76:0:1:75:75:0.986842:28:47:0:0:28:47:1:0 chr22 17264904 . A G 292.42 PASS AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0334618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.385;QD=14.6212;RBI=0.0334737;REFB=-0.024423;REVB=0.000894029;RO=47;SAF=21;SAR=12;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156164;STB=0.58873;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0340159;OID=.;OPOS=17264904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:12:21:23:24:12:21:23:24 chr22 17265124 . A C 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100003;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.398;QD=58.5878;RBI=0.0138556;REFB=0;REVB=0.00959019;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.31943e-07;OID=.;OPOS=17265124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr22 17265194 . G A 150.95 PASS AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0137692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.852;QD=12.5793;RBI=0.0138301;REFB=-0.00947667;REVB=0.00129586;RO=31;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447419;STB=0.526285;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0154741;OID=.;OPOS=17265194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:10:7:14:17:10:7:14:17 chr22 17468873 . G A 222.67 PASS AF=0.380282;AO=26;DP=69;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0111252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.053;QD=12.5445;RBI=0.0132698;REFB=-0.0200306;REVB=0.00723306;RO=42;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224973;STB=0.599302;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0318165;OID=.;OPOS=17468873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:42:44:26:27:0.380282:10:16:17:25:11:16:19:25 chr22 17586471 . C T 592.01 PASS AF=0.491935;AO=60;DP=123;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=0.0108609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.575;QD=19.097;RBI=0.0141635;REFB=-0.0135878;REVB=0.00909096;RO=63;SAF=30;SAR=30;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184381;STB=0.604606;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0105106;OID=.;OPOS=17586471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:63:63:60:61:0.491935:30:30:44:19:31:30:44:19 chr22 17589297 . G A 431.34 PASS AF=0.426087;AO=45;DP=111;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.0471402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.293;QD=15.003;RBI=0.0471423;REFB=0.000221849;REVB=-0.000439112;RO=63;SAF=23;SAR=22;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689522;STB=0.523226;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-3.86418e-05;OID=.;OPOS=17589297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:115:63:66:45:49:0.426087:22:23:28:35:24:25:31:35 chr22 17589794 . C A 65.68 PASS AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0399088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.8832;QD=11.4235;RBI=0.0538816;REFB=-0.0651071;REVB=0.0362009;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248624;STB=0.646176;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.057044;OID=.;OPOS=17589794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:11:3:4:5:11:3 chr22 17600293 . G A 48.86 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0388026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5553;QD=13.9589;RBI=0.0471631;REFB=0.0182849;REVB=0.0268088;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439386;STB=0.768342;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=-0.0205118;OID=.;OPOS=17600293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:1:6:3:4:1:6:3:4 chr22 17600497 . G A 41.14 PASS AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0218668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.583;QD=16.4543;RBI=0.0408403;REFB=-0.0522884;REVB=0.0344932;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119263;STB=0.571183;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0321977;OID=.;OPOS=17600497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:4:2:2:2:4:2:2:2 chr22 17600977 . G A 142.06 PASS AF=0.395349;AO=15;DP=42;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00909536;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.619;QD=13.2149;RBI=0.0320127;REFB=-0.0196106;REVB=0.0306935;RO=25;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115578;STB=0.609632;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0535624;OID=.;OPOS=17600977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:43:25:26:15:17:0.395349:7:8:16:9:9:8:17:9 chr22 17602839 . G A 264.72 PASS AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00249203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.099;QD=20.7622;RBI=0.0236556;REFB=-0.0340443;REVB=-0.023524;RO=24;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776579;STB=0.543346;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0317664;OID=.;OPOS=17602839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:17:10:11:13:17:10:11:13 chr22 17603503 . G A 451.94 PASS AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00513083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2402;QD=22.0458;RBI=0.0130169;REFB=-0.0073126;REVB=0.0119631;RO=38;SAF=22;SAR=22;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663659;STB=0.536569;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00835926;OID=.;OPOS=17603503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:22:22:22:16:22:22:22:16 chr22 17622267 . C T 130.97 PASS AF=0.52;AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0213493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.378;QD=20.9558;RBI=0.0236274;REFB=-0.019565;REVB=0.0101223;RO=9;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232556;STB=0.61523;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0220166;OID=.;OPOS=17622267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:25:25:9:10:11:13:0.52:7:4:1:8:9:4:1:9 chr22 17630486 . C A 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00458304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.496;QD=12.3948;RBI=0.00460432;REFB=-0.00694412;REVB=-0.000442176;RO=24;SAF=9;SAR=5;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280665;STB=0.516506;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0111781;OID=.;OPOS=17630486;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:5:9:16:8:5:9:16:8 chr22 17640399 . G GGGC 134.16 PASS AF=0.326923;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00349343;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=3;MLLD=227.634;QD=10.32;RBI=0.0374192;REFB=-0.0146153;REVB=-0.0372558;RO=43;SAF=13;SAR=4;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37256;STB=0.687421;STBP=0.079;TYPE=ins;VARB=0.0297967;OID=.;OPOS=17640400;OREF=-;OALT=GGC;OMAPALT=GGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.326923:17:60:17:52:35:13:4:18:17:99:43:13:4:20:23 chr22 17690409 . G A 199.48 PASS AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0172461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.064;QD=15.6454;RBI=0.017727;REFB=0.0104017;REVB=0.00410084;RO=28;SAF=7;SAR=15;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374199;STB=0.528277;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.014656;OID=.;OPOS=17690409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:28:29:22:22:0.431373:15:7:8:20:15:7:8:21 chr22 17990852 . G A 298.09 PASS AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0134097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.574;QD=20.9185;RBI=0.0135878;REFB=-0.00754834;REVB=0.00219299;RO=26;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134092;STB=0.574277;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00770882;OID=.;OPOS=17990852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:14:17:10:16:14:17:10:16 chr22 18021604 . C T 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0293005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.827;QD=18.9664;RBI=0.0310427;REFB=0.00341062;REVB=0.0102532;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137902;STB=0.507805;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.00509543;OID=.;OPOS=18021604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:12:10:11:14:12:10:11:14 chr22 18111431 . T C 167.09 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.043687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.391;QD=15.1896;RBI=0.0439407;REFB=-0.00166687;REVB=-0.00471559;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787827;STB=0.545404;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00215655;OID=.;OPOS=18111431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:9:9:11:15:9:9:11:15 chr22 18209612 . CA C,CG 620.23 PASS AF=0.404762,0.595238;AO=14,25;DP=40;FAO=17,25;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17,1;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0465703,-0.0635547;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=49.3797,59.716;QD=59.0695;RBI=0.0624163,0.112901;REFB=0,0;REVB=-0.0415572,-0.0933131;RO=0;SAF=14,1;SAR=0,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.20334e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00586215,0.0205233;OID=.,.;OPOS=18209613,18209613;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.404762,0.595238:14,25:40:17,25:42:0:17,1:0,24:0:0:84:0:14,1:0,24:0:0 chr22 18211983 . T C 1587.81 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=355.216;QD=64.154;RBI=0.0136101;REFB=0;REVB=0.00615784;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46245e-06;OID=.;OPOS=18211983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:60:39:0:0:60:39:0:0 chr22 18226771 . G A 239.33 PASS AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0537458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.632;QD=20.8112;RBI=0.0545334;REFB=0.00464595;REVB=0.00923454;RO=23;SAF=11;SAR=12;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196628;STB=0.609852;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00536913;OID=.;OPOS=18226771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:12:11:6:17:12:11:6:17 chr22 18300240 . T C 527.8 PASS AF=0.435115;AO=57;DP=132;FAO=57;FDP=131;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=-0.0010832;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.964;QD=16.1161;RBI=0.0187957;REFB=0.000142327;REVB=-0.0187645;RO=74;SAF=33;SAR=24;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187538;STB=0.604745;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.000375845;OID=.;OPOS=18300240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:74:74:57:57:0.435115:24:33:29:45:24:33:29:45 chr22 18300775 . G A 224.61 PASS AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0180279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8419;QD=17.6168;RBI=0.0180791;REFB=-0.0449283;REVB=0.0013592;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137635;STB=0.577824;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0328717;OID=.;OPOS=18300775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:9:15:13:14:9:15:13:14 chr22 18304821 . G A 210.81 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0230516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.247;QD=14.0542;RBI=0.0303539;REFB=-0.0252602;REVB=-0.0197479;RO=35;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762227;STB=0.543472;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0407478;OID=.;OPOS=18304821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:11:14:17:18:11:14:17:18 chr22 18304891 . C T 182.04 PASS AF=0.413043;AO=12;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0217774;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.798;QD=15.8298;RBI=0.0286755;REFB=-0.0100256;REVB=0.0186556;RO=22;SAF=3;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294148;STB=0.569404;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0162082;OID=.;OPOS=18304891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:27:12:19:0.413043:9:3:11:11:10:9:16:11 chr22 18305797 . C T 133.13 PASS AF=0.483871;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00355163;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.306;QD=17.1775;RBI=0.00757094;REFB=-0.0267447;REVB=0.00668619;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246747;STB=0.590784;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0367388;OID=.;OPOS=18305797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:17:16:14:15:0.483871:10:4:9:8:10:5:8:8 chr22 18310439 . G A 372.93 PASS AF=0.412371;AO=40;DP=97;FAO=40;FDP=97;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.00754923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2127;QD=15.3787;RBI=0.0627008;REFB=-0.00199313;REVB=0.0622446;RO=57;SAF=23;SAR=17;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329172;STB=0.518606;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00523439;OID=.;OPOS=18310439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:57:57:40:40:0.412371:17:23:31:26:17:23:31:26 chr22 18324564 . C T 397.3 PASS AF=0.565217;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0168437;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.556;QD=23.0321;RBI=0.0383007;REFB=-0.0713958;REVB=0.0343982;RO=29;SAF=21;SAR=18;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645567;STB=0.54174;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0283035;OID=.;OPOS=18324564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:29:30:39:39:0.565217:18:21:18:11:18:21:19:11 chr22 18364030 . CTTTTTT CTTTTT,CTTTTTG,GCTTTTT 500.55 PASS AF=0.547619,0.0892857,0;AO=52,15,13;DP=168;FAO=92,15,0;FDP=168;FR=.;FRO=61;FSAF=42,13,0;FSAR=50,2,0;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.073839,0.133847,-0.0318079;FXX=0.011764;HRUN=6,6,1;LEN=1,1,2;MLLD=9.14771,13.89,37.6819;QD=11.9179;RBI=0.0770544,0.148795,0.0692652;REFB=-0.201753,-0.144132,-0.0599802;REVB=0.022027,0.0649999,-0.0615299;RO=69;SAF=29,13,0;SAR=23,2,13;SRF=22;SRR=47;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.239681,0.632854,-0.661989;STB=0.545445,0.888774,0.5;STBP=0.192,0,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.188615,-0.00822321,0;OID=.,.,.;OPOS=18364031,18364036,18364030;OREF=T,T,CT;OALT=-,G,GC;OMAPALT=CTTTTT,CTTTTTG,GCTTTTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:69:61:52,15,13:92,15,0:0.547619,0.0892857,0:23,2,13:29,13,0:22:47:50,2,0:42,13,0:21:40 chr22 18571828 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.226;QD=59.4353;RBI=0.0168838;REFB=0;REVB=0.0116737;RO=0;SAF=8;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103559;OID=.;OPOS=18571828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:27:8:0:0:27:8:0:0 chr22 18607020 . C T 187.92 PASS AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0229559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0768;QD=20.3152;RBI=0.0309565;REFB=-0.0185693;REVB=-0.0207685;RO=18;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345601;STB=0.692966;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0157892;OID=.;OPOS=18607020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:11:8:15:3:11:8:15:3 chr22 18609642 . C T 168.62 PASS AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.000371221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4584;QD=16.0592;RBI=0.00288041;REFB=-0.0194389;REVB=-0.00285639;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113876;STB=0.565147;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0123625;OID=.;OPOS=18609642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:8:16:10:8:8:16 chr22 18628436 . T C 180.83 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0108254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4099;QD=13.9102;RBI=0.0491427;REFB=-0.00506095;REVB=-0.0479355;RO=31;SAF=6;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314893;STB=0.68164;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00834503;OID=.;OPOS=18628436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:15:6:18:13:15:6:18:13 chr22 18628499 . G T 1377.52 PASS AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00966311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.879;QD=62.6146;RBI=0.00966445;REFB=0;REVB=-0.000160536;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.43993e-06;OID=.;OPOS=18628499;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0 chr22 18628632 . C T 520.3 PASS AF=0.519608;AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.00804836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0521;QD=20.4038;RBI=0.0399115;REFB=-0.00105353;REVB=0.0390916;RO=49;SAF=28;SAR=25;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157261;STB=0.586517;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00153932;OID=.;OPOS=18628632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:49:49:53:53:0.519608:25:28:17:32:25:28:17:32 chr22 18628715 . C T 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.323;QD=59.4356;RBI=0.0178906;REFB=0;REVB=0.0135124;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.02883e-05;OID=.;OPOS=18628715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0 chr22 18650682 . C T 235.68 PASS AF=0.341176;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00115472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.265;QD=11.0907;RBI=0.0271386;REFB=-0.00738283;REVB=-0.027114;RO=55;SAF=17;SAR=12;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675978;STB=0.533861;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0116469;OID=.;OPOS=18650682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:55:56:29:29:0.341176:12:17:29:26:12:17:30:26 chr22 18835364 . GT G,GG 74.3 PASS AF=0.125,0.875;AO=2,6;DP=8;FAO=1,7;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1,5;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096441,0.0116308;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.731,241.558;QD=37.1522;RBI=0.011117,0.0116324;REFB=0,0;REVB=-0.00552991,-0.000193188;RO=0;SAF=2,4;SAR=0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000528189,0.000156397;OID=.,.;OPOS=18835365,18835365;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.125,0.875:2,6:8:1,7:8:0:1,5:0,2:0:0:6:0:2,4:0,2:0:0 chr22 18870920 . C T 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00210807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.14;QD=10.0338;RBI=0.0466266;REFB=0.0215504;REVB=0.0465789;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090044;STB=0.555348;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=-0.098901;OID=.;OPOS=18870920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:1:4:6:1:1:4:6:1 chr22 18870940 . C A 72.93 PASS AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0683357;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.9689;QD=18.2324;RBI=0.0802038;REFB=-0.0280424;REVB=-0.0419867;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092312;STB=0.553081;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0152955;OID=.;OPOS=18870940;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:17:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:6:1:2:7:6:1 chr22 18870955 . CG GA 118.82 PASS AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0118733;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=229.165;QD=22.6322;RBI=0.0405258;REFB=0.0127725;REVB=0.0387475;RO=8;SAF=10;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107729;STB=0.560353;STBP=0.632;TYPE=mnp;VARB=-0.00576335;OID=.;OPOS=18870955;OREF=CG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:3:10:7:1:3:10:7:1 chr22 18870974 . T G 115.91 PASS AF=0.608696;AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0487726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2273;QD=20.1576;RBI=0.0828211;REFB=-0.0919942;REVB=-0.0669371;RO=10;SAF=9;SAR=4;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205829;STB=0.590048;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0713072;OID=.;OPOS=18870974;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:23:23:10:9:13:14:0.608696:4:9:9:1:4:10:8:1 chr22 18896169 . C T 327.74 PASS AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0028601;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.582;QD=15.2439;RBI=0.013235;REFB=-0.0169428;REVB=0.0129222;RO=50;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982356;STB=0.555525;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0230323;OID=.;OPOS=18896169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:16:20:23:27:16:20:23:27 chr22 18896189 . T C 417.18 PASS AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0370341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1985;QD=17.2032;RBI=0.0386516;REFB=0.0124504;REVB=0.0110642;RO=54;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621782;STB=0.534823;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.0149431;OID=.;OPOS=18896189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:0.443299:22:21:23:31:22:21:23:31 chr22 18897578 . G A 430.87 PASS AF=0.422414;AO=48;DP=115;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=0.0130208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.313;QD=14.8575;RBI=0.0150985;REFB=-0.0183399;REVB=0.00764343;RO=67;SAF=28;SAR=20;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00132366;STB=0.505812;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0256175;OID=.;OPOS=18897578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:67:67:48:49:0.422414:20:28:39:28:20:29:39:28 chr22 18900750 . G A 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.325;QD=58.1416;RBI=0.0472798;REFB=0;REVB=0.0209353;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355664;OID=.;OPOS=18900750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr22 18901004 . C T 109.05 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000591999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.418;QD=36.3488;RBI=0.0196106;REFB=-0.0783536;REVB=0.0196017;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555452;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00324747;OID=.;OPOS=18901004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:0:1:11:11:0.916667:7:4:0:0:7:4:1:0 chr22 18904414 . A G 417.76 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.0926;QD=55.701;RBI=0.0629664;REFB=0;REVB=-0.054406;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162137;OID=.;OPOS=18904414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:17:12:0:0:18:12:0:0 chr22 18907124 . G A 959.55 PASS AF=0.932432;AO=69;DP=75;FAO=69;FDP=74;FR=.;FRO=5;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0336634;FXX=0.0133316;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.57;QD=51.8677;RBI=0.0408955;REFB=-0.0848781;REVB=0.023221;RO=5;SAF=47;SAR=22;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118481;STB=0.506282;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00136843;OID=.;OPOS=18907124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:75:74:5:5:69:69:0.932432:22:47:3:2:22:47:3:2 chr22 18908875 . A G 905.91 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0479865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.673;QD=56.6193;RBI=0.0812152;REFB=-0.0767922;REVB=-0.0655226;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017815;STB=0.509431;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00127696;OID=.;OPOS=18908875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:37:26:1:0:37:26:1:0 chr22 18912678 . A G 1190.43 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.562;QD=61.0477;RBI=0.0150834;REFB=0;REVB=0.0145574;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36851e-05;OID=.;OPOS=18912678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:43:35:0:0:43:35:0:0 chr22 19026613 . A G 261.15 PASS AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0712267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9947;QD=12.2894;RBI=0.0839977;REFB=-0.0192116;REVB=-0.0445238;RO=54;SAF=19;SAR=12;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166739;STB=0.595959;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0334382;OID=.;OPOS=19026613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:12:19:25:29:12:19:25:29 chr22 19034240 . A G 545.32 PASS AF=0.533981;AO=54;DP=102;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0254352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.934;QD=21.1774;RBI=0.029287;REFB=-0.0278292;REVB=0.0145182;RO=48;SAF=32;SAR=22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133491;STB=0.567552;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0199133;OID=.;OPOS=19034240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:48:48:54:55:0.533981:22:32:21:27:23:32:21:27 chr22 19048413 . A G 558.17 PASS AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0310577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.427;QD=23.0173;RBI=0.0315199;REFB=-0.0124497;REVB=-0.005378;RO=45;SAF=35;SAR=17;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237369;STB=0.630837;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0154405;OID=.;OPOS=19048413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:17:35:18:27:17:35:18:27 chr22 19119545 . C T 140.11 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00967719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.21;QD=12.737;RBI=0.0434888;REFB=-0.00998491;REVB=0.0423984;RO=28;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00984449;STB=0.505773;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0180498;OID=.;OPOS=19119545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:7:9:16:12:7:9:16:12 chr22 19119686 . C T 108.0 PASS AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0245134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.824;QD=13.091;RBI=0.0245202;REFB=-0.0231596;REVB=-0.000579484;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910385;STB=0.553406;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0313246;OID=.;OPOS=19119686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:9:11:6:7:9:11 chr22 19119751 . C T 37.39 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00203104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.064;QD=8.79722;RBI=0.0177101;REFB=-0.0022756;REVB=-0.0175933;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100718;STB=0.58795;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00299233;OID=.;OPOS=19119751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:10:11:6:6:0.352941:3:3:4:6:3:3:4:7 chr22 19119938 . G A 98.55 PASS AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00614802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.632;QD=14.0792;RBI=0.00861209;REFB=-0.0153733;REVB=-0.00603076;RO=16;SAF=10;SAR=2;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354515;STB=0.520798;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0200985;OID=.;OPOS=19119938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:2:10:13:3:2:10:13:3 chr22 19163577 . C CAT 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443574;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=314.35;QD=58.0611;RBI=0.0497435;REFB=0;REVB=0.0225129;RO=1;SAF=26;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178082;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=9.35125e-05;OID=.;OPOS=19163578;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:61:62:61:61:0:26:35:0:0:5:1:26:35:1:0 chr22 19165478 . A G 61.37 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0330452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.594;QD=18.8845;RBI=0.0368567;REFB=-0.0107274;REVB=0.0163228;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175135;STB=0.510178;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.00284917;OID=.;OPOS=19165478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:2:3:5:3:2:3 chr22 19167409 . T C 747.92 PASS AF=0.642857;AO=63;DP=98;FAO=63;FDP=98;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00979067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5732;QD=30.5274;RBI=0.00990847;REFB=0.0123572;REVB=0.00152333;RO=35;SAF=30;SAR=33;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885871;STB=0.54793;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00658526;OID=.;OPOS=19167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:35:35:63:63:0.642857:33:30:12:23:33:30:12:23 chr22 19167421 . G A 293.76 PASS AF=0.350515;AO=33;DP=97;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.01008;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.49;QD=12.1137;RBI=0.118292;REFB=-0.00472778;REVB=0.117861;RO=63;SAF=13;SAR=20;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952809;STB=0.562579;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00932737;OID=.;OPOS=19167421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:63:63:33:34:0.350515:20:13:30:33:21:13:30:33 chr22 19170956 . C T 113.83 PASS AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0462762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.292;QD=9.89822;RBI=0.0462856;REFB=0.00230717;REVB=0.000931239;RO=32;SAF=9;SAR=5;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972001;STB=0.558738;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.0046852;OID=.;OPOS=19170956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:32:32:14:14:0.304348:5:9:18:14:5:9:18:14 chr22 19172006 . T C 1283.44 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00065744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.544;QD=61.8526;RBI=0.0116139;REFB=0;REVB=0.0115953;RO=0;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83728e-05;OID=.;OPOS=19172006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:33:50:0:0:33:50:0:0 chr22 19189003 . A AC,C 597.73 PASS AF=1,0;AO=31,9;DP=44;FAO=41,0;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106115,-0.187616;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=25.0728,5.32939;QD=58.315;RBI=0.15663,0.199201;REFB=0,0;REVB=0.115207,0.0669417;RO=4;SAF=8,9;SAR=23,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.184931,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00755479,0;OID=.,.;OPOS=19189004,19189003;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:41:4:0:31,9:41,0:1,0:23,0:8,9:4:0:23,0:18,0:0:0 chr22 19197896 . T C 766.46 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.122;QD=63.8719;RBI=0.035666;REFB=0;REVB=0.0265187;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024321;OID=.;OPOS=19197896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0 chr22 19230365 . T C 303.76 PASS AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.00120487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8403;QD=14.8173;RBI=0.0139906;REFB=-0.00393985;REVB=-0.0139386;RO=48;SAF=18;SAR=16;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122038;STB=0.568901;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00445209;OID=.;OPOS=19230365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:16:18:31:17:16:18:31:17 chr22 19263214 . G A 284.66 PASS AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0101273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.875;QD=17.791;RBI=0.014688;REFB=-0.000272547;REVB=0.0106384;RO=33;SAF=20;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152849;STB=0.585717;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00039812;OID=.;OPOS=19263214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:11:20:16:17:11:20:16:17 chr22 19318912 . C T 348.94 PASS AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0153615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.215;QD=22.881;RBI=0.0234436;REFB=-0.0408118;REVB=0.0177095;RO=26;SAF=22;SAR=13;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422247;STB=0.523277;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0262392;OID=.;OPOS=19318912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:13:22:15:11:13:22:15:11 chr22 19353360 . C T 300.64 PASS AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00880244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.301;QD=21.4745;RBI=0.00988197;REFB=-0.0376967;REVB=0.00449114;RO=25;SAF=13;SAR=18;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176915;STB=0.597875;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0178955;OID=.;OPOS=19353360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:18:13:16:9:18:13:16:9 chr22 19398313 . G A 86.1 PASS AF=0.411765;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00455893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.912;QD=20.2596;RBI=0.00724499;REFB=-0.0220223;REVB=0.00563081;RO=4;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31972;STB=0.788535;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00257767;OID=.;OPOS=19398313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:15:17:4:6:7:7:0.411765:1:6:2:2:1:6:2:4 chr22 19423250 . G A 268.03 PASS AF=0.631579;AO=23;DP=37;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0164566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.137;QD=28.2136;RBI=0.0165781;REFB=-0.0339451;REVB=0.00200385;RO=13;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615279;STB=0.552588;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0254933;OID=.;OPOS=19423250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:37:38:13:14:23:24:0.631579:11:12:8:5:12:12:9:5 chr22 19444181 . G A 303.49 PASS AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0139432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.955;QD=22.0721;RBI=0.0164138;REFB=0.00224154;REVB=-0.00866011;RO=24;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455643;STB=0.525189;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00123539;OID=.;OPOS=19444181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:16:15:13:11:16:15:13:11 chr22 19458224 . C T 79.41 PASS AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00571252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=338.537;QD=15.8819;RBI=0.00855712;REFB=-0.00326845;REVB=0.00637115;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916023;STB=0.553088;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00348974;OID=.;OPOS=19458224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:6:4:3:7:6:4:3:7 chr22 19511925 . G A 30.99 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00126141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.362;QD=12.3961;RBI=0.00425686;REFB=-0.00288068;REVB=-0.00406568;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00100866;OID=.;OPOS=19511925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:3:2:3:2:3:2 chr22 19750773 . T C 249.31 PASS AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0018131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0478;QD=14.2465;RBI=0.00483021;REFB=-0.0115243;REVB=0.004477;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817751;STB=0.53458;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0140637;OID=.;OPOS=19750773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:41:29:29:0.414286:13:16:24:14:13:16:25:16 chr22 19751829 . C T 185.74 PASS AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0440151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1627;QD=12.3829;RBI=0.0518957;REFB=-0.0171906;REVB=0.0274924;RO=36;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146089;STB=0.59262;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.033142;OID=.;OPOS=19751829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:9:14:17:19:9:14:17:20 chr22 19766782 . C T 352.34 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.0223503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.373;QD=21.3541;RBI=0.0236123;REFB=-0.025694;REVB=-0.0076161;RO=30;SAF=18;SAR=18;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248427;STB=0.636293;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0207785;OID=.;OPOS=19766782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:18:18:24:6:18:18:24:6 chr22 19776159 . T TG 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00682654;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=321.547;QD=57.0008;RBI=0.0142502;REFB=0;REVB=0.0125087;RO=2;SAF=29;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031395;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=1.91383e-05;OID=.;OPOS=19776160;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:54:56:54:54:0:29:25:0:0:4:2:29:25:2:0 chr22 19789541 . A C 576.94 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00589928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.684;QD=60.7308;RBI=0.0488451;REFB=0;REVB=0.0484876;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015045;OID=.;OPOS=19789541;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:12:24:0:0:14:24:0:0 chr22 19868218 . A G 103.1 PASS AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0472939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9694;QD=9.59087;RBI=0.0504254;REFB=-0.00307746;REVB=0.0174933;RO=30;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156308;STB=0.595178;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00932212;OID=.;OPOS=19868218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:9:4:13:17:9:4:13:17 chr22 19898886 . C T 549.27 PASS AF=0.573034;AO=50;DP=88;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0133012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9391;QD=24.6864;RBI=0.0202146;REFB=-0.0127398;REVB=-0.0152219;RO=38;SAF=25;SAR=25;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504185;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.014338;OID=.;OPOS=19898886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:38:38:50:51:0.573034:25:25:19:19:25:26:19:19 chr22 19907099 . C A 786.93 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00243746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9157;QD=55.2233;RBI=0.031932;REFB=-0.125424;REVB=0.0318388;RO=1;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136677;STB=0.507244;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00232292;OID=.;OPOS=19907099;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:34:22:0:1:34:22:0:1 chr22 19907118 . G A 788.6 PASS AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267047;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.811;QD=57.3526;RBI=0.0385624;REFB=0;REVB=0.0278194;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352077;OID=.;OPOS=19907118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0 chr22 19920949 . G A 246.25 PASS AF=0.547619;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0173134;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.855;QD=23.4521;RBI=0.0191523;REFB=-0.014464;REVB=-0.00818875;RO=18;SAF=16;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024996;STB=0.506077;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0105654;OID=.;OPOS=19920949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:18:19:23:23:0.547619:7:16:13:5:7:16:13:6 chr22 19921003 . T C 358.13 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.114928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.775;QD=55.0976;RBI=0.117179;REFB=0;REVB=0.022859;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000549578;OID=.;OPOS=19921003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:10:15:0:0:11:15:0:0 chr22 19951207 . C G 514.07 PASS AF=0.676471;AO=46;DP=68;FAO=46;FDP=68;FR=.;FRO=22;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0284954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3957;QD=30.2394;RBI=0.040949;REFB=-0.0570164;REVB=0.0294081;RO=21;SAF=26;SAR=20;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242782;STB=0.521336;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0343172;OID=.;OPOS=19951207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:21:22:46:46:0.676471:20:26:11:10:20:26:11:11 chr22 19959473 . C T 265.31 PASS AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0190602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.804;QD=15.6065;RBI=0.0694049;REFB=-0.0181896;REVB=0.0667364;RO=37;SAF=11;SAR=19;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198802;STB=0.619485;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0266067;OID=.;OPOS=19959473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:38:30:30:0.441176:19:11:21:16:19:11:22:16 chr22 19959955 . A G 258.36 PASS AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0459507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.093;QD=13.9656;RBI=0.0503953;REFB=-0.0125961;REVB=-0.0206934;RO=44;SAF=16;SAR=14;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821363;STB=0.546731;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0205136;OID=.;OPOS=19959955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:14:16:20:24:14:16:20:24 chr22 19965047 . G A 145.72 PASS AF=0.652174;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0482291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.993;QD=25.3425;RBI=0.0498478;REFB=-0.0212406;REVB=-0.0125999;RO=7;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596536;STB=0.55484;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0156184;OID=.;OPOS=19965047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:22:23:7:8:15:15:0.652174:7:8:3:4:7:8:3:5 chr22 19969075 . A G 107.79 PASS AF=0.40625;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0120148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.057;QD=13.4743;RBI=0.0213399;REFB=-0.0145178;REVB=-0.0176362;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731013;STB=0.585233;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0275274;OID=.;OPOS=19969075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:12:19:12:13:0.40625:5:7:6:6:5:8:9:10 chr22 20136379 . C A 314.99 PASS AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00714219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4404;QD=19.9995;RBI=0.0326708;REFB=-0.0150307;REVB=0.0318806;RO=30;SAF=14;SAR=19;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941385;STB=0.552294;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0167354;OID=.;OPOS=20136379;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:19:14:16:14:19:14:16:14 chr22 20137723 . C T 132.7 PASS AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00453827;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.25;QD=15.1657;RBI=0.0334897;REFB=-0.00797497;REVB=0.0331808;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108301;STB=0.547465;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0138848;OID=.;OPOS=20137723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:8:7:11:8:8:7:11:9 chr22 20138105 . T C 167.9 PASS AF=0.4;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.00515579;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.769;QD=14.9243;RBI=0.00515733;REFB=-0.00835475;REVB=0.00012595;RO=27;SAF=13;SAR=5;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128875;STB=0.573695;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0140908;OID=.;OPOS=20138105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:27:27:18:18:0.4:5:13:22:5:5:13:22:5 chr22 20302797 . AC AA,A 89.47 PASS AF=0.030303,0.424242;AO=2,8;DP=31;FAO=1,14;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=0,12;FSAR=1,2;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=0.130286,0.113278;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=19.1249,14.9635;QD=10.8449;RBI=0.180202,0.154478;REFB=-0.0745694,-0.0777825;REVB=-0.124492,-0.105032;RO=17;SAF=0,8;SAR=2,0;SRF=15;SRR=2;SSEN=0,0.353952;SSEP=0,0;SSSB=-0.745913,0.695114;STB=0.996837,0.53841;STBP=0.06,0.839;TYPE=snp,del;VARB=0.0689918,0.089756;OID=.,.;OPOS=20302798,20302798;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.030303,0.424242:2,8:31:1,14:33:18:0,12:1,2:16:2:81:17:0,8:2,0:15:2 chr22 20458029 . A C 51.45 PASS AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0203334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.006;QD=5.717;RBI=0.0452244;REFB=-0.00133152;REVB=-0.0403955;RO=26;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593907;STB=0.543368;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00293393;OID=.;OPOS=20458029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:36:36:26:28:8:8:0.222222:3:5:15:11:3:5:16:12 chr22 20771144 . A T 990.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.575;QD=59.1425;RBI=0.0155825;REFB=0;REVB=0.0011564;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08327e-05;OID=.;OPOS=20771144;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0 chr22 20784050 . T A 210.71 PASS AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.014459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.053;QD=19.1557;RBI=0.0148203;REFB=-0.000216935;REVB=-0.00325258;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789497;STB=0.54462;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.000471746;OID=.;OPOS=20784050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:14:9:10:11:14:9 chr22 20800835 . A G 189.96 PASS AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0175025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.283;QD=15.1968;RBI=0.0193269;REFB=-0.0252988;REVB=-0.00819714;RO=29;SAF=14;SAR=6;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201677;STB=0.608582;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0511268;OID=.;OPOS=20800835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:29:30:20:20:0.4:6:14:15:14:6:14:16:14 chr22 20847472 . A T 117.22 PASS AF=0.290909;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0235649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.614;QD=8.52505;RBI=0.0304455;REFB=0.000570874;REVB=-0.0192776;RO=38;SAF=3;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328592;STB=0.712033;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00410221;OID=.;OPOS=20847472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:38:39:16:16:0.290909:13:3:16:22:13:3:17:22 chr22 20862646 . T G 239.03 PASS AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.014944;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.409;QD=16.2054;RBI=0.0154963;REFB=-0.0017798;REVB=-0.00410017;RO=32;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00676195;STB=0.503814;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00231844;OID=.;OPOS=20862646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:32:32:27:27:0.457627:12:15:18:14:12:15:18:14 chr22 20891497 . GC GCCCTA,G 225.72 PASS AF=0.366667,0.4;AO=11,11;DP=30;FAO=11,12;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=2,1;FSAR=9,11;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00778167,-0.0180487;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=4,1;MLLD=244.532,23.5846;QD=30.0963;RBI=0.0189144,0.132752;REFB=0.0100158,-0.0763559;REVB=0.0172395,0.13152;RO=8;SAF=2,1;SAR=9,10;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.458767,-0.602244;STB=0.782062,0.864442;STBP=0.011,0.001;TYPE=ins,del;VARB=0.000587558,0.118119;OID=.,.;OPOS=20891499,20891498;OREF=-,C;OALT=CCTA,-;OMAPALT=GCCCTA,G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.366667,0.4:11,11:30:11,12:30:7:2,1:9,11:6:1:98:8:2,1:9,10:6:2 chr22 20940085 . G A 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00815151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.646;QD=21.0138;RBI=0.0220108;REFB=-0.0249756;REVB=0.0204457;RO=7;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224559;STB=0.628965;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0290954;OID=.;OPOS=20940085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:8:3:4:3:8:3:4:3 chr22 21044848 . A T 95.18 PASS AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0398703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.988;QD=11.1978;RBI=0.0400106;REFB=-0.0141786;REVB=0.00334831;RO=22;SAF=4;SAR=8;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323268;STB=0.691994;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0198733;OID=.;OPOS=21044848;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:8:4:14:8:8:4:14:8 chr22 21066789 . A G 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0206523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.582;QD=17.3255;RBI=0.0271055;REFB=-0.0225555;REVB=-0.0175554;RO=24;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037267;STB=0.513076;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0299865;OID=.;OPOS=21066789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:14:6:8:16:14:6:8:17 chr22 21073011 . T C 602.48 PASS AF=0.476923;AO=62;DP=130;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=0.00647903;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.973;QD=18.5379;RBI=0.00654428;REFB=0.0079442;REVB=-0.000921825;RO=68;SAF=34;SAR=28;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665368;STB=0.53682;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.0098048;OID=.;OPOS=21073011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:68:68:62:62:0.476923:28:34:42:26:28:34:42:26 chr22 21079909 . A G 122.13 PASS AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.013465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.17;QD=25.7109;RBI=0.0237666;REFB=-0.017122;REVB=-0.0195842;RO=6;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729992;STB=0.540921;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0140087;OID=.;OPOS=21079909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:7:6:2:4:7:6:2:4 chr22 21141300 . T C 279.6 PASS AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00877548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.209;QD=21.1018;RBI=0.0152886;REFB=-0.0164431;REVB=0.0125193;RO=24;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373646;STB=0.502073;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0195664;OID=.;OPOS=21141300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:11:18:15:9:11:18:15:9 chr22 21167787 . G A 270.53 PASS AF=0.461538;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0328296;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.972;QD=16.6479;RBI=0.0374214;REFB=-0.01825;REVB=0.0179603;RO=35;SAF=12;SAR=18;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561898;STB=0.531624;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0150733;OID=.;OPOS=21167787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:35:35:30:30:0.461538:18:12:16:19:18:12:16:19 chr22 21213416 . A G 224.92 PASS AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=-0.0015741;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=342.069;QD=19.9928;RBI=0.0173397;REFB=-0.0130916;REVB=-0.0172681;RO=23;SAF=15;SAR=7;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216314;STB=0.620158;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0112435;OID=.;OPOS=21213416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:7:15:20:3:7:15:20:3 chr22 21301003 . CCT C,CC,CCC 243.54 PASS AF=0,0.3,0.7;AO=3,6,12;DP=21;FAO=0,6,14;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,4;FSAR=0,3,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412385,0.0570783,0.0684093;FXX=0;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=210.308,222.634,226.489;QD=48.7072;RBI=0.0426348,0.0572828,0.068415;REFB=0,0,0;REVB=0.0108218,0.00483654,0.000876475;RO=0;SAF=3,4,0;SAR=0,2,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0124702,0.00890262,0.0088954;OID=.,.,.;OPOS=21301004,21301005,21301005;OREF=CT,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.3,0.7:3,6,12:21:0,6,14:20:0:0,3,4:0,3,10:0:0:12:0:3,4,0:0,2,12:0:0 chr22 21304408 . A G 718.48 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0242669;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.259;QD=61.1476;RBI=0.0449836;REFB=-0.0566645;REVB=0.0378767;RO=1;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191868;STB=0.5102;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00065821;OID=.;OPOS=21304408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:47:1:1:46:46:0.978723:24:22:0:1:24:22:0:1 chr22 21306743 . A G 591.62 PASS AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0088322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2503;QD=56.3449;RBI=0.0593987;REFB=-0.0984688;REVB=0.0587383;RO=2;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585022;STB=0.531234;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0045651;OID=.;OPOS=21306743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:15:25:0:2:15:25:0:2 chr22 21307712 . AAAC A 301.22 PASS AF=0.837838;AO=19;DP=36;FAO=31;FDP=37;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0279635;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=161.228;QD=32.5647;RBI=0.0440766;REFB=-0.0307008;REVB=0.0340703;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.325513;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.525312;STBP=0.527;TYPE=del;VARB=0.011649;OID=.;OPOS=21307713;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.837838:19:36:31:37:6:20:11:3:3:22:0:12:7:0:0 chr22 21327589 . C T 238.42 PASS AF=0.45;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.000437801;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.059;QD=15.895;RBI=0.0310252;REFB=-0.0179265;REVB=-0.0310221;RO=32;SAF=7;SAR=20;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133378;STB=0.569661;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0326465;OID=.;OPOS=21327589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:32:33:27:27:0.45:20:7:12:20:20:7:12:21 chr22 21331043 . A T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.954;QD=44.6897;RBI=0.0381099;REFB=0;REVB=0.0115639;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461895;OID=.;OPOS=21331043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0 chr22 21335259 . C A 217.82 PASS AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00793193;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.918;QD=16.7551;RBI=0.0159464;REFB=-0.0229155;REVB=-0.0138337;RO=27;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121745;STB=0.57686;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0227459;OID=.;OPOS=21335259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:12:12:17:10:12:12:18:10 chr22 21335606 . C T 537.89 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.691;QD=59.766;RBI=0.0858957;REFB=0;REVB=-0.015771;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000635056;OID=.;OPOS=21335606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:24:11:0:0:24:12:0:0 chr22 21335611 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.395;QD=60.6103;RBI=0.0128797;REFB=0;REVB=0.0119028;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27304e-05;OID=.;OPOS=21335611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0 chr22 21337325 . G A 177.7 PASS AF=0.395833;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0458007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.716;QD=14.8084;RBI=0.0476318;REFB=-0.0284673;REVB=-0.0130799;RO=29;SAF=14;SAR=4;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287846;STB=0.527127;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0643084;OID=.;OPOS=21337325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:29:29:18:19:0.395833:4:14:22:7:4:15:22:7 chr22 21348914 . C T 117.19 PASS AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00546985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.435;QD=12.0197;RBI=0.0220584;REFB=-0.0178398;REVB=-0.0213695;RO=25;SAF=4;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306053;STB=0.681551;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0286485;OID=.;OPOS=21348914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:10:4:14:11:10:4:14:11 chr22 21354970 . C G 1033.85 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.384;QD=59.0773;RBI=0.0399242;REFB=0;REVB=0.0394947;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65245e-05;OID=.;OPOS=21354970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:70:0:0:66:70:1:24:42:0:0:25:45:0:0 chr22 21356824 . G A 505.53 PASS AF=0.49;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00453704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.566;QD=20.2213;RBI=0.0146712;REFB=-0.0284887;REVB=0.013952;RO=50;SAF=25;SAR=24;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275206;STB=0.520188;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0253684;OID=.;OPOS=21356824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:50:51:49:49:0.49:24:25:24:26:24:25:24:27 chr22 21356892 . AAGAC A 252.45 PASS AF=0.475;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0109618;FXX=0.0476134;HRUN=3;LEN=4;MLLD=273.735;QD=12.6226;RBI=0.014093;REFB=-0.0170942;REVB=-0.0088572;RO=43;SAF=17;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391777;STB=0.515244;STBP=0.799;TYPE=del;VARB=0.0187247;OID=.;OPOS=21356893;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.475:38:84:38:80:42:17:21:20:22:99:43:17:21:21:22 chr22 21356925 . T A 205.62 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0656921;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.1924;QD=12.8511;RBI=0.0750823;REFB=0.00973464;REVB=0.0363578;RO=35;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245361;STB=0.668173;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0180887;OID=.;OPOS=21356925;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:39:25:25:0.390625:9:16:14:21:9:16:14:25 chr22 21370237 . T G 606.14 PASS AF=0.561224;AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00025958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6248;QD=24.7404;RBI=0.0667862;REFB=-0.0121886;REVB=-0.0667857;RO=43;SAF=30;SAR=25;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124782;STB=0.568158;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0129143;OID=.;OPOS=21370237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:43:43:55:55:0.561224:25:30:30:13:25:30:30:13 chr22 21384578 . C T 68.18 PASS AF=0.642857;AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.078834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1787;QD=19.479;RBI=0.0796831;REFB=-0.00224255;REVB=-0.011601;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453777;STB=0.555438;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0169693;OID=.;OPOS=21384578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:14:5:5:8:9:0.642857:6:2:1:4:6:3:1:4 chr22 21570296 . A G 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.215;QD=39.2068;RBI=0.0135705;REFB=0;REVB=-0.00783215;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81997e-05;OID=.;OPOS=21570296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0 chr22 21797094 . C G 112.61 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795607;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=27.263;QD=40.9481;RBI=0.0986445;REFB=0;REVB=0.0583167;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00867319;OID=.;OPOS=21797094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chr22 21800444 . T C 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.263;QD=64.1535;RBI=0.0375307;REFB=0;REVB=0.0179595;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208187;OID=.;OPOS=21800444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0 chr22 21801588 . T A 785.21 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.155;QD=57.1061;RBI=0.0286564;REFB=0;REVB=0.0231344;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91562e-05;OID=.;OPOS=21801588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0 chr22 21822725 . T C 728.84 PASS AF=0.981481;AO=51;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00493122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5372;QD=53.9882;RBI=0.0176797;REFB=-0.0662103;REVB=-0.0169781;RO=1;SAF=7;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626057;STB=0.5294;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00141718;OID=.;OPOS=21822725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:54:1:1:51:53:0.981481:44:7:1:0:45:8:1:0 chr22 21841121 . TTCTTA T 50.0 PASS AO=30;DP=53;LEN=5;RO=23;SAF=21;SAR=18;SRF=8;SRR=6;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=21841122;OREF=TCTTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:53:23:30:18:21:8:6 chr22 21982892 . C T 45.55 PASS AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0485418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.919;QD=26.0259;RBI=0.0546031;REFB=-0.0367916;REVB=0.025004;RO=1;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171372;STB=0.599655;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0060522;OID=.;OPOS=21982892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:2:4:0:1:2:4:0:1 chr22 21984205 . A G 414.1 PASS AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0161707;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2018;QD=18.8229;RBI=0.0396711;REFB=-0.0188734;REVB=-0.0362257;RO=44;SAF=22;SAR=20;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428096;STB=0.535118;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0206189;OID=.;OPOS=21984205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:44:46:42:42:0.477273:20:22:21:23:20:22:21:25 chr22 22516998 . C T 419.42 PASS AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00780818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.181;QD=20.213;RBI=0.0132601;REFB=-0.0109698;REVB=-0.0107174;RO=40;SAF=16;SAR=26;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172713;STB=0.601803;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0117812;OID=.;OPOS=22516998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:41:42:42:0.506024:26:16:23:17:26:16:24:17 chr22 22517026 . T C 1048.09 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00141393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.014;QD=58.227;RBI=0.00186924;REFB=0.039108;REVB=-0.00122265;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.506665;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=2.58296e-07;OID=.;OPOS=22517026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:37:34:0:0:37:34:0:1 chr22 22550401 . C G 220.93 PASS AF=0.4375;AO=18;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0587416;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.752;QD=18.4105;RBI=0.059321;REFB=-0.0370926;REVB=-0.00827036;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478406;STB=0.745524;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0420637;OID=.;OPOS=22550401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:21:25:18:21:0.4375:5:13:4:17:5:16:8:17 chr22 22550450 . C G 458.76 PASS AF=0.564103;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0686706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.5055;QD=23.526;RBI=0.0692874;REFB=-0.00189058;REVB=-0.00922396;RO=34;SAF=14;SAR=30;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155373;STB=0.585602;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.000722948;OID=.;OPOS=22550450;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:44:44:0.564103:30:14:17:17:30:14:17:17 chr22 22550510 . T G 1442.06 PASS AF=0.943925;AO=100;DP=111;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0160421;FXX=0.0446389;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.736;QD=53.9086;RBI=0.0179238;REFB=0.00170467;REVB=0.00799454;RO=6;SAF=38;SAR=62;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02442;STB=0.513055;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-1.50133e-05;OID=.;OPOS=22550510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:111:107:6:6:100:101:0.943925:62:38:1:5:62:39:1:5 chr22 22569448 . T A 281.58 PASS AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0349931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5349;QD=17.0652;RBI=0.0675736;REFB=-0.0297027;REVB=-0.0578073;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826029;STB=0.546312;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0316819;OID=.;OPOS=22569448;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:16:15:20:15:16:15:20:15 chr22 22569554 . C A 109.92 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0112217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.5;QD=14.6562;RBI=0.0443555;REFB=-0.0189091;REVB=0.0429125;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21212;STB=0.624792;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0438639;OID=.;OPOS=22569554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:3:10:10:7:3:10:10:7 chr22 22569640 . T G 30.5 PASS AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0148566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4472;QD=11.0922;RBI=0.0321989;REFB=-0.0555178;REVB=0.0285666;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158244;STB=0.599562;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0729112;OID=.;OPOS=22569640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:4:2:1:4:4:2 chr22 22599380 . G A 272.29 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0420976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.952;QD=17.2885;RBI=0.0484004;REFB=-0.0322994;REVB=0.0238829;RO=33;SAF=10;SAR=20;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919343;STB=0.551689;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0296339;OID=.;OPOS=22599380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:20:10:14:19:20:10:14:19 chr22 22681721 . T C 260.53 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0754249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7759;QD=24.8124;RBI=0.107765;REFB=-0.0488508;REVB=-0.0769697;RO=18;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749028;STB=0.541632;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0311012;OID=.;OPOS=22681721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:11:13:8:10:11:13:8:10 chr22 22681765 . G A 236.58 PASS AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0405893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.039;QD=26.2863;RBI=0.0407586;REFB=-0.0229763;REVB=-0.0037118;RO=14;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10021;STB=0.555506;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0254476;OID=.;OPOS=22681765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:11:11:5:9:11:11:5:9 chr22 22698027 . A G 834.38 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5884;QD=57.5436;RBI=0.0334015;REFB=0;REVB=-0.0213699;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.77456e-05;OID=.;OPOS=22698027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0 chr22 22707275 . C A 156.59 PASS AF=0.275;AO=22;DP=80;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.00700535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.037;QD=7.82935;RBI=0.0155519;REFB=-0.00770698;REVB=-0.0138847;RO=58;SAF=8;SAR=14;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106113;STB=0.563922;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0159937;OID=.;OPOS=22707275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:58:58:22:22:0.275:14:8:26:32:14:8:26:32 chr22 22707299 . A C 118.96 PASS AF=0.246575;AO=18;DP=73;FAO=18;FDP=73;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0527215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2545;QD=6.5182;RBI=0.0813999;REFB=-0.00397383;REVB=-0.0620193;RO=54;SAF=6;SAR=12;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973517;STB=0.554393;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0133609;OID=.;OPOS=22707299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:54:55:18:18:0.246575:12:6:22:32:12:6:22:33 chr22 22707309 . C T 119.55 PASS AF=0.25;AO=17;DP=72;FAO=18;FDP=72;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0467319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0272;QD=6.64162;RBI=0.0723176;REFB=-0.0165543;REVB=0.0551902;RO=54;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129866;STB=0.545403;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0327268;OID=.;OPOS=22707309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:54:54:17:18:0.25:12:5:21:33:12:6:21:33 chr22 22707473 . C G 348.86 PASS AF=0.612245;AO=29;DP=48;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0805059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0301;QD=28.4783;RBI=0.0936437;REFB=-0.0234098;REVB=0.0478324;RO=19;SAF=18;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2189;STB=0.609683;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0191685;OID=.;OPOS=22707473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:19:19:29:30:0.612245:11:18:6:13:12:18:6:13 chr22 22707555 . A G 140.11 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0474349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.698;QD=12.7371;RBI=0.0781444;REFB=-0.00782809;REVB=0.0621005;RO=28;SAF=3;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419999;STB=0.749659;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0171497;OID=.;OPOS=22707555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:13:3:15:13:13:3:15:13 chr22 22707557 . C G 140.59 PASS AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0411828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0196;QD=12.7805;RBI=0.0468952;REFB=-0.0687964;REVB=0.0224307;RO=28;SAF=3;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419999;STB=0.749659;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0564039;OID=.;OPOS=22707557;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:13:3:15:13:13:3:15:13 chr22 22707576 . T A 104.82 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0168537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.284;QD=10.7512;RBI=0.0372401;REFB=-0.00458699;REVB=-0.0332081;RO=26;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510449;STB=0.80901;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.034378;OID=.;OPOS=22707576;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:11:2:15:11:11:2:15:11 chr22 22707597 . A G 85.07 PASS AF=0.333333;AO=10;DP=34;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0234631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.737;QD=9.45208;RBI=0.0234651;REFB=-0.00465458;REVB=0.000306974;RO=24;SAF=1;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.57491;STB=0.705523;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0177666;OID=.;OPOS=22707597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:34:36:24:24:10:12:0.333333:9:1:13:11:9:3:13:11 chr22 22707601 . C T 61.74 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0254641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.7284;QD=7.26401;RBI=0.0359447;REFB=-0.0296389;REVB=-0.0253692;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221667;STB=0.639684;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0147685;OID=.;OPOS=22707601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:6:3:13:12:6:3:13:12 chr22 22707608 . C A 61.81 PASS AF=0.264706;AO=7;DP=33;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0337242;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.834;QD=7.27199;RBI=0.0345974;REFB=0.00336652;REVB=0.00772372;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443974;STB=0.611989;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00960422;OID=.;OPOS=22707608;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:33:34:21:25:7:9:0.264706:6:1:10:11:6:3:12:13 chr22 22707621 . G A 42.14 PASS AF=0.189189;AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0306265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.095;QD=4.55555;RBI=0.0306525;REFB=-0.03016;REVB=0.0012628;RO=30;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461395;STB=0.53116;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0493251;OID=.;OPOS=22707621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:37:37:30:30:7:7:0.189189:4:3:14:16:4:3:14:16 chr22 22712467 . T G 462.36 PASS AF=0.578947;AO=44;DP=76;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=0.0346606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3311;QD=24.3345;RBI=0.034672;REFB=0.0162599;REVB=0.00088873;RO=32;SAF=32;SAR=12;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863878;STB=0.547149;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.00972051;OID=.;OPOS=22712467;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:32:32:44:44:0.578947:12:32:26:6:12:32:26:6 chr22 22724394 . T C 654.26 PASS AF=0.436364;AO=72;DP=166;FAO=72;FDP=165;FR=.;FRO=93;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=-0.0208045;FXX=0.0119753;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.833;QD=15.8608;RBI=0.021107;REFB=-0.00495336;REVB=-0.00356063;RO=91;SAF=43;SAR=29;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158503;STB=0.588419;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00909289;OID=.;OPOS=22724394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:91:93:72:72:0.436364:29:43:40:51:29:43:41:52 chr22 22730634 . G A 437.9 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.0367337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9952;QD=21.6246;RBI=0.0381354;REFB=-1.20403e-05;REVB=-0.0102443;RO=38;SAF=25;SAR=18;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222965;STB=0.622821;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.000331586;OID=.;OPOS=22730634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:18:25:12:26:18:25:12:26 chr22 22842206 . T C 851.25 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.203;QD=57.7119;RBI=0.0368881;REFB=0;REVB=0.0148355;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212594;OID=.;OPOS=22842206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0 chr22 22842957 . T G 1442.47 PASS AF=0.978947;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00672386;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.244;QD=60.7356;RBI=0.00723815;REFB=-0.155851;REVB=-0.00267964;RO=1;SAF=33;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00796808;STB=0.50333;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.000559898;OID=.;OPOS=22842957;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:94:95:1:2:92:93:0.978947:59:33:0:1:60:33:1:1 chr22 22843118 . C T 632.22 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.425;QD=61.6801;RBI=0.0283191;REFB=0;REVB=-0.0277429;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.68013e-05;OID=.;OPOS=22843118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:23:18:0:0 chr22 22868493 . G T 503.33 PASS AF=0.382166;AO=59;DP=156;FAO=60;FDP=157;FR=.;FRO=97;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=-0.00552017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.009;QD=12.8237;RBI=0.00698967;REFB=-0.00124061;REVB=0.00428756;RO=97;SAF=29;SAR=30;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827402;STB=0.541388;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00436416;OID=.;OPOS=22868493;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:97:97:59:60:0.382166:30:29:55:42:30:30:55:42 chr22 22868497 . G C 529.58 PASS AF=0.394904;AO=61;DP=157;FAO=62;FDP=157;FR=.;FRO=95;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=41;FWDB=-0.0107056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.999;QD=13.4926;RBI=0.0163894;REFB=-0.00240076;REVB=-0.0124098;RO=94;SAF=32;SAR=29;SRF=53;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423839;STB=0.531729;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0035322;OID=.;OPOS=22868497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:94:95:61:62:0.394904:29:32:53:41:30:32:54:41 chr22 22868773 . G A 178.7 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00540419;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.428;QD=14.5879;RBI=0.0195042;REFB=-0.0247;REVB=-0.0187406;RO=30;SAF=9;SAR=10;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980003;STB=0.556686;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0367819;OID=.;OPOS=22868773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:30:30:19:19:0.387755:10:9:17:13:10:9:17:13 chr22 22868776 . G A 165.72 PASS AF=0.375;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0254745;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.5394;QD=13.8104;RBI=0.0656686;REFB=0.00400994;REVB=0.0605262;RO=30;SAF=8;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165687;STB=0.596225;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.00588461;OID=.;OPOS=22868776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:30:30:18:18:0.375:10:8:18:12:10:8:18:12 chr22 22869123 . T C 648.81 PASS AF=0.403315;AO=73;DP=181;FAO=73;FDP=181;FR=.;FRO=108;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=67;FSRR=41;FWDB=0.0262095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6124;QD=14.3382;RBI=0.0263594;REFB=-0.0172188;REVB=-0.00280764;RO=108;SAF=44;SAR=29;SRF=67;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019645;STB=0.51103;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0262289;OID=.;OPOS=22869123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:108:108:73:73:0.403315:29:44:67:41:29:44:67:41 chr22 22869209 . C G 563.22 PASS AF=0.434783;AO=60;DP=140;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=0.0559589;FXX=0.0142847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7717;QD=16.3253;RBI=0.0960149;REFB=-0.0134789;REVB=-0.0780222;RO=79;SAF=32;SAR=28;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112052;STB=0.502912;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0165626;OID=.;OPOS=22869209;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:79:78:60:60:0.434783:28:32:43:36:28:32:42:36 chr22 22869218 . T C 532.34 PASS AF=0.452381;AO=57;DP=126;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=0.0571469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3986;QD=16.8997;RBI=0.0571509;REFB=-0.0209284;REVB=0.000680687;RO=69;SAF=27;SAR=30;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977571;STB=0.505447;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0283962;OID=.;OPOS=22869218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:69:69:57:57:0.452381:30:27:32:37:30:27:32:37 chr22 22869538 . A G 257.76 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=0.0149065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.119;QD=23.4328;RBI=0.015984;REFB=-0.00155618;REVB=-0.00576948;RO=20;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408901;STB=0.725637;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00156815;OID=.;OPOS=22869538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:15:9:18:2:15:9:18:2 chr22 22869545 . T G 222.86 PASS AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=2;FWDB=0.00831182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.321;QD=18.9665;RBI=0.00955389;REFB=0.00967823;REVB=0.00471068;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490475;STB=0.772037;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00929615;OID=.;OPOS=22869545;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:23:2:14:8:23:2 chr22 22869548 . T C 207.85 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=3;FWDB=-0.0136833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.627;QD=17.6895;RBI=0.0182907;REFB=0.00302628;REVB=-0.0121374;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=23;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463833;STB=0.758739;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00400358;OID=.;OPOS=22869548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:13:8:23:3:13:8:23:3 chr22 22869649 . G C 104.35 PASS AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0349164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4633;QD=10.435;RBI=0.0390262;REFB=0.00788884;REVB=-0.0174324;RO=27;SAF=7;SAR=6;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28395;STB=0.666444;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.0184929;OID=.;OPOS=22869649;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:6:7:21:6:6:7:21:6 chr22 22869742 . C A 356.25 PASS AF=0.625;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.000737052;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.629;QD=29.6873;RBI=0.0132793;REFB=-0.0130371;REVB=0.0132588;RO=18;SAF=14;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135853;STB=0.574537;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00745295;OID=.;OPOS=22869742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:18:18:30:30:0.625:16:14:12:6:16:14:12:6 chr22 22899234 . A G 920.09 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.933;QD=58.4183;RBI=0.0155895;REFB=0;REVB=-0.0016598;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51787e-05;OID=.;OPOS=22899234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0 chr22 22986764 . G C 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.21;QD=35.5759;RBI=0.0477059;REFB=0;REVB=0.0364492;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166058;OID=.;OPOS=22986764;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr22 22989256 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.158;QD=35.5759;RBI=0.0178106;REFB=0;REVB=-0.00412368;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209498;OID=.;OPOS=22989256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr22 22989270 . G A 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000398594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.283;QD=37.488;RBI=0.00464741;REFB=0;REVB=-0.00463028;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.32981e-05;OID=.;OPOS=22989270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr22 22989281 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.193;QD=37.4884;RBI=0.0714665;REFB=0;REVB=0.0704811;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00244056;OID=.;OPOS=22989281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chr22 23029263 . T C 489.32 PASS AF=0.490566;AO=52;DP=104;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.104891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.391;QD=18.4649;RBI=0.12979;REFB=-0.0139585;REVB=-0.0764406;RO=52;SAF=22;SAR=30;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501485;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.01138;OID=.;OPOS=23029263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:52:54:52:52:0.490566:30:22:22:30:30:22:23:31 chr22 23029698 . T C 785.85 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.544;QD=64.1509;RBI=0.028563;REFB=0;REVB=0.0263019;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14978e-05;OID=.;OPOS=23029698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0 chr22 23040462 . T C 341.77 PASS AF=0.586207;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00740699;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.575;QD=23.5701;RBI=0.0135895;REFB=-0.0302309;REVB=0.0113934;RO=25;SAF=20;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04144;STB=0.533879;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0200342;OID=.;OPOS=23040462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:25:24:34:34:0.586207:14:20:16:9:14:20:16:8 chr22 23040767 . G T 723.73 PASS AF=0.530303;AO=70;DP=133;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=-0.0295417;FXX=0.00751823;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.497;QD=21.9313;RBI=0.0371947;REFB=-0.00916099;REVB=0.0225993;RO=62;SAF=27;SAR=43;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234446;STB=0.62851;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0074821;OID=.;OPOS=23040767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:62:62:70:70:0.530303:43:27:41:21:43:27:41:21 chr22 23047069 . C A 151.97 PASS AF=0.377778;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.00826103;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.608;QD=13.5086;RBI=0.0088708;REFB=-0.0291882;REVB=-0.00323211;RO=29;SAF=9;SAR=7;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271915;STB=0.657961;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0514712;OID=.;OPOS=23047069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:29:28:16:17:0.377778:7:9:23:6:7:10:23:5 chr22 23047104 . G A 177.75 PASS AF=0.359375;AO=22;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.106914;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.667;QD=11.1096;RBI=0.110443;REFB=-0.00103831;REVB=0.0276981;RO=39;SAF=10;SAR=12;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17566;STB=0.599107;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00337693;OID=.;OPOS=23047104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:39:41:22:23:0.359375:12:10:24:15:12:11:26:15 chr22 23047144 . C T 238.76 PASS AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00961766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.377;QD=14.0449;RBI=0.0268327;REFB=-0.0217383;REVB=0.0250498;RO=40;SAF=15;SAR=13;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883697;STB=0.550279;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00889982;OID=.;OPOS=23047144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:13:15:18:22:13:15:18:22 chr22 23047146 . CCT TAC 224.71 PASS AF=0.385714;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0245878;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=3;MLLD=260.194;QD=12.8407;RBI=0.0345648;REFB=-0.0122577;REVB=-0.0242933;RO=41;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058021;STB=0.546956;STBP=0.552;TYPE=mnp;VARB=0.033344;OID=.;OPOS=23047146;OREF=CCT;OALT=TAC;OMAPALT=TAC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:41:43:27:27:0.385714:13:14:19:22:13:14:19:24 chr22 23047290 . G A 264.59 PASS AF=0.329897;AO=32;DP=97;FAO=32;FDP=97;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0127064;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.1497;QD=10.9109;RBI=0.047379;REFB=0.00513776;REVB=0.0456434;RO=65;SAF=24;SAR=8;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253897;STB=0.649023;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.00981802;OID=.;OPOS=23047290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:65:65:32:32:0.329897:8:24:36:29:8:24:36:29 chr22 23054916 . G T 409.72 PASS AF=0.6875;AO=33;DP=48;FAO=33;FDP=48;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0099395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.837;QD=34.1431;RBI=0.0134727;REFB=-0.0160762;REVB=0.00909502;RO=15;SAF=21;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625481;STB=0.534116;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00453316;OID=.;OPOS=23054916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:15:15:33:33:0.6875:12:21:8:7:12:21:8:7 chr22 23055421 . G A 255.17 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0296125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.322;QD=22.1888;RBI=0.031043;REFB=-0.0238871;REVB=0.009315;RO=22;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307566;STB=0.517227;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0244014;OID=.;OPOS=23055421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:15:9:9:13:15:9:9:13 chr22 23055440 . C A 740.77 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.888;QD=56.9826;RBI=0.0601538;REFB=0;REVB=0.00057389;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128463;OID=.;OPOS=23055440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:52:0:0:50:52:1:29:21:0:0:29:23:0:0 chr22 23055533 . G A 456.14 PASS AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00129451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.123;QD=20.2728;RBI=0.00774424;REFB=-0.00272761;REVB=0.00763528;RO=44;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500668;STB=0.522245;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00269698;OID=.;OPOS=23055533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:45:45:45:0.5:21:24:21:23:21:24:22:23 chr22 23055539 . G T 524.69 PASS AF=0.510204;AO=49;DP=96;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.025034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5941;QD=21.4161;RBI=0.0307917;REFB=-0.00336187;REVB=0.0179284;RO=47;SAF=28;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355095;STB=0.519143;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0028501;OID=.;OPOS=23055539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:47:48:49:50:0.510204:21:28:25:22:21:29:26:22 chr22 23055691 . G A 347.54 PASS AF=0.45679;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0510325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.056;QD=17.1626;RBI=0.0511651;REFB=-0.0159035;REVB=0.0036815;RO=44;SAF=18;SAR=18;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667995;STB=0.52975;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.022927;OID=.;OPOS=23055691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:44:36:37:0.45679:18:18:25:19:18:19:25:19 chr22 23063178 . C T 298.73 PASS AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0646131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7947;QD=18.6705;RBI=0.0818888;REFB=-0.0229222;REVB=0.0503083;RO=31;SAF=15;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043943;STB=0.515707;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0259323;OID=.;OPOS=23063178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:32:32:32:0.5:17:15:13:18:17:15:14:18 chr22 23077555 . T C 893.21 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105636;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.741;QD=56.7115;RBI=0.0529899;REFB=0.00776935;REVB=0.0519263;RO=1;SAF=28;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165629;STB=0.508769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=9.37234e-05;OID=.;OPOS=23077555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:63:1:1:62:62:0.984127:34:28:1:0:34:28:1:0 chr22 23089941 . ACT A 70.08 PASS AF=0.322581;AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00936584;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=205.643;QD=9.04217;RBI=0.0178374;REFB=-0.018284;REVB=-0.0151807;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191462;STB=0.612689;STBP=0.41;TYPE=del;VARB=0.0503578;OID=.;OPOS=23089942;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.322581:9:29:10:31:21:5:5:7:14:70:18:4:5:5:13 chr22 23090399 . G C 164.05 PASS AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0115482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.41;QD=29.827;RBI=0.0142724;REFB=-0.0341554;REVB=0.00838684;RO=6;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310499;STB=0.51722;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0153735;OID=.;OPOS=23090399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:9:7:3:3:9:7:3:3 chr22 23101216 . A G 358.53 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.437;QD=55.1591;RBI=0.0279831;REFB=0;REVB=0.0231667;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42211e-05;OID=.;OPOS=23101216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:10:16:0:0 chr22 23101221 . A G 325.69 PASS AF=1;AO=21;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.242;QD=52.11;RBI=0.0506956;REFB=0;REVB=0.00925877;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155881;OID=.;OPOS=23101221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:25:0:0:21:25:1:9:12:0:0:9:16:0:0 chr22 23101247 . GC AT 73.06 PASS AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.011089;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.985;QD=9.13236;RBI=0.0193094;REFB=-0.00889959;REVB=-0.0158078;RO=22;SAF=9;SAR=1;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512177;STB=0.824218;STBP=0.038;TYPE=mnp;VARB=0.0100972;OID=.;OPOS=23101247;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:1:9:12:10:1:9:12:10 chr22 23101280 . C T 617.19 PASS AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146294;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.265;QD=61.7189;RBI=0.0403608;REFB=0;REVB=0.0376161;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165122;OID=.;OPOS=23101280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0 chr22 23101301 . A G 755.46 PASS AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.767;QD=62.9553;RBI=0.0419985;REFB=0;REVB=0.0350787;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10028e-05;OID=.;OPOS=23101301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:21:26:0:0:21:27:0:0 chr22 23101559 . G T 1898.98 PASS AF=0.992;AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.404;QD=60.7674;RBI=0.0221466;REFB=0.146031;REVB=-0.0104039;RO=1;SAF=59;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736582;STB=0.503816;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=2.08223e-05;OID=.;OPOS=23101559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:125:1:1:123:124:0.992:64:59:0:1:65:59:0:1 chr22 23101568 . T G 499.55 PASS AF=0.457627;AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0150906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.476;QD=16.9338;RBI=0.0173742;REFB=0.00133225;REVB=-0.00861023;RO=64;SAF=29;SAR=25;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815897;STB=0.545438;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.00177564;OID=.;OPOS=23101568;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:64:64:54:54:0.457627:25:29:29:35:25:29:29:35 chr22 23101698 . C T 258.1 PASS AF=0.533333;AO=21;DP=42;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0671883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.706;QD=22.9421;RBI=0.0671893;REFB=-0.0498338;REVB=-0.000369345;RO=21;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134711;STB=0.595793;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0464832;OID=.;OPOS=23101698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:45:21:21:21:24:0.533333:7:14:11:10:7:17:11:10 chr22 23114327 . T C 594.54 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.474;QD=60.9782;RBI=0.0394877;REFB=0;REVB=-0.0131116;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014357;OID=.;OPOS=23114327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0 chr22 23114350 . A G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7775;QD=57.2023;RBI=0.10242;REFB=0;REVB=-0.0122457;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113733;OID=.;OPOS=23114350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:22:8:0:0:22:8:0:0 chr22 23114993 . G A 655.58 PASS AF=0.52;AO=65;DP=126;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.00386756;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.419;QD=20.9785;RBI=0.0057767;REFB=-0.00667304;REVB=0.00429096;RO=58;SAF=30;SAR=35;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07738;STB=0.550353;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00699991;OID=.;OPOS=23114993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:58:60:65:65:0.52:35:30:32:26:35:30:34:26 chr22 23241705 . G A 230.8 PASS AF=0.833333;AO=19;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0800089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.87;QD=38.4673;RBI=0.0870351;REFB=-0.0356809;REVB=0.034259;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.576849;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0117652;OID=.;OPOS=23241705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:24:24:0:4:19:20:0.833333:8:11:0:0:9:11:4:0 chr22 23241753 . T TA 298.48 PASS AF=1;AO=16;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250479;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=134.017;QD=47.7564;RBI=0.0300245;REFB=0;REVB=0.0165552;RO=5;SAF=10;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184814;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000654449;OID=.;OPOS=23241754;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:16:23:25:25:0:12:13:0:0:3:5:10:6:1:4 chr22 23247082 . C G 1473.1 PASS AF=0.628571;AO=132;DP=209;FAO=132;FDP=210;FR=.;FRO=78;FSAF=82;FSAR=50;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=-0.0343359;FXX=0.00473911;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.1429;QD=28.059;RBI=0.0435041;REFB=-0.00474848;REVB=0.0267143;RO=77;SAF=82;SAR=50;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110355;STB=0.502763;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00283034;OID=.;OPOS=23247082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:210:77:78:132:132:0.628571:50:82:49:28:50:82:49:29 chr22 23248758 . G A 107.54 PASS AF=0.631579;AO=11;DP=18;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0474306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.335;QD=22.6407;RBI=0.0487841;REFB=-0.0396588;REVB=0.0114117;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.608516;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.02907;OID=.;OPOS=23248758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:19:7:7:11:12:0.631579:5:6:2:5:5:7:2:5 chr22 23256464 . G C 2124.54 PASS AF=1;AO=133;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340897;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6308;QD=62.9493;RBI=0.0427706;REFB=0;REVB=-0.0258306;RO=1;SAF=61;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772858;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86989e-05;OID=.;OPOS=23256464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:136:135:1:0:133:135:1:72:61:1:0:72:63:0:0 chr22 23263602 . C T 1994.28 PASS AF=1;AO=84;DP=145;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176033;FXX=0.0067563;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.315;QD=54.266;RBI=0.0931343;REFB=0;REVB=0.0914556;RO=0;SAF=54;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0051157;OID=.;OPOS=23263602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:145:147:0:0:84:147:1:30:54:0:0:92:55:0:0 chr22 23503170 . A G 508.38 PASS AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0376238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.058;QD=56.4865;RBI=0.0546752;REFB=0.0852983;REVB=-0.0396715;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217573;STB=0.511621;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.00579193;OID=.;OPOS=23503170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:21:14:0:1:21:14:0:1 chr22 23503205 . G C 517.88 PASS AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0459084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.231;QD=54.514;RBI=0.0512103;REFB=-0.0879492;REVB=0.0226918;RO=2;SAF=15;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841969;STB=0.504502;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.000911229;OID=.;OPOS=23503205;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:21:15:1:1:21:15:1:1 chr22 23503755 . G GA 149.17 PASS AF=1;AO=2;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171134;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=181.166;QD=39.7789;RBI=0.193011;REFB=0;REVB=-0.089256;RO=12;SAF=2;SAR=0;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.671794;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00173631;OID=.;OPOS=23503756;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:2:15:15:15:0:6:9:0:0:4:12:2:0:3:9 chr22 23503756 . G A,C 148.18 PASS AF=0.8,0.133333;AO=12,2;DP=15;FAO=12,2;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=3,2;FSAR=9,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0797571,0.0822912;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=219.891,58.9462;QD=39.5134;RBI=0.0798362,0.0823523;REFB=-0.0650749,-0.0618339;REVB=-0.00355315,-0.00317156;RO=0;SAF=3,2;SAR=9,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.571302,0.5;STBP=0.165,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00280583,0.0217217;OID=.,.;OPOS=23503756,23503756;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:15:15:0:1:12,2:12,2:0.8,0.133333:9,0:3,2:0:0:9,0:3,2:1:0 chr22 23504862 . C T 427.74 PASS AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0487093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.032;QD=51.8475;RBI=0.0768202;REFB=-0.105383;REVB=0.0594033;RO=1;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217036;STB=0.512187;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00067994;OID=.;OPOS=23504862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:33:33:1:2:31:31:0.939394:21:10:0:1:21:10:1:1 chr22 23504916 . G A 837.29 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00389359;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.963;QD=57.7442;RBI=0.00726253;REFB=0;REVB=-0.00613061;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.54124e-05;OID=.;OPOS=23504916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0 chr22 23504959 . C T 825.82 PASS AF=0.967213;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0272205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.766;QD=54.152;RBI=0.0851355;REFB=-0.128564;REVB=0.0806666;RO=1;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140815;STB=0.514701;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.000972253;OID=.;OPOS=23504959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:60:61:1:2:58:59:0.967213:33:25:0:1:33:26:0:2 chr22 23513128 . C G 1680.67 PASS AF=1;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000767363;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1945;QD=60.5646;RBI=0.00420491;REFB=0;REVB=0.0041343;RO=0;SAF=48;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203286;OID=.;OPOS=23513128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:112:111:0:0:111:111:1:63:48:0:0:63:48:0:0 chr22 23513523 . A C 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0455131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.178;QD=62.0219;RBI=0.0492426;REFB=0;REVB=0.0187986;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104731;OID=.;OPOS=23513523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chr22 23585132 . A G 811.79 PASS AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.269;QD=55.9852;RBI=0.033648;REFB=0;REVB=0.0232613;RO=1;SAF=22;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209528;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000767618;OID=.;OPOS=23585132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:58:58:1:0:57:58:1:35:22:1:0:35:23:0:0 chr22 23917223 . G A 207.21 PASS AF=0.390625;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.010535;FXX=0.0302984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.566;QD=12.9506;RBI=0.0125862;REFB=-0.0075261;REVB=-0.00688652;RO=39;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151114;STB=0.508664;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.011506;OID=.;OPOS=23917223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:39:39:25:25:0.390625:17:8:12:27:17:8:12:27 chr22 23962744 . T TTTC 226.85 PASS AF=0.421875;AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00940806;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=299.097;QD=14.1779;RBI=0.0159912;REFB=-0.007391;REVB=0.0129309;RO=38;SAF=17;SAR=9;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138781;STB=0.593335;STBP=0.218;TYPE=ins;VARB=0.0102742;OID=.;OPOS=23962745;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.421875:26:66:27:64:37:18:9:19:18:99:38:17:9:20:18 chr22 24034288 . A G 235.53 PASS AF=0.466667;AO=24;DP=56;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0129733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3845;QD=15.7022;RBI=0.108793;REFB=0.0102164;REVB=0.108016;RO=32;SAF=16;SAR=8;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795645;STB=0.507457;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.00940276;OID=.;OPOS=24034288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:60:32:32:24:28:0.466667:8:16:19:13:11:17:19:13 chr22 24035970 . C T 189.22 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0058287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.594;QD=13.0499;RBI=0.019482;REFB=-0.0235441;REVB=-0.0185896;RO=33;SAF=10;SAR=13;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174917;STB=0.615287;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0297633;OID=.;OPOS=24035970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:33:35:23:23:0.396552:13:10:20:13:13:10:22:13 chr22 24036563 . G A 171.2 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0434247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.199;QD=17.5595;RBI=0.0434462;REFB=-1.98221e-05;REVB=0.00136736;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3319;STB=0.690048;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.000671787;OID=.;OPOS=24036563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:13:5:13:8:13:5:13:8 chr22 24038847 . T C 159.43 PASS AF=0.472222;AO=14;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00809683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4292;QD=17.7139;RBI=0.0288302;REFB=-0.0668248;REVB=0.0276699;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215384;STB=0.533294;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0755032;OID=.;OPOS=24038847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:36:16:19:14:17:0.472222:4:10:8:8:7:10:10:9 chr22 24086107 . A G 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.01;QD=58.0608;RBI=0.0678293;REFB=0;REVB=-0.0587293;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.46402e-05;OID=.;OPOS=24086107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0 chr22 24086948 . G C 294.43 PASS AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0114739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.327;QD=15.0991;RBI=0.0175759;REFB=-0.0140705;REVB=-0.013314;RO=44;SAF=14;SAR=19;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00782669;STB=0.501193;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0308538;OID=.;OPOS=24086948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:45:33:33:0.423077:19:14:19:25:19:14:19:26 chr22 24087319 . A C 189.88 PASS AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0376131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.895;QD=11.3359;RBI=0.037885;REFB=-0.00684618;REVB=0.00453034;RO=43;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116048;STB=0.567109;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0107173;OID=.;OPOS=24087319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:12:12:17:26:12:12:17:26 chr22 24108412 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.392;QD=40.7629;RBI=0.0522308;REFB=0;REVB=0.013517;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010439;OID=.;OPOS=24108412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0 chr22 24121378 . C T 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7799;QD=35.5757;RBI=0.0829856;REFB=0;REVB=0.0820883;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00558715;OID=.;OPOS=24121378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chr22 24143502 . C G 246.82 PASS AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.113208;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.869;QD=47.0141;RBI=0.114415;REFB=-0.117737;REVB=0.0165735;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.521717;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00176556;OID=.;OPOS=24143502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:21:21:0:1:20:20:0.952381:9:11:0:0:9:11:1:0 chr22 24158899 . C A 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.803;QD=49.5992;RBI=0.0547664;REFB=0;REVB=-0.0138544;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011485;OID=.;OPOS=24158899;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0 chr22 24224655 . G A 237.85 PASS AF=0.490196;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00598823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.472;QD=18.6548;RBI=0.00609368;REFB=-0.0265162;REVB=-0.00112875;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245859;STB=0.645051;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0131202;OID=.;OPOS=24224655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:25:26:25:25:0.490196:11:14:7:18:11:14:7:19 chr22 24224659 . C A 219.87 PASS AF=0.44;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00605897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.836;QD=17.5894;RBI=0.043982;REFB=-0.000923922;REVB=0.0435627;RO=27;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114389;STB=0.559946;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000285404;OID=.;OPOS=24224659;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:27:28:21:22:0.44:10:11:11:16:11:11:11:17 chr22 24237463 . T C 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00802728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.794;QD=62.3509;RBI=0.0139599;REFB=0;REVB=-0.0114211;RO=0;SAF=33;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.98952e-05;OID=.;OPOS=24237463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:10:33:0:0:10:33:0:0 chr22 24238079 . T A 263.53 PASS AF=0.518519;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0174427;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.772;QD=19.5209;RBI=0.0226082;REFB=-0.00298754;REVB=0.0143834;RO=26;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133027;STB=0.574022;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00239808;OID=.;OPOS=24238079;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:26:26:28:28:0.518519:14:14:9:17:14:14:9:17 chr22 24459438 . T C 1305.59 PASS AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044373;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.404;QD=62.171;RBI=0.0478471;REFB=0;REVB=0.0178991;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017278;OID=.;OPOS=24459438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:40:43:0:0:41:43:0:0 chr22 24472173 . C T 402.42 PASS AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00399658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.958;QD=16.5948;RBI=0.0201381;REFB=-0.00874532;REVB=-0.0197375;RO=54;SAF=23;SAR=19;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106825;STB=0.511611;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0103919;OID=.;OPOS=24472173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:55:42:42:0.43299:19:23:29:25:19:23:29:26 chr22 24535243 . TTA T,TTT 225.83 PASS AF=0.507463,0;AO=18,18;DP=74;FAO=34,0;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=4,0;FSAR=30,0;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.202644,0.073178;FXX=0.0563301;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=20.4031,14.3748;QD=13.4824;RBI=0.215123,0.074492;REFB=-0.126718,0.000191653;REVB=-0.072204,0.0139298;RO=28;SAF=4,0;SAR=14,18;SRF=9;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.135932,-0.794959;STB=0.643465,0.5;STBP=0.079,1;TYPE=del,snp;VARB=0.11902,0;OID=.,.;OPOS=24535244,24535245;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.507463,0:18,18:74:34,0:67:33:4,0:30,0:9:24:99:28:4,0:14,18:9:19 chr22 24535559 . T C 422.79 PASS AF=0.416667;AO=48;DP=121;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00372278;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.991;QD=14.093;RBI=0.00859841;REFB=0.0167134;REVB=-0.00775071;RO=69;SAF=20;SAR=28;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348294;STB=0.534233;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.00686313;OID=.;OPOS=24535559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:69:70:48:50:0.416667:28:20:31:38:30:20:32:38 chr22 24546298 . G A 246.84 PASS AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0188456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.729;QD=31.8502;RBI=0.0188629;REFB=-0.0203939;REVB=-0.000806798;RO=9;SAF=5;SAR=17;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14778;STB=0.58167;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00538308;OID=.;OPOS=24546298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:9:9:22:22:0.709677:17:5:4:5:17:5:4:5 chr22 24579049 . G A 67.01 PASS AF=0.173913;AO=12;DP=69;FAO=12;FDP=69;FR=.;FRO=57;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=-0.0173968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.464;QD=3.88456;RBI=0.0177337;REFB=0.00191816;REVB=0.00344061;RO=57;SAF=5;SAR=7;SRF=40;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349218;STB=0.723815;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.00498449;OID=.;OPOS=24579049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:69:69:57:57:12:12:0.173913:7:5:40:17:7:5:40:17 chr22 24579157 . GA TC 94.15 PASS AF=0.223881;AO=15;DP=67;FAO=15;FDP=67;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0101127;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=269.202;QD=5.62094;RBI=0.0225093;REFB=-0.0131884;REVB=-0.0201097;RO=52;SAF=8;SAR=7;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152927;STB=0.595021;STBP=0.412;TYPE=mnp;VARB=0.0500939;OID=.;OPOS=24579157;OREF=GA;OALT=TC;OMAPALT=TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:67:67:52:52:15:15:0.223881:7:8:34:18:7:8:34:18 chr22 24717850 . A G 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.524;QD=60.6102;RBI=0.016949;REFB=0;REVB=-0.00195015;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08731e-05;OID=.;OPOS=24717850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0 chr22 24761467 . G A 782.3 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976258;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.06;QD=63.8612;RBI=0.0589472;REFB=0;REVB=0.0581332;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336138;OID=.;OPOS=24761467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:17:32:0:0:17:32:0:0 chr22 24964128 . T C 505.57 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560088;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.355;QD=59.4793;RBI=0.0596833;REFB=0;REVB=-0.0206184;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000551892;OID=.;OPOS=24964128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0 chr22 25003922 . G A 201.97 PASS AF=0.373134;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0313094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.2551;QD=12.0579;RBI=0.0314445;REFB=-0.0338443;REVB=0.00291094;RO=41;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142283;STB=0.575621;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0329908;OID=.;OPOS=25003922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:41:42:25:25:0.373134:9:16:21:20:9:16:22:20 chr22 25145453 . C T 740.56 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291688;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.323;QD=56.9662;RBI=0.0383828;REFB=0;REVB=0.0249484;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193846;OID=.;OPOS=25145453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:35:17:0:0:35:17:0:0 chr22 25145471 . A G 176.78 PASS AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0188634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.225;QD=13.3417;RBI=0.0190652;REFB=-0.0125663;REVB=0.00276639;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779305;STB=0.544706;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0203462;OID=.;OPOS=25145471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:13:8:10:22:13:8:10:22 chr22 25291182 . TTTC T,TCTT 108.35 PASS AF=0.40625,0;AO=13,2;DP=35;FAO=13,0;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=11,0;FSAR=2,0;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0303938,-0.0766834;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,3;MLLD=188.97,58.6285;QD=13.5431;RBI=0.0373251,0.0815118;REFB=-0.0211316,-0.0140988;REVB=-0.0216653,-0.0276375;RO=20;SAF=11,2;SAR=2,0;SRF=7;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.54119,0.58092;STB=0.810011,0.5;STBP=0.01,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0281694,0;OID=.,.;OPOS=25291183,25291183;OREF=TTC,TTC;OALT=-,CTT;OMAPALT=T,TCTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.40625,0:13,2:35:13,0:32:19:11,0:2,0:7:12:99:20:11,2:2,0:7:13 chr22 25435140 . G A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.928;QD=51.1846;RBI=0.0623816;REFB=0;REVB=0.00324987;RO=0;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052972;OID=.;OPOS=25435140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:17:3:0:0:17:3:0:0 chr22 25577733 . T C 785.58 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.56;QD=64.1292;RBI=0.0519311;REFB=0;REVB=-0.0189062;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51892e-05;OID=.;OPOS=25577733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:17:31:0:0:18:31:0:0 chr22 25601196 . C G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3878;QD=58.5875;RBI=0.056644;REFB=0;REVB=0.0522536;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553139;OID=.;OPOS=25601196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0 chr22 25627604 . G A 315.12 PASS AF=0.36;AO=36;DP=100;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0410887;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.132;QD=12.6048;RBI=0.0420366;REFB=-0.00605504;REVB=0.00887621;RO=64;SAF=15;SAR=21;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145078;STB=0.583287;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00802394;OID=.;OPOS=25627604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:64:64:36:36:0.36:21:15:35:29:21:15:35:29 chr22 25714110 . T C 108.61 PASS AF=0.40625;AO=12;DP=31;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0103036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.182;QD=13.5766;RBI=0.0374207;REFB=-0.0477289;REVB=-0.0359742;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153067;STB=0.606048;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0266453;OID=.;OPOS=25714110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:32:19:19:12:13:0.40625:8:4:9:10:9:4:9:10 chr22 25714113 . A G 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00854593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.877;QD=13.5766;RBI=0.0240114;REFB=-0.00819387;REVB=0.0224391;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180198;STB=0.606048;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00909576;OID=.;OPOS=25714113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:9:4:9:10:9:4:9:10 chr22 25714180 . A G 244.85 PASS AF=0.547619;AO=22;DP=41;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0252164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.258;QD=23.3191;RBI=0.0265944;REFB=-0.0387045;REVB=0.00844954;RO=19;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265202;STB=0.617303;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0167702;OID=.;OPOS=25714180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:19:19:22:23:0.547619:18:4:8:11:18:5:8:11 chr22 25714182 . A G 262.66 PASS AF=0.571429;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00928355;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.189;QD=25.0156;RBI=0.0106913;REFB=-0.0218505;REVB=0.00530285;RO=19;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16322;STB=0.573465;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00772598;OID=.;OPOS=25714182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:42:19:18:24:24:0.571429:18:6:8:11:18:6:7:11 chr22 25714220 . C G 327.87 PASS AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00432091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.842;QD=23.0081;RBI=0.0182696;REFB=-0.0275103;REVB=0.0177513;RO=24;SAF=11;SAR=22;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103056;STB=0.556927;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0187313;OID=.;OPOS=25714220;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:22:11:11:13:22:11:11:13 chr22 25715756 . G A 75.62 PASS AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0153064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.691;QD=11.6341;RBI=0.0155994;REFB=-0.00646331;REVB=-0.00300914;RO=16;SAF=9;SAR=1;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431396;STB=0.767623;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0209433;OID=.;OPOS=25715756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:1:9:10:6:1:9:10:6 chr22 25715774 . G A 230.88 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.000540749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.185;QD=23.0883;RBI=0.000543091;REFB=-0.0195777;REVB=-5.03787e-05;RO=18;SAF=15;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381109;STB=0.521258;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0164908;OID=.;OPOS=25715774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:7:15:13:5:7:15:13:5 chr22 25750578 . C G 553.08 PASS AF=0.508929;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.000790199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.664;QD=19.7527;RBI=0.0229473;REFB=-0.00628174;REVB=0.0229337;RO=54;SAF=27;SAR=30;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259141;STB=0.509431;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00658503;OID=.;OPOS=25750578;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:54:55:57:57:0.508929:30:27:24:30:30:27:25:30 chr22 25753387 . C T 234.94 PASS AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0199675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.579;QD=18.7952;RBI=0.025279;REFB=-0.0140543;REVB=0.0155026;RO=27;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09777;STB=0.555506;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0173211;OID=.;OPOS=25753387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:15:8:12:15:15:8:12:15 chr22 25755885 . C T 638.87 PASS AF=0.471014;AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.0197438;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8284;QD=18.5179;RBI=0.0361979;REFB=-0.00280113;REVB=-0.0303392;RO=74;SAF=46;SAR=19;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228337;STB=0.630095;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00349031;OID=.;OPOS=25755885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:74:73:65:65:0.471014:19:46:36:38:19:46:35:38 chr22 25756024 . C T 520.99 PASS AF=0.419118;AO=57;DP=136;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=0.00357053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5832;QD=15.3232;RBI=0.016505;REFB=0.00682849;REVB=0.0161142;RO=79;SAF=36;SAR=21;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107359;STB=0.560365;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00895558;OID=.;OPOS=25756024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:79:79:57:57:0.419118:21:36:42:37:21:36:42:37 chr22 26159289 . G A 602.4 PASS AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0203046;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=269.813;QD=54.7635;RBI=0.0204988;REFB=-0.0171781;REVB=-0.00281485;RO=1;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302497;STB=0.521831;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000461905;OID=.;OPOS=26159289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:44:44:1:3:41:41:0.931818:15:26:0:1:15:26:1:2 chr22 26164079 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0719454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.7543;QD=53.277;RBI=0.0731204;REFB=0;REVB=0.0130561;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013978;OID=.;OPOS=26164079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:17:6:0:0:17:6:0:0 chr22 26166900 . G C 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.988;QD=63.2868;RBI=0.0258074;REFB=0;REVB=0.00447394;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58288e-05;OID=.;OPOS=26166900;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0 chr22 26173661 . T C,G 385.15 PASS AF=0.928571,0.0714286;AO=26,2;DP=28;FAO=26,2;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11,2;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117155,-0.0131711;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=170.822,130.002;QD=55.0217;RBI=0.0288443,0.0288094;REFB=0,0;REVB=0.0263579,0.0256223;RO=0;SAF=11,2;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00253088,0.113197;OID=.,.;OPOS=26173661,26173661;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:28:28:0:0:26,2:26,2:0.928571,0.0714286:15,0:11,2:0:0:15,0:11,2:0:0 chr22 26193982 . C G 1016.9 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9874;QD=58.951;RBI=0.0731697;REFB=0;REVB=0.0716427;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396896;OID=.;OPOS=26193982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:64:69:0:0:64:69:1:35:29:0:0:40:29:0:0 chr22 26194045 . T C 874.73 PASS AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.532;QD=57.3592;RBI=0.0388999;REFB=0;REVB=-0.000920142;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.48043e-06;OID=.;OPOS=26194045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:37:23:0:0:37:24:0:0 chr22 26239850 . C A 419.97 PASS AF=0.96875;AO=29;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0807677;FXX=0.0588062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2519;QD=52.4959;RBI=0.0807908;REFB=0.0354702;REVB=0.00193275;RO=2;SAF=11;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153102;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0105132;OID=.;OPOS=26239850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:33:32:2:1:29:31:0.96875:18:11:1:1:19:12:0:1 chr22 26853905 . C A 265.41 PASS AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-5.82266e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.876;QD=27.2215;RBI=0.0211161;REFB=-0.02168;REVB=-0.0211161;RO=14;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376817;STB=0.536882;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0187962;OID=.;OPOS=26853905;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:14:15:24:24:0.615385:15:9:6:8:15:9:7:8 chr22 26854441 . G A 300.32 PASS AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.0451478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.814;QD=24.5162;RBI=0.0451612;REFB=-0.0233731;REVB=0.00110049;RO=22;SAF=12;SAR=15;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262949;STB=0.644455;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0335725;OID=.;OPOS=26854441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:15:12:3:19:15:12:3:19 chr22 26859942 . C T 84.79 PASS AF=0.354839;AO=10;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00869538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.966;QD=10.941;RBI=0.00888927;REFB=-0.0136698;REVB=0.00184648;RO=20;SAF=8;SAR=2;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494115;STB=0.807811;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0200984;OID=.;OPOS=26859942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:31:31:20:20:10:11:0.354839:2:8:7:13:2:9:7:13 chr22 26861502 . G A 216.66 PASS AF=0.4;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00419852;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.526;QD=13.3329;RBI=0.0183985;REFB=-0.000522364;REVB=0.017913;RO=38;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110727;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00091159;OID=.;OPOS=26861502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:38:39:26:26:0.4:16:10:15:23:16:10:15:24 chr22 26862212 . T C 293.27 PASS AF=0.525424;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00146937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.635;QD=19.8824;RBI=0.011874;REFB=-0.0270192;REVB=0.0117827;RO=28;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390504;STB=0.515072;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0247212;OID=.;OPOS=26862212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:28:28:30:31:0.525424:12:18:18:10:12:19:18:10 chr22 26884039 . G A 275.12 PASS AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0201642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.907;QD=15.4996;RBI=0.0222303;REFB=-0.00252264;REVB=0.00935905;RO=39;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142909;STB=0.587432;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00762713;OID=.;OPOS=26884039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:40:31:31:0.43662:18:13:22:17:18:13:23:17 chr22 26895337 . G A 154.79 PASS AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0163831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.385;QD=14.7423;RBI=0.0280505;REFB=-0.00884858;REVB=0.0227689;RO=25;SAF=12;SAR=5;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695149;STB=0.540024;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0143856;OID=.;OPOS=26895337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:5:12:19:6:5:12:19:6 chr22 26924177 . T C 182.99 PASS AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0105964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.369;QD=17.4276;RBI=0.026517;REFB=0.00227754;REVB=-0.0243078;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134659;STB=0.507684;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.00276422;OID=.;OPOS=26924177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:11:8:10:13:11:8:10:13 chr22 26932150 . G A 801.29 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0078425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8123;QD=57.2349;RBI=0.039481;REFB=0;REVB=-0.0386943;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00044692;OID=.;OPOS=26932150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0 chr22 26937327 . C G 376.05 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.523;QD=55.7105;RBI=0.0561849;REFB=0;REVB=0.0334842;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171672;OID=.;OPOS=26937327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:11:15:0:0:11:16:0:0 chr22 27012203 . TGGGGC TGGG,TGGGC,TGGGCC 239.27 PASS AF=1,0,0;AO=6,8,2;DP=31;FAO=22,0,0;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0,0;FSAR=17,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248814,0.440315,0.543892;FXX=0.0434594;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=19.226,11.0281,5.67895;QD=43.503;RBI=0.0390951,0.582203,0.712788;REFB=0,0,0;REVB=0.0301553,-0.380898,-0.460703;RO=8;SAF=2,0,1;SAR=4,8,1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0.594203,0.594203,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.573303,-0.844818,-0.662376;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00417691,0,0;OID=.,.,.;OPOS=27012207,27012204,27012207;OREF=GC,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=TGGG,TGGGC,TGGGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0,0:6,8,2:31:22,0,0:22:0:5,0,0:17,0,0:0:0:3:8:2,0,1:4,8,1:8:0 chr22 27021457 . T C 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.318;QD=56.1914;RBI=0.0438489;REFB=0;REVB=0.0406132;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07384e-05;OID=.;OPOS=27021457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chr22 28144379 . GA G 69.57 PASS AF=0.733333;AO=6;DP=16;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0142101;FXX=0.062461;HRUN=7;LEN=1;MLLD=11.0312;QD=18.5522;RBI=0.0286358;REFB=-0.0448364;REVB=0.0248613;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123249;STB=0.578172;STBP=0.371;TYPE=del;VARB=0.0326689;OID=.;OPOS=28144380;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.733333:6:16:11:15:4:5:6:3:1:14:1:3:3:0:1 chr22 28248840 . C T 168.47 PASS AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00821824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.511;QD=10.3673;RBI=0.0107892;REFB=-0.00106636;REVB=-0.00699053;RO=43;SAF=16;SAR=6;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286145;STB=0.668496;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00276804;OID=.;OPOS=28248840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:6:16:21:22:6:16:21:22 chr22 28316590 . CT CTG,CTGG,TG 704.11 PASS AF=0.966667,0,0.0333333;AO=47,7,3;DP=60;FAO=58,0,2;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0,2;FSAR=43,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.053288,-0.0283646,0.0225812;FXX=0;HRUN=2,2,3;LEN=1,2,2;MLLD=17.4011,7.97092,10.5218;QD=46.9404;RBI=0.237229,0.123021,0.136308;REFB=0,0,0;REVB=-0.231166,-0.119707,-0.134425;RO=0;SAF=13,1,2;SAR=34,6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=-0.00531265,0,-0.0372868;OID=.,.,.;OPOS=28316592,28316592,28316590;OREF=-,-,CT;OALT=G,GG,TG;OMAPALT=CTG,CTGG,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:7:60:60:0:0:47,7,3:58,0,2:0.966667,0,0.0333333:34,6,1:13,1,2:0:0:43,0,0:15,0,2:0:0 chr22 28389453 . T C 162.39 PASS AF=0.485714;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.024224;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.596;QD=18.5589;RBI=0.0248535;REFB=-0.0216251;REVB=0.00555848;RO=18;SAF=4;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113657;STB=0.565136;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00947855;OID=.;OPOS=28389453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:18:18:17:17:0.485714:13:4:6:12:13:4:6:12 chr22 28424993 . C T 312.67 PASS AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00504183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2989;QD=21.942;RBI=0.039686;REFB=-0.0406133;REVB=-0.0393644;RO=24;SAF=16;SAR=16;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323374;STB=0.508766;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0588608;OID=.;OPOS=28424993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:24:25:32:32:0.561404:16:16:11:13:16:16:12:13 chr22 28504183 . G A 604.21 PASS AF=0.574257;AO=58;DP=101;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0179446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6203;QD=23.9291;RBI=0.0264863;REFB=-0.0146316;REVB=0.0194812;RO=43;SAF=17;SAR=41;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150087;STB=0.582312;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0119318;OID=.;OPOS=28504183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:43:43:58:58:0.574257:41:17:20:23:41:17:20:23 chr22 28504258 . A G 522.07 PASS AF=0.524272;AO=53;DP=102;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.00589694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.803;QD=20.2746;RBI=0.0223312;REFB=0.00470267;REVB=0.0215386;RO=49;SAF=23;SAR=30;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206425;STB=0.607637;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00184231;OID=.;OPOS=28504258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:49:49:53:54:0.524272:30:23:33:16:30:24:33:16 chr22 29133276 . AT A 39.0 PASS AF=0.315789;AO=19;DP=60;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.106225;FXX=0.0499917;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.79506;QD=2.73698;RBI=0.227943;REFB=-0.118117;REVB=0.201678;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367013;STB=0.648972;STBP=0.142;TYPE=del;VARB=0.126192;OID=.;OPOS=29133277;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.315789:19:60:18:57:39:9:9:11:28:39:31:11:8:7:24 chr22 29182500 . C A 1098.64 PASS AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.688;QD=60.1996;RBI=0.0169041;REFB=0;REVB=-0.00977977;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85153e-06;OID=.;OPOS=29182500;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0 chr22 29445451 . C T 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.17;QD=18.7441;RBI=0.00942328;REFB=0.00719706;REVB=0.00942328;RO=4;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00330604;OID=.;OPOS=29445451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:7:0:0:4:7:0:0:4 chr22 29446611 . A C 956.55 PASS AF=1;AO=42;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.971;QD=58.8647;RBI=0.101191;REFB=0;REVB=0.0829356;RO=0;SAF=32;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96961e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000647288;OID=.;OPOS=29446611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:42:65:1:10:32:0:0:22:43:0:0 chr22 29450107 . A G 425.23 PASS AF=0.477778;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0399017;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.012;QD=18.8989;RBI=0.0399159;REFB=0.011511;REVB=0.00106593;RO=46;SAF=20;SAR=23;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727345;STB=0.545902;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.0128158;OID=.;OPOS=29450107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:46:47:43:43:0.477778:23:20:25:21:23:20:26:21 chr22 29450923 . A G 167.15 PASS AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0376531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.451;QD=15.1954;RBI=0.0377198;REFB=-0.0204897;REVB=-0.00224233;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393585;STB=0.522702;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0261605;OID=.;OPOS=29450923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:9:9:14:12:9:9:14:12 chr22 29453027 . A G 410.69 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.383;QD=56.6463;RBI=0.00720382;REFB=0;REVB=0.00557162;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63881e-06;OID=.;OPOS=29453027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0 chr22 29453193 . G C 288.83 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0100247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.042;QD=16.2722;RBI=0.0238858;REFB=-0.0326173;REVB=-0.0216804;RO=39;SAF=19;SAR=13;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552055;STB=0.531089;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0306986;OID=.;OPOS=29453193;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:13:19:21:18:13:19:21:18 chr22 29454778 . G A 434.7 PASS AF=0.511905;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0156984;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.146;QD=20.7;RBI=0.0350933;REFB=-0.00403289;REVB=0.0313863;RO=41;SAF=21;SAR=22;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220231;STB=0.512189;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00380719;OID=.;OPOS=29454778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:41:41:43:43:0.511905:22:21:19:22:22:21:19:22 chr22 29456699 . A G 857.17 PASS AF=0.533333;AO=80;DP=150;FAO=80;FDP=150;FR=.;FRO=70;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=0.00309927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0869;QD=22.858;RBI=0.039733;REFB=-0.0305018;REVB=-0.0396119;RO=69;SAF=35;SAR=45;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00233602;STB=0.502537;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0227836;OID=.;OPOS=29456699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:69:70:80:80:0.533333:45:35:30:39:45:35:31:39 chr22 29534621 . A G 437.8 PASS AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0266586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6265;QD=21.6197;RBI=0.0578105;REFB=0.00841681;REVB=-0.0512969;RO=38;SAF=18;SAR=25;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00213543;STB=0.501179;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.00916801;OID=.;OPOS=29534621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:25:18:16:22:25:18:16:22 chr22 29534664 . C T 444.75 PASS AF=0.505747;AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0154437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.016;QD=20.4483;RBI=0.0177244;REFB=-0.0247122;REVB=0.0086975;RO=43;SAF=20;SAR=24;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324439;STB=0.517962;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0276645;OID=.;OPOS=29534664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:43:44:44:0.505747:24:20:18:25:24:20:18:25 chr22 29537965 . G A 437.87 PASS AF=0.4375;AO=47;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=-0.0184907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.871;QD=15.638;RBI=0.0186382;REFB=-0.0123186;REVB=-0.00233988;RO=63;SAF=35;SAR=12;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117047;STB=0.542151;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.017742;OID=.;OPOS=29537965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:63:47:49:0.4375:12:35:41:22:14:35:41:22 chr22 29542182 . AT A 266.3 PASS AF=0.440367;AO=43;DP=113;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0720695;FXX=0.0438558;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.0649;QD=9.77229;RBI=0.0761764;REFB=-0.0344618;REVB=-0.0246748;RO=61;SAF=15;SAR=28;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120496;STB=0.548905;STBP=0.389;TYPE=del;VARB=0.0530935;OID=.;OPOS=29542183;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.440367:43:113:48:109:61:18:30:28:33:99:61:15:28:28:33 chr22 29542748 . C A 1208.33 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4152;QD=61.1811;RBI=0.00367936;REFB=0;REVB=-0.00227172;RO=0;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75808e-06;OID=.;OPOS=29542748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:45:32:0:0:47:32:0:0 chr22 29621128 . C G 85.04 PASS AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0340105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.147;QD=22.6781;RBI=0.0344577;REFB=-0.0319118;REVB=0.00553318;RO=5;SAF=9;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139199;STB=0.580463;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0264092;OID=.;OPOS=29621128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:1:9:4:1:1:9:4:1 chr22 29659960 . C T 174.69 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0802459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1135;QD=19.9642;RBI=0.0868218;REFB=-0.0240216;REVB=0.0331453;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270773;STB=0.652015;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0273978;OID=.;OPOS=29659960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:10:8:13:4:10:8:13:4 chr22 29704125 . C T 292.15 PASS AF=0.470588;AO=28;DP=65;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00457047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.364;QD=17.185;RBI=0.00612269;REFB=-0.0117688;REVB=0.00407409;RO=34;SAF=10;SAR=18;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11522;STB=0.571938;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0249878;OID=.;OPOS=29704125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:34:36:28:32:0.470588:18:10:16:18:21:11:17:19 chr22 29727866 . C T 85.25 PASS AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0500079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4099;QD=11.3667;RBI=0.0501322;REFB=-0.0105659;REVB=-0.00352833;RO=19;SAF=2;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454614;STB=0.774298;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0100654;OID=.;OPOS=29727866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:9:2:11:8:9:2:11:8 chr22 29727886 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00975694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.795;QD=44.6898;RBI=0.0221421;REFB=0;REVB=0.0198765;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.09336e-05;OID=.;OPOS=29727886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr22 29755888 . T C 231.5 PASS AF=0.373333;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00145025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.735;QD=12.3464;RBI=0.0014508;REFB=0.00884221;REVB=-3.9963e-05;RO=46;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518306;STB=0.52063;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=-0.0138702;OID=.;OPOS=29755888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:46:47:28:28:0.373333:17:11:16:30:17:11:17:30 chr22 29837537 . T C 153.43 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0240165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.888;QD=13.948;RBI=0.0365652;REFB=-0.00183024;REVB=-0.0275722;RO=27;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300833;STB=0.673384;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.000722246;OID=.;OPOS=29837537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:7:10:8:19:7:10:8:19 chr22 29837566 . TTCC T 121.47 PASS AF=0.375;AO=20;DP=55;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0109076;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=246.458;QD=8.67652;RBI=0.0155;REFB=-0.0175805;REVB=-0.0110124;RO=32;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373712;STB=0.682182;STBP=0.046;TYPE=del;VARB=0.0294272;OID=.;OPOS=29837567;OREF=TCC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.375:20:55:21:56:35:14:7:13:22:99:32:14:6:11:21 chr22 29885861 . T C 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.974;QD=40.7629;RBI=0.0598683;REFB=0;REVB=0.0444055;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00058794;OID=.;OPOS=29885861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0 chr22 29886413 . A G 714.49 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0257726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.478;QD=60.8079;RBI=0.0775804;REFB=0.0380158;REVB=0.0731744;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.001676;OID=.;OPOS=29886413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:47:0:1:46:46:0.978723:18:28:0:0:18:28:1:0 chr22 29886893 . G T 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.469;QD=53.9112;RBI=0.00730063;REFB=0;REVB=-0.00209342;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38847e-06;OID=.;OPOS=29886893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0 chr22 29904354 . G A 331.27 PASS AF=0.486111;AO=32;DP=69;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.012264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.634;QD=18.4041;RBI=0.0147081;REFB=-0.014978;REVB=0.00811931;RO=37;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257576;STB=0.517231;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0162477;OID=.;OPOS=29904354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:72:37:37:32:35:0.486111:19:13:16:21:21:14:16:21 chr22 29913272 . C T 261.79 PASS AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0300667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.801;QD=17.1664;RBI=0.0374872;REFB=-0.0261757;REVB=0.0223894;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864879;STB=0.548618;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0513113;OID=.;OPOS=29913272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:18:11:15:17:18:11:15:17 chr22 29957137 . CCA C 56.85 PASS AF=0.289474;AO=9;DP=41;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0105997;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=226.345;QD=5.98413;RBI=0.0256862;REFB=-0.00140654;REVB=-0.0233971;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334411;STB=0.622427;STBP=0.372;TYPE=del;VARB=0.0041595;OID=.;OPOS=29957138;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.289474:9:41:11:38:27:6:5:10:17:56:29:6:3:11:18 chr22 29957570 . G A 290.32 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0462691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.832;QD=17.3327;RBI=0.0476887;REFB=-0.0094678;REVB=-0.0115491;RO=35;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235695;STB=0.631888;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0111682;OID=.;OPOS=29957570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:12:20:13:22:12:20:13:22 chr22 29960335 . A G 237.61 PASS AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.00036564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.098;QD=13.7744;RBI=0.0181484;REFB=-0.00550965;REVB=-0.0181447;RO=41;SAF=17;SAR=11;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200008;STB=0.613954;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00726267;OID=.;OPOS=29960335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:11:17:17:24:11:17:17:24 chr22 30221201 . G A 188.95 PASS AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0174529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8373;QD=13.0312;RBI=0.0403695;REFB=-0.0227005;REVB=0.0364018;RO=35;SAF=8;SAR=15;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34578;STB=0.69751;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.049611;OID=.;OPOS=30221201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:15:8:24:11:15:8:24:11 chr22 30234192 . TGCC T 78.46 PASS AF=0.818182;AO=6;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0106047;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=164.428;QD=28.5293;RBI=0.0379706;REFB=-0.122723;REVB=0.0364597;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.510181;STBP=0.893;TYPE=del;VARB=0.0235788;OID=.;OPOS=30234193;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.818182:6:11:9:11:2:5:4:1:1:10:1:3:3:1:0 chr22 30403996 . C T 197.69 PASS AF=0.347222;AO=23;DP=71;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00403343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.225;QD=10.9828;RBI=0.00584933;REFB=-0.00284446;REVB=0.00423629;RO=45;SAF=7;SAR=16;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290178;STB=0.655202;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00660977;OID=.;OPOS=30403996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:45:47:23:25:0.347222:16:7:25:20:17:8:26:21 chr22 30422656 . G T 222.01 PASS AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00938416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0677;QD=14.558;RBI=0.0604176;REFB=-0.00738952;REVB=-0.0596843;RO=35;SAF=9;SAR=17;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586509;STB=0.533398;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00822045;OID=.;OPOS=30422656;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:17:9:14:21:17:9:14:21 chr22 30422708 . C T 309.04 PASS AF=0.426829;AO=32;DP=79;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0056318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.563;QD=15.0751;RBI=0.0526065;REFB=-0.020479;REVB=0.0523042;RO=47;SAF=8;SAR=24;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190109;STB=0.577643;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0243605;OID=.;OPOS=30422708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:82:47:47:32:35:0.426829:24:8:19:28:25:10:19:28 chr22 30423460 . C T 389.94 PASS AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00548831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.385;QD=21.6633;RBI=0.0315897;REFB=-0.0111363;REVB=0.0311093;RO=33;SAF=21;SAR=18;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696398;STB=0.538442;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0100886;OID=.;OPOS=30423460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:18:21:15:18:18:21:15:18 chr22 30638721 . G A 123.98 PASS AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0675172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6067;QD=17.1001;RBI=0.0676605;REFB=-0.0140483;REVB=0.00440094;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263751;STB=0.51513;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0100503;OID=.;OPOS=30638721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:8:6:6:9:8:6:6:9 chr22 30681257 . C G 34.15 PASS AF=0.1875;AO=5;DP=31;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0024365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.763;QD=4.26926;RBI=0.0030093;REFB=-0.00660967;REVB=0.00176616;RO=26;SAF=3;SAR=2;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118031;STB=0.65578;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0353275;OID=.;OPOS=30681257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:32:26:26:5:6:0.1875:2:3:18:8:3:3:18:8 chr22 30714684 . A C 125.84 PASS AF=0.5;AO=9;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0110508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.828;QD=17.9776;RBI=0.0664658;REFB=-0.0309289;REVB=0.0655407;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19924;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0458954;OID=.;OPOS=30714684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:28:28:14:14:9:14:0.5:4:5:5:9:9:5:5:9 chr22 30770603 . T A 591.17 PASS AF=0.693333;AO=51;DP=75;FAO=52;FDP=75;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00730112;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.389;QD=31.5289;RBI=0.00763364;REFB=-0.00258834;REVB=-0.00222847;RO=24;SAF=23;SAR=28;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291631;STB=0.505153;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00148396;OID=.;OPOS=30770603;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:24:23:51:52:0.693333:28:23:12:12:28:24:11:12 chr22 30771554 . T G 762.33 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.821;QD=56.4692;RBI=0.097981;REFB=0;REVB=-0.0842073;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.38673e-05;OID=.;OPOS=30771554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:29:23:0:0:29:25:0:0 chr22 30782089 . A G 252.58 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00478322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0453;QD=17.4192;RBI=0.0705233;REFB=0.00196141;REVB=-0.0703609;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257677;STB=0.654335;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00343322;OID=.;OPOS=30782089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:29:30:28:28:0.482759:8:20:13:16:8:20:13:17 chr22 30819758 . G A 439.35 PASS AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00299526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5402;QD=19.3119;RBI=0.00527706;REFB=0.0118704;REVB=-0.00434463;RO=47;SAF=18;SAR=26;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464853;STB=0.502584;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.0126115;OID=.;OPOS=30819758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:26:18:19:28:26:18:19:28 chr22 30856121 . G A 305.99 PASS AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0258457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.067;QD=20.3994;RBI=0.0275934;REFB=-0.0632124;REVB=0.00966409;RO=27;SAF=15;SAR=17;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201724;STB=0.518856;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0456363;OID=.;OPOS=30856121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:17:15:12:15:17:15:12:16 chr22 30857373 . A C 129.42 PASS AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0107277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.669;QD=12.9416;RBI=0.0131339;REFB=-0.00509194;REVB=-0.00757727;RO=25;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183615;STB=0.607122;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00997016;OID=.;OPOS=30857373;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:8:7:16:9:8:7:16:9 chr22 30857448 . A G 85.74 PASS AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.00191779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.296;QD=11.8268;RBI=0.0057985;REFB=-0.0288989;REVB=-0.00547218;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334266;STB=0.69481;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0157825;OID=.;OPOS=30857448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:14:4:6:5:14:4 chr22 30860830 . C T 180.86 PASS AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0100077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8734;QD=13.9119;RBI=0.0680616;REFB=0.011193;REVB=-0.0673219;RO=31;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255701;STB=0.514692;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.0208903;OID=.;OPOS=30860830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:11:10:14:17:11:10:14:17 chr22 30862400 . T A 240.11 PASS AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0153912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.561;QD=16.5593;RBI=0.0162658;REFB=-0.0129053;REVB=-0.00526201;RO=31;SAF=6;SAR=21;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2289;STB=0.630226;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0173788;OID=.;OPOS=30862400;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:21:6:13:18:21:6:13:18 chr22 30864817 . A G 32.4 PASS AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0630287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4792;QD=16.1989;RBI=0.0630287;REFB=-0.00562299;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00330674;OID=.;OPOS=30864817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:0:5:3:0:0:5:3:0 chr22 30921659 . C T 342.53 PASS AF=0.659091;AO=28;DP=43;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0215955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1689;QD=31.1393;RBI=0.0731909;REFB=0.00978765;REVB=0.0699324;RO=13;SAF=14;SAR=14;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222789;STB=0.539879;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.0011178;OID=.;OPOS=30921659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:44:13:15:28:29:0.659091:14:14:7:6:15:14:9:6 chr22 30927975 . C T 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0981226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.1174;QD=44.6893;RBI=0.0986162;REFB=0;REVB=0.00985451;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00495022;OID=.;OPOS=30927975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0 chr22 30928836 . T G 198.92 PASS AF=0.4;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00540271;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.598;QD=13.2612;RBI=0.0228988;REFB=-0.0161461;REVB=-0.0222523;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029703;STB=0.517031;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0315931;OID=.;OPOS=30928836;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:36:36:24:24:0.4:14:10:16:20:14:10:16:20 chr22 30973025 . G A 455.89 PASS AF=0.48913;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.00833801;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.871;QD=19.8214;RBI=0.0660071;REFB=-0.0174355;REVB=0.0654784;RO=47;SAF=15;SAR=30;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282333;STB=0.656864;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0324805;OID=.;OPOS=30973025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:47:47:45:45:0.48913:30:15:30:17:30:15:30:17 chr22 30975861 . C T 158.38 PASS AF=0.472222;AO=16;DP=35;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.044127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6537;QD=17.5978;RBI=0.0460276;REFB=-0.0315364;REVB=0.0130898;RO=19;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241071;STB=0.614753;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0217411;OID=.;OPOS=30975861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:36:19:19:16:17:0.472222:6:10:7:12:7:10:7:12 chr22 31011610 . G C 188.68 PASS AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0346084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.795;QD=29.0281;RBI=0.0354129;REFB=-0.0030382;REVB=0.00750553;RO=8;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310974;STB=0.517222;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00121772;OID=.;OPOS=31011610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:10:8:4:4:10:8:4:4 chr22 31032920 . A G 62.69 PASS AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00076824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.977;QD=8.08966;RBI=0.0109399;REFB=-0.00619285;REVB=-0.0109129;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142856;STB=0.571271;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0113603;OID=.;OPOS=31032920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:21:22:9:9:0.290323:4:5:9:12:4:5:10:12 chr22 31060029 . G C 30.1 PASS AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0375021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5787;QD=10.0339;RBI=0.106524;REFB=0.0336746;REVB=0.0997043;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260267;STB=0.665925;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.024744;OID=.;OPOS=31060029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:1:4:4:3:1:4:4:3 chr22 31090066 . CT CTCCACAACTA,TA 339.64 PASS AF=0.533333,0.133333;AO=23,6;DP=46;FAO=24,6;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=5,6;FSAR=19,0;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0240457,-0.00820129;FXX=0.0217344;HRUN=1,2;LEN=9,2;MLLD=411.809,181.444;QD=30.1899;RBI=0.0243669,0.0116788;REFB=-0.000208845,-0.00703469;REVB=-0.00394359,-0.00831469;RO=15;SAF=4,6;SAR=19,0;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.332158,0.724028;STB=0.65503,0.99778;STBP=0.025,0.022;TYPE=ins,mnp;VARB=0.000892837,0.0294117;OID=.,.;OPOS=31090068,31090066;OREF=-,CT;OALT=CCACAACTA,TA;OMAPALT=CTCCACAACTA,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:15:15:23,6:24,6:0.533333,0.133333:19,0:4,6:8:7:19,0:5,6:8:7 chr22 31127604 . C T 307.99 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0566927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.28;QD=24.1563;RBI=0.0570717;REFB=-0.00900865;REVB=-0.00656643;RO=21;SAF=12;SAR=18;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524803;STB=0.528907;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00581271;OID=.;OPOS=31127604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:18:12:7:14:18:12:7:14 chr22 31266546 . T C 955.37 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00441482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.995;QD=58.7921;RBI=0.0480408;REFB=0;REVB=0.0478375;RO=0;SAF=45;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163144;OID=.;OPOS=31266546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:19:45:0:0:20:45:0:0 chr22 31302125 . C G 194.22 PASS AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0191826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5349;QD=26.7889;RBI=0.0775959;REFB=-0.125144;REVB=0.0751875;RO=8;SAF=16;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164976;STB=0.634744;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00740202;OID=.;OPOS=31302125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:29:29:8:10:18:18:0.62069:2:16:6:2:2:16:7:3 chr22 31302233 . T C 250.42 PASS AF=0.5;AO=22;DP=46;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.00471577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.17;QD=20.8687;RBI=0.00559522;REFB=-0.0356006;REVB=0.00301131;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254714;STB=0.643232;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0267966;OID=.;OPOS=31302233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:23:24:22:24:0.5:10:12:6:17:11:13:6:18 chr22 31303606 . GT G 68.36 PASS AF=0.272727;AO=30;DP=125;FAO=30;FDP=110;FR=.;FRO=80;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=53;FSRR=27;FWDB=-0.0408163;FXX=0.133848;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.2617;QD=2.48575;RBI=0.101497;REFB=-0.0870714;REVB=-0.0929283;RO=70;SAF=14;SAR=16;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22508;STB=0.750708;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.112412;OID=.;OPOS=31303607;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.272727:30:125:30:110:80:9:21:53:27:68:70:14:16:46:24 chr22 31303619 . TAA TA,T,TAT 585.9 PASS AF=0.652542,0.152542,0.186441;AO=52,13,23;DP=126;FAO=77,18,22;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=33,12,6;FSAR=44,6,16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135931,-0.00441526,-0.00459969;FXX=0.0781189;HRUN=11,11,11;LEN=1,2,1;MLLD=6.44381,9.74501,156.721;QD=19.861;RBI=0.0733126,0.0320781,0.0389009;REFB=0.0551615,0.0344,0.00406191;REVB=0.0720414,0.0317728,-0.038628;RO=18;SAF=20,12,6;SAR=32,1,17;SRF=9;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0573414,0.580072,-0.214513;STB=0.507461,0.519978,0.538425;STBP=0.29,0.612,0.17;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00122815,0.0653829,0.0167301;OID=.,.,.;OPOS=31303620,31303620,31303621;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=TA,T,TAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.652542,0.152542,0.186441:52,13,23:126:77,18,22:118:1:33,12,6:44,6,16:1:0:99:18:20,12,6:32,1,17:9:9 chr22 31333631 . T C 366.17 PASS AF=0.465116;AO=37;DP=84;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.000528428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.245;QD=17.0313;RBI=0.0145034;REFB=-0.00768316;REVB=-0.0144938;RO=43;SAF=24;SAR=13;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159375;STB=0.566004;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00687638;OID=.;OPOS=31333631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:43:46:37:40:0.465116:13:24:21:22:16:24:22:24 chr22 31342376 . G C 250.29 PASS AF=0.306306;AO=34;DP=111;FAO=34;FDP=111;FR=.;FRO=77;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0103359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.121;QD=9.01944;RBI=0.0165137;REFB=-0.00982075;REVB=0.0128792;RO=77;SAF=15;SAR=19;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151639;STB=0.50888;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0222797;OID=.;OPOS=31342376;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:77:77:34:34:0.306306:19:15:33:44:19:15:33:44 chr22 31354653 . G A 120.09 PASS AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00873711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=359.55;QD=9.41879;RBI=0.0257859;REFB=-0.00784113;REVB=-0.0242606;RO=36;SAF=9;SAR=6;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832198;STB=0.549935;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0203826;OID=.;OPOS=31354653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:6:9:24:12:6:9:24:12 chr22 31521404 . G A 212.39 PASS AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.00225777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.671;QD=20.7214;RBI=0.041315;REFB=-0.0331999;REVB=0.0412532;RO=20;SAF=1;SAR=20;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195096;STB=0.612117;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0326711;OID=.;OPOS=31521404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:20:1:2:18:20:1:2:18 chr22 31533796 . G C 1172.27 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.165;QD=60.8969;RBI=0.0460391;REFB=0;REVB=0.0389692;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.60217e-06;OID=.;OPOS=31533796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:32:43:0:0:33:44:0:0 chr22 31533967 . G A 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0003;QD=39.2066;RBI=0.0629692;REFB=0;REVB=0.0431542;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00592525;OID=.;OPOS=31533967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0 chr22 31535872 . G C 669.93 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0630413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.742;QD=62.3193;RBI=0.0719016;REFB=0;REVB=-0.034578;RO=0;SAF=10;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00155566;OID=.;OPOS=31535872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:33:10:0:0:33:10:0:0 chr22 31536133 . A C 804.82 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1804;QD=64.3855;RBI=0.0240842;REFB=0;REVB=0.00656519;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163571;OID=.;OPOS=31536133;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0 chr22 31602671 . C T 250.81 PASS AF=0.365854;AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0355292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6366;QD=12.2344;RBI=0.0377022;REFB=0.00926441;REVB=-0.0126149;RO=52;SAF=10;SAR=20;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127926;STB=0.573862;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.0085034;OID=.;OPOS=31602671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:52:52:30:30:0.365854:20:10:23:29:20:10:23:29 chr22 31602710 . G T 72.69 PASS AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0346235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0277;QD=8.81037;RBI=0.0348939;REFB=0.0111282;REVB=-0.00433583;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515121;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0317642;OID=.;OPOS=31602710;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:5:5:11:11:5:5:12:11 chr22 31663842 . C G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.186;QD=63.5817;RBI=0.0321473;REFB=0;REVB=0.0133185;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018135;OID=.;OPOS=31663842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr22 31679110 . G C,GC 725.94 PASS AF=0.0222222,0.977778;AO=39,5;DP=46;FAO=1,44;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=1,20;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228709,0.0110917;FXX=0.0217344;HRUN=2,0;LEN=1,1;MLLD=114.984,136.578;QD=64.5283;RBI=0.303841,0.11698;REFB=0,0;REVB=-0.302979,0.116453;RO=0;SAF=16,4;SAR=23,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.43889e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00425594,0.000721343;OID=.,.;OPOS=31679110,31679111;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:46:45:0:0:39,5:1,44:0.0222222,0.977778:23,1:16,4:0:0:0,24:1,20:0:0 chr22 31740566 . GTC GTCG,TCG 33.06 PASS AF=0.0833333,0.0238095;AO=9,4;DP=86;FAO=7,2;FDP=84;FR=.;FRO=75;FSAF=1,1;FSAR=6,1;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=-0.128816,-0.10121;FXX=0.0117633;HRUN=0,4;LEN=1,3;MLLD=113.148,119.031;QD=1.57438;RBI=0.128893,0.101375;REFB=-0.00131594,-0.00135575;REVB=-0.00444652,-0.00579324;RO=73;SAF=2,2;SAR=7,2;SRF=29;SRR=44;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.232838,0.095681;STB=0.774959,0.609348;STBP=0.181,0.779;TYPE=ins,mnp;VARB=0.149356,0.168424;OID=.,.;OPOS=31740569,31740566;OREF=-,GTC;OALT=G,TCG;OMAPALT=GTCG,TCG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:86:84:73:75:9,4:7,2:0.0833333,0.0238095:7,2:2,2:29:44:6,1:1,1:29:46 chr22 31859859 . A G 738.26 PASS AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00486094;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.463;QD=61.5212;RBI=0.02256;REFB=0.0409262;REVB=0.0220301;RO=1;SAF=23;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200087;STB=0.510634;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.000416105;OID=.;OPOS=31859859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:24:23:1:0:24:23:1:0 chr22 31971258 . T C 651.16 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2012;QD=62.0153;RBI=0.095312;REFB=0;REVB=0.0918002;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000880164;OID=.;OPOS=31971258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0 chr22 32011225 . T C 115.96 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8754;QD=42.1685;RBI=0.128935;REFB=0;REVB=-0.0751236;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0101736;OID=.;OPOS=32011225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0 chr22 32015450 . T G 483.13 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.58;QD=58.5616;RBI=0.0333409;REFB=0;REVB=-0.00349731;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213711;OID=.;OPOS=32015450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chr22 32110163 . G A 182.56 PASS AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0521626;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4962;QD=23.5563;RBI=0.063824;REFB=-0.0657168;REVB=-0.0367773;RO=13;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10519;STB=0.55876;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0275386;OID=.;OPOS=32110163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:8:10:9:4:8:10:9:4 chr22 32112461 . T C 37.45 PASS AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0166085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.367;QD=8.8111;RBI=0.0272465;REFB=-0.00137366;REVB=0.0215993;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469701;STB=0.529314;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00289893;OID=.;OPOS=32112461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:3:3:5:6:3:3:5:6 chr22 32153371 . A G 278.87 PASS AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00740266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.739;QD=21.8719;RBI=0.0168531;REFB=-0.01371;REVB=-0.0151403;RO=23;SAF=9;SAR=19;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273713;STB=0.65225;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00862236;OID=.;OPOS=32153371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:19:9:15:8:19:9:15:8 chr22 32222476 . C G 325.2 PASS AF=0.523077;AO=33;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00999819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1594;QD=20.0125;RBI=0.0179579;REFB=0.00644127;REVB=0.0149172;RO=31;SAF=18;SAR=15;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146933;STB=0.587107;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.00785559;OID=.;OPOS=32222476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:31:33:34:0.523077:15:18:22:9:16:18:22:9 chr22 32334021 . T A 339.28 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0121571;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.658;QD=17.6247;RBI=0.0123339;REFB=-0.00696907;REVB=-0.00208086;RO=42;SAF=17;SAR=19;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00382332;STB=0.504704;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00759991;OID=.;OPOS=32334021;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:42:41:36:36:0.467532:19:17:20:22:19:17:19:22 chr22 32334203 . C T 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=3.88927e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.016;QD=14.0966;RBI=0.00938965;REFB=-0.0127939;REVB=-0.00938957;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073535;STB=0.542783;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0179943;OID=.;OPOS=32334203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:8:3:3:11:8:3:3:11 chr22 32334229 . A C 38.57 PASS AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0715;QD=11.0198;RBI=0.0112903;REFB=0.00173404;REVB=0.0112903;RO=8;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000504547;OID=.;OPOS=32334229;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:6:0:0:8:6:0:0:8 chr22 32377135 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.925;QD=51.1842;RBI=0.0123393;REFB=0;REVB=0.0112866;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161604;OID=.;OPOS=32377135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chr22 32554985 . A G 742.41 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383458;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.149;QD=57.1088;RBI=0.0140738;REFB=0;REVB=-0.0135413;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000493973;OID=.;OPOS=32554985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0 chr22 32754103 . A C 399.0 PASS AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0139012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.033;QD=18.345;RBI=0.0855309;REFB=0.000530448;REVB=0.0843936;RO=45;SAF=17;SAR=24;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112224;STB=0.557163;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=-0.000453595;OID=.;OPOS=32754103;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:46:41:41:0.471264:24:17:24:21:24:17:24:22 chr22 32754230 . A G 336.67 PASS AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0195989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.564;QD=14.7986;RBI=0.0216427;REFB=-0.0139078;REVB=0.00918085;RO=53;SAF=18;SAR=19;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00424532;STB=0.508017;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0123845;OID=.;OPOS=32754230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:53:54:37:37:0.406593:19:18:26:27:19:18:27:27 chr22 32754232 . C T 339.76 PASS AF=0.420455;AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0119533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.364;QD=15.4434;RBI=0.0153104;REFB=-0.0189639;REVB=0.00956695;RO=49;SAF=19;SAR=18;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00334675;STB=0.50215;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0200749;OID=.;OPOS=32754232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:51:37:37:0.420455:18:19:25:24:18:19:26:25 chr22 32754306 . T C 554.38 PASS AF=0.479339;AO=57;DP=119;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.0323707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.022;QD=18.3267;RBI=0.0343369;REFB=-0.0375913;REVB=0.0114526;RO=62;SAF=20;SAR=37;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261906;STB=0.643833;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0226546;OID=.;OPOS=32754306;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:62:63:57:58:0.479339:37:20:39:23:38:20:39:24 chr22 32756407 . A G 595.8 PASS AF=0.495935;AO=61;DP=123;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.0087392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.307;QD=19.3755;RBI=0.078993;REFB=-0.0146784;REVB=-0.0785081;RO=62;SAF=37;SAR=24;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00932774;STB=0.505153;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0182339;OID=.;OPOS=32756407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:62:62:61:61:0.495935:24:37:37:25:24:37:37:25 chr22 32756555 . G C 662.79 PASS AF=0.40884;AO=74;DP=181;FAO=74;FDP=181;FR=.;FRO=107;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=52;FSRR=55;FWDB=-0.0265281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3924;QD=14.6473;RBI=0.0361143;REFB=0.0278257;REVB=0.0245051;RO=107;SAF=40;SAR=34;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057551;STB=0.532288;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.0324492;OID=.;OPOS=32756555;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:107:107:74:74:0.40884:34:40:52:55:34:40:52:55 chr22 32756744 . A G 439.41 PASS AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=-0.0584292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8549;QD=21.9705;RBI=0.0594958;REFB=0.00786599;REVB=-0.0112155;RO=37;SAF=24;SAR=19;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173457;STB=0.595139;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00945894;OID=.;OPOS=32756744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:0.5375:19:24:28:9:19:24:28:9 chr22 32759025 . G C 255.14 PASS AF=0.491228;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.000703005;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.429;QD=17.9048;RBI=0.0104823;REFB=-0.0410091;REVB=-0.0104587;RO=26;SAF=16;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288887;STB=0.527899;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0381588;OID=.;OPOS=32759025;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:57:26:29:28:28:0.491228:12:16:14:12:12:16:15:14 chr22 32784051 . T C 110.7 PASS AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0306789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.069;QD=15.269;RBI=0.0360961;REFB=-0.00514195;REVB=-0.0190192;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141401;STB=0.581278;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0102096;OID=.;OPOS=32784051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:8:5:4:12:8:5:4:12 chr22 32795641 . C T 280.3 PASS AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00905997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9357;QD=14.1924;RBI=0.0119901;REFB=-0.00625193;REVB=-0.00785369;RO=47;SAF=15;SAR=17;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132328;STB=0.575091;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0102256;OID=.;OPOS=32795641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:17:15:28:19:17:15:28:19 chr22 32811952 . A G 315.2 PASS AF=0.492754;AO=33;DP=67;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0274806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3997;QD=18.2722;RBI=0.0307675;REFB=-0.0101227;REVB=0.0138367;RO=34;SAF=20;SAR=13;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394283;STB=0.521264;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0395668;OID=.;OPOS=32811952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:34:35:33:34:0.492754:13:20:22:12:14:20:22:13 chr22 32909251 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0052614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.274;QD=53.2769;RBI=0.0200732;REFB=0;REVB=0.0193714;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101856;OID=.;OPOS=32909251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr22 33253280 . T C 493.23 PASS AF=0.605263;AO=45;DP=76;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00876889;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0915;QD=25.9596;RBI=0.0184778;REFB=-0.0183883;REVB=-0.0162646;RO=30;SAF=32;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17221;STB=0.585081;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00995129;OID=.;OPOS=33253280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:30:30:45:46:0.605263:13:32:15:15:14:32:15:15 chr22 33253290 . TCC TC,TCT 768.11 PASS AF=0.219178,0.657534;AO=12,48;DP=73;FAO=16,48;FDP=73;FR=.;FRO=9;FSAF=0,33;FSAR=16,15;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0237965,0.00248653;FXX=0.0135117;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.8441,171.442;QD=42.0883;RBI=0.0301549,0.0220071;REFB=0.0686429,-0.00591235;REVB=-0.0185215,-0.0218662;RO=9;SAF=0,33;SAR=12,15;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.821146,0.0444296;STB=0.999048,0.503815;STBP=0.001,0.946;TYPE=del,snp;VARB=-0.142311,0.0433326;OID=.,.;OPOS=33253291,33253292;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=TC,TCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.219178,0.657534:12,48:73:16,48:73:9:0,33:16,15:6:3:99:9:0,33:12,15:5:4 chr22 34022284 . G A 272.3 PASS AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.00223982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.897;QD=17.2888;RBI=0.00964148;REFB=0.000199758;REVB=0.0093777;RO=33;SAF=8;SAR=22;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760966;STB=0.542828;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.000171139;OID=.;OPOS=34022284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:22:8:11:22:22:8:11:22 chr22 35463162 . A G 2216.85 PASS AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00294491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.845;QD=63.3385;RBI=0.020462;REFB=0;REVB=0.020249;RO=0;SAF=75;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.32058e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4502e-05;OID=.;OPOS=35463162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:65:75:0:0:65:75:0:0 chr22 35463179 . T C 2312.6 PASS AF=1;AO=144;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.905;QD=63.7958;RBI=0.0310811;REFB=0;REVB=0.00309996;RO=0;SAF=77;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.76828e-05;OID=.;OPOS=35463179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:145:145:0:0:144:145:1:67:77:0:0:67:78:0:0 chr22 35463249 . C T 708.03 PASS AF=0.522727;AO=69;DP=133;FAO=69;FDP=132;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00406183;FXX=0.00751823;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.266;QD=21.4554;RBI=0.00480687;REFB=-0.0241431;REVB=0.00257053;RO=63;SAF=36;SAR=33;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711816;STB=0.539062;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0202301;OID=.;OPOS=35463249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:63:63:69:69:0.522727:33:36:38:25:33:36:38:25 chr22 35480467 . C T 559.9 PASS AF=0.541667;AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00757596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.232;QD=23.329;RBI=0.0111605;REFB=-0.0193663;REVB=-0.0081952;RO=42;SAF=23;SAR=29;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085923;STB=0.537023;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0154452;OID=.;OPOS=35480467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:42:44:52:52:0.541667:29:23:23:19:29:23:23:21 chr22 35660875 . G T 176.65 PASS AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0155196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3605;QD=14.1319;RBI=0.0167634;REFB=-0.00258322;REVB=-0.00633666;RO=31;SAF=14;SAR=5;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290002;STB=0.669515;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00327819;OID=.;OPOS=35660875;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:5:14:15:16:5:14:15:16 chr22 35679951 . T C 1150.32 PASS AF=0.974684;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.016484;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.783;QD=58.2443;RBI=0.0386752;REFB=0.0553505;REVB=-0.0349864;RO=2;SAF=33;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00349053;STB=0.501845;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.000596027;OID=.;OPOS=35679951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:80:79:2:2:77:77:0.974684:44:33:1:1:44:33:1:1 chr22 35817553 . C T 206.45 PASS AF=0.416667;AO=24;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00803125;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.519;QD=13.7631;RBI=0.0362673;REFB=-0.0289194;REVB=0.0353669;RO=36;SAF=16;SAR=8;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124087;STB=0.559392;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0381798;OID=.;OPOS=35817553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:36:35:24:25:0.416667:8:16:20:16:9:16:19:16 chr22 36007045 . G A 805.19 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00313504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.677;QD=64.4153;RBI=0.030042;REFB=0;REVB=0.029878;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101756;OID=.;OPOS=36007045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0 chr22 36007075 . C T 739.08 PASS AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.01367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9314;QD=54.747;RBI=0.0169016;REFB=-0.119702;REVB=-0.00993968;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00193078;OID=.;OPOS=36007075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:21:32:1:0:21:32:1:0 chr22 36122517 . T C 223.2 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00570494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.876;QD=49.599;RBI=0.0857997;REFB=0;REVB=-0.0856098;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00095022;OID=.;OPOS=36122517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0 chr22 36123083 . C T 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.96;QD=59.4346;RBI=0.0163002;REFB=0;REVB=-0.00872222;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94162e-05;OID=.;OPOS=36123083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0 chr22 36537893 . A G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0534693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.966;QD=44.6898;RBI=0.0597013;REFB=0;REVB=0.0265571;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000852425;OID=.;OPOS=36537893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0 chr22 36545137 . A T 955.19 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.386;QD=58.7811;RBI=0.0138865;REFB=0;REVB=0.00557042;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82679e-05;OID=.;OPOS=36545137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:23:42:0:0:23:42:0:0 chr22 36556823 . G T 1472.56 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8416;QD=63.3359;RBI=0.0227834;REFB=0;REVB=0.0212594;RO=0;SAF=37;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69696e-05;OID=.;OPOS=36556823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:56:37:0:0:56:37:0:0 chr22 36573945 . A G 546.11 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.75575e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.0862;QD=59.0392;RBI=0.0258288;REFB=0;REVB=0.0258288;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00325165;OID=.;OPOS=36573945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:19:17:0:0:19:18:0:0 chr22 36575664 . G A 964.61 PASS AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00903674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.263;QD=55.9196;RBI=0.0101415;REFB=-0.0176478;REVB=0.00460295;RO=2;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363077;STB=0.519225;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.000327608;OID=.;OPOS=36575664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:25:42:0:2:25:42:0:2 chr22 36575680 . G T 338.66 PASS AF=0.538462;AO=34;DP=64;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0146578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.86;QD=20.8407;RBI=0.0169153;REFB=-0.0143042;REVB=-0.00844257;RO=30;SAF=24;SAR=10;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161857;STB=0.594003;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0129162;OID=.;OPOS=36575680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:30:30:34:35:0.538462:10:24:16:14:10:25:16:14 chr22 36587202 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.017;QD=50.4134;RBI=0.0461841;REFB=0;REVB=-0.0461469;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454282;OID=.;OPOS=36587202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0 chr22 36587223 . G T 288.92 PASS AF=1;AO=16;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.84708e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.592;QD=52.5306;RBI=0.0376044;REFB=0;REVB=0.0376044;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000750546;OID=.;OPOS=36587223;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:16:22:1:9:7:0:0:12:10:0:0 chr22 36587279 . A G 594.51 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0887;QD=60.9751;RBI=0.071818;REFB=0;REVB=-0.0362096;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000938698;OID=.;OPOS=36587279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0 chr22 36587486 . A G 1009.65 PASS AF=0.934211;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=76;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.016724;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5475;QD=53.1397;RBI=0.0241583;REFB=-0.0711599;REVB=0.0174337;RO=3;SAF=36;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377854;STB=0.519282;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00520682;OID=.;OPOS=36587486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:76:76:3:5:71:71:0.934211:35:36:3:0:35:36:4:1 chr22 36587511 . C T 834.4 PASS AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0463;QD=57.5448;RBI=0.0204816;REFB=0;REVB=-0.000574648;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157383;OID=.;OPOS=36587511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0 chr22 36587845 . A ACT 332.14 PASS AF=0.866667;AO=26;DP=33;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00346959;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=2;MLLD=290.055;QD=44.2855;RBI=0.00669082;REFB=-0.0282252;REVB=-0.00572093;RO=6;SAF=12;SAR=14;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04472;STB=0.528476;STBP=0.469;TYPE=ins;VARB=0.00423927;OID=.;OPOS=36587846;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.866667:26:33:26:30:4:12:14:1:3:20:6:12:14:2:4 chr22 36591380 . A G 594.53 PASS AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.572;QD=60.9778;RBI=0.0455929;REFB=0;REVB=0.0429657;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153251;OID=.;OPOS=36591380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0 chr22 36598049 . C G 627.82 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1155;QD=61.251;RBI=0.113491;REFB=0;REVB=0.0746578;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223337;OID=.;OPOS=36598049;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:18:22:0:0:19:22:0:0 chr22 36598058 . T C 594.17 PASS AF=1;AO=33;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525703;FXX=0.0465008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.929;QD=57.9682;RBI=0.00853954;REFB=0;REVB=0.00672958;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00709743;OID=.;OPOS=36598058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:33:41:1:16:17:0:0:18:23:0:0 chr22 36623731 . T C 1051.91 PASS AF=0.986111;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0152542;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.456;QD=58.4395;RBI=0.0280602;REFB=0.0494744;REVB=0.0235517;RO=1;SAF=42;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111269;STB=0.505881;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00011487;OID=.;OPOS=36623731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:72:1:1:71:71:0.986111:29:42:1:0:29:42:1:0 chr22 36661330 . G A 1062.4 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.148;QD=59.8537;RBI=0.0295427;REFB=0;REVB=-0.00971872;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73443e-05;OID=.;OPOS=36661330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0 chr22 36661536 . C A 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3716;QD=55.656;RBI=0.0205005;REFB=0;REVB=-0.0118377;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000431034;OID=.;OPOS=36661536;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chr22 36661566 . G A 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.438;QD=60.6103;RBI=0.0175455;REFB=0;REVB=0.00460335;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71127e-05;OID=.;OPOS=36661566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0 chr22 36661646 . G A 747.04 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.6493;QD=63.5776;RBI=0.126069;REFB=0;REVB=0.113885;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241455;OID=.;OPOS=36661646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0 chr22 36661842 . G A 263.01 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.012784;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.533;QD=47.8206;RBI=0.0438498;REFB=-0.0130706;REVB=0.0419449;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439301;STB=0.523787;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000283641;OID=.;OPOS=36661842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:10:11:0:1:10:11:0:1 chr22 36677400 . G A 771.4 PASS AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149772;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.674;QD=57.141;RBI=0.0169786;REFB=0;REVB=0.00799721;RO=0;SAF=40;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18693e-05;OID=.;OPOS=36677400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:14:40:0:0:14:40:0:0 chr22 36678453 . C G 772.62 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0682187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.324;QD=61.8099;RBI=0.069033;REFB=-0.168914;REVB=0.0105714;RO=1;SAF=28;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165122;STB=0.508768;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00162986;OID=.;OPOS=36678453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:50:50:1:1:49:49:0.98:21:28:1:0:21:28:1:0 chr22 36678476 . C A 579.12 PASS AF=0.95122;AO=38;DP=42;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0726059;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.322;QD=56.4996;RBI=0.0841133;REFB=-0.103554;REVB=0.0424669;RO=2;SAF=20;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445736;STB=0.522716;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000691794;OID=.;OPOS=36678476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:42:41:2:2:38:39:0.95122:18:20:2:0:18:21:2:0 chr22 36684354 . T C 188.84 PASS AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0254885;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.042;QD=19.8781;RBI=0.0403296;REFB=0.00418771;REVB=-0.031254;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317973;STB=0.679064;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00930362;OID=.;OPOS=36684354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:38:19:19:19:19:0.5:12:7:14:5:12:7:14:5 chr22 36684358 . C A 196.72 PASS AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0102384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.71;QD=18.2998;RBI=0.0374587;REFB=-0.00901849;REVB=0.0360324;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195504;STB=0.611001;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0318533;OID=.;OPOS=36684358;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:12:8:14:9:12:8:14:9 chr22 36691607 . A C 557.13 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.786;QD=60.2306;RBI=0.0404929;REFB=0;REVB=0.0102496;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126621;OID=.;OPOS=36691607;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0 chr22 36700175 . A G 424.18 PASS AF=0.472527;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0123946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.206;QD=18.6452;RBI=0.0149109;REFB=-0.0106448;REVB=0.00828902;RO=48;SAF=30;SAR=13;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220219;STB=0.623232;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00814495;OID=.;OPOS=36700175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:48:48:43:43:0.472527:13:30:23:25:13:30:23:25 chr22 37163329 . C T 627.42 PASS AF=0.895833;AO=43;DP=48;FAO=43;FDP=48;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0325901;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.3569;QD=52.2846;RBI=0.0508272;REFB=-0.193618;REVB=0.0390038;RO=2;SAF=19;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0049111;STB=0.504423;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0219244;OID=.;OPOS=37163329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:48:48:2:5:43:43:0.895833:24:19:1:1:24:19:2:3 chr22 37196970 . AC A,AA 674.43 PASS AF=1,0;AO=16,27;DP=43;FAO=43,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0772888,-0.0778071;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=221.995,215.059;QD=62.7375;RBI=0.0777451,0.0865171;REFB=0,0;REVB=-0.00841051,-0.0378321;RO=0;SAF=2,13;SAR=14,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.39874e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000125676,-0.00238382;OID=.,.;OPOS=37196971,37196971;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0:16,27:43:43,0:43:0:15,0:28,0:0:0:4:0:2,13:14,14:0:0 chr22 37267767 . A G 175.15 PASS AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0238919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.218;QD=20.0176;RBI=0.0253109;REFB=-0.0194174;REVB=-0.00835579;RO=17;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327536;STB=0.518498;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0238241;OID=.;OPOS=37267767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:11:7:6:11:11:7:6:11 chr22 37268257 . C T 219.85 PASS AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00864095;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.717;QD=17.5882;RBI=0.00916188;REFB=0.00876014;REVB=-0.00304531;RO=27;SAF=5;SAR=17;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174197;STB=0.592932;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.0100179;OID=.;OPOS=37268257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:27:28:22:22:0.44:17:5:10:17:17:5:10:18 chr22 37271882 . T C 133.45 PASS AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.000131234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.747;QD=15.7005;RBI=0.0103162;REFB=-0.0249162;REVB=-0.0103153;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445112;STB=0.525658;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0407845;OID=.;OPOS=37271882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:7:8:11:8:7:8:11:8 chr22 37326821 . G A 88.1 PASS AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0135595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.924;QD=14.0962;RBI=0.0366989;REFB=-0.0555708;REVB=0.0341021;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250796;STB=0.514679;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0417452;OID=.;OPOS=37326821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:8:6:5:6:8:6 chr22 37333794 . A G 306.33 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.94;QD=53.2744;RBI=0.0589803;REFB=0;REVB=0.00680072;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002398;OID=.;OPOS=37333794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0 chr22 37398195 . C T 346.46 PASS AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0307483;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2083;QD=16.6967;RBI=0.0346463;REFB=-0.0168211;REVB=-0.0159657;RO=46;SAF=20;SAR=17;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15696;STB=0.587721;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0221521;OID=.;OPOS=37398195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:17:20:32:14:17:20:32:14 chr22 37398201 . C A 373.13 PASS AF=0.458824;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0217935;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.204;QD=17.5591;RBI=0.0235374;REFB=-0.00767878;REVB=0.00889103;RO=45;SAF=22;SAR=17;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146885;STB=0.586165;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00868345;OID=.;OPOS=37398201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:45:46:39:39:0.458824:17:22:32:13:17:22:33:13 chr22 37407107 . TGGGGGGGC TGGGGGG,TGGGGGGC 36.21 PASS AF=0.0454545,0.454545;AO=3,8;DP=21;FAO=1,10;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=1,4;FSAR=0,6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.161648,-0.0976545;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=19.023,8.24445;QD=6.58404;RBI=0.19321,0.113246;REFB=0.000451688,-0.101282;REVB=-0.105829,-0.0573429;RO=8;SAF=2,2;SAR=1,6;SRF=7;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.294841,-0.502688;STB=0.985328,0.666349;STBP=0.563,0.183;TYPE=del,del;VARB=-0.0824531,0.101911;OID=.,.;OPOS=37407114,37407108;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGGGG,TGGGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0454545,0.454545:3,8:21:1,10:22:11:1,4:0,6:8:3:32:8:2,2:1,6:7:1 chr22 37409319 . T C 337.83 PASS AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0392365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6642;QD=17.5496;RBI=0.0406792;REFB=0.00513211;REVB=0.0107374;RO=40;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290058;STB=0.523243;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.0076108;OID=.;OPOS=37409319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:41:36:36:0.467532:16:20:21:19:16:20:21:20 chr22 37453452 . C T 757.8 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.188;QD=61.8609;RBI=0.0837224;REFB=-0.0750788;REVB=0.0372378;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191698;OID=.;OPOS=37453452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:49:49:0:0:48:49:1:29:19:0:0:30:19:0:0 chr22 37462926 . G A 561.38 PASS AF=0.527778;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0207062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.462;QD=20.7918;RBI=0.0214627;REFB=-0.013626;REVB=0.00564781;RO=51;SAF=24;SAR=33;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601917;STB=0.533124;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0118228;OID=.;OPOS=37462926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:51:51:57:57:0.527778:33:24:25:26:33:24:25:26 chr22 37462936 . A G 510.13 PASS AF=0.520408;AO=49;DP=97;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0263262;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.137;QD=20.8216;RBI=0.0443496;REFB=-0.0252613;REVB=0.0356906;RO=47;SAF=17;SAR=32;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151399;STB=0.589892;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0224058;OID=.;OPOS=37462936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:47:47:49:51:0.520408:32:17:24:23:34:17:24:23 chr22 37469591 . G A 194.85 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00631333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.044;QD=17.3201;RBI=0.0319967;REFB=0.00148465;REVB=-0.0313677;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200688;STB=0.599904;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.0029641;OID=.;OPOS=37469591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:10:10:17:7:10:10:17:8 chr22 37480797 . C T 171.09 PASS AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0143552;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.372;QD=16.6916;RBI=0.016956;REFB=0.000306106;REVB=-0.00902419;RO=23;SAF=14;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249323;STB=0.644561;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.00102505;OID=.;OPOS=37480797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:4:14:13:10:4:14:13:10 chr22 37485724 . T C 649.74 PASS AF=0.423529;AO=72;DP=172;FAO=72;FDP=170;FR=.;FRO=98;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=0.00453557;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.802;QD=15.2879;RBI=0.00522888;REFB=-0.00695085;REVB=-0.00260188;RO=97;SAF=32;SAR=40;SRF=38;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552133;STB=0.533324;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00924286;OID=.;OPOS=37485724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:170:97:98:72:72:0.423529:40:32:38:59:40:32:38:60 chr22 37531436 . G A 256.69 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0319219;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.426;QD=15.7962;RBI=0.0377853;REFB=-0.0137778;REVB=0.0202169;RO=36;SAF=20;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143494;STB=0.581337;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.015647;OID=.;OPOS=37531436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:36:36:29:29:0.446154:9:20:20:16:9:20:20:16 chr22 37578388 . C T 358.31 PASS AF=0.638298;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0128094;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.239;QD=30.4946;RBI=0.0215598;REFB=-0.0464269;REVB=0.017342;RO=17;SAF=14;SAR=16;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041404;STB=0.522712;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0237774;OID=.;OPOS=37578388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:17:17:30:30:0.638298:16:14:9:8:16:14:9:8 chr22 37578579 . C T 885.01 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3523;QD=58.0335;RBI=0.0607709;REFB=0;REVB=0.0165052;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000698759;OID=.;OPOS=37578579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0 chr22 37578652 . G A 966.1 PASS AF=0.903614;AO=66;DP=76;FAO=75;FDP=83;FR=.;FRO=8;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0357941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.806;QD=46.5588;RBI=0.0588426;REFB=-0.0469449;REVB=0.0467036;RO=7;SAF=44;SAR=22;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192005;STB=0.501567;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00243539;OID=.;OPOS=37578652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:76:83:7:8:66:75:0.903614:22:44:4:3:27:48:5:3 chr22 37578653 . G A 32.49 PASS AF=0.0952381;AO=8;DP=82;FAO=8;FDP=84;FR=.;FRO=76;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=48;FSRR=28;FWDB=0.0127458;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.4233;QD=1.54696;RBI=0.0162332;REFB=-0.0202721;REVB=-0.0100528;RO=74;SAF=4;SAR=4;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175795;STB=0.618767;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.102777;OID=.;OPOS=37578653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:82:84:74:76:8:8:0.0952381:4:4:48:26:4:4:48:28 chr22 37602583 . G GC 260.19 PASS AF=1;AO=25;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.2935;QD=37.1695;RBI=0.0657836;REFB=-0.00728693;REVB=-0.00608799;RO=2;SAF=13;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661725;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00632916;OID=.;OPOS=37602584;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:25:28:28:28:0:16:12:0:0:3:2:13:12:2:0 chr22 37603745 . G A 154.07 PASS AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0125596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.707;QD=23.7035;RBI=0.0502392;REFB=-0.0269507;REVB=0.048644;RO=10;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181774;STB=0.510191;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0249902;OID=.;OPOS=37603745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:10:6:4:6:10:6:4:6 chr22 37637653 . G C 452.13 PASS AF=0.483871;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00025545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.846;QD=19.4463;RBI=0.0320202;REFB=-0.00377483;REVB=-0.0320192;RO=47;SAF=18;SAR=27;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243167;STB=0.508925;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.00337834;OID=.;OPOS=37637653;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:47:48:45:45:0.483871:27:18:20:27:27:18:20:28 chr22 37678551 . A G 194.91 PASS AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00163014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.351;QD=17.3251;RBI=0.00938023;REFB=-0.0150986;REVB=-0.0092375;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194604;STB=0.5111;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0307334;OID=.;OPOS=37678551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:10:10:12:13:10:10:12:13 chr22 37678565 . G A 233.47 PASS AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0163327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.526;QD=16.9796;RBI=0.0174036;REFB=-0.0195372;REVB=-0.00601077;RO=29;SAF=13;SAR=13;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484183;STB=0.527252;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0278892;OID=.;OPOS=37678565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:13:13:13:16:13:13:13:16 chr22 37699377 . T C 923.35 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0347771;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.1991;QD=56.8216;RBI=0.0360106;REFB=-0.112554;REVB=-0.00934425;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.509801;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00100464;OID=.;OPOS=37699377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:25:39:0:0:25:39:0:1 chr22 37770066 . G T 1062.41 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.779;QD=59.8543;RBI=0.0197954;REFB=0;REVB=-0.0196959;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.99761e-05;OID=.;OPOS=37770066;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0 chr22 37770357 . A G 1133.28 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.6014;QD=60.4416;RBI=0.0221485;REFB=0;REVB=-0.0153632;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17574e-06;OID=.;OPOS=37770357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0 chr22 37771158 . G A 785.29 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3694;QD=64.1056;RBI=0.0548012;REFB=0;REVB=0.0357989;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000817053;OID=.;OPOS=37771158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0 chr22 37771985 . A G 843.3 PASS AF=1;AO=43;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1008;QD=57.1728;RBI=0.116207;REFB=0;REVB=0.0420774;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000851536;OID=.;OPOS=37771985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:43:59:1:25:18:0:0:39:20:0:0 chr22 37900276 . A G 45.35 PASS AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0173328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.337;QD=8.24623;RBI=0.0361447;REFB=-0.0147018;REVB=-0.0317177;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461886;STB=0.782407;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.015991;OID=.;OPOS=37900276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:4:11:2:5:4:11 chr22 37900762 . G A 199.93 PASS AF=0.433962;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0226549;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.299;QD=15.089;RBI=0.0227662;REFB=-0.0143125;REVB=0.00224872;RO=28;SAF=17;SAR=6;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112638;STB=0.550561;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0180205;OID=.;OPOS=37900762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:28:30:23:23:0.433962:6:17:18:10:6:17:20:10 chr22 37906308 . GCTCCTT G 341.19 PASS AF=0.300613;AO=48;DP=138;FAO=49;FDP=163;FR=.;FRO=114;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=60;FSRR=54;FWDB=-0.0567464;FXX=0.0355009;HRUN=1;LEN=6;MLLD=151.889;QD=8.37287;RBI=0.0599191;REFB=-0.0114419;REVB=-0.0192394;RO=69;SAF=29;SAR=19;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881415;STB=0.561513;STBP=0.317;TYPE=del;VARB=0.0399328;OID=.;OPOS=37906309;OREF=CTCCTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.300613:48:138:49:163:114:30:19:60:54:99:69:29:19:36:33 chr22 37966686 . C T 554.48 PASS AF=0.508929;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0381508;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.964;QD=19.8027;RBI=0.0631885;REFB=-0.03715;REVB=-0.0503716;RO=55;SAF=23;SAR=34;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111592;STB=0.561605;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0299602;OID=.;OPOS=37966686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:55:55:57:57:0.508929:34:23:29:26:34:23:29:26 chr22 38051999 . C T 386.84 PASS AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.003367;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.924;QD=23.4447;RBI=0.0159315;REFB=-0.0283802;REVB=-0.0155717;RO=28;SAF=22;SAR=16;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223982;STB=0.512309;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.021572;OID=.;OPOS=38051999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:16:22:17:11:16:22:17:11 chr22 38062112 . C G 109.26 PASS AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0235203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.717;QD=14.0975;RBI=0.0239038;REFB=-0.0247116;REVB=0.00426476;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932572;STB=0.554372;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0233927;OID=.;OPOS=38062112;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:7:6:10:8:7:6:10:8 chr22 38065655 . A G 228.33 PASS AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.000484394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.972;QD=21.7461;RBI=0.0421365;REFB=-0.0225906;REVB=0.0421337;RO=20;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206276;STB=0.615283;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0170793;OID=.;OPOS=38065655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:12:10:14:6:12:10:14:6 chr22 38074343 . C T 304.06 PASS AF=0.588235;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00261109;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.177;QD=23.8479;RBI=0.0113055;REFB=-0.00895538;REVB=0.0109998;RO=21;SAF=14;SAR=16;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100842;STB=0.555519;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0121944;OID=.;OPOS=38074343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:21:21:30:30:0.588235:16:14:7:14:16:14:7:14 chr22 38074434 . G A 288.87 PASS AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0216088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.824;QD=16.2743;RBI=0.022713;REFB=-0.0225224;REVB=0.00699572;RO=36;SAF=16;SAR=16;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184386;STB=0.591494;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0269701;OID=.;OPOS=38074434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:36:39:32:32:0.450704:16:16:11:25:16:16:13:26 chr22 38119213 . G A 264.22 PASS AF=0.529412;AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0431465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.844;QD=20.723;RBI=0.0433052;REFB=-0.0339077;REVB=-0.00370372;RO=24;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426327;STB=0.533309;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0300857;OID=.;OPOS=38119213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:24:24:26:27:0.529412:11:15:15:9:12:15:15:9 chr22 38119754 . TCAA T 48.51 PASS AF=0.583333;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0098874;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=234.375;QD=16.1708;RBI=0.0133435;REFB=-0.0238648;REVB=0.00896037;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=del;VARB=0.0174702;OID=.;OPOS=38119755;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.583333:6:12:7:12:5:4:3:2:3:30:5:3:3:2:3 chr22 38121152 . C A 115.51 PASS AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0115023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3013;QD=8.88552;RBI=0.0613027;REFB=-0.00438965;REVB=-0.060214;RO=37;SAF=9;SAR=6;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714096;STB=0.543249;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0080328;OID=.;OPOS=38121152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:37:37:15:15:0.288462:6:9:20:17:6:9:20:17 chr22 38122122 . T C 551.25 PASS AF=0.56044;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=44;FSRF=9;FSRR=31;FWDB=-0.0503409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7526;QD=24.2309;RBI=0.067979;REFB=0.0162615;REVB=-0.0456829;RO=40;SAF=7;SAR=44;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13167;STB=0.572792;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.0143385;OID=.;OPOS=38122122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:40:40:51:51:0.56044:44:7:9:31:44:7:9:31 chr22 38122462 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.513;QD=33.4284;RBI=0.109887;REFB=0;REVB=-0.108593;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00558914;OID=.;OPOS=38122462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr22 38129332 . G A 436.19 PASS AF=0.45283;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0489813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6823;QD=16.46;RBI=0.110352;REFB=-0.0298367;REVB=0.098886;RO=56;SAF=21;SAR=27;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116069;STB=0.552163;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0347598;OID=.;OPOS=38129332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:56:58:48:48:0.45283:27:21:18:38:27:21:20:38 chr22 38130459 . G T 230.49 PASS AF=0.55;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0162743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.843;QD=23.0491;RBI=0.0237983;REFB=-0.0233367;REVB=0.017364;RO=8;SAF=12;SAR=9;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929886;STB=0.59451;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0185431;OID=.;OPOS=38130459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:8:18:21:22:0.55:9:12:6:2:10:12:6:12 chr22 38130472 . T C 747.03 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1694;QD=63.577;RBI=0.0491464;REFB=0;REVB=-0.0466064;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000446983;OID=.;OPOS=38130472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chr22 38161826 . T G,TG 36.28 PASS AF=0,0.238095;AO=3,7;DP=42;FAO=0,10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=0,1;FSAR=0,9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.000357791,0.00449044;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=179.862,96.9163;QD=3.45536;RBI=0.0181923,0.0105631;REFB=-0.00820207,-0.0101623;REVB=-0.0181888,0.00956116;RO=32;SAF=0,2;SAR=3,5;SRF=19;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.579947,-0.361879;STB=0.5,0.8992;STBP=1,0.006;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.209844;OID=.,.;OPOS=38161826,38161827;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:37:42:42:32:32:3,7:0,10:0,0.238095:3,5:0,2:19:13:0,9:0,1:20:12 chr22 38164106 . C T 142.59 PASS AF=0.4;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.000695638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.819;QD=14.2591;RBI=0.030775;REFB=-0.00621848;REVB=-0.0307671;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663586;STB=0.549938;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0131932;OID=.;OPOS=38164106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:40:23:24:16:16:0.4:8:8:13:10:8:8:14:10 chr22 38202398 . A AC 51.77 PASS AF=0.4;AO=4;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.00739195;FXX=0.0475964;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.9951;QD=10.3539;RBI=0.00739195;REFB=-0.00503452;REVB=0;RO=16;SAF=4;SAR=0;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00382732;OID=.;OPOS=38202399;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.4:4:21:8:20:12:8:0:12:0:51:16:4:0:16:0 chr22 38202552 . T C 774.56 PASS AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.017234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.7341;QD=54.3549;RBI=0.0197844;REFB=0.0384082;REVB=0.00971644;RO=1;SAF=14;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324755;STB=0.517235;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.000116549;OID=.;OPOS=38202552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:57:1:1:55:56:0.982456:41:14:1:0:42:14:1:0 chr22 38202642 . G T 296.39 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00898259;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.217;QD=49.3982;RBI=0.0124387;REFB=0.0615813;REVB=-0.0086043;RO=1;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298695;STB=0.516115;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.000235113;OID=.;OPOS=38202642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:15:8:0:1:15:8:0:1 chr22 38202734 . G C 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.657;QD=54.5177;RBI=0.0287722;REFB=0;REVB=0.0154707;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014319;OID=.;OPOS=38202734;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0 chr22 38204089 . C T 243.8 PASS AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0135377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.847;QD=15.2375;RBI=0.0153631;REFB=-0.0172127;REVB=-0.00726329;RO=36;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21554;STB=0.621865;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0195186;OID=.;OPOS=38204089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:11:17:14:22:11:17:14:22 chr22 38205989 . T C 361.58 PASS AF=0.463415;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.000991788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.226;QD=17.638;RBI=0.0151251;REFB=-0.0251857;REVB=0.0150926;RO=43;SAF=7;SAR=31;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412046;STB=0.729001;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0203121;OID=.;OPOS=38205989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:43:44:38:38:0.463415:31:7:24:19:31:7:24:20 chr22 38251629 . C G 161.84 PASS AF=0.515152;AO=16;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0100355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.382;QD=19.6171;RBI=0.0379881;REFB=-0.00428928;REVB=0.0366386;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518497;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.004058;OID=.;OPOS=38251629;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:33:16:16:16:17:0.515152:10:6:6:10:10:7:6:10 chr22 38273749 . T C 58.61 PASS AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0531222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6216;QD=14.6527;RBI=0.0778626;REFB=-0.0149688;REVB=-0.0569264;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0197817;OID=.;OPOS=38273749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:5:3:3:5:5:3 chr22 38323507 . G T 134.25 PASS AF=0.405405;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0343722;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3992;QD=14.513;RBI=0.040013;REFB=-0.0276177;REVB=-0.020484;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081389;STB=0.568869;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.027308;OID=.;OPOS=38323507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:37:21:22:15:15:0.405405:4:11:14:7:4:11:14:8 chr22 38341134 . T C 166.43 PASS AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0216519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.019;QD=14.7939;RBI=0.0216857;REFB=-0.00477917;REVB=-0.00120998;RO=27;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961317;STB=0.555495;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00701945;OID=.;OPOS=38341134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:9:9:11:16:9:9:11:16 chr22 38369976 . A G 51.55 PASS AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0143967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.297;QD=18.7441;RBI=0.0164218;REFB=-0.0151352;REVB=0.00790004;RO=4;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120201;STB=0.571204;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00831867;OID=.;OPOS=38369976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:1:6:3:1:1:6:3:1 chr22 38474696 . A G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.381;QD=59.0186;RBI=0.0328509;REFB=0;REVB=0.0113157;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341532;OID=.;OPOS=38474696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:25:9:0:0:25:9:0:0 chr22 38477342 . T A 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.872;QD=33.4271;RBI=0.0511813;REFB=0;REVB=0.0215039;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000961965;OID=.;OPOS=38477342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0 chr22 38477930 . G A 295.91 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0236871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5211;QD=49.3177;RBI=0.0584812;REFB=-0.102895;REVB=0.0534693;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402265;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0346698;OID=.;OPOS=38477930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:11:12:0:1:11:12:0:1 chr22 38506509 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00672142;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.786;QD=50.4135;RBI=0.0178;REFB=0;REVB=0.0164822;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.87518e-05;OID=.;OPOS=38506509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0 chr22 38611080 . C G 556.86 PASS AF=0.440299;AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.023136;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.099;QD=16.6226;RBI=0.0333373;REFB=-0.0289263;REVB=-0.0240021;RO=69;SAF=34;SAR=25;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123347;STB=0.559302;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0270065;OID=.;OPOS=38611080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:69:75:59:59:0.440299:25:34:31:38:26:33:34:41 chr22 38615536 . A T 189.44 PASS AF=1;AO=5;DP=14;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262894;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=162.158;QD=44.573;RBI=0.0889604;REFB=0;REVB=0.0849872;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209919;OID=.;OPOS=38615536;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:17:0:0:5:17:1:3:2:0:0:12:5:0:0 chr22 38757572 . T C 30.63 PASS AF=0.0985915;AO=7;DP=71;FAO=7;FDP=71;FR=.;FRO=64;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.00585565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.772;QD=1.72578;RBI=0.00704086;REFB=-0.00210332;REVB=0.00390961;RO=63;SAF=3;SAR=4;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963748;STB=0.564675;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.04835;OID=.;OPOS=38757572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:71:71:63:64:7:7:0.0985915:4:3:22:41:4:3:23:41 chr22 38823136 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.983;QD=53.9108;RBI=0.0150594;REFB=0;REVB=-0.0144085;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000205994;OID=.;OPOS=38823136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0 chr22 38877461 . T G 334.26 PASS AF=0.384615;AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0199634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.783;QD=12.856;RBI=0.0212805;REFB=-0.0141111;REVB=0.00737014;RO=63;SAF=19;SAR=21;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183784;STB=0.515392;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0228568;OID=.;OPOS=38877461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:63:64:40:40:0.384615:21:19:31:32:21:19:32:32 chr22 38903624 . T C 293.99 PASS AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00118898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.22;QD=17.5518;RBI=0.0109475;REFB=-0.0052198;REVB=0.0108828;RO=35;SAF=10;SAR=22;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199735;STB=0.612253;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00620628;OID=.;OPOS=38903624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:22:10:18:17:22:10:18:17 chr22 38993370 . C T 527.66 PASS AF=0.53;AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0126528;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.941;QD=21.1065;RBI=0.0129443;REFB=-0.00663902;REVB=-0.00273178;RO=47;SAF=21;SAR=32;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117682;STB=0.564826;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00652134;OID=.;OPOS=38993370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:47:47:53:53:0.53:32:21:25:22:32:21:25:22 chr22 39069181 . T C 386.99 PASS AF=0.686275;AO=35;DP=51;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.011447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.512;QD=30.3518;RBI=0.0119423;REFB=-0.0255822;REVB=-0.0034035;RO=16;SAF=20;SAR=15;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183826;STB=0.599944;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00839067;OID=.;OPOS=39069181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:16:16:35:35:0.686275:15:20:4:12:15:20:4:12 chr22 39079964 . T C 127.5 PASS AF=0.518519;AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.038141;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.306;QD=18.8887;RBI=0.0382228;REFB=-0.00556444;REVB=-0.00249891;RO=13;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526279;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00535368;OID=.;OPOS=39079964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:13:13:13:14:0.518519:9:4:4:9:9:5:4:9 chr22 39130843 . C G 96.73 PASS AF=0.387097;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=8.84919e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.13;QD=12.4817;RBI=0.000809833;REFB=0.000112806;REVB=-0.000804984;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857139;STB=0.535459;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.000159925;OID=.;OPOS=39130843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:30:31:18:19:12:12:0.387097:7:5:9:9:7:5:9:10 chr22 39134207 . C T 223.58 PASS AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00612567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.696;QD=14.9051;RBI=0.00791603;REFB=-0.020295;REVB=0.00501396;RO=34;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656652;STB=0.537162;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.025952;OID=.;OPOS=39134207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:16:10:11:23:16:10:11:23 chr22 39134712 . GCCT GCCC,GCC,GCT 523.42 PASS AF=0,0.528302,0.471698;AO=15,9,12;DP=48;FAO=0,28,25;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16,8;FSAR=0,12,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.489822,-0.0577332,0.887985;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=19.9801,19.2721,13.4889;QD=39.5034;RBI=0.498253,0.0591636,0.903382;REFB=0,0,0;REVB=0.0912688,0.0129306,-0.166076;RO=8;SAF=15,0,0;SAR=0,9,12;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.848352,-0.857136;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,-0.00687814,0.151318;OID=.,.,.;OPOS=39134715,39134715,39134713;OREF=T,T,C;OALT=C,-,-;OMAPALT=GCCC,GCC,GCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:0,0.528302,0.471698:15,9,12:48:0,28,25:53:0:0,16,8:0,12,17:0:0:99:8:15,0,0:0,9,12:8:0 chr22 39178701 . A G 103.94 PASS AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0139537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1333;QD=10.1405;RBI=0.0159745;REFB=-0.02219;REVB=0.00777688;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251516;STB=0.648445;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0329335;OID=.;OPOS=39178701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:7:6:7:21:7:6:7:21 chr22 39222652 . G A 362.63 PASS AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00516813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.702;QD=20.7218;RBI=0.0187856;REFB=-0.00862576;REVB=0.0180608;RO=33;SAF=20;SAR=17;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109377;STB=0.560408;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0093059;OID=.;OPOS=39222652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:17:20:22:11:17:20:22:11 chr22 39358104 . A G 57.16 PASS AF=0.133333;AO=12;DP=90;FAO=12;FDP=90;FR=.;FRO=78;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.0274442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0011;QD=2.54033;RBI=0.0427238;REFB=-0.00305829;REVB=-0.0327435;RO=78;SAF=2;SAR=10;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473344;STB=0.832778;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0318301;OID=.;OPOS=39358104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:90:90:78:78:12:12:0.133333:10:2:43:35:10:2:43:35 chr22 39358108 . A G 58.07 PASS AF=0.133333;AO=12;DP=85;FAO=12;FDP=90;FR=.;FRO=78;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.0945814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.084;QD=2.58103;RBI=0.0945891;REFB=-0.00738657;REVB=-0.00120208;RO=73;SAF=2;SAR=10;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462413;STB=0.832778;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.028918;OID=.;OPOS=39358108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:85:90:73:78:12:12:0.133333:10:2:39:34:10:2:43:35 chr22 39358111 . C T 57.73 PASS AF=0.131868;AO=12;DP=91;FAO=12;FDP=91;FR=.;FRO=79;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=0.00206027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.635;QD=2.53758;RBI=0.0148384;REFB=-0.00428213;REVB=0.0146947;RO=78;SAF=2;SAR=10;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473344;STB=0.835808;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0387601;OID=.;OPOS=39358111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:91:91:78:79:12:12:0.131868:10:2:43:35:10:2:44:35 chr22 39358132 . G T 48.86 PASS AF=0.114583;AO=11;DP=96;FAO=11;FDP=96;FR=.;FRO=85;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=-0.0201934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9135;QD=2.03577;RBI=0.0245726;REFB=0.000463546;REVB=0.0140014;RO=85;SAF=1;SAR=10;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.540929;STB=0.901206;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00600647;OID=.;OPOS=39358132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:96:96:85:85:11:11:0.114583:10:1:45:40:10:1:45:40 chr22 39358136 . A G 49.72 PASS AF=0.11828;AO=11;DP=93;FAO=11;FDP=93;FR=.;FRO=82;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.0155068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.88;QD=2.13846;RBI=0.0218182;REFB=-0.00175928;REVB=-0.0153483;RO=78;SAF=1;SAR=10;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529528;STB=0.899038;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0109442;OID=.;OPOS=39358136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:93:93:78:82:11:11:0.11828:10:1:39:39:10:1:43:39 chr22 39381826 . A G 689.33 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00211821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.534;QD=62.6662;RBI=0.0141276;REFB=0;REVB=0.0139679;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48377e-05;OID=.;OPOS=39381826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:13:31:0:0:13:31:0:0 chr22 39381999 . T C 182.12 PASS AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000677939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5518;QD=45.5298;RBI=0.000828362;REFB=0;REVB=0.000476007;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434393;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157536;OID=.;OPOS=39381999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:1:0:15:16:1:10:5:0:1:11:5:0:0 chr22 39382079 . C A 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.991;QD=51.1845;RBI=0.0368898;REFB=0;REVB=0.0283753;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408145;OID=.;OPOS=39382079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0 chr22 39387558 . C T 354.36 PASS AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0120566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.491;QD=21.4764;RBI=0.0154482;REFB=0.000635218;REVB=0.00965838;RO=30;SAF=19;SAR=17;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598298;STB=0.533033;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.000503077;OID=.;OPOS=39387558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:17:19:18:12:17:19:18:12 chr22 39440149 . C T 160.2 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00548153;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.1449;QD=45.7716;RBI=0.00939035;REFB=0;REVB=0.0076244;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105067;OID=.;OPOS=39440149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0 chr22 39441096 . G T 958.69 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114073;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.799;QD=58.996;RBI=0.0230751;REFB=0;REVB=0.0200583;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70417e-05;OID=.;OPOS=39441096;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:41:24:0:0:41:24:0:0 chr22 39441203 . C T 820.17 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0382373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.022;QD=55.6047;RBI=0.0396177;REFB=-0.0178122;REVB=-0.0103666;RO=1;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108465;STB=0.505745;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.000441167;OID=.;OPOS=39441203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:43:15:0:1:43:15:0:1 chr22 39445554 . G A 724.16 PASS AF=0.981132;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0501853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.682;QD=54.6532;RBI=0.054161;REFB=-0.101418;REVB=0.020368;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00117158;OID=.;OPOS=39445554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:0:1:51:52:0.981132:27:24:0:0:27:25:1:0 chr22 39477123 . T C 353.56 PASS AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0356781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.247;QD=23.97;RBI=0.0356887;REFB=0.00393136;REVB=0.00087114;RO=24;SAF=14;SAR=21;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167;STB=0.591784;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.0027373;OID=.;OPOS=39477123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:21:14:15:9:21:14:15:9 chr22 39497509 . A G 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0711964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1104;QD=51.9136;RBI=0.0770129;REFB=0;REVB=-0.0293608;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00161614;OID=.;OPOS=39497509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0 chr22 39709009 . G A 801.33 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.571;QD=57.2377;RBI=0.101971;REFB=0;REVB=0.0162038;RO=0;SAF=17;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274758;OID=.;OPOS=39709009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:39:17:0:0:39:17:0:0 chr22 39712981 . A G 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.041;QD=62.022;RBI=0.0399388;REFB=0;REVB=0.00963457;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83501e-05;OID=.;OPOS=39712981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0 chr22 39715593 . C G 312.0 PASS AF=0.6;AO=17;DP=46;FAO=27;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0149027;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.076;QD=27.7329;RBI=0.0154561;REFB=-0.0323143;REVB=-0.00409885;RO=11;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757294;STB=0.576213;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0101333;OID=.;OPOS=39715593;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:45:11:15:17:27:0.6:8:9:7:4:18:9:8:7 chr22 39770597 . A G 272.51 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.267;QD=51.9064;RBI=0.0609709;REFB=0;REVB=-0.0114979;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000724349;OID=.;OPOS=39770597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0 chr22 39777822 . C CCAA 555.16 PASS AF=0.95;AO=36;DP=43;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0176085;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=288.285;QD=55.516;RBI=0.0179955;REFB=-0.0988095;REVB=0.00371224;RO=6;SAF=21;SAR=15;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116566;STB=0.520822;STBP=0.294;TYPE=ins;VARB=0.00581843;OID=.;OPOS=39777823;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=CCAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.95:36:43:38:40:2:23:15:2:0:9:6:21:15:6:0 chr22 39781585 . C T 1113.83 PASS AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.334;QD=60.207;RBI=0.0528525;REFB=0;REVB=0.0283674;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000613102;OID=.;OPOS=39781585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:35:38:0:0:35:39:0:0 chr22 39907941 . G C 387.28 PASS AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00109722;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.786;QD=23.8323;RBI=0.0166641;REFB=-0.0270897;REVB=-0.0166279;RO=26;SAF=14;SAR=24;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158004;STB=0.594991;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0207205;OID=.;OPOS=39907941;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:26:27:38:38:0.584615:24:14:15:11:24:14:16:11 chr22 39966856 . C T 305.18 PASS AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0549876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6411;QD=46.9502;RBI=0.0873777;REFB=-0.0404469;REVB=0.0679061;RO=2;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00596561;STB=0.503223;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0526845;OID=.;OPOS=39966856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:11:13:1:1:11:13:1:1 chr22 40054948 . T C 272.54 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4356;QD=51.913;RBI=0.11111;REFB=0;REVB=0.0358883;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00109051;OID=.;OPOS=40054948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr22 40057273 . T C 1641.88 PASS AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.663;QD=60.2525;RBI=0.0681394;REFB=0;REVB=0.0621266;RO=0;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123017;OID=.;OPOS=40057273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:55:54:0:0:55:54:0:0 chr22 40574169 . TTA AAT,TAA 551.06 PASS AF=0,0.854167;AO=2,29;DP=49;FAO=0,41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=0,10;FSAR=0,31;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.070425,0.00828536;FXX=0.020404;HRUN=8,8;LEN=3,1;MLLD=194.059,30.1087;QD=45.9218;RBI=0.0710467,0.0434798;REFB=-0.0163065,-0.0873853;REVB=-0.00937797,0.0426831;RO=1;SAF=2,3;SAR=0,26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.697199,0.0175878;STB=0.5,0.607787;STBP=1,0.004;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0191217;OID=.,.;OPOS=40574169,40574170;OREF=TTA,T;OALT=AAT,A;OMAPALT=AAT,TAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:34:49:48:1:7:2,29:0,41:0,0.854167:0,26:2,3:0:1:0,31:0,10:6:1 chr22 40673999 . C T 1146.14 PASS AF=0.987342;AO=72;DP=74;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00729146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.965;QD=58.0326;RBI=0.071225;REFB=-0.0305885;REVB=0.0708508;RO=2;SAF=54;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171951;STB=0.504424;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00407287;OID=.;OPOS=40673999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:74:79:2:1:72:78:0.987342:18:54:2:0:22:56:1:0 chr22 40719120 . TGGGGGC TGGGG,TGGGGC 92.54 PASS AF=0.6,0;AO=10,5;DP=25;FAO=15,0;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=5,0;FSAR=10,0;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.215769,0.316196;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=17.7744,9.79388;QD=14.8063;RBI=0.231585,0.326;REFB=-0.137857,-0.0848311;REVB=0.0841133,-0.0793458;RO=7;SAF=4,0;SAR=6,5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0.326531,0.326531;SSEP=0,0;SSSB=-0.123877,-0.748008;STB=0.57133,0.5;STBP=0.404,1;TYPE=del,del;VARB=0.122709,0;OID=.,.;OPOS=40719125,40719121;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGG,TGGGGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.6,0:10,5:25:15,0:25:10:5,0:10,0:5:5:51:7:4,0:6,5:4:3 chr22 40720704 . A G 3280.34 PASS AF=0.986175;AO=213;DP=217;FAO=214;FDP=217;FR=.;FRO=3;FSAF=99;FSAR=115;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0254635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5071;QD=60.4671;RBI=0.0429877;REFB=-0.00672562;REVB=-0.0346346;RO=2;SAF=99;SAR=114;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00952598;STB=0.502835;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-1.3075e-05;OID=.;OPOS=40720704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:217:217:2:3:213:214:0.986175:114:99:2:0:115:99:2:1 chr22 40722745 . A G 941.02 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0104159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.58;QD=57.0313;RBI=0.0320644;REFB=-0.0950346;REVB=0.0303255;RO=1;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119601;STB=0.506327;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00115432;OID=.;OPOS=40722745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:39:26:0:1:39:26:0:1 chr22 40726749 . C T 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.145;QD=64.1539;RBI=0.0271622;REFB=0;REVB=-0.00402874;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36363e-05;OID=.;OPOS=40726749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chr22 40726762 . A G 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2991;QD=62.3508;RBI=0.0526919;REFB=0;REVB=-0.0108923;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000581025;OID=.;OPOS=40726762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0 chr22 40731777 . G A 40.1 PASS AF=0.166667;AO=10;DP=44;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.0221603;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.134;QD=3.81934;RBI=0.0227833;REFB=-0.00172307;REVB=0.00529114;RO=31;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360211;STB=0.91435;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0376193;OID=.;OPOS=40731777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:44:42:31:35:10:7:0.166667:4:6:9:22:1:6:9:26 chr22 40803112 . C T 250.1 PASS AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0393048;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5713;QD=18.5257;RBI=0.0447247;REFB=-0.0315007;REVB=-0.0213409;RO=25;SAF=7;SAR=20;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28345;STB=0.662523;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0288908;OID=.;OPOS=40803112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:27:27:27:0.5:20:7:14:11:20:7:15:12 chr22 40803186 . G T 737.43 PASS AF=0.981481;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2406;QD=54.6243;RBI=0.0485265;REFB=-0.0286695;REVB=0.0428235;RO=1;SAF=15;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030361;STB=0.516123;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0107671;OID=.;OPOS=40803186;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:54:1:1:52:53:0.981481:37:15:1:0:38:15:1:0 chr22 40808676 . A T 185.58 PASS AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00144534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.7792;QD=13.7466;RBI=0.0370884;REFB=0.000771483;REVB=-0.0370602;RO=32;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126892;STB=0.572815;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=-0.00180936;OID=.;OPOS=40808676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:13:9:17:15:13:9:17:15 chr22 40814500 . T C 291.65 PASS AF=0.694444;AO=25;DP=36;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.000377044;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.028;QD=32.4052;RBI=0.0252498;REFB=-0.00791485;REVB=0.025247;RO=11;SAF=6;SAR=19;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256319;STB=0.641436;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00849215;OID=.;OPOS=40814500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:36:36:11:11:25:25:0.694444:19:6:7:4:19:6:7:4 chr22 40814594 . C T 41.7 PASS AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0219012;FXX=0.076864;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.56;QD=13.9004;RBI=0.0242906;REFB=0.00304321;REVB=0.0105058;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280783;STB=0.666171;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.0390733;OID=.;OPOS=40814594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:5:1:3:3:5:1 chr22 40814663 . G A 76.38 PASS AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0050631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.617;QD=25.4588;RBI=0.0200523;REFB=-0.0368458;REVB=0.0194026;RO=3;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292304;STB=0.666295;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0268291;OID=.;OPOS=40814663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:6:3:3:0:6:3:3:0 chr22 41075543 . A G 130.45 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6602;QD=43.4839;RBI=0.047548;REFB=0;REVB=0.00655486;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000672589;OID=.;OPOS=41075543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0 chr22 41075695 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.732;QD=51.9167;RBI=0.0388782;REFB=0;REVB=0.0105594;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214737;OID=.;OPOS=41075695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0 chr22 41078121 . GT G 71.13 PASS AF=0.5625;AO=16;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.022549;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.5663;QD=8.89125;RBI=0.024603;REFB=-0.153142;REVB=-0.0098413;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.444444;SSSB=0.154064;STB=0.613897;STBP=0.21;TYPE=del;VARB=0.162457;OID=.;OPOS=41078122;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.5625:16:32:18:32:14:14:4:8:6:64:15:12:4:9:6 chr22 41523688 . C T 171.43 PASS AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0352071;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.027;QD=12.4675;RBI=0.0359808;REFB=-0.00460191;REVB=0.00742126;RO=34;SAF=15;SAR=6;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330033;STB=0.691303;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00709358;OID=.;OPOS=41523688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:6:15:14:20:6:15:14:20 chr22 41547944 . A G 487.41 PASS AF=0.575;AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00746581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.185;QD=24.3703;RBI=0.0385749;REFB=-0.0110671;REVB=-0.0378455;RO=34;SAF=12;SAR=34;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212219;STB=0.616967;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0051149;OID=.;OPOS=41547944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:0.575:34:12:17:17:34:12:17:17 chr22 41551039 . T A 671.29 PASS AF=0.678571;AO=57;DP=84;FAO=57;FDP=84;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.00445598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.376;QD=31.9661;RBI=0.0156915;REFB=-0.0100216;REVB=-0.0150455;RO=27;SAF=19;SAR=38;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00644817;OID=.;OPOS=41551039;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:27:27:57:57:0.678571:38:19:9:18:38:19:9:18 chr22 41610024 . G A 499.03 PASS AF=0.559524;AO=47;DP=85;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0691855;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.452;QD=23.7633;RBI=0.0729181;REFB=0.00556954;REVB=0.0230307;RO=37;SAF=21;SAR=26;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337335;STB=0.518511;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00355163;OID=.;OPOS=41610024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:37:37:47:47:0.559524:26:21:15:22:26:21:15:22 chr22 41617318 . G C 370.06 PASS AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0161151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.831;QD=19.7364;RBI=0.0161758;REFB=-0.0240912;REVB=-0.00140005;RO=37;SAF=24;SAR=14;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059929;STB=0.533316;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0253441;OID=.;OPOS=41617318;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:14:24:21:16:14:24:21:16 chr22 41645757 . C G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.375;QD=54.5168;RBI=0.058846;REFB=0;REVB=0.0118557;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537792;OID=.;OPOS=41645757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0 chr22 41829794 . C G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.568;QD=52.6132;RBI=0.0182303;REFB=0;REVB=0.0130285;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74611e-07;OID=.;OPOS=41829794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chr22 41833116 . C T 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.298;QD=50.4123;RBI=0.0229702;REFB=0;REVB=0.0129362;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226717;OID=.;OPOS=41833116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chr22 41903813 . A C 332.91 PASS AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0125369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.969;QD=19.0235;RBI=0.0143015;REFB=-0.0234614;REVB=0.00688164;RO=35;SAF=16;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076948;STB=0.542833;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0232998;OID=.;OPOS=41903813;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:19:16:19:16:19:16:19:16 chr22 42059768 . G T 975.27 PASS AF=0.75;AO=81;DP=108;FAO=81;FDP=108;FR=.;FRO=27;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0203841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.558;QD=36.1209;RBI=0.0238534;REFB=-0.0383924;REVB=0.0123883;RO=27;SAF=44;SAR=37;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00581232;STB=0.503111;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0134454;OID=.;OPOS=42059768;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:27:27:81:81:0.75:37:44:15:12:37:44:15:12 chr22 42089623 . T C 741.68 PASS AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000687414;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.882;QD=57.0526;RBI=0.0164727;REFB=0;REVB=0.0164584;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146413;OID=.;OPOS=42089623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0 chr22 42159229 . G T 465.12 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00573406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5863;QD=58.1394;RBI=0.00727856;REFB=0;REVB=-0.00448308;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158229;OID=.;OPOS=42159229;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chr22 42336172 . G A 223.87 PASS AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0115061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.491;QD=19.4668;RBI=0.0153023;REFB=-0.00895593;REVB=0.0100881;RO=24;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100027;STB=0.556715;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00991477;OID=.;OPOS=42336172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:15:7:10:14:15:7:10:14 chr22 42416056 . A G 766.25 PASS AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.819;QD=56.7593;RBI=0.0373872;REFB=0;REVB=0.0114353;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100292;OID=.;OPOS=42416056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:31:23:0:0 chr22 42423110 . G C 554.6 PASS AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0101224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.174;QD=55.4599;RBI=0.0359505;REFB=-0.115733;REVB=-0.034496;RO=2;SAF=22;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407079;STB=0.521728;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0100866;OID=.;OPOS=42423110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:16:22:2:0:16:22:2:0 chr22 42428727 . A T 1405.48 PASS AF=0.989011;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00376642;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0494;QD=61.7794;RBI=0.0450088;REFB=-0.0962506;REVB=0.0448509;RO=1;SAF=52;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902834;STB=0.504761;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0004661;OID=.;OPOS=42428727;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:92:91:1:1:90:90:0.989011:38:52:1:0:38:52:1:0 chr22 42463814 . C T 801.21 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.888;QD=57.2295;RBI=0.0211451;REFB=0;REVB=0.0177634;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60389e-05;OID=.;OPOS=42463814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0 chr22 42473603 . C T 206.55 PASS AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0280349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.433;QD=17.5787;RBI=0.0280553;REFB=-0.0193216;REVB=-0.00106801;RO=26;SAF=7;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241107;STB=0.637548;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0256371;OID=.;OPOS=42473603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:14:7:15:11:14:7:15:11 chr22 42522613 . G C 189.88 PASS AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.000572219;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.98;QD=21.7007;RBI=0.00177317;REFB=-0.0290177;REVB=-0.0016783;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304235;STB=0.670414;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0222284;OID=.;OPOS=42522613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:12:7:12:4:12:7:12:4 chr22 42523636 . C A 97.32 PASS AF=0.207792;AO=16;DP=77;FAO=16;FDP=77;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.00171833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0198;QD=5.05538;RBI=0.0039966;REFB=-0.00157891;REVB=-0.00360834;RO=61;SAF=10;SAR=6;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245217;STB=0.654762;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00729311;OID=.;OPOS=42523636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:77:77:61:61:16:16:0.207792:6:10:26:35:6:10:26:35 chr22 42523943 . A G 885.43 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.868;QD=58.0609;RBI=0.037961;REFB=0;REVB=0.0114573;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224998;OID=.;OPOS=42523943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0 chr22 42525756 . G A 287.04 PASS AF=0.568627;AO=26;DP=49;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00104713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.032;QD=22.5128;RBI=0.0596466;REFB=-0.0219665;REVB=0.0596374;RO=21;SAF=18;SAR=8;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677183;STB=0.543201;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0176985;OID=.;OPOS=42525756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:21:22:26:29:0.568627:8:18:16:5:9:20:17:5 chr22 42526694 . G A 315.49 PASS AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0444715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.924;QD=22.5346;RBI=0.0486843;REFB=-0.0185325;REVB=0.0198102;RO=23;SAF=14;SAR=18;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357773;STB=0.509085;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0134346;OID=.;OPOS=42526694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:23:24:32:32:0.571429:18:14:9:14:18:14:10:14 chr22 42536313 . G A 206.52 PASS AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0108646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.943;QD=23.602;RBI=0.0564656;REFB=-0.0144216;REVB=0.0554105;RO=14;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370888;STB=0.507197;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00729804;OID=.;OPOS=42536313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:9:11:7:7:9:11:8:7 chr22 42537196 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000502816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.85;QD=56.7066;RBI=0.00360091;REFB=0;REVB=-0.00356563;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.12321e-05;OID=.;OPOS=42537196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chr22 42537271 . T C 559.65 PASS AF=0.738462;AO=48;DP=65;FAO=48;FDP=65;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0460021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.99;QD=34.4399;RBI=0.0466887;REFB=-0.0200061;REVB=0.00797768;RO=17;SAF=22;SAR=26;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169533;STB=0.591052;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00570809;OID=.;OPOS=42537271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:17:17:48:48:0.738462:26:22:2:15:26:22:2:15 chr22 42537404 . G C 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.884;QD=64.1537;RBI=0.00476579;REFB=0;REVB=-0.00317309;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.42913e-05;OID=.;OPOS=42537404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0 chr22 42537597 . A G 230.88 PASS AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00843481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.27;QD=23.0883;RBI=0.00990289;REFB=-0.00425677;REVB=0.00518856;RO=18;SAF=6;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330752;STB=0.685539;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00903253;OID=.;OPOS=42537597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:16:6:12:6:16:6:12:6 chr22 42538029 . A G 937.6 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.326;QD=58.5997;RBI=0.00708689;REFB=0;REVB=0.00489443;RO=0;SAF=23;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.85678e-05;OID=.;OPOS=42538029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:41:23:0:0:41:23:0:0 chr22 42538508 . AG GA 165.99 PASS AF=0.882353;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00698632;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.459;QD=39.0568;RBI=0.00718723;REFB=-0.0901436;REVB=0.00168747;RO=2;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394328;STB=0.52171;STBP=0.785;TYPE=mnp;VARB=0.0066897;OID=.;OPOS=42538508;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:18:17:2:2:15:15:0.882353:10:5:1:1:10:5:1:1 chr22 42538514 . T TC 162.23 PASS AF=0.941176;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0318815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.2734;QD=38.1714;RBI=0.0395742;REFB=-0.0244054;REVB=-0.0234454;RO=1;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479918;STB=0.52378;STBP=0.521;TYPE=ins;VARB=-0.000723401;OID=.;OPOS=42538515;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.941176:15:17:16:17:1:6:10:0:1:5:1:6:9:0:1 chr22 42538669 . C T 113.11 PASS AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0317345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.966;QD=17.4023;RBI=0.0365959;REFB=-0.0318152;REVB=0.0182258;RO=13;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146024;STB=0.58428;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0252128;OID=.;OPOS=42538669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:9:4:6:7:9:4:6:7 chr22 42538670 . G T 88.59 PASS AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0139676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.549;QD=13.6297;RBI=0.0272184;REFB=-0.0321205;REVB=-0.0233612;RO=12;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188581;STB=0.657268;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0519841;OID=.;OPOS=42538670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:26:26:12:15:11:11:0.423077:5:6:4:8:5:6:4:11 chr22 42606257 . C T 217.63 PASS AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0128554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.905;QD=22.9084;RBI=0.0166161;REFB=-0.0266736;REVB=0.0105278;RO=17;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517698;STB=0.52894;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0272725;OID=.;OPOS=42606257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:11:10:7:10:11:10:7:10 chr22 42912029 . G T 115.64 PASS AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0598656;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9043;QD=11.0131;RBI=0.0758976;REFB=-0.0178789;REVB=-0.0466536;RO=28;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404376;STB=0.524103;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0355065;OID=.;OPOS=42912029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:8:6:13:15:8:6:13:15 chr22 42912106 . C T 322.21 PASS AF=0.592593;AO=31;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0308527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.4;QD=23.8672;RBI=0.0340378;REFB=-0.00285416;REVB=0.0143763;RO=22;SAF=13;SAR=18;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043411;STB=0.530787;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00166468;OID=.;OPOS=42912106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:22:22:31:32:0.592593:18:13:8:14:18:14:8:14 chr22 42961277 . T C 77.93 PASS AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00540414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.488;QD=14.1694;RBI=0.0174777;REFB=0.00630622;REVB=-0.0166213;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655979;STB=0.538386;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.011799;OID=.;OPOS=42961277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:8:4:4:6:8:4 chr22 42961298 . T A 68.82 PASS AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.013023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.622;QD=15.2927;RBI=0.0279616;REFB=-0.00470106;REVB=-0.0247437;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00397073;OID=.;OPOS=42961298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:5:4:4:5:5:4 chr22 42965169 . A AG 319.23 PASS AF=0.651163;AO=25;DP=45;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00652308;FXX=0.0444346;HRUN=0;LEN=1;MLLD=208.997;QD=29.6955;RBI=0.0099913;REFB=-0.0149124;REVB=0.00756806;RO=15;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153141;STB=0.582723;STBP=0.121;TYPE=ins;VARB=0.00710116;OID=.;OPOS=42965170;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.651163:25:45:28:43:15:12:16:10:5:99:15:11:14:10:5 chr22 42970032 . T C 60.3 PASS AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0464754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.133;QD=17.2298;RBI=0.0546261;REFB=-0.0440268;REVB=0.0287062;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21129;STB=0.624664;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.016883;OID=.;OPOS=42970032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:3:3:6:2:3:3 chr22 43036245 . G A 439.36 PASS AF=0.591549;AO=42;DP=71;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0147444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.852;QD=24.7527;RBI=0.0166706;REFB=-0.00763921;REVB=0.00777887;RO=29;SAF=20;SAR=22;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00490521;STB=0.502687;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00526998;OID=.;OPOS=43036245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:29:29:42:42:0.591549:22:20:14:15:22:20:14:15 chr22 43088668 . G A 78.64 PASS AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00592933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.379;QD=14.9786;RBI=0.0366251;REFB=-0.0103204;REVB=0.036142;RO=11;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501495;STB=0.529352;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.016747;OID=.;OPOS=43088668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:6:4:5:6:6:4:5:6 chr22 43089858 . C T 108.61 PASS AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0170488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.348;QD=13.5766;RBI=0.018288;REFB=-0.010627;REVB=-0.00661751;RO=19;SAF=3;SAR=10;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536492;STB=0.81037;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0190259;OID=.;OPOS=43089858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:10:3:15:4:10:3:15:4 chr22 43193641 . G A 72.35 PASS AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00656254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.091;QD=8.51179;RBI=0.00836299;REFB=-0.00251937;REVB=-0.00518389;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208064;STB=0.627655;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00938137;OID=.;OPOS=43193641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:4:6:10:14:4:6:10:14 chr22 43206950 . A C 171.08 PASS AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.082238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1087;QD=17.547;RBI=0.087812;REFB=-0.0248102;REVB=0.0307873;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389249;STB=0.52223;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0291007;OID=.;OPOS=43206950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:11:7:9:12:11:7:9:12 chr22 43435812 . C T 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428029;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.172;QD=47.8223;RBI=0.0509353;REFB=0;REVB=0.02761;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000596413;OID=.;OPOS=43435812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0 chr22 43455432 . G A 207.67 PASS AF=0.396825;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.000546903;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.122;QD=13.1852;RBI=0.0341471;REFB=-0.0142594;REVB=-0.0341428;RO=38;SAF=14;SAR=11;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280082;STB=0.659113;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0181202;OID=.;OPOS=43455432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:38:38:25:25:0.396825:11:14:11:27:11:14:11:27 chr22 43459864 . G A 240.54 PASS AF=0.5;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0162663;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1261;QD=19.2429;RBI=0.0165566;REFB=-0.00673954;REVB=-0.00308702;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141918;STB=0.579554;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00503443;OID=.;OPOS=43459864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:50:25:25:25:25:0.5:11:14:10:15:11:14:10:15 chr22 43465814 . A G 266.17 PASS AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00699036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4486;QD=21.2934;RBI=0.00726203;REFB=0.0223019;REVB=-0.00196772;RO=25;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181881;STB=0.602208;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.0154925;OID=.;OPOS=43465814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:16:9:14:11:16:9:14:11 chr22 43466247 . G C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.423;QD=44.6896;RBI=0.0454034;REFB=0;REVB=0.0230131;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240537;OID=.;OPOS=43466247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0 chr22 43558926 . A G 920.01 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9928;QD=58.4136;RBI=0.0166646;REFB=0;REVB=-0.00192175;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193625;OID=.;OPOS=43558926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0 chr22 43563472 . CCT C 252.39 PASS AF=0.475;AO=36;DP=81;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00555324;FXX=0.0123442;HRUN=4;LEN=2;MLLD=176.916;QD=12.6193;RBI=0.00750627;REFB=-0.0285575;REVB=-0.0050503;RO=43;SAF=18;SAR=18;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0.317697;SSSB=-0.0338451;STB=0.524987;STBP=0.706;TYPE=del;VARB=0.0301005;OID=.;OPOS=43563473;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.475:36:81:38:80:42:19:19:23:19:99:43:18:18:23:20 chr22 43563672 . A G 36.41 PASS AF=0.285714;AO=7;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00813918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3008;QD=6.93436;RBI=0.012452;REFB=0.00543902;REVB=-0.00942372;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162774;STB=0.666173;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=-0.015469;OID=.;OPOS=43563672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:14:15:7:6:0.285714:4:3:4:10:3:3:4:11 chr22 43567876 . G A 344.85 PASS AF=0.555556;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0343743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.557;QD=21.895;RBI=0.0392809;REFB=-0.066352;REVB=-0.0190105;RO=26;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704714;STB=0.522199;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0484122;OID=.;OPOS=43567876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:26:28:35:35:0.555556:17:18:11:15:17:18:13:15 chr22 43606143 . C T 398.32 PASS AF=0.609375;AO=38;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0156355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4902;QD=24.8947;RBI=0.0162492;REFB=-0.0452724;REVB=-0.00442359;RO=22;SAF=18;SAR=20;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128886;STB=0.52288;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0312691;OID=.;OPOS=43606143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:22:25:38:39:0.609375:20:18:10:12:21:18:13:12 chr22 43606215 . G A 242.05 PASS AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0215298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2894;QD=14.8951;RBI=0.0661624;REFB=-0.0176856;REVB=0.0625614;RO=36;SAF=16;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153138;STB=0.59382;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0274789;OID=.;OPOS=43606215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:37:28:28:0.430769:12:16:15:21:12:16:15:22 chr22 43610207 . A G 648.13 PASS AF=0.503876;AO=65;DP=127;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0424553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6527;QD=20.0972;RBI=0.0426271;REFB=-0.0269731;REVB=0.0038231;RO=62;SAF=39;SAR=26;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104671;STB=0.566017;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0241762;OID=.;OPOS=43610207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:129:62:64:65:65:0.503876:26:39:30:32:26:39:30:34 chr22 43623418 . G C 43.07 PASS AF=0.384615;AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0308628;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.5833;QD=13.2526;RBI=0.0491593;REFB=0.0364746;REVB=0.0382638;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231237;STB=0.6423;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0435402;OID=.;OPOS=43623418;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:13:13:6:6:5:5:0.384615:3:2:4:2:3:2:4:2 chr22 43936219 . C T 356.15 PASS AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0585728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.411;QD=21.9168;RBI=0.058767;REFB=-0.0238506;REVB=0.00477328;RO=29;SAF=15;SAR=21;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054342;STB=0.530009;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0191954;OID=.;OPOS=43936219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:21:15:14:15:21:15:14:15 chr22 44079645 . T C 421.5 PASS AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0105645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.824;QD=18.3259;RBI=0.0208862;REFB=0.00195771;REVB=0.0180174;RO=45;SAF=20;SAR=23;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191398;STB=0.530598;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.00173442;OID=.;OPOS=44079645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:49:43:43:0.467391:23:20:20:25:23:20:20:29 chr22 44083442 . T C 944.18 PASS AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0412113;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9761;QD=57.2233;RBI=0.055586;REFB=-0.0535537;REVB=0.0373018;RO=1;SAF=21;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106171;STB=0.505616;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00102844;OID=.;OPOS=44083442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:44:21:0:1:44:21:0:1 chr22 44112845 . C T 1840.9 PASS AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.758;QD=61.3633;RBI=0.0564505;REFB=0;REVB=0.00741837;RO=0;SAF=59;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116022;OID=.;OPOS=44112845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:61:59:0:0:61:59:0:0 chr22 44178103 . T C 803.96 PASS AF=0.456522;AO=84;DP=184;FAO=84;FDP=184;FR=.;FRO=100;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=55;FWDB=0.0301556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.163;QD=17.4773;RBI=0.0381824;REFB=-0.0200445;REVB=0.0234208;RO=100;SAF=41;SAR=43;SRF=45;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373956;STB=0.520731;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0226874;OID=.;OPOS=44178103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:100:100:84:84:0.456522:43:41:45:55:43:41:45:55 chr22 44221565 . C CAATA 957.64 PASS AF=0.884615;AO=67;DP=81;FAO=69;FDP=78;FR=.;FRO=9;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0201681;FXX=0.0602337;HRUN=2;LEN=4;MLLD=269.496;QD=49.1095;RBI=0.0202;REFB=0.00991199;REVB=0.00113518;RO=10;SAF=39;SAR=28;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297379;STB=0.510326;STBP=0.655;TYPE=ins;VARB=-0.000938641;OID=.;OPOS=44221566;OREF=-;OALT=AATA;OMAPALT=CAATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.884615:67:81:69:78:9:40:29:6:3:41:10:39:28:7:3 chr22 44282276 . A G 258.62 PASS AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00779565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.691;QD=16.4201;RBI=0.0320489;REFB=-0.0129201;REVB=-0.0310863;RO=34;SAF=19;SAR=10;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691128;STB=0.53898;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0151399;OID=.;OPOS=44282276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:10:19:20:14:10:19:20:14 chr22 44282307 . G A 255.74 PASS AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0156458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.83;QD=15.738;RBI=0.0199538;REFB=0.00656696;REVB=0.0123839;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941007;STB=0.553201;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-0.0104798;OID=.;OPOS=44282307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:11:18:19:17:11:18:19:17 chr22 44285765 . A G 191.63 PASS AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00957513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.421;QD=15.643;RBI=0.0186164;REFB=-0.0066858;REVB=0.0159652;RO=29;SAF=5;SAR=15;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448106;STB=0.757321;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00879425;OID=.;OPOS=44285765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:15:5:20:9:15:5:20:9 chr22 44287062 . A G 311.04 PASS AF=0.559322;AO=32;DP=57;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0169821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7689;QD=21.0872;RBI=0.05473;REFB=-0.0472837;REVB=-0.0520287;RO=24;SAF=17;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887484;STB=0.557343;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0346317;OID=.;OPOS=44287062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:24:26:32:33:0.559322:15:17:10:14:16:17:10:16 chr22 44287629 . G A 395.04 PASS AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.00648165;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.687;QD=22.5737;RBI=0.036811;REFB=-0.0273166;REVB=0.0362359;RO=31;SAF=16;SAR=23;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212766;STB=0.617055;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0204448;OID=.;OPOS=44287629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:23:16:21:10:23:16:21:10 chr22 44322922 . T G 473.58 PASS AF=0.637681;AO=43;DP=68;FAO=44;FDP=69;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0102461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.021;QD=27.4541;RBI=0.0110956;REFB=-0.0235112;REVB=-0.00425786;RO=24;SAF=15;SAR=28;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213506;STB=0.615947;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0130495;OID=.;OPOS=44322922;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:24:25:43:44:0.637681:28:15:16:8:28:16:17:8 chr22 44342116 . A G 646.84 PASS AF=0.977273;AO=42;DP=45;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0301342;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.122;QD=58.8035;RBI=0.0329047;REFB=-0.0462998;REVB=0.0132156;RO=1;SAF=25;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184086;STB=0.514279;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00133389;OID=.;OPOS=44342116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:44:1:1:42:43:0.977273:17:25:1:0:17:26:0:1 chr22 44368204 . A G 1456.98 PASS AF=1;AO=90;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8196;QD=62.6657;RBI=0.0635778;REFB=0;REVB=-0.0136657;RO=1;SAF=38;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123092;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000502793;OID=.;OPOS=44368204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:92:93:1:0:90:93:1:52:38:1:0:53:40:0:0 chr22 44379822 . T C 679.01 PASS AF=0.896552;AO=51;DP=62;FAO=52;FDP=58;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0043858;FXX=0.0645057;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.07;QD=46.8282;RBI=0.00455561;REFB=0.0119729;REVB=0.00123221;RO=6;SAF=20;SAR=31;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560651;STB=0.530375;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00192644;OID=.;OPOS=44379822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:62:58:6:6:51:52:0.896552:31:20:4:2:32:20:4:2 chr22 44379838 . A G 854.12 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.499;QD=56.0076;RBI=0.0231978;REFB=-0.0772365;REVB=0.0165475;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.506847;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000814821;OID=.;OPOS=44379838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:36:24:0:0:36:24:0:1 chr22 44386281 . C T 1008.46 PASS AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6993;QD=59.3213;RBI=0.017435;REFB=0;REVB=0.0126142;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130206;OID=.;OPOS=44386281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0 chr22 44489868 . T C 888.33 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0582866;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7571;QD=58.2509;RBI=0.0963623;REFB=0;REVB=-0.0767357;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115109;OID=.;OPOS=44489868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0 chr22 44489896 . T C 672.89 PASS AF=0.93617;AO=43;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.016689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.462;QD=57.267;RBI=0.0199946;REFB=0.0440554;REVB=0.0110119;RO=2;SAF=16;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551391;STB=0.529398;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00298559;OID=.;OPOS=44489896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:47:47:2:2:43:44:0.93617:27:16:2:0:28:16:2:0 chr22 44546582 . A G 769.51 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000218093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.257;QD=57.0006;RBI=0.0107098;REFB=0;REVB=-0.0107076;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.64341e-05;OID=.;OPOS=44546582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chr22 44559755 . C T 778.99 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7075;QD=63.5913;RBI=0.0928033;REFB=0;REVB=0.027162;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000921289;OID=.;OPOS=44559755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:18:28:0:0:20:29:0:0 chr22 44568932 . G A 277.6 PASS AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0154659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7366;QD=20.5629;RBI=0.0165705;REFB=0.00831984;REVB=-0.00594863;RO=25;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313603;STB=0.673155;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00553266;OID=.;OPOS=44568932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:17:12:20:5:17:12:20:5 chr22 44582499 . T C 223.78 PASS AF=0.380282;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00629862;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.649;QD=12.6075;RBI=0.0113713;REFB=-0.00392018;REVB=0.00946747;RO=44;SAF=13;SAR=14;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117777;STB=0.567518;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00790943;OID=.;OPOS=44582499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:44:44:27:27:0.380282:14:13:26:18:14:13:26:18 chr22 44602229 . A C 208.07 PASS AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.00248299;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.464;QD=15.1324;RBI=0.0057478;REFB=-0.00262623;REVB=0.00518382;RO=31;SAF=16;SAR=8;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0871079;STB=0.549256;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00345697;OID=.;OPOS=44602229;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:8:16:23:8:8:16:23:8 chr22 44965320 . G A 888.65 PASS AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0975001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7242;QD=56.4222;RBI=0.115174;REFB=-0.101395;REVB=0.061308;RO=0;SAF=17;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514281;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00131724;OID=.;OPOS=44965320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:45:17:0:0:45:17:1:0 chr22 45075738 . T C 318.42 PASS AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00134609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.666;QD=23.1578;RBI=0.0120496;REFB=-0.00350795;REVB=0.0119742;RO=23;SAF=12;SAR=20;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581603;STB=0.532;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00408813;OID=.;OPOS=45075738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:20:12:7:16:20:12:7:16 chr22 45126775 . TA AC,CA 1238.9 PASS AF=0.0487805,0.95122;AO=4,67;DP=82;FAO=4,78;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=4,47;FSAR=0,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00633053,-0.00527897;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=72.5926,121.384;QD=60.4341;RBI=0.0178551,0.0442717;REFB=0,0;REVB=0.0166952,0.0439558;RO=0;SAF=4,36;SAR=0,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00606976,0.000962512;OID=.,.;OPOS=45126775,45126775;OREF=TA,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:82:82:0:0:4,67:4,78:0.0487805,0.95122:0,31:4,36:0:0:0,31:4,47:0:0 chr22 45128232 . T C 646.53 PASS AF=0.440994;AO=71;DP=162;FAO=71;FDP=161;FR=.;FRO=90;FSAF=11;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=46;FWDB=-0.013966;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9471;QD=16.0629;RBI=0.0191472;REFB=-0.0111439;REVB=-0.0130984;RO=90;SAF=11;SAR=60;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422141;STB=0.738839;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0254804;OID=.;OPOS=45128232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:90:90:71:71:0.440994:60:11:44:46:60:11:44:46 chr22 45198009 . A G 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4651;QD=62.982;RBI=0.0443859;REFB=0;REVB=-0.0167729;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306964;OID=.;OPOS=45198009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0 chr22 45244930 . C T 257.12 PASS AF=0.521739;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0656136;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.85;QD=22.3581;RBI=0.0660226;REFB=4.27698e-05;REVB=0.00733768;RO=22;SAF=6;SAR=18;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254671;STB=0.514274;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.000378055;OID=.;OPOS=45244930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:46:22:22:24:24:0.521739:18:6:6:16:18:6:6:16 chr22 45255580 . G C 174.34 PASS AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0641481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.975;QD=11.623;RBI=0.064386;REFB=-0.0169988;REVB=0.00552944;RO=38;SAF=3;SAR=19;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413447;STB=0.745604;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.032651;OID=.;OPOS=45255580;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:19:3:16:22:19:3:16:22 chr22 45255637 . G C 338.27 PASS AF=0.37963;AO=41;DP=108;FAO=41;FDP=108;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0186214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1411;QD=12.5286;RBI=0.0518665;REFB=0.000187255;REVB=-0.0484084;RO=67;SAF=16;SAR=25;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11352;STB=0.564744;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00115408;OID=.;OPOS=45255637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:67:67:41:41:0.37963:25:16:33:34:25:16:33:34 chr22 45258324 . C T 101.17 PASS AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0406886;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.347;QD=8.4304;RBI=0.0439173;REFB=0.00468186;REVB=0.0165278;RO=35;SAF=3;SAR=10;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513191;STB=0.81037;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00524582;OID=.;OPOS=45258324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:10:3:24:11:10:3:24:11 chr22 45277909 . A G 173.29 PASS AF=0.404255;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0155158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.327;QD=14.7485;RBI=0.015684;REFB=-0.0187231;REVB=-0.00229102;RO=28;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191516;STB=0.589192;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0248339;OID=.;OPOS=45277909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:28:28:18:19:0.404255:7:11:12:16:8:11:12:16 chr22 45278187 . A T 126.69 PASS AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0292209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.539;QD=11.2611;RBI=0.0310319;REFB=-0.0124082;REVB=-0.0104461;RO=30;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193245;STB=0.615227;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0215277;OID=.;OPOS=45278187;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:10:5:15:15:10:5:15:15 chr22 45566843 . A G 830.97 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.751;QD=57.308;RBI=0.0168973;REFB=0;REVB=0.0115671;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10954e-05;OID=.;OPOS=45566843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:33:24:0:0:34:24:0:0 chr22 45566912 . C A 813.44 PASS AF=1;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.384;QD=56.0991;RBI=0.0179016;REFB=0;REVB=0.0097425;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506688;OID=.;OPOS=45566912;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:56:58:1:34:22:0:0:36:22:0:0 chr22 45577231 . T C 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.822;QD=53.9112;RBI=0.0108272;REFB=0;REVB=-0.00152425;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.91453e-05;OID=.;OPOS=45577231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chr22 45583898 . A G 710.24 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.764;QD=54.6342;RBI=0.0367332;REFB=-0.0148845;REVB=0.0251941;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508471;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000395269;OID=.;OPOS=45583898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:29:22:0:0:29:22:0:1 chr22 45603631 . C G 924.11 PASS AF=0.492308;AO=94;DP=186;FAO=96;FDP=195;FR=.;FRO=99;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=58;FSRR=41;FWDB=0.0182062;FXX=0.0346518;HRUN=6;LEN=1;MLLD=146.922;QD=18.9561;RBI=0.0301757;REFB=-0.0266822;REVB=0.0240647;RO=91;SAF=58;SAR=36;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032501;STB=0.515281;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00700592;OID=.;OPOS=45603631;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:195:91:99:94:96:0.492308:36:58:53:38:37:59:58:41 chr22 45603638 . A G 819.54 PASS AF=0.436893;AO=89;DP=204;FAO=90;FDP=206;FR=.;FRO=116;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=71;FSRR=45;FWDB=-0.00218775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.911;QD=15.9134;RBI=0.00378125;REFB=-0.0190762;REVB=-0.00308409;RO=114;SAF=52;SAR=37;SRF=70;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311208;STB=0.513541;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0208909;OID=.;OPOS=45603638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:206:114:116:89:90:0.436893:37:52:70:44:37:53:71:45 chr22 45683304 . G C 45.66 PASS AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0129952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.846;QD=8.69805;RBI=0.016775;REFB=-0.00144675;REVB=-0.0106078;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388841;STB=0.749167;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00335942;OID=.;OPOS=45683304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:6:1:6:8:6:1:6:8 chr22 45685002 . A G 465.14 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.06041e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.209;QD=58.1421;RBI=0.00378617;REFB=0;REVB=-0.00378595;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.96942e-06;OID=.;OPOS=45685002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0 chr22 45691594 . A G 766.43 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7678;QD=63.8695;RBI=0.0300301;REFB=0;REVB=-0.00238352;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000325365;OID=.;OPOS=45691594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0 chr22 45718041 . A G 1593.46 PASS AF=0.981818;AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0046638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.984;QD=57.9438;RBI=0.00466677;REFB=-0.114571;REVB=0.000166335;RO=2;SAF=53;SAR=53;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500168;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00109059;OID=.;OPOS=45718041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:109:110:2:2:106:108:0.981818:53:53:1:1:55:53:1:1 chr22 45723807 . G C 803.09 PASS AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.042072;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5805;QD=54.4465;RBI=0.0521509;REFB=-0.10381;REVB=-0.0308166;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159856;STB=0.508194;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00291943;OID=.;OPOS=45723807;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:57:58:0.983051:28:29:1:0:28:30:1:0 chr22 45723842 . G A 644.69 PASS AF=0.897959;AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00378777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.358;QD=52.6276;RBI=0.00878256;REFB=-0.146572;REVB=-0.00792377;RO=2;SAF=23;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00185832;STB=0.528412;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00198218;OID=.;OPOS=45723842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:49:49:2:5:44:44:0.897959:21:23:1:1:21:23:4:1 chr22 45723947 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0407568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.887;QD=35.5754;RBI=0.0407568;REFB=0;REVB=1.7184e-05;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000914061;OID=.;OPOS=45723947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0 chr22 45728370 . G A 1232.22 PASS AF=0.976471;AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0418745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.84;QD=57.987;RBI=0.0421773;REFB=-0.220181;REVB=0.00504511;RO=3;SAF=45;SAR=37;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305258;STB=0.510636;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00434641;OID=.;OPOS=45728370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:85:85:3:2:82:83:0.976471:37:45:3:0:37:46:2:0 chr22 45737787 . A G 232.58 PASS AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0691003;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5432;QD=15.005;RBI=0.0693306;REFB=-0.00520056;REVB=-0.00564692;RO=35;SAF=10;SAR=17;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146678;STB=0.583271;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00521159;OID=.;OPOS=45737787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:17:10:18:17:17:10:18:17 chr22 45767391 . C T 253.59 PASS AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00209699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.693;QD=17.4891;RBI=0.00250451;REFB=-0.0137699;REVB=0.00136937;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286651;STB=0.654335;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0190228;OID=.;OPOS=45767391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:30:28:28:0.482759:8:20:12:17:8:20:13:17 chr22 45767455 . A G 708.55 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.587;QD=62.9824;RBI=0.0466932;REFB=0;REVB=0.0183704;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000529567;OID=.;OPOS=45767455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:20:24:0:0:21:24:0:0 chr22 45782903 . T C 1415.31 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.358;QD=62.9028;RBI=0.0540541;REFB=0;REVB=-0.0173663;RO=0;SAF=32;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7991e-05;OID=.;OPOS=45782903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:58:32:0:0:58:32:0:0 chr22 45789642 . A C 526.77 PASS AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0139443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.425;QD=56.9476;RBI=0.0208901;REFB=-0.00025177;REVB=0.0155548;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.512188;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00025712;OID=.;OPOS=45789642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:20:16:0:0:20:16:0:1 chr22 45813687 . G A 389.09 PASS AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=0.00301918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0949;QD=18.7512;RBI=0.0163849;REFB=0.013862;REVB=0.0161043;RO=42;SAF=20;SAR=20;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265188;STB=0.63849;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0112453;OID=.;OPOS=45813687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:43:40:40:0.481928:20:20:9:33:20:20:10:33 chr22 45821887 . G A 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.445;QD=61.3358;RBI=0.0205709;REFB=0;REVB=0.0133624;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012831;OID=.;OPOS=45821887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0 chr22 45821909 . C T 306.58 PASS AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0147707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.419;QD=27.2512;RBI=0.0148393;REFB=-0.00970116;REVB=-0.00142462;RO=18;SAF=14;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268812;STB=0.51484;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00439418;OID=.;OPOS=45821909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:13:14:10:8:13:14:10:8 chr22 45821935 . G A 257.75 PASS AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00458252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9802;QD=23.4314;RBI=0.0752662;REFB=-0.0337665;REVB=0.0751266;RO=20;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014;STB=0.507806;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0269065;OID=.;OPOS=45821935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:14:10:8:12:14:10:8:12 chr22 45821955 . TC T,TG 152.12 PASS AF=0.243243,0.216216;AO=9,8;DP=37;FAO=9,8;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=1,5;FSAR=8,3;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.102012,0.0890861;FXX=0.0263089;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.774,115.917;QD=16.4449;RBI=0.104423,0.0932816;REFB=-0.0374771,-0.0273197;REVB=0.0223099,0.0276609;RO=20;SAF=0,6;SAR=9,2;SRF=9;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.756878,0.351552;STB=0.807265,0.624688;STBP=0.046,0.465;TYPE=del,snp;VARB=0.0619965,-0.0257241;OID=.,.;OPOS=45821956,45821956;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.243243,0.216216:9,8:37:9,8:37:20:1,5:8,3:9:11:60:20:0,6:9,2:9:11 chr22 45826880 . G A 632.18 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.862;QD=61.6757;RBI=0.0801554;REFB=0;REVB=0.00206514;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382402;OID=.;OPOS=45826880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0 chr22 45923827 . A G 2351.13 PASS AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00383336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.386;QD=63.9764;RBI=0.00743006;REFB=0;REVB=-0.00636483;RO=0;SAF=79;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.90966e-06;OID=.;OPOS=45923827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:68:79:0:0:68:79:0:0 chr22 46156446 . G A 77.23 PASS AF=0.434783;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00315676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8147;QD=13.4305;RBI=0.0377937;REFB=0.00414862;REVB=-0.0376617;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555787;STB=0.554343;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.00884325;OID=.;OPOS=46156446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:23:23:13:13:9:10:0.434783:6:3:5:8:7:3:5:8 chr22 46202925 . A G 291.43 PASS AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.045145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.142;QD=16.8944;RBI=0.0454784;REFB=-0.0170556;REVB=0.00549696;RO=37;SAF=12;SAR=20;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135472;STB=0.57616;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0174939;OID=.;OPOS=46202925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:20:12:19:18:20:12:19:18 chr22 46493852 . C T 205.77 PASS AF=0.342105;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0512034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.551;QD=10.8302;RBI=0.0519179;REFB=-0.00741982;REVB=-0.0085839;RO=50;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117149;STB=0.56785;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0205683;OID=.;OPOS=46493852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:50:50:26:26:0.342105:14:12:18:32:14:12:18:32 chr22 46652959 . A G 75.96 PASS AF=0.4;AO=8;DP=23;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00153178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.391;QD=12.1542;RBI=0.0337505;REFB=-0.0121992;REVB=0.0337157;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178816;STB=0.54229;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.00969633;OID=.;OPOS=46652959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:23:25:15:15:8:10:0.4:4:4:5:10:6:4:5:10 chr22 46677607 . T C 697.94 PASS AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0136521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3635;QD=54.7404;RBI=0.0486136;REFB=-0.127027;REVB=0.0466573;RO=1;SAF=21;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218873;STB=0.511623;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00903756;OID=.;OPOS=46677607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:29:21:1:0:29:21:1:0 chr22 46691610 . C T 370.69 PASS AF=0.453488;AO=38;DP=84;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00821169;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.8101;QD=17.2412;RBI=0.0141994;REFB=-0.0205657;REVB=0.0115841;RO=46;SAF=11;SAR=27;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242686;STB=0.618258;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0328752;OID=.;OPOS=46691610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:46:47:38:39:0.453488:27:11:24:22:27:12:24:23 chr22 46704379 . G A 260.42 PASS AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0116477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.849;QD=18.9394;RBI=0.0120238;REFB=0.00204678;REVB=0.00298385;RO=27;SAF=21;SAR=7;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165988;STB=0.593336;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00233074;OID=.;OPOS=46704379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:7:21:16:11:7:21:16:11 chr22 46722400 . T C 447.35 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.709;QD=57.7224;RBI=0.0059647;REFB=0;REVB=0.00585026;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6948e-05;OID=.;OPOS=46722400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0 chr22 46929692 . A G 1026.4 PASS AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.616;QD=59.5015;RBI=0.00972227;REFB=0;REVB=0.00880456;RO=0;SAF=23;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94904e-05;OID=.;OPOS=46929692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:46:23:0:0:46:23:0:0 chr22 46931077 . G C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.944;QD=51.9167;RBI=0.0111143;REFB=0;REVB=-0.00772907;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.13436e-07;OID=.;OPOS=46931077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chr22 46931793 . G C 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00633521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.924;QD=48.7373;RBI=0.0110364;REFB=0;REVB=-0.00903695;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.12117e-05;OID=.;OPOS=46931793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0 chr22 46931838 . G A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.73;QD=45.8068;RBI=0.0414493;REFB=0;REVB=0.025452;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000680562;OID=.;OPOS=46931838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0 chr22 47058992 . T C 2381.31 PASS AF=1;AO=156;DP=158;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193407;FXX=0.0126574;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7459;QD=61.0593;RBI=0.0303525;REFB=0;REVB=-0.0233926;RO=0;SAF=91;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147185;OID=.;OPOS=47058992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:158:156:0:0:156:156:1:65:91:0:0:65:91:0:0 chr22 47075462 . C T 398.96 PASS AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00416007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.944;QD=20.9981;RBI=0.0160624;REFB=-0.019891;REVB=-0.0155143;RO=36;SAF=21;SAR=19;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688905;STB=0.538089;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0194382;OID=.;OPOS=47075462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:19:21:16:20:19:21:16:20 chr22 47311404 . A T 342.15 PASS AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0120045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.958;QD=12.9113;RBI=0.0162649;REFB=-0.017535;REVB=0.0109744;RO=65;SAF=22;SAR=19;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035516;STB=0.520176;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.02243;OID=.;OPOS=47311404;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:65:65:41:41:0.386792:19:22:37:28:19:22:37:28 chr22 47569571 . G C 272.11 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.216;QD=51.8307;RBI=0.01107;REFB=0;REVB=-0.00695215;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000465199;OID=.;OPOS=47569571;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr22 47569605 . G C 116.0 PASS AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2278;QD=42.1812;RBI=0.097158;REFB=0;REVB=0.0775808;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00772498;OID=.;OPOS=47569605;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:4:6:0:0:4:7:0:0 chr22 47857537 . T C 793.13 PASS AF=0.41784;AO=89;DP=213;FAO=89;FDP=213;FR=.;FRO=124;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=54;FSRR=70;FWDB=0.0177426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.876;QD=14.8944;RBI=0.0177925;REFB=-0.00800868;REVB=-0.00133139;RO=124;SAF=38;SAR=51;SRF=54;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904923;STB=0.505058;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0107658;OID=.;OPOS=47857537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:124:124:89:89:0.41784:51:38:54:70:51:38:54:70 chr22 47857551 . T G 782.53 PASS AF=0.434555;AO=82;DP=190;FAO=83;FDP=191;FR=.;FRO=108;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=-0.0233711;FXX=0.0103622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.774;QD=16.3881;RBI=0.0392603;REFB=-0.0219774;REVB=0.0315462;RO=107;SAF=35;SAR=47;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128649;STB=0.507804;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0311198;OID=.;OPOS=47857551;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:107:108:82:83:0.434555:47:35:47:60:48:35:47:61 chr22 47857576 . A G 638.13 PASS AF=0.404494;AO=72;DP=178;FAO=72;FDP=178;FR=.;FRO=106;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=61;FWDB=-0.0134818;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.569;QD=14.34;RBI=0.0140154;REFB=-0.0111371;REVB=-0.00383036;RO=105;SAF=26;SAR=46;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752684;STB=0.540002;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0163391;OID=.;OPOS=47857576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:105:106:72:72:0.404494:46:26:45:60:46:26:45:61 chr22 48023297 . A G 1919.1 PASS AF=0.992063;AO=123;DP=125;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0262963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.402;QD=60.9238;RBI=0.0311138;REFB=-0.117498;REVB=-0.0166306;RO=0;SAF=56;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.60146e-08;STB=0.503597;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.000103137;OID=.;OPOS=48023297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:125:126:0:1:123:125:0.992063:67:56:0:0:69:56:0:1 chr22 48940553 . T C 1231.09 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363723;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.618;QD=61.5544;RBI=0.0422783;REFB=0;REVB=0.0215526;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30181e-05;OID=.;OPOS=48940553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0 chr22 48940644 . C T 482.53 PASS AF=0.490385;AO=50;DP=103;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00168035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5307;QD=18.5589;RBI=0.0230976;REFB=-0.00880017;REVB=-0.0230364;RO=53;SAF=21;SAR=29;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101154;STB=0.559976;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00648258;OID=.;OPOS=48940644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:53:53:50:51:0.490385:29:21:28:25:30:21:28:25 chr22 48940714 . T TC 233.09 PASS AF=0.534483;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0957753;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=110.4;QD=16.0755;RBI=0.0958005;REFB=-0.00532167;REVB=-0.00219725;RO=33;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000901156;STB=0.501113;STBP=0.979;TYPE=ins;VARB=0.00365767;OID=.;OPOS=48940715;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.534483:31:64:31:58:27:16:15:14:13:99:33:16:15:17:16 chr22 49246723 . A C 680.79 PASS AF=0.423729;AO=75;DP=178;FAO=75;FDP=177;FR=.;FRO=102;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=31;FSRR=71;FWDB=-0.0568566;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.192;QD=15.3852;RBI=0.0575714;REFB=-0.0090661;REVB=-0.00904393;RO=91;SAF=27;SAR=48;SRF=21;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145528;STB=0.535759;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0102395;OID=.;OPOS=49246723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:91:102:75:75:0.423729:48:27:21:70:48:27:31:71 chr22 50017234 . A G 689.69 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.485;QD=62.6993;RBI=0.153944;REFB=0;REVB=0.150779;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958799;OID=.;OPOS=50017234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:18:25:0:0:19:25:0:0 chr22 50018045 . G A 138.4 PASS AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.042909;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.6001;QD=39.5429;RBI=0.0479711;REFB=-0.0923599;REVB=-0.0214485;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.529367;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0070156;OID=.;OPOS=50018045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:14:14:0:1:13:13:0.928571:8:5:0:0:8:5:0:1 chr22 50018069 . A G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.795;QD=52.6132;RBI=0.0358597;REFB=0;REVB=0.0273436;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133088;OID=.;OPOS=50018069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0 chr22 50018497 . G A 2028.7 PASS AF=1;AO=126;DP=126;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.563;QD=62.4216;RBI=0.0665261;REFB=0;REVB=0.00588813;RO=0;SAF=63;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188723;OID=.;OPOS=50018497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:126:130:0:0:126:130:1:63:63:0:0:63:67:0:0 chr22 50132408 . G A 337.61 PASS AF=0.522388;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0439373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.731;QD=20.156;RBI=0.0442316;REFB=-0.0290821;REVB=-0.00509357;RO=31;SAF=23;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409485;STB=0.516844;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0293423;OID=.;OPOS=50132408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:31:32:35:35:0.522388:12:23:19:12:12:23:20:12 chr22 50216754 . G A 379.1 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0126558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.276;QD=19.1949;RBI=0.023371;REFB=0.0146164;REVB=0.0196478;RO=40;SAF=16;SAR=23;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601012;STB=0.533449;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=-0.0084438;OID=.;OPOS=50216754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:23:16:19:21:23:16:19:21 chr22 50277835 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.255;QD=51.9167;RBI=0.024183;REFB=0;REVB=-0.0204594;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.2043e-05;OID=.;OPOS=50277835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0 chr22 50277883 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.742;QD=53.277;RBI=0.071799;REFB=0;REVB=0.0111142;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107299;OID=.;OPOS=50277883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0 chr22 50278438 . A G 429.5 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.732;QD=57.2668;RBI=0.0350161;REFB=0;REVB=0.011615;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144826;OID=.;OPOS=50278438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:15:14:0:0:15:15:0:0 chr22 50278568 . A G 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00649513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.038;QD=48.7366;RBI=0.0119568;REFB=0;REVB=0.0100388;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107702;OID=.;OPOS=50278568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0 chr22 50278642 . C T 272.52 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7349;QD=51.9081;RBI=0.0255018;REFB=0;REVB=-0.0018945;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000775294;OID=.;OPOS=50278642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chr22 50280136 . T C 582.43 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.033367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.557;QD=58.2429;RBI=0.0333795;REFB=-0.0289702;REVB=0.000914237;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218009;STB=0.511622;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00124259;OID=.;OPOS=50280136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:21:18:0:1:21:18:0:1 chr22 50281917 . A G 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.128;QD=58.2396;RBI=0.0150507;REFB=0;REVB=0.00290107;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22327e-05;OID=.;OPOS=50281917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0 chr22 50356693 . T C 214.03 PASS AF=0.458333;AO=20;DP=46;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00759486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5818;QD=17.8362;RBI=0.0445705;REFB=-0.0243685;REVB=0.0439187;RO=26;SAF=13;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262169;STB=0.610802;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0239015;OID=.;OPOS=50356693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:26:26:20:22:0.458333:7:13:10:16:9:13:10:16 chr22 50435480 . A G 240.09 PASS AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0272132;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.7558;QD=14.3338;RBI=0.0782967;REFB=-0.0106289;REVB=-0.0734153;RO=38;SAF=16;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035246;STB=0.510909;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00773001;OID=.;OPOS=50435480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:39:28:28:0.41791:12:16:23:15:12:16:23:16 chr22 50439194 . C T 63.03 PASS AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00107177;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=206.058;QD=8.40355;RBI=0.00664032;REFB=-0.0220974;REVB=-0.00655326;RO=21;SAF=7;SAR=2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958897;STB=0.559859;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0459721;OID=.;OPOS=50439194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:2:7:15:6:2:7:15:6 chr22 50454933 . C G 78.0 PASS AF=0.25;AO=3;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=14;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0333297;FXX=0.142806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.627;QD=13.0006;RBI=0.0526276;REFB=-0.0111283;REVB=-0.0407283;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317885;STB=0.728298;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0294261;OID=.;OPOS=50454933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:24:24:6:14:3:6:0.25:1:2:2:4:1:5:8:6 chr22 50468907 . C G 158.05 PASS AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00941182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.517;QD=25.2873;RBI=0.00941476;REFB=-0.0144141;REVB=-0.000235133;RO=9;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698094;STB=0.538875;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00966194;OID=.;OPOS=50468907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:5:11:7:2:5:11:7:2 chr22 50480108 . C T 179.04 PASS AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0690781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0714;QD=10.8508;RBI=0.0906127;REFB=0.0239329;REVB=0.058642;RO=43;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187825;STB=0.609659;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0400337;OID=.;OPOS=50480108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:43:43:23:23:0.348485:8:15:21:22:8:15:21:22 chr22 50528916 . C T 520.05 PASS AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120643;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1711;QD=59.4339;RBI=0.0751292;REFB=0;REVB=0.0741542;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346006;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164298;OID=.;OPOS=50528916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:1:0:34:35:1:21:13:1:0:21:14:0:0 chr22 50529134 . T C 816.91 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4361;QD=57.3269;RBI=0.0214;REFB=0;REVB=0.00922196;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112608;OID=.;OPOS=50529134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:38:19:0:0:38:19:0:0 chr22 50529146 . C T 787.54 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.0884;QD=64.2886;RBI=0.117367;REFB=0;REVB=-0.0480114;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062324;OID=.;OPOS=50529146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:33:14:0:0:33:16:0:0 chr22 50529148 . C G 708.54 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.177;QD=62.9815;RBI=0.0307271;REFB=0;REVB=-0.00900823;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010652;OID=.;OPOS=50529148;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0 chr22 50529462 . A G 487.93 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354043;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.488;QD=59.1424;RBI=0.035656;REFB=0;REVB=0.00422951;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428455;OID=.;OPOS=50529462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0 chr22 50530501 . A T 1552.62 PASS AF=1;AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.955;QD=59.7161;RBI=0.0625077;REFB=0;REVB=0.0621967;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66445e-05;OID=.;OPOS=50530501;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:102:104:0:0:102:104:1:50:52:0:0:52:52:0:0 chr22 50546666 . C T 854.15 PASS AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0526983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5643;QD=56.0101;RBI=0.0528076;REFB=-0.11576;REVB=-0.00339585;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140874;STB=0.50746;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.000478145;OID=.;OPOS=50546666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:33:27:0:1:33:27:0:1 chr22 50547247 . A G 1685.52 PASS AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00806473;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.865;QD=59.6643;RBI=0.0484992;REFB=-0.105472;REVB=0.0478239;RO=1;SAF=40;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011721;STB=0.506172;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000862012;OID=.;OPOS=50547247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:113:113:1:1:112:112:0.99115:72:40:1:0:72:40:1:0 chr22 50555619 . C T 1020.21 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.704;QD=59.1427;RBI=0.0465373;REFB=0;REVB=0.0342485;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43864e-05;OID=.;OPOS=50555619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:41:26:0:0:41:28:0:0 chr22 50555635 . C T 1084.23 PASS AF=0.986486;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.033701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1852;QD=58.6072;RBI=0.0391937;REFB=-0.16659;REVB=-0.0200097;RO=2;SAF=28;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0057182;STB=0.508472;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00290151;OID=.;OPOS=50555635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:73:74:2:1:71:73:0.986486:43:28:1:1:44:29:1:0 chr22 50564618 . A AT 236.71 PASS AF=1;AO=24;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.243834;FXX=0.0908816;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.0973;QD=31.5614;RBI=0.260579;REFB=0;REVB=-0.0919049;RO=5;SAF=7;SAR=17;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241143;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0188231;OID=.;OPOS=50564619;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:24:31:30:30:0:11:19:0:0:5:5:7:17:5:0 chr22 50572473 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.765;QD=64.1536;RBI=0.0219393;REFB=0;REVB=-0.00367698;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.4047e-05;OID=.;OPOS=50572473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0 chr22 50573036 . A G 236.29 PASS AF=0.481481;AO=25;DP=53;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0840432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.548;QD=17.503;RBI=0.0845389;REFB=-0.0198832;REVB=0.00914151;RO=28;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680509;STB=0.523791;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0284796;OID=.;OPOS=50573036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:28:28:25:26:0.481481:16:9:12:16:16:10:12:16 chr22 50581707 . T C 354.88 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.597;QD=54.5973;RBI=0.0461356;REFB=0;REVB=0.0392277;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408644;OID=.;OPOS=50581707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:18:7:0:0:18:8:0:0 chr22 50582550 . C A 429.83 PASS AF=0.456311;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=103;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.000690614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.084;QD=16.6925;RBI=0.0503146;REFB=-0.00183077;REVB=0.0503098;RO=56;SAF=19;SAR=28;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163029;STB=0.591021;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00603381;OID=.;OPOS=50582550;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:56:56:47:47:0.456311:28:19:32:24:28:19:32:24 chr22 50582626 . A G 1492.0 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.163;QD=63.4893;RBI=0.0440738;REFB=0;REVB=0.0105329;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.77846e-05;OID=.;OPOS=50582626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:47:46:0:0:47:47:0:0 chr22 50584201 . A C 922.05 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00376936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.896;QD=56.7412;RBI=0.0044316;REFB=-0.135691;REVB=-0.00233045;RO=1;SAF=21;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111125;STB=0.505745;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.000860815;OID=.;OPOS=50584201;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:42:21:0:1:43:21:0:1 chr22 50585595 . G A,C 243.12 PASS AF=0.904762,0.047619;AO=19,2;DP=21;FAO=19,1;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11,0;FSAR=8,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0338449,-0.00995288;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=87.952,28.8574;QD=46.3078;RBI=0.0590875,0.09126;REFB=0.00112104,-0.0241643;REVB=0.048434,0.0907156;RO=0;SAF=11,1;SAR=8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.41338e-08,0;STB=0.521716,0.989913;STBP=0.513,0.496;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0112943,0.0208019;OID=.,.;OPOS=50585595,50585595;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:21:21:0:1:19,2:19,1:0.904762,0.047619:8,1:11,1:0:0:8,1:11,0:1:0 chr22 50599466 . C A 817.75 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.554;QD=57.3859;RBI=0.0117695;REFB=0;REVB=0.00625663;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75557e-05;OID=.;OPOS=50599466;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0 chr22 50637597 . G C 920.11 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.455;QD=58.4197;RBI=0.0168464;REFB=0;REVB=0.000147801;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.48994e-05;OID=.;OPOS=50637597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0 chr22 50646936 . G C 318.72 PASS AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0175543;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4073;QD=26.5598;RBI=0.0264036;REFB=-0.0464626;REVB=-0.0197229;RO=18;SAF=15;SAR=13;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103896;STB=0.576869;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0294767;OID=.;OPOS=50646936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:18:20:28:28:0.583333:13:15:7:11:13:15:7:13 chr22 50657010 . C G 845.99 PASS AF=1;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7549;QD=56.3991;RBI=0.145968;REFB=0;REVB=0.0266493;RO=1;SAF=23;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200666;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128076;OID=.;OPOS=50657010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:59:60:1:0:58:60:1:35:23:1:0:35:25:0:0 chr22 50664612 . A G 404.12 PASS AF=0.493976;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.00527215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4531;QD=19.4756;RBI=0.0373698;REFB=0.0101584;REVB=0.036996;RO=42;SAF=18;SAR=23;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205032;STB=0.613635;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0133459;OID=.;OPOS=50664612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:42:41:41:0.493976:23:18:28:14:23:18:28:14 chr22 50678620 . G C 69.97 PASS AF=0.473684;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0190563;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9743;QD=14.7297;RBI=0.0419325;REFB=-0.0305954;REVB=-0.0373523;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138165;STB=0.581216;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0459398;OID=.;OPOS=50678620;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:20:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:4:6:4:5:4:6 chr22 50684256 . T C 177.2 PASS AF=0.396226;AO=20;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0884399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9021;QD=13.3734;RBI=0.0888339;REFB=-0.0186134;REVB=-0.00835757;RO=33;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760974;STB=0.524062;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0143815;OID=.;OPOS=50684256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:33:32:20:21:0.396226:12:8:11:22:13:8:11:21 chr22 50684415 . T C 62.46 PASS AF=0.28125;AO=7;DP=30;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0425218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7095;QD=7.80811;RBI=0.0428025;REFB=-0.0178186;REVB=0.00489336;RO=23;SAF=1;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.577461;STB=0.719538;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0768589;OID=.;OPOS=50684415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:30:32:23:23:7:9:0.28125:6:1:15:8:6:3:15:8 chr22 50684747 . C T 114.26 PASS AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0511886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0837;QD=10.1562;RBI=0.0513343;REFB=-0.00998607;REVB=-0.00386533;RO=31;SAF=3;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311104;STB=0.68974;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0254831;OID=.;OPOS=50684747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:11:3:14:17:11:3:14:17 chr22 50688348 . A G 920.05 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0807934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.779;QD=58.416;RBI=0.0810054;REFB=0;REVB=0.00585719;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000565101;OID=.;OPOS=50688348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:37:26:0:0:37:26:0:0 chr22 50693521 . C T 44.61 PASS AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.0432;QD=29.7376;RBI=0.202222;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.024309;OID=.;OPOS=50693521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:1:0:5:6:1:0:5:1:0:0:6:0:0 chr22 50693534 . A G 88.21 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.816;QD=39.2064;RBI=0.00827375;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8669e-05;OID=.;OPOS=50693534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0 chr22 50693538 . G A 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.777;QD=40.7629;RBI=0.00894989;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47502e-05;OID=.;OPOS=50693538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0 chr22 50693554 . A G 221.54 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.7;QD=49.2306;RBI=0.0598359;REFB=0;REVB=0.053917;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158828;OID=.;OPOS=50693554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:18:0:0:14:18:1:4:10:0:0:5:13:0:0 chr22 50694297 . A G 358.14 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.58;QD=55.0987;RBI=0.0242331;REFB=0;REVB=0.0165691;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87939e-05;OID=.;OPOS=50694297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0 chr22 50696662 . C T 174.13 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.719;QD=46.4351;RBI=0.0696065;REFB=0;REVB=0.0415418;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121237;OID=.;OPOS=50696662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0 chr22 50705466 . A G 273.52 PASS AF=1;AO=14;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335243;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.362;QD=49.7315;RBI=0.0504732;REFB=0;REVB=0.0377315;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000913818;OID=.;OPOS=50705466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:14:22:1:9:5:0:0:12:10:0:0 chr22 50713866 . G C 465.12 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.412;QD=58.14;RBI=0.036497;REFB=0;REVB=0.00650672;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288864;OID=.;OPOS=50713866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:16:16:0:0 chr22 50716167 . G A 1061.8 PASS AF=1;AO=65;DP=65;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.484;QD=59.8196;RBI=0.0653098;REFB=0;REVB=0.0445581;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128888;OID=.;OPOS=50716167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:65:71:0:0:65:71:1:34:31:0:0:37:34:0:0 chr22 50719251 . A G 861.88 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00612284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.727;QD=57.4586;RBI=0.0105658;REFB=0;REVB=-0.00861084;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000517299;OID=.;OPOS=50719251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:33:26:0:0:33:27:0:0 chr22 50720622 . C T 832.83 PASS AF=0.539474;AO=81;DP=151;FAO=82;FDP=152;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.0122318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.858;QD=21.9166;RBI=0.0751542;REFB=-0.00563705;REVB=0.0741521;RO=69;SAF=40;SAR=41;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600002;STB=0.532887;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00453565;OID=.;OPOS=50720622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:69:70:81:82:0.539474:41:40:39:30:41:41:40:30 chr22 50722134 . T C 318.35 PASS AF=0.692308;AO=26;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0459203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.888;QD=32.6515;RBI=0.0557927;REFB=0.00706634;REVB=-0.0316884;RO=11;SAF=14;SAR=12;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143562;STB=0.593152;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00267142;OID=.;OPOS=50722134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:39:39:11:12:26:27:0.692308:12:14:3:8:12:15:3:9 chr22 50725553 . T C 109.94 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00498438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.326;QD=14.6584;RBI=0.0373088;REFB=-0.0107612;REVB=-0.0369744;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00617278;STB=0.503592;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00552955;OID=.;OPOS=50725553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:3:10:13:4:3:10:13:4 chr22 50728062 . T C 582.9 PASS AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0458631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.535;QD=58.2904;RBI=0.0510731;REFB=-0.168326;REVB=0.022473;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514278;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00145498;OID=.;OPOS=50728062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:40:40:0:1:39:39:0.975:22:17:0:0:22:17:1:0 chr22 50750835 . G A 72.79 PASS AF=0.47619;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.16037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.6161;QD=13.8655;RBI=0.185346;REFB=-0.0347046;REVB=0.0929232;RO=11;SAF=0;SAR=9;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.760545;STB=0.678806;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0632831;OID=.;OPOS=50750835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:20:21:11:11:9:10:0.47619:9:0:3:8:9:1:3:8 chr22 50754512 . C T 274.21 PASS AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.011363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9626;QD=24.9285;RBI=0.0222009;REFB=-0.0853906;REVB=-0.0190726;RO=19;SAF=12;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767554;STB=0.542616;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0423152;OID=.;OPOS=50754512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:13:12:11:8:13:12:11:8 chr22 50754648 . T C 89.48 PASS AF=0.478261;AO=8;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0625082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.736;QD=15.562;RBI=0.0631854;REFB=-0.00755281;REVB=-0.00922608;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466517;STB=0.813242;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0421451;OID=.;OPOS=50754648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:23:23:12:12:8:11:0.478261:1:7:6:6:1:10:6:6 chr22 50757470 . T C 207.19 PASS AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0407355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.217;QD=24.3751;RBI=0.0408466;REFB=-0.000505862;REVB=0.00301107;RO=14;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168909;STB=0.594415;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00147029;OID=.;OPOS=50757470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:7:13:6:8:7:13:6:8 chr22 50877166 . G C 326.26 PASS AF=1;AO=6;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0917947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.243;QD=54.3769;RBI=0.0929325;REFB=0;REVB=0.0144977;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00349057;OID=.;OPOS=50877166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:6:24:1:3:3:0:0:7:17:0:0 chr22 50878275 . A G 260.52 PASS AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.00541498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.977;QD=14.4733;RBI=0.00626438;REFB=-0.00348307;REVB=0.00314968;RO=42;SAF=16;SAR=14;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204088;STB=0.615311;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00472131;OID=.;OPOS=50878275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:14:16:14:28:14:16:14:28 chr22 50879447 . T G 90.35 PASS AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0789805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.017;QD=16.4265;RBI=0.0795568;REFB=-0.00770402;REVB=-0.00955832;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0043972;OID=.;OPOS=50879447;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:9:2:2:9:9:2:2:9 chr22 50885775 . A G 94.56 PASS AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0522908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.671;QD=21.0138;RBI=0.0580372;REFB=-0.00679929;REVB=0.0251791;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221094;STB=0.624791;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00812187;OID=.;OPOS=50885775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:1:6:6:5:1:6 chr22 50898026 . G A 877.0 PASS AF=0.612403;AO=79;DP=129;FAO=79;FDP=129;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0281952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.949;QD=27.1939;RBI=0.032921;REFB=-0.0248902;REVB=0.0169948;RO=49;SAF=32;SAR=47;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757853;STB=0.537618;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0179909;OID=.;OPOS=50898026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:49:50:79:79:0.612403:47:32:25:24:47:32:25:25 chr22 50901009 . C T 164.17 PASS AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.00240727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.73;QD=11.1305;RBI=0.0271996;REFB=-0.00169093;REVB=0.0270929;RO=38;SAF=7;SAR=14;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375678;STB=0.717195;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00352964;OID=.;OPOS=50901009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:14:7:26:12:14:7:26:12 chr22 50921652 . C CG 40.67 PASS AF=0.16129;AO=8;DP=76;FAO=10;FDP=62;FR=.;FRO=52;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00905196;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=51.3461;QD=2.62357;RBI=0.0173553;REFB=-0.00390069;REVB=0.0148078;RO=66;SAF=0;SAR=8;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.657338;STB=0.899201;STBP=0.008;TYPE=ins;VARB=0.0924831;OID=.;OPOS=50921653;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.16129:8:76:10:62:52:1:9:30:22:40:66:0:8:37:29 chr22 50923042 . C G 30.12 PASS AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.106484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7215;QD=12.0482;RBI=0.107878;REFB=0.030613;REVB=0.0172865;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471002;STB=0.776909;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=-0.00126764;OID=.;OPOS=50923042;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:0:5:2:3:0:5 chr22 50923217 . T C 695.16 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00136595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.251;QD=60.4488;RBI=0.0118171;REFB=0.0660791;REVB=0.0117379;RO=1;SAF=22;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208829;STB=0.511106;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.000615158;OID=.;OPOS=50923217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:23:22:1:0:23:22:1:0 chr22 50923282 . C A,CCCACCCCCACCTTCCCCAGCAA 159.1 PASS AF=0.136364,0.590909;AO=4,11;DP=27;FAO=3,13;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=1,0;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0324747,0.0159893;FXX=0.0434594;HRUN=3,3;LEN=1,22;MLLD=57.5729,425.188;QD=28.9272;RBI=0.0355097,0.0164507;REFB=-0.00226032,-0.0123188;REVB=0.0143641,-0.00386857;RO=10;SAF=1,0;SAR=3,11;SRF=2;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0756169,-0.77992;STB=0.798912,0.5;STBP=0.823,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0121737,0.00402851;OID=.,.;OPOS=50923282,50923283;OREF=C,-;OALT=A,CCACCCCCACCTTCCCCAGCAA;OMAPALT=A,CCCACCCCCACCTTCCCCAGCAA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:41:27:22:10:6:4,11:3,13:0.136364,0.590909:3,11:1,0:2:8:2,13:1,0:0:6 chr22 50928026 . G A 72.93 PASS AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0907867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0732;QD=20.8377;RBI=0.092879;REFB=-0.00383791;REVB=0.019603;RO=5;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964512;STB=0.555432;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00709766;OID=.;OPOS=50928026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:5:4:3:2:5:4:3:2 chr22 50941985 . T C 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.067439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.412;QD=9.19912;RBI=0.0697841;REFB=-0.0142016;REVB=-0.0179389;RO=13;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413297;STB=0.762764;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0166835;OID=.;OPOS=50941985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:6:1:6:7:6:1:6:7 chr22 50944128 . G A 197.53 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00178696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.115;QD=26.3373;RBI=0.0627003;REFB=-0.0212773;REVB=0.0626748;RO=11;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828023;STB=0.54605;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0104822;OID=.;OPOS=50944128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:11:8:6:5:11:8:6:5 chr22 50944163 . G A 520.02 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000299092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.464;QD=59.4309;RBI=0.0301116;REFB=0;REVB=0.0301101;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149814;OID=.;OPOS=50944163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0 chr22 50959434 . AGGG A,AG,AGG 398.73 PASS AF=0,1,0;AO=5,16,9;DP=44;FAO=0,44,0;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24,0;FSAR=0,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161966,0.239516,0.469042;FXX=0.0434688;HRUN=5,5,5;LEN=3,2,1;MLLD=12.0735,16.7473,9.62457;QD=36.2484;RBI=0.197228,0.293036,0.571889;REFB=-0.0538351,-0.0478771,-0.029549;REVB=-0.112543,-0.168826,-0.327195;RO=2;SAF=0,4,9;SAR=5,12,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.78221,-0.181062,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0436835,0.0271508,-0.0256751;OID=.,.,.;OPOS=50959435,50959435,50959435;OREF=GGG,GG,G;OALT=-,-,-;OMAPALT=A,AG,AGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:0,1,0:5,16,9:44:0,44,0:44:0:0,24,0:0,20,0:0:0:7:2:0,4,9:5,12,0:2:0 chr22 50961169 . A G 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.487;QD=40.7629;RBI=0.0211758;REFB=0;REVB=0.0165449;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014118;OID=.;OPOS=50961169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0 chr22 50962208 . T G 1588.19 PASS AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.229;QD=59.9318;RBI=0.0253174;REFB=0;REVB=0.00146184;RO=0;SAF=71;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31848e-05;OID=.;OPOS=50962208;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:34:71:0:0:35:71:0:0 chr22 50962782 . C G 600.47 PASS AF=0.97561;AO=41;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0153396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2207;QD=58.582;RBI=0.0234317;REFB=-0.025841;REVB=0.0177127;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00160424;OID=.;OPOS=50962782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:0:1:41:40:0.97561:15:26:0:0:15:25:1:0 chr22 50988062 . G T 1373.86 PASS AF=0.967742;AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0254654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3057;QD=59.0907;RBI=0.0301435;REFB=-0.00794292;REVB=-0.016129;RO=3;SAF=44;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106392;STB=0.505735;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.000811811;OID=.;OPOS=50988062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:92:93:3:3:89:90:0.967742:45:44:2:1:46:44:2:1 chr22 50988193 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.572;QD=46.8479;RBI=0.078669;REFB=0;REVB=0.0784811;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00197614;OID=.;OPOS=50988193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0 chr22 50989326 . A G 340.66 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299499;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.3956;QD=54.5061;RBI=0.073921;REFB=0;REVB=-0.0675819;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000805683;OID=.;OPOS=50989326;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chr22 51012311 . G T 373.34 PASS AF=0.660377;AO=35;DP=53;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00413679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.099;QD=28.1765;RBI=0.00874433;REFB=-0.0256343;REVB=-0.00770391;RO=18;SAF=16;SAR=19;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429771;STB=0.523433;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0186627;OID=.;OPOS=51012311;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:18:18:35:35:0.660377:19:16:7:11:19:16:7:11 chr22 51012358 . G C 360.29 PASS AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0256595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.735;QD=32.0256;RBI=0.0257;REFB=-0.0250915;REVB=0.00144204;RO=15;SAF=14;SAR=16;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409217;STB=0.522373;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.020242;OID=.;OPOS=51012358;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:16:14:6:9:16:14:6:9 chr22 51012775 . C T 210.81 PASS AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0112017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.248;QD=14.0542;RBI=0.0119512;REFB=-0.00629056;REVB=0.00416562;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112036;STB=0.563708;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0084014;OID=.;OPOS=51012775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:12:13:22:13:12:13:22:13 chr22 51015838 . T C 190.85 PASS AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0237418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0977;QD=30.5357;RBI=0.0461;REFB=-0.0174145;REVB=-0.0395163;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23654;STB=0.629499;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00316986;OID=.;OPOS=51015838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:10:8:0:7:10:8:0:7 chr22 51020224 . TGGGGCC TGGGC,TGGGCC,TGGGG 424.94 PASS AF=1,0,0;AO=5,15,13;DP=48;FAO=48,0,0;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0,0;FSAR=25,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311881,0.919702,-0.461202;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,2;MLLD=13.9074,7.25602,9.77855;QD=35.4116;RBI=0.243796,0.952755,0.584411;REFB=0,0,0;REVB=0.241793,-0.248777,0.358928;RO=1;SAF=2,0,13;SAR=3,15,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.527273,0.527273,0;SSEP=0,0,0.555556;SSSB=0.121807,0,0.836493;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0078668,0,0;OID=.,.,.;OPOS=51020228,51020225,51020229;OREF=GC,G,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGGGC,TGGGCC,TGGGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1,0,0:5,15,13:48:48,0,0:48:0:23,0,0:25,0,0:0:0:9:1:2,0,13:3,15,0:0:1 chr22 51043278 . G A 44.79 PASS AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0194788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.104;QD=7.46504;RBI=0.027063;REFB=-0.00923494;REVB=-0.0187878;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281128;STB=0.678486;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0264637;OID=.;OPOS=51043278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:9:8:5:2:9:8 chr22 51045433 . C T 61.4 PASS AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0825976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5544;QD=18.8929;RBI=0.0886605;REFB=-0.0083844;REVB=-0.0322231;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788369;STB=0.574292;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0155764;OID=.;OPOS=51045433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:13:4:5:8:8:0.615385:5:3:1:3:5:3:1:4 chr22 51048400 . A G 169.28 PASS AF=0.428571;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0115547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.228;QD=16.1217;RBI=0.0300232;REFB=-0.0368683;REVB=0.0277107;RO=24;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129645;STB=0.559936;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0826134;OID=.;OPOS=51048400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:41:42:24:24:17:18:0.428571:10:7:7:17:11:7:7:17 chr22 51064039 . G C 46.0 PASS AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0141162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.072;QD=9.19977;RBI=0.0144254;REFB=-0.00743731;REVB=-0.00297027;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260866;STB=0.66611;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0158514;OID=.;OPOS=51064039;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:1:6:9:4:1:6:9:4 chr22 51064416 . T C 211.14 PASS AF=0.606061;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.000589922;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5328;QD=25.5922;RBI=0.0154884;REFB=-0.00669633;REVB=0.0154771;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996226;STB=0.555499;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00627262;OID=.;OPOS=51064416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:34:33:13:13:20:20:0.606061:12:8:7:6:12:8:7:6 chr22 51159931 . CTG CT,CTGG,GCT 44.74 PASS AF=0.764706,0,0;AO=8,2,2;DP=17;FAO=13,0,0;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=6,0,0;FSAR=7,0,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0211923,0.0218489,-0.0411395;FXX=0;HRUN=8,8,1;LEN=1,1,3;MLLD=6.84233,7.04272,14.6655;QD=10.5272;RBI=0.268266,0.268468,0.208906;REFB=-0.0215996,0.0241855,-0.0654234;REVB=0.267428,-0.267578,0.204815;RO=4;SAF=5,0,0;SAR=3,2,2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.215906,-0.569412,-0.569412;STB=0.550382,0.5,0.5;STBP=0.515,1,1;TYPE=del,ins,mnp;VARB=0.108803,0.058637,0;OID=.,.,.;OPOS=51159933,51159933,51159931;OREF=G,-,CTG;OALT=-,G,GCT;OMAPALT=CT,CTGG,GCT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:17:17:4:4:8,2,2:13,0,0:0.764706,0,0:3,2,2:5,0,0:1:3:7,0,0:6,0,0:1:3 chr22 51183255 . A G 62.26 PASS AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.129;QD=35.5759;RBI=0.0461372;REFB=0;REVB=0.00213554;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150304;OID=.;OPOS=51183255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0 chrX 200860 . T C 1464.45 PASS AF=1;AO=76;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182151;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.416;QD=63.6716;RBI=0.0649102;REFB=0;REVB=0.062302;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143395;OID=.;OPOS=200860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:90:92:0:0:76:92:1:44:32:0:0:60:32:0:0 chrX 207362 . C T 580.14 PASS AF=0.56383;AO=51;DP=92;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0154859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.982;QD=24.6868;RBI=0.0180609;REFB=-0.0164917;REVB=0.00929427;RO=41;SAF=24;SAR=27;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457401;STB=0.525031;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0134642;OID=.;OPOS=207362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:41:41:51:53:0.56383:27:24:17:24:28:25:17:24 chrX 228892 . C A 143.04 PASS AF=0.386364;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=3;FWDB=-0.0184656;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.882;QD=13.0032;RBI=0.0216554;REFB=-0.0693968;REVB=-0.0113128;RO=26;SAF=14;SAR=3;SRF=23;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120876;STB=0.619129;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0674387;OID=.;OPOS=228892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:44:26:27:17:17:0.386364:3:14:23:3:4:13:24:3 chrX 228934 . A G 374.7 PASS AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00358978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.5462;QD=49.9602;RBI=0.0040754;REFB=-0.0516201;REVB=-0.00192934;RO=2;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102941;STB=0.555514;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000864386;OID=.;OPOS=228934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:30:2:2:28:28:0.933333:8:20:0:2:8:20:0:2 chrX 228940 . A G 461.28 PASS AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0186325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7361;QD=54.2678;RBI=0.0370252;REFB=-0.0514801;REVB=0.0319953;RO=1;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405505;STB=0.519988;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0143776;OID=.;OPOS=228940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:34:1:1:32:33:0.970588:11:21:0:1:12:21:0:1 chrX 228976 . G C 99.52 PASS AF=0.188889;AO=17;DP=90;FAO=17;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=-0.00396251;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.568;QD=4.42327;RBI=0.0118388;REFB=-0.0223568;REVB=-0.011156;RO=69;SAF=9;SAR=8;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824728;STB=0.526285;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0709186;OID=.;OPOS=228976;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:69:73:17:17:0.188889:8:9:41:28:8:9:41:32 chrX 229137 . A G 1024.22 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00968061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.067;QD=59.3752;RBI=0.118639;REFB=0;REVB=0.118244;RO=1;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230304;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031857;OID=.;OPOS=229137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:66:69:1:0:65:69:1:20:45:0:1:24:45:0:0 chrX 295132 . T C 57.21 PASS AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0178778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5346;QD=12.7143;RBI=0.0556278;REFB=0.0162016;REVB=-0.0526767;RO=9;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298237;STB=0.666171;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.0262105;OID=.;OPOS=295132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:18:18:9:10:8:8:0.444444:1:7:6:3:1:7:7:3 chrX 295231 . A G 538.54 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.262;QD=59.8376;RBI=0.043811;REFB=0;REVB=0.0160562;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187734;OID=.;OPOS=295231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0 chrX 299362 . A G 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.02;QD=59.4356;RBI=0.0462574;REFB=0;REVB=0.00210048;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201281;OID=.;OPOS=299362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0 chrX 299591 . A G 1516.99 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.29;QD=59.4896;RBI=0.0295643;REFB=0;REVB=-0.018635;RO=0;SAF=66;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53132e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449287;OID=.;OPOS=299591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:102:0:0:101:102:1:35:66:0:0:35:67:0:0 chrX 305984 . G A 224.46 PASS AF=0.6;AO=20;DP=36;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=-0.0146444;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4337;QD=25.6528;RBI=0.0238869;REFB=0.00592876;REVB=0.0188713;RO=15;SAF=5;SAR=15;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212659;STB=0.658971;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.00738399;OID=.;OPOS=305984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:36:35:15:14:20:21:0.6:15:5:1:14:15:6:0:14 chrX 306056 . G A 88.99 PASS AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00609364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.336;QD=27.3817;RBI=0.0231291;REFB=7.88522e-05;REVB=0.022312;RO=3;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163937;STB=0.593025;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000369706;OID=.;OPOS=306056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:3:7:1:2:3:7:1:2 chrX 322161 . A G 678.13 PASS AF=0.440476;AO=74;DP=168;FAO=74;FDP=168;FR=.;FRO=94;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=59;FSRR=35;FWDB=-0.0135746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.043;QD=16.146;RBI=0.0322833;REFB=-0.0102038;REVB=-0.0292906;RO=93;SAF=33;SAR=41;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176341;STB=0.60061;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0201422;OID=.;OPOS=322161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:93:94:74:74:0.440476:41:33:58:35:41:33:59:35 chrX 322193 . C T 922.13 PASS AF=0.412698;AO=104;DP=254;FAO=104;FDP=252;FR=.;FRO=148;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=85;FSRR=63;FWDB=0.0144669;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.449;QD=14.6369;RBI=0.0147311;REFB=-0.0107001;REVB=-0.00277741;RO=147;SAF=50;SAR=54;SRF=84;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094842;STB=0.554784;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0125682;OID=.;OPOS=322193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:252:147:148:104:104:0.412698:54:50:84:63:54:50:85:63 chrX 610715 . C G 3821.04 PASS AF=1;AO=240;DP=243;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000946504;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.946;QD=63.4198;RBI=0.0237907;REFB=0;REVB=0.0237719;RO=0;SAF=125;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61382e-05;OID=.;OPOS=610715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:243:241:0:0:240:241:1:115:125:0:0:115:126:0:0 chrX 1428421 . G T 434.23 PASS AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0141472;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=259.821;QD=17.0284;RBI=0.0241374;REFB=-0.0186139;REVB=-0.0195569;RO=55;SAF=28;SAR=19;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676342;STB=0.537756;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0180824;OID=.;OPOS=1428421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:0.460784:19:28:29:26:19:28:29:26 chrX 1460740 . A G 501.66 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00300773;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=286.747;QD=59.0187;RBI=0.00800567;REFB=0;REVB=0.00741919;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3486e-05;OID=.;OPOS=1460740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0 chrX 1537002 . C G 520.85 PASS AF=0.455285;AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=123;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0255004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1109;QD=16.9383;RBI=0.052713;REFB=-0.0161475;REVB=-0.0461345;RO=65;SAF=24;SAR=32;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017278;STB=0.510634;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.018786;OID=.;OPOS=1537002;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:65:67:56:56:0.455285:32:24:29:36:32:24:30:37 chrX 1537953 . C T 316.82 PASS AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.018875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.759;QD=20.4401;RBI=0.0489889;REFB=-0.0172654;REVB=0.0452068;RO=29;SAF=21;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142075;STB=0.507882;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0150659;OID=.;OPOS=1537953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:12:21:18:11:12:21:18:11 chrX 1540706 . A G 1123.28 PASS AF=0.526066;AO=110;DP=210;FAO=111;FDP=211;FR=.;FRO=100;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=0.00177394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5618;QD=21.2945;RBI=0.0361445;REFB=-0.0233801;REVB=-0.036101;RO=100;SAF=60;SAR=50;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00399092;STB=0.500216;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177828;OID=.;OPOS=1540706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:100:100:110:111:0.526066:50:60:55:45:50:61:55:45 chrX 1546792 . G A 48.69 PASS AF=0.35;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0331155;FXX=0.0908678;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.326;QD=9.73892;RBI=0.0338133;REFB=0.00801545;REVB=-0.00683405;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567703;STB=0.852933;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00175247;OID=.;OPOS=1546792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:21:20:11:13:7:7:0.35:2:5:1:10:2:5:1:12 chrX 1546842 . A G 154.94 PASS AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00984792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.648;QD=22.9547;RBI=0.0168913;REFB=-0.0196647;REVB=0.0137235;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460516;STB=0.748351;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00922048;OID=.;OPOS=1546842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:27:27:10:11:16:16:0.592593:13:3:8:2:13:3:8:3 chrX 1546876 . A G 117.73 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.00253037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4196;QD=12.3926;RBI=0.0617018;REFB=-0.0186025;REVB=-0.0616499;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33698;STB=0.695401;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0162142;OID=.;OPOS=1546876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:6:8:6:18:6:8:6:18 chrX 1554649 . T C 781.14 PASS AF=0.448649;AO=82;DP=184;FAO=83;FDP=185;FR=.;FRO=102;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=43;FSRR=59;FWDB=-0.0227419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.02;QD=16.8895;RBI=0.0234678;REFB=-0.010922;REVB=-0.00579151;RO=102;SAF=43;SAR=39;SRF=43;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10227;STB=0.559622;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0105295;OID=.;OPOS=1554649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:185:102:102:82:83:0.448649:39:43:43:59:39:44:43:59 chrX 1554655 . T C 733.91 PASS AF=0.436464;AO=77;DP=179;FAO=79;FDP=181;FR=.;FRO=102;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=59;FWDB=0.0212735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4247;QD=16.2191;RBI=0.0292916;REFB=0.000758039;REVB=-0.0201355;RO=101;SAF=39;SAR=38;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082113;STB=0.554736;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.000689283;OID=.;OPOS=1554655;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:101:102:77:79:0.436464:38:39:43:58:38:41:43:59 chrX 1755404 . C T 713.68 PASS AF=0.603604;AO=67;DP=111;FAO=67;FDP=111;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0131189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3239;QD=25.7182;RBI=0.0286374;REFB=-0.00617731;REVB=-0.0254558;RO=43;SAF=28;SAR=39;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085122;STB=0.542097;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00375325;OID=.;OPOS=1755404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:43:44:67:67:0.603604:39:28:23:20:39:28:23:21 chrX 2139186 . C T 429.64 PASS AF=0.415254;AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0398957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.775;QD=14.5642;RBI=0.0441689;REFB=-0.00159552;REVB=0.0189532;RO=69;SAF=22;SAR=27;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120365;STB=0.567708;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00121583;OID=.;OPOS=2139186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:69:49:49:0.415254:27:22:39:30:27:22:39:30 chrX 2139200 . T C 1740.28 PASS AF=1;AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00276412;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.085;QD=60.5316;RBI=0.0108488;REFB=0;REVB=0.0104908;RO=0;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013917;OID=.;OPOS=2139200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:116:115:0:0:114:115:1:52:62:0:0:53:62:0:0 chrX 2161129 . C G 520.84 PASS AF=0.520833;AO=49;DP=95;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00419449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.964;QD=21.7018;RBI=0.036037;REFB=-0.0167922;REVB=0.0357921;RO=45;SAF=16;SAR=33;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188615;STB=0.601521;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.023646;OID=.;OPOS=2161129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:45:46:49:50:0.520833:33:16:24:21:33:17:25:21 chrX 2407207 . G A 403.74 PASS AF=0.366412;AO=48;DP=132;FAO=48;FDP=131;FR=.;FRO=83;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.0571414;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.997;QD=12.3281;RBI=0.0598189;REFB=-0.0170611;REVB=0.0176964;RO=83;SAF=12;SAR=36;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367663;STB=0.710752;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0177538;OID=.;OPOS=2407207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:83:83:48:48:0.366412:36:12:47:36:36:12:47:36 chrX 2632482 . C T 839.4 PASS AF=0.403433;AO=94;DP=233;FAO=94;FDP=233;FR=.;FRO=139;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=82;FSRR=57;FWDB=0.0104298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.617;QD=14.4104;RBI=0.0114083;REFB=-0.0118924;REVB=0.00462267;RO=139;SAF=51;SAR=43;SRF=82;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510654;STB=0.528601;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0189277;OID=.;OPOS=2632482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:139:139:94:94:0.403433:43:51:82:57:43:51:82:57 chrX 2645366 . G C 1240.41 PASS AF=0.41018;AO=137;DP=336;FAO=137;FDP=334;FR=.;FRO=197;FSAF=66;FSAR=71;FSRF=107;FSRR=90;FWDB=0.00492765;FXX=0.0059522;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.465;QD=14.8553;RBI=0.00768846;REFB=-0.00842391;REVB=-0.00590176;RO=197;SAF=66;SAR=71;SRF=107;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647818;STB=0.53616;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.014117;OID=.;OPOS=2645366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:334:197:197:137:137:0.41018:71:66:107:90:71:66:107:90 chrX 2656261 . A G 768.74 PASS AF=0.421569;AO=86;DP=204;FAO=86;FDP=204;FR=.;FRO=118;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=57;FSRR=61;FWDB=-0.00407849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.823;QD=15.0734;RBI=0.0165015;REFB=-0.00951326;REVB=-0.0159895;RO=117;SAF=31;SAR=55;SRF=56;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12676;STB=0.573714;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.01955;OID=.;OPOS=2656261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:117:118:86:86:0.421569:55:31:56:61:55:31:57:61 chrX 2656283 . A T 558.71 PASS AF=0.396341;AO=65;DP=164;FAO=65;FDP=164;FR=.;FRO=99;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=51;FWDB=0.015565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.003;QD=13.6272;RBI=0.0161581;REFB=0.00122276;REVB=0.00433734;RO=98;SAF=21;SAR=44;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187477;STB=0.603426;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.000933176;OID=.;OPOS=2656283;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:98:99:65:65:0.396341:44:21:48:50:44:21:48:51 chrX 2724760 . T C 381.71 PASS AF=1;AO=21;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974891;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.801;QD=56.5494;RBI=0.0721475;REFB=0;REVB=0.0714859;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565077;OID=.;OPOS=2724760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:21:27:1:13:8:0:0:19:8:0:0 chrX 2748253 . G C 824.21 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.207;QD=56.842;RBI=0.0476166;REFB=0;REVB=0.0326333;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182504;OID=.;OPOS=2748253;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:23:35:0:0 chrX 2761050 . C T 190.85 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.714;QD=47.7127;RBI=0.0918591;REFB=0;REVB=0.0894547;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111453;OID=.;OPOS=2761050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:6:9:0:0:7:9:0:0 chrX 2832668 . A G 89.23 PASS AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0241985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.387;QD=8.11194;RBI=0.025297;REFB=-0.0109206;REVB=-0.00737361;RO=32;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538921;STB=0.533277;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0196776;OID=.;OPOS=2832668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:44:44:32:32:12:12:0.272727:8:4:12:20:8:4:12:20 chrX 2832696 . T C 128.88 PASS AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00335935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.82;QD=8.45108;RBI=0.0204607;REFB=-0.00950307;REVB=-0.020183;RO=43;SAF=7;SAR=11;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918131;STB=0.555078;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0189673;OID=.;OPOS=2832696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:43:43:18:18:0.295082:11:7:20:23:11:7:20:23 chrX 2832708 . G T 153.67 PASS AF=0.304348;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0145443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.591;QD=8.90866;RBI=0.0530166;REFB=-0.00700994;REVB=-0.0509826;RO=47;SAF=9;SAR=12;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714285;STB=0.535531;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0238818;OID=.;OPOS=2832708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:47:48:21:21:0.304348:12:9:23:24:12:9:23:25 chrX 2832715 . T C 151.1 PASS AF=0.291667;AO=19;DP=72;FAO=21;FDP=72;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0404374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7695;QD=8.39427;RBI=0.0517993;REFB=-0.00483045;REVB=0.0323725;RO=51;SAF=9;SAR=10;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274817;STB=0.516114;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0146359;OID=.;OPOS=2832715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:51:51:19:21:0.291667:10:9:23:28:12:9:23:28 chrX 2832742 . G C 1286.78 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266277;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2036;QD=62.0135;RBI=0.00266436;REFB=0;REVB=-9.18628e-05;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91757e-05;OID=.;OPOS=2832742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:47:36:0:0:47:36:0:0 chrX 2832771 . C T 227.13 PASS AF=0.35;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00396949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.781;QD=11.3566;RBI=0.00728649;REFB=-0.00984348;REVB=-0.00611032;RO=52;SAF=9;SAR=19;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229299;STB=0.633236;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0100575;OID=.;OPOS=2832771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:52:52:28:28:0.35:19:9:27:25:19:9:27:25 chrX 2832787 . A G 241.29 PASS AF=0.367089;AO=28;DP=79;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0187963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.788;QD=12.2173;RBI=0.0335597;REFB=-0.0130096;REVB=0.0278021;RO=50;SAF=9;SAR=19;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227872;STB=0.638587;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0271166;OID=.;OPOS=2832787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:50:50:28:29:0.367089:19:9:26:24:20:9:26:24 chrX 2833605 . C T 58.95 PASS AF=0.195652;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0131334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.46;QD=5.12633;RBI=0.0310604;REFB=-0.00278357;REVB=-0.0281472;RO=37;SAF=6;SAR=3;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909761;STB=0.559197;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0138756;OID=.;OPOS=2833605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:46:46:37:37:9:9:0.195652:3:6:27:10:3:6:27:10 chrX 2833628 . A C 74.2 PASS AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0136351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.925;QD=5.60023;RBI=0.0138904;REFB=0.000810634;REVB=-0.00265083;RO=41;SAF=7;SAR=4;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134165;STB=0.569112;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00330649;OID=.;OPOS=2833628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:53:53:41:42:11:11:0.207547:4:7:30:11:4:7:30:12 chrX 2833631 . A G 65.84 PASS AF=0.192308;AO=10;DP=53;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.000606075;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.447;QD=5.06483;RBI=0.00912459;REFB=-0.0194747;REVB=0.00910444;RO=42;SAF=7;SAR=3;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021164;STB=0.513861;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0168561;OID=.;OPOS=2833631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:53:52:42:42:10:10:0.192308:3:7:30:12:3:7:30:12 chrX 2833638 . C T 110.39 PASS AF=0.304348;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0471491;FXX=0.148121;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.211;QD=9.59932;RBI=0.0483231;REFB=-0.00450052;REVB=-0.0105868;RO=29;SAF=10;SAR=4;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160888;STB=0.571322;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0156555;OID=.;OPOS=2833638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:46:29:32:14:14:0.304348:4:10:17:12:4:10:20:12 chrX 2833643 . C A 99.98 PASS AF=0.259259;AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.00966839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.975;QD=7.40619;RBI=0.0146109;REFB=-0.0150335;REVB=-0.0109545;RO=40;SAF=10;SAR=4;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558647;STB=0.534541;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0184128;OID=.;OPOS=2833643;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:40:40:14:14:0.259259:4:10:27:13:4:10:27:13 chrX 2835863 . G T 806.13 PASS AF=0.435897;AO=85;DP=195;FAO=85;FDP=195;FR=.;FRO=110;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=63;FWDB=0.00906347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.522;QD=16.5361;RBI=0.0109137;REFB=-0.00545989;REVB=-0.00607974;RO=110;SAF=28;SAR=57;SRF=47;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107284;STB=0.559907;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00634522;OID=.;OPOS=2835863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:110:110:85:85:0.435897:57:28:47:63:57:28:47:63 chrX 2835964 . G A 757.21 PASS AF=0.5625;AO=73;DP=126;FAO=72;FDP=128;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0118015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5707;QD=23.6628;RBI=0.0187023;REFB=-0.0224044;REVB=0.0145086;RO=48;SAF=29;SAR=44;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615422;STB=0.503603;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0199947;OID=.;OPOS=2835964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:48:56:73:72:0.5625:44:29:23:25:43:29:23:33 chrX 2835985 . G A 388.15 PASS AF=0.536585;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.214699;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.1199;QD=18.9339;RBI=0.241807;REFB=-0.14145;REVB=0.111243;RO=32;SAF=18;SAR=26;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224478;STB=0.530598;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.227564;OID=.;OPOS=2835985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:32:38:44:44:0.536585:26:18:14:18:26:18:18:20 chrX 2835989 . A C 379.43 PASS AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00238024;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=263.705;QD=19.2114;RBI=0.0023933;REFB=-0.00357881;REVB=0.00024967;RO=40;SAF=16;SAR=23;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601012;STB=0.533449;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00242836;OID=.;OPOS=2835989;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:23:16:19:21:23:16:19:21 chrX 2835993 . G A 357.81 PASS AF=0.493333;AO=39;DP=76;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.018339;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7909;QD=19.0831;RBI=0.0187257;REFB=0.00408049;REVB=-0.00378595;RO=37;SAF=18;SAR=21;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498112;STB=0.505879;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=-0.0216115;OID=.;OPOS=2835993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:37:38:39:37:0.493333:21:18:15:22:21:16:16:22 chrX 2835995 . C A 283.38 PASS AF=0.550725;AO=39;DP=70;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0826293;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.955;QD=16.428;RBI=0.0826346;REFB=-0.0280164;REVB=0.00093072;RO=30;SAF=18;SAR=21;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224553;STB=0.509949;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.044461;OID=.;OPOS=2835995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:30:31:39:38:0.550725:21:18:13:17:20:18:14:17 chrX 2835998 . CCCACGCCGG C,CCCATGCCGG 242.97 PASS AF=0.52,0;AO=23,4;DP=52;FAO=26,0;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=15,0;FSAR=11,0;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0282347,0.0102854;FXX=0.0908926;HRUN=3,1;LEN=9,1;MLLD=247.051,121.518;QD=19.4373;RBI=0.0282974,0.0442632;REFB=0.000336633,-0.00653733;REVB=-0.00188292,-0.0430516;RO=21;SAF=13,0;SAR=10,4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.116308,-0.621043;STB=0.537354,0.5;STBP=0.645,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000372628,0;OID=.,.;OPOS=2835999,2836002;OREF=CCACGCCGG,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,CCCATGCCGG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.52,0:23,4:52:26,0:50:24:15,0:11,0:12:12:99:21:13,0:10,4:9:12 chrX 2836037 . G C 162.19 PASS AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.004556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.678;QD=12.0142;RBI=0.0198126;REFB=-0.0188435;REVB=0.0192817;RO=34;SAF=9;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117509;STB=0.568198;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0305392;OID=.;OPOS=2836037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:11:9:19:15:11:9:19:15 chrX 2836041 . A T 353.56 PASS AF=0.62963;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0234165;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.113;QD=26.1894;RBI=0.0239352;REFB=0.0047609;REVB=-0.0049562;RO=20;SAF=20;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946266;STB=0.551846;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.00277385;OID=.;OPOS=2836041;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:20:20:34:34:0.62963:14:20:9:11:14:20:9:11 chrX 2836047 . C T 346.34 PASS AF=0.634615;AO=33;DP=52;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00191222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.078;QD=26.6412;RBI=0.00888339;REFB=-0.0389979;REVB=-0.00867514;RO=19;SAF=18;SAR=15;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829596;STB=0.545427;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0167052;OID=.;OPOS=2836047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:19:19:33:33:0.634615:15:18:8:11:15:18:8:11 chrX 2836060 . G A 325.99 PASS AF=0.636364;AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0128869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.972;QD=29.6352;RBI=0.0132713;REFB=-0.0258338;REVB=-0.00317068;RO=16;SAF=16;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891088;STB=0.548984;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.014109;OID=.;OPOS=2836060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:16:16:28:28:0.636364:12:16:7:9:12:16:7:9 chrX 2836084 . C G 233.87 PASS AF=0.724138;AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00626902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.217;QD=32.2578;RBI=0.0164758;REFB=-0.01192;REVB=-0.0152365;RO=8;SAF=11;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119634;STB=0.506573;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00402796;OID=.;OPOS=2836084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:29:29:8:8:21:21:0.724138:10:11:4:4:10:11:4:4 chrX 2836138 . G A 111.17 PASS AF=0.631579;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00174474;FXX=0.049975;HRUN=6;LEN=1;MLLD=195.789;QD=23.4031;RBI=0.0431909;REFB=0.00612969;REVB=0.0431557;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096601;STB=0.557426;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.00174471;OID=.;OPOS=2836138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:19:5:7:12:12:0.631579:5:7:2:3:5:7:3:4 chrX 2836181 . A T 178.71 PASS AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0101673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.625;QD=22.3386;RBI=0.0104116;REFB=-0.0472183;REVB=-0.00224211;RO=14;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695042;STB=0.538964;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0476139;OID=.;OPOS=2836181;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:10:8:5:9:10:8:5:9 chrX 2836184 . C T 167.1 PASS AF=0.53125;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0135294;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.025;QD=20.8876;RBI=0.0233815;REFB=-0.0415823;REVB=-0.0190697;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681317;STB=0.538417;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0270623;OID=.;OPOS=2836184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:33:32:15:15:17:17:0.53125:10:7:5:10:10:7:5:10 chrX 2836211 . A T 192.51 PASS AF=0.542857;AO=13;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00435009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.254;QD=22.0012;RBI=0.0244614;REFB=0.0134613;REVB=-0.0240715;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201895;STB=0.582196;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00741299;OID=.;OPOS=2836211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:35:35:11:16:13:19:0.542857:5:8:4:7:11:8:4:12 chrX 2836238 . G A 109.93 PASS AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.037731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.5838;QD=14.6568;RBI=0.0398996;REFB=0.0094133;REVB=-0.0129752;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292758;STB=0.668106;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.0104475;OID=.;OPOS=2836238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:4:13:6:7:4:13 chrX 2942109 . T C 905.74 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0141395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0927;QD=56.6089;RBI=0.033924;REFB=-0.0234959;REVB=-0.0308369;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154807;STB=0.508194;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00252222;OID=.;OPOS=2942109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:33:30:1:0:33:30:1:0 chrX 3002687 . A G 115.99 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1977;QD=42.1781;RBI=0.115709;REFB=0;REVB=-0.112985;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00737516;OID=.;OPOS=3002687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:10:1:0:0:10:1:0:0 chrX 3228411 . G A 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.575;QD=58.5872;RBI=0.0433469;REFB=0;REVB=-0.0116198;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154849;OID=.;OPOS=3228411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chrX 3228891 . A G 785.2 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.515;QD=57.1052;RBI=0.0313008;REFB=0;REVB=0.00169625;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.53064e-05;OID=.;OPOS=3228891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:32:22:0:0:33:22:0:0 chrX 3235724 . C T 1973.68 PASS AF=0.992248;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00461716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.599;QD=61.1993;RBI=0.0254591;REFB=-0.114885;REVB=0.0250369;RO=1;SAF=57;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826413;STB=0.504347;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=8.77088e-05;OID=.;OPOS=3235724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:129:129:1:1:128:128:0.992248:71:57:1:0:71:57:1:0 chrX 3238167 . T G 1934.78 PASS AF=1;AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=364.675;QD=61.4216;RBI=0.043021;REFB=0;REVB=0.0427438;RO=0;SAF=47;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.88373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3751e-05;OID=.;OPOS=3238167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:124:126:0:0:123:126:1:76:47:0:0:79:47:0:0 chrX 3238733 . G A 1315.67 PASS AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9568;QD=61.1938;RBI=0.0581023;REFB=0;REVB=0.0183352;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000823864;OID=.;OPOS=3238733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:86:86:0:0:85:86:1:43:42:0:0:43:43:0:0 chrX 3239545 . C T 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7927;QD=61.3359;RBI=0.0593574;REFB=0;REVB=-0.0406319;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20962e-05;OID=.;OPOS=3239545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chrX 3240343 . G A 1215.19 PASS AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5744;QD=60.7594;RBI=0.0387106;REFB=0;REVB=0.0163388;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000628642;OID=.;OPOS=3240343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:34:44:0:0:34:46:0:0 chrX 3241050 . G A 561.01 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141292;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.156;QD=60.6496;RBI=0.0315867;REFB=0;REVB=-0.0282504;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7583e-05;OID=.;OPOS=3241050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0 chrX 3241256 . T C 482.9 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.913;QD=58.5337;RBI=0.0440079;REFB=0;REVB=0.0117601;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260688;OID=.;OPOS=3241256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:15:18:0:0 chrX 3241284 . A G 502.64 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.396;QD=59.1335;RBI=0.0315374;REFB=0;REVB=0.0290214;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86588e-05;OID=.;OPOS=3241284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:15:17:0:0:17:17:0:0 chrX 3241317 . T C 739.31 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102411;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.946;QD=62.9202;RBI=0.0117016;REFB=0;REVB=0.00566106;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418972;OID=.;OPOS=3241317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:19:27:0:0:20:27:0:0 chrX 3241791 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0019654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.228;QD=64.1535;RBI=0.00196719;REFB=0;REVB=8.38364e-05;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27889e-05;OID=.;OPOS=3241791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0 chrX 3261847 . G C 52.68 PASS AF=0.166667;AO=9;DP=58;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0390509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.5708;QD=3.512;RBI=0.0517678;REFB=-0.0024144;REVB=-0.0339844;RO=49;SAF=4;SAR=5;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556212;STB=0.567431;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0361487;OID=.;OPOS=3261847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:58:60:49:50:9:10:0.166667:5:4:24:25:6:4:24:26 chrX 3592725 . G A 888.43 PASS AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130356;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.835;QD=58.2578;RBI=0.0236308;REFB=0;REVB=0.0197101;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.45179e-05;OID=.;OPOS=3592725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0 chrX 3756501 . C T 48.85 PASS AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.105725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.268;QD=13.9584;RBI=0.107373;REFB=-0.0134912;REVB=-0.0187388;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358511;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.021105;OID=.;OPOS=3756501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:2:5:2:5:2:5 chrX 5810090 . A G 494.99 PASS AF=1;AO=33;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0937155;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0609;QD=56.5704;RBI=0.148714;REFB=-0.0878159;REVB=0.11547;RO=2;SAF=18;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00488373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00484629;OID=.;OPOS=5810090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:35:35:2:0:33:35:1:15:18:1:1:16:19:0:0 chrX 6451856 . A G 260.01 PASS AF=0.676471;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0539531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.205;QD=30.5895;RBI=0.0631122;REFB=-0.0839182;REVB=0.0327445;RO=9;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142984;STB=0.608601;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0153395;OID=.;OPOS=6451856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:34:34:9:11:23:23:0.676471:14:9:6:3:14:9:8:3 chrX 6975752 . G T 152.05 PASS AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00569498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0597;QD=40.5478;RBI=0.063976;REFB=-0.0838115;REVB=0.063722;RO=1;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824047;STB=0.545388;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0375964;OID=.;OPOS=6975752;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:5:9:0:1:5:9:0:1 chrX 6975782 . C G 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.981;QD=52.6131;RBI=0.0695977;REFB=0;REVB=-0.0454386;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87537e-05;OID=.;OPOS=6975782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0 chrX 6995315 . C T 1018.93 PASS AF=0.985714;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.006706;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.086;QD=58.2245;RBI=0.0181525;REFB=-0.0285355;REVB=0.0168684;RO=1;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013701;STB=0.507244;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-1.35147e-05;OID=.;OPOS=6995315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:72:70:1:1:69:69:0.985714:34:35:0:1:34:35:0:1 chrX 7066051 . A C 215.05 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024153;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.127;QD=47.7893;RBI=0.0346057;REFB=-0.164273;REVB=0.0247828;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00852805;OID=.;OPOS=7066051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:17:18:0:0:17:18:1:5:12:0:0:5:13:0:0 chrX 8138080 . G C 453.8 PASS AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0216376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9351;QD=55.0065;RBI=0.0502109;REFB=0.0863986;REVB=0.0453095;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282865;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.00213666;OID=.;OPOS=8138080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:16:16:1:0:16:16:1:0 chrX 8138160 . T C 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00298578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0291;QD=51.9166;RBI=0.071299;REFB=0;REVB=-0.0712365;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00226341;OID=.;OPOS=8138160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chrX 8138165 . C G 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.37;QD=51.9167;RBI=0.0396516;REFB=0;REVB=0.0279532;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411052;OID=.;OPOS=8138165;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chrX 8138170 . CT GC 232.41 PASS AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0958271;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.209;QD=48.9292;RBI=0.17994;REFB=0;REVB=0.1523;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00397185;OID=.;OPOS=8138170;OREF=CT;OALT=GC;OMAPALT=GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:12:7:0:0 chrX 8138182 . A G 221.57 PASS AF=1;AO=13;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.766;QD=49.2386;RBI=0.0254488;REFB=0;REVB=-0.0147676;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561664;OID=.;OPOS=8138182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:18:18:0:0:13:18:1:8:5:0:0:12:6:0:0 chrX 8497510 . C T 2983.09 PASS AF=0.989583;AO=188;DP=190;FAO=190;FDP=192;FR=.;FRO=2;FSAF=103;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.019792;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.489;QD=62.1476;RBI=0.0199237;REFB=-0.0715797;REVB=0.00228701;RO=2;SAF=102;SAR=86;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000859131;STB=0.500442;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00140706;OID=.;OPOS=8497510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:190:192:2:2:188:190:0.989583:86:102:1:1:87:103:1:1 chrX 8503641 . G A 447.01 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2992;QD=57.6791;RBI=0.129905;REFB=0;REVB=-0.129596;RO=0;SAF=27;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00167526;OID=.;OPOS=8503641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:4:27:0:0:4:27:0:0 chrX 8504833 . C T 1189.53 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0668281;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6956;QD=61.0015;RBI=0.0837888;REFB=0;REVB=-0.0505427;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278884;OID=.;OPOS=8504833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0 chrX 9001164 . G A 778.09 PASS AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0073317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.57;QD=54.6027;RBI=0.0104157;REFB=-0.0267252;REVB=-0.0073982;RO=1;SAF=24;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192354;STB=0.5102;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00129597;OID=.;OPOS=9001164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:55:56:0.982456:31:24:1:0:32:24:1:0 chrX 9369866 . C G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00227068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.148;QD=56.1916;RBI=0.0342184;REFB=0;REVB=0.034143;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.84381e-05;OID=.;OPOS=9369866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0 chrX 9370301 . T G,TATAG 521.08 PASS AF=0.0375,0.9375;AO=38,31;DP=98;FAO=3,75;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=0,40;FSAR=3,35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0117896,-0.0272529;FXX=0.157878;HRUN=1,1;LEN=1,4;MLLD=95.7974,67.1675;QD=26.054;RBI=0.236501,0.110775;REFB=-0.0997091,-0.118675;REVB=0.236207,0.10737;RO=23;SAF=14,21;SAR=24,10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.254514,-0.0557472;STB=0.994603,0.500869;STBP=0.202,0.864;TYPE=snp,ins;VARB=0.0326143,0.0117928;OID=.,.;OPOS=9370301,9370302;OREF=T,-;OALT=G,ATAG;OMAPALT=G,TATAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:98:80:23:2:38,31:3,75:0.0375,0.9375:24,10:14,21:17:6:3,35:0,40:1:1 chrX 9842669 . G A 289.35 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9403;QD=52.6081;RBI=0.0353185;REFB=0;REVB=-0.0278136;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175871;OID=.;OPOS=9842669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0 chrX 9859098 . A G 2351.95 PASS AF=1;AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.387;QD=61.0895;RBI=0.00956303;REFB=0;REVB=0.00121828;RO=0;SAF=85;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37009e-05;OID=.;OPOS=9859098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:154:154:0:0:154:154:1:69:85:0:0:69:85:0:0 chrX 9863112 . A G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.22;QD=54.5172;RBI=0.0601872;REFB=0;REVB=0.0394196;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256051;OID=.;OPOS=9863112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0 chrX 9863374 . G C 613.36 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=338.551;QD=61.3364;RBI=0.0282366;REFB=0;REVB=0.0127934;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.5285e-05;OID=.;OPOS=9863374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chrX 9905342 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00935348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.755;QD=51.1846;RBI=0.0104958;REFB=0;REVB=-0.00476181;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000181195;OID=.;OPOS=9905342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chrX 9912792 . A G 801.32 PASS AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.838;QD=57.2373;RBI=0.019459;REFB=0;REVB=0.00815531;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90713e-05;OID=.;OPOS=9912792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:22:34:0:0:22:34:0:0 chrX 9914947 . G C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1424;QD=59.4352;RBI=0.0386097;REFB=0;REVB=-0.0348433;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000818129;OID=.;OPOS=9914947;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0 chrX 9915165 . C T 69.1 PASS AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0439549;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.0011;QD=30.7116;RBI=0.0619355;REFB=0.0936229;REVB=0.0436346;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080241;STB=0.545344;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=-0.0248814;OID=.;OPOS=9915165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:1:0:3:5:1:0 chrX 10085674 . T C 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00685186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.308;QD=33.4285;RBI=0.0134519;REFB=0;REVB=0.0115761;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109515;OID=.;OPOS=10085674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0 chrX 10202343 . C T 255.83 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.672;QD=51.1654;RBI=0.0468747;REFB=0;REVB=-0.00822791;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000607301;OID=.;OPOS=10202343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chrX 10204812 . A G 501.84 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4502;QD=59.0399;RBI=0.0363305;REFB=0;REVB=0.0183735;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000884598;OID=.;OPOS=10204812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:13:20:0:0:14:20:0:0 chrX 12725701 . C G 2239.45 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399952;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.028;QD=63.5304;RBI=0.0557254;REFB=0;REVB=0.0388035;RO=0;SAF=69;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.16819e-05;OID=.;OPOS=12725701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:72:69:0:0:72:69:0:0 chrX 12809661 . G A 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.42;QD=39.2068;RBI=0.0588757;REFB=0;REVB=0.0578137;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114072;OID=.;OPOS=12809661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0 chrX 12924826 . A G 731.36 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124134;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.629;QD=63.5961;RBI=0.00197523;REFB=0;REVB=-0.00153643;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.42036e-07;OID=.;OPOS=12924826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0 chrX 12939928 . T C 88.22 PASS AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.01;QD=39.2068;RBI=0.0470602;REFB=0;REVB=0.0463122;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254037;OID=.;OPOS=12939928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0 chrX 13337059 . C T 923.44 PASS AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0039742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.856;QD=56.827;RBI=0.00728177;REFB=-0.0675898;REVB=0.00610163;RO=1;SAF=29;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160078;STB=0.508472;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00516566;OID=.;OPOS=13337059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:35:29:1:0:35:29:1:0 chrX 13681115 . C T 538.42 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.123;QD=59.824;RBI=0.0161767;REFB=0;REVB=0.000738185;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105698;OID=.;OPOS=13681115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0 chrX 13681638 . C T 742.06 PASS AF=1;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036535;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.676;QD=57.0815;RBI=0.044286;REFB=0;REVB=0.0250288;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.01405e-05;OID=.;OPOS=13681638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0 chrX 13681679 . G T 648.02 PASS AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=5.5304e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3491;QD=57.6019;RBI=0.0303326;REFB=-0.0131773;REVB=-0.0303326;RO=2;SAF=25;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00696279;STB=0.50371;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000254398;OID=.;OPOS=13681679;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:18:25:1:1:18:25:1:1 chrX 13682066 . G A 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.239;QD=53.2771;RBI=0.0492331;REFB=0;REVB=0.0213416;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000294117;OID=.;OPOS=13682066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chrX 13682577 . G A 417.97 PASS AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0273653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.911;QD=53.9312;RBI=0.0310508;REFB=-0.0481896;REVB=0.014673;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00192929;OID=.;OPOS=13682577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:15:15:0:0:15:15:0:1 chrX 13682715 . G A 289.37 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4195;QD=52.6126;RBI=0.0398994;REFB=0;REVB=-0.024141;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205561;OID=.;OPOS=13682715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:16:6:0:0:16:6:0:0 chrX 13683170 . G A 2863.3 PASS AF=1;AO=181;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175991;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.884;QD=62.9297;RBI=0.0200724;REFB=0;REVB=0.00965247;RO=0;SAF=76;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82322e-05;OID=.;OPOS=13683170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:182:182:0:0:181:182:1:105:76:0:0:105:77:0:0 chrX 13684432 . T A 3386.98 PASS AF=1;AO=217;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187376;FXX=0.0090905;HRUN=5;LEN=1;MLLD=138.184;QD=62.1463;RBI=0.0187853;REFB=-0.0460499;REVB=-0.00133768;RO=0;SAF=114;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21477e-05;OID=.;OPOS=13684432;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:219:218:0:0:217:218:1:103:114:0:0:103:115:0:0 chrX 13758375 . G A 428.67 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.429;QD=57.1555;RBI=0.0202211;REFB=0;REVB=0.00606702;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145188;OID=.;OPOS=13758375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:13:16:0:0:13:17:0:0 chrX 13771576 . A G 1001.25 PASS AF=0.975904;AO=68;DP=75;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0191725;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.1032;QD=48.2529;RBI=0.127253;REFB=-0.0792284;REVB=0.125801;RO=7;SAF=53;SAR=15;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164731;STB=0.508063;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00633822;OID=.;OPOS=13771576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:75:83:7:2:68:81:0.975904:15:53:5:2:20:61:2:0 chrX 13789349 . T G 331.87 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515559;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.356;QD=55.3114;RBI=0.0592397;REFB=0;REVB=-0.0291776;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020433;OID=.;OPOS=13789349;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0 chrX 15415583 . C T 1514.78 PASS AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0357721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7081;QD=62.465;RBI=0.0549463;REFB=0.0241691;REVB=0.0417068;RO=1;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870172;STB=0.504586;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000259296;OID=.;OPOS=15415583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:54:42:0:1:54:42:0:1 chrX 15800751 . G A 1621.89 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.739;QD=60.0699;RBI=0.0489078;REFB=0;REVB=0.0383461;RO=0;SAF=41;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93175e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46287e-05;OID=.;OPOS=15800751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:108:0:0:106:108:1:65:41:0:0:66:42:0:0 chrX 15838366 . C T 1543.58 PASS AF=1;AO=101;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161791;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.454;QD=59.9447;RBI=0.0210546;REFB=0;REVB=-0.0134735;RO=0;SAF=47;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.98528e-05;OID=.;OPOS=15838366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:105:103:0:0:101:103:1:54:47:0:0:54:49:0:0 chrX 15844898 . TAAAAAAAAAAAAA TAAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAAG,TAAAAAAAAAAAGA,TAAAAAAAAAAGAA 232.79 PASS AF=0,0.73913,0.0434783,0.0652174,0.152174;AO=10,7,2,2,2;DP=50;FAO=0,34,2,3,7;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,2,3,7;FSAR=0,34,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.130989,-0.0966483,-0.00181368,-0.00512646,-0.00593863;FXX=0.09802;HRUN=16,16,16,16,16;LEN=1,2,1,1,1;MLLD=3.63335,5.94354,219.161,213.602,212.997;QD=20.2425;RBI=0.678203,0.355926,0.0364681,0.0395309,0.0431559;REFB=0.345593,0.484747,0.0960057,0.102972,0.110858;REVB=0.665433,0.342553,0.0364229,0.0391971,0.0427454;RO=10;SAF=0,0,2,2,2;SAR=10,7,0,0,0;SRF=0;SRR=10;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0,0,0.826059,0.826059,0.826059;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=del,del,snp,snp,snp;VARB=0.0509023,0.0778111,-0.0480782,0.0320321,0.0159225;OID=.,.,.,.,.;OPOS=15844899,15844899,15844911,15844910,15844909;OREF=A,AA,A,A,A;OALT=-,-,G,G,G;OMAPALT=TAAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAAG,TAAAAAAAAAAAGA,TAAAAAAAAAAGAA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/5:0,0.73913,0.0434783,0.0652174,0.152174:10,7,2,2,2:50:0,34,2,3,7:46:0:0,0,2,3,7:0,34,0,0,0:0:0:34:10:0,0,2,2,2:10,7,0,0,0:0:10 chrX 16168467 . T C 770.63 PASS AF=0.982143;AO=56;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00251056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.302;QD=55.0448;RBI=0.0167727;REFB=0.0271534;REVB=0.0165837;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00102998;OID=.;OPOS=16168467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:0:1:56:55:0.982143:27:29:0:0:27:28:1:0 chrX 16168677 . T C 740.35 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9103;QD=56.9498;RBI=0.0730177;REFB=0;REVB=0.071997;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000722451;OID=.;OPOS=16168677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0 chrX 16859628 . G A 1513.42 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.872;QD=59.9376;RBI=0.0340531;REFB=0;REVB=0.0327562;RO=0;SAF=46;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29484e-05;OID=.;OPOS=16859628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:55:46:0:0:55:46:0:0 chrX 16860134 . T C 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.1;QD=42.1821;RBI=0.011929;REFB=0;REVB=0.011929;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354923;OID=.;OPOS=16860134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0 chrX 17166219 . C T 937.57 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00423421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.631;QD=58.5978;RBI=0.00606627;REFB=0;REVB=0.00434408;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27182e-07;OID=.;OPOS=17166219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0 chrX 17705850 . C CT 1298.34 PASS AF=1;AO=118;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241904;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.7478;QD=40.8925;RBI=0.0311404;REFB=-0.0226452;REVB=-0.0196099;RO=2;SAF=67;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00102647;OID=.;OPOS=17705851;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:118:128:127:127:0:68:59:0:0:22:2:67:51:2:0 chrX 18230715 . A C 1120.78 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001649;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.904;QD=60.5827;RBI=0.0117121;REFB=0;REVB=0.0115955;RO=0;SAF=27;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4782e-05;OID=.;OPOS=18230715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:47:27:0:0:47:27:0:0 chrX 19041592 . C T 2366.4 PASS AF=0.993631;AO=155;DP=158;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0477856;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.135;QD=60.2904;RBI=0.0497001;REFB=0.103689;REVB=-0.0136613;RO=0;SAF=70;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54544e-08;STB=0.502924;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000197271;OID=.;OPOS=19041592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:158:157:0:1:155:156:0.993631:85:70:0:0:85:71:0:1 chrX 19482476 . C T 289.36 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8561;QD=52.6114;RBI=0.121696;REFB=0;REVB=-0.00332766;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196925;OID=.;OPOS=19482476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0 chrX 23398214 . T C 519.95 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.261;QD=59.4232;RBI=0.0425365;REFB=0;REVB=0.0421365;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439185;OID=.;OPOS=23398214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0 chrX 23693285 . C G 708.55 PASS AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.021;QD=62.9826;RBI=0.0185929;REFB=0;REVB=0.0149508;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46057e-05;OID=.;OPOS=23693285;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:26:18:0:0:26:19:0:0 chrX 23858452 . G A 766.45 PASS AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3683;QD=63.8713;RBI=0.0569145;REFB=0;REVB=-0.0270915;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319278;OID=.;OPOS=23858452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0 chrX 23925834 . A T 651.0 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9385;QD=61.9998;RBI=0.0288005;REFB=0;REVB=0.00460802;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217388;OID=.;OPOS=23925834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0 chrX 24232095 . C T 1320.95 PASS AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.966;QD=62.1623;RBI=0.0291156;REFB=0;REVB=0.0269111;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47251e-05;OID=.;OPOS=24232095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:45:40:0:0:45:40:0:0 chrX 24578803 . C T 749.28 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2709;QD=55.5025;RBI=0.0637946;REFB=0;REVB=0.00557018;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000919773;OID=.;OPOS=24578803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:18:34:0:0:18:36:0:0 chrX 24751958 . T C 1496.37 PASS AF=1;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146359;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.565;QD=63.6752;RBI=0.0491731;REFB=0;REVB=0.0469445;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78175e-05;OID=.;OPOS=24751958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:94:0:0:92:94:1:49:43:0:0:51:43:0:0 chrX 26157220 . C T 1472.58 PASS AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156264;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.7;QD=63.3367;RBI=0.0156691;REFB=0;REVB=-0.00115631;RO=0;SAF=61;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35236e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30791e-05;OID=.;OPOS=26157220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:32:61:0:0:32:61:0:0 chrX 26157792 . C T 601.17 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0105965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4256;QD=58.6505;RBI=0.0122238;REFB=-0.0965975;REVB=0.00609396;RO=1;SAF=25;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183934;STB=0.509799;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000152384;OID=.;OPOS=26157792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:15:25:1:0:15:25:1:0 chrX 26212251 . C T 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1635;QD=43.4861;RBI=0.092364;REFB=0;REVB=-0.0882223;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00536185;OID=.;OPOS=26212251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chrX 26212256 . G A 130.45 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0823942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.359;QD=43.4845;RBI=0.0827317;REFB=0;REVB=-0.00746535;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000712144;OID=.;OPOS=26212256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0 chrX 26212262 . C T 101.91 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.866;QD=40.7629;RBI=0.043123;REFB=0;REVB=-0.0123487;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117207;OID=.;OPOS=26212262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0 chrX 26213219 . T C 556.94 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0829167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1851;QD=60.2101;RBI=0.0904057;REFB=0;REVB=0.0360278;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659974;OID=.;OPOS=26213219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:17:19:0:0:17:20:0:0 chrX 26213364 . T TTTGTC 572.43 PASS AF=0.95122;AO=35;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000206474;FXX=0;HRUN=4;LEN=5;MLLD=314.698;QD=55.8464;RBI=0.0542737;REFB=-0.0386016;REVB=0.0542733;RO=2;SAF=21;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424896;STB=0.521728;STBP=0.219;TYPE=ins;VARB=0.00119046;OID=.;OPOS=26213365;OREF=-;OALT=TTGTC;OMAPALT=TTTGTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.95122:35:41:39:41:2:22:17:2:0:9:2:21:14:2:0 chrX 26808285 . T G 3405.97 PASS AF=1;AO=219;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206237;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.456;QD=62.4949;RBI=0.043347;REFB=0;REVB=0.0432979;RO=0;SAF=111;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53434e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77586e-05;OID=.;OPOS=26808285;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:219:218:0:0:219:218:1:108:111:0:0:107:111:0:0 chrX 27479339 . A G 753.51 PASS AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0524803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.552;QD=61.5111;RBI=0.0585626;REFB=0.0280613;REVB=0.0259884;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517234;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=7.45902e-05;OID=.;OPOS=27479339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:34:14:0:0:34:14:1:0 chrX 30236878 . G A 2771.38 PASS AF=1;AO=176;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00575689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8509;QD=62.6302;RBI=0.00803389;REFB=0;REVB=0.00560372;RO=1;SAF=97;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598759;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.60023e-07;OID=.;OPOS=30236878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:177:177:1:0:176:177:1:79:97:0:1:80:97:0:0 chrX 30254361 . G A 786.9 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00238001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7895;QD=55.2207;RBI=0.00539656;REFB=0.0324145;REVB=0.00484339;RO=1;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132829;STB=0.50704;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000528945;OID=.;OPOS=30254361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:35:21:0:1:35:21:0:1 chrX 30254376 . T C 689.38 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.146;QD=62.6708;RBI=0.0630118;REFB=0;REVB=0.0266665;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197519;OID=.;OPOS=30254376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:32:12:0:0:32:12:0:0 chrX 30254530 . A G 450.99 PASS AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000316222;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7975;QD=58.1918;RBI=0.0464023;REFB=0;REVB=0.0464013;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127718;OID=.;OPOS=30254530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0 chrX 30255520 . C T 1510.61 PASS AF=0.981481;AO=94;DP=95;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00976866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.064;QD=55.9485;RBI=0.0298247;REFB=-0.0165517;REVB=0.0281795;RO=1;SAF=28;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166302;STB=0.515622;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00129623;OID=.;OPOS=30255520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:95:108:1:2:94:106:0.981481:66:28:1:0:75:31:2:0 chrX 30261002 . A G 805.17 PASS AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.172;QD=64.4132;RBI=0.0322044;REFB=0;REVB=0.0207133;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0662e-05;OID=.;OPOS=30261002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0 chrX 30261158 . G C 277.82 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213696;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.611;QD=52.918;RBI=0.0411005;REFB=0;REVB=0.0351083;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025659;OID=.;OPOS=30261158;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0 chrX 30269887 . T A 1362.71 PASS AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0113937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.476;QD=61.2455;RBI=0.0320021;REFB=-0.114598;REVB=0.0299052;RO=1;SAF=56;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083879;STB=0.504424;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000196518;OID=.;OPOS=30269887;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:32:56:1:0:32:56:1:0 chrX 30270134 . TAAA TAA,TA,TAAT 1314.72 PASS AF=0.932886,0,0.0671141;AO=16,15,7;DP=150;FAO=139,0,10;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=79,0,0;FSAR=60,0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.764365,0.391255,0.0573075;FXX=0.0261421;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,1;MLLD=11.6228,10.2779,156.328;QD=35.2946;RBI=0.76718,0.392584,0.0957449;REFB=0,0,0;REVB=-0.0656616,-0.0322695,-0.0767003;RO=84;SAF=6,0,0;SAR=10,15,7;SRF=73;SRR=11;SSEN=0.380952,0.380952,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.607085,-0.843174,-0.781519;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0775653,-0.0103347,0.237667;OID=.,.,.;OPOS=30270135,30270135,30270137;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=TAA,TA,TAAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:0.932886,0,0.0671141:16,15,7:150:139,0,10:149:0:79,0,0:60,0,10:0:0:25:84:6,0,0:10,15,7:73:11 chrX 30323916 . T G 340.73 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.26;QD=54.5175;RBI=0.0415645;REFB=0;REVB=0.0415337;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102284;OID=.;OPOS=30323916;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chrX 30326983 . C T 116.0 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0355;QD=42.1823;RBI=0.115579;REFB=0;REVB=0.0994591;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00739599;OID=.;OPOS=30326983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chrX 30577846 . A C 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.216;QD=63.5829;RBI=0.0202981;REFB=0;REVB=0.00855708;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135699;OID=.;OPOS=30577846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0 chrX 30715827 . C T 1677.87 PASS AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.718;QD=60.4636;RBI=0.0376267;REFB=0;REVB=0.0353968;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40254e-05;OID=.;OPOS=30715827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:58:52:0:0:59:52:0:0 chrX 30849176 . G A 1832.43 PASS AF=0.991803;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00628867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.566;QD=60.0797;RBI=0.0151292;REFB=0.000705716;REVB=-0.0137603;RO=1;SAF=48;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655229;STB=0.503401;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=2.01848e-05;OID=.;OPOS=30849176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:122:122:1:1:120:121:0.991803:72:48:0:1:73:48:0:1 chrX 30872602 . A G 1396.05 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.566;QD=62.7438;RBI=0.0542577;REFB=0;REVB=0.0333565;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.32462e-05;OID=.;OPOS=30872602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:51:38:0:0:51:38:0:0 chrX 31496350 . C T 1208.96 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.74;QD=61.2132;RBI=0.0371154;REFB=0;REVB=0.00518356;RO=0;SAF=21;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10271e-05;OID=.;OPOS=31496350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:58:21:0:0:58:21:0:0 chrX 31697636 . A G,T 1365.68 PASS AF=0.955056,0.0449438;AO=85,4;DP=89;FAO=85,4;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=32,3;FSAR=53,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312377,-0.066178;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.1098,167.59;QD=61.3789;RBI=0.0318518,0.0665102;REFB=0,0;REVB=0.00622474,-0.00663873;RO=0;SAF=32,3;SAR=53,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.07334e-08,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000860873,0.179239;OID=.,.;OPOS=31697636,31697636;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:89:89:0:0:85,4:85,4:0.955056,0.0449438:53,1:32,3:0:0:53,1:32,3:0:0 chrX 32380996 . C T 1825.68 PASS AF=1;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0510966;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.363;QD=61.3676;RBI=0.0526213;REFB=0;REVB=0.0125754;RO=0;SAF=51;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129849;OID=.;OPOS=32380996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:120:119:0:0:119:119:1:68:51:0:0:68:51:0:0 chrX 32503194 . T C 753.18 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.349;QD=56.8438;RBI=0.108385;REFB=0;REVB=0.105101;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631021;OID=.;OPOS=32503194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:53:0:0:49:53:1:31:18:0:0:35:18:0:0 chrX 34674970 . C G 1541.87 PASS AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0108567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.2;QD=57.6401;RBI=0.0285647;REFB=0.0169409;REVB=-0.0264211;RO=1;SAF=43;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759342;STB=0.507935;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.000168333;OID=.;OPOS=34674970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:107:107:1:2:105:105:0.981308:62:43:0:1:62:43:0:2 chrX 34962909 . A C 447.02 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0953;QD=57.6797;RBI=0.0727561;REFB=0;REVB=0.0387966;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163301;OID=.;OPOS=34962909;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0 chrX 35820265 . C T 923.39 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0329962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.704;QD=56.8238;RBI=0.0388943;REFB=-0.0219081;REVB=0.0205916;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140954;STB=0.507244;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000642167;OID=.;OPOS=35820265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:33:30:0:1:34:30:0:1 chrX 35820425 . C T 644.87 PASS AF=0.897959;AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0886081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.1658;QD=52.6424;RBI=0.093176;REFB=-0.19135;REVB=0.0288162;RO=2;SAF=18;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493711;STB=0.540624;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0145083;OID=.;OPOS=35820425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:49:49:2:5:44:44:0.897959:26:18:2:0:26:18:4:1 chrX 35820695 . T TA 100.13 PASS AF=1;AO=3;DP=25;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135678;FXX=0.479808;HRUN=0;LEN=1;MLLD=118.227;QD=30.8101;RBI=0.042934;REFB=0;REVB=0.0407338;RO=22;SAF=0;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.567298;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000309538;OID=.;OPOS=35820696;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:3:25:13:13:0:0:13:0:0:4:22:0:3:10:12 chrX 35820696 . G A 340.71 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.548;QD=54.5137;RBI=0.0555221;REFB=0;REVB=0.0517969;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000782856;OID=.;OPOS=35820696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chrX 35820795 . A G 1959.3 PASS AF=1;AO=108;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.242;QD=61.2281;RBI=0.0559852;REFB=0;REVB=0.055231;RO=0;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133912;OID=.;OPOS=35820795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:108:128:1:59:49:0:0:79:49:0:0 chrX 35821055 . AT GA 622.45 PASS AF=1;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834265;FXX=0.0476077;HRUN=2;LEN=2;MLLD=177.1;QD=62.2454;RBI=0.0410485;REFB=0;REVB=0.0401918;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000123315;OID=.;OPOS=35821055;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0 chrX 35821127 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.697;QD=51.9162;RBI=0.0125111;REFB=0;REVB=0.00338872;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166179;OID=.;OPOS=35821127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0 chrX 35821302 . C G 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.159;QD=57.2025;RBI=0.033228;REFB=0;REVB=0.0244068;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032666;OID=.;OPOS=35821302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chrX 35821308 . C T 429.17 PASS AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0727204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1872;QD=55.3772;RBI=0.101602;REFB=0;REVB=0.0709553;RO=1;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102299;OID=.;OPOS=35821308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:1:0:30:31:1:18:12:0:1:19:12:0:0 chrX 35821464 . A G 613.01 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.456;QD=61.3014;RBI=0.044254;REFB=0;REVB=0.0415655;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277594;OID=.;OPOS=35821464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0 chrX 35821558 . G A 306.71 PASS AF=1;AO=21;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.95808e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.319;QD=53.341;RBI=0.0186814;REFB=0;REVB=0.0186814;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.67846e-05;OID=.;OPOS=35821558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:21:23:1:13:8:0:0:13:10:0:0 chrX 35821763 . G A 296.26 PASS AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9804;QD=49.3762;RBI=0.0653396;REFB=-0.018721;REVB=-0.0619991;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319244;STB=0.517226;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=8.63359e-05;OID=.;OPOS=35821763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:9:14:1:0:9:14:1:0 chrX 35821789 . T G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.901;QD=53.9111;RBI=0.0276436;REFB=0;REVB=0.0226839;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104723;OID=.;OPOS=35821789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0 chrX 36371719 . T A 758.96 PASS AF=0.933333;AO=56;DP=61;FAO=56;FDP=60;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0113522;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.663;QD=50.5974;RBI=0.0163813;REFB=0.00131621;REVB=0.01181;RO=1;SAF=30;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154585;STB=0.531239;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=8.57383e-06;OID=.;OPOS=36371719;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:61:60:1:4:56:56:0.933333:26:30:1:0:26:30:4:0 chrX 36385156 . A G 1227.72 PASS AF=0.923077;AO=84;DP=91;FAO=84;FDP=91;FR=.;FRO=7;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00929579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.624;QD=53.9658;RBI=0.0320256;REFB=0.0256554;REVB=0.0306468;RO=7;SAF=33;SAR=51;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163803;STB=0.508668;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.00271183;OID=.;OPOS=36385156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:91:91:7:7:84:84:0.923077:51:33:2:5:51:33:2:5 chrX 36403036 . A G 3056.8 PASS AF=1;AO=190;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00206109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.9;QD=63.6833;RBI=0.0198457;REFB=0;REVB=0.0197384;RO=0;SAF=98;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69201e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40184e-05;OID=.;OPOS=36403036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:191:192:0:0:190:192:1:92:98:0:0:94:98:0:0 chrX 37518806 . C T 1358.51 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.459;QD=62.4602;RBI=0.0182856;REFB=0;REVB=0.00190308;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.53813e-05;OID=.;OPOS=37518806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0 chrX 37527659 . T C 1175.22 PASS AF=1;AO=50;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10308;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.302;QD=61.8536;RBI=0.115313;REFB=0;REVB=0.051688;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044947;OID=.;OPOS=37527659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:76:0:0:50:76:1:34:16:0:0:34:42:0:0 chrX 38229135 . G C 3090.41 PASS AF=1;AO=199;DP=200;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158582;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.877;QD=61.8082;RBI=0.0105055;REFB=0;REVB=-0.0103851;RO=0;SAF=96;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.74097e-05;OID=.;OPOS=38229135;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:200:200:0:0:199:200:1:103:96:0:0:103:97:0:0 chrX 38505492 . T C 958.68 PASS AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.012787;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.623;QD=57.2344;RBI=0.0145361;REFB=0.0100607;REVB=0.0069131;RO=1;SAF=21;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219643;STB=0.511624;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=2.05731e-05;OID=.;OPOS=38505492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:45:21:1:0:45:21:1:0 chrX 39932907 . T C 101.69 PASS AF=1;AO=8;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0663564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.726;QD=40.6738;RBI=0.0684977;REFB=0;REVB=0.016993;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00706787;OID=.;OPOS=39932907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:8:10:1:5:3:0:0:5:5:0:0 chrX 39933339 . A G,T 550.61 PASS AF=0.897436,0.0769231;AO=35,3;DP=39;FAO=35,3;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18,1;FSAR=17,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0109148,0.000761533;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.444,83.7959;QD=56.4732;RBI=0.0109151,0.00164819;REFB=-0.177444,-0.115925;REVB=-8.29765e-05,-0.00146172;RO=0;SAF=18,1;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.11116e-08,0;STB=0.513506,0.665547;STBP=0.515,0.558;TYPE=snp,snp;VARB=8.86043e-05,0.168505;OID=.,.;OPOS=39933339,39933339;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:39:39:0:1:35,3:35,3:0.897436,0.0769231:17,2:18,1:0:0:17,2:18,1:1:0 chrX 41203673 . GTTTTT G,GTTGTT 421.28 PASS AF=0.333333,0.666667;AO=10,20;DP=31;FAO=10,20;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3,10;FSAR=7,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147173,-0.00107718;FXX=0.0624805;HRUN=7,7;LEN=5,1;MLLD=43.4426,198.052;QD=56.1709;RBI=0.0254264,0.0220634;REFB=0,0;REVB=-0.020734,-0.0220371;RO=0;SAF=3,10;SAR=7,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00854355,0.00475508;OID=.,.;OPOS=41203674,41203676;OREF=TTTTT,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GTTGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.333333,0.666667:10,20:31:10,20:30:0:3,10:7,10:0:0:79:0:3,10:7,10:0:0 chrX 41556195 . A T 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.978;QD=48.7366;RBI=0.0165522;REFB=0;REVB=0.00465717;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47124e-05;OID=.;OPOS=41556195;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0 chrX 41587218 . T C 1419.12 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184626;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.129;QD=63.0721;RBI=0.0405162;REFB=0;REVB=0.0360652;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06744e-05;OID=.;OPOS=41587218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:44:46:0:0:44:46:0:0 chrX 41587569 . C G 635.94 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296557;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3401;QD=62.0434;RBI=0.0647226;REFB=0;REVB=0.0575287;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.82064e-05;OID=.;OPOS=41587569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0 chrX 41588169 . T C 1431.64 PASS AF=1;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.763;QD=62.9292;RBI=0.0321524;REFB=0;REVB=0.0320219;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.81701e-05;OID=.;OPOS=41588169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:90:91:1:43:47:0:0:44:47:0:0 chrX 44202890 . G GC 783.41 PASS AF=1;AO=64;DP=82;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00429458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.3653;QD=41.2323;RBI=0.0199801;REFB=0;REVB=0.0195131;RO=15;SAF=30;SAR=34;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000743221;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00441413;OID=.;OPOS=44202891;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:64:82:76:76:0:31:45:0:0:15:15:30:34:7:8 chrX 44938563 . G A 668.71 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00685682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.571;QD=62.2055;RBI=0.0176138;REFB=0;REVB=0.0162244;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118282;OID=.;OPOS=44938563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:27:15:0:0:27:16:0:0 chrX 45051111 . C T 1152.27 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.015;QD=60.6459;RBI=0.0393198;REFB=0;REVB=0.0389225;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180764;OID=.;OPOS=45051111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:76:0:0:72:76:1:34:38:0:0:37:39:0:0 chrX 46618321 . C G 638.79 PASS AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0549121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3872;QD=59.4224;RBI=0.0605797;REFB=-0.0150749;REVB=-0.0255842;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00155893;OID=.;OPOS=46618321;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:25:17:0:1:25:17:0:1 chrX 46740032 . G A 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.59;QD=61.6839;RBI=0.0349389;REFB=0;REVB=-0.0280577;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017736;OID=.;OPOS=46740032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0 chrX 46920599 . C A 1088.22 PASS AF=0.949367;AO=74;DP=78;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00468265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.234;QD=55.0997;RBI=0.00882398;REFB=-0.0566082;REVB=0.007479;RO=4;SAF=40;SAR=34;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282586;STB=0.515106;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000751647;OID=.;OPOS=46920599;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:78:79:4:4:74:75:0.949367:34:40:1:3:34:41:1:3 chrX 47057647 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000104891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.681;QD=56.1915;RBI=0.042151;REFB=0;REVB=0.0421509;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018212;OID=.;OPOS=47057647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:23:5:0:0:23:5:0:0 chrX 47062534 . G A 817.64 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.555;QD=57.3783;RBI=0.120493;REFB=0;REVB=0.118052;RO=0;SAF=40;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659218;OID=.;OPOS=47062534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:17:40:0:0:17:40:0:0 chrX 47085196 . C T 2386.03 PASS AF=0.993671;AO=157;DP=158;FAO=157;FDP=158;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8803;QD=60.4059;RBI=0.0160099;REFB=-0.0533097;REVB=0.00605895;RO=0;SAF=64;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5449e-08;STB=0.502673;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000289304;OID=.;OPOS=47085196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:158:158:0:1:157:157:0.993671:93:64:0:0:93:64:0:1 chrX 47444879 . G C 785.68 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2689;QD=64.1374;RBI=0.0616241;REFB=0;REVB=-0.0570066;RO=0;SAF=45;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000988276;OID=.;OPOS=47444879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:4:45:0:0:4:45:0:0 chrX 47444985 . T C 289.36 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522682;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.273;QD=52.6105;RBI=0.0537177;REFB=0;REVB=0.0123945;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189145;OID=.;OPOS=47444985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0 chrX 47445286 . A C,G 638.21 PASS AF=0.047619,0.952381;AO=2,40;DP=42;FAO=2,40;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=1,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000192403,0.0152386;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=165.027,67.335;QD=60.7817;RBI=0.0221613,0.0176845;REFB=0,0;REVB=-0.0221605,0.00897358;RO=0;SAF=1,8;SAR=1,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.142762,-0.00418857;OID=.,.;OPOS=47445286,47445286;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:42:42:0:0:2,40:2,40:0.047619,0.952381:1,32:1,8:0:0:1,32:1,8:0:0 chrX 47466361 . A G 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.396;QD=50.4134;RBI=0.0197511;REFB=0;REVB=0.00842742;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.90018e-05;OID=.;OPOS=47466361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0 chrX 47487912 . T TG 374.9 PASS AF=1;AO=31;DP=36;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059568;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.1007;QD=46.8629;RBI=0.0616439;REFB=0;REVB=0.015863;RO=4;SAF=16;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498038;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00298754;OID=.;OPOS=47487913;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:31:36:32:32:0:16:16:0:0:7:4:16:15:3:1 chrX 47487916 . T A 469.53 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385047;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.555;QD=58.6918;RBI=0.00721176;REFB=0;REVB=-0.00609781;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.35857e-05;OID=.;OPOS=47487916;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0 chrX 47695547 . T C 2125.4 PASS AF=0.992701;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.921;QD=62.0553;RBI=0.051777;REFB=-0.0116131;REVB=0.0468603;RO=1;SAF=72;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00655692;STB=0.503401;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00574286;OID=.;OPOS=47695547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:136:137:1:1:135:136:0.992701:63:72:1:0:63:73:1:0 chrX 47695742 . CT CC,C 464.34 PASS AF=0.121212,0.878788;AO=8,25;DP=33;FAO=4,29;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=3,14;FSAR=1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599003,-0.0150479;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.0161,31.7513;QD=56.2837;RBI=0.0749175,0.052574;REFB=0,0;REVB=-0.0449954,-0.0503745;RO=0;SAF=4,13;SAR=4,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.94263e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.0260193,0.00533611;OID=.,.;OPOS=47695743,47695743;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.121212,0.878788:8,25:33:4,29:33:0:3,14:1,15:0:0:22:0:4,13:4,12:0:0 chrX 47918205 . G A 56.57 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.142653;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7286;QD=37.7146;RBI=0.0258983;REFB=0;REVB=0.0258983;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216336;OID=.;OPOS=47918205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chrX 48049666 . C T 613.35 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3514;QD=61.3346;RBI=0.0346089;REFB=0;REVB=-0.0330239;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309594;OID=.;OPOS=48049666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0 chrX 48054740 . C G 657.76 PASS AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0188598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.491;QD=59.7967;RBI=0.0565612;REFB=0.0293981;REVB=0.0533242;RO=1;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323574;STB=0.517233;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=1.56387e-05;OID=.;OPOS=48054740;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:14:29:0:1:14:29:0:1 chrX 48209527 . T C 632.26 PASS AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.867;QD=61.684;RBI=0.0361838;REFB=0;REVB=0.010199;RO=0;SAF=6;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46866e-05;OID=.;OPOS=48209527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:35:6:0:0:35:6:0:0 chrX 48433139 . G A 392.3 PASS AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00622761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.192;QD=50.6198;RBI=0.077893;REFB=-0.0777928;REVB=0.0776436;RO=1;SAF=18;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251798;STB=0.526298;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0224146;OID=.;OPOS=48433139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:31:31:1:2:29:29:0.935484:11:18:1:0:11:18:2:0 chrX 48435928 . C T 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.74;QD=51.1846;RBI=0.0182204;REFB=0;REVB=0.00881435;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156353;OID=.;OPOS=48435928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0 chrX 48460314 . A G 769.36 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.922;QD=56.9893;RBI=0.0785224;REFB=0;REVB=-0.074419;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000295714;OID=.;OPOS=48460314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chrX 48751471 . A G 393.09 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8595;QD=56.1559;RBI=0.0884653;REFB=0;REVB=0.0824265;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00290964;OID=.;OPOS=48751471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0 chrX 48759204 . C T 239.32 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00389023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8796;QD=50.3839;RBI=0.0907261;REFB=0;REVB=0.0906426;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158004;OID=.;OPOS=48759204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chrX 49021256 . A G 1396.46 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.087;QD=62.7621;RBI=0.0266137;REFB=0;REVB=0.0124672;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88432e-05;OID=.;OPOS=49021256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0 chrX 49021537 . G C 740.41 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00857776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9989;QD=56.9548;RBI=0.0337017;REFB=0;REVB=-0.0325918;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215413;OID=.;OPOS=49021537;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0 chrX 49022700 . T C 340.74 PASS AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00257951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.029;QD=54.5177;RBI=0.0394642;REFB=0;REVB=0.0393798;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011363;OID=.;OPOS=49022700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:13:12:0:0 chrX 49071964 . A G 175.66 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00487171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.377;QD=46.8424;RBI=0.0609775;REFB=0;REVB=0.0607826;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288197;OID=.;OPOS=49071964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0 chrX 49081291 . G A 919.87 PASS AF=0.984615;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00173375;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8041;QD=56.6076;RBI=0.0613043;REFB=-0.0759458;REVB=0.0612798;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00072381;OID=.;OPOS=49081291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:65:65:0:1:63:64:0.984615:25:38:0:0:25:39:0:1 chrX 49103224 . G A 670.27 PASS AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00781646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.878;QD=62.3509;RBI=0.0171122;REFB=0;REVB=0.0152227;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94274e-05;OID=.;OPOS=49103224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:9:34:0:0:9:34:0:0 chrX 49767832 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024326;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=229.466;QD=56.1916;RBI=0.0275437;REFB=0;REVB=-0.0129189;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68143e-05;OID=.;OPOS=49767832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chrX 49767835 . A G 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351174;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=215.193;QD=56.1916;RBI=0.0382078;REFB=0;REVB=-0.0150535;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.54926e-05;OID=.;OPOS=49767835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0 chrX 50121146 . A AG 561.44 PASS AF=1;AO=47;DP=55;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.6678;QD=45.8318;RBI=0.153057;REFB=0;REVB=0.0339078;RO=7;SAF=20;SAR=27;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105205;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0060977;OID=.;OPOS=50121147;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:47:55:49:49:0:22:27:0:0:10:7:20:27:6:1 chrX 50146570 . C T 246.31 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.626;QD=49.2623;RBI=0.0247973;REFB=0;REVB=0.0184094;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354706;OID=.;OPOS=50146570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:10:9:0:0:10:10:0:0 chrX 51075841 . A G 107.42 PASS AF=0.272727;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00791633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.961;QD=7.81252;RBI=0.0113257;REFB=-8.52126e-05;REVB=-0.00809956;RO=40;SAF=13;SAR=2;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480453;STB=0.800129;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=2.27829e-05;OID=.;OPOS=51075841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:40:40:15:15:0.272727:2:13:21:19:2:13:21:19 chrX 51075901 . G A 79.42 PASS AF=0.181818;AO=14;DP=77;FAO=14;FDP=77;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.0164563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.853;QD=4.12566;RBI=0.0208291;REFB=-0.00514174;REVB=-0.0127688;RO=62;SAF=12;SAR=2;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441685;STB=0.801243;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0514083;OID=.;OPOS=51075901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:77:77:62:63:14:14:0.181818:2:12:34:28:2:12:34:29 chrX 52825546 . C G 868.15 PASS AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4878;QD=57.877;RBI=0.0287044;REFB=0;REVB=-0.021743;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.10765e-05;OID=.;OPOS=52825546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:31:27:0:0:33:27:0:0 chrX 52891619 . GTTTTG GTTTG,GTTTGT 102.08 PASS AF=0.333333,0.0175439;AO=18,2;DP=56;FAO=19,1;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=9,1;FSAR=10,0;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=0.00505983,-0.0892813;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=17.6745,29.2076;QD=7.16372;RBI=0.0551549,0.0922826;REFB=0.0137647,0.000173612;REVB=0.0549223,0.0233438;RO=34;SAF=8,2;SAR=10,0;SRF=7;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.284323,0.622748;STB=0.673546,0.995296;STBP=0.097,0.108;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0507464,0.136512;OID=.,.;OPOS=52891620,52891623;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=GTTTG,GTTTGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.333333,0.0175439:18,2:56:19,1:57:37:9,1:10,0:8:29:99:34:8,2:10,0:7:27 chrX 52891645 . A G 152.83 PASS AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=-0.0389537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.541;QD=10.3615;RBI=0.0469915;REFB=-0.00245823;REVB=-0.0262833;RO=39;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261408;STB=0.650661;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0094224;OID=.;OPOS=52891645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:11:9:9:30:11:9:9:30 chrX 52891653 . C T 140.62 PASS AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=32;FWDB=-0.0636876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2249;QD=9.37436;RBI=0.0637821;REFB=0.00211118;REVB=0.00347044;RO=40;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245342;STB=0.647699;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.00719067;OID=.;OPOS=52891653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:40:41:19:19:0.316667:11:8:9:31:11:8:9:32 chrX 53457622 . T C 519.53 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000285614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.252;QD=59.3753;RBI=0.0176626;REFB=0;REVB=0.0176603;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110965;OID=.;OPOS=53457622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:23:11:0:0:24:11:0:0 chrX 53563589 . A G 323.44 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8116;QD=53.9069;RBI=0.0486195;REFB=0;REVB=0.00569991;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000961535;OID=.;OPOS=53563589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0 chrX 53587351 . T TG 32.28 PASS AF=0.232558;AO=12;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0104505;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=139.727;QD=3.00248;RBI=0.0357911;REFB=-0.000807348;REVB=-0.0342314;RO=31;SAF=11;SAR=1;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507094;STB=0.812141;STBP=0.067;TYPE=ins;VARB=0.0835771;OID=.;OPOS=53587352;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.232558:12:43:10:43:33:9:1:20:13:32:31:11:1:19:12 chrX 53641647 . T C 520.06 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.148;QD=59.4349;RBI=0.0415869;REFB=0;REVB=0.041511;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138718;OID=.;OPOS=53641647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0 chrX 53652838 . G A 467.26 PASS AF=0.942857;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.016411;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.376;QD=53.4013;RBI=0.0169135;REFB=-0.036562;REVB=0.00409246;RO=2;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582943;STB=0.531231;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000105086;OID=.;OPOS=53652838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:35:2:2:33:33:0.942857:15:18:0:2:15:18:0:2 chrX 53652846 . G T 600.04 PASS AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.000687653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.943;QD=47.0615;RBI=0.0475678;REFB=-0.233462;REVB=0.0475628;RO=5;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119937;STB=0.564074;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00181907;OID=.;OPOS=53652846;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:51:51:5:5:46:46:0.901961:17:29:0:5:17:29:0:5 chrX 53652852 . T G 820.18 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0048649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.048;QD=55.6056;RBI=0.0295949;REFB=-0.00226231;REVB=0.0291924;RO=1;SAF=32;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145145;STB=0.50769;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=7.17868e-05;OID=.;OPOS=53652852;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:26:32:1:0:26:32:1:0 chrX 53659047 . C A,T 1789.39 PASS AF=0.140496,0.859504;AO=17,104;DP=121;FAO=17,104;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=16,55;FSAR=1,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160697,0.0277964;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.373,68.2486;QD=59.1532;RBI=0.0176314,0.0284551;REFB=0,0;REVB=0.0072547,-0.00608684;RO=0;SAF=16,55;SAR=1,49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0637951,-0.00804255;OID=.,.;OPOS=53659047,53659047;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:72:121:121:0:0:17,104:17,104:0.140496,0.859504:1,49:16,55:0:0:1,49:16,55:0:0 chrX 54956673 . T C 442.79 PASS AF=1;AO=27;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.59;QD=57.1344;RBI=0.0538281;REFB=0;REVB=0.0253331;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355247;OID=.;OPOS=54956673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:0:0:27:31:1:13:14:0:0:16:15:0:0 chrX 55116466 . C G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7647;QD=59.8388;RBI=0.0774244;REFB=0;REVB=0.0632755;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014763;OID=.;OPOS=55116466;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0 chrX 55172537 . G A 1666.25 PASS AF=0.857143;AO=120;DP=140;FAO=120;FDP=140;FR=.;FRO=20;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0245394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4918;QD=47.6071;RBI=0.0310019;REFB=0.00507623;REVB=-0.0189455;RO=20;SAF=58;SAR=62;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360361;STB=0.51909;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.000778974;OID=.;OPOS=55172537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:140:140:20:20:120:120:0.857143:62:58:7:13:62:58:7:13 chrX 55172572 . G A 493.63 PASS AF=0.346591;AO=61;DP=176;FAO=61;FDP=176;FR=.;FRO=115;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=52;FSRR=63;FWDB=-0.0237215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.939;QD=11.2189;RBI=0.0239319;REFB=-0.0185662;REVB=0.00316653;RO=115;SAF=24;SAR=37;SRF=52;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689706;STB=0.539511;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0348089;OID=.;OPOS=55172572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:115:115:61:61:0.346591:37:24:52:63:37:24:52:63 chrX 55172606 . G A 502.43 PASS AF=0.291845;AO=68;DP=233;FAO=68;FDP=233;FR=.;FRO=165;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=85;FSRR=80;FWDB=-0.00366442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.929;QD=8.6254;RBI=0.0131592;REFB=-0.00976588;REVB=-0.0126387;RO=165;SAF=29;SAR=39;SRF=85;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10785;STB=0.56298;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0198675;OID=.;OPOS=55172606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:165:165:68:68:0.291845:39:29:85:80:39:29:85:80 chrX 55172630 . G A 470.82 PASS AF=0.267717;AO=68;DP=255;FAO=68;FDP=254;FR=.;FRO=186;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=99;FSRR=87;FWDB=-0.00190369;FXX=0.00392141;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.625;QD=7.41441;RBI=0.0651395;REFB=0.00343519;REVB=0.0651116;RO=186;SAF=32;SAR=36;SRF=99;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076314;STB=0.545063;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.00766629;OID=.;OPOS=55172630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:186:186:68:68:0.267717:36:32:99:87:36:32:99:87 chrX 55172645 . C T 2228.02 PASS AF=0.71875;AO=182;DP=255;FAO=184;FDP=256;FR=.;FRO=72;FSAF=109;FSAR=75;FSRF=26;FSRR=46;FWDB=-0.00890953;FXX=0.0115826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.069;QD=34.8127;RBI=0.00891609;REFB=-0.00880908;REVB=0.00034208;RO=70;SAF=109;SAR=73;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127355;STB=0.565704;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00700493;OID=.;OPOS=55172645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:256:70:72:182:184:0.71875:73:109:25:45:75:109:26:46 chrX 55172659 . A G 189.78 PASS AF=0.152091;AO=40;DP=263;FAO=40;FDP=263;FR=.;FRO=223;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=121;FSRR=102;FWDB=-0.030104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.12;QD=2.88638;RBI=0.0302787;REFB=-0.00785486;REVB=0.00324769;RO=222;SAF=24;SAR=16;SRF=120;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777936;STB=0.549664;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0515236;OID=.;OPOS=55172659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:222:223:40:40:0.152091:16:24:120:102:16:24:121:102 chrX 55172680 . G C 506.69 PASS AF=0.281633;AO=69;DP=244;FAO=69;FDP=245;FR=.;FRO=176;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=102;FSRR=74;FWDB=-0.0440018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.615;QD=8.27245;RBI=0.0443014;REFB=-0.0120922;REVB=-0.00514345;RO=174;SAF=46;SAR=23;SRF=101;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112804;STB=0.567231;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0290468;OID=.;OPOS=55172680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:245:174:176:69:69:0.281633:23:46:101:73:23:46:102:74 chrX 55172686 . CT CC,TC 1841.11 PASS AF=0.43913,0.26087;AO=100,60;DP=230;FAO=101,60;FDP=230;FR=.;FRO=69;FSAF=74,42;FSAR=27,18;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=0.0143187,-0.011483;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,2;MLLD=45.6242,182.954;QD=32.0193;RBI=0.0169921,0.0254195;REFB=0.0120895,-0.0129966;REVB=-0.00914913,-0.022678;RO=68;SAF=73,42;SAR=27,18;SRF=27;SRR=41;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.271191,0.298412;STB=0.646258,0.662866;STBP=0,0.002;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0118226,0.0221087;OID=.,.;OPOS=55172687,55172686;OREF=T,CT;OALT=C,TC;OMAPALT=CC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:68:69:100,60:101,60:0.43913,0.26087:27,18:73,42:27:41:27,18:74,42:28:41 chrX 55172708 . T G 1716.01 PASS AF=0.69378;AO=144;DP=208;FAO=145;FDP=209;FR=.;FRO=64;FSAF=119;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.0298526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.87;QD=32.8423;RBI=0.0315118;REFB=0.00307573;REVB=-0.0100903;RO=64;SAF=118;SAR=26;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311967;STB=0.668865;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00170382;OID=.;OPOS=55172708;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:64:64:144:145:0.69378:26:118:26:38:26:119:26:38 chrX 55172716 . C T 99.14 PASS AF=0.119403;AO=24;DP=201;FAO=24;FDP=201;FR=.;FRO=177;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=121;FSRR=56;FWDB=-0.0108635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.025;QD=1.97302;RBI=0.0111904;REFB=-0.00472681;REVB=-0.0026851;RO=176;SAF=22;SAR=2;SRF=121;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.412308;STB=0.816567;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0285448;OID=.;OPOS=55172716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:176:177:24:24:0.119403:2:22:121:55:2:22:121:56 chrX 55185568 . A G 515.44 PASS AF=0.470085;AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0179943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.163;QD=17.6219;RBI=0.0180498;REFB=-0.000388934;REVB=-0.00141451;RO=62;SAF=27;SAR=28;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221099;STB=0.512282;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.000346438;OID=.;OPOS=55185568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:62:55:55:0.470085:28:27:29:33:28:27:29:33 chrX 55205242 . CTT C,CT 40.5 PASS AF=0.0833333,0.291667;AO=3,8;DP=25;FAO=2,7;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2,6;FSAR=0,1;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0431719,-0.0754914;FXX=0.039984;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=22.9789,11.3871;QD=6.74938;RBI=0.0469674,0.0816884;REFB=-0.0390643,-0.0729507;REVB=0.0184965,0.0312097;RO=12;SAF=3,6;SAR=0,2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.664653,0.345943;STB=0.994743,0.804999;STBP=0.174,0.08;TYPE=del,del;VARB=0.0728977,-0.0306518;OID=.,.;OPOS=55205243,55205243;OREF=TT,T;OALT=-,-;OMAPALT=C,CT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0833333,0.291667:3,8:25:2,7:24:15:2,6:0,1:7:8:21:12:3,6:0,2:5:7 chrX 55247030 . C G 1530.02 PASS AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.988;QD=63.751;RBI=0.0214418;REFB=0;REVB=-0.00573133;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25629e-05;OID=.;OPOS=55247030;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:56:40:0:0:56:40:0:0 chrX 55289774 . T C 1044.39 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.876;QD=59.6792;RBI=0.0220533;REFB=0;REVB=0.0207368;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.13426e-05;OID=.;OPOS=55289774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:41:29:0:0:41:29:0:0 chrX 55479299 . G A 1280.74 PASS AF=0.945055;AO=86;DP=91;FAO=86;FDP=91;FR=.;FRO=5;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0545875;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.5121;QD=56.2964;RBI=0.0553894;REFB=-0.090332;REVB=-0.00939144;RO=5;SAF=37;SAR=49;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598328;STB=0.531638;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0041037;OID=.;OPOS=55479299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:91:91:5:5:86:86:0.945055:49:37:5:0:49:37:5:0 chrX 55651001 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.642;QD=51.1846;RBI=0.0320695;REFB=0;REVB=-0.0164021;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018342;OID=.;OPOS=55651001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0 chrX 57313357 . T C 1060.42 PASS AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.145;QD=59.7419;RBI=0.0195745;REFB=0;REVB=-0.00705982;RO=0;SAF=21;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.39976e-05;OID=.;OPOS=57313357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:50:21:0:0:50:21:0:0 chrX 57405163 . T C 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.601;QD=57.7112;RBI=0.00947698;REFB=0;REVB=-0.00691477;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.4135e-06;OID=.;OPOS=57405163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0 chrX 57619648 . G T 695.87 PASS AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.761;QD=60.5101;RBI=0.0231115;REFB=-0.0127368;REVB=0.0097331;RO=1;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030296;STB=0.516122;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000454509;OID=.;OPOS=57619648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:15:30:0:1:15:30:0:1 chrX 57622607 . G A 724.13 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00726238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.326;QD=54.6514;RBI=0.0161074;REFB=-0.00722757;REVB=0.0143773;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018468;STB=0.5098;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=1.09062e-05;OID=.;OPOS=57622607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:27:25:1:0:27:25:1:0 chrX 65382685 . T A,C 711.89 PASS AF=0.0784314,0.921569;AO=3,46;DP=50;FAO=4,47;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=4,16;FSAR=0,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112503,0.0125309;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.6861,55.391;QD=55.8348;RBI=0.0141226,0.0132573;REFB=0,0;REVB=0.0085369,-0.00432807;RO=0;SAF=3,15;SAR=0,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0124139,0.0028335;OID=.,.;OPOS=65382685,65382685;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:17:50:51:0:0:3,46:4,47:0.0784314,0.921569:0,31:3,15:0:0:0,31:4,16:0:0 chrX 65822607 . T C 2477.6 PASS AF=1;AO=161;DP=162;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264316;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.01;QD=61.5553;RBI=0.0162855;REFB=0;REVB=-0.0160695;RO=0;SAF=70;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31345e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.49894e-05;OID=.;OPOS=65822607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:162:161:0:0:161:161:1:91:70:0:0:91:70:0:0 chrX 65824986 . C T 1415.43 PASS AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.142;QD=62.9081;RBI=0.036636;REFB=0;REVB=0.0317235;RO=0;SAF=48;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.13007e-06;OID=.;OPOS=65824986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:42:48:0:0:42:48:0:0 chrX 67674212 . T A 152.25 PASS AF=0.806452;AO=15;DP=27;FAO=25;FDP=31;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.1874;FXX=0.0312402;HRUN=7;LEN=1;MLLD=24.7307;QD=19.6448;RBI=0.187935;REFB=-0.145119;REVB=0.0141636;RO=10;SAF=0;SAR=15;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.838061;STB=0.604844;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0328508;OID=.;OPOS=67674212;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:27:31:10:6:15:25:0.806452:15:0:6:4:21:4:3:3 chrX 67942295 . G C 612.81 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0479;QD=61.2811;RBI=0.0482802;REFB=0;REVB=0.0482001;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445812;OID=.;OPOS=67942295;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0 chrX 67945420 . A G 181.02 PASS AF=0.888889;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.185052;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1898;QD=40.2273;RBI=0.214518;REFB=-0.0984306;REVB=0.108507;RO=2;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129916;STB=0.571338;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0234297;OID=.;OPOS=67945420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:19:18:2:2:16:16:0.888889:10:6:2:0:10:6:2:0 chrX 68725640 . T C 55.12 PASS AF=0.875;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0958871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2442;QD=27.5599;RBI=0.0967774;REFB=0.0119784;REVB=-0.0130971;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962265;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00672505;OID=.;OPOS=68725640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:8:1:1:6:7:0.875:4:2:0:1:4:3:0:1 chrX 69250308 . C T 851.24 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8281;QD=57.7111;RBI=0.0353094;REFB=0;REVB=0.0201727;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029205;OID=.;OPOS=69250308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0 chrX 69258515 . T G 1173.08 PASS AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532924;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.7504;QD=58.6542;RBI=0.0532938;REFB=-0.167459;REVB=0.000376328;RO=0;SAF=26;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00767394;OID=.;OPOS=69258515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:80:80:0:0:78:80:1:52:26:0:0:54:26:0:0 chrX 69478749 . G T 447.03 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0798945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.261;QD=57.6807;RBI=0.0806742;REFB=0;REVB=0.0111889;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659281;OID=.;OPOS=69478749;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0 chrX 69478775 . A C 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.772;QD=53.2767;RBI=0.0355147;REFB=0;REVB=0.0115839;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567459;OID=.;OPOS=69478775;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chrX 69478942 . T G 1226.05 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00897097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3114;QD=61.3023;RBI=0.0153881;REFB=0;REVB=-0.0125026;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75342e-05;OID=.;OPOS=69478942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:36:44:0:0:36:44:0:0 chrX 69489530 . C T 464.84 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6429;QD=58.1048;RBI=0.0211635;REFB=0;REVB=-0.00337694;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131344;OID=.;OPOS=69489530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0 chrX 69510335 . C G,T 718.12 PASS AF=0.0392157,0.960784;AO=2,49;DP=51;FAO=2,49;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=0,26;FSAR=2,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132083,0.0357957;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.0013,171.181;QD=56.323;RBI=0.135201,0.0388884;REFB=0,0;REVB=0.0288713,0.0151979;RO=0;SAF=0,26;SAR=2,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.105477,0.00268396;OID=.,.;OPOS=69510335,69510335;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:51:51:0:0:2,49:2,49:0.0392157,0.960784:2,23:0,26:0:0:2,23:0,26:0:0 chrX 69550080 . A G 1231.07 PASS AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201755;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.232;QD=61.5536;RBI=0.0202339;REFB=0;REVB=-0.00153651;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79038e-05;OID=.;OPOS=69550080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:49:31:0:0:49:31:0:0 chrX 69652762 . A G 1227.41 PASS AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0516712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1647;QD=61.3705;RBI=0.0684468;REFB=0;REVB=-0.0448893;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000806915;OID=.;OPOS=69652762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0 chrX 69774517 . A T 710.28 PASS AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.761;QD=54.637;RBI=0.0214959;REFB=-0.157252;REVB=0.0109569;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.508768;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00104887;OID=.;OPOS=69774517;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:23:28:0:0:23:28:1:0 chrX 69964084 . GAAAAAAA GAAAAAA,GAAAAAAT,GAAAAATA 102.98 PASS AF=0.333333,0.466667,0.133333;AO=4,4,2;DP=16;FAO=5,7,2;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=0,4,2;FSAR=5,3,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.314484,-0.0445971,-0.0870421;FXX=0.062461;HRUN=8,8,8;LEN=1,1,1;MLLD=7.6473,174.874,162.428;QD=27.4602;RBI=0.317242,0.0486473,0.0891964;REFB=-0.0543256,0.000368201,0.00150625;REVB=-0.041746,-0.0194334,-0.0194849;RO=2;SAF=0,2,2;SAR=4,2,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.277405,0.727176;STB=0.5,0.571224,0.993266;STBP=1,0.543,0.227;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.053626,0.0105292,-0.0462023;OID=.,.,.;OPOS=69964085,69964091,69964090;OREF=A,A,A;OALT=-,T,T;OMAPALT=GAAAAAA,GAAAAAAT,GAAAAATA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.333333,0.466667,0.133333:4,4,2:16:5,7,2:15:1:0,4,2:5,3,0:0:1:31:2:0,2,2:4,2,0:0:2 chrX 70146398 . A G 1877.85 PASS AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00533521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.693;QD=61.569;RBI=0.0246483;REFB=0;REVB=0.024064;RO=0;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88865e-05;OID=.;OPOS=70146398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:69:53:0:0:69:53:0:0 chrX 70146475 . G C 1302.17 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00591121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.212;QD=62.0081;RBI=0.0158797;REFB=0;REVB=0.0147384;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6425e-05;OID=.;OPOS=70146475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:48:35:0:0:49:35:0:0 chrX 70636469 . A C 34.83 PASS AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00357497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.582;QD=23.2183;RBI=0.0302514;REFB=-0.0126499;REVB=0.0300394;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00557456;OID=.;OPOS=70636469;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1 chrX 70836827 . CGGGGGC CGGG,CGGGG,CGGGGC,CGGGGCC 85.83 PASS AF=0.121212,0.0909091,0.30303,0;AO=4,5,6,2;DP=38;FAO=4,3,10,0;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=2,0,1,0;FSAR=2,3,9,0;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.103545,-0.17623,-0.146714,0.0147817;FXX=0.0833102;HRUN=5,5,5,5;LEN=3,2,1,1;MLLD=33.0306,19.6149,11.8787,14.7626;QD=10.4031;RBI=0.118023,0.201362,0.170266,0.0169093;REFB=-0.0678964,-0.0911639,-0.147468,-0.0644227;REVB=-0.0566371,-0.0974137,-0.0864042,0.00821131;RO=16;SAF=2,0,1,2;SAR=2,5,5,0;SRF=6;SRR=10;SSEN=0.375,0.375,0.375,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.142855,-0.67111,-0.299254,0.589174;STB=0.5,0.996157,0.825746,0.5;STBP=1,0.072,0.026,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=0.0376319,0.197723,0.154957,0;OID=.,.,.,.;OPOS=70836831,70836832,70836828,70836832;OREF=GGC,GC,G,G;OALT=-,-,-,C;OMAPALT=CGGG,CGGGG,CGGGGC,CGGGGCC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:0.121212,0.0909091,0.30303,0:4,5,6,2:38:4,3,10,0:33:16:2,0,1,0:2,3,9,0:8:8:33:16:2,0,1,2:2,5,5,0:6:10 chrX 71349774 . T C 585.8 PASS AF=1;AO=24;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.091;QD=61.6627;RBI=0.0702892;REFB=0;REVB=0.0701117;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460296;OID=.;OPOS=71349774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:24:38:1:4:20:0:0:18:20:0:0 chrX 71351443 . A G 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0600106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.394;QD=45.8068;RBI=0.0615665;REFB=0;REVB=0.0137535;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163409;OID=.;OPOS=71351443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0 chrX 71358984 . C T 2090.04 PASS AF=0.971429;AO=135;DP=140;FAO=136;FDP=140;FR=.;FRO=4;FSAF=65;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0340834;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.71;QD=59.7155;RBI=0.0364754;REFB=-0.198031;REVB=0.0129913;RO=1;SAF=64;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736987;STB=0.514923;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00108672;OID=.;OPOS=71358984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:140:140:1:4:135:136:0.971429:71:64:1:0:71:65:4:0 chrX 71363415 . C T 350.69 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142717;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.49;QD=53.9528;RBI=0.0176351;REFB=0;REVB=0.0103593;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57393e-05;OID=.;OPOS=71363415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:17:8:0:0:18:8:0:0 chrX 71379881 . G A 689.36 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.174;QD=62.6693;RBI=0.0232501;REFB=0;REVB=0.0196296;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164598;OID=.;OPOS=71379881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0 chrX 71406301 . T C 1562.85 PASS AF=0.972973;AO=105;DP=110;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00201933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1764;QD=56.3191;RBI=0.0493472;REFB=-0.124306;REVB=0.0493059;RO=2;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186017;STB=0.514283;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00988637;OID=.;OPOS=71406301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:110:111:2:3:105:108:0.972973:50:55:0:2:51:57:0:3 chrX 71416721 . C T 1513.4 PASS AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.58;QD=59.9368;RBI=0.0200485;REFB=0;REVB=0.00928487;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21551e-05;OID=.;OPOS=71416721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:51:50:0:0:51:50:0:0 chrX 71418669 . C A 160.32 PASS AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114086;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.515;QD=45.8068;RBI=0.0360643;REFB=0;REVB=0.0342123;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195184;OID=.;OPOS=71418669;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0 chrX 71521867 . G C 289.05 PASS AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00984267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.361;QD=52.5536;RBI=0.0495988;REFB=0;REVB=0.0486123;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486661;OID=.;OPOS=71521867;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0 chrX 71549512 . G C 1160.18 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118413;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4234;QD=61.0623;RBI=0.0382557;REFB=0;REVB=-0.036377;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000401831;OID=.;OPOS=71549512;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0 chrX 71791912 . C T 1588.46 PASS AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00823344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.659;QD=64.1803;RBI=0.0368298;REFB=0;REVB=0.0358977;RO=0;SAF=44;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40252e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.12431e-05;OID=.;OPOS=71791912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:54:44:0:0:55:44:0:0 chrX 71819691 . A G 1116.93 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.827;QD=60.3745;RBI=0.0249451;REFB=0;REVB=0.0235499;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2217e-05;OID=.;OPOS=71819691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:30:44:0:0:30:44:0:0 chrX 72902707 . G T 340.74 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.283;QD=54.5176;RBI=0.0521077;REFB=0;REVB=-0.0297153;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169201;OID=.;OPOS=72902707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0 chrX 73043817 . T C 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.974;QD=58.1415;RBI=0.0606207;REFB=0;REVB=0.0603915;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236591;OID=.;OPOS=73043817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0 chrX 73066439 . T C 601.38 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00706531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.264;QD=58.6712;RBI=0.0154384;REFB=-0.186193;REVB=-0.0137268;RO=1;SAF=28;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164593;STB=0.508768;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00156688;OID=.;OPOS=73066439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:12:28:1:0:12:28:1:0 chrX 73462520 . T C 1175.24 PASS AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00850168;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.081;QD=61.0516;RBI=0.0690307;REFB=0;REVB=0.0685052;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49714e-05;OID=.;OPOS=73462520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:43:34:0:0:43:34:0:0 chrX 73641569 . T C 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.562;QD=51.1846;RBI=0.0423592;REFB=0;REVB=-0.0194503;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.4162e-05;OID=.;OPOS=73641569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:18:2:0:0:18:2:0:0 chrX 74494470 . T G 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.923;QD=56.7066;RBI=0.0336074;REFB=0;REVB=0.00668911;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116365;OID=.;OPOS=74494470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0 chrX 74511202 . G C 1215.85 PASS AF=1;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141077;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1453;QD=61.562;RBI=0.0166885;REFB=0;REVB=0.00891516;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97504e-05;OID=.;OPOS=74511202;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:81:79:0:0:79:79:1:37:42:0:0:37:42:0:0 chrX 75004529 . C A 1116.96 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6789;QD=60.3763;RBI=0.0648649;REFB=0;REVB=-0.0640017;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000672723;OID=.;OPOS=75004529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0 chrX 75648898 . CT CTC,TC 53.06 PASS AF=0.470588,0.0588235;AO=6,3;DP=17;FAO=8,1;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=1,0;FSAR=7,1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.133885,-0.188036;FXX=0;HRUN=0,4;LEN=1,2;MLLD=28.6026,33.5784;QD=12.4855;RBI=0.158629,0.22826;REFB=-0.0460981,-0.000289636;REVB=-0.0850767,-0.129404;RO=8;SAF=0,1;SAR=6,2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.718972,0.103748;STB=0.617308,0.984745;STBP=0.551,0.54;TYPE=ins,mnp;VARB=0.141761,0.0196874;OID=.,.;OPOS=75648900,75648898;OREF=-,CT;OALT=C,TC;OMAPALT=CTC,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:17:17:8:8:6,3:8,1:0.470588,0.0588235:6,2:0,1:2:6:7,1:1,0:2:6 chrX 77298857 . G A 706.89 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00419003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.949;QD=62.8349;RBI=0.0364641;REFB=0;REVB=0.0362225;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177487;OID=.;OPOS=77298857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:14:30:0:0:15:30:0:0 chrX 77528317 . G A 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.522;QD=64.1534;RBI=0.00934167;REFB=0;REVB=0.00524771;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01642e-05;OID=.;OPOS=77528317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0 chrX 78011737 . T C 1009.09 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.069999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.887;QD=59.3581;RBI=0.0868729;REFB=0;REVB=0.0514493;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.57355e-05;OID=.;OPOS=78011737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:40:28:0:0 chrX 78426988 . T C 785.43 PASS AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.823;QD=64.1166;RBI=0.0291191;REFB=0;REVB=0.00143341;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56888e-05;OID=.;OPOS=78426988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:24:24:0:0:24:25:0:0 chrX 79286038 . GCCCCCT GCCCCCC,GCCCCT 36.21 PASS AF=0.0701754,0.122807;AO=3,15;DP=57;FAO=4,7;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=0,6;FSAR=4,1;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00934603,-0.218319;FXX=0.065563;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=274.872,12.1592;QD=2.54086;RBI=0.00973056,0.229094;REFB=-0.00255254,-0.124647;REVB=-0.00270841,-0.0694323;RO=33;SAF=0,13;SAR=3,2;SRF=14;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0.366667;SSSB=-0.503221,0.55114;STB=0.997509,0.80884;STBP=0.028,0.109;TYPE=snp,del;VARB=0.0402731,0.0379511;OID=.,.;OPOS=79286044,79286039;OREF=T,C;OALT=C,-;OMAPALT=GCCCCCC,GCCCCT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.0701754,0.122807:3,15:57:4,7:57:46:0,6:4,1:25:21:14:33:0,13:3,2:14:19 chrX 79699998 . T A 1291.89 PASS AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330854;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.803;QD=61.5186;RBI=0.0364085;REFB=0;REVB=-0.0151967;RO=0;SAF=34;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140292;OID=.;OPOS=79699998;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:49:34:0:0:49:35:0:0 chrX 79931831 . CGTGTGTGTGTGTC CGTGTGTGTC,CGTGTGTGTCTGTG 644.02 PASS AF=0.72093,0.27907;AO=28,14;DP=45;FAO=31,12;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12,2;FSAR=19,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0789094,0.0170847;FXX=0.0227221;HRUN=1,1;LEN=4,5;MLLD=170.169,100.991;QD=59.9092;RBI=0.0802679,0.0203757;REFB=0,0;REVB=0.0147051,-0.0111031;RO=0;SAF=11,3;SAR=17,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.31638e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.000854838,0.0248762;OID=.,.;OPOS=79931832,79931840;OREF=GTGT,GTGTC;OALT=-,CTGTG;OMAPALT=CGTGTGTGTC,CGTGTGTGTCTGTG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.72093,0.27907:28,14:45:31,12:43:0:12,2:19,10:0:0:93:0:11,3:17,11:0:0 chrX 79943569 . T C 1888.56 PASS AF=0.991935;AO=122;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0988227;FXX=0.0158718;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2665;QD=60.9213;RBI=0.1047;REFB=-0.0539553;REVB=0.0345864;RO=0;SAF=68;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72266e-08;STB=0.504424;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00139688;OID=.;OPOS=79943569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:124:124:0:1:122:123:0.991935:54:68:0:0:56:67:0:1 chrX 79989018 . C G 714.92 PASS AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0208843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6416;QD=60.8438;RBI=0.0333748;REFB=-0.128025;REVB=-0.0260331;RO=1;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170959;STB=0.509087;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00132101;OID=.;OPOS=79989018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:27:19:0:1:27:19:0:1 chrX 80185294 . G A 708.54 PASS AF=1;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.802;QD=62.9809;RBI=0.0620243;REFB=0;REVB=-0.0604489;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000401025;OID=.;OPOS=80185294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:45:0:0:43:45:1:18:25:0:0:19:26:0:0 chrX 80191990 . G C 803.88 PASS AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.007048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.698;QD=55.44;RBI=0.0103347;REFB=-0.0632719;REVB=0.00755855;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154619;STB=0.508194;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=9.5154e-05;OID=.;OPOS=80191990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:27:30:1:0:27:30:1:0 chrX 83128011 . C T 1764.75 PASS AF=1;AO=105;DP=106;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1292;QD=59.3195;RBI=0.139483;REFB=0;REVB=-0.0115447;RO=1;SAF=33;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000864126;OID=.;OPOS=83128011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:106:119:1:0:105:119:1:72:33:1:0:73:46:0:0 chrX 84350010 . A G 538.55 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00815696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.062;QD=59.8385;RBI=0.00997565;REFB=0;REVB=-0.00574262;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101252;OID=.;OPOS=84350010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0 chrX 84358864 . C T 793.06 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0174032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.619;QD=54.6938;RBI=0.0226558;REFB=-0.116145;REVB=-0.0145056;RO=1;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200576;STB=0.510201;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000571822;OID=.;OPOS=84358864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:23:33:0:1:24:33:0:1 chrX 84362350 . ATTT ATT,ATTC 390.76 PASS AF=1,0;AO=30,2;DP=37;FAO=38,0;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161493,0.171196;FXX=0.0256345;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.8969,8.58721;QD=41.1329;RBI=0.199857,0.249926;REFB=-0.0297404,0.00937415;REVB=0.117741,-0.182085;RO=4;SAF=30,0;SAR=0,2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.868968,-0.687939;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0134984,0;OID=.,.;OPOS=84362351,84362353;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATT,ATTC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1,0:30,2:37:38,0:38:0:35,0:3,0:0:0:3:4:30,0:0,2:3:1 chrX 84363140 . A G 1483.07 PASS AF=1;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575068;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.176;QD=59.922;RBI=0.0248248;REFB=0;REVB=0.0241495;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129587;OID=.;OPOS=84363140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:101:99:0:0:99:99:1:48:51:0:0:48:51:0:0 chrX 84534383 . A C 956.28 PASS AF=0.985714;AO=31;DP=74;FAO=69;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0320531;FXX=0.0540468;HRUN=10;LEN=1;MLLD=102.49;QD=54.6448;RBI=0.0815284;REFB=-0.245065;REVB=0.0749632;RO=1;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217036;STB=0.506492;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000850863;OID=.;OPOS=84534383;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:74:70:1:1:31:69:0.985714:21:10:0:1:38:31:0:1 chrX 84563135 . T A 2293.81 PASS AF=1;AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.464;QD=63.7169;RBI=0.0312531;REFB=0;REVB=0.0221079;RO=0;SAF=70;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12326e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24165e-05;OID=.;OPOS=84563135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:143:144:0:0:143:144:1:73:70:0:0:73:71:0:0 chrX 86877348 . G T 1421.32 PASS AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0370719;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5437;QD=60.4816;RBI=0.037178;REFB=-0.0261814;REVB=-0.00280603;RO=2;SAF=44;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00087825;STB=0.500463;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000313582;OID=.;OPOS=86877348;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:94:94:2:2:92:92:0.978723:48:44:1:1:48:44:1:1 chrX 86887244 . C T 651.21 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0088579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.959;QD=62.0199;RBI=0.0239792;REFB=0;REVB=0.0222832;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.80103e-05;OID=.;OPOS=86887244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chrX 88008423 . A C 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5224;QD=56.9373;RBI=0.0859514;REFB=0;REVB=0.0756104;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144834;OID=.;OPOS=88008423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0 chrX 88009322 . A G 1153.56 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.977;QD=60.7135;RBI=0.0160571;REFB=0;REVB=-0.010055;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69325e-06;OID=.;OPOS=88009322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:40:36:0:0:40:36:0:0 chrX 90693458 . A T 1891.8 PASS AF=1;AO=97;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2672;QD=60.0571;RBI=0.121206;REFB=0;REVB=0.092035;RO=0;SAF=31;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0033683;OID=.;OPOS=90693458;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:126:126:0:0:97:126:1:66:31:0:0:87:39:0:0 chrX 91578946 . C T 191.14 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4463;QD=47.786;RBI=0.0348223;REFB=0;REVB=-0.0142718;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286313;OID=.;OPOS=91578946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0 chrX 91585410 . A G 130.46 PASS AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.746;QD=43.4862;RBI=0.0186933;REFB=0;REVB=0.00676913;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146609;OID=.;OPOS=91585410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0 chrX 91873265 . G C 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00203625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.123;QD=64.1539;RBI=0.0192198;REFB=0;REVB=-0.0191116;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.54367e-05;OID=.;OPOS=91873265;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0 chrX 92966454 . GTA AGT,GAT,GT 296.75 PASS AF=0.015625,0,0.5625;AO=8,7,54;DP=130;FAO=2,0,72;FDP=128;FR=.;FRO=54;FSAF=1,0,33;FSAR=1,0,39;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0112811,0.00205697,0.0459637;FXX=0.0153834;HRUN=1,1,5;LEN=3,2,1;MLLD=71.3181,132.706,9.05831;QD=9.27351;RBI=0.0307489,0.137993,0.080963;REFB=-0.0318035,-0.0151555,-0.163836;REVB=-0.0286047,-0.137978,-0.0666509;RO=51;SAF=2,0,27;SAR=6,7,27;SRF=36;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.510661,-0.728565,-0.181935;STB=0.623838,0.5,0.573006;STBP=0.782,1,0.074;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0.120431,0,0.18793;OID=.,.,.;OPOS=92966454,92966455,92966456;OREF=GTA,TA,A;OALT=AGT,AT,-;OMAPALT=AGT,GAT,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/3:99:130:128:51:54:8,7,54:2,0,72:0.015625,0,0.5625:6,7,27:2,0,27:36:15:1,0,39:1,0,33:34:20 chrX 96139406 . G A 1339.77 PASS AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00965078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.233;QD=62.3147;RBI=0.0252692;REFB=0;REVB=-0.0233536;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114328;OID=.;OPOS=96139406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0 chrX 96139459 . T C 1188.58 PASS AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.808;QD=60.9528;RBI=0.0277855;REFB=0;REVB=0.0147259;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130307;OID=.;OPOS=96139459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:44:34:0:0:44:34:0:0 chrX 99355146 . C T 651.23 PASS AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.514;QD=62.0219;RBI=0.02638;REFB=0;REVB=0.0146674;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.73524e-05;OID=.;OPOS=99355146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0 chrX 99849017 . G A 483.34 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0825257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.348;QD=58.5872;RBI=0.0836877;REFB=0;REVB=0.013898;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00035399;OID=.;OPOS=99849017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0 chrX 99854083 . T G 1312.5 PASS AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0118167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7619;QD=59.6589;RBI=0.0494354;REFB=-0.00782023;REVB=0.0480023;RO=2;SAF=31;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016916;STB=0.508927;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000660775;OID=.;OPOS=99854083;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:88:88:2:2:86:86:0.977273:55:31:0:2:55:31:0:2 chrX 99941705 . T C 432.84 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434199;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2211;QD=57.7113;RBI=0.0580599;REFB=0;REVB=0.0385443;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000916694;OID=.;OPOS=99941705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chrX 100243459 . G T 1246.05 PASS AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.067;QD=61.5334;RBI=0.0174954;REFB=0;REVB=0.0100309;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.10432e-05;OID=.;OPOS=100243459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:46:35:0:0:46:35:0:0 chrX 100245606 . A G 429.0 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00221489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1832;QD=57.2003;RBI=0.0335393;REFB=0;REVB=0.0334661;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336828;OID=.;OPOS=100245606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0 chrX 100547933 . A G 1172.0 PASS AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8968;QD=60.8833;RBI=0.0308491;REFB=0;REVB=-0.0150328;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230978;OID=.;OPOS=100547933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0 chrX 100608191 . G A 1135.13 PASS AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.925;QD=60.5403;RBI=0.00738539;REFB=0;REVB=-0.00497658;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93662e-07;OID=.;OPOS=100608191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0 chrX 100645467 . T C 867.73 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0133544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.951;QD=55.9827;RBI=0.0240359;REFB=0.00348255;REVB=0.0199846;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-3.46245e-05;OID=.;OPOS=100645467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:62:0:1:61:61:0.983871:30:31:0:0:30:31:1:0 chrX 100668489 . T G 565.29 PASS AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00535704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.491;QD=53.8372;RBI=0.014572;REFB=-0.0417351;REVB=0.0135516;RO=1;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028395;STB=0.518787;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.000252301;OID=.;OPOS=100668489;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:42:42:1:3:39:39:0.928571:16:23:0:1:16:23:1:2 chrX 100745021 . C T 2235.25 PASS AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000500859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.149;QD=63.4112;RBI=0.00642686;REFB=0;REVB=-0.00640731;RO=0;SAF=68;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2436e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.30439e-05;OID=.;OPOS=100745021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:73:68:0:0:73:68:0:0 chrX 100748078 . A G 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1004;QD=55.6555;RBI=0.0408294;REFB=0;REVB=-0.0185515;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262885;OID=.;OPOS=100748078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:4:23:0:0:4:23:0:0 chrX 100911066 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.532;QD=57.2023;RBI=0.0195092;REFB=0;REVB=0.0156589;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75473e-05;OID=.;OPOS=100911066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0 chrX 101138792 . T C 495.84 PASS AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.774;QD=58.3343;RBI=0.0394207;REFB=0;REVB=0.0371912;RO=1;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207543;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025127;OID=.;OPOS=101138792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:34:1:0:32:34:1:22:10:0:1:24:10:0:0 chrX 101623772 . T C 612.39 PASS AF=0.539823;AO=61;DP=113;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.0155985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4753;QD=21.6776;RBI=0.0490715;REFB=-0.0275758;REVB=-0.0465263;RO=52;SAF=28;SAR=33;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0797175;STB=0.543675;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0228934;OID=.;OPOS=101623772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:52:61:61:0.539823:33:28:19:33:33:28:19:33 chrX 101911337 . C T 340.68 PASS AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.68;QD=54.509;RBI=0.0346157;REFB=0;REVB=-0.017781;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27859e-05;OID=.;OPOS=101911337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0 chrX 101970316 . A C 1399.78 PASS AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00550989;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7805;QD=62.9114;RBI=0.00926568;REFB=0;REVB=-0.00744943;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.30929e-05;OID=.;OPOS=101970316;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:46:43:0:0:46:43:0:0 chrX 102529190 . C G 769.4 PASS AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.1714;QD=56.9926;RBI=0.0573691;REFB=0;REVB=-0.00783959;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487428;OID=.;OPOS=102529190;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0 chrX 102564583 . A G 785.89 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00906756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.35;QD=64.1539;RBI=0.018351;REFB=0;REVB=0.0159543;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29315e-05;OID=.;OPOS=102564583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0 chrX 102754848 . T G 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.684;QD=44.6898;RBI=0.0224818;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200948;OID=.;OPOS=102754848;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:0:13:0:0:0:13:0:0 chrX 102930960 . A G 272.55 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281501;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.7183;QD=51.9133;RBI=0.216142;REFB=0;REVB=0.214301;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00590971;OID=.;OPOS=102930960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0 chrX 102979486 . T C 1158.62 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304272;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.942;QD=60.9801;RBI=0.059999;REFB=0;REVB=0.0517113;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003959;OID=.;OPOS=102979486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:40:36:0:0:40:36:0:0 chrX 103046526 . TG T 396.05 PASS AF=1;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398453;FXX=0.0277701;HRUN=5;LEN=1;MLLD=19.5286;QD=45.2632;RBI=0.0694733;REFB=0;REVB=0.0569112;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000860402;OID=.;OPOS=103046527;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:34:36:35:35:0:15:20:0:0:7:0:15:19:0:0 chrX 105153001 . A G 675.07 PASS AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0580505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.6928;QD=60.0062;RBI=0.0597402;REFB=-0.0169035;REVB=0.014108;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00109944;OID=.;OPOS=105153001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:25:19:0:0:25:19:0:1 chrX 106200202 . G A 1980.32 PASS AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00621219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2292;QD=61.8849;RBI=0.00621792;REFB=0;REVB=0.000267096;RO=0;SAF=55;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86064e-05;OID=.;OPOS=106200202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:72:55:0:0:72:56:0:0 chrX 107418906 . A G 1212.3 PASS AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540407;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.675;QD=61.3824;RBI=0.00702368;REFB=0;REVB=0.00448645;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85103e-05;OID=.;OPOS=107418906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:40:39:0:0:40:39:0:0 chrX 107422624 . CAG CGA 38.65 PASS AF=0.285714;AO=3;DP=22;FAO=4;FDP=14;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=5;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0.29985;HRUN=1;LEN=2;MLLD=46.0638;QD=11.0422;RBI=0.0506993;REFB=-0.0449681;REVB=-0.0506993;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590815;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.207205;OID=.;OPOS=107422625;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=CGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.285714:3:22:4:14:5:0:4:0:5:28:7:0:3:1:6 chrX 107422627 . GA AG 88.48 PASS AF=0.588235;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.149925;HRUN=2;LEN=2;MLLD=81.3796;QD=20.8177;RBI=0.035732;REFB=-0.0735141;REVB=0.035732;RO=7;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0868443;OID=.;OPOS=107422627;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:19:17:7:7:10:10:0.588235:10:0:0:7:10:0:0:7 chrX 107433688 . A G 2553.2 PASS AF=1;AO=166;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.134;QD=61.1544;RBI=0.0478065;REFB=-0.0819708;REVB=0.00448062;RO=1;SAF=74;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638765;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232662;OID=.;OPOS=107433688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:167:167:1:0:166:167:1:92:74:1:0:92:75:0:0 chrX 107437848 . G C 724.13 PASS AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.028237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.278;QD=54.6514;RBI=0.0369471;REFB=-0.0566039;REVB=0.0238277;RO=1;SAF=30;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00081673;OID=.;OPOS=107437848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:22:30:1:0:22:30:1:0 chrX 107462974 . TA T 30.2 PASS AF=0.533333;AO=7;DP=16;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.126326;FXX=0.062461;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.79669;QD=8.05416;RBI=0.166222;REFB=-0.147022;REVB=0.108035;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329175;STB=0.705493;STBP=0.182;TYPE=del;VARB=0.187326;OID=.;OPOS=107462975;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.533333:7:16:8:15:7:3:5:0:7:20:6:2:5:0:6 chrX 108297375 . T C 4718.41 PASS AF=1;AO=305;DP=310;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=226;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102247;FXX=0.0160767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.431;QD=61.6786;RBI=0.0283284;REFB=-0.0414969;REVB=-0.0264188;RO=4;SAF=80;SAR=225;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154305;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.77018e-05;OID=.;OPOS=108297375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:310:306:4:0:305:306:1:225:80:3:1:226:80:0:0 chrX 108297445 . A G 6892.93 PASS AF=0.988764;AO=435;DP=442;FAO=440;FDP=445;FR=.;FRO=5;FSAF=149;FSAR=291;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00132435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=362.094;QD=61.9589;RBI=0.00349692;REFB=-0.0179158;REVB=-0.00323644;RO=6;SAF=146;SAR=289;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00960354;STB=0.503271;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.000142776;OID=.;OPOS=108297445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:442:445:6:5:435:440:0.988764:289:146:4:2:291:149:3:2 chrX 108297500 . G C 5235.86 PASS AF=0.982405;AO=334;DP=341;FAO=335;FDP=341;FR=.;FRO=6;FSAF=119;FSAR=216;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0259221;FXX=0.00292389;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.838;QD=61.4177;RBI=0.0288009;REFB=-0.0365812;REVB=0.0125514;RO=6;SAF=119;SAR=215;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113455;STB=0.50596;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.000230243;OID=.;OPOS=108297500;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:341:341:6:6:334:335:0.982405:215:119:4:2:216:119:4:2 chrX 108297573 . A G 898.79 PASS AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0711;QD=57.9866;RBI=0.0533413;REFB=0;REVB=-0.0489471;RO=0;SAF=13;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236156;OID=.;OPOS=108297573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:48:13:0:0:49:13:0:0 chrX 108297602 . T C 873.35 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.231;QD=57.2691;RBI=0.0144447;REFB=0;REVB=0.0119414;RO=0;SAF=11;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385752;OID=.;OPOS=108297602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:61:0:0:57:61:1:46:11:0:0:49:12:0:0 chrX 108297641 . G A 905.89 PASS AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0594571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0466;QD=56.6181;RBI=0.0608237;REFB=-0.063424;REVB=0.0128211;RO=1;SAF=12;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00917148;STB=0.504853;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000587055;OID=.;OPOS=108297641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:51:12:0:1:51:12:0:1 chrX 108297675 . G GC 435.45 PASS AF=1;AO=45;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.28974;FXX=0.0151492;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.53479;QD=26.7969;RBI=0.297144;REFB=-0.000884626;REVB=0.0659194;RO=14;SAF=3;SAR=42;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475798;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0103084;OID=.;OPOS=108297676;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:45:66:65:65:0:13:52:0:0:8:14:3:42:8:6 chrX 108297699 . T C 491.56 PASS AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.288;QD=57.8308;RBI=0.0196058;REFB=0;REVB=0.0147947;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102949;OID=.;OPOS=108297699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:25:8:0:0:26:8:0:0 chrX 108297702 . A G 344.67 PASS AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366748;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.855;QD=55.1467;RBI=0.0391646;REFB=0;REVB=0.0137413;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120475;OID=.;OPOS=108297702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0 chrX 108297713 . T C 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.176;QD=37.4885;RBI=0.0194836;REFB=0;REVB=-0.00790854;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83547e-05;OID=.;OPOS=108297713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0 chrX 108297794 . T C 62.43 PASS AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.539;QD=35.6766;RBI=0.124099;REFB=0;REVB=0.114669;RO=0;SAF=5;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130019;OID=.;OPOS=108297794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:0:5:0:0:2:5:0:0 chrX 108297832 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.451;QD=33.4285;RBI=0.0662925;REFB=0;REVB=-0.0071591;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00373411;OID=.;OPOS=108297832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0 chrX 108708516 . C T 1305.79 PASS AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127108;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.915;QD=62.1802;RBI=0.0335275;REFB=0;REVB=-0.0310246;RO=0;SAF=41;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09377e-05;OID=.;OPOS=108708516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:43:41:0:0:43:41:0:0 chrX 108787014 . T C 3292.85 PASS AF=0.948718;AO=217;DP=235;FAO=222;FDP=234;FR=.;FRO=12;FSAF=104;FSAR=118;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00398615;FXX=0.0126577;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.084;QD=56.288;RBI=0.0232172;REFB=-0.168168;REVB=0.0228725;RO=10;SAF=104;SAR=113;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665604;STB=0.502668;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.000214023;OID=.;OPOS=108787014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:235:234:10:12:217:222:0.948718:113:104:4:6:118:104:5:7 chrX 114267002 . G A 1283.92 PASS AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0022531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.061;QD=61.8757;RBI=0.0155591;REFB=0;REVB=0.0153951;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5454e-05;OID=.;OPOS=114267002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:41:41:0:0:41:42:0:0 chrX 114425196 . G A 69.64 PASS AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.727;QD=16.3858;RBI=0.0628058;REFB=-0.00342891;REVB=0.0421071;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243059;STB=0.640727;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00940099;OID=.;OPOS=114425196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:6:2:5:4:6:2 chrX 114425400 . G A 186.92 PASS AF=1;AO=14;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.247785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8264;QD=46.729;RBI=0.257909;REFB=0;REVB=0.0715512;RO=2;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129287;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00766536;OID=.;OPOS=114425400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:2:0:14:16:1:8:6:2:0:8:8:0:0 chrX 114426171 . C T 57.07 PASS AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.098529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8008;QD=28.5374;RBI=0.101436;REFB=-0.108051;REVB=0.0241085;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124421;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0386246;OID=.;OPOS=114426171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:0:1:3:4:0:1 chrX 114426917 . C T 380.55 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489452;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.492;QD=56.3776;RBI=0.0579725;REFB=0;REVB=0.0310674;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523519;OID=.;OPOS=114426917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0 chrX 114845260 . ATTTTA ATTTA,ATTTAT 85.79 PASS AF=0.619048,0;AO=10,2;DP=21;FAO=13,0;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=8,0;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.133557,-0.154788;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=13.2424,103.055;QD=16.3409;RBI=0.134197,0.15797;REFB=-0.13908,-0.0176484;REVB=-0.0130931,-0.0315481;RO=8;SAF=6,2;SAR=4,0;SRF=0;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.442187,0.812466;STB=0.721916,0.5;STBP=0.024,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.129521,0;OID=.,.;OPOS=114845261,114845264;OREF=T,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=ATTTA,ATTTAT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.619048,0:10,2:21:13,0:21:8:8,0:5,0:0:8:30:8:6,2:4,0:0:8 chrX 115304830 . A G 708.51 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.608;QD=62.9784;RBI=0.0219927;REFB=0;REVB=0.00770128;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96697e-05;OID=.;OPOS=115304830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0 chrX 115305126 . A C 435.82 PASS AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0591186;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=183.708;QD=54.4775;RBI=0.0591246;REFB=-0.100679;REVB=0.000838578;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282674;STB=0.515142;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000341447;OID=.;OPOS=115305126;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:16:15:0:1:16:15:0:1 chrX 117521338 . G A 708.55 PASS AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8578;QD=62.9824;RBI=0.0158837;REFB=0;REVB=-0.00934514;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208382;OID=.;OPOS=117521338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0 chrX 117528056 . G A 740.41 PASS AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.036;QD=56.9545;RBI=0.0491308;REFB=0;REVB=0.0421374;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405905;OID=.;OPOS=117528056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0 chrX 117528142 . C T 817.74 PASS AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000250274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=314.09;QD=57.3853;RBI=0.0174964;REFB=0;REVB=0.0174946;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.68597e-05;OID=.;OPOS=117528142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0 chrX 117566782 . C T 727.8 PASS AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.529;QD=63.2868;RBI=0.0154863;REFB=0;REVB=-0.0106517;RO=0;SAF=34;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13059e-05;OID=.;OPOS=117566782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:12:34:0:0:12:34:0:0 chrX 117904229 . T C 272.51 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0477367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6036;QD=51.9063;RBI=0.0553003;REFB=0;REVB=-0.0279164;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00148926;OID=.;OPOS=117904229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chrX 117904433 . T C 411.12 PASS AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.847;QD=56.706;RBI=0.0503732;REFB=0;REVB=-0.0430583;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.99636e-05;OID=.;OPOS=117904433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0 chrX 117925898 . A G 323.47 PASS AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00544774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.288;QD=53.9112;RBI=0.0246359;REFB=0;REVB=0.024026;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.51533e-05;OID=.;OPOS=117925898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0 chrX 117938928 . G A 1572.73 PASS AF=1;AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227661;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.28;QD=63.5448;RBI=0.0233091;REFB=0;REVB=-0.00500177;RO=0;SAF=30;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000688079;OID=.;OPOS=117938928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:97:99:0:0:97:99:1:67:30:0:0:67:32:0:0 chrX 118108785 . T C 930.76 PASS AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.249;QD=58.1728;RBI=0.0215478;REFB=0;REVB=0.0190795;RO=0;SAF=43;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413453;OID=.;OPOS=118108785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:20:43:0:0:20:44:0:0 chrX 118146810 . C T 1161.57 PASS AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.699;QD=60.3414;RBI=0.0384075;REFB=0;REVB=0.0274359;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00527e-05;OID=.;OPOS=118146810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:39:37:0:0:39:38:0:0 chrX 118219347 . T C 802.04 PASS AF=1;AO=51;DP=52;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00215303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.297;QD=57.2884;RBI=0.0574373;REFB=0;REVB=0.0573969;RO=0;SAF=41;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27466e-05;OID=.;OPOS=118219347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:56:0:0:51:56:1:10:41:0:0:15:41:0:0 chrX 118220720 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5567;QD=58.5874;RBI=0.0718314;REFB=0;REVB=0.0598713;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142106;OID=.;OPOS=118220720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0 chrX 118222360 . T A 585.99 PASS AF=0.975;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00467152;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8678;QD=58.5994;RBI=0.033063;REFB=-0.0476003;REVB=0.0327314;RO=1;SAF=17;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267753;STB=0.514278;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0137244;OID=.;OPOS=118222360;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:40:1:1:39:39:0.975:22:17:1:0:22:17:1:0 chrX 118281538 . C A 465.13 PASS AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00854545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0416;QD=58.1411;RBI=0.0577537;REFB=0;REVB=0.057118;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103562;OID=.;OPOS=118281538;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0 chrX 118603668 . A G 37.67 PASS AF=0.25;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0564001;FXX=0.0768935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6159;QD=6.27834;RBI=0.058145;REFB=-0.00665349;REVB=-0.0141376;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581081;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103259;OID=.;OPOS=118603668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:26:24:20:18:6:6:0.25:3:3:9:11:3:3:9:9 chrX 118603706 . A AG 33.48 PASS AF=0.258065;AO=9;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0351626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.8882;QD=4.31942;RBI=0.194414;REFB=-0.0306055;REVB=-0.191208;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244319;STB=0.60948;STBP=0.526;TYPE=ins;VARB=0.0600547;OID=.;OPOS=118603707;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.258065:9:31:8:31:23:3:5:12:11:33:22:3:6:12:10 chrX 118603713 . T C 62.38 PASS AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00443385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6907;QD=7.79799;RBI=0.00798959;REFB=-0.0110218;REVB=0.0066464;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22078;STB=0.637985;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0294587;OID=.;OPOS=118603713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:6:3:12:11:6:3:12:11 chrX 118603729 . G A 61.81 PASS AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0429674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.393;QD=7.2714;RBI=0.0437931;REFB=-0.0068924;REVB=0.00846397;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264784;STB=0.666296;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0181133;OID=.;OPOS=118603729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:6:3:14:11:6:3:14:11 chrX 118603742 . A C 81.96 PASS AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0117314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.984;QD=8.62782;RBI=0.0133369;REFB=0.00115585;REVB=-0.00634401;RO=27;SAF=3;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333768;STB=0.7055;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00914437;OID=.;OPOS=118603742;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:8:3:15:12:8:3:15:12 chrX 118603747 . A T 76.66 PASS AF=0.261905;AO=8;DP=39;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0512561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.625;QD=7.30113;RBI=0.0529331;REFB=-0.00569922;REVB=0.0132185;RO=31;SAF=0;SAR=8;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.743528;STB=0.72686;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0197203;OID=.;OPOS=118603747;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:39:42:31:31:8:11:0.261905:8:0:18:13:8:3:18:13 chrX 118603773 . T C 71.42 PASS AF=0.25;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0275438;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.58;QD=7.14188;RBI=0.0283658;REFB=-0.0113118;REVB=-0.0067792;RO=29;SAF=3;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336122;STB=0.6996;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0501346;OID=.;OPOS=118603773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:41:40:29:30:10:10:0.25:7:3:17:12:7:3:17:13 chrX 118603818 . T G 50.96 PASS AF=0.190476;AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0182375;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.306;QD=4.85286;RBI=0.0294167;REFB=5.5933e-05;REVB=-0.023081;RO=35;SAF=2;SAR=6;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329205;STB=0.731116;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.000239153;OID=.;OPOS=118603818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:43:42:35:34:8:8:0.190476:6:2:18:17:6:2:18:16 chrX 118699320 . A G 1434.44 PASS AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000373561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.079;QD=63.0524;RBI=0.00916523;REFB=0;REVB=0.00915762;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61182e-05;OID=.;OPOS=118699320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:54:37:0:0:54:37:0:0 chrX 118829467 . G T 2665.38 PASS AF=0.988571;AO=173;DP=176;FAO=173;FDP=175;FR=.;FRO=2;FSAF=102;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0244529;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.647;QD=60.9231;RBI=0.0259312;REFB=-0.0973714;REVB=0.0086301;RO=2;SAF=102;SAR=71;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00924105;STB=0.504854;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000658178;OID=.;OPOS=118829467;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:176:175:2:2:173:173:0.988571:71:102:2:0:71:102:2:0 chrX 118893390 . A G 520.02 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1294;QD=59.431;RBI=0.0373923;REFB=0;REVB=-0.031869;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000159413;OID=.;OPOS=118893390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:28:7:0:0:28:7:0:0 chrX 119005705 . C G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.103;QD=53.2772;RBI=0.0334244;REFB=0;REVB=0.0075708;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162679;OID=.;OPOS=119005705;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0 chrX 119065893 . G A 239.46 PASS AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.361;QD=50.4133;RBI=0.0280802;REFB=0;REVB=0.0256461;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138357;OID=.;OPOS=119065893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0 chrX 119387833 . C CTGA 265.81 PASS AF=0.846154;AO=22;DP=32;FAO=22;FDP=26;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00714838;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=3;MLLD=287.248;QD=40.8937;RBI=0.0412794;REFB=0.0131652;REVB=0.0406558;RO=9;SAF=9;SAR=13;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136763;STB=0.590826;STBP=0.049;TYPE=ins;VARB=-0.0010656;OID=.;OPOS=119387834;OREF=-;OALT=TGA;OMAPALT=CTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.846154:22:32:22:26:4:9:13:4:0:20:9:9:13:6:3 chrX 119389966 . C T 271.43 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.795;QD=51.7013;RBI=0.0415597;REFB=0;REVB=0.0205748;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118442;OID=.;OPOS=119389966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0 chrX 119390465 . A G 373.56 PASS AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266039;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.933;QD=55.343;RBI=0.0268834;REFB=0;REVB=-0.00386641;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000892212;OID=.;OPOS=119390465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:14:13:0:0 chrX 119391880 . G A 207.13 PASS AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.666;QD=48.7371;RBI=0.036556;REFB=0;REVB=0.0242429;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000528194;OID=.;OPOS=119391880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0 chrX 119590533 . T A 3957.4 PASS AF=1;AO=246;DP=247;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203529;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9169;QD=63.829;RBI=0.07162;REFB=-0.077523;REVB=0.0686672;RO=0;SAF=141;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351794;OID=.;OPOS=119590533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:247:248:0:0:246:248:1:105:141:0:0:107:141:0:0 chrX 120008978 . CT C,CC 292.68 PASS AF=0.0434783,0.956522;AO=4,18;DP=23;FAO=1,22;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=1,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594019,0.0576079;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=178.306,199.862;QD=50.9012;RBI=0.0859936,0.102844;REFB=0,0;REVB=0.0621797,0.0851947;RO=0;SAF=2,12;SAR=2,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0339422,0.000374422;OID=.,.;OPOS=120008979,120008979;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.0434783,0.956522:4,18:23:1,22:23:0:0,14:1,8:0:0:3:0:2,12:2,6:0:0 chrX 122318386 . A AG 2374.61 PASS AF=1;AO=146;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234399;FXX=0.00671096;HRUN=0;LEN=1;MLLD=294.999;QD=64.1786;RBI=0.0238516;REFB=0;REVB=-0.00441266;RO=1;SAF=87;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799228;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.61351e-06;OID=.;OPOS=122318387;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:146:149:148:148:0:89:59:0:0:13:1:87:59:0:1 chrX 122336600 . T TG 806.02 PASS AF=1;AO=74;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0997733;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4338;QD=39.8037;RBI=0.101412;REFB=0;REVB=-0.0181569;RO=6;SAF=32;SAR=42;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143146;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000820041;OID=.;OPOS=122336601;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:74:83:81:81:0:35:46:0:0:16:6:32:42:2:4 chrX 123041043 . A G 255.92 PASS AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.761;QD=51.1835;RBI=0.0315081;REFB=0;REVB=0.02397;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236752;OID=.;OPOS=123041043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0 chrX 123042424 . G A 1624.42 PASS AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.494;QD=60.1635;RBI=0.0134032;REFB=0;REVB=0.00629374;RO=0;SAF=69;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89526e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07369e-05;OID=.;OPOS=123042424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:39:69:0:0:39:69:0:0 chrX 123042707 . T C 2491.41 PASS AF=0.987952;AO=162;DP=164;FAO=164;FDP=166;FR=.;FRO=2;FSAF=87;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0354916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.29;QD=60.034;RBI=0.0364117;REFB=0.00734825;REVB=0.00813351;RO=1;SAF=85;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613977;STB=0.500369;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=1.06055e-05;OID=.;OPOS=123042707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:164:166:1:2:162:164:0.987952:77:85:0:1:77:87:1:1 chrX 123043324 . TGTATA T,TGTCTA 1112.07 PASS AF=0.763158,0.236842;AO=58,18;DP=77;FAO=58,18;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=23,17;FSAR=35,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212651,0.0683661;FXX=0.0129853;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=243.889,34.8086;QD=58.5302;RBI=0.0415177,0.068595;REFB=0,0;REVB=0.0356583,-0.00560001;RO=0;SAF=23,17;SAR=35,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0060982,0.0298253;OID=.,.;OPOS=123043325,123043327;OREF=GTATA,A;OALT=-,C;OMAPALT=T,TGTCTA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.763158,0.236842:58,18:77:58,18:76:0:23,17:35,1:0:0:99:0:23,17:35,1:0:0 chrX 123514006 . G A 1361.94 PASS AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724498;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.487;QD=62.6181;RBI=0.00960774;REFB=0;REVB=-0.00631022;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.68156e-07;OID=.;OPOS=123514006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:38:49:0:0:38:49:0:0 chrX 123526031 . T C 785.82 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.196;QD=64.1486;RBI=0.00513146;REFB=0;REVB=-0.0017941;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43038e-05;OID=.;OPOS=123526031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0 chrX 123540315 . G T 742.48 PASS AF=0.979592;AO=46;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000949435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6166;QD=60.6105;RBI=0.0599663;REFB=0.164973;REVB=0.0599588;RO=1;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268486;STB=0.51428;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00377287;OID=.;OPOS=123540315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:49:49:1:1:46:48:0.979592:17:29:0:1:17:31:0:1 chrX 125954900 . C T 1075.54 PASS AF=1;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00531094;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.885;QD=59.752;RBI=0.0102714;REFB=0;REVB=-0.0087918;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95255e-05;OID=.;OPOS=125954900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:72:0:0:71:72:1:32:39:0:0:33:39:0:0 chrX 125955199 . T C 575.8 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.92;QD=60.6102;RBI=0.0189286;REFB=0;REVB=0.0161747;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21588e-05;OID=.;OPOS=125955199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:22:15:0:0:23:15:0:0 chrX 128780176 . A AAGC,AGC 161.15 PASS AF=0.933333,0;AO=9,2;DP=20;FAO=14,0;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6,0;FSAR=8,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0936441,0.0700638;FXX=0.117578;HRUN=2,1;LEN=3,2;MLLD=219.762,200.376;QD=42.9725;RBI=0.134775,0.115546;REFB=-0.0591666,-0.0818028;REVB=0.0969285,0.0918803;RO=7;SAF=6,0;SAR=3,2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.186168,-0.577625;STB=0.538406,0.5;STBP=0.298,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00385908,0;OID=.,.;OPOS=128780177,128780177;OREF=-,-;OALT=AGC,GC;OMAPALT=AAGC,AGC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.933333,0:9,2:20:14,0:15:1:6,0:8,0:1:0:6:7:6,0:3,2:3:4 chrX 128781864 . C A 549.11 PASS AF=0.973684;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0111912;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1535;QD=57.8009;RBI=0.0210187;REFB=0.0574302;REVB=0.0177917;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283678;STB=0.515143;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00174671;OID=.;OPOS=128781864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:39:38:1:1:37:37:0.973684:21:16:1:0:21:16:1:0 chrX 128878004 . A G 1252.12 PASS AF=1;AO=76;DP=78;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332817;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.244;QD=61.8331;RBI=0.0350018;REFB=0;REVB=-0.0108376;RO=0;SAF=54;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77513e-05;OID=.;OPOS=128878004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:78:81:0:0:76:81:1:22:54:0:0:24:57:0:0 chrX 128880614 . T C 1344.34 PASS AF=0.988636;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0211086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.394;QD=61.1064;RBI=0.0215087;REFB=-0.0127943;REVB=0.00412924;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=2.05482e-05;OID=.;OPOS=128880614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:88:0:1:86:87:0.988636:50:36:0:0:50:37:1:0 chrX 129147079 . T C 446.92 PASS AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00786414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.636;QD=57.6668;RBI=0.0657891;REFB=0;REVB=0.0653174;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511;OID=.;OPOS=129147079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0 chrX 130408745 . G A 1284.89 PASS AF=0.935484;AO=87;DP=93;FAO=87;FDP=93;FR=.;FRO=6;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0594518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6183;QD=55.2642;RBI=0.0596388;REFB=-0.0480469;REVB=-0.00471806;RO=6;SAF=41;SAR=46;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238763;STB=0.512627;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0195851;OID=.;OPOS=130408745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:93:93:6:6:87:87:0.935484:46:41:4:2:46:41:4:2 chrX 130415818 . T C 747.06 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.9072;QD=63.5798;RBI=0.029055;REFB=0;REVB=0.0279192;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142392;OID=.;OPOS=130415818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:15:32:0:0:15:32:0:0 chrX 130416958 . C T 1387.93 PASS AF=0.943396;AO=97;DP=104;FAO=100;FDP=106;FR=.;FRO=6;FSAF=72;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0735255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0056;QD=52.3747;RBI=0.0749601;REFB=0.0307411;REVB=0.0145951;RO=7;SAF=69;SAR=28;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0846577;STB=0.548377;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000583771;OID=.;OPOS=130416958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:104:106:7:6:97:100:0.943396:28:69:1:6:28:72:0:6 chrX 130420006 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.403;QD=57.7123;RBI=0.0278685;REFB=0;REVB=0.0179099;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.44335e-05;OID=.;OPOS=130420006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0 chrX 130420415 . T C 802.91 PASS AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0583521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3965;QD=55.3731;RBI=0.074713;REFB=-0.0151585;REVB=0.046659;RO=1;SAF=28;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165422;STB=0.508472;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000213117;OID=.;OPOS=130420415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:28:28:1:0:28:29:1:0 chrX 130678467 . A G 1587.58 PASS AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.844;QD=64.1445;RBI=0.0466181;REFB=0;REVB=0.0208045;RO=0;SAF=38;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5137e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08819e-05;OID=.;OPOS=130678467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:61:38:0:0:61:38:0:0 chrX 130678844 . A C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.137229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.689;QD=47.8222;RBI=0.137246;REFB=0;REVB=-0.00216275;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000800989;OID=.;OPOS=130678844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:14:2:0:0:14:2:0:0 chrX 132437337 . G A 937.61 PASS AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.048;QD=58.6006;RBI=0.0187113;REFB=0;REVB=-0.00525891;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86924e-05;OID=.;OPOS=132437337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0 chrX 132438872 . C A 575.79 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4905;QD=60.6094;RBI=0.0490044;REFB=0;REVB=0.0115985;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000963008;OID=.;OPOS=132438872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0 chrX 133379551 . C T 880.6 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.711;QD=57.7442;RBI=0.00502721;REFB=0;REVB=-0.000542876;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17834e-06;OID=.;OPOS=133379551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:27:32:0:0:27:34:0:0 chrX 134125475 . C G 957.85 PASS AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318489;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.692;QD=58.9445;RBI=0.0404568;REFB=0;REVB=0.024948;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276431;OID=.;OPOS=134125475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0 chrX 134155904 . G T 375.68 PASS AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.521;QD=55.656;RBI=0.0501741;REFB=0;REVB=-0.0174703;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026015;OID=.;OPOS=134155904;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0 chrX 134156121 . G C 190.57 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8443;QD=47.6435;RBI=0.126813;REFB=0;REVB=-0.0355656;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00348213;OID=.;OPOS=134156121;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:6:9:0:0:6:10:0:0 chrX 134185997 . T A 1556.34 PASS AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00187381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.358;QD=58.7299;RBI=0.0298171;REFB=0.00982252;REVB=0.0297582;RO=0;SAF=61;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=2.1769e-05;OID=.;OPOS=134185997;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:106:106:0:1:105:105:0.990566:44:61:0:0:44:61:1:0 chrX 134807790 . A G 115.99 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.548;QD=42.1792;RBI=0.107777;REFB=0;REVB=0.0816477;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00842818;OID=.;OPOS=134807790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0 chrX 134807815 . C A 115.86 PASS AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.697;QD=42.1301;RBI=0.0367857;REFB=0;REVB=0.0332824;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173074;OID=.;OPOS=134807815;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:3:7:0:0:3:8:0:0 chrX 134948034 . A G,T 323.27 PASS AF=0.884615,0.0769231;AO=23,2;DP=26;FAO=23,2;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13,2;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147577,0.00616867;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.2143,55.1359;QD=49.7338;RBI=0.0416123,0.0545991;REFB=-0.120817,-0.166705;REVB=-0.0389075,-0.0542496;RO=1;SAF=13,2;SAR=10,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0440445,0.697199;STB=0.523789,0.993266;STBP=0.298,0.227;TYPE=snp,snp;VARB=0.003742,0.0719164;OID=.,.;OPOS=134948034,134948034;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:26:26:1:1:23,2:23,2:0.884615,0.0769231:10,0:13,2:0:1:10,0:13,2:0:1 chrX 135307049 . G A 242.17 PASS AF=0.952381;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.106909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1887;QD=46.1273;RBI=0.108754;REFB=-0.036596;REVB=-0.0199467;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.521717;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0290867;OID=.;OPOS=135307049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:0:1:19:20:0.952381:10:9:0:0:11:9:0:1 chrX 135310785 . T C 1713.81 PASS AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0411228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.561;QD=59.6108;RBI=0.0493626;REFB=-0.129693;REVB=0.0273053;RO=0;SAF=63;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26593e-08;STB=0.504853;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000189493;OID=.;OPOS=135310785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:115:115:0:1:114:114:0.991304:51:63:0:0:51:63:0:1 chrX 135313034 . T G 747.1 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687694;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.64;QD=63.5826;RBI=0.0077492;REFB=0;REVB=0.0035718;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.76906e-06;OID=.;OPOS=135313034;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0 chrX 135474420 . C A 1098.72 PASS AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.614;QD=60.2039;RBI=0.0104508;REFB=0;REVB=0.00645186;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.32161e-05;OID=.;OPOS=135474420;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:39:33:0:0:40:33:0:0 chrX 135474444 . AGAT A 1130.21 PASS AF=0.986842;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107801;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=3;MLLD=266.632;QD=59.4847;RBI=0.0189655;REFB=-0.014148;REVB=0.0156038;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.522;TYPE=del;VARB=0.000258455;OID=.;OPOS=135474445;OREF=GAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:0.986842:75:79:75:76:1:34:41:0:1:3:0:34:41:0:0 chrX 135480126 . T C 591.77 PASS AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0160697;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.5938;QD=56.3594;RBI=0.0351394;REFB=-0.00265673;REVB=-0.0312496;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.504948;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.000810022;OID=.;OPOS=135480126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:41:42:0:2:39:40:0.952381:23:16:0:0:24:16:1:1 chrX 135496398 . G A 1116.94 PASS AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.268;QD=60.3754;RBI=0.0317436;REFB=0;REVB=-0.0232977;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106229;OID=.;OPOS=135496398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:31:43:0:0:31:43:0:0 chrX 135956342 . C G 127.73 PASS AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0238828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.083;QD=11.8818;RBI=0.0240578;REFB=-0.0137928;REVB=0.00289638;RO=28;SAF=8;SAR=7;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759084;STB=0.544832;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0247911;OID=.;OPOS=135956342;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:7:8:13:15:7:8:13:15 chrX 135956370 . G A 127.2 PASS AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0250415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5618;QD=11.5636;RBI=0.0535434;REFB=-0.00277284;REVB=0.0473268;RO=29;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561997;STB=0.533289;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00589785;OID=.;OPOS=135956370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:7:8:14:15:7:8:14:15 chrX 135956391 . A G 115.18 PASS AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00311094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.149;QD=10.7148;RBI=0.00332503;REFB=-0.010558;REVB=0.00117382;RO=29;SAF=9;SAR=5;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183728;STB=0.61001;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0221001;OID=.;OPOS=135956391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:5:9:14:15:5:9:14:15 chrX 135956408 . A G 103.51 PASS AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00105752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.306;QD=9.85817;RBI=0.0176312;REFB=-0.00542478;REVB=-0.0175995;RO=28;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337048;STB=0.692012;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00768993;OID=.;OPOS=135956408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:42:28:29:13:13:0.309524:4:9:11:17:4:9:12:17 chrX 135956462 . G C 151.54 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0167968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.559;QD=12.8974;RBI=0.0279859;REFB=0.00254358;REVB=-0.0223848;RO=30;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303744;STB=0.678448;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00158567;OID=.;OPOS=135956462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:5:12:13:17:5:12:13:17 chrX 135956467 . C T 151.54 PASS AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00649555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.669;QD=12.8973;RBI=0.00684375;REFB=0.00237376;REVB=0.00215515;RO=30;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303744;STB=0.678448;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00194449;OID=.;OPOS=135956467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:5:12:13:17:5:12:13:17 chrX 135956506 . C G 117.75 PASS AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00328779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.516;QD=12.3948;RBI=0.00633986;REFB=-0.00778339;REVB=-0.00542073;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285454;STB=0.669041;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00793231;OID=.;OPOS=135956506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:4:10:11:13:4:10:11:13 chrX 136112707 . A G 161.24 PASS AF=1;AO=9;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.523;QD=46.0683;RBI=0.149837;REFB=0;REVB=0.147516;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129612;OID=.;OPOS=136112707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:14:14:0:0:9:14:1:0:9:0:0:5:9:0:0 chrX 138067202 . A G 1387.44 PASS AF=0.978261;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0287719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4647;QD=60.3234;RBI=0.0293834;REFB=-0.0347739;REVB=0.00596363;RO=1;SAF=48;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111514;STB=0.511625;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00378772;OID=.;OPOS=138067202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:92:92:1:2:90:90:0.978261:42:48:0:1:42:48:0:2 chrX 138774209 . C T 2822.67 PASS AF=1;AO=178;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00765071;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.137;QD=62.7259;RBI=0.0190471;REFB=0;REVB=0.017443;RO=0;SAF=92;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55663e-05;OID=.;OPOS=138774209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:180:180:0:0:178:180:1:86:92:0:0:86:94:0:0 chrX 138811003 . G A 716.36 PASS AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0144562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7156;QD=51.1682;RBI=0.0305655;REFB=0.0981976;REVB=0.0269308;RO=2;SAF=28;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324675;STB=0.525414;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0046882;OID=.;OPOS=138811003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:56:56:2:3:53:53:0.946429:25:28:2:0:25:28:3:0 chrX 138897130 . A C 1368.06 PASS AF=1;AO=71;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0981299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7146;QD=62.8993;RBI=0.0983136;REFB=0;REVB=0.00600683;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346965;OID=.;OPOS=138897130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:87:87:0:0:71:87:1:38:33:0:0:39:48:0:0 chrX 139099828 . T A 914.32 PASS AF=0.841463;AO=68;DP=81;FAO=69;FDP=82;FR=.;FRO=13;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0168903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2463;QD=44.6011;RBI=0.0190447;REFB=-0.0049029;REVB=-0.00879871;RO=13;SAF=27;SAR=41;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201797;STB=0.511625;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0070612;OID=.;OPOS=139099828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:81:82:13:13:68:69:0.841463:41:27:6:7:42:27:6:7 chrX 139858438 . TCGG T 741.74 PASS AF=1;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126202;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=3;MLLD=306.559;QD=57.0567;RBI=0.0269726;REFB=0;REVB=0.023838;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.54739e-05;OID=.;OPOS=139858439;OREF=CGG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:51:53:52:52:0:31:21:0:0:4:0:30:21:0:0 chrX 140008385 . G T 2758.11 PASS AF=0.988889;AO=176;DP=178;FAO=178;FDP=180;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0552098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.398;QD=61.2912;RBI=0.059588;REFB=-0.0233871;REVB=-0.022419;RO=1;SAF=85;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520252;STB=0.505319;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.000448619;OID=.;OPOS=140008385;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:178:180:1:2:176:178:0.988889:91:85:0:1:93:85:0:2 chrX 140270418 . T C 379.55 PASS AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159077;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.34;QD=56.2296;RBI=0.053162;REFB=0;REVB=0.0507261;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229484;OID=.;OPOS=140270418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0 chrX 140714231 . A G 635.89 PASS AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000113326;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.592;QD=62.0381;RBI=0.00703758;REFB=0;REVB=0.00703666;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20867e-05;OID=.;OPOS=140714231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0 chrX 140714251 . A G 520.05 PASS AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1338;QD=59.4346;RBI=0.0203518;REFB=0;REVB=-0.00264426;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196337;OID=.;OPOS=140714251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0 chrX 140785696 . T C 204.18 PASS AF=0.333333;AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=-0.00565208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.787;QD=10.4707;RBI=0.0188233;REFB=-0.0125321;REVB=0.0179547;RO=52;SAF=16;SAR=10;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711875;STB=0.54137;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0201291;OID=.;OPOS=140785696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:52:52:26:26:0.333333:10:16:35:17:10:16:35:17 chrX 140785739 . A C 256.95 PASS AF=0.3125;AO=34;DP=112;FAO=35;FDP=112;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=0.00429769;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.051;QD=9.17664;RBI=0.00958628;REFB=-0.00324537;REVB=0.00856893;RO=76;SAF=19;SAR=15;SRF=49;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104724;STB=0.574659;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00664303;OID=.;OPOS=140785739;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:76:77:34:35:0.3125:15:19:49:27:16:19:50:27 chrX 140785741 . A C 303.39 PASS AF=0.336207;AO=39;DP=116;FAO=39;FDP=116;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=0.00330232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.178;QD=10.4617;RBI=0.0487176;REFB=0.00102469;REVB=-0.0486056;RO=77;SAF=22;SAR=17;SRF=50;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101408;STB=0.558365;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=-0.00204498;OID=.;OPOS=140785741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:77:77:39:39:0.336207:17:22:50:27:17:22:50:27 chrX 140967165 . T C 1662.33 PASS AF=0.982456;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0359905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.66;QD=58.3274;RBI=0.0589692;REFB=-0.00237293;REVB=-0.0467124;RO=1;SAF=34;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00604894;STB=0.504061;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.000242744;OID=.;OPOS=140967165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:113:114:1:2:112:112:0.982456:78:34:0:1:78:34:1:1 chrX 140967195 . T A 1029.92 PASS AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0665486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.137;QD=58.0236;RBI=0.0665629;REFB=0.0522539;REVB=-0.00138193;RO=1;SAF=19;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0091821;STB=0.504853;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00160452;OID=.;OPOS=140967195;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:51:19:0:1:51:19:0:1 chrX 140968628 . G T 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.409;QD=60.61;RBI=0.029532;REFB=0;REVB=0.00226562;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010988;OID=.;OPOS=140968628;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0 chrX 140968664 . C T 575.8 PASS AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.113;QD=60.6102;RBI=0.0753743;REFB=0;REVB=0.00772447;RO=0;SAF=7;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522141;OID=.;OPOS=140968664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:31:7:0:0:31:7:0:0 chrX 140983064 . G A 2345.91 PASS AF=0.987342;AO=155;DP=159;FAO=156;FDP=158;FR=.;FRO=2;FSAF=96;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0658028;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6753;QD=59.3902;RBI=0.0766222;REFB=-0.155842;REVB=0.0392549;RO=2;SAF=95;SAR=60;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00990942;STB=0.505154;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00204467;OID=.;OPOS=140983064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:159:158:2:2:155:156:0.987342:60:95:2:0:60:96:2:0 chrX 140983127 . G A 3903.53 PASS AF=1;AO=247;DP=251;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.267;QD=61.7158;RBI=0.0253702;REFB=0;REVB=0.00503754;RO=0;SAF=121;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24445e-05;OID=.;OPOS=140983127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:251:253:0:0:247:253:1:126:121:0:0:126:127:0:0 chrX 140993642 . C T 1619.3 PASS AF=0.941667;AO=108;DP=114;FAO=113;FDP=120;FR=.;FRO=7;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0349595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.754;QD=53.9766;RBI=0.039435;REFB=-0.0574662;REVB=-0.0182472;RO=5;SAF=59;SAR=49;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292102;STB=0.525602;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00218933;OID=.;OPOS=140993642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:114:120:5:7:108:113:0.941667:49:59:1:4:48:65:1:6 chrX 140994037 . C A 62.39 PASS AF=1;AO=3;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0965018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7721;QD=35.6534;RBI=0.0980516;REFB=0;REVB=0.0173647;RO=0;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00622398;OID=.;OPOS=140994037;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:3:7:1:3:0:0:0:4:3:0:0 chrX 140994171 . C G 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.895;QD=47.8222;RBI=0.0404529;REFB=0;REVB=-0.00878421;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520019;OID=.;OPOS=140994171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0 chrX 140996364 . G A 1028.37 PASS AF=1;AO=68;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4094;QD=58.7638;RBI=0.10825;REFB=0;REVB=0.107672;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129488;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000874668;OID=.;OPOS=140996364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:69:70:1:0:68:70:1:36:32:0:1:37:33:0:0 chrX 141290865 . C T 872.93 PASS AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0225752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.173;QD=56.3177;RBI=0.0369643;REFB=-0.0793781;REVB=-0.0292698;RO=1;SAF=28;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165597;STB=0.508769;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00113989;OID=.;OPOS=141290865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:33:28:1:0:33:28:1:0 chrX 142517782 . C T 393.34 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204172;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=323.127;QD=56.1916;RBI=0.0374239;REFB=0;REVB=0.0313638;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4864e-05;OID=.;OPOS=142517782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0 chrX 142716114 . G A 1343.71 PASS AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0091939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.536;QD=61.0777;RBI=0.0105164;REFB=0.0440231;REVB=-0.00510551;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.505493;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-8.72952e-06;OID=.;OPOS=142716114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:88:88:0:1:87:87:0.988636:45:42:0:0:45:42:0:1 chrX 142795225 . G A 203.06 PASS AF=0.633333;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0387742;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.15;QD=27.0747;RBI=0.0397366;REFB=-0.0787129;REVB=-0.00869243;RO=10;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145096;STB=0.556719;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0453253;OID=.;OPOS=142795225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:32:30:10:11:19:19:0.633333:8:11:8:2:8:11:8:3 chrX 142795438 . G T 998.64 PASS AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00270473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.605;QD=58.7438;RBI=0.0315356;REFB=0;REVB=0.0314194;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677613;OID=.;OPOS=142795438;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:37:30:0:0:38:30:0:0 chrX 144904882 . T C 145.24 PASS AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.527;QD=44.6898;RBI=0.0222532;REFB=0;REVB=-0.0102733;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180161;OID=.;OPOS=144904882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0 chrX 144906688 . T C 71.54 PASS AF=0.4;AO=11;DP=22;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=22;LEN=1;MLLD=25.7372;QD=11.4465;RBI=0.0763195;REFB=-0.0736812;REVB=-0.0763195;RO=11;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0786147;OID=.;OPOS=144906688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:22:25:11:15:11:10:0.4:11:0:0:11:10:0:0:15 chrX 144910142 . G A 1194.04 PASS AF=1;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022084;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.88;QD=61.2326;RBI=0.0235983;REFB=0;REVB=0.00831739;RO=0;SAF=16;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04823e-05;OID=.;OPOS=144910142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:79:78:0:0:77:78:1:61:16:0:0:62:16:0:0 chrX 144910936 . C T 429.02 PASS AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.523;QD=57.2026;RBI=0.0164656;REFB=0;REVB=-0.00560423;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27657e-05;OID=.;OPOS=144910936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0 chrX 147014960 . C T 2770.8 PASS AF=1;AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6018;QD=62.6169;RBI=0.043528;REFB=0;REVB=-0.0412271;RO=0;SAF=81;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43551e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208838;OID=.;OPOS=147014960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:177:177:0:0:177:177:1:96:81:0:0:96:81:0:0 chrX 147903704 . C T 2121.66 PASS AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.785;QD=62.8641;RBI=0.0451367;REFB=0;REVB=-0.0237527;RO=0;SAF=71;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.26516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147557;OID=.;OPOS=147903704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:64:71:0:0:64:71:0:0 chrX 147903927 . C T 744.24 PASS AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0507288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.539;QD=59.5394;RBI=0.0522834;REFB=-0.0101561;REVB=-0.0126548;RO=2;SAF=16;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140241;STB=0.50746;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.000355519;OID=.;OPOS=147903927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:50:50:2:2:48:48:0.96:32:16:1:1:32:16:1:1 chrX 148628490 . A T 115.77 PASS AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.74;QD=42.0966;RBI=0.0249425;REFB=0;REVB=0.0157196;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498693;OID=.;OPOS=148628490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0 chrX 148798223 . T C 728.98 PASS AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000178416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.588;QD=57.1749;RBI=0.0470161;REFB=0;REVB=-0.0470158;RO=0;SAF=39;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.36214e-05;OID=.;OPOS=148798223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:12:39:0:0:12:39:0:0 chrX 149013727 . A G 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.265;QD=58.5878;RBI=0.0151544;REFB=0;REVB=0.0100251;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018729;OID=.;OPOS=149013727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0 chrX 149400169 . A T 1483.74 PASS AF=0.550201;AO=137;DP=250;FAO=137;FDP=249;FR=.;FRO=112;FSAF=70;FSAR=67;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=-0.0343532;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0796;QD=23.8352;RBI=0.0361402;REFB=-0.0242134;REVB=-0.0112236;RO=112;SAF=70;SAR=67;SRF=51;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459169;STB=0.524986;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0197478;OID=.;OPOS=149400169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:249:112:112:137:137:0.550201:67:70:51:61:67:70:51:61 chrX 149400195 . T C 1067.31 PASS AF=0.5;AO=108;DP=215;FAO=108;FDP=216;FR=.;FRO=108;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.00344564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.768;QD=19.7651;RBI=0.00382446;REFB=0.00865822;REVB=-0.00165954;RO=107;SAF=56;SAR=52;SRF=55;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00408372;STB=0.504634;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.00977512;OID=.;OPOS=149400195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:107:108:108:108:0.5:52:56:55:52:52:56:55:53 chrX 149931106 . C T 786.92 PASS AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00395287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.492;QD=55.2221;RBI=0.0039541;REFB=-0.0523333;REVB=-9.86447e-05;RO=1;SAF=16;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285524;STB=0.515146;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000307705;OID=.;OPOS=149931106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:40:16:1:0:40:16:1:0 chrX 149933341 . T C 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.936;QD=57.7124;RBI=0.0454186;REFB=0;REVB=0.0369177;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112755;OID=.;OPOS=149933341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0 chrX 150349557 . CCACCACTGGCCA C,CCAC 202.24 PASS AF=0.833333,0.166667;AO=15,3;DP=22;FAO=15,3;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7,3;FSAR=8,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.06044,0.0175812;FXX=0.142789;HRUN=3,2;LEN=12,9;MLLD=303.052,93.8166;QD=44.9411;RBI=0.06068,0.0234519;REFB=0,0;REVB=0.00539156,0.0155207;RO=0;SAF=7,3;SAR=8,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.291032,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00720633,0.0664275;OID=.,.;OPOS=150349558,150349561;OREF=CACCACTGGCCA,CACTGGCCA;OALT=-,-;OMAPALT=C,CCAC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.833333,0.166667:15,3:22:15,3:18:0:7,3:8,0:0:0:13:0:7,3:8,0:0:0 chrX 150349648 . C CG 132.85 PASS AF=1;AO=4;DP=34;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574965;FXX=0.302939;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.3114;QD=23.1043;RBI=0.0822132;REFB=0;REVB=0.0587637;RO=29;SAF=1;SAR=3;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.011399;OID=.;OPOS=150349649;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:1:4:34:23:23:0:1:22:0:0:3:29:1:3:11:18 chrX 150349649 . A C,G 485.27 PASS AF=0.147059,0.852941;AO=4,29;DP=33;FAO=5,29;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=1,11;FSAR=4,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632028,0.0505353;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=115.617,93.4568;QD=57.0906;RBI=0.0707997,0.0507641;REFB=0,0;REVB=-0.0319062,0.00481474;RO=0;SAF=1,11;SAR=3,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.180899,-0.00184031;OID=.,.;OPOS=150349649,150349649;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:26:33:34:0:0:4,29:5,29:0.147059,0.852941:3,18:1,11:0:0:4,18:1,11:0:0 chrX 150840185 . T C 1127.67 PASS AF=0.974359;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0153953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.804;QD=57.8291;RBI=0.0177443;REFB=-0.105542;REVB=0.00882296;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.501018;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.000388611;OID=.;OPOS=150840185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:77:78:0:2:75:76:0.974359:35:40:0:0:35:41:1:1 chrX 150869267 . A G 1020.74 PASS AF=0.971831;AO=66;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0137676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.555;QD=57.5066;RBI=0.0589844;REFB=-0.110437;REVB=0.0573551;RO=1;SAF=47;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242139;STB=0.511108;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00153409;OID=.;OPOS=150869267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:71:71:1:1:66:69:0.971831:19:47:0:1:22:47:0:1 chrX 150884620 . C T 789.39 PASS AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503944;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.795;QD=64.4398;RBI=0.0610201;REFB=0;REVB=0.0344073;RO=0;SAF=35;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159092;OID=.;OPOS=150884620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:14:35:0:0:14:35:0:0 chrX 150909307 . G T 332.91 PASS AF=0.896552;AO=25;DP=29;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0261617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8203;QD=45.9194;RBI=0.101485;REFB=-0.153626;REVB=-0.0980544;RO=3;SAF=8;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145562;STB=0.571372;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0149925;OID=.;OPOS=150909307;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:29:29:3:3:25:26:0.896552:17:8:3:0:17:9:3:0 chrX 151092220 . A G 754.42 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2523;QD=56.9376;RBI=0.0536849;REFB=0;REVB=-0.0513433;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000774235;OID=.;OPOS=151092220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0 chrX 151092653 . G A 770.62 PASS AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00187654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5944;QD=55.0443;RBI=0.0185878;REFB=-0.0020924;REVB=-0.0184928;RO=1;SAF=27;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171391;STB=0.509088;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.000158408;OID=.;OPOS=151092653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:28:27:1:0:28:27:1:0 chrX 151138179 . A C 1384.77 PASS AF=0.988889;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273776;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.432;QD=61.5452;RBI=0.0456055;REFB=-0.047612;REVB=0.0364737;RO=1;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126361;STB=0.506665;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00465745;OID=.;OPOS=151138179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:91:90:1:1:89:89:0.988889:37:52:0:1:37:52:0:1 chrX 151303393 . C T 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.395;QD=53.2771;RBI=0.0390228;REFB=0;REVB=0.00717531;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180946;OID=.;OPOS=151303393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0 chrX 151303596 . C T 262.98 PASS AF=0.954545;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0139895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.607;QD=47.8146;RBI=0.0393782;REFB=-0.0245053;REVB=-0.0368094;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.521719;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00157437;OID=.;OPOS=151303596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:22:0:1:21:21:0.954545:10:11:0:0:10:11:1:0 chrX 151899913 . T C 868.36 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000264314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.325;QD=57.8906;RBI=0.00465424;REFB=0;REVB=-0.00464673;RO=0;SAF=21;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91605e-06;OID=.;OPOS=151899913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:38:21:0:0:38:22:0:0 chrX 151904488 . C A 876.95 PASS AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000913369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.832;QD=54.8096;RBI=0.00118436;REFB=-0.0285902;REVB=0.000753966;RO=2;SAF=37;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248371;STB=0.513154;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00233957;OID=.;OPOS=151904488;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:25:37:2:0:25:37:2:0 chrX 152018832 . T G 586.94 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.157;QD=60.1991;RBI=0.0297134;REFB=0;REVB=0.0294559;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21953e-05;OID=.;OPOS=152018832;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:22:14:0:0:24:15:0:0 chrX 152226542 . T C 501.65 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00112164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9821;QD=59.0173;RBI=0.0247505;REFB=0;REVB=0.0247251;RO=0;SAF=30;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250446;OID=.;OPOS=152226542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:4:30:0:0:4:30:0:0 chrX 152227132 . C T 1683.28 PASS AF=0.982456;AO=111;DP=115;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.006499;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.068;QD=59.0624;RBI=0.0635998;REFB=-0.0556841;REVB=0.0632669;RO=2;SAF=53;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017576;STB=0.509089;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.000647158;OID=.;OPOS=152227132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:115:114:2:2:111:112:0.982456:58:53:2:0:58:54:2:0 chrX 152482796 . C T 1001.63 PASS AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0708;QD=58.9195;RBI=0.0323152;REFB=0;REVB=0.00802568;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331487;OID=.;OPOS=152482796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:35:32:0:0:35:33:0:0 chrX 152482917 . T C 604.73 PASS AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438071;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.88;QD=60.4725;RBI=0.0438974;REFB=0;REVB=0.00281339;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000919386;OID=.;OPOS=152482917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:24:15:0:0:24:16:0:0 chrX 152483030 . G A 483.35 PASS AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.564;QD=58.5878;RBI=0.0567189;REFB=0;REVB=0.056647;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014941;OID=.;OPOS=152483030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0 chrX 152747937 . G A 1329.57 PASS AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0067148;FXX=0.0224694;HRUN=5;LEN=1;MLLD=72.3458;QD=61.1295;RBI=0.0151701;REFB=0.0724806;REVB=0.0136031;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.00163251;OID=.;OPOS=152747937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:0:1:86:86:0.988506:43:43:0:0:43:43:0:1 chrX 152771533 . C T 1416.13 PASS AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.123;QD=62.9392;RBI=0.0474624;REFB=0;REVB=0.0283635;RO=0;SAF=32;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191592;OID=.;OPOS=152771533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:57:32:0:0:57:33:0:0 chrX 152815089 . A G 639.6 PASS AF=1;AO=29;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.289;QD=62.3996;RBI=0.113104;REFB=0;REVB=0.00265673;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301991;OID=.;OPOS=152815089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:41:0:0:29:41:1:19:10:0:0:19:22:0:0 chrX 152823728 . G C 689.16 PASS AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8106;QD=62.6512;RBI=0.131165;REFB=0;REVB=0.0728628;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248189;OID=.;OPOS=152823728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0 chrX 152846544 . TT TG,TGT 121.27 PASS AF=0.909091,0.0909091;AO=5,4;DP=16;FAO=10,1;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4,0;FSAR=6,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000404706,-0.000301767;FXX=0.312305;HRUN=15,0;LEN=1,1;MLLD=195.429,193.12;QD=44.0988;RBI=0.0203086,0.00356438;REFB=0,0;REVB=-0.0203045,0.00355158;RO=0;SAF=2,2;SAR=3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00645463,0.0101365;OID=.,.;OPOS=152846545,152846545;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=TG,TGT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.909091,0.0909091:5,4:16:10,1:11:0:4,0:6,1:0:0:9:0:2,2:3,2:0:0 chrX 152958290 . C T 346.17 PASS AF=0.962963;AO=23;DP=24;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.101042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.714;QD=51.2839;RBI=0.103672;REFB=0.0752145;REVB=0.0232025;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486633;STB=0.526295;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.000157943;OID=.;OPOS=152958290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:24:27:1:1:23:26:0.962963:9:14:0:1:9:17:0:1 chrX 153010059 . G T 64.18 PASS AF=0.310345;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.027735;FXX=0.0333222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.926;QD=8.85241;RBI=0.0294169;REFB=-0.0214707;REVB=-0.00980428;RO=20;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.482351;STB=0.807265;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0274044;OID=.;OPOS=153010059;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:29:20:20:9:9:0.310345:1:8:11:9:1:8:11:9 chrX 153010090 . G A 99.2 PASS AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0572104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6521;QD=14.6967;RBI=0.0610948;REFB=0.00914181;REVB=-0.0214371;RO=14;SAF=11;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500024;STB=0.793185;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00882542;OID=.;OPOS=153010090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:27:27:14:15:12:12:0.444444:1:11:8:6:1:11:9:6 chrX 153010092 . G A 97.91 PASS AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00588755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.241;QD=13.5055;RBI=0.00643528;REFB=-0.0198805;REVB=0.00259799;RO=17;SAF=11;SAR=1;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453569;STB=0.777181;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0181602;OID=.;OPOS=153010092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:1:11:11:6:1:11:11:6 chrX 153049535 . A G 443.66 PASS AF=1;AO=16;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.280866;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.291;QD=57.247;RBI=0.283432;REFB=0;REVB=0.0380475;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262008;OID=.;OPOS=153049535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:31:0:0:16:31:1:11:5:0:0:14:17:0:0 chrX 153050159 . GA GT,TC 73.96 PASS AF=0.25,0.75;AO=2,5;DP=8;FAO=2,6;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=1,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662774,0.000543473;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=63.6761,103.587;QD=36.9813;RBI=0.120883,0.0557978;REFB=0,0;REVB=0.101094,0.0557951;RO=0;SAF=1,4;SAR=1,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0543664,0.00992729;OID=.,.;OPOS=153050160,153050159;OREF=A,GA;OALT=T,TC;OMAPALT=GT,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:8:8:0:0:2,5:2,6:0.25,0.75:1,1:1,4:0:0:1,2:1,4:0:0 chrX 153056311 . C CAG 939.6 PASS AF=0.930556;AO=67;DP=74;FAO=67;FDP=72;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0111162;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=2;MLLD=175.525;QD=52.1998;RBI=0.0273795;REFB=-0.0332826;REVB=0.0250214;RO=7;SAF=32;SAR=35;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421524;STB=0.522381;STBP=0.204;TYPE=ins;VARB=0.0100565;OID=.;OPOS=153056312;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.930556:67:74:67:72:5:32:35:4:1:18:7:32:35:5:2 chrX 153067740 . C G 175.57 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.763;QD=46.8198;RBI=0.0603393;REFB=0;REVB=-0.0255332;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026885;OID=.;OPOS=153067740;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chrX 153070999 . G A 2110.13 PASS AF=0.985507;AO=135;DP=138;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0109525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.463;QD=61.1632;RBI=0.011028;REFB=-0.0341492;REVB=0.00128881;RO=2;SAF=55;SAR=80;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00265918;STB=0.501319;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000324593;OID=.;OPOS=153070999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:138:138:2:2:135:136:0.985507:80:55:1:1:80:56:1:1 chrX 153149708 . G GC 536.86 PASS AF=1;AO=42;DP=53;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147879;FXX=0.062487;HRUN=0;LEN=1;MLLD=277.818;QD=47.7212;RBI=0.0248706;REFB=0;REVB=0.0199967;RO=6;SAF=28;SAR=14;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445187;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-1.42005e-05;OID=.;OPOS=153149709;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:42:53:45:45:0:31:14:0:0:10:6:28:14:5:1 chrX 153149715 . C G 747.09 PASS AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00247981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.798;QD=63.582;RBI=0.0168451;REFB=0;REVB=0.0166616;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22009e-05;OID=.;OPOS=153149715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:16:31:0:0:16:31:0:0 chrX 153171993 . A G 74.98 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.136;QD=37.4884;RBI=0.0327416;REFB=0;REVB=-0.03117;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011065;OID=.;OPOS=153171993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0 chrX 153176254 . A G 972.88 PASS AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000531231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.578;QD=58.9625;RBI=0.0204618;REFB=0;REVB=0.0204549;RO=0;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59647e-05;OID=.;OPOS=153176254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:44:22:0:0:44:22:0:0 chrX 153178458 . AG AGC,GC 661.13 PASS AF=0.958333,0.0416667;AO=42,2;DP=48;FAO=46,2;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0950059,-0.00389052;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=20.2003,114.389;QD=55.0938;RBI=0.20816,0.0775872;REFB=0,0;REVB=0.185214,0.0774896;RO=3;SAF=22,2;SAR=20,0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0238127,0.666583;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.015992,-0.00699484;OID=.,.;OPOS=153178460,153178458;OREF=-,AG;OALT=C,GC;OMAPALT=AGC,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:48:48:3:0:42,2:46,2:0.958333,0.0416667:20,0:22,2:1:2:23,0:23,2:0:0 chrX 153218365 . C A 809.25 PASS AF=1;AO=53;DP=53;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3955;QD=56.7898;RBI=0.0942918;REFB=0;REVB=0.0886583;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000892397;OID=.;OPOS=153218365;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:53:57:0:0:53:57:1:27:26:0:0:29:28:0:0 chrX 153219665 . C T 114.33 PASS AF=0.916667;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0295248;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3906;QD=38.1096;RBI=0.0304229;REFB=-0.0682076;REVB=0.00733749;RO=1;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599362;STB=0.533274;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0133276;OID=.;OPOS=153219665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:12:1:1:11:11:0.916667:4:7:1:0:4:7:1:0 chrX 153221657 . T C 191.29 PASS AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.416;QD=47.8223;RBI=0.0533322;REFB=0;REVB=-0.0528732;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000968387;OID=.;OPOS=153221657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0 chrX 153222835 . G C 609.71 PASS AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.063663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.168;QD=56.7175;RBI=0.0698019;REFB=-0.0190738;REVB=0.028624;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.523798;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.000374725;OID=.;OPOS=153222835;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:43:43:0:2:41:41:0.953488:20:21:0:0:20:21:0:2 chrX 153247720 . G GT 92.29 PASS AF=1;AO=3;DP=21;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337334;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=7.65851;QD=24.6118;RBI=0.0683118;REFB=0;REVB=0.0594017;RO=18;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.625404;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0151148;OID=.;OPOS=153247721;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:1:3:21:15:15:0:7:8:0:0:3:18:3:0:8:10 chrX 153247722 . C G,T 202.59 PASS AF=0.176471,0.823529;AO=3,14;DP=17;FAO=3,14;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3,4;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340741,-0.00464596;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=36.5142,67.1229;QD=47.669;RBI=0.0461184,0.0364857;REFB=0,0;REVB=0.0310784,0.0361886;RO=0;SAF=3,4;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.63386e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0620221,-0.00117959;OID=.,.;OPOS=153247722,153247722;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:17:17:0:0:3,14:3,14:0.176471,0.823529:0,10:3,4:0:0:0,10:3,4:0:0 chrX 153247745 . A G 175.68 PASS AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.943;QD=46.848;RBI=0.0187744;REFB=0;REVB=0.00412483;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41595e-05;OID=.;OPOS=153247745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0 chrX 153247954 . C T 646.91 PASS AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.921;QD=60.1778;RBI=0.022978;REFB=0;REVB=0.0218654;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000590782;OID=.;OPOS=153247954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:43:43:0:0:42:43:1:17:25:0:0:18:25:0:0 chrX 153248248 . G A 2763.12 PASS AF=1;AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00058559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.005;QD=62.4433;RBI=0.0434532;REFB=0;REVB=0.0434492;RO=0;SAF=112;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30781e-05;OID=.;OPOS=153248248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:177:177:0:0:177:177:1:65:112:0:0:65:112:0:0 chrX 153418524 . C T 1607.12 PASS AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.957;QD=64.2847;RBI=0.0320309;REFB=0;REVB=0.0250392;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93773e-05;OID=.;OPOS=153418524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:53:47:0:0:53:47:0:0 chrX 153629155 . A G 306.34 PASS AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.009;QD=53.2771;RBI=0.0267513;REFB=0;REVB=0.024637;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211872;OID=.;OPOS=153629155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0 chrX 153633359 . G C 772.72 PASS AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.031676;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.234;QD=61.8173;RBI=0.0404848;REFB=-0.0319115;REVB=0.0252121;RO=1;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184525;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000206111;OID=.;OPOS=153633359;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:25:24:0:1:25:24:0:1 chrX 153649812 . CG C,CC 1150.69 PASS AF=0.012987,0.987013;AO=13,63;DP=76;FAO=1,76;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=1,56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300934,0.223147;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=139.457,154.08;QD=59.7761;RBI=0.0316796,0.22336;REFB=0,0;REVB=0.0098984,0.00976213;RO=0;SAF=10,9;SAR=3,54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.31521e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00968477,0.00178612;OID=.,.;OPOS=153649813,153649813;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:0.012987,0.987013:13,63:76:1,76:77:0:0,20:1,56:0:0:4:0:10,9:3,54:0:0 chrX 153657083 . A G 50.14 PASS AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.405;QD=33.4285;RBI=0.0157081;REFB=0;REVB=0.0157081;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00075943;OID=.;OPOS=153657083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0 chrX 153760484 . C A 88.38 PASS AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.322;QD=39.2791;RBI=0.160919;REFB=0;REVB=0.159166;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00529936;OID=.;OPOS=153760484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:4:4:0:0:5:4:0:0 chrX 153908497 . C G 613.24 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.47;QD=61.3236;RBI=0.0204411;REFB=0;REVB=-0.00160915;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.54241e-05;OID=.;OPOS=153908497;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0 chrX 153994596 . G T 785.06 PASS AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.409;QD=57.0952;RBI=0.0177413;REFB=0;REVB=-0.00846834;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47846e-05;OID=.;OPOS=153994596;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0 chrX 154158201 . T G 1007.64 PASS AF=0.934211;AO=71;DP=75;FAO=71;FDP=76;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0550323;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=47.0604;QD=53.0339;RBI=0.0717874;REFB=-0.090332;REVB=0.0460964;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501375;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00682437;OID=.;OPOS=154158201;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:75:76:0:5:71:71:0.934211:27:44:0:0:27:44:3:2 chrX 154456747 . A G 393.33 PASS AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477435;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.736;QD=56.1904;RBI=0.0506383;REFB=0;REVB=0.0168759;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215223;OID=.;OPOS=154456747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0 chrX 155003641 . A G 566.42 PASS AF=0.55914;AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00499203;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.057;QD=24.3621;RBI=0.00528343;REFB=-0.00926298;REVB=-0.0017304;RO=40;SAF=31;SAR=21;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00317099;STB=0.50624;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00960699;OID=.;OPOS=155003641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:40:41:52:52:0.55914:21:31:24:16:21:31:25:16 chrX 155004437 . G T 104.68 PASS AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0161635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9095;QD=10.7362;RBI=0.0191189;REFB=-0.0242761;REVB=0.0102113;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332952;STB=0.696688;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0508235;OID=.;OPOS=155004437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:18:8:8:5:18:8 chrX 155005254 . C T 1605.48 PASS AF=1;AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.383;QD=60.0179;RBI=0.0279199;REFB=0;REVB=0.0182124;RO=0;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119145;OID=.;OPOS=155005254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:106:107:0:0:106:107:1:58:48:0:0:58:49:0:0 chrX 155006050 . C T 557.06 PASS AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4785;QD=60.2224;RBI=0.0360042;REFB=0;REVB=-0.0154482;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000823381;OID=.;OPOS=155006050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0 chrX 155006982 . A T 785.88 PASS AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.365;QD=64.1532;RBI=0.0389396;REFB=0;REVB=0.00177038;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224279;OID=.;OPOS=155006982;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0 chrX 155007278 . G A 232.49 PASS AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.14158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.44;QD=23.8447;RBI=0.14165;REFB=-0.0261778;REVB=-0.00446146;RO=17;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128396;STB=0.571366;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0136851;OID=.;OPOS=155007278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:10:12:12:5:10:12:12:5 chrX 155008583 . G A 501.61 PASS AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.144;QD=59.0132;RBI=0.041877;REFB=0;REVB=0.00376745;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261233;OID=.;OPOS=155008583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0 chrX 155008671 . G A 1062.44 PASS AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.163;QD=59.8558;RBI=0.00894496;REFB=0;REVB=0.00803571;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85121e-06;OID=.;OPOS=155008671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:40:30:0:0:40:31:0:0 chrX 155009102 . G A 1145.72 PASS AF=0.974684;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.07098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.453;QD=58.0114;RBI=0.0711992;REFB=0.00988674;REVB=0.0055829;RO=1;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108787;STB=0.501499;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.000122091;OID=.;OPOS=155009102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:77:79:1:2:76:77:0.974684:43:33:0:1:43:34:1:1 chrX 155009225 . C T 601.15 PASS AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0312689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.419;QD=58.6485;RBI=0.036426;REFB=-0.0874284;REVB=0.0186844;RO=1;SAF=19;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000724103;OID=.;OPOS=155009225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:21:19:1:0:21:19:1:0 chrX 155009661 . A C 322.17 PASS AF=0.592593;AO=31;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00265855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.2;QD=23.8643;RBI=0.0154708;REFB=-0.00880707;REVB=0.0152407;RO=22;SAF=8;SAR=23;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571026;STB=0.535691;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0052207;OID=.;OPOS=155009661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:22:22:31:32:0.592593:23:8:7:15:24:8:7:15 chrX 155009829 . C T 929.3 PASS AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0059221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.839;QD=55.4806;RBI=0.00646497;REFB=0.0363033;REVB=0.00259317;RO=2;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349541;STB=0.518513;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.00167272;OID=.;OPOS=155009829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:26:39:0:2:26:39:0:2 chrX 155009856 . T C 214.48 PASS AF=0.4;AO=25;DP=63;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00448482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.519;QD=13.1989;RBI=0.00449307;REFB=-0.00446291;REVB=0.000272136;RO=38;SAF=11;SAR=14;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145495;STB=0.576412;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0051152;OID=.;OPOS=155009856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:65:38:39:25:26:0.4:14:11:22:16:14:12:23:16 chrX 155009935 . C A 220.58 PASS AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00951334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.198;QD=14.2309;RBI=0.0233453;REFB=-0.0157803;REVB=0.021319;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133551;STB=0.575701;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0213582;OID=.;OPOS=155009935;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:12:14:24:12:12:14:24:12 chrX 155010062 . G A 902.71 PASS AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.658;QD=58.2394;RBI=0.0258588;REFB=0;REVB=0.00368047;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.00054e-05;OID=.;OPOS=155010062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0 chrX 155010077 . G A 851.26 PASS AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.428;QD=57.7124;RBI=0.0266388;REFB=0;REVB=0.0166372;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.35579e-05;OID=.;OPOS=155010077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0 chrX 155010230 . A C 177.37 PASS AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.050109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7665;QD=14.4795;RBI=0.0538346;REFB=-0.0319718;REVB=0.0196787;RO=30;SAF=9;SAR=10;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203105;STB=0.616903;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0535798;OID=.;OPOS=155010230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:10:9:20:10:10:9:20:10 chrX 155010308 . G A 1066.09 PASS AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0179305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0007;QD=58.4156;RBI=0.0430418;REFB=-0.0727557;REVB=-0.0391292;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000637547;OID=.;OPOS=155010308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:73:73:0:1:72:72:0.986301:36:36:0:0:36:36:1:0 chrX 155011012 . T C 518.56 PASS AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00342468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.158;QD=18.037;RBI=0.00653205;REFB=-0.00721893;REVB=0.00556231;RO=60;SAF=28;SAR=27;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711832;STB=0.539468;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.015325;OID=.;OPOS=155011012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:60:60:55:55:0.478261:27:28:26:34:27:28:26:34 chrX 155011216 . T A 538.56 PASS AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.692;QD=59.8394;RBI=0.0111283;REFB=0;REVB=-0.00195474;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.87498e-05;OID=.;OPOS=155011216;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0 chrX 155011276 . C T 272.56 PASS AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304121;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.938;QD=51.9167;RBI=0.0381936;REFB=0;REVB=0.0231054;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55999e-05;OID=.;OPOS=155011276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0 chrX 155011472 . T A 703.25 PASS AF=0.929825;AO=52;DP=57;FAO=53;FDP=57;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0012728;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.918;QD=49.351;RBI=0.0239304;REFB=0.0171347;REVB=0.0238965;RO=4;SAF=28;SAR=24;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519074;STB=0.501991;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=-0.000401996;OID=.;OPOS=155011472;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:57:57:4:4:52:53:0.929825:24:28:2:2:25:28:2:2 chrX 155011926 . T C 722.1 PASS AF=0.496503;AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=56;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.00456041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.194;QD=20.1985;RBI=0.00596535;REFB=-0.00478495;REVB=0.00384553;RO=72;SAF=15;SAR=56;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31297;STB=0.674167;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00754474;OID=.;OPOS=155011926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:72:72:71:71:0.496503:56:15:36:36:56:15:36:36 chrX 155227464 . C T 1661.67 PASS AF=0.498498;AO=157;DP=323;FAO=166;FDP=333;FR=.;FRO=167;FSAF=50;FSAR=116;FSRF=69;FSRR=98;FWDB=0.00416201;FXX=0.00299392;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.709;QD=19.96;RBI=0.0283222;REFB=-0.021882;REVB=0.0280147;RO=161;SAF=42;SAR=115;SRF=66;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153721;STB=0.563329;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0249792;OID=.;OPOS=155227464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:333:161:167:157:166:0.498498:115:42:66:95:116:50:69:98 chrX 155235014 . C T 977.46 PASS AF=0.470852;AO=100;DP=218;FAO=105;FDP=223;FR=.;FRO=118;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=0.00442587;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.639;QD=17.5328;RBI=0.0107483;REFB=-0.00445494;REVB=0.00979473;RO=115;SAF=40;SAR=60;SRF=53;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604597;STB=0.525354;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00520213;OID=.;OPOS=155235014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:223:115:118:100:105:0.470852:60:40:53:62:61:44:55:63 chrY 4900800 . C T 820.18 PASS AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0328135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.455;QD=55.6056;RBI=0.0338028;REFB=-0.0647737;REVB=0.0081177;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140815;STB=0.50746;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00145202;OID=.;OPOS=4900800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:25:33:1:0:25:33:1:0 chrY 10035664 . C G 613.28 PASS AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.048;QD=61.3282;RBI=0.0210998;REFB=0;REVB=0.0162211;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67209e-05;OID=.;OPOS=10035664;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0 chrY 10036057 . GT AC 349.04 PASS AF=0.870968;AO=27;DP=32;FAO=27;FDP=31;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00106757;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=2;MLLD=142.373;QD=45.0369;RBI=0.0169129;REFB=0.00721343;REVB=0.0168792;RO=4;SAF=20;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140707;STB=0.576309;STBP=0.064;TYPE=mnp;VARB=-0.000842181;OID=.;OPOS=10036057;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:31:4:4:27:27:0.870968:7:20:1:3:7:20:1:3 chrY 10036088 . A G 3282.5 PASS AF=0.981735;AO=213;DP=217;FAO=215;FDP=219;FR=.;FRO=4;FSAF=143;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0032677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.385;QD=59.9544;RBI=0.00908366;REFB=-0.0031798;REVB=-0.00847555;RO=4;SAF=142;SAR=71;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163572;STB=0.508462;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=1.06444e-05;OID=.;OPOS=10036088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:217:219:4:4:213:215:0.981735:71:142:1:3:72:143:1:3 chrY 10036105 . T C 4888.61 PASS AF=0.97546;AO=318;DP=327;FAO=318;FDP=326;FR=.;FRO=8;FSAF=248;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0125014;FXX=0.00305801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.963;QD=59.9829;RBI=0.0208851;REFB=-0.0529395;REVB=0.0167302;RO=7;SAF=248;SAR=70;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207402;STB=0.514237;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.000442518;OID=.;OPOS=10036105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:327:326:7:8:318:318:0.97546:70:248:3:4:70:248:3:5 chrY 10036107 . T C 5092.94 PASS AF=0.981982;AO=328;DP=336;FAO=327;FDP=333;FR=.;FRO=6;FSAF=258;FSAR=69;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0150237;FXX=0.0118691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.64;QD=61.1764;RBI=0.0275418;REFB=-0.0141693;REVB=0.0230833;RO=6;SAF=258;SAR=70;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144876;STB=0.507749;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-8.33458e-07;OID=.;OPOS=10036107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:336:333:6:6:328:327:0.981982:70:258:3:3:69:258:3:3 chrY 10036132 . T C 5667.43 PASS AF=0.976127;AO=366;DP=378;FAO=368;FDP=377;FR=.;FRO=9;FSAF=286;FSAR=82;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00185636;FXX=0.00264543;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3833;QD=60.1319;RBI=0.0383087;REFB=-0.0434307;REVB=0.0382637;RO=9;SAF=286;SAR=80;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149899;STB=0.507573;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.000944715;OID=.;OPOS=10036132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:378:377:9:9:366:368:0.976127:80:286:5:4:82:286:5:4 chrY 10036156 . G C 5475.48 PASS AF=0.965147;AO=360;DP=375;FAO=360;FDP=373;FR=.;FRO=13;FSAF=281;FSAR=79;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0121239;FXX=0.00533319;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.245;QD=58.7183;RBI=0.0137884;REFB=-0.0410426;REVB=0.00656733;RO=11;SAF=281;SAR=79;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019166;STB=0.508323;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00137444;OID=.;OPOS=10036156;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:375:373:11:13:360:360:0.965147:79:281:6:5:79:281:8:5 chrY 10036164 . T C 5553.7 PASS AF=0.970588;AO=363;DP=375;FAO=363;FDP=374;FR=.;FRO=11;FSAF=283;FSAR=80;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0026685;FXX=0.0026666;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190;QD=59.3979;RBI=0.00406896;REFB=-0.0149583;REVB=0.00307174;RO=11;SAF=283;SAR=80;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188827;STB=0.509909;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-2.69863e-05;OID=.;OPOS=10036164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:375:374:11:11:363:363:0.970588:80:283:6:5:80:283:6:5 chrY 10036171 . A G 5567.49 PASS AF=0.970667;AO=363;DP=374;FAO=364;FDP=375;FR=.;FRO=11;FSAF=284;FSAR=80;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.036687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.791;QD=59.3866;RBI=0.036687;REFB=-0.0379226;REVB=-3.09686e-05;RO=11;SAF=283;SAR=80;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188827;STB=0.509928;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00096436;OID=.;OPOS=10036171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:374:375:11:11:363:364:0.970667:80:283:6:5:80:284:6:5 chrY 10036189 . C CCGTT 5485.24 PASS AF=0.97561;AO=350;DP=372;FAO=360;FDP=369;FR=.;FRO=9;FSAF=281;FSAR=79;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0112796;FXX=0.00539069;HRUN=2;LEN=4;MLLD=211.856;QD=59.4606;RBI=0.018225;REFB=-0.0127184;REVB=-0.014315;RO=13;SAF=272;SAR=78;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00831522;STB=0.507938;STBP=0.104;TYPE=ins;VARB=-2.2065e-05;OID=.;OPOS=10036190;OREF=-;OALT=CGTT;OMAPALT=CCGTT GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.97561:350:372:360:369:9:281:79:5:4:3:13:272:78:9:4 chrY 10036204 . T C 5334.87 PASS AF=0.95935;AO=354;DP=369;FAO=354;FDP=369;FR=.;FRO=15;FSAF=281;FSAR=73;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0314812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2956;QD=57.8306;RBI=0.0525261;REFB=-0.0181899;REVB=0.0420467;RO=15;SAF=281;SAR=73;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377529;STB=0.519834;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.000892467;OID=.;OPOS=10036204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:369:369:15:15:354:354:0.95935:73:281:7:8:73:281:7:8 chrY 10036229 . T C 4172.47 PASS AF=0.951724;AO=276;DP=290;FAO=276;FDP=290;FR=.;FRO=14;FSAF=237;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00312302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.048;QD=57.5514;RBI=0.00371245;REFB=0.00430316;REVB=0.00200724;RO=14;SAF=237;SAR=39;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883487;STB=0.546552;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000231483;OID=.;OPOS=10036229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:290:290:14:14:276:276:0.951724:39:237:5:9:39:237:5:9 chrY 10036233 . G C 3726.23 PASS AF=0.94052;AO=252;DP=268;FAO=253;FDP=269;FR=.;FRO=16;FSAF=221;FSAR=32;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0322492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.395;QD=55.4086;RBI=0.0352804;REFB=0.010143;REVB=-0.0143073;RO=16;SAF=220;SAR=32;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10217;STB=0.553948;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000447093;OID=.;OPOS=10036233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:268:269:16:16:252:253:0.94052:32:220:7:9:32:221:7:9 chrY 10036269 . A G 914.8 PASS AF=0.860759;AO=68;DP=79;FAO=68;FDP=79;FR=.;FRO=11;FSAF=57;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0188343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.336;QD=46.3189;RBI=0.0250054;REFB=-0.0264309;REVB=-0.0164481;RO=11;SAF=57;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162296;STB=0.586889;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00596323;OID=.;OPOS=10036269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:79:79:11:11:68:68:0.860759:11:57:5:6:11:57:5:6 chrY 10036277 . A G 231.46 PASS AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0139303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.303;QD=30.8607;RBI=0.0157948;REFB=-0.0432817;REVB=-0.00744445;RO=9;SAF=10;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078358;STB=0.54309;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00572429;OID=.;OPOS=10036277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:11:10:3:6:11:10:3:6 chrY 10036280 . A G 231.46 PASS AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0180568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.631;QD=30.8607;RBI=0.0180574;REFB=0.0113612;REVB=0.000156389;RO=9;SAF=10;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078358;STB=0.54309;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.000488616;OID=.;OPOS=10036280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:11:10:3:6:11:10:3:6 chrY 10036383 . G C 36.37 PASS AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.00713756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.821;QD=6.92819;RBI=0.0206329;REFB=-0.0253198;REVB=0.019359;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423585;STB=0.763935;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0637857;OID=.;OPOS=10036383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:2:4:4:11:2:4:4:11 chrY 10036405 . ACCC AACA,ACCA 85.63 PASS AF=0.08,0.24;AO=2,6;DP=25;FAO=2,6;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=1,5;FSAR=1,1;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0508875,-0.0432073;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=3,1;MLLD=159.543,145.219;QD=13.7;RBI=0.0519345,0.0432088;REFB=-0.0110475,-0.011898;REVB=0.0103757,-0.000370752;RO=10;SAF=1,5;SAR=1,1;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.493481,0.656508;STB=0.731512,0.871919;STBP=0.708,0.066;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0362538,0.05715;OID=.,.;OPOS=10036406,10036408;OREF=CCC,C;OALT=ACA,A;OMAPALT=AACA,ACCA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:0.08,0.24:2,6:25:2,6:25:13:1,5:1,1:3:10:43:10:1,5:1,1:1:9 chrY 10036422 . C T 60.75 PASS AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0112553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.718;QD=6.39523;RBI=0.0372912;REFB=-0.0034178;REVB=-0.0355521;RO=28;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386521;STB=0.758445;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0337645;OID=.;OPOS=10036422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:38:38:28:29:9:9:0.236842:2:7:13:15:2:7:13:16 chrY 10036438 . C T 68.47 PASS AF=0.205128;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00984792;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.538;QD=7.02209;RBI=0.0461251;REFB=-0.00193133;REVB=-0.0450615;RO=28;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312713;STB=0.717745;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00458158;OID=.;OPOS=10036438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:42:39:28:29:8:8:0.205128:2:6:14:14:2:6:14:15 chrY 10036483 . T C 164.13 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00750125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.992;QD=12.8726;RBI=0.0129609;REFB=-0.00239623;REVB=0.0105696;RO=30;SAF=11;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132681;STB=0.509544;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00130363;OID=.;OPOS=10036483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:30:32:19:19:0.372549:8:11:17:13:8:11:19:13 chrY 10036486 . C G 164.15 PASS AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00161408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.185;QD=12.8741;RBI=0.00521682;REFB=-0.00253196;REVB=0.00496084;RO=32;SAF=11;SAR=8;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164237;STB=0.509544;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00737672;OID=.;OPOS=10036486;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:8:11:19:13:8:11:19:13 chrY 10036503 . T C 48.73 PASS AF=0.177778;AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.0352261;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.499;QD=4.33138;RBI=0.03631;REFB=0.000227407;REVB=-0.00880538;RO=37;SAF=5;SAR=3;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676294;STB=0.545344;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00152397;OID=.;OPOS=10036503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:45:45:37:37:8:8:0.177778:3:5:25:12:3:5:25:12 chrY 10036512 . G A 40.53 PASS AF=0.155556;AO=6;DP=44;FAO=7;FDP=45;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.00865399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.913;QD=3.60259;RBI=0.0208935;REFB=-0.0206194;REVB=0.019017;RO=38;SAF=4;SAR=2;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023622;STB=0.530215;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.124094;OID=.;OPOS=10036512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:44:45:38:38:6:7:0.155556:2:4:26:12:2:5:26:12 chrY 10036518 . C T 69.93 PASS AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0265953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.848;QD=6.6596;RBI=0.0300075;REFB=-0.00180598;REVB=-0.0138975;RO=32;SAF=8;SAR=2;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218533;STB=0.641661;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.00610588;OID=.;OPOS=10036518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:42:42:32:32:10:10:0.238095:2:8:21:11:2:8:21:11 chrY 10036519 . G GTTGA 33.8 PASS AF=0.146341;AO=6;DP=42;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0173083;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=4;MLLD=305.937;QD=3.29732;RBI=0.0176039;REFB=-0.00307776;REVB=0.00321206;RO=35;SAF=4;SAR=2;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661941;STB=0.547019;STBP=0.895;TYPE=ins;VARB=0.0136776;OID=.;OPOS=10036520;OREF=-;OALT=TTGA;OMAPALT=GTTGA GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.146341:6:42:6:41:35:4:2:25:10:33:35:4:2:25:10 chrY 10036530 . A G 51.29 PASS AF=0.2;AO=7;DP=42;FAO=8;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=-0.0437294;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.231;QD=5.12942;RBI=0.0459702;REFB=-0.00500596;REVB=-0.0141773;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136586;STB=0.724551;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0531835;OID=.;OPOS=10036530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:42:40:22:32:7:8:0.2:3:4:15:7:4:4:25:7 chrY 10036545 . T C 241.69 PASS AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.018956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.21;QD=21.9722;RBI=0.0225314;REFB=0.00347196;REVB=-0.0121793;RO=21;SAF=17;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763899;STB=0.542959;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00240114;OID=.;OPOS=10036545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:6:17:14:7:6:17:14:7 chrY 10036549 . A C 102.69 PASS AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0133153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.911;QD=9.335;RBI=0.039804;REFB=-0.00586338;REVB=-0.0375108;RO=31;SAF=8;SAR=5;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164423;STB=0.598316;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.013012;OID=.;OPOS=10036549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:5:8:23:8:5:8:23:8 chrY 10036552 . C T 80.01 PASS AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0265823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.259;QD=7.27372;RBI=0.0339786;REFB=-0.00804804;REVB=-0.0211642;RO=33;SAF=9;SAR=2;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238948;STB=0.653317;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0259954;OID=.;OPOS=10036552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:44:44:33:33:11:11:0.25:2:9:22:11:2:9:22:11 chrY 10036561 . T C 91.82 PASS AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.00954401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.909;QD=8.74514;RBI=0.0278313;REFB=-0.00946094;REVB=0.0261437;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914955;STB=0.555467;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0173747;OID=.;OPOS=10036561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:4:8:22:8:4:8:22:8 chrY 10036586 . TG CA,CG 142.19 PASS AF=0.193548,0.322581;AO=6,10;DP=31;FAO=6,10;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=4,8;FSAR=2,2;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00207136,-0.00645675;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=200.635,113.662;QD=18.3474;RBI=0.0198354,0.0460383;REFB=0.00721112,0.00141417;REVB=-0.019727,-0.0455833;RO=14;SAF=4,8;SAR=2,2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.159998,0.0215705;STB=0.555379,0.558016;STBP=0.774,0.736;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0103071,0.0087166;OID=.,.;OPOS=10036586,10036586;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:83:31:31:14:15:6,10:6,10:0.193548,0.322581:2,2:4,8:11:3:2,2:4,8:11:4 chrY 10036590 . T G 34.58 PASS AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00577551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.896;QD=4.46156;RBI=0.0384834;REFB=-0.0203107;REVB=-0.0380475;RO=25;SAF=4;SAR=2;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134621;STB=0.58947;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0391917;OID=.;OPOS=10036590;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:2:4:19:6:2:4:19:6 chrY 10036621 . TG CC,CG 71.65 PASS AF=0.266667,0.333333;AO=4,5;DP=16;FAO=4,5;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3,4;FSAR=1,1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0580362,-0.101925;FXX=0.062461;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=84.7362,67.3443;QD=19.107;RBI=0.0740017,0.121965;REFB=-0.0275556,-0.0518886;REVB=0.0459135,0.066984;RO=5;SAF=3,4;SAR=1,1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.15474,0.20967;STB=0.562171,0.599562;STBP=0.793,0.674;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0157052,0.0300583;OID=.,.;OPOS=10036621,10036621;OREF=TG,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:37:16:15:5:6:4,5:4,5:0.266667,0.333333:1,1:3,4:3:2:1,1:3,4:4:2 chrY 10037768 . T C 1943.73 PASS AF=0.787234;AO=148;DP=188;FAO=148;FDP=188;FR=.;FRO=40;FSAF=48;FSAR=100;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00926322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.911;QD=41.3561;RBI=0.0113247;REFB=-0.00329032;REVB=0.00651474;RO=40;SAF=48;SAR=100;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130343;STB=0.569413;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000901068;OID=.;OPOS=10037768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:40:40:148:148:0.787234:100:48:25:15:100:48:25:15 chrY 10037786 . G A 73.98 PASS AF=0.0969163;AO=22;DP=221;FAO=22;FDP=227;FR=.;FRO=205;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=90;FSRR=115;FWDB=-0.00202863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.606;QD=1.30367;RBI=0.0332469;REFB=-0.00398931;REVB=-0.033185;RO=199;SAF=14;SAR=8;SRF=90;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219831;STB=0.674083;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0401127;OID=.;OPOS=10037786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:221:227:199:205:22:22:0.0969163:8:14:90:109:8:14:90:115 chrY 10037791 . C G 2626.37 PASS AF=0.825532;AO=194;DP=236;FAO=194;FDP=235;FR=.;FRO=41;FSAF=87;FSAR=107;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.00218802;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.586;QD=44.7041;RBI=0.0140909;REFB=-0.0188354;REVB=0.01392;RO=40;SAF=87;SAR=107;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491744;STB=0.524021;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00279474;OID=.;OPOS=10037791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:40:41:194:194:0.825532:107:87:24:16:107:87:24:17 chrY 10037797 . T C 2854.33 PASS AF=0.834677;AO=207;DP=248;FAO=207;FDP=248;FR=.;FRO=41;FSAF=96;FSAR=111;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00382706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.289;QD=46.0376;RBI=0.0283887;REFB=-0.0226712;REVB=0.0281295;RO=41;SAF=96;SAR=111;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045683;STB=0.524175;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00411571;OID=.;OPOS=10037797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:41:41:207:207:0.834677:111:96:25:16:111:96:25:16 chrY 10037807 . T C 3044.8 PASS AF=0.870588;AO=215;DP=249;FAO=222;FDP=255;FR=.;FRO=33;FSAF=102;FSAR=120;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0352317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.211;QD=47.7616;RBI=0.0438007;REFB=-0.0183334;REVB=0.0260236;RO=33;SAF=96;SAR=119;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251434;STB=0.511181;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00245858;OID=.;OPOS=10037807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:255:33:33:215:222:0.870588:119:96:18:15:120:102:18:15 chrY 10037819 . T C 3079.24 PASS AF=0.859316;AO=225;DP=264;FAO=226;FDP=263;FR=.;FRO=37;FSAF=102;FSAR=124;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00966846;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.233;QD=46.8325;RBI=0.0954483;REFB=-0.0790315;REVB=0.0949573;RO=37;SAF=102;SAR=123;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379467;STB=0.520266;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00863792;OID=.;OPOS=10037819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:263:37:37:225:226:0.859316:123:102:22:15:124:102:22:15 chrY 10037877 . G GC 1472.38 PASS AF=0.91623;AO=154;DP=220;FAO=175;FDP=191;FR=.;FRO=16;FSAF=83;FSAR=92;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0305999;FXX=0.0353517;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.5856;QD=30.8353;RBI=0.161012;REFB=-0.0189075;REVB=0.158078;RO=63;SAF=77;SAR=77;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129282;STB=0.512641;STBP=0.277;TYPE=ins;VARB=0.0141369;OID=.;OPOS=10037878;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.91623:154:220:175:191:16:83:92:10:6:10:63:77:77:33:30 chrY 10037892 . A G 1818.88 PASS AF=0.879195;AO=86;DP=156;FAO=131;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0718899;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.003;QD=48.8289;RBI=0.0744311;REFB=-0.0362731;REVB=-0.019283;RO=19;SAF=22;SAR=64;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11326;STB=0.50735;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00529927;OID=.;OPOS=10037892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:156:149:19:17:86:131:0.879195:64:22:10:9:61:70:8:9 chrY 10037899 . T C 1297.61 PASS AF=0.852174;AO=98;DP=115;FAO=98;FDP=115;FR=.;FRO=17;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00431476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3029;QD=45.1341;RBI=0.0165055;REFB=-0.0247675;REVB=0.0159316;RO=17;SAF=58;SAR=40;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179253;STB=0.509515;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00909708;OID=.;OPOS=10037899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:115:115:17:17:98:98:0.852174:40:58:9:8:40:58:9:8 chrY 10037912 . T G 764.72 PASS AF=0.919355;AO=57;DP=62;FAO=57;FDP=62;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0218047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.268;QD=49.3369;RBI=0.0224383;REFB=-0.0394004;REVB=-0.00529449;RO=5;SAF=32;SAR=25;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247685;STB=0.513168;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00977424;OID=.;OPOS=10037912;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:62:62:5:5:57:57:0.919355:25:32:2:3:25:32:2:3 chrY 10037914 . T C 698.57 PASS AF=0.913793;AO=53;DP=58;FAO=53;FDP=58;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0357263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.307;QD=48.177;RBI=0.0372805;REFB=-0.0449314;REVB=0.0106523;RO=5;SAF=32;SAR=21;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342046;STB=0.518212;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0122351;OID=.;OPOS=10037914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:58:58:5:5:53:53:0.913793:21:32:2:3:21:32:2:3 chrY 13262908 . C G 33.48 PASS AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00229669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.887;QD=19.1341;RBI=0.00229669;REFB=-0.0745469;REVB=0;RO=2;SAF=5;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012606;OID=.;OPOS=13262908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:0:5:2:0:0:5:2:0 chrY 13262918 . A T 55.02 PASS AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0244157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.858;QD=9.56872;RBI=0.047715;REFB=-0.0442143;REVB=-0.0409951;RO=15;SAF=7;SAR=1;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152616;STB=0.595475;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0535364;OID=.;OPOS=13262918;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:1:7:12:3:1:7:12:3 chrY 13262943 . AC A 225.52 PASS AF=0.72973;AO=24;DP=37;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0321319;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.2977;QD=24.3804;RBI=0.0443123;REFB=0.0204497;REVB=0.0305142;RO=9;SAF=20;SAR=4;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.204545;SSSB=-0.169769;STB=0.592533;STBP=0.206;TYPE=del;VARB=-0.00546249;OID=.;OPOS=13262944;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.72973:24:37:27:37:10:22:5:10:0:36:9:20:4:9:0 chrY 13263091 . G A 475.06 PASS AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0176258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.651;QD=24.3622;RBI=0.0370871;REFB=-0.018274;REVB=0.032631;RO=32;SAF=25;SAR=20;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11311;STB=0.555531;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00740285;OID=.;OPOS=13263091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:32:33:45:45:0.576923:20:25:13:19:20:25:14:19 chrY 21152662 . CAA C 214.83 PASS AF=0.426829;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0467867;FXX=0.0238067;HRUN=4;LEN=2;MLLD=38.9976;QD=10.4794;RBI=0.0598626;REFB=-0.000906188;REVB=0.0373434;RO=46;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285786;STB=0.510632;STBP=0.901;TYPE=del;VARB=0.00241859;OID=.;OPOS=21152663;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:0.426829:35:84:35:82:47:20:15:26:21:99:46:20:15:25:21 chrY 21152701 . G T 295.59 PASS AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.000290234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.74;QD=15.3555;RBI=0.00683514;REFB=0.00858425;REVB=-0.00682897;RO=44;SAF=23;SAR=10;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189863;STB=0.607775;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.0146654;OID=.;OPOS=21152701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:44:33:33:0.428571:10:23:23:21:10:23:23:21 chrY 21152719 . T C 256.44 PASS AF=0.453125;AO=28;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0088465;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.689;QD=16.0275;RBI=0.0101015;REFB=-0.0126949;REVB=0.00487642;RO=36;SAF=19;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132038;STB=0.587481;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0165836;OID=.;OPOS=21152719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:36:35:28:29:0.453125:9:19:20:16:9:20:19:16 chrY 21153609 . T C 949.65 PASS AF=0.580645;AO=90;DP=155;FAO=90;FDP=155;FR=.;FRO=65;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.04607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5518;QD=24.5071;RBI=0.0538374;REFB=-0.0127004;REVB=0.0278572;RO=65;SAF=51;SAR=39;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459875;STB=0.525005;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0121537;OID=.;OPOS=21153609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:65:65:90:90:0.580645:39:51:33:32:39:51:33:32 chrY 21154426 . G A 190.59 PASS AF=0.225564;AO=30;DP=133;FAO=30;FDP=133;FR=.;FRO=103;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=-0.00928201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.65;QD=5.73215;RBI=0.0129141;REFB=-0.00992902;REVB=-0.0089788;RO=101;SAF=20;SAR=10;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148341;STB=0.592529;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.017009;OID=.;OPOS=21154426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:101:103:30:30:0.225564:10:20:56:45:10:20:57:46 chrY 21154466 . T A 621.27 PASS AF=0.554545;AO=61;DP=111;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00423613;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.077;QD=22.5917;RBI=0.0043287;REFB=0.00481135;REVB=0.000890397;RO=49;SAF=33;SAR=28;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913141;STB=0.549984;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00541727;OID=.;OPOS=21154466;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:49:49:61:61:0.554545:28:33:21:28:28:33:21:28